diff --git a/NEWS.md b/NEWS.md index eec9716..8440650 100644 --- a/NEWS.md +++ b/NEWS.md @@ -3,6 +3,7 @@ * Fork from Cristianetaniguti/Qploidy@development * Re-branding with Qploidy2 * Adding updated vignettes +* Allow `hmm_estimate_CN_multi` to run with raw data (not standardized) # Qploidy 1.8.7 diff --git a/R/hmm_main.R b/R/hmm_main.R index af6bbb7..c70bba4 100644 --- a/R/hmm_main.R +++ b/R/hmm_main.R @@ -721,6 +721,9 @@ hmm_estimate_CN <- function( #' Returns a combined data.frame with results for all samples. #' #' @param qploidy_standarize_result An object of class qploidy_standardization as returned by standardize(). +#' @param data Optional data.frame with raw input data (MarkerName, SampleName, ratio, R) if qploidy_standarize_result is not provided. +#' @param use_values Character vector of column names to use for CN estimation. If qploidy_standarize_result is provided, these should match the columns in qploidy_standarize_result$data (e.g., c("BAF", "zscore")). If qploidy_standarize_result is NULL, use_values must be c("ratio", "R") and these columns must be present in the provided 'data'. +#' @param geno.pos Optional data.frame with marker genomic positions (MarkerName, Chromosome, Position) if qploidy_standarize_result is not provided. #' @param sample_ids Character vector of sample IDs to analyze, or "all" for all samples in the data. #' @param n_cores Number of cores to use (default: 2). #' @param parallel_type Character. Parallel backend to use: \code{"FORK"}, \code{"PSOCK"}, or \code{"auto"} (default). \code{"auto"} selects \code{"FORK"} on Unix/macOS (faster; workers inherit the parent environment automatically) and \code{"PSOCK"} on Windows (the only option available there). Use \code{"PSOCK"} explicitly if you need cross-platform reproducibility or are debugging worker crashes. diff --git a/README.md b/README.md index 3c1ae7e..3229b33 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -2,7 +2,6 @@ [![Development](https://img.shields.io/badge/development-active-blue.svg)](https://img.shields.io/badge/development-active-blue.svg) [![License: GPL v3](https://img.shields.io/badge/License-GPL%20v3-blue.svg)](https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0) [![R-CMD-check](https://github.com/Breeding-Insight/Qploidy2/workflows/R-CMD-check/badge.svg)](https://github.com/Breeding-Insight/Qploidy2/actions) -![](https://img.shields.io/badge/RRID-SCR_026724-yellow.svg) [![codecov](https://codecov.io/gh/Breeding-Insight/Qploidy2/graph/badge.svg?token=DQBM227JSY)](https://codecov.io/gh/Breeding-Insight/Qploidy2) @@ -28,7 +27,7 @@ devtools::install_github("Breeding-Insight/Qploidy2") ## Documentation -* [Tutorial](https://github.com/Breeding-Insight/Qploidy2/Qploidy_alfalfa_tutorial.html) - large-scale copy number estimation in alfalfa mapping population using DArTag sequencing data +* [Tutorial](https://Breeding-Insight.github.io/Qploidy2/Qploidy_alfalfa_tutorial.html) - large-scale copy number estimation in alfalfa mapping population using DArTag sequencing data ## Contributing diff --git a/alfalfa_F1_marker_panel_dataset_publicly_available.vcf.gz b/alfalfa_F1_marker_panel_dataset_publicly_available.vcf.gz deleted file mode 100644 index 38510c1..0000000 Binary files a/alfalfa_F1_marker_panel_dataset_publicly_available.vcf.gz and /dev/null differ diff --git a/alfalfa_Qploidy_CN_dosages.vcf b/alfalfa_Qploidy_CN_dosages.vcf deleted file mode 100644 index 0a16205..0000000 --- a/alfalfa_Qploidy_CN_dosages.vcf +++ /dev/null @@ -1,2774 +0,0 @@ -##fileformat=VCFv4.2 -##INFO= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT 85-1 85-100 85-102 85-103 85-104 85-106 85-110 85-111 85-112 85-113 85-117 85-119 85-120 85-122 85-123 85-124 85-126 85-133 85-141 85-147 85-148 85-153 85-155 85-156 85-157 85-158 85-168 85-169 85-17 85-171 85-172 85-176 85-177 85-178 85-179 85-181 85-182 85-184 85-185 85-187 85-188 85-191 85-192 85-193 85-196 85-198 85-2 85-201 85-202 85-203 85-205 85-206 85-207 85-209 85-21 85-210 85-211 85-212 85-213 85-215 85-216 85-217 85-218 85-222 85-223 85-224 85-226 85-227 85-229 85-23 85-231 85-234 85-239 85-24 85-242 85-244 85-245 85-247 85-251 85-253 85-256 85-257 85-259 85-26 85-263 85-267 85-269 85-272 85-273 85-274 85-275 85-277 85-278 85-28 85-281 85-284 85-285 85-287 85-288 85-29 85-291 85-292 85-294 85-295 85-297 85-298 85-299 85-3 85-30 85-303 85-304 85-31 85-311 85-313 85-314 85-315 85-316 85-317 85-318 85-319 85-321 85-322 85-324 85-33 85-331 85-336 85-338 85-341 85-345 85-346 85-349 85-35 85-351 85-353 85-356 85-36 85-360 85-364 85-368 85-370 85-375 85-376 85-38 85-380 85-4 85-40 85-41 85-43 85-46 85-47 85-48 85-49 85-5 85-52 85-53 85-55 85-59 85-60 85-61 85-62 85-63 85-66 85-67 85-68 85-69 85-70 85-71 85-72 85-73 85-74 85-75 85-76 85-77 85-78 85-79 85-84 85-85 85-89 85-92 85-93 85-94 85-95 85-98 85-99 J432 -chr1.1 194324 chr1.1_000194324 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,339:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.27:1.000:. ./.:4:55,204:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,211:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,330:.: 1.05:1.000:. ./.:4:70,198:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,170:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,312:.: 0.79:1.000:. ./.:4:46,237:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,17:.:-3.49:1.000:. ./.:4:0,45:.:-3.08:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.25:1.000:. ./.:4:47,206:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,274:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,305:.: 0.69:1.000:. ./.:4:49,310:.: 1.47:1.000:. ./.:4:82,263:.: 1.27:1.000:. ./.:4:98,299:.: 2.02:1.000:. ./.:4:6,15:.:-3.43:1.000:. ./.:4:60,213:.: 0.23:1.000:. ./.:4:68,214:.: 0.36:1.000:. ./.:4:76,235:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,20:.:-3.44:1.000:. ./.:4:65,234:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.46:1.000:. ./.:4:66,276:.: 1.23:1.000:. ./.:4:47,244:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,244:.: 0.78:1.000:. ./.:4:43,196:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,11:.:-3.56:1.000:. ./.:4:11,45:.:-2.92:1.000:. ./.:3:6,5:.:-3.57:1.000:. ./.:4:47,201:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,304:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.27:1.000:. ./.:4:53,202:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,215:.: 0.37:1.000:. ./.:4:62,222:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.88:1.000:. ./.:4:53,210:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,372:.: 1.66:1.000:. ./.:4:46,146:.:-0.95:1.000:. ./.:4:56,159:.:-0.62:1.000:. ./.:4:58,206:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.79:1.000:. ./.:4:62,257:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,350:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,208:.: 0.05:1.000:. ./.:4:67,231:.: 0.59:1.000:. ./.:4:41,152:.:-0.93:1.000:. ./.:4:43,186:.:-0.41:1.000:. ./.:6:12,181:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.44:1.000:. ./.:4:75,198:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,193:.:-0.27:1.000:. ./.:4:38,174:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,316:.: 0.85:1.000:. ./.:4:62,176:.:-0.28:1.000:. ./.:4:43,158:.:-0.82:1.000:. ./.:4:68,209:.: 0.28:1.000:. ./.:4:73,252:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.34:1.000:. ./.:4:71,213:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,174:.:-1.21:1.000:. ./.:3:0,262:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.10:1.000:. ./.:4:44,178:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,202:.:-0.06:1.000:. ./.:4:68,208:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,208:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,186:.:-0.28:1.000:. ./.:4:48,204:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.63:1.000:. ./.:4:22,180:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.57:1.000:. ./.:4:67,192:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.93:1.000:. ./.:4:98,94:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.72:1.000:. ./.:4:58,236:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,151:.:-1.15:1.000:. ./.:4:46,209:.:-0.04:1.000:. ./.:4:38,151:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,163:.:-0.76:1.000:. ./.:4:38,162:.:-0.83:1.000:. ./.:4:73,243:.: 0.85:1.000:. ./.:4:66,263:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.15:1.000:. ./.:4:50,174:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,381:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.50:1.000:. ./.:3:0,175:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.72:1.000:. ./.:4:38,176:.:-0.63:1.000:. ./.:4:36,162:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,160:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,150:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,84:.:-1.30:1.000:. ./.:4:55,208:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,339:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.27:1.000:. ./.:6:0,368:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.33:1.000:. ./.:4:45,170:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.50:1.000:. ./.:4:74,205:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,137:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.47:1.000:. ./.:4:65,195:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,377:.: 1.73:1.000:. ./.:4:57,183:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.43:1.000:. ./.:6:49,214:.: 0.08:0.989:. ./.:4:52,155:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.25:1.000:. ./.:4:54,209:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,245:.: 0.68:1.000:. ./.:4:27,161:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,340:.: 1.20:1.000:. ./.:4:91,264:.: 1.41:1.000:. ./.:4:79,221:.: 0.62:1.000:. ./.:4:57,214:.: 0.20:1.000:. ./.:4:75,223:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.78:1.000:. ./.:4:60,187:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,24:.:-3.38:1.000:. ./.:4:58,190:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.98:1.000:. ./.:4:75,235:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.98:1.000:. ./.:4:77,235:.: 0.79:1.000:. ./.:4:60,194:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.97:1.000:. ./.:4:64,162:.:-0.46:1.000:. ./.:4:50,199:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.33:1.000:. ./.:4:72,218:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,338:.: 1.17:1.000:. ./.:4:59,184:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.19:1.000:. ./.:4:73,224:.: 0.57:1.000:. ./.:4:53,213:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,235:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.08:1.000:. ./.:4:50,178:.:-0.43:1.000:. ./.:4:58,209:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,261:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,331:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,287:.: 0.43:1.000:. ./.:4:38,209:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,363:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,335:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,339:.: 1.18:1.000:. ./.:4:43,167:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.10:1.000:. -chr1.1 452961 chr1.1_000452961 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:3,2:0.42: 0.04:1.000:0.900 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.04:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.84:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.25:1.000:0.840 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.84:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,5:0.57: 0.63:1.000:0.943 0/0/1/1:4:1,4:0.62: 0.04:1.000:0.503 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.84:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.55:1.000:0.679 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.34:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.84:1.000:0.987 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.57: 0.63:1.000:0.943 0/0/0:3:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.33: 0.04:1.000:0.906 0/1/1/1:4:1,6:0.66: 0.63:1.000:0.873 0/0/1/1:4:2,4:0.54: 0.34:1.000:0.987 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.34:1.000:0.987 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,8:0.62: 1.52:1.000:0.503 0/1/1/1:4:0,6:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.54: 1.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,5:0.57: 0.63:1.000:0.943 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.34:1.000:0.752 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.25:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.34:1.000:0.987 0/0/0/0/1/1:6:6,2:0.35: 0.93:1.000:0.889 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.52: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.55:1.000:0.679 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.84:1.000:0.987 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.54: 1.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.55:1.000:0.679 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,7:0.61: 1.22:1.000:0.679 0/0/0:3:6,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.66: 0.63:1.000:0.873 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.42: 2.11:1.000:0.928 0/0/0/1:4:4,1:0.33: 0.04:1.000:0.906 0/0/1/1:4:3,4:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,11:0.58: 2.99:1.000:0.900 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,7:0.61: 1.22:1.000:0.679 0/0/1/1:4:3,7:0.56: 1.52:1.000:0.963 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/0/1/1:4:3,4:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:3,6:0.54: 1.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,5:0.57: 0.63:1.000:0.943 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42: 0.04:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,8:0.58: 1.81:1.000:0.916 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.50: 1.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.25:1.000:0.752 0/0/1/1:4:8,7:0.44: 2.99:1.000:0.974 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.43: 0.63:1.000:0.943 0/0/1/1:4:5,3:0.41: 0.93:1.000:0.840 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.37: 0.63:1.000:0.576 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,6:0.59: 0.93:1.000:0.840 0/0/1/1:4:2,4:0.54: 0.34:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:4,7:0.52: 1.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,6:0.50: 1.52:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,5:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.48: 1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,11:0.55: 3.29:1.000:0.975 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.34:1.000:0.752 0/0/1/1:4:2,4:0.54: 0.34:1.000:0.987 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/0/1/1:4:5,3:0.41: 0.93:1.000:0.840 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.04:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,10:0.65: 2.11:1.000:0.752 0/0/1/1:4:3,5:0.52: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:5,4:0.44: 1.22:1.000:0.643 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,6:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.25:1.000:0.840 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,7:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:2,1:0.39:-0.55:0.989:0.727 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.33: 1.81:1.000:0.937 0/1/1/1:4:0,7:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.42: 0.04:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,4:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,7:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.33: 0.04:1.000:0.906 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.55:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.84:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:4,4:0.46: 0.93:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.55:1.000:0.679 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,7:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.25:1.000:0.840 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.84:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.55:1.000:0.679 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.55:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.55:1.000:0.679 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.34:1.000:0.752 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.25:1.000:0.840 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.55:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,2:0.42: 0.04:1.000:0.900 -chr1.1 532584 chr1.1_000532584 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:128,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:188,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.49:1.000:. ./.:3:13,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:114,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:134,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.50:1.000:. ./.:3:95,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:250,1:.: 1.78:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:135,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:230,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:232,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.80:1.000:. ./.:3:99,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:206,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:14,0:.:-1.36:0.989:. ./.:4:208,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:285,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:235,2:.: 1.59:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.15:1.000:. -chr1.1 735393 chr1.1_000735393 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:24,90:0.78: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,37:0.55:-0.68:1.000:0.981 0/0/1/1:4:44,49:0.51: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,56:0.61: 0.36:1.000:0.688 0/1/1/1:4:18,86:0.82: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,58:0.50: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,30:0.54:-1.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:42,46:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,35:0.35: 0.75:1.000:0.822 0/0/0/1:4:12,6:0.32:-2.71:1.000:0.942 0/1/1/1:4:8,22:0.72:-2.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,53:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,43:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,19:0.30:-0.85:1.000:0.981 0/0/1/1:4:47,45:0.47: 0.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,54:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,55:0.72:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,50:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,68:0.58: 1.44:1.000:0.926 0/0/1/1:4:56,68:0.53: 1.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,11:0.48:-2.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,47:0.53: 0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,73:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,28:0.30: 0.49:1.000:0.987 0/0/1/1:4:15,16:0.50:-2.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,47:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,72:0.60: 1.57:1.000:0.822 0/1/1/1:4:11,73:0.86: 0.14:1.000:0.967 0/0/1/1:4:40,65:0.60: 1.05:1.000:0.792 0/0/1/1:4:37,46:0.53: 0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,37:0.47:-0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:40,43:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,10:0.39:-2.41:1.000:0.652 0/0/0/1:4:21,9:0.29:-2.19:1.000:0.990 0/0/0:3:9,1:0.10:-3.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,25:0.30: 0.06:1.000:0.987 0/1/1/1:4:23,66:0.73: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,53:0.56: 0.45:1.000:0.963 0/0/1/1:4:22,33:0.58:-1.11:1.000:0.912 0/0/1/1:4:47,45:0.47: 0.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:54,25:0.31:-0.07:1.000:0.976 0/0/1/1:4:49,52:0.49: 0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,80:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,35:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,30:0.41:-0.42:1.000:0.849 0/0/1/1:4:51,48:0.47: 0.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:79,24:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,64:0.53: 1.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,36:0.41: 0.14:1.000:0.883 0/0/0/1:4:48,20:0.29:-0.55:1.000:0.993 0/1/1/1:4:13,51:0.78:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,22:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,41:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,51:0.52: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,47:0.47: 0.66:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,30:0.44:-0.68:1.000:0.973 0/1/1/1:4:28,62:0.67: 0.40:1.000:0.926 0/0/1/1:4:43,30:0.40:-0.33:1.000:0.762 0/0/1/1:4:42,48:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:30,34:0.51:-0.72:1.000:0.883 0/1/1/1:4:22,72:0.75: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,25:0.28: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,42:0.44: 0.49:1.000:0.966 0/0/0/1:4:47,16:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,79:0.82: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,54:0.59: 0.36:1.000:0.879 0/0/0/1:4:30,10:0.25:-1.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,62:0.83:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,47:0.59:-0.16:1.000:0.857 0/0/1/1:4:45,43:0.47: 0.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:47,21:0.30:-0.55:1.000:0.984 0/0/1/1:4:25,20:0.43:-1.55:1.000:0.942 1/1/1:3:0,70:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,87:0.76: 1.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,17:0.27:-0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,39:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:32,36:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:62,6:0.09:-0.55:1.000:0.966 0/0/0/1:4:71,28:0.28: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,26:0.50:-1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,24:0.39:-0.90:1.000:0.652 0/0/1/1:4:33,44:0.55:-0.16:1.000:0.979 0/0/0/1:4:53,19:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,49:0.82:-0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,47:0.68:-0.59:1.000:0.963 0/0/1/1:4:32,28:0.45:-0.90:1.000:0.979 0/0/0/1:4:56,27:0.32: 0.10:1.000:0.961 0/1/1/1:4:11,50:0.81:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,24:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,20:0.43:-1.55:1.000:0.942 0/0/0/1:4:49,14:0.22:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,68:0.72: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,32:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,78:0.73: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,36:0.52:-0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,35:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,46:0.69:-0.68:1.000:0.974 0/1/1/1:4:23,66:0.73: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,78:0.74: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,19:0.54:-2.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:38,38:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:41,11:0.21:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,18:0.26:-0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,41:0.74:-1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,55:0.77:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,11:0.15:-0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:65,23:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,63:0.52: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,47:0.48: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:48,27:0.35:-0.25:1.000:0.800 0/0/1/1:4:59,76:0.54: 2.35:1.000:0.986 0/1/1/1:4:22,49:0.67:-0.42:1.000:0.931 0/1/1/1:4:24,71:0.73: 0.62:1.000:0.998 0/1/1:3:17,30:0.62:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,41:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,26:0.48:-1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,33:0.52:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,33:0.47:-0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,32:0.39:-0.03:1.000:0.652 0/0/1/1:4:35,53:0.58: 0.32:1.000:0.902 0/0/1/1:4:40,37:0.46:-0.16:1.000:0.989 0/0/0/1:4:61,13:0.17:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,71:0.57: 1.70:1.000:0.941 0/0/1/1:4:29,36:0.53:-0.68:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,33:0.46:-0.51:1.000:0.987 0/0/0/0/0/1:6:68,17:0.20: 0.19:1.000:0.934 0/1/1/1:4:14,38:0.71:-1.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:30,9:0.23:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,43:0.57:-0.33:1.000:0.948 0/1/1/1:4:22,50:0.68:-0.38:1.000:0.945 0/0/0/1:4:77,18:0.19: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,13:0.27:-1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,45:0.73:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,24:0.29:-0.03:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,102:0.78: 2.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,68:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,42:0.59:-0.51:1.000:0.868 0/0/0/0/0/1:6:51,16:0.24:-0.59:0.989:0.682 0/0/1/1:4:38,40:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,62:0.79:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,36:0.47:-0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:58,24:0.29: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:50,18:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,38:0.28: 2.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,95:0.71: 2.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,69:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,63:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,36:0.32: 1.18:1.000:0.942 0/0/1/1:4:52,33:0.38: 0.19:1.000:0.511 0/1/1/1:4:25,101:0.79: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,59:0.59: 0.71:1.000:0.871 0/0/1/1:4:9,9:0.48:-2.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,53:0.56: 0.49:1.000:0.973 0/0/1/1:4:38,52:0.56: 0.40:1.000:0.971 0/0/0/1:4:61,28:0.31: 0.36:1.000:0.978 0/0/1/1:4:52,63:0.53: 1.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,50:0.53: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,51:0.57: 0.23:1.000:0.937 0/1/1/1:4:16,90:0.84: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,26:0.30: 0.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:31,50:0.60: 0.01:1.000:0.807 0/0/0/1:4:45,24:0.34:-0.51:1.000:0.882 0/0/1/1:4:46,51:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,50:0.56: 0.23:1.000:0.965 0/0/0/1:4:72,27:0.27: 0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,37:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,66:0.71: 0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:34,34:0.48:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,44:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,14:0.17: 0.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:17,76:0.80: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,45:0.54: 0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:44,33:0.41:-0.16:1.000:0.883 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,46:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:77,27:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,56:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,66:0.63: 0.92:1.000:0.544 0/0/1/1:4:48,53:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,59:0.57: 0.84:1.000:0.946 0/1/1/1:4:29,101:0.76: 2.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,50:0.42: 1.44:1.000:0.924 0/0/1/1:4:32,44:0.56:-0.20:1.000:0.969 0/1/1/1:4:29,82:0.72: 1.31:1.000:0.996 -chr1.1 837330 chr1.1_000837330 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:158,96:.: 1.23:1.000:. ./.:4:211,34:.: 1.06:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:132,48:.:-0.17:1.000:. ./.:4:181,61:.: 1.01:1.000:. ./.:4:195,44:.: 0.95:1.000:. ./.:4:150,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:93,97:.: 0.02:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,7:.:-2.56:1.000:. ./.:4:29,17:.:-2.72:1.000:. ./.:4:211,36:.: 1.10:1.000:. ./.:4:202,48:.: 1.16:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:94,84:.:-0.21:1.000:. ./.:4:132,38:.:-0.36:1.000:. ./.:4:84,86:.:-0.36:1.000:. ./.:4:229,38:.: 1.48:1.000:. ./.:4:238,40:.: 1.69:1.000:. ./.:4:168,44:.: 0.44:1.000:. ./.:4:32,12:.:-2.75:1.000:. ./.:4:206,52:.: 1.31:1.000:. ./.:4:256,50:.: 2.22:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:42,1:.:-2.77:1.000:. ./.:4:108,94:.: 0.25:1.000:. ./.:4:87,83:.:-0.36:1.000:. ./.:4:85,71:.:-0.63:1.000:. ./.:4:140,42:.:-0.13:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:112,25:.:-0.99:1.000:. ./.:4:153,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,8:.:-3.08:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.22:1.000:. ./.:3:23,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:133,79:.: 0.44:1.000:. ./.:4:169,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:137,32:.:-0.38:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:170,24:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,86:.:-0.32:1.000:. ./.:4:107,39:.:-0.82:1.000:. ./.:4:178,43:.: 0.61:1.000:. ./.:4:144,39:.:-0.11:1.000:. ./.:4:231,50:.: 1.75:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:130,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:110,21:.:-1.10:1.000:. ./.:4:266,2:.: 1.50:1.000:. ./.:4:133,30:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,57:.: 0.25:1.000:. ./.:4:161,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:111,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:65,67:.:-1.08:1.000:. ./.:4:128,29:.:-0.61:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:131,34:.:-0.46:1.000:. ./.:4:134,85:.: 0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:102,115:.: 0.53:1.000:. ./.:4:118,30:.:-0.78:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:97,68:.:-0.46:1.000:. ./.:4:183,40:.: 0.64:1.000:. ./.:4:219,38:.: 1.29:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:133,36:.:-0.38:1.000:. ./.:3:159,67:.: 0.70:1.000:. ./.:4:211,55:.: 1.46:1.000:. ./.:4:70,78:.:-0.78:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,41:.:-0.44:1.000:. ./.:4:167,28:.: 0.11:1.000:. ./.:4:201,24:.: 0.68:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:190,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:156,44:.: 0.21:1.000:. ./.:4:108,40:.:-0.78:1.000:. ./.:4:211,65:.: 1.65:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:123,31:.:-0.66:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:152,84:.: 0.89:1.000:. ./.:4:67,30:.:-1.75:1.000:. ./.:4:87,91:.:-0.21:1.000:. ./.:4:130,47:.:-0.23:1.000:. ./.:4:150,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:126,20:.:-0.82:1.000:. ./.:4:110,119:.: 0.76:1.000:. ./.:4:103,77:.:-0.17:1.000:. ./.:4:137,32:.:-0.38:1.000:. ./.:4:193,39:.: 0.82:1.000:. ./.:4:125,24:.:-0.76:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:99,26:.:-1.22:1.000:. ./.:4:142,33:.:-0.27:1.000:. ./.:4:159,24:.:-0.11:1.000:. ./.:4:162,41:.: 0.27:1.000:. ./.:4:128,96:.: 0.66:1.000:. ./.:4:125,43:.:-0.40:1.000:. ./.:4:120,37:.:-0.61:1.000:. ./.:4:160,83:.: 1.02:1.000:. ./.:4:143,34:.:-0.23:1.000:. ./.:4:92,85:.:-0.23:1.000:. ./.:3:36,28:.:-2.37:1.000:. ./.:4:157,96:.: 1.21:1.000:. ./.:4:106,32:.:-0.97:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:131,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:223,41:.: 1.42:1.000:. ./.:4:130,47:.:-0.23:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:154,78:.: 0.82:1.000:. ./.:4:118,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:94,80:.:-0.29:1.000:. ./.:6:165,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:114,30:.:-0.85:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:100,48:.:-0.78:1.000:. ./.:4:87,71:.:-0.59:1.000:. ./.:4:167,39:.: 0.32:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:71,57:.:-1.16:1.000:. ./.:4:185,41:.: 0.70:1.000:. ./.:4:116,95:.: 0.42:1.000:. ./.:4:92,78:.:-0.36:1.000:. ./.:4:65,57:.:-1.27:1.000:. ./.:6:191,0:.: 0.04:0.989:. ./.:4:166,35:.: 0.23:1.000:. ./.:4:145,67:.: 0.44:1.000:. ./.:4:141,29:.:-0.36:1.000:. ./.:4:136,52:.:-0.02:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:249,65:.: 2.37:1.000:. ./.:4:185,100:.: 1.82:1.000:. ./.:4:202,37:.: 0.95:1.000:. ./.:4:126,29:.:-0.65:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:101,80:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,48:.: 1.16:1.000:. ./.:4:153,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,26:.:-2.56:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:145,78:.: 0.64:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:188,108:.: 2.03:1.000:. ./.:4:139,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:149,36:.:-0.08:1.000:. ./.:4:151,49:.: 0.21:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:102,38:.:-0.93:1.000:. ./.:4:152,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:190,47:.: 0.91:1.000:. ./.:4:115,46:.:-0.53:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:178,44:.: 0.63:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:178,38:.: 0.51:1.000:. ./.:4:179,39:.: 0.55:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:105,44:.:-0.76:1.000:. ./.:4:131,64:.: 0.11:1.000:. ./.:4:158,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:219,46:.: 1.44:1.000:. ./.:4:217,52:.: 1.52:1.000:. ./.:4:171,33:.: 0.28:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:185,39:.: 0.66:1.000:. ./.:4:116,96:.: 0.44:1.000:. ./.:4:240,53:.: 1.97:1.000:. ./.:4:178,36:.: 0.47:1.000:. ./.:4:196,46:.: 1.01:1.000:. -chr1.1 915014 chr1.1_000915014 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:80,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:78,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:64,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:47,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.20:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:106,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:72,3:.: 0.88:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:133,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.88:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.93:1.000:. ./.:6:35,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.88:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.18:1.000:. ./.:3:0,1:.:-1.92:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.88:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:76,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.92:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:82,2:.: 1.22:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:3:22,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:67,1:.: 0.62:1.000:. ./.:6:76,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,2:.:-1.05:1.000:. ./.:6:44,0:.:-0.29:0.989:. ./.:4:31,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:54,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:150,1:.: 3.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:49,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:105,1:.: 2.05:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:71,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:93,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:93,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:87,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. -chr1.1 1169609 chr1.1_001169609 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:405,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:320,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:500,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:548,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:399,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:221,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:378,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.18:1.000:. ./.:3:189,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:412,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:533,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:719,1:.: 4.09:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:147,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:269,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.36:1.000:. ./.:6:210,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:287,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.57:1.000:. ./.:3:273,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:294,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:168,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:308,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:543,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.85:1.000:. ./.:3:117,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:324,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:380,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:273,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:338,2:.: 0.33:1.000:. ./.:6:461,2:.: 1.55:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.47:1.000:. ./.:6:284,1:.:-0.21:0.989:. ./.:4:166,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:547,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:286,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:247,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:487,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:222,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:479,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:379,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:278,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:259,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:571,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:393,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:509,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.22:1.000:. -chr1.1 1494903 chr1.1_001494903 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:15,16:0.53:-0.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,19:0.85:-0.89:1.000:0.981 0/1/1/1:4:6,26:0.80:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,12:0.60:-0.99:1.000:0.765 0/0/1/1:4:17,21:0.56:-0.06:1.000:0.966 0/1/1/1:4:5,13:0.71:-1.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:5,5:0.51:-1.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,24:0.79:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,16:0.41: 0.19:1.000:0.841 0/0/1/1:4:28,16:0.40: 0.24:1.000:0.785 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,11:0.44:-0.63:1.000:0.960 0/1/1/1:4:5,17:0.76:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.70:-1.15:1.000:0.982 0/1/1/1:4:2,8:0.79:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.54:-1.25:1.000:0.985 0/0/0/1:4:12,5:0.34:-1.15:1.000:0.862 0/1/1/1:4:9,18:0.66:-0.63:1.000:0.881 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,26:0.61: 0.19:1.000:0.724 0/0/1/1:4:18,14:0.46:-0.37:1.000:0.988 0/0/1/1:4:20,16:0.47:-0.17:1.000:0.991 0/1/1/1:4:7,17:0.70:-0.79:1.000:0.984 0/0/0/1:4:19,8:0.34:-0.63:1.000:0.850 0/0/1/1:4:12,9:0.45:-0.94:1.000:0.983 0/0/1/1:4:13,10:0.46:-0.84:1.000:0.987 0/0/1/1:4:6,6:0.51:-1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,23:0.71:-0.37:1.000:0.991 0/1/1/1:4:3,13:0.80:-1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,11:0.64:-1.15:1.000:0.739 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.49:-1.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1:3:6,10:0.63:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.51:-1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,21:0.54: 0.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,22:0.84:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,14:0.43:-0.22:1.000:0.946 0/0/1/1:4:22,25:0.54: 0.40:1.000:0.986 0/1/1/1:4:6,45:0.87: 0.60:1.000:0.862 0/1/1/1:4:12,29:0.70: 0.09:1.000:0.983 0/1/1/1:4:16,40:0.70: 0.86:1.000:0.988 0/0/1/1:4:23,28:0.56: 0.60:1.000:0.971 0/0/1/1:4:36,36:0.51: 1.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,36:0.79: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,26:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,81:0.49: 6.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,28:0.62: 0.30:1.000:0.536 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 2.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,21:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,24:0.66:-0.17:1.000:0.881 0/0/1/1:4:22,20:0.49: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,35:0.69: 0.55:1.000:0.976 0/0/1/1:4:10,9:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,22:0.39: 1.17:1.000:0.713 0/1/1/1:4:11,22:0.66:-0.32:1.000:0.881 0/1/1/1:4:23,56:0.70: 2.04:1.000:0.984 0/1/1/1:4:15,49:0.75: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:21,28:0.58: 0.50:1.000:0.540 0/0/1/1:4:28,24:0.48: 0.66:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,29:0.41: 1.94:1.000:0.865 0/1/1/1:4:14,47:0.75: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.30: 0.71:1.000:0.985 0/1/1/1:4:14,47:0.75: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,38:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,21:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,44:0.74: 0.96:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,76:0.83: 2.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,21:0.60:-0.22:1.000:0.765 0/1/1:3:9,46:0.83: 0.81:1.000:0.979 0/0/0/1:4:28,6:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,25:0.56: 0.30:1.000:0.961 0/1/1/1:4:12,21:0.64:-0.32:1.000:0.629 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,40:0.75: 0.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,52:0.79: 1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,46:0.67: 1.48:1.000:0.923 0/0/1/1:4:34,32:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,13:0.65:-0.99:1.000:0.766 0/0/1/1:4:30,33:0.54: 1.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:33,14:0.34: 0.40:1.000:0.840 0/0/0/1:4:24,9:0.32:-0.32:1.000:0.945 0/1/1/1:4:12,39:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,27:0.47: 1.07:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,40:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.57:-0.27:1.000:0.955 0/1/1/1:4:13,29:0.68: 0.14:1.000:0.961 0/0/0/1:4:44,18:0.34: 1.17:1.000:0.882 0/0/1/1:4:11,8:0.45:-1.04:1.000:0.977 0/0/0/1:4:42,12:0.28: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,25:0.43: 1.22:1.000:0.939 0/0/0/1:4:36,11:0.29: 0.40:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,47:0.73: 1.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:16,60:0.77: 1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,27:0.67: 0.04:1.000:0.918 0/1/1/1:4:7,33:0.81: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,16:0.35: 0.66:1.000:0.770 0/1/1/1:4:11,38:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,39:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,32:0.46: 1.74:1.000:0.989 0/0/1/1:4:17,22:0.57:-0.01:1.000:0.944 0/1/1/1:4:11,43:0.78: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,26:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,16:0.53:-0.42:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,27:0.81:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.46: 0.60:1.000:0.985 0/0/0/1:4:41,10:0.26: 0.60:1.000:0.999 0/1/1:3:12,38:0.74: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,34:0.56: 1.17:1.000:0.971 0/0/1/1:4:25,18:0.45: 0.19:1.000:0.975 0/0/1/1:4:32,32:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,24:0.44: 0.96:1.000:0.969 0/1/1/1:4:17,42:0.70: 1.02:1.000:0.987 0/1/1/1:4:9,20:0.68:-0.53:1.000:0.959 0/1/1/1:4:19,39:0.67: 0.96:1.000:0.908 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,28:0.55: 0.66:1.000:0.981 0/0/1/1:4:24,18:0.45: 0.14:1.000:0.983 0/1/1/1/1/1:6:9,56:0.85: 1.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:21,31:0.60: 0.66:1.000:0.795 0/1/1/1:4:11,39:0.76: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,38:0.74: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,25:0.47: 0.86:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,32:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,19:0.53:-0.12:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,33:0.79: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,32:0.70: 0.30:1.000:0.986 1/1/1/1/1/1:6:0,55:1.00: 0.81:0.989:1.000 0/0/1/1:4:25,25:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,23:0.67:-0.27:1.000:0.923 0/0/1/1:4:24,28:0.55: 0.66:1.000:0.981 0/1/1/1:4:4,25:0.85:-0.53:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,27:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,23:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,13:0.53:-0.73:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,19:0.58:-0.32:1.000:0.908 0/1/1/1:4:7,23:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,20:0.54:-0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:10,10:0.51:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,7:0.44:-1.15:1.000:0.967 0/0/1/1:4:11,9:0.47:-0.99:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,14:0.69:-0.99:1.000:0.976 0/1/1/1:4:6,17:0.73:-0.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,24:0.76:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,14:0.69:-0.99:1.000:0.976 0/0/1/1:4:15,14:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,7:0.49:-1.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,15:0.65:-0.84:1.000:0.784 0/1/1/1:4:4,20:0.82:-0.79:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,26:0.96:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.56:-0.99:1.000:0.969 0/0/0/1:4:16,3:0.22:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,15:0.68:-0.89:1.000:0.940 0/0/1/1:4:11,16:0.60:-0.63:1.000:0.821 0/0/1/1:4:10,10:0.51:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,16:0.60:-0.63:1.000:0.821 0/0/1/1:4:12,11:0.50:-0.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.71:-1.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,15:0.56:-0.63:1.000:0.961 0/0/0/1:4:29,7:0.26:-0.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.57:-1.20:1.000:0.947 0/1/1/1:4:4,22:0.84:-0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,30:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.23:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.55:-0.89:1.000:0.975 0/0/1/1:4:10,9:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,30:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,19:0.81:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.79:-1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.75:-0.68:1.000:0.999 -chr1.1 1590881 chr1.1_001590881 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,26:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,39:.: 0.52:1.000:. ./.:4:12,51:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,63:.: 1.30:1.000:. ./.:4:6,23:.:-1.37:1.000:. ./.:4:10,43:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,13:.:-2.63:1.000:. ./.:4:4,3:.:-3.10:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.43:1.000:. ./.:4:15,32:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.28:1.000:. ./.:4:14,43:.: 0.83:1.000:. ./.:4:20,37:.: 0.83:1.000:. ./.:4:32,30:.: 1.22:1.000:. ./.:4:16,29:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,41:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.94:1.000:. ./.:4:11,54:.: 1.46:1.000:. ./.:4:13,36:.: 0.20:1.000:. ./.:4:10,30:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,1:.:-3.49:1.000:. ./.:4:12,66:.: 2.48:1.000:. ./.:4:32,22:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,20:.:-1.21:1.000:. ./.:4:16,36:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,71:.: 2.71:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:2,7:.:-2.94:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.86:1.000:. ./.:3:0,5:.:-3.26:1.000:. ./.:4:19,35:.: 0.59:1.000:. ./.:4:33,33:.: 1.54:1.000:. ./.:4:14,59:.: 2.09:1.000:. ./.:4:14,39:.: 0.52:1.000:. ./.:4:13,36:.: 0.20:1.000:. ./.:4:9,42:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.91:1.000:. ./.:4:5,36:.:-0.43:1.000:. ./.:4:15,24:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,43:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:13,40:.: 0.52:1.000:. ./.:4:4,19:.:-1.84:1.000:. ./.:4:13,34:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.75:1.000:. ./.:4:5,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,55:.: 1.54:1.000:. ./.:4:9,44:.: 0.52:1.000:. ./.:4:13,42:.: 0.67:1.000:. ./.:4:13,33:.:-0.03:1.000:. ./.:4:10,47:.: 0.83:1.000:. ./.:4:7,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.75:1.000:. ./.:6:10,39:.: 0.20:1.000:. ./.:4:8,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.67:1.000:. ./.:4:26,28:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.91:1.000:. ./.:4:8,20:.:-1.45:1.000:. ./.:4:6,30:.:-0.82:1.000:. ./.:4:9,32:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,62:.: 1.22:1.000:. ./.:4:10,11:.:-2.00:1.000:. ./.:3:0,56:.: 0.75:1.000:. ./.:4:28,36:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.54:1.000:. ./.:4:7,48:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,37:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.07:1.000:. ./.:4:10,36:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.58:1.000:. ./.:4:11,47:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,36:.: 0.12:1.000:. ./.:4:15,41:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,43:.: 0.28:1.000:. ./.:4:21,19:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:11,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:3,33:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:5,33:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:13,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:9,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:11,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:10,35:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,18:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.45:1.000:. ./.:4:9,37:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,41:.: 0.20:1.000:. ./.:4:9,23:.:-1.13:1.000:. ./.:4:15,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:5,29:.:-0.98:1.000:. ./.:4:14,52:.: 1.54:1.000:. ./.:4:7,34:.:-0.43:1.000:. ./.:4:8,46:.: 0.59:1.000:. ./.:4:8,46:.: 0.59:1.000:. ./.:4:12,32:.:-0.19:1.000:. ./.:4:13,40:.: 0.52:1.000:. ./.:4:8,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:14,44:.: 0.91:1.000:. ./.:4:7,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,23:.:-0.27:1.000:. ./.:3:4,8:.:-2.71:1.000:. ./.:4:17,29:.:-0.03:1.000:. ./.:4:9,36:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,31:.:-0.27:1.000:. ./.:4:5,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.27:1.000:. ./.:4:9,46:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.54:1.000:. ./.:4:22,22:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:17,30:.: 0.04:1.000:. ./.:6:10,48:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.06:1.000:. ./.:4:5,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:20,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.82:1.000:. ./.:4:16,32:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.69:1.000:. ./.:4:14,46:.: 1.07:1.000:. ./.:4:12,27:.:-0.58:1.000:. ./.:4:6,27:.:-1.06:1.000:. ./.:6:0,49:.: 0.20:0.989:. ./.:4:9,32:.:-0.43:1.000:. ./.:4:10,23:.:-1.06:1.000:. ./.:4:8,19:.:-1.53:1.000:. ./.:4:13,36:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.36:1.000:. ./.:4:16,42:.: 0.91:1.000:. ./.:4:7,44:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:20,36:.: 0.75:1.000:. ./.:4:15,26:.:-0.43:1.000:. ./.:4:17,37:.: 0.59:1.000:. ./.:4:17,39:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,42:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,50:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.91:1.000:. ./.:4:10,45:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.83:1.000:. ./.:4:12,31:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,45:.: 0.91:1.000:. ./.:4:13,25:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.27:1.000:. ./.:4:8,30:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,35:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,21:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.35:1.000:. ./.:4:15,28:.:-0.27:1.000:. ./.:4:12,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.13:1.000:. ./.:4:8,43:.: 0.36:1.000:. ./.:4:25,15:.:-0.51:1.000:. ./.:4:18,24:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:11,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:18,34:.: 0.44:1.000:. ./.:4:8,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.90:1.000:. ./.:4:19,25:.:-0.19:1.000:. ./.:4:17,49:.: 1.54:1.000:. ./.:4:14,36:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.04:1.000:. -chr1.1 1938036 chr1.1_001938036 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:21,58:0.75: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,20:0.31: 0.38:1.000:0.970 0/1/1/1:4:19,42:0.71:-0.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,49:0.72: 0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,70:0.72: 1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,39:0.55: 0.33:1.000:0.981 0/0/1/1:4:28,27:0.54:-0.70:1.000:0.987 0/0/0/1:4:62,10:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,30:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:11,9:0.50:-2.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,12:0.59:-2.18:1.000:0.874 0/0/0/1:4:67,10:0.19: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,28:0.41: 0.42:1.000:0.843 0/0/1/1:4:44,26:0.43:-0.03:1.000:0.941 0/0/0/1:4:50,20:0.34:-0.03:1.000:0.843 0/0/1/1:4:31,21:0.46:-0.84:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,46:0.71:-0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,29:0.47:-0.03:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,62:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,48:0.48: 1.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,9:0.55:-2.36:1.000:0.981 0/1/1/1:4:26,43:0.66:-0.07:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,82:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,49:0.74:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,10:0.63:-2.41:1.000:0.510 0/0/1/1:4:32,18:0.42:-0.93:1.000:0.899 0/0/1/1:4:27,28:0.56:-0.70:1.000:0.973 0/0/1/1:4:48,34:0.47: 0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,79:0.71: 2.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:23,38:0.66:-0.43:1.000:0.846 0/1/1/1:4:14,37:0.75:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,19:0.56:-1.51:1.000:0.967 0/0/0/0:4:3,0:0.07:-3.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,4:0.37:-2.59:1.000:0.623 1/1/1:3:0,1:1.00:-3.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,46:0.71:-0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,33:0.79:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,35:0.54: 0.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:28,22:0.49:-0.93:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,48:0.80:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,24:0.40:-0.07:1.000:0.828 0/0/1/1:4:49,34:0.47: 0.56:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,36:0.71:-0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:47,53:0.57: 1.32:1.000:0.933 0/0/1/1:4:39,28:0.47:-0.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:97,15:0.20: 1.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.37:-2.32:1.000:0.519 0/1/1/1:4:21,60:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,54:0.69: 0.51:1.000:0.970 0/0/1/1:4:39,29:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,31:0.35: 1.55:1.000:0.762 0/0/1/1:4:47,41:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,40:0.73:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,61:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,26:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,51:0.68: 0.33:1.000:0.962 0/0/1/1/1/1:6:23,37:0.65:-0.48:1.000:0.901 0/0/1/1:4:65,34:0.40: 1.28:1.000:0.794 0/0/1/1:4:40,26:0.45:-0.21:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,82:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,27:0.54:-0.70:1.000:0.987 0/1/1/1:4:15,57:0.81: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,35:0.52: 0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:10,35:0.80:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,49:0.72:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,47:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,16:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,49:0.59: 0.83:1.000:0.846 0/1/1/1:4:8,37:0.84:-1.15:1.000:0.997 0/0/1:3:29,22:0.49:-0.88:1.000:0.711 0/1/1/1:4:24,69:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,34:0.45: 0.74:1.000:0.976 0/0/1/1:4:37,29:0.49:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,26:0.43:-0.07:1.000:0.954 0/0/1/1:4:46,41:0.52: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,20:0.32: 0.33:1.000:0.965 0/1/1/1:4:16,44:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,11:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,32:0.49: 0.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,32:0.45: 0.47:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-2.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,56:0.67: 0.74:1.000:0.939 0/1/1/1:4:9,43:0.84:-0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,52:0.70: 0.29:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,56:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,36:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,37:0.69:-0.66:1.000:0.973 0/1/1/1:4:24,54:0.72: 0.33:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,53:0.71: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,22:0.48:-0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,74:0.77: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,31:0.52:-0.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,51:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,20:0.44:-0.84:1.000:0.968 0/0/1/1:4:56,41:0.48: 1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,43:0.53: 0.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,28:0.56:-0.75:1.000:0.959 0/1/1/1:4:27,51:0.68: 0.33:1.000:0.962 0/0/1/1:4:37,23:0.44:-0.48:1.000:0.966 0/1/1/1:4:13,57:0.83:-0.03:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,28:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,34:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,68:0.58: 2.53:1.000:0.916 0/0/1/1:4:58,37:0.45: 1.10:1.000:0.975 0/0/0/1:4:72,20:0.28: 0.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,15:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,78:0.76: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,74:0.77: 1.23:1.000:1.000 0/0/1:3:16,4:0.26:-2.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,42:0.58: 0.33:1.000:0.905 0/0/1/1:4:25,34:0.62:-0.52:1.000:0.627 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,57:0.74: 0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,45:0.66: 0.06:1.000:0.858 0/0/0/1:4:58,25:0.36: 0.56:1.000:0.700 0/1/1/1:4:22,46:0.70:-0.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:48,34:0.47: 0.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,43:0.52: 1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,35:0.71:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,44:0.53: 0.92:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:67,31:0.37: 1.23:1.000:0.816 0/0/1/1:4:34,26:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,19:0.50:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,15:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,47:0.81:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,11:0.19: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,21:0.44:-0.75:1.000:0.974 0/1/1/1:4:23,43:0.68:-0.21:1.000:0.958 0/0/0/1:4:68,17:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,34:0.47: 0.56:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,45:0.82:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,26:0.46:-0.25:1.000:0.985 0/0/0/1/1/1:6:48,32:0.46: 0.42:0.989:0.776 0/1/1/1:4:22,36:0.65:-0.57:1.000:0.831 0/0/1/1:4:36,39:0.57: 0.20:1.000:0.956 0/1/1/1:4:17,72:0.82: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,32:0.52:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,27:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:82,23:0.28: 1.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,85:0.76: 1.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,53:0.68: 0.51:1.000:0.946 0/0/1/1:4:29,36:0.60:-0.25:1.000:0.825 0/1/1/1:4:28,75:0.75: 1.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,37:0.66:-0.52:1.000:0.871 0/0/0/1:4:8,2:0.26:-2.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,66:0.71: 1.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,10:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,40:0.52: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,33:0.33: 2.22:1.000:0.906 0/0/1/1:4:50,37:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,63:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,67:0.74: 1.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,50:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,32:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:42,26:0.44:-0.12:1.000:0.965 0/1/1/1:4:24,61:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,16:0.82:-2.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,25:0.41: 0.02:1.000:0.857 0/1/1/1:4:17,56:0.79: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,49:0.72: 0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,53:0.71: 0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,58:0.81: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,33:0.55:-0.21:1.000:0.981 0/1/1/1:4:20,34:0.66:-0.75:1.000:0.884 0/0/1/1:4:37,30:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,47:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,11:0.36:-1.51:1.000:0.742 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,39:0.66:-0.39:1.000:0.881 0/0/1/1:4:60,41:0.46: 1.37:1.000:0.988 0/1/1/1:4:29,53:0.68: 0.51:1.000:0.946 0/1/1/1:4:10,58:0.86:-0.12:1.000:0.949 0/1/1/1:4:29,61:0.70: 0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:37,42:0.58: 0.38:1.000:0.928 0/0/1/1:4:64,54:0.51: 2.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,27:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,48:0.53: 1.32:1.000:0.992 -chr1.1 2111756 chr1.1_002111756 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:74,8:.:-0.56:1.000:. ./.:4:83,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:83,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:163,2:.: 2.15:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:109,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:44,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:67,7:.:-0.82:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:100,5:.: 0.19:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:82,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:184,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:64,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:30,2:.:-2.19:1.000:. ./.:4:88,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:102,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:113,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:101,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:118,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:64,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,1:.:-3.04:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.83:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:87,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:68,5:.:-0.85:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:141,2:.: 1.43:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:119,3:.: 0.75:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:61,4:.:-1.11:1.000:. ./.:4:108,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.29:1.000:. ./.:6:98,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:119,3:.: 0.75:1.000:. ./.:4:113,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:108,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:99,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:118,4:.: 0.75:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:59,2:.:-1.25:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.70:1.000:. ./.:3:25,5:.:-2.26:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:77,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:54,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:60,3:.:-1.18:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:106,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:111,8:.: 0.65:1.000:. ./.:4:86,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:95,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:65,5:.:-0.95:1.000:. ./.:4:54,4:.:-1.34:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:74,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:88,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:124,3:.: 0.91:1.000:. ./.:4:97,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:118,6:.: 0.81:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.03:1.000:. ./.:3:47,2:.:-1.64:1.000:. ./.:4:108,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:72,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:97,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:100,3:.: 0.13:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:111,2:.: 0.45:1.000:. ./.:6:121,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:127,5:.: 1.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:96,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.54:1.000:. ./.:6:92,1:.:-0.20:0.989:. ./.:4:157,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:117,3:.: 0.68:1.000:. ./.:4:142,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:101,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:93,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,3:.: 0.71:1.000:. ./.:4:102,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:99,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:115,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:114,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:125,2:.: 0.91:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:78,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:90,7:.:-0.07:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:95,4:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,3:.:-1.15:1.000:. -chr1.1 2341138 chr1.1_002341138 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,6:.:-0.59:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:9,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:5,9:.:-1.34:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:26,11:.: 1.11:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:11,14:.:-0.17:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:26,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:29,10:.: 1.33:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:29,11:.: 1.44:1.000:. ./.:4:16,25:.: 1.54:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:36,10:.: 2.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:17,15:.: 0.58:1.000:. ./.:4:23,10:.: 0.69:1.000:. ./.:4:24,10:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,17:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,2:.:-2.09:1.000:. ./.:3:2,3:.:-2.30:1.000:. ./.:4:14,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,12:.:-0.06:1.000:. ./.:4:14,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:13,7:.:-0.70:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:32,6:.: 1.22:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:31,8:.: 1.33:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.52:1.000:. ./.:4:7,18:.:-0.17:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:12,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,21:.: 1.01:1.000:. ./.:4:23,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,14:.: 0.26:1.000:. ./.:6:23,7:.: 0.37:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:12,19:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,17:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,7:.: 0.15:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:26,8:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:25,7:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,4:.:-1.45:1.000:. ./.:3:22,8:.: 0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.69:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.69:1.000:. ./.:4:32,7:.: 1.33:1.000:. ./.:4:16,19:.: 0.90:1.000:. ./.:4:27,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:18,9:.: 0.05:1.000:. ./.:4:8,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,5:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:14,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:9,10:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,8:.:-0.81:1.000:. ./.:4:21,18:.: 1.33:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.47:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:31,7:.: 1.22:1.000:. ./.:4:41,7:.: 2.29:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,4:.:-1.24:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.38:1.000:. ./.:4:10,6:.:-1.13:1.000:. ./.:4:16,19:.: 0.90:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.06:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:30,9:.: 1.33:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:31,9:.: 1.44:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.06:1.000:. ./.:3:13,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,8:.: 0.90:1.000:. ./.:4:6,9:.:-1.24:1.000:. ./.:4:17,13:.: 0.37:1.000:. ./.:4:16,12:.: 0.15:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:11,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:24,8:.: 0.58:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:6:26,5:.: 0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:12,6:.:-0.92:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:15,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.47:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:10,6:.:-1.13:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.27:1.000:. ./.:6:19,20:.: 1.33:0.989:. ./.:4:18,9:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,6:.: 0.15:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,4:.:-1.24:1.000:. ./.:4:11,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:24,8:.: 0.58:1.000:. ./.:4:15,11:.:-0.06:1.000:. ./.:4:20,24:.: 1.86:1.000:. ./.:4:6,8:.:-1.34:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:28,12:.: 1.44:1.000:. ./.:4:24,7:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:9,10:.:-0.81:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:18,15:.: 0.69:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:30,6:.: 1.01:1.000:. ./.:4:12,3:.:-1.24:1.000:. ./.:4:28,8:.: 1.01:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:26,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:10,3:.:-1.45:1.000:. ./.:4:34,5:.: 1.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.47:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:15,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:16,8:.:-0.27:1.000:. ./.:4:6,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:11,2:.:-1.45:1.000:. ./.:4:34,9:.: 1.76:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:20,12:.: 0.58:1.000:. ./.:4:17,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:28,12:.: 1.44:1.000:. ./.:4:27,6:.: 0.69:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.47:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.27:1.000:. -chr1.1 2432574 chr1.1_002432574 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:93,125:0.53: 0.98:1.000:0.993 0/0/0/1:4:103,51:0.33:-0.31:1.000:0.933 0/0/1/1:4:78,124:0.57: 0.65:1.000:0.955 0/0/1/1:4:103,113:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,107:0.58: 0.01:1.000:0.908 0/0/1/1:4:132,158:0.50: 2.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,112:0.62:-0.05:1.000:0.554 0/0/0/1:4:121,74:0.37: 0.51:1.000:0.615 0/0/0/1:4:116,66:0.35: 0.25:1.000:0.770 0/1/1/1:4:13,76:0.80:-1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,123:0.66: 0.05:1.000:0.893 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,108:0.60:-0.07:1.000:0.774 0/0/1/1:4:69,107:0.56: 0.13:1.000:0.966 0/0/0/1:4:140,61:0.30: 0.63:1.000:0.981 0/0/0/1:4:164,82:0.33: 1.54:1.000:0.926 0/0/1/1:4:128,159:0.51: 2.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,223:0.75: 2.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,209:0.77: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,53:0.27: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,67:0.53:-1.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:39,160:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,180:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,103:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,98:0.66:-0.66:1.000:0.894 0/0/1/1:4:99,164:0.58: 1.88:1.000:0.929 0/0/1/1:4:92,152:0.58: 1.50:1.000:0.931 0/0/1/1:4:82,130:0.57: 0.85:1.000:0.956 0/0/1/1:4:68,107:0.56: 0.11:1.000:0.960 0/0/1/1:4:96,139:0.54: 1.32:1.000:0.984 0/1/1/1:4:42,224:0.79: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,67:0.34: 0.51:1.000:0.887 0/0/0/1:4:90,18:0.18:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,24:0.27:-1.52:1.000:0.998 0/0/1:3:44,37:0.43:-1.79:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,206:0.79: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,166:0.63: 1.54:1.000:0.501 0/0/0/1:4:113,65:0.35: 0.17:1.000:0.749 0/0/1/1:4:64,100:0.56:-0.11:1.000:0.963 0/1/1/1:4:46,188:0.75: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,70:0.45:-0.52:1.000:0.982 0/0/1/1:4:78,91:0.49:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,61:0.33: 0.19:1.000:0.899 0/0/1/1:4:72,118:0.57: 0.41:1.000:0.937 0/0/1/1:4:47,86:0.60:-0.74:1.000:0.807 0/0/1/1:4:84,80:0.45:-0.11:1.000:0.983 0/0/0/1:4:116,57:0.33: 0.07:1.000:0.937 0/1/1/1:4:35,217:0.80: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,167:0.77: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,62:0.35: 0.03:1.000:0.770 0/0/1/1:4:49,79:0.57:-0.84:1.000:0.947 0/0/1/1:4:93,130:0.54: 1.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:62,71:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:110,46:0.30:-0.27:1.000:0.987 0/0/1/1:4:72,96:0.53:-0.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,172:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,78:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,123:0.58: 0.55:1.000:0.927 0/0/1/1:4:64,92:0.54:-0.27:1.000:0.985 0/0/0/1/1/1:6:56,81:0.54:-0.66:1.000:0.774 0/0/1/1:4:53,84:0.57:-0.66:1.000:0.956 0/0/0/1:4:92,49:0.34:-0.58:1.000:0.868 0/1/1/1:4:47,185:0.74: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,113:0.63:-0.07:1.000:0.575 0/1/1/1:4:33,136:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,83:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,69:0.56:-1.14:1.000:0.961 0/1/1/1:4:29,117:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,88:0.57:-0.54:1.000:0.952 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,93:0.56:-0.31:1.000:0.972 0/1/1/1:4:47,113:0.66:-0.19:1.000:0.838 0/0/1:3:158,67:0.30: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,166:0.75: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,97:0.52: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,102:0.56:-0.01:1.000:0.972 0/0/0/1:4:117,36:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,27:0.30:-1.62:1.000:0.981 0/0/0/1:4:76,38:0.33:-1.12:1.000:0.926 0/0/1/1:4:47,92:0.61:-0.62:1.000:0.660 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,43:0.31:-0.66:1.000:0.969 0/1/1/1:4:43,153:0.73: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,95:0.53:-0.11:1.000:0.991 0/1/1/1:4:39,162:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,131:0.77:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,59:0.49:-1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,72:0.47:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,68:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,52:0.35:-0.52:1.000:0.782 0/0/1/1:4:46,86:0.60:-0.76:1.000:0.766 0/1/1/1:4:33,132:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,115:0.68:-0.23:1.000:0.943 0/0/1/1:4:55,82:0.55:-0.66:1.000:0.978 0/1/1/1:4:22,107:0.77:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,133:0.64: 0.49:1.000:0.635 0/1/1/1:4:26,80:0.70:-1.28:1.000:0.987 0/0/0/1:4:85,41:0.32:-0.88:1.000:0.948 0/0/1/1:4:60,78:0.52:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,45:0.32:-0.56:1.000:0.964 0/0/0/1:4:54,23:0.30:-1.87:1.000:0.985 0/1/1/1:4:28,114:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,41:0.50:-1.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,56:0.46:-1.12:1.000:0.985 0/1/1/1:4:27,136:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,132:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,67:0.52:-1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,128:0.60: 0.55:1.000:0.782 0/0/1/1:4:126,118:0.45: 1.50:1.000:0.980 0/0/1/1:4:64,95:0.55:-0.21:1.000:0.979 0/0/0/1:4:66,39:0.36:-1.30:1.000:0.694 0/0/0/1:4:165,98:0.36: 1.88:1.000:0.683 0/0/1/1:4:46,54:0.50:-1.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,124:0.71:-0.15:1.000:0.993 0/0/1:3:50,34:0.39:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,79:0.57:-0.82:1.000:0.958 0/1/1/1:4:32,101:0.71:-0.74:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,117:0.74:-0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,115:0.73:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,75:0.54:-0.84:1.000:0.988 0/0/0/1:4:87,44:0.33:-0.78:1.000:0.918 0/1/1/1:4:19,85:0.76:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,79:0.57:-0.84:1.000:0.947 0/0/1/1:4:101,156:0.56: 1.76:1.000:0.967 0/0/1/1:4:60,84:0.54:-0.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:61,89:0.55:-0.40:1.000:0.983 0/0/0/1/1/1:6:63,63:0.46:-0.88:1.000:0.814 0/0/1/1:4:65,102:0.56:-0.05:1.000:0.961 0/1/1/1:4:18,62:0.72:-1.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,40:0.36:-1.28:1.000:0.636 0/0/1/1:4:67,65:0.46:-0.76:1.000:0.986 0/0/0/1:4:123,59:0.32: 0.25:1.000:0.950 0/0/1/1:4:36,61:0.58:-1.46:1.000:0.910 0/0/1/1:4:64,75:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,35:0.30:-1.04:1.000:0.986 0/0/0/1:4:167,82:0.33: 1.60:1.000:0.938 0/1/1/1:4:39,141:0.73: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:62,37:0.36:-1.42:1.000:0.672 0/0/0/0/1/1:6:51,27:0.34:-1.85:0.989:0.916 0/1/1/1:4:16,95:0.80:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,45:0.32:-0.58:1.000:0.960 0/0/1/1:4:35,70:0.62:-1.30:1.000:0.603 0/0/1/1:4:68,110:0.57: 0.17:1.000:0.945 0/0/1/1:4:43,34:0.42:-1.87:1.000:0.898 0/0/0/1:4:143,58:0.29: 0.63:1.000:0.991 0/1/1/1:4:44,161:0.73: 0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,179:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,133:0.68: 0.25:1.000:0.951 0/0/1/1:4:91,107:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,100:0.57:-0.13:1.000:0.956 0/0/1/1:4:91,132:0.55: 1.08:1.000:0.984 0/1/1/1:4:49,220:0.76: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,27:0.34:-1.85:1.000:0.875 0/1/1/1:4:44,94:0.63:-0.64:1.000:0.580 0/0/0/1:4:146,88:0.36: 1.30:1.000:0.649 0/0/1/1:4:101,67:0.38:-0.03:1.000:0.591 0/0/0/1:4:126,57:0.31: 0.27:1.000:0.972 0/0/1/1:4:97,128:0.52: 1.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,141:0.79:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,110:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,189:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,108:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,60:0.38:-0.35:1.000:0.548 0/1/1/1:4:35,184:0.78: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,234:0.77: 2.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,121:0.52: 0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,102:0.60:-0.23:1.000:0.815 0/0/1/1:4:89,89:0.46: 0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:38,163:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,180:0.74: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,51:0.34:-0.42:1.000:0.893 0/0/1/1:4:80,110:0.53: 0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:68,105:0.56: 0.07:1.000:0.967 0/1/1/1:4:23,136:0.80:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,45:0.31:-0.48:1.000:0.976 0/1/1/1:4:29,141:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,194:0.56: 2.99:1.000:0.962 0/0/0/1:4:109,53:0.32:-0.15:1.000:0.943 0/1/1/1:4:46,212:0.77: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,108:0.51: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,110:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:132,69:0.34: 0.63:1.000:0.889 0/0/0/1:4:152,68:0.31: 1.02:1.000:0.975 0/0/1/1:4:75,97:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:139,43:0.25: 0.25:1.000:0.999 -chr1.1 2703089 chr1.1_002703089 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:221,83:0.27: 0.74:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,242:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,176:0.45: 2.04:1.000:0.979 0/0/0/1:4:219,59:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,185:0.52: 1.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:93,251:0.72: 1.37:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,162:0.76:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,225:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,149:0.52: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,29:0.84:-3.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,36:0.49:-2.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,202:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,230:0.72: 0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,206:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,201:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,145:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,69:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,248:0.78: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,188:0.52: 1.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,177:0.53: 1.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,33:0.42:-2.80:1.000:0.929 0/0/1/1:4:136,160:0.53: 0.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:204,86:0.30: 0.53:1.000:0.988 0/0/0/1:4:208,79:0.28: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,26:0.71:-3.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:135,146:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,148:0.51: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,217:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,102:0.28: 1.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,154:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,118:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,125:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,29:0.79:-3.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,30:0.50:-3.08:1.000:0.997 0/0/1:3:23,8:0.26:-3.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,148:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,79:0.28: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,111:0.47:-0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:61,170:0.72:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:168,49:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,47:0.24:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,204:0.78: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,167:0.56: 0.54:1.000:0.959 0/0/0/1:4:172,65:0.27:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,207:0.71: 0.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,226:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,254:0.75: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,46:0.29:-1.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:175,54:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,138:0.67:-0.83:1.000:0.909 0/0/1/1:4:111,110:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,85:0.25: 1.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,192:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,244:0.77: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,205:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,131:0.52:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:167,62:0.27:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,204:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,121:0.52:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:109,109:0.49:-0.60:1.000:0.886 0/0/1/1:4:143,119:0.45: 0.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:125,118:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,61:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,159:0.70:-0.50:1.000:0.982 0/0/1/1:4:134,120:0.47:-0.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:82,210:0.71: 0.56:1.000:0.989 0/0/0/1:4:131,41:0.24:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,147:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,56:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,211:0.79: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,193:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:167,38:0.19:-0.80:1.000:1.000 0/1/1:3:59,180:0.74:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,153:0.52: 0.56:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,268:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,159:0.70:-0.52:1.000:0.985 0/0/1/1:4:115,115:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,126:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,163:0.65:-0.13:1.000:0.748 0/0/0/1:4:193,61:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,122:0.67:-1.22:1.000:0.931 0/0/1/1:4:154,169:0.52: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:228,67:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,133:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,61:0.27:-0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:153,158:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,125:0.57:-0.61:1.000:0.955 0/0/0/1:4:184,61:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,112:0.47:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:118,132:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,92:0.47:-0.99:1.000:0.992 0/0/1/1:4:111,112:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,151:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,168:0.78:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,122:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,204:0.73: 0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,108:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,158:0.70:-0.55:1.000:0.986 0/0/1/1:4:145,175:0.54: 0.99:1.000:0.988 0/0/1/1:4:143,137:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,102:0.47:-0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:176,141:0.44: 0.95:1.000:0.967 0/0/1/1:4:98,100:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:190,70:0.27: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:145,49:0.25:-0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,75:0.31:-0.25:1.000:0.971 0/0/1/1:4:102,122:0.54:-0.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:139,121:0.46: 0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:146,191:0.56: 1.26:1.000:0.971 0/1/1/1:4:69,192:0.72: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,186:0.74:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,253:0.73: 1.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,148:0.54: 0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:129,130:0.49: 0.04:1.000:0.997 0/1/1:3:57,92:0.61:-1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,152:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,129:0.53:-0.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:169,60:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:133,92:0.40:-0.49:1.000:0.830 0/0/1/1:4:117,108:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:142,154:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,143:0.53: 0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:44,185:0.80:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,145:0.44: 1.13:1.000:0.960 0/0/0/1:4:200,61:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,158:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:130,192:0.59: 1.03:1.000:0.531 1/1/1/1:4:0,217:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,138:0.77:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,139:0.73:-1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:149,53:0.26:-0.85:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,192:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,132:0.75:-1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,71:0.29:-0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:57,214:0.78: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,162:0.47: 1.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,142:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,128:0.55:-0.44:1.000:0.977 0/0/0/1/1/1:6:121,129:0.51:-0.10:0.989:0.885 0/0/1/1:4:119,126:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,136:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:197,60:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,141:0.47: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,83:0.50:-1.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,288:0.76: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,200:0.49: 2.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,58:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,97:0.30: 1.06:1.000:0.986 0/0/0/1:4:260,94:0.27: 1.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:117,126:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,167:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,123:0.45: 0.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:29,22:0.43:-3.21:1.000:0.937 0/0/1/1:4:127,123:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,219:0.78: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,159:0.53: 0.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,235:0.68: 1.32:1.000:0.943 0/1/1/1:4:79,211:0.71: 0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:116,155:0.56: 0.23:1.000:0.962 0/0/1/1:4:131,171:0.56: 0.71:1.000:0.971 0/0/1/1:4:146,140:0.48: 0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,176:0.76:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,111:0.45:-0.21:1.000:0.981 0/0/1/1:4:136,147:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,134:0.52:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,250:0.79: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,64:0.30:-0.72:1.000:0.981 0/1/1/1:4:59,212:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,144:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,121:0.45: 0.14:1.000:0.981 0/0/1/1:4:122,114:0.48:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,108:0.47:-0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,130:0.53:-0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:121,127:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,157:0.78:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,52:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:167,152:0.47: 0.98:1.000:0.992 0/0/1/1:4:157,142:0.47: 0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:170,175:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,152:0.55: 0.24:1.000:0.980 0/0/0/1:4:227,84:0.27: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,178:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,202:0.54: 1.74:1.000:0.987 0/1/1/1:4:64,198:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,241:0.74: 0.99:1.000:0.999 -chr1.1 2798325 chr1.1_002798325 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.51: 1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:7,2:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,8:0.62: 0.71:1.000:0.503 0/0/1/1:4:6,9:0.50: 2.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.43:-0.96:1.000:0.943 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.41:1.000:0.943 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.13:1.000:0.537 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.13:1.000:0.537 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.41:1.000:0.943 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.29: 1.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:9,2:0.18: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,6:0.32: 2.66:1.000:0.944 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.15:1.000:0.873 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:9,4:0.29: 1.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:11,3:0.21: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,12:0.62: 2.10:1.000:0.503 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.20: 2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,11:0.62: 1.82:1.000:0.620 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.13:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:7,4:0.33: 0.99:1.000:0.916 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.41:1.000:0.943 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.41:1.000:0.974 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.57:-0.13:1.000:0.943 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.96:1.000:0.840 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,5:0.57:-0.13:1.000:0.943 0/0/1/1:4:4,5:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.15:1.000:0.873 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.24:1.000:0.974 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.96:1.000:0.840 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.15:1.000:0.873 0/0/0/1:4:7,5:0.37: 1.26:1.000:0.576 0/0/0/0:4:9,1:0.10: 0.71:1.000:0.801 0/0/1/1:4:6,6:0.43: 1.26:1.000:0.943 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.69:1.000:0.721 0/0/0/0/0/1:6:6,2:0.25: 0.15:1.000:0.522 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,5:0.40: 0.99:1.000:0.755 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.64: 0.99:1.000:0.645 0/0/1/1:4:2,2:0.43:-0.96:1.000:0.943 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.46: 0.99:1.000:0.988 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.31: 0.43:1.000:0.974 0/0/0/1:4:9,2:0.18: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1:3:1,5:0.65:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.15:1.000:0.873 0/1/1/1:4:0,8:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.24:1.000:0.974 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.69:1.000:0.721 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,4:0.33: 0.99:1.000:0.916 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,4:0.33: 0.99:1.000:0.916 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.31: 0.43:1.000:0.974 0/0/0/1:4:6,4:0.36: 0.71:1.000:0.721 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-0.13:1.000:0.975 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,5:0.57:-0.13:1.000:0.943 0/0/1/1:4:2,4:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.15:1.000:0.873 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.24:1.000:0.974 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/0/1/1:4:4,5:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.13:1.000:0.537 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-1.24:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.69:1.000:0.721 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.41:1.000:0.974 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,4:0.29: 1.54:1.000:0.991 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,6:0.36: 2.10:1.000:0.721 0/0/1/1:4:1,1:0.43:-1.52:1.000:0.943 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/0/1:3:3,1:0.25:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.18: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,4:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,6:0.59: 0.15:1.000:0.840 0/0/1/1:4:2,2:0.43:-0.96:1.000:0.943 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,5:0.28: 2.66:1.000:0.995 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.43:-1.52:1.000:0.943 0/0/0/1/1/1:6:3,3:0.43:-0.41:1.000:0.591 0/0/1/1:4:2,8:0.62: 0.71:1.000:0.503 0/0/1/1:4:2,2:0.43:-0.96:1.000:0.943 0/0/1/1:4:2,6:0.59: 0.15:1.000:0.840 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:10,3:0.23: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-1.24:1.000:0.987 0/0/0/1:4:6,3:0.31: 0.43:1.000:0.974 0/0/1/1:4:1,4:0.62:-0.69:1.000:0.503 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/0/0/0/0/0:6:5,0:0.00:-0.69:0.989:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.41:1.000:0.974 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.39: 0.43:1.000:0.679 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.52: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:2,4:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/1:4:7,1:0.12: 0.15:1.000:0.852 0/0/1/1:4:2,4:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-1.24:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,6:0.38: 1.82:1.000:0.537 0/0/0/1:4:11,5:0.29: 2.38:1.000:0.989 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,5:0.37: 1.26:1.000:0.576 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,8:0.58: 0.99:1.000:0.916 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/1/1/1:4:1,5:0.65:-0.41:1.000:0.752 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.52: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,10:0.61: 1.54:1.000:0.737 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-0.13:1.000:0.975 0/0/1/1:4:2,6:0.59: 0.15:1.000:0.840 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,3:0.31: 0.43:1.000:0.974 0/0/0/0:4:10,1:0.09: 0.99:1.000:0.938 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.52: 0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:8,4:0.31: 1.26:1.000:0.974 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,5:0.33: 1.82:1.000:0.934 0/0/0/1:4:9,2:0.18: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.56: 0.71:1.000:0.963 0/0/1/1:4:2,8:0.62: 0.71:1.000:0.503 -chr1.1 3103125 chr1.1_003103125 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:28,35:0.56: 0.82:1.000:0.966 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,34:0.51: 1.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,43:0.64: 0.87:1.000:0.672 0/0/1/1:4:45,34:0.47: 1.67:1.000:0.991 0/0/0/1:4:58,10:0.19: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.11:-1.30:1.000:0.520 0/0/0/1:4:57,9:0.17: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,29:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,3:0.32:-1.93:1.000:0.950 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:47,20:0.35: 1.03:1.000:0.832 0/0/0/1:4:47,6:0.14: 0.29:1.000:0.979 0/0/0/1:4:36,13:0.31: 0.08:1.000:0.966 0/0/0/1:4:50,9:0.19: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,37:0.47: 1.98:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,40:0.66: 0.50:1.000:0.860 0/0/1/1:4:49,30:0.42: 1.67:1.000:0.916 0/0/0/1:4:52,16:0.29: 1.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,26:0.41: 1.24:1.000:0.852 0/0/1/1:4:1,1:0.52:-2.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,23:0.46: 0.34:1.000:0.989 0/1/1/1:4:15,33:0.65: 0.03:1.000:0.784 0/0/1/1:4:13,20:0.59:-0.77:1.000:0.835 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,21:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,35:0.51: 1.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,11:0.15: 2.46:1.000:0.987 0/0/1/1:4:24,40:0.61: 0.87:1.000:0.723 0/0/1/1:4:49,28:0.41: 1.56:1.000:0.835 0/0/0/1:4:34,16:0.37: 0.13:1.000:0.625 0/0/1/1:4:39,28:0.46: 1.03:1.000:0.985 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,2:0.64:-2.35:1.000:0.629 0/0/1:3:2,1:0.38:-2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,24:0.45: 0.55:1.000:0.982 0/1/1/1:4:15,35:0.66: 0.13:1.000:0.852 0/0/1/1:4:34,25:0.46: 0.61:1.000:0.988 0/0/0/0:4:50,4:0.09: 0.34:1.000:0.896 0/1/1/1:4:25,49:0.63: 1.40:1.000:0.591 0/0/1/1:4:15,25:0.61:-0.40:1.000:0.723 0/0/0/1:4:39,5:0.15:-0.19:1.000:0.980 0/0/1/1:4:17,22:0.57:-0.45:1.000:0.955 0/0/1/1:4:17,30:0.62:-0.03:1.000:0.620 0/0/0/1:4:31,8:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,8:0.19: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,9:0.18: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,4:0.48:-2.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,22:0.64:-0.77:1.000:0.629 0/0/0/0:4:20,1:0.06:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.56:-1.46:1.000:0.972 0/1/1/1:4:15,35:0.66: 0.13:1.000:0.852 0/0/0/1:4:44,11:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:50,4:0.09: 0.34:1.000:0.896 0/0/0/1:4:44,13:0.28: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,8:0.33:-1.03:1.000:0.905 0/1/1/1:4:9,25:0.68:-0.71:1.000:0.957 0/0/0/1:4:24,4:0.18:-1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,27:0.53: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/1/1/1:6:16,12:0.47:-1.03:1.000:0.823 0/0/1/1:4:33,24:0.46: 0.50:1.000:0.987 0/0/1/1:4:28,18:0.43:-0.08:1.000:0.950 0/0/1/1:4:18,22:0.56:-0.40:1.000:0.972 0/0/0/0:4:41,1:0.03:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,22:0.48: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,7:0.16: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,15:0.79:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.47:-0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,16:0.56:-0.98:1.000:0.970 0/0/0/1:4:56,25:0.35: 1.77:1.000:0.747 0/0/0/1:4:41,5:0.14:-0.08:1.000:0.963 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-1.77:1.000:0.944 0/0/1:3:25,14:0.40:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,14:0.31: 0.34:1.000:0.975 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,5:0.17:-0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,15:0.53:-0.98:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,16:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,6:0.16:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,23:0.63:-0.66:1.000:0.546 0/0/0/1:4:39,9:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,16:0.44:-0.40:1.000:0.966 0/0/1/1:4:13,24:0.62:-0.56:1.000:0.530 0/0/0/1:4:42,9:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,23:0.72:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,12:0.32:-0.19:1.000:0.950 0/0/1/1:4:16,11:0.45:-1.09:1.000:0.976 0/1/1/1:4:11,24:0.65:-0.66:1.000:0.773 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-1.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,24:0.47: 0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:15,13:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,15:0.39:-0.24:1.000:0.713 0/0/1/1:4:30,19:0.43: 0.08:1.000:0.941 0/0/0/1:4:37,9:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,17:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:34,3:0.10:-0.56:1.000:0.711 0/0/0/1:4:28,8:0.27:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,11:0.30:-0.19:1.000:0.985 0/0/0/1:4:25,10:0.33:-0.66:1.000:0.905 0/0/1/1:4:34,26:0.47: 0.66:1.000:0.992 0/0/1/1:4:9,8:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,13:0.46:-0.87:1.000:0.986 0/0/1/1:4:15,12:0.48:-1.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,28:0.66:-0.40:1.000:0.852 0/1/1/1:4:10,25:0.67:-0.66:1.000:0.908 0/0/1/1:4:18,33:0.62: 0.18:1.000:0.544 0/0/1/1:4:23,13:0.40:-0.61:1.000:0.818 0/0/1/1:4:37,20:0.39: 0.50:1.000:0.733 0/0/1/1:4:40,25:0.43: 0.92:1.000:0.932 0/0/0/1:4:41,6:0.16:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,7:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,10:0.14: 2.30:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,16:0.44:-0.40:1.000:0.966 0/0/1/1:4:37,19:0.38: 0.45:1.000:0.609 0/0/1:3:27,4:0.16:-0.87:1.000:0.934 0/0/0/1:4:28,11:0.33:-0.45:1.000:0.921 0/0/0/1:4:9,4:0.35:-1.83:1.000:0.756 0/0/1/1:4:10,18:0.62:-1.03:1.000:0.581 0/0/0/1:4:27,13:0.37:-0.40:1.000:0.565 0/0/1/1:4:19,16:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,15:0.43:-0.45:1.000:0.932 0/0/0/1:4:22,8:0.32:-0.93:1.000:0.963 0/0/0/1:4:41,5:0.14:-0.08:1.000:0.963 0/0/1/1:4:43,27:0.43: 1.19:1.000:0.936 0/0/1/1:4:14,19:0.57:-0.77:1.000:0.935 0/0/0/1:4:27,6:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:31,10:0.29:-0.34:1.000:0.849 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,7:0.22:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,3:0.16:-1.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,15:0.63:-1.30:1.000:0.502 0/0/0/1:4:61,7:0.13: 1.08:1.000:0.923 0/0/0/1:4:30,3:0.12:-0.77:1.000:0.669 0/0/1/1:4:14,17:0.56:-0.87:1.000:0.973 0/0/0/1:4:49,9:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,32:0.46: 1.51:1.000:0.987 0/0/0/1:4:33,9:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,14:0.43:-0.61:1.000:0.944 0/0/0/0/1/1:6:34,19:0.40: 0.29:0.989:0.638 0/0/0/1:4:28,13:0.36:-0.34:1.000:0.659 0/0/1/1:4:21,15:0.45:-0.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:12,20:0.61:-0.82:1.000:0.723 0/0/0/1:4:35,17:0.37: 0.24:1.000:0.542 0/0/1/1:4:11,6:0.40:-1.61:1.000:0.752 0/0/0/1:4:53,8:0.17: 0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:27,18:0.44:-0.13:1.000:0.966 0/0/1/1:4:27,43:0.60: 1.19:1.000:0.791 0/1/1/1:4:16,40:0.67: 0.45:1.000:0.908 0/1/1/1:4:17,42:0.67: 0.61:1.000:0.900 0/0/1/1:4:23,16:0.45:-0.45:1.000:0.979 0/0/1/1:4:46,53:0.55: 2.72:1.000:0.983 0/0/0/1:4:52,25:0.37: 1.56:1.000:0.569 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,22:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,11:0.28: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,25:0.43: 0.87:1.000:0.948 0/0/0/1:4:48,11:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,15:0.29: 0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,21:0.38: 0.77:1.000:0.602 0/0/1/1:4:30,30:0.52: 0.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:31,14:0.36:-0.13:1.000:0.723 0/0/0/1:4:44,12:0.27: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,26:0.46: 0.77:1.000:0.986 0/0/1/1:4:37,19:0.38: 0.45:1.000:0.609 0/0/1/1:4:39,27:0.45: 0.98:1.000:0.978 0/0/0/0:4:64,5:0.09: 1.14:1.000:0.921 0/1/1/1:4:12,33:0.68:-0.13:1.000:0.953 0/0/0/1:4:39,19:0.37: 0.55:1.000:0.533 0/0/1/1:4:25,16:0.43:-0.34:1.000:0.947 0/0/1/1:4:37,20:0.39: 0.50:1.000:0.733 0/0/1/1:4:32,23:0.46: 0.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:34,21:0.42: 0.40:1.000:0.924 0/0/1/1:4:29,16:0.40:-0.13:1.000:0.775 0/0/0/1:4:56,20:0.31: 1.51:1.000:0.969 0/0/0/0:4:53,3:0.07: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,44:0.60: 1.29:1.000:0.809 0/0/0/1:4:52,20:0.33: 1.29:1.000:0.936 0/0/1/1:4:35,30:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,18:0.46:-0.24:1.000:0.985 0/0/1/1:4:32,28:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,28:0.64:-0.29:1.000:0.629 0/0/1/1:4:46,36:0.48: 1.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,46:0.55: 2.04:1.000:0.983 0/0/0/0:4:50,3:0.07: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,17:0.28: 1.51:1.000:0.997 -chr1.1 3243094 chr1.1_003243094 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,13:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.08:1.000:. ./.:4:32,11:.: 0.53:1.000:. ./.:4:42,16:.: 1.83:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,4:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:15,10:.:-1.03:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:40,12:.: 1.31:1.000:. ./.:4:24,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:30,16:.: 0.79:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.54:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:43,10:.: 1.39:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:38,10:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,5:.:-1.98:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:26,14:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,13:.: 0.62:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:36,7:.: 0.53:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:38,16:.: 1.48:1.000:. ./.:4:16,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.16:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:29,16:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,14:.: 1.91:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:23,17:.: 0.27:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:30,12:.: 0.44:1.000:. ./.:6:27,6:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,13:.: 0.88:1.000:. ./.:4:31,15:.: 0.79:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.96:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:7,6:.:-2.06:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:36,13:.: 1.05:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.32:1.000:. ./.:3:32,6:.: 0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.10:1.000:. ./.:4:36,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:32,14:.: 0.79:1.000:. ./.:4:28,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:32,15:.: 0.88:1.000:. ./.:4:35,16:.: 1.22:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:25,12:.: 0.01:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:19,9:.:-0.77:1.000:. ./.:4:28,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,10:.: 0.53:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.51:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:27,15:.: 0.44:1.000:. ./.:4:13,4:.:-1.72:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:28,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:32,12:.: 0.62:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:3:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,18:.: 1.39:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:31,12:.: 0.53:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.62:1.000:. ./.:6:58,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,13:.:-0.77:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:41,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,22:.: 0.53:1.000:. ./.:6:32,15:.: 0.88:0.989:. ./.:4:40,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,14:.: 0.44:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.27:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:23,12:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.10:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:36,6:.: 0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:24,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,12:.: 1.22:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.77:1.000:. ./.:4:24,12:.:-0.08:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.16:1.000:. ./.:4:25,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:23,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.44:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.68:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:41,10:.: 1.22:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.68:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:22,14:.:-0.08:1.000:. -chr1.1 3329439 chr1.1_003329439 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:8,10:0.53: 0.70:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,11:0.63: 0.13:1.000:0.580 0/0/0/1:4:19,9:0.34: 2.61:1.000:0.888 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.44:1.000:0.813 0/0/1/1:4:16,10:0.39: 2.23:1.000:0.740 0/0/0/1:4:16,3:0.17: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-0.25:1.000:0.942 0/0/1/1:4:7,8:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,10:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:4,2:0.35:-1.58:1.000:0.813 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,4:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-0.82:1.000:0.855 0/1/1/1:4:2,9:0.68:-0.63:1.000:0.951 0/1/1/1:4:4,11:0.63: 0.13:1.000:0.580 0/0/0/1:4:12,5:0.31: 0.51:1.000:0.971 0/0/0/1:4:19,4:0.19: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.64: 0.32:1.000:0.696 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.46:-0.25:1.000:0.990 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 2.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.64: 0.32:1.000:0.696 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.37: 0.51:1.000:0.620 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-1.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:14,3:0.19: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.24: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.17:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,8:0.43: 0.89:1.000:0.941 0/0/1/1:4:6,14:0.61: 1.08:1.000:0.663 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.54:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.17:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:3,6:0.59:-1.01:1.000:0.840 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-1.01:1.000:0.979 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-0.25:1.000:0.942 0/0/0/1:4:12,5:0.31: 0.51:1.000:0.971 0/0/1/1:4:3,6:0.59:-1.01:1.000:0.840 0/0/1/1:4:3,5:0.57:-1.20:1.000:0.946 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-1.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:6,9:0.56: 0.13:1.000:0.973 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.26: 1.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.18:-1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,5:0.31: 0.51:1.000:0.971 0/1/1/1:4:1,3:0.64:-1.97:1.000:0.696 0/0/0/1:4:10,4:0.30:-0.06:1.000:0.981 0/1/1/1:4:3,11:0.66:-0.06:1.000:0.873 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-0.82:1.000:0.960 0/0/1/1:4:8,7:0.47: 0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:10,6:0.39: 0.32:1.000:0.642 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:14,5:0.28: 0.89:1.000:0.994 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-0.25:1.000:0.942 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.44:1.000:0.813 0/0/0/0/0/1:6:13,3:0.21: 0.32:1.000:0.893 0/0/0/1:4:12,4:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,5:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,8:0.38: 1.47:1.000:0.508 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.44:1.000:0.813 0/0/0/1:4:13,5:0.30: 0.70:1.000:0.988 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-0.63:1.000:0.987 0/0/0/1:4:8,3:0.29:-0.63:1.000:0.991 0/0/0/0:4:20,2:0.10: 1.47:1.000:0.794 0/0/1/1:4:11,7:0.40: 0.70:1.000:0.777 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.22:-1.78:1.000:1.000 0/1/1:3:6,12:0.59: 0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:10,3:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,3:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,8:0.59:-0.44:1.000:0.840 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,4:0.38:-0.63:1.000:0.508 0/0/1/1:4:12,7:0.38: 0.89:1.000:0.566 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,6:0.33: 0.89:1.000:0.914 0/0/0/1:4:16,2:0.12: 0.70:1.000:0.814 0/0/0/1:4:18,6:0.27: 1.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,8:0.56:-0.25:1.000:0.958 0/0/1/1:4:5,9:0.58:-0.06:1.000:0.913 0/0/1/1:4:7,10:0.55: 0.51:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:11,6:0.37: 0.51:1.000:0.620 0/0/0/1:4:15,4:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,9:0.42: 1.47:1.000:0.901 0/0/0/1:4:16,3:0.17: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,4:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,4:0.59:-1.58:1.000:0.840 0/0/0/1:4:12,6:0.35: 0.70:1.000:0.813 0/1/1/1:4:4,11:0.63: 0.13:1.000:0.580 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-1.39:1.000:0.957 0/0/0/1:4:16,5:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-1.39:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.38:-0.63:1.000:0.508 0/0/1/1:4:8,9:0.52: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,6:0.29: 1.47:1.000:0.991 0/1/1/1:4:3,11:0.66:-0.06:1.000:0.873 0/0/1/1:4:8,6:0.43:-0.06:1.000:0.957 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:18,7:0.30: 2.04:1.000:0.986 0/0/0/1:4:13,6:0.33: 0.89:1.000:0.914 0/0/1:3:7,4:0.38:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,10:0.59: 0.13:1.000:0.840 0/0/0/1:4:9,5:0.37:-0.06:1.000:0.571 0/0/0/1:4:16,3:0.17: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,4:0.30:-0.06:1.000:0.981 0/0/0/1:4:11,3:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.54:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/0:4:19,2:0.11: 1.28:1.000:0.668 0/0/0/1:4:13,7:0.36: 1.08:1.000:0.654 0/0/1/1:4:10,6:0.39: 0.32:1.000:0.642 0/0/1/1:4:4,8:0.59:-0.44:1.000:0.840 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-1.01:1.000:0.979 0/0/0/0/1/1:6:7,3:0.32:-0.82:1.000:0.913 0/0/0/1:4:11,3:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.42:-0.44:1.000:0.928 0/0/1/1:4:3,7:0.61:-0.82:1.000:0.663 0/0/1/1:4:6,13:0.60: 0.89:1.000:0.758 0/0/0/1:4:11,2:0.17:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,7:0.58:-0.63:1.000:0.926 0/0/1/1:4:8,7:0.47: 0.13:1.000:0.992 0/0/0/0:4:16,1:0.06: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,5:0.42:-0.44:1.000:0.928 0/0/1/1/1/1:6:4,9:0.61:-0.25:0.989:0.706 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.37: 0.51:1.000:0.620 0/0/0/1:4:9,2:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.20:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,1:0.05: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,3:0.17: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:22,1:0.05: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-1.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:6,1:0.16:-1.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:10,9:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/0/0/1:4:17,7:0.31: 1.85:1.000:0.974 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:7,4:0.38:-0.63:1.000:0.508 0/0/1/1:4:7,11:0.56: 0.70:1.000:0.963 0/0/1/1:4:4,7:0.58:-0.63:1.000:0.926 0/0/1/1:4:8,5:0.39:-0.25:1.000:0.740 0/0/0/1:4:12,4:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,7:0.33: 1.47:1.000:0.904 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-0.25:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.18: 2.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,3:0.27:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,7:0.36: 1.08:1.000:0.654 0/1/1/1:4:1,8:0.72:-1.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,2:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,1:0.07: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,7:0.44: 0.32:1.000:0.971 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,7:0.47: 0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,4:0.29: 0.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.44:1.000:0.813 0/0/0/1:4:14,4:0.25: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,13:0.57: 1.28:1.000:0.954 0/0/0/1:4:15,5:0.27: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,3:0.27:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,11:0.56: 0.70:1.000:0.963 0/0/1/1:4:9,10:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,3:0.39:-1.20:1.000:0.642 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-1.01:1.000:0.814 0/0/1/1:4:7,5:0.42:-0.44:1.000:0.928 -chr1.1 3491884 chr1.1_003491884 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:38,94:0.71: 0.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,52:0.54:-0.44:1.000:0.987 0/0/0/1:4:126,36:0.28: 1.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,61:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,69:0.53: 0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,72:0.52: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,29:0.38:-0.88:1.000:0.521 0/0/1/1:4:87,47:0.40: 0.55:1.000:0.793 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,5:0.24:-2.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,19:0.95:-3.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,32:0.25: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,42:0.42:-0.12:1.000:0.915 0/0/0/1:4:91,30:0.30: 0.14:1.000:0.984 0/0/1/1:4:68,56:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,22:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,89:0.65: 0.71:1.000:0.813 0/0/1/1:4:78,58:0.47: 0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,65:0.44: 1.53:1.000:0.970 0/0/0/1:4:147,41:0.27: 2.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,16:0.49:-2.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,105:0.71: 1.02:1.000:0.989 0/0/0/1:4:84,35:0.35: 0.07:1.000:0.827 0/0/0/1:4:105,29:0.27: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,7:0.44:-3.14:1.000:0.962 0/0/1/1:4:81,54:0.45: 0.58:1.000:0.977 0/1/1/1:4:37,102:0.73: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,91:0.71: 0.39:1.000:0.990 0/0/0/1:4:108,24:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,28:0.23: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,97:0.68: 0.87:1.000:0.953 0/0/0/1:4:86,40:0.37: 0.29:1.000:0.586 0/0/1/1:4:8,9:0.56:-3.17:1.000:0.965 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1:3:9,2:0.23:-3.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,49:0.42: 0.52:1.000:0.902 0/1/1/1:4:45,92:0.68: 0.64:1.000:0.949 0/0/0/1:4:112,18:0.18: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,48:0.42: 0.45:1.000:0.893 0/0/1/1:4:87,60:0.46: 0.96:1.000:0.984 0/0/0/1:4:115,14:0.14: 0.39:1.000:0.966 0/0/1/1:4:82,46:0.41: 0.36:1.000:0.855 0/0/1/1:4:104,68:0.44: 1.76:1.000:0.972 0/0/1/1:4:58,49:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,39:0.39:-0.02:1.000:0.648 0/0/1/1:4:81,56:0.46: 0.64:1.000:0.985 0/0/1/1:4:70,81:0.57: 1.09:1.000:0.954 0/0/1/1:4:19,13:0.45:-2.69:1.000:0.983 0/0/1/1:4:69,41:0.42:-0.21:1.000:0.919 0/0/0/1:4:101,19:0.20: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,29:0.42:-1.23:1.000:0.916 0/0/0/1:4:127,31:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,84:0.63: 0.64:1.000:0.565 0/0/1/1:4:64,62:0.53: 0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,47:0.43: 0.20:1.000:0.947 0/1/1/1:4:34,85:0.71: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,63:0.46: 1.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,65:0.55: 0.33:1.000:0.983 0/0/0/1:4:85,22:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:56,51:0.52:-0.31:1.000:0.871 0/0/0/1:4:80,27:0.31:-0.31:1.000:0.979 0/0/0/1:4:91,29:0.30: 0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:69,53:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:90,30:0.30: 0.10:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,131:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,69:0.57: 0.39:1.000:0.956 0/0/0/1:4:79,11:0.16:-0.85:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,73:0.71:-0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:97,24:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,28:0.29: 0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:105,17:0.18: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,31:0.43:-1.10:1.000:0.936 0/1/1:3:36,81:0.70: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,79:0.67: 0.10:1.000:0.909 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,49:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,26:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,22:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,18:0.16: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,27:0.27: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,20:0.26:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,29:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,39:0.37: 0.14:1.000:0.524 0/0/1/1:4:60,46:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,41:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,69:0.67:-0.41:1.000:0.927 0/0/1/1:4:57,36:0.44:-0.75:1.000:0.958 0/0/0/1:4:66,11:0.18:-1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,53:0.45: 0.48:1.000:0.979 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,29:0.39:-1.01:1.000:0.703 0/0/1/1:4:71,43:0.43:-0.09:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,129:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,60:0.74:-1.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,54:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,52:0.64:-1.07:1.000:0.701 0/0/1/1:4:72,53:0.47: 0.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,63:0.49: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,75:0.53: 1.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,13:0.21:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,63:0.75:-1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,42:0.51:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,20:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,30:0.43:-1.23:1.000:0.953 0/0/1/1:4:71,54:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,58:0.52: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,55:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,68:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,79:0.73:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,26:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,97:0.52: 2.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,35:0.39:-0.47:1.000:0.723 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1:3:30,26:0.51:-1.93:1.000:0.627 0/1/1/1:4:31,75:0.71:-0.34:1.000:0.991 0/1/1/1:4:32,57:0.65:-0.88:1.000:0.815 0/0/1/1:4:66,36:0.40:-0.47:1.000:0.810 0/1/1/1:4:23,69:0.74:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,25:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/0/0/0:4:130,12:0.11: 0.80:1.000:0.554 0/0/1/1:4:48,34:0.46:-1.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:117,30:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,72:0.71:-0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,51:0.56:-0.66:1.000:0.962 0/1/1/1:4:31,77:0.71:-0.28:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:92,70:0.48: 1.44:1.000:0.863 0/1/1/1:4:22,62:0.73:-1.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:69,19:0.27:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,41:0.52:-1.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,71:0.66:-0.25:1.000:0.878 0/0/0/1:4:95,44:0.37: 0.71:1.000:0.597 0/0/0/1:4:73,11:0.17:-1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,58:0.66:-0.85:1.000:0.840 0/0/0/1:4:100,35:0.31: 0.58:1.000:0.970 0/0/1/1:4:90,82:0.52: 1.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,96:0.73: 0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,40:0.44:-0.50:1.000:0.973 0/0/0/0/0/0:6:129,0:0.00: 0.39:0.989:1.000 0/0/1/1:4:60,35:0.42:-0.69:1.000:0.902 0/0/0/1:4:103,28:0.27: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,39:0.43:-0.44:1.000:0.938 0/0/1/1:4:73,52:0.46: 0.26:1.000:0.989 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,83:0.52: 1.82:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,99:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,44:0.42: 0.10:1.000:0.894 0/0/1/1:4:57,46:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:137,33:0.25: 1.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,79:0.68: 0.01:1.000:0.956 0/0/1/1:4:88,55:0.43: 0.83:1.000:0.953 0/0/0/1:4:75,34:0.36:-0.25:1.000:0.653 0/0/1/1:4:11,16:0.61:-2.85:1.000:0.654 0/0/0/1:4:91,18:0.21:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,66:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,58:0.44: 0.93:1.000:0.974 0/0/1/1:4:66,85:0.59: 1.09:1.000:0.871 0/0/1/1:4:34,48:0.61:-1.10:1.000:0.721 0/0/1/1:4:65,52:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,45:0.47:-0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:57,51:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,17:0.21:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,48:0.43: 0.29:1.000:0.944 0/1/1/1:4:40,70:0.65:-0.21:1.000:0.785 0/0/0/1:4:112,24:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,39:0.43:-0.47:1.000:0.948 0/0/1/1:4:63,51:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,51:0.47: 0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:24,76:0.75:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,30:0.38:-0.85:1.000:0.614 0/1/1/1:4:32,55:0.65:-0.95:1.000:0.752 0/1/1/1:4:34,58:0.64:-0.79:1.000:0.737 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,39:0.41:-0.31:1.000:0.883 0/0/1/1:4:80,73:0.52: 1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,27:0.23: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,76:0.72:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,21:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,45:0.42: 0.10:1.000:0.927 0/0/1/1:4:73,72:0.53: 0.90:1.000:0.991 0/0/0/1:4:142,34:0.25: 1.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,58:0.53: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:60,42:0.46:-0.47:1.000:0.987 -chr1.1 3613850 chr1.1_003613850 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:419,184:0.29: 0.32:1.000:0.990 0/0/1/1:4:213,231:0.50:-1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,298:0.56:-0.54:1.000:0.970 0/0/0/1:4:449,167:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:325,309:0.47: 0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:461,194:0.28: 0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:263,254:0.48:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:276,294:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:142,417:0.72:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,235:0.56:-1.63:1.000:0.970 0/0/0/0:4:554,10:0.02:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:127,419:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:265,269:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:307,323:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:286,278:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:173,486:0.71: 0.88:1.000:0.993 0/0/0/1:4:503,166:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:446,141:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:554,182:0.24: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:339,340:0.49: 1.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:363,154:0.29:-0.54:1.000:0.993 0/0/0/0:4:547,1:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:482,162:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,259:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,145:0.58:-3.30:1.000:0.903 0/0/0/1:4:571,167:0.22: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:441,165:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:402,125:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:343,343:0.48: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:326,332:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:708,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,285:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,172:0.54:-2.63:1.000:0.987 0/1/1/1:4:138,379:0.71:-0.54:1.000:0.991 0/0/1:3:141,113:0.43:-3.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:464,122:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:401,139:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:162,460:0.72: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:334,396:0.53: 1.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:532,194:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:269,281:0.49:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:458,151:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:315,355:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:263,292:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:359,357:0.48: 1.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:461,171:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:349,328:0.47: 1.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:692,286:0.28: 4.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:406,159:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:357,400:0.51: 1.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:243,325:0.55:-0.03:1.000:0.975 0/0/1/1:4:319,380:0.53: 1.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:383,143:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:306,318:0.49: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:252,277:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/0:4:632,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:380,117:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:479,155:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:266,302:0.52:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:305,221:0.41:-0.45:1.000:0.595 0/0/1/1:4:240,305:0.54:-0.26:1.000:0.986 0/0/1/1:4:253,253:0.48:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:474,170:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:290,360:0.54: 0.79:1.000:0.990 0/0/0/0:4:651,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:467,143:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:258,300:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/0/0:4:544,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:327,349:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:134,386:0.72:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:386,380:0.48: 1.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:278,319:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/1:3:594,152:0.20: 1.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:492,153:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:572,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:285,266:0.47:-0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:240,292:0.53:-0.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:115,469:0.78: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,282:0.55:-0.76:1.000:0.978 0/0/1/1:4:313,286:0.46: 0.28:1.000:0.989 0/1/1/1:4:100,379:0.77:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:149,541:0.76: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:486,184:0.26: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:363,115:0.23:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:532,168:0.23: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:488,158:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,236:0.52:-1.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:224,237:0.50:-1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:258,273:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:133,410:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:224,288:0.54:-0.59:1.000:0.984 0/0/0/1:4:355,140:0.27:-0.76:1.000:0.997 0/0/0/0:4:633,2:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:355,122:0.25:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:683,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:304,292:0.47: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:354,125:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:247,268:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:441,141:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:290,315:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:150,454:0.73: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:360,167:0.31:-0.44:1.000:0.980 0/0/0/1:4:311,117:0.26:-1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:300,300:0.48: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:343,153:0.30:-0.75:1.000:0.988 0/0/0/1:4:384,135:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:374,145:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:448,152:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:492,181:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:363,149:0.28:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:243,249:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:433,390:0.46: 2.53:1.000:0.987 0/0/1/1:4:269,282:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:572,1:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1:3:224,137:0.37:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:415,196:0.31: 0.40:1.000:0.975 0/0/0/0:4:561,2:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:420,163:0.27: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/0:4:531,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,275:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:141,390:0.71:-0.40:1.000:0.992 0/0/0/0:4:564,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,347:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:458,139:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:271,271:0.48:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:468,154:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:415,274:0.38: 1.18:1.000:0.757 0/0/0/1:4:372,154:0.28:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:227,220:0.48:-1.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:232,207:0.46:-1.32:1.000:0.985 0/0/0/1:4:349,144:0.28:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:268,253:0.47:-0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:172,168:0.48:-2.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:407,152:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:219,276:0.54:-0.76:1.000:0.988 0/0/1/1:4:364,336:0.46: 1.29:1.000:0.990 0/0/0/0:4:547,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,282:0.53:-0.57:1.000:0.992 0/1/1/1/1/1:6:126,440:0.75:-0.05:0.989:0.545 0/0/0/1:4:343,133:0.27:-0.95:1.000:0.998 0/1/1/1:4:160,485:0.73: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:239,301:0.54:-0.31:1.000:0.988 0/0/0/1:4:382,133:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,366:0.77:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:331,360:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:685,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:411,157:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:393,132:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:343,359:0.50: 1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:355,122:0.25:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:325,330:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:348,123:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,257:0.56:-1.28:1.000:0.964 0/0/1/1:4:219,218:0.48:-1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:385,376:0.48: 1.91:1.000:0.995 0/1/1/1:4:133,483:0.76: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:341,304:0.46: 0.74:1.000:0.985 0/0/0/1:4:499,152:0.22: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:460,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,350:0.52: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:335,119:0.25:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:360,118:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:142,385:0.71:-0.44:1.000:0.990 0/0/0/1:4:412,156:0.26:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:407,161:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:280,275:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:204,233:0.52:-1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:252,252:0.48:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:360,111:0.23:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:491,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,340:0.72:-1.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:217,214:0.48:-1.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:442,155:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:354,111:0.23:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,407:0.70:-0.12:1.000:0.989 0/0/0/1:4:311,127:0.28:-1.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:525,204:0.27: 1.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:178,496:0.71: 1.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:406,137:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:249,235:0.47:-0.87:1.000:0.992 0/0/1/1:4:305,292:0.47: 0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:337,369:0.51: 1.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:153,521:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:339,119:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:282,301:0.50: 0.12:1.000:0.997 -chr1.1 3712477 chr1.1_003712477 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:76,93:.: 1.08:1.000:. ./.:4:92,34:.:-0.11:1.000:. ./.:4:96,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:81,88:.: 1.08:1.000:. ./.:4:140,57:.: 1.85:1.000:. ./.:4:109,35:.: 0.39:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:104,48:.: 0.61:1.000:. ./.:4:95,30:.:-0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:19,10:.:-2.79:1.000:. ./.:4:47,67:.:-0.44:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,35:.: 0.50:1.000:. ./.:4:105,28:.: 0.09:1.000:. ./.:4:90,108:.: 1.88:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:79,92:.: 1.14:1.000:. ./.:4:6,2:.:-3.37:1.000:. ./.:4:96,46:.: 0.33:1.000:. ./.:4:102,45:.: 0.47:1.000:. ./.:4:76,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:108,37:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:102,42:.: 0.39:1.000:. ./.:4:117,54:.: 1.14:1.000:. ./.:4:83,39:.:-0.22:1.000:. ./.:4:113,40:.: 0.64:1.000:. ./.:4:62,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:14,5:.:-3.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:124,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,87:.: 0.91:1.000:. ./.:4:96,43:.: 0.25:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:116,41:.: 0.75:1.000:. ./.:4:105,37:.: 0.33:1.000:. ./.:4:118,51:.: 1.08:1.000:. ./.:4:78,92:.: 1.11:1.000:. ./.:4:78,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:127,37:.: 0.94:1.000:. ./.:4:110,56:.: 1.00:1.000:. ./.:4:3,4:.:-3.40:1.000:. ./.:4:80,26:.:-0.66:1.000:. ./.:4:75,32:.:-0.63:1.000:. ./.:4:80,30:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,49:.: 1.33:1.000:. ./.:4:90,39:.:-0.03:1.000:. ./.:4:121,44:.: 0.97:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:86,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:63,86:.: 0.53:1.000:. ./.:4:93,39:.: 0.06:1.000:. ./.:4:98,39:.: 0.20:1.000:. ./.:6:69,31:.:-0.83:1.000:. ./.:4:84,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:95,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,35:.: 0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,47:.: 1.03:1.000:. ./.:4:95,31:.:-0.11:1.000:. ./.:4:53,23:.:-1.49:1.000:. ./.:4:103,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:92,48:.: 0.28:1.000:. ./.:4:63,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:56,27:.:-1.30:1.000:. ./.:3:40,113:.: 0.64:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:77,106:.: 1.47:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:55,96:.: 0.58:1.000:. ./.:4:100,55:.: 0.69:1.000:. ./.:4:106,20:.:-0.11:1.000:. ./.:4:105,45:.: 0.56:1.000:. ./.:4:53,75:.:-0.05:1.000:. ./.:4:95,49:.: 0.39:1.000:. ./.:4:101,50:.: 0.58:1.000:. ./.:4:91,39:.: 0.00:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.74:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:89,37:.:-0.11:1.000:. ./.:4:93,38:.: 0.03:1.000:. ./.:4:81,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:106,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,31:.:-1.19:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:101,51:.: 0.61:1.000:. ./.:4:86,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:95,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:48,71:.:-0.30:1.000:. ./.:4:104,36:.: 0.28:1.000:. ./.:4:84,87:.: 1.14:1.000:. ./.:4:61,31:.:-1.05:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:78,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,30:.:-0.36:1.000:. ./.:4:92,36:.:-0.05:1.000:. ./.:4:99,41:.: 0.28:1.000:. ./.:4:76,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:104,35:.: 0.25:1.000:. ./.:4:132,45:.: 1.30:1.000:. ./.:4:128,52:.: 1.38:1.000:. ./.:4:92,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:139,42:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,48:.: 0.36:1.000:. ./.:4:94,24:.:-0.33:1.000:. ./.:3:41,24:.:-1.80:1.000:. ./.:4:102,45:.: 0.47:1.000:. ./.:4:74,19:.:-1.02:1.000:. ./.:4:84,30:.:-0.44:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.27:1.000:. ./.:4:97,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:98,32:.: 0.00:1.000:. ./.:4:91,42:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:100,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:90,31:.:-0.25:1.000:. ./.:4:94,38:.: 0.06:1.000:. ./.:6:120,32:.: 0.61:1.000:. ./.:4:69,25:.:-0.99:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:98,27:.:-0.14:1.000:. ./.:4:59,55:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,37:.: 0.09:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:58,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:105,28:.: 0.09:1.000:. ./.:4:92,92:.: 1.50:1.000:. ./.:4:105,32:.: 0.20:1.000:. ./.:4:56,64:.:-0.27:1.000:. ./.:6:96,32:.:-0.05:0.989:. ./.:4:86,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:85,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:92,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:108,43:.: 0.58:1.000:. ./.:4:61,24:.:-1.24:1.000:. ./.:4:132,45:.: 1.30:1.000:. ./.:4:137,61:.: 1.88:1.000:. ./.:4:113,39:.: 0.61:1.000:. ./.:4:118,48:.: 1.00:1.000:. ./.:4:113,40:.: 0.64:1.000:. ./.:4:105,26:.: 0.03:1.000:. ./.:4:115,46:.: 0.86:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,2:.:-3.23:1.000:. ./.:4:66,21:.:-1.19:1.000:. ./.:4:128,54:.: 1.44:1.000:. ./.:4:118,46:.: 0.94:1.000:. ./.:4:136,47:.: 1.47:1.000:. ./.:4:118,33:.: 0.58:1.000:. ./.:4:90,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:123,41:.: 0.94:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:111,33:.: 0.39:1.000:. ./.:4:89,30:.:-0.30:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:67,38:.:-0.69:1.000:. ./.:4:101,36:.: 0.20:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:80,26:.:-0.66:1.000:. ./.:4:76,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,47:.: 0.20:1.000:. ./.:4:110,42:.: 0.61:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:99,34:.: 0.09:1.000:. ./.:4:117,49:.: 1.00:1.000:. ./.:4:119,44:.: 0.91:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:94,40:.: 0.11:1.000:. ./.:4:104,46:.: 0.56:1.000:. ./.:4:92,100:.: 1.72:1.000:. ./.:4:107,50:.: 0.75:1.000:. ./.:4:71,30:.:-0.80:1.000:. ./.:4:62,86:.: 0.50:1.000:. -chr1.1 3898103 chr1.1_003898103 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:32,47:0.58:-0.14:1.000:0.920 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,15:0.22:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,32:0.59:-1.12:1.000:0.879 0/0/0/1:4:80,26:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,24:0.31:-0.33:1.000:0.974 0/0/0/1:4:55,8:0.12:-0.75:1.000:0.770 0/0/0/1:4:43,21:0.31:-0.71:1.000:0.968 0/0/0/1:4:58,12:0.16:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,20:0.40:-1.31:1.000:0.791 0/1/1/1:4:14,33:0.69:-1.35:1.000:0.971 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.27:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,28:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,20:0.37:-1.16:1.000:0.581 0/0/0/1:4:66,16:0.18:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,24:0.55:-1.54:1.000:0.975 0/0/1/1:4:42,35:0.44:-0.22:1.000:0.962 0/0/1/1:4:55,69:0.54: 1.56:1.000:0.988 0/0/0/1:4:59,25:0.28: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,32:0.59:-1.12:1.000:0.879 0/1/1/1:4:18,36:0.65:-1.09:1.000:0.809 0/0/1/1:4:52,43:0.44: 0.46:1.000:0.959 0/0/1/1:4:38,38:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,13:0.19:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,31:0.60:-1.24:1.000:0.754 0/1/1/1:4:19,40:0.66:-0.90:1.000:0.889 0/0/0/1:4:48,15:0.23:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,55:0.43: 1.52:1.000:0.947 0/0/0/1:4:60,15:0.19:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,27:0.60:-1.46:1.000:0.812 0/0/1/1:4:20,13:0.38:-1.88:1.000:0.540 0/0/1/1:4:16,22:0.56:-1.69:1.000:0.964 0/0/0/1:4:52,24:0.30:-0.26:1.000:0.984 0/0/1:3:11,4:0.25:-2.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,46:0.57:-0.14:1.000:0.957 0/1/1/1:4:13,37:0.73:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,20:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,9:0.14:-0.86:1.000:0.974 0/0/1/1:4:38,29:0.42:-0.60:1.000:0.896 0/0/1/1:4:57,45:0.42: 0.73:1.000:0.929 0/0/1/1:4:38,28:0.41:-0.63:1.000:0.848 0/0/0/1:4:51,25:0.31:-0.26:1.000:0.967 0/0/0/1:4:33,20:0.36:-1.12:1.000:0.671 0/0/0/1:4:90,26:0.21: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,18:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,32:0.31: 0.61:1.000:0.976 0/0/0/1:4:8,4:0.32:-2.67:1.000:0.958 0/0/1/1:4:24,39:0.60:-0.75:1.000:0.763 0/0/0/1:4:27,10:0.26:-1.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,29:0.28: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,41:0.45: 0.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:49,27:0.34:-0.26:1.000:0.870 0/0/0/1:4:75,32:0.28: 0.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:44,22:0.32:-0.63:1.000:0.958 0/0/1/1:4:32,46:0.57:-0.18:1.000:0.938 0/1/1/1:4:26,49:0.64:-0.29:1.000:0.667 0/0/0/1:4:51,31:0.36:-0.03:1.000:0.663 0/0/0/1:4:64,29:0.30: 0.39:1.000:0.987 0/0/0/1/1/1:6:50,47:0.47: 0.54:1.000:0.826 0/0/0/1:4:104,26:0.19: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,26:0.36:-0.52:1.000:0.677 0/0/1/1:4:64,68:0.50: 1.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,26:0.29: 0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,56:0.69:-0.11:1.000:0.967 0/0/0/1:4:37,14:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,53:0.47: 0.95:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,60:0.64: 0.31:1.000:0.737 0/0/1/1:4:57,58:0.49: 1.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,41:0.28: 2.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,31:0.52:-0.94:1.000:0.996 0/0/0:3:32,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,35:0.43:-0.18:1.000:0.950 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,22:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,29:0.33: 0.01:1.000:0.902 0/0/0/1:4:83,43:0.33: 1.63:1.000:0.936 0/0/0/1:4:53,25:0.31:-0.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:55,52:0.47: 0.91:1.000:0.992 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,25:0.21: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,80:0.44: 3.41:1.000:0.974 0/1/1/1:4:18,38:0.66:-1.01:1.000:0.893 0/0/1/1:4:34,32:0.47:-0.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:61,65:0.50: 1.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,19:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,54:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:82,22:0.20: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.17: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,24:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,49:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,77:0.64: 1.29:1.000:0.724 0/0/0/1:4:29,12:0.28:-1.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,83:0.68: 1.41:1.000:0.947 0/0/0/1:4:58,24:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,64:0.49: 1.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,69:0.70: 0.54:1.000:0.983 0/0/0/1:4:60,20:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,20:0.21: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,57:0.46: 1.37:1.000:0.988 0/0/1/1:4:31,53:0.62: 0.05:1.000:0.630 0/0/1/1:4:68,72:0.50: 2.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,50:0.43: 1.07:1.000:0.954 0/0/1/1:4:55,39:0.40: 0.42:1.000:0.776 0/0/1/1:4:30,51:0.61:-0.07:1.000:0.646 0/0/1/1:4:27,42:0.59:-0.52:1.000:0.848 0/1/1/1:4:24,77:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,21:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,33:0.30: 0.88:1.000:0.988 0/0/0/1:4:46,27:0.35:-0.37:1.000:0.753 0/0/0/1:4:118,35:0.22: 2.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,62:0.69: 0.20:1.000:0.975 0/0/1:3:21,17:0.43:-1.69:1.000:0.991 0/1/1/1:4:29,75:0.71: 0.80:1.000:0.991 0/0/1/1:4:33,51:0.59: 0.05:1.000:0.859 0/0/1/1:4:55,48:0.45: 0.76:1.000:0.978 0/1/1/1:4:35,73:0.66: 0.95:1.000:0.877 0/0/0/1:4:76,20:0.20: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,30:0.31: 0.39:1.000:0.977 0/0/1/1:4:39,61:0.59: 0.65:1.000:0.839 0/0/0/1:4:82,25:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,33:0.51:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,55:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,54:0.64:-0.03:1.000:0.728 0/0/0/1/1/1:6:70,70:0.48: 2.16:1.000:0.871 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,17:0.17: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,20:0.27:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,50:0.61:-0.11:1.000:0.701 0/0/0/1:4:55,24:0.29:-0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:73,10:0.11: 0.01:1.000:0.614 0/1/1/1:4:13,24:0.63:-1.73:1.000:0.608 0/0/0/1:4:31,12:0.27:-1.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,31:0.38:-0.14:1.000:0.520 0/0/1/1:4:26,37:0.57:-0.75:1.000:0.945 0/0/0/1:4:78,39:0.32: 1.29:1.000:0.958 0/0/0/0/0/1:6:108,28:0.20: 2.01:0.989:0.939 0/0/1/1:4:63,54:0.44: 1.29:1.000:0.973 0/0/0/1:4:87,31:0.25: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,40:0.35: 0.95:1.000:0.747 0/1/1/1:4:21,44:0.66:-0.67:1.000:0.883 0/0/0/1:4:79,31:0.27: 1.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,33:0.29: 0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,53:0.57: 0.31:1.000:0.957 0/0/1/1:4:40,54:0.56: 0.42:1.000:0.971 0/1/1/1:4:25,49:0.65:-0.33:1.000:0.767 0/0/1/1:4:52,47:0.46: 0.61:1.000:0.986 0/0/1/1:4:27,44:0.60:-0.45:1.000:0.757 0/0/0/1:4:69,33:0.31: 0.73:1.000:0.975 0/0/1/1:4:51,59:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:48,26:0.34:-0.33:1.000:0.893 0/0/0/1:4:70,16:0.18: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,10:0.20:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,21:0.21: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,31:0.37:-0.07:1.000:0.606 0/0/0/1:4:47,22:0.30:-0.52:1.000:0.981 0/1/1/1:4:17,42:0.70:-0.90:1.000:0.983 0/0/0/1:4:60,24:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,35:0.37: 0.31:1.000:0.581 0/0/0/1:4:40,15:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,29:0.31: 0.27:1.000:0.977 0/0/1/1:4:39,42:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,18:0.42:-1.58:1.000:0.922 0/0/0/1:4:62,17:0.20:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,33:0.46:-0.52:1.000:0.988 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,26:0.30: 0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:38,39:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,19:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.24:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,41:0.64:-0.75:1.000:0.635 0/0/1/1:4:32,35:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,16:0.24:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,34:0.40:-0.07:1.000:0.816 0/0/1/1:4:32,54:0.61: 0.12:1.000:0.667 0/0/0/1:4:78,31:0.27: 0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,30:0.41:-0.48:1.000:0.874 0/0/0/1:4:49,16:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,44:0.42: 0.69:1.000:0.909 0/0/0/1:4:48,15:0.23:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,35:0.23: 2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,21:0.40:-1.20:1.000:0.747 0/0/0/0:4:64,1:0.01:-0.67:1.000:1.000 -chr1.1 4102347 chr1.1_004102347 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:80,67:0.48: 1.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:84,24:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,75:0.71: 0.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:32,69:0.68: 0.01:1.000:0.953 0/0/1/1:4:93,65:0.44: 1.87:1.000:0.959 0/0/1/1:4:86,56:0.42: 1.34:1.000:0.912 0/0/0/1:4:62,15:0.23:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,26:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,41:0.46:-0.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:9,4:0.34:-2.86:1.000:0.873 0/0/1/1:4:14,9:0.42:-2.54:1.000:0.900 0/0/0/1:4:78,20:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,19:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,57:0.53: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,27:0.27: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,59:0.47: 0.98:1.000:0.993 0/0/0/1:4:99,38:0.31: 1.18:1.000:0.971 0/0/1/1:4:64,60:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,59:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,3:0.15:-2.51:1.000:0.985 0/1/1/1:4:43,77:0.64: 0.63:1.000:0.719 0/1/1/1:4:41,74:0.64: 0.46:1.000:0.737 0/1/1/1:4:36,73:0.67: 0.27:1.000:0.911 0/0/1/1:4:4,4:0.52:-3.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:104,15:0.15: 0.59:1.000:0.987 0/0/0/1:4:116,31:0.25: 1.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,29:0.27: 0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,46:0.42: 0.50:1.000:0.920 0/1/1/1:4:27,73:0.72:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,97:0.76: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,41:0.46:-0.22:1.000:0.986 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.22:-2.77:1.000:1.000 1/1/1:3:1,7:0.87:-3.03:1.000:0.855 0/1/1/1:4:28,72:0.71:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:66,55:0.48: 0.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,32:0.28: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:77,33:0.33: 0.30:1.000:0.911 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,69:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,54:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,23:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,54:0.60:-0.32:1.000:0.793 0/0/0/1:4:88,27:0.27: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,40:0.45:-0.22:1.000:0.978 0/0/0/1:4:88,31:0.30: 0.59:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-2.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,14:0.26:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,55:0.55: 0.07:1.000:0.983 0/1/1/1:4:37,118:0.75: 1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,72:0.54: 1.15:1.000:0.986 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,21:0.22: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,89:0.74: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,57:0.46: 0.98:1.000:0.986 0/0/1/1:4:60,44:0.45: 0.10:1.000:0.976 0/1/1/1:4:23,77:0.76:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:39,47:0.56:-0.48:1.000:0.692 0/0/1/1:4:51,45:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,75:0.82:-0.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,106:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,32:0.47:-0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:58,56:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,55:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,35:0.72:-1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,48:0.53:-0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,40:0.53:-0.74:1.000:0.993 0/0/0/1:4:95,23:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,51:0.46: 0.50:1.000:0.988 0/0/1/1:4:33,42:0.57:-0.84:1.000:0.946 0/0/1:3:67,52:0.46: 0.59:1.000:0.939 0/0/1/1:4:68,70:0.52: 1.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,38:0.39: 0.17:1.000:0.649 0/0/1/1:4:37,45:0.56:-0.61:1.000:0.967 0/0/1/1:4:51,55:0.53: 0.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:66,17:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,19:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,63:0.68:-0.29:1.000:0.956 0/0/0/1:4:61,17:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,64:0.55: 0.63:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,105:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,58:0.59:-0.06:1.000:0.844 0/1/1/1:4:24,51:0.68:-0.84:1.000:0.945 0/0/1/1:4:72,50:0.43: 0.69:1.000:0.956 0/1/1/1:4:20,59:0.74:-0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,50:0.68:-0.91:1.000:0.957 0/1/1/1:4:32,62:0.66:-0.22:1.000:0.860 0/0/1/1:4:49,45:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,63:0.79:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,81:0.70: 0.43:1.000:0.988 0/0/1/1:4:57,55:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,39:0.44:-0.22:1.000:0.965 0/0/1/1:4:60,37:0.41:-0.12:1.000:0.849 0/0/0/1:4:72,19:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,23:0.33:-0.81:1.000:0.899 0/0/1/1:4:37,35:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,27:0.27: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,32:0.28: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:38,9:0.23:-1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,44:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,24:0.45:-1.46:1.000:0.981 0/1/1/1:4:22,58:0.72:-0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,41:0.75:-1.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,74:0.69: 0.17:1.000:0.978 0/0/1/1:4:54,34:0.41:-0.42:1.000:0.877 0/0/1/1:4:57,46:0.47: 0.07:1.000:0.991 0/0/0/1:4:133,22:0.17: 1.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,60:0.54: 0.43:1.000:0.988 0/0/0/1:4:73,22:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,51:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,43:0.51:-0.42:1.000:0.997 0/0/0:3:60,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,18:0.20: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,50:0.76:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,50:0.71:-1.01:1.000:0.990 0/1/1/1:4:18,58:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,26:0.23: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,48:0.66:-0.94:1.000:0.897 0/0/1/1:4:49,48:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,24:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,56:0.47: 0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:77,17:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:60,44:0.45: 0.10:1.000:0.720 0/0/1/1:4:41,42:0.52:-0.58:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,34:0.63:-1.53:1.000:0.589 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,45:0.46: 0.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:91,18:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,25:0.48:-1.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,36:0.45:-0.55:1.000:0.981 0/0/0/1:4:73,17:0.22:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,33:0.23: 2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,53:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,15:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:50,37:0.45:-0.45:0.989:0.733 0/0/1/1:4:48,28:0.40:-0.81:1.000:0.750 0/0/0/1:4:99,22:0.22: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,35:0.43:-0.45:1.000:0.938 0/0/1/1:4:57,43:0.45:-0.03:1.000:0.982 0/0/0/1:4:41,21:0.37:-1.27:1.000:0.589 0/0/0/1:4:122,33:0.25: 1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,51:0.42: 0.92:1.000:0.916 0/1/1/1:4:33,92:0.73: 0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,77:0.69: 0.33:1.000:0.972 0/1/1/1:4:38,92:0.70: 0.95:1.000:0.986 0/0/0/1:4:90,27:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:93,35:0.31: 0.89:1.000:0.977 0/0/1/1:4:72,46:0.42: 0.56:1.000:0.893 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,60:0.77:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,59:0.57: 0.14:1.000:0.942 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,48:0.53:-0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:32,54:0.63:-0.48:1.000:0.569 0/0/1/1:4:68,68:0.52: 1.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,82:0.77: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,47:0.46: 0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,52:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,56:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,45:0.43: 0.30:1.000:0.954 0/0/1/1:4:53,40:0.45:-0.26:1.000:0.982 0/0/1/1:4:50,57:0.55: 0.20:1.000:0.984 0/1/1/1:4:31,105:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,31:0.27: 1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,79:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,44:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,51:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,19:0.22: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,40:0.42:-0.03:1.000:0.931 0/0/0/1:4:74,8:0.12:-0.61:1.000:0.652 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,65:0.45: 1.64:1.000:0.983 0/0/0/1:4:89,34:0.31: 0.72:1.000:0.973 0/0/1/1:4:64,67:0.53: 0.98:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,77:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,56:0.47: 0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:113,37:0.28: 1.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,36:0.27: 1.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,40:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,72:0.51: 1.47:1.000:0.996 -chr1.1 4436755 chr1.1_004436755 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:65,20:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,44:0.79:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,21:0.32:-0.21:1.000:0.943 0/0/0/1:4:67,12:0.16: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,13:0.15: 1.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:49,37:0.44: 0.81:1.000:0.965 0/0/1/1:4:12,19:0.59:-2.30:1.000:0.863 0/0/1/1:4:42,32:0.44: 0.13:1.000:0.968 0/0/1/1:4:42,27:0.40:-0.15:1.000:0.807 0/0/1/1:4:12,15:0.55:-2.52:1.000:0.983 0/0/0/1:4:22,8:0.28:-2.35:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,49:0.64: 0.02:1.000:0.710 0/0/1/1:4:46,41:0.48: 0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:33,29:0.47:-0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,50:0.67:-0.09:1.000:0.911 0/0/1/1:4:50,45:0.48: 1.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,21:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,39:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,19:0.22: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,40:0.46: 0.98:1.000:0.986 0/1/1/1:4:3,10:0.71:-3.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:73,20:0.23: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,19:0.31:-0.38:1.000:0.976 0/0/0/1:4:13,2:0.14:-3.20:1.000:0.979 0/0/1/1:4:35,37:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,45:0.55: 0.47:1.000:0.978 0/0/1/1:4:45,43:0.49: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,19:0.27: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,18:0.21: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,16:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,35:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,10:0.71:-3.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:23,21:0.48:-1.56:1.000:0.995 0/0/1:3:9,2:0.20:-3.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,26:0.33: 0.58:1.000:0.914 0/0/0/1:4:56,21:0.29: 0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:41,30:0.43:-0.04:1.000:0.950 0/0/1/1:4:34,34:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,23:0.30: 0.58:1.000:0.987 0/0/1/1:4:44,33:0.44: 0.30:1.000:0.962 0/0/1/1:4:28,47:0.60: 0.19:1.000:0.785 0/0/0/1:4:44,17:0.30:-0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:38,39:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,33:0.52:-0.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:25,62:0.67: 0.87:1.000:0.905 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,60:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,14:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,22:0.27: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,48:0.56: 0.70:1.000:0.970 0/1/1/1:4:27,66:0.66: 1.20:1.000:0.893 0/0/1/1:4:44,35:0.45: 0.41:1.000:0.981 0/0/0/1:4:49,12:0.21:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.19: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,33:0.42: 0.47:1.000:0.921 0/0/0/1:4:62,18:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:34,24:0.42:-0.77:1.000:0.546 0/0/0/1:4:55,21:0.29: 0.24:1.000:0.990 0/0/0/1:4:59,18:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,30:0.53:-0.88:1.000:0.992 0/0/0/1:4:56,21:0.29: 0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:36,39:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,4:0.14:-2.35:1.000:0.979 0/0/0/1:4:44,17:0.30:-0.60:1.000:0.989 0/0/0/1:4:57,26:0.33: 0.64:1.000:0.929 0/1/1/1:4:22,66:0.69: 0.92:1.000:0.980 0/0/1/1:4:36,40:0.52: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:35,8:0.20:-1.62:1.000:1.000 0/0/1:3:34,30:0.48:-0.43:1.000:0.840 0/0/0/1:4:78,36:0.33: 2.39:1.000:0.919 0/0/1/1:4:29,30:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,35:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,34:0.55:-0.60:1.000:0.982 0/0/1/1:4:53,43:0.46: 1.37:1.000:0.985 0/1/1/1:4:15,53:0.72:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:47,15:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,32:0.65:-1.45:1.000:0.822 0/0/1/1:4:37,37:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,34:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,14:0.20: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,13:0.19: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,15:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,19:0.32:-0.49:1.000:0.961 0/0/1/1:4:40,28:0.42:-0.21:1.000:0.919 0/0/0/1:4:46,19:0.31:-0.38:1.000:0.976 0/0/0/1:4:72,12:0.15: 0.70:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,19:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,27:0.45:-0.60:1.000:0.980 0/0/0/1:4:56,14:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,31:0.52:-0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:65,17:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,48:0.53: 0.98:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,36:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,39:0.46: 0.87:1.000:0.985 0/0/1/1:4:11,16:0.57:-2.52:1.000:0.933 0/0/0/1:4:69,22:0.26: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,25:0.51:-1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,27:0.42:-0.32:1.000:0.909 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,27:0.44:-0.55:1.000:0.973 0/0/1/1:4:44,31:0.42: 0.19:1.000:0.924 0/0/1/1:4:49,43:0.47: 1.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,50:0.50: 1.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,50:0.65: 0.02:1.000:0.814 0/1/1/1:4:25,68:0.68: 1.20:1.000:0.955 0/0/0/1:4:55,15:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.31:-0.21:1.000:0.974 0/1/1:3:18,30:0.60:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,41:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,15:0.32:-1.22:1.000:0.964 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,14:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,13:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,43:0.54: 0.41:1.000:0.989 0/0/0/1:4:63,10:0.15: 0.07:1.000:0.986 0/0/1/1:4:36,33:0.48:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,42:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,15:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,33:0.47: 0.02:1.000:0.990 0/0/0/1/1/1:6:46,58:0.55: 1.82:1.000:0.756 0/0/1/1:4:27,18:0.41:-1.51:1.000:0.865 0/0/1/1:4:25,26:0.51:-1.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,54:0.74:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,22:0.31: 0.24:1.000:0.979 0/1/1/1:4:11,59:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,19:0.42:-1.45:1.000:0.923 0/0/0/1:4:78,16:0.18: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,60:0.67: 0.64:1.000:0.937 0/0/1/1:4:47,39:0.46: 0.81:1.000:0.988 0/0/0/1:4:58,20:0.27: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,31:0.45:-0.09:1.000:0.980 0/0/0/0/1/1:6:47,28:0.38: 0.19:0.989:0.753 0/0/0/1:4:60,16:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,37:0.55:-0.32:1.000:0.980 0/0/0/1:4:51,16:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,39:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,23:0.55:-1.73:1.000:0.979 0/1/1/1:4:30,72:0.66: 1.71:1.000:0.877 0/0/0/1:4:83,15:0.17: 1.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,27:0.28: 1.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,45:0.55: 0.53:1.000:0.983 0/0/1/1:4:46,40:0.47: 0.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:66,24:0.28: 1.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,26:0.77:-2.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,11:0.23:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,52:0.67: 0.07:1.000:0.904 0/0/1/1:4:44,41:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,61:0.70: 0.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:33,31:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,17:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,23:0.32: 0.24:1.000:0.958 0/0/0/1:4:44,17:0.30:-0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:31,28:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,31:0.40: 0.47:1.000:0.776 0/0/0/1:4:49,16:0.26:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,34:0.47: 0.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:58,11:0.17:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:62,14:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,22:0.36:-0.43:1.000:0.724 0/0/0/1:4:54,18:0.27: 0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,32:0.53:-0.66:1.000:0.992 0/0/0/1:4:55,15:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,32:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:68,24:0.28: 1.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,40:0.66:-0.83:1.000:0.856 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,35:0.46: 0.36:1.000:0.985 0/0/1/1:4:46,50:0.52: 1.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,11:0.15: 0.53:1.000:0.984 0/0/0/1:4:64,14:0.19: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,14:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,35:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,33:0.51:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,30:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,33:0.47: 0.02:1.000:0.990 -chr1.1 4538231 chr1.1_004538231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:344,55:0.21:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,57:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,165:0.49:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,111:0.50:-1.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:445,154:0.32: 1.05:1.000:0.955 0/0/0/1:4:283,130:0.36:-0.18:1.000:0.648 0/0/0/1:4:360,50:0.18:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:428,77:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,79:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,47:0.30:-1.56:1.000:0.985 0/0/0/1:4:108,20:0.24:-2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:428,41:0.13: 0.19:1.000:0.922 0/0/0/1:4:556,53:0.13: 1.11:1.000:0.917 0/0/0/1:4:454,144:0.31: 1.04:1.000:0.978 0/0/0/0:4:597,1:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:557,38:0.10: 1.02:1.000:0.876 0/0/0/1:4:282,45:0.21:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:338,118:0.32: 0.11:1.000:0.952 0/0/0/1:4:468,168:0.32: 1.29:1.000:0.940 0/0/1/1:4:255,143:0.40:-0.27:1.000:0.767 0/0/0/1:4:159,19:0.16:-1.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,123:0.49:-1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:236,224:0.49: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:212,147:0.44:-0.53:1.000:0.959 0/0/0/0:4:98,4:0.06:-2.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:589,81:0.18: 1.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:462,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:430,67:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:472,141:0.30: 1.14:1.000:0.986 0/0/1/1:4:168,180:0.52:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,110:0.43:-1.09:1.000:0.945 0/0/0/1:4:202,84:0.35:-1.01:1.000:0.816 0/0/0/0:4:218,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,18:0.24:-2.16:1.000:1.000 0/0/1:3:26,15:0.40:-2.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,128:0.39:-0.45:1.000:0.642 0/0/0/1:4:329,45:0.18:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:636,56:0.12: 1.66:1.000:0.797 0/0/0/1:4:673,66:0.13: 1.97:1.000:0.942 0/1/1/1:4:70,198:0.68:-1.13:1.000:0.946 0/0/1/1:4:283,149:0.39:-0.05:1.000:0.649 0/0/0/1:4:269,128:0.37:-0.28:1.000:0.574 0/0/0/1:4:555,78:0.19: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:462,80:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:695,105:0.20: 2.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,148:0.40:-0.21:1.000:0.791 0/0/0/0:4:638,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,43:0.78:-2.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,189:0.67:-1.19:1.000:0.924 0/0/0/1:4:510,50:0.13: 0.79:1.000:0.941 0/0/0/1:4:352,127:0.33: 0.26:1.000:0.938 0/0/0/1:4:331,142:0.35: 0.22:1.000:0.771 0/0/0/1:4:278,63:0.26:-0.65:1.000:0.998 0/0/0/0:4:809,0:0.00: 2.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:520,57:0.15: 0.90:1.000:0.986 0/0/1/1:4:130,117:0.48:-1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:251,81:0.31:-0.71:1.000:0.974 0/0/0/1:4:315,148:0.37: 0.15:1.000:0.601 0/0/1/1:4:179,174:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:309,85:0.29:-0.30:1.000:0.814 0/0/0/1:4:432,140:0.31: 0.87:1.000:0.974 0/0/1/1:4:165,158:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,212:0.68:-1.01:1.000:0.946 0/0/0/1:4:387,141:0.33: 0.58:1.000:0.933 0/0/0/1:4:394,65:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,135:0.37:-0.16:1.000:0.552 0/0/1/1:4:229,113:0.38:-0.64:1.000:0.507 0/0/1/1:4:267,146:0.39:-0.18:1.000:0.723 0/0/0/1:4:409,117:0.29: 0.57:1.000:0.990 0/0/0/1:4:415,45:0.15: 0.13:1.000:0.984 0/0/0/1:4:479,142:0.30: 1.19:1.000:0.987 0/0/0/1:4:400,60:0.20: 0.13:1.000:1.000 0/0/1:3:162,155:0.50:-0.81:1.000:0.561 0/0/0/1:4:443,72:0.21: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,140:0.48:-0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:399,42:0.14: 0.01:1.000:0.976 0/0/0/1:4:240,117:0.37:-0.54:1.000:0.520 0/0/0/1:4:695,60:0.12: 2.08:1.000:0.752 0/0/0/1:4:372,68:0.23: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,136:0.39:-0.29:1.000:0.644 0/0/0/1:4:390,53:0.18: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:522,56:0.15: 0.91:1.000:0.981 0/1/1/1:4:83,217:0.67:-0.92:1.000:0.904 0/0/0/1:4:288,65:0.26:-0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,157:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:492,82:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,106:0.41:-1.06:1.000:0.887 0/0/0/1:4:241,118:0.37:-0.53:1.000:0.510 0/0/0/1:4:247,121:0.37:-0.47:1.000:0.509 0/0/0/1:4:358,106:0.30: 0.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:219,83:0.33:-0.91:1.000:0.908 0/0/1/1:4:279,153:0.39:-0.05:1.000:0.729 0/0/0/1:4:345,50:0.19:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,49:0.24:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:332,67:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:613,74:0.16: 1.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:399,54:0.18: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:234,117:0.38:-0.58:1.000:0.537 0/0/0/1:4:500,78:0.20: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:311,62:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:548,52:0.13: 1.06:1.000:0.913 0/0/0/1:4:497,101:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:292,49:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:285,147:0.38:-0.05:1.000:0.606 0/0/1/1:4:173,153:0.48:-0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,181:0.53:-0.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:272,53:0.25:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:326,61:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:620,96:0.20: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,57:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:437,70:0.21: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:742,0:0.00: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:381,127:0.31: 0.45:1.000:0.967 0/0/0/1:4:351,64:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0:3:396,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:593,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,121:0.49:-1.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:77,183:0.65:-1.18:1.000:0.810 0/0/1/1:4:118,131:0.52:-1.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:168,172:0.51:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:560,60:0.15: 1.19:1.000:0.981 0/1/1/1:4:57,229:0.72:-1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:440,140:0.31: 0.92:1.000:0.977 0/0/0/0:4:481,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:467,66:0.19: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:591,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:500,71:0.19: 0.86:1.000:0.960 0/0/0/1:4:204,93:0.36:-0.94:1.000:0.663 0/0/0/1:4:258,101:0.34:-0.53:1.000:0.882 0/0/0/0:4:550,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,52:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:386,58:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,72:0.29:-0.77:1.000:0.990 0/0/0/1:4:304,44:0.19:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:408,53:0.17: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:563,73:0.17: 1.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:267,140:0.39:-0.22:1.000:0.641 0/0/0/1:4:411,48:0.16: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/0/1/1:6:376,102:0.29: 0.25:0.989:0.804 0/0/0/1:4:409,111:0.29: 0.53:1.000:0.994 0/0/0/0:4:598,47:0.11: 1.35:1.000:0.529 0/0/0/1:4:466,46:0.14: 0.48:1.000:0.946 0/0/0/1:4:326,58:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,93:0.29:-0.17:1.000:0.989 0/0/0/0:4:604,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:380,203:0.39: 0.94:1.000:0.679 0/0/1/1:4:204,199:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:204,204:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,127:0.37:-0.32:1.000:0.549 0/0/0/0:4:454,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:637,85:0.18: 1.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:349,107:0.30: 0.11:1.000:0.983 0/0/0/0:4:204,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,98:0.48:-1.52:1.000:0.995 0/0/0/0:4:695,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:396,91:0.27: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/0:4:785,2:0.00: 2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,141:0.39:-0.25:1.000:0.708 0/0/1/1:4:106,119:0.53:-1.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:415,118:0.29: 0.61:1.000:0.991 0/0/0/1:4:213,100:0.37:-0.83:1.000:0.603 0/0/0/1:4:218,99:0.36:-0.81:1.000:0.671 0/0/0/1:4:416,64:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:448,132:0.30: 0.92:1.000:0.988 0/0/0/1:4:226,78:0.32:-0.89:1.000:0.956 0/0/0/1:4:372,129:0.32: 0.40:1.000:0.954 0/0/0/1:4:378,47:0.17:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,166:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:594,71:0.16: 1.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,115:0.52:-1.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:305,94:0.30:-0.27:1.000:0.982 0/0/0/1:4:257,62:0.27:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/0:4:553,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:446,63:0.19: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:526,34:0.09: 0.79:1.000:0.934 0/1/1/1:4:44,160:0.71:-1.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:371,71:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:665,58:0.12: 1.87:1.000:0.776 0/0/0/1:4:407,86:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,162:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:455,39:0.12: 0.36:1.000:0.734 0/0/0/1:4:598,67:0.15: 1.48:1.000:0.989 0/0/0/0:4:771,59:0.11: 2.57:1.000:0.613 0/0/1/1:4:195,103:0.39:-0.93:1.000:0.656 0/0/0/1:4:297,118:0.34:-0.16:1.000:0.868 -chr1.1 4614862 chr1.1_004614862 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:2,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.29:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.65:1.000:. ./.:6:10,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-1.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:27,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.29:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 3.15:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.29:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.39:1.000:. -chr1.1 4757298 chr1.1_004757298 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:272,95:.: 0.86:1.000:. ./.:4:210,77:.:-0.26:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:254,92:.: 0.57:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:279,96:.: 0.97:1.000:. ./.:4:203,1:.:-1.42:1.000:. ./.:4:224,78:.:-0.05:1.000:. ./.:4:349,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:89,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:44,28:.:-3.26:1.000:. ./.:4:228,93:.: 0.22:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:234,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:277,90:.: 0.86:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:324,91:.: 1.53:1.000:. ./.:4:95,17:.:-2.70:1.000:. ./.:4:228,103:.: 0.36:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:88,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:285,113:.: 1.29:1.000:. ./.:4:283,81:.: 0.82:1.000:. ./.:4:206,72:.:-0.38:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:233,101:.: 0.40:1.000:. ./.:4:219,79:.:-0.10:1.000:. ./.:4:55,27:.:-3.12:1.000:. ./.:4:138,1:.:-2.33:1.000:. ./.:3:86,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:240,81:.: 0.22:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:239,94:.: 0.39:1.000:. ./.:4:272,101:.: 0.94:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:260,101:.: 0.78:1.000:. ./.:4:291,115:.: 1.41:1.000:. ./.:4:183,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:212,62:.:-0.44:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:154,67:.:-1.18:1.000:. ./.:4:249,83:.: 0.37:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:212,84:.:-0.13:1.000:. ./.:4:211,82:.:-0.17:1.000:. ./.:4:259,89:.: 0.59:1.000:. ./.:4:306,1:.: 0.02:1.000:. ./.:6:210,19:.:-1.07:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:255,89:.: 0.54:1.000:. ./.:4:204,95:.:-0.09:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:228,87:.: 0.13:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:218,86:.:-0.02:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.38:1.000:. ./.:3:161,210:.: 0.92:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:111,168:.:-0.37:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:198,87:.:-0.29:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:277,40:.: 0.16:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:215,64:.:-0.37:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:219,88:.: 0.02:1.000:. ./.:4:328,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:228,78:.: 0.01:1.000:. ./.:4:157,86:.:-0.87:1.000:. ./.:4:238,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:204,69:.:-0.45:1.000:. ./.:4:228,89:.: 0.16:1.000:. ./.:4:271,88:.: 0.75:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:157,65:.:-1.17:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:204,64:.:-0.52:1.000:. ./.:4:289,104:.: 1.22:1.000:. ./.:4:270,93:.: 0.80:1.000:. ./.:4:248,94:.: 0.51:1.000:. ./.:4:214,74:.:-0.24:1.000:. ./.:4:313,120:.: 1.78:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:242,86:.: 0.32:1.000:. ./.:3:129,49:.:-1.78:1.000:. ./.:4:227,110:.: 0.44:1.000:. ./.:4:183,52:.:-0.98:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:194,69:.:-0.59:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:204,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:274,82:.: 0.71:1.000:. ./.:4:331,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:272,83:.: 0.69:1.000:. ./.:6:308,76:.: 1.10:1.000:. ./.:4:166,76:.:-0.89:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:175,66:.:-0.90:1.000:. ./.:4:198,82:.:-0.36:1.000:. ./.:4:262,75:.: 0.44:1.000:. ./.:4:189,1:.:-1.61:1.000:. ./.:4:245,85:.: 0.34:1.000:. ./.:4:195,63:.:-0.66:1.000:. ./.:4:338,144:.: 2.47:1.000:. ./.:4:237,84:.: 0.22:1.000:. ./.:4:212,75:.:-0.26:1.000:. ./.:6:270,0:.:-0.50:0.989:. ./.:4:251,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:262,81:.: 0.53:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:316,111:.: 1.70:1.000:. ./.:4:335,110:.: 1.95:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:209,73:.:-0.33:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:112,34:.:-2.23:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:237,98:.: 0.41:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:366,113:.: 2.43:1.000:. ./.:4:282,98:.: 1.04:1.000:. ./.:4:234,89:.: 0.25:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:162,67:.:-1.07:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:313,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:226,67:.:-0.17:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:235,83:.: 0.18:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:300,93:.: 1.22:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:298,114:.: 1.49:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:173,65:.:-0.94:1.000:. ./.:4:235,73:.: 0.04:1.000:. -chr1.1 4964967 chr1.1_004964967 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:45,43:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,8:0.29:-1.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,73:0.61: 0.66:1.000:0.735 0/1/1/1:4:41,62:0.63: 0.14:1.000:0.506 0/0/1/1:4:58,80:0.59: 1.01:1.000:0.848 0/0/1/1:4:51,64:0.56: 0.44:1.000:0.971 0/0/1/1:4:29,35:0.54:-0.84:1.000:0.985 0/0/1/1:4:56,55:0.49: 0.34:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-1.84:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,17:0.45:-1.46:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-2.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,57:0.55: 0.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:52,55:0.50: 0.24:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,69:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,82:0.65: 0.86:1.000:0.831 0/1/1/1:4:66,145:0.75: 2.83:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,68:0.45: 1.46:1.000:0.981 0/1/1/1:4:56,112:0.72: 1.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,41:0.39: 0.69:1.000:0.661 0/0/1/1:4:12,9:0.45:-1.91:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,161:1.00: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,58:0.47: 0.61:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,63:0.65: 0.11:1.000:0.786 1/1/1/1:4:0,109:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,61:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,79:0.42: 2.68:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-2.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/1/1:3:10,16:0.65:-1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,51:0.40: 1.23:1.000:0.779 0/0/1/1:4:73,67:0.48: 1.06:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,73:0.55: 0.89:1.000:0.983 0/0/1/1:4:103,73:0.44: 1.96:1.000:0.965 0/0/1/1:4:46,61:0.58: 0.24:1.000:0.922 0/0/1/1:4:39,56:0.61:-0.06:1.000:0.723 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,59:0.63: 0.01:1.000:0.508 0/0/1/1:4:59,70:0.54: 0.79:1.000:0.989 0/1/1/1:4:34,55:0.65:-0.21:1.000:0.790 0/0/0/1:4:50,11:0.30:-0.91:1.000:0.985 0/0/1/1:4:23,15:0.43:-1.49:1.000:0.938 0/0/1/1:4:89,60:0.43: 1.28:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,51:0.57:-0.19:1.000:0.939 0/0/1/1:4:51,58:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,6:0.23:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,51:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,47:0.38: 1.21:1.000:0.618 1/1/1/1:4:0,100:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,64:0.61: 0.26:1.000:0.672 0/0/1/1:4:55,66:0.54: 0.59:1.000:0.987 0/0/0/1/1/1:6:43,44:0.49:-0.26:1.000:0.886 0/0/1/1:4:41,43:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,54:0.58:-0.06:1.000:0.930 0/0/1/1:4:96,49:0.39: 1.18:1.000:0.727 0/0/1/1:4:39,53:0.59:-0.14:1.000:0.881 0/0/1/1:4:100,54:0.40: 1.41:1.000:0.798 0/1/1/1:4:50,76:0.63: 0.71:1.000:0.531 0/1/1/1:4:32,49:0.63:-0.41:1.000:0.566 0/1/1/1:4:55,101:0.69: 1.46:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,62:0.61: 0.19:1.000:0.707 0/0/1/1:4:31,45:0.61:-0.54:1.000:0.680 0/0/1:3:46,11:0.31:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,75:0.46: 1.71:1.000:0.988 0/0/0/1:4:87,9:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,6:0.22:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,68:0.56: 0.61:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,15:0.32:-0.71:1.000:0.949 0/0/0/1:4:111,39:0.35: 1.31:1.000:0.818 0/0/1/1:4:51,44:0.47:-0.06:1.000:0.991 0/1/1/1:4:42,92:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,57:0.42: 1.26:1.000:0.919 0/0/0/1:4:84,7:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,49:0.60:-0.34:1.000:0.809 0/0/0/1:4:73,8:0.25:-0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,55:0.70:-0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:91,45:0.39: 0.96:1.000:0.681 0/0/1/1:4:105,67:0.42: 1.86:1.000:0.928 0/0/0/1:4:85,6:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,51:0.43: 0.76:1.000:0.944 0/0/1/1:4:40,54:0.58:-0.09:1.000:0.894 0/0/1/1:4:63,41:0.43: 0.16:1.000:0.937 0/0/0/1:4:33,11:0.34:-1.34:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,100:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,13:0.34:-1.09:1.000:0.894 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,62:0.47: 0.86:1.000:0.993 0/0/1/1:4:22,33:0.62:-1.06:1.000:0.532 0/1/1/1:4:32,64:0.72:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,87:0.88: 0.14:1.000:0.825 0/1/1/1:4:46,100:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,43:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,60:0.47: 0.74:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,144:1.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,5:0.21:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,54:0.65:-0.26:1.000:0.825 0/0/1/1:4:92,52:0.41: 1.16:1.000:0.845 1/1/1:3:0,35:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,51:0.53:-0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:86,36:0.37: 0.61:1.000:0.591 0/0/1/1:4:95,56:0.41: 1.33:1.000:0.880 0/0/1/1:4:89,40:0.38: 0.79:1.000:0.527 0/1/1/1:4:23,56:0.77:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,62:0.65: 0.06:1.000:0.816 0/0/1/1:4:61,65:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,60:0.53: 0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,52:0.58:-0.16:1.000:0.914 0/0/1/1:4:34,48:0.60:-0.39:1.000:0.783 0/0/1/1/1/1:6:38,60:0.64: 0.01:1.000:0.876 0/0/0/1:4:73,6:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,37:0.60:-0.86:1.000:0.756 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,52:0.56:-0.11:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,43:0.70:-0.79:1.000:0.985 0/0/1/1:4:46,58:0.56: 0.16:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,84:0.70: 0.79:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,46:1.00:-1.29:0.989:1.000 0/1/1/1:4:36,73:0.73: 0.29:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,39:0.46:-0.26:1.000:0.987 0/0/1/1:4:46,58:0.56: 0.16:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,8:0.27:-0.86:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,127:0.79: 1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,114:0.78: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,114:0.77: 1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,58:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,48:0.51:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,59:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,107:0.73: 1.53:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,46:0.98:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,45:0.48:-0.11:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,62:0.54: 0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:88,50:0.41: 1.01:1.000:0.850 0/0/1/1:4:50,66:0.58: 0.46:1.000:0.928 0/0/1/1:4:96,54:0.41: 1.31:1.000:0.840 0/0/1/1:4:37,49:0.58:-0.29:1.000:0.923 0/0/0/1:4:52,10:0.29:-0.89:1.000:0.992 0/1/1/1:4:44,85:0.71: 0.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:93,52:0.41: 1.18:1.000:0.835 0/0/1/1:4:59,58:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,55:0.58:-0.04:1.000:0.904 0/0/0/1:4:100,7:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,53:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,54:0.42: 1.06:1.000:0.920 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,49:0.58:-0.29:1.000:0.923 0/0/1/1:4:44,57:0.57: 0.09:1.000:0.948 0/0/1/1:4:81,42:0.40: 0.64:1.000:0.748 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,48:0.40: 1.01:1.000:0.783 0/1/1/1:4:60,100:0.66: 1.56:1.000:0.871 1/1/1/1:4:1,71:0.99:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,57:0.37: 2.23:1.000:0.515 0/0/1/1:4:63,54:0.47: 0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,70:0.52: 0.86:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,17:0.31:-0.34:1.000:0.969 0/0/1/1:4:38,48:0.56:-0.29:1.000:0.967 0/0/0/1:4:37,11:0.33:-1.24:1.000:0.926 -chr1.1 5027893 chr1.1_005027893 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:20,9:0.32: 0.21:1.000:0.964 0/0/1/1:4:6,11:0.60:-1.19:1.000:0.802 0/0/1/1:4:11,8:0.41:-0.96:1.000:0.887 0/0/0/0:4:24,2:0.08:-0.14:1.000:0.986 0/0/0/1:4:27,7:0.22: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.43:-1.07:1.000:0.958 0/0/0/1:4:13,6:0.32:-0.96:1.000:0.953 0/0/1/1:4:17,18:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,11:0.48:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,5:0.41:-1.78:1.000:0.865 0/0/1/1:4:14,10:0.41:-0.37:1.000:0.865 0/1/1/1:4:2,15:0.78:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.28:-1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,14:0.53:-0.26:1.000:0.991 0/1/1/1:4:9,20:0.63: 0.21:1.000:0.578 0/0/1/1:4:9,11:0.52:-0.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:21,6:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.26:1.000:0.943 0/0/0/1:4:28,12:0.31: 1.50:1.000:0.979 0/0/1/1:4:11,13:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:10,6:0.37:-1.31:1.000:0.524 0/0/0/0:4:14,1:0.07:-1.43:1.000:0.998 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,7:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,2:0.48:-2.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,9:0.17: 3.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,11:0.55:-0.96:1.000:0.983 0/0/1/1:4:12,12:0.48:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,7:0.20: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.28: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:30,9:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.46:-0.72:1.000:0.989 0/0/0/1:4:16,3:0.17:-0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,9:0.40:-0.61:1.000:0.819 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:23,6:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.18: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-0.84:1.000:0.747 0/0/1/1:4:16,15:0.47: 0.45:1.000:0.992 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,10:0.28: 1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,16:0.35: 2.20:1.000:0.804 0/0/1/1:4:25,19:0.42: 1.97:1.000:0.928 0/0/0/1:4:31,8:0.22: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,13:0.40: 0.56:1.000:0.798 0/0/1/1:4:23,22:0.47: 2.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:9,25:0.67: 0.80:1.000:0.902 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.68:-1.31:1.000:0.945 0/0/0/1:4:20,7:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,6:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,17:0.72:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,16:0.59:-0.26:1.000:0.842 0/0/0/1:4:33,12:0.28: 2.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,6:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,24:0.52: 1.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,4:0.14: 0.45:1.000:0.950 0/0/0/0/0/1:6:24,4:0.15: 0.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:23,7:0.25: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,3:0.11: 0.10:1.000:0.574 0/0/0/1:4:35,9:0.22: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.38: 0.80:1.000:0.563 0/0/0/1:4:40,9:0.19: 2.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.36:-0.61:1.000:0.655 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,5:0.18: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,9:0.30: 0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:10,12:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,16:0.41: 1.27:1.000:0.887 0/0/0/1:4:22,4:0.16:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,23:0.53: 1.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:14,3:0.19:-1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,10:0.34: 0.33:1.000:0.894 0/0/1/1:4:12,15:0.53:-0.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:25,11:0.31: 1.03:1.000:0.972 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.49:1.000:0.989 0/1/1/1:4:9,22:0.65: 0.45:1.000:0.758 0/0/0/1:4:24,4:0.15: 0.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:14,16:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,11:0.27: 1.73:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.42:-1.54:1.000:0.917 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,5:0.21:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,7:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,4:0.18:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,7:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.41:-0.96:1.000:0.887 0/0/0/0:4:17,1:0.06:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,2:0.09:-0.37:1.000:0.961 0/0/0/1:4:33,11:0.26: 1.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,11:0.52:-0.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:25,6:0.20: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,12:0.54:-0.72:1.000:0.987 0/0/0/1:4:26,7:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,12:0.47:-0.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,15:0.47: 0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:15,13:0.45: 0.10:1.000:0.982 0/0/1/1:4:14,15:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,7:0.19: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,18:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,16:0.38: 1.73:1.000:0.547 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,11:0.39: 0.10:1.000:0.679 0/0/1/1:4:13,9:0.40:-0.61:1.000:0.819 0/0/1/1:4:21,19:0.46: 1.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:15,8:0.35:-0.49:1.000:0.804 0/0/1/1:4:11,13:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,33:0.64: 2.32:1.000:0.696 0/0/0/1:4:28,9:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,5:0.15: 1.03:1.000:0.982 0/0/1:3:3,2:0.40:-2.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,13:0.47:-0.02:1.000:0.992 0/0/0/0:4:20,2:0.10:-0.61:1.000:0.880 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:21,2:0.09:-0.49:1.000:0.931 0/0/1/1:4:14,14:0.48: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,10:0.27: 1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.49:1.000:0.989 0/0/1/1:4:7,12:0.59:-0.96:1.000:0.881 0/0/0/1:4:22,8:0.28: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:14,8:0.36:-0.61:1.000:0.655 0/0/1/1/1/1:6:10,17:0.59:-0.02:1.000:0.525 0/0/0/1:4:17,7:0.30:-0.37:1.000:0.986 0/0/1/1:4:15,11:0.42:-0.14:1.000:0.896 0/1/1/1:4:4,13:0.69:-1.19:1.000:0.971 0/0/0/1:4:26,7:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,20:0.63: 0.21:1.000:0.578 0/0/1/1:4:12,10:0.44:-0.61:1.000:0.973 0/0/0/1:4:18,4:0.19:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.56:-0.61:1.000:0.973 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.49:1.000:0.989 0/0/0/1:4:23,3:0.12:-0.14:1.000:0.794 0/0/1/1:4:18,11:0.38: 0.21:1.000:0.527 0/0/0/1/1/1:6:13,14:0.50:-0.02:0.989:0.889 0/0/0/1:4:27,10:0.28: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,12:0.41: 0.21:1.000:0.849 0/0/0/1:4:21,7:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,15:0.53:-0.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:15,9:0.37:-0.37:1.000:0.524 0/1/1/1:4:6,13:0.63:-0.96:1.000:0.523 0/0/0/1:4:22,8:0.28: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,9:0.30: 0.45:1.000:0.987 0/0/0/1:4:13,7:0.35:-0.84:1.000:0.787 0/0/1/1:4:17,14:0.44: 0.45:1.000:0.969 0/0/0/1:4:22,3:0.13:-0.26:1.000:0.871 0/0/1/1:4:1,2:0.61:-2.83:1.000:0.649 0/0/0/1:4:10,4:0.29:-1.54:1.000:0.990 0/0/1/1:4:13,12:0.47:-0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.26:1.000:0.943 0/1/1/1:4:8,25:0.68: 0.68:1.000:0.960 0/0/1/1:4:15,14:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.26:1.000:0.943 0/0/0/1:4:18,10:0.36: 0.10:1.000:0.722 0/0/0/1:4:23,9:0.29: 0.56:1.000:0.992 0/0/1/1:4:8,13:0.58:-0.72:1.000:0.924 0/0/0/1:4:17,7:0.30:-0.37:1.000:0.986 0/0/0/1:4:23,3:0.12:-0.14:1.000:0.794 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.54: 0.10:1.000:0.987 0/0/1/1:4:10,12:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:17,7:0.30:-0.37:1.000:0.986 0/0/0/1:4:19,8:0.30:-0.02:1.000:0.983 0/0/0/1:4:17,4:0.20:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.51:-0.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,9:0.36:-0.26:1.000:0.694 0/0/1/1:4:10,11:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:19,2:0.10:-0.72:1.000:0.794 0/0/1/1:4:8,14:0.59:-0.61:1.000:0.860 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,18:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,14:0.37: 1.27:1.000:0.601 0/0/0/1:4:25,4:0.15: 0.21:1.000:0.981 0/0/0/1:4:14,5:0.27:-0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,12:0.43:-0.02:1.000:0.958 0/0/1/1:4:13,9:0.40:-0.61:1.000:0.819 0/0/1/1:4:9,12:0.54:-0.72:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,10:0.53:-1.07:1.000:0.993 -chr1.1 5278309 chr1.1_005278309 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:102,42:0.29: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:20,59:0.73:-1.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,80:0.61:-0.33:1.000:0.716 0/0/0/1:4:76,45:0.36:-0.53:1.000:0.662 0/0/1/1:4:57,83:0.58: 0.02:1.000:0.932 0/0/0/1:4:96,55:0.36: 0.34:1.000:0.743 0/0/1/1:4:33,55:0.61:-1.50:1.000:0.716 0/0/0/1:4:90,45:0.33:-0.13:1.000:0.935 0/0/1/1:4:52,71:0.56:-0.48:1.000:0.968 0/1/1/1:4:20,43:0.67:-2.23:1.000:0.905 0/0/0/1:4:95,32:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,64:0.67:-1.35:1.000:0.929 0/0/1/1:4:59,54:0.46:-0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:71,71:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,34:0.29:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:58,71:0.53:-0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:110,54:0.32: 0.72:1.000:0.947 0/0/0/1:4:103,61:0.36: 0.72:1.000:0.661 0/0/0/1:4:152,47:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,75:0.32: 2.56:1.000:0.944 0/0/0/1:4:53,17:0.24:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,41:0.30:-0.13:1.000:0.986 0/0/0/1:4:143,59:0.29: 1.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,70:0.46: 0.19:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,55:0.98:-2.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,28:0.14: 1.62:1.000:0.971 0/0/0/1:4:82,42:0.33:-0.45:1.000:0.916 0/0/0/1:4:88,31:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,66:0.32: 1.92:1.000:0.964 0/0/1/1:4:70,79:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:127,40:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,36:0.33:-0.94:1.000:0.925 0/0/0/1:4:36,10:0.22:-2.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,78:0.75:-1.09:1.000:0.999 0/1/1:3:18,34:0.64:-2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,54:0.42:-0.42:1.000:0.908 0/0/1/1:4:82,58:0.40: 0.02:1.000:0.807 0/0/1/1:4:65,66:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,75:0.43: 0.84:1.000:0.952 0/0/1/1:4:62,84:0.56: 0.19:1.000:0.971 0/0/1/1:4:57,66:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:90,47:0.34:-0.07:1.000:0.896 0/0/0/1:4:115,67:0.36: 1.24:1.000:0.703 0/0/1/1:4:64,73:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,85:0.54: 0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:101,60:0.36: 0.63:1.000:0.653 0/1/1/1:4:51,95:0.63: 0.19:1.000:0.614 0/1/1/1:4:18,35:0.64:-2.52:1.000:0.731 0/0/1/1:4:56,88:0.59: 0.14:1.000:0.840 0/0/0/1:4:108,41:0.27: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,83:0.61:-0.21:1.000:0.673 0/0/1/1:4:59,87:0.58: 0.19:1.000:0.921 0/1/1/1:4:39,79:0.65:-0.62:1.000:0.819 0/0/0/1:4:121,60:0.32: 1.22:1.000:0.941 0/0/1/1:4:47,78:0.61:-0.42:1.000:0.726 0/0/0/1:4:109,47:0.30: 0.49:1.000:0.988 0/0/0/1:4:129,27:0.17: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,72:0.34: 1.94:1.000:0.861 0/0/1/1:4:52,74:0.57:-0.39:1.000:0.948 0/0/0/1/1/1:6:59,59:0.48:-0.62:1.000:0.871 0/0/1/1:4:63,78:0.53: 0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:40,63:0.59:-1.06:1.000:0.836 0/0/1/1:4:80,99:0.53: 1.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:77,105:0.56: 1.24:1.000:0.969 0/0/0/1:4:118,54:0.31: 0.95:1.000:0.976 0/0/1/1:4:83,56:0.39:-0.01:1.000:0.705 0/0/1/1:4:58,69:0.52:-0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:170,29:0.14: 1.74:1.000:0.977 0/0/0/1:4:101,57:0.35: 0.54:1.000:0.775 0/1/1/1:4:28,68:0.69:-1.26:1.000:0.977 0/0/1/1:4:82,119:0.57: 1.80:1.000:0.934 0/0/1/1:4:56,55:0.48:-0.83:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,77:0.41: 1.24:1.000:0.865 0/0/1/1:4:53,72:0.56:-0.42:1.000:0.970 0/0/1/1:4:75,54:0.41:-0.30:1.000:0.838 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,76:0.40: 1.30:1.000:0.797 0/0/1/1:4:63,107:0.61: 0.89:1.000:0.665 0/0/1/1:4:81,54:0.39:-0.13:1.000:0.675 0/0/1/1:4:66,87:0.55: 0.40:1.000:0.979 0/0/1/1:4:44,57:0.55:-1.12:1.000:0.983 1/1/1/1:4:1,112:0.99:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,83:0.54: 0.28:1.000:0.988 0/0/0/1:4:98,45:0.31: 0.11:1.000:0.975 0/0/0/1:4:138,38:0.21: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,88:0.59: 0.19:1.000:0.891 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,95:0.65: 0.08:1.000:0.815 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,66:0.59:-0.91:1.000:0.840 0/0/1/1:4:58,67:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,85:0.60:-0.07:1.000:0.762 0/0/0/1:4:139,59:0.29: 1.71:1.000:0.990 0/1/1/1:4:28,67:0.69:-1.29:1.000:0.973 0/0/0/1:4:133,63:0.32: 1.65:1.000:0.965 0/0/1/1:4:66,75:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,73:0.55:-0.33:1.000:0.978 0/1/1/1:4:35,73:0.66:-0.91:1.000:0.867 0/0/0/1:4:178,30:0.14: 2.00:1.000:0.973 0/1/1/1:4:43,94:0.67:-0.07:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,73:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,61:0.36: 0.75:1.000:0.686 0/0/1/1:4:65,96:0.58: 0.63:1.000:0.920 0/0/0/1:4:108,51:0.31: 0.57:1.000:0.966 0/0/0/1:4:112,57:0.33: 0.87:1.000:0.921 0/0/0/1:4:90,50:0.35: 0.02:1.000:0.806 0/0/0/1:4:103,32:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,28:0.11: 3.32:1.000:0.569 0/1/1/1:4:24,73:0.74:-1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,42:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,65:0.34: 1.45:1.000:0.892 0/0/1/1:4:69,105:0.59: 1.01:1.000:0.887 0/0/0/1:4:101,62:0.37: 0.69:1.000:0.561 0/0/1:3:83,18:0.18:-1.12:1.000:0.982 0/0/0/1:4:131,57:0.30: 1.42:1.000:0.987 0/0/0/1:4:90,56:0.37: 0.19:1.000:0.521 0/0/1/1:4:63,68:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,51:0.29: 0.89:1.000:0.989 0/0/1/1:4:60,85:0.57: 0.17:1.000:0.951 0/0/1/1:4:50,74:0.58:-0.45:1.000:0.918 0/0/0/1:4:105,48:0.31: 0.40:1.000:0.977 0/0/1/1:4:68,107:0.59: 1.04:1.000:0.838 0/0/1/1:4:83,56:0.39:-0.01:1.000:0.705 0/0/1/1:4:66,76:0.52: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,61:0.36: 0.81:1.000:0.733 0/0/0/1/1/1:6:123,94:0.42: 2.27:1.000:0.516 0/0/1/1:4:60,68:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,77:0.56:-0.15:1.000:0.972 0/0/0/1:4:64,35:0.35:-1.18:1.000:0.834 0/0/0/1:4:90,51:0.35: 0.05:1.000:0.767 0/0/0/1:4:86,52:0.37:-0.04:1.000:0.604 0/0/1/1:4:38,41:0.50:-1.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,64:0.39: 0.63:1.000:0.648 0/0/0/1:4:86,34:0.28:-0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,45:0.31: 0.05:1.000:0.969 0/0/0/1:4:165,25:0.13: 1.48:1.000:0.903 0/0/1/1:4:82,56:0.39:-0.04:1.000:0.734 0/0/1/1/1/1:6:47,76:0.60:-0.48:0.989:0.649 0/0/0/1:4:101,61:0.37: 0.66:1.000:0.607 0/0/1/1:4:81,94:0.52: 1.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,79:0.55: 0.02:1.000:0.983 0/0/0/1:4:100,51:0.33: 0.34:1.000:0.920 0/0/1/1:4:49,75:0.59:-0.45:1.000:0.880 0/1/1/1:4:52,97:0.63: 0.28:1.000:0.619 0/0/0/1:4:158,42:0.21: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,44:0.27: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:120,48:0.28: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,79:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,43:0.32:-0.18:1.000:0.961 0/0/1/1:4:75,85:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,54:0.34: 0.40:1.000:0.838 0/0/1/1:4:57,44:0.42:-1.12:1.000:0.921 0/0/1/1:4:35,53:0.58:-1.50:1.000:0.893 0/0/0/1:4:84,50:0.36:-0.15:1.000:0.648 0/0/1/1:4:49,77:0.59:-0.39:1.000:0.840 0/0/0/1:4:111,65:0.36: 1.07:1.000:0.690 0/0/0/1:4:101,49:0.32: 0.31:1.000:0.954 0/0/0/1:4:85,36:0.29:-0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:60,86:0.57: 0.19:1.000:0.943 0/0/1/1:4:64,71:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,34:0.28:-0.56:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,50:0.29: 0.81:1.000:0.989 0/0/1/1:4:51,34:0.39:-1.58:1.000:0.675 0/1/1/1:4:46,84:0.63:-0.27:1.000:0.554 0/0/1/1:4:55,56:0.49:-0.83:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,68:0.57:-0.71:1.000:0.937 0/0/0/1:4:87,46:0.34:-0.18:1.000:0.882 0/0/1/1:4:52,59:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,57:0.56:-1.20:1.000:0.961 0/0/0/1:4:97,48:0.32: 0.17:1.000:0.942 0/0/1/1:4:67,62:0.46:-0.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:56,63:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,64:0.58:-0.94:1.000:0.912 0/0/0/1:4:129,43:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,80:0.53: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:66,62:0.47:-0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,64:0.54:-0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:62,76:0.53:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:96,61:0.38: 0.52:1.000:0.541 1/1/1/1:4:1,111:0.99:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,37:0.31:-0.62:1.000:0.977 0/1/1/1:4:36,74:0.66:-0.85:1.000:0.844 -chr1.1 5509457 chr1.1_005509457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:136,56:0.29: 0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,90:0.55:-0.41:1.000:0.983 0/1/1/1:4:39,166:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,111:0.52: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,118:0.54: 0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:121,128:0.48: 1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,74:0.61:-1.14:1.000:0.653 0/0/0/1:4:128,58:0.31: 0.18:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,219:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,16:0.66:-2.81:1.000:0.875 0/0/0/0:4:18,2:0.10:-2.86:1.000:0.767 0/1/1/1:4:39,162:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,103:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,198:0.82: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,113:0.48: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,197:0.71: 1.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:180,57:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,58:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,135:0.49: 1.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,215:0.78: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.27:-2.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,47:0.28:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,113:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,93:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,4:0.53:-3.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:128,111:0.44: 1.15:1.000:0.961 0/0/0/1:4:187,63:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,62:0.30: 0.51:1.000:0.986 0/1/1/1:4:62,194:0.72: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,189:0.77: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,87:0.37: 0.88:1.000:0.542 0/1/1/1:4:54,165:0.72: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,6:0.51:-3.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-2.77:1.000:1.000 1/1/1:3:0,6:1.00:-3.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,123:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,51:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,206:0.78: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,119:0.52: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,139:0.51: 1.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,128:0.79:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,52:0.29: 0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:95,107:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,85:0.47:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:84,86:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,100:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,111:0.48: 0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,66:0.64:-1.43:1.000:0.668 0/0/1/1:4:82,106:0.53: 0.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,129:0.73:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,69:0.53:-1.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:52,195:0.76: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,45:0.27:-0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,119:0.61: 0.16:1.000:0.721 0/0/1/1:4:90,120:0.53: 0.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:127,57:0.30: 0.14:1.000:0.981 0/0/1/1:4:69,99:0.55:-0.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:58,104:0.61:-0.26:1.000:0.734 0/1/1/1:4:38,140:0.75: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:54,71:0.53:-0.94:1.000:0.837 0/0/1/1:4:68,103:0.57:-0.10:1.000:0.957 0/1/1/1:4:30,139:0.80:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,103:0.55: 0.00:1.000:0.982 0/1/1/1:4:34,112:0.73:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/0:4:196,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,103:0.54: 0.03:1.000:0.987 0/1/1/1:4:30,108:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,51:0.31:-0.26:1.000:0.976 0/1/1/1:4:49,134:0.70: 0.12:1.000:0.984 0/1/1/1:4:40,91:0.66:-0.83:1.000:0.868 0/1/1/1:4:32,135:0.78:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,86:0.64:-0.88:1.000:0.648 0/0/0/1:4:111,47:0.29:-0.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:139,54:0.28: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,102:0.56:-0.08:1.000:0.973 0/1/1/1:4:45,118:0.69:-0.24:1.000:0.973 0/1/1/1:4:40,127:0.73:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,136:0.85:-0.35:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,184:0.80: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,103:0.69:-0.61:1.000:0.967 0/1/1/1:4:26,138:0.82:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,105:0.54: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,81:0.46:-0.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:67,87:0.53:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:121,49:0.29:-0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:59,63:0.48:-0.99:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,102:0.80:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,72:0.57:-1.07:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,193:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,145:0.83:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,89:0.54:-0.39:1.000:0.989 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,40:0.30:-0.79:1.000:0.988 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,103:0.53: 0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:74,27:0.27:-1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,95:0.61:-0.52:1.000:0.735 0/0/1/1:4:68,74:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,94:0.48: 0.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,99:0.71:-0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:95,53:0.35:-0.52:1.000:0.829 0/0/1/1:4:53,49:0.45:-1.36:1.000:0.980 0/1/1/1:4:28,139:0.81:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,67:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,90:0.54:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,76:0.44:-0.28:1.000:0.972 0/0/1/1:4:110,93:0.43: 0.49:1.000:0.950 0/0/1/1:4:97,131:0.54: 0.95:1.000:0.989 0/0/0/1:4:138,66:0.32: 0.51:1.000:0.963 0/1/1/1:4:28,127:0.79:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,158:0.51: 2.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,69:0.48:-0.77:1.000:0.995 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1:3:62,39:0.37:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,48:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:82,33:0.28:-1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,60:0.52:-1.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:84,54:0.37:-0.70:1.000:0.509 0/1/1/1:4:27,126:0.80:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,136:0.69: 0.22:1.000:0.972 0/0/0/1:4:81,42:0.33:-0.97:1.000:0.915 0/1/1/1:4:25,167:0.85: 0.29:1.000:0.988 0/0/0/1:4:171,47:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,71:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,23:0.17:-0.70:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:76,135:0.60: 0.64:1.000:0.674 0/0/0/1:4:91,37:0.29:-0.88:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,87:0.72:-1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,66:0.50:-0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,41:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,171:0.74: 0.84:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,85:0.75:-1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:118,45:0.28:-0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,142:0.73: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,162:0.53: 1.99:1.000:0.992 0/0/0/1:4:137,55:0.28: 0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,75:0.51:-0.72:1.000:0.996 1/1/1/1/1/1:6:0,129:1.00:-0.86:0.989:1.000 0/0/1/1:4:64,86:0.54:-0.48:1.000:0.990 0/1/1/1:4:38,131:0.74:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,66:0.51:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,105:0.51: 0.29:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,142:0.51: 1.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,68:0.30: 0.80:1.000:0.982 0/0/1/1:4:84,122:0.56: 0.55:1.000:0.974 0/0/1/1:4:80,97:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,190:0.69: 1.61:1.000:0.966 0/0/0/1:4:138,57:0.29: 0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:114,158:0.54: 1.75:1.000:0.985 0/0/1/1:4:104,108:0.48: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:8,8:0.47:-2.93:1.000:0.991 0/1/1/1:4:26,120:0.80:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,150:0.54: 1.53:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,240:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,143:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,120:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,39:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,110:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,121:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,94:0.49: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,159:0.71: 0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:92,119:0.53: 0.64:1.000:0.993 0/0/0/1:4:177,55:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,186:0.77: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,105:0.57:-0.08:1.000:0.936 0/0/1/1:4:73,87:0.51:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,92:0.47: 0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:119,64:0.34: 0.12:1.000:0.878 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,110:0.57: 0.07:1.000:0.934 0/0/0/1:4:105,41:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,53:0.31:-0.15:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,166:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,85:0.44: 0.12:1.000:0.961 0/0/1/1:4:138,137:0.47: 1.81:1.000:0.990 0/1/1/1:4:53,191:0.75: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,73:0.32: 0.86:1.000:0.955 0/1/1/1:4:57,150:0.69: 0.56:1.000:0.974 0/0/1/1:4:121,133:0.49: 1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,148:0.53: 1.57:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,188:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,96:0.54:-0.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:80,112:0.55: 0.29:1.000:0.983 -chr1.1 5850336 chr1.1_005850336 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:284,81:.: 2.32:1.000:. ./.:4:138,5:.:-0.83:1.000:. ./.:4:151,72:.: 0.31:1.000:. ./.:4:227,71:.: 1.37:1.000:. ./.:4:201,82:.: 1.16:1.000:. ./.:4:246,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:113,5:.:-1.18:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,70:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,4:.:-2.55:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:63,79:.:-0.84:1.000:. ./.:4:158,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:171,6:.:-0.35:1.000:. ./.:4:122,58:.:-0.30:1.000:. ./.:4:80,106:.:-0.22:1.000:. ./.:4:236,82:.: 1.65:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:284,2:.: 1.20:1.000:. ./.:4:194,96:.: 1.26:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:262,76:.: 1.94:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:228,83:.: 1.55:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:229,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:178,95:.: 1.02:1.000:. ./.:4:146,85:.: 0.42:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:124,78:.: 0.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:15,16:.:-2.42:1.000:. ./.:3:6,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:217,73:.: 1.26:1.000:. ./.:4:65,112:.:-0.35:1.000:. ./.:4:155,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:252,88:.: 1.97:1.000:. ./.:4:138,64:.: 0.01:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:158,78:.: 0.49:1.000:. ./.:4:107,67:.:-0.39:1.000:. ./.:4:153,9:.:-0.56:1.000:. ./.:4:201,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:173,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,34:.:-1.40:1.000:. ./.:4:164,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:116,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:109,51:.:-0.59:1.000:. ./.:4:134,81:.: 0.19:1.000:. ./.:4:142,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:131,5:.:-0.93:1.000:. ./.:4:146,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:195,65:.: 0.83:1.000:. ./.:4:190,6:.:-0.08:1.000:. ./.:4:133,61:.:-0.11:1.000:. ./.:6:135,40:.:-0.38:1.000:. ./.:4:132,81:.: 0.16:1.000:. ./.:4:141,63:.: 0.04:1.000:. ./.:4:220,3:.: 0.31:1.000:. ./.:4:126,13:.:-0.89:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:212,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:100,58:.:-0.62:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:134,75:.: 0.11:1.000:. ./.:4:73,63:.:-0.93:1.000:. ./.:4:158,9:.:-0.49:1.000:. ./.:4:101,55:.:-0.65:1.000:. ./.:4:237,95:.: 1.85:1.000:. ./.:4:276,3:.: 1.10:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:115,5:.:-1.16:1.000:. ./.:4:116,64:.:-0.30:1.000:. ./.:4:63,82:.:-0.80:1.000:. ./.:4:127,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:147,96:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,72:.:-1.00:1.000:. ./.:4:70,85:.:-0.66:1.000:. ./.:4:227,94:.: 1.70:1.000:. ./.:4:209,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:178,81:.: 0.82:1.000:. ./.:4:252,4:.: 0.77:1.000:. ./.:4:106,63:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,65:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,60:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,62:.:-1.07:1.000:. ./.:4:102,66:.:-0.48:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:167,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:162,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:159,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:128,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:205,7:.: 0.15:1.000:. ./.:4:153,82:.: 0.48:1.000:. ./.:4:53,55:.:-1.33:1.000:. ./.:4:211,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:151,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:127,81:.: 0.09:1.000:. ./.:4:166,68:.: 0.46:1.000:. ./.:4:206,84:.: 1.26:1.000:. ./.:4:166,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:228,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:258,4:.: 0.86:1.000:. ./.:4:233,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:127,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:187,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.34:1.000:. ./.:3:105,2:.:-1.34:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:151,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:110,50:.:-0.59:1.000:. ./.:4:59,91:.:-0.73:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:137,3:.:-0.87:1.000:. ./.:4:212,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:110,57:.:-0.49:1.000:. ./.:4:208,2:.: 0.12:1.000:. ./.:6:213,64:.: 1.07:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:107,4:.:-1.28:1.000:. ./.:4:94,7:.:-1.43:1.000:. ./.:4:142,48:.:-0.16:1.000:. ./.:4:143,3:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:180,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:140,3:.:-0.83:1.000:. ./.:4:233,111:.: 2.02:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:116,53:.:-0.46:1.000:. ./.:6:69,52:.:-1.14:0.989:. ./.:4:150,3:.:-0.69:1.000:. ./.:4:42,86:.:-1.04:1.000:. ./.:4:140,59:.:-0.04:1.000:. ./.:4:229,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:52,46:.:-1.47:1.000:. ./.:4:194,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:241,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:196,69:.: 0.90:1.000:. ./.:4:184,80:.: 0.89:1.000:. ./.:4:179,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:224,7:.: 0.42:1.000:. ./.:4:221,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:80,49:.:-1.03:1.000:. ./.:4:130,5:.:-0.94:1.000:. ./.:4:94,92:.:-0.22:1.000:. ./.:4:204,6:.: 0.12:1.000:. ./.:4:257,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:275,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:178,83:.: 0.84:1.000:. ./.:4:237,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:201,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,87:.:-0.74:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:253,87:.: 1.97:1.000:. ./.:4:162,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:162,95:.: 0.79:1.000:. ./.:4:170,95:.: 0.90:1.000:. ./.:4:152,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:69,79:.:-0.76:1.000:. ./.:4:144,68:.: 0.15:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:219,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:60,6:.:-1.92:1.000:. ./.:4:164,76:.: 0.55:1.000:. ./.:4:263,4:.: 0.93:1.000:. ./.:4:91,110:.:-0.01:1.000:. ./.:4:255,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:158,106:.: 0.89:1.000:. ./.:4:158,118:.: 1.06:1.000:. ./.:4:168,91:.: 0.82:1.000:. ./.:4:103,96:.:-0.04:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:178,82:.: 0.83:1.000:. -chr1.1 6072575 chr1.1_006072575 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:1,141:0.82:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,45:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,115:0.52: 0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:1,184:0.87:-0.04:1.000:0.942 0/0/1/1:4:114,141:0.52: 1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,127:0.52: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:117,35:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,116:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:161,88:0.36: 0.91:1.000:0.703 0/0/0/1:4:65,17:0.22:-1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,30:0.74:-2.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,120:0.39: 1.84:1.000:0.663 0/0/0/1:4:168,59:0.27: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:185,61:0.26: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,141:0.58: 0.35:1.000:0.898 0/0/0/1:4:208,103:0.34: 1.82:1.000:0.880 1/1/1/1:4:0,193:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,114:0.53: 0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:128,151:0.52: 1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,197:0.58: 1.69:1.000:0.931 0/1/1/1:4:15,48:0.63:-1.83:1.000:0.590 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,185:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,59:0.40:-0.58:1.000:0.795 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,216:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,110:0.52: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,89:0.46: 0.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:121,200:0.56: 1.97:1.000:0.967 0/0/1/1:4:84,122:0.54: 0.27:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,120:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:34,4:0.11:-2.20:1.000:0.538 0/0/0/1:4:81,43:0.35:-0.94:1.000:0.768 0/0/1:3:19,15:0.44:-2.26:1.000:0.983 0/0/0/1:4:104,53:0.34:-0.45:1.000:0.841 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,130:0.44: 1.57:1.000:0.968 0/0/0/1:4:169,53:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,98:0.73:-1.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,94:0.52:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,100:0.52:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,170:0.58: 1.00:1.000:0.902 0/0/1/1:4:79,51:0.39:-0.85:1.000:0.741 0/0/0/1:4:174,56:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,99:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:219,58:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,53:0.75:-1.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,78:0.74:-1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,72:0.32: 0.61:1.000:0.946 0/0/1/1:4:74,79:0.51:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,112:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,58:0.38:-0.52:1.000:0.629 0/0/0/1:4:211,123:0.37: 2.16:1.000:0.531 0/0/0/1:4:147,39:0.22:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,198:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,99:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,85:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:74,71:0.48:-0.63:1.000:0.876 0/0/1/1:4:83,98:0.52:-0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,98:0.52:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,66:0.41:-0.36:1.000:0.840 0/0/0/1:4:133,46:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,99:0.74:-1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,116:0.53: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,86:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:1,171:0.86:-0.23:1.000:0.979 0/0/1/1:4:85,154:0.57: 0.76:1.000:0.943 0/0/1/1:4:171,105:0.38: 1.31:1.000:0.616 0/0/0/1:4:231,62:0.22: 1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,77:0.54:-0.79:1.000:0.990 0/1/1/1:4:1,166:0.85:-0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:88,63:0.42:-0.54:1.000:0.904 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,38:0.32:-0.95:1.000:0.959 0/0/1/1:4:72,151:0.59: 0.52:1.000:0.874 0/0/0/1:4:183,105:0.37: 1.48:1.000:0.576 0/0/1/1:4:186,118:0.39: 1.72:1.000:0.701 0/0/1/1:4:104,110:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,79:0.37: 0.44:1.000:0.582 0/0/0/1:4:192,44:0.20: 0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,100:0.52:-0.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,46:0.31:-0.54:1.000:0.967 0/0/1/1:4:74,44:0.38:-1.02:1.000:0.526 0/0/1/1:4:65,77:0.52:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:75,32:0.31:-1.19:1.000:0.976 0/0/0/1:4:159,89:0.36: 0.89:1.000:0.643 0/0/1/1:4:72,88:0.52:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,57:0.42:-0.76:1.000:0.911 0/1/1/1:4:1,121:0.80:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,45:0.36:-0.89:1.000:0.693 0/1/1/1:4:3,136:0.74:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,59:0.28: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,44:0.36:-0.95:1.000:0.656 0/0/1/1:4:79,71:0.47:-0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,149:0.56: 0.79:1.000:0.970 0/0/1/1:4:106,117:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,39:0.28:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,58:0.37:-0.45:1.000:0.516 0/0/1/1:4:68,77:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,113:0.56:-0.05:1.000:0.973 0/1/1/1:4:1,112:0.78:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,162:0.85:-0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,91:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,99:0.47: 0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:118,190:0.56: 1.78:1.000:0.972 0/0/0/1:4:98,51:0.35:-0.57:1.000:0.806 0/0/0/1:4:198,89:0.32: 1.47:1.000:0.957 0/0/0/1:4:219,111:0.34: 2.10:1.000:0.849 0/0/1/1:4:73,95:0.53:-0.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,116:0.79:-1.04:1.000:1.000 0/0/1:3:85,75:0.47:-0.40:1.000:0.911 0/0/1/1:4:101,104:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,95:0.74:-1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,87:0.74:-1.44:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,74:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:175,105:0.38: 1.36:1.000:0.552 0/1/1/1:4:2,104:0.75:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,60:0.27: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,107:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,93:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,102:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:91,137:0.55: 0.60:1.000:0.751 0/0/0/1:4:86,33:0.29:-1.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:127,30:0.20:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,82:0.35: 0.80:1.000:0.832 0/1/1/1:4:1,127:0.81:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,110:0.40: 1.31:1.000:0.794 0/0/0/1:4:102,26:0.22:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,139:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,81:0.34: 0.86:1.000:0.890 0/0/1/1:4:122,179:0.55: 1.67:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,139:0.57: 0.45:1.000:0.952 0/0/0/0/1/1:6:165,96:0.37: 1.08:0.989:0.824 0/0/1/1:4:84,97:0.52:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,104:0.39: 1.19:1.000:0.700 0/0/1/1:4:84,93:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,98:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,74:0.43:-0.26:1.000:0.957 0/0/0/1:4:213,63:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,197:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,100:0.51: 0.08:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,152:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,110:0.51: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,102:0.54:-0.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:208,65:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,111:0.54: 0.02:1.000:0.986 0/0/1/1:4:38,45:0.52:-1.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,78:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:223,134:0.38: 2.50:1.000:0.556 0/0/0/1:4:204,95:0.33: 1.64:1.000:0.936 0/0/1/1:4:224,139:0.39: 2.59:1.000:0.645 0/0/1/1:4:74,117:0.55: 0.05:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,104:0.46: 0.51:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,64:0.48:-0.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,84:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:161,51:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,110:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,151:0.84:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,55:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,82:0.52:-0.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:107,57:0.35:-0.35:1.000:0.761 0/0/0/1:4:177,59:0.26: 0.72:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,91:0.39: 0.73:1.000:0.656 0/0/1/1:4:73,84:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,120:0.56: 0.10:1.000:0.970 0/0/1/1:4:73,54:0.42:-0.89:1.000:0.932 0/0/0/1:4:206,39:0.17: 0.85:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,100:0.75:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,133:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:215,126:0.37: 2.26:1.000:0.515 0/0/0/1:4:103,52:0.34:-0.48:1.000:0.854 0/0/1/1:4:91,109:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,123:0.52: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,194:0.58: 1.62:1.000:0.929 0/0/0/1:4:215,73:0.27: 1.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,86:0.53:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,102:0.54:-0.17:1.000:0.989 -chr1.1 6263297 chr1.1_006263297 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:49,5:0.11: 0.41:1.000:0.637 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.32: 0.85:1.000:0.958 0/0/0/1:4:65,10:0.15: 1.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:43,17:0.32: 0.70:1.000:0.963 0/0/1/1:4:38,34:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,39:0.56: 0.99:1.000:0.969 0/0/1/1:4:39,24:0.41: 0.85:1.000:0.890 0/0/0/1:4:49,15:0.27: 0.90:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,9:0.70:-1.75:1.000:0.988 0/0/0/1:4:10,4:0.32:-1.56:1.000:0.958 0/0/1/1:4:26,16:0.41:-0.18:1.000:0.890 0/0/1/1:4:22,21:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,23:0.54:-0.18:1.000:0.988 0/0/0/1:4:56,10:0.17: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,34:0.42: 2.12:1.000:0.895 0/0/0/1:4:69,17:0.23: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,36:0.54: 0.95:1.000:0.987 0/0/0/1:4:61,29:0.36: 2.17:1.000:0.741 0/0/0/1:4:61,10:0.16: 1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,2:0.13:-1.41:1.000:0.945 0/0/1/1:4:22,19:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,9:0.14: 1.49:1.000:0.950 0/0/1/1:4:25,22:0.50: 0.06:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 3.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,29:0.42: 1.49:1.000:0.893 0/0/1/1:4:22,13:0.40:-0.53:1.000:0.830 0/0/0/1:4:49,10:0.19: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,36:0.46: 1.93:1.000:0.986 0/0/1/1:4:37,30:0.48: 1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:46,12:0.24: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.46:-1.31:1.000:0.984 0/0/1:3:5,4:0.48:-1.80:1.000:0.805 0/0/1/1:4:27,31:0.53: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:63,16:0.23: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,17:0.30: 0.85:1.000:0.983 0/0/1/1:4:17,36:0.60: 0.36:1.000:0.791 0/0/0/1:4:60,24:0.32: 1.88:1.000:0.958 0/0/0/1:4:33,10:0.26:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,11:0.37:-0.63:1.000:0.609 0/0/0/1:4:49,13:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,15:0.38:-0.13:1.000:0.597 0/0/1/1:4:19,25:0.55:-0.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:12,15:0.54:-0.92:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,11:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,22:0.35: 1.19:1.000:0.816 0/0/1/1:4:21,15:0.45:-0.48:1.000:0.981 0/0/0/1:4:40,11:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,19:0.28: 1.53:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,25:0.58:-0.33:1.000:0.905 0/0/1/1:4:21,17:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,20:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,23:0.53:-0.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,13:0.21: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:15,5:0.28:-1.26:1.000:0.780 0/0/1/1:4:16,10:0.42:-0.97:1.000:0.907 0/0/0/1:4:41,19:0.35: 0.70:1.000:0.796 0/0/0/1:4:56,25:0.34: 1.73:1.000:0.859 0/0/1/1:4:23,26:0.53: 0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,14:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,14:0.46:-0.63:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,19:0.46:-0.04:1.000:0.985 0/0/0/1:4:18,5:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,11:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,12:0.41:-0.67:1.000:0.855 0/0/1/1:4:27,29:0.52: 0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,14:0.30: 0.36:1.000:0.988 0/0/0/1:4:29,14:0.36:-0.13:1.000:0.704 0/0/1/1:4:20,27:0.55: 0.06:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,30:0.57: 0.11:1.000:0.933 0/0/0/1:4:47,6:0.13: 0.36:1.000:0.908 0/0/0/1:4:24,7:0.26:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,19:0.46:-0.04:1.000:0.985 0/0/0/1:4:39,11:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,11:0.52:-1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,21:0.52:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,9:0.19: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,16:0.47:-0.43:1.000:0.991 0/0/0/1:4:62,7:0.12: 1.14:1.000:0.673 0/0/1/1:4:25,19:0.47:-0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,16:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,12:0.40:-0.63:1.000:0.765 0/0/1/1:4:9,20:0.60:-0.82:1.000:0.746 0/0/0/1:4:34,14:0.32: 0.11:1.000:0.941 0/0/0/1:4:32,8:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.54:-0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:28,17:0.41:-0.04:1.000:0.872 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.55:-0.87:1.000:0.980 0/0/1/1:4:21,32:0.56: 0.36:1.000:0.959 0/0/1/1:4:6,16:0.62:-1.17:1.000:0.537 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-0.97:1.000:0.986 0/0/0/1:4:35,6:0.17:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,16:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:4,9:0.61:-1.61:1.000:0.734 0/0/1/1:4:20,22:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,10:0.39:-0.87:1.000:0.698 0/0/0/0:4:34,2:0.06:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,8:0.20: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.46:-1.31:1.000:0.984 0/0/0/1:4:31,10:0.28:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,12:0.17: 1.73:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.52:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,39:0.56: 0.95:1.000:0.962 0/0/1/1:4:23,14:0.41:-0.43:1.000:0.876 0/0/1/1:4:18,13:0.45:-0.72:1.000:0.983 0/0/1:3:11,4:0.30:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,11:0.40:-0.77:1.000:0.792 0/0/1/1:4:16,16:0.52:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,13:0.31: 0.06:1.000:0.975 0/0/1/1:4:15,13:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,13:0.32:-0.04:1.000:0.949 0/0/0/1:4:24,12:0.37:-0.48:1.000:0.609 0/0/1/1:4:8,6:0.46:-1.56:1.000:0.989 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-0.77:1.000:0.982 0/0/1/1:4:37,33:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,6:0.18:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-1.51:1.000:0.997 0/0/0/0/0/1:6:25,7:0.25:-0.67:1.000:0.514 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,22:0.59:-0.63:1.000:0.837 0/0/0/1:4:15,4:0.24:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,3:0.11:-0.77:1.000:0.627 0/0/1/1:4:25,18:0.45:-0.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:5,11:0.60:-1.46:1.000:0.756 0/0/0/1:4:24,6:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,7:0.31:-1.02:1.000:0.969 0/0/0/1:4:60,10:0.16: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,5:0.20:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.35:-1.46:1.000:0.831 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-1.02:1.000:0.728 0/0/0/1:4:30,13:0.34:-0.13:1.000:0.897 0/0/0/1:4:23,6:0.24:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-1.02:1.000:0.728 0/0/0/1:4:22,10:0.35:-0.67:1.000:0.831 0/0/0/1:4:20,6:0.26:-0.97:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,9:0.21: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,15:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,7:0.14: 0.60:1.000:0.961 0/0/0/1:4:63,27:0.33: 2.17:1.000:0.909 0/0/1/1:4:20,12:0.41:-0.67:1.000:0.855 0/0/1/1:4:29,42:0.56: 1.24:1.000:0.969 0/0/0/1:4:51,23:0.34: 1.39:1.000:0.844 0/1/1/1:4:3,9:0.63:-1.66:1.000:0.603 0/0/0/1:4:52,21:0.32: 1.34:1.000:0.953 0/0/1/1:4:23,24:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,16:0.33: 0.36:1.000:0.899 0/0/1/1:4:28,29:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,18:0.39: 0.21:1.000:0.728 0/0/1/1:4:19,20:0.52:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,14:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,23:0.44: 0.50:1.000:0.974 0/0/1/1:4:18,21:0.53:-0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:17,32:0.59: 0.16:1.000:0.877 0/0/0/1:4:47,19:0.32: 0.99:1.000:0.952 0/0/0/0:4:66,7:0.11: 1.34:1.000:0.518 0/0/1/1:4:37,25:0.44: 0.80:1.000:0.962 0/0/0/1:4:56,11:0.19: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,20:0.51:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,25:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,20:0.46: 0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:45,17:0.31: 0.80:1.000:0.978 0/0/0/1:4:50,16:0.27: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,18:0.48:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,27:0.59:-0.23:1.000:0.862 0/0/1/1:4:10,24:0.61:-0.58:1.000:0.664 0/0/0/1:4:41,17:0.33: 0.60:1.000:0.936 0/0/1/1:4:26,34:0.55: 0.70:1.000:0.982 0/0/1/1:4:32,21:0.43: 0.36:1.000:0.947 0/0/1/1:4:26,45:0.58: 1.24:1.000:0.919 0/0/1/1:4:43,24:0.39: 1.04:1.000:0.709 0/0/1/1:4:49,26:0.38: 1.44:1.000:0.569 0/0/0/1:4:61,11:0.18: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,42:0.57: 1.14:1.000:0.954 0/0/1/1:4:27,20:0.46: 0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,15:0.40:-0.23:1.000:0.785 -chr1.1 6342913 chr1.1_006342913 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:273,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:210,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:339,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.39:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:242,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.71:1.000:. ./.:6:152,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:123,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:192,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.14:1.000:. ./.:3:80,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.11:1.000:. ./.:6:236,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:173,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:345,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:253,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:334,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.97:1.000:. -chr1.1 6491042 chr1.1_006491042 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:120,13:0.17: 1.72:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,8:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-1.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,5:0.15:-0.24:1.000:0.987 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-1.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,5:0.29:-1.39:1.000:0.989 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,9:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,5:0.09: 0.70:1.000:0.903 0/0/0/1:4:63,10:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,9:0.12: 1.80:1.000:0.725 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,13:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 3.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.27:-1.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,11:0.15: 1.58:1.000:0.991 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,6:0.06: 2.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,10:0.20: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,10:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,10:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0:3:8,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,10:0.18: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,8:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,9:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,4:0.18:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,7:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,8:0.15: 0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:35,12:0.28:-0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:0,9:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,18:0.30:-0.27:1.000:0.987 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,10:0.27:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,17:0.29:-0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:0,10:0.50:-1.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,12:0.17: 1.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:47,4:0.14:-0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:25,6:0.27:-1.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,26:0.34:-0.27:1.000:0.884 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,11:0.26:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,8:0.16: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,15:0.28:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,6:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,7:0.33:-1.39:1.000:0.925 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,15:0.44:-1.34:1.000:0.965 0/0/0/0:4:96,1:0.02: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,8:0.26:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,1:0.02: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,8:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,11:0.36:-1.29:1.000:0.670 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,18:0.30:-0.30:1.000:0.985 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,17:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,14:0.38:-1.21:1.000:0.555 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,22:0.29: 0.30:1.000:0.992 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,10:0.37:-1.37:1.000:0.552 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,9:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,9:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 2.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,13:0.17: 1.85:1.000:0.998 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,13:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,13:0.29:-0.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:51,9:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/1:3:25,8:0.28:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,4:0.13:-0.32:1.000:0.859 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.27:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,2:0.05:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,5:0.19:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,19:0.30:-0.16:1.000:0.988 0/0/0/0/0/0:6:107,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.29:-0.97:1.000:0.992 0/0/0/1:4:60,7:0.19:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,6:0.11: 0.72:1.000:0.541 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,11:0.16: 1.53:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,7:0.14: 0.54:1.000:0.969 0/0/0/1:4:59,13:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,13:0.29:-0.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:29,6:0.26:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,7:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,14:0.17: 2.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,9:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,8:0.13: 1.05:1.000:0.930 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,9:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,5:0.50:-1.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,10:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,7:0.37:-1.50:1.000:0.617 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,13:0.27:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:82,1:0.02: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,11:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,10:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,9:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:83,3:0.06: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,8:0.23:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.77:1.000:0.997 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,3:0.11:-0.51:1.000:0.601 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,7:0.35:-1.48:1.000:0.747 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,13:0.26: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,10:0.39:-1.42:1.000:0.703 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,8:0.18: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,14:0.18: 1.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 -chr1.1 6660525 chr1.1_006660525 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:139,130:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:201,41:0.17:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,59:0.27:-0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:191,61:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,147:0.46: 1.01:1.000:0.988 0/0/0/1:4:251,67:0.21: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,103:0.53:-1.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:125,131:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:274,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,35:0.45:-3.11:1.000:0.976 0/1/1/1:4:26,52:0.65:-3.11:1.000:0.831 0/0/0/0:4:277,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,110:0.51:-0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:239,81:0.26: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,61:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,76:0.24: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,151:0.50: 0.70:0.997:0.997 0/0/0/1:4:215,66:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,168:0.46: 1.75:1.000:0.990 0/0/0/0:4:320,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,15:0.21:-3.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,129:0.49: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,133:0.47: 0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:135,131:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,27:0.44:-3.40:1.000:0.968 0/0/0/1:4:233,80:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,132:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,124:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:219,68:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,72:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,173:0.57: 0.71:1.000:0.949 0/0/0/0:4:250,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,25:0.40:-3.38:1.000:0.808 0/0/0/0:4:93,2:0.02:-2.81:1.000:1.000 0/0/1:3:22,4:0.16:-4.00:1.000:0.821 0/0/1/1:4:142,152:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,154:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,70:0.28:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,118:0.46:-0.03:1.000:0.985 0/0/1/1:4:146,151:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,147:0.52: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,129:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,68:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,109:0.46:-0.39:1.000:0.987 0/0/1/1:4:129,160:0.55: 0.52:1.000:0.982 0/0/0/1:4:210,74:0.26: 0.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:227,99:0.31: 1.16:1.000:0.980 0/1/1/1:4:50,154:0.74:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,129:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/0:4:277,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,90:0.47:-1.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:216,114:0.35: 1.23:1.000:0.828 0/0/1/1:4:134,130:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,83:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,89:0.48:-1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,134:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,61:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,72:0.23: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,66:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:126,101:0.44:-0.54:1.000:0.696 0/0/1/1:4:135,142:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:168,54:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,145:0.46: 0.89:1.000:0.990 0/0/0/1:4:203,59:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,216:0.74: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:233,73:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,52:0.28:-1.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:148,110:0.42:-0.01:1.000:0.931 0/0/1/1:4:129,129:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:233,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,82:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,122:0.56:-0.75:1.000:0.967 0/0/0/1:4:240,71:0.23: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,191:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,133:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,183:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:261,1:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,62:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:275,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,85:0.27: 1.04:1.000:0.998 0/0/0/0:4:224,1:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,67:0.28:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:145,188:0.56: 1.28:1.000:0.971 0/0/0/1:4:158,47:0.23:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,137:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,238:0.73: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,98:0.50:-1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:177,73:0.29:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,129:0.56:-0.54:1.000:0.965 0/0/0/0:4:204,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,66:0.27:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,112:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:101,251:0.70: 1.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:74,96:0.56:-1.52:1.000:0.971 0/0/1/1:4:162,172:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,124:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,193:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,55:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,66:0.22: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,92:0.29: 1.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:152,67:0.31:-0.68:1.000:0.977 0/1/1/1:4:78,207:0.71: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:165,60:0.27:-0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:207,92:0.31: 0.70:1.000:0.975 0/0/1/1:4:122,110:0.47:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,121:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:183,53:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,73:0.26: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:214,76:0.26: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:152,149:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/0:4:279,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:284,78:0.22: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,131:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:87,213:0.70: 0.71:1.000:0.981 0/0/1:3:129,42:0.25:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,169:0.53: 1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:133,105:0.44:-0.35:1.000:0.965 0/0/1/1:4:105,113:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,161:0.51: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,57:0.26:-0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:209,70:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,115:0.43: 0.13:1.000:0.947 0/0/0/1:4:224,63:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,130:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,160:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,176:0.49: 1.66:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:298,67:0.19: 1.83:1.000:0.962 0/0/1/1:4:117,80:0.40:-1.06:1.000:0.829 0/0/0/1:4:163,59:0.27:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:190,61:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,121:0.48:-0.10:1.000:0.994 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,45:0.27:-1.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:136,133:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/0:4:246,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:275,83:0.23: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,124:0.43: 0.54:1.000:0.934 0/0/0/1:4:191,64:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:236,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,121:0.51:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,66:0.29:-0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:110,130:0.54:-0.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:180,67:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,99:0.30: 1.18:1.000:0.981 0/0/1/1:4:160,139:0.46: 0.70:1.000:0.989 0/0/1/1:4:111,103:0.48:-0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,130:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,87:0.29: 0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:107,117:0.52:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:149,145:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,107:0.51:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,23:0.22:-2.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,47:0.23:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,76:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:279,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,69:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:240,55:0.19: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,114:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,132:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,141:0.54:-0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:152,58:0.28:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,65:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,116:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:125,154:0.55: 0.35:1.000:0.984 0/0/0/1:4:189,73:0.28: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,128:0.53:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,116:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,125:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:138,115:0.45:-0.10:1.000:0.982 0/0/0/0:4:266,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,102:0.46:-0.70:1.000:0.990 0/0/0/1:4:231,68:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,193:0.70: 0.21:1.000:0.983 0/0/0/1:4:189,50:0.21:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,105:0.53:-1.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:254,120:0.32: 1.99:1.000:0.949 0/0/0/1:4:238,93:0.28: 1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,221:0.74: 0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:198,65:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,142:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:285,84:0.23: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,84:0.27: 1.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,50:0.24:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,48:0.21:-0.41:1.000:1.000 -chr1.1 6759713 chr1.1_006759713 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,65:0.88:-0.24:1.000:0.822 1/1/1/1:4:1,97:0.92: 0.36:1.000:0.982 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,91:0.50: 1.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,103:0.92: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,57:0.47: 0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:70,66:0.48: 1.06:1.000:0.995 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.48:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,51:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,81:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,78:0.80: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.19:0.997:1.000 0/1/1/1:4:5,77:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,87:0.48: 1.88:1.000:0.995 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,91:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,82:0.52: 1.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:3,61:0.74:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,21:0.72:-1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:91,1:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,65:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,77:0.73: 0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,96:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1:3:0,8:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,64:0.73:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,88:0.51: 1.53:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,80:0.48: 1.58:1.000:0.995 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,99:0.56: 1.45:1.000:0.969 0/1/1/1:4:3,81:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,128:0.49: 3.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,77:0.73: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,63:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,56:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,70:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,91:0.83: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,109:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,73:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:34,41:0.51:-0.07:1.000:0.881 0/0/1/1:4:56,81:0.54: 1.08:1.000:0.989 0/1/1/1:4:2,70:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,85:0.48: 1.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,80:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,121:0.56: 2.04:1.000:0.959 0/1/1/1:4:3,75:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,71:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,85:0.54: 1.15:1.000:0.985 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,97:0.84: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,102:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,83:0.49: 1.64:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,167:0.95: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,74:0.53: 0.91:1.000:0.992 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,1:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,83:0.74: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:3,1:0.37:-1.39:1.000:0.578 0/0/1/1:4:70,114:0.55: 1.95:1.000:0.977 0/0/1/1:4:83,72:0.47: 1.41:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,72:0.74:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,77:0.90:-0.02:1.000:0.695 0/1/1/1:4:4,69:0.74:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,93:0.50: 1.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,50:0.84:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,70:0.89:-0.15:1.000:0.621 0/0/1/1:4:77,81:0.49: 1.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,65:0.47: 1.17:1.000:0.991 0/1/1/1:4:2,70:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,59:0.47: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,64:0.53: 0.56:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,66:0.48: 1.04:1.000:0.995 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,73:0.78:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,54:0.46: 0.80:1.000:0.988 0/0/1/1:4:71,72:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/0/0:3:45,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,70:0.74:-0.09:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,72:0.89:-0.11:1.000:0.526 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,83:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,104:0.85: 0.50:1.000:0.991 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:2,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,142:0.78: 1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,41:0.74:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:51,64:0.52: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,130:0.53: 2.68:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,70:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,78:0.49: 1.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,93:0.52: 1.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,82:0.48: 1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,1:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,63:0.75:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,84:0.74: 0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,50:0.74:-0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,94:0.53: 1.56:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,61:0.74:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,84:0.54: 1.17:1.000:0.989 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,87:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,147:0.95: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,62:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,75:0.79:-0.03:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:56,62:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,70:0.52: 0.82:1.000:0.994 0/1/1/1:4:1,72:0.89:-0.11:1.000:0.526 0/1/1/1:4:2,62:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,86:0.49: 1.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,74:0.79:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,64:0.88:-0.26:1.000:0.852 1/1/1/1:4:1,86:0.91: 0.15:1.000:0.912 -chr1.1 6927231 chr1.1_006927231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:154,76:.:-0.11:1.000:. ./.:4:49,178:.:-0.15:1.000:. ./.:4:70,212:.: 0.66:1.000:. ./.:4:126,135:.: 0.35:1.000:. ./.:4:129,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:89,279:.: 1.93:1.000:. ./.:4:49,201:.: 0.19:1.000:. ./.:4:121,156:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,243:.: 0.96:1.000:. ./.:4:4,55:.:-2.64:1.000:. ./.:4:10,31:.:-2.91:1.000:. ./.:4:135,163:.: 0.90:1.000:. ./.:4:58,219:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.59:1.000:. ./.:4:165,56:.:-0.24:1.000:. ./.:4:131,157:.: 0.75:1.000:. ./.:4:213,89:.: 0.96:0.997:. ./.:4:50,237:.: 0.74:1.000:. ./.:4:74,302:.: 2.05:1.000:. ./.:4:149,198:.: 1.62:1.000:. ./.:4:20,33:.:-2.73:1.000:. ./.:4:52,198:.: 0.19:1.000:. ./.:4:134,157:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,315:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,37:.:-2.96:1.000:. ./.:4:175,105:.: 0.63:1.000:. ./.:4:124,184:.: 1.05:1.000:. ./.:4:100,113:.:-0.36:1.000:. ./.:4:132,162:.: 0.84:1.000:. ./.:4:57,277:.: 1.43:1.000:. ./.:4:98,279:.: 2.07:1.000:. ./.:4:107,156:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,26:.:-3.11:1.000:. ./.:4:10,69:.:-2.34:1.000:. ./.:3:0,17:.:-3.26:1.000:. ./.:4:0,342:.: 1.55:1.000:. ./.:4:189,80:.: 0.47:1.000:. ./.:4:129,135:.: 0.40:1.000:. ./.:4:73,232:.: 1.00:1.000:. ./.:4:81,301:.: 2.14:1.000:. ./.:4:104,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:95,107:.:-0.52:1.000:. ./.:4:159,60:.:-0.27:1.000:. ./.:4:151,70:.:-0.24:1.000:. ./.:4:56,155:.:-0.39:1.000:. ./.:4:61,182:.: 0.08:1.000:. ./.:4:60,217:.: 0.59:1.000:. ./.:4:24,50:.:-2.42:1.000:. ./.:4:42,175:.:-0.30:1.000:. ./.:4:61,213:.: 0.54:1.000:. ./.:4:68,93:.:-1.13:1.000:. ./.:4:56,243:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,150:.:-0.60:1.000:. ./.:4:113,129:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,198:.: 0.20:1.000:. ./.:4:60,249:.: 1.06:1.000:. ./.:4:163,76:.: 0.03:1.000:. ./.:4:68,200:.: 0.45:1.000:. ./.:4:56,178:.:-0.05:1.000:. ./.:6:64,96:.:-1.14:1.000:. ./.:4:104,116:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,167:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,212:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.57:1.000:. ./.:4:114,150:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,183:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,156:.:-0.58:1.000:. ./.:4:81,116:.:-0.60:1.000:. ./.:4:42,184:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,107:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.97:1.000:. ./.:4:86,120:.:-0.46:1.000:. ./.:4:212,72:.: 0.69:1.000:. ./.:4:66,201:.: 0.44:1.000:. ./.:4:83,113:.:-0.61:1.000:. ./.:4:61,205:.: 0.43:1.000:. ./.:4:91,107:.:-0.58:1.000:. ./.:4:83,118:.:-0.54:1.000:. ./.:4:31,202:.:-0.06:1.000:. ./.:4:72,216:.: 0.75:1.000:. ./.:4:93,98:.:-0.69:1.000:. ./.:4:60,171:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,203:.: 0.62:1.000:. ./.:4:46,161:.:-0.45:1.000:. ./.:4:118,164:.: 0.66:1.000:. ./.:4:78,187:.: 0.41:1.000:. ./.:4:69,127:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,139:.:-0.80:1.000:. ./.:4:40,145:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,193:.: 0.04:1.000:. ./.:4:57,173:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.98:1.000:. ./.:4:122,138:.: 0.34:1.000:. ./.:4:33,145:.:-0.88:1.000:. ./.:4:71,210:.: 0.65:1.000:. ./.:4:80,218:.: 0.90:1.000:. ./.:4:39,116:.:-1.22:1.000:. ./.:4:88,77:.:-1.07:1.000:. ./.:4:97,105:.:-0.52:1.000:. ./.:4:131,136:.: 0.44:1.000:. ./.:4:32,157:.:-0.71:1.000:. ./.:4:57,177:.:-0.05:1.000:. ./.:4:39,124:.:-1.10:1.000:. ./.:4:44,171:.:-0.33:1.000:. ./.:4:80,85:.:-1.07:1.000:. ./.:4:119,152:.: 0.50:1.000:. ./.:4:48,179:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,203:.: 0.43:1.000:. ./.:4:130,163:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,170:.:-0.12:1.000:. ./.:4:40,132:.:-0.97:1.000:. ./.:4:155,191:.: 1.61:1.000:. ./.:4:98,106:.:-0.49:1.000:. ./.:4:111,138:.: 0.17:1.000:. ./.:3:78,78:.:-1.20:1.000:. ./.:4:109,110:.:-0.27:1.000:. ./.:4:55,185:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,147:.:-0.69:1.000:. ./.:4:41,164:.:-0.48:1.000:. ./.:4:46,146:.:-0.67:1.000:. ./.:4:95,118:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,132:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.10:1.000:. ./.:4:126,139:.: 0.41:1.000:. ./.:4:86,112:.:-0.58:1.000:. ./.:4:112,110:.:-0.23:1.000:. ./.:6:94,158:.: 0.22:1.000:. ./.:4:34,166:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.39:1.000:. ./.:4:72,82:.:-1.23:1.000:. ./.:4:128,45:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,207:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,137:.:-1.48:1.000:. ./.:4:136,60:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,146:.:-0.55:1.000:. ./.:4:260,102:.: 1.85:1.000:. ./.:4:112,130:.: 0.07:1.000:. ./.:4:121,48:.:-1.01:1.000:. ./.:4:38,130:.:-1.03:1.000:. ./.:4:37,115:.:-1.26:1.000:. ./.:4:92,99:.:-0.69:1.000:. ./.:4:87,85:.:-0.97:1.000:. ./.:4:63,178:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,117:.:-1.20:1.000:. ./.:4:66,234:.: 0.93:1.000:. ./.:4:97,141:.: 0.01:1.000:. ./.:4:52,199:.: 0.20:1.000:. ./.:4:116,122:.: 0.01:1.000:. ./.:4:66,283:.: 1.65:1.000:. ./.:4:116,113:.:-0.12:1.000:. ./.:4:76,296:.: 1.99:1.000:. ./.:4:68,224:.: 0.81:1.000:. ./.:4:13,35:.:-2.80:1.000:. ./.:4:46,180:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,183:.: 1.09:1.000:. ./.:4:67,208:.: 0.56:1.000:. ./.:4:135,167:.: 0.96:1.000:. ./.:4:59,247:.: 1.02:1.000:. ./.:4:54,181:.:-0.03:1.000:. ./.:4:116,173:.: 0.77:1.000:. ./.:4:45,204:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,180:.:-0.18:1.000:. ./.:4:40,190:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,200:.: 0.35:1.000:. ./.:4:191,99:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,320:.: 1.22:1.000:. ./.:4:127,140:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,212:.: 0.45:1.000:. ./.:4:36,200:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.77:1.000:. ./.:4:54,179:.:-0.06:1.000:. ./.:4:104,127:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,141:.:-0.49:1.000:. ./.:4:58,169:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,153:.:-0.63:1.000:. ./.:4:84,308:.: 2.29:1.000:. ./.:4:129,139:.: 0.45:1.000:. ./.:4:50,240:.: 0.78:1.000:. ./.:4:51,195:.: 0.13:1.000:. ./.:4:118,137:.: 0.26:1.000:. ./.:4:237,115:.: 1.70:1.000:. ./.:4:59,263:.: 1.25:1.000:. ./.:4:57,205:.: 0.37:1.000:. ./.:4:93,128:.:-0.24:1.000:. -chr1.1 7050147 chr1.1_007050147 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:80,21:.: 0.69:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:66,58:.: 1.63:1.000:. ./.:4:45,19:.:-0.82:1.000:. ./.:4:20,28:.:-1.48:1.000:. ./.:4:41,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:32,19:.:-1.35:1.000:. ./.:4:29,13:.:-1.72:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:50,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.90:1.000:. ./.:4:36,13:.:-1.43:1.000:. ./.:4:51,29:.:-0.17:0.997:. ./.:4:43,22:.:-0.78:1.000:. ./.:4:59,68:.: 1.75:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:45,10:.:-1.19:1.000:. ./.:4:48,27:.:-0.37:1.000:. ./.:4:55,53:.: 0.98:1.000:. ./.:4:55,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,5:.:-2.29:1.000:. ./.:4:36,11:.:-1.52:1.000:. ./.:4:29,14:.:-1.68:1.000:. ./.:4:25,34:.:-1.03:1.000:. ./.:4:95,30:.: 1.67:1.000:. ./.:4:37,9:.:-1.56:1.000:. ./.:4:37,9:.:-1.56:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.31:1.000:. ./.:3:17,3:.:-2.62:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:48,10:.:-1.07:1.000:. ./.:4:60,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:36,37:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:82,28:.: 1.06:1.000:. ./.:4:34,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:81,15:.: 0.49:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,66:.: 2.24:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.13:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:21,19:.:-1.80:1.000:. ./.:4:44,15:.:-1.03:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:55,59:.: 1.22:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:73,24:.: 0.53:1.000:. ./.:4:81,26:.: 0.94:1.000:. ./.:4:45,45:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,27:.:-0.04:1.000:. ./.:4:88,27:.: 1.26:1.000:. ./.:4:56,30:.: 0.08:1.000:. ./.:6:70,31:.: 0.69:1.000:. ./.:4:63,56:.: 1.43:1.000:. ./.:4:63,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,65:.: 2.28:1.000:. ./.:4:78,20:.: 0.57:1.000:. ./.:4:40,51:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:44,44:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,28:.: 1.75:1.000:. ./.:4:41,10:.:-1.35:1.000:. ./.:4:57,22:.:-0.21:1.000:. ./.:4:51,38:.: 0.20:1.000:. ./.:4:41,42:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,35:.:-0.98:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,38:.: 1.30:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:109,34:.: 2.41:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,28:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,57:.: 1.30:1.000:. ./.:4:60,18:.:-0.25:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:74,20:.: 0.40:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:68,27:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,52:.: 0.90:1.000:. ./.:4:38,16:.:-1.23:1.000:. ./.:4:98,20:.: 1.39:1.000:. ./.:4:56,41:.: 0.53:1.000:. ./.:4:49,31:.:-0.17:1.000:. ./.:4:68,21:.: 0.20:1.000:. ./.:4:84,26:.: 1.06:1.000:. ./.:4:139,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:44,47:.: 0.28:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:48,41:.: 0.20:1.000:. ./.:4:40,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:92,31:.: 1.59:1.000:. ./.:4:67,18:.: 0.04:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:67,24:.: 0.28:1.000:. ./.:4:53,69:.: 1.55:1.000:. ./.:4:51,51:.: 0.73:1.000:. ./.:3:36,20:.:-1.15:1.000:. ./.:4:116,27:.: 2.41:1.000:. ./.:4:68,26:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:85,29:.: 1.22:1.000:. ./.:4:75,16:.: 0.28:1.000:. ./.:4:49,22:.:-0.54:1.000:. ./.:4:76,23:.: 0.61:1.000:. ./.:4:82,30:.: 1.14:1.000:. ./.:4:56,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,24:.: 0.32:1.000:. ./.:4:76,31:.: 0.94:1.000:. ./.:6:135,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:40,35:.:-0.37:1.000:. ./.:4:58,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,23:.: 0.61:1.000:. ./.:4:67,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:47,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,15:.:-1.15:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:61,20:.:-0.13:1.000:. ./.:4:54,34:.: 0.16:1.000:. ./.:4:71,26:.: 0.53:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,49:.: 0.24:1.000:. ./.:4:68,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:86,25:.: 1.10:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:54,40:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,40:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,36:.:-0.74:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:58,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:45,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,30:.:-0.94:1.000:. ./.:4:26,10:.:-1.97:1.000:. ./.:4:42,22:.:-0.82:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:71,32:.: 0.77:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,24:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,15:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,11:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,35:.:-0.54:1.000:. ./.:4:21,4:.:-2.41:1.000:. ./.:4:42,21:.:-0.86:1.000:. ./.:4:65,21:.: 0.08:1.000:. ./.:4:57,54:.: 1.10:1.000:. ./.:4:49,38:.: 0.12:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:37,22:.:-1.03:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:46,35:.:-0.13:1.000:. ./.:4:45,19:.:-0.82:1.000:. ./.:4:50,21:.:-0.54:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:76,36:.: 1.14:1.000:. ./.:4:36,37:.:-0.45:1.000:. ./.:4:58,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:52,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:82,12:.: 0.40:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:45,13:.:-1.07:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.25:1.000:. -chr1.1 7233177 chr1.1_007233177 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.73:0.997:. ./.:4:160,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:43,0:.:-3.39:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:135,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.62:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.60:1.000:. ./.:3:24,0:.:-3.89:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:178,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:6:143,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:147,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:3:94,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:224,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.10:1.000:. ./.:6:206,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:167,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:160,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.60:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:230,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. -chr1.1 7349949 chr1.1_007349949 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:110,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:97,18:.: 0.53:1.000:. ./.:4:85,20:.: 0.21:1.000:. ./.:4:139,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:127,27:.: 1.77:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:87,16:.: 0.14:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,19:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.13:0.997:. ./.:4:114,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:127,18:.: 1.48:1.000:. ./.:4:107,25:.: 1.07:1.000:. ./.:4:16,1:.:-2.60:1.000:. ./.:4:72,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:102,24:.: 0.88:1.000:. ./.:4:76,31:.: 0.27:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:81,22:.: 0.14:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:89,18:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,27:.: 1.29:1.000:. ./.:4:102,21:.: 0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:12,4:.:-2.63:1.000:. ./.:3:3,2:.:-2.98:1.000:. ./.:4:118,15:.: 1.10:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:99,17:.: 0.56:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:92,19:.: 0.40:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:68,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:68,11:.:-0.62:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:103,19:.: 0.75:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:71,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:86,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:82,13:.:-0.11:1.000:. ./.:6:67,3:.:-0.91:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:96,18:.: 0.49:1.000:. ./.:4:65,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:90,16:.: 0.24:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:89,17:.: 0.24:1.000:. ./.:4:51,12:.:-1.13:1.000:. ./.:4:80,21:.: 0.08:1.000:. ./.:4:68,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:94,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:57,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:82,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:99,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:73,20:.:-0.18:1.000:. ./.:4:81,19:.: 0.05:1.000:. ./.:4:60,15:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:74,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:89,21:.: 0.37:1.000:. ./.:4:39,14:.:-1.45:1.000:. ./.:4:59,23:.:-0.53:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:107,21:.: 0.94:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:85,24:.: 0.33:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:55,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:75,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:60,16:.:-0.72:1.000:. ./.:4:111,28:.: 1.29:1.000:. ./.:4:59,11:.:-0.91:1.000:. ./.:4:93,15:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,15:.: 1.19:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:63,11:.:-0.78:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:3:61,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,13:.:-1.13:1.000:. ./.:4:53,15:.:-0.97:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.62:1.000:. ./.:4:69,13:.:-0.53:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:61,10:.:-0.88:1.000:. ./.:4:106,20:.: 0.88:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.75:1.000:. ./.:6:92,14:.: 0.24:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:76,9:.:-0.43:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:134,21:.: 1.80:1.000:. ./.:4:48,8:.:-1.35:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:113,12:.: 0.84:1.000:. ./.:4:176,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:100,23:.: 0.78:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:67,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:93,16:.: 0.33:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:82,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,15:.:-0.72:1.000:. ./.:4:135,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:92,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:117,22:.: 1.29:1.000:. ./.:4:97,18:.: 0.53:1.000:. ./.:4:114,19:.: 1.10:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:117,33:.: 1.64:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:80,17:.:-0.05:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:100,22:.: 0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:95,19:.: 0.49:1.000:. ./.:4:84,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:78,18:.:-0.08:1.000:. ./.:4:107,18:.: 0.84:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:107,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:110,18:.: 0.94:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:81,21:.: 0.11:1.000:. ./.:4:88,13:.: 0.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,15:.: 0.37:1.000:. ./.:4:75,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:110,17:.: 0.91:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:103,19:.: 0.75:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:73,11:.:-0.46:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.21:1.000:. -chr1.1 7519233 chr1.1_007519233 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,27:0.29: 0.31:1.000:0.992 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,30:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,67:0.59: 1.21:1.000:0.862 0/0/0/1:4:61,33:0.24: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,38:0.53: 0.13:1.000:0.992 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,42:0.19: 3.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 1.38:0.997:1.000 0/0/0/1:4:51,28:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,45:0.44: 1.04:1.000:0.974 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.17:-1.95:1.000:0.998 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,26:0.41:-0.18:1.000:0.835 0/0/1/1:4:4,5:0.51:-1.78:1.000:0.996 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,39:0.25: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,33:0.20: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.44:-1.95:1.000:0.974 1/1/1:3:0,1:1.00:-2.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,37:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,27:0.14: 2.53:1.000:0.964 0/0/0/1:4:58,41:0.32: 1.35:1.000:0.950 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,34:0.26: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,16:0.17: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,34:0.34: 0.65:1.000:0.836 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,43:0.29: 1.70:1.000:0.990 0/0/0/1:4:57,25:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,24:0.53:-0.70:1.000:0.991 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,34:0.34: 0.65:1.000:0.836 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,39:0.38: 0.90:1.000:0.542 0/0/0/1:4:51,34:0.30: 0.86:1.000:0.984 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:39,5:0.08:-0.56:1.000:0.510 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,20:0.41:-0.63:1.000:0.867 0/0/1/1:4:22,31:0.53:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,11:0.20:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,33:0.53:-0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:24,46:0.56: 0.34:1.000:0.960 0/0/0/1:4:31,24:0.35:-0.18:1.000:0.761 0/0/0/1:4:42,17:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,33:0.29: 0.83:1.000:0.991 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:44,24:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,20:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,36:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,37:0.42: 0.58:1.000:0.900 0/0/1/1:4:15,44:0.61:-0.04:1.000:0.665 0/0/0/1:4:47,17:0.18: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,23:0.44:-0.49:1.000:0.974 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,29:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,18:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,38:0.38: 0.79:1.000:0.622 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,28:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,31:0.32: 0.51:1.000:0.953 0/0/0/1:4:28,23:0.37:-0.32:1.000:0.506 0/0/1/1:4:16,18:0.49:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,19:0.39:-0.67:1.000:0.715 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,17:0.32:-0.67:1.000:0.948 0/0/1/1:4:35,33:0.42: 0.27:1.000:0.927 0/0/1/1:4:11,24:0.58:-0.87:1.000:0.915 0/0/0/1:4:39,31:0.36: 0.34:1.000:0.657 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,24:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,35:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,43:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.46:-0.74:1.000:0.989 0/0/0/1:4:74,44:0.26: 2.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0:3:46,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,25:0.31: 0.06:1.000:0.979 0/0/0/0:4:27,1:0.02:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,31:0.20: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,35:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,43:0.27: 1.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,23:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,27:0.37:-0.01:1.000:0.525 0/0/0/0/0/0:6:47,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.48:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,17:0.32:-0.67:1.000:0.948 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,43:0.52: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,14:0.44:-1.12:1.000:0.974 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,24:0.44:-0.42:1.000:0.974 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,21:0.31:-0.28:1.000:0.978 0/0/0/1:4:25,16:0.29:-0.67:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,20:0.18: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,23:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,28:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,13:0.33:-1.01:1.000:0.925 0/0/0/1:4:55,36:0.29: 1.07:1.000:0.989 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,39:0.53: 0.17:1.000:0.991 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,39:0.43: 0.69:1.000:0.938 0/0/0/1:4:42,23:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,35:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,33:0.40: 0.34:1.000:0.821 0/1/1/1:4:1,4:0.64:-1.92:1.000:0.708 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,44:0.23: 2.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,30:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,41:0.32: 1.38:1.000:0.964 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,44:0.25: 2.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,33:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,34:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,29:0.20: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,43:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,38:0.33: 1.04:1.000:0.908 0/0/1/1:4:24,31:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,29:0.33: 0.31:1.000:0.920 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,39:0.33: 1.14:1.000:0.925 0/0/1/1:4:44,41:0.42: 0.86:1.000:0.911 0/0/0/1:4:26,21:0.37:-0.46:1.000:0.585 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,43:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:76,35:0.22: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,35:0.26: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,8:0.10:-0.21:1.000:0.763 0/0/0/1:4:80,36:0.21: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,44:0.19: 3.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,26:0.51:-0.49:1.000:0.996 -chr1.1 7830610 chr1.1_007830610 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:4,136:0.97: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,40:0.34: 0.40:1.000:0.871 0/1/1/1:4:43,104:0.71: 0.25:1.000:0.991 1/1/1/1:4:6,135:0.96: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,112:0.71: 0.48:1.000:0.992 0/1/1/1:4:81,210:0.73: 3.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,54:0.47:-0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,129:0.69: 1.07:1.000:0.972 0/1/1/1:4:52,101:0.66: 0.38:1.000:0.835 0/0/1/1:4:31,26:0.46:-1.60:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,49:0.75:-1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,43:0.39:-0.14:1.000:0.643 0/0/1/1:4:90,108:0.52: 1.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,78:0.47: 0.56:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,112:0.62: 0.89:1.000:0.573 1/1/1/1:4:5,176:0.97: 0.95:0.997:1.000 0/0/1/1:4:114,114:0.49: 1.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,106:0.46: 1.94:1.000:0.989 1/1/1/1:4:3,126:0.98:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,37:0.91:-1.93:1.000:0.892 0/1/1/1:4:50,124:0.72: 0.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:57,102:0.63: 0.50:1.000:0.612 0/0/1/1:4:83,65:0.45: 0.27:1.000:0.978 0/0/1/1:4:26,19:0.44:-1.84:1.000:0.964 1/1/1/1:4:3,178:0.98: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,174:0.79: 1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,125:0.70: 0.91:1.000:0.984 0/0/1/1:4:52,89:0.62: 0.13:1.000:0.544 0/1/1/1:4:44,88:0.66:-0.06:1.000:0.884 0/1/1/1:4:49,152:0.76: 1.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,158:0.98: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,37:0.81:-1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,32:0.75:-1.88:1.000:0.999 0/1/1:3:10,17:0.62:-2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,104:0.49: 1.44:1.000:0.996 1/1/1/1:4:5,134:0.96: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,84:0.68:-0.24:1.000:0.956 0/0/1/1:4:94,93:0.48: 1.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,92:0.63: 0.19:1.000:0.573 0/1/1/1:4:34,71:0.67:-0.61:1.000:0.934 0/0/1/1:4:85,79:0.47: 0.60:1.000:0.993 1/1/1/1:4:9,148:0.94: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:7,118:0.95:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,58:0.45:-0.12:1.000:0.984 0/1/1/1:4:34,102:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,156:0.78: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,109:0.48: 1.81:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,70:0.64:-0.55:1.000:0.704 0/1/1/1:4:25,89:0.79:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,50:0.61:-1.10:1.000:0.734 0/1/1/1:4:58,121:0.67: 0.91:1.000:0.933 0/1/1/1:4:33,102:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,103:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,63:0.46: 0.01:1.000:0.990 0/1/1/1:4:38,138:0.79: 0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,125:0.98:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,123:0.70: 0.83:1.000:0.988 0/1/1/1:4:36,79:0.69:-0.40:1.000:0.966 0/0/1/1/1/1:6:21,35:0.61:-1.62:1.000:0.751 0/1/1/1:4:35,76:0.68:-0.49:1.000:0.961 0/1/1/1:4:44,83:0.65:-0.16:1.000:0.769 0/0/1/1:4:74,87:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,56:0.46:-0.26:1.000:0.988 0/1/1/1:4:52,124:0.71: 0.85:1.000:0.989 0/1/1/1:4:34,142:0.81: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,25:0.48:-1.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,103:0.79:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,79:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,35:0.40:-0.75:1.000:0.779 0/0/1/1:4:88,87:0.48: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,64:0.70:-0.90:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,87:0.56: 0.31:1.000:0.961 0/0/1/1:4:102,106:0.49: 1.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,67:0.44: 0.42:1.000:0.973 0/0/1/1:4:62,78:0.54: 0.11:1.000:0.989 1/1/1/1:4:4,95:0.96:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,51:0.54:-0.90:1.000:0.987 0/1/1/1:4:40,99:0.71: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,65:0.59:-0.55:1.000:0.874 0/0/1/1:4:54,28:0.39:-1.08:1.000:0.682 0/0/1/1:4:43,52:0.53:-0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,73:0.62:-0.38:1.000:0.572 0/1/1/1:4:24,102:0.81:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,71:0.65:-0.55:1.000:0.809 0/0/1/1:4:66,70:0.49: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,55:0.60:-0.92:1.000:0.800 0/0/1/1:4:32,53:0.61:-1.02:1.000:0.655 0/0/1/1:4:31,50:0.61:-1.10:1.000:0.734 0/1/1/1:4:43,75:0.63:-0.34:1.000:0.523 0/0/1/1:4:36,58:0.61:-0.84:1.000:0.737 0/0/1/1:4:71,62:0.46:-0.03:1.000:0.990 0/1/1/1:4:30,116:0.80: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,106:0.79: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,88:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,67:0.47: 0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,38:0.47:-1.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:59,24:0.36:-1.06:1.000:0.717 0/1/1/1:4:25,71:0.75:-0.79:1.000:0.999 1/1/1/1:4:5,102:0.95:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,36:0.61:-1.58:1.000:0.692 0/0/1/1:4:59,68:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,37:0.63:-1.58:1.000:0.559 0/0/1/1:4:28,41:0.58:-1.35:1.000:0.915 0/0/1/1:4:30,41:0.56:-1.31:1.000:0.966 0/1/1/1:4:30,62:0.67:-0.88:1.000:0.924 0/1/1/1:4:27,78:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,120:0.78: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,150:0.76: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,125:0.67: 1.05:1.000:0.915 0/1/1/1:4:28,79:0.74:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,182:0.76: 2.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,38:0.66:-1.60:1.000:0.884 0/1/1/1:4:32,95:0.75:-0.16:1.000:1.000 1/1/1:3:4,68:0.95:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,104:0.81:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,63:0.68:-0.88:1.000:0.961 0/0/1/1:4:41,60:0.58:-0.69:1.000:0.916 0/1/1/1:4:20,74:0.79:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,51:0.63:-1.12:1.000:0.552 0/0/1/1:4:42,72:0.62:-0.43:1.000:0.538 0/0/1/1:4:35,53:0.59:-0.96:1.000:0.871 0/0/1/1:4:55,57:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,166:0.83: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,51:0.59:-1.02:1.000:0.885 0/1/1/1:4:28,81:0.75:-0.53:1.000:0.999 1/1/1/1/1/1:6:3,98:0.97:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,25:0.31:-0.36:1.000:0.971 0/0/1/1:4:40,48:0.52:-0.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,61:0.79:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,94:0.95:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,138:0.70: 1.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:30,22:0.44:-1.70:1.000:0.965 1/1/1/1:4:5,80:0.94:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,101:0.76:-0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,172:0.99: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,110:0.79: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,67:0.99:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,39:0.63:-1.51:1.000:0.580 0/0/1/1:4:47,41:0.46:-0.96:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,68:0.69:-0.73:1.000:0.966 0/0/1/1:4:28,43:0.59:-1.31:1.000:0.847 0/1/1/1:4:27,106:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,35:0.67:-1.70:1.000:0.920 0/1/1/1:4:75,157:0.67: 2.00:1.000:0.936 0/1/1/1:4:56,165:0.75: 1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,96:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,84:0.61: 0.01:1.000:0.672 0/0/1/1:4:74,110:0.58: 1.01:1.000:0.897 0/1/1/1:4:32,93:0.75:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,90:0.47: 1.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:89,91:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,31:0.67:-1.82:1.000:0.924 0/1/1/1:4:45,104:0.70: 0.29:1.000:0.984 0/1/1/1:4:54,177:0.77: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,83:0.57: 0.15:1.000:0.950 0/1/1/1:4:60,156:0.73: 1.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,122:0.68: 0.91:1.000:0.953 0/1/1/1:4:53,116:0.69: 0.71:1.000:0.965 0/1/1/1:4:56,115:0.67: 0.75:1.000:0.918 0/1/1/1:4:44,137:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,131:0.74: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,87:0.66:-0.08:1.000:0.867 0/0/1/1:4:104,100:0.48: 1.42:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,140:0.99: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,112:0.52: 1.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,80:0.72:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,1:0.16:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,94:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,90:0.47: 1.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,79:0.66:-0.32:1.000:0.865 0/0/1/1:4:49,78:0.60:-0.16:1.000:0.769 0/1/1/1:4:36,134:0.79: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,81:0.51: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,67:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,77:0.62:-0.24:1.000:0.620 0/1/1/1:4:58,145:0.72: 1.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,71:0.59:-0.36:1.000:0.837 0/0/1/1:4:118,123:0.49: 2.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,63:0.51:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,81:0.65:-0.24:1.000:0.820 1/1/1/1:4:4,176:0.98: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,110:0.59: 0.99:1.000:0.878 0/1/1/1:4:42,102:0.71: 0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:89,44:0.38:-0.03:1.000:0.604 -chr1.1 8362856 chr1.1_008362856 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:88,208:0.72: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:217,60:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,138:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,137:0.52:-0.27:1.000:0.995 0/1/1/1:4:94,252:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:194,152:0.46: 1.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:103,92:0.49:-1.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,171:0.66:-0.43:1.000:0.877 0/0/1/1:4:164,139:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,98:0.67:-2.54:1.000:0.936 0/0/1/1:4:104,69:0.42:-2.13:1.000:0.928 0/0/1/1:4:141,125:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,126:0.48:-0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:244,99:0.32: 0.94:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,220:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,212:0.76:-0.05:0.997:1.000 0/0/1/1:4:142,149:0.53: 0.00:1.000:0.991 0/0/0/1:4:317,81:0.23: 1.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,249:0.79: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,90:0.48:-1.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:212,63:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,158:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/0/0/0:4:287,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,19:0.18:-3.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:97,223:0.72: 0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:84,206:0.73:-0.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:94,214:0.72: 0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:92,229:0.73: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,158:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:258,63:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,154:0.71:-1.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,39:0.50:-3.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,88:0.51:-2.00:1.000:0.996 0/0/1:3:37,23:0.41:-4.17:1.000:0.998 0/0/0/0:4:309,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,211:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:87,205:0.72: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,138:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,87:0.27: 1.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:184,134:0.45: 0.49:1.000:0.975 0/0/1/1:4:178,144:0.47: 0.56:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,317:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,176:0.69:-0.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:174,156:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,173:0.55: 0.67:1.000:0.980 0/0/1/1:4:174,170:0.52: 0.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,15:0.21:-3.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,78:0.28: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,136:0.47: 0.29:1.000:0.991 0/1/1/1:4:57,223:0.81:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,83:0.30: 0.35:1.000:0.988 0/0/1/1:4:133,122:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,230:0.74: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,130:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,77:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:87,173:0.69:-0.55:1.000:0.967 0/0/1/1:4:224,179:0.47: 2.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:167,154:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:115,165:0.61:-0.19:1.000:0.723 0/1/1/1:4:94,227:0.73: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,122:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:264,67:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,92:0.28: 1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:179,141:0.46: 0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:156,163:0.53: 0.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:176,48:0.24:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,113:0.49:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:245,51:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,96:0.42:-0.90:1.000:0.926 0/0/0/1:4:314,104:0.28: 2.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,100:0.40:-0.43:1.000:0.792 0/1/1/1:4:92,246:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:274,64:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,129:0.45: 0.24:1.000:0.978 0/0/0/1:4:201,59:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,222:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,246:0.75: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,119:0.43: 0.06:1.000:0.945 0/0/0/1:4:274,84:0.26: 1.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,126:0.52:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:167,162:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:297,100:0.28: 1.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:174,46:0.24:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,181:0.54: 1.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:234,71:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,122:0.53:-0.95:1.000:0.990 0/0/0/1:4:206,71:0.29:-0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:159,163:0.53: 0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:146,133:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,149:0.53: 0.00:1.000:0.991 0/0/0/0:4:295,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,167:0.47: 1.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,115:0.53:-1.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:161,155:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,162:0.48: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:224,54:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,134:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,150:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:86,197:0.72:-0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,137:0.53:-0.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:290,60:0.20: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,51:0.24:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,78:0.27: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:140,117:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,125:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:205,57:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,71:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,141:0.45: 0.74:1.000:0.979 0/0/1/1:4:136,137:0.52:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:162,140:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,269:0.75: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,211:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:172,134:0.46: 0.28:1.000:0.988 1/1/1:3:16,164:0.92:-2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,136:0.45: 0.56:1.000:0.976 0/0/1/1:4:148,120:0.47:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:220,78:0.29: 0.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:245,69:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,126:0.48:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,211:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,53:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,81:0.28: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,87:0.35:-0.45:1.000:0.753 0/0/1/1:4:177,160:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:177,131:0.45: 0.31:1.000:0.979 0/0/1/1/1/1:6:183,249:0.60: 2.55:1.000:0.628 0/0/0/1:4:234,42:0.17:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:226,64:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,152:0.71:-1.26:1.000:0.991 0/1/1/1:4:74,193:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,142:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,54:0.28:-1.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:80,216:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,111:0.47:-0.75:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,368:1.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,119:0.44:-0.10:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,275:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,149:0.54:-0.07:1.000:0.987 0/0/0/1:4:223,59:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,236:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,129:0.45: 0.19:1.000:0.982 0/0/0/1:4:208,59:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,109:0.46:-0.74:1.000:0.987 0/0/1/1:4:192,187:0.52: 1.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,143:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:245,69:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,143:0.51: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:288,90:0.27: 1.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:139,126:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,156:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:233,54:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,87:0.71:-2.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:122,120:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/1/1/1:4:72,241:0.79: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,160:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,216:0.72: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,146:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,51:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,214:0.76:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,58:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,137:0.52:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,149:0.54:-0.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:240,52:0.20: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,198:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,58:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,105:0.47:-0.99:1.000:0.992 0/0/0/1:4:215,72:0.28:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:136,128:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/0:4:278,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,157:0.57:-0.05:1.000:0.954 0/1/1/1:4:73,168:0.72:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:149,141:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:212,54:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,64:0.26:-0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,60:0.27:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:283,65:0.21: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,238:0.73: 0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:229,56:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,126:0.45: 0.09:1.000:0.980 0/0/1/1:4:179,159:0.49: 0.85:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,356:0.99: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,197:0.54: 1.65:1.000:0.989 0/0/1/1:4:145,136:0.51:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,124:0.46:-0.12:1.000:0.988 -chr1.1 8573540 chr1.1_008573540 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:97,72:0.47: 0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:47,103:0.70:-0.36:1.000:0.987 0/0/0/1:4:143,45:0.28: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,59:0.39: 0.16:1.000:0.673 0/0/0/1:4:174,41:0.23: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,113:0.53: 1.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:86,58:0.45:-0.51:1.000:0.977 0/0/1/1:4:122,97:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,83:0.54: 0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:46,14:0.28:-2.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,18:0.45:-3.01:1.000:0.983 0/1/1/1:4:43,139:0.77: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,85:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,83:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,69:0.45: 0.11:1.000:0.982 0/0/1/1:4:123,94:0.48: 1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,115:0.56: 1.36:0.997:0.965 0/0/1/1:4:102,93:0.52: 0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,189:0.75: 2.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,112:0.54: 1.49:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-2.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,90:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,86:0.48: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,69:0.48:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,8:0.29:-3.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:67,142:0.70: 1.11:1.000:0.981 0/0/1/1:4:105,90:0.51: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,78:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,83:0.45: 0.99:1.000:0.981 0/0/0/1:4:166,41:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,104:0.55: 0.91:1.000:0.975 0/0/1/1:4:86,85:0.54: 0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:12,17:0.61:-3.39:1.000:0.638 0/0/1/1:4:39,26:0.44:-2.49:1.000:0.973 0/0/1:3:13,3:0.22:-3.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,90:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,76:0.46: 0.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:114,60:0.39: 0.24:1.000:0.671 0/0/1/1:4:90,83:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,41:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,77:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,59:0.45:-0.44:1.000:0.975 0/0/1/1:4:96,78:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,75:0.55:-0.49:1.000:0.975 0/0/1/1:4:85,66:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,56:0.38:-0.01:1.000:0.630 0/0/1/1:4:101,85:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,54:0.46:-0.89:1.000:0.989 0/0/0/1:4:131,35:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,68:0.67:-1.49:1.000:0.914 0/0/0/1:4:94,23:0.24:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,90:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,42:0.29: 0.06:1.000:0.990 0/1/1/1:4:50,128:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,76:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,91:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,112:0.69: 0.04:1.000:0.976 0/0/1/1:4:99,80:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:153,31:0.20: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:97,45:0.36:-0.56:1.000:0.873 0/0/0/1:4:118,34:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:142,44:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,108:0.68:-0.01:1.000:0.948 0/0/1/1:4:71,65:0.52:-0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,82:0.46: 0.81:1.000:0.988 0/0/1/1:4:107,63:0.41: 0.14:1.000:0.888 0/0/1/1:4:61,52:0.50:-1.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,113:0.72:-0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,127:0.72: 0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,109:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,104:0.56: 0.86:1.000:0.969 0/0/1/1:4:77,61:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,93:0.48: 1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,86:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,64:0.45:-0.19:1.000:0.982 0/0/1/1:4:93,83:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,70:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,70:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,107:0.67:-0.01:1.000:0.931 0/0/1/1:4:118,88:0.47: 1.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:42,77:0.67:-1.14:1.000:0.911 0/0/0/1:4:154,37:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,45:0.28: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,98:0.80:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,56:0.40:-0.21:1.000:0.812 0/0/1/1:4:110,84:0.48: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,43:0.47:-1.56:1.000:0.991 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,65:0.44: 0.01:1.000:0.964 0/0/0/1:4:157,37:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,64:0.45:-0.19:1.000:0.982 0/0/1/1:4:99,83:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,64:0.53:-0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:127,89:0.46: 1.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:80,53:0.44:-0.79:1.000:0.971 0/0/1/1:4:67,50:0.47:-1.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,69:0.51:-0.39:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,39:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,20:0.22:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,76:0.45: 0.56:1.000:0.980 0/1/1/1:4:27,75:0.75:-1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,59:0.44:-0.39:1.000:0.967 0/0/1/1:4:66,53:0.49:-1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,72:0.46: 0.19:1.000:0.989 0/1/1/1:4:46,90:0.68:-0.71:1.000:0.955 0/1/1/1:4:57,107:0.67:-0.01:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,189:1.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,41:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,125:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,168:0.77: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,32:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,73:0.46: 0.29:1.000:0.987 0/1/1:3:44,58:0.60:-1.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,101:0.69:-0.36:1.000:0.975 0/0/1/1:4:81,70:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,35:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,75:0.47: 0.34:1.000:0.991 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,79:0.48: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,61:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,79:0.48: 0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,131:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,26:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,143:0.78: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:111,73:0.44: 0.49:1.000:0.683 0/0/1/1:4:72,78:0.56:-0.36:1.000:0.972 0/0/1/1:4:52,49:0.53:-1.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,81:0.67:-0.99:1.000:0.915 0/0/1/1:4:76,57:0.47:-0.79:1.000:0.993 0/1/1/1:4:63,101:0.64:-0.01:1.000:0.695 0/0/1/1:4:57,49:0.51:-1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,68:0.46:-0.06:1.000:0.990 0/1/1/1:4:43,117:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,90:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,108:0.67: 0.01:1.000:0.937 0/0/1/1:4:72,48:0.44:-1.11:1.000:0.973 0/0/1/1:4:74,47:0.43:-1.09:1.000:0.952 0/1/1/1:4:27,103:0.80:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,84:0.54: 0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,66:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/1/1/1:4:46,110:0.72:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,53:0.49:-1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,94:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,130:0.73: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,120:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,74:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,92:0.46: 1.39:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,129:0.75: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,82:0.47: 0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,123:0.68: 0.54:1.000:0.954 0/0/1/1:4:19,18:0.53:-3.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:145,35:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,131:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,112:0.52: 1.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,123:0.71: 0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,93:0.57: 0.24:1.000:0.948 0/0/1/1:4:93,69:0.47:-0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:160,47:0.27: 1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,84:0.46: 0.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:104,76:0.47: 0.39:1.000:0.991 0/0/0/1:4:159,37:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,138:0.85:-0.04:1.000:0.985 0/0/1/1:4:108,96:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,138:0.71: 0.89:1.000:0.989 0/0/1/1:4:99,77:0.48: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,43:0.30: 0.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:96,76:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,84:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,54:0.50:-1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,36:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,67:0.47:-0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:118,67:0.41: 0.51:1.000:0.836 0/0/1/1:4:79,75:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:113,28:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,171:0.76: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,86:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,94:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:132,42:0.28: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,84:0.48: 0.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:115,101:0.51: 1.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,51:0.26: 1.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:85,73:0.51:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,73:0.42: 0.76:1.000:0.906 -chr1.1 8671918 chr1.1_008671918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:71,4:0.17:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:170,2:0.04: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,6:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,4:0.20:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,10:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:147,1:0.02: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,4:0.12:-0.01:1.000:0.766 0/0/0/1:4:138,9:0.19: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,18:0.33:-1.17:1.000:0.920 0/0/0/1:4:42,39:0.36:-0.49:1.000:0.699 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,4:0.11: 0.29:1.000:0.644 0/0/0/0:4:127,2:0.05: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,2:0.15:-1.28:1.000:0.981 0/0/0/0:4:113,1:0.03: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,7:0.25:-0.44:0.997:0.999 0/0/0/1:4:69,4:0.17:-0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:81,6:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,14:0.29:-0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:67,7:0.25:-0.63:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,1:0.06:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,15:0.29:-0.88:1.000:0.990 0/0/0/0:4:65,1:0.05:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,1:0.05:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,3:0.09:-0.05:1.000:0.928 0/0/0/0:4:135,4:0.09: 0.72:1.000:0.946 0/0/0/0:4:50,1:0.06:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,3:0.12:-0.59:1.000:0.826 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,10:0.29:-1.30:1.000:0.990 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1:3:7,1:0.26:-2.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,2:0.09:-0.80:1.000:0.896 0/0/0/1:4:56,5:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/0:4:147,3:0.06: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,13:0.24: 1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,8:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,17:0.26: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,7:0.16: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,17:0.29:-0.69:1.000:0.990 0/0/0/1:4:146,21:0.26: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,7:0.15: 0.95:1.000:0.982 0/0/0/0:4:221,4:0.06: 2.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,52:0.37:-0.03:1.000:0.622 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-2.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:218,0:0.00: 2.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,22:0.31:-0.59:1.000:0.978 0/0/0/1:4:91,7:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,22:0.27: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:201,10:0.15: 2.23:1.000:0.985 0/0/0/1:4:130,10:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,22:0.29:-0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:62,5:0.23:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,12:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,3:0.13:-0.63:1.000:0.874 0/0/0/0/1/1:6:74,21:0.29:-0.19:1.000:0.817 0/0/0/1:4:74,24:0.29:-0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:57,4:0.20:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,17:0.29:-0.57:1.000:0.993 0/0/0/1:4:123,13:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,22:0.29:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:116,8:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,7:0.27:-1.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,10:0.26:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:71,9:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,14:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,12:0.27:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,7:0.17: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,12:0.27:-0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,6:0.18: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,19:0.29:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,17:0.26: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,7:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,10:0.24: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,4:0.11: 0.22:1.000:0.558 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,22:0.29:-0.28:1.000:0.990 0/0/0/1:4:44,12:0.29:-1.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:44,7:0.27:-1.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:53,17:0.29:-0.71:1.000:0.989 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,13:0.27:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,10:0.26:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,33:0.33:-0.28:1.000:0.933 0/0/0/1:4:89,4:0.13:-0.23:1.000:0.942 0/0/0/1:4:113,12:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,28:0.28: 0.83:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,25:0.33:-0.78:1.000:0.922 0/0/0/1:4:98,8:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,9:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,5:0.10: 1.12:1.000:0.825 0/0/0/1:4:68,7:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,36:0.32:-0.05:1.000:0.942 0/0/0/1:4:106,5:0.14: 0.14:1.000:0.969 0/0/0/1:4:60,12:0.27:-0.67:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-2.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,12:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,6:0.12: 1.02:1.000:0.812 0/0/0/0:4:135,4:0.09: 0.72:1.000:0.946 0/0/0/1:4:105,15:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 2.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,20:0.29:-0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:60,31:0.32:-0.28:1.000:0.951 0/0/0:3:139,4:0.09: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,24:0.27: 1.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,23:0.33:-0.86:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,19:0.31:-0.84:1.000:0.975 0/0/0/1:4:53,20:0.30:-0.65:1.000:0.983 0/0/0/1:4:101,10:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,30:0.32:-0.36:1.000:0.948 0/0/0/1:4:147,10:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,1:0.02: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,10:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,17:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:126,14:0.26: 0.75:1.000:0.537 0/0/0/1:4:97,19:0.27: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:91,1:0.03:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,11:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,24:0.30:-0.21:1.000:0.987 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,4:0.16:-0.51:1.000:0.993 0/0/0/1:4:92,13:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,1:0.02: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,16:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,10:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,27:0.31:-0.38:1.000:0.968 0/0/0/1:4:135,8:0.17: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,26:0.31:-0.40:1.000:0.971 0/0/0/0:4:123,4:0.10: 0.47:1.000:0.834 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:250,3:0.04: 3.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,12:0.27:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,6:0.25:-0.80:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,5:0.17:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:125,15:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:151,5:0.10: 1.08:1.000:0.798 0/0/0/0:4:118,2:0.05: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,17:0.29:-0.63:1.000:0.991 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:220,0:0.00: 2.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:229,2:0.03: 2.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,5:0.13: 0.29:1.000:0.929 0/0/0/1:4:58,6:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,5:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,8:0.26:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,3:0.08: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,6:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:74,1:0.04:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,2:0.09:-0.74:1.000:0.941 0/0/0/1:4:48,6:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,4:0.24:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,5:0.12: 0.47:1.000:0.820 0/0/0/1:4:50,7:0.26:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,2:0.04: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,9:0.27:-0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,5:0.14: 0.10:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,2:0.04: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,4:0.09: 0.77:1.000:0.955 0/0/0/1:4:68,9:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,2:0.08:-0.55:1.000:0.988 0/0/0/1:4:68,6:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:171,5:0.09: 1.50:1.000:0.954 0/0/0/0:4:117,2:0.05: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,2:0.07:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/0:4:154,5:0.10: 1.14:1.000:0.837 -chr1.1 9082943 chr1.1_009082943 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,114:.: 0.57:1.000:. ./.:4:25,79:.:-0.65:1.000:. ./.:4:75,64:.: 0.28:1.000:. ./.:4:35,108:.: 0.38:1.000:. ./.:4:71,89:.: 0.84:1.000:. ./.:4:28,91:.:-0.26:1.000:. ./.:4:10,35:.:-2.23:1.000:. ./.:4:30,107:.: 0.22:1.000:. ./.:4:28,78:.:-0.60:1.000:. ./.:4:11,9:.:-2.89:1.000:. ./.:4:3,13:.:-3.00:1.000:. ./.:4:28,92:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,92:.:-0.15:1.000:. ./.:4:25,99:.:-0.12:1.000:. ./.:4:47,56:.:-0.68:1.000:. ./.:4:23,96:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,136:.: 1.00:0.997:. ./.:4:48,30:.:-1.35:1.000:. ./.:4:32,126:.: 0.78:1.000:. ./.:4:37,124:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,16:.:-3.00:1.000:. ./.:4:29,98:.:-0.04:1.000:. ./.:4:50,83:.: 0.12:1.000:. ./.:4:23,89:.:-0.44:1.000:. ./.:4:5,12:.:-2.97:1.000:. ./.:4:41,114:.: 0.70:1.000:. ./.:4:26,98:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,81:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,124:.: 0.68:1.000:. ./.:4:49,54:.:-0.68:1.000:. ./.:4:37,114:.: 0.60:1.000:. ./.:4:21,82:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,10:.:-3.16:1.000:. ./.:4:5,15:.:-2.89:1.000:. ./.:3:3,5:.:-3.21:1.000:. ./.:4:29,92:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,115:.: 0.22:1.000:. ./.:4:43,155:.: 1.85:1.000:. ./.:4:46,165:.: 2.20:1.000:. ./.:4:69,81:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,131:.: 0.92:1.000:. ./.:4:28,126:.: 0.68:1.000:. ./.:4:46,135:.: 1.40:1.000:. ./.:4:21,111:.: 0.09:1.000:. ./.:4:36,146:.: 1.42:1.000:. ./.:4:25,104:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.20:1.000:. ./.:4:7,13:.:-2.89:1.000:. ./.:4:54,98:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.71:1.000:. ./.:4:69,62:.: 0.06:1.000:. ./.:4:39,134:.: 1.18:1.000:. ./.:4:27,112:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.80:1.000:. ./.:4:26,95:.:-0.20:1.000:. ./.:4:31,116:.: 0.49:1.000:. ./.:4:28,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:36,122:.: 0.78:1.000:. ./.:4:76,89:.: 0.97:1.000:. ./.:6:20,61:.:-1.27:1.000:. ./.:4:62,77:.: 0.28:1.000:. ./.:4:62,70:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,138:.: 1.45:1.000:. ./.:4:44,146:.: 1.64:1.000:. ./.:4:51,128:.: 1.34:1.000:. ./.:4:40,122:.: 0.89:1.000:. ./.:4:11,64:.:-1.43:1.000:. ./.:4:32,108:.: 0.30:1.000:. ./.:4:34,117:.: 0.60:1.000:. ./.:4:20,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,129:.: 0.94:1.000:. ./.:4:13,32:.:-2.23:1.000:. ./.:4:64,94:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,117:.: 0.60:1.000:. ./.:4:66,64:.: 0.04:1.000:. ./.:4:20,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,114:.: 0.12:1.000:. ./.:4:31,113:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,143:.: 1.45:1.000:. ./.:4:22,96:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,125:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,87:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.07:1.000:. ./.:4:72,89:.: 0.86:1.000:. ./.:4:37,113:.: 0.57:1.000:. ./.:4:42,61:.:-0.68:1.000:. ./.:4:21,100:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,61:.:-0.34:1.000:. ./.:4:33,93:.:-0.07:1.000:. ./.:4:41,50:.:-1.00:1.000:. ./.:4:38,137:.: 1.24:1.000:. ./.:4:41,147:.: 1.58:1.000:. ./.:4:27,90:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,134:.: 1.16:1.000:. ./.:4:25,124:.: 0.54:1.000:. ./.:4:37,91:.:-0.02:1.000:. ./.:4:76,88:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.52:1.000:. ./.:4:37,108:.: 0.44:1.000:. ./.:4:16,49:.:-1.69:1.000:. ./.:4:37,133:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.33:1.000:. ./.:4:33,92:.:-0.10:1.000:. ./.:4:67,90:.: 0.76:1.000:. ./.:4:72,79:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.20:1.000:. ./.:4:29,95:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,171:.: 1.13:1.000:. ./.:4:78,66:.: 0.41:1.000:. ./.:4:33,86:.:-0.26:1.000:. ./.:3:0,83:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.32:1.000:. ./.:4:17,75:.:-0.97:1.000:. ./.:4:53,76:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,99:.:-0.04:1.000:. ./.:4:50,57:.:-0.57:1.000:. ./.:4:31,120:.: 0.60:1.000:. ./.:4:27,103:.: 0.04:1.000:. ./.:4:28,132:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,96:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.60:1.000:. ./.:6:20,135:.: 0.70:1.000:. ./.:4:57,76:.: 0.12:1.000:. ./.:4:27,88:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.54:1.000:. ./.:4:28,81:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.22:1.000:. ./.:4:27,91:.:-0.28:1.000:. ./.:4:29,102:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,110:.: 0.17:1.000:. ./.:4:40,145:.: 1.50:1.000:. ./.:4:37,107:.: 0.41:1.000:. ./.:4:42,98:.: 0.30:1.000:. ./.:4:31,96:.:-0.04:1.000:. ./.:4:32,105:.: 0.22:1.000:. ./.:4:27,119:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.31:1.000:. ./.:4:23,76:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:42,116:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,100:.:-0.02:1.000:. ./.:4:75,61:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,109:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.62:1.000:. ./.:4:35,137:.: 1.16:1.000:. ./.:4:32,62:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,14:.:-3.05:1.000:. ./.:4:28,27:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.81:1.000:. ./.:4:26,110:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.25:1.000:. ./.:4:26,104:.: 0.04:1.000:. ./.:4:28,83:.:-0.47:1.000:. ./.:4:45,69:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,69:.:-1.03:1.000:. ./.:4:20,81:.:-0.73:1.000:. ./.:4:32,109:.: 0.33:1.000:. ./.:4:32,107:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,95:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,76:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,87:.:-0.36:1.000:. ./.:4:74,36:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,97:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,77:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,82:.:-0.81:1.000:. ./.:4:43,61:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.41:1.000:. ./.:4:26,94:.:-0.23:1.000:. ./.:4:33,141:.: 1.21:1.000:. ./.:4:68,69:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.65:1.000:. ./.:4:35,119:.: 0.68:1.000:. ./.:4:17,85:.:-0.71:1.000:. ./.:4:60,51:.:-0.47:1.000:. ./.:4:30,102:.: 0.09:1.000:. ./.:4:37,104:.: 0.33:1.000:. ./.:4:30,104:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,81:.:-0.63:1.000:. ./.:4:57,60:.:-0.31:1.000:. -chr1.1 9175857 chr1.1_009175857 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:167,18:.: 0.14:1.000:. ./.:4:109,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:93,33:.:-0.94:1.000:. ./.:4:129,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:145,47:.: 0.27:1.000:. ./.:4:150,17:.:-0.19:1.000:. ./.:4:53,4:.:-2.21:1.000:. ./.:4:130,10:.:-0.69:1.000:. ./.:4:117,14:.:-0.85:1.000:. ./.:4:42,7:.:-2.36:1.000:. ./.:4:67,1:.:-2.01:1.000:. ./.:4:115,11:.:-0.94:1.000:. ./.:4:135,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:167,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,35:.:-0.72:1.000:. ./.:4:159,25:.: 0.12:1.000:. ./.:4:174,23:.: 0.36:0.997:. ./.:4:149,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:161,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:147,27:.:-0.06:1.000:. ./.:4:105,31:.:-0.76:1.000:. ./.:4:112,17:.:-0.89:1.000:. ./.:4:65,11:.:-1.86:1.000:. ./.:4:165,17:.: 0.08:1.000:. ./.:4:113,13:.:-0.94:1.000:. ./.:4:130,19:.:-0.52:1.000:. ./.:4:188,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:67,30:.:-1.48:1.000:. ./.:4:149,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:115,15:.:-0.87:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:79,3:.:-1.75:1.000:. ./.:3:22,13:.:-2.61:1.000:. ./.:4:109,22:.:-0.85:1.000:. ./.:4:142,14:.:-0.39:1.000:. ./.:4:134,12:.:-0.58:1.000:. ./.:4:182,20:.: 0.45:1.000:. ./.:4:107,41:.:-0.54:1.000:. ./.:4:154,20:.:-0.06:1.000:. ./.:4:195,36:.: 0.98:1.000:. ./.:4:215,24:.: 1.13:1.000:. ./.:4:204,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:194,27:.: 0.80:1.000:. ./.:4:212,24:.: 1.07:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:83,12:.:-1.51:1.000:. ./.:4:109,28:.:-0.74:1.000:. ./.:4:324,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:125,34:.:-0.34:1.000:. ./.:4:214,34:.: 1.30:1.000:. ./.:4:177,21:.: 0.38:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:149,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:236,28:.: 1.59:1.000:. ./.:4:183,26:.: 0.58:1.000:. ./.:4:262,17:.: 1.86:1.000:. ./.:4:126,35:.:-0.30:1.000:. ./.:6:126,22:.:-0.54:1.000:. ./.:4:124,34:.:-0.36:1.000:. ./.:4:122,44:.:-0.21:1.000:. ./.:4:207,20:.: 0.91:1.000:. ./.:4:193,17:.: 0.60:1.000:. ./.:4:199,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:198,25:.: 0.84:1.000:. ./.:4:115,15:.:-0.87:1.000:. ./.:4:151,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:186,20:.: 0.52:1.000:. ./.:4:149,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:231,26:.: 1.46:1.000:. ./.:4:191,14:.: 0.51:1.000:. ./.:4:147,42:.: 0.21:1.000:. ./.:4:167,24:.: 0.25:1.000:. ./.:4:161,40:.: 0.43:1.000:. ./.:4:159,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:171,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:203,21:.: 0.85:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:216,15:.: 0.98:1.000:. ./.:4:150,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:225,20:.: 1.24:1.000:. ./.:4:133,42:.:-0.04:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:147,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:211,27:.: 1.11:1.000:. ./.:4:94,27:.:-1.04:1.000:. ./.:4:195,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:130,35:.:-0.23:1.000:. ./.:4:168,19:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,36:.:-0.70:1.000:. ./.:4:159,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:235,26:.: 1.53:1.000:. ./.:4:128,11:.:-0.70:1.000:. ./.:4:187,28:.: 0.69:1.000:. ./.:4:217,17:.: 1.04:1.000:. ./.:4:188,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:116,24:.:-0.69:1.000:. ./.:4:296,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:193,25:.: 0.74:1.000:. ./.:4:113,10:.:-1.00:1.000:. ./.:4:182,19:.: 0.43:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:209,17:.: 0.89:1.000:. ./.:4:100,36:.:-0.76:1.000:. ./.:4:138,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:294,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:200,17:.: 0.73:1.000:. ./.:4:304,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:156,32:.: 0.19:1.000:. ./.:4:207,25:.: 1.00:1.000:. ./.:3:152,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:287,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:186,17:.: 0.47:1.000:. ./.:4:132,30:.:-0.28:1.000:. ./.:4:181,25:.: 0.52:1.000:. ./.:4:119,29:.:-0.54:1.000:. ./.:4:213,21:.: 1.04:1.000:. ./.:4:208,23:.: 0.98:1.000:. ./.:4:188,19:.: 0.54:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:215,22:.: 1.09:1.000:. ./.:4:307,0:.: 2.38:1.000:. ./.:6:262,20:.: 1.92:1.000:. ./.:4:110,23:.:-0.81:1.000:. ./.:4:157,10:.:-0.19:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:218,12:.: 0.96:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:148,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:199,19:.: 0.74:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:186,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:233,13:.: 1.26:1.000:. ./.:4:172,20:.: 0.27:1.000:. ./.:4:165,23:.: 0.19:1.000:. ./.:4:197,10:.: 0.54:1.000:. ./.:4:199,21:.: 0.78:1.000:. ./.:4:191,18:.: 0.58:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:158,18:.:-0.03:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:202,22:.: 0.85:1.000:. ./.:4:140,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,42:.:-0.87:1.000:. ./.:4:202,21:.: 0.84:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:138,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:115,11:.:-0.94:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:67,28:.:-1.51:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:155,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:134,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:105,10:.:-1.15:1.000:. ./.:4:89,50:.:-0.70:1.000:. ./.:4:98,20:.:-1.09:1.000:. ./.:4:127,16:.:-0.63:1.000:. ./.:4:120,12:.:-0.83:1.000:. ./.:4:147,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:151,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:150,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:112,7:.:-1.07:1.000:. ./.:4:38,54:.:-1.57:1.000:. ./.:4:107,14:.:-1.04:1.000:. ./.:4:104,17:.:-1.04:1.000:. ./.:4:91,6:.:-1.48:1.000:. ./.:4:58,22:.:-1.79:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:121,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:148,15:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,22:.:-1.86:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:159,17:.:-0.03:1.000:. ./.:4:133,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,41:.:-1.13:1.000:. ./.:4:132,23:.:-0.41:1.000:. ./.:4:176,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:131,20:.:-0.48:1.000:. ./.:4:104,15:.:-1.07:1.000:. ./.:4:90,54:.:-0.61:1.000:. -chr1.1 9325684 chr1.1_009325684 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:86,80:0.48: 0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,53:0.47:-0.49:1.000:0.990 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,25:0.21:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,56:0.29: 1.69:1.000:0.992 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,21:0.33:-1.84:1.000:0.924 0/0/0/1:4:100,27:0.21:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,29:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,2:0.11:-3.06:1.000:0.641 0/0/0/1:4:18,10:0.36:-2.81:1.000:0.710 0/0/1/1:4:64,52:0.45:-0.44:1.000:0.978 0/0/1/1:4:68,59:0.46:-0.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:106,35:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,39:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,65:0.47: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:80,66:0.45: 0.37:0.997:0.982 0/1/1/1:4:35,117:0.74: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,69:0.47: 0.37:1.000:0.993 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.38:-3.14:1.000:0.515 0/0/0/1:4:101,21:0.17:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,41:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,54:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,12:0.62:-3.06:1.000:0.577 0/0/0/1:4:85,24:0.22:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,77:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,32:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,95:0.49: 1.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,25:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-3.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:20,5:0.20:-2.90:1.000:1.000 0/0/0:3:5,0:0.00:-3.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,56:0.41: 0.13:1.000:0.860 0/0/1/1:4:59,71:0.54:-0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:84,83:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,43:0.49:-1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,32:0.28:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,100:0.72: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,69:0.48: 0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:106,37:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,58:0.54:-0.71:1.000:0.986 0/0/1/1:4:63,73:0.53: 0.10:1.000:0.991 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,55:0.43:-0.09:1.000:0.938 0/1/1/1:4:55,149:0.71: 1.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:80,21:0.21:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,34:0.28:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:91,33:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,65:0.45: 0.34:1.000:0.978 0/0/0/1:4:109,36:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,91:0.54: 0.94:1.000:0.987 0/0/1/1:4:70,75:0.52: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,42:0.29: 0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,54:0.36: 0.53:1.000:0.730 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:79,38:0.33:-0.41:1.000:0.920 0/0/0/1:4:110,42:0.28: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,65:0.45: 0.32:1.000:0.981 0/0/0/1:4:67,24:0.27:-1.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,67:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,39:0.53:-1.60:1.000:0.992 0/0/0/1:4:119,38:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,65:0.55:-0.41:1.000:0.979 0/0/1/1:4:81,54:0.40: 0.07:1.000:0.797 0/0/0/1:4:126,50:0.29: 1.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,59:0.70:-1.36:1.000:0.984 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,122:0.71: 0.94:1.000:0.991 0/0/0/0:4:127,1:0.01:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,58:0.46:-0.14:1.000:0.986 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,64:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,35:0.31:-0.49:1.000:0.976 0/0/1/1:4:74,60:0.45: 0.05:1.000:0.978 0/0/1/1:4:55,61:0.52:-0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,68:0.47: 0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:99,24:0.20:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,52:0.44:-0.36:1.000:0.963 0/0/0/1:4:91,31:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,123:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,31:0.28:-0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,77:0.55: 0.21:1.000:0.984 0/0/0/1:4:93,34:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:114,33:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,67:0.54:-0.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:77,87:0.53: 0.86:1.000:0.993 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,50:0.45:-0.60:1.000:0.984 0/1/1/1:4:33,98:0.73:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,26:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,86:0.54: 0.67:1.000:0.985 0/0/0/1:4:145,40:0.22: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,41:0.42:-0.95:1.000:0.926 0/1/1/1:4:40,107:0.71: 0.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:48,59:0.55:-0.68:1.000:0.983 0/0/1/1:4:81,74:0.48: 0.61:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:97,30:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,47:0.38:-0.22:1.000:0.568 0/0/1/1:4:72,44:0.38:-0.44:1.000:0.572 0/0/1/1:4:99,101:0.50: 1.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,41:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,25:0.20:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,70:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,36:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,86:0.56: 0.51:1.000:0.962 0/0/1:3:75,35:0.32:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,121:0.71: 0.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:59,62:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,28:0.29:-0.95:1.000:0.992 0/0/0/1:4:102,31:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,30:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,93:0.50: 1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,32:0.26:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,31:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,96:0.72:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,61:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,98:0.65: 0.40:1.000:0.804 0/0/0/0/0/1:6:169,33:0.16: 1.88:1.000:0.988 0/0/0/1:4:72,30:0.30:-0.82:1.000:0.989 0/0/0/1:4:73,30:0.29:-0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:48,59:0.55:-0.68:1.000:0.983 0/0/1/1:4:69,65:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,26:0.26:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,20:0.20:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,73:0.51: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,49:0.31: 0.69:1.000:0.971 0/0/0/1:4:156,60:0.28: 2.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,42:0.23: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,31:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,24:0.22:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,54:0.42:-0.06:1.000:0.896 0/0/1/1:4:79,72:0.48: 0.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,129:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,66:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:101,33:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,104:0.48: 2.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,63:0.26: 2.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,65:0.48: 0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:127,51:0.29: 1.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,86:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,74:0.66:-0.60:1.000:0.847 0/0/1/1:4:84,73:0.47: 0.67:1.000:0.990 0/0/0/1:4:130,32:0.20: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.26:-3.06:1.000:0.998 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,70:0.45: 0.67:1.000:0.976 0/0/0/1:4:141,31:0.18: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,106:0.55: 1.56:1.000:0.977 0/0/0/0:4:151,2:0.01: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,26:0.20: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,45:0.26: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,36:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,52:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,62:0.46: 0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:99,93:0.48: 1.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,67:0.47: 0.32:1.000:0.990 0/1/1/1:4:28,85:0.73:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,33:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,74:0.54: 0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:58,64:0.52:-0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,27:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,34:0.29:-0.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:61,61:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,111:0.68: 0.72:1.000:0.953 0/0/0/1:4:95,22:0.19:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,20:0.21:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,65:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,71:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,82:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/0/0/0:4:129,4:0.03: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,106:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,46:0.26: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,97:0.52: 1.48:1.000:0.995 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,33:0.19: 1.05:1.000:1.000 -chr1.1 9654615 chr1.1_009654615 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:24,13:0.39: 0.14:1.000:0.726 0/0/1/1:4:12,12:0.52:-0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,16:0.57:-0.52:1.000:0.958 0/1/1/1:4:9,22:0.69:-0.35:1.000:0.979 0/0/0/1:4:38,9:0.25: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,8:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,5:0.57:-2.16:1.000:0.951 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,18:0.76:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.57:-2.16:1.000:0.951 0/0/0/1:4:11,3:0.27:-1.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,16:0.68:-1.01:1.000:0.960 0/0/0/1:4:28,6:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.46:-0.60:1.000:0.988 0/0/0/1:4:38,6:0.18: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-0.93:1.000:0.503 0/0/1/1:4:22,15:0.44: 0.14:0.997:0.969 0/0/0/1:4:23,7:0.29:-0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,15:0.41: 0.39:1.000:0.887 0/0/1/1:4:21,26:0.57: 0.97:1.000:0.955 0/0/1/1:4:3,2:0.44:-2.49:1.000:0.960 0/0/1/1:4:17,17:0.52:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,14:0.45:-0.10:1.000:0.976 0/1/1/1:4:7,26:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.16:-2.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,15:0.40: 0.55:1.000:0.776 0/0/1/1:4:8,12:0.60:-1.26:1.000:0.749 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,12:0.51:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,25:0.54: 1.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:37,16:0.35: 1.46:1.000:0.798 0/0/1/1:4:21,14:0.44:-0.02:1.000:0.960 0/1/1/1:4:2,5:0.70:-2.33:1.000:0.983 0/1/1/1:4:6,11:0.64:-1.50:1.000:0.723 0/0/1:3:3,2:0.44:-2.49:1.000:0.986 0/1/1/1:4:6,23:0.77:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,12:0.51:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,11:0.39:-0.27:1.000:0.650 0/0/0/1:4:40,11:0.27: 1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,18:0.53:-0.02:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,34:0.63: 1.54:1.000:0.547 0/0/0/1:4:31,7:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,13:0.25: 2.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,25:0.54: 1.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:44,9:0.22: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,11:0.22: 2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.40:-0.19:1.000:0.823 0/0/1/1:4:3,4:0.58:-2.33:1.000:0.909 0/0/1/1:4:14,13:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,12:0.84:-1.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,6:0.19: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.28: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,8:0.22: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.42:-0.10:1.000:0.916 0/0/1/1:4:14,14:0.52:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,19:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,9:0.21: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,14:0.40: 0.31:1.000:0.790 0/0/0/0/1/1:6:28,13:0.36: 0.47:1.000:0.862 0/0/0/1:4:38,14:0.32: 1.38:1.000:0.952 0/0/1/1:4:20,12:0.41:-0.27:1.000:0.887 0/0/1/1:4:27,14:0.38: 0.47:1.000:0.625 0/0/1/1:4:20,12:0.41:-0.27:1.000:0.887 0/0/0/1:4:36,10:0.27: 0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,7:0.21: 0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,8:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,24:0.47: 1.62:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,10:0.59:-1.50:1.000:0.831 0/0/1/1:4:18,15:0.48:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,13:0.62:-1.17:1.000:0.568 0/0/0/1:4:57,6:0.13: 2.28:1.000:0.861 0/0/1/1:4:21,12:0.40:-0.19:1.000:0.823 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,19:0.41: 1.38:1.000:0.835 0/0/1/1:4:20,19:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,22:0.52: 0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,12:0.38: 0.06:1.000:0.533 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,19:0.62:-0.35:1.000:0.632 0/1/1/1:4:10,32:0.74: 0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,38:0.74: 1.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,22:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,9:0.39:-0.76:1.000:0.675 0/0/1/1:4:30,15:0.38: 0.80:1.000:0.533 0/0/1/1:4:9,13:0.60:-1.09:1.000:0.815 1/1/1/1:4:0,54:1.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,26:0.48: 1.87:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,23:0.70:-0.27:1.000:0.987 0/0/1/1:4:19,11:0.41:-0.43:1.000:0.843 0/1/1/1:4:8,26:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,7:0.19: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.16:-0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:43,9:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,5:0.17: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,25:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,12:0.39:-0.10:1.000:0.740 0/0/1/1:4:23,34:0.60: 1.79:1.000:0.776 0/0/1/1:4:22,19:0.49: 0.47:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,10:0.90:-2.00:1.000:0.747 0/0/1/1:4:19,20:0.53: 0.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,32:0.78: 0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,22:0.39: 2.28:1.000:0.705 0/0/0/1:4:27,3:0.13:-0.43:1.000:0.926 0/0/1/1:4:14,23:0.62: 0.14:1.000:0.540 0/1/1/1:4:5,13:0.70:-1.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:22,17:0.47: 0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:34,12:0.31: 0.88:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,22:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,7:0.17: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,10:0.30: 0.47:1.000:0.987 0/0/0/1:4:27,6:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/1:3:10,2:0.22:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,15:0.39: 0.64:1.000:0.702 0/0/0/1:4:19,5:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,26:0.69: 0.14:1.000:0.971 0/0/1/1:4:23,17:0.46: 0.39:1.000:0.987 0/0/1/1:4:18,14:0.47:-0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,17:0.44: 0.55:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,27:0.55: 1.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:19,17:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,19:0.57:-0.10:1.000:0.944 0/1/1/1:4:6,21:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,18:0.41: 1.05:1.000:0.887 0/0/1/1/1/1:6:19,33:0.63: 1.38:1.000:0.846 0/0/0/1:4:17,5:0.28:-1.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,11:0.43:-0.60:1.000:0.946 0/0/0/1:4:29,6:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,27:0.54: 1.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:17,13:0.47:-0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:22,10:0.36:-0.27:1.000:0.702 0/0/1/1:4:18,14:0.47:-0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,14:0.57:-0.85:1.000:0.942 0/0/1/1:4:24,14:0.41: 0.23:1.000:0.853 0/0/0/1:4:32,8:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,12:0.37: 0.14:1.000:0.573 0/1/1/1:4:9,31:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,13:0.33: 0.97:1.000:0.932 0/0/1/1:4:17,12:0.45:-0.52:1.000:0.978 0/1/1/1:4:8,20:0.70:-0.60:1.000:0.983 0/1/1/1:4:10,23:0.68:-0.19:1.000:0.963 0/1/1/1:4:7,19:0.71:-0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:20,11:0.40:-0.35:1.000:0.757 0/0/0/1:4:28,12:0.35: 0.39:1.000:0.812 0/0/1/1:4:23,12:0.39:-0.02:1.000:0.641 0/0/1/1:4:17,14:0.48:-0.35:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,20:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,11:0.30: 0.80:1.000:0.986 0/1/1/1:4:13,28:0.67: 0.47:1.000:0.930 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,13:0.54:-0.85:1.000:0.988 0/0/0/1:4:35,8:0.25: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,21:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,4:0.13: 0.47:1.000:0.898 0/0/0/1:4:21,9:0.35:-0.43:1.000:0.812 0/0/1/1:4:16,16:0.52:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:19,7:0.32:-0.76:1.000:0.952 0/1/1/1:4:8,20:0.70:-0.60:1.000:0.983 0/0/0/1:4:23,9:0.33:-0.27:1.000:0.916 0/1/1/1:4:10,37:0.76: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.44:-0.43:1.000:0.960 0/0/1/1:4:5,4:0.48:-2.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,15:0.48:-0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,20:0.68:-0.52:1.000:0.948 0/0/1/1:4:16,14:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,9:0.29: 0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:8,27:0.74:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,34:0.73: 0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:21,4:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,12:0.39:-0.10:1.000:0.740 0/0/1/1:4:12,11:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,19:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,11:0.59:-1.34:1.000:0.879 0/1/1/1:4:10,32:0.74: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,24:0.57: 0.64:1.000:0.946 0/0/1/1:4:17,20:0.56: 0.14:1.000:0.973 0/0/1/1:4:17,14:0.48:-0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,29:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,14:0.42: 0.14:1.000:0.901 0/1/1/1:4:11,25:0.68: 0.06:1.000:0.958 0/0/0/1:4:20,7:0.31:-0.68:1.000:0.971 0/0/0/1:4:23,10:0.35:-0.19:1.000:0.788 -chr1.1 9788520 chr1.1_009788520 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:149,121:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,148:0.77:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,168:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,112:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,150:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,232:0.81: 1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,205:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,152:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,76:0.75:-2.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,60:0.66:-2.62:1.000:0.897 0/0/1/1:4:120,107:0.54:-0.31:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,228:1.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,251:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,177:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,174:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,141:0.52: 1.24:0.997:0.995 1/1/1/1:4:0,236:1.00:-0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,303:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,173:0.59: 1.60:1.000:0.885 0/1/1/1:4:35,65:0.71:-2.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:73,187:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,183:0.71: 0.69:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,237:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-3.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,122:0.46: 1.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:86,99:0.60:-1.07:1.000:0.788 0/1/1/1:4:72,164:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,204:0.72: 1.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,168:0.79:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,196:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,94:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,14:0.47:-3.80:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,87:0.76:-2.16:1.000:1.000 0/0/1:3:43,25:0.44:-3.20:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,195:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,104:0.47: 0.33:1.000:0.991 0/1/1/1:4:93,166:0.71: 0.27:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,244:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,204:0.81: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,169:0.73: 0.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,268:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,122:0.47: 1.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:172,106:0.45: 0.62:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,269:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,193:0.70: 1.11:1.000:0.983 0/1/1/1:4:94,177:0.72: 0.49:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-3.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,179:0.81:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,142:0.73:-0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,182:0.74: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:131,208:0.68: 1.73:1.000:0.949 0/1/1/1:4:71,127:0.71:-0.84:1.000:0.990 0/1/1/1:4:94,208:0.75: 1.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,176:0.79:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,97:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/1/1/1:4:115,209:0.71: 1.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:66,206:0.81: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:68,167:0.77:-0.16:1.000:0.732 0/1/1/1:4:75,173:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,165:0.75:-0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,268:1.00: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,237:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,177:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,180:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,157:0.74:-0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,195:0.75: 0.73:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,253:0.99: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,104:0.48: 0.15:1.000:0.995 1/1/1/1:4:2,265:0.99: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,139:0.67:-0.27:1.000:0.928 0/0/0/1:4:313,60:0.25: 2.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,225:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,122:0.45: 1.46:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,198:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,112:0.53:-0.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:93,190:0.74: 0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,164:0.85:-0.74:1.000:0.991 0/1/1/1:4:95,184:0.72: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,90:0.47:-0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:74,183:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,190:0.72: 0.86:1.000:0.995 0/1/1/1:4:76,127:0.69:-0.74:1.000:0.974 0/1/1/1:4:58,146:0.77:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,277:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,119:0.68:-0.89:1.000:0.940 0/1/1/1:4:78,162:0.74:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,128:0.67:-0.56:1.000:0.902 0/1/1/1:4:91,161:0.70: 0.15:1.000:0.988 0/1/1/1:4:50,147:0.80:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,188:0.76: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,133:0.75:-0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,208:0.78: 0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,230:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,116:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,176:0.69: 0.67:1.000:0.975 0/0/1/1:4:161,118:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,136:0.73:-0.71:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,253:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,147:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,183:0.77: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,148:0.75:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,170:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,136:0.76:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,195:0.78: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,215:0.74: 1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:105,191:0.71: 0.95:1.000:0.992 0/1/1/1:4:74,146:0.73:-0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,247:0.78: 1.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,162:0.70: 0.20:1.000:0.985 0/1/1/1:4:64,186:0.80: 0.11:1.000:1.000 0/1/1:3:57,74:0.63:-2.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,209:0.75: 1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,145:0.73:-0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:87,149:0.70:-0.14:1.000:0.981 0/1/1/1:4:79,168:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,148:0.72:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,165:0.66: 0.58:1.000:0.886 0/1/1/1:4:81,166:0.74: 0.06:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,172:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,212:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,189:0.73: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:166,196:0.61: 2.15:1.000:0.695 0/1/1/1:4:66,145:0.75:-0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,174:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,147:0.70:-0.25:1.000:0.988 0/0/1/1:4:164,91:0.43: 0.20:1.000:0.944 0/1/1/1:4:73,216:0.80: 0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,127:0.53: 0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:73,151:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,145:0.51: 1.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,162:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,110:0.48: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,143:0.73:-0.51:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,172:0.74: 0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:85,179:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,166:0.74: 0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:75,128:0.70:-0.74:1.000:0.980 0/1/1/1:4:103,197:0.72: 1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,232:0.74: 1.76:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,264:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,174:0.78:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,225:0.74: 1.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,157:0.73:-0.14:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,266:1.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,249:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,81:0.79:-2.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,134:0.75:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,192:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,202:0.77: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,229:0.80: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,203:0.77: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,142:0.70:-0.40:1.000:0.989 0/1/1/1:4:81,192:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,172:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,133:0.77:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,176:0.76: 0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,202:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,117:0.54: 0.06:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,219:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,180:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,173:0.78:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,205:1.00:-0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,212:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,143:0.82:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,140:0.80:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,184:0.74: 0.55:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,223:1.00:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,189:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,145:0.78:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,195:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,199:0.73: 1.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,240:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,173:0.83:-0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:71,167:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,143:0.51: 1.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,225:0.80: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,141:0.75:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,110:0.46: 0.64:1.000:0.989 -chr1.1 10059811 chr1.1_010059811 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,380:.: 0.70:1.000:. ./.:4:83,187:.:-1.26:1.000:. ./.:4:128,235:.: 0.02:1.000:. ./.:4:32,347:.: 0.24:1.000:. ./.:4:43,441:.: 1.69:1.000:. ./.:4:140,315:.: 1.29:1.000:. ./.:4:78,165:.:-1.63:1.000:. ./.:4:115,270:.: 0.33:1.000:. ./.:4:25,303:.:-0.46:1.000:. ./.:4:35,154:.:-2.38:1.000:. ./.:4:48,230:.:-1.15:1.000:. ./.:4:28,298:.:-0.49:1.000:. ./.:4:125,266:.: 0.41:1.000:. ./.:4:117,261:.: 0.23:1.000:. ./.:4:118,255:.: 0.16:1.000:. ./.:4:27,378:.: 0.60:1.000:. ./.:4:35,370:.: 0.60:0.997:. ./.:4:189,204:.: 0.44:1.000:. ./.:4:141,364:.: 1.98:1.000:. ./.:4:27,416:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,226:.:-1.69:1.000:. ./.:4:113,267:.: 0.26:1.000:. ./.:4:146,300:.: 1.17:1.000:. ./.:4:95,222:.:-0.61:1.000:. ./.:4:21,132:.:-2.87:1.000:. ./.:4:32,446:.: 1.61:1.000:. ./.:4:25,373:.: 0.51:1.000:. ./.:4:108,231:.:-0.31:1.000:. ./.:4:32,372:.: 0.59:1.000:. ./.:4:103,258:.: 0.00:1.000:. ./.:4:136,279:.: 0.74:1.000:. ./.:4:32,309:.:-0.28:1.000:. ./.:4:10,99:.:-3.48:1.000:. ./.:4:11,258:.:-1.27:1.000:. ./.:3:9,97:.:-3.52:1.000:. ./.:4:115,235:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,384:.: 0.80:1.000:. ./.:4:28,347:.: 0.19:1.000:. ./.:4:131,279:.: 0.67:1.000:. ./.:4:118,267:.: 0.33:1.000:. ./.:4:26,299:.:-0.50:1.000:. ./.:4:120,252:.: 0.15:1.000:. ./.:4:28,376:.: 0.59:1.000:. ./.:4:39,339:.: 0.23:1.000:. ./.:4:115,284:.: 0.52:1.000:. ./.:4:139,306:.: 1.15:1.000:. ./.:4:29,377:.: 0.62:1.000:. ./.:4:140,489:.: 3.69:1.000:. ./.:4:117,254:.: 0.13:1.000:. ./.:4:36,437:.: 1.54:1.000:. ./.:4:89,238:.:-0.47:1.000:. ./.:4:38,440:.: 1.61:1.000:. ./.:4:102,251:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,364:.: 0.42:1.000:. ./.:4:101,213:.:-0.65:1.000:. ./.:4:107,281:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,295:.:-0.46:1.000:. ./.:4:144,332:.: 1.58:1.000:. ./.:4:113,252:.: 0.05:1.000:. ./.:6:66,235:.:-0.83:1.000:. ./.:4:106,278:.: 0.31:1.000:. ./.:4:91,245:.:-0.35:1.000:. ./.:4:120,286:.: 0.62:1.000:. ./.:4:127,282:.: 0.66:1.000:. ./.:4:133,280:.: 0.71:1.000:. ./.:4:124,254:.: 0.23:1.000:. ./.:4:23,248:.:-1.25:1.000:. ./.:4:110,225:.:-0.36:1.000:. ./.:4:90,273:.: 0.02:1.000:. ./.:4:25,315:.:-0.29:1.000:. ./.:4:147,270:.: 0.77:1.000:. ./.:4:24,369:.: 0.44:1.000:. ./.:4:127,304:.: 0.96:1.000:. ./.:4:117,286:.: 0.57:1.000:. ./.:4:126,261:.: 0.35:1.000:. ./.:4:96,209:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,320:.:-0.29:1.000:. ./.:4:30,349:.: 0.24:1.000:. ./.:4:27,290:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,379:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,259:.:-1.08:1.000:. ./.:4:29,432:.: 1.37:1.000:. ./.:4:117,296:.: 0.71:1.000:. ./.:4:15,316:.:-0.42:1.000:. ./.:4:122,317:.: 1.07:1.000:. ./.:4:120,271:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,188:.:-1.29:1.000:. ./.:4:31,335:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,244:.:-0.22:1.000:. ./.:4:32,301:.:-0.39:1.000:. ./.:4:108,241:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,239:.:-0.03:1.000:. ./.:4:142,288:.: 0.95:1.000:. ./.:4:96,186:.:-1.09:1.000:. ./.:4:97,274:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,264:.: 0.44:1.000:. ./.:4:106,226:.:-0.40:1.000:. ./.:4:83,224:.:-0.75:1.000:. ./.:4:24,361:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,343:.: 0.04:1.000:. ./.:4:18,248:.:-1.31:1.000:. ./.:4:103,255:.:-0.05:1.000:. ./.:4:28,268:.:-0.90:1.000:. ./.:4:24,343:.: 0.08:1.000:. ./.:4:85,205:.:-0.98:1.000:. ./.:4:101,230:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,322:.:-0.16:1.000:. ./.:4:26,345:.: 0.13:1.000:. ./.:4:33,419:.: 1.25:1.000:. ./.:4:112,296:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,339:.: 0.11:1.000:. ./.:4:47,469:.: 2.13:1.000:. ./.:4:112,237:.:-0.17:1.000:. ./.:4:126,282:.: 0.64:1.000:. ./.:3:23,210:.:-1.77:1.000:. ./.:4:19,397:.: 0.75:1.000:. ./.:4:79,219:.:-0.87:1.000:. ./.:4:106,228:.:-0.38:1.000:. ./.:4:108,249:.:-0.06:1.000:. ./.:4:100,235:.:-0.36:1.000:. ./.:4:30,371:.: 0.55:1.000:. ./.:4:97,238:.:-0.36:1.000:. ./.:4:123,275:.: 0.51:1.000:. ./.:4:21,400:.: 0.82:1.000:. ./.:4:28,363:.: 0.41:1.000:. ./.:4:29,351:.: 0.26:1.000:. ./.:6:23,414:.: 1.04:1.000:. ./.:4:181,126:.:-0.75:1.000:. ./.:4:73,171:.:-1.62:1.000:. ./.:4:23,267:.:-0.98:1.000:. ./.:4:47,356:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,293:.:-0.50:1.000:. ./.:4:76,151:.:-1.85:1.000:. ./.:4:20,339:.:-0.03:1.000:. ./.:4:18,299:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,447:.: 1.57:1.000:. ./.:4:129,270:.: 0.52:1.000:. ./.:4:22,279:.:-0.83:1.000:. ./.:4:25,303:.:-0.46:1.000:. ./.:4:93,210:.:-0.80:1.000:. ./.:4:25,388:.: 0.71:1.000:. ./.:4:18,322:.:-0.29:1.000:. ./.:4:19,306:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,265:.:-1.02:1.000:. ./.:4:42,445:.: 1.73:1.000:. ./.:4:131,368:.: 1.90:1.000:. ./.:4:114,241:.:-0.09:1.000:. ./.:4:115,242:.:-0.06:1.000:. ./.:4:33,439:.: 1.53:1.000:. ./.:4:22,287:.:-0.72:1.000:. ./.:4:133,284:.: 0.77:1.000:. ./.:4:107,243:.:-0.16:1.000:. ./.:4:4,173:.:-2.54:1.000:. ./.:4:80,178:.:-1.42:1.000:. ./.:4:29,390:.: 0.80:1.000:. ./.:4:34,381:.: 0.74:1.000:. ./.:4:29,393:.: 0.84:1.000:. ./.:4:113,228:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,235:.:-0.34:1.000:. ./.:4:121,281:.: 0.56:1.000:. ./.:4:88,223:.:-0.69:1.000:. ./.:4:102,209:.:-0.69:1.000:. ./.:4:18,296:.:-0.65:1.000:. ./.:4:106,240:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,343:.: 0.12:1.000:. ./.:4:101,280:.: 0.27:1.000:. ./.:4:18,289:.:-0.75:1.000:. ./.:4:158,171:.:-0.45:1.000:. ./.:4:117,227:.:-0.24:1.000:. ./.:4:95,236:.:-0.42:1.000:. ./.:4:19,244:.:-1.36:1.000:. ./.:4:84,184:.:-1.29:1.000:. ./.:4:28,286:.:-0.65:1.000:. ./.:4:84,240:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,205:.:-0.67:1.000:. ./.:4:84,185:.:-1.27:1.000:. ./.:4:34,410:.: 1.14:1.000:. ./.:4:32,390:.: 0.84:1.000:. ./.:4:116,257:.: 0.16:1.000:. ./.:4:113,207:.:-0.57:1.000:. ./.:4:22,332:.:-0.10:1.000:. ./.:4:42,508:.: 2.60:1.000:. ./.:4:41,398:.: 1.07:1.000:. ./.:4:87,208:.:-0.91:1.000:. ./.:4:106,274:.: 0.26:1.000:. -chr1.1 10182954 chr1.1_010182954 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:50,139:0.72: 1.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,66:0.76:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,29:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,107:0.72: 0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,81:0.43: 1.78:1.000:0.958 0/0/0/1:4:134,33:0.21: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,9:0.20:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,24:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,59:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,18:0.34:-1.81:1.000:0.858 0/0/1/1:4:16,10:0.38:-2.55:1.000:0.612 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,21:0.20:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,22:0.21:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,40:0.27: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,95:0.56: 1.31:1.000:0.970 0/1/1/1:4:56,104:0.64: 1.12:0.997:0.677 0/0/0/1:4:164,45:0.22: 2.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,39:0.27: 0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,98:0.56: 1.48:1.000:0.973 0/0/1/1:4:20,18:0.47:-2.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:84,69:0.44: 0.93:1.000:0.974 0/0/0/1:4:125,47:0.28: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,70:0.54: 0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:17,19:0.52:-2.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,53:0.56:-0.71:1.000:0.968 0/1/1/1:4:33,111:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,37:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,61:0.44: 0.49:1.000:0.966 0/0/0/1:4:80,22:0.23:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,57:0.47:-0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,78:0.55: 0.57:1.000:0.983 0/0/1/1:4:10,13:0.55:-2.63:1.000:0.975 0/0/1/1:4:21,29:0.57:-1.89:1.000:0.948 0/0/1:3:18,7:0.29:-2.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,71:0.47: 0.79:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,99:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,90:0.54: 1.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:75,25:0.26:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,59:0.47: 0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:21,100:0.82: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,34:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,60:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,75:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,21:0.24:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,33:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,131:0.79: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,58:0.61:-0.69:1.000:0.733 0/0/1/1:4:38,43:0.52:-1.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,34:0.44:-1.15:1.000:0.960 0/0/0/1:4:76,31:0.30:-0.33:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,125:0.75: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,60:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,79:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,40:0.30: 0.41:1.000:0.982 0/0/1/1:4:35,45:0.55:-1.07:1.000:0.978 0/0/1/1:4:57,55:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,21:0.26:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,42:0.37:-0.19:1.000:0.504 0/0/0/0/1/1:6:61,40:0.39:-0.50:1.000:0.691 0/0/0/1:4:88,27:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,48:0.34: 0.60:1.000:0.853 0/0/0/1:4:91,27:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,24:0.30:-1.04:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,63:0.49: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,28:0.30:-0.63:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,46:0.68:-1.43:1.000:0.941 0/0/0/1:4:101,39:0.29: 0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:77,33:0.30:-0.25:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,151:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,28:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,40:0.72:-1.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,55:0.66:-1.02:1.000:0.867 0/0/1/1:4:98,101:0.50: 2.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,92:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,20:0.28:-1.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,42:0.39:-0.36:1.000:0.736 0/0/1/1:4:86,69:0.44: 0.98:1.000:0.966 0/0/1/1:4:84,55:0.39: 0.54:1.000:0.730 0/1/1/1:4:30,92:0.74: 0.08:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,83:0.70:-0.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:51,63:0.54:-0.14:1.000:0.986 0/1/1/1:4:42,93:0.68: 0.44:1.000:0.947 0/0/0/1:4:68,20:0.24:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,55:0.43: 0.24:1.000:0.933 0/0/1/1:4:43,27:0.38:-1.34:1.000:0.625 0/1/1/1:4:31,69:0.68:-0.52:1.000:0.951 0/0/1/1:4:47,49:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,76:0.54: 0.49:1.000:0.985 0/0/0/1:4:73,21:0.23:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,59:0.52:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,52:0.43: 0.00:1.000:0.951 0/0/0/1:4:93,29:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,27:0.29:-0.69:1.000:0.990 0/0/0/1:4:80,13:0.15:-0.71:1.000:0.988 0/0/1/1:4:55,51:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/1/1/1:4:18,62:0.76:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,49:0.42:-0.08:1.000:0.907 0/1/1/1:4:31,123:0.79: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,31:0.73:-2.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,53:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,58:0.83:-1.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,84:0.80:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,20:0.29:-1.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:101,29:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,71:0.75:-0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,104:0.73: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,101:0.50: 2.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,83:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,54:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,85:0.49: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,37:0.28: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,49:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1:3:30,14:0.32:-2.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,88:0.66: 0.33:1.000:0.873 0/0/1/1:4:39,30:0.43:-1.37:1.000:0.946 0/0/1/1:4:31,50:0.61:-1.04:1.000:0.730 0/0/1/1:4:44,41:0.47:-0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,57:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,84:0.55: 0.85:1.000:0.980 0/0/1/1:4:55,61:0.52:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,30:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,140:0.75: 1.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,71:0.74:-0.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,89:0.71: 0.13:1.000:0.990 0/0/0/1/1/1:6:67,74:0.51: 0.60:1.000:0.878 0/0/1/1:4:31,29:0.47:-1.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:51,13:0.21:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,47:0.57:-1.04:1.000:0.948 0/1/1/1:4:38,81:0.67: 0.00:1.000:0.919 0/0/1/1:4:62,74:0.53: 0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:52,19:0.27:-1.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,110:0.77: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,52:0.42: 0.13:1.000:0.894 0/0/1/1:4:90,89:0.49: 1.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,37:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,53:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,65:0.46: 0.57:1.000:0.986 0/0/0/1:4:83,25:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,68:0.56: 0.02:1.000:0.973 0/1/1/1:4:28,86:0.74:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,98:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,42:0.45:-0.71:1.000:0.975 0/1/1/1:4:45,123:0.72: 1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,58:0.29: 2.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:130,32:0.21: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,44:0.32: 0.60:1.000:0.963 0/1/1/1:4:43,107:0.70: 0.85:1.000:0.987 0/1/1/1:4:30,80:0.72:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:125,44:0.27: 1.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:110,35:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,16:0.31:-1.81:1.000:0.978 0/0/0/1:4:84,16:0.17:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,55:0.44: 0.08:1.000:0.974 0/0/1/1:4:89,76:0.45: 1.26:1.000:0.983 0/0/1/1:4:69,87:0.55: 1.01:1.000:0.983 0/0/0/1:4:100,37:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,69:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,33:0.28: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,63:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,26:0.21: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,104:0.80: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,36:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,123:0.78: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,27:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,83:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,62:0.47: 0.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:119,41:0.26: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,56:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,61:0.58:-0.44:1.000:0.908 0/0/0/1:4:84,25:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,96:0.70: 0.44:1.000:0.985 0/0/1/1:4:70,77:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,21:0.24:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,57:0.59:-0.66:1.000:0.869 0/1/1/1:4:35,133:0.78: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,84:0.51: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,78:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,40:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,102:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,67:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,120:0.71: 1.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:65,18:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,111:0.74: 0.76:1.000:0.999 -chr1.1 10318074 chr1.1_010318074 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:60,104:0.66: 0.28:1.000:0.864 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,84:0.41: 1.54:1.000:0.863 0/0/1/1:4:98,91:0.49: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,74:0.41: 0.95:1.000:0.843 0/0/1/1:4:134,101:0.45: 2.04:1.000:0.975 0/0/1/1:4:35,39:0.54:-1.96:1.000:0.986 0/1/1/1:4:51,122:0.74: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/0:4:132,8:0.10:-0.32:1.000:0.871 0/0/1/1:4:33,21:0.41:-2.45:1.000:0.852 1/1/1/1:4:3,74:0.97:-1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,72:0.68:-1.04:1.000:0.939 0/0/1/1:4:46,66:0.61:-1.01:1.000:0.690 0/0/0/1:4:104,48:0.34:-0.02:1.000:0.864 0/0/0/1:4:160,43:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,13:0.14:-0.64:1.000:0.966 0/1/1/1:4:59,131:0.72: 0.92:0.997:0.995 0/0/0/1:4:130,65:0.36: 1.04:1.000:0.724 0/1/1/1:4:65,106:0.64: 0.45:1.000:0.729 0/0/0/1:4:185,55:0.26: 2.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,38:0.60:-2.15:1.000:0.828 0/1/1/1:4:59,129:0.72: 0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:144,70:0.35: 1.52:1.000:0.782 0/1/1/1:4:60,105:0.66: 0.30:1.000:0.879 0/1/1/1:4:9,31:0.80:-2.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,54:0.36: 0.13:1.000:0.632 0/1/1/1:4:35,90:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,77:0.69:-0.89:1.000:0.966 0/0/0/1:4:139,34:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,49:0.27: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,132:0.73: 0.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:158,44:0.25: 1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,44:0.69:-2.15:1.000:0.980 0/0/0/1:4:81,24:0.26:-1.19:1.000:0.999 0/0/1:3:25,11:0.33:-2.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,103:0.72:-0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:61,117:0.68: 0.62:1.000:0.964 0/0/0/1:4:97,22:0.22:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,59:0.54:-0.99:1.000:0.989 0/0/1/1:4:105,93:0.48: 1.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,61:0.58:-1.09:1.000:0.923 0/0/1/1:4:54,81:0.62:-0.44:1.000:0.545 0/0/1/1:4:106,68:0.41: 0.52:1.000:0.863 0/1/1/1:4:49,103:0.71:-0.02:1.000:0.990 0/1/1/1:4:41,82:0.69:-0.74:1.000:0.980 0/0/1/1:4:100,87:0.48: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,92:0.60: 0.15:1.000:0.804 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,90:0.51: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,58:0.40: 0.00:1.000:0.783 0/0/1/1:4:62,43:0.43:-1.19:1.000:0.939 0/0/0/1:4:161,81:0.36: 2.21:1.000:0.710 0/1/1/1:4:60,145:0.74: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,76:0.59:-0.49:1.000:0.860 0/0/1/1:4:62,80:0.58:-0.27:1.000:0.906 0/1/1/1:4:53,156:0.78: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,56:0.38: 0.03:1.000:0.631 0/0/1/1:4:128,92:0.44: 1.66:1.000:0.958 0/0/0/1:4:158,45:0.25: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:59,60:0.52:-0.84:1.000:0.873 0/0/1/1:4:109,60:0.38: 0.40:1.000:0.529 0/0/0/1:4:171,51:0.26: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,92:0.62: 0.00:1.000:0.526 0/0/1/1:4:92,52:0.38:-0.22:1.000:0.602 1/1/1/1:4:0,177:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,91:0.45: 1.34:1.000:0.984 0/0/0/1:4:81,30:0.30:-1.04:1.000:0.986 0/1/1/1:4:43,91:0.71:-0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,61:0.57:-1.04:1.000:0.954 0/0/1/1:4:45,63:0.60:-1.11:1.000:0.758 0/0/0/1:4:125,62:0.36: 0.85:1.000:0.741 0/0/1/1:4:48,70:0.61:-0.86:1.000:0.639 0/1/1/1:4:67,180:0.76: 2.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,147:0.78: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,105:0.65: 0.40:1.000:0.745 0/0/0/1:4:137,43:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,29:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,61:0.33: 1.17:1.000:0.918 0/0/1/1:4:105,66:0.41: 0.45:1.000:0.834 0/1/1/1:4:48,73:0.63:-0.79:1.000:0.503 0/0/1/1:4:115,63:0.38: 0.62:1.000:0.515 0/0/1/1:4:129,102:0.46: 1.94:1.000:0.985 0/1/1/1:4:49,86:0.66:-0.44:1.000:0.883 0/0/1/1:4:93,64:0.43: 0.10:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,79:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,60:0.41: 0.00:1.000:0.871 0/0/1/1:4:88,71:0.46: 0.15:1.000:0.988 0/0/0/0:4:161,12:0.11: 0.50:1.000:0.578 0/0/0/1:4:135,36:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,94:0.68:-0.22:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,186:1.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,60:0.44:-0.29:1.000:0.970 0/0/1/1:4:103,93:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,91:0.62:-0.02:1.000:0.564 1/1/1/1:4:2,98:0.98:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,82:0.69:-0.74:1.000:0.980 0/1/1/1:4:48,79:0.65:-0.64:1.000:0.753 0/0/1/1:4:100,81:0.46: 0.70:1.000:0.989 0/0/0/1:4:96,51:0.37:-0.15:1.000:0.570 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,64:0.69:-1.41:1.000:0.980 0/0/1/1:4:107,63:0.39: 0.42:1.000:0.705 0/0/1/1:4:72,54:0.44:-0.67:1.000:0.974 0/0/1/1:4:85,61:0.43:-0.17:1.000:0.958 0/1/1/1:4:48,115:0.74: 0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,81:0.69:-0.77:1.000:0.976 0/1/1/1:4:69,122:0.66: 0.95:1.000:0.893 0/1/1/1:4:54,137:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,97:0.68:-0.10:1.000:0.947 0/0/1/1:4:59,72:0.57:-0.54:1.000:0.954 0/0/0/1:4:89,45:0.36:-0.47:1.000:0.698 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1:3:28,48:0.66:-1.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,101:0.54: 0.99:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,144:0.81: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,87:0.54: 0.30:1.000:0.986 0/0/0/1:4:96,32:0.28:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,100:0.80:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,86:0.43: 1.39:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,58:0.43:-0.27:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:153,62:0.32: 1.54:1.000:0.910 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,41:0.35:-0.72:1.000:0.750 0/0/1/1:4:45,55:0.57:-1.31:1.000:0.953 0/1/1/1:4:49,108:0.72: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,69:0.40: 0.67:1.000:0.816 0/0/0/1:4:74,40:0.37:-0.96:1.000:0.522 0/1/1/1:4:45,78:0.66:-0.74:1.000:0.864 0/0/1/1:4:86,60:0.43:-0.17:1.000:0.943 0/0/1/1:4:107,69:0.41: 0.57:1.000:0.870 0/1/1/1:4:67,141:0.71: 1.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:81,30:0.30:-1.04:1.000:0.986 0/0/0/1:4:106,16:0.17:-0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,75:0.70:-1.01:1.000:0.983 0/0/0/1:4:104,31:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,49:0.52:-1.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,100:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,7:0.09:-0.57:1.000:0.915 0/1/1/1:4:67,130:0.69: 1.09:1.000:0.969 0/1/1/1:4:71,146:0.70: 1.59:1.000:0.986 0/1/1/1:4:48,87:0.67:-0.44:1.000:0.923 0/0/1/1:4:112,66:0.39: 0.62:1.000:0.707 0/0/0/1:4:114,60:0.37: 0.52:1.000:0.596 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,66:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,60:0.40: 0.18:1.000:0.748 0/1/1/1:4:17,38:0.72:-2.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:152,37:0.23: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,75:0.68:-0.94:1.000:0.951 0/0/0/1:4:179,18:0.13: 1.09:1.000:0.902 0/0/1/1:4:60,88:0.62:-0.12:1.000:0.621 0/0/1/1:4:111,109:0.51: 1.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,127:0.82: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,57:0.34: 0.62:1.000:0.836 0/1/1/1:4:53,146:0.76: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,79:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,59:0.40: 0.05:1.000:0.796 0/1/1/1:4:44,73:0.65:-0.89:1.000:0.774 0/1/1/1:4:38,78:0.70:-0.91:1.000:0.986 0/0/1/1:4:59,62:0.53:-0.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,65:0.61:-1.04:1.000:0.733 0/1/1/1:4:51,113:0.72: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,52:0.57:-1.46:1.000:0.945 0/1/1/1:4:47,104:0.72:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:150,12:0.11: 0.23:1.000:0.565 0/0/1/1:4:70,48:0.42:-0.86:1.000:0.931 0/1/1/1:4:32,113:0.80:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,45:0.39:-0.77:1.000:0.688 0/0/1/1:4:94,75:0.46: 0.40:1.000:0.987 0/1/1/1:4:58,115:0.69: 0.50:1.000:0.977 0/0/0/1:4:119,33:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,109:0.65: 0.50:1.000:0.832 0/0/0/1:4:143,50:0.29: 0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:55,77:0.60:-0.52:1.000:0.758 0/0/0/1:4:131,65:0.36: 1.07:1.000:0.740 0/0/0/1:4:126,63:0.36: 0.90:1.000:0.724 0/0/1/1:4:95,86:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,132:0.75: 0.77:1.000:0.999 -chr1.1 10513693 chr1.1_010513693 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:57,85:0.54: 1.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,47:0.55:-0.54:1.000:0.982 0/1/1/1:4:16,87:0.79: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,34:0.31: 0.30:1.000:0.971 0/1/1/1:4:27,132:0.77: 1.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,130:0.69: 2.36:1.000:0.972 0/0/1/1:4:30,36:0.49:-0.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,35:0.31: 0.49:1.000:0.980 0/0/1/1:4:7,12:0.57:-2.29:1.000:0.948 0/1/1/1:4:2,14:0.83:-2.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,19:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,78:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,72:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,58:0.48: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,77:0.55: 0.91:1.000:0.976 0/0/1/1:4:50,59:0.48: 0.43:0.997:0.995 0/1/1/1:4:20,120:0.81: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,90:0.47: 2.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,73:0.45: 1.57:1.000:0.978 0/0/1/1:4:5,7:0.52:-2.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,68:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,75:0.60: 0.58:1.000:0.827 0/0/0/1:4:62,25:0.28:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,58:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,82:0.49: 1.60:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,125:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,68:0.54: 0.55:1.000:0.988 0/0/1/1:4:47,59:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,60:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,78:0.54: 1.03:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,1:0.08:-2.47:1.000:0.991 0/1/1:3:1,5:0.78:-2.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,46:0.33: 1.15:1.000:0.924 0/0/1/1:4:44,56:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,77:0.60: 0.64:1.000:0.778 0/1/1/1:4:9,64:0.84:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,32:0.35:-0.24:1.000:0.822 0/0/0/1:4:56,18:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,97:0.82: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,78:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,48:0.60:-0.66:1.000:0.829 0/1/1/1:4:19,88:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,88:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,77:0.54: 0.97:1.000:0.985 0/0/1/1:4:27,20:0.39:-1.45:1.000:0.715 0/0/0/1:4:53,29:0.34:-0.39:1.000:0.896 0/0/1/1:4:20,37:0.59:-1.15:1.000:0.882 0/1/1/1:4:12,43:0.72:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,67:0.64: 0.03:1.000:0.634 0/1/1/1:4:17,95:0.80: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,106:0.74: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,60:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,77:0.55: 0.91:1.000:0.976 0/1/1/1:4:15,63:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,55:0.56:-0.21:1.000:0.963 0/0/1/1/1/1:6:21,54:0.66:-0.60:1.000:0.912 0/1/1/1:4:17,68:0.74:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,54:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,58:0.55: 0.00:1.000:0.982 0/0/1/1:4:23,32:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,76:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,89:0.70: 0.67:1.000:0.983 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,87:0.66: 0.76:1.000:0.885 0/0/1/1:4:38,39:0.46:-0.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:64,35:0.34: 0.12:1.000:0.896 0/0/1/1:4:40,58:0.53: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:28,11:0.28:-1.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,77:0.86:-0.27:1.000:0.966 0/0/1/1:4:42,65:0.55: 0.36:1.000:0.984 0/1/1/1:4:14,66:0.77:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,33:0.51:-1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,51:0.55:-0.36:1.000:0.978 0/0/1/1:4:32,56:0.57:-0.21:1.000:0.935 0/0/1/1:4:57,44:0.40: 0.18:1.000:0.792 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,19:0.32:-1.18:1.000:0.942 0/0/0/1:4:61,30:0.32:-0.12:1.000:0.962 0/0/0/1:4:71,28:0.28: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,24:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,37:0.47:-0.72:1.000:0.991 0/0/1/1:4:33,65:0.60: 0.09:1.000:0.783 0/0/1/1:4:34,43:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,34:0.52:-1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:55,26:0.31:-0.42:1.000:0.974 0/0/1/1:4:16,25:0.55:-1.63:1.000:0.982 0/0/0/1:4:65,18:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,92:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,66:0.67:-0.15:1.000:0.924 0/0/1/1:4:37,81:0.62: 0.70:1.000:0.516 0/1/1/1:4:16,59:0.72:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,50:0.58:-0.51:1.000:0.919 0/0/1/1:4:31,30:0.44:-1.02:1.000:0.974 0/0/1/1:4:47,62:0.51: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,79:0.56: 0.97:1.000:0.968 0/0/0/1:4:23,10:0.30:-1.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:44,69:0.55: 0.55:1.000:0.981 0/0/0/1:4:38,12:0.24:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,29:0.53:-1.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:22,76:0.71: 0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,21:0.27:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:78,33:0.29: 0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,86:0.51: 1.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,80:0.65: 0.55:1.000:0.750 0/0/1/1:4:38,52:0.52:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,140:0.79: 2.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,97:0.83: 0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:16,62:0.73:-0.51:1.000:0.998 1/1/1:3:3,48:0.92:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,53:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,57:0.87:-0.96:1.000:0.878 0/0/0/1:4:42,27:0.37:-0.78:1.000:0.627 0/0/1/1:4:25,55:0.63:-0.45:1.000:0.502 0/0/1/1:4:33,52:0.55:-0.30:1.000:0.980 0/0/1/1:4:53,69:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,41:0.48:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,54:0.51: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,57:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,24:0.30:-0.54:1.000:0.983 0/0/1/1:4:44,47:0.46:-0.12:1.000:0.990 0/0/0/0/1/1:6:55,43:0.40: 0.09:1.000:0.625 0/1/1/1:4:10,45:0.76:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,39:0.55:-0.93:1.000:0.983 0/1/1/1:4:9,60:0.83:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,45:0.54:-0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:55,60:0.47: 0.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:26,32:0.49:-1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,48:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,54:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,102:0.72: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,66:0.46: 1.00:1.000:0.989 0/1/1/1:4:13,54:0.74:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,20:0.28:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,46:0.56:-0.63:1.000:0.968 0/0/1/1:4:38,57:0.54: 0.00:1.000:0.989 0/0/0/1:4:58,28:0.31:-0.27:1.000:0.968 0/0/0/1:4:82,27:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,15:0.27:-1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,78:0.48: 1.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,146:0.74: 2.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,66:0.47: 0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,68:0.52: 0.64:1.000:0.994 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,48:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,121:0.70: 1.91:1.000:0.988 0/0/1/1:4:58,85:0.53: 1.45:1.000:0.991 0/1/1/1:4:1,8:0.85:-2.60:1.000:0.985 0/0/1/1:4:36,47:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,91:0.79: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,29:0.30: 0.00:1.000:0.987 0/1/1/1:4:27,119:0.75: 1.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,96:0.71: 0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,54:0.47: 0.27:1.000:0.991 0/1/1/1:4:28,108:0.73: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,61:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,82:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,27:0.32:-0.42:1.000:0.955 0/0/1/1:4:46,68:0.53: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:48,68:0.52: 0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,83:0.48: 1.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:49,28:0.34:-0.54:1.000:0.847 0/0/1/1:4:42,64:0.54: 0.33:1.000:0.987 0/1/1/1:4:25,78:0.69: 0.24:1.000:0.980 0/0/0/1:4:73,28:0.28: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,27:0.31:-0.30:1.000:0.978 0/1/1/1:4:21,87:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,68:0.60: 0.21:1.000:0.751 0/0/1/1:4:48,50:0.46: 0.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:31,49:0.55:-0.45:1.000:0.980 0/0/0/1:4:63,26:0.29:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:84,31:0.27: 0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,55:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,82:0.51: 1.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,66:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,36:0.31: 0.58:1.000:0.980 0/1/1/1:4:21,114:0.79: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,39:0.33: 0.58:1.000:0.935 0/1/1/1:4:22,90:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,63:0.52: 0.43:1.000:0.996 -chr1.1 10654139 chr1.1_010654139 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:41,44:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,37:0.52:-0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:63,31:0.34: 0.75:1.000:0.849 0/1/1/1:4:17,68:0.79: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,25:0.26: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,26:0.25: 1.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,15:0.43:-2.44:1.000:0.935 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,63:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,11:0.25:-1.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,11:0.30:-2.28:1.000:0.987 0/1/1/1:4:9,46:0.83:-1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,26:0.33: 0.09:1.000:0.917 0/0/1/1:4:42,33:0.45:-0.29:1.000:0.978 0/0/1/1:4:39,50:0.56: 0.48:1.000:0.964 0/0/1/1:4:46,45:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,52:0.54: 0.86:0.997:0.985 0/0/0/1:4:74,27:0.28: 1.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,44:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,41:0.47: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,20:0.59:-2.55:1.000:0.884 0/1/1/1:4:17,54:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,46:0.48: 0.97:1.000:0.994 0/1/1/1:4:9,50:0.84:-1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,22:0.54:-2.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:51,65:0.56: 1.97:1.000:0.966 0/0/1/1:4:53,38:0.43: 0.59:1.000:0.938 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,55:0.60: 0.64:1.000:0.828 0/0/1/1:4:42,39:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,49:0.53: 0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,40:0.45: 0.59:1.000:0.977 0/0/1/1:4:21,15:0.43:-2.44:1.000:0.935 0/1/1/1:4:6,33:0.84:-2.28:1.000:0.997 0/0/1:3:11,9:0.46:-3.32:1.000:0.944 0/1/1/1:4:17,69:0.79: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,30:0.37: 0.15:1.000:0.521 0/0/1/1:4:35,42:0.55:-0.18:1.000:0.983 0/0/1/1:4:39,29:0.44:-0.68:1.000:0.958 0/1/1/1:4:17,57:0.75:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,48:0.68:-0.57:1.000:0.943 0/0/0/1:4:71,23:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,20:0.21: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,60:0.54: 1.75:1.000:0.989 0/0/0/1:4:64,16:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,25:0.26: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,41:0.47: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:49,53:0.52: 1.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:25,62:0.70: 0.37:1.000:0.986 0/0/1/1:4:39,47:0.55: 0.31:1.000:0.982 0/0/0/1:4:62,15:0.21:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,121:1.00: 2.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,22:0.28: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:66,34:0.35: 1.08:1.000:0.767 0/0/0/1:4:63,17:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,52:0.51: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,42:0.52: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,25:0.29: 0.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:58,54:0.49: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:49,31:0.40:-0.02:1.000:0.660 0/0/0/1:4:66,28:0.31: 0.75:1.000:0.969 0/0/1/1:4:48,49:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,47:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,47:0.62:-0.29:1.000:0.544 0/0/0/1:4:79,25:0.26: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,20:0.23: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,19:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,55:0.58: 0.75:1.000:0.898 0/1/1/1:4:16,49:0.74:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,54:0.51: 1.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,49:0.73:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,28:0.24: 2.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,48:0.58: 0.15:1.000:0.924 0/0/0/1:4:71,23:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,26:0.43:-1.01:1.000:0.942 0/0/1/1:4:65,45:0.42: 1.64:1.000:0.908 0/0/1/1:4:49,47:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,42:0.58:-0.46:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,83:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,44:0.74:-1.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,63:0.74: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,62:0.67: 0.64:1.000:0.900 0/1/1/1:4:20,61:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,39:0.45: 0.48:1.000:0.976 0/0/1/1:4:46,40:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,22:0.44:-1.61:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,38:0.54:-0.57:1.000:0.984 0/1/1/1:4:17,61:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,23:0.47:-1.67:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,67:0.79: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,20:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,22:0.37:-1.01:1.000:0.604 0/0/0/1:4:63,15:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,31:0.34: 0.75:1.000:0.849 0/0/1/1:4:29,38:0.57:-0.73:1.000:0.954 0/0/1/1:4:42,48:0.54: 0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:37,35:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,44:0.51: 0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,36:0.79:-1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,39:0.53:-0.35:1.000:0.992 0/1/1/1:4:15,49:0.75:-0.90:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,40:0.44: 0.64:1.000:0.972 0/0/0/1:4:66,20:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,58:0.72:-0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,51:0.80:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,34:0.43:-0.02:1.000:0.956 0/0/0/1:4:77,23:0.25: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,29:0.45:-0.79:1.000:0.977 0/0/0/1:4:67,30:0.32: 0.92:1.000:0.944 0/0/0/1:4:64,17:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,22:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/1:3:51,9:0.16:-1.12:1.000:0.903 0/0/1/1:4:51,39:0.44: 0.53:1.000:0.970 0/0/0/1:4:42,21:0.35:-0.95:1.000:0.823 0/1/1/1:4:20,62:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,36:0.47:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,31:0.51:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,46:0.53: 0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:31,42:0.57:-0.40:1.000:0.933 0/0/1/1:4:45,41:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,46:0.57: 0.04:1.000:0.952 0/1/1/1:4:21,59:0.72:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,50:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:40,61:0.60: 1.14:1.000:0.653 0/0/0/1:4:42,19:0.33:-1.06:1.000:0.938 0/0/1/1:4:29,26:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:45,12:0.23:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,46:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,28:0.40:-0.46:1.000:0.785 0/0/1/1:4:23,28:0.55:-1.61:1.000:0.979 0/0/1/1:4:37,46:0.56: 0.15:1.000:0.974 0/0/1/1:4:34,38:0.53:-0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:69,24:0.27: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,38:0.42: 0.64:1.000:0.923 0/0/0/1:4:49,15:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,70:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,30:0.44:-0.57:1.000:0.962 0/0/1/1:4:45,43:0.49: 0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,59:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,55:0.74:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,65:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,47:0.51: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,21:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,50:0.53: 0.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:44,43:0.50: 0.37:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,45:0.61:-0.40:1.000:0.663 0/0/0/1:4:65,32:0.34: 0.92:1.000:0.848 0/0/1/1:4:47,50:0.52: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,12:0.33:-2.33:1.000:0.922 0/1/1/1:4:18,33:0.64:-1.61:1.000:0.697 0/0/0/1:4:53,28:0.36: 0.04:1.000:0.710 0/1/1/1:4:25,67:0.72: 0.64:1.000:0.994 0/0/0/1:4:69,28:0.30: 0.92:1.000:0.982 0/0/0/1:4:60,14:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,47:0.68:-0.68:1.000:0.957 0/0/0/1:4:55,27:0.34: 0.09:1.000:0.853 0/0/1/1:4:31,34:0.53:-0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:70,27:0.29: 0.92:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,65:0.78: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,50:0.61: 0.04:1.000:0.654 0/0/1/1:4:61,38:0.39: 1.03:1.000:0.740 0/0/1/1:4:44,39:0.48: 0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,48:0.70:-0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:20,31:0.60:-1.61:1.000:0.749 0/0/0/1:4:64,17:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,52:0.72:-0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,48:0.70:-0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:37,22:0.38:-1.17:1.000:0.621 0/0/1/1:4:43,34:0.45:-0.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:31,33:0.52:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,30:0.58:-1.56:1.000:0.929 0/1/1/1:4:19,64:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,74:0.76: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,41:0.54:-0.24:1.000:0.987 0/0/1/1:4:38,44:0.54: 0.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,42:0.54:-0.13:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,63:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,24:0.34:-0.35:1.000:0.883 0/1/1/1:4:28,78:0.72: 1.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,16:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,49:0.55: 0.53:1.000:0.983 -chr1.1 10740435 chr1.1_010740435 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:177,24:.: 0.40:1.000:. ./.:4:137,32:.:-0.20:1.000:. ./.:4:176,52:.: 0.91:1.000:. ./.:4:176,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:199,57:.: 1.44:1.000:. ./.:4:174,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:134,14:.:-0.59:1.000:. ./.:4:193,36:.: 0.93:1.000:. ./.:4:182,49:.: 0.97:1.000:. ./.:4:33,1:.:-2.73:1.000:. ./.:4:23,3:.:-2.88:1.000:. ./.:4:167,48:.: 0.67:1.000:. ./.:4:167,29:.: 0.31:1.000:. ./.:4:199,19:.: 0.72:1.000:. ./.:4:165,55:.: 0.76:1.000:. ./.:4:172,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:208,29:.: 1.08:0.997:. ./.:4:204,50:.: 1.40:1.000:. ./.:4:224,26:.: 1.33:1.000:. ./.:4:256,43:.: 2.25:1.000:. ./.:4:23,4:.:-2.86:1.000:. ./.:4:185,35:.: 0.76:1.000:. ./.:4:189,41:.: 0.95:1.000:. ./.:4:149,29:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:167,17:.: 0.09:1.000:. ./.:4:167,21:.: 0.16:1.000:. ./.:4:126,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:222,18:.: 1.14:1.000:. ./.:4:229,50:.: 1.87:1.000:. ./.:4:153,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:163,19:.: 0.05:1.000:. ./.:4:20,2:.:-2.96:1.000:. ./.:4:28,8:.:-2.70:1.000:. ./.:3:15,1:.:-3.07:1.000:. ./.:4:178,36:.: 0.65:1.000:. ./.:4:171,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:195,28:.: 0.82:1.000:. ./.:4:158,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:205,32:.: 1.08:1.000:. ./.:4:182,28:.: 0.57:1.000:. ./.:4:157,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:150,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:132,34:.:-0.25:1.000:. ./.:4:180,42:.: 0.80:1.000:. ./.:4:169,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:212,62:.: 1.78:1.000:. ./.:4:26,3:.:-2.83:1.000:. ./.:4:130,33:.:-0.31:1.000:. ./.:4:52,7:.:-2.26:1.000:. ./.:4:137,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:175,17:.: 0.24:1.000:. ./.:4:140,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:169,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:157,39:.: 0.31:1.000:. ./.:4:113,21:.:-0.85:1.000:. ./.:4:150,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:123,17:.:-0.74:1.000:. ./.:4:138,27:.:-0.27:1.000:. ./.:6:105,23:.:-0.97:1.000:. ./.:4:154,49:.: 0.44:1.000:. ./.:4:146,31:.:-0.05:1.000:. ./.:4:147,41:.: 0.16:1.000:. ./.:4:96,15:.:-1.29:1.000:. ./.:4:166,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:161,20:.: 0.03:1.000:. ./.:4:119,18:.:-0.80:1.000:. ./.:4:183,23:.: 0.50:1.000:. ./.:4:147,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:126,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:164,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,19:.:-1.59:1.000:. ./.:4:110,30:.:-0.74:1.000:. ./.:4:154,32:.: 0.12:1.000:. ./.:4:163,24:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,19:.:-0.80:1.000:. ./.:4:139,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:128,24:.:-0.52:1.000:. ./.:4:157,24:.: 0.03:1.000:. ./.:4:109,30:.:-0.76:1.000:. ./.:4:145,35:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,42:.: 0.56:1.000:. ./.:4:149,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:95,23:.:-1.15:1.000:. ./.:4:188,33:.: 0.78:1.000:. ./.:4:111,27:.:-0.78:1.000:. ./.:4:136,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:145,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:129,29:.:-0.40:1.000:. ./.:4:134,20:.:-0.48:1.000:. ./.:4:186,29:.: 0.67:1.000:. ./.:4:111,16:.:-0.99:1.000:. ./.:4:177,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:167,42:.: 0.56:1.000:. ./.:4:141,29:.:-0.18:1.000:. ./.:4:129,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:132,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:170,50:.: 0.76:1.000:. ./.:4:87,3:.:-1.68:1.000:. ./.:4:138,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:133,27:.:-0.37:1.000:. ./.:4:116,33:.:-0.57:1.000:. ./.:4:125,24:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:132,20:.:-0.52:1.000:. ./.:4:168,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:186,30:.: 0.69:1.000:. ./.:4:175,27:.: 0.42:1.000:. ./.:4:123,19:.:-0.70:1.000:. ./.:4:227,41:.: 1.66:1.000:. ./.:4:164,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:171,43:.: 0.65:1.000:. ./.:3:59,3:.:-2.21:1.000:. ./.:4:156,24:.: 0.01:1.000:. ./.:4:138,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:114,27:.:-0.72:1.000:. ./.:4:136,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:118,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:147,15:.:-0.33:1.000:. ./.:4:114,29:.:-0.68:1.000:. ./.:4:187,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:207,60:.: 1.65:1.000:. ./.:4:143,30:.:-0.12:1.000:. ./.:4:143,36:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:132,24:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:147,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:194,57:.: 1.34:1.000:. ./.:4:77,17:.:-1.61:1.000:. ./.:4:117,25:.:-0.70:1.000:. ./.:4:152,17:.:-0.20:1.000:. ./.:4:198,26:.: 0.84:1.000:. ./.:4:158,22:.: 0.01:1.000:. ./.:4:140,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:140,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:127,41:.:-0.22:1.000:. ./.:4:141,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:170,39:.: 0.56:1.000:. ./.:4:175,32:.: 0.52:1.000:. ./.:4:127,14:.:-0.72:1.000:. ./.:4:229,43:.: 1.74:1.000:. ./.:4:222,34:.: 1.44:1.000:. ./.:4:180,32:.: 0.61:1.000:. ./.:4:179,31:.: 0.57:1.000:. ./.:4:178,10:.: 0.16:1.000:. ./.:4:164,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:245,32:.: 1.83:1.000:. ./.:4:176,25:.: 0.40:1.000:. ./.:4:28,5:.:-2.75:1.000:. ./.:4:146,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:167,23:.: 0.20:1.000:. ./.:4:177,44:.: 0.78:1.000:. ./.:4:210,41:.: 1.34:1.000:. ./.:4:212,41:.: 1.38:1.000:. ./.:4:161,65:.: 0.87:1.000:. ./.:4:196,27:.: 0.82:1.000:. ./.:4:168,25:.: 0.25:1.000:. ./.:4:139,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:160,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:196,17:.: 0.63:1.000:. ./.:4:138,6:.:-0.67:1.000:. ./.:4:156,30:.: 0.12:1.000:. ./.:4:165,27:.: 0.24:1.000:. ./.:4:180,64:.: 1.21:1.000:. ./.:4:173,10:.: 0.07:1.000:. ./.:4:150,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:166,29:.: 0.29:1.000:. ./.:4:145,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:163,27:.: 0.20:1.000:. ./.:4:174,23:.: 0.33:1.000:. ./.:4:119,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,28:.:-0.05:1.000:. ./.:4:229,33:.: 1.55:1.000:. ./.:4:203,37:.: 1.14:1.000:. ./.:4:213,6:.: 0.74:1.000:. ./.:4:175,39:.: 0.65:1.000:. ./.:4:197,36:.: 1.01:1.000:. ./.:4:243,32:.: 1.80:1.000:. ./.:4:230,44:.: 1.78:1.000:. ./.:4:136,11:.:-0.61:1.000:. ./.:4:158,41:.: 0.37:1.000:. -chr1.1 11053888 chr1.1_011053888 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,168:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,86:.:-2.37:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.39:1.000:. ./.:4:67,209:.: 0.09:1.000:. ./.:4:93,353:.: 2.30:1.000:. ./.:4:0,351:.: 1.06:1.000:. ./.:4:53,130:.:-1.11:1.000:. ./.:4:62,279:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,108:.:-1.92:1.000:. ./.:4:48,57:.:-2.12:1.000:. ./.:4:0,130:.:-1.80:1.000:. ./.:4:57,168:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.17:1.000:. ./.:4:79,204:.: 0.18:1.000:. ./.:4:132,143:.: 0.08:0.997:. ./.:4:65,101:.:-1.33:1.000:. ./.:4:102,184:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,392:.: 1.60:1.000:. ./.:4:12,90:.:-2.16:1.000:. ./.:4:53,151:.:-0.84:1.000:. ./.:4:78,222:.: 0.40:1.000:. ./.:4:66,146:.:-0.74:1.000:. ./.:4:10,50:.:-2.71:1.000:. ./.:4:68,165:.:-0.46:1.000:. ./.:4:137,136:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,241:.: 0.33:1.000:. ./.:4:84,258:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.69:1.000:. ./.:4:46,207:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,45:.:-2.73:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.54:1.000:. ./.:3:0,80:.:-2.45:1.000:. ./.:4:68,157:.:-0.57:1.000:. ./.:4:133,126:.:-0.13:1.000:. ./.:4:64,169:.:-0.46:1.000:. ./.:4:72,240:.: 0.56:1.000:. ./.:4:58,221:.: 0.13:1.000:. ./.:4:143,65:.:-0.79:1.000:. ./.:4:65,204:.: 0.00:1.000:. ./.:4:64,363:.: 2.05:1.000:. ./.:4:94,130:.:-0.58:1.000:. ./.:4:117,299:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,384:.: 1.49:1.000:. ./.:4:75,249:.: 0.71:1.000:. ./.:4:72,25:.:-2.23:1.000:. ./.:4:62,206:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,355:.: 1.83:1.000:. ./.:4:66,174:.:-0.37:1.000:. ./.:4:71,287:.: 1.15:1.000:. ./.:4:68,228:.: 0.35:1.000:. ./.:4:80,196:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,242:.: 0.62:1.000:. ./.:4:60,213:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,447:.: 2.31:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.58:1.000:. ./.:6:68,246:.: 0.58:1.000:. ./.:4:70,326:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,206:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.66:1.000:. ./.:4:135,155:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.88:1.000:. ./.:4:44,105:.:-1.55:1.000:. ./.:4:69,198:.:-0.02:1.000:. ./.:4:68,153:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,377:.: 1.40:1.000:. ./.:4:95,45:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,370:.: 1.31:1.000:. ./.:4:123,57:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.17:1.000:. ./.:4:72,137:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.86:1.000:. ./.:4:91,228:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,149:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.88:1.000:. ./.:4:81,265:.: 1.00:1.000:. ./.:4:87,248:.: 0.86:1.000:. ./.:4:64,127:.:-1.01:1.000:. ./.:4:62,230:.: 0.30:1.000:. ./.:4:167,75:.:-0.35:1.000:. ./.:4:75,267:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,119:.:-1.01:1.000:. ./.:4:76,272:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,291:.: 0.29:1.000:. ./.:4:59,141:.:-0.89:1.000:. ./.:4:169,204:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,360:.: 1.18:1.000:. ./.:4:68,239:.: 0.49:1.000:. ./.:4:153,71:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,179:.:-1.16:1.000:. ./.:4:105,167:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,270:.: 0.88:1.000:. ./.:4:59,193:.:-0.22:1.000:. ./.:4:84,238:.: 0.69:1.000:. ./.:4:69,145:.:-0.71:1.000:. ./.:4:99,165:.:-0.06:1.000:. ./.:4:74,200:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,319:.: 1.47:1.000:. ./.:4:68,140:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,131:.:-0.71:1.000:. ./.:4:88,175:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,276:.: 1.17:1.000:. ./.:4:63,207:.: 0.01:1.000:. ./.:4:97,243:.: 0.92:1.000:. ./.:4:78,374:.: 2.37:1.000:. ./.:4:157,148:.: 0.47:1.000:. ./.:3:61,155:.:-0.68:1.000:. ./.:4:188,83:.: 0.03:1.000:. ./.:4:134,112:.:-0.30:1.000:. ./.:4:54,197:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,239:.: 0.64:1.000:. ./.:4:85,271:.: 1.13:1.000:. ./.:4:64,226:.: 0.27:1.000:. ./.:4:66,268:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.14:1.000:. ./.:4:142,75:.:-0.67:1.000:. ./.:4:60,214:.: 0.07:1.000:. ./.:4:163,71:.:-0.45:1.000:. ./.:6:91,360:.: 2.36:1.000:. ./.:4:0,191:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.75:1.000:. ./.:4:50,174:.:-0.58:1.000:. ./.:4:121,150:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.44:1.000:. ./.:4:138,170:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,249:.:-0.26:1.000:. ./.:4:94,337:.: 2.10:1.000:. ./.:4:69,207:.: 0.09:1.000:. ./.:4:70,328:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.21:1.000:. ./.:4:62,147:.:-0.78:1.000:. ./.:4:80,213:.: 0.31:1.000:. ./.:4:154,81:.:-0.44:1.000:. ./.:4:67,142:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,272:.: 1.22:1.000:. ./.:4:87,239:.: 0.74:1.000:. ./.:4:94,139:.:-0.46:1.000:. ./.:4:79,218:.: 0.36:1.000:. ./.:4:76,170:.:-0.30:1.000:. ./.:4:130,66:.:-0.94:1.000:. ./.:4:94,261:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,249:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,122:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.02:1.000:. ./.:4:66,236:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,271:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,249:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,371:.: 1.32:1.000:. ./.:4:69,176:.:-0.31:1.000:. ./.:4:78,284:.: 1.21:1.000:. ./.:4:52,220:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.40:1.000:. ./.:4:57,193:.:-0.24:1.000:. ./.:4:69,147:.:-0.68:1.000:. ./.:4:92,104:.:-0.94:1.000:. ./.:4:52,131:.:-1.11:1.000:. ./.:4:121,44:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.76:1.000:. ./.:4:66,203:.: 0.00:1.000:. ./.:4:54,131:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.13:1.000:. ./.:4:54,211:.:-0.05:1.000:. ./.:4:60,197:.:-0.15:1.000:. ./.:4:113,73:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.68:1.000:. ./.:4:65,186:.:-0.23:1.000:. ./.:4:83,150:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,221:.: 0.51:1.000:. ./.:4:63,244:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.44:1.000:. ./.:4:157,92:.:-0.26:1.000:. ./.:4:68,292:.: 1.18:1.000:. ./.:4:85,255:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.32:1.000:. -chr1.1 11205612 chr1.1_011205612 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:22,89:0.80: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,17:0.61:-1.83:1.000:0.677 0/1/1/1:4:21,88:0.80: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,86:0.99:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,105:0.82: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,88:0.77: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,26:0.68:-1.54:1.000:0.953 0/1/1/1:4:32,48:0.65:-0.26:1.000:0.754 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,28:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,11:0.56:-2.09:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,20:0.50:-1.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,49:0.73:-0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:16,67:0.80:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,45:0.73:-0.84:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,83:0.79: 0.55:0.997:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,35:0.49: 0.16:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.69:-1.96:1.000:0.975 0/1/1/1:4:21,53:0.72:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,61:0.63: 0.55:1.000:0.604 0/1/1/1:4:19,32:0.66:-1.19:1.000:0.895 0/1/1/1:4:1,4:0.80:-2.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:7,64:0.90:-0.55:1.000:0.792 0/1/1/1:4:15,78:0.84: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,42:0.64:-0.55:1.000:0.692 0/1/1/1:4:24,71:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,57:0.82:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,49:0.75:-0.74:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-2.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1:3:0,12:1.00:-2.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,45:0.80:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,56:0.77:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,45:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,13:0.41:-1.51:1.000:0.885 0/1/1/1:4:18,49:0.73:-0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,80:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,24:0.42:-0.42:1.000:0.904 0/1/1/1:4:32,89:0.74: 1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,76:0.85: 0.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:61,46:0.53: 0.61:1.000:0.992 0/1/1/1:4:35,88:0.72: 1.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,5:0.43:-2.35:1.000:0.958 0/1/1/1:4:14,60:0.81:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,77:0.62: 1.61:1.000:0.599 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,110:0.78: 1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,83:0.71: 1.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:33,16:0.43:-1.25:1.000:0.936 0/1/1/1:4:15,57:0.79:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,91:0.88: 0.48:1.000:0.732 0/1/1/1:4:30,79:0.73: 0.67:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,93:0.76: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:42,71:0.67: 0.80:1.000:0.919 0/1/1/1:4:55,73:0.63: 1.28:1.000:0.510 0/1/1/1:4:17,67:0.79:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,36:0.44: 0.58:1.000:0.972 0/1/1/1:4:25,55:0.70:-0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:55,60:0.59: 0.87:1.000:0.843 0/1/1/1:4:24,84:0.77: 0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,62:0.63: 0.61:1.000:0.591 0/0/1/1:4:56,30:0.46:-0.06:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,75:0.68: 0.83:1.000:0.965 0/1/1/1:4:6,32:0.84:-1.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,71:0.80: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,33:0.56:-0.58:1.000:0.968 0/1/1/1:4:24,104:0.81: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,25:0.44:-0.45:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,100:0.74: 1.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,137:0.77: 2.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,45:0.68:-0.61:1.000:0.956 0/0/1/1:4:71,33:0.41: 0.51:1.000:0.887 0/1/1/1:4:23,77:0.77: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,90:0.75: 1.00:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,64:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,54:0.62: 0.22:1.000:0.507 0/1/1/1:4:42,73:0.67: 0.87:1.000:0.918 0/1/1/1:4:22,57:0.73:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,126:0.75: 2.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,35:0.55:-0.35:1.000:0.982 0/0/1/1:4:67,41:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,55:0.68:-0.13:1.000:0.960 0/1/1/1:4:33,74:0.71: 0.61:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,76:0.74: 0.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,151:1.00: 2.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,82:0.63: 1.70:1.000:0.610 0/1/1/1:4:50,72:0.64: 1.09:1.000:0.681 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,73:0.81: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,91:0.76: 1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,114:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,68:0.79:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,89:0.62: 2.28:1.000:0.584 0/0/1/1:4:55,69:0.62: 1.16:1.000:0.612 1/1/1:3:7,52:0.88:-0.93:1.000:0.967 0/1/1/1:4:33,89:0.73: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,48:0.57: 0.38:1.000:0.958 0/1/1/1:4:25,106:0.81: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,104:0.76: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,87:0.78: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,52:0.71:-0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:35,114:0.76: 1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,74:0.73: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,63:0.74:-0.06:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,63:0.72: 0.03:1.000:0.995 1/1/1/1/1/1:6:0,201:1.00: 3.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,36:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,63:0.72: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,65:0.72: 0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,106:0.81: 1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,86:0.99:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,38:0.68:-0.96:1.000:0.961 0/1/1/1:4:8,59:0.88:-0.68:1.000:0.794 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,97:0.84: 0.87:1.000:0.995 0/1/1/1:4:21,73:0.77: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,111:0.75: 1.89:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,99:0.99: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,27:0.39: 0.06:1.000:0.708 0/1/1/1:4:24,68:0.74: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,77:0.71: 0.74:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,68:0.64: 0.83:1.000:0.729 0/0/1/1:4:39,39:0.58:-0.32:1.000:0.919 0/1/1/1:4:30,42:0.63:-0.51:1.000:0.625 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,43:0.67:-0.64:1.000:0.911 0/0/1/1:4:49,32:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,38:0.60:-0.55:1.000:0.770 0/1/1/1:4:8,19:0.72:-1.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,71:0.85:-0.16:1.000:0.984 0/1/1/1:4:9,47:0.84:-1.03:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,70:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,77:0.80: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,96:0.85: 0.80:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,56:0.67: 0.03:1.000:0.901 0/1/1/1:4:14,58:0.80:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,39:0.85:-1.35:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,25:0.44:-0.45:1.000:0.968 0/1/1/1:4:6,39:0.86:-1.38:1.000:0.950 0/0/1/1:4:37,23:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,38:0.69:-1.00:1.000:0.975 0/0/1/1:4:55,31:0.47:-0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:31,18:0.48:-1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,46:0.68:-0.58:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,61:0.81:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,26:0.46:-0.48:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,31:0.74:-1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,63:0.71: 0.10:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,68:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,51:0.76:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,65:0.69: 0.29:1.000:0.978 0/1/1/1:4:24,69:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,95:0.85: 0.77:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,103:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,56:0.81:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,50:0.66:-0.26:1.000:0.886 -chr1.1 11294632 chr1.1_011294632 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:168,195:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,217:0.79:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,81:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:197,73:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,236:0.51: 2.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:272,97:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,57:0.23:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,163:0.51:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:204,98:0.30:-0.09:1.000:0.982 0/0/0/1:4:120,39:0.23:-2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,126:0.56:-1.45:1.000:0.967 0/1/1/1:4:69,206:0.73:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:144,173:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:235,88:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:309,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,186:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:160,179:0.50: 0.49:0.997:0.997 0/1/1/1:4:88,203:0.68:-0.26:1.000:0.955 0/0/1/1:4:180,183:0.48: 0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:266,94:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,155:0.79:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,75:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,75:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,86:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,37:0.30:-3.06:1.000:0.982 0/0/1/1:4:166,211:0.53: 1.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:153,169:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,153:0.55:-0.66:1.000:0.979 0/0/1/1:4:154,210:0.55: 0.89:1.000:0.977 0/0/0/0:4:309,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,98:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,86:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,64:0.56:-3.12:1.000:0.970 0/0/0/1:4:123,36:0.21:-2.35:1.000:1.000 0/0/0:3:86,0:0.00:-3.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,87:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,185:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,165:0.55:-0.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:146,174:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/0:4:335,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,158:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,203:0.52: 1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,219:0.51: 1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,143:0.46:-0.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:150,203:0.55: 0.71:1.000:0.979 0/0/0/1:4:221,82:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,136:0.44:-0.20:1.000:0.960 0/0/1/1:4:220,248:0.50: 2.53:1.000:0.997 0/0/0/0:4:305,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,228:0.56: 1.30:1.000:0.965 0/0/0/1:4:175,74:0.28:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:297,80:0.20: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,82:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,285:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,138:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:308,101:0.23: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,170:0.53:-0.06:1.000:0.990 0/0/0/1:4:285,106:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:301,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:181,85:0.30:-0.66:1.000:0.865 0/0/0/1:4:216,85:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:312,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,243:0.52: 2.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:260,81:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,160:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:243,81:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,71:0.28:-1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,143:0.47:-0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:159,160:0.48: 0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,200:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:308,95:0.22: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,206:0.51: 1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:225,241:0.49: 2.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,180:0.52: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,169:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,164:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:272,80:0.21: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,177:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,113:0.40:-0.64:1.000:0.785 0/0/0/1:4:224,95:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,189:0.74:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:240,75:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:341,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,125:0.48:-0.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:269,93:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,194:0.53: 0.65:1.000:0.992 0/0/0/0:4:264,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,80:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:329,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,86:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:311,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,89:0.29:-0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:167,179:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,67:0.30:-1.54:1.000:0.987 0/0/0/1:4:219,83:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,181:0.52: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,145:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,139:0.48:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,299:0.75: 1.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,70:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,83:0.28:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:252,89:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,91:0.40:-1.48:1.000:0.801 0/0/0/1:4:234,70:0.21:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,77:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,87:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,156:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,136:0.48:-0.60:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,316:0.76: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,89:0.29:-0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:143,152:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:106,346:0.75: 2.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:238,88:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,149:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/1/1:3:70,158:0.68:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,293:0.77: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,215:0.54: 1.19:1.000:0.989 0/0/0/0:4:303,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,85:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:268,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,181:0.53: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:207,82:0.26:-0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:214,71:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,233:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:198,76:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,271:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:299,81:0.20: 1.14:1.000:0.932 0/0/1/1:4:131,137:0.48:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,41:0.19:-1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,173:0.75:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,158:0.47: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,156:0.53:-0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:123,57:0.30:-2.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:164,157:0.46: 0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:131,134:0.48:-0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:191,223:0.51: 1.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,61:0.19:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,147:0.46:-0.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:172,62:0.25:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,149:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,167:0.45: 0.70:1.000:0.979 0/0/1/1:4:153,151:0.47:-0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,124:0.50:-1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,67:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,194:0.47: 1.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:198,222:0.50: 1.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,190:0.52: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:213,101:0.30: 0.10:1.000:0.985 0/0/0/1:4:328,112:0.24: 2.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,189:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,166:0.46: 0.57:1.000:0.986 0/0/0/1:4:229,67:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,88:0.69:-2.88:1.000:0.969 0/0/0/0:4:235,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,274:0.72: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:253,89:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,261:0.74: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,94:0.26: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:184,59:0.22:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,108:0.29: 0.54:1.000:0.989 0/0/0/1:4:267,92:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,72:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,60:0.23:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,148:0.46:-0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:161,171:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,184:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,131:0.49:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:204,83:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:137,173:0.53: 0.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:211,57:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,128:0.44:-0.52:1.000:0.968 0/0/1/1:4:116,155:0.55:-0.58:1.000:0.982 0/0/1/1:4:115,146:0.53:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:111,120:0.49:-1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,57:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:235,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,195:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,182:0.52: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:267,91:0.24: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:266,14:0.05:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,170:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,199:0.51: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:251,98:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,82:0.26:-0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,172:0.56:-0.19:1.000:0.971 -chr1.1 11550587 chr1.1_011550587 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:52,254:0.80: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,180:0.73:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:197,67:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,149:0.55: 0.14:1.000:0.975 0/1/1/1:4:85,237:0.70: 1.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:263,120:0.30: 2.18:1.000:0.980 0/0/0/1:4:125,41:0.24:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,150:0.47: 0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:136,110:0.43:-0.06:1.000:0.951 0/0/1/1:4:59,42:0.40:-2.42:1.000:0.807 0/1/1/1:4:24,49:0.64:-2.88:1.000:0.708 1/1/1/1:4:1,282:1.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,140:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:214,83:0.27: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:185,80:0.29: 0.25:1.000:0.990 0/1/1/1:4:80,243:0.72: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,244:0.77: 0.87:0.997:1.000 0/1/1/1:4:87,240:0.70: 1.26:1.000:0.985 0/0/1/1:4:139,182:0.54: 1.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:130,171:0.55: 0.84:1.000:0.984 0/1/1/1:4:16,48:0.72:-3.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:180,72:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,154:0.47: 1.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:173,76:0.30:-0.01:1.000:0.987 0/0/0/1:4:28,14:0.32:-3.38:1.000:0.943 0/1/1/1:4:61,260:0.78: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,221:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,155:0.47: 1.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:67,252:0.75: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:221,85:0.27: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,73:0.26: 0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,156:0.54: 0.48:1.000:0.989 0/0/1/1:4:17,12:0.40:-3.59:1.000:0.791 0/0/1/1:4:47,42:0.46:-2.62:1.000:0.984 0/0/1:3:29,9:0.23:-3.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,84:0.31: 0.22:1.000:0.973 0/1/1/1:4:48,214:0.78: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,217:0.69: 0.79:1.000:0.980 0/0/1/1:4:163,148:0.46: 1.00:1.000:0.987 0/0/0/1:4:200,82:0.28: 0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,192:0.77:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,140:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,233:0.74: 0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,169:0.77:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,147:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:197,76:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,168:0.58: 0.50:1.000:0.931 0/0/1/1:4:164,164:0.48: 1.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:152,65:0.29:-0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:107,150:0.56: 0.12:1.000:0.967 0/0/1/1:4:109,111:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,167:0.59: 0.33:1.000:0.848 0/0/0/1:4:143,47:0.24:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,240:0.74: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,158:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,71:0.32:-0.53:1.000:0.959 0/1/1/1:4:45,193:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,57:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,79:0.29: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:96,112:0.52:-0.68:1.000:0.871 0/0/1/1:4:136,157:0.52: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,61:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,149:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,68:0.29:-0.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:118,158:0.55: 0.43:1.000:0.980 0/0/0/1:4:185,54:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,115:0.64:-1.25:1.000:0.636 0/0/1/1:4:118,145:0.53: 0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:131,143:0.50: 0.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,308:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,68:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,134:0.75:-1.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,208:0.73: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,142:0.51: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,201:0.71: 0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,109:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,124:0.56:-0.61:1.000:0.965 0/1/1/1:4:52,203:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,100:0.43:-0.43:1.000:0.953 0/0/1/1:4:104,118:0.51:-0.45:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,217:0.99:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,109:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:161,80:0.32:-0.14:1.000:0.947 0/0/1/1:4:95,135:0.56:-0.32:1.000:0.962 0/0/1/1:4:129,133:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,152:0.54: 0.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:131,52:0.28:-1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,98:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,52:0.25:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,126:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:170,51:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,71:0.32:-0.56:1.000:0.952 0/0/1/1:4:129,158:0.53: 0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:177,59:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,84:0.32: 0.14:1.000:0.962 0/0/1/1:4:122,123:0.48:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,114:0.55:-0.84:1.000:0.977 0/1/1/1:4:57,168:0.71:-0.40:1.000:0.993 0/1/1/1:4:46,188:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,143:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,88:0.53:-1.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:183,67:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,104:0.63:-1.49:1.000:0.557 0/0/1/1:4:83,104:0.53:-1.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:105,106:0.48:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,105:0.46:-0.50:1.000:0.989 0/0/1/1:4:90,131:0.57:-0.46:1.000:0.950 0/0/1/1:4:118,155:0.55: 0.38:1.000:0.984 0/1/1/1:4:70,258:0.75: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,78:0.28: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,94:0.47:-0.90:1.000:0.991 0/1/1/1:4:99,277:0.70: 2.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:115,135:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,130:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/1/1:3:51,109:0.65:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,211:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,103:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,60:0.31:-0.97:1.000:0.978 0/0/0/1:4:127,58:0.30:-1.05:1.000:0.980 0/0/0/1:4:157,57:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,225:0.72: 0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:126,64:0.33:-0.97:1.000:0.932 0/0/0/1:4:185,65:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,268:0.74: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,144:0.55: 0.02:1.000:0.979 0/1/1/1:4:56,215:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:141,123:0.45: 0.24:1.000:0.740 0/0/1/1:4:103,97:0.47:-0.81:1.000:0.991 0/0/0/1:4:122,55:0.30:-1.18:1.000:0.983 0/1/1/1:4:60,170:0.70:-0.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:32,191:0.83:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,151:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,29:0.22:-1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,218:0.83: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,144:0.55: 0.01:1.000:0.977 0/1/1/1:4:93,280:0.72: 2.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:152,87:0.35:-0.17:1.000:0.766 0/1/1/1:4:49,183:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,114:0.55:-0.82:1.000:0.980 0/0/1/1:4:87,111:0.54:-0.84:1.000:0.988 0/1/1/1:4:60,205:0.74: 0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,171:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,129:0.53:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,112:0.55:-0.87:1.000:0.981 0/0/1/1:4:115,141:0.53: 0.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:173,182:0.49: 1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,159:0.54: 0.51:1.000:0.985 0/0/1/1:4:120,137:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,170:0.54: 0.91:1.000:0.990 0/1/1/1:4:44,212:0.80: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,163:0.47: 1.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:205,88:0.29: 0.71:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,56:0.62:-2.66:1.000:0.530 0/0/0/1:4:158,55:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,208:0.72: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,159:0.52: 0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:93,291:0.72: 2.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,78:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:174,75:0.29:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,139:0.46: 0.66:1.000:0.989 0/0/0/1:4:164,50:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,58:0.27:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,167:0.59: 0.35:1.000:0.861 0/0/1/1:4:120,126:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,261:0.77: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,155:0.57: 0.19:1.000:0.948 0/1/1/1:4:46,179:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,136:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:151,148:0.48: 0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:175,56:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,192:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,200:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,144:0.54: 0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:122,158:0.54: 0.50:1.000:0.986 0/0/0/1:4:171,82:0.31: 0.06:1.000:0.965 0/0/0/1:4:133,66:0.32:-0.82:1.000:0.948 0/0/1/1:4:130,184:0.56: 1.05:1.000:0.963 0/1/1/1:4:77,232:0.72: 0.97:1.000:0.994 0/0/0/1:4:200,79:0.28: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:201,69:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,229:0.78: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,300:0.73: 2.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,194:0.53: 1.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:173,66:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:72,211:0.71: 0.55:1.000:0.992 -chr1.1 11602715 chr1.1_011602715 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,13:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.90:1.000:. ./.:4:20,13:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.40:1.000:. ./.:4:9,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:11,8:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,16:.: 1.04:1.000:. ./.:4:9,18:.: 1.17:1.000:. ./.:4:6,17:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.: 1.31:1.000:. ./.:4:9,16:.: 0.90:1.000:. ./.:4:6,18:.: 0.77:1.000:. ./.:4:8,12:.: 0.23:1.000:. ./.:4:9,25:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.90:0.997:. ./.:4:0,29:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:12,6:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.04:1.000:. ./.:4:8,12:.: 0.23:1.000:. ./.:4:7,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,13:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.85:1.000:. ./.:4:10,11:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.50:1.000:. ./.:4:9,29:.: 2.66:1.000:. ./.:4:10,13:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,19:.: 1.04:1.000:. ./.:4:7,17:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.59:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.99:1.000:. ./.:4:7,16:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.08:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:8,14:.: 0.50:1.000:. ./.:4:9,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:6,18:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.67:1.000:. ./.:4:7,12:.: 0.09:1.000:. ./.:6:4,10:.:-0.59:1.000:. ./.:4:5,19:.: 0.77:1.000:. ./.:4:11,11:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,14:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:9,6:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.77:1.000:. ./.:4:10,10:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.94:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,27:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,6:.:-1.26:1.000:. ./.:4:6,16:.: 0.50:1.000:. ./.:4:6,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:4,10:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:7,20:.: 1.17:1.000:. ./.:4:11,18:.: 1.45:1.000:. ./.:4:11,10:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:5,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,18:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.40:1.000:. ./.:4:5,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,16:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:4,19:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:7,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:12,24:.: 2.39:1.000:. ./.:4:4,22:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.09:1.000:. ./.:3:3,7:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.40:1.000:. ./.:4:6,15:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.67:1.000:. ./.:4:9,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,23:.: 1.04:1.000:. ./.:4:4,17:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.04:1.000:. ./.:6:7,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.94:1.000:. ./.:4:1,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.13:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.99:1.000:. ./.:4:5,4:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.94:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,13:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,10:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:9,9:.:-0.04:1.000:. ./.:4:9,9:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.99:1.000:. ./.:4:10,24:.: 2.12:1.000:. ./.:4:9,14:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,14:.:-0.31:1.000:. ./.:4:18,14:.: 1.85:1.000:. ./.:4:12,16:.: 1.31:1.000:. ./.:4:6,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:9,12:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,20:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:8,8:.:-0.31:1.000:. ./.:4:7,21:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.63:1.000:. ./.:4:6,10:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.04:1.000:. ./.:4:6,10:.:-0.31:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.72:1.000:. ./.:4:10,10:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.63:1.000:. ./.:4:8,21:.: 1.45:1.000:. ./.:4:15,16:.: 1.72:1.000:. ./.:4:8,18:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.72:1.000:. ./.:4:15,20:.: 2.26:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.90:1.000:. ./.:4:5,7:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.23:1.000:. -chr1.1 11667046 chr1.1_011667046 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:113,76:0.34: 1.27:1.000:0.896 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,77:0.45: 0.60:1.000:0.975 0/1/1/1:4:24,128:0.77: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,78:0.43: 0.75:1.000:0.938 0/0/1/1:4:107,84:0.38: 1.31:1.000:0.624 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,117:0.56: 1.44:1.000:0.973 0/0/0/1:4:102,31:0.17: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,68:0.67:-0.78:1.000:0.906 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,88:0.48: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,142:0.62: 1.76:1.000:0.560 0/0/1/1:4:74,89:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,93:0.65: 0.04:0.997:0.797 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,85:0.57: 0.21:1.000:0.954 0/0/1/1:4:88,159:0.60: 2.52:1.000:0.805 0/0/0/1:4:83,47:0.28: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,65:0.58:-0.54:1.000:0.925 0/1/1/1:4:17,131:0.81: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,69:0.62:-0.57:1.000:0.629 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,198:0.82: 1.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,101:0.84:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,75:0.25: 1.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,191:0.61: 3.43:1.000:0.656 0/1/1/1:4:30,105:0.71: 0.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:67,165:0.66: 2.20:1.000:0.843 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,52:0.34:-0.07:1.000:0.835 0/1/1:3:43,76:0.59:-0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,78:0.70:-0.61:1.000:0.987 0/0/1/1:4:33,60:0.60:-0.80:1.000:0.794 0/0/1/1:4:70,55:0.38:-0.11:1.000:0.627 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,206:0.78: 2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,67:0.59:-0.52:1.000:0.874 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,85:0.41: 1.20:1.000:0.842 0/0/0/1:4:72,51:0.35:-0.16:1.000:0.777 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,37:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,101:0.80:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,52:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,37:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,155:0.70: 1.57:1.000:0.986 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,80:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,104:0.66: 0.34:1.000:0.850 0/0/0/1:4:134,77:0.29: 1.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,95:0.56: 0.62:1.000:0.969 0/0/0/0/1/1:6:57,35:0.31:-0.82:1.000:0.893 0/0/0/1:4:72,51:0.35:-0.16:1.000:0.777 0/0/1/1:4:84,122:0.55: 1.64:1.000:0.975 0/0/1/1:4:95,89:0.44: 1.16:1.000:0.969 0/0/0/1:4:102,53:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,67:0.32: 0.90:1.000:0.956 0/0/1/1:4:52,107:0.62: 0.62:1.000:0.525 0/0/1/1:4:44,39:0.42:-1.02:1.000:0.927 0/0/1/1:4:47,66:0.55:-0.37:1.000:0.982 0/1/1/1:4:25,70:0.68:-0.76:1.000:0.949 0/0/0/1:4:118,74:0.31: 1.33:1.000:0.967 0/0/1/1:4:53,49:0.44:-0.61:1.000:0.962 0/0/1/1:4:69,72:0.48: 0.23:1.000:0.994 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,58:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,50:0.27: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,97:0.54: 0.79:1.000:0.985 0/0/0/1:4:68,41:0.30:-0.46:1.000:0.984 0/0/0/1:4:97,54:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,145:0.73: 1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,52:0.52:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,54:0.22: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,126:0.70: 0.75:1.000:0.986 0/1/1/1:4:34,78:0.64:-0.39:1.000:0.728 0/0/1/1:4:69,141:0.62: 1.72:1.000:0.542 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,37:0.31:-0.74:1.000:0.967 0/1/1/1:4:27,83:0.69:-0.44:1.000:0.978 0/0/0/1:4:79,46:0.29:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,110:0.60: 0.86:1.000:0.780 0/0/1/1:4:79,111:0.55: 1.29:1.000:0.982 0/1/1/1:4:26,101:0.73:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,50:0.38:-0.33:1.000:0.540 0/0/0/1:4:139,55:0.21: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,48:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,41:0.31:-0.48:1.000:0.979 0/0/0/1:4:97,53:0.27: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,39:0.22: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,1:0.01:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,36:0.53:-1.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,100:0.63: 0.38:1.000:0.506 0/0/1/1:4:36,71:0.62:-0.50:1.000:0.629 0/0/0/1:4:73,50:0.34:-0.16:1.000:0.862 0/0/1/1:4:44,49:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,64:0.61:-0.70:1.000:0.731 0/0/1/1:4:48,75:0.57:-0.16:1.000:0.948 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,41:0.25:-0.16:0.999:0.999 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0:3:51,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,103:0.73:-0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,59:0.45:-0.20:1.000:0.976 0/0/0/1:4:68,49:0.36:-0.29:1.000:0.722 0/0/0/1:4:95,46:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,36:0.35:-0.93:1.000:0.788 0/0/0/1:4:105,63:0.30: 0.82:1.000:0.985 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,45:0.34:-0.41:1.000:0.871 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:68,118:0.59: 1.20:1.000:0.566 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,46:0.32:-0.24:1.000:0.964 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,47:0.44:-0.70:1.000:0.960 0/0/0/1:4:86,62:0.36: 0.38:1.000:0.720 0/0/0/1:4:61,45:0.36:-0.52:1.000:0.635 0/0/1/1:4:46,49:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,50:0.32:-0.05:1.000:0.952 0/0/0/1:4:110,82:0.37: 1.33:1.000:0.592 0/0/1/1:4:46,52:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,39:0.35:-0.76:1.000:0.824 0/0/1/1:4:66,82:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,40:0.50:-1.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,42:0.25:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,39:0.42:-1.02:1.000:0.927 0/0/1/1:4:34,39:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,78:0.55: 0.08:1.000:0.984 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,55:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,69:0.65:-0.70:1.000:0.793 0/1/1/1:4:18,140:0.81: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,187:0.78: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,74:0.40: 0.71:1.000:0.813 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,136:0.55: 2.18:1.000:0.979 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,149:0.58: 2.33:1.000:0.900 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,90:0.36: 1.83:1.000:0.725 0/0/1/1:4:33,62:0.61:-0.76:1.000:0.735 0/0/0/1:4:115,83:0.36: 1.46:1.000:0.716 0/1/1/1:4:32,72:0.64:-0.57:1.000:0.688 0/0/0/1:4:80,59:0.36: 0.19:1.000:0.636 0/0/1/1:4:97,81:0.40: 1.03:1.000:0.824 0/1/1/1:4:30,69:0.64:-0.67:1.000:0.733 0/1/1/1:4:21,66:0.70:-0.93:1.000:0.982 0/1/1/1:4:25,86:0.71:-0.41:1.000:0.992 0/1/1/1:4:27,58:0.63:-0.98:1.000:0.582 0/1/1/1:4:21,60:0.68:-1.06:1.000:0.957 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,57:0.57:-0.78:1.000:0.955 0/1/1/1:4:22,131:0.78: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,44:0.27:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:114,60:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-2.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,71:0.40: 0.58:1.000:0.795 0/1/1/1:4:26,119:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,93:0.68:-0.09:1.000:0.952 0/0/0/1:4:104,77:0.37: 1.10:1.000:0.620 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,121:0.60: 1.25:1.000:0.805 0/1/1/1:4:21,89:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,78:0.32: 1.51:1.000:0.955 0/0/0/1:4:105,69:0.33: 0.94:1.000:0.928 0/0/0/1:4:96,65:0.34: 0.66:1.000:0.884 0/1/1/1:4:27,57:0.63:-1.00:1.000:0.539 -chr1.1 11839955 chr1.1_011839955 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:290,68:.: 0.38:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:279,74:.: 0.32:1.000:. ./.:4:370,76:.: 1.48:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:138,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:239,53:.:-0.44:1.000:. ./.:4:117,57:.:-1.90:1.000:. ./.:4:289,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:172,43:.:-1.39:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:251,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:303,73:.: 0.61:1.000:. ./.:4:345,87:.: 1.30:0.997:. ./.:4:402,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:328,77:.: 0.97:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:322,72:.: 0.83:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:157,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:329,75:.: 0.96:1.000:. ./.:4:274,61:.: 0.10:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:305,76:.: 0.67:1.000:. ./.:4:231,57:.:-0.49:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:213,64:.:-0.62:1.000:. ./.:4:227,7:.:-1.16:1.000:. ./.:4:158,43:.:-1.57:1.000:. ./.:3:72,55:.:-2.49:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:294,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:319,80:.: 0.89:1.000:. ./.:4:468,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:258,52:.:-0.21:1.000:. ./.:4:246,45:.:-0.45:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:379,100:.: 1.89:1.000:. ./.:4:276,69:.: 0.22:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:392,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:602,0:.: 3.42:1.000:. ./.:4:228,44:.:-0.68:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:234,63:.:-0.37:1.000:. ./.:4:366,84:.: 1.53:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:201,52:.:-0.92:1.000:. ./.:4:473,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:245,66:.:-0.20:1.000:. ./.:6:247,30:.:-0.62:1.000:. ./.:4:261,69:.: 0.04:1.000:. ./.:4:220,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:416,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:154,47:.:-1.57:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:230,65:.:-0.40:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:219,61:.:-0.59:1.000:. ./.:4:390,90:.: 1.90:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:287,88:.: 0.60:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:284,69:.: 0.32:1.000:. ./.:4:260,51:.:-0.20:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:325,53:.: 0.63:1.000:. ./.:4:158,33:.:-1.69:1.000:. ./.:4:350,79:.: 1.27:1.000:. ./.:4:248,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:250,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:168,39:.:-1.49:1.000:. ./.:4:252,63:.:-0.15:1.000:. ./.:4:223,62:.:-0.52:1.000:. ./.:4:202,49:.:-0.95:1.000:. ./.:4:159,36:.:-1.64:1.000:. ./.:4:286,84:.: 0.53:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:250,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:310,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:163,44:.:-1.49:1.000:. ./.:4:334,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:228,61:.:-0.47:1.000:. ./.:4:198,37:.:-1.14:1.000:. ./.:4:285,73:.: 0.38:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:541,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:218,48:.:-0.76:0.999:. ./.:4:347,0:.: 0.25:1.000:. ./.:3:160,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:263,51:.:-0.16:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:250,46:.:-0.39:1.000:. ./.:4:303,63:.: 0.48:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:232,65:.:-0.37:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.55:1.000:. ./.:6:319,40:.: 0.40:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:227,54:.:-0.57:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:260,64:.:-0.04:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:388,66:.: 1.58:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:249,66:.:-0.15:1.000:. ./.:4:159,47:.:-1.50:1.000:. ./.:4:282,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:276,62:.: 0.14:1.000:. ./.:4:244,50:.:-0.41:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:178,46:.:-1.28:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:444,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:217,57:.:-0.66:1.000:. ./.:4:346,74:.: 1.15:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:144,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:108,22:.:-2.45:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:230,49:.:-0.60:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:264,63:.: 0.00:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:208,62:.:-0.71:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:241,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:251,53:.:-0.29:1.000:. ./.:4:251,50:.:-0.32:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:163,40:.:-1.54:1.000:. ./.:4:230,33:.:-0.80:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:196,39:.:-1.14:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:381,93:.: 1.83:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:268,67:.: 0.10:1.000:. ./.:4:229,58:.:-0.50:1.000:. ./.:4:298,64:.: 0.43:1.000:. ./.:4:312,77:.: 0.77:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:264,69:.: 0.07:1.000:. -chr1.1 12022200 chr1.1_012022200 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:161,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.38:0.997:. ./.:4:162,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.61:1.000:. ./.:3:39,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:55,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:100,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:208,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:116,0:.:-0.08:1.000:. ./.:3:50,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.80:1.000:. ./.:6:135,3:.: 0.46:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.93:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:202,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:152,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:163,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:244,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:246,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.42:1.000:. -chr1.1 12607158 chr1.1_012607158 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:226,44:.: 1.03:1.000:. ./.:4:179,20:.:-0.17:1.000:. ./.:4:138,60:.:-0.19:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:149,81:.: 0.35:1.000:. ./.:4:190,74:.: 0.93:1.000:. ./.:4:124,39:.:-0.78:1.000:. ./.:4:71,97:.:-0.69:1.000:. ./.:4:240,35:.: 1.12:1.000:. ./.:4:28,44:.:-2.32:1.000:. ./.:4:33,32:.:-2.43:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:85,94:.:-0.51:1.000:. ./.:4:177,81:.: 0.83:1.000:. ./.:4:136,56:.:-0.29:1.000:. ./.:4:72,99:.:-0.64:1.000:. ./.:4:239,33:.: 1.06:0.997:. ./.:4:158,82:.: 0.52:1.000:. ./.:4:210,102:.: 1.74:1.000:. ./.:4:285,56:.: 2.23:1.000:. ./.:4:34,14:.:-2.72:1.000:. ./.:4:215,39:.: 0.76:1.000:. ./.:4:158,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:211,34:.: 0.61:1.000:. ./.:4:29,37:.:-2.42:1.000:. ./.:4:198,17:.: 0.10:1.000:. ./.:4:228,31:.: 0.84:1.000:. ./.:4:66,107:.:-0.61:1.000:. ./.:4:191,89:.: 1.20:1.000:. ./.:4:174,70:.: 0.59:1.000:. ./.:4:231,28:.: 0.84:1.000:. ./.:4:192,28:.: 0.19:1.000:. ./.:4:11,8:.:-3.21:1.000:. ./.:4:54,7:.:-2.50:1.000:. ./.:3:13,2:.:-3.28:1.000:. ./.:4:202,42:.: 0.59:1.000:. ./.:4:218,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:159,76:.: 0.44:1.000:. ./.:4:78,80:.:-0.86:1.000:. ./.:4:264,27:.: 1.39:1.000:. ./.:4:196,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:61,73:.:-1.27:1.000:. ./.:4:124,57:.:-0.47:1.000:. ./.:4:140,24:.:-0.76:1.000:. ./.:4:88,145:.: 0.41:1.000:. ./.:4:143,75:.: 0.15:1.000:. ./.:4:231,44:.: 1.12:1.000:. ./.:4:136,57:.:-0.27:1.000:. ./.:4:105,37:.:-1.13:1.000:. ./.:4:239,26:.: 0.95:1.000:. ./.:4:61,84:.:-1.08:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:99,71:.:-0.66:1.000:. ./.:4:139,88:.: 0.30:1.000:. ./.:4:62,84:.:-1.06:1.000:. ./.:4:179,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:170,26:.:-0.22:1.000:. ./.:4:118,53:.:-0.64:1.000:. ./.:4:74,79:.:-0.95:1.000:. ./.:6:88,62:.:-1.00:1.000:. ./.:4:55,136:.:-0.30:1.000:. ./.:4:111,62:.:-0.61:1.000:. ./.:4:134,92:.: 0.29:1.000:. ./.:4:128,59:.:-0.37:1.000:. ./.:4:128,69:.:-0.20:1.000:. ./.:4:119,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:114,76:.:-0.32:1.000:. ./.:4:121,63:.:-0.42:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:215,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:147,19:.:-0.73:1.000:. ./.:4:166,19:.:-0.41:1.000:. ./.:4:136,80:.: 0.12:1.000:. ./.:4:165,30:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,42:.:-1.13:1.000:. ./.:4:146,26:.:-0.63:1.000:. ./.:4:121,66:.:-0.37:1.000:. ./.:4:169,39:.:-0.02:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:199,21:.: 0.19:1.000:. ./.:4:215,40:.: 0.78:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:138,62:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,78:.:-0.07:1.000:. ./.:4:79,37:.:-1.57:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:123,67:.:-0.32:1.000:. ./.:4:169,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:138,74:.: 0.05:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:141,71:.: 0.05:1.000:. ./.:4:93,54:.:-1.05:1.000:. ./.:4:163,82:.: 0.61:1.000:. ./.:4:64,93:.:-0.88:1.000:. ./.:4:95,53:.:-1.03:1.000:. ./.:4:139,28:.:-0.71:1.000:. ./.:4:210,44:.: 0.76:1.000:. ./.:4:175,94:.: 1.01:1.000:. ./.:4:187,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:125,69:.:-0.25:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:114,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:58,106:.:-0.76:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:333,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:259,55:.: 1.77:1.000:. ./.:4:127,83:.: 0.02:1.000:. ./.:4:171,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:208,91:.: 1.52:1.000:. ./.:4:66,109:.:-0.57:0.999:. ./.:4:124,59:.:-0.44:1.000:. ./.:3:55,34:.:-2.03:1.000:. ./.:4:199,30:.: 0.34:1.000:. ./.:4:106,74:.:-0.49:1.000:. ./.:4:137,23:.:-0.83:1.000:. ./.:4:201,38:.: 0.51:1.000:. ./.:4:93,61:.:-0.93:1.000:. ./.:4:121,72:.:-0.27:1.000:. ./.:4:182,44:.: 0.29:1.000:. ./.:4:114,74:.:-0.35:1.000:. ./.:4:214,36:.: 0.69:1.000:. ./.:4:159,40:.:-0.17:1.000:. ./.:4:197,37:.: 0.42:1.000:. ./.:6:266,32:.: 1.50:1.000:. ./.:4:110,43:.:-0.95:1.000:. ./.:4:90,52:.:-1.13:1.000:. ./.:4:94,65:.:-0.85:1.000:. ./.:4:153,31:.:-0.42:1.000:. ./.:4:234,41:.: 1.12:1.000:. ./.:4:83,44:.:-1.39:1.000:. ./.:4:204,23:.: 0.30:1.000:. ./.:4:172,37:.: 0.00:1.000:. ./.:4:231,75:.: 1.64:1.000:. ./.:4:189,26:.: 0.10:1.000:. ./.:4:106,84:.:-0.32:1.000:. ./.:4:140,39:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,61:.:-0.76:1.000:. ./.:4:179,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:181,42:.: 0.24:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:154,25:.:-0.51:1.000:. ./.:4:276,55:.: 2.06:1.000:. ./.:4:168,106:.: 1.10:1.000:. ./.:4:167,80:.: 0.64:1.000:. ./.:4:137,77:.: 0.08:1.000:. ./.:4:251,38:.: 1.35:1.000:. ./.:4:180,32:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,164:.: 0.95:1.000:. ./.:4:151,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:15,20:.:-2.94:1.000:. ./.:4:122,78:.:-0.15:1.000:. ./.:4:152,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:236,43:.: 1.18:1.000:. ./.:4:182,105:.: 1.32:1.000:. ./.:4:155,77:.: 0.39:1.000:. ./.:4:188,44:.: 0.39:1.000:. ./.:4:62,125:.:-0.37:1.000:. ./.:4:212,41:.: 0.74:1.000:. ./.:4:106,42:.:-1.03:1.000:. ./.:4:203,45:.: 0.66:1.000:. ./.:4:132,67:.:-0.17:1.000:. ./.:4:224,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:163,66:.: 0.34:1.000:. ./.:4:213,34:.: 0.64:1.000:. ./.:4:136,75:.: 0.03:1.000:. ./.:4:75,105:.:-0.49:1.000:. ./.:4:208,49:.: 0.81:1.000:. ./.:4:191,40:.: 0.37:1.000:. ./.:4:87,66:.:-0.95:1.000:. ./.:4:193,36:.: 0.34:1.000:. ./.:4:133,59:.:-0.29:1.000:. ./.:4:107,54:.:-0.81:1.000:. ./.:4:142,24:.:-0.73:1.000:. ./.:4:391,1:.: 3.09:1.000:. ./.:4:165,92:.: 0.81:1.000:. ./.:4:146,70:.: 0.12:1.000:. ./.:4:144,65:.: 0.00:1.000:. ./.:4:226,40:.: 0.96:1.000:. ./.:4:183,71:.: 0.76:1.000:. ./.:4:299,46:.: 2.30:1.000:. ./.:4:128,61:.:-0.34:1.000:. ./.:4:208,32:.: 0.52:1.000:. -chr1.1 12673656 chr1.1_012673656 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:59,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:109,0:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.:-0.51:0.992:. ./.:4:88,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:113,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:95,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:155,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:155,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:43,0:.:-1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:77,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:171,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:77,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:127,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:120,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.:-0.22:1.000:. ./.:3:10,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.40:1.000:. ./.:6:76,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:132,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:138,0:.: 1.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.:-0.07:1.000:. -chr1.1 12905400 chr1.1_012905400 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:416,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:431,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:107,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:171,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.83:0.992:. ./.:4:393,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:457,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:184,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:453,2:.: 1.37:1.000:. ./.:4:276,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:107,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:412,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:111,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:170,0:.:-2.60:1.000:. ./.:3:94,0:.:-3.66:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:391,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:445,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:468,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:293,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:456,2:.: 1.41:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:371,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:404,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:285,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:429,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:485,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:273,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:307,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:396,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:416,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:334,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:348,1:.:-0.10:1.000:. ./.:3:244,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.98:1.000:. ./.:6:440,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:278,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:252,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:482,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:242,1:.:-1.58:1.000:. ./.:4:464,2:.: 1.53:1.000:. ./.:4:495,2:.: 1.96:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:140,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:491,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:341,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:280,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:399,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:313,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:497,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:498,1:.: 1.99:1.000:. ./.:4:278,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.27:1.000:. -chr1.1 12952616 chr1.1_012952616 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:3,2:.:-1.90:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:44,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.81:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.42:0.992:. ./.:4:90,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:110,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:18,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:8,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.22:1.000:. ./.:3:8,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:70,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:64,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:65,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:50,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:59,3:.: 0.87:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:56,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.49:1.000:. ./.:6:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:45,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:65,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.61:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:54,5:.: 0.73:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.34:1.000:. ./.:3:29,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:32,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:89,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:17,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:26,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.81:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:16,2:.:-1.27:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:76,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.41:1.000:. -chr1.1 13166244 chr1.1_013166244 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:44,29:0.36: 0.30:1.000:0.651 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,22:0.32:-0.14:1.000:0.946 0/0/0/1:4:101,42:0.22: 2.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,29:0.43: 0.08:1.000:0.953 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,25:0.23: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:7,3:0.23:-1.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:70,19:0.16: 0.80:0.992:0.996 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,39:0.39: 0.99:1.000:0.633 0/0/1/1:4:18,22:0.53:-0.74:1.000:0.991 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,28:0.29: 0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,35:0.32: 0.99:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,26:0.16: 1.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,26:0.40:-0.05:1.000:0.787 0/0/1/1:4:5,10:0.59:-1.53:1.000:0.866 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:99,1:0.01: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,29:0.27: 0.67:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 1.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,25:0.25: 0.39:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:49,20:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,29:0.25: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,22:0.52:-0.65:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,29:0.29: 0.58:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.99:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:99,20:0.13: 1.74:1.000:0.887 0/0/0/1:4:36,18:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,27:0.35: 0.17:1.000:0.761 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0/1/1:6:10,7:0.39:-1.46:1.000:0.739 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,24:0.20: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,23:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,28:0.32: 0.39:1.000:0.964 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.49:0.987:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,35:0.43: 0.52:1.000:0.945 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:50,9:0.12:-0.14:1.000:0.665 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 1.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,17:0.19: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,21:0.14: 1.49:1.000:0.978 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,23:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,19:0.31:-0.36:1.000:0.973 0/0/0/1:4:63,33:0.27: 1.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,33:0.33: 0.77:1.000:0.935 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,18:0.12: 1.46:1.000:0.843 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:97,23:0.15: 1.77:1.000:0.981 0/0/0/1:4:112,43:0.21: 2.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,29:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,25:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,29:0.26: 0.74:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.58:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:80,29:0.20: 1.43:1.000:1.000 0/0/1:3:33,13:0.21:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,27:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,23:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,26:0.14: 2.34:1.000:0.976 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:83,29:0.20: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,35:0.39: 0.67:1.000:0.658 0/0/0/1:4:49,30:0.33: 0.49:1.000:0.902 0/0/0/1:4:47,31:0.36: 0.45:1.000:0.648 0/0/0/0/0/1:6:103,25:0.15: 2.03:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,33:0.46: 0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:45,43:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,18:0.26:-0.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,20:0.13: 1.65:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,29:0.20: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,34:0.26: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:49,31:0.35: 0.52:1.000:0.818 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,21:0.27:-0.05:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,39:0.35: 1.15:1.000:0.782 0/0/0/1:4:106,30:0.17: 2.28:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:87,23:0.16: 1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,25:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,25:0.31: 0.14:1.000:0.966 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,25:0.34: 0.05:1.000:0.854 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,30:0.16: 2.50:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,20:0.40:-0.49:1.000:0.746 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.90:1.000:1.000 -chr1.1 13536075 chr1.1_013536075 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:5,14:0.74: 0.49:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.53:-0.23:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,7:0.65:-0.66:1.000:0.797 0/0/1/1:4:11,14:0.58: 1.35:1.000:0.898 0/0/1/1:4:16,8:0.39: 1.20:1.000:0.692 0/0/1/1:4:3,2:0.45:-1.52:1.000:0.975 0/0/1/1:4:12,10:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,7:0.37: 1.06:1.000:0.620 0/0/1/1:4:5,4:0.48:-0.94:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,16:0.80: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.47: 1.49:1.000:0.990 0/0/0/1:4:16,5:0.31: 0.77:1.000:0.973 0/0/1/1:4:14,7:0.39: 0.77:1.000:0.692 1/1/1/1:4:1,14:0.93:-0.08:0.992:0.999 0/0/0/1:4:15,6:0.35: 0.77:1.000:0.792 0/1/1/1:4:6,15:0.72: 0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,7:0.31: 1.92:1.000:0.969 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,21:0.71: 2.06:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,12:0.68: 0.34:1.000:0.946 0/1/1/1:4:1,3:0.75:-1.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.53:-0.80:1.000:0.992 0/1/1/1:4:8,17:0.69: 1.35:1.000:0.972 0/1/1/1:4:5,11:0.70: 0.06:1.000:0.980 0/0/1/1:4:12,10:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,4:0.26: 0.92:1.000:0.998 0/1/1/1:4:2,11:0.85:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:16,4:0.28: 0.63:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:4,1:0.28:-1.52:1.000:0.996 0/0/0:3:1,0:0.10:-2.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,15:0.72: 0.77:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,11:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.27: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,10:0.77:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.30:-0.94:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.87:-0.08:1.000:0.935 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.53:-1.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,7:0.78:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.51: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,11:0.55: 0.77:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.75:-1.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,3:0.42:-1.09:1.000:0.932 0/0/1/1:4:10,6:0.42: 0.06:1.000:0.932 0/0/1/1:4:8,6:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/1/1/1:4:6,15:0.72: 0.77:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,14:0.68: 0.77:1.000:0.946 0/1/1/1:4:2,7:0.78:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,13:0.64: 0.77:1.000:0.633 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-1.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,8:0.63:-0.37:1.000:0.592 0/0/0/0/1/1:6:11,4:0.33:-0.08:1.000:0.920 0/0/1/1:4:13,10:0.48: 1.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:7,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,10:0.91:-0.66:1.000:0.938 0/0/0/1:4:7,3:0.36:-0.80:1.000:0.665 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,1:0.32:-1.66:1.000:0.954 0/1/1/1:4:4,11:0.74:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,4:0.53:-1.09:0.987:0.992 0/1/1/1:4:2,11:0.85:-0.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,9:0.66:-0.23:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.53:-1.37:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,10:0.68:-0.08:1.000:0.946 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,1:0.18:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,6:0.68:-0.94:1.000:0.946 0/0/1/1:4:13,12:0.51: 1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,9:0.56: 0.20:1.000:0.972 0/1/1/1:4:3,6:0.68:-0.94:1.000:0.946 0/0/1/1:4:9,7:0.48: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:8,10:0.58: 0.34:1.000:0.915 0/1/1/1:4:4,8:0.68:-0.51:1.000:0.946 0/0/0/1:4:8,1:0.20:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.72:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,9:0.62:-0.08:1.000:0.586 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,6:0.68:-0.94:1.000:0.946 0/0/0/1:4:17,2:0.19: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.10:-1.66:1.000:0.801 0/0/1/1:4:6,8:0.59:-0.23:1.000:0.840 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,4:0.39:-0.51:1.000:0.692 0/0/0/1:4:11,3:0.29:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:3,2:0.45:-1.52:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.68:-0.94:1.000:0.946 0/1/1/1:4:3,13:0.81: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.58: 0.63:1.000:0.932 0/1/1/1:4:2,4:0.68:-1.37:1.000:0.946 0/1/1/1:4:2,12:0.86:-0.23:1.000:0.975 0/1/1/1:4:4,8:0.68:-0.51:1.000:0.946 0/1/1/1:4:3,10:0.77:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.25:-1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,7:0.88:-1.09:1.000:0.852 0/1/1/1:4:6,12:0.68: 0.34:1.000:0.946 0/0/1/1:4:9,13:0.61: 0.92:1.000:0.683 0/0/1/1:4:10,10:0.53: 0.63:1.000:0.992 0/1/1/1:4:7,13:0.66: 0.63:1.000:0.884 0/1/1/1:4:4,14:0.78: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.43: 0.77:0.999:0.947 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1:3:1,3:0.75:-1.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.28:-0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,10:0.68:-0.08:1.000:0.946 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,5:0.53:-0.80:1.000:0.992 0/1/1/1:4:3,11:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.56:-0.37:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.41: 0.20:1.000:0.841 0/1/1/1:4:3,12:0.80:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:15,5:0.32: 0.63:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-1.37:1.000:0.692 0/1/1/1:4:1,6:0.86:-1.23:1.000:0.975 0/1/1/1:4:1,7:0.88:-1.09:1.000:0.852 0/0/1/1:4:12,15:0.58: 1.63:1.000:0.915 0/0/1/1:4:6,5:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,10:0.64: 0.06:1.000:0.696 0/0/1/1:4:9,5:0.41:-0.23:1.000:0.864 0/0/1/1:4:9,10:0.55: 0.49:1.000:0.975 0/1/1/1:4:5,10:0.68:-0.08:1.000:0.946 0/0/1/1:4:8,8:0.53: 0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:13,4:0.31: 0.20:1.000:0.977 0/1/1/1:4:2,15:0.88: 0.20:1.000:0.708 0/0/0/1:4:10,4:0.35:-0.23:1.000:0.792 0/1/1/1:4:7,13:0.66: 0.63:1.000:0.884 0/0/1/1:4:6,9:0.62:-0.08:1.000:0.586 0/0/0/1:4:6,2:0.32:-1.09:1.000:0.954 0/1/1/1:4:5,14:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,16:0.61: 1.63:1.000:0.666 0/1/1/1:4:6,14:0.71: 0.63:1.000:0.990 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,16:0.65: 1.35:1.000:0.824 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,15:0.72: 0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,12:0.38: 3.21:1.000:0.507 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,6:0.30: 1.63:1.000:0.988 0/1/1/1:4:3,12:0.80:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,20:0.72: 1.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,13:0.50: 1.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,14:0.71: 0.63:1.000:0.990 0/0/1/1:4:10,13:0.59: 1.06:1.000:0.874 0/1/1/1:4:10,21:0.69: 2.21:1.000:0.968 0/0/1/1:4:7,5:0.46:-0.51:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,14:0.63: 1.06:1.000:0.515 0/1/1/1:4:2,7:0.78:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,10:0.91:-0.66:1.000:0.938 0/1/1/1:4:11,21:0.67: 2.35:1.000:0.912 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,17:0.71: 1.20:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,10:0.64: 0.06:1.000:0.696 0/1/1/1:4:6,18:0.75: 1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,10:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,9:0.42: 1.20:1.000:0.932 0/1/1/1:4:5,9:0.66:-0.23:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,3:0.39:-0.94:1.000:0.692 0/0/1/1:4:11,9:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,14:0.71: 0.63:1.000:0.990 0/0/1/1:4:10,14:0.60: 1.20:1.000:0.753 0/1/1/1:4:4,15:0.79: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,9:0.38: 1.78:1.000:0.569 0/1/1/1:4:8,20:0.72: 1.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,9:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,11:0.47: 1.49:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,11:0.66: 0.20:1.000:0.869 0/1/1/1:4:8,19:0.71: 1.63:1.000:0.992 -chr1.1 14007601 chr1.1_014007601 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.90:0.992:. ./.:4:81,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:122,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:6:31,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.79:0.987:. ./.:4:88,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.26:0.999:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:3:11,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:122,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:6:64,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:100,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:102,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:124,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.50:1.000:. -chr1.1 14290088 chr1.1_014290088 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:16,16:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,4:0.13: 0.51:1.000:0.928 0/0/0/1:4:33,12:0.27: 1.76:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,1:0.03: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.06:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,20:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,5:0.59:-1.63:1.000:0.834 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,19:0.54: 0.51:1.000:0.988 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,1:0.04:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,15:0.47: 0.42:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,17:0.58:-0.02:1.000:0.929 0/0/1/1:4:16,16:0.47: 0.60:0.992:0.991 0/0/1/1:4:24,16:0.38: 1.31:1.000:0.589 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.53:-0.02:1.000:0.991 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,1:0.03: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,6:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:30,2:0.06: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.42: 0.15:1.000:0.910 0/0/1/1:4:10,18:0.56: 0.24:1.000:0.973 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,18:0.42: 1.31:1.000:0.928 0/0/0/1:4:24,3:0.11: 0.15:1.000:0.603 0/0/1/1:4:16,15:0.45: 0.51:1.000:0.982 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.47:-1.72:1.000:0.991 0/1/1:3:2,6:0.61:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,1:0.03: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:9,16:0.55:-0.02:1.000:0.975 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,15:0.24: 3.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,13:0.38: 0.69:1.000:0.522 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.49:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,1:0.04:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,5:0.20:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,11:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,17:0.30: 2.83:1.000:0.988 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.45:-0.20:1.000:0.977 0/0/0/0:4:16,1:0.06:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.42:-0.65:1.000:0.910 0/0/0/1/1/1:6:7,12:0.55:-0.56:1.000:0.747 0/0/1/1:4:7,14:0.57:-0.38:1.000:0.950 0/0/1/1:4:14,18:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,2:0.09:-0.29:1.000:0.915 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,2:0.08:-0.02:1.000:0.984 0/0/0/1:4:22,13:0.36: 0.87:1.000:0.718 0/0/0/0:4:25,1:0.04: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.12:-0.02:0.987:0.819 0/0/0/1:4:15,9:0.36:-0.11:1.000:0.683 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.47:-1.00:1.000:0.991 0/0/0/1:4:18,9:0.33: 0.15:1.000:0.938 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.47:-0.65:1.000:0.991 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,16:0.57:-0.11:1.000:0.950 0/0/1/1:4:6,6:0.47:-1.18:1.000:0.991 0/0/0/0:4:16,1:0.06:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,10:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,8:0.42:-0.65:1.000:0.910 0/0/1/1:4:8,19:0.59: 0.15:1.000:0.871 0/0/0/1:4:30,11:0.27: 1.40:1.000:0.998 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.28: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,14:0.45: 0.33:1.000:0.981 0/0/0/1:4:20,11:0.34: 0.51:1.000:0.846 0/0/0/1:4:27,13:0.32: 1.31:1.000:0.958 0/0/1/1:4:12,10:0.43:-0.29:1.000:0.940 0/0/0/1:4:21,11:0.33: 0.60:1.000:0.902 0/0/1/1:4:13,11:0.43:-0.11:1.000:0.948 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.52:-1.00:1.000:0.995 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,10:0.45:-0.38:1.000:0.975 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,7:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,9:0.35:-0.02:1.000:0.812 0/0/1/1:4:6,10:0.55:-0.83:1.000:0.983 0/0/0/0:4:15,1:0.06:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,2:0.07: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,2:0.07: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,15:0.55:-0.11:0.999:0.983 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0:3:8,1:0.11:-1.45:1.000:0.989 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,17:0.37: 1.67:1.000:0.563 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.31:-0.29:1.000:0.969 0/0/1/1:4:13,11:0.43:-0.11:1.000:0.948 0/0/0/0:4:25,1:0.04: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,2:0.07: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,18:0.53: 0.42:1.000:0.991 0/0/0/1:4:20,10:0.33: 0.42:1.000:0.938 0/0/0/0/0/1:6:25,8:0.25: 0.69:1.000:0.540 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,2:0.09:-0.11:1.000:0.973 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,6:0.38:-0.92:1.000:0.589 0/0/0/0:4:17,1:0.06:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,21:0.63: 0.15:1.000:0.551 0/0/0/1:4:13,2:0.14:-0.92:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,2:0.06: 0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.29:-1.00:1.000:0.994 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,7:0.35:-0.56:1.000:0.745 0/0/1/1:4:11,11:0.47:-0.29:1.000:0.991 0/0/0/0:4:34,1:0.03: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.36:-0.83:1.000:0.683 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,2:0.07: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,14:0.29: 2.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,10:0.36: 0.15:1.000:0.727 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:24,15:0.37: 1.22:1.000:0.582 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,17:0.44: 0.96:1.000:0.971 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,15:0.56:-0.20:1.000:0.966 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,1:0.05:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,10:0.36: 0.15:1.000:0.727 0/0/0/0:4:37,3:0.08: 1.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,14:0.55:-0.29:1.000:0.978 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,11:0.33: 0.60:1.000:0.902 0/0/0/1:4:27,14:0.33: 1.40:1.000:0.911 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,2:0.04: 2.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,18:0.41: 1.49:1.000:0.835 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,15:0.29: 2.38:1.000:0.993 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,15:0.58:-0.29:1.000:0.926 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,16:0.34: 1.85:1.000:0.884 0/0/0/1:4:32,9:0.22: 1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,26:0.47: 2.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:19,1:0.05:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,16:0.45: 0.69:1.000:0.983 -chr1.1 14683124 chr1.1_014683124 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 2.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.13:0.992:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.40:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:3,0:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.40:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./.:3:3,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.30:1.000:. ./.:6:8,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.40:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:14,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.00:1.000:. -chr1.1 14788595 chr1.1_014788595 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:449,119:.: 0.41:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:383,93:.:-0.14:1.000:. ./.:4:818,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:176,78:.:-1.46:1.000:. ./.:4:609,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:271,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:349,48:.:-0.61:1.000:. ./.:4:295,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:676,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:714,137:.: 2.09:0.992:. ./.:4:229,124:.:-0.87:1.000:. ./.:4:644,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:728,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:312,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:232,120:.:-0.87:1.000:. ./.:4:663,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:255,101:.:-0.85:1.000:. ./.:4:76,24:.:-2.37:1.000:. ./.:4:900,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:583,121:.: 1.22:1.000:. ./.:4:662,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:770,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:620,155:.: 1.64:1.000:. ./.:4:622,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:137,28:.:-1.98:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.86:1.000:. ./.:3:96,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:268,123:.:-0.64:1.000:. ./.:4:349,129:.:-0.12:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:577,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:443,146:.: 0.54:1.000:. ./.:4:350,103:.:-0.27:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:845,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:567,127:.: 1.16:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:595,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:397,134:.: 0.19:1.000:. ./.:4:766,176:.: 2.63:1.000:. ./.:4:308,102:.:-0.53:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:255,143:.:-0.60:1.000:. ./.:4:396,95:.:-0.05:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:508,123:.: 0.79:1.000:. ./.:4:643,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:710,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:598,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:430,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:640,136:.: 1.65:1.000:. ./.:4:634,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:195,68:.:-1.40:1.000:. ./.:4:691,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.82:0.987:. ./.:4:283,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:281,115:.:-0.61:1.000:. ./.:4:338,103:.:-0.34:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:358,111:.:-0.18:1.000:. ./.:4:692,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:279,113:.:-0.64:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:455,109:.: 0.39:1.000:. ./.:4:371,117:.:-0.06:1.000:. ./.:4:271,73:.:-0.92:1.000:. ./.:4:801,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:435,137:.: 0.43:1.000:. ./.:4:235,90:.:-1.03:1.000:. ./.:4:203,94:.:-1.20:1.000:. ./.:4:321,107:.:-0.42:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:216,83:.:-1.19:1.000:. ./.:4:750,167:.: 2.49:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:672,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:839,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:319,87:.:-0.55:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:355,92:.:-0.31:1.000:. ./.:4:208,83:.:-1.24:1.000:. ./.:4:264,114:.:-0.72:1.000:. ./.:4:249,69:.:-1.07:1.000:. ./.:4:219,122:.:-0.94:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:315,92:.:-0.55:1.000:. ./.:4:374,105:.:-0.12:1.000:. ./.:4:674,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:457,104:.: 0.37:1.000:. ./.:4:304,100:.:-0.56:1.000:. ./.:4:841,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:631,124:.: 1.52:1.000:. ./.:3:464,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:534,120:.: 0.92:1.000:. ./.:4:532,66:.: 0.59:1.000:. ./.:4:202,92:.:-1.22:1.000:. ./.:4:511,99:.: 0.66:1.000:. ./.:4:259,87:.:-0.91:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:402,106:.: 0.05:1.000:. ./.:4:376,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:462,108:.: 0.42:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:635,109:.: 1.46:1.000:. ./.:6:605,109:.: 1.28:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:289,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:571,79:.: 0.90:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:536,107:.: 0.86:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:873,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:460,107:.: 0.41:1.000:. ./.:4:630,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:277,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:437,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:203,126:.:-1.01:1.000:. ./.:4:330,82:.:-0.52:1.000:. ./.:4:443,91:.: 0.21:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:409,145:.: 0.33:1.000:. ./.:4:771,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:333,84:.:-0.49:1.000:. ./.:4:279,111:.:-0.65:1.000:. ./.:4:429,100:.: 0.18:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:289,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:671,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:701,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:643,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:415,91:.: 0.04:1.000:. ./.:4:641,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:419,116:.: 0.21:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:208,114:.:-1.05:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:647,115:.: 1.56:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:341,98:.:-0.36:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:244,93:.:-0.96:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:282,98:.:-0.71:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:256,109:.:-0.80:1.000:. ./.:4:487,185:.: 1.03:1.000:. ./.:4:253,145:.:-0.60:1.000:. ./.:4:268,113:.:-0.70:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:381,122:.: 0.02:1.000:. ./.:4:929,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:334,130:.:-0.21:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.37:1.000:. -chr1.1 14974968 chr1.1_014974968 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:61,56:.: 0.46:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:151,38:.: 2.57:1.000:. ./.:4:32,7:.:-1.83:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:68,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:39,34:.:-0.83:1.000:. ./.:4:79,35:.: 0.37:1.000:. ./.:4:114,33:.: 1.33:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.39:0.992:. ./.:4:123,24:.: 1.33:1.000:. ./.:4:120,35:.: 1.57:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:10,5:.:-2.53:1.000:. ./.:4:103,23:.: 0.72:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:83,16:.:-0.07:1.000:. ./.:4:20,3:.:-2.30:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:18,1:.:-2.42:1.000:. ./.:4:30,4:.:-1.98:1.000:. ./.:3:13,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:89,22:.: 0.28:1.000:. ./.:4:93,32:.: 0.69:1.000:. ./.:4:101,44:.: 1.28:1.000:. ./.:4:94,28:.: 0.60:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:61,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:45,14:.:-1.24:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:86,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,4:.:-2.33:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:64,8:.:-0.86:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:126,42:.: 1.95:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:93,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,21:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.42:1.000:. ./.:6:75,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:89,24:.: 0.34:1.000:. ./.:4:70,21:.:-0.31:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:39,14:.:-1.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:60,15:.:-0.78:0.987:. ./.:4:50,47:.:-0.13:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:32,14:.:-1.63:1.000:. ./.:4:70,20:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,33:.: 0.69:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:52,13:.:-1.07:1.000:. ./.:4:96,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:62,26:.:-0.39:1.000:. ./.:4:95,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:117,24:.: 1.16:1.000:. ./.:4:33,22:.:-1.36:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:74,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:82,42:.: 0.66:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.92:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:65,26:.:-0.31:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:69,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.92:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.92:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:24,8:.:-2.04:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:51,18:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,28:.:-0.48:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:63,27:.:-0.34:1.000:. ./.:4:94,25:.: 0.51:1.000:. ./.:4:113,36:.: 1.39:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:73,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:121,49:.: 2.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.48:0.999:. ./.:4:87,0:.:-0.42:1.000:. ./.:3:36,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:71,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.83:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:95,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:78,30:.: 0.19:1.000:. ./.:4:95,19:.: 0.37:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.19:1.000:. ./.:6:96,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:45,13:.:-1.27:1.000:. ./.:4:50,19:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,10:.:-1.36:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:99,26:.: 0.69:1.000:. ./.:4:33,13:.:-1.63:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:83,20:.: 0.05:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:62,21:.:-0.54:1.000:. ./.:4:71,30:.:-0.01:1.000:. ./.:4:90,18:.: 0.19:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:111,22:.: 0.92:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:114,31:.: 1.28:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:130,32:.: 1.77:1.000:. ./.:4:85,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:121,46:.: 1.92:1.000:. ./.:4:90,36:.: 0.72:1.000:. ./.:4:22,6:.:-2.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:110,30:.: 1.13:1.000:. ./.:4:98,22:.: 0.54:1.000:. ./.:4:125,30:.: 1.57:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:83,26:.: 0.22:1.000:. ./.:4:73,23:.:-0.16:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,17:.:-0.13:1.000:. ./.:4:77,25:.: 0.02:1.000:. ./.:4:80,24:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,25:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:77,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:84,30:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,18:.:-0.48:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:142,30:.: 2.07:1.000:. ./.:4:130,40:.: 2.01:1.000:. ./.:4:94,22:.: 0.43:1.000:. ./.:4:122,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.19:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:93,31:.: 0.66:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:83,24:.: 0.16:1.000:. -chr1.1 15282744 chr1.1_015282744 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:284,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:186,50:.: 0.56:1.000:. ./.:4:191,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:279,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:216,70:.: 1.43:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:174,55:.: 0.44:1.000:. ./.:4:141,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:206,57:.: 1.03:1.000:. ./.:4:177,57:.: 0.53:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.81:0.992:. ./.:4:280,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:226,56:.: 1.36:1.000:. ./.:4:179,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:35,9:.:-2.78:1.000:. ./.:4:181,52:.: 0.51:1.000:. ./.:4:190,57:.: 0.75:1.000:. ./.:4:154,45:.:-0.08:1.000:. ./.:4:26,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:132,45:.:-0.47:1.000:. ./.:4:247,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:161,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:205,59:.: 1.05:1.000:. ./.:4:171,64:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:63,11:.:-2.26:1.000:. ./.:3:12,3:.:-3.29:1.000:. ./.:4:163,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:188,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:196,43:.: 0.61:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:508,0:.: 5.30:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:153,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:187,82:.: 1.14:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:171,52:.: 0.34:1.000:. ./.:4:131,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:128,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.36:1.000:. ./.:6:179,10:.:-0.26:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:164,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:157,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:161,51:.: 0.14:1.000:. ./.:4:95,20:.:-1.55:1.000:. ./.:4:175,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:165,46:.: 0.13:0.987:. ./.:4:197,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:155,40:.:-0.15:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:147,55:.:-0.03:1.000:. ./.:4:135,34:.:-0.61:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:138,57:.:-0.15:1.000:. ./.:4:167,62:.: 0.44:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:155,57:.: 0.14:1.000:. ./.:4:139,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:187,52:.: 0.61:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:138,46:.:-0.34:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:155,56:.: 0.13:1.000:. ./.:4:114,33:.:-0.99:1.000:. ./.:4:130,46:.:-0.48:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:116,40:.:-0.83:1.000:. ./.:4:149,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:141,52:.:-0.19:1.000:. ./.:4:225,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:112,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:134,53:.:-0.29:1.000:. ./.:4:133,46:.:-0.43:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:117,58:.:-0.50:1.000:. ./.:4:167,52:.: 0.27:1.000:. ./.:4:220,75:.: 1.59:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.55:0.999:. ./.:4:239,1:.: 0.63:1.000:. ./.:3:85,41:.:-1.35:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:118,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:132,40:.:-0.55:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:129,43:.:-0.55:1.000:. ./.:4:169,60:.: 0.44:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:125,52:.:-0.47:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.18:1.000:. ./.:6:173,45:.: 0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:120,21:.:-1.09:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:190,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:164,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:105,38:.:-1.06:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:166,57:.: 0.34:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:177,70:.: 0.75:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:121,35:.:-0.83:1.000:. ./.:4:97,50:.:-0.99:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:149,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,38:.:-1.02:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:205,66:.: 1.17:1.000:. ./.:4:201,61:.: 1.01:1.000:. ./.:4:159,52:.: 0.13:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:191,54:.: 0.72:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:112,27:.:-1.13:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:157,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:149,41:.:-0.24:1.000:. ./.:4:158,56:.: 0.18:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:128,42:.:-0.59:1.000:. ./.:4:146,45:.:-0.22:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:168,64:.: 0.49:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:165,63:.: 0.42:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:165,45:.: 0.11:1.000:. ./.:4:153,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:135,58:.:-0.19:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:135,40:.:-0.50:1.000:. ./.:4:131,41:.:-0.55:1.000:. ./.:4:186,51:.: 0.58:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:147,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:211,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:222,1:.: 0.34:1.000:. -chr1.1 15424890 chr1.1_015424890 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:228,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:112,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.47:0.992:. ./.:4:293,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:365,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:257,2:.: 0.25:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:55,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.91:1.000:. ./.:3:53,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:373,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:241,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.76:1.000:. ./.:6:190,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:228,1:.:-0.25:0.987:. ./.:4:263,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:384,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:288,0:.: 0.73:1.000:. ./.:3:154,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.93:1.000:. ./.:6:256,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:403,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.45:1.000:. -chr1.1 15712918 chr1.1_015712918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:144,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:152,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:137,45:.: 1.68:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:26,17:.:-2.66:1.000:. ./.:4:21,13:.:-2.94:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:104,36:.: 0.37:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:140,43:.: 1.71:1.000:. ./.:4:120,25:.: 0.52:0.992:. ./.:4:154,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:131,27:.: 0.93:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:20,9:.:-3.10:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,30:.: 0.49:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:24,2:.:-3.19:1.000:. ./.:4:107,52:.: 0.96:1.000:. ./.:4:143,36:.: 1.58:1.000:. ./.:4:100,34:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,31:.: 0.18:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.81:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.47:0.970:. ./.:4:132,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:93,28:.:-0.23:1.000:. ./.:4:119,39:.: 0.93:1.000:. ./.:4:123,35:.: 0.93:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:96,33:.: 0.02:1.000:. ./.:4:77,22:.:-0.91:1.000:. ./.:4:114,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:103,23:.:-0.07:1.000:. ./.:4:136,29:.: 1.15:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:71,15:.:-1.32:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:102,29:.: 0.09:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:136,46:.: 1.68:1.000:. ./.:4:110,25:.: 0.21:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:97,29:.:-0.07:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:100,27:.:-0.04:1.000:. ./.:6:100,14:.:-0.44:1.000:. ./.:4:113,32:.: 0.52:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:100,31:.: 0.09:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:129,34:.: 1.08:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:103,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:0.987:. ./.:4:151,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:57,21:.:-1.57:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:111,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:82,22:.:-0.76:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.24:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:68,31:.:-0.91:1.000:. ./.:4:136,36:.: 1.37:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:121,38:.: 0.96:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:95,28:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:100,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:133,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,21:.:-0.82:1.000:. ./.:4:104,25:.: 0.02:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:133,46:.: 1.58:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:127,43:.: 1.30:1.000:. ./.:4:110,38:.: 0.62:0.999:. ./.:4:98,45:.: 0.46:1.000:. ./.:3:51,23:.:-1.69:1.000:. ./.:4:114,33:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:101,37:.: 0.30:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:136,37:.: 1.40:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:94,30:.:-0.13:1.000:. ./.:6:158,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:66,27:.:-1.10:1.000:. ./.:4:99,27:.:-0.07:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:113,33:.: 0.55:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:117,34:.: 0.71:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:76,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:81,28:.:-0.60:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:90,24:.:-0.44:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:125,45:.: 1.30:1.000:. ./.:4:88,43:.: 0.09:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:117,25:.: 0.43:1.000:. ./.:4:127,50:.: 1.52:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:26,9:.:-2.91:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:93,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:85,25:.:-0.57:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:105,39:.: 0.49:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:108,34:.: 0.43:1.000:. ./.:4:94,24:.:-0.32:1.000:. ./.:4:116,28:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,27:.:-0.29:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:91,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:85,33:.:-0.32:1.000:. ./.:4:77,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:116,30:.: 0.55:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,39:.: 0.55:1.000:. ./.:4:117,37:.: 0.80:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.37:1.000:. -chr1.1 16006885 chr1.1_016006885 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:18,1:0.06: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.58:-0.99:1.000:0.929 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.35: 1.23:1.000:0.810 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.48:-1.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.45: 0.05:1.000:0.982 0/0/0/1:4:6,2:0.28:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,1:0.12:-0.40:1.000:0.709 0/0/0/1:4:11,3:0.25: 0.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,10:0.58: 0.34:1.000:0.929 0/0/0/1:4:15,5:0.28: 1.08:0.992:0.995 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,1:0.08: 0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:3,3:0.48:-0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,5:0.39: 0.05:1.000:0.687 0/0/0/1:4:7,2:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.54:-1.14:1.000:0.987 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-0.69:1.000:0.984 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.10:1.000:0.810 0/0/0/0:4:10,1:0.11:-0.25:1.000:0.611 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.10:1.000:0.810 0/0/0/1:4:14,7:0.35: 1.23:1.000:0.810 0/0/0/1:4:6,1:0.17:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-0.69:1.000:0.984 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.73:0.970:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.28:-1.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,3:0.30:-0.25:1.000:0.986 0/0/0/1:4:13,6:0.33: 0.93:1.000:0.904 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.38: 0.49:1.000:0.593 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.17: 1.23:1.000:0.998 0/0/0/0:4:20,2:0.11: 1.38:1.000:0.611 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,6:0.31: 1.23:1.000:0.974 0/0/0/1:4:5,1:0.20:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.17:-0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:3,5:0.55:-0.69:1.000:0.975 0/0/1/1:4:3,3:0.48:-0.99:1.000:0.995 0/0/0/1:4:13,3:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,2:0.17: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,11:0.41: 2.12:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,3:0.16: 1.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:4,2:0.35:-0.99:1.000:0.810 0/0/1/1:4:10,7:0.41: 0.64:1.000:0.873 0/0/0/0/1/1:6:8,3:0.30:-0.25:1.000:0.867 0/0/0/1:4:9,5:0.37: 0.19:1.000:0.598 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.31:-0.84:1.000:0.974 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,2:0.14: 0.64:1.000:0.962 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-1.43:0.987:0.929 0/0/0/1:4:12,5:0.32: 0.64:1.000:0.962 0/0/0/1:4:6,3:0.35:-0.55:1.000:0.810 0/0/0/1:4:3,1:0.28:-1.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-0.55:1.000:0.964 0/0/1/1:4:2,4:0.58:-0.99:1.000:0.929 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.10:1.000:0.810 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.51: 1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,5:0.39: 0.05:1.000:0.687 0/0/0/1:4:21,4:0.19: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,6:0.31: 1.23:1.000:0.974 0/0/0/1:4:26,3:0.12: 2.41:1.000:0.798 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.17: 1.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,2:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,7:0.34: 1.38:1.000:0.894 0/0/0/1:4:8,1:0.13:-0.55:1.000:0.916 0/0/0/1:4:16,5:0.27: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,5:0.39: 0.05:1.000:0.687 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-0.69:1.000:0.984 0/0/0/0:4:25,1:0.05: 1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.20: 2.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.35:-1.43:1.000:0.810 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.33: 0.49:1.000:0.916 0/0/1/1:4:6,8:0.53: 0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:15,4:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,4:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/0:4:17,1:0.07: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,1:0.17:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-0.69:1.000:0.984 0/0/0/1:4:23,3:0.14: 1.97:1.000:0.950 0/0/0/1:4:26,5:0.19: 2.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.13:-0.55:1.000:0.916 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-0.55:1.000:0.964 0/0/0/1:4:13,3:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.21:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,4:0.37:-0.25:1.000:0.529 0/0/0/0:4:20,1:0.06: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.28: 2.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,2:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,4:0.37:-0.25:0.999:0.529 0/0/0/1:4:19,6:0.27: 1.82:1.000:0.997 0/0/0:3:9,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.29: 2.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.10:1.000:0.810 0/0/0/0:4:23,2:0.09: 1.82:1.000:0.903 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,13:0.65: 0.49:1.000:0.811 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.28:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:15,3:0.20: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.17: 1.23:1.000:0.998 0/0/0/0/0/1:6:23,4:0.17: 2.12:1.000:0.980 0/0/0/1:4:4,2:0.35:-0.99:1.000:0.810 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:28,1:0.04: 2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.40:-0.40:1.000:0.808 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,5:0.42:-0.10:1.000:0.894 0/0/0/1:4:7,2:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,4:0.20: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.45:-0.25:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,3:0.21: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.45:-0.25:1.000:0.976 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-0.84:1.000:0.933 0/0/0/1:4:15,2:0.14: 0.64:1.000:0.962 0/0/1/1:4:5,12:0.60: 0.64:1.000:0.819 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.31:-0.84:1.000:0.974 0/0/0/1:4:16,5:0.27: 1.23:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.48:-0.99:1.000:0.995 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.59:-0.40:1.000:0.841 0/0/0/1:4:10,4:0.31: 0.19:1.000:0.974 0/0/1/1:4:11,7:0.39: 0.78:1.000:0.725 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-0.40:1.000:0.951 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-0.55:1.000:0.964 0/0/0/0:4:11,1:0.10:-0.10:1.000:0.841 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,4:0.37:-0.25:1.000:0.529 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,3:0.26: 0.05:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-0.69:1.000:0.984 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-0.55:1.000:0.964 0/0/0/1:4:5,2:0.31:-0.84:1.000:0.974 0/0/1/1:4:2,3:0.54:-1.14:1.000:0.987 0/0/0/1:4:5,2:0.31:-0.84:1.000:0.974 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.33: 0.49:1.000:0.916 0/0/1/1:4:9,6:0.40: 0.34:1.000:0.808 0/0/0/1:4:6,2:0.28:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,4:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,5:0.24: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.33: 0.93:1.000:0.904 0/0/0/1:4:4,1:0.24:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 -chr1.1 16136535 chr1.1_016136535 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:131,21:.: 0.25:1.000:. ./.:4:112,29:.:-0.02:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:167,36:.: 1.48:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:119,26:.: 0.08:1.000:. ./.:4:120,23:.: 0.03:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,23:.: 0.56:1.000:. ./.:4:150,28:.: 0.87:1.000:. ./.:4:120,32:.: 0.25:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.54:0.992:. ./.:4:184,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:155,24:.: 0.90:1.000:. ./.:4:167,25:.: 1.21:1.000:. ./.:4:34,9:.:-2.39:1.000:. ./.:4:115,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:141,38:.: 0.90:1.000:. ./.:4:88,25:.:-0.70:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:111,18:.:-0.31:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:145,34:.: 0.90:1.000:. ./.:4:95,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:119,31:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:42,10:.:-2.17:1.000:. ./.:3:14,0:.:-3.09:0.970:. ./.:4:101,20:.:-0.50:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:89,22:.:-0.75:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:124,30:.: 0.29:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:93,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:83,17:.:-1.01:1.000:. ./.:4:120,27:.: 0.13:1.000:. ./.:4:80,14:.:-1.16:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:159,4:.: 0.51:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:115,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:67,31:.:-1.06:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:91,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:60,13:.:-1.66:1.000:. ./.:4:163,27:.: 1.16:1.000:. ./.:4:100,26:.:-0.38:0.987:. ./.:4:152,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:90,31:.:-0.50:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:96,16:.:-0.72:1.000:. ./.:4:114,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:107,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:111,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:111,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.21:1.000:. ./.:4:116,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:92,19:.:-0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:84,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:87,16:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,29:.:-0.62:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:105,25:.:-0.29:1.000:. ./.:4:141,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:137,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:105,33:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:89,26:.:-0.65:1.000:. ./.:4:105,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:165,34:.: 1.38:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:232,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:154,0:.: 0.29:1.000:. ./.:3:55,15:.:-1.74:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:74,24:.:-1.06:1.000:. ./.:4:79,29:.:-0.82:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.43:1.000:. ./.:4:106,38:.: 0.05:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:132,32:.: 0.54:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.68:1.000:. ./.:6:154,22:.: 0.83:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:67,17:.:-1.40:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:146,35:.: 0.95:1.000:. ./.:4:84,16:.:-1.01:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,20:.:-0.41:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:109,26:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,33:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:121,29:.: 0.20:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:115,32:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:194,38:.: 2.18:1.000:. ./.:4:161,40:.: 1.43:1.000:. ./.:4:116,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:131,30:.: 0.46:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:97,22:.:-0.55:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:126,23:.: 0.17:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:142,26:.: 0.63:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.21:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:97,20:.:-0.60:1.000:. ./.:4:95,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:157,25:.: 0.97:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:130,29:.: 0.42:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:110,20:.:-0.29:1.000:. ./.:4:118,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:118,33:.: 0.22:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,24:.:-0.87:1.000:. ./.:4:88,19:.:-0.84:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:157,25:.: 0.97:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:267,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.04:1.000:. -chr1.1 16221768 chr1.1_016221768 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:12,42:0.76: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,25:0.71:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,27:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,41:0.62: 1.55:1.000:0.604 0/1/1/1:4:18,35:0.64: 0.90:1.000:0.657 0/0/0/1:4:28,2:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,24:0.53: 0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.89:1.000:0.987 0/1/1/1:4:1,4:0.78:-1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.40:-2.08:1.000:0.762 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,1:0.16:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.44: 0.30:1.000:0.971 0/0/1/1:4:23,39:0.61: 1.43:1.000:0.739 0/1/1/1:4:27,56:0.65: 2.68:0.992:0.809 0/0/1/1:4:19,14:0.45:-0.29:1.000:0.975 0/0/0/0:4:61,1:0.07: 1.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,58:0.69: 2.56:1.000:0.979 0/0/1/1:4:7,8:0.51:-1.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,1:0.13:-0.35:1.000:0.898 0/0/1/1:4:38,32:0.46: 1.91:1.000:0.989 0/0/0/0:4:40,1:0.10: 0.18:1.000:0.790 0/0/0/1:4:6,1:0.29:-1.84:1.000:0.989 0/1/1/1:4:29,69:0.68: 3.58:1.000:0.958 0/0/1/1:4:34,41:0.52: 2.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,16:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,52:0.73: 1.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,30:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,31:0.45: 1.97:1.000:0.982 0/0/1/1:4:22,26:0.52: 0.60:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.64:-1.72:1.000:0.730 1/1/1:3:0,1:1.00:-2.20:0.970:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,29:0.49: 1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,14:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,33:0.43: 2.62:1.000:0.956 0/1/1/1:4:11,23:0.65:-0.23:1.000:0.824 0/0/0/1:4:16,1:0.24:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,49:0.73: 1.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,32:0.62: 0.72:1.000:0.612 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,18:0.67:-0.71:1.000:0.920 0/0/0/1:4:11,3:0.33:-1.42:1.000:0.909 0/0/1/1:4:18,16:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/1/1/1:4:3,19:0.85:-0.95:1.000:0.987 0/0/1/1:4:19,8:0.38:-0.65:1.000:0.528 0/0/1/1:4:24,26:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,23:0.63:-0.17:1.000:0.616 0/0/1/1:4:14,22:0.59:-0.11:1.000:0.879 0/0/0/1:4:24,1:0.16:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,18:0.41: 0.78:1.000:0.847 0/0/1/1:4:22,38:0.61: 1.31:1.000:0.693 0/0/1/1:4:31,20:0.43: 0.78:1.000:0.943 0/0/1/1:4:18,20:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:17,20:0.52:-0.05:1.000:0.875 0/0/1/1:4:19,18:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,16:0.44: 0.06:1.000:0.964 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,2:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,22:0.39: 1.73:1.000:0.736 0/0/1/1:4:18,16:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,13:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,22:0.45: 0.78:1.000:0.979 0/0/0/1:4:14,1:0.25:-1.36:0.987:0.999 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,13:0.60:-1.01:1.000:0.828 0/1/1/1:4:16,30:0.63: 0.48:1.000:0.550 0/0/0/1:4:27,1:0.15:-0.59:1.000:0.984 0/1/1/1:4:19,51:0.71: 1.91:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,19:0.44: 0.48:1.000:0.967 0/1/1/1:4:11,24:0.66:-0.17:1.000:0.887 0/1/1/1:4:6,13:0.66:-1.13:1.000:0.878 0/0/1/1:4:13,7:0.41:-1.07:1.000:0.836 0/0/1/1:4:23,24:0.49: 0.54:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,44:0.83: 0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,28:0.46: 1.43:1.000:0.988 0/0/1/1:4:12,18:0.58:-0.47:1.000:0.929 0/0/1/1:4:29,17:0.42: 0.48:1.000:0.898 0/0/1/1:4:16,17:0.49:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,14:0.43:-0.17:1.000:0.953 0/0/1/1:4:13,17:0.54:-0.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:18,19:0.49:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,15:0.58:-0.77:1.000:0.929 0/0/1/1:4:13,18:0.56:-0.41:1.000:0.972 0/0/1/1:4:24,10:0.38:-0.23:1.000:0.513 0/0/1/1:4:32,21:0.43: 0.90:1.000:0.948 0/0/1/1:4:18,22:0.53: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,23:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,25:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,27:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,18:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,22:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,12:0.78:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,1:0.23:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.43:-0.89:1.000:0.941 0/0/1/1:4:12,10:0.46:-0.95:1.000:0.989 0/0/0/1:4:25,8:0.35:-0.29:1.000:0.811 0/0/1/1:4:38,24:0.43: 1.43:1.000:0.935 0/0/1/1:4:26,14:0.41: 0.12:1.000:0.836 0/0/1/1:4:25,22:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,30:0.71: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,21:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,9:0.62:-1.42:1.000:0.575 0/1/1/1:4:12,39:0.74: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,15:0.48:-0.41:0.999:0.994 0/0/1/1:4:30,19:0.43: 0.66:1.000:0.936 0/1/1:3:12,14:0.51:-0.71:1.000:0.713 0/0/1/1:4:19,27:0.56: 0.48:1.000:0.962 0/0/1/1:4:21,11:0.40:-0.35:1.000:0.811 0/0/1/1:4:13,10:0.45:-0.89:1.000:0.981 0/0/0/1:4:37,11:0.34: 0.60:1.000:0.864 0/0/1/1:4:14,14:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,20:0.69:-0.59:1.000:0.976 0/0/0/1:4:24,8:0.35:-0.35:1.000:0.774 0/0/0/1:4:24,1:0.16:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,17:0.40: 0.72:1.000:0.794 0/1/1/1:4:13,38:0.72: 0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,28:0.63: 0.30:1.000:0.536 0/0/1/1/1/1:6:17,27:0.59: 0.36:1.000:0.562 0/0/1/1:4:15,16:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,1:0.24:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,17:0.61:-0.65:1.000:0.733 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:13,27:0.65: 0.12:1.000:0.811 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,22:0.53: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,16:0.57:-0.65:1.000:0.950 0/1/1/1:4:19,62:0.74: 2.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,24:0.44: 1.14:1.000:0.973 0/0/1/1:4:16,22:0.55: 0.01:1.000:0.975 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.89:1.000:0.987 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.47:-0.89:1.000:0.994 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,21:0.41: 1.20:1.000:0.877 0/1/1/1:4:5,16:0.74:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,17:0.52:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:19,27:0.56: 0.48:1.000:0.962 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,22:0.43: 1.08:1.000:0.944 0/0/1/1:4:15,24:0.59: 0.06:1.000:0.853 0/0/1/1:4:12,20:0.60:-0.35:1.000:0.778 0/0/0/1:4:30,2:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,1:0.16:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,4:0.78:-1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,15:0.48:-0.41:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,26:0.63: 0.12:1.000:0.521 0/1/1/1:4:11,25:0.67:-0.11:1.000:0.928 0/1/1/1:4:10,20:0.64:-0.47:1.000:0.730 0/0/1/1:4:21,15:0.44:-0.11:1.000:0.970 0/0/0/1:4:30,11:0.36: 0.18:1.000:0.667 0/0/1/1:4:22,22:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,19:0.44: 0.48:1.000:0.967 0/0/1/1:4:15,14:0.48:-0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,25:0.63: 0.01:1.000:0.625 0/0/0/1:4:30,1:0.13:-0.41:1.000:0.933 0/0/1/1:4:23,34:0.57: 1.14:1.000:0.940 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,22:0.55: 0.01:1.000:0.975 0/0/1/1:4:22,20:0.47: 0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,1:0.15:-0.59:1.000:0.984 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,15:0.41: 0.18:1.000:0.888 0/1/1/1:4:11,39:0.76: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,24:0.68:-0.23:1.000:0.962 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,3:0.30:-1.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:24,18:0.45: 0.24:1.000:0.978 0/0/1/1:4:25,27:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,25:0.57: 0.24:1.000:0.943 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,23:0.44: 1.02:1.000:0.971 0/0/1/1:4:22,23:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,51:0.75: 1.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,21:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,22:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,44:0.75: 1.14:1.000:0.999 -chr1.1 16403559 chr1.1_016403559 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:2,7:0.70:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:9,5:0.35: 1.11:1.000:0.762 0/1/1/1:4:2,10:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,8:0.56: 0.88:1.000:0.966 0/1/1/1:4:3,8:0.66: 0.41:1.000:0.855 0/0/0/0:4:10,1:0.10: 0.41:1.000:0.775 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.30:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:5,3:0.37:-0.29:1.000:0.601 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.61:-1.45:1.000:0.742 0/0/0/1:4:4,2:0.33:-0.75:1.000:0.899 0/0/0/1:4:9,2:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.46:-0.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,10:0.51: 2.04:0.992:0.996 0/0/0/1:4:13,8:0.37: 2.74:1.000:0.540 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,17:0.73: 2.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:1,2:0.61:-1.45:1.000:0.742 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:5,6:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,5:0.32: 1.58:1.000:0.958 0/0/1/1:4:3,5:0.57:-0.29:1.000:0.949 0/0/1/1:4:4,7:0.58: 0.41:1.000:0.918 0/0/1/1:4:2,3:0.55:-0.99:1.000:0.982 0/0/1/1:4:9,8:0.44: 1.81:1.000:0.970 0/0/1/1:4:3,4:0.52:-0.52:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:11,1:0.09: 0.64:1.000:0.920 0/0/0/1:4:12,7:0.36: 2.28:1.000:0.665 0/0/1/1:4:6,5:0.43: 0.41:1.000:0.944 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,5:0.35: 1.11:1.000:0.762 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-1.45:1.000:0.899 0/0/1/1:4:3,6:0.61:-0.06:1.000:0.742 0/0/1/1:4:7,7:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.61:-0.75:1.000:0.742 0/0/1/1:4:5,4:0.42:-0.06:1.000:0.919 0/0/1/1:4:3,3:0.46:-0.75:1.000:0.990 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-0.99:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,6:0.35: 1.81:1.000:0.793 0/0/1/1:4:1,2:0.61:-1.45:1.000:0.742 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.31: 0.18:1.000:0.975 0/0/1/1:4:5,6:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.46:-0.29:1.000:0.990 0/1/1/1:4:1,6:0.79:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:5,4:0.42:-0.06:1.000:0.530 0/1/1/1:4:2,10:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,1:0.19:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.19:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,4:0.28: 1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:4,6:0.55: 0.18:1.000:0.982 0/0/0/1:4:5,2:0.30:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:11,6:0.35: 1.81:1.000:0.793 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.75:0.987:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.27: 1.58:1.000:0.998 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.61:-1.45:1.000:0.742 0/0/1/1:4:5,4:0.42:-0.06:1.000:0.919 0/0/0/1:4:7,1:0.14:-0.29:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.21: 1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.69: 0.88:1.000:0.979 0/0/1/1:4:7,7:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:9,3:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,4:0.28: 1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,5:0.43: 0.41:1.000:0.944 0/1/1/1:4:2,10:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,5:0.40: 0.64:1.000:0.788 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,5:0.40: 0.64:1.000:0.788 0/0/1/1:4:3,2:0.39:-0.99:1.000:0.652 0/0/0/1:4:5,3:0.37:-0.29:1.000:0.601 0/0/1/1:4:4,5:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,6:0.46: 0.64:1.000:0.990 0/1/1/1:4:1,5:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,2:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,5:0.32: 1.58:1.000:0.958 0/0/1/1:4:3,2:0.39:-0.99:1.000:0.652 0/0/1/1:4:4,3:0.41:-0.52:1.000:0.857 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-1.22:1.000:0.990 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:5,3:0.37:-0.29:1.000:0.601 0/1/1/1:4:1,5:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.25: 2.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,1:0.16:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,5:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,3:0.33:-0.06:1.000:0.899 0/0/0/1:4:9,3:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:10,5:0.33: 1.34:1.000:0.899 0/0/1/1:4:4,5:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:7,3:0.31: 0.18:1.000:0.975 0/0/0/1:4:8,2:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.61:-1.45:0.999:0.742 0/0/1/1:4:5,6:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1:3:5,1:0.19:-0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:7,3:0.31: 0.18:1.000:0.975 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:7,4:0.36: 0.41:1.000:0.708 0/0/1/1:4:6,4:0.39: 0.18:1.000:0.652 0/1/1/1:4:3,7:0.63: 0.18:1.000:0.618 0/0/0/1:4:12,2:0.16: 1.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-0.06:1.000:0.830 0/0/0/1:4:10,3:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,6:0.61:-0.06:1.000:0.742 0/0/1/1:4:5,8:0.56: 0.88:1.000:0.966 0/0/0/0/1/1:6:7,5:0.40: 0.64:1.000:0.648 0/1/1/1:4:1,5:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.52:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,14:0.55: 3.21:1.000:0.974 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.46: 0.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:5,2:0.30:-0.52:1.000:0.987 0/1/1/1:4:1,3:0.68:-1.22:1.000:0.947 0/0/0/1:4:9,1:0.11: 0.18:1.000:0.524 0/0/1/1:4:6,12:0.61: 2.04:1.000:0.742 0/0/1/1:4:5,4:0.42:-0.06:1.000:0.919 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.41:-0.52:1.000:0.857 0/0/0/1:4:9,4:0.31: 0.88:1.000:0.965 0/0/0/1:4:11,2:0.17: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,6:0.41: 1.11:1.000:0.857 0/0/0/1:4:7,3:0.31: 0.18:1.000:0.975 0/0/0/1:4:12,5:0.30: 1.81:1.000:0.981 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.41:-0.52:1.000:0.857 0/0/0/1:4:4,2:0.33:-0.75:1.000:0.899 0/0/0/1:4:4,2:0.33:-0.75:1.000:0.899 0/0/0/1:4:6,1:0.16:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:4,4:0.46:-0.29:1.000:0.990 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:3,2:0.39:-0.99:1.000:0.652 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-1.45:1.000:0.899 0/0/0/1:4:8,5:0.37: 0.88:1.000:0.502 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.68:-0.29:1.000:0.947 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.46:-0.75:1.000:0.990 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.17: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,4:0.39: 0.18:1.000:0.652 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.42:-0.06:1.000:0.919 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.39: 0.18:1.000:0.652 0/0/0/1:4:14,3:0.20: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.31: 0.88:1.000:0.965 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-1.45:1.000:0.899 0/0/0/1:4:10,3:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,5:0.57:-0.29:1.000:0.949 0/0/0/1:4:6,2:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.58: 0.41:1.000:0.918 -chr1.1 16522945 chr1.1_016522945 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:145,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:110,42:.: 0.39:1.000:. ./.:4:84,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:108,37:.: 0.21:1.000:. ./.:4:134,31:.: 0.72:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:104,29:.:-0.09:1.000:. ./.:4:116,26:.: 0.14:1.000:. ./.:4:22,3:.:-2.83:1.000:. ./.:4:16,2:.:-3.01:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:110,28:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,19:.:-1.21:1.000:. ./.:4:99,22:.:-0.40:1.000:. ./.:4:115,37:.: 0.39:0.992:. ./.:4:168,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:121,93:.: 1.96:1.000:. ./.:4:142,28:.: 0.85:1.000:. ./.:4:28,12:.:-2.45:1.000:. ./.:4:83,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:52,51:.:-0.85:1.000:. ./.:4:77,26:.:-0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:101,90:.: 1.38:1.000:. ./.:4:71,18:.:-1.21:1.000:. ./.:4:72,25:.:-1.01:1.000:. ./.:4:88,15:.:-0.85:1.000:. ./.:4:114,28:.: 0.14:1.000:. ./.:4:174,32:.: 1.76:1.000:. ./.:4:89,19:.:-0.73:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:26,11:.:-2.53:1.000:. ./.:3:10,0:.:-3.21:0.970:. ./.:4:95,29:.:-0.32:1.000:. ./.:4:129,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:118,27:.: 0.21:1.000:. ./.:4:177,46:.: 2.19:1.000:. ./.:4:152,29:.: 1.12:1.000:. ./.:4:125,29:.: 0.44:1.000:. ./.:4:115,36:.: 0.36:1.000:. ./.:4:141,42:.: 1.18:1.000:. ./.:4:112,54:.: 0.74:1.000:. ./.:4:169,36:.: 1.73:1.000:. ./.:4:111,43:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:18,3:.:-2.93:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:72,22:.:-1.08:1.000:. ./.:4:90,15:.:-0.80:1.000:. ./.:4:118,35:.: 0.41:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:151,40:.: 1.38:1.000:. ./.:4:95,27:.:-0.37:1.000:. ./.:4:122,43:.: 0.72:1.000:. ./.:4:73,67:.: 0.08:1.000:. ./.:4:174,48:.: 2.17:1.000:. ./.:4:149,45:.: 1.45:1.000:. ./.:6:101,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:97,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:164,44:.: 1.81:1.000:. ./.:4:137,32:.: 0.82:1.000:. ./.:4:125,31:.: 0.49:1.000:. ./.:4:115,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:111,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:77,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:162,40:.: 1.66:0.987:. ./.:4:105,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:149,35:.: 1.20:1.000:. ./.:4:113,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:241,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:83,30:.:-0.60:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:112,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:103,25:.:-0.22:1.000:. ./.:4:114,29:.: 0.16:1.000:. ./.:4:124,40:.: 0.69:1.000:. ./.:4:153,32:.: 1.23:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:150,38:.: 1.30:1.000:. ./.:4:83,23:.:-0.78:1.000:. ./.:4:85,62:.: 0.26:1.000:. ./.:4:116,35:.: 0.36:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:93,22:.:-0.55:1.000:. ./.:4:132,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:122,26:.: 0.29:1.000:. ./.:4:146,51:.: 1.53:1.000:. ./.:4:57,19:.:-1.54:1.000:. ./.:4:142,44:.: 1.25:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:103,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:85,76:.: 0.62:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:99,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:132,20:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,46:.:-0.75:1.000:. ./.:4:123,40:.: 0.67:1.000:. ./.:4:134,29:.: 0.67:1.000:. ./.:4:97,26:.:-0.35:1.000:. ./.:4:79,59:.: 0.03:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:171,36:.: 1.78:1.000:. ./.:4:104,37:.: 0.11:0.999:. ./.:4:126,28:.: 0.44:1.000:. ./.:3:27,42:.:-1.72:1.000:. ./.:4:120,27:.: 0.26:1.000:. ./.:4:122,33:.: 0.47:1.000:. ./.:4:100,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:109,35:.: 0.19:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:129,33:.: 0.64:1.000:. ./.:4:89,21:.:-0.68:1.000:. ./.:4:98,33:.:-0.14:1.000:. ./.:4:95,33:.:-0.22:1.000:. ./.:6:169,37:.: 1.76:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:97,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:100,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:104,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.09:1.000:. ./.:4:86,19:.:-0.80:1.000:. ./.:4:88,31:.:-0.45:1.000:. ./.:4:99,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:113,26:.: 0.06:1.000:. ./.:4:108,27:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,48:.:-0.70:1.000:. ./.:4:102,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:73,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:100,39:.: 0.06:1.000:. ./.:4:91,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:88,20:.:-0.73:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,66:.: 0.08:1.000:. ./.:4:64,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:85,28:.:-0.60:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:101,24:.:-0.30:1.000:. ./.:4:140,28:.: 0.80:1.000:. ./.:4:115,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:27,8:.:-2.58:1.000:. ./.:4:75,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:139,41:.: 1.10:1.000:. ./.:4:132,32:.: 0.69:1.000:. ./.:4:99,24:.:-0.35:1.000:. ./.:4:108,27:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,18:.:-0.55:1.000:. ./.:4:89,32:.:-0.40:1.000:. ./.:4:71,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:87,26:.:-0.60:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:79,56:.:-0.04:1.000:. ./.:4:74,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:52,28:.:-1.44:1.000:. ./.:4:136,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:90,28:.:-0.47:1.000:. ./.:4:95,22:.:-0.50:1.000:. ./.:4:47,42:.:-1.21:1.000:. ./.:4:83,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:107,26:.:-0.09:1.000:. ./.:4:86,30:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,37:.: 0.34:1.000:. ./.:4:109,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:133,29:.: 0.64:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:103,26:.:-0.19:1.000:. ./.:4:102,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,29:.: 0.16:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:141,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.04:1.000:. -chr1.1 16563045 chr1.1_016563045 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:176,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.81:0.992:. ./.:4:122,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:192,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.75:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.46:0.970:. ./.:4:138,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.57:1.000:. ./.:6:89,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.79:0.987:. ./.:4:187,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.92:0.999:. ./.:4:161,0:.: 0.65:1.000:. ./.:3:98,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.06:1.000:. ./.:6:180,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:230,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:183,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.21:1.000:. -chr1.1 16763798 chr1.1_016763798 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:393,92:.: 1.67:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:218,107:.: 0.26:1.000:. ./.:4:379,147:.: 2.03:1.000:. ./.:4:423,81:.: 1.84:1.000:. ./.:4:112,174:.:-0.09:1.000:. ./.:4:72,81:.:-1.26:1.000:. ./.:4:246,117:.: 0.59:1.000:. ./.:4:246,143:.: 0.82:1.000:. ./.:4:129,24:.:-1.26:1.000:. ./.:4:300,56:.: 0.53:1.000:. ./.:4:361,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:102,138:.:-0.50:1.000:. ./.:4:95,118:.:-0.73:1.000:. ./.:4:234,124:.: 0.55:1.000:. ./.:4:320,138:.: 1.43:1.000:. ./.:4:452,110:.: 2.35:0.992:. ./.:4:114,145:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,169:.: 0.19:1.000:. ./.:4:414,142:.: 2.29:1.000:. ./.:4:353,73:.: 1.15:1.000:. ./.:4:98,104:.:-0.83:1.000:. ./.:4:266,129:.: 0.87:1.000:. ./.:4:79,122:.:-0.84:1.000:. ./.:4:86,35:.:-1.55:1.000:. ./.:4:505,193:.: 3.55:1.000:. ./.:4:482,119:.: 2.69:1.000:. ./.:4:219,84:.: 0.06:1.000:. ./.:4:387,93:.: 1.62:1.000:. ./.:4:240,144:.: 0.78:1.000:. ./.:4:252,154:.: 0.97:1.000:. ./.:4:235,138:.: 0.68:1.000:. ./.:4:214,25:.:-0.50:1.000:. ./.:4:175,45:.:-0.67:1.000:. ./.:3:135,44:.:-1.03:0.970:. ./.:4:132,155:.:-0.08:1.000:. ./.:4:315,88:.: 0.94:1.000:. ./.:4:260,77:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,78:.:-0.80:1.000:. ./.:4:247,124:.: 0.66:1.000:. ./.:4:204,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:102,65:.:-1.14:1.000:. ./.:4:402,77:.: 1.61:1.000:. ./.:4:374,69:.: 1.30:1.000:. ./.:4:88,58:.:-1.33:1.000:. ./.:4:204,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:246,105:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,66:.:-0.78:1.000:. ./.:4:191,72:.:-0.29:1.000:. ./.:4:288,123:.: 1.01:1.000:. ./.:4:171,49:.:-0.67:1.000:. ./.:4:286,134:.: 1.09:1.000:. ./.:4:173,64:.:-0.52:1.000:. ./.:4:175,55:.:-0.58:1.000:. ./.:4:102,70:.:-1.10:1.000:. ./.:4:227,126:.: 0.50:1.000:. ./.:4:278,102:.: 0.74:1.000:. ./.:4:301,102:.: 0.94:1.000:. ./.:4:195,60:.:-0.36:1.000:. ./.:6:133,47:.:-1.03:1.000:. ./.:4:153,42:.:-0.89:1.000:. ./.:4:198,100:.: 0.02:1.000:. ./.:4:135,57:.:-0.92:1.000:. ./.:4:96,84:.:-1.03:1.000:. ./.:4:231,76:.: 0.10:1.000:. ./.:4:183,91:.:-0.20:1.000:. ./.:4:163,51:.:-0.72:1.000:. ./.:4:167,76:.:-0.47:1.000:. ./.:4:96,101:.:-0.87:0.987:. ./.:4:354,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:100,131:.:-0.57:1.000:. ./.:4:269,62:.: 0.31:1.000:. ./.:4:371,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:105,86:.:-0.93:1.000:. ./.:4:459,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:254,92:.: 0.44:1.000:. ./.:4:331,96:.: 1.16:1.000:. ./.:4:147,52:.:-0.86:1.000:. ./.:4:133,96:.:-0.59:1.000:. ./.:4:192,89:.:-0.13:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:343,70:.: 1.03:1.000:. ./.:4:168,87:.:-0.36:1.000:. ./.:4:207,86:.:-0.03:1.000:. ./.:4:212,114:.: 0.26:1.000:. ./.:4:211,57:.:-0.25:1.000:. ./.:4:149,53:.:-0.83:1.000:. ./.:4:132,67:.:-0.86:1.000:. ./.:4:152,51:.:-0.82:1.000:. ./.:4:208,94:.: 0.05:1.000:. ./.:4:155,77:.:-0.57:1.000:. ./.:4:204,90:.:-0.02:1.000:. ./.:4:205,59:.:-0.28:1.000:. ./.:4:160,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:145,51:.:-0.88:1.000:. ./.:4:200,66:.:-0.27:1.000:. ./.:4:77,43:.:-1.55:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:162,59:.:-0.66:1.000:. ./.:4:205,79:.:-0.11:1.000:. ./.:4:184,60:.:-0.46:1.000:. ./.:4:66,67:.:-1.44:1.000:. ./.:4:89,54:.:-1.35:1.000:. ./.:4:153,63:.:-0.71:1.000:. ./.:4:142,60:.:-0.83:1.000:. ./.:4:183,73:.:-0.35:1.000:. ./.:4:195,72:.:-0.26:1.000:. ./.:4:221,107:.: 0.28:1.000:. ./.:4:337,145:.: 1.64:1.000:. ./.:4:183,57:.:-0.50:1.000:. ./.:4:150,36:.:-0.97:1.000:. ./.:4:384,132:.: 1.94:1.000:. ./.:4:135,38:.:-1.09:0.999:. ./.:4:182,50:.:-0.57:1.000:. ./.:3:114,45:.:-1.21:1.000:. ./.:4:170,43:.:-0.73:1.000:. ./.:4:175,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:209,84:.:-0.03:1.000:. ./.:4:171,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:171,49:.:-0.67:1.000:. ./.:4:238,50:.:-0.07:1.000:. ./.:4:137,62:.:-0.86:1.000:. ./.:4:79,89:.:-1.13:1.000:. ./.:4:282,111:.: 0.86:1.000:. ./.:4:263,77:.: 0.39:1.000:. ./.:4:270,47:.: 0.18:1.000:. ./.:6:229,88:.: 0.18:1.000:. ./.:4:170,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:52,54:.:-1.68:1.000:. ./.:4:120,24:.:-1.34:1.000:. ./.:4:284,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:211,104:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,57:.:-1.67:1.000:. ./.:4:298,43:.: 0.40:1.000:. ./.:4:174,69:.:-0.47:1.000:. ./.:4:478,108:.: 2.56:1.000:. ./.:4:214,100:.: 0.16:1.000:. ./.:4:151,48:.:-0.86:1.000:. ./.:4:112,44:.:-1.24:1.000:. ./.:4:76,42:.:-1.57:1.000:. ./.:4:195,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,27:.:-1.82:1.000:. ./.:4:178,105:.:-0.12:1.000:. ./.:4:133,56:.:-0.95:1.000:. ./.:4:300,99:.: 0.91:1.000:. ./.:4:323,171:.: 1.75:1.000:. ./.:4:131,127:.:-0.34:1.000:. ./.:4:204,119:.: 0.24:1.000:. ./.:4:318,110:.: 1.16:1.000:. ./.:4:205,60:.:-0.27:1.000:. ./.:4:146,93:.:-0.50:1.000:. ./.:4:127,124:.:-0.40:1.000:. ./.:4:162,28:.:-0.94:1.000:. ./.:4:224,114:.: 0.37:1.000:. ./.:4:350,96:.: 1.32:1.000:. ./.:4:261,144:.: 0.96:1.000:. ./.:4:319,104:.: 1.12:1.000:. ./.:4:261,154:.: 1.05:1.000:. ./.:4:174,99:.:-0.20:1.000:. ./.:4:284,106:.: 0.83:1.000:. ./.:4:225,106:.: 0.31:1.000:. ./.:4:240,109:.: 0.47:1.000:. ./.:4:229,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:141,107:.:-0.42:1.000:. ./.:4:403,104:.: 1.86:1.000:. ./.:4:117,134:.:-0.40:1.000:. ./.:4:239,75:.: 0.16:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:105,79:.:-0.99:1.000:. ./.:4:102,100:.:-0.83:1.000:. ./.:4:201,113:.: 0.16:1.000:. ./.:4:296,72:.: 0.63:1.000:. ./.:4:205,110:.: 0.17:1.000:. ./.:4:92,55:.:-1.32:1.000:. ./.:4:84,85:.:-1.12:1.000:. ./.:4:174,66:.:-0.50:1.000:. ./.:4:333,165:.: 1.78:1.000:. ./.:4:258,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:122,102:.:-0.64:1.000:. ./.:4:208,98:.: 0.09:1.000:. ./.:4:264,90:.: 0.51:1.000:. ./.:4:525,128:.: 3.15:1.000:. ./.:4:320,122:.: 1.29:1.000:. ./.:4:181,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:416,1:.: 1.07:1.000:. -chr1.1 16976894 chr1.1_016976894 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,294:1.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,60:0.31:-0.85:1.000:0.970 0/0/1/1:4:107,138:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,181:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,205:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,92:0.30: 1.27:1.000:0.988 0/0/1/1:4:78,87:0.48:-1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,136:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,147:0.57: 0.35:1.000:0.958 0/0/1/1:4:16,30:0.60:-3.40:1.000:0.765 0/0/1/1:4:25,49:0.61:-2.86:1.000:0.656 0/0/1/1:4:95,123:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,53:0.26:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,51:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,138:0.56: 0.08:1.000:0.961 0/0/1/1:4:102,148:0.54: 0.57:1.000:0.987 0/1/1/1:4:56,226:0.76: 1.19:0.992:1.000 0/0/0/1:4:151,70:0.29: 0.00:1.000:0.990 0/0/0/0:4:267,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,203:0.73: 0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,22:0.35:-3.17:1.000:0.811 0/0/0/1:4:158,74:0.29: 0.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:185,82:0.28: 0.90:1.000:0.994 0/0/0/1:4:133,42:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,22:0.69:-3.71:1.000:0.966 0/0/1/1:4:105,123:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,192:0.78: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,133:0.48: 0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,249:0.80: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,135:0.49: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,134:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,132:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,33:0.70:-3.44:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,65:0.71:-2.62:1.000:0.991 1/1/1:3:2,29:0.92:-3.69:0.970:1.000 0/0/0/1:4:149,85:0.33: 0.26:1.000:0.904 0/0/1/1:4:79,125:0.56:-0.33:1.000:0.963 0/0/1/1:4:110,146:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:162,66:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:114,144:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,139:0.49: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,67:0.29:-0.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:61,214:0.73: 1.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,187:0.79: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,77:0.31: 0.16:1.000:0.974 0/0/1/1:4:95,141:0.55: 0.29:1.000:0.982 0/1/1/1:4:64,226:0.73: 1.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,26:0.25:-2.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,155:0.73:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,77:0.48:-1.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,116:0.58:-0.74:1.000:0.895 0/0/1/1:4:108,149:0.53: 0.70:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,162:0.72:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,134:0.53: 0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:158,65:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:117,138:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,134:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,124:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,134:0.47: 0.70:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:80,118:0.55:-0.44:1.000:0.769 0/0/1/1:4:128,160:0.50: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,127:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:161,79:0.30: 0.37:1.000:0.982 0/0/0/1:4:124,80:0.36:-0.33:1.000:0.697 0/0/1/1:4:90,129:0.54:-0.04:1.000:0.988 0/0/1/1:4:101,123:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,103:0.55:-0.95:1.000:0.981 0/0/0/1:4:166,62:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:159,62:0.26: 0.00:0.987:0.999 0/0/1/1:4:105,99:0.44:-0.33:1.000:0.970 0/0/0/1:4:206,74:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,73:0.49:-1.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:162,66:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:180,72:0.27: 0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,197:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,62:0.27:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,174:0.73: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,140:0.54: 0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:103,113:0.48:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,141:0.48: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,94:0.47:-0.76:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,274:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,157:0.54: 0.92:1.000:0.990 0/0/1/1:4:111,95:0.42:-0.29:1.000:0.915 0/0/0/1:4:113,48:0.28:-1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,131:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,148:0.78:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,131:0.52: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,175:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,121:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:87,121:0.53:-0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,118:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,153:0.55: 0.64:1.000:0.978 0/0/1/1:4:74,99:0.52:-0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,168:0.58: 0.88:1.000:0.906 0/1/1/1:4:64,198:0.71: 0.80:1.000:0.991 0/0/0/1:4:141,75:0.32:-0.09:1.000:0.955 0/0/1/1:4:79,128:0.57:-0.27:1.000:0.951 0/0/0/1:4:164,64:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,177:0.74: 0.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,156:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,139:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,113:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,110:0.47:-0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:126,51:0.27:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,138:0.53: 0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:81,118:0.54:-0.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:107,133:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,77:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,189:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,183:0.79: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,155:0.48: 1.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,140:0.51: 0.53:0.999:0.996 0/0/1/1:4:108,140:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1:3:77,61:0.40:-1.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,132:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,101:0.61:-1.32:1.000:0.681 0/0/1/1:4:100,119:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,132:0.57:-0.15:1.000:0.947 0/1/1/1:4:32,193:0.83: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,130:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,113:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,79:0.29: 0.59:1.000:0.991 0/0/1/1:4:117,170:0.54: 1.29:1.000:0.986 0/1/1/1:4:49,177:0.74: 0.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:53,205:0.75: 0.72:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:60,274:0.78: 2.20:1.000:0.809 0/0/0/1:4:127,66:0.31:-0.54:1.000:0.965 0/0/0/1:4:105,47:0.29:-1.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,127:0.55:-0.15:1.000:0.984 0/1/1/1:4:46,176:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,127:0.49: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,49:0.33:-1.61:1.000:0.934 0/1/1/1:4:43,188:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,112:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,273:0.78: 2.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,137:0.47: 0.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,121:0.56:-0.43:1.000:0.970 0/0/1/1:4:119,136:0.48: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,210:0.76: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,69:0.29:-0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:109,117:0.47: 0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,90:0.54:-1.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,192:0.77: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,83:0.28: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,125:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,183:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,123:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:154,79:0.31: 0.24:1.000:0.970 0/0/0/1:4:145,58:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,24:0.53:-3.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:97,113:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,150:0.56: 0.49:1.000:0.968 0/0/1/1:4:100,134:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,157:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,145:0.53: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,134:0.54: 0.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:108,138:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,132:0.57:-0.17:1.000:0.939 0/0/1/1:4:75,126:0.58:-0.39:1.000:0.925 0/1/1/1:4:66,160:0.66: 0.10:1.000:0.867 0/0/0/0:4:200,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,184:0.75: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,136:0.54: 0.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:131,65:0.31:-0.48:1.000:0.979 0/0/0/1:4:165,58:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,59:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,66:0.30:-0.29:1.000:0.988 0/1/1/1:4:28,142:0.80:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,110:0.43: 0.27:1.000:0.937 0/0/0/1:4:159,76:0.30: 0.27:1.000:0.986 0/0/0/1:4:121,53:0.28:-0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,128:0.53: 0.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:138,188:0.53: 2.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:74,216:0.70: 1.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:112,141:0.51: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,137:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,146:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,251:0.77: 1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,202:0.70: 0.99:1.000:0.980 0/1/1/1:4:37,156:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,121:0.46: 0.39:1.000:0.985 -chr1.1 17030914 chr1.1_017030914 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:199,228:.: 1.15:1.000:. ./.:4:227,78:.:-0.55:1.000:. ./.:4:278,89:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,212:.: 0.19:1.000:. ./.:4:204,241:.: 1.40:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:282,91:.: 0.40:1.000:. ./.:4:243,84:.:-0.24:1.000:. ./.:4:133,30:.:-2.52:1.000:. ./.:4:118,27:.:-2.77:1.000:. ./.:4:171,190:.: 0.23:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:269,105:.: 0.41:1.000:. ./.:4:272,99:.: 0.37:1.000:. ./.:4:180,217:.: 0.73:0.992:. ./.:4:299,93:.: 0.66:1.000:. ./.:4:489,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:204,257:.: 1.62:1.000:. ./.:4:132,38:.:-2.42:1.000:. ./.:4:337,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:290,95:.: 0.57:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:120,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:226,216:.: 1.36:1.000:. ./.:4:201,217:.: 1.03:1.000:. ./.:4:239,87:.:-0.25:1.000:. ./.:4:198,226:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:281,91:.: 0.39:1.000:. ./.:4:225,66:.:-0.74:1.000:. ./.:4:92,23:.:-3.19:1.000:. ./.:4:115,53:.:-2.45:1.000:. ./.:3:76,20:.:-3.45:0.970:. ./.:4:414,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:265,100:.: 0.29:1.000:. ./.:4:255,98:.: 0.12:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:285,99:.: 0.55:1.000:. ./.:4:273,86:.: 0.21:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:186,191:.: 0.46:1.000:. ./.:4:149,141:.:-0.75:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:267,80:.: 0.04:1.000:. ./.:4:297,108:.: 0.85:1.000:. ./.:4:191,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:219,71:.:-0.75:1.000:. ./.:4:242,61:.:-0.57:1.000:. ./.:4:226,66:.:-0.73:1.000:. ./.:4:298,104:.: 0.80:1.000:. ./.:4:268,83:.: 0.09:1.000:. ./.:4:277,99:.: 0.44:1.000:. ./.:4:349,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:258,100:.: 0.19:1.000:. ./.:4:172,212:.: 0.55:1.000:. ./.:4:291,102:.: 0.68:1.000:. ./.:4:221,95:.:-0.39:1.000:. ./.:6:180,78:.:-1.20:1.000:. ./.:4:228,91:.:-0.35:1.000:. ./.:4:280,97:.: 0.46:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:301,106:.: 0.87:1.000:. ./.:4:247,84:.:-0.18:1.000:. ./.:4:209,62:.:-1.02:1.000:. ./.:4:303,86:.: 0.62:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.26:0.987:. ./.:4:145,166:.:-0.46:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:224,59:.:-0.85:1.000:. ./.:4:268,91:.: 0.21:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:85,298:.: 0.54:1.000:. ./.:4:263,91:.: 0.14:1.000:. ./.:4:182,190:.: 0.39:1.000:. ./.:4:273,77:.: 0.08:1.000:. ./.:4:241,56:.:-0.66:1.000:. ./.:4:304,94:.: 0.75:1.000:. ./.:4:128,140:.:-1.06:1.000:. ./.:4:178,218:.: 0.72:1.000:. ./.:4:256,111:.: 0.32:1.000:. ./.:4:226,89:.:-0.41:1.000:. ./.:4:285,116:.: 0.79:1.000:. ./.:4:300,91:.: 0.65:1.000:. ./.:4:187,73:.:-1.17:1.000:. ./.:4:242,68:.:-0.48:1.000:. ./.:4:231,82:.:-0.43:1.000:. ./.:4:262,101:.: 0.26:1.000:. ./.:4:232,87:.:-0.35:1.000:. ./.:4:252,79:.:-0.18:1.000:. ./.:4:282,101:.: 0.54:1.000:. ./.:4:218,63:.:-0.88:1.000:. ./.:4:272,89:.: 0.23:1.000:. ./.:4:229,85:.:-0.42:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:154,122:.:-0.95:1.000:. ./.:4:333,97:.: 1.19:1.000:. ./.:4:322,109:.: 1.21:1.000:. ./.:4:189,77:.:-1.09:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:174,52:.:-1.64:1.000:. ./.:4:261,95:.: 0.16:1.000:. ./.:4:215,73:.:-0.78:1.000:. ./.:4:237,93:.:-0.20:1.000:. ./.:4:228,80:.:-0.50:1.000:. ./.:4:297,98:.: 0.71:1.000:. ./.:4:359,134:.: 2.07:1.000:. ./.:4:227,100:.:-0.24:1.000:. ./.:4:261,83:.: 0.00:1.000:. ./.:4:349,112:.: 1.62:1.000:. ./.:4:288,96:.: 0.55:0.999:. ./.:4:256,105:.: 0.23:1.000:. ./.:3:143,68:.:-1.85:1.000:. ./.:4:240,98:.:-0.09:1.000:. ./.:4:225,85:.:-0.48:1.000:. ./.:4:247,90:.:-0.10:1.000:. ./.:4:177,89:.:-1.09:1.000:. ./.:4:246,72:.:-0.36:1.000:. ./.:4:256,104:.: 0.22:1.000:. ./.:4:242,89:.:-0.18:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:280,122:.: 0.80:1.000:. ./.:4:167,156:.:-0.29:1.000:. ./.:4:186,202:.: 0.61:1.000:. ./.:6:242,174:.: 1.00:1.000:. ./.:4:216,57:.:-0.99:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:202,54:.:-1.23:1.000:. ./.:4:132,178:.:-0.48:1.000:. ./.:4:267,87:.: 0.14:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:182,223:.: 0.85:1.000:. ./.:4:241,90:.:-0.18:1.000:. ./.:4:211,239:.: 1.47:1.000:. ./.:4:294,118:.: 0.94:1.000:. ./.:4:114,137:.:-1.30:1.000:. ./.:4:208,81:.:-0.77:1.000:. ./.:4:322,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:236,120:.: 0.16:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:223,88:.:-0.46:1.000:. ./.:4:184,65:.:-1.32:1.000:. ./.:4:351,106:.: 1.57:1.000:. ./.:4:376,131:.: 2.26:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:276,61:.:-0.10:1.000:. ./.:4:306,102:.: 0.89:1.000:. ./.:4:234,78:.:-0.45:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:100,22:.:-3.09:1.000:. ./.:4:243,74:.:-0.38:1.000:. ./.:4:272,111:.: 0.54:1.000:. ./.:4:286,93:.: 0.48:1.000:. ./.:4:323,141:.: 1.67:1.000:. ./.:4:282,117:.: 0.76:1.000:. ./.:4:238,86:.:-0.28:1.000:. ./.:4:322,116:.: 1.30:1.000:. ./.:4:290,97:.: 0.59:1.000:. ./.:4:251,81:.:-0.17:1.000:. ./.:4:251,68:.:-0.35:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:177,193:.: 0.36:1.000:. ./.:4:326,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:218,74:.:-0.73:1.000:. ./.:4:279,103:.: 0.53:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:313,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:229,76:.:-0.55:1.000:. ./.:4:173,133:.:-0.53:1.000:. ./.:4:272,116:.: 0.61:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:314,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:206,90:.:-0.67:1.000:. ./.:4:303,110:.: 0.96:1.000:. ./.:4:277,115:.: 0.66:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:237,63:.:-0.61:1.000:. ./.:4:280,89:.: 0.34:1.000:. ./.:4:229,237:.: 1.69:1.000:. ./.:4:329,121:.: 1.47:1.000:. ./.:4:216,69:.:-0.82:1.000:. ./.:4:208,221:.: 1.18:1.000:. -chr1.1 17368305 chr1.1_017368305 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:92,6:0.08: 0.84:1.000:0.988 0/0/1/1:4:35,21:0.42:-0.55:1.000:0.926 0/0/0/1:4:30,13:0.35:-0.98:1.000:0.744 0/0/0/1:4:88,15:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,14:0.14: 2.00:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.25:-1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,18:0.40:-0.71:1.000:0.811 0/0/1/1:4:26,25:0.53:-0.71:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:29,3:0.12:-1.34:1.000:0.823 0/0/0/1:4:45,11:0.26:-0.55:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,19:0.48:-0.95:1.000:0.994 0/0/0/1:4:84,11:0.15: 0.74:1.000:0.990 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 2.53:0.992:1.000 0/0/1/1:4:44,43:0.53: 0.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:37,27:0.47:-0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:61,12:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.51:-1.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,18:0.46:-0.98:1.000:0.990 0/0/0/1:4:48,11:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,8:0.20:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.45:-2.24:1.000:0.976 0/0/0/0:4:116,8:0.08: 1.70:1.000:0.975 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,13:0.22: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,10:0.12: 1.10:1.000:0.836 0/0/1/1:4:22,15:0.45:-1.18:1.000:0.981 0/0/0/1:4:64,8:0.15:-0.02:1.000:0.982 0/0/0/1:4:33,13:0.34:-0.88:1.000:0.890 0/0/1/1:4:2,3:0.62:-2.24:1.000:0.582 0/0/1/1:4:5,6:0.57:-2.04:1.000:0.937 0/1/1:3:2,7:0.77:-2.10:0.970:1.000 0/0/0/1:4:68,16:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:85,5:0.07: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,15:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,32:0.49:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,14:0.18: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:94,3:0.04: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,26:0.45:-0.28:1.000:0.982 0/0/0/0:4:116,6:0.06: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,25:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,30:0.43: 0.21:1.000:0.940 0/0/0/1:4:86,12:0.16: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,9:0.56:-1.84:1.000:0.967 0/0/0/1:4:61,10:0.19:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,38:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,19:0.32:-0.02:1.000:0.956 0/0/0/1:4:98,23:0.25: 1.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,20:0.28: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,26:0.31: 1.04:1.000:0.979 0/0/1/1:4:28,17:0.43:-0.91:1.000:0.934 0/0/0/1:4:81,27:0.31: 1.17:1.000:0.979 0/0/0/1:4:91,13:0.16: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,29:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,20:0.31: 0.21:1.000:0.975 0/0/0/0/1/1:6:40,22:0.40:-0.35:1.000:0.612 0/0/0/1:4:71,17:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,31:0.46: 0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,21:0.44:-0.62:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,12:0.13: 1.47:1.000:0.944 0/0/1/1:4:40,33:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,8:0.27:-1.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,17:0.28: 0.11:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.91:0.987:1.000 0/0/0/1:4:57,13:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,35:0.61:-0.42:1.000:0.743 0/0/0/0:4:52,3:0.07:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,26:0.42:-0.12:1.000:0.931 0/0/0/1:4:78,13:0.19: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,8:0.08: 1.77:1.000:0.980 0/0/0/1:4:56,18:0.30: 0.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:70,17:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,15:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,45:0.64:-0.02:1.000:0.687 0/0/0/1:4:86,28:0.30: 1.37:1.000:0.983 0/0/0/1:4:62,19:0.29: 0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,11:0.13: 1.24:1.000:0.921 0/0/0/1:4:85,25:0.28: 1.24:1.000:0.994 0/0/0/0:4:55,5:0.11:-0.42:1.000:0.532 0/0/0/1:4:65,13:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,8:0.10: 1.24:1.000:0.883 0/0/0/1:4:30,8:0.27:-1.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,15:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,12:0.18: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,18:0.36:-0.48:1.000:0.659 0/0/1/1:4:20,20:0.54:-1.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:77,22:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:143,9:0.08: 2.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:22,10:0.36:-1.34:1.000:0.634 0/0/1/1:4:45,57:0.58: 0.97:1.000:0.893 0/0/0/1:4:50,13:0.27:-0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,26:0.38: 0.24:1.000:0.519 0/0/0/1:4:62,17:0.27: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,29:0.36: 0.71:1.000:0.680 0/0/0/1:4:71,19:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,13:0.35:-0.98:1.000:0.744 0/0/1/1:4:34,19:0.41:-0.65:1.000:0.849 0/0/0/1:4:46,19:0.35:-0.25:1.000:0.830 0/0/0/1:4:51,21:0.34:-0.02:1.000:0.834 0/0/0/1:4:49,14:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,22:0.30: 0.64:1.000:0.988 0/0/0/1:4:69,29:0.35: 0.84:1.000:0.802 0/0/0/1:4:46,10:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,18:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,14:0.19: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,29:0.38: 0.48:1.000:0.621 0/0/0/1:4:82,9:0.13: 0.61:1.000:0.909 0/0/0/1:4:62,18:0.28: 0.24:0.999:0.995 0/0/0/1:4:106,11:0.12: 1.47:1.000:0.829 0/0/1:3:45,13:0.28:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,12:0.17: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,11:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,11:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,31:0.40: 0.51:1.000:0.806 0/0/1/1:4:60,29:0.38: 0.54:1.000:0.530 0/0/0/1:4:75,25:0.31: 0.91:1.000:0.979 0/0/0/1:4:67,13:0.21: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,4:0.05: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,20:0.29: 0.38:1.000:0.989 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:92,18:0.21: 1.24:1.000:0.849 0/0/1/1:4:25,27:0.55:-0.68:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,11:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,25:0.53:-0.71:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,29:0.59:-0.71:1.000:0.845 0/0/0/0:4:123,7:0.07: 1.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,15:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,8:0.11: 0.81:1.000:0.568 0/0/1/1:4:33,23:0.46:-0.55:1.000:0.985 0/0/1/1:4:38,32:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,19:0.32: 0.01:1.000:0.964 0/0/0/1:4:56,11:0.22:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,8:0.17:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,28:0.57:-0.68:1.000:0.952 0/0/0/1:4:92,9:0.12: 0.94:1.000:0.693 0/0/0/1:4:77,20:0.26: 0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,19:0.41:-0.65:1.000:0.849 0/0/0/1:4:60,12:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,15:0.19: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,16:0.17: 1.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:33,15:0.36:-0.81:1.000:0.634 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.47:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:30,16:0.40:-0.88:1.000:0.769 0/0/0/1:4:76,11:0.17: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,19:0.36:-0.38:1.000:0.646 0/0/0/1:4:64,17:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,16:0.34:-0.58:1.000:0.840 0/0/0/1:4:59,15:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,10:0.21:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,13:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,23:0.46:-0.55:1.000:0.985 0/0/0/1:4:70,13:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,20:0.42:-0.62:1.000:0.909 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,14:0.31:-0.62:1.000:0.966 0/0/0/0:4:63,4:0.08:-0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,10:0.39:-1.44:1.000:0.742 0/0/1/1:4:26,18:0.45:-0.95:1.000:0.984 0/0/0/1:4:28,11:0.34:-1.11:1.000:0.893 0/0/0/1:4:47,7:0.17:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/0:4:66,6:0.11:-0.02:1.000:0.532 0/0/1/1:4:26,16:0.43:-1.01:1.000:0.943 0/0/0/1:4:52,16:0.29:-0.15:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,4:0.09:-0.48:1.000:0.940 0/0/0/1:4:78,12:0.18: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,9:0.17:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,23:0.44:-0.45:1.000:0.962 0/0/0/1:4:38,14:0.32:-0.68:1.000:0.942 0/0/0/0:4:113,3:0.03: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,6:0.07: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,9:0.16: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,5:0.12:-0.55:1.000:0.699 0/0/0/1:4:76,17:0.24: 0.67:1.000:1.000 -chr1.1 17502654 chr1.1_017502654 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:159,46:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,113:0.79:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,101:0.48: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,92:0.48: 0.20:1.000:0.995 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,143:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,82:0.78:-2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,88:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,93:0.53:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:94,67:0.44:-0.76:1.000:0.958 0/0/1/1:4:86,69:0.46:-0.91:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,20:0.40:-3.51:1.000:0.812 0/1/1/1:4:53,135:0.74:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,132:0.71: 0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:92,88:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,50:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,55:0.23: 1.66:0.992:1.000 0/0/1/1:4:117,105:0.49: 0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,190:0.73: 1.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:176,49:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,85:0.51:-0.46:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,201:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,78:0.48:-0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,126:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,84:0.72:-1.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:201,69:0.27: 1.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:159,43:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,37:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.59:-4.65:1.000:0.848 0/1/1/1:4:60,164:0.75: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,60:0.41:-0.96:1.000:0.866 0/0/0/1:4:65,35:0.37:-2.30:1.000:0.603 0/0/1/1:4:84,69:0.47:-0.96:1.000:0.993 0/0/1:3:48,36:0.45:-2.70:0.970:0.970 0/1/1/1:4:51,146:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,91:0.47: 0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:163,48:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,109:0.56: 0.33:1.000:0.974 0/1/1/1:4:37,107:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,123:0.57: 0.80:1.000:0.940 0/0/1/1:4:110,92:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/0:4:238,1:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,47:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,142:0.70: 0.48:1.000:0.983 0/0/1/1:4:110,104:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,94:0.46: 0.55:1.000:0.988 0/1/1/1:4:57,157:0.75: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,100:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,90:0.44: 0.53:1.000:0.973 0/0/0/1:4:157,48:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,182:0.77: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,80:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,41:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,85:0.51:-0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,146:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,45:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:146,116:0.46: 1.79:1.000:0.989 0/0/0/1:4:157,52:0.26: 0.45:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:108,57:0.36:-0.66:1.000:0.864 0/0/0/1:4:145,48:0.26: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,90:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,88:0.42: 0.65:1.000:0.929 0/1/1/1:4:43,145:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,113:0.53: 0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:117,90:0.45: 0.40:1.000:0.984 0/1/1/1:4:55,118:0.70:-0.46:1.000:0.988 0/0/1/1:4:127,106:0.47: 1.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,162:0.79: 0.45:0.987:1.000 0/0/1/1:4:114,81:0.43: 0.10:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,74:0.51:-0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,166:0.73: 1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,140:0.74: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,68:0.25: 2.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,77:0.46:-0.43:1.000:0.989 0/0/0/1:4:159,57:0.28: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,56:0.25: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,102:0.59:-0.33:1.000:0.837 0/1/1/1:4:53,138:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,92:0.53:-0.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:156,55:0.28: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,63:0.66:-2.35:1.000:0.893 0/1/1/1:4:58,147:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,81:0.42: 0.22:1.000:0.927 0/0/1/1:4:111,123:0.55: 1.08:1.000:0.983 0/0/1/1:4:90,70:0.46:-0.79:1.000:0.986 0/1/1/1:4:50,131:0.75:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,129:0.54: 1.44:1.000:0.987 0/0/1/1:4:117,86:0.44: 0.30:1.000:0.971 0/0/1/1:4:75,64:0.48:-1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,165:0.77: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,77:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,87:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,73:0.47:-0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:120,105:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,110:0.75:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,88:0.53:-0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:104,97:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,147:0.74: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:99,64:0.41:-0.71:1.000:0.869 0/1/1/1:4:60,153:0.74: 0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,115:0.75:-0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,142:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,81:0.46:-0.23:1.000:0.990 0/0/0/1:4:155,52:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:53,124:0.72:-0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,156:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,102:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,70:0.50:-1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,89:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:230,57:0.21: 2.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,64:0.32: 0.55:0.999:0.963 0/0/1/1:4:92,106:0.56: 0.17:1.000:0.973 0/0/1:3:75,49:0.41:-1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,113:0.47: 1.51:1.000:0.992 0/0/0/1:4:123,33:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,143:0.75: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,126:0.76:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,87:0.54:-0.61:1.000:0.986 0/0/0/1:4:172,44:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,142:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,122:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,114:0.49: 1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,45:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,63:0.27: 1.41:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:161,86:0.37: 1.41:1.000:0.854 0/1/1/1:4:44,102:0.72:-1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,107:0.72:-0.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:137,28:0.18:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,40:0.28:-1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,79:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,116:0.72:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,47:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,98:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,137:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,45:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,97:0.60:-0.56:1.000:0.831 0/1/1/1:4:52,153:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,91:0.45: 0.53:1.000:0.978 0/1/1/1:4:63,152:0.73: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,120:0.70:-0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:84,76:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,110:0.47: 1.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:131,128:0.52: 1.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,145:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,144:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,127:0.55: 1.28:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,41:0.42:-2.23:1.000:0.899 0/0/1/1:4:110,109:0.52: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,75:0.46:-0.56:1.000:0.989 0/0/0/1:4:103,18:0.16:-1.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:59,59:0.52:-1.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,62:0.27: 1.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,95:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,68:0.30: 1.23:1.000:0.986 0/0/1/1:4:117,107:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,117:0.73:-0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:149,46:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,123:0.78:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,94:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,94:0.52:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,155:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,54:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,117:0.71:-0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,80:0.52:-0.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,119:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,101:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,125:0.73:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,76:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,70:0.44:-0.61:1.000:0.964 0/1/1/1:4:53,118:0.71:-0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:59,150:0.74: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,81:0.70:-1.80:1.000:0.982 0/1/1/1:4:70,182:0.74: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,102:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,132:0.75:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,87:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,93:0.51: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,99:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,98:0.54:-0.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:116,83:0.44: 0.20:1.000:0.960 -chr1.1 17604907 chr1.1_017604907 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:102,420:0.80: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,90:0.33:-1.13:1.000:0.919 0/0/0/1:4:242,134:0.37:-0.23:1.000:0.609 0/1/1/1:4:105,282:0.72:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:123,488:0.79: 2.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,195:0.42: 0.70:1.000:0.913 0/0/1/1:4:147,118:0.45:-1.30:1.000:0.980 0/0/1/1:4:240,168:0.42: 0.08:1.000:0.908 0/0/1/1:4:226,159:0.42:-0.14:1.000:0.913 0/1/1/1:4:20,57:0.74:-3.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,87:0.74:-2.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,143:0.52:-1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:342,84:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:362,118:0.26: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:287,180:0.39: 0.65:1.000:0.732 0/0/1/1:4:188,260:0.58: 0.47:1.000:0.915 1/1/1/1:4:0,388:1.00:-0.11:0.992:1.000 0/0/0/1:4:256,96:0.29:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:403,122:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,297:0.55: 1.34:1.000:0.978 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:264,88:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:227,236:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,173:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,43:0.46:-2.94:1.000:0.986 0/1/1/1:4:103,285:0.73:-0.11:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,312:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,267:0.62: 0.30:1.000:0.594 0/1/1/1:4:92,412:0.81: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,162:0.39: 0.24:1.000:0.699 0/0/1/1:4:176,198:0.53:-0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:240,147:0.39:-0.12:1.000:0.675 0/1/1/1:4:22,44:0.66:-3.22:1.000:0.893 0/0/1/1:4:93,69:0.43:-2.30:1.000:0.951 0/1/1:3:14,14:0.50:-3.59:0.970:0.525 0/0/1/1:4:188,177:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,274:0.78:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,229:0.53: 0.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:271,220:0.45: 0.88:1.000:0.982 0/0/1/1:4:190,195:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:91,280:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:322,221:0.41: 1.38:1.000:0.887 0/1/1/1:4:93,390:0.80: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,347:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:290,205:0.42: 0.92:1.000:0.917 0/0/1/1:4:273,201:0.43: 0.72:1.000:0.947 0/1/1/1:4:200,350:0.63: 1.45:1.000:0.622 0/0/1/1:4:55,42:0.44:-2.92:1.000:0.965 0/0/1/1:4:158,257:0.62: 0.15:1.000:0.597 0/0/1/1:4:266,206:0.44: 0.70:1.000:0.970 0/0/1/1:4:153,243:0.61:-0.04:1.000:0.665 0/0/1/1:4:216,204:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,243:0.60: 0.03:1.000:0.774 0/0/1/1:4:200,302:0.60: 0.99:1.000:0.786 0/0/0/1:4:280,159:0.37: 0.38:1.000:0.537 0/0/1/1:4:193,189:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:102,265:0.72:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:230,337:0.59: 1.62:1.000:0.841 0/0/1/1:4:162,265:0.62: 0.26:1.000:0.580 0/0/1/1/1/1:6:135,193:0.59:-0.69:1.000:0.544 0/1/1/1:4:177,303:0.63: 0.78:1.000:0.557 0/0/1/1:4:249,178:0.42: 0.26:1.000:0.926 0/0/1/1:4:377,247:0.40: 2.17:1.000:0.820 0/0/0/1:4:339,88:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,299:0.71: 0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:315,195:0.39: 1.07:1.000:0.702 0/0/1/1:4:134,135:0.50:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,168:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:387,107:0.23: 0.91:0.987:1.000 0/0/1/1:4:159,151:0.49:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:396,134:0.27: 1.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:92,260:0.73:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:333,96:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,205:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,282:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,158:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,276:0.60: 0.55:1.000:0.765 0/0/1/1:4:181,271:0.60: 0.51:1.000:0.803 0/0/1/1:4:332,192:0.38: 1.20:1.000:0.516 0/0/1/1:4:238,233:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,168:0.57:-1.04:1.000:0.932 0/1/1/1:4:108,358:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,216:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:172,147:0.46:-0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:218,194:0.47: 0.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:137,345:0.71: 0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:151,180:0.54:-0.66:1.000:0.985 0/0/1/1:4:188,205:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:167,233:0.58: 0.00:1.000:0.906 0/0/1/1:4:242,176:0.43: 0.18:1.000:0.939 0/0/1/1:4:211,157:0.43:-0.31:1.000:0.953 0/0/1/1:4:192,178:0.48:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:127,317:0.71: 0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:195,132:0.41:-0.70:1.000:0.870 0/0/1/1:4:262,182:0.42: 0.43:1.000:0.900 0/0/1/1:4:214,283:0.57: 0.94:1.000:0.949 0/0/1/1:4:186,229:0.55: 0.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:171,157:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:227,203:0.48: 0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:190,188:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,225:0.60:-0.25:1.000:0.786 0/0/1/1:4:293,218:0.43: 1.08:1.000:0.953 0/0/1/1:4:152,162:0.52:-0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:205,164:0.45:-0.30:1.000:0.979 0/0/1/1:4:187,181:0.49:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,258:0.55: 0.66:1.000:0.978 0/0/1/1:4:176,179:0.51:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:170,181:0.52:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:268,241:0.48: 1.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:181,297:0.62: 0.76:1.000:0.571 0/0/1/1:4:181,233:0.56: 0.14:1.000:0.962 0/1/1/1:4:229,388:0.63: 2.10:1.000:0.526 0/0/1/1:4:196,306:0.61: 0.99:0.999:0.710 0/1/1/1:4:106,331:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/1/1:3:92,136:0.60:-1.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:100,317:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,204:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,171:0.52:-0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:205,199:0.49: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,248:0.60: 0.11:1.000:0.770 0/1/1/1:4:180,314:0.63: 0.91:1.000:0.613 0/0/1/1:4:208,198:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:395,118:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,250:0.78:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,309:0.60: 1.13:1.000:0.817 1/1/1/1:4:1,425:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:196,401:0.67: 1.91:1.000:0.921 0/0/0/1:4:247,83:0.27:-0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:283,88:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:125,220:0.64:-0.53:1.000:0.638 1/1/1/1:4:0,341:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,168:0.40: 0.24:1.000:0.823 0/0/0/1:4:245,46:0.18:-1.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,379:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:244,167:0.41: 0.11:1.000:0.883 0/1/1/1:4:124,493:0.80: 2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,192:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:115,308:0.72: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:252,167:0.41: 0.19:1.000:0.839 0/0/0/1:4:250,86:0.27:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:198,265:0.57: 0.61:1.000:0.941 0/0/1/1:4:178,187:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,148:0.47:-0.83:1.000:0.994 0/0/1/1:4:236,151:0.40:-0.12:1.000:0.775 0/0/1/1:4:217,342:0.61: 1.54:1.000:0.685 0/0/1/1:4:253,230:0.48: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:218,178:0.45:-0.04:1.000:0.983 0/0/1/1:4:192,209:0.52: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:182,273:0.60: 0.53:1.000:0.799 0/1/1/1:4:66,258:0.79:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:293,181:0.39: 0.72:1.000:0.696 0/0/1/1:4:258,158:0.39: 0.16:1.000:0.675 0/1/1/1:4:46,93:0.67:-2.52:1.000:0.905 0/0/1/1:4:150,95:0.40:-1.49:1.000:0.754 0/0/1/1:4:186,280:0.60: 0.64:1.000:0.792 0/0/1/1:4:273,212:0.44: 0.82:1.000:0.971 0/0/1/1:4:234,345:0.59: 1.73:1.000:0.831 0/0/1/1:4:304,201:0.41: 1.02:1.000:0.835 0/0/1/1:4:138,152:0.53:-1.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:191,309:0.62: 0.97:1.000:0.613 0/0/1/1:4:138,147:0.52:-1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:216,155:0.42:-0.28:1.000:0.929 0/1/1/1:4:140,246:0.64:-0.13:1.000:0.633 0/0/0/1:4:275,107:0.29:-0.17:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,358:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,90:0.26:-0.35:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,239:0.74:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:283,73:0.22:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:268,182:0.41: 0.49:1.000:0.874 0/0/0/1:4:270,80:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,169:0.56:-0.94:1.000:0.968 0/1/1/1:4:67,284:0.81:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:244,168:0.41: 0.12:1.000:0.890 0/0/1/1:4:174,176:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:323,85:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,133:0.48:-1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:205,205:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,245:0.54: 0.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:288,188:0.40: 0.74:1.000:0.813 0/0/1/1:4:254,167:0.40: 0.21:1.000:0.826 0/1/1/1:4:112,288:0.72: 0.00:1.000:0.994 0/1/1/1:4:125,435:0.77: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,352:0.60: 1.81:1.000:0.802 0/0/1/1:4:135,225:0.62:-0.38:1.000:0.524 0/0/1/1:4:174,173:0.50:-0.51:1.000:0.997 -chr1.1 17863839 chr1.1_017863839 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:998,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:711,151:.: 0.67:1.000:. ./.:4:674,155:.: 0.46:1.000:. ./.:4:641,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:949,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:774,252:.: 1.68:1.000:. ./.:4:434,113:.:-1.28:1.000:. ./.:4:596,178:.: 0.12:1.000:. ./.:4:834,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:282,126:.:-2.14:1.000:. ./.:4:258,183:.:-1.93:1.000:. ./.:4:824,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:653,172:.: 0.44:1.000:. ./.:4:699,172:.: 0.72:1.000:. ./.:4:531,177:.:-0.29:1.000:. ./.:4:547,184:.:-0.14:1.000:. ./.:4:718,0:.:-0.22:0.992:. ./.:4:758,225:.: 1.41:1.000:. ./.:4:868,218:.: 2.05:1.000:. ./.:4:828,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:517,3:.:-1.45:1.000:. ./.:4:650,144:.: 0.25:1.000:. ./.:4:852,182:.: 1.73:1.000:. ./.:4:640,148:.: 0.21:1.000:. ./.:4:203,146:.:-2.50:1.000:. ./.:4:774,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:690,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:504,171:.:-0.49:1.000:. ./.:4:811,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:480,165:.:-0.67:1.000:. ./.:4:581,163:.:-0.06:1.000:. ./.:4:695,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:285,1:.:-2.89:1.000:. ./.:4:423,1:.:-2.04:1.000:. ./.:3:175,36:.:-3.35:0.970:. ./.:4:913,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:882,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:803,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:663,179:.: 0.54:1.000:. ./.:4:492,186:.:-0.47:1.000:. ./.:4:811,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:720,197:.: 1.01:1.000:. ./.:4:925,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:637,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:723,193:.: 1.00:1.000:. ./.:4:588,207:.: 0.25:1.000:. ./.:4:971,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:301,357:.:-0.59:1.000:. ./.:4:535,154:.:-0.40:1.000:. ./.:4:926,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:522,175:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1100,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:517,150:.:-0.54:1.000:. ./.:4:895,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:610,163:.: 0.12:1.000:. ./.:4:551,167:.:-0.22:1.000:. ./.:4:668,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:665,203:.: 0.70:1.000:. ./.:4:460,153:.:-0.87:1.000:. ./.:6:548,89:.:-0.72:1.000:. ./.:4:667,157:.: 0.43:1.000:. ./.:4:485,155:.:-0.71:1.000:. ./.:4:726,238:.: 1.30:1.000:. ./.:4:643,182:.: 0.44:1.000:. ./.:4:554,166:.:-0.21:1.000:. ./.:4:528,173:.:-0.33:1.000:. ./.:4:609,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:506,171:.:-0.48:1.000:. ./.:4:637,183:.: 0.41:0.987:. ./.:4:968,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:722,184:.: 0.94:1.000:. ./.:4:834,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:883,226:.: 2.19:1.000:. ./.:4:757,190:.: 1.19:1.000:. ./.:4:605,187:.: 0.23:1.000:. ./.:4:741,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:706,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:645,177:.: 0.42:1.000:. ./.:4:714,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:822,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:696,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:718,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:542,170:.:-0.26:1.000:. ./.:4:764,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:521,182:.:-0.32:1.000:. ./.:4:909,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:377,112:.:-1.64:1.000:. ./.:4:776,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:543,165:.:-0.29:1.000:. ./.:4:802,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:390,154:.:-1.30:1.000:. ./.:4:845,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:625,173:.: 0.27:1.000:. ./.:4:426,125:.:-1.25:1.000:. ./.:4:489,145:.:-0.74:1.000:. ./.:4:513,181:.:-0.37:1.000:. ./.:4:577,178:.: 0.01:1.000:. ./.:4:531,158:.:-0.40:1.000:. ./.:4:877,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:572,185:.: 0.02:1.000:. ./.:4:752,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:704,188:.: 0.85:1.000:. ./.:4:569,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:775,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:456,150:.:-0.92:1.000:. ./.:4:409,132:.:-1.32:1.000:. ./.:4:780,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:687,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:915,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:513,192:.:-0.30:1.000:. ./.:4:651,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1176,1:.: 2.61:1.000:. ./.:4:531,150:.:-0.45:0.999:. ./.:4:531,179:.:-0.27:1.000:. ./.:3:380,18:.:-2.20:1.000:. ./.:4:835,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:441,130:.:-1.13:1.000:. ./.:4:798,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:474,162:.:-0.73:1.000:. ./.:4:514,156:.:-0.52:1.000:. ./.:4:854,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:524,141:.:-0.55:1.000:. ./.:4:665,152:.: 0.39:1.000:. ./.:4:829,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:692,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:748,1:.:-0.03:1.000:. ./.:6:871,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:313,256:.:-1.14:1.000:. ./.:4:414,113:.:-1.40:1.000:. ./.:4:628,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:613,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:808,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:383,87:.:-1.75:1.000:. ./.:4:694,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:747,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:943,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:486,164:.:-0.64:1.000:. ./.:4:635,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:608,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:615,154:.: 0.09:1.000:. ./.:4:942,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:635,181:.: 0.38:1.000:. ./.:4:496,135:.:-0.76:1.000:. ./.:4:659,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1082,1:.: 2.03:1.000:. ./.:4:1215,1:.: 2.85:1.000:. ./.:4:857,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:566,177:.:-0.07:1.000:. ./.:4:938,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:703,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:742,183:.: 1.05:1.000:. ./.:4:483,168:.:-0.64:1.000:. ./.:4:541,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:331,100:.:-2.00:1.000:. ./.:4:907,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:894,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1076,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:592,179:.: 0.10:1.000:. ./.:4:456,144:.:-0.95:1.000:. ./.:4:629,212:.: 0.54:1.000:. ./.:4:479,152:.:-0.76:1.000:. ./.:4:424,156:.:-1.08:1.000:. ./.:4:574,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:695,169:.: 0.68:1.000:. ./.:4:685,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:712,164:.: 0.75:1.000:. ./.:4:708,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:471,314:.: 0.19:1.000:. ./.:4:625,166:.: 0.23:1.000:. ./.:4:621,134:.: 0.01:1.000:. ./.:4:648,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:575,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:773,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:565,145:.:-0.27:1.000:. ./.:4:545,110:.:-0.61:1.000:. ./.:4:344,124:.:-1.77:1.000:. ./.:4:963,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:953,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:648,163:.: 0.35:1.000:. ./.:4:469,199:.:-0.53:1.000:. ./.:4:850,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:867,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1069,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:648,137:.: 0.19:1.000:. ./.:4:685,180:.: 0.68:1.000:. -chr1.1 18083264 chr1.1_018083264 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:158,123:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.42:1.000:. ./.:4:71,191:.: 0.41:1.000:. ./.:4:68,232:.: 1.15:1.000:. ./.:4:90,286:.: 2.62:1.000:. ./.:4:132,99:.:-0.19:1.000:. ./.:4:70,90:.:-1.56:1.000:. ./.:4:49,196:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,182:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,68:.:-2.68:1.000:. ./.:4:37,75:.:-2.49:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.34:1.000:. ./.:4:64,167:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,190:.: 0.03:1.000:. ./.:4:58,196:.: 0.26:1.000:. ./.:4:58,176:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,191:.: 0.14:0.992:. ./.:4:68,217:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,346:.: 2.04:1.000:. ./.:4:84,238:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.68:1.000:. ./.:4:46,187:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.45:1.000:. ./.:4:51,198:.: 0.16:1.000:. ./.:4:49,53:.:-2.68:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.61:1.000:. ./.:4:56,151:.:-0.65:1.000:. ./.:4:46,168:.:-0.52:1.000:. ./.:4:65,251:.: 1.46:1.000:. ./.:4:83,177:.: 0.37:1.000:. ./.:4:64,154:.:-0.44:1.000:. ./.:4:37,159:.:-0.86:1.000:. ./.:4:87,52:.:-1.97:1.000:. ./.:4:28,98:.:-2.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,197:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,171:.:-0.24:1.000:. ./.:4:55,189:.: 0.06:1.000:. ./.:4:60,202:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,186:.: 0.16:1.000:. ./.:4:61,149:.:-0.59:1.000:. ./.:4:68,211:.: 0.74:1.000:. ./.:4:82,186:.: 0.53:1.000:. ./.:4:70,195:.: 0.47:1.000:. ./.:4:134,130:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,215:.: 0.92:1.000:. ./.:4:142,175:.: 1.48:1.000:. ./.:4:53,140:.:-0.92:1.000:. ./.:4:117,99:.:-0.48:1.000:. ./.:4:48,169:.:-0.46:1.000:. ./.:4:57,173:.:-0.21:1.000:. ./.:4:73,216:.: 0.94:1.000:. ./.:4:114,130:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,233:.: 1.63:1.000:. ./.:4:58,173:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,168:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.55:1.000:. ./.:4:75,240:.: 1.44:1.000:. ./.:4:68,157:.:-0.30:1.000:. ./.:6:61,134:.:-0.88:1.000:. ./.:4:58,174:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,153:.:-0.67:1.000:. ./.:4:92,250:.: 1.96:1.000:. ./.:4:69,225:.: 1.03:1.000:. ./.:4:70,208:.: 0.72:1.000:. ./.:4:74,204:.: 0.72:1.000:. ./.:4:51,157:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.15:1.000:. ./.:4:64,168:.:-0.17:0.987:. ./.:4:0,248:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,219:.: 1.21:1.000:. ./.:4:55,200:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.26:1.000:. ./.:4:53,184:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.13:1.000:. ./.:4:78,181:.: 0.36:1.000:. ./.:4:68,205:.: 0.63:1.000:. ./.:4:68,159:.:-0.26:1.000:. ./.:4:66,170:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.15:1.000:. ./.:4:151,151:.: 1.19:1.000:. ./.:4:70,179:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,200:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,247:.: 1.32:1.000:. ./.:4:92,88:.:-1.17:1.000:. ./.:4:58,145:.:-0.73:1.000:. ./.:4:104,120:.:-0.32:1.000:. ./.:4:49,177:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,154:.:-0.71:1.000:. ./.:4:58,174:.:-0.17:1.000:. ./.:4:75,202:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,170:.:-0.67:1.000:. ./.:4:68,184:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,133:.: 0.37:1.000:. ./.:4:58,185:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.14:1.000:. ./.:4:68,260:.: 1.69:1.000:. ./.:4:110,106:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,134:.: 0.32:1.000:. ./.:4:40,147:.:-1.04:1.000:. ./.:4:51,188:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,211:.:-0.55:1.000:. ./.:4:58,155:.:-0.53:1.000:. ./.:4:62,174:.:-0.09:1.000:. ./.:4:69,161:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,365:.: 2.41:1.000:. ./.:4:120,98:.:-0.44:1.000:. ./.:4:113,104:.:-0.46:1.000:. ./.:4:89,237:.: 1.65:1.000:. ./.:4:61,197:.: 0.34:0.999:. ./.:4:67,193:.: 0.37:1.000:. ./.:3:0,81:.:-3.09:1.000:. ./.:4:56,171:.:-0.26:1.000:. ./.:4:62,186:.: 0.14:1.000:. ./.:4:65,169:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,192:.: 0.16:1.000:. ./.:4:128,108:.:-0.09:1.000:. ./.:4:70,191:.: 0.39:1.000:. ./.:4:56,192:.: 0.14:1.000:. ./.:4:68,183:.: 0.20:1.000:. ./.:4:59,179:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,179:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,203:.: 0.68:1.000:. ./.:6:116,196:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,187:.:-1.04:1.000:. ./.:4:46,119:.:-1.46:1.000:. ./.:4:33,119:.:-1.72:1.000:. ./.:4:53,174:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,209:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,97:.:-2.01:1.000:. ./.:4:54,181:.:-0.11:1.000:. ./.:4:47,193:.:-0.01:1.000:. ./.:4:72,199:.: 0.59:1.000:. ./.:4:61,207:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.24:1.000:. ./.:4:44,125:.:-1.39:1.000:. ./.:4:1,187:.:-1.02:1.000:. ./.:4:109,136:.: 0.08:1.000:. ./.:4:69,152:.:-0.38:1.000:. ./.:4:68,153:.:-0.38:1.000:. ./.:4:32,137:.:-1.39:1.000:. ./.:4:172,183:.: 2.21:1.000:. ./.:4:0,355:.: 2.21:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.47:1.000:. ./.:4:73,175:.: 0.14:1.000:. ./.:4:127,153:.: 0.76:1.000:. ./.:4:55,185:.:-0.01:1.000:. ./.:4:100,246:.: 2.04:1.000:. ./.:4:67,195:.: 0.41:1.000:. ./.:4:20,96:.:-2.41:1.000:. ./.:4:43,126:.:-1.39:1.000:. ./.:4:53,174:.:-0.26:1.000:. ./.:4:74,187:.: 0.39:1.000:. ./.:4:74,261:.: 1.83:1.000:. ./.:4:72,217:.: 0.94:1.000:. ./.:4:42,147:.:-1.00:1.000:. ./.:4:55,188:.: 0.05:1.000:. ./.:4:60,203:.: 0.43:1.000:. ./.:4:57,150:.:-0.65:1.000:. ./.:4:117,110:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,251:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,111:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.23:1.000:. ./.:4:60,188:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.39:1.000:. ./.:4:69,172:.: 0.01:1.000:. ./.:4:61,175:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.65:1.000:. ./.:4:49,143:.:-0.94:1.000:. ./.:4:51,167:.:-0.44:1.000:. ./.:4:61,177:.:-0.05:1.000:. ./.:4:41,145:.:-1.06:1.000:. ./.:4:52,160:.:-0.55:1.000:. ./.:4:67,231:.: 1.11:1.000:. ./.:4:143,144:.: 0.90:1.000:. ./.:4:132,136:.: 0.53:1.000:. ./.:4:52,184:.:-0.09:1.000:. ./.:4:64,199:.: 0.43:1.000:. ./.:4:63,203:.: 0.49:1.000:. ./.:4:170,167:.: 1.86:1.000:. ./.:4:112,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.84:1.000:. -chr1.1 18128065 chr1.1_018128065 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,45:0.59: 1.67:1.000:0.871 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,31:0.39: 2.63:1.000:0.685 0/0/0/1:4:45,20:0.36: 1.96:1.000:0.696 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,33:0.81: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,34:0.77: 0.66:0.992:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,27:0.67: 0.41:1.000:0.930 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:71,43:0.38: 4.32:1.000:0.620 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,41:0.61: 1.38:1.000:0.742 0/1/1/1:4:5,30:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,25:0.80: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,27:0.83: 0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:2,27:0.80: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,31:0.64: 0.70:1.000:0.656 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0:3:12,0:0.00:-0.60:0.970:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,31:0.64: 0.70:1.000:0.656 0/1/1/1:4:6,29:0.69: 0.51:1.000:0.970 0/0/1/1:4:10,34:0.60: 0.94:1.000:0.755 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,27:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,37:0.58: 1.19:1.000:0.924 0/0/1/1:4:20,40:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,24:0.47: 0.70:1.000:0.992 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,18:0.39: 1.04:1.000:0.680 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,26:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,39:0.64: 1.19:1.000:0.675 0/0/1/1:4:7,24:0.61: 0.32:1.000:0.733 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,32:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,41:0.47: 1.96:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:17,25:0.46: 0.85:1.000:0.804 0/0/1/1:4:18,42:0.50: 1.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,35:0.46: 1.62:1.000:0.990 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,42:0.66: 1.33:1.000:0.846 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,26:0.56: 0.51:1.000:0.969 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.26:0.987:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,29:0.56: 0.70:1.000:0.967 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,37:0.71: 0.94:1.000:0.990 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,30:0.44: 1.52:1.000:0.968 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,44:0.60: 1.57:1.000:0.766 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,32:0.42: 1.96:1.000:0.932 0/0/1/1:4:16,38:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,43:0.69: 1.33:1.000:0.966 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,29:0.47: 1.04:1.000:0.993 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,41:0.49: 1.77:1.000:0.996 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,28:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,31:0.61: 0.75:1.000:0.720 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,39:0.69: 1.09:1.000:0.973 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,26:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,30:0.49: 0.99:0.999:0.996 0/1/1/1:4:10,42:0.66: 1.33:1.000:0.846 0/0/1:3:9,21:0.50: 0.27:1.000:0.522 0/0/1/1:4:14,32:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,33:0.49: 1.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,29:0.62: 0.61:1.000:0.562 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,27:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,34:0.53: 1.09:1.000:0.992 0/0/0/0/0/0:6:13,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,25:0.52: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,38:0.50: 1.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,30:0.70: 0.56:1.000:0.980 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,40:0.67: 1.19:1.000:0.919 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,32:0.65: 0.75:1.000:0.744 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,32:0.68: 0.70:1.000:0.942 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,44:0.69: 1.38:1.000:0.974 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,43:0.74: 1.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,43:0.69: 1.33:1.000:0.966 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,27:0.67: 0.41:1.000:0.930 0/1/1/1:4:3,31:0.79: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,54:0.46: 3.21:1.000:0.988 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,24:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,48:0.73: 1.52:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,37:0.76: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,33:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,21:0.79:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,22:0.82:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,28:0.61: 0.56:1.000:0.674 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,18:0.78:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,26:0.66: 0.37:1.000:0.892 0/0/1/1:4:7,16:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,20:0.56: 0.12:1.000:0.973 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,27:0.78: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,36:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 -chr1.1 18698343 chr1.1_018698343 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:666,35:.: 0.95:1.000:. ./.:4:398,34:.:-0.69:1.000:. ./.:4:514,41:.: 0.06:1.000:. ./.:4:672,25:.: 0.92:1.000:. ./.:4:795,76:.: 1.98:1.000:. ./.:4:459,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:244,22:.:-1.70:1.000:. ./.:4:464,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:458,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:174,26:.:-2.10:1.000:. ./.:4:227,35:.:-1.72:1.000:. ./.:4:505,34:.:-0.04:1.000:. ./.:4:284,40:.:-1.35:1.000:. ./.:4:357,54:.:-0.82:1.000:. ./.:4:459,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:576,44:.: 0.45:1.000:. ./.:4:966,51:.: 2.87:0.992:. ./.:4:297,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:497,55:.: 0.04:1.000:. ./.:4:722,52:.: 1.39:1.000:. ./.:4:132,37:.:-2.29:1.000:. ./.:4:422,29:.:-0.57:1.000:. ./.:4:592,52:.: 0.60:1.000:. ./.:4:437,32:.:-0.46:1.000:. ./.:4:83,6:.:-2.77:1.000:. ./.:4:700,32:.: 1.13:1.000:. ./.:4:845,38:.: 2.05:1.000:. ./.:4:454,30:.:-0.37:1.000:. ./.:4:857,26:.: 2.05:1.000:. ./.:4:541,23:.: 0.11:1.000:. ./.:4:596,17:.: 0.41:1.000:. ./.:4:410,36:.:-0.60:1.000:. ./.:4:48,12:.:-2.95:1.000:. ./.:4:141,23:.:-2.32:1.000:. ./.:3:47,3:.:-3.01:0.970:. ./.:4:541,30:.: 0.16:1.000:. ./.:4:613,47:.: 0.70:1.000:. ./.:4:583,51:.: 0.54:1.000:. ./.:4:390,49:.:-0.65:1.000:. ./.:4:659,30:.: 0.87:1.000:. ./.:4:572,32:.: 0.36:1.000:. ./.:4:375,37:.:-0.81:1.000:. ./.:4:752,57:.: 1.60:1.000:. ./.:4:688,35:.: 1.08:1.000:. ./.:4:431,67:.:-0.29:1.000:. ./.:4:457,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:613,38:.: 0.64:1.000:. ./.:4:274,21:.:-1.52:1.000:. ./.:4:474,26:.:-0.28:1.000:. ./.:4:443,45:.:-0.35:1.000:. ./.:4:414,31:.:-0.61:1.000:. ./.:4:664,58:.: 1.07:1.000:. ./.:4:510,21:.:-0.09:1.000:. ./.:4:502,49:.: 0.03:1.000:. ./.:4:369,38:.:-0.84:1.000:. ./.:4:577,27:.: 0.36:1.000:. ./.:4:601,35:.: 0.55:1.000:. ./.:4:576,52:.: 0.50:1.000:. ./.:4:533,35:.: 0.14:1.000:. ./.:6:491,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:506,56:.: 0.10:1.000:. ./.:4:408,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:403,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:366,60:.:-0.73:1.000:. ./.:4:699,39:.: 1.17:1.000:. ./.:4:499,52:.: 0.03:1.000:. ./.:4:371,34:.:-0.85:1.000:. ./.:4:513,42:.: 0.06:1.000:. ./.:4:295,43:.:-1.26:0.987:. ./.:4:478,38:.:-0.18:1.000:. ./.:4:522,75:.: 0.31:1.000:. ./.:4:390,30:.:-0.76:1.000:. ./.:4:440,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:448,27:.:-0.43:1.000:. ./.:4:674,52:.: 1.10:1.000:. ./.:4:446,47:.:-0.32:1.000:. ./.:4:544,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:418,63:.:-0.39:1.000:. ./.:4:410,63:.:-0.44:1.000:. ./.:4:700,61:.: 1.31:1.000:. ./.:4:458,43:.:-0.27:1.000:. ./.:4:797,65:.: 1.92:1.000:. ./.:4:683,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:455,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:519,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:672,62:.: 1.15:1.000:. ./.:4:398,22:.:-0.76:1.000:. ./.:4:478,35:.:-0.20:1.000:. ./.:4:517,35:.: 0.04:1.000:. ./.:4:390,47:.:-0.66:1.000:. ./.:4:338,31:.:-1.07:1.000:. ./.:4:479,34:.:-0.20:1.000:. ./.:4:765,63:.: 1.72:1.000:. ./.:4:335,24:.:-1.13:1.000:. ./.:4:568,74:.: 0.59:1.000:. ./.:4:648,36:.: 0.84:1.000:. ./.:4:382,35:.:-0.78:1.000:. ./.:4:590,40:.: 0.51:1.000:. ./.:4:556,62:.: 0.44:1.000:. ./.:4:683,60:.: 1.20:1.000:. ./.:4:303,30:.:-1.29:1.000:. ./.:4:438,59:.:-0.29:1.000:. ./.:4:441,44:.:-0.37:1.000:. ./.:4:545,55:.: 0.33:1.000:. ./.:4:499,30:.:-0.10:1.000:. ./.:4:545,64:.: 0.39:1.000:. ./.:4:484,46:.:-0.09:1.000:. ./.:4:563,34:.: 0.31:1.000:. ./.:4:606,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:577,42:.: 0.45:1.000:. ./.:4:517,45:.: 0.10:1.000:. ./.:4:627,48:.: 0.79:1.000:. ./.:4:524,49:.: 0.17:0.999:. ./.:4:682,55:.: 1.16:1.000:. ./.:3:363,21:.:-0.98:1.000:. ./.:4:672,44:.: 1.04:1.000:. ./.:4:480,52:.:-0.08:1.000:. ./.:4:488,53:.:-0.03:1.000:. ./.:4:554,39:.: 0.29:1.000:. ./.:4:531,39:.: 0.15:1.000:. ./.:4:531,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:514,50:.: 0.11:1.000:. ./.:4:341,66:.:-0.84:1.000:. ./.:4:626,36:.: 0.71:1.000:. ./.:4:591,37:.: 0.50:1.000:. ./.:4:808,48:.: 1.89:1.000:. ./.:6:836,44:.: 2.03:1.000:. ./.:4:383,27:.:-0.82:1.000:. ./.:4:249,35:.:-1.59:1.000:. ./.:4:438,42:.:-0.40:1.000:. ./.:4:630,39:.: 0.75:1.000:. ./.:4:521,35:.: 0.06:1.000:. ./.:4:237,38:.:-1.64:1.000:. ./.:4:676,26:.: 0.95:1.000:. ./.:4:436,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:900,41:.: 2.40:1.000:. ./.:4:635,35:.: 0.76:1.000:. ./.:4:656,45:.: 0.95:1.000:. ./.:4:462,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:347,42:.:-0.95:1.000:. ./.:4:520,48:.: 0.14:1.000:. ./.:4:455,34:.:-0.34:1.000:. ./.:4:477,37:.:-0.19:1.000:. ./.:4:354,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:701,25:.: 1.10:1.000:. ./.:4:576,62:.: 0.56:1.000:. ./.:4:603,37:.: 0.58:1.000:. ./.:4:541,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:686,46:.: 1.13:1.000:. ./.:4:590,38:.: 0.50:1.000:. ./.:4:448,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:469,27:.:-0.30:1.000:. ./.:4:144,18:.:-2.33:1.000:. ./.:4:312,18:.:-1.31:1.000:. ./.:4:544,21:.: 0.12:1.000:. ./.:4:517,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:739,48:.: 1.47:1.000:. ./.:4:503,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:446,36:.:-0.39:1.000:. ./.:4:571,48:.: 0.45:1.000:. ./.:4:498,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:403,24:.:-0.72:1.000:. ./.:4:560,38:.: 0.32:1.000:. ./.:4:396,49:.:-0.61:1.000:. ./.:4:823,22:.: 1.82:1.000:. ./.:4:363,30:.:-0.93:1.000:. ./.:4:575,36:.: 0.40:1.000:. ./.:4:422,55:.:-0.42:1.000:. ./.:4:342,35:.:-1.02:1.000:. ./.:4:312,47:.:-1.13:1.000:. ./.:4:418,43:.:-0.51:1.000:. ./.:4:503,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:389,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:452,44:.:-0.30:1.000:. ./.:4:330,27:.:-1.15:1.000:. ./.:4:487,37:.:-0.13:1.000:. ./.:4:718,37:.: 1.27:1.000:. ./.:4:706,86:.: 1.50:1.000:. ./.:4:415,46:.:-0.51:1.000:. ./.:4:382,37:.:-0.77:1.000:. ./.:4:573,40:.: 0.41:1.000:. ./.:4:823,46:.: 1.97:1.000:. ./.:4:683,57:.: 1.18:1.000:. ./.:4:505,25:.:-0.09:1.000:. ./.:4:587,35:.: 0.47:1.000:. -chr1.1 18789059 chr1.1_018789059 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:384,160:.: 0.94:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:429,138:.: 1.15:1.000:. ./.:4:463,167:.: 1.74:1.000:. ./.:4:419,156:.: 1.23:1.000:. ./.:4:342,133:.: 0.30:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:94,85:.:-2.46:1.000:. ./.:4:158,183:.:-0.95:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:405,156:.: 1.10:1.000:. ./.:4:271,269:.: 0.90:0.992:. ./.:4:499,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:537,176:.: 2.51:1.000:. ./.:4:619,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:177,59:.:-1.93:1.000:. ./.:4:318,116:.:-0.09:1.000:. ./.:4:433,194:.: 1.71:1.000:. ./.:4:240,260:.: 0.53:1.000:. ./.:4:142,49:.:-2.35:1.000:. ./.:4:468,175:.: 1.86:1.000:. ./.:4:286,276:.: 1.11:1.000:. ./.:4:362,130:.: 0.46:1.000:. ./.:4:451,153:.: 1.50:1.000:. ./.:4:556,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:432,136:.: 1.16:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:198,61:.:-1.72:1.000:. ./.:4:169,0:.:-2.55:1.000:. ./.:3:197,0:.:-2.29:0.970:. ./.:4:403,156:.: 1.08:1.000:. ./.:4:259,268:.: 0.78:1.000:. ./.:4:352,126:.: 0.32:1.000:. ./.:4:352,137:.: 0.43:1.000:. ./.:4:433,161:.: 1.41:1.000:. ./.:4:212,234:.: 0.03:1.000:. ./.:4:294,139:.:-0.09:1.000:. ./.:4:343,121:.: 0.19:1.000:. ./.:4:173,261:.:-0.09:1.000:. ./.:4:337,93:.:-0.12:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:438,151:.: 1.36:1.000:. ./.:4:237,235:.: 0.27:1.000:. ./.:4:314,118:.:-0.10:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:228,81:.:-1.25:1.000:. ./.:4:368,133:.: 0.54:1.000:. ./.:4:253,71:.:-1.11:1.000:. ./.:4:359,136:.: 0.48:1.000:. ./.:4:344,103:.: 0.04:1.000:. ./.:4:322,93:.:-0.26:1.000:. ./.:4:265,111:.:-0.63:1.000:. ./.:4:306,108:.:-0.27:1.000:. ./.:4:305,115:.:-0.22:1.000:. ./.:6:245,62:.:-1.27:1.000:. ./.:4:275,116:.:-0.49:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:352,158:.: 0.62:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:244,260:.: 0.57:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:285,102:.:-0.52:1.000:. ./.:4:287,140:.:-0.15:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.54:0.987:. ./.:4:438,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:361,96:.: 0.13:1.000:. ./.:4:203,209:.:-0.29:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:255,280:.: 0.86:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:277,94:.:-0.67:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:296,117:.:-0.28:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:329,107:.:-0.07:1.000:. ./.:4:306,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:311,104:.:-0.26:1.000:. ./.:4:352,99:.: 0.07:1.000:. ./.:4:282,102:.:-0.55:1.000:. ./.:4:332,128:.: 0.16:1.000:. ./.:4:233,223:.: 0.12:1.000:. ./.:4:268,67:.:-1.01:1.000:. ./.:4:269,91:.:-0.77:1.000:. ./.:4:282,93:.:-0.63:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:245,86:.:-1.04:1.000:. ./.:4:212,233:.: 0.02:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:311,101:.:-0.29:1.000:. ./.:4:161,164:.:-1.10:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:269,116:.:-0.54:1.000:. ./.:4:317,122:.:-0.04:1.000:. ./.:4:285,79:.:-0.74:1.000:. ./.:4:323,102:.:-0.17:1.000:. ./.:4:226,63:.:-1.44:1.000:. ./.:4:275,96:.:-0.67:1.000:. ./.:4:214,94:.:-1.26:1.000:. ./.:4:267,113:.:-0.59:1.000:. ./.:4:216,74:.:-1.43:1.000:. ./.:4:398,156:.: 1.03:1.000:. ./.:4:429,171:.: 1.46:1.000:. ./.:4:303,109:.:-0.29:1.000:. ./.:4:267,86:.:-0.84:1.000:. ./.:4:503,186:.: 2.29:1.000:. ./.:4:264,82:.:-0.91:0.999:. ./.:4:200,238:.:-0.05:1.000:. ./.:3:164,96:.:-1.71:1.000:. ./.:4:223,218:.:-0.02:1.000:. ./.:4:227,138:.:-0.73:1.000:. ./.:4:268,86:.:-0.83:1.000:. ./.:4:280,98:.:-0.61:1.000:. ./.:4:254,81:.:-1.01:1.000:. ./.:4:327,138:.: 0.20:1.000:. ./.:4:252,87:.:-0.97:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:275,274:.: 0.99:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:224,251:.: 0.30:1.000:. ./.:6:371,68:.:-0.04:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:267,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:216,85:.:-1.32:1.000:. ./.:4:165,170:.:-1.01:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:224,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:220,223:.: 0.00:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:547,216:.: 2.98:1.000:. ./.:4:344,120:.: 0.19:1.000:. ./.:4:250,102:.:-0.85:1.000:. ./.:4:289,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:238,94:.:-1.04:1.000:. ./.:4:312,79:.:-0.49:1.000:. ./.:4:180,203:.:-0.56:1.000:. ./.:4:355,130:.: 0.39:1.000:. ./.:4:292,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:444,174:.: 1.63:1.000:. ./.:4:454,165:.: 1.64:1.000:. ./.:4:409,153:.: 1.11:1.000:. ./.:4:365,143:.: 0.60:1.000:. ./.:4:468,153:.: 1.66:1.000:. ./.:4:215,200:.:-0.26:1.000:. ./.:4:470,193:.: 2.05:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:422,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:376,130:.: 0.59:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:496,178:.: 2.15:1.000:. ./.:4:547,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:310,97:.:-0.34:1.000:. ./.:4:450,149:.: 1.45:1.000:. ./.:4:360,114:.: 0.29:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:338,99:.:-0.06:1.000:. ./.:4:357,142:.: 0.52:1.000:. ./.:4:267,267:.: 0.85:1.000:. ./.:4:342,143:.: 0.39:1.000:. ./.:4:223,231:.: 0.10:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:382,132:.: 0.66:1.000:. ./.:4:486,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:311,120:.:-0.11:1.000:. ./.:4:289,89:.:-0.61:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:234,212:.: 0.03:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:308,88:.:-0.44:1.000:. ./.:4:446,171:.: 1.62:1.000:. ./.:4:428,133:.: 1.10:1.000:. ./.:4:370,130:.: 0.53:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:268,290:.: 1.07:1.000:. ./.:4:474,170:.: 1.87:1.000:. ./.:4:449,185:.: 1.78:1.000:. ./.:4:322,109:.:-0.11:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.25:1.000:. -chr1.1 18934716 chr1.1_018934716 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,2:0.26: 0.32:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,43:0.51: 1.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,16:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,3:0.27: 0.16:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,17:0.46: 0.06:1.000:0.990 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,3:0.28:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:68,1:0.16: 0.67:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.10:0.992:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,1:0.15: 0.83:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:53,32:0.49: 1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,3:0.27: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:43,28:0.50: 0.73:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,1:0.16: 0.60:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,1:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,43:0.51: 1.82:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0:3:6,0:0.00:-1.35:0.970:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,1:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,49:0.51: 2.24:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,1:0.17: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,56:0.74: 0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,34:0.45: 1.85:1.000:0.981 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,59:0.56: 1.98:1.000:0.969 0/0/1/1:4:62,45:0.51: 1.88:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,5:0.28: 0.99:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,27:0.51: 0.51:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:42,1:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,39:0.51: 1.50:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,40:0.49: 1.85:1.000:0.996 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:29,2:0.28:-0.55:1.000:0.749 0/0/0/1:4:52,2:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,1:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,31:0.49: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,1:0.19: 0.32:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,1:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.22:0.987:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,32:0.48: 1.28:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,1:0.17: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,27:0.47: 0.89:1.000:0.994 0/0/0/1:4:42,7:0.33: 0.03:1.000:0.918 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,1:0.17: 0.48:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,34:0.46: 1.72:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,21:0.49: 0.25:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,30:0.51: 0.76:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,56:0.52: 2.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:27,1:0.26:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,2:0.25: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,35:0.47: 1.72:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,39:0.53: 1.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:68,1:0.16: 0.67:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,36:0.50: 1.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,32:0.50: 1.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,5:0.29: 0.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:57,4:0.28: 0.41:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,32:0.46: 1.47:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,3:0.27: 0.06:0.999:0.997 0/0/1/1:4:52,39:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/0/0:3:7,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,6:0.33:-0.13:1.000:0.935 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,24:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,39:0.49: 1.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,35:0.47: 1.63:1.000:0.993 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,40:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.39:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,42:0.50: 1.88:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:57,3:0.27: 0.38:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,36:0.46: 1.92:1.000:0.987 0/0/1/1:4:47,28:0.49: 0.86:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.44:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,41:0.53: 1.28:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,1:0.15: 0.83:1.000:0.981 0/0/0/1:4:55,1:0.19: 0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,1:0.26:-0.74:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,24:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,23:0.45: 0.73:1.000:0.983 0/0/0/1:4:49,1:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,34:0.47: 1.60:1.000:0.992 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,1:0.16: 0.64:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,29:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,37:0.53: 0.96:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,39:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,25:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 -chr1.1 19009023 chr1.1_019009023 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:83,104:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.16:1.000:. ./.:4:72,78:.: 0.63:1.000:. ./.:4:91,84:.: 1.13:1.000:. ./.:4:74,77:.: 0.65:1.000:. ./.:4:96,89:.: 1.34:1.000:. ./.:4:61,75:.: 0.34:1.000:. ./.:4:74,65:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,88:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,15:.:-2.13:1.000:. ./.:4:7,17:.:-1.94:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.79:1.000:. ./.:4:70,72:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,84:.: 0.95:1.000:. ./.:4:75,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:91,74:.: 0.93:1.000:. ./.:4:89,85:.: 1.11:0.992:. ./.:4:37,145:.: 1.28:1.000:. ./.:4:106,88:.: 1.52:1.000:. ./.:4:108,90:.: 1.60:1.000:. ./.:4:9,7:.:-2.11:1.000:. ./.:4:75,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:83,95:.: 1.20:1.000:. ./.:4:78,72:.: 0.63:1.000:. ./.:4:7,13:.:-2.03:1.000:. ./.:4:104,106:.: 1.85:1.000:. ./.:4:96,99:.: 1.54:1.000:. ./.:4:60,71:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,79:.: 0.77:1.000:. ./.:4:100,98:.: 1.60:1.000:. ./.:4:104,94:.: 1.60:1.000:. ./.:4:91,67:.: 0.79:1.000:. ./.:4:17,8:.:-1.92:1.000:. ./.:4:6,14:.:-2.03:1.000:. ./.:3:5,11:.:-2.11:0.970:. ./.:4:85,83:.: 0.99:1.000:. ./.:4:69,66:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,90:.: 1.03:1.000:. ./.:4:83,53:.: 0.34:1.000:. ./.:4:84,97:.: 1.26:1.000:. ./.:4:56,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:49,41:.:-0.60:1.000:. ./.:4:71,73:.: 0.50:1.000:. ./.:4:48,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,54:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,44:.:-0.62:1.000:. ./.:4:87,93:.: 1.24:1.000:. ./.:4:80,105:.: 1.34:1.000:. ./.:4:49,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:51,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,39:.:-0.92:1.000:. ./.:4:78,79:.: 0.77:1.000:. ./.:4:35,35:.:-1.01:1.000:. ./.:4:59,48:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,62:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,71:.: 0.26:1.000:. ./.:4:38,59:.:-0.46:1.000:. ./.:4:39,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:51,65:.:-0.07:1.000:. ./.:6:32,22:.:-1.33:1.000:. ./.:4:40,41:.:-0.78:1.000:. ./.:4:59,66:.: 0.12:1.000:. ./.:4:48,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:38,59:.:-0.46:1.000:. ./.:4:69,80:.: 0.60:1.000:. ./.:4:48,60:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,46:.:-0.62:1.000:. ./.:4:63,59:.: 0.05:1.000:. ./.:4:58,59:.:-0.05:0.987:. ./.:4:0,123:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,44:.:-0.66:1.000:. ./.:4:40,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.07:1.000:. ./.:4:71,66:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.44:1.000:. ./.:4:50,50:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,64:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,25:.:-1.33:1.000:. ./.:4:45,50:.:-0.50:1.000:. ./.:4:62,53:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.09:1.000:. ./.:4:50,41:.:-0.58:1.000:. ./.:4:55,59:.:-0.11:1.000:. ./.:4:66,79:.: 0.52:1.000:. ./.:4:49,53:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,62:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,35:.:-0.84:1.000:. ./.:4:37,42:.:-0.82:1.000:. ./.:4:34,35:.:-1.03:1.000:. ./.:4:42,44:.:-0.68:1.000:. ./.:4:33,51:.:-0.72:1.000:. ./.:4:48,48:.:-0.48:1.000:. ./.:4:52,29:.:-0.78:1.000:. ./.:4:56,58:.:-0.11:1.000:. ./.:4:34,33:.:-1.07:1.000:. ./.:4:44,48:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,20:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.99:1.000:. ./.:4:34,32:.:-1.09:1.000:. ./.:4:64,70:.: 0.30:1.000:. ./.:4:23,46:.:-1.03:1.000:. ./.:4:43,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:26,23:.:-1.43:1.000:. ./.:4:27,34:.:-1.19:1.000:. ./.:4:32,35:.:-1.07:1.000:. ./.:4:35,54:.:-0.62:1.000:. ./.:4:42,39:.:-0.78:1.000:. ./.:4:93,97:.: 1.44:1.000:. ./.:4:103,79:.: 1.28:1.000:. ./.:4:44,58:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,44:.:-0.74:1.000:. ./.:4:109,101:.: 1.85:1.000:. ./.:4:32,27:.:-1.23:0.999:. ./.:4:49,40:.:-0.62:1.000:. ./.:3:26,20:.:-1.50:1.000:. ./.:4:34,53:.:-0.66:1.000:. ./.:4:44,35:.:-0.82:1.000:. ./.:4:57,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,30:.:-1.19:1.000:. ./.:4:34,33:.:-1.07:1.000:. ./.:4:49,64:.:-0.13:1.000:. ./.:4:16,29:.:-1.52:1.000:. ./.:4:50,60:.:-0.19:1.000:. ./.:4:91,78:.: 1.01:1.000:. ./.:4:30,42:.:-0.97:1.000:. ./.:4:35,39:.:-0.92:1.000:. ./.:6:54,40:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,28:.:-1.37:1.000:. ./.:4:28,37:.:-1.11:1.000:. ./.:4:36,28:.:-1.13:1.000:. ./.:4:85,75:.: 0.83:1.000:. ./.:4:18,24:.:-1.58:1.000:. ./.:4:48,57:.:-0.29:1.000:. ./.:4:42,50:.:-0.56:1.000:. ./.:4:91,107:.: 1.60:1.000:. ./.:4:58,54:.:-0.15:1.000:. ./.:4:32,26:.:-1.25:1.000:. ./.:4:24,34:.:-1.25:1.000:. ./.:4:31,30:.:-1.19:1.000:. ./.:4:43,33:.:-0.88:1.000:. ./.:4:33,24:.:-1.27:1.000:. ./.:4:71,64:.: 0.32:1.000:. ./.:4:25,27:.:-1.37:1.000:. ./.:4:86,74:.: 0.83:1.000:. ./.:4:86,101:.: 1.38:1.000:. ./.:4:77,87:.: 0.91:1.000:. ./.:4:76,64:.: 0.42:1.000:. ./.:4:101,92:.: 1.50:1.000:. ./.:4:66,58:.: 0.09:1.000:. ./.:4:100,104:.: 1.73:1.000:. ./.:4:84,95:.: 1.22:1.000:. ./.:4:3,15:.:-2.07:1.000:. ./.:4:77,73:.: 0.63:1.000:. ./.:4:80,87:.: 0.97:1.000:. ./.:4:61,70:.: 0.24:1.000:. ./.:4:99,104:.: 1.71:1.000:. ./.:4:86,99:.: 1.34:1.000:. ./.:4:56,69:.: 0.12:1.000:. ./.:4:108,88:.: 1.56:1.000:. ./.:4:66,82:.: 0.58:1.000:. ./.:4:59,48:.:-0.25:1.000:. ./.:4:71,73:.: 0.50:1.000:. ./.:4:89,69:.: 0.79:1.000:. ./.:4:90,94:.: 1.32:1.000:. ./.:4:78,74:.: 0.67:1.000:. ./.:4:56,67:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,165:.: 0.95:1.000:. ./.:4:75,73:.: 0.58:1.000:. ./.:4:64,80:.: 0.50:1.000:. ./.:4:80,71:.: 0.65:1.000:. ./.:4:67,62:.: 0.20:1.000:. ./.:4:68,74:.: 0.46:1.000:. ./.:4:64,62:.: 0.14:1.000:. ./.:4:43,48:.:-0.58:1.000:. ./.:4:70,62:.: 0.26:1.000:. ./.:4:88,109:.: 1.58:1.000:. ./.:4:70,63:.: 0.28:1.000:. ./.:4:73,73:.: 0.54:1.000:. ./.:4:72,79:.: 0.65:1.000:. ./.:4:80,81:.: 0.85:1.000:. ./.:4:109,105:.: 1.93:1.000:. ./.:4:125,106:.: 2.28:1.000:. ./.:4:70,68:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,188:.: 1.40:1.000:. -chr1.1 19232221 chr1.1_019232221 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:216,81:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,141:0.48:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,143:0.46:-0.12:1.000:0.989 0/0/1/1:4:124,167:0.52: 0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:161,217:0.52: 1.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:243,74:0.19: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,65:0.27:-1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,176:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:211,68:0.20:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,62:0.51:-2.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,97:0.60:-2.07:1.000:0.762 0/0/1/1:4:110,135:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,65:0.21:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,98:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,163:0.54:-0.18:1.000:0.986 0/0/1/1:4:163,197:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,184:0.51: 0.57:0.992:0.996 0/1/1/1:4:78,274:0.75: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:290,116:0.25: 1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,178:0.48: 0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,56:0.40:-2.43:1.000:0.782 0/0/0/1:4:192,77:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,214:0.52: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,65:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,11:0.19:-3.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,194:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,167:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,148:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:138,185:0.52: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:128,165:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,139:0.46:-0.24:1.000:0.989 0/0/0/1:4:175,71:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,10:0.19:-3.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,52:0.29:-1.94:1.000:0.993 0/1/1:3:15,32:0.64:-3.62:0.970:1.000 0/0/0/1:4:194,72:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,97:0.30:-0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:202,90:0.27: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:183,80:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:142,176:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:178,73:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:216,80:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,230:0.51: 1.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,144:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,105:0.30: 0.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:114,185:0.57: 0.16:1.000:0.938 0/0/0/1:4:218,73:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:277,131:0.28: 1.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,182:0.53: 0.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:250,140:0.32: 1.53:1.000:0.958 0/0/1/1:4:87,154:0.59:-0.71:1.000:0.831 0/0/0/1:4:252,99:0.25: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,185:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,86:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,66:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,202:0.56: 0.65:1.000:0.960 0/0/1/1:4:126,146:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,220:0.50: 1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,133:0.44:-0.24:1.000:0.969 0/0/0/1/1/1:6:125,117:0.44:-0.69:1.000:0.648 0/0/1/1:4:113,171:0.55:-0.06:1.000:0.974 0/0/1/1:4:128,153:0.49:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:268,138:0.30: 1.77:1.000:0.985 0/0/0/1:4:194,100:0.30: 0.09:1.000:0.985 0/0/1/1:4:125,155:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,154:0.45: 0.27:1.000:0.984 0/0/0/1:4:157,66:0.26:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,129:0.48:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:199,76:0.24:-0.20:0.987:1.000 0/0/1/1:4:117,157:0.52:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:225,99:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:216,112:0.30: 0.60:1.000:0.984 0/0/1/1:4:149,194:0.52: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:224,86:0.24: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,345:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,53:0.21:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,178:0.52: 0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:194,78:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:206,57:0.18:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,93:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,142:0.52:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:168,228:0.53: 1.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:143,185:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:187,84:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,161:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:277,103:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,148:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,74:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:136,180:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:158,73:0.28:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,135:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:175,71:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,106:0.31: 0.27:1.000:0.978 0/0/1/1:4:90,127:0.54:-1.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:158,199:0.51: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,165:0.47: 0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:168,78:0.28:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,230:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,106:0.27: 0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:144,178:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:185,76:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,105:0.30: 0.27:1.000:0.982 0/0/0/1:4:142,67:0.28:-1.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:223,91:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,144:0.52:-0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:119,186:0.56: 0.25:1.000:0.961 0/0/0/1:4:254,93:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,83:0.27:-0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:294,95:0.21: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,157:0.45: 0.39:1.000:0.981 0/0/0/1:4:218,93:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:277,138:0.29: 1.91:1.000:0.990 0/0/1/1:4:117,179:0.56: 0.12:0.999:0.970 0/0/1/1:4:131,177:0.53: 0.30:1.000:0.994 0/0/1:3:91,68:0.38:-1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,99:0.27: 0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:145,201:0.53: 0.87:1.000:0.991 0/0/0/1:4:177,115:0.35: 0.06:1.000:0.781 0/0/1/1:4:144,169:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,199:0.54: 0.75:1.000:0.987 0/0/0/1:4:214,95:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:138,185:0.52: 0.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:177,90:0.30:-0.32:1.000:0.987 0/0/0/1:4:186,76:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,177:0.54: 0.18:1.000:0.986 0/0/1/1:4:151,209:0.53: 1.08:1.000:0.992 0/0/0/0/1/1:6:190,163:0.42: 0.98:0.556:0.517 0/1/1/1:4:42,217:0.81:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,56:0.27:-1.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:149,62:0.26:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,154:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,87:0.29:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,52:0.24:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,190:0.52: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,75:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,226:0.48: 2.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:129,161:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,146:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,76:0.33:-1.23:1.000:0.930 0/0/0/1:4:196,70:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,113:0.30: 0.74:1.000:0.988 0/0/0/1:4:191,113:0.33: 0.24:1.000:0.920 0/0/1/1:4:135,135:0.45:-0.27:1.000:0.981 0/0/0/1:4:165,86:0.30:-0.56:1.000:0.982 0/0/0/1:4:292,97:0.21: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,125:0.29: 1.40:1.000:0.992 0/0/0/1:4:184,77:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,161:0.46: 0.39:1.000:0.990 0/0/0/1:4:252,98:0.24: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,75:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:245,92:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,179:0.55: 0.19:1.000:0.983 0/0/0/1:4:36,10:0.18:-3.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,111:0.55:-1.53:1.000:0.981 0/0/0/1:4:202,104:0.30: 0.27:1.000:0.985 0/0/0/1:4:235,96:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:257,102:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,181:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,126:0.51:-0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,178:0.46: 0.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:141,168:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,142:0.45:-0.05:1.000:0.980 0/0/1/1:4:119,136:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:170,73:0.26:-0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,137:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:279,94:0.21: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,80:0.26:-0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,263:0.75: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,76:0.27:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:168,67:0.25:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,68:0.27:-0.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,140:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,85:0.28:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:155,61:0.25:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,78:0.28:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,90:0.44:-1.56:1.000:0.969 0/0/0/1:4:233,101:0.26: 0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:263,99:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,79:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,155:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:219,65:0.19:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,204:0.52: 1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:270,113:0.26: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,140:0.47:-0.30:1.000:0.993 0/1/1/1:4:75,249:0.74: 0.54:1.000:0.998 -chr1.1 19281061 chr1.1_019281061 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:141,144:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,70:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,186:0.71:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:157,150:0.47: 0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:258,94:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,262:0.71: 1.29:1.000:0.991 0/1/1/1:4:53,133:0.71:-1.31:1.000:0.990 0/1/1/1:4:95,258:0.72: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,158:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,74:0.81:-2.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,57:0.49:-2.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,212:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,187:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,207:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,155:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:248,105:0.28: 1.12:0.992:0.996 0/0/1/1:4:172,166:0.47: 0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:161,219:0.56: 1.51:1.000:0.963 0/0/1/1:4:204,211:0.49: 2.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,26:0.26:-2.67:1.000:0.998 0/1/1/1:4:60,221:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,170:0.52: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,150:0.55:-0.12:1.000:0.984 1/1/1/1:4:6,70:0.91:-2.90:1.000:0.958 0/0/0/1:4:237,85:0.25: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,71:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,138:0.53:-0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:199,180:0.46: 1.49:1.000:0.987 0/1/1/1:4:81,264:0.76: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,273:0.77: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,108:0.41:-0.38:1.000:0.892 0/1/1/1:4:24,50:0.67:-2.93:1.000:0.899 0/1/1/1:4:47,87:0.64:-2.06:1.000:0.663 0/1/1:3:14,46:0.76:-3.14:0.970:1.000 0/0/1/1:4:194,164:0.44: 1.19:1.000:0.969 0/0/0/1:4:217,89:0.27: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:216,85:0.26: 0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,176:0.58: 0.33:1.000:0.932 0/1/1/1:4:104,325:0.75: 2.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,59:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,130:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:187,181:0.48: 1.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:194,77:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:60,223:0.78: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,222:0.73: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:163,181:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,120:0.61:-1.19:1.000:0.733 0/1/1/1:4:66,152:0.69:-0.84:1.000:0.970 0/0/1/1:4:134,121:0.46:-0.31:1.000:0.986 0/0/1/1:4:104,146:0.57:-0.38:1.000:0.946 0/0/0/1:4:217,91:0.28: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,198:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,60:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,135:0.57:-0.64:1.000:0.951 0/1/1/1:4:63,231:0.78: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,64:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,202:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,131:0.54:-0.58:1.000:0.987 0/0/0/1/1/1:6:102,116:0.52:-0.84:1.000:0.874 0/0/1/1:4:136,150:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,203:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,167:0.53: 0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,253:0.78: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,161:0.53: 0.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:75,197:0.72:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:110,127:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:125,144:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,163:0.72:-0.74:0.987:0.994 0/0/0/0:4:258,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,259:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,57:0.24:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,88:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,151:0.53: 0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:204,60:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,67:0.28:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,110:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,131:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,155:0.59:-0.26:1.000:0.877 0/0/1/1:4:178,178:0.48: 1.16:1.000:0.996 0/0/0/0:4:203,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,165:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:87,241:0.73: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,134:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,173:0.56: 0.33:1.000:0.959 0/0/0/1:4:236,75:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,138:0.68:-1.10:1.000:0.954 0/0/1/1:4:113,105:0.47:-0.84:1.000:0.990 0/1/1/1:4:76,193:0.71:-0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:136,116:0.44:-0.35:1.000:0.973 0/1/1/1:4:75,172:0.69:-0.42:1.000:0.968 0/0/1/1:4:145,132:0.46: 0.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:150,181:0.53: 0.80:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,178:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,290:0.75: 1.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,258:0.74: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,108:0.53:-1.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:177,70:0.26:-0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:206,78:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,307:0.76: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,97:0.46:-1.08:1.000:0.990 0/1/1/1:4:63,216:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,106:0.52:-1.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:160,136:0.44: 0.29:1.000:0.971 0/0/1/1:4:113,110:0.48:-0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,143:0.57:-0.44:1.000:0.953 0/0/1/1:4:152,141:0.46: 0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:158,146:0.46: 0.40:1.000:0.990 0/0/0/1:4:259,105:0.27: 1.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,194:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,154:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:294,110:0.25: 1.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,124:0.48:-0.35:0.999:0.994 0/0/1/1:4:143,152:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1:3:66,51:0.42:-2.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,84:0.28: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,156:0.57:-0.13:1.000:0.945 0/0/1/1:4:126,124:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:87,212:0.70: 0.33:1.000:0.985 0/1/1/1:4:67,222:0.76: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,71:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,191:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,226:0.78: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,143:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,132:0.46: 0.03:1.000:0.987 0/0/0/1:4:207,78:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:135,212:0.60: 1.03:0.556:0.631 0/0/1/1:4:105,105:0.48:-0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,152:0.80:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,46:0.21:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,46:0.19:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,180:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,139:0.76:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,56:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,116:0.43:-0.25:1.000:0.949 0/0/0/1:4:289,86:0.21: 1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,264:0.75: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,74:0.27:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,113:0.48:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,121:0.53:-0.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:152,164:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,142:0.54:-0.32:1.000:0.985 0/1/1/1:4:80,188:0.69:-0.12:1.000:0.976 0/0/1/1:4:87,109:0.54:-1.16:1.000:0.987 0/0/1/1:4:189,207:0.51: 1.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:221,89:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:261,91:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,184:0.72:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:196,193:0.48: 1.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:158,71:0.29:-0.68:1.000:0.991 0/0/1/1:4:130,182:0.57: 0.52:1.000:0.947 0/1/1/1:4:90,249:0.73: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,21:0.26:-2.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,105:0.74:-1.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:209,97:0.30: 0.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:172,151:0.45: 0.68:1.000:0.981 0/0/0/1:4:276,85:0.22: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,288:0.76: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,103:0.49:-1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,161:0.53: 0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,255:0.73: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,172:0.68:-0.41:1.000:0.962 0/1/1/1:4:96,244:0.71: 0.93:1.000:0.991 0/0/1/1:4:106,150:0.57:-0.29:1.000:0.940 0/0/0/1:4:171,71:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,177:0.56: 0.43:1.000:0.959 0/0/0/1:4:205,85:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,166:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,151:0.60:-0.42:1.000:0.802 0/1/1/1:4:71,225:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,54:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:186,74:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,117:0.52:-0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,139:0.57:-0.57:1.000:0.938 0/1/1/1:4:65,247:0.78: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,188:0.77:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,237:0.54: 2.19:1.000:0.987 0/0/1/1:4:185,173:0.47: 1.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:61,173:0.73:-0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:86,228:0.72: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:226,87:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:288,119:0.27: 1.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,196:0.51: 1.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,223:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,90:0.25: 0.77:1.000:0.999 -chr1.1 19387175 chr1.1_019387175 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:30,2:0.07:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.26:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,5:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,5:0.14: 0.21:1.000:0.973 0/0/0/0:4:21,2:0.10:-0.83:1.000:0.706 0/0/0/0:4:13,1:0.09:-1.32:1.000:0.973 0/0/0/1:4:25,8:0.28:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:24,6:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,25:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,61:0.58: 3.60:1.000:0.910 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.14:-0.67:1.000:0.959 0/0/0/0:4:21,2:0.10:-0.83:1.000:0.706 0/0/0/0:4:20,2:0.11:-0.89:1.000:0.563 0/0/0/1:4:19,5:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:22,2:0.10:-0.78:0.992:0.813 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,7:0.27:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:20,1:0.06:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,54:0.57: 3.11:1.000:0.951 0/0/0/1:4:24,8:0.29:-0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:19,7:0.31:-0.67:1.000:0.978 0/0/0/1:4:26,3:0.12:-0.50:1.000:0.828 0/1/1/1:4:14,67:0.75: 2.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,3:0.21:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.21:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.24:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,11:0.31: 0.15:1.000:0.979 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-1.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:12,2:0.17:-1.32:1.000:0.998 0/0/0/0:4:15,1:0.07:-1.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,4:0.73:-1.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,26:0.48: 1.08:1.000:0.994 0/1/1:3:29,108:0.72: 5.40:0.970:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,3:0.19:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.21:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.27:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,5:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,12:0.32: 0.21:1.000:0.946 0/0/0/1:4:30,10:0.29: 0.10:1.000:0.992 0/0/0/1:4:36,7:0.19: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.30:-0.61:1.000:0.987 0/0/0/1:4:37,11:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,7:0.22:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,9:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.48:-0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,6:0.27:-0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,13:0.41:-0.23:1.000:0.891 0/0/0/1:4:39,20:0.37: 1.14:1.000:0.515 0/0/0/0:4:37,3:0.09: 0.10:1.000:0.949 0/0/0/1:4:36,13:0.30: 0.59:1.000:0.982 0/0/0/1:4:32,9:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,5:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:32,7:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.28: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,6:0.22:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:33,25:0.46: 1.08:1.000:0.804 0/0/1/1:4:46,25:0.39: 1.79:1.000:0.646 0/0/0/1:4:16,6:0.31:-0.89:1.000:0.973 0/0/0/1:4:39,14:0.30: 0.81:1.000:0.983 0/0/0/1:4:38,17:0.35: 0.92:1.000:0.833 0/0/0/1:4:27,5:0.19:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,6:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,7:0.32:-0.72:1.000:0.960 0/0/0/1:4:35,8:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,15:0.44:-0.07:0.987:0.962 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,12:0.24: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.32:-0.34:1.000:0.957 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.14:-0.67:1.000:0.959 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.33:-0.23:1.000:0.917 0/0/0/1:4:40,10:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,19:0.38: 0.92:1.000:0.566 0/0/0/1:4:32,6:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,6:0.18: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,17:0.31: 1.30:1.000:0.971 0/0/0/1:4:54,10:0.19: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.31:-0.28:1.000:0.973 0/0/0/1:4:24,6:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,10:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,12:0.32: 0.26:1.000:0.962 0/0/1/1:4:28,18:0.42: 0.43:1.000:0.927 0/0/0/1:4:26,13:0.37: 0.04:1.000:0.587 0/0/0/1:4:27,12:0.34: 0.04:1.000:0.843 0/0/0/1:4:38,9:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,13:0.36: 0.10:1.000:0.686 0/0/0/1:4:20,4:0.20:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,21:0.40: 1.08:1.000:0.751 0/0/0/1:4:50,9:0.18: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,16:0.32: 0.97:1.000:0.946 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,22:0.36: 1.63:1.000:0.702 0/0/0/1:4:28,10:0.30:-0.01:1.000:0.984 0/0/0/1:4:20,9:0.35:-0.50:1.000:0.824 0/0/1/1:4:38,21:0.39: 1.14:1.000:0.689 0/0/0/1:4:36,16:0.34: 0.75:1.000:0.843 0/0/1/1:4:40,37:0.51: 2.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,13:0.34: 0.26:1.000:0.877 0/0/0/1:4:24,9:0.31:-0.28:1.000:0.973 0/0/1/1:4:24,18:0.46: 0.21:1.000:0.987 0/0/0/1:4:19,4:0.21:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,12:0.29: 0.54:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,5:0.20:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,10:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,2:0.08:-0.39:1.000:0.993 0/0/0/1:4:49,16:0.29: 1.47:0.999:0.994 0/0/0/1:4:36,14:0.32: 0.65:1.000:0.960 0/0/1:3:10,3:0.27:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.33: 0.92:1.000:0.930 0/0/0/1:4:30,8:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,17:0.37: 0.70:1.000:0.587 0/0/0/1:4:35,16:0.35: 0.70:1.000:0.797 0/0/0/1:4:31,14:0.35: 0.37:1.000:0.818 0/0/0/1:4:38,9:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,13:0.31: 0.54:1.000:0.976 0/0/0/1:4:40,17:0.33: 1.03:1.000:0.899 0/0/0/1:4:12,3:0.24:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,15:0.32: 0.81:1.000:0.953 0/0/0/1:4:35,13:0.31: 0.54:1.000:0.976 0/0/0/1/1/1:6:33,22:0.43: 0.92:0.556:0.617 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.29:-0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,12:0.36:-0.07:1.000:0.693 0/0/0/1:4:35,9:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,3:0.15:-0.78:1.000:0.987 0/0/0/1:4:24,10:0.33:-0.23:1.000:0.917 0/0/0/1:4:21,8:0.31:-0.50:1.000:0.968 0/0/0/1:4:20,4:0.20:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,3:0.19:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,4:0.14:-0.28:1.000:0.979 0/0/0/1:4:38,11:0.26: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,24:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,18:0.32: 1.36:1.000:0.946 0/0/0/1:4:44,10:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,9:0.20: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,16:0.45:-0.01:1.000:0.982 0/0/0/1:4:32,6:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,2:0.07:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:13,6:0.35:-1.05:1.000:0.779 0/0/1/1:4:26,16:0.41: 0.21:1.000:0.885 0/0/0/1:4:26,3:0.12:-0.50:1.000:0.828 0/0/0/1:4:21,6:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,4:0.16:-0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,3:0.19:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,48:0.51: 3.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,2:0.12:-0.99:1.000:0.749 0/0/0/1:4:14,3:0.21:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,4:0.18:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:40,4:0.11: 0.32:1.000:0.563 0/0/0/1:4:21,4:0.19:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,1:0.08:-1.27:1.000:0.989 0/0/0/0:4:20,2:0.11:-0.89:1.000:0.563 0/0/0/1:4:21,5:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.25:-1.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,3:0.14:-0.72:1.000:0.976 0/0/0/1:4:19,4:0.21:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.26:-1.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,7:0.27:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,4:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,6:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,8:0.36:-0.72:1.000:0.739 0/0/0/1:4:19,2:0.11:-0.94:1.000:0.599 0/0/0/1:4:22,8:0.30:-0.45:1.000:0.981 0/0/0/1:4:28,6:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.14:-0.72:1.000:0.976 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,2:0.14:-1.16:1.000:0.969 0/0/0/1:4:26,8:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:29,1:0.04:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,4:0.17:-0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:15,4:0.25:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,7:0.31:-0.67:1.000:0.978 0/0/0/1:4:24,8:0.29:-0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:15,7:0.35:-0.89:1.000:0.756 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 -chr1.1 19596141 chr1.1_019596141 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:79,72:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,70:0.59:-0.37:1.000:0.888 0/0/1/1:4:78,53:0.44: 0.35:1.000:0.966 0/0/1/1:4:55,51:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,68:0.52: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,36:0.30: 0.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:57,13:0.20:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,23:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,54:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,6:0.25:-3.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,3:0.10:-2.87:1.000:0.778 0/1/1/1:4:1,129:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,29:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,51:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,22:0.21:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,30:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,66:0.51: 0.54:0.992:0.996 0/0/1/1:4:63,73:0.54: 0.51:1.000:0.990 0/0/0/1:4:115,41:0.28: 1.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,70:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,15:0.44:-2.71:1.000:0.968 0/0/0/1:4:112,28:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,37:0.28: 0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:90,25:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.27:-3.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,53:0.46: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:60,51:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,15:0.14:-0.20:1.000:0.972 0/0/1/1:4:72,66:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,28:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,33:0.25: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,53:0.52:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:11,5:0.34:-3.39:1.000:0.879 0/0/1/1:4:21,17:0.49:-2.68:1.000:0.996 0/0/0:3:11,0:0.00:-3.56:0.970:1.000 0/0/1/1:4:64,44:0.44:-0.40:1.000:0.971 0/0/1/1:4:54,50:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,58:0.51: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,26:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,24:0.18: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,70:0.54: 0.32:1.000:0.989 0/0/0/1:4:84,39:0.34: 0.09:1.000:0.846 0/0/1/1:4:82,77:0.51: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,55:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,44:0.35: 0.58:1.000:0.832 0/0/0/1:4:101,27:0.23: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,66:0.47: 1.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:13,2:0.14:-3.43:1.000:0.977 0/0/0/1:4:87,29:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,62:0.54:-0.24:1.000:0.987 0/0/0/1:4:75,21:0.24:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,64:0.47: 0.87:1.000:0.993 0/0/0/1:4:92,35:0.30: 0.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:84,63:0.47: 0.87:1.000:0.991 0/0/0/1:4:106,21:0.18: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,26:0.21: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,61:0.48: 0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,26:0.18: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,32:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:69,37:0.38:-0.46:1.000:0.791 0/0/0/1:4:127,33:0.22: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,31:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:90,36:0.31: 0.19:1.000:0.975 0/0/0/1:4:82,21:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,27:0.20: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,34:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,34:0.52:-1.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,37:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/0/1:4:97,36:0.29: 0.41:0.987:0.990 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,34:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,29:0.51:-1.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,97:0.63: 0.35:1.000:0.586 0/0/0/1:4:102,41:0.31: 0.74:1.000:0.973 0/0/1/1:4:40,62:0.57:-0.59:1.000:0.948 0/0/1/1:4:66,44:0.43:-0.33:1.000:0.957 0/0/1/1:4:62,43:0.44:-0.50:1.000:0.974 0/0/0/1:4:116,24:0.18: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,52:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:77,65:0.50: 0.71:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,56:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,42:0.25: 1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,52:0.47: 0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:83,31:0.29:-0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,74:0.51: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,23:0.27:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,54:0.46: 0.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:103,24:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,56:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,19:0.23:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,53:0.46: 0.19:1.000:0.986 0/0/0/1:4:138,40:0.24: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,21:0.24:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,36:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,31:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,27:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,77:0.62:-0.43:1.000:0.543 0/0/1/1:4:77,56:0.46: 0.41:1.000:0.986 0/0/0/1:4:100,36:0.29: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,29:0.46:-1.67:1.000:0.985 0/0/0/1:4:90,32:0.28: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,55:0.53:-0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:75,50:0.43: 0.15:1.000:0.957 0/0/0/1:4:86,20:0.20:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,40:0.31: 0.64:1.000:0.975 0/0/1/1:4:70,59:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,56:0.51:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,77:0.53: 0.90:1.000:0.993 0/0/0/1:4:107,36:0.27: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,58:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,79:0.53: 0.97:1.000:0.992 0/0/0/1:4:90,44:0.36: 0.45:0.999:0.736 0/0/0/1:4:108,21:0.18: 0.28:1.000:0.999 0/0/1:3:76,29:0.30:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,85:0.51: 1.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,21:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,47:0.54:-1.15:1.000:0.985 0/0/0/1:4:88,37:0.32: 0.15:1.000:0.953 0/0/0/1:4:78,28:0.29:-0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,56:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,29:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,38:0.24: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,75:0.54: 0.64:1.000:0.990 0/0/1/1:4:73,77:0.53: 0.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:72,66:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:100,62:0.42: 1.36:0.556:0.517 0/0/1/1:4:62,46:0.46:-0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:80,33:0.32:-0.24:1.000:0.963 0/0/1/1:4:48,49:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,46:0.47:-0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:66,54:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,17:0.20:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,59:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,58:0.47: 0.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:89,80:0.51: 1.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,40:0.30: 0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:68,66:0.52: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,58:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,30:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,68:0.52: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,31:0.28:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,32:0.29: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,35:0.47:-1.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,100:0.53: 2.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:78,79:0.52: 1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,43:0.40:-0.11:1.000:0.780 0/0/0/1:4:102,32:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,66:0.52: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,64:0.49: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,24:0.19: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,34:0.29: 0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,10:0.49:-3.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,21:0.20:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,56:0.47: 0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,65:0.53: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:81,67:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,30:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,26:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,40:0.30: 0.77:1.000:0.985 0/0/0/1:4:85,20:0.21:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,25:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,31:0.27: 0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,21:0.18: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,72:0.53: 0.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:72,23:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,47:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,48:0.47:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:87,25:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,18:0.20:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,46:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,40:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,61:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,24:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,16:0.22:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,34:0.35:-0.46:1.000:0.815 0/0/1/1:4:71,57:0.48: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,69:0.47: 1.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:96,27:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,45:0.38: 0.22:1.000:0.624 0/0/1/1:4:85,51:0.41: 0.51:1.000:0.844 0/0/1/1:4:98,75:0.47: 1.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,51:0.45: 0.06:1.000:0.984 0/0/0/1:4:76,27:0.28:-0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,79:0.61:-0.20:1.000:0.697 -chr1.1 19780298 chr1.1_019780298 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:0.992:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:6:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.53:0.987:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:0.999:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:3:15,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:41,0:.: 1.31:0.556:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.30:1.000:. -chr1.1 20097917 chr1.1_020097917 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:131,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:457,0:.: 3.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.90:0.992:. ./.:4:139,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:417,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:87,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:380,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:378,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:401,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.15:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.84:0.970:. ./.:4:158,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:259,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.46:1.000:. ./.:6:139,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:224,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:237,1:.: 0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:198,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:366,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:204,0:.: 0.32:1.000:. ./.:3:94,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:363,0:.: 2.03:1.000:. ./.:6:259,0:.: 0.91:0.556:. ./.:4:118,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:154,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:322,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:434,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:130,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:505,0:.: 3.56:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:297,0:.: 1.32:1.000:. -chr1.1 20310833 chr1.1_020310833 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.98:0.992:. ./.:4:50,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.58:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.84:0.970:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:115,1:.: 5.40:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.80:0.987:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:3:20,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.36:1.000:. ./.:6:25,0:.:-0.48:0.556:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.27:1.000:. -chr1.1 20548930 chr1.1_020548930 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:95,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.26:0.992:. ./.:4:94,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:170,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.81:0.970:. ./.:4:104,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.20:1.000:. ./.:6:63,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.47:0.987:. ./.:4:116,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:135,0:.: 1.26:1.000:. ./.:3:43,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.44:1.000:. ./.:6:106,0:.: 0.38:0.556:. ./.:4:107,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.11:1.000:. -chr1.1 20860458 chr1.1_020860458 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,6:.: 1.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:13,3:.: 1.29:1.000:. ./.:4:11,6:.: 1.53:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,9:.: 1.06:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:17,4:.: 2.46:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:14,5:.: 2.00:1.000:. ./.:4:15,4:.: 2.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:12,3:.: 1.06:0.992:. ./.:4:5,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:7,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:13,6:.: 2.00:1.000:. ./.:4:6,10:.: 1.29:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.04:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,3:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.98:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:9,5:.: 0.83:1.000:. ./.:4:11,4:.: 1.06:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,8:.: 1.06:1.000:. ./.:3:4,2:.:-1.04:0.970:. ./.:4:6,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,5:.: 1.29:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:14,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:8,6:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,6:.: 2.00:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.81:1.000:. ./.:6:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,4:.: 1.06:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.28:0.987:. ./.:4:2,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.13:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:7,6:.: 0.59:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:8,6:.: 0.83:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:8,7:.: 1.06:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.51:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,4:.: 2.23:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:9,6:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,5:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:7,1:.:-0.58:1.000:. ./.:3:3,2:.:-1.28:1.000:. ./.:4:15,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:6,5:.: 0.13:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.59:1.000:. ./.:6:9,5:.: 0.83:0.556:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:6,10:.: 1.29:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,14:.: 3.40:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:8,8:.: 1.29:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.28:1.000:. ./.:4:5,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.59:1.000:. ./.:4:6,5:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,5:.: 1.29:1.000:. ./.:4:12,3:.: 1.06:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.51:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:6,5:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,10:.: 1.53:1.000:. ./.:4:10,6:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.34:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,6:.: 0.59:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. -chr1.1 22487705 chr1.1_022487705 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:240,49:.: 1.25:1.000:. ./.:4:118,82:.:-0.17:1.000:. ./.:4:230,36:.: 0.88:1.000:. ./.:4:163,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:101,98:.:-0.19:1.000:. ./.:4:285,52:.: 2.01:1.000:. ./.:4:166,25:.:-0.32:1.000:. ./.:4:148,89:.: 0.42:1.000:. ./.:4:269,36:.: 1.50:1.000:. ./.:4:45,16:.:-2.39:1.000:. ./.:4:28,14:.:-2.69:1.000:. ./.:4:135,82:.: 0.10:1.000:. ./.:4:234,46:.: 1.10:1.000:. ./.:4:255,49:.: 1.49:1.000:. ./.:4:145,88:.: 0.35:1.000:. ./.:4:78,73:.:-0.95:1.000:. ./.:4:87,98:.:-0.41:0.992:. ./.:4:186,49:.: 0.39:1.000:. ./.:4:205,54:.: 0.77:1.000:. ./.:4:186,88:.: 1.01:1.000:. ./.:4:54,8:.:-2.37:1.000:. ./.:4:227,35:.: 0.82:1.000:. ./.:4:149,41:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,29:.:-0.44:1.000:. ./.:4:61,6:.:-2.29:1.000:. ./.:4:93,72:.:-0.73:1.000:. ./.:4:84,102:.:-0.40:1.000:. ./.:4:77,68:.:-1.05:1.000:. ./.:4:186,92:.: 1.07:1.000:. ./.:4:189,96:.: 1.18:1.000:. ./.:4:179,85:.: 0.85:1.000:. ./.:4:216,46:.: 0.82:1.000:. ./.:4:47,3:.:-2.56:1.000:. ./.:4:88,11:.:-1.78:1.000:. ./.:3:21,6:.:-2.93:1.000:. ./.:4:244,46:.: 1.26:1.000:. ./.:4:144,48:.:-0.30:1.000:. ./.:4:180,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:166,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:186,98:.: 1.17:1.000:. ./.:4:154,34:.:-0.36:1.000:. ./.:4:176,42:.: 0.11:1.000:. ./.:4:194,87:.: 1.12:1.000:. ./.:4:77,61:.:-1.16:1.000:. ./.:4:190,31:.: 0.16:1.000:. ./.:4:166,86:.: 0.66:1.000:. ./.:4:222,34:.: 0.72:1.000:. ./.:4:13,7:.:-3.04:1.000:. ./.:4:140,65:.:-0.09:1.000:. ./.:4:154,36:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,67:.:-1.32:1.000:. ./.:4:192,48:.: 0.47:1.000:. ./.:4:158,80:.: 0.43:1.000:. ./.:4:176,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:140,40:.:-0.49:1.000:. ./.:4:168,77:.: 0.54:1.000:. ./.:4:70,70:.:-1.13:1.000:. ./.:4:151,74:.: 0.23:1.000:. ./.:4:63,80:.:-1.08:1.000:. ./.:6:96,63:.:-0.83:1.000:. ./.:4:83,75:.:-0.84:1.000:. ./.:4:168,102:.: 0.94:1.000:. ./.:4:180,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:244,41:.: 1.18:1.000:. ./.:4:98,97:.:-0.25:1.000:. ./.:4:174,87:.: 0.80:1.000:. ./.:4:148,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,89:.:-0.97:1.000:. ./.:4:240,39:.: 1.09:0.910:. ./.:4:131,73:.:-0.11:1.000:. ./.:4:235,32:.: 0.90:1.000:. ./.:4:143,28:.:-0.63:1.000:. ./.:4:200,97:.: 1.37:1.000:. ./.:4:172,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.99:1.000:. ./.:4:184,39:.: 0.19:1.000:. ./.:4:141,89:.: 0.31:1.000:. ./.:4:154,30:.:-0.43:1.000:. ./.:4:245,28:.: 0.99:1.000:. ./.:4:273,27:.: 1.42:1.000:. ./.:4:115,61:.:-0.55:1.000:. ./.:4:146,89:.: 0.39:1.000:. ./.:4:192,102:.: 1.33:1.000:. ./.:4:180,30:.:-0.01:1.000:. ./.:4:81,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:193,46:.: 0.45:1.000:. ./.:4:113,61:.:-0.59:1.000:. ./.:4:184,35:.: 0.13:1.000:. ./.:4:135,82:.: 0.10:1.000:. ./.:4:214,37:.: 0.64:1.000:. ./.:4:141,73:.: 0.05:1.000:. ./.:4:203,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:171,44:.: 0.07:1.000:. ./.:4:100,60:.:-0.81:1.000:. ./.:4:190,75:.: 0.86:1.000:. ./.:4:157,96:.: 0.67:1.000:. ./.:4:134,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:75,91:.:-0.71:1.000:. ./.:4:162,42:.:-0.11:1.000:. ./.:4:191,98:.: 1.25:1.000:. ./.:4:147,20:.:-0.70:1.000:. ./.:4:244,38:.: 1.13:1.000:. ./.:4:127,25:.:-0.94:1.000:. ./.:4:189,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:63,65:.:-1.32:1.000:. ./.:4:75,62:.:-1.18:1.000:. ./.:4:218,49:.: 0.90:1.000:. ./.:4:190,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:192,51:.: 0.51:1.000:. ./.:4:150,71:.: 0.16:1.000:. ./.:4:236,43:.: 1.09:1.000:. ./.:4:213,62:.: 1.02:1.000:. ./.:4:79,93:.:-0.62:0.999:. ./.:4:109,76:.:-0.41:1.000:. ./.:3:63,34:.:-1.81:1.000:. ./.:4:140,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,73:.:-1.18:1.000:. ./.:4:217,35:.: 0.66:1.000:. ./.:4:141,76:.: 0.10:1.000:. ./.:4:138,69:.:-0.06:1.000:. ./.:4:156,47:.:-0.12:1.000:. ./.:4:118,58:.:-0.55:1.000:. ./.:4:268,40:.: 1.55:1.000:. ./.:4:228,46:.: 1.01:1.000:. ./.:4:135,60:.:-0.25:1.000:. ./.:4:61,82:.:-1.08:1.000:. ./.:6:195,66:.: 0.80:0.556:. ./.:4:57,84:.:-1.11:1.000:. ./.:4:155,15:.:-0.65:1.000:. ./.:4:121,27:.:-1.00:1.000:. ./.:4:85,70:.:-0.89:1.000:. ./.:4:223,41:.: 0.85:1.000:. ./.:4:158,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,71:.:-1.16:1.000:. ./.:4:203,37:.: 0.47:1.000:. ./.:4:85,85:.:-0.65:1.000:. ./.:4:154,89:.: 0.51:1.000:. ./.:4:52,57:.:-1.62:1.000:. ./.:4:190,29:.: 0.13:1.000:. ./.:4:126,37:.:-0.76:1.000:. ./.:4:207,34:.: 0.48:1.000:. ./.:4:121,39:.:-0.81:1.000:. ./.:4:140,69:.:-0.03:1.000:. ./.:4:160,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:289,54:.: 2.11:1.000:. ./.:4:194,39:.: 0.35:1.000:. ./.:4:269,48:.: 1.69:1.000:. ./.:4:150,75:.: 0.23:1.000:. ./.:4:277,45:.: 1.77:1.000:. ./.:4:177,53:.: 0.31:1.000:. ./.:4:183,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:166,83:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,10:.:-2.69:1.000:. ./.:4:121,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:201,37:.: 0.43:1.000:. ./.:4:274,49:.: 1.79:1.000:. ./.:4:177,51:.: 0.27:1.000:. ./.:4:183,82:.: 0.86:1.000:. ./.:4:73,69:.:-1.10:1.000:. ./.:4:93,104:.:-0.22:1.000:. ./.:4:156,77:.: 0.35:1.000:. ./.:4:129,68:.:-0.22:1.000:. ./.:4:172,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:152,46:.:-0.20:1.000:. ./.:4:95,80:.:-0.57:1.000:. ./.:4:164,36:.:-0.17:1.000:. ./.:4:136,40:.:-0.55:1.000:. ./.:4:78,123:.:-0.16:1.000:. ./.:4:119,38:.:-0.86:1.000:. ./.:4:219,45:.: 0.85:1.000:. ./.:4:108,36:.:-1.06:1.000:. ./.:4:138,71:.:-0.03:1.000:. ./.:4:218,39:.: 0.74:1.000:. ./.:4:131,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:194,32:.: 0.24:1.000:. ./.:4:106,71:.:-0.54:1.000:. ./.:4:299,60:.: 2.36:1.000:. ./.:4:255,38:.: 1.31:1.000:. ./.:4:243,51:.: 1.33:1.000:. ./.:4:104,78:.:-0.46:1.000:. ./.:4:163,45:.:-0.04:1.000:. ./.:4:111,100:.: 0.00:1.000:. ./.:4:284,55:.: 2.04:1.000:. ./.:4:196,48:.: 0.53:1.000:. ./.:4:64,118:.:-0.46:1.000:. -chr1.1 22582932 chr1.1_022582932 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:179,77:0.30: 0.32:1.000:0.981 0/0/0/1:4:171,56:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,110:0.44: 0.22:1.000:0.967 0/0/0/1:4:195,73:0.28: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,163:0.57: 0.83:1.000:0.944 0/0/1/1:4:158,169:0.52: 1.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,111:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:77,211:0.74: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,151:0.52: 0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:46,27:0.37:-2.81:1.000:0.543 0/0/1/1:4:87,64:0.42:-1.47:1.000:0.929 0/0/0/0:4:271,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,179:0.69: 0.41:1.000:0.975 0/0/1/1:4:123,103:0.46:-0.19:1.000:0.984 0/1/1/1:4:65,183:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,244:0.75: 1.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:172,152:0.47: 1.48:0.992:0.992 0/0/0/1:4:170,72:0.30: 0.08:1.000:0.984 0/1/1/1:4:95,245:0.73: 1.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,169:0.54: 1.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:64,59:0.48:-1.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:138,140:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,214:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,158:0.53: 1.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:39,34:0.46:-2.81:1.000:0.990 0/0/1/1:4:148,133:0.47: 0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:238,81:0.26: 1.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,159:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:197,80:0.29: 0.68:1.000:0.990 0/1/1/1:4:88,233:0.73: 1.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:186,156:0.46: 1.79:1.000:0.985 0/0/1/1:4:147,128:0.46: 0.65:1.000:0.990 0/0/0/0:4:57,5:0.08:-3.00:1.000:0.983 0/0/1/1:4:53,87:0.62:-1.66:1.000:0.512 0/0/1:3:41,19:0.32:-3.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,72:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,69:0.27: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,157:0.53: 0.97:1.000:0.991 0/1/1/1:4:69,195:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,156:0.54: 0.92:1.000:0.990 0/0/0/1:4:163,58:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,169:0.76:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,47:0.20: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,52:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,144:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,187:0.74: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,78:0.26: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,59:0.55:-2.21:1.000:0.983 0/0/1/1:4:114,104:0.48:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,101:0.54:-0.84:1.000:0.989 0/1/1/1:4:57,134:0.71:-0.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:221,68:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,112:0.54:-0.50:1.000:0.989 0/0/1/1:4:114,105:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:70,167:0.71: 0.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:103,111:0.52:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,107:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,138:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,136:0.70:-0.69:1.000:0.981 0/0/1/1/1/1:6:48,115:0.71:-1.27:1.000:0.817 0/1/1/1:4:62,163:0.73:-0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,186:0.81:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,182:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,205:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,133:0.52: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,184:0.77: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,61:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,166:0.75:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,112:0.51:-0.28:0.910:0.997 0/0/0/0:4:194,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,111:0.45: 0.17:1.000:0.979 0/0/0/1:4:135,52:0.28:-0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,67:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,109:0.43: 0.30:1.000:0.940 0/0/0/1:4:165,45:0.22:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,93:0.47:-0.65:1.000:0.991 0/0/1/1:4:103,106:0.51:-0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,145:0.73:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,115:0.53:-0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:214,62:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,42:0.20:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,105:0.46:-0.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:148,52:0.26:-0.64:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,174:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,65:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,77:0.43:-1.01:1.000:0.953 0/0/0/1:4:139,44:0.25:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,107:0.52:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,110:0.47:-0.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:56,150:0.74:-0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:153,46:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,107:0.48:-0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:41,147:0.79:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,205:0.80: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,117:0.47: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,84:0.50:-1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,44:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,101:0.45:-0.24:1.000:0.982 0/0/1/1:4:128,130:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,57:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,111:0.46: 0.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:124,31:0.20:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,43:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,148:0.77:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,158:0.71:-0.21:1.000:0.991 0/0/0/1:4:153,52:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:240,61:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,173:0.55: 1.33:1.000:0.981 0/0/1/1:4:105,118:0.53:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:147,40:0.22:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,174:0.45: 2.53:1.000:0.981 0/1/1/1:4:44,116:0.73:-1.32:0.999:0.998 0/0/1/1:4:112,111:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/1/1:3:37,76:0.68:-2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,66:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,147:0.72:-0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:163,39:0.20:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,107:0.46:-0.11:1.000:0.989 0/0/1/1:4:73,88:0.55:-1.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:115,111:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,78:0.42:-0.88:1.000:0.913 0/1/1/1:4:69,172:0.72: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,74:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,107:0.47:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:170,59:0.26:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:141,99:0.41: 0.05:0.556:0.537 0/0/1/1:4:103,116:0.53:-0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:51,133:0.73:-0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,68:0.56:-1.97:1.000:0.971 0/0/0/1:4:151,62:0.29:-0.41:1.000:0.989 0/0/1/1:4:136,147:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,111:0.77:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,51:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,103:0.48:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:186,163:0.47: 1.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:120,113:0.48:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,101:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,70:0.48:-1.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,128:0.78:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,51:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,122:0.54:-0.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:129,133:0.51: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,75:0.49:-1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:215,75:0.26: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,142:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:204,68:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,125:0.53: 0.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:215,58:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,67:0.29:-0.07:1.000:0.991 0/1/1/1:4:82,249:0.76: 1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,232:0.77: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,40:0.48:-2.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:41,131:0.77:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,197:0.76: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,131:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,167:0.50: 1.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,264:0.81: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,175:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,240:0.75: 1.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,154:0.52: 1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,158:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,120:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,149:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:187,46:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,183:0.74: 0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,54:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,133:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/1/1/1:4:63,206:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,189:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,132:0.56:-0.06:1.000:0.959 0/0/1/1:4:108,96:0.47:-0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:132,131:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,116:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,170:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,112:0.48:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:301,108:0.27: 2.94:1.000:0.998 0/0/0/1:4:228,74:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,159:0.52: 1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:82,181:0.69: 0.44:1.000:0.979 0/0/0/1:4:206,68:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,148:0.47: 1.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:268,87:0.25: 2.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,126:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:189,64:0.26: 0.27:1.000:0.999 -chr1.1 23535207 chr1.1_023535207 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,211:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,126:0.77:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,198:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,187:0.75: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,125:0.53: 0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:60,164:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,101:0.75:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,158:0.68: 0.58:1.000:0.959 0/1/1/1:4:52,133:0.74:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,39:0.54:-2.77:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,28:0.52:-3.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,137:0.72:-0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,154:0.77:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,202:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,111:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:225,68:0.25: 1.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,141:0.51: 1.55:0.992:0.997 0/0/0/1:4:217,62:0.24: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,129:0.55: 0.67:1.000:0.983 0/1/1/1:4:65,193:0.76: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,48:0.79:-3.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,169:0.81: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,133:0.55: 0.75:1.000:0.976 0/0/1/1:4:113,92:0.46:-0.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,38:0.71:-3.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:143,148:0.52: 1.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,135:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,115:0.53: 0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:92,164:0.66: 0.97:1.000:0.836 0/0/1/1:4:120,123:0.52: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,187:0.79: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,174:0.75: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-3.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,61:0.76:-2.61:1.000:1.000 0/1/1:3:12,23:0.67:-3.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,247:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,98:0.44: 0.46:1.000:0.960 0/0/1/1:4:107,130:0.56: 0.58:1.000:0.968 0/0/1/1:4:139,147:0.52: 1.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:180,143:0.45: 2.35:1.000:0.983 0/0/1/1:4:112,85:0.44:-0.24:1.000:0.972 0/0/1/1:4:130,89:0.42: 0.21:1.000:0.910 0/1/1/1:4:64,165:0.74: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,103:0.56:-0.45:1.000:0.964 0/1/1/1:4:55,128:0.72:-0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,154:0.71: 0.29:1.000:0.990 0/1/1/1:4:45,155:0.79:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,49:0.43:-1.87:1.000:0.940 0/0/1/1:4:117,95:0.46: 0.07:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,36:0.24:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,98:0.41: 0.81:1.000:0.853 0/1/1/1:4:58,177:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,169:0.77: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,110:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:77,153:0.68: 0.44:1.000:0.955 0/0/1/1:4:113,98:0.47: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,180:0.76: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,51:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:91,79:0.47:-0.80:1.000:0.854 0/0/0/1:4:179,54:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,99:0.44: 0.50:1.000:0.962 0/0/1/1:4:100,125:0.57: 0.34:1.000:0.954 0/1/1/1:4:66,175:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,138:0.53: 1.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:57,183:0.78: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,104:0.67:-1.04:1.000:0.934 0/0/1/1:4:91,94:0.52:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:63,162:0.74: 0.34:0.910:0.999 0/1/1/1:4:55,126:0.71:-0.57:1.000:0.993 0/1/1/1:4:75,166:0.71: 0.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:85,69:0.46:-1.13:1.000:0.987 0/1/1/1:4:61,143:0.72:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,126:0.54: 0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:118,85:0.43:-0.12:1.000:0.949 0/0/1/1:4:97,101:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,128:0.72:-0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,108:0.52: 0.07:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,198:0.78: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,114:0.71:-0.92:1.000:0.993 0/1/1/1:4:68,162:0.72: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,142:0.50: 1.65:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,46:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,128:0.51: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,90:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,135:0.77:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,79:0.46:-0.69:1.000:0.989 0/1/1/1:4:61,183:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,101:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,162:0.80:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,136:0.53: 1.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,112:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,164:0.70: 0.62:1.000:0.987 0/1/1/1:4:59,164:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,89:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,115:0.54: 0.19:1.000:0.989 0/1/1/1:4:40,163:0.82:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,106:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,102:0.70:-1.21:1.000:0.981 0/1/1/1:4:47,154:0.78:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,135:0.71:-0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:132,46:0.28:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,49:0.24: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,229:1.00: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,250:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,121:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,168:0.75: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,172:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,218:0.79: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,46:0.25:-0.18:0.999:0.999 0/0/1/1:4:112,118:0.52: 0.44:1.000:0.994 0/1/1:3:53,81:0.62:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,174:0.81: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,78:0.52:-1.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:55,109:0.68:-0.92:1.000:0.954 0/1/1/1:4:50,136:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,99:0.46: 0.27:1.000:0.986 0/0/1/1:4:126,89:0.43: 0.13:1.000:0.936 0/1/1/1:4:40,116:0.76:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,152:0.69: 0.32:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,204:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,126:0.69:-0.47:1.000:0.978 0/0/1/1:4:95,97:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1/1/1:6:43,211:0.84: 0.93:0.556:0.991 0/0/1/1:4:105,109:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,121:0.80:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,133:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,92:0.50:-0.41:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,232:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,95:0.75:-1.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,100:0.53:-0.36:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,206:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,131:0.52: 0.99:1.000:0.995 0/1/1/1:4:90,200:0.71: 1.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,89:0.53:-0.76:1.000:0.993 0/1/1/1:4:45,155:0.79:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,85:0.51:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,153:0.72: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,107:0.56:-0.28:1.000:0.967 0/1/1/1:4:68,159:0.72: 0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,124:0.76:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,169:0.70: 0.79:1.000:0.985 0/1/1/1:4:52,148:0.76:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,229:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,111:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,194:0.76: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,162:0.78: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,134:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,108:0.45: 0.77:1.000:0.980 0/1/1/1:4:20,32:0.63:-3.23:1.000:0.550 0/0/1/1:4:84,83:0.51:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,142:0.54: 1.22:1.000:0.987 0/1/1/1:4:73,164:0.71: 0.58:1.000:0.991 0/1/1/1:4:56,166:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,156:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,94:0.47:-0.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:192,60:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,155:0.72: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,90:0.47:-0.22:1.000:0.990 0/0/1/1:4:111,107:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,100:0.45: 0.38:1.000:0.982 0/0/1/1:4:142,132:0.49: 1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,88:0.45:-0.20:1.000:0.983 0/0/1/1:4:106,100:0.49:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,106:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,85:0.46:-0.36:1.000:0.985 0/1/1/1:4:54,116:0.70:-0.80:1.000:0.984 0/0/1/1:4:105,84:0.46:-0.41:1.000:0.985 0/1/1/1:4:38,133:0.79:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,177:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,86:0.45:-0.22:1.000:0.975 0/1/1/1:4:46,164:0.80: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,91:0.47:-0.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:74,184:0.73: 1.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:53,193:0.80: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,175:0.77: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,95:0.47:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,95:0.47:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:153,148:0.50: 1.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,180:0.74: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,124:0.72:-0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,114:0.48: 0.69:1.000:0.995 -chr1.1 24489859 chr1.1_024489859 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:115,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.70:0.992:. ./.:4:173,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.01:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.13:1.000:. ./.:6:116,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.01:0.910:. ./.:4:42,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:267,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.25:0.999:. ./.:4:156,0:.: 0.19:1.000:. ./.:3:95,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.56:1.000:. ./.:6:197,0:.: 0.99:0.556:. ./.:4:82,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:131,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.36:1.000:. -chr1.1 24760634 chr1.1_024760634 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:306,98:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,179:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:254,107:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:305,119:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:320,145:0.29: 1.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:355,109:0.21: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,70:0.24:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:389,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,181:0.47: 0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:29,16:0.33:-3.51:1.000:0.926 0/0/0/0:4:68,3:0.04:-3.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,334:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,99:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,108:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,120:0.29: 0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:295,139:0.29: 0.85:1.000:0.990 0/0/0/0:4:437,0:0.00: 0.89:0.992:1.000 0/1/1/1:4:96,295:0.70: 0.37:1.000:0.986 0/0/0/1:4:383,126:0.22: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:383,156:0.26: 2.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,22:0.31:-3.28:1.000:0.978 0/0/0/1:4:271,89:0.22: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:316,109:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,99:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,26:0.38:-3.30:1.000:0.560 0/0/0/1:4:296,91:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,110:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:415,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:467,1:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,124:0.26: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:363,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,160:0.46:-0.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:41,56:0.54:-2.93:1.000:0.985 0/0/1/1:4:30,32:0.49:-3.32:1.000:0.996 0/0/0:3:23,0:0.00:-3.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:299,100:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,214:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,220:0.52: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,126:0.30: 0.28:1.000:0.983 0/0/0/1:4:351,123:0.23: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,214:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:246,106:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:278,111:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,91:0.27:-0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:335,121:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:367,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:358,118:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,103:0.35:-0.99:1.000:0.748 0/0/0/1:4:238,97:0.26:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:201,96:0.30:-0.69:1.000:0.988 0/0/0/1:4:198,76:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,244:0.52: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/0:4:282,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,120:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:255,83:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:311,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,96:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:237,96:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:213,103:0.30:-0.47:1.000:0.986 0/0/0/1/1/1:6:164,168:0.48:-0.29:1.000:0.864 0/0/1/1:4:190,209:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:231,75:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,107:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,98:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:337,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:307,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,181:0.45: 0.25:1.000:0.979 0/0/0/0:4:371,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:274,97:0.24: 0.14:0.910:1.000 0/1/1/1:4:68,248:0.73:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:313,118:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,140:0.51:-1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,220:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:283,105:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,96:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,182:0.54:-0.43:1.000:0.989 0/0/0/1:4:217,79:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:277,105:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,111:0.33:-0.53:1.000:0.920 0/0/1/1:4:199,205:0.48: 0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,300:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,114:0.29:-0.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:331,117:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,81:0.21:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,105:0.27:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,197:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:201,78:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:166,180:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:239,94:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,172:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:238,106:0.28:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:166,187:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:283,75:0.19: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:263,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:400,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:331,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,68:0.21:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,188:0.55:-0.42:1.000:0.978 0/0/0/1:4:263,110:0.27: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:293,112:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,149:0.51:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:298,94:0.22: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,65:0.19:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,178:0.46: 0.04:1.000:0.990 0/0/0/1:4:240,91:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,67:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,99:0.31:-0.69:1.000:0.978 0/0/0/1:4:315,112:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:311,132:0.27: 0.95:1.000:0.997 0/0/0/0:4:324,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:313,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:359,132:0.24: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,113:0.27: 0.31:0.999:0.998 0/0/0/0:4:380,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0:3:176,0:0.00:-2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:305,113:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,1:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,179:0.52:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/0:4:307,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,95:0.29:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:192,196:0.48: 0.34:1.000:0.994 0/0/0/0:4:305,1:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,92:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:337,131:0.25: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,90:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,127:0.28: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/0/0/1:6:311,106:0.23: 0.66:0.556:0.732 0/0/0/1:4:229,92:0.26:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:188,79:0.27:-1.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:227,99:0.28:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:239,71:0.21:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:283,121:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:199,74:0.25:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,67:0.21:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,103:0.28:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:360,135:0.25: 1.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:330,1:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,97:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:187,185:0.47: 0.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:241,96:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,201:0.54:-0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:294,102:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:382,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,146:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:263,249:0.46: 1.73:1.000:0.987 0/0/0/1:4:339,141:0.27: 1.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:316,127:0.26: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:247,92:0.25:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,230:0.52: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:237,98:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:355,131:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,95:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.31:-3.46:1.000:0.968 0/0/0/1:4:283,92:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,86:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,224:0.51: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:362,129:0.24: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:426,1:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:346,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,115:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:304,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,72:0.21:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,116:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:319,106:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:319,117:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,103:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,182:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:267,119:0.28: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:302,103:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,88:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,197:0.52: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:181,87:0.30:-1.01:1.000:0.987 0/0/0/1:4:301,85:0.20: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,85:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,97:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,109:0.30:-0.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:230,300:0.53: 1.93:1.000:0.991 0/0/1/1:4:221,266:0.52: 1.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:273,95:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:284,104:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,291:0.53: 1.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:356,151:0.27: 1.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:254,239:0.46: 1.51:1.000:0.986 0/0/0/1:4:233,77:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,210:0.48: 0.62:1.000:0.995 -chr1.1 24951410 chr1.1_024951410 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:46,50:.: 0.85:1.000:. ./.:4:69,19:.: 0.49:1.000:. ./.:4:57,24:.: 0.17:1.000:. ./.:4:30,37:.:-0.47:1.000:. ./.:4:53,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:70,26:.: 0.85:1.000:. ./.:4:62,21:.: 0.26:1.000:. ./.:4:78,22:.: 1.03:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:14,5:.:-2.67:1.000:. ./.:4:10,11:.:-2.58:1.000:. ./.:4:58,18:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.39:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:51,59:.: 1.49:0.992:. ./.:4:55,16:.:-0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:89,34:.: 2.09:1.000:. ./.:4:16,8:.:-2.44:1.000:. ./.:4:60,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:80,19:.: 0.99:1.000:. ./.:4:27,9:.:-1.89:1.000:. ./.:4:52,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:32,42:.:-0.15:1.000:. ./.:4:55,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:68,59:.: 2.27:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:51,47:.: 0.94:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.89:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.35:1.000:. ./.:4:47,48:.: 0.81:1.000:. ./.:4:54,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.39:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:22,38:.:-0.79:1.000:. ./.:4:30,33:.:-0.66:1.000:. ./.:4:68,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,27:.: 0.12:1.000:. ./.:4:65,26:.: 0.62:1.000:. ./.:4:75,19:.: 0.76:1.000:. ./.:4:36,20:.:-0.98:1.000:. ./.:4:66,16:.: 0.21:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,21:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,37:.:-0.15:1.000:. ./.:4:80,20:.: 1.03:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,38:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:44,23:.:-0.47:1.000:. ./.:4:53,31:.: 0.30:1.000:. ./.:6:51,4:.:-1.02:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:37,50:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:42,19:.:-0.75:1.000:. ./.:4:46,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:68,14:.: 0.21:0.910:. ./.:4:43,17:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,25:.: 0.49:1.000:. ./.:4:26,9:.:-1.94:1.000:. ./.:4:63,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:83,26:.: 1.45:1.000:. ./.:4:19,42:.:-0.75:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,20:.:-0.57:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:67,15:.: 0.21:1.000:. ./.:4:57,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:42,26:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,38:.:-0.47:1.000:. ./.:4:55,19:.:-0.15:1.000:. ./.:4:29,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:65,32:.: 0.90:1.000:. ./.:4:34,9:.:-1.57:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.34:1.000:. ./.:4:53,12:.:-0.57:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:42,20:.:-0.70:1.000:. ./.:4:70,33:.: 1.17:1.000:. ./.:4:32,18:.:-1.25:1.000:. ./.:4:89,40:.: 2.36:1.000:. ./.:4:54,36:.: 0.58:1.000:. ./.:4:61,14:.:-0.11:1.000:. ./.:4:48,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:70,19:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,25:.: 0.49:1.000:. ./.:4:42,12:.:-1.07:1.000:. ./.:4:59,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,40:.: 0.12:1.000:. ./.:4:49,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:42,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:53,40:.: 0.71:1.000:. ./.:4:58,25:.: 0.26:1.000:. ./.:4:40,55:.: 0.81:1.000:. ./.:4:40,41:.: 0.17:1.000:. ./.:4:89,21:.: 1.49:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:54,41:.: 0.81:1.000:. ./.:3:37,17:.:-1.07:1.000:. ./.:4:43,52:.: 0.81:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.75:1.000:. ./.:4:44,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:38,37:.:-0.11:1.000:. ./.:4:48,15:.:-0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:33,35:.:-0.43:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:60,62:.: 2.04:1.000:. ./.:4:40,24:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,38:.:-0.29:1.000:. ./.:6:54,44:.: 0.94:0.556:. ./.:4:60,16:.:-0.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,12:.:-0.98:1.000:. ./.:4:32,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:106,28:.: 2.59:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:21,28:.:-1.30:1.000:. ./.:4:43,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:63,34:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,23:.:-1.07:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.66:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:36,14:.:-1.25:1.000:. ./.:4:48,24:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,46:.: 0.58:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:67,28:.: 0.81:1.000:. ./.:4:88,34:.: 2.04:1.000:. ./.:4:43,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:40,23:.:-0.66:1.000:. ./.:4:69,24:.: 0.71:1.000:. ./.:4:38,43:.: 0.17:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:29,3:.:-2.07:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:62,17:.: 0.07:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:85,30:.: 1.72:1.000:. ./.:4:81,31:.: 1.58:1.000:. ./.:4:67,21:.: 0.49:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,21:.:-0.29:1.000:. ./.:4:60,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:29,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:75,30:.: 1.26:1.000:. ./.:4:72,26:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,16:.:-1.39:1.000:. ./.:4:46,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:58,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:54,26:.: 0.12:1.000:. ./.:4:77,22:.: 0.99:1.000:. ./.:4:63,27:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,23:.: 1.26:1.000:. ./.:4:96,4:.: 1.03:1.000:. ./.:4:66,25:.: 0.62:1.000:. ./.:4:59,38:.: 0.90:1.000:. ./.:4:82,24:.: 1.31:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:47,35:.: 0.21:1.000:. -chr1.1 25474859 chr1.1_025474859 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:363,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:360,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:317,87:.: 1.15:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:194,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:164,39:.:-2.17:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:263,78:.: 0.11:1.000:. ./.:4:294,76:.: 0.59:1.000:. ./.:4:192,141:.:-0.02:1.000:. ./.:4:312,85:.: 1.03:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:174,40:.:-1.99:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:303,78:.: 0.77:1.000:. ./.:4:232,47:.:-0.92:1.000:. ./.:4:179,6:.:-2.47:1.000:. ./.:4:273,77:.: 0.26:1.000:. ./.:4:298,88:.: 0.85:1.000:. ./.:4:233,66:.:-0.58:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:159,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.23:1.000:. ./.:3:185,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:272,66:.: 0.06:1.000:. ./.:4:277,67:.: 0.16:1.000:. ./.:4:274,72:.: 0.19:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:213,60:.:-1.01:1.000:. ./.:4:268,72:.: 0.09:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:243,67:.:-0.40:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:295,78:.: 0.64:1.000:. ./.:4:512,132:.: 5.11:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:258,64:.:-0.21:1.000:. ./.:4:361,91:.: 1.94:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:293,83:.: 0.69:1.000:. ./.:4:223,62:.:-0.82:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:252,84:.: 0.03:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:252,58:.:-0.40:1.000:. ./.:6:295,38:.:-0.02:1.000:. ./.:4:258,71:.:-0.09:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:311,80:.: 0.93:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:329,78:.: 1.20:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:242,58:.:-0.57:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.18:0.910:. ./.:4:330,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:246,50:.:-0.63:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:276,78:.: 0.32:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:248,52:.:-0.57:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:245,80:.:-0.16:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:318,71:.: 0.90:1.000:. ./.:4:291,69:.: 0.42:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:280,68:.: 0.22:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:245,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:261,69:.:-0.07:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:209,59:.:-1.10:1.000:. ./.:4:266,79:.: 0.17:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:430,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:333,84:.: 1.36:1.000:. ./.:4:304,68:.: 0.62:0.999:. ./.:4:295,71:.: 0.52:1.000:. ./.:3:151,51:.:-2.19:1.000:. ./.:4:300,89:.: 0.90:1.000:. ./.:4:206,67:.:-1.01:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:323,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:298,67:.: 0.50:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:332,84:.: 1.35:1.000:. ./.:6:434,0:.: 1.64:0.556:. ./.:4:255,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:222,49:.:-1.05:1.000:. ./.:4:263,57:.:-0.24:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:168,50:.:-1.92:1.000:. ./.:4:285,71:.: 0.36:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:327,65:.: 0.95:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:239,63:.:-0.54:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:270,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:286,79:.: 0.50:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:362,83:.: 1.82:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:242,58:.:-0.57:1.000:. ./.:4:264,82:.: 0.19:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:169,19:.:-2.42:1.000:. ./.:4:203,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:260,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:282,67:.: 0.24:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:219,54:.:-1.01:1.000:. ./.:4:289,74:.: 0.47:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:272,67:.: 0.08:1.000:. ./.:4:291,84:.: 0.67:1.000:. ./.:4:244,68:.:-0.37:1.000:. ./.:4:216,48:.:-1.16:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:256,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:223,50:.:-1.01:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:209,58:.:-1.11:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:238,77:.:-0.32:1.000:. ./.:4:364,81:.: 1.82:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.36:1.000:. -chr1.1 25688638 chr1.1_025688638 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:238,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:111,37:.:-1.00:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:146,33:.:-0.32:1.000:. ./.:4:196,57:.: 1.31:1.000:. ./.:4:147,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,22:.:-2.13:1.000:. ./.:4:141,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:123,29:.:-0.92:1.000:. ./.:4:85,22:.:-1.91:1.000:. ./.:4:51,21:.:-2.68:1.000:. ./.:4:144,33:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,80:.:-0.06:1.000:. ./.:4:98,65:.:-0.67:1.000:. ./.:4:191,35:.: 0.72:1.000:. ./.:4:95,82:.:-0.36:1.000:. ./.:4:206,56:.: 1.51:1.000:. ./.:4:143,88:.: 0.83:1.000:. ./.:4:75,1:.:-2.59:1.000:. ./.:4:155,47:.: 0.19:1.000:. ./.:4:207,54:.: 1.49:1.000:. ./.:4:130,32:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,7:.:-3.01:1.000:. ./.:4:133,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:126,26:.:-0.92:1.000:. ./.:4:122,32:.:-0.87:1.000:. ./.:4:230,52:.: 1.95:1.000:. ./.:4:107,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:151,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:120,27:.:-1.03:1.000:. ./.:4:39,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:79,27:.:-1.93:1.000:. ./.:3:18,1:.:-3.85:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:157,48:.: 0.25:1.000:. ./.:4:186,40:.: 0.72:1.000:. ./.:4:157,54:.: 0.39:1.000:. ./.:4:137,79:.: 0.50:1.000:. ./.:4:176,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:163,52:.: 0.47:1.000:. ./.:4:183,60:.: 1.09:1.000:. ./.:4:125,49:.:-0.43:1.000:. ./.:4:218,46:.: 1.56:1.000:. ./.:4:171,51:.: 0.63:1.000:. ./.:4:182,45:.: 0.74:1.000:. ./.:4:31,8:.:-3.41:1.000:. ./.:4:111,77:.:-0.12:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:103,73:.:-0.39:1.000:. ./.:4:213,40:.: 1.31:1.000:. ./.:4:173,49:.: 0.63:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:176,47:.: 0.65:1.000:. ./.:4:166,38:.: 0.23:1.000:. ./.:4:152,42:.: 0.01:1.000:. ./.:4:121,94:.: 0.47:1.000:. ./.:4:177,34:.: 0.39:1.000:. ./.:6:161,16:.:-0.36:1.000:. ./.:4:186,57:.: 1.09:1.000:. ./.:4:98,90:.:-0.12:1.000:. ./.:4:191,62:.: 1.31:1.000:. ./.:4:158,52:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,55:.: 1.00:1.000:. ./.:4:150,45:.: 0.03:1.000:. ./.:4:111,20:.:-1.38:1.000:. ./.:4:167,47:.: 0.45:1.000:. ./.:4:173,58:.: 0.83:0.910:. ./.:4:119,31:.:-0.96:1.000:. ./.:4:182,49:.: 0.83:1.000:. ./.:4:140,39:.:-0.32:1.000:. ./.:4:126,52:.:-0.34:1.000:. ./.:4:211,45:.: 1.38:1.000:. ./.:4:75,104:.:-0.32:1.000:. ./.:4:152,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:144,43:.:-0.14:1.000:. ./.:4:184,54:.: 0.98:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:190,58:.: 1.20:1.000:. ./.:4:143,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:174,57:.: 0.83:1.000:. ./.:4:143,96:.: 1.00:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:118,74:.:-0.03:1.000:. ./.:4:176,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:102,73:.:-0.41:1.000:. ./.:4:132,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:117,67:.:-0.21:1.000:. ./.:4:147,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:118,76:.: 0.01:1.000:. ./.:4:176,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:223,61:.: 2.00:1.000:. ./.:4:116,43:.:-0.76:1.000:. ./.:4:196,42:.: 0.98:1.000:. ./.:4:158,46:.: 0.23:1.000:. ./.:4:142,47:.:-0.10:1.000:. ./.:4:73,80:.:-0.89:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:138,104:.: 1.07:1.000:. ./.:4:123,27:.:-0.96:1.000:. ./.:4:164,57:.: 0.61:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:159,49:.: 0.32:1.000:. ./.:4:96,67:.:-0.67:1.000:. ./.:4:119,89:.: 0.32:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:214,55:.: 1.67:1.000:. ./.:4:154,39:.:-0.01:1.000:. ./.:4:136,43:.:-0.32:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:115,81:.: 0.06:0.999:. ./.:4:165,43:.: 0.32:1.000:. ./.:3:120,6:.:-1.49:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:141,36:.:-0.36:1.000:. ./.:4:144,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:165,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:102,71:.:-0.45:1.000:. ./.:4:180,42:.: 0.63:1.000:. ./.:4:157,42:.: 0.12:1.000:. ./.:4:212,46:.: 1.42:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:139,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:176,48:.: 0.67:1.000:. ./.:6:213,45:.: 1.42:0.556:. ./.:4:69,58:.:-1.47:1.000:. ./.:4:118,44:.:-0.69:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:147,31:.:-0.34:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,30:.:-0.94:1.000:. ./.:4:135,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:198,53:.: 1.27:1.000:. ./.:4:164,31:.: 0.03:1.000:. ./.:4:141,48:.:-0.10:1.000:. ./.:4:159,46:.: 0.25:1.000:. ./.:4:168,38:.: 0.28:1.000:. ./.:4:186,52:.: 0.98:1.000:. ./.:4:153,41:.: 0.01:1.000:. ./.:4:142,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:127,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:213,63:.: 1.82:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:127,81:.: 0.32:1.000:. ./.:4:186,46:.: 0.85:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:103,82:.:-0.19:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:87,64:.:-0.94:1.000:. ./.:4:170,53:.: 0.65:1.000:. ./.:4:182,38:.: 0.58:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:151,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:149,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:114,101:.: 0.47:1.000:. ./.:4:139,35:.:-0.43:1.000:. ./.:4:85,62:.:-1.03:1.000:. ./.:4:119,70:.:-0.10:1.000:. ./.:4:156,42:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:140,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:135,28:.:-0.67:1.000:. ./.:4:84,73:.:-0.81:1.000:. ./.:4:157,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:142,38:.:-0.30:1.000:. ./.:4:120,29:.:-0.98:1.000:. ./.:4:116,42:.:-0.78:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:140,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:134,37:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,66:.:-0.58:1.000:. ./.:4:163,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:197,53:.: 1.25:1.000:. ./.:4:167,42:.: 0.34:1.000:. ./.:4:99,68:.:-0.58:1.000:. ./.:4:205,45:.: 1.25:1.000:. ./.:4:203,43:.: 1.16:1.000:. ./.:4:185,57:.: 1.07:1.000:. ./.:4:132,40:.:-0.47:1.000:. ./.:4:99,89:.:-0.12:1.000:. -chr1.1 25728959 chr1.1_025728959 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:309,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:61,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:293,87:.: 1.11:1.000:. ./.:4:476,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:450,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:93,2:.:-2.63:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:345,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:93,0:.:-2.65:1.000:. ./.:3:45,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:254,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.48:1.000:. ./.:6:248,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.18:0.910:. ./.:4:246,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:228,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:313,0:.: 0.23:1.000:. ./.:3:154,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:245,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:334,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.20:1.000:. ./.:6:362,0:.: 0.87:0.556:. ./.:4:215,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:221,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:459,1:.: 2.15:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:356,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:57,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:257,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:448,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.12:1.000:. -chr1.1 26050142 chr1.1_026050142 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:180,69:.: 1.16:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:191,63:.: 1.25:1.000:. ./.:4:189,58:.: 1.12:1.000:. ./.:4:232,63:.: 2.02:1.000:. ./.:4:98,40:.:-0.90:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:38,15:.:-2.48:1.000:. ./.:4:28,47:.:-2.07:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:182,58:.: 0.99:1.000:. ./.:4:108,99:.: 0.38:1.000:. ./.:4:185,62:.: 1.12:1.000:. ./.:4:178,63:.: 1.01:1.000:. ./.:4:239,75:.: 2.37:1.000:. ./.:4:51,27:.:-2.02:1.000:. ./.:4:157,55:.: 0.47:1.000:. ./.:4:212,54:.: 1.48:1.000:. ./.:4:117,95:.: 0.47:1.000:. ./.:4:44,25:.:-2.19:1.000:. ./.:4:154,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,108:.: 0.40:1.000:. ./.:4:159,56:.: 0.53:1.000:. ./.:4:173,71:.: 1.07:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:128,48:.:-0.20:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:10,12:.:-3.06:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.37:1.000:. ./.:3:33,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:172,35:.: 0.38:1.000:. ./.:4:109,102:.: 0.46:1.000:. ./.:4:163,56:.: 0.60:1.000:. ./.:4:133,45:.:-0.16:1.000:. ./.:4:167,52:.: 0.60:1.000:. ./.:4:75,85:.:-0.49:1.000:. ./.:4:133,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:155,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:63,66:.:-1.07:1.000:. ./.:4:152,49:.: 0.27:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:111,122:.: 0.86:1.000:. ./.:4:160,174:.: 2.74:1.000:. ./.:4:90,40:.:-1.05:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:103,127:.: 0.81:1.000:. ./.:4:140,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:136,45:.:-0.10:1.000:. ./.:4:161,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:129,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:137,45:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,36:.:-0.59:1.000:. ./.:6:120,31:.:-0.66:1.000:. ./.:4:135,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:121,38:.:-0.51:1.000:. ./.:4:92,48:.:-0.87:1.000:. ./.:4:125,87:.: 0.47:1.000:. ./.:4:144,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,27:.:-1.24:1.000:. ./.:4:149,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:99,37:.:-0.94:0.910:. ./.:4:173,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,108:.: 0.81:1.000:. ./.:4:75,78:.:-0.62:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:118,129:.: 1.12:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:145,44:.: 0.05:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:126,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:148,45:.: 0.12:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:136,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:153,57:.: 0.44:1.000:. ./.:4:134,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:160,43:.: 0.31:1.000:. ./.:4:90,100:.: 0.06:1.000:. ./.:4:85,22:.:-1.48:1.000:. ./.:4:115,37:.:-0.64:1.000:. ./.:4:112,37:.:-0.70:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:105,32:.:-0.92:1.000:. ./.:4:107,100:.: 0.38:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:146,42:.: 0.03:1.000:. ./.:4:72,74:.:-0.75:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:160,42:.: 0.29:1.000:. ./.:4:202,63:.: 1.46:1.000:. ./.:4:86,25:.:-1.40:1.000:. ./.:4:146,44:.: 0.06:1.000:. ./.:4:82,26:.:-1.46:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:97,19:.:-1.31:1.000:. ./.:4:142,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,32:.:-1.03:1.000:. ./.:4:146,54:.: 0.25:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:143,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:147,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:221,56:.: 1.68:1.000:. ./.:4:129,32:.:-0.47:0.999:. ./.:4:97,101:.: 0.21:1.000:. ./.:3:63,25:.:-1.83:1.000:. ./.:4:92,103:.: 0.16:1.000:. ./.:4:111,40:.:-0.66:1.000:. ./.:4:120,33:.:-0.62:1.000:. ./.:4:121,41:.:-0.46:1.000:. ./.:4:114,30:.:-0.79:1.000:. ./.:4:161,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:112,41:.:-0.62:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:177,51:.: 0.77:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:99,88:.: 0.01:1.000:. ./.:6:165,23:.: 0.03:0.556:. ./.:4:115,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:90,33:.:-1.18:1.000:. ./.:4:68,71:.:-0.88:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:77,22:.:-1.63:1.000:. ./.:4:90,81:.:-0.29:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:242,71:.: 2.35:1.000:. ./.:4:182,50:.: 0.85:1.000:. ./.:4:154,36:.: 0.06:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:130,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:125,44:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,67:.:-1.27:1.000:. ./.:4:139,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:215,63:.: 1.70:1.000:. ./.:4:205,87:.: 1.96:1.000:. ./.:4:187,66:.: 1.24:1.000:. ./.:4:163,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:184,67:.: 1.20:1.000:. ./.:4:77,77:.:-0.60:1.000:. ./.:4:202,49:.: 1.20:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:52,14:.:-2.24:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:123,128:.: 1.20:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:189,63:.: 1.22:1.000:. ./.:4:167,58:.: 0.72:1.000:. ./.:4:131,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:210,67:.: 1.68:1.000:. ./.:4:168,51:.: 0.60:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:136,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,104:.: 0.01:1.000:. ./.:4:116,91:.: 0.38:1.000:. ./.:4:165,47:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,83:.:-0.47:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:161,51:.: 0.47:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:106,41:.:-0.73:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:78,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:111,37:.:-0.72:1.000:. ./.:4:185,61:.: 1.11:1.000:. ./.:4:172,57:.: 0.79:1.000:. ./.:4:186,49:.: 0.90:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:119,98:.: 0.57:1.000:. ./.:4:235,57:.: 1.96:1.000:. ./.:4:207,67:.: 1.63:1.000:. ./.:4:91,82:.:-0.25:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.55:1.000:. -chr1.1 26445102 chr1.1_026445102 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,128:.: 0.34:1.000:. ./.:4:358,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:351,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:182,220:.: 0.19:1.000:. ./.:4:351,134:.: 1.30:1.000:. ./.:4:334,121:.: 0.90:1.000:. ./.:4:213,69:.:-1.41:1.000:. ./.:4:399,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:320,100:.: 0.44:1.000:. ./.:4:60,110:.:-2.91:1.000:. ./.:4:123,167:.:-1.30:1.000:. ./.:4:277,100:.:-0.14:1.000:. ./.:4:384,6:.: 0.03:1.000:. ./.:4:433,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:284,102:.:-0.02:1.000:. ./.:4:330,127:.: 0.93:1.000:. ./.:4:345,124:.: 1.09:1.000:. ./.:4:307,120:.: 0.53:1.000:. ./.:4:527,12:.: 2.03:1.000:. ./.:4:227,276:.: 1.55:1.000:. ./.:4:202,33:.:-2.04:1.000:. ./.:4:275,88:.:-0.33:1.000:. ./.:4:481,9:.: 1.37:1.000:. ./.:4:270,111:.:-0.09:1.000:. ./.:4:118,97:.:-2.31:1.000:. ./.:4:359,171:.: 1.91:1.000:. ./.:4:236,255:.: 1.39:1.000:. ./.:4:359,7:.:-0.29:1.000:. ./.:4:346,151:.: 1.47:1.000:. ./.:4:295,115:.: 0.30:1.000:. ./.:4:370,115:.: 1.30:1.000:. ./.:4:282,97:.:-0.11:1.000:. ./.:4:83,80:.:-3.00:1.000:. ./.:4:124,97:.:-2.23:1.000:. ./.:3:70,29:.:-3.86:1.000:. ./.:4:369,100:.: 1.09:1.000:. ./.:4:209,217:.: 0.52:1.000:. ./.:4:327,122:.: 0.82:1.000:. ./.:4:393,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:256,270:.: 1.85:1.000:. ./.:4:176,216:.: 0.06:1.000:. ./.:4:341,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:177,232:.: 0.29:1.000:. ./.:4:174,212:.:-0.02:1.000:. ./.:4:298,150:.: 0.81:1.000:. ./.:4:385,21:.: 0.25:1.000:. ./.:4:313,137:.: 0.84:1.000:. ./.:4:296,175:.: 1.12:1.000:. ./.:4:165,202:.:-0.27:1.000:. ./.:4:473,21:.: 1.43:1.000:. ./.:4:210,108:.:-0.93:1.000:. ./.:4:199,224:.: 0.48:1.000:. ./.:4:246,106:.:-0.47:1.000:. ./.:4:373,11:.:-0.05:1.000:. ./.:4:350,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:298,106:.: 0.22:1.000:. ./.:4:272,99:.:-0.22:1.000:. ./.:4:185,259:.: 0.76:1.000:. ./.:4:229,127:.:-0.42:1.000:. ./.:6:210,61:.:-1.56:1.000:. ./.:4:272,135:.: 0.26:1.000:. ./.:4:245,107:.:-0.47:1.000:. ./.:4:461,42:.: 1.55:1.000:. ./.:4:290,132:.: 0.46:1.000:. ./.:4:273,124:.: 0.13:1.000:. ./.:4:236,125:.:-0.35:1.000:. ./.:4:134,152:.:-1.36:1.000:. ./.:4:357,22:.:-0.11:1.000:. ./.:4:275,111:.:-0.02:0.910:. ./.:4:238,76:.:-0.98:1.000:. ./.:4:348,124:.: 1.13:1.000:. ./.:4:170,217:.:-0.01:1.000:. ./.:4:411,23:.: 0.62:1.000:. ./.:4:281,91:.:-0.21:1.000:. ./.:4:255,114:.:-0.25:1.000:. ./.:4:216,106:.:-0.88:1.000:. ./.:4:281,127:.: 0.27:1.000:. ./.:4:374,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:377,27:.: 0.22:1.000:. ./.:4:214,206:.: 0.44:1.000:. ./.:4:236,104:.:-0.64:1.000:. ./.:4:187,246:.: 0.61:1.000:. ./.:4:222,239:.: 0.98:1.000:. ./.:4:226,104:.:-0.77:1.000:. ./.:4:284,136:.: 0.44:1.000:. ./.:4:215,228:.: 0.74:1.000:. ./.:4:123,153:.:-1.49:1.000:. ./.:4:169,187:.:-0.42:1.000:. ./.:4:151,215:.:-0.29:1.000:. ./.:4:262,110:.:-0.21:1.000:. ./.:4:231,114:.:-0.57:1.000:. ./.:4:156,192:.:-0.53:1.000:. ./.:4:282,112:.: 0.09:1.000:. ./.:4:305,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:386,31:.: 0.40:1.000:. ./.:4:297,123:.: 0.44:1.000:. ./.:4:233,96:.:-0.78:1.000:. ./.:4:268,104:.:-0.21:1.000:. ./.:4:393,37:.: 0.57:1.000:. ./.:4:185,216:.: 0.18:1.000:. ./.:4:211,199:.: 0.30:1.000:. ./.:4:295,138:.: 0.61:1.000:. ./.:4:226,85:.:-1.02:1.000:. ./.:4:179,216:.: 0.10:1.000:. ./.:4:216,105:.:-0.89:1.000:. ./.:4:244,106:.:-0.50:1.000:. ./.:4:243,116:.:-0.38:1.000:. ./.:4:287,104:.: 0.05:1.000:. ./.:4:345,148:.: 1.41:1.000:. ./.:4:263,93:.:-0.42:1.000:. ./.:4:245,116:.:-0.35:1.000:. ./.:4:540,4:.: 2.09:1.000:. ./.:4:244,105:.:-0.51:0.999:. ./.:4:348,142:.: 1.37:1.000:. ./.:3:230,20:.:-1.84:1.000:. ./.:4:325,119:.: 0.76:1.000:. ./.:4:358,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:154,220:.:-0.18:1.000:. ./.:4:263,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:164,183:.:-0.54:1.000:. ./.:4:236,95:.:-0.76:1.000:. ./.:4:286,145:.: 0.58:1.000:. ./.:4:400,21:.: 0.45:1.000:. ./.:4:244,100:.:-0.58:1.000:. ./.:4:230,120:.:-0.50:1.000:. ./.:4:206,215:.: 0.45:1.000:. ./.:6:255,193:.: 0.81:0.556:. ./.:4:325,10:.:-0.70:1.000:. ./.:4:278,26:.:-1.12:1.000:. ./.:4:259,17:.:-1.49:1.000:. ./.:4:143,173:.:-0.96:1.000:. ./.:4:374,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:225,20:.:-1.91:1.000:. ./.:4:198,194:.: 0.06:1.000:. ./.:4:330,10:.:-0.64:1.000:. ./.:4:420,176:.: 2.79:1.000:. ./.:4:302,109:.: 0.31:1.000:. ./.:4:224,82:.:-1.09:1.000:. ./.:4:206,85:.:-1.29:1.000:. ./.:4:313,25:.:-0.66:1.000:. ./.:4:233,230:.: 1.01:1.000:. ./.:4:254,124:.:-0.13:1.000:. ./.:4:271,93:.:-0.31:1.000:. ./.:4:213,93:.:-1.09:1.000:. ./.:4:264,246:.: 1.64:1.000:. ./.:4:464,14:.: 1.21:1.000:. ./.:4:333,129:.: 1.00:1.000:. ./.:4:166,216:.:-0.07:1.000:. ./.:4:201,260:.: 0.98:1.000:. ./.:4:231,93:.:-0.85:1.000:. ./.:4:424,6:.: 0.57:1.000:. ./.:4:282,94:.:-0.15:1.000:. ./.:4:160,17:.:-2.82:1.000:. ./.:4:238,82:.:-0.90:1.000:. ./.:4:291,137:.: 0.54:1.000:. ./.:4:288,124:.: 0.33:1.000:. ./.:4:487,8:.: 1.44:1.000:. ./.:4:441,9:.: 0.84:1.000:. ./.:4:312,5:.:-0.94:1.000:. ./.:4:312,138:.: 0.84:1.000:. ./.:4:304,100:.: 0.22:1.000:. ./.:4:230,81:.:-1.02:1.000:. ./.:4:193,193:.:-0.02:1.000:. ./.:4:270,89:.:-0.38:1.000:. ./.:4:189,189:.:-0.13:1.000:. ./.:4:364,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:163,174:.:-0.68:1.000:. ./.:4:380,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:361,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:404,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:241,73:.:-0.98:1.000:. ./.:4:236,85:.:-0.89:1.000:. ./.:4:350,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:258,105:.:-0.33:1.000:. ./.:4:370,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:158,170:.:-0.80:1.000:. ./.:4:284,259:.: 2.08:1.000:. ./.:4:205,244:.: 0.82:1.000:. ./.:4:289,122:.: 0.31:1.000:. ./.:4:310,93:.: 0.21:1.000:. ./.:4:210,205:.: 0.37:1.000:. ./.:4:351,143:.: 1.43:1.000:. ./.:4:250,263:.: 1.68:1.000:. ./.:4:295,105:.: 0.17:1.000:. ./.:4:306,116:.: 0.46:1.000:. -chr1.1 26502181 chr1.1_026502181 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:213,68:.: 1.34:1.000:. ./.:4:72,91:.:-0.73:1.000:. ./.:4:142,60:.:-0.05:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:332,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:162,65:.: 0.39:1.000:. ./.:4:104,49:.:-0.91:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:124,59:.:-0.38:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:87,120:.: 0.04:1.000:. ./.:4:170,61:.: 0.46:1.000:. ./.:4:190,65:.: 0.88:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:128,150:.: 1.29:1.000:. ./.:4:230,74:.: 1.75:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:21,14:.:-2.98:1.000:. ./.:4:168,72:.: 0.62:1.000:. ./.:4:199,81:.: 1.32:1.000:. ./.:4:120,48:.:-0.65:1.000:. ./.:4:12,8:.:-3.25:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:125,43:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,5:.:-3.44:1.000:. ./.:4:53,28:.:-2.17:1.000:. ./.:3:13,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:134,65:.:-0.10:1.000:. ./.:4:151,60:.: 0.11:1.000:. ./.:4:141,62:.:-0.03:1.000:. ./.:4:145,55:.:-0.08:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:152,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:170,66:.: 0.55:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:178,69:.: 0.74:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:219,75:.: 1.57:1.000:. ./.:4:16,6:.:-3.21:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:83,49:.:-1.28:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:211,76:.: 1.45:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:184,90:.: 1.22:1.000:. ./.:4:191,53:.: 0.69:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.24:1.000:. ./.:6:99,50:.:-0.98:1.000:. ./.:4:151,68:.: 0.25:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:134,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:143,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:269,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:91,52:.:-1.08:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,69:.: 0.29:0.910:. ./.:4:103,122:.: 0.36:1.000:. ./.:4:214,75:.: 1.48:1.000:. ./.:4:97,49:.:-1.03:1.000:. ./.:4:102,126:.: 0.41:1.000:. ./.:4:183,75:.: 0.94:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:112,62:.:-0.54:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:137,83:.: 0.27:1.000:. ./.:4:151,69:.: 0.27:1.000:. ./.:4:159,67:.: 0.37:1.000:. ./.:4:90,87:.:-0.49:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:164,55:.: 0.25:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:165,69:.: 0.51:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:139,47:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:148,58:.: 0.02:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:146,64:.: 0.09:1.000:. ./.:4:148,60:.: 0.06:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:127,54:.:-0.42:1.000:. ./.:4:121,55:.:-0.50:1.000:. ./.:4:153,74:.: 0.39:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:141,57:.:-0.12:1.000:. ./.:4:186,85:.: 1.17:1.000:. ./.:4:96,44:.:-1.14:1.000:. ./.:4:190,73:.: 1.02:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,59:.:-0.01:1.000:. ./.:4:144,67:.: 0.11:1.000:. ./.:4:324,1:.: 2.11:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:181,87:.: 1.11:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:248,0:.: 0.76:1.000:. ./.:3:88,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:194,80:.: 1.22:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:145,63:.: 0.06:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:211,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:176,68:.: 0.69:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:154,87:.: 0.64:1.000:. ./.:4:183,57:.: 0.62:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.37:1.000:. ./.:6:265,0:.: 1.06:0.556:. ./.:4:127,49:.:-0.50:1.000:. ./.:4:105,54:.:-0.80:1.000:. ./.:4:104,44:.:-1.00:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:141,53:.:-0.19:1.000:. ./.:4:109,37:.:-1.03:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:169,67:.: 0.55:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:233,2:.: 0.53:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:152,60:.: 0.13:1.000:. ./.:4:147,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:157,49:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,62:.: 0.16:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.77:1.000:. ./.:4:231,80:.: 1.87:1.000:. ./.:4:286,80:.: 2.84:1.000:. ./.:4:165,62:.: 0.39:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:170,86:.: 0.90:1.000:. ./.:4:142,73:.: 0.18:1.000:. ./.:4:167,61:.: 0.41:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,12:.:-2.77:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:158,70:.: 0.41:1.000:. ./.:4:183,65:.: 0.76:1.000:. ./.:4:218,76:.: 1.57:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:197,64:.: 0.99:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:142,64:.: 0.02:1.000:. ./.:4:143,59:.:-0.05:1.000:. ./.:4:143,53:.:-0.15:1.000:. ./.:4:140,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:155,69:.: 0.34:1.000:. ./.:4:138,66:.:-0.01:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:190,73:.: 1.02:1.000:. ./.:4:138,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:126,41:.:-0.66:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:180,56:.: 0.55:1.000:. ./.:4:158,54:.: 0.13:1.000:. ./.:4:167,50:.: 0.22:1.000:. ./.:4:216,15:.: 0.46:1.000:. ./.:4:178,59:.: 0.57:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:192,76:.: 1.11:1.000:. ./.:4:123,46:.:-0.63:1.000:. ./.:4:191,70:.: 0.99:1.000:. -chr1.1 26672067 chr1.1_026672067 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:50,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:72,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:16,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.65:0.910:. ./.:4:48,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:44,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:3:25,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:6:31,0:.:-0.09:0.556:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:71,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:71,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. -chr1.1 26865008 chr1.1_026865008 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:38,15:0.32: 1.48:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,21:0.38: 1.87:1.000:0.584 0/0/0/1:4:44,16:0.30: 1.94:1.000:0.984 0/0/1/1:4:22,24:0.52: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:40,4:0.11: 0.88:1.000:0.561 0/0/0/0:4:18,1:0.06:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,18:0.36: 1.61:1.000:0.739 0/0/0/0:4:30,1:0.04: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,2:0.06: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,32:0.47: 2.60:1.000:0.993 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,22:0.53: 0.62:1.000:0.992 0/0/0/0:4:22,1:0.05:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,4:0.17:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.51:-1.77:1.000:0.997 0/0/0/0:4:30,1:0.04: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.11:-0.64:1.000:0.601 0/0/0/0:4:20,1:0.06:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.24:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,15:0.46: 0.22:1.000:0.986 0/0/1/1:4:26,14:0.38: 0.62:1.000:0.514 0/0/1/1:4:19,20:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,25:0.43: 2.01:1.000:0.945 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,21:0.45: 1.21:1.000:0.976 0/0/0/0:4:24,1:0.05:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.59:-1.84:1.000:0.881 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.84:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:25,18:0.44: 0.81:1.000:0.962 0/0/0/0:4:27,1:0.04:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,1:0.05:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,2:0.14:-0.91:1.000:0.969 0/0/0/0:4:25,1:0.05:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,13:0.36: 0.55:1.000:0.678 0/0/0/1:4:18,9:0.36:-0.25:1.000:0.678 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,11:0.34: 0.28:1.000:0.843 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,7:0.43:-0.91:1.000:0.949 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,13:0.37: 0.48:1.000:0.580 0/0/1/1:4:21,15:0.44: 0.35:1.000:0.959 0/0/0/1:4:19,2:0.11:-0.64:1.000:0.601 0/0/0/1:4:23,9:0.31: 0.09:1.000:0.966 0/0/1/1:4:24,17:0.43: 0.68:1.000:0.955 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,11:0.38: 0.02:1.000:0.571 0/0/0/0/1/1:6:10,4:0.32:-1.11:1.000:0.914 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,1:0.04:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,12:0.40: 0.09:1.000:0.775 0/0/0/1:4:36,13:0.30: 1.21:1.000:0.985 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.35: 0.42:1.000:0.765 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.25:0.910:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,1:0.03: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,12:0.38: 0.22:1.000:0.549 0/0/0/0:4:13,1:0.09:-1.11:1.000:0.973 0/0/0/1:4:34,9:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:25,1:0.05:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,13:0.36: 0.55:1.000:0.678 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,21:0.42: 1.48:1.000:0.902 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,1:0.11:-1.31:1.000:0.561 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,2:0.10:-0.44:1.000:0.811 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,2:0.09:-0.25:1.000:0.956 0/0/1/1:4:22,14:0.41: 0.35:1.000:0.868 0/0/0/1:4:33,15:0.34: 1.15:1.000:0.854 0/0/1/1:4:28,19:0.42: 1.08:1.000:0.930 0/0/0/0:4:12,1:0.09:-1.17:1.000:0.929 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.29:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,1:0.06:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,2:0.09:-0.18:1.000:0.973 0/0/1/1:4:15,18:0.53: 0.15:1.000:0.993 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.33:-0.25:1.000:0.929 0/0/0/0:4:29,2:0.08: 0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,22:0.41: 1.74:1.000:0.851 0/0/1/1:4:38,30:0.46: 2.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:23,22:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,31:0.50: 2.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.97:0.999:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.47:-0.58:1.000:0.992 0/0/1:3:10,8:0.46:-0.84:1.000:0.934 0/0/1/1:4:20,15:0.45: 0.28:1.000:0.976 0/0/1/1:4:12,7:0.39:-0.78:1.000:0.717 0/0/0/0:4:19,1:0.06:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,16:0.42: 0.62:1.000:0.916 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/0:4:24,1:0.05:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,27:0.38: 3.00:1.000:0.576 0/0/0/1:4:24,11:0.34: 0.28:1.000:0.843 0/0/1/1:4:9,16:0.57:-0.38:1.000:0.936 0/0/0/0/1/1:6:40,12:0.27: 1.41:0.556:0.676 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,1:0.07:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,8:0.37:-0.51:1.000:0.512 0/0/1/1:4:15,13:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:44,23:0.37: 2.41:1.000:0.566 0/0/0/0:4:19,1:0.06:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,15:0.59:-0.58:1.000:0.835 0/0/0/1:4:29,11:0.31: 0.62:1.000:0.975 0/0/1/1:4:38,26:0.43: 2.21:1.000:0.936 0/0/0/1:4:34,15:0.34: 1.21:1.000:0.889 0/0/1/1:4:16,15:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,2:0.13:-0.78:1.000:0.862 0/0/0/1:4:18,2:0.12:-0.71:1.000:0.750 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,18:0.41: 1.08:1.000:0.833 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,3:0.08: 1.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,18:0.40: 1.15:1.000:0.775 0/0/1/1:4:35,29:0.47: 2.21:1.000:0.991 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,1:0.03: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,17:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,27:0.49: 1.68:1.000:0.997 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.24:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,4:0.08: 1.74:1.000:0.979 0/0/1/1:4:30,31:0.51: 2.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,20:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,22:0.46: 1.21:1.000:0.990 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,20:0.38: 1.68:1.000:0.598 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,2:0.09:-0.18:1.000:0.973 0/0/1/1:4:17,10:0.39:-0.25:1.000:0.735 0/0/0/1:4:27,3:0.12:-0.05:1.000:0.750 0/0/0/0:4:27,1:0.04:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,2:0.10:-0.38:1.000:0.883 0/0/0/0:4:24,1:0.05:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,16:0.40: 0.75:1.000:0.819 0/0/1/1:4:17,21:0.53: 0.48:1.000:0.992 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,2:0.08: 0.02:1.000:0.993 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,6:0.12: 1.94:1.000:0.750 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,4:0.09: 1.41:1.000:0.929 0/0/0/1:4:37,8:0.21: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,2:0.11:-0.58:1.000:0.561 0/0/1/1:4:18,16:0.48: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:55,1:0.02: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.11:-0.64:1.000:0.601 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.11:1.000:1.000 -chr1.1 26940687 chr1.1_026940687 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:192,66:.: 0.92:1.000:. ./.:4:90,90:.:-0.72:1.000:. ./.:4:165,44:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:198,73:.: 1.19:1.000:. ./.:4:164,73:.: 0.48:1.000:. ./.:4:105,45:.:-1.35:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:191,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:109,42:.:-1.33:1.000:. ./.:4:115,110:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,62:.:-0.53:1.000:. ./.:4:194,62:.: 0.88:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:157,69:.: 0.25:1.000:. ./.:4:168,71:.: 0.52:1.000:. ./.:4:140,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:106,149:.: 0.85:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:46,42:.:-2.65:1.000:. ./.:4:128,49:.:-0.78:1.000:. ./.:4:82,120:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,110:.:-0.28:1.000:. ./.:4:36,17:.:-3.39:1.000:. ./.:4:194,66:.: 0.96:1.000:. ./.:4:172,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:144,63:.:-0.15:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:184,61:.: 0.64:1.000:. ./.:4:40,7:.:-3.51:1.000:. ./.:4:93,38:.:-1.75:1.000:. ./.:3:33,1:.:-3.78:1.000:. ./.:4:221,71:.: 1.63:1.000:. ./.:4:113,119:.: 0.37:1.000:. ./.:4:113,124:.: 0.48:1.000:. ./.:4:97,127:.: 0.20:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:132,114:.: 0.67:1.000:. ./.:4:71,115:.:-0.59:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:205,56:.: 0.98:1.000:. ./.:4:188,62:.: 0.75:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:90,106:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,160:.: 0.20:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:200,58:.: 0.92:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,141:.: 1.02:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:118,118:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,124:.:-0.26:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:185,47:.: 0.37:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:207,68:.: 1.27:1.000:. ./.:6:109,106:.: 0.01:1.000:. ./.:4:141,104:.: 0.64:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,155:.: 0.37:1.000:. ./.:4:142,50:.:-0.47:1.000:. ./.:4:161,59:.: 0.12:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:129,43:.:-0.89:1.000:. ./.:4:144,64:.:-0.13:1.000:. ./.:4:138,64:.:-0.26:0.910:. ./.:4:119,91:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,155:.: 0.50:1.000:. ./.:4:103,91:.:-0.43:1.000:. ./.:4:112,118:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,107:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:139,95:.: 0.41:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,100:.:-0.83:1.000:. ./.:4:175,59:.: 0.41:1.000:. ./.:4:217,62:.: 1.36:1.000:. ./.:4:111,70:.:-0.70:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:156,55:.:-0.07:1.000:. ./.:4:148,64:.:-0.05:1.000:. ./.:4:139,138:.: 1.32:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.47:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:166,52:.: 0.08:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:171,58:.: 0.31:1.000:. ./.:4:82,127:.:-0.11:1.000:. ./.:4:151,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:76,109:.:-0.62:1.000:. ./.:4:134,57:.:-0.49:1.000:. ./.:4:121,150:.: 1.19:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:150,38:.:-0.55:1.000:. ./.:4:169,62:.: 0.35:1.000:. ./.:4:132,44:.:-0.80:1.000:. ./.:4:216,63:.: 1.36:1.000:. ./.:4:140,51:.:-0.49:1.000:. ./.:4:148,60:.:-0.13:1.000:. ./.:4:167,47:.:-0.01:1.000:. ./.:4:161,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:188,172:.: 3.06:1.000:. ./.:4:153,59:.:-0.05:0.999:. ./.:4:160,63:.: 0.18:1.000:. ./.:3:98,43:.:-1.54:1.000:. ./.:4:108,133:.: 0.56:1.000:. ./.:4:120,58:.:-0.76:1.000:. ./.:4:193,58:.: 0.77:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:114,104:.: 0.08:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:145,69:.:-0.01:1.000:. ./.:4:186,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:215,64:.: 1.36:1.000:. ./.:6:342,0:.: 2.68:0.556:. ./.:4:96,49:.:-1.45:1.000:. ./.:4:97,54:.:-1.33:1.000:. ./.:4:96,96:.:-0.47:1.000:. ./.:4:156,63:.: 0.10:1.000:. ./.:4:175,55:.: 0.33:1.000:. ./.:4:47,77:.:-1.90:1.000:. ./.:4:161,46:.:-0.15:1.000:. ./.:4:150,57:.:-0.15:1.000:. ./.:4:244,64:.: 1.97:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:163,68:.: 0.35:1.000:. ./.:4:175,43:.: 0.08:1.000:. ./.:4:87,141:.: 0.29:1.000:. ./.:4:198,66:.: 1.04:1.000:. ./.:4:100,124:.: 0.20:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:163,35:.:-0.34:1.000:. ./.:4:228,77:.: 1.90:1.000:. ./.:4:141,124:.: 1.06:1.000:. ./.:4:170,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:216,76:.: 1.63:1.000:. ./.:4:96,121:.: 0.06:1.000:. ./.:4:156,133:.: 1.57:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:55,70:.:-1.87:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:86,130:.: 0.04:1.000:. ./.:4:174,50:.: 0.20:1.000:. ./.:4:148,123:.: 1.19:1.000:. ./.:4:143,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:117,49:.:-1.01:1.000:. ./.:4:132,70:.:-0.26:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,111:.:-0.41:1.000:. ./.:4:197,70:.: 1.11:1.000:. ./.:4:97,120:.: 0.06:1.000:. ./.:4:122,104:.: 0.25:1.000:. ./.:4:119,61:.:-0.72:1.000:. ./.:4:105,106:.:-0.07:1.000:. ./.:4:120,54:.:-0.85:1.000:. ./.:4:91,100:.:-0.49:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:179,66:.: 0.64:1.000:. ./.:4:80,92:.:-0.89:1.000:. ./.:4:116,51:.:-0.99:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:240,55:.: 1.69:1.000:. ./.:4:220,64:.: 1.46:1.000:. ./.:4:153,54:.:-0.15:1.000:. ./.:4:201,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:131,111:.: 0.58:1.000:. ./.:4:228,79:.: 1.95:1.000:. ./.:4:212,68:.: 1.38:1.000:. ./.:4:79,107:.:-0.59:1.000:. ./.:4:115,49:.:-1.06:1.000:. -chr1.1 27050989 chr1.1_027050989 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:187,47:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,80:.:-0.64:1.000:. ./.:4:166,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:237,68:.: 1.69:1.000:. ./.:4:203,53:.: 0.81:1.000:. ./.:4:144,34:.:-0.60:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:160,36:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:39,22:.:-2.71:1.000:. ./.:4:110,95:.:-0.11:1.000:. ./.:4:186,50:.: 0.44:1.000:. ./.:4:237,51:.: 1.38:1.000:. ./.:4:232,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:188,39:.: 0.28:1.000:. ./.:4:202,53:.: 0.79:1.000:. ./.:4:224,69:.: 1.47:1.000:. ./.:4:155,103:.: 0.84:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:42,28:.:-2.55:1.000:. ./.:4:182,54:.: 0.44:1.000:. ./.:4:202,128:.: 2.14:1.000:. ./.:4:115,96:.:-0.01:1.000:. ./.:4:48,4:.:-2.87:1.000:. ./.:4:151,48:.:-0.22:1.000:. ./.:4:178,34:.: 0.01:1.000:. ./.:4:166,34:.:-0.20:1.000:. ./.:4:323,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:209,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:122,48:.:-0.74:1.000:. ./.:4:48,7:.:-2.82:1.000:. ./.:4:69,30:.:-2.02:1.000:. ./.:3:26,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:182,58:.: 0.52:1.000:. ./.:4:117,88:.:-0.11:1.000:. ./.:4:120,117:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,75:.:-1.12:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,77:.:-0.74:1.000:. ./.:4:112,109:.: 0.17:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:134,39:.:-0.69:1.000:. ./.:4:184,49:.: 0.39:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:170,119:.: 1.40:1.000:. ./.:4:9,8:.:-3.50:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:56,35:.:-2.17:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:141,118:.: 0.86:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:109,99:.:-0.06:1.000:. ./.:4:140,99:.: 0.50:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:175,47:.: 0.19:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:116,48:.:-0.85:1.000:. ./.:6:90,91:.:-0.55:1.000:. ./.:4:120,107:.: 0.28:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:119,85:.:-0.13:1.000:. ./.:4:126,32:.:-0.96:1.000:. ./.:4:183,72:.: 0.79:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:146,36:.:-0.53:1.000:. ./.:4:165,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:126,45:.:-0.73:0.910:. ./.:4:101,87:.:-0.42:1.000:. ./.:4:116,109:.: 0.25:1.000:. ./.:4:97,84:.:-0.55:1.000:. ./.:4:96,67:.:-0.87:1.000:. ./.:4:151,123:.: 1.13:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:101,103:.:-0.13:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:143,114:.: 0.82:1.000:. ./.:4:132,53:.:-0.47:1.000:. ./.:4:186,38:.: 0.23:1.000:. ./.:4:69,84:.:-1.05:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:154,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:92,39:.:-1.45:1.000:. ./.:4:123,117:.: 0.52:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:165,45:.:-0.02:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,52:.:-0.19:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:138,41:.:-0.58:1.000:. ./.:4:139,105:.: 0.59:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:96,97:.:-0.33:1.000:. ./.:4:143,39:.:-0.53:1.000:. ./.:4:128,86:.: 0.05:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:203,44:.: 0.64:1.000:. ./.:4:184,72:.: 0.81:1.000:. ./.:4:124,36:.:-0.93:1.000:. ./.:4:183,51:.: 0.41:1.000:. ./.:4:130,48:.:-0.60:1.000:. ./.:4:152,46:.:-0.24:1.000:. ./.:4:152,42:.:-0.31:1.000:. ./.:4:185,44:.: 0.32:1.000:. ./.:4:342,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:135,102:.: 0.46:1.000:. ./.:4:170,68:.: 0.48:0.999:. ./.:4:179,39:.: 0.12:1.000:. ./.:3:63,23:.:-2.26:1.000:. ./.:4:132,114:.: 0.62:1.000:. ./.:4:161,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:125,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:112,108:.: 0.16:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:178,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:193,57:.: 0.70:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:180,53:.: 0.39:1.000:. ./.:6:266,0:.: 0.99:0.556:. ./.:4:99,36:.:-1.38:1.000:. ./.:4:124,38:.:-0.89:1.000:. ./.:4:91,59:.:-1.11:1.000:. ./.:4:137,47:.:-0.49:1.000:. ./.:4:172,50:.: 0.19:1.000:. ./.:4:72,76:.:-1.14:1.000:. ./.:4:174,45:.: 0.14:1.000:. ./.:4:188,39:.: 0.28:1.000:. ./.:4:230,71:.: 1.62:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:171,52:.: 0.21:1.000:. ./.:4:144,40:.:-0.49:1.000:. ./.:4:111,89:.:-0.20:1.000:. ./.:4:175,52:.: 0.28:1.000:. ./.:4:109,88:.:-0.26:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:132,45:.:-0.62:1.000:. ./.:4:242,51:.: 1.47:1.000:. ./.:4:179,161:.: 2.32:1.000:. ./.:4:221,70:.: 1.44:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:209,53:.: 0.91:1.000:. ./.:4:94,83:.:-0.62:1.000:. ./.:4:152,118:.: 1.06:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,21:.:-2.76:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:143,111:.: 0.77:1.000:. ./.:4:240,61:.: 1.62:1.000:. ./.:4:170,152:.: 1.99:1.000:. ./.:4:188,57:.: 0.61:1.000:. ./.:4:167,39:.:-0.10:1.000:. ./.:4:216,53:.: 1.04:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:136,93:.: 0.32:1.000:. ./.:4:152,41:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,113:.: 0.39:1.000:. ./.:4:119,101:.: 0.16:1.000:. ./.:4:181,48:.: 0.32:1.000:. ./.:4:111,93:.:-0.13:1.000:. ./.:4:193,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:103,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:157,53:.:-0.02:1.000:. ./.:4:118,97:.: 0.07:1.000:. ./.:4:125,40:.:-0.83:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:202,56:.: 0.84:1.000:. ./.:4:209,64:.: 1.11:1.000:. ./.:4:189,50:.: 0.50:1.000:. ./.:4:225,14:.: 0.50:1.000:. ./.:4:134,116:.: 0.70:1.000:. ./.:4:220,74:.: 1.49:1.000:. ./.:4:250,67:.: 1.90:1.000:. ./.:4:101,92:.:-0.33:1.000:. ./.:4:191,43:.: 0.41:1.000:. -chr1.1 27377103 chr1.1_027377103 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:39,35:0.47: 2.03:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,51:0.74: 1.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,25:0.67:-0.36:1.000:0.912 0/0/0/1:4:37,12:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,14:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,18:0.25: 1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,10:0.37:-0.92:1.000:0.591 0/0/0/1:4:23,12:0.32:-0.36:1.000:0.953 0/0/1/1:4:17,15:0.46:-0.55:1.000:0.990 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,14:0.66:-1.28:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,17:0.47:-0.30:1.000:0.992 0/1/1/1:4:13,35:0.68: 0.43:1.000:0.953 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,22:0.32: 1.48:1.000:0.965 0/0/0/1:4:49,12:0.17: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,24:0.42: 0.92:1.000:0.907 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.53:-1.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,13:0.30:-0.06:1.000:0.985 0/0/0/1:4:26,13:0.31:-0.12:1.000:0.975 0/0/0/1:4:44,15:0.23: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.11:-2.02:1.000:0.515 0/0/0/1:4:36,10:0.19: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,15:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,11:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,21:0.37: 0.80:1.000:0.526 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,15:0.38:-0.18:1.000:0.563 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-0.79:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-2.02:1.000:0.997 0/0/0:3:4,0:0.00:-2.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,22:0.44: 0.49:1.000:0.970 0/0/0/1:4:30,17:0.34: 0.37:1.000:0.858 0/0/0/1:4:25,12:0.30:-0.24:1.000:0.986 0/0/1/1:4:23,15:0.38:-0.18:1.000:0.563 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,15:0.31: 0.25:1.000:0.975 0/0/1/1:4:22,19:0.46: 0.00:1.000:0.986 0/0/1/1:4:28,19:0.39: 0.37:1.000:0.696 0/0/0/1:4:28,13:0.29: 0.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,16:0.33: 0.25:1.000:0.900 0/0/1/1:4:17,16:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,19:0.25: 1.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,10:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.43:-0.98:1.000:0.950 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,22:0.34: 1.23:1.000:0.866 0/0/0/1:4:25,13:0.32:-0.18:1.000:0.956 0/0/1/1:4:23,27:0.53: 0.56:1.000:0.992 0/0/0/1:4:41,9:0.16: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,12:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,9:0.22:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:17,9:0.32:-0.92:1.000:0.919 0/0/1/1:4:18,21:0.53:-0.12:1.000:0.992 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,15:0.31: 0.25:1.000:0.975 0/0/0/1:4:29,13:0.28: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,11:0.18: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,5:0.12:-0.24:1.000:0.761 0/0/1/1:4:16,13:0.44:-0.73:1.000:0.968 0/0/0/1:4:27,17:0.37: 0.19:1.000:0.565 0/0/0/1:4:22,11:0.31:-0.49:0.910:0.975 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,16:0.22: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,9:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,56:0.76: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,10:0.16: 0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,26:0.69:-0.36:1.000:0.974 0/0/0/1:4:14,4:0.20:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.33:-1.28:1.000:0.928 0/0/0/1:4:29,10:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,23:0.62:-0.36:1.000:0.527 0/0/1/1:4:29,20:0.39: 0.49:1.000:0.743 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,18:0.38: 0.31:1.000:0.511 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,32:0.60: 0.62:1.000:0.791 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,25:0.30: 2.15:1.000:0.981 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,18:0.37: 0.37:1.000:0.615 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,13:0.59:-1.22:1.000:0.842 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,12:0.40:-0.73:1.000:0.802 0/0/0/1:4:40,19:0.30: 1.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:9,12:0.56:-1.22:1.000:0.973 0/0/1/1:4:15,22:0.57:-0.24:1.000:0.935 0/0/0/1:4:30,15:0.31: 0.25:1.000:0.975 0/0/0/1:4:37,16:0.27: 0.74:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,24:0.89:-0.92:1.000:0.639 0/0/1/1:4:26,30:0.53: 0.92:1.000:0.993 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,19:0.46: 0.00:1.000:0.986 0/0/1/1:4:16,13:0.44:-0.73:1.000:0.968 0/0/1/1:4:20,27:0.56: 0.37:1.000:0.970 0/0/1/1:4:15,18:0.54:-0.49:1.000:0.990 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,34:0.57: 1.05:1.000:0.952 0/0/1/1:4:20,21:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,20:0.56:-0.36:1.000:0.973 0/0/0/1:4:30,11:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,21:0.41: 0.56:1.000:0.854 0/0/1/1:4:26,44:0.60: 1.78:1.000:0.784 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.19:0.999:1.000 0/0/0/1:4:38,9:0.17: 0.37:1.000:0.998 0/0/1:3:18,6:0.22:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,34:0.40: 2.52:1.000:0.810 0/0/1/1:4:22,19:0.46: 0.00:1.000:0.986 0/0/0/1:4:30,7:0.17:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,16:0.33: 0.25:1.000:0.900 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,17:0.44:-0.18:1.000:0.967 0/0/0/1:4:28,12:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,12:0.30:-0.24:1.000:0.986 0/0/1/1:4:31,33:0.51: 1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,7:0.40:-1.47:1.000:0.782 0/0/0/1:4:41,17:0.26: 1.05:1.000:0.998 0/0/0/0/0/1:6:34,12:0.23: 0.31:0.556:0.717 0/1/1/1:4:7,19:0.68:-0.92:1.000:0.956 0/0/1/1:4:12,9:0.42:-1.22:1.000:0.907 0/0/1/1:4:15,23:0.58:-0.18:1.000:0.903 0/0/0/1:4:38,15:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,27:0.70:-0.30:1.000:0.981 0/0/0/1:4:23,7:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,12:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,29:0.66: 0.00:1.000:0.885 0/0/1/1:4:23,20:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/0/0/1:4:29,14:0.30: 0.13:1.000:0.985 0/0/1/1:4:24,16:0.39:-0.06:1.000:0.639 0/0/1/1:4:10,13:0.55:-1.10:1.000:0.979 0/0/0/1:4:31,9:0.20:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,11:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,12:0.20: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,13:0.59:-1.22:1.000:0.842 0/0/0/1:4:46,20:0.27: 1.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,52:0.51: 3.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,29:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,20:0.39: 0.56:1.000:0.639 0/0/1/1:4:23,33:0.57: 0.92:1.000:0.947 0/0/1/1:4:31,55:0.61: 2.76:1.000:0.698 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.22:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,17:0.22: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,13:0.62:-1.28:1.000:0.600 0/0/1/1:4:25,33:0.55: 1.05:1.000:0.975 0/0/0/1:4:48,18:0.24: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,15:0.35: 0.00:1.000:0.823 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,11:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,13:0.18: 1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,19:0.35: 0.68:1.000:0.827 0/0/0/1:4:34,9:0.19: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,10:0.21: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,45:0.69: 1.23:1.000:0.968 0/0/0/1:4:30,13:0.27: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,13:0.41:-0.61:1.000:0.849 0/0/1/1:4:21,18:0.46:-0.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:14,11:0.43:-0.98:1.000:0.950 0/1/1/1:4:8,35:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,18:0.29: 0.98:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,10:0.63:-1.59:1.000:0.573 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,17:0.32: 0.49:1.000:0.940 0/0/0/1:4:39,15:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,20:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/0/0/0:4:21,2:0.08:-1.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:43,26:0.36: 1.72:1.000:0.701 0/0/0/1:4:34,16:0.29: 0.56:1.000:0.990 0/0/0/1:4:47,28:0.35: 2.09:1.000:0.744 0/0/0/1:4:46,11:0.17: 0.98:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,20:0.67:-0.79:1.000:0.912 -chr1.1 27461652 chr1.1_027461652 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:116,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:128,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:204,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.48:1.000:. ./.:3:14,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:72,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.20:0.910:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:109,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:173,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:152,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:100,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.32:0.999:. ./.:4:140,0:.: 0.64:1.000:. ./.:3:56,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.55:1.000:. ./.:6:149,0:.: 0.87:0.556:. ./.:4:62,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:176,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:78,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.29:1.000:. -chr1.1 27966972 chr1.1_027966972 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:73,164:.: 0.22:1.000:. ./.:4:54,197:.: 0.41:1.000:. ./.:4:78,167:.: 0.33:1.000:. ./.:4:79,219:.: 1.02:1.000:. ./.:4:86,142:.: 0.10:1.000:. ./.:4:80,217:.: 1.01:1.000:. ./.:4:37,121:.:-0.82:1.000:. ./.:4:82,203:.: 0.85:1.000:. ./.:4:70,147:.:-0.04:1.000:. ./.:4:7,4:.:-2.75:1.000:. ./.:4:9,9:.:-2.66:1.000:. ./.:4:27,140:.:-0.70:1.000:. ./.:4:52,218:.: 0.66:1.000:. ./.:4:64,192:.: 0.47:1.000:. ./.:4:91,176:.: 0.62:1.000:. ./.:4:72,196:.: 0.63:1.000:. ./.:4:67,154:.: 0.01:1.000:. ./.:4:85,128:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,207:.: 0.60:1.000:. ./.:4:89,199:.: 0.89:1.000:. ./.:4:3,16:.:-2.65:1.000:. ./.:4:77,243:.: 1.31:1.000:. ./.:4:56,196:.: 0.42:1.000:. ./.:4:31,145:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.79:1.000:. ./.:4:87,257:.: 1.63:1.000:. ./.:4:72,199:.: 0.67:1.000:. ./.:4:52,129:.:-0.51:1.000:. ./.:4:79,177:.: 0.47:1.000:. ./.:4:100,217:.: 1.27:1.000:. ./.:4:137,283:.: 2.63:1.000:. ./.:4:67,233:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,4:.:-2.80:1.000:. ./.:4:12,14:.:-2.55:1.000:. ./.:3:0,3:.:-2.86:1.000:. ./.:4:80,174:.: 0.45:1.000:. ./.:4:49,250:.: 1.04:1.000:. ./.:4:45,178:.: 0.04:1.000:. ./.:4:62,265:.: 1.41:1.000:. ./.:4:110,241:.: 1.72:1.000:. ./.:4:28,154:.:-0.50:1.000:. ./.:4:44,150:.:-0.34:1.000:. ./.:4:80,184:.: 0.58:1.000:. ./.:4:53,167:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,110:.:-0.98:1.000:. ./.:4:71,231:.: 1.08:1.000:. ./.:4:31,117:.:-0.95:1.000:. ./.:4:6,31:.:-2.41:1.000:. ./.:4:93,152:.: 0.33:1.000:. ./.:4:59,121:.:-0.53:1.000:. ./.:4:62,110:.:-0.63:1.000:. ./.:4:57,254:.: 1.19:1.000:. ./.:4:72,95:.:-0.70:1.000:. ./.:4:38,241:.: 0.77:1.000:. ./.:4:41,159:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,206:.: 1.01:1.000:. ./.:4:53,187:.: 0.26:1.000:. ./.:4:79,122:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,179:.: 0.35:1.000:. ./.:6:22,140:.:-0.76:1.000:. ./.:4:30,227:.: 0.48:1.000:. ./.:4:93,231:.: 1.37:1.000:. ./.:4:46,130:.:-0.58:1.000:. ./.:4:69,194:.: 0.56:1.000:. ./.:4:67,197:.: 0.58:1.000:. ./.:4:103,203:.: 1.13:1.000:. ./.:4:33,72:.:-1.51:1.000:. ./.:4:51,168:.:-0.02:1.000:. ./.:4:53,119:.:-0.63:0.910:. ./.:4:29,158:.:-0.44:1.000:. ./.:4:42,172:.:-0.08:1.000:. ./.:4:32,121:.:-0.88:1.000:. ./.:4:49,159:.:-0.16:1.000:. ./.:4:47,159:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,149:.: 0.22:1.000:. ./.:4:44,133:.:-0.57:1.000:. ./.:4:78,154:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,123:.:-0.78:1.000:. ./.:4:51,230:.: 0.80:1.000:. ./.:4:55,193:.: 0.37:1.000:. ./.:4:24,109:.:-1.15:1.000:. ./.:4:70,179:.: 0.38:1.000:. ./.:4:91,233:.: 1.37:1.000:. ./.:4:50,118:.:-0.69:1.000:. ./.:4:54,169:.: 0.04:1.000:. ./.:4:42,188:.: 0.13:1.000:. ./.:4:53,136:.:-0.41:1.000:. ./.:4:38,166:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,110:.:-0.87:1.000:. ./.:4:55,199:.: 0.45:1.000:. ./.:4:67,140:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,93:.:-0.98:1.000:. ./.:4:62,214:.: 0.73:1.000:. ./.:4:62,155:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,204:.: 0.83:1.000:. ./.:4:101,146:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,85:.:-1.48:1.000:. ./.:4:41,151:.:-0.37:1.000:. ./.:4:26,132:.:-0.82:1.000:. ./.:4:77,169:.: 0.34:1.000:. ./.:4:34,96:.:-1.19:1.000:. ./.:4:46,167:.:-0.09:1.000:. ./.:4:34,139:.:-0.62:1.000:. ./.:4:41,157:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,123:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,193:.: 0.47:1.000:. ./.:4:53,126:.:-0.54:1.000:. ./.:4:54,253:.: 1.14:1.000:. ./.:4:90,236:.: 1.39:1.000:. ./.:4:79,222:.: 1.06:1.000:. ./.:4:68,149:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,230:.: 0.93:1.000:. ./.:4:44,126:.:-0.66:0.999:. ./.:4:56,144:.:-0.26:1.000:. ./.:3:41,121:.:-0.76:1.000:. ./.:4:38,185:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,97:.:-1.08:1.000:. ./.:4:54,104:.:-0.82:1.000:. ./.:4:69,153:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,115:.:-0.66:1.000:. ./.:4:39,153:.:-0.37:1.000:. ./.:4:39,74:.:-1.41:1.000:. ./.:4:63,178:.: 0.27:1.000:. ./.:4:61,97:.:-0.82:1.000:. ./.:4:50,156:.:-0.19:1.000:. ./.:4:38,188:.: 0.08:1.000:. ./.:6:76,182:.: 0.50:0.556:. ./.:4:48,134:.:-0.50:1.000:. ./.:4:47,98:.:-0.99:1.000:. ./.:4:27,74:.:-1.57:1.000:. ./.:4:54,133:.:-0.44:1.000:. ./.:4:79,260:.: 1.56:1.000:. ./.:4:21,78:.:-1.59:1.000:. ./.:4:52,132:.:-0.48:1.000:. ./.:4:53,188:.: 0.27:1.000:. ./.:4:94,275:.: 1.96:1.000:. ./.:4:92,217:.: 1.17:1.000:. ./.:4:36,154:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,110:.:-0.94:1.000:. ./.:4:25,119:.:-1.00:1.000:. ./.:4:58,149:.:-0.17:1.000:. ./.:4:24,129:.:-0.88:1.000:. ./.:4:78,134:.:-0.11:1.000:. ./.:4:32,70:.:-1.55:1.000:. ./.:4:66,248:.: 1.23:1.000:. ./.:4:49,233:.: 0.81:1.000:. ./.:4:52,164:.:-0.05:1.000:. ./.:4:73,166:.: 0.25:1.000:. ./.:4:70,231:.: 1.06:1.000:. ./.:4:54,168:.: 0.02:1.000:. ./.:4:58,254:.: 1.21:1.000:. ./.:4:93,202:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.78:1.000:. ./.:4:60,106:.:-0.71:1.000:. ./.:4:62,211:.: 0.70:1.000:. ./.:4:63,170:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,257:.: 1.05:1.000:. ./.:4:66,159:.: 0.06:1.000:. ./.:4:57,177:.: 0.18:1.000:. ./.:4:61,215:.: 0.73:1.000:. ./.:4:101,232:.: 1.48:1.000:. ./.:4:88,130:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,156:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,185:.: 0.22:1.000:. ./.:4:94,139:.: 0.17:1.000:. ./.:4:44,249:.: 0.96:1.000:. ./.:4:40,254:.: 0.97:1.000:. ./.:4:64,206:.: 0.66:1.000:. ./.:4:34,136:.:-0.66:1.000:. ./.:4:51,151:.:-0.24:1.000:. ./.:4:39,150:.:-0.41:1.000:. ./.:4:81,169:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,177:.: 0.12:1.000:. ./.:4:41,140:.:-0.51:1.000:. ./.:4:74,225:.: 1.04:1.000:. ./.:4:65,125:.:-0.40:1.000:. ./.:4:77,261:.: 1.55:1.000:. ./.:4:59,259:.: 1.29:1.000:. ./.:4:66,219:.: 0.85:1.000:. ./.:4:94,131:.: 0.06:1.000:. ./.:4:33,161:.:-0.34:1.000:. ./.:4:91,271:.: 1.87:1.000:. ./.:4:73,263:.: 1.52:1.000:. ./.:4:24,174:.:-0.29:1.000:. ./.:4:62,177:.: 0.25:1.000:. -chr1.1 28084165 chr1.1_028084165 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:38,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.35:1.000:. ./.:3:43,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:177,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:100,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:6:65,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:0.910:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:89,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:181,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:120,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:157,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:32,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:176,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:45,0:.:-0.84:1.000:. ./.:3:54,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:6:159,1:.: 2.42:0.556:. ./.:4:27,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.72:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.56:1.000:. -chr1.1 28189850 chr1.1_028189850 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:169,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:161,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.94:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.76:1.000:. ./.:3:30,0:.:-3.53:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:180,1:.: 2.04:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.75:1.000:. ./.:6:129,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:163,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.68:0.910:. ./.:4:120,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:123,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.53:0.999:. ./.:4:134,0:.: 0.31:1.000:. ./.:3:94,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:170,2:.: 1.71:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.60:1.000:. ./.:6:150,0:.: 0.90:0.556:. ./.:4:106,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:141,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.39:1.000:. -chr1.1 28465946 chr1.1_028465946 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.35:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.97:1.000:. ./.:6:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.23:0.910:. ./.:4:72,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.41:0.999:. ./.:4:50,0:.:-0.75:1.000:. ./.:3:18,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.19:1.000:. ./.:6:95,0:.: 0.67:0.556:. ./.:4:22,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:165,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:165,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.10:1.000:. -chr1.1 28687110 chr1.1_028687110 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:174,88:0.32: 0.37:1.000:0.956 0/0/0/0:4:170,3:0.02:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:299,1:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,172:0.53: 1.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:233,90:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:190,230:0.55: 2.70:1.000:0.984 0/0/1/1:4:110,75:0.40:-0.77:1.000:0.768 0/0/0/0:4:221,5:0.02:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,86:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,92:0.69:-1.58:1.000:0.971 0/0/0/1:4:58,32:0.34:-2.16:1.000:0.861 0/0/0/1:4:185,80:0.28: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/0:4:234,3:0.01: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:265,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,108:0.42: 0.24:1.000:0.920 0/0/0/1:4:152,95:0.37: 0.15:1.000:0.510 0/0/1/1:4:150,109:0.41: 0.32:1.000:0.891 0/0/0/0:4:268,2:0.01: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:271,8:0.03: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,231:0.73: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,20:0.16:-1.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,102:0.40: 0.19:1.000:0.794 0/0/0/0:4:280,10:0.03: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,70:0.33:-0.49:1.000:0.931 0/1/1/1:4:29,69:0.69:-2.05:1.000:0.966 0/0/0/1:4:225,104:0.30: 1.36:1.000:0.988 0/0/1/1:4:161,191:0.54: 1.69:1.000:0.987 0/0/0/0:4:198,4:0.02:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,114:0.40: 0.65:1.000:0.771 0/0/0/1:4:128,72:0.35:-0.54:1.000:0.824 0/0/1/1:4:138,91:0.39:-0.12:1.000:0.673 0/0/0/1:4:194,86:0.29: 0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:63,31:0.31:-2.11:1.000:0.970 0/0/0/1:4:99,51:0.32:-1.28:1.000:0.943 0/0/0:3:72,13:0.14:-2.24:1.000:0.658 0/0/0/1:4:235,110:0.30: 1.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:166,159:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:208,90:0.28: 0.90:1.000:0.995 0/0/0/0:4:179,5:0.02:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,167:0.68: 0.03:1.000:0.955 0/0/1/1:4:98,127:0.56:-0.18:1.000:0.966 0/0/0/0:4:160,8:0.04:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,149:0.57: 0.35:1.000:0.955 0/0/1/1:4:97,114:0.54:-0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:90,71:0.44:-1.12:1.000:0.963 0/0/0/0:4:195,9:0.04:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,95:0.38: 0.06:1.000:0.630 0/0/1/1:4:124,96:0.43:-0.25:1.000:0.952 0/1/1/1:4:49,132:0.71:-0.82:1.000:0.991 0/0/0/0:4:175,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,73:0.48:-1.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:189,215:0.53: 2.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:107,99:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/0/0/0:4:281,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:200,10:0.04:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,93:0.45:-0.46:1.000:0.979 0/0/0/1:4:189,69:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,173:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:179,76:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:168,44:0.19:-0.37:1.000:0.955 0/0/0/1:4:203,76:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,94:0.40:-0.10:1.000:0.800 0/0/0/0:4:203,16:0.07:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,63:0.38:-1.13:1.000:0.624 0/0/1/1:4:130,94:0.41:-0.19:1.000:0.884 0/0/0/1:4:123,75:0.37:-0.57:1.000:0.597 0/0/1/1:4:68,95:0.58:-1.09:1.000:0.925 0/0/0/0:4:169,15:0.07:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,89:0.41:-0.34:0.910:0.859 0/0/0/1:4:177,77:0.28: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,96:0.39: 0.03:1.000:0.726 0/1/1/1:4:87,167:0.64: 0.25:1.000:0.731 0/0/0/0:4:186,11:0.05:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,100:0.38: 0.27:1.000:0.601 0/0/0/1:4:152,91:0.36: 0.09:1.000:0.658 0/0/0/1:4:214,91:0.28: 1.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,80:0.31: 0.10:1.000:0.973 0/0/0/0:4:181,15:0.07:-0.60:1.000:0.998 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,155:0.56: 0.57:1.000:0.970 0/0/0/1:4:102,55:0.34:-1.18:1.000:0.896 0/0/1/1:4:161,169:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,184:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,64:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,89:0.43:-0.50:1.000:0.957 0/0/1/1:4:152,176:0.54: 1.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:39,114:0.72:-1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,118:0.54:-0.29:1.000:0.986 0/1/1/1:4:42,158:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,100:0.30: 1.13:1.000:0.986 0/0/1/1:4:106,106:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,142:0.60:-0.06:1.000:0.783 0/0/1/1:4:134,93:0.40:-0.15:1.000:0.809 0/0/0/0:4:142,7:0.04:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,15:0.07:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,93:0.45:-0.44:1.000:0.976 0/0/0/1:4:154,61:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,72:0.50:-1.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:246,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,176:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,172:0.57: 0.88:1.000:0.936 0/0/0/0:4:186,8:0.04:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,50:0.29:-1.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:133,145:0.52: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:83,57:0.40:-1.43:1.000:0.785 0/0/1/1:4:99,103:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/0:4:247,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,67:0.32:-0.54:1.000:0.958 0/0/0/1:4:287,124:0.28: 2.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,87:0.45:-0.68:1.000:0.983 0/0/1/1:4:115,85:0.42:-0.54:1.000:0.912 0/0/0/0:4:322,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,94:0.40:-0.12:0.999:0.816 0/0/0/1:4:140,82:0.36:-0.22:1.000:0.724 0/0/0:3:155,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:272,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,12:0.07:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,126:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,81:0.40:-0.57:1.000:0.804 0/1/1/1:4:59,152:0.70:-0.38:1.000:0.985 0/0/0/1:4:197,81:0.27: 0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,82:0.46:-0.87:1.000:0.987 0/0/0/0:4:218,21:0.08: 0.03:1.000:0.988 0/0/0/1:4:262,105:0.26: 1.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:183,84:0.30: 0.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:133,177:0.57: 1.08:1.000:0.955 0/0/0/0/1/1:6:162,116:0.41: 0.60:0.556:0.557 0/0/0/1:4:82,17:0.16:-2.03:1.000:0.993 0/0/0/0:4:109,5:0.04:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,168:0.57: 0.78:1.000:0.935 0/0/0/0:4:263,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,4:0.03:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,161:0.55: 0.84:1.000:0.984 0/0/0/0:4:258,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,110:0.27: 2.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,108:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,67:0.30:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/1:4:166,64:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:159,15:0.08:-0.93:1.000:0.991 0/0/1/1:4:122,94:0.43:-0.31:1.000:0.949 0/0/1/1:4:105,90:0.46:-0.62:1.000:0.988 0/0/0/1:4:133,77:0.35:-0.40:1.000:0.756 0/0/0/1:4:122,61:0.32:-0.80:1.000:0.962 0/0/1/1:4:165,205:0.55: 1.96:1.000:0.978 0/0/0/0:4:361,0:0.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,71:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,165:0.67: 0.07:1.000:0.900 0/0/1/1:4:149,215:0.58: 1.87:1.000:0.896 0/0/0/1:4:167,77:0.30: 0.10:1.000:0.988 0/0/0/0:4:290,1:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,89:0.35: 0.10:1.000:0.777 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,76:0.41:-0.81:1.000:0.871 0/0/0/1:4:161,91:0.35: 0.22:1.000:0.814 0/0/0/1:4:253,86:0.23: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:316,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,9:0.04:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,7:0.04:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,109:0.37: 0.71:1.000:0.542 0/0/0/1:4:148,91:0.37: 0.03:1.000:0.568 0/0/0/1:4:123,64:0.33:-0.74:1.000:0.935 0/1/1/1:4:71,143:0.65:-0.34:1.000:0.821 0/0/1/1:4:149,115:0.43: 0.40:1.000:0.950 0/0/1/1:4:188,197:0.51: 2.18:1.000:0.996 0/0/0/0:4:234,5:0.02: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,142:0.55: 0.31:1.000:0.982 0/0/0/0:4:137,12:0.07:-1.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:194,7:0.03:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,1:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,73:0.30:-0.12:1.000:0.985 0/0/0/1:4:184,76:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/0/0/0:4:214,1:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,100:0.45:-0.25:1.000:0.982 0/0/0/0:4:164,5:0.03:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,127:0.67:-0.77:1.000:0.920 0/0/1/1:4:189,190:0.50: 2.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,178:0.55: 1.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:155,104:0.39: 0.32:1.000:0.725 0/0/0/1:4:125,74:0.36:-0.56:1.000:0.693 0/0/1/1:4:138,161:0.54: 0.91:1.000:0.989 0/0/0/1:4:303,137:0.29: 2.99:1.000:0.991 0/0/1/1:4:181,207:0.53: 2.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:120,80:0.39:-0.54:1.000:0.706 0/0/0/1:4:167,92:0.34: 0.32:1.000:0.863 -chr1.1 28857948 chr1.1_028857948 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,44:.: 1.31:1.000:. ./.:4:16,22:.:-0.05:1.000:. ./.:4:15,45:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,52:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,33:.: 0.63:1.000:. ./.:4:2,8:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.31:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.61:1.000:. ./.:4:21,28:.: 0.78:1.000:. ./.:4:20,42:.: 1.76:1.000:. ./.:4:8,25:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,52:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,52:.: 1.01:1.000:. ./.:4:17,33:.: 0.86:1.000:. ./.:4:21,42:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:10,41:.: 0.93:1.000:. ./.:4:9,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:10,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:4,6:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:10,43:.: 1.08:1.000:. ./.:4:5,3:.:-2.31:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.53:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.84:1.000:. ./.:4:8,30:.:-0.05:1.000:. ./.:4:5,22:.:-0.88:1.000:. ./.:4:8,31:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,33:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:17,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:8,34:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,31:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,43:.: 1.16:1.000:. ./.:4:7,11:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.10:1.000:. ./.:4:6,18:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.65:1.000:. ./.:4:5,47:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:17,38:.: 1.23:1.000:. ./.:4:8,22:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.63:1.000:. ./.:6:5,19:.:-1.10:1.000:. ./.:4:7,37:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.86:1.000:. ./.:4:12,28:.: 0.10:1.000:. ./.:4:7,20:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,58:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:3,12:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:15,31:.: 0.56:0.910:. ./.:4:21,30:.: 0.93:1.000:. ./.:4:8,29:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.76:1.000:. ./.:4:11,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,30:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:8,29:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,36:.: 0.33:1.000:. ./.:4:10,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,34:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,19:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.56:1.000:. ./.:4:7,32:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.88:1.000:. ./.:4:8,23:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.48:1.000:. ./.:4:4,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.73:1.000:. ./.:4:10,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.78:1.000:. ./.:4:15,38:.: 1.08:1.000:. ./.:4:16,44:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:5,27:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,22:.:-0.80:1.000:. ./.:4:12,31:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.71:1.000:. ./.:4:4,5:.:-2.23:1.000:. ./.:4:7,33:.: 0.10:1.000:. ./.:4:8,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.63:1.000:. ./.:4:11,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:5,35:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:9,47:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.40:0.999:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:3:0,10:.:-2.16:1.000:. ./.:4:4,29:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.48:1.000:. ./.:4:5,20:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:11,26:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:11,44:.: 1.23:1.000:. ./.:4:18,43:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.50:1.000:. ./.:6:0,50:.: 0.86:0.556:. ./.:4:8,24:.:-0.50:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.88:1.000:. ./.:4:4,21:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,42:.: 1.31:1.000:. ./.:4:3,26:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:10,39:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.88:1.000:. ./.:4:14,27:.: 0.18:1.000:. ./.:4:6,27:.:-0.42:1.000:. ./.:4:15,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.78:1.000:. ./.:4:12,30:.: 0.25:1.000:. ./.:4:8,36:.: 0.40:1.000:. ./.:4:9,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:12,33:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,56:.: 1.31:1.000:. ./.:4:6,16:.:-1.25:1.000:. ./.:4:14,30:.: 0.40:1.000:. ./.:4:15,56:.: 2.44:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.93:1.000:. ./.:4:3,5:.:-2.31:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.42:1.000:. ./.:4:14,28:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,33:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,35:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,62:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:14,45:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.93:1.000:. ./.:4:8,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:12,16:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,38:.: 1.38:1.000:. ./.:4:13,29:.: 0.25:1.000:. ./.:4:9,29:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:13,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,39:.: 1.01:1.000:. ./.:4:5,20:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,38:.: 0.93:1.000:. ./.:4:13,37:.: 0.86:1.000:. ./.:4:8,33:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,50:.: 0.93:1.000:. ./.:4:11,30:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:9,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:11,18:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,38:.: 0.86:1.000:. -chr1.1 28955804 chr1.1_028955804 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:103,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:121,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:7,0:.:-3.77:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:118,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.40:0.910:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:102,0:.: 0.27:1.000:. ./.:3:54,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:119,0:.: 1.00:0.556:. ./.:4:71,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:63,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. -chr1.1 29222133 chr1.1_029222133 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:91,25:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,17:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:43,43:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,25:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,58:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:211,25:0.13: 3.57:1.000:0.922 0/0/1/1:4:52,29:0.38:-0.39:1.000:0.584 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,57:0.40: 1.42:1.000:0.748 0/0/0/0:4:23,1:0.05:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.36:-1.85:1.000:0.683 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,73:0.57: 0.45:1.000:0.939 0/0/1/1:4:35,40:0.52:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,70:0.56: 0.43:1.000:0.964 0/0/1/1:4:45,97:0.60: 1.17:1.000:0.830 0/0/1/1:4:73,44:0.40: 0.53:1.000:0.757 0/0/1/1:4:48,43:0.48:-0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,88:0.61: 0.68:1.000:0.671 0/0/1/1:4:95,72:0.44: 1.81:1.000:0.971 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-2.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,60:0.39: 1.68:1.000:0.708 0/0/1/1:4:45,75:0.56: 0.60:1.000:0.958 0/0/0/1:4:87,41:0.35: 0.81:1.000:0.796 0/0/0/1:4:16,3:0.20:-1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,37:0.43:-0.21:1.000:0.955 0/0/0/1:4:109,29:0.26: 1.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,56:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,91:0.57: 1.24:1.000:0.956 0/0/1/1:4:60,41:0.42: 0.12:1.000:0.919 0/0/0/1:4:100,46:0.35: 1.27:1.000:0.833 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,10:0.42:-1.82:1.000:0.898 0/0/0:3:5,0:0.00:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,28:0.29: 0.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:135,20:0.16: 1.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,40:0.35: 0.73:1.000:0.799 0/0/1/1:4:30,44:0.55:-0.57:1.000:0.981 0/0/0/1:4:97,41:0.33: 1.06:1.000:0.920 0/0/0/1:4:100,17:0.18: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,59:0.58:-0.19:1.000:0.894 0/0/0/1:4:100,14:0.15: 0.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:83,14:0.18: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,31:0.31: 0.40:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,44:0.32: 1.52:1.000:0.960 0/0/0/1:4:124,34:0.26: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,34:0.30: 0.81:1.000:0.981 0/0/1/1:4:19,28:0.55:-1.26:1.000:0.980 0/0/1/1:4:26,39:0.55:-0.80:1.000:0.978 0/0/0/1:4:143,19:0.15: 1.68:1.000:0.981 0/0/1/1:4:42,27:0.41:-0.70:1.000:0.858 0/0/1/1:4:41,40:0.49:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,62:0.58:-0.01:1.000:0.930 0/0/1/1:4:60,35:0.39:-0.03:1.000:0.690 0/0/1/1:4:27,31:0.52:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,24:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,30:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:52,30:0.39:-0.37:1.000:0.735 0/0/0/1:4:79,31:0.32: 0.35:1.000:0.960 0/0/1/1:4:40,44:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,45:0.60:-0.80:1.000:0.793 0/0/1/1:4:58,38:0.41:-0.01:1.000:0.880 0/0/1/1:4:52,44:0.47:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:38,30:0.45:-0.72:1.000:0.981 0/0/0/1:4:59,9:0.16:-0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,69:0.81:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,42:0.40: 0.32:0.910:0.823 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,34:0.37: 0.07:1.000:0.577 0/0/0/0:4:65,3:0.05:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,15:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,49:0.35: 1.37:1.000:0.745 0/0/1/1:4:35,21:0.40:-1.03:1.000:0.748 0/0/0/1:4:61,14:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,18:0.44:-1.39:1.000:0.967 0/0/1/1:4:33,55:0.56:-0.21:1.000:0.958 0/0/1/1:4:32,32:0.50:-0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,24:0.22: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,10:0.14:-0.14:1.000:0.953 0/0/0/1:4:102,33:0.29: 0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:67,12:0.19:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,27:0.48:-1.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:105,11:0.12: 0.50:1.000:0.710 0/0/0/1:4:59,16:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,7:0.08: 0.22:1.000:0.982 0/0/0/1:4:62,26:0.33:-0.21:1.000:0.926 0/0/0/1:4:57,30:0.37:-0.24:1.000:0.562 0/0/1/1:4:19,38:0.59:-1.01:1.000:0.884 0/0/0/1:4:121,22:0.19: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,46:0.36: 1.12:1.000:0.728 0/1/1/1:4:1,46:0.75:-1.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,33:0.45:-0.57:1.000:0.984 0/0/0/1:4:61,14:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,7:0.13:-0.78:1.000:0.924 0/0/1/1:4:25,25:0.50:-1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,52:0.41: 0.96:1.000:0.840 0/0/0/1:4:56,6:0.12:-0.88:1.000:0.765 0/0/1/1:4:35,43:0.53:-0.47:1.000:0.993 0/0/0/1:4:40,7:0.18:-1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,12:0.17:-0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,34:0.56:-1.06:1.000:0.965 0/0/1/1:4:29,36:0.53:-0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,30:0.51:-1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,44:0.34: 1.22:1.000:0.886 0/0/1/1:4:57,56:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,36:0.42:-0.21:1.000:0.928 0/0/1/1:4:29,33:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,61:0.54: 0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,52:0.56:-0.29:0.999:0.970 0/0/1/1:4:43,32:0.44:-0.55:1.000:0.965 1/1/1:3:0,22:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,33:0.53:-0.95:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,27:0.74:-1.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,8:0.09: 0.25:1.000:0.909 0/0/1/1:4:38,22:0.39:-0.93:1.000:0.673 0/0/0/1:4:77,27:0.30: 0.20:1.000:0.986 0/0/1/1:4:60,48:0.45: 0.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:38,23:0.40:-0.90:1.000:0.765 0/0/1/1:4:43,49:0.52:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,33:0.28: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,33:0.52:-0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:82,14:0.18:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:79,30:0.31: 0.32:0.556:0.904 0/0/1/1:4:17,27:0.56:-1.34:1.000:0.969 0/0/1/1:4:19,23:0.52:-1.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,22:0.49:-1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:80,17:0.22: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,43:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,29:0.54:-1.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:86,13:0.16: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,34:0.47:-0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,65:0.54: 0.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:58,34:0.39:-0.11:1.000:0.700 0/0/1/1:4:33,31:0.49:-0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,27:0.42:-0.78:1.000:0.928 0/0/1/1:4:23,38:0.56:-0.90:1.000:0.960 0/0/0/1:4:62,30:0.35:-0.11:1.000:0.750 0/0/0/1:4:58,23:0.32:-0.39:1.000:0.956 0/0/1/1:4:40,43:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,26:0.35:-0.37:1.000:0.819 0/0/0/1:4:163,19:0.13: 2.19:1.000:0.906 0/0/1/1:4:48,70:0.55: 0.55:1.000:0.981 0/0/0/1:4:103,30:0.27: 0.94:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,46:0.36: 1.04:1.000:0.659 0/0/0/1:4:154,26:0.18: 2.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,14:0.19:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,61:0.52: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,112:0.59: 1.73:1.000:0.831 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-2.18:1.000:0.643 0/0/1/1:4:33,64:0.58: 0.02:1.000:0.901 0/0/0/1:4:122,36:0.27: 1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,48:0.39: 0.89:1.000:0.671 0/0/1/1:4:48,48:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,64:0.79:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,56:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,46:0.46: 0.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:39,68:0.57: 0.27:1.000:0.946 0/0/0/1:4:90,41:0.34: 0.89:1.000:0.846 0/0/0/1:4:91,46:0.36: 1.04:1.000:0.659 0/0/0/1:4:115,29:0.25: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,68:0.57: 0.25:1.000:0.937 0/0/0/1:4:95,18:0.20: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,46:0.57:-0.60:1.000:0.953 0/0/1/1:4:35,67:0.58: 0.14:1.000:0.908 0/0/1/1:4:41,70:0.57: 0.37:1.000:0.952 0/0/1/1:4:75,45:0.40: 0.60:1.000:0.748 0/0/1/1:4:38,29:0.44:-0.75:1.000:0.973 0/0/0/1:4:71,37:0.37: 0.30:1.000:0.586 0/0/0/1:4:90,32:0.30: 0.66:1.000:0.984 0/0/1/1:4:26,46:0.57:-0.62:1.000:0.941 0/0/0/1:4:100,31:0.28: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:162,26:0.17: 2.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,25:0.21: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,46:0.38: 0.81:1.000:0.599 0/0/1/1:4:57,70:0.53: 0.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:171,18:0.12: 2.37:1.000:0.722 0/0/1/1:4:67,62:0.48: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,23:0.16: 2.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:77,30:0.32: 0.27:1.000:0.963 0/0/0/1:4:98,33:0.29: 0.89:1.000:0.991 -chr1.1 29326140 chr1.1_029326140 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:217,60:.: 1.38:1.000:. ./.:4:93,107:.:-0.02:1.000:. ./.:4:179,67:.: 0.82:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:221,81:.: 1.84:1.000:. ./.:4:145,58:.: 0.03:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:170,68:.: 0.67:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:97,126:.: 0.40:1.000:. ./.:4:154,61:.: 0.25:1.000:. ./.:4:159,69:.: 0.49:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:220,64:.: 1.51:1.000:. ./.:4:184,79:.: 1.13:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:25,11:.:-3.02:1.000:. ./.:4:182,63:.: 0.80:1.000:. ./.:4:161,73:.: 0.60:1.000:. ./.:4:164,54:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,5:.:-3.20:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:260,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:148,58:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,9:.:-3.39:1.000:. ./.:4:63,23:.:-2.11:1.000:. ./.:3:19,1:.:-3.31:1.000:. ./.:4:196,74:.: 1.26:1.000:. ./.:4:159,68:.: 0.47:1.000:. ./.:4:142,63:.: 0.07:1.000:. ./.:4:148,58:.: 0.09:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.74:1.000:. ./.:4:154,58:.: 0.20:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:180,72:.: 0.93:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:213,70:.: 1.49:1.000:. ./.:4:70,24:.:-1.96:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:119,41:.:-0.75:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:196,76:.: 1.29:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:165,71:.: 0.64:1.000:. ./.:4:178,77:.: 0.98:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:106,55:.:-0.74:1.000:. ./.:4:126,65:.:-0.19:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:115,55:.:-0.57:1.000:. ./.:4:130,46:.:-0.46:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:77,38:.:-1.58:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:139,61:.:-0.02:0.910:. ./.:4:84,137:.: 0.36:1.000:. ./.:4:171,61:.: 0.56:1.000:. ./.:4:106,51:.:-0.81:1.000:. ./.:4:101,99:.:-0.02:1.000:. ./.:4:192,90:.: 1.48:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,65:.:-0.21:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:126,63:.:-0.22:1.000:. ./.:4:126,62:.:-0.24:1.000:. ./.:4:134,50:.:-0.32:1.000:. ./.:4:65,77:.:-1.08:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:147,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:127,54:.:-0.37:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:117,46:.:-0.70:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:132,60:.:-0.17:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:166,61:.: 0.47:1.000:. ./.:4:173,70:.: 0.76:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:122,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:92,39:.:-1.28:1.000:. ./.:4:120,77:.:-0.08:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:117,42:.:-0.77:1.000:. ./.:4:165,53:.: 0.31:1.000:. ./.:4:98,37:.:-1.21:1.000:. ./.:4:155,62:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:123,60:.:-0.33:1.000:. ./.:4:172,53:.: 0.43:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:193,82:.: 1.35:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:193,0:.:-0.15:1.000:. ./.:3:111,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:142,48:.:-0.21:1.000:. ./.:4:148,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:125,63:.:-0.24:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:141,73:.: 0.23:1.000:. ./.:4:157,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:114,61:.:-0.48:1.000:. ./.:4:203,92:.: 1.71:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.05:1.000:. ./.:6:215,0:.: 0.25:0.556:. ./.:4:96,54:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,32:.:-1.50:1.000:. ./.:4:77,40:.:-1.54:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:159,70:.: 0.51:1.000:. ./.:4:92,42:.:-1.23:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:156,64:.: 0.34:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:109,45:.:-0.86:1.000:. ./.:4:125,51:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,65:.:-0.13:1.000:. ./.:4:138,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:95,41:.:-1.19:1.000:. ./.:4:207,93:.: 1.81:1.000:. ./.:4:231,83:.: 2.06:1.000:. ./.:4:170,75:.: 0.80:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:200,93:.: 1.68:1.000:. ./.:4:152,69:.: 0.36:1.000:. ./.:4:201,71:.: 1.29:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:35,11:.:-2.84:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:183,76:.: 1.06:1.000:. ./.:4:137,77:.: 0.23:1.000:. ./.:4:208,84:.: 1.66:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,60:.: 0.53:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:187,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:126,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:126,42:.:-0.61:1.000:. ./.:4:141,56:.:-0.08:1.000:. ./.:4:204,69:.: 1.31:1.000:. ./.:4:128,67:.:-0.11:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:139,63:.: 0.01:1.000:. ./.:4:133,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,56:.:-0.75:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:211,68:.: 1.42:1.000:. ./.:4:155,59:.: 0.23:1.000:. ./.:4:180,80:.: 1.07:1.000:. ./.:4:207,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:169,81:.: 0.89:1.000:. ./.:4:267,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:192,73:.: 1.17:1.000:. ./.:4:111,60:.:-0.55:1.000:. ./.:4:181,70:.: 0.91:1.000:. -chr1.1 29362039 chr1.1_029362039 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:61,0:.: 3.19:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:23,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:0.910:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:0.999:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:6:43,0:.: 1.17:0.556:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:13,1:.:-2.09:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. -chr1.1 29584457 chr1.1_029584457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:62,22:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,21:.:-0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,24:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:119,34:.: 2.24:1.000:. ./.:4:46,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:85,34:.: 0.98:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:24,22:.:-1.73:1.000:. ./.:4:15,20:.:-2.14:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:82,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,10:.: 0.24:1.000:. ./.:4:89,12:.: 0.31:1.000:. ./.:4:26,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:59,47:.: 0.50:1.000:. ./.:4:125,21:.: 1.98:1.000:. ./.:4:74,60:.: 1.54:1.000:. ./.:4:27,15:.:-1.88:1.000:. ./.:4:67,41:.: 0.57:1.000:. ./.:4:103,19:.: 1.09:1.000:. ./.:4:68,41:.: 0.61:1.000:. ./.:4:12,13:.:-2.51:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.27:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.47:1.000:. ./.:4:23,33:.:-1.36:1.000:. ./.:4:121,23:.: 1.91:1.000:. ./.:4:32,51:.:-0.36:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:26,7:.:-2.22:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.73:1.000:. ./.:3:10,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,16:.: 0.05:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:82,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:103,23:.: 1.24:1.000:. ./.:4:91,9:.: 0.27:1.000:. ./.:4:85,20:.: 0.46:1.000:. ./.:4:55,24:.:-0.51:1.000:. ./.:4:53,12:.:-1.03:1.000:. ./.:4:63,51:.: 0.79:1.000:. ./.:4:79,16:.: 0.09:1.000:. ./.:4:55,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:23,17:.:-1.96:1.000:. ./.:4:49,39:.:-0.17:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:68,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:81,18:.: 0.24:1.000:. ./.:4:34,27:.:-1.18:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:82,18:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,28:.:-1.33:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:56,29:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,23:.:-0.40:1.000:. ./.:6:89,6:.: 0.09:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:100,24:.: 1.17:1.000:. ./.:4:93,25:.: 0.94:1.000:. ./.:4:65,46:.: 0.68:1.000:. ./.:4:40,42:.:-0.40:1.000:. ./.:4:33,35:.:-0.92:1.000:. ./.:4:65,13:.:-0.54:1.000:. ./.:4:74,25:.: 0.24:1.000:. ./.:4:54,53:.: 0.53:0.910:. ./.:4:66,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:63,42:.: 0.46:1.000:. ./.:4:44,9:.:-1.47:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:25,13:.:-2.03:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:69,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:102,33:.: 1.57:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,19:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,45:.: 0.64:1.000:. ./.:4:58,17:.:-0.66:1.000:. ./.:4:65,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:83,18:.: 0.31:1.000:. ./.:4:42,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:77,17:.: 0.05:1.000:. ./.:4:59,37:.: 0.12:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:73,14:.:-0.21:1.000:. ./.:4:97,17:.: 0.79:1.000:. ./.:4:63,48:.: 0.68:1.000:. ./.:4:52,13:.:-1.03:1.000:. ./.:4:63,20:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,37:.:-1.21:1.000:. ./.:4:42,19:.:-1.18:1.000:. ./.:4:53,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:59,45:.: 0.42:1.000:. ./.:4:56,12:.:-0.92:1.000:. ./.:4:108,34:.: 1.83:1.000:. ./.:4:46,9:.:-1.40:1.000:. ./.:4:96,24:.: 1.02:1.000:. ./.:4:74,10:.:-0.32:1.000:. ./.:4:87,17:.: 0.42:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:54,39:.: 0.01:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:22,35:.:-1.33:1.000:. ./.:4:25,28:.:-1.47:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:82,28:.: 0.64:0.999:. ./.:4:33,49:.:-0.40:1.000:. ./.:3:42,1:.:-1.85:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:43,11:.:-1.44:1.000:. ./.:4:66,15:.:-0.43:1.000:. ./.:4:19,34:.:-1.47:1.000:. ./.:4:37,42:.:-0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:24,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,20:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.36:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:65,15:.:-0.47:1.000:. ./.:6:95,23:.: 0.94:0.556:. ./.:4:37,31:.:-0.92:1.000:. ./.:4:75,15:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:69,22:.:-0.06:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:69,7:.:-0.62:1.000:. ./.:4:38,20:.:-1.29:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:26,32:.:-1.29:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:90,20:.: 0.64:1.000:. ./.:4:48,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,38:.:-0.32:1.000:. ./.:4:40,42:.:-0.40:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:93,20:.: 0.76:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:58,25:.:-0.36:1.000:. ./.:4:48,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:87,15:.: 0.35:1.000:. ./.:4:77,19:.: 0.12:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:88,26:.: 0.79:1.000:. ./.:4:41,2:.:-1.85:1.000:. ./.:4:95,22:.: 0.91:1.000:. ./.:4:60,41:.: 0.31:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:53,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:84,28:.: 0.72:1.000:. ./.:4:33,47:.:-0.47:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.36:1.000:. ./.:4:72,40:.: 0.72:1.000:. ./.:4:62,46:.: 0.57:1.000:. ./.:4:61,13:.:-0.69:1.000:. ./.:4:67,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:100,17:.: 0.91:1.000:. ./.:4:29,38:.:-0.95:1.000:. ./.:4:99,22:.: 1.05:1.000:. ./.:4:90,27:.: 0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:144,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:61,27:.:-0.17:1.000:. ./.:4:65,9:.:-0.69:1.000:. ./.:4:63,53:.: 0.87:1.000:. ./.:4:136,29:.: 2.69:1.000:. ./.:4:92,22:.: 0.79:1.000:. ./.:4:59,22:.:-0.43:1.000:. ./.:4:92,29:.: 1.05:1.000:. ./.:4:102,18:.: 1.02:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:119,22:.: 1.80:1.000:. ./.:4:52,53:.: 0.46:1.000:. ./.:4:56,24:.:-0.47:1.000:. -chr1.1 30458048 chr1.1_030458048 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:230,107:.: 1.18:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:186,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:165,114:.: 0.30:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:115,79:.:-0.98:1.000:. ./.:4:102,72:.:-1.28:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:140,99:.:-0.30:1.000:. ./.:4:182,172:.: 1.43:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:219,97:.: 0.86:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:332,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:146,131:.: 0.27:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:192,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:279,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:204,88:.: 0.50:1.000:. ./.:4:147,80:.:-0.48:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:142,103:.:-0.21:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:255,128:.: 1.87:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:128,116:.:-0.23:1.000:. ./.:4:102,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:234,87:.: 0.94:1.000:. ./.:4:205,2:.:-0.78:1.000:. ./.:3:141,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:166,104:.: 0.17:1.000:. ./.:4:149,74:.:-0.54:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:201,125:.: 1.01:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:198,116:.: 0.83:1.000:. ./.:4:192,105:.: 0.57:1.000:. ./.:4:272,146:.: 2.40:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:275,113:.: 1.95:1.000:. ./.:4:343,150:.: 3.53:1.000:. ./.:4:130,86:.:-0.65:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:219,118:.: 1.18:1.000:. ./.:4:185,102:.: 0.42:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:171,120:.: 0.48:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:206,157:.: 1.57:1.000:. ./.:4:172,119:.: 0.48:1.000:. ./.:6:240,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:222,134:.: 1.46:1.000:. ./.:4:269,138:.: 2.23:1.000:. ./.:4:180,126:.: 0.71:1.000:. ./.:4:169,127:.: 0.56:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:229,125:.: 1.43:0.910:. ./.:4:228,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:264,129:.: 2.02:1.000:. ./.:4:184,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:252,118:.: 1.67:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:233,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:183,111:.: 0.53:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:166,122:.: 0.44:1.000:. ./.:4:167,130:.: 0.57:1.000:. ./.:4:153,105:.:-0.01:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:230,119:.: 1.36:1.000:. ./.:4:121,78:.:-0.90:1.000:. ./.:4:169,109:.: 0.29:1.000:. ./.:4:143,92:.:-0.36:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:143,79:.:-0.56:1.000:. ./.:4:213,118:.: 1.09:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:181,109:.: 0.47:1.000:. ./.:4:214,114:.: 1.04:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:139,116:.:-0.06:1.000:. ./.:4:151,76:.:-0.48:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:159,83:.:-0.26:1.000:. ./.:4:212,127:.: 1.21:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:183,111:.: 0.53:1.000:. ./.:4:210,160:.: 1.67:1.000:. ./.:4:155,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:211,110:.: 0.94:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:254,112:.: 1.61:1.000:. ./.:3:124,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:172,85:.:-0.03:1.000:. ./.:4:225,101:.: 1.01:1.000:. ./.:4:150,84:.:-0.38:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:185,131:.: 0.86:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:182,86:.: 0.14:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:210,125:.: 1.15:1.000:. ./.:6:203,114:.: 0.88:0.556:. ./.:4:245,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:162,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:150,82:.:-0.41:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:164,82:.:-0.19:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:205,85:.: 0.47:1.000:. ./.:4:245,98:.: 1.27:1.000:. ./.:4:202,82:.: 0.38:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:191,126:.: 0.88:1.000:. ./.:4:348,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:194,103:.: 0.57:1.000:. ./.:4:129,101:.:-0.44:1.000:. ./.:4:131,115:.:-0.19:1.000:. ./.:4:172,78:.:-0.13:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:181,102:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:234,115:.: 1.36:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:171,109:.: 0.32:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:134,116:.:-0.13:1.000:. ./.:4:253,132:.: 1.90:1.000:. ./.:4:113,67:.:-1.19:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:166,88:.:-0.07:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:197,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:99,76:.:-1.27:1.000:. ./.:4:128,118:.:-0.19:1.000:. ./.:4:166,130:.: 0.56:1.000:. ./.:4:160,88:.:-0.16:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:206,96:.: 0.65:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:143,122:.: 0.09:1.000:. ./.:4:170,76:.:-0.19:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.59:1.000:. -chr1.1 30744456 chr1.1_030744456 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:176,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:13,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.11:1.000:. ./.:6:133,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.36:0.910:. ./.:4:150,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:84,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.03:0.999:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:3:74,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:136,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.70:1.000:. ./.:6:204,0:.: 1.71:0.556:. ./.:4:55,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:136,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:243,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.38:1.000:. -chr1.1 30969636 chr1.1_030969636 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:127,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:104,14:.: 0.24:1.000:. ./.:4:158,20:.: 1.90:1.000:. ./.:4:49,16:.:-1.21:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,9:.:-1.71:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:54,9:.:-1.27:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,7:.:-0.83:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:87,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:124,19:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:72,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,9:.:-1.46:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:23,3:.:-2.29:1.000:. ./.:3:10,5:.:-2.59:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:65,16:.:-0.77:1.000:. ./.:4:66,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:88,14:.:-0.20:1.000:. ./.:4:82,24:.:-0.09:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:155,26:.: 1.98:1.000:. ./.:4:115,33:.: 1.07:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:211,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:101,18:.: 0.27:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:92,20:.: 0.08:1.000:. ./.:4:79,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:115,28:.: 0.93:1.000:. ./.:4:105,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:123,21:.: 0.96:1.000:. ./.:6:71,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:84,21:.:-0.11:1.000:. ./.:4:109,17:.: 0.46:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:33,13:.:-1.74:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:105,3:.:-0.03:0.910:. ./.:4:75,20:.:-0.39:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:57,15:.:-1.02:1.000:. ./.:4:99,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:170,24:.: 2.34:1.000:. ./.:4:64,15:.:-0.83:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:69,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:143,23:.: 1.57:1.000:. ./.:4:132,19:.: 1.15:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:93,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:91,20:.: 0.05:1.000:. ./.:4:80,15:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,18:.:-0.20:1.000:. ./.:4:88,15:.:-0.17:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:90,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:85,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:76,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:96,18:.: 0.13:1.000:. ./.:4:42,13:.:-1.49:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:89,32:.: 0.33:1.000:. ./.:4:74,22:.:-0.36:1.000:. ./.:4:113,20:.: 0.66:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:147,16:.: 1.48:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:108,19:.: 0.49:0.999:. ./.:4:173,0:.: 1.76:1.000:. ./.:3:97,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:105,16:.: 0.33:1.000:. ./.:4:84,23:.:-0.06:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:119,21:.: 0.85:1.000:. ./.:4:138,25:.: 1.48:1.000:. ./.:6:156,14:.: 1.68:0.556:. ./.:4:102,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:124,23:.: 1.04:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:110,11:.: 0.33:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:91,14:.:-0.11:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:102,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:66,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:84,16:.:-0.25:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,16:.:-0.03:1.000:. ./.:4:79,16:.:-0.39:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:78,8:.:-0.64:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:54,15:.:-1.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:95,22:.: 0.22:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:75,14:.:-0.55:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:76,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:66,11:.:-0.88:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,6:.:-1.05:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:44,14:.:-1.41:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:48,13:.:-1.32:1.000:. ./.:4:96,13:.: 0.00:1.000:. ./.:4:75,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,15:.:-0.53:1.000:. ./.:4:63,20:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,29:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:75,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:50,12:.:-1.30:1.000:. ./.:4:126,18:.: 0.96:1.000:. ./.:4:86,9:.:-0.39:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:113,13:.: 0.46:1.000:. -chr1.1 31180522 chr1.1_031180522 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:27,68:0.69: 1.20:1.000:0.980 0/0/1/1:4:30,31:0.49:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,63:0.80: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,59:0.69: 0.59:1.000:0.974 0/0/1/1:4:61,57:0.48: 2.37:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,32:0.80:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,26:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,55:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,16:0.78:-2.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.31:-3.05:1.000:0.970 0/1/1/1:4:22,52:0.68: 0.14:1.000:0.959 0/1/1/1:4:16,58:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,62:0.82: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,52:0.69: 0.09:1.000:0.976 0/0/1/1:4:40,47:0.52: 0.80:1.000:0.994 0/0/0/1:4:49,21:0.33:-0.06:1.000:0.906 0/0/1/1:4:37,48:0.55: 0.70:1.000:0.981 0/0/1/1:4:52,46:0.46: 1.35:1.000:0.990 0/1/1/1:4:28,84:0.73: 2.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,11:0.51:-2.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,64:0.70: 0.90:1.000:0.983 0/1/1/1:4:16,77:0.81: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,27:0.54:-1.13:1.000:0.990 0/1/1/1:4:7,25:0.76:-1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,25:0.49:-1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,43:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,19:0.33:-0.32:1.000:0.931 0/0/1/1:4:47,54:0.52: 1.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,60:0.87:-0.17:1.000:0.904 0/0/1/1:4:30,29:0.48:-0.62:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-3.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.55:1.000:1.000 0/1/1:3:2,6:0.73:-3.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,48:0.77:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,62:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,65:0.68: 1.10:1.000:0.950 0/0/1/1:4:25,31:0.54:-0.77:1.000:0.989 0/0/1/1:4:32,36:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,61:0.72: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,33:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,54:0.74:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,38:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,71:0.70: 1.35:1.000:0.988 0/1/1/1:4:27,54:0.65: 0.49:1.000:0.766 0/0/1/1:4:43,34:0.44: 0.29:1.000:0.972 0/0/1/1:4:25,23:0.47:-1.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,47:0.74:-0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,27:0.71:-1.74:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,55:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,55:0.70: 0.24:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,46:0.66:-0.17:1.000:0.847 0/0/1/1:4:33,39:0.53: 0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,39:0.46: 0.64:1.000:0.988 0/0/1/1:4:31,42:0.56: 0.09:1.000:0.969 0/0/1/1:4:40,36:0.47: 0.24:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,63:0.78: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,38:0.56:-0.27:1.000:0.968 0/1/1/1/1/1:6:17,59:0.75: 0.24:1.000:0.565 0/1/1/1:4:18,63:0.76: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,64:0.79: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,47:0.59: 0.29:1.000:0.847 0/1/1/1:4:16,59:0.77: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,17:0.30:-0.22:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,38:0.63:-0.62:1.000:0.501 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,22:0.37:-0.37:1.000:0.598 0/1/1/1:4:26,54:0.66: 0.44:0.910:0.836 0/1/1/1:4:24,60:0.69: 0.64:1.000:0.978 0/0/1/1:4:35,45:0.55: 0.44:1.000:0.983 0/1/1/1:4:8,23:0.72:-2.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,38:0.67:-0.83:1.000:0.924 0/0/1/1:4:45,42:0.48: 0.80:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,14:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,44:0.69:-0.47:1.000:0.972 0/0/1/1:4:31,25:0.45:-0.77:1.000:0.977 0/0/1/1:4:35,40:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,82:0.84: 1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,57:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,56:0.79:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,56:0.77:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,80:0.75: 1.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,56:0.71: 0.29:1.000:0.990 0/1/1/1:4:24,45:0.63:-0.12:1.000:0.605 0/1/1/1:4:18,66:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,37:0.75:-1.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,59:0.79: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,46:0.77:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,61:0.64: 1.10:1.000:0.650 0/0/1/1:4:29,22:0.44:-1.03:1.000:0.959 0/0/1/1:4:34,50:0.58: 0.64:1.000:0.922 0/0/1/1:4:29,45:0.59: 0.14:1.000:0.861 0/0/1/1:4:30,33:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,28:0.48:-0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,46:0.66:-0.17:1.000:0.847 0/1/1/1:4:21,66:0.74: 0.80:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,63:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,57:0.77: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,49:0.59: 0.49:1.000:0.879 0/0/1/1:4:44,32:0.43: 0.24:1.000:0.939 0/1/1/1:4:20,49:0.69:-0.12:1.000:0.972 0/1/1/1:4:25,88:0.76: 2.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,87:0.80: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,38:0.51: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,41:0.59:-0.22:1.000:0.836 0/0/1/1:4:55,42:0.44: 1.30:1.000:0.961 0/0/1/1:4:39,55:0.57: 1.15:0.999:0.951 0/0/1/1:4:53,32:0.39: 0.70:1.000:0.721 0/0/1:3:20,12:0.39:-1.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,41:0.47: 0.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:37,16:0.33:-0.93:1.000:0.899 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,30:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,65:0.84: 0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,68:0.78: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,41:0.49: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,61:0.72: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,70:0.74: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,67:0.84: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,36:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1/1/1:6:12,90:0.87: 1.56:0.556:0.990 0/0/0/1:4:43,19:0.34:-0.47:1.000:0.879 0/0/1/1:4:24,35:0.58:-0.62:1.000:0.929 0/0/1/1:4:32,26:0.45:-0.67:1.000:0.978 0/0/1/1:4:25,42:0.61:-0.22:1.000:0.706 0/1/1/1:4:19,77:0.78: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,17:0.41:-1.48:1.000:0.890 0/0/1/1:4:14,19:0.56:-1.94:1.000:0.968 0/1/1/1:4:12,45:0.77:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,55:0.50: 1.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,36:0.55:-0.42:1.000:0.974 0/0/1/1:4:26,42:0.60:-0.17:1.000:0.793 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,35:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,63:0.79: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,30:0.45:-0.27:1.000:0.983 0/0/1/1:4:40,52:0.55: 1.05:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 2.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,53:0.59: 0.80:1.000:0.854 0/1/1/1:4:18,58:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,60:0.75: 0.34:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,37:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,50:0.50: 1.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,64:0.78: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,12:0.55:-2.55:1.000:0.974 0/1/1/1:4:15,52:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,30:0.47:-0.42:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,47:0.58: 0.39:1.000:0.923 0/0/1/1:4:34,27:0.44:-0.52:1.000:0.973 0/0/1/1:4:46,28:0.39: 0.14:1.000:0.736 0/0/1/1:4:46,40:0.46: 0.75:1.000:0.988 0/0/1/1:4:23,34:0.58:-0.72:1.000:0.917 0/1/1/1:4:10,53:0.83:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,67:0.71: 1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,43:0.48: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,32:0.54:-0.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,38:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,52:0.68: 0.14:1.000:0.959 0/0/0/1:4:66,15:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,44:0.54: 0.39:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,67:0.78: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,53:0.70: 0.09:1.000:0.989 0/1/1/1:4:9,29:0.74:-1.69:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,43:0.56: 0.19:1.000:0.972 0/1/1/1:4:9,47:0.82:-0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,56:0.78:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,61:0.78: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,55:0.73: 0.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:17,63:0.77: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,54:0.52: 1.46:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,34:0.54:-0.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:38,42:0.51: 0.44:1.000:0.996 -chr1.1 31360007 chr1.1_031360007 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:28,21:0.41: 0.53:1.000:0.882 0/0/1/1:4:19,17:0.46:-0.42:1.000:0.988 0/1/1/1:4:15,45:0.69: 1.33:1.000:0.966 0/0/0/1:4:26,9:0.23:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,20:0.30: 1.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:15,19:0.54:-0.57:1.000:0.989 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-1.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,24:0.55: 0.02:1.000:0.982 0/1/1/1:4:7,23:0.70:-0.86:1.000:0.984 0/0/1/1:4:11,9:0.44:-1.59:1.000:0.960 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,24:0.64:-0.49:1.000:0.641 0/1/1/1:4:7,26:0.71:-0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:8,36:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,9:0.34:-1.22:1.000:0.872 0/0/0/1:4:18,10:0.34:-1.00:1.000:0.890 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,11:0.27:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,19:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,12:0.28:-0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,6:0.77:-2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,42:0.77: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,10:0.29:-0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,6:0.77:-2.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.27:-1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,13:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,13:0.47:-1.08:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,15:0.32: 0.16:1.000:0.956 0/1/1/1:4:6,27:0.74:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,5:0.54:-2.39:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,9:0.64:-2.09:1.000:0.701 0/0/1:3:5,4:0.43:-2.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:20,16:0.43:-0.42:1.000:0.947 0/0/0/1:4:26,11:0.27:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,22:0.59:-0.49:1.000:0.852 0/0/1/1:4:20,16:0.43:-0.42:1.000:0.947 0/0/0/1:4:19,11:0.35:-0.86:1.000:0.821 0/0/0/1:4:40,15:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,32:0.56: 0.89:1.000:0.960 0/0/0/1:4:34,17:0.31: 0.67:1.000:0.972 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,30:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,26:0.54: 0.31:1.000:0.986 0/0/0/1:4:34,9:0.19: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:0.90:-2.82:1.000:0.801 0/0/0/1:4:34,9:0.19: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,23:0.74:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,19:0.44: 0.02:1.000:0.965 0/0/0/1:4:31,17:0.33: 0.45:1.000:0.906 0/0/0/1:4:45,14:0.21: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,37:0.61: 1.11:1.000:0.716 0/0/1/1:4:17,23:0.55:-0.13:1.000:0.979 0/0/0/1:4:35,14:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,15:0.28: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,8:0.20:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:30,30:0.49: 1.33:1.000:0.883 0/0/1/1:4:30,52:0.60: 2.93:1.000:0.822 0/0/1/1:4:20,33:0.59: 0.82:1.000:0.880 0/0/1/1:4:26,32:0.53: 1.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,27:0.59: 0.09:1.000:0.855 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,16:0.33: 0.23:1.000:0.899 0/0/1/1:4:10,15:0.57:-1.22:1.000:0.947 0/0/0/1:4:34,14:0.27: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:27,36:0.55: 1.54:0.910:0.982 0/0/1/1:4:20,17:0.45:-0.35:1.000:0.976 0/0/0/1:4:39,19:0.30: 1.18:1.000:0.980 0/0/0/1:4:14,2:0.11:-1.88:1.000:0.578 0/0/1/1:4:15,16:0.51:-0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,10:0.18: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,20:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,9:0.18: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,31:0.47: 1.62:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,67:0.77: 2.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,31:0.51: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,22:0.54:-0.20:1.000:0.986 0/0/0/1:4:29,14:0.30: 0.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:33,16:0.30: 0.53:1.000:0.982 0/0/1/1:4:16,23:0.56:-0.20:1.000:0.964 0/0/0/1:4:24,8:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,24:0.40: 1.18:1.000:0.766 0/0/0/1:4:21,12:0.34:-0.64:1.000:0.846 0/0/1/1:4:24,20:0.44: 0.16:1.000:0.969 0/0/0/1:4:25,12:0.30:-0.35:1.000:0.984 0/1/1/1:4:14,41:0.68: 0.96:1.000:0.959 0/0/1/1:4:18,23:0.54:-0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,19:0.46:-0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:60,19:0.22: 2.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,17:0.59:-1.08:1.000:0.847 0/0/1/1:4:29,30:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,21:0.36: 1.03:1.000:0.737 0/0/0/1:4:33,16:0.30: 0.53:1.000:0.982 0/0/0/0:4:41,5:0.10: 0.31:1.000:0.837 0/0/1/1:4:23,24:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,14:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,18:0.57:-0.86:1.000:0.947 0/1/1/1:4:10,54:0.76: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,32:0.53: 1.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,43:0.61: 1.76:1.000:0.696 0/0/0/1:4:33,11:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,21:0.32: 1.47:1.000:0.961 0/0/0/1:4:32,17:0.33: 0.53:1.000:0.938 0/0/1/1:4:16,18:0.52:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,7:0.12: 0.74:1.000:0.796 0/0/1/1:4:33,25:0.42: 1.18:1.000:0.895 0/0/0/1:4:17,10:0.35:-1.08:1.000:0.787 0/0/1/1:4:22,19:0.45:-0.06:1.000:0.980 0/0/0/1:4:40,8:0.15: 0.45:0.999:0.988 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1:3:27,14:0.32:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,39:0.58: 1.62:1.000:0.925 0/0/1/1:4:22,15:0.39:-0.35:1.000:0.671 0/1/1/1:4:18,39:0.63: 1.11:1.000:0.626 0/0/0/1:4:32,13:0.26: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,11:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,31:0.55: 0.89:1.000:0.980 0/0/0/1:4:33,13:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,55:0.77: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,18:0.62:-1.08:1.000:0.552 0/0/1/1:4:17,19:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:25,36:0.56: 1.40:0.556:0.662 0/0/1/1:4:23,16:0.39:-0.20:1.000:0.729 0/1/1/1:4:11,36:0.70: 0.38:1.000:0.983 0/0/1/1:4:26,25:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,38:0.74: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,18:0.53:-0.64:1.000:0.993 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,35:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,14:0.34:-0.20:1.000:0.879 0/0/0/1:4:25,12:0.30:-0.35:1.000:0.984 0/0/0/1:4:44,7:0.12: 0.67:1.000:0.837 0/1/1/1:4:16,39:0.65: 0.96:1.000:0.827 0/0/1/1:4:33,33:0.49: 1.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,31:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,9:0.17: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,10:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,49:0.77: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,26:0.43: 1.18:1.000:0.956 0/0/1/1:4:29,35:0.53: 1.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,21:0.47: 0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,15:0.43:-0.57:1.000:0.937 0/0/1/1:4:27,22:0.43: 0.53:1.000:0.958 0/0/0/1:4:34,13:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,19:0.57:-0.71:1.000:0.958 0/0/0/1:4:19,12:0.37:-0.78:1.000:0.582 0/0/1/1:4:7,14:0.62:-1.51:1.000:0.552 0/0/1/1:4:11,17:0.58:-1.00:1.000:0.931 0/0/0/1:4:21,11:0.32:-0.71:1.000:0.948 0/1/1/1:4:9,41:0.74: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,26:0.52: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,9:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.20:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,15:0.36:-0.13:1.000:0.737 0/0/1/1:4:12,18:0.57:-0.86:1.000:0.947 0/0/0/1:4:33,14:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,14:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.46:-1.80:1.000:0.986 0/0/0/1:4:27,14:0.32:-0.06:1.000:0.955 0/0/0/1:4:21,8:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,14:0.42:-0.71:1.000:0.924 0/1/1/1:4:6,30:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,15:0.43:-0.57:1.000:0.937 0/0/1/1:4:21,18:0.45:-0.20:1.000:0.978 0/1/1/1:4:11,26:0.65:-0.35:1.000:0.784 0/0/0/1:4:28,6:0.16:-0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,25:0.87:-1.15:1.000:0.943 0/0/1/1:4:16,12:0.41:-1.00:1.000:0.882 0/0/1/1:4:18,19:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,29:0.54: 0.74:1.000:0.989 0/0/1/1:4:20,23:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,29:0.55: 0.67:1.000:0.984 0/0/0/1:4:26,14:0.33:-0.13:1.000:0.926 0/0/0/1:4:30,13:0.28: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,20:0.54:-0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:15,9:0.36:-1.29:1.000:0.737 0/0/0/1:4:27,14:0.32:-0.06:1.000:0.955 -chr1.1 31442927 chr1.1_031442927 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:195,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.29:1.000:. ./.:3:113,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:291,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:221,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:180,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:293,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.10:1.000:. ./.:6:187,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.15:0.910:. ./.:4:176,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:284,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:235,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:287,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:292,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:172,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:239,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.62:0.999:. ./.:4:197,1:.: 0.18:1.000:. ./.:3:132,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.40:1.000:. ./.:6:262,0:.: 1.58:0.556:. ./.:4:138,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:163,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:187,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:245,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:260,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.17:1.000:. -chr1.1 31816459 chr1.1_031816459 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:170,53:.: 1.44:1.000:. ./.:4:115,36:.:-0.01:1.000:. ./.:4:148,40:.: 0.74:1.000:. ./.:4:171,51:.: 1.42:1.000:. ./.:4:207,40:.: 1.92:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:152,44:.: 0.90:1.000:. ./.:4:135,30:.: 0.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:31,2:.:-2.38:1.000:. ./.:4:167,21:.: 0.74:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:147,41:.: 0.74:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:131,46:.: 0.51:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:195,2:.: 0.92:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:170,36:.: 1.10:1.000:. ./.:4:181,35:.: 1.30:1.000:. ./.:4:125,46:.: 0.39:1.000:. ./.:4:155,40:.: 0.88:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:150,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,5:.:-2.70:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.48:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:144,40:.: 0.66:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:191,42:.: 1.64:1.000:. ./.:4:129,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:166,43:.: 1.16:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,21:.:-0.05:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:121,28:.:-0.05:1.000:. ./.:4:113,37:.:-0.03:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:146,24:.: 0.37:1.000:. ./.:4:148,35:.: 0.64:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:138,28:.: 0.29:1.000:. ./.:6:104,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:108,45:.: 0.03:1.000:. ./.:4:147,36:.: 0.64:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:115,30:.:-0.13:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.95:0.910:. ./.:4:140,40:.: 0.57:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:197,42:.: 1.76:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:172,60:.: 1.62:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:118,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:122,19:.:-0.21:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:130,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:198,26:.: 1.46:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:117,44:.: 0.19:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:107,23:.:-0.43:1.000:. ./.:4:105,33:.:-0.27:1.000:. ./.:4:120,40:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:157,33:.: 0.78:1.000:. ./.:4:114,44:.: 0.13:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:93,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,30:.:-0.71:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:189,38:.: 1.52:1.000:. ./.:4:121,29:.:-0.03:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.65:1.000:. ./.:4:167,63:.: 1.58:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.23:0.999:. ./.:4:118,33:.:-0.01:1.000:. ./.:3:67,21:.:-1.28:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:91,23:.:-0.75:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:95,23:.:-0.67:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:150,44:.: 0.86:1.000:. ./.:4:179,26:.: 1.08:1.000:. ./.:4:163,30:.: 0.84:1.000:. ./.:6:165,39:.: 1.06:0.556:. ./.:4:91,18:.:-0.85:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:99,35:.:-0.35:1.000:. ./.:4:131,38:.: 0.35:1.000:. ./.:4:150,35:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:175,23:.: 0.94:1.000:. ./.:4:120,39:.: 0.15:1.000:. ./.:4:227,59:.: 2.71:1.000:. ./.:4:131,38:.: 0.35:1.000:. ./.:4:137,42:.: 0.55:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:107,31:.:-0.27:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:155,50:.: 1.08:1.000:. ./.:4:153,47:.: 0.98:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:109,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:155,59:.: 1.26:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:10,2:.:-2.80:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:149,45:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,34:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,34:.:-0.13:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:120,30:.:-0.03:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:162,33:.: 0.88:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:120,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:137,29:.: 0.29:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:251,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:170,6:.: 0.49:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:193,33:.: 1.50:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:190,27:.: 1.32:1.000:. -chr1.1 31907509 chr1.1_031907509 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:35,132:0.76: 1.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,57:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,69:0.56: 0.19:1.000:0.971 0/0/0/1:4:120,45:0.27: 1.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,77:0.53: 0.80:1.000:0.991 0/1/1/1:4:12,31:0.69:-2.18:1.000:0.970 0/0/1/1:4:39,63:0.59:-0.29:1.000:0.891 0/0/1/1:4:48,75:0.58: 0.38:1.000:0.924 0/0/1/1:4:14,15:0.49:-2.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,18:0.66:-2.73:1.000:0.866 0/1/1/1:4:23,77:0.74:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,51:0.53:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,62:0.56:-0.20:1.000:0.970 0/0/1/1:4:62,61:0.47: 0.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:85,18:0.18:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,78:0.73:-0.29:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,139:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,72:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,82:0.59: 0.67:1.000:0.872 0/0/1/1:4:19,23:0.52:-2.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,116:0.84: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,61:0.53:-0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,74:0.80:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.67:-3.02:1.000:0.933 0/0/0/1:4:54,30:0.35:-0.87:1.000:0.818 0/0/1/1:4:58,65:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,74:0.54: 0.57:1.000:0.987 0/1/1/1:4:34,114:0.74: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,25:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,60:0.66:-0.81:1.000:0.897 0/0/0/1:4:62,23:0.27:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,13:0.49:-2.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,10:0.32:-2.57:1.000:0.961 0/0/1:3:13,6:0.31:-2.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,85:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,69:0.66:-0.39:1.000:0.894 0/0/0/1:4:95,23:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,53:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,31:0.32:-0.52:1.000:0.953 0/0/1/1:4:72,76:0.48: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,69:0.58: 0.06:1.000:0.921 0/0/1/1:4:56,69:0.52: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,51:0.61:-1.03:1.000:0.657 0/1/1/1:4:28,105:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,78:0.54: 0.83:1.000:0.989 0/1/1/1:4:38,141:0.76: 2.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,24:0.80:-2.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,49:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,47:0.60:-1.19:1.000:0.768 0/0/0/1:4:86,39:0.31: 0.45:1.000:0.977 0/0/1/1:4:71,83:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,103:0.70: 0.96:1.000:0.983 0/0/1/1:4:73,106:0.56: 2.18:1.000:0.968 0/0/1/1:4:61,74:0.52: 0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,92:0.82:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,36:0.29: 0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:37,58:0.58:-0.52:1.000:0.922 0/0/1/1:4:43,69:0.58: 0.03:1.000:0.899 0/0/0/1/1/1:6:66,53:0.42: 0.25:1.000:0.554 0/0/0/1:4:95,31:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,28:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,47:0.43:-0.20:1.000:0.936 0/1/1/1:4:20,47:0.67:-1.41:1.000:0.915 0/1/1/1:4:17,106:0.84: 0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,102:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,31:0.60:-1.99:1.000:0.790 0/0/1/1:4:57,84:0.56: 0.96:1.000:0.961 0/1/1/1:4:19,105:0.82: 0.41:0.910:0.999 0/1/1/1:4:29,124:0.78: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,86:0.81:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,34:0.62:-1.90:1.000:0.554 0/1/1/1:4:22,64:0.71:-0.81:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,122:0.75: 1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,72:0.65:-0.16:1.000:0.759 0/0/0/1:4:67,25:0.27:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,54:0.48:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,81:0.54: 0.96:1.000:0.986 0/0/1/1:4:66,72:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,98:0.74: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,73:0.70:-0.39:1.000:0.989 0/0/1/1:4:39,61:0.58:-0.36:1.000:0.924 0/0/1/1:4:77,78:0.47: 1.41:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,111:0.72: 1.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:58,31:0.34:-0.71:1.000:0.873 0/0/1/1:4:64,74:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,45:0.54:-1.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:42,54:0.53:-0.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:49,68:0.55: 0.19:1.000:0.981 0/0/0/1:4:64,35:0.34:-0.39:1.000:0.842 0/0/0/1:4:57,34:0.36:-0.64:1.000:0.671 0/0/1/1:4:61,82:0.54: 1.02:1.000:0.987 0/1/1/1:4:42,130:0.72: 1.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,66:0.56: 0.03:1.000:0.972 0/0/1/1:4:69,57:0.43: 0.48:1.000:0.947 0/1/1/1:4:21,79:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,89:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,83:0.80:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,81:0.58: 0.67:1.000:0.909 0/0/1/1:4:67,83:0.52: 1.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,36:0.62:-1.80:1.000:0.544 0/0/1/1:4:46,66:0.56: 0.03:1.000:0.972 0/1/1/1:4:25,66:0.69:-0.64:1.000:0.977 0/0/1/1:4:46,79:0.60: 0.45:1.000:0.796 0/0/0/1:4:59,26:0.30:-0.84:1.000:0.983 0/0/0/1:4:64,38:0.36:-0.29:1.000:0.683 0/0/1/1:4:52,64:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,101:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,85:0.46: 1.99:1.000:0.990 0/1/1/1:4:29,123:0.78: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,119:0.76: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,61:0.48: 0.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:88,42:0.32: 0.61:0.999:0.960 0/1/1/1:4:23,83:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/0/1:3:39,25:0.38:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,70:0.53: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,36:0.47:-1.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:25,42:0.59:-1.41:1.000:0.836 0/1/1/1:4:27,77:0.71:-0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:65,63:0.47: 0.54:1.000:0.990 0/0/0/1:4:102,43:0.29: 1.09:1.000:0.989 0/1/1/1:4:26,111:0.78: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,58:0.55:-0.36:1.000:0.982 0/1/1/1:4:32,104:0.73: 0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,27:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,75:0.54: 0.61:1.000:0.985 0/0/0/1/1/1:6:75,67:0.45: 0.99:0.556:0.727 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,35:0.52:-1.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,57:0.56:-0.45:1.000:0.974 0/0/1/1:4:58,66:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,66:0.53: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,44:0.46:-0.64:1.000:0.986 0/0/1/1:4:67,64:0.46: 0.64:1.000:0.989 0/0/1/1:4:70,69:0.47: 0.90:1.000:0.992 0/0/0/1:4:83,48:0.36: 0.64:1.000:0.742 0/1/1/1:4:27,82:0.72:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,36:0.35:-0.32:1.000:0.823 0/0/0/1:4:84,39:0.31: 0.38:1.000:0.970 0/0/1/1:4:44,68:0.57: 0.03:1.000:0.933 0/1/1/1:4:31,95:0.72: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,117:0.76: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,90:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,37:0.36:-0.42:1.000:0.629 0/0/1/1:4:68,82:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,101:0.56: 1.92:1.000:0.970 0/1/1/1:4:21,96:0.79: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,74:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,83:0.51: 1.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,86:0.71: 0.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,70:0.51: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,34:0.31:-0.07:1.000:0.977 0/0/1/1:4:19,21:0.49:-2.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,26:0.34:-1.19:1.000:0.856 0/1/1/1:4:12,94:0.87:-0.16:1.000:0.914 0/0/0/1:4:79,35:0.30: 0.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:57,79:0.55: 0.80:1.000:0.981 0/1/1/1:4:17,93:0.82:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,52:0.52:-0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:72,29:0.29:-0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:25,96:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,34:0.29: 0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,55:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,82:0.64: 0.35:1.000:0.682 0/0/1/1:4:47,72:0.57: 0.25:1.000:0.940 0/0/1/1:4:51,67:0.54: 0.22:1.000:0.990 0/0/1/1:4:42,51:0.52:-0.58:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,124:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,60:0.47: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,42:0.49:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,20:0.26:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,36:0.35:-0.32:1.000:0.823 0/0/0/1:4:91,37:0.29: 0.54:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,115:0.85: 0.67:1.000:0.986 0/0/1/1:4:50,50:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,51:0.49:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,68:0.53: 0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,64:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,105:0.79: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,53:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,78:0.61: 0.35:1.000:0.727 0/0/0/1:4:79,36:0.31: 0.13:1.000:0.976 0/0/1/1:4:41,68:0.59:-0.07:1.000:0.856 0/1/1/1:4:21,79:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,106:0.70: 1.06:1.000:0.988 -chr1.1 32180745 chr1.1_032180745 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:76,114:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.19:1.000:. ./.:4:3,124:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,95:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,137:.: 0.08:1.000:. ./.:4:40,41:.:-1.32:1.000:. ./.:4:68,116:.: 1.00:1.000:. ./.:4:1,105:.:-0.75:1.000:. ./.:4:22,35:.:-1.85:1.000:. ./.:4:4,26:.:-2.46:1.000:. ./.:4:12,148:.: 0.46:1.000:. ./.:4:73,112:.: 1.02:1.000:. ./.:4:2,117:.:-0.46:1.000:. ./.:4:78,79:.: 0.39:1.000:. ./.:4:77,124:.: 1.38:1.000:. ./.:4:4,138:.: 0.05:1.000:. ./.:4:14,180:.: 1.22:1.000:. ./.:4:99,162:.: 2.73:1.000:. ./.:4:86,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:15,37:.:-1.97:1.000:. ./.:4:12,110:.:-0.39:1.000:. ./.:4:90,127:.: 1.74:1.000:. ./.:4:3,89:.:-1.07:1.000:. ./.:4:8,8:.:-2.77:1.000:. ./.:4:11,115:.:-0.30:1.000:. ./.:4:83,104:.: 1.07:1.000:. ./.:4:71,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:82,133:.: 1.69:1.000:. ./.:4:64,101:.: 0.57:1.000:. ./.:4:68,106:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.82:1.000:. ./.:4:9,14:.:-2.62:1.000:. ./.:4:1,40:.:-2.21:1.000:. ./.:3:4,19:.:-2.62:1.000:. ./.:4:66,128:.: 1.22:1.000:. ./.:4:73,143:.: 1.72:1.000:. ./.:4:77,73:.: 0.23:1.000:. ./.:4:58,107:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.93:1.000:. ./.:4:1,94:.:-1.00:1.000:. ./.:4:84,82:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,74:.: 0.12:1.000:. ./.:4:46,72:.:-0.48:1.000:. ./.:4:70,113:.: 0.98:1.000:. ./.:4:72,81:.: 0.30:1.000:. ./.:4:80,150:.: 2.03:1.000:. ./.:4:9,132:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,102:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,86:.:-1.18:1.000:. ./.:4:72,57:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,88:.: 0.41:1.000:. ./.:4:66,79:.: 0.12:1.000:. ./.:4:4,162:.: 0.59:1.000:. ./.:4:72,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,59:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,63:.:-0.28:1.000:. ./.:4:56,63:.:-0.46:1.000:. ./.:4:52,103:.: 0.35:1.000:. ./.:6:14,69:.:-1.27:1.000:. ./.:4:10,90:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,99:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,102:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.89:1.000:. ./.:4:10,100:.:-0.66:1.000:. ./.:4:5,120:.:-0.33:1.000:. ./.:4:38,77:.:-0.55:1.000:. ./.:4:9,152:.: 0.48:1.000:. ./.:4:3,103:.:-0.75:0.910:. ./.:4:1,132:.:-0.15:1.000:. ./.:4:61,102:.: 0.53:1.000:. ./.:4:4,64:.:-1.61:1.000:. ./.:4:2,149:.: 0.26:1.000:. ./.:4:93,125:.: 1.76:1.000:. ./.:4:6,143:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1,87:.:-1.16:1.000:. ./.:4:7,109:.:-0.53:1.000:. ./.:4:3,110:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.37:1.000:. ./.:4:77,84:.: 0.48:1.000:. ./.:4:7,98:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,104:.:-0.78:1.000:. ./.:4:67,73:.: 0.01:1.000:. ./.:4:7,111:.:-0.48:1.000:. ./.:4:59,83:.: 0.05:1.000:. ./.:4:84,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:35,75:.:-0.66:1.000:. ./.:4:8,92:.:-0.89:1.000:. ./.:4:12,125:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,109:.:-0.55:1.000:. ./.:4:47,76:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,108:.:-0.55:1.000:. ./.:4:73,130:.: 1.42:1.000:. ./.:4:7,89:.:-0.98:1.000:. ./.:4:66,68:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,92:.:-0.98:1.000:. ./.:4:15,128:.: 0.08:1.000:. ./.:4:6,108:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:71,123:.: 1.22:1.000:. ./.:4:2,63:.:-1.67:1.000:. ./.:4:70,128:.: 1.31:1.000:. ./.:4:48,65:.:-0.60:1.000:. ./.:4:2,207:.: 1.56:1.000:. ./.:4:4,130:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,129:.: 1.25:1.000:. ./.:4:73,54:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,86:.:-1.02:1.000:. ./.:4:5,146:.: 0.26:1.000:. ./.:4:7,135:.: 0.05:1.000:. ./.:4:6,108:.:-0.57:1.000:. ./.:4:101,184:.: 3.27:1.000:. ./.:4:65,102:.: 0.62:0.999:. ./.:4:15,174:.: 1.11:1.000:. ./.:3:2,92:.:-1.02:1.000:. ./.:4:76,70:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,88:.:-1.11:1.000:. ./.:4:57,101:.: 0.41:1.000:. ./.:4:8,86:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,92:.:-0.87:1.000:. ./.:4:90,127:.: 1.74:1.000:. ./.:4:10,144:.: 0.32:1.000:. ./.:4:52,81:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,142:.: 0.21:1.000:. ./.:4:62,63:.:-0.33:1.000:. ./.:4:83,121:.: 1.45:1.000:. ./.:5:67,66:.:-0.15:0.988:. ./.:4:10,95:.:-0.78:1.000:. ./.:4:2,105:.:-0.73:1.000:. ./.:4:53,90:.: 0.08:1.000:. ./.:4:12,96:.:-0.71:1.000:. ./.:4:74,121:.: 1.25:1.000:. ./.:4:37,46:.:-1.27:1.000:. ./.:4:60,86:.: 0.14:1.000:. ./.:4:7,126:.:-0.15:1.000:. ./.:4:78,95:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1,134:.:-0.10:1.000:. ./.:4:4,94:.:-0.93:1.000:. ./.:4:63,58:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,102:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,103:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,100:.: 0.44:1.000:. ./.:4:13,100:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,59:.:-1.74:1.000:. ./.:4:94,93:.: 1.07:1.000:. ./.:4:98,103:.: 1.38:1.000:. ./.:4:14,178:.: 1.18:1.000:. ./.:4:12,124:.:-0.08:1.000:. ./.:4:71,92:.: 0.53:1.000:. ./.:4:64,104:.: 0.64:1.000:. ./.:4:3,125:.:-0.26:1.000:. ./.:4:72,130:.: 1.40:1.000:. ./.:4:19,32:.:-1.99:1.000:. ./.:4:4,88:.:-1.07:1.000:. ./.:4:6,154:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,95:.: 0.57:1.000:. ./.:4:80,101:.: 0.93:1.000:. ./.:4:2,153:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.06:1.000:. ./.:4:64,129:.: 1.20:1.000:. ./.:4:71,70:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,141:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,124:.: 1.22:1.000:. ./.:4:4,120:.:-0.35:1.000:. ./.:4:59,106:.: 0.57:1.000:. ./.:4:5,116:.:-0.42:1.000:. ./.:4:4,110:.:-0.57:1.000:. ./.:4:6,195:.: 1.38:1.000:. ./.:4:73,71:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,88:.:-1.16:1.000:. ./.:4:5,97:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,102:.: 0.46:1.000:. ./.:4:19,132:.: 0.26:1.000:. ./.:4:64,120:.: 1.00:1.000:. ./.:4:64,88:.: 0.28:1.000:. ./.:4:58,56:.:-0.57:1.000:. ./.:4:77,112:.: 1.11:1.000:. ./.:4:84,107:.: 1.16:1.000:. ./.:4:4,110:.:-0.57:1.000:. ./.:4:57,111:.: 0.64:1.000:. ./.:4:91,82:.: 0.75:1.000:. ./.:4:3,206:.: 1.56:1.000:. ./.:4:85,108:.: 1.20:1.000:. ./.:4:2,100:.:-0.84:1.000:. ./.:4:10,182:.: 1.18:1.000:. -chr1.1 32924623 chr1.1_032924623 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:349,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:360,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:267,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:188,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:137,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:133,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:141,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:343,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:247,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:391,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.02:1.000:. ./.:6:277,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:378,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:456,1:.: 1.86:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.39:0.910:. ./.:4:231,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:519,2:.: 2.83:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:372,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:360,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.63:0.999:. ./.:4:405,2:.: 1.10:1.000:. ./.:3:202,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:351,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.78:1.000:. ./.:5:502,1:.: 2.56:0.988:. ./.:4:304,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:269,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:269,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:516,1:.: 2.77:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:239,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:411,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:492,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.85:1.000:. -chr1.1 33171704 chr1.1_033171704 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,60:.: 0.94:1.000:. ./.:4:11,55:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,50:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,93:.: 2.05:1.000:. ./.:4:23,60:.: 1.43:1.000:. ./.:4:8,13:.:-2.41:1.000:. ./.:4:11,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,12:.:-1.79:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,49:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,80:.: 1.25:1.000:. ./.:4:22,19:.:-1.17:1.000:. ./.:4:14,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:27,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,22:.: 0.44:1.000:. ./.:4:19,63:.: 1.37:1.000:. ./.:4:37,38:.: 0.94:1.000:. ./.:4:9,9:.:-2.59:1.000:. ./.:4:24,33:.:-0.18:1.000:. ./.:4:16,47:.: 0.19:1.000:. ./.:4:17,34:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,16:.:-1.97:1.000:. ./.:4:8,27:.:-1.54:1.000:. ./.:4:11,43:.:-0.36:1.000:. ./.:4:14,50:.: 0.26:1.000:. ./.:4:34,45:.: 1.19:1.000:. ./.:4:12,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:17,28:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,18:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,21:.:-2.41:1.000:. ./.:3:0,6:.:-3.34:1.000:. ./.:4:18,53:.: 0.69:1.000:. ./.:4:10,53:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.94:1.000:. ./.:4:6,40:.:-0.86:1.000:. ./.:4:9,42:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,59:.: 0.75:1.000:. ./.:4:18,60:.: 1.12:1.000:. ./.:4:17,79:.: 2.24:1.000:. ./.:4:11,38:.:-0.67:1.000:. ./.:4:36,34:.: 0.63:1.000:. ./.:4:12,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:24,39:.: 0.19:1.000:. ./.:4:33,48:.: 1.31:1.000:. ./.:4:19,22:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.29:1.000:. ./.:4:16,53:.: 0.57:1.000:. ./.:4:25,65:.: 1.87:1.000:. ./.:4:24,25:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.94:1.000:. ./.:4:10,51:.: 0.07:1.000:. ./.:4:18,26:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.13:1.000:. ./.:4:30,28:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,47:.: 0.01:1.000:. ./.:6:10,35:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,45:.:-0.18:1.000:. ./.:4:24,66:.: 1.87:1.000:. ./.:4:28,35:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,35:.: 1.37:1.000:. ./.:4:26,32:.:-0.11:1.000:. ./.:4:8,34:.:-1.11:1.000:. ./.:4:9,64:.: 0.81:1.000:. ./.:4:16,32:.:-0.73:0.910:. ./.:4:0,59:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:5,23:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,76:.: 1.00:1.000:. ./.:4:34,30:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,48:.: 0.19:1.000:. ./.:4:21,53:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,77:.: 1.06:1.000:. ./.:4:30,34:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.55:1.000:. ./.:4:16,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:32,35:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,60:.: 0.63:1.000:. ./.:4:7,49:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,65:.: 1.50:1.000:. ./.:4:21,22:.:-1.04:1.000:. ./.:4:17,39:.:-0.24:1.000:. ./.:4:29,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.13:1.000:. ./.:4:9,30:.:-1.29:1.000:. ./.:4:17,44:.: 0.07:1.000:. ./.:4:44,37:.: 1.31:1.000:. ./.:4:15,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:21,62:.: 1.43:1.000:. ./.:4:23,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,47:.:-0.05:1.000:. ./.:4:12,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.26:1.000:. ./.:4:28,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:6,42:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,62:.: 1.31:1.000:. ./.:4:18,50:.: 0.50:1.000:. ./.:4:18,49:.: 0.44:1.000:. ./.:4:16,56:.: 0.75:1.000:. ./.:4:17,51:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.30:1.000:. ./.:4:28,37:.: 0.32:1.000:. ./.:4:18,79:.: 2.30:1.000:. ./.:4:28,35:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,23:.:-0.73:1.000:. ./.:4:11,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:18,50:.: 0.50:0.999:. ./.:4:29,43:.: 0.75:1.000:. ./.:3:2,24:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.88:1.000:. ./.:4:12,40:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,43:.:-0.05:1.000:. ./.:4:21,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,27:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.44:1.000:. ./.:4:27,33:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,42:.:-0.36:1.000:. ./.:4:9,63:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,82:.: 1.37:1.000:. ./.:4:18,54:.: 0.75:1.000:. ./.:5:9,54:.: 0.19:0.988:. ./.:4:21,25:.:-0.86:1.000:. ./.:4:6,30:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,59:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.43:1.000:. ./.:4:7,20:.:-2.04:1.000:. ./.:4:12,35:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.07:1.000:. ./.:4:28,21:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.23:1.000:. ./.:4:18,26:.:-0.98:1.000:. ./.:4:26,35:.: 0.07:1.000:. ./.:4:35,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:35,31:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:17,65:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.94:1.000:. ./.:4:9,80:.: 1.81:1.000:. ./.:4:30,33:.: 0.19:1.000:. ./.:4:17,54:.: 0.69:1.000:. ./.:4:13,44:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,88:.: 1.74:1.000:. ./.:4:21,36:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,17:.:-2.66:1.000:. ./.:4:13,34:.:-0.80:1.000:. ./.:4:27,34:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,79:.: 1.19:1.000:. ./.:4:26,37:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,46:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,49:.: 0.13:1.000:. ./.:4:14,22:.:-1.48:1.000:. ./.:4:5,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:21,35:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:11,40:.:-0.55:1.000:. ./.:4:7,63:.: 0.63:1.000:. ./.:4:7,43:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,35:.: 0.32:1.000:. ./.:4:8,33:.:-1.17:1.000:. ./.:4:12,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.30:1.000:. ./.:4:27,36:.: 0.19:1.000:. ./.:4:11,43:.:-0.36:1.000:. ./.:4:17,28:.:-0.92:1.000:. ./.:4:19,57:.: 1.00:1.000:. ./.:4:18,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,30:.: 0.13:1.000:. ./.:4:14,54:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,63:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,86:.: 1.62:1.000:. ./.:4:18,61:.: 1.19:1.000:. ./.:4:23,30:.:-0.42:1.000:. ./.:4:13,34:.:-0.80:1.000:. -chr1.1 34199458 chr1.1_034199458 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.75:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:6:42,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.77:0.910:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:64,0:.:-0.31:1.000:. ./.:3:46,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.68:1.000:. ./.:5:83,0:.: 0.54:0.988:. ./.:4:65,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.04:1.000:. -chr1.1 34579746 chr1.1_034579746 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.26:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.25:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:230,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.16:1.000:. ./.:6:152,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.22:0.910:. ./.:4:126,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:128,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:190,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:169,0:.: 0.88:1.000:. ./.:3:96,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.25:1.000:. ./.:5:214,0:.: 2.02:0.988:. ./.:4:133,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.21:1.000:. -chr1.1 34663420 chr1.1_034663420 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,212:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,81:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,66:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,295:.: 2.07:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.81:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.86:1.000:. ./.:4:0,231:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1,216:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,223:.: 1.03:1.000:. ./.:4:1,189:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,288:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,257:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,242:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.03:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,170:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,82:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1,240:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.:-1.96:1.000:. ./.:3:0,2:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,248:.: 1.39:1.000:. ./.:4:1,156:.: 0.09:1.000:. ./.:4:2,142:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,170:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,130:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,229:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,74:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,366:.: 3.09:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.54:1.000:. ./.:4:1,95:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,254:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,49:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,152:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.69:1.000:. ./.:6:0,109:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,75:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.83:0.910:. ./.:4:0,202:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,238:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,278:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,65:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,63:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,264:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,238:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,72:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,232:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,81:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,250:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,114:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,112:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,75:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1,205:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.58:0.999:. ./.:4:0,130:.:-0.30:1.000:. ./.:3:0,9:.:-2.04:1.000:. ./.:4:1,76:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1,152:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,153:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,173:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,46:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.23:1.000:. ./.:5:1,157:.: 0.10:0.988:. ./.:4:0,179:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.60:1.000:. ./.:4:2,57:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,130:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,256:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,326:.: 2.52:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,193:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,240:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,230:.: 1.14:1.000:. ./.:4:1,149:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,150:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,12:.:-2.00:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,257:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.27:1.000:. ./.:4:2,177:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,76:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,159:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,159:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,212:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,285:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,226:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,163:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,52:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,239:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,269:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,260:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,228:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,267:.: 1.67:1.000:. ./.:4:1,79:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,283:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.44:1.000:. -chr1.1 34929778 chr1.1_034929778 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:151,36:0.20: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,22:0.21:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,39:0.28: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,102:0.51: 1.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,137:0.70: 1.10:1.000:0.985 0/0/0/1:4:91,23:0.21:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,28:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,22:0.21:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,3:0.07:-2.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,36:0.59:-2.12:1.000:0.891 0/0/1/1:4:71,81:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,45:0.30: 0.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:102,34:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,56:0.46:-0.51:1.000:0.987 0/0/1/1:4:54,63:0.53:-0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,35:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,56:0.28: 1.64:1.000:0.994 0/0/0/1:4:144,37:0.21: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,11:0.33:-2.76:1.000:0.924 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,32:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-2.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,83:0.76:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,107:0.69: 0.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:75,56:0.43:-0.25:1.000:0.934 0/0/0/1:4:162,63:0.29: 2.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:103,39:0.28: 0.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,38:0.33:-0.64:1.000:0.907 0/0/0/1:4:60,18:0.24:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-3.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,8:0.11:-1.68:1.000:0.502 0/0/1:3:8,7:0.46:-3.26:1.000:0.927 0/0/0/1:4:102,19:0.16:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,57:0.48:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,80:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,28:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,70:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,96:0.51: 1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,31:0.29:-0.82:1.000:0.990 0/0/1/1:4:84,84:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,114:0.71: 0.27:1.000:0.989 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,46:0.28: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,52:0.26: 1.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:281,81:0.24: 5.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,35:0.28:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,29:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,51:0.36: 0.01:1.000:0.632 0/0/1/1:4:76,86:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,30:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,73:0.51: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,30:0.20: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,32:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,110:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,36:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,114:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:81,53:0.40:-0.17:1.000:0.675 0/0/1/1:4:75,72:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,36:0.31:-0.51:1.000:0.980 0/0/0/1:4:146,34:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,76:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,32:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,49:0.28: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,72:0.45: 0.42:1.000:0.984 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.65:0.910:1.000 0/0/1/1:4:95,70:0.42: 0.63:1.000:0.924 0/0/0/1:4:129,41:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,71:0.44: 0.50:1.000:0.968 0/0/1/1:4:81,76:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:131,44:0.26: 0.89:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,74:0.52:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,62:0.47:-0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:121,38:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,16:0.13:-0.23:1.000:0.882 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,62:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,76:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,44:0.30: 0.24:1.000:0.984 0/0/0/1:4:107,30:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,58:0.41:-0.02:1.000:0.884 0/0/1/1:4:81,78:0.48: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,30:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:95,35:0.28:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,27:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,27:0.24:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,32:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,40:0.30:-0.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:129,34:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,25:0.24:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,40:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,25:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,57:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,80:0.54: 0.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:76,64:0.45:-0.02:1.000:0.983 0/0/0/1:4:117,42:0.27: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,42:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,19:0.21:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,38:0.22: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,55:0.47:-0.64:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,59:0.43:-0.12:1.000:0.950 0/0/1/1:4:61,67:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,99:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,28:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,37:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:144,37:0.21: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,83:0.52: 0.40:0.999:0.995 0/0/1/1:4:72,85:0.53: 0.42:1.000:0.993 0/1/1:3:34,76:0.65:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,76:0.47: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:59,73:0.54:-0.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:84,34:0.30:-0.59:1.000:0.988 0/0/0/1:4:97,37:0.29:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:90,38:0.30:-0.33:1.000:0.981 0/0/1/1:4:77,66:0.46: 0.06:1.000:0.986 0/0/0/1:4:116,33:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,30:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,56:0.47:-0.61:1.000:0.993 0/1/1/1:4:35,123:0.72: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:106,56:0.35: 0.55:0.988:0.902 0/0/0/1:4:92,29:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,22:0.22:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,55:0.48:-0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,95:0.73:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,31:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,19:0.23:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,78:0.69:-0.90:1.000:0.973 0/0/0/1:4:94,43:0.32:-0.10:1.000:0.953 0/1/1/1:4:46,140:0.70: 1.17:1.000:0.988 0/0/0/1:4:84,37:0.31:-0.51:1.000:0.969 0/1/1/1:4:33,83:0.67:-0.64:1.000:0.931 0/0/0/1:4:106,28:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,25:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,36:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,34:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,32:0.35:-1.26:1.000:0.775 0/0/0/1:4:186,52:0.23: 2.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,117:0.50: 2.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,38:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,32:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,50:0.26: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,66:0.45: 0.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:78,87:0.52: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,27:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,12:0.60:-3.15:1.000:0.765 0/0/0/1:4:99,38:0.29:-0.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:108,32:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,40:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,87:0.47: 1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,70:0.46: 0.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:54,77:0.57:-0.25:1.000:0.955 0/0/1/1:4:92,72:0.44: 0.60:1.000:0.961 0/0/0/1:4:111,30:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,25:0.24:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,36:0.26: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:105,50:0.33: 0.37:1.000:0.927 0/1/1/1:4:28,119:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,36:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,59:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,29:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,32:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,65:0.46: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:45,49:0.51:-1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,31:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,44:0.30: 0.21:1.000:0.982 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,36:0.28:-0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,38:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:109,44:0.30: 0.32:1.000:0.988 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,37:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,90:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,130:0.69: 0.94:1.000:0.971 0/0/0/1:4:149,35:0.20: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,27:0.21:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,83:0.51: 0.53:1.000:0.997 -chr1.1 35085053 chr1.1_035085053 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.21:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,3:.: 1.18:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.38:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:3:8,0:.:-0.56:0.983:. ./.:4:8,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:13,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,2:.: 1.18:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:14,4:.: 1.38:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:22,7:.: 3.51:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:6:10,5:.: 0.80:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,4:.: 1.18:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:18,4:.: 2.15:0.910:. ./.:4:9,4:.: 0.41:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.99:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,4:.: 1.57:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.38:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.99:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:15,6:.: 1.96:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:16,2:.: 1.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:18,5:.: 2.35:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.38:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,5:.: 0.80:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.38:0.999:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:3:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.38:1.000:. ./.:5:24,0:.: 2.54:0.988:. ./.:4:4,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.33:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.60:1.000:. ./.:4:16,5:.: 1.96:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:15,4:.: 1.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,6:.: 1.57:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:17,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.21:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.02:1.000:. -chr1.1 35253375 chr1.1_035253375 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:943,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:448,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:604,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:945,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:696,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:928,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:605,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:657,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:518,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:535,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:713,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:495,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:617,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:719,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:668,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:603,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:847,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:601,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:783,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:689,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:397,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:897,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:797,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:715,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:586,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:632,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:672,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:586,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:1107,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:657,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:848,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:447,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:348,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:447,0:.:-1.54:1.000:. ./.:3:335,0:.:-2.07:0.983:. ./.:4:717,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:763,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:583,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:667,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:853,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:904,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:712,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1194,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:919,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1295,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:766,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1141,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:1503,0:.: 3.52:1.000:. ./.:4:1020,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:1057,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:682,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:966,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:906,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:711,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:548,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1145,1:.: 1.81:1.000:. ./.:4:525,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:1346,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:640,0:.:-0.61:1.000:. ./.:6:608,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:793,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:649,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:886,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:813,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:991,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:660,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:708,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:679,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:881,0:.: 0.54:0.910:. ./.:4:496,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1190,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:746,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:774,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:888,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:736,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:547,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:722,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:706,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:574,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:1001,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:466,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:1183,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:1207,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:761,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:770,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:867,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:757,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:904,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1058,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:578,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:726,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:865,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:932,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:542,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:694,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1048,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:845,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:505,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:678,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:981,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:989,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1132,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:707,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1080,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:601,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:574,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:850,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:803,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:768,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:885,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:885,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:629,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:768,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:1003,1:.: 1.13:1.000:. ./.:3:510,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:1044,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:627,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:969,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1032,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:961,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:670,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1044,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:839,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:798,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:712,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1051,0:.: 1.36:1.000:. ./.:5:1156,1:.: 1.86:0.988:. ./.:4:616,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:544,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:500,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:870,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:542,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:466,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:1089,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:675,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:746,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1083,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:654,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:682,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:670,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1039,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:976,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:813,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:594,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1180,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:920,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:843,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:948,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:853,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:689,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:667,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:568,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:353,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:510,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:650,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:687,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:673,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:848,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:595,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:815,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:707,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:613,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:727,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:686,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:856,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:569,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:649,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:563,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:630,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:624,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:503,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:448,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:736,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:712,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:598,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:635,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:859,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:973,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:849,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:606,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:822,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:819,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1070,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:650,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:645,0:.:-0.59:1.000:. -chr1.1 35517292 chr1.1_035517292 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,1:0.05: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.30:-0.94:1.000:0.989 0/0/0/1:4:25,5:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,2:0.20:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,1:0.08:-0.10:1.000:0.993 0/0/0/0:4:36,2:0.09: 1.04:1.000:0.912 0/0/0/1:4:26,3:0.18: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.31:-1.32:1.000:0.973 0/0/0/1:4:42,7:0.25: 1.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,5:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:36,2:0.09: 1.04:1.000:0.912 0/0/0/0:4:29,1:0.06: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,3:0.18: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,6:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,7:0.26: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,7:0.25: 1.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,3:0.30:-0.94:1.000:0.989 0/0/0/1:4:27,3:0.18: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,6:0.19: 2.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.27:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.40:-1.40:1.000:0.784 0/0/1/1:4:2,2:0.40:-1.55:1.000:0.784 0/0/0/1:4:24,4:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,5:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 2.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,3:0.20: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,1:0.14:-0.87:1.000:0.953 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.55:1.000:0.989 0/0/0/1:4:6,2:0.30:-1.25:1.000:0.989 0/1/1:3:0,1:0.75:-1.78:0.983:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.40:-1.40:1.000:0.784 0/0/0/1:4:14,1:0.12:-0.71:1.000:0.724 0/0/0/1:4:25,2:0.13: 0.20:1.000:0.922 0/0/0/1:4:28,3:0.17: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.55:1.000:0.989 0/0/0/1:4:34,7:0.26: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,3:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:1,2:0.47:-1.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,2:0.13: 0.20:1.000:0.922 0/0/0/1:4:58,4:0.11: 2.87:1.000:0.623 0/0/0/0:4:23,1:0.07:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,5:0.34:-0.79:1.000:0.870 0/0/0/0:4:27,1:0.06: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,6:0.29: 0.05:1.000:0.991 0/0/0/0:4:35,1:0.05: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,9:0.57:-1.02:1.000:0.937 0/0/0/1:4:25,3:0.19: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-0.64:1.000:0.950 0/0/0/1:4:35,5:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.29: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:19,9:0.33: 0.28:1.000:0.939 0/0/0/1:4:26,5:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,6:0.47:-1.17:1.000:0.992 0/0/0/0/0/0:6:22,1:0.08:-0.10:1.000:0.513 0/0/0/1:4:15,6:0.31:-0.26:1.000:0.973 0/0/0/1:4:40,8:0.26: 1.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:37,2:0.09: 1.12:1.000:0.937 0/0/0/1:4:20,2:0.16:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,7:0.31: 0.05:1.000:0.977 0/0/0/1:4:29,3:0.17: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,3:0.20: 0.20:0.910:1.000 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,5:0.31:-0.49:1.000:0.978 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.55:1.000:0.989 0/0/0/1:4:8,5:0.35:-0.87:1.000:0.780 0/1/1/1:4:0,8:0.75:-1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-1.48:1.000:0.715 0/0/0/1:4:17,2:0.19:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,1:0.07: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,3:0.15: 0.81:1.000:0.990 0/0/0/1:4:22,3:0.21: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.40:-1.55:1.000:0.784 0/0/0/1:4:20,4:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,1:0.07: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,2:0.27:-1.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,6:0.28: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:8,4:0.33:-0.94:1.000:0.921 0/0/0/1:4:24,5:0.26: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,8:0.26: 1.65:1.000:0.998 0/0/0/0:4:45,2:0.08: 1.73:1.000:0.995 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.26:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,8:0.24: 2.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,5:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-1.63:1.000:0.921 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-0.87:1.000:0.955 0/0/0/1:4:27,6:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,6:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,3:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:63,4:0.11: 3.25:1.000:0.643 0/0/0/1:4:13,4:0.29:-0.56:1.000:0.992 0/0/0/0:4:16,1:0.10:-0.56:1.000:0.689 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,2:0.13: 0.28:1.000:0.875 0/0/0/1:4:16,7:0.32:-0.10:1.000:0.959 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.17:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:27,2:0.12: 0.35:1.000:0.809 0/0/0/1:4:33,6:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,5:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,5:0.26: 0.58:0.999:0.999 0/0/0/0:4:21,1:0.08:-0.18:1.000:0.987 0/0/0:3:13,1:0.13:-0.79:1.000:0.922 0/0/0/1:4:17,3:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:36,2:0.09: 1.04:1.000:0.912 0/0/0/1:4:23,6:0.28: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,6:0.28: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:18,5:0.28:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/0:4:20,1:0.08:-0.26:1.000:0.976 0/0/0/0:4:34,2:0.10: 0.89:1.000:0.831 0/0/0/0:4:49,3:0.10: 2.11:1.000:0.744 0/0/0/1:4:11,3:0.28:-0.79:1.000:0.995 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.20:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:24,1:0.07: 0.05:0.988:0.935 0/0/0/1:4:17,5:0.29:-0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:27,3:0.18: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.25:-1.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:21,1:0.08:-0.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:20,2:0.16:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-1.63:1.000:0.921 0/0/0/0:4:23,1:0.07:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:13,7:0.34:-0.33:1.000:0.887 0/0/0/1:4:28,5:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,1:0.16:-1.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,1:0.07: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,2:0.20:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,3:0.24:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,6:0.30:-0.18:1.000:0.980 0/0/0/1:4:22,5:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,5:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:22,1:0.08:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:2,3:0.44:-1.48:1.000:0.968 0/0/0/1:4:25,2:0.13: 0.20:1.000:0.922 0/0/0/0:4:48,1:0.04: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-1.63:1.000:0.921 0/0/0/1:4:40,7:0.25: 1.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,5:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:34,2:0.10: 0.89:1.000:0.831 0/0/0/1:4:23,4:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,3:0.20: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,5:0.26: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:26,4:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,3:0.12: 1.57:1.000:0.724 0/0/0/1:4:18,7:0.31: 0.05:1.000:0.977 0/0/0/1:4:11,6:0.34:-0.56:1.000:0.880 0/0/1/1:4:3,4:0.43:-1.32:1.000:0.944 0/0/0/1:4:28,3:0.17: 0.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,2:0.11: 0.51:1.000:0.623 0/0/0/1:4:28,2:0.12: 0.43:1.000:0.724 0/0/0/0:4:46,1:0.04: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,6:0.33:-0.49:1.000:0.921 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,1:0.06: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:16,1:0.10:-0.56:1.000:0.689 0/0/0/1:4:23,5:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/0:4:21,1:0.08:-0.18:1.000:0.987 0/0/0/0:4:16,1:0.10:-0.56:1.000:0.689 0/0/0/1:4:15,4:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,3:0.11: 1.80:1.000:0.513 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.38:-1.17:1.000:0.519 0/0/0/1:4:23,5:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,3:0.16: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/0:4:18,1:0.09:-0.41:1.000:0.912 0/0/0/1:4:17,3:0.25:-0.33:1.000:0.999 -chr1.1 35606739 chr1.1_035606739 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:288,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:179,73:.: 0.17:1.000:. ./.:4:146,138:.: 0.72:1.000:. ./.:4:212,88:.: 0.99:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:65,28:.:-2.58:1.000:. ./.:4:56,25:.:-2.78:1.000:. ./.:4:156,50:.:-0.63:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:179,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:166,126:.: 0.86:1.000:. ./.:4:230,65:.: 0.91:0.998:. ./.:4:191,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:252,78:.: 1.51:1.000:. ./.:4:261,67:.: 1.48:1.000:. ./.:4:54,20:.:-2.90:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:191,53:.: 0.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:166,140:.: 1.10:1.000:. ./.:4:140,145:.: 0.73:1.000:. ./.:4:192,59:.: 0.15:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:230,59:.: 0.80:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:181,72:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:70,23:.:-2.58:1.000:. ./.:3:22,8:.:-3.66:0.983:. ./.:4:255,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:162,131:.: 0.87:1.000:. ./.:4:139,114:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,89:.: 0.17:1.000:. ./.:4:172,131:.: 1.04:1.000:. ./.:4:128,131:.: 0.29:1.000:. ./.:4:181,63:.: 0.03:1.000:. ./.:4:222,69:.: 0.84:1.000:. ./.:4:147,139:.: 0.75:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:228,71:.: 0.98:1.000:. ./.:4:70,26:.:-2.53:1.000:. ./.:4:179,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:166,60:.:-0.28:1.000:. ./.:4:170,137:.: 1.11:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:221,63:.: 0.72:1.000:. ./.:4:230,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:111,111:.:-0.35:1.000:. ./.:4:205,75:.: 0.65:1.000:. ./.:4:156,135:.: 0.84:1.000:. ./.:6:135,95:.:-0.21:1.000:. ./.:4:120,131:.: 0.15:1.000:. ./.:4:177,57:.:-0.15:1.000:. ./.:4:221,73:.: 0.89:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:161,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:116,28:.:-1.70:1.000:. ./.:4:196,61:.: 0.25:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.04:0.910:. ./.:4:175,51:.:-0.28:1.000:. ./.:4:206,76:.: 0.68:1.000:. ./.:4:104,58:.:-1.39:1.000:. ./.:4:225,64:.: 0.80:1.000:. ./.:4:207,64:.: 0.49:1.000:. ./.:4:115,117:.:-0.18:1.000:. ./.:4:132,117:.: 0.11:1.000:. ./.:4:166,52:.:-0.42:1.000:. ./.:4:189,66:.: 0.22:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:162,56:.:-0.42:1.000:. ./.:4:201,63:.: 0.37:1.000:. ./.:4:204,90:.: 0.89:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:129,117:.: 0.06:1.000:. ./.:4:120,159:.: 0.63:1.000:. ./.:4:155,40:.:-0.82:1.000:. ./.:4:157,47:.:-0.66:1.000:. ./.:4:170,48:.:-0.42:1.000:. ./.:4:175,58:.:-0.16:1.000:. ./.:4:159,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:194,75:.: 0.46:1.000:. ./.:4:244,82:.: 1.44:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:173,61:.:-0.15:1.000:. ./.:4:191,46:.:-0.09:1.000:. ./.:4:213,71:.: 0.72:1.000:. ./.:4:208,60:.: 0.44:1.000:. ./.:4:101,29:.:-1.94:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:169,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,104:.:-0.73:1.000:. ./.:4:113,120:.:-0.16:1.000:. ./.:4:182,48:.:-0.21:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:226,78:.: 1.06:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:374,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:115,113:.:-0.25:0.999:. ./.:4:214,77:.: 0.84:1.000:. ./.:3:110,41:.:-1.58:1.000:. ./.:4:235,60:.: 0.91:1.000:. ./.:4:149,48:.:-0.78:1.000:. ./.:4:175,51:.:-0.28:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:186,58:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,130:.: 0.42:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:165,50:.:-0.47:1.000:. ./.:4:124,116:.:-0.04:1.000:. ./.:5:251,58:.: 1.15:0.988:. ./.:4:226,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:168,48:.:-0.46:1.000:. ./.:4:141,47:.:-0.94:1.000:. ./.:4:125,123:.: 0.10:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:128,37:.:-1.34:1.000:. ./.:4:126,118:.: 0.03:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:147,151:.: 0.96:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:117,118:.:-0.13:1.000:. ./.:4:161,51:.:-0.52:1.000:. ./.:4:194,54:.: 0.10:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:164,57:.:-0.37:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,44:.:-0.96:1.000:. ./.:4:248,64:.: 1.20:1.000:. ./.:4:243,70:.: 1.22:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:175,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:228,93:.: 1.36:1.000:. ./.:4:192,64:.: 0.23:1.000:. ./.:4:226,64:.: 0.82:1.000:. ./.:4:206,68:.: 0.54:1.000:. ./.:4:34,13:.:-3.37:1.000:. ./.:4:172,57:.:-0.23:1.000:. ./.:4:234,76:.: 1.17:1.000:. ./.:4:209,57:.: 0.41:1.000:. ./.:4:206,67:.: 0.53:1.000:. ./.:4:212,65:.: 0.60:1.000:. ./.:4:190,56:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,138:.: 0.25:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:187,57:.: 0.03:1.000:. ./.:4:206,55:.: 0.32:1.000:. ./.:4:202,73:.: 0.56:1.000:. ./.:4:136,161:.: 0.94:1.000:. ./.:4:231,54:.: 0.73:1.000:. ./.:4:98,111:.:-0.58:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:158,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:130,101:.:-0.20:1.000:. ./.:4:149,48:.:-0.78:1.000:. ./.:4:162,52:.:-0.49:1.000:. ./.:4:171,48:.:-0.40:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:181,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:231,71:.: 1.03:1.000:. ./.:4:201,76:.: 0.60:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:159,49:.:-0.59:1.000:. ./.:4:130,129:.: 0.29:1.000:. ./.:4:186,155:.: 1.70:1.000:. ./.:4:211,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:196,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:182,58:.:-0.04:1.000:. -chr1.1 35758205 chr1.1_035758205 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:163,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.57:0.998:. ./.:4:245,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:310,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.83:1.000:. ./.:3:49,0:.:-1.86:0.983:. ./.:4:133,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.57:1.000:. ./.:6:120,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:343,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.30:0.910:. ./.:4:135,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:296,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:221,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:156,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.58:0.999:. ./.:4:303,0:.: 1.92:1.000:. ./.:3:110,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:330,0:.: 2.33:1.000:. ./.:5:175,0:.: 0.02:0.988:. ./.:4:189,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:349,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.03:1.000:. -chr1.1 35847212 chr1.1_035847212 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,11:.:-0.94:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:20,35:.: 0.18:1.000:. ./.:4:15,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:20,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:43,24:.: 0.74:1.000:. ./.:4:24,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:37,30:.: 0.74:1.000:. ./.:4:18,29:.:-0.19:1.000:. ./.:4:16,7:.:-1.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:47,39:.: 1.63:1.000:. ./.:4:14,56:.: 0.88:1.000:. ./.:4:66,29:.: 2.05:1.000:. ./.:4:67,17:.: 1.54:1.000:. ./.:4:50,16:.: 0.70:0.998:. ./.:4:90,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:76,25:.: 2.33:1.000:. ./.:4:65,14:.: 1.30:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.64:1.000:. ./.:4:47,20:.: 0.74:1.000:. ./.:4:44,35:.: 1.30:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,7:.:-1.50:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:41,17:.: 0.32:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,32:.: 1.54:1.000:. ./.:4:35,19:.: 0.14:1.000:. ./.:4:40,17:.: 0.28:1.000:. ./.:4:4,4:.:-2.01:1.000:. ./.:4:17,11:.:-1.08:1.000:. ./.:3:3,9:.:-1.82:0.983:. ./.:4:20,22:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,21:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,20:.: 0.60:1.000:. ./.:4:55,12:.: 0.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:54,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.80:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:71,19:.: 1.82:1.000:. ./.:4:37,29:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:54,19:.: 1.02:1.000:. ./.:4:35,33:.: 0.79:1.000:. ./.:4:47,22:.: 0.84:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:23,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:45,11:.: 0.23:1.000:. ./.:4:16,13:.:-1.03:1.000:. ./.:4:68,14:.: 1.44:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.54:1.000:. ./.:6:39,18:.: 0.28:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.98:1.000:. ./.:4:44,47:.: 1.86:1.000:. ./.:4:46,22:.: 0.79:1.000:. ./.:4:65,16:.: 1.40:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:38,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:17,4:.:-1.40:1.000:. ./.:4:27,16:.:-0.38:1.000:. ./.:4:45,15:.: 0.42:0.910:. ./.:4:44,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:22,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,13:.:-0.24:1.000:. ./.:4:51,19:.: 0.88:1.000:. ./.:4:19,37:.: 0.23:1.000:. ./.:4:48,9:.: 0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,20:.:-0.61:1.000:. ./.:4:60,22:.: 1.44:1.000:. ./.:4:21,16:.:-0.66:1.000:. ./.:4:58,8:.: 0.70:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:36,17:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,15:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.98:1.000:. ./.:4:39,26:.: 0.65:1.000:. ./.:4:41,21:.: 0.51:1.000:. ./.:4:30,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:29,27:.: 0.23:1.000:. ./.:4:38,30:.: 0.79:1.000:. ./.:4:32,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:21,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:62,16:.: 1.26:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:74,32:.: 2.56:1.000:. ./.:4:5,6:.:-1.87:1.000:. ./.:4:31,10:.:-0.47:1.000:. ./.:4:45,16:.: 0.46:1.000:. ./.:4:54,23:.: 1.21:1.000:. ./.:4:14,13:.:-1.12:1.000:. ./.:4:54,7:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,19:.:-0.56:1.000:. ./.:4:40,16:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:16,22:.:-0.61:1.000:. ./.:4:61,17:.: 1.26:0.999:. ./.:4:33,0:.:-0.84:1.000:. ./.:3:5,15:.:-1.45:1.000:. ./.:4:16,21:.:-0.66:1.000:. ./.:4:22,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.19:1.000:. ./.:4:31,19:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,13:.: 0.93:1.000:. ./.:4:41,23:.: 0.60:1.000:. ./.:4:40,12:.: 0.04:1.000:. ./.:4:61,31:.: 1.91:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.98:1.000:. ./.:4:13,28:.:-0.47:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.26:1.000:. ./.:5:13,32:.:-0.28:0.988:. ./.:4:71,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:45,10:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,15:.:-1.26:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:17,34:.: 0.00:1.000:. ./.:4:30,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:10,30:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,13:.:-1.17:1.000:. ./.:4:27,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:13,7:.:-1.45:1.000:. ./.:4:27,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:48,18:.: 0.70:1.000:. ./.:4:50,21:.: 0.93:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:29,14:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.18:1.000:. ./.:4:18,17:.:-0.75:1.000:. ./.:4:9,21:.:-0.98:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.51:1.000:. ./.:4:40,25:.: 0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:16,18:.:-0.80:1.000:. ./.:4:51,36:.: 1.68:1.000:. ./.:4:4,12:.:-1.64:1.000:. ./.:4:41,18:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:28,37:.: 0.65:1.000:. ./.:4:19,11:.:-0.98:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:15,17:.:-0.89:1.000:. ./.:4:61,23:.: 1.54:1.000:. ./.:4:39,14:.: 0.09:1.000:. ./.:4:66,25:.: 1.86:1.000:. ./.:4:47,12:.: 0.37:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:50,18:.: 0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:39,19:.: 0.32:1.000:. ./.:4:46,38:.: 1.54:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.66:1.000:. ./.:4:19,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:34,30:.: 0.60:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:51,31:.: 1.44:1.000:. ./.:4:33,15:.:-0.14:1.000:. ./.:4:30,21:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:63,15:.: 1.26:1.000:. ./.:4:51,19:.: 0.88:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:22,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:48,29:.: 1.21:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.93:1.000:. -chr1.1 36130046 chr1.1_036130046 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.: 6.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,2:.: 0.78:0.983:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,2:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,2:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,3:.: 1.94:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.: 1.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:5:0,1:.:-0.38:0.988:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr1.1 37016138 chr1.1_037016138 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,52:0.64:-1.61:1.000:0.713 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,73:0.21: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,57:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,87:0.25: 1.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,47:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,64:0.22: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,49:0.57:-1.48:1.000:0.944 0/0/1/1:4:29,34:0.53:-1.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:39,62:0.58:-1.17:1.000:0.906 0/0/0/1:4:131,63:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,111:0.44: 1.23:1.000:0.973 0/0/1/1:4:148,152:0.51: 2.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:190,73:0.23: 1.51:0.998:1.000 0/1/1/1:4:59,130:0.63: 0.28:1.000:0.590 0/0/0/1:4:183,74:0.23: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,161:0.42: 3.29:1.000:0.917 0/0/0/1:4:31,12:0.23:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,75:0.35: 0.43:1.000:0.820 0/0/0/1:4:174,70:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,56:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.45:-1.83:1.000:0.984 0/0/0/1:4:151,67:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,84:0.24: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,47:0.19: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,57:0.18: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,154:0.49: 2.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:200,53:0.17: 1.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:113,50:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-2.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,16:0.22:-1.85:1.000:1.000 0/0/0:3:35,1:0.02:-2.24:0.983:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,50:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,57:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,61:0.36:-0.24:1.000:0.691 0/0/1/1:4:161,136:0.45: 2.07:1.000:0.982 0/0/0/1:4:104,56:0.31:-0.19:1.000:0.976 0/0/0/1:4:108,66:0.35: 0.04:1.000:0.815 0/0/0/1:4:126,42:0.20:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,42:0.28:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,41:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,50:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,80:0.30: 0.98:1.000:0.982 0/0/0/1:4:62,29:0.27:-1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,85:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,81:0.48:-0.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:127,65:0.29: 0.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:120,32:0.17:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,68:0.34: 0.19:1.000:0.887 0/0/0/1:4:101,45:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,39:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,88:0.46: 0.32:1.000:0.985 0/0/0/1:4:108,43:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:77,32:0.24:-1.04:1.000:0.638 0/0/0/1:4:94,44:0.27:-0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,104:0.52: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,49:0.36:-0.74:1.000:0.731 0/0/0/1:4:74,47:0.36:-0.84:1.000:0.693 0/0/0/1:4:154,56:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,48:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,34:0.21:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,49:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,53:0.25:-0.01:0.910:0.999 0/1/1/1:4:19,52:0.66:-1.66:1.000:0.883 0/0/0/1:4:104,58:0.32:-0.16:1.000:0.956 0/0/0/1:4:60,39:0.37:-1.20:1.000:0.602 0/1/1/1:4:17,40:0.64:-1.90:1.000:0.706 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,92:0.61:-0.54:1.000:0.640 0/0/1/1:4:73,53:0.40:-0.76:1.000:0.814 0/0/0/1:4:114,32:0.18:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,57:0.34:-0.29:1.000:0.897 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,50:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,37:0.59:-1.86:1.000:0.859 0/0/0/1:4:110,50:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,107:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,79:0.45: 0.00:1.000:0.984 0/0/0/1:4:132,50:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,72:0.46:-0.26:1.000:0.986 0/0/0/1:4:91,45:0.28:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,78:0.43: 0.07:1.000:0.954 0/0/0/1:4:102,43:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,79:0.46:-0.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:92,46:0.29:-0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:97,57:0.34:-0.29:1.000:0.897 0/0/0/1:4:133,36:0.17:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:133,49:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,38:0.21:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,96:0.80:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,135:0.48: 1.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:98,32:0.20:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,65:0.30: 0.28:1.000:0.985 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,41:0.27:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,82:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,85:0.45: 0.27:1.000:0.974 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,68:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,67:0.23: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,64:0.28: 0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,41:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:221,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,90:0.49: 0.22:0.999:0.996 0/0/0/1:4:114,51:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0:3:65,5:0.06:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,45:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,37:0.28:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,32:0.18:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,79:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,45:0.23:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,44:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,49:0.31:-0.56:1.000:0.965 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,45:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,56:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:184,47:0.17: 0.98:0.988:0.999 0/1/1/1:4:9,70:0.77:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,27:0.21:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,41:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,27:0.25:-1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,53:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,77:0.23: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,47:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,48:0.29:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:83,42:0.29:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,49:0.44:-1.02:1.000:0.960 0/0/0/1:4:88,51:0.33:-0.54:1.000:0.918 0/0/0/1:4:89,54:0.35:-0.48:1.000:0.833 0/0/0/1:4:133,65:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:68,39:0.33:-1.07:1.000:0.930 0/0/0/1:4:162,83:0.29: 1.21:1.000:0.990 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,97:0.45: 0.68:1.000:0.979 0/0/0/1:4:158,64:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,152:0.51: 2.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,107:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,60:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,52:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:228,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,71:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,53:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,150:0.50: 2.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,54:0.20: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,109:0.53: 0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:116,119:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,72:0.33: 0.42:1.000:0.925 0/0/0/1:4:137,63:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,48:0.21: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,61:0.31: 0.05:1.000:0.979 0/1/1/1:4:36,138:0.70: 0.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:130,83:0.36: 0.68:1.000:0.673 0/0/0/1:4:134,73:0.31: 0.58:1.000:0.971 0/0/0/1:4:132,67:0.29: 0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:123,36:0.18:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,58:0.27: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,48:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,41:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,104:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:189,84:0.25: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,66:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,70:0.28: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,113:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,82:0.28: 1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,92:0.25: 2.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,87:0.24: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,64:0.32: 0.09:1.000:0.943 0/1/1/1:4:26,134:0.73:-0.19:1.000:0.998 -chr1.1 37235555 chr1.1_037235555 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:321,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:248,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:108,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:325,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:257,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.30:0.998:. ./.:4:207,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:357,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:120,1:.:-2.24:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.77:1.000:. ./.:3:71,0:.:-2.99:0.983:. ./.:4:237,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:189,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:358,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:61,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.23:1.000:. ./.:6:233,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.60:0.910:. ./.:4:245,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:358,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:289,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:221,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:373,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:344,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:409,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:309,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:289,0:.: 0.29:1.000:. ./.:3:140,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:279,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:335,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:298,1:.: 0.44:1.000:. ./.:5:363,1:.: 1.42:0.988:. ./.:4:194,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:243,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:408,2:.: 2.11:1.000:. ./.:4:386,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:360,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:354,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:263,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.18:1.000:. -chr1.1 37514123 chr1.1_037514123 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:80,20:.: 0.64:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:55,51:.: 0.85:1.000:. ./.:4:73,27:.: 0.64:1.000:. ./.:4:81,67:.: 2.25:1.000:. ./.:4:72,37:.: 0.95:1.000:. ./.:4:23,22:.:-1.19:1.000:. ./.:4:44,57:.: 0.68:1.000:. ./.:4:61,47:.: 0.91:1.000:. ./.:4:8,5:.:-2.26:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.49:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:37,62:.: 0.61:1.000:. ./.:4:67,56:.: 1.41:1.000:. ./.:4:44,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:52,65:.: 1.21:1.000:. ./.:4:32,52:.: 0.11:0.998:. ./.:4:58,39:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,71:.: 0.88:1.000:. ./.:4:57,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:6,8:.:-2.22:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:42,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,4:.:-2.52:1.000:. ./.:4:80,23:.: 0.75:1.000:. ./.:4:82,13:.: 0.48:1.000:. ./.:4:41,52:.: 0.41:1.000:. ./.:4:46,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,63:.: 0.78:1.000:. ./.:4:57,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,30:.: 1.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:7,7:.:-2.22:1.000:. ./.:3:2,3:.:-2.52:0.983:. ./.:4:101,28:.: 1.61:1.000:. ./.:4:70,24:.: 0.44:1.000:. ./.:4:89,43:.: 1.71:1.000:. ./.:4:26,34:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:69,21:.: 0.31:1.000:. ./.:4:32,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:74,22:.: 0.51:1.000:. ./.:4:46,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:31,19:.:-1.02:1.000:. ./.:4:35,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,2:.:-2.59:1.000:. ./.:4:23,18:.:-1.32:1.000:. ./.:4:28,16:.:-1.22:1.000:. ./.:4:27,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:82,34:.: 1.18:1.000:. ./.:4:37,22:.:-0.72:1.000:. ./.:4:82,43:.: 1.48:1.000:. ./.:4:46,62:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,13:.:-1.02:1.000:. ./.:4:65,40:.: 0.81:1.000:. ./.:4:37,20:.:-0.79:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.09:1.000:. ./.:6:34,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:45,37:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,54:.: 0.48:1.000:. ./.:4:32,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:33,19:.:-0.96:1.000:. ./.:4:51,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:49,12:.:-0.66:1.000:. ./.:4:32,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:28,40:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,23:.:-0.79:0.910:. ./.:4:146,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.89:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:74,38:.: 1.05:1.000:. ./.:4:111,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:42,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:35,38:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:52,49:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,25:.:-0.72:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,15:.:-1.42:1.000:. ./.:4:72,36:.: 0.91:1.000:. ./.:4:29,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:56,16:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,15:.:-0.92:1.000:. ./.:4:55,55:.: 0.98:1.000:. ./.:4:36,30:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.82:1.000:. ./.:4:25,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.56:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:54,43:.: 0.54:1.000:. ./.:4:43,21:.:-0.56:1.000:. ./.:4:39,10:.:-1.06:1.000:. ./.:4:36,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:70,20:.: 0.31:1.000:. ./.:4:26,35:.:-0.66:1.000:. ./.:4:33,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:39,47:.: 0.18:1.000:. ./.:4:49,30:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,28:.: 1.05:1.000:. ./.:4:54,33:.: 0.21:1.000:. ./.:4:45,20:.:-0.52:1.000:. ./.:4:97,47:.: 2.11:1.000:. ./.:4:31,42:.:-0.26:0.999:. ./.:4:45,22:.:-0.46:1.000:. ./.:3:16,16:.:-1.62:1.000:. ./.:4:56,49:.: 0.81:1.000:. ./.:4:29,28:.:-0.79:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:39,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:44,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:50,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,18:.:-1.19:1.000:. ./.:4:33,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:86,30:.: 1.18:1.000:. ./.:4:46,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:62,26:.: 0.24:1.000:. ./.:5:69,39:.: 0.91:0.988:. ./.:4:55,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:18,33:.:-0.99:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:61,18:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,76:.: 1.61:1.000:. ./.:4:16,33:.:-1.06:1.000:. ./.:4:65,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:54,47:.: 0.68:1.000:. ./.:4:96,53:.: 2.28:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.26:1.000:. ./.:4:55,41:.: 0.51:1.000:. ./.:4:51,39:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,53:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,17:.:-1.06:1.000:. ./.:4:22,26:.:-1.09:1.000:. ./.:4:63,28:.: 0.34:1.000:. ./.:4:40,19:.:-0.72:1.000:. ./.:4:70,41:.: 1.01:1.000:. ./.:4:70,65:.: 1.81:1.000:. ./.:4:74,20:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,25:.: 0.01:1.000:. ./.:4:83,30:.: 1.08:1.000:. ./.:4:56,21:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,60:.: 2.35:1.000:. ./.:4:43,66:.: 0.95:1.000:. ./.:4:7,2:.:-2.39:1.000:. ./.:4:36,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:41,28:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,58:.: 1.51:1.000:. ./.:4:74,51:.: 1.48:1.000:. ./.:4:47,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:34,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:49,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:44,26:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:45,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,10:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,55:.: 0.44:1.000:. ./.:4:72,20:.: 0.38:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:32,45:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,52:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,43:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,43:.: 0.44:1.000:. ./.:4:49,49:.: 0.58:1.000:. ./.:4:43,26:.:-0.39:1.000:. ./.:4:24,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,22:.:-0.96:1.000:. ./.:4:108,31:.: 1.95:1.000:. ./.:4:75,29:.: 0.78:1.000:. ./.:4:39,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:47,51:.: 0.58:1.000:. ./.:4:73,31:.: 0.78:1.000:. ./.:4:86,47:.: 1.75:1.000:. ./.:4:105,36:.: 2.01:1.000:. ./.:4:35,20:.:-0.86:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.28:1.000:. -chr1.1 37725360 chr1.1_037725360 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:157,31:0.21: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,87:0.54:-0.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:124,37:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,57:0.42:-0.68:1.000:0.920 0/1/1/1:4:70,155:0.70: 0.90:1.000:0.986 0/0/0/1:4:148,44:0.28: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,33:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,84:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,39:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,26:0.43:-2.60:1.000:0.934 0/1/1/1:4:16,24:0.63:-3.28:1.000:0.542 0/0/1/1:4:108,88:0.51: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:147,43:0.27: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,54:0.30: 0.62:1.000:0.984 0/0/1/1:4:88,63:0.47:-0.77:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,91:0.68:-1.07:1.000:0.945 0/1/1/1:4:51,132:0.73:-0.05:0.998:0.997 0/0/1/1:4:96,81:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,114:0.53: 1.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:114,71:0.44:-0.01:1.000:0.965 0/0/0/1:4:42,18:0.35:-2.83:1.000:0.791 0/0/0/1:4:153,43:0.27: 0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:176,55:0.28: 1.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,77:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,13:0.26:-2.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,164:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,93:0.75:-1.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,118:0.70:-0.30:1.000:0.984 0/0/1/1:4:111,79:0.47: 0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,72:0.48:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,101:0.48: 1.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:123,24:0.21:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,1:0.09:-3.55:1.000:0.942 0/0/1/1:4:69,35:0.39:-1.84:1.000:0.677 0/1/1:3:3,13:0.81:-3.82:0.983:0.995 0/0/0/1:4:182,41:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,86:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,101:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,109:0.56: 0.53:1.000:0.959 0/1/1/1:4:55,142:0.73: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,79:0.45: 0.31:1.000:0.982 0/0/1/1:4:97,92:0.54: 0.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:102,115:0.57: 0.71:1.000:0.943 0/1/1/1:4:52,123:0.71:-0.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:204,49:0.24: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,82:0.47: 0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:124,89:0.47: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:19,16:0.51:-3.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,90:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:159,53:0.30: 0.60:1.000:0.987 0/0/1/1:4:114,89:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,104:0.48: 1.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,72:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,130:0.54: 1.73:1.000:0.985 0/0/1/1:4:92,61:0.45:-0.73:1.000:0.984 0/0/1/1:4:105,101:0.54: 0.47:1.000:0.988 0/1/1/1:4:41,118:0.74:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,111:0.52: 1.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,135:0.72: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:98,76:0.49:-0.26:1.000:0.887 0/0/1/1:4:122,68:0.41: 0.11:1.000:0.871 0/0/1/1:4:92,79:0.52:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,111:0.52: 1.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:190,40:0.22: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,145:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,70:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:209,38:0.20: 1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,123:0.69:-0.10:1.000:0.978 0/0/0/1:4:212,53:0.25: 1.80:0.910:1.000 0/0/1/1:4:105,62:0.43:-0.41:1.000:0.933 0/0/1/1:4:130,108:0.51: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,52:0.44:-1.16:1.000:0.972 0/0/1/1:4:133,98:0.48: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,87:0.49: 0.38:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,183:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,76:0.47:-0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:61,150:0.72: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,83:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:178,17:0.14: 0.22:1.000:0.963 0/0/0/1:4:200,48:0.24: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,79:0.52:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,91:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:114,90:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,46:0.33:-0.50:1.000:0.915 0/1/1/1:4:68,163:0.71: 1.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:152,105:0.46: 1.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:93,72:0.49:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,46:0.31:-0.23:1.000:0.972 0/0/1/1:4:105,102:0.54: 0.49:1.000:0.987 0/0/0/1:4:190,39:0.22: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,94:0.56:-0.10:1.000:0.962 0/0/0/1:4:155,45:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,101:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,64:0.47:-0.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:128,77:0.43: 0.44:1.000:0.946 0/0/1/1:4:113,106:0.53: 0.76:1.000:0.991 0/0/1/1:4:96,72:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,126:0.71:-0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:123,86:0.47: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:122,98:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,39:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,48:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,45:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,48:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,103:0.71:-0.84:1.000:0.990 0/1/1/1:4:50,116:0.71:-0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:101,57:0.41:-0.62:1.000:0.888 0/0/0/1:4:143,47:0.29: 0.11:1.000:0.989 0/0/1/1:4:142,88:0.44: 1.01:1.000:0.962 0/0/1/1:4:128,82:0.45: 0.56:1.000:0.975 0/0/1/1:4:98,78:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,50:0.25: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,138:0.68: 0.51:0.999:0.954 0/1/1/1:4:65,133:0.69: 0.29:1.000:0.968 0/1/1:3:47,76:0.64:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,110:0.46: 1.98:1.000:0.987 0/1/1/1:4:47,127:0.73:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:157,46:0.27: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,88:0.44: 0.96:1.000:0.968 0/0/1/1:4:103,74:0.47:-0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,73:0.45: 0.04:1.000:0.975 0/0/1/1:4:108,88:0.51: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:183,43:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,31:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,83:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,95:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:176,93:0.40: 1.89:0.988:0.971 0/1/1/1:4:45,122:0.73:-0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,66:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,62:0.43:-0.41:1.000:0.933 0/1/1/1:4:55,111:0.68:-0.44:1.000:0.963 0/0/0/1:4:112,36:0.29:-0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,66:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,116:0.69:-0.32:1.000:0.977 0/0/0/1:4:135,30:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,165:0.76: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,80:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,125:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,33:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,75:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:192,36:0.21: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,84:0.46: 0.51:1.000:0.987 0/0/1/1:4:93,89:0.54:-0.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:177,45:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,54:0.29: 0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:134,103:0.49: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,39:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,86:0.53:-0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:160,45:0.27: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:112,94:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,90:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,56:0.46:-1.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,27:0.51:-2.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,43:0.50:-1.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,113:0.51: 1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,42:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,97:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,122:0.70:-0.21:1.000:0.988 0/1/1/1:4:33,121:0.79:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,155:0.75: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,65:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,55:0.51:-1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,80:0.52:-0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,48:0.41:-1.14:1.000:0.856 0/1/1/1:4:33,104:0.76:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,71:0.47:-0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,65:0.51:-0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,113:0.69:-0.39:1.000:0.969 0/0/1/1:4:94,74:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,33:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,53:0.44:-1.05:1.000:0.960 0/0/1/1:4:85,56:0.45:-1.00:1.000:0.982 0/0/0/1:4:168,48:0.27: 0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,73:0.43: 0.15:1.000:0.957 0/0/0/1:4:165,43:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,71:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,39:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,64:0.29: 1.66:1.000:0.989 0/0/0/1:4:155,39:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,66:0.54:-1.16:1.000:0.987 0/0/1/1:4:98,78:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,150:0.70: 0.78:1.000:0.980 0/0/0/1:4:144,53:0.32: 0.26:1.000:0.959 0/0/1/1:4:95,70:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:68,113:0.65:-0.10:1.000:0.776 -chr1.1 38307940 chr1.1_038307940 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:173,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.67:0.998:. ./.:4:80,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.52:1.000:. ./.:3:23,0:.:-2.66:0.983:. ./.:4:173,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.07:1.000:. ./.:6:128,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:0.910:. ./.:4:172,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.75:0.999:. ./.:4:114,0:.:-0.51:1.000:. ./.:3:93,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:227,0:.: 2.15:0.988:. ./.:4:82,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:1.000:. -chr1.1 38471232 chr1.1_038471232 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:193,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:164,18:.: 0.81:1.000:. ./.:4:219,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:39,9:.:-2.67:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:168,11:.: 0.73:1.000:. ./.:4:128,10:.:-0.33:0.998:. ./.:4:157,10:.: 0.42:1.000:. ./.:4:184,13:.: 1.20:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:40,7:.:-2.70:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:119,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:119,8:.:-0.62:1.000:. ./.:4:135,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:114,10:.:-0.70:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:19,0:.:-3.43:0.983:. ./.:4:199,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:136,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:151,9:.: 0.24:1.000:. ./.:4:116,7:.:-0.72:1.000:. ./.:4:134,13:.:-0.10:1.000:. ./.:4:117,10:.:-0.62:1.000:. ./.:4:110,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:102,7:.:-1.09:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:138,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:102,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:115,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:173,16:.: 0.99:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:135,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:145,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:136,12:.:-0.07:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:128,12:.:-0.28:1.000:. ./.:6:105,15:.:-0.80:1.000:. ./.:4:125,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:138,13:.: 0.00:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:147,15:.: 0.29:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:122,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.19:0.910:. ./.:4:140,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:133,13:.:-0.13:1.000:. ./.:4:104,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:145,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:127,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:108,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:148,11:.: 0.21:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:90,12:.:-1.27:1.000:. ./.:4:151,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:158,12:.: 0.50:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:125,9:.:-0.44:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:141,16:.: 0.16:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,9:.:-1.22:1.000:. ./.:4:127,15:.:-0.23:1.000:. ./.:4:124,17:.:-0.26:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:224,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:127,15:.:-0.23:0.999:. ./.:4:143,16:.: 0.21:1.000:. ./.:3:75,8:.:-1.76:1.000:. ./.:4:129,14:.:-0.20:1.000:. ./.:4:119,11:.:-0.54:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:148,11:.: 0.21:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.68:1.000:. ./.:5:183,0:.: 0.84:0.988:. ./.:4:107,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:94,7:.:-1.29:1.000:. ./.:4:86,7:.:-1.50:1.000:. ./.:4:107,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:88,8:.:-1.42:1.000:. ./.:4:131,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:158,13:.: 0.52:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:102,12:.:-0.96:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:91,13:.:-1.22:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:147,13:.: 0.24:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:239,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:151,12:.: 0.32:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:241,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:109,12:.:-0.78:1.000:. ./.:4:133,14:.:-0.10:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:28,1:.:-3.17:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:148,9:.: 0.16:1.000:. ./.:4:238,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:156,18:.: 0.60:1.000:. ./.:4:131,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:111,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:124,10:.:-0.44:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:138,13:.: 0.00:1.000:. ./.:4:134,3:.:-0.36:1.000:. ./.:4:158,10:.: 0.45:1.000:. ./.:4:123,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:114,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:113,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:120,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:147,17:.: 0.34:1.000:. ./.:4:163,21:.: 0.86:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:139,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.24:1.000:. -chr1.1 38598815 chr1.1_038598815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:67,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:30,2:.:-1.45:1.000:. ./.:4:52,4:.:-0.33:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:107,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.68:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.74:0.998:. ./.:4:56,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:18,2:.:-2.00:1.000:. ./.:4:37,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:48,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:26,4:.:-1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:36,4:.:-1.07:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.80:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:69,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:65,3:.: 0.23:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.47:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:71,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.19:1.000:. ./.:6:66,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:68,4:.: 0.41:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.04:0.910:. ./.:4:28,5:.:-1.40:1.000:. ./.:4:63,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:41,3:.:-0.89:1.000:. ./.:4:38,7:.:-0.84:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:71,3:.: 0.51:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:52,3:.:-0.38:1.000:. ./.:4:33,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:85,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:58,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:141,0:.: 3.62:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:70,11:.: 0.83:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:54,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,3:.:-0.38:1.000:. ./.:4:61,5:.: 0.13:1.000:. ./.:4:86,6:.: 1.34:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:135,0:.: 3.34:0.999:. ./.:4:112,0:.: 2.27:1.000:. ./.:3:33,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:61,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:45,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:80,6:.: 1.06:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.92:1.000:. ./.:5:109,0:.: 2.13:0.988:. ./.:4:53,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:73,4:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:63,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:71,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:89,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:77,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:43,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:80,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:33,3:.:-1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,2:.: 1.16:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:72,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:74,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:54,4:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.56:1.000:. -chr1.1 38750613 chr1.1_038750613 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:120,87:.: 0.32:1.000:. ./.:4:86,53:.:-1.07:1.000:. ./.:4:113,64:.:-0.29:1.000:. ./.:4:145,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:190,74:.: 1.48:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:139,67:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,52:.:-0.84:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:39,6:.:-2.98:1.000:. ./.:4:85,58:.:-0.98:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:140,65:.: 0.28:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:165,65:.: 0.79:0.998:. ./.:4:121,54:.:-0.33:1.000:. ./.:4:226,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:37,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.60:1.000:. ./.:4:144,56:.: 0.18:1.000:. ./.:4:133,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:129,46:.:-0.33:1.000:. ./.:4:175,78:.: 1.26:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:158,68:.: 0.71:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:7,7:.:-3.62:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.84:1.000:. ./.:3:6,14:.:-3.49:0.983:. ./.:4:134,60:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:257,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:163,60:.: 0.65:1.000:. ./.:4:154,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:194,64:.: 1.36:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:135,69:.: 0.26:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:154,81:.: 0.89:1.000:. ./.:4:173,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:155,65:.: 0.59:1.000:. ./.:4:146,59:.: 0.28:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:142,63:.: 0.28:1.000:. ./.:6:170,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:216,74:.: 2.01:1.000:. ./.:4:156,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:168,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.22:0.910:. ./.:4:85,64:.:-0.86:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:130,71:.: 0.20:1.000:. ./.:4:136,63:.: 0.16:1.000:. ./.:4:103,137:.: 0.99:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:157,46:.: 0.24:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:164,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:104,46:.:-0.84:1.000:. ./.:4:174,66:.: 0.99:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:135,45:.:-0.23:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:134,55:.:-0.05:1.000:. ./.:4:220,68:.: 1.97:1.000:. ./.:4:172,55:.: 0.73:1.000:. ./.:4:132,73:.: 0.28:1.000:. ./.:4:125,56:.:-0.21:1.000:. ./.:4:140,81:.: 0.61:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:101,30:.:-1.23:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:135,64:.: 0.16:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:182,60:.: 1.04:1.000:. ./.:4:159,67:.: 0.71:1.000:. ./.:4:169,61:.: 0.79:1.000:. ./.:4:125,66:.: 0.00:1.000:. ./.:4:229,1:.: 0.79:0.999:. ./.:4:141,57:.: 0.14:1.000:. ./.:3:80,64:.:-0.96:1.000:. ./.:4:161,80:.: 1.02:1.000:. ./.:4:139,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:158,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,80:.: 0.44:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:160,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:114,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:141,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:174,83:.: 1.34:1.000:. ./.:5:210,63:.: 1.67:0.988:. ./.:4:132,41:.:-0.37:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:97,51:.:-0.88:1.000:. ./.:4:155,48:.: 0.24:1.000:. ./.:4:127,69:.: 0.10:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:168,84:.: 1.24:1.000:. ./.:4:162,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:211,86:.: 2.16:1.000:. ./.:4:187,77:.: 1.48:1.000:. ./.:4:141,63:.: 0.26:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,63:.: 0.16:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:163,69:.: 0.83:1.000:. ./.:4:124,47:.:-0.41:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:153,57:.: 0.38:1.000:. ./.:4:130,69:.: 0.16:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,8:.:-3.43:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:218,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:140,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:160,67:.: 0.73:1.000:. ./.:4:137,62:.: 0.16:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,66:.: 0.18:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,61:.: 0.30:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:132,56:.:-0.07:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:108,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:192,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:213,71:.: 1.89:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:123,66:.:-0.05:1.000:. -chr1.1 38795094 chr1.1_038795094 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,96:.: 0.59:1.000:. ./.:4:19,59:.:-0.72:1.000:. ./.:4:87,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:73,34:.:-0.15:1.000:. ./.:4:68,93:.: 0.91:1.000:. ./.:4:79,167:.: 2.58:1.000:. ./.:4:35,21:.:-1.16:1.000:. ./.:4:103,88:.: 1.50:1.000:. ./.:4:52,30:.:-0.65:1.000:. ./.:4:5,5:.:-2.06:1.000:. ./.:4:8,27:.:-1.57:1.000:. ./.:4:44,93:.: 0.44:1.000:. ./.:4:75,40:.: 0.00:1.000:. ./.:4:95,54:.: 0.67:1.000:. ./.:4:28,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:84,132:.: 1.99:1.000:. ./.:4:82,87:.: 1.07:0.998:. ./.:4:21,56:.:-0.74:1.000:. ./.:4:110,115:.: 2.17:1.000:. ./.:4:125,31:.: 0.81:1.000:. ./.:4:10,2:.:-2.02:1.000:. ./.:4:56,82:.: 0.46:1.000:. ./.:4:80,78:.: 0.85:1.000:. ./.:4:76,84:.: 0.89:1.000:. ./.:4:5,4:.:-2.08:1.000:. ./.:4:62,84:.: 0.61:1.000:. ./.:4:33,57:.:-0.49:1.000:. ./.:4:47,122:.: 1.07:1.000:. ./.:4:80,40:.: 0.10:1.000:. ./.:4:119,30:.: 0.67:1.000:. ./.:4:71,55:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,74:.: 0.14:1.000:. ./.:4:11,3:.:-1.98:1.000:. ./.:4:4,5:.:-2.08:1.000:. ./.:3:2,1:.:-2.20:0.983:. ./.:4:56,90:.: 0.61:1.000:. ./.:4:70,94:.: 0.97:1.000:. ./.:4:90,26:.: 0.02:1.000:. ./.:4:36,88:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,126:.: 1.24:1.000:. ./.:4:32,90:.: 0.14:1.000:. ./.:4:17,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:58,63:.: 0.12:1.000:. ./.:4:19,64:.:-0.63:1.000:. ./.:4:22,34:.:-1.16:1.000:. ./.:4:79,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:27,39:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,30:.:-1.31:1.000:. ./.:4:22,46:.:-0.92:1.000:. ./.:4:16,55:.:-0.86:1.000:. ./.:4:31,63:.:-0.41:1.000:. ./.:4:18,112:.: 0.30:1.000:. ./.:4:25,74:.:-0.31:1.000:. ./.:4:55,96:.: 0.71:1.000:. ./.:4:29,60:.:-0.51:1.000:. ./.:4:20,30:.:-1.27:1.000:. ./.:4:28,78:.:-0.17:1.000:. ./.:4:32,61:.:-0.43:1.000:. ./.:4:42,46:.:-0.53:1.000:. ./.:6:16,65:.:-0.66:1.000:. ./.:4:36,70:.:-0.17:1.000:. ./.:4:62,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,11:.:-1.04:1.000:. ./.:4:54,52:.:-0.17:1.000:. ./.:4:38,69:.:-0.15:1.000:. ./.:4:51,101:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,39:.:-0.70:1.000:. ./.:4:74,129:.: 1.74:1.000:. ./.:4:51,39:.:-0.49:0.910:. ./.:4:28,71:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,82:.: 0.02:1.000:. ./.:4:10,46:.:-1.16:1.000:. ./.:4:21,37:.:-1.12:1.000:. ./.:4:34,23:.:-1.14:1.000:. ./.:4:18,46:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:46,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:70,71:.: 0.52:1.000:. ./.:4:99,82:.: 1.30:1.000:. ./.:4:54,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:23,31:.:-1.20:1.000:. ./.:4:53,54:.:-0.15:1.000:. ./.:4:35,56:.:-0.47:1.000:. ./.:4:40,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:32,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:49,68:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,54:.:-0.57:1.000:. ./.:4:40,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:47,69:.: 0.02:1.000:. ./.:4:60,77:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,42:.:-0.78:1.000:. ./.:4:55,72:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,51:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,58:.: 0.12:1.000:. ./.:4:77,80:.: 0.83:1.000:. ./.:4:79,98:.: 1.22:1.000:. ./.:4:53,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,61:.:-0.80:1.000:. ./.:4:32,91:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,73:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,39:.:-1.22:1.000:. ./.:4:44,44:.:-0.53:1.000:. ./.:4:37,36:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,26:.:-0.86:1.000:. ./.:4:78,106:.: 1.36:1.000:. ./.:4:18,59:.:-0.74:1.000:. ./.:4:51,78:.: 0.28:1.000:. ./.:4:53,106:.: 0.87:1.000:. ./.:4:72,69:.: 0.52:1.000:. ./.:4:74,58:.: 0.34:1.000:. ./.:4:107,186:.: 3.51:1.000:. ./.:4:60,69:.: 0.28:0.999:. ./.:4:47,60:.:-0.15:1.000:. ./.:3:43,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:37,97:.: 0.38:1.000:. ./.:4:52,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:51,47:.:-0.33:1.000:. ./.:4:29,37:.:-0.96:1.000:. ./.:4:16,59:.:-0.78:1.000:. ./.:4:95,22:.: 0.04:1.000:. ./.:4:57,63:.: 0.10:1.000:. ./.:4:74,110:.: 1.36:1.000:. ./.:4:66,69:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,34:.:-0.33:1.000:. ./.:4:43,60:.:-0.23:1.000:. ./.:5:27,63:.:-0.49:0.988:. ./.:4:10,51:.:-1.06:1.000:. ./.:4:50,11:.:-1.06:1.000:. ./.:4:16,53:.:-0.90:1.000:. ./.:4:29,14:.:-1.41:1.000:. ./.:4:91,120:.: 1.89:1.000:. ./.:4:26,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:32,77:.:-0.11:1.000:. ./.:4:38,43:.:-0.66:1.000:. ./.:4:88,76:.: 0.97:1.000:. ./.:4:62,108:.: 1.09:1.000:. ./.:4:43,59:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,39:.:-0.88:1.000:. ./.:4:35,12:.:-1.33:1.000:. ./.:4:72,65:.: 0.44:1.000:. ./.:4:41,40:.:-0.66:1.000:. ./.:4:24,64:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,66:.:-0.29:1.000:. ./.:4:88,134:.: 2.11:1.000:. ./.:4:58,72:.: 0.30:1.000:. ./.:4:80,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:74,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:77,135:.: 1.91:1.000:. ./.:4:68,47:.: 0.00:1.000:. ./.:4:99,167:.: 2.97:1.000:. ./.:4:72,77:.: 0.67:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.06:1.000:. ./.:4:67,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:65,84:.: 0.67:1.000:. ./.:4:71,69:.: 0.50:1.000:. ./.:4:85,101:.: 1.40:1.000:. ./.:4:115,97:.: 1.91:1.000:. ./.:4:72,40:.:-0.05:1.000:. ./.:4:45,78:.: 0.16:1.000:. ./.:4:95,83:.: 1.24:1.000:. ./.:4:86,21:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,135:.: 1.91:1.000:. ./.:4:57,70:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,45:.:-1.06:1.000:. ./.:4:82,67:.: 0.67:1.000:. ./.:4:36,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:19,89:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,41:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,92:.: 0.93:1.000:. ./.:4:34,63:.:-0.35:1.000:. ./.:4:60,66:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,120:.: 1.36:1.000:. ./.:4:56,105:.: 0.91:1.000:. ./.:4:54,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,39:.:-0.63:1.000:. ./.:4:52,59:.:-0.07:1.000:. ./.:4:78,90:.: 1.05:1.000:. ./.:4:50,105:.: 0.79:1.000:. ./.:4:49,82:.: 0.32:1.000:. ./.:4:23,81:.:-0.21:1.000:. ./.:4:114,103:.: 2.01:1.000:. ./.:4:117,137:.: 2.74:1.000:. ./.:4:35,59:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,67:.:-0.39:1.000:. -chr1.1 39099328 chr1.1_039099328 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:39,35:0.40: 1.43:1.000:0.761 0/0/1/1:4:20,45:0.62: 0.94:1.000:0.582 0/0/0/1:4:48,39:0.35: 2.14:1.000:0.765 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,34:0.28: 1.92:1.000:0.994 0/0/0/1:4:27,21:0.33: 0.02:1.000:0.904 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,36:0.37: 1.70:1.000:0.615 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,40:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,24:0.32: 0.45:1.000:0.959 0/0/0/1:4:35,26:0.31: 0.73:1.000:0.967 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.29:0.998:1.000 0/0/0/1:4:64,33:0.22: 2.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,26:0.17: 2.68:1.000:0.998 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.04:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,20:0.16: 1.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:48,38:0.34: 2.09:1.000:0.859 0/0/0/1:4:43,18:0.19: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.24:-2.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,28:0.28: 1.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:4,2:0.21:-2.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.18:-2.21:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:44,32:0.30: 1.54:1.000:0.981 0/0/0/1:4:40,28:0.29: 1.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,27:0.46: 0.29:1.000:0.988 0/0/0/1:4:36,25:0.28: 0.73:1.000:0.994 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,17:0.33:-0.47:1.000:0.917 0/0/0/1:4:31,24:0.33: 0.40:1.000:0.913 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,21:0.29: 0.18:1.000:0.993 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.19: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,18:0.47:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,13:0.30:-0.91:1.000:0.984 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,33:0.41: 1.16:1.000:0.838 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,31:0.39: 1.00:1.000:0.701 0/0/0/1:4:40,33:0.36: 1.38:1.000:0.693 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:14,25:0.58:-0.47:1.000:0.510 0/0/1/1:4:15,17:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,18:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.15:-1.67:1.000:0.989 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.21: 0.29:0.910:1.000 0/1/1/1:4:2,45:0.83:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,18:0.19: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,8:0.24:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,36:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,26:0.28: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,17:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,18:0.17: 1.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,28:0.39: 0.67:1.000:0.639 0/0/0/1:4:47,25:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,25:0.72:-0.96:1.000:0.996 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,23:0.36: 0.18:1.000:0.715 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,29:0.39: 0.78:1.000:0.662 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,28:0.54: 0.02:1.000:0.988 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,17:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,19:0.32:-0.20:1.000:0.943 0/0/0/1:4:41,18:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,16:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,9:0.32:-1.45:1.000:0.959 0/0/0/1:4:26,11:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.44:-1.29:1.000:0.974 0/0/0/1:4:40,25:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,13:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,17:0.33:-0.47:1.000:0.917 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,16:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,19:0.18: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,35:0.26: 2.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.12:0.999:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0:3:23,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.38:-0.47:1.000:0.522 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,23:0.39: 0.07:1.000:0.695 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,16:0.30:-0.52:1.000:0.981 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,18:0.21: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,34:0.34: 1.60:1.000:0.863 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:39,0:0.00:-0.47:0.988:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,14:0.19:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,17:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,26:0.30: 0.78:1.000:0.984 0/0/0/1:4:25,8:0.16:-0.80:1.000:0.993 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,20:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,16:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.41:-1.01:1.000:0.887 0/0/1/1:4:21,19:0.40:-0.42:1.000:0.793 0/0/0/1:4:30,12:0.18:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,10:0.22:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,32:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,28:0.26: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,25:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,35:0.44: 1.22:1.000:0.974 0/0/1/1:4:25,24:0.43: 0.07:1.000:0.937 0/0/0/1:4:34,20:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.21:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,28:0.25: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,22:0.31: 0.24:1.000:0.976 0/0/0/1:4:44,25:0.23: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,18:0.16: 1.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,27:0.34: 0.73:1.000:0.850 0/0/1/1:4:21,31:0.55: 0.24:1.000:0.982 0/0/0/1:4:32,20:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,20:0.17: 1.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:49,16:0.16: 0.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:24,18:0.32:-0.31:1.000:0.959 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,31:0.46: 0.73:1.000:0.987 0/0/0/1:4:43,26:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,20:0.20: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,38:0.39: 1.81:1.000:0.690 0/0/0/1:4:33,22:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,26:0.18: 2.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:45,5:0.06: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,26:0.31: 0.73:1.000:0.967 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,31:0.34: 1.22:1.000:0.847 0/0/0/1:4:32,19:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,39:0.60: 0.56:1.000:0.751 -chr1.1 39649704 chr1.1_039649704 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:22,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.82:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.82:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:33,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.82:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.01:0.910:. ./.:4:57,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:71,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:41,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.75:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.82:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:12,1:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.82:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.58:1.000:. -chr1.1 39750391 chr1.1_039750391 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:108,55:0.35: 1.66:1.000:0.795 0/1/1/1:4:34,70:0.67: 0.12:1.000:0.925 0/1/1/1:4:34,60:0.63:-0.14:1.000:0.538 0/0/0/0:4:141,14:0.11: 1.45:1.000:0.538 0/0/1/1:4:70,44:0.39: 0.38:1.000:0.653 0/0/1/1:4:104,79:0.42: 2.19:1.000:0.920 0/0/1/1:4:33,33:0.47:-0.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,58:0.58:-0.06:1.000:0.921 0/1/1/1:4:41,87:0.68: 0.75:1.000:0.952 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,55:0.46: 0.41:1.000:0.986 0/1/1/1:4:28,95:0.78: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,79:0.67: 0.49:1.000:0.906 0/0/0/1:4:80,40:0.35: 0.54:1.000:0.822 0/1/1/1:4:34,68:0.66: 0.07:1.000:0.888 0/0/1/1:4:34,51:0.58:-0.38:0.998:0.911 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,137:1.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,48:0.32: 1.56:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,76:0.53: 0.96:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,63:0.52: 0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:10,4:0.31:-2.24:1.000:0.973 0/0/0/1:4:119,15:0.14: 0.90:1.000:0.948 0/0/0/1:4:144,27:0.19: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,50:0.54:-0.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:85,41:0.34: 0.69:1.000:0.866 0/1/1/1:4:33,67:0.67: 0.01:1.000:0.909 0/0/0/1:4:119,43:0.29: 1.64:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,79:0.63: 0.62:1.000:0.603 0/0/0/1:4:6,1:0.17:-2.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,4:0.66:-2.44:1.000:0.888 0/0/0:3:5,0:0.00:-2.47:0.983:1.000 0/0/0/1:4:106,54:0.35: 1.58:1.000:0.795 0/0/0/1:4:80,46:0.37: 0.69:1.000:0.553 0/0/1/1:4:49,78:0.60: 0.72:1.000:0.805 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,58:0.54: 0.07:1.000:0.986 0/0/0/1:4:78,39:0.35: 0.46:1.000:0.822 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,12:0.12: 0.54:1.000:0.783 0/0/0/1:4:78,15:0.20:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,48:0.48:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,34:0.46:-0.74:1.000:0.986 0/0/1/1:4:69,70:0.48: 1.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,15:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,26:0.35:-0.56:1.000:0.822 0/1/1/1:4:17,32:0.65:-1.32:1.000:0.758 0/0/1/1:4:21,33:0.59:-1.19:1.000:0.834 0/0/1/1:4:99,65:0.39: 1.69:1.000:0.740 0/0/0/1:4:80,25:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,75:0.74: 0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,22:0.30:-0.46:1.000:0.988 0/0/0/1:4:59,23:0.31:-0.46:1.000:0.979 0/0/0/1:4:65,13:0.20:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,14:0.16: 0.25:1.000:0.993 0/1/1/1/1/1:6:12,54:0.83:-0.87:1.000:0.981 0/1/1/1:4:28,60:0.68:-0.30:1.000:0.958 0/0/1/1:4:27,41:0.58:-0.82:1.000:0.894 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,46:0.64:-0.74:1.000:0.688 0/0/0/1:4:92,28:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,27:0.27: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,23:0.30:-0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:29,38:0.54:-0.85:1.000:0.987 0/0/1/1:4:41,53:0.54:-0.14:0.910:0.990 0/0/1/1:4:52,79:0.58: 0.83:1.000:0.894 0/0/1/1:4:57,42:0.42:-0.01:1.000:0.896 0/0/0/1:4:47,14:0.27:-1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,58:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,54:0.39: 1.03:1.000:0.676 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,55:0.75:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,22:0.39:-1.14:1.000:0.713 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,67:0.84:-0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,79:0.63: 0.64:1.000:0.519 0/0/1/1:4:45,57:0.53: 0.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:89,11:0.13: 0.01:1.000:0.934 0/0/0/1:4:77,34:0.33: 0.30:1.000:0.936 0/0/0/1:4:76,42:0.36: 0.49:1.000:0.643 0/0/1/1:4:18,27:0.58:-1.42:1.000:0.911 0/0/1/1:4:67,53:0.43: 0.54:1.000:0.944 0/0/0/1:4:51,11:0.21:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,41:0.40: 0.09:1.000:0.753 0/0/0/1:4:44,25:0.37:-0.80:1.000:0.581 0/1/1/1:4:27,65:0.71:-0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,22:0.50:-1.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,49:0.41: 0.49:1.000:0.858 0/0/1/1:4:47,61:0.54: 0.22:1.000:0.989 0/1/1/1:4:18,37:0.67:-1.16:1.000:0.924 0/0/1/1:4:30,48:0.60:-0.56:1.000:0.793 0/0/0/1:4:69,18:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,40:0.41:-0.06:1.000:0.843 0/0/1/1:4:45,33:0.41:-0.56:1.000:0.891 0/0/1/1:4:26,44:0.62:-0.77:1.000:0.619 0/0/0/1:4:86,29:0.28: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,32:0.38:-0.35:1.000:0.518 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,23:0.37:-0.93:1.000:0.610 0/0/1/1:4:70,48:0.40: 0.49:1.000:0.812 0/0/1/1:4:21,27:0.53:-1.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,47:0.59:-0.59:1.000:0.841 0/1/1/1:4:27,62:0.70:-0.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:62,75:0.52: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/0:4:182,18:0.11: 2.63:1.000:0.551 0/0/0/1:4:65,37:0.37: 0.07:1.000:0.577 0/0/0/1:4:72,30:0.32: 0.07:1.000:0.961 0/0/1/1:4:101,73:0.41: 1.95:1.000:0.877 0/0/1/1:4:36,34:0.46:-0.77:0.999:0.989 0/0/0/1:4:55,22:0.31:-0.59:1.000:0.973 0/0/1:3:34,16:0.34:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,61:0.65:-0.17:1.000:0.792 0/0/1/1:4:20,24:0.51:-1.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,20:0.28:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:61,13:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,19:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,67:0.68:-0.04:1.000:0.963 0/0/0/1:4:72,21:0.26:-0.17:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,78:0.40: 2.53:1.000:0.753 0/0/1/1:4:26,37:0.57:-0.95:1.000:0.958 0/0/0/0:4:94,8:0.09: 0.07:1.000:0.893 0/0/0/0/1:5:94,31:0.28: 0.67:0.988:0.719 0/1/1/1:4:19,36:0.65:-1.16:1.000:0.776 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,47:0.68:-0.80:1.000:0.956 0/0/0/0:4:106,3:0.03: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,75:0.66: 0.35:1.000:0.866 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,16:0.15: 0.88:1.000:0.981 0/1/1/1:4:32,63:0.66:-0.12:1.000:0.862 0/0/0/1:4:105,44:0.32: 1.30:1.000:0.959 0/0/0/1:4:88,19:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,21:0.32:-0.74:1.000:0.959 0/1/1/1:4:23,69:0.76:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,58:0.56: 0.01:1.000:0.973 0/0/1/1:4:35,44:0.53:-0.53:1.000:0.993 0/0/0/1:4:96,25:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,46:0.64:-0.74:1.000:0.688 0/0/0/1:4:127,72:0.37: 2.60:1.000:0.586 0/1/1/1:4:34,69:0.67: 0.09:1.000:0.909 0/0/1/1:4:96,59:0.38: 1.45:1.000:0.603 0/0/0/1:4:82,33:0.31: 0.41:1.000:0.972 0/0/0/1:4:94,51:0.36: 1.19:1.000:0.682 0/0/1/1:4:61,64:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,96:0.58: 1.61:1.000:0.928 0/1/1/1:4:34,69:0.67: 0.09:1.000:0.909 0/0/1/1:4:8,7:0.45:-2.21:1.000:0.978 0/1/1/1:4:25,48:0.65:-0.69:1.000:0.809 0/0/1/1:4:57,65:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,77:0.77: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,98:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,52:0.34: 1.66:1.000:0.894 0/0/1/1:4:30,37:0.52:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,62:0.61:-0.01:1.000:0.654 0/0/0/1:4:97,38:0.31: 0.93:1.000:0.978 0/0/1/1:4:27,44:0.61:-0.74:1.000:0.743 0/0/0/1:4:76,34:0.33: 0.28:1.000:0.928 0/0/1/1:4:62,68:0.49: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,16:0.11: 1.87:1.000:0.585 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,51:0.38: 0.98:1.000:0.520 0/1/1/1:4:34,87:0.73: 0.56:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,56:0.62:-0.27:1.000:0.609 0/0/0/1:4:61,33:0.36:-0.14:1.000:0.688 0/1/1/1:4:27,61:0.70:-0.30:1.000:0.981 0/0/1/1:4:52,74:0.57: 0.69:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,35:0.31: 0.56:1.000:0.969 0/0/1/1:4:107,74:0.40: 2.13:1.000:0.824 0/0/0/1:4:103,58:0.37: 1.61:1.000:0.601 0/0/1/1:4:49,68:0.56: 0.46:1.000:0.971 0/0/1/1:4:38,57:0.58:-0.12:1.000:0.911 0/0/1/1:4:84,68:0.43: 1.37:1.000:0.955 0/0/0/1:4:70,33:0.34: 0.09:1.000:0.889 0/0/1/1:4:110,73:0.40: 2.19:1.000:0.759 0/0/1/1:4:40,49:0.52:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,49:0.40: 0.56:1.000:0.801 -chr1.1 39921266 chr1.1_039921266 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:353,132:.: 1.03:1.000:. ./.:4:187,192:.: 0.00:1.000:. ./.:4:263,87:.:-0.29:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:504,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:423,155:.: 1.94:1.000:. ./.:4:261,102:.:-0.16:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:303,95:.: 0.18:1.000:. ./.:4:151,1:.:-2.21:1.000:. ./.:4:131,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:194,218:.: 0.32:1.000:. ./.:4:352,138:.: 1.08:1.000:. ./.:4:385,142:.: 1.44:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:485,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:489,1:.: 1.08:0.998:. ./.:4:362,118:.: 0.98:1.000:. ./.:4:447,163:.: 2.25:1.000:. ./.:4:533,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:112,32:.:-2.29:1.000:. ./.:4:323,102:.: 0.45:1.000:. ./.:4:340,137:.: 0.95:1.000:. ./.:4:267,131:.: 0.18:1.000:. ./.:4:79,42:.:-2.52:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:473,3:.: 0.94:1.000:. ./.:4:412,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:384,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:269,108:.:-0.02:1.000:. ./.:4:58,26:.:-2.88:1.000:. ./.:4:129,37:.:-2.08:1.000:. ./.:3:51,1:.:-3.19:0.983:. ./.:4:331,132:.: 0.82:1.000:. ./.:4:314,113:.: 0.46:1.000:. ./.:4:333,124:.: 0.76:1.000:. ./.:4:227,107:.:-0.44:1.000:. ./.:4:376,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:277,105:.: 0.03:1.000:. ./.:4:250,98:.:-0.30:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:252,100:.:-0.27:1.000:. ./.:4:413,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:382,149:.: 1.48:1.000:. ./.:4:361,102:.: 0.82:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:203,57:.:-1.16:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:388,141:.: 1.46:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:293,105:.: 0.18:1.000:. ./.:4:299,95:.: 0.14:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:272,0:.:-1.05:1.000:. ./.:6:178,66:.:-1.32:1.000:. ./.:4:285,82:.:-0.12:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:280,98:.:-0.01:1.000:. ./.:4:217,64:.:-0.96:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:229,109:.:-0.40:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:244,91:.:-0.43:0.910:. ./.:4:201,237:.: 0.57:1.000:. ./.:4:290,110:.: 0.20:1.000:. ./.:4:257,88:.:-0.33:1.000:. ./.:4:157,186:.:-0.35:1.000:. ./.:4:349,141:.: 1.08:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:219,85:.:-0.73:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:243,101:.:-0.34:1.000:. ./.:4:230,91:.:-0.57:1.000:. ./.:4:276,114:.: 0.10:1.000:. ./.:4:118,139:.:-1.19:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:270,120:.: 0.10:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:339,140:.: 0.97:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:235,99:.:-0.44:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:284,85:.:-0.10:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:213,78:.:-0.86:1.000:. ./.:4:318,113:.: 0.50:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:260,76:.:-0.42:1.000:. ./.:4:209,75:.:-0.93:1.000:. ./.:4:293,109:.: 0.22:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:230,99:.:-0.49:1.000:. ./.:4:326,112:.: 0.57:1.000:. ./.:4:201,90:.:-0.86:1.000:. ./.:4:255,95:.:-0.29:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:186,76:.:-1.14:1.000:. ./.:4:334,128:.: 0.81:1.000:. ./.:4:594,2:.: 2.11:1.000:. ./.:4:444,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:440,161:.: 2.16:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:374,0:.:-0.05:1.000:. ./.:3:165,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:290,100:.: 0.10:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:200,71:.:-1.06:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:317,101:.: 0.38:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:239,99:.:-0.40:1.000:. ./.:4:333,128:.: 0.80:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.05:1.000:. ./.:5:377,0:.:-0.02:0.988:. ./.:4:185,63:.:-1.28:1.000:. ./.:4:177,68:.:-1.31:1.000:. ./.:4:184,65:.:-1.27:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:334,122:.: 0.75:1.000:. ./.:4:137,58:.:-1.80:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:288,114:.: 0.22:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:311,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:217,84:.:-0.76:1.000:. ./.:4:215,73:.:-0.89:1.000:. ./.:4:252,106:.:-0.21:1.000:. ./.:4:253,98:.:-0.28:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:188,81:.:-1.07:1.000:. ./.:4:447,150:.: 2.12:1.000:. ./.:4:449,170:.: 2.34:1.000:. ./.:4:347,138:.: 1.03:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:386,140:.: 1.43:1.000:. ./.:4:260,109:.:-0.10:1.000:. ./.:4:340,161:.: 1.19:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:68,37:.:-2.67:1.000:. ./.:4:276,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:347,121:.: 0.86:1.000:. ./.:4:350,128:.: 0.96:1.000:. ./.:4:332,126:.: 0.77:1.000:. ./.:4:503,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:484,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:330,122:.: 0.71:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:334,129:.: 0.82:1.000:. ./.:4:299,96:.: 0.15:1.000:. ./.:4:336,100:.: 0.55:1.000:. ./.:4:306,138:.: 0.63:1.000:. ./.:4:255,123:.:-0.01:1.000:. ./.:4:235,105:.:-0.38:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:304,122:.: 0.46:1.000:. ./.:4:285,114:.: 0.19:1.000:. ./.:4:236,76:.:-0.66:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:371,154:.: 1.42:1.000:. ./.:4:344,130:.: 0.92:1.000:. ./.:4:346,129:.: 0.93:1.000:. ./.:4:372,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:383,130:.: 1.30:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:438,161:.: 2.14:1.000:. ./.:4:312,99:.: 0.31:1.000:. ./.:4:321,122:.: 0.62:1.000:. -chr1.1 40119373 chr1.1_040119373 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:111,106:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,107:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,154:0.72:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,122:0.58:-0.17:1.000:0.895 0/1/1/1:4:63,224:0.77: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,70:0.28: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,70:0.55:-1.75:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,225:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,151:0.72:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,16:0.31:-3.17:1.000:0.978 0/0/1/1:4:18,13:0.42:-3.62:1.000:0.911 0/0/0/1:4:134,49:0.28:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,128:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,172:0.70: 0.53:1.000:0.987 0/0/1/1:4:91,106:0.53:-0.35:1.000:0.992 0/1/1/1:4:75,195:0.71: 1.09:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,293:1.00: 1.54:0.998:1.000 0/1/1/1:4:61,169:0.73: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,218:0.77: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,115:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,17:0.73:-3.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,125:0.56: 0.14:1.000:0.974 0/1/1/1:4:64,179:0.73: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,103:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,6:0.31:-3.84:1.000:0.974 0/0/1/1:4:116,111:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,127:0.51: 0.59:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,218:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,188:0.72: 0.87:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,186:0.77: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,182:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,109:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:9,2:0.20:-4.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,34:0.48:-2.85:1.000:0.995 0/1/1:3:12,24:0.66:-3.52:0.983:1.000 0/0/1/1:4:140,145:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,58:0.27: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,116:0.46: 0.73:1.000:0.985 0/1/1/1:4:73,225:0.75: 1.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,199:0.78: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,45:0.22: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,175:0.72: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,118:0.48: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,106:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,144:0.52: 1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,253:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,135:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,109:0.56:-0.43:1.000:0.972 0/0/1/1:4:102,117:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,228:0.77: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,154:0.71:-0.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:192,60:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,151:0.77:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,164:0.71: 0.28:1.000:0.990 0/1/1/1:4:53,141:0.72:-0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,206:0.78: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,156:0.76:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,144:0.54: 0.95:1.000:0.988 0/0/1/1:4:125,133:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:65,110:0.62:-0.78:1.000:0.785 0/0/1/1:4:107,140:0.56: 0.63:1.000:0.969 0/1/1/1:4:38,166:0.81:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,198:0.72: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,116:0.48: 0.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,206:0.74: 1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,171:0.75: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,37:0.30:-1.73:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,195:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,125:0.48: 0.89:0.910:0.994 0/0/0/1:4:145,40:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,137:0.58: 0.40:1.000:0.932 0/0/0/1:4:122,35:0.24:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,57:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,133:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,121:0.53: 0.20:1.000:0.992 0/0/1/1:4:109,84:0.43:-0.43:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,187:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,171:0.79: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,188:0.79: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,119:0.48: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,47:0.28:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,115:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,126:0.54: 0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:79,102:0.56:-0.67:1.000:0.973 0/1/1/1:4:51,162:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,56:0.27: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,91:0.49:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,50:0.33:-1.18:1.000:0.918 0/0/1/1:4:103,101:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,105:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,129:0.77:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,42:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,138:0.47: 1.44:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,203:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,171:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,90:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,108:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,179:0.72: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,107:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,44:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,177:0.72: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,74:0.44:-0.94:1.000:0.969 0/0/0/1:4:154,52:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,161:0.79:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,109:0.51:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,142:0.66:-0.06:1.000:0.878 0/0/1/1:4:92,108:0.53:-0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:126,118:0.48: 0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,169:0.78:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,165:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,200:0.57: 2.60:1.000:0.950 0/1/1/1:4:54,149:0.73:-0.23:0.999:0.997 0/1/1/1:4:65,200:0.75: 0.99:1.000:0.999 1/1/1:3:0,210:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,185:0.72: 0.77:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,177:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,55:0.28:-0.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,172:0.79: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,145:0.75:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,120:0.48: 0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,137:0.69:-0.37:1.000:0.974 0/1/1/1:4:50,179:0.77: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,152:0.58: 0.85:1.000:0.909 1/1/1/1:4:0,228:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,114:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1/1:5:97,165:0.62: 0.93:0.988:0.963 0/1/1/1:4:51,149:0.74:-0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,168:0.78:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,124:0.73:-0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,102:0.45: 0.20:1.000:0.980 0/1/1/1:4:47,151:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,129:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,153:0.55: 1.18:1.000:0.981 0/1/1/1:4:47,174:0.78: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,218:0.74: 1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,189:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,165:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,100:0.54:-0.63:1.000:0.988 0/1/1/1:4:47,151:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,112:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,126:0.56: 0.10:1.000:0.958 0/1/1/1:4:57,164:0.73: 0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,77:0.52:-1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:186,65:0.27: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,205:0.78: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,150:0.55: 1.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:108,105:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,63:0.29: 0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,108:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,204:0.81: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,190:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,23:0.69:-3.58:1.000:0.971 0/1/1/1:4:36,130:0.78:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,110:0.51:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,115:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,174:0.74: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,160:0.77:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,181:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,159:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,181:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,115:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,123:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:132,133:0.49: 0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,171:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,63:0.32:-0.17:1.000:0.964 0/1/1/1:4:52,156:0.74:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,193:0.79: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,158:0.78:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,86:0.43:-0.35:1.000:0.958 0/1/1/1:4:53,146:0.72:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,105:0.47: 0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:97,119:0.54: 0.02:1.000:0.986 0/1/1/1:4:51,154:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,108:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,62:0.27: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,59:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,116:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,150:0.70:-0.06:1.000:0.984 0/0/0/1:4:168,52:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,222:0.75: 1.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:178,59:0.26: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:106,97:0.47:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,104:0.55:-0.53:1.000:0.984 -chr1.1 40239853 chr1.1_040239853 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:44,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.92:0.998:. ./.:4:13,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.91:0.983:. ./.:4:20,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.: 4.97:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.74:1.000:. ./.:6:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:0.910:. ./.:4:43,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:3:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.16:1.000:. ./.:5:29,0:.: 0.33:0.988:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.74:1.000:. -chr1.1 40459914 chr1.1_040459914 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:129,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:154,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:72,1:.:-1.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.85:0.998:. ./.:4:158,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:186,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.32:1.000:. ./.:3:42,0:.:-2.68:0.983:. ./.:4:158,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.20:1.000:. ./.:6:95,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:154,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:0.910:. ./.:4:118,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:168,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.21:0.999:. ./.:4:163,0:.: 0.61:1.000:. ./.:3:47,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.36:1.000:. ./.:5:156,0:.: 0.42:0.988:. ./.:4:116,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.44:1.000:. -chr1.1 40541523 chr1.1_040541523 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:139,416:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1,391:.:-0.71:1.000:. ./.:4:183,209:.:-0.71:1.000:. ./.:4:103,376:.: 0.12:1.000:. ./.:4:268,306:.: 1.03:1.000:. ./.:4:132,448:.: 1.09:1.000:. ./.:4:86,256:.:-1.19:1.000:. ./.:4:229,234:.:-0.03:1.000:. ./.:4:221,229:.:-0.16:1.000:. ./.:4:33,125:.:-2.95:1.000:. ./.:4:35,110:.:-3.08:1.000:. ./.:4:0,486:.: 0.19:1.000:. ./.:4:245,230:.: 0.08:1.000:. ./.:4:262,257:.: 0.50:1.000:. ./.:4:120,376:.: 0.28:1.000:. ./.:4:264,332:.: 1.24:1.000:. ./.:4:190,250:.:-0.25:0.998:. ./.:4:112,376:.: 0.21:1.000:. ./.:4:290,324:.: 1.41:1.000:. ./.:4:117,386:.: 0.35:1.000:. ./.:4:52,89:.:-3.12:1.000:. ./.:4:113,366:.: 0.12:1.000:. ./.:4:293,294:.: 1.16:1.000:. ./.:4:128,355:.: 0.16:1.000:. ./.:4:9,69:.:-3.72:1.000:. ./.:4:132,413:.: 0.75:1.000:. ./.:4:149,423:.: 1.01:1.000:. ./.:4:269,289:.: 0.88:1.000:. ./.:4:120,410:.: 0.61:1.000:. ./.:4:230,255:.: 0.18:1.000:. ./.:4:101,373:.: 0.07:1.000:. ./.:4:95,335:.:-0.35:1.000:. ./.:4:4,114:.:-3.34:1.000:. ./.:4:70,93:.:-2.90:1.000:. ./.:3:44,31:.:-3.75:0.983:. ./.:4:125,421:.: 0.76:1.000:. ./.:4:137,392:.: 0.60:1.000:. ./.:4:225,237:.:-0.04:1.000:. ./.:4:253,278:.: 0.62:1.000:. ./.:4:240,281:.: 0.52:1.000:. ./.:4:107,385:.: 0.25:1.000:. ./.:4:241,267:.: 0.40:1.000:. ./.:4:142,408:.: 0.80:1.000:. ./.:4:121,356:.: 0.10:1.000:. ./.:4:151,443:.: 1.22:1.000:. ./.:4:243,233:.: 0.09:1.000:. ./.:4:142,420:.: 0.92:1.000:. ./.:4:28,85:.:-3.38:1.000:. ./.:4:117,352:.: 0.03:1.000:. ./.:4:191,253:.:-0.21:1.000:. ./.:4:252,237:.: 0.22:1.000:. ./.:4:137,462:.: 1.27:1.000:. ./.:4:119,305:.:-0.41:1.000:. ./.:4:262,281:.: 0.73:1.000:. ./.:4:206,227:.:-0.32:1.000:. ./.:4:144,381:.: 0.56:1.000:. ./.:4:214,219:.:-0.32:1.000:. ./.:4:122,389:.: 0.43:1.000:. ./.:4:122,358:.: 0.13:1.000:. ./.:6:196,186:.:-0.81:1.000:. ./.:4:243,243:.: 0.19:1.000:. ./.:4:193,215:.:-0.56:1.000:. ./.:4:276,331:.: 1.35:1.000:. ./.:4:116,412:.: 0.59:1.000:. ./.:4:126,363:.: 0.22:1.000:. ./.:4:143,366:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,272:.:-1.09:1.000:. ./.:4:226,243:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,367:.: 0.30:0.910:. ./.:4:2,471:.: 0.06:1.000:. ./.:4:134,392:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,298:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,550:.: 0.80:1.000:. ./.:4:141,399:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,495:.: 0.28:1.000:. ./.:4:195,225:.:-0.44:1.000:. ./.:4:232,230:.:-0.04:1.000:. ./.:4:249,260:.: 0.41:1.000:. ./.:4:257,176:.:-0.32:1.000:. ./.:4:157,392:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,393:.:-0.69:1.000:. ./.:4:141,391:.: 0.63:1.000:. ./.:4:152,412:.: 0.94:1.000:. ./.:4:120,354:.: 0.07:1.000:. ./.:4:211,214:.:-0.40:1.000:. ./.:4:127,388:.: 0.47:1.000:. ./.:4:82,282:.:-0.98:1.000:. ./.:4:111,340:.:-0.15:1.000:. ./.:4:106,318:.:-0.41:1.000:. ./.:4:216,189:.:-0.59:1.000:. ./.:4:163,179:.:-1.19:1.000:. ./.:4:141,342:.: 0.16:1.000:. ./.:4:143,416:.: 0.89:1.000:. ./.:4:208,208:.:-0.48:1.000:. ./.:4:209,231:.:-0.25:1.000:. ./.:4:118,350:.: 0.02:1.000:. ./.:4:124,368:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,439:.:-0.26:1.000:. ./.:4:257,247:.: 0.36:1.000:. ./.:4:113,359:.: 0.05:1.000:. ./.:4:107,281:.:-0.75:1.000:. ./.:4:256,300:.: 0.86:1.000:. ./.:4:92,265:.:-1.05:1.000:. ./.:4:126,405:.: 0.62:1.000:. ./.:4:222,224:.:-0.19:1.000:. ./.:4:96,317:.:-0.51:1.000:. ./.:4:224,192:.:-0.48:1.000:. ./.:4:124,351:.: 0.08:1.000:. ./.:4:161,463:.: 1.51:1.000:. ./.:4:107,390:.: 0.29:1.000:. ./.:4:111,375:.: 0.19:1.000:. ./.:4:165,509:.: 1.99:1.000:. ./.:4:248,244:.: 0.25:0.999:. ./.:4:130,422:.: 0.82:1.000:. ./.:3:202,109:.:-1.49:1.000:. ./.:4:279,282:.: 0.91:1.000:. ./.:4:204,215:.:-0.45:1.000:. ./.:4:109,363:.: 0.05:1.000:. ./.:4:109,398:.: 0.39:1.000:. ./.:4:95,296:.:-0.72:1.000:. ./.:4:225,292:.: 0.49:1.000:. ./.:4:101,345:.:-0.19:1.000:. ./.:4:270,214:.: 0.17:1.000:. ./.:4:127,403:.: 0.61:1.000:. ./.:4:222,277:.: 0.31:1.000:. ./.:4:110,393:.: 0.35:1.000:. ./.:5:253,351:.: 1.32:0.988:. ./.:4:2,415:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,179:.:-0.88:1.000:. ./.:4:191,193:.:-0.79:1.000:. ./.:4:123,351:.: 0.07:1.000:. ./.:4:215,213:.:-0.37:1.000:. ./.:4:151,131:.:-1.76:1.000:. ./.:4:136,418:.: 0.84:1.000:. ./.:4:242,211:.:-0.13:1.000:. ./.:4:294,343:.: 1.63:1.000:. ./.:4:104,385:.: 0.22:1.000:. ./.:4:239,235:.: 0.07:1.000:. ./.:4:206,181:.:-0.76:1.000:. ./.:4:222,203:.:-0.40:1.000:. ./.:4:101,378:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,377:.: 0.30:1.000:. ./.:4:113,307:.:-0.44:1.000:. ./.:4:189,177:.:-0.96:1.000:. ./.:4:140,461:.: 1.29:1.000:. ./.:4:337,309:.: 1.72:1.000:. ./.:4:117,432:.: 0.79:1.000:. ./.:4:119,385:.: 0.36:1.000:. ./.:4:140,423:.: 0.93:1.000:. ./.:4:120,336:.:-0.10:1.000:. ./.:4:262,318:.: 1.09:1.000:. ./.:4:239,252:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,68:.:-3.32:1.000:. ./.:4:161,180:.:-1.20:1.000:. ./.:4:108,348:.:-0.10:1.000:. ./.:4:258,235:.: 0.26:1.000:. ./.:4:294,270:.: 0.94:1.000:. ./.:4:139,391:.: 0.61:1.000:. ./.:4:218,220:.:-0.27:1.000:. ./.:4:271,303:.: 1.03:1.000:. ./.:4:99,335:.:-0.31:1.000:. ./.:4:227,207:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,305:.:-0.64:1.000:. ./.:4:106,380:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,357:.:-0.05:1.000:. ./.:4:223,229:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,322:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1,457:.:-0.08:1.000:. ./.:4:240,251:.: 0.24:1.000:. ./.:4:222,236:.:-0.08:1.000:. ./.:4:204,215:.:-0.45:1.000:. ./.:4:152,181:.:-1.28:1.000:. ./.:4:209,213:.:-0.42:1.000:. ./.:4:124,367:.: 0.24:1.000:. ./.:4:219,227:.:-0.19:1.000:. ./.:4:106,287:.:-0.70:1.000:. ./.:4:144,425:.: 0.98:1.000:. ./.:4:126,451:.: 1.06:1.000:. ./.:4:117,397:.: 0.46:1.000:. ./.:4:181,279:.:-0.06:1.000:. ./.:4:137,395:.: 0.63:1.000:. ./.:4:272,323:.: 1.23:1.000:. ./.:4:173,462:.: 1.62:1.000:. ./.:4:102,333:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1,559:.: 0.90:1.000:. -chr1.1 40765683 chr1.1_040765683 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:42,13:0.29:-0.74:1.000:0.993 0/0/0/0:4:168,8:0.05: 2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,17:0.30:-0.38:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,27:0.32: 0.44:1.000:0.955 0/0/0/1:4:68,12:0.18:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,21:0.34:-0.21:1.000:0.885 0/0/0/1:4:56,15:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,4:0.18:-1.44:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,8:0.11:-0.02:1.000:0.577 0/0/0/1:4:41,15:0.33:-0.72:1.000:0.918 0/0/1/1:4:47,38:0.53:-0.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:61,22:0.33:-0.07:1.000:0.933 0/0/0/1:4:92,20:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,34:0.38: 0.61:0.998:0.606 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 3.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,24:0.13: 3.32:1.000:0.896 0/0/0/1:4:79,23:0.27: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,10:0.23:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,14:0.16: 0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:101,18:0.18: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,14:0.15: 0.56:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,22:0.38:-0.31:1.000:0.519 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,21:0.42:-0.55:1.000:0.912 0/0/1/1:4:53,31:0.47:-0.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:52,18:0.32:-0.38:1.000:0.962 0/0/0/1:4:68,27:0.35: 0.22:1.000:0.765 0/0/0/1:4:111,13:0.13: 0.92:1.000:0.863 0/0/0/1:4:25,8:0.30:-1.27:1.000:0.988 0/0/1/1:4:58,25:0.38:-0.07:1.000:0.516 1/1/1:3:0,10:1.00:-1.82:0.983:1.000 0/0/0/1:4:79,24:0.28: 0.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:119,15:0.13: 1.16:1.000:0.942 0/0/0/1:4:63,18:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:179,21:0.13: 2.75:1.000:0.865 0/0/0/1:4:86,17:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,16:0.30:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:95,17:0.18: 0.63:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,19:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,37:0.45: 0.44:1.000:0.980 0/0/0/1:4:116,25:0.21: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,28:0.22: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,14:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,23:0.32: 0.08:1.000:0.959 0/0/0/1:4:53,20:0.34:-0.31:1.000:0.875 0/0/0/1:4:70,13:0.19:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,28:0.49:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,20:0.33:-0.26:1.000:0.924 0/0/0/1:4:70,14:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,37:0.44: 0.49:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,28:0.39: 0.10:1.000:0.684 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:52,15:0.27:-0.45:1.000:0.693 0/0/0/1:4:52,18:0.32:-0.38:1.000:0.962 0/0/0/1:4:38,14:0.33:-0.81:1.000:0.910 0/0/0/1:4:145,36:0.24: 2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,23:0.20: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,26:0.38: 0.00:1.000:0.536 0/0/1/1:4:67,35:0.43: 0.39:1.000:0.953 0/0/1/1:4:54,28:0.43:-0.09:1.000:0.948 0/0/1/1:4:49,31:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,21:0.19: 1.18:0.910:1.000 0/0/0/0:4:94,5:0.06: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,29:0.22: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,17:0.31:-0.43:1.000:0.978 0/0/0/1:4:142,15:0.11: 1.71:1.000:0.627 0/0/0/1:4:62,23:0.33:-0.02:1.000:0.901 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,14:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,30:0.46:-0.09:1.000:0.990 0/0/0/1:4:89,24:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,44:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,27:0.20: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,7:0.12:-0.40:1.000:0.798 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,25:0.34: 0.10:1.000:0.840 0/0/1/1:4:34,23:0.51:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,15:0.19: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,21:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,8:0.21:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,20:0.43:-0.64:1.000:0.939 0/0/1/1:4:55,26:0.40:-0.12:1.000:0.814 0/0/1/1:4:34,16:0.40:-0.86:1.000:0.803 0/0/0/1:4:38,16:0.37:-0.76:1.000:0.573 0/0/0/1:4:54,16:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,28:0.18: 2.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,14:0.29:-0.64:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,47:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,42:0.45: 0.75:1.000:0.984 0/0/1/1:4:53,23:0.38:-0.24:1.000:0.541 0/0/0/0:4:109,7:0.07: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,34:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,22:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,11:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,23:0.19: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,23:0.48:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,28:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,17:0.33:-0.55:1.000:0.906 0/0/0/1:4:61,25:0.36: 0.00:1.000:0.669 0/0/1/1:4:65,31:0.41: 0.25:1.000:0.833 0/0/0/1:4:101,19:0.19: 0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,27:0.37: 0.10:1.000:0.506 0/0/0/1:4:55,18:0.30:-0.31:1.000:0.983 0/0/0/1:4:97,31:0.30: 1.01:1.000:0.988 0/0/0/1:4:52,12:0.22:-0.52:0.999:1.000 0/0/0/1:4:63,26:0.36: 0.08:1.000:0.645 0/1/1:3:3,17:0.75:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,37:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,25:0.44:-0.36:1.000:0.974 0/0/0/1:4:39,16:0.36:-0.74:1.000:0.665 0/0/1/1:4:78,48:0.48: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,36:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:57,16:0.26:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,43:0.53: 0.25:1.000:0.992 0/0/0/1:4:118,28:0.23: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,21:0.46:-0.67:1.000:0.987 0/0/0/1:4:53,17:0.30:-0.38:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.68:1.000:1.000 1/1/1/1/1:5:0,40:1.00:-1.10:0.988:1.000 0/0/0/0:4:132,9:0.08: 1.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:91,18:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,29:0.52:-0.40:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,23:0.35:-0.12:1.000:0.769 0/0/0/1:4:55,13:0.23:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,22:0.50:-0.74:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,15:0.25:-0.33:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,24:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,34:0.29: 1.33:1.000:0.989 0/0/0/1:4:119,23:0.19: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,23:0.19: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,27:0.51:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,19:0.38:-0.55:1.000:0.523 0/0/0/1:4:71,22:0.29: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,30:0.42: 0.08:1.000:0.931 0/0/0/1:4:63,23:0.33: 0.00:1.000:0.920 0/0/0/1:4:47,8:0.17:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,17:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,16:0.32:-0.57:1.000:0.960 0/0/0/1:4:91,32:0.32: 0.89:1.000:0.953 0/0/0/1:4:63,14:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,14:0.42:-1.05:1.000:0.912 0/0/0/1:4:32,11:0.31:-1.03:1.000:0.966 0/0/0/1:4:133,19:0.15: 1.59:1.000:0.988 0/0/0/1:4:69,18:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,36:0.46: 0.34:1.000:0.985 0/0/1/1:4:71,39:0.45: 0.58:1.000:0.978 0/0/1/1:4:35,23:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,13:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,34:0.55:-0.36:1.000:0.983 0/0/0/1:4:49,13:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,21:0.31:-0.04:1.000:0.978 0/0/0/1:4:87,20:0.22: 0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,22:0.19: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,16:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:192,18:0.10: 2.99:0.999:0.731 0/0/0/0:4:104,9:0.10: 0.65:1.000:0.883 0/0/0/1:4:90,16:0.18: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,9:0.23:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,9:0.20:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,23:0.21: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,20:0.16: 1.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,20:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,19:0.20: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,22:0.28: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:123,17:0.15: 1.30:1.000:0.981 0/0/0/1:4:72,14:0.20: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,21:0.47:-0.69:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,8:0.13:-0.33:1.000:0.935 0/0/0/1:4:106,14:0.14: 0.82:1.000:0.967 0/0/0/0:4:99,6:0.07: 0.46:1.000:0.999 -chr1.1 40884556 chr1.1_040884556 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:19,60:0.73: 0.71:1.000:0.998 1/1/1/1:4:4,47:0.91:-0.44:1.000:0.961 1/1/1/1:4:2,57:0.96:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.45:-0.03:1.000:0.979 0/0/1/1:4:41,69:0.61: 1.99:1.000:0.700 0/0/1/1:4:36,32:0.46: 0.26:1.000:0.988 0/1/1/1:4:10,40:0.78:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 1.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,51:0.98:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.30:-2.01:1.000:0.984 0/0/0/1:4:13,7:0.34:-1.72:1.000:0.854 0/0/1/1:4:15,18:0.53:-1.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,27:0.61:-0.77:1.000:0.693 0/0/1/1:4:20,30:0.58:-0.49:1.000:0.899 0/0/1/1:4:33,27:0.44:-0.07:1.000:0.967 0/1/1/1:4:25,59:0.68: 0.91:1.000:0.954 0/1/1/1:4:19,84:0.79: 1.70:0.998:1.000 1/1/1/1:4:3,95:0.97: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,45:0.59: 0.50:1.000:0.857 0/0/1/1:4:34,42:0.54: 0.59:1.000:0.988 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:16,17:0.50:-1.19:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,72:0.98: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,28:0.39: 0.34:1.000:0.704 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,23:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,19:0.33:-0.20:1.000:0.936 0/1/1/1:4:14,79:0.83: 1.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,116:0.76: 3.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,56:0.82: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,50:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,38:0.65:-0.20:1.000:0.758 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.68:-1.31:1.000:0.948 1/1/1:3:0,9:1.00:-2.18:0.983:1.000 0/0/1/1:4:32,37:0.52: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:42,34:0.44: 0.59:1.000:0.963 0/0/1/1:4:45,38:0.45: 0.87:1.000:0.977 0/1/1/1:4:18,43:0.68:-0.03:1.000:0.959 0/0/1/1:4:24,31:0.55:-0.28:1.000:0.981 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,43:0.77:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,58:0.69: 0.79:1.000:0.978 0/0/0/1:4:41,20:0.32:-0.03:1.000:0.952 0/1/1/1:4:27,68:0.69: 1.37:1.000:0.977 1/1/1/1:4:1,81:0.99: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,32:0.40: 0.71:1.000:0.755 0/0/1/1:4:16,24:0.58:-0.90:1.000:0.899 0/0/1/1:4:26,35:0.56:-0.03:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,35:0.77:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,64:0.75: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,50:0.70: 0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:15,22:0.58:-1.02:1.000:0.920 0/1/1/1:4:15,43:0.72:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,22:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,30:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,19:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:20,35:0.62:-0.28:1.000:0.770 0/0/1/1:4:28,30:0.51:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,57:0.72: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,60:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,26:0.62:-0.86:1.000:0.624 0/0/1/1:4:29,44:0.59: 0.46:1.000:0.886 0/1/1/1:4:12,52:0.79: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,56:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,47:0.74:-0.03:0.910:0.999 0/0/1/1:4:18,24:0.56:-0.82:1.000:0.972 0/0/1/1:4:36,30:0.44: 0.17:1.000:0.974 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,17:0.46:-1.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:35,31:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/1/1/1:4:18,46:0.70: 0.09:1.000:0.981 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,36:0.67:-0.40:1.000:0.923 0/1/1/1:4:18,46:0.70: 0.09:1.000:0.981 1/1/1/1:4:1,65:0.98: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,37:0.64:-0.24:1.000:0.697 0/1/1/1:4:11,23:0.66:-1.15:1.000:0.839 0/0/1/1:4:30,54:0.62: 0.91:1.000:0.518 0/0/1/1:4:27,37:0.56: 0.09:1.000:0.962 0/0/1/1:4:22,18:0.44:-0.90:1.000:0.967 0/0/1/1:4:23,24:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,28:0.55:-0.49:1.000:0.984 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,45:0.67: 0.13:1.000:0.923 0/1/1/1:4:10,29:0.72:-0.94:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,42:0.78:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,31:0.42: 0.46:1.000:0.893 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 2.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,75:0.79: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,24:0.43:-0.28:1.000:0.937 0/1/1/1:4:10,43:0.79:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,25:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,69:0.64: 1.78:1.000:0.658 0/0/1/1:4:22,34:0.59:-0.24:1.000:0.862 1/1/1/1:4:5,65:0.92: 0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:16,26:0.60:-0.82:1.000:0.778 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,28:0.47:-0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,67:0.69: 1.33:1.000:0.973 0/0/1/1:4:14,23:0.60:-1.02:1.000:0.755 0/0/1/1:4:21,33:0.59:-0.32:1.000:0.838 0/1/1/1:4:23,58:0.69: 0.79:1.000:0.978 0/1/1/1:4:20,90:0.80: 1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,88:0.83: 1.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,73:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,81:0.70: 2.07:0.999:0.985 0/0/1/1:4:39,52:0.56: 1.20:1.000:0.972 0/1/1:3:10,20:0.65:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,72:0.73: 1.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,71:0.84: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,50:0.65: 0.50:1.000:0.833 0/1/1/1:4:10,73:0.87: 0.87:1.000:0.945 0/0/0/1:4:36,18:0.33:-0.32:1.000:0.936 0/1/1/1:4:12,41:0.75:-0.36:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,69:0.97: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,44:0.68: 0.05:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,83:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,50:0.64: 0.59:1.000:0.666 0/0/1/1/1:5:22,46:0.66: 0.26:0.988:0.879 1/1/1/1:4:1,49:0.98:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,26:0.68:-1.02:1.000:0.954 0/1/1/1:4:12,44:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,34:0.49: 0.26:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,19:0.71:-1.47:1.000:0.990 0/0/0/1:4:27,12:0.30:-0.94:1.000:0.984 1/1/1/1:4:1,44:0.98:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,76:0.70: 1.78:1.000:0.985 0/1/1/1:4:12,74:0.84: 1.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:34,13:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,23:0.62:-1.06:1.000:0.567 0/1/1/1:4:13,25:0.64:-0.98:1.000:0.666 0/1/1/1:4:12,48:0.78:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,27:0.41: 0.09:1.000:0.878 0/1/1/1:4:20,58:0.72: 0.67:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,22:0.63:-1.15:1.000:0.535 0/0/1/1:4:36,44:0.54: 0.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:29,31:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,42:0.67:-0.03:1.000:0.907 0/0/1/1:4:33,22:0.39:-0.28:1.000:0.704 0/0/1/1:4:31,24:0.43:-0.28:1.000:0.937 0/0/1/1:4:33,35:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,69:0.67: 1.53:1.000:0.939 0/1/1/1:4:12,64:0.82: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,22:0.83:-1.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,39:0.72:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,24:0.40:-0.16:1.000:0.828 0/1/1/1:4:12,45:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,77:0.72: 1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,73:0.60: 2.36:1.000:0.822 0/1/1/1:4:13,69:0.82: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,62:0.65: 1.24:1.000:0.820 0/1/1/1:4:18,68:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,51:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,57:0.68: 0.79:1.000:0.957 0/0/1/1:4:38,38:0.49: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,10:0.27:-1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,37:0.62:-0.16:1.000:0.579 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,112:0.99: 2.11:0.999:1.000 0/1/1/1:4:19,66:0.75: 0.96:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,55:0.98:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,52:0.80: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,30:0.66:-0.73:1.000:0.873 0/0/1/1:4:33,28:0.45:-0.03:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,19:0.36:-0.44:1.000:0.637 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,43:0.58: 0.42:1.000:0.910 0/1/1/1:4:23,52:0.67: 0.54:1.000:0.927 0/1/1/1:4:12,56:0.80: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,70:0.65: 1.74:1.000:0.813 0/0/1/1:4:50,45:0.46: 1.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:24,32:0.56:-0.24:1.000:0.972 0/1/1/1:4:10,60:0.84: 0.34:1.000:0.995 -chr1.1 41090446 chr1.1_041090446 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:33,1:.:-1.19:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.19:0.998:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.77:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.17:0.983:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:107,1:.: 2.11:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:40,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:68,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.57:0.910:. ./.:4:44,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:32,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:125,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.30:0.999:. ./.:4:78,0:.: 0.77:1.000:. ./.:3:40,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.57:1.000:. ./.:5:121,0:.: 2.69:0.988:. ./.:4:54,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:30,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.19:1.000:. -chr1.1 41475198 chr1.1_041475198 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:44,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:59,3:.: 1.29:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:65,8:.: 1.88:1.000:. ./.:4:55,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:39,5:.: 0.32:1.000:. ./.:4:57,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.78:1.000:. ./.:4:107,0:.: 3.71:1.000:. ./.:4:66,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:35,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:40,3:.: 0.26:0.998:. ./.:4:29,8:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,4:.: 1.02:1.000:. ./.:4:43,4:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,6:.: 0.48:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.73:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:70,2:.: 1.83:1.000:. ./.:4:35,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:43,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.51:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.73:0.983:. ./.:4:46,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.87:1.000:. ./.:4:58,4:.: 1.29:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:35,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:40,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.19:1.000:. ./.:4:37,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:8,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:53,5:.: 1.07:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:49,4:.: 0.80:1.000:. ./.:4:30,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:37,3:.: 0.10:1.000:. ./.:6:26,8:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:31,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:17,1:.:-1.08:0.910:. ./.:4:84,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:56,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:40,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:14,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.76:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:15,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:34,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:14,2:.:-1.19:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:69,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.87:0.999:. ./.:4:22,1:.:-0.81:1.000:. ./.:3:22,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,4:.: 0.26:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:12,2:.:-1.30:1.000:. ./.:4:41,5:.: 0.42:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:30,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.26:1.000:. ./.:5:34,3:.:-0.06:0.988:. ./.:4:31,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,3:.: 1.34:1.000:. ./.:4:12,2:.:-1.30:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:67,4:.: 1.77:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:34,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.19:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:63,2:.: 1.45:1.000:. ./.:4:67,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:58,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:77,2:.: 2.20:1.000:. ./.:4:42,3:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:32,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:56,8:.: 1.39:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:42,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:34,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:49,3:.: 0.75:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,1:.: 0.59:0.999:. ./.:4:27,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:44,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:73,2:.: 1.99:1.000:. ./.:4:68,2:.: 1.72:1.000:. ./.:4:15,3:.:-1.08:1.000:. ./.:4:82,4:.: 2.58:1.000:. -chr1.1 41552398 chr1.1_041552398 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:85,26:.: 1.49:1.000:. ./.:4:55,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:51,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:73,20:.: 0.78:1.000:. ./.:4:67,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.75:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:54,24:.: 0.19:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:65,26:.: 0.70:0.998:. ./.:4:83,16:.: 1.02:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:40,24:.:-0.36:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:78,23:.: 1.10:1.000:. ./.:4:83,23:.: 1.29:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,22:.: 0.74:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.79:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.40:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.83:0.983:. ./.:4:56,23:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,22:.:-0.55:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:71,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:68,22:.: 0.66:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:62,25:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,22:.: 1.61:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:70,30:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.24:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:44,24:.:-0.20:1.000:. ./.:6:67,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:80,27:.: 1.33:1.000:. ./.:4:100,24:.: 2.00:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:66,23:.: 0.62:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.00:0.910:. ./.:4:52,21:.: 0.00:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:38,15:.:-0.79:1.000:. ./.:4:75,24:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.61:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:52,14:.:-0.28:1.000:. ./.:4:132,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:96,6:.: 1.13:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:40,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:32,27:.:-0.55:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:80,26:.: 1.29:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:59,17:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,21:.: 0.04:1.000:. ./.:4:54,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:66,21:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.75:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:64,15:.: 0.23:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,30:.: 0.59:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,24:.: 0.90:1.000:. ./.:4:78,36:.: 1.61:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:61,12:.: 0.00:1.000:. ./.:3:34,21:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,14:.: 0.55:1.000:. ./.:4:26,17:.:-1.18:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:63,15:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:66,14:.: 0.27:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:81,22:.: 1.17:1.000:. ./.:4:82,20:.: 1.13:1.000:. ./.:4:40,25:.:-0.32:1.000:. ./.:5:75,27:.: 1.13:0.988:. ./.:4:38,11:.:-0.95:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:43,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.95:1.000:. ./.:4:67,30:.: 0.94:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:50,22:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,23:.: 1.13:1.000:. ./.:4:56,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,27:.: 1.29:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:62,26:.: 0.59:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:89,31:.: 1.84:1.000:. ./.:4:76,22:.: 0.98:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:59,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,31:.: 1.45:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.71:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:85,15:.: 1.06:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,16:.: 0.39:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,20:.: 0.74:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:38,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:73,12:.: 0.47:0.999:. ./.:4:95,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,14:.:-1.14:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:56,6:.:-0.44:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:57,32:.: 0.62:1.000:. -chr1.1 41861948 chr1.1_041861948 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:64,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:53,12:.:-0.96:1.000:. ./.:4:49,15:.:-1.00:1.000:. ./.:4:83,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:74,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:52,11:.:-1.04:1.000:. ./.:4:103,35:.: 1.88:1.000:. ./.:4:79,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,31:.:-0.88:1.000:. ./.:4:44,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:65,7:.:-0.69:1.000:. ./.:4:77,7:.:-0.22:1.000:. ./.:4:71,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:90,26:.: 1.03:1.000:. ./.:4:68,34:.: 0.48:0.998:. ./.:4:60,44:.: 0.56:1.000:. ./.:4:101,53:.: 2.51:1.000:. ./.:4:87,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:68,93:.: 2.78:1.000:. ./.:4:53,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:71,28:.: 0.36:1.000:. ./.:4:59,29:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,18:.:-1.00:1.000:. ./.:4:119,26:.: 2.15:1.000:. ./.:4:81,8:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,10:.:-0.61:1.000:. ./.:4:76,17:.: 0.13:1.000:. ./.:4:76,36:.: 0.87:1.000:. ./.:4:65,11:.:-0.53:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:68,20:.:-0.07:1.000:. ./.:3:28,11:.:-1.97:0.983:. ./.:4:79,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:67,33:.: 0.40:1.000:. ./.:4:71,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,48:.: 1.84:1.000:. ./.:4:83,59:.: 2.04:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:55,35:.: 0.01:1.000:. ./.:4:96,22:.: 1.10:1.000:. ./.:4:69,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:74,17:.: 0.05:1.000:. ./.:4:70,33:.: 0.52:1.000:. ./.:4:82,31:.: 0.91:1.000:. ./.:4:141,62:.: 4.41:1.000:. ./.:4:50,20:.:-0.77:1.000:. ./.:4:78,38:.: 1.03:1.000:. ./.:4:57,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.60:1.000:. ./.:4:76,10:.:-0.14:1.000:. ./.:4:73,11:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,30:.: 0.32:1.000:. ./.:4:90,54:.: 2.12:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.65:1.000:. ./.:4:103,56:.: 2.70:1.000:. ./.:4:75,19:.: 0.17:1.000:. ./.:6:68,12:.:-0.38:1.000:. ./.:4:61,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:48,30:.:-0.45:1.000:. ./.:4:71,51:.: 1.26:1.000:. ./.:4:83,45:.: 1.49:1.000:. ./.:4:65,29:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,37:.: 1.96:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:57,50:.: 0.67:1.000:. ./.:4:66,8:.:-0.61:0.910:. ./.:4:49,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:74,47:.: 1.22:1.000:. ./.:4:63,11:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,20:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:53,41:.: 0.17:1.000:. ./.:4:64,58:.: 1.26:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:75,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:68,38:.: 0.64:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,30:.: 0.56:1.000:. ./.:4:68,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:98,77:.: 3.32:1.000:. ./.:4:79,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,11:.:-1.31:1.000:. ./.:4:45,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:57,26:.:-0.26:1.000:. ./.:4:57,9:.:-0.92:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.88:1.000:. ./.:4:63,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:72,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.65:1.000:. ./.:4:66,40:.: 0.64:1.000:. ./.:4:95,27:.: 1.26:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.93:1.000:. ./.:4:60,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.25:1.000:. ./.:4:95,16:.: 0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:65,46:.: 0.83:1.000:. ./.:4:52,10:.:-1.08:1.000:. ./.:4:67,11:.:-0.45:1.000:. ./.:4:64,44:.: 0.71:1.000:. ./.:4:75,13:.:-0.07:1.000:. ./.:4:59,39:.: 0.32:1.000:. ./.:4:73,23:.: 0.25:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:63,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:60,10:.:-0.77:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:54,24:.:-0.45:0.999:. ./.:4:71,24:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,16:.:-0.96:1.000:. ./.:4:57,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,17:.:-0.42:1.000:. ./.:4:53,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,6:.:-1.00:1.000:. ./.:4:54,14:.:-0.84:1.000:. ./.:4:60,23:.:-0.26:1.000:. ./.:4:87,30:.: 1.06:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:62,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.62:1.000:. ./.:5:69,11:.:-0.38:0.988:. ./.:4:47,37:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:42,8:.:-1.55:1.000:. ./.:4:55,13:.:-0.84:1.000:. ./.:4:76,5:.:-0.34:1.000:. ./.:4:34,32:.:-0.92:1.000:. ./.:4:40,11:.:-1.51:1.000:. ./.:4:35,6:.:-1.90:1.000:. ./.:4:91,8:.: 0.36:1.000:. ./.:4:66,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,13:.:-1.12:1.000:. ./.:4:48,31:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,6:.:-1.39:1.000:. ./.:4:60,37:.: 0.29:1.000:. ./.:4:56,22:.:-0.45:1.000:. ./.:4:39,13:.:-1.47:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,31:.: 1.14:1.000:. ./.:4:82,14:.: 0.25:1.000:. ./.:4:67,20:.:-0.10:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:88,12:.: 0.40:1.000:. ./.:4:97,17:.: 0.95:1.000:. ./.:4:70,23:.: 0.13:1.000:. ./.:4:53,23:.:-0.53:1.000:. ./.:4:48,10:.:-1.23:1.000:. ./.:4:100,35:.: 1.77:1.000:. ./.:4:80,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:90,17:.: 0.67:1.000:. ./.:4:78,31:.: 0.75:1.000:. ./.:4:59,26:.:-0.18:1.000:. ./.:4:91,29:.: 1.18:1.000:. ./.:4:79,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:54,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:72,14:.:-0.14:1.000:. ./.:4:87,34:.: 1.22:1.000:. ./.:4:78,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:68,45:.: 0.91:1.000:. ./.:4:72,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.32:0.999:. ./.:4:65,20:.:-0.18:1.000:. ./.:4:90,23:.: 0.91:1.000:. ./.:4:62,25:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,11:.:-1.47:1.000:. ./.:4:74,10:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:69,35:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,19:.:-0.53:1.000:. ./.:4:85,13:.: 0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:66,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,24:.: 0.09:1.000:. ./.:4:87,18:.: 0.60:1.000:. ./.:4:92,16:.: 0.71:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,21:.:-0.26:1.000:. ./.:4:88,12:.: 0.40:1.000:. -chr1.1 41973913 chr1.1_041973913 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:233,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:233,63:.:-0.47:1.000:. ./.:4:287,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:267,63:.:-0.15:1.000:. ./.:4:266,64:.:-0.15:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:179,45:.:-1.13:1.000:. ./.:4:308,102:.: 0.58:1.000:. ./.:4:274,67:.:-0.05:1.000:. ./.:4:80,40:.:-2.08:1.000:. ./.:4:146,21:.:-1.65:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:243,60:.:-0.40:1.000:. ./.:4:288,62:.: 0.03:1.000:. ./.:4:327,93:.: 0.67:1.000:. ./.:4:340,127:.: 1.10:1.000:. ./.:4:389,132:.: 1.60:0.998:. ./.:4:389,187:.: 2.11:1.000:. ./.:4:487,220:.: 3.31:1.000:. ./.:4:437,126:.: 1.99:1.000:. ./.:4:143,60:.:-1.32:1.000:. ./.:4:357,88:.: 0.90:1.000:. ./.:4:409,135:.: 1.81:1.000:. ./.:4:314,112:.: 0.73:1.000:. ./.:4:84,15:.:-2.28:1.000:. ./.:4:286,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:304,70:.: 0.25:1.000:. ./.:4:324,122:.: 0.91:1.000:. ./.:4:312,66:.: 0.29:1.000:. ./.:4:360,146:.: 1.46:1.000:. ./.:4:362,139:.: 1.42:1.000:. ./.:4:243,46:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,1:.:-2.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:55,2:.:-2.66:0.983:. ./.:4:308,61:.: 0.20:1.000:. ./.:4:381,147:.: 1.66:1.000:. ./.:4:273,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:321,121:.: 0.87:1.000:. ./.:4:448,176:.: 2.55:1.000:. ./.:4:253,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:265,106:.: 0.22:1.000:. ./.:4:247,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:261,42:.:-0.40:1.000:. ./.:4:227,51:.:-0.63:1.000:. ./.:4:285,104:.: 0.39:1.000:. ./.:4:371,118:.: 1.31:1.000:. ./.:4:274,101:.: 0.26:1.000:. ./.:4:228,42:.:-0.71:1.000:. ./.:4:206,43:.:-0.90:1.000:. ./.:4:242,86:.:-0.17:1.000:. ./.:4:322,67:.: 0.39:1.000:. ./.:4:227,46:.:-0.68:1.000:. ./.:4:261,58:.:-0.26:1.000:. ./.:4:336,182:.: 1.57:1.000:. ./.:4:278,91:.: 0.20:1.000:. ./.:4:289,103:.: 0.41:1.000:. ./.:4:306,100:.: 0.54:1.000:. ./.:4:273,56:.:-0.16:1.000:. ./.:6:224,47:.:-0.70:1.000:. ./.:4:216,50:.:-0.74:1.000:. ./.:4:264,84:.: 0.01:1.000:. ./.:4:281,107:.: 0.38:1.000:. ./.:4:269,88:.: 0.09:1.000:. ./.:4:365,130:.: 1.36:1.000:. ./.:4:316,111:.: 0.74:1.000:. ./.:4:215,43:.:-0.82:1.000:. ./.:4:360,148:.: 1.48:1.000:. ./.:4:233,47:.:-0.61:0.910:. ./.:4:187,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:342,107:.: 0.94:1.000:. ./.:4:171,40:.:-1.25:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:318,54:.: 0.23:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:351,93:.: 0.89:1.000:. ./.:4:340,134:.: 1.17:1.000:. ./.:4:269,94:.: 0.15:1.000:. ./.:4:222,54:.:-0.65:1.000:. ./.:4:282,120:.: 0.51:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:335,94:.: 0.75:1.000:. ./.:4:249,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:392,165:.: 1.93:1.000:. ./.:4:248,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:188,29:.:-1.19:1.000:. ./.:4:187,26:.:-1.23:1.000:. ./.:4:230,50:.:-0.61:1.000:. ./.:4:273,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:314,84:.: 0.47:1.000:. ./.:4:220,38:.:-0.82:1.000:. ./.:4:314,113:.: 0.74:1.000:. ./.:4:239,100:.:-0.07:1.000:. ./.:4:306,105:.: 0.59:1.000:. ./.:4:271,66:.:-0.09:1.000:. ./.:4:203,39:.:-0.96:1.000:. ./.:4:211,44:.:-0.84:1.000:. ./.:4:310,105:.: 0.63:1.000:. ./.:4:262,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:302,103:.: 0.53:1.000:. ./.:4:184,29:.:-1.23:1.000:. ./.:4:212,48:.:-0.80:1.000:. ./.:4:278,128:.: 0.54:1.000:. ./.:4:225,40:.:-0.75:1.000:. ./.:4:240,76:.:-0.28:1.000:. ./.:4:342,112:.: 0.98:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:249,63:.:-0.32:1.000:. ./.:4:225,48:.:-0.68:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:248,92:.:-0.06:0.999:. ./.:4:297,106:.: 0.52:1.000:. ./.:3:194,69:.:-0.77:1.000:. ./.:4:253,48:.:-0.42:1.000:. ./.:4:237,75:.:-0.32:1.000:. ./.:4:238,63:.:-0.42:1.000:. ./.:4:306,87:.: 0.42:1.000:. ./.:4:202,38:.:-0.98:1.000:. ./.:4:254,50:.:-0.39:1.000:. ./.:4:245,92:.:-0.09:1.000:. ./.:4:299,96:.: 0.44:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:242,100:.:-0.04:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.38:1.000:. ./.:5:254,44:.:-0.45:0.988:. ./.:4:286,80:.: 0.18:1.000:. ./.:4:256,98:.: 0.07:1.000:. ./.:4:180,42:.:-1.15:1.000:. ./.:4:232,45:.:-0.64:1.000:. ./.:4:271,72:.:-0.04:1.000:. ./.:4:224,103:.:-0.18:1.000:. ./.:4:251,55:.:-0.38:1.000:. ./.:4:256,47:.:-0.40:1.000:. ./.:4:318,80:.: 0.47:1.000:. ./.:4:259,63:.:-0.23:1.000:. ./.:4:265,74:.:-0.07:1.000:. ./.:4:205,50:.:-0.84:1.000:. ./.:4:319,135:.: 0.98:1.000:. ./.:4:223,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:358,140:.: 1.39:1.000:. ./.:4:348,97:.: 0.90:1.000:. ./.:4:168,36:.:-1.31:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:431,135:.: 2.01:1.000:. ./.:4:263,44:.:-0.37:1.000:. ./.:4:305,116:.: 0.68:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:254,63:.:-0.27:1.000:. ./.:4:332,75:.: 0.55:1.000:. ./.:4:322,137:.: 1.03:1.000:. ./.:4:71,18:.:-2.37:1.000:. ./.:4:327,111:.: 0.84:1.000:. ./.:4:376,120:.: 1.37:1.000:. ./.:4:262,61:.:-0.22:1.000:. ./.:4:283,66:.: 0.02:1.000:. ./.:4:378,123:.: 1.42:1.000:. ./.:4:328,152:.: 1.22:1.000:. ./.:4:350,134:.: 1.26:1.000:. ./.:4:332,104:.: 0.82:1.000:. ./.:4:282,108:.: 0.40:1.000:. ./.:4:282,53:.:-0.11:1.000:. ./.:4:333,119:.: 0.97:1.000:. ./.:4:284,68:.: 0.05:1.000:. ./.:4:410,169:.: 2.13:1.000:. ./.:4:261,49:.:-0.34:1.000:. ./.:4:323,131:.: 0.98:0.999:. ./.:4:306,108:.: 0.62:1.000:. ./.:4:320,127:.: 0.92:1.000:. ./.:4:300,110:.: 0.58:1.000:. ./.:4:247,55:.:-0.41:1.000:. ./.:4:291,58:.: 0.02:1.000:. ./.:4:325,106:.: 0.77:1.000:. ./.:4:233,102:.:-0.11:1.000:. ./.:4:303,99:.: 0.51:1.000:. ./.:4:403,78:.: 1.23:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:262,53:.:-0.29:1.000:. ./.:4:302,113:.: 0.63:1.000:. ./.:4:324,80:.: 0.53:1.000:. ./.:4:355,75:.: 0.76:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:295,114:.: 0.57:1.000:. ./.:4:257,57:.:-0.30:1.000:. -chr1.1 42133605 chr1.1_042133605 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,2:0.19: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 1.44:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,12:0.31:-0.15:1.000:0.978 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.44:-1.15:1.000:0.959 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.15:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:70,2:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,3:0.25: 0.97:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-1.19:0.983:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,4:0.25: 1.24:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,3:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,6:0.26: 1.03:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:99,4:0.25: 1.10:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,7:0.26: 1.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,16:0.27: 2.85:1.000:0.998 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.21:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:65,5:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,8:0.26: 0.90:1.000:0.998 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,5:0.26: 0.99:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:85,6:0.26: 0.83:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.08:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:78,1:0.11: 0.56:0.999:0.657 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1:3:0,9:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.99:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,5:0.26: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:110,10:0.26: 1.49:0.988:0.862 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.10:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,8:0.27: 0.78:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:93,1:0.09: 0.90:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,3:0.19: 1.83:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,5:0.26: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,1:0.10: 0.60:1.000:0.731 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,1:0.10: 0.67:1.000:0.818 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:80,2:0.20: 0.63:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.19:0.999:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,1:0.12: 0.38:1.000:0.701 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,1:0.09: 0.81:1.000:0.921 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,1:0.10: 0.72:1.000:0.862 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:102,3:0.24: 1.15:1.000:1.000 -chr1.1 42326466 chr1.1_042326466 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:0.998:. ./.:4:2,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,0:.: 3.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:30,0:.: 3.11:1.000:. ./.:3:12,0:.: 0.44:0.983:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.: 3.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.03:1.000:. ./.:6:26,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:30,0:.: 3.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:0.910:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:26,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.15:1.000:. ./.:3:23,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.44:1.000:. ./.:5:27,0:.: 2.67:0.988:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.: 3.55:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.04:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.04:1.000:. -chr1.1 42878649 chr1.1_042878649 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:96,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.91:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:133,2:.: 1.72:1.000:. ./.:4:170,0:.: 2.60:0.998:. ./.:4:152,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:70,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:83,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:89,4:.: 0.66:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:57,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.15:1.000:. ./.:3:23,0:.:-1.10:0.983:. ./.:4:17,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:68,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:54,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:62,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:110,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:69,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:72,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:56,4:.:-0.17:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:76,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:83,2:.: 0.46:1.000:. ./.:6:95,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:125,2:.: 1.52:1.000:. ./.:4:54,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:110,4:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.16:0.910:. ./.:4:19,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:47,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:110,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:88,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:60,4:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:61,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:61,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,2:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:57,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,4:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:70,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:113,2:.: 1.22:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.85:0.999:. ./.:4:79,2:.: 0.36:1.000:. ./.:3:70,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:137,1:.: 1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:115,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,3:.: 0.36:1.000:. ./.:5:126,1:.: 1.52:0.988:. ./.:4:24,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:84,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:84,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:54,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:124,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.18:0.999:. ./.:4:118,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:78,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:61,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.20:1.000:. -chr1.1 42937109 chr1.1_042937109 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:75,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:55,14:.: 0.27:1.000:. ./.:4:85,19:.: 2.08:1.000:. ./.:4:52,13:.: 0.06:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:18,3:.:-2.22:1.000:. ./.:4:14,1:.:-2.53:1.000:. ./.:4:48,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,19:.:-0.10:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:57,15:.: 0.42:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.35:0.998:. ./.:4:48,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:59,28:.: 1.20:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:53,12:.: 0.06:1.000:. ./.:4:52,13:.: 0.06:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:51,13:.: 0.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:21,4:.:-2.02:1.000:. ./.:3:3,4:.:-2.95:0.983:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,13:.:-0.20:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:52,20:.: 0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:61,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.51:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:57,18:.: 0.58:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:38,16:.:-0.51:1.000:. ./.:4:57,15:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:48,12:.:-0.20:1.000:. ./.:4:38,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:49,15:.: 0.01:1.000:. ./.:6:48,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:37,14:.:-0.67:1.000:. ./.:4:44,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,8:.:-1.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.61:0.910:. ./.:4:53,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:13,8:.:-2.22:1.000:. ./.:4:46,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:26,34:.:-0.20:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.51:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:40,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:58,23:.: 0.89:1.000:. ./.:4:61,26:.: 1.20:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:29,14:.:-1.08:1.000:. ./.:4:48,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,12:.:-0.15:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,13:.: 0.37:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.77:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.48:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:51,22:.: 0.48:1.000:. ./.:4:25,8:.:-1.60:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:59,26:.: 1.10:1.000:. ./.:4:47,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:52,12:.: 0.01:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:73,29:.: 1.98:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:74,23:.: 1.72:0.999:. ./.:4:74,0:.: 0.53:1.000:. ./.:3:31,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:30,17:.:-0.87:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:65,17:.: 0.94:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:5:75,19:.: 1.57:0.988:. ./.:4:52,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:28,16:.:-1.03:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.67:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:56,11:.: 0.16:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:37,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:37,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:34,16:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,23:.: 2.29:1.000:. ./.:4:107,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:54,27:.: 0.89:1.000:. ./.:4:53,27:.: 0.84:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:54,22:.: 0.63:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:41,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:65,13:.: 0.73:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.67:1.000:. ./.:4:49,22:.: 0.37:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:29,8:.:-1.39:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:56,11:.: 0.16:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.15:0.999:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:64,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:44,19:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:51,15:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:69,17:.: 1.15:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:41,13:.:-0.51:1.000:. ./.:4:81,33:.: 2.60:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:49,18:.: 0.16:1.000:. -chr1.1 43165938 chr1.1_043165938 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:68,159:0.76: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,82:0.39: 1.03:1.000:0.732 0/0/1/1:4:145,74:0.39: 0.56:1.000:0.697 0/0/1/1:4:130,112:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,120:0.44: 2.53:1.000:0.960 0/0/1/1:4:74,85:0.58:-0.76:1.000:0.917 0/0/1/1:4:155,84:0.40: 1.00:1.000:0.811 0/0/1/1:4:157,80:0.39: 0.96:1.000:0.693 0/0/1/1:4:72,47:0.44:-1.65:1.000:0.968 0/0/1/1:4:69,84:0.60:-0.90:1.000:0.830 0/1/1/1:4:69,163:0.76: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,63:0.30: 1.69:1.000:0.987 0/1/1/1:4:74,114:0.66:-0.12:1.000:0.854 0/0/1/1:4:143,72:0.39: 0.47:1.000:0.666 0/0/0/1:4:146,60:0.35: 0.27:1.000:0.799 0/1/1/1:4:90,132:0.64: 0.63:0.998:0.742 1/1/1/1:4:0,199:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,167:0.67: 1.71:1.000:0.914 0/0/1/1:4:176,100:0.41: 1.82:1.000:0.876 0/1/1/1:4:31,105:0.82:-1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,127:0.69: 0.16:1.000:0.966 0/0/1/1:4:150,114:0.47: 1.56:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,60:0.56:-1.71:1.000:0.967 0/1/1/1:4:82,115:0.63: 0.08:1.000:0.602 0/0/1/1:4:70,94:0.62:-0.65:1.000:0.551 0/0/1/1:4:67,87:0.61:-0.87:1.000:0.664 0/1/1/1:4:79,131:0.68: 0.36:1.000:0.945 0/0/0/1:4:233,42:0.23: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,106:0.57: 0.14:1.000:0.934 0/0/1/1:4:68,89:0.61:-0.81:1.000:0.638 0/0/1/1:4:34,40:0.59:-2.64:1.000:0.888 0/0/1/1:4:94,49:0.39:-1.12:1.000:0.741 0/0/1:3:75,12:0.21:-2.35:0.983:1.000 0/1/1/1:4:77,122:0.67: 0.12:1.000:0.898 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,93:0.44: 0.94:1.000:0.967 0/1/1/1:4:57,134:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,75:0.38: 0.85:1.000:0.537 0/1/1/1:4:65,124:0.71:-0.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,143:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,78:0.39: 0.85:1.000:0.680 0/1/1/1:4:69,113:0.67:-0.26:1.000:0.934 0/1/1/1:4:56,135:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,78:0.42: 0.36:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,173:1.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,52:0.35:-0.32:1.000:0.804 0/0/1/1:4:105,76:0.46:-0.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:111,56:0.39:-0.59:1.000:0.671 0/1/1/1:4:88,167:0.71: 1.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:82,107:0.61:-0.10:1.000:0.648 0/1/1/1:4:65,131:0.73: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,127:0.70: 0.10:1.000:0.981 0/1/1/1:4:60,105:0.69:-0.63:1.000:0.974 0/0/1/1:4:138,74:0.40: 0.41:1.000:0.794 0/0/1/1:4:142,83:0.42: 0.69:1.000:0.905 0/1/1/1:4:69,121:0.69:-0.08:1.000:0.975 0/0/1/1/1/1:6:69,94:0.63:-0.68:1.000:0.811 0/0/1/1:4:115,91:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:213,32:0.21: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,145:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,101:0.72:-0.90:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,113:0.70:-0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,62:0.46:-0.96:1.000:0.986 0/1/1/1:4:67,103:0.66:-0.52:1.000:0.850 0/1/1/1:4:74,125:0.68: 0.12:0.910:0.957 0/1/1/1:4:71,128:0.70: 0.12:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,81:0.66:-1.34:1.000:0.873 0/1/1/1:4:94,170:0.70: 1.56:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,181:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,93:0.47: 0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:141,84:0.42: 0.69:1.000:0.921 0/1/1/1:4:67,126:0.71:-0.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:47,109:0.76:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,64:0.39:-0.10:1.000:0.704 0/1/1/1:4:61,103:0.68:-0.65:1.000:0.957 0/1/1/1:4:63,131:0.73: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,93:0.46: 0.61:1.000:0.990 0/1/1/1:4:68,105:0.66:-0.45:1.000:0.858 0/1/1/1:4:58,135:0.76:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,69:0.38: 0.41:1.000:0.563 0/1/1/1:4:84,142:0.68: 0.72:1.000:0.958 0/0/1/1:4:112,54:0.38:-0.61:1.000:0.561 0/1/1/1:4:47,114:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,52:0.41:-1.07:1.000:0.856 0/0/0/1:4:213,47:0.25: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,17:0.17:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,97:0.49: 0.50:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,178:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,52:0.43:-1.32:1.000:0.958 0/0/1/1:4:113,72:0.44:-0.19:1.000:0.960 0/1/1/1:4:67,107:0.67:-0.43:1.000:0.908 1/1/1/1:4:0,137:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,113:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,148:0.78: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,82:0.44: 0.30:1.000:0.970 0/0/1/1:4:69,60:0.50:-1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,99:0.48: 0.74:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,89:0.78:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,94:0.52: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:90,57:0.43:-1.03:1.000:0.957 0/0/1/1:4:120,60:0.39:-0.30:1.000:0.650 0/1/1/1:4:54,118:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,136:0.69: 0.47:1.000:0.967 0/0/1/1:4:171,91:0.40: 1.51:1.000:0.780 0/1/1/1:4:52,117:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,108:0.71:-0.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,182:0.75: 1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,65:0.44:-0.65:0.999:0.970 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1:3:47,36:0.48:-2.44:1.000:0.841 0/1/1/1:4:68,131:0.71: 0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,108:0.71:-0.61:1.000:0.990 0/0/1/1:4:131,83:0.43: 0.45:1.000:0.957 0/1/1/1:4:56,118:0.74:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:49,108:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,79:0.48:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,105:0.72:-0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,96:0.48: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,139:0.71: 0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,70:0.43:-0.28:1.000:0.955 0/1/1/1:4:54,117:0.74:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:193,42:0.25: 0.92:0.988:0.928 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,76:0.69:-1.65:1.000:0.978 0/1/1/1:4:50,90:0.70:-1.18:1.000:0.983 0/1/1/1:4:58,105:0.70:-0.68:1.000:0.984 0/0/1/1:4:152,106:0.45: 1.42:1.000:0.984 0/1/1/1:4:32,84:0.78:-1.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,112:0.73:-0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,87:0.47: 0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:172,109:0.43: 1.93:1.000:0.957 0/0/1/1:4:74,95:0.61:-0.54:1.000:0.699 0/0/1/1:4:101,54:0.40:-0.85:1.000:0.788 0/0/0/1:4:144,50:0.32: 0.01:1.000:0.954 0/1/1/1:4:44,112:0.77:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,118:0.71:-0.28:1.000:0.990 0/1/1/1:4:74,114:0.66:-0.12:1.000:0.854 0/1/1/1:4:62,109:0.69:-0.50:1.000:0.976 0/0/0/1:4:124,41:0.31:-0.63:1.000:0.971 0/0/1/1:4:154,100:0.44: 1.34:1.000:0.967 0/1/1/1:4:74,188:0.77: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,155:0.73: 0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:154,82:0.40: 0.94:1.000:0.781 0/0/1/1:4:146,125:0.50: 1.71:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,168:0.74: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:230,36:0.21: 1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,104:0.78:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,41:0.22: 1.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,173:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,75:0.30: 2.90:1.000:0.988 0/1/1/1:4:82,166:0.73: 1.20:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,104:0.71:-0.74:1.000:0.989 0/0/0/1:4:162,69:0.36: 0.83:1.000:0.735 0/1/1/1:4:63,122:0.72:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:193,25:0.19: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,52:0.35:-0.41:1.000:0.749 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,74:0.66:-1.58:1.000:0.855 0/1/1/1:4:71,131:0.70: 0.19:1.000:0.988 0/1/1/1:4:65,125:0.71:-0.08:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-0.74:0.999:1.000 0/1/1/1:4:67,104:0.66:-0.50:1.000:0.867 0/0/1/1:4:149,91:0.43: 1.03:1.000:0.938 0/0/1/1:4:133,70:0.40: 0.21:1.000:0.760 0/0/0/1:4:200,48:0.26: 1.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:210,43:0.24: 1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,125:0.99:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,68:0.41:-0.06:1.000:0.841 0/0/0/1:4:127,45:0.32:-0.48:1.000:0.945 0/0/1/1:4:176,115:0.44: 2.15:1.000:0.969 0/0/1/1:4:140,109:0.48: 1.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:82,122:0.65: 0.23:1.000:0.779 0/0/0/1:4:161,52:0.31: 0.43:1.000:0.977 0/1/1/1:4:86,168:0.72: 1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:175,100:0.41: 1.80:1.000:0.882 0/0/1/1:4:155,107:0.45: 1.51:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,123:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,141:0.72: 0.41:1.000:0.996 -chr1.1 43407161 chr1.1_043407161 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:364,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:295,71:.: 0.51:1.000:. ./.:4:297,79:.: 0.64:1.000:. ./.:4:348,88:.: 1.45:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:342,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:65,18:.:-3.31:1.000:. ./.:4:87,25:.:-2.91:1.000:. ./.:4:240,66:.:-0.30:1.000:. ./.:4:244,76:.:-0.11:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:254,65:.:-0.13:1.000:. ./.:4:270,62:.: 0.05:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.15:0.998:. ./.:4:402,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:339,82:.: 1.25:1.000:. ./.:4:163,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:98,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:337,97:.: 1.42:1.000:. ./.:4:259,72:.: 0.04:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:398,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:307,79:.: 0.78:1.000:. ./.:4:506,2:.: 2.42:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:81,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:109,14:.:-2.77:1.000:. ./.:3:40,3:.:-3.84:0.983:. ./.:4:400,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:305,74:.: 0.68:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:315,77:.: 0.86:1.000:. ./.:4:237,66:.:-0.34:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:303,71:.: 0.61:1.000:. ./.:4:252,65:.:-0.15:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:132,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:249,61:.:-0.25:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:240,54:.:-0.46:1.000:. ./.:4:313,94:.: 1.06:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:388,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:237,62:.:-0.40:1.000:. ./.:4:290,71:.: 0.44:1.000:. ./.:4:297,69:.: 0.51:1.000:. ./.:6:234,40:.:-0.73:1.000:. ./.:4:254,81:.: 0.09:1.000:. ./.:4:239,70:.:-0.26:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:257,48:.:-0.32:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.03:0.910:. ./.:4:193,46:.:-1.20:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:254,66:.:-0.11:1.000:. ./.:4:299,104:.: 1.00:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:194,138:.: 0.05:1.000:. ./.:4:305,75:.: 0.70:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:287,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:210,51:.:-0.91:1.000:. ./.:4:255,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:266,76:.: 0.18:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:286,96:.: 0.72:1.000:. ./.:4:288,61:.: 0.28:1.000:. ./.:4:189,47:.:-1.24:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:289,61:.: 0.29:1.000:. ./.:4:251,63:.:-0.19:1.000:. ./.:4:244,58:.:-0.36:1.000:. ./.:4:245,52:.:-0.42:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:248,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:231,66:.:-0.42:1.000:. ./.:4:343,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:250,73:.:-0.07:1.000:. ./.:4:218,57:.:-0.72:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:201,65:.:-0.84:1.000:. ./.:4:200,37:.:-1.23:1.000:. ./.:4:269,61:.: 0.02:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:326,75:.: 0.98:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:498,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:223,58:.:-0.64:0.999:. ./.:4:355,0:.: 0.36:1.000:. ./.:3:207,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:263,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:236,76:.:-0.22:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.37:1.000:. ./.:5:313,65:.: 0.67:0.988:. ./.:4:260,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:243,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:244,55:.:-0.40:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:213,66:.:-0.67:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:320,95:.: 1.17:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:223,72:.:-0.45:1.000:. ./.:4:190,46:.:-1.24:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:167,64:.:-1.31:1.000:. ./.:4:315,76:.: 0.84:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:256,58:.:-0.19:1.000:. ./.:4:329,75:.: 1.02:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:266,67:.: 0.06:1.000:. ./.:4:106,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:195,53:.:-1.08:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:291,77:.: 0.53:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:324,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:262,91:.: 0.33:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:227,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:269,65:.: 0.08:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:253,78:.: 0.04:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:260,75:.: 0.09:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.37:0.999:. ./.:4:333,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:198,55:.:-1.02:1.000:. ./.:4:239,57:.:-0.44:1.000:. ./.:4:248,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:209,59:.:-0.81:1.000:. ./.:4:363,85:.: 1.61:1.000:. ./.:4:307,93:.: 0.96:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:228,64:.:-0.49:1.000:. ./.:4:286,78:.: 0.48:1.000:. ./.:4:333,96:.: 1.36:1.000:. ./.:4:308,76:.: 0.75:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:233,60:.:-0.48:1.000:. -chr1.1 43662924 chr1.1_043662924 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,0:.: 0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.73:0.998:. ./.:4:0,1:.:-1.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.71:1.000:. ./.:3:10,0:.:-1.00:0.983:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:6:25,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.67:0.910:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:59,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.50:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.50:1.000:. ./.:5:67,0:.: 2.28:0.988:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. -chr1.1 43883037 chr1.1_043883037 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,149:.: 1.15:1.000:. ./.:4:65,70:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,57:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.61:1.000:. ./.:4:44,165:.: 1.55:1.000:. ./.:4:37,150:.: 1.03:1.000:. ./.:4:14,92:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.86:1.000:. ./.:4:35,114:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,19:.:-2.92:1.000:. ./.:4:7,20:.:-2.74:1.000:. ./.:4:67,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:33,138:.: 0.65:1.000:. ./.:4:38,137:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,128:.: 0.42:1.000:. ./.:4:35,130:.: 0.51:0.998:. ./.:4:67,100:.: 0.56:1.000:. ./.:4:72,99:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,209:.: 1.55:1.000:. ./.:4:5,13:.:-2.95:1.000:. ./.:4:34,126:.: 0.39:1.000:. ./.:4:29,152:.: 0.89:1.000:. ./.:4:63,78:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.99:1.000:. ./.:4:39,151:.: 1.10:1.000:. ./.:4:31,164:.: 1.22:1.000:. ./.:4:27,122:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,210:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,183:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.89:1.000:. ./.:4:30,121:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-3.35:1.000:. ./.:4:11,19:.:-2.67:1.000:. ./.:3:0,8:.:-3.18:1.000:. ./.:4:28,123:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,93:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,94:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,91:.: 0.39:1.000:. ./.:4:28,136:.: 0.49:1.000:. ./.:4:64,75:.:-0.10:1.000:. ./.:4:59,94:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,174:.: 0.72:1.000:. ./.:4:22,106:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,121:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,168:.: 0.61:1.000:. ./.:4:91,99:.: 1.10:1.000:. ./.:4:27,23:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,80:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,99:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.39:1.000:. ./.:4:66,99:.: 0.51:1.000:. ./.:4:70,94:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.39:1.000:. ./.:4:42,100:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,101:.:-0.31:1.000:. ./.:6:35,71:.:-0.88:1.000:. ./.:4:60,72:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,81:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,81:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,121:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.25:1.000:. ./.:4:17,68:.:-1.37:1.000:. ./.:4:39,113:.: 0.21:1.000:. ./.:4:23,113:.:-0.17:0.910:. ./.:4:43,73:.:-0.64:1.000:. ./.:4:52,72:.:-0.45:1.000:. ./.:4:55,64:.:-0.57:1.000:. ./.:4:46,67:.:-0.71:1.000:. ./.:4:62,112:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.37:1.000:. ./.:4:54,47:.:-0.99:1.000:. ./.:4:31,105:.:-0.17:1.000:. ./.:4:46,76:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,71:.:-0.95:1.000:. ./.:4:44,136:.: 0.86:1.000:. ./.:4:26,52:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.65:1.000:. ./.:4:35,135:.: 0.63:1.000:. ./.:4:34,114:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,102:.:-0.48:1.000:. ./.:4:70,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.14:1.000:. ./.:4:29,96:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,100:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.90:1.000:. ./.:4:33,79:.:-0.74:1.000:. ./.:4:71,72:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,153:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,60:.:-0.74:1.000:. ./.:4:28,98:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,65:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,191:.: 1.12:1.000:. ./.:4:19,73:.:-1.21:1.000:. ./.:4:30,124:.: 0.25:1.000:. ./.:4:19,75:.:-1.16:1.000:. ./.:4:29,99:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,66:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.04:1.000:. ./.:4:43,65:.:-0.83:1.000:. ./.:4:28,137:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,230:.: 2.04:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.51:1.000:. ./.:4:52,170:.: 1.85:1.000:. ./.:4:25,94:.:-0.57:0.999:. ./.:4:24,107:.:-0.29:1.000:. ./.:3:27,57:.:-1.39:1.000:. ./.:4:64,98:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,84:.:-0.92:1.000:. ./.:4:27,89:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.41:1.000:. ./.:4:64,93:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,99:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,134:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.51:1.000:. ./.:5:0,184:.: 0.96:0.988:. ./.:4:20,94:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,49:.:-1.30:1.000:. ./.:4:42,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:12,94:.:-0.88:1.000:. ./.:4:26,120:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,42:.:-1.51:1.000:. ./.:4:28,121:.: 0.14:1.000:. ./.:4:32,97:.:-0.34:1.000:. ./.:4:35,185:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.49:1.000:. ./.:4:20,86:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,89:.:-0.59:1.000:. ./.:4:64,44:.:-0.83:1.000:. ./.:4:14,108:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,88:.:-0.88:1.000:. ./.:4:1,168:.: 0.61:1.000:. ./.:4:20,92:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,157:.: 0.89:1.000:. ./.:4:84,109:.: 1.17:1.000:. ./.:4:28,127:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.84:1.000:. ./.:4:49,165:.: 1.66:1.000:. ./.:4:62,80:.:-0.03:1.000:. ./.:4:75,93:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.54:1.000:. ./.:4:7,13:.:-2.90:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.42:1.000:. ./.:4:72,119:.: 1.12:1.000:. ./.:4:21,127:.: 0.11:1.000:. ./.:4:79,142:.: 1.83:1.000:. ./.:4:25,154:.: 0.84:1.000:. ./.:4:33,79:.:-0.74:1.000:. ./.:4:29,170:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.30:1.000:. ./.:4:47,78:.:-0.43:1.000:. ./.:4:30,153:.: 0.94:1.000:. ./.:4:73,81:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,76:.:-0.36:1.000:. ./.:4:37,127:.: 0.49:0.999:. ./.:4:70,104:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.77:1.000:. ./.:4:62,75:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.37:1.000:. ./.:4:26,108:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,130:.: 0.54:1.000:. ./.:4:28,95:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.26:1.000:. ./.:4:48,137:.: 0.98:1.000:. ./.:4:39,135:.: 0.72:1.000:. ./.:4:41,158:.: 1.31:1.000:. ./.:4:7,162:.: 0.61:1.000:. ./.:4:64,100:.: 0.49:1.000:. ./.:4:53,167:.: 1.81:1.000:. ./.:4:48,177:.: 1.92:1.000:. ./.:4:54,88:.:-0.03:1.000:. ./.:4:34,169:.: 1.41:1.000:. -chr1.1 43956745 chr1.1_043956745 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:178,66:.: 0.37:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:239,83:.: 1.71:1.000:. ./.:4:169,79:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,61:.:-0.72:1.000:. ./.:4:181,59:.: 0.31:1.000:. ./.:4:178,70:.: 0.44:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:184,76:.: 0.65:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:203,57:.: 0.65:1.000:. ./.:4:181,74:.: 0.56:0.998:. ./.:4:236,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:207,89:.: 1.26:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:19,6:.:-3.38:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:214,87:.: 1.35:1.000:. ./.:4:165,78:.: 0.36:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:150,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:10,4:.:-3.57:1.000:. ./.:4:45,11:.:-2.85:1.000:. ./.:3:13,3:.:-3.53:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:201,77:.: 0.96:1.000:. ./.:4:160,65:.: 0.05:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:174,57:.: 0.15:1.000:. ./.:4:155,64:.:-0.05:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:198,61:.: 0.63:1.000:. ./.:4:184,59:.: 0.36:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:138,51:.:-0.57:1.000:. ./.:4:92,13:.:-2.01:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:157,54:.:-0.19:1.000:. ./.:4:201,79:.: 0.99:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.52:1.000:. ./.:6:128,43:.:-0.88:1.000:. ./.:4:176,71:.: 0.43:1.000:. ./.:4:139,35:.:-0.83:1.000:. ./.:4:193,59:.: 0.51:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,49:.:-0.47:0.910:. ./.:4:206,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:160,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,70:.:-0.05:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:160,52:.:-0.17:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:139,48:.:-0.60:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:157,51:.:-0.24:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:126,42:.:-0.93:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:128,42:.:-0.89:1.000:. ./.:4:238,84:.: 1.71:1.000:. ./.:4:193,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:191,69:.: 0.65:1.000:. ./.:4:177,58:.: 0.22:1.000:. ./.:4:157,65:.: 0.00:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:163,60:.: 0.01:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:188,89:.: 0.94:1.000:. ./.:4:188,75:.: 0.70:1.000:. ./.:4:165,66:.: 0.15:1.000:. ./.:4:233,81:.: 1.57:1.000:. ./.:4:174,42:.:-0.11:0.999:. ./.:4:196,0:.:-0.45:1.000:. ./.:3:110,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:200,79:.: 0.97:1.000:. ./.:4:154,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:142,40:.:-0.69:1.000:. ./.:4:165,67:.: 0.17:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:191,72:.: 0.70:1.000:. ./.:4:161,76:.: 0.25:1.000:. ./.:4:145,62:.:-0.26:1.000:. ./.:4:173,68:.: 0.32:1.000:. ./.:5:180,126:.: 1.44:0.988:. ./.:4:189,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:121,52:.:-0.84:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:181,74:.: 0.56:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:138,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:223,100:.: 1.73:1.000:. ./.:4:162,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:141,39:.:-0.72:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:168,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:108,41:.:-1.25:1.000:. ./.:4:212,94:.: 1.44:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:193,79:.: 0.85:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,83:.: 0.84:1.000:. ./.:4:175,65:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,8:.:-2.97:1.000:. ./.:4:131,45:.:-0.79:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:190,90:.: 0.99:1.000:. ./.:4:221,70:.: 1.18:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:199,71:.: 0.82:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:149,38:.:-0.60:1.000:. ./.:4:162,74:.: 0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.96:0.999:. ./.:4:171,43:.:-0.14:1.000:. ./.:4:159,66:.: 0.05:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:142,43:.:-0.64:1.000:. ./.:4:173,68:.: 0.32:1.000:. ./.:4:167,63:.: 0.13:1.000:. ./.:4:148,45:.:-0.50:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:215,87:.: 1.37:1.000:. ./.:4:185,96:.: 1.01:1.000:. ./.:4:198,55:.: 0.53:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:213,99:.: 1.54:1.000:. ./.:4:240,69:.: 1.49:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.03:1.000:. -chr1.1 44240352 chr1.1_044240352 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:200,67:.: 0.72:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:229,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:182,71:.: 0.47:1.000:. ./.:4:233,90:.: 1.70:1.000:. ./.:4:145,46:.:-0.61:1.000:. ./.:4:202,56:.: 0.56:1.000:. ./.:4:206,65:.: 0.79:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:183,63:.: 0.35:1.000:. ./.:4:241,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:212,66:.: 0.91:1.000:. ./.:4:225,72:.: 1.24:0.998:. ./.:4:289,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:214,64:.: 0.91:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,10:.:-3.24:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:279,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:197,63:.: 0.59:1.000:. ./.:4:231,72:.: 1.35:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:192,73:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,9:.:-3.20:1.000:. ./.:4:49,17:.:-2.80:1.000:. ./.:3:11,5:.:-3.67:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:219,60:.: 0.93:1.000:. ./.:4:193,61:.: 0.49:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:168,43:.:-0.26:1.000:. ./.:4:198,57:.: 0.51:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:157,62:.:-0.12:1.000:. ./.:4:180,60:.: 0.24:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:140,43:.:-0.75:1.000:. ./.:4:157,44:.:-0.44:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:155,65:.:-0.11:1.000:. ./.:4:174,62:.: 0.17:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.58:1.000:. ./.:6:115,40:.:-1.24:1.000:. ./.:4:176,59:.: 0.16:1.000:. ./.:4:156,46:.:-0.42:1.000:. ./.:4:169,55:.:-0.04:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:160,67:.: 0.02:0.910:. ./.:4:216,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:162,46:.:-0.31:1.000:. ./.:4:162,68:.: 0.07:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:194,42:.: 0.17:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:126,46:.:-0.94:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:142,44:.:-0.70:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:140,42:.:-0.77:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:149,47:.:-0.52:1.000:. ./.:4:171,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:160,54:.:-0.21:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:172,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:111,36:.:-1.38:1.000:. ./.:4:167,51:.:-0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:167,62:.: 0.05:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:199,76:.: 0.86:1.000:. ./.:4:177,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:111,36:.:-1.38:1.000:. ./.:4:235,87:.: 1.68:1.000:. ./.:4:174,54:.: 0.03:0.999:. ./.:4:253,0:.: 0.47:1.000:. ./.:3:131,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:178,61:.: 0.23:1.000:. ./.:4:113,44:.:-1.21:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:147,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,37:.:-0.40:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:169,59:.: 0.03:1.000:. ./.:4:255,78:.: 1.87:1.000:. ./.:4:155,46:.:-0.44:1.000:. ./.:4:155,44:.:-0.47:1.000:. ./.:5:147,111:.: 0.56:0.988:. ./.:4:224,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:105,38:.:-1.45:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:235,56:.: 1.14:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:144,64:.:-0.31:1.000:. ./.:4:233,72:.: 1.38:1.000:. ./.:4:195,60:.: 0.51:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:134,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:175,54:.: 0.05:1.000:. ./.:4:164,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,37:.:-1.29:1.000:. ./.:4:227,86:.: 1.52:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:200,74:.: 0.84:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:243,91:.: 1.89:1.000:. ./.:4:230,79:.: 1.45:1.000:. ./.:4:75,10:.:-2.47:1.000:. ./.:4:217,63:.: 0.94:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:183,65:.: 0.38:1.000:. ./.:4:207,73:.: 0.94:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:231,79:.: 1.47:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:166,55:.:-0.09:1.000:. ./.:4:183,46:.: 0.05:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:200,50:.: 0.42:1.000:. ./.:4:192,46:.: 0.21:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:149,49:.:-0.49:1.000:. ./.:4:180,65:.: 0.33:1.000:. ./.:4:172,56:.: 0.03:1.000:. ./.:4:147,41:.:-0.66:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:359,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:202,60:.: 0.63:1.000:. ./.:4:184,69:.: 0.47:1.000:. ./.:4:196,49:.: 0.33:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:248,82:.: 1.82:1.000:. ./.:4:251,83:.: 1.89:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.56:1.000:. -chr1.1 44362502 chr1.1_044362502 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:175,66:.: 1.35:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:163,68:.: 1.15:1.000:. ./.:4:229,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:197,95:.: 2.36:1.000:. ./.:4:59,44:.:-1.38:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:24,27:.:-2.40:1.000:. ./.:4:39,20:.:-2.24:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:152,62:.: 0.82:1.000:. ./.:4:88,77:.:-0.15:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.21:0.998:. ./.:4:116,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:123,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:113,71:.: 0.23:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:106,68:.: 0.03:1.000:. ./.:4:12,23:.:-2.72:1.000:. ./.:4:116,85:.: 0.56:1.000:. ./.:4:160,77:.: 1.27:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,67:.:-0.15:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,84:.: 0.82:1.000:. ./.:4:113,77:.: 0.34:1.000:. ./.:4:30,12:.:-2.58:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.89:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:187,81:.: 1.88:1.000:. ./.:4:78,58:.:-0.72:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:130,75:.: 0.64:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:125,94:.: 0.92:1.000:. ./.:4:135,73:.: 0.70:1.000:. ./.:4:116,79:.: 0.44:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:105,72:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,64:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,53:.:-0.58:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:85,54:.:-0.66:1.000:. ./.:4:149,74:.: 1.00:1.000:. ./.:4:70,63:.:-0.78:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:124,75:.: 0.52:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:118,78:.: 0.46:1.000:. ./.:4:148,95:.: 1.39:1.000:. ./.:6:153,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:80,66:.:-0.53:1.000:. ./.:4:119,83:.: 0.58:1.000:. ./.:4:105,79:.: 0.23:1.000:. ./.:4:83,45:.:-0.88:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:120,76:.: 0.46:0.910:. ./.:4:190,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:108,75:.: 0.21:1.000:. ./.:4:79,20:.:-1.45:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:151,68:.: 0.92:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:109,85:.: 0.42:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:157,82:.: 1.31:1.000:. ./.:4:123,96:.: 0.92:1.000:. ./.:4:147,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:146,91:.: 1.27:1.000:. ./.:4:43,48:.:-1.61:1.000:. ./.:4:126,70:.: 0.46:1.000:. ./.:4:89,75:.:-0.17:1.000:. ./.:4:152,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:156,65:.: 0.96:1.000:. ./.:4:134,78:.: 0.78:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:107,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:146,76:.: 0.98:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:81,88:.:-0.07:1.000:. ./.:4:80,47:.:-0.90:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:118,48:.:-0.13:1.000:. ./.:4:144,72:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:83,68:.:-0.43:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:87,67:.:-0.37:1.000:. ./.:4:169,72:.: 1.35:1.000:. ./.:4:104,78:.: 0.19:1.000:. ./.:4:78,81:.:-0.27:1.000:. ./.:4:198,88:.: 2.24:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:98,73:.:-0.03:1.000:. ./.:3:102,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:139,57:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,61:.:-0.41:1.000:. ./.:4:58,55:.:-1.18:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:100,77:.: 0.09:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:166,81:.: 1.47:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,81:.: 0.32:1.000:. ./.:5:190,0:.: 0.34:0.988:. ./.:4:99,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,1:.:-2.01:1.000:. ./.:4:120,55:.: 0.05:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:277,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:94,85:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:85,60:.:-0.55:1.000:. ./.:4:104,50:.:-0.37:1.000:. ./.:4:104,72:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:165,82:.: 1.47:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:154,62:.: 0.86:1.000:. ./.:4:99,54:.:-0.39:1.000:. ./.:4:165,64:.: 1.11:1.000:. ./.:4:133,65:.: 0.50:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:120,85:.: 0.64:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:104,61:.:-0.15:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:100,64:.:-0.17:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:101,79:.: 0.15:1.000:. ./.:4:109,84:.: 0.40:1.000:. ./.:4:150,78:.: 1.09:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:141,48:.: 0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.55:0.999:. ./.:4:146,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:95,76:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:76,46:.:-1.00:1.000:. ./.:4:182,94:.: 2.04:1.000:. ./.:4:167,86:.: 1.59:1.000:. ./.:4:124,76:.: 0.54:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:160,74:.: 1.21:1.000:. ./.:4:250,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:175,75:.: 1.53:1.000:. ./.:4:97,51:.:-0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.19:1.000:. -chr1.1 44852814 chr1.1_044852814 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:126,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.81:0.998:. ./.:4:96,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.77:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:100,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.53:1.000:. ./.:6:96,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:0.910:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:126,0:.: 0.47:1.000:. ./.:3:67,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.23:1.000:. ./.:5:129,0:.: 0.55:0.988:. ./.:4:97,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:127,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.18:1.000:. -chr1.1 45057203 chr1.1_045057203 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:142,43:0.20: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,65:0.31: 0.37:1.000:0.974 0/0/1/1:4:108,117:0.48: 1.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,116:0.54: 0.65:1.000:0.986 0/0/1/1:4:121,114:0.45: 1.50:1.000:0.977 0/0/0/1:4:88,39:0.27:-1.04:1.000:0.998 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:169,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,61:0.63:-1.91:1.000:0.563 0/1/1/1:4:23,97:0.75:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,53:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,64:0.28: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:135,55:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,87:0.41: 0.51:1.000:0.880 0/0/1/1:4:126,111:0.43: 1.54:1.000:0.948 0/0/0/1:4:170,49:0.19: 1.12:0.998:1.000 0/0/0/0:4:155,1:0.01:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,70:0.25: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,127:0.50: 1.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,15:0.28:-2.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,39:0.18: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,83:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,26:0.31:-2.29:1.000:0.968 0/1/1/1:4:53,179:0.72: 1.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,182:0.68: 1.80:1.000:0.959 0/0/0/1:4:148,63:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,50:0.23: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,55:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,56:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,42:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,48:0.59:-2.26:1.000:0.832 0/0/0/1:4:50,21:0.26:-2.36:1.000:0.999 0/0/0:3:36,0:0.00:-3.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,72:0.27: 1.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:104,101:0.45: 0.79:1.000:0.984 0/0/1/1:4:95,115:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,48:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,105:0.54: 0.23:1.000:0.988 0/1/1/1:4:34,145:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,47:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,108:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,130:0.73:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:126,64:0.30: 0.44:1.000:0.986 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,98:0.47: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:162,170:0.47: 3.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,85:0.57:-0.76:1.000:0.951 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,80:0.46:-0.22:1.000:0.985 0/1/1/1:4:43,178:0.75: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,26:0.18:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,113:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,49:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,50:0.30:-0.59:1.000:0.981 0/0/1/1:4:83,82:0.46:-0.15:1.000:0.987 0/0/1/1:4:72,77:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,155:0.76: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:71,72:0.47:-0.66:1.000:0.822 0/0/1/1:4:69,87:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:124,34:0.19:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,55:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,35:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,99:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,41:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,48:0.48:-1.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:109,41:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,44:0.24:-0.34:0.910:1.000 0/0/0/1:4:101,47:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,98:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,51:0.78:-2.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,57:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,93:0.45: 0.46:1.000:0.979 0/0/1/1:4:66,97:0.55:-0.19:1.000:0.977 0/0/1/1:4:57,81:0.55:-0.78:1.000:0.984 0/0/0/1:4:113,49:0.26:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,45:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,50:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,39:0.24:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,77:0.45:-0.31:1.000:0.979 0/1/1/1:4:39,146:0.73: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,42:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,50:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,140:0.70: 0.37:1.000:0.981 0/0/1/1:4:57,53:0.44:-1.44:1.000:0.973 0/0/0/1:4:97,25:0.18:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,61:0.46:-1.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:74,90:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,40:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,80:0.44:-0.12:1.000:0.973 0/0/1/1:4:70,92:0.53:-0.22:1.000:0.993 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,55:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,79:0.51:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,34:0.19:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,46:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,87:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,61:0.50:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,50:0.30:-0.59:1.000:0.981 0/0/1/1:4:78,88:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,72:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,90:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,40:0.27:-0.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:149,53:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,104:0.41: 1.45:1.000:0.854 0/0/0/1:4:99,52:0.31:-0.48:1.000:0.978 0/0/0/1:4:107,43:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,86:0.28: 2.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,94:0.57:-0.41:0.999:0.953 0/0/1/1:4:77,99:0.52: 0.11:1.000:0.994 0/0/1:3:77,37:0.29:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,100:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,37:0.24:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,78:0.51:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,54:0.28:-0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:107,39:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,96:0.52: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,35:0.22:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,52:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,49:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:135,33:0.17:-0.08:0.988:0.999 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,30:0.24:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,39:0.29:-1.20:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,136:0.68: 0.35:1.000:0.953 0/0/0/0:4:186,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,35:0.33:-1.79:1.000:0.919 0/1/1/1:4:48,128:0.68: 0.11:1.000:0.942 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,152:0.52: 2.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:147,52:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,69:0.44:-0.66:1.000:0.974 0/0/0/1:4:109,36:0.22:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,44:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,38:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,35:0.21:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,46:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,36:0.23:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,136:0.52: 1.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:163,73:0.27: 1.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,63:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,96:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,103:0.47: 0.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,76:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:174,83:0.28: 2.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:145,43:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,21:0.26:-2.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,35:0.30:-1.60:1.000:0.983 0/0/1/1:4:91,133:0.55: 1.24:1.000:0.978 0/0/0/1:4:123,50:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,48:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,109:0.55: 0.30:1.000:0.979 0/0/0/1:4:122,56:0.28: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,97:0.45: 0.65:1.000:0.979 0/0/0/1:4:120,53:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,48:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,87:0.46: 0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:80,97:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,159:0.69: 1.00:1.000:0.974 0/0/0/1:4:117,49:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,136:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 0.23:0.999:1.000 0/0/0/1:4:151,62:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,76:0.41:-0.08:1.000:0.889 0/0/0/1:4:93,53:0.33:-0.59:1.000:0.939 0/0/0/1:4:126,52:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,51:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,99:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,116:0.54: 0.63:1.000:0.985 0/0/1/1:4:82,88:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,62:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,57:0.22: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,153:0.72: 0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:142,122:0.42: 2.18:1.000:0.929 0/0/1/1:4:117,140:0.51: 2.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,78:0.48:-0.45:1.000:0.994 0/0/0/1:4:114,56:0.29:-0.03:1.000:0.991 -chr1.1 45279885 chr1.1_045279885 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:212,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:114,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:123,45:.: 0.17:1.000:. ./.:4:178,46:.: 1.50:1.000:. ./.:4:156,43:.: 0.91:1.000:. ./.:4:65,16:.:-1.90:1.000:. ./.:4:116,47:.: 0.05:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:19,10:.:-3.14:1.000:. ./.:4:36,3:.:-2.90:1.000:. ./.:4:97,30:.:-0.81:1.000:. ./.:4:127,38:.: 0.10:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:97,69:.: 0.12:1.000:. ./.:4:97,87:.: 0.55:1.000:. ./.:4:147,31:.: 0.41:0.998:. ./.:4:87,68:.:-0.14:1.000:. ./.:4:176,57:.: 1.72:1.000:. ./.:4:106,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:29,7:.:-2.98:1.000:. ./.:4:139,24:.: 0.05:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:120,35:.:-0.14:1.000:. ./.:4:9,8:.:-3.43:1.000:. ./.:4:113,93:.: 1.07:1.000:. ./.:4:122,33:.:-0.14:1.000:. ./.:4:133,45:.: 0.41:1.000:. ./.:4:148,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:140,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:164,49:.: 1.24:1.000:. ./.:4:117,40:.:-0.09:1.000:. ./.:4:29,1:.:-3.12:1.000:. ./.:4:35,7:.:-2.83:1.000:. ./.:3:26,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:132,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:147,47:.: 0.79:1.000:. ./.:4:105,55:.:-0.02:1.000:. ./.:4:81,88:.: 0.19:1.000:. ./.:4:148,39:.: 0.62:1.000:. ./.:4:144,34:.: 0.41:1.000:. ./.:4:84,89:.: 0.29:1.000:. ./.:4:117,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:151,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:144,40:.: 0.55:1.000:. ./.:4:165,46:.: 1.19:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:84,79:.: 0.05:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:79,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:174,49:.: 1.48:1.000:. ./.:4:130,42:.: 0.26:1.000:. ./.:4:142,44:.: 0.60:1.000:. ./.:4:143,37:.: 0.45:1.000:. ./.:4:106,44:.:-0.26:1.000:. ./.:4:127,34:.: 0.00:1.000:. ./.:4:84,80:.: 0.07:1.000:. ./.:4:132,30:.: 0.03:1.000:. ./.:6:103,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:124,26:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,84:.: 0.00:1.000:. ./.:4:170,38:.: 1.12:1.000:. ./.:4:106,46:.:-0.21:1.000:. ./.:4:139,37:.: 0.36:1.000:. ./.:4:141,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:75,26:.:-1.43:1.000:. ./.:4:123,33:.:-0.12:1.000:. ./.:4:113,36:.:-0.28:0.910:. ./.:4:128,30:.:-0.07:1.000:. ./.:4:155,40:.: 0.81:1.000:. ./.:4:88,24:.:-1.17:1.000:. ./.:4:146,51:.: 0.86:1.000:. ./.:4:189,2:.: 0.72:1.000:. ./.:4:95,78:.: 0.29:1.000:. ./.:4:109,35:.:-0.40:1.000:. ./.:4:131,36:.: 0.14:1.000:. ./.:4:129,38:.: 0.14:1.000:. ./.:4:157,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:141,49:.: 0.69:1.000:. ./.:4:104,30:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,39:.: 0.57:1.000:. ./.:4:106,88:.: 0.79:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:74,74:.:-0.31:1.000:. ./.:4:153,40:.: 0.76:1.000:. ./.:4:48,60:.:-1.26:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:74,66:.:-0.50:1.000:. ./.:4:115,35:.:-0.26:1.000:. ./.:4:62,59:.:-0.95:1.000:. ./.:4:138,35:.: 0.29:1.000:. ./.:4:131,54:.: 0.57:1.000:. ./.:4:86,22:.:-1.26:1.000:. ./.:4:151,46:.: 0.86:1.000:. ./.:4:130,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:73,83:.:-0.12:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:80,20:.:-1.45:1.000:. ./.:4:127,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:116,28:.:-0.40:1.000:. ./.:4:79,60:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,77:.:-0.21:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:126,46:.: 0.26:1.000:. ./.:4:171,53:.: 1.50:1.000:. ./.:4:121,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:118,33:.:-0.24:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:88,73:.: 0.00:0.999:. ./.:4:139,54:.: 0.76:1.000:. ./.:3:65,2:.:-2.24:1.000:. ./.:4:125,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:100,32:.:-0.69:1.000:. ./.:4:106,28:.:-0.64:1.000:. ./.:4:101,35:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,29:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,48:.: 0.79:1.000:. ./.:4:122,37:.:-0.05:1.000:. ./.:4:157,35:.: 0.74:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:157,38:.: 0.81:1.000:. ./.:4:146,47:.: 0.76:1.000:. ./.:5:201,38:.: 1.86:0.988:. ./.:4:71,63:.:-0.64:1.000:. ./.:4:90,25:.:-1.09:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:129,32:.: 0.00:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:73,30:.:-1.38:1.000:. ./.:4:110,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:183,45:.: 1.60:1.000:. ./.:4:113,35:.:-0.31:1.000:. ./.:4:101,32:.:-0.67:1.000:. ./.:4:89,42:.:-0.71:1.000:. ./.:4:115,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:122,30:.:-0.21:1.000:. ./.:4:102,36:.:-0.55:1.000:. ./.:4:118,37:.:-0.14:1.000:. ./.:4:88,20:.:-1.26:1.000:. ./.:4:191,59:.: 2.12:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:89,78:.: 0.14:1.000:. ./.:4:149,44:.: 0.76:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:100,82:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:77,65:.:-0.45:1.000:. ./.:4:127,32:.:-0.05:1.000:. ./.:4:141,37:.: 0.41:1.000:. ./.:4:166,61:.: 1.57:1.000:. ./.:4:136,38:.: 0.31:1.000:. ./.:4:130,41:.: 0.24:1.000:. ./.:4:80,82:.: 0.03:1.000:. ./.:4:124,41:.: 0.10:1.000:. ./.:4:86,74:.:-0.02:1.000:. ./.:4:92,78:.: 0.22:1.000:. ./.:4:139,40:.: 0.43:1.000:. ./.:4:112,30:.:-0.45:1.000:. ./.:4:149,31:.: 0.45:1.000:. ./.:4:114,26:.:-0.50:1.000:. ./.:4:97,78:.: 0.33:0.999:. ./.:4:137,39:.: 0.36:1.000:. ./.:4:117,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:109,38:.:-0.33:1.000:. ./.:4:117,39:.:-0.12:1.000:. ./.:4:120,31:.:-0.24:1.000:. ./.:4:113,34:.:-0.33:1.000:. ./.:4:99,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:82,75:.:-0.09:1.000:. ./.:4:113,86:.: 0.91:1.000:. ./.:4:155,47:.: 0.98:1.000:. ./.:4:121,47:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,86:.: 0.67:1.000:. ./.:4:153,47:.: 0.93:1.000:. ./.:4:160,48:.: 1.12:1.000:. ./.:4:178,41:.: 1.38:1.000:. ./.:4:111,27:.:-0.55:1.000:. ./.:4:85,99:.: 0.55:1.000:. -chr1.1 45471702 chr1.1_045471702 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:107,45:0.29: 0.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:130,20:0.13: 0.66:1.000:0.935 0/0/0/1:4:87,36:0.28: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:59,58:0.45:-0.15:1.000:0.981 0/0/1/1:4:53,71:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,46:0.28: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:73,15:0.17:-0.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:141,25:0.15: 1.06:1.000:0.988 0/0/0/1:4:131,23:0.15: 0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,11:0.51:-2.57:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-2.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,46:0.30: 0.57:1.000:0.982 0/0/0/1:4:135,19:0.12: 0.76:1.000:0.827 0/0/0/1:4:113,48:0.29: 0.94:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,31:0.30:-0.60:1.000:0.984 0/0/0/1:4:95,51:0.33: 0.57:1.000:0.916 0/0/0/1:4:84,34:0.28:-0.13:0.998:0.995 0/0/0/1:4:169,24:0.12: 1.73:1.000:0.842 0/0/0/1:4:167,32:0.16: 1.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,57:0.30: 1.55:1.000:0.988 0/0/0/0:4:27,2:0.07:-2.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,19:0.12: 0.74:1.000:0.839 0/0/0/0:4:171,20:0.10: 1.68:1.000:0.680 0/0/0/1:4:98,43:0.29: 0.44:1.000:0.989 0/0/0/1:4:11,2:0.15:-2.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:33,45:0.51:-1.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,43:0.28: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,49:0.31: 0.71:1.000:0.975 0/0/0/1:4:138,22:0.14: 0.91:1.000:0.958 0/0/0/1:4:81,34:0.29:-0.20:1.000:0.993 0/0/0/0:4:113,12:0.10: 0.05:1.000:0.876 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.17:-2.47:1.000:0.999 0/0/1:3:8,2:0.20:-2.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,50:0.33: 0.47:1.000:0.906 0/0/0/1:4:87,27:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,51:0.37: 0.12:1.000:0.547 0/0/0/1:4:104,19:0.15: 0.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:116,39:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,59:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:113,12:0.10: 0.05:1.000:0.876 0/0/0/1:4:86,28:0.25:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,28:0.16: 1.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:117,15:0.11: 0.22:1.000:0.597 0/0/0/1:4:117,63:0.33: 1.41:1.000:0.914 0/0/1/1:4:15,26:0.54:-2.03:1.000:0.985 0/0/0/1:4:68,24:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/0:4:62,6:0.09:-1.36:1.000:0.958 0/0/0/1:4:70,25:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,53:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,35:0.29:-0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:84,28:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,27:0.15: 1.45:1.000:0.986 0/0/0/1:4:67,23:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,53:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,26:0.26:-0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:85,19:0.18:-0.47:1.000:0.968 0/0/0/1:4:103,36:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,18:0.14: 0.10:1.000:0.972 0/0/0/1:4:126,16:0.11: 0.47:1.000:0.568 0/0/0/1:4:114,17:0.13: 0.19:1.000:0.908 0/0/1/1:4:55,50:0.43:-0.45:1.000:0.958 0/0/0/1:4:76,32:0.29:-0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:58,17:0.23:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,43:0.29: 0.57:1.000:0.993 0/0/0/1:4:109,24:0.18: 0.24:0.910:0.999 0/0/0/1:4:86,31:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,26:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,23:0.45:-1.91:1.000:0.984 0/0/0/1:4:63,26:0.28:-0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,63:0.50:-0.27:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,29:0.29:-0.67:1.000:0.990 0/0/0/1:4:74,41:0.34:-0.20:1.000:0.887 0/0/0/0:4:133,15:0.10: 0.61:1.000:0.770 0/0/0/0:4:145,14:0.09: 0.89:1.000:0.959 0/0/0/1:4:129,17:0.12: 0.57:1.000:0.677 0/0/0/1:4:76,23:0.23:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,50:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,54:0.43:-0.23:1.000:0.953 0/0/0/1:4:87,31:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:91,9:0.09:-0.57:1.000:0.945 0/0/1/1:4:63,80:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,22:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,27:0.27:-0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,26:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,41:0.32:-0.08:1.000:0.940 0/0/0/0:4:92,10:0.10:-0.52:1.000:0.841 0/0/0/1:4:88,24:0.21:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,31:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,16:0.13: 0.00:1.000:0.910 0/0/0/0:4:159,14:0.08: 1.23:1.000:0.987 0/0/0/1:4:86,20:0.19:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,38:0.49:-1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,31:0.30:-0.62:1.000:0.981 0/0/0/1:4:99,44:0.30: 0.49:1.000:0.987 0/0/0/1:4:109,49:0.30: 0.86:1.000:0.986 0/0/0/1:4:72,22:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,47:0.32: 0.44:1.000:0.958 0/0/0/1:4:82,44:0.33: 0.07:1.000:0.917 0/0/0/1:4:75,25:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,35:0.31:-0.32:1.000:0.979 0/0/0/1:4:56,13:0.19:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,27:0.13: 1.95:1.000:0.938 0/0/1/1:4:49,72:0.52:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:94,47:0.32: 0.44:1.000:0.958 0/0/0/1:4:86,35:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:120,50:0.29: 1.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:87,43:0.32: 0.17:0.999:0.963 0/0/1/1:4:49,54:0.47:-0.50:1.000:0.993 0/0/1:3:37,24:0.37:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,50:0.33: 0.57:1.000:0.937 0/0/0/1:4:59,36:0.36:-0.69:1.000:0.740 0/0/0/1:4:79,18:0.19:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,36:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,32:0.30:-0.52:1.000:0.983 0/0/0/1:4:75,30:0.28:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,36:0.31:-0.30:1.000:0.972 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,55:0.32: 1.06:1.000:0.962 0/0/0/0:4:121,10:0.08: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:94,39:0.29: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/0/1:5:146,36:0.20: 1.45:0.988:0.996 0/0/0/1:4:76,12:0.14:-0.87:1.000:0.953 0/0/0/1:4:87,13:0.13:-0.57:1.000:0.910 0/0/0/1:4:53,26:0.31:-1.09:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,29:0.16: 1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,13:0.14:-0.74:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,23:0.13: 1.38:1.000:0.895 0/0/1/1:4:67,75:0.48: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:83,33:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,51:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,15:0.11: 0.27:1.000:0.546 0/0/0/1:4:135,18:0.12: 0.74:1.000:0.708 0/0/0/0:4:113,14:0.11: 0.10:1.000:0.508 0/0/0/1:4:139,18:0.11: 0.84:1.000:0.627 0/0/0/1:4:110,39:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,14:0.12:-0.15:1.000:0.755 0/0/0/1:4:128,44:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,55:0.31: 1.11:1.000:0.968 0/0/0/1:4:107,53:0.32: 0.91:1.000:0.962 0/0/0/1:4:102,24:0.19: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,47:0.31: 0.61:1.000:0.980 0/0/1/1:4:38,54:0.52:-0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:116,50:0.29: 1.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:139,23:0.14: 0.96:1.000:0.973 0/0/1/1:4:8,9:0.48:-2.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,16:0.11: 0.44:1.000:0.593 0/0/0/1:4:72,35:0.31:-0.40:1.000:0.969 0/0/0/1:4:151,20:0.12: 1.18:1.000:0.690 0/0/0/1:4:155,25:0.14: 1.41:1.000:0.963 0/0/1/1:4:57,85:0.52: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,49:0.32: 0.61:1.000:0.962 0/0/0/1:4:98,46:0.31: 0.52:1.000:0.978 0/0/0/1:4:82,41:0.32: 0.00:1.000:0.958 0/0/0/0:4:120,11:0.08: 0.19:1.000:0.978 0/0/0/1:4:94,33:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,31:0.23: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,25:0.17: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,69:0.56:-0.45:1.000:0.972 0/0/0/1:4:150,27:0.15: 1.33:0.999:0.990 0/0/0/1:4:149,19:0.11: 1.11:1.000:0.581 0/0/0/0:4:150,15:0.09: 1.03:1.000:0.938 0/0/0/1:4:76,37:0.31:-0.25:1.000:0.968 0/0/0/1:4:92,36:0.28: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,20:0.11: 1.31:1.000:0.597 0/0/0/0:4:137,16:0.10: 0.74:1.000:0.684 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,39:0.30: 0.07:1.000:0.986 0/0/0/1:4:116,62:0.33: 1.36:1.000:0.920 0/0/0/1:4:109,51:0.31: 0.91:1.000:0.979 0/0/0/1:4:135,20:0.13: 0.79:1.000:0.900 0/0/0/1:4:172,27:0.14: 1.87:1.000:0.949 0/0/1/1:4:56,85:0.53: 0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:67,65:0.45: 0.22:1.000:0.978 0/0/0/1:4:115,57:0.32: 1.21:1.000:0.962 0/0/0/1:4:70,32:0.30:-0.52:1.000:0.983 0/0/0/1:4:104,40:0.27: 0.52:1.000:0.997 -chr1.1 45523314 chr1.1_045523314 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:90,112:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,150:0.72: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,97:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,63:0.32: 0.07:1.000:0.961 0/0/0/1:4:146,65:0.30: 0.53:1.000:0.987 0/0/1/1:4:103,149:0.55: 1.50:1.000:0.981 0/1/1/1:4:10,86:0.87:-2.16:1.000:0.906 0/0/0/1:4:136,54:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,40:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,50:0.52:-2.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,42:0.53:-2.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,127:0.60: 0.21:1.000:0.787 0/0/0/1:4:120,66:0.34:-0.05:1.000:0.878 0/0/1/1:4:69,101:0.55:-0.43:1.000:0.978 0/0/1/1:4:78,126:0.57: 0.37:1.000:0.934 0/0/1/1:4:110,103:0.45: 0.58:1.000:0.980 0/0/1/1:4:108,115:0.48: 0.82:0.998:0.995 0/1/1/1:4:49,160:0.72: 0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,209:0.80: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,101:0.47: 0.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,53:0.79:-2.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,168:0.71: 0.82:1.000:0.989 0/0/0/1:4:128,62:0.31: 0.04:1.000:0.967 1/1/1/1:4:1,187:0.99:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,59:0.73:-2.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,170:0.72: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,118:0.54: 0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:104,116:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,114:0.54: 0.18:1.000:0.988 0/0/0/1:4:134,73:0.34: 0.44:1.000:0.889 0/0/1/1:4:96,116:0.51: 0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,140:0.72:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,20:0.37:-3.22:1.000:0.550 0/0/1/1:4:59,43:0.40:-2.02:1.000:0.759 0/0/1:3:17,15:0.44:-3.66:1.000:0.985 0/0/1/1:4:89,110:0.51: 0.25:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,234:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,109:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,171:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,118:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,167:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,163:0.73: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,131:0.55: 0.79:1.000:0.982 0/0/1/1:4:80,105:0.53:-0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,187:0.75: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,43:0.23: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,225:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,48:0.74:-2.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,96:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,73:0.32: 0.72:1.000:0.954 0/0/1/1:4:69,116:0.58:-0.08:1.000:0.899 0/1/1/1:4:59,238:0.75: 2.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,84:0.45:-0.31:1.000:0.977 0/0/1/1:4:116,122:0.48: 1.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,158:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,126:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:134,46:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,120:0.49: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,124:0.57: 0.32:1.000:0.945 0/0/1/1/1/1:6:69,119:0.59:-0.01:1.000:0.556 0/0/1/1:4:81,119:0.55: 0.28:1.000:0.977 0/0/0/1:4:122,57:0.31:-0.22:1.000:0.978 0/1/1/1:4:36,170:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,166:0.84: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,206:0.82: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,123:0.53: 0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,57:0.60:-2.33:1.000:0.820 0/0/1/1:4:63,104:0.58:-0.50:1.000:0.917 0/1/1/1:4:43,179:0.76: 0.79:0.910:1.000 0/0/1/1:4:95,106:0.49: 0.30:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,240:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,73:0.68:-2.07:1.000:0.961 0/0/1/1:4:111,128:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,170:0.73: 0.70:1.000:0.998 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,93:0.53:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:99,111:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,165:0.75: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,54:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,185:0.77: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,88:0.49:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,55:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,175:0.70: 1.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:78,90:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,45:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,193:0.81: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,73:0.45:-0.90:1.000:0.983 0/0/1/1:4:66,84:0.52:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,102:0.55:-0.40:1.000:0.976 0/0/1/1:4:94,97:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:118,42:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,94:0.45: 0.11:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,287:1.00: 2.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,37:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,50:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,117:0.60:-0.12:1.000:0.828 0/1/1/1:4:48,152:0.71: 0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:60,93:0.56:-0.83:1.000:0.958 0/0/1/1:4:80,128:0.57: 0.46:1.000:0.941 0/0/1/1:4:90,106:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,75:0.62:-1.76:1.000:0.583 0/0/1/1:4:87,107:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,55:0.43:-1.62:1.000:0.951 0/0/1/1:4:87,100:0.49:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,90:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,115:0.59:-0.15:1.000:0.875 0/0/1/1:4:67,106:0.57:-0.36:1.000:0.948 0/1/1/1:4:34,170:0.79: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,66:0.28: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,111:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,78:0.47:-0.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:97,127:0.53: 0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,108:0.50: 0.25:0.999:0.997 0/1/1/1:4:42,160:0.74: 0.32:1.000:0.999 0/0/1:3:69,52:0.40:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,125:0.53: 0.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,79:0.54:-1.23:1.000:0.988 0/0/1/1:4:86,91:0.48:-0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,87:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,91:0.55:-0.80:1.000:0.981 0/0/1/1:4:90,96:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,101:0.47: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:87,118:0.53: 0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:101,100:0.46: 0.30:1.000:0.989 0/0/0/1:4:117,49:0.29:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,127:0.54: 0.70:1.000:0.987 0/0/0/0/0:5:209,0:0.00: 0.49:0.988:1.000 0/1/1/1:4:52,142:0.68: 0.14:1.000:0.965 0/1/1/1:4:25,125:0.79:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,87:0.56:-1.04:1.000:0.965 0/0/1/1:4:83,99:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:120,48:0.28:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,103:0.80:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,103:0.54:-0.29:1.000:0.986 0/0/0/1:4:138,45:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,67:0.30: 0.67:1.000:0.986 0/0/1/1:4:96,121:0.52: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,56:0.34:-0.78:1.000:0.840 0/0/0/1:4:111,47:0.29:-0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,121:0.72:-0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,158:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,141:0.73:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:73,93:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,43:0.33:-1.53:1.000:0.903 0/0/1/1:4:110,115:0.47: 0.86:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,164:0.55: 2.04:1.000:0.976 0/0/1/1:4:87,121:0.54: 0.46:1.000:0.988 0/0/1/1:4:97,111:0.49: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,106:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,177:0.76: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,127:0.53: 0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:164,57:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,43:0.47:-2.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:90,44:0.32:-1.27:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,252:1.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,58:0.28: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,203:0.82: 1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,183:0.76: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,103:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,123:0.59: 0.16:1.000:0.881 0/0/1/1:4:76,91:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,58:0.30: 0.02:1.000:0.988 0/0/1/1:4:76,100:0.53:-0.29:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,231:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,132:0.57: 0.65:1.000:0.951 0/1/1/1:4:46,147:0.71: 0.11:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,152:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,163:0.77: 0.28:0.999:1.000 0/1/1/1:4:41,166:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,51:0.32:-0.85:1.000:0.949 0/0/1/1:4:78,95:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,44:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,153:0.77:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,92:0.54:-0.71:1.000:0.988 0/0/1/1:4:84,99:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,140:0.57: 0.91:1.000:0.937 0/0/1/1:4:78,109:0.54:-0.03:1.000:0.987 0/1/1/1:4:51,188:0.74: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,64:0.34:-0.26:1.000:0.838 0/1/1/1:4:40,183:0.78: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,79:0.29: 1.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:115,133:0.50: 1.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,121:0.53: 0.56:1.000:0.993 -chr1.1 45583010 chr1.1_045583010 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:103,30:.: 1.19:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,10:.:-1.84:1.000:. ./.:4:50,26:.:-0.71:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,2:.:-2.81:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:60,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:63,33:.:-0.04:0.998:. ./.:4:38,87:.: 0.92:1.000:. ./.:4:121,38:.: 2.05:1.000:. ./.:4:123,43:.: 2.28:1.000:. ./.:4:15,3:.:-2.64:1.000:. ./.:4:107,18:.: 0.92:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:75,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:11,3:.:-2.77:1.000:. ./.:4:117,39:.: 1.95:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:85,24:.: 0.39:1.000:. ./.:4:73,34:.: 0.32:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:102,34:.: 1.29:1.000:. ./.:4:49,32:.:-0.54:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.24:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,43:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:71,29:.: 0.09:1.000:. ./.:4:118,30:.: 1.69:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:70,23:.:-0.14:1.000:. ./.:4:50,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:58,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.19:1.000:. ./.:4:112,34:.: 1.62:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:56,34:.:-0.24:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:76,18:.:-0.11:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:53,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:86,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:121,30:.: 1.79:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:103,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:124,1:.: 0.92:1.000:. ./.:6:64,8:.:-0.84:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:60,27:.:-0.34:1.000:. ./.:4:83,33:.: 0.62:1.000:. ./.:4:113,30:.: 1.52:1.000:. ./.:4:107,29:.: 1.29:1.000:. ./.:4:109,22:.: 1.12:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:83,22:.: 0.25:1.000:. ./.:4:78,23:.: 0.12:0.910:. ./.:4:110,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:97,26:.: 0.85:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:92,21:.: 0.52:1.000:. ./.:4:51,29:.:-0.58:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:107,29:.: 1.29:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:132,24:.: 1.95:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,32:.: 0.62:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:51,16:.:-1.01:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:40,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:33,27:.:-1.24:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:105,30:.: 1.25:1.000:. ./.:4:87,20:.: 0.32:1.000:. ./.:4:66,34:.: 0.09:1.000:. ./.:4:65,37:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:94,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:80,25:.: 0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:53,27:.:-0.58:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:69,25:.:-0.11:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:71,26:.:-0.01:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:89,29:.: 0.69:1.000:. ./.:4:70,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:52,17:.:-0.94:0.999:. ./.:4:103,27:.: 1.09:1.000:. ./.:3:78,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:52,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:79,23:.: 0.15:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:59,16:.:-0.74:1.000:. ./.:4:90,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,22:.:-0.64:1.000:. ./.:4:49,20:.:-0.94:1.000:. ./.:5:75,0:.:-0.74:0.988:. ./.:4:50,32:.:-0.51:1.000:. ./.:4:63,19:.:-0.51:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:50,17:.:-1.01:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.84:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:89,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:62,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:69,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,14:.:-1.11:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:87,21:.: 0.35:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:124,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:62,29:.:-0.21:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:39,13:.:-1.51:1.000:. ./.:4:121,23:.: 1.55:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:85,29:.: 0.55:1.000:. ./.:4:81,15:.:-0.04:1.000:. ./.:4:75,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:63,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,16:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,19:.:-1.11:1.000:. ./.:4:68,24:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,30:.: 0.52:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,22:.: 0.75:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:59,37:.:-0.04:0.999:. ./.:4:64,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:43,24:.:-1.01:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:58,24:.:-0.51:1.000:. ./.:4:70,23:.:-0.14:1.000:. ./.:4:63,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,17:.: 0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,43:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:92,35:.: 0.99:1.000:. -chr1.1 45815957 chr1.1_045815957 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:65,34:0.29: 0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:20,80:0.73: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,41:0.28: 1.08:1.000:0.994 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,32:0.29: 0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,48:0.53:-0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:35,70:0.61: 0.56:1.000:0.660 0/0/0/1:4:74,34:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,10:0.29:-2.10:1.000:0.993 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,66:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,35:0.22: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,33:0.29: 0.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:57,26:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,36:0.29: 0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:53,42:0.39: 0.21:0.998:0.734 1/1/1/1:4:0,109:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,93:0.55: 2.31:1.000:0.976 0/0/0/1:4:96,53:0.30: 2.10:1.000:0.986 0/0/1/1:4:10,12:0.51:-2.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,60:0.51: 0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,40:0.26: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,57:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,6:0.35:-2.59:1.000:0.811 0/0/0/1:4:52,29:0.30:-0.28:1.000:0.983 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,22:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,44:0.27: 1.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,31:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,20:0.24:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,52:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,11:0.34:-2.14:1.000:0.868 0/0/1:3:3,3:0.46:-2.91:1.000:0.946 0/0/0/1:4:44,24:0.30:-0.74:1.000:0.988 0/0/1/1:4:40,59:0.55: 0.35:1.000:0.980 0/0/0/1:4:73,34:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,39:0.62:-1.09:1.000:0.598 0/0/0/1:4:64,23:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,21:0.25:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,54:0.53: 0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,22:0.30:-0.95:1.000:0.986 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,52:0.61:-0.35:1.000:0.742 0/0/0/1:4:66,22:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,71:0.52: 1.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:5,3:0.32:-2.84:1.000:0.952 0/0/0/1:4:39,22:0.30:-0.98:1.000:0.980 0/0/0/1:4:11,4:0.21:-2.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.26:-1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,20:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,24:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,32:0.30: 0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,72:0.55: 1.15:1.000:0.984 0/0/0/1:4:42,16:0.22:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,23:0.29:-0.81:1.000:0.991 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:42,29:0.36:-0.63:1.000:0.881 0/0/0/1:4:88,37:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,25:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,40:0.45:-0.28:1.000:0.980 0/0/1/1:4:34,38:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:80,29:0.21: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,25:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,20:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,27:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,50:0.60:-0.42:0.910:0.813 0/0/1/1:4:33,50:0.56:-0.21:1.000:0.973 0/0/1/1:4:51,56:0.48: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,23:0.33:-1.02:1.000:0.922 0/0/1/1:4:30,35:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,24:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,17:0.18:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,17:0.22:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,53:0.55: 0.00:1.000:0.980 0/0/0/1:4:61,33:0.29: 0.17:1.000:0.989 0/1/1/1:4:21,45:0.63:-0.81:1.000:0.511 0/0/1/1:4:35,49:0.54:-0.18:1.000:0.988 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,36:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,20:0.21:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,22:0.34:-1.16:1.000:0.868 0/0/0/1:4:72,40:0.30: 0.80:1.000:0.984 0/0/0/1:4:58,24:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,26:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,18:0.22:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,22:0.19: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,29:0.32:-0.39:1.000:0.960 0/0/0/1:4:52,20:0.22:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,70:0.59: 0.73:1.000:0.887 0/0/0/1:4:44,11:0.16:-1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,41:0.26: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,26:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,27:0.28:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,42:0.55:-0.63:1.000:0.983 0/0/0/1:4:65,43:0.35: 0.66:1.000:0.827 0/0/0/1:4:86,42:0.27: 1.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,34:0.33:-0.04:1.000:0.907 0/0/1/1:4:45,64:0.54: 0.70:1.000:0.986 0/0/0/1:4:54,26:0.27:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,27:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,17:0.24:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,26:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,23:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,53:0.46: 0.59:1.000:0.986 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,30:0.30:-0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:70,21:0.19: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,46:0.30: 1.40:1.000:0.985 0/0/0/1:4:72,31:0.24: 0.49:0.999:1.000 0/0/0/1:4:58,40:0.36: 0.31:1.000:0.724 0/0/0:3:23,5:0.14:-2.14:1.000:0.508 0/0/0/1:4:76,33:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,32:0.33:-0.18:1.000:0.932 0/0/0/1:4:44,23:0.29:-0.77:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,36:0.30: 0.38:1.000:0.981 0/0/0/1:4:75,23:0.19: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,31:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,17:0.19:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,56:0.49: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,34:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,19:0.19:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,26:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/0/0:5:104,0:0.00: 0.52:0.988:1.000 0/1/1/1:4:13,60:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,40:0.60:-0.98:1.000:0.764 0/0/0/1:4:55,22:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,34:0.20: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.50:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,21:0.18: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,25:0.34:-0.88:1.000:0.883 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,28:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,47:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,58:0.53: 0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,49:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,34:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,21:0.29:-1.02:1.000:0.990 0/0/0/1:4:92,38:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,38:0.30: 0.63:1.000:0.986 0/0/0/1:4:64,37:0.31: 0.42:1.000:0.972 0/0/0/1:4:54,28:0.28:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:63,20:0.19:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,26:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:87,37:0.24: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,30:0.21: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.17:-2.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:89,39:0.25: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,69:0.55: 0.94:1.000:0.981 0/0/0/1:4:77,21:0.17: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:43,82:0.60: 1.26:1.000:0.761 0/0/0/1:4:97,44:0.25: 1.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,36:0.29: 0.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:84,22:0.17: 0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,46:0.34: 1.01:1.000:0.888 0/0/0/1:4:56,19:0.20:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,37:0.31: 0.42:1.000:0.972 0/0/1/1:4:54,60:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,60:0.47: 0.98:1.000:0.993 0/0/0/1:4:64,37:0.31: 0.42:1.000:0.972 0/1/1/1:4:23,107:0.75: 1.43:0.999:0.999 0/0/1/1:4:48,72:0.55: 1.08:1.000:0.976 0/0/0/1:4:98,50:0.28: 2.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,30:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,28:0.32:-0.49:1.000:0.957 0/0/1/1:4:45,55:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,32:0.45:-0.84:1.000:0.979 0/0/0/1:4:70,32:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,55:0.33: 1.85:1.000:0.902 0/0/1/1:4:61,48:0.39: 0.70:1.000:0.714 0/0/1/1:4:63,51:0.40: 0.87:1.000:0.788 0/0/0/1:4:61,36:0.32: 0.28:1.000:0.962 0/0/0/1:4:69,40:0.31: 0.70:1.000:0.971 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,36:0.21: 1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,47:0.48: 0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,51:0.52: 0.07:1.000:0.995 -chr1.1 45978944 chr1.1_045978944 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.13:0.998:. ./.:4:128,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.53:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:152,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:6:81,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:0.910:. ./.:4:66,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:74,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:154,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. ./.:3:33,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:5:116,0:.: 0.82:0.988:. ./.:4:100,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.69:0.999:. ./.:4:72,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.24:1.000:. -chr1.1 46180304 chr1.1_046180304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,80:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.26:1.000:. ./.:4:35,62:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,71:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.71:1.000:. ./.:4:36,62:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,72:.: 1.29:1.000:. ./.:4:4,18:.:-1.92:1.000:. ./.:4:0,11:.:-2.29:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.84:1.000:. ./.:4:40,43:.: 0.14:1.000:. ./.:4:32,82:.: 1.19:1.000:. ./.:4:31,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,56:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,104:.: 0.85:0.998:. ./.:4:31,100:.: 1.77:1.000:. ./.:4:45,69:.: 1.19:1.000:. ./.:4:32,61:.: 0.48:1.000:. ./.:4:7,8:.:-2.15:1.000:. ./.:4:40,57:.: 0.62:1.000:. ./.:4:30,73:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,14:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,103:.: 1.70:1.000:. ./.:4:1,125:.: 1.60:1.000:. ./.:4:34,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,100:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.46:1.000:. ./.:4:4,10:.:-2.19:1.000:. ./.:3:0,3:.:-2.56:1.000:. ./.:4:31,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,57:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.55:1.000:. ./.:4:35,110:.: 2.24:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.14:1.000:. ./.:4:17,62:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,61:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.23:1.000:. ./.:4:32,65:.: 0.62:1.000:. ./.:4:23,115:.: 2.00:1.000:. ./.:4:30,73:.: 0.82:1.000:. ./.:4:29,51:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.11:1.000:. ./.:6:0,48:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1,44:.:-1.14:1.000:. ./.:4:32,63:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.09:1.000:. ./.:4:24,49:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.25:1.000:. ./.:4:41,93:.: 1.87:1.000:. ./.:4:13,23:.:-1.44:1.000:. ./.:4:31,105:.: 1.94:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.08:0.910:. ./.:4:0,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.18:1.000:. ./.:4:26,27:.:-0.87:1.000:. ./.:4:30,99:.: 1.70:1.000:. ./.:4:34,67:.: 0.75:1.000:. ./.:4:37,59:.: 0.58:1.000:. ./.:4:28,62:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.90:1.000:. ./.:4:36,55:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,58:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1,39:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.80:1.000:. ./.:4:39,55:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,62:.: 0.75:1.000:. ./.:4:21,33:.:-0.84:1.000:. ./.:4:32,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.43:1.000:. ./.:4:21,86:.: 0.96:1.000:. ./.:4:31,106:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.26:1.000:. ./.:4:40,84:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.71:1.000:. ./.:4:43,81:.: 1.53:1.000:. ./.:4:22,57:.: 0.01:1.000:. ./.:4:35,39:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,43:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,55:.: 0.04:1.000:. ./.:4:43,57:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.79:1.000:. ./.:4:25,97:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.53:0.999:. ./.:4:0,88:.: 0.31:1.000:. ./.:3:17,62:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.28:1.000:. ./.:4:18,34:.:-0.90:1.000:. ./.:4:31,86:.: 1.29:1.000:. ./.:4:1,102:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.24:1.000:. ./.:4:34,84:.: 1.33:1.000:. ./.:4:35,84:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,86:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,110:.: 1.06:1.000:. ./.:5:27,83:.: 1.06:0.988:. ./.:4:0,79:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,54:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,63:.: 0.45:1.000:. ./.:4:17,41:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.13:1.000:. ./.:4:28,70:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,113:.: 1.16:1.000:. ./.:4:37,58:.: 0.55:1.000:. ./.:4:32,43:.:-0.13:1.000:. ./.:4:30,67:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,67:.: 1.13:1.000:. ./.:4:24,80:.: 0.85:1.000:. ./.:4:19,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.17:1.000:. ./.:4:42,85:.: 1.63:1.000:. ./.:4:36,73:.: 1.02:1.000:. ./.:4:44,61:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.08:1.000:. ./.:4:37,68:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,17:.:-2.09:1.000:. ./.:4:21,53:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.77:1.000:. ./.:4:33,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.99:1.000:. ./.:4:20,84:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.09:1.000:. ./.:4:26,83:.: 1.02:1.000:. ./.:4:30,61:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.11:1.000:. ./.:4:54,57:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.96:0.999:. ./.:4:0,82:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,60:.: 0.28:1.000:. ./.:4:29,25:.:-0.84:1.000:. ./.:4:19,44:.:-0.53:1.000:. ./.:4:43,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.87:1.000:. ./.:4:19,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:20,75:.: 0.55:1.000:. ./.:4:24,71:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,79:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.92:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,96:.: 0.62:1.000:. -chr1.1 46229506 chr1.1_046229506 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:344,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:456,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:243,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:352,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:67,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:356,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.71:0.998:. ./.:4:371,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:487,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:72,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-3.70:1.000:. ./.:4:426,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:337,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.73:1.000:. ./.:4:71,0:.:-3.32:1.000:. ./.:3:18,0:.:-3.93:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:495,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:425,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:321,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:481,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:368,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:459,2:.: 1.17:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:516,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.55:1.000:. ./.:6:332,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:522,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:358,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:327,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.17:0.910:. ./.:4:329,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:468,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:318,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:425,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:460,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:289,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:384,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:398,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:252,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:342,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.04:0.999:. ./.:4:382,0:.: 0.26:1.000:. ./.:3:239,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.49:1.000:. ./.:5:531,0:.: 1.98:0.988:. ./.:4:373,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:313,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:414,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:323,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:509,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:390,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:456,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:356,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:82,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:502,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:329,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.28:1.000:. -chr1.1 46377798 chr1.1_046377798 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:60,171:.: 1.27:1.000:. ./.:4:32,122:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,94:.:-0.37:1.000:. ./.:4:52,107:.:-0.03:1.000:. ./.:4:78,209:.: 2.28:1.000:. ./.:4:0,222:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.39:1.000:. ./.:4:62,88:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,35:.:-2.25:1.000:. ./.:4:30,31:.:-1.80:1.000:. ./.:4:47,165:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,109:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,238:.: 1.39:1.000:. ./.:4:59,134:.: 0.58:0.998:. ./.:4:0,211:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,43:.:-2.12:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.35:1.000:. ./.:4:78,125:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1,32:.:-2.30:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,174:.: 1.39:1.000:. ./.:4:36,100:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,219:.: 2.57:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,62:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.22:1.000:. ./.:4:15,23:.:-2.21:1.000:. ./.:4:0,25:.:-2.45:1.000:. ./.:3:8,8:.:-2.61:1.000:. ./.:4:49,121:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,247:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,103:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,65:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,253:.: 1.67:1.000:. ./.:4:26,64:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.57:1.000:. ./.:4:30,29:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,109:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,200:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,61:.:-0.75:1.000:. ./.:4:46,88:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.70:1.000:. ./.:4:45,121:.: 0.10:1.000:. ./.:6:0,137:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1,109:.:-0.91:1.000:. ./.:4:51,137:.: 0.49:1.000:. ./.:4:61,78:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.44:1.000:. ./.:4:48,106:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,139:.:-0.37:0.910:. ./.:4:33,126:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.17:1.000:. ./.:4:61,119:.: 0.35:1.000:. ./.:4:60,172:.: 1.29:1.000:. ./.:4:87,80:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.64:1.000:. ./.:4:40,72:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.72:1.000:. ./.:4:42,94:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.17:1.000:. ./.:4:40,103:.:-0.32:1.000:. ./.:4:71,144:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.58:1.000:. ./.:4:50,82:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.59:1.000:. ./.:4:39,68:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,102:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.38:1.000:. ./.:4:37,83:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,104:.:-0.16:1.000:. ./.:4:52,111:.: 0.04:1.000:. ./.:4:34,98:.:-0.52:1.000:. ./.:4:38,100:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,98:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.52:1.000:. ./.:4:25,65:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.25:1.000:. ./.:4:50,69:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.46:1.000:. ./.:4:77,200:.: 2.10:1.000:. ./.:4:45,92:.:-0.43:1.000:. ./.:4:49,140:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,188:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.04:0.999:. ./.:4:54,153:.: 0.84:1.000:. ./.:3:31,34:.:-1.72:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,128:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,88:.:-1.31:1.000:. ./.:4:42,92:.:-0.48:1.000:. ./.:4:40,104:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.55:1.000:. ./.:4:38,86:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,170:.: 1.21:1.000:. ./.:4:44,62:.:-0.99:1.000:. ./.:4:46,124:.: 0.17:1.000:. ./.:5:50,135:.: 0.44:0.988:. ./.:4:42,90:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,79:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.73:1.000:. ./.:4:47,104:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,129:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,77:.:-1.51:1.000:. ./.:4:34,101:.:-0.46:1.000:. ./.:4:38,73:.:-0.90:1.000:. ./.:4:76,215:.: 2.35:1.000:. ./.:4:56,137:.: 0.58:1.000:. ./.:4:30,86:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.44:1.000:. ./.:4:61,103:.: 0.06:1.000:. ./.:4:35,59:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,278:.: 2.12:1.000:. ./.:4:81,132:.: 0.94:1.000:. ./.:4:75,115:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,228:.: 1.21:1.000:. ./.:4:47,146:.: 0.58:1.000:. ./.:4:66,216:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.01:1.000:. ./.:4:14,30:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,302:.: 2.55:1.000:. ./.:4:55,164:.: 1.05:1.000:. ./.:4:58,89:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,244:.: 1.50:1.000:. ./.:4:54,130:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.44:1.000:. ./.:4:61,169:.: 1.25:1.000:. ./.:4:42,114:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.19:1.000:. ./.:4:65,205:.: 1.97:0.999:. ./.:4:0,191:.: 0.55:1.000:. ./.:4:71,126:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.66:1.000:. ./.:4:35,83:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,232:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,177:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,229:.: 1.23:1.000:. ./.:4:60,206:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,302:.: 2.55:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.51:1.000:. ./.:4:63,133:.: 0.64:1.000:. -chr1.1 46506264 chr1.1_046506264 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:116,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:214,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:110,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.55:0.998:. ./.:4:2,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:321,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:328,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.42:1.000:. ./.:3:84,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.76:1.000:. ./.:6:87,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.36:0.910:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:231,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:210,0:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:178,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:228,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:120,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:181,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:163,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:0.999:. ./.:4:225,0:.: 1.15:1.000:. ./.:3:121,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:120,2:.:-0.40:1.000:. ./.:5:131,0:.:-0.27:0.988:. ./.:4:10,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:297,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:212,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.23:0.999:. ./.:4:114,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:287,1:.: 2.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.22:1.000:. -chr1.1 46790681 chr1.1_046790681 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:144,0:.: 3.02:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.38:0.998:. ./.:4:106,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:80,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.54:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:57,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.02:0.910:. ./.:4:82,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:66,0:.:-0.10:1.000:. ./.:3:32,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.30:1.000:. ./.:5:57,0:.:-0.46:0.988:. ./.:4:60,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:99,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:140,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:136,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.90:1.000:. -chr1.1 46909735 chr1.1_046909735 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,1:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,2:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:37,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:0.998:. ./.:4:33,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:57,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,3:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:51,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,4:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.37:1.000:. ./.:6:10,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:25,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.06:0.910:. ./.:4:34,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,2:.: 1.63:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.00:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:40,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:2,1:.:-1.00:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:23,2:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:38,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:40,1:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:35,2:.: 0.94:0.988:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:10,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:39,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,2:.: 1.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. -chr1.1 47070995 chr1.1_047070995 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:805,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:619,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:643,3:.: 0.69:1.000:. ./.:4:785,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:308,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:514,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:161,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:221,3:.:-1.85:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:380,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:659,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:689,0:.: 0.95:0.998:. ./.:4:443,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:618,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:156,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:605,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:616,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:483,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:190,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:714,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:617,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:613,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:172,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.90:1.000:. ./.:3:120,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:543,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:623,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:727,2:.: 1.19:1.000:. ./.:4:746,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:460,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:751,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:706,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:578,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:638,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:827,2:.: 1.79:1.000:. ./.:4:1252,1:.: 4.34:1.000:. ./.:4:472,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:555,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:895,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:788,2:.: 1.56:1.000:. ./.:4:544,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:436,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:589,1:.: 0.36:1.000:. ./.:6:625,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:772,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:662,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:518,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:733,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:279,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:674,0:.: 0.86:0.910:. ./.:4:503,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:746,2:.: 1.31:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:530,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:814,2:.: 1.71:1.000:. ./.:4:295,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:521,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:643,3:.: 0.69:1.000:. ./.:4:602,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:643,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:495,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:649,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:507,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:511,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:681,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:424,3:.:-0.62:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:359,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:953,1:.: 2.54:1.000:. ./.:4:363,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:631,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:635,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:363,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:528,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:599,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:577,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:625,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:569,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:852,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:528,1:.:-0.01:0.999:. ./.:4:699,0:.: 1.01:1.000:. ./.:3:307,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:729,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:329,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:483,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:757,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:783,3:.: 1.53:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:620,0:.: 0.54:1.000:. ./.:5:540,0:.: 0.05:0.988:. ./.:4:369,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:364,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:516,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:344,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:699,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:695,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:379,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:559,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:484,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:709,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:363,3:.:-0.99:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:810,3:.: 1.70:1.000:. ./.:4:658,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:523,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:711,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:749,2:.: 1.32:1.000:. ./.:4:807,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:285,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:787,4:.: 1.56:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:721,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:364,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:373,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:360,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:600,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:714,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:371,1:.:-0.96:0.999:. ./.:4:657,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:348,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:515,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:696,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:362,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:668,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:662,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:348,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:602,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:680,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:715,2:.: 1.12:1.000:. ./.:4:454,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.46:1.000:. -chr1.1 47343338 chr1.1_047343338 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:331,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:289,5:.:-0.25:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:340,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:263,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:302,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:93,7:.:-2.67:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:335,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:252,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:292,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:305,10:.: 0.01:0.998:. ./.:4:97,9:.:-2.59:1.000:. ./.:4:326,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:369,8:.: 0.79:1.000:. ./.:4:148,23:.:-1.78:1.000:. ./.:4:289,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:284,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:161,15:.:-1.72:1.000:. ./.:4:296,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:308,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:484,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:397,4:.: 1.09:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.02:1.000:. ./.:3:117,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:299,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:330,9:.: 0.31:1.000:. ./.:4:365,7:.: 0.73:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:250,9:.:-0.68:1.000:. ./.:4:325,6:.: 0.21:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:356,13:.: 0.69:1.000:. ./.:4:312,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:300,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:817,1:.: 6.29:1.000:. ./.:4:248,5:.:-0.76:1.000:. ./.:4:447,2:.: 1.69:1.000:. ./.:4:215,14:.:-1.06:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:273,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:375,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:252,7:.:-0.68:1.000:. ./.:4:297,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:295,15:.:-0.05:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.93:1.000:. ./.:6:326,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:221,4:.:-1.11:1.000:. ./.:4:339,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:307,12:.: 0.06:1.000:. ./.:4:296,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:255,8:.:-0.63:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:271,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:344,12:.: 0.53:0.910:. ./.:4:263,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:306,17:.: 0.11:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:251,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:258,10:.:-0.57:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:290,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:324,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:356,8:.: 0.63:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:174,6:.:-1.67:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:282,11:.:-0.26:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:235,15:.:-0.80:1.000:. ./.:4:365,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:319,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:198,3:.:-1.41:1.000:. ./.:4:333,13:.: 0.40:1.000:. ./.:4:351,12:.: 0.61:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:257,13:.:-0.55:1.000:. ./.:4:376,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:298,9:.:-0.08:1.000:. ./.:4:273,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:267,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:236,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:249,10:.:-0.68:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:217,7:.:-1.12:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:242,8:.:-0.80:0.999:. ./.:4:303,11:.: 0.00:1.000:. ./.:3:259,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:207,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:267,12:.:-0.43:1.000:. ./.:4:214,8:.:-1.14:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:201,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:302,15:.: 0.04:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:260,13:.:-0.51:1.000:. ./.:4:306,10:.: 0.03:1.000:. ./.:5:473,0:.: 1.98:0.988:. ./.:4:165,18:.:-1.63:1.000:. ./.:4:205,15:.:-1.17:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:188,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:278,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:214,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:257,9:.:-0.60:1.000:. ./.:4:251,11:.:-0.65:1.000:. ./.:4:320,7:.: 0.16:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:252,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:267,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:242,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:320,6:.: 0.15:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:307,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:333,5:.: 0.30:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:275,6:.:-0.41:1.000:. ./.:4:232,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:223,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:274,7:.:-0.41:1.000:. ./.:4:267,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:280,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:267,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:179,6:.:-1.61:0.999:. ./.:4:232,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:262,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:237,3:.:-0.92:1.000:. ./.:4:256,8:.:-0.62:1.000:. ./.:4:261,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:394,4:.: 1.05:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:266,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:270,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:513,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:256,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:243,2:.:-0.86:1.000:. -chr1.1 47570277 chr1.1_047570277 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:288,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:151,23:.:-0.81:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:75,14:.:-2.41:1.000:. ./.:4:195,39:.: 0.32:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:65,14:.:-2.60:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:213,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:243,23:.: 0.93:1.000:. ./.:4:231,46:.: 1.13:0.998:. ./.:4:70,113:.:-0.64:1.000:. ./.:4:226,33:.: 0.79:1.000:. ./.:4:193,28:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,15:.:-2.49:1.000:. ./.:4:192,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:155,30:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,11:.:-2.58:1.000:. ./.:4:231,44:.: 1.10:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:204,34:.: 0.40:1.000:. ./.:4:210,28:.: 0.40:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:213,43:.: 0.74:1.000:. ./.:4:195,35:.: 0.25:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.79:1.000:. ./.:3:46,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:187,34:.: 0.08:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:234,38:.: 1.04:1.000:. ./.:4:232,38:.: 1.00:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:203,30:.: 0.30:1.000:. ./.:4:193,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:161,21:.:-0.66:1.000:. ./.:4:217,26:.: 0.49:1.000:. ./.:4:177,33:.:-0.13:1.000:. ./.:4:442,0:.: 4.25:1.000:. ./.:4:173,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:170,14:.:-0.62:1.000:. ./.:4:325,1:.: 2.06:1.000:. ./.:4:173,23:.:-0.39:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:181,36:.: 0.00:1.000:. ./.:4:198,29:.: 0.19:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:214,14:.: 0.21:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.72:1.000:. ./.:6:199,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:201,28:.: 0.23:1.000:. ./.:4:206,22:.: 0.21:1.000:. ./.:4:156,18:.:-0.81:1.000:. ./.:4:194,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:203,24:.: 0.19:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:180,28:.:-0.17:1.000:. ./.:4:195,22:.: 0.00:0.910:. ./.:4:230,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:199,21:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:233,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:187,33:.: 0.06:1.000:. ./.:4:194,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:189,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:202,25:.: 0.19:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:230,34:.: 0.89:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:121,13:.:-1.56:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:169,22:.:-0.49:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:148,17:.:-0.98:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:207,25:.: 0.28:1.000:. ./.:4:131,30:.:-1.05:1.000:. ./.:4:148,18:.:-0.96:1.000:. ./.:4:204,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,18:.:-0.13:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:180,30:.:-0.13:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:187,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:166,15:.:-0.68:1.000:. ./.:4:192,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:221,28:.: 0.60:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:143,11:.:-1.19:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:195,15:.:-0.13:0.999:. ./.:4:170,26:.:-0.39:1.000:. ./.:3:153,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:101,18:.:-1.85:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:160,15:.:-0.79:1.000:. ./.:4:177,17:.:-0.43:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:179,13:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:166,24:.:-0.51:1.000:. ./.:4:213,32:.: 0.53:1.000:. ./.:5:292,0:.: 1.42:0.988:. ./.:4:106,29:.:-1.55:1.000:. ./.:4:126,17:.:-1.39:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:105,17:.:-1.79:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:225,17:.: 0.47:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:159,14:.:-0.83:1.000:. ./.:4:156,18:.:-0.81:1.000:. ./.:4:133,18:.:-1.24:1.000:. ./.:4:160,36:.:-0.39:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:167,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:181,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:132,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:205,37:.: 0.47:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:200,42:.: 0.47:1.000:. ./.:4:172,25:.:-0.38:1.000:. ./.:4:139,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:167,33:.:-0.32:1.000:. ./.:4:143,28:.:-0.87:1.000:. ./.:4:187,19:.:-0.21:1.000:. ./.:4:189,25:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,34:.:-0.36:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:181,32:.:-0.07:1.000:. ./.:4:137,17:.:-1.19:1.000:. ./.:4:97,73:.:-0.89:0.999:. ./.:4:177,28:.:-0.23:1.000:. ./.:4:161,26:.:-0.56:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:195,25:.: 0.06:1.000:. ./.:4:179,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:168,21:.:-0.53:1.000:. ./.:4:217,36:.: 0.68:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:210,40:.: 0.62:1.000:. ./.:4:160,39:.:-0.34:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:142,30:.:-0.85:1.000:. ./.:4:199,46:.: 0.53:1.000:. -chr1.1 47675063 chr1.1_047675063 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:150,45:.: 1.66:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:129,37:.: 0.96:1.000:. ./.:4:141,33:.: 1.15:1.000:. ./.:4:145,43:.: 1.49:1.000:. ./.:4:153,47:.: 1.78:1.000:. ./.:4:62,37:.:-0.66:1.000:. ./.:4:38,82:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,87:.: 0.93:1.000:. ./.:4:19,20:.:-2.11:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:72,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:152,40:.: 1.58:1.000:. ./.:4:89,40:.: 0.06:1.000:. ./.:4:111,56:.: 0.98:1.000:. ./.:4:106,37:.: 0.40:0.998:. ./.:4:91,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:119,52:.: 1.08:1.000:. ./.:4:110,51:.: 0.83:1.000:. ./.:4:73,6:.:-1.15:1.000:. ./.:4:89,42:.: 0.11:1.000:. ./.:4:94,102:.: 1.68:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,23:.:-1.34:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:90,44:.: 0.18:1.000:. ./.:4:111,52:.: 0.88:1.000:. ./.:4:90,86:.: 1.20:1.000:. ./.:4:103,41:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:33,14:.:-1.92:1.000:. ./.:4:43,33:.:-1.22:1.000:. ./.:3:17,19:.:-2.19:1.000:. ./.:4:141,48:.: 1.51:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:134,56:.: 1.54:1.000:. ./.:4:86,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:113,51:.: 0.91:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:83,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,30:.:-0.66:1.000:. ./.:4:94,36:.: 0.09:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:41,50:.:-0.86:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:68,30:.:-0.69:1.000:. ./.:4:66,51:.:-0.23:1.000:. ./.:4:54,23:.:-1.20:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:64,29:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:91,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:56,33:.:-0.91:1.000:. ./.:4:102,23:.:-0.04:1.000:. ./.:4:74,23:.:-0.71:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.40:1.000:. ./.:6:89,23:.:-0.35:1.000:. ./.:4:88,33:.:-0.13:1.000:. ./.:4:37,69:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,46:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.83:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,27:.:-1.12:1.000:. ./.:4:75,22:.:-0.71:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,24:.:-1.36:0.910:. ./.:4:150,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:86,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,28:.:-0.98:1.000:. ./.:4:65,25:.:-0.88:1.000:. ./.:4:50,60:.:-0.40:1.000:. ./.:4:86,23:.:-0.42:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:126,34:.: 0.81:1.000:. ./.:4:85,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:40,21:.:-1.58:1.000:. ./.:4:74,23:.:-0.71:1.000:. ./.:4:66,27:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,23:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,50:.:-1.05:1.000:. ./.:4:95,19:.:-0.30:1.000:. ./.:4:100,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:37,63:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,46:.:-0.93:1.000:. ./.:4:73,33:.:-0.49:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:113,17:.: 0.09:1.000:. ./.:4:89,34:.:-0.08:1.000:. ./.:4:89,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,59:.:-0.62:1.000:. ./.:4:84,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:87,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:54,16:.:-1.36:1.000:. ./.:4:82,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:85,24:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,46:.: 0.40:1.000:. ./.:4:149,58:.: 1.95:1.000:. ./.:4:105,32:.: 0.25:1.000:. ./.:4:66,25:.:-0.86:1.000:. ./.:4:175,44:.: 2.24:1.000:. ./.:4:50,28:.:-1.17:0.999:. ./.:4:88,33:.:-0.13:1.000:. ./.:3:59,30:.:-0.91:1.000:. ./.:4:96,33:.: 0.06:1.000:. ./.:4:69,39:.:-0.45:1.000:. ./.:4:78,19:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:65,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:106,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,27:.:-1.24:1.000:. ./.:4:27,68:.:-0.76:1.000:. ./.:4:146,45:.: 1.56:1.000:. ./.:4:39,57:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,31:.:-0.20:1.000:. ./.:5:65,94:.: 0.79:0.988:. ./.:4:45,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:45,18:.:-1.53:1.000:. ./.:4:84,27:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.57:1.000:. ./.:4:99,81:.: 1.29:1.000:. ./.:4:43,11:.:-1.75:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:125,36:.: 0.83:1.000:. ./.:4:178,68:.: 2.89:1.000:. ./.:4:74,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:116,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:54,42:.:-0.74:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.83:1.000:. ./.:4:67,40:.:-0.47:1.000:. ./.:4:72,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:41,72:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,44:.:-1.00:1.000:. ./.:4:175,38:.: 2.09:1.000:. ./.:4:167,41:.: 1.97:1.000:. ./.:4:144,33:.: 1.22:1.000:. ./.:4:87,37:.:-0.06:1.000:. ./.:4:190,52:.: 2.79:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:146,53:.: 1.75:1.000:. ./.:4:55,78:.: 0.16:1.000:. ./.:4:46,15:.:-1.58:1.000:. ./.:4:37,64:.:-0.62:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:96,92:.: 1.49:1.000:. ./.:4:120,51:.: 1.08:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:60,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:104,47:.: 0.59:1.000:. ./.:4:68,29:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,78:.:-0.35:1.000:. ./.:4:87,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:99,41:.: 0.33:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.78:0.999:. ./.:4:84,33:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,72:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,20:.: 0.28:1.000:. ./.:4:80,73:.: 0.64:1.000:. ./.:4:72,49:.:-0.13:1.000:. ./.:4:68,26:.:-0.78:1.000:. ./.:4:26,56:.:-1.07:1.000:. ./.:4:74,26:.:-0.64:1.000:. ./.:4:122,41:.: 0.88:1.000:. ./.:4:158,37:.: 1.66:1.000:. ./.:4:89,34:.:-0.08:1.000:. ./.:4:43,64:.:-0.47:1.000:. ./.:4:153,36:.: 1.51:1.000:. ./.:4:161,60:.: 2.28:1.000:. ./.:4:181,59:.: 2.74:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.28:1.000:. -chr1.1 48245831 chr1.1_048245831 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.55: 0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.75:0.998:0.997 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 0/0/1/1:4:2,4:0.58: 0.75:1.000:0.900 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,2:0.42: 0.75:1.000:0.900 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.08:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.58: 0.75:1.000:0.900 0/0/1/1:4:2,1:0.42:-0.49:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 1.16:1.000:0.723 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 0/0/1/1:4:7,5:0.46: 3.23:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 0/0/0/1:4:5,1:0.33: 0.75:1.000:0.906 0/0/1/1:4:2,4:0.58: 0.75:1.000:0.900 0/1/1/1:4:1,6:0.68: 1.16:1.000:0.950 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,8:0.61: 2.81:1.000:0.649 0/0/1/1:4:2,3:0.55: 0.34:1.000:0.980 0/0/0/0/0/0:6:2,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.45: 0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:2,3:0.55: 0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,5:0.53: 1.99:1.000:0.993 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.42:-0.49:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:0.910:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.39: 1.16:1.000:0.723 0/0/0/1:4:5,1:0.33: 0.75:1.000:0.906 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.39: 1.16:1.000:0.723 0/1/1/1:4:1,4:0.65: 0.34:1.000:0.792 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.42: 0.75:1.000:0.900 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,4:0.47: 1.99:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.75:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.65: 0.34:1.000:0.792 0/1/1/1:4:1,5:0.67: 0.75:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,4:0.47: 1.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 1.16:1.000:0.723 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,8:0.69: 1.99:1.000:0.979 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 2.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.34:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.47: 1.99:1.000:0.993 0/1/1/1:4:1,4:0.65: 0.34:1.000:0.792 0/0/1/1:4:2,6:0.62: 1.57:1.000:0.503 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 1.16:0.999:0.723 0/0/1/1:4:2,1:0.42:-0.49:1.000:0.900 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:6,3:0.42: 1.99:1.000:0.900 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 0/1/1/1:4:1,4:0.65: 0.34:1.000:0.792 0/0/1/1:4:5,2:0.39: 1.16:1.000:0.723 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 2.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.55: 0.34:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1/1:5:0,4:1.00:-0.08:0.988:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.39: 1.16:1.000:0.723 0/0/1/1:4:5,3:0.44: 1.57:1.000:0.963 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 1.16:1.000:0.723 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 0/0/0/1:4:4,1:0.35: 0.34:1.000:0.792 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 0/0/1/1:4:2,4:0.58: 0.75:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.08:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,3:0.55: 0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:2,4:0.58: 0.75:1.000:0.900 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.46: 1.16:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,3:0.42: 1.99:1.000:0.900 0/1/1/1:4:1,4:0.65: 0.34:1.000:0.792 0/0/1/1:4:3,4:0.54: 1.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,7:0.64: 1.99:1.000:0.675 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-0.08:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,6:0.52: 2.81:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.45: 0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.42:-0.49:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,6:0.62: 1.57:1.000:0.503 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-0.49:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.75:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.08:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.08:1.000:1.000 -chr1.1 48594376 chr1.1_048594376 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,25:.: 0.09:1.000:. ./.:4:167,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:160,28:.:-0.29:1.000:. ./.:4:187,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:259,23:.: 1.49:1.000:. ./.:4:252,29:.: 1.47:1.000:. ./.:4:148,13:.:-0.80:1.000:. ./.:4:187,23:.: 0.13:1.000:. ./.:4:171,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,10:.:-2.65:1.000:. ./.:4:58,39:.:-2.01:1.000:. ./.:4:146,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:164,14:.:-0.48:1.000:. ./.:4:232,14:.: 0.81:1.000:. ./.:4:180,22:.:-0.02:1.000:. ./.:4:246,15:.: 1.09:1.000:. ./.:4:255,31:.: 1.56:0.998:. ./.:4:209,25:.: 0.58:1.000:. ./.:4:280,17:.: 1.77:1.000:. ./.:4:252,23:.: 1.35:1.000:. ./.:4:42,39:.:-2.31:1.000:. ./.:4:173,21:.:-0.18:1.000:. ./.:4:188,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:181,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:51,17:.:-2.55:1.000:. ./.:4:229,37:.: 1.18:1.000:. ./.:4:182,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:178,16:.:-0.18:1.000:. ./.:4:259,26:.: 1.54:1.000:. ./.:4:211,21:.: 0.54:1.000:. ./.:4:242,23:.: 1.17:1.000:. ./.:4:163,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,39:.:-2.25:1.000:. ./.:4:54,14:.:-2.55:1.000:. ./.:3:18,2:.:-3.46:1.000:. ./.:4:214,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:218,19:.: 0.64:1.000:. ./.:4:212,18:.: 0.50:1.000:. ./.:4:236,41:.: 1.39:1.000:. ./.:4:257,47:.: 1.90:1.000:. ./.:4:176,24:.:-0.06:1.000:. ./.:4:202,26:.: 0.47:1.000:. ./.:4:239,27:.: 1.18:1.000:. ./.:4:177,35:.: 0.16:1.000:. ./.:4:180,28:.: 0.09:1.000:. ./.:4:203,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:239,9:.: 0.84:1.000:. ./.:4:52,18:.:-2.52:1.000:. ./.:4:182,22:.: 0.01:1.000:. ./.:4:155,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:157,28:.:-0.35:1.000:. ./.:4:239,35:.: 1.34:1.000:. ./.:4:127,19:.:-1.08:1.000:. ./.:4:175,35:.: 0.13:1.000:. ./.:4:168,16:.:-0.36:1.000:. ./.:4:167,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:166,22:.:-0.29:1.000:. ./.:4:193,47:.: 0.69:1.000:. ./.:4:185,25:.: 0.13:1.000:. ./.:6:136,26:.:-0.78:1.000:. ./.:4:149,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:164,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:202,32:.: 0.58:1.000:. ./.:4:135,35:.:-0.63:1.000:. ./.:4:218,25:.: 0.75:1.000:. ./.:4:194,43:.: 0.64:1.000:. ./.:4:174,26:.:-0.06:1.000:. ./.:4:162,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:178,34:.: 0.16:0.910:. ./.:4:158,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:204,44:.: 0.84:1.000:. ./.:4:200,27:.: 0.45:1.000:. ./.:4:227,50:.: 1.39:1.000:. ./.:4:213,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:185,40:.: 0.41:1.000:. ./.:4:190,47:.: 0.64:1.000:. ./.:4:189,25:.: 0.20:1.000:. ./.:4:159,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:205,19:.: 0.39:1.000:. ./.:4:214,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:104,24:.:-1.42:1.000:. ./.:4:190,42:.: 0.54:1.000:. ./.:4:210,35:.: 0.79:1.000:. ./.:4:182,23:.: 0.03:1.000:. ./.:4:229,49:.: 1.41:1.000:. ./.:4:250,48:.: 1.79:1.000:. ./.:4:114,8:.:-1.53:1.000:. ./.:4:148,26:.:-0.55:1.000:. ./.:4:171,29:.:-0.06:1.000:. ./.:4:143,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:114,7:.:-1.55:1.000:. ./.:4:174,27:.:-0.04:1.000:. ./.:4:230,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:131,15:.:-1.08:1.000:. ./.:4:223,35:.: 1.03:1.000:. ./.:4:204,40:.: 0.77:1.000:. ./.:4:168,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:180,30:.: 0.13:1.000:. ./.:4:138,29:.:-0.68:1.000:. ./.:4:201,24:.: 0.41:1.000:. ./.:4:146,22:.:-0.67:1.000:. ./.:4:203,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:137,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:168,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:131,23:.:-0.93:1.000:. ./.:4:203,15:.: 0.28:1.000:. ./.:4:164,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:164,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:247,30:.: 1.39:1.000:. ./.:4:184,20:.: 0.01:1.000:. ./.:4:187,36:.: 0.37:1.000:. ./.:4:309,34:.: 2.64:1.000:. ./.:4:159,31:.:-0.25:0.999:. ./.:4:196,33:.: 0.49:1.000:. ./.:3:68,10:.:-2.37:1.000:. ./.:4:204,29:.: 0.56:1.000:. ./.:4:166,22:.:-0.29:1.000:. ./.:4:140,42:.:-0.40:1.000:. ./.:4:203,31:.: 0.58:1.000:. ./.:4:134,25:.:-0.84:1.000:. ./.:4:218,19:.: 0.64:1.000:. ./.:4:186,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:178,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:160,18:.:-0.48:1.000:. ./.:4:161,32:.:-0.19:1.000:. ./.:4:202,29:.: 0.52:1.000:. ./.:5:201,27:.: 0.47:0.988:. ./.:4:103,31:.:-1.31:1.000:. ./.:4:136,13:.:-1.02:1.000:. ./.:4:129,19:.:-1.04:1.000:. ./.:4:161,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:195,22:.: 0.26:1.000:. ./.:4:100,19:.:-1.59:1.000:. ./.:4:149,13:.:-0.78:1.000:. ./.:4:154,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:255,21:.: 1.37:1.000:. ./.:4:163,23:.:-0.33:1.000:. ./.:4:128,19:.:-1.06:1.000:. ./.:4:124,20:.:-1.12:1.000:. ./.:4:158,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:185,26:.: 0.15:1.000:. ./.:4:136,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:154,22:.:-0.52:1.000:. ./.:4:125,22:.:-1.06:1.000:. ./.:4:236,25:.: 1.09:1.000:. ./.:4:243,28:.: 1.28:1.000:. ./.:4:209,13:.: 0.35:1.000:. ./.:4:155,18:.:-0.57:1.000:. ./.:4:252,26:.: 1.41:1.000:. ./.:4:168,21:.:-0.27:1.000:. ./.:4:261,27:.: 1.60:1.000:. ./.:4:170,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,26:.:-2.21:1.000:. ./.:4:90,7:.:-2.01:1.000:. ./.:4:236,25:.: 1.09:1.000:. ./.:4:200,16:.: 0.24:1.000:. ./.:4:254,28:.: 1.49:1.000:. ./.:4:224,22:.: 0.81:1.000:. ./.:4:142,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:191,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:203,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:167,13:.:-0.44:1.000:. ./.:4:208,17:.: 0.41:1.000:. ./.:4:178,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:183,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:219,20:.: 0.67:1.000:. ./.:4:202,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:187,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:189,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:178,13:.:-0.23:1.000:. ./.:4:137,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:163,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:187,12:.:-0.08:1.000:. ./.:4:160,27:.:-0.31:1.000:. ./.:4:133,12:.:-1.10:1.000:. ./.:4:259,38:.: 1.77:1.000:. ./.:4:256,45:.: 1.85:1.000:. ./.:4:211,23:.: 0.58:1.000:. ./.:4:196,17:.: 0.18:1.000:. ./.:4:209,18:.: 0.45:1.000:. ./.:4:252,14:.: 1.18:1.000:. ./.:4:254,22:.: 1.37:1.000:. ./.:4:171,21:.:-0.21:1.000:. ./.:4:189,6:.:-0.16:1.000:. -chr1.1 48745063 chr1.1_048745063 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:94,125:0.58: 1.13:1.000:0.931 0/0/1/1:4:95,96:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,114:0.57: 0.72:1.000:0.949 0/0/1/1:4:95,100:0.52: 0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,151:0.63: 1.67:1.000:0.541 0/1/1/1:4:63,142:0.70: 0.80:1.000:0.982 0/0/1/1:4:58,62:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:141,38:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,77:0.40: 0.70:1.000:0.779 0/0/1/1:4:37,48:0.57:-2.04:1.000:0.948 0/1/1/1:4:39,94:0.71:-0.90:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,150:0.81: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,74:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:67,111:0.63: 0.16:1.000:0.536 0/0/1/1:4:92,73:0.45:-0.15:1.000:0.982 0/0/1/1:4:87,86:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,84:0.40: 1.17:0.998:0.754 0/0/0/1:4:185,88:0.34: 2.40:1.000:0.844 0/0/1/1:4:81,95:0.54: 0.11:1.000:0.985 0/0/1/1:4:76,77:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,20:0.32:-2.44:1.000:0.958 0/0/1/1:4:68,100:0.60:-0.08:1.000:0.793 0/0/1/1:4:117,84:0.43: 0.70:1.000:0.947 0/1/1/1:4:57,109:0.66:-0.12:1.000:0.874 0/0/1/1:4:29,29:0.50:-2.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,145:0.74: 0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,161:0.80: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,62:0.37: 0.06:1.000:0.504 0/0/1/1:4:137,90:0.41: 1.32:1.000:0.869 0/0/1/1:4:93,74:0.45:-0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:106,84:0.45: 0.44:1.000:0.982 0/0/1/1:4:88,86:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,22:0.44:-2.84:1.000:0.971 0/0/1/1:4:30,47:0.61:-2.23:1.000:0.635 0/1/1:3:18,25:0.59:-3.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,117:0.61: 0.51:1.000:0.684 0/1/1/1:4:44,124:0.74:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,116:0.71:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,92:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,101:0.57: 0.21:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,82:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,98:0.46: 1.06:1.000:0.989 0/1/1/1:4:73,121:0.63: 0.54:1.000:0.538 0/0/1/1:4:89,80:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:160,37:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,117:0.74:-0.27:1.000:0.998 1/1/1/1:4:3,47:0.94:-2.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,87:0.54:-0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:77,62:0.46:-0.76:1.000:0.985 0/0/1/1:4:104,74:0.43: 0.16:1.000:0.942 1/1/1/1:4:1,166:0.99:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,82:0.41: 0.82:1.000:0.877 0/1/1/1:4:50,109:0.69:-0.29:1.000:0.973 0/1/1/1:4:24,98:0.81:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,78:0.43: 0.42:1.000:0.933 0/0/1/1:4:67,105:0.61: 0.02:1.000:0.634 0/0/1/1:4:79,75:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,155:0.80: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:59,63:0.52:-1.16:1.000:0.864 0/0/1/1:4:67,66:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,50:0.36:-0.57:1.000:0.691 0/0/1/1:4:144,94:0.41: 1.57:1.000:0.860 0/0/1/1:4:69,70:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,100:0.45: 1.29:1.000:0.982 0/0/0/1:4:128,65:0.36: 0.51:1.000:0.725 0/1/1/1:4:9,61:0.87:-2.39:1.000:0.873 0/0/1/1:4:122,72:0.39: 0.54:1.000:0.667 0/0/1/1:4:91,66:0.43:-0.34:0.910:0.952 0/1/1/1:4:42,152:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,159:0.75: 0.98:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,219:0.79: 2.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,180:0.74: 1.76:1.000:0.998 0/1/1/1:4:82,168:0.68: 1.86:1.000:0.943 0/1/1/1:4:32,103:0.77:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,73:0.40: 0.42:1.000:0.804 0/0/1/1:4:67,81:0.55:-0.55:1.000:0.978 0/0/1/1:4:101,67:0.41:-0.08:1.000:0.880 0/1/1/1:4:47,131:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,131:0.73: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,178:0.79: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,125:0.73:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,100:0.59:-0.03:1.000:0.847 0/0/1/1:4:87,70:0.46:-0.34:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,64:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,140:0.81: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,79:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,107:0.77:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,29:0.28:-1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,115:0.59: 0.61:1.000:0.874 0/1/1/1:4:49,117:0.71:-0.12:1.000:0.991 0/0/0/1:4:130,34:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,40:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,86:0.42: 0.94:1.000:0.917 0/1/1/1:4:42,140:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,94:0.61:-0.41:1.000:0.635 0/1/1/1:4:76,151:0.67: 1.32:1.000:0.918 0/0/1/1:4:78,71:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,94:0.81:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,35:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,95:0.63:-0.48:1.000:0.608 0/1/1/1:4:34,146:0.81: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,72:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,90:0.54:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:82,107:0.57: 0.42:1.000:0.945 0/0/1/1:4:59,80:0.58:-0.76:1.000:0.914 0/0/1/1:4:112,137:0.55: 1.83:1.000:0.974 0/0/1/1:4:81,124:0.61: 0.80:1.000:0.699 0/0/1/1:4:120,74:0.40: 0.54:1.000:0.765 0/0/1/1:4:120,160:0.58: 2.57:1.000:0.929 0/0/1/1:4:102,75:0.44: 0.13:0.999:0.959 0/0/1/1:4:130,95:0.43: 1.27:1.000:0.956 0/1/1:3:45,55:0.55:-1.68:1.000:0.975 0/1/1/1:4:50,132:0.73: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,71:0.40: 0.25:1.000:0.831 0/1/1/1:4:29,116:0.80:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,74:0.46:-0.12:1.000:0.984 0/0/1/1:4:104,60:0.38:-0.17:1.000:0.609 0/1/1/1:4:45,110:0.71:-0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,74:0.40: 0.54:1.000:0.765 0/0/0/1:4:135,49:0.29: 0.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,138:0.62: 1.22:1.000:0.527 0/0/0/1:4:153,42:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,100:0.44: 1.48:1.000:0.965 0/0/0/1/1:5:139,66:0.34: 0.80:0.988:0.874 0/0/1/1:4:101,69:0.42:-0.03:1.000:0.911 0/0/1/1:4:52,51:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,94:0.77:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,133:0.64: 0.91:1.000:0.661 0/0/1/1:4:128,72:0.38: 0.68:1.000:0.540 0/0/1/1:4:51,47:0.49:-1.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,180:0.86: 0.91:1.000:0.969 0/1/1/1:4:63,110:0.64: 0.04:1.000:0.690 0/0/1/1:4:94,127:0.58: 1.17:1.000:0.917 0/0/0/1:4:139,70:0.36: 0.89:1.000:0.743 0/1/1/1:4:45,98:0.69:-0.67:1.000:0.973 0/0/1/1:4:62,59:0.49:-1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,64:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,68:0.45:-0.41:1.000:0.981 0/0/1/1:4:73,80:0.53:-0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:148,36:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,59:0.44:-0.81:1.000:0.970 0/1/1/1:4:49,144:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,164:0.75: 1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,130:0.66: 0.61:1.000:0.893 0/0/1/1:4:70,80:0.54:-0.50:1.000:0.989 0/1/1/1:4:54,132:0.71: 0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,139:0.85:-0.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:99,143:0.60: 1.67:1.000:0.828 0/0/0/1:4:134,37:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,59:0.57:-1.56:1.000:0.955 0/0/0/1:4:97,31:0.27:-1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,121:0.72:-0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,81:0.53:-0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:117,119:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,122:0.73:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,75:0.39: 0.68:1.000:0.706 0/0/1/1:4:107,94:0.48: 0.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,67:0.36: 0.56:1.000:0.654 0/0/0/1:4:120,36:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,70:0.53:-0.90:1.000:0.992 0/0/1/1:4:98,122:0.56: 1.15:1.000:0.968 0/1/1/1:4:24,119:0.83:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,73:0.48:-0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,73:0.72:-1.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,73:0.38: 0.70:1.000:0.578 0/0/1/1:4:73,70:0.49:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,40:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,103:0.81:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,68:0.43:-0.24:1.000:0.956 0/0/1/1:4:58,62:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,87:0.55:-0.24:1.000:0.984 0/0/0/1:4:88,32:0.29:-1.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,73:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,91:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,117:0.72:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,81:0.45: 0.32:1.000:0.978 0/0/0/1:4:126,43:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,129:0.80:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,159:0.56: 2.73:1.000:0.969 0/1/1/1:4:48,119:0.72:-0.10:1.000:0.994 0/1/1/1:4:41,106:0.73:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,113:0.56: 0.72:1.000:0.960 -chr1.1 48967392 chr1.1_048967392 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:247,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:309,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:331,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.29:0.998:. ./.:4:187,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:323,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.35:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.77:1.000:. ./.:3:73,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:378,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:118,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:364,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.64:1.000:. ./.:6:199,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:328,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.32:0.910:. ./.:4:179,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:286,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:315,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:381,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:261,1:.: 0.09:1.000:. ./.:3:170,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:257,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.95:1.000:. ./.:5:287,1:.: 0.52:0.988:. ./.:4:212,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:383,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:395,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:313,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:243,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:387,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:297,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.78:1.000:. -chr1.1 49209776 chr1.1_049209776 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:13,6:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,6:.:-1.23:1.000:. ./.:4:14,6:.: 0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.86:1.000:. ./.:4:7,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:13,8:.: 0.99:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:4,6:.:-1.04:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:6,3:.:-1.23:0.998:. ./.:4:11,5:.: 0.06:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.78:1.000:. ./.:4:6,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:11,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,11:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:6,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:6,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.06:1.000:. ./.:4:10,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:15,3:.: 0.43:1.000:. ./.:3:12,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:4,4:.:-1.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.86:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:7,12:.: 0.62:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,9:.:-0.49:1.000:. ./.:4:6,17:.: 1.36:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:4,9:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.86:1.000:. ./.:6:15,6:.: 0.99:1.000:. ./.:4:11,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:19,6:.: 1.73:1.000:. ./.:4:10,7:.: 0.25:1.000:. ./.:4:14,7:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:11,8:.: 0.62:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.80:0.910:. ./.:4:16,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:16,5:.: 0.99:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:12,22:.: 3.39:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,11:.: 0.25:1.000:. ./.:4:17,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,10:.: 0.62:1.000:. ./.:4:19,5:.: 1.54:1.000:. ./.:4:14,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:6,11:.: 0.25:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:13,7:.: 0.80:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:15,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.67:1.000:. ./.:4:16,14:.: 2.65:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:12,5:.: 0.25:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:12,10:.: 1.17:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:14,6:.: 0.80:1.000:. ./.:4:10,7:.: 0.25:1.000:. ./.:4:13,11:.: 1.54:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,8:.: 0.25:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:15,8:.: 1.36:1.000:. ./.:4:8,11:.: 0.62:1.000:. ./.:4:15,6:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:7,11:.: 0.43:1.000:. ./.:3:1,5:.:-1.78:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.86:1.000:. ./.:4:13,4:.: 0.25:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.67:1.000:. ./.:4:14,8:.: 1.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,8:.: 0.80:1.000:. ./.:4:18,6:.: 1.54:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,7:.: 1.17:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.67:1.000:. ./.:5:13,11:.: 1.54:0.988:. ./.:4:9,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:12,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.67:1.000:. ./.:4:13,4:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.97:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.67:1.000:. ./.:4:17,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:11,11:.: 1.17:1.000:. ./.:4:21,7:.: 2.28:1.000:. ./.:4:20,7:.: 2.10:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.67:1.000:. ./.:4:9,8:.: 0.25:1.000:. ./.:4:15,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,8:.: 1.73:1.000:. ./.:4:15,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:3,6:.:-1.23:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.86:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:4,6:.:-1.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.06:1.000:. ./.:4:6,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:16,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:10,8:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:17,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,4:.: 0.80:1.000:. ./.:4:10,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.62:1.000:. -chr1.1 49674571 chr1.1_049674571 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.35:0.998:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:100,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:68,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.42:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:6:48,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:0.910:. ./.:4:60,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:62,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:68,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:0.999:. ./.:4:61,0:.: 0.17:1.000:. ./.:3:34,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.06:1.000:. ./.:5:89,0:.: 1.74:0.988:. ./.:4:42,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.06:1.000:. -chr1.1 49986705 chr1.1_049986705 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:214,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:150,43:.:-0.45:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:161,44:.:-0.17:1.000:. ./.:4:216,48:.: 1.17:1.000:. ./.:4:209,57:.: 1.22:1.000:. ./.:4:131,38:.:-0.99:1.000:. ./.:4:175,48:.: 0.24:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:70,33:.:-2.50:1.000:. ./.:4:126,30:.:-1.29:1.000:. ./.:4:173,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:165,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:139,40:.:-0.76:1.000:. ./.:4:100,74:.:-0.88:1.000:. ./.:4:140,107:.: 0.78:1.000:. ./.:4:193,53:.: 0.76:0.998:. ./.:4:122,100:.: 0.21:1.000:. ./.:4:241,49:.: 1.76:1.000:. ./.:4:136,129:.: 1.19:1.000:. ./.:4:74,19:.:-2.72:1.000:. ./.:4:171,39:.:-0.06:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:173,47:.: 0.17:1.000:. ./.:4:61,6:.:-3.32:1.000:. ./.:4:115,106:.: 0.19:1.000:. ./.:4:168,52:.: 0.17:1.000:. ./.:4:159,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:174,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:181,55:.: 0.53:1.000:. ./.:4:208,71:.: 1.51:1.000:. ./.:4:163,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:53,9:.:-3.43:1.000:. ./.:4:86,19:.:-2.45:1.000:. ./.:3:54,0:.:-3.61:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:169,43:.:-0.01:1.000:. ./.:4:172,55:.: 0.33:1.000:. ./.:4:187,66:.: 0.92:1.000:. ./.:4:153,132:.: 1.65:1.000:. ./.:4:169,49:.: 0.12:1.000:. ./.:4:151,51:.:-0.24:1.000:. ./.:4:129,93:.: 0.21:1.000:. ./.:4:147,49:.:-0.38:1.000:. ./.:4:220,56:.: 1.44:1.000:. ./.:4:147,37:.:-0.65:1.000:. ./.:4:184,63:.: 0.78:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:95,97:.:-0.47:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:175,58:.: 0.46:1.000:. ./.:4:168,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:189,56:.: 0.74:1.000:. ./.:4:147,47:.:-0.42:1.000:. ./.:4:189,56:.: 0.74:1.000:. ./.:4:200,40:.: 0.62:1.000:. ./.:4:148,143:.: 1.79:1.000:. ./.:4:168,38:.:-0.15:1.000:. ./.:6:152,42:.:-0.42:1.000:. ./.:4:193,53:.: 0.76:1.000:. ./.:4:87,75:.:-1.15:1.000:. ./.:4:204,54:.: 1.03:1.000:. ./.:4:194,63:.: 1.01:1.000:. ./.:4:185,40:.: 0.28:1.000:. ./.:4:155,55:.:-0.06:1.000:. ./.:4:120,42:.:-1.15:1.000:. ./.:4:201,61:.: 1.13:1.000:. ./.:4:156,53:.:-0.08:0.910:. ./.:4:135,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:252,54:.: 2.13:1.000:. ./.:4:103,30:.:-1.81:1.000:. ./.:4:171,43:.: 0.03:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:146,41:.:-0.58:1.000:. ./.:4:147,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:172,47:.: 0.15:1.000:. ./.:4:168,56:.: 0.26:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:142,52:.:-0.42:1.000:. ./.:4:166,49:.: 0.06:1.000:. ./.:4:144,139:.: 1.60:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:112,85:.:-0.35:1.000:. ./.:4:162,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:76,72:.:-1.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:101,98:.:-0.31:1.000:. ./.:4:133,35:.:-1.02:1.000:. ./.:4:103,85:.:-0.56:1.000:. ./.:4:132,40:.:-0.92:1.000:. ./.:4:177,67:.: 0.72:1.000:. ./.:4:112,26:.:-1.70:1.000:. ./.:4:236,61:.: 1.92:1.000:. ./.:4:210,59:.: 1.28:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:112,115:.: 0.33:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:105,91:.:-0.38:1.000:. ./.:4:123,34:.:-1.27:1.000:. ./.:4:163,43:.:-0.15:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:166,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:90,100:.:-0.51:1.000:. ./.:4:102,99:.:-0.26:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:178,55:.: 0.46:1.000:. ./.:4:201,56:.: 1.01:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:176,47:.: 0.24:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:111,101:.:-0.01:0.999:. ./.:4:174,56:.: 0.40:1.000:. ./.:3:131,4:.:-1.77:1.000:. ./.:4:189,45:.: 0.49:1.000:. ./.:4:143,41:.:-0.65:1.000:. ./.:4:142,43:.:-0.63:1.000:. ./.:4:180,46:.: 0.31:1.000:. ./.:4:168,35:.:-0.22:1.000:. ./.:4:130,45:.:-0.86:1.000:. ./.:4:156,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:133,102:.: 0.51:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:145,36:.:-0.72:1.000:. ./.:4:187,43:.: 0.40:1.000:. ./.:5:301,0:.: 2.01:0.988:. ./.:4:91,104:.:-0.40:1.000:. ./.:4:128,43:.:-0.95:1.000:. ./.:4:133,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:143,54:.:-0.35:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:111,38:.:-1.45:1.000:. ./.:4:139,36:.:-0.86:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:216,57:.: 1.38:1.000:. ./.:4:166,56:.: 0.21:1.000:. ./.:4:173,48:.: 0.19:1.000:. ./.:4:146,42:.:-0.56:1.000:. ./.:4:189,51:.: 0.62:1.000:. ./.:4:167,52:.: 0.15:1.000:. ./.:4:173,55:.: 0.35:1.000:. ./.:4:185,50:.: 0.51:1.000:. ./.:4:167,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:198,65:.: 1.15:1.000:. ./.:4:195,52:.: 0.78:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:91,79:.:-0.97:1.000:. ./.:4:152,43:.:-0.40:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:338,1:.: 2.88:1.000:. ./.:4:90,105:.:-0.40:1.000:. ./.:4:140,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:81,54:.:-1.77:1.000:. ./.:4:160,54:.: 0.03:1.000:. ./.:4:167,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:180,56:.: 0.53:1.000:. ./.:4:179,50:.: 0.37:1.000:. ./.:4:151,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:120,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:201,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:76,71:.:-1.49:1.000:. ./.:4:120,96:.: 0.08:1.000:. ./.:4:164,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:159,36:.:-0.40:1.000:. ./.:4:142,46:.:-0.56:1.000:. ./.:4:108,110:.: 0.12:1.000:. ./.:4:134,98:.: 0.44:1.000:. ./.:4:147,42:.:-0.54:1.000:. ./.:4:132,51:.:-0.67:1.000:. ./.:4:148,39:.:-0.58:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:159,45:.:-0.20:1.000:. ./.:4:147,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:144,48:.:-0.47:1.000:. ./.:4:123,87:.:-0.06:1.000:. ./.:4:161,124:.: 1.65:1.000:. ./.:4:180,51:.: 0.42:1.000:. ./.:4:188,46:.: 0.49:1.000:. ./.:4:106,97:.:-0.22:1.000:. ./.:4:186,46:.: 0.44:1.000:. ./.:4:213,52:.: 1.19:1.000:. ./.:4:209,63:.: 1.35:1.000:. ./.:4:156,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,101:.: 0.08:1.000:. -chr1.1 50196038 chr1.1_050196038 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,109:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,149:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,159:.: 2.05:1.000:. ./.:4:0,149:.: 1.77:0.998:. ./.:4:0,162:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.59:1.000:. ./.:4:1,45:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,117:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,143:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.39:1.000:. ./.:3:0,9:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.87:1.000:. ./.:4:1,39:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1,86:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,158:.: 2.03:1.000:. ./.:4:0,134:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,154:.: 1.90:1.000:. ./.:4:1,51:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,148:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,104:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.22:1.000:. ./.:6:0,42:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,145:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.29:0.910:. ./.:4:0,80:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,129:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,139:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,177:.: 2.49:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,142:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.63:0.999:. ./.:4:0,84:.: 0.09:1.000:. ./.:3:0,39:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.30:1.000:. ./.:5:0,122:.: 1.07:0.988:. ./.:4:0,107:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,163:.: 2.13:1.000:. ./.:4:0,145:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,128:.: 1.23:1.000:. ./.:4:1,45:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,123:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,141:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,137:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,148:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,120:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,124:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,143:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1,104:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,154:.: 1.90:1.000:. -chr1.1 50410075 chr1.1_050410075 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,62:.: 1.32:1.000:. ./.:4:15,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.67:1.000:. ./.:4:20,50:.: 0.38:1.000:. ./.:4:20,51:.: 0.43:1.000:. ./.:4:4,10:.:-2.40:1.000:. ./.:4:0,13:.:-2.45:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,39:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:21,45:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.37:0.998:. ./.:4:0,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,57:.: 0.93:1.000:. ./.:4:22,70:.: 1.47:1.000:. ./.:4:1,17:.:-2.20:1.000:. ./.:4:18,31:.:-0.66:1.000:. ./.:4:16,41:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.43:1.000:. ./.:4:4,16:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,114:.: 2.57:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,52:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.22:1.000:. ./.:4:27,68:.: 1.62:1.000:. ./.:4:31,102:.: 3.51:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.65:1.000:. ./.:4:7,11:.:-2.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,44:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,102:.: 1.97:1.000:. ./.:4:23,58:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,88:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,89:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.73:1.000:. ./.:4:24,42:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,12:.:-2.50:1.000:. ./.:4:0,84:.: 1.08:1.000:. ./.:4:14,22:.:-1.31:1.000:. ./.:4:12,49:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,87:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:21,38:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,36:.:-0.36:1.000:. ./.:4:14,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:25,80:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,88:.: 1.27:1.000:. ./.:6:8,37:.:-0.86:1.000:. ./.:4:20,50:.: 0.38:1.000:. ./.:4:19,35:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.92:1.000:. ./.:4:26,70:.: 1.67:1.000:. ./.:4:21,55:.: 0.68:1.000:. ./.:4:22,69:.: 1.42:1.000:. ./.:4:21,51:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,36:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,92:.: 1.47:0.910:. ./.:4:0,40:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,110:.: 2.37:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.33:1.000:. ./.:4:19,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:28,48:.: 0.68:1.000:. ./.:4:16,39:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,34:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.43:1.000:. ./.:4:18,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:15,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,46:.: 0.28:1.000:. ./.:4:17,47:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.93:1.000:. ./.:4:10,27:.:-1.26:1.000:. ./.:4:23,54:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:27,48:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.73:1.000:. ./.:4:13,40:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,38:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,37:.:-0.17:1.000:. ./.:4:17,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:16,44:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.91:1.000:. ./.:4:14,29:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.32:0.999:. ./.:4:18,55:.: 0.53:1.000:. ./.:3:13,18:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:13,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,46:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,39:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:17,38:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.46:1.000:. ./.:5:17,45:.:-0.02:0.988:. ./.:4:0,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:21,50:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,28:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.46:1.000:. ./.:4:16,35:.:-0.56:1.000:. ./.:4:10,28:.:-1.21:1.000:. ./.:4:12,37:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:17,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:12,35:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,42:.: 0.33:1.000:. ./.:4:18,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:11,42:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,87:.: 1.22:1.000:. ./.:4:16,51:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.75:1.000:. ./.:4:22,31:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,117:.: 2.72:1.000:. ./.:4:17,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.12:1.000:. ./.:4:19,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:16,43:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.66:1.000:. ./.:4:17,58:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,63:.: 0.98:1.000:. ./.:4:26,50:.: 0.68:1.000:. ./.:4:14,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:13,46:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.31:1.000:. ./.:4:17,52:.: 0.33:1.000:. ./.:4:17,65:.: 0.98:1.000:. ./.:4:29,82:.: 2.42:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.73:1.000:. ./.:4:15,29:.:-0.91:1.000:. ./.:4:18,48:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,44:.:-0.91:1.000:. -chr1.1 50445236 chr1.1_050445236 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:65,20:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,13:0.17: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,16:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,24:0.33: 0.34:1.000:0.929 0/0/1/1:4:51,42:0.46: 0.92:1.000:0.988 0/0/1/1:4:70,49:0.42: 1.72:1.000:0.913 0/0/1/1:4:13,16:0.55:-1.04:1.000:0.977 0/0/0/1:4:75,22:0.23: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,13:0.53:-1.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:8,3:0.27:-1.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,13:0.12: 1.42:1.000:0.746 0/0/0/1:4:58,11:0.16: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:59,30:0.34: 0.80:1.000:0.860 0/0/1/1:4:24,30:0.56:-0.27:1.000:0.974 0/1/1/1:4:14,47:0.73:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:55,29:0.35: 0.65:0.998:0.793 0/0/0/1:4:70,35:0.34: 1.29:1.000:0.885 0/0/0/1:4:64,29:0.31: 0.92:1.000:0.965 0/0/1/1:4:46,51:0.53: 1.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:13,2:0.13:-1.47:1.000:0.935 0/0/0/1:4:38,19:0.34:-0.18:1.000:0.885 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,38:0.55: 0.19:1.000:0.978 0/0/1/1:4:10,8:0.45:-1.38:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,52:0.61: 0.62:1.000:0.644 0/0/0/1:4:79,38:0.33: 1.66:1.000:0.927 0/0/0/1:4:36,16:0.31:-0.34:1.000:0.973 0/0/0/1:4:81,14:0.15: 0.99:1.000:0.984 0/0/1/1:4:69,41:0.38: 1.45:1.000:0.553 0/0/1/1:4:40,29:0.43: 0.19:1.000:0.943 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,2:0.11:-1.35:1.000:0.664 0/0/0:3:6,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,9:0.06: 2.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,52:0.67: 0.37:1.000:0.918 0/0/1/1:4:28,32:0.54:-0.09:1.000:0.989 0/0/1/1:4:33,22:0.41:-0.24:1.000:0.847 0/0/1/1:4:29,49:0.62: 0.46:1.000:0.627 0/0/1/1:4:13,21:0.61:-0.89:1.000:0.726 0/0/0/1:4:37,19:0.34:-0.21:1.000:0.844 0/1/1/1:4:9,28:0.72:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,19:0.35:-0.24:1.000:0.791 0/0/1/1:4:27,17:0.39:-0.58:1.000:0.724 0/0/0/1:4:37,9:0.20:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,21:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,103:0.32: 7.93:1.000:0.941 0/1/1/1:4:6,17:0.71:-1.23:1.000:0.990 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,3:0.07:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,28:0.56:-0.40:1.000:0.968 0/0/0/1:4:28,15:0.35:-0.61:1.000:0.757 0/0/0/1:4:41,17:0.30:-0.15:1.000:0.989 0/0/0/1:4:53,13:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,22:0.30: 0.31:1.000:0.981 0/0/0/1:4:58,23:0.29: 0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,26:0.56:-0.52:1.000:0.961 0/0/1/1:4:20,31:0.60:-0.37:1.000:0.802 0/0/0/0/0/1:6:22,6:0.21:-1.07:1.000:0.853 0/0/0/1:4:31,18:0.37:-0.43:1.000:0.522 0/0/1/1:4:26,23:0.48:-0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,20:0.40:-0.37:1.000:0.783 0/0/0/1:4:22,12:0.36:-0.89:1.000:0.712 0/0/0/1:4:47,21:0.31: 0.16:1.000:0.971 0/0/0/1:4:31,13:0.30:-0.58:1.000:0.987 0/0/0/1:4:34,14:0.29:-0.46:1.000:0.990 0/0/0/1:4:43,20:0.32: 0.00:1.000:0.952 0/0/1/1:4:23,17:0.43:-0.70:0.910:0.955 0/0/0/0:4:102,11:0.10: 1.54:1.000:0.854 0/0/1/1:4:23,29:0.56:-0.34:1.000:0.971 0/0/1/1:4:14,14:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,11:0.13: 0.71:1.000:0.889 0/0/0/1:4:56,19:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,9:0.12: 0.31:1.000:0.825 0/0/1/1:4:26,16:0.39:-0.64:1.000:0.661 0/0/0/1:4:44,15:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,17:0.35:-0.43:1.000:0.777 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,14:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,11:0.15: 0.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:23,34:0.59:-0.18:1.000:0.868 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,15:0.15: 1.20:1.000:0.984 0/1/1/1:4:13,26:0.65:-0.73:1.000:0.767 0/1/1/1:4:15,32:0.66:-0.49:1.000:0.862 0/1/1/1:4:8,26:0.73:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,16:0.30:-0.27:1.000:0.986 0/1/1/1:4:6,19:0.72:-1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,21:0.35:-0.06:1.000:0.802 0/0/1/1:4:32,19:0.38:-0.37:1.000:0.550 0/0/0/1:4:44,11:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,26:0.63:-0.70:1.000:0.609 0/0/0/1:4:55,9:0.14: 0.03:1.000:0.969 0/0/0/1:4:43,10:0.19:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,19:0.33:-0.15:1.000:0.915 0/0/1/1:4:28,17:0.38:-0.55:1.000:0.621 0/0/0/1:4:27,12:0.31:-0.73:1.000:0.973 0/0/0/1:4:53,10:0.16: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,20:0.54:-0.80:1.000:0.986 0/0/0/1:4:16,5:0.24:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,10:0.14: 0.28:1.000:0.963 0/0/0/1:4:35,7:0.17:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,17:0.32:-0.30:1.000:0.942 0/0/1/1:4:13,22:0.62:-0.86:1.000:0.623 0/1/1/1:4:10,18:0.63:-1.07:1.000:0.531 0/0/0/0:4:79,8:0.09: 0.74:1.000:0.928 0/0/1/1:4:47,33:0.42: 0.52:1.000:0.916 0/0/0/1:4:62,25:0.29: 0.74:1.000:0.992 0/0/0/0:4:55,4:0.07:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,12:0.27:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,27:0.18: 2.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,24:0.70:-0.92:0.999:0.983 0/0/0/1:4:36,16:0.31:-0.34:1.000:0.973 0/0/1:3:29,10:0.26:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,17:0.47:-0.80:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,13:0.31:-0.64:1.000:0.970 0/0/0/1:4:30,15:0.34:-0.55:1.000:0.885 0/0/0/1:4:43,11:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,13:0.36:-0.80:1.000:0.730 0/0/1/1:4:34,22:0.40:-0.21:1.000:0.789 0/0/0/1:4:30,8:0.21:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,14:0.42:-0.89:1.000:0.913 0/0/0/1:4:89,12:0.12: 1.17:1.000:0.736 0/0/0/0:4:38,3:0.07:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,11:0.22:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:53,0:0.00:-0.30:0.988:1.000 0/0/0/1:4:33,13:0.28:-0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:30,10:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,16:0.36:-0.55:1.000:0.680 0/0/1/1:4:22,21:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.35:-1.32:1.000:0.745 0/0/1/1:4:25,18:0.43:-0.61:1.000:0.938 0/0/0/0:4:41,4:0.09:-0.55:1.000:0.953 0/0/0/1:4:80,40:0.34: 1.75:1.000:0.885 0/0/1/1:4:26,19:0.43:-0.55:1.000:0.948 0/0/0/1:4:35,9:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,4:0.15:-1.10:1.000:0.985 0/0/0/1:4:28,12:0.30:-0.70:1.000:0.983 0/0/1/1:4:21,24:0.54:-0.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:30,18:0.38:-0.46:1.000:0.584 0/0/0/1:4:65,14:0.18: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,26:0.38: 0.22:1.000:0.535 0/0/0/1:4:58,16:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,9:0.08: 1.63:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,36:0.64:-0.24:1.000:0.656 0/0/0/1:4:65,36:0.36: 1.17:1.000:0.669 0/0/0/1:4:46,16:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,11:0.14: 0.49:1.000:0.964 0/0/1/1:4:41,30:0.43: 0.25:1.000:0.949 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.42:-0.67:1.000:0.924 0/1/1/1:4:17,45:0.70:-0.03:1.000:0.981 0/0/0/0:4:61,6:0.09: 0.13:1.000:0.949 0/0/1/1:4:53,43:0.46: 1.02:1.000:0.986 0/0/1/1:4:22,35:0.60:-0.18:1.000:0.756 0/0/0/1:4:49,19:0.28: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,53:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,28:0.28: 1.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,21:0.46:-0.49:1.000:0.985 0/1/1/1:4:10,49:0.80:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,50:0.60: 0.59:1.000:0.789 0/0/1/1:4:57,50:0.48: 1.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,41:0.48: 0.74:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,17:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,20:0.39:-0.34:1.000:0.705 0/0/0/1:4:63,10:0.14: 0.31:1.000:0.955 0/0/0/1:4:59,24:0.29: 0.62:1.000:0.991 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,8:0.12: 0.03:1.000:0.852 0/0/1/1:4:30,20:0.41:-0.40:1.000:0.847 0/0/0/0:4:74,7:0.09: 0.56:1.000:0.968 0/1/1/1:4:15,34:0.67:-0.43:1.000:0.920 0/0/1/1:4:23,38:0.61:-0.06:1.000:0.678 0/0/1/1:4:50,36:0.43: 0.71:1.000:0.938 0/0/1/1:4:35,21:0.38:-0.21:1.000:0.584 0/0/1/1:4:33,32:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,40:0.38: 1.32:1.000:0.615 0/0/1/1:4:57,38:0.41: 0.99:1.000:0.847 0/0/1/1:4:52,40:0.44: 0.89:1.000:0.973 0/1/1/1:4:20,39:0.64:-0.12:1.000:0.718 0/0/0/1:4:76,35:0.32: 1.48:1.000:0.957 -chr1.1 50666099 chr1.1_050666099 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:86,54:0.45: 0.23:1.000:0.976 0/1/1/1:4:28,62:0.70:-0.97:1.000:0.986 0/1/1/1:4:44,74:0.65:-0.30:1.000:0.801 0/1/1/1:4:43,110:0.73: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,72:0.46: 1.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:107,73:0.46: 1.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:72,12:0.20:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,70:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,100:0.66: 0.63:1.000:0.863 0/0/1/1:4:14,8:0.43:-2.58:1.000:0.933 0/0/0/1:4:17,7:0.36:-2.54:1.000:0.715 1/1/1/1:4:0,128:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,86:0.70:-0.11:1.000:0.982 0/1/1/1:4:56,104:0.67: 0.70:1.000:0.920 0/0/1/1:4:93,62:0.46: 0.58:1.000:0.987 0/0/0/1:4:118,49:0.36: 0.87:1.000:0.696 0/0/0/1:4:150,32:0.25: 1.23:0.998:0.999 0/0/1/1:4:97,64:0.46: 0.73:1.000:0.986 0/0/1/1:4:112,78:0.47: 1.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:99,74:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,4:0.50:-2.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,50:0.44: 0.01:1.000:0.971 0/1/1/1:4:49,127:0.73: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,20:0.19: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.24:-2.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,34:0.24: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,80:0.50: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,83:0.54: 0.89:1.000:0.986 0/0/0/1:4:155,40:0.28: 1.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,114:0.72: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,65:0.47: 0.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:128,25:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,1:0.11:-2.80:1.000:0.560 0/0/0/0:4:14,1:0.09:-2.75:1.000:0.903 0/1/1:3:2,2:0.55:-3.01:1.000:0.958 0/1/1/1:4:54,96:0.66: 0.46:1.000:0.878 0/0/0/1:4:145,28:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,57:0.46: 0.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:136,17:0.16: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,77:0.52: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,41:0.39:-0.16:1.000:0.738 0/0/0/1:4:135,25:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,30:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,54:0.45: 0.20:1.000:0.979 0/0/0/1:4:124,17:0.17: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,57:0.47: 0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:156,20:0.16: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,25:0.43:-1.51:1.000:0.957 0/0/0/1:4:109,17:0.19:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,77:0.56: 0.46:1.000:0.971 0/1/1/1:4:27,49:0.67:-1.30:1.000:0.900 0/0/1/1:4:115,57:0.40: 0.99:1.000:0.745 0/0/0/1:4:120,29:0.27: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,42:0.38: 0.11:1.000:0.517 0/1/1/1:4:44,82:0.67:-0.11:1.000:0.922 0/0/1/1:4:99,48:0.39: 0.39:1.000:0.697 0/1/1/1:4:46,93:0.69: 0.20:1.000:0.966 0/0/0/1:4:89,30:0.32:-0.27:1.000:0.952 0/0/1/1:4:76,39:0.40:-0.37:1.000:0.810 0/0/0/0/1/1:6:67,30:0.37:-0.80:1.000:0.813 0/1/1/1:4:33,62:0.67:-0.85:1.000:0.928 0/0/1/1:4:81,51:0.45: 0.03:1.000:0.976 0/0/0/1:4:145,20:0.17: 0.82:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,26:0.37:-1.11:1.000:0.503 0/0/1/1:4:95,58:0.44: 0.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:78,63:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,48:0.65:-1.27:1.000:0.773 0/0/1/1:4:71,56:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,13:0.14: 0.01:0.910:0.967 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:135,10:0.10: 0.34:1.000:0.854 0/0/1/1:4:63,36:0.43:-0.75:1.000:0.933 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,60:0.41: 0.99:1.000:0.873 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,47:0.59:-1.08:1.000:0.863 0/0/1/1:4:71,38:0.41:-0.51:1.000:0.871 0/0/1/1:4:71,36:0.40:-0.56:1.000:0.789 0/1/1/1:4:44,72:0.65:-0.35:1.000:0.751 0/0/1/1:4:91,51:0.42: 0.27:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,57:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,22:0.18: 0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,67:0.79:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,28:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,45:0.41:-0.04:1.000:0.873 0/0/0/1:4:79,17:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,36:0.41:-0.63:1.000:0.857 0/0/0/1:4:99,26:0.28:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,87:0.63: 0.34:1.000:0.546 0/0/1/1:4:58,37:0.45:-0.85:1.000:0.979 0/1/1/1:4:47,80:0.65:-0.08:1.000:0.820 0/0/0/1:4:129,16:0.16: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,51:0.47:-0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,47:0.41: 0.11:1.000:0.869 0/0/0/1:4:102,27:0.28:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,24:0.34:-1.04:1.000:0.850 0/1/1/1:4:25,57:0.71:-1.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,84:0.74:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:154,43:0.29: 1.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,32:0.40:-0.85:1.000:0.792 0/0/1/1:4:99,48:0.39: 0.39:1.000:0.697 0/0/1/1:4:15,22:0.62:-2.23:1.000:0.513 0/1/1/1:4:26,47:0.66:-1.37:1.000:0.896 0/0/1/1:4:55,29:0.41:-1.11:1.000:0.852 0/0/0/1:4:122,17:0.17: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,58:0.64:-0.85:1.000:0.657 0/0/1/1:4:81,53:0.46: 0.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:113,92:0.50: 1.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,110:0.71: 0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:125,21:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,87:0.51: 1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,26:0.28:-0.08:0.999:0.997 0/0/1/1:4:85,50:0.43: 0.11:1.000:0.951 0/1/1:3:33,36:0.56:-1.47:1.000:0.987 0/0/1/1:4:81,53:0.46: 0.08:1.000:0.984 0/0/0/1:4:131,22:0.20: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,50:0.66:-1.25:1.000:0.883 0/0/0/1:4:93,40:0.37: 0.06:1.000:0.612 0/0/0/1:4:95,18:0.22:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,41:0.40:-0.20:1.000:0.786 0/0/1/1:4:73,48:0.46:-0.23:1.000:0.985 0/0/1/1:4:93,61:0.46: 0.56:1.000:0.985 0/0/1/1:4:94,70:0.48: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,61:0.55:-0.20:1.000:0.983 0/0/0/1:4:106,24:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:74,70:0.54: 0.32:0.988:0.804 0/0/0/1:4:54,20:0.34:-1.35:1.000:0.884 0/0/0/1:4:55,19:0.32:-1.35:1.000:0.940 0/0/0/1:4:62,21:0.32:-1.13:1.000:0.950 0/0/0/1:4:70,30:0.37:-0.73:1.000:0.621 0/1/1/1:4:41,95:0.71: 0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:60,29:0.39:-0.99:1.000:0.690 0/0/1/1:4:77,38:0.39:-0.37:1.000:0.736 0/0/1/1:4:67,62:0.53:-0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:142,92:0.45: 2.46:1.000:0.983 0/0/0/1:4:144,29:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,51:0.61:-0.99:1.000:0.728 0/1/1/1:4:32,55:0.66:-1.04:1.000:0.835 0/0/1/1:4:51,38:0.48:-0.99:1.000:0.996 0/0/0/0:4:130,11:0.11: 0.25:1.000:0.511 0/0/0/1:4:87,37:0.36:-0.16:1.000:0.640 0/0/1/1:4:77,66:0.52: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,35:0.59:-1.61:1.000:0.850 0/0/1/1:4:93,70:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,106:0.66: 0.87:1.000:0.850 0/1/1/1:4:40,94:0.71: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:96,76:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,77:0.43: 1.84:1.000:0.950 0/0/1/1:4:82,37:0.38:-0.27:1.000:0.514 0/0/1/1:4:109,66:0.44: 1.06:1.000:0.964 0/0/1/1:4:79,80:0.55: 0.68:1.000:0.981 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-2.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,55:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:139,23:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,89:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,23:0.18: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:133,19:0.18: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,63:0.54:-0.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:127,28:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,68:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,52:0.43: 0.27:1.000:0.941 0/0/0/1:4:91,27:0.30:-0.30:1.000:0.986 0/0/0/1:4:121,44:0.33: 0.82:1.000:0.902 0/0/1/1:4:113,78:0.47: 1.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:112,69:0.44: 1.20:1.000:0.970 0/0/0/1:4:111,26:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,59:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,24:0.21: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,58:0.45: 0.46:1.000:0.977 0/1/1/1:4:41,84:0.69:-0.13:1.000:0.970 0/1/1/1:4:30,64:0.70:-0.87:1.000:0.980 0/1/1/1:4:33,81:0.72:-0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:132,21:0.19: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,34:0.38:-0.54:1.000:0.563 0/0/1/1:4:76,56:0.48: 0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,100:0.56: 1.53:1.000:0.971 0/0/1/1:4:98,66:0.46: 0.80:1.000:0.989 0/0/0/1:4:153,29:0.22: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,66:0.47: 0.70:1.000:0.993 0/1/1/1:4:34,92:0.74:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,84:0.47: 1.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,69:0.48: 0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,13:0.13: 0.25:1.000:0.911 0/1/1/1:4:43,120:0.74: 0.77:1.000:0.999 -chr1.1 50888730 chr1.1_050888730 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:47,21:0.32:-0.20:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,18:0.28:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,47:0.52: 0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,56:0.50: 1.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,28:0.31: 0.63:1.000:0.978 0/0/1/1:4:24,22:0.52:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:109,33:0.23: 2.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,17:0.16: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,5:0.57:-2.08:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,18:0.17: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,46:0.47: 1.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,47:0.56: 0.34:1.000:0.959 0/0/1/1:4:51,57:0.55: 1.07:1.000:0.982 0/0/1/1:4:54,35:0.42: 0.47:0.998:0.929 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,37:0.45: 0.47:1.000:0.981 0/0/1/1:4:58,52:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,4:0.29:-1.92:1.000:0.991 0/0/1/1:4:40,31:0.48:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,29:0.23: 1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,28:0.64:-1.03:1.000:0.686 0/0/1/1:4:2,2:0.53:-2.24:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,49:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,47:0.83:-0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,55:0.59: 0.59:1.000:0.864 0/0/1/1:4:44,45:0.53: 0.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:102,28:0.21: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,63:0.51: 1.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,29:0.43:-0.04:1.000:0.944 0/1/1/1:4:1,8:0.83:-2.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:16,1:0.06:-1.83:1.000:1.000 0/0/1:3:3,1:0.25:-2.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,23:0.34:-0.11:1.000:0.875 0/1/1/1:4:11,24:0.65:-1.25:1.000:0.813 0/0/0/1:4:46,16:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,34:0.34: 1.01:1.000:0.897 0/0/1/1:4:48,64:0.58: 1.20:1.000:0.926 0/1/1/1:4:7,26:0.72:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,24:0.35:-0.07:1.000:0.788 0/0/1/1:4:38,44:0.55: 0.24:1.000:0.976 0/0/1/1:4:38,39:0.53: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,25:0.41:-0.27:1.000:0.839 0/0/0/1:4:87,45:0.36: 1.84:1.000:0.691 0/1/1/1:4:13,25:0.63:-1.16:1.000:0.615 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,53:0.60: 0.44:1.000:0.814 0/0/0/1:4:83,33:0.29: 1.33:1.000:0.991 0/0/0/1:4:40,16:0.29:-0.58:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,24:0.69:-1.35:1.000:0.980 0/0/1/1:4:41,43:0.54: 0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:48,16:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,17:0.27:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,50:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,42:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,38:0.47: 0.47:1.000:0.990 0/1/1/1:4:10,30:0.69:-1.09:1.000:0.980 0/0/0/0/1/1:6:45,27:0.40:-0.07:1.000:0.633 0/0/0/1:4:46,16:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,61:0.45: 2.28:1.000:0.983 0/0/1/1:4:49,38:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,17:0.31:-0.55:1.000:0.977 0/0/1/1:4:57,41:0.45: 0.75:1.000:0.984 0/0/1/1:4:44,37:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,7:0.18:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,44:0.53: 0.44:1.000:0.992 0/0/1/1:4:36,25:0.44:-0.42:0.910:0.973 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,32:0.64:-0.84:1.000:0.686 0/0/1/1:4:8,7:0.51:-1.89:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,20:0.59:-1.28:1.000:0.876 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,14:0.31:-0.90:1.000:0.965 0/0/1/1:4:41,42:0.53: 0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:50,22:0.32:-0.07:1.000:0.962 0/0/0/0:4:102,11:0.10: 1.23:1.000:0.881 0/1/1/1:4:9,23:0.67:-1.35:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,37:0.71:-0.84:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,47:0.78:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,19:0.31:-0.36:1.000:0.971 0/0/1/1:4:39,50:0.57: 0.47:1.000:0.945 0/0/1/1:4:10,15:0.60:-1.57:1.000:0.826 0/0/1/1:4:37,38:0.53: 0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,12:0.60:-1.73:1.000:0.826 0/0/1/1:4:37,34:0.52:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,24:0.39:-0.27:1.000:0.664 0/0/0/1:4:65,35:0.37: 0.82:1.000:0.551 0/0/1/1:4:44,39:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,12:0.50:-1.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,36:0.38: 0.85:1.000:0.554 0/0/0/1:4:98,34:0.26: 1.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,40:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,14:0.69:-1.76:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,19:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,49:0.54: 0.63:1.000:0.985 0/0/0/1:4:30,8:0.21:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,29:0.24: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,24:0.36:-0.14:1.000:0.663 0/0/1/1:4:38,40:0.54: 0.12:1.000:0.989 0/0/1/1:4:40,46:0.55: 0.37:1.000:0.977 0/0/0/1:4:46,16:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,23:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,48:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,16:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,35:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,33:0.33: 0.91:1.000:0.900 0/0/1/1:4:43,49:0.55: 0.56:0.999:0.979 0/0/1/1:4:49,50:0.53: 0.79:1.000:0.991 0/0/1:3:25,18:0.46:-1.00:1.000:0.953 0/0/0/1:4:53,22:0.30: 0.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:30,31:0.53:-0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:37,10:0.21:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,38:0.48: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,32:0.41: 0.28:1.000:0.889 0/0/0/1:4:47,24:0.36:-0.11:1.000:0.731 0/0/1/1:4:23,35:0.60:-0.52:1.000:0.808 0/0/0/1:4:88,35:0.29: 1.55:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,35:0.45: 0.31:1.000:0.982 0/0/0/1:4:68,37:0.37: 0.98:1.000:0.512 0/0/1/1:4:52,44:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/0/1:5:126,19:0.13: 2.25:0.988:0.982 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,15:0.28:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,16:0.31:-0.68:1.000:0.970 0/0/1/1:4:41,43:0.54: 0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:107,19:0.15: 1.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:38,16:0.31:-0.65:1.000:0.980 0/1/1/1:4:7,35:0.75:-1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,16:0.33:-0.74:1.000:0.934 0/0/1/1:4:59,49:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,45:0.53: 0.50:1.000:0.992 0/0/0/1:4:51,26:0.36: 0.08:1.000:0.735 0/0/0/1:4:78,17:0.18: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,14:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,29:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,21:0.38:-0.49:1.000:0.546 0/0/0/1:4:87,31:0.26: 1.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,12:0.15: 0.18:1.000:0.986 0/0/0/1:4:59,31:0.36: 0.50:1.000:0.639 0/0/0/1:4:56,21:0.28: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,14:0.19:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,56:0.53: 1.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:49,22:0.32:-0.11:1.000:0.949 0/1/1/1:4:8,20:0.67:-1.48:1.000:0.926 0/0/0/1:4:69,23:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,49:0.36: 2.19:1.000:0.666 0/0/0/1:4:12,2:0.14:-1.92:1.000:0.971 0/0/0/1:4:70,31:0.32: 0.85:1.000:0.958 0/1/1/1:4:14,30:0.65:-0.97:1.000:0.791 0/0/0/1:4:81,22:0.21: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,29:0.42: 0.02:1.000:0.896 0/0/1/1:4:21,23:0.54:-0.97:1.000:0.985 0/0/1/1:4:41,57:0.58: 0.75:1.000:0.899 0/0/1/1:4:52,42:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,45:0.53: 0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:65,44:0.44: 1.10:1.000:0.961 0/0/1/1:4:51,40:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,59:0.80:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,45:0.91:-0.84:1.000:0.908 0/0/0/1:4:44,22:0.35:-0.27:1.000:0.788 0/1/1/1:4:7,42:0.79:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,28:0.42:-0.07:1.000:0.908 0/0/1/1:4:76,42:0.38: 1.39:1.000:0.546 0/0/0/1:4:49,25:0.36:-0.01:1.000:0.733 0/0/0/1:4:65,22:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,30:0.30: 0.94:1.000:0.989 0/0/0/1:4:44,22:0.35:-0.27:1.000:0.788 0/0/0/1:4:75,22:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,41:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,54:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,27:0.38: 0.02:1.000:0.610 0/0/0/1:4:50,21:0.30:-0.11:1.000:0.981 0/0/1/1:4:78,44:0.38: 1.52:1.000:0.620 0/0/1/1:4:37,25:0.44:-0.39:1.000:0.960 0/0/1/1:4:67,65:0.52: 1.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:48,20:0.30:-0.20:1.000:0.983 0/1/1/1:4:6,32:0.76:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.49:1.000:1.000 -chr1.1 51100476 chr1.1_051100476 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,118:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,77:.:-1.03:1.000:. ./.:4:47,86:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,90:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.74:1.000:. ./.:4:38,61:.:-1.43:1.000:. ./.:4:77,65:.:-0.20:1.000:. ./.:4:44,92:.:-0.37:1.000:. ./.:4:48,37:.:-1.83:1.000:. ./.:4:1,71:.:-2.20:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.25:1.000:. ./.:4:36,84:.:-0.83:1.000:. ./.:4:58,99:.: 0.23:1.000:. ./.:4:72,60:.:-0.48:1.000:. ./.:4:34,113:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,126:.: 0.66:0.998:. ./.:4:37,101:.:-0.31:1.000:. ./.:4:123,81:.: 1.58:1.000:. ./.:4:144,103:.: 2.81:1.000:. ./.:4:60,43:.:-1.31:1.000:. ./.:4:67,58:.:-0.68:1.000:. ./.:4:43,137:.: 0.89:1.000:. ./.:4:57,88:.:-0.11:1.000:. ./.:4:45,22:.:-2.35:1.000:. ./.:4:50,94:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.71:1.000:. ./.:4:64,45:.:-1.14:1.000:. ./.:4:56,139:.: 1.32:1.000:. ./.:4:51,102:.: 0.12:1.000:. ./.:4:76,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,89:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,29:.:-3.43:1.000:. ./.:4:26,47:.:-2.17:1.000:. ./.:3:12,16:.:-3.46:1.000:. ./.:4:29,84:.:-1.03:1.000:. ./.:4:28,95:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.49:1.000:. ./.:4:47,94:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,57:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,93:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,121:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,147:.: 1.78:1.000:. ./.:4:97,85:.: 0.95:1.000:. ./.:4:44,128:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,89:.:-1.69:1.000:. ./.:4:33,87:.:-0.83:1.000:. ./.:4:30,73:.:-1.31:1.000:. ./.:4:62,84:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,113:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.32:1.000:. ./.:4:49,105:.: 0.15:1.000:. ./.:4:107,60:.: 0.52:1.000:. ./.:4:49,119:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,85:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.20:1.000:. ./.:6:37,103:.:-0.25:1.000:. ./.:4:67,124:.: 1.21:1.000:. ./.:4:74,47:.:-0.80:1.000:. ./.:4:50,138:.: 1.12:1.000:. ./.:4:120,79:.: 1.44:1.000:. ./.:4:96,87:.: 0.98:1.000:. ./.:4:115,59:.: 0.72:1.000:. ./.:4:43,94:.:-0.34:1.000:. ./.:4:118,82:.: 1.47:1.000:. ./.:4:56,113:.: 0.58:0.910:. ./.:4:0,113:.:-1.03:1.000:. ./.:4:81,124:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,101:.:-0.51:1.000:. ./.:4:89,77:.: 0.49:1.000:. ./.:4:103,87:.: 1.18:1.000:. ./.:4:53,104:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.49:1.000:. ./.:4:78,155:.: 2.41:1.000:. ./.:4:44,97:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,116:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,195:.: 1.32:1.000:. ./.:4:27,114:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.03:1.000:. ./.:4:36,100:.:-0.37:1.000:. ./.:4:42,91:.:-0.45:1.000:. ./.:4:90,68:.: 0.26:1.000:. ./.:4:41,91:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,127:.: 1.15:1.000:. ./.:4:58,37:.:-1.54:1.000:. ./.:4:129,109:.: 2.55:1.000:. ./.:4:46,126:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.29:1.000:. ./.:4:45,91:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,107:.: 0.72:1.000:. ./.:4:54,132:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.94:1.000:. ./.:4:89,72:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,103:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,127:.: 1.38:1.000:. ./.:4:76,71:.:-0.05:1.000:. ./.:4:44,122:.: 0.49:1.000:. ./.:4:41,92:.:-0.45:1.000:. ./.:4:84,66:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,187:.: 1.09:1.000:. ./.:4:30,112:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,100:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,114:.: 0.41:0.999:. ./.:4:96,93:.: 1.15:1.000:. ./.:3:29,47:.:-2.09:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,111:.: 0.32:1.000:. ./.:4:33,80:.:-1.03:1.000:. ./.:4:88,86:.: 0.72:1.000:. ./.:4:28,105:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.18:1.000:. ./.:4:106,84:.: 1.18:1.000:. ./.:4:111,80:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.37:1.000:. ./.:4:104,66:.: 0.61:1.000:. ./.:4:60,142:.: 1.52:1.000:. ./.:5:48,160:.: 1.69:0.988:. ./.:4:81,60:.:-0.23:1.000:. ./.:4:85,60:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.65:1.000:. ./.:4:52,116:.: 0.55:1.000:. ./.:4:66,55:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.35:1.000:. ./.:4:35,106:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,108:.: 0.43:1.000:. ./.:4:51,98:.: 0.00:1.000:. ./.:4:129,70:.: 1.44:1.000:. ./.:4:34,129:.: 0.41:1.000:. ./.:4:103,88:.: 1.21:1.000:. ./.:4:78,72:.: 0.03:1.000:. ./.:4:19,81:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.78:1.000:. ./.:4:58,121:.: 0.86:1.000:. ./.:4:48,83:.:-0.51:1.000:. ./.:4:88,71:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,201:.: 1.49:1.000:. ./.:4:85,80:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,52:.:-2.78:1.000:. ./.:4:72,52:.:-0.71:1.000:. ./.:4:38,88:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:67,129:.: 1.35:1.000:. ./.:4:63,105:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,66:.: 0.26:1.000:. ./.:4:52,114:.: 0.49:1.000:. ./.:4:88,71:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:47,125:.: 0.66:1.000:. ./.:4:58,106:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.92:1.000:. ./.:4:85,87:.: 0.66:1.000:. ./.:4:51,105:.: 0.20:1.000:. ./.:4:85,75:.: 0.32:1.000:. ./.:4:55,99:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,80:.: 0.58:1.000:. ./.:4:37,98:.:-0.40:1.000:. ./.:4:30,69:.:-1.43:1.000:. ./.:4:39,99:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,86:.:-0.51:1.000:. ./.:4:82,48:.:-0.54:1.000:. ./.:4:88,80:.: 0.55:1.000:. ./.:4:103,93:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.03:1.000:. ./.:4:47,105:.: 0.09:1.000:. ./.:4:99,74:.: 0.69:1.000:. ./.:4:54,127:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.61:1.000:. ./.:4:40,74:.:-1.00:1.000:. ./.:4:46,103:.: 0.00:1.000:. -chr1.1 51210992 chr1.1_051210992 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:9,107:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,31:.:-0.77:1.000:. ./.:4:13,106:.: 0.20:1.000:. ./.:4:12,89:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,109:.: 0.60:1.000:. ./.:4:61,68:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,35:.:-1.39:1.000:. ./.:4:29,70:.:-0.43:1.000:. ./.:4:16,108:.: 0.35:1.000:. ./.:4:6,13:.:-2.91:1.000:. ./.:4:1,38:.:-2.29:1.000:. ./.:4:77,45:.: 0.29:1.000:. ./.:4:34,51:.:-0.86:1.000:. ./.:4:14,127:.: 0.88:1.000:. ./.:4:24,66:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,52:.:-0.80:1.000:. ./.:4:19,118:.: 0.76:0.998:. ./.:4:70,44:.: 0.04:1.000:. ./.:4:50,101:.: 1.19:1.000:. ./.:4:34,73:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,17:.:-2.85:1.000:. ./.:4:34,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:28,101:.: 0.51:1.000:. ./.:4:37,63:.:-0.40:1.000:. ./.:4:2,7:.:-3.22:1.000:. ./.:4:50,87:.: 0.76:1.000:. ./.:4:8,93:.:-0.36:1.000:. ./.:4:11,105:.: 0.10:1.000:. ./.:4:13,95:.:-0.15:1.000:. ./.:4:51,77:.: 0.48:1.000:. ./.:4:38,141:.: 2.06:1.000:. ./.:4:32,37:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,11:.:-3.16:1.000:. ./.:4:11,38:.:-1.98:1.000:. ./.:3:3,11:.:-3.07:1.000:. ./.:4:33,119:.: 1.22:1.000:. ./.:4:46,79:.: 0.38:1.000:. ./.:4:37,66:.:-0.30:1.000:. ./.:4:51,87:.: 0.79:1.000:. ./.:4:45,117:.: 1.53:1.000:. ./.:4:45,76:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,70:.:-0.24:1.000:. ./.:4:45,78:.: 0.32:1.000:. ./.:4:23,127:.: 1.16:1.000:. ./.:4:40,98:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,114:.: 0.51:1.000:. ./.:4:39,69:.:-0.15:1.000:. ./.:4:8,37:.:-2.11:1.000:. ./.:4:42,88:.: 0.54:1.000:. ./.:4:26,122:.: 1.10:1.000:. ./.:4:15,106:.: 0.26:1.000:. ./.:4:39,98:.: 0.76:1.000:. ./.:4:14,90:.:-0.27:1.000:. ./.:4:37,86:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,68:.:-0.49:1.000:. ./.:4:18,136:.: 1.28:1.000:. ./.:4:20,127:.: 1.07:1.000:. ./.:4:48,94:.: 0.91:1.000:. ./.:4:30,144:.: 1.91:1.000:. ./.:6:29,54:.:-0.92:1.000:. ./.:4:34,102:.: 0.72:1.000:. ./.:4:58,80:.: 0.79:1.000:. ./.:4:21,132:.: 1.25:1.000:. ./.:4:28,79:.:-0.18:1.000:. ./.:4:11,114:.: 0.38:1.000:. ./.:4:9,125:.: 0.66:1.000:. ./.:4:40,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:18,133:.: 1.19:1.000:. ./.:4:42,81:.: 0.32:0.910:. ./.:4:35,26:.:-1.61:1.000:. ./.:4:46,87:.: 0.63:1.000:. ./.:4:13,43:.:-1.76:1.000:. ./.:4:92,52:.: 0.97:1.000:. ./.:4:15,100:.: 0.07:1.000:. ./.:4:38,82:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,84:.: 0.54:1.000:. ./.:4:19,136:.: 1.31:1.000:. ./.:4:25,82:.:-0.18:1.000:. ./.:4:18,108:.: 0.41:1.000:. ./.:4:35,140:.: 1.94:1.000:. ./.:4:53,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:12,138:.: 1.16:1.000:. ./.:4:35,105:.: 0.85:1.000:. ./.:4:15,117:.: 0.60:1.000:. ./.:4:51,97:.: 1.10:1.000:. ./.:4:43,105:.: 1.10:1.000:. ./.:4:27,56:.:-0.92:1.000:. ./.:4:16,116:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,56:.:-0.71:1.000:. ./.:4:48,91:.: 0.82:1.000:. ./.:4:34,64:.:-0.46:1.000:. ./.:4:26,129:.: 1.31:1.000:. ./.:4:37,93:.: 0.54:1.000:. ./.:4:11,67:.:-1.08:1.000:. ./.:4:12,118:.: 0.54:1.000:. ./.:4:22,141:.: 1.56:1.000:. ./.:4:16,113:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,46:.: 0.23:1.000:. ./.:4:20,119:.: 0.82:1.000:. ./.:4:43,66:.:-0.12:1.000:. ./.:4:21,52:.:-1.23:1.000:. ./.:4:62,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,121:.: 0.82:1.000:. ./.:4:39,70:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,70:.:-0.40:1.000:. ./.:4:22,68:.:-0.71:1.000:. ./.:4:16,140:.: 1.35:1.000:. ./.:4:27,66:.:-0.61:1.000:. ./.:4:6,107:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,124:.: 1.07:1.000:. ./.:4:12,92:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,123:.: 1.16:1.000:. ./.:4:23,72:.:-0.55:0.999:. ./.:4:11,133:.: 0.97:1.000:. ./.:3:2,122:.: 0.35:1.000:. ./.:4:38,104:.: 0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,59:.:-0.64:1.000:. ./.:4:17,124:.: 0.88:1.000:. ./.:4:13,95:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,73:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,121:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,89:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,80:.:-0.74:1.000:. ./.:4:10,127:.: 0.76:1.000:. ./.:4:11,121:.: 0.60:1.000:. ./.:5:14,136:.: 1.16:0.988:. ./.:4:62,47:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,76:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,66:.: 0.04:1.000:. ./.:4:22,133:.: 1.31:1.000:. ./.:4:6,75:.:-0.99:1.000:. ./.:4:24,53:.:-1.11:1.000:. ./.:4:12,112:.: 0.35:1.000:. ./.:4:11,76:.:-0.80:1.000:. ./.:4:21,140:.: 1.50:1.000:. ./.:4:14,95:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,134:.: 1.13:1.000:. ./.:4:35,70:.:-0.24:1.000:. ./.:4:30,82:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,85:.: 0.07:1.000:. ./.:4:34,78:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,99:.:-0.21:1.000:. ./.:4:14,114:.: 0.48:1.000:. ./.:4:22,78:.:-0.40:1.000:. ./.:4:37,88:.: 0.38:1.000:. ./.:4:14,114:.: 0.48:1.000:. ./.:4:23,86:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:14,130:.: 0.97:1.000:. ./.:4:21,120:.: 0.88:1.000:. ./.:4:23,51:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,27:.:-2.67:1.000:. ./.:4:13,39:.:-1.89:1.000:. ./.:4:52,75:.: 0.44:1.000:. ./.:4:30,56:.:-0.83:1.000:. ./.:4:21,61:.:-0.96:1.000:. ./.:4:34,90:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,108:.: 0.23:1.000:. ./.:4:30,63:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,76:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,50:.:-1.05:1.000:. ./.:4:30,69:.:-0.43:1.000:. ./.:4:14,122:.: 0.72:1.000:. ./.:4:23,131:.: 1.28:1.000:. ./.:4:25,66:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,76:.:-0.36:1.000:. ./.:4:48,22:.:-1.33:1.000:. ./.:4:24,65:.:-0.74:1.000:. ./.:4:13,74:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,55:.:-0.99:1.000:. ./.:4:20,86:.:-0.21:1.000:. ./.:4:25,65:.:-0.71:1.000:. ./.:4:23,67:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,68:.:-0.33:1.000:. ./.:4:29,62:.:-0.68:1.000:. ./.:4:44,85:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,82:.: 0.76:1.000:. ./.:4:50,77:.: 0.44:1.000:. ./.:4:24,46:.:-1.33:1.000:. ./.:4:49,86:.: 0.69:1.000:. ./.:4:29,115:.: 0.97:1.000:. ./.:4:28,61:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,60:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,34:.:-1.55:1.000:. -chr1.1 51370226 chr1.1_051370226 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,303:.: 1.02:1.000:. ./.:4:82,137:.:-1.25:1.000:. ./.:4:78,117:.:-1.63:1.000:. ./.:4:44,280:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,369:.: 1.10:1.000:. ./.:4:42,246:.:-0.17:1.000:. ./.:4:29,176:.:-1.47:1.000:. ./.:4:56,145:.:-1.54:1.000:. ./.:4:82,133:.:-1.32:1.000:. ./.:4:40,238:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,393:.: 1.51:1.000:. ./.:4:87,137:.:-1.18:1.000:. ./.:4:112,142:.:-0.70:1.000:. ./.:4:41,221:.:-0.58:1.000:. ./.:4:40,219:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,285:.:-0.22:0.998:. ./.:4:94,127:.:-1.22:1.000:. ./.:4:135,222:.: 0.91:1.000:. ./.:4:52,298:.: 0.80:1.000:. ./.:4:82,161:.:-0.88:1.000:. ./.:4:79,157:.:-0.99:1.000:. ./.:4:110,193:.: 0.07:1.000:. ./.:4:38,209:.:-0.81:1.000:. ./.:4:68,181:.:-0.78:1.000:. ./.:4:2,280:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,290:.:-0.12:1.000:. ./.:4:45,220:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,398:.: 1.56:1.000:. ./.:4:100,154:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,194:.:-1.10:1.000:. ./.:4:39,164:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,211:.:-1.38:1.000:. ./.:4:65,176:.:-0.91:1.000:. ./.:3:40,78:.:-2.84:1.000:. ./.:4:88,141:.:-1.10:1.000:. ./.:4:28,178:.:-1.46:1.000:. ./.:4:45,257:.: 0.05:1.000:. ./.:4:32,259:.:-0.12:1.000:. ./.:4:52,247:.: 0.00:1.000:. ./.:4:50,277:.: 0.44:1.000:. ./.:4:28,194:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,426:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,380:.: 2.45:1.000:. ./.:4:43,293:.: 0.58:1.000:. ./.:4:69,327:.: 1.53:1.000:. ./.:4:96,480:.: 4.36:1.000:. ./.:4:0,304:.: 0.08:1.000:. ./.:4:129,201:.: 0.49:1.000:. ./.:4:109,165:.:-0.39:1.000:. ./.:4:56,284:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.66:1.000:. ./.:4:73,302:.: 1.20:1.000:. ./.:4:88,139:.:-1.13:1.000:. ./.:4:37,272:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,208:.:-0.83:1.000:. ./.:4:57,306:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,317:.: 0.29:1.000:. ./.:6:98,206:.: 0.08:1.000:. ./.:4:100,183:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,208:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,437:.: 2.17:1.000:. ./.:4:110,217:.: 0.44:1.000:. ./.:4:59,288:.: 0.76:1.000:. ./.:4:45,261:.: 0.11:1.000:. ./.:4:103,176:.:-0.31:1.000:. ./.:4:65,260:.: 0.41:1.000:. ./.:4:57,279:.: 0.58:0.910:. ./.:4:95,164:.:-0.63:1.000:. ./.:4:57,315:.: 1.15:1.000:. ./.:4:51,238:.:-0.15:1.000:. ./.:4:84,206:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,233:.:-0.26:1.000:. ./.:4:38,237:.:-0.37:1.000:. ./.:4:68,128:.:-1.62:1.000:. ./.:4:38,226:.:-0.55:1.000:. ./.:4:106,187:.:-0.09:1.000:. ./.:4:119,139:.:-0.64:1.000:. ./.:4:61,275:.: 0.58:1.000:. ./.:4:93,155:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,396:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,420:.: 1.90:1.000:. ./.:4:73,157:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,382:.: 1.31:1.000:. ./.:4:72,321:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.42:1.000:. ./.:4:57,212:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.87:1.000:. ./.:4:82,148:.:-1.08:1.000:. ./.:4:50,214:.:-0.55:1.000:. ./.:4:36,239:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,261:.: 0.46:1.000:. ./.:4:34,216:.:-0.77:1.000:. ./.:4:71,295:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.63:1.000:. ./.:4:63,259:.: 0.36:1.000:. ./.:4:50,265:.: 0.25:1.000:. ./.:4:129,205:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,358:.: 0.93:1.000:. ./.:4:42,235:.:-0.34:1.000:. ./.:4:123,178:.: 0.03:1.000:. ./.:4:104,179:.:-0.25:1.000:. ./.:4:129,194:.: 0.38:1.000:. ./.:4:61,267:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.79:1.000:. ./.:4:80,145:.:-1.16:1.000:. ./.:4:101,142:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,432:.: 2.09:1.000:. ./.:4:104,158:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,390:.: 1.43:1.000:. ./.:4:58,273:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,394:.: 1.50:0.999:. ./.:4:63,217:.:-0.30:1.000:. ./.:3:40,146:.:-1.77:1.000:. ./.:4:65,306:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.51:1.000:. ./.:4:88,168:.:-0.67:1.000:. ./.:4:54,269:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.36:1.000:. ./.:4:51,286:.: 0.60:1.000:. ./.:4:58,267:.: 0.41:1.000:. ./.:4:52,313:.: 1.04:1.000:. ./.:4:54,240:.:-0.08:1.000:. ./.:4:56,251:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,376:.: 1.21:1.000:. ./.:5:118,270:.: 1.40:0.988:. ./.:4:39,229:.:-0.48:1.000:. ./.:4:83,154:.:-0.97:1.000:. ./.:4:51,221:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,286:.:-0.20:1.000:. ./.:4:81,139:.:-1.24:1.000:. ./.:4:80,109:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.60:1.000:. ./.:4:48,229:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,445:.: 2.30:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,276:.: 0.49:1.000:. ./.:4:99,155:.:-0.70:1.000:. ./.:4:106,156:.:-0.58:1.000:. ./.:4:59,261:.: 0.33:1.000:. ./.:4:117,193:.: 0.18:1.000:. ./.:4:54,221:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,137:.:-1.10:1.000:. ./.:4:59,367:.: 2.00:1.000:. ./.:4:119,214:.: 0.54:1.000:. ./.:4:117,176:.:-0.09:1.000:. ./.:4:42,239:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,301:.: 0.96:1.000:. ./.:4:40,227:.:-0.50:1.000:. ./.:4:51,334:.: 1.35:1.000:. ./.:4:50,220:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,255:.:-0.12:1.000:. ./.:4:33,204:.:-0.97:1.000:. ./.:4:35,212:.:-0.81:1.000:. ./.:4:92,174:.:-0.52:1.000:. ./.:4:64,291:.: 0.88:1.000:. ./.:4:64,292:.: 0.90:1.000:. ./.:4:49,195:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.41:1.000:. ./.:4:49,235:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,205:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,334:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,250:.:-0.75:1.000:. ./.:4:96,160:.:-0.67:1.000:. ./.:4:2,336:.: 0.62:1.000:. ./.:4:58,266:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,255:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,206:.:-0.78:1.000:. ./.:4:61,153:.:-1.33:1.000:. ./.:4:69,101:.:-2.02:1.000:. ./.:4:85,174:.:-0.63:1.000:. ./.:4:60,221:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,145:.:-1.21:1.000:. ./.:4:43,235:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,271:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,295:.: 0.82:1.000:. ./.:4:35,208:.:-0.88:1.000:. ./.:4:43,220:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,168:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,399:.: 1.57:1.000:. ./.:4:57,336:.: 1.48:1.000:. ./.:4:28,191:.:-1.25:1.000:. ./.:4:54,253:.: 0.13:1.000:. -chr1.1 51484533 chr1.1_051484533 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:0.998:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:3:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.96:1.000:. ./.:6:10,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:0.910:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.70:0.999:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:3:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.: 3.77:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.47:1.000:. ./.:5:8,0:.: 0.66:0.988:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. -chr1.1 51632256 chr1.1_051632256 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:88,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.18:0.998:. ./.:4:114,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.48:1.000:. ./.:3:22,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:51,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:0.910:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.29:0.999:. ./.:4:41,0:.:-1.22:1.000:. ./.:3:42,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:5:37,0:.:-1.37:0.988:. ./.:4:92,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:139,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.25:1.000:. -chr1.1 51703372 chr1.1_051703372 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:50,186:.: 0.10:1.000:. ./.:4:40,145:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,194:.: 0.30:1.000:. ./.:4:81,121:.:-0.57:1.000:. ./.:4:121,144:.: 0.68:1.000:. ./.:4:55,207:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1,251:.: 0.42:1.000:. ./.:4:57,199:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,77:.:-2.52:1.000:. ./.:4:53,59:.:-2.35:1.000:. ./.:4:93,107:.:-0.61:1.000:. ./.:4:59,168:.:-0.08:1.000:. ./.:4:75,113:.:-0.85:1.000:. ./.:4:54,185:.: 0.16:1.000:. ./.:4:54,203:.: 0.52:1.000:. ./.:4:62,226:.: 1.13:0.998:. ./.:4:57,218:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,288:.: 1.13:1.000:. ./.:4:48,181:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,86:.:-2.82:1.000:. ./.:4:1,250:.: 0.40:1.000:. ./.:4:56,202:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,73:.:-3.12:1.000:. ./.:4:62,208:.: 0.77:1.000:. ./.:4:124,139:.: 0.64:1.000:. ./.:4:47,189:.: 0.10:1.000:. ./.:4:62,183:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,188:.: 0.28:1.000:. ./.:4:56,216:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.19:1.000:. ./.:4:20,40:.:-3.37:1.000:. ./.:4:22,84:.:-2.46:1.000:. ./.:3:6,52:.:-3.41:1.000:. ./.:4:58,204:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.95:1.000:. ./.:4:57,182:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,253:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,193:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,198:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.93:1.000:. ./.:4:56,234:.: 1.17:1.000:. ./.:4:98,121:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.15:1.000:. ./.:4:69,195:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.73:1.000:. ./.:4:77,402:.: 4.90:1.000:. ./.:4:43,204:.: 0.32:1.000:. ./.:4:54,207:.: 0.60:1.000:. ./.:4:44,168:.:-0.37:1.000:. ./.:4:71,224:.: 1.27:1.000:. ./.:4:54,174:.:-0.06:1.000:. ./.:4:62,230:.: 1.21:1.000:. ./.:4:68,177:.: 0.28:1.000:. ./.:4:55,185:.: 0.18:1.000:. ./.:4:111,119:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,220:.: 1.07:1.000:. ./.:4:123,152:.: 0.87:1.000:. ./.:6:29,194:.:-0.15:1.000:. ./.:4:48,189:.: 0.12:1.000:. ./.:4:61,195:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,214:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.46:1.000:. ./.:4:41,206:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,199:.: 0.54:1.000:. ./.:4:19,91:.:-2.38:1.000:. ./.:4:48,204:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.71:0.910:. ./.:4:93,117:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.81:1.000:. ./.:4:30,108:.:-1.83:1.000:. ./.:4:140,191:.: 1.98:1.000:. ./.:4:66,210:.: 0.89:1.000:. ./.:4:164,67:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,178:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,190:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.73:1.000:. ./.:4:47,222:.: 0.75:1.000:. ./.:4:74,224:.: 1.33:1.000:. ./.:4:105,85:.:-0.81:1.000:. ./.:4:101,113:.:-0.33:1.000:. ./.:4:68,238:.: 1.48:1.000:. ./.:4:48,178:.:-0.09:1.000:. ./.:4:45,194:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,204:.: 0.58:1.000:. ./.:4:38,121:.:-1.42:1.000:. ./.:4:46,170:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,197:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,171:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,162:.:-0.55:1.000:. ./.:4:94,136:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,321:.: 1.80:1.000:. ./.:4:50,147:.:-0.67:1.000:. ./.:4:58,209:.: 0.71:1.000:. ./.:4:52,204:.: 0.50:1.000:. ./.:4:53,170:.:-0.15:1.000:. ./.:4:85,131:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,191:.: 0.30:1.000:. ./.:4:58,187:.: 0.28:1.000:. ./.:4:19,96:.:-2.29:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.46:1.000:. ./.:4:31,130:.:-1.38:1.000:. ./.:4:51,147:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,168:.:-0.43:1.000:. ./.:4:59,174:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,183:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.20:1.000:. ./.:4:115,141:.: 0.50:1.000:. ./.:4:62,187:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,187:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,222:.: 1.11:1.000:. ./.:4:42,175:.:-0.27:0.999:. ./.:4:48,152:.:-0.61:1.000:. ./.:3:40,100:.:-1.79:1.000:. ./.:4:52,209:.: 0.60:1.000:. ./.:4:37,118:.:-1.50:1.000:. ./.:4:46,179:.:-0.11:1.000:. ./.:4:43,168:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,158:.:-0.63:1.000:. ./.:4:50,216:.: 0.69:1.000:. ./.:4:48,162:.:-0.41:1.000:. ./.:4:58,195:.: 0.44:1.000:. ./.:4:44,188:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,195:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,201:.: 0.56:1.000:. ./.:5:54,235:.: 1.15:0.988:. ./.:4:44,181:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,152:.:-0.86:1.000:. ./.:4:101,152:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,185:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,180:.:-1.00:1.000:. ./.:4:93,120:.:-0.35:1.000:. ./.:4:52,169:.:-0.19:1.000:. ./.:4:102,138:.: 0.18:1.000:. ./.:4:62,207:.: 0.75:1.000:. ./.:4:92,113:.:-0.51:1.000:. ./.:4:52,161:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,150:.:-0.59:1.000:. ./.:4:41,138:.:-1.02:1.000:. ./.:4:59,233:.: 1.21:1.000:. ./.:4:50,230:.: 0.97:1.000:. ./.:4:48,208:.: 0.50:1.000:. ./.:4:59,188:.: 0.32:1.000:. ./.:4:56,227:.: 1.03:1.000:. ./.:4:46,176:.:-0.17:1.000:. ./.:4:67,215:.: 1.01:1.000:. ./.:4:59,216:.: 0.87:1.000:. ./.:4:31,82:.:-2.33:1.000:. ./.:4:36,152:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.77:1.000:. ./.:4:48,181:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,295:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.12:1.000:. ./.:4:42,155:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,188:.: 0.16:1.000:. ./.:4:44,154:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,163:.:-0.61:1.000:. ./.:4:51,171:.:-0.17:1.000:. ./.:4:60,157:.:-0.27:1.000:. ./.:4:100,143:.: 0.24:1.000:. ./.:4:46,191:.: 0.12:1.000:. ./.:4:35,146:.:-0.98:1.000:. ./.:4:39,182:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,158:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,163:.:-0.59:1.000:. ./.:4:43,139:.:-0.96:1.000:. ./.:4:40,166:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,115:.:-1.58:1.000:. ./.:4:60,227:.: 1.11:1.000:. ./.:4:48,202:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,212:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,180:.: 0.08:1.000:. ./.:4:108,137:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,189:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.39:1.000:. ./.:4:94,110:.:-0.53:1.000:. -chr1.1 51814520 chr1.1_051814520 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:191,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:213,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.19:0.998:. ./.:4:135,60:.: 1.03:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.17:1.000:. ./.:6:89,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.93:0.910:. ./.:4:162,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:158,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.95:0.999:. ./.:4:133,0:.:-0.26:1.000:. ./.:3:80,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.22:1.000:. ./.:5:195,0:.: 1.03:0.988:. ./.:4:109,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:196,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:193,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:267,1:.: 2.55:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.40:1.000:. -chr1.1 51972182 chr1.1_051972182 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:116,10:0.09: 1.43:1.000:0.969 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.48:-1.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,35:0.35: 0.68:1.000:0.831 0/0/0/1:4:92,13:0.13: 0.56:1.000:0.942 0/0/0/1:4:101,15:0.14: 1.01:1.000:0.968 0/0/0/1:4:49,7:0.14:-1.48:1.000:0.949 0/0/0/1:4:119,18:0.14: 1.89:1.000:0.975 0/0/0/1:4:85,13:0.14: 0.27:1.000:0.978 0/1/1/1:4:25,57:0.64:-0.40:1.000:0.710 0/0/1/1:4:38,61:0.59: 0.31:1.000:0.860 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,15:0.15: 0.72:1.000:0.987 0/0/0/1:4:67,28:0.32: 0.14:1.000:0.964 0/0/0/1:4:54,17:0.26:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,12:0.13: 0.39:1.000:0.900 0/0/0/1:4:75,16:0.19:-0.03:0.998:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,40:0.36: 1.10:1.000:0.682 0/0/0/1:4:70,37:0.37: 0.64:1.000:0.596 0/0/1/1:4:44,32:0.44:-0.65:1.000:0.973 0/0/0/1:4:65,18:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,12:0.12: 0.72:1.000:0.752 0/0/0/1:4:63,17:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,100:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,15:0.27:-1.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:84,29:0.28: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,29:0.30: 0.43:1.000:0.980 0/0/0/1:4:100,19:0.17: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:79,8:0.10:-0.19:1.000:0.805 0/0/0/1:4:49,17:0.28:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,10:0.14:-0.52:1.000:0.957 0/0/1/1:4:26,20:0.46:-1.90:1.000:0.986 0/0/1/1:4:51,32:0.41:-0.36:1.000:0.850 0/1/1:3:8,21:0.66:-2.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,34:0.39: 0.02:1.000:0.709 0/0/0/1:4:49,24:0.35:-0.77:1.000:0.791 0/0/0/0:4:98,9:0.09: 0.64:1.000:0.934 0/0/0/1:4:56,8:0.14:-1.15:1.000:0.949 0/0/1/1:4:49,31:0.41:-0.48:1.000:0.863 0/0/0/1:4:62,29:0.34:-0.03:1.000:0.870 0/0/0/1:4:81,12:0.14: 0.06:1.000:0.967 0/0/0/1:4:83,18:0.19: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,16:0.24:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,22:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,18:0.17: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,38:0.37: 0.72:1.000:0.559 0/0/1/1:4:98,57:0.39: 2.64:1.000:0.689 0/0/0/1:4:46,10:0.19:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,15:0.28:-1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,35:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,30:0.33: 0.22:1.000:0.919 0/0/0/1:4:69,27:0.30: 0.18:1.000:0.983 0/0/0/1:4:82,27:0.27: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,22:0.29:-0.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:68,14:0.19:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,34:0.48:-0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,35:0.52:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,21:0.39:-1.44:1.000:0.697 0/0/0/0/1/1:6:37,23:0.41:-1.31:1.000:0.600 0/0/1/1:4:52,37:0.44:-0.11:1.000:0.965 0/0/0/0:4:65,7:0.11:-0.82:1.000:0.655 0/0/0/1:4:75,26:0.28: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,20:0.41:-1.65:1.000:0.844 0/0/0/1:4:74,31:0.32: 0.56:1.000:0.963 0/0/1/1:4:45,28:0.41:-0.77:1.000:0.837 0/0/0/1:4:50,20:0.31:-0.90:1.000:0.978 0/0/1/1:4:50,28:0.38:-0.57:1.000:0.580 0/0/0/1:4:72,23:0.26: 0.14:0.910:0.999 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,36:0.45:-0.27:1.000:0.976 0/0/1/1:4:34,34:0.52:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,32:0.33: 0.56:1.000:0.937 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,35:0.54:-1.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:58,38:0.42: 0.18:1.000:0.907 0/0/1/1:4:65,40:0.40: 0.56:1.000:0.817 0/0/0/1:4:57,20:0.28:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,24:0.35:-0.73:1.000:0.829 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,37:0.52:-0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,51:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,34:0.40:-0.11:1.000:0.825 0/0/0/1:4:57,24:0.32:-0.44:1.000:0.960 0/0/0/1:4:95,22:0.20: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,6:0.10:-1.15:1.000:0.759 0/0/1/1:4:58,32:0.38:-0.07:1.000:0.535 0/0/0/1:4:51,16:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,30:0.49:-1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,13:0.20:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,21:0.35:-1.15:1.000:0.797 0/0/1/1:4:48,36:0.45:-0.32:1.000:0.981 0/0/0/1:4:75,14:0.17:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,27:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,16:0.19:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,30:0.50:-1.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,38:0.44:-0.03:1.000:0.968 0/0/0/1:4:87,19:0.19: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,25:0.32:-0.36:1.000:0.948 0/0/0/1:4:73,22:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,25:0.41:-1.11:1.000:0.844 0/0/1/1:4:53,40:0.45: 0.06:1.000:0.983 0/0/0/1:4:43,22:0.36:-1.11:1.000:0.688 0/0/0/1:4:65,11:0.16:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,30:0.51:-1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,38:0.36: 0.81:1.000:0.641 0/0/0/1:4:116,17:0.14: 1.72:1.000:0.963 0/0/0/1:4:58,27:0.34:-0.27:1.000:0.876 0/0/0/1:4:67,25:0.29: 0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,24:0.17: 2.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:73,19:0.22: 0.02:0.999:1.000 0/0/1/1:4:62,37:0.40: 0.31:1.000:0.753 0/1/1:3:15,18:0.54:-2.44:1.000:0.953 0/0/0/1:4:77,28:0.29: 0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,22:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,28:0.38:-0.57:1.000:0.580 0/0/1/1:4:49,32:0.42:-0.44:1.000:0.904 0/0/0/1:4:68,16:0.21:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,18:0.20: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,32:0.39:-0.15:1.000:0.640 0/0/0/1:4:77,18:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,17:0.14: 1.80:1.000:0.954 0/0/0/1:4:96,18:0.17: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,31:0.30: 0.81:1.000:0.985 0/0/0/0/1:5:93,14:0.14: 0.64:0.988:0.994 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,34:0.56:-1.31:1.000:0.969 0/0/0/1:4:48,11:0.20:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.19:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,12:0.12: 0.60:1.000:0.819 0/0/1/1:4:41,33:0.47:-0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:45,39:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,16:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:145,13:0.09: 2.76:1.000:0.950 0/0/0/1:4:68,20:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,39:0.45: 0.02:1.000:0.977 0/0/0/1:4:56,20:0.28:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,32:0.41:-0.40:1.000:0.879 0/0/0/1:4:74,19:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,31:0.38:-0.23:1.000:0.600 0/0/0/1:4:102,20:0.18: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,35:0.51:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,16:0.12: 2.18:1.000:0.776 0/0/0/1:4:77,34:0.33: 0.81:1.000:0.931 0/0/0/1:4:70,32:0.33: 0.43:1.000:0.898 0/0/0/1:4:63,34:0.37: 0.22:1.000:0.533 0/0/0/1:4:76,20:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,23:0.36:-1.02:1.000:0.629 0/0/0/0:4:113,12:0.10: 1.39:1.000:0.693 0/0/0/1:4:89,17:0.17: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,23:0.43:-1.44:1.000:0.936 0/0/0/1:4:52,12:0.20:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,22:0.33:-0.82:1.000:0.934 0/0/0/1:4:86,12:0.13: 0.27:1.000:0.933 0/0/0/1:4:125,20:0.15: 2.22:1.000:0.987 0/0/0/1:4:74,28:0.29: 0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:49,31:0.41:-0.48:1.000:0.863 0/0/0/1:4:97,17:0.16: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,15:0.21:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,12:0.20:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,18:0.17: 1.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,19:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,22:0.28:-0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,34:0.33: 0.81:1.000:0.931 0/0/1/1:4:51,28:0.38:-0.52:1.000:0.520 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,16:0.17: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/0:4:84,7:0.08:-0.03:1.000:0.980 0/0/0/1:4:58,28:0.35:-0.23:1.000:0.819 0/0/0/1:4:60,11:0.17:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:86,10:0.11: 0.18:1.000:0.581 0/0/0/0:4:94,9:0.09: 0.47:1.000:0.893 0/0/0/1:4:68,17:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,25:0.41:-1.15:1.000:0.881 0/0/0/1:4:68,35:0.36: 0.47:1.000:0.672 0/0/0/1:4:94,12:0.12: 0.60:1.000:0.819 0/0/0/0:4:109,8:0.07: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,16:0.20:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,27:0.27: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,16:0.11: 2.64:1.000:0.550 0/0/0/1:4:146,24:0.15: 3.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:44,22:0.35:-1.07:1.000:0.746 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 2.30:1.000:1.000 -chr1.1 52161558 chr1.1_052161558 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:199,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:208,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.22:0.998:. ./.:4:129,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.56:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.64:1.000:. ./.:3:26,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:169,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.95:0.910:. ./.:4:136,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:197,0:.: 0.64:1.000:. ./.:3:97,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:215,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.38:1.000:. ./.:5:228,0:.: 1.37:0.988:. ./.:4:151,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:286,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:257,1:.: 2.07:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:261,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:260,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.40:1.000:. -chr1.1 52249466 chr1.1_052249466 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.91:0.998:. ./.:4:39,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-2.44:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.85:1.000:. ./.:6:55,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:0.910:. ./.:4:47,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:77,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:24,0:.:-1.30:1.000:. ./.:3:25,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:5:40,0:.:-0.44:0.988:. ./.:4:48,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.06:1.000:. -chr1.1 52470363 chr1.1_052470363 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:83,209:0.73: 0.99:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,205:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,194:0.71: 0.74:1.000:0.989 0/0/1/1:4:124,120:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,150:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,138:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,147:0.81:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,114:0.47: 0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:136,117:0.47: 0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,54:0.47:-2.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,58:0.60:-2.74:1.000:0.785 0/1/1/1:4:36,183:0.84:-0.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:200,59:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,132:0.55: 0.03:1.000:0.976 0/0/1/1:4:84,110:0.58:-0.89:1.000:0.930 0/0/1/1:4:138,144:0.52: 0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:77,172:0.70: 0.17:0.998:0.986 0/1/1/1:4:100,193:0.67: 1.01:1.000:0.914 0/1/1/1:4:90,258:0.75: 2.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,153:0.54: 0.88:1.000:0.986 0/0/1/1:4:65,55:0.47:-2.32:1.000:0.992 0/1/1/1:4:72,193:0.74: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,135:0.46: 1.21:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,234:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,60:0.77:-3.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,156:0.54: 0.98:1.000:0.985 0/1/1/1:4:41,206:0.84: 0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,209:0.72: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,218:0.74: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:190,76:0.31: 0.49:1.000:0.972 0/1/1/1:4:78,166:0.69: 0.07:1.000:0.974 0/1/1/1:4:76,165:0.69: 0.01:1.000:0.980 0/0/1/1:4:13,15:0.54:-4.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:99,25:0.23:-2.24:1.000:1.000 0/0/1:3:42,20:0.34:-3.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,203:0.78: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,255:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,112:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:97,192:0.67: 0.94:1.000:0.936 0/0/1/1:4:125,131:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,152:0.84:-1.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,222:0.74: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,149:0.55: 0.71:1.000:0.983 0/0/1/1:4:114,127:0.54: 0.01:1.000:0.990 0/1/1/1:4:95,239:0.73: 1.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,108:0.43: 0.38:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,276:1.00: 0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,115:0.48: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:166,123:0.44: 0.94:1.000:0.965 0/1/1/1:4:62,155:0.72:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,203:0.81: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,160:0.72:-0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,118:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,128:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,140:0.47: 1.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:105,115:0.53:-0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:135,152:0.54: 0.90:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,186:0.81:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:111,107:0.50:-0.43:1.000:0.889 0/0/1/1:4:105,95:0.48:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,57:0.30:-0.57:1.000:0.988 0/1/1/1:4:74,200:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,164:0.68: 0.07:1.000:0.958 0/1/1/1:4:66,246:0.80: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,213:0.78: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,77:0.53:-1.80:1.000:0.992 0/1/1/1:4:73,170:0.71: 0.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,196:0.79: 0.19:0.910:1.000 0/1/1/1:4:46,189:0.81:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,288:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,165:0.81:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,219:0.82: 0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,249:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,165:0.80:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,79:0.47:-1.34:1.000:0.993 0/1/1/1:4:70,157:0.70:-0.26:1.000:0.987 0/1/1/1:4:58,171:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,101:0.46:-0.28:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,226:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,139:0.78:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,213:0.83: 0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,198:0.85:-0.12:1.000:0.984 0/1/1/1:4:69,154:0.70:-0.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:83,103:0.56:-1.05:1.000:0.964 0/0/1/1:4:124,116:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,97:0.52:-0.95:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,226:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,109:0.55:-0.78:1.000:0.976 0/0/1/1:4:97,130:0.58:-0.26:1.000:0.909 0/0/0/1:4:151,44:0.26:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,103:0.49:-0.55:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,273:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,97:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,118:0.44: 0.69:1.000:0.968 0/1/1/1:4:62,190:0.76: 0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,207:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,159:0.78:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,186:0.71: 0.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:123,127:0.52: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,103:0.48:-0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,130:0.47: 0.86:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,107:0.70:-1.65:1.000:0.985 0/0/1/1:4:123,115:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,81:0.46:-1.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:92,105:0.54:-0.84:1.000:0.987 0/1/1/1:4:63,180:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,146:0.64:-0.16:1.000:0.673 0/0/1/1:4:154,158:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,198:0.70: 0.92:1.000:0.983 0/1/1/1:4:56,176:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,291:0.75: 2.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,109:0.48:-0.12:0.999:0.994 0/1/1/1:4:60,162:0.74:-0.35:1.000:0.999 0/1/1:3:46,97:0.69:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,154:0.52: 1.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,152:0.71:-0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,107:0.47:-0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:84,146:0.64:-0.20:1.000:0.735 0/1/1/1:4:69,168:0.72:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:132,103:0.45:-0.10:1.000:0.980 0/1/1/1:4:47,196:0.81: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,59:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,211:0.73: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,127:0.52: 0.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:74,202:0.74: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:206,118:0.38: 1.61:0.988:0.967 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,118:0.69:-1.28:1.000:0.970 0/0/1/1:4:85,92:0.53:-1.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:99,122:0.56:-0.37:1.000:0.966 0/0/1/1:4:145,94:0.41:-0.03:1.000:0.859 0/1/1/1:4:41,141:0.78:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,195:0.84:-0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:58,170:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,141:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,175:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,102:0.52:-0.82:1.000:0.994 0/0/0/1:4:146,56:0.30:-0.74:1.000:0.982 0/1/1/1:4:61,149:0.72:-0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,186:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,179:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,122:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,135:0.76:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,194:0.59: 1.84:1.000:0.886 0/0/1/1:4:157,166:0.52: 1.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,196:0.72: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,136:0.53: 0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:156,156:0.51: 1.38:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,213:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,224:0.73: 1.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:216,58:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,91:0.86:-2.57:1.000:0.977 0/0/0/1:4:190,59:0.27: 0.17:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,267:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,68:0.27: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:99,220:0.70: 1.52:1.000:0.985 1/1/1/1:4:2,316:0.99: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,173:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,135:0.55: 0.13:1.000:0.974 0/1/1/1:4:75,179:0.72: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:178,68:0.30: 0.11:1.000:0.983 0/0/1/1:4:107,113:0.52:-0.39:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,251:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,189:0.85:-0.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:126,164:0.57: 0.96:1.000:0.935 0/1/1/1:4:50,143:0.75:-0.91:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,236:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,210:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,106:0.45: 0.09:1.000:0.975 0/0/1/1:4:105,121:0.54:-0.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:119,96:0.46:-0.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:203,55:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,174:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,88:0.45:-0.76:1.000:0.980 0/0/1/1:4:84,106:0.57:-0.97:1.000:0.955 0/0/1/1:4:137,133:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,138:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,203:0.71: 0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:170,90:0.37: 0.38:1.000:0.614 0/0/1/1:4:141,144:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,160:0.54: 1.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:155,149:0.50: 1.23:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,279:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,194:0.80: 0.09:1.000:1.000 -chr1.1 52738087 chr1.1_052738087 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:28,98:0.78: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,40:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,51:0.48: 0.91:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,90:0.72: 1.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,87:0.83: 0.68:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,112:0.99: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,25:0.80:-2.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,43:0.53:-0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,55:0.59: 0.33:1.000:0.879 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-2.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,30:0.79:-1.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,65:0.65: 0.52:1.000:0.826 0/1/1/1:4:23,68:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,42:0.44: 0.56:1.000:0.961 0/0/1/1:4:59,60:0.52: 1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,74:0.76: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,59:0.47: 1.71:0.998:0.991 0/0/0/1:4:60,25:0.33:-0.05:1.000:0.935 0/0/1/1:4:67,65:0.51: 1.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,60:0.48: 1.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,3:0.51:-3.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,52:0.57: 0.22:1.000:0.934 0/0/1/1:4:39,56:0.60: 0.33:1.000:0.814 0/1/1/1:4:18,60:0.77:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.70:-2.93:1.000:0.986 0/1/1/1:4:22,66:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,94:0.71: 1.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:76,22:0.26: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,47:0.46: 0.79:1.000:0.986 0/1/1/1:4:22,65:0.74: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,30:0.36: 0.14:1.000:0.668 0/1/1/1:4:32,70:0.69: 0.60:1.000:0.970 1/1/1/1:4:1,9:0.90:-2.93:1.000:0.777 1/1/1/1:4:1,11:0.92:-2.85:1.000:0.977 0/0/1:3:3,2:0.42:-3.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,46:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/1/1/1:4:22,82:0.79: 0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,40:0.45: 0.22:1.000:0.983 0/0/1/1:4:46,37:0.46:-0.13:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,66:0.81:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,58:0.68:-0.01:1.000:0.945 0/1/1/1:4:22,65:0.74: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,80:0.81: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,17:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,82:0.77: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,56:0.78:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,75:0.81: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,44:0.48: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,36:0.53:-0.66:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,52:0.69:-0.43:1.000:0.980 1/1/1/1:4:1,90:0.99: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,68:0.68: 0.52:1.000:0.958 0/0/0/1:4:80,22:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,53:0.55: 0.48:1.000:0.983 0/0/1/1:4:31,42:0.58:-0.51:1.000:0.897 0/1/1/1:4:24,75:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:18,48:0.73:-0.78:1.000:0.716 0/1/1/1:4:20,68:0.77: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,54:0.52: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,44:0.57:-0.28:1.000:0.954 0/0/1/1:4:34,43:0.57:-0.36:1.000:0.951 0/0/0/1:4:87,30:0.29: 1.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,23:0.29: 0.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:13,42:0.76:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,18:0.26:-0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,66:0.82:-0.24:0.910:0.999 0/1/1/1:4:19,60:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,86:0.83: 0.68:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-2.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,51:0.79:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,84:0.72: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,43:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,48:0.76:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,37:0.56:-0.74:1.000:0.963 0/0/1/1:4:37,49:0.58:-0.01:1.000:0.919 0/0/1/1:4:44,55:0.57: 0.48:1.000:0.957 0/1/1/1:4:28,77:0.73: 0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:17,37:0.69:-1.24:1.000:0.968 0/1/1/1:4:23,49:0.68:-0.55:1.000:0.960 0/1/1/1:4:24,71:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,45:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,51:0.77:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,31:0.75:-1.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,59:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,50:0.86:-1.09:1.000:0.965 0/1/1/1:4:24,61:0.72:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,28:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,48:0.52: 0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,58:0.68:-0.05:1.000:0.963 0/0/0/1:4:59,20:0.29:-0.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:73,25:0.29: 0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,49:0.59:-0.05:1.000:0.891 0/1/1/1:4:10,41:0.80:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,34:0.56:-0.93:1.000:0.969 0/0/1/1:4:45,34:0.45:-0.28:1.000:0.980 0/1/1/1:4:26,59:0.70:-0.05:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-2.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,33:0.47:-0.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,35:0.56:-0.86:1.000:0.971 0/1/1/1:4:15,59:0.80:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,32:0.47:-0.59:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,62:0.68: 0.22:1.000:0.943 0/0/1/1:4:37,53:0.60: 0.14:1.000:0.818 0/0/1/1:4:47,55:0.55: 0.60:1.000:0.980 0/1/1/1:4:34,88:0.72: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,49:0.56: 0.14:1.000:0.974 0/0/1/1:4:53,44:0.47: 0.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:34,103:0.75: 1.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,69:0.73: 0.33:0.999:0.997 0/0/0/1:4:89,29:0.28: 1.21:1.000:0.995 0/0/1:3:29,16:0.38:-1.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,41:0.65:-0.89:1.000:0.831 0/1/1/1:4:21,56:0.73:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,17:0.39:-1.51:1.000:0.662 0/0/1/1:4:32,34:0.53:-0.78:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,90:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,22:0.32:-0.40:1.000:0.949 0/0/1/1:4:50,34:0.43:-0.09:1.000:0.937 0/1/1/1:4:35,66:0.66: 0.56:1.000:0.850 0/0/0/1:4:64,14:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,56:0.63: 0.14:1.000:0.535 0/0/1/1/1:5:49,60:0.56: 0.87:0.988:0.918 0/0/0/1:4:45,17:0.31:-0.93:1.000:0.976 0/0/1/1:4:32,33:0.52:-0.82:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,63:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,54:0.52: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:21,30:0.60:-1.35:1.000:0.823 0/1/1/1:4:19,67:0.78:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,66:0.77:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,89:0.80: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,49:0.56: 0.14:1.000:0.974 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:23,46:0.67:-0.66:1.000:0.919 0/0/1/1:4:29,30:0.52:-1.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,70:0.80: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,52:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,29:0.31: 0.71:1.000:0.974 0/0/1/1:4:33,27:0.47:-1.01:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,87:0.71: 1.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:71,72:0.52: 2.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,47:0.50: 0.41:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,67:0.80:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,85:0.73: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,56:0.48: 1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-2.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:36,41:0.54:-0.36:1.000:0.985 0/1/1/1:4:31,53:0.64:-0.09:1.000:0.641 0/1/1/1:4:24,70:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,75:0.70: 0.79:1.000:0.986 0/1/1/1:4:20,56:0.74:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,24:0.32:-0.09:1.000:0.957 0/1/1/1:4:21,78:0.79: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,27:0.36:-0.20:1.000:0.668 0/0/1/1:4:53,36:0.43: 0.10:1.000:0.936 0/1/1/1:4:32,74:0.70: 0.75:1.000:0.984 0/0/1/1:4:48,55:0.55: 0.64:1.000:0.984 0/1/1/1:4:26,83:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,70:0.69: 0.60:1.000:0.970 0/1/1/1:4:13,61:0.82:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,23:0.29: 0.10:1.000:0.990 0/1/1/1:4:30,78:0.72: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,21:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,97:0.82: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,32:0.46:-0.51:1.000:0.986 0/1/1/1:4:29,82:0.74: 0.94:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,86:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,23:0.50:-1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,52:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,49:0.44: 1.14:1.000:0.971 1/1/1/1:4:1,105:0.99: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,84:0.75: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,41:0.46: 0.26:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,73:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,85:0.73: 1.14:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,132:1.00: 1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,44:0.76:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,62:0.62: 0.56:1.000:0.569 -chr1.1 52910315 chr1.1_052910315 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:99,44:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,87:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,50:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,1:0.01: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,77:0.30: 2.45:1.000:0.986 0/0/0/1:4:48,33:0.30:-0.73:1.000:0.984 0/0/0/1:4:92,47:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,47:0.29: 0.35:1.000:0.990 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,108:0.51: 1.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,48:0.27: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.50:0.998:1.000 0/1/1/1:4:27,150:0.75: 2.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,61:0.27: 1.81:1.000:0.998 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,10:0.34:-2.44:1.000:0.885 0/0/0/1:4:77,37:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,44:0.24: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,50:0.31: 0.44:1.000:0.980 0/0/0/0:4:7,1:0.09:-2.85:1.000:0.933 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,65:0.29: 1.66:1.000:0.989 0/0/0/0:4:114,2:0.01: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,40:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-3.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.23:-2.62:1.000:1.000 0/1/1:3:1,6:0.76:-2.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,48:0.28: 0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:82,39:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,45:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,38:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,42:0.26: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,45:0.27: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,59:0.26: 1.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,15:0.28:-1.95:1.000:0.995 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,27:0.30:-1.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:65,29:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,53:0.28: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,55:0.27: 1.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:81,45:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:59,30:0.25:-0.49:1.000:0.560 0/0/0/1:4:81,32:0.21: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,2:0.02:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,29:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,33:0.30:-0.70:1.000:0.988 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,34:0.28:-0.49:0.910:0.995 0/0/1/1:4:49,80:0.47: 0.67:1.000:0.990 0/0/0/1:4:57,47:0.34:-0.06:1.000:0.896 0/0/0/1:4:22,12:0.26:-2.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,58:0.45:-0.29:1.000:0.983 0/0/0/1:4:94,39:0.21: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,43:0.36:-0.46:1.000:0.740 0/0/0/1:4:60,40:0.30:-0.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:66,32:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,59:0.33: 0.73:1.000:0.902 0/0/0/1:4:88,48:0.26: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,43:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,65:0.54:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.19: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,37:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,36:0.31:-0.55:1.000:0.979 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,22:0.18:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,39:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,34:0.28:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,26:0.24:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,34:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,18:0.22:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,45:0.30: 0.12:1.000:0.983 0/0/0/1:4:51,36:0.31:-0.55:1.000:0.979 0/0/0/1:4:76,35:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,42:0.29: 0.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:92,54:0.27: 1.17:1.000:0.997 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,34:0.21: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,51:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.58:0.999:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0:3:39,0:0.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,42:0.30:-0.03:1.000:0.989 0/0/0/0:4:64,1:0.01:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,31:0.27:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,37:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,72:0.28: 2.42:1.000:0.995 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:90,38:0.22: 0.64:0.988:0.988 0/0/0/1:4:52,27:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,29:0.26:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,23:0.22:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,1:0.01:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,52:0.28: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,24:0.21:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,38:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,39:0.31:-0.38:1.000:0.973 0/0/0/1:4:65,23:0.19:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,29:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,38:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,27:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,39:0.20: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,40:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,51:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,47:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,38:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,65:0.27: 2.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,37:0.28:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,40:0.23: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,58:0.29: 1.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:88,51:0.27: 0.96:1.000:0.998 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,1:0.01:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,43:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,47:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,30:0.19: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,1:0.01: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,34:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,35:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,39:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:94,44:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,27:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,57:0.26: 1.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,53:0.28: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:113,4:0.03: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,36:0.20: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,55:0.28: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,44:0.34:-0.32:1.000:0.841 0/0/0/1:4:77,50:0.29: 0.61:1.000:0.992 -chr1.1 53016387 chr1.1_053016387 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:53,25:0.31:-0.44:1.000:0.971 0/0/0/1:4:73,16:0.18:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,38:0.44:-0.25:1.000:0.973 0/0/0/1:4:73,22:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,67:0.50: 1.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,50:0.54:-0.04:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,58:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,30:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.58:-2.43:1.000:0.909 0/0/0/1:4:18,4:0.18:-2.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,21:0.27:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,40:0.47:-0.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:75,22:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,45:0.45: 0.22:1.000:0.984 0/1/1/1:4:24,70:0.70: 0.14:1.000:0.985 0/0/1/1:4:69,66:0.47: 1.63:0.998:0.993 0/0/1/1:4:48,59:0.53: 0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:103,31:0.23: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,48:0.55:-0.25:1.000:0.975 0/0/1/1:4:12,13:0.50:-2.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:61,17:0.21:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,19:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,30:0.28: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:7,3:0.29:-2.90:1.000:0.991 0/1/1/1:4:23,92:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,19:0.22:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,22:0.27:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:43,39:0.46:-0.29:1.000:0.988 0/0/1/1:4:81,76:0.47: 2.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:99,50:0.33: 2.14:1.000:0.935 0/0/1/1:4:61,82:0.55: 1.92:1.000:0.980 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-2.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:14,17:0.53:-2.14:1.000:0.993 0/0/1:3:5,2:0.28:-3.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,32:0.28: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:53,28:0.34:-0.33:1.000:0.892 0/0/1/1:4:62,61:0.48: 1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,78:0.48: 2.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:77,19:0.19: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,47:0.48: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,88:0.74: 0.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,51:0.58:-0.22:1.000:0.915 0/0/1/1:4:58,50:0.45: 0.65:1.000:0.979 0/0/1/1:4:45,52:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,21:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-2.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,63:0.67:-0.07:1.000:0.939 0/0/0/1:4:82,21:0.20: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,1:0.01:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,28:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,45:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,58:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,25:0.28:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,82:0.50: 2.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,33:0.32: 0.33:1.000:0.942 0/0/1/1:4:52,55:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,33:0.27: 1.09:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:48,29:0.37:-0.47:1.000:0.851 0/0/0/1:4:73,28:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,72:0.81:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,68:0.54: 1.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:88,26:0.22: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,33:0.34: 0.14:1.000:0.861 0/0/0/1:4:90,26:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,25:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,41:0.45:-0.07:1.000:0.982 0/0/1/1:4:62,65:0.50: 1.34:0.910:0.997 0/0/0/1:4:43,8:0.15:-1.42:1.000:0.991 0/0/0/1:4:93,32:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,23:0.33:-0.84:1.000:0.904 0/0/0/1:4:95,38:0.28: 1.56:1.000:0.996 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,16:0.16: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,29:0.21: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,23:0.29:-0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:52,13:0.20:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,26:0.32:-0.44:1.000:0.942 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,21:0.28:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,35:0.26: 1.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,50:0.44: 0.69:1.000:0.974 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,88:0.67: 1.20:1.000:0.938 0/0/1/1:4:60,54:0.46: 0.87:1.000:0.987 0/1/1/1:4:8,63:0.83:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,61:0.67:-0.15:1.000:0.917 0/0/0/1:4:74,31:0.29: 0.54:1.000:0.993 0/1/1/1:4:23,60:0.68:-0.25:1.000:0.956 0/0/0/1:4:55,17:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,23:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,26:0.43:-1.16:1.000:0.958 0/0/1/1:4:62,45:0.41: 0.62:1.000:0.852 0/0/1/1:4:54,71:0.55: 1.27:1.000:0.984 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,49:0.49: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,60:0.74:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,38:0.47:-0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,48:0.54:-0.18:1.000:0.986 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,18:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,31:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,52:0.66:-0.58:1.000:0.889 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,21:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,28:0.42:-0.91:1.000:0.905 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,35:0.44:-0.47:1.000:0.968 0/0/0/1:4:91,38:0.29: 1.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,55:0.66:-0.40:0.999:0.854 0/0/0/1:4:72,18:0.20: 0.00:1.000:1.000 0/0/0:3:46,4:0.08:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,53:0.54: 0.14:1.000:0.986 0/0/1/1:4:52,40:0.42: 0.07:1.000:0.921 0/0/0/1:4:76,26:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,24:0.31:-0.51:1.000:0.977 0/0/1/1:4:30,39:0.54:-0.76:1.000:0.986 0/0/1/1:4:47,34:0.41:-0.33:1.000:0.847 0/0/0/1:4:56,17:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,97:0.75: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,37:0.34: 0.54:1.000:0.853 0/0/1/1:4:44,47:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,43:0.43: 0.22:1.000:0.957 0/0/0/1/1:5:67,53:0.43: 1.09:0.988:0.943 0/0/1/1:4:50,63:0.54: 0.83:1.000:0.990 0/0/0/1:4:51,23:0.30:-0.58:1.000:0.983 0/0/1/1:4:47,44:0.47: 0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,25:0.40:-1.09:1.000:0.826 0/0/0/1:4:58,20:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,12:0.22:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,21:0.17: 1.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,20:0.29:-0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:37,60:0.59: 0.25:1.000:0.865 0/0/1/1:4:49,64:0.54: 0.83:1.000:0.985 0/0/0/1:4:63,17:0.21:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,47:0.54:-0.25:1.000:0.985 0/0/0/1:4:51,14:0.21:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,55:0.57: 0.07:1.000:0.942 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,29:0.57:-1.49:1.000:0.955 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,39:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/1:4:62,20:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,38:0.42:-0.07:1.000:0.910 0/0/1/1:4:46,50:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,28:0.32:-0.15:1.000:0.961 0/1/1/1:4:27,63:0.66: 0.00:1.000:0.876 0/0/0/1:4:14,7:0.32:-2.50:1.000:0.942 0/1/1/1:4:8,39:0.78:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,39:0.35: 0.65:1.000:0.784 0/0/1/1:4:41,38:0.47:-0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,29:0.42:-0.84:1.000:0.914 0/0/0/1:4:87,26:0.22: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,15:0.18:-0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,74:0.67: 0.51:1.000:0.925 0/0/0/1:4:61,22:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,65:0.70:-0.11:1.000:0.987 0/1/1/1:4:26,72:0.69: 0.29:1.000:0.976 0/0/0/1:4:56,23:0.28:-0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,21:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,21:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,42:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,33:0.41:-0.44:1.000:0.867 0/0/1/1:4:30,39:0.54:-0.76:1.000:0.986 0/0/1/1:4:44,37:0.44:-0.33:1.000:0.972 0/0/0/1:4:55,17:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,21:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,62:0.53: 0.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,43:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,54:0.47: 0.80:1.000:0.991 0/0/1/1:4:35,37:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,72:0.47: 2.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,40:0.44:-0.04:1.000:0.960 0/0/1/1:4:59,62:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,59:0.67:-0.25:1.000:0.923 0/0/0/1:4:71,20:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,68:0.51: 1.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,48:0.44: 0.58:1.000:0.966 0/0/0/1:4:75,28:0.26: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,28:0.50:-1.31:1.000:0.997 -chr1.1 53207743 chr1.1_053207743 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:152,175:0.54: 0.74:1.000:0.986 0/0/0/1:4:205,63:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,161:0.57:-0.06:1.000:0.933 0/1/1/1:4:75,199:0.73:-0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,282:0.77: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,152:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,57:0.28:-1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,117:0.46:-0.54:1.000:0.990 0/1/1/1:4:77,188:0.71:-0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:121,119:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,89:0.46:-1.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:165,115:0.42:-0.12:1.000:0.918 0/1/1/1:4:78,224:0.74: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,231:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,120:0.44:-0.16:1.000:0.969 0/0/1/1:4:137,118:0.47:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:177,147:0.46: 0.69:0.998:0.989 0/0/1/1:4:133,176:0.58: 0.41:1.000:0.931 0/0/0/1:4:278,87:0.25: 1.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,179:0.50: 1.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,93:0.48:-1.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:224,76:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,257:0.76: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:288,1:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,26:0.21:-2.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,138:0.47: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,109:0.52:-1.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:146,134:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,177:0.53: 0.97:1.000:0.992 0/1/1/1:4:68,188:0.74:-0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,143:0.46: 0.58:1.000:0.987 0/0/0/1:4:174,62:0.28:-0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,62:0.78:-3.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,140:0.72:-1.68:1.000:0.996 0/1/1:3:43,69:0.62:-3.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,145:0.54:-0.30:1.000:0.985 0/0/0/0:4:289,1:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,163:0.52: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:184,156:0.47: 0.98:1.000:0.991 0/0/1/1:4:152,149:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:253,63:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,99:0.32: 0.71:1.000:0.959 0/0/1/1:4:164,183:0.53: 1.11:1.000:0.990 0/1/1/1:4:72,195:0.73:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:293,88:0.25: 1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,218:0.71: 0.43:1.000:0.989 0/0/0/0:4:350,1:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.27:-4.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,134:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,196:0.78:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,139:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,86:0.26: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,148:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,147:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,128:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,201:0.71:-0.01:1.000:0.989 0/1/1/1:4:64,193:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,182:0.53: 1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:156,129:0.46:-0.03:1.000:0.989 0/0/0/1/1/1:6:153,107:0.42:-0.49:1.000:0.534 0/0/1/1:4:170,179:0.52: 1.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,199:0.69: 0.06:1.000:0.972 0/0/1/1:4:196,184:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:248,76:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,178:0.57: 0.58:1.000:0.956 0/0/1/1:4:128,124:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,131:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,128:0.46:-0.10:1.000:0.990 0/0/0/1:4:241,106:0.32: 1.11:0.910:0.957 0/0/1/1:4:128,120:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:392,0:0.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,56:0.29:-1.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:205,184:0.48: 1.89:1.000:0.995 0/0/0/1:4:239,73:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,192:0.71:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:163,149:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:238,67:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,83:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,229:0.73: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:247,67:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,138:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,153:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,77:0.25: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,139:0.52:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:180,137:0.44: 0.56:1.000:0.970 0/0/1/1:4:172,155:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,104:0.47:-1.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:218,77:0.28: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,161:0.53: 0.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:147,139:0.49:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,199:0.75:-0.40:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:346,1:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,139:0.69:-1.54:1.000:0.970 0/1/1/1:4:87,296:0.77: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,158:0.48: 0.89:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,58:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,157:0.56:-0.03:1.000:0.971 0/0/1/1:4:159,127:0.45:-0.01:1.000:0.983 0/0/1/1:4:184,149:0.46: 0.86:1.000:0.985 0/0/1/1:4:116,119:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,159:0.51: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,93:0.42:-1.10:1.000:0.914 0/0/1/1:4:173,144:0.46: 0.56:1.000:0.989 0/0/1/1:4:154,123:0.45:-0.18:1.000:0.983 0/0/1/1:4:157,129:0.46:-0.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:134,121:0.48:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:241,74:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:106,261:0.71: 1.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:145,169:0.54: 0.51:1.000:0.984 0/0/1/1:4:152,134:0.48:-0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:192,192:0.51: 1.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,135:0.49:-0.10:0.999:0.996 0/0/1/1:4:148,153:0.52: 0.27:1.000:0.996 0/1/1:3:50,101:0.67:-2.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,150:0.46: 0.80:1.000:0.990 0/0/1/1:4:120,110:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,149:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:158,127:0.45:-0.03:1.000:0.984 0/0/1/1:4:148,127:0.47:-0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:160,145:0.48: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,134:0.48:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:102,252:0.71: 1.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,160:0.55: 0.19:1.000:0.984 0/1/1/1:4:85,184:0.69:-0.32:1.000:0.968 0/0/1/1:4:148,156:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/1/1/1/1:5:72,320:0.82: 1.94:0.988:0.998 0/0/0/1:4:184,72:0.30:-0.56:1.000:0.989 0/0/0/1:4:190,60:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,109:0.47:-0.91:1.000:0.992 0/1/1/1:4:65,224:0.78: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,202:0.74:-0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:155,43:0.23:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,137:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,135:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,281:0.76: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,179:0.58: 0.51:1.000:0.929 0/1/1/1:4:89,213:0.71: 0.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:54,169:0.76:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,77:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:255,73:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,135:0.47: 0.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:69,198:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,120:0.52:-1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:170,180:0.52: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,170:0.52: 0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,144:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,123:0.49:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,164:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:208,57:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,165:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,195:0.72:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,90:0.50:-1.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,196:0.79:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:344,2:0.01: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,188:0.72:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:244,98:0.30: 1.02:1.000:0.985 0/0/0/0:4:350,4:0.01: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,130:0.52:-0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:153,150:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,120:0.55:-1.21:1.000:0.980 0/1/1/1:4:55,146:0.73:-1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,138:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:239,61:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,130:0.58:-1.08:1.000:0.929 0/0/1/1:4:150,120:0.45:-0.30:1.000:0.983 0/0/0/1:4:216,86:0.30: 0.28:1.000:0.986 0/0/0/1:4:211,62:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,69:0.26:-0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,263:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,100:0.45:-1.13:1.000:0.983 0/1/1/1:4:43,154:0.78:-1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,230:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:177,70:0.30:-0.73:1.000:0.987 0/0/1/1:4:135,121:0.48:-0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,131:0.52:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,159:0.52: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:173,166:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:210,73:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,167:0.62:-0.27:1.000:0.586 0/0/1/1:4:173,155:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:82,255:0.76: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,181:0.54: 1.02:1.000:0.990 0/0/0/0:4:252,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,147:0.49: 0.36:1.000:0.996 -chr1.1 53252858 chr1.1_053252858 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:39,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:128,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.68:0.998:. ./.:4:33,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.45:1.000:. ./.:3:14,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:108,0:.: 1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.37:1.000:. ./.:6:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:137,0:.: 2.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:97,0:.: 1.30:1.000:. ./.:3:59,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.39:1.000:. ./.:5:99,0:.: 1.37:0.988:. ./.:4:41,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:137,1:.: 2.80:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:87,0:.: 0.93:1.000:. -chr1.1 53507789 chr1.1_053507789 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,260:.: 0.75:1.000:. ./.:4:61,169:.:-0.97:1.000:. ./.:4:144,195:.: 0.58:1.000:. ./.:4:73,250:.: 0.35:1.000:. ./.:4:158,191:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,392:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,254:.: 0.48:1.000:. ./.:4:162,148:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,79:.:-2.72:1.000:. ./.:4:42,67:.:-2.69:1.000:. ./.:4:85,271:.: 0.82:1.000:. ./.:4:98,262:.: 0.88:1.000:. ./.:4:142,182:.: 0.36:1.000:. ./.:4:71,242:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,342:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,266:.: 0.89:0.998:. ./.:4:243,103:.: 0.68:1.000:. ./.:4:93,298:.: 1.32:1.000:. ./.:4:85,305:.: 1.30:1.000:. ./.:4:29,77:.:-2.73:1.000:. ./.:4:100,265:.: 0.95:1.000:. ./.:4:180,198:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,84:.:-2.89:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.18:1.000:. ./.:4:79,268:.: 0.69:1.000:. ./.:4:137,160:.:-0.02:1.000:. ./.:4:79,298:.: 1.12:1.000:. ./.:4:83,268:.: 0.75:1.000:. ./.:4:178,176:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,378:.: 1.13:1.000:. ./.:4:20,54:.:-3.18:1.000:. ./.:4:25,105:.:-2.39:1.000:. ./.:3:19,23:.:-3.64:1.000:. ./.:4:184,178:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,330:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.73:1.000:. ./.:4:69,211:.:-0.26:1.000:. ./.:4:72,259:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,278:.:-0.29:1.000:. ./.:4:44,195:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.17:1.000:. ./.:4:164,150:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,386:.: 1.24:1.000:. ./.:4:142,487:.: 4.69:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,124:.:-0.27:1.000:. ./.:4:93,120:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,371:.: 1.05:1.000:. ./.:4:62,209:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.56:1.000:. ./.:4:69,236:.: 0.09:1.000:. ./.:4:140,167:.: 0.12:1.000:. ./.:4:132,132:.:-0.49:1.000:. ./.:4:67,215:.:-0.23:1.000:. ./.:4:87,237:.: 0.36:1.000:. ./.:6:38,212:.:-0.69:1.000:. ./.:4:72,225:.:-0.02:1.000:. ./.:4:74,239:.: 0.21:1.000:. ./.:4:69,204:.:-0.36:1.000:. ./.:4:64,170:.:-0.91:1.000:. ./.:4:138,172:.: 0.17:1.000:. ./.:4:140,160:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,149:.:-1.34:1.000:. ./.:4:81,230:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.72:0.910:. ./.:4:64,176:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,213:.:-1.21:1.000:. ./.:4:77,221:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,252:.: 0.59:1.000:. ./.:4:171,173:.: 0.65:1.000:. ./.:4:75,228:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,183:.:-0.57:1.000:. ./.:4:56,210:.:-0.46:1.000:. ./.:4:114,164:.:-0.29:1.000:. ./.:4:75,263:.: 0.56:1.000:. ./.:4:58,190:.:-0.71:1.000:. ./.:4:66,246:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,375:.: 1.09:1.000:. ./.:4:110,141:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.91:1.000:. ./.:4:59,228:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,292:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,228:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,198:.:-0.62:1.000:. ./.:4:133,123:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.41:1.000:. ./.:4:113,111:.:-1.06:1.000:. ./.:4:157,153:.: 0.17:1.000:. ./.:4:72,214:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,198:.:-0.69:1.000:. ./.:4:55,183:.:-0.86:1.000:. ./.:4:165,162:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.46:1.000:. ./.:4:74,234:.: 0.14:1.000:. ./.:4:105,105:.:-1.25:1.000:. ./.:4:59,244:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.05:1.000:. ./.:4:122,136:.:-0.57:1.000:. ./.:4:80,221:.: 0.04:1.000:. ./.:4:88,303:.: 1.32:1.000:. ./.:4:137,162:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,190:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,307:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.37:0.999:. ./.:4:159,198:.: 0.83:1.000:. ./.:3:104,69:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,348:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,190:.:-0.60:1.000:. ./.:4:65,204:.:-0.42:1.000:. ./.:4:119,125:.:-0.77:1.000:. ./.:4:61,206:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.54:1.000:. ./.:4:93,117:.:-1.25:1.000:. ./.:4:65,238:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,275:.: 0.86:1.000:. ./.:4:127,137:.:-0.49:1.000:. ./.:4:69,236:.: 0.09:1.000:. ./.:5:176,217:.: 1.34:0.988:. ./.:4:72,189:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,191:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,228:.:-1.00:1.000:. ./.:4:62,214:.:-0.32:1.000:. ./.:4:161,175:.: 0.53:1.000:. ./.:4:44,166:.:-1.25:1.000:. ./.:4:70,191:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,228:.:-0.15:1.000:. ./.:4:101,329:.: 1.87:1.000:. ./.:4:75,228:.: 0.07:1.000:. ./.:4:117,119:.:-0.88:1.000:. ./.:4:59,182:.:-0.81:1.000:. ./.:4:53,166:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.15:1.000:. ./.:4:132,115:.:-0.73:1.000:. ./.:4:160,154:.: 0.22:1.000:. ./.:4:114,114:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,352:.: 0.76:1.000:. ./.:4:93,291:.: 1.22:1.000:. ./.:4:135,151:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,231:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,386:.: 1.24:1.000:. ./.:4:87,189:.:-0.32:1.000:. ./.:4:78,265:.: 0.63:1.000:. ./.:4:155,155:.: 0.17:1.000:. ./.:4:33,64:.:-2.86:1.000:. ./.:4:53,215:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,374:.: 1.07:1.000:. ./.:4:89,276:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.97:1.000:. ./.:4:2,310:.: 0.19:1.000:. ./.:4:148,151:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.56:1.000:. ./.:4:120,131:.:-0.67:1.000:. ./.:4:74,194:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,287:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,237:.: 0.31:1.000:. ./.:4:84,294:.: 1.13:1.000:. ./.:4:79,225:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,210:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.22:1.000:. ./.:4:155,160:.: 0.24:1.000:. ./.:4:73,208:.:-0.25:1.000:. ./.:4:121,128:.:-0.70:1.000:. ./.:4:75,222:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,207:.:-0.49:1.000:. ./.:4:61,208:.:-0.42:1.000:. ./.:4:94,306:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,379:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,263:.: 0.46:1.000:. ./.:4:97,323:.: 1.73:1.000:. ./.:4:90,322:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,405:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,248:.: 0.25:1.000:. -chr1.1 53727670 chr1.1_053727670 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:316,94:.: 0.45:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:304,94:.: 0.27:1.000:. ./.:4:259,85:.:-0.52:1.000:. ./.:4:289,113:.: 0.33:1.000:. ./.:4:345,120:.: 1.26:1.000:. ./.:4:237,63:.:-1.17:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:148,43:.:-2.78:1.000:. ./.:4:150,125:.:-1.54:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:304,77:.: 0.02:1.000:. ./.:4:279,96:.:-0.07:1.000:. ./.:4:308,107:.: 0.52:1.000:. ./.:4:304,103:.: 0.41:0.998:. ./.:4:416,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:358,118:.: 1.42:1.000:. ./.:4:296,115:.: 0.46:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:254,103:.:-0.33:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:205,175:.: 0.01:1.000:. ./.:4:137,39:.:-3.00:1.000:. ./.:4:327,105:.: 0.77:1.000:. ./.:4:183,186:.:-0.15:1.000:. ./.:4:258,104:.:-0.26:1.000:. ./.:4:320,92:.: 0.48:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:338,117:.: 1.11:1.000:. ./.:4:270,91:.:-0.27:1.000:. ./.:4:131,11:.:-3.50:1.000:. ./.:4:219,2:.:-2.34:1.000:. ./.:3:114,1:.:-3.90:1.000:. ./.:4:307,106:.: 0.49:1.000:. ./.:4:218,164:.: 0.04:1.000:. ./.:4:283,109:.: 0.18:1.000:. ./.:4:354,106:.: 1.19:1.000:. ./.:4:304,102:.: 0.39:1.000:. ./.:4:200,189:.: 0.14:1.000:. ./.:4:323,108:.: 0.76:1.000:. ./.:4:368,119:.: 1.58:1.000:. ./.:4:311,86:.: 0.26:1.000:. ./.:4:378,107:.: 1.56:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:214,195:.: 0.43:1.000:. ./.:4:93,117:.:-2.50:1.000:. ./.:4:319,99:.: 0.57:1.000:. ./.:4:466,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:272,114:.: 0.10:1.000:. ./.:4:224,262:.: 1.57:1.000:. ./.:4:248,97:.:-0.51:1.000:. ./.:4:299,99:.: 0.27:1.000:. ./.:4:240,95:.:-0.66:1.000:. ./.:4:462,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:268,73:.:-0.57:1.000:. ./.:4:381,127:.: 1.89:1.000:. ./.:4:220,191:.: 0.46:1.000:. ./.:6:250,87:.:-0.63:1.000:. ./.:4:343,115:.: 1.16:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:345,115:.: 1.19:1.000:. ./.:4:344,101:.: 0.97:1.000:. ./.:4:335,119:.: 1.10:1.000:. ./.:4:313,85:.: 0.27:1.000:. ./.:4:242,67:.:-1.04:1.000:. ./.:4:277,88:.:-0.21:1.000:. ./.:4:342,111:.: 1.08:0.910:. ./.:4:292,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:265,212:.: 1.44:1.000:. ./.:4:219,171:.: 0.15:1.000:. ./.:4:510,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:222,183:.: 0.38:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:330,86:.: 0.54:1.000:. ./.:4:322,94:.: 0.54:1.000:. ./.:4:315,112:.: 0.70:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:208,203:.: 0.46:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:194,209:.: 0.35:1.000:. ./.:4:215,243:.: 1.16:1.000:. ./.:4:254,73:.:-0.77:1.000:. ./.:4:311,128:.: 0.88:1.000:. ./.:4:327,104:.: 0.76:1.000:. ./.:4:210,83:.:-1.27:1.000:. ./.:4:193,170:.:-0.24:1.000:. ./.:4:323,107:.: 0.74:1.000:. ./.:4:263,95:.:-0.32:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:257,80:.:-0.63:1.000:. ./.:4:208,216:.: 0.66:1.000:. ./.:4:234,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:354,98:.: 1.07:1.000:. ./.:4:171,223:.: 0.21:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:313,113:.: 0.69:1.000:. ./.:4:224,88:.:-0.99:1.000:. ./.:4:312,92:.: 0.36:1.000:. ./.:4:484,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:224,63:.:-1.36:1.000:. ./.:4:299,117:.: 0.54:1.000:. ./.:4:280,90:.:-0.14:1.000:. ./.:4:267,92:.:-0.30:1.000:. ./.:4:297,74:.:-0.13:1.000:. ./.:4:250,107:.:-0.33:1.000:. ./.:4:307,88:.: 0.23:1.000:. ./.:4:247,102:.:-0.45:1.000:. ./.:4:277,85:.:-0.26:1.000:. ./.:4:382,144:.: 2.16:1.000:. ./.:4:298,118:.: 0.54:0.999:. ./.:4:280,109:.: 0.14:1.000:. ./.:3:184,77:.:-1.75:1.000:. ./.:4:304,112:.: 0.54:1.000:. ./.:4:267,89:.:-0.35:1.000:. ./.:4:304,104:.: 0.42:1.000:. ./.:4:243,104:.:-0.48:1.000:. ./.:4:287,97:.: 0.07:1.000:. ./.:4:315,103:.: 0.57:1.000:. ./.:4:276,104:.: 0.01:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:327,93:.: 0.60:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:367,131:.: 1.75:1.000:. ./.:5:473,0:.: 1.38:0.988:. ./.:4:373,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:236,72:.:-1.05:1.000:. ./.:4:251,74:.:-0.80:1.000:. ./.:4:273,89:.:-0.26:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:200,71:.:-1.60:1.000:. ./.:4:224,219:.: 0.94:1.000:. ./.:4:253,82:.:-0.66:1.000:. ./.:4:350,143:.: 1.67:1.000:. ./.:4:296,116:.: 0.48:1.000:. ./.:4:280,93:.:-0.10:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:274,98:.:-0.11:1.000:. ./.:4:322,90:.: 0.48:1.000:. ./.:4:290,113:.: 0.35:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:198,85:.:-1.42:1.000:. ./.:4:354,102:.: 1.13:1.000:. ./.:4:330,123:.: 1.08:1.000:. ./.:4:233,90:.:-0.83:1.000:. ./.:4:252,84:.:-0.64:1.000:. ./.:4:271,95:.:-0.20:1.000:. ./.:4:160,157:.:-0.92:1.000:. ./.:4:307,88:.: 0.23:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:181,47:.:-2.23:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:211,212:.: 0.64:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:334,112:.: 0.98:1.000:. ./.:4:206,207:.: 0.49:1.000:. ./.:4:266,79:.:-0.51:1.000:. ./.:4:301,103:.: 0.36:1.000:. ./.:4:264,81:.:-0.51:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:255,100:.:-0.36:1.000:. ./.:4:213,176:.: 0.14:1.000:. ./.:4:207,203:.: 0.45:1.000:. ./.:4:266,97:.:-0.24:1.000:. ./.:4:185,160:.:-0.51:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:282,108:.: 0.15:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:229,83:.:-0.99:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:242,67:.:-1.04:1.000:. ./.:4:337,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:206,84:.:-1.32:1.000:. ./.:4:338,125:.: 1.23:1.000:. ./.:4:308,95:.: 0.35:1.000:. ./.:4:309,97:.: 0.39:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:292,101:.: 0.20:1.000:. ./.:4:360,126:.: 1.57:1.000:. ./.:4:334,104:.: 0.86:1.000:. ./.:4:150,146:.:-1.23:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.33:1.000:. -chr1.1 54336339 chr1.1_054336339 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:16,35:0.68:-0.41:1.000:0.940 0/0/1/1:4:7,12:0.60:-1.58:1.000:0.797 0/0/1/1:4:21,26:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,41:0.74:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,62:0.82: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,23:0.69:-1.07:1.000:0.974 0/0/1/1:4:5,4:0.42:-1.95:1.000:0.910 0/0/1/1:4:10,12:0.49:-1.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,18:0.83:-1.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,73:0.72: 1.46:1.000:0.994 1/1/1/1:4:6,94:0.94: 1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,28:0.65:-0.74:1.000:0.774 0/1/1/1:4:8,25:0.77:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,37:0.85:-0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,16:0.48:-1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,13:0.45:-1.29:1.000:0.974 0/1/1/1:4:10,27:0.74:-0.92:0.998:0.998 0/1/1/1:4:15,32:0.67:-0.56:1.000:0.911 0/0/0/1:4:39,13:0.28:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,27:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,45:0.60: 0.32:1.000:0.769 0/0/0/1:4:18,6:0.28:-1.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,56:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.30:-1.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:16,19:0.49:-0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,21:0.69:-1.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:13,11:0.43:-1.40:1.000:0.943 0/1/1/1:4:30,61:0.65: 1.06:1.000:0.819 0/1/1/1:4:7,20:0.75:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,9:0.42:-1.54:1.000:0.925 0/0/0/1:4:12,3:0.25:-1.73:1.000:0.999 1/1/1/1:4:4,61:0.94: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:9,79:0.90: 0.95:1.000:0.834 0/1/1:3:16,59:0.79: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,14:0.50:-1.36:1.000:0.997 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,34:0.69:-0.48:1.000:0.966 0/1/1/1:4:20,41:0.66:-0.04:1.000:0.839 0/0/1/1:4:13,10:0.41:-1.43:1.000:0.878 0/0/1/1:4:40,28:0.40: 0.21:1.000:0.756 0/0/0/1:4:45,22:0.34: 0.18:1.000:0.882 0/0/1/1:4:36,55:0.56: 1.06:1.000:0.964 0/1/1/1:4:13,61:0.83: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,44:0.44: 1.13:1.000:0.966 0/1/1/1:4:16,59:0.79: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,46:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,43:0.59: 0.25:1.000:0.877 1/1/1/1:4:10,92:0.91: 1.46:1.000:0.900 0/0/1/1:4:26,43:0.59: 0.25:1.000:0.877 0/0/1/1:4:22,19:0.43:-0.78:1.000:0.952 0/1/1/1:4:28,55:0.64: 0.76:1.000:0.716 0/1/1/1:4:30,57:0.63: 0.91:1.000:0.590 0/0/1/1:4:23,19:0.42:-0.74:1.000:0.931 0/1/1/1:4:13,77:0.86: 1.02:1.000:0.964 0/1/1/1:4:12,59:0.84: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,70:0.72: 1.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,67:0.66: 1.35:1.000:0.881 0/0/1/1/1/1:6:35,57:0.58: 1.09:1.000:0.500 0/1/1/1:4:34,76:0.68: 1.75:1.000:0.958 0/1/1/1:4:5,38:0.89:-0.70:1.000:0.544 0/1/1/1:4:27,66:0.71: 1.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:43,19:0.32:-0.01:1.000:0.947 0/0/1/1:4:36,54:0.56: 1.02:1.000:0.974 0/1/1/1:4:23,52:0.69: 0.47:1.000:0.965 0/0/1/1:4:26,31:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,56:0.51: 1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,30:0.40: 0.32:0.910:0.821 0/1/1/1:4:20,47:0.70: 0.18:1.000:0.982 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,17:0.32:-0.19:1.000:0.961 0/0/1/1:4:35,59:0.59: 1.17:1.000:0.839 0/0/1/1:4:29,18:0.38:-0.56:1.000:0.517 1/1/1/1:4:9,77:0.90: 0.87:1.000:0.786 0/0/1/1:4:17,31:0.62:-0.52:1.000:0.581 0/0/0/1:4:37,13:0.29:-0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:52,23:0.32: 0.47:1.000:0.946 0/1/1/1:4:17,75:0.82: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,25:0.37: 0.14:1.000:0.522 0/1/1/1:4:29,55:0.63: 0.80:1.000:0.583 0/1/1/1:4:32,77:0.70: 1.72:1.000:0.988 0/0/1/1:4:43,36:0.43: 0.62:1.000:0.938 0/0/1/1:4:18,25:0.53:-0.70:1.000:0.992 0/1/1/1:4:25,67:0.73: 1.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,58:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,44:0.72:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,21:0.36:-0.12:1.000:0.721 0/1/1/1:4:25,88:0.79: 1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,25:0.69:-0.96:1.000:0.968 0/1/1/1:4:17,50:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,45:0.77:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,17:0.71:-1.40:1.000:0.989 0/1/1/1:4:19,117:0.87: 2.71:1.000:0.942 0/1/1/1:4:27,74:0.74: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,27:0.36: 0.43:1.000:0.648 0/0/1/1:4:34,56:0.59: 1.02:1.000:0.885 0/1/1/1:4:40,91:0.69: 2.52:1.000:0.968 0/1/1/1:4:17,48:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,31:0.62:-0.52:1.000:0.581 0/0/1/1:4:29,40:0.53: 0.25:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,65:0.80: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,74:0.62: 1.94:1.000:0.622 0/1/1/1:4:19,56:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,45:0.63: 0.25:1.000:0.535 0/0/1/1:4:37,40:0.47: 0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:19,3:0.17:-1.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,71:0.84: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,33:0.60:-0.37:1.000:0.759 0/1/1/1:4:27,81:0.76: 1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,40:0.58: 0.10:1.000:0.926 0/1/1/1:4:37,82:0.68: 2.08:0.999:0.951 0/0/1/1:4:33,44:0.52: 0.54:1.000:0.996 0/1/1:3:17,48:0.75: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,59:0.62: 1.06:1.000:0.535 0/1/1/1:4:21,58:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,50:0.73: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,48:0.55: 0.69:1.000:0.984 0/1/1/1:4:27,60:0.68: 0.91:1.000:0.953 0/0/1/1:4:25,44:0.61: 0.25:1.000:0.716 0/0/1/1:4:41,59:0.54: 1.39:1.000:0.987 0/1/1/1:4:14,95:0.88: 1.72:1.000:0.830 0/1/1/1:4:13,26:0.65:-0.85:1.000:0.774 0/1/1/1:4:13,84:0.87: 1.28:1.000:0.900 0/1/1/1:4:30,73:0.71: 1.50:1.000:0.990 0/1/1/1/1:5:16,115:0.88: 2.52:0.988:0.947 0/0/1/1:4:24,37:0.56:-0.04:1.000:0.959 0/0/1/1:4:27,17:0.38:-0.67:1.000:0.549 0/0/1/1:4:23,42:0.62: 0.10:1.000:0.575 1/1/1/1:4:10,106:0.92: 1.97:1.000:0.981 0/1/1/1:4:11,25:0.69:-0.96:1.000:0.968 0/0/0/1:4:27,7:0.25:-1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,44:0.71:-0.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,36:0.70:-0.41:1.000:0.987 0/1/1/1:4:7,50:0.88:-0.19:1.000:0.720 0/1/1/1:4:25,71:0.75: 1.24:1.000:0.999 1/1/1/1:4:12,94:0.89: 1.61:1.000:0.550 0/1/1/1:4:11,66:0.86: 0.54:1.000:0.957 0/0/0/1:4:31,15:0.34:-0.59:1.000:0.891 0/0/1/1:4:44,31:0.40: 0.47:1.000:0.767 0/0/1/1:4:31,42:0.52: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,38:0.80:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,45:0.64: 0.21:1.000:0.702 0/0/1/1:4:30,54:0.61: 0.80:1.000:0.633 0/1/1/1:4:19,48:0.72: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,21:0.49:-0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,27:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,41:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,21:0.36:-0.12:1.000:0.721 0/0/1/1:4:21,36:0.60:-0.19:1.000:0.797 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,90:0.81: 1.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,23:0.69:-1.07:1.000:0.974 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,59:0.85: 0.29:1.000:0.989 0/0/0/1:4:39,16:0.31:-0.26:1.000:0.971 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,26:0.52:-0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,31:0.62:-0.52:1.000:0.581 0/0/1/1:4:14,10:0.40:-1.40:1.000:0.788 0/1/1/1:4:5,21:0.81:-1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,29:0.62:-0.63:1.000:0.606 0/0/0/1:4:39,20:0.35:-0.12:1.000:0.832 0/1/1/1:4:8,26:0.77:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,17:0.51:-1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,14:0.35:-0.78:1.000:0.818 0/0/0/1:4:28,13:0.33:-0.78:1.000:0.921 0/0/1/1:4:20,15:0.41:-0.99:1.000:0.851 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,20:0.49:-0.92:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,14:0.94:-1.73:1.000:0.999 1/1/1/1:4:6,49:0.90:-0.26:1.000:0.672 0/0/1/1:4:20,13:0.38:-1.07:1.000:0.617 0/0/1/1:4:21,23:0.47:-0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:9,22:0.71:-1.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,12:0.56:-1.54:1.000:0.974 0/1/1/1:4:17,34:0.65:-0.41:1.000:0.774 0/0/1/1:4:11,14:0.50:-1.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,31:0.78:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,29:0.60:-0.59:1.000:0.810 0/1/1/1:4:19,49:0.72: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,31:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,34:0.63:-0.37:1.000:0.566 -chr1.1 54507030 chr1.1_054507030 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:232,63:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,43:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,54:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,134:0.53:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:190,170:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,164:0.51: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,97:0.49:-1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,59:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:264,2:0.01:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,43:0.45:-2.90:1.000:0.975 0/1/1/1:4:26,43:0.64:-3.43:1.000:0.692 0/0/0/1:4:210,70:0.28: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:266,94:0.29: 1.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:152,143:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,193:0.70: 0.05:1.000:0.982 0/1/1/1:4:84,188:0.71:-0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:157,139:0.49: 0.26:0.998:0.996 0/0/1/1:4:163,194:0.56: 1.25:1.000:0.961 0/0/1/1:4:204,172:0.48: 1.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,273:0.76: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,23:0.19:-2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,145:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,212:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,15:0.24:-3.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,220:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,211:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,127:0.54:-0.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:186,156:0.48: 1.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:229,61:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,135:0.49: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,116:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,29:0.51:-3.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,19:0.17:-2.54:1.000:0.998 0/0/0:3:61,0:0.00:-3.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,80:0.28: 0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,191:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:167,142:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:129,114:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:96,193:0.68: 0.15:1.000:0.961 0/1/1/1:4:66,164:0.73:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,149:0.53: 0.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:83,228:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,110:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,151:0.49: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:238,63:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,255:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,46:0.51:-3.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,146:0.69:-1.02:1.000:0.970 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,53:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,234:0.72: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,132:0.47: 0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:199,147:0.45: 1.07:1.000:0.978 0/0/1/1:4:149,121:0.47:-0.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:266,60:0.21: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,127:0.47: 0.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:86,230:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,193:0.72:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:134,104:0.46:-0.68:1.000:0.800 0/0/1/1:4:157,155:0.52: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,160:0.56: 0.28:1.000:0.968 0/0/1/1:4:190,131:0.43: 0.67:1.000:0.952 0/0/1/1:4:146,113:0.46:-0.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:161,134:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,122:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,108:0.47:-0.62:1.000:0.992 0/0/1/1:4:154,129:0.48: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:160,131:0.47: 0.18:0.910:0.993 0/0/0/1:4:188,61:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,237:0.73: 0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:71,168:0.72:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:223,60:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,147:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:224,61:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,130:0.51:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,106:0.47:-0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,123:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/0:4:300,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,136:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:201,57:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,227:0.71: 0.78:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,321:1.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,59:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,158:0.73:-0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:187,146:0.46: 0.86:1.000:0.989 0/1/1/1:4:74,175:0.72:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,115:0.45:-0.18:1.000:0.981 0/1/1/1:4:73,200:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,140:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,122:0.46: 0.00:1.000:0.987 0/0/1/1:4:142,135:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:87,228:0.74: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,57:0.31:-1.25:1.000:0.978 0/0/0/1:4:280,95:0.28: 1.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,129:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,140:0.55:-0.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:132,112:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:247,61:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,214:0.70: 0.54:1.000:0.984 0/0/1/1:4:151,93:0.41:-0.59:1.000:0.835 0/0/0/1:4:253,84:0.28: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,53:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,171:0.53: 0.90:1.000:0.991 0/1/1/1:4:64,144:0.71:-1.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:68,199:0.76:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,72:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,126:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:223,190:0.48: 2.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:261,86:0.27: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,130:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:290,86:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,213:0.76: 0.10:0.999:1.000 0/0/1/1:4:159,145:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1:3:103,42:0.32:-2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,156:0.51: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,136:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,107:0.42:-0.11:1.000:0.898 0/0/1/1:4:176,158:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,134:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,127:0.48: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:162,119:0.45: 0.02:1.000:0.977 0/0/1/1:4:159,145:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,57:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:238,73:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,173:0.52: 1.11:1.000:0.995 0/0/0/0/0:5:395,0:0.00: 1.87:0.988:1.000 0/0/1/1:4:127,105:0.48:-0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,101:0.48:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,114:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,143:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:265,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,108:0.52:-0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,185:0.69:-0.11:1.000:0.977 0/0/0/1:4:216,61:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,180:0.49: 1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,150:0.52: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,113:0.48:-0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:196,62:0.27:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:135,103:0.46:-0.68:1.000:0.985 0/0/1/1:4:151,123:0.47:-0.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:226,76:0.28: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:221,75:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:195,60:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:200,152:0.46: 1.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:184,163:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:204,66:0.27:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,206:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,160:0.53: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:152,127:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:276,83:0.26: 1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:228,80:0.29: 0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:97,15:0.15:-2.73:1.000:0.988 0/0/1/1:4:114,112:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,216:0.76: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,88:0.28: 1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:214,177:0.48: 1.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:83,232:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,132:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:197,184:0.51: 1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,133:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,124:0.54:-0.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:62,181:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,215:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,177:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,133:0.42: 0.96:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,149:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,128:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:232,64:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,133:0.54:-0.36:1.000:0.989 0/0/0/0:4:262,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,64:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,102:0.47:-0.80:1.000:0.990 0/0/0/1:4:168,64:0.30:-0.78:1.000:0.983 0/1/1/1:4:65,158:0.72:-0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,243:0.74: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,152:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,155:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,140:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,168:0.48: 1.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:217,198:0.50: 2.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:196,180:0.50: 1.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,194:0.74:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,146:0.52: 0.23:1.000:0.995 -chr1.1 54605569 chr1.1_054605569 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:115,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.11:0.998:. ./.:4:95,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.90:1.000:. ./.:3:10,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.08:1.000:. ./.:6:71,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:0.910:. ./.:4:117,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:59,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:52,0:.:-0.61:1.000:. ./.:3:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.03:1.000:. ./.:5:141,0:.: 2.59:0.988:. ./.:4:60,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:128,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.22:1.000:. -chr1.1 54806633 chr1.1_054806633 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:288,89:.:-0.09:1.000:. ./.:4:351,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:373,118:.: 0.87:1.000:. ./.:4:203,154:.:-0.26:1.000:. ./.:4:377,189:.: 1.51:1.000:. ./.:4:257,103:.:-0.24:1.000:. ./.:4:208,96:.:-0.71:1.000:. ./.:4:309,83:.: 0.04:1.000:. ./.:4:357,140:.: 0.92:1.000:. ./.:4:181,75:.:-1.12:1.000:. ./.:4:236,103:.:-0.41:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:173,130:.:-0.72:1.000:. ./.:4:346,73:.: 0.26:1.000:. ./.:4:282,68:.:-0.32:1.000:. ./.:4:233,90:.:-0.55:1.000:. ./.:4:325,1:.:-0.52:0.998:. ./.:4:295,107:.: 0.12:1.000:. ./.:4:545,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:354,179:.: 1.23:1.000:. ./.:4:165,50:.:-1.46:1.000:. ./.:4:369,144:.: 1.06:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:402,81:.: 0.81:1.000:. ./.:4:188,28:.:-1.46:1.000:. ./.:4:234,155:.: 0.01:1.000:. ./.:4:295,91:.:-0.02:1.000:. ./.:4:408,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:319,172:.: 0.87:1.000:. ./.:4:195,133:.:-0.51:1.000:. ./.:4:568,76:.: 2.17:1.000:. ./.:4:279,81:.:-0.24:1.000:. ./.:4:84,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:167,78:.:-1.21:1.000:. ./.:3:82,44:.:-2.22:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:235,179:.: 0.22:1.000:. ./.:4:380,115:.: 0.91:1.000:. ./.:4:394,141:.: 1.25:1.000:. ./.:4:332,76:.: 0.17:1.000:. ./.:4:301,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:233,224:.: 0.59:1.000:. ./.:4:205,124:.:-0.50:1.000:. ./.:4:337,84:.: 0.28:1.000:. ./.:4:333,128:.: 0.62:1.000:. ./.:4:433,192:.: 2.01:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:410,67:.: 0.76:1.000:. ./.:4:354,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:353,86:.: 0.43:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:230,176:.: 0.15:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:352,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:374,175:.: 1.37:1.000:. ./.:4:341,121:.: 0.63:1.000:. ./.:6:278,56:.:-0.46:1.000:. ./.:4:297,75:.:-0.13:1.000:. ./.:4:196,110:.:-0.69:1.000:. ./.:4:404,216:.: 1.97:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:416,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:403,79:.: 0.80:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:283,170:.: 0.55:1.000:. ./.:4:370,146:.: 1.09:0.910:. ./.:4:241,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:476,174:.: 2.22:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:344,125:.: 0.69:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:294,108:.: 0.12:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:395,139:.: 1.24:1.000:. ./.:4:262,86:.:-0.34:1.000:. ./.:4:468,76:.: 1.32:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:315,140:.: 0.57:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:297,142:.: 0.43:1.000:. ./.:4:224,280:.: 0.98:1.000:. ./.:4:147,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:344,121:.: 0.65:1.000:. ./.:4:212,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:240,61:.:-0.74:1.000:. ./.:4:150,44:.:-1.64:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:442,94:.: 1.26:1.000:. ./.:4:224,47:.:-0.99:1.000:. ./.:4:347,222:.: 1.53:1.000:. ./.:4:353,74:.: 0.33:1.000:. ./.:4:354,196:.: 1.37:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:405,187:.: 1.73:1.000:. ./.:4:201,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:135,99:.:-1.30:1.000:. ./.:4:329,71:.: 0.10:1.000:. ./.:4:319,183:.: 0.97:1.000:. ./.:4:317,235:.: 1.39:1.000:. ./.:4:169,69:.:-1.27:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:324,60:.:-0.03:1.000:. ./.:4:411,66:.: 0.76:1.000:. ./.:4:240,275:.: 1.08:1.000:. ./.:4:383,157:.: 1.29:1.000:. ./.:4:319,211:.: 1.20:1.000:. ./.:4:400,96:.: 0.92:1.000:. ./.:4:221,236:.: 0.59:0.999:. ./.:4:385,165:.: 1.37:1.000:. ./.:3:275,133:.: 0.17:1.000:. ./.:4:216,67:.:-0.89:1.000:. ./.:4:218,2:.:-1.42:1.000:. ./.:4:273,119:.: 0.04:1.000:. ./.:4:401,138:.: 1.28:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:191,144:.:-0.45:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:216,81:.:-0.77:1.000:. ./.:4:323,230:.: 1.40:1.000:. ./.:4:305,219:.: 1.15:1.000:. ./.:4:333,72:.: 0.15:1.000:. ./.:5:316,85:.: 0.11:0.988:. ./.:4:374,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:327,103:.: 0.36:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:190,141:.:-0.48:1.000:. ./.:4:289,86:.:-0.11:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:303,59:.:-0.22:1.000:. ./.:4:239,191:.: 0.36:1.000:. ./.:4:272,173:.: 0.48:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:256,111:.:-0.18:1.000:. ./.:4:183,63:.:-1.20:1.000:. ./.:4:321,138:.: 0.60:1.000:. ./.:4:305,144:.: 0.52:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:296,142:.: 0.43:1.000:. ./.:4:330,54:.:-0.03:1.000:. ./.:4:217,97:.:-0.63:1.000:. ./.:4:353,266:.: 1.96:1.000:. ./.:4:414,165:.: 1.62:1.000:. ./.:4:293,212:.: 0.99:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:361,72:.: 0.38:1.000:. ./.:4:363,275:.: 2.12:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:146,37:.:-1.73:1.000:. ./.:4:126,48:.:-1.81:1.000:. ./.:4:420,137:.: 1.43:1.000:. ./.:4:198,199:.: 0.08:1.000:. ./.:4:350,181:.: 1.21:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:363,194:.: 1.43:1.000:. ./.:4:197,169:.:-0.18:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:164,94:.:-1.10:1.000:. ./.:4:203,125:.:-0.51:1.000:. ./.:4:392,82:.: 0.73:1.000:. ./.:4:304,84:.: 0.00:1.000:. ./.:4:280,68:.:-0.34:1.000:. ./.:4:278,117:.: 0.06:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:272,228:.: 0.95:1.000:. ./.:4:179,74:.:-1.14:1.000:. ./.:4:288,204:.: 0.88:1.000:. ./.:4:231,101:.:-0.47:1.000:. ./.:4:187,94:.:-0.90:1.000:. ./.:4:263,69:.:-0.47:1.000:. ./.:4:272,107:.:-0.07:1.000:. ./.:4:258,75:.:-0.46:1.000:. ./.:4:371,267:.: 2.12:1.000:. ./.:4:215,268:.: 0.81:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:246,103:.:-0.33:1.000:. ./.:4:307,77:.:-0.03:1.000:. ./.:4:271,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:272,99:.:-0.14:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.01:1.000:. -chr1.1 54850273 chr1.1_054850273 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,430:.: 1.80:1.000:. ./.:4:45,216:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,312:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,340:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,404:.: 1.39:1.000:. ./.:4:1,353:.: 0.63:1.000:. ./.:4:53,183:.:-1.16:1.000:. ./.:4:70,226:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.28:1.000:. ./.:4:33,160:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,177:.:-2.06:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,352:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,307:.:-0.08:1.000:. ./.:4:86,231:.: 0.07:1.000:. ./.:4:60,233:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,290:.: 0.78:0.998:. ./.:4:75,294:.: 0.86:1.000:. ./.:4:105,326:.: 1.80:1.000:. ./.:4:79,277:.: 0.66:1.000:. ./.:4:52,149:.:-1.70:1.000:. ./.:4:69,221:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,403:.: 1.37:1.000:. ./.:4:57,253:.:-0.04:1.000:. ./.:4:88,143:.:-1.24:1.000:. ./.:4:88,270:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,279:.:-0.51:1.000:. ./.:4:65,226:.:-0.33:1.000:. ./.:4:101,332:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,342:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,284:.: 0.68:1.000:. ./.:4:67,227:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,153:.:-2.43:1.000:. ./.:4:0,209:.:-1.57:1.000:. ./.:3:0,119:.:-2.94:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.43:1.000:. ./.:4:80,241:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,319:.: 0.10:1.000:. ./.:4:70,250:.: 0.11:1.000:. ./.:4:69,236:.:-0.12:1.000:. ./.:4:74,200:.:-0.59:1.000:. ./.:4:78,293:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,308:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,280:.: 0.74:1.000:. ./.:4:87,284:.: 0.89:1.000:. ./.:4:91,326:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,58:.:-3.87:1.000:. ./.:4:62,203:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,208:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,297:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,405:.: 1.41:1.000:. ./.:4:62,200:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,316:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,244:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.39:1.000:. ./.:4:79,265:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,304:.:-0.12:1.000:. ./.:6:22,170:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.33:1.000:. ./.:4:85,198:.:-0.45:1.000:. ./.:4:95,274:.: 0.86:1.000:. ./.:4:82,203:.:-0.42:1.000:. ./.:4:82,253:.: 0.34:1.000:. ./.:4:68,259:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,204:.:-1.65:1.000:. ./.:4:73,236:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,249:.: 0.13:0.910:. ./.:4:0,317:.: 0.07:1.000:. ./.:4:85,295:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,413:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,237:.:-1.13:1.000:. ./.:4:65,245:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,241:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,282:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,333:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1,247:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,379:.: 1.01:1.000:. ./.:4:84,275:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,346:.: 0.51:1.000:. ./.:4:75,197:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,399:.: 1.31:1.000:. ./.:4:47,160:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.62:1.000:. ./.:4:62,210:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,198:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,259:.: 0.22:1.000:. ./.:4:74,206:.:-0.50:1.000:. ./.:4:55,209:.:-0.74:1.000:. ./.:4:69,245:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,277:.:-0.53:1.000:. ./.:4:56,166:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,257:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.45:1.000:. ./.:4:81,289:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,244:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.08:1.000:. ./.:4:66,214:.:-0.50:1.000:. ./.:4:54,233:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,268:.:-0.68:1.000:. ./.:4:63,227:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,517:.: 3.11:1.000:. ./.:4:0,388:.: 1.15:1.000:. ./.:4:78,207:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,413:.: 1.53:1.000:. ./.:4:77,227:.:-0.13:0.999:. ./.:4:85,252:.: 0.37:1.000:. ./.:3:7,149:.:-2.38:1.000:. ./.:4:0,383:.: 1.07:1.000:. ./.:4:70,228:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.36:1.000:. ./.:4:76,244:.: 0.11:1.000:. ./.:4:64,218:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,319:.: 0.10:1.000:. ./.:4:71,193:.:-0.74:1.000:. ./.:4:90,230:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,261:.:-0.05:1.000:. ./.:4:90,241:.: 0.28:1.000:. ./.:5:0,341:.: 0.43:0.988:. ./.:4:113,145:.:-0.83:1.000:. ./.:4:59,150:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,278:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,153:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,468:.: 2.36:1.000:. ./.:4:87,233:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.69:1.000:. ./.:4:58,219:.:-0.54:1.000:. ./.:4:85,248:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,247:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,224:.:-1.35:1.000:. ./.:4:1,447:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,454:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.80:1.000:. ./.:4:86,271:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,389:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,155:.:-2.40:1.000:. ./.:4:64,210:.:-0.59:1.000:. ./.:4:90,253:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,396:.: 1.27:1.000:. ./.:4:88,322:.: 1.48:1.000:. ./.:4:66,288:.: 0.63:1.000:. ./.:4:62,249:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.55:1.000:. ./.:4:60,251:.:-0.02:1.000:. ./.:4:68,234:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,231:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,231:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.93:1.000:. ./.:4:57,217:.:-0.59:1.000:. ./.:4:154,150:.:-0.13:1.000:. ./.:4:82,288:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.04:1.000:. ./.:4:73,232:.:-0.12:1.000:. ./.:4:57,186:.:-1.06:1.000:. ./.:4:63,241:.:-0.13:1.000:. ./.:4:80,270:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1,353:.: 0.63:1.000:. ./.:4:74,263:.: 0.37:1.000:. ./.:4:26,301:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,402:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,460:.: 2.24:1.000:. ./.:4:68,215:.:-0.45:1.000:. ./.:4:93,293:.: 1.12:1.000:. -chr1.1 55078568 chr1.1_055078568 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.47:1.000:. ./.:6:14,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,1:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,1:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.50:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.93:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.96:1.000:. -chr1.1 55541494 chr1.1_055541494 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:67,197:0.74: 0.94:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,188:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,78:0.42:-0.54:1.000:0.896 0/0/1/1:4:124,111:0.46: 0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:256,73:0.22: 2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,137:0.53: 0.72:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,119:0.83:-1.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,159:0.71: 0.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:46,162:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,6:0.10:-2.79:1.000:0.884 0/0/0/1:4:40,15:0.27:-2.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,143:0.72:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,112:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,49:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,61:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,122:0.48: 0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:70,148:0.67: 0.09:0.998:0.914 0/1/1/1:4:73,204:0.73: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,160:0.48: 2.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:207,68:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,65:0.85:-2.53:1.000:0.989 0/0/1/1:4:118,126:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,176:0.71: 0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:82,105:0.55:-0.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:17,21:0.54:-3.23:1.000:0.987 0/0/1/1:4:94,101:0.51:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,61:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,136:0.54: 0.59:1.000:0.985 0/1/1/1:4:75,212:0.73: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,126:0.54: 0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:95,88:0.47:-0.56:1.000:0.992 0/1/1/1:4:39,135:0.77:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,19:0.67:-3.42:1.000:0.912 0/0/1/1:4:41,31:0.42:-2.60:1.000:0.922 0/1/1:3:9,23:0.71:-3.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,115:0.46: 0.61:1.000:0.986 0/0/1/1:4:97,100:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,122:0.48: 0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,131:0.74:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,57:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:174,54:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,160:0.71: 0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:116,136:0.53: 0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:96,92:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,179:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,166:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,171:0.58: 1.42:1.000:0.920 0/0/1/1:4:42,37:0.46:-2.48:1.000:0.987 0/0/1/1:4:114,85:0.42:-0.26:1.000:0.910 0/1/1/1:4:29,88:0.74:-1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,97:0.55:-0.76:1.000:0.977 0/0/0/1:4:179,83:0.31: 0.90:1.000:0.968 0/1/1/1:4:51,136:0.72:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,119:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,61:0.27: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,175:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,53:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:162,49:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,48:0.23:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:114,92:0.44:-0.13:1.000:0.661 0/0/0/1:4:159,65:0.29: 0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:117,122:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,176:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,105:0.55:-0.50:1.000:0.976 0/0/1/1:4:123,124:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,110:0.58:-0.48:1.000:0.925 0/0/0/1:4:106,38:0.26:-1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,192:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,158:0.70: 0.16:0.910:0.986 0/1/1/1:4:52,162:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,132:0.48: 1.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:111,45:0.29:-1.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,173:0.82:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,119:0.44: 0.96:1.000:0.967 0/1/1/1:4:64,164:0.71: 0.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:122,54:0.30:-0.69:1.000:0.982 0/0/1/1:4:105,90:0.45:-0.34:1.000:0.982 0/0/1/1:4:108,114:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,149:0.68: 0.05:1.000:0.952 0/0/1/1:4:99,109:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,131:0.71:-0.56:1.000:0.989 0/0/0/1:4:195,76:0.28: 1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,68:0.27: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,126:0.52: 0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,78:0.52:-1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,136:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,74:0.41:-0.69:1.000:0.879 0/0/1/1:4:103,88:0.45:-0.41:1.000:0.981 0/0/1/1:4:92,105:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:172,44:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,83:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:153,63:0.29: 0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:121,115:0.48: 0.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:53,146:0.72:-0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,192:0.77: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,159:0.79:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,130:0.59: 0.09:1.000:0.891 0/1/1/1:4:53,138:0.71:-0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:123,141:0.52: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,114:0.47: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,78:0.48:-1.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,175:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,96:0.55:-0.76:1.000:0.983 0/0/0/1:4:185,84:0.31: 1.03:1.000:0.975 0/0/1/1:4:89,93:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,107:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,95:0.45:-0.13:1.000:0.981 0/0/1/1:4:111,118:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:177,157:0.46: 2.23:1.000:0.988 0/0/1/1:4:96,122:0.55: 0.09:1.000:0.981 0/1/1/1:4:48,192:0.79: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,123:0.46: 0.90:1.000:0.987 0/0/1/1:4:138,116:0.45: 0.75:0.999:0.977 0/0/1/1:4:117,141:0.54: 0.83:1.000:0.990 0/0/1:3:59,36:0.37:-2.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,155:0.53: 1.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,156:0.75:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,37:0.21:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,98:0.52:-0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,168:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,117:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,114:0.54:-0.15:1.000:0.984 0/0/1/1:4:126,117:0.47: 0.55:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,188:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,176:0.80: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,205:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:55,235:0.80: 1.42:0.988:0.996 1/1/1/1:4:3,148:0.98:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,90:0.55:-0.96:1.000:0.982 0/0/1/1:4:86,71:0.44:-1.04:1.000:0.972 0/0/1/1:4:83,107:0.55:-0.43:1.000:0.978 0/1/1/1:4:55,148:0.72:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,56:0.45:-1.68:1.000:0.979 0/0/0/1:4:148,57:0.28:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,183:0.80: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,162:0.53: 1.60:1.000:0.993 0/1/1/1:4:71,154:0.67: 0.22:1.000:0.936 0/0/0/1:4:147,45:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,100:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,108:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,156:0.67: 0.27:1.000:0.935 0/0/1/1:4:139,105:0.42: 0.57:1.000:0.922 0/1/1/1:4:53,149:0.73:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,89:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,152:0.51: 1.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:275,88:0.24: 2.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,124:0.51: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,60:0.26: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:135,148:0.51: 1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,117:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,211:0.74: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,122:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,51:0.83:-2.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,100:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,114:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,140:0.53: 0.83:1.000:0.992 0/1/1/1:4:64,228:0.77: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,127:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,104:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,143:0.54: 0.88:1.000:0.990 0/0/1/1:4:111,110:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,99:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,110:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,102:0.44: 0.29:1.000:0.961 0/0/0/1:4:107,43:0.28:-1.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:156,61:0.28: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,40:0.25:-1.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,200:0.99:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,177:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,107:0.48: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,48:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,126:0.67:-0.54:1.000:0.937 0/0/1/1:4:111,108:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,104:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,119:0.68:-0.74:1.000:0.946 0/0/0/1:4:105,36:0.25:-1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,59:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,138:0.55: 0.64:1.000:0.984 0/1/1/1:4:56,176:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,128:0.56: 0.18:1.000:0.962 0/0/0/1:4:214,76:0.26: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,122:0.45: 0.94:1.000:0.982 0/0/1/1:4:147,158:0.51: 1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,113:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,192:0.77: 0.59:1.000:1.000 -chr1.1 55663565 chr1.1_055663565 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,4:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,2:.: 1.06:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:46,4:.: 0.77:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.92:1.000:. ./.:4:22,14:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,4:.: 1.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:33,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:31,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:40,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,4:.: 1.55:0.998:. ./.:4:16,6:.:-1.21:1.000:. ./.:4:31,10:.: 0.14:1.000:. ./.:4:46,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.62:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:39,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:28,6:.:-0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:53,3:.: 1.20:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:37,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:38,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:48,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:41,5:.: 0.49:1.000:. ./.:4:24,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.55:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.34:1.000:. ./.:3:10,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,6:.:-1.00:1.000:. ./.:4:34,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:33,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:46,2:.: 0.63:1.000:. ./.:4:55,5:.: 1.48:1.000:. ./.:4:27,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,14:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,11:.: 1.13:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:21,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:23,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:44,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:34,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:48,5:.: 0.99:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.56:1.000:. ./.:6:23,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:27,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:42,4:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.78:1.000:. ./.:4:44,12:.: 1.20:1.000:. ./.:4:48,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:29,4:.:-0.43:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:17,10:.:-0.85:0.910:. ./.:4:31,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:16,8:.:-1.07:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.35:1.000:. ./.:4:25,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,9:.:-1.00:1.000:. ./.:4:29,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.42:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:37,3:.: 0.07:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.92:1.000:. ./.:4:50,5:.: 1.13:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:34,7:.: 0.14:1.000:. ./.:4:40,6:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.42:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:29,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,5:.: 0.00:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.21:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.64:1.000:. ./.:4:25,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:58,4:.: 1.62:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.92:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,6:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,7:.: 0.21:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.78:1.000:. ./.:4:71,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:43,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:38,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.08:0.999:. ./.:4:50,4:.: 1.06:1.000:. ./.:3:19,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:36,9:.: 0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.35:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,3:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,4:.:-1.14:1.000:. ./.:4:35,6:.: 0.14:1.000:. ./.:4:51,3:.: 1.06:1.000:. ./.:4:32,6:.:-0.08:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.43:1.000:. ./.:5:51,0:.: 0.85:0.988:. ./.:4:11,11:.:-1.21:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.92:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:9,6:.:-1.70:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,6:.:-0.36:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.71:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:31,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:49,6:.: 1.13:1.000:. ./.:4:56,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:51,4:.: 1.13:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:34,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,6:.: 0.56:1.000:. ./.:4:66,4:.: 2.19:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:38,3:.: 0.14:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:47,3:.: 0.77:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:45,4:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:33,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:44,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:40,4:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.85:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.15:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:41,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,4:.: 0.63:1.000:. ./.:4:43,6:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,4:.: 0.70:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:48,4:.: 0.92:1.000:. ./.:4:66,5:.: 2.26:1.000:. ./.:4:62,5:.: 1.98:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:39,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:56,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,4:.:-0.57:1.000:. -chr1.1 56166196 chr1.1_056166196 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:144,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:151,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:157,2:.: 0.86:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.46:0.998:. ./.:4:118,9:.: 0.03:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:168,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.21:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:160,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:178,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.47:1.000:. ./.:6:92,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.18:0.910:. ./.:4:138,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:134,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:214,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:3:69,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.04:1.000:. ./.:5:154,0:.: 0.73:0.988:. ./.:4:99,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.01:0.999:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.08:1.000:. -chr1.1 56238297 chr1.1_056238297 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:166,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:202,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:262,0:.: 2.03:0.998:. ./.:4:238,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:54,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.94:1.000:. ./.:3:38,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.92:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:169,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:297,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.05:1.000:. ./.:6:86,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.39:0.910:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:77,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.50:0.999:. ./.:4:219,0:.: 1.33:1.000:. ./.:3:78,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:261,0:.: 2.02:1.000:. ./.:5:174,0:.: 0.60:0.988:. ./.:4:131,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:261,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:67,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.32:0.999:. ./.:4:160,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.68:1.000:. -chr1.1 56493802 chr1.1_056493802 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,5:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,6:0.57:-0.83:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,6:0.57:-0.83:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:1,3:0.48:-0.95:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,3:0.21: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,5:0.26: 1.72:0.998:0.999 0/0/0/1:4:52,10:0.29: 1.43:1.000:0.994 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,3:0.21: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,4:0.25: 1.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,5:0.26: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,3:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,6:0.57:-0.83:1.000:0.943 0/0/0/1:4:57,7:0.27: 1.51:1.000:0.998 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,4:0.25: 1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,3:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:48,3:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,3:0.21: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,2:0.25: 0.08:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,4:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,4:0.46:-0.87:1.000:0.984 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,1:0.07: 1.35:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,3:0.26: 0.32:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,4:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:11,4:0.32:-0.50:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,2:0.19: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,2:0.17: 0.98:1.000:0.998 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,4:0.25: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,1:0.09: 0.81:1.000:0.917 0/0/1/1:4:1,2:0.46:-0.99:1.000:0.984 0/0/0/1:4:47,2:0.18: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,1:0.10: 0.73:0.910:0.858 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.40:-0.95:1.000:0.782 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.31:-0.95:1.000:0.965 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,4:0.26: 0.81:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:18,1:0.23:-0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,5:0.28: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/0:4:48,1:0.09: 0.90:1.000:0.951 0/0/0/1:4:28,2:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.40:-0.87:1.000:0.782 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,4:0.26: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,6:0.27: 1.06:1.000:0.998 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,1:0.09: 0.81:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,2:0.16: 1.14:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.46:-0.99:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,2:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,3:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.40:-1.03:1.000:0.782 0/0/0/1:4:51,4:0.26: 1.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,1:0.09: 0.86:0.999:0.936 0/0/0/1:4:62,2:0.14: 1.51:1.000:0.954 0/0/1:3:9,3:0.31:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,4:0.26: 1.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,4:0.25: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,1:0.10: 0.73:1.000:0.858 0/0/1/1:4:2,5:0.47:-0.83:1.000:0.993 0/0/0/1:4:35,1:0.12: 0.36:1.000:0.792 0/0/0/1:4:50,4:0.26: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,3:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,3:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,3:0.25: 0.90:1.000:0.999 1/1/1/1/1:5:0,3:1.00:-0.99:0.988:1.000 0/0/0/0:4:64,1:0.07: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.40:-1.03:1.000:0.782 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,1:0.08: 1.14:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.40:-1.03:1.000:0.782 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,2:0.16: 1.06:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.48:-0.95:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,5:0.26: 1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.43:-0.91:1.000:0.953 0/0/1/1:4:2,5:0.47:-0.83:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,6:0.57:-0.83:1.000:0.943 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:42,3:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 2.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,1:0.10: 0.77:1.000:0.891 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,3:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,1:0.10: 0.61:1.000:0.698 0/0/0/1:4:47,3:0.25: 0.94:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,4:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,3:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,3:0.12: 3.40:0.999:0.745 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,4:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,3:0.27:-0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:74,5:0.25: 2.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,4:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:1,9:0.62:-0.71:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,8:0.27: 1.51:1.000:0.997 -chr1.1 56606323 chr1.1_056606323 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:152,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,39:.: 0.00:1.000:. ./.:4:205,35:.: 1.06:1.000:. ./.:4:105,98:.: 0.35:1.000:. ./.:4:118,91:.: 0.46:1.000:. ./.:4:224,54:.: 1.78:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:138,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,12:.:-2.66:1.000:. ./.:4:51,8:.:-2.41:1.000:. ./.:4:97,83:.:-0.09:1.000:. ./.:4:160,49:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,67:.:-0.57:1.000:. ./.:4:167,39:.: 0.40:1.000:. ./.:4:193,58:.: 1.27:1.000:. ./.:4:206,61:.: 1.57:0.998:. ./.:4:119,64:.:-0.04:1.000:. ./.:4:271,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:230,46:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:229,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:177,55:.: 0.90:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:207,60:.: 1.57:1.000:. ./.:4:135,114:.: 1.23:1.000:. ./.:4:160,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:171,53:.: 0.75:1.000:. ./.:4:183,67:.: 1.25:1.000:. ./.:4:212,69:.: 1.84:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:43,5:.:-2.62:1.000:. ./.:4:49,8:.:-2.45:1.000:. ./.:3:21,5:.:-3.04:1.000:. ./.:4:178,54:.: 0.90:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:162,53:.: 0.58:1.000:. ./.:4:194,60:.: 1.32:1.000:. ./.:4:205,54:.: 1.42:1.000:. ./.:4:135,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:159,39:.: 0.25:1.000:. ./.:4:114,79:.: 0.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:150,40:.: 0.10:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:190,40:.: 0.86:1.000:. ./.:4:130,38:.:-0.32:1.000:. ./.:4:143,36:.:-0.11:1.000:. ./.:4:103,30:.:-0.99:1.000:. ./.:4:159,56:.: 0.58:1.000:. ./.:4:116,28:.:-0.78:1.000:. ./.:4:123,44:.:-0.34:1.000:. ./.:4:139,38:.:-0.15:1.000:. ./.:4:185,52:.: 1.00:1.000:. ./.:4:104,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:127,35:.:-0.44:1.000:. ./.:4:127,112:.: 1.04:1.000:. ./.:6:115,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:129,49:.:-0.13:1.000:. ./.:4:141,56:.: 0.23:1.000:. ./.:4:157,43:.: 0.29:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:182,52:.: 0.94:1.000:. ./.:4:179,54:.: 0.92:1.000:. ./.:4:100,13:.:-1.38:1.000:. ./.:4:160,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:133,43:.:-0.17:0.910:. ./.:4:76,77:.:-0.61:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:118,29:.:-0.73:1.000:. ./.:4:104,119:.: 0.73:1.000:. ./.:4:119,52:.:-0.27:1.000:. ./.:4:46,112:.:-0.52:1.000:. ./.:4:168,45:.: 0.54:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:181,20:.: 0.31:1.000:. ./.:4:179,40:.: 0.65:1.000:. ./.:4:76,65:.:-0.84:1.000:. ./.:4:76,86:.:-0.44:1.000:. ./.:4:160,35:.: 0.19:1.000:. ./.:4:123,47:.:-0.29:1.000:. ./.:4:172,51:.: 0.73:1.000:. ./.:4:131,42:.:-0.23:1.000:. ./.:4:92,34:.:-1.13:1.000:. ./.:4:91,29:.:-1.24:1.000:. ./.:4:106,22:.:-1.09:1.000:. ./.:4:129,35:.:-0.40:1.000:. ./.:4:113,22:.:-0.96:1.000:. ./.:4:82,83:.:-0.38:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:107,26:.:-0.99:1.000:. ./.:4:164,41:.: 0.38:1.000:. ./.:4:163,51:.: 0.56:1.000:. ./.:4:95,29:.:-1.17:1.000:. ./.:4:96,83:.:-0.11:1.000:. ./.:4:133,43:.:-0.17:1.000:. ./.:4:145,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:66,20:.:-1.90:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:83,28:.:-1.42:1.000:. ./.:4:111,26:.:-0.92:1.000:. ./.:4:136,25:.:-0.46:1.000:. ./.:4:162,43:.: 0.38:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:121,108:.: 0.84:1.000:. ./.:4:160,44:.: 0.37:1.000:. ./.:4:119,32:.:-0.65:1.000:. ./.:4:150,175:.: 2.68:1.000:. ./.:4:108,20:.:-1.09:0.999:. ./.:4:149,41:.: 0.10:1.000:. ./.:3:86,18:.:-1.55:1.000:. ./.:4:138,50:.: 0.06:1.000:. ./.:4:99,23:.:-1.21:1.000:. ./.:4:117,29:.:-0.75:1.000:. ./.:4:143,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:114,25:.:-0.88:1.000:. ./.:4:131,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:92,32:.:-1.17:1.000:. ./.:4:164,48:.: 0.52:1.000:. ./.:4:158,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:117,34:.:-0.65:1.000:. ./.:4:110,40:.:-0.67:1.000:. ./.:5:158,43:.: 0.31:0.988:. ./.:4:139,41:.:-0.09:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:109,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:84,66:.:-0.67:1.000:. ./.:4:176,65:.: 1.07:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:95,65:.:-0.48:1.000:. ./.:4:145,39:.:-0.02:1.000:. ./.:4:176,116:.: 2.05:1.000:. ./.:4:144,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:69,54:.:-1.19:1.000:. ./.:4:78,35:.:-1.38:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:93,23:.:-1.32:1.000:. ./.:4:144,47:.: 0.12:1.000:. ./.:4:93,29:.:-1.21:1.000:. ./.:4:169,49:.: 0.63:1.000:. ./.:4:174,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:152,48:.: 0.29:1.000:. ./.:4:148,41:.: 0.08:1.000:. ./.:4:187,44:.: 0.88:1.000:. ./.:4:128,36:.:-0.40:1.000:. ./.:4:202,64:.: 1.55:1.000:. ./.:4:123,117:.: 1.06:1.000:. ./.:4:42,1:.:-2.72:1.000:. ./.:4:97,32:.:-1.07:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:170,37:.: 0.42:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:144,41:.: 0.00:1.000:. ./.:4:172,34:.: 0.40:1.000:. ./.:4:143,50:.: 0.15:1.000:. ./.:4:125,30:.:-0.57:1.000:. ./.:4:162,52:.: 0.56:1.000:. ./.:4:99,101:.: 0.29:1.000:. ./.:4:134,112:.: 1.17:1.000:. ./.:4:167,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:158,48:.: 0.40:1.000:. ./.:4:160,60:.: 0.67:0.999:. ./.:4:162,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:91,85:.:-0.17:1.000:. ./.:4:154,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:135,38:.:-0.23:1.000:. ./.:4:136,40:.:-0.17:1.000:. ./.:4:131,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:160,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:225,53:.: 1.78:1.000:. ./.:4:153,47:.: 0.29:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:164,42:.: 0.40:1.000:. ./.:4:170,39:.: 0.46:1.000:. ./.:4:156,139:.: 2.11:1.000:. ./.:4:168,53:.: 0.69:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,78:.:-0.27:1.000:. -chr1.1 56647379 chr1.1_056647379 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.90:0.998:. ./.:4:22,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:3:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.64:1.000:. ./.:6:65,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.31:0.910:. ./.:4:29,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:63,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:65,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:82,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:80,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.43:0.999:. ./.:4:53,0:.: 0.64:1.000:. ./.:3:36,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:80,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.31:1.000:. ./.:5:66,0:.: 1.31:0.988:. ./.:4:43,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:60,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:0.999:. ./.:4:19,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.59:1.000:. -chr1.1 56974244 chr1.1_056974244 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:72,14:.: 1.68:1.000:. ./.:4:44,12:.: 0.08:1.000:. ./.:4:54,6:.: 0.30:1.000:. ./.:4:44,11:.: 0.03:1.000:. ./.:4:58,15:.: 0.99:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:44,13:.: 0.14:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:34,7:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,12:.: 0.14:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:71,12:.: 1.52:0.998:. ./.:4:19,24:.:-0.61:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:44,13:.: 0.14:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:71,10:.: 1.41:1.000:. ./.:4:63,12:.: 1.10:1.000:. ./.:4:52,14:.: 0.62:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,10:.:-0.40:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,9:.: 0.94:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:40,8:.:-0.34:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:39,8:.:-0.40:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:36,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:53,6:.: 0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:22,6:.:-1.41:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.13:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:42,8:.:-0.24:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.46:1.000:. ./.:4:51,5:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:58,14:.: 0.94:1.000:. ./.:6:39,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:57,7:.: 0.51:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,11:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:44,6:.:-0.24:1.000:. ./.:4:35,7:.:-0.66:0.910:. ./.:4:36,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:60,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.08:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:48,10:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:49,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:49,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:58,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.40:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:49,7:.: 0.08:1.000:. ./.:4:55,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,7:.:-1.19:1.000:. ./.:4:49,6:.: 0.03:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:21,12:.:-1.14:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:81,14:.: 2.16:1.000:. ./.:4:51,20:.: 0.88:1.000:. ./.:4:46,15:.: 0.35:1.000:. ./.:4:63,14:.: 1.20:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:36,6:.:-0.66:1.000:. ./.:3:17,2:.:-1.89:0.999:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:32,6:.:-0.87:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:38,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.09:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:34,7:.:-0.72:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:61,10:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,11:.:-1.19:1.000:. ./.:4:44,6:.:-0.24:1.000:. ./.:5:44,7:.:-0.18:0.988:. ./.:4:19,11:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:35,13:.:-0.34:1.000:. ./.:4:46,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:39,6:.:-0.50:1.000:. ./.:4:40,9:.:-0.29:1.000:. ./.:4:62,13:.: 1.10:1.000:. ./.:4:38,6:.:-0.56:1.000:. ./.:4:29,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:45,11:.: 0.08:1.000:. ./.:4:35,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:28,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:58,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:48,10:.: 0.19:1.000:. ./.:4:85,12:.: 2.27:1.000:. ./.:4:46,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:6,3:.:-2.42:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:51,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.13:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:59,18:.: 1.20:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.56:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:49,10:.: 0.24:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:30,8:.:-0.87:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:34,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:53,12:.: 0.56:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:61,4:.: 0.56:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:62,10:.: 0.94:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:44,12:.: 0.08:1.000:. -chr1.1 57154748 chr1.1_057154748 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:143,68:.: 1.26:1.000:. ./.:4:92,52:.:-0.34:1.000:. ./.:4:133,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:137,58:.: 0.88:1.000:. ./.:4:127,59:.: 0.66:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:134,54:.: 0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:121,69:.: 0.76:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:129,52:.: 0.54:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:150,72:.: 1.52:0.998:. ./.:4:125,42:.: 0.21:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:247,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:144,60:.: 1.09:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:144,64:.: 1.19:1.000:. ./.:4:156,64:.: 1.47:1.000:. ./.:4:154,60:.: 1.33:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:166,67:.: 1.78:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:31,1:.:-3.01:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.58:1.000:. ./.:3:11,6:.:-3.36:1.000:. ./.:4:144,51:.: 0.88:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:147,63:.: 1.23:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,44:.:-0.39:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:48,21:.:-2.13:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:107,55:.: 0.09:1.000:. ./.:4:96,46:.:-0.39:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:96,48:.:-0.34:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:133,68:.: 1.02:1.000:. ./.:4:128,35:.: 0.11:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,41:.:-0.17:1.000:. ./.:6:108,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:120,62:.: 0.57:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:138,56:.: 0.85:1.000:. ./.:4:121,53:.: 0.38:1.000:. ./.:4:109,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:113,53:.: 0.19:1.000:. ./.:4:112,63:.: 0.40:0.910:. ./.:4:71,100:.: 0.31:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:159,66:.: 1.59:1.000:. ./.:4:147,46:.: 0.83:1.000:. ./.:4:106,40:.:-0.29:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,53:.:-0.48:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:137,50:.: 0.69:1.000:. ./.:4:92,52:.:-0.34:1.000:. ./.:4:88,49:.:-0.51:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:125,43:.: 0.23:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.70:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:105,45:.:-0.20:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:97,29:.:-0.77:1.000:. ./.:4:118,60:.: 0.47:1.000:. ./.:4:96,47:.:-0.36:1.000:. ./.:4:79,40:.:-0.93:1.000:. ./.:4:81,38:.:-0.93:1.000:. ./.:4:106,40:.:-0.29:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:71,47:.:-0.96:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:143,64:.: 1.16:1.000:. ./.:4:124,41:.: 0.16:1.000:. ./.:4:105,45:.:-0.20:1.000:. ./.:4:148,79:.: 1.64:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.48:0.999:. ./.:4:107,45:.:-0.15:1.000:. ./.:3:49,43:.:-1.58:0.999:. ./.:4:139,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:74,36:.:-1.15:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:119,46:.: 0.16:1.000:. ./.:4:94,45:.:-0.46:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,42:.:-0.74:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:143,57:.: 1.00:1.000:. ./.:4:112,37:.:-0.22:1.000:. ./.:4:122,54:.: 0.42:1.000:. ./.:5:142,43:.: 0.64:0.988:. ./.:4:107,47:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:86,53:.:-0.46:1.000:. ./.:4:132,73:.: 1.12:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:111,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:121,47:.: 0.23:1.000:. ./.:4:167,65:.: 1.76:1.000:. ./.:4:135,49:.: 0.61:1.000:. ./.:4:82,59:.:-0.41:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:99,45:.:-0.34:1.000:. ./.:4:118,48:.: 0.19:1.000:. ./.:4:77,33:.:-1.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:128,44:.: 0.33:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:218,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:113,45:.: 0.00:1.000:. ./.:4:153,75:.: 1.66:1.000:. ./.:4:136,74:.: 1.23:1.000:. ./.:4:31,23:.:-2.48:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:113,59:.: 0.33:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:125,51:.: 0.42:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:148,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:119,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:161,68:.: 1.69:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:109,57:.: 0.19:0.999:. ./.:4:185,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:107,47:.:-0.10:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:104,50:.:-0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:178,11:.: 0.73:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:155,68:.: 1.54:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:129,44:.: 0.35:1.000:. -chr1.1 57428157 chr1.1_057428157 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:61,83:0.56: 0.31:1.000:0.964 0/1/1/1:4:29,104:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,68:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,101:0.71: 0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:34,134:0.77: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,93:0.50: 1.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,52:0.62:-1.54:1.000:0.538 0/1/1/1:4:38,126:0.74: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,121:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,30:0.49:-2.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,1:0.11:-3.18:1.000:0.630 0/0/1/1:4:65,75:0.52: 0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,113:0.75: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,127:0.74: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,122:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,116:0.73: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,117:0.77: 0.40:0.998:1.000 0/1/1/1:4:42,133:0.73: 1.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:73,120:0.60: 1.74:1.000:0.756 0/1/1/1:4:26,157:0.84: 1.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,38:0.72:-2.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,66:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,118:0.79: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,30:0.29:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:13,6:0.35:-3.35:1.000:0.791 0/1/1/1:4:28,127:0.79: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,44:0.35: 0.25:1.000:0.830 0/1/1/1:4:34,121:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,157:0.79: 1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,118:0.71: 0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,132:0.76: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,71:0.55:-0.19:1.000:0.983 0/1/1/1:4:10,20:0.65:-3.03:1.000:0.745 0/1/1/1:4:7,31:0.79:-2.80:1.000:1.000 1/1/1:3:1,8:0.87:-3.65:1.000:0.923 0/1/1/1:4:44,118:0.70: 0.83:1.000:0.987 0/0/1/1:4:113,61:0.38: 1.19:1.000:0.532 0/0/1/1:4:65,74:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,106:0.70: 0.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:74,68:0.48: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,87:0.60: 0.19:1.000:0.759 0/0/1/1:4:56,89:0.60: 0.34:1.000:0.820 0/1/1/1:4:38,134:0.75: 1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,97:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,64:0.48:-0.04:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,41:0.31: 0.54:1.000:0.966 0/0/0/1:4:94,20:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,108:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,95:0.72:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,50:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,38:0.26: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,76:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,128:0.74: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,62:0.46: 0.07:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,155:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,113:0.75: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,107:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,91:0.59: 0.51:1.000:0.885 0/0/0/1/1/1:6:63,70:0.52:-0.01:1.000:0.875 0/0/1/1:4:53,70:0.56:-0.31:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,143:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,118:0.74: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,58:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,117:0.73: 0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,96:0.71:-0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,36:0.49:-1.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,92:0.71:-0.25:1.000:0.991 0/1/1/1:4:40,127:0.73: 0.98:0.910:0.998 0/0/1/1:4:44,73:0.61:-0.48:1.000:0.736 0/0/0/1:4:106,46:0.34: 0.54:1.000:0.869 0/0/0/1:4:58,22:0.32:-1.57:1.000:0.957 0/0/1/1:4:62,83:0.56: 0.34:1.000:0.970 0/0/0/1:4:108,38:0.31: 0.37:1.000:0.978 0/1/1/1:4:29,83:0.71:-0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,75:0.57:-0.13:1.000:0.955 0/0/1/1:4:57,70:0.54:-0.19:1.000:0.988 0/1/1/1:4:21,76:0.75:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,91:0.67:-0.07:1.000:0.924 0/0/0/1:4:105,34:0.29: 0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:51,53:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,85:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,74:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,68:0.60:-0.66:1.000:0.828 0/1/1/1:4:36,106:0.72: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,101:0.58: 1.01:1.000:0.892 0/1/1/1:4:25,89:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,37:0.37:-0.69:1.000:0.613 0/1/1/1:4:26,94:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,104:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,78:0.82:-1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,97:0.76:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,54:0.38: 0.63:1.000:0.510 0/1/1/1:4:15,89:0.84:-0.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,98:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,33:0.31:-0.28:1.000:0.971 0/1/1/1:4:23,86:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,83:0.53: 0.57:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,34:0.46:-1.74:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,115:0.78: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.53:-1.95:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,47:0.43:-0.63:1.000:0.948 0/1/1/1:4:31,78:0.69:-0.72:1.000:0.974 0/1/1/1:4:31,115:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,79:0.57: 0.01:1.000:0.935 0/0/1/1:4:53,68:0.55:-0.37:1.000:0.981 0/1/1/1:4:48,136:0.71: 1.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,83:0.57: 0.25:1.000:0.948 0/1/1/1:4:28,113:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,136:0.71: 1.51:1.000:0.991 0/1/1/1:4:36,108:0.72: 0.31:0.999:0.996 0/1/1/1:4:36,131:0.75: 0.98:1.000:1.000 0/1/1:3:27,53:0.64:-1.57:0.999:1.000 0/0/1/1:4:74,73:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,112:0.79: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,49:0.50:-1.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,94:0.78:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,98:0.80:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,67:0.44: 0.66:1.000:0.964 0/1/1/1:4:21,88:0.78:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,128:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,84:0.57: 0.28:1.000:0.941 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,104:0.84:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1/1:5:50,116:0.67: 0.95:0.988:0.757 0/1/1/1:4:26,72:0.71:-1.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:52,46:0.47:-1.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,47:0.58:-1.60:1.000:0.917 0/1/1/1:4:24,93:0.77:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,155:0.85: 1.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:27,41:0.59:-1.92:1.000:0.884 0/0/1/1:4:71,71:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,71:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,149:0.79: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,96:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,79:0.82:-1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,91:0.78:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,55:0.48:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,64:0.48:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,48:0.49:-1.04:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,48:0.47:-0.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:95,100:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,82:0.48: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,71:0.54:-0.13:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,115:0.69: 0.78:1.000:0.978 0/0/1/1:4:85,90:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,68:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,96:0.55: 1.10:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.51:-3.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,43:0.32: 0.72:1.000:0.962 0/1/1/1:4:37,123:0.74: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,53:0.34: 1.13:1.000:0.840 0/0/0/1:4:111,49:0.34: 0.78:1.000:0.850 0/1/1/1:4:17,100:0.83:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,89:0.57: 0.57:1.000:0.954 0/1/1/1:4:39,122:0.73: 0.81:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,135:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,97:0.76:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,74:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,70:0.45: 0.72:1.000:0.979 0/0/1/1:4:77,75:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,75:0.56:-0.07:1.000:0.969 0/1/1/1:4:25,94:0.76:-0.42:0.999:1.000 0/0/1/1:4:73,60:0.46:-0.01:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,136:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,67:0.51:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,114:0.78: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,102:0.72: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,57:0.56:-1.01:1.000:0.965 0/1/1/1:4:24,85:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,90:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,143:0.78: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,79:0.54: 0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:77,72:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,114:0.78: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,83:0.52: 0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,145:0.79: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,96:0.57: 0.92:1.000:0.954 0/0/0/1:4:97,41:0.34: 0.13:1.000:0.894 0/1/1/1:4:39,115:0.72: 0.60:1.000:0.995 -chr1.1 57869947 chr1.1_057869947 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:75,61:0.52: 0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,62:0.77:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,49:0.52:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,80:0.58: 0.63:1.000:0.921 0/0/1/1:4:68,88:0.57: 1.03:1.000:0.943 0/0/1/1:4:90,126:0.58: 2.34:1.000:0.915 0/0/0/1:4:66,26:0.33:-0.37:1.000:0.923 0/0/0/1:4:161,22:0.15: 1.62:1.000:0.985 0/0/0/1:4:137,49:0.30: 1.68:1.000:0.983 0/0/1/1:4:20,17:0.52:-1.57:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,48:0.27: 1.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,78:0.54: 1.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:68,60:0.53: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:78,57:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,55:0.46: 0.81:0.998:0.988 0/0/1/1:4:79,54:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,41:0.43: 0.13:1.000:0.954 0/0/1/1:4:90,72:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,7:0.15:-1.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:78,46:0.45: 0.33:1.000:0.983 0/0/0/1:4:177,48:0.24: 2.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,70:0.90:-0.83:1.000:0.763 0/0/1/1:4:25,15:0.46:-1.51:1.000:0.987 0/0/1/1:4:59,66:0.56: 0.35:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,155:1.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,58:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,45:0.42: 0.46:1.000:0.908 0/0/0/1:4:154,39:0.23: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,49:0.47: 0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:81,55:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,39:0.58:-0.90:1.000:0.931 0/0/0/1:4:48,18:0.32:-0.94:1.000:0.963 0/0/0:3:35,1:0.06:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,48:0.31: 1.55:1.000:0.977 1/1/1/1:4:1,84:0.92:-0.52:1.000:0.975 0/0/1/1:4:75,81:0.55: 1.03:1.000:0.979 0/0/1/1:4:76,35:0.38: 0.04:1.000:0.507 0/0/1/1:4:74,69:0.53: 0.74:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,60:0.77:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,39:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,50:0.44: 0.66:1.000:0.963 0/0/1/1:4:60,30:0.40:-0.42:1.000:0.795 0/0/0/1:4:100,24:0.22: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,12:0.11: 0.94:1.000:0.588 0/1/1/1:4:3,65:0.75:-0.90:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,40:0.51:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,40:0.37: 0.44:1.000:0.590 0/0/0/1:4:60,25:0.35:-0.52:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,25:0.34:-0.50:1.000:0.864 0/0/1/1:4:83,40:0.39: 0.31:1.000:0.682 0/0/1/1:4:74,51:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,15:0.14: 0.68:1.000:0.946 0/0/1/1:4:65,53:0.52: 0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,40:0.45: 0.00:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:51,31:0.46:-0.59:1.000:0.811 0/0/1/1:4:72,47:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,18:0.17: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,28:0.35:-0.33:1.000:0.784 0/0/0/1:4:57,18:0.27:-0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,41:0.43: 0.15:1.000:0.943 0/1/1/1:4:3,43:0.74:-1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,31:0.53:-0.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,22:0.28:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,37:0.51:-0.46:0.910:0.996 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,52:0.75:-1.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,66:0.89:-0.92:1.000:0.589 0/0/1/1:4:61,53:0.53: 0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:58,28:0.39:-0.50:1.000:0.688 0/0/0/1:4:79,29:0.31:-0.02:1.000:0.974 0/0/0/0:4:119,8:0.09: 0.39:1.000:0.925 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,42:0.83:-1.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,60:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,39:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,41:0.45: 0.07:1.000:0.976 0/0/1/1:4:45,23:0.41:-0.90:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,22:0.33:-0.70:1.000:0.903 0/0/0/1:4:61,28:0.37:-0.44:1.000:0.506 0/0/0/1:4:55,25:0.37:-0.63:1.000:0.545 0/0/1/1:4:61,36:0.45:-0.26:1.000:0.983 0/1/1/1:4:2,34:0.74:-1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,39:0.54:-0.63:1.000:0.989 0/0/0/1:4:66,15:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,27:0.37:-0.48:1.000:0.585 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,29:0.72:-1.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,23:0.34:-0.66:1.000:0.860 0/0/0/1:4:154,18:0.13: 1.38:1.000:0.931 0/0/1/1:4:43,26:0.46:-0.87:1.000:0.988 0/0/0/0:4:155,13:0.11: 1.29:1.000:0.635 0/0/0/1:4:46,20:0.36:-0.94:1.000:0.710 0/0/0/1:4:55,18:0.28:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,18:0.35:-1.05:1.000:0.818 0/0/1/1:4:57,33:0.45:-0.42:1.000:0.977 0/0/0/1:4:58,18:0.27:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,52:0.44: 0.74:1.000:0.972 0/0/1/1:4:77,90:0.56: 1.27:1.000:0.967 0/0/1/1:4:55,30:0.43:-0.52:1.000:0.941 0/0/0/1:4:58,14:0.22:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,81:0.53: 1.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,13:0.19:-0.61:0.999:1.000 0/0/1/1:4:66,36:0.43:-0.15:1.000:0.941 0/0/1:3:45,16:0.30:-1.05:0.999:1.000 0/0/1/1:4:78,40:0.41: 0.20:1.000:0.854 0/0/0/1:4:49,17:0.29:-0.94:1.000:0.989 0/0/1/1:4:57,49:0.53:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,22:0.39:-0.90:1.000:0.654 0/0/0/1:4:59,21:0.30:-0.63:1.000:0.984 0/0/1/1:4:52,56:0.55:-0.02:1.000:0.979 0/0/0/1:4:67,16:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,17:0.13: 1.38:1.000:0.878 0/0/1/1:4:92,108:0.56: 1.99:1.000:0.966 0/0/0/1:4:114,12:0.12: 0.37:1.000:0.829 0/0/0/1:4:84,36:0.35: 0.24:1.000:0.755 0/0/0/0/1:5:121,20:0.17: 0.70:0.988:0.999 0/1/1/1:4:3,27:0.72:-1.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,14:0.25:-1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,25:0.42:-0.81:1.000:0.914 0/0/1/1:4:64,45:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,42:0.23: 2.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,22:0.37:-0.83:1.000:0.594 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,32:0.47:-0.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:97,93:0.54: 1.77:1.000:0.989 0/0/0/1:4:79,35:0.36: 0.11:1.000:0.644 0/0/0/1:4:56,20:0.30:-0.72:1.000:0.983 0/0/0/1:4:126,15:0.13: 0.70:1.000:0.942 0/0/0/1:4:59,9:0.16:-0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,22:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,27:0.42:-0.68:1.000:0.908 0/0/0/1:4:159,17:0.12: 1.47:1.000:0.849 0/0/1/1:4:39,28:0.51:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,73:0.55: 0.77:1.000:0.984 0/0/1/1:4:86,94:0.55: 1.55:1.000:0.977 0/0/1/1:4:75,60:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,35:0.43:-0.22:1.000:0.943 0/0/1/1:4:80,75:0.54: 1.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,47:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,74:0.52: 1.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,58:0.31: 2.32:1.000:0.971 0/0/0/1:4:33,14:0.35:-1.36:1.000:0.784 0/0/0/1:4:105,17:0.17: 0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,72:0.72:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,44:0.32: 1.09:1.000:0.950 1/1/1/1:4:1,95:0.92:-0.28:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,46:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,72:0.53: 0.94:1.000:0.992 0/0/0/1:4:77,30:0.33:-0.04:1.000:0.935 0/0/0/1:4:120,21:0.18: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,42:0.40: 0.35:1.000:0.825 0/1/1/1:4:2,83:0.83:-0.52:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,82:0.56: 0.94:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,35:0.67:-1.42:0.999:0.937 0/0/1/1:4:83,42:0.40: 0.35:1.000:0.825 0/0/0/1:4:138,52:0.32: 1.77:1.000:0.961 0/0/1/1:4:63,70:0.55: 0.53:1.000:0.975 0/0/0/1:4:105,36:0.29: 0.70:1.000:0.991 0/0/0/1:4:163,43:0.23: 2.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,57:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,14:0.14: 0.28:1.000:0.974 0/0/0/1:4:92,31:0.29: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,42:0.40: 0.37:1.000:0.795 0/0/1/1:4:93,46:0.40: 0.66:1.000:0.765 0/0/1/1:4:90,47:0.41: 0.61:1.000:0.887 0/0/0/1:4:111,45:0.34: 1.03:1.000:0.883 0/0/1/1:4:85,71:0.52: 1.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,126:0.58: 2.41:1.000:0.928 0/0/1/1:4:94,116:0.57: 2.21:1.000:0.956 0/1/1/1:4:3,50:0.74:-1.22:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.01:1.000:1.000 -chr1.1 57981154 chr1.1_057981154 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,26:.: 0.78:1.000:. ./.:4:35,25:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,27:.: 1.49:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:21,25:.:-0.55:1.000:. ./.:4:30,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:49,23:.: 0.68:1.000:. ./.:4:46,25:.: 0.64:1.000:. ./.:4:17,10:.:-1.44:1.000:. ./.:4:3,8:.:-2.20:1.000:. ./.:4:25,51:.: 0.87:1.000:. ./.:4:30,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.40:0.998:. ./.:4:86,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:74,36:.: 2.48:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:3,4:.:-2.39:1.000:. ./.:4:54,23:.: 0.92:1.000:. ./.:4:46,24:.: 0.59:1.000:. ./.:4:58,22:.: 1.06:1.000:. ./.:4:13,2:.:-2.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:12,20:.:-1.21:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:17,15:.:-1.21:1.000:. ./.:3:15,6:.:-1.73:1.000:. ./.:4:45,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:68,19:.: 1.39:1.000:. ./.:4:14,23:.:-0.97:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,15:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,20:.: 0.07:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:70,29:.: 1.96:1.000:. ./.:4:28,11:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:45,24:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,25:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.03:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:43,17:.: 0.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.21:1.000:. ./.:6:24,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:43,29:.: 0.68:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:53,24:.: 0.92:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:25,12:.:-0.97:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.54:0.910:. ./.:4:42,41:.: 1.20:1.000:. ./.:4:67,32:.: 1.96:1.000:. ./.:4:24,15:.:-0.88:1.000:. ./.:4:15,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:65,14:.: 1.01:1.000:. ./.:4:34,25:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,22:.: 0.21:1.000:. ./.:4:49,17:.: 0.40:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:25,26:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,36:.:-0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:28,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:23,19:.:-0.73:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:64,25:.: 1.49:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:52,28:.: 1.06:1.000:. ./.:4:30,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:84,25:.: 2.43:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:19,15:.:-1.11:1.000:. ./.:4:49,26:.: 0.83:1.000:. ./.:4:68,20:.: 1.44:1.000:. ./.:4:48,24:.: 0.68:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:49,24:.: 0.73:1.000:. ./.:4:60,21:.: 1.11:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:57,35:.: 1.63:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.69:0.999:. ./.:4:94,0:.: 1.72:1.000:. ./.:3:29,0:.:-1.35:0.999:. ./.:4:25,28:.:-0.21:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:23,18:.:-0.78:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:17,30:.:-0.50:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:64,31:.: 1.77:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:5:32,27:.: 0.07:0.988:. ./.:4:36,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,16:.: 0.26:1.000:. ./.:4:17,17:.:-1.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:40,21:.: 0.16:1.000:. ./.:4:26,19:.:-0.59:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:23,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,22:.:-1.02:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.35:1.000:. ./.:4:56,20:.: 0.87:1.000:. ./.:4:61,19:.: 1.06:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:41,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,29:.: 1.30:1.000:. ./.:4:51,30:.: 1.11:1.000:. ./.:4:78,23:.: 2.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:22,21:.:-0.69:1.000:. ./.:4:56,20:.: 0.87:1.000:. ./.:4:49,38:.: 1.39:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,6:.:-2.20:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:65,23:.: 1.44:1.000:. ./.:4:16,24:.:-0.83:1.000:. ./.:4:87,26:.: 2.62:1.000:. ./.:4:72,36:.: 2.39:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:18,26:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:52,25:.: 0.92:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:69,24:.: 1.68:0.999:. ./.:4:42,29:.: 0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:31,25:.:-0.07:1.000:. ./.:4:43,20:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:26,23:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,15:.:-1.02:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:47,35:.: 1.16:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:29,40:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,18:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,23:.: 0.07:1.000:. -chr1.1 58019546 chr1.1_058019546 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:221,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:301,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:94,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:253,2:.: 1.29:0.998:. ./.:4:175,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:79,1:.:-1.98:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:112,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.66:1.000:. ./.:3:61,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:165,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:149,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.50:1.000:. ./.:6:157,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:256,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.23:0.910:. ./.:4:89,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:175,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:105,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:130,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:195,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:361,0:.: 3.27:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:257,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:233,2:.: 0.92:0.999:. ./.:4:245,0:.: 1.11:1.000:. ./.:3:111,0:.:-1.40:0.999:. ./.:4:204,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:208,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:279,2:.: 1.78:1.000:. ./.:5:245,0:.: 1.11:0.988:. ./.:4:103,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:124,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:224,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:219,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:255,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:165,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:166,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.15:1.000:. -chr1.1 58204817 chr1.1_058204817 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:46,43:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,52:0.82:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,35:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,76:0.84: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,68:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,37:0.45:-0.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:24,18:0.44:-2.13:1.000:0.967 0/0/0/1:4:49,17:0.29:-0.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,24:0.41:-1.25:1.000:0.888 0/0/1/1:4:53,61:0.54: 1.38:1.000:0.989 0/1/1/1:4:34,95:0.72: 2.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,42:0.54:-0.37:1.000:0.987 0/0/0/1:4:50,16:0.27:-0.96:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,79:0.79: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,59:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,62:0.74:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,55:0.81:-0.91:0.998:1.000 0/1/1/1:4:17,51:0.74:-0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,51:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,60:0.79:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,48:0.33: 3.38:1.000:0.909 0/0/1/1:4:44,36:0.46:-0.28:1.000:0.987 0/0/1/1:4:57,32:0.38: 0.16:1.000:0.539 0/1/1/1:4:11,51:0.81:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,54:0.58: 0.36:1.000:0.915 0/1/1/1:4:17,47:0.72:-1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,64:0.86:-0.57:1.000:0.976 0/1/1/1:4:16,60:0.78:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,81:0.78: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,24:0.35:-0.62:1.000:0.793 0/1/1/1:4:16,30:0.65:-1.93:1.000:0.756 0/0/1/1:4:18,19:0.52:-2.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,53:0.73:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:43,37:0.47:-0.28:1.000:0.992 0/0/1:3:36,20:0.38:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,20:0.34:-1.11:1.000:0.871 0/1/1/1:4:17,56:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,40:0.55:-0.62:1.000:0.981 0/1/1/1:4:20,52:0.71:-0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:33,35:0.52:-0.86:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,48:0.53: 0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:26,88:0.76: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,53:0.74:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,65:0.54: 1.72:1.000:0.988 0/0/1/1:4:44,52:0.54: 0.50:1.000:0.985 0/1/1/1:4:23,75:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,129:0.75: 4.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,61:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,40:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,43:0.43: 0.80:1.000:0.955 0/1/1/1:4:25,66:0.71: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,51:0.52: 0.60:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,84:0.71: 1.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,33:0.46:-0.57:1.000:0.985 0/0/1/1:4:47,64:0.58: 1.23:1.000:0.929 0/1/1/1:4:23,55:0.70:-0.37:1.000:0.981 0/1/1/1:4:29,95:0.75: 1.87:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,82:0.99:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:47,55:0.54: 0.80:1.000:0.792 0/0/1/1:4:34,51:0.60:-0.03:1.000:0.810 0/0/1/1:4:38,41:0.52:-0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,79:0.71: 1.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:53,37:0.42: 0.21:1.000:0.930 0/1/1/1:4:16,76:0.82: 0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,24:0.41:-1.25:1.000:0.888 0/1/1/1:4:26,67:0.71: 0.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:25,80:0.75: 0.94:0.910:0.999 0/0/1/1:4:36,46:0.56:-0.18:1.000:0.965 0/1/1/1:4:21,74:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,68:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,50:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,68:0.78: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,73:0.74: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,37:0.52:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,60:0.52: 1.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:25,86:0.76: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,15:0.21: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,91:0.99: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,38:0.45: 0.06:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 1.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,46:0.53: 0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:26,73:0.73: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,59:0.59: 0.65:1.000:0.838 0/1/1/1:4:14,43:0.74:-1.40:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,90:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,70:0.82:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,65:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,50:0.69:-0.72:1.000:0.980 0/1/1/1:4:19,52:0.72:-0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,99:0.79: 1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,44:0.70:-1.15:1.000:0.985 0/1/1/1:4:32,77:0.70: 1.14:1.000:0.982 0/1/1/1:4:20,76:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,70:0.73: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,58:0.72:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,75:0.58: 2.16:1.000:0.928 0/0/1/1:4:36,50:0.58: 0.02:1.000:0.913 0/0/1/1:4:26,24:0.49:-1.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,32:0.38: 0.16:1.000:0.539 0/0/1/1:4:25,32:0.56:-1.40:1.000:0.964 0/0/1/1:4:69,60:0.47: 2.11:1.000:0.993 0/1/1/1:4:23,55:0.70:-0.37:1.000:0.981 0/1/1/1:4:9,65:0.87:-0.57:1.000:0.897 0/0/1/1:4:42,44:0.52: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,30:0.49:-1.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,103:0.81: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,46:0.56:-0.13:1.000:0.974 0/1/1/1:4:30,78:0.71: 1.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:20,63:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,71:0.67: 0.89:0.999:0.938 0/1/1/1:4:29,78:0.72: 1.04:1.000:0.995 0/1/1:3:11,40:0.77:-1.69:0.999:1.000 0/0/1/1:4:47,60:0.56: 1.04:1.000:0.965 0/1/1/1:4:30,65:0.68: 0.45:1.000:0.942 0/0/1/1:4:41,44:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,73:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,71:0.82: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,30:0.34: 0.45:1.000:0.880 0/1/1/1:4:23,88:0.78: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,50:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,24:0.41:-1.25:1.000:0.888 0/0/1/1:4:50,57:0.54: 1.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,73:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:59,48:0.46: 1.04:0.988:0.842 0/1/1/1:4:19,58:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,33:0.44:-0.42:1.000:0.967 0/0/1/1:4:32,35:0.53:-0.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,73:0.81: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,15:0.28:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,37:0.48:-0.37:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,45:0.49: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,76:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,73:0.85:-0.03:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,59:0.70:-0.13:1.000:0.986 0/0/0/1:4:75,21:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,55:0.44: 2.01:1.000:0.973 0/0/1/1:4:51,46:0.48: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:60,47:0.45: 1.04:1.000:0.979 0/0/1/1:4:37,41:0.53:-0.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,39:0.55:-0.72:1.000:0.979 0/0/1/1:4:45,68:0.60: 1.33:1.000:0.797 0/1/1/1:4:35,62:0.63: 0.55:1.000:0.617 0/0/1/1:4:33,51:0.60:-0.08:1.000:0.751 0/1/1/1:4:26,74:0.73: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,58:0.61: 0.41:1.000:0.651 0/0/1/1:4:36,31:0.47:-0.91:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,60:0.61: 0.60:1.000:0.702 0/0/1/1:4:30,39:0.57:-0.81:1.000:0.957 0/0/1/1:4:59,54:0.48: 1.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,41:0.58:-0.76:1.000:0.895 0/1/1/1:4:24,58:0.70:-0.18:1.000:0.983 0/0/0/1:4:66,27:0.32: 0.36:1.000:0.964 0/1/1/1:4:19,80:0.80: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,62:0.77:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,45:0.73:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,38:0.55:-0.81:1.000:0.978 0/1/1/1:4:19,58:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,23:0.53:-2.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,49:0.78:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,40:0.49:-0.13:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,65:0.73: 0.06:0.999:0.998 0/0/1/1:4:34,49:0.59:-0.13:1.000:0.872 0/0/1/1:4:39,36:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,36:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,19:0.38:-1.59:1.000:0.527 0/0/0/1:4:47,14:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,33:0.62:-1.59:1.000:0.586 0/0/0/1:4:54,15:0.25:-0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,53:0.88:-1.25:1.000:0.827 0/1/1/1:4:10,51:0.83:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,42:0.53:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,30:0.44:-0.76:1.000:0.967 0/0/1/1:4:36,27:0.44:-1.11:1.000:0.967 0/0/1/1:4:38,41:0.52:-0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,84:0.74: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,38:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,66:0.79:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,74:0.81: 0.21:1.000:1.000 -chr1.1 58425180 chr1.1_058425180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:90,71:.: 0.66:1.000:. ./.:4:41,98:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,146:.: 1.18:1.000:. ./.:4:39,156:.: 1.35:1.000:. ./.:4:2,178:.: 1.04:1.000:. ./.:4:102,117:.: 1.83:1.000:. ./.:4:54,68:.:-0.13:1.000:. ./.:4:72,109:.: 1.06:1.000:. ./.:4:97,77:.: 0.92:1.000:. ./.:4:6,31:.:-1.84:1.000:. ./.:4:12,49:.:-1.36:1.000:. ./.:4:87,71:.: 0.60:1.000:. ./.:4:72,59:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,190:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,181:.: 1.06:1.000:. ./.:4:55,152:.: 1.59:1.000:. ./.:4:44,150:.: 1.33:0.998:. ./.:4:40,145:.: 1.14:1.000:. ./.:4:50,144:.: 1.33:1.000:. ./.:4:1,196:.: 1.39:1.000:. ./.:4:24,29:.:-1.52:1.000:. ./.:4:25,121:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,97:.: 1.02:1.000:. ./.:4:53,109:.: 0.68:1.000:. ./.:4:4,26:.:-1.99:1.000:. ./.:4:27,125:.: 0.48:1.000:. ./.:4:55,180:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.00:1.000:. ./.:4:38,114:.: 0.48:1.000:. ./.:4:101,103:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.68:1.000:. ./.:4:107,74:.: 1.06:1.000:. ./.:4:16,42:.:-1.42:1.000:. ./.:4:29,20:.:-1.60:1.000:. ./.:3:5,9:.:-2.31:1.000:. ./.:4:79,67:.: 0.36:1.000:. ./.:4:42,125:.: 0.78:1.000:. ./.:4:95,65:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,96:.:-0.07:1.000:. ./.:4:51,148:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.39:1.000:. ./.:4:81,55:.: 0.15:1.000:. ./.:4:44,83:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,73:.:-0.59:1.000:. ./.:4:47,47:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,73:.:-0.63:1.000:. ./.:4:52,147:.: 1.43:1.000:. ./.:4:67,234:.: 3.49:1.000:. ./.:4:26,81:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,88:.:-0.23:1.000:. ./.:4:19,58:.:-1.04:1.000:. ./.:4:57,115:.: 0.88:1.000:. ./.:4:54,37:.:-0.75:1.000:. ./.:4:27,77:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,98:.: 0.11:1.000:. ./.:4:31,91:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.73:1.000:. ./.:6:30,61:.:-0.75:1.000:. ./.:4:29,70:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,88:.:-0.23:1.000:. ./.:4:28,79:.:-0.43:1.000:. ./.:4:27,72:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.59:1.000:. ./.:4:30,75:.:-0.47:1.000:. ./.:4:63,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:20,93:.:-0.31:0.910:. ./.:4:63,77:.: 0.24:1.000:. ./.:4:27,72:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,51:.:-0.98:1.000:. ./.:4:81,49:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,125:.: 1.04:1.000:. ./.:4:27,86:.:-0.31:1.000:. ./.:4:27,86:.:-0.31:1.000:. ./.:4:28,76:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.57:1.000:. ./.:4:48,38:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,32:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.45:1.000:. ./.:4:70,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:31,85:.:-0.25:1.000:. ./.:4:50,45:.:-0.67:1.000:. ./.:4:20,31:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.34:1.000:. ./.:4:23,56:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,60:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:24,62:.:-0.85:1.000:. ./.:4:29,60:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,45:.:-1.20:1.000:. ./.:4:24,50:.:-1.10:1.000:. ./.:4:28,57:.:-0.88:1.000:. ./.:4:68,55:.:-0.11:1.000:. ./.:4:52,45:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:9,50:.:-1.40:1.000:. ./.:4:24,61:.:-0.88:1.000:. ./.:4:21,58:.:-1.00:1.000:. ./.:4:25,102:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,50:.:-1.10:1.000:. ./.:4:34,151:.: 1.14:1.000:. ./.:4:42,145:.: 1.18:1.000:. ./.:4:34,105:.: 0.22:1.000:. ./.:4:15,61:.:-1.06:1.000:. ./.:4:57,189:.: 2.38:1.000:. ./.:4:12,51:.:-1.32:0.999:. ./.:4:0,104:.:-0.49:1.000:. ./.:3:0,48:.:-1.62:0.999:. ./.:4:46,41:.:-0.83:1.000:. ./.:4:14,50:.:-1.30:1.000:. ./.:4:18,69:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.94:1.000:. ./.:4:29,63:.:-0.73:1.000:. ./.:4:58,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.16:1.000:. ./.:4:24,80:.:-0.49:1.000:. ./.:4:80,85:.: 0.74:1.000:. ./.:4:22,86:.:-0.41:1.000:. ./.:4:18,81:.:-0.59:1.000:. ./.:5:58,46:.:-0.49:0.988:. ./.:4:19,49:.:-1.22:1.000:. ./.:4:10,43:.:-1.52:1.000:. ./.:4:33,26:.:-1.40:1.000:. ./.:4:22,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:69,89:.: 0.60:1.000:. ./.:4:14,41:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:66,163:.: 2.03:1.000:. ./.:4:31,81:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,72:.:-1.14:1.000:. ./.:4:40,50:.:-0.77:1.000:. ./.:4:25,51:.:-1.06:1.000:. ./.:4:28,46:.:-1.10:1.000:. ./.:4:22,49:.:-1.16:1.000:. ./.:4:32,117:.: 0.42:1.000:. ./.:4:20,51:.:-1.16:1.000:. ./.:4:45,129:.: 0.92:1.000:. ./.:4:48,158:.: 1.57:1.000:. ./.:4:46,124:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.01:1.000:. ./.:4:104,99:.: 1.51:1.000:. ./.:4:25,84:.:-0.39:1.000:. ./.:4:105,104:.: 1.63:1.000:. ./.:4:48,136:.: 1.12:1.000:. ./.:4:28,16:.:-1.70:1.000:. ./.:4:37,131:.: 0.80:1.000:. ./.:4:60,135:.: 1.35:1.000:. ./.:4:80,76:.: 0.56:1.000:. ./.:4:42,139:.: 1.06:1.000:. ./.:4:61,121:.: 1.08:1.000:. ./.:4:37,113:.: 0.44:1.000:. ./.:4:78,86:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.15:1.000:. ./.:4:30,102:.: 0.07:1.000:. ./.:4:33,115:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,181:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,202:.: 1.49:1.000:. ./.:4:50,116:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,115:.: 0.78:0.999:. ./.:4:81,83:.: 0.72:1.000:. ./.:4:34,124:.: 0.60:1.000:. ./.:4:32,104:.: 0.15:1.000:. ./.:4:64,59:.:-0.11:1.000:. ./.:4:73,73:.: 0.36:1.000:. ./.:4:59,63:.:-0.13:1.000:. ./.:4:61,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,216:.: 1.77:1.000:. ./.:4:60,87:.: 0.38:1.000:. ./.:4:95,77:.: 0.88:1.000:. ./.:4:70,84:.: 0.52:1.000:. ./.:4:62,135:.: 1.39:1.000:. ./.:4:55,158:.: 1.71:1.000:. ./.:4:100,110:.: 1.65:1.000:. ./.:4:33,99:.: 0.07:1.000:. ./.:4:31,133:.: 0.72:1.000:. -chr1.1 58563877 chr1.1_058563877 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:46,12:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,3:.:-1.45:1.000:. ./.:4:24,17:.:-0.99:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:62,20:.: 1.42:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:47,8:.:-0.16:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.16:1.000:. ./.:4:41,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,11:.:-1.28:1.000:. ./.:4:38,30:.: 0.60:1.000:. ./.:4:46,6:.:-0.34:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,8:.:-0.57:1.000:. ./.:4:44,11:.:-0.16:0.998:. ./.:4:50,6:.:-0.10:1.000:. ./.:4:39,25:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:36,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:48,9:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,10:.: 0.83:1.000:. ./.:4:22,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:22,9:.:-1.57:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:19,11:.:-1.63:1.000:. ./.:4:35,6:.:-0.99:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.40:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:27,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:30,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:68,3:.: 0.78:1.000:. ./.:3:28,5:.:-1.45:1.000:. ./.:4:54,8:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,12:.:-1.45:1.000:. ./.:4:24,15:.:-1.10:1.000:. ./.:4:36,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:20,21:.:-0.99:1.000:. ./.:4:50,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:29,19:.:-0.57:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:50,6:.:-0.10:1.000:. ./.:4:100,14:.: 3.30:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:48,24:.: 0.83:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.80:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:37,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:21,21:.:-0.93:1.000:. ./.:4:51,8:.: 0.07:1.000:. ./.:4:54,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:23,14:.:-1.22:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:38,6:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:60,9:.: 0.66:1.000:. ./.:6:52,13:.: 0.42:1.000:. ./.:4:71,16:.: 1.71:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,16:.: 1.24:1.000:. ./.:4:46,11:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:32,6:.:-1.16:1.000:. ./.:4:55,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:43,17:.: 0.13:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.66:0.910:. ./.:4:23,13:.:-1.28:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,12:.:-1.63:1.000:. ./.:4:31,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:22,18:.:-1.04:1.000:. ./.:4:56,9:.: 0.42:1.000:. ./.:4:28,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:35,18:.:-0.28:1.000:. ./.:4:66,9:.: 1.01:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:41,15:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,26:.: 0.25:1.000:. ./.:4:57,13:.: 0.72:1.000:. ./.:4:66,11:.: 1.13:1.000:. ./.:4:24,18:.:-0.93:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,11:.: 0.95:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:51,14:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:40,24:.: 0.36:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:125,0:.: 3.94:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:33,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,13:.: 1.07:1.000:. ./.:4:43,24:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,10:.: 0.36:1.000:. ./.:4:61,11:.: 0.83:1.000:. ./.:4:63,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:75,9:.: 1.54:1.000:. ./.:4:64,9:.: 0.89:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:29,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:53,10:.: 0.31:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:24,20:.:-0.81:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:66,16:.: 1.42:0.999:. ./.:4:76,0:.: 1.07:1.000:. ./.:3:26,9:.:-1.34:0.999:. ./.:4:40,29:.: 0.66:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.22:1.000:. ./.:4:47,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:59,7:.: 0.48:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:51,7:.: 0.01:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.24:1.000:. ./.:5:73,22:.: 2.18:0.988:. ./.:4:47,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:28,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,18:.: 0.78:1.000:. ./.:4:39,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:28,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:36,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:49,8:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:72,11:.: 1.48:1.000:. ./.:4:69,6:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,31:.: 0.83:1.000:. ./.:4:44,31:.: 1.01:1.000:. ./.:4:86,16:.: 2.59:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:59,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:63,16:.: 1.24:1.000:. ./.:4:48,19:.: 0.54:1.000:. ./.:4:53,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,8:.:-1.28:1.000:. ./.:4:55,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:38,36:.: 0.95:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,12:.:-0.87:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:33,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:40,6:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:37,28:.: 0.42:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.22:1.000:. ./.:4:29,23:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:45,7:.:-0.34:1.000:. ./.:4:18,1:.:-2.28:1.000:. ./.:4:32,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:47,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,18:.: 0.78:0.999:. ./.:4:28,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:29,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:30,6:.:-1.28:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:32,3:.:-1.34:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:35,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:56,15:.: 0.78:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.57:1.000:. ./.:4:42,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,22:.: 0.54:1.000:. ./.:4:61,14:.: 1.01:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.89:1.000:. ./.:4:30,18:.:-0.57:1.000:. ./.:4:44,6:.:-0.46:1.000:. -chr1.1 58774660 chr1.1_058774660 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,17:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,20:.: 0.37:1.000:. ./.:4:6,14:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,42:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:10,15:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,10:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,5:.:-2.06:1.000:. ./.:4:2,9:.:-1.53:1.000:. ./.:4:6,13:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,12:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.90:0.998:. ./.:4:0,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:7,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.06:1.000:. ./.:4:8,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,13:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,23:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.17:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.48:1.000:. ./.:4:3,2:.:-2.17:1.000:. ./.:3:0,2:.:-2.48:1.000:. ./.:4:7,18:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,25:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.26:1.000:. ./.:4:9,29:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,45:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,27:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:8,27:.: 1.00:1.000:. ./.:4:3,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.43:1.000:. ./.:4:7,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:12,21:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,31:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,45:.: 2.06:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,42:.: 1.74:1.000:. ./.:6:5,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.16:1.000:. ./.:4:5,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,28:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.37:0.910:. ./.:4:7,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:5,19:.:-0.16:1.000:. ./.:4:4,10:.:-1.22:1.000:. ./.:4:8,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:6,20:.: 0.05:1.000:. ./.:4:5,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:6,12:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:9,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.11:1.000:. ./.:4:4,22:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,42:.: 1.74:1.000:. ./.:4:6,31:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,28:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.58:0.999:. ./.:4:0,32:.: 0.68:1.000:. ./.:4:5,32:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,16:.:-0.58:1.000:. ./.:4:3,9:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,24:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:3,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:7,13:.:-0.58:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,23:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.11:1.000:. ./.:4:3,17:.:-0.58:1.000:. ./.:4:5,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.68:1.000:. ./.:4:5,18:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.32:0.999:. ./.:4:0,26:.: 0.05:1.000:. ./.:3:0,8:.:-1.85:0.999:. ./.:4:7,30:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.79:1.000:. ./.:4:2,16:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:5,18:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.58:1.000:. ./.:4:8,42:.: 2.59:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.37:1.000:. ./.:5:8,30:.: 1.32:0.988:. ./.:4:5,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.85:1.000:. ./.:4:7,17:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:8,39:.: 2.27:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,12:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,37:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,14:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:3,14:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:5,11:.:-1.01:1.000:. ./.:4:11,21:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,22:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:5,26:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,11:.:-1.32:1.000:. ./.:4:9,29:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,23:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,13:.:-0.58:1.000:. ./.:4:8,28:.: 1.11:1.000:. ./.:4:9,31:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.16:1.000:. ./.:4:5,38:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.43:1.000:. ./.:4:11,11:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:15,35:.: 2.59:0.999:. ./.:4:7,28:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,20:.: 0.05:1.000:. ./.:4:3,14:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,14:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,23:.: 0.37:1.000:. ./.:4:6,13:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.58:1.000:. ./.:4:12,21:.: 0.79:1.000:. ./.:4:6,24:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.11:1.000:. ./.:4:6,32:.: 1.32:1.000:. ./.:4:7,19:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,26:.: 1.00:1.000:. -chr1.1 59058568 chr1.1_059058568 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:256,81:0.24: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,61:0.30:-0.74:1.000:0.986 0/0/0/1:4:159,52:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,150:0.53: 0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:161,165:0.50: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,143:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,35:0.24:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,69:0.27: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:160,64:0.29:-0.42:1.000:0.993 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-2.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,66:0.56:-2.28:1.000:0.971 0/0/0/1:4:163,72:0.31:-0.23:1.000:0.977 0/0/1/1:4:106,133:0.54:-0.16:1.000:0.986 0/0/0/1:4:196,71:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:172,58:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,210:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,137:0.56:-0.19:0.998:0.965 0/0/1/1:4:115,146:0.54: 0.22:1.000:0.985 0/0/0/1:4:237,84:0.26: 1.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:198,82:0.29: 0.54:1.000:0.989 0/0/0/1:4:75,21:0.22:-2.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:276,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,77:0.28: 0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:164,57:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,6:0.14:-3.48:1.000:0.947 0/0/1/1:4:126,118:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:148,63:0.30:-0.64:1.000:0.985 0/0/0/1:4:195,75:0.28: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:244,65:0.21: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,154:0.58: 0.17:1.000:0.923 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,45:0.25:-1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,18:0.37:-3.43:1.000:0.529 0/0/1/1:4:33,40:0.53:-3.00:1.000:0.990 0/0/1:3:17,7:0.29:-3.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,65:0.30:-0.59:1.000:0.980 0/0/0/1:4:172,66:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,180:0.71:-0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:146,136:0.47: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,135:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,135:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:146,112:0.43: 0.17:1.000:0.944 0/0/1/1:4:163,138:0.45: 0.90:1.000:0.982 0/1/1/1:4:58,173:0.71:-0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:289,70:0.20: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,70:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:245,81:0.25: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,28:0.31:-2.71:1.000:0.971 0/0/1/1:4:135,148:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,118:0.43: 0.39:1.000:0.947 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,186:0.49: 2.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,64:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,206:0.69: 0.65:1.000:0.967 0/0/1/1:4:122,151:0.54: 0.42:1.000:0.988 0/0/0/1:4:214,69:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,152:0.54: 0.42:1.000:0.986 0/0/0/1:4:252,60:0.20: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,102:0.45:-0.43:1.000:0.981 0/0/0/0/1/1:6:165,79:0.32:-0.07:1.000:0.919 0/0/0/1:4:230,56:0.20: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,104:0.44:-0.30:1.000:0.973 0/0/1/1:4:171,138:0.44: 1.04:1.000:0.968 0/0/0/0:4:304,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:271,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,47:0.20:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,41:0.21:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,103:0.48:-0.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:221,64:0.23: 0.63:0.910:1.000 0/0/0/0:4:233,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,70:0.23: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,123:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:225,53:0.19: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,71:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:210,61:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,88:0.44:-0.90:1.000:0.972 0/0/0/1:4:227,62:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,58:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,68:0.29:-0.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:153,133:0.46: 0.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:153,46:0.23:-0.84:0.984:1.000 0/0/1/1:4:137,153:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:151,111:0.42: 0.24:1.000:0.910 0/0/1/1:4:102,132:0.55:-0.24:1.000:0.981 0/0/1/1:4:142,127:0.47: 0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:136,133:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,121:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:176,54:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,124:0.47: 0.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:188,56:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,74:0.32:-0.24:0.999:0.962 0/0/0/1:4:226,62:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,125:0.47: 0.24:1.000:0.992 0/0/0/0:4:229,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,76:0.29: 0.25:1.000:0.991 0/0/0/1:4:204,62:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,54:0.23:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,69:0.32:-0.52:1.000:0.961 0/0/0/1:4:271,84:0.24: 1.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,212:0.73: 0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,117:0.48:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:226,77:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,68:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,170:0.72:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,104:0.45:-0.35:1.000:0.980 0/0/0/1:4:201,54:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:235,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,162:0.46: 1.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:201,56:0.22: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,77:0.27: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:228,93:0.29: 1.25:1.000:0.991 0/1/1/1:4:72,219:0.71: 0.73:0.999:0.994 0/0/0/0:4:243,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1:3:60,80:0.56:-1.86:0.999:0.976 0/1/1/1:4:90,240:0.69: 1.40:1.000:0.977 0/0/1/1:4:126,131:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,64:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:269,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,72:0.27: 0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,108:0.45:-0.21:1.000:0.981 0/0/0/0:4:300,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,127:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,54:0.26:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:180,55:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,81:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:136,181:0.55: 1.18:0.988:0.899 0/0/0/0:4:205,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,39:0.18:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,153:0.69:-0.66:1.000:0.978 0/1/1/1:4:53,183:0.73:-0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:148,48:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,46:0.24:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,129:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,52:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,264:0.75: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:209,62:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,120:0.47: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,93:0.46:-0.86:1.000:0.989 0/0/0/1:4:190,52:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,60:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:336,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,60:0.28:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:210,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,82:0.25: 1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,224:0.54: 2.62:1.000:0.985 0/0/0/0:4:281,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,72:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,170:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:230,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,162:0.57: 0.49:1.000:0.954 0/0/0/1:4:143,47:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,36:0.69:-3.40:1.000:0.967 0/0/1/1:4:83,93:0.52:-1.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:184,40:0.18:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,134:0.47: 0.56:1.000:0.992 0/0/0/1:4:220,75:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:218,78:0.27: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,102:0.48:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,195:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:241,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,127:0.53:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,124:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,111:0.45:-0.12:1.000:0.983 0/0/1/1:4:132,108:0.44:-0.14:1.000:0.973 0/0/1/1:4:111,151:0.56: 0.24:1.000:0.968 0/0/1/1:4:82,113:0.56:-0.91:1.000:0.963 0/0/0/0:4:233,0:0.00:-0.26:0.999:1.000 0/0/1/1:4:134,131:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,129:0.54:-0.30:1.000:0.985 0/0/1/1:4:101,118:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:125,56:0.31:-1.15:1.000:0.973 0/0/1/1:4:124,126:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,104:0.45:-0.31:1.000:0.976 0/0/0/1:4:151,49:0.25:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,76:0.31:-0.07:1.000:0.970 0/0/0/1:4:191,60:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,76:0.30: 0.10:1.000:0.985 0/0/1/1:4:143,107:0.42: 0.03:1.000:0.926 0/0/1/1:4:130,152:0.53: 0.58:1.000:0.993 0/1/1/1:4:63,257:0.76: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,164:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:173,58:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:223,71:0.25: 0.78:1.000:1.000 -chr1.1 59269690 chr1.1_059269690 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:59,23:.:-0.09:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,44:.: 0.44:1.000:. ./.:4:67,21:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,84:.: 2.19:1.000:. ./.:4:77,28:.: 0.92:1.000:. ./.:4:39,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:53,48:.: 0.74:1.000:. ./.:4:37,52:.: 0.22:1.000:. ./.:4:34,6:.:-1.93:1.000:. ./.:4:14,8:.:-2.71:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:37,39:.:-0.35:1.000:. ./.:4:66,35:.: 0.74:1.000:. ./.:4:71,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:57,45:.: 0.79:0.998:. ./.:4:73,30:.: 0.83:1.000:. ./.:4:49,59:.: 1.05:1.000:. ./.:4:86,27:.: 1.27:1.000:. ./.:4:10,13:.:-2.67:1.000:. ./.:4:52,14:.:-0.79:1.000:. ./.:4:54,51:.: 0.92:1.000:. ./.:4:47,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,12:.:-2.76:1.000:. ./.:4:69,20:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.05:1.000:. ./.:4:38,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,28:.: 1.31:1.000:. ./.:4:47,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:42,19:.:-1.01:1.000:. ./.:4:54,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:33,3:.:-2.10:1.000:. ./.:4:31,11:.:-1.84:1.000:. ./.:3:2,4:.:-3.41:1.000:. ./.:4:35,32:.:-0.75:1.000:. ./.:4:72,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:39,51:.: 0.26:1.000:. ./.:4:46,56:.: 0.79:1.000:. ./.:4:49,39:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,13:.:-0.66:1.000:. ./.:4:47,57:.: 0.87:1.000:. ./.:4:86,23:.: 1.09:1.000:. ./.:4:51,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:50,61:.: 1.18:1.000:. ./.:4:87,29:.: 1.40:1.000:. ./.:4:14,6:.:-2.80:1.000:. ./.:4:52,23:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,29:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,29:.: 0.44:1.000:. ./.:4:77,37:.: 1.31:1.000:. ./.:4:69,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:51,49:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,28:.:-1.01:1.000:. ./.:4:47,44:.: 0.30:1.000:. ./.:4:42,49:.: 0.30:1.000:. ./.:4:50,14:.:-0.88:1.000:. ./.:4:64,23:.: 0.13:1.000:. ./.:6:45,16:.:-1.01:1.000:. ./.:4:60,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,29:.:-0.96:1.000:. ./.:4:46,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:68,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:55,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:38,15:.:-1.36:1.000:. ./.:4:32,37:.:-0.66:1.000:. ./.:4:71,17:.: 0.17:0.910:. ./.:4:72,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:55,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:42,15:.:-1.18:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:60,18:.:-0.26:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,29:.:-1.14:1.000:. ./.:4:38,49:.: 0.13:1.000:. ./.:4:34,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,54:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,41:.: 1.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.40:0.984:. ./.:4:66,31:.: 0.57:1.000:. ./.:4:72,24:.: 0.52:1.000:. ./.:4:47,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:62,23:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,28:.: 0.87:1.000:. ./.:4:43,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:60,29:.: 0.22:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:68,26:.: 0.44:1.000:. ./.:4:58,11:.:-0.66:0.999:. ./.:4:66,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:62,60:.: 1.66:1.000:. ./.:4:60,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:100,31:.: 2.06:1.000:. ./.:4:44,28:.:-0.53:1.000:. ./.:4:62,27:.: 0.22:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:44,45:.: 0.22:1.000:. ./.:4:49,54:.: 0.83:1.000:. ./.:4:41,9:.:-1.49:1.000:. ./.:4:46,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:32,17:.:-1.53:1.000:. ./.:4:59,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:36,38:.:-0.44:1.000:. ./.:4:65,21:.: 0.09:1.000:. ./.:4:40,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:70,24:.: 0.44:1.000:. ./.:4:82,38:.: 1.57:1.000:. ./.:4:48,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:63,26:.: 0.22:1.000:. ./.:4:86,40:.: 1.84:1.000:. ./.:4:44,55:.: 0.65:0.999:. ./.:4:64,19:.:-0.05:1.000:. ./.:3:15,27:.:-1.84:0.999:. ./.:4:53,46:.: 0.65:1.000:. ./.:4:38,46:.: 0.00:1.000:. ./.:4:45,21:.:-0.79:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.09:1.000:. ./.:4:70,27:.: 0.57:1.000:. ./.:4:50,46:.: 0.52:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.35:1.000:. ./.:4:38,58:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:37,43:.:-0.18:1.000:. ./.:4:79,32:.: 1.18:1.000:. ./.:5:42,63:.: 0.92:0.988:. ./.:4:57,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:25,32:.:-1.18:1.000:. ./.:4:34,31:.:-0.83:1.000:. ./.:4:22,42:.:-0.88:1.000:. ./.:4:80,21:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,35:.:-0.70:1.000:. ./.:4:49,18:.:-0.75:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,50:.: 0.70:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.61:1.000:. ./.:4:38,44:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,37:.:-0.88:1.000:. ./.:4:38,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:41,41:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,28:.: 0.39:1.000:. ./.:4:27,34:.:-1.01:1.000:. ./.:4:37,18:.:-1.27:1.000:. ./.:4:89,33:.: 1.66:1.000:. ./.:4:57,48:.: 0.92:1.000:. ./.:4:74,27:.: 0.74:1.000:. ./.:4:69,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:89,30:.: 1.53:1.000:. ./.:4:50,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:51,52:.: 0.83:1.000:. ./.:4:51,51:.: 0.79:1.000:. ./.:4:12,12:.:-2.63:1.000:. ./.:4:19,17:.:-2.10:1.000:. ./.:4:86,27:.: 1.27:1.000:. ./.:4:62,50:.: 1.22:1.000:. ./.:4:83,34:.: 1.44:1.000:. ./.:4:75,31:.: 0.96:1.000:. ./.:4:45,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:40,53:.: 0.39:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.48:1.000:. ./.:4:41,53:.: 0.44:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.70:1.000:. ./.:4:70,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:43,22:.:-0.83:1.000:. ./.:4:45,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.09:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.18:0.999:. ./.:4:38,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,41:.:-0.48:1.000:. ./.:4:27,41:.:-0.70:1.000:. ./.:4:31,41:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:58,21:.:-0.22:1.000:. ./.:4:48,38:.: 0.09:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.83:1.000:. ./.:4:83,20:.: 0.83:1.000:. ./.:4:87,25:.: 1.22:1.000:. ./.:4:98,25:.: 1.71:1.000:. ./.:4:47,36:.:-0.05:1.000:. ./.:4:70,54:.: 1.75:1.000:. ./.:4:62,50:.: 1.22:1.000:. ./.:4:89,28:.: 1.44:1.000:. ./.:4:70,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.22:1.000:. -chr1.1 59868522 chr1.1_059868522 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:249,80:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,109:0.50:-1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,166:0.47: 0.77:1.000:0.992 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,91:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,95:0.25: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,87:0.53:-1.96:1.000:0.992 0/0/1/1:4:209,164:0.42: 1.29:1.000:0.909 0/0/0/1:4:257,71:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,70:0.41:-1.88:1.000:0.887 0/0/1/1:4:41,69:0.59:-2.64:1.000:0.879 0/0/1/1:4:84,141:0.59:-0.92:1.000:0.882 0/0/0/1:4:226,87:0.26: 0.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:264,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,71:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,208:0.48: 1.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:199,195:0.47: 1.60:0.998:0.993 0/0/1/1:4:124,168:0.54: 0.08:1.000:0.985 0/0/1/1:4:148,263:0.60: 1.86:1.000:0.807 0/0/0/1:4:215,115:0.33: 0.65:1.000:0.916 0/0/1/1:4:59,49:0.43:-2.67:1.000:0.952 0/0/1/1:4:169,160:0.46: 0.63:1.000:0.990 0/0/0/1:4:280,86:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,212:0.73:-0.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:34,72:0.63:-2.70:1.000:0.582 0/0/0/1:4:287,86:0.22: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,226:0.63: 0.74:1.000:0.507 0/0/1/1:4:144,154:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:258,104:0.27: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:263,76:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,94:0.30: 0.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:144,143:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:87,15:0.14:-2.76:1.000:0.965 0/0/0/1:4:89,40:0.29:-2.35:1.000:0.989 0/0/1:3:55,16:0.21:-3.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,78:0.22: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,275:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,166:0.49: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:203,194:0.47: 1.65:1.000:0.991 0/0/1/1:4:218,191:0.45: 1.83:1.000:0.974 0/0/1/1:4:113,174:0.57: 0.01:1.000:0.948 0/1/1/1:4:111,259:0.65: 1.25:1.000:0.783 0/0/0/1:4:259,94:0.25: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,83:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,153:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:284,75:0.20: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,303:0.76: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,207:0.53: 1.25:1.000:0.992 0/0/0/1:4:207,89:0.29: 0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:310,99:0.23: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,66:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,208:0.57: 0.80:1.000:0.934 0/0/0/1:4:159,76:0.31:-0.77:1.000:0.978 0/0/1/1:4:192,159:0.43: 0.96:1.000:0.951 0/0/1/1:4:132,153:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:295,79:0.20: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,66:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,88:0.27: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,75:0.28:-0.46:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:133,110:0.43:-0.65:1.000:0.613 0/0/0/1:4:203,66:0.23:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,71:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,93:0.28: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,158:0.44: 0.78:1.000:0.973 0/0/0/1:4:285,81:0.21: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,156:0.58:-0.49:1.000:0.928 0/0/0/1:4:106,56:0.33:-1.86:1.000:0.927 0/0/1/1:4:155,149:0.47: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:225,72:0.23: 0.16:0.910:1.000 0/0/1/1:4:98,159:0.58:-0.44:1.000:0.914 0/1/1/1:4:47,268:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,105:0.56:-1.67:1.000:0.959 0/0/1/1:4:147,188:0.53: 0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:132,170:0.53: 0.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:126,141:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,137:0.48:-0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,208:0.65: 0.19:1.000:0.747 0/0/1/1:4:156,150:0.47: 0.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:219,109:0.32: 0.62:1.000:0.963 0/0/0/1:4:183,76:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,105:0.55:-1.61:0.984:0.977 0/0/0/1:4:156,61:0.27:-1.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:121,174:0.56: 0.13:1.000:0.973 0/0/1/1:4:135,111:0.43:-0.61:1.000:0.947 0/0/0/1:4:214,90:0.28: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:171,90:0.33:-0.38:1.000:0.930 0/0/0/1:4:137,55:0.27:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,140:0.60:-1.02:1.000:0.790 0/0/0/1:4:201,73:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,73:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,68:0.28:-0.82:0.999:0.996 0/0/0/0:4:232,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,250:0.63: 1.23:1.000:0.562 0/0/0/1:4:183,53:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,74:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,84:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,105:0.51:-1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,118:0.54:-1.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:166,130:0.42: 0.14:1.000:0.907 0/0/0/1:4:270,87:0.23: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,42:0.27:-2.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:167,145:0.44: 0.38:1.000:0.972 0/0/0/1:4:155,43:0.21:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,66:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,137:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,53:0.19:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,210:0.66: 0.14:1.000:0.849 0/0/1/1:4:175,170:0.47: 0.87:1.000:0.992 0/0/0/0:4:327,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,166:0.49: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,66:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:290,104:0.25: 1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,154:0.51: 0.05:0.999:0.997 0/0/0/1:4:211,89:0.28: 0.20:1.000:0.995 0/0/1:3:94,62:0.38:-1.95:0.999:1.000 0/0/1/1:4:152,163:0.49: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,109:0.49:-1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:195,78:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,80:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:174,73:0.28:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:268,75:0.21: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,50:0.19:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,71:0.19: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,86:0.27: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:224,76:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,90:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:208,148:0.40: 1.04:0.988:0.971 0/1/1/1:4:54,198:0.72:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,140:0.61:-1.05:1.000:0.744 0/0/1/1:4:121,101:0.43:-0.96:1.000:0.955 0/0/0/1:4:198,56:0.21:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,70:0.25:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,145:0.62:-1.02:1.000:0.576 0/0/0/1:4:166,91:0.34:-0.44:1.000:0.889 0/0/0/1:4:173,75:0.29:-0.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:262,94:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:234,93:0.27: 0.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:199,74:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:216,64:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,194:0.66:-0.25:1.000:0.896 0/1/1/1:4:86,243:0.68: 0.63:1.000:0.958 0/0/0/1:4:180,53:0.22:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,77:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,52:0.28:-1.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:254,94:0.26: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:195,214:0.50: 1.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:221,101:0.30: 0.53:1.000:0.987 0/0/0/1:4:183,61:0.24:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,81:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,76:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,196:0.47: 1.60:1.000:0.994 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,64:0.61:-2.83:1.000:0.633 0/0/0/1:4:214,64:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,263:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:267,64:0.18: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,303:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,230:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,144:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,181:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:162,59:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:242,71:0.21: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,90:0.29: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:177,84:0.31:-0.38:1.000:0.979 0/0/0/1:4:188,93:0.31:-0.08:1.000:0.966 0/0/1/1:4:166,130:0.42: 0.14:1.000:0.907 0/0/1/1:4:108,117:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,221:0.75:-0.28:0.999:1.000 0/1/1/1:4:94,217:0.65: 0.36:1.000:0.765 0/0/0/0:4:245,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,126:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,113:0.41:-0.37:1.000:0.869 0/0/0/1:4:244,70:0.21: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,67:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,140:0.38: 0.98:1.000:0.551 0/0/0/1:4:170,63:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:264,85:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,168:0.51: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,177:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,96:0.31: 0.11:1.000:0.973 0/0/1/1:4:150,169:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:268,95:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,111:0.31: 0.77:1.000:0.970 0/1/1/1:4:39,152:0.73:-1.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,174:0.61:-0.31:1.000:0.690 -chr1.1 60072647 chr1.1_060072647 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:53,136:0.72: 0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,104:0.81:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,133:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,141:0.73: 0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,165:0.74: 1.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,184:0.79: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,79:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,45:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,40:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,32:0.59:-2.46:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-2.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,200:1.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,114:0.55: 0.85:1.000:0.980 0/1/1/1:4:49,129:0.72: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,109:0.55: 0.62:1.000:0.976 0/0/1/1:4:90,121:0.56: 1.05:1.000:0.967 0/0/1/1:4:110,102:0.47: 1.07:0.998:0.991 0/0/0/1:4:155,61:0.29: 1.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:105,131:0.54: 1.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:104,123:0.53: 1.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,16:0.38:-2.71:1.000:0.578 0/0/1/1:4:84,77:0.47:-0.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:116,112:0.48: 1.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,124:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,21:0.57:-2.84:1.000:0.945 0/0/1/1:4:95,83:0.45: 0.31:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,203:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,98:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,114:0.46: 1.71:1.000:0.988 0/0/1/1:4:99,110:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,69:0.46:-0.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:70,73:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,16:0.38:-2.71:1.000:0.578 0/1/1/1:4:19,52:0.73:-2.06:1.000:0.998 0/1/1:3:13,21:0.61:-2.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,104:0.53: 0.60:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,157:0.79: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,134:0.73: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,64:0.49:-0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,133:0.79: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,112:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,82:0.46: 0.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,81:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,107:0.69:-0.20:1.000:0.967 0/0/1/1:4:84,96:0.52: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,37:0.28:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,184:0.74: 1.87:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,57:0.46:-0.97:1.000:0.989 0/0/0/1:4:86,43:0.34:-0.77:1.000:0.874 0/1/1/1:4:35,93:0.73:-0.80:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,232:1.00: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,119:0.78:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,109:0.59: 0.40:1.000:0.879 0/1/1/1:4:46,168:0.79: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,37:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,134:0.78: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,69:0.55:-0.91:1.000:0.983 1/1/1/1:4:1,147:0.99:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:44,84:0.65:-0.80:1.000:0.898 0/1/1/1:4:35,127:0.78:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,36:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,121:0.71: 0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,71:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,98:0.54: 0.29:1.000:0.988 0/1/1/1:4:33,95:0.74:-0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,101:0.79:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,124:0.73: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,76:0.50:-0.40:0.910:0.997 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,116:0.73:-0.13:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,239:1.00: 1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,112:0.78:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,113:0.77:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,66:0.47:-0.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,77:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:84,47:0.36:-0.73:1.000:0.673 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,103:0.75:-0.60:0.984:0.999 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,127:0.80:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,143:0.83: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,59:0.45:-0.82:1.000:0.983 0/1/1/1:4:35,144:0.81: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,55:0.44:-0.93:1.000:0.969 0/1/1/1:4:30,88:0.75:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,60:0.41:-0.44:1.000:0.874 0/0/1/1:4:82,81:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,79:0.52:-0.40:0.999:0.994 0/1/1/1:4:30,98:0.77:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,91:0.47: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,71:0.46:-0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:63,83:0.55:-0.40:1.000:0.975 0/0/1/1:4:54,60:0.51:-1.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,101:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,125:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,60:0.29: 1.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,79:0.68:-1.06:1.000:0.943 0/0/0/1:4:107,53:0.34:-0.09:1.000:0.885 0/1/1/1:4:26,81:0.76:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,142:0.79: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,57:0.54:-1.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:64,74:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,70:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,103:0.52: 0.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,204:0.77: 2.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,129:0.73: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,74:0.56:-0.77:1.000:0.967 0/0/1/1:4:104,115:0.51: 1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,102:0.55: 0.40:0.999:0.984 0/0/1/1:4:86,84:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/1/1:3:32,65:0.66:-1.48:0.999:1.000 0/1/1/1:4:45,130:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,82:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,114:0.81:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,81:0.59:-0.66:1.000:0.842 0/0/1/1:4:69,57:0.44:-0.84:1.000:0.971 0/0/1/1:4:69,92:0.56:-0.06:1.000:0.971 0/0/1/1:4:81,58:0.41:-0.55:1.000:0.877 0/0/0/1:4:105,52:0.34:-0.15:1.000:0.885 0/1/1/1:4:67,174:0.72: 1.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,33:0.32:-1.29:1.000:0.953 0/0/1/1:4:84,92:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:59,98:0.61:-0.15:0.988:0.968 0/0/1/1:4:53,60:0.51:-1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,42:0.46:-1.66:1.000:0.987 0/1/1/1:4:28,84:0.75:-1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,117:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,137:0.74: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,43:0.53:-1.88:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,180:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,140:0.73: 0.60:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,184:0.80: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,89:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,87:0.72:-0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,65:0.55:-1.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:59,67:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,65:0.43:-0.31:1.000:0.936 0/1/1/1:4:33,113:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,49:0.32:-0.15:1.000:0.952 0/1/1/1:4:35,81:0.69:-1.06:1.000:0.980 0/1/1/1:4:52,167:0.76: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,198:0.77: 2.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,152:0.69: 1.22:1.000:0.974 0/0/1/1:4:92,98:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,197:0.75: 2.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,127:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,157:0.72: 1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,100:0.53: 0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,30:0.71:-2.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:145,51:0.28: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,148:0.78: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,112:0.49: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,185:0.76: 1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,136:0.71: 0.60:1.000:0.992 0/1/1/1:4:35,135:0.79: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,156:0.72: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,108:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,38:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,86:0.53:-0.15:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,157:0.78: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,125:0.80:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,83:0.45: 0.40:0.999:0.975 0/0/1/1:4:62,89:0.58:-0.29:1.000:0.925 0/0/1/1:4:98,119:0.53: 1.18:1.000:0.991 0/1/1/1:4:40,133:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,45:0.32:-0.46:1.000:0.945 0/0/1/1:4:72,81:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,127:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,44:0.36:-0.89:1.000:0.712 0/0/1/1:4:73,81:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,101:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,94:0.54: 0.11:1.000:0.987 0/0/1/1:4:91,102:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,87:0.56:-0.26:1.000:0.969 0/1/1/1:4:50,182:0.79: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,194:0.74: 2.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,179:0.74: 1.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,127:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,140:0.74: 0.58:1.000:0.998 -chr1.1 60190289 chr1.1_060190289 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:82,90:0.51: 1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,64:0.56:-0.24:1.000:0.974 0/0/1/1:4:84,76:0.46: 1.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:70,80:0.52: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,85:0.52: 1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,67:0.31: 2.51:1.000:0.973 0/0/1/1:4:35,41:0.52:-1.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,50:0.33: 0.79:1.000:0.930 0/0/1/1:4:50,60:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,16:0.58:-2.59:1.000:0.925 0/0/1/1:4:17,24:0.57:-2.20:1.000:0.947 0/0/0/1:4:91,39:0.29: 0.26:1.000:0.990 0/0/0/0:4:130,1:0.01: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,69:0.46: 0.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:73,81:0.51: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,100:0.57: 1.43:1.000:0.957 0/1/1/1:4:29,124:0.80: 0.90:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,198:1.00: 2.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,83:0.58: 0.51:1.000:0.906 0/0/1/1:4:67,85:0.54: 0.87:1.000:0.986 0/0/0/1:4:16,10:0.37:-2.62:1.000:0.510 0/0/1/1:4:68,89:0.55: 1.01:1.000:0.979 0/0/0/1:4:125,39:0.23: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,108:0.78: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,29:0.63:-2.09:1.000:0.573 0/0/1/1:4:71,80:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,174:0.81: 2.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,101:0.73: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,106:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,119:0.78: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,76:0.52: 0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,38:0.72:-1.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:31,7:0.18:-2.29:1.000:0.999 0/0/1:3:19,11:0.36:-2.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,48:0.33: 0.65:1.000:0.938 0/1/1/1:4:22,111:0.83: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,37:0.26: 0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,107:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,44:0.30: 0.71:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,87:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,64:0.46: 0.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:59,53:0.46:-0.24:1.000:0.986 0/0/1/1:4:43,54:0.54:-0.65:1.000:0.987 0/0/1/1:4:56,46:0.44:-0.51:1.000:0.962 0/0/1/1:4:70,56:0.43: 0.15:1.000:0.948 0/1/1/1:4:35,133:0.78: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,124:0.79: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,53:0.47:-0.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,24:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,36:0.45:-1.21:1.000:0.982 0/0/1/1:4:88,94:0.50: 1.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,60:0.52:-0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,56:0.45: 0.01:1.000:0.978 0/0/0/1:4:88,39:0.30: 0.18:1.000:0.985 0/0/1/1:4:50,78:0.59: 0.21:1.000:0.834 0/1/1/1:4:32,80:0.70:-0.24:1.000:0.987 0/0/1/1:4:50,56:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,71:0.70:-0.57:1.000:0.984 0/0/0/0/1/1:6:51,24:0.31:-1.26:1.000:0.906 0/0/0/1:4:86,23:0.21:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,29:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,61:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,48:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,124:0.71: 1.40:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,15:0.28:-1.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,52:0.46:-0.32:1.000:0.988 0/1/1/1:4:30,80:0.72:-0.29:0.910:0.994 0/0/1/1:4:65,62:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:19,100:0.83:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,44:0.54:-1.15:1.000:0.987 0/0/0/1:4:77,29:0.27:-0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,124:0.73: 1.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,59:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,32:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,58:0.55:-0.49:1.000:0.983 0/1/1/1:4:30,94:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,16:0.19:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,90:0.72: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,32:0.39:-1.12:0.984:0.675 0/1/1/1:4:24,76:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,89:0.74:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,55:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,60:0.52:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,31:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,37:0.50:-1.37:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,48:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,54:0.46:-0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:46,53:0.52:-0.60:0.999:0.995 0/0/1/1:4:56,40:0.40:-0.68:1.000:0.826 0/0/1/1:4:59,53:0.46:-0.24:1.000:0.986 0/1/1/1:4:20,77:0.79:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,65:0.67:-0.71:1.000:0.928 0/1/1/1:4:31,85:0.72:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,59:0.73:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,43:0.49:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,43:0.42:-0.57:1.000:0.901 0/0/0/1:4:77,25:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,23:0.31:-1.32:1.000:0.976 0/0/0/1:4:74,38:0.33:-0.24:1.000:0.916 0/0/1/1:4:41,40:0.48:-1.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,30:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,41:0.55:-1.32:1.000:0.984 0/0/1/1:4:63,53:0.44:-0.13:1.000:0.971 0/0/1/1:4:37,34:0.46:-1.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:56,78:0.57: 0.37:1.000:0.955 0/0/1/1:4:78,98:0.54: 1.54:1.000:0.987 0/0/1/1:4:66,62:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/1/1/1:4:20,59:0.74:-1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,83:0.43: 1.81:1.000:0.952 0/0/1/1:4:40,49:0.53:-0.87:0.999:0.991 0/1/1/1:4:28,76:0.72:-0.46:1.000:0.995 0/0/1:3:55,21:0.27:-1.23:0.999:1.000 0/0/0/1:4:103,25:0.19: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,66:0.74:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,38:0.31: 0.01:1.000:0.977 0/1/1/1:4:28,81:0.73:-0.32:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,59:0.67:-0.93:1.000:0.900 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,69:0.68:-0.60:1.000:0.965 0/0/0/1:4:85,25:0.22:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,102:0.54: 1.73:1.000:0.987 0/0/1/1:4:44,49:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,86:0.66: 0.21:1.000:0.863 0/0/0/1/1:5:70,47:0.39:-0.10:0.988:0.970 0/1/1/1:4:25,58:0.69:-1.04:1.000:0.968 0/0/1/1:4:41,40:0.48:-1.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:57,18:0.24:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,49:0.43:-0.26:1.000:0.941 0/0/1/1:4:67,74:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,26:0.43:-1.73:1.000:0.957 0/1/1/1:4:37,105:0.73: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,62:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,95:0.49: 1.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,91:0.69: 0.26:1.000:0.970 0/0/1/1:4:35,37:0.50:-1.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,39:0.44:-0.98:1.000:0.973 0/0/1/1:4:47,57:0.53:-0.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:25,48:0.64:-1.32:1.000:0.736 0/0/1/1:4:58,78:0.56: 0.43:1.000:0.971 0/0/1/1:4:31,39:0.54:-1.40:1.000:0.987 0/0/0/1:4:110,43:0.28: 0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,38:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,69:0.49: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,68:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,37:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,52:0.48:-0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:80,91:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,41:0.26: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,14:0.37:-2.31:1.000:0.588 0/0/0/1:4:89,34:0.27: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,97:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:133,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,135:0.81: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,120:0.81: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,76:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:102,39:0.27: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,101:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,32:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,78:0.48: 0.98:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,128:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,138:0.76: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,36:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,98:0.77: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,116:0.78: 0.73:0.999:1.000 0/0/1/1:4:79,68:0.45: 0.73:1.000:0.978 0/0/0/1:4:97,39:0.28: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,67:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,25:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,32:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,31:0.28:-0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,100:0.80: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,94:0.52: 1.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,88:0.55: 0.98:1.000:0.982 0/0/1/1:4:68,84:0.54: 0.87:1.000:0.990 0/0/0/1:4:105,18:0.14: 0.07:1.000:0.979 0/0/0/1:4:101,34:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,124:0.57: 2.51:1.000:0.941 0/0/0/1:4:132,56:0.29: 1.87:1.000:0.991 0/1/1/1:4:25,88:0.77:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,89:0.54: 1.07:1.000:0.985 -chr1.1 60454213 chr1.1_060454213 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:126,142:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,158:0.80:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,119:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,184:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,225:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,159:0.56: 0.98:1.000:0.969 0/0/1/1:4:67,60:0.46:-1.71:1.000:0.989 0/0/0/1:4:158,60:0.34: 0.00:1.000:0.889 0/0/1/1:4:85,128:0.57:-0.09:1.000:0.943 0/1/1/1:4:10,47:0.80:-3.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,50:0.77:-2.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,91:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,66:0.38:-0.45:1.000:0.547 0/1/1/1:4:56,188:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,184:0.71: 0.57:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,217:0.75: 1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,183:0.77: 0.23:0.998:1.000 0/1/1/1:4:51,196:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,161:0.52: 1.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,233:0.74: 1.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,20:0.58:-3.48:1.000:0.928 0/0/1/1:4:107,112:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,73:0.36: 0.30:1.000:0.687 0/1/1/1:4:41,171:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,30:0.70:-3.33:1.000:0.987 0/1/1/1:4:44,186:0.78: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,179:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,176:0.78: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,209:0.70: 1.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:134,60:0.36:-0.45:1.000:0.707 0/1/1/1:4:60,168:0.71: 0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,111:0.55:-0.53:1.000:0.975 0/1/1/1:4:4,26:0.85:-3.54:1.000:0.989 0/1/1/1:4:29,64:0.66:-2.35:1.000:0.861 0/1/1:3:7,11:0.58:-3.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,62:0.34: 0.15:1.000:0.892 0/1/1/1:4:54,191:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,123:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,194:0.71: 0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,105:0.50:-0.38:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,223:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,132:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,182:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,192:0.85: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:102,136:0.54: 0.38:1.000:0.987 0/0/1/1:4:107,171:0.59: 1.13:1.000:0.889 0/1/1/1:4:45,188:0.78: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,139:0.87:-1.15:1.000:0.906 0/1/1/1:4:49,173:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,120:0.62:-0.60:1.000:0.625 0/0/1/1:4:92,119:0.53:-0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:73,232:0.73: 1.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,117:0.57:-0.41:1.000:0.953 0/1/1/1:4:69,222:0.73: 1.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,133:0.54: 0.28:1.000:0.987 0/0/1/1:4:118,125:0.49: 0.47:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,225:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,190:0.76: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,226:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:88,94:0.49:-0.68:1.000:0.885 0/0/1/1:4:110,135:0.52: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,109:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,225:0.76: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,119:0.57:-0.38:1.000:0.943 0/1/1/1:4:52,189:0.76: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,73:0.51:-1.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,109:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,194:0.79: 0.40:0.910:1.000 0/0/1/1:4:91,119:0.54:-0.15:1.000:0.989 0/1/1/1:4:58,215:0.76: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,128:0.73:-0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,120:0.53:-0.09:1.000:0.991 0/1/1/1:4:66,194:0.72: 0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,191:0.74: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,95:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,113:0.54:-0.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,206:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,30:0.25:-0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,261:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,141:0.80:-0.86:0.984:1.000 1/1/1/1:4:0,283:1.00: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,288:1.00: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,98:0.48:-0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,167:0.84:-0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:113,158:0.55: 1.00:1.000:0.976 0/1/1/1:4:67,148:0.66:-0.06:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,219:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,194:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,181:0.76: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,161:0.76:-0.24:0.999:1.000 0/1/1/1:4:59,183:0.73: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,165:0.53: 1.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,132:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,198:0.77: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,173:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,184:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,141:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,131:0.46: 1.11:1.000:0.989 0/0/1/1:4:96,139:0.56: 0.32:1.000:0.964 0/0/1/1:4:59,72:0.52:-1.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:167,57:0.32: 0.11:1.000:0.945 0/0/1/1:4:69,79:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,118:0.53:-0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:28,153:0.83:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,194:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,121:0.54:-0.13:1.000:0.985 0/0/1/1:4:85,111:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/1/1/1:4:69,240:0.75: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,133:0.53: 0.40:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,187:0.81: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,251:0.76: 1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,180:0.72: 0.41:0.999:0.996 0/1/1/1:4:52,175:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/1/1:3:32,91:0.71:-1.79:0.999:1.000 0/0/1/1:4:110,134:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,160:0.78:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,137:0.60: 0.02:1.000:0.824 0/1/1/1:4:48,197:0.78: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,155:0.71:-0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:152,58:0.34:-0.15:1.000:0.886 0/1/1/1:4:52,165:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,133:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,128:0.55: 0.04:1.000:0.978 0/0/1/1:4:103,131:0.53: 0.30:1.000:0.992 0/1/1/1:4:71,199:0.71: 0.98:1.000:0.991 0/0/0/1/1:5:161,128:0.44: 1.34:0.988:0.903 0/1/1/1:4:47,144:0.72:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,81:0.55:-1.49:1.000:0.977 0/0/1/1:4:77,92:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,169:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,116:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,85:0.55:-1.33:1.000:0.981 1/1/1/1:4:1,247:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,121:0.54:-0.07:1.000:0.990 0/1/1/1:4:68,219:0.73: 1.30:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,165:0.66: 0.38:1.000:0.892 0/1/1/1:4:36,165:0.80:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,58:0.37:-0.83:1.000:0.512 0/0/1/1:4:116,123:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,144:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,110:0.47: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:115,121:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,67:0.46:-1.45:1.000:0.990 0/0/1/1:4:135,156:0.51: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,178:0.54: 1.75:1.000:0.986 0/0/1/1:4:110,99:0.46:-0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:54,185:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,127:0.45: 1.24:1.000:0.976 0/0/1/1:4:106,107:0.48:-0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,137:0.49: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,124:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,24:0.60:-3.39:1.000:0.773 0/0/1/1:4:85,82:0.47:-0.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,182:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,70:0.33: 0.90:1.000:0.925 0/1/1/1:4:61,188:0.73: 0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,184:0.77: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,101:0.53:-0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,125:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,200:0.78: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,91:0.47:-0.60:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,134:0.76:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,230:1.00: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,246:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,135:0.52: 0.53:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,203:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,178:0.76: 0.13:0.999:1.000 0/0/1/1:4:95,98:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,103:0.55:-0.77:1.000:0.978 0/0/1/1:4:86,95:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,53:0.34:-0.64:1.000:0.836 0/0/1/1:4:126,64:0.38:-0.53:1.000:0.518 0/0/1/1:4:104,105:0.48:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,66:0.41:-0.86:1.000:0.839 0/1/1/1:4:32,140:0.79:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,216:0.73: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,115:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,106:0.46: 0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:121,82:0.42:-0.28:1.000:0.910 0/0/1/1:4:100,128:0.53: 0.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:70,208:0.72: 1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:119,143:0.52: 0.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,134:0.69:-0.60:1.000:0.975 0/1/1/1:4:62,175:0.71: 0.36:1.000:0.991 -chr1.1 60508241 chr1.1_060508241 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:344,133:.: 1.60:1.000:. ./.:4:188,90:.:-0.46:1.000:. ./.:4:296,107:.: 0.84:1.000:. ./.:4:235,125:.: 0.39:1.000:. ./.:4:314,132:.: 1.28:1.000:. ./.:4:391,153:.: 2.30:1.000:. ./.:4:187,93:.:-0.44:1.000:. ./.:4:218,97:.:-0.07:1.000:. ./.:4:297,130:.: 1.09:1.000:. ./.:4:64,18:.:-2.49:1.000:. ./.:4:71,21:.:-2.38:1.000:. ./.:4:237,109:.: 0.25:1.000:. ./.:4:225,109:.: 0.12:1.000:. ./.:4:207,103:.:-0.13:1.000:. ./.:4:290,110:.: 0.81:1.000:. ./.:4:299,153:.: 1.34:1.000:. ./.:4:325,125:.: 1.32:0.998:. ./.:4:329,134:.: 1.46:1.000:. ./.:4:398,129:.: 2.12:1.000:. ./.:4:210,120:.: 0.08:1.000:. ./.:4:60,31:.:-2.39:1.000:. ./.:4:252,111:.: 0.42:1.000:. ./.:4:230,113:.: 0.22:1.000:. ./.:4:228,105:.: 0.11:1.000:. ./.:4:67,20:.:-2.43:1.000:. ./.:4:226,116:.: 0.21:1.000:. ./.:4:283,157:.: 1.22:1.000:. ./.:4:226,116:.: 0.21:1.000:. ./.:4:316,117:.: 1.15:1.000:. ./.:4:328,114:.: 1.24:1.000:. ./.:4:353,131:.: 1.68:1.000:. ./.:4:246,132:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,25:.:-2.37:1.000:. ./.:4:93,29:.:-2.07:1.000:. ./.:3:35,21:.:-2.75:1.000:. ./.:4:290,146:.: 1.18:1.000:. ./.:4:318,122:.: 1.22:1.000:. ./.:4:282,147:.: 1.11:1.000:. ./.:4:258,89:.: 0.26:1.000:. ./.:4:224,110:.: 0.12:1.000:. ./.:4:229,101:.: 0.08:1.000:. ./.:4:236,108:.: 0.23:1.000:. ./.:4:237,96:.: 0.11:1.000:. ./.:4:233,72:.:-0.18:1.000:. ./.:4:191,98:.:-0.34:1.000:. ./.:4:221,108:.: 0.07:1.000:. ./.:4:310,136:.: 1.28:1.000:. ./.:4:387,156:.: 2.29:1.000:. ./.:4:205,67:.:-0.52:1.000:. ./.:4:238,99:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,62:.:-1.01:1.000:. ./.:4:302,138:.: 1.22:1.000:. ./.:4:172,90:.:-0.62:1.000:. ./.:4:283,112:.: 0.75:1.000:. ./.:4:234,102:.: 0.14:1.000:. ./.:4:226,98:.: 0.02:1.000:. ./.:4:188,91:.:-0.45:1.000:. ./.:4:243,79:.: 0.00:1.000:. ./.:4:231,90:.:-0.01:1.000:. ./.:6:169,54:.:-1.03:1.000:. ./.:4:216,71:.:-0.36:1.000:. ./.:4:201,99:.:-0.23:1.000:. ./.:4:208,108:.:-0.06:1.000:. ./.:4:221,69:.:-0.33:1.000:. ./.:4:269,100:.: 0.49:1.000:. ./.:4:232,103:.: 0.13:1.000:. ./.:4:132,66:.:-1.28:1.000:. ./.:4:219,95:.:-0.08:1.000:. ./.:4:167,85:.:-0.73:0.910:. ./.:4:291,110:.: 0.82:1.000:. ./.:4:249,110:.: 0.38:1.000:. ./.:4:119,46:.:-1.63:1.000:. ./.:4:256,102:.: 0.37:1.000:. ./.:4:283,154:.: 1.19:1.000:. ./.:4:274,109:.: 0.63:1.000:. ./.:4:172,71:.:-0.82:1.000:. ./.:4:236,85:.:-0.01:1.000:. ./.:4:214,81:.:-0.28:1.000:. ./.:4:191,87:.:-0.46:1.000:. ./.:4:233,82:.:-0.07:1.000:. ./.:4:204,76:.:-0.44:0.984:. ./.:4:179,86:.:-0.59:1.000:. ./.:4:206,105:.:-0.12:1.000:. ./.:4:246,110:.: 0.35:1.000:. ./.:4:209,99:.:-0.15:1.000:. ./.:4:244,89:.: 0.11:1.000:. ./.:4:115,65:.:-1.47:1.000:. ./.:4:157,63:.:-1.06:1.000:. ./.:4:202,71:.:-0.51:1.000:. ./.:4:258,100:.: 0.37:1.000:. ./.:4:200,75:.:-0.49:0.999:. ./.:4:210,94:.:-0.19:1.000:. ./.:4:217,87:.:-0.19:1.000:. ./.:4:259,82:.: 0.20:1.000:. ./.:4:147,80:.:-0.98:1.000:. ./.:4:253,75:.: 0.06:1.000:. ./.:4:120,69:.:-1.38:1.000:. ./.:4:185,67:.:-0.73:1.000:. ./.:4:177,79:.:-0.68:1.000:. ./.:4:238,101:.: 0.17:1.000:. ./.:4:139,50:.:-1.38:1.000:. ./.:4:251,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:126,39:.:-1.63:1.000:. ./.:4:136,72:.:-1.18:1.000:. ./.:4:159,61:.:-1.06:1.000:. ./.:4:175,75:.:-0.75:1.000:. ./.:4:156,68:.:-1.02:1.000:. ./.:4:271,133:.: 0.85:1.000:. ./.:4:278,143:.: 1.02:1.000:. ./.:4:254,93:.: 0.26:1.000:. ./.:4:181,72:.:-0.72:1.000:. ./.:4:330,171:.: 1.85:1.000:. ./.:4:134,81:.:-1.11:0.999:. ./.:4:222,82:.:-0.19:1.000:. ./.:3:141,53:.:-1.33:0.999:. ./.:4:228,80:.:-0.15:1.000:. ./.:4:146,57:.:-1.23:1.000:. ./.:4:218,75:.:-0.30:1.000:. ./.:4:154,71:.:-1.01:1.000:. ./.:4:149,83:.:-0.93:1.000:. ./.:4:236,106:.: 0.21:1.000:. ./.:4:176,85:.:-0.63:1.000:. ./.:4:195,74:.:-0.55:1.000:. ./.:4:312,142:.: 1.36:1.000:. ./.:4:157,71:.:-0.97:1.000:. ./.:4:244,83:.: 0.05:1.000:. ./.:5:227,86:.:-0.09:0.988:. ./.:4:230,80:.:-0.13:1.000:. ./.:4:111,55:.:-1.62:1.000:. ./.:4:184,62:.:-0.79:1.000:. ./.:4:157,79:.:-0.89:1.000:. ./.:4:274,114:.: 0.68:1.000:. ./.:4:124,50:.:-1.53:1.000:. ./.:4:166,108:.:-0.50:1.000:. ./.:4:190,110:.:-0.23:1.000:. ./.:4:269,153:.: 1.03:1.000:. ./.:4:243,108:.: 0.30:1.000:. ./.:4:224,76:.:-0.23:1.000:. ./.:4:183,68:.:-0.74:1.000:. ./.:4:156,75:.:-0.94:1.000:. ./.:4:183,77:.:-0.64:1.000:. ./.:4:176,68:.:-0.81:1.000:. ./.:4:223,108:.: 0.09:1.000:. ./.:4:129,51:.:-1.47:1.000:. ./.:4:244,123:.: 0.46:1.000:. ./.:4:376,132:.: 1.92:1.000:. ./.:4:253,129:.: 0.62:1.000:. ./.:4:250,143:.: 0.73:1.000:. ./.:4:308,141:.: 1.31:1.000:. ./.:4:243,91:.: 0.12:1.000:. ./.:4:341,135:.: 1.59:1.000:. ./.:4:225,116:.: 0.20:1.000:. ./.:4:54,30:.:-2.46:1.000:. ./.:4:292,116:.: 0.89:1.000:. ./.:4:246,152:.: 0.79:1.000:. ./.:4:215,123:.: 0.16:1.000:. ./.:4:351,144:.: 1.79:1.000:. ./.:4:216,97:.:-0.09:1.000:. ./.:4:213,130:.: 0.22:1.000:. ./.:4:336,128:.: 1.47:1.000:. ./.:4:170,99:.:-0.55:1.000:. ./.:4:193,123:.:-0.06:1.000:. ./.:4:193,101:.:-0.29:1.000:. ./.:4:304,113:.: 0.98:1.000:. ./.:4:342,150:.: 1.76:1.000:. ./.:4:256,117:.: 0.53:1.000:. ./.:4:189,89:.:-0.46:1.000:. ./.:4:177,96:.:-0.51:0.999:. ./.:4:236,125:.: 0.40:1.000:. ./.:4:222,123:.: 0.24:1.000:. ./.:4:199,121:.:-0.02:1.000:. ./.:4:159,83:.:-0.83:1.000:. ./.:4:256,96:.: 0.31:1.000:. ./.:4:162,96:.:-0.66:1.000:. ./.:4:223,82:.:-0.18:1.000:. ./.:4:181,110:.:-0.32:1.000:. ./.:4:301,143:.: 1.26:1.000:. ./.:4:226,96:.: 0.00:1.000:. ./.:4:254,140:.: 0.74:1.000:. ./.:4:238,133:.: 0.51:1.000:. ./.:4:335,147:.: 1.65:1.000:. ./.:4:340,136:.: 1.59:1.000:. ./.:4:323,153:.: 1.59:1.000:. ./.:4:247,109:.: 0.35:1.000:. ./.:4:325,118:.: 1.25:1.000:. -chr1.1 60661578 chr1.1_060661578 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,530:.: 1.29:1.000:. ./.:4:108,259:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.28:1.000:. ./.:4:164,429:.: 1.82:1.000:. ./.:4:109,340:.: 0.61:1.000:. ./.:4:171,443:.: 2.00:1.000:. ./.:4:0,453:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,474:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,436:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,157:.:-1.87:1.000:. ./.:4:50,226:.:-0.86:1.000:. ./.:4:120,324:.: 0.56:1.000:. ./.:4:139,324:.: 0.72:1.000:. ./.:4:118,356:.: 0.82:1.000:. ./.:4:120,330:.: 0.61:1.000:. ./.:4:144,350:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,484:.: 0.90:0.998:. ./.:4:253,207:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,593:.: 1.82:1.000:. ./.:4:128,425:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,275:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,433:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,504:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,435:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,224:.:-1.30:1.000:. ./.:4:159,471:.: 2.14:1.000:. ./.:4:1,529:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,458:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,479:.: 0.86:1.000:. ./.:4:140,389:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,574:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.16:1.000:. ./.:4:83,102:.:-1.63:1.000:. ./.:4:34,145:.:-1.68:1.000:. ./.:3:0,199:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,456:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,417:.: 0.33:1.000:. ./.:4:122,349:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,449:.: 0.61:1.000:. ./.:4:142,346:.: 0.94:1.000:. ./.:4:82,262:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,358:.:-0.16:1.000:. ./.:4:114,330:.: 0.56:1.000:. ./.:4:86,272:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,365:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,519:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,121:.:-2.17:1.000:. ./.:4:96,296:.: 0.12:1.000:. ./.:4:88,316:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.94:1.000:. ./.:4:112,320:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,214:.:-1.38:1.000:. ./.:4:79,252:.:-0.39:1.000:. ./.:4:92,303:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,391:.: 0.12:1.000:. ./.:4:82,227:.:-0.58:1.000:. ./.:4:99,318:.: 0.33:1.000:. ./.:4:87,209:.:-0.69:1.000:. ./.:6:49,184:.:-1.22:1.000:. ./.:4:78,211:.:-0.75:1.000:. ./.:4:96,256:.:-0.22:1.000:. ./.:4:84,273:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.31:1.000:. ./.:4:89,247:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,370:.:-0.06:0.910:. ./.:4:0,429:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,366:.:-0.10:1.000:. ./.:4:93,261:.:-0.20:1.000:. ./.:4:117,362:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,421:.: 0.37:1.000:. ./.:4:101,280:.: 0.03:1.000:. ./.:4:100,255:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,310:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,247:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.73:1.000:. ./.:4:86,255:.:-0.31:1.000:. ./.:4:50,175:.:-1.29:0.984:. ./.:4:84,271:.:-0.19:1.000:. ./.:4:99,213:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,339:.:-0.33:1.000:. ./.:4:94,233:.:-0.43:1.000:. ./.:4:77,263:.:-0.32:1.000:. ./.:4:64,161:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,250:.:-1.08:1.000:. ./.:4:67,178:.:-1.12:1.000:. ./.:4:77,242:.:-0.50:1.000:. ./.:4:93,223:.:-0.52:0.999:. ./.:4:86,231:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,365:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,248:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,191:.:-1.58:1.000:. ./.:4:48,190:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,264:.:-0.96:1.000:. ./.:4:119,269:.: 0.09:1.000:. ./.:4:67,230:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,343:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,168:.:-1.77:1.000:. ./.:4:62,179:.:-1.16:1.000:. ./.:4:49,181:.:-1.25:1.000:. ./.:4:58,223:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,222:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,499:.: 1.03:1.000:. ./.:4:137,458:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,248:.:-1.09:1.000:. ./.:4:151,495:.: 2.27:1.000:. ./.:4:67,196:.:-0.97:0.999:. ./.:4:0,354:.:-0.20:1.000:. ./.:3:63,128:.:-1.58:0.999:. ./.:4:75,249:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,263:.:-0.97:1.000:. ./.:4:63,234:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,228:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,258:.:-1.01:1.000:. ./.:4:96,263:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,252:.:-1.06:1.000:. ./.:4:92,275:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1,522:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,259:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,312:.:-0.55:1.000:. ./.:5:0,308:.:-0.59:0.988:. ./.:4:0,317:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,177:.:-1.70:1.000:. ./.:4:58,176:.:-1.21:1.000:. ./.:4:61,190:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,152:.:-1.91:1.000:. ./.:4:76,241:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,310:.:-0.57:1.000:. ./.:4:169,462:.: 2.15:1.000:. ./.:4:100,286:.: 0.07:1.000:. ./.:4:72,188:.:-0.99:1.000:. ./.:4:58,170:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,176:.:-1.71:1.000:. ./.:4:1,308:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,239:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,204:.:-1.47:1.000:. ./.:4:140,401:.: 1.38:1.000:. ./.:4:158,436:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,491:.: 0.96:1.000:. ./.:4:93,306:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,380:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,585:.: 1.76:1.000:. ./.:4:113,340:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,242:.:-1.15:1.000:. ./.:4:82,302:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,592:.: 1.82:1.000:. ./.:4:116,324:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,551:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,531:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,372:.:-0.05:1.000:. ./.:4:148,399:.: 1.44:1.000:. ./.:4:2,361:.:-0.12:1.000:. ./.:4:83,279:.:-0.13:1.000:. ./.:4:110,364:.: 0.82:1.000:. ./.:4:123,399:.: 1.22:1.000:. ./.:4:150,378:.: 1.27:1.000:. ./.:4:126,377:.: 1.06:1.000:. ./.:4:105,245:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,387:.: 0.08:0.999:. ./.:4:0,446:.: 0.58:1.000:. ./.:4:123,304:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.31:1.000:. ./.:4:117,317:.: 0.48:1.000:. ./.:4:89,274:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,354:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,371:.:-0.05:1.000:. ./.:4:133,468:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,436:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.36:1.000:. ./.:4:58,305:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,383:.: 1.31:1.000:. ./.:4:196,459:.: 2.35:1.000:. ./.:4:161,480:.: 2.23:1.000:. ./.:4:0,408:.: 0.26:1.000:. ./.:4:136,362:.: 1.02:1.000:. -chr1.1 60904991 chr1.1_060904991 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:247,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:176,59:.: 1.14:1.000:. ./.:4:163,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:131,69:.: 0.43:1.000:. ./.:4:101,65:.:-0.26:1.000:. ./.:4:158,72:.: 1.04:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:61,26:.:-1.86:1.000:. ./.:4:215,61:.: 1.97:1.000:. ./.:4:85,51:.:-0.87:1.000:. ./.:4:160,87:.: 1.38:1.000:. ./.:4:111,50:.:-0.36:1.000:. ./.:4:86,69:.:-0.48:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.19:0.998:. ./.:4:243,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:153,64:.: 0.77:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:165,64:.: 1.02:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:93,61:.:-0.50:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:31,11:.:-2.77:1.000:. ./.:4:57,35:.:-1.76:1.000:. ./.:3:21,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:91,66:.:-0.44:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:102,85:.: 0.16:1.000:. ./.:4:145,53:.: 0.39:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:152,78:.: 1.04:1.000:. ./.:4:79,53:.:-0.95:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:126,53:.: 0.00:1.000:. ./.:4:104,68:.:-0.14:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:149,64:.: 0.69:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:83,85:.:-0.22:1.000:. ./.:4:67,45:.:-1.35:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:136,63:.: 0.41:1.000:. ./.:4:172,75:.: 1.38:1.000:. ./.:4:137,58:.: 0.33:1.000:. ./.:6:156,36:.: 0.27:1.000:. ./.:4:161,61:.: 0.87:1.000:. ./.:4:81,58:.:-0.81:1.000:. ./.:4:78,73:.:-0.56:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:108,57:.:-0.28:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.36:0.910:. ./.:4:223,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:88,34:.:-1.15:1.000:. ./.:4:237,67:.: 2.54:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:177,60:.: 1.18:1.000:. ./.:4:86,58:.:-0.71:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:126,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:154,62:.: 0.75:1.000:. ./.:4:151,42:.: 0.29:0.984:. ./.:4:122,55:.:-0.04:1.000:. ./.:4:156,86:.: 1.28:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:159,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:146,56:.: 0.47:1.000:. ./.:4:92,40:.:-0.95:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:134,68:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,57:.: 0.65:1.000:. ./.:4:133,47:.: 0.02:0.999:. ./.:4:144,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:216,60:.: 1.97:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:106,56:.:-0.34:1.000:. ./.:4:94,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:143,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:79,58:.:-0.85:1.000:. ./.:4:128,49:.:-0.04:1.000:. ./.:4:132,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:152,62:.: 0.71:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:175,69:.: 1.32:1.000:. ./.:4:88,42:.:-0.99:0.999:. ./.:4:205,0:.: 0.53:1.000:. ./.:3:32,48:.:-2.00:0.999:. ./.:4:96,81:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:133,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:82,63:.:-0.69:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:78,58:.:-0.87:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.98:1.000:. ./.:5:159,0:.:-0.40:0.988:. ./.:4:240,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:79,58:.:-0.85:1.000:. ./.:4:76,63:.:-0.81:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:144,64:.: 0.59:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:90,76:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,42:.:-1.27:1.000:. ./.:4:67,46:.:-1.33:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,70:.: 0.93:1.000:. ./.:4:92,78:.:-0.18:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:147,54:.: 0.45:1.000:. ./.:4:152,72:.: 0.91:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:185,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:90,65:.:-0.48:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:54,39:.:-1.74:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:92,66:.:-0.42:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:104,73:.:-0.04:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,50:.:-1.11:1.000:. ./.:4:187,47:.: 1.12:1.000:. ./.:4:162,82:.: 1.32:1.000:. ./.:4:136,69:.: 0.53:1.000:. ./.:4:78,70:.:-0.63:1.000:. ./.:4:138,62:.: 0.43:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.04:0.999:. ./.:4:151,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:102,55:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:121,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:93,74:.:-0.24:1.000:. ./.:4:116,55:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,60:.:-0.69:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:203,82:.: 2.15:1.000:. ./.:4:226,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:101,60:.:-0.36:1.000:. ./.:4:93,63:.:-0.46:1.000:. ./.:4:130,70:.: 0.43:1.000:. ./.:4:162,74:.: 1.16:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:178,51:.: 1.02:1.000:. -chr1.1 61015913 chr1.1_061015913 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:128,117:0.46:-0.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:161,56:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,116:0.45:-0.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:162,68:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:228,88:0.26: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:166,167:0.48: 1.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,113:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,213:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,127:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,56:0.43:-2.43:1.000:0.938 0/0/0/1:4:66,31:0.30:-2.98:1.000:0.983 0/0/1/1:4:126,133:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,203:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:226,82:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,71:0.25: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,68:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,75:0.27: 0.32:0.998:0.998 0/0/0/1:4:188,67:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,159:0.46: 1.55:1.000:0.988 0/0/0/1:4:251,80:0.23: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,94:0.69:-2.31:1.000:0.974 0/0/1/1:4:126,117:0.46:-0.13:1.000:0.987 0/1/1/1:4:81,238:0.72: 1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:196,69:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,41:0.60:-3.58:1.000:0.824 0/0/0/1:4:228,65:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,74:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,84:0.30: 0.32:1.000:0.987 0/0/0/1:4:223,90:0.27: 1.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,232:0.73: 1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:203,71:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,118:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,16:0.24:-3.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,79:0.52:-2.02:1.000:0.995 0/1/1:3:16,31:0.63:-3.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,211:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,69:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,122:0.46: 0.05:1.000:0.989 0/0/0/1:4:195,59:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,160:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/0:4:229,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,120:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:221,72:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,68:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:133,149:0.51: 0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,137:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,79:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,49:0.23:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,61:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,179:0.53: 1.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:98,104:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,72:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,108:0.42:-0.07:1.000:0.907 0/0/0/1:4:203,75:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,149:0.46: 1.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,135:0.45: 0.71:1.000:0.980 0/0/0/0:4:237,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:220,82:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:227,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:121,109:0.45:-0.38:1.000:0.757 0/0/1/1:4:120,137:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,127:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,72:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,115:0.48:-0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:202,72:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,92:0.47:-1.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,117:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:174,68:0.26:-0.15:0.910:0.998 0/0/1/1:4:108,113:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:195,88:0.29: 0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:190,66:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,172:0.53: 1.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:178,72:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,78:0.28: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,126:0.59:-0.87:1.000:0.867 0/0/1/1:4:100,126:0.53:-0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:178,66:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,200:0.81:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:245,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,52:0.25:-1.04:0.984:0.999 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:285,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,94:0.50:-1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,80:0.27: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,127:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:166,50:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,72:0.28:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,54:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,59:0.25:-0.50:0.999:0.999 0/0/0/1:4:146,62:0.28:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,152:0.51: 0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,52:0.25:-1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,68:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,77:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,55:0.26:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,66:0.32:-1.10:1.000:0.943 0/0/1/1:4:131,146:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,131:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,112:0.56:-1.10:1.000:0.973 0/1/1/1:4:69,205:0.72: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,99:0.51:-1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,120:0.45: 0.09:1.000:0.981 0/0/0/1:4:151,61:0.27:-0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:199,61:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,127:0.55:-0.56:1.000:0.979 0/0/1/1:4:129,113:0.45:-0.15:1.000:0.975 0/0/0/1:4:263,92:0.24: 2.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,144:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:199,78:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:268,100:0.26: 2.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,78:0.26: 0.58:0.999:0.998 0/0/0/1:4:193,76:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/1:3:127,41:0.23:-1.59:0.999:1.000 0/0/1/1:4:140,129:0.46: 0.38:1.000:0.986 0/0/0/1:4:197,74:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,120:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:182,66:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,45:0.20:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,197:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,67:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,133:0.52:-0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,120:0.45: 0.05:1.000:0.984 0/0/1/1:4:113,128:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,68:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:117,179:0.58: 0.91:0.988:0.957 0/0/0/1:4:156,61:0.26:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,116:0.52:-0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,85:0.51:-1.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,61:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,128:0.46: 0.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:84,95:0.51:-1.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:238,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,101:0.45:-0.73:1.000:0.984 0/0/0/1:4:286,90:0.22: 2.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,61:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,57:0.26:-0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,167:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,120:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,133:0.47: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:124,136:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,111:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,92:0.51:-1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,184:0.51: 1.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,185:0.51: 1.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,140:0.46: 0.79:1.000:0.988 0/0/0/1:4:197,75:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,157:0.47: 1.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,119:0.52:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:142,167:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,137:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,55:0.44:-2.55:1.000:0.968 0/0/1/1:4:109,123:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:212,70:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,221:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,85:0.25: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,87:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,121:0.48:-0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:140,170:0.52: 1.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:217,73:0.24: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,120:0.47:-0.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:156,59:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:230,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:281,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,131:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/0:4:223,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,59:0.21: 0.26:0.999:1.000 0/0/1/1:4:121,131:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,120:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,115:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,183:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,196:0.71: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,127:0.54:-0.44:1.000:0.990 0/1/1/1:4:53,172:0.74:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:165,65:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:233,80:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,158:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,144:0.47: 0.85:1.000:0.992 0/1/1/1:4:70,155:0.66:-0.48:1.000:0.882 0/0/1/1:4:129,152:0.52: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:256,74:0.21: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,165:0.53: 0.99:1.000:0.993 0/0/0/1:4:164,58:0.25:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,63:0.22: 0.34:1.000:1.000 -chr1.1 61361427 chr1.1_061361427 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:70,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:36,20:.:-1.68:1.000:. ./.:4:105,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,44:.:-1.08:1.000:. ./.:4:71,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:50,21:.:-1.18:1.000:. ./.:4:69,2:.:-1.18:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:76,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,14:.:-1.18:1.000:. ./.:4:61,45:.:-0.02:1.000:. ./.:4:69,32:.:-0.19:1.000:. ./.:4:71,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,43:.:-0.92:1.000:. ./.:4:54,18:.:-1.15:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.68:1.000:. ./.:4:77,6:.:-0.78:0.998:. ./.:4:34,10:.:-2.08:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:69,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:80,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:123,10:.: 0.88:1.000:. ./.:4:84,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:41,25:.:-1.35:1.000:. ./.:4:53,9:.:-1.48:1.000:. ./.:4:76,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:81,12:.:-0.45:1.000:. ./.:4:62,29:.:-0.52:1.000:. ./.:4:38,6:.:-2.08:1.000:. ./.:4:72,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,35:.:-1.35:1.000:. ./.:4:45,45:.:-0.55:1.000:. ./.:3:32,5:.:-2.31:1.000:. ./.:4:89,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:93,5:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,28:.: 0.38:1.000:. ./.:4:74,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:81,24:.:-0.05:1.000:. ./.:4:74,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:66,41:.: 0.01:1.000:. ./.:4:74,37:.: 0.15:1.000:. ./.:4:139,18:.: 1.67:1.000:. ./.:4:121,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:123,4:.: 0.68:1.000:. ./.:4:151,53:.: 3.23:1.000:. ./.:4:52,26:.:-0.95:1.000:. ./.:4:120,32:.: 1.51:1.000:. ./.:4:64,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:60,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:77,20:.:-0.32:1.000:. ./.:4:113,46:.: 1.74:1.000:. ./.:4:98,20:.: 0.38:1.000:. ./.:4:118,16:.: 0.91:1.000:. ./.:4:29,62:.:-0.52:1.000:. ./.:4:65,49:.: 0.25:1.000:. ./.:4:40,56:.:-0.35:1.000:. ./.:6:126,42:.: 2.04:1.000:. ./.:4:76,66:.: 1.18:1.000:. ./.:4:83,20:.:-0.12:1.000:. ./.:4:77,50:.: 0.68:1.000:. ./.:4:112,21:.: 0.88:1.000:. ./.:4:116,7:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.42:1.000:. ./.:4:90,39:.: 0.74:1.000:. ./.:4:108,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:85,29:.: 0.25:0.910:. ./.:4:34,6:.:-2.21:1.000:. ./.:4:124,10:.: 0.91:1.000:. ./.:4:87,53:.: 1.11:1.000:. ./.:4:71,55:.: 0.64:1.000:. ./.:4:68,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:61,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:100,37:.: 1.01:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:105,17:.: 0.51:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:46,77:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,30:.:-0.72:0.984:. ./.:4:42,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,50:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:57,47:.:-0.09:1.000:. ./.:4:90,44:.: 0.91:1.000:. ./.:4:62,37:.:-0.25:1.000:. ./.:4:59,22:.:-0.85:1.000:. ./.:4:88,51:.: 1.08:1.000:. ./.:4:71,45:.: 0.31:1.000:. ./.:4:70,48:.: 0.38:0.999:. ./.:4:34,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:36,8:.:-2.08:1.000:. ./.:4:83,33:.: 0.31:1.000:. ./.:4:80,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:82,41:.: 0.54:1.000:. ./.:4:118,16:.: 0.91:1.000:. ./.:4:106,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:66,42:.: 0.05:1.000:. ./.:4:167,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:49,16:.:-1.38:1.000:. ./.:4:80,69:.: 1.41:1.000:. ./.:4:110,31:.: 1.14:1.000:. ./.:4:57,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:81,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:51,67:.: 0.38:1.000:. ./.:4:125,12:.: 1.01:1.000:. ./.:4:81,21:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,36:.:-0.25:1.000:. ./.:4:124,47:.: 2.14:0.999:. ./.:4:82,27:.: 0.08:1.000:. ./.:3:69,29:.:-0.29:0.999:. ./.:4:136,25:.: 1.81:1.000:. ./.:4:137,13:.: 1.44:1.000:. ./.:4:55,33:.:-0.62:1.000:. ./.:4:75,33:.: 0.05:1.000:. ./.:4:74,27:.:-0.19:1.000:. ./.:4:108,32:.: 1.11:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.75:1.000:. ./.:4:124,37:.: 1.81:1.000:. ./.:4:70,8:.:-0.95:1.000:. ./.:4:97,6:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,24:.:-0.12:1.000:. ./.:5:154,16:.: 2.11:0.988:. ./.:4:91,14:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:84,31:.: 0.28:1.000:. ./.:4:70,39:.: 0.08:1.000:. ./.:4:64,4:.:-1.28:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:30,41:.:-1.18:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,33:.: 0.38:1.000:. ./.:4:57,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:53,30:.:-0.78:1.000:. ./.:4:100,36:.: 0.98:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:71,18:.:-0.58:1.000:. ./.:4:102,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:50,17:.:-1.31:1.000:. ./.:4:92,57:.: 1.41:1.000:. ./.:4:120,39:.: 1.74:1.000:. ./.:4:54,7:.:-1.51:1.000:. ./.:4:59,37:.:-0.35:1.000:. ./.:4:67,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:108,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:71,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:66,13:.:-0.92:1.000:. ./.:4:93,34:.: 0.68:1.000:. ./.:4:81,5:.:-0.68:1.000:. ./.:4:125,39:.: 1.91:1.000:. ./.:4:134,12:.: 1.31:1.000:. ./.:4:114,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:100,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,20:.: 1.31:1.000:. ./.:4:58,8:.:-1.35:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:62,22:.:-0.75:1.000:. ./.:4:29,46:.:-1.05:1.000:. ./.:4:29,31:.:-1.55:1.000:. ./.:4:71,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:93,8:.:-0.19:0.999:. ./.:4:140,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:55,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:91,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:97,23:.: 0.45:1.000:. ./.:4:66,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:80,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:58,10:.:-1.28:1.000:. ./.:4:74,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:93,5:.:-0.29:1.000:. ./.:4:79,5:.:-0.75:1.000:. ./.:4:112,19:.: 0.81:1.000:. ./.:4:107,32:.: 1.08:1.000:. ./.:4:76,52:.: 0.71:1.000:. ./.:4:44,53:.:-0.32:1.000:. ./.:4:67,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:49,32:.:-0.85:1.000:. -chr1.1 61556964 chr1.1_061556964 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:239,85:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,74:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,83:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,86:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,97:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:305,122:0.24: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,165:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,285:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,279:0.72: 0.93:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,52:0.89:-2.52:1.000:0.540 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-2.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:253,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,186:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:248,108:0.26: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:190,92:0.28: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,216:0.49: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,196:0.47: 0.96:0.998:0.991 0/0/1/1:4:211,219:0.44: 1.69:1.000:0.970 0/0/1/1:4:195,271:0.51: 2.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:192,292:0.53: 2.30:1.000:0.991 1/1/1/1:4:3,150:0.92:-1.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:140,169:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:162,212:0.49: 1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:243,102:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,75:0.76:-2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,232:0.48: 1.59:1.000:0.995 0/0/0/0:4:322,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,189:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,218:0.48: 1.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:170,229:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,220:0.51: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,209:0.49: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,47:0.69:-2.43:1.000:0.976 0/0/1/1:4:38,36:0.42:-2.31:1.000:0.920 1/1/1:3:2,41:0.90:-2.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:153,168:0.45: 0.47:1.000:0.984 0/0/0/1:4:235,98:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:270,85:0.20: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,188:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:255,118:0.27: 1.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:160,82:0.29:-0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:121,197:0.55: 0.43:1.000:0.979 0/0/1/1:4:109,206:0.59: 0.40:1.000:0.869 0/0/0/1:4:160,107:0.34:-0.14:1.000:0.839 0/0/1/1:4:115,183:0.54: 0.21:1.000:0.984 0/1/1/1:4:55,260:0.78: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,117:0.27: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,170:0.57:-0.15:1.000:0.939 0/1/1/1:4:39,210:0.79:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,55:0.27:-1.20:1.000:0.998 0/0/0/0:4:317,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,58:0.25:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,152:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,93:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,295:0.78: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:228,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,166:0.59:-0.28:1.000:0.887 0/0/0/0:4:231,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:102,97:0.42:-0.90:1.000:0.539 0/0/0/1:4:135,68:0.29:-0.86:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:145,109:0.37:-0.29:1.000:0.564 0/0/1/1:4:88,172:0.60:-0.22:1.000:0.811 0/1/1/1:4:68,269:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,92:0.28:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:154,68:0.26:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:178,79:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,156:0.57:-0.40:0.910:0.939 0/0/0/0:4:258,1:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,99:0.34:-0.34:1.000:0.859 0/0/0/0:4:193,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:221,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:317,1:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,50:0.20:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,70:0.31:-0.96:1.000:0.976 0/0/1/1:4:82,143:0.57:-0.61:1.000:0.950 0/0/1/1:4:97,144:0.53:-0.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,257:0.75: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:249,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,78:0.31:-0.75:0.984:0.968 0/0/0/0:4:214,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,75:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,79:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,149:0.56:-0.48:1.000:0.965 0/0/0/1:4:187,76:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,55:0.27:-1.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,71:0.33:-1.08:1.000:0.908 0/0/1/1:4:80,132:0.55:-0.76:1.000:0.975 0/0/1/1:4:107,154:0.52:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,139:0.53:-0.52:0.999:0.994 0/0/0/1:4:153,70:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,164:0.58:-0.28:1.000:0.925 0/0/1/1:4:98,137:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,207:0.56: 0.58:1.000:0.971 0/0/1/1:4:98,163:0.56:-0.21:1.000:0.972 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,64:0.34:-1.34:1.000:0.844 0/0/0/1:4:151,82:0.30:-0.52:1.000:0.985 0/1/1/1:4:68,300:0.77: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,64:0.28:-0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,231:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,59:0.30:-1.26:1.000:0.984 0/0/0/1:4:155,62:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,127:0.54:-0.82:1.000:0.985 0/0/1/1:4:97,151:0.54:-0.35:1.000:0.988 0/0/1/1:4:81,115:0.51:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,184:0.48: 0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:281,118:0.25: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:195,77:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,122:0.58:-1.02:1.000:0.915 0/0/1/1:4:232,300:0.49: 2.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,137:0.57:-0.74:0.999:0.936 0/0/1/1:4:119,188:0.54: 0.31:1.000:0.986 0/0/1:3:69,60:0.40:-1.69:0.999:0.999 0/0/0/1:4:166,76:0.27:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,133:0.56:-0.75:1.000:0.973 0/0/0/1:4:111,68:0.33:-1.13:1.000:0.937 0/0/1/1:4:75,162:0.62:-0.48:1.000:0.542 0/0/1/1:4:85,120:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,161:0.53:-0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,125:0.56:-0.90:1.000:0.967 0/1/1/1:4:41,273:0.82: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,101:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,219:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,169:0.56:-0.10:1.000:0.974 0/0/1/1/1:5:128,179:0.51: 0.31:0.988:0.600 0/0/1/1:4:81,130:0.55:-0.77:1.000:0.983 0/0/1/1:4:73,114:0.54:-1.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:97,63:0.34:-1.34:1.000:0.881 0/0/0/1:4:116,68:0.32:-1.07:1.000:0.962 0/0/0/1:4:237,88:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,98:0.53:-1.31:1.000:0.992 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,76:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:340,117:0.22: 1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,172:0.58:-0.14:1.000:0.921 0/0/0/1:4:114,64:0.31:-1.14:1.000:0.977 0/0/1/1:4:49,106:0.62:-1.40:1.000:0.537 0/0/1/1:4:69,126:0.58:-0.95:1.000:0.912 0/0/1/1:4:105,158:0.53:-0.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:127,58:0.27:-1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,228:0.72: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,61:0.35:-1.44:1.000:0.816 0/0/0/1:4:277,122:0.26: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:253,134:0.30: 1.21:1.000:0.989 0/0/0/1:4:257,105:0.25: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,175:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:267,111:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,73:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:299,132:0.26: 1.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:195,184:0.42: 1.12:1.000:0.916 0/0/1/1:4:25,23:0.41:-2.60:1.000:0.891 0/1/1/1:4:57,222:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:219,87:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,210:0.53: 0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:290,115:0.24: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,127:0.25: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,85:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,108:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,186:0.46: 0.83:1.000:0.986 0/1/1/1:4:72,276:0.74: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,197:0.57: 0.34:1.000:0.950 0/0/0/0:4:287,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:271,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,89:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,103:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,189:0.43: 1.11:0.999:0.955 0/0/1/1:4:148,158:0.45: 0.30:1.000:0.978 0/0/1/1:4:160,197:0.48: 0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:209,75:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,223:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,202:0.58: 0.36:1.000:0.906 0/0/0/1:4:212,73:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,125:0.42:-0.22:1.000:0.898 0/0/1/1:4:131,162:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:208,247:0.47: 1.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:147,220:0.53: 0.98:1.000:0.993 0/0/1/1:4:165,200:0.48: 0.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:167,185:0.46: 0.81:1.000:0.985 0/0/0/1:4:242,106:0.26: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:296,121:0.25: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,118:0.24: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,89:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,96:0.28: 0.17:1.000:0.996 -chr1.1 61744598 chr1.1_061744598 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:254,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:40,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.77:0.998:. ./.:4:145,48:.:-0.09:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.59:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:214,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:248,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.73:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.42:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.69:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:250,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:228,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.05:1.000:. ./.:6:178,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.30:0.910:. ./.:4:197,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:203,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.85:0.984:. ./.:4:232,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:151,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:191,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:134,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.44:0.999:. ./.:4:243,0:.: 0.93:1.000:. ./.:3:139,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:227,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:190,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.30:1.000:. ./.:5:271,1:.: 1.52:0.988:. ./.:4:180,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:237,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:194,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:214,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:219,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:171,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:249,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.20:1.000:. -chr1.1 61878825 chr1.1_061878825 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:97,310:.: 0.69:1.000:. ./.:4:100,155:.:-1.28:1.000:. ./.:4:79,262:.:-0.17:1.000:. ./.:4:83,259:.:-0.15:1.000:. ./.:4:104,359:.: 1.42:1.000:. ./.:4:153,195:.:-0.08:1.000:. ./.:4:58,166:.:-1.69:1.000:. ./.:4:86,280:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.58:1.000:. ./.:4:34,183:.:-1.78:1.000:. ./.:4:72,78:.:-2.65:1.000:. ./.:4:245,90:.:-0.24:1.000:. ./.:4:149,168:.:-0.48:1.000:. ./.:4:88,319:.: 0.69:1.000:. ./.:4:159,168:.:-0.35:1.000:. ./.:4:74,267:.:-0.17:1.000:. ./.:4:1,359:.: 0.08:0.998:. ./.:4:87,270:.: 0.04:1.000:. ./.:4:106,360:.: 1.46:1.000:. ./.:4:97,305:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,95:.:-3.05:1.000:. ./.:4:74,243:.:-0.48:1.000:. ./.:4:102,272:.: 0.26:1.000:. ./.:4:74,269:.:-0.14:1.000:. ./.:4:13,89:.:-3.27:1.000:. ./.:4:97,298:.: 0.54:1.000:. ./.:4:73,266:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,349:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,450:.: 1.25:1.000:. ./.:4:147,178:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.77:1.000:. ./.:4:67,212:.:-0.97:1.000:. ./.:4:25,46:.:-3.68:1.000:. ./.:4:104,121:.:-1.67:1.000:. ./.:3:14,59:.:-3.65:1.000:. ./.:4:83,234:.:-0.48:1.000:. ./.:4:84,234:.:-0.46:1.000:. ./.:4:160,200:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,440:.: 1.12:1.000:. ./.:4:179,185:.: 0.13:1.000:. ./.:4:107,275:.: 0.37:1.000:. ./.:4:75,246:.:-0.43:1.000:. ./.:4:97,340:.: 1.08:1.000:. ./.:4:75,256:.:-0.30:1.000:. ./.:4:117,372:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,384:.: 0.39:1.000:. ./.:4:101,322:.: 0.90:1.000:. ./.:4:12,35:.:-3.99:1.000:. ./.:4:86,295:.: 0.35:1.000:. ./.:4:112,316:.: 0.96:1.000:. ./.:4:105,252:.: 0.04:1.000:. ./.:4:234,218:.: 1.28:1.000:. ./.:4:74,253:.:-0.35:1.000:. ./.:4:108,321:.: 0.98:1.000:. ./.:4:169,197:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.59:1.000:. ./.:4:75,234:.:-0.58:1.000:. ./.:4:125,326:.: 1.26:1.000:. ./.:4:80,263:.:-0.14:1.000:. ./.:6:138,192:.:-0.31:1.000:. ./.:4:211,232:.: 1.16:1.000:. ./.:4:69,246:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,332:.: 1.03:1.000:. ./.:4:96,305:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,451:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.46:1.000:. ./.:4:136,146:.:-0.93:1.000:. ./.:4:92,294:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,400:.: 0.60:0.910:. ./.:4:156,193:.:-0.06:1.000:. ./.:4:115,327:.: 1.15:1.000:. ./.:4:103,122:.:-1.67:1.000:. ./.:4:306,102:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,283:.: 0.13:1.000:. ./.:4:162,232:.: 0.52:1.000:. ./.:4:164,154:.:-0.46:1.000:. ./.:4:103,276:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,435:.: 1.06:1.000:. ./.:4:120,229:.:-0.06:1.000:. ./.:4:119,329:.: 1.22:1.000:. ./.:4:159,153:.:-0.54:0.984:. ./.:4:116,348:.: 1.43:1.000:. ./.:4:106,351:.: 1.34:1.000:. ./.:4:65,241:.:-0.62:1.000:. ./.:4:99,268:.: 0.17:1.000:. ./.:4:165,221:.: 0.42:1.000:. ./.:4:71,241:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,362:.: 0.11:1.000:. ./.:4:74,287:.: 0.09:1.000:. ./.:4:85,289:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,238:.:-0.61:0.999:. ./.:4:76,271:.:-0.09:1.000:. ./.:4:116,286:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,307:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,423:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,414:.: 0.78:1.000:. ./.:4:71,231:.:-0.67:1.000:. ./.:4:175,169:.:-0.13:1.000:. ./.:4:91,323:.: 0.78:1.000:. ./.:4:111,282:.: 0.51:1.000:. ./.:4:124,157:.:-0.95:1.000:. ./.:4:110,288:.: 0.57:1.000:. ./.:4:72,260:.:-0.28:1.000:. ./.:4:215,233:.: 1.22:1.000:. ./.:4:97,274:.: 0.22:1.000:. ./.:4:104,290:.: 0.52:1.000:. ./.:4:94,327:.: 0.87:1.000:. ./.:4:86,269:.: 0.02:1.000:. ./.:4:117,351:.: 1.48:1.000:. ./.:4:88,275:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,378:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,325:.: 0.78:1.000:. ./.:4:105,295:.: 0.60:0.999:. ./.:4:0,410:.: 0.73:1.000:. ./.:3:88,187:.:-1.02:0.999:. ./.:4:224,255:.: 1.63:1.000:. ./.:4:2,361:.: 0.12:1.000:. ./.:4:158,176:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.58:1.000:. ./.:4:198,170:.: 0.18:1.000:. ./.:4:2,406:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,325:.: 0.87:1.000:. ./.:4:90,260:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,333:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.94:1.000:. ./.:5:116,398:.: 2.08:0.988:. ./.:4:91,261:.:-0.02:1.000:. ./.:4:64,225:.:-0.84:1.000:. ./.:4:135,127:.:-1.19:1.000:. ./.:4:87,275:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,257:.:-0.17:1.000:. ./.:4:70,206:.:-1.01:1.000:. ./.:4:78,302:.: 0.34:1.000:. ./.:4:83,271:.: 0.00:1.000:. ./.:4:111,404:.: 2.10:1.000:. ./.:4:106,312:.: 0.83:1.000:. ./.:4:89,296:.: 0.41:1.000:. ./.:4:184,219:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,280:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,295:.: 0.17:1.000:. ./.:4:92,303:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.40:1.000:. ./.:4:92,227:.:-0.45:1.000:. ./.:4:210,237:.: 1.21:1.000:. ./.:4:256,259:.: 2.10:1.000:. ./.:4:85,247:.:-0.28:1.000:. ./.:4:81,259:.:-0.18:1.000:. ./.:4:191,206:.: 0.56:1.000:. ./.:4:110,276:.: 0.42:1.000:. ./.:4:96,347:.: 1.16:1.000:. ./.:4:73,229:.:-0.67:1.000:. ./.:4:39,130:.:-2.40:1.000:. ./.:4:67,189:.:-1.27:1.000:. ./.:4:97,329:.: 0.94:1.000:. ./.:4:185,169:.: 0.00:1.000:. ./.:4:102,294:.: 0.55:1.000:. ./.:4:66,262:.:-0.33:1.000:. ./.:4:81,238:.:-0.45:1.000:. ./.:4:146,176:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.56:1.000:. ./.:4:66,216:.:-0.93:1.000:. ./.:4:83,234:.:-0.48:1.000:. ./.:4:81,292:.: 0.25:1.000:. ./.:4:83,277:.: 0.08:1.000:. ./.:4:139,165:.:-0.65:1.000:. ./.:4:60,227:.:-0.87:1.000:. ./.:4:68,239:.:-0.61:0.999:. ./.:4:75,258:.:-0.27:1.000:. ./.:4:71,230:.:-0.69:1.000:. ./.:4:60,199:.:-1.23:1.000:. ./.:4:65,204:.:-1.10:1.000:. ./.:4:151,161:.:-0.54:1.000:. ./.:4:172,155:.:-0.35:1.000:. ./.:4:138,158:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.82:1.000:. ./.:4:82,276:.: 0.05:1.000:. ./.:4:103,293:.: 0.55:1.000:. ./.:4:78,272:.:-0.05:1.000:. ./.:4:129,168:.:-0.74:1.000:. ./.:4:179,189:.: 0.18:1.000:. ./.:4:101,328:.: 0.98:1.000:. ./.:4:85,329:.: 0.78:1.000:. ./.:4:60,217:.:-1.00:1.000:. ./.:4:164,181:.:-0.11:1.000:. -chr1.1 61916680 chr1.1_061916680 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:117,34:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,34:0.32:-0.84:1.000:0.964 0/0/0/1:4:130,39:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,44:0.27: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:175,49:0.22: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,50:0.22: 2.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,54:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,129:0.74: 0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,113:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,12:0.30:-2.59:1.000:0.987 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-2.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,80:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,40:0.22: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,30:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,76:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,80:0.49: 0.49:0.998:0.996 0/0/0/1:4:131,58:0.31: 1.21:1.000:0.972 0/0/1/1:4:113,109:0.49: 2.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,100:0.44: 2.11:1.000:0.973 1/1/1/1:4:1,27:0.94:-2.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,75:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,64:0.44: 0.03:1.000:0.974 0/0/0/1:4:120,41:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,13:0.71:-3.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:73,85:0.53: 0.42:1.000:0.992 0/0/0/0:4:218,1:0.00: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,80:0.52: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,84:0.45: 1.16:1.000:0.976 0/0/1/1:4:83,91:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,95:0.57: 0.60:1.000:0.953 0/0/1/1:4:91,67:0.42: 0.42:1.000:0.924 0/0/1/1:4:14,13:0.48:-2.95:1.000:0.994 0/0/0/1:4:24,11:0.32:-2.74:1.000:0.959 0/0/1:3:12,10:0.45:-3.08:1.000:0.962 0/0/1/1:4:79,77:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,36:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,32:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,73:0.57:-0.40:1.000:0.944 0/0/0/1:4:113,38:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,33:0.27:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,67:0.54:-0.51:1.000:0.986 0/0/1/1:4:75,97:0.56: 0.78:1.000:0.973 0/0/0/1:4:84,30:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,70:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,115:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,36:0.20: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,72:0.55:-0.30:1.000:0.983 0/1/1/1:4:25,82:0.75:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,23:0.21:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,1:0.01: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,28:0.21:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,69:0.52:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,26:0.20:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,99:0.71:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,67:0.55:-0.56:1.000:0.979 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:94,29:0.24:-0.48:1.000:0.606 0/0/0/1:4:105,33:0.25:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,110:0.69: 0.37:1.000:0.975 0/0/0/1:4:115,34:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,65:0.57:-0.74:1.000:0.954 0/1/1/1:4:49,115:0.69: 0.57:1.000:0.969 0/0/0/1:4:121,33:0.22: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,20:0.21:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,30:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,70:0.49:-0.02:0.910:0.996 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,40:0.28: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:89,25:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,60:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,76:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,67:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,113:0.72: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,28:0.25:-0.69:0.984:0.999 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,38:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,36:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,60:0.53:-0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:125,41:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,33:0.33:-1.02:1.000:0.934 0/0/0/1:4:74,35:0.32:-0.84:1.000:0.942 0/0/1/1:4:70,67:0.48:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,60:0.45:-0.28:1.000:0.984 0/0/1/1:4:55,62:0.52:-0.64:0.999:0.994 0/0/0/1:4:104,31:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,62:0.44:-0.02:1.000:0.963 0/0/1/1:4:52,46:0.47:-1.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:97,60:0.38: 0.39:1.000:0.602 0/0/1/1:4:87,91:0.51: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,25:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,33:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,101:0.69: 0.06:1.000:0.970 0/0/0/1:4:81,37:0.32:-0.61:1.000:0.961 0/1/1/1:4:33,94:0.72:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,26:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,30:0.21: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,49:0.53:-1.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,65:0.46:-0.02:1.000:0.986 0/0/1/1:4:61,66:0.51:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,60:0.42:-0.02:1.000:0.928 0/0/0/1:4:136,61:0.31: 1.42:1.000:0.968 0/0/0/1:4:135,37:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,67:0.53:-0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:110,93:0.45: 1.57:1.000:0.984 0/0/1/1:4:65,65:0.49:-0.30:0.999:0.997 0/0/1/1:4:71,67:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/0/1:3:54,37:0.41:-1.30:0.999:0.998 0/0/0/1:4:100,42:0.30: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:66,79:0.54: 0.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:98,42:0.30:-0.05:1.000:0.981 0/0/1/1:4:67,60:0.47:-0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:56,53:0.48:-0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,72:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,59:0.47:-0.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,116:0.71: 0.47:1.000:0.992 0/0/0/1:4:130,46:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,109:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,63:0.43: 0.11:1.000:0.946 0/0/0/1/1:5:112,66:0.37: 0.93:0.988:0.955 0/0/1/1:4:69,58:0.45:-0.38:1.000:0.983 0/0/1/1:4:43,49:0.53:-1.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:86,32:0.28:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,41:0.31:-0.25:1.000:0.966 0/0/0/1:4:135,54:0.29: 1.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,43:0.47:-1.33:1.000:0.993 0/0/0/0:4:104,1:0.01:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,32:0.27:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,54:0.26: 1.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,66:0.47:-0.05:1.000:0.991 0/0/0/1:4:89,23:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,41:0.48:-1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,62:0.54:-0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:43,67:0.60:-0.82:1.000:0.797 0/0/0/1:4:92,23:0.21:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,115:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,16:0.19:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,30:0.19: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,40:0.22: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,44:0.28: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,77:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:114,47:0.30: 0.49:1.000:0.988 0/0/0/1:4:111,37:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,45:0.23: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,78:0.48: 0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:26,7:0.22:-2.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,107:0.69: 0.24:1.000:0.979 0/0/0/1:4:116,39:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,100:0.50: 1.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,41:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,40:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,45:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,42:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,72:0.47: 0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,78:0.71:-0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:72,66:0.47:-0.10:1.000:0.994 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,53:0.30: 1.01:1.000:0.987 0/0/0/1:4:117,38:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,92:0.48: 1.21:0.999:0.995 0/0/1/1:4:92,73:0.44: 0.60:1.000:0.967 0/0/1/1:4:81,89:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:112,20:0.16:-0.25:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,79:0.73:-0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:104,107:0.50: 1.78:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:61,79:0.56:-0.05:1.000:0.972 0/0/1/1:4:71,61:0.46:-0.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:98,107:0.52: 1.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,97:0.50: 1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,77:0.41: 1.21:1.000:0.842 0/0/1/1:4:83,56:0.40:-0.07:1.000:0.810 0/0/0/1:4:118,39:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,55:0.28: 1.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:164,56:0.26: 2.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,42:0.34:-0.48:1.000:0.844 0/0/0/1:4:120,30:0.21: 0.21:1.000:1.000 -chr1.1 62212163 chr1.1_062212163 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.65:-0.37:1.000:0.752 0/0/0/1:4:10,4:0.28: 1.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-0.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:4,8:0.54: 1.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.37:1.000:0.974 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,4:0.54:-0.37:1.000:0.987 0/0/1/1:4:5,5:0.43: 0.68:1.000:0.943 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.37:1.000:0.943 0/0/1/1:4:2,4:0.54:-0.37:1.000:0.987 0/0/1/1:4:6,6:0.43: 1.20:0.998:0.943 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.11:1.000:0.537 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.15:1.000:0.974 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.43:-1.42:1.000:0.943 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,4:0.31: 1.20:1.000:0.974 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.37:1.000:0.943 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.89:1.000:0.840 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.16:1.000:0.943 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,6:0.46: 0.94:1.000:0.988 0/0/1/1:4:4,8:0.54: 1.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:7,1:0.12: 0.16:1.000:0.852 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.11:1.000:0.537 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.15:1.000:0.974 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.57:-0.11:1.000:0.943 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.43: 1.73:1.000:0.943 0/0/1/1:4:1,4:0.62:-0.63:1.000:0.503 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.57:-0.11:1.000:0.943 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.37:1.000:0.943 0/0/0/1/1/1:6:3,4:0.48:-0.11:1.000:0.866 0/0/0/0:4:10,1:0.09: 0.94:1.000:0.938 0/0/0/1:4:14,5:0.26: 3.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,5:0.40: 0.94:1.000:0.755 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.17: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.43:-1.42:1.000:0.943 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.20:0.910:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.37:1.000:0.943 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,4:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,6:0.46: 0.94:1.000:0.988 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,9:0.50: 1.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.16:0.984:0.873 0/0/1/1:4:3,6:0.54: 0.42:1.000:0.987 0/1/1/1:4:2,10:0.65: 1.20:1.000:0.752 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.37:1.000:0.943 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,4:0.26: 1.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.63:1.000:0.721 0/0/1/1:4:3,4:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:10,2:0.17: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,8:0.48: 1.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,1:0.12: 0.16:0.999:0.852 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,7:0.35: 2.77:1.000:0.799 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 2.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:6,3:0.31: 0.42:1.000:0.974 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.63:1.000:0.721 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.38: 2.25:1.000:0.620 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.89:1.000:0.840 0/0/0/1:4:8,4:0.31: 1.20:1.000:0.974 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.37:1.000:0.943 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.43: 1.73:1.000:0.943 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.16:0.999:0.943 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1:3:0,4:0.75:-0.89:0.999:1.000 0/0/1/1:4:2,7:0.61: 0.42:1.000:0.679 0/0/0/1:4:10,4:0.28: 1.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.26: 3.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:9,4:0.29: 1.47:0.988:0.614 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.11:1.000:0.537 0/0/1/1:4:3,5:0.52: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,3:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.65:-0.37:1.000:0.752 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,3:0.29: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:6,7:0.46: 1.47:1.000:0.985 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,9:0.56: 1.47:1.000:0.971 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-0.11:1.000:0.975 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.16:1.000:0.873 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,4:0.33: 0.94:1.000:0.916 0/0/0/0:4:9,1:0.10: 0.68:1.000:0.801 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.15:1.000:0.974 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.37:1.000:0.943 0/0/1/1:4:1,4:0.62:-0.63:1.000:0.503 0/0/1/1:4:4,5:0.47: 0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:3,8:0.58: 0.94:1.000:0.916 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.89:1.000:0.840 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,8:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,2:0.43:-0.89:1.000:0.943 0/0/1/1:4:3,6:0.54: 0.42:1.000:0.987 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.16:0.999:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.43: 0.16:1.000:0.943 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-0.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.46: 0.94:1.000:0.988 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.43: 0.68:1.000:0.943 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,6:0.40: 1.47:1.000:0.800 0/0/1/1:4:3,4:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,4:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.63:1.000:0.997 -chr1.1 62342149 chr1.1_062342149 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:171,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.23:0.998:. ./.:4:147,53:.: 0.89:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-4.01:1.000:. ./.:4:72,1:.:-2.44:1.000:. ./.:3:29,0:.:-3.59:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.18:1.000:. ./.:6:139,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.39:0.910:. ./.:4:149,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.63:0.984:. ./.:4:208,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:132,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.52:0.999:. ./.:4:185,0:.: 0.49:1.000:. ./.:3:112,0:.:-1.42:0.999:. ./.:4:205,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.89:1.000:. ./.:5:215,0:.: 1.28:0.988:. ./.:4:129,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:218,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:140,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.05:1.000:. -chr1.1 62673159 chr1.1_062673159 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,717:.: 1.07:1.000:. ./.:4:131,427:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,577:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,590:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,731:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,664:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,287:.:-1.42:1.000:. ./.:4:127,478:.: 0.26:1.000:. ./.:4:158,472:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,58:.:-3.42:1.000:. ./.:4:0,128:.:-3.15:1.000:. ./.:4:164,455:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,641:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,687:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,552:.:-0.12:1.000:. ./.:4:155,465:.: 0.37:1.000:. ./.:4:172,449:.: 0.38:0.998:. ./.:4:224,276:.:-0.49:1.000:. ./.:4:209,632:.: 1.95:1.000:. ./.:4:158,534:.: 0.89:1.000:. ./.:4:17,111:.:-3.15:1.000:. ./.:4:145,418:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,729:.: 1.15:1.000:. ./.:4:163,455:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,60:.:-3.52:1.000:. ./.:4:160,477:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,582:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,481:.: 0.37:1.000:. ./.:4:176,553:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,676:.: 0.77:1.000:. ./.:4:175,465:.: 0.51:1.000:. ./.:4:112,360:.:-0.69:1.000:. ./.:4:2,21:.:-3.90:1.000:. ./.:4:0,128:.:-3.15:1.000:. ./.:3:0,14:.:-3.97:1.000:. ./.:4:0,587:.: 0.13:1.000:. ./.:4:158,425:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,621:.: 0.38:1.000:. ./.:4:141,531:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,666:.: 0.70:1.000:. ./.:4:146,469:.: 0.33:1.000:. ./.:4:122,451:.: 0.03:1.000:. ./.:4:160,504:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,503:.:-0.47:1.000:. ./.:4:163,573:.: 1.20:1.000:. ./.:4:155,481:.: 0.49:1.000:. ./.:4:178,574:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,694:.: 0.90:1.000:. ./.:4:126,435:.:-0.05:1.000:. ./.:4:125,455:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,487:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,729:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,528:.:-0.29:1.000:. ./.:4:160,517:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,487:.:-0.57:1.000:. ./.:4:132,441:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,519:.:-0.35:1.000:. ./.:4:132,428:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,551:.:-0.12:1.000:. ./.:6:34,402:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,566:.:-0.02:1.000:. ./.:4:129,361:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,661:.: 0.66:1.000:. ./.:4:134,396:.:-0.27:1.000:. ./.:4:299,317:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,463:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,549:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,655:.: 0.64:1.000:. ./.:4:155,417:.: 0.03:0.910:. ./.:4:0,600:.: 0.23:1.000:. ./.:4:160,509:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,393:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,614:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,569:.: 0.01:1.000:. ./.:4:149,485:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,443:.:-0.90:1.000:. ./.:4:93,356:.:-0.85:1.000:. ./.:4:141,478:.: 0.36:1.000:. ./.:4:66,405:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,604:.: 0.26:1.000:. ./.:4:95,347:.:-0.90:0.984:. ./.:4:2,562:.:-0.03:1.000:. ./.:4:168,499:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,522:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,440:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,656:.: 0.63:1.000:. ./.:4:102,341:.:-0.90:1.000:. ./.:4:118,375:.:-0.54:1.000:. ./.:4:157,409:.:-0.02:1.000:. ./.:4:113,355:.:-0.72:1.000:. ./.:4:86,314:.:-1.20:0.999:. ./.:4:0,534:.:-0.25:1.000:. ./.:4:151,488:.: 0.51:1.000:. ./.:4:118,321:.:-0.93:1.000:. ./.:4:150,456:.: 0.27:1.000:. ./.:4:148,416:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,468:.:-0.72:1.000:. ./.:4:126,418:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,639:.: 0.51:1.000:. ./.:4:149,457:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,463:.:-0.75:1.000:. ./.:4:138,483:.: 0.38:1.000:. ./.:4:2,526:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,517:.:-0.36:1.000:. ./.:4:123,374:.:-0.51:1.000:. ./.:4:122,369:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,327:.:-0.95:1.000:. ./.:4:187,561:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,726:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,613:.: 0.32:1.000:. ./.:4:168,400:.: 0.00:1.000:. ./.:4:193,604:.: 1.64:1.000:. ./.:4:129,431:.:-0.06:0.999:. ./.:4:134,419:.:-0.11:1.000:. ./.:3:13,378:.:-1.27:0.999:. ./.:4:1,675:.: 0.77:1.000:. ./.:4:107,342:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,535:.:-0.24:1.000:. ./.:4:153,384:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,429:.:-0.99:1.000:. ./.:4:2,631:.: 0.46:1.000:. ./.:4:126,434:.:-0.06:1.000:. ./.:4:130,397:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,601:.: 0.23:1.000:. ./.:4:123,401:.:-0.32:1.000:. ./.:4:167,567:.: 1.19:1.000:. ./.:5:0,731:.: 1.17:0.988:. ./.:4:226,250:.:-0.66:1.000:. ./.:4:134,324:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,517:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,476:.:-0.66:1.000:. ./.:4:138,463:.: 0.23:1.000:. ./.:4:91,302:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,581:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,616:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,932:.: 2.60:1.000:. ./.:4:118,450:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,584:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,473:.:-0.68:1.000:. ./.:4:127,418:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,442:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,613:.: 0.32:1.000:. ./.:4:173,472:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,477:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,714:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,809:.: 1.72:1.000:. ./.:4:1,644:.: 0.55:1.000:. ./.:4:171,409:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,652:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,548:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,776:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,603:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,88:.:-3.44:1.000:. ./.:4:86,258:.:-1.61:1.000:. ./.:4:158,430:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,618:.: 0.36:1.000:. ./.:4:167,543:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,495:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,535:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,639:.: 0.51:1.000:. ./.:4:128,409:.:-0.22:1.000:. ./.:4:129,389:.:-0.36:1.000:. ./.:4:119,436:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,579:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,632:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,679:.: 0.79:1.000:. ./.:4:145,412:.:-0.08:1.000:. ./.:4:307,308:.: 0.33:0.999:. ./.:4:153,454:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,549:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,613:.: 0.32:1.000:. ./.:4:122,343:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1,653:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,624:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,580:.: 0.08:1.000:. ./.:4:151,461:.: 0.31:1.000:. ./.:4:162,533:.: 0.91:1.000:. ./.:4:176,546:.: 1.10:1.000:. ./.:4:173,504:.: 0.78:1.000:. ./.:4:59,598:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,633:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,752:.: 1.32:1.000:. ./.:4:1,779:.: 1.52:1.000:. ./.:4:139,422:.:-0.05:1.000:. ./.:4:122,480:.: 0.24:1.000:. -chr1.1 62762651 chr1.1_062762651 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:135,106:0.43: 1.34:1.000:0.939 0/0/1/1:4:95,86:0.46: 0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:83,40:0.31:-0.90:1.000:0.970 0/0/1/1:4:118,102:0.45: 0.94:1.000:0.981 0/0/0/1:4:136,59:0.29: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:169,65:0.26: 1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,49:0.41:-1.02:1.000:0.839 0/0/0/1:4:154,51:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,97:0.45: 0.71:1.000:0.983 0/0/1/1:4:4,3:0.42:-3.11:1.000:0.896 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,76:0.37: 0.56:1.000:0.598 0/0/0/0:4:262,0:0.00: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,107:0.46: 1.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:154,38:0.19: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,62:0.36:-0.05:1.000:0.730 0/0/1/1:4:52,79:0.59:-0.75:0.998:0.850 0/0/1/1:4:63,81:0.55:-0.51:1.000:0.979 0/0/0/1:4:151,71:0.31: 0.98:1.000:0.978 0/0/1/1:4:120,135:0.52: 1.60:1.000:0.995 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-3.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,107:0.47: 1.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:212,57:0.20: 1.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,107:0.64:-0.11:1.000:0.671 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-3.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,107:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,111:0.59: 0.25:1.000:0.848 0/1/1/1:4:47,115:0.70:-0.16:1.000:0.986 0/1/1/1:4:59,171:0.74: 1.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:226,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,142:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,72:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-3.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.13:-2.96:1.000:0.876 0/0/0:3:1,0:0.00:-3.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,65:0.30: 0.67:1.000:0.983 0/0/1/1:4:59,96:0.61:-0.30:1.000:0.704 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,79:0.62:-0.85:1.000:0.613 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,95:0.65:-0.49:1.000:0.747 0/0/0/1:4:93,46:0.32:-0.60:1.000:0.958 0/0/1/1:4:113,105:0.47: 0.90:1.000:0.992 0/0/0/1:4:83,34:0.28:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,85:0.43: 0.41:1.000:0.947 0/0/1/1:4:93,86:0.47: 0.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,128:0.61: 0.69:1.000:0.715 0/1/1/1:4:63,110:0.63: 0.05:1.000:0.505 0/0/1/1:4:66,83:0.55:-0.41:1.000:0.984 0/0/0/1:4:135,40:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,72:0.46:-0.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:114,48:0.28:-0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,76:0.46:-0.16:1.000:0.985 0/0/0/1:4:101,47:0.30:-0.43:1.000:0.980 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,85:0.51:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,80:0.60:-0.75:1.000:0.791 0/0/1/1:4:70,62:0.46:-0.73:1.000:0.986 0/0/1/1:4:51,78:0.59:-0.79:1.000:0.839 0/0/0/0/0/1:6:106,23:0.17:-0.79:1.000:0.984 0/0/0/1:4:170,38:0.17: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,62:0.31: 0.41:1.000:0.973 0/0/0/1:4:76,45:0.36:-0.94:1.000:0.698 0/0/1/1:4:81,70:0.45:-0.37:1.000:0.981 0/1/1/1:4:66,158:0.70: 1.01:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,49:0.29:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:100,56:0.35:-0.28:1.000:0.824 0/1/1/1:4:49,111:0.68:-0.20:0.910:0.964 0/0/1/1:4:106,87:0.44: 0.43:1.000:0.964 0/0/1/1:4:69,107:0.60: 0.10:1.000:0.814 0/0/0/1:4:81,34:0.28:-1.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:134,37:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,107:0.60: 0.08:1.000:0.784 0/0/1/1:4:90,82:0.46: 0.03:1.000:0.990 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,38:0.30:-0.90:1.000:0.988 0/0/1/1:4:74,87:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:142,25:0.14:-0.07:1.000:0.974 0/1/1/1:4:57,125:0.68: 0.22:1.000:0.947 0/0/1/1:4:71,72:0.49:-0.52:0.984:0.996 0/0/1/1:4:57,92:0.61:-0.41:1.000:0.725 0/0/1/1:4:60,76:0.55:-0.66:1.000:0.982 0/0/0/1:4:110,39:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,102:0.47: 0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:178,50:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,84:0.63:-0.75:1.000:0.578 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,74:0.43:-0.05:1.000:0.941 0/0/1/1:4:78,82:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,59:0.35:-0.13:0.999:0.818 0/0/1/1:4:100,83:0.44: 0.24:1.000:0.969 0/0/0/1:4:111,47:0.28:-0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:42,114:0.72:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,126:0.65: 0.39:1.000:0.792 0/1/1/1:4:48,122:0.71:-0.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,77:0.64:-1.00:1.000:0.719 0/0/1/1:4:62,84:0.56:-0.47:1.000:0.960 0/0/0/1:4:111,42:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,47:0.16: 1.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,35:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,43:0.21: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,75:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,63:0.29: 0.73:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,30:0.29:-1.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:87,81:0.47:-0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:79,46:0.36:-0.87:1.000:0.741 0/0/1/1:4:133,140:0.50: 1.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,103:0.41: 1.39:1.000:0.861 0/0/0/1:4:106,60:0.35:-0.09:1.000:0.804 0/1/1/1:4:34,97:0.73:-0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,137:0.53: 1.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:97,55:0.35:-0.35:0.999:0.800 0/1/1/1:4:54,139:0.71: 0.43:1.000:0.993 0/0/0:3:79,4:0.05:-1.66:0.999:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,35:0.27:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,44:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,119:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,79:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,117:0.69:-0.07:1.000:0.976 0/0/0/1:4:148,47:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,85:0.40: 0.67:1.000:0.791 0/0/1/1:4:88,72:0.44:-0.20:1.000:0.963 0/1/1/1:4:54,129:0.70: 0.24:1.000:0.981 0/0/0/0/1:5:144,44:0.22: 0.33:0.988:0.983 0/1/1/1:4:36,101:0.73:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,33:0.31:-1.28:1.000:0.977 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,33:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,100:0.48: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,48:0.40:-1.02:1.000:0.770 0/0/1/1:4:55,89:0.61:-0.51:1.000:0.719 0/0/1/1:4:95,92:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:155,88:0.35: 1.38:1.000:0.798 0/0/1/1:4:90,112:0.54: 0.60:1.000:0.986 0/0/0/1:4:92,34:0.26:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,35:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,43:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,83:0.42: 0.37:1.000:0.930 0/0/1/1:4:112,105:0.47: 0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,66:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,63:0.22: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,119:0.45: 1.70:1.000:0.974 0/0/1/1:4:111,100:0.46: 0.77:1.000:0.988 0/0/0/1:4:208,44:0.17: 1.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,95:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,53:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,55:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.17:-3.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,34:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,80:0.61:-0.79:1.000:0.695 0/0/0/0:4:250,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,107:0.60: 0.08:1.000:0.784 0/0/1/1:4:68,114:0.62: 0.22:1.000:0.620 0/0/0/1:4:106,39:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:211,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,148:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,44:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,92:0.45: 0.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:62,105:0.62:-0.07:1.000:0.590 0/1/1/1:4:66,130:0.65: 0.48:1.000:0.823 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,92:0.61:-0.43:1.000:0.678 0/1/1/1:4:52,158:0.74: 0.75:0.999:0.999 0/0/0/1:4:105,54:0.33:-0.22:1.000:0.933 0/0/0/1:4:156,42:0.20: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,46:0.30:-0.47:1.000:0.983 0/0/0/1:4:117,45:0.26:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/0:4:206,1:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,46:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,125:0.71: 0.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:116,117:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,115:0.46: 1.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:114,97:0.45: 0.77:1.000:0.977 0/0/0/0:4:218,21:0.08: 1.30:1.000:0.979 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,69:0.32: 0.67:1.000:0.948 0/0/1/1:4:134,133:0.49: 1.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,101:0.65:-0.35:1.000:0.833 0/0/1/1:4:109,96:0.46: 0.65:1.000:0.985 -chr1.1 63109180 chr1.1_063109180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.06:0.998:. ./.:4:23,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.70:1.000:. ./.:6:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.51:0.910:. ./.:4:39,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:75,0:.: 4.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:0.984:. ./.:4:39,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:37,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:0.999:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:3:12,0:.:-0.92:0.999:. ./.:4:18,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:24,0:.: 0.03:0.988:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:36,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:62,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:0.999:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. -chr1.1 63422231 chr1.1_063422231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,30:.: 1.62:1.000:. ./.:4:1,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,25:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,42:.: 3.22:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,18:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1,22:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,27:.: 1.23:1.000:. ./.:4:3,20:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:0.998:. ./.:4:0,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,22:.: 0.83:1.000:. ./.:4:3,30:.: 2.02:1.000:. ./.:4:1,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,44:.: 3.49:1.000:. ./.:4:3,17:.: 0.29:1.000:. ./.:4:4,11:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,16:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,25:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.69:1.000:. ./.:4:2,19:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.30:1.000:. ./.:3:0,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.36:1.000:. ./.:4:3,9:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.10:1.000:. ./.:6:0,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:2,15:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:3,17:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,11:.:-0.77:0.910:. ./.:4:0,29:.: 1.49:1.000:. ./.:4:1,9:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,19:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,10:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,32:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.90:0.984:. ./.:4:0,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,21:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.50:0.999:. ./.:4:0,28:.: 1.36:1.000:. ./.:4:2,8:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,19:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:2,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,34:.: 2.16:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,5:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,33:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.36:1.000:. ./.:4:3,28:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.50:0.999:. ./.:4:1,11:.:-0.77:1.000:. ./.:3:1,12:.:-0.64:0.999:. ./.:4:2,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:5:0,31:.: 1.76:0.988:. ./.:4:2,11:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,18:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,20:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1,18:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,25:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.70:1.000:. ./.:4:3,19:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,29:.: 1.62:1.000:. ./.:4:2,21:.: 0.69:1.000:. ./.:4:2,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,28:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.44:1.000:. ./.:4:2,15:.:-0.10:0.999:. ./.:4:1,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,10:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,37:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,35:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.69:1.000:. -chr1.1 63517450 chr1.1_063517450 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:95,82:0.47: 1.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:97,21:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,83:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,31:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,46:0.27: 1.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,82:0.49: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,37:0.51:-2.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,102:0.71: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,62:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,42:0.61:-2.21:1.000:0.718 0/0/1/1:4:31,26:0.46:-2.57:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,34:0.27: 0.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,104:0.70: 0.23:1.000:0.988 0/0/0/1:4:96,34:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,43:0.42:-1.00:1.000:0.913 0/0/0/1:4:127,45:0.28: 1.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,36:0.24: 0.92:0.998:1.000 0/0/0/1:4:118,35:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,72:0.48: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,48:0.29: 1.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:14,41:0.72:-2.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,71:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,134:0.71: 1.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:110,31:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,16:0.40:-3.09:1.000:0.805 0/0/0/1:4:105,28:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,38:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:118,32:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,40:0.27: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,71:0.53:-0.09:1.000:0.991 0/0/0/1:4:103,33:0.26: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,59:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,15:0.41:-3.18:1.000:0.837 0/0/0/1:4:57,31:0.37:-1.56:1.000:0.612 0/0/1:3:24,10:0.31:-3.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,116:0.73: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,21:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,63:0.48:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:131,36:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,75:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,61:0.44: 0.14:1.000:0.973 0/0/0/1:4:110,34:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,36:0.31:-0.38:1.000:0.976 0/0/1/1:4:82,99:0.55: 1.47:1.000:0.984 0/0/1/1:4:90,79:0.47: 1.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,33:0.21: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,6:0.10:-2.34:1.000:0.733 0/0/0/1:4:88,19:0.19:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,58:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,63:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,43:0.25: 1.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,53:0.55:-1.30:1.000:0.980 0/0/0/1:4:116,38:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,69:0.47: 0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:66,52:0.45:-0.58:1.000:0.979 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,42:0.30: 0.43:1.000:0.985 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:73,68:0.49: 0.17:1.000:0.881 0/0/1/1:4:76,89:0.54: 0.95:1.000:0.988 0/0/1/1:4:61,58:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,51:0.34: 0.66:1.000:0.852 0/0/1/1:4:77,81:0.52: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,47:0.27: 1.80:1.000:0.998 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,47:0.47:-1.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:73,73:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,46:0.33: 0.43:0.910:0.938 0/0/1/1:4:75,70:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,43:0.26: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,17:0.20:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,80:0.54: 0.40:1.000:0.988 0/0/0/1:4:119,26:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,27:0.22:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,88:0.73:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,66:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,49:0.30: 1.28:1.000:0.986 0/1/1/1:4:47,89:0.64: 0.01:1.000:0.688 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,27:0.24:-0.38:0.984:1.000 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,64:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,35:0.30:-0.42:1.000:0.982 0/0/1/1:4:69,66:0.49:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,30:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,24:0.24:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,22:0.28:-1.65:0.999:0.996 0/0/0/1:4:97,37:0.29:-0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,70:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,16:0.20:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,29:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,32:0.25: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,35:0.28:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:89,26:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,61:0.44: 0.17:1.000:0.969 0/0/1/1:4:63,73:0.54: 0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:47,46:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,100:0.73:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,64:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,60:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,26:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,31:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,63:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,77:0.49: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,44:0.27: 1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,76:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,35:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,34:0.20: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,30:0.21: 0.72:0.999:1.000 0/0/0/1:4:101,34:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/1:3:54,26:0.34:-1.82:0.999:1.000 0/0/1/1:4:82,72:0.47: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,47:0.53:-1.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,55:0.53:-1.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,22:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,49:0.43:-0.61:1.000:0.942 0/1/1/1:4:32,112:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,33:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,72:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,84:0.52: 0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,63:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,35:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:75,82:0.52: 0.69:0.988:0.721 0/0/0/1:4:82,21:0.22:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,60:0.57:-1.00:1.000:0.954 0/0/1/1:4:67,45:0.41:-0.77:1.000:0.879 0/0/0/1:4:99,28:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,66:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,49:0.56:-1.59:1.000:0.968 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,63:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:136,40:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,24:0.20:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,37:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,87:0.68:-0.35:1.000:0.944 0/0/1/1:4:76,54:0.43:-0.19:1.000:0.933 0/0/1/1:4:64,58:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,66:0.45: 0.50:1.000:0.975 0/0/1/1:4:69,59:0.47:-0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,57:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,101:0.52: 1.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,84:0.47: 1.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,76:0.48: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,27:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,60:0.44: 0.14:1.000:0.963 0/0/1/1:4:74,70:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,104:0.51: 2.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,64:0.43: 0.50:1.000:0.954 0/0/1/1:4:11,17:0.60:-3.51:1.000:0.805 0/0/1/1:4:55,49:0.48:-1.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:80,36:0.33:-0.64:1.000:0.932 0/1/1/1:4:39,110:0.71: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:129,41:0.26: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,38:0.31:-0.22:1.000:0.970 0/0/1/1:4:80,66:0.46: 0.33:1.000:0.987 0/0/1/1:4:66,46:0.42:-0.77:1.000:0.918 0/0/0/1:4:124,34:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,42:0.41:-1.03:1.000:0.889 0/0/0/1:4:119,28:0.21: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,32:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,28:0.24:-0.25:0.999:1.000 0/0/1/1:4:58,89:0.60: 0.37:1.000:0.817 0/0/1/1:4:77,49:0.40:-0.32:1.000:0.795 0/0/1/1:4:84,54:0.40: 0.07:1.000:0.813 0/0/1/1:4:41,70:0.62:-0.81:1.000:0.582 0/1/1/1:4:28,100:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,62:0.47:-0.03:1.000:0.991 0/1/1/1:4:34,78:0.68:-0.77:1.000:0.945 0/0/0/1:4:111,28:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,28:0.18: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,93:0.57: 0.85:1.000:0.948 0/0/1/1:4:74,62:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:58,94:0.61: 0.53:1.000:0.710 0/0/1/1:4:69,82:0.54: 0.50:1.000:0.986 0/0/0/1:4:147,46:0.26: 1.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,47:0.30: 1.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:89,46:0.36:-0.03:1.000:0.739 0/0/0/1:4:126,35:0.24: 0.82:1.000:1.000 -chr1.1 63670977 chr1.1_063670977 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,67:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,62:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:22,86:.: 1.49:1.000:. ./.:4:27,95:.: 2.07:1.000:. ./.:4:13,24:.:-1.46:1.000:. ./.:4:56,31:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,40:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.71:1.000:. ./.:4:3,13:.:-2.34:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,34:.: 0.16:1.000:. ./.:4:13,66:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:22,78:.: 1.15:1.000:. ./.:4:20,82:.: 1.24:0.998:. ./.:4:0,112:.: 1.65:1.000:. ./.:4:33,68:.: 1.20:1.000:. ./.:4:23,73:.: 0.99:1.000:. ./.:4:3,4:.:-2.71:1.000:. ./.:4:19,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,40:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:2,2:.:-2.83:1.000:. ./.:4:18,76:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.15:1.000:. ./.:4:23,60:.: 0.45:1.000:. ./.:4:25,63:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,74:.: 0.78:1.000:. ./.:4:20,68:.: 0.66:1.000:. ./.:4:19,66:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,4:.:-2.75:1.000:. ./.:4:4,15:.:-2.21:1.000:. ./.:3:3,1:.:-2.83:1.000:. ./.:4:42,44:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,98:.: 1.07:1.000:. ./.:4:12,66:.: 0.24:1.000:. ./.:4:14,61:.: 0.12:1.000:. ./.:4:27,68:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,63:.: 0.45:1.000:. ./.:4:30,67:.: 1.03:1.000:. ./.:4:22,47:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:46,44:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,122:.: 2.07:1.000:. ./.:4:19,46:.:-0.30:1.000:. ./.:4:53,46:.: 1.11:1.000:. ./.:4:13,35:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.20:1.000:. ./.:4:19,51:.:-0.09:1.000:. ./.:4:24,61:.: 0.53:1.000:. ./.:4:23,62:.: 0.53:1.000:. ./.:4:60,37:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.05:1.000:. ./.:4:31,60:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.57:1.000:. ./.:6:10,22:.:-1.67:1.000:. ./.:4:15,56:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,45:.: 0.95:1.000:. ./.:4:23,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:10,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:19,69:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.03:1.000:. ./.:4:9,20:.:-1.79:1.000:. ./.:4:20,51:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,55:.:-0.05:0.910:. ./.:4:0,81:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,110:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,31:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,43:.:-0.34:1.000:. ./.:4:17,44:.:-0.47:1.000:. ./.:4:35,30:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.92:0.984:. ./.:4:0,86:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.05:1.000:. ./.:4:23,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:20,47:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,51:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.55:1.000:. ./.:4:14,39:.:-0.80:1.000:. ./.:4:20,67:.: 0.61:1.000:. ./.:4:11,39:.:-0.92:0.999:. ./.:4:15,50:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,48:.:-0.34:1.000:. ./.:4:17,44:.:-0.47:1.000:. ./.:4:19,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:22,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.21:1.000:. ./.:4:17,38:.:-0.71:1.000:. ./.:4:36,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,26:.:-1.59:1.000:. ./.:4:28,38:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,31:.:-1.59:1.000:. ./.:4:15,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,29:.:-1.30:1.000:. ./.:4:26,55:.: 0.37:1.000:. ./.:4:13,49:.:-0.42:1.000:. ./.:4:16,63:.: 0.28:1.000:. ./.:4:23,81:.: 1.32:1.000:. ./.:4:22,60:.: 0.41:1.000:. ./.:4:13,54:.:-0.22:1.000:. ./.:4:24,88:.: 1.65:1.000:. ./.:4:22,44:.:-0.26:0.999:. ./.:4:22,64:.: 0.57:1.000:. ./.:3:14,21:.:-1.55:0.999:. ./.:4:12,52:.:-0.34:1.000:. ./.:4:22,39:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:12,55:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,61:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,41:.: 0.82:1.000:. ./.:4:15,36:.:-0.88:1.000:. ./.:4:48,43:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,59:.: 0.70:1.000:. ./.:4:35,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,64:.: 0.66:1.000:. ./.:5:28,36:.:-0.34:0.988:. ./.:4:0,47:.:-1.05:1.000:. ./.:4:7,32:.:-1.38:1.000:. ./.:4:10,34:.:-1.17:1.000:. ./.:4:13,40:.:-0.80:1.000:. ./.:4:16,51:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,34:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.95:1.000:. ./.:4:16,63:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,69:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,69:.: 1.03:1.000:. ./.:4:15,39:.:-0.76:1.000:. ./.:4:24,18:.:-1.25:1.000:. ./.:4:12,40:.:-0.84:1.000:. ./.:4:17,48:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,27:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:11,26:.:-1.46:1.000:. ./.:4:26,81:.: 1.45:1.000:. ./.:4:34,62:.: 0.99:1.000:. ./.:4:31,58:.: 0.70:1.000:. ./.:4:27,67:.: 0.91:1.000:. ./.:4:22,78:.: 1.15:1.000:. ./.:4:29,66:.: 0.95:1.000:. ./.:4:21,83:.: 1.32:1.000:. ./.:4:56,54:.: 1.57:1.000:. ./.:4:2,7:.:-2.63:1.000:. ./.:4:26,23:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.20:1.000:. ./.:4:43,37:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:14,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:20,83:.: 1.28:1.000:. ./.:4:20,54:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,52:.: 0.95:1.000:. ./.:4:23,52:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.99:1.000:. ./.:4:17,64:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.84:0.999:. ./.:4:25,59:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,27:.:-0.76:1.000:. ./.:4:9,50:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:49,32:.: 0.37:1.000:. ./.:4:22,42:.:-0.34:1.000:. ./.:4:29,29:.:-0.59:1.000:. ./.:4:16,49:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,93:.: 1.90:1.000:. ./.:4:21,43:.:-0.34:1.000:. ./.:4:18,72:.: 0.74:1.000:. ./.:4:36,34:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,58:.: 0.20:1.000:. ./.:4:27,100:.: 2.28:1.000:. ./.:4:18,67:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.91:1.000:. -chr1.1 64260200 chr1.1_064260200 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,306:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,295:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,334:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,32:.:-3.00:1.000:. ./.:4:0,62:.:-2.55:1.000:. ./.:4:0,274:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,321:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,307:.: 1.07:0.998:. ./.:4:73,183:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,364:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,400:.: 2.44:1.000:. ./.:4:0,17:.:-3.22:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,13:.:-3.28:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,326:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,350:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,26:.:-3.08:1.000:. ./.:4:0,48:.:-2.76:1.000:. ./.:3:0,4:.:-3.41:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,251:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,167:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.13:1.000:. ./.:6:0,219:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.25:0.910:. ./.:4:0,223:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,157:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,197:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.46:1.000:. ./.:4:2,151:.:-1.21:0.984:. ./.:4:0,179:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,146:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,151:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,173:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.38:0.999:. ./.:4:0,213:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,159:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,392:.: 2.33:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.25:0.999:. ./.:4:0,250:.: 0.23:1.000:. ./.:3:0,158:.:-1.13:0.999:. ./.:4:0,228:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.45:1.000:. ./.:5:0,305:.: 1.04:0.988:. ./.:4:0,176:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,166:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,153:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,163:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,418:.: 2.71:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,186:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,348:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,321:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,349:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,344:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,287:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,29:.:-3.04:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,267:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,322:.: 1.29:1.000:. ./.:4:1,318:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,274:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.71:0.999:. ./.:4:0,267:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,227:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,369:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,331:.: 1.42:1.000:. ./.:4:2,350:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.24:1.000:. -chr1.1 64512571 chr1.1_064512571 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:201,64:0.27: 1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,79:0.45:-0.05:1.000:0.984 0/0/0/1:4:191,53:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,96:0.46: 0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:126,111:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,114:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,56:0.57:-1.84:1.000:0.943 0/0/0/1:4:172,58:0.28: 0.89:1.000:0.995 0/0/0/1:4:143,42:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,30:0.48:-2.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:50,16:0.27:-2.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,75:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:175,40:0.21: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,93:0.53:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:122,95:0.47: 0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:62,172:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,92:0.49: 0.27:0.998:0.996 0/0/0/1:4:205,53:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,92:0.45: 0.66:1.000:0.980 0/1/1/1:4:58,152:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,10:0.24:-3.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,88:0.43: 0.64:1.000:0.955 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,123:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,19:0.45:-3.06:1.000:0.982 0/1/1/1:4:41,179:0.82: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,92:0.40: 1.26:1.000:0.812 0/0/1/1:4:114,90:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:129,121:0.51: 1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,90:0.52:-0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,90:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,97:0.52: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,17:0.59:-3.38:1.000:0.880 0/0/0/1:4:39,20:0.37:-2.76:1.000:0.574 0/0/0:3:24,0:0.00:-3.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,127:0.71:-0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:110,92:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,90:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,87:0.50:-0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,163:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,100:0.47: 0.81:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,144:0.79:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,86:0.45: 0.34:1.000:0.981 0/0/1/1:4:98,76:0.47:-0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:172,55:0.27: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,141:0.69: 0.42:1.000:0.970 0/0/1/1:4:148,131:0.50: 1.94:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,166:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,75:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,47:0.30:-0.24:1.000:0.988 0/1/1/1:4:73,167:0.70: 1.11:1.000:0.988 0/0/0/1:4:152,47:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,144:0.73: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,72:0.44:-0.24:1.000:0.961 0/0/0/1:4:147,37:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,122:0.68:-0.13:1.000:0.957 0/1/1/1:4:36,121:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,127:0.70:-0.09:1.000:0.984 0/0/0/1/1/1:6:85,56:0.43:-1.01:1.000:0.579 0/0/1/1:4:119,89:0.46: 0.42:1.000:0.986 0/0/1/1:4:100,96:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,99:0.55:-0.03:1.000:0.976 0/0/1/1:4:68,57:0.49:-1.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,155:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,122:0.71:-0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,43:0.53:-2.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:169,55:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,89:0.52:-0.20:0.910:0.994 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,155:0.71: 0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:26,80:0.76:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,39:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,96:0.42: 1.19:1.000:0.927 0/0/1/1:4:138,109:0.47: 1.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,44:0.31:-0.71:1.000:0.966 0/0/1/1:4:101,78:0.47:-0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:141,99:0.44: 1.11:1.000:0.971 0/0/1/1:4:102,63:0.41:-0.50:1.000:0.875 0/1/1/1:4:44,138:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,68:0.42:-0.28:0.984:0.908 0/1/1/1:4:45,136:0.76:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,37:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,125:0.74:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,93:0.49: 0.29:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,113:0.69:-0.45:1.000:0.969 0/1/1/1:4:44,131:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,126:0.71:-0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,73:0.56:-1.12:0.999:0.967 0/0/1/1:4:107,83:0.47: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:110,101:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,63:0.39:-0.33:1.000:0.737 0/0/1/1:4:83,74:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,74:0.46:-0.33:1.000:0.986 0/0/1/1:4:109,64:0.40:-0.33:1.000:0.791 0/0/1/1:4:102,69:0.43:-0.37:1.000:0.955 0/0/0/1:4:161,48:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,88:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,61:0.51:-1.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,43:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,23:0.20:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,84:0.43: 0.44:1.000:0.951 0/1/1/1:4:33,104:0.76:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,106:0.70:-0.73:1.000:0.983 0/0/1/1:4:99,91:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,94:0.53:-0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:146,143:0.52: 2.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:160,37:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,85:0.47: 0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:61,162:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,117:0.69:-0.33:0.999:0.968 0/0/1/1:4:109,102:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/1/1:3:37,80:0.69:-1.52:0.999:1.000 0/0/1/1:4:113,78:0.44: 0.06:1.000:0.964 0/0/1/1:4:89,56:0.42:-0.92:1.000:0.897 0/0/1/1:4:103,73:0.44:-0.26:1.000:0.974 0/0/1/1:4:87,77:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:155,38:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,44:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,83:0.46: 0.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:93,102:0.55: 0.14:1.000:0.982 0/0/0/1:4:203,53:0.24: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,40:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,101:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/0/1:5:185,51:0.25: 1.02:0.988:0.940 0/0/1/1:4:96,73:0.46:-0.41:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,52:0.47:-1.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:68,73:0.54:-1.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:97,92:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,87:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,60:0.53:-1.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,145:0.71: 0.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:173,42:0.22: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,117:0.48: 1.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,158:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,62:0.42:-0.62:1.000:0.914 0/0/0/1:4:138,42:0.26:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,77:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,78:0.46:-0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:90,68:0.46:-0.65:1.000:0.988 0/0/0/1:4:150,51:0.28: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:116,33:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,132:0.53: 1.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:173,135:0.47: 2.56:1.000:0.991 0/0/0/1:4:164,50:0.26: 0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:61,147:0.71: 0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:126,109:0.49: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,47:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:199,55:0.25: 1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,61:0.30: 0.87:1.000:0.988 0/0/0/1:4:65,15:0.21:-2.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,68:0.55:-1.24:1.000:0.982 0/1/1/1:4:65,158:0.72: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:198,50:0.23: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,142:0.70: 0.40:1.000:0.981 0/1/1/1:4:74,159:0.69: 0.96:1.000:0.977 0/0/0/1:4:158,44:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,103:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,95:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,87:0.56:-0.58:1.000:0.961 0/1/1/1:4:49,122:0.72:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,155:0.67: 0.98:1.000:0.936 0/1/1/1:4:84,151:0.66: 1.00:1.000:0.842 0/0/1/1:4:108,86:0.47: 0.12:1.000:0.993 1/1/1/1:4:1,148:0.99:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,93:0.51: 0.12:0.999:0.996 0/0/1/1:4:118,84:0.45: 0.29:1.000:0.975 0/0/0/1:4:132,43:0.28:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,37:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,31:0.22:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,55:0.28: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,96:0.47: 0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:106,30:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,68:0.52:-1.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,161:0.73: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,104:0.55: 0.21:1.000:0.980 0/0/1/1:4:112,90:0.48: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:151,63:0.32: 0.55:1.000:0.940 0/0/1/1:4:105,90:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,124:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,120:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,119:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,95:0.46: 0.66:1.000:0.990 -chr1.1 64709912 chr1.1_064709912 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:353,108:.: 1.54:1.000:. ./.:4:160,101:.:-0.96:1.000:. ./.:4:212,154:.: 0.35:1.000:. ./.:4:325,86:.: 0.92:1.000:. ./.:4:260,222:.: 1.81:1.000:. ./.:4:202,186:.: 0.63:1.000:. ./.:4:140,56:.:-1.78:1.000:. ./.:4:268,90:.: 0.25:1.000:. ./.:4:321,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:136,13:.:-2.37:1.000:. ./.:4:34,65:.:-3.00:1.000:. ./.:4:184,133:.:-0.26:1.000:. ./.:4:186,177:.: 0.31:1.000:. ./.:4:317,95:.: 0.93:1.000:. ./.:4:176,160:.:-0.02:1.000:. ./.:4:190,142:.:-0.07:1.000:. ./.:4:278,83:.: 0.29:0.998:. ./.:4:428,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:260,187:.: 1.37:1.000:. ./.:4:341,103:.: 1.33:1.000:. ./.:4:177,11:.:-1.88:1.000:. ./.:4:289,78:.: 0.36:1.000:. ./.:4:365,113:.: 1.76:1.000:. ./.:4:195,142:.:-0.01:1.000:. ./.:4:61,48:.:-2.87:1.000:. ./.:4:285,86:.: 0.41:1.000:. ./.:4:199,199:.: 0.75:1.000:. ./.:4:309,81:.: 0.65:1.000:. ./.:4:519,1:.: 2.28:1.000:. ./.:4:86,196:.:-0.70:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:214,62:.:-0.78:1.000:. ./.:4:174,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:92,59:.:-2.34:1.000:. ./.:3:61,3:.:-3.43:1.000:. ./.:4:266,71:.:-0.01:1.000:. ./.:4:169,147:.:-0.28:1.000:. ./.:4:108,222:.:-0.10:1.000:. ./.:4:247,78:.:-0.16:1.000:. ./.:4:96,194:.:-0.60:1.000:. ./.:4:203,158:.: 0.29:1.000:. ./.:4:188,160:.: 0.13:1.000:. ./.:4:350,87:.: 1.24:1.000:. ./.:4:159,135:.:-0.55:1.000:. ./.:4:319,73:.: 0.68:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:266,222:.: 1.88:1.000:. ./.:4:163,120:.:-0.69:1.000:. ./.:4:160,118:.:-0.75:1.000:. ./.:4:228,55:.:-0.69:1.000:. ./.:4:252,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:114,267:.: 0.54:1.000:. ./.:4:226,66:.:-0.58:1.000:. ./.:4:214,176:.: 0.65:1.000:. ./.:4:94,219:.:-0.31:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:161,136:.:-0.51:1.000:. ./.:4:245,74:.:-0.24:1.000:. ./.:4:197,123:.:-0.23:1.000:. ./.:6:160,106:.:-0.90:1.000:. ./.:4:225,180:.: 0.84:1.000:. ./.:4:230,74:.:-0.43:1.000:. ./.:4:219,128:.: 0.11:1.000:. ./.:4:232,69:.:-0.46:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:287,59:.: 0.10:1.000:. ./.:4:158,126:.:-0.68:1.000:. ./.:4:179,139:.:-0.25:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.33:0.910:. ./.:4:203,178:.: 0.54:1.000:. ./.:4:205,175:.: 0.53:1.000:. ./.:4:69,151:.:-1.48:1.000:. ./.:4:95,176:.:-0.84:1.000:. ./.:4:203,164:.: 0.36:1.000:. ./.:4:206,138:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,106:.:-0.96:1.000:. ./.:4:183,137:.:-0.23:1.000:. ./.:4:356,88:.: 1.33:1.000:. ./.:4:240,63:.:-0.44:1.000:. ./.:4:188,138:.:-0.15:1.000:. ./.:4:183,131:.:-0.30:0.984:. ./.:4:170,146:.:-0.28:1.000:. ./.:4:190,145:.:-0.04:1.000:. ./.:4:174,144:.:-0.25:1.000:. ./.:4:250,52:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,165:.: 0.55:1.000:. ./.:4:158,116:.:-0.80:1.000:. ./.:4:265,74:.: 0.01:1.000:. ./.:4:264,76:.: 0.03:1.000:. ./.:4:263,63:.:-0.15:1.000:. ./.:4:134,116:.:-1.10:0.999:. ./.:4:322,84:.: 0.85:1.000:. ./.:4:200,140:.: 0.03:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:176,124:.:-0.48:1.000:. ./.:4:149,101:.:-1.10:1.000:. ./.:4:218,173:.: 0.66:1.000:. ./.:4:304,90:.: 0.70:1.000:. ./.:4:167,146:.:-0.31:1.000:. ./.:4:313,84:.: 0.74:1.000:. ./.:4:278,53:.:-0.09:1.000:. ./.:4:349,87:.: 1.23:1.000:. ./.:4:154,120:.:-0.80:1.000:. ./.:4:238,69:.:-0.39:1.000:. ./.:4:150,108:.:-1.00:1.000:. ./.:4:296,75:.: 0.41:1.000:. ./.:4:387,85:.: 1.68:1.000:. ./.:4:192,145:.:-0.01:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:398,90:.: 1.88:1.000:. ./.:4:191,128:.:-0.24:0.999:. ./.:4:378,0:.: 0.50:1.000:. ./.:3:61,81:.:-2.46:0.999:. ./.:4:100,218:.:-0.25:1.000:. ./.:4:141,100:.:-1.22:1.000:. ./.:4:164,141:.:-0.41:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:257,80:.:-0.01:1.000:. ./.:4:183,166:.: 0.14:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:317,83:.: 0.78:1.000:. ./.:4:353,103:.: 1.48:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.90:1.000:. ./.:5:282,124:.: 0.85:0.988:. ./.:4:208,71:.:-0.74:1.000:. ./.:4:147,85:.:-1.33:1.000:. ./.:4:71,169:.:-1.23:1.000:. ./.:4:157,136:.:-0.56:1.000:. ./.:4:303,93:.: 0.73:1.000:. ./.:4:114,73:.:-1.89:1.000:. ./.:4:148,114:.:-0.95:1.000:. ./.:4:261,77:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,169:.: 0.93:1.000:. ./.:4:259,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:120,111:.:-1.34:1.000:. ./.:4:163,149:.:-0.33:1.000:. ./.:4:178,140:.:-0.25:1.000:. ./.:4:198,134:.:-0.07:1.000:. ./.:4:289,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:268,72:.: 0.03:1.000:. ./.:4:212,63:.:-0.79:1.000:. ./.:4:293,229:.: 2.31:1.000:. ./.:4:143,367:.: 2.16:1.000:. ./.:4:346,97:.: 1.32:1.000:. ./.:4:314,98:.: 0.93:1.000:. ./.:4:222,137:.: 0.26:1.000:. ./.:4:262,72:.:-0.05:1.000:. ./.:4:217,180:.: 0.74:1.000:. ./.:4:290,62:.: 0.18:1.000:. ./.:4:53,52:.:-2.92:1.000:. ./.:4:266,73:.: 0.01:1.000:. ./.:4:177,132:.:-0.36:1.000:. ./.:4:199,166:.: 0.34:1.000:. ./.:4:266,226:.: 1.93:1.000:. ./.:4:204,161:.: 0.34:1.000:. ./.:4:183,178:.: 0.29:1.000:. ./.:4:110,271:.: 0.54:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:252,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:282,78:.: 0.28:1.000:. ./.:4:211,183:.: 0.70:1.000:. ./.:4:167,132:.:-0.49:1.000:. ./.:4:188,160:.: 0.13:1.000:. ./.:4:157,149:.:-0.40:1.000:. ./.:4:305,93:.: 0.75:0.999:. ./.:4:321,84:.: 0.84:1.000:. ./.:4:291,89:.: 0.53:1.000:. ./.:4:195,155:.: 0.15:1.000:. ./.:4:199,49:.:-1.13:1.000:. ./.:4:196,161:.: 0.24:1.000:. ./.:4:180,136:.:-0.28:1.000:. ./.:4:142,91:.:-1.32:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:302,93:.: 0.71:1.000:. ./.:4:329,105:.: 1.20:1.000:. ./.:4:278,84:.: 0.30:1.000:. ./.:4:204,126:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,265:.: 0.56:1.000:. ./.:4:261,168:.: 1.14:1.000:. ./.:4:468,123:.: 3.17:1.000:. ./.:4:176,140:.:-0.28:1.000:. ./.:4:207,160:.: 0.36:1.000:. -chr1.1 64843909 chr1.1_064843909 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:145,144:0.52: 0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:112,127:0.55:-0.10:1.000:0.975 0/1/1/1:4:72,192:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,190:0.74: 0.25:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,319:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,162:0.52: 1.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:194,56:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,151:0.51: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,239:0.79: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,28:0.30:-2.27:1.000:0.983 0/1/1/1:4:23,57:0.73:-2.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:164,153:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,210:0.76: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,199:0.72: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,157:0.50: 1.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,252:0.78: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,211:0.80: 0.37:0.998:1.000 0/0/0/1:4:177,65:0.30:-0.05:1.000:0.986 0/0/1/1:4:180,139:0.46: 1.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:193,120:0.41: 1.07:1.000:0.869 0/0/1/1:4:47,61:0.59:-2.19:1.000:0.882 0/0/0/1:4:213,50:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,202:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,73:0.29: 0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,26:0.52:-3.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:185,159:0.49: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,150:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,190:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,127:0.47: 0.65:1.000:0.992 0/1/1/1:4:78,246:0.77: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,153:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:193,62:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,41:0.53:-2.62:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,54:0.46:-1.92:1.000:0.986 0/1/1:3:15,26:0.65:-3.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,231:0.72: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:204,85:0.32: 0.69:1.000:0.943 0/1/1/1:4:61,178:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,170:0.77:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,202:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,110:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,123:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,126:0.50: 0.34:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,206:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,66:0.34:-0.53:1.000:0.866 0/1/1/1:4:72,195:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:231,60:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,121:0.61:-0.64:1.000:0.676 0/0/1/1:4:138,96:0.44:-0.18:1.000:0.962 0/1/1/1:4:57,196:0.79: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,108:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,180:0.52: 1.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:112,105:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,209:0.83: 0.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:89,227:0.74: 1.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:82,226:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,198:0.78: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,120:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,163:0.72:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:111,79:0.44:-0.88:1.000:0.694 0/0/1/1:4:126,89:0.44:-0.48:1.000:0.968 0/1/1/1:4:65,186:0.76: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,228:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,39:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,53:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,134:0.52: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,81:0.52:-1.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,200:0.83:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:122,103:0.48:-0.33:0.910:0.995 0/0/1/1:4:134,106:0.47:-0.09:1.000:0.991 0/0/0/1:4:178,67:0.30:-0.01:1.000:0.982 0/0/1/1:4:116,99:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,140:0.52: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,133:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,104:0.48:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,180:0.79:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,114:0.51:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,147:0.75:-0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,167:0.83:-0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:80,176:0.71: 0.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:91,90:0.52:-1.03:0.984:0.995 0/1/1/1:4:70,146:0.69:-0.47:1.000:0.979 0/0/1/1:4:121,125:0.53: 0.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:53,181:0.79:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,112:0.43: 0.57:1.000:0.934 0/0/1/1:4:120,139:0.56: 0.22:1.000:0.968 0/0/1/1:4:101,101:0.52:-0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,99:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,78:0.45:-0.98:1.000:0.980 0/0/1/1:4:132,118:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,90:0.46:-0.63:0.999:0.989 0/1/1/1:4:45,149:0.78:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,117:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,107:0.49:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,88:0.47:-0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:111,109:0.52:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,74:0.46:-1.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:110,91:0.48:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,164:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,229:0.80: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,77:0.47:-1.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:118,115:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,69:0.54:-1.77:1.000:0.988 0/0/0/1:4:153,48:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,142:0.79:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,108:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:97,101:0.53:-0.76:1.000:0.991 0/0/0/1:4:210,55:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,242:0.70: 1.71:1.000:0.988 0/1/1/1:4:72,180:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,123:0.56:-0.28:1.000:0.963 0/0/1/1:4:199,151:0.46: 1.66:1.000:0.986 0/1/1/1:4:50,123:0.73:-1.15:0.999:0.997 0/1/1/1:4:56,170:0.77:-0.31:1.000:1.000 1/1/1:3:7,124:0.95:-1.82:0.999:1.000 0/1/1/1:4:66,168:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,110:0.51:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,86:0.42:-0.45:1.000:0.927 0/0/1/1:4:110,114:0.53:-0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:117,95:0.47:-0.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,208:0.78: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,66:0.44:-1.34:1.000:0.961 0/1/1/1:4:58,172:0.76:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,124:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,133:0.72:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,115:0.49:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1/1:5:47,181:0.81:-0.28:0.988:0.997 0/0/0/1:4:127,40:0.27:-1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,64:0.49:-1.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,122:0.76:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,229:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,57:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,64:0.50:-1.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,154:0.69:-0.28:1.000:0.978 0/0/1/1:4:124,126:0.53: 0.07:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,316:1.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,129:0.53: 0.15:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,111:0.77:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,94:0.47:-0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:131,139:0.54: 0.39:1.000:0.988 0/1/1/1:4:65,129:0.68:-0.82:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,228:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,62:0.47:-1.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:209,205:0.52: 2.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,262:0.77: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,128:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,119:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:173,161:0.51: 1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,131:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,203:0.72: 0.68:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,271:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,50:0.75:-2.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,165:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:253,82:0.28: 1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:80,245:0.77: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,92:0.29: 1.82:1.000:0.993 0/0/0/1:4:286,66:0.22: 1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,137:0.70:-0.69:1.000:0.982 0/0/1/1:4:168,152:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,151:0.55: 0.68:1.000:0.982 0/1/1/1:4:67,184:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,94:0.44:-0.28:1.000:0.965 0/1/1/1:4:69,200:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,204:0.73: 0.68:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,295:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,111:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:208,67:0.27: 0.47:0.999:0.997 0/0/0/1:4:240,65:0.24: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,251:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,165:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,118:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,184:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,100:0.47:-0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:62,142:0.71:-0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:116,99:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:200,173:0.49: 2.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,61:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:291,68:0.22: 1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,176:0.69: 0.28:1.000:0.970 0/1/1/1:4:87,219:0.73: 0.96:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,343:1.00: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,252:0.74: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:221,67:0.26: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:134,150:0.55: 0.61:1.000:0.978 -chr1.1 64977592 chr1.1_064977592 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:136,152:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,162:0.54: 0.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:137,145:0.48: 0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,242:0.78: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,270:0.73: 1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,203:0.52: 1.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,119:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,160:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,233:0.77: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,15:0.35:-2.92:1.000:0.754 0/0/1/1:4:19,35:0.62:-2.72:1.000:0.593 0/0/1/1:4:138,143:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/1/1/1:4:81,254:0.74: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,277:0.72: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,154:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,181:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,166:0.47: 0.91:0.998:0.992 0/0/0/1:4:166,97:0.34: 0.06:1.000:0.874 0/0/0/1:4:305,112:0.24: 2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,195:0.52: 1.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,22:0.45:-2.84:1.000:0.982 0/0/0/1:4:179,71:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,281:0.73: 1.53:1.000:0.998 0/0/0/0:4:258,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.20:-3.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,134:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:221,89:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,159:0.49: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,184:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,166:0.47: 0.95:1.000:0.990 0/0/1/1:4:139,165:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:201,73:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.31:-3.28:1.000:0.979 0/0/1/1:4:35,24:0.37:-2.65:1.000:0.502 0/0/1:3:13,15:0.50:-3.07:1.000:0.562 0/1/1/1:4:86,280:0.75: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:274,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,196:0.52: 1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,134:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:151,182:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:203,66:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,68:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,138:0.55:-0.29:1.000:0.983 0/1/1/1:4:49,154:0.74:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,42:0.17:-0.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,187:0.78:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:322,1:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,60:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,57:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,152:0.77:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,104:0.52:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:186,75:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,117:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,152:0.55: 0.00:1.000:0.978 0/0/1/1:4:117,128:0.48:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,162:0.80:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,134:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,104:0.48:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,140:0.53:-0.17:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:107,73:0.37:-1.05:1.000:0.816 0/0/1/1:4:122,153:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,131:0.53:-0.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,190:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,43:0.21:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,87:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,67:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,135:0.55:-0.35:1.000:0.983 0/0/1/1:4:124,151:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,116:0.54:-0.77:0.910:0.987 0/0/1/1:4:99,134:0.54:-0.34:1.000:0.988 0/0/0/0:4:255,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,50:0.26:-1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,124:0.57:-0.71:1.000:0.944 0/0/0/1:4:203,71:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,122:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,145:0.74:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,54:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,138:0.51:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,223:0.85: 0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:153,170:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,94:0.52:-1.21:0.984:0.995 0/0/1/1:4:111,135:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,93:0.29: 0.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:111,105:0.45:-0.57:1.000:0.979 0/0/1/1:4:84,104:0.51:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,149:0.45: 0.60:1.000:0.983 0/0/0/1:4:126,57:0.29:-1.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:158,54:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,93:0.44:-0.83:1.000:0.965 0/0/1/1:4:113,127:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,123:0.55:-0.66:0.999:0.976 0/1/1/1:4:66,154:0.67:-0.51:1.000:0.938 0/0/0/1:4:222,88:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,114:0.51:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,159:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,136:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,54:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,129:0.54:-0.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:122,136:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,252:0.77: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,117:0.52:-0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:135,161:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,100:0.59:-1.30:1.000:0.872 0/0/0/1:4:165,64:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,86:0.47:-1.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:87,131:0.57:-0.54:1.000:0.954 0/0/0/1:4:168,42:0.18:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:199,90:0.29: 0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:77,270:0.76: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,171:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,134:0.56:-0.45:1.000:0.966 0/0/1/1:4:157,208:0.53: 1.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:112,133:0.50:-0.18:0.999:0.997 0/1/1/1:4:55,216:0.78: 0.16:1.000:1.000 0/1/1:3:56,96:0.60:-1.42:0.999:0.999 0/0/1/1:4:122,140:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,51:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,112:0.56:-0.95:1.000:0.959 0/0/1/1:4:103,120:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,99:0.48:-0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:72,240:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,127:0.56:-0.62:1.000:0.959 0/1/1/1:4:65,182:0.71:-0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:145,186:0.52: 0.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,172:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,144:0.51: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:141,200:0.55: 1.09:0.988:0.884 0/0/0/1:4:146,49:0.23:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,62:0.28:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,85:0.47:-1.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:64,162:0.69:-0.43:1.000:0.978 0/0/0/1:4:196,87:0.28: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,49:0.26:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,114:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,122:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:103,288:0.71: 1.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,125:0.46:-0.12:1.000:0.989 0/1/1/1:4:43,216:0.82: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,154:0.72:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,61:0.26:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:178,67:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,180:0.75:-0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,308:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,93:0.46:-0.95:1.000:0.988 0/0/1/1:4:202,227:0.49: 2.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,204:0.55: 1.23:1.000:0.984 0/0/1/1:4:128,196:0.57: 0.87:1.000:0.944 0/0/1/1:4:140,154:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,156:0.48: 0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,163:0.51: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,168:0.47: 0.99:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,325:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,23:0.67:-3.00:1.000:0.926 0/1/1/1:4:55,226:0.79: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,275:0.77: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:319,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:342,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,144:0.46: 0.40:1.000:0.988 0/0/0/1:4:244,80:0.23: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,156:0.47: 0.64:1.000:0.992 0/1/1/1:4:45,211:0.81:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,135:0.45: 0.22:1.000:0.983 0/0/1/1:4:124,157:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:174,183:0.47: 1.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,234:0.72: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:212,95:0.28: 0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:241,93:0.25: 1.00:0.999:0.999 0/0/0/1:4:216,97:0.28: 0.72:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,273:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,155:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,140:0.47: 0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,241:0.72: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,150:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,181:0.72:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,129:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,234:0.53: 2.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:251,90:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,85:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:97,206:0.65: 0.59:1.000:0.816 0/0/1/1:4:168,181:0.48: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,339:0.77: 2.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,336:0.77: 2.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:249,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,144:0.50: 0.14:1.000:0.997 -chr1.1 65291839 chr1.1_065291839 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:250,93:.: 0.70:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:223,115:.: 0.63:1.000:. ./.:4:408,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:321,140:.: 2.34:1.000:. ./.:4:174,66:.:-0.73:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:76,48:.:-2.34:1.000:. ./.:4:124,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:215,114:.: 0.51:1.000:. ./.:4:228,110:.: 0.63:1.000:. ./.:4:414,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.30:0.998:. ./.:4:153,178:.: 0.54:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:278,110:.: 1.33:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:249,69:.: 0.36:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:257,104:.: 0.95:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:236,132:.: 1.05:1.000:. ./.:4:253,120:.: 1.12:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:228,109:.: 0.62:1.000:. ./.:4:339,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:233,80:.: 0.29:1.000:. ./.:4:231,76:.: 0.20:1.000:. ./.:4:50,18:.:-3.12:1.000:. ./.:4:63,34:.:-2.72:1.000:. ./.:3:19,0:.:-3.80:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:267,92:.: 0.93:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:244,98:.: 0.69:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:193,71:.:-0.40:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:211,106:.: 0.34:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:304,105:.: 1.62:1.000:. ./.:4:229,84:.: 0.29:1.000:. ./.:4:209,91:.: 0.11:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:162,70:.:-0.84:1.000:. ./.:4:273,104:.: 1.18:1.000:. ./.:4:198,85:.:-0.13:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:224,54:.:-0.20:1.000:. ./.:4:201,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:219,89:.: 0.22:1.000:. ./.:6:176,51:.:-0.91:1.000:. ./.:4:212,92:.: 0.16:1.000:. ./.:4:277,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:135,64:.:-1.30:1.000:. ./.:4:271,92:.: 0.98:1.000:. ./.:4:174,81:.:-0.52:1.000:. ./.:4:159,74:.:-0.83:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:222,76:.: 0.08:0.910:. ./.:4:278,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:227,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:145,83:.:-0.90:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:265,96:.: 0.95:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:236,96:.: 0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.78:0.984:. ./.:4:196,82:.:-0.20:1.000:. ./.:4:257,97:.: 0.86:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:208,70:.:-0.20:1.000:. ./.:4:203,92:.: 0.04:1.000:. ./.:4:148,63:.:-1.13:1.000:. ./.:4:187,56:.:-0.69:1.000:. ./.:4:188,102:.:-0.03:1.000:. ./.:4:222,103:.: 0.45:1.000:. ./.:4:182,96:.:-0.20:0.999:. ./.:4:173,80:.:-0.55:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:151,62:.:-1.10:1.000:. ./.:4:177,85:.:-0.42:1.000:. ./.:4:196,79:.:-0.24:1.000:. ./.:4:164,68:.:-0.84:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:143,64:.:-1.19:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:136,74:.:-1.15:1.000:. ./.:4:169,84:.:-0.55:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:217,97:.: 0.30:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:264,96:.: 0.94:1.000:. ./.:4:252,113:.: 1.01:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:156,62:.:-1.03:1.000:. ./.:4:309,127:.: 2.00:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:282,0:.:-0.14:1.000:. ./.:3:169,0:.:-1.72:0.999:. ./.:4:313,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:163,65:.:-0.90:1.000:. ./.:4:172,62:.:-0.81:1.000:. ./.:4:130,69:.:-1.30:1.000:. ./.:4:260,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,68:.:-0.95:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:295,98:.: 1.40:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:194,95:.:-0.05:1.000:. ./.:5:337,0:.: 0.62:0.988:. ./.:4:241,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:264,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:248,96:.: 0.72:1.000:. ./.:4:194,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:233,102:.: 0.59:1.000:. ./.:4:209,76:.:-0.10:1.000:. ./.:4:450,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:236,96:.: 0.55:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:209,73:.:-0.14:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:145,70:.:-1.08:1.000:. ./.:4:276,99:.: 1.15:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:222,86:.: 0.22:1.000:. ./.:4:229,75:.: 0.16:1.000:. ./.:4:274,101:.: 1.15:1.000:. ./.:4:211,100:.: 0.26:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:301,121:.: 1.80:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:285,99:.: 1.27:1.000:. ./.:4:267,76:.: 0.70:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:265,102:.: 1.04:1.000:. ./.:4:241,85:.: 0.47:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:207,80:.:-0.08:1.000:. ./.:4:247,78:.: 0.45:1.000:. ./.:4:271,120:.: 1.37:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:227,82:.: 0.23:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.13:0.999:. ./.:4:236,80:.: 0.33:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:226,77:.: 0.15:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:207,75:.:-0.14:1.000:. ./.:4:343,128:.: 2.48:1.000:. ./.:4:240,96:.: 0.61:1.000:. ./.:4:252,95:.: 0.76:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:443,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:281,89:.: 1.08:1.000:. ./.:4:212,73:.:-0.10:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.20:1.000:. -chr1.1 65610245 chr1.1_065610245 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:59,220:.: 0.61:1.000:. ./.:4:156,77:.:-0.05:1.000:. ./.:4:77,189:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,214:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,204:.: 0.62:1.000:. ./.:4:179,185:.: 1.81:1.000:. ./.:4:100,114:.:-0.32:1.000:. ./.:4:139,133:.: 0.51:1.000:. ./.:4:57,193:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,58:.:-2.26:1.000:. ./.:4:44,41:.:-2.15:1.000:. ./.:4:164,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:140,135:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,215:.: 0.62:1.000:. ./.:4:135,145:.: 0.62:1.000:. ./.:4:150,171:.: 1.20:1.000:. ./.:4:126,161:.: 0.72:0.998:. ./.:4:168,131:.: 0.89:1.000:. ./.:4:147,184:.: 1.35:1.000:. ./.:4:144,178:.: 1.22:1.000:. ./.:4:49,46:.:-2.01:1.000:. ./.:4:123,110:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,220:.: 0.79:1.000:. ./.:4:128,154:.: 0.65:1.000:. ./.:4:26,30:.:-2.56:1.000:. ./.:4:153,167:.: 1.19:1.000:. ./.:4:65,239:.: 0.96:1.000:. ./.:4:58,197:.: 0.27:1.000:. ./.:4:64,215:.: 0.61:1.000:. ./.:4:139,141:.: 0.62:1.000:. ./.:4:56,191:.: 0.15:1.000:. ./.:4:118,135:.: 0.24:1.000:. ./.:4:17,17:.:-2.87:1.000:. ./.:4:45,47:.:-2.05:1.000:. ./.:3:6,40:.:-2.70:1.000:. ./.:4:70,222:.: 0.79:1.000:. ./.:4:149,188:.: 1.43:1.000:. ./.:4:116,146:.: 0.37:1.000:. ./.:4:41,191:.:-0.06:1.000:. ./.:4:125,175:.: 0.91:1.000:. ./.:4:104,105:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,124:.: 0.18:1.000:. ./.:4:123,136:.: 0.32:1.000:. ./.:4:60,137:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,101:.:-0.44:1.000:. ./.:4:54,182:.: 0.00:1.000:. ./.:4:135,141:.: 0.56:1.000:. ./.:4:154,493:.: 5.83:1.000:. ./.:4:105,96:.:-0.50:1.000:. ./.:4:104,147:.: 0.21:1.000:. ./.:4:47,120:.:-0.98:1.000:. ./.:4:149,139:.: 0.74:1.000:. ./.:4:58,155:.:-0.33:1.000:. ./.:4:129,126:.: 0.27:1.000:. ./.:4:131,130:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,200:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,165:.:-0.22:1.000:. ./.:4:90,130:.:-0.23:1.000:. ./.:4:44,184:.:-0.12:1.000:. ./.:6:80,82:.:-1.05:1.000:. ./.:4:107,102:.:-0.39:1.000:. ./.:4:121,125:.: 0.14:1.000:. ./.:4:55,190:.: 0.12:1.000:. ./.:4:61,105:.:-1.00:1.000:. ./.:4:123,144:.: 0.44:1.000:. ./.:4:53,166:.:-0.24:1.000:. ./.:4:68,80:.:-1.25:1.000:. ./.:4:51,152:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,191:.: 0.10:0.910:. ./.:4:116,106:.:-0.20:1.000:. ./.:4:128,123:.: 0.21:1.000:. ./.:4:107,124:.:-0.07:1.000:. ./.:4:173,65:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,207:.: 0.78:1.000:. ./.:4:176,56:.:-0.06:1.000:. ./.:4:99,119:.:-0.26:1.000:. ./.:4:121,134:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,169:.:-0.46:1.000:. ./.:4:79,98:.:-0.84:1.000:. ./.:4:52,173:.:-0.16:1.000:. ./.:4:110,47:.:-1.12:0.984:. ./.:4:42,188:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,116:.: 0.03:1.000:. ./.:4:52,150:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,105:.:-0.33:1.000:. ./.:4:103,126:.:-0.10:1.000:. ./.:4:72,96:.:-0.97:1.000:. ./.:4:55,157:.:-0.34:1.000:. ./.:4:103,79:.:-0.77:1.000:. ./.:4:127,101:.:-0.12:1.000:. ./.:4:96,100:.:-0.57:0.999:. ./.:4:63,168:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,112:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,135:.:-0.78:1.000:. ./.:4:58,167:.:-0.16:1.000:. ./.:4:42,160:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,124:.:-1.20:1.000:. ./.:4:109,52:.:-1.07:1.000:. ./.:4:104,112:.:-0.29:1.000:. ./.:4:132,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:101,115:.:-0.29:1.000:. ./.:4:92,126:.:-0.26:1.000:. ./.:4:33,118:.:-1.21:1.000:. ./.:4:97,117:.:-0.32:1.000:. ./.:4:83,69:.:-1.20:1.000:. ./.:4:95,109:.:-0.46:1.000:. ./.:4:115,104:.:-0.24:1.000:. ./.:4:104,120:.:-0.17:1.000:. ./.:4:100,258:.: 1.73:1.000:. ./.:4:60,157:.:-0.27:1.000:. ./.:4:50,127:.:-0.84:1.000:. ./.:4:164,177:.: 1.49:1.000:. ./.:4:107,95:.:-0.49:0.999:. ./.:4:53,192:.: 0.12:1.000:. ./.:3:58,101:.:-1.10:0.999:. ./.:4:111,127:.: 0.03:1.000:. ./.:4:102,114:.:-0.29:1.000:. ./.:4:99,105:.:-0.46:1.000:. ./.:4:48,160:.:-0.40:1.000:. ./.:4:61,139:.:-0.51:1.000:. ./.:4:119,116:.:-0.02:1.000:. ./.:4:43,148:.:-0.64:1.000:. ./.:4:96,133:.:-0.10:1.000:. ./.:4:57,208:.: 0.41:1.000:. ./.:4:35,150:.:-0.73:1.000:. ./.:4:65,177:.: 0.08:1.000:. ./.:5:47,199:.: 0.14:0.988:. ./.:4:103,31:.:-1.45:1.000:. ./.:4:58,63:.:-1.64:1.000:. ./.:4:68,55:.:-1.61:1.000:. ./.:4:45,146:.:-0.64:1.000:. ./.:4:128,127:.: 0.27:1.000:. ./.:4:62,78:.:-1.37:1.000:. ./.:4:62,147:.:-0.39:1.000:. ./.:4:43,150:.:-0.61:1.000:. ./.:4:69,304:.: 1.94:1.000:. ./.:4:120,123:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,127:.:-0.86:1.000:. ./.:4:101,64:.:-1.01:1.000:. ./.:4:98,99:.:-0.56:1.000:. ./.:4:116,107:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,131:.:-0.61:1.000:. ./.:4:51,175:.:-0.15:1.000:. ./.:4:28,109:.:-1.41:1.000:. ./.:4:171,163:.: 1.39:1.000:. ./.:4:181,181:.: 1.79:1.000:. ./.:4:54,183:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,132:.: 0.34:1.000:. ./.:4:151,173:.: 1.25:1.000:. ./.:4:56,176:.:-0.06:1.000:. ./.:4:83,235:.: 1.16:1.000:. ./.:4:71,219:.: 0.76:1.000:. ./.:4:18,50:.:-2.39:1.000:. ./.:4:119,102:.:-0.22:1.000:. ./.:4:162,155:.: 1.15:1.000:. ./.:4:157,152:.: 1.03:1.000:. ./.:4:157,188:.: 1.54:1.000:. ./.:4:127,139:.: 0.42:1.000:. ./.:4:67,180:.: 0.15:1.000:. ./.:4:173,172:.: 1.54:1.000:. ./.:4:80,201:.: 0.64:1.000:. ./.:4:122,122:.: 0.11:1.000:. ./.:4:129,135:.: 0.39:1.000:. ./.:4:59,226:.: 0.69:1.000:. ./.:4:95,236:.: 1.35:1.000:. ./.:4:75,223:.: 0.88:1.000:. ./.:4:108,103:.:-0.36:1.000:. ./.:4:174,58:.:-0.06:0.999:. ./.:4:114,133:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,198:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,165:.:-0.33:1.000:. ./.:4:114,125:.: 0.04:1.000:. ./.:4:116,103:.:-0.24:1.000:. ./.:4:101,115:.:-0.29:1.000:. ./.:4:81,101:.:-0.77:1.000:. ./.:4:55,148:.:-0.47:1.000:. ./.:4:179,177:.: 1.70:1.000:. ./.:4:117,151:.: 0.45:1.000:. ./.:4:158,169:.: 1.29:1.000:. ./.:4:100,112:.:-0.34:1.000:. ./.:4:138,172:.: 1.05:1.000:. ./.:4:79,288:.: 1.86:1.000:. ./.:4:87,311:.: 2.30:1.000:. ./.:4:112,116:.:-0.12:1.000:. ./.:4:212,71:.: 0.66:1.000:. -chr1.1 65651962 chr1.1_065651962 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:142,83:.: 1.18:1.000:. ./.:4:73,81:.:-0.12:1.000:. ./.:4:94,111:.: 0.82:1.000:. ./.:4:102,105:.: 0.85:1.000:. ./.:4:71,163:.: 1.35:1.000:. ./.:4:227,93:.: 2.93:1.000:. ./.:4:79,58:.:-0.44:1.000:. ./.:4:127,119:.: 1.57:1.000:. ./.:4:34,109:.:-0.33:1.000:. ./.:4:10,12:.:-2.55:1.000:. ./.:4:13,23:.:-2.29:1.000:. ./.:4:38,95:.:-0.51:1.000:. ./.:4:101,113:.: 0.98:1.000:. ./.:4:78,100:.: 0.32:1.000:. ./.:4:154,58:.: 0.94:1.000:. ./.:4:78,177:.: 1.74:1.000:. ./.:4:49,184:.: 1.33:0.998:. ./.:4:59,132:.: 0.56:1.000:. ./.:4:100,136:.: 1.39:1.000:. ./.:4:100,138:.: 1.42:1.000:. ./.:4:17,13:.:-2.41:1.000:. ./.:4:127,58:.: 0.45:1.000:. ./.:4:87,93:.: 0.36:1.000:. ./.:4:119,69:.: 0.50:1.000:. ./.:4:25,9:.:-2.33:1.000:. ./.:4:129,121:.: 1.64:1.000:. ./.:4:136,72:.: 0.87:1.000:. ./.:4:45,135:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,68:.:-0.09:1.000:. ./.:4:160,120:.: 2.20:1.000:. ./.:4:84,140:.: 1.16:1.000:. ./.:4:114,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:7,17:.:-2.52:1.000:. ./.:4:32,15:.:-2.09:1.000:. ./.:3:9,8:.:-2.64:1.000:. ./.:4:85,128:.: 0.96:1.000:. ./.:4:136,74:.: 0.91:1.000:. ./.:4:136,78:.: 0.98:1.000:. ./.:4:44,135:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,94:.: 0.65:1.000:. ./.:4:91,73:.: 0.06:1.000:. ./.:4:86,79:.: 0.08:1.000:. ./.:4:102,81:.: 0.41:1.000:. ./.:4:47,115:.: 0.02:1.000:. ./.:4:90,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,119:.:-0.05:1.000:. ./.:4:123,83:.: 0.83:1.000:. ./.:4:88,62:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,89:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,95:.:-0.68:1.000:. ./.:4:54,44:.:-1.15:1.000:. ./.:4:164,78:.: 1.50:1.000:. ./.:4:90,68:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,131:.: 0.69:1.000:. ./.:4:103,86:.: 0.52:1.000:. ./.:4:25,114:.:-0.40:1.000:. ./.:4:63,79:.:-0.34:1.000:. ./.:4:69,98:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,68:.:-0.62:1.000:. ./.:6:71,44:.:-0.84:1.000:. ./.:4:109,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:74,111:.: 0.45:1.000:. ./.:4:62,113:.: 0.26:1.000:. ./.:4:83,34:.:-0.80:1.000:. ./.:4:70,100:.: 0.17:1.000:. ./.:4:54,106:.:-0.01:1.000:. ./.:4:40,50:.:-1.30:1.000:. ./.:4:65,62:.:-0.62:1.000:. ./.:4:55,82:.:-0.44:0.910:. ./.:4:59,56:.:-0.84:1.000:. ./.:4:96,59:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,27:.:-1.60:1.000:. ./.:4:108,82:.: 0.54:1.000:. ./.:4:153,74:.: 1.22:1.000:. ./.:4:63,94:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,81:.: 0.08:1.000:. ./.:4:79,59:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,77:.:-0.90:1.000:. ./.:4:54,116:.: 0.17:1.000:. ./.:4:74,97:.: 0.19:1.000:. ./.:4:23,88:.:-0.91:0.984:. ./.:4:83,73:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,77:.:-0.23:1.000:. ./.:4:87,63:.:-0.20:1.000:. ./.:4:68,96:.: 0.06:1.000:. ./.:4:128,50:.: 0.32:1.000:. ./.:4:54,56:.:-0.93:1.000:. ./.:4:43,52:.:-1.21:1.000:. ./.:4:59,54:.:-0.88:1.000:. ./.:4:69,71:.:-0.38:1.000:. ./.:4:105,66:.: 0.19:0.999:. ./.:4:86,96:.: 0.39:1.000:. ./.:4:81,76:.:-0.07:1.000:. ./.:4:53,72:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,80:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,70:.:-0.80:1.000:. ./.:4:59,33:.:-1.26:1.000:. ./.:4:32,56:.:-1.34:1.000:. ./.:4:47,73:.:-0.75:1.000:. ./.:4:62,136:.: 0.69:1.000:. ./.:4:50,27:.:-1.54:1.000:. ./.:4:64,95:.:-0.03:1.000:. ./.:4:68,23:.:-1.28:1.000:. ./.:4:77,42:.:-0.77:1.000:. ./.:4:30,64:.:-1.23:1.000:. ./.:4:94,92:.: 0.47:1.000:. ./.:4:61,65:.:-0.64:1.000:. ./.:4:133,66:.: 0.70:1.000:. ./.:4:110,112:.: 1.13:1.000:. ./.:4:80,81:.: 0.01:1.000:. ./.:4:45,61:.:-1.01:1.000:. ./.:4:125,126:.: 1.66:1.000:. ./.:4:38,84:.:-0.71:0.999:. ./.:4:44,102:.:-0.27:1.000:. ./.:3:28,58:.:-1.37:0.999:. ./.:4:76,71:.:-0.25:1.000:. ./.:4:67,48:.:-0.84:1.000:. ./.:4:106,51:.:-0.07:1.000:. ./.:4:53,56:.:-0.95:1.000:. ./.:4:92,42:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,77:.: 0.23:1.000:. ./.:4:54,46:.:-1.12:1.000:. ./.:4:44,103:.:-0.25:1.000:. ./.:4:150,70:.: 1.09:1.000:. ./.:4:22,81:.:-1.06:1.000:. ./.:4:58,82:.:-0.38:1.000:. ./.:5:89,63:.:-0.16:0.988:. ./.:4:42,60:.:-1.08:1.000:. ./.:4:40,41:.:-1.47:1.000:. ./.:4:69,48:.:-0.80:1.000:. ./.:4:38,82:.:-0.75:1.000:. ./.:4:100,89:.: 0.52:1.000:. ./.:4:31,40:.:-1.65:1.000:. ./.:4:61,90:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,58:.: 0.23:1.000:. ./.:4:77,151:.: 1.24:1.000:. ./.:4:101,97:.: 0.69:1.000:. ./.:4:42,61:.:-1.06:1.000:. ./.:4:69,68:.:-0.44:1.000:. ./.:4:53,49:.:-1.08:1.000:. ./.:4:49,64:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,41:.:-1.54:1.000:. ./.:4:58,114:.: 0.21:1.000:. ./.:4:64,20:.:-1.41:1.000:. ./.:4:165,69:.: 1.35:1.000:. ./.:4:151,78:.: 1.26:1.000:. ./.:4:122,58:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,100:.: 0.50:1.000:. ./.:4:144,70:.: 0.98:1.000:. ./.:4:113,57:.: 0.17:1.000:. ./.:4:136,129:.: 1.92:1.000:. ./.:4:61,144:.: 0.82:1.000:. ./.:4:10,17:.:-2.46:1.000:. ./.:4:80,88:.: 0.13:1.000:. ./.:4:131,78:.: 0.89:1.000:. ./.:4:97,109:.: 0.83:1.000:. ./.:4:154,70:.: 1.16:1.000:. ./.:4:116,80:.: 0.65:1.000:. ./.:4:71,80:.:-0.18:1.000:. ./.:4:165,75:.: 1.46:1.000:. ./.:4:64,85:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,114:.: 0.17:1.000:. ./.:4:107,105:.: 0.94:1.000:. ./.:4:120,100:.: 1.09:1.000:. ./.:4:88,101:.: 0.52:1.000:. ./.:4:62,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,76:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,89:.:-0.44:0.999:. ./.:4:103,45:.:-0.23:1.000:. ./.:4:52,145:.: 0.67:1.000:. ./.:4:78,75:.:-0.14:1.000:. ./.:4:68,79:.:-0.25:1.000:. ./.:4:99,88:.: 0.48:1.000:. ./.:4:121,64:.: 0.45:1.000:. ./.:4:79,69:.:-0.23:1.000:. ./.:4:63,89:.:-0.16:1.000:. ./.:4:115,129:.: 1.53:1.000:. ./.:4:146,65:.: 0.93:1.000:. ./.:4:175,75:.: 1.64:1.000:. ./.:4:102,89:.: 0.56:1.000:. ./.:4:143,97:.: 1.46:1.000:. ./.:4:93,169:.: 1.86:1.000:. ./.:4:97,125:.: 1.13:1.000:. ./.:4:76,47:.:-0.69:1.000:. ./.:4:65,95:.:-0.01:1.000:. -chr1.1 65913202 chr1.1_065913202 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,53:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,36:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.45:1.000:. ./.:4:11,47:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,82:.: 1.03:1.000:. ./.:4:15,57:.: 0.36:1.000:. ./.:4:14,29:.:-1.60:1.000:. ./.:4:7,46:.:-0.92:1.000:. ./.:4:9,51:.:-0.45:1.000:. ./.:4:24,36:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.49:1.000:. ./.:4:7,39:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,82:.: 1.03:1.000:. ./.:4:15,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,43:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,58:.:-0.11:1.000:. ./.:4:18,38:.:-0.72:0.998:. ./.:4:34,40:.: 0.49:1.000:. ./.:4:15,69:.: 1.17:1.000:. ./.:4:26,45:.: 0.29:1.000:. ./.:4:7,53:.:-0.45:1.000:. ./.:4:23,30:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.10:1.000:. ./.:4:25,31:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,28:.:-2.34:1.000:. ./.:4:24,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:21,58:.: 0.83:1.000:. ./.:4:13,43:.:-0.72:1.000:. ./.:4:51,28:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,22:.:-2.07:1.000:. ./.:4:20,35:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,25:.:-2.21:1.000:. ./.:4:11,34:.:-1.46:1.000:. ./.:3:0,28:.:-2.61:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.90:1.000:. ./.:4:23,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,52:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.10:1.000:. ./.:4:21,30:.:-1.06:1.000:. ./.:4:18,50:.: 0.09:1.000:. ./.:4:32,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.79:1.000:. ./.:4:27,39:.:-0.05:1.000:. ./.:4:18,62:.: 0.90:1.000:. ./.:4:34,44:.: 0.76:1.000:. ./.:4:26,94:.: 3.60:1.000:. ./.:4:17,18:.:-2.14:1.000:. ./.:4:22,60:.: 1.03:1.000:. ./.:4:9,56:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,58:.: 0.16:1.000:. ./.:4:17,70:.: 1.37:1.000:. ./.:4:23,66:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,94:.: 1.84:1.000:. ./.:4:13,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,47:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:11,55:.:-0.05:1.000:. ./.:6:8,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,74:.: 1.17:1.000:. ./.:4:9,49:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,85:.: 1.24:1.000:. ./.:4:32,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:34,24:.:-0.59:1.000:. ./.:4:26,41:.: 0.02:1.000:. ./.:4:21,42:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.76:1.000:. ./.:4:28,30:.:-0.59:0.910:. ./.:4:0,80:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,39:.:-0.38:1.000:. ./.:4:7,42:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.70:1.000:. ./.:4:18,53:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,53:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:11,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:17,56:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,79:.: 1.24:1.000:. ./.:4:12,65:.: 0.70:1.000:. ./.:4:20,23:.:-1.60:0.984:. ./.:4:18,54:.: 0.36:1.000:. ./.:4:33,32:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,56:.: 0.22:1.000:. ./.:4:20,28:.:-1.26:1.000:. ./.:4:22,40:.:-0.32:1.000:. ./.:4:37,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:21,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,45:.:-0.86:0.999:. ./.:4:8,41:.:-1.19:1.000:. ./.:4:14,83:.: 2.05:1.000:. ./.:4:11,24:.:-2.14:1.000:. ./.:4:29,51:.: 0.90:1.000:. ./.:4:23,37:.:-0.45:1.000:. ./.:4:8,46:.:-0.86:1.000:. ./.:4:11,51:.:-0.32:1.000:. ./.:4:12,68:.: 0.90:1.000:. ./.:4:9,63:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,34:.:-1.46:1.000:. ./.:4:10,65:.: 0.56:1.000:. ./.:4:13,48:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,52:.: 1.84:1.000:. ./.:4:9,49:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,38:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,57:.: 0.22:1.000:. ./.:4:28,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:15,84:.: 2.18:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.11:1.000:. ./.:4:39,45:.: 1.17:1.000:. ./.:4:37,36:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,58:.: 0.16:0.999:. ./.:4:11,58:.: 0.16:1.000:. ./.:3:2,61:.:-0.25:0.988:. ./.:4:0,94:.: 1.84:1.000:. ./.:4:10,48:.:-0.59:1.000:. ./.:4:13,39:.:-0.99:1.000:. ./.:4:20,47:.: 0.02:1.000:. ./.:4:11,60:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,34:.:-0.38:1.000:. ./.:4:17,76:.: 1.78:1.000:. ./.:4:10,70:.: 0.90:1.000:. ./.:4:9,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:32,45:.: 0.70:1.000:. ./.:5:0,95:.: 1.91:0.988:. ./.:4:23,25:.:-1.26:1.000:. ./.:4:9,51:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.02:1.000:. ./.:4:31,41:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,41:.:-1.46:1.000:. ./.:4:9,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,61:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,86:.: 1.30:1.000:. ./.:4:26,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.18:1.000:. ./.:4:13,60:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,52:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,58:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,85:.: 1.30:1.000:. ./.:4:11,53:.:-0.18:1.000:. ./.:4:14,92:.: 2.65:1.000:. ./.:4:19,70:.: 1.51:1.000:. ./.:4:15,78:.: 1.78:1.000:. ./.:4:25,32:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,56:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,49:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,92:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.49:1.000:. ./.:4:18,31:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,34:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.97:1.000:. ./.:4:31,47:.: 0.76:1.000:. ./.:4:31,34:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.63:1.000:. ./.:4:13,54:.: 0.02:1.000:. ./.:4:26,44:.: 0.22:1.000:. ./.:4:12,29:.:-1.73:1.000:. ./.:4:25,37:.:-0.32:1.000:. ./.:4:13,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,50:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.18:1.000:. ./.:4:21,33:.:-0.86:1.000:. ./.:4:30,44:.: 0.49:0.999:. ./.:4:19,24:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,34:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,49:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.33:1.000:. ./.:4:17,29:.:-1.40:1.000:. ./.:4:17,28:.:-1.46:1.000:. ./.:4:28,41:.: 0.16:1.000:. ./.:4:30,44:.: 0.49:1.000:. ./.:4:2,54:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.10:1.000:. ./.:4:20,81:.: 2.32:1.000:. ./.:4:16,39:.:-0.79:1.000:. ./.:4:18,59:.: 0.70:1.000:. -chr1.1 66048468 chr1.1_066048468 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:163,229:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:224,102:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:167,200:0.47: 0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:155,220:0.52: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,220:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:319,138:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,80:0.24:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,241:0.52: 0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:90,371:0.74: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,32:0.51:-3.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,48:0.53:-2.79:1.000:0.993 0/0/0/1:4:246,119:0.26: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:176,246:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,268:0.53: 1.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:249,110:0.25: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,104:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,129:0.24: 1.02:0.998:1.000 0/0/1/1:4:85,175:0.60:-0.80:1.000:0.747 0/0/0/1:4:335,159:0.26: 1.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:352,136:0.22: 1.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,103:0.68:-2.15:1.000:0.956 0/0/0/1:4:230,120:0.28: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,348:0.75: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:359,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,63:0.52:-2.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:310,140:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:267,136:0.27: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,246:0.56: 0.65:1.000:0.968 0/0/0/1:4:267,123:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,129:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,277:0.50: 1.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:253,105:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,45:0.59:-2.92:1.000:0.844 0/0/1/1:4:49,40:0.38:-2.69:1.000:0.599 0/1/1:3:6,57:0.83:-2.98:1.000:0.939 0/1/1/1:4:71,321:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:383,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:275,98:0.21: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,243:0.52: 0.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:323,145:0.25: 1.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:303,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,133:0.30: 0.39:1.000:0.986 0/0/0/1:4:224,109:0.26: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,186:0.55:-0.33:1.000:0.984 0/0/0/1:4:218,136:0.32: 0.24:1.000:0.955 0/1/1/1:4:72,309:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:331,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,132:0.30: 0.39:1.000:0.988 0/0/0/0:4:272,1:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,310:0.61: 1.38:1.000:0.689 0/0/1/1:4:101,164:0.55:-0.74:1.000:0.981 0/0/0/0:4:340,1:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,159:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:213,113:0.28:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:214,93:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,406:0.78: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,94:0.26:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:225,128:0.30: 0.23:1.000:0.986 0/0/0/1:4:201,98:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:146,84:0.30:-1.13:1.000:0.876 0/0/0/1:4:183,96:0.28:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:200,99:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:162,270:0.55: 1.11:1.000:0.974 0/0/0/1:4:186,105:0.30:-0.45:1.000:0.987 0/0/0/1:4:224,107:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,112:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:190,78:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,199:0.53: 0.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:137,243:0.57: 0.53:0.910:0.947 0/0/1/1:4:108,181:0.56:-0.48:1.000:0.973 0/0/0/0:4:298,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:223,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,147:0.31: 0.71:1.000:0.977 0/0/0/1:4:269,90:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,103:0.28:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,246:0.57: 0.56:1.000:0.939 0/0/0/1:4:196,125:0.32:-0.12:1.000:0.940 0/0/1/1:4:122,183:0.53:-0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:161,88:0.29:-0.92:1.000:0.992 0/0/0/1:4:223,97:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,82:0.29:-1.13:0.984:0.990 0/0/0/1:4:218,120:0.29: 0.07:1.000:0.991 0/0/0/0:4:295,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,206:0.53: 0.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:250,154:0.32: 0.80:1.000:0.961 0/0/0/1:4:223,101:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:201,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,71:0.26:-1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,84:0.28:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:209,109:0.28:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,78:0.24:-0.77:0.999:1.000 0/0/1/1:4:126,170:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:217,109:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,142:0.47:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:132,181:0.51:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,246:0.54: 0.76:1.000:0.986 0/0/0/1:4:140,79:0.30:-1.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:173,80:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,115:0.35:-0.60:1.000:0.811 0/0/1/1:4:160,220:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,85:0.28:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,221:0.53: 0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,122:0.53:-1.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:165,70:0.24:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,95:0.34:-1.05:1.000:0.895 0/0/0/1:4:202,85:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,74:0.26:-1.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:255,110:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,271:0.51: 1.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,336:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,174:0.54:-0.51:1.000:0.989 0/0/0/1:4:351,165:0.26: 2.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,76:0.25:-0.94:0.999:0.999 0/1/1/1:4:68,299:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1:3:110,87:0.37:-1.49:0.988:1.000 0/0/0/1:4:209,103:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:167,88:0.28:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:185,104:0.30:-0.48:1.000:0.988 0/0/1/1:4:113,164:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,163:0.54:-0.74:1.000:0.984 0/0/1/1:4:133,191:0.52:-0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,90:0.32:-1.08:1.000:0.954 0/0/1/1:4:150,203:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,245:0.48: 1.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,306:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,188:0.54:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1/1:5:125,266:0.61: 0.65:0.988:0.970 0/0/0/1:4:194,110:0.30:-0.31:1.000:0.987 0/0/0/1:4:142,68:0.26:-1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,78:0.28:-1.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,173:0.56:-0.63:1.000:0.968 0/0/0/1:4:241,113:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,70:0.31:-1.61:1.000:0.970 0/0/0/1:4:175,92:0.28:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,176:0.49:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:218,266:0.48: 1.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:217,115:0.28: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,184:0.54:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:94,156:0.55:-0.91:1.000:0.976 0/0/0/1:4:141,67:0.26:-1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:179,83:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,165:0.53:-0.64:1.000:0.992 0/1/1/1:4:80,281:0.71: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,139:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:308,139:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:298,136:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,265:0.52: 1.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:222,95:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:318,119:0.22: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,187:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,284:0.50: 1.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,340:0.73: 1.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,53:0.79:-2.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,90:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:369,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,219:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/0/0:4:382,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:379,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,186:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:402,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,177:0.46: 0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:149,193:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:239,110:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,106:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,130:0.24: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,242:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:316,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,120:0.25: 0.54:0.999:0.999 0/0/0/1:4:260,113:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,307:0.70: 0.75:1.000:0.987 0/0/1/1:4:141,207:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:135,192:0.52:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,213:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:232,75:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,181:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,185:0.47: 0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:359,163:0.25: 2.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,93:0.21: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:286,128:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,194:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:285,138:0.26: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:202,278:0.51: 1.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:232,274:0.47: 1.92:1.000:0.992 0/0/0/0:4:344,1:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,97:0.22: 0.17:1.000:1.000 -chr1.1 66243893 chr1.1_066243893 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:315,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:231,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.37:0.998:. ./.:4:160,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:340,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.17:1.000:. ./.:3:22,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:335,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:567,0:.: 5.55:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:6:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.25:0.910:. ./.:4:270,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:239,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.91:0.984:. ./.:4:185,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.56:0.999:. ./.:4:196,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:184,0:.:-0.06:1.000:. ./.:3:113,0:.:-1.10:0.988:. ./.:4:218,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.10:1.000:. ./.:5:304,0:.: 1.70:0.988:. ./.:4:97,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.78:0.999:. ./.:4:195,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:148,1:.:-0.57:1.000:. -chr1.1 66308844 chr1.1_066308844 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,28:.:-1.58:1.000:. ./.:4:139,21:.: 0.47:1.000:. ./.:4:106,15:.:-0.34:1.000:. ./.:4:227,17:.: 2.24:1.000:. ./.:4:52,47:.:-0.81:1.000:. ./.:4:49,40:.:-1.02:1.000:. ./.:4:118,15:.:-0.09:1.000:. ./.:4:161,12:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,13:.:-2.32:1.000:. ./.:4:49,17:.:-1.50:1.000:. ./.:4:52,37:.:-1.02:1.000:. ./.:4:112,28:.: 0.05:1.000:. ./.:4:112,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:53,58:.:-0.55:1.000:. ./.:4:111,18:.:-0.18:1.000:. ./.:4:105,22:.:-0.22:0.998:. ./.:4:144,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:138,27:.: 0.58:1.000:. ./.:4:80,25:.:-0.68:1.000:. ./.:4:48,6:.:-1.75:1.000:. ./.:4:69,38:.:-0.64:1.000:. ./.:4:190,13:.: 1.38:1.000:. ./.:4:55,33:.:-1.04:1.000:. ./.:4:13,5:.:-2.51:1.000:. ./.:4:63,72:.:-0.05:1.000:. ./.:4:108,9:.:-0.43:1.000:. ./.:4:147,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:53,33:.:-1.08:1.000:. ./.:4:81,29:.:-0.58:1.000:. ./.:4:103,33:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,16:.:-1.35:1.000:. ./.:4:19,4:.:-2.40:1.000:. ./.:4:13,16:.:-2.28:1.000:. ./.:3:15,2:.:-2.53:1.000:. ./.:4:164,20:.: 0.98:1.000:. ./.:4:44,50:.:-0.91:1.000:. ./.:4:111,34:.: 0.16:1.000:. ./.:4:147,10:.: 0.41:1.000:. ./.:4:104,46:.: 0.26:1.000:. ./.:4:51,55:.:-0.66:1.000:. ./.:4:136,38:.: 0.77:1.000:. ./.:4:78,70:.: 0.22:1.000:. ./.:4:157,23:.: 0.89:1.000:. ./.:4:52,51:.:-0.72:1.000:. ./.:4:202,13:.: 1.63:1.000:. ./.:4:59,29:.:-1.04:1.000:. ./.:4:225,26:.: 2.38:1.000:. ./.:4:60,58:.:-0.41:1.000:. ./.:4:160,54:.: 1.61:1.000:. ./.:4:117,56:.: 0.75:1.000:. ./.:4:163,59:.: 1.78:1.000:. ./.:4:122,38:.: 0.47:1.000:. ./.:4:144,46:.: 1.10:1.000:. ./.:4:111,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:212,33:.: 2.26:1.000:. ./.:4:145,31:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,83:.: 0.10:1.000:. ./.:4:110,39:.: 0.24:1.000:. ./.:6:60,58:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:110,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:255,33:.: 3.16:1.000:. ./.:4:47,63:.:-0.58:1.000:. ./.:4:64,36:.:-0.79:1.000:. ./.:4:154,41:.: 1.21:1.000:. ./.:4:49,37:.:-1.08:1.000:. ./.:4:163,23:.: 1.02:1.000:. ./.:4:114,35:.: 0.24:0.910:. ./.:4:90,32:.:-0.32:1.000:. ./.:4:63,56:.:-0.39:1.000:. ./.:4:73,107:.: 0.89:1.000:. ./.:4:81,123:.: 1.40:1.000:. ./.:4:121,21:.: 0.10:1.000:. ./.:4:54,72:.:-0.24:1.000:. ./.:4:126,68:.: 1.19:1.000:. ./.:4:111,49:.: 0.47:1.000:. ./.:4:174,12:.: 1.02:1.000:. ./.:4:147,49:.: 1.23:1.000:. ./.:4:136,56:.: 1.15:1.000:. ./.:4:47,39:.:-1.08:0.984:. ./.:4:134,67:.: 1.33:1.000:. ./.:4:66,81:.: 0.20:1.000:. ./.:4:149,24:.: 0.75:1.000:. ./.:4:74,86:.: 0.47:1.000:. ./.:4:65,72:.:-0.01:1.000:. ./.:4:50,55:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,28:.:-0.16:1.000:. ./.:4:68,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:51,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:45,67:.:-0.53:0.999:. ./.:4:99,45:.: 0.14:1.000:. ./.:4:133,45:.: 0.85:1.000:. ./.:4:77,15:.:-0.95:1.000:. ./.:4:140,31:.: 0.71:1.000:. ./.:4:130,45:.: 0.79:1.000:. ./.:4:112,36:.: 0.22:1.000:. ./.:4:40,59:.:-0.81:1.000:. ./.:4:141,51:.: 1.15:1.000:. ./.:4:84,23:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,53:.:-0.89:1.000:. ./.:4:131,50:.: 0.91:1.000:. ./.:4:84,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:61,67:.:-0.20:1.000:. ./.:4:105,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:59,55:.:-0.49:1.000:. ./.:4:144,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:57,21:.:-1.25:1.000:. ./.:4:168,25:.: 1.17:1.000:. ./.:4:165,25:.: 1.10:1.000:. ./.:4:137,29:.: 0.60:1.000:. ./.:4:70,44:.:-0.49:1.000:. ./.:4:129,43:.: 0.73:0.999:. ./.:4:188,12:.: 1.31:1.000:. ./.:3:99,20:.:-0.39:0.988:. ./.:4:151,58:.: 1.50:1.000:. ./.:4:110,49:.: 0.45:1.000:. ./.:4:62,75:.:-0.01:1.000:. ./.:4:124,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:131,38:.: 0.66:1.000:. ./.:4:128,48:.: 0.81:1.000:. ./.:4:82,25:.:-0.64:1.000:. ./.:4:107,44:.: 0.29:1.000:. ./.:4:91,13:.:-0.70:1.000:. ./.:4:155,13:.: 0.64:1.000:. ./.:4:124,24:.: 0.22:1.000:. ./.:5:240,28:.: 2.74:0.988:. ./.:4:44,57:.:-0.76:1.000:. ./.:4:95,31:.:-0.24:1.000:. ./.:4:74,39:.:-0.51:1.000:. ./.:4:175,33:.: 1.48:1.000:. ./.:4:58,36:.:-0.91:1.000:. ./.:4:81,27:.:-0.62:1.000:. ./.:4:102,34:.:-0.03:1.000:. ./.:4:122,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:233,13:.: 2.28:1.000:. ./.:4:63,37:.:-0.79:1.000:. ./.:4:147,16:.: 0.54:1.000:. ./.:4:94,43:.:-0.01:1.000:. ./.:4:116,31:.: 0.20:1.000:. ./.:4:153,42:.: 1.21:1.000:. ./.:4:131,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:142,13:.: 0.37:1.000:. ./.:4:81,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:83,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:122,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:71,28:.:-0.81:1.000:. ./.:4:76,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:98,42:.: 0.05:1.000:. ./.:4:164,13:.: 0.83:1.000:. ./.:4:147,10:.: 0.41:1.000:. ./.:4:42,4:.:-1.92:1.000:. ./.:4:32,20:.:-1.79:1.000:. ./.:4:65,62:.:-0.22:1.000:. ./.:4:139,36:.: 0.79:1.000:. ./.:4:64,37:.:-0.76:1.000:. ./.:4:55,33:.:-1.04:1.000:. ./.:4:131,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:62,46:.:-0.62:1.000:. ./.:4:127,14:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,19:.:-1.67:1.000:. ./.:4:102,28:.:-0.16:1.000:. ./.:4:105,19:.:-0.28:1.000:. ./.:4:203,23:.: 1.86:1.000:. ./.:4:52,20:.:-1.37:1.000:. ./.:4:39,26:.:-1.52:0.999:. ./.:4:44,20:.:-1.54:1.000:. ./.:4:153,11:.: 0.56:1.000:. ./.:4:118,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,19:.:-0.20:1.000:. ./.:4:94,23:.:-0.43:1.000:. ./.:4:46,34:.:-1.20:1.000:. ./.:4:96,44:.: 0.05:1.000:. ./.:4:102,10:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,49:.:-0.89:1.000:. ./.:4:55,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:60,40:.:-0.79:1.000:. ./.:4:92,26:.:-0.41:1.000:. ./.:4:125,30:.: 0.37:1.000:. ./.:4:212,15:.: 1.88:1.000:. ./.:4:120,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:56,37:.:-0.93:1.000:. ./.:4:67,40:.:-0.64:1.000:. -chr1.1 66462122 chr1.1_066462122 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:128,276:0.72: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:269,153:0.39: 0.54:1.000:0.680 0/0/1/1:4:126,170:0.61:-0.64:1.000:0.660 0/1/1/1:4:134,277:0.71: 0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:297,209:0.44: 1.33:1.000:0.973 0/1/1/1:4:124,337:0.77: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,111:0.70:-1.84:1.000:0.986 0/0/1/1:4:233,175:0.46: 0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:202,164:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,89:0.64:-2.02:1.000:0.644 0/0/1/1:4:118,108:0.51:-1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,163:0.47: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:115,240:0.72:-0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:121,282:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:107,240:0.73:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:259,127:0.35: 0.20:1.000:0.770 0/0/0/1:4:505,77:0.15: 2.04:0.998:0.986 0/0/0/1:4:231,53:0.20:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:328,135:0.31: 0.93:1.000:0.971 0/0/1/1:4:265,191:0.45: 0.86:1.000:0.980 0/1/1/1:4:52,79:0.64:-2.19:1.000:0.713 0/0/1/1:4:260,166:0.42: 0.58:1.000:0.908 0/1/1/1:4:119,268:0.73: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:303,123:0.31: 0.58:1.000:0.976 0/0/0/1:4:167,39:0.20:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,192:0.48: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:232,201:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:233,129:0.38:-0.02:1.000:0.598 0/0/1/1:4:302,248:0.49: 1.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:228,176:0.47: 0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:254,183:0.45: 0.68:1.000:0.980 0/0/1/1:4:99,140:0.62:-1.18:1.000:0.511 0/0/1/1:4:64,81:0.60:-2.06:1.000:0.818 1/1/1/1:4:2,189:0.99:-1.63:1.000:1.000 1/1/1:3:6,102:0.95:-2.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,220:0.71:-0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:365,127:0.27: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,183:0.62:-0.47:1.000:0.551 0/0/0/1:4:363,123:0.27: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:262,187:0.45: 0.79:1.000:0.978 0/0/0/1:4:252,132:0.37: 0.18:1.000:0.583 0/0/0/1:4:279,118:0.32: 0.31:1.000:0.959 0/0/1/1:4:285,176:0.41: 0.91:1.000:0.864 0/0/1/1:4:111,145:0.60:-1.02:1.000:0.748 0/0/1/1:4:155,205:0.61:-0.04:1.000:0.716 0/0/1/1:4:260,194:0.46: 0.84:1.000:0.987 0/0/1/1:4:187,195:0.55: 0.17:1.000:0.982 0/0/1/1:4:626,424:0.43: 6.43:1.000:0.956 0/0/0/1:4:337,92:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:271,232:0.50: 1.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,248:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:280,204:0.45: 1.12:1.000:0.983 0/1/1/1:4:89,194:0.73:-0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:310,121:0.30: 0.63:1.000:0.985 0/0/1/1:4:204,153:0.46:-0.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:128,172:0.61:-0.60:1.000:0.672 0/0/1/1:4:223,165:0.46: 0.22:1.000:0.986 0/0/1/1:4:260,183:0.44: 0.74:1.000:0.973 0/1/1/1:4:109,159:0.63:-0.90:1.000:0.591 0/0/1/1/1/1:6:82,173:0.72:-1.03:1.000:0.769 1/1/1/1:4:0,280:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,99:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,207:0.61: 0.00:1.000:0.724 0/0/1/1:4:241,209:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:257,124:0.35: 0.16:1.000:0.806 0/0/0/1:4:351,122:0.27: 1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:114,172:0.64:-0.73:1.000:0.694 0/0/1/1:4:237,160:0.43: 0.31:1.000:0.954 0/0/1/1:4:147,189:0.60:-0.27:0.910:0.785 0/0/1/1:4:212,213:0.54: 0.57:1.000:0.989 0/0/0/1:4:320,148:0.34: 0.97:1.000:0.879 0/0/1/1:4:96,133:0.62:-1.27:1.000:0.578 0/1/1/1:4:134,223:0.66:-0.07:1.000:0.894 0/0/1/1:4:249,169:0.43: 0.50:1.000:0.957 0/0/1/1:4:256,168:0.43: 0.56:1.000:0.935 0/1/1/1:4:83,223:0.77:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:274,125:0.34: 0.33:1.000:0.897 0/0/0/1:4:429,132:0.25: 1.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,109:0.43:-0.86:1.000:0.944 0/0/1/1:4:252,187:0.46: 0.70:1.000:0.986 0/0/0/1:4:424,91:0.19: 1.41:0.920:1.000 0/1/1/1:4:133,197:0.64:-0.32:1.000:0.639 0/0/0/1:4:306,140:0.34: 0.77:1.000:0.893 0/0/1/1:4:107,131:0.59:-1.18:1.000:0.874 0/0/1/1:4:171,211:0.59: 0.17:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,290:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,93:0.36:-0.83:1.000:0.676 0/0/0/1:4:328,95:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,175:0.63:-0.62:1.000:0.510 0/0/1/1:4:217,147:0.43: 0.00:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,236:1.00:-1.20:0.999:1.000 0/1/1/1:4:97,202:0.72:-0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:252,116:0.34: 0.03:1.000:0.885 0/0/1/1:4:197,149:0.46:-0.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:258,174:0.43: 0.64:1.000:0.954 0/0/1/1:4:245,196:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:252,159:0.42: 0.44:1.000:0.894 0/0/0/1:4:332,174:0.37: 1.33:1.000:0.582 0/0/0/1:4:400,120:0.25: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,163:0.47: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:102,178:0.68:-0.79:1.000:0.941 0/0/1/1:4:281,189:0.43: 0.99:1.000:0.952 0/1/1/1:4:101,202:0.71:-0.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:268,181:0.43: 0.79:1.000:0.954 0/0/0/1:4:327,105:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,175:0.65:-0.73:1.000:0.803 0/0/0/1:4:245,111:0.33:-0.08:1.000:0.905 0/0/1/1:4:216,195:0.51: 0.44:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,298:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,218:0.69:-0.26:1.000:0.969 0/0/1/1:4:139,165:0.58:-0.57:1.000:0.912 0/0/1/1:4:295,213:0.45: 1.35:1.000:0.981 0/0/0/1:4:262,100:0.29:-0.02:0.999:0.989 0/0/1/1:4:133,183:0.62:-0.45:1.000:0.600 0/0/1:3:208,111:0.37:-0.42:0.988:1.000 0/0/1/1:4:299,204:0.44: 1.30:1.000:0.960 0/0/0/1:4:232,123:0.37:-0.09:1.000:0.544 0/1/1/1:4:100,232:0.74:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,206:0.61:-0.04:1.000:0.685 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,202:0.69:-0.48:1.000:0.966 0/0/0/1:4:313,130:0.31: 0.74:1.000:0.968 0/0/1/1:4:141,162:0.57:-0.57:1.000:0.941 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,182:0.61:-0.43:1.000:0.684 0/1/1/1:4:172,253:0.63: 0.57:1.000:0.618 0/0/1/1/1:5:252,259:0.54: 1.38:0.988:0.851 0/0/0/1:4:297,109:0.29: 0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:177,105:0.40:-0.77:1.000:0.788 0/1/1/1:4:93,147:0.65:-1.17:1.000:0.808 0/0/1/1:4:251,178:0.45: 0.61:1.000:0.976 0/0/1/1:4:192,178:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:258,73:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:280,213:0.46: 1.21:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,229:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,242:0.49: 1.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,161:0.61:-0.78:1.000:0.676 0/0/1/1:4:241,181:0.46: 0.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:111,217:0.70:-0.34:1.000:0.987 0/0/0/1:4:250,105:0.32:-0.09:1.000:0.963 0/0/0/1:4:405,108:0.23: 1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,248:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,226:0.72:-0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,185:0.72:-0.85:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,296:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:157,307:0.70: 0.94:1.000:0.987 0/1/1/1:4:133,243:0.69: 0.11:1.000:0.968 0/0/1/1:4:251,141:0.39: 0.26:1.000:0.643 0/1/1/1:4:103,259:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,185:0.70:-0.77:1.000:0.982 0/0/1/1:4:154,206:0.61:-0.04:1.000:0.685 0/1/1/1:4:118,192:0.66:-0.51:1.000:0.862 0/0/1/1:4:62,78:0.60:-2.10:1.000:0.830 0/0/1/1:4:109,127:0.58:-1.20:1.000:0.930 0/0/0/1:4:390,137:0.28: 1.53:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,223:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,140:0.33: 0.80:1.000:0.908 0/0/1/1:4:252,136:0.38: 0.22:1.000:0.515 0/1/1/1:4:99,152:0.64:-1.06:1.000:0.741 0/0/1/1:4:250,218:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:217,148:0.44: 0.01:1.000:0.960 0/0/1/1:4:197,123:0.41:-0.42:1.000:0.880 0/0/1/1:4:212,168:0.48: 0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,181:0.61:-0.42:1.000:0.738 0/1/1/1:4:117,186:0.65:-0.57:1.000:0.820 0/1/1/1:4:115,173:0.64:-0.72:1.000:0.686 0/0/0/1:4:267,100:0.29: 0.03:1.000:0.991 0/0/0/1:4:337,101:0.25: 0.69:0.999:1.000 0/0/1/1:4:247,194:0.47: 0.72:1.000:0.993 0/1/1/1:4:103,203:0.70:-0.55:1.000:0.988 0/0/1/1:4:93,125:0.61:-1.37:1.000:0.671 0/0/1/1:4:175,141:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:97,210:0.73:-0.54:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,198:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,216:0.74:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,153:0.67:-1.13:1.000:0.906 0/1/1/1:4:134,231:0.67: 0.01:1.000:0.931 0/0/1/1:4:252,218:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:228,200:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,203:0.81:-0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:123,190:0.65:-0.48:1.000:0.756 0/1/1/1:4:150,260:0.67: 0.43:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,276:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,88:0.33:-0.76:1.000:0.909 0/0/1/1:4:276,174:0.42: 0.80:1.000:0.893 -chr1.1 66653706 chr1.1_066653706 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:25,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:27,5:.: 0.18:1.000:. ./.:4:13,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:34,4:.: 0.75:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.56:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.42:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:27,5:.: 0.18:1.000:. ./.:4:28,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:34,5:.: 0.84:0.998:. ./.:4:19,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:46,4:.: 1.88:1.000:. ./.:4:58,2:.: 2.82:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:30,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:35,10:.: 1.40:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:28,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.46:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:15,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.61:1.000:. ./.:3:10,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:25,6:.: 0.09:1.000:. ./.:4:47,2:.: 1.78:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:33,3:.: 0.56:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:31,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:26,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,3:.:-1.13:1.000:. ./.:4:32,3:.: 0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.42:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:31,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.13:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.76:1.000:. ./.:6:27,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:30,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:15,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,4:.: 1.50:1.000:. ./.:4:14,6:.:-0.95:0.910:. ./.:4:32,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:36,13:.: 1.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:31,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.18:0.920:. ./.:4:22,6:.:-0.19:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:26,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:24,12:.: 0.56:1.000:. ./.:4:8,8:.:-1.32:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:22,5:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.23:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:30,6:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,5:.: 1.40:1.000:. ./.:4:39,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:53,6:.: 2.72:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.38:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.36:0.988:. ./.:4:40,2:.: 1.12:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:24,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.85:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,5:.: 0.75:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.66:1.000:. ./.:5:37,3:.: 0.93:0.988:. ./.:4:34,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:39,4:.: 1.22:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:10,5:.:-1.42:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.04:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:32,3:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:38,2:.: 0.93:1.000:. ./.:4:47,6:.: 2.16:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:31,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:27,4:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,5:.: 1.22:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:8,5:.:-1.61:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:39,5:.: 1.31:1.000:. ./.:4:37,8:.: 1.40:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.75:1.000:. ./.:4:32,4:.: 0.56:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:46,4:.: 1.88:1.000:. ./.:4:22,9:.: 0.09:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.89:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.46:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.69:0.999:. ./.:4:37,4:.: 1.03:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:40,9:.: 1.78:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:43,5:.: 1.69:1.000:. ./.:4:36,4:.: 0.93:1.000:. ./.:4:31,5:.: 0.56:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:50,5:.: 2.35:1.000:. ./.:4:28,4:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,3:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,10:.: 0.65:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.97:1.000:. -chr1.1 67016814 chr1.1_067016814 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,32:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,43:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,51:.: 1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.15:1.000:. ./.:6:0,15:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,49:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,54:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,36:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,51:.: 1.54:0.920:. ./.:4:0,44:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,51:.: 1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.34:0.999:. ./.:4:0,44:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,60:.: 2.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.07:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,19:.:-1.08:0.988:. ./.:4:0,53:.: 1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.:-0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,42:.: 0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,50:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,46:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,44:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.: 1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.: 1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,43:.: 0.89:1.000:. -chr1.1 67076739 chr1.1_067076739 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:44,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.47:0.998:. ./.:4:40,11:.: 2.80:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.48:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.77:1.000:. ./.:6:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.57:0.910:. ./.:4:25,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.59:0.920:. ./.:4:25,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.55:0.999:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:0.999:. ./.:4:20,0:.:-0.08:1.000:. ./.:3:7,0:.:-1.29:0.988:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:5:8,0:.:-1.20:0.988:. ./.:4:28,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.31:0.999:. ./.:4:20,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:44,0:.: 2.15:1.000:. -chr1.1 67331622 chr1.1_067331622 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:4,49:0.74:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,35:0.73:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,104:0.88: 0.76:1.000:0.801 0/0/1/1:4:68,54:0.51: 1.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,138:1.00: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,63:0.87:-0.24:1.000:0.938 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.66:-1.27:1.000:0.881 0/0/1/1:4:12,17:0.58:-1.08:1.000:0.928 0/1/1/1:4:11,54:0.70:-0.24:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,95:0.91: 0.52:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,91:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,103:0.88: 0.73:1.000:0.821 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.00:0.998:1.000 0/1/1/1:4:5,30:0.71:-0.94:1.000:0.991 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,124:0.86: 1.25:1.000:0.950 0/0/1/1:4:3,3:0.53:-1.63:1.000:0.991 0/1/1/1:4:3,47:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,47:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,2:0.29:-1.11:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,69:0.94:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,63:0.53: 1.30:1.000:0.993 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,129:0.75: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,55:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,55:0.73:-0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,57:0.78:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,37:0.89:-0.87:1.000:0.621 0/1/1:3:1,2:0.62:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,46:0.52: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,45:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,46:0.47: 1.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:73,99:0.57: 2.29:1.000:0.944 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,73:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,33:0.42: 0.87:1.000:0.919 0/1/1/1:4:4,39:0.73:-0.75:1.000:0.998 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,64:0.87:-0.21:1.000:0.924 0/0/1/1:4:31,21:0.48:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,70:0.53: 1.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:9,18:0.62:-1.13:1.000:0.627 0/1/1/1:4:4,38:0.73:-0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,88:0.56: 1.96:1.000:0.964 0/1/1/1:4:3,52:0.76:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,47:0.48: 1.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,52:0.48: 1.27:1.000:0.996 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,80:0.53: 2.03:1.000:0.991 0/1/1/1:4:6,56:0.73:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,93:0.56: 2.19:1.000:0.967 0/0/1/1/1/1:6:15,38:0.64:-0.52:1.000:0.872 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,30:0.45: 0.33:1.000:0.976 0/0/1/1:4:66,47:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,33:0.71:-0.87:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,45:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,44:0.48: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,55:0.78:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,33:0.68:-0.80:0.910:0.960 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,31:0.40: 1.01:1.000:0.814 0/0/1/1:4:31,40:0.57:-0.09:1.000:0.958 0/1/1/1:4:6,23:0.68:-1.08:1.000:0.946 0/0/1/1:4:65,51:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,35:0.71:-0.80:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,44:0.45: 1.23:1.000:0.981 0/0/1/1:4:91,69:0.50: 2.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,54:0.70:-0.26:0.920:0.987 0/0/1/1:4:65,71:0.54: 1.44:1.000:0.984 0/0/1/1:4:82,96:0.55: 2.43:1.000:0.976 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,46:0.75:-0.61:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,53:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,37:0.45: 0.83:1.000:0.975 0/1/1/1:4:6,81:0.74: 0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,87:0.95: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.05:0.999:1.000 0/1/1/1:4:3,69:0.82:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,32:0.72:-0.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,43:0.68:-0.49:1.000:0.950 0/1/1/1:4:11,40:0.67:-0.57:1.000:0.932 0/0/1/1:4:65,39:0.47: 0.68:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,37:0.67:-0.66:1.000:0.937 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,48:0.83:-0.59:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,35:0.76:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,32:0.69:-0.85:1.000:0.974 0/0/1/1:4:70,26:0.41: 0.50:1.000:0.848 0/1/1/1:4:4,76:0.78: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,1:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,50:0.75:-0.52:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,120:0.93: 1.11:1.000:0.998 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,30:0.70:-0.92:1.000:0.982 0/1/1/1:4:4,123:0.86: 1.23:1.000:0.955 0/0/1/1:4:71,38:0.45: 0.80:0.999:0.982 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1:3:45,22:0.44:-0.19:0.988:0.981 0/0/1/1:4:81,47:0.46: 1.25:1.000:0.990 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,39:0.70:-0.66:1.000:0.980 0/1/1/1:4:5,29:0.71:-0.97:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,39:0.47: 0.64:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,39:0.73:-0.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,54:0.77:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,2:0.31:-1.34:1.000:0.966 0/1/1/1:4:7,36:0.70:-0.75:1.000:0.984 0/0/0/0/0:5:82,0:0.00: 0.17:0.988:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,1:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,29:0.46: 0.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:65,41:0.47: 0.73:1.000:0.994 0/1/1/1:4:4,115:0.85: 1.04:1.000:0.982 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,68:0.56: 1.11:1.000:0.963 1/1/1/1:4:1,46:0.91:-0.66:1.000:0.922 0/0/1/1:4:93,62:0.48: 1.89:1.000:0.995 1/1/1/1:4:2,93:0.91: 0.47:1.000:0.932 0/0/1/1:4:63,30:0.44: 0.43:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,70:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,54:0.77:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,27:0.68:-0.97:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,55:0.78:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,106:0.92: 0.78:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,28:0.85:-1.08:1.000:0.988 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,64:0.81:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,81:0.90: 0.19:1.000:0.678 0/0/1/1:4:73,51:0.49: 1.16:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,71:0.52: 1.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,55:0.51: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,53:0.71:-0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:1,30:0.86:-1.04:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,111:0.60: 2.41:1.000:0.822 0/0/1/1:4:74,81:0.55: 1.89:1.000:0.984 0/0/1/1:4:68,51:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,79:0.59: 1.30:1.000:0.883 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.60:0.999:1.000 0/1/1/1:4:2,57:0.85:-0.38:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,90:1.00: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,37:0.71:-0.75:1.000:0.992 1/1/1/1:4:2,129:0.93: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,47:0.82:-0.61:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,67:0.51: 1.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,60:0.49: 1.68:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,121:0.96: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,40:0.46: 0.85:1.000:0.987 0/1/1/1:4:6,50:0.73:-0.45:1.000:0.997 -chr1.1 67627947 chr1.1_067627947 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.38:1.000:. ./.:4:3,9:.: 0.27:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,13:.: 0.69:1.000:. ./.:4:2,10:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:0.998:. ./.:4:0,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,13:.: 0.69:1.000:. ./.:4:2,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,23:.: 2.54:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.27:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.00:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.97:1.000:. ./.:4:1,8:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,8:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.69:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,13:.: 0.89:1.000:. ./.:4:4,12:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:4,16:.: 1.92:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,11:.: 0.27:1.000:. ./.:4:2,16:.: 1.51:1.000:. ./.:4:2,14:.: 1.10:1.000:. ./.:4:3,8:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,8:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,11:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.14:1.000:. ./.:6:3,8:.: 0.07:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:4,17:.: 2.13:1.000:. ./.:4:2,12:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,17:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,16:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.07:0.910:. ./.:4:2,8:.:-0.14:1.000:. ./.:4:6,13:.: 1.72:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.79:1.000:. ./.:4:7,9:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,12:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.14:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.35:0.920:. ./.:4:1,15:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,9:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:4,16:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.76:0.999:. ./.:4:1,16:.: 1.30:1.000:. ./.:4:2,15:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.72:1.000:. ./.:4:2,17:.: 1.72:1.000:. ./.:4:9,11:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,22:.: 2.34:1.000:. ./.:4:7,13:.: 1.92:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1,8:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,13:.: 0.89:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:4,10:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.69:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:6,7:.: 0.48:1.000:. ./.:4:3,12:.: 0.89:0.999:. ./.:4:0,16:.: 1.10:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.00:0.988:. ./.:4:5,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,22:.: 2.34:1.000:. ./.:4:2,14:.: 1.10:1.000:. ./.:4:6,12:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,17:.: 1.30:1.000:. ./.:4:5,14:.: 1.72:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.14:1.000:. ./.:5:2,16:.: 1.51:0.988:. ./.:4:1,9:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.14:1.000:. ./.:4:4,9:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:4,9:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,13:.: 1.10:1.000:. ./.:4:9,7:.: 1.10:1.000:. ./.:4:3,10:.: 0.48:1.000:. ./.:4:6,11:.: 1.30:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:2,5:.:-0.76:1.000:. ./.:4:5,8:.: 0.48:1.000:. ./.:4:6,16:.: 2.34:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:2,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:3,8:.: 0.07:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:3,12:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:4,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.27:0.999:. ./.:4:4,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:3,10:.: 0.48:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.07:1.000:. ./.:4:2,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:7,7:.: 0.69:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,12:.: 0.69:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:4,9:.: 0.48:1.000:. -chr1.1 67727317 chr1.1_067727317 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:128,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:129,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:83,67:.:-0.12:1.000:. ./.:4:167,29:.: 1.01:1.000:. ./.:4:91,80:.: 0.40:1.000:. ./.:4:94,50:.:-0.26:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:38,14:.:-2.52:1.000:. ./.:4:48,9:.:-2.39:1.000:. ./.:4:118,28:.:-0.22:1.000:. ./.:4:132,41:.: 0.44:1.000:. ./.:4:87,50:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:108,62:.: 0.37:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.33:0.998:. ./.:4:208,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:96,84:.: 0.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:104,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:151,27:.: 0.57:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:94,56:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,32:.:-0.36:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:100,60:.: 0.13:1.000:. ./.:4:157,35:.: 0.91:1.000:. ./.:4:143,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:124,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,8:.:-3.40:1.000:. ./.:4:40,17:.:-2.39:1.000:. ./.:3:30,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:134,32:.: 0.27:1.000:. ./.:4:167,28:.: 0.98:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:117,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:67,46:.:-1.02:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:73,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:115,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:136,34:.: 0.37:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:145,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:8,14:.:-3.25:1.000:. ./.:4:93,61:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,8:.:-2.61:1.000:. ./.:4:93,16:.:-1.12:1.000:. ./.:4:99,87:.: 0.76:1.000:. ./.:4:123,22:.:-0.24:1.000:. ./.:4:115,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:134,51:.: 0.74:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:87,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:70,62:.:-0.56:1.000:. ./.:4:88,66:.:-0.02:1.000:. ./.:6:96,27:.:-0.78:1.000:. ./.:4:94,76:.: 0.37:1.000:. ./.:4:104,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:152,40:.: 0.91:1.000:. ./.:4:115,23:.:-0.41:1.000:. ./.:4:136,37:.: 0.44:1.000:. ./.:4:121,28:.:-0.14:1.000:. ./.:4:76,47:.:-0.78:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:151,43:.: 0.96:0.910:. ./.:4:124,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:143,35:.: 0.57:1.000:. ./.:4:59,42:.:-1.32:1.000:. ./.:4:127,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:130,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:137,25:.: 0.18:1.000:. ./.:4:107,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:133,31:.: 0.22:1.000:. ./.:4:86,82:.: 0.32:1.000:. ./.:4:72,67:.:-0.39:0.920:. ./.:4:84,66:.:-0.12:1.000:. ./.:4:103,80:.: 0.69:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:52,38:.:-1.59:1.000:. ./.:4:95,60:.: 0.00:1.000:. ./.:4:85,54:.:-0.39:1.000:. ./.:4:102,19:.:-0.83:1.000:. ./.:4:62,56:.:-0.90:1.000:. ./.:4:83,65:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,68:.:-0.34:0.999:. ./.:4:69,48:.:-0.93:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:94,14:.:-1.15:1.000:. ./.:4:145,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:126,35:.: 0.15:1.000:. ./.:4:119,33:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:117,31:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,65:.: 0.30:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:111,22:.:-0.53:1.000:. ./.:4:142,46:.: 0.81:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,52:.:-0.63:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:143,29:.: 0.42:1.000:. ./.:4:148,86:.: 1.94:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:121,21:.:-0.31:1.000:. ./.:4:146,96:.: 2.13:1.000:. ./.:4:116,27:.:-0.29:0.999:. ./.:4:170,33:.: 1.18:1.000:. ./.:3:30,10:.:-2.81:0.988:. ./.:4:140,35:.: 0.49:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:81,59:.:-0.36:1.000:. ./.:4:144,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:108,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:118,23:.:-0.34:1.000:. ./.:4:124,29:.:-0.04:1.000:. ./.:4:151,39:.: 0.86:1.000:. ./.:4:165,41:.: 1.25:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:132,20:.:-0.07:1.000:. ./.:5:238,0:.: 2.03:0.988:. ./.:4:144,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:120,27:.:-0.19:1.000:. ./.:4:97,42:.:-0.39:1.000:. ./.:4:112,86:.: 1.06:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:53,46:.:-1.37:1.000:. ./.:4:108,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:169,39:.: 1.30:1.000:. ./.:4:95,76:.: 0.40:1.000:. ./.:4:114,19:.:-0.53:1.000:. ./.:4:119,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:86,60:.:-0.22:1.000:. ./.:4:131,38:.: 0.35:1.000:. ./.:4:88,14:.:-1.29:1.000:. ./.:4:123,84:.: 1.28:1.000:. ./.:4:112,54:.: 0.27:1.000:. ./.:4:116,24:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,63:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,72:.: 0.22:1.000:. ./.:4:100,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:251,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:143,48:.: 0.89:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:90,69:.: 0.10:1.000:. ./.:4:118,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:135,36:.: 0.40:1.000:. ./.:4:197,37:.: 1.94:1.000:. ./.:4:182,27:.: 1.33:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:89,63:.:-0.07:1.000:. ./.:4:150,37:.: 0.79:1.000:. ./.:4:106,27:.:-0.53:1.000:. ./.:4:96,55:.:-0.09:1.000:. ./.:4:106,83:.: 0.84:1.000:. ./.:4:50,43:.:-1.51:1.000:. ./.:4:138,40:.: 0.57:1.000:. ./.:4:96,42:.:-0.41:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.40:0.999:. ./.:4:136,42:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,34:.: 0.08:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:139,26:.: 0.25:1.000:. ./.:4:74,52:.:-0.70:1.000:. ./.:4:93,16:.:-1.12:1.000:. ./.:4:131,34:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,76:.: 0.84:1.000:. ./.:4:179,23:.: 1.15:1.000:. ./.:4:102,81:.: 0.69:1.000:. ./.:4:137,20:.: 0.05:1.000:. ./.:4:160,33:.: 0.93:1.000:. ./.:4:158,48:.: 1.25:1.000:. ./.:4:122,94:.: 1.50:1.000:. ./.:4:141,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:112,40:.:-0.07:1.000:. -chr1.1 67783227 chr1.1_067783227 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:131,292:0.69: 1.33:1.000:0.977 0/0/0/1:4:247,69:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,296:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,175:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:189,206:0.52: 0.92:1.000:0.994 0/1/1/1:4:126,319:0.72: 1.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,132:0.54:-1.30:1.000:0.987 0/1/1/1:4:93,255:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:176,187:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,118:0.73:-2.53:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,116:0.79:-2.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,255:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,176:0.51: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,280:0.79: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,179:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:203,223:0.53: 1.38:0.998:0.993 0/0/0/1:4:296,110:0.29: 1.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:95,301:0.76: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,211:0.52: 1.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,112:0.80:-2.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,271:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,293:0.79: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,251:0.74: 0.13:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,85:0.74:-3.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,195:0.54: 0.47:1.000:0.989 0/1/1/1:4:119,266:0.69: 0.77:1.000:0.977 0/0/1/1:4:205,177:0.47: 0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:177,214:0.55: 0.86:1.000:0.980 0/1/1/1:4:94,278:0.75: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,204:0.48: 1.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:97,268:0.74: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:47,54:0.54:-3.43:1.000:0.989 0/1/1/1:4:28,110:0.80:-2.88:1.000:1.000 0/1/1:3:12,55:0.82:-3.93:1.000:0.984 0/1/1/1:4:105,294:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:107,293:0.73: 0.99:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,245:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,173:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:107,284:0.73: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,149:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,277:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:172,200:0.54: 0.58:1.000:0.987 0/0/1/1:4:193,166:0.47: 0.39:1.000:0.991 0/1/1/1:4:91,242:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:176,174:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:118,282:0.71: 0.99:1.000:0.990 0/1/1/1:4:40,298:0.88: 0.07:1.000:0.678 0/0/1/1:4:156,175:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:179,181:0.51: 0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,221:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,216:0.50: 1.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,247:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,169:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,172:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,189:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,157:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:206,168:0.46: 0.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:149,144:0.49:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:89,199:0.69:-0.66:1.000:0.893 0/1/1/1:4:85,305:0.78: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,231:0.56: 1.18:1.000:0.964 0/0/1/1:4:176,187:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:78,246:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,204:0.49: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,198:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,110:0.50:-1.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,237:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,198:0.50: 0.93:0.910:0.997 0/0/1/1:4:185,173:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,286:0.79: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,221:0.77:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,198:0.47: 1.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:83,296:0.78: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,104:0.29: 0.74:1.000:0.992 0/1/1/1:4:89,244:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:85,249:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,177:0.53: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:145,177:0.55:-0.16:1.000:0.977 0/0/1/1:4:166,209:0.56: 0.62:1.000:0.967 0/0/0/0:4:310,0:0.00:-0.34:0.920:1.000 0/0/1/1:4:164,156:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,147:0.47:-0.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:83,219:0.73:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,182:0.53: 0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:100,272:0.73: 0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,120:0.50:-1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,136:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,138:0.47:-0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:174,183:0.52: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,238:0.75:-0.22:0.999:0.999 0/0/1/1:4:157,143:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:93,315:0.77: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,119:0.47:-1.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:174,164:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:178,144:0.45:-0.16:1.000:0.983 0/1/1/1:4:64,206:0.76:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,64:0.25:-0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,241:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,168:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,212:0.80:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,270:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,159:0.75:-1.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,229:0.75:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,115:0.47:-1.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:152,147:0.49:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,271:0.81: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,246:0.74:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:240,204:0.46: 1.64:1.000:0.990 0/1/1/1:4:93,215:0.70:-0.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:155,160:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,228:0.55: 1.24:1.000:0.980 0/0/1/1:4:143,179:0.56:-0.16:0.999:0.970 0/0/1/1:4:168,182:0.52: 0.25:1.000:0.994 0/1/1:3:59,151:0.72:-1.82:0.988:1.000 0/1/1/1:4:83,249:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,207:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,218:0.73:-0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:160,172:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:77,234:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,258:0.78:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,165:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,166:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:101,296:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,162:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,191:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:73,308:0.81: 0.71:0.988:0.998 0/0/0/1:4:215,80:0.29:-0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:69,201:0.75:-0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,194:0.74:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,163:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,137:0.45:-0.40:1.000:0.983 0/1/1/1:4:55,164:0.75:-1.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:194,219:0.53: 1.18:1.000:0.991 0/1/1/1:4:79,262:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,195:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:208,182:0.47: 0.84:1.000:0.993 0/0/1/1:4:141,144:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,197:0.71:-0.80:1.000:0.991 0/1/1/1:4:76,239:0.76:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,266:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,140:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:168,149:0.47:-0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,165:0.73:-1.60:1.000:0.998 0/1/1/1:4:89,331:0.79: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,344:0.76: 1.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,256:0.75: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,177:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:101,270:0.73: 0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:85,252:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,323:0.78: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,188:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,89:0.87:-3.42:1.000:0.860 0/0/1/1:4:161,121:0.44:-0.75:1.000:0.961 0/1/1/1:4:106,303:0.74: 1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,284:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:108,306:0.74: 1.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,252:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,267:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:114,301:0.73: 1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,163:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:175,155:0.47:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:175,168:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:191,155:0.45: 0.19:1.000:0.983 0/0/1/1:4:180,198:0.53: 0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:176,203:0.54: 0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:142,147:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:229,77:0.27:-0.40:0.999:0.998 0/1/1/1:4:88,224:0.72:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,143:0.48:-0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,236:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,203:0.74:-0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,233:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,249:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,221:0.77:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,125:0.45:-0.71:1.000:0.974 0/0/1/1:4:219,184:0.46: 1.04:1.000:0.989 0/1/1/1:4:81,245:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,279:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:97,210:0.69:-0.38:1.000:0.967 0/1/1/1:4:80,276:0.78: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,229:0.50: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,216:0.54: 1.05:1.000:0.989 0/1/1/1:4:57,203:0.78:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,94:0.28: 0.40:1.000:0.996 -chr1.1 68356794 chr1.1_068356794 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:207,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.40:0.998:. ./.:4:243,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:20,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.11:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.57:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.77:1.000:. ./.:6:123,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.11:0.910:. ./.:4:172,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.57:0.920:. ./.:4:192,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:173,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:153,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:186,0:.: 0.40:1.000:. ./.:3:126,0:.:-0.93:0.988:. ./.:4:125,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.13:1.000:. ./.:5:188,0:.: 0.44:0.988:. ./.:4:143,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:108,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:140,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:243,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.04:0.999:. ./.:4:190,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.35:1.000:. -chr1.1 68477558 chr1.1_068477558 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:7,19:0.69:-0.71:1.000:0.978 0/0/1/1:4:9,12:0.52:-1.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,24:0.69:-0.06:1.000:0.973 0/0/1/1:4:13,17:0.52:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,32:0.60: 1.51:1.000:0.829 0/0/0/1:4:26,15:0.37: 0.68:1.000:0.533 0/0/1/1:4:12,17:0.54:-0.44:1.000:0.989 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,23:0.59: 0.21:1.000:0.837 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.35:-2.57:1.000:0.793 0/1/1/1:4:7,26:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,27:0.62: 0.68:1.000:0.629 0/0/0/1:4:31,8:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,17:0.61:-0.71:1.000:0.689 1/1/1/1:4:1,41:0.97: 0.77:0.998:1.000 0/1/1/1:4:9,40:0.79: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,23:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,23:0.59: 0.21:1.000:0.837 0/1/1/1:4:1,5:0.81:-2.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,26:0.62: 0.49:1.000:0.516 0/1/1/1:4:9,20:0.65:-0.44:1.000:0.782 0/1/1/1:4:7,32:0.79: 0.49:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:16,23:0.54: 0.49:1.000:0.987 0/0/1/1:4:10,15:0.55:-0.81:1.000:0.978 1/1/1/1:4:3,31:0.90: 0.03:1.000:0.758 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,13:0.39:-0.06:1.000:0.709 0/1/1/1:4:13,47:0.75: 2.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,17:0.56:-0.53:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-3.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-2.01:1.000:0.793 0/0/0:3:2,0:0.00:-2.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.30:-0.34:1.000:0.981 0/1/1/1:4:8,43:0.82: 1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,6:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,34:0.70: 1.14:1.000:0.987 0/0/0/1:4:18,9:0.35:-0.62:1.000:0.793 1/1/1/1:4:3,38:0.92: 0.68:1.000:0.976 0/0/1/1:4:18,19:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,30:0.68: 0.77:1.000:0.941 0/1/1/1:4:10,26:0.68: 0.21:1.000:0.963 0/0/1/1:4:14,26:0.61: 0.59:1.000:0.734 0/1/1/1:4:6,19:0.72:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,16:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,9:0.88:-2.20:1.000:0.648 0/1/1/1:4:7,24:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,5:0.37:-1.83:1.000:0.611 0/1/1/1:4:9,25:0.70: 0.03:1.000:0.983 0/1/1/1:4:9,29:0.73: 0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,26:0.68: 0.21:1.000:0.963 0/0/1/1:4:19,33:0.59: 1.70:1.000:0.867 0/0/1/1:4:14,23:0.58: 0.31:1.000:0.931 0/0/1/1:4:18,15:0.43:-0.06:1.000:0.954 0/1/1/1:4:5,43:0.88: 1.33:1.000:0.767 0/0/1/1:4:23,21:0.45: 0.96:1.000:0.979 0/1/1/1:4:9,25:0.70: 0.03:1.000:0.983 0/0/0/1/1/1:6:18,18:0.46: 0.21:1.000:0.817 0/0/1/1:4:21,24:0.49: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,26:0.61: 0.59:1.000:0.734 0/0/1/1:4:16,24:0.55: 0.59:1.000:0.978 1/1/1/1:4:4,42:0.90: 1.14:1.000:0.794 0/1/1/1:4:12,40:0.73: 1.70:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,18:0.55:-0.34:1.000:0.978 0/0/1/1:4:20,21:0.47: 0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,38:0.72: 1.51:0.910:0.997 0/1/1/1:4:4,12:0.71:-1.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,38:0.82: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,16:0.62:-0.90:1.000:0.516 0/0/0/1:4:23,10:0.33:-0.06:1.000:0.924 1/1/1/1:4:3,33:0.90: 0.21:1.000:0.874 0/1/1/1:4:11,26:0.66: 0.31:1.000:0.887 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,20:0.60:-0.25:1.000:0.783 0/1/1/1:4:5,37:0.86: 0.77:1.000:0.957 0/0/1/1:4:18,22:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,43:0.80: 1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,19:0.59:-0.34:0.920:0.875 0/1/1/1:4:15,32:0.64: 1.23:1.000:0.681 1/1/1/1:4:1,40:0.97: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,20:0.54: 0.03:1.000:0.988 0/1/1/1:4:12,25:0.63: 0.31:1.000:0.612 0/0/0/1:4:29,15:0.36: 0.96:1.000:0.742 0/1/1/1:4:9,30:0.73: 0.49:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,25:0.63: 0.31:1.000:0.612 0/0/1/1:4:16,22:0.53: 0.40:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,4:0.25:-1.18:0.999:0.999 0/1/1/1:4:11,26:0.66: 0.31:1.000:0.887 0/0/1/1:4:19,27:0.54: 1.14:1.000:0.989 0/1/1/1:4:3,22:0.86:-0.81:1.000:0.962 1/1/1/1:4:4,44:0.90: 1.33:1.000:0.874 0/1/1/1:4:7,39:0.82: 1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,29:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,10:0.58:-1.64:1.000:0.918 0/1/1/1:4:14,33:0.66: 1.23:1.000:0.883 0/0/1/1:4:22,17:0.42: 0.49:1.000:0.916 0/0/1/1:4:16,10:0.39:-0.71:1.000:0.635 0/0/1/1:4:27,19:0.40: 1.14:1.000:0.829 0/0/1/1:4:9,13:0.54:-1.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:19,27:0.54: 1.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:9,16:0.60:-0.81:1.000:0.829 0/1/1/1:4:9,21:0.66:-0.34:1.000:0.869 0/1/1/1:4:10,28:0.70: 0.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:13,16:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,25:0.56: 0.68:1.000:0.963 0/0/0/1:4:19,10:0.36:-0.44:1.000:0.713 0/1/1/1:4:6,43:0.86: 1.42:1.000:0.971 0/0/1/1:4:17,23:0.53: 0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,29:0.60: 1.05:0.999:0.790 0/0/0/1:4:22,5:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/1:3:10,8:0.43:-1.46:0.988:0.993 0/0/1/1:4:23,19:0.43: 0.77:1.000:0.951 0/0/1/1:4:18,14:0.42:-0.16:1.000:0.920 0/0/0/1:4:30,17:0.37: 1.23:1.000:0.570 0/1/1/1:4:9,54:0.84: 2.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,20:0.62:-0.34:1.000:0.516 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.46:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:13,20:0.56:-0.06:1.000:0.969 0/1/1/1:4:9,19:0.64:-0.53:1.000:0.652 0/1/1/1:4:4,36:0.88: 0.59:1.000:0.648 0/0/0/1/1:5:20,21:0.47: 0.68:0.988:0.748 0/1/1/1:4:4,26:0.85:-0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:8,16:0.62:-0.90:1.000:0.516 0/0/1/1:4:15,14:0.45:-0.44:1.000:0.982 0/0/1/1:4:11,17:0.56:-0.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:15,12:0.43:-0.62:1.000:0.936 0/1/1/1:4:9,25:0.70: 0.03:1.000:0.983 0/1/1/1:4:4,18:0.79:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,15:0.61:-0.99:1.000:0.709 0/1/1/1:4:9,23:0.68:-0.16:1.000:0.954 0/0/1/1:4:10,20:0.62:-0.34:1.000:0.516 0/0/1/1:4:14,18:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,22:0.53: 0.40:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,29:0.67: 0.68:1.000:0.912 0/0/1/1:4:25,19:0.42: 0.96:1.000:0.904 0/0/1/1:4:13,16:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,10:0.45:-1.18:1.000:0.978 0/0/1/1:4:19,18:0.46: 0.31:1.000:0.984 0/0/1/1:4:16,12:0.42:-0.53:1.000:0.894 0/0/1/1:4:12,18:0.55:-0.34:1.000:0.978 0/0/1/1:4:19,16:0.44: 0.12:1.000:0.958 0/0/0/1:4:14,8:0.37:-1.08:1.000:0.553 0/0/1/1:4:20,27:0.52: 1.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,18:0.71:-0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,11:0.40:-0.62:1.000:0.798 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:10,15:0.55:-0.81:1.000:0.978 0/1/1/1:4:9,55:0.84: 2.81:1.000:0.996 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,29:0.83: 0.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,27:0.79:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,24:0.59: 0.40:1.000:0.885 0/0/0/1:4:21,10:0.34:-0.25:1.000:0.852 0/1/1/1:4:6,24:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-1.27:1.000:0.752 0/0/1/1:4:20,28:0.53: 1.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,19:0.49: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,27:0.82:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,14:0.59:-1.08:1.000:0.856 0/1/1/1:4:5,28:0.83:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,22:0.82:-0.71:0.999:0.999 0/1/1/1:4:8,18:0.65:-0.71:1.000:0.808 0/0/1/1:4:19,14:0.41:-0.06:1.000:0.878 0/1/1/1:4:4,18:0.79:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.45:-1.18:1.000:0.978 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.43:-0.62:1.000:0.936 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,27:0.88:-0.34:1.000:0.648 0/0/1/1:4:13,20:0.56:-0.06:1.000:0.969 0/1/1/1:4:5,28:0.83:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,14:0.43:-0.25:1.000:0.950 0/0/0/1:4:14,6:0.33:-1.27:1.000:0.932 0/0/1/1:4:15,19:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,25:0.63: 0.31:1.000:0.612 0/0/1/1:4:18,20:0.48: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,23:0.73:-0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,26:0.73: 0.03:1.000:0.998 -chr1.1 68772824 chr1.1_068772824 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:61,92:0.60: 1.69:1.000:0.750 0/0/1/1:4:58,38:0.40: 0.03:1.000:0.778 0/1/1/1:4:35,72:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,84:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,95:0.76: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,58:0.36: 2.33:1.000:0.725 0/0/1/1:4:19,26:0.55:-1.46:1.000:0.975 0/0/1/1:4:91,55:0.39: 1.49:1.000:0.647 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,17:0.62:-1.95:1.000:0.609 0/0/0/1:4:20,5:0.27:-2.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,46:0.48:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,50:0.40: 0.87:1.000:0.801 0/1/1/1:4:43,79:0.70: 0.79:1.000:0.988 0/0/1/1:4:83,50:0.39: 1.11:1.000:0.641 0/1/1/1:4:56,97:0.67: 1.69:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.06:0.998:1.000 0/1/1/1:4:47,89:0.72: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,78:0.64: 0.90:1.000:0.715 0/0/1/1:4:48,70:0.59: 0.67:1.000:0.880 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-2.42:1.000:0.711 0/1/1/1:4:40,76:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,84:0.71: 0.99:1.000:0.992 0/0/1/1:4:33,46:0.56:-0.47:1.000:0.960 0/0/1/1:4:9,6:0.40:-2.33:1.000:0.801 0/1/1/1:4:34,55:0.64:-0.17:1.000:0.689 0/0/1/1:4:55,77:0.57: 1.08:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,112:0.99: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,51:0.39: 1.05:1.000:0.738 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,70:0.67: 0.47:1.000:0.908 0/1/1/1:4:1,2:0.74:-2.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,2:0.25:-2.42:1.000:0.999 0/0/1:3:3,2:0.40:-2.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,84:0.70: 1.02:1.000:0.985 0/1/1/1:4:36,59:0.65: 0.00:1.000:0.760 0/0/1/1:4:96,58:0.39: 1.72:1.000:0.646 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,40:0.34: 1.05:1.000:0.870 0/0/1/1:4:48,63:0.53: 0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,75:0.59: 0.90:1.000:0.855 0/0/1/1:4:40,60:0.60: 0.15:1.000:0.776 0/0/1/1:4:48,49:0.47: 0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:39,54:0.56:-0.06:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,89:0.61: 1.52:1.000:0.654 0/1/1/1:4:22,41:0.71:-0.93:1.000:0.992 0/0/1/1:4:31,48:0.62:-0.47:1.000:0.597 0/1/1/1:4:17,42:0.78:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,47:0.66:-0.58:1.000:0.860 0/0/1/1:4:56,82:0.59: 1.25:1.000:0.868 0/0/1/1:4:40,56:0.57: 0.03:1.000:0.956 0/1/1/1:4:34,71:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,68:0.65: 0.41:1.000:0.815 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,57:0.72:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,33:0.45:-0.73:1.000:0.977 0/0/1/1:4:46,62:0.55: 0.38:1.000:0.983 0/0/0/0/1/1:6:47,27:0.38:-0.61:1.000:0.791 0/0/1/1:4:58,35:0.39:-0.06:1.000:0.644 0/1/1/1:4:36,75:0.75: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,60:0.67: 0.00:1.000:0.917 0/0/1/1:4:27,40:0.60:-0.82:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,125:1.00: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,22:0.66:-1.75:1.000:0.885 0/1/1/1:4:31,58:0.71:-0.17:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.22:0.910:1.000 0/0/0/1:4:88,49:0.37: 1.22:1.000:0.513 0/0/1/1:4:38,56:0.59:-0.03:1.000:0.848 0/0/1/1:4:28,25:0.45:-1.22:1.000:0.977 0/0/0/1:4:123,13:0.19: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,90:0.56: 1.75:1.000:0.967 0/0/0/1:4:80,38:0.35: 0.67:1.000:0.786 0/0/0/1:4:52,27:0.36:-0.47:1.000:0.647 0/1/1/1:4:34,58:0.67:-0.09:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,47:0.48:-0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,61:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,30:0.40:-0.58:0.920:0.801 0/0/1/1:4:40,42:0.47:-0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,64:0.65: 0.23:1.000:0.766 0/0/1/1:4:34,50:0.59:-0.32:1.000:0.855 0/0/1/1:4:38,30:0.43:-0.79:1.000:0.941 0/0/0/1:4:74,24:0.30: 0.09:1.000:0.984 0/0/1/1:4:22,27:0.50:-1.34:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,44:0.74:-0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,61:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,25:0.34:-0.44:0.999:0.838 0/0/1/1:4:38,43:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,68:0.53: 0.73:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,49:0.70:-0.55:1.000:0.982 0/0/0/1:4:66,22:0.30:-0.20:1.000:0.981 0/0/1/1:4:31,38:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,65:0.64: 0.29:1.000:0.715 0/0/0/1:4:29,11:0.32:-1.60:1.000:0.953 0/1/1/1:4:22,46:0.76:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,36:0.67:-1.11:1.000:0.917 0/0/1/1:4:33,51:0.62:-0.32:1.000:0.609 0/0/1/1:4:30,25:0.44:-1.17:1.000:0.961 0/0/1/1:4:37,49:0.54:-0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:36,56:0.62:-0.09:1.000:0.567 0/1/1/1:4:31,57:0.70:-0.20:1.000:0.988 0/1/1/1:4:55,95:0.67: 1.60:1.000:0.932 0/0/1/1:4:48,55:0.49: 0.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,81:0.67: 0.96:1.000:0.928 0/1/1/1:4:30,64:0.76:-0.03:0.999:1.000 0/1/1/1:4:33,60:0.70:-0.06:1.000:0.983 0/0/1:3:34,24:0.41:-1.08:0.988:0.998 0/0/0/1:4:79,29:0.32: 0.38:1.000:0.963 0/0/1/1:4:30,35:0.49:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,33:0.37:-0.09:1.000:0.504 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,43:0.71:-0.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,33:0.35: 0.26:1.000:0.813 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,62:0.62: 0.20:1.000:0.590 0/1/1/1:4:39,121:0.82: 1.90:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:25,53:0.76:-0.50:0.988:0.951 0/0/1/1:4:22,29:0.53:-1.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:23,19:0.44:-1.54:1.000:0.958 0/0/1/1:4:47,28:0.38:-0.58:1.000:0.620 0/0/1/1:4:37,53:0.58:-0.15:1.000:0.922 0/1/1/1:4:27,85:0.82: 0.50:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,58:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,79:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,94:0.66: 1.60:1.000:0.860 0/1/1/1:4:38,67:0.68: 0.29:1.000:0.961 0/1/1/1:4:22,43:0.73:-0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,32:0.41:-0.50:1.000:0.851 0/1/1/1:4:28,48:0.67:-0.55:1.000:0.917 0/1/1/1:4:36,66:0.70: 0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,39:0.60:-0.87:1.000:0.776 0/1/1/1:4:27,57:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,40:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,62:0.36: 2.54:1.000:0.655 0/0/1/1:4:102,79:0.42: 2.51:1.000:0.932 0/0/1/1:4:47,68:0.58: 0.58:1.000:0.901 0/1/1/1:4:36,71:0.74: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:113,62:0.37: 2.33:1.000:0.542 0/1/1/1:4:32,56:0.68:-0.20:1.000:0.952 0/1/1/1:4:42,85:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,81:0.52: 1.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,13:0.71:-2.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:32,70:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,78:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,45:0.39: 0.70:1.000:0.658 0/1/1/1:4:46,89:0.73: 1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,66:0.73: 0.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,85:0.79: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,57:0.40: 1.40:1.000:0.794 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,56:0.55: 0.06:1.000:0.976 0/0/1/1:4:34,39:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,77:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,73:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,76:0.62: 0.87:1.000:0.586 0/1/1/1:4:30,63:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,68:0.55: 0.67:0.999:0.979 0/1/1/1:4:43,73:0.66: 0.61:1.000:0.894 0/1/1/1:4:28,66:0.77:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,66:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,47:0.57:-0.44:1.000:0.932 0/0/0/1:4:70,35:0.36: 0.29:1.000:0.711 0/0/1/1:4:63,44:0.41: 0.35:1.000:0.855 0/0/0/1:4:57,28:0.36:-0.29:1.000:0.739 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,79:0.63: 0.99:1.000:0.538 0/1/1/1:4:29,60:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,46:0.38: 0.93:1.000:0.527 0/0/0/1:4:84,30:0.31: 0.55:1.000:0.969 0/0/0/1:4:83,36:0.34: 0.70:1.000:0.881 0/1/1/1:4:53,103:0.73: 1.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,88:0.80: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,44:0.57:-0.58:1.000:0.938 0/0/1/1:4:75,52:0.41: 0.93:1.000:0.847 -chr1.1 68859167 chr1.1_068859167 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:120,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:66,10:.:-0.85:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:132,5:.: 0.26:1.000:. ./.:4:161,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:161,3:.: 0.76:1.000:. ./.:4:71,14:.:-0.69:1.000:. ./.:4:135,8:.: 0.37:1.000:. ./.:4:41,2:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:261,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:72,16:.:-0.63:1.000:. ./.:4:178,7:.: 1.14:1.000:. ./.:4:116,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:207,5:.: 1.63:1.000:. ./.:4:132,4:.: 0.25:0.998:. ./.:4:182,4:.: 1.16:1.000:. ./.:4:84,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:234,8:.: 2.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:107,11:.:-0.08:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.34:1.000:. ./.:4:129,9:.: 0.28:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:207,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:111,11:.:-0.01:1.000:. ./.:4:131,9:.: 0.32:1.000:. ./.:4:281,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:77,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:216,4:.: 1.78:1.000:. ./.:4:108,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.16:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:68,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:137,11:.: 0.46:1.000:. ./.:4:71,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:120,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:76,8:.:-0.71:1.000:. ./.:4:154,5:.: 0.67:1.000:. ./.:4:57,6:.:-1.09:1.000:. ./.:4:191,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:129,7:.: 0.25:1.000:. ./.:4:114,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:153,12:.: 0.78:1.000:. ./.:4:76,3:.:-0.80:1.000:. ./.:4:160,3:.: 0.74:1.000:. ./.:4:112,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:80,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:171,5:.: 0.98:1.000:. ./.:4:86,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:109,8:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,13:.:-0.14:1.000:. ./.:4:101,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:144,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:176,2:.: 1.01:1.000:. ./.:6:53,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:94,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:80,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:106,6:.:-0.19:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:197,2:.: 1.40:1.000:. ./.:4:159,3:.: 0.72:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:72,10:.:-0.74:1.000:. ./.:4:161,2:.: 0.74:0.910:. ./.:4:104,4:.:-0.27:1.000:. ./.:4:100,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:121,4:.: 0.04:1.000:. ./.:4:121,6:.: 0.08:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:56,4:.:-1.14:1.000:. ./.:4:54,5:.:-1.16:1.000:. ./.:4:75,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:82,8:.:-0.60:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:0.920:. ./.:4:135,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:152,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:52,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:136,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:114,7:.:-0.03:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:139,2:.: 0.34:1.000:. ./.:4:161,3:.: 0.76:1.000:. ./.:4:88,6:.:-0.52:0.999:. ./.:4:147,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:40,4:.:-1.44:1.000:. ./.:4:125,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:134,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:78,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:92,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:98,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,10:.:-0.83:1.000:. ./.:4:68,7:.:-0.87:1.000:. ./.:4:98,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:41,3:.:-1.44:1.000:. ./.:4:142,6:.: 0.46:1.000:. ./.:4:215,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:69,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:122,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:255,7:.: 2.55:1.000:. ./.:4:86,7:.:-0.54:0.999:. ./.:4:92,8:.:-0.41:1.000:. ./.:3:35,0:.:-1.60:0.988:. ./.:4:43,6:.:-1.34:1.000:. ./.:4:41,6:.:-1.38:1.000:. ./.:4:103,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:72,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:43,7:.:-1.33:1.000:. ./.:4:132,4:.: 0.25:1.000:. ./.:4:115,6:.:-0.03:1.000:. ./.:4:123,19:.: 0.35:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:146,3:.: 0.48:1.000:. ./.:5:38,6:.:-1.44:0.988:. ./.:4:143,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:27,7:.:-1.62:1.000:. ./.:4:53,7:.:-1.14:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:214,7:.: 1.80:1.000:. ./.:4:52,7:.:-1.16:1.000:. ./.:4:127,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:183,9:.: 1.27:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:42,6:.:-1.36:1.000:. ./.:4:34,8:.:-1.47:1.000:. ./.:4:48,8:.:-1.22:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:153,6:.: 0.67:1.000:. ./.:4:83,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:171,4:.: 0.96:1.000:. ./.:4:155,13:.: 0.83:1.000:. ./.:4:121,15:.: 0.25:1.000:. ./.:4:191,4:.: 1.32:1.000:. ./.:4:146,10:.: 0.61:1.000:. ./.:4:97,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:81,22:.:-0.36:1.000:. ./.:4:126,9:.: 0.23:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:193,8:.: 1.43:1.000:. ./.:4:139,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,14:.:-0.87:1.000:. ./.:4:149,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:145,9:.: 0.57:1.000:. ./.:4:68,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:121,9:.: 0.14:1.000:. ./.:4:199,9:.: 1.56:1.000:. ./.:4:97,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:218,3:.: 1.80:1.000:. ./.:4:198,9:.: 1.54:1.000:. ./.:4:132,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:203,5:.: 1.56:0.999:. ./.:4:128,13:.: 0.34:1.000:. ./.:4:112,8:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,11:.:-0.80:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.98:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.96:1.000:. ./.:4:113,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:164,7:.: 0.88:1.000:. ./.:4:269,2:.: 2.71:1.000:. ./.:4:138,12:.: 0.50:1.000:. ./.:4:132,7:.: 0.30:1.000:. ./.:4:94,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,15:.:-0.74:1.000:. ./.:4:171,5:.: 0.98:1.000:. ./.:4:275,8:.: 2.93:1.000:. ./.:4:121,11:.: 0.17:1.000:. ./.:4:189,2:.: 1.25:1.000:. -chr1.1 68948271 chr1.1_068948271 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:99,97:0.52: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,74:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,150:0.73: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,69:0.46:-0.04:1.000:0.988 0/1/1/1:4:58,169:0.74: 1.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,58:0.29: 1.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,50:0.52:-1.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,87:0.51: 0.46:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,161:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,16:0.65:-3.36:1.000:0.766 0/0/1/1:4:24,20:0.48:-2.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,135:0.75: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.53: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,87:0.54: 0.21:1.000:0.988 0/0/0/1:4:141,51:0.28: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,79:0.47: 0.41:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 0.11:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,172:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,151:0.71: 1.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:101,78:0.46: 0.51:1.000:0.986 0/1/1/1:4:9,17:0.66:-3.33:1.000:0.867 0/0/1/1:4:88,112:0.57: 1.04:1.000:0.933 0/1/1/1:4:46,150:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,75:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,16:0.80:-3.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,89:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,77:0.48: 0.24:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,160:0.99: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,89:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,105:0.57: 0.76:1.000:0.945 0/1/1/1:4:35,123:0.78:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,85:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,16:0.73:-3.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,7:0.21:-3.08:1.000:1.000 0/0/1:3:9,7:0.46:-3.59:1.000:0.941 0/1/1/1:4:37,118:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,100:0.53: 0.94:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,80:0.50: 0.24:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,74:0.49:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,79:0.46: 0.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:44,120:0.73: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,105:0.53: 1.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:40,112:0.73:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:98,83:0.48: 0.56:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,187:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,91:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,109:0.47: 2.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:66,71:0.54:-0.54:1.000:0.989 0/1/1/1:4:35,127:0.78: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,76:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,96:0.52: 0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,68:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,129:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,117:0.73: 0.06:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,160:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,105:0.57: 0.79:1.000:0.951 0/0/1/1:4:82,87:0.53: 0.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,77:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:72,40:0.38:-1.17:1.000:0.806 0/0/0/1:4:88,35:0.30:-0.90:1.000:0.984 0/1/1/1:4:33,134:0.80: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,129:0.73: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,67:0.54:-0.77:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,134:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,118:0.72: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,36:0.40:-1.62:1.000:0.811 0/1/1/1:4:39,141:0.78: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,125:0.79:-0.04:0.910:1.000 0/0/1/1:4:75,77:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,81:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,30:0.30:-1.37:1.000:0.980 0/0/0/1:4:127,30:0.21:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,107:0.61: 0.49:1.000:0.669 0/0/1/1:4:73,94:0.58: 0.21:1.000:0.924 0/0/1/1:4:66,83:0.57:-0.24:1.000:0.941 0/1/1/1:4:33,137:0.80: 0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,103:0.71:-0.32:1.000:0.990 0/0/1/1:4:89,73:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:70,80:0.55:-0.22:0.920:0.979 0/0/1/1:4:92,70:0.45: 0.09:1.000:0.983 0/0/1/1:4:88,100:0.55: 0.74:1.000:0.981 0/1/1/1:4:29,104:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,80:0.58:-0.42:1.000:0.923 0/0/0/1:4:131,46:0.28: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,79:0.54:-0.22:1.000:0.985 0/1/1/1:4:32,104:0.76:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,65:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,70:0.45: 0.14:1.000:0.977 0/0/0/1:4:106,33:0.25:-0.49:0.999:0.999 0/0/1/1:4:89,72:0.47: 0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,142:0.72: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,97:0.74:-0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,124:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,126:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,74:0.54:-0.44:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,61:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,137:0.77: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,146:0.75: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,32:0.29:-1.02:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,112:0.80:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,45:0.47:-1.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:95,68:0.44: 0.11:1.000:0.963 0/0/1/1:4:63,46:0.44:-1.25:1.000:0.971 0/0/1/1:4:77,62:0.47:-0.49:1.000:0.991 0/1/1/1:4:28,110:0.79:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,86:0.52: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,108:0.55: 1.12:1.000:0.980 0/1/1/1:4:44,127:0.74: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,97:0.70:-0.47:1.000:0.980 0/0/1/1:4:102,119:0.56: 1.57:1.000:0.974 0/1/1/1:4:44,118:0.73: 0.09:0.999:0.997 0/1/1/1:4:54,102:0.66:-0.07:1.000:0.867 0/1/1:3:37,79:0.68:-1.07:0.988:1.000 0/0/1/1:4:90,69:0.46: 0.01:1.000:0.984 0/1/1/1:4:30,101:0.77:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,45:0.29: 0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:35,107:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,61:0.47:-0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:93,76:0.47: 0.26:1.000:0.993 0/1/1/1:4:30,116:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,109:0.71:-0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:83,100:0.56: 0.61:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,115:0.67: 0.36:1.000:0.919 0/1/1/1/1:5:37,146:0.79: 0.61:0.988:0.994 0/1/1/1:4:41,110:0.73:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,89:0.76:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,70:0.56:-0.74:1.000:0.969 0/1/1/1:4:31,107:0.77:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,93:0.58: 0.16:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,130:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,84:0.56:-0.12:1.000:0.965 0/1/1/1:4:61,195:0.76: 2.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,69:0.46:-0.04:1.000:0.988 0/1/1/1:4:35,119:0.77:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,53:0.52:-1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,102:0.78:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,115:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,72:0.53:-0.47:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,104:0.72:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,56:0.48:-0.90:1.000:0.994 0/0/0/1:4:147,50:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/0/1:4:174,60:0.27: 1.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,65:0.41: 0.19:1.000:0.871 0/0/1/1:4:81,116:0.60: 0.97:1.000:0.784 0/0/0/1:4:172,58:0.27: 1.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,73:0.53:-0.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:56,152:0.73: 1.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,145:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,29:0.80:-3.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,71:0.46: 0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:90,86:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,79:0.48: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,98:0.48: 1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,81:0.44: 0.81:1.000:0.974 0/1/1/1:4:29,132:0.82: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:138,42:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,114:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,118:0.72: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,63:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,82:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,82:0.48: 0.54:1.000:0.994 0/1/1/1:4:49,143:0.74: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,55:0.44:-0.67:1.000:0.962 0/1/1/1:4:43,115:0.73:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,81:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,104:0.70:-0.24:1.000:0.985 0/1/1/1:4:30,117:0.79:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,106:0.73:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,74:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,41:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,49:0.47:-1.25:1.000:0.993 0/1/1/1:4:35,107:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,110:0.58: 0.86:1.000:0.898 0/0/1/1:4:104,74:0.44: 0.49:1.000:0.960 0/0/0/1:4:138,48:0.27: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,99:0.58: 0.39:1.000:0.902 0/0/1/1:4:92,103:0.55: 0.92:1.000:0.983 0/1/1/1:4:70,177:0.72: 2.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:120,107:0.49: 1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,68:0.42: 0.26:1.000:0.923 0/0/1/1:4:93,94:0.52: 0.71:1.000:0.994 -chr1.1 69097581 chr1.1_069097581 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:280,10:.: 0.12:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:274,21:.: 0.19:1.000:. ./.:4:254,15:.:-0.16:1.000:. ./.:4:337,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:365,17:.: 1.36:1.000:. ./.:4:215,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:189,25:.:-0.91:1.000:. ./.:4:200,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:97,7:.:-2.39:1.000:. ./.:4:163,2:.:-1.57:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:169,30:.:-1.11:1.000:. ./.:4:253,21:.:-0.10:1.000:. ./.:4:255,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:281,22:.: 0.30:1.000:. ./.:4:315,22:.: 0.75:0.998:. ./.:4:293,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:386,23:.: 1.73:1.000:. ./.:4:295,13:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,7:.:-2.57:1.000:. ./.:4:274,22:.: 0.20:1.000:. ./.:4:182,51:.:-0.65:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:63,3:.:-2.90:1.000:. ./.:4:310,19:.: 0.65:1.000:. ./.:4:274,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:282,24:.: 0.34:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:314,18:.: 0.69:1.000:. ./.:4:320,15:.: 0.73:1.000:. ./.:4:241,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:97,7:.:-2.39:1.000:. ./.:4:139,6:.:-1.84:1.000:. ./.:3:30,3:.:-3.35:1.000:. ./.:4:208,24:.:-0.66:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:286,16:.: 0.28:1.000:. ./.:4:318,16:.: 0.71:1.000:. ./.:4:286,17:.: 0.30:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:282,15:.: 0.21:1.000:. ./.:4:302,17:.: 0.51:1.000:. ./.:4:258,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:287,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:187,24:.:-0.95:1.000:. ./.:4:351,9:.: 1.07:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:169,22:.:-1.22:1.000:. ./.:4:221,10:.:-0.68:1.000:. ./.:4:394,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:217,8:.:-0.76:1.000:. ./.:4:331,21:.: 0.96:1.000:. ./.:4:257,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:210,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:328,18:.: 0.88:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.23:1.000:. ./.:6:215,11:.:-0.74:1.000:. ./.:4:249,16:.:-0.22:1.000:. ./.:4:262,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:313,13:.: 0.61:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:307,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:190,16:.:-1.01:1.000:. ./.:4:254,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:280,13:.: 0.16:0.910:. ./.:4:303,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:455,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:477,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:168,36:.:-1.04:1.000:. ./.:4:250,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:260,21:.: 0.00:1.000:. ./.:4:247,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.50:0.920:. ./.:4:396,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:429,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:198,15:.:-0.92:1.000:. ./.:4:273,10:.: 0.03:1.000:. ./.:4:313,22:.: 0.73:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:267,22:.: 0.11:1.000:. ./.:4:247,28:.:-0.08:1.000:. ./.:4:257,8:.:-0.22:0.999:. ./.:4:218,15:.:-0.65:1.000:. ./.:4:270,10:.:-0.01:1.000:. ./.:4:183,14:.:-1.14:1.000:. ./.:4:265,16:.: 0.00:1.000:. ./.:4:336,17:.: 0.97:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:299,13:.: 0.42:1.000:. ./.:4:170,27:.:-1.14:1.000:. ./.:4:218,8:.:-0.74:1.000:. ./.:4:202,43:.:-0.49:1.000:. ./.:4:218,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:262,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:235,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:264,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:225,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:276,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:342,20:.: 1.09:1.000:. ./.:4:172,24:.:-1.15:1.000:. ./.:4:229,14:.:-0.51:1.000:. ./.:4:363,28:.: 1.48:1.000:. ./.:4:276,14:.: 0.12:0.999:. ./.:4:195,27:.:-0.80:1.000:. ./.:3:149,12:.:-1.62:0.988:. ./.:4:297,16:.: 0.43:1.000:. ./.:4:259,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:250,13:.:-0.24:1.000:. ./.:4:254,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:199,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:174,21:.:-1.16:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:189,29:.:-0.85:1.000:. ./.:4:278,14:.: 0.15:1.000:. ./.:4:185,31:.:-0.88:1.000:. ./.:4:286,11:.: 0.21:1.000:. ./.:5:236,28:.:-0.23:0.988:. ./.:4:364,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:204,10:.:-0.91:1.000:. ./.:4:208,18:.:-0.74:1.000:. ./.:4:265,11:.:-0.07:1.000:. ./.:4:227,22:.:-0.43:1.000:. ./.:4:154,13:.:-1.54:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:253,11:.:-0.23:1.000:. ./.:4:331,19:.: 0.93:1.000:. ./.:4:288,14:.: 0.28:1.000:. ./.:4:221,14:.:-0.62:1.000:. ./.:4:152,18:.:-1.50:1.000:. ./.:4:255,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:239,13:.:-0.39:1.000:. ./.:4:246,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:194,25:.:-0.84:1.000:. ./.:4:191,17:.:-0.99:1.000:. ./.:4:329,24:.: 0.97:1.000:. ./.:4:351,16:.: 1.16:1.000:. ./.:4:272,11:.: 0.03:1.000:. ./.:4:250,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:309,24:.: 0.70:1.000:. ./.:4:271,6:.:-0.06:1.000:. ./.:4:297,20:.: 0.48:1.000:. ./.:4:160,29:.:-1.24:1.000:. ./.:4:103,2:.:-2.38:1.000:. ./.:4:215,15:.:-0.69:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:169,29:.:-1.12:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:233,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:320,16:.: 0.74:1.000:. ./.:4:266,6:.:-0.12:1.000:. ./.:4:163,17:.:-1.37:1.000:. ./.:4:276,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:289,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:252,12:.:-0.23:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:250,24:.:-0.10:1.000:. ./.:4:254,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:249,24:.:-0.11:1.000:. ./.:4:116,25:.:-1.89:1.000:. ./.:4:159,32:.:-1.22:1.000:. ./.:4:254,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:139,19:.:-1.66:1.000:. ./.:4:207,18:.:-0.76:1.000:. ./.:4:350,21:.: 1.21:1.000:. ./.:4:296,18:.: 0.44:1.000:. ./.:4:301,13:.: 0.44:1.000:. ./.:4:207,38:.:-0.49:1.000:. ./.:4:273,17:.: 0.12:1.000:. ./.:4:342,20:.: 1.09:1.000:. ./.:4:347,24:.: 1.21:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.74:1.000:. -chr1.1 69275148 chr1.1_069275148 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.76:0.998:. ./.:4:83,28:.: 0.39:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.60:1.000:. ./.:3:31,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:126,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.26:1.000:. ./.:6:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:0.910:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:0.920:. ./.:4:145,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.16:0.999:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:152,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.62:0.999:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:3:40,0:.:-2.43:0.988:. ./.:4:137,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.31:1.000:. ./.:5:139,0:.: 1.50:0.988:. ./.:4:82,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. -chr1.1 69607033 chr1.1_069607033 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:212,194:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,166:0.54:-0.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:199,177:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:201,183:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,207:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:110,282:0.73: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,145:0.52:-1.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:209,180:0.47: 0.39:1.000:0.994 0/0/0/0:4:440,0:0.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,104:0.53:-2.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:46,139:0.76:-2.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,86:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,174:0.53:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:195,183:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,264:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:232,207:0.48: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:312,103:0.25: 0.74:0.998:0.999 0/0/1/1:4:201,118:0.38:-0.54:1.000:0.539 0/0/1/1:4:314,256:0.46: 2.80:1.000:0.988 0/0/1/1:4:231,241:0.52: 1.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:135,40:0.23:-2.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,165:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:330,105:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,234:0.73:-0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,62:0.63:-3.47:1.000:0.626 0/0/1/1:4:213,204:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:245,209:0.47: 1.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:258,91:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:212,176:0.47: 0.38:1.000:0.990 0/1/1/1:4:103,317:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:372,96:0.21: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,161:0.45: 0.08:1.000:0.981 0/0/0/1:4:67,30:0.31:-3.50:1.000:0.966 0/1/1/1:4:40,142:0.78:-2.37:1.000:1.000 0/0/1:3:63,22:0.26:-3.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:306,103:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:87,289:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,279:0.75: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:289,89:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,328:0.74: 1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,258:0.72: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,138:0.47:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:182,205:0.54: 0.36:1.000:0.987 0/0/1/1:4:165,169:0.52:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:194,176:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:363,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,173:0.47: 0.24:1.000:0.992 0/1/1/1:4:174,467:0.73: 3.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,208:0.75:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:249,100:0.29:-0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:144,134:0.49:-1.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,299:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,149:0.43:-0.12:1.000:0.957 0/0/1/1:4:220,216:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,157:0.45:-0.06:1.000:0.983 0/0/0/0:4:428,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,215:0.69:-0.62:1.000:0.978 0/0/1/1:4:189,193:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,289:0.79: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:123,181:0.60:-0.74:1.000:0.683 0/1/1/1:4:105,306:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,163:0.53:-0.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:211,188:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,283:0.78: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,106:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,174:0.47: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:152,112:0.43:-1.27:1.000:0.957 0/0/1/1:4:170,188:0.54:-0.02:1.000:0.989 0/0/0/1:4:309,103:0.25: 0.70:0.910:0.999 0/0/0/1:4:217,57:0.21:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,284:0.72: 0.52:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,268:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,272:0.74: 0.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:88,265:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,148:0.45:-0.26:1.000:0.975 0/0/1/1:4:154,180:0.55:-0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:169,168:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:258,82:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,201:0.57: 0.02:1.000:0.952 0/1/1/1:4:110,299:0.74: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:168,161:0.50:-0.41:0.920:0.997 0/1/1/1:4:105,283:0.73: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:106,370:0.78: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,150:0.51:-0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,188:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,281:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,207:0.77:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,152:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,164:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,162:0.52:-0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,225:0.79:-0.95:0.999:1.000 0/0/1/1:4:160,181:0.54:-0.25:1.000:0.986 0/0/1/1:4:257,258:0.51: 2.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:203,61:0.23:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,122:0.29: 0.84:1.000:0.990 0/0/0/1:4:322,106:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,211:0.74:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,150:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,188:0.48: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:282,69:0.20:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,228:0.76:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:293,89:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,116:0.47:-1.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:185,185:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,144:0.48:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,160:0.47:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:157,184:0.55:-0.25:1.000:0.979 0/0/1/1:4:190,167:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:237,202:0.47: 1.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:295,78:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,86:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:231,222:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,178:0.50: 0.12:0.999:0.997 0/0/0/1:4:325,107:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/1/1:3:75,143:0.66:-1.89:0.988:1.000 0/1/1/1:4:94,321:0.78: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,142:0.48:-0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:81,252:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,89:0.29:-0.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:155,168:0.53:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:171,188:0.54:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:142,172:0.56:-0.61:1.000:0.969 0/0/0/1:4:316,84:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,201:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/0:4:397,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,108:0.27: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:286,194:0.41: 1.60:0.988:0.964 0/0/0/1:4:236,76:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,156:0.55:-0.90:1.000:0.984 0/1/1/1:4:55,235:0.81:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,181:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,190:0.51: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,68:0.26:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,212:0.55: 0.42:1.000:0.976 0/0/1/1:4:211,159:0.44: 0.14:1.000:0.967 0/0/1/1:4:243,257:0.53: 1.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:203,202:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,144:0.47:-0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:188,180:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,170:0.53:-0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:187,158:0.47:-0.20:1.000:0.992 0/0/1/1:4:192,174:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,87:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,136:0.47:-0.87:1.000:0.994 0/1/1/1:4:113,337:0.75: 1.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,340:0.79: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,151:0.45:-0.18:1.000:0.977 0/0/1/1:4:181,176:0.51:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:119,292:0.72: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:157,192:0.56:-0.14:1.000:0.965 0/0/1/1:4:241,211:0.48: 1.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:317,99:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,64:0.50:-3.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,145:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:107,340:0.77: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,222:0.50: 1.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,300:0.77: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,297:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,155:0.47:-0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:89,278:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,84:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,82:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,178:0.52:-0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:224,156:0.42: 0.27:1.000:0.914 0/1/1/1:4:120,262:0.69: 0.30:1.000:0.977 0/0/1/1:4:199,179:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:84,240:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,98:0.29:-0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:186,165:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:204,172:0.47: 0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:170,166:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:229,68:0.23:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,183:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,245:0.73:-0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,164:0.54:-0.65:1.000:0.988 0/0/0/1:4:260,88:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,215:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,181:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:126,305:0.71: 0.95:1.000:0.993 0/0/1/1:4:211,164:0.45: 0.20:1.000:0.978 0/1/1/1:4:117,310:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:265,270:0.52: 2.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:225,209:0.49: 0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,235:0.74:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,182:0.54:-0.24:1.000:0.985 -chr1.1 69984402 chr1.1_069984402 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:115,221:.: 1.45:1.000:. ./.:4:73,103:.:-0.81:1.000:. ./.:4:114,192:.: 1.02:1.000:. ./.:4:87,183:.: 0.52:1.000:. ./.:4:134,236:.: 1.93:1.000:. ./.:4:128,268:.: 2.29:1.000:. ./.:4:48,46:.:-1.96:1.000:. ./.:4:101,119:.:-0.19:1.000:. ./.:4:92,186:.: 0.63:1.000:. ./.:4:33,44:.:-2.20:1.000:. ./.:4:38,21:.:-2.46:1.000:. ./.:4:91,93:.:-0.69:1.000:. ./.:4:70,72:.:-1.29:1.000:. ./.:4:80,128:.:-0.36:1.000:. ./.:4:89,231:.: 1.22:1.000:. ./.:4:108,227:.: 1.43:1.000:. ./.:4:128,272:.: 2.35:0.998:. ./.:4:113,129:.: 0.12:1.000:. ./.:4:150,240:.: 2.21:1.000:. ./.:4:116,169:.: 0.73:1.000:. ./.:4:18,23:.:-2.71:1.000:. ./.:4:101,170:.: 0.53:1.000:. ./.:4:93,155:.: 0.21:1.000:. ./.:4:86,107:.:-0.57:1.000:. ./.:4:14,17:.:-2.85:1.000:. ./.:4:146,190:.: 1.45:1.000:. ./.:4:91,121:.:-0.30:1.000:. ./.:4:95,168:.: 0.42:1.000:. ./.:4:112,187:.: 0.93:1.000:. ./.:4:106,129:.: 0.02:1.000:. ./.:4:117,91:.:-0.36:1.000:. ./.:4:91,144:.: 0.02:1.000:. ./.:4:22,21:.:-2.68:1.000:. ./.:4:36,58:.:-1.96:1.000:. ./.:3:16,16:.:-2.84:1.000:. ./.:4:99,169:.: 0.49:1.000:. ./.:4:112,140:.: 0.26:1.000:. ./.:4:101,85:.:-0.67:1.000:. ./.:4:114,222:.: 1.45:1.000:. ./.:4:108,272:.: 2.07:1.000:. ./.:4:107,171:.: 0.63:1.000:. ./.:4:95,131:.:-0.10:1.000:. ./.:4:114,191:.: 1.01:1.000:. ./.:4:119,117:.: 0.04:1.000:. ./.:4:103,127:.:-0.05:1.000:. ./.:4:106,143:.: 0.22:1.000:. ./.:4:135,154:.: 0.78:1.000:. ./.:4:24,50:.:-2.24:1.000:. ./.:4:101,144:.: 0.16:1.000:. ./.:4:62,134:.:-0.53:1.000:. ./.:4:92,71:.:-0.99:1.000:. ./.:4:107,161:.: 0.49:1.000:. ./.:4:94,159:.: 0.28:1.000:. ./.:4:106,199:.: 1.01:1.000:. ./.:4:100,136:.: 0.04:1.000:. ./.:4:115,128:.: 0.14:1.000:. ./.:4:87,115:.:-0.44:1.000:. ./.:4:121,216:.: 1.46:1.000:. ./.:4:112,126:.: 0.07:1.000:. ./.:6:93,110:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,133:.: 0.40:1.000:. ./.:4:94,156:.: 0.24:1.000:. ./.:4:129,235:.: 1.84:1.000:. ./.:4:129,243:.: 1.95:1.000:. ./.:4:131,193:.: 1.28:1.000:. ./.:4:107,157:.: 0.43:1.000:. ./.:4:58,61:.:-1.61:1.000:. ./.:4:87,149:.: 0.04:1.000:. ./.:4:115,164:.: 0.64:0.910:. ./.:4:59,108:.:-0.93:1.000:. ./.:4:105,194:.: 0.93:1.000:. ./.:4:46,36:.:-2.13:1.000:. ./.:4:137,69:.:-0.38:1.000:. ./.:4:78,187:.: 0.45:1.000:. ./.:4:127,83:.:-0.33:1.000:. ./.:4:90,138:.:-0.07:1.000:. ./.:4:94,182:.: 0.60:1.000:. ./.:4:84,113:.:-0.51:1.000:. ./.:4:116,228:.: 1.56:1.000:. ./.:4:90,168:.: 0.35:1.000:. ./.:4:85,100:.:-0.68:0.920:. ./.:4:102,127:.:-0.06:1.000:. ./.:4:109,162:.: 0.53:1.000:. ./.:4:86,136:.:-0.16:1.000:. ./.:4:106,121:.:-0.09:1.000:. ./.:4:105,149:.: 0.29:1.000:. ./.:4:54,115:.:-0.91:1.000:. ./.:4:75,105:.:-0.75:1.000:. ./.:4:73,125:.:-0.50:1.000:. ./.:4:106,217:.: 1.26:1.000:. ./.:4:81,129:.:-0.33:0.999:. ./.:4:129,163:.: 0.83:1.000:. ./.:4:123,220:.: 1.55:1.000:. ./.:4:76,146:.:-0.16:1.000:. ./.:4:119,106:.:-0.12:1.000:. ./.:4:102,173:.: 0.59:1.000:. ./.:4:67,134:.:-0.46:1.000:. ./.:4:80,85:.:-0.96:1.000:. ./.:4:98,78:.:-0.81:1.000:. ./.:4:104,173:.: 0.62:1.000:. ./.:4:63,71:.:-1.40:1.000:. ./.:4:101,179:.: 0.66:1.000:. ./.:4:73,82:.:-1.10:1.000:. ./.:4:102,206:.: 1.05:1.000:. ./.:4:86,133:.:-0.20:1.000:. ./.:4:89,162:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,142:.:-0.03:1.000:. ./.:4:106,196:.: 0.97:1.000:. ./.:4:128,208:.: 1.45:1.000:. ./.:4:102,208:.: 1.08:1.000:. ./.:4:83,136:.:-0.20:1.000:. ./.:4:139,161:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,180:.: 0.56:0.999:. ./.:4:102,153:.: 0.31:1.000:. ./.:3:52,94:.:-1.23:0.988:. ./.:4:107,162:.: 0.50:1.000:. ./.:4:65,55:.:-1.60:1.000:. ./.:4:81,130:.:-0.31:1.000:. ./.:4:93,125:.:-0.22:1.000:. ./.:4:93,112:.:-0.40:1.000:. ./.:4:107,153:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,116:.:-0.38:1.000:. ./.:4:104,101:.:-0.40:1.000:. ./.:4:126,215:.: 1.52:1.000:. ./.:4:83,144:.:-0.09:1.000:. ./.:4:95,168:.: 0.42:1.000:. ./.:5:100,108:.:-0.36:0.988:. ./.:4:98,76:.:-0.84:1.000:. ./.:4:66,122:.:-0.64:1.000:. ./.:4:86,129:.:-0.26:1.000:. ./.:4:105,97:.:-0.44:1.000:. ./.:4:111,175:.: 0.74:1.000:. ./.:4:59,112:.:-0.88:1.000:. ./.:4:83,98:.:-0.74:1.000:. ./.:4:104,126:.:-0.05:1.000:. ./.:4:93,92:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,179:.: 0.60:1.000:. ./.:4:77,148:.:-0.12:1.000:. ./.:4:88,86:.:-0.84:1.000:. ./.:4:74,86:.:-1.03:1.000:. ./.:4:87,75:.:-1.00:1.000:. ./.:4:94,62:.:-1.09:1.000:. ./.:4:91,131:.:-0.16:1.000:. ./.:4:64,137:.:-0.46:1.000:. ./.:4:124,124:.: 0.21:1.000:. ./.:4:120,107:.:-0.09:1.000:. ./.:4:102,109:.:-0.31:1.000:. ./.:4:87,164:.: 0.25:1.000:. ./.:4:105,128:.: 0.00:1.000:. ./.:4:94,94:.:-0.64:1.000:. ./.:4:142,232:.: 1.98:1.000:. ./.:4:121,90:.:-0.31:1.000:. ./.:4:20,22:.:-2.69:1.000:. ./.:4:88,176:.: 0.43:1.000:. ./.:4:102,149:.: 0.25:1.000:. ./.:4:95,122:.:-0.23:1.000:. ./.:4:103,189:.: 0.83:1.000:. ./.:4:96,120:.:-0.24:1.000:. ./.:4:88,190:.: 0.63:1.000:. ./.:4:116,142:.: 0.35:1.000:. ./.:4:97,71:.:-0.92:1.000:. ./.:4:95,122:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,150:.:-0.07:1.000:. ./.:4:127,165:.: 0.83:1.000:. ./.:4:69,159:.:-0.07:1.000:. ./.:4:105,202:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,114:.:-0.36:1.000:. ./.:4:88,112:.:-0.47:1.000:. ./.:4:108,44:.:-1.15:1.000:. ./.:4:82,198:.: 0.66:1.000:. ./.:4:87,134:.:-0.17:1.000:. ./.:4:75,122:.:-0.51:1.000:. ./.:4:96,136:.:-0.02:1.000:. ./.:4:102,221:.: 1.26:1.000:. ./.:4:93,155:.: 0.21:1.000:. ./.:4:98,106:.:-0.41:1.000:. ./.:4:114,139:.: 0.28:1.000:. ./.:4:113,100:.:-0.29:1.000:. ./.:4:105,179:.: 0.71:1.000:. ./.:4:101,110:.:-0.31:1.000:. ./.:4:100,120:.:-0.19:1.000:. ./.:4:95,215:.: 1.08:1.000:. ./.:4:127,137:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,136:.:-0.27:1.000:. ./.:4:88,105:.:-0.57:1.000:. -chr1.1 70030472 chr1.1_070030472 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:451,173:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,238:0.50:-0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:232,282:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:430,125:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:343,383:0.51: 1.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:292,370:0.54: 1.02:1.000:0.988 0/0/0/1:4:272,119:0.29:-1.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:264,285:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:523,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,52:0.15:-2.04:1.000:0.992 0/1/1/1:4:53,233:0.79:-2.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:352,140:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:243,294:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:446,139:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,283:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:415,157:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:418,149:0.24: 0.18:0.998:1.000 0/0/0/1:4:435,162:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:374,428:0.51: 2.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:444,179:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:155,47:0.22:-3.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:369,159:0.28:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:462,155:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,271:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,96:0.45:-3.02:1.000:0.980 0/0/0/1:4:441,135:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:401,147:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:391,137:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:657,2:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,380:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:475,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,115:0.25:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,37:0.21:-3.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,155:0.50:-2.19:1.000:0.997 0/0/0:3:88,12:0.11:-3.94:1.000:0.992 0/0/0/1:4:412,142:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:409,134:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:132,431:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:336,147:0.29:-0.56:1.000:0.994 0/1/1/1:4:121,453:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,285:0.47: 0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:289,311:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:434,189:0.28: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:245,291:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:464,189:0.27: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/0:4:643,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:468,178:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,156:0.49:-2.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:253,247:0.47:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:390,150:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:400,132:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:326,386:0.52: 1.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:402,147:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:336,325:0.47: 1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:290,299:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:486,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:233,252:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:480,165:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,296:0.53:-0.07:1.000:0.992 0/0/0/1/1/1:6:241,279:0.52:-0.23:1.000:0.875 0/0/1/1:4:307,293:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:250,264:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:318,377:0.52: 1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:266,289:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:571,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:421,156:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:375,130:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:268,282:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:496,0:0.00:-0.45:0.910:1.000 0/0/0/1:4:380,129:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:325,340:0.49: 1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:140,456:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:160,495:0.74: 0.96:1.000:0.998 0/0/1/1:4:323,322:0.48: 0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:244,297:0.53:-0.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:218,244:0.51:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:258,318:0.53: 0.26:1.000:0.992 0/0/0/1:4:447,173:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,333:0.60:-0.10:1.000:0.772 0/0/1/1:4:276,316:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:244,257:0.49:-0.40:0.920:0.996 0/0/1/1:4:344,365:0.49: 1.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:340,372:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:254,243:0.47:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:336,156:0.30:-0.48:1.000:0.986 0/0/1/1:4:302,324:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:234,255:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:384,136:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:364,134:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:374,134:0.25:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,246:0.49:-0.53:0.999:0.996 0/0/0/1:4:376,157:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:292,392:0.55: 1.21:1.000:0.977 0/0/0/0:4:393,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:625,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:550,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,275:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:243,266:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:325,374:0.51: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:434,155:0.25: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:269,304:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:470,182:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:325,113:0.24:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:493,169:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:372,137:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:409,130:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,279:0.54:-0.41:1.000:0.989 0/0/0/1:4:345,119:0.24:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:552,192:0.24: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:448,143:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:564,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:501,197:0.26: 1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:316,325:0.49: 0.84:0.999:0.996 0/0/0/1:4:430,164:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/1/1:3:112,239:0.66:-1.73:0.988:1.000 0/1/1/1:4:151,539:0.76: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:313,311:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:282,310:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/0:4:494,2:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:432,166:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:288,356:0.53: 0.86:1.000:0.991 0/0/0/1:4:394,146:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:417,155:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:397,142:0.25:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:567,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:656,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:402,340:0.44: 1.73:0.988:0.920 0/0/0/1:4:326,130:0.27:-0.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:203,218:0.50:-1.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,313:0.75:-1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:291,285:0.47: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:330,99:0.22:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:284,113:0.27:-1.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:432,174:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:372,125:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:326,402:0.53: 1.60:1.000:0.992 0/0/0/1:4:392,142:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:289,313:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:319,117:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:281,325:0.52: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:321,333:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:409,171:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:397,109:0.20:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:320,126:0.26:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:367,437:0.52: 2.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:430,433:0.48: 2.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:442,178:0.27: 0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:399,142:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,374:0.55: 0.96:1.000:0.979 0/0/0/1:4:386,136:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:318,326:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:336,168:0.31:-0.37:1.000:0.966 0/0/1/1:4:148,104:0.39:-2.60:1.000:0.726 0/0/0/1:4:306,124:0.27:-1.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:279,328:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:328,350:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:299,348:0.52: 0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:290,310:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,228:0.52:-1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:307,302:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/0/0/0:4:462,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:325,101:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,262:0.55:-0.74:1.000:0.984 0/0/0/1:4:376,139:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,247:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:262,316:0.53: 0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:234,238:0.48:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:396,141:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:371,130:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:292,276:0.47: 0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:240,233:0.47:-0.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:294,109:0.25:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:236,264:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:231,226:0.47:-0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:210,219:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:421,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:455,157:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,340:0.53: 0.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:267,287:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:262,241:0.46:-0.38:1.000:0.987 0/1/1/1:4:178,471:0.71: 0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:349,381:0.50: 1.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:532,211:0.27: 1.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:216,280:0.54:-0.45:1.000:0.985 0/0/1/1:4:257,291:0.51: 0.01:1.000:0.996 -chr1.1 70738276 chr1.1_070738276 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:156,161:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,150:0.53:-0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:150,184:0.55: 0.37:1.000:0.977 0/0/1/1:4:159,172:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:201,214:0.52: 1.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:330,128:0.28: 1.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,159:0.53: 0.00:1.000:0.993 0/0/0/0:4:360,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,185:0.53: 0.51:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,31:0.74:-2.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,32:0.41:-2.56:1.000:0.861 0/1/1/1:4:79,244:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:338,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,185:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,86:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,168:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:113,297:0.73: 1.24:0.998:0.997 0/1/1/1:4:108,256:0.70: 0.71:1.000:0.988 0/0/1/1:4:237,194:0.45: 1.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:236,200:0.46: 1.53:1.000:0.987 0/0/0/1:4:77,16:0.17:-2.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:174,153:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:266,109:0.29: 0.83:1.000:0.993 0/1/1/1:4:93,257:0.74: 0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,36:0.75:-2.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,206:0.54: 0.95:1.000:0.989 0/0/1/1:4:185,199:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/1/1/1:4:83,266:0.76: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,417:1.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,108:0.26: 1.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,308:0.79: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,162:0.49: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,40:0.72:-2.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,24:0.25:-2.38:1.000:0.999 0/1/1:3:23,23:0.50:-2.93:1.000:0.525 0/0/0/1:4:297,100:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:210,186:0.47: 1.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:260,96:0.27: 0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:69,244:0.78: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,118:0.28: 1.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,180:0.73:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:143,140:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,178:0.53: 0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:142,145:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,137:0.45: 0.05:1.000:0.978 0/0/1/1:4:146,155:0.52:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,181:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,246:0.81: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,197:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,80:0.28:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,105:0.48:-0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:106,319:0.75: 1.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,195:0.78:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,139:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,158:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,144:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,185:0.72:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,143:0.48:-0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,207:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:131,67:0.34:-1.19:1.000:0.919 0/0/0/1:4:191,63:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,130:0.47:-0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:155,145:0.48:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,190:0.78:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,284:0.75: 0.87:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,302:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,136:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,136:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,231:0.76: 0.02:0.910:1.000 0/1/1/1:4:69,202:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,241:0.72: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,154:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:219,81:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:97,281:0.74: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,141:0.49:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:231,2:0.01:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,116:0.46:-0.56:1.000:0.987 0/1/1/1:4:59,216:0.79:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,106:0.42:-0.59:1.000:0.927 0/1/1/1:4:65,230:0.78:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,112:0.51:-0.91:0.920:0.997 0/1/1/1:4:70,233:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,203:0.72:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,141:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,161:0.53: 0.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:208,58:0.21:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,143:0.75:-1.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,224:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,123:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,131:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:215,64:0.22:-0.26:0.999:1.000 0/0/1/1:4:110,124:0.53:-0.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:151,166:0.53: 0.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,171:0.73:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,215:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,189:0.74:-0.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,126:0.78:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,118:0.52:-0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:139,129:0.48:-0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:258,79:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,61:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,69:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,74:0.42:-1.46:1.000:0.932 0/0/1/1:4:112,95:0.46:-1.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:90,99:0.53:-1.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,140:0.51:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,130:0.53:-0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:183,195:0.52: 0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,206:0.53: 1.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:227,64:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,155:0.68:-0.83:1.000:0.948 0/0/1/1:4:218,235:0.52: 1.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,120:0.52:-0.80:0.999:0.995 0/0/0/1:4:220,75:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/1:3:111,63:0.36:-1.46:0.988:1.000 0/0/0/1:4:227,77:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,166:0.55:-0.01:1.000:0.977 0/0/0/1:4:197,61:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,187:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,135:0.53:-0.54:1.000:0.992 0/0/0/0:4:297,1:0.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,232:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,153:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,204:0.54: 0.86:1.000:0.986 0/0/1/1:4:120,128:0.52:-0.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,183:0.71:-0.50:1.000:0.992 0/0/0/1/1:5:195,130:0.40: 0.26:0.988:0.971 0/1/1/1:4:64,154:0.71:-0.96:1.000:0.990 0/0/1/1:4:101,98:0.49:-1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,46:0.25:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,131:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:192,192:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,127:0.78:-1.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,275:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,165:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:257,248:0.49: 2.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,204:0.55: 0.83:1.000:0.984 0/0/1/1:4:101,90:0.47:-1.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:172,48:0.21:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,104:0.53:-1.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,137:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,106:0.47:-0.86:1.000:0.991 0/0/0/1:4:248,67:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,103:0.54:-1.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:321,117:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:336,138:0.29: 1.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:172,184:0.52: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,135:0.46:-0.07:1.000:0.985 0/0/0/1:4:304,107:0.26: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,154:0.55:-0.26:1.000:0.976 0/0/1/1:4:266,245:0.48: 2.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:235,97:0.29: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,23:0.45:-2.87:1.000:0.981 0/0/1/1:4:134,139:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:96,332:0.78: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:377,1:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,348:0.79: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,305:0.79: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,151:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:328,112:0.25: 1.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,244:0.72: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:223,79:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,126:0.42:-0.06:1.000:0.928 0/0/1/1:4:179,163:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:99,325:0.77: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,196:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,252:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,244:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:172,146:0.46: 0.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:167,183:0.52: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,124:0.47:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:205,74:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:337,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,82:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:277,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,217:0.73:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:238,234:0.50: 1.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,174:0.47: 0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:276,96:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:283,42:0.13: 0.26:1.000:0.875 0/0/0/1:4:309,106:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:248,250:0.50: 2.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,220:0.53: 1.34:1.000:0.993 0/1/1/1:4:87,248:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,183:0.54: 0.43:1.000:0.988 -chr1.1 71071717 chr1.1_071071717 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:81,50:0.44: 1.52:1.000:0.968 0/0/1/1:4:42,35:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:83,16:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,51:0.56: 0.31:1.000:0.973 0/0/0/1:4:102,19:0.19: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,29:0.28: 1.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,5:0.29:-2.78:1.000:0.992 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,44:0.52: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,16:0.66:-2.63:1.000:0.846 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,50:0.65:-0.51:1.000:0.802 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,34:0.44:-0.08:1.000:0.960 0/0/0/1:4:78,25:0.29: 0.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,57:0.51: 1.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,57:0.50: 1.52:0.998:0.997 0/1/1/1:4:41,85:0.68: 1.33:1.000:0.962 0/0/0/1:4:99,25:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,45:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,6:0.26:-2.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,47:0.57:-0.16:1.000:0.934 0/0/0/1:4:82,24:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,34:0.46:-0.32:1.000:0.990 0/0/0/0:4:14,1:0.08:-3.02:1.000:0.982 0/0/1/1:4:66,35:0.40: 0.35:1.000:0.817 0/0/1/1:4:59,48:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,46:0.52: 0.27:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,1:0.01: 2.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,62:0.64: 0.35:1.000:0.644 0/0/1/1:4:57,39:0.47: 0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:17,5:0.28:-2.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,3:0.17:-2.74:1.000:0.998 0/0/1:3:16,4:0.25:-2.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,30:0.31: 0.90:1.000:0.969 0/0/1/1:4:64,46:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/0:4:124,1:0.01: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,50:0.48: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,41:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,23:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,45:0.43: 1.09:1.000:0.954 0/0/0/1:4:83,24:0.27: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,37:0.45: 0.11:1.000:0.978 0/0/1/1:4:61,62:0.55: 1.21:1.000:0.979 0/0/1/1:4:60,56:0.53: 0.93:1.000:0.990 0/0/0/1:4:47,14:0.28:-1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,37:0.44: 0.23:1.000:0.960 0/0/0/1:4:54,11:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,41:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,49:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,40:0.54:-0.40:1.000:0.988 0/0/0/1:4:101,30:0.28: 1.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,23:0.28: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,32:0.44:-0.36:1.000:0.973 0/0/1/1:4:52,26:0.39:-0.55:1.000:0.682 0/0/1/1:4:62,39:0.44: 0.35:1.000:0.974 0/0/1/1:4:54,41:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:79,16:0.21: 0.11:1.000:0.884 0/0/0/1:4:82,24:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,18:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,28:0.27: 1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,42:0.56:-0.40:1.000:0.971 0/0/1/1:4:51,69:0.61: 1.09:1.000:0.733 0/1/1/1:4:25,57:0.70:-0.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:29,17:0.43:-1.80:1.000:0.940 0/0/0/1:4:84,24:0.27: 0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,46:0.76:-1.26:0.910:1.000 0/1/1/1:4:37,79:0.69: 0.93:1.000:0.971 0/0/1/1:4:57,39:0.47: 0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:54,11:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,21:0.23: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,42:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,34:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,28:0.38:-0.20:1.000:0.531 0/0/1/1:4:46,34:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,17:0.17: 1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,42:0.43: 0.82:1.000:0.946 0/0/1/1:4:42,29:0.47:-0.83:0.920:0.992 0/0/1/1:4:55,40:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,39:0.46: 0.23:1.000:0.986 0/0/0/1:4:104,18:0.18: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,28:0.53:-1.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:89,21:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,26:0.47:-1.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:30,39:0.60:-0.90:1.000:0.803 0/0/1/1:4:56,36:0.45: 0.00:1.000:0.980 0/0/1/1:4:44,32:0.48:-0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:61,6:0.11:-0.98:0.999:0.518 0/0/1/1:4:47,50:0.56: 0.19:1.000:0.967 0/0/0/1:4:78,27:0.31: 0.50:1.000:0.975 0/1/1/1:4:18,51:0.73:-0.90:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,50:0.70:-0.79:1.000:0.984 0/1/1/1:4:33,52:0.63:-0.28:1.000:0.624 0/0/1/1:4:45,31:0.47:-0.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,33:0.45:-0.32:1.000:0.982 0/0/0/1:4:80,16:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,19:0.22: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,7:0.17:-1.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,14:0.20:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,33:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,39:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,40:0.53:-0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:53,37:0.47:-0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:77,17:0.22: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,41:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,52:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,17:0.19: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,62:0.72:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,64:0.53: 1.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:84,18:0.22: 0.39:0.999:1.000 0/0/0/1:4:79,26:0.30: 0.50:1.000:0.986 0/0/0:3:43,2:0.06:-1.84:0.988:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,10:0.23:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,13:0.21:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,43:0.68:-1.10:1.000:0.957 0/0/1/1:4:46,34:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/0:4:137,0:0.00: 1.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,42:0.64:-0.94:1.000:0.680 0/0/1/1:4:59,39:0.46: 0.23:1.000:0.986 0/0/1/1:4:66,48:0.48: 0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,34:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,50:0.67:-0.63:1.000:0.923 0/0/0/0/1:5:86,22:0.25: 0.62:0.988:0.920 0/1/1/1:4:20,49:0.71:-0.90:1.000:0.992 0/0/0/1:4:46,11:0.24:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,13:0.22:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,34:0.37: 0.58:1.000:0.527 0/0/1/1:4:30,30:0.55:-1.26:1.000:0.982 0/0/1/1:4:25,35:0.61:-1.26:1.000:0.661 0/0/1/1:4:49,33:0.46:-0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:86,28:0.30: 0.86:1.000:0.988 0/0/1/1:4:49,34:0.47:-0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:74,25:0.30: 0.27:1.000:0.981 0/0/0/1:4:59,15:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,20:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,16:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,36:0.53:-0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:74,19:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,27:0.47:-1.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:114,28:0.24: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,30:0.27: 1.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,51:0.48: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,46:0.45: 1.05:1.000:0.975 0/0/0/1:4:94,27:0.27: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,37:0.41: 0.54:1.000:0.836 0/0/0/1:4:111,24:0.22: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,20:0.25: 0.35:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:48,39:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,29:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,47:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,27:0.40:-0.51:1.000:0.774 0/0/0/1:4:66,18:0.26:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:86,27:0.29: 0.82:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,62:0.68: 0.00:1.000:0.961 0/0/0/1:4:56,20:0.32:-0.63:1.000:0.965 0/0/0/1:4:84,18:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,37:0.44: 0.23:1.000:0.960 0/0/1/1:4:36,22:0.44:-1.33:1.000:0.963 0/0/0/1:4:91,23:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,41:0.53:-0.24:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,57:0.65:-0.08:1.000:0.805 0/0/1/1:4:46,55:0.58: 0.35:1.000:0.903 0/0/0/1:4:70,13:0.19:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,22:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,9:0.14:-0.51:1.000:0.971 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,20:0.22: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,60:0.72:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,38:0.42: 0.50:1.000:0.911 0/0/0/1:4:89,20:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,22:0.27: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,20:0.20: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,20:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,52:0.43: 1.83:1.000:0.952 0/0/1/1:4:43,45:0.56:-0.16:1.000:0.972 0/0/1/1:4:59,42:0.48: 0.35:1.000:0.994 -chr1.1 71333915 chr1.1_071333915 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:10,19:0.63: 0.46:1.000:0.571 0/0/1/1:4:11,7:0.42:-0.60:1.000:0.928 0/1/1/1:4:3,28:0.89: 0.65:1.000:0.610 0/0/1/1:4:8,4:0.39:-1.18:1.000:0.679 0/0/1/1:4:11,14:0.54: 0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:4,10:0.68:-0.99:1.000:0.962 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-1.28:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,21:0.81: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,9:0.62:-0.99:1.000:0.576 0/1/1/1:4:15,59:0.76: 4.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.69:-0.60:1.000:0.975 0/0/0/1:4:18,6:0.34:-0.03:1.000:0.890 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,1:0.22:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.64: 0.26:0.998:0.699 0/0/1/1:4:13,6:0.38:-0.51:1.000:0.541 0/1/1/1:4:4,38:0.89: 1.71:1.000:0.555 0/0/1/1:4:9,11:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/1/1/1:4:5,42:0.87: 2.20:1.000:0.857 0/1/1/1:4:2,15:0.86:-0.70:1.000:0.962 0/1/1/1:4:4,25:0.84: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,15:0.80:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,18:0.62: 0.36:1.000:0.576 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,13:0.73:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,20:0.64: 0.55:1.000:0.699 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,13:0.78:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,5:0.39:-0.89:1.000:0.679 0/1/1/1:4:2,12:0.83:-0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:7,1:0.26:-1.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,12:0.64:-0.60:1.000:0.699 1/1/1:3:0,2:1.00:-2.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,27:0.82: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,16:0.81:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,23:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,23:0.62: 1.13:1.000:0.621 0/1/1/1:4:4,18:0.79:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.45:-0.12:1.000:0.982 0/1/1/1:4:10,32:0.73: 1.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,10:0.57:-0.70:1.000:0.946 0/0/1/1:4:12,19:0.59: 0.65:1.000:0.848 0/1/1/1:4:9,29:0.73: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,26:0.56: 2.00:1.000:0.966 0/1/1/1:4:8,16:0.64:-0.03:1.000:0.699 0/1/1/1:4:18,35:0.64: 2.78:1.000:0.631 0/0/1/1:4:8,9:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,30:0.49: 3.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,20:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.46: 0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:10,17:0.61: 0.26:1.000:0.717 0/1/1/1:4:14,27:0.63: 1.62:1.000:0.610 0/0/1/1:4:11,8:0.44:-0.51:1.000:0.973 0/0/1/1:4:25,29:0.52: 2.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,6:0.38:-0.51:1.000:0.541 0/0/1/1:4:29,15:0.39: 1.91:1.000:0.731 0/0/1/1:4:9,15:0.60:-0.03:1.000:0.760 0/1/1/1/1/1:6:3,17:0.82:-0.41:1.000:0.977 0/1/1/1:4:3,18:0.83:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,16:0.56: 0.36:1.000:0.974 0/0/1/1:4:20,36:0.62: 3.07:1.000:0.576 0/1/1/1:4:10,24:0.68: 0.94:1.000:0.943 0/0/1/1:4:11,8:0.44:-0.51:1.000:0.973 0/0/1/1:4:16,14:0.47: 0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:7,7:0.49:-0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,22:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,10:0.40: 0.36:0.910:0.822 0/0/1/1:4:12,9:0.45:-0.31:1.000:0.979 0/0/1/1:4:11,20:0.62: 0.65:1.000:0.549 0/1/1/1:4:3,15:0.80:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,23:0.52: 1.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,15:0.86:-0.70:1.000:0.962 0/0/1/1:4:20,11:0.40: 0.65:1.000:0.811 0/1/1/1:4:7,26:0.75: 0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,27:0.72: 1.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,27:0.79: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,28:0.70: 1.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:15,9:0.42:-0.03:1.000:0.892 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.60:0.920:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.45: 0.36:1.000:0.979 0/0/1/1:4:16,15:0.48: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,17:0.71:-0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:24,16:0.43: 1.52:1.000:0.949 0/1/1/1:4:10,29:0.71: 1.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:15,6:0.36:-0.31:1.000:0.701 0/0/0/1:4:9,4:0.37:-1.09:1.000:0.526 0/0/1/1:4:14,11:0.46: 0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:14,11:0.46: 0.07:1.000:0.985 0/1/1/1:4:8,18:0.66: 0.17:0.999:0.893 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-0.99:1.000:0.979 0/1/1/1:4:10,29:0.71: 1.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:8,3:0.35:-1.28:1.000:0.785 0/0/1/1:4:11,7:0.42:-0.60:1.000:0.928 0/0/1/1:4:14,19:0.56: 0.84:1.000:0.968 0/1/1/1:4:6,23:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.34:-0.12:1.000:0.847 0/1/1/1:4:8,33:0.77: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.55:-0.12:1.000:0.980 0/1/1/1:4:3,22:0.86: 0.07:1.000:0.971 0/1/1/1:4:5,22:0.78: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,14:0.67:-0.41:1.000:0.925 0/1/1/1:4:5,20:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,10:0.35: 1.13:1.000:0.754 0/0/1/1:4:11,11:0.49:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,20:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,14:0.79:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,16:0.57: 0.26:1.000:0.934 0/1/1/1:4:8,27:0.74: 1.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,11:0.49:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,8:0.43:-0.41:1.000:0.949 0/1/1/1:4:8,20:0.68: 0.36:0.999:0.962 0/0/1/1:4:12,13:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/1/1:3:8,14:0.61:-0.22:0.988:1.000 0/1/1/1:4:14,30:0.65: 1.91:1.000:0.831 0/1/1/1:4:9,19:0.65: 0.36:1.000:0.807 0/1/1/1:4:6,14:0.67:-0.41:1.000:0.925 0/0/1/1:4:11,14:0.54: 0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:7,21:0.72: 0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,21:0.77: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.89:1.000:0.993 0/1/1/1:4:5,13:0.69:-0.60:1.000:0.975 0/0/1/1:4:8,9:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,11:0.46: 0.07:1.000:0.985 0/1/1/1/1:5:5,23:0.79: 0.36:0.988:0.992 0/0/0/1:4:20,6:0.32: 0.17:1.000:0.941 0/1/1/1:4:5,24:0.80: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,23:0.91: 0.07:1.000:0.901 0/0/1/1:4:12,20:0.60: 0.75:1.000:0.760 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,9:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,9:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,10:0.73:-1.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:7,20:0.71: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:12,4:0.34:-0.80:1.000:0.890 0/0/1/1:4:11,14:0.54: 0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:4,35:0.88: 1.42:1.000:0.781 1/1/1/1:4:2,24:0.91: 0.17:1.000:0.940 0/1/1/1:4:5,20:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.56:-0.51:1.000:0.964 0/0/1/1:4:9,10:0.51:-0.51:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,19:0.94:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,14:0.74:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,19:0.70: 0.17:1.000:0.984 0/1/1/1:4:3,15:0.80:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.53:-1.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,16:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,21:0.69: 0.46:1.000:0.977 0/1/1/1:4:3,22:0.86: 0.07:1.000:0.971 0/1/1/1:4:6,14:0.67:-0.41:1.000:0.925 0/1/1/1:4:8,18:0.66: 0.17:1.000:0.893 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,10:0.68:-0.99:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,13:0.69:-0.60:1.000:0.975 0/1/1/1:4:3,23:0.86: 0.17:1.000:0.951 0/1/1/1:4:2,12:0.83:-0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:9,3:0.34:-1.18:1.000:0.890 0/0/0/1:4:7,2:0.32:-1.47:1.000:0.956 0/0/1/1:4:7,11:0.59:-0.60:1.000:0.858 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-1.47:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.89:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,16:0.70:-0.22:1.000:0.981 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-1.18:1.000:0.969 0/0/1/1:4:7,9:0.55:-0.80:1.000:0.982 0/1/1/1:4:2,18:0.88:-0.41:1.000:0.713 0/0/1/1:4:6,10:0.60:-0.80:1.000:0.760 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,12:0.76:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,28:0.96: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,14:0.79:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,23:0.69: 0.75:1.000:0.970 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,5:0.60:-1.57:1.000:0.760 0/1/1/1:4:8,24:0.72: 0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,15:0.86:-0.70:1.000:0.962 0/1/1/1:4:6,22:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,24:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,16:0.56: 0.36:1.000:0.974 0/0/1/1:4:5,9:0.62:-0.99:1.000:0.576 0/1/1/1:4:5,11:0.66:-0.80:1.000:0.867 0/0/1/1:4:14,7:0.39:-0.31:1.000:0.679 -chr1.1 71537340 chr1.1_071537340 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:63,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:92,36:.: 2.06:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:80,21:.: 0.98:0.998:. ./.:4:78,24:.: 1.02:1.000:. ./.:4:93,18:.: 1.38:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:66,19:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:120,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:83,22:.: 1.14:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:78,21:.: 0.90:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.90:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,17:.: 0.02:1.000:. ./.:4:70,16:.: 0.38:1.000:. ./.:4:72,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:67,19:.: 0.38:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:20,7:.:-1.98:1.000:. ./.:4:65,15:.: 0.14:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:80,28:.: 1.26:1.000:. ./.:4:51,8:.:-0.70:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.38:1.000:. ./.:4:55,20:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:61,16:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.26:1.000:. ./.:6:46,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,21:.: 0.02:1.000:. ./.:4:45,27:.:-0.18:1.000:. ./.:4:50,14:.:-0.50:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:55,25:.: 0.14:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:65,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.58:0.910:. ./.:4:101,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:65,7:.:-0.18:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.94:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:88,19:.: 1.22:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:52,15:.:-0.38:1.000:. ./.:4:43,14:.:-0.78:1.000:. ./.:4:38,15:.:-0.94:1.000:. ./.:4:51,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.94:0.920:. ./.:4:66,19:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,17:.:-0.06:1.000:. ./.:4:81,18:.: 0.90:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:45,7:.:-0.98:1.000:. ./.:4:42,15:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:60,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:50,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,20:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.14:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:59,15:.:-0.10:0.999:. ./.:4:70,0:.:-0.26:1.000:. ./.:3:26,8:.:-1.70:0.988:. ./.:4:51,15:.:-0.42:1.000:. ./.:4:47,13:.:-0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:31,17:.:-1.14:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.34:1.000:. ./.:5:72,13:.: 0.34:0.988:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:33,6:.:-1.50:1.000:. ./.:4:51,9:.:-0.66:1.000:. ./.:4:55,15:.:-0.26:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:44,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:47,9:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:72,24:.: 0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.90:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.26:1.000:. ./.:4:56,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:111,2:.: 1.46:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:76,25:.: 0.98:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:102,23:.: 1.94:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:77,43:.: 1.74:1.000:. ./.:4:65,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:79,19:.: 0.86:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:56,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,16:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,20:.: 0.78:1.000:. ./.:4:54,15:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:68,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.22:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:61,17:.: 0.06:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:67,24:.: 0.58:1.000:. ./.:4:85,29:.: 1.50:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,17:.: 0.34:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.98:1.000:. -chr1.1 71659392 chr1.1_071659392 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:1,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 2.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:8,1:.: 2.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:0,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:1,0:.:-1.39:0.988:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.60:1.000:. -chr1.1 71902779 chr1.1_071902779 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:145,220:.: 0.34:1.000:. ./.:4:186,169:.: 0.25:1.000:. ./.:4:172,204:.: 0.43:1.000:. ./.:4:176,240:.: 0.79:1.000:. ./.:4:212,270:.: 1.37:1.000:. ./.:4:217,300:.: 1.68:1.000:. ./.:4:151,168:.:-0.07:1.000:. ./.:4:220,181:.: 0.65:1.000:. ./.:4:214,174:.: 0.54:1.000:. ./.:4:9,10:.:-2.71:1.000:. ./.:4:13,23:.:-2.56:1.000:. ./.:4:200,180:.: 0.47:1.000:. ./.:4:227,211:.: 0.98:1.000:. ./.:4:214,274:.: 1.42:1.000:. ./.:4:157,215:.: 0.40:1.000:. ./.:4:207,284:.: 1.45:1.000:. ./.:4:199,245:.: 1.03:0.998:. ./.:4:203,214:.: 0.80:1.000:. ./.:4:237,289:.: 1.75:1.000:. ./.:4:223,308:.: 1.80:1.000:. ./.:4:14,11:.:-2.66:1.000:. ./.:4:154,212:.: 0.35:1.000:. ./.:4:291,184:.: 1.31:1.000:. ./.:4:122,285:.: 0.71:1.000:. ./.:4:3,11:.:-2.75:1.000:. ./.:4:202,255:.: 1.15:1.000:. ./.:4:217,264:.: 1.36:1.000:. ./.:4:149,172:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,343:.: 1.36:1.000:. ./.:4:177,252:.: 0.90:1.000:. ./.:4:215,289:.: 1.56:1.000:. ./.:4:169,211:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,6:.:-2.73:1.000:. ./.:4:5,14:.:-2.71:1.000:. ./.:3:11,8:.:-2.71:1.000:. ./.:4:209,178:.: 0.53:1.000:. ./.:4:181,244:.: 0.87:1.000:. ./.:4:182,248:.: 0.91:1.000:. ./.:4:176,196:.: 0.40:1.000:. ./.:4:191,236:.: 0.88:1.000:. ./.:4:84,199:.:-0.38:1.000:. ./.:4:141,153:.:-0.29:1.000:. ./.:4:169,183:.: 0.22:1.000:. ./.:4:102,122:.:-0.90:1.000:. ./.:4:135,172:.:-0.17:1.000:. ./.:4:191,115:.:-0.18:1.000:. ./.:4:218,273:.: 1.45:1.000:. ./.:4:23,48:.:-2.25:1.000:. ./.:4:74,171:.:-0.72:1.000:. ./.:4:147,90:.:-0.79:1.000:. ./.:4:84,119:.:-1.09:1.000:. ./.:4:116,258:.: 0.42:1.000:. ./.:4:60,183:.:-0.74:1.000:. ./.:4:141,146:.:-0.35:1.000:. ./.:4:136,168:.:-0.20:1.000:. ./.:4:219,109:.: 0.01:1.000:. ./.:4:95,230:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,152:.:-0.48:1.000:. ./.:4:72,139:.:-1.02:1.000:. ./.:6:85,106:.:-1.19:1.000:. ./.:4:138,163:.:-0.23:1.000:. ./.:4:141,175:.:-0.09:1.000:. ./.:4:111,142:.:-0.65:1.000:. ./.:4:84,188:.:-0.48:1.000:. ./.:4:182,223:.: 0.69:1.000:. ./.:4:100,198:.:-0.25:1.000:. ./.:4:138,167:.:-0.19:1.000:. ./.:4:138,164:.:-0.22:1.000:. ./.:4:125,150:.:-0.46:0.910:. ./.:4:174,132:.:-0.18:1.000:. ./.:4:102,252:.: 0.24:1.000:. ./.:4:90,199:.:-0.33:1.000:. ./.:4:176,127:.:-0.21:1.000:. ./.:4:105,270:.: 0.43:1.000:. ./.:4:186,94:.:-0.41:1.000:. ./.:4:163,94:.:-0.61:1.000:. ./.:4:120,120:.:-0.76:1.000:. ./.:4:128,143:.:-0.49:1.000:. ./.:4:115,162:.:-0.44:1.000:. ./.:4:101,235:.: 0.08:1.000:. ./.:4:140,89:.:-0.86:0.920:. ./.:4:77,202:.:-0.42:1.000:. ./.:4:94,204:.:-0.25:1.000:. ./.:4:131,134:.:-0.54:1.000:. ./.:4:154,143:.:-0.26:1.000:. ./.:4:151,203:.: 0.24:1.000:. ./.:4:68,148:.:-0.97:1.000:. ./.:4:74,148:.:-0.92:1.000:. ./.:4:111,160:.:-0.49:1.000:. ./.:4:133,178:.:-0.14:1.000:. ./.:4:129,170:.:-0.24:0.999:. ./.:4:120,145:.:-0.54:1.000:. ./.:4:151,161:.:-0.13:1.000:. ./.:4:121,145:.:-0.53:1.000:. ./.:4:154,192:.: 0.17:1.000:. ./.:4:155,140:.:-0.28:1.000:. ./.:4:49,147:.:-1.15:1.000:. ./.:4:131,104:.:-0.81:1.000:. ./.:4:119,150:.:-0.51:1.000:. ./.:4:199,144:.: 0.14:1.000:. ./.:4:81,120:.:-1.11:1.000:. ./.:4:182,120:.:-0.22:1.000:. ./.:4:97,125:.:-0.92:1.000:. ./.:4:134,178:.:-0.13:1.000:. ./.:4:95,119:.:-0.99:1.000:. ./.:4:136,168:.:-0.20:1.000:. ./.:4:93,132:.:-0.90:1.000:. ./.:4:211,278:.: 1.43:1.000:. ./.:4:223,263:.: 1.40:1.000:. ./.:4:189,139:.: 0.01:1.000:. ./.:4:122,137:.:-0.60:1.000:. ./.:4:240,319:.: 2.05:1.000:. ./.:4:94,139:.:-0.83:0.999:. ./.:4:199,141:.: 0.12:1.000:. ./.:3:76,81:.:-1.49:0.988:. ./.:4:188,195:.: 0.50:1.000:. ./.:4:102,144:.:-0.71:1.000:. ./.:4:120,126:.:-0.71:1.000:. ./.:4:122,165:.:-0.35:1.000:. ./.:4:115,141:.:-0.62:1.000:. ./.:4:181,152:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,143:.:-0.89:1.000:. ./.:4:168,185:.: 0.23:1.000:. ./.:4:181,284:.: 1.22:1.000:. ./.:4:166,115:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,172:.:-0.08:1.000:. ./.:5:159,152:.:-0.14:0.988:. ./.:4:138,99:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,105:.:-1.22:1.000:. ./.:4:86,99:.:-1.25:1.000:. ./.:4:93,111:.:-1.08:1.000:. ./.:4:173,220:.: 0.58:1.000:. ./.:4:86,105:.:-1.19:1.000:. ./.:4:74,159:.:-0.83:1.000:. ./.:4:116,172:.:-0.34:1.000:. ./.:4:208,263:.: 1.27:1.000:. ./.:4:158,196:.: 0.24:1.000:. ./.:4:115,124:.:-0.77:1.000:. ./.:4:131,109:.:-0.76:1.000:. ./.:4:117,138:.:-0.63:1.000:. ./.:4:109,171:.:-0.41:1.000:. ./.:4:110,146:.:-0.62:1.000:. ./.:4:196,153:.: 0.20:1.000:. ./.:4:83,109:.:-1.19:1.000:. ./.:4:213,276:.: 1.43:1.000:. ./.:4:188,272:.: 1.17:1.000:. ./.:4:175,231:.: 0.70:1.000:. ./.:4:143,204:.: 0.18:1.000:. ./.:4:202,278:.: 1.35:1.000:. ./.:4:110,197:.:-0.17:1.000:. ./.:4:231,305:.: 1.84:1.000:. ./.:4:211,185:.: 0.61:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.75:1.000:. ./.:4:148,186:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,300:.: 0.81:1.000:. ./.:4:259,188:.: 1.06:1.000:. ./.:4:146,331:.: 1.32:1.000:. ./.:4:143,311:.: 1.12:1.000:. ./.:4:120,162:.:-0.39:1.000:. ./.:4:195,228:.: 0.85:1.000:. ./.:4:159,235:.: 0.59:1.000:. ./.:4:176,132:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,201:.: 0.49:1.000:. ./.:4:174,225:.: 0.64:1.000:. ./.:4:156,296:.: 1.10:1.000:. ./.:4:183,224:.: 0.71:1.000:. ./.:4:114,279:.: 0.58:1.000:. ./.:4:182,146:.: 0.01:1.000:. ./.:4:154,196:.: 0.21:1.000:. ./.:4:136,204:.: 0.12:1.000:. ./.:4:145,160:.:-0.19:1.000:. ./.:4:177,146:.:-0.03:1.000:. ./.:4:194,155:.: 0.20:1.000:. ./.:4:141,173:.:-0.11:1.000:. ./.:4:230,159:.: 0.55:1.000:. ./.:4:140,200:.: 0.12:1.000:. ./.:4:245,345:.: 2.32:1.000:. ./.:4:229,264:.: 1.46:1.000:. ./.:4:189,259:.: 1.07:1.000:. ./.:4:202,158:.: 0.29:1.000:. ./.:4:219,240:.: 1.16:1.000:. ./.:4:244,275:.: 1.69:1.000:. ./.:4:226,308:.: 1.83:1.000:. ./.:4:109,259:.: 0.36:1.000:. ./.:4:238,169:.: 0.71:1.000:. -chr1.1 72105213 chr1.1_072105213 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:272,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:149,64:.:-0.18:1.000:. ./.:4:208,71:.: 0.83:1.000:. ./.:4:218,74:.: 1.02:1.000:. ./.:4:135,150:.: 0.92:1.000:. ./.:4:247,91:.: 1.72:1.000:. ./.:4:102,41:.:-1.24:1.000:. ./.:4:197,80:.: 0.80:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:8,19:.:-3.01:1.000:. ./.:4:176,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:201,57:.: 0.51:1.000:. ./.:4:203,71:.: 0.75:1.000:. ./.:4:195,75:.: 0.69:1.000:. ./.:4:210,84:.: 1.05:1.000:. ./.:4:228,79:.: 1.25:0.998:. ./.:4:301,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:233,75:.: 1.27:1.000:. ./.:4:218,73:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:173,55:.: 0.05:1.000:. ./.:4:11,2:.:-3.22:1.000:. ./.:4:188,83:.: 0.70:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:194,82:.: 0.78:1.000:. ./.:4:291,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:130,144:.: 0.75:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,1:.:-3.28:1.000:. ./.:4:17,2:.:-3.13:1.000:. ./.:3:9,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:151,137:.: 0.96:1.000:. ./.:4:154,48:.:-0.34:1.000:. ./.:4:131,146:.: 0.80:1.000:. ./.:4:103,95:.:-0.41:1.000:. ./.:4:164,56:.:-0.07:1.000:. ./.:4:186,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:94,105:.:-0.39:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:159,52:.:-0.21:1.000:. ./.:4:93,89:.:-0.65:1.000:. ./.:4:144,48:.:-0.50:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:158,146:.: 1.21:1.000:. ./.:4:171,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:138,134:.: 0.72:1.000:. ./.:4:127,132:.: 0.52:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:118,103:.:-0.06:1.000:. ./.:4:155,45:.:-0.38:1.000:. ./.:4:106,118:.:-0.01:1.000:. ./.:6:121,36:.:-1.03:1.000:. ./.:4:159,78:.: 0.19:1.000:. ./.:4:134,124:.: 0.51:1.000:. ./.:4:104,96:.:-0.38:1.000:. ./.:4:124,34:.:-1.01:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:163,65:.: 0.05:1.000:. ./.:4:95,35:.:-1.44:1.000:. ./.:4:207,70:.: 0.80:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.34:0.910:. ./.:4:227,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:172,60:.: 0.11:1.000:. ./.:4:37,56:.:-2.00:1.000:. ./.:4:142,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:208,64:.: 0.72:1.000:. ./.:4:169,56:.: 0.01:1.000:. ./.:4:137,55:.:-0.50:1.000:. ./.:4:158,59:.:-0.12:1.000:. ./.:4:192,63:.: 0.46:1.000:. ./.:4:105,88:.:-0.48:1.000:. ./.:4:101,143:.: 0.29:1.000:. ./.:4:84,103:.:-0.57:0.920:. ./.:4:89,147:.: 0.17:1.000:. ./.:4:126,139:.: 0.61:1.000:. ./.:4:131,55:.:-0.59:1.000:. ./.:4:160,60:.:-0.07:1.000:. ./.:4:201,52:.: 0.43:1.000:. ./.:4:89,91:.:-0.68:1.000:. ./.:4:128,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:120,46:.:-0.89:1.000:. ./.:4:165,59:.:-0.01:1.000:. ./.:4:122,44:.:-0.89:0.999:. ./.:4:151,52:.:-0.33:1.000:. ./.:4:176,77:.: 0.43:1.000:. ./.:4:180,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:120,51:.:-0.82:1.000:. ./.:4:142,34:.:-0.74:1.000:. ./.:4:153,75:.: 0.05:1.000:. ./.:4:192,66:.: 0.51:1.000:. ./.:4:86,33:.:-1.61:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:101,50:.:-1.12:1.000:. ./.:4:156,58:.:-0.16:1.000:. ./.:4:133,55:.:-0.56:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:205,78:.: 0.89:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:206,73:.: 0.83:1.000:. ./.:4:115,98:.:-0.18:0.999:. ./.:4:200,70:.: 0.69:1.000:. ./.:3:59,106:.:-0.91:0.988:. ./.:4:117,120:.: 0.19:1.000:. ./.:4:98,48:.:-1.20:1.000:. ./.:4:117,39:.:-1.04:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:191,60:.: 0.40:1.000:. ./.:4:108,58:.:-0.89:1.000:. ./.:4:201,64:.: 0.61:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.17:1.000:. ./.:5:201,50:.: 0.40:0.988:. ./.:4:192,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:117,42:.:-1.00:1.000:. ./.:4:87,96:.:-0.63:1.000:. ./.:4:89,94:.:-0.63:1.000:. ./.:4:206,77:.: 0.89:1.000:. ./.:4:92,32:.:-1.53:1.000:. ./.:4:193,60:.: 0.43:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:221,86:.: 1.25:1.000:. ./.:4:211,75:.: 0.93:1.000:. ./.:4:87,98:.:-0.60:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:144,44:.:-0.56:1.000:. ./.:4:141,60:.:-0.36:1.000:. ./.:4:147,53:.:-0.38:1.000:. ./.:4:162,70:.: 0.11:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:221,95:.: 1.39:1.000:. ./.:4:224,83:.: 1.25:1.000:. ./.:4:262,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:200,70:.: 0.69:1.000:. ./.:4:234,74:.: 1.27:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:215,99:.: 1.36:1.000:. ./.:4:191,76:.: 0.64:1.000:. ./.:4:17,6:.:-3.07:1.000:. ./.:4:173,64:.: 0.19:1.000:. ./.:4:132,104:.: 0.17:1.000:. ./.:4:193,69:.: 0.57:1.000:. ./.:4:196,84:.: 0.84:1.000:. ./.:4:172,72:.: 0.29:1.000:. ./.:4:182,71:.: 0.43:1.000:. ./.:4:189,64:.: 0.43:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:156,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:119,120:.: 0.22:1.000:. ./.:4:201,97:.: 1.12:1.000:. ./.:4:159,186:.: 1.83:1.000:. ./.:4:109,138:.: 0.34:1.000:. ./.:4:108,99:.:-0.27:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:133,130:.: 0.58:1.000:. ./.:4:171,76:.: 0.34:1.000:. ./.:4:231,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:180,61:.: 0.25:1.000:. ./.:4:187,60:.: 0.34:1.000:. ./.:4:140,46:.:-0.59:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:231,75:.: 1.24:1.000:. ./.:4:180,50:.: 0.08:1.000:. ./.:4:198,63:.: 0.55:1.000:. ./.:4:196,51:.: 0.34:1.000:. ./.:4:143,149:.: 1.02:1.000:. ./.:4:146,182:.: 1.57:1.000:. ./.:4:231,104:.: 1.68:1.000:. ./.:4:151,62:.:-0.18:1.000:. ./.:4:172,73:.: 0.31:1.000:. -chr1.1 72294346 chr1.1_072294346 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.51: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,19:0.77: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,13:0.68: 0.15:1.000:0.942 0/0/0/1:4:18,8:0.35: 1.12:1.000:0.749 0/1/1/1:4:6,18:0.73: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,5:0.49:-0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,26:0.65: 3.05:1.000:0.776 0/1/1/1:4:4,20:0.81: 0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.48: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,8:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,20:0.85: 0.70:1.000:0.981 0/1/1/1:4:7,14:0.66: 0.43:1.000:0.879 0/0/1/1:4:9,5:0.40:-0.54:1.000:0.789 0/0/0/1:4:14,4:0.28: 0.01:0.998:0.996 0/1/1/1:4:3,16:0.82: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,17:0.40: 4.16:1.000:0.764 0/0/1/1:4:10,15:0.61: 0.98:1.000:0.716 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,15:0.81: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.59: 0.15:1.000:0.859 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:17,11:0.43: 1.40:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,20:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,5:0.38:-0.40:1.000:0.543 0/1/1/1:4:3,15:0.81: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.53: 0.84:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,7:0.69:-1.09:1.000:0.971 0/0/1/1:4:4,6:0.61:-1.09:1.000:0.716 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.30:-1.37:1.000:0.984 1/1/1:3:0,3:1.00:-2.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,14:0.93:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,12:0.56: 0.57:1.000:0.961 0/0/1/1:4:7,9:0.58:-0.26:1.000:0.924 0/0/1/1:4:8,11:0.59: 0.15:1.000:0.859 0/0/0/0:4:17,1:0.07: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,10:0.45: 0.84:1.000:0.984 0/0/1/1:4:9,8:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,12:0.47: 1.40:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,8:0.66:-0.82:1.000:0.879 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,10:0.63:-0.26:1.000:0.537 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-1.23:1.000:0.879 0/0/0/1:4:17,7:0.34: 0.84:1.000:0.870 0/0/1/1:4:11,6:0.40:-0.13:1.000:0.753 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.34: 1.26:1.000:0.841 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,5:0.28: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,9:0.45: 0.57:1.000:0.977 0/1/1/1:4:3,11:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,8:0.33: 1.40:1.000:0.901 0/0/1/1:4:14,8:0.41: 0.57:1.000:0.836 0/1/1/1:4:8,17:0.67: 0.98:1.000:0.930 0/0/0/1/1/1:6:8,7:0.50:-0.40:1.000:0.889 0/1/1/1:4:5,9:0.64:-0.54:1.000:0.716 0/0/0/1:4:11,3:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,8:0.32: 1.67:1.000:0.961 0/0/0/1:4:13,4:0.29:-0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,6:0.38: 0.01:1.000:0.543 0/0/1/1:4:6,5:0.49:-0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,9:0.61:-0.40:1.000:0.716 0/1/1/1:4:4,9:0.68:-0.68:0.910:0.959 1/1/1/1:4:1,11:0.91:-0.82:1.000:0.917 0/0/1/1:4:9,12:0.58: 0.43:1.000:0.893 0/0/1/1:4:11,6:0.40:-0.13:1.000:0.753 0/0/1/1:4:11,10:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,9:0.73:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,6:0.53:-0.82:1.000:0.993 0/1/1/1:4:5,10:0.66:-0.40:1.000:0.879 0/0/1/1:4:13,8:0.42: 0.43:1.000:0.920 0/0/1/1:4:9,6:0.44:-0.40:1.000:0.965 0/0/0/1:4:20,6:0.28: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,6:0.28: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.82:0.920:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.37: 0.98:1.000:0.618 0/0/0/1:4:16,3:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.85:-0.40:1.000:0.986 0/0/1/1:4:8,6:0.47:-0.54:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,11:0.59: 0.15:1.000:0.859 0/0/0/1:4:10,3:0.28:-0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,6:0.56:-0.96:1.000:0.961 0/0/1/1:4:10,11:0.55: 0.43:1.000:0.983 0/0/0/1:4:16,4:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,4:0.48:-1.23:0.999:0.995 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,9:0.45: 0.57:1.000:0.977 0/1/1/1:4:2,9:0.80:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,9:0.61:-0.40:1.000:0.716 0/1/1/1:4:4,10:0.70:-0.54:1.000:0.985 0/1/1/1:4:4,8:0.66:-0.82:1.000:0.879 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-1.23:1.000:0.879 0/0/1/1:4:3,4:0.58:-1.51:1.000:0.893 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,3:0.47:-1.51:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,13:0.85:-0.40:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,7:0.64:-0.96:1.000:0.655 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-0.26:1.000:0.950 0/1/1/1:4:6,10:0.63:-0.26:1.000:0.537 0/1/1/1:4:5,20:0.78: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,13:0.68: 0.15:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.74:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,14:0.54: 1.26:1.000:0.986 0/0/0/1:4:17,3:0.19: 0.29:0.999:1.000 0/1/1/1:4:6,13:0.68: 0.15:1.000:0.942 0/0/1:3:7,2:0.28:-1.23:0.988:1.000 0/0/1/1:4:8,10:0.57: 0.01:1.000:0.942 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,10:0.57: 0.01:1.000:0.942 0/1/1/1:4:3,16:0.82: 0.15:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,14:0.80:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,11:0.55: 0.43:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,38:1.00: 2.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:8,13:0.62: 0.43:0.988:0.962 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-1.65:1.000:0.543 0/0/1/1:4:5,8:0.62:-0.68:1.000:0.567 0/0/1/1:4:8,9:0.55:-0.13:1.000:0.979 0/0/1/1:4:14,12:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,12:0.54: 0.70:1.000:0.985 0/0/1/1:4:4,4:0.53:-1.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,5:0.42:-0.68:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,15:0.67: 0.57:1.000:0.936 0/0/1/1:4:4,6:0.61:-1.09:1.000:0.716 0/0/1/1:4:10,8:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,6:0.84:-1.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,5:0.38:-0.40:1.000:0.543 0/1/1/1:4:3,5:0.63:-1.37:1.000:0.537 0/0/1/1:4:8,10:0.57: 0.01:1.000:0.942 0/0/1/1:4:8,5:0.42:-0.68:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,17:0.67: 0.98:1.000:0.930 0/1/1/1:4:8,15:0.65: 0.70:1.000:0.792 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.35:-0.68:1.000:0.749 0/1/1/1:4:4,12:0.73:-0.26:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,15:0.65: 0.70:1.000:0.792 0/1/1/1:4:4,23:0.83: 1.26:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,6:0.25: 1.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,13:0.71: 0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,7:0.41: 0.15:1.000:0.864 0/0/1/1:4:9,10:0.55: 0.15:1.000:0.982 0/1/1/1:4:4,16:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,17:0.67: 0.98:1.000:0.930 0/1/1/1:4:5,18:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.41: 0.15:1.000:0.864 0/0/0/1:4:23,4:0.19: 1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,18:0.70: 0.98:1.000:0.989 0/0/0/1:4:13,2:0.17:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,14:0.50: 1.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,9:0.37: 1.40:1.000:0.602 0/0/1/1:4:7,10:0.60:-0.13:1.000:0.805 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.40:-0.13:1.000:0.753 1/1/1/1:4:1,16:0.93:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,8:0.78:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,17:0.88: 0.15:1.000:0.703 0/1/1/1:4:5,12:0.69:-0.13:1.000:0.978 0/1/1/1:4:5,18:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,12:0.84:-0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,14:0.50: 1.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,22:0.65: 2.22:1.000:0.752 0/1/1/1:4:7,19:0.71: 1.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,13:0.62: 0.43:1.000:0.528 0/0/0/1:4:21,10:0.37: 1.81:1.000:0.588 0/0/1/1:4:13,12:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,17:0.60: 1.53:1.000:0.818 0/0/1/1:4:13,16:0.57: 1.53:1.000:0.950 0/0/0/1:4:19,8:0.34: 1.26:1.000:0.841 -chr1.1 72564623 chr1.1_072564623 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:31,41:0.54:-0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,24:0.49:-0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,40:0.60:-0.58:1.000:0.769 0/0/1/1:4:24,39:0.58:-0.52:1.000:0.932 0/0/1/1:4:35,45:0.53:-0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,23:0.53:-1.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:19,7:0.29:-1.60:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,23:0.59:-1.31:1.000:0.865 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:43,54:0.53: 0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:17,33:0.61:-0.90:1.000:0.738 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,43:0.54:-0.17:1.000:0.987 0/0/1/1:4:27,30:0.51:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:41,23:0.37:-0.49:1.000:0.602 0/0/0/1:4:65,10:0.15:-0.17:0.998:0.990 0/0/0/1:4:43,23:0.36:-0.43:1.000:0.713 0/0/0/1:4:54,25:0.33:-0.05:1.000:0.916 0/0/0/1:4:68,29:0.32: 0.48:1.000:0.962 0/0/1/1:4:31,28:0.46:-0.64:1.000:0.989 0/0/0/1:4:42,12:0.25:-0.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,3:0.05:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,21:0.56:-1.34:1.000:0.966 0/0/0/1:4:23,13:0.37:-1.31:1.000:0.583 0/0/1/1:4:17,34:0.61:-0.87:1.000:0.685 0/0/0/1:4:38,20:0.35:-0.67:1.000:0.745 0/0/0/1:4:132,21:0.16: 2.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,22:0.61:-1.40:1.000:0.685 0/0/0/1:4:25,12:0.34:-1.28:1.000:0.883 0/0/1/1:4:21,13:0.39:-1.37:1.000:0.648 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,21:0.49:-1.16:1.000:0.997 1/1/1:3:0,5:1.00:-2.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,26:0.38:-0.31:1.000:0.531 0/0/1/1:4:26,42:0.57:-0.37:1.000:0.935 0/0/1/1:4:42,37:0.46:-0.05:1.000:0.986 0/0/1/1:4:16,24:0.56:-1.19:1.000:0.966 0/0/0/1:4:99,16:0.16: 1.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:66,24:0.29: 0.27:1.000:0.992 0/0/0/1:4:81,31:0.30: 0.92:1.000:0.987 0/0/1/1:4:42,41:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,51:0.36: 1.94:1.000:0.727 0/0/1/1:4:35,49:0.55: 0.10:1.000:0.981 0/0/0/1:4:65,31:0.34: 0.45:1.000:0.890 0/0/1/1:4:161,126:0.43: 6.04:1.000:0.955 0/0/0/1:4:94,14:0.15: 0.80:1.000:0.985 0/0/1/1:4:48,65:0.54: 0.95:1.000:0.986 0/0/1/1:4:53,56:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,29:0.33: 0.30:1.000:0.908 0/0/0/1:4:76,21:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,26:0.28: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,30:0.54:-0.84:1.000:0.985 0/0/1/1:4:34,58:0.58: 0.33:1.000:0.899 0/0/0/1:4:46,24:0.35:-0.31:1.000:0.762 0/0/0/1:4:115,51:0.32: 2.50:1.000:0.944 0/0/1/1:4:57,35:0.38: 0.33:1.000:0.628 0/0/0/1/1/1:6:58,51:0.46: 0.83:1.000:0.787 0/0/1/1:4:50,58:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,25:0.33:-0.02:1.000:0.929 0/0/1/1:4:50,70:0.55: 1.15:1.000:0.981 0/0/0/1:4:146,22:0.15: 2.56:1.000:0.987 0/0/0/1:4:108,20:0.18: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,14:0.12: 1.39:1.000:0.845 0/0/0/1:4:47,22:0.33:-0.34:1.000:0.907 0/0/1/1:4:31,32:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,14:0.18: 0.24:0.910:0.999 0/0/1/1:4:31,44:0.55:-0.17:1.000:0.979 0/0/0/0:4:155,13:0.09: 2.56:1.000:0.958 0/0/0/1:4:65,32:0.34: 0.48:1.000:0.853 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,32:0.34: 0.51:1.000:0.872 0/0/1/1:4:47,41:0.46: 0.21:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,27:0.33: 0.18:1.000:0.936 0/0/0/1:4:81,38:0.33: 1.12:1.000:0.905 0/0/1/1:4:63,37:0.38: 0.57:1.000:0.515 0/0/0/1:4:82,36:0.32: 1.09:1.000:0.949 0/0/0/1:4:64,18:0.25: 0.04:0.920:0.999 0/0/0/1:4:82,34:0.31: 1.03:1.000:0.971 0/0/0/0:4:133,14:0.11: 1.94:1.000:0.565 0/0/1/1:4:23,35:0.56:-0.67:1.000:0.961 0/0/0/1:4:96,19:0.19: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,52:0.55: 0.24:1.000:0.981 0/0/0/0:4:87,9:0.11: 0.45:1.000:0.618 0/0/0/1:4:89,15:0.16: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,38:0.36: 0.86:1.000:0.740 0/0/1/1:4:59,40:0.40: 0.54:1.000:0.826 0/0/1/1:4:30,38:0.53:-0.37:0.999:0.992 0/0/1/1:4:36,35:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,34:0.31: 1.00:1.000:0.967 0/0/0/1:4:38,21:0.36:-0.64:1.000:0.639 0/0/0/1:4:74,39:0.36: 0.95:1.000:0.743 0/0/0/1:4:77,30:0.30: 0.77:1.000:0.984 0/0/0/1:4:71,33:0.33: 0.68:1.000:0.913 0/0/1/1:4:29,43:0.56:-0.26:1.000:0.969 0/0/0/1:4:88,35:0.30: 1.24:1.000:0.981 0/0/1/1:4:42,51:0.52: 0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,40:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:30,50:0.58:-0.02:1.000:0.916 0/0/1/1:4:37,40:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,36:0.27: 2.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,33:0.32: 0.80:1.000:0.948 0/0/0/1:4:61,24:0.30: 0.13:1.000:0.983 0/0/0/1:4:82,26:0.27: 0.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,28:0.43:-0.46:1.000:0.938 0/0/1/1:4:44,75:0.58: 1.12:1.000:0.899 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,33:0.27: 1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,19:0.30:-0.37:1.000:0.985 0/0/0/1:4:90,33:0.29: 1.24:0.999:0.991 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1:3:30,36:0.52:-0.43:0.988:0.794 0/0/1/1:4:45,49:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,37:0.37: 0.62:1.000:0.565 0/0/1/1:4:42,50:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,32:0.30: 0.95:1.000:0.982 0/0/1/1:4:36,50:0.55: 0.15:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,82:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,16:0.13: 1.88:1.000:0.861 0/0/0/1:4:95,37:0.30: 1.50:1.000:0.984 0/1/1/1:4:17,42:0.64:-0.64:1.000:0.736 0/0/1/1:4:41,54:0.54: 0.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:87,45:0.35: 1.50:1.000:0.778 0/0/1/1/1:5:36,67:0.60: 0.65:0.988:0.971 0/0/0/1:4:67,24:0.29: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,19:0.28:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,39:0.54:-0.37:1.000:0.987 0/0/1/1:4:42,36:0.45:-0.08:1.000:0.982 0/0/0/1:4:28,16:0.37:-1.08:1.000:0.556 0/0/0/1:4:52,25:0.34:-0.11:1.000:0.881 0/0/0/0:4:109,9:0.09: 1.09:1.000:0.966 0/0/1/1:4:39,43:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,51:0.53: 0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:74,24:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,47:0.55: 0.01:1.000:0.983 0/0/1/1:4:28,41:0.56:-0.34:1.000:0.972 0/0/0/1:4:62,23:0.29: 0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:69,34:0.34: 0.65:1.000:0.852 0/0/1/1:4:42,45:0.50: 0.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,48:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,48:0.58:-0.11:1.000:0.921 0/0/1/1:4:48,62:0.53: 0.86:1.000:0.991 0/0/1/1:4:27,38:0.55:-0.46:1.000:0.980 0/0/0/1:4:56,24:0.32:-0.02:1.000:0.960 0/0/1/1:4:29,47:0.57:-0.14:1.000:0.933 0/0/1/1:4:29,36:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,39:0.61:-0.67:1.000:0.634 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,17:0.38:-1.05:1.000:0.600 0/0/0/1:4:30,13:0.32:-1.10:1.000:0.955 0/0/0/1:4:69,11:0.16:-0.02:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,20:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,8:0.12:-0.23:1.000:0.849 0/0/1/1:4:21,42:0.61:-0.52:1.000:0.685 0/0/1/1:4:18,35:0.61:-0.81:1.000:0.736 0/0/0/1:4:43,19:0.32:-0.55:1.000:0.946 0/0/1/1:4:25,28:0.51:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,19:0.40:-0.96:1.000:0.769 0/0/1/1:4:25,35:0.55:-0.61:1.000:0.981 0/0/1/1:4:44,37:0.45: 0.01:1.000:0.978 0/0/1/1:4:22,32:0.56:-0.78:1.000:0.974 0/0/0/1:4:50,9:0.17:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,29:0.41:-0.28:1.000:0.852 0/0/1/1:4:25,29:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,36:0.62:-0.81:1.000:0.570 0/0/1/1:4:17,22:0.53:-1.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:15,18:0.52:-1.40:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,21:0.44:-0.99:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,22:0.41:-0.78:1.000:0.846 0/0/0/1:4:33,19:0.37:-0.84:1.000:0.536 0/0/1/1:4:54,36:0.40: 0.27:1.000:0.799 0/0/1/1:4:15,16:0.50:-1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,35:0.75:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,35:0.55:-0.61:1.000:0.981 0/1/1/1:4:20,55:0.66:-0.17:1.000:0.871 0/0/1/1:4:36,34:0.47:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:54,10:0.18:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,37:0.52:-0.37:1.000:0.995 -chr1.1 72633470 chr1.1_072633470 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:64,248:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,124:0.54:-1.08:1.000:0.989 0/1/1/1:4:54,192:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,119:0.47:-0.80:1.000:0.991 0/0/1/1:4:166,199:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,141:0.54:-0.69:1.000:0.988 0/0/0/1:4:162,62:0.26:-1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,213:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,184:0.79:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,76:0.54:-2.23:1.000:0.985 0/1/1/1:4:32,66:0.64:-2.69:1.000:0.734 0/0/1/1:4:106,111:0.48:-1.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,186:0.74:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,169:0.55:-0.07:1.000:0.984 0/0/1/1:4:124,136:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:169,48:0.21:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,82:0.27:-0.14:0.998:0.998 0/0/0/1:4:260,152:0.35: 1.53:1.000:0.834 0/0/1/1:4:192,200:0.48: 1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:191,64:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,108:0.86:-2.35:1.000:0.955 0/0/1/1:4:129,147:0.50:-0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,365:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,80:0.34:-1.06:1.000:0.859 0/1/1/1:4:19,52:0.70:-3.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:266,93:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,136:0.73:-1.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,136:0.53:-0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:228,85:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,129:0.50:-0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,150:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,114:0.51:-1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,24:0.32:-3.07:1.000:0.953 0/0/1/1:4:53,48:0.45:-2.65:1.000:0.975 1/1/1:3:0,42:1.00:-3.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,245:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,154:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,138:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,172:0.52: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,149:0.46: 0.04:1.000:0.990 0/0/0/0:4:339,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,180:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/0/0/1:4:265,109:0.27: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,187:0.54: 0.36:1.000:0.985 0/0/1/1:4:196,210:0.49: 1.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,271:0.76: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,183:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,163:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,221:0.53: 1.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:64,269:0.78: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,114:0.28: 1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:172,171:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:280,109:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,138:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,300:0.75: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:232,94:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:305,136:0.29: 1.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:239,78:0.23: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:127,182:0.56: 0.14:1.000:0.693 0/0/1/1:4:155,179:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:234,91:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:225,215:0.46: 1.90:1.000:0.987 0/0/0/1:4:205,89:0.28:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:243,86:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,83:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,78:0.30:-0.72:1.000:0.987 0/1/1/1:4:71,278:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,204:0.53: 0.87:0.910:0.992 0/1/1/1:4:70,213:0.72:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:275,114:0.27: 1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:224,96:0.28: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:120,339:0.71: 2.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:153,184:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,191:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,281:0.73: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,199:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,196:0.53: 0.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:214,100:0.30: 0.21:1.000:0.987 0/0/0/1:4:311,104:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,0:0.00:-0.33:0.920:1.000 0/0/0/1:4:265,117:0.29: 1.13:1.000:0.994 0/0/0/0:4:387,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,206:0.74:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:246,93:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,196:0.49: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:247,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,95:0.32:-0.33:1.000:0.942 0/0/0/1:4:240,89:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,82:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,189:0.54: 0.40:0.994:0.984 0/0/1/1:4:160,150:0.45: 0.16:1.000:0.983 0/0/1/1:4:177,235:0.54: 1.53:1.000:0.988 0/0/1/1:4:100,121:0.52:-1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,220:0.51: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,187:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,157:0.45: 0.43:1.000:0.976 0/0/1/1:4:119,179:0.57: 0.00:1.000:0.947 0/0/1/1:4:168,212:0.53: 1.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:146,166:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,160:0.55:-0.29:1.000:0.983 0/1/1/1:4:107,315:0.72: 1.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,183:0.73:-0.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,163:0.45: 0.57:1.000:0.978 0/0/0/1:4:213,88:0.27: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:218,74:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,184:0.47: 0.92:1.000:0.992 0/0/1/1:4:97,121:0.52:-1.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:214,198:0.45: 1.53:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,361:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,183:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:230,72:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,92:0.25: 0.64:0.999:0.999 0/1/1/1:4:83,295:0.75: 1.07:1.000:0.999 0/0/1:3:196,93:0.30:-0.12:0.988:1.000 0/0/1/1:4:174,196:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,206:0.55: 0.74:1.000:0.977 0/0/1/1:4:161,167:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:144,164:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,258:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,231:0.73: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:234,83:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:274,111:0.27: 1.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,161:0.76:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,303:0.78: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,230:0.52: 1.58:1.000:0.995 0/1/1/1/1:5:82,384:0.80: 2.25:0.988:0.996 0/0/1/1:4:127,158:0.52:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,134:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,152:0.55:-0.50:1.000:0.979 0/0/1/1:4:149,180:0.52: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,55:0.25:-1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,137:0.53:-0.72:1.000:0.993 0/0/0/1:4:225,90:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:60,230:0.77:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,172:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,89:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,180:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,233:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,174:0.47: 0.66:1.000:0.992 0/0/1/1:4:159,216:0.54: 1.03:1.000:0.984 0/0/1/1:4:169,209:0.52: 1.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,182:0.73:-0.80:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,242:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,209:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:184,227:0.52: 1.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,156:0.69:-1.09:1.000:0.974 0/0/0/1:4:209,97:0.30: 0.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:163,161:0.47: 0.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:78,270:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,195:0.73:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,167:0.76:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,86:0.81:-2.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,54:0.29:-1.66:1.000:0.993 0/0/0/0:4:321,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,251:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,65:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,74:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,194:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,153:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,143:0.58:-0.84:1.000:0.932 0/0/1/1:4:129,135:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:169,63:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,154:0.52:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:198,77:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,141:0.53:-0.65:1.000:0.991 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,114:0.48:-0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:120,129:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,122:0.52:-1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,168:0.75:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,198:0.78:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,220:0.75:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,146:0.52:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,216:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,119:0.46:-0.76:1.000:0.988 0/0/0/1:4:181,80:0.29:-0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:141,167:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,144:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,157:0.69:-1.06:1.000:0.971 0/0/1/1:4:138,138:0.47:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:136,179:0.54: 0.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:124,162:0.53:-0.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:167,54:0.23:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,134:0.50:-0.61:1.000:0.997 -chr1.1 72911768 chr1.1_072911768 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:236,80:.: 0.57:1.000:. ./.:4:185,52:.:-0.65:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:150,107:.:-0.34:1.000:. ./.:4:280,86:.: 1.33:1.000:. ./.:4:192,166:.: 1.21:1.000:. ./.:4:128,110:.:-0.63:1.000:. ./.:4:239,71:.: 0.47:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:77,25:.:-2.72:1.000:. ./.:4:70,14:.:-3.00:1.000:. ./.:4:243,65:.: 0.44:1.000:. ./.:4:230,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:165,160:.: 0.70:1.000:. ./.:4:145,121:.:-0.20:1.000:. ./.:4:164,132:.: 0.26:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.06:0.998:. ./.:4:244,63:.: 0.43:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:176,150:.: 0.72:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:238,76:.: 0.53:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:226,64:.: 0.17:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.58:1.000:. ./.:4:159,159:.: 0.60:1.000:. ./.:4:239,58:.: 0.27:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:204,147:.: 1.10:1.000:. ./.:4:232,77:.: 0.46:1.000:. ./.:4:249,78:.: 0.73:1.000:. ./.:4:203,64:.:-0.19:1.000:. ./.:4:44,20:.:-3.31:1.000:. ./.:4:45,66:.:-2.58:1.000:. ./.:3:24,0:.:-3.92:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:228,74:.: 0.35:1.000:. ./.:4:249,65:.: 0.53:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:256,84:.: 0.93:1.000:. ./.:4:170,143:.: 0.52:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:171,142:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,54:.:-0.69:1.000:. ./.:4:250,73:.: 0.67:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:253,81:.: 0.84:1.000:. ./.:4:89,5:.:-2.85:1.000:. ./.:4:122,107:.:-0.77:1.000:. ./.:4:191,56:.:-0.49:1.000:. ./.:4:185,38:.:-0.86:1.000:. ./.:4:181,154:.: 0.86:1.000:. ./.:4:213,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:277,66:.: 0.98:1.000:. ./.:4:221,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:144,127:.:-0.13:1.000:. ./.:4:164,126:.: 0.17:1.000:. ./.:4:144,122:.:-0.20:1.000:. ./.:6:158,77:.:-0.68:1.000:. ./.:4:153,126:.: 0.00:1.000:. ./.:4:224,61:.: 0.09:1.000:. ./.:4:247,65:.: 0.50:1.000:. ./.:4:98,125:.:-0.86:1.000:. ./.:4:266,75:.: 0.95:1.000:. ./.:4:208,49:.:-0.34:1.000:. ./.:4:109,89:.:-1.25:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:219,64:.: 0.06:0.910:. ./.:4:269,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:237,63:.: 0.32:1.000:. ./.:4:123,81:.:-1.16:1.000:. ./.:4:262,61:.: 0.67:1.000:. ./.:4:239,52:.: 0.18:1.000:. ./.:4:215,62:.:-0.03:1.000:. ./.:4:213,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:192,87:.: 0.00:1.000:. ./.:4:171,158:.: 0.77:1.000:. ./.:4:126,96:.:-0.88:0.920:. ./.:4:136,150:.: 0.10:1.000:. ./.:4:179,147:.: 0.72:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:137,149:.: 0.10:1.000:. ./.:4:155,174:.: 0.77:1.000:. ./.:4:119,98:.:-0.96:1.000:. ./.:4:190,41:.:-0.74:1.000:. ./.:4:127,115:.:-0.57:1.000:. ./.:4:165,112:.:-0.03:1.000:. ./.:4:140,111:.:-0.43:0.994:. ./.:4:148,118:.:-0.20:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:181,49:.:-0.76:1.000:. ./.:4:241,97:.: 0.90:1.000:. ./.:4:235,67:.: 0.35:1.000:. ./.:4:189,51:.:-0.60:1.000:. ./.:4:169,36:.:-1.14:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:205,57:.:-0.26:1.000:. ./.:4:136,94:.:-0.76:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:160,34:.:-1.31:1.000:. ./.:4:239,60:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,117:.:-0.63:1.000:. ./.:4:146,108:.:-0.39:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:229,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:204,155:.: 1.23:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:195,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:215,176:.: 1.72:1.000:. ./.:4:217,57:.:-0.08:0.999:. ./.:4:272,72:.: 1.00:1.000:. ./.:3:123,42:.:-1.75:0.988:. ./.:4:250,74:.: 0.69:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:124,110:.:-0.69:1.000:. ./.:4:217,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:209,60:.:-0.16:1.000:. ./.:4:232,60:.: 0.20:1.000:. ./.:4:139,42:.:-1.51:1.000:. ./.:4:157,129:.: 0.10:1.000:. ./.:4:242,71:.: 0.52:1.000:. ./.:4:265,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:252,62:.: 0.53:1.000:. ./.:5:345,0:.: 1.01:0.988:. ./.:4:239,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:161,43:.:-1.16:1.000:. ./.:4:217,58:.:-0.06:1.000:. ./.:4:149,144:.: 0.21:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:221,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:194,59:.:-0.40:1.000:. ./.:4:220,179:.: 1.84:1.000:. ./.:4:145,130:.:-0.06:1.000:. ./.:4:184,41:.:-0.83:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:134,130:.:-0.23:1.000:. ./.:4:225,69:.: 0.23:1.000:. ./.:4:164,30:.:-1.31:1.000:. ./.:4:196,193:.: 1.69:1.000:. ./.:4:209,155:.: 1.30:1.000:. ./.:4:240,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:158,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:168,150:.: 0.60:1.000:. ./.:4:214,68:.: 0.04:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:237,62:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:155,120:.:-0.06:1.000:. ./.:4:184,152:.: 0.87:1.000:. ./.:4:244,78:.: 0.66:1.000:. ./.:4:301,100:.: 1.87:1.000:. ./.:4:245,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:179,147:.: 0.72:1.000:. ./.:4:217,61:.:-0.02:1.000:. ./.:4:194,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:203,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:126,139:.:-0.22:1.000:. ./.:4:144,140:.: 0.07:1.000:. ./.:4:212,55:.:-0.19:1.000:. ./.:4:125,119:.:-0.54:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:139,115:.:-0.39:1.000:. ./.:4:219,60:.: 0.00:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:236,61:.: 0.27:1.000:. ./.:4:111,122:.:-0.71:1.000:. ./.:4:195,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:185,50:.:-0.68:1.000:. ./.:4:164,187:.: 1.10:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:150,118:.:-0.17:1.000:. ./.:4:246,61:.: 0.43:1.000:. ./.:4:258,80:.: 0.90:1.000:. ./.:4:301,97:.: 1.83:1.000:. ./.:4:185,161:.: 1.03:1.000:. ./.:4:227,57:.: 0.07:1.000:. ./.:4:230,58:.: 0.14:1.000:. -chr1.1 73072750 chr1.1_073072750 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,23:.: 0.27:1.000:. ./.:4:91,30:.: 0.24:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:55,26:.:-0.98:1.000:. ./.:4:106,27:.: 0.61:1.000:. ./.:4:54,38:.:-0.64:1.000:. ./.:4:36,16:.:-1.86:1.000:. ./.:4:101,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:17,6:.:-2.75:1.000:. ./.:4:19,5:.:-2.72:1.000:. ./.:4:79,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:81,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:69,41:.:-0.09:1.000:. ./.:4:73,34:.:-0.18:1.000:. ./.:4:49,22:.:-1.28:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.71:0.998:. ./.:4:86,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:57,33:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:110,25:.: 0.67:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:95,16:.:-0.06:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:61,36:.:-0.49:1.000:. ./.:4:63,15:.:-1.07:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,48:.:-0.12:1.000:. ./.:4:84,10:.:-0.58:1.000:. ./.:4:122,28:.: 1.13:1.000:. ./.:4:79,12:.:-0.67:1.000:. ./.:4:8,2:.:-3.14:1.000:. ./.:4:9,16:.:-2.68:1.000:. ./.:3:15,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:95,11:.:-0.21:1.000:. ./.:4:93,22:.: 0.06:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:125,17:.: 0.88:1.000:. ./.:4:79,51:.: 0.52:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:86,57:.: 0.91:1.000:. ./.:4:113,30:.: 0.91:1.000:. ./.:4:141,32:.: 1.83:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:124,20:.: 0.94:1.000:. ./.:4:22,3:.:-2.68:1.000:. ./.:4:87,49:.: 0.70:1.000:. ./.:4:58,22:.:-1.01:1.000:. ./.:4:97,25:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,53:.: 1.62:1.000:. ./.:4:97,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:132,23:.: 1.28:1.000:. ./.:4:92,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:80,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,43:.: 0.24:1.000:. ./.:4:75,42:.: 0.12:1.000:. ./.:6:91,33:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,53:.:-0.18:1.000:. ./.:4:112,23:.: 0.67:1.000:. ./.:4:139,22:.: 1.46:1.000:. ./.:4:66,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:134,24:.: 1.37:1.000:. ./.:4:138,17:.: 1.28:1.000:. ./.:4:50,43:.:-0.61:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:129,24:.: 1.22:0.910:. ./.:4:123,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:113,27:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,22:.:-1.65:1.000:. ./.:4:123,28:.: 1.16:1.000:. ./.:4:101,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:132,23:.: 1.28:1.000:. ./.:4:112,29:.: 0.85:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:106,19:.: 0.37:1.000:. ./.:4:69,55:.: 0.33:1.000:. ./.:4:51,29:.:-1.01:0.920:. ./.:4:85,59:.: 0.94:1.000:. ./.:4:84,29:.: 0.00:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:63,37:.:-0.40:1.000:. ./.:4:88,61:.: 1.10:1.000:. ./.:4:50,28:.:-1.07:1.000:. ./.:4:91,13:.:-0.28:1.000:. ./.:4:72,46:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,40:.:-0.58:1.000:. ./.:4:67,46:.: 0.00:0.994:. ./.:4:90,41:.: 0.55:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:78,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:112,16:.: 0.46:1.000:. ./.:4:111,20:.: 0.55:1.000:. ./.:4:79,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:108,21:.: 0.49:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:124,22:.: 1.01:1.000:. ./.:4:43,24:.:-1.40:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:91,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:92,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:66,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:86,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:87,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:77,35:.:-0.03:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:90,21:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,43:.: 0.43:1.000:. ./.:4:97,23:.: 0.21:0.999:. ./.:4:109,26:.: 0.67:1.000:. ./.:3:57,15:.:-1.25:0.988:. ./.:4:121,14:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,36:.:-0.95:1.000:. ./.:4:109,24:.: 0.61:1.000:. ./.:4:84,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:110,26:.: 0.70:1.000:. ./.:4:98,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,46:.: 0.43:1.000:. ./.:4:77,15:.:-0.64:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:109,20:.: 0.49:1.000:. ./.:5:142,0:.: 0.88:0.988:. ./.:4:115,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:109,13:.: 0.27:1.000:. ./.:4:106,25:.: 0.55:1.000:. ./.:4:50,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:113,23:.: 0.70:1.000:. ./.:4:107,18:.: 0.37:1.000:. ./.:4:63,28:.:-0.67:1.000:. ./.:4:78,51:.: 0.49:1.000:. ./.:4:112,17:.: 0.49:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:87,46:.: 0.61:1.000:. ./.:4:79,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,17:.:-0.98:1.000:. ./.:4:82,53:.: 0.67:1.000:. ./.:4:77,54:.: 0.55:1.000:. ./.:4:82,17:.:-0.43:1.000:. ./.:4:68,44:.:-0.03:1.000:. ./.:4:65,44:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,18:.: 0.09:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:67,6:.:-1.22:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:44,21:.:-1.46:1.000:. ./.:4:97,40:.: 0.73:1.000:. ./.:4:88,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:97,13:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:79,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:69,15:.:-0.89:1.000:. ./.:4:113,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:106,17:.: 0.30:1.000:. ./.:4:58,44:.:-0.34:1.000:. ./.:4:50,22:.:-1.25:1.000:. ./.:4:76,13:.:-0.73:1.000:. ./.:4:51,28:.:-1.04:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:70,11:.:-0.98:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:90,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:63,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:116,21:.: 0.73:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:63,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:65,36:.:-0.37:1.000:. ./.:4:71,8:.:-1.04:1.000:. ./.:4:95,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:127,19:.: 1.01:1.000:. ./.:4:53,33:.:-0.82:1.000:. ./.:4:81,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:108,20:.: 0.46:1.000:. -chr1.1 73335128 chr1.1_073335128 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1,16:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.29:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,11:.: 0.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.03:0.998:. ./.:4:5,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,9:.: 0.27:1.000:. ./.:3:0,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,15:.: 0.66:1.000:. ./.:4:3,12:.: 0.27:1.000:. ./.:4:7,13:.: 0.92:1.000:. ./.:4:3,18:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,17:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:5,22:.: 1.83:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,19:.: 0.92:1.000:. ./.:4:9,21:.: 2.22:1.000:. ./.:4:5,14:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,23:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.14:1.000:. ./.:4:3,13:.: 0.40:1.000:. ./.:4:6,13:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,12:.: 0.53:1.000:. ./.:6:7,15:.: 1.18:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.38:1.000:. ./.:4:3,17:.: 0.92:1.000:. ./.:4:10,11:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1,19:.: 0.92:1.000:. ./.:4:3,18:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,13:.: 0.27:0.910:. ./.:4:0,13:.: 0.01:1.000:. ./.:4:3,15:.: 0.66:1.000:. ./.:4:4,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,7:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,9:.: 0.27:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:4,22:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,11:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.03:0.920:. ./.:4:4,18:.: 1.18:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,16:.: 0.53:1.000:. ./.:4:11,18:.: 2.09:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:4,18:.: 1.18:1.000:. ./.:4:4,10:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,17:.: 0.79:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.77:0.994:. ./.:4:7,15:.: 1.18:1.000:. ./.:4:4,31:.: 2.87:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,23:.: 1.83:1.000:. ./.:4:5,21:.: 1.70:1.000:. ./.:4:2,18:.: 0.92:1.000:. ./.:4:3,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:3,20:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:5,8:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,27:.: 1.96:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:2,17:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,14:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,16:.: 1.05:1.000:. ./.:4:5,24:.: 2.09:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:6,9:.: 0.27:1.000:. ./.:4:4,22:.: 1.70:1.000:. ./.:4:1,23:.: 1.44:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,18:.: 1.05:1.000:. ./.:3:2,9:.:-0.25:0.988:. ./.:4:3,13:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,22:.: 1.44:1.000:. ./.:4:5,22:.: 1.83:1.000:. ./.:4:1,16:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,25:.: 1.83:1.000:. ./.:4:3,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,32:.: 2.48:1.000:. ./.:4:1,21:.: 1.18:1.000:. ./.:5:2,25:.: 1.83:0.988:. ./.:4:3,2:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,15:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.53:1.000:. ./.:4:1,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:3,8:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,24:.: 1.44:1.000:. ./.:4:2,14:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,17:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,14:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.14:1.000:. ./.:4:8,11:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,8:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,8:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,31:.: 2.35:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,12:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,12:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:3,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.01:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,16:.: 0.66:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.03:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,11:.: 0.14:1.000:. -chr1.1 73381901 chr1.1_073381901 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:112,105:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,80:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,135:0.71: 0.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:121,93:0.46: 0.78:1.000:0.989 0/1/1/1:4:69,168:0.73: 1.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:157,62:0.31: 0.90:1.000:0.975 0/0/1/1:4:35,40:0.56:-2.50:1.000:0.968 0/0/1/1:4:103,69:0.43:-0.21:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,178:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,28:0.31:-1.91:1.000:0.979 0/0/1/1:4:64,42:0.42:-1.77:1.000:0.926 0/1/1/1:4:40,112:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,62:0.40:-0.36:1.000:0.794 0/0/1/1:4:82,87:0.54:-0.28:1.000:0.987 0/0/0/1:4:138,43:0.26: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:113,113:0.53: 1.06:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,212:1.00: 0.73:0.998:1.000 0/0/1/1:4:113,96:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,180:0.77: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,93:0.56:-0.19:1.000:0.961 0/1/1/1:4:18,44:0.73:-2.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,73:0.46:-0.28:1.000:0.987 0/1/1/1:4:67,146:0.71: 0.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,59:0.47:-1.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:30,29:0.52:-2.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,102:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,110:0.50: 1.23:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,195:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,98:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,103:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,118:0.80:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,81:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,35:0.78:-3.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,27:0.28:-1.80:1.000:0.995 0/1/1:3:17,25:0.62:-3.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,118:0.67: 0.00:1.000:0.937 0/0/1/1:4:104,82:0.47: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:100,70:0.44:-0.26:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,100:0.52: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,74:0.45:-0.10:1.000:0.975 0/1/1/1:4:54,166:0.77: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,120:0.50: 1.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,141:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,111:0.54: 0.87:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,226:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,122:0.52: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:66,36:0.38:-1.87:1.000:0.565 0/0/1/1:4:85,84:0.52:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,112:0.74:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,91:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,129:0.52: 1.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,89:0.49: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,133:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,127:0.73:-0.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,69:0.44:-0.33:1.000:0.968 0/0/1/1:4:125,78:0.41: 0.52:1.000:0.871 0/0/1/1:4:137,95:0.44: 1.20:1.000:0.961 0/0/0/1/1/1:6:88,72:0.48:-0.50:1.000:0.861 0/0/0/1:4:157,49:0.26: 0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,144:0.79: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,186:0.77: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,43:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,159:0.71: 1.18:1.000:0.992 0/1/1/1:4:51,135:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,32:0.48:-2.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,117:0.71:-0.28:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,135:0.71: 0.38:0.910:0.990 0/1/1/1:4:56,138:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,106:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,29:0.25:-1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,43:0.22: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,106:0.49: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,103:0.55: 0.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:86,60:0.44:-0.83:1.000:0.964 0/1/1/1:4:61,126:0.70: 0.14:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,171:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,141:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,108:0.53: 0.75:1.000:0.991 0/0/1/1:4:88,77:0.49:-0.38:0.920:0.997 0/0/1/1:4:118,104:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,104:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,138:0.73: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,88:0.52:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,54:0.30: 0.31:1.000:0.981 0/0/1/1:4:57,64:0.55:-1.42:1.000:0.974 0/1/1/1:4:44,135:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,83:0.47: 0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,92:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,25:0.23:-1.44:0.994:1.000 0/0/1/1:4:86,96:0.55: 0.02:1.000:0.976 0/1/1/1:4:57,175:0.77: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,115:0.73:-0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,113:0.77:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,147:0.72: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,83:0.46: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:104,78:0.46: 0.02:1.000:0.985 0/1/1/1:4:49,150:0.77: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,148:0.79: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,17:0.19:-1.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,124:0.69: 0.14:1.000:0.965 0/0/1/1:4:56,62:0.55:-1.49:1.000:0.978 0/0/1/1:4:106,90:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,62:0.44:-0.76:1.000:0.972 0/0/1/1:4:97,98:0.53: 0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,111:0.77:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,99:0.55: 0.16:1.000:0.977 0/0/1/1:4:125,133:0.54: 1.82:1.000:0.986 0/1/1/1:4:53,151:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,140:0.79: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,127:0.52: 1.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,164:0.76: 0.99:0.999:1.000 0/1/1/1:4:50,115:0.72:-0.38:1.000:0.995 0/1/1:3:36,77:0.70:-1.61:0.988:1.000 0/0/1/1:4:115,116:0.53: 1.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,90:0.72:-1.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:149,43:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,137:0.77: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,57:0.36:-0.26:1.000:0.667 0/0/1/1:4:114,128:0.55: 1.44:1.000:0.974 0/1/1/1:4:77,126:0.64: 0.52:1.000:0.733 0/0/1/1:4:102,95:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,100:0.54: 0.33:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,140:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1/1:5:48,168:0.79: 0.83:0.988:0.994 0/1/1/1:4:44,106:0.73:-0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,89:0.68:-1.09:1.000:0.957 0/0/1/1:4:61,75:0.58:-1.06:1.000:0.926 0/1/1/1:4:43,146:0.79: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,112:0.60: 0.35:1.000:0.822 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,147:0.76: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,94:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,102:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,99:0.45: 1.30:1.000:0.976 0/1/1/1:4:53,124:0.72:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,106:0.77:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,132:0.70: 0.33:1.000:0.984 0/1/1/1:4:58,140:0.73: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,85:0.48: 0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,97:0.73:-1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:84,64:0.46:-0.78:1.000:0.987 0/0/0/1:4:214,85:0.31: 2.79:1.000:0.973 0/0/0/1:4:192,67:0.28: 1.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:113,104:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,80:0.46: 0.12:1.000:0.986 0/0/0/1:4:164,67:0.32: 1.18:1.000:0.962 0/0/1/1:4:118,104:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,159:0.73: 0.99:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,150:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,44:0.72:-2.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,40:0.46:-2.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:101,81:0.47: 0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,69:0.45:-0.43:1.000:0.980 0/0/1/1:4:125,90:0.45: 0.80:1.000:0.975 0/0/1/1:4:79,80:0.53:-0.52:1.000:0.992 0/1/1/1:4:61,98:0.64:-0.52:1.000:0.686 0/0/0/1:4:177,49:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,133:0.81:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,146:0.78: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,132:0.79:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,70:0.42:-0.10:1.000:0.924 0/0/1/1:4:84,99:0.57: 0.05:1.000:0.955 0/1/1/1:4:53,112:0.70:-0.38:1.000:0.985 0/0/1/1:4:68,71:0.54:-0.99:1.000:0.989 0/1/1/1:4:33,125:0.81:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,42:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,93:0.73:-1.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,124:0.76:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,114:0.76:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,82:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,31:0.21:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,84:0.54:-0.40:1.000:0.988 0/1/1/1:4:32,106:0.79:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,83:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,114:0.66:-0.07:1.000:0.888 0/0/0/1:4:149,47:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,86:0.54:-0.33:1.000:0.987 0/0/1/1:4:109,80:0.45: 0.19:1.000:0.980 0/1/1/1:4:76,141:0.67: 0.85:1.000:0.930 0/0/1/1:4:110,100:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,60:0.44:-0.87:1.000:0.973 0/0/1/1:4:138,80:0.39: 0.87:1.000:0.732 -chr1.1 73499503 chr1.1_073499503 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,17:.:-1.19:1.000:. ./.:4:115,10:.: 0.48:1.000:. ./.:4:46,14:.:-1.27:1.000:. ./.:4:41,12:.:-1.45:1.000:. ./.:4:69,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:43,4:.:-1.62:1.000:. ./.:4:40,1:.:-1.78:1.000:. ./.:4:82,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:83,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:53,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:41,23:.:-1.16:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.24:0.998:. ./.:4:95,6:.:-0.16:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.92:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:92,9:.:-0.16:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:80,8:.:-0.51:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:73,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:49,4:.:-1.45:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,22:.:-0.62:1.000:. ./.:4:76,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:119,17:.: 0.78:1.000:. ./.:4:76,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:22,5:.:-2.15:1.000:. ./.:3:11,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:112,9:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:102,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:88,22:.: 0.08:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:93,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:100,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:139,4:.: 0.97:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:76,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:72,15:.:-0.54:1.000:. ./.:4:159,5:.: 1.53:1.000:. ./.:4:101,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:92,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:102,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:82,11:.:-0.38:1.000:. ./.:4:193,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:85,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:85,19:.:-0.08:1.000:. ./.:4:92,17:.: 0.05:1.000:. ./.:6:114,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:101,27:.: 0.57:1.000:. ./.:4:99,9:.: 0.03:1.000:. ./.:4:165,10:.: 1.83:1.000:. ./.:4:57,11:.:-1.05:1.000:. ./.:4:120,13:.: 0.70:1.000:. ./.:4:161,13:.: 1.80:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:132,11:.: 0.97:0.910:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,14:.: 1.67:1.000:. ./.:4:59,13:.:-0.94:1.000:. ./.:4:143,11:.: 1.27:1.000:. ./.:4:94,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:109,5:.: 0.19:1.000:. ./.:4:143,7:.: 1.16:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:126,12:.: 0.83:1.000:. ./.:4:105,22:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,22:.:-0.19:0.920:. ./.:4:88,29:.: 0.27:1.000:. ./.:4:117,28:.: 1.02:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:89,16:.:-0.05:1.000:. ./.:4:79,19:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,13:.:-0.59:1.000:. ./.:4:87,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:79,15:.:-0.35:1.000:. ./.:4:89,9:.:-0.24:1.000:. ./.:4:93,16:.: 0.05:0.994:. ./.:4:82,13:.:-0.32:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.91:1.000:. ./.:4:48,6:.:-1.43:1.000:. ./.:4:170,13:.: 2.05:1.000:. ./.:4:144,4:.: 1.10:1.000:. ./.:4:115,11:.: 0.51:1.000:. ./.:4:110,11:.: 0.38:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:113,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:53,10:.:-1.19:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:94,4:.:-0.24:1.000:. ./.:4:139,11:.: 1.16:1.000:. ./.:4:78,20:.:-0.24:1.000:. ./.:4:95,23:.: 0.30:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:85,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:73,21:.:-0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:102,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.35:1.000:. ./.:4:123,19:.: 0.94:0.999:. ./.:4:134,11:.: 1.02:1.000:. ./.:3:69,8:.:-0.81:0.988:. ./.:4:132,9:.: 0.92:1.000:. ./.:4:164,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:74,13:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,13:.: 0.73:1.000:. ./.:4:131,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:93,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:115,8:.: 0.43:1.000:. ./.:4:97,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:59,7:.:-1.10:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:118,11:.: 0.59:1.000:. ./.:5:210,0:.: 2.77:0.988:. ./.:4:156,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:106,5:.: 0.11:1.000:. ./.:4:56,13:.:-1.02:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:112,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:89,12:.:-0.16:1.000:. ./.:4:68,19:.:-0.54:1.000:. ./.:4:82,19:.:-0.16:1.000:. ./.:4:94,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:157,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:66,17:.:-0.65:1.000:. ./.:4:78,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:113,9:.: 0.40:1.000:. ./.:4:93,27:.: 0.35:1.000:. ./.:4:64,10:.:-0.89:1.000:. ./.:4:80,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:61,18:.:-0.75:1.000:. ./.:4:75,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:123,13:.: 0.78:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:79,9:.:-0.51:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:25,7:.:-2.02:1.000:. ./.:4:99,22:.: 0.38:1.000:. ./.:4:99,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:81,8:.:-0.49:1.000:. ./.:4:84,10:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:58,12:.:-1.00:1.000:. ./.:4:78,8:.:-0.57:1.000:. ./.:4:83,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:81,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,6:.:-1.16:1.000:. ./.:4:73,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:90,8:.:-0.24:1.000:. ./.:4:62,25:.:-0.54:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:45,16:.:-1.24:1.000:. ./.:4:70,4:.:-0.89:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:91,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:52,21:.:-0.92:1.000:. ./.:4:107,3:.: 0.08:1.000:. ./.:4:67,13:.:-0.73:1.000:. ./.:4:58,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:49,14:.:-1.19:1.000:. ./.:4:72,7:.:-0.75:1.000:. ./.:4:80,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:103,9:.: 0.13:1.000:. ./.:4:42,23:.:-1.13:1.000:. ./.:4:64,4:.:-1.05:1.000:. ./.:4:84,15:.:-0.22:1.000:. -chr1.1 73917225 chr1.1_073917225 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:124,31:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,18:.:-1.42:1.000:. ./.:4:111,63:.: 1.05:1.000:. ./.:4:164,21:.: 1.28:1.000:. ./.:4:113,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:168,32:.: 1.58:1.000:. ./.:4:75,10:.:-0.77:1.000:. ./.:4:153,36:.: 1.36:1.000:. ./.:4:132,29:.: 0.79:1.000:. ./.:4:18,12:.:-1.89:1.000:. ./.:4:17,26:.:-1.63:1.000:. ./.:4:124,15:.: 0.34:1.000:. ./.:4:134,25:.: 0.74:1.000:. ./.:4:140,32:.: 1.01:1.000:. ./.:4:130,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:134,31:.: 0.87:1.000:. ./.:4:45,38:.:-0.81:0.998:. ./.:4:99,43:.: 0.40:1.000:. ./.:4:51,55:.:-0.34:1.000:. ./.:4:138,48:.: 1.30:1.000:. ./.:4:22,13:.:-1.79:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.05:1.000:. ./.:4:143,39:.: 1.22:1.000:. ./.:4:34,24:.:-1.32:1.000:. ./.:4:7,4:.:-2.28:1.000:. ./.:4:144,39:.: 1.24:1.000:. ./.:4:127,21:.: 0.52:1.000:. ./.:4:70,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:163,15:.: 1.13:1.000:. ./.:4:94,13:.:-0.32:1.000:. ./.:4:132,34:.: 0.89:1.000:. ./.:4:94,26:.:-0.05:1.000:. ./.:4:12,5:.:-2.16:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.85:1.000:. ./.:3:9,22:.:-1.87:1.000:. ./.:4:138,29:.: 0.91:1.000:. ./.:4:83,52:.: 0.25:1.000:. ./.:4:78,26:.:-0.38:1.000:. ./.:4:72,58:.: 0.15:1.000:. ./.:4:76,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,15:.:-1.08:1.000:. ./.:4:55,43:.:-0.50:1.000:. ./.:4:110,28:.: 0.32:1.000:. ./.:4:124,25:.: 0.54:1.000:. ./.:4:63,41:.:-0.38:1.000:. ./.:4:98,37:.: 0.25:1.000:. ./.:4:96,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,41:.:-1.22:1.000:. ./.:4:73,47:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,68:.: 0.36:1.000:. ./.:4:76,17:.:-0.61:1.000:. ./.:4:140,65:.: 1.69:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:75,54:.: 0.13:1.000:. ./.:4:116,36:.: 0.60:1.000:. ./.:4:131,75:.: 1.71:1.000:. ./.:4:135,28:.: 0.83:1.000:. ./.:4:111,44:.: 0.66:1.000:. ./.:4:107,60:.: 0.91:1.000:. ./.:6:46,41:.:-0.73:1.000:. ./.:4:102,57:.: 0.74:1.000:. ./.:4:81,13:.:-0.58:1.000:. ./.:4:113,52:.: 0.87:1.000:. ./.:4:39,71:.:-0.26:1.000:. ./.:4:87,48:.: 0.25:1.000:. ./.:4:81,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:36,13:.:-1.51:1.000:. ./.:4:64,36:.:-0.46:1.000:. ./.:4:104,42:.: 0.48:0.910:. ./.:4:77,8:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,53:.:-0.67:1.000:. ./.:4:45,48:.:-0.61:1.000:. ./.:4:97,88:.: 1.28:1.000:. ./.:4:100,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:72,43:.:-0.16:1.000:. ./.:4:103,47:.: 0.56:1.000:. ./.:4:34,36:.:-1.08:1.000:. ./.:4:68,36:.:-0.38:1.000:. ./.:4:83,51:.: 0.23:1.000:. ./.:4:125,24:.: 0.54:1.000:. ./.:4:61,34:.:-0.56:0.920:. ./.:4:104,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:88,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:65,17:.:-0.83:1.000:. ./.:4:75,13:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,37:.: 0.11:1.000:. ./.:4:59,39:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,30:.:-0.95:1.000:. ./.:4:83,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:132,48:.: 1.17:1.000:. ./.:4:90,51:.: 0.38:0.994:. ./.:4:143,18:.: 0.79:1.000:. ./.:4:48,46:.:-0.58:1.000:. ./.:4:73,18:.:-0.65:1.000:. ./.:4:110,33:.: 0.42:1.000:. ./.:4:95,41:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,17:.:-1.32:1.000:. ./.:4:43,41:.:-0.79:1.000:. ./.:4:36,19:.:-1.38:1.000:. ./.:4:132,12:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,19:.:-0.99:1.000:. ./.:4:74,45:.:-0.07:1.000:. ./.:4:49,29:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,37:.:-0.28:1.000:. ./.:4:69,27:.:-0.54:1.000:. ./.:4:110,52:.: 0.81:1.000:. ./.:4:29,39:.:-1.12:1.000:. ./.:4:74,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:222,49:.: 3.04:1.000:. ./.:4:114,30:.: 0.44:1.000:. ./.:4:93,21:.:-0.18:1.000:. ./.:4:152,58:.: 1.79:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.87:0.999:. ./.:4:165,42:.: 1.73:1.000:. ./.:3:37,33:.:-1.08:0.988:. ./.:4:72,32:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,35:.:-1.36:1.000:. ./.:4:83,59:.: 0.40:1.000:. ./.:4:86,35:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:94,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:53,25:.:-0.91:1.000:. ./.:4:122,49:.: 0.99:1.000:. ./.:4:196,22:.: 1.95:1.000:. ./.:4:85,36:.:-0.03:1.000:. ./.:4:97,24:.:-0.03:1.000:. ./.:5:77,25:.:-0.42:0.988:. ./.:4:24,42:.:-1.16:1.000:. ./.:4:19,15:.:-1.81:1.000:. ./.:4:41,18:.:-1.30:1.000:. ./.:4:125,50:.: 1.07:1.000:. ./.:4:123,13:.: 0.27:1.000:. ./.:4:42,14:.:-1.36:1.000:. ./.:4:55,4:.:-1.30:1.000:. ./.:4:106,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:187,13:.: 1.58:1.000:. ./.:4:132,28:.: 0.77:1.000:. ./.:4:78,13:.:-0.65:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.93:1.000:. ./.:4:21,10:.:-1.87:1.000:. ./.:4:41,31:.:-1.03:1.000:. ./.:4:95,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:136,19:.: 0.66:1.000:. ./.:4:74,33:.:-0.32:1.000:. ./.:4:146,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:138,33:.: 0.99:1.000:. ./.:4:119,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,31:.:-0.16:1.000:. ./.:4:151,23:.: 1.05:1.000:. ./.:4:111,44:.: 0.66:1.000:. ./.:4:83,35:.:-0.09:1.000:. ./.:4:216,39:.: 2.71:1.000:. ./.:4:10,14:.:-2.02:1.000:. ./.:4:95,22:.:-0.11:1.000:. ./.:4:148,28:.: 1.09:1.000:. ./.:4:130,32:.: 0.81:1.000:. ./.:4:49,36:.:-0.77:1.000:. ./.:4:36,17:.:-1.42:1.000:. ./.:4:76,26:.:-0.42:1.000:. ./.:4:117,56:.: 1.03:1.000:. ./.:4:114,37:.: 0.58:1.000:. ./.:4:99,38:.: 0.29:1.000:. ./.:4:76,13:.:-0.69:1.000:. ./.:4:170,41:.: 1.81:1.000:. ./.:4:132,26:.: 0.72:1.000:. ./.:4:141,27:.: 0.93:1.000:. ./.:4:58,26:.:-0.79:1.000:. ./.:4:35,22:.:-1.34:1.000:. ./.:4:114,12:.: 0.07:1.000:. ./.:4:112,42:.: 0.64:1.000:. ./.:4:77,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:102,52:.: 0.64:1.000:. ./.:4:103,29:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,43:.: 0.05:1.000:. ./.:4:117,29:.: 0.48:1.000:. ./.:4:156,19:.: 1.07:1.000:. ./.:4:36,23:.:-1.30:1.000:. ./.:4:123,39:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:186,37:.: 2.05:1.000:. ./.:4:236,26:.: 2.85:1.000:. ./.:4:38,24:.:-1.24:1.000:. ./.:4:81,21:.:-0.42:1.000:. -chr1.1 74003328 chr1.1_074003328 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:110,23:.: 0.51:1.000:. ./.:4:53,55:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,27:.: 0.82:1.000:. ./.:4:103,30:.: 0.51:1.000:. ./.:4:150,21:.: 1.41:1.000:. ./.:4:109,42:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,27:.:-0.37:1.000:. ./.:4:122,56:.: 1.57:1.000:. ./.:4:152,24:.: 1.52:1.000:. ./.:4:15,5:.:-2.16:1.000:. ./.:4:18,7:.:-2.04:1.000:. ./.:4:92,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:96,31:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,20:.: 0.67:1.000:. ./.:4:71,31:.:-0.22:1.000:. ./.:4:115,50:.: 1.26:1.000:. ./.:4:101,60:.: 1.17:0.998:. ./.:4:160,54:.: 2.42:1.000:. ./.:4:157,63:.: 2.56:1.000:. ./.:4:135,58:.: 1.93:1.000:. ./.:4:12,5:.:-2.23:1.000:. ./.:4:97,34:.: 0.46:1.000:. ./.:4:124,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:60,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:5,1:.:-2.49:1.000:. ./.:4:109,70:.: 1.59:1.000:. ./.:4:118,27:.: 0.79:1.000:. ./.:4:112,22:.: 0.53:1.000:. ./.:4:106,16:.: 0.25:1.000:. ./.:4:109,44:.: 0.98:1.000:. ./.:4:124,27:.: 0.93:1.000:. ./.:4:96,46:.: 0.72:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.47:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:162,20:.: 1.67:1.000:. ./.:4:93,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:84,38:.: 0.25:1.000:. ./.:4:96,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:74,42:.: 0.11:1.000:. ./.:4:64,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:79,37:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,42:.: 0.01:1.000:. ./.:4:77,16:.:-0.44:1.000:. ./.:4:57,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:96,12:.:-0.08:1.000:. ./.:4:109,40:.: 0.89:1.000:. ./.:4:12,3:.:-2.28:1.000:. ./.:4:46,27:.:-0.91:1.000:. ./.:4:44,15:.:-1.24:1.000:. ./.:4:67,14:.:-0.72:1.000:. ./.:4:99,24:.: 0.27:1.000:. ./.:4:55,7:.:-1.17:1.000:. ./.:4:82,51:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,16:.: 0.20:1.000:. ./.:4:68,20:.:-0.55:1.000:. ./.:4:76,37:.: 0.04:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.39:1.000:. ./.:6:50,20:.:-0.98:1.000:. ./.:4:64,44:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,43:.:-0.08:1.000:. ./.:4:93,19:.: 0.01:1.000:. ./.:4:45,33:.:-0.79:1.000:. ./.:4:73,42:.: 0.08:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,22:.:-1.17:1.000:. ./.:4:99,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:81,12:.:-0.44:0.910:. ./.:4:98,28:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,33:.:-0.79:1.000:. ./.:4:21,13:.:-1.83:1.000:. ./.:4:86,67:.: 0.98:1.000:. ./.:4:78,28:.:-0.13:1.000:. ./.:4:72,51:.: 0.27:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.20:1.000:. ./.:4:64,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:71,13:.:-0.65:1.000:. ./.:4:93,29:.: 0.25:1.000:. ./.:4:76,14:.:-0.51:1.000:. ./.:4:41,60:.:-0.25:0.920:. ./.:4:65,8:.:-0.91:1.000:. ./.:4:43,27:.:-0.98:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:42,20:.:-1.17:1.000:. ./.:4:70,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:39,20:.:-1.24:1.000:. ./.:4:60,7:.:-1.05:1.000:. ./.:4:68,15:.:-0.67:1.000:. ./.:4:74,37:.:-0.01:1.000:. ./.:4:63,26:.:-0.53:0.994:. ./.:4:81,12:.:-0.44:1.000:. ./.:4:82,35:.: 0.13:1.000:. ./.:4:70,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:97,13:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,15:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,19:.:-1.00:1.000:. ./.:4:48,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.74:1.000:. ./.:4:100,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:57,16:.:-0.91:1.000:. ./.:4:104,36:.: 0.67:1.000:. ./.:4:60,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,25:.:-0.15:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.77:1.000:. ./.:4:94,33:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.84:1.000:. ./.:4:87,42:.: 0.41:1.000:. ./.:4:132,25:.: 1.08:1.000:. ./.:4:128,20:.: 0.86:1.000:. ./.:4:87,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:140,55:.: 1.97:1.000:. ./.:4:72,23:.:-0.39:0.999:. ./.:4:91,20:.:-0.01:1.000:. ./.:3:26,7:.:-1.85:0.962:. ./.:4:68,26:.:-0.41:1.000:. ./.:4:47,9:.:-1.31:1.000:. ./.:4:47,24:.:-0.96:1.000:. ./.:4:86,14:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,13:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,32:.: 0.46:1.000:. ./.:4:73,9:.:-0.70:1.000:. ./.:4:71,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,27:.: 0.79:1.000:. ./.:4:88,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:68,8:.:-0.84:1.000:. ./.:5:100,15:.: 0.08:0.988:. ./.:4:68,35:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.91:1.000:. ./.:4:55,19:.:-0.88:1.000:. ./.:4:68,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:97,43:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,11:.:-1.38:1.000:. ./.:4:59,2:.:-1.19:1.000:. ./.:4:58,7:.:-1.10:1.000:. ./.:4:144,25:.: 1.36:1.000:. ./.:4:58,31:.:-0.53:1.000:. ./.:4:64,14:.:-0.79:1.000:. ./.:4:65,21:.:-0.60:1.000:. ./.:4:50,24:.:-0.88:1.000:. ./.:4:51,26:.:-0.81:1.000:. ./.:4:73,13:.:-0.60:1.000:. ./.:4:126,18:.: 0.77:1.000:. ./.:4:51,6:.:-1.29:1.000:. ./.:4:136,55:.: 1.88:1.000:. ./.:4:134,51:.: 1.74:1.000:. ./.:4:120,21:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,42:.: 0.15:1.000:. ./.:4:78,49:.: 0.37:1.000:. ./.:4:93,27:.: 0.20:1.000:. ./.:4:137,24:.: 1.17:1.000:. ./.:4:160,23:.: 1.69:1.000:. ./.:4:22,2:.:-2.07:1.000:. ./.:4:93,42:.: 0.56:1.000:. ./.:4:78,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:112,25:.: 0.60:1.000:. ./.:4:67,51:.: 0.15:1.000:. ./.:4:77,50:.: 0.37:1.000:. ./.:4:105,26:.: 0.46:1.000:. ./.:4:133,40:.: 1.45:1.000:. ./.:4:114,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:118,35:.: 0.98:1.000:. ./.:4:82,43:.: 0.32:1.000:. ./.:4:124,15:.: 0.65:1.000:. ./.:4:65,10:.:-0.86:1.000:. ./.:4:105,26:.: 0.46:1.000:. ./.:4:46,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:90,45:.: 0.56:1.000:. ./.:4:87,41:.: 0.39:1.000:. ./.:4:111,27:.: 0.63:1.000:. ./.:4:104,23:.: 0.37:1.000:. ./.:4:87,31:.: 0.15:1.000:. ./.:4:126,52:.: 1.57:1.000:. ./.:4:65,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:103,32:.: 0.56:1.000:. ./.:4:127,22:.: 0.89:1.000:. ./.:4:116,70:.: 1.76:1.000:. ./.:4:115,50:.: 1.26:1.000:. ./.:4:84,53:.: 0.60:1.000:. ./.:4:127,63:.: 1.85:1.000:. ./.:4:124,50:.: 1.48:1.000:. ./.:4:122,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:167,29:.: 2.00:1.000:. ./.:4:54,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:101,66:.: 1.31:1.000:. -chr1.1 74288136 chr1.1_074288136 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:20,15:0.43: 0.49:1.000:0.943 0/1/1/1:4:6,31:0.76: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.58:-0.63:1.000:0.926 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.32: 0.72:1.000:0.941 0/0/0/1:4:26,8:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,6:0.33:-1.42:1.000:0.906 0/0/0/1:4:12,6:0.33:-1.42:1.000:0.906 0/0/0/1:4:14,7:0.33:-1.08:1.000:0.906 0/1/1/1:4:1,18:0.86:-1.31:1.000:0.966 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-2.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,8:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,2:0.08:-0.63:1.000:0.989 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.35:-1.19:1.000:0.792 0/0/0/1:4:14,7:0.33:-1.08:1.000:0.906 0/1/1/1:4:6,35:0.78: 1.17:0.998:1.000 0/1/1/1:4:5,19:0.72:-0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,29:0.63: 1.39:1.000:0.613 0/0/0/1:4:27,14:0.34: 1.17:1.000:0.859 0/1/1/1:4:5,14:0.68:-1.31:1.000:0.958 0/1/1/1:4:11,26:0.66: 0.72:1.000:0.838 0/0/1/1:4:18,12:0.40:-0.07:1.000:0.791 0/1/1/1:4:4,18:0.74:-0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,8:0.59:-1.98:1.000:0.873 0/0/0/1:4:18,7:0.28:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,9:0.39:-0.86:1.000:0.706 0/0/1/1:4:7,13:0.62:-1.19:1.000:0.631 0/0/0/1:4:26,8:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,18:0.55: 0.16:1.000:0.982 0/0/0/1:4:21,3:0.12:-0.74:1.000:0.852 0/1/1/1:4:3,19:0.78:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.38:-1.64:1.000:0.503 0/0/0/1:4:22,7:0.24:-0.18:1.000:1.000 0/0/0:3:6,0:0.00:-2.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.16:-0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,18:0.67:-0.63:1.000:0.916 0/0/1/1:4:19,22:0.53: 1.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.97:1.000:0.947 0/0/1/1:4:7,10:0.57:-1.53:1.000:0.952 0/0/1/1:4:15,19:0.55: 0.38:1.000:0.984 0/1/1/1:4:7,36:0.76: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,5:0.17:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,10:0.37:-0.41:1.000:0.558 0/1/1/1:4:14,32:0.65: 1.73:1.000:0.794 0/0/0/1:4:21,9:0.30:-0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:21,21:0.50: 1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,18:0.59:-0.18:1.000:0.847 0/1/1/1:4:5,19:0.72:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,7:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,14:0.55:-0.63:1.000:0.983 0/0/0/1:4:26,13:0.33: 0.94:1.000:0.906 0/0/1/1:4:12,18:0.58:-0.07:1.000:0.926 0/0/1/1:4:16,22:0.56: 0.83:1.000:0.966 0/0/1/1:4:16,11:0.41:-0.41:1.000:0.848 0/0/0/1:4:18,7:0.28:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,6:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,15:0.36: 1.28:1.000:0.721 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.63:1.000:0.954 0/0/0/1/1/1:6:12,9:0.43:-1.08:1.000:0.591 0/0/0/1:4:27,11:0.29: 0.83:1.000:0.992 0/1/1/1:4:13,32:0.66: 1.62:1.000:0.881 0/0/0/1:4:38,7:0.16: 1.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,14:0.55:-0.63:1.000:0.983 0/0/1/1:4:18,21:0.53: 0.94:1.000:0.992 0/0/1/1:4:21,23:0.52: 1.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,7:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,27:0.61: 1.28:1.000:0.696 0/0/0/1:4:28,8:0.22: 0.61:0.910:1.000 0/0/1/1:4:18,19:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,35:0.76: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.45:-0.97:1.000:0.984 0/0/1/1:4:15,25:0.60: 1.05:1.000:0.824 0/0/1/1:4:16,15:0.48: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,20:0.66:-0.29:1.000:0.895 0/0/1/1:4:19,15:0.44: 0.38:1.000:0.969 0/1/1/1:4:12,31:0.67: 1.39:1.000:0.919 0/0/1/1:4:18,18:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,13:0.59:-1.08:1.000:0.856 0/0/0/1:4:25,14:0.36: 0.94:1.000:0.700 0/0/1/1:4:9,15:0.60:-0.74:0.920:0.824 0/0/1/1:4:21,17:0.45: 0.83:1.000:0.977 0/1/1/1:4:7,25:0.72: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,21:0.58: 0.49:1.000:0.926 0/0/0/1:4:20,6:0.23:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,13:0.29: 1.62:1.000:0.992 0/1/1/1:4:6,14:0.65:-1.19:1.000:0.822 0/1/1/1:4:10,20:0.63:-0.07:1.000:0.535 0/0/0/1:4:28,12:0.30: 1.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:24,10:0.29: 0.38:1.000:0.989 0/0/1/1:4:18,14:0.44: 0.16:0.994:0.963 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,36:0.76: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.23:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.32: 0.72:1.000:0.941 0/0/0/1:4:23,5:0.18:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,20:0.54: 0.61:1.000:0.986 0/0/1/1:4:16,19:0.53: 0.49:1.000:0.991 0/1/1/1:4:7,44:0.78: 2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,14:0.35: 1.05:1.000:0.792 0/0/0/1:4:17,10:0.37:-0.41:1.000:0.558 0/0/1/1:4:14,18:0.55: 0.16:1.000:0.982 0/0/0/1:4:19,9:0.32:-0.29:1.000:0.950 0/0/1/1:4:12,17:0.57:-0.18:1.000:0.956 0/0/0/1:4:16,7:0.30:-0.86:1.000:0.981 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,38:0.77: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,20:0.54: 0.61:1.000:0.986 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,7:0.21: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.43:-0.86:1.000:0.958 0/0/1/1:4:23,14:0.38: 0.72:1.000:0.548 0/0/1/1:4:22,42:0.62: 3.75:0.999:0.571 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1:3:11,5:0.31:-1.64:0.962:1.000 0/0/1/1:4:17,25:0.57: 1.28:1.000:0.938 0/1/1/1:4:3,35:0.84: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,13:0.43:-0.07:1.000:0.955 0/0/1/1:4:19,13:0.41: 0.16:1.000:0.840 0/0/1/1:4:13,11:0.46:-0.74:1.000:0.987 0/0/0/1:4:25,13:0.34: 0.83:1.000:0.855 0/1/1/1:4:5,35:0.79: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.45:-0.18:1.000:0.978 0/0/0/1:4:17,5:0.23:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.35: 0.38:1.000:0.765 0/0/0/1:4:18,7:0.28:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:19,25:0.55: 1.50:0.988:0.890 0/1/1/1:4:6,18:0.69:-0.74:1.000:0.976 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,14:0.53:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,12:0.30: 1.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:12,7:0.37:-1.31:1.000:0.584 0/0/1/1:4:9,6:0.40:-1.76:1.000:0.791 0/0/0/1:4:11,3:0.21:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,10:0.37:-0.41:1.000:0.558 0/0/0/1:4:21,9:0.30:-0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,21:0.55: 0.72:1.000:0.978 0/1/1/1:4:8,35:0.74: 1.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,27:0.77: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,12:0.48:-0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:30,10:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,16:0.42: 0.83:1.000:0.918 0/0/1/1:4:18,11:0.38:-0.18:1.000:0.560 0/1/1/1:4:6,26:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,8:0.20: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,8:0.29:-0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,20:0.48: 1.28:1.000:0.994 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.97:1.000:0.947 0/0/1/1:4:10,6:0.38:-1.64:1.000:0.503 0/0/0/1:4:15,8:0.35:-0.86:1.000:0.811 0/0/0/1:4:30,5:0.14: 0.49:1.000:0.975 0/1/1/1:4:10,41:0.73: 2.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,28:0.71: 0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:10,17:0.60:-0.41:1.000:0.795 0/0/0/1:4:24,12:0.33: 0.61:1.000:0.906 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-0.63:1.000:0.791 0/0/0/1:4:19,8:0.30:-0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,17:0.60:-0.41:1.000:0.795 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.48:-1.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,15:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,30:0.69: 1.05:1.000:0.976 0/0/0/1:4:22,8:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:19,11:0.37:-0.07:1.000:0.607 0/0/1/1:4:15,15:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,16:0.67:-0.97:1.000:0.937 0/0/0/1:4:24,14:0.37: 0.83:1.000:0.584 0/0/0/1:4:14,6:0.30:-1.19:1.000:0.985 0/0/0/1:4:21,6:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,9:0.31:-0.18:1.000:0.973 0/0/0/1:4:24,10:0.29: 0.38:1.000:0.989 0/1/1/1:4:9,37:0.73: 1.73:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,5:0.19:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,25:0.61: 0.94:1.000:0.711 0/0/0/1:4:21,6:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,27:0.71: 0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-1.19:1.000:0.997 -chr1.1 74445606 chr1.1_074445606 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:31,67:0.69: 1.05:1.000:0.968 0/1/1/1:4:19,61:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,60:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,32:0.40: 0.54:1.000:0.829 0/0/1/1:4:40,48:0.55: 0.71:1.000:0.983 0/0/1/1:4:75,50:0.42: 1.99:1.000:0.900 0/0/1/1:4:32,39:0.55: 0.12:1.000:0.980 0/1/1/1:4:18,63:0.78: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00: 1.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,18:0.90:-1.63:1.000:0.834 0/0/0/1:4:18,6:0.29:-1.50:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,58:0.65: 0.74:1.000:0.828 0/1/1/1:4:30,64:0.68: 0.92:1.000:0.962 0/0/1/1:4:42,46:0.52: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,55:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,45:0.43: 1.40:1.000:0.948 0/1/1/1:4:16,72:0.82: 0.71:0.998:0.999 0/1/1/1:4:23,60:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,60:0.72: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,63:0.50: 2.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,52:0.66: 0.40:1.000:0.874 1/1/1/1:4:0,104:1.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,51:0.52: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-1.91:1.000:0.673 0/0/1/1:4:30,39:0.57: 0.06:1.000:0.955 0/1/1/1:4:28,89:0.76: 1.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,63:0.74: 0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,51:0.49: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,61:0.61: 1.12:1.000:0.671 0/1/1/1:4:19,67:0.78: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,74:0.77: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.06:-2.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-1.84:1.000:0.939 1/1/1:3:0,15:1.00:-1.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,55:0.70: 0.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:64,44:0.42: 1.40:1.000:0.925 0/1/1/1:4:13,53:0.81:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,25:0.41:-0.12:1.000:0.858 0/0/0/1:4:40,17:0.33:-0.36:1.000:0.912 0/1/1/1:4:17,45:0.73:-0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,34:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,22:0.47:-0.67:1.000:0.990 0/1/1/1:4:13,45:0.78:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,82:0.71: 1.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-1.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,6:0.19:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,20:0.72:-1.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,35:0.80:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,15:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,22:0.47:-0.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,30:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,45:0.60: 0.26:1.000:0.776 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,20:0.32: 0.09:1.000:0.949 0/0/1/1:4:21,22:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,15:0.33:-0.57:1.000:0.926 0/0/1/1/1/1:6:12,21:0.64:-1.19:1.000:0.868 0/0/1/1:4:30,30:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,31:0.56:-0.43:1.000:0.959 0/0/1/1:4:28,36:0.56:-0.12:1.000:0.961 0/0/0/1:4:39,10:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,45:0.72:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,22:0.45:-0.60:1.000:0.980 0/0/1/1:4:25,27:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,37:0.69:-0.46:1.000:0.971 0/1/1/1:4:17,42:0.72:-0.29:0.910:0.994 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.47:-0.84:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,16:0.39:-0.84:1.000:0.730 0/1/1/1:4:16,50:0.76:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,35:0.49: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,35:0.70:-0.60:1.000:0.988 0/1/1/1:4:15,69:0.82: 0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,48:0.86:-0.39:1.000:0.969 0/1/1/1:4:6,35:0.86:-0.91:1.000:0.978 0/0/1/1:4:27,15:0.38:-0.88:1.000:0.584 0/0/0/1:4:40,17:0.33:-0.36:1.000:0.912 0/0/1/1:4:18,13:0.43:-1.25:0.920:0.954 0/0/0/1:4:33,8:0.25:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.29:-0.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,53:0.82:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,30:0.57:-0.50:1.000:0.954 0/0/1/1:4:23,28:0.55:-0.57:1.000:0.980 0/0/0/1:4:34,11:0.29:-0.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,23:0.59:-0.98:1.000:0.856 0/0/1/1:4:19,22:0.54:-0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:42,37:0.47: 0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,28:0.57:-0.63:0.994:0.939 0/0/1/1:4:18,18:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,37:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,45:0.81:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,30:0.60:-0.60:1.000:0.776 0/1/1/1:4:15,39:0.73:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,12:0.40:-1.22:1.000:0.754 0/1/1/1:4:14,28:0.67:-0.88:1.000:0.918 0/1/1/1:4:17,29:0.63:-0.74:1.000:0.597 0/1/1/1:4:19,35:0.65:-0.46:1.000:0.797 0/0/1/1:4:27,20:0.44:-0.70:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,21:0.75:-1.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,30:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,17:0.52:-1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,30:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,33:0.81:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,77:0.81: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,36:0.42: 0.74:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,41:0.78:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,44:0.44: 1.26:1.000:0.960 0/0/1/1:4:20,24:0.55:-0.81:0.999:0.983 0/1/1/1:4:25,49:0.66: 0.23:1.000:0.897 0/0/1:3:9,5:0.38:-1.84:0.962:1.000 0/0/1/1:4:27,19:0.43:-0.74:1.000:0.940 0/1/1/1:4:13,33:0.72:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,23:0.46:-0.57:1.000:0.987 0/1/1/1:4:8,35:0.82:-0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,32:0.71:-0.77:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,43:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,18:0.45:-0.91:1.000:0.979 0/1/1/1:4:19,32:0.63:-0.57:1.000:0.557 0/1/1/1:4:30,100:0.77: 2.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,37:0.83:-0.77:1.000:0.999 0/1/1/1/1:5:9,38:0.81:-0.70:0.988:0.998 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,23:0.75:-1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,27:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,20:0.67:-1.29:1.000:0.918 0/0/1/1:4:40,58:0.59: 1.05:1.000:0.842 0/1/1/1:4:10,31:0.76:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.47:-0.84:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,38:0.65:-0.29:1.000:0.758 0/0/1/1:4:52,59:0.53: 1.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:27,19:0.43:-0.74:1.000:0.940 0/0/1/1:4:13,19:0.60:-1.22:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,26:0.67:-0.98:1.000:0.918 0/1/1/1:4:9,28:0.76:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,22:0.48:-0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,69:0.66: 1.30:1.000:0.867 0/1/1/1:4:5,29:0.86:-1.15:1.000:0.979 0/0/1/1:4:52,52:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,55:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,68:0.78: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,57:0.72: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,50:0.55: 0.81:1.000:0.980 0/1/1/1:4:16,63:0.80: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,88:0.71: 1.95:1.000:0.993 0/1/1/1:4:35,95:0.73: 2.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,7:0.64:-1.94:1.000:0.672 0/0/1/1:4:60,72:0.55: 2.23:1.000:0.983 0/0/0/1:4:66,23:0.30: 0.74:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,73:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,79:0.55: 2.64:1.000:0.980 0/0/1/1:4:47,38:0.46: 0.61:1.000:0.985 0/1/1/1:4:13,68:0.84: 0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,39:0.47: 0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:20,68:0.78: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,67:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,42:0.53: 0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,38:0.47: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:50,17:0.30:-0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,49:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,15:0.26: 0.16:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,91:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,39:0.53: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,56:0.54: 1.23:1.000:0.985 0/1/1/1:4:21,58:0.74: 0.40:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,59:0.70: 0.61:1.000:0.983 0/0/1/1:4:37,42:0.53: 0.40:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,35:0.70:-0.60:1.000:0.988 0/1/1/1:4:23,60:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,59:0.51: 1.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,60:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,49:0.53: 0.88:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,89:0.77: 1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,48:0.45: 1.47:1.000:0.977 0/0/1/1:4:60,53:0.47: 1.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,51:0.47: 1.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,47:0.60: 0.40:1.000:0.820 0/1/1/1:4:28,86:0.76: 1.61:1.000:1.000 -chr1.1 74623263 chr1.1_074623263 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,87:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,75:.:-1.06:1.000:. ./.:4:27,59:.:-0.53:1.000:. ./.:4:30,55:.:-0.58:1.000:. ./.:4:27,79:.: 0.42:1.000:. ./.:4:17,47:.:-1.59:1.000:. ./.:4:25,48:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,60:.:-1.78:1.000:. ./.:4:5,79:.:-0.63:1.000:. ./.:4:13,71:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,73:.:-1.16:1.000:. ./.:4:25,75:.: 0.14:1.000:. ./.:4:28,44:.:-1.21:1.000:. ./.:4:41,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,79:.: 0.42:0.998:. ./.:4:32,66:.: 0.04:1.000:. ./.:4:38,79:.: 0.95:1.000:. ./.:4:27,61:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.58:1.000:. ./.:4:36,61:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,44:.: 0.38:1.000:. ./.:4:8,37:.:-2.50:1.000:. ./.:4:31,58:.:-0.39:1.000:. ./.:4:37,43:.:-0.82:1.000:. ./.:4:22,47:.:-1.35:1.000:. ./.:4:67,47:.: 0.81:1.000:. ./.:4:23,61:.:-0.63:1.000:. ./.:4:16,47:.:-1.64:1.000:. ./.:4:15,50:.:-1.54:1.000:. ./.:4:12,52:.:-1.59:1.000:. ./.:4:13,61:.:-1.11:1.000:. ./.:3:0,34:.:-3.03:1.000:. ./.:4:0,72:.:-1.21:1.000:. ./.:4:33,77:.: 0.62:1.000:. ./.:4:32,74:.: 0.42:1.000:. ./.:4:22,70:.:-0.25:1.000:. ./.:4:33,67:.: 0.14:1.000:. ./.:4:50,48:.: 0.04:1.000:. ./.:4:22,81:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,75:.: 0.38:1.000:. ./.:4:28,65:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:67,69:.: 1.86:1.000:. ./.:4:54,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.01:1.000:. ./.:4:24,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:77,53:.: 1.57:1.000:. ./.:4:60,44:.: 0.33:1.000:. ./.:4:29,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:22,82:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.19:1.000:. ./.:4:24,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:26,83:.: 0.57:1.000:. ./.:4:65,61:.: 1.38:1.000:. ./.:6:23,82:.: 0.38:1.000:. ./.:4:32,95:.: 1.43:1.000:. ./.:4:29,69:.: 0.04:1.000:. ./.:4:34,97:.: 1.62:1.000:. ./.:4:45,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:52,84:.: 1.86:1.000:. ./.:4:49,62:.: 0.66:1.000:. ./.:4:21,55:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,70:.:-0.01:1.000:. ./.:4:41,78:.: 1.05:0.910:. ./.:4:0,90:.:-0.34:1.000:. ./.:4:78,70:.: 2.44:1.000:. ./.:4:43,43:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.18:1.000:. ./.:4:69,43:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.62:1.000:. ./.:4:17,83:.: 0.14:1.000:. ./.:4:27,70:.:-0.01:1.000:. ./.:4:26,76:.: 0.23:1.000:. ./.:4:62,59:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.01:0.920:. ./.:4:63,64:.: 1.43:1.000:. ./.:4:69,63:.: 1.67:1.000:. ./.:4:30,47:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,82:.: 0.81:1.000:. ./.:4:39,79:.: 1.00:1.000:. ./.:4:41,38:.:-0.87:1.000:. ./.:4:39,42:.:-0.77:1.000:. ./.:4:21,95:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:9,74:.:-0.68:0.994:. ./.:4:23,64:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,132:.: 3.40:1.000:. ./.:4:24,45:.:-1.35:1.000:. ./.:4:26,115:.: 2.10:1.000:. ./.:4:36,110:.: 2.34:1.000:. ./.:4:42,46:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,93:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,58:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1,114:.: 0.86:1.000:. ./.:4:16,54:.:-1.30:1.000:. ./.:4:32,86:.: 1.00:1.000:. ./.:4:9,65:.:-1.11:1.000:. ./.:4:20,86:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,78:.: 0.52:1.000:. ./.:4:32,56:.:-0.44:1.000:. ./.:4:40,76:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.38:1.000:. ./.:4:32,95:.: 1.43:1.000:. ./.:4:42,75:.: 0.95:1.000:. ./.:4:21,97:.: 1.00:0.999:. ./.:4:0,115:.: 0.86:1.000:. ./.:3:14,41:.:-2.02:0.962:. ./.:4:37,90:.: 1.43:1.000:. ./.:4:36,91:.: 1.43:1.000:. ./.:4:30,72:.: 0.23:1.000:. ./.:4:24,86:.: 0.62:1.000:. ./.:4:16,82:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.95:1.000:. ./.:4:38,56:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,86:.: 1.43:1.000:. ./.:4:23,55:.:-0.92:1.000:. ./.:4:1,103:.: 0.33:1.000:. ./.:4:23,67:.:-0.34:1.000:. ./.:5:26,93:.: 1.05:0.988:. ./.:4:0,91:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,59:.:-1.25:1.000:. ./.:4:24,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.62:1.000:. ./.:4:30,57:.:-0.49:1.000:. ./.:4:24,52:.:-1.01:1.000:. ./.:4:33,51:.:-0.63:1.000:. ./.:4:18,59:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,59:.:-0.44:1.000:. ./.:4:21,66:.:-0.49:1.000:. ./.:4:26,71:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,87:.: 0.33:1.000:. ./.:4:30,76:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,72:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.92:1.000:. ./.:4:21,59:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,99:.: 1.77:1.000:. ./.:4:34,80:.: 0.81:1.000:. ./.:4:33,85:.: 1.00:1.000:. ./.:4:18,67:.:-0.58:1.000:. ./.:4:26,82:.: 0.52:1.000:. ./.:4:22,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:25,66:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,58:.:-1.45:1.000:. ./.:4:21,50:.:-1.25:1.000:. ./.:4:57,40:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.52:1.000:. ./.:4:78,60:.: 1.96:1.000:. ./.:4:63,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,63:.:-0.49:1.000:. ./.:4:35,88:.: 1.24:1.000:. ./.:4:22,56:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.01:1.000:. ./.:4:31,78:.: 0.57:1.000:. ./.:4:26,52:.:-0.92:1.000:. ./.:4:36,19:.:-2.02:1.000:. ./.:4:30,64:.:-0.15:1.000:. ./.:4:58,35:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,58:.:-0.63:1.000:. ./.:4:38,69:.: 0.47:1.000:. ./.:4:28,47:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,52:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.77:1.000:. ./.:4:28,55:.:-0.68:1.000:. ./.:4:33,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:29,80:.: 0.57:1.000:. ./.:4:27,46:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.87:1.000:. ./.:4:31,65:.:-0.06:1.000:. ./.:4:34,77:.: 0.66:1.000:. ./.:4:34,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:37,30:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.01:1.000:. -chr1.1 74842300 chr1.1_074842300 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,171:0.61:-0.30:1.000:0.737 0/0/0/0:4:271,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,58:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,91:0.30: 0.79:1.000:0.981 0/0/0/1:4:275,95:0.27: 1.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,105:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:243,59:0.21: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,87:0.28: 0.90:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,22:0.29:-2.95:1.000:0.991 0/0/0/1:4:50,12:0.20:-3.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,110:0.47:-0.25:1.000:0.992 0/0/0/1:4:231,64:0.23: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,63:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,59:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,132:0.46: 0.62:1.000:0.989 0/0/1/1:4:188,170:0.50: 1.44:0.998:0.997 0/0/1/1:4:86,148:0.58:-0.52:1.000:0.919 0/0/0/1:4:290,85:0.24: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,154:0.51: 0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,14:0.22:-3.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:220,56:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,56:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,19:0.51:-3.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,152:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:291,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,60:0.22: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,75:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,67:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,92:0.27: 1.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:256,64:0.21: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.45:-3.91:1.000:0.981 0/0/0/1:4:73,16:0.19:-2.81:1.000:1.000 0/0/0:3:24,0:0.00:-3.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:327,1:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,86:0.30: 0.55:1.000:0.984 0/0/0/1:4:227,74:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,92:0.29: 1.08:1.000:0.992 0/0/0/1:4:298,80:0.22: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,126:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:183,51:0.23:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,139:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,138:0.52: 0.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:246,60:0.21: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,64:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,60:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:298,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,100:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,155:0.52: 0.51:1.000:0.994 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,66:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,136:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:215,54:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,79:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:218,60:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,144:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:228,63:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:183,49:0.22:-0.55:1.000:0.798 0/0/0/1:4:213,60:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,110:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:236,77:0.26: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,56:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,137:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,68:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,113:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,56:0.20: 0.40:0.910:1.000 0/0/0/1:4:191,58:0.25:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,80:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:179,52:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,76:0.28: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,131:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:182,48:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,66:0.28:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:186,59:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,120:0.45: 0.25:1.000:0.984 0/0/0/1:4:254,87:0.27: 1.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,189:0.75:-1.21:0.920:0.999 0/0/0/1:4:194,64:0.26:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,173:0.54: 0.79:1.000:0.989 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,147:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,72:0.23: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,77:0.49:-1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,51:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,92:0.48:-0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,122:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:163,53:0.26:-0.80:0.994:0.999 0/0/0/1:4:194,49:0.21:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,61:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,52:0.25:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:242,71:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,70:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,98:0.44:-0.42:1.000:0.962 0/0/0/1:4:197,79:0.30: 0.14:1.000:0.982 0/0/1/1:4:139,119:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,52:0.27:-1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:200,72:0.28: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,67:0.31:-0.55:1.000:0.979 0/0/1/1:4:138,115:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,118:0.47: 0.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:166,68:0.31:-0.52:1.000:0.976 0/0/0/1:4:239,72:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,72:0.22: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:295,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,59:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:216,175:0.48: 1.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,118:0.50:-0.30:0.999:0.997 0/0/0/1:4:202,64:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1:3:118,52:0.32:-1.53:0.962:1.000 0/0/0/1:4:197,54:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,46:0.22:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,54:0.28:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,58:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,71:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:192,65:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:172,152:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:363,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,48:0.23:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,83:0.29: 0.62:1.000:0.993 0/0/0/0/0:5:340,0:0.00: 1.15:0.988:1.000 0/0/1/1:4:100,87:0.50:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,104:0.53:-1.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:155,52:0.26:-0.94:1.000:0.998 0/0/0/1:4:172,54:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,135:0.48: 0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:143,49:0.27:-1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:203,69:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/0:4:264,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,86:0.25: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,142:0.48: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:171,54:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,53:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,51:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:186,67:0.28:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:187,72:0.29:-0.12:1.000:0.989 0/0/0/1:4:207,63:0.25: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,1:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,139:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:226,66:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:304,1:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,68:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:267,73:0.23: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:359,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:238,74:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-3.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,82:0.50:-1.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:256,65:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,85:0.29: 0.74:1.000:0.993 0/0/0/1:4:229,74:0.26: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:250,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,81:0.29: 0.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:205,71:0.27: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,118:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,141:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,64:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:254,58:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,70:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,121:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,136:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:235,62:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,60:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:249,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,40:0.19:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,69:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,65:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:190,68:0.28:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:234,67:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,175:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:245,75:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,70:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:228,94:0.31: 0.87:1.000:0.974 0/0/0/1:4:232,61:0.22: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,85:0.26: 1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:249,57:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,68:0.31:-0.49:1.000:0.980 0/0/1/1:4:136,133:0.51: 0.03:1.000:0.996 -chr1.1 75061265 chr1.1_075061265 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:70,16:.:-0.68:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:46,15:.:-1.05:1.000:. ./.:4:103,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:31,11:.:-1.33:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.59:1.000:. ./.:4:56,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:363,0:.: 3.37:1.000:. ./.:4:212,51:.: 1.91:1.000:. ./.:4:40,7:.:-1.26:1.000:. ./.:4:42,13:.:-1.14:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,18:.:-0.90:1.000:. ./.:4:29,16:.:-1.28:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.42:0.998:. ./.:4:104,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:86,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:359,0:.: 3.31:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:396,0:.: 3.85:1.000:. ./.:4:60,13:.:-0.87:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,2:.:-1.55:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:172,26:.: 0.95:1.000:. ./.:4:186,47:.: 1.47:1.000:. ./.:3:67,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,19:.:-0.74:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:63,12:.:-0.85:1.000:. ./.:4:161,32:.: 0.88:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:129,32:.: 0.41:1.000:. ./.:4:62,72:.: 0.02:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:421,0:.: 4.22:1.000:. ./.:4:123,27:.: 0.25:1.000:. ./.:4:155,41:.: 0.93:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:96,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:153,39:.: 0.87:1.000:. ./.:4:41,24:.:-0.99:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:90,16:.:-0.39:1.000:. ./.:4:201,44:.: 1.64:1.000:. ./.:4:112,45:.: 0.35:1.000:. ./.:6:151,43:.: 0.90:1.000:. ./.:4:100,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:154,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:138,55:.: 0.88:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:96,23:.:-0.20:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.71:0.910:. ./.:4:116,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:72,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:128,24:.: 0.28:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:151,42:.: 0.88:1.000:. ./.:4:100,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:128,53:.: 0.71:1.000:. ./.:4:130,52:.: 0.72:1.000:. ./.:4:112,55:.: 0.50:0.920:. ./.:4:135,41:.: 0.63:1.000:. ./.:4:158,33:.: 0.85:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:199,49:.: 1.69:1.000:. ./.:4:145,41:.: 0.78:1.000:. ./.:4:86,20:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:170,32:.: 1.01:1.000:. ./.:4:121,25:.: 0.19:1.000:. ./.:4:85,26:.:-0.32:0.994:. ./.:4:89,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:137,34:.: 0.56:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:105,34:.: 0.09:1.000:. ./.:4:82,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:192,30:.: 1.31:1.000:. ./.:4:125,38:.: 0.44:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:96,34:.:-0.04:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:62,14:.:-0.83:1.000:. ./.:4:189,47:.: 1.51:0.999:. ./.:4:86,30:.:-0.25:1.000:. ./.:3:64,24:.:-0.66:0.962:. ./.:4:101,31:.:-0.01:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:95,28:.:-0.14:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:147,30:.: 0.65:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.82:1.000:. ./.:5:167,0:.: 0.50:0.988:. ./.:4:170,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:88,29:.:-0.23:1.000:. ./.:4:102,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:117,28:.: 0.18:1.000:. ./.:4:66,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:56,29:.:-0.70:1.000:. ./.:4:108,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:128,55:.: 0.74:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:95,38:.: 0.00:1.000:. ./.:4:48,18:.:-0.98:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:103,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:102,27:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:80,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:45,16:.:-1.05:1.000:. ./.:4:353,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:32,10:.:-1.33:1.000:. ./.:4:58,19:.:-0.82:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.74:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:61,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:66,16:.:-0.74:1.000:. ./.:4:52,15:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,17:.:-0.99:1.000:. ./.:4:54,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.77:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,20:.:-0.71:1.000:. ./.:4:37,13:.:-1.21:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:68,24:.:-0.60:1.000:. ./.:4:67,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:73,21:.:-0.57:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:49,11:.:-1.07:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:48,12:.:-1.07:1.000:. ./.:4:64,20:.:-0.71:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.92:1.000:. ./.:4:64,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:57,23:.:-0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:81,18:.:-0.49:1.000:. -chr1.1 75143374 chr1.1_075143374 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:334,113:.: 0.73:1.000:. ./.:4:359,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:336,116:.: 0.79:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:363,134:.: 1.28:1.000:. ./.:4:281,98:.:-0.01:1.000:. ./.:4:405,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:82,20:.:-3.03:1.000:. ./.:4:94,1:.:-3.10:1.000:. ./.:4:413,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:333,111:.: 0.70:1.000:. ./.:4:290,100:.: 0.11:1.000:. ./.:4:345,105:.: 0.76:1.000:. ./.:4:471,1:.: 1.00:0.998:. ./.:4:390,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:580,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:386,131:.: 1.49:1.000:. ./.:4:124,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:273,101:.:-0.06:1.000:. ./.:4:445,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:293,101:.: 0.15:1.000:. ./.:4:66,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:348,126:.: 1.03:1.000:. ./.:4:321,98:.: 0.43:1.000:. ./.:4:402,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:246,274:.: 1.53:1.000:. ./.:4:504,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:411,135:.: 1.81:1.000:. ./.:4:259,108:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,12:.:-3.47:1.000:. ./.:4:100,35:.:-2.67:1.000:. ./.:3:43,0:.:-3.67:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:317,126:.: 0.69:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:451,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:296,104:.: 0.22:1.000:. ./.:4:363,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:328,118:.: 0.72:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:383,114:.: 1.28:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:333,122:.: 0.82:1.000:. ./.:4:350,174:.: 1.57:1.000:. ./.:4:274,107:.: 0.01:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:211,76:.:-1.01:1.000:. ./.:4:343,114:.: 0.84:1.000:. ./.:4:286,99:.: 0.06:1.000:. ./.:4:394,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:265,87:.:-0.30:1.000:. ./.:4:311,98:.: 0.32:1.000:. ./.:4:266,91:.:-0.25:1.000:. ./.:6:242,55:.:-0.90:1.000:. ./.:4:277,100:.:-0.03:1.000:. ./.:4:359,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:261,89:.:-0.33:1.000:. ./.:4:324,129:.: 0.80:1.000:. ./.:4:259,115:.:-0.06:1.000:. ./.:4:295,111:.: 0.28:1.000:. ./.:4:352,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:297,100:.: 0.19:0.910:. ./.:4:319,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:309,124:.: 0.58:1.000:. ./.:4:224,102:.:-0.59:1.000:. ./.:4:394,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:302,110:.: 0.35:1.000:. ./.:4:354,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:335,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:303,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.87:0.920:. ./.:4:304,108:.: 0.35:1.000:. ./.:4:285,97:.: 0.02:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:286,113:.: 0.21:1.000:. ./.:4:301,146:.: 0.73:1.000:. ./.:4:203,66:.:-1.21:1.000:. ./.:4:225,85:.:-0.76:1.000:. ./.:4:243,104:.:-0.36:1.000:. ./.:4:275,81:.:-0.26:1.000:. ./.:4:278,105:.: 0.03:0.994:. ./.:4:235,92:.:-0.58:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:219,80:.:-0.88:1.000:. ./.:4:270,127:.: 0.19:1.000:. ./.:4:278,84:.:-0.20:1.000:. ./.:4:230,86:.:-0.70:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:254,111:.:-0.16:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:192,64:.:-1.35:1.000:. ./.:4:289,92:.: 0.01:1.000:. ./.:4:258,88:.:-0.37:1.000:. ./.:4:256,77:.:-0.51:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:344,104:.: 0.74:1.000:. ./.:4:380,114:.: 1.24:1.000:. ./.:4:397,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:261,110:.:-0.10:1.000:. ./.:4:402,137:.: 1.73:1.000:. ./.:4:346,1:.:-0.36:0.999:. ./.:4:395,0:.: 0.16:1.000:. ./.:3:194,0:.:-2.03:0.962:. ./.:4:391,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:231,73:.:-0.83:1.000:. ./.:4:262,90:.:-0.30:1.000:. ./.:4:247,77:.:-0.61:1.000:. ./.:4:303,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:260,86:.:-0.37:1.000:. ./.:4:293,95:.: 0.09:1.000:. ./.:4:290,97:.: 0.08:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:287,97:.: 0.04:1.000:. ./.:5:438,0:.: 0.63:0.988:. ./.:4:294,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:282,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:311,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:303,93:.: 0.18:1.000:. ./.:4:246,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:273,81:.:-0.28:1.000:. ./.:4:243,91:.:-0.50:1.000:. ./.:4:400,149:.: 1.84:1.000:. ./.:4:305,119:.: 0.48:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:278,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:235,86:.:-0.64:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:210,66:.:-1.13:1.000:. ./.:4:363,134:.: 1.28:1.000:. ./.:4:355,149:.: 1.35:1.000:. ./.:4:342,120:.: 0.89:1.000:. ./.:4:257,98:.:-0.27:1.000:. ./.:4:362,128:.: 1.20:1.000:. ./.:4:276,105:.: 0.01:1.000:. ./.:4:508,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:371,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:105,1:.:-2.98:1.000:. ./.:4:238,86:.:-0.61:1.000:. ./.:4:338,118:.: 0.83:1.000:. ./.:4:453,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:360,134:.: 1.24:1.000:. ./.:4:410,125:.: 1.69:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:343,111:.: 0.81:1.000:. ./.:4:277,105:.: 0.02:1.000:. ./.:4:310,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:376,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:304,104:.: 0.31:1.000:. ./.:4:323,115:.: 0.63:1.000:. ./.:4:414,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:277,110:.: 0.08:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:311,96:.: 0.30:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:350,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:346,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:383,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:247,101:.:-0.35:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:288,81:.:-0.12:1.000:. ./.:4:436,148:.: 2.22:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:323,93:.: 0.39:1.000:. ./.:4:358,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:520,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:390,131:.: 1.54:1.000:. ./.:4:319,107:.: 0.50:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.47:1.000:. -chr1.1 75309520 chr1.1_075309520 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:218,72:.: 1.32:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:187,59:.: 0.58:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:238,96:.: 2.06:1.000:. ./.:4:154,55:.:-0.04:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:65,15:.:-2.21:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:196,82:.: 1.12:1.000:. ./.:4:184,60:.: 0.55:1.000:. ./.:4:197,91:.: 1.29:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.97:0.998:. ./.:4:213,79:.: 1.36:1.000:. ./.:4:341,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:236,92:.: 1.96:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:190,59:.: 0.63:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:179,82:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:205,75:.: 1.16:1.000:. ./.:4:234,72:.: 1.59:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:136,132:.: 0.95:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:222,63:.: 1.24:1.000:. ./.:4:170,57:.: 0.26:1.000:. ./.:4:80,17:.:-1.92:1.000:. ./.:4:82,37:.:-1.55:1.000:. ./.:3:49,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:214,69:.: 1.21:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:159,58:.: 0.10:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:169,55:.: 0.21:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:149,62:.:-0.01:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:198,51:.: 0.63:1.000:. ./.:4:140,43:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:119,45:.:-0.80:1.000:. ./.:4:207,73:.: 1.16:1.000:. ./.:4:148,46:.:-0.29:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:141,56:.:-0.24:1.000:. ./.:4:126,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:128,52:.:-0.53:1.000:. ./.:6:107,24:.:-1.35:1.000:. ./.:4:133,46:.:-0.54:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:112,50:.:-0.83:1.000:. ./.:4:155,42:.:-0.24:1.000:. ./.:4:130,42:.:-0.66:1.000:. ./.:4:112,35:.:-1.08:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:138,45:.:-0.48:0.910:. ./.:4:207,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,52:.:-1.08:1.000:. ./.:4:132,40:.:-0.66:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:194,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:126,50:.:-0.59:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.03:0.920:. ./.:4:143,51:.:-0.29:1.000:. ./.:4:143,52:.:-0.27:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:134,54:.:-0.39:1.000:. ./.:4:143,44:.:-0.41:1.000:. ./.:4:127,21:.:-1.07:1.000:. ./.:4:105,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:126,39:.:-0.78:1.000:. ./.:4:146,68:.: 0.05:1.000:. ./.:4:151,55:.:-0.09:0.994:. ./.:4:152,39:.:-0.34:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:117,50:.:-0.75:1.000:. ./.:4:128,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:142,66:.:-0.06:1.000:. ./.:4:99,35:.:-1.30:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:126,49:.:-0.61:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:98,37:.:-1.28:1.000:. ./.:4:110,38:.:-1.07:1.000:. ./.:4:119,33:.:-1.00:1.000:. ./.:4:149,48:.:-0.24:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:212,55:.: 0.94:1.000:. ./.:4:226,93:.: 1.81:1.000:. ./.:4:183,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:116,65:.:-0.51:1.000:. ./.:4:256,100:.: 2.44:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:175,0:.:-0.61:1.000:. ./.:3:90,0:.:-2.04:0.962:. ./.:4:202,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:151,45:.:-0.26:1.000:. ./.:4:131,48:.:-0.54:1.000:. ./.:4:125,44:.:-0.71:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:122,46:.:-0.73:1.000:. ./.:4:142,50:.:-0.32:1.000:. ./.:4:183,61:.: 0.55:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:135,45:.:-0.53:1.000:. ./.:5:221,0:.: 0.16:0.988:. ./.:4:139,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:189,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:150,55:.:-0.11:1.000:. ./.:4:141,41:.:-0.49:1.000:. ./.:4:265,96:.: 2.52:1.000:. ./.:4:128,41:.:-0.71:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:137,41:.:-0.56:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,28:.:-1.79:1.000:. ./.:4:247,66:.: 1.71:1.000:. ./.:4:248,74:.: 1.86:1.000:. ./.:4:168,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:162,66:.: 0.28:1.000:. ./.:4:198,71:.: 0.97:1.000:. ./.:4:157,58:.: 0.06:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:76,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:144,73:.: 0.10:1.000:. ./.:4:190,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:229,80:.: 1.64:1.000:. ./.:4:196,66:.: 0.85:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:202,83:.: 1.24:1.000:. ./.:4:170,55:.: 0.23:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:181,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:169,60:.: 0.30:1.000:. ./.:4:191,80:.: 1.00:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:164,75:.: 0.47:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.55:0.999:. ./.:4:183,58:.: 0.50:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:173,44:.: 0.10:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:133,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:243,85:.: 1.96:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:204,87:.: 1.34:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:365,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:259,84:.: 2.22:1.000:. ./.:4:156,72:.: 0.28:1.000:. ./.:4:222,1:.: 0.20:1.000:. -chr1.1 75444453 chr1.1_075444453 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:19,46:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,39:0.67: 0.70:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,24:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,12:0.35:-0.40:1.000:0.816 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,58:0.76: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,14:0.63:-1.24:1.000:0.613 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,38:0.78: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,43:0.71: 0.80:1.000:0.989 0/0/1/1:4:16,20:0.61:-0.64:1.000:0.710 0/0/0/1:4:46,21:0.37: 0.90:1.000:0.575 0/0/1/1:4:45,54:0.60: 2.49:0.996:0.799 0/1/1/1:4:19,48:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,52:0.61: 2.19:1.000:0.673 0/0/0/1:4:47,20:0.35: 0.90:1.000:0.760 0/1/1/1:4:8,12:0.65:-1.44:1.000:0.785 0/0/1/1:4:32,21:0.46: 0.20:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,20:0.41: 0.40:1.000:0.855 0/1/1/1:4:10,19:0.70:-0.99:1.000:0.985 0/0/1/1:4:49,33:0.46: 1.65:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,55:0.71: 1.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,63:0.78: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,27:0.41: 1.40:1.000:0.853 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,58:0.60: 2.89:1.000:0.824 0/0/1/1:4:41,29:0.48: 1.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:19,5:0.26:-1.24:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,7:0.89:-2.04:1.000:0.591 1/1/1:3:0,17:1.00:-1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,25:0.39: 1.35:1.000:0.638 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,65:0.79: 1.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,9:0.28:-0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,40:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,15:0.32: 0.40:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,13:0.37:-0.40:1.000:0.524 0/1/1/1:4:13,48:0.82: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,19:0.40: 0.35:1.000:0.758 0/1/1/1:4:4,8:0.71:-1.84:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,3:0.13:-1.04:1.000:0.938 0/1/1/1:4:18,44:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,22:0.79:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,45:0.66: 1.20:1.000:0.894 0/1/1/1:4:12,28:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,28:0.63:-0.05:1.000:0.613 1/1/1/1:4:1,50:0.98: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,48:0.74: 1.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,27:0.69:-0.35:1.000:0.971 0/0/0/1:4:37,12:0.30: 0.00:1.000:0.988 0/0/1/1:4:24,29:0.60: 0.20:1.000:0.786 0/0/0/1/1/1:6:11,12:0.58:-1.29:1.000:0.543 0/0/1/1:4:14,11:0.50:-1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,32:0.60: 0.45:1.000:0.747 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,11:0.47:-1.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:39,18:0.37: 0.40:1.000:0.542 0/0/1/1:4:33,29:0.53: 0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,13:0.54:-1.09:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,26:0.51: 0.45:0.910:0.996 0/1/1/1:4:9,34:0.82:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,14:0.39:-0.35:1.000:0.692 0/0/1/1:4:15,10:0.46:-1.19:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,35:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,12:0.49:-1.04:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,39:0.98:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,28:0.67:-0.20:1.000:0.919 0/1/1/1:4:17,32:0.70: 0.00:1.000:0.983 0/1/1/1:4:7,37:0.86:-0.25:1.000:0.955 0/1/1/1:4:17,28:0.67:-0.20:1.000:0.919 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.29:0.920:1.000 0/1/1/1:4:21,42:0.71: 0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,15:0.44:-0.50:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,21:0.35: 1.10:1.000:0.788 0/0/1/1:4:18,10:0.42:-1.04:1.000:0.892 0/0/0/1:4:24,9:0.33:-0.79:1.000:0.935 0/1/1/1:4:13,29:0.73:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,10:0.30:-0.45:1.000:0.983 0/0/0/1:4:42,15:0.32: 0.40:1.000:0.962 0/0/1/1:4:14,14:0.56:-1.04:0.994:0.971 0/1/1/1:4:13,25:0.70:-0.54:1.000:0.987 0/1/1/1:4:10,36:0.81:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,35:0.63: 0.55:1.000:0.613 0/0/1/1:4:30,34:0.59: 0.75:1.000:0.887 0/0/1/1:4:35,29:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,22:0.77:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.53:-1.69:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,24:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,27:0.66:-0.25:1.000:0.879 0/0/1/1:4:7,7:0.56:-1.74:1.000:0.971 0/1/1/1:4:15,24:0.66:-0.50:1.000:0.889 0/1/1/1:4:5,14:0.77:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,11:0.39:-0.79:1.000:0.692 0/0/0/1:4:21,5:0.24:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,20:0.43: 0.25:1.000:0.944 0/1/1/1:4:13,29:0.73:-0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,19:0.42: 0.20:1.000:0.899 0/1/1/1:4:19,61:0.80: 1.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,19:0.44: 0.05:1.000:0.966 0/0/1/1:4:65,36:0.41: 2.59:1.000:0.889 0/1/1/1:4:12,20:0.67:-0.84:0.999:0.929 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1:3:1,19:0.96:-1.44:0.962:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.71:-1.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:13,12:0.54:-1.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:24,21:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:22,21:0.55:-0.30:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,23:0.63:-0.45:1.000:0.512 0/0/1/1:4:22,11:0.39:-0.79:1.000:0.692 0/1/1/1:4:16,56:0.81: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,32:0.71:-0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,19:0.41: 0.25:1.000:0.861 1/1/1/1/1:5:0,38:1.00:-0.54:0.988:1.000 0/0/0/1:4:18,8:0.36:-1.14:1.000:0.652 0/1/1/1:4:9,14:0.66:-1.29:1.000:0.850 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,21:0.37: 0.85:1.000:0.509 0/1/1/1:4:14,31:0.73:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,27:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,21:0.65:-0.69:1.000:0.785 0/1/1/1:4:27,61:0.73: 1.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,17:0.39: 0.10:1.000:0.692 1/1/1/1:4:1,32:0.97:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,15:0.72:-1.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,15:0.72:-1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,22:0.62:-0.50:1.000:0.618 0/1/1/1:4:8,21:0.76:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.71:-1.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:59,17:0.27: 1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,24:0.55: 0.00:1.000:0.982 0/1/1/1:4:16,42:0.76: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,20:0.42: 0.30:1.000:0.922 0/0/1/1:4:32,30:0.54: 0.65:1.000:0.986 0/1/1/1:4:16,30:0.70:-0.15:1.000:0.982 1/1/1/1:4:1,87:0.99: 1.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,9:0.28:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,41:0.67: 0.85:1.000:0.915 1/1/1/1:4:0,50:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,21:0.34: 1.25:1.000:0.882 0/0/1/1:4:38,24:0.45: 0.65:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.59: 0.05:1.000:0.838 0/0/1/1:4:38,37:0.55: 1.30:1.000:0.979 0/1/1/1:4:25,42:0.67: 0.90:1.000:0.935 0/1/1/1:4:19,49:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,32:0.69: 0.05:1.000:0.967 0/1/1/1:4:23,42:0.69: 0.80:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,11:0.30:-0.25:1.000:0.983 0/0/1/1:4:34,22:0.45: 0.35:0.999:0.982 0/1/1/1:4:18,25:0.63:-0.30:1.000:0.590 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,45:0.75: 0.70:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,35:0.95:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,15:0.56:-0.94:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.56:-0.74:1.000:0.971 0/0/1/1:4:71,34:0.38: 2.79:1.000:0.570 0/1/1/1:4:21,46:0.73: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,25:0.54: 0.15:1.000:0.988 0/1/1/1:4:6,36:0.88:-0.35:1.000:0.820 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,73:0.72: 2.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,17:0.34: 0.50:1.000:0.853 0/0/1/1:4:23,28:0.60: 0.10:1.000:0.770 -chr1.1 75668041 chr1.1_075668041 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,193:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,30:0.45:-0.70:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,148:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,44:0.48:-0.29:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,192:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,213:0.78: 2.30:0.996:1.000 0/1/1/1:4:68,133:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,182:0.71: 2.20:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,92:0.98:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,183:0.83: 1.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,54:0.58:-0.39:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,91:0.63: 0.42:1.000:0.606 1/1/1/1:4:0,237:1.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,36:0.46:-0.52:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,192:1.00: 0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1:3:0,14:1.00:-1.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,228:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,54:0.56:-0.33:1.000:0.958 0/0/1/1:4:111,111:0.61: 1.15:1.000:0.712 0/0/1/1:4:102,46:0.44: 0.08:1.000:0.968 0/1/1/1:4:77,133:0.72: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,172:0.78: 1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,198:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:142,197:0.68: 2.85:1.000:0.949 0/1/1/1:4:93,171:0.74: 1.76:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,82:0.60: 0.37:1.000:0.809 0/1/1/1:4:64,86:0.67: 0.10:1.000:0.927 0/1/1/1:4:86,115:0.67: 0.85:1.000:0.923 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,60:0.99:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,209:1.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,54:0.59:-0.45:1.000:0.847 0/1/1/1/1/1:6:29,91:0.82:-0.33:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,103:0.72: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,114:0.67: 0.85:1.000:0.904 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,181:0.77: 1.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,28:0.41:-0.64:1.000:0.891 1/1/1/1:4:0,181:1.00: 0.56:0.910:1.000 1/1/1/1:4:0,152:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,241:0.81: 2.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,78:0.66:-0.06:1.000:0.875 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,136:0.73: 1.01:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,180:1.00: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,149:0.77: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,81:0.63: 0.15:1.000:0.609 0/0/1/1:4:109,74:0.53: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,70:0.52: 0.45:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.39:0.920:1.000 0/0/1/1:4:95,76:0.56: 0.41:1.000:0.967 0/1/1/1:4:90,201:0.77: 2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,45:0.53:-0.46:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,161:1.00: 0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,124:0.79: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,153:0.77: 1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,150:1.00: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.38:0.994:1.000 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,217:0.81: 2.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,195:1.00: 0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,88:0.69: 0.09:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,168:0.75: 1.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,160:1.00: 0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,165:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,167:0.80: 1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,160:1.00: 0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,195:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,104:0.69: 0.45:0.999:0.977 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1:3:60,7:0.25:-1.10:0.962:1.000 0/0/1/1:4:76,69:0.59: 0.03:1.000:0.880 0/1/1/1:4:78,130:0.72: 0.95:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,163:0.76: 1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,151:1.00: 0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:86,45:0.47:-0.17:0.988:0.762 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,80:0.67:-0.06:1.000:0.934 0/0/1/1:4:72,33:0.44:-0.55:1.000:0.973 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,66:0.69:-0.48:1.000:0.980 0/1/1/1:4:90,176:0.75: 1.79:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,148:0.76: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,186:0.78: 1.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,51:0.99:-1.32:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,204:1.00: 0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,173:1.00: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,160:1.00: 0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,47:0.46:-0.01:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:41,29:0.53:-1.06:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,60:0.56:-0.13:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,247:0.79: 2.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,195:0.79: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,34:0.44:-0.49:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,73:0.60: 0.09:1.000:0.796 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,41:0.45:-0.22:1.000:0.979 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,125:0.78: 0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,251:1.00: 1.57:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,36:0.50:-0.68:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,153:0.75: 1.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,45:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,187:0.83: 1.46:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 0.05:1.000:1.000 -chr1.1 76061917 chr1.1_076061917 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,178:.: 1.35:1.000:. ./.:4:54,55:.:-0.67:1.000:. ./.:4:47,116:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.65:1.000:. ./.:4:33,128:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,180:.: 1.41:1.000:. ./.:4:29,54:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.77:1.000:. ./.:4:34,117:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,44:.:-2.04:1.000:. ./.:4:20,38:.:-2.16:1.000:. ./.:4:31,93:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.77:1.000:. ./.:4:45,118:.: 0.91:1.000:. ./.:4:126,54:.: 1.41:0.996:. ./.:4:49,113:.: 0.88:1.000:. ./.:4:94,84:.: 1.35:1.000:. ./.:4:44,140:.: 1.53:1.000:. ./.:4:21,33:.:-2.27:1.000:. ./.:4:28,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:16,19:.:-2.83:1.000:. ./.:4:46,137:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.77:1.000:. ./.:4:51,70:.:-0.32:1.000:. ./.:4:26,137:.: 0.91:1.000:. ./.:4:31,119:.: 0.53:1.000:. ./.:4:49,112:.: 0.85:1.000:. ./.:4:38,107:.: 0.39:1.000:. ./.:4:14,50:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,49:.:-2.42:1.000:. ./.:3:0,72:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,175:.: 1.26:1.000:. ./.:4:30,122:.: 0.59:1.000:. ./.:4:39,96:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,72:.: 0.91:1.000:. ./.:4:34,116:.: 0.53:1.000:. ./.:4:70,60:.:-0.05:1.000:. ./.:4:64,64:.:-0.11:1.000:. ./.:4:40,136:.: 1.29:1.000:. ./.:4:45,111:.: 0.71:1.000:. ./.:4:25,100:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,127:.: 1.32:1.000:. ./.:4:41,100:.: 0.27:1.000:. ./.:4:34,123:.: 0.74:1.000:. ./.:4:67,64:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,68:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.70:1.000:. ./.:4:68,148:.: 2.46:1.000:. ./.:4:17,89:.:-0.75:1.000:. ./.:4:39,128:.: 1.03:1.000:. ./.:4:37,97:.: 0.06:1.000:. ./.:4:53,138:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.23:1.000:. ./.:4:61,97:.: 0.77:1.000:. ./.:4:32,100:.: 0.01:1.000:. ./.:6:13,83:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.84:1.000:. ./.:4:86,56:.: 0.30:1.000:. ./.:4:36,114:.: 0.53:1.000:. ./.:4:28,86:.:-0.52:1.000:. ./.:4:74,71:.: 0.39:1.000:. ./.:4:80,78:.: 0.77:1.000:. ./.:4:20,58:.:-1.57:1.000:. ./.:4:21,84:.:-0.78:1.000:. ./.:4:27,106:.: 0.04:0.910:. ./.:4:34,91:.:-0.20:1.000:. ./.:4:85,68:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,78:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.50:1.000:. ./.:4:30,124:.: 0.65:1.000:. ./.:4:30,99:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.64:1.000:. ./.:4:64,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,46:.:-1.08:1.000:. ./.:4:57,72:.:-0.08:1.000:. ./.:4:52,116:.: 1.06:1.000:. ./.:4:47,32:.:-1.54:0.920:. ./.:4:32,111:.: 0.33:1.000:. ./.:4:71,75:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,82:.:-0.58:1.000:. ./.:4:39,111:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.30:1.000:. ./.:4:64,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:45,63:.:-0.70:1.000:. ./.:4:29,101:.:-0.05:1.000:. ./.:4:33,98:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.04:0.994:. ./.:4:0,113:.:-0.55:1.000:. ./.:4:66,81:.: 0.44:1.000:. ./.:4:32,91:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,87:.:-0.52:1.000:. ./.:4:43,111:.: 0.65:1.000:. ./.:4:17,68:.:-1.37:1.000:. ./.:4:26,71:.:-1.02:1.000:. ./.:4:75,38:.:-0.55:1.000:. ./.:4:42,114:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,75:.:-1.66:1.000:. ./.:4:32,83:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.34:1.000:. ./.:4:33,76:.:-0.67:1.000:. ./.:4:29,91:.:-0.34:1.000:. ./.:4:26,117:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,44:.:-0.93:1.000:. ./.:4:24,79:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,186:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.39:1.000:. ./.:4:21,71:.:-1.16:1.000:. ./.:4:47,143:.: 1.70:1.000:. ./.:4:45,64:.:-0.67:0.999:. ./.:4:0,127:.:-0.14:1.000:. ./.:3:18,31:.:-2.42:0.962:. ./.:4:29,95:.:-0.23:1.000:. ./.:4:59,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.49:1.000:. ./.:4:30,85:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.17:1.000:. ./.:4:51,52:.:-0.84:1.000:. ./.:4:30,96:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.62:1.000:. ./.:4:22,106:.:-0.11:1.000:. ./.:4:26,92:.:-0.40:1.000:. ./.:5:31,100:.:-0.02:0.988:. ./.:4:56,52:.:-0.70:1.000:. ./.:4:41,44:.:-1.37:1.000:. ./.:4:18,50:.:-1.86:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.11:1.000:. ./.:4:29,118:.: 0.44:1.000:. ./.:4:37,45:.:-1.46:1.000:. ./.:4:59,50:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.80:1.000:. ./.:4:31,86:.:-0.43:1.000:. ./.:4:16,70:.:-1.34:1.000:. ./.:4:22,61:.:-1.43:1.000:. ./.:4:49,36:.:-1.37:1.000:. ./.:4:63,63:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,84:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.93:1.000:. ./.:4:45,139:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.01:1.000:. ./.:4:38,99:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,180:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,133:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.50:1.000:. ./.:4:9,38:.:-2.48:1.000:. ./.:4:35,108:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,150:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.18:1.000:. ./.:4:92,90:.: 1.47:1.000:. ./.:4:78,62:.: 0.24:1.000:. ./.:4:24,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,181:.: 1.44:1.000:. ./.:4:35,128:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,112:.: 0.50:1.000:. ./.:4:67,54:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,153:.: 0.65:1.000:. ./.:4:29,83:.:-0.58:1.000:. ./.:4:33,119:.: 0.59:1.000:. ./.:4:72,72:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,56:.:-0.20:0.999:. ./.:4:0,118:.:-0.40:1.000:. ./.:4:48,99:.: 0.44:1.000:. ./.:4:36,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:32,90:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.11:1.000:. ./.:4:30,109:.: 0.21:1.000:. ./.:4:52,153:.: 2.14:1.000:. ./.:4:71,75:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.68:1.000:. ./.:4:15,103:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,122:.: 0.91:1.000:. ./.:4:46,139:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,222:.: 2.64:1.000:. ./.:4:72,57:.:-0.08:1.000:. ./.:4:37,105:.: 0.30:1.000:. -chr1.1 76269128 chr1.1_076269128 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:67,0:.: 3.65:0.996:. ./.:4:26,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:10,0:.:-1.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.61:0.910:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 1.57:0.920:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.11:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:7,0:.:-1.79:0.962:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.20:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.30:1.000:. -chr1.1 76401726 chr1.1_076401726 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:144,57:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,129:0.69: 0.20:1.000:0.978 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,88:0.44: 0.33:1.000:0.966 0/0/0/1:4:144,50:0.23: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,143:0.47: 2.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,99:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,57:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,68:0.30: 0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:36,42:0.48:-1.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,29:0.39:-2.17:1.000:0.651 0/0/1/1:4:83,83:0.45: 0.04:1.000:0.977 0/0/0/1:4:142,51:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,95:0.47: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,90:0.46: 0.22:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,184:0.76: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,123:0.55: 0.87:0.996:0.981 0/1/1/1:4:52,112:0.63: 0.00:1.000:0.541 0/0/0/1:4:162,81:0.30: 1.76:1.000:0.987 0/1/1/1:4:43,195:0.77: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,22:0.28:-2.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,109:0.52: 0.51:1.000:0.994 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,118:0.48: 1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,21:0.30:-2.26:1.000:0.987 0/1/1/1:4:43,148:0.72: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:137,66:0.29: 0.87:1.000:0.992 0/0/0/1:4:124,65:0.31: 0.56:1.000:0.978 0/1/1/1:4:41,156:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,49:0.26: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:84,111:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,109:0.47: 0.98:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,44:0.75:-2.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,55:0.66:-1.95:1.000:0.874 0/0/0:3:42,0:0.00:-2.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:197,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,97:0.45: 0.67:1.000:0.977 0/0/0/1:4:139,57:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,44:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,63:0.31: 0.42:1.000:0.978 0/1/1/1:4:37,121:0.71:-0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:126,57:0.28: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,153:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,84:0.57:-0.65:1.000:0.957 0/0/1/1:4:64,101:0.56: 0.02:1.000:0.974 0/0/0/1:4:104,53:0.30:-0.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:96,112:0.48: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:69,27:0.25:-1.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,131:0.77:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,88:0.57:-0.54:1.000:0.941 0/0/0/1:4:102,41:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,101:0.48: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:102,30:0.20:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,173:0.76: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,39:0.27:-0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,47:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,94:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,157:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,78:0.51:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:49,63:0.50:-1.17:1.000:0.888 0/0/1/1:4:85,73:0.41:-0.14:1.000:0.880 0/0/1/1:4:79,119:0.54: 0.76:1.000:0.985 0/0/0/1:4:110,59:0.31: 0.11:1.000:0.972 0/0/1/1:4:54,95:0.58:-0.34:1.000:0.908 0/1/1/1:4:41,152:0.74: 0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,121:0.60: 0.44:1.000:0.772 0/1/1/1:4:24,99:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,143:0.79: 0.18:0.910:1.000 0/0/0/1:4:123,43:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,113:0.56: 0.44:1.000:0.971 0/0/1/1:4:50,53:0.46:-1.37:1.000:0.988 0/0/0/1:4:106,40:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,43:0.22: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,96:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:72,38:0.31:-1.21:1.000:0.976 0/0/0/1:4:101,42:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,51:0.28:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,73:0.44:-0.34:1.000:0.964 0/0/1/1:4:81,84:0.46: 0.02:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 0.00:0.920:1.000 0/0/1/1:4:71,90:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,138:0.72: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,106:0.80:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,90:0.55:-0.36:1.000:0.979 0/1/1/1:4:34,95:0.68:-0.79:1.000:0.962 0/0/1/1:4:59,74:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,116:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,135:0.80:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,66:0.50:-1.01:0.994:0.997 0/0/1/1:4:62,86:0.52:-0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:109,56:0.30: 0.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:59,94:0.56:-0.25:1.000:0.971 0/0/1/1:4:49,86:0.58:-0.65:1.000:0.911 0/0/1/1:4:58,88:0.55:-0.41:1.000:0.984 0/0/0/1:4:81,34:0.26:-1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,76:0.47:-0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,47:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,93:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,69:0.53:-1.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:130,56:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,33:0.29:-1.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,75:0.58:-1.03:1.000:0.917 0/1/1/1:4:31,77:0.66:-1.26:1.000:0.865 0/1/1/1:4:43,102:0.65:-0.43:1.000:0.788 0/0/0/1:4:77,37:0.29:-1.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:89,118:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,129:0.46: 1.97:1.000:0.986 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,68:0.53:-1.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,215:0.71: 2.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:63,101:0.56: 0.00:0.999:0.969 0/0/0/1:4:112,42:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/1:3:53,32:0.34:-1.77:0.962:1.000 0/0/0/1:4:107,45:0.26:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,24:0.21:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,82:0.63:-0.99:1.000:0.546 0/0/1/1:4:47,82:0.58:-0.79:1.000:0.917 0/0/0/1:4:97,24:0.18:-0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,39:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,75:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,123:0.82:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:178,60:0.22: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,41:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,97:0.52: 0.06:1.000:0.994 0/0/0/0/0:5:149,0:0.00:-0.34:0.988:1.000 0/0/1/1:4:50,72:0.53:-0.94:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,67:0.51:-1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,30:0.25:-1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,33:0.26:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,161:0.72: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,29:0.31:-1.79:1.000:0.977 0/0/1/1:4:67,106:0.56: 0.20:1.000:0.973 0/0/0/1:4:103,47:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,154:0.53: 2.17:1.000:0.991 0/1/1/1:4:38,132:0.73: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,40:0.30:-1.03:1.000:0.983 0/0/0/1:4:75,22:0.20:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,31:0.24:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,33:0.27:-1.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,63:0.48:-1.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:149,55:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,28:0.25:-1.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,208:0.77: 2.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,137:0.50: 1.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,52:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,100:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,107:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,31:0.20:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,0:0.00: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,58:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/0:4:72,1:0.01:-2.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,134:0.78:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,112:0.55: 0.47:1.000:0.982 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,149:0.54: 1.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:83,112:0.52: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,109:0.48: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,95:0.47: 0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:75,97:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,98:0.55:-0.05:1.000:0.982 0/0/1/1:4:79,105:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,100:0.47: 0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:154,56:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,147:0.69: 0.78:1.000:0.967 0/0/1/1:4:94,115:0.49: 1.00:0.999:0.996 0/0/1/1:4:87,110:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:120,49:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,44:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,61:0.29: 0.47:1.000:0.990 0/0/1/1:4:86,109:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,48:0.33:-0.81:1.000:0.900 0/0/1/1:4:80,86:0.46: 0.04:1.000:0.989 0/1/1/1:4:53,211:0.75: 2.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,63:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,126:0.54: 1.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:137,67:0.29: 0.89:1.000:0.990 0/0/0/1:4:153,51:0.22: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,61:0.23: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,139:0.45: 2.53:1.000:0.978 0/0/1/1:4:80,90:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,118:0.51: 0.94:1.000:0.996 -chr1.1 76590836 chr1.1_076590836 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:35,12:0.25: 2.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,11:0.57:-0.98:1.000:0.951 0/0/1/1:4:13,10:0.41:-0.38:1.000:0.851 0/0/0/1:4:20,7:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,19:0.44: 1.31:1.000:0.972 0/0/1/1:4:18,18:0.47: 0.91:1.000:0.991 0/0/0/1:4:15,2:0.11:-0.98:1.000:0.619 0/0/1/1:4:15,16:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.32:-2.38:1.000:0.959 0/0/1/1:4:3,3:0.47:-2.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:18,5:0.21:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,10:0.34: 0.12:1.000:0.876 0/0/0/1:4:25,10:0.28: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,21:0.59: 0.41:1.000:0.879 0/0/0/1:4:17,9:0.33:-0.08:1.000:0.924 0/0/0/1:4:17,11:0.37: 0.12:0.996:0.555 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,15:0.29: 2.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:10,4:0.28:-1.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,6:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,10:0.30: 0.51:1.000:0.986 0/0/1/1:4:13,11:0.43:-0.28:1.000:0.943 0/0/0/1:4:12,3:0.19:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,9:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,4:0.13: 0.22:1.000:0.940 0/0/0/1:4:20,7:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,1:0.80:-2.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,5:0.27:-0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:3,3:0.47:-2.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:0,3:0.80:-2.38:1.000:1.000 0/0/1:3:1,1:0.47:-2.48:1.000:0.907 0/0/1/1:4:13,13:0.47:-0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:21,11:0.33: 0.51:1.000:0.932 0/1/1/1:4:5,33:0.71: 1.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:14,5:0.26:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,18:0.57: 0.12:1.000:0.957 0/0/1/1:4:12,11:0.45:-0.38:1.000:0.976 0/0/1/1:4:12,23:0.57: 0.81:1.000:0.933 0/0/1/1:4:19,13:0.38: 0.51:1.000:0.602 0/1/1/1:4:2,29:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,7:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,5:0.11: 1.61:1.000:0.580 0/0/0/1:4:7,1:0.12:-1.88:1.000:0.793 0/0/1/1:4:12,9:0.40:-0.58:1.000:0.810 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.19:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,26:0.57: 1.31:1.000:0.946 0/0/1/1:4:8,17:0.59:-0.18:1.000:0.869 0/0/0/1:4:14,9:0.37:-0.38:1.000:0.573 0/1/1/1:4:7,21:0.63: 0.12:1.000:0.605 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,6:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,18:0.63:-0.28:1.000:0.605 0/0/1/1/1/1:6:5,12:0.61:-0.98:1.000:0.686 0/0/1/1:4:11,15:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,9:0.40:-0.58:1.000:0.810 0/0/1/1:4:6,16:0.62:-0.48:1.000:0.584 0/1/1/1:4:1,17:0.76:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.30:-0.78:1.000:0.983 0/0/1/1:4:11,14:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.88:0.910:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.38: 0.31:1.000:0.529 0/0/0/1:4:14,9:0.37:-0.38:1.000:0.573 0/0/1/1:4:5,13:0.62:-0.88:1.000:0.624 0/0/1/1:4:6,15:0.61:-0.58:1.000:0.684 0/0/1/1:4:13,18:0.53: 0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:16,10:0.36:-0.08:1.000:0.649 0/0/1/1:4:14,13:0.45: 0.02:1.000:0.979 0/0/1/1:4:10,15:0.54:-0.18:1.000:0.988 0/0/0/1:4:17,8:0.31:-0.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:8,18:0.60:-0.08:1.000:0.817 0/0/1/1:4:8,15:0.57:-0.38:1.000:0.942 0/0/1/1:4:10,9:0.44:-0.78:0.920:0.971 0/0/1/1:4:18,17:0.45: 0.81:1.000:0.983 0/0/1/1:4:9,11:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,20:0.48: 1.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:10,3:0.22:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,22:0.55: 0.91:1.000:0.984 0/0/1/1:4:11,16:0.53: 0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:22,5:0.18: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,6:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,6:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,10:0.47:-0.68:0.994:0.991 0/0/0/1:4:28,8:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,15:0.55:-0.28:1.000:0.975 0/0/0/0:4:24,1:0.04:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.43:-0.48:1.000:0.933 0/0/1/1:4:7,15:0.59:-0.48:1.000:0.862 0/0/1/1:4:9,22:0.61: 0.41:1.000:0.716 0/0/0/1:4:35,13:0.26: 2.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,17:0.54: 0.12:1.000:0.985 0/0/0/1:4:21,11:0.33: 0.51:1.000:0.932 0/0/0/1:4:5,3:0.35:-1.88:1.000:0.746 0/0/0/1:4:30,8:0.20: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.28:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,13:0.32: 1.21:1.000:0.959 0/0/1/1:4:6,10:0.55:-1.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:16,12:0.40: 0.12:1.000:0.810 0/0/0/1:4:26,9:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,5:0.16: 0.41:1.000:0.994 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,4:0.14: 0.12:1.000:0.963 0/1/1/1:4:6,20:0.65:-0.08:0.999:0.747 0/0/1/1:4:6,10:0.55:-1.08:1.000:0.975 0/1/1:3:3,9:0.63:-1.48:0.962:1.000 0/1/1/1:4:4,28:0.71: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,14:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,14:0.60:-0.68:1.000:0.776 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,5:0.19:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.52: 1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,14:0.27: 2.31:1.000:0.998 0/0/0/0:4:12,1:0.07:-1.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:23,6:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:26,8:0.23: 0.71:0.988:0.976 0/0/1/1:4:4,6:0.54:-1.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:7,9:0.52:-1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,15:0.59:-0.48:1.000:0.862 0/0/0/0:4:21,2:0.08:-0.38:1.000:0.976 0/0/0/1:4:23,8:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,3:0.19:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,12:0.26: 1.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,10:0.38:-0.18:1.000:0.529 0/0/1/1:4:13,13:0.47:-0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:10,9:0.44:-0.78:1.000:0.971 0/0/1/1:4:12,14:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,14:0.54:-0.38:1.000:0.985 0/0/0/1:4:21,3:0.12:-0.28:1.000:0.793 0/0/0/1:4:20,10:0.32: 0.31:1.000:0.959 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,14:0.28: 2.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:27,28:0.47: 2.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:26,15:0.35: 1.41:1.000:0.821 0/0/0/1:4:28,11:0.27: 1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,23:0.51: 1.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,6:0.28:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,22:0.56: 0.81:1.000:0.972 0/0/0/1:4:19,7:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,16:0.75:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,4:0.12: 0.61:1.000:0.713 0/0/1/1:4:14,16:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,10:0.31: 0.41:1.000:0.976 0/0/1/1:4:23,23:0.47: 1.91:1.000:0.991 0/0/0/1:4:11,5:0.30:-1.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:13,16:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,19:0.45: 1.21:1.000:0.984 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,13:0.55:-0.58:1.000:0.979 0/0/0/1:4:30,10:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,15:0.61:-0.58:1.000:0.684 0/0/1/1:4:23,29:0.51: 2.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,20:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,9:0.26: 0.71:0.999:0.999 0/0/1/1:4:10,19:0.57: 0.22:1.000:0.937 0/0/1/1:4:12,17:0.53: 0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,14:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,4:0.19:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,14:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,13:0.43: 0.12:1.000:0.956 0/0/1/1:4:8,13:0.55:-0.58:1.000:0.979 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,15:0.34: 1.51:1.000:0.876 0/0/1/1:4:17,27:0.55: 1.71:1.000:0.982 0/0/1/1:4:14,18:0.52: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:14,9:0.37:-0.38:1.000:0.573 0/0/1/1:4:15,28:0.57: 1.61:1.000:0.944 0/0/1/1:4:20,16:0.42: 0.91:1.000:0.899 0/0/0/1:4:31,13:0.28: 1.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,14:0.39: 0.71:1.000:0.662 0/0/1/1:4:16,14:0.44: 0.31:1.000:0.960 -chr1.1 76773801 chr1.1_076773801 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:148,187:0.57: 1.28:1.000:0.943 0/0/1/1:4:128,97:0.44:-0.51:1.000:0.971 0/0/1/1:4:144,133:0.49: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,96:0.42:-0.38:1.000:0.923 0/0/1/1:4:169,127:0.44: 0.65:1.000:0.968 0/1/1/1:4:86,178:0.68: 0.12:1.000:0.963 0/0/1/1:4:94,69:0.43:-1.53:1.000:0.957 0/0/1/1:4:110,98:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/0:4:210,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,51:0.56:-2.65:1.000:0.973 0/1/1/1:4:18,62:0.78:-2.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,32:0.16:-0.86:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,112:0.47:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:166,118:0.43: 0.45:1.000:0.936 0/1/1/1:4:65,152:0.71:-0.64:1.000:0.992 0/0/1/1:4:132,95:0.43:-0.48:1.000:0.945 0/0/0/1:4:234,72:0.24: 0.81:0.996:1.000 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,179:0.50: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,124:0.42: 0.74:1.000:0.918 0/0/0/1:4:76,37:0.33:-2.34:1.000:0.910 0/0/1/1:4:142,154:0.53: 0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:244,81:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,201:0.73: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,32:0.48:-3.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,96:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,139:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,78:0.32:-0.12:1.000:0.960 0/0/1/1:4:180,184:0.52: 1.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,181:0.79:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,84:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,116:0.57:-0.81:1.000:0.937 0/0/1/1:4:34,48:0.60:-2.85:1.000:0.810 0/1/1/1:4:33,118:0.79:-1.72:1.000:1.000 0/0/0:3:25,3:0.11:-3.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,70:0.29:-0.25:1.000:0.990 0/0/1/1:4:129,136:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,181:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:177,67:0.28:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,184:0.74:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,155:0.72:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:112,137:0.56:-0.12:1.000:0.961 0/0/1/1:4:125,103:0.46:-0.46:1.000:0.990 0/1/1/1:4:60,130:0.69:-1.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:166,164:0.51: 1.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,177:0.52: 1.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,109:0.82:-2.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,167:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:196,27:0.12:-0.55:1.000:0.785 0/0/1/1:4:114,145:0.57: 0.04:1.000:0.939 0/1/1/1:4:82,234:0.75: 0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,236:0.76: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,141:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,104:0.42:-0.07:1.000:0.926 0/0/0/0:4:281,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,110:0.43: 0.11:1.000:0.944 0/0/1/1:4:113,100:0.48:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,150:0.71:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1/1/1:6:95,159:0.64:-0.04:1.000:0.862 0/1/1/1:4:94,217:0.71: 0.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:113,101:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,151:0.46: 1.30:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,239:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:240,91:0.28: 1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,131:0.53:-0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:158,109:0.42: 0.17:1.000:0.908 0/0/1/1:4:157,174:0.54: 1.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:146,140:0.50: 0.48:0.910:0.997 0/0/0/1:4:186,77:0.30: 0.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:108,239:0.70: 1.48:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,287:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,193:0.71: 0.30:1.000:0.992 0/1/1/1:4:85,219:0.73: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,108:0.47:-0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:138,117:0.47:-0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:140,176:0.57: 0.97:1.000:0.946 0/0/0/1:4:252,96:0.28: 1.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,122:0.55:-0.50:1.000:0.976 0/1/1/1:4:70,174:0.72:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,52:0.31:-1.41:0.920:0.974 0/1/1/1:4:96,224:0.71: 1.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:93,235:0.73: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,138:0.53: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:178,134:0.44: 0.91:1.000:0.969 0/1/1/1:4:99,239:0.72: 1.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:53,135:0.73:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,120:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,98:0.42:-0.27:1.000:0.908 0/0/1/1:4:118,108:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,170:0.74:-0.40:0.994:0.999 0/0/1/1:4:138,107:0.45:-0.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:165,179:0.53: 1.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:177,50:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,105:0.29: 1.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:236,79:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,220:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,93:0.49:-0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,180:0.55: 1.30:1.000:0.980 0/0/0/1:4:232,51:0.18: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,187:0.73: 0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:242,81:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,131:0.53:-0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:189,182:0.51: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,117:0.54:-0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:143,98:0.42:-0.25:1.000:0.900 0/0/1/1:4:131,146:0.54: 0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:140,153:0.54: 0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:142,106:0.44:-0.14:1.000:0.965 0/0/0/1:4:244,95:0.28: 1.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:212,82:0.28: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,141:0.44: 1.22:1.000:0.963 0/0/1/1:4:163,131:0.46: 0.61:0.999:0.986 0/0/0/1:4:207,38:0.16:-0.19:1.000:0.992 0/1/1:3:67,82:0.56:-1.76:0.962:0.986 0/1/1/1:4:59,177:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,151:0.56: 0.32:1.000:0.966 0/1/1/1:4:61,171:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:230,65:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,110:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,118:0.51:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,213:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,140:0.44: 1.10:1.000:0.973 0/0/1/1:4:107,118:0.54:-0.51:1.000:0.988 0/0/0/0:4:234,1:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,85:0.27: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:225,173:0.45: 2.31:0.988:0.894 0/0/0/1:4:140,70:0.34:-0.76:1.000:0.877 0/0/1/1:4:134,97:0.43:-0.42:1.000:0.949 0/1/1/1:4:48,143:0.76:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,40:0.17:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,110:0.48:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,49:0.29:-1.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:124,156:0.57: 0.38:1.000:0.946 0/0/1/1:4:137,147:0.53: 0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:205,138:0.41: 1.41:1.000:0.877 0/0/1/1:4:148,126:0.47: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:171,118:0.42: 0.53:1.000:0.908 0/0/0/1:4:203,67:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,150:0.56: 0.34:1.000:0.974 0/0/1/1:4:147,131:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,134:0.53: 0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:158,42:0.21:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,106:0.52:-0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:162,128:0.45: 0.55:1.000:0.983 0/1/1/1:4:84,247:0.75: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,126:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:146,125:0.47: 0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,187:0.70: 0.21:1.000:0.988 0/0/1/1:4:148,153:0.52: 0.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:160,157:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,36:0.19:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,50:0.60:-2.80:1.000:0.787 0/0/1/1:4:104,70:0.41:-1.35:1.000:0.876 0/1/1/1:4:90,203:0.70: 0.60:1.000:0.987 0/0/0/1:4:236,89:0.28: 1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,296:0.81: 1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,216:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,133:0.60:-0.50:1.000:0.785 0/1/1/1:4:75,169:0.70:-0.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:194,61:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,24:0.14:-1.46:1.000:0.977 0/0/1/1:4:145,105:0.43:-0.11:1.000:0.949 0/0/1/1:4:124,99:0.46:-0.55:1.000:0.985 0/1/1/1:4:70,165:0.71:-0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,116:0.47:-0.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:75,155:0.68:-0.43:1.000:0.962 0/0/0/1:4:183,76:0.30: 0.04:0.999:0.988 0/1/1/1:4:61,173:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,87:0.45:-0.94:1.000:0.979 0/0/1/1:4:99,142:0.60:-0.25:1.000:0.779 0/0/0/1:4:145,52:0.26:-0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,89:0.45:-0.84:1.000:0.976 0/1/1/1:4:55,170:0.76:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,94:0.48:-0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:172,52:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,125:0.42: 0.79:1.000:0.915 0/0/1/1:4:168,189:0.54: 1.64:1.000:0.985 0/1/1/1:4:55,188:0.78:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,84:0.40:-0.64:1.000:0.754 0/1/1/1:4:81,208:0.73: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,137:0.44: 1.07:1.000:0.962 0/0/1/1:4:153,101:0.41:-0.04:1.000:0.846 0/1/1/1:4:69,171:0.72:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,106:0.50:-0.64:1.000:0.997 -chr1.1 76861974 chr1.1_076861974 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:105,2:.: 2.08:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.98:0.996:. ./.:4:91,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:6:42,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:0.910:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:0.920:. ./.:4:37,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.13:0.994:. ./.:4:58,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:126,0:.: 2.91:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:0.999:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:3:27,0:.:-1.44:0.962:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.65:1.000:. ./.:5:62,0:.: 0.10:0.988:. ./.:4:56,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.41:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:113,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.24:1.000:. -chr1.1 77069813 chr1.1_077069813 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:90,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:0.996:. ./.:4:99,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:73,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:137,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.11:1.000:. ./.:6:88,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.27:0.910:. ./.:4:62,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.54:0.920:. ./.:4:109,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.24:0.994:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:136,0:.: 2.01:1.000:. ./.:3:55,0:.:-1.26:0.962:. ./.:4:99,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.47:1.000:. ./.:5:110,0:.: 0.96:0.988:. ./.:4:72,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:72,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.46:0.999:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. -chr1.1 77233102 chr1.1_077233102 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:187,63:.: 1.24:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:158,46:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,40:.: 0.13:1.000:. ./.:4:191,48:.: 1.02:1.000:. ./.:4:166,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:111,23:.:-1.10:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,13:.:-3.22:1.000:. ./.:4:29,10:.:-3.02:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:145,53:.: 0.19:1.000:. ./.:4:144,43:.:-0.03:1.000:. ./.:4:134,43:.:-0.23:1.000:. ./.:4:142,47:.: 0.01:0.996:. ./.:4:164,36:.: 0.23:1.000:. ./.:4:207,47:.: 1.32:1.000:. ./.:4:170,38:.: 0.40:1.000:. ./.:4:19,1:.:-3.40:1.000:. ./.:4:138,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:103,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:21,9:.:-3.20:1.000:. ./.:4:144,42:.:-0.05:1.000:. ./.:4:136,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:154,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:112,98:.: 0.44:1.000:. ./.:4:136,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:169,44:.: 0.50:1.000:. ./.:4:124,33:.:-0.63:1.000:. ./.:4:13,3:.:-3.48:1.000:. ./.:4:33,9:.:-2.96:1.000:. ./.:3:15,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:148,53:.: 0.25:1.000:. ./.:4:166,38:.: 0.31:1.000:. ./.:4:179,56:.: 0.94:1.000:. ./.:4:151,44:.: 0.13:1.000:. ./.:4:103,90:.: 0.09:1.000:. ./.:4:162,53:.: 0.54:1.000:. ./.:4:187,63:.: 1.24:1.000:. ./.:4:136,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:183,63:.: 1.16:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:183,52:.: 0.94:1.000:. ./.:4:240,199:.: 5.06:1.000:. ./.:4:92,96:.:-0.01:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:148,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:134,116:.: 1.24:1.000:. ./.:4:95,77:.:-0.33:1.000:. ./.:4:185,55:.: 1.04:1.000:. ./.:4:138,44:.:-0.13:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:156,43:.: 0.21:1.000:. ./.:4:150,53:.: 0.29:1.000:. ./.:4:107,93:.: 0.23:1.000:. ./.:6:149,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:164,41:.: 0.33:1.000:. ./.:4:161,45:.: 0.35:1.000:. ./.:4:179,48:.: 0.78:1.000:. ./.:4:89,99:.:-0.01:1.000:. ./.:4:163,51:.: 0.52:1.000:. ./.:4:101,100:.: 0.25:1.000:. ./.:4:71,27:.:-1.83:1.000:. ./.:4:138,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:107,109:.: 0.56:0.910:. ./.:4:187,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:105,92:.: 0.17:1.000:. ./.:4:51,40:.:-1.97:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:105,100:.: 0.33:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:150,60:.: 0.44:1.000:. ./.:4:165,44:.: 0.42:1.000:. ./.:4:139,41:.:-0.17:1.000:. ./.:4:127,96:.: 0.70:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.27:0.920:. ./.:4:105,88:.: 0.09:1.000:. ./.:4:126,119:.: 1.14:1.000:. ./.:4:144,38:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,48:.: 0.27:1.000:. ./.:4:164,47:.: 0.46:1.000:. ./.:4:76,67:.:-0.92:1.000:. ./.:4:99,69:.:-0.41:1.000:. ./.:4:129,44:.:-0.31:1.000:. ./.:4:153,44:.: 0.17:1.000:. ./.:4:138,32:.:-0.37:0.994:. ./.:4:165,40:.: 0.33:1.000:. ./.:4:186,52:.: 1.00:1.000:. ./.:4:145,41:.:-0.05:1.000:. ./.:4:155,29:.:-0.09:1.000:. ./.:4:185,38:.: 0.70:1.000:. ./.:4:86,73:.:-0.59:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,49:.: 0.33:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,26:.:-1.34:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:127,39:.:-0.45:1.000:. ./.:4:151,49:.: 0.23:1.000:. ./.:4:134,40:.:-0.29:1.000:. ./.:4:116,45:.:-0.55:1.000:. ./.:4:131,39:.:-0.37:1.000:. ./.:4:146,44:.: 0.03:1.000:. ./.:4:198,60:.: 1.40:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:140,53:.: 0.09:1.000:. ./.:4:169,48:.: 0.58:1.000:. ./.:4:180,49:.: 0.82:0.999:. ./.:4:211,0:.: 0.46:1.000:. ./.:3:106,38:.:-0.90:0.962:. ./.:4:165,43:.: 0.40:1.000:. ./.:4:100,35:.:-1.08:1.000:. ./.:4:126,40:.:-0.45:1.000:. ./.:4:134,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:126,44:.:-0.37:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:102,83:.:-0.07:1.000:. ./.:4:154,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:169,42:.: 0.46:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:169,44:.: 0.50:1.000:. ./.:5:237,37:.: 1.73:0.988:. ./.:4:216,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:107,34:.:-0.96:1.000:. ./.:4:119,37:.:-0.66:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:154,31:.:-0.07:1.000:. ./.:4:94,35:.:-1.20:1.000:. ./.:4:98,92:.: 0.03:1.000:. ./.:4:125,43:.:-0.41:1.000:. ./.:4:218,53:.: 1.67:1.000:. ./.:4:178,58:.: 0.96:1.000:. ./.:4:144,33:.:-0.23:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:136,41:.:-0.23:1.000:. ./.:4:150,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:160,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:133,35:.:-0.41:1.000:. ./.:4:165,43:.: 0.40:1.000:. ./.:4:226,64:.: 2.05:1.000:. ./.:4:154,48:.: 0.27:1.000:. ./.:4:159,52:.: 0.46:1.000:. ./.:4:164,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:145,45:.: 0.03:1.000:. ./.:4:176,46:.: 0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,4:.:-3.28:1.000:. ./.:4:131,35:.:-0.45:1.000:. ./.:4:118,76:.: 0.11:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,86:.: 0.40:1.000:. ./.:4:94,76:.:-0.37:1.000:. ./.:4:137,44:.:-0.15:1.000:. ./.:4:155,41:.: 0.15:1.000:. ./.:4:139,24:.:-0.51:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:145,41:.:-0.05:1.000:. ./.:4:118,47:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:126,18:.:-0.90:1.000:. ./.:4:77,55:.:-1.14:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:164,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:136,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:147,34:.:-0.15:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:142,35:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:143,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:162,56:.: 0.60:1.000:. ./.:4:147,54:.: 0.25:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:171,33:.: 0.31:1.000:. ./.:4:167,49:.: 0.56:1.000:. ./.:4:215,46:.: 1.47:1.000:. ./.:4:68,60:.:-1.22:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.70:1.000:. -chr1.1 77454304 chr1.1_077454304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:443,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:160,205:.:-1.17:1.000:. ./.:4:331,45:.:-1.05:1.000:. ./.:4:375,50:.:-0.52:1.000:. ./.:4:569,97:.: 2.07:1.000:. ./.:4:457,56:.: 0.42:1.000:. ./.:4:260,120:.:-1.01:1.000:. ./.:4:425,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:319,164:.: 0.10:1.000:. ./.:4:180,70:.:-2.40:1.000:. ./.:4:277,42:.:-1.66:1.000:. ./.:4:271,161:.:-0.45:1.000:. ./.:4:388,58:.:-0.30:1.000:. ./.:4:468,68:.: 0.67:1.000:. ./.:4:404,37:.:-0.35:1.000:. ./.:4:330,169:.: 0.27:1.000:. ./.:4:208,292:.: 0.28:0.996:. ./.:4:246,280:.: 0.56:1.000:. ./.:4:446,210:.: 1.96:1.000:. ./.:4:387,202:.: 1.24:1.000:. ./.:4:243,46:.:-1.98:1.000:. ./.:4:268,119:.:-0.93:1.000:. ./.:4:487,59:.: 0.78:1.000:. ./.:4:305,142:.:-0.29:1.000:. ./.:4:177,123:.:-1.87:1.000:. ./.:4:437,177:.: 1.51:1.000:. ./.:4:399,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:303,153:.:-0.19:1.000:. ./.:4:392,171:.: 0.96:1.000:. ./.:4:414,44:.:-0.17:1.000:. ./.:4:256,142:.:-0.81:1.000:. ./.:4:263,100:.:-1.19:1.000:. ./.:4:113,44:.:-3.40:1.000:. ./.:4:314,33:.:-1.36:1.000:. ./.:3:208,14:.:-2.70:1.000:. ./.:4:450,48:.: 0.26:1.000:. ./.:4:341,137:.: 0.05:1.000:. ./.:4:459,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:361,160:.: 0.51:1.000:. ./.:4:486,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:327,139:.:-0.08:1.000:. ./.:4:340,154:.: 0.22:1.000:. ./.:4:374,158:.: 0.63:1.000:. ./.:4:358,34:.:-0.88:1.000:. ./.:4:429,190:.: 1.56:1.000:. ./.:4:324,140:.:-0.10:1.000:. ./.:4:385,179:.: 0.97:1.000:. ./.:4:149,47:.:-2.98:1.000:. ./.:4:306,121:.:-0.50:1.000:. ./.:4:407,159:.: 0.99:1.000:. ./.:4:438,45:.: 0.10:1.000:. ./.:4:558,80:.: 1.77:1.000:. ./.:4:454,51:.: 0.34:1.000:. ./.:4:352,177:.: 0.59:1.000:. ./.:4:416,56:.:-0.02:1.000:. ./.:4:325,138:.:-0.11:1.000:. ./.:4:446,57:.: 0.32:1.000:. ./.:4:489,194:.: 2.25:1.000:. ./.:4:374,41:.:-0.63:1.000:. ./.:6:340,65:.:-0.74:1.000:. ./.:4:438,56:.: 0.22:1.000:. ./.:4:336,165:.: 0.29:1.000:. ./.:4:680,60:.: 2.86:1.000:. ./.:4:563,65:.: 1.66:1.000:. ./.:4:202,219:.:-0.57:1.000:. ./.:4:323,144:.:-0.07:1.000:. ./.:4:279,135:.:-0.64:1.000:. ./.:4:379,42:.:-0.57:1.000:. ./.:4:358,117:.: 0.01:0.910:. ./.:4:308,141:.:-0.26:1.000:. ./.:4:379,164:.: 0.74:1.000:. ./.:4:621,39:.: 2.00:1.000:. ./.:4:556,57:.: 1.50:1.000:. ./.:4:407,52:.:-0.16:1.000:. ./.:4:368,162:.: 0.61:1.000:. ./.:4:373,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:295,172:.:-0.07:1.000:. ./.:4:306,149:.:-0.20:1.000:. ./.:4:347,113:.:-0.15:1.000:. ./.:4:460,48:.: 0.37:1.000:. ./.:4:158,182:.:-1.44:0.920:. ./.:4:545,49:.: 1.29:1.000:. ./.:4:399,159:.: 0.91:1.000:. ./.:4:371,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:344,144:.: 0.15:1.000:. ./.:4:510,74:.: 1.19:1.000:. ./.:4:286,138:.:-0.53:1.000:. ./.:4:295,156:.:-0.24:1.000:. ./.:4:314,144:.:-0.17:1.000:. ./.:4:313,125:.:-0.38:1.000:. ./.:4:422,56:.: 0.05:0.994:. ./.:4:411,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:377,184:.: 0.94:1.000:. ./.:4:265,116:.:-1.00:1.000:. ./.:4:343,136:.: 0.06:1.000:. ./.:4:387,145:.: 0.63:1.000:. ./.:4:428,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:278,142:.:-0.58:1.000:. ./.:4:384,172:.: 0.88:1.000:. ./.:4:338,153:.: 0.19:1.000:. ./.:4:447,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:373,165:.: 0.69:1.000:. ./.:4:285,106:.:-0.89:1.000:. ./.:4:344,190:.: 0.65:1.000:. ./.:4:294,119:.:-0.65:1.000:. ./.:4:304,142:.:-0.30:1.000:. ./.:4:328,159:.: 0.14:1.000:. ./.:4:272,140:.:-0.66:1.000:. ./.:4:600,85:.: 2.27:1.000:. ./.:4:404,41:.:-0.31:1.000:. ./.:4:320,131:.:-0.24:1.000:. ./.:4:341,190:.: 0.62:1.000:. ./.:4:352,153:.: 0.34:0.999:. ./.:4:430,53:.: 0.10:1.000:. ./.:3:269,51:.:-1.65:0.962:. ./.:4:541,47:.: 1.23:1.000:. ./.:4:371,163:.: 0.65:1.000:. ./.:4:402,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:418,173:.: 1.26:1.000:. ./.:4:427,70:.: 0.25:1.000:. ./.:4:416,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:345,127:.:-0.02:1.000:. ./.:4:326,150:.: 0.03:1.000:. ./.:4:336,43:.:-1.02:1.000:. ./.:4:336,163:.: 0.27:1.000:. ./.:4:412,161:.: 1.07:1.000:. ./.:5:554,55:.: 1.45:0.988:. ./.:4:189,187:.:-1.05:1.000:. ./.:4:273,112:.:-0.95:1.000:. ./.:4:292,38:.:-1.54:1.000:. ./.:4:432,50:.: 0.09:1.000:. ./.:4:323,116:.:-0.37:1.000:. ./.:4:224,105:.:-1.55:1.000:. ./.:4:313,112:.:-0.52:1.000:. ./.:4:405,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:586,76:.: 2.02:1.000:. ./.:4:302,136:.:-0.38:1.000:. ./.:4:473,66:.: 0.70:1.000:. ./.:4:263,119:.:-0.98:1.000:. ./.:4:338,134:.:-0.02:1.000:. ./.:4:368,163:.: 0.62:1.000:. ./.:4:510,43:.: 0.85:1.000:. ./.:4:392,49:.:-0.35:1.000:. ./.:4:319,40:.:-1.23:1.000:. ./.:4:459,209:.: 2.09:1.000:. ./.:4:564,61:.: 1.63:1.000:. ./.:4:388,46:.:-0.43:1.000:. ./.:4:350,165:.: 0.44:1.000:. ./.:4:567,56:.: 1.60:1.000:. ./.:4:386,41:.:-0.50:1.000:. ./.:4:452,70:.: 0.52:1.000:. ./.:4:371,40:.:-0.67:1.000:. ./.:4:261,55:.:-1.69:1.000:. ./.:4:235,126:.:-1.21:1.000:. ./.:4:430,45:.: 0.01:1.000:. ./.:4:474,58:.: 0.63:1.000:. ./.:4:347,199:.: 0.78:1.000:. ./.:4:379,171:.: 0.82:1.000:. ./.:4:315,40:.:-1.27:1.000:. ./.:4:518,64:.: 1.16:1.000:. ./.:4:371,177:.: 0.80:1.000:. ./.:4:306,129:.:-0.42:1.000:. ./.:4:261,104:.:-1.17:1.000:. ./.:4:429,54:.: 0.10:1.000:. ./.:4:361,21:.:-0.98:1.000:. ./.:4:479,50:.: 0.59:1.000:. ./.:4:284,154:.:-0.38:1.000:. ./.:4:220,256:.: 0.03:0.999:. ./.:4:363,48:.:-0.67:1.000:. ./.:4:367,57:.:-0.53:1.000:. ./.:4:316,51:.:-1.15:1.000:. ./.:4:277,111:.:-0.92:1.000:. ./.:4:376,60:.:-0.40:1.000:. ./.:4:366,50:.:-0.62:1.000:. ./.:4:352,42:.:-0.86:1.000:. ./.:4:233,93:.:-1.59:1.000:. ./.:4:353,151:.: 0.33:1.000:. ./.:4:370,160:.: 0.61:1.000:. ./.:4:443,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:340,89:.:-0.48:1.000:. ./.:4:464,66:.: 0.61:1.000:. ./.:4:493,71:.: 0.97:1.000:. ./.:4:534,87:.: 1.58:1.000:. ./.:4:324,140:.:-0.10:1.000:. ./.:4:322,151:.:-0.01:1.000:. -chr1.1 77487606 chr1.1_077487606 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:525,161:.: 0.38:1.000:. ./.:4:258,243:.:-1.15:1.000:. ./.:4:597,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:515,161:.: 0.29:1.000:. ./.:4:806,3:.: 1.39:1.000:. ./.:4:593,192:.: 1.19:1.000:. ./.:4:210,235:.:-1.61:1.000:. ./.:4:712,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:475,155:.:-0.09:1.000:. ./.:4:212,193:.:-1.94:1.000:. ./.:4:460,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:468,129:.:-0.36:1.000:. ./.:4:630,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:510,179:.: 0.40:1.000:. ./.:4:486,159:.: 0.04:1.000:. ./.:4:315,329:.: 0.03:1.000:. ./.:4:334,350:.: 0.36:0.996:. ./.:4:547,154:.: 0.50:1.000:. ./.:4:653,203:.: 1.78:1.000:. ./.:4:406,387:.: 1.26:1.000:. ./.:4:363,99:.:-1.47:1.000:. ./.:4:348,324:.: 0.26:1.000:. ./.:4:799,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:294,286:.:-0.50:1.000:. ./.:4:232,67:.:-2.82:1.000:. ./.:4:387,373:.: 0.99:1.000:. ./.:4:519,177:.: 0.46:1.000:. ./.:4:460,132:.:-0.40:1.000:. ./.:4:195,539:.: 0.77:1.000:. ./.:4:704,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:413,379:.: 1.25:1.000:. ./.:4:284,242:.:-0.94:1.000:. ./.:4:128,145:.:-3.03:1.000:. ./.:4:515,96:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:619,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:300,298:.:-0.35:1.000:. ./.:4:664,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:622,183:.: 1.36:1.000:. ./.:4:816,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:338,324:.: 0.18:1.000:. ./.:4:472,179:.: 0.09:1.000:. ./.:4:424,356:.: 1.15:1.000:. ./.:4:693,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:375,343:.: 0.64:1.000:. ./.:4:560,161:.: 0.66:1.000:. ./.:4:379,367:.: 0.87:1.000:. ./.:4:174,57:.:-3.38:1.000:. ./.:4:288,282:.:-0.58:1.000:. ./.:4:576,154:.: 0.74:1.000:. ./.:4:453,159:.:-0.24:1.000:. ./.:4:579,189:.: 1.05:1.000:. ./.:4:455,97:.:-0.73:1.000:. ./.:4:356,345:.: 0.50:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:564,159:.: 0.68:1.000:. ./.:4:434,132:.:-0.61:1.000:. ./.:4:393,364:.: 0.96:1.000:. ./.:4:457,152:.:-0.26:1.000:. ./.:6:461,157:.:-0.19:1.000:. ./.:4:563,153:.: 0.62:1.000:. ./.:4:437,145:.:-0.48:1.000:. ./.:4:791,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:575,178:.: 0.93:1.000:. ./.:4:168,505:.: 0.27:1.000:. ./.:4:343,324:.: 0.22:1.000:. ./.:4:304,257:.:-0.66:1.000:. ./.:4:621,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:197,501:.: 0.47:0.910:. ./.:4:458,137:.:-0.38:1.000:. ./.:4:407,389:.: 1.28:1.000:. ./.:4:469,146:.:-0.21:1.000:. ./.:4:887,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:522,142:.: 0.19:1.000:. ./.:4:554,162:.: 0.62:1.000:. ./.:4:559,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:494,178:.: 0.26:1.000:. ./.:4:510,152:.: 0.18:1.000:. ./.:4:525,83:.:-0.27:1.000:. ./.:4:579,188:.: 1.04:1.000:. ./.:4:233,216:.:-1.58:0.920:. ./.:4:618,193:.: 1.41:1.000:. ./.:4:455,380:.: 1.60:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:402,416:.: 1.46:1.000:. ./.:4:598,171:.: 1.06:1.000:. ./.:4:247,239:.:-1.27:1.000:. ./.:4:316,257:.:-0.56:1.000:. ./.:4:327,283:.:-0.25:1.000:. ./.:4:258,280:.:-0.85:1.000:. ./.:4:374,109:.:-1.30:0.994:. ./.:4:467,121:.:-0.43:1.000:. ./.:4:589,172:.: 0.99:1.000:. ./.:4:227,235:.:-1.47:1.000:. ./.:4:425,357:.: 1.17:1.000:. ./.:4:407,372:.: 1.14:1.000:. ./.:4:451,133:.:-0.47:1.000:. ./.:4:451,125:.:-0.53:1.000:. ./.:4:560,181:.: 0.83:1.000:. ./.:4:525,179:.: 0.52:1.000:. ./.:4:426,137:.:-0.64:1.000:. ./.:4:549,171:.: 0.66:1.000:. ./.:4:271,218:.:-1.25:1.000:. ./.:4:322,313:.:-0.05:1.000:. ./.:4:289,257:.:-0.78:1.000:. ./.:4:287,296:.:-0.47:1.000:. ./.:4:442,122:.:-0.63:1.000:. ./.:4:330,311:.: 0.00:1.000:. ./.:4:657,197:.: 1.76:1.000:. ./.:4:666,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:335,297:.:-0.07:1.000:. ./.:4:462,417:.: 1.97:1.000:. ./.:4:465,151:.:-0.20:0.999:. ./.:4:702,0:.: 0.51:1.000:. ./.:3:361,14:.:-2.19:0.962:. ./.:4:821,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:418,139:.:-0.69:1.000:. ./.:4:536,128:.: 0.19:1.000:. ./.:4:331,325:.: 0.13:1.000:. ./.:4:408,127:.:-0.87:1.000:. ./.:4:633,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:347,292:.:-0.01:1.000:. ./.:4:373,304:.: 0.30:1.000:. ./.:4:515,134:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:380,347:.: 0.71:1.000:. ./.:5:786,2:.: 1.22:0.988:. ./.:4:261,261:.:-0.98:1.000:. ./.:4:398,130:.:-0.93:1.000:. ./.:4:590,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:609,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:292,302:.:-0.38:1.000:. ./.:4:313,79:.:-2.05:1.000:. ./.:4:320,274:.:-0.38:1.000:. ./.:4:408,132:.:-0.83:1.000:. ./.:4:648,211:.: 1.80:1.000:. ./.:4:348,325:.: 0.27:1.000:. ./.:4:626,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:458,121:.:-0.51:1.000:. ./.:4:532,137:.: 0.24:1.000:. ./.:4:526,187:.: 0.60:1.000:. ./.:4:445,141:.:-0.45:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:395,132:.:-0.94:1.000:. ./.:4:374,353:.: 0.71:1.000:. ./.:4:643,197:.: 1.65:1.000:. ./.:4:530,163:.: 0.43:1.000:. ./.:4:306,305:.:-0.24:1.000:. ./.:4:604,163:.: 1.04:1.000:. ./.:4:415,148:.:-0.64:1.000:. ./.:4:782,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:608,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:421,11:.:-1.72:1.000:. ./.:4:226,202:.:-1.75:1.000:. ./.:4:560,172:.: 0.75:1.000:. ./.:4:645,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:387,364:.: 0.91:1.000:. ./.:4:424,324:.: 0.89:1.000:. ./.:4:502,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:528,184:.: 0.59:1.000:. ./.:4:277,260:.:-0.85:1.000:. ./.:4:403,122:.:-0.95:1.000:. ./.:4:525,132:.: 0.14:1.000:. ./.:4:510,157:.: 0.22:1.000:. ./.:4:489,151:.: 0.00:1.000:. ./.:4:608,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:299,267:.:-0.61:1.000:. ./.:4:306,264:.:-0.58:0.999:. ./.:4:449,158:.:-0.28:1.000:. ./.:4:582,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:508,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:311,122:.:-1.71:1.000:. ./.:4:718,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:403,146:.:-0.75:1.000:. ./.:4:623,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:250,254:.:-1.13:1.000:. ./.:4:394,372:.: 1.04:1.000:. ./.:4:593,188:.: 1.16:1.000:. ./.:4:558,169:.: 0.71:1.000:. ./.:4:526,51:.:-0.52:1.000:. ./.:4:674,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:845,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:637,190:.: 1.54:1.000:. ./.:4:236,273:.:-1.08:1.000:. ./.:4:519,150:.: 0.24:1.000:. -chr1.1 77708852 chr1.1_077708852 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:76,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,29:.: 0.65:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:96,15:.: 0.89:1.000:. ./.:4:55,9:.:-0.94:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:7,4:.:-3.01:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:83,25:.: 0.77:1.000:. ./.:4:62,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:93,25:.: 1.16:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.96:0.996:. ./.:4:61,49:.: 0.85:1.000:. ./.:4:142,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:110,28:.: 1.94:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:85,32:.: 1.12:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:74,24:.: 0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:95,23:.: 1.16:1.000:. ./.:4:89,25:.: 1.00:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:63,39:.: 0.54:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:99,26:.: 1.43:1.000:. ./.:4:67,17:.:-0.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:16,2:.:-2.73:1.000:. ./.:3:9,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:82,19:.: 0.50:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:152,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:80,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:75,23:.: 0.38:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:83,26:.: 0.81:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,22:.: 1.12:1.000:. ./.:4:27,12:.:-1.92:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:43,11:.:-1.33:1.000:. ./.:4:81,22:.: 0.57:1.000:. ./.:4:47,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:63,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:69,22:.: 0.11:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,22:.: 0.38:1.000:. ./.:6:54,8:.:-1.02:1.000:. ./.:4:70,26:.: 0.30:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:69,17:.:-0.09:1.000:. ./.:4:95,35:.: 1.63:1.000:. ./.:4:73,23:.: 0.30:1.000:. ./.:4:52,11:.:-0.98:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:38,29:.:-0.83:0.910:. ./.:4:93,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:70,22:.: 0.15:1.000:. ./.:4:45,5:.:-1.49:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:79,24:.: 0.57:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:73,14:.:-0.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.59:0.920:. ./.:4:54,12:.:-0.87:1.000:. ./.:4:69,26:.: 0.26:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:52,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:70,15:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,10:.:-1.22:1.000:. ./.:4:51,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:52,10:.:-1.02:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.71:0.994:. ./.:4:58,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:89,20:.: 0.81:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.38:1.000:. ./.:4:48,20:.:-0.79:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:36,5:.:-1.84:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,12:.:-0.52:1.000:. ./.:4:47,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:87,24:.: 0.89:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:94,21:.: 1.04:1.000:. ./.:4:85,24:.: 0.81:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.32:1.000:. ./.:4:113,30:.: 2.13:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:0.999:. ./.:4:104,0:.: 0.61:1.000:. ./.:3:49,0:.:-1.53:0.962:. ./.:4:74,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:47,8:.:-1.29:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.83:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:55,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:92,29:.: 1.27:1.000:. ./.:4:75,20:.: 0.26:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,17:.:-0.32:1.000:. ./.:5:81,0:.:-0.28:0.988:. ./.:4:82,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:95,22:.: 1.12:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:70,20:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:83,15:.: 0.38:1.000:. ./.:4:71,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,15:.:-1.14:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,10:.:-1.26:1.000:. ./.:4:80,32:.: 0.92:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,25:.: 0.34:1.000:. ./.:4:70,23:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.65:1.000:. ./.:4:75,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:68,33:.: 0.50:1.000:. ./.:4:93,27:.: 1.24:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:72,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:75,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:76,33:.: 0.81:1.000:. ./.:4:71,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:75,28:.: 0.57:1.000:. ./.:4:92,28:.: 1.24:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:71,15:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:68,23:.: 0.11:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:78,13:.: 0.11:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:89,27:.: 1.08:1.000:. ./.:4:111,21:.: 1.70:1.000:. ./.:4:119,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:92,18:.: 0.85:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:88,30:.: 1.16:1.000:. ./.:4:51,14:.:-0.90:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.18:1.000:. -chr1.1 77908817 chr1.1_077908817 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.: 2.12:0.996:. ./.:4:4,6:.: 1.47:1.000:. ./.:4:15,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:12,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:15,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:6:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:0.910:. ./.:4:16,0:.: 3.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:0.920:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:0.994:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.76:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:3:3,0:.:-0.79:0.962:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:5:8,0:.: 0.82:0.988:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.76:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.82:1.000:. -chr1.1 78197005 chr1.1_078197005 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:403,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:322,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.04:0.996:. ./.:4:283,134:.: 0.80:1.000:. ./.:4:471,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:551,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:501,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:463,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:482,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.76:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:363,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:275,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.81:1.000:. ./.:6:252,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.20:0.910:. ./.:4:344,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.94:0.920:. ./.:4:278,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.26:0.994:. ./.:4:269,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:326,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:230,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:481,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.73:0.999:. ./.:4:352,0:.: 0.16:1.000:. ./.:3:194,0:.:-1.39:0.962:. ./.:4:331,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.18:1.000:. ./.:5:339,0:.: 0.04:0.988:. ./.:4:243,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:517,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:551,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:460,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:467,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.41:0.999:. ./.:4:412,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:511,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:551,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:518,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.44:1.000:. -chr1.1 78353592 chr1.1_078353592 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:0.996:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:3:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:6:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:0.910:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:0.920:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:0.994:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:16,0:.: 3.91:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:9,0:.: 1.48:1.000:. ./.:3:2,0:.:-0.95:0.962:. ./.:4:8,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:5:9,0:.: 1.48:0.988:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:0.999:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.95:1.000:. -chr1.1 78564815 chr1.1_078564815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,37:.: 0.22:1.000:. ./.:4:86,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:70,67:.: 0.20:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:128,54:.: 1.20:1.000:. ./.:4:128,60:.: 1.33:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:104,42:.: 0.40:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:53,9:.:-1.46:1.000:. ./.:4:8,22:.:-2.17:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:97,40:.: 0.20:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:94,38:.: 0.09:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:179,40:.: 2.02:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:151,118:.: 3.13:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:41,6:.:-1.80:1.000:. ./.:4:121,34:.: 0.60:1.000:. ./.:4:146,51:.: 1.53:1.000:. ./.:4:80,66:.: 0.40:1.000:. ./.:4:23,16:.:-1.97:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:166,43:.: 1.80:1.000:. ./.:4:127,36:.: 0.78:1.000:. ./.:4:190,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:78,101:.: 1.13:1.000:. ./.:4:225,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:152,30:.: 1.20:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:36,15:.:-1.71:1.000:. ./.:3:20,5:.:-2.29:1.000:. ./.:4:169,48:.: 1.98:1.000:. ./.:4:121,37:.: 0.67:1.000:. ./.:4:68,90:.: 0.67:1.000:. ./.:4:117,26:.: 0.33:1.000:. ./.:4:61,93:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,37:.:-0.51:1.000:. ./.:4:100,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:102,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,18:.:-1.64:1.000:. ./.:4:91,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:145,38:.: 1.22:1.000:. ./.:4:36,14:.:-1.73:1.000:. ./.:4:54,22:.:-1.15:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:91,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,36:.: 0.51:1.000:. ./.:4:59,44:.:-0.55:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:96,37:.: 0.11:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,30:.:-0.95:1.000:. ./.:6:56,24:.:-1.06:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.87:1.000:. ./.:4:68,20:.:-0.89:1.000:. ./.:4:82,32:.:-0.31:1.000:. ./.:4:46,51:.:-0.69:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:95,28:.:-0.11:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:75,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.47:0.910:. ./.:4:100,30:.: 0.04:1.000:. ./.:4:72,47:.:-0.20:1.000:. ./.:4:31,34:.:-1.40:1.000:. ./.:4:43,69:.:-0.35:1.000:. ./.:4:95,78:.: 1.00:1.000:. ./.:4:64,25:.:-0.87:1.000:. ./.:4:57,22:.:-1.09:1.000:. ./.:4:83,69:.: 0.53:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.44:1.000:. ./.:4:73,28:.:-0.60:1.000:. ./.:4:120,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.53:0.920:. ./.:4:82,35:.:-0.24:1.000:. ./.:4:93,46:.: 0.24:1.000:. ./.:4:74,56:.: 0.04:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:105,49:.: 0.58:1.000:. ./.:4:44,20:.:-1.42:1.000:. ./.:4:79,12:.:-0.82:1.000:. ./.:4:72,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:44,21:.:-1.40:0.994:. ./.:4:94,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:98,81:.: 1.13:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:58,44:.:-0.58:1.000:. ./.:4:57,18:.:-1.18:1.000:. ./.:4:100,58:.: 0.67:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:45,23:.:-1.33:1.000:. ./.:4:100,31:.: 0.07:1.000:. ./.:4:55,10:.:-1.40:1.000:. ./.:4:136,30:.: 0.84:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,47:.:-0.89:1.000:. ./.:4:139,37:.: 1.07:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:115,31:.: 0.40:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:66,24:.:-0.84:0.999:. ./.:4:112,0:.:-0.35:1.000:. ./.:3:23,10:.:-2.11:0.962:. ./.:4:35,52:.:-0.91:1.000:. ./.:4:46,44:.:-0.84:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.87:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,30:.:-0.44:1.000:. ./.:4:82,36:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.95:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:135,44:.: 1.13:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.13:1.000:. ./.:5:112,56:.: 0.89:0.988:. ./.:4:55,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:54,16:.:-1.29:1.000:. ./.:4:34,33:.:-1.35:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:68,13:.:-1.04:1.000:. ./.:4:91,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,26:.: 0.31:1.000:. ./.:4:188,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:57,28:.:-0.95:1.000:. ./.:4:83,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:49,45:.:-0.75:1.000:. ./.:4:63,63:.:-0.04:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,19:.:-1.24:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:115,50:.: 0.82:1.000:. ./.:4:155,42:.: 1.53:1.000:. ./.:4:116,24:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,44:.: 0.04:1.000:. ./.:4:122,30:.: 0.53:1.000:. ./.:4:126,106:.: 2.31:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,36:.:-1.31:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.07:1.000:. ./.:4:141,36:.: 1.09:1.000:. ./.:4:94,76:.: 0.93:1.000:. ./.:4:125,93:.: 2.00:1.000:. ./.:4:68,61:.: 0.02:1.000:. ./.:4:98,45:.: 0.33:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:92,26:.:-0.22:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:82,34:.:-0.27:1.000:. ./.:4:123,41:.: 0.80:1.000:. ./.:4:87,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:134,36:.: 0.93:0.999:. ./.:4:88,26:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,41:.: 0.07:1.000:. ./.:4:49,62:.:-0.38:1.000:. ./.:4:117,42:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,26:.:-0.42:1.000:. ./.:4:73,33:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,24:.:-0.60:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:99,83:.: 1.20:1.000:. ./.:4:123,47:.: 0.93:1.000:. ./.:4:91,44:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,104:.: 0.71:1.000:. ./.:4:121,44:.: 0.82:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:85,63:.: 0.44:1.000:. ./.:4:109,28:.: 0.20:1.000:. -chr1.1 78756250 chr1.1_078756250 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:23,13:0.32:-0.08:1.000:0.954 0/0/1/1:4:12,26:0.61: 0.05:1.000:0.686 0/0/0/1:4:31,20:0.36: 0.91:1.000:0.688 0/0/0/1:4:39,9:0.15: 0.71:1.000:0.990 0/0/1/1:4:23,23:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,39:0.51: 2.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,8:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,36:0.57: 1.43:1.000:0.956 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.70:-2.04:1.000:0.985 0/1/1/1:4:4,11:0.64:-1.45:1.000:0.688 0/0/1/1:4:34,25:0.40: 1.43:1.000:0.800 0/0/1/1:4:22,21:0.48: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,14:0.33: 0.05:1.000:0.924 0/0/1/1:4:28,45:0.57: 2.35:1.000:0.947 0/0/0/1:4:30,16:0.30: 0.58:1.000:0.983 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.25:0.996:1.000 0/0/1/1:4:22,43:0.60: 1.82:1.000:0.816 0/0/0/1:4:32,15:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,19:0.28: 1.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:1,2:0.60:-2.24:1.000:0.791 0/0/1/1:4:28,28:0.50: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,15:0.23: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,18:0.35: 0.64:1.000:0.809 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,9:0.12: 1.50:1.000:0.803 0/0/0/1:4:44,28:0.36: 2.28:1.000:0.735 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,50:0.59: 2.55:1.000:0.833 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,23:0.44: 0.91:1.000:0.961 0/1/1/1:4:0,1:0.82:-2.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-2.04:1.000:0.997 0/1/1:3:0,2:0.82:-2.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:28,24:0.45: 0.97:1.000:0.980 0/0/1/1:4:28,21:0.41: 0.78:1.000:0.847 0/0/1/1:4:18,35:0.60: 1.04:1.000:0.822 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,39:0.58: 1.63:1.000:0.924 0/0/0/1:4:19,5:0.17:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,9:0.19: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,14:0.40:-0.27:1.000:0.805 0/0/1/1:4:13,18:0.55:-0.40:1.000:0.981 0/0/0/1:4:20,5:0.16:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,14:0.37:-0.14:1.000:0.560 0/0/0/1:4:8,4:0.28:-1.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,18:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,13:0.43:-0.54:1.000:0.954 0/0/1/1:4:13,14:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,10:0.30:-0.54:1.000:0.986 0/0/0/1:4:18,4:0.15:-0.99:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,11:0.38:-0.67:1.000:0.567 0/0/0/1:4:32,12:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.31:-0.21:1.000:0.975 0/0/0/1:4:23,9:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,10:0.35:-0.73:1.000:0.790 0/0/0/1/1/1:6:11,16:0.56:-0.67:1.000:0.709 0/0/1/1:4:14,19:0.55:-0.27:1.000:0.984 0/0/0/1:4:26,12:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,10:0.22:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,22:0.67:-0.60:1.000:0.927 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.24:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.41:-0.14:1.000:0.847 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.60:0.910:1.000 0/0/1/1:4:25,17:0.38: 0.32:1.000:0.522 0/0/0/1:4:21,11:0.30:-0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:11,13:0.52:-0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:4,44:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,16:0.38: 0.12:1.000:0.615 0/0/1/1:4:12,21:0.58:-0.27:1.000:0.906 0/0/1/1:4:17,27:0.57: 0.45:1.000:0.951 0/0/1/1:4:20,14:0.39:-0.21:1.000:0.639 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,13:0.38:-0.34:1.000:0.548 0/0/1/1:4:20,14:0.39:-0.21:1.000:0.639 0/0/1/1:4:9,19:0.61:-0.60:0.920:0.723 0/0/0/1:4:14,7:0.28:-1.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,19:0.42: 0.38:1.000:0.931 0/0/0/1:4:28,14:0.28: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,11:0.38:-0.67:1.000:0.567 0/0/1/1:4:12,20:0.58:-0.34:1.000:0.932 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.14:-0.47:1.000:0.949 0/0/0/1:4:24,11:0.26:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,22:0.61:-0.34:0.994:0.663 0/0/0/1:4:24,8:0.20:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,10:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,1:0.03:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,9:0.36:-0.93:1.000:0.701 0/0/1/1:4:9,17:0.59:-0.73:1.000:0.849 0/0/0/1:4:24,4:0.12:-0.60:1.000:0.670 0/0/0/1:4:27,13:0.27: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,10:0.47:-1.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:26,10:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,9:0.30:-0.73:1.000:0.985 0/0/0/1:4:19,11:0.33:-0.47:1.000:0.932 0/0/0/1:4:16,5:0.19:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,14:0.32: 0.12:1.000:0.961 0/0/0/1:4:21,7:0.20:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,14:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:41,15:0.22: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,12:0.32:-0.27:1.000:0.945 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,24:0.28: 2.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:23,5:0.15:-0.60:0.999:0.980 0/0/1/1:4:11,12:0.51:-0.93:1.000:0.996 0/0/1:3:13,8:0.35:-1.06:0.962:1.000 0/0/1/1:4:11,21:0.59:-0.34:1.000:0.840 0/0/0/1:4:24,7:0.18:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,19:0.62:-0.67:1.000:0.540 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,11:0.30:-0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:12,21:0.58:-0.27:1.000:0.906 0/0/1/1:4:15,12:0.43:-0.67:1.000:0.941 0/0/0/1:4:26,12:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,15:0.22: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:20,9:0.25:-0.54:0.988:0.913 0/0/1/1:4:14,18:0.54:-0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:16,10:0.35:-0.73:1.000:0.790 0/0/1/1:4:14,12:0.45:-0.73:1.000:0.980 0/0/1/1:4:13,11:0.45:-0.86:1.000:0.975 0/0/0/1:4:32,14:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,9:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,22:0.28: 1.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,12:0.51:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:17,5:0.18:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,9:0.47:-1.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:14,6:0.24:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.21:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,6:0.18:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,17:0.38: 0.32:1.000:0.522 0/0/0/1:4:14,5:0.21:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,11:0.17: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,22:0.54: 0.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:29,21:0.40: 0.84:1.000:0.756 0/0/1/1:4:22,17:0.42: 0.12:1.000:0.900 0/0/1/1:4:16,30:0.59: 0.58:1.000:0.856 0/0/0/1:4:28,13:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,16:0.32: 0.45:1.000:0.945 0/0/0/1:4:33,17:0.29: 0.84:1.000:0.991 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.17:-0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,17:0.43: 0.05:1.000:0.951 0/0/0/1:4:29,14:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,17:0.29: 0.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:24,9:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,15:0.33: 0.25:1.000:0.936 0/1/1/1:4:18,46:0.63: 1.76:1.000:0.580 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,15:0.36: 0.05:1.000:0.648 0/0/0/1:4:43,17:0.23: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,16:0.31: 0.51:1.000:0.969 0/0/0/1:4:40,15:0.22: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,12:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,22:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,12:0.19: 0.91:0.999:1.000 0/0/1/1:4:21,28:0.54: 0.78:1.000:0.986 0/0/0/1:4:39,17:0.25: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,20:0.34: 1.04:1.000:0.864 0/0/0/1:4:22,12:0.31:-0.21:1.000:0.975 0/0/1/1:4:15,16:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,20:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,25:0.65:-0.27:1.000:0.831 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,34:0.47: 2.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:33,18:0.31: 0.91:1.000:0.975 0/0/1/1:4:16,34:0.61: 0.84:1.000:0.714 0/0/1/1:4:33,41:0.53: 2.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:25,35:0.55: 1.50:1.000:0.980 0/0/0/1:4:51,21:0.24: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,22:0.28: 1.89:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,15:0.30: 0.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:21,27:0.54: 0.71:1.000:0.989 -chr1.1 78896738 chr1.1_078896738 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:87,40:.: 1.12:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:70,35:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,26:.:-0.49:1.000:. ./.:4:113,41:.: 2.09:1.000:. ./.:4:78,48:.: 1.09:1.000:. ./.:4:36,19:.:-1.46:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:32,16:.:-1.71:1.000:. ./.:4:11,5:.:-2.85:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:59,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,38:.: 0.80:1.000:. ./.:4:71,19:.:-0.20:1.000:. ./.:4:81,35:.: 0.73:0.996:. ./.:4:104,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:88,31:.: 0.84:1.000:. ./.:4:76,42:.: 0.80:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:60,28:.:-0.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,4:.:-2.56:1.000:. ./.:4:70,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:66,32:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,70:.: 1.34:1.000:. ./.:4:47,28:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,25:.:-1.03:1.000:. ./.:4:38,26:.:-1.13:1.000:. ./.:4:3,2:.:-3.24:1.000:. ./.:4:28,19:.:-1.74:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,32:.: 0.08:1.000:. ./.:4:68,31:.: 0.12:1.000:. ./.:4:58,35:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,26:.:-0.27:1.000:. ./.:4:35,61:.: 0.01:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:67,31:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,24:.:-0.77:1.000:. ./.:4:71,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:98,36:.: 1.37:1.000:. ./.:4:4,7:.:-3.03:1.000:. ./.:4:40,47:.:-0.31:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:69,32:.: 0.19:1.000:. ./.:4:65,76:.: 1.62:1.000:. ./.:4:48,65:.: 0.62:1.000:. ./.:4:93,26:.: 0.84:1.000:. ./.:4:67,30:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,34:.: 0.55:1.000:. ./.:4:56,20:.:-0.70:1.000:. ./.:4:30,59:.:-0.24:1.000:. ./.:6:57,25:.:-0.49:1.000:. ./.:4:95,32:.: 1.12:1.000:. ./.:4:64,29:.:-0.09:1.000:. ./.:4:91,35:.: 1.09:1.000:. ./.:4:34,28:.:-1.20:1.000:. ./.:4:85,17:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,39:.:-0.63:1.000:. ./.:4:55,29:.:-0.42:1.000:. ./.:4:69,20:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,66:.: 0.66:0.910:. ./.:4:73,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:40,70:.: 0.51:1.000:. ./.:4:42,38:.:-0.56:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,68:.: 1.66:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:61,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:86,29:.: 0.69:1.000:. ./.:4:62,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:54,60:.: 0.66:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.31:0.920:. ./.:4:57,63:.: 0.87:1.000:. ./.:4:69,75:.: 1.73:1.000:. ./.:4:63,28:.:-0.17:1.000:. ./.:4:40,21:.:-1.24:1.000:. ./.:4:92,47:.: 1.55:1.000:. ./.:4:36,41:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,55:.:-0.24:1.000:. ./.:4:46,66:.: 0.59:1.000:. ./.:4:83,28:.: 0.55:1.000:. ./.:4:78,19:.: 0.05:0.994:. ./.:4:78,39:.: 0.76:1.000:. ./.:4:117,35:.: 2.02:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.92:1.000:. ./.:4:98,37:.: 1.41:1.000:. ./.:4:46,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:45,46:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:79,34:.: 0.62:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:55,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:52,35:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,40:.: 0.55:1.000:. ./.:4:51,25:.:-0.70:1.000:. ./.:4:74,36:.: 0.51:1.000:. ./.:4:70,24:.:-0.06:1.000:. ./.:4:46,37:.:-0.45:1.000:. ./.:4:89,36:.: 1.05:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,41:.: 1.19:1.000:. ./.:4:87,46:.: 1.34:0.999:. ./.:4:85,0:.:-0.38:1.000:. ./.:3:19,17:.:-2.14:0.962:. ./.:4:68,36:.: 0.30:1.000:. ./.:4:75,31:.: 0.37:1.000:. ./.:4:61,29:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,23:.:-0.06:1.000:. ./.:4:60,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:47,69:.: 0.73:1.000:. ./.:4:89,48:.: 1.48:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:80,37:.: 0.76:1.000:. ./.:5:96,27:.: 0.98:0.988:. ./.:4:52,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:47,19:.:-1.06:1.000:. ./.:4:72,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:70,43:.: 0.62:1.000:. ./.:4:49,22:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,49:.:-0.63:1.000:. ./.:4:67,22:.:-0.24:1.000:. ./.:4:77,37:.: 0.66:1.000:. ./.:4:63,46:.: 0.48:1.000:. ./.:4:64,20:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,36:.: 0.59:1.000:. ./.:4:80,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:52,25:.:-0.67:1.000:. ./.:4:116,32:.: 1.87:1.000:. ./.:4:113,48:.: 2.34:1.000:. ./.:4:79,32:.: 0.55:1.000:. ./.:4:88,32:.: 0.87:1.000:. ./.:4:72,38:.: 0.51:1.000:. ./.:4:70,31:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,38:.: 1.66:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,9:.:-1.99:1.000:. ./.:4:65,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:49,67:.: 0.73:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:61,82:.: 1.70:1.000:. ./.:4:44,90:.: 1.37:1.000:. ./.:4:66,35:.: 0.19:1.000:. ./.:4:66,43:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,43:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:48,21:.:-0.95:1.000:. ./.:4:82,39:.: 0.91:1.000:. ./.:4:18,37:.:-1.46:1.000:. ./.:4:68,26:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,57:.: 0.08:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.02:0.999:. ./.:4:54,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:81,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:58,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:65,33:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:44,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:86,26:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,39:.: 0.98:1.000:. ./.:4:77,46:.: 0.98:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:90,44:.: 1.37:1.000:. ./.:4:80,38:.: 0.80:1.000:. ./.:4:95,38:.: 1.34:1.000:. ./.:4:36,56:.:-0.13:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.48:1.000:. -chr1.1 79067515 chr1.1_079067515 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:135,139:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,113:0.56:-0.94:1.000:0.973 0/0/1/1:4:116,135:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,121:0.52:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:134,168:0.53: 0.52:1.000:0.991 0/1/1/1:4:69,166:0.71:-0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:71,62:0.44:-1.81:1.000:0.966 0/0/1/1:4:105,155:0.58:-0.06:1.000:0.918 0/0/0/0:4:192,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.22:-3.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,59:0.72:-2.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,57:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,117:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,129:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,189:0.73:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,118:0.52:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:185,63:0.23:-0.22:0.996:1.000 0/0/1/1:4:127,130:0.48:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:150,175:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,134:0.47: 0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:30,10:0.23:-3.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,142:0.52:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:203,83:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,190:0.81:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.44:-3.45:1.000:0.967 0/0/1/1:4:161,159:0.47: 0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:119,105:0.44:-0.56:1.000:0.970 0/0/0/1:4:162,56:0.24:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,150:0.44: 0.81:1.000:0.963 0/1/1/1:4:62,159:0.72:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,62:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,95:0.44:-0.82:1.000:0.961 0/0/0/1:4:19,6:0.22:-3.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,68:0.75:-2.38:1.000:0.999 0/1/1:3:3,5:0.61:-3.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,55:0.27:-1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,136:0.52:-0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,200:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:199,94:0.30: 0.40:1.000:0.987 0/1/1/1:4:87,236:0.74: 0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:74,239:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,84:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,208:0.51: 1.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,215:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,229:0.55: 1.89:1.000:0.980 0/0/0/0:4:258,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,136:0.46: 0.18:1.000:0.989 0/1/1/1:4:62,153:0.71:-0.68:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,202:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:268,109:0.27: 1.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:133,162:0.52: 0.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:95,281:0.76: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,225:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,160:0.47: 0.81:1.000:0.991 0/0/1/1:4:125,133:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:221,86:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,148:0.54: 0.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:155,185:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:88,220:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:78,189:0.71: 0.04:1.000:0.828 0/1/1/1:4:82,186:0.69: 0.05:1.000:0.978 0/0/1/1:4:131,132:0.47:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:170,269:0.60: 2.42:1.000:0.803 1/1/1/1:4:12,348:0.98: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,68:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,175:0.49: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,110:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,159:0.55: 0.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:149,155:0.48: 0.55:0.910:0.995 0/0/0/1:4:184,71:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:105,266:0.72: 1.48:1.000:0.996 1/1/1/1:4:15,284:0.96: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,319:0.81: 1.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,227:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,170:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,130:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,154:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:219,112:0.31: 0.93:1.000:0.966 0/0/1/1:4:122,180:0.58: 0.52:1.000:0.918 0/1/1/1:4:81,294:0.79: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,128:0.48:-0.20:0.920:0.996 0/1/1/1:4:82,281:0.78: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,283:0.80: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,139:0.58:-0.44:1.000:0.903 0/0/1/1:4:157,184:0.51: 1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,274:0.71: 1.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,116:0.52:-0.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,130:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:81,252:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,148:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,182:0.76:-0.31:0.994:1.000 0/0/1/1:4:136,177:0.54: 0.68:1.000:0.985 0/0/1/1:4:157,196:0.53: 1.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:152,60:0.26:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:204,80:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,80:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,206:0.71: 0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:142,152:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,206:0.54: 1.38:1.000:0.985 0/0/0/1:4:216,83:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,184:0.73:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:223,108:0.30: 0.93:1.000:0.983 0/0/1/1:4:103,134:0.54:-0.38:1.000:0.986 0/0/1/1:4:155,169:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,133:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,152:0.47: 0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:114,163:0.57: 0.18:1.000:0.946 0/0/1/1:4:116,121:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:152,161:0.49: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:209,73:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,99:0.30: 0.62:1.000:0.988 0/0/1/1:4:141,155:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,181:0.51: 1.02:0.999:0.996 0/0/0/1:4:187,79:0.27: 0.03:1.000:0.997 0/1/1:3:79,129:0.61:-0.78:0.962:0.999 0/1/1/1:4:90,275:0.76: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,154:0.48: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,226:0.77: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,83:0.30:-0.10:1.000:0.986 0/0/1/1:4:137,167:0.52: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:127,148:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,208:0.76: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,146:0.53: 0.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:89,89:0.47:-1.19:1.000:0.993 0/0/0/0:4:239,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,84:0.27: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:193,175:0.45: 1.44:0.988:0.887 0/0/1/1:4:128,150:0.51: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,137:0.54:-0.28:1.000:0.988 0/1/1/1:4:57,164:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:174,69:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,109:0.48:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,58:0.28:-1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:126,155:0.53: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:132,149:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,204:0.54: 1.38:1.000:0.989 0/0/1/1:4:137,163:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:168,81:0.30:-0.21:1.000:0.984 0/0/0/1:4:151,70:0.29:-0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:102,153:0.58:-0.13:1.000:0.898 0/0/1/1:4:129,184:0.57: 0.68:1.000:0.948 0/0/1/1:4:151,188:0.53: 1.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:155,60:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,126:0.54:-0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:168,175:0.48: 1.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:96,271:0.75: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,132:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,141:0.45: 0.43:1.000:0.981 0/1/1/1:4:84,254:0.76: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,152:0.54: 0.07:1.000:0.986 0/0/1/1:4:134,135:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:141,54:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,24:0.71:-3.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,67:0.49:-1.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,238:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,74:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,231:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,210:0.70: 0.48:1.000:0.988 0/0/1/1:4:84,104:0.53:-1.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:72,218:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,46:0.22:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,55:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,114:0.54:-0.85:1.000:0.988 0/0/1/1:4:118,119:0.47:-0.38:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,231:0.77: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,129:0.51:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,166:0.74:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,136:0.51:-0.17:0.999:0.996 0/1/1/1:4:59,182:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,111:0.52:-0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,100:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,57:0.29:-1.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:120,123:0.48:-0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,151:0.71:-0.71:1.000:0.992 0/0/1/1:4:127,137:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,38:0.20:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,124:0.46:-0.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:134,164:0.53: 0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:72,224:0.76: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,97:0.44:-0.76:1.000:0.962 0/1/1/1:4:62,165:0.73:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:136,166:0.52: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:140,152:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,161:0.72:-0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:136,135:0.47: 0.10:1.000:0.992 -chr1.1 79690059 chr1.1_079690059 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:184,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:90,27:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.22:1.000:. ./.:4:94,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:143,68:.: 2.27:1.000:. ./.:4:74,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:29,12:.:-2.18:1.000:. ./.:4:95,32:.: 0.07:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:4,12:.:-2.83:1.000:. ./.:4:95,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:101,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,35:.:-0.14:1.000:. ./.:4:99,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:125,24:.: 0.64:1.000:. ./.:4:95,28:.:-0.04:0.996:. ./.:4:103,26:.: 0.12:1.000:. ./.:4:101,32:.: 0.23:1.000:. ./.:4:114,29:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:64,16:.:-1.16:1.000:. ./.:4:8,5:.:-2.91:1.000:. ./.:4:94,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:115,32:.: 0.59:1.000:. ./.:4:194,1:.: 1.85:1.000:. ./.:4:70,45:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:2,2:.:-3.15:1.000:. ./.:4:18,3:.:-2.70:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:68,56:.:-0.01:1.000:. ./.:4:106,33:.: 0.38:1.000:. ./.:4:50,64:.:-0.27:1.000:. ./.:4:59,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,68:.:-0.27:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:4,4:.:-3.04:1.000:. ./.:4:63,36:.:-0.66:1.000:. ./.:4:92,14:.:-0.48:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:82,77:.: 0.91:1.000:. ./.:4:104,28:.: 0.20:1.000:. ./.:4:124,29:.: 0.75:1.000:. ./.:4:97,51:.: 0.62:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:140,28:.: 1.14:1.000:. ./.:4:86,24:.:-0.38:1.000:. ./.:4:88,49:.: 0.33:1.000:. ./.:6:86,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:145,37:.: 1.51:1.000:. ./.:4:70,71:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,61:.: 0.64:1.000:. ./.:4:77,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:122,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:43,16:.:-1.71:1.000:. ./.:4:97,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.25:0.910:. ./.:4:109,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:118,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:19,29:.:-2.00:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.77:1.000:. ./.:4:105,36:.: 0.44:1.000:. ./.:4:93,26:.:-0.14:1.000:. ./.:4:80,26:.:-0.48:1.000:. ./.:4:79,29:.:-0.43:1.000:. ./.:4:104,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,80:.: 0.96:1.000:. ./.:4:45,69:.:-0.27:1.000:. ./.:4:94,42:.: 0.30:0.920:. ./.:4:112,46:.: 0.88:1.000:. ./.:4:110,68:.: 1.40:1.000:. ./.:4:86,24:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,20:.:-1.06:1.000:. ./.:4:94,40:.: 0.25:1.000:. ./.:4:78,19:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,36:.:-0.19:1.000:. ./.:4:57,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:105,21:.: 0.04:1.000:. ./.:4:63,23:.:-1.00:0.994:. ./.:4:85,32:.:-0.19:1.000:. ./.:4:106,40:.: 0.57:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:99,26:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.11:1.000:. ./.:4:81,28:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,11:.:-1.79:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:103,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:89,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:134,36:.: 1.19:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:102,42:.: 0.51:1.000:. ./.:4:79,63:.: 0.46:0.999:. ./.:4:139,41:.: 1.46:1.000:. ./.:3:52,39:.:-0.87:0.962:. ./.:4:110,75:.: 1.59:1.000:. ./.:4:64,15:.:-1.19:1.000:. ./.:4:101,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:113,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,54:.: 0.02:1.000:. ./.:4:104,38:.: 0.46:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.12:1.000:. ./.:5:179,25:.: 2.08:0.988:. ./.:4:140,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:77,30:.:-0.45:1.000:. ./.:4:32,43:.:-1.29:1.000:. ./.:4:107,26:.: 0.23:1.000:. ./.:4:89,37:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:105,40:.: 0.54:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:116,36:.: 0.72:1.000:. ./.:4:128,33:.: 0.96:1.000:. ./.:4:117,28:.: 0.54:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:133,28:.: 0.96:1.000:. ./.:4:116,23:.: 0.38:1.000:. ./.:4:124,22:.: 0.57:1.000:. ./.:4:83,21:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:153,38:.: 1.74:1.000:. ./.:4:111,31:.: 0.46:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:145,28:.: 1.27:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,33:.: 0.25:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.30:1.000:. ./.:4:9,3:.:-2.94:1.000:. ./.:4:56,22:.:-1.21:1.000:. ./.:4:68,56:.:-0.01:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:112,35:.: 0.59:1.000:. ./.:4:91,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:88,33:.:-0.09:1.000:. ./.:4:127,26:.: 0.75:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,26:.:-0.56:1.000:. ./.:4:50,40:.:-0.90:1.000:. ./.:4:96,27:.:-0.04:1.000:. ./.:4:80,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:57,58:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:138,28:.: 1.09:0.999:. ./.:4:87,24:.:-0.35:1.000:. ./.:4:52,41:.:-0.82:1.000:. ./.:4:107,26:.: 0.23:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,26:.:-0.06:1.000:. ./.:4:98,37:.: 0.28:1.000:. ./.:4:74,16:.:-0.90:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:94,24:.:-0.17:1.000:. ./.:4:149,30:.: 1.43:1.000:. ./.:4:115,35:.: 0.67:1.000:. ./.:4:105,21:.: 0.04:1.000:. ./.:4:66,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:66,80:.: 0.57:1.000:. ./.:4:131,24:.: 0.80:1.000:. ./.:4:63,22:.:-1.03:1.000:. ./.:4:142,36:.: 1.40:1.000:. -chr1.1 79871662 chr1.1_079871662 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:0.996:. ./.:4:64,0:.:11.62:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:6:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:0.910:. ./.:4:7,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:0.920:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:0.994:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:0.999:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:4,0:.:-0.06:0.988:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:0.999:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.13:1.000:. -chr1.1 79947678 chr1.1_079947678 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.84:0.996:. ./.:4:87,0:.: 3.38:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,1:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.37:1.000:. ./.:6:10,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.34:0.994:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,1:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.05:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:24,0:.:-0.34:0.962:. ./.:4:27,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:23,0:.:-0.40:0.988:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 1.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,3:.: 1.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr1.1 80108022 chr1.1_080108022 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:197,113:.: 0.80:1.000:. ./.:4:170,117:.: 0.45:1.000:. ./.:4:165,81:.:-0.17:1.000:. ./.:4:169,136:.: 0.72:1.000:. ./.:4:239,117:.: 1.49:1.000:. ./.:4:275,131:.: 2.24:1.000:. ./.:4:100,68:.:-1.35:1.000:. ./.:4:218,108:.: 1.04:1.000:. ./.:4:197,100:.: 0.60:1.000:. ./.:4:107,27:.:-1.86:1.000:. ./.:4:66,38:.:-2.31:1.000:. ./.:4:142,76:.:-0.59:1.000:. ./.:4:187,82:.: 0.18:1.000:. ./.:4:198,120:.: 0.92:1.000:. ./.:4:185,112:.: 0.60:1.000:. ./.:4:216,67:.: 0.39:1.000:. ./.:4:191,84:.: 0.27:0.996:. ./.:4:202,187:.: 1.99:1.000:. ./.:4:182,142:.: 1.01:1.000:. ./.:4:196,150:.: 1.34:1.000:. ./.:4:57,32:.:-2.54:1.000:. ./.:4:167,120:.: 0.45:1.000:. ./.:4:190,113:.: 0.69:1.000:. ./.:4:122,102:.:-0.50:1.000:. ./.:4:48,7:.:-3.05:1.000:. ./.:4:199,97:.: 0.58:1.000:. ./.:4:213,121:.: 1.16:1.000:. ./.:4:182,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:227,138:.: 1.63:1.000:. ./.:4:172,48:.:-0.56:1.000:. ./.:4:215,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:181,54:.:-0.34:1.000:. ./.:4:45,24:.:-2.84:1.000:. ./.:4:85,36:.:-2.05:1.000:. ./.:3:31,27:.:-3.01:1.000:. ./.:4:221,122:.: 1.29:1.000:. ./.:4:170,67:.:-0.31:1.000:. ./.:4:196,148:.: 1.31:1.000:. ./.:4:158,118:.: 0.28:1.000:. ./.:4:163,96:.: 0.03:1.000:. ./.:4:147,50:.:-0.91:1.000:. ./.:4:191,91:.: 0.37:1.000:. ./.:4:219,88:.: 0.75:1.000:. ./.:4:149,132:.: 0.36:1.000:. ./.:4:160,62:.:-0.53:1.000:. ./.:4:199,146:.: 1.32:1.000:. ./.:4:189,107:.: 0.58:1.000:. ./.:4:49,27:.:-2.73:1.000:. ./.:4:128,72:.:-0.86:1.000:. ./.:4:122,55:.:-1.21:1.000:. ./.:4:152,96:.:-0.14:1.000:. ./.:4:225,118:.: 1.29:1.000:. ./.:4:161,94:.:-0.03:1.000:. ./.:4:204,100:.: 0.71:1.000:. ./.:4:178,54:.:-0.38:1.000:. ./.:4:149,64:.:-0.67:1.000:. ./.:4:184,90:.: 0.25:1.000:. ./.:4:191,99:.: 0.49:1.000:. ./.:4:158,55:.:-0.67:1.000:. ./.:6:147,65:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,53:.: 0.03:1.000:. ./.:4:179,102:.: 0.36:1.000:. ./.:4:162,74:.:-0.32:1.000:. ./.:4:165,71:.:-0.32:1.000:. ./.:4:195,95:.: 0.49:1.000:. ./.:4:171,62:.:-0.37:1.000:. ./.:4:97,43:.:-1.77:1.000:. ./.:4:166,104:.: 0.19:1.000:. ./.:4:170,67:.:-0.31:0.910:. ./.:4:178,97:.: 0.27:1.000:. ./.:4:204,94:.: 0.61:1.000:. ./.:4:118,65:.:-1.12:1.000:. ./.:4:207,70:.: 0.30:1.000:. ./.:4:179,94:.: 0.24:1.000:. ./.:4:164,63:.:-0.46:1.000:. ./.:4:177,85:.: 0.07:1.000:. ./.:4:156,74:.:-0.41:1.000:. ./.:4:184,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:194,146:.: 1.25:1.000:. ./.:4:163,42:.:-0.79:1.000:. ./.:4:131,100:.:-0.40:0.920:. ./.:4:192,71:.: 0.09:1.000:. ./.:4:187,71:.: 0.01:1.000:. ./.:4:144,97:.:-0.25:1.000:. ./.:4:166,48:.:-0.65:1.000:. ./.:4:259,83:.: 1.28:1.000:. ./.:4:130,87:.:-0.61:1.000:. ./.:4:126,97:.:-0.52:1.000:. ./.:4:136,115:.:-0.09:1.000:. ./.:4:185,127:.: 0.83:1.000:. ./.:4:120,71:.:-1.00:0.994:. ./.:4:201,81:.: 0.37:1.000:. ./.:4:242,46:.: 0.46:1.000:. ./.:4:119,50:.:-1.33:1.000:. ./.:4:247,128:.: 1.78:1.000:. ./.:4:197,118:.: 0.87:1.000:. ./.:4:137,108:.:-0.18:1.000:. ./.:4:158,106:.: 0.10:1.000:. ./.:4:136,95:.:-0.40:1.000:. ./.:4:204,85:.: 0.48:1.000:. ./.:4:78,46:.:-2.01:1.000:. ./.:4:187,78:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,63:.:-1.10:1.000:. ./.:4:192,117:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,66:.:-0.76:1.000:. ./.:4:226,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:173,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:195,116:.: 0.81:1.000:. ./.:4:221,132:.: 1.44:1.000:. ./.:4:212,141:.: 1.44:1.000:. ./.:4:155,77:.:-0.38:1.000:. ./.:4:267,111:.: 1.82:1.000:. ./.:4:145,110:.:-0.03:0.999:. ./.:4:224,82:.: 0.74:1.000:. ./.:3:68,49:.:-2.12:0.962:. ./.:4:180,132:.: 0.83:1.000:. ./.:4:122,65:.:-1.06:1.000:. ./.:4:143,57:.:-0.86:1.000:. ./.:4:180,114:.: 0.55:1.000:. ./.:4:160,76:.:-0.32:1.000:. ./.:4:213,90:.: 0.69:1.000:. ./.:4:123,85:.:-0.74:1.000:. ./.:4:202,82:.: 0.40:1.000:. ./.:4:181,137:.: 0.92:1.000:. ./.:4:163,68:.:-0.40:1.000:. ./.:4:203,104:.: 0.75:1.000:. ./.:5:192,122:.: 0.86:0.988:. ./.:4:136,101:.:-0.31:1.000:. ./.:4:122,72:.:-0.95:1.000:. ./.:4:105,89:.:-0.95:1.000:. ./.:4:163,68:.:-0.40:1.000:. ./.:4:202,72:.: 0.25:1.000:. ./.:4:111,62:.:-1.27:1.000:. ./.:4:155,61:.:-0.62:1.000:. ./.:4:172,97:.: 0.18:1.000:. ./.:4:201,153:.: 1.46:1.000:. ./.:4:226,91:.: 0.90:1.000:. ./.:4:164,57:.:-0.55:1.000:. ./.:4:140,85:.:-0.49:1.000:. ./.:4:149,71:.:-0.56:1.000:. ./.:4:190,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:152,105:.: 0.00:1.000:. ./.:4:156,117:.: 0.24:1.000:. ./.:4:153,83:.:-0.32:1.000:. ./.:4:231,131:.: 1.58:1.000:. ./.:4:248,83:.: 1.11:1.000:. ./.:4:231,96:.: 1.05:1.000:. ./.:4:199,122:.: 0.96:1.000:. ./.:4:201,133:.: 1.16:1.000:. ./.:4:163,56:.:-0.58:1.000:. ./.:4:198,99:.: 0.60:1.000:. ./.:4:184,59:.:-0.21:1.000:. ./.:4:50,16:.:-2.88:1.000:. ./.:4:146,95:.:-0.25:1.000:. ./.:4:194,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:213,61:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,138:.: 0.77:1.000:. ./.:4:143,78:.:-0.55:1.000:. ./.:4:135,105:.:-0.26:1.000:. ./.:4:219,119:.: 1.22:1.000:. ./.:4:188,81:.: 0.18:1.000:. ./.:4:135,65:.:-0.86:1.000:. ./.:4:170,61:.:-0.40:1.000:. ./.:4:224,93:.: 0.90:1.000:. ./.:4:153,42:.:-0.94:1.000:. ./.:4:163,60:.:-0.52:1.000:. ./.:4:148,104:.:-0.08:1.000:. ./.:4:173,99:.: 0.22:0.999:. ./.:4:154,114:.: 0.16:1.000:. ./.:4:151,99:.:-0.11:1.000:. ./.:4:125,78:.:-0.82:1.000:. ./.:4:91,22:.:-2.18:1.000:. ./.:4:192,88:.: 0.34:1.000:. ./.:4:177,94:.: 0.21:1.000:. ./.:4:128,61:.:-1.03:1.000:. ./.:4:162,92:.:-0.05:1.000:. ./.:4:240,87:.: 1.05:1.000:. ./.:4:194,144:.: 1.22:1.000:. ./.:4:211,110:.: 0.96:1.000:. ./.:4:191,74:.: 0.12:1.000:. ./.:4:181,77:.: 0.01:1.000:. ./.:4:176,151:.: 1.05:1.000:. ./.:4:215,157:.: 1.73:1.000:. ./.:4:130,92:.:-0.53:1.000:. ./.:4:171,94:.: 0.12:1.000:. -chr1.1 80365520 chr1.1_080365520 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:129,56:.: 0.55:1.000:. ./.:4:109,55:.: 0.15:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:90,111:.: 0.85:1.000:. ./.:4:174,48:.: 1.25:1.000:. ./.:4:111,147:.: 1.93:1.000:. ./.:4:70,113:.: 0.51:1.000:. ./.:4:129,55:.: 0.53:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:8,5:.:-2.70:1.000:. ./.:4:12,1:.:-2.70:1.000:. ./.:4:129,68:.: 0.77:1.000:. ./.:4:125,54:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,114:.: 0.81:1.000:. ./.:4:88,97:.: 0.55:1.000:. ./.:4:103,122:.: 1.30:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.17:0.996:. ./.:4:201,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:104,110:.: 1.10:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:130,49:.: 0.43:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:123,58:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:86,130:.: 1.13:1.000:. ./.:4:167,53:.: 1.21:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:153,69:.: 1.25:1.000:. ./.:4:163,49:.: 1.06:1.000:. ./.:4:136,62:.: 0.79:1.000:. ./.:4:137,46:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.87:1.000:. ./.:4:11,11:.:-2.53:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:149,47:.: 0.76:1.000:. ./.:4:156,65:.: 1.23:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:144,61:.: 0.93:1.000:. ./.:4:96,35:.:-0.47:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:107,45:.:-0.08:1.000:. ./.:4:62,57:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,33:.:-0.19:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:148,55:.: 0.89:1.000:. ./.:4:9,11:.:-2.57:1.000:. ./.:4:61,55:.:-0.76:1.000:. ./.:4:47,25:.:-1.59:1.000:. ./.:4:88,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:96,122:.: 1.17:1.000:. ./.:4:94,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:72,81:.:-0.06:1.000:. ./.:4:127,49:.: 0.38:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:80,84:.: 0.15:1.000:. ./.:4:50,83:.:-0.43:1.000:. ./.:4:68,81:.:-0.13:1.000:. ./.:6:73,53:.:-0.57:1.000:. ./.:4:60,85:.:-0.21:1.000:. ./.:4:117,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:58,60:.:-0.72:1.000:. ./.:4:124,53:.: 0.40:1.000:. ./.:4:98,55:.:-0.06:1.000:. ./.:4:52,63:.:-0.77:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:48,85:.:-0.43:0.910:. ./.:4:147,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:113,45:.: 0.04:1.000:. ./.:4:35,45:.:-1.44:1.000:. ./.:4:87,44:.:-0.47:1.000:. ./.:4:144,52:.: 0.76:1.000:. ./.:4:93,59:.:-0.08:1.000:. ./.:4:86,29:.:-0.77:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:110,51:.: 0.09:1.000:. ./.:4:60,106:.: 0.19:1.000:. ./.:4:52,68:.:-0.68:0.920:. ./.:4:77,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:100,97:.: 0.77:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:46,75:.:-0.66:1.000:. ./.:4:78,96:.: 0.34:1.000:. ./.:4:76,36:.:-0.83:1.000:. ./.:4:90,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:50,58:.:-0.91:1.000:. ./.:4:60,98:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,72:.:-0.47:0.994:. ./.:4:81,78:.: 0.06:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:91,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:109,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:98,46:.:-0.23:1.000:. ./.:4:73,37:.:-0.87:1.000:. ./.:4:73,34:.:-0.93:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:144,72:.: 1.13:1.000:. ./.:4:43,46:.:-1.27:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:62,29:.:-1.23:1.000:. ./.:4:114,42:.: 0.00:1.000:. ./.:4:50,67:.:-0.74:1.000:. ./.:4:84,100:.: 0.53:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:134,52:.: 0.57:1.000:. ./.:4:97,132:.: 1.38:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:80,43:.:-0.62:1.000:. ./.:4:136,110:.: 1.70:1.000:. ./.:4:101,44:.:-0.21:0.999:. ./.:4:116,49:.: 0.17:1.000:. ./.:3:41,20:.:-1.79:0.962:. ./.:4:91,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:47,66:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,43:.:-0.49:1.000:. ./.:4:91,24:.:-0.77:1.000:. ./.:4:122,48:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,85:.:-0.30:1.000:. ./.:4:81,89:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,54:.: 0.74:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:103,50:.:-0.06:1.000:. ./.:5:161,0:.: 0.09:0.988:. ./.:4:95,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:65,30:.:-1.15:1.000:. ./.:4:67,27:.:-1.17:1.000:. ./.:4:97,24:.:-0.66:1.000:. ./.:4:89,101:.: 0.64:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:79,44:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,50:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,135:.: 1.45:1.000:. ./.:4:79,107:.: 0.57:1.000:. ./.:4:85,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:60,67:.:-0.55:1.000:. ./.:4:124,56:.: 0.45:1.000:. ./.:4:72,24:.:-1.13:1.000:. ./.:4:116,148:.: 2.04:1.000:. ./.:4:118,116:.: 1.47:1.000:. ./.:4:149,65:.: 1.10:1.000:. ./.:4:118,59:.: 0.40:1.000:. ./.:4:86,110:.: 0.76:1.000:. ./.:4:125,46:.: 0.28:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:147,66:.: 1.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:60,103:.: 0.13:1.000:. ./.:4:89,121:.: 1.02:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:151,75:.: 1.32:1.000:. ./.:4:142,64:.: 0.94:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:105,128:.: 1.45:1.000:. ./.:4:117,39:.: 0.00:1.000:. ./.:4:96,46:.:-0.26:1.000:. ./.:4:134,56:.: 0.64:1.000:. ./.:4:102,86:.: 0.60:1.000:. ./.:4:66,117:.: 0.51:1.000:. ./.:4:148,64:.: 1.06:1.000:. ./.:4:77,74:.:-0.09:1.000:. ./.:4:135,56:.: 0.66:0.999:. ./.:4:68,119:.: 0.59:1.000:. ./.:4:119,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:114,48:.: 0.11:1.000:. ./.:4:83,97:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:109,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:126,159:.: 2.44:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,125:.: 1.00:1.000:. ./.:4:147,66:.: 1.08:1.000:. ./.:4:145,62:.: 0.96:1.000:. ./.:4:166,70:.: 1.51:1.000:. ./.:4:114,148:.: 2.00:1.000:. ./.:4:103,39:.:-0.26:1.000:. ./.:4:133,60:.: 0.70:1.000:. -chr1.1 80473699 chr1.1_080473699 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,37:.:-0.73:1.000:. ./.:4:127,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:128,89:.: 0.50:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:185,36:.: 0.59:1.000:. ./.:4:186,39:.: 0.67:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:154,32:.:-0.16:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,7:.:-3.02:1.000:. ./.:4:61,38:.:-2.01:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:135,41:.:-0.37:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:169,41:.: 0.35:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:145,44:.:-0.10:0.996:. ./.:4:146,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:123,99:.: 0.61:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:58,14:.:-2.59:1.000:. ./.:4:145,44:.:-0.10:1.000:. ./.:4:167,32:.: 0.12:1.000:. ./.:4:90,80:.:-0.50:1.000:. ./.:4:31,11:.:-3.23:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:120,27:.:-0.99:1.000:. ./.:4:128,39:.:-0.56:1.000:. ./.:4:240,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:116,93:.: 0.33:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:127,36:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.25:1.000:. ./.:4:112,1:.:-1.72:1.000:. ./.:3:51,8:.:-2.87:1.000:. ./.:4:134,37:.:-0.48:1.000:. ./.:4:150,40:.:-0.07:1.000:. ./.:4:107,74:.:-0.27:1.000:. ./.:4:189,45:.: 0.86:1.000:. ./.:4:136,80:.: 0.48:1.000:. ./.:4:129,66:.: 0.03:1.000:. ./.:4:156,35:.:-0.05:1.000:. ./.:4:178,42:.: 0.57:1.000:. ./.:4:171,36:.: 0.29:1.000:. ./.:4:192,41:.: 0.84:1.000:. ./.:4:220,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:165,46:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:181,37:.: 0.52:1.000:. ./.:4:370,0:.: 3.76:1.000:. ./.:4:165,34:.: 0.12:1.000:. ./.:4:179,45:.: 0.65:1.000:. ./.:4:82,69:.:-0.91:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:137,34:.:-0.48:1.000:. ./.:4:194,37:.: 0.80:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:187,30:.: 0.50:1.000:. ./.:6:130,34:.:-0.63:1.000:. ./.:4:192,41:.: 0.84:1.000:. ./.:4:180,30:.: 0.35:1.000:. ./.:4:222,47:.: 1.61:1.000:. ./.:4:141,77:.: 0.52:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:145,29:.:-0.42:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:93,60:.:-0.86:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.25:0.910:. ./.:4:141,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:120,79:.: 0.12:1.000:. ./.:4:95,47:.:-1.10:1.000:. ./.:4:161,71:.: 0.82:1.000:. ./.:4:100,75:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,40:.: 0.80:1.000:. ./.:4:203,32:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,80:.:-0.03:1.000:. ./.:4:135,40:.:-0.39:1.000:. ./.:4:160,40:.: 0.14:1.000:. ./.:4:219,37:.: 1.33:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.01:0.920:. ./.:4:200,39:.: 0.97:1.000:. ./.:4:249,35:.: 1.93:1.000:. ./.:4:93,67:.:-0.71:1.000:. ./.:4:296,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:205,38:.: 1.06:1.000:. ./.:4:127,28:.:-0.82:1.000:. ./.:4:136,38:.:-0.42:1.000:. ./.:4:143,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:103,58:.:-0.69:0.994:. ./.:4:226,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:113,92:.: 0.25:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:115,71:.:-0.16:1.000:. ./.:4:173,36:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,88:.: 0.05:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:175,27:.: 0.18:1.000:. ./.:4:202,48:.: 1.21:1.000:. ./.:4:116,26:.:-1.10:1.000:. ./.:4:149,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:132,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:135,45:.:-0.29:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:141,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:189,29:.: 0.52:0.999:. ./.:4:266,0:.: 1.55:1.000:. ./.:3:111,33:.:-1.05:0.962:. ./.:4:147,86:.: 0.84:1.000:. ./.:4:89,57:.:-1.01:1.000:. ./.:4:170,44:.: 0.44:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:165,34:.: 0.12:1.000:. ./.:4:153,31:.:-0.20:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:130,41:.:-0.48:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.01:1.000:. ./.:5:122,57:.:-0.31:0.988:. ./.:4:85,73:.:-0.76:1.000:. ./.:4:145,21:.:-0.59:1.000:. ./.:4:106,46:.:-0.88:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:105,18:.:-1.50:1.000:. ./.:4:117,35:.:-0.88:1.000:. ./.:4:140,25:.:-0.61:1.000:. ./.:4:266,2:.: 1.59:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,25:.:-0.95:1.000:. ./.:4:97,59:.:-0.80:1.000:. ./.:4:121,67:.:-0.12:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:130,32:.:-0.67:1.000:. ./.:4:252,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:168,37:.: 0.25:1.000:. ./.:4:130,42:.:-0.46:1.000:. ./.:4:142,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:178,49:.: 0.71:1.000:. ./.:4:144,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:119,76:.: 0.03:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,13:.:-3.27:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:198,37:.: 0.89:1.000:. ./.:4:187,44:.: 0.80:1.000:. ./.:4:97,81:.:-0.33:1.000:. ./.:4:109,84:.:-0.01:1.000:. ./.:4:65,60:.:-1.46:1.000:. ./.:4:160,37:.: 0.08:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:158,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:190,46:.: 0.91:1.000:. ./.:4:141,51:.:-0.03:1.000:. ./.:4:127,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:138,31:.:-0.52:0.999:. ./.:4:151,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:131,29:.:-0.71:1.000:. ./.:4:72,56:.:-1.40:1.000:. ./.:4:133,42:.:-0.39:1.000:. ./.:4:176,40:.: 0.48:1.000:. ./.:4:135,35:.:-0.50:1.000:. ./.:4:182,30:.: 0.40:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:259,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:128,81:.: 0.33:1.000:. ./.:4:191,41:.: 0.82:1.000:. ./.:4:152,46:.: 0.10:1.000:. ./.:4:94,64:.:-0.76:1.000:. ./.:4:204,49:.: 1.27:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:68,62:.:-1.35:1.000:. ./.:4:157,39:.: 0.05:1.000:. -chr1.1 80596889 chr1.1_080596889 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:54,13:0.19: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,18:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,24:0.36: 0.41:1.000:0.679 0/0/1/1:4:40,35:0.46: 0.90:1.000:0.987 0/0/1/1:4:39,62:0.58: 2.17:1.000:0.919 0/0/1/1:4:49,42:0.45: 1.68:1.000:0.983 0/0/1/1:4:9,16:0.60:-1.54:1.000:0.807 0/0/0/1:4:59,21:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.19:-2.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.32:-2.32:1.000:0.940 0/0/0/1:4:28,13:0.31:-0.76:1.000:0.976 0/0/0/1:4:49,14:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,35:0.47: 0.85:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,31:0.45: 0.51:1.000:0.984 0/0/1/1:4:39,46:0.52: 1.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,26:0.30: 1.39:0.996:0.988 0/0/0/1:4:67,19:0.21: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,26:0.34: 0.90:1.000:0.881 0/0/1/1:4:43,40:0.47: 1.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,12:0.23:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,29:0.60:-0.57:1.000:0.779 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,32:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:41,15:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,13:0.18: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,13:0.19: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,41:0.56: 0.66:1.000:0.970 0/0/0/1:4:45,9:0.16:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,23:0.29: 1.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:9,4:0.30:-2.13:1.000:0.986 0/0/0/1:4:14,6:0.29:-1.79:1.000:0.991 0/0/0:3:9,0:0.00:-2.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,13:0.19: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,39:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,17:0.30:-0.08:1.000:0.985 0/0/1/1:4:33,42:0.54: 0.90:1.000:0.988 0/1/1/1:4:11,36:0.69:-0.47:1.000:0.975 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,19:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,33:0.63:-0.42:1.000:0.606 0/0/0/1:4:26,5:0.16:-1.25:1.000:0.993 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,27:0.34: 1.05:1.000:0.884 0/1/1/1:4:39,100:0.66: 4.02:1.000:0.848 0/1/1/1:4:15,33:0.63:-0.42:1.000:0.606 0/0/0/1:4:34,8:0.18:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,10:0.25:-0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,61:0.66: 1.34:1.000:0.881 0/0/1/1:4:30,28:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,25:0.46:-0.13:1.000:0.984 0/0/1/1:4:34,23:0.40: 0.02:1.000:0.748 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,26:0.44: 0.07:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,26:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,42:0.67: 0.02:1.000:0.920 0/0/0/0/1/1:6:19,14:0.42:-1.15:1.000:0.510 0/0/1/1:4:31,20:0.38:-0.27:1.000:0.619 0/0/1/1:4:37,28:0.42: 0.41:1.000:0.925 0/0/1/1:4:31,23:0.42:-0.13:1.000:0.905 0/1/1/1:4:10,42:0.72:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,14:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,34:0.54: 0.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:19,13:0.40:-1.20:1.000:0.774 0/0/0/1:4:35,16:0.30:-0.27:1.000:0.980 0/0/1/1:4:19,23:0.53:-0.71:0.910:0.992 0/0/0/0:4:62,1:0.02: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,28:0.43: 0.36:1.000:0.945 0/1/1/1:4:5,37:0.78:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,18:0.32:-0.13:1.000:0.940 0/0/1/1:4:44,56:0.54: 2.12:1.000:0.988 0/0/0/1:4:29,13:0.30:-0.71:1.000:0.985 0/0/0/1:4:42,15:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,21:0.40:-0.22:1.000:0.751 0/0/1/1:4:21,18:0.45:-0.86:1.000:0.983 0/0/1/1:4:33,26:0.43: 0.12:1.000:0.953 0/1/1/1:4:13,71:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,22:0.60:-1.10:0.920:0.761 0/0/1/1:4:21,42:0.62: 0.31:1.000:0.597 0/1/1/1:4:7,61:0.80: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,9:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,24:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,30:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,23:0.55:-0.81:1.000:0.980 0/0/1/1:4:19,26:0.55:-0.57:1.000:0.978 0/1/1/1:4:14,36:0.66:-0.32:1.000:0.851 0/0/1/1:4:33,25:0.42: 0.07:1.000:0.926 0/1/1/1:4:7,38:0.75:-0.57:0.994:0.999 0/0/1/1:4:35,24:0.40: 0.12:1.000:0.779 0/0/0/1:4:54,16:0.22: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,6:0.13:-0.61:1.000:0.922 0/0/0/1:4:55,12:0.17: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,14:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,25:0.54:-0.57:1.000:0.990 0/0/0/1:4:25,9:0.26:-1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,10:0.20:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,28:0.32: 1.34:1.000:0.940 0/0/1/1:4:16,11:0.40:-1.44:1.000:0.784 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,3:0.13:-1.64:1.000:0.862 0/0/0/1:4:33,7:0.17:-0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,14:0.43:-1.20:1.000:0.945 0/0/1/1:4:41,36:0.46: 1.00:1.000:0.987 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.33:-0.32:1.000:0.915 0/0/1/1:4:46,41:0.46: 1.48:1.000:0.990 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,15:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,43:0.46: 1.73:1.000:0.987 0/0/1/1:4:25,20:0.44:-0.57:0.999:0.961 0/0/0/1:4:45,11:0.19:-0.03:1.000:1.000 0/1/1:3:7,11:0.58:-1.88:0.962:0.994 0/0/1/1:4:29,31:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,5:0.17:-1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,22:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:44,15:0.25: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,14:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,12:0.18: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,27:0.70:-1.05:1.000:0.981 0/0/1/1:4:23,22:0.48:-0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:46,14:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,14:0.28:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/0/1:5:44,16:0.26: 0.17:0.988:0.897 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,15:0.45:-1.15:1.000:0.976 0/0/1/1:4:14,14:0.49:-1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,15:0.31:-0.47:1.000:0.973 0/0/1/1:4:23,33:0.56:-0.03:1.000:0.966 0/0/0/1:4:27,5:0.15:-1.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,16:0.40:-0.86:1.000:0.809 0/0/0/1:4:33,7:0.17:-0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,38:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,24:0.48:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:21,11:0.34:-1.20:1.000:0.897 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,7:0.16:-0.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:47,11:0.18: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,13:0.47:-1.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:36,14:0.27:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,10:0.38:-1.49:1.000:0.520 0/0/1/1:4:65,52:0.44: 2.95:1.000:0.961 0/0/1/1:4:33,32:0.48: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,22:0.31: 0.61:1.000:0.973 0/0/0/1:4:53,16:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,42:0.37: 2.61:1.000:0.517 0/0/0/1:4:37,19:0.33:-0.03:1.000:0.918 0/0/0/1:4:65,18:0.21: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,21:0.29: 0.70:1.000:0.993 0/0/0/1:4:7,3:0.29:-2.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:28,25:0.46:-0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,73:0.67: 2.07:1.000:0.922 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,44:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,31:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,13:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,30:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,12:0.19: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,22:0.29: 0.85:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,34:0.56: 0.07:1.000:0.970 0/0/1/1:4:20,31:0.57:-0.27:1.000:0.934 0/1/1/1:4:17,54:0.69: 0.70:1.000:0.969 0/0/1/1:4:39,29:0.42: 0.56:1.000:0.908 0/1/1/1:4:16,43:0.66: 0.12:1.000:0.892 0/0/0/1:4:47,21:0.30: 0.56:0.999:0.985 0/0/1/1:4:27,34:0.54: 0.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:20,35:0.60:-0.08:1.000:0.828 0/0/0/1:4:35,15:0.29:-0.32:1.000:0.991 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,6:0.14:-0.71:1.000:0.959 0/0/1/1:4:26,35:0.55: 0.22:1.000:0.981 0/0/0/1:4:35,18:0.33:-0.17:1.000:0.917 0/0/0/1:4:34,9:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,43:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,21:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,32:0.43: 0.80:1.000:0.948 0/0/0/1:4:57,14:0.19: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,37:0.60: 0.02:1.000:0.746 0/0/1/1:4:34,46:0.55: 1.14:1.000:0.980 0/0/1/1:4:35,32:0.47: 0.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,26:0.46:-0.03:1.000:0.985 0/0/0/1:4:55,21:0.27: 0.95:1.000:0.998 -chr1.1 80757246 chr1.1_080757246 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:44,114:.: 0.39:1.000:. ./.:4:40,85:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.28:1.000:. ./.:4:80,81:.: 0.46:1.000:. ./.:4:31,143:.: 0.79:1.000:. ./.:4:77,79:.: 0.33:1.000:. ./.:4:53,46:.:-1.12:1.000:. ./.:4:36,104:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,11:.:-3.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,84:.:-0.43:1.000:. ./.:4:41,97:.:-0.13:1.000:. ./.:4:97,74:.: 0.72:1.000:. ./.:4:95,57:.: 0.23:1.000:. ./.:4:89,74:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,192:.: 1.25:0.996:. ./.:4:0,103:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,210:.: 1.71:1.000:. ./.:4:98,90:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,24:.:-3.04:1.000:. ./.:4:45,119:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.23:1.000:. ./.:4:40,95:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,6:.:-3.50:1.000:. ./.:4:102,88:.: 1.20:1.000:. ./.:4:25,113:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.13:1.000:. ./.:4:43,119:.: 0.49:1.000:. ./.:4:42,87:.:-0.36:1.000:. ./.:4:51,131:.: 1.00:1.000:. ./.:4:38,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,2:.:-3.57:1.000:. ./.:4:14,16:.:-2.88:1.000:. ./.:3:0,9:.:-3.42:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.02:1.000:. ./.:4:50,122:.: 0.74:1.000:. ./.:4:36,114:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,223:.: 2.04:1.000:. ./.:4:46,136:.: 1.00:1.000:. ./.:4:41,109:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.13:1.000:. ./.:4:41,119:.: 0.44:1.000:. ./.:4:85,61:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,119:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.03:1.000:. ./.:4:53,110:.: 0.51:1.000:. ./.:4:22,17:.:-2.65:1.000:. ./.:4:91,54:.: 0.05:1.000:. ./.:4:37,82:.:-0.61:1.000:. ./.:4:39,88:.:-0.41:1.000:. ./.:4:93,76:.: 0.67:1.000:. ./.:4:53,102:.: 0.31:1.000:. ./.:4:93,90:.: 1.02:1.000:. ./.:4:39,80:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.54:1.000:. ./.:4:86,98:.: 1.05:1.000:. ./.:4:91,83:.: 0.79:1.000:. ./.:4:83,86:.: 0.67:1.000:. ./.:6:47,82:.:-0.36:1.000:. ./.:4:91,82:.: 0.77:1.000:. ./.:4:29,110:.:-0.10:1.000:. ./.:4:55,131:.: 1.10:1.000:. ./.:4:85,63:.: 0.13:1.000:. ./.:4:53,146:.: 1.43:1.000:. ./.:4:40,117:.: 0.36:1.000:. ./.:4:77,67:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.46:1.000:. ./.:4:87,69:.: 0.33:0.910:. ./.:4:0,129:.:-0.36:1.000:. ./.:4:37,110:.: 0.10:1.000:. ./.:4:55,41:.:-1.20:1.000:. ./.:4:60,117:.: 0.87:1.000:. ./.:4:37,122:.: 0.41:1.000:. ./.:4:37,107:.: 0.03:1.000:. ./.:4:38,109:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.26:1.000:. ./.:4:56,125:.: 0.97:1.000:. ./.:4:102,93:.: 1.33:1.000:. ./.:4:68,56:.:-0.48:0.920:. ./.:4:76,89:.: 0.56:1.000:. ./.:4:96,93:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.76:1.000:. ./.:4:69,61:.:-0.33:1.000:. ./.:4:86,66:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,80:.:-0.92:1.000:. ./.:4:30,94:.:-0.48:1.000:. ./.:4:58,65:.:-0.51:1.000:. ./.:4:76,74:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,87:.: 0.36:0.994:. ./.:4:72,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.64:1.000:. ./.:4:34,82:.:-0.69:1.000:. ./.:4:58,134:.: 1.25:1.000:. ./.:4:45,146:.: 1.23:1.000:. ./.:4:34,93:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,111:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.66:1.000:. ./.:4:43,104:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,40:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,78:.:-0.81:1.000:. ./.:4:39,101:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,53:.:-0.36:1.000:. ./.:4:68,78:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.03:1.000:. ./.:4:34,102:.:-0.18:1.000:. ./.:4:93,93:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.16:1.000:. ./.:4:37,74:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,99:.: 1.10:1.000:. ./.:4:33,77:.:-0.84:0.999:. ./.:4:48,153:.: 1.48:1.000:. ./.:3:34,58:.:-1.30:0.962:. ./.:4:56,118:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.33:1.000:. ./.:4:70,48:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,118:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,90:.:-0.33:1.000:. ./.:4:43,105:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:93,92:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.79:1.000:. ./.:4:49,96:.: 0.05:1.000:. ./.:5:0,168:.: 0.64:0.988:. ./.:4:0,137:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,72:.:-0.76:1.000:. ./.:4:29,76:.:-0.97:1.000:. ./.:4:43,91:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.79:1.000:. ./.:4:40,93:.:-0.25:1.000:. ./.:4:35,106:.:-0.05:1.000:. ./.:4:114,91:.: 1.59:1.000:. ./.:4:91,73:.: 0.54:1.000:. ./.:4:28,83:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,127:.:-0.38:1.000:. ./.:4:75,63:.:-0.13:1.000:. ./.:4:45,80:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,76:.:-1.02:1.000:. ./.:4:96,102:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,68:.: 0.51:1.000:. ./.:4:49,94:.: 0.00:1.000:. ./.:4:42,106:.: 0.13:1.000:. ./.:4:105,91:.: 1.36:1.000:. ./.:4:41,118:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.90:1.000:. ./.:4:35,118:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,18:.:-3.19:1.000:. ./.:4:57,61:.:-0.64:1.000:. ./.:4:109,89:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,134:.: 0.79:1.000:. ./.:4:59,82:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.26:1.000:. ./.:4:85,78:.: 0.51:1.000:. ./.:4:41,110:.: 0.21:1.000:. ./.:4:43,99:.:-0.02:1.000:. ./.:4:45,96:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,66:.: 0.21:1.000:. ./.:4:91,78:.: 0.67:1.000:. ./.:4:33,93:.:-0.43:1.000:. ./.:4:87,69:.: 0.33:1.000:. ./.:4:33,88:.:-0.56:0.999:. ./.:4:85,60:.: 0.05:1.000:. ./.:4:28,76:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.89:1.000:. ./.:4:48,108:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,65:.: 0.00:1.000:. ./.:4:40,125:.: 0.56:1.000:. ./.:4:30,106:.:-0.18:1.000:. ./.:4:108,98:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1,162:.: 0.51:1.000:. ./.:4:65,72:.:-0.15:1.000:. ./.:4:44,119:.: 0.51:1.000:. ./.:4:43,110:.: 0.26:1.000:. ./.:4:72,160:.: 2.27:1.000:. ./.:4:97,85:.: 1.00:1.000:. ./.:4:27,90:.:-0.66:1.000:. ./.:4:35,89:.:-0.48:1.000:. -chr1.1 80888940 chr1.1_080888940 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:139,43:0.25: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,25:0.19:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,55:0.44:-0.26:1.000:0.959 0/0/0/1:4:131,40:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,69:0.46: 0.45:1.000:0.985 0/0/0/1:4:38,21:0.37:-2.25:1.000:0.542 0/0/0/1:4:133,43:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.48:-3.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:31,7:0.19:-2.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,25:0.21:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,31:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,70:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,73:0.52: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,66:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 1.16:0.996:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,83:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-3.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,36:0.21: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,21:0.18:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-3.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,101:0.51: 1.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,27:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,36:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,21:0.16:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,34:0.18: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,39:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.75:-3.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,30:0.66:-2.74:1.000:0.888 0/0/0:3:25,0:0.00:-3.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,29:0.19: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,32:0.21: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,41:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,44:0.31: 0.18:1.000:0.974 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,46:0.29: 0.62:1.000:0.991 0/0/1/1:4:80,75:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:108,33:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,42:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,67:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,71:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,38:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,41:0.36:-0.64:1.000:0.656 0/0/1/1:4:104,113:0.53: 2.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:94,19:0.17:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,84:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,34:0.32:-0.80:1.000:0.962 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,72:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,98:0.54: 1.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,89:0.53: 0.72:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:74,37:0.35:-0.83:1.000:0.903 0/0/1/1:4:60,68:0.53:-0.37:1.000:0.991 0/0/0/1:4:116,35:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,46:0.28: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,91:0.54: 0.78:1.000:0.989 0/0/0/1:4:141,37:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,39:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,36:0.46:-1.65:1.000:0.990 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,73:0.45: 0.81:0.910:0.976 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,41:0.23: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,42:0.51:-1.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:137,52:0.29: 1.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:137,34:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,45:0.26: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,33:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,49:0.34: 0.23:1.000:0.863 0/0/1/1:4:90,69:0.45: 0.48:1.000:0.983 0/0/1/1:4:63,69:0.53:-0.26:0.920:0.993 0/0/1/1:4:91,78:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,89:0.53: 0.83:1.000:0.994 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,93:0.51: 1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,78:0.53: 0.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,36:0.35:-0.94:1.000:0.782 0/0/0/1:4:93,26:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,81:0.57:-0.09:1.000:0.946 0/0/1/1:4:60,73:0.55:-0.23:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,43:0.43:-0.99:0.994:0.941 0/0/1/1:4:68,58:0.48:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,30:0.26:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,34:0.29:-0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,49:0.30: 0.75:1.000:0.983 0/0/0/1:4:64,27:0.31:-1.38:1.000:0.974 0/0/0/1:4:108,32:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,31:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,44:0.47:-1.21:1.000:0.994 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,26:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,32:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,63:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,59:0.46:-0.23:1.000:0.990 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,39:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,82:0.51: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,33:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,87:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,39:0.33:-0.48:0.999:0.928 0/0/0/1:4:107,29:0.22:-0.15:1.000:1.000 0/0/1:3:76,29:0.29:-0.99:0.962:1.000 0/0/0/1:4:118,32:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,53:0.51:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,33:0.27:-0.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:83,35:0.31:-0.64:1.000:0.975 0/0/0/1:4:104,41:0.29: 0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:69,66:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,66:0.45: 0.29:1.000:0.983 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,45:0.31: 0.26:1.000:0.972 0/0/0/0/0:5:186,0:0.00: 1.22:0.988:1.000 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,26:0.26:-0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,31:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,42:0.29: 0.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,54:0.42:-0.23:1.000:0.930 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,37:0.28:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,34:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,110:0.50: 2.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,80:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,29:0.29:-0.99:1.000:0.993 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,45:0.49:-1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,30:0.21: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,29:0.26:-0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,81:0.48: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,91:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,24:0.17: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:117,37:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,83:0.54: 0.34:1.000:0.988 0/0/0/1:4:108,43:0.30: 0.26:1.000:0.988 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,27:0.20: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-3.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,27:0.40:-1.92:1.000:0.766 0/0/1/1:4:113,89:0.46: 1.65:1.000:0.988 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,37:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,28:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,81:0.48: 1.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:91,35:0.29:-0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:108,30:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,24:0.17: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,59:0.51:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,73:0.45: 0.72:1.000:0.984 0/0/0/1:4:117,40:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,56:0.45:-0.28:1.000:0.977 0/0/0/1:4:122,27:0.19: 0.21:0.999:1.000 0/0/1/1:4:69,59:0.48:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:119,28:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,28:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,69:0.44: 0.59:1.000:0.971 0/0/0/1:4:103,34:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,33:0.29:-0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,67:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/0/0/0:4:142,1:0.01: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,73:0.44: 0.92:1.000:0.960 0/0/0/1:4:136,39:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,41:0.28: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:171,32:0.16: 1.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,61:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,30:0.26:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,32:0.23: 0.02:1.000:1.000 -chr1.1 81270233 chr1.1_081270233 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.95:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.65:1.000:. ./.:3:8,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.19:1.000:. ./.:6:71,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.91:0.910:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.11:0.920:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:76,1:.: 1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.74:0.994:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:54,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:3:28,0:.:-0.70:0.962:. ./.:4:107,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:68,2:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:53,0:.: 0.46:0.988:. ./.:4:74,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:72,2:.: 1.44:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:99,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.50:0.999:. ./.:4:50,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.79:1.000:. -chr1.1 81321362 chr1.1_081321362 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:145,185:.: 0.77:1.000:. ./.:4:80,206:.: 0.19:1.000:. ./.:4:50,258:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,252:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,402:.: 1.71:1.000:. ./.:4:174,214:.: 1.53:1.000:. ./.:4:56,224:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,243:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.38:1.000:. ./.:4:13,19:.:-3.12:1.000:. ./.:4:6,31:.:-3.06:1.000:. ./.:4:0,268:.:-0.04:1.000:. ./.:4:72,216:.: 0.22:1.000:. ./.:4:72,266:.: 0.87:1.000:. ./.:4:136,186:.: 0.66:1.000:. ./.:4:78,281:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.51:0.996:. ./.:4:96,293:.: 1.54:1.000:. ./.:4:77,314:.: 1.57:1.000:. ./.:4:79,299:.: 1.40:1.000:. ./.:4:5,34:.:-3.03:1.000:. ./.:4:122,159:.: 0.13:1.000:. ./.:4:71,275:.: 0.98:1.000:. ./.:4:146,132:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,16:.:-3.28:1.000:. ./.:4:61,246:.: 0.47:1.000:. ./.:4:150,181:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,319:.: 0.63:1.000:. ./.:4:96,311:.: 1.77:1.000:. ./.:4:83,270:.: 1.07:1.000:. ./.:4:82,254:.: 0.85:1.000:. ./.:4:133,118:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,18:.:-3.20:1.000:. ./.:4:28,43:.:-2.61:1.000:. ./.:3:13,25:.:-3.04:1.000:. ./.:4:58,252:.: 0.51:1.000:. ./.:4:135,166:.: 0.39:1.000:. ./.:4:72,220:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.13:1.000:. ./.:4:77,240:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.09:1.000:. ./.:4:56,193:.:-0.29:1.000:. ./.:4:144,153:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.21:1.000:. ./.:4:118,184:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.01:1.000:. ./.:4:171,212:.: 1.46:1.000:. ./.:4:11,59:.:-2.63:1.000:. ./.:4:38,198:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,112:.:-0.76:1.000:. ./.:4:68,286:.: 1.08:1.000:. ./.:4:113,134:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,217:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.82:1.000:. ./.:4:44,177:.:-0.65:1.000:. ./.:4:55,209:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,228:.: 0.09:1.000:. ./.:4:40,187:.:-0.58:1.000:. ./.:6:79,149:.:-0.56:1.000:. ./.:4:97,141:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.16:1.000:. ./.:4:95,129:.:-0.62:1.000:. ./.:4:73,271:.: 0.95:1.000:. ./.:4:52,188:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,150:.:-1.12:1.000:. ./.:4:50,214:.:-0.09:1.000:. ./.:4:81,146:.:-0.58:0.910:. ./.:4:74,221:.: 0.31:1.000:. ./.:4:111,171:.: 0.14:1.000:. ./.:4:86,105:.:-1.05:1.000:. ./.:4:103,139:.:-0.38:1.000:. ./.:4:180,185:.: 1.23:1.000:. ./.:4:47,179:.:-0.59:1.000:. ./.:4:55,169:.:-0.62:1.000:. ./.:4:34,181:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.86:1.000:. ./.:4:56,216:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.34:0.920:. ./.:4:67,222:.: 0.23:1.000:. ./.:4:56,206:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,225:.: 0.04:1.000:. ./.:4:33,163:.:-0.98:1.000:. ./.:4:123,151:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,168:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,156:.:-1.03:1.000:. ./.:4:35,208:.:-0.37:1.000:. ./.:4:52,205:.:-0.18:1.000:. ./.:4:77,123:.:-0.93:0.994:. ./.:4:59,216:.: 0.05:1.000:. ./.:4:71,234:.: 0.44:1.000:. ./.:4:63,195:.:-0.17:1.000:. ./.:4:50,212:.:-0.12:1.000:. ./.:4:51,184:.:-0.47:1.000:. ./.:4:82,122:.:-0.88:1.000:. ./.:4:39,144:.:-1.15:1.000:. ./.:4:71,247:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,356:.: 1.11:1.000:. ./.:4:103,125:.:-0.56:1.000:. ./.:4:58,226:.: 0.17:1.000:. ./.:4:69,88:.:-1.49:1.000:. ./.:4:115,141:.:-0.20:1.000:. ./.:4:35,171:.:-0.85:1.000:. ./.:4:58,188:.:-0.33:1.000:. ./.:4:62,188:.:-0.28:1.000:. ./.:4:137,153:.: 0.25:1.000:. ./.:4:91,329:.: 1.94:1.000:. ./.:4:71,233:.: 0.43:1.000:. ./.:4:44,185:.:-0.55:1.000:. ./.:4:72,257:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.08:0.999:. ./.:4:0,291:.: 0.26:1.000:. ./.:3:0,166:.:-1.37:0.962:. ./.:4:72,226:.: 0.35:1.000:. ./.:4:46,176:.:-0.64:1.000:. ./.:4:73,120:.:-1.02:1.000:. ./.:4:46,192:.:-0.43:1.000:. ./.:4:107,134:.:-0.39:1.000:. ./.:4:53,221:.: 0.04:1.000:. ./.:4:42,189:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,200:.:-0.39:1.000:. ./.:4:81,274:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.33:1.000:. ./.:4:54,254:.: 0.48:1.000:. ./.:5:54,281:.: 0.83:0.988:. ./.:4:75,97:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.88:1.000:. ./.:4:38,152:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,248:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,200:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,179:.:-1.20:1.000:. ./.:4:50,240:.: 0.25:1.000:. ./.:4:109,142:.:-0.26:1.000:. ./.:4:90,308:.: 1.66:1.000:. ./.:4:52,260:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.80:1.000:. ./.:4:47,199:.:-0.33:1.000:. ./.:4:46,194:.:-0.41:1.000:. ./.:4:64,232:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,226:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.29:1.000:. ./.:4:63,100:.:-1.41:1.000:. ./.:4:87,329:.: 1.89:1.000:. ./.:4:172,227:.: 1.67:1.000:. ./.:4:147,180:.: 0.73:1.000:. ./.:4:144,183:.: 0.73:1.000:. ./.:4:180,193:.: 1.33:1.000:. ./.:4:126,137:.:-0.11:1.000:. ./.:4:85,301:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.66:1.000:. ./.:4:5,31:.:-3.07:1.000:. ./.:4:53,218:.: 0.00:1.000:. ./.:4:65,255:.: 0.64:1.000:. ./.:4:81,250:.: 0.78:1.000:. ./.:4:167,208:.: 1.36:1.000:. ./.:4:151,183:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,219:.: 0.10:1.000:. ./.:4:138,148:.: 0.19:1.000:. ./.:4:56,228:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.29:1.000:. ./.:4:87,259:.: 0.98:1.000:. ./.:4:60,219:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,342:.: 0.93:1.000:. ./.:4:39,207:.:-0.33:1.000:. ./.:4:69,237:.: 0.46:0.999:. ./.:4:149,150:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,352:.: 1.06:1.000:. ./.:4:52,195:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,207:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,240:.: 0.35:1.000:. ./.:4:113,138:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,145:.:-0.98:1.000:. ./.:4:49,223:.: 0.01:1.000:. ./.:4:66,266:.: 0.80:1.000:. ./.:4:57,209:.:-0.07:1.000:. ./.:4:129,170:.: 0.36:1.000:. ./.:4:61,226:.: 0.21:1.000:. ./.:4:72,279:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,412:.: 1.84:1.000:. ./.:4:72,313:.: 1.49:1.000:. ./.:4:137,132:.:-0.03:1.000:. ./.:4:77,263:.: 0.90:1.000:. -chr1.1 81443125 chr1.1_081443125 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:146,480:.: 0.73:1.000:. ./.:4:106,340:.:-0.84:1.000:. ./.:4:242,263:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,589:.: 0.41:1.000:. ./.:4:155,498:.: 0.96:1.000:. ./.:4:178,481:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,534:.:-0.07:1.000:. ./.:4:151,429:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,533:.:-0.08:1.000:. ./.:4:55,187:.:-2.61:1.000:. ./.:4:127,139:.:-2.40:1.000:. ./.:4:0,522:.:-0.18:1.000:. ./.:4:137,428:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,644:.: 0.88:1.000:. ./.:4:136,377:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,572:.: 0.26:1.000:. ./.:4:146,483:.: 0.75:0.996:. ./.:4:168,489:.: 1.00:1.000:. ./.:4:316,331:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,656:.: 0.99:1.000:. ./.:4:81,150:.:-2.71:1.000:. ./.:4:154,429:.: 0.35:1.000:. ./.:4:201,534:.: 1.67:1.000:. ./.:4:252,274:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,87:.:-3.15:1.000:. ./.:4:0,651:.: 0.94:1.000:. ./.:4:159,477:.: 0.81:1.000:. ./.:4:148,416:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,773:.: 2.01:1.000:. ./.:4:304,294:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,547:.: 0.04:1.000:. ./.:4:122,339:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,114:.:-3.72:1.000:. ./.:4:62,196:.:-2.47:1.000:. ./.:3:25,52:.:-4.04:1.000:. ./.:4:148,398:.: 0.03:1.000:. ./.:4:172,426:.: 0.48:1.000:. ./.:4:289,307:.: 0.47:1.000:. ./.:4:109,427:.:-0.05:1.000:. ./.:4:260,266:.:-0.14:1.000:. ./.:4:310,278:.: 0.40:1.000:. ./.:4:147,466:.: 0.61:1.000:. ./.:4:151,496:.: 0.91:1.000:. ./.:4:139,396:.:-0.06:1.000:. ./.:4:161,438:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,572:.: 0.26:1.000:. ./.:4:189,528:.: 1.52:1.000:. ./.:4:200,523:.: 1.57:1.000:. ./.:4:136,431:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,515:.:-0.24:1.000:. ./.:4:117,348:.:-0.67:1.000:. ./.:4:189,478:.: 1.08:1.000:. ./.:4:224,231:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,614:.: 0.62:1.000:. ./.:4:147,450:.: 0.48:1.000:. ./.:4:155,498:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,527:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,675:.: 1.15:1.000:. ./.:4:122,360:.:-0.52:1.000:. ./.:6:144,358:.:-0.35:1.000:. ./.:4:157,424:.: 0.34:1.000:. ./.:4:127,401:.:-0.12:1.000:. ./.:4:126,419:.: 0.02:1.000:. ./.:4:225,275:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,644:.: 0.88:1.000:. ./.:4:140,392:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,375:.:-1.45:1.000:. ./.:4:297,298:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,657:.: 1.00:0.910:. ./.:4:124,385:.:-0.29:1.000:. ./.:4:308,301:.: 0.58:1.000:. ./.:4:223,232:.:-0.76:1.000:. ./.:4:353,342:.: 1.33:1.000:. ./.:4:281,276:.: 0.13:1.000:. ./.:4:143,462:.: 0.54:1.000:. ./.:4:127,324:.:-0.79:1.000:. ./.:4:258,295:.: 0.09:1.000:. ./.:4:132,387:.:-0.20:1.000:. ./.:4:132,315:.:-0.83:1.000:. ./.:4:149,356:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,525:.:-0.15:0.920:. ./.:4:156,444:.: 0.50:1.000:. ./.:4:161,441:.: 0.52:1.000:. ./.:4:241,239:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,528:.:-0.12:1.000:. ./.:4:138,377:.:-0.24:1.000:. ./.:4:107,318:.:-1.02:1.000:. ./.:4:116,332:.:-0.82:1.000:. ./.:4:124,412:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,549:.: 0.06:1.000:. ./.:4:263,220:.:-0.52:0.994:. ./.:4:0,473:.:-0.60:1.000:. ./.:4:273,275:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,438:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,423:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,554:.: 0.10:1.000:. ./.:4:221,215:.:-0.92:1.000:. ./.:4:116,343:.:-0.72:1.000:. ./.:4:262,303:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,531:.:-0.10:1.000:. ./.:4:179,485:.: 1.06:1.000:. ./.:4:143,423:.: 0.21:1.000:. ./.:4:85,268:.:-1.64:1.000:. ./.:4:141,471:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,468:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,369:.:-1.51:1.000:. ./.:4:116,360:.:-0.58:1.000:. ./.:4:162,457:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,702:.: 1.39:1.000:. ./.:4:117,340:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,469:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,586:.: 0.38:1.000:. ./.:4:142,428:.: 0.24:0.999:. ./.:4:0,519:.:-0.20:1.000:. ./.:3:92,249:.:-1.75:0.962:. ./.:4:304,335:.: 0.84:1.000:. ./.:4:243,252:.:-0.41:1.000:. ./.:4:139,377:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,469:.:-0.64:1.000:. ./.:4:142,364:.:-0.32:1.000:. ./.:4:151,447:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,390:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,584:.: 0.36:1.000:. ./.:4:185,453:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,511:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,572:.: 0.26:1.000:. ./.:5:245,334:.: 0.32:0.988:. ./.:4:264,257:.:-0.19:1.000:. ./.:4:95,274:.:-1.51:1.000:. ./.:4:216,232:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,516:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,531:.:-0.10:1.000:. ./.:4:72,260:.:-1.83:1.000:. ./.:4:168,524:.: 1.30:1.000:. ./.:4:173,477:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,628:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,670:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,490:.:-0.45:1.000:. ./.:4:151,396:.: 0.04:1.000:. ./.:4:220,254:.:-0.59:1.000:. ./.:4:285,283:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,541:.:-0.01:1.000:. ./.:4:2,538:.:-0.02:1.000:. ./.:4:108,278:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,620:.: 0.68:1.000:. ./.:4:206,649:.: 2.72:1.000:. ./.:4:131,418:.: 0.06:1.000:. ./.:4:155,445:.: 0.50:1.000:. ./.:4:141,340:.:-0.53:1.000:. ./.:4:139,390:.:-0.12:1.000:. ./.:4:318,280:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,513:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,122:.:-2.65:1.000:. ./.:4:0,446:.:-0.84:1.000:. ./.:4:181,468:.: 0.93:1.000:. ./.:4:173,438:.: 0.60:1.000:. ./.:4:347,300:.: 0.91:1.000:. ./.:4:299,315:.: 0.62:1.000:. ./.:4:296,277:.: 0.27:1.000:. ./.:4:165,515:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,460:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,516:.:-0.23:1.000:. ./.:4:121,354:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,720:.: 1.54:1.000:. ./.:4:196,516:.: 1.47:1.000:. ./.:4:159,475:.: 0.80:1.000:. ./.:4:131,352:.:-0.52:1.000:. ./.:4:125,365:.:-0.45:0.999:. ./.:4:157,428:.: 0.37:1.000:. ./.:4:149,431:.: 0.33:1.000:. ./.:4:293,287:.: 0.33:1.000:. ./.:4:109,282:.:-1.31:1.000:. ./.:4:165,506:.: 1.12:1.000:. ./.:4:144,371:.:-0.24:1.000:. ./.:4:120,336:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,436:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,666:.: 1.08:1.000:. ./.:4:290,278:.: 0.22:1.000:. ./.:4:163,448:.: 0.60:1.000:. ./.:4:143,393:.:-0.05:1.000:. ./.:4:337,341:.: 1.18:1.000:. ./.:4:202,570:.: 2.00:1.000:. ./.:4:0,745:.: 1.76:1.000:. ./.:4:244,203:.:-0.83:1.000:. ./.:4:171,442:.: 0.61:1.000:. -chr1.1 81577787 chr1.1_081577787 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:25,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:0.996:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.40:1.000:. ./.:6:17,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:0.910:. ./.:4:28,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:0.920:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:0.994:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:46,0:.: 1.30:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.40:0.962:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.59:1.000:. ./.:5:47,0:.: 1.40:0.988:. ./.:4:28,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.73:1.000:. -chr1.1 81862655 chr1.1_081862655 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:203,54:.: 0.19:1.000:. ./.:4:97,133:.:-0.27:1.000:. ./.:4:187,75:.: 0.28:1.000:. ./.:4:211,67:.: 0.56:1.000:. ./.:4:237,61:.: 0.90:1.000:. ./.:4:161,152:.: 1.16:1.000:. ./.:4:138,32:.:-1.31:1.000:. ./.:4:133,130:.: 0.30:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,12:.:-2.84:1.000:. ./.:4:77,76:.:-1.60:1.000:. ./.:4:173,74:.: 0.02:1.000:. ./.:4:142,139:.: 0.61:1.000:. ./.:4:230,67:.: 0.88:1.000:. ./.:4:127,122:.: 0.06:1.000:. ./.:4:225,73:.: 0.90:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.64:0.996:. ./.:4:235,78:.: 1.16:1.000:. ./.:4:282,72:.: 1.87:1.000:. ./.:4:249,88:.: 1.58:1.000:. ./.:4:86,29:.:-2.26:1.000:. ./.:4:175,55:.:-0.27:1.000:. ./.:4:223,72:.: 0.85:1.000:. ./.:4:173,80:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,22:.:-2.84:1.000:. ./.:4:236,67:.: 0.99:1.000:. ./.:4:220,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:154,139:.: 0.82:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:181,66:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,15:.:-3.19:1.000:. ./.:4:66,58:.:-2.10:1.000:. ./.:3:50,16:.:-3.10:1.000:. ./.:4:184,56:.:-0.10:1.000:. ./.:4:220,88:.: 1.07:1.000:. ./.:4:146,155:.: 0.95:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:151,155:.: 1.04:1.000:. ./.:4:188,57:.:-0.01:1.000:. ./.:4:200,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:226,60:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,118:.:-0.58:1.000:. ./.:4:209,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:235,70:.: 1.02:1.000:. ./.:4:340,71:.: 2.85:1.000:. ./.:4:174,73:.: 0.02:1.000:. ./.:4:232,44:.: 0.52:1.000:. ./.:4:161,40:.:-0.77:1.000:. ./.:4:229,71:.: 0.94:1.000:. ./.:4:160,55:.:-0.53:1.000:. ./.:4:203,63:.: 0.35:1.000:. ./.:4:177,65:.:-0.06:1.000:. ./.:4:186,61:.: 0.02:1.000:. ./.:4:161,51:.:-0.58:1.000:. ./.:4:179,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:168,49:.:-0.50:1.000:. ./.:6:103,67:.:-1.31:1.000:. ./.:4:127,121:.: 0.04:1.000:. ./.:4:165,46:.:-0.60:1.000:. ./.:4:218,69:.: 0.71:1.000:. ./.:4:111,109:.:-0.44:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:143,36:.:-1.15:1.000:. ./.:4:219,54:.: 0.47:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.01:0.910:. ./.:4:183,52:.:-0.18:1.000:. ./.:4:232,72:.: 1.01:1.000:. ./.:4:85,96:.:-1.12:1.000:. ./.:4:70,203:.: 0.47:1.000:. ./.:4:205,65:.: 0.42:1.000:. ./.:4:128,112:.:-0.10:1.000:. ./.:4:99,84:.:-1.08:1.000:. ./.:4:174,42:.:-0.51:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:158,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:194,51:.:-0.01:1.000:. ./.:4:100,93:.:-0.91:0.920:. ./.:4:182,52:.:-0.20:1.000:. ./.:4:203,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:177,60:.:-0.15:1.000:. ./.:4:238,69:.: 1.06:1.000:. ./.:4:125,115:.:-0.10:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:178,53:.:-0.25:1.000:. ./.:4:146,53:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,96:.:-0.44:0.994:. ./.:4:173,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:176,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:165,43:.:-0.65:1.000:. ./.:4:91,83:.:-1.24:1.000:. ./.:4:186,69:.: 0.16:1.000:. ./.:4:186,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,76:.:-1.44:1.000:. ./.:4:218,69:.: 0.71:1.000:. ./.:4:126,46:.:-1.27:1.000:. ./.:4:154,52:.:-0.69:1.000:. ./.:4:144,36:.:-1.13:1.000:. ./.:4:178,41:.:-0.46:1.000:. ./.:4:143,57:.:-0.79:1.000:. ./.:4:234,75:.: 1.09:1.000:. ./.:4:265,86:.: 1.82:1.000:. ./.:4:216,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:330,114:.: 3.42:1.000:. ./.:4:186,45:.:-0.25:0.999:. ./.:4:193,56:.: 0.06:1.000:. ./.:3:94,39:.:-1.94:0.962:. ./.:4:112,113:.:-0.36:1.000:. ./.:4:156,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:95,92:.:-1.01:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:140,47:.:-1.01:1.000:. ./.:4:124,100:.:-0.37:1.000:. ./.:4:152,47:.:-0.81:1.000:. ./.:4:170,63:.:-0.22:1.000:. ./.:4:219,71:.: 0.76:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.16:1.000:. ./.:5:214,52:.: 0.35:0.988:. ./.:4:97,93:.:-0.96:1.000:. ./.:4:129,40:.:-1.32:1.000:. ./.:4:87,101:.:-1.00:1.000:. ./.:4:154,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:210,67:.: 0.54:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:168,56:.:-0.37:1.000:. ./.:4:248,76:.: 1.35:1.000:. ./.:4:223,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:195,55:.: 0.07:1.000:. ./.:4:148,45:.:-0.91:1.000:. ./.:4:162,39:.:-0.77:1.000:. ./.:4:152,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,47:.:-0.29:1.000:. ./.:4:164,61:.:-0.36:1.000:. ./.:4:151,44:.:-0.88:1.000:. ./.:4:265,80:.: 1.71:1.000:. ./.:4:139,139:.: 0.56:1.000:. ./.:4:227,58:.: 0.68:1.000:. ./.:4:184,69:.: 0.13:1.000:. ./.:4:152,160:.: 1.14:1.000:. ./.:4:172,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:254,107:.: 1.99:1.000:. ./.:4:189,69:.: 0.21:1.000:. ./.:4:100,37:.:-1.88:1.000:. ./.:4:157,51:.:-0.65:1.000:. ./.:4:211,70:.: 0.61:1.000:. ./.:4:216,62:.: 0.56:1.000:. ./.:4:251,85:.: 1.56:1.000:. ./.:4:208,61:.: 0.40:1.000:. ./.:4:186,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:149,141:.: 0.76:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:192,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:229,83:.: 1.14:1.000:. ./.:4:209,70:.: 0.57:1.000:. ./.:4:211,67:.: 0.56:1.000:. ./.:4:202,66:.: 0.38:1.000:. ./.:4:202,54:.: 0.18:1.000:. ./.:4:125,128:.: 0.13:0.999:. ./.:4:138,117:.: 0.16:1.000:. ./.:4:196,65:.: 0.26:1.000:. ./.:4:175,56:.:-0.25:1.000:. ./.:4:154,43:.:-0.84:1.000:. ./.:4:130,133:.: 0.30:1.000:. ./.:4:103,110:.:-0.56:1.000:. ./.:4:112,111:.:-0.39:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:291,96:.: 2.44:1.000:. ./.:4:235,78:.: 1.16:1.000:. ./.:4:129,126:.: 0.16:1.000:. ./.:4:129,127:.: 0.18:1.000:. ./.:4:165,133:.: 0.90:1.000:. ./.:4:260,70:.: 1.45:1.000:. ./.:4:235,84:.: 1.26:1.000:. ./.:4:195,47:.:-0.06:1.000:. ./.:4:148,129:.: 0.54:1.000:. -chr1.1 81910582 chr1.1_081910582 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:184,61:.: 0.32:1.000:. ./.:4:102,97:.:-0.71:1.000:. ./.:4:201,68:.: 0.86:1.000:. ./.:4:223,80:.: 1.62:1.000:. ./.:4:198,56:.: 0.53:1.000:. ./.:4:170,167:.: 2.38:1.000:. ./.:4:147,55:.:-0.64:1.000:. ./.:4:137,134:.: 0.91:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:130,29:.:-1.60:1.000:. ./.:4:64,98:.:-1.54:1.000:. ./.:4:148,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:134,123:.: 0.59:1.000:. ./.:4:199,73:.: 0.93:1.000:. ./.:4:124,130:.: 0.53:1.000:. ./.:4:225,74:.: 1.53:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.94:0.996:. ./.:4:210,68:.: 1.06:1.000:. ./.:4:233,67:.: 1.56:1.000:. ./.:4:197,73:.: 0.88:1.000:. ./.:4:119,48:.:-1.42:1.000:. ./.:4:195,77:.: 0.93:1.000:. ./.:4:211,65:.: 1.02:1.000:. ./.:4:157,56:.:-0.39:1.000:. ./.:4:59,35:.:-3.06:1.000:. ./.:4:221,68:.: 1.31:1.000:. ./.:4:206,98:.: 1.65:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:275,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:138,129:.: 0.82:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:161,78:.: 0.19:1.000:. ./.:4:87,8:.:-3.04:1.000:. ./.:4:83,83:.:-1.45:1.000:. ./.:3:38,31:.:-3.62:1.000:. ./.:4:209,69:.: 1.06:1.000:. ./.:4:176,77:.: 0.50:1.000:. ./.:4:114,119:.: 0.05:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:130,129:.: 0.64:1.000:. ./.:4:181,64:.: 0.32:1.000:. ./.:4:176,57:.: 0.05:1.000:. ./.:4:204,58:.: 0.70:1.000:. ./.:4:108,111:.:-0.26:1.000:. ./.:4:158,52:.:-0.46:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:184,54:.: 0.17:1.000:. ./.:4:188,47:.: 0.10:1.000:. ./.:4:149,62:.:-0.44:1.000:. ./.:4:180,60:.: 0.21:1.000:. ./.:4:143,38:.:-1.11:1.000:. ./.:4:238,69:.: 1.71:1.000:. ./.:4:181,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:184,68:.: 0.48:1.000:. ./.:4:181,58:.: 0.19:1.000:. ./.:4:183,66:.: 0.41:1.000:. ./.:4:190,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:205,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:150,56:.:-0.55:1.000:. ./.:6:120,83:.:-0.62:1.000:. ./.:4:110,111:.:-0.21:1.000:. ./.:4:178,51:.:-0.03:1.000:. ./.:4:201,52:.: 0.50:1.000:. ./.:4:104,92:.:-0.77:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:95,50:.:-1.92:1.000:. ./.:4:168,75:.: 0.28:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.44:0.910:. ./.:4:171,49:.:-0.24:1.000:. ./.:4:169,74:.: 0.28:1.000:. ./.:4:100,101:.:-0.66:1.000:. ./.:4:61,209:.: 0.88:1.000:. ./.:4:197,72:.: 0.86:1.000:. ./.:4:123,115:.: 0.17:1.000:. ./.:4:113,126:.: 0.19:1.000:. ./.:4:186,47:.: 0.05:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:134,62:.:-0.77:1.000:. ./.:4:178,69:.: 0.37:1.000:. ./.:4:103,97:.:-0.68:0.920:. ./.:4:201,67:.: 0.84:1.000:. ./.:4:219,75:.: 1.42:1.000:. ./.:4:149,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:197,63:.: 0.66:1.000:. ./.:4:114,127:.: 0.23:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:150,44:.:-0.82:1.000:. ./.:4:185,57:.: 0.26:1.000:. ./.:4:86,126:.:-0.42:0.994:. ./.:4:176,57:.: 0.05:1.000:. ./.:4:212,71:.: 1.17:1.000:. ./.:4:164,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:249,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:136,41:.:-1.20:1.000:. ./.:4:115,94:.:-0.48:1.000:. ./.:4:169,49:.:-0.28:1.000:. ./.:4:157,61:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,106:.:-0.91:1.000:. ./.:4:165,55:.:-0.24:1.000:. ./.:4:115,44:.:-1.60:1.000:. ./.:4:151,47:.:-0.73:1.000:. ./.:4:139,42:.:-1.11:1.000:. ./.:4:198,63:.: 0.68:1.000:. ./.:4:164,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:188,51:.: 0.19:1.000:. ./.:4:216,66:.: 1.15:1.000:. ./.:4:157,54:.:-0.44:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:227,83:.: 1.78:1.000:. ./.:4:147,49:.:-0.77:0.999:. ./.:4:176,60:.: 0.12:1.000:. ./.:3:108,42:.:-1.80:0.962:. ./.:4:132,136:.: 0.84:1.000:. ./.:4:135,55:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,88:.:-1.58:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:161,46:.:-0.53:1.000:. ./.:4:105,109:.:-0.37:1.000:. ./.:4:160,55:.:-0.35:1.000:. ./.:4:164,54:.:-0.28:1.000:. ./.:4:238,60:.: 1.51:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.15:1.000:. ./.:5:210,60:.: 0.88:0.988:. ./.:4:100,112:.:-0.42:1.000:. ./.:4:118,51:.:-1.38:1.000:. ./.:4:87,91:.:-1.18:1.000:. ./.:4:164,38:.:-0.64:1.000:. ./.:4:171,53:.:-0.15:1.000:. ./.:4:135,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:153,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:234,79:.: 1.85:1.000:. ./.:4:202,67:.: 0.86:1.000:. ./.:4:137,39:.:-1.22:1.000:. ./.:4:129,34:.:-1.51:1.000:. ./.:4:168,56:.:-0.15:1.000:. ./.:4:145,71:.:-0.33:1.000:. ./.:4:117,41:.:-1.63:1.000:. ./.:4:155,53:.:-0.51:1.000:. ./.:4:146,33:.:-1.16:1.000:. ./.:4:217,53:.: 0.88:1.000:. ./.:4:145,144:.: 1.31:1.000:. ./.:4:185,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:162,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:151,163:.: 1.87:1.000:. ./.:4:171,53:.:-0.15:1.000:. ./.:4:200,80:.: 1.11:1.000:. ./.:4:180,79:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,31:.:-1.80:1.000:. ./.:4:149,46:.:-0.80:1.000:. ./.:4:205,72:.: 1.04:1.000:. ./.:4:189,64:.: 0.50:1.000:. ./.:4:177,61:.: 0.17:1.000:. ./.:4:187,62:.: 0.41:1.000:. ./.:4:154,57:.:-0.44:1.000:. ./.:4:144,150:.: 1.42:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:165,58:.:-0.17:1.000:. ./.:4:167,57:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,66:.: 0.84:1.000:. ./.:4:218,94:.: 1.82:1.000:. ./.:4:192,68:.: 0.66:1.000:. ./.:4:136,74:.:-0.46:1.000:. ./.:4:101,125:.:-0.10:0.999:. ./.:4:105,108:.:-0.39:1.000:. ./.:4:157,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:140,48:.:-0.95:1.000:. ./.:4:163,61:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,107:.:-0.73:1.000:. ./.:4:90,107:.:-0.75:1.000:. ./.:4:120,121:.: 0.23:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:229,70:.: 1.53:1.000:. ./.:4:196,60:.: 0.57:1.000:. ./.:4:133,139:.: 0.93:1.000:. ./.:4:115,134:.: 0.41:1.000:. ./.:4:113,136:.: 0.41:1.000:. ./.:4:228,97:.: 2.12:1.000:. ./.:4:226,68:.: 1.42:1.000:. ./.:4:153,44:.:-0.75:1.000:. ./.:4:122,106:.:-0.06:1.000:. -chr2.1 171719 chr2.1_000171719 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.43:0.997:. ./.:4:97,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.89:1.000:. ./.:3:15,0:.:-3.43:0.997:. ./.:4:96,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.25:1.000:. ./.:6:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:136,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.52:0.777:. ./.:4:73,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:0.846:. ./.:4:117,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:3:56,0:.:-1.57:0.964:. ./.:4:74,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:124,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:140,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:122,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.66:0.774:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:0.993:. ./.:4:81,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.98:1.000:. -chr2.1 218426 chr2.1_000218426 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,32:.:-0.91:1.000:. ./.:4:16,44:.: 0.59:1.000:. ./.:4:10,48:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.13:1.000:. ./.:4:13,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.84:1.000:. ./.:4:8,14:.:-1.88:1.000:. ./.:4:16,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:8,21:.:-1.43:1.000:. ./.:4:4,9:.:-2.47:1.000:. ./.:4:4,14:.:-2.14:1.000:. ./.:4:11,36:.:-0.26:1.000:. ./.:4:12,46:.: 0.46:1.000:. ./.:4:39,37:.: 1.63:1.000:. ./.:4:16,41:.: 0.39:1.000:. ./.:4:31,23:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,55:.: 1.50:0.997:. ./.:4:18,35:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:21,54:.: 1.56:1.000:. ./.:4:9,8:.:-2.21:1.000:. ./.:4:14,42:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:3,2:.:-2.99:1.000:. ./.:4:16,43:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,27:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,67:.: 1.04:1.000:. ./.:4:15,35:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,49:.: 1.11:1.000:. ./.:4:14,23:.:-0.91:1.000:. ./.:4:6,7:.:-2.47:1.000:. ./.:4:8,8:.:-2.27:1.000:. ./.:3:6,2:.:-2.79:0.997:. ./.:4:10,35:.:-0.39:1.000:. ./.:4:13,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:10,49:.: 0.52:1.000:. ./.:4:38,34:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,102:.: 3.31:1.000:. ./.:4:22,47:.: 1.17:1.000:. ./.:4:13,57:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.85:1.000:. ./.:4:12,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:15,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,75:.: 1.56:1.000:. ./.:4:27,35:.: 0.72:1.000:. ./.:4:3,3:.:-2.92:1.000:. ./.:4:18,33:.: 0.00:1.000:. ./.:4:38,37:.: 1.56:1.000:. ./.:4:18,34:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,46:.: 2.21:1.000:. ./.:4:20,27:.:-0.26:1.000:. ./.:4:12,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:11,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:16,52:.: 1.11:1.000:. ./.:4:11,36:.:-0.26:1.000:. ./.:6:2,37:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.46:1.000:. ./.:4:8,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,53:.: 1.04:1.000:. ./.:4:37,23:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:19,56:.: 1.56:1.000:. ./.:4:6,29:.:-1.04:1.000:. ./.:4:36,23:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.52:0.777:. ./.:4:0,30:.:-1.36:1.000:. ./.:4:14,54:.: 1.11:1.000:. ./.:4:5,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:33,25:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,33:.: 1.30:1.000:. ./.:4:15,34:.:-0.13:1.000:. ./.:4:16,37:.: 0.13:1.000:. ./.:4:15,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:34,34:.: 1.11:1.000:. ./.:4:39,24:.: 0.78:1.000:. ./.:4:13,44:.: 0.39:1.000:. ./.:4:9,22:.:-1.30:0.846:. ./.:4:28,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:21,31:.: 0.07:1.000:. ./.:4:23,20:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,30:.: 0.46:1.000:. ./.:4:26,23:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,37:.:-0.26:1.000:. ./.:3:17,22:.:-0.78:0.964:. ./.:4:16,37:.: 0.13:1.000:. ./.:4:14,48:.: 0.72:1.000:. ./.:4:10,30:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,67:.: 1.04:1.000:. ./.:4:36,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,42:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.84:1.000:. ./.:4:29,29:.: 0.46:1.000:. ./.:4:12,17:.:-1.43:1.000:. ./.:4:31,27:.: 0.46:1.000:. ./.:4:10,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:15,33:.:-0.19:1.000:. ./.:4:6,48:.: 0.20:1.000:. ./.:4:29,34:.: 0.78:1.000:. ./.:4:15,49:.: 0.85:1.000:. ./.:4:13,47:.: 0.59:1.000:. ./.:4:17,54:.: 1.30:1.000:. ./.:4:13,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.00:1.000:. ./.:4:42,40:.: 2.02:1.000:. ./.:4:18,25:.:-0.52:0.999:. ./.:4:10,50:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,13:.:-1.10:0.774:. ./.:4:16,51:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:11,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:13,32:.:-0.39:1.000:. ./.:4:23,34:.: 0.39:1.000:. ./.:4:10,27:.:-0.91:1.000:. ./.:4:15,47:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:19,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.32:0.993:. ./.:4:0,36:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.23:1.000:. ./.:4:14,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:22,21:.:-0.52:1.000:. ./.:4:8,36:.:-0.45:1.000:. ./.:4:9,23:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:13,47:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,51:.: 1.37:1.000:. ./.:4:17,56:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.04:1.000:. ./.:4:5,34:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,41:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,36:.:-0.58:1.000:. ./.:4:19,57:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:35,31:.: 0.98:1.000:. ./.:4:14,40:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,31:.: 0.20:1.000:. ./.:4:34,29:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,73:.: 1.43:1.000:. ./.:4:14,30:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,7:.:-2.47:1.000:. ./.:4:6,19:.:-1.69:1.000:. ./.:4:36,40:.: 1.63:1.000:. ./.:4:10,39:.:-0.13:1.000:. ./.:4:34,29:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,45:.:-0.32:1.000:. ./.:4:34,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:11,43:.: 0.20:1.000:. ./.:4:7,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,48:.: 0.91:1.000:. ./.:4:17,48:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,50:.: 0.72:1.000:. ./.:4:11,37:.:-0.19:1.000:. ./.:4:16,33:.:-0.13:1.000:. ./.:4:17,38:.: 0.26:1.000:. ./.:4:12,36:.:-0.19:1.000:. ./.:4:16,33:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,17:.:-1.62:1.000:. ./.:4:5,32:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,27:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,29:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:8,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:25,34:.: 0.52:1.000:. ./.:4:14,42:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:6,36:.:-0.58:1.000:. ./.:4:8,47:.: 0.26:1.000:. -chr2.1 313197 chr2.1_000313197 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:116,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:197,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.45:0.997:. ./.:4:155,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.83:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.92:0.997:. ./.:4:211,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:243,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:45,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.10:0.777:. ./.:4:51,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.91:0.846:. ./.:4:138,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.36:1.000:. ./.:3:53,0:.:-0.93:0.964:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:217,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:106,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.03:0.774:. ./.:4:35,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.14:0.993:. ./.:4:56,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:194,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:223,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.32:1.000:. -chr2.1 616827 chr2.1_000616827 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:87,39:0.31: 0.21:1.000:0.972 0/0/1/1:4:48,58:0.54:-0.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:61,70:0.53: 0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:106,47:0.31: 1.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:77,70:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,39:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,17:0.19:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,80:0.55: 0.73:1.000:0.979 0/0/0/1:4:86,30:0.26:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:25,3:0.11:-2.91:1.000:0.577 0/0/0/1:4:31,10:0.25:-2.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,34:0.27: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,40:0.29: 0.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,70:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,56:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,73:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,45:0.28: 1.27:0.997:0.994 0/1/1/1:4:32,105:0.71: 0.57:1.000:0.993 0/0/0/1:4:142,37:0.21: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,70:0.46: 1.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:16,16:0.50:-2.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,61:0.43: 0.73:1.000:0.947 0/0/0/1:4:113,24:0.18: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,20:0.67:-2.91:1.000:0.925 0/0/0/1:4:118,26:0.18: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,36:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,72:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,32:0.20: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,75:0.53: 0.60:1.000:0.990 0/0/0/1:4:21,5:0.19:-2.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,7:0.27:-2.98:1.000:0.997 0/0/1:3:10,5:0.33:-3.33:0.997:1.000 0/0/0/1:4:114,37:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,77:0.54: 0.63:1.000:0.986 0/0/0/1:4:91,39:0.30: 0.34:1.000:0.984 0/1/1/1:4:38,102:0.68: 0.66:1.000:0.959 0/0/0/1:4:126,41:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,27:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,62:0.55:-0.33:1.000:0.974 0/0/0/1:4:105,23:0.18: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,82:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,29:0.20: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,35:0.26: 0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,108:0.69: 0.89:1.000:0.969 0/0/1/1:4:15,9:0.38:-3.04:1.000:0.518 0/0/1/1:4:60,42:0.41:-0.55:1.000:0.879 0/0/1/1:4:70,65:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,17:0.21:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,78:0.52: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,53:0.47:-0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,51:0.45:-0.17:1.000:0.978 0/0/1/1:4:61,50:0.45:-0.26:1.000:0.981 0/0/0/1:4:107,25:0.19: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,68:0.52: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,65:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,38:0.28: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:72,25:0.26:-0.71:1.000:0.584 0/0/0/1:4:104,33:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,54:0.48:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,47:0.45:-0.49:1.000:0.982 0/0/1/1:4:70,63:0.47: 0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:105,38:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,60:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,43:0.55:-1.35:1.000:0.983 0/0/1/1:4:76,59:0.44: 0.50:1.000:0.963 0/0/0/1:4:93,36:0.28: 0.31:0.777:0.995 0/0/0/1:4:77,31:0.29:-0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,64:0.52: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,35:0.47:-1.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:56,70:0.54: 0.21:1.000:0.985 0/1/1/1:4:28,105:0.73: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,47:0.47:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,55:0.53:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,46:0.46:-0.65:1.000:0.990 0/1/1/1:4:23,108:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,70:0.44: 1.27:1.000:0.968 0/0/0/1:4:85,36:0.30: 0.06:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.78:0.846:1.000 0/0/1/1:4:43,55:0.55:-0.68:1.000:0.981 0/0/0/0:4:137,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,31:0.29:-0.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:89,27:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,73:0.65:-0.42:1.000:0.797 0/0/1/1:4:50,50:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,58:0.66:-1.16:1.000:0.860 0/0/1/1:4:35,52:0.58:-1.03:1.000:0.922 0/0/0/1:4:80,20:0.20:-0.62:1.000:1.000 0/1/1:3:23,62:0.68:-1.09:0.964:1.000 0/1/1/1:4:18,82:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,60:0.47: 0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:41,64:0.59:-0.46:1.000:0.879 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,98:0.73: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,23:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,59:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,55:0.47:-0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,36:0.49:-1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,50:0.43:-0.07:1.000:0.941 0/0/1/1:4:45,40:0.47:-1.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:73,27:0.27:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,43:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,57:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,30:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,77:0.51: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,75:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,71:0.55: 0.21:1.000:0.979 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,97:0.52: 2.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,84:0.67:-0.07:0.999:0.935 0/0/1/1:4:63,60:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,39:0.43:-0.93:0.774:0.956 0/0/1/1:4:62,56:0.47:-0.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,17:0.23:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,64:0.53: 0.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:77,32:0.30:-0.33:1.000:0.989 0/0/1/1:4:41,34:0.45:-1.41:1.000:0.983 0/0/1/1:4:43,64:0.58:-0.39:1.000:0.921 0/0/0/1:4:76,25:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,53:0.45:-0.01:1.000:0.975 0/0/0/1:4:140,33:0.19: 1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,62:0.56:-0.36:1.000:0.969 0/0/0/1:4:79,29:0.27:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.01:0.993:1.000 0/0/0/1:4:77,24:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,20:0.22:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,39:0.48:-1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,62:0.54:-0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:85,73:0.46: 1.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:46,29:0.39:-1.41:1.000:0.665 0/0/0/1:4:89,25:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,56:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,44:0.28: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,30:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,27:0.31:-0.97:1.000:0.980 0/0/0/1:4:67,21:0.24:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,33:0.30:-0.23:1.000:0.988 0/0/0/1:4:96,29:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,52:0.47:-0.26:1.000:0.992 0/0/0/1:4:96,33:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,22:0.28:-1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,84:0.56: 0.89:1.000:0.972 0/0/0/1:4:133,36:0.21: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,69:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,66:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,59:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,74:0.54: 0.44:1.000:0.984 0/0/0/1:4:125,56:0.31: 1.97:1.000:0.972 0/0/0/1:4:119,38:0.24: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.47:-3.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:52,43:0.45:-0.78:1.000:0.983 0/0/1/1:4:66,76:0.53: 0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,63:0.51: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,57:0.42: 0.50:1.000:0.925 0/0/0/1:4:96,37:0.28: 0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,109:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,58:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,22:0.24:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,36:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,82:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,79:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:102,33:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,27:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,42:0.31: 0.50:1.000:0.969 0/0/1/1:4:81,65:0.45: 0.85:1.000:0.975 0/0/1/1:4:65,59:0.48: 0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:88,25:0.22:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,57:0.47: 0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:59,70:0.53: 0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:84,31:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,29:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,38:0.22: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,33:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,26:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,57:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,69:0.48: 0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,78:0.50: 1.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,23:0.19: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,70:0.54: 0.21:1.000:0.985 -chr2.1 651174 chr2.1_000651174 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-3.35:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.34:0.997:. ./.:4:104,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.74:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.76:1.000:. ./.:6:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.72:0.777:. ./.:4:61,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.56:0.846:. ./.:4:77,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.05:1.000:. ./.:3:49,0:.:-1.09:0.964:. ./.:4:66,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.21:0.999:. ./.:4:88,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.16:0.774:. ./.:4:74,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.05:0.993:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:117,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.61:1.000:. -chr2.1 925919 chr2.1_000925919 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.71:0.997:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:3:61,0:.: 1.71:0.997:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:68,1:.: 2.18:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.17:1.000:. ./.:6:47,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.53:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.65:0.777:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.11:0.846:. ./.:4:51,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:67,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:3:30,0:.:-0.12:0.964:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:57,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:0.774:. ./.:4:51,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:0.993:. ./.:4:51,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. -chr2.1 1148661 chr2.1_001148661 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:306,146:.:-0.27:1.000:. ./.:4:223,228:.:-0.28:1.000:. ./.:4:265,140:.:-0.70:1.000:. ./.:4:245,114:.:-1.12:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:474,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:308,115:.:-0.54:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:283,132:.:-0.61:1.000:. ./.:4:148,65:.:-2.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:264,273:.: 0.51:1.000:. ./.:4:271,132:.:-0.72:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:431,127:.: 0.71:1.000:. ./.:4:488,146:.: 1.41:1.000:. ./.:4:308,141:.:-0.30:0.997:. ./.:4:606,2:.: 1.17:1.000:. ./.:4:565,189:.: 2.51:1.000:. ./.:4:703,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:410,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:460,127:.: 0.97:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:161,279:.:-0.38:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:346,117:.:-0.17:1.000:. ./.:4:290,128:.:-0.58:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:369,156:.: 0.40:1.000:. ./.:4:293,142:.:-0.43:1.000:. ./.:4:411,107:.: 0.34:1.000:. ./.:4:319,100:.:-0.57:1.000:. ./.:4:98,82:.:-2.77:1.000:. ./.:4:277,97:.:-0.99:1.000:. ./.:3:122,0:.:-3.31:0.997:. ./.:4:574,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:391,155:.: 0.60:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:428,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:682,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:314,142:.:-0.23:1.000:. ./.:4:707,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:145,52:.:-2.62:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:291,88:.:-0.94:1.000:. ./.:4:282,126:.:-0.67:1.000:. ./.:4:326,167:.: 0.11:1.000:. ./.:4:515,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:418,130:.: 0.62:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:270,129:.:-0.76:1.000:. ./.:6:381,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:719,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:472,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:328,116:.:-0.34:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:310,150:.:-0.19:0.777:. ./.:4:291,221:.: 0.28:1.000:. ./.:4:482,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:244,100:.:-1.26:1.000:. ./.:4:484,155:.: 1.45:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:408,130:.: 0.52:1.000:. ./.:4:281,99:.:-0.93:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:457,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:320,133:.:-0.26:1.000:. ./.:4:474,0:.:-0.07:0.846:. ./.:4:680,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:370,158:.: 0.43:1.000:. ./.:4:367,113:.:-0.01:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:735,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:271,131:.:-0.73:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:257,119:.:-0.97:1.000:. ./.:4:422,132:.: 0.67:1.000:. ./.:3:348,0:.:-1.23:0.964:. ./.:4:355,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:321,150:.:-0.09:1.000:. ./.:4:320,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:451,119:.: 0.82:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:393,112:.: 0.22:1.000:. ./.:4:221,232:.:-0.26:1.000:. ./.:4:313,166:.:-0.02:1.000:. ./.:4:441,144:.: 0.96:1.000:. ./.:4:385,138:.: 0.38:1.000:. ./.:4:669,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:450,151:.: 1.10:1.000:. ./.:4:396,106:.: 0.19:1.000:. ./.:4:380,120:.: 0.17:1.000:. ./.:4:333,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:398,130:.: 0.43:1.000:. ./.:4:795,4:.: 2.93:1.000:. ./.:4:530,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:288,134:.:-0.54:1.000:. ./.:4:555,6:.: 0.73:1.000:. ./.:4:628,0:.: 1.35:0.999:. ./.:4:641,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.46:0.774:. ./.:4:349,185:.: 0.49:1.000:. ./.:4:407,138:.: 0.59:1.000:. ./.:4:437,109:.: 0.60:1.000:. ./.:4:424,131:.: 0.68:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:423,125:.: 0.62:1.000:. ./.:4:321,131:.:-0.27:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:630,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:499,130:.: 1.36:0.993:. ./.:4:383,106:.: 0.07:1.000:. ./.:4:182,99:.:-1.84:1.000:. ./.:4:356,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:375,98:.:-0.08:1.000:. ./.:4:417,136:.: 0.66:1.000:. ./.:4:281,101:.:-0.91:1.000:. ./.:4:282,120:.:-0.73:1.000:. ./.:4:336,98:.:-0.43:1.000:. ./.:4:334,155:.: 0.07:1.000:. ./.:4:574,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:355,112:.:-0.13:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:322,152:.:-0.07:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:278,134:.:-0.64:1.000:. ./.:4:360,104:.:-0.16:1.000:. ./.:4:370,150:.: 0.36:1.000:. ./.:4:603,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:424,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:463,153:.: 1.24:1.000:. ./.:4:256,103:.:-1.12:1.000:. ./.:4:323,152:.:-0.06:1.000:. ./.:4:398,127:.: 0.40:1.000:. ./.:4:225,62:.:-1.79:1.000:. ./.:4:336,94:.:-0.47:1.000:. ./.:4:452,126:.: 0.89:1.000:. ./.:4:574,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:541,151:.: 1.94:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:336,142:.:-0.03:1.000:. ./.:4:242,124:.:-1.06:1.000:. ./.:4:342,91:.:-0.44:1.000:. ./.:4:256,126:.:-0.91:1.000:. ./.:4:616,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:212,86:.:-1.69:1.000:. ./.:4:296,125:.:-0.55:1.000:. ./.:4:369,123:.: 0.10:1.000:. ./.:4:267,264:.: 0.46:1.000:. ./.:4:577,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:375,121:.: 0.14:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:432,133:.: 0.77:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:236,95:.:-1.38:1.000:. ./.:4:351,155:.: 0.23:1.000:. ./.:4:653,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:281,134:.:-0.61:1.000:. ./.:4:371,47:.:-0.58:1.000:. ./.:4:645,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:505,163:.: 1.72:1.000:. ./.:4:382,205:.: 0.97:1.000:. ./.:4:234,100:.:-1.35:1.000:. ./.:4:485,152:.: 1.43:1.000:. -chr2.1 1387962 chr2.1_001387962 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:70,46:0.26: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,41:0.30: 0.18:1.000:0.981 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,51:0.22: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,16:0.53:-1.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:10,15:0.49:-1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,25:0.44:-1.17:1.000:0.969 0/0/0/1:4:60,37:0.25: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,52:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,37:0.37:-0.34:1.000:0.566 0/0/0/1:4:62,35:0.23: 0.26:0.997:1.000 0/0/0/1:4:108,89:0.32: 3.01:1.000:0.948 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,56:0.33: 0.95:1.000:0.919 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.64:-1.96:1.000:0.646 0/0/0/1:4:70,38:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,36:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,27:0.32:-0.75:1.000:0.953 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,19:0.65:-1.72:1.000:0.754 0/1/1:3:3,15:0.72:-1.91:0.997:1.000 0/0/1/1:4:29,38:0.45:-0.56:1.000:0.984 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,41:0.22: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,35:0.18: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,52:0.43: 0.23:1.000:0.932 0/0/0/1:4:83,47:0.23: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,52:0.36: 0.56:1.000:0.731 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,48:0.32: 0.51:1.000:0.944 0/0/1/1:4:82,110:0.46: 2.87:1.000:0.988 0/0/0/1:4:48,43:0.35: 0.10:1.000:0.827 0/1/1/1:4:8,53:0.75:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,44:0.35: 0.12:1.000:0.769 0/0/0/1:4:75,47:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,45:0.64:-0.75:1.000:0.646 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,58:0.57:-0.07:1.000:0.942 0/0/0/1:4:87,58:0.26: 1.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:111,54:0.21: 2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,43:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:74,21:0.14: 0.21:1.000:0.994 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,1:0.01: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,42:0.44:-0.32:1.000:0.963 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,46:0.18: 2.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,88:0.49: 1.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.62:0.777:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,57:0.22: 2.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,116:0.69: 1.52:1.000:0.980 0/0/0/1:4:70,55:0.31: 1.03:1.000:0.975 0/0/1/1:4:48,51:0.39: 0.32:1.000:0.742 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,44:0.19: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,42:0.28: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,76:0.38: 1.77:0.846:0.535 0/0/1/1:4:36,57:0.51: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,66:0.29: 1.88:1.000:0.992 0/0/0/1:4:57,34:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,34:0.29:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,55:0.42: 0.40:1.000:0.923 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0:3:38,0:0.00:-1.36:0.964:1.000 0/0/0/1:4:75,60:0.31: 1.30:1.000:0.967 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,43:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,53:0.20: 2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,49:0.56:-0.40:1.000:0.965 0/0/0/1:4:43,34:0.31:-0.29:1.000:0.973 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,53:0.52:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:21,32:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,46:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,25:0.28:-0.75:1.000:0.995 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,44:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,52:0.34: 0.67:1.000:0.890 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,45:0.22: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,43:0.29: 0.37:0.999:0.991 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,35:0.68:-1.19:0.774:0.953 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,52:0.30: 0.89:1.000:0.984 0/0/1/1:4:30,37:0.44:-0.56:1.000:0.962 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,45:0.30: 0.45:1.000:0.985 0/1/1/1:4:11,53:0.71:-0.64:1.000:0.992 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.52:0.993:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,30:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,47:0.60:-0.59:1.000:0.789 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,24:0.52:-1.36:1.000:0.994 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,51:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,51:0.59:-0.40:1.000:0.879 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,40:0.55:-0.73:1.000:0.983 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,51:0.24: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,43:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,53:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,43:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,33:0.37:-0.56:1.000:0.578 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,59:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,58:0.48: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,35:0.39:-0.51:1.000:0.641 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,42:0.28: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,43:0.48:-0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,25:0.21:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,27:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,20:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,40:0.39:-0.26:1.000:0.714 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,34:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,24:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,36:0.45:-0.64:1.000:0.979 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,30:0.15: 1.08:1.000:0.990 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,50:0.35: 0.48:1.000:0.791 -chr2.1 1699360 chr2.1_001699360 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,84:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.12:1.000:. ./.:4:66,42:.:-0.54:1.000:. ./.:4:31,79:.:-0.46:1.000:. ./.:4:68,62:.: 0.36:1.000:. ./.:4:25,71:.:-1.04:1.000:. ./.:4:26,45:.:-2.07:1.000:. ./.:4:28,76:.:-0.71:1.000:. ./.:4:56,50:.:-0.62:1.000:. ./.:4:44,80:.: 0.12:1.000:. ./.:4:20,61:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.95:1.000:. ./.:4:29,82:.:-0.42:1.000:. ./.:4:38,87:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,83:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,89:.: 0.12:1.000:. ./.:4:41,87:.: 0.28:0.997:. ./.:4:50,52:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,146:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.78:1.000:. ./.:4:65,67:.: 0.45:1.000:. ./.:4:29,86:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,111:.: 1.48:1.000:. ./.:4:35,76:.:-0.42:1.000:. ./.:4:18,45:.:-2.40:1.000:. ./.:4:31,80:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,90:.:-0.13:1.000:. ./.:4:27,73:.:-0.87:1.000:. ./.:4:45,111:.: 1.44:1.000:. ./.:4:64,46:.:-0.46:1.000:. ./.:4:31,58:.:-1.32:1.000:. ./.:4:27,60:.:-1.41:1.000:. ./.:4:37,67:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.69:1.000:. ./.:3:37,38:.:-1.90:0.997:. ./.:4:1,100:.:-0.83:1.000:. ./.:4:44,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,86:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,92:.: 0.16:1.000:. ./.:4:42,80:.: 0.03:1.000:. ./.:4:30,83:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.45:1.000:. ./.:4:51,56:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,108:.: 0.90:1.000:. ./.:4:37,91:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,103:.: 0.65:1.000:. ./.:4:83,60:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.41:1.000:. ./.:4:26,83:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,98:.: 0.61:1.000:. ./.:4:53,64:.:-0.17:1.000:. ./.:4:25,88:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,75:.: 1.48:1.000:. ./.:4:36,76:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.25:1.000:. ./.:4:34,74:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,75:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,77:.:-0.42:1.000:. ./.:6:36,81:.:-0.17:1.000:. ./.:4:44,91:.: 0.57:1.000:. ./.:4:28,87:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,105:.: 1.31:1.000:. ./.:4:33,122:.: 1.39:1.000:. ./.:4:39,90:.: 0.32:1.000:. ./.:4:31,81:.:-0.38:1.000:. ./.:4:36,79:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,81:.:-0.01:1.000:. ./.:4:46,74:.:-0.05:0.777:. ./.:4:0,117:.:-0.17:1.000:. ./.:4:40,109:.: 1.15:1.000:. ./.:4:55,66:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,104:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.75:1.000:. ./.:4:69,47:.:-0.21:1.000:. ./.:4:62,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,68:.: 0.73:1.000:. ./.:4:115,102:.: 3.95:1.000:. ./.:4:80,69:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,69:.:-2.15:0.846:. ./.:4:45,102:.: 1.06:1.000:. ./.:4:46,114:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.05:1.000:. ./.:4:39,90:.: 0.32:1.000:. ./.:4:45,130:.: 2.22:1.000:. ./.:4:52,56:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,82:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,61:.: 0.36:1.000:. ./.:4:28,83:.:-0.42:1.000:. ./.:3:28,42:.:-2.11:0.964:. ./.:4:62,57:.:-0.09:1.000:. ./.:4:88,65:.: 1.31:1.000:. ./.:4:35,72:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,174:.: 2.18:1.000:. ./.:4:85,53:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.21:1.000:. ./.:4:39,113:.: 1.27:1.000:. ./.:4:46,94:.: 0.78:1.000:. ./.:4:45,67:.:-0.38:1.000:. ./.:4:36,95:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.12:1.000:. ./.:4:48,124:.: 2.09:1.000:. ./.:4:36,74:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,96:.: 0.08:1.000:. ./.:4:30,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,98:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,107:.: 1.27:1.000:. ./.:4:33,99:.: 0.45:1.000:. ./.:4:33,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:86,76:.: 1.68:1.000:. ./.:4:28,92:.:-0.05:0.999:. ./.:4:26,82:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,43:.:-2.27:0.774:. ./.:4:77,91:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.78:1.000:. ./.:4:29,72:.:-0.83:1.000:. ./.:4:44,103:.: 1.06:1.000:. ./.:4:28,79:.:-0.58:1.000:. ./.:4:71,69:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.13:1.000:. ./.:4:102,54:.: 1.44:1.000:. ./.:4:27,96:.: 0.08:1.000:. ./.:4:58,64:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,146:.: 1.02:0.993:. ./.:4:1,88:.:-1.32:1.000:. ./.:4:26,88:.:-0.29:1.000:. ./.:4:32,71:.:-0.75:1.000:. ./.:4:23,67:.:-1.28:1.000:. ./.:4:41,96:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.24:1.000:. ./.:4:38,65:.:-0.75:1.000:. ./.:4:27,75:.:-0.79:1.000:. ./.:4:35,105:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:37,95:.: 0.45:1.000:. ./.:4:44,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,59:.:-1.37:1.000:. ./.:4:113,88:.: 3.29:1.000:. ./.:4:43,132:.: 2.22:1.000:. ./.:4:87,66:.: 1.31:1.000:. ./.:4:63,59:.: 0.03:1.000:. ./.:4:30,95:.: 0.16:1.000:. ./.:4:66,48:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,63:.:-1.32:1.000:. ./.:4:26,62:.:-1.37:1.000:. ./.:4:43,90:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,127:.: 1.60:1.000:. ./.:4:41,113:.: 1.35:1.000:. ./.:4:39,126:.: 1.81:1.000:. ./.:4:55,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,113:.: 1.19:1.000:. ./.:4:75,53:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,62:.:-1.53:1.000:. ./.:4:56,43:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.79:1.000:. ./.:4:45,31:.:-1.86:1.000:. ./.:4:58,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,81:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.45:1.000:. ./.:4:32,86:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,61:.:-1.04:1.000:. ./.:4:38,65:.:-0.75:1.000:. ./.:4:34,103:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,151:.: 1.23:1.000:. ./.:4:37,85:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,80:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,90:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,102:.: 0.49:1.000:. ./.:4:74,77:.: 1.23:1.000:. ./.:4:59,46:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.41:1.000:. -chr2.1 1844350 chr2.1_001844350 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:87,94:.:-0.35:1.000:. ./.:4:43,128:.:-0.57:1.000:. ./.:4:149,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:160,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:298,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:132,31:.:-0.74:1.000:. ./.:4:176,51:.: 0.64:1.000:. ./.:4:164,50:.: 0.36:1.000:. ./.:4:22,24:.:-3.25:1.000:. ./.:4:20,35:.:-3.06:1.000:. ./.:4:52,139:.:-0.14:1.000:. ./.:4:74,89:.:-0.74:1.000:. ./.:4:172,53:.: 0.59:1.000:. ./.:4:158,48:.: 0.19:1.000:. ./.:4:122,113:.: 0.81:1.000:. ./.:4:128,104:.: 0.74:0.997:. ./.:4:185,55:.: 0.92:1.000:. ./.:4:258,53:.: 2.44:1.000:. ./.:4:224,73:.: 2.14:1.000:. ./.:4:57,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:148,43:.:-0.14:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:94,87:.:-0.35:1.000:. ./.:4:31,9:.:-3.38:1.000:. ./.:4:112,116:.: 0.66:1.000:. ./.:4:179,54:.: 0.77:1.000:. ./.:4:152,39:.:-0.14:1.000:. ./.:4:199,66:.: 1.45:1.000:. ./.:4:188,65:.: 1.20:1.000:. ./.:4:196,56:.: 1.17:1.000:. ./.:4:88,83:.:-0.57:1.000:. ./.:4:19,11:.:-3.60:1.000:. ./.:4:58,50:.:-1.92:1.000:. ./.:3:24,11:.:-3.49:0.997:. ./.:4:198,51:.: 1.11:1.000:. ./.:4:182,52:.: 0.79:1.000:. ./.:4:175,51:.: 0.62:1.000:. ./.:4:159,45:.: 0.14:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:160,42:.: 0.10:1.000:. ./.:4:141,65:.: 0.19:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:134,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:143,49:.:-0.11:1.000:. ./.:4:169,63:.: 0.74:1.000:. ./.:4:118,161:.: 1.75:1.000:. ./.:4:148,38:.:-0.24:1.000:. ./.:4:85,91:.:-0.46:1.000:. ./.:4:79,84:.:-0.74:1.000:. ./.:4:114,121:.: 0.81:1.000:. ./.:4:159,66:.: 0.59:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:123,106:.: 0.68:1.000:. ./.:4:169,42:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:84,101:.:-0.27:1.000:. ./.:6:194,19:.: 0.34:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:164,43:.: 0.21:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:149,51:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,45:.:-0.59:1.000:. ./.:4:79,85:.:-0.72:1.000:. ./.:4:147,40:.:-0.22:0.777:. ./.:4:84,76:.:-0.80:1.000:. ./.:4:149,54:.: 0.12:1.000:. ./.:4:131,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,141:.: 0.01:1.000:. ./.:4:166,60:.: 0.62:1.000:. ./.:4:82,77:.:-0.82:1.000:. ./.:4:121,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:135,44:.:-0.39:1.000:. ./.:4:158,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:141,53:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,88:.:-0.24:0.846:. ./.:4:147,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:180,63:.: 0.98:1.000:. ./.:4:145,45:.:-0.16:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:163,56:.: 0.47:1.000:. ./.:4:55,79:.:-1.36:1.000:. ./.:4:122,48:.:-0.59:1.000:. ./.:4:73,79:.:-0.97:1.000:. ./.:4:140,48:.:-0.20:1.000:. ./.:3:170,0:.:-0.59:0.964:. ./.:4:124,39:.:-0.74:1.000:. ./.:4:173,66:.: 0.89:1.000:. ./.:4:92,40:.:-1.40:1.000:. ./.:4:232,61:.: 2.06:1.000:. ./.:4:147,51:.: 0.01:1.000:. ./.:4:98,99:.:-0.01:1.000:. ./.:4:40,115:.:-0.91:1.000:. ./.:4:174,66:.: 0.92:1.000:. ./.:4:116,116:.: 0.74:1.000:. ./.:4:94,80:.:-0.50:1.000:. ./.:4:150,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:120,25:.:-1.12:1.000:. ./.:4:172,68:.: 0.92:1.000:. ./.:4:124,39:.:-0.74:1.000:. ./.:4:104,92:.:-0.03:1.000:. ./.:4:133,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:155,53:.: 0.23:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:221,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:144,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:194,55:.: 1.11:1.000:. ./.:4:165,59:.: 0.57:0.999:. ./.:4:192,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:105,35:.:-1.23:0.774:. ./.:4:132,59:.:-0.14:1.000:. ./.:4:148,53:.: 0.08:1.000:. ./.:4:128,41:.:-0.61:1.000:. ./.:4:156,56:.: 0.31:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:131,45:.:-0.46:1.000:. ./.:4:94,85:.:-0.39:1.000:. ./.:4:143,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:128,43:.:-0.57:1.000:. ./.:4:161,54:.: 0.38:1.000:. ./.:4:201,44:.: 1.02:0.993:. ./.:4:124,39:.:-0.74:1.000:. ./.:4:127,42:.:-0.61:1.000:. ./.:4:94,30:.:-1.58:1.000:. ./.:4:80,103:.:-0.31:1.000:. ./.:4:197,50:.: 1.07:1.000:. ./.:4:83,73:.:-0.89:1.000:. ./.:4:155,53:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:124,127:.: 1.15:1.000:. ./.:4:191,45:.: 0.83:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:94,71:.:-0.69:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:138,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:143,58:.: 0.08:1.000:. ./.:4:150,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:97,44:.:-1.21:1.000:. ./.:4:175,79:.: 1.22:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:153,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:129,131:.: 1.35:1.000:. ./.:4:87,101:.:-0.20:1.000:. ./.:4:199,53:.: 1.17:1.000:. ./.:4:124,115:.: 0.89:1.000:. ./.:4:29,9:.:-3.42:1.000:. ./.:4:125,50:.:-0.48:1.000:. ./.:4:117,98:.: 0.38:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:128,114:.: 0.96:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:117,45:.:-0.76:1.000:. ./.:4:162,59:.: 0.51:1.000:. ./.:4:121,62:.:-0.31:1.000:. ./.:4:116,37:.:-0.95:1.000:. ./.:4:134,38:.:-0.54:1.000:. ./.:4:184,54:.: 0.87:1.000:. ./.:4:159,46:.: 0.16:1.000:. ./.:4:159,65:.: 0.57:1.000:. ./.:4:151,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:53,148:.: 0.08:1.000:. ./.:4:164,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:179,49:.: 0.66:1.000:. ./.:4:92,90:.:-0.33:1.000:. ./.:4:118,31:.:-1.04:1.000:. ./.:4:148,46:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,32:.:-1.10:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:137,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:203,54:.: 1.28:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:157,53:.: 0.27:1.000:. ./.:4:105,59:.:-0.72:1.000:. ./.:4:175,50:.: 0.59:1.000:. ./.:4:204,62:.: 1.48:1.000:. ./.:4:111,114:.: 0.59:1.000:. ./.:4:115,44:.:-0.82:1.000:. ./.:4:100,100:.: 0.06:1.000:. -chr2.1 2020911 chr2.1_002020911 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.74:0.997:. ./.:4:91,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:61,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:125,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:94,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.36:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.82:0.997:. ./.:4:91,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.73:0.777:. ./.:4:75,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:0.846:. ./.:4:54,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.33:1.000:. ./.:3:44,0:.:-1.34:0.964:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:70,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.77:0.774:. ./.:4:72,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:0.993:. ./.:4:77,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:120,2:.: 1.95:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:124,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:96,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.35:1.000:. -chr2.1 2180364 chr2.1_002180364 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.82:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.16:0.997:. ./.:4:1,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.30:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:3:6,0:.:-0.82:0.997:. ./.:4:6,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:16,2:.: 1.13:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:25,2:.: 2.59:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.97:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:17,6:.: 1.94:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.97:1.000:. ./.:6:28,1:.: 2.92:1.000:. ./.:4:30,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:13,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:16,2:.: 1.13:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.48:0.777:. ./.:4:3,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.81:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.48:0.846:. ./.:4:6,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:16,2:.: 1.13:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.13:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.32:1.000:. ./.:3:5,0:.:-0.98:0.964:. ./.:4:12,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:17,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:25,5:.: 3.08:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.65:0.999:. ./.:4:14,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:0.774:. ./.:4:14,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,4:.: 1.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,3:.: 1.94:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:17,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.97:0.993:. ./.:4:21,2:.: 1.94:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.97:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:20,2:.: 1.78:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.82:1.000:. -chr2.1 2601144 chr2.1_002601144 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.43:0.997:. ./.:4:68,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.46:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.07:0.997:. ./.:4:128,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.01:1.000:. ./.:6:87,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.21:0.777:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:83,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:0.846:. ./.:4:139,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.29:1.000:. ./.:3:59,0:.:-0.52:0.964:. ./.:4:50,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:120,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.54:0.774:. ./.:4:28,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.45:0.993:. ./.:4:67,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.21:1.000:. -chr2.1 2907091 chr2.1_002907091 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:10,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:0.997:. ./.:4:27,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:24,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.50:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.87:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.94:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.97:0.997:. ./.:4:35,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:25,2:.: 0.28:1.000:. ./.:6:42,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:35,2:.: 1.22:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:49,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.66:0.777:. ./.:4:11,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:35,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:0.846:. ./.:4:47,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:39,2:.: 1.60:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.19:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.84:1.000:. ./.:3:19,0:.:-0.47:0.964:. ./.:4:28,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:25,3:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,2:.: 2.25:0.999:. ./.:4:31,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:0.774:. ./.:4:19,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:25,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.47:0.993:. ./.:4:19,4:.:-0.09:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.57:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.28:1.000:. -chr2.1 2963182 chr2.1_002963182 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:114,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:165,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:187,50:.: 0.57:1.000:. ./.:4:153,66:.: 0.30:1.000:. ./.:4:142,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:277,119:.: 2.92:1.000:. ./.:4:109,112:.: 0.33:1.000:. ./.:4:156,99:.: 0.83:1.000:. ./.:4:148,94:.: 0.64:1.000:. ./.:4:36,20:.:-2.11:1.000:. ./.:4:86,75:.:-0.56:1.000:. ./.:4:123,94:.: 0.27:1.000:. ./.:4:154,87:.: 0.63:1.000:. ./.:4:121,63:.:-0.22:1.000:. ./.:4:204,53:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,101:.: 0.97:1.000:. ./.:4:171,146:.: 1.75:0.997:. ./.:4:258,46:.: 1.56:1.000:. ./.:4:168,79:.: 0.71:1.000:. ./.:4:197,88:.: 1.28:1.000:. ./.:4:71,16:.:-1.65:1.000:. ./.:4:178,50:.: 0.43:1.000:. ./.:4:169,83:.: 0.79:1.000:. ./.:4:130,90:.: 0.32:1.000:. ./.:4:44,24:.:-1.93:1.000:. ./.:4:177,164:.: 2.11:1.000:. ./.:4:181,151:.: 1.97:1.000:. ./.:4:123,92:.: 0.24:1.000:. ./.:4:132,84:.: 0.26:1.000:. ./.:4:236,64:.: 1.50:1.000:. ./.:4:204,147:.: 2.25:1.000:. ./.:4:202,111:.: 1.69:1.000:. ./.:4:66,48:.:-1.25:1.000:. ./.:4:66,48:.:-1.25:1.000:. ./.:3:31,36:.:-1.95:0.997:. ./.:4:136,139:.: 1.13:1.000:. ./.:4:185,55:.: 0.61:1.000:. ./.:4:120,84:.: 0.08:1.000:. ./.:4:161,71:.: 0.49:1.000:. ./.:4:165,107:.: 1.08:1.000:. ./.:4:110,83:.:-0.08:1.000:. ./.:4:156,53:.: 0.15:1.000:. ./.:4:142,49:.:-0.11:1.000:. ./.:4:183,21:.: 0.08:1.000:. ./.:4:107,77:.:-0.22:1.000:. ./.:4:132,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:156,39:.:-0.05:1.000:. ./.:4:275,220:.: 4.38:1.000:. ./.:4:128,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:130,111:.: 0.63:1.000:. ./.:4:96,68:.:-0.51:1.000:. ./.:4:153,74:.: 0.42:1.000:. ./.:4:121,65:.:-0.19:1.000:. ./.:4:148,38:.:-0.19:1.000:. ./.:4:171,34:.: 0.09:1.000:. ./.:4:162,135:.: 1.45:1.000:. ./.:4:108,76:.:-0.22:1.000:. ./.:4:180,93:.: 1.10:1.000:. ./.:4:89,77:.:-0.48:1.000:. ./.:6:104,63:.:-0.47:1.000:. ./.:4:122,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:158,44:.: 0.05:1.000:. ./.:4:144,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:112,71:.:-0.23:1.000:. ./.:4:153,64:.: 0.27:1.000:. ./.:4:137,52:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,33:.:-1.08:1.000:. ./.:4:103,50:.:-0.68:1.000:. ./.:4:145,73:.: 0.29:0.777:. ./.:4:113,50:.:-0.53:1.000:. ./.:4:132,59:.:-0.11:1.000:. ./.:4:91,34:.:-1.09:1.000:. ./.:4:175,170:.: 2.16:1.000:. ./.:4:152,44:.:-0.04:1.000:. ./.:4:170,72:.: 0.64:1.000:. ./.:4:240,62:.: 1.53:1.000:. ./.:4:148,50:.:-0.01:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.91:1.000:. ./.:4:123,64:.:-0.17:1.000:. ./.:4:103,77:.:-0.28:1.000:. ./.:4:120,26:.:-0.78:0.846:. ./.:4:97,56:.:-0.68:1.000:. ./.:4:136,82:.: 0.29:1.000:. ./.:4:100,53:.:-0.68:1.000:. ./.:4:195,128:.: 1.84:1.000:. ./.:4:100,34:.:-0.96:1.000:. ./.:4:76,40:.:-1.22:1.000:. ./.:4:76,26:.:-1.43:1.000:. ./.:4:98,68:.:-0.48:1.000:. ./.:4:146,73:.: 0.30:1.000:. ./.:3:130,28:.:-0.60:0.964:. ./.:4:95,31:.:-1.08:1.000:. ./.:4:165,57:.: 0.34:1.000:. ./.:4:111,47:.:-0.60:1.000:. ./.:4:117,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:150,58:.: 0.14:1.000:. ./.:4:69,51:.:-1.16:1.000:. ./.:4:97,45:.:-0.84:1.000:. ./.:4:88,71:.:-0.59:1.000:. ./.:4:108,68:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,59:.:-0.94:1.000:. ./.:4:103,80:.:-0.23:1.000:. ./.:4:55,35:.:-1.61:1.000:. ./.:4:69,37:.:-1.37:1.000:. ./.:4:91,23:.:-1.25:1.000:. ./.:4:113,63:.:-0.34:1.000:. ./.:4:97,75:.:-0.40:1.000:. ./.:4:153,65:.: 0.29:1.000:. ./.:4:153,48:.: 0.03:1.000:. ./.:4:138,38:.:-0.34:1.000:. ./.:4:62,51:.:-1.27:1.000:. ./.:4:177,116:.: 1.40:1.000:. ./.:4:82,28:.:-1.31:0.999:. ./.:4:132,34:.:-0.48:1.000:. ./.:4:83,52:.:-0.94:0.774:. ./.:4:116,29:.:-0.79:1.000:. ./.:4:115,49:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,46:.:-0.74:1.000:. ./.:4:98,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:97,20:.:-1.21:1.000:. ./.:4:89,61:.:-0.72:1.000:. ./.:4:75,68:.:-0.82:1.000:. ./.:4:140,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:209,107:.: 1.74:1.000:. ./.:4:81,42:.:-1.12:1.000:. ./.:4:77,79:.:-0.63:1.000:. ./.:4:89,77:.:-0.48:0.993:. ./.:4:137,50:.:-0.17:1.000:. ./.:4:81,48:.:-1.03:1.000:. ./.:4:80,42:.:-1.14:1.000:. ./.:4:119,70:.:-0.14:1.000:. ./.:4:172,50:.: 0.34:1.000:. ./.:4:71,37:.:-1.34:1.000:. ./.:4:118,53:.:-0.41:1.000:. ./.:4:96,21:.:-1.21:1.000:. ./.:4:182,150:.: 1.97:1.000:. ./.:4:133,73:.: 0.11:1.000:. ./.:4:81,35:.:-1.22:1.000:. ./.:4:75,38:.:-1.27:1.000:. ./.:4:62,43:.:-1.39:1.000:. ./.:4:112,63:.:-0.35:1.000:. ./.:4:79,34:.:-1.27:1.000:. ./.:4:125,51:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,38:.:-1.16:1.000:. ./.:4:146,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:155,78:.: 0.51:1.000:. ./.:4:108,53:.:-0.56:1.000:. ./.:4:125,26:.:-0.71:1.000:. ./.:4:147,91:.: 0.58:1.000:. ./.:4:106,57:.:-0.53:1.000:. ./.:4:164,90:.: 0.82:1.000:. ./.:4:146,110:.: 0.85:1.000:. ./.:4:48,24:.:-1.88:1.000:. ./.:4:175,46:.: 0.33:1.000:. ./.:4:186,108:.: 1.41:1.000:. ./.:4:160,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:142,72:.: 0.23:1.000:. ./.:4:158,97:.: 0.83:1.000:. ./.:4:96,38:.:-0.96:1.000:. ./.:4:149,97:.: 0.70:1.000:. ./.:4:165,52:.: 0.27:1.000:. ./.:4:127,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:111,79:.:-0.13:1.000:. ./.:4:172,73:.: 0.69:1.000:. ./.:4:271,73:.: 2.15:1.000:. ./.:4:127,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:96,68:.:-0.51:1.000:. ./.:4:104,77:.:-0.26:1.000:. ./.:4:150,58:.: 0.14:1.000:. ./.:4:165,68:.: 0.51:1.000:. ./.:4:114,90:.: 0.08:1.000:. ./.:4:142,67:.: 0.15:1.000:. ./.:4:142,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:92,66:.:-0.60:1.000:. ./.:4:123,70:.:-0.08:1.000:. ./.:4:106,84:.:-0.13:1.000:. ./.:4:233,122:.: 2.31:1.000:. ./.:4:141,73:.: 0.23:1.000:. ./.:4:157,128:.: 1.28:1.000:. ./.:4:121,86:.: 0.12:1.000:. ./.:4:149,85:.: 0.52:1.000:. ./.:4:287,82:.: 2.52:1.000:. ./.:4:140,94:.: 0.52:1.000:. ./.:4:133,68:.: 0.03:1.000:. ./.:4:141,52:.:-0.08:1.000:. -chr2.1 3167657 chr2.1_003167657 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,203:.: 0.30:1.000:. ./.:4:147,137:.:-0.90:1.000:. ./.:4:206,133:.:-0.25:1.000:. ./.:4:151,207:.:-0.03:1.000:. ./.:4:218,209:.: 0.78:1.000:. ./.:4:166,206:.: 0.13:1.000:. ./.:4:158,101:.:-1.19:1.000:. ./.:4:185,220:.: 0.52:1.000:. ./.:4:181,130:.:-0.58:1.000:. ./.:4:56,101:.:-2.38:1.000:. ./.:4:50,53:.:-3.01:1.000:. ./.:4:184,197:.: 0.24:1.000:. ./.:4:162,212:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,157:.:-0.17:1.000:. ./.:4:182,142:.:-0.43:1.000:. ./.:4:192,136:.:-0.38:1.000:. ./.:4:158,160:.:-0.50:0.997:. ./.:4:163,173:.:-0.29:1.000:. ./.:4:224,235:.: 1.15:1.000:. ./.:4:204,265:.: 1.27:1.000:. ./.:4:49,67:.:-2.86:1.000:. ./.:4:192,160:.:-0.10:1.000:. ./.:4:196,247:.: 0.96:1.000:. ./.:4:164,187:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,37:.:-3.36:1.000:. ./.:4:125,167:.:-0.80:1.000:. ./.:4:135,202:.:-0.28:1.000:. ./.:4:174,182:.:-0.05:1.000:. ./.:4:228,255:.: 1.43:1.000:. ./.:4:200,158:.:-0.03:1.000:. ./.:4:153,139:.:-0.80:1.000:. ./.:4:145,104:.:-1.31:1.000:. ./.:4:21,19:.:-3.75:1.000:. ./.:4:103,70:.:-2.19:1.000:. ./.:3:30,33:.:-3.48:0.997:. ./.:4:164,176:.:-0.24:1.000:. ./.:4:183,126:.:-0.60:1.000:. ./.:4:178,228:.: 0.53:1.000:. ./.:4:164,113:.:-0.98:1.000:. ./.:4:155,186:.:-0.23:1.000:. ./.:4:186,253:.: 0.92:1.000:. ./.:4:151,230:.: 0.24:1.000:. ./.:4:148,241:.: 0.33:1.000:. ./.:4:166,145:.:-0.58:1.000:. ./.:4:235,304:.: 2.08:1.000:. ./.:4:168,232:.: 0.46:1.000:. ./.:4:251,185:.: 0.88:1.000:. ./.:4:73,33:.:-2.98:1.000:. ./.:4:141,212:.:-0.09:1.000:. ./.:4:135,74:.:-1.77:1.000:. ./.:4:133,197:.:-0.36:1.000:. ./.:4:207,171:.: 0.20:1.000:. ./.:4:224,183:.: 0.54:1.000:. ./.:4:222,176:.: 0.44:1.000:. ./.:4:146,235:.: 0.24:1.000:. ./.:4:140,181:.:-0.46:1.000:. ./.:4:163,205:.: 0.09:1.000:. ./.:4:142,231:.: 0.14:1.000:. ./.:4:162,210:.: 0.13:1.000:. ./.:6:177,284:.: 1.17:1.000:. ./.:4:175,295:.: 1.28:1.000:. ./.:4:172,148:.:-0.48:1.000:. ./.:4:249,210:.: 1.15:1.000:. ./.:4:207,200:.: 0.54:1.000:. ./.:4:192,283:.: 1.34:1.000:. ./.:4:152,221:.: 0.14:1.000:. ./.:4:192,157:.:-0.14:1.000:. ./.:4:202,228:.: 0.81:1.000:. ./.:4:163,216:.: 0.21:0.777:. ./.:4:121,199:.:-0.48:1.000:. ./.:4:201,308:.: 1.73:1.000:. ./.:4:117,101:.:-1.67:1.000:. ./.:4:163,179:.:-0.22:1.000:. ./.:4:215,166:.: 0.24:1.000:. ./.:4:152,201:.:-0.09:1.000:. ./.:4:193,141:.:-0.31:1.000:. ./.:4:176,172:.:-0.15:1.000:. ./.:4:239,191:.: 0.81:1.000:. ./.:4:224,180:.: 0.51:1.000:. ./.:4:207,141:.:-0.15:1.000:. ./.:4:177,205:.: 0.25:0.846:. ./.:4:198,172:.: 0.11:1.000:. ./.:4:194,272:.: 1.23:1.000:. ./.:4:152,190:.:-0.22:1.000:. ./.:4:119,222:.:-0.23:1.000:. ./.:4:229,182:.: 0.59:1.000:. ./.:4:156,116:.:-1.04:1.000:. ./.:4:207,169:.: 0.18:1.000:. ./.:4:215,145:.:-0.01:1.000:. ./.:4:186,144:.:-0.36:1.000:. ./.:3:137,106:.:-1.38:0.964:. ./.:4:210,156:.: 0.06:1.000:. ./.:4:212,184:.: 0.41:1.000:. ./.:4:120,167:.:-0.86:1.000:. ./.:4:216,291:.: 1.71:1.000:. ./.:4:194,157:.:-0.11:1.000:. ./.:4:197,239:.: 0.88:1.000:. ./.:4:139,154:.:-0.79:1.000:. ./.:4:208,274:.: 1.42:1.000:. ./.:4:191,162:.:-0.09:1.000:. ./.:4:167,162:.:-0.37:1.000:. ./.:4:232,201:.: 0.85:1.000:. ./.:4:166,211:.: 0.19:1.000:. ./.:4:258,227:.: 1.45:1.000:. ./.:4:199,163:.: 0.02:1.000:. ./.:4:169,126:.:-0.77:1.000:. ./.:4:137,211:.:-0.15:1.000:. ./.:4:211,154:.: 0.05:1.000:. ./.:4:261,221:.: 1.42:1.000:. ./.:4:214,168:.: 0.25:1.000:. ./.:4:167,244:.: 0.59:1.000:. ./.:4:246,199:.: 0.99:1.000:. ./.:4:281,203:.: 1.44:0.999:. ./.:4:226,199:.: 0.75:1.000:. ./.:4:100,111:.:-1.75:0.774:. ./.:4:261,209:.: 1.28:1.000:. ./.:4:165,214:.: 0.21:1.000:. ./.:4:151,149:.:-0.71:1.000:. ./.:4:243,179:.: 0.72:1.000:. ./.:4:181,161:.:-0.22:1.000:. ./.:4:211,147:.:-0.03:1.000:. ./.:4:185,226:.: 0.59:1.000:. ./.:4:268,189:.: 1.13:1.000:. ./.:4:172,257:.: 0.80:1.000:. ./.:4:211,183:.: 0.39:1.000:. ./.:4:187,245:.: 0.83:1.000:. ./.:4:205,268:.: 1.31:0.993:. ./.:4:128,185:.:-0.56:1.000:. ./.:4:130,177:.:-0.63:1.000:. ./.:4:151,191:.:-0.22:1.000:. ./.:4:181,165:.:-0.17:1.000:. ./.:4:217,135:.:-0.10:1.000:. ./.:4:129,153:.:-0.92:1.000:. ./.:4:122,177:.:-0.72:1.000:. ./.:4:173,134:.:-0.63:1.000:. ./.:4:178,207:.: 0.28:1.000:. ./.:4:144,167:.:-0.58:1.000:. ./.:4:170,259:.: 0.80:1.000:. ./.:4:174,213:.: 0.31:1.000:. ./.:4:168,271:.: 0.92:1.000:. ./.:4:178,263:.: 0.94:1.000:. ./.:4:225,270:.: 1.57:1.000:. ./.:4:164,233:.: 0.42:1.000:. ./.:4:215,161:.: 0.18:1.000:. ./.:4:230,232:.: 1.18:1.000:. ./.:4:222,277:.: 1.62:1.000:. ./.:4:200,147:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,192:.: 0.40:1.000:. ./.:4:197,136:.:-0.32:1.000:. ./.:4:176,136:.:-0.57:1.000:. ./.:4:232,264:.: 1.58:1.000:. ./.:4:194,196:.: 0.34:1.000:. ./.:4:74,64:.:-2.60:1.000:. ./.:4:240,158:.: 0.44:1.000:. ./.:4:198,138:.:-0.29:1.000:. ./.:4:207,198:.: 0.52:1.000:. ./.:4:276,193:.: 1.27:1.000:. ./.:4:180,258:.: 0.90:1.000:. ./.:4:255,107:.: 0.02:1.000:. ./.:4:164,221:.: 0.28:1.000:. ./.:4:208,145:.:-0.09:1.000:. ./.:4:157,102:.:-1.19:1.000:. ./.:4:158,163:.:-0.46:1.000:. ./.:4:141,217:.:-0.03:1.000:. ./.:4:117,92:.:-1.77:1.000:. ./.:4:198,145:.:-0.21:1.000:. ./.:4:202,164:.: 0.06:1.000:. ./.:4:152,186:.:-0.26:1.000:. ./.:4:160,227:.: 0.31:1.000:. ./.:4:145,257:.: 0.48:1.000:. ./.:4:178,203:.: 0.24:1.000:. ./.:4:119,152:.:-1.05:1.000:. ./.:4:198,165:.: 0.03:1.000:. ./.:4:130,206:.:-0.29:1.000:. ./.:4:115,182:.:-0.74:1.000:. ./.:4:136,179:.:-0.53:1.000:. ./.:4:166,213:.: 0.21:1.000:. ./.:4:175,256:.: 0.82:1.000:. ./.:4:165,181:.:-0.17:1.000:. ./.:4:165,215:.: 0.23:1.000:. ./.:4:236,197:.: 0.85:1.000:. ./.:4:261,174:.: 0.87:1.000:. ./.:4:284,191:.: 1.34:1.000:. ./.:4:196,132:.:-0.38:1.000:. ./.:4:178,211:.: 0.33:1.000:. -chr2.1 3383309 chr2.1_003383309 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:260,282:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:136,384:0.73:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:278,314:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:416,142:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:466,169:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:643,6:0.01: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,257:0.46:-0.37:1.000:0.984 0/0/0/1:4:415,128:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:315,280:0.45: 0.11:1.000:0.982 0/1/1/1:4:113,204:0.63:-2.45:1.000:0.546 0/0/1/1:4:132,197:0.58:-2.34:1.000:0.906 0/1/1/1:4:130,395:0.74:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:261,290:0.51:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:314,367:0.52: 0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:288,274:0.47:-0.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:158,480:0.74: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:319,345:0.50: 0.74:0.997:0.997 0/1/1/1:4:144,434:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:552,196:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:506,151:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,110:0.31:-2.18:1.000:0.978 0/0/1/1:4:250,296:0.52:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/0:4:667,3:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:280,274:0.48:-0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:135,102:0.41:-3.19:1.000:0.889 0/0/1/1:4:338,366:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:436,123:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:389,121:0.23:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:529,181:0.25: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:338,322:0.47: 0.71:1.000:0.992 0/0/1/1:4:384,334:0.45: 1.24:1.000:0.977 0/1/1/1:4:103,377:0.78:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,186:0.57:-2.44:1.000:0.953 0/1/1/1:4:68,382:0.84:-1.23:1.000:0.996 0/0/1:3:106,82:0.42:-3.64:0.997:0.995 0/0/0/1:4:478,146:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:298,318:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:456,147:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:385,395:0.49: 1.81:1.000:0.996 0/0/0/0:4:805,0:0.00: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:442,156:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:277,134:0.32:-1.59:1.000:0.965 0/0/0/0:4:648,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:365,145:0.28:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:579,201:0.25: 1.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:431,156:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:278,318:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,345:0.82:-1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:436,153:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:178,726:0.79: 2.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,318:0.57:-0.38:1.000:0.948 0/1/1/1:4:158,527:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:279,281:0.48:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:410,132:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:512,2:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:337,293:0.45: 0.43:1.000:0.977 0/0/0/1:4:391,111:0.21:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:604,267:0.30: 2.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:273,309:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:488,45:0.08:-0.46:1.000:0.620 0/0/0/0:4:615,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:424,138:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:515,185:0.26: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:349,413:0.52: 1.64:1.000:0.994 0/0/0/0:4:648,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:402,148:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:311,305:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:274,323:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:471,189:0.28: 0.71:0.777:0.996 0/0/1/1:4:218,277:0.54:-0.81:1.000:0.987 0/0/0/1:4:517,200:0.27: 1.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:314,353:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:173,652:0.78: 2.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,268:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:287,299:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:263,280:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:466,164:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:284,309:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:312,355:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:301,325:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,235:0.50:-1.24:0.846:0.997 0/0/1/1:4:296,358:0.53: 0.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:467,170:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:381,132:0.25:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:773,1:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:360,378:0.49: 1.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:125,366:0.74:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:240,296:0.53:-0.44:1.000:0.991 0/1/1/1:4:146,453:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:289,287:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/0/1:3:299,133:0.30:-1.39:0.964:1.000 0/0/1/1:4:232,278:0.53:-0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:307,362:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:316,115:0.26:-1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:489,164:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:293,331:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:245,296:0.53:-0.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:138,425:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:451,170:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/1/1/1:4:159,517:0.76: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:170,481:0.73: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:342,343:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:313,141:0.30:-1.19:1.000:0.985 0/0/1/1:4:333,364:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:315,303:0.47: 0.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:129,442:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:436,115:0.20:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,308:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:426,191:0.30: 0.31:1.000:0.986 0/0/0/1:4:359,141:0.27:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:438,188:0.29: 0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:334,366:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:294,318:0.50: 0.26:0.999:0.997 0/0/0/1:4:444,159:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,262:0.53:-0.95:0.774:0.993 0/0/1/1:4:298,391:0.55: 0.97:1.000:0.981 0/0/0/1:4:463,177:0.27: 0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:274,331:0.53: 0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:293,387:0.55: 0.89:1.000:0.979 0/0/0/1:4:386,163:0.29:-0.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:139,510:0.78: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:290,322:0.51: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:237,313:0.55:-0.31:1.000:0.979 0/0/0/0:4:544,4:0.01:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,317:0.53:-0.10:1.000:0.990 0/0/0/1:4:466,189:0.28: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:417,160:0.27:-0.06:0.993:0.998 0/0/0/1:4:409,151:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:348,110:0.23:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:380,124:0.24:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:127,380:0.74:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:232,281:0.53:-0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:200,221:0.50:-1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:488,185:0.27: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:293,261:0.45:-0.27:1.000:0.983 0/0/1/1:4:400,356:0.45: 1.59:1.000:0.983 0/0/0/1:4:460,152:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:505,2:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:233,264:0.51:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/0:4:485,1:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:471,164:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:448,163:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:404,121:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,244:0.48:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:321,351:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/0:4:692,1:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,309:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:392,132:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:174,504:0.73: 0.87:1.000:0.998 0/1/1/1:4:130,412:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:509,162:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,247:0.45:-0.55:1.000:0.983 0/0/1/1:4:144,148:0.49:-2.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,158:0.47:-2.37:1.000:0.991 0/1/1/1:4:145,457:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:488,150:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:153,525:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:672,2:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,360:0.76:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:486,165:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:320,274:0.44: 0.10:1.000:0.973 0/0/1/1:4:220,278:0.54:-0.79:1.000:0.988 0/0/1/1:4:281,307:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:426,155:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:274,302:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:308,273:0.45:-0.02:1.000:0.982 0/0/1/1:4:281,288:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:171,399:0.69:-0.12:1.000:0.970 0/0/0/1:4:413,144:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:352,125:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,236:0.50:-1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:327,103:0.23:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,303:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:339,116:0.25:-1.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:593,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,90:0.22:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:595,168:0.21: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:711,1:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:470,163:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:358,185:0.33:-0.37:1.000:0.925 0/0/1/1:4:341,308:0.46: 0.60:1.000:0.985 0/0/1/1:4:348,377:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:173,532:0.74: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:301,270:0.45:-0.11:1.000:0.984 0/0/1/1:4:246,260:0.49:-0.71:1.000:0.997 -chr2.1 3485139 chr2.1_003485139 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:282,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:154,59:.:-0.77:1.000:. ./.:4:196,68:.:-0.11:1.000:. ./.:4:201,167:.: 1.23:1.000:. ./.:4:235,101:.: 0.82:1.000:. ./.:4:228,188:.: 1.85:1.000:. ./.:4:169,34:.:-0.90:1.000:. ./.:4:198,142:.: 0.87:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:66,22:.:-2.38:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:178,145:.: 0.65:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:329,78:.: 1.73:0.997:. ./.:4:197,162:.: 1.11:1.000:. ./.:4:245,189:.: 2.08:1.000:. ./.:4:206,199:.: 1.71:1.000:. ./.:4:50,45:.:-2.29:1.000:. ./.:4:181,138:.: 0.60:1.000:. ./.:4:183,142:.: 0.68:1.000:. ./.:4:243,74:.: 0.57:1.000:. ./.:4:25,8:.:-3.09:1.000:. ./.:4:326,77:.: 1.68:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:268,77:.: 0.93:1.000:. ./.:4:191,84:.: 0.03:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:40,16:.:-2.79:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.42:1.000:. ./.:3:27,0:.:-3.17:0.997:. ./.:4:246,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:204,163:.: 1.22:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:223,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:216,94:.: 0.48:1.000:. ./.:4:246,82:.: 0.72:1.000:. ./.:4:184,203:.: 1.48:1.000:. ./.:4:181,73:.:-0.24:1.000:. ./.:4:113,129:.:-0.39:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:195,172:.: 1.22:1.000:. ./.:4:216,183:.: 1.63:1.000:. ./.:4:105,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:157,141:.: 0.33:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:347,92:.: 2.15:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:174,100:.: 0.02:1.000:. ./.:4:114,234:.: 0.97:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:170,78:.:-0.32:1.000:. ./.:4:201,86:.: 0.19:1.000:. ./.:4:238,66:.: 0.41:1.000:. ./.:6:153,104:.:-0.20:1.000:. ./.:4:167,185:.: 1.02:1.000:. ./.:4:157,66:.:-0.64:1.000:. ./.:4:195,98:.: 0.26:1.000:. ./.:4:210,68:.: 0.07:1.000:. ./.:4:198,88:.: 0.17:1.000:. ./.:4:192,88:.: 0.10:1.000:. ./.:4:117,104:.:-0.66:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:196,70:.:-0.08:0.777:. ./.:4:165,86:.:-0.28:1.000:. ./.:4:193,186:.: 1.37:1.000:. ./.:4:132,101:.:-0.51:1.000:. ./.:4:275,75:.: 1.00:1.000:. ./.:4:187,89:.: 0.04:1.000:. ./.:4:185,133:.: 0.59:1.000:. ./.:4:148,57:.:-0.87:1.000:. ./.:4:204,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:149,85:.:-0.50:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:87,190:.: 0.06:0.846:. ./.:4:272,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:141,113:.:-0.24:1.000:. ./.:4:159,71:.:-0.55:1.000:. ./.:4:153,104:.:-0.20:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:124,133:.:-0.20:1.000:. ./.:4:229,75:.: 0.41:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.14:1.000:. ./.:3:80,105:.:-1.13:0.964:. ./.:4:180,82:.:-0.14:1.000:. ./.:4:184,81:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,123:.:-0.36:1.000:. ./.:4:209,75:.: 0.15:1.000:. ./.:4:171,148:.: 0.60:1.000:. ./.:4:155,59:.:-0.75:1.000:. ./.:4:161,144:.: 0.42:1.000:. ./.:4:231,104:.: 0.81:1.000:. ./.:4:244,88:.: 0.77:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:103,110:.:-0.77:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:129,54:.:-1.15:1.000:. ./.:4:205,70:.: 0.03:1.000:. ./.:4:184,54:.:-0.45:1.000:. ./.:4:185,164:.: 0.99:1.000:. ./.:4:230,198:.: 2.00:1.000:. ./.:4:143,148:.: 0.24:1.000:. ./.:4:213,79:.: 0.25:1.000:. ./.:4:361,93:.: 2.34:1.000:. ./.:4:148,85:.:-0.51:0.999:. ./.:4:159,87:.:-0.34:1.000:. ./.:4:136,62:.:-0.96:0.774:. ./.:4:195,82:.: 0.06:1.000:. ./.:4:117,135:.:-0.26:1.000:. ./.:4:153,144:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,83:.:-0.10:1.000:. ./.:4:143,65:.:-0.83:1.000:. ./.:4:262,75:.: 0.83:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:194,64:.:-0.19:1.000:. ./.:4:160,80:.:-0.42:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:234,97:.: 0.75:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.73:0.993:. ./.:4:128,183:.: 0.50:1.000:. ./.:4:130,55:.:-1.13:1.000:. ./.:4:115,52:.:-1.36:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:203,83:.: 0.17:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:202,65:.:-0.07:1.000:. ./.:4:174,152:.: 0.69:1.000:. ./.:4:339,101:.: 2.16:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:137,135:.:-0.01:1.000:. ./.:4:177,57:.:-0.50:1.000:. ./.:4:160,133:.: 0.26:1.000:. ./.:4:202,156:.: 1.10:1.000:. ./.:4:163,139:.: 0.38:1.000:. ./.:4:153,121:.: 0.02:1.000:. ./.:4:149,64:.:-0.77:1.000:. ./.:4:216,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:242,167:.: 1.76:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:173,156:.: 0.73:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:213,80:.: 0.26:1.000:. ./.:4:201,114:.: 0.55:1.000:. ./.:4:270,73:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,30:.:-2.51:1.000:. ./.:4:129,53:.:-1.17:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:188,83:.:-0.02:1.000:. ./.:4:287,88:.: 1.32:1.000:. ./.:4:187,187:.: 1.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:267,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,120:.: 0.21:1.000:. ./.:4:200,87:.: 0.19:1.000:. ./.:4:239,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:189,159:.: 0.97:1.000:. ./.:4:170,77:.:-0.33:1.000:. ./.:4:287,66:.: 1.04:1.000:. ./.:4:203,64:.:-0.07:1.000:. ./.:4:236,76:.: 0.51:1.000:. ./.:4:169,148:.: 0.57:1.000:. ./.:4:165,70:.:-0.48:1.000:. ./.:4:208,67:.: 0.03:1.000:. ./.:4:133,57:.:-1.06:1.000:. ./.:4:170,142:.: 0.51:1.000:. ./.:4:181,67:.:-0.32:1.000:. ./.:4:175,143:.: 0.59:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:208,88:.: 0.30:1.000:. ./.:4:199,188:.: 1.48:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:202,70:.:-0.01:1.000:. ./.:4:306,96:.: 1.67:1.000:. ./.:4:234,190:.: 1.95:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:161,140:.: 0.37:1.000:. -chr2.1 3814453 chr2.1_003814453 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:89,215:.: 0.46:1.000:. ./.:4:119,130:.:-0.46:1.000:. ./.:4:147,136:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,248:.: 0.80:1.000:. ./.:4:77,264:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,391:.: 1.91:1.000:. ./.:4:131,135:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.65:1.000:. ./.:4:145,165:.: 0.56:1.000:. ./.:4:35,89:.:-2.54:1.000:. ./.:4:27,92:.:-2.62:1.000:. ./.:4:166,146:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,203:.:-0.19:1.000:. ./.:4:83,231:.: 0.63:1.000:. ./.:4:134,122:.:-0.34:1.000:. ./.:4:174,153:.: 0.85:1.000:. ./.:4:90,245:.: 0.98:0.997:. ./.:4:0,312:.: 0.60:1.000:. ./.:4:93,326:.: 2.38:1.000:. ./.:4:0,393:.: 1.95:1.000:. ./.:4:28,111:.:-2.29:1.000:. ./.:4:158,127:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,340:.: 1.06:1.000:. ./.:4:153,158:.: 0.58:1.000:. ./.:4:14,68:.:-3.24:1.000:. ./.:4:77,193:.:-0.10:1.000:. ./.:4:78,267:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,221:.: 0.60:1.000:. ./.:4:158,176:.: 0.96:1.000:. ./.:4:159,171:.: 0.90:1.000:. ./.:4:118,113:.:-0.76:1.000:. ./.:4:33,54:.:-3.16:1.000:. ./.:4:84,80:.:-1.87:1.000:. ./.:3:0,87:.:-3.16:0.997:. ./.:4:1,311:.: 0.60:1.000:. ./.:4:155,135:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.65:1.000:. ./.:4:68,206:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,354:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,200:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,166:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,328:.: 0.86:1.000:. ./.:4:65,246:.: 0.58:1.000:. ./.:4:84,233:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,73:.:-2.24:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.59:1.000:. ./.:4:101,116:.:-0.99:1.000:. ./.:4:54,180:.:-0.71:1.000:. ./.:4:174,172:.: 1.16:1.000:. ./.:4:76,205:.: 0.08:1.000:. ./.:4:71,216:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,204:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.04:1.000:. ./.:4:77,198:.:-0.02:1.000:. ./.:6:0,209:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.61:1.000:. ./.:4:69,169:.:-0.64:1.000:. ./.:4:80,234:.: 0.63:1.000:. ./.:4:73,203:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.05:1.000:. ./.:4:122,140:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,266:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,220:.: 0.36:0.777:. ./.:4:113,130:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,263:.:-0.22:1.000:. ./.:4:107,132:.:-0.62:1.000:. ./.:4:71,214:.: 0.15:1.000:. ./.:4:65,199:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,185:.:-0.52:1.000:. ./.:4:132,114:.:-0.51:1.000:. ./.:4:56,196:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,189:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,231:.: 0.60:1.000:. ./.:4:168,169:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,205:.:-1.19:0.846:. ./.:4:70,185:.:-0.36:1.000:. ./.:4:91,256:.: 1.18:1.000:. ./.:4:53,201:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.61:1.000:. ./.:4:72,250:.: 0.76:1.000:. ./.:4:110,104:.:-1.04:1.000:. ./.:4:66,181:.:-0.49:1.000:. ./.:4:128,121:.:-0.46:1.000:. ./.:4:122,122:.:-0.54:1.000:. ./.:3:68,136:.:-1.21:0.964:. ./.:4:78,192:.:-0.10:1.000:. ./.:4:152,175:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.92:1.000:. ./.:4:76,264:.: 1.06:1.000:. ./.:4:74,200:.:-0.04:1.000:. ./.:4:59,154:.:-1.06:1.000:. ./.:4:114,116:.:-0.77:1.000:. ./.:4:70,216:.: 0.16:1.000:. ./.:4:156,151:.: 0.51:1.000:. ./.:4:113,133:.:-0.51:1.000:. ./.:4:61,204:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,195:.:-1.36:1.000:. ./.:4:141,130:.:-0.09:1.000:. ./.:4:123,114:.:-0.66:1.000:. ./.:4:129,126:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.42:1.000:. ./.:4:149,165:.: 0.63:1.000:. ./.:4:101,250:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,179:.:-0.51:1.000:. ./.:4:104,303:.: 2.18:1.000:. ./.:4:56,221:.: 0.01:0.999:. ./.:4:79,222:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,124:.:-1.81:0.774:. ./.:4:77,241:.: 0.70:1.000:. ./.:4:77,214:.: 0.25:1.000:. ./.:4:143,141:.: 0.13:1.000:. ./.:4:118,134:.:-0.41:1.000:. ./.:4:62,202:.:-0.21:1.000:. ./.:4:156,150:.: 0.50:1.000:. ./.:4:57,162:.:-0.96:1.000:. ./.:4:193,141:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1,319:.: 0.73:1.000:. ./.:4:43,155:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.26:1.000:. ./.:4:86,222:.: 0.53:0.993:. ./.:4:65,157:.:-0.91:1.000:. ./.:4:45,173:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,205:.:-1.19:1.000:. ./.:4:121,132:.:-0.39:1.000:. ./.:4:160,161:.: 0.75:1.000:. ./.:4:50,148:.:-1.31:1.000:. ./.:4:64,232:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,131:.:-0.14:1.000:. ./.:4:120,305:.: 2.48:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,208:.:-1.12:1.000:. ./.:4:48,154:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.74:1.000:. ./.:4:55,192:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.34:1.000:. ./.:4:63,215:.: 0.03:1.000:. ./.:4:105,115:.:-0.94:1.000:. ./.:4:193,195:.: 1.86:1.000:. ./.:4:1,378:.: 1.71:1.000:. ./.:4:72,202:.:-0.04:1.000:. ./.:4:81,227:.: 0.53:1.000:. ./.:4:174,199:.: 1.61:1.000:. ./.:4:147,133:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,274:.: 1.51:1.000:. ./.:4:65,245:.: 0.56:1.000:. ./.:4:61,70:.:-2.42:1.000:. ./.:4:138,147:.: 0.15:1.000:. ./.:4:134,154:.: 0.20:1.000:. ./.:4:68,236:.: 0.46:1.000:. ./.:4:178,169:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,362:.: 1.43:1.000:. ./.:4:132,127:.:-0.29:1.000:. ./.:4:65,212:.: 0.01:1.000:. ./.:4:160,142:.: 0.43:1.000:. ./.:4:106,98:.:-1.21:1.000:. ./.:4:154,166:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1,306:.: 0.51:1.000:. ./.:4:140,179:.: 0.71:1.000:. ./.:4:159,141:.: 0.40:1.000:. ./.:4:143,137:.: 0.06:1.000:. ./.:4:153,152:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,183:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,204:.:-1.21:1.000:. ./.:4:153,157:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,255:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.86:1.000:. ./.:4:66,195:.:-0.26:1.000:. ./.:4:85,258:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,347:.: 1.18:1.000:. ./.:4:93,221:.: 0.63:1.000:. ./.:4:29,245:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,250:.: 1.01:1.000:. ./.:4:207,156:.: 1.45:1.000:. ./.:4:206,187:.: 1.95:1.000:. ./.:4:127,138:.:-0.19:1.000:. ./.:4:68,215:.: 0.11:1.000:. -chr2.1 4048159 chr2.1_004048159 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:23,4:0.18: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,2:0.16:-1.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:13,4:0.27:-1.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,8:0.37:-0.40:1.000:0.501 0/1/1/1:4:5,13:0.68:-0.90:1.000:0.960 0/0/1/1:4:10,19:0.62: 0.48:1.000:0.531 0/1/1/1:4:4,8:0.63:-1.66:1.000:0.605 0/0/1/1:4:12,14:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:13,6:0.34:-0.78:1.000:0.894 0/0/0/0:4:50,3:0.07: 3.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,23:0.41: 4.01:1.000:0.847 0/0/0/1:4:17,4:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.42: 0.10:1.000:0.926 0/0/1/1:4:12,9:0.43:-0.53:1.000:0.940 0/0/0/1:4:12,5:0.32:-1.03:1.000:0.958 0/0/0/1:4:13,5:0.30:-0.90:0.997:0.980 0/1/1/1:4:6,14:0.66:-0.65:1.000:0.886 0/1/1/1:4:5,23:0.78: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,19:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,20:0.68: 0.36:1.000:0.941 0/0/1/1:4:13,10:0.43:-0.27:1.000:0.953 0/1/1/1:4:6,13:0.65:-0.78:1.000:0.781 0/0/0/1:4:12,5:0.32:-1.03:1.000:0.958 0/0/0/1:4:25,8:0.28: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,5:0.33:-1.16:1.000:0.907 0/0/1/1:4:9,10:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-2.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:15,15:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,6:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-1.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,5:0.49:-1.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,11:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:13,6:0.34:-0.78:1.000:0.894 0/0/1:3:18,9:0.35: 0.23:0.997:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.67:-1.03:1.000:0.913 0/0/1/1:4:16,10:0.39: 0.10:1.000:0.712 0/0/1/1:4:10,9:0.46:-0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:11,11:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,19:0.69: 0.10:1.000:0.974 0/0/0/1:4:15,8:0.36:-0.27:1.000:0.666 0/0/0/1:4:16,8:0.35:-0.15:1.000:0.792 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,22:0.65: 0.86:1.000:0.808 0/0/1/1:4:15,16:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,13:0.47: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,21:0.59: 1.11:1.000:0.867 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.53: 0.23:1.000:0.991 0/0/0/1:4:25,11:0.33: 1.37:1.000:0.931 0/0/0/1:4:23,10:0.33: 0.99:1.000:0.938 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.53:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,16:0.46: 1.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:7,17:0.67:-0.15:1.000:0.922 0/0/1/1:4:12,12:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,12:0.45: 0.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:14,15:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,6:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:14,16:0.51: 0.61:1.000:0.878 0/1/1/1:4:8,20:0.68: 0.36:1.000:0.941 0/1/1/1:4:5,14:0.70:-0.78:1.000:0.981 0/1/1/1:4:8,32:0.75: 1.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,17:0.39: 2.50:1.000:0.649 0/0/1/1:4:12,22:0.62: 1.11:1.000:0.624 0/0/1/1:4:17,12:0.42: 0.48:1.000:0.895 0/0/0/1:4:11,6:0.37:-1.03:1.000:0.614 0/0/0/1:4:24,9:0.30: 0.99:1.000:0.985 0/0/1/1:4:15,11:0.42: 0.10:0.777:0.926 0/0/1/1:4:17,15:0.46: 0.86:1.000:0.988 0/0/0/1:4:26,13:0.35: 1.74:1.000:0.792 0/0/0/1:4:14,2:0.15:-1.16:1.000:0.986 0/0/0/1:4:37,10:0.25: 2.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,13:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,18:0.53: 0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:9,2:0.22:-1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.57:-0.02:1.000:0.936 0/0/0/1:4:23,6:0.25: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,6:0.19: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.36:-0.65:1.000:0.644 0/0/1/1:4:14,8:0.37:-0.40:0.846:0.501 0/0/1/1:4:15,15:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,12:0.44: 0.23:1.000:0.968 0/0/1/1:4:9,10:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,29:0.76: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,17:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.59: 0.10:1.000:0.879 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.46: 0.86:1.000:0.988 0/1/1:3:4,10:0.68:-1.41:0.964:1.000 0/0/0/1:4:19,6:0.27:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,11:0.31: 1.62:1.000:0.966 0/0/1/1:4:9,9:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,15:0.65:-0.40:1.000:0.761 0/0/1/1:4:23,14:0.39: 1.49:1.000:0.655 0/0/1/1:4:13,15:0.52: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,10:0.30: 1.37:1.000:0.980 0/0/1/1:4:25,17:0.41: 2.12:1.000:0.853 0/0/0/1:4:20,3:0.15:-0.27:1.000:0.992 0/0/0/0:4:10,1:0.11:-1.79:1.000:0.581 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.40:1.000:0.957 0/1/1/1:4:6,15:0.68:-0.53:1.000:0.941 0/0/1/1:4:14,18:0.54: 0.86:1.000:0.987 0/0/1/1:4:15,14:0.47: 0.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:28,7:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.40:-0.27:1.000:0.767 0/0/1/1:4:9,12:0.55:-0.53:1.000:0.981 0/0/1/1:4:13,19:0.57: 0.86:1.000:0.951 0/1/1/1:4:6,22:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-0.02:1.000:0.826 0/0/0/1:4:22,6:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.23:0.999:0.573 0/0/1/1:4:12,13:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,10:0.60:-1.16:0.774:0.823 0/0/1/1:4:14,16:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,18:0.78:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.34:-0.02:1.000:0.874 0/0/1/1:4:8,12:0.57:-0.65:1.000:0.936 0/1/1/1:4:10,20:0.63: 0.61:1.000:0.605 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,15:0.45: 0.99:1.000:0.979 0/0/0/1:4:13,7:0.36:-0.65:1.000:0.644 0/0/1/1:4:9,17:0.62: 0.10:1.000:0.546 0/0/0/1:4:22,5:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,28:0.78: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,15:0.60:-0.15:0.993:0.823 1/1/1/1:4:1,14:0.92:-1.28:1.000:0.983 0/0/1/1:4:10,11:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,6:0.40:-1.28:1.000:0.826 0/0/0/1:4:22,6:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,10:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,4:0.33:-1.54:1.000:0.924 0/0/1/1:4:12,11:0.47:-0.27:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,11:0.65:-1.16:1.000:0.808 0/0/1/1:4:13,12:0.47:-0.02:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,16:0.75:-0.65:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,14:0.54:-0.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:6,18:0.71:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,14:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,19:0.52: 1.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,12:0.63:-0.90:1.000:0.605 0/0/1/1:4:14,12:0.45: 0.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:24,12:0.35: 1.37:1.000:0.792 0/1/1/1:4:9,35:0.75: 2.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,8:0.28: 0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,17:0.60: 0.23:1.000:0.789 0/0/0/1:4:20,6:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-0.65:1.000:0.826 0/0/1/1:4:10,11:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-1.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,5:0.45:-1.79:1.000:0.979 0/0/0/1:4:18,7:0.31:-0.02:1.000:0.978 0/0/1/1:4:12,23:0.62: 1.24:1.000:0.507 0/0/0/1:4:19,5:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,11:0.55:-0.78:1.000:0.974 0/0/0/1:4:23,5:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.53:-0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:23,5:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,9:0.66:-1.54:1.000:0.842 0/0/0/1:4:27,7:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.40:1.000:0.957 0/0/0/1:4:15,7:0.34:-0.40:1.000:0.883 0/0/0/1:4:12,2:0.17:-1.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:10,5:0.35:-1.28:1.000:0.792 0/0/0/1:4:16,7:0.33:-0.27:1.000:0.934 0/1/1/1:4:5,20:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,12:0.53:-0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,17:0.70:-0.27:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,14:0.66:-0.65:1.000:0.886 0/1/1/1:4:4,15:0.74:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,8:0.42:-0.78:1.000:0.920 0/0/1/1:4:9,14:0.58:-0.27:1.000:0.908 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.49:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,11:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,22:0.65: 0.86:1.000:0.808 0/0/1/1:4:14,14:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,13:0.62:-0.65:1.000:0.591 -chr2.1 4228766 chr2.1_004228766 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:36,13:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,32:0.62: 0.29:1.000:0.557 0/1/1/1:4:11,48:0.75: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,20:0.43:-0.02:1.000:0.956 0/0/1/1:4:22,29:0.53: 0.53:1.000:0.990 0/0/0/1:4:42,14:0.25: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,22:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,15:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,25:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,2:0.23:-2.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.11:-2.76:1.000:0.571 0/0/1/1:4:15,19:0.53:-0.80:1.000:0.994 0/0/0/1:4:27,16:0.36:-0.10:1.000:0.676 0/0/0/1:4:49,16:0.25: 1.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,29:0.72:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,20:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,11:0.21: 0.68:0.997:1.000 0/0/0/1:4:24,15:0.37:-0.41:1.000:0.535 0/0/1/1:4:32,26:0.43: 1.08:1.000:0.942 0/0/0/1:4:41,18:0.30: 1.15:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.65:-1.12:1.000:0.796 0/0/0/1:4:42,12:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.55:-0.65:1.000:0.982 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-3.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,21:0.36: 1.00:1.000:0.714 0/0/0/1:4:38,6:0.14:-0.02:1.000:0.961 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,11:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,36:0.66: 0.53:1.000:0.838 0/0/1/1:4:18,28:0.57: 0.14:1.000:0.947 0/0/1/1:4:19,26:0.54: 0.06:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-3.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.74:-3.08:1.000:0.999 0/0/1:3:5,1:0.17:-3.00:0.997:0.960 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,32:0.82:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,22:0.42: 0.45:1.000:0.918 0/0/0/1:4:38,10:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,14:0.28: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,14:0.33:-0.18:1.000:0.933 0/0/1/1:4:14,22:0.57:-0.65:1.000:0.941 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,27:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,20:0.39: 0.37:1.000:0.723 0/0/1/1:4:14,12:0.44:-1.43:1.000:0.967 0/0/0/1:4:33,10:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.49:-1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,13:0.27: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,25:0.43: 0.84:1.000:0.956 0/0/0/1:4:35,7:0.17:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,30:0.52: 0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,24:0.59:-0.49:1.000:0.864 0/0/0/1:4:29,9:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,8:0.16: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,17:0.37: 0.06:1.000:0.614 0/0/0/1:4:33,7:0.18:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:30,5:0.14:-0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:32,8:0.20:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.44: 0.29:1.000:0.962 0/0/1/1:4:21,36:0.59: 1.00:1.000:0.864 0/0/0/1:4:25,9:0.27:-0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,18:0.32: 0.92:1.000:0.962 0/0/0/1:4:39,11:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,37:0.69: 0.45:1.000:0.966 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,25:0.48: 0.37:0.777:0.995 0/1/1/1:4:4,30:0.84:-0.80:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,13:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,24:0.74:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,13:0.31:-0.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:18,24:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:22,28:0.53: 0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:9,26:0.69:-0.73:1.000:0.971 0/0/1/1:4:19,17:0.45:-0.65:1.000:0.979 0/0/0/1:4:37,20:0.34: 1.00:1.000:0.854 0/0/0/1:4:51,16:0.24: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,19:0.41:-0.02:1.000:0.885 0/0/0/1:4:29,12:0.29:-0.26:0.846:0.991 0/0/0/1:4:34,8:0.19:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,18:0.32: 0.92:1.000:0.962 0/0/1/1:4:18,20:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,6:0.18:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,22:0.56:-0.57:1.000:0.971 0/0/1/1:4:18,26:0.55:-0.02:1.000:0.975 0/0/1/1:4:24,24:0.47: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,21:0.47:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,21:0.40: 0.45:1.000:0.818 0/1/1:3:7,30:0.75:-0.57:0.964:1.000 0/0/1/1:4:21,22:0.48:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,40:0.66: 0.92:1.000:0.887 0/0/0/1:4:27,6:0.18:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,15:0.33: 0.06:1.000:0.933 0/0/1/1:4:15,24:0.58:-0.41:1.000:0.930 0/0/0/1:4:24,12:0.33:-0.65:1.000:0.933 0/1/1/1:4:11,35:0.70: 0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:37,11:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,35:0.52: 1.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,21:0.56:-0.73:1.000:0.963 0/0/0/1:4:38,16:0.29: 0.76:1.000:0.990 0/0/0/1:4:23,10:0.30:-0.88:1.000:0.985 0/0/1/1:4:28,27:0.47: 0.84:1.000:0.991 0/1/1/1:4:9,32:0.72:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,26:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,45:0.82: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,22:0.43: 0.37:1.000:0.944 0/0/0/1:4:44,13:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,15:0.30: 0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:23,30:0.53: 0.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:31,19:0.37: 0.45:0.999:0.589 0/0/1/1:4:16,18:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,7:0.30:-1.67:0.774:0.984 0/1/1/1:4:12,30:0.66:-0.18:1.000:0.887 0/0/1/1:4:21,26:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,26:0.75:-0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,30:0.63:-0.02:1.000:0.619 0/0/0/1:4:19,12:0.37:-1.04:1.000:0.506 0/1/1/1:4:10,23:0.65:-0.88:1.000:0.771 0/0/0/1:4:31,17:0.35: 0.29:1.000:0.832 0/1/1/1:4:17,59:0.72: 2.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:33,8:0.20:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,12:0.27: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,12:0.31:-0.49:0.993:0.971 0/0/1/1:4:21,22:0.48:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,18:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,7:0.22:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.41:-0.73:1.000:0.870 0/1/1/1:4:13,50:0.73: 1.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,11:0.28:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,23:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,38:0.79: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,19:0.29: 1.55:1.000:0.989 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.29:-1.35:1.000:0.990 0/0/0/1:4:27,8:0.23:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,12:0.35:-0.88:1.000:0.758 0/0/1/1:4:12,21:0.59:-0.88:1.000:0.836 0/0/0/1:4:28,10:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,31:0.55: 0.68:1.000:0.981 0/0/1/1:4:15,18:0.51:-0.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,42:0.66: 1.15:1.000:0.874 0/0/0/1:4:44,15:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,15:0.30: 0.37:1.000:0.982 0/0/1/1:4:24,31:0.53: 0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,27:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,33:0.52: 1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,23:0.43: 0.53:1.000:0.948 0/0/0/1:4:33,11:0.25:-0.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,37:0.69: 0.45:1.000:0.966 0/0/1/1:4:33,37:0.50: 2.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,13:0.44:-1.28:1.000:0.971 0/0/1/1:4:26,27:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:44,19:0.30: 1.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:16,20:0.52:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,17:0.25: 1.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,34:0.73:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,24:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:14,27:0.61:-0.26:1.000:0.647 0/0/0/1:4:31,13:0.29:-0.02:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,21:0.79:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.47:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,28:0.54: 0.37:1.000:0.989 0/1/1/1:4:13,31:0.65:-0.02:1.000:0.829 0/0/0/1:4:39,9:0.19: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,15:0.29: 0.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:29,10:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,6:0.15:-0.26:1.000:0.986 0/1/1/1:4:16,39:0.66: 0.84:1.000:0.858 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,9:0.21:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,9:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,44:0.56: 2.25:1.000:0.959 0/0/0/1:4:24,13:0.34:-0.57:1.000:0.851 0/0/0/1:4:30,10:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,2:0.04: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,45:0.76: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,30:0.47: 1.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,21:0.45:-0.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:39,31:0.42: 2.02:1.000:0.927 -chr2.1 4409859 chr2.1_004409859 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:197,166:.: 0.83:1.000:. ./.:4:171,131:.: 0.14:1.000:. ./.:4:160,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:182,158:.: 0.57:1.000:. ./.:4:219,207:.: 1.54:1.000:. ./.:4:249,214:.: 1.96:1.000:. ./.:4:99,82:.:-1.23:1.000:. ./.:4:186,144:.: 0.45:1.000:. ./.:4:186,142:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,25:.:-2.67:1.000:. ./.:4:46,29:.:-2.43:1.000:. ./.:4:134,139:.:-0.19:1.000:. ./.:4:166,137:.: 0.15:1.000:. ./.:4:195,140:.: 0.51:1.000:. ./.:4:209,162:.: 0.92:1.000:. ./.:4:219,183:.: 1.27:1.000:. ./.:4:211,156:.: 0.87:0.997:. ./.:4:243,135:.: 1.00:1.000:. ./.:4:227,213:.: 1.70:1.000:. ./.:4:217,215:.: 1.61:1.000:. ./.:4:31,32:.:-2.57:1.000:. ./.:4:180,157:.: 0.53:1.000:. ./.:4:184,141:.: 0.40:1.000:. ./.:4:160,149:.: 0.21:1.000:. ./.:4:19,18:.:-2.87:1.000:. ./.:4:225,147:.: 0.93:1.000:. ./.:4:194,178:.: 0.93:1.000:. ./.:4:188,155:.: 0.60:1.000:. ./.:4:198,172:.: 0.91:1.000:. ./.:4:222,146:.: 0.88:1.000:. ./.:4:178,134:.: 0.25:1.000:. ./.:4:174,149:.: 0.37:1.000:. ./.:4:14,12:.:-2.99:1.000:. ./.:4:28,31:.:-2.62:1.000:. ./.:3:9,6:.:-3.11:0.997:. ./.:4:192,161:.: 0.71:1.000:. ./.:4:186,155:.: 0.58:1.000:. ./.:4:188,174:.: 0.81:1.000:. ./.:4:171,131:.: 0.14:1.000:. ./.:4:243,172:.: 1.41:1.000:. ./.:4:154,136:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,103:.:-0.27:1.000:. ./.:4:195,136:.: 0.46:1.000:. ./.:4:166,98:.:-0.29:1.000:. ./.:4:161,100:.:-0.33:1.000:. ./.:4:184,134:.: 0.32:1.000:. ./.:4:197,203:.: 1.24:1.000:. ./.:4:97,124:.:-0.78:1.000:. ./.:4:135,130:.:-0.28:1.000:. ./.:4:124,89:.:-0.87:1.000:. ./.:4:117,104:.:-0.78:1.000:. ./.:4:251,161:.: 1.38:1.000:. ./.:4:133,117:.:-0.45:1.000:. ./.:4:161,114:.:-0.17:1.000:. ./.:4:154,153:.: 0.19:1.000:. ./.:4:185,125:.: 0.23:1.000:. ./.:4:167,132:.: 0.10:1.000:. ./.:4:156,107:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,111:.:-0.42:1.000:. ./.:6:122,78:.:-1.02:1.000:. ./.:4:134,112:.:-0.50:1.000:. ./.:4:141,109:.:-0.45:1.000:. ./.:4:188,112:.: 0.11:1.000:. ./.:4:150,97:.:-0.49:1.000:. ./.:4:201,145:.: 0.63:1.000:. ./.:4:179,127:.: 0.18:1.000:. ./.:4:98,81:.:-1.26:1.000:. ./.:4:165,113:.:-0.14:1.000:. ./.:4:125,106:.:-0.67:0.777:. ./.:4:140,142:.:-0.09:1.000:. ./.:4:166,131:.: 0.08:1.000:. ./.:4:116,71:.:-1.17:1.000:. ./.:4:217,166:.: 1.05:1.000:. ./.:4:209,191:.: 1.24:1.000:. ./.:4:161,118:.:-0.13:1.000:. ./.:4:147,84:.:-0.67:1.000:. ./.:4:144,109:.:-0.42:1.000:. ./.:4:139,123:.:-0.32:1.000:. ./.:4:177,146:.: 0.37:1.000:. ./.:4:189,154:.: 0.60:1.000:. ./.:4:106,89:.:-1.08:0.846:. ./.:4:180,129:.: 0.21:1.000:. ./.:4:171,115:.:-0.05:1.000:. ./.:4:150,130:.:-0.11:1.000:. ./.:4:148,118:.:-0.27:1.000:. ./.:4:183,139:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,71:.:-1.34:1.000:. ./.:4:123,107:.:-0.68:1.000:. ./.:4:129,97:.:-0.73:1.000:. ./.:4:140,126:.:-0.27:1.000:. ./.:3:77,68:.:-1.64:0.964:. ./.:4:146,114:.:-0.34:1.000:. ./.:4:188,139:.: 0.42:1.000:. ./.:4:158,140:.: 0.09:1.000:. ./.:4:183,145:.: 0.43:1.000:. ./.:4:164,133:.: 0.08:1.000:. ./.:4:144,90:.:-0.63:1.000:. ./.:4:137,99:.:-0.61:1.000:. ./.:4:131,99:.:-0.68:1.000:. ./.:4:194,182:.: 0.97:1.000:. ./.:4:84,75:.:-1.48:1.000:. ./.:4:145,109:.:-0.41:1.000:. ./.:4:96,75:.:-1.35:1.000:. ./.:4:141,126:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,83:.:-0.96:1.000:. ./.:4:142,122:.:-0.29:1.000:. ./.:4:144,88:.:-0.66:1.000:. ./.:4:165,163:.: 0.43:1.000:. ./.:4:222,199:.: 1.48:1.000:. ./.:4:196,138:.: 0.50:1.000:. ./.:4:173,144:.: 0.31:1.000:. ./.:4:259,230:.: 2.25:1.000:. ./.:4:134,90:.:-0.75:0.999:. ./.:4:148,107:.:-0.40:1.000:. ./.:4:78,57:.:-1.76:0.774:. ./.:4:161,119:.:-0.11:1.000:. ./.:4:132,75:.:-0.94:1.000:. ./.:4:130,88:.:-0.82:1.000:. ./.:4:137,91:.:-0.70:1.000:. ./.:4:133,103:.:-0.61:1.000:. ./.:4:206,149:.: 0.74:1.000:. ./.:4:143,112:.:-0.40:1.000:. ./.:4:162,112:.:-0.18:1.000:. ./.:4:175,174:.: 0.67:1.000:. ./.:4:123,114:.:-0.60:1.000:. ./.:4:187,168:.: 0.74:1.000:. ./.:4:139,83:.:-0.77:0.993:. ./.:4:90,85:.:-1.30:1.000:. ./.:4:112,92:.:-0.97:1.000:. ./.:4:96,83:.:-1.26:1.000:. ./.:4:144,102:.:-0.50:1.000:. ./.:4:169,132:.: 0.12:1.000:. ./.:4:76,72:.:-1.61:1.000:. ./.:4:172,109:.:-0.10:1.000:. ./.:4:164,151:.: 0.28:1.000:. ./.:4:185,215:.: 1.24:1.000:. ./.:4:173,132:.: 0.17:1.000:. ./.:4:111,99:.:-0.91:1.000:. ./.:4:122,87:.:-0.92:1.000:. ./.:4:146,125:.:-0.22:1.000:. ./.:4:157,136:.: 0.03:1.000:. ./.:4:144,104:.:-0.48:1.000:. ./.:4:143,125:.:-0.25:1.000:. ./.:4:104,74:.:-1.27:1.000:. ./.:4:253,251:.: 2.42:1.000:. ./.:4:224,185:.: 1.35:1.000:. ./.:4:197,182:.: 1.01:1.000:. ./.:4:133,136:.:-0.24:1.000:. ./.:4:236,205:.: 1.71:1.000:. ./.:4:168,113:.:-0.10:1.000:. ./.:4:238,199:.: 1.66:1.000:. ./.:4:195,173:.: 0.88:1.000:. ./.:4:41,17:.:-2.63:1.000:. ./.:4:148,118:.:-0.27:1.000:. ./.:4:234,168:.: 1.27:1.000:. ./.:4:209,149:.: 0.77:1.000:. ./.:4:232,178:.: 1.36:1.000:. ./.:4:242,146:.: 1.11:1.000:. ./.:4:143,112:.:-0.40:1.000:. ./.:4:210,158:.: 0.88:1.000:. ./.:4:168,157:.: 0.40:1.000:. ./.:4:179,153:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,149:.: 0.15:1.000:. ./.:4:192,158:.: 0.68:1.000:. ./.:4:186,155:.: 0.58:1.000:. ./.:4:199,161:.: 0.79:1.000:. ./.:4:143,125:.:-0.25:1.000:. ./.:4:188,176:.: 0.84:1.000:. ./.:4:167,111:.:-0.14:1.000:. ./.:4:171,133:.: 0.16:1.000:. ./.:4:142,99:.:-0.56:1.000:. ./.:4:163,137:.: 0.11:1.000:. ./.:4:163,134:.: 0.08:1.000:. ./.:4:154,107:.:-0.33:1.000:. ./.:4:158,120:.:-0.14:1.000:. ./.:4:125,94:.:-0.80:1.000:. ./.:4:195,173:.: 0.88:1.000:. ./.:4:209,181:.: 1.13:1.000:. ./.:4:201,185:.: 1.09:1.000:. ./.:4:161,144:.: 0.17:1.000:. ./.:4:183,160:.: 0.60:1.000:. ./.:4:263,206:.: 2.03:1.000:. ./.:4:244,189:.: 1.62:1.000:. ./.:4:171,152:.: 0.37:1.000:. ./.:4:179,166:.: 0.62:1.000:. -chr2.1 4642549 chr2.1_004642549 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:230,81:.: 0.60:1.000:. ./.:4:118,123:.:-0.47:1.000:. ./.:4:221,46:.:-0.07:1.000:. ./.:4:221,59:.: 0.13:1.000:. ./.:4:269,73:.: 1.08:1.000:. ./.:4:266,75:.: 1.06:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:151,134:.: 0.21:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:63,27:.:-2.78:1.000:. ./.:4:84,21:.:-2.55:1.000:. ./.:4:194,67:.:-0.16:1.000:. ./.:4:214,76:.: 0.28:1.000:. ./.:4:260,76:.: 0.99:1.000:. ./.:4:202,50:.:-0.30:1.000:. ./.:4:263,85:.: 1.17:1.000:. ./.:4:264,76:.: 1.05:0.997:. ./.:4:141,147:.: 0.25:1.000:. ./.:4:314,103:.: 2.23:1.000:. ./.:4:163,155:.: 0.71:1.000:. ./.:4:66,26:.:-2.75:1.000:. ./.:4:197,72:.:-0.04:1.000:. ./.:4:249,64:.: 0.63:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:29,37:.:-3.15:1.000:. ./.:4:249,76:.: 0.82:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:226,67:.: 0.33:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:240,79:.: 0.73:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:194,53:.:-0.38:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:93,22:.:-2.40:1.000:. ./.:3:26,36:.:-3.21:0.997:. ./.:4:182,69:.:-0.31:1.000:. ./.:4:207,66:.: 0.02:1.000:. ./.:4:247,77:.: 0.80:1.000:. ./.:4:181,161:.: 1.08:1.000:. ./.:4:256,93:.: 1.19:1.000:. ./.:4:203,69:.: 0.01:1.000:. ./.:4:143,131:.: 0.04:1.000:. ./.:4:265,71:.: 0.99:1.000:. ./.:4:135,114:.:-0.35:1.000:. ./.:4:274,77:.: 1.22:1.000:. ./.:4:267,71:.: 1.02:1.000:. ./.:4:157,131:.: 0.25:1.000:. ./.:4:41,7:.:-3.42:1.000:. ./.:4:116,108:.:-0.73:1.000:. ./.:4:261,73:.: 0.96:1.000:. ./.:4:207,71:.: 0.10:1.000:. ./.:4:247,81:.: 0.86:1.000:. ./.:4:168,61:.:-0.65:1.000:. ./.:4:256,66:.: 0.77:1.000:. ./.:4:123,98:.:-0.77:1.000:. ./.:4:229,71:.: 0.44:1.000:. ./.:4:108,116:.:-0.73:1.000:. ./.:4:157,141:.: 0.40:1.000:. ./.:4:214,48:.:-0.15:1.000:. ./.:6:169,57:.:-0.70:1.000:. ./.:4:229,82:.: 0.60:1.000:. ./.:4:197,68:.:-0.10:1.000:. ./.:4:248,80:.: 0.86:1.000:. ./.:4:220,77:.: 0.39:1.000:. ./.:4:239,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,128:.: 0.04:1.000:. ./.:4:154,45:.:-1.11:1.000:. ./.:4:143,132:.: 0.05:1.000:. ./.:4:211,70:.: 0.14:0.777:. ./.:4:187,47:.:-0.57:1.000:. ./.:4:193,155:.: 1.17:1.000:. ./.:4:126,40:.:-1.62:1.000:. ./.:4:184,167:.: 1.22:1.000:. ./.:4:162,131:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,116:.: 0.04:1.000:. ./.:4:186,58:.:-0.42:1.000:. ./.:4:195,56:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,129:.: 0.24:1.000:. ./.:4:214,65:.: 0.11:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:45,143:.:-1.28:0.846:. ./.:4:255,63:.: 0.71:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:169,51:.:-0.79:1.000:. ./.:4:302,92:.: 1.87:1.000:. ./.:4:197,145:.: 1.08:1.000:. ./.:4:151,64:.:-0.87:1.000:. ./.:4:126,120:.:-0.39:1.000:. ./.:4:194,64:.:-0.21:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.59:1.000:. ./.:3:107,58:.:-1.63:0.964:. ./.:4:148,120:.:-0.05:1.000:. ./.:4:230,89:.: 0.73:1.000:. ./.:4:121,115:.:-0.54:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:142,132:.: 0.04:1.000:. ./.:4:199,56:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,105:.:-0.80:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:238,93:.: 0.91:1.000:. ./.:4:126,39:.:-1.63:1.000:. ./.:4:229,69:.: 0.40:1.000:. ./.:4:116,119:.:-0.56:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:195,43:.:-0.51:1.000:. ./.:4:225,61:.: 0.22:1.000:. ./.:4:191,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:247,70:.: 0.70:1.000:. ./.:4:283,92:.: 1.58:1.000:. ./.:4:197,60:.:-0.22:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:202,193:.: 1.89:1.000:. ./.:4:147,139:.: 0.22:0.999:. ./.:4:227,59:.: 0.22:1.000:. ./.:4:140,54:.:-1.19:0.774:. ./.:4:217,77:.: 0.34:1.000:. ./.:4:187,53:.:-0.48:1.000:. ./.:4:193,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:228,57:.: 0.21:1.000:. ./.:4:266,55:.: 0.76:1.000:. ./.:4:225,50:.: 0.05:1.000:. ./.:4:225,58:.: 0.18:1.000:. ./.:4:238,68:.: 0.53:1.000:. ./.:4:186,73:.:-0.19:1.000:. ./.:4:242,60:.: 0.47:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.09:0.993:. ./.:4:161,59:.:-0.79:1.000:. ./.:4:150,51:.:-1.08:1.000:. ./.:4:112,97:.:-0.96:1.000:. ./.:4:197,53:.:-0.33:1.000:. ./.:4:221,62:.: 0.18:1.000:. ./.:4:128,32:.:-1.71:1.000:. ./.:4:226,84:.: 0.59:1.000:. ./.:4:216,71:.: 0.24:1.000:. ./.:4:290,82:.: 1.54:1.000:. ./.:4:225,69:.: 0.34:1.000:. ./.:4:197,53:.:-0.33:1.000:. ./.:4:131,62:.:-1.20:1.000:. ./.:4:190,60:.:-0.33:1.000:. ./.:4:240,58:.: 0.40:1.000:. ./.:4:137,142:.: 0.11:1.000:. ./.:4:210,54:.:-0.12:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:280,78:.: 1.32:1.000:. ./.:4:298,78:.: 1.60:1.000:. ./.:4:224,73:.: 0.39:1.000:. ./.:4:223,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:269,70:.: 1.03:1.000:. ./.:4:213,75:.: 0.25:1.000:. ./.:4:254,77:.: 0.91:1.000:. ./.:4:213,73:.: 0.22:1.000:. ./.:4:49,19:.:-3.12:1.000:. ./.:4:152,41:.:-1.20:1.000:. ./.:4:238,82:.: 0.74:1.000:. ./.:4:240,75:.: 0.66:1.000:. ./.:4:251,80:.: 0.91:1.000:. ./.:4:239,67:.: 0.53:1.000:. ./.:4:179,45:.:-0.73:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:175,59:.:-0.57:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:146,142:.: 0.25:1.000:. ./.:4:234,71:.: 0.51:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:195,59:.:-0.27:1.000:. ./.:4:142,146:.: 0.25:1.000:. ./.:4:139,133:.: 0.01:1.000:. ./.:4:159,55:.:-0.88:1.000:. ./.:4:145,55:.:-1.10:1.000:. ./.:4:221,59:.: 0.13:1.000:. ./.:4:181,65:.:-0.39:1.000:. ./.:4:193,56:.:-0.35:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:256,93:.: 1.19:1.000:. ./.:4:253,81:.: 0.96:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:189,52:.:-0.47:1.000:. ./.:4:252,73:.: 0.82:1.000:. ./.:4:261,86:.: 1.15:1.000:. ./.:4:252,82:.: 0.96:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:155,123:.: 0.10:1.000:. -chr2.1 4934550 chr2.1_004934550 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,1:0.19: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,1:0.15: 1.45:1.000:0.980 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,2:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,1:0.16: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.88:0.997:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,2:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,2:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,2:0.25: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,1:0.21: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,1:0.26:-0.38:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,5:0.27: 1.15:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.88:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,2:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,6:0.28: 0.74:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:38,5:0.27: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,1:0.16: 1.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,1:0.19: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,1:0.14: 1.55:1.000:0.965 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.889 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,1:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:31,6:0.28: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:0.777:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,1:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,2:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,1:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,2:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,8:0.28: 1.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,1:0.17: 1.10:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:39,1:0.18: 0.94:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,1:0.12: 1.86:1.000:0.852 0/0/0/1:4:23,2:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,1:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,1:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/1:3:29,2:0.26: 0.49:0.964:1.000 0/0/0/1:4:41,3:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,5:0.27: 1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,1:0.19: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,3:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,1:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,2:0.25: 1.40:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.94:0.999:1.000 0/0/0/1:4:45,4:0.26: 1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,3:0.27: 0.39:0.774:0.998 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:28,1:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,1:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,2:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,3:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,1:0.19: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.88:0.993:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:31,3:0.26: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,1:0.18: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,4:0.26: 1.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,1:0.16: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:1,1:0.37:-0.98:1.000:0.556 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,2:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,2:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 2.82:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:36,1:0.20: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,1:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,1:0.18: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,1:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,1:0.17: 1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.88:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,1:0.13: 1.76:1.000:0.905 0/0/0/1:4:40,1:0.18: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,1:0.20: 0.74:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 5091230 chr2.1_005091230 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:223,267:0.53: 0.47:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,466:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,301:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:231,252:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:240,249:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:394,155:0.28: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,240:0.53: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:232,265:0.52: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:271,289:0.51: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,46:0.56:-3.34:1.000:0.972 0/0/1/1:4:58,82:0.57:-2.79:1.000:0.936 0/1/1/1:4:146,436:0.73: 1.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:201,241:0.53: 0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:250,243:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:108,319:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:125,392:0.74: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:266,261:0.49: 0.81:0.997:0.996 0/1/1/1:4:94,351:0.77: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:326,319:0.49: 1.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:284,324:0.52: 1.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,35:0.48:-3.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:111,365:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:406,151:0.27: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:240,247:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,60:0.75:-3.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:243,242:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:351,127:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:345,137:0.28: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:383,126:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:141,441:0.74: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:279,341:0.54: 1.68:1.000:0.988 0/1/1/1:4:112,334:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,33:0.55:-3.54:1.000:0.982 0/1/1/1:4:22,79:0.77:-3.15:1.000:1.000 0/1/1:3:14,30:0.67:-3.68:0.997:1.000 0/0/0/1:4:374,119:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,340:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:357,145:0.28: 0.58:1.000:0.995 0/1/1/1:4:109,354:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:425,135:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:283,133:0.31:-0.22:1.000:0.968 0/0/1/1:4:202,214:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:330,125:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:196,200:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:401,135:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,235:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:114,493:0.80: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,467:0.78: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,210:0.54:-0.57:1.000:0.986 0/1/1/1:4:78,312:0.79:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,189:0.47:-0.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:110,372:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,200:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:215,257:0.53: 0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:199,244:0.54: 0.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:216,217:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:234,221:0.48: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:172,201:0.53:-0.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:251,215:0.45: 0.24:1.000:0.982 0/0/0/0/0/1:6:248,85:0.25:-0.99:1.000:0.522 0/0/0/1:4:331,128:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,224:0.53:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:204,231:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:166,224:0.56:-0.46:1.000:0.962 0/0/0/1:4:307,121:0.28:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,183:0.46:-0.48:1.000:0.989 0/1/1/1:4:89,330:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,259:0.54: 0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:231,251:0.51: 0.39:0.777:0.996 0/1/1/1:4:91,323:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,256:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,228:0.73:-1.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:112,306:0.72:-0.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,369:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,286:0.73:-0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:92,308:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,199:0.55:-0.81:1.000:0.977 0/1/1/1:4:94,353:0.77: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,230:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,237:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,279:0.78:-0.84:0.846:1.000 0/0/1/1:4:221,212:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:381,124:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,206:0.55:-0.66:1.000:0.982 0/0/0/1:4:317,126:0.28: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,397:0.75: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,267:0.77:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,266:0.76:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,279:0.72:-0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:188,233:0.54:-0.17:1.000:0.986 0/1/1:3:92,199:0.67:-1.38:0.964:1.000 0/1/1/1:4:94,301:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:133,340:0.70: 0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:162,181:0.52:-0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:360,143:0.28: 0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:115,381:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,164:0.48:-0.97:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,415:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:358,112:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,426:0.78: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,267:0.74:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:243,267:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,186:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,211:0.51:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,305:0.78:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,316:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,101:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:121,390:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:237,302:0.55: 0.92:1.000:0.981 0/0/0/1:4:320,123:0.27: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:277,89:0.24:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:137,438:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,348:0.74: 0.16:0.999:0.999 0/0/1/1:4:248,264:0.51: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,217:0.49:-0.08:0.774:0.997 0/0/1/1:4:280,251:0.46: 0.85:1.000:0.990 0/0/1/1:4:189,201:0.51:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,304:0.80:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,222:0.54:-0.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:155,168:0.51:-1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,313:0.78:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,184:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,377:0.76: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:363,131:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,214:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:303,129:0.29:-0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:269,127:0.31:-0.41:0.993:0.966 0/0/1/1:4:199,207:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,165:0.54:-1.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:181,196:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,300:0.74:-0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:118,401:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,145:0.49:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:215,236:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:93,325:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:367,377:0.50: 2.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:345,134:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:274,99:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:183,208:0.52:-0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:263,123:0.31:-0.50:1.000:0.970 0/0/1/1:4:207,189:0.47:-0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:207,242:0.53: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:252,231:0.47: 0.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:164,178:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,448:0.78: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:422,174:0.29: 1.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:207,252:0.54: 0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:219,213:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:120,403:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,329:0.74:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:263,297:0.52: 1.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:233,236:0.49: 0.27:1.000:0.997 1/1/1/1:4:4,60:0.93:-3.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,342:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:133,390:0.73: 0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:240,239:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:123,456:0.77: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:402,146:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,338:0.74: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:342,126:0.26: 0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:134,368:0.72: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:163,169:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:196,222:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:224,267:0.53: 0.48:1.000:0.991 0/1/1/1:4:128,417:0.75: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,250:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:226,222:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:117,361:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,209:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:228,260:0.52: 0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:216,206:0.48:-0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:251,108:0.29:-0.75:1.000:0.989 0/1/1/1:4:112,366:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:336,120:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,103:0.27:-0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:339,115:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:283,295:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:412,120:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,140:0.27: 0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:307,163:0.34: 0.28:1.000:0.870 0/0/1/1:4:281,292:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:143,525:0.77: 2.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:141,485:0.76: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,208:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:109,347:0.74: 0.15:1.000:0.999 -chr2.1 5194072 chr2.1_005194072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:121,257:.: 1.09:1.000:. ./.:4:200,124:.: 0.37:1.000:. ./.:4:102,199:.: 0.06:1.000:. ./.:4:107,244:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,380:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.65:1.000:. ./.:4:76,96:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.27:1.000:. ./.:4:97,234:.: 0.46:1.000:. ./.:4:44,70:.:-2.44:1.000:. ./.:4:26,52:.:-2.92:1.000:. ./.:4:195,145:.: 0.58:1.000:. ./.:4:103,243:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,331:.: 0.48:1.000:. ./.:4:109,221:.: 0.45:1.000:. ./.:4:114,245:.: 0.84:1.000:. ./.:4:123,213:.: 0.53:0.997:. ./.:4:109,241:.: 0.72:1.000:. ./.:4:141,319:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,366:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,93:.:-2.72:1.000:. ./.:4:116,222:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,370:.: 0.98:1.000:. ./.:4:221,147:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,41:.:-3.41:1.000:. ./.:4:110,199:.: 0.17:1.000:. ./.:4:115,229:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,301:.: 0.06:1.000:. ./.:4:109,275:.: 1.17:1.000:. ./.:4:93,210:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,185:.:-0.27:1.000:. ./.:4:91,183:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,28:.:-3.33:1.000:. ./.:4:44,74:.:-2.38:1.000:. ./.:3:0,20:.:-3.69:0.997:. ./.:4:0,306:.: 0.13:1.000:. ./.:4:108,235:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,357:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,268:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1,318:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.38:1.000:. ./.:4:102,247:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,390:.: 1.25:1.000:. ./.:4:48,100:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.81:1.000:. ./.:4:52,135:.:-1.46:1.000:. ./.:4:76,162:.:-0.78:1.000:. ./.:4:116,280:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.75:1.000:. ./.:4:2,311:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.01:1.000:. ./.:4:75,202:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,291:.:-0.06:1.000:. ./.:4:86,181:.:-0.39:1.000:. ./.:6:0,227:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,166:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.31:1.000:. ./.:4:109,186:.:-0.02:0.777:. ./.:4:200,116:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,362:.: 0.88:1.000:. ./.:4:73,145:.:-1.05:1.000:. ./.:4:100,217:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,298:.: 0.04:1.000:. ./.:4:98,206:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,198:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,263:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,305:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.26:1.000:. ./.:4:112,204:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.95:0.846:. ./.:4:104,222:.: 0.40:1.000:. ./.:4:101,248:.: 0.70:1.000:. ./.:4:110,206:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.38:1.000:. ./.:4:80,171:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.30:1.000:. ./.:4:94,181:.:-0.29:1.000:. ./.:4:99,222:.: 0.33:1.000:. ./.:3:0,155:.:-1.89:0.964:. ./.:4:0,279:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,251:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.87:1.000:. ./.:4:105,221:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.08:1.000:. ./.:4:83,178:.:-0.47:1.000:. ./.:4:179,130:.: 0.17:1.000:. ./.:4:94,201:.:-0.02:1.000:. ./.:4:87,244:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,137:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,219:.:-1.02:1.000:. ./.:4:103,217:.: 0.32:1.000:. ./.:4:85,176:.:-0.47:1.000:. ./.:4:100,229:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.62:1.000:. ./.:4:143,246:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,378:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.21:1.000:. ./.:4:96,202:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,419:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.03:0.999:. ./.:4:0,317:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.90:0.774:. ./.:4:139,235:.: 1.04:1.000:. ./.:4:70,181:.:-0.61:1.000:. ./.:4:93,175:.:-0.38:1.000:. ./.:4:85,221:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.71:1.000:. ./.:4:89,219:.: 0.16:1.000:. ./.:4:117,210:.: 0.41:1.000:. ./.:4:112,248:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,264:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.09:1.000:. ./.:4:95,217:.: 0.21:0.993:. ./.:4:78,162:.:-0.75:1.000:. ./.:4:83,178:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.67:1.000:. ./.:4:82,173:.:-0.55:1.000:. ./.:4:141,234:.: 1.05:1.000:. ./.:4:51,123:.:-1.64:1.000:. ./.:4:79,188:.:-0.39:1.000:. ./.:4:107,196:.: 0.09:1.000:. ./.:4:163,294:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,292:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,272:.:-0.31:1.000:. ./.:4:94,182:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,285:.:-0.15:1.000:. ./.:4:88,241:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,215:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,140:.:-1.29:1.000:. ./.:4:116,279:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,400:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,378:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,220:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,196:.: 0.01:1.000:. ./.:4:155,285:.: 1.92:1.000:. ./.:4:127,242:.: 0.97:1.000:. ./.:4:18,55:.:-2.98:1.000:. ./.:4:79,148:.:-0.93:1.000:. ./.:4:134,211:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,316:.: 0.26:1.000:. ./.:4:140,287:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.01:1.000:. ./.:4:106,251:.: 0.81:1.000:. ./.:4:102,217:.: 0.30:1.000:. ./.:4:84,194:.:-0.25:1.000:. ./.:4:120,245:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.41:1.000:. ./.:4:84,171:.:-0.55:1.000:. ./.:4:125,217:.: 0.61:1.000:. ./.:4:99,190:.:-0.10:1.000:. ./.:4:216,145:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,262:.:-0.46:1.000:. ./.:4:111,193:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.82:1.000:. ./.:4:93,208:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.77:1.000:. ./.:4:74,166:.:-0.75:1.000:. ./.:4:140,278:.: 1.63:1.000:. ./.:4:1,385:.: 1.20:1.000:. ./.:4:104,246:.: 0.72:1.000:. ./.:4:51,258:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,304:.: 0.10:1.000:. ./.:4:159,331:.: 2.59:1.000:. ./.:4:156,297:.: 2.09:1.000:. ./.:4:110,202:.: 0.21:1.000:. ./.:4:104,265:.: 0.97:1.000:. -chr2.1 5398237 chr2.1_005398237 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:1,39:0.79:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,23:0.25: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,28:0.40: 0.41:1.000:0.772 0/0/0/1:4:121,30:0.28: 1.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:117,35:0.36: 1.17:1.000:0.681 0/0/0/1:4:129,20:0.18: 1.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,25:0.28: 0.67:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,39:0.46: 1.01:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.17:0.997:1.000 0/0/0/1:4:120,29:0.27: 1.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,46:0.40: 1.88:1.000:0.750 0/0/0/1:4:120,27:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,30:0.53:-0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:99,41:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,36:0.40: 1.05:1.000:0.792 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,5:0.19:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,21:0.74:-1.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,50:0.83:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,24:0.25: 0.73:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0:3:24,0:0.00:-1.37:0.997:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,30:0.32: 0.93:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,26:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,19:0.26: 0.14:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,40:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,53:0.50: 1.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,17:0.14: 1.50:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,32:0.42: 0.65:1.000:0.906 0/0/0/1:4:117,29:0.28: 1.05:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,30:0.37: 0.71:1.000:0.613 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,43:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/0/0:4:199,11:0.07: 2.32:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,31:0.41: 0.61:1.000:0.854 0/0/1/1:4:85,34:0.50: 0.51:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:49,39:0.56:-0.10:1.000:0.700 0/0/1/1:4:79,57:0.55: 0.85:1.000:0.982 0/0/1/1:4:80,33:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,54:0.53: 1.13:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,36:0.43: 0.93:1.000:0.935 0/0/1/1:4:101,44:0.51: 1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,24:0.36: 0.23:1.000:0.727 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,45:0.51: 0.89:0.777:0.996 0/0/1/1:4:96,37:0.48: 0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:109,65:0.53: 1.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,32:0.50: 0.27:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,30:0.36: 0.73:1.000:0.667 0/0/1/1:4:91,43:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,21:0.42:-0.22:1.000:0.926 0/0/1/1:4:106,38:0.44: 1.01:1.000:0.970 0/0/1/1:4:97,50:0.52: 1.07:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,31:0.51: 0.16:0.846:0.996 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,33:0.39: 0.85:1.000:0.699 0/0/1/1:4:89,30:0.41: 0.51:1.000:0.884 0/0/1/1:4:104,51:0.52: 1.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,41:0.49: 1.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1:3:72,15:0.23:-0.12:0.964:1.000 0/0/0/1:4:101,31:0.37: 0.77:1.000:0.540 0/0/1/1:4:99,43:0.51: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,21:0.25: 0.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,41:0.51: 0.63:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,42:0.50: 0.93:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,71:0.57: 1.11:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,49:0.54: 0.63:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,16:0.16: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,49:0.45: 1.80:1.000:0.978 0/0/1/1:4:130,50:0.48: 1.72:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,39:0.36: 1.54:1.000:0.740 0/0/1/1:4:114,51:0.51: 1.42:0.999:0.996 0/0/1/1:4:91,43:0.51: 0.81:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.17:0.774:1.000 0/0/1/1:4:100,45:0.51: 1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,35:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,46:0.52: 0.81:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,48:0.51: 1.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,56:0.54: 0.99:1.000:0.989 0/0/0/1:4:108,25:0.26: 0.79:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.82:0.993:1.000 0/0/1/1:4:90,36:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,30:0.47: 0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,32:0.51: 0.25:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,30:0.34: 0.83:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,21:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,24:0.32: 0.37:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,46:0.51: 1.07:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,44:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,56:0.53: 1.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,42:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,42:0.50: 1.01:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,43:0.40: 1.60:1.000:0.804 0/0/1/1:4:146,55:0.47: 2.14:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,38:0.41: 1.17:1.000:0.854 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,37:0.40: 1.15:1.000:0.758 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,12:0.53:-1.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:73,11:0.18:-0.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,36:0.40: 1.07:1.000:0.755 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,38:0.50: 0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,20:0.24: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,18:0.22: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,17:0.22: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,36:0.43: 0.91:1.000:0.947 0/0/0/1:4:102,26:0.29: 0.69:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,18:0.35:-0.28:1.000:0.746 0/0/1/1:4:90,35:0.48: 0.63:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,28:0.44: 0.27:1.000:0.962 0/1/1/1:4:1,29:0.75:-1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,29:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,48:0.50: 1.48:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,27:0.26: 1.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,29:0.29: 1.01:1.000:0.991 -chr2.1 5458463 chr2.1_005458463 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:338,109:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,171:0.55:-1.24:1.000:0.977 0/0/1/1:4:208,203:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:318,121:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:217,280:0.56: 0.94:1.000:0.969 0/0/0/1:4:371,147:0.28: 1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,67:0.26:-1.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:227,207:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:284,104:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,35:0.15:-2.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:152,42:0.21:-2.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:312,93:0.22:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:324,86:0.20:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,235:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,177:0.48:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:194,221:0.53: 0.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:380,116:0.23: 0.93:0.997:1.000 0/1/1/1:4:125,331:0.71: 0.47:1.000:0.992 0/0/0/1:4:433,138:0.23: 1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:231,236:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,113:0.50:-2.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,229:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:379,154:0.28: 1.35:1.000:0.995 0/0/0/0:4:381,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,67:0.50:-3.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:349,110:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:430,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,103:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:490,3:0.01: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,206:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:357,109:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,157:0.46:-0.88:1.000:0.988 0/0/0/1:4:93,16:0.14:-3.52:1.000:0.973 0/0/1/1:4:122,99:0.45:-2.23:1.000:0.975 0/1/1:3:58,70:0.54:-3.30:0.997:0.948 0/0/0/1:4:280,114:0.28:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:213,257:0.54: 0.63:1.000:0.985 0/0/0/1:4:327,119:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:139,416:0.73: 1.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:408,149:0.26: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:324,89:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,207:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:385,139:0.26: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,251:0.54: 0.58:1.000:0.990 0/0/0/1:4:411,132:0.24: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:361,124:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,372:0.74: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,34:0.41:-3.82:1.000:0.839 0/0/1/1:4:216,209:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:201,154:0.43:-0.69:1.000:0.949 0/0/0/1:4:303,117:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:262,254:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,173:0.48:-0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:228,250:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,187:0.52:-0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:291,110:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:200,193:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:247,257:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:328,105:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:282,82:0.22:-0.59:1.000:0.830 0/0/0/1:4:307,111:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,211:0.53:-0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:247,221:0.47: 0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:263,255:0.49: 1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:334,119:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,215:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,218:0.53:-0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:224,218:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:330,121:0.26: 0.41:0.777:0.999 0/0/0/1:4:241,94:0.27:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:309,291:0.48: 2.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,148:0.54:-1.62:1.000:0.989 0/0/1/1:4:228,224:0.49: 0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:135,335:0.70: 0.63:1.000:0.984 0/0/1/1:4:242,230:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,161:0.47:-0.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:214,187:0.46:-0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:107,378:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,193:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:339,136:0.28: 0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,246:0.74:-1.01:0.846:0.998 0/0/0/1:4:377,102:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:537,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:275,90:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:365,141:0.27: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:105,396:0.77: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,159:0.45:-0.69:1.000:0.975 0/1/1/1:4:83,283:0.76:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,186:0.48:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:298,89:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/1/1:3:91,167:0.64:-1.81:0.964:1.000 0/1/1/1:4:106,298:0.72:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,234:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,166:0.48:-0.78:1.000:0.994 0/0/0/0:4:447,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,343:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,94:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,184:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/0:4:451,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:248,255:0.51: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,142:0.45:-1.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:208,205:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,187:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:350,127:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,235:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:197,174:0.47:-0.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:319,105:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,243:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:244,262:0.52: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:272,121:0.30:-0.26:1.000:0.984 0/0/0/0:4:411,1:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:139,390:0.72: 1.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:115,367:0.74: 0.77:0.999:0.999 0/0/1/1:4:205,232:0.53: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:151,127:0.45:-1.58:0.774:0.984 0/0/0/1:4:359,149:0.29: 1.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:297,96:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,154:0.46:-0.90:1.000:0.984 0/0/0/1:4:333,101:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,207:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:250,192:0.43: 0.31:1.000:0.951 0/0/0/1:4:344,101:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,262:0.51: 1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:292,115:0.27:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:217,224:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:323,122:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/0/0/0:4:397,0:0.00:-0.21:0.993:1.000 0/0/0/1:4:270,102:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:246,74:0.22:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,199:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,181:0.46:-0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:207,212:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:223,83:0.26:-1.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:339,144:0.29: 0.78:1.000:0.991 0/0/1/1:4:208,222:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:433,151:0.25: 1.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:379,129:0.25: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:354,121:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:261,90:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:293,92:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:341,129:0.27: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:252,253:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:291,115:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:276,87:0.23:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:269,261:0.49: 1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:391,132:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:233,241:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:210,184:0.47:-0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:224,225:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,198:0.51:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:392,137:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:300,118:0.27: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,91:0.49:-2.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,125:0.52:-2.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:258,203:0.44: 0.53:1.000:0.964 0/0/1/1:4:232,223:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:264,234:0.47: 0.95:1.000:0.992 0/0/0/1:4:340,133:0.27: 0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:105,285:0.72:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:372,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,213:0.59:-0.68:1.000:0.853 0/0/0/1:4:263,83:0.23:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:350,110:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,226:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:201,229:0.53: 0.17:1.000:0.992 0/0/0/1:4:307,90:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,118:0.31:-0.47:1.000:0.975 0/0/0/1:4:292,119:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:180,200:0.52:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:194,193:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:255,84:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,93:0.27:-0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,210:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:284,99:0.25:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,128:0.29: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/0:4:343,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:375,135:0.26: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:376,132:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:381,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,94:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,219:0.47: 0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:248,288:0.53: 1.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:246,255:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:242,81:0.24:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,207:0.50:-0.03:1.000:0.997 -chr2.1 5666195 chr2.1_005666195 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:14,16:0.53:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:28,23:0.46: 0.24:1.000:0.985 0/0/0/1:4:36,15:0.31: 0.24:1.000:0.965 0/0/1/1:4:17,19:0.53:-0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:31,11:0.29:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:59,53:0.48: 3.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,41:0.71: 0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:49,14:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,35:0.46: 1.43:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,7:0.63:-1.68:1.000:0.508 0/0/1/1:4:15,19:0.55:-0.58:1.000:0.975 0/1/1/1:4:11,20:0.63:-0.72:1.000:0.615 0/0/1/1:4:18,16:0.47:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:31,20:0.40: 0.24:1.000:0.815 0/0/1/1:4:31,27:0.47: 0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,26:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,40:0.54: 1.34:0.997:0.989 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.55:-0.92:1.000:0.979 0/0/1/1:4:25,30:0.54: 0.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:20,13:0.40:-0.63:1.000:0.827 0/0/1/1:4:23,24:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,18:0.40: 0.00:1.000:0.809 0/1/1/1:4:11,36:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,42:0.49: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,23:0.54:-0.20:1.000:0.985 0/0/1/1:4:21,34:0.61: 0.43:1.000:0.702 0/1/1/1:4:9,24:0.71:-0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:54,13:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,83:0.76: 2.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,43:0.51: 1.82:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.26:-1.20:1.000:0.998 0/0/0:3:22,0:0.00:-1.16:0.997:1.000 0/1/1/1:4:23,62:0.71: 1.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,21:0.46: 0.00:1.000:0.988 0/0/1/1:4:14,24:0.62:-0.39:1.000:0.550 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,37:0.51: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,25:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,7:0.13: 0.67:1.000:0.920 0/1/1/1:4:12,54:0.80: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,9:0.17: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,30:0.57: 0.28:1.000:0.944 0/0/1/1:4:24,19:0.45:-0.15:1.000:0.977 0/0/0/1:4:24,4:0.16:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,18:0.16: 3.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,26:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:49,41:0.46: 2.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:24,29:0.54: 0.33:1.000:0.985 0/0/0/1:4:68,20:0.25: 2.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,27:0.48: 0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:45,12:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,6:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,49:0.66: 1.29:1.000:0.856 0/0/0/1:4:33,10:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,20:0.25: 2.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,24:0.45: 0.38:1.000:0.980 0/0/0/1/1/1:6:16,19:0.54:-0.53:1.000:0.799 0/0/1/1:4:15,13:0.47:-0.87:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,40:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,32:0.47: 1.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,16:0.53:-0.77:1.000:0.992 0/0/0/1:4:23,12:0.36:-0.53:1.000:0.705 0/0/1/1:4:27,20:0.43: 0.04:1.000:0.954 0/0/0/1:4:26,13:0.35:-0.34:1.000:0.792 0/0/0/1:4:22,5:0.21:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,41:0.54: 1.39:0.777:0.986 0/1/1/1:4:7,19:0.71:-0.96:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,8:0.15: 0.62:1.000:0.990 0/0/0/1:4:33,10:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,45:0.48: 2.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:38,14:0.29: 0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,29:0.43: 1.05:1.000:0.956 0/0/0/1:4:67,25:0.29: 2.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:58,18:0.26: 1.43:1.000:0.998 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.28:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,24:0.46: 0.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:23,8:0.28:-0.72:0.846:0.995 0/1/1/1:4:16,28:0.63:-0.10:1.000:0.508 0/1/1/1:4:13,31:0.69:-0.10:1.000:0.972 0/1/1/1:4:9,28:0.74:-0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,42:0.40: 2.97:1.000:0.791 0/0/0/1:4:38,16:0.32: 0.38:1.000:0.961 0/0/0/1:4:24,8:0.28:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,13:0.28: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,8:0.20:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,58:0.69: 1.72:1.000:0.975 0/1/1:3:19,22:0.53:-0.24:0.964:0.905 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,14:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,11:0.27:-0.05:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,27:0.73:-0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,16:0.43:-0.39:1.000:0.944 0/0/1/1:4:15,22:0.59:-0.44:1.000:0.879 0/0/1/1:4:19,13:0.42:-0.68:1.000:0.895 0/0/1/1:4:15,10:0.41:-1.01:1.000:0.864 0/0/1/1:4:42,32:0.44: 1.34:1.000:0.966 0/0/1/1:4:7,9:0.56:-1.44:1.000:0.971 0/1/1/1:4:10,25:0.70:-0.53:1.000:0.983 0/0/1/1:4:23,15:0.41:-0.39:1.000:0.833 0/0/0/1:4:23,12:0.36:-0.53:1.000:0.705 0/0/1/1:4:19,16:0.46:-0.53:1.000:0.988 0/0/1/1:4:18,19:0.51:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,16:0.41:-0.29:1.000:0.864 0/0/1/1:4:22,14:0.40:-0.48:1.000:0.791 0/1/1/1:4:9,24:0.71:-0.63:1.000:0.992 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 2.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.21:-1.20:0.999:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.34:-1.16:1.000:0.890 0/0/1/1:4:22,24:0.52: 0.00:0.774:0.995 0/0/1/1:4:16,20:0.55:-0.48:1.000:0.979 0/1/1/1:4:9,16:0.63:-1.01:1.000:0.553 0/0/1/1:4:35,29:0.46: 0.86:1.000:0.986 0/1/1/1:4:9,28:0.74:-0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,12:0.38:-0.63:1.000:0.534 0/0/0/1:4:26,6:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,20:0.78:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.23:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,25:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,10:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,26:0.62:-0.24:1.000:0.519 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.53:0.993:1.000 0/1/1/1:4:6,22:0.77:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.48:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,8:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,22:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,15:0.47:-0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,11:0.64:-1.40:1.000:0.637 0/0/1/1:4:20,12:0.39:-0.68:1.000:0.663 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-1.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,25:0.60:-0.24:1.000:0.779 0/0/1/1:4:13,21:0.61:-0.58:1.000:0.707 0/1/1/1:4:7,14:0.65:-1.20:1.000:0.825 0/0/1/1:4:16,18:0.53:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,12:0.44:-0.87:1.000:0.960 0/0/1/1:4:18,20:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:24,4:0.16:-0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,17:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,18:0.73:-1.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:13,6:0.33:-1.30:1.000:0.902 0/0/1/1:4:22,18:0.46:-0.29:1.000:0.984 0/0/1/1:4:11,7:0.40:-1.35:1.000:0.791 0/0/0/1:4:26,9:0.28:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,22:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,9:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,19:0.45:-0.15:1.000:0.977 0/1/1/1:4:8,22:0.72:-0.77:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,7:0.28:-0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:17,8:0.34:-1.01:1.000:0.881 0/0/1/1:4:37,26:0.42: 0.81:1.000:0.920 0/0/0/1:4:30,8:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,21:0.55:-0.39:1.000:0.981 0/0/1/1:4:13,18:0.57:-0.72:1.000:0.934 0/0/0/1:4:21,4:0.18:-1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,37:0.87:-0.20:1.000:0.908 0/0/0/1:4:22,10:0.33:-0.68:1.000:0.916 0/1/1/1:4:10,38:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,30:0.55: 0.38:1.000:0.979 0/0/1/1:4:22,23:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,6:0.15:-0.05:1.000:0.988 0/0/1/1:4:19,19:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,21:0.86:-1.06:1.000:0.953 0/0/1/1:4:8,12:0.59:-1.25:1.000:0.849 0/0/1/1:4:21,12:0.38:-0.63:1.000:0.534 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,14:0.63:-1.16:1.000:0.508 0/1/1/1:4:17,34:0.65: 0.24:1.000:0.825 0/0/1/1:4:33,26:0.45: 0.62:1.000:0.976 0/0/1/1:4:14,22:0.60:-0.48:1.000:0.768 0/0/1/1:4:28,32:0.53: 0.67:1.000:0.992 0/1/1/1:4:7,36:0.82:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,40:0.45: 2.11:1.000:0.980 0/1/1/1:4:21,39:0.64: 0.67:1.000:0.670 0/1/1/1:4:22,63:0.72: 1.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,21:0.43: 0.19:1.000:0.941 0/0/1/1:4:23,29:0.55: 0.28:1.000:0.976 0/0/1/1:4:31,22:0.42: 0.33:1.000:0.927 0/0/1/1:4:15,15:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,18:0.46:-0.29:1.000:0.984 0/0/1/1:4:18,18:0.50:-0.48:1.000:0.997 -chr2.1 6010709 chr2.1_006010709 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:143,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.22:0.997:. ./.:4:119,46:.: 1.45:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:170,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:187,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:165,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.32:1.000:. ./.:3:21,0:.:-2.79:0.997:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:194,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:136,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:79,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.05:0.777:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.05:0.846:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.05:1.000:. ./.:3:57,0:.:-1.73:0.964:. ./.:4:124,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:112,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:213,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.73:0.999:. ./.:4:117,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:0.774:. ./.:4:123,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.73:0.993:. ./.:4:79,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. -chr2.1 6192930 chr2.1_006192930 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:244,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:325,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.01:0.997:. ./.:4:191,55:.: 0.18:1.000:. ./.:4:322,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:344,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.30:1.000:. ./.:3:65,0:.:-2.25:0.997:. ./.:4:330,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:294,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:755,1:.: 7.05:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.21:1.000:. ./.:6:154,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.28:0.777:. ./.:4:193,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.88:0.846:. ./.:4:187,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:149,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.00:1.000:. ./.:3:153,0:.:-1.07:0.964:. ./.:4:190,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:169,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:284,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:214,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.64:0.774:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:186,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:204,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.53:0.993:. ./.:4:181,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:116,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:338,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:237,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:312,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:299,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:386,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:253,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:246,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.08:1.000:. -chr2.1 6363128 chr2.1_006363128 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:12,2:0.26:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,3:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:1,3:0.61:-1.31:1.000:0.638 0/0/0/1:4:22,2:0.17: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,3:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:8,2:0.30:-0.78:1.000:0.989 0/0/1/1:4:6,6:0.48:-0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:16,2:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.38:-1.40:1.000:0.516 0/0/0/1:4:15,6:0.35: 0.18:1.000:0.817 0/0/1/1:4:8,8:0.48:-0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,4:0.48:-0.96:1.000:0.994 0/0/0/1:4:17,3:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:12,5:0.35:-0.17:1.000:0.771 0/0/1/1:4:6,7:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,2:0.24:-0.17:0.997:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.48:-0.61:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-0.87:1.000:0.972 0/0/0/1:4:21,3:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,4:0.34:-0.34:1.000:0.894 0/0/0/1:4:15,1:0.12:-0.26:1.000:0.852 0/0/0/1:4:25,2:0.15: 0.71:1.000:0.985 0/0/0/1:4:8,1:0.22:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,1:0.11:-0.08:1.000:0.520 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.22:1.000:0.898 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.43:-0.61:1.000:0.936 0/0/0:3:12,0:0.00:-0.61:0.997:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.43:-0.61:1.000:0.936 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-0.78:1.000:0.898 0/0/0/0:4:19,1:0.10: 0.09:1.000:0.801 0/0/0/1:4:25,3:0.21: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.19: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,1:0.15:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:18,2:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,1:0.13:-0.34:1.000:0.935 0/0/0/1:4:13,4:0.32:-0.17:1.000:0.961 0/0/0/0:4:40,1:0.05: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,1:0.14:-0.43:1.000:0.975 0/0/0/1:4:12,1:0.15:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:58,7:0.22: 4.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,3:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:13,2:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,2:0.17: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:26,1:0.07: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 2.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.34:-0.69:1.000:0.873 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,1:0.12:-0.17:1.000:0.708 0/0/1/1:4:20,10:0.38: 0.97:1.000:0.516 0/0/0/1:4:12,1:0.15:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/0/0/1:6:33,2:0.11: 1.41:1.000:0.972 0/0/0/0:4:29,1:0.07: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,3:0.28:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,3:0.14: 2.02:1.000:0.975 0/0/0/1:4:33,5:0.25: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,6:0.36: 0.09:1.000:0.735 0/0/0/0:4:30,1:0.06: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,3:0.30:-0.43:1.000:0.981 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,4:0.38:-0.61:0.777:0.516 0/0/0/1:4:10,2:0.28:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,4:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,3:0.18: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,9:0.38: 0.62:1.000:0.617 0/0/0/1:4:12,1:0.15:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:13,3:0.29:-0.26:1.000:0.993 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,1:0.05: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,1:0.05: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,2:0.09: 2.20:1.000:0.938 0/0/0/1:4:47,3:0.12: 2.72:1.000:0.762 0/0/0/1:4:15,4:0.30: 0.01:0.846:0.984 0/0/0/0:4:41,2:0.09: 2.11:1.000:0.916 0/0/0/1:4:40,5:0.22: 2.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,3:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,2:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.30: 0.09:1.000:0.989 0/0/0/1:4:28,3:0.19: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1:3:10,3:0.31:-0.52:0.964:1.000 0/0/0/1:4:34,2:0.11: 1.50:1.000:0.520 0/0/0/1:4:24,4:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-1.13:1.000:0.516 0/0/0/1:4:18,3:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,1:0.07: 0.88:1.000:0.998 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,2:0.12: 1.23:1.000:0.787 0/0/0/1:4:13,2:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,2:0.28:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,3:0.16: 1.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 3.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.29: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:13,7:0.39: 0.09:1.000:0.646 0/0/0/0:4:23,1:0.08: 0.44:1.000:0.980 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-1.04:1.000:0.817 0/0/0/1:4:28,4:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,2:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,2:0.12: 1.32:1.000:0.708 0/0/0/1:4:24,6:0.30: 0.97:1.000:0.989 0/0/0/1:4:27,2:0.14: 0.88:0.999:0.959 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.08:0.774:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.36:-0.78:1.000:0.735 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,3:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/0:4:32,1:0.06: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,1:0.08: 0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,2:0.14: 0.88:1.000:0.959 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,5:0.26: 1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,2:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,1:0.04: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.30:-0.78:1.000:0.989 0/0/0/1:4:9,1:0.20:-0.78:0.993:1.000 0/0/0/0:4:21,1:0.09: 0.27:1.000:0.938 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.30:-0.78:1.000:0.989 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.33:-0.96:1.000:0.937 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,2:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,3:0.34:-0.69:1.000:0.873 0/0/0/1:4:14,1:0.13:-0.34:1.000:0.935 0/0/0/0:4:20,1:0.10: 0.18:1.000:0.888 0/0/0/1:4:17,4:0.29: 0.18:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:26,1:0.07: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,3:0.31:-0.52:1.000:0.967 0/0/0/1:4:16,3:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,6:0.42:-0.34:1.000:0.898 0/0/0/1:4:21,2:0.17: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,1:0.07: 0.88:1.000:0.998 0/0/0/0:4:29,1:0.07: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/0:4:24,1:0.08: 0.53:1.000:0.989 0/0/0/0:4:21,1:0.09: 0.27:1.000:0.938 0/0/1/1:4:11,8:0.43: 0.01:1.000:0.944 0/0/0/1:4:31,3:0.18: 1.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,1:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-1.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.59:-0.78:1.000:0.879 0/0/0/1:4:6,2:0.33:-0.96:1.000:0.937 0/0/0/1:4:16,2:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.30:-0.43:1.000:0.981 0/0/0/1:4:18,2:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,1:0.11:-0.08:1.000:0.520 0/0/0/1:4:9,1:0.20:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,2:0.26:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,4:0.33:-0.26:1.000:0.937 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.30: 0.09:1.000:0.989 0/0/1/1:4:10,6:0.40:-0.26:1.000:0.801 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-0.87:1.000:0.972 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.22:1.000:0.898 0/0/1/1:4:3,3:0.48:-1.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:16,5:0.32: 0.18:1.000:0.958 0/0/0/1:4:13,3:0.29:-0.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:3,1:0.33:-1.31:1.000:0.937 0/0/0/1:4:10,1:0.18:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,2:0.28:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,1:0.15:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,3:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:10,3:0.31:-0.52:1.000:0.967 0/0/1/1:4:10,7:0.42:-0.17:1.000:0.927 0/0/0/1:4:12,2:0.26:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,3:0.28:-0.08:1.000:0.997 -chr2.1 6661298 chr2.1_006661298 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.25:0.997:. ./.:4:64,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:111,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.66:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:56,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.28:1.000:. ./.:6:42,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:0.777:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.34:0.846:. ./.:4:45,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.90:1.000:. ./.:3:44,0:.:-0.73:0.964:. ./.:4:63,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:79,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.47:0.774:. ./.:4:74,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:0.993:. ./.:4:41,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.17:1.000:. -chr2.1 6733104 chr2.1_006733104 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:112,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:126,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:116,5:.: 0.81:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:54,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:107,4:.: 0.49:1.000:. ./.:4:65,9:.:-0.68:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:108,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:116,4:.: 0.78:0.997:. ./.:4:63,11:.:-0.68:1.000:. ./.:4:189,0:.: 2.96:1.000:. ./.:4:129,7:.: 1.28:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:49,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:145,7:.: 1.79:1.000:. ./.:4:144,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:60,8:.:-0.87:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:100,7:.: 0.37:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:63,3:.:-0.93:1.000:. ./.:3:37,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:82,11:.:-0.08:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:60,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:112,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:41,2:.:-1.66:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:114,3:.: 0.68:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:71,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:118,5:.: 0.87:1.000:. ./.:4:56,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:144,3:.: 1.63:1.000:. ./.:4:48,5:.:-1.34:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:100,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:73,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:105,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:88,4:.:-0.11:1.000:. ./.:6:59,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:55,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:71,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:53,7:.:-1.12:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.52:0.777:. ./.:4:97,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:38,9:.:-1.53:1.000:. ./.:4:110,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:60,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:75,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:56,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:20,10:.:-2.07:0.846:. ./.:4:79,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:95,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:74,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:63,2:.:-0.96:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.84:1.000:. ./.:3:54,0:.:-1.31:0.964:. ./.:4:69,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:71,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:88,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:62,3:.:-0.96:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:53,7:.:-1.12:1.000:. ./.:4:54,3:.:-1.22:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:94,6:.: 0.14:1.000:. ./.:4:37,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:124,3:.: 1.00:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:61,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:153,5:.: 1.98:1.000:. ./.:4:90,2:.:-0.11:0.999:. ./.:4:94,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:48,5:.:-1.34:0.774:. ./.:4:101,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:84,4:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:126,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:49,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:60,6:.:-0.93:1.000:. ./.:4:71,2:.:-0.71:0.993:. ./.:4:50,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:74,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:70,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:52,3:.:-1.28:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,7:.: 0.97:1.000:. ./.:4:43,5:.:-1.50:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:56,2:.:-1.19:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:86,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:166,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:138,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:157,7:.: 2.17:1.000:. ./.:4:73,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:167,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:106,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:134,4:.: 1.35:1.000:. ./.:4:126,4:.: 1.09:1.000:. ./.:4:79,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:102,5:.: 0.37:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:90,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:65,7:.:-0.74:1.000:. ./.:4:86,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:97,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:96,4:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:63,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:177,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:119,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:84,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,11:.:-0.01:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:164,5:.: 2.33:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:79,5:.:-0.36:1.000:. -chr2.1 6975295 chr2.1_006975295 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:237,368:0.62: 1.20:1.000:0.608 0/1/1/1:4:75,241:0.76:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,229:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:241,239:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:404,246:0.40: 1.64:1.000:0.756 0/0/1/1:4:222,239:0.53:-0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:204,132:0.41:-1.49:1.000:0.865 0/0/1/1:4:206,205:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:197,303:0.61: 0.15:1.000:0.635 0/1/1/1:4:67,186:0.74:-2.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:209,113:0.37:-1.63:1.000:0.570 1/1/1/1:4:0,463:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,309:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:346,256:0.44: 1.17:1.000:0.970 0/0/0/1:4:382,96:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,221:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:236,339:0.60: 0.90:0.997:0.798 0/0/0/1:4:350,111:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:581,159:0.24: 2.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:398,160:0.31: 0.73:1.000:0.977 0/0/0/1:4:143,54:0.29:-2.88:1.000:0.989 0/0/0/1:4:314,97:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:242,231:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:198,311:0.62: 0.24:1.000:0.574 0/0/1/1:4:126,105:0.47:-2.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:220,350:0.62: 0.85:1.000:0.536 0/1/1/1:4:109,357:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,320:0.59: 0.69:1.000:0.877 0/0/1/1:4:254,373:0.60: 1.42:1.000:0.752 0/0/1/1:4:245,242:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:268,274:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,193:0.54:-1.21:1.000:0.986 0/0/1/1:4:112,64:0.38:-3.09:1.000:0.593 0/0/1/1:4:222,138:0.40:-1.25:1.000:0.799 0/0/1:3:116,54:0.34:-3.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:289,206:0.43: 0.10:1.000:0.953 0/0/0/1:4:362,104:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,355:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:258,265:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:273,256:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:140,407:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,213:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:410,132:0.27: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:483,114:0.21: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:158,504:0.76: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,239:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:519,141:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,103:0.54:-2.90:1.000:0.987 0/0/0/1:4:362,99:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:321,308:0.50: 1.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:205,297:0.60: 0.17:1.000:0.781 0/1/1/1:4:151,407:0.73: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:295,220:0.44: 0.30:1.000:0.972 0/0/1/1:4:383,251:0.41: 1.49:1.000:0.882 0/0/0/1:4:397,108:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,248:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,189:0.45:-0.46:1.000:0.976 0/0/1/1:4:293,275:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:109,335:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:205,238:0.55:-0.42:1.000:0.748 0/0/1/1:4:274,254:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:313,107:0.28:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:452,150:0.27: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:349,287:0.47: 1.51:1.000:0.991 0/0/1/1:4:274,247:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,343:0.60: 0.99:1.000:0.815 0/0/0/1:4:355,104:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:129,350:0.73:-0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:282,263:0.50: 0.60:0.777:0.997 0/1/1/1:4:80,281:0.78:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,287:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:200,159:0.46:-1.26:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,573:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:352,123:0.28:-0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:117,357:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,188:0.43:-0.25:1.000:0.934 0/0/1/1:4:315,218:0.43: 0.48:1.000:0.935 0/0/1/1:4:257,244:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:246,356:0.60: 1.17:1.000:0.783 0/1/1/1:4:145,429:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,315:0.78:-0.80:0.846:1.000 0/0/1/1:4:364,263:0.44: 1.42:1.000:0.960 0/0/1/1:4:281,372:0.58: 1.67:1.000:0.913 0/0/0/1:4:270,84:0.26:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,259:0.53: 0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:507,131:0.23: 1.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:139,241:0.64:-1.05:1.000:0.708 0/0/0/1:4:424,114:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,308:0.61: 0.31:1.000:0.733 0/0/0/1:4:394,110:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/0:3:268,0:0.00:-2.17:0.964:1.000 0/0/1/1:4:313,213:0.42: 0.41:1.000:0.921 0/0/1/1:4:273,265:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:197,181:0.49:-1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:367,323:0.48: 2.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:258,252:0.51: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:203,189:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,314:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:265,414:0.62: 1.93:1.000:0.590 0/0/1/1:4:231,253:0.54:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:256,165:0.41:-0.64:1.000:0.859 0/0/1/1:4:242,288:0.56: 0.45:1.000:0.974 0/0/0/1:4:278,99:0.28:-1.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:218,243:0.54:-0.24:1.000:0.988 0/0/0/1:4:401,128:0.26: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:211,209:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,317:0.73:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:356,105:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:520,141:0.23: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,236:0.46: 0.51:1.000:0.985 0/1/1/1:4:130,326:0.72:-0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:269,251:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:491,124:0.22: 1.30:0.999:1.000 0/0/0/1:4:364,128:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:199,205:0.52:-0.81:0.774:0.995 0/0/1/1:4:280,245:0.48: 0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:343,106:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:404,108:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,207:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:324,82:0.22:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,334:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:327,241:0.44: 0.83:1.000:0.968 0/0/1/1:4:376,228:0.40: 1.19:1.000:0.747 0/0/1/1:4:326,215:0.41: 0.56:1.000:0.889 0/1/1/1:4:201,358:0.65: 0.74:1.000:0.771 0/0/1/1:4:246,287:0.55: 0.48:1.000:0.979 0/0/1/1:4:243,235:0.51:-0.07:0.993:0.997 0/1/1/1:4:125,327:0.73:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:251,178:0.43:-0.56:1.000:0.950 0/0/1/1:4:267,174:0.41:-0.44:1.000:0.875 0/0/1/1:4:234,222:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:297,107:0.29:-0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:200,144:0.44:-1.41:1.000:0.958 0/0/1/1:4:248,272:0.54: 0.35:1.000:0.990 0/0/0/1:4:317,107:0.27:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:246,372:0.61: 1.33:1.000:0.680 0/1/1/1:4:117,379:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:344,129:0.29:-0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:314,212:0.42: 0.41:1.000:0.914 0/0/1/1:4:297,208:0.43: 0.20:1.000:0.943 0/0/1/1:4:256,230:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:335,233:0.43: 0.83:1.000:0.938 0/0/1/1:4:225,194:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:266,183:0.42:-0.36:1.000:0.930 0/0/1/1:4:399,275:0.42: 1.88:1.000:0.932 0/0/1/1:4:299,290:0.51: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,323:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:305,199:0.41: 0.19:1.000:0.876 0/0/1/1:4:235,240:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:227,329:0.60: 0.71:1.000:0.780 0/0/1/1:4:262,261:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:201,222:0.54:-0.62:1.000:0.989 0/0/0/1:4:196,55:0.24:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,72:0.20:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:252,255:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:315,114:0.29:-0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:257,250:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:367,260:0.43: 1.42:1.000:0.950 0/0/1/1:4:205,186:0.49:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,335:0.61: 0.71:1.000:0.674 0/0/1/1:4:258,167:0.41:-0.60:1.000:0.865 0/0/1/1:4:194,199:0.52:-0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:116,315:0.73:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:446,118:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:307,241:0.46: 0.63:1.000:0.985 0/1/1/1:4:101,291:0.74:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,203:0.53:-0.91:1.000:0.993 1/1/1/1:4:1,405:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,85:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:338,99:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:285,187:0.41:-0.13:1.000:0.883 0/0/0/1:4:316,97:0.26:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:421,100:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:261,209:0.46:-0.15:1.000:0.988 0/0/1/1:4:325,217:0.42: 0.57:1.000:0.903 0/1/1/1:4:154,290:0.66:-0.41:1.000:0.868 0/0/1/1:4:367,248:0.42: 1.30:1.000:0.915 0/0/1/1:4:268,263:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,279:0.76:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:131,324:0.72:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:397,236:0.39: 1.48:1.000:0.699 0/0/0/1:4:412,150:0.29: 0.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:262,284:0.53: 0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:87,285:0.77:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,326:0.71:-0.24:1.000:0.992 -chr2.1 7034650 chr2.1_007034650 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:9,13:0.55:-0.32:1.000:0.979 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,10:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,11:0.43:-0.08:1.000:0.936 0/0/1/1:4:32,29:0.47: 2.75:1.000:0.990 0/1/1/1:4:12,31:0.63: 1.34:1.000:0.546 0/0/0/1:4:10,5:0.31:-0.87:1.000:0.977 0/0/0/1:4:29,9:0.21: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,39:0.62: 2.28:1.000:0.548 0/0/0/1:4:6,2:0.22:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,6:0.38:-0.87:1.000:0.593 0/0/1/1:4:13,9:0.39:-0.32:1.000:0.713 0/0/1/1:4:18,15:0.44: 0.55:1.000:0.971 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,14:0.53:-0.08:0.997:0.991 0/0/0/1:4:45,14:0.21: 2.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.45:-1.03:1.000:0.980 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,32:0.63: 1.42:1.000:0.596 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.49:-1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,14:0.53:-0.08:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,22:0.70: 0.00:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-1.50:1.000:0.988 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0:3:5,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,11:0.56:-0.63:1.000:0.962 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,30:0.68: 0.86:1.000:0.960 0/0/0/1:4:17,7:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,26:0.63: 0.79:1.000:0.556 0/0/1/1:4:21,20:0.48: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,12:0.43: 0.08:1.000:0.950 0/0/1/1:4:12,9:0.41:-0.40:1.000:0.884 0/0/0/1:4:21,12:0.34: 0.55:1.000:0.859 0/0/1/1:4:8,15:0.59:-0.24:1.000:0.879 0/0/1/1:4:7,10:0.55:-0.71:1.000:0.981 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.79:1.000:0.927 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.41:-0.95:1.000:0.884 0/0/1/1:4:18,15:0.44: 0.55:1.000:0.971 0/0/0/1:4:25,6:0.17: 0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,27:0.53: 1.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:36,10:0.19: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,14:0.38: 0.71:1.000:0.593 0/0/0/1:4:21,8:0.25: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.41:-0.40:1.000:0.884 0/0/1/1/1/1:6:5,14:0.64:-0.55:1.000:0.866 0/1/1/1:4:10,27:0.63: 0.86:1.000:0.615 0/0/0/1:4:23,9:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,9:0.44:-0.47:1.000:0.963 0/0/0/1:4:15,8:0.32:-0.24:1.000:0.943 0/1/1/1:4:10,27:0.63: 0.86:1.000:0.615 0/0/1/1:4:9,16:0.58:-0.08:1.000:0.913 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,10:0.38:-0.08:1.000:0.593 0/0/0/1:4:13,8:0.36:-0.40:0.777:0.680 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.79:1.000:0.927 0/0/0/1:4:19,10:0.32: 0.23:1.000:0.952 0/0/1/1:4:3,5:0.57:-1.42:1.000:0.944 0/0/0/1:4:32,9:0.20: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.43:-0.63:1.000:0.950 0/0/1/1:4:20,16:0.43: 0.79:1.000:0.950 0/0/1/1:4:21,25:0.52: 1.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:34,16:0.29: 1.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,20:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,23:0.60: 0.63:1.000:0.773 0/0/0/1:4:26,7:0.19: 0.55:0.846:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.40:-0.16:1.000:0.794 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.55:-0.32:1.000:0.979 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.46: 0.47:1.000:0.986 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.40:-0.16:1.000:0.794 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0:3:12,0:0.00:-1.10:0.964:1.000 0/0/0/1:4:21,5:0.17: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,12:0.31: 0.79:1.000:0.977 0/0/0/1:4:26,8:0.21: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,10:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,15:0.38: 0.94:1.000:0.517 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.42:-0.24:1.000:0.916 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,17:0.57: 0.08:1.000:0.936 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,16:0.29: 1.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:15,25:0.57: 1.10:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,17:0.25: 2.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.08:0.999:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,6:0.38:-0.87:0.774:0.593 0/0/1/1:4:10,7:0.39:-0.71:1.000:0.744 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.35:-0.79:1.000:0.753 0/0/0/1:4:17,10:0.35: 0.08:1.000:0.802 0/0/0/1:4:23,8:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,34:0.65: 1.49:1.000:0.788 0/0/1/1:4:17,16:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,8:0.38:-0.47:1.000:0.593 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.79:0.993:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.65:-0.79:1.000:0.756 0/0/1/1:4:3,7:0.62:-1.26:1.000:0.619 0/0/1/1:4:8,8:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,5:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.33:-0.47:1.000:0.935 0/0/1/1:4:13,23:0.58: 0.79:1.000:0.916 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-1.34:1.000:0.992 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,20:0.61: 0.23:1.000:0.692 0/0/1/1:4:11,8:0.41:-0.55:1.000:0.832 0/0/1/1:4:14,10:0.40:-0.16:1.000:0.794 0/0/1/1:4:11,12:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,3:0.21:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,14:0.39: 0.63:1.000:0.744 0/0/1/1:4:18,29:0.57: 1.65:1.000:0.955 0/0/1/1:4:27,29:0.51: 2.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,28:0.61: 1.18:1.000:0.735 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,14:0.41: 0.55:1.000:0.856 0/0/1/1:4:18,16:0.46: 0.63:1.000:0.988 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,18:0.39: 1.42:1.000:0.713 0/0/0/0:4:49,1:0.02: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,32:0.62: 1.49:1.000:0.532 0/0/0/1:4:39,16:0.26: 2.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,17:0.32: 1.81:1.000:0.946 0/0/1/1:4:12,11:0.47:-0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,14:0.53:-0.08:1.000:0.991 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,11:0.28: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,13:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,20:0.53: 0.79:1.000:0.992 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.56:-0.08:1.000:0.973 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-1.03:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.47: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,24:0.61: 0.71:1.000:0.718 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,28:0.61: 1.18:1.000:0.735 0/0/1/1:4:23,20:0.45: 1.34:1.000:0.984 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,15:0.57:-0.16:1.000:0.944 0/0/0/1:4:26,14:0.33: 1.10:1.000:0.935 -chr2.1 7292278 chr2.1_007292278 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:116,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:0.997:. ./.:4:84,30:.: 0.84:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.47:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.47:1.000:. ./.:6:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:0.777:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.37:0.846:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.23:1.000:. ./.:3:60,0:.:-1.02:0.964:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:102,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.02:0.774:. ./.:4:71,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:0.993:. ./.:4:66,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:164,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.91:1.000:. -chr2.1 7456230 chr2.1_007456230 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:151,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:101,23:.: 0.34:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:91,24:.: 0.04:1.000:. ./.:4:174,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:40,5:.:-2.29:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:95,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:32,1:.:-2.69:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:97,18:.: 0.04:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:109,25:.: 0.67:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.87:0.997:. ./.:4:145,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:22,3:.:-2.95:1.000:. ./.:4:94,27:.: 0.24:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:95,37:.: 0.61:1.000:. ./.:4:93,27:.: 0.21:1.000:. ./.:4:100,28:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,2:.:-3.32:1.000:. ./.:4:41,8:.:-2.15:1.000:. ./.:3:13,0:.:-3.35:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:84,28:.:-0.06:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:106,32:.: 0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:105,32:.: 0.77:1.000:. ./.:4:24,16:.:-2.45:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:101,25:.: 0.41:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:109,29:.: 0.81:1.000:. ./.:4:90,39:.: 0.51:1.000:. ./.:4:114,31:.: 1.04:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:86,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:104,31:.: 0.71:1.000:. ./.:4:95,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:33,8:.:-2.42:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.37:0.777:. ./.:4:124,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:107,31:.: 0.81:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:66,18:.:-0.99:1.000:. ./.:4:81,29:.:-0.12:1.000:. ./.:4:92,33:.: 0.37:1.000:. ./.:4:99,33:.: 0.61:1.000:. ./.:4:99,32:.: 0.57:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.32:0.846:. ./.:4:83,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:83,22:.:-0.29:1.000:. ./.:4:49,17:.:-1.59:1.000:. ./.:4:91,20:.:-0.09:1.000:. ./.:4:88,15:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,24:.: 0.21:1.000:. ./.:3:46,24:.:-1.46:0.964:. ./.:4:100,28:.: 0.47:1.000:. ./.:4:138,42:.: 2.20:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:82,23:.:-0.29:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:114,20:.: 0.67:1.000:. ./.:4:28,4:.:-2.72:1.000:. ./.:4:76,21:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:87,25:.:-0.06:1.000:. ./.:4:52,23:.:-1.29:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.74:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:88,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:119,26:.: 1.04:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:120,34:.: 1.34:1.000:. ./.:4:92,19:.:-0.09:0.999:. ./.:4:90,24:.: 0.01:1.000:. ./.:4:70,26:.:-0.59:0.774:. ./.:4:111,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:88,28:.: 0.07:1.000:. ./.:4:69,15:.:-0.99:1.000:. ./.:4:77,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:79,23:.:-0.39:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:130,26:.: 1.41:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:84,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.91:0.993:. ./.:4:91,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:72,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:81,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:98,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:52,22:.:-1.32:1.000:. ./.:4:106,31:.: 0.77:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:100,29:.: 0.51:1.000:. ./.:4:115,36:.: 1.24:1.000:. ./.:4:117,26:.: 0.97:1.000:. ./.:4:108,28:.: 0.74:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,12:.:-2.65:1.000:. ./.:4:62,11:.:-1.36:1.000:. ./.:4:108,26:.: 0.67:1.000:. ./.:4:90,32:.: 0.27:1.000:. ./.:4:94,27:.: 0.24:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:63,45:.:-0.19:0.998:. ./.:4:156,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:76,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:88,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:97,35:.: 0.61:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:114,29:.: 0.97:1.000:. ./.:4:78,24:.:-0.39:1.000:. ./.:4:70,20:.:-0.79:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:97,30:.: 0.44:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:88,17:.:-0.29:1.000:. ./.:4:95,32:.: 0.44:1.000:. ./.:4:106,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.36:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.34:1.000:. -chr2.1 7487844 chr2.1_007487844 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:268,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:320,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:284,1:.: 1.34:0.997:. ./.:4:120,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:355,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:278,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.76:1.000:. ./.:3:34,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:140,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:225,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:105,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:151,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.29:1.000:. ./.:6:128,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.06:0.777:. ./.:4:250,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.09:0.846:. ./.:4:195,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.94:1.000:. ./.:3:63,0:.:-1.59:0.964:. ./.:4:64,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.46:0.999:. ./.:4:135,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.00:0.774:. ./.:4:224,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:124,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.01:0.993:. ./.:4:170,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:413,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:341,2:.: 2.11:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.26:0.998:. ./.:4:334,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:104,2:.:-1.02:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:378,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:314,2:.: 1.75:1.000:. ./.:4:211,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.11:1.000:. -chr2.1 7721952 chr2.1_007721952 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,104:0.75: 1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,64:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,115:0.67: 2.12:1.000:0.899 0/0/1/1:4:62,70:0.54: 1.01:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,56:0.51: 0.52:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.33:-0.99:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,65:0.59: 0.61:1.000:0.876 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.88:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:49,114:0.75: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.43:-1.57:1.000:0.957 0/0/1/1:4:56,56:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,58:0.47: 0.98:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.48:-1.63:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,47:0.98:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,100:0.76: 1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.43:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:50,69:0.60: 0.72:1.000:0.790 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,123:0.71: 2.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,63:0.49: 0.98:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,50:0.53: 0.21:1.000:0.993 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,55:0.42: 1.58:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,57:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,67:0.58: 0.72:1.000:0.918 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,155:0.77: 2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,60:0.45: 1.32:1.000:0.983 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:39,53:0.60: 0.12:1.000:0.828 0/0/1/1:4:63,74:0.55: 1.12:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:28,46:0.65:-0.28:1.000:0.904 0/0/1/1:4:46,44:0.49: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,61:0.60: 0.41:1.000:0.778 0/0/1/1:4:61,63:0.51: 0.83:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,64:0.99:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,49:0.50: 0.25:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,47:0.50: 0.19:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,63:0.52: 0.79:0.777:0.995 0/0/0/1:4:43,1:0.25:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,50:0.46: 0.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:39,34:0.48:-0.30:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:58,46:0.47: 0.39:1.000:0.992 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,89:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,100:0.62: 1.78:1.000:0.518 0/1/1/1:4:49,105:0.73: 1.50:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,117:0.99: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.68:0.846:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,53:0.47: 0.79:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,45:0.46: 0.47:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,53:0.57: 0.19:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,52:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/1/1:3:47,48:0.51: 0.19:0.964:0.608 0/1/1/1:4:46,85:0.69: 0.98:1.000:0.968 0/1/1/1:4:58,114:0.70: 1.89:1.000:0.988 0/0/1/1:4:43,40:0.49:-0.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,125:0.74: 2.09:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,42:0.49: 0.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,52:0.51: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,55:0.47: 0.87:1.000:0.991 0/0/1/1:4:55,60:0.53: 0.63:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,157:0.76: 2.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,41:0.45: 0.30:0.999:0.982 0/0/1/1:4:49,52:0.52: 0.32:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.88:0.774:1.000 0/0/1/1:4:63,70:0.53: 1.03:1.000:0.991 0/0/0/1:4:43,1:0.25:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,42:0.56:-0.21:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,38:0.47:-0.04:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,105:1.00: 0.41:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:53,104:0.70: 1.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:64,57:0.48: 0.76:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.90:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:45,1:0.24:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,38:0.54:-0.35:1.000:0.985 0/0/1/1:4:46,43:0.49: 0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,63:0.50: 0.90:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:59,51:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,46:0.50: 0.12:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,48:0.98:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:41,49:0.56: 0.08:1.000:0.973 0/0/1/1:4:39,51:0.58: 0.08:1.000:0.898 0/0/1/1:4:48,57:0.55: 0.41:1.000:0.976 0/0/1/1:4:54,58:0.52: 0.56:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,127:0.72: 2.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,94:0.56: 1.89:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,104:0.69: 1.61:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,68:0.48: 1.38:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.47:-1.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,39:0.60:-0.44:1.000:0.765 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,49:0.48: 0.45:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,65:0.49: 1.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.01:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,113:0.75: 1.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,130:0.80: 1.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.95:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:54,1:0.20:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,52:0.50: 0.41:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:43,35:0.47:-0.19:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,65:0.61: 0.54:1.000:0.721 0/0/1/1:4:55,64:0.55: 0.72:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,63:0.99:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,69:0.47: 1.47:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 -chr2.1 7887726 chr2.1_007887726 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.00:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.09:0.997:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,53:.: 2.49:1.000:. ./.:4:0,65:.: 3.68:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.20:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.50:1.000:. ./.:3:0,3:.:-2.49:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:6:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,34:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.20:0.777:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.80:0.846:. ./.:4:0,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,53:.: 2.49:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:3:0,25:.:-0.30:0.964:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,45:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,54:.: 2.59:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.19:0.999:. ./.:4:0,38:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.80:0.774:. ./.:4:0,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.29:0.993:. ./.:4:0,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,48:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,46:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,50:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.40:0.998:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,49:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,42:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.39:1.000:. -chr2.1 8002584 chr2.1_008002584 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:395,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:230,66:.:-1.20:1.000:. ./.:4:309,51:.:-0.65:1.000:. ./.:4:274,29:.:-1.14:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:243,31:.:-1.39:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:257,31:.:-1.27:1.000:. ./.:4:148,7:.:-2.41:1.000:. ./.:4:147,28:.:-2.24:1.000:. ./.:4:246,73:.:-1.00:1.000:. ./.:4:307,25:.:-0.89:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:276,38:.:-1.04:1.000:. ./.:4:277,21:.:-1.18:1.000:. ./.:4:444,55:.: 0.54:0.997:. ./.:4:264,79:.:-0.79:1.000:. ./.:4:481,58:.: 0.89:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:169,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:361,40:.:-0.30:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:290,84:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,1:.:-2.98:1.000:. ./.:4:370,50:.:-0.13:1.000:. ./.:4:215,24:.:-1.69:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:439,48:.: 0.44:1.000:. ./.:4:321,26:.:-0.76:1.000:. ./.:4:444,57:.: 0.56:1.000:. ./.:4:280,24:.:-1.13:1.000:. ./.:4:85,14:.:-2.89:1.000:. ./.:4:202,15:.:-1.88:1.000:. ./.:3:68,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:314,35:.:-0.74:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:553,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:558,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:821,0:.: 3.30:1.000:. ./.:4:448,59:.: 0.61:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:126,6:.:-2.60:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:480,94:.: 1.19:1.000:. ./.:4:417,47:.: 0.24:1.000:. ./.:4:459,47:.: 0.60:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:522,71:.: 1.35:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:592,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:422,48:.: 0.29:1.000:. ./.:6:522,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:547,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:701,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:587,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:459,47:.: 0.60:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:486,58:.: 0.93:0.777:. ./.:4:202,65:.:-1.45:1.000:. ./.:4:648,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:275,45:.:-0.99:1.000:. ./.:4:512,78:.: 1.32:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:364,55:.:-0.14:1.000:. ./.:4:375,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:592,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:458,47:.: 0.59:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.49:0.846:. ./.:4:487,47:.: 0.84:1.000:. ./.:4:446,56:.: 0.57:1.000:. ./.:4:297,33:.:-0.91:1.000:. ./.:4:602,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:665,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:357,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:454,46:.: 0.55:1.000:. ./.:4:402,45:.: 0.10:1.000:. ./.:3:357,0:.:-0.67:0.964:. ./.:4:478,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:439,60:.: 0.54:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:516,65:.: 1.25:1.000:. ./.:4:539,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:463,48:.: 0.65:1.000:. ./.:4:319,85:.:-0.27:1.000:. ./.:4:509,55:.: 1.10:1.000:. ./.:4:531,43:.: 1.19:1.000:. ./.:4:387,56:.: 0.06:1.000:. ./.:4:643,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:484,55:.: 0.89:1.000:. ./.:4:438,58:.: 0.52:1.000:. ./.:4:423,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:370,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:425,63:.: 0.45:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:628,0:.: 1.65:0.999:. ./.:4:461,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.23:0.774:. ./.:4:472,74:.: 0.95:1.000:. ./.:4:400,43:.: 0.06:1.000:. ./.:4:373,47:.:-0.13:1.000:. ./.:4:452,48:.: 0.55:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:398,39:.: 0.01:1.000:. ./.:4:513,58:.: 1.16:1.000:. ./.:4:460,51:.: 0.65:1.000:. ./.:4:293,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:513,55:.: 1.13:0.993:. ./.:4:353,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:365,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:465,58:.: 0.75:1.000:. ./.:4:347,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:372,43:.:-0.18:1.000:. ./.:4:362,40:.:-0.29:1.000:. ./.:4:376,22:.:-0.32:1.000:. ./.:4:478,34:.: 0.65:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:421,44:.: 0.25:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:435,78:.: 0.66:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:324,39:.:-0.62:1.000:. ./.:4:441,44:.: 0.42:1.000:. ./.:4:439,59:.: 0.53:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:384,41:.:-0.09:1.000:. ./.:4:395,50:.: 0.08:1.000:. ./.:4:381,40:.:-0.13:1.000:. ./.:4:312,26:.:-0.84:1.000:. ./.:4:129,10:.:-2.54:1.000:. ./.:4:258,23:.:-1.33:1.000:. ./.:4:381,44:.:-0.09:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:472,42:.: 0.67:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.57:0.998:. ./.:4:327,31:.:-0.67:1.000:. ./.:4:284,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:237,29:.:-1.46:1.000:. ./.:4:332,48:.:-0.48:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:298,36:.:-0.87:1.000:. ./.:4:338,38:.:-0.51:1.000:. ./.:4:361,28:.:-0.40:1.000:. ./.:4:277,72:.:-0.74:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:292,33:.:-0.95:1.000:. ./.:4:280,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:385,39:.:-0.10:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:401,40:.: 0.05:1.000:. ./.:4:300,35:.:-0.86:1.000:. ./.:4:370,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:339,46:.:-0.43:1.000:. ./.:4:348,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:419,53:.: 0.31:1.000:. ./.:4:423,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:292,33:.:-0.95:1.000:. ./.:4:303,38:.:-0.81:1.000:. -chr2.1 8315059 chr2.1_008315059 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:241,96:.: 0.45:1.000:. ./.:4:203,69:.:-0.59:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:438,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:230,82:.: 0.05:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:163,54:.:-1.46:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:214,67:.:-0.44:1.000:. ./.:4:213,85:.:-0.17:1.000:. ./.:4:247,94:.: 0.51:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:265,100:.: 0.89:1.000:. ./.:4:251,88:.: 0.48:0.997:. ./.:4:215,85:.:-0.14:1.000:. ./.:4:421,3:.: 1.83:1.000:. ./.:4:262,107:.: 0.95:1.000:. ./.:4:203,3:.:-1.64:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:296,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:104,52:.:-2.43:1.000:. ./.:4:261,128:.: 1.27:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:204,86:.:-0.30:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:224,87:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:188,58:.:-1.00:1.000:. ./.:3:49,5:.:-4.05:1.000:. ./.:4:236,89:.: 0.25:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:230,81:.: 0.03:1.000:. ./.:4:266,112:.: 1.10:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:226,81:.:-0.03:1.000:. ./.:4:236,101:.: 0.45:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:251,90:.: 0.51:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:250,81:.: 0.35:1.000:. ./.:4:67,31:.:-3.35:1.000:. ./.:4:180,92:.:-0.59:1.000:. ./.:4:285,102:.: 1.24:1.000:. ./.:4:192,87:.:-0.48:1.000:. ./.:4:321,106:.: 1.88:1.000:. ./.:4:230,107:.: 0.45:1.000:. ./.:4:332,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:258,104:.: 0.84:1.000:. ./.:4:176,76:.:-0.91:1.000:. ./.:4:250,120:.: 0.97:1.000:. ./.:4:212,95:.:-0.03:1.000:. ./.:6:220,34:.:-0.87:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:260,97:.: 0.76:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:217,94:.: 0.03:1.000:. ./.:4:236,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:133,148:.:-0.44:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.14:0.777:. ./.:4:292,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:240,109:.: 0.64:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:256,234:.: 2.88:1.000:. ./.:4:272,109:.: 1.15:1.000:. ./.:4:235,106:.: 0.51:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:316,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:253,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:287,89:.: 1.07:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:135,124:.:-0.79:0.846:. ./.:4:382,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:249,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:253,106:.: 0.80:1.000:. ./.:4:167,68:.:-1.18:1.000:. ./.:4:174,66:.:-1.10:1.000:. ./.:4:245,79:.: 0.24:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.78:1.000:. ./.:3:170,0:.:-2.21:0.964:. ./.:4:214,87:.:-0.13:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:160,54:.:-1.51:1.000:. ./.:4:399,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:240,102:.: 0.53:1.000:. ./.:4:192,69:.:-0.76:1.000:. ./.:4:241,93:.: 0.40:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:289,93:.: 1.16:1.000:. ./.:4:215,67:.:-0.43:1.000:. ./.:4:262,96:.: 0.78:1.000:. ./.:4:162,47:.:-1.59:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:283,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:233,97:.: 0.33:1.000:. ./.:4:208,79:.:-0.35:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:317,116:.: 1.97:1.000:. ./.:4:250,75:.: 0.25:0.999:. ./.:4:325,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:160,51:.:-1.56:0.774:. ./.:4:298,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:282,90:.: 1.00:1.000:. ./.:4:219,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:241,97:.: 0.46:1.000:. ./.:4:264,98:.: 0.84:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.10:0.993:. ./.:4:269,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:154,58:.:-1.54:1.000:. ./.:4:215,92:.:-0.03:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:154,63:.:-1.46:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:281,121:.: 1.48:1.000:. ./.:4:215,81:.:-0.21:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:189,70:.:-0.79:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:294,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:176,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:263,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:256,83:.: 0.48:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:326,117:.: 2.13:1.000:. ./.:4:224,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:352,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:196,87:.:-0.41:1.000:. ./.:4:172,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:273,100:.: 1.02:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:263,93:.: 0.75:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:224,83:.:-0.03:0.998:. ./.:4:337,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:199,94:.:-0.25:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:207,79:.:-0.37:1.000:. ./.:4:245,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:238,92:.: 0.33:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:269,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:189,86:.:-0.54:1.000:. ./.:4:215,72:.:-0.35:1.000:. ./.:4:163,86:.:-0.95:1.000:. ./.:4:236,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:206,79:.:-0.38:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:405,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:328,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:202,68:.:-0.62:1.000:. ./.:4:267,96:.: 0.86:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:309,108:.: 1.72:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:226,84:.: 0.02:1.000:. -chr2.1 8444668 chr2.1_008444668 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:47,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:72,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:78,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.52:0.997:. ./.:4:76,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:119,1:.: 2.52:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.68:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:94,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:58,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.68:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:75,3:.: 0.77:1.000:. ./.:4:17,1:.:-1.72:1.000:. ./.:4:67,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:24,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:84,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:74,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.60:1.000:. ./.:6:39,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:84,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:86,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.56:0.777:. ./.:4:90,3:.: 1.39:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:93,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:27,2:.:-1.27:0.846:. ./.:4:82,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:61,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.60:1.000:. ./.:3:49,0:.:-0.44:0.964:. ./.:4:58,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:86,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:96,2:.: 1.60:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:30,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:93,3:.: 1.52:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:91,3:.: 1.43:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:69,2:.: 0.48:0.999:. ./.:4:89,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.23:0.774:. ./.:4:86,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:105,2:.: 1.98:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.52:0.993:. ./.:4:78,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.64:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:101,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.68:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:68,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:117,1:.: 2.43:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:62,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:74,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:83,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:87,3:.: 1.27:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.27:0.998:. ./.:4:60,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,1:.: 2.35:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:48,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,2:.: 0.40:1.000:. -chr2.1 8612395 chr2.1_008612395 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:137,118:0.49: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,111:0.57: 0.00:1.000:0.943 0/0/1/1:4:112,88:0.47:-0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,106:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,109:0.47: 1.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,89:0.48:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,72:0.44:-0.76:1.000:0.969 0/1/1/1:4:52,178:0.79: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,57:0.26: 0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,71:0.55:-1.73:1.000:0.981 0/0/1/1:4:70,88:0.59:-1.19:1.000:0.885 0/0/0/1:4:186,43:0.21: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,104:0.54:-0.03:1.000:0.987 0/1/1/1:4:60,139:0.72:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,138:0.71:-0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:67,134:0.69:-0.10:1.000:0.976 0/1/1/1:4:58,126:0.71:-0.53:0.997:0.992 1/1/1/1:4:1,208:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,180:0.75: 1.12:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,253:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,118:0.73:-0.97:1.000:0.998 0/1/1/1:4:62,156:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,119:0.47: 1.70:1.000:0.992 0/0/0/1:4:178,51:0.25: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,73:0.86:-3.02:1.000:0.961 0/0/1/1:4:118,88:0.46: 0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:172,54:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,76:0.46:-0.69:1.000:0.986 0/0/0/1:4:177,63:0.29: 0.89:1.000:0.993 0/0/1/1:4:128,113:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,85:0.45:-0.10:1.000:0.983 0/1/1/1:4:52,125:0.73:-0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,50:0.57:-2.87:1.000:0.938 0/1/1/1:4:21,122:0.87:-1.58:1.000:0.942 0/1/1:3:16,42:0.75:-3.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,172:0.77: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,114:0.76:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,107:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,138:0.72:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,106:0.46: 1.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:97,106:0.55:-0.05:1.000:0.977 0/1/1/1:4:40,143:0.80:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,149:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,123:0.75:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,99:0.47: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,120:0.57: 0.41:1.000:0.939 1/1/1/1:4:1,228:1.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,110:0.47: 1.12:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,162:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,159:0.85:-0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:90,68:0.46:-1.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:134,119:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,134:0.74:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:122,124:0.54: 1.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:52,166:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,134:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,135:0.73:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,147:0.68: 0.48:1.000:0.959 0/0/1/1:4:104,101:0.52: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1/1/1:6:87,115:0.60:-0.08:1.000:0.630 0/0/1/1:4:104,110:0.54: 0.23:1.000:0.984 0/1/1/1:4:52,147:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,166:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,144:0.79:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,94:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,88:0.53:-0.69:1.000:0.994 0/1/1/1:4:55,103:0.68:-1.19:1.000:0.948 0/1/1/1:4:50,145:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,103:0.48: 0.66:0.777:0.994 0/0/0/1:4:135,43:0.26:-0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,157:0.76: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,75:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,106:0.57:-0.23:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,232:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,94:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,81:0.52:-0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,100:0.48: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,159:0.70: 0.81:1.000:0.981 0/0/1/1:4:124,109:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:195,46:0.21: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,118:0.69:-0.69:0.846:0.971 0/0/1/1:4:129,124:0.52: 1.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:192,77:0.31: 1.63:1.000:0.972 0/1/1/1:4:42,116:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,115:0.54: 0.48:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,87:0.55:-0.91:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,193:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,82:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,155:0.77: 0.03:1.000:1.000 1/1/1:3:0,164:1.00:-1.04:0.964:1.000 0/1/1/1:4:50,142:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,93:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,86:0.68:-1.88:1.000:0.959 0/0/1/1:4:117,104:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,143:0.77:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,120:0.71:-0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,77:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,54:0.28: 0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,174:0.80: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,133:0.78:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,170:0.75: 0.76:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,146:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,54:0.27: 0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,121:0.75:-0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,130:0.66: 0.00:1.000:0.873 0/0/1/1:4:115,92:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:59,141:0.73:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,204:0.77: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,113:0.55: 0.36:1.000:0.983 0/0/0/1:4:161,44:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,180:0.71: 1.50:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,201:1.00:-0.10:0.999:1.000 0/1/1/1:4:61,175:0.76: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,92:0.72:-1.86:0.774:0.996 0/0/1/1:4:126,125:0.53: 1.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:50,154:0.78:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,137:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,79:0.43:-0.25:1.000:0.958 0/1/1/1:4:45,132:0.77:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,97:0.51: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,138:0.74:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,99:0.48: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,102:0.49: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,83:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:70,161:0.72: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,102:0.54:-0.10:0.993:0.988 0/0/0/1:4:126,27:0.20:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,80:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,88:0.74:-2.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,148:0.81:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,152:0.73: 0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,87:0.80:-2.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,100:0.52:-0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,138:0.82:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,118:0.53: 0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:110,91:0.48:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,117:0.75:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,132:0.78:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,67:0.43:-0.99:1.000:0.955 0/0/1/1:4:99,102:0.54:-0.10:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,147:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,100:0.54:-0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:98,65:0.43:-1.07:1.000:0.942 0/0/1/1:4:158,121:0.46: 1.88:1.000:0.990 0/0/1/1:4:168,132:0.47: 2.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:140,121:0.50: 1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,107:0.52: 0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,147:0.71: 0.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:100,114:0.56: 0.23:1.000:0.962 0/0/1/1:4:146,104:0.45: 1.14:1.000:0.976 0/1/1/1:4:67,165:0.74: 0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,104:0.79:-1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,122:0.71:-0.69:1.000:0.992 0/1/1/1:4:66,150:0.72: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,185:0.78: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,219:0.75: 2.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,110:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,143:0.73:-0.05:0.998:0.997 0/0/0/1:4:217,61:0.24: 1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,158:0.77: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,102:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:138,56:0.31:-0.28:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,197:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,78:0.47:-0.66:1.000:0.991 0/0/1/1:4:115,140:0.58: 1.27:1.000:0.920 0/0/1/1:4:109,111:0.54: 0.38:1.000:0.990 0/0/0/1:4:217,64:0.25: 1.93:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,203:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,139:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,144:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,141:0.77:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,141:0.73:-0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,67:0.53:-1.80:1.000:0.992 0/0/0/1:4:131,41:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,110:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,105:0.42: 1.55:1.000:0.929 0/0/0/1:4:149,47:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,85:0.43: 0.13:1.000:0.957 0/1/1/1:4:80,192:0.73: 1.70:1.000:0.998 0/1/1/1:4:103,201:0.69: 2.52:1.000:0.968 0/1/1/1:4:73,226:0.78: 2.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,63:0.29: 0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:121,121:0.53: 0.94:1.000:0.992 -chr2.1 8836327 chr2.1_008836327 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:164,82:.: 0.71:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:250,4:.: 0.89:1.000:. ./.:4:148,60:.:-0.12:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:196,69:.: 1.13:1.000:. ./.:4:115,27:.:-1.56:1.000:. ./.:4:144,59:.:-0.23:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:82,31:.:-2.20:1.000:. ./.:4:77,30:.:-2.33:1.000:. ./.:4:169,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:157,56:.:-0.01:1.000:. ./.:4:170,57:.: 0.30:1.000:. ./.:4:124,52:.:-0.82:1.000:. ./.:4:166,68:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,140:.: 0.63:0.997:. ./.:4:266,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:134,165:.: 1.88:1.000:. ./.:4:115,155:.: 1.24:1.000:. ./.:4:78,38:.:-2.13:1.000:. ./.:4:174,61:.: 0.47:1.000:. ./.:4:195,80:.: 1.35:1.000:. ./.:4:138,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:41,23:.:-3.27:1.000:. ./.:4:181,52:.: 0.43:1.000:. ./.:4:187,63:.: 0.80:1.000:. ./.:4:143,53:.:-0.38:1.000:. ./.:4:183,73:.: 0.93:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:192,65:.: 0.96:1.000:. ./.:4:162,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:26,12:.:-3.84:1.000:. ./.:4:107,29:.:-1.70:1.000:. ./.:3:41,10:.:-3.56:1.000:. ./.:4:99,114:.:-0.01:1.000:. ./.:4:158,59:.: 0.08:1.000:. ./.:4:175,70:.: 0.69:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:181,67:.: 0.76:1.000:. ./.:4:143,59:.:-0.25:1.000:. ./.:4:172,84:.: 0.93:1.000:. ./.:4:116,146:.: 1.07:1.000:. ./.:4:147,54:.:-0.27:1.000:. ./.:4:176,78:.: 0.89:1.000:. ./.:4:159,66:.: 0.25:1.000:. ./.:4:172,71:.: 0.65:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:69,105:.:-0.86:1.000:. ./.:4:161,62:.: 0.21:1.000:. ./.:4:174,59:.: 0.43:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:172,48:.: 0.14:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:132,60:.:-0.47:1.000:. ./.:4:107,108:.: 0.04:1.000:. ./.:4:151,58:.:-0.10:1.000:. ./.:4:170,67:.: 0.52:1.000:. ./.:4:157,65:.: 0.19:1.000:. ./.:6:140,55:.:-0.40:1.000:. ./.:4:180,69:.: 0.78:1.000:. ./.:4:175,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:203,90:.: 1.74:1.000:. ./.:4:182,67:.: 0.78:1.000:. ./.:4:161,76:.: 0.52:1.000:. ./.:4:162,68:.: 0.36:1.000:. ./.:4:129,39:.:-1.00:1.000:. ./.:4:166,61:.: 0.30:1.000:. ./.:4:159,71:.: 0.36:0.777:. ./.:4:154,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:158,84:.: 0.63:1.000:. ./.:4:125,44:.:-0.97:1.000:. ./.:4:241,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:148,78:.: 0.28:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.13:0.846:. ./.:4:190,66:.: 0.93:1.000:. ./.:4:199,71:.: 1.24:1.000:. ./.:4:99,83:.:-0.69:1.000:. ./.:4:160,63:.: 0.21:1.000:. ./.:4:167,60:.: 0.30:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:140,50:.:-0.51:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:141,61:.:-0.25:1.000:. ./.:3:96,42:.:-1.65:0.964:. ./.:4:200,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:104,41:.:-1.50:1.000:. ./.:4:135,127:.: 1.07:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:109,99:.:-0.12:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:157,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:154,60:.: 0.01:1.000:. ./.:4:129,43:.:-0.91:1.000:. ./.:4:153,61:.: 0.01:1.000:. ./.:4:76,69:.:-1.50:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:122,54:.:-0.82:1.000:. ./.:4:138,58:.:-0.38:1.000:. ./.:4:192,72:.: 1.11:1.000:. ./.:4:141,52:.:-0.45:1.000:. ./.:4:227,80:.: 2.05:1.000:. ./.:4:195,58:.: 0.87:1.000:. ./.:4:160,57:.: 0.08:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:187,66:.: 0.87:0.999:. ./.:4:208,68:.: 1.37:1.000:. ./.:4:112,41:.:-1.32:0.774:. ./.:4:197,59:.: 0.93:1.000:. ./.:4:90,92:.:-0.69:1.000:. ./.:4:136,67:.:-0.23:1.000:. ./.:4:181,58:.: 0.56:1.000:. ./.:4:131,63:.:-0.43:1.000:. ./.:4:216,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:97,121:.: 0.10:1.000:. ./.:4:258,7:.: 1.13:1.000:. ./.:4:178,64:.: 0.63:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:116,116:.: 0.41:1.000:. ./.:4:108,117:.: 0.25:0.993:. ./.:4:189,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:120,57:.:-0.80:1.000:. ./.:4:120,49:.:-0.97:1.000:. ./.:4:175,62:.: 0.52:1.000:. ./.:4:138,62:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,64:.:-2.18:1.000:. ./.:4:154,56:.:-0.07:1.000:. ./.:4:151,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:210,80:.: 1.68:1.000:. ./.:4:166,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,89:.:-0.40:1.000:. ./.:4:74,85:.:-1.19:1.000:. ./.:4:150,51:.:-0.27:1.000:. ./.:4:154,59:.:-0.01:1.000:. ./.:4:161,52:.:-0.01:1.000:. ./.:4:141,49:.:-0.51:1.000:. ./.:4:127,52:.:-0.75:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:210,67:.: 1.39:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:204,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:185,69:.: 0.89:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:174,77:.: 0.82:1.000:. ./.:4:108,153:.: 1.04:1.000:. ./.:4:79,21:.:-2.49:1.000:. ./.:4:89,44:.:-1.76:1.000:. ./.:4:166,84:.: 0.80:1.000:. ./.:4:179,65:.: 0.67:1.000:. ./.:4:205,80:.: 1.57:1.000:. ./.:4:192,61:.: 0.87:1.000:. ./.:4:204,4:.:-0.12:0.998:. ./.:4:179,59:.: 0.54:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:153,44:.:-0.36:1.000:. ./.:4:182,3:.:-0.62:1.000:. ./.:4:98,122:.: 0.14:1.000:. ./.:4:173,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:145,54:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:68,117:.:-0.62:1.000:. ./.:4:76,103:.:-0.75:1.000:. ./.:4:81,111:.:-0.47:1.000:. ./.:4:80,92:.:-0.91:1.000:. ./.:4:143,63:.:-0.16:1.000:. ./.:4:80,108:.:-0.56:1.000:. ./.:4:114,49:.:-1.10:1.000:. ./.:4:108,59:.:-1.02:1.000:. ./.:4:192,72:.: 1.11:1.000:. ./.:4:185,62:.: 0.74:1.000:. ./.:4:183,76:.: 1.00:1.000:. ./.:4:162,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:159,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:198,75:.: 1.31:1.000:. ./.:4:190,79:.: 1.22:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:192,1:.:-0.45:1.000:. -chr2.1 9015188 chr2.1_009015188 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:87,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.34:0.997:. ./.:4:113,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-1.61:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.38:1.000:. ./.:6:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.40:0.777:. ./.:4:16,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.89:0.846:. ./.:4:49,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.47:1.000:. ./.:3:39,0:.:-0.89:0.964:. ./.:4:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.34:0.999:. ./.:4:70,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.14:0.774:. ./.:4:112,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.79:0.993:. ./.:4:9,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:133,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.09:0.998:. ./.:4:54,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.57:1.000:. -chr2.1 9068382 chr2.1_009068382 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:256,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:390,0:.: 2.16:0.997:. ./.:4:306,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:385,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:408,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.92:1.000:. ./.:3:58,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:451,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:352,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.77:1.000:. ./.:6:209,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.56:0.777:. ./.:4:215,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.38:0.846:. ./.:4:256,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.75:1.000:. ./.:3:137,0:.:-1.64:0.964:. ./.:4:237,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.63:0.999:. ./.:4:262,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.86:0.774:. ./.:4:236,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.56:0.993:. ./.:4:205,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:412,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.29:0.998:. ./.:4:316,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:388,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.34:1.000:. -chr2.1 9112874 chr2.1_009112874 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:197,80:0.26: 1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,110:0.47:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:96,129:0.54: 0.15:1.000:0.990 0/0/0/1:4:159,65:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,164:0.49: 1.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,64:0.25: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,65:0.75:-2.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,177:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,31:0.43:-2.63:1.000:0.953 0/0/0/1:4:27,16:0.34:-3.03:1.000:0.882 0/1/1/1:4:37,128:0.74:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,36:0.17:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,154:0.54: 0.85:1.000:0.985 0/0/1/1:4:98,106:0.48:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,102:0.45:-0.11:1.000:0.978 0/0/0/1:4:181,67:0.24: 0.55:0.997:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,104:0.28: 2.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:246,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,30:0.41:-2.59:1.000:0.831 0/0/1/1:4:101,104:0.47:-0.20:1.000:0.992 0/0/0/1:4:188,66:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,111:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-2.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,52:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,75:0.39:-0.72:1.000:0.722 0/0/0/1:4:166,45:0.19:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,139:0.44: 1.27:1.000:0.973 0/0/1/1:4:84,93:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,168:0.79:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,95:0.55:-0.97:1.000:0.977 0/1/1/1:4:10,26:0.69:-3.15:1.000:0.969 0/0/1/1:4:33,56:0.59:-2.23:1.000:0.849 0/0/0:3:17,1:0.05:-3.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,60:0.29:-0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,127:0.52: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:194,60:0.21: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,64:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,77:0.28: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,52:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:232,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,79:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,64:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,68:0.23: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,89:0.28: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,24:0.59:-3.12:1.000:0.832 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,99:0.55:-0.83:1.000:0.982 0/0/0/1:4:165,70:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:156,177:0.49: 2.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,116:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:115,158:0.54: 0.99:1.000:0.987 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,47:0.25:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,47:0.21:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:131,57:0.27:-0.50:1.000:0.691 0/0/0/1:4:180,79:0.27: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,108:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,161:0.53: 1.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:128,155:0.51: 1.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,64:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,77:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,130:0.61:-0.27:1.000:0.687 0/0/0/1:4:128,53:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,63:0.28:-0.24:0.777:0.996 0/1/1/1:4:61,193:0.73: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/0:4:248,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,42:0.25:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,119:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:185,72:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,137:0.55: 0.29:1.000:0.980 0/0/1/1:4:98,114:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,104:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:185,78:0.26: 0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:114,133:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,210:0.72: 1.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,39:0.27:-1.49:0.846:0.998 0/1/1/1:4:51,216:0.77: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,143:0.53: 0.59:1.000:0.991 0/0/0/1:4:169,60:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,61:0.23: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,69:0.22: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,77:0.49:-1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,92:0.31: 0.83:1.000:0.965 0/0/1/1:4:102,128:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,98:0.46:-0.32:1.000:0.986 0/0/1:3:77,51:0.36:-1.55:0.964:1.000 0/0/0/1:4:178,70:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,143:0.48: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,122:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:161,71:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,75:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,103:0.52:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,153:0.51: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,171:0.51: 1.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,100:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:115,135:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,191:0.73: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,118:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:141,143:0.47: 1.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:165,56:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,106:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,187:0.52: 2.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:182,74:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,110:0.45: 0.20:1.000:0.975 0/0/0/1:4:217,89:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:193,68:0.23: 0.78:0.999:1.000 0/0/1/1:4:108,133:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,59:0.47:-1.74:0.774:0.991 0/0/0/1:4:174,69:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,65:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,126:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,217:0.78: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,138:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,147:0.52: 0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:169,65:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,148:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,61:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,127:0.45: 0.80:1.000:0.977 0/0/0/1:4:167,79:0.29: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:101,118:0.50: 0.04:0.993:0.997 0/1/1/1:4:29,133:0.79:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,48:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,118:0.47: 0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,128:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:112,33:0.20:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,52:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,95:0.52:-0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:191,76:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,75:0.30: 0.11:1.000:0.982 0/0/0/1:4:157,83:0.31: 0.41:1.000:0.970 0/0/0/1:4:153,58:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,61:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,68:0.30:-0.24:1.000:0.983 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,52:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,152:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,182:0.56: 1.51:1.000:0.962 0/0/0/1:4:203,93:0.28: 1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,147:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,104:0.48:-0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,137:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,114:0.54:-0.36:1.000:0.985 0/0/0/1:4:194,61:0.21: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,56:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,50:0.50:-2.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,59:0.47:-1.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:80,105:0.53:-0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,134:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,181:0.53: 1.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:204,73:0.23: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,148:0.74:-0.43:0.998:0.998 0/0/1/1:4:123,141:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,54:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,169:0.78:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,189:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,82:0.47:-0.93:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,121:0.55:-0.18:1.000:0.980 0/1/1/1:4:49,200:0.77: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,187:0.72: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,37:0.21:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,42:0.26:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,120:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,74:0.30: 0.13:1.000:0.987 0/0/0/1:4:147,59:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,86:0.47:-0.81:1.000:0.991 0/0/0/1:4:166,64:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,67:0.19: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,107:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,72:0.34:-0.41:1.000:0.876 0/0/1/1:4:124,94:0.40: 0.03:1.000:0.748 0/0/1/1:4:141,147:0.47: 1.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,161:0.52: 1.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,153:0.71:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,119:0.50: 0.10:1.000:0.997 -chr2.1 9359877 chr2.1_009359877 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:67,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:111,3:.: 2.61:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.79:0.997:. ./.:4:55,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:88,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:78,3:.: 1.18:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.98:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:95,2:.: 1.87:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:73,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:57,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:68,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.27:1.000:. ./.:6:55,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:65,4:.: 0.66:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.49:0.777:. ./.:4:22,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:77,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:58,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.27:0.846:. ./.:4:20,1:.:-1.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.25:1.000:. ./.:3:34,0:.:-0.86:0.964:. ./.:4:70,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:77,4:.: 1.18:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,1:.: 2.13:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:58,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:40,2:.:-0.51:0.774:. ./.:4:81,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.68:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:93,3:.: 1.83:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.38:0.993:. ./.:4:15,2:.:-1.59:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:26,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:92,2:.: 1.74:1.000:. ./.:4:70,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:63,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,2:.:-1.55:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:100,1:.: 2.05:1.000:. ./.:4:54,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:97,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:85,2:.: 1.44:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.29:0.998:. ./.:4:59,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.46:1.000:. ./.:4:101,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:25,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:76,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:66,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.10:1.000:. -chr2.1 9635376 chr2.1_009635376 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:192,80:.: 0.87:1.000:. ./.:4:159,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:181,59:.: 0.29:1.000:. ./.:4:228,70:.: 1.35:1.000:. ./.:4:182,187:.: 2.63:1.000:. ./.:4:90,116:.:-0.32:1.000:. ./.:4:184,63:.: 0.42:1.000:. ./.:4:142,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:52,33:.:-2.52:1.000:. ./.:4:60,32:.:-2.39:1.000:. ./.:4:163,52:.:-0.16:1.000:. ./.:4:170,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:113,192:.: 1.47:1.000:. ./.:4:186,85:.: 0.86:1.000:. ./.:4:193,74:.: 0.78:1.000:. ./.:4:123,147:.: 0.84:0.997:. ./.:4:172,90:.: 0.69:1.000:. ./.:4:149,154:.: 1.44:1.000:. ./.:4:149,169:.: 1.71:1.000:. ./.:4:72,60:.:-1.67:1.000:. ./.:4:184,62:.: 0.40:1.000:. ./.:4:175,140:.: 1.66:1.000:. ./.:4:150,63:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,11:.:-2.95:1.000:. ./.:4:136,76:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,140:.: 1.04:1.000:. ./.:4:127,112:.: 0.28:1.000:. ./.:4:143,152:.: 1.29:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:118,125:.: 0.35:1.000:. ./.:4:131,54:.:-0.70:1.000:. ./.:4:43,28:.:-2.77:1.000:. ./.:4:62,25:.:-2.48:1.000:. ./.:3:43,14:.:-3.03:1.000:. ./.:4:107,229:.: 2.04:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,124:.: 0.37:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:151,134:.: 1.11:1.000:. ./.:4:89,104:.:-0.56:1.000:. ./.:4:97,41:.:-1.56:1.000:. ./.:4:98,203:.: 1.40:1.000:. ./.:4:143,53:.:-0.50:1.000:. ./.:4:75,184:.: 0.64:1.000:. ./.:4:167,31:.:-0.47:1.000:. ./.:4:163,64:.: 0.06:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:104,95:.:-0.45:1.000:. ./.:4:121,56:.:-0.85:1.000:. ./.:4:124,52:.:-0.87:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:100,110:.:-0.25:1.000:. ./.:4:163,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:200,62:.: 0.69:1.000:. ./.:4:109,128:.: 0.24:1.000:. ./.:4:177,66:.: 0.35:1.000:. ./.:4:151,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:157,60:.:-0.12:1.000:. ./.:6:114,110:.: 0.00:1.000:. ./.:4:154,122:.: 0.95:1.000:. ./.:4:122,105:.: 0.06:1.000:. ./.:4:137,128:.: 0.75:1.000:. ./.:4:80,126:.:-0.32:1.000:. ./.:4:157,144:.: 1.40:1.000:. ./.:4:113,106:.:-0.09:1.000:. ./.:4:94,42:.:-1.59:1.000:. ./.:4:139,56:.:-0.52:1.000:. ./.:4:155,59:.:-0.18:0.777:. ./.:4:169,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:181,67:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,48:.:-1.03:1.000:. ./.:4:152,80:.: 0.15:1.000:. ./.:4:172,76:.: 0.44:1.000:. ./.:4:187,67:.: 0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:169,74:.: 0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:176,72:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,65:.: 0.04:1.000:. ./.:4:136,39:.:-0.89:0.846:. ./.:4:94,125:.:-0.09:1.000:. ./.:4:171,124:.: 1.29:1.000:. ./.:4:119,123:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,138:.: 0.93:1.000:. ./.:4:181,60:.: 0.31:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:124,63:.:-0.67:1.000:. ./.:4:131,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:186,57:.: 0.35:1.000:. ./.:3:98,76:.:-0.90:0.964:. ./.:4:150,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:124,61:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,203:.: 1.11:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:90,111:.:-0.41:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:142,135:.: 0.97:1.000:. ./.:4:148,67:.:-0.16:1.000:. ./.:4:108,56:.:-1.09:1.000:. ./.:4:128,150:.: 0.98:1.000:. ./.:4:79,82:.:-1.14:1.000:. ./.:4:131,64:.:-0.52:1.000:. ./.:4:110,53:.:-1.10:1.000:. ./.:4:165,65:.: 0.11:1.000:. ./.:4:100,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:136,56:.:-0.58:1.000:. ./.:4:169,169:.: 2.07:1.000:. ./.:4:145,128:.: 0.89:1.000:. ./.:4:124,107:.: 0.13:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:137,64:.:-0.41:0.999:. ./.:4:131,129:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,118:.:-0.67:0.774:. ./.:4:161,73:.: 0.19:1.000:. ./.:4:114,108:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,52:.:-0.94:1.000:. ./.:4:95,147:.: 0.33:1.000:. ./.:4:89,126:.:-0.16:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:73,113:.:-0.69:1.000:. ./.:4:146,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:159,156:.: 1.66:1.000:. ./.:4:133,74:.:-0.30:1.000:. ./.:4:83,197:.: 1.02:1.000:. ./.:4:76,160:.: 0.22:0.993:. ./.:4:96,79:.:-0.89:1.000:. ./.:4:98,46:.:-1.45:1.000:. ./.:4:97,48:.:-1.43:1.000:. ./.:4:145,72:.:-0.12:1.000:. ./.:4:164,86:.: 0.48:1.000:. ./.:4:102,37:.:-1.54:1.000:. ./.:4:162,73:.: 0.20:1.000:. ./.:4:151,60:.:-0.23:1.000:. ./.:4:185,103:.: 1.17:1.000:. ./.:4:119,134:.: 0.53:1.000:. ./.:4:61,167:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,106:.:-0.21:1.000:. ./.:4:128,108:.: 0.22:1.000:. ./.:4:169,56:.: 0.02:1.000:. ./.:4:143,66:.:-0.27:1.000:. ./.:4:174,51:.: 0.02:1.000:. ./.:4:61,96:.:-1.21:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:196,156:.: 2.33:1.000:. ./.:4:133,149:.: 1.06:1.000:. ./.:4:175,52:.: 0.06:1.000:. ./.:4:157,86:.: 0.35:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:204,85:.: 1.18:1.000:. ./.:4:124,137:.: 0.68:1.000:. ./.:4:58,35:.:-2.37:1.000:. ./.:4:136,61:.:-0.49:1.000:. ./.:4:180,86:.: 0.77:1.000:. ./.:4:154,155:.: 1.55:1.000:. ./.:4:171,71:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,146:.: 1.07:1.000:. ./.:4:134,55:.:-0.63:0.998:. ./.:4:141,128:.: 0.82:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:101,102:.:-0.38:1.000:. ./.:4:152,65:.:-0.12:1.000:. ./.:4:131,137:.: 0.80:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:86,107:.:-0.56:1.000:. ./.:4:134,65:.:-0.45:1.000:. ./.:4:109,139:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,131:.: 0.48:1.000:. ./.:4:101,100:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,164:.: 0.29:1.000:. ./.:4:141,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:66,162:.: 0.08:1.000:. ./.:4:122,40:.:-1.12:1.000:. ./.:4:85,89:.:-0.90:1.000:. ./.:4:202,90:.: 1.24:1.000:. ./.:4:127,158:.: 1.11:1.000:. ./.:4:146,136:.: 1.06:1.000:. ./.:4:147,114:.: 0.68:1.000:. ./.:4:150,144:.: 1.27:1.000:. ./.:4:218,108:.: 1.85:1.000:. ./.:4:211,80:.: 1.22:1.000:. ./.:4:159,77:.: 0.22:1.000:. ./.:4:176,56:.: 0.15:1.000:. -chr2.1 9767791 chr2.1_009767791 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:41,15:.: 1.28:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.53:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:67,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:30,13:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:31,12:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,14:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,15:.: 1.14:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:57,12:.: 2.22:1.000:. ./.:4:46,11:.: 1.35:0.997:. ./.:4:35,10:.: 0.49:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:54,12:.: 2.00:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:3,2:.:-2.40:1.000:. ./.:4:43,7:.: 0.85:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:34,6:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:34,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.40:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,13:.: 1.21:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:40,8:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:7,3:.:-2.04:1.000:. ./.:4:29,5:.:-0.31:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.39:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,9:.: 0.12:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:21,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.60:1.000:. ./.:4:19,3:.:-1.18:1.000:. ./.:4:37,6:.: 0.34:1.000:. ./.:6:16,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,11:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.16:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.45:0.777:. ./.:4:36,13:.: 0.77:1.000:. ./.:4:45,10:.: 1.21:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:23,19:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,12:.: 0.63:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.05:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:33,8:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,13:.:-0.45:0.846:. ./.:4:29,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,10:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.39:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.82:1.000:. ./.:4:24,15:.: 0.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.67:1.000:. ./.:3:24,0:.:-1.03:0.964:. ./.:4:29,8:.:-0.09:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:30,8:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,11:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.89:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:37,7:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,3:.:-1.75:1.000:. ./.:4:33,11:.: 0.41:1.000:. ./.:4:26,8:.:-0.31:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:23,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:50,10:.: 1.57:1.000:. ./.:4:32,11:.: 0.34:0.999:. ./.:4:39,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.39:0.774:. ./.:4:34,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:36,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,5:.:-0.31:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:26,10:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.53:0.993:. ./.:4:21,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.67:1.000:. ./.:4:26,8:.:-0.31:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:45,14:.: 1.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:15,4:.:-1.39:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:35,14:.: 0.77:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:36,11:.: 0.63:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:37,13:.: 0.85:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,14:.: 1.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.70:0.998:. ./.:4:53,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:32,9:.: 0.20:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:40,17:.: 1.35:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.41:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,7:.: 0.41:1.000:. ./.:4:33,12:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.70:1.000:. ./.:4:38,11:.: 0.77:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:31,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:40,14:.: 1.14:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:46,13:.: 1.50:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.67:1.000:. -chr2.1 10055664 chr2.1_010055664 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:192,70:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:221,1:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,61:0.19: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,66:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,172:0.49: 1.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,162:0.53: 0.82:1.000:0.992 0/0/0/1:4:210,65:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,88:0.28: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:47,14:0.22:-2.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,51:0.34:-1.51:1.000:0.895 0/0/0/1:4:210,75:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,69:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,139:0.52: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:183,76:0.28: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:244,82:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,162:0.50: 1.18:0.997:0.997 0/0/1/1:4:144,144:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,200:0.51: 2.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:201,182:0.47: 2.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:44,69:0.59:-2.05:1.000:0.863 0/0/0/1:4:186,62:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,163:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:218,72:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,24:0.29:-2.58:1.000:0.989 0/0/0/1:4:238,101:0.29: 1.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:141,173:0.54: 1.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:153,123:0.44: 0.48:1.000:0.961 0/0/1/1:4:128,152:0.53: 0.54:1.000:0.992 0/0/0/0:4:343,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,215:0.51: 2.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,61:0.23: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,21:0.27:-2.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,34:0.32:-2.19:1.000:0.959 0/0/1:3:52,13:0.19:-2.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,215:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,141:0.47: 0.81:1.000:0.990 0/0/0/1:4:203,84:0.28: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:179,181:0.49: 1.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,116:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:177,65:0.26:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,171:0.74:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,38:0.21:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,175:0.74:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,48:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,80:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,126:0.53:-0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:215,91:0.29: 0.95:1.000:0.993 0/0/0/1:4:128,37:0.22:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,117:0.55:-0.59:1.000:0.980 0/0/0/1:4:186,69:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,54:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,138:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:174,59:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,69:0.29:-0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:159,51:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:86,106:0.54:-0.82:1.000:0.806 0/0/1/1:4:121,139:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,106:0.47:-0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:137,141:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,137:0.53: 0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:132,126:0.48: 0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,106:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:192,64:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,51:0.22:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,71:0.27: 0.14:0.777:0.998 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,63:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,49:0.26:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,60:0.21: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,66:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,42:0.21:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,47:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,61:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,60:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,50:0.29:-1.24:0.846:0.990 0/0/1/1:4:112,128:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,139:0.54: 0.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:102,118:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,131:0.54:-0.14:1.000:0.987 0/0/0/1:4:159,78:0.32:-0.12:1.000:0.953 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,50:0.28:-1.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,62:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/1:3:109,64:0.36:-1.12:0.964:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:233,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,37:0.21:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,189:0.73: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:245,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,86:0.55:-1.43:1.000:0.983 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,123:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:226,72:0.23: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,54:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,113:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,88:0.45:-0.82:1.000:0.979 0/0/0/1:4:145,62:0.29:-0.59:1.000:0.992 0/0/0/1:4:118,38:0.24:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,60:0.29:-0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,93:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:212,77:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,186:0.48: 2.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,90:0.44:-0.68:1.000:0.965 0/0/1/1:4:87,108:0.54:-0.78:1.000:0.988 0/0/0/0:4:359,0:0.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,54:0.24:-0.37:0.999:1.000 0/0/1/1:4:119,123:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,85:0.48:-1.09:0.774:0.994 0/0/0/1:4:167,70:0.29:-0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:101,122:0.53:-0.34:1.000:0.991 0/0/0/1:4:117,42:0.26:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,120:0.55:-0.53:1.000:0.977 0/0/1/1:4:89,89:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:214,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,95:0.52:-1.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:164,63:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,161:0.55: 0.64:1.000:0.982 0/0/0/1:4:156,63:0.28:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,172:0.72:-0.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,185:0.69: 0.16:0.993:0.977 0/0/1/1:4:99,104:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,49:0.29:-1.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:103,38:0.26:-1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,52:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,72:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,41:0.23:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,60:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,70:0.28:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:288,92:0.23: 2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,116:0.47:-0.06:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,143:0.73:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,83:0.51:-1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,82:0.49:-1.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:152,47:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,67:0.33:-0.76:1.000:0.908 0/0/0/1:4:184,72:0.27: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,91:0.47:-0.88:1.000:0.994 0/0/0/0:4:362,0:0.00: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,151:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,132:0.49: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,71:0.28:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:213,62:0.22: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:226,1:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,87:0.24: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,121:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,35:0.35:-2.30:1.000:0.776 0/0/0/1:4:156,45:0.22:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,72:0.22: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,139:0.46: 0.76:1.000:0.990 0/0/0/1:4:245,81:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:277,73:0.20: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,67:0.29:-0.34:0.998:0.991 0/0/1/1:4:150,151:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:288,1:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,118:0.52:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,68:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:148,143:0.48: 0.71:1.000:0.995 0/0/0/0:4:326,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,126:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:178,80:0.30: 0.20:1.000:0.984 0/0/1/1:4:134,121:0.47: 0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:150,131:0.46: 0.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:110,135:0.54: 0.00:1.000:0.989 0/1/1/1:4:46,186:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,68:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,167:0.68:-0.17:1.000:0.958 0/0/0/1:4:185,57:0.23:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,150:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:311,114:0.26: 2.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,168:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,150:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,136:0.47: 0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:140,168:0.53: 0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:253,92:0.26: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:266,88:0.24: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,43:0.18:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:215,70:0.24: 0.62:1.000:1.000 -chr2.1 10317390 chr2.1_010317390 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:237,312:0.55: 1.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:159,112:0.41:-1.20:1.000:0.855 0/0/1/1:4:141,218:0.58:-0.50:1.000:0.916 0/0/1/1:4:155,109:0.41:-1.25:1.000:0.853 0/0/1/1:4:211,180:0.46:-0.24:1.000:0.985 0/0/1/1:4:169,324:0.62: 0.57:1.000:0.595 0/0/0/1:4:288,113:0.28:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,296:0.60: 0.35:1.000:0.772 0/0/1/1:4:267,300:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:143,40:0.21:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,144:0.57:-1.42:1.000:0.951 0/0/0/1:4:358,139:0.27: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:207,296:0.56: 0.65:1.000:0.958 0/0/1/1:4:359,229:0.38: 1.33:1.000:0.629 0/0/1/1:4:168,215:0.54:-0.30:1.000:0.985 0/0/0/1:4:349,86:0.19: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:356,0:0.00:-0.52:0.997:1.000 0/0/1/1:4:197,234:0.53: 0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:336,395:0.53: 2.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:339,395:0.53: 2.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:146,47:0.24:-1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:222,291:0.55: 0.73:1.000:0.981 0/0/1/1:4:201,227:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:228,235:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,101:0.60:-2.09:1.000:0.782 0/0/0/1:4:239,96:0.28:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:235,122:0.34:-0.51:1.000:0.888 0/0/1/1:4:239,189:0.44: 0.05:1.000:0.962 0/0/0/1:4:287,86:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,238:0.53: 0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:346,269:0.43: 1.55:1.000:0.953 0/0/0/0:4:257,2:0.01:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,1:0.02:-2.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,120:0.40:-0.99:1.000:0.785 0/1/1:3:56,65:0.53:-2.39:1.000:0.845 0/0/1/1:4:314,242:0.43: 1.07:1.000:0.948 0/1/1/1:4:151,325:0.64: 0.44:1.000:0.662 0/0/0/1:4:280,83:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:310,329:0.51: 1.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:231,379:0.59: 1.51:1.000:0.862 0/0/0/1:4:263,99:0.27:-0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:146,338:0.65: 0.50:1.000:0.790 0/0/1/1:4:281,174:0.38: 0.27:1.000:0.539 0/1/1/1:4:78,371:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:424,308:0.42: 2.48:1.000:0.897 0/0/1/1:4:163,148:0.47:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:271,256:0.48: 0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:46,28:0.37:-2.77:1.000:0.515 0/0/0/1:4:193,82:0.29:-1.17:1.000:0.990 0/0/0/1:4:220,118:0.34:-0.66:1.000:0.840 0/0/1/1:4:238,217:0.47: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:251,201:0.44: 0.25:1.000:0.967 0/0/0/0:4:278,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,257:0.55: 0.21:1.000:0.976 0/1/1/1:4:79,386:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:298,124:0.29: 0.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:176,365:0.63: 0.96:1.000:0.583 0/0/1/1:4:212,386:0.61: 1.41:1.000:0.703 0/0/1/1:4:245,295:0.53: 0.95:1.000:0.991 0/0/0/1/1/1:6:168,187:0.52:-0.53:1.000:0.872 0/0/1/1:4:196,246:0.54: 0.17:1.000:0.987 0/0/1/1:4:204,191:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:318,346:0.51: 1.94:1.000:0.996 0/0/0/0:4:367,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:157,418:0.67: 1.23:1.000:0.928 0/0/1/1:4:234,237:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:253,256:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:277,330:0.53: 1.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:159,229:0.57:-0.27:0.777:0.955 0/0/1/1:4:197,134:0.40:-0.72:1.000:0.792 0/0/1/1:4:182,177:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,166:0.53:-0.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:343,81:0.19: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:266,293:0.52: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:207,122:0.37:-0.74:1.000:0.615 0/1/1/1:4:122,253:0.63:-0.37:1.000:0.583 0/0/1/1:4:153,194:0.54:-0.59:1.000:0.986 0/0/1/1:4:155,234:0.58:-0.26:1.000:0.932 0/0/0/1:4:291,107:0.26:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:288,147:0.33: 0.11:1.000:0.908 0/0/1/1:4:199,200:0.50:-0.18:0.846:0.997 0/0/0/1:4:343,151:0.30: 0.58:1.000:0.985 0/0/0/1:4:311,189:0.37: 0.63:1.000:0.521 0/0/1/1:4:200,249:0.54: 0.22:1.000:0.988 0/1/1/1:4:161,328:0.63: 0.54:1.000:0.543 0/0/1/1:4:284,359:0.54: 1.77:1.000:0.987 0/0/0/1:4:222,60:0.21:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,62:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,300:0.55: 0.81:1.000:0.976 0/0/1/1:4:210,137:0.39:-0.59:1.000:0.693 0/0/1:3:150,131:0.46:-1.12:0.964:0.928 0/0/1/1:4:137,160:0.53:-0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:186,356:0.62: 0.96:1.000:0.599 0/0/1/1:4:102,99:0.49:-1.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:417,175:0.29: 1.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:189,162:0.46:-0.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:314,212:0.40: 0.84:1.000:0.776 0/0/1/1:4:208,155:0.42:-0.46:1.000:0.923 0/0/1/1:4:285,252:0.46: 0.92:1.000:0.990 0/0/0/1:4:337,166:0.33: 0.65:1.000:0.939 0/0/1/1:4:341,213:0.38: 1.06:1.000:0.566 0/0/0/1:4:344,90:0.20: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,62:0.21:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,265:0.47: 1.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:223,129:0.36:-0.55:1.000:0.669 0/0/0/0:4:303,1:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,80:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:284,244:0.46: 0.85:1.000:0.986 0/0/0/1:4:290,84:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,267:0.60:-0.03:1.000:0.757 0/0/0/1:4:232,126:0.35:-0.50:1.000:0.818 0/0/1/1:4:215,190:0.46:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:257,320:0.54: 1.24:0.999:0.988 0/0/0/1:4:270,148:0.35:-0.03:1.000:0.800 0/0/0/0:4:214,0:0.00:-1.65:0.774:1.000 0/1/1/1:4:188,505:0.67: 2.17:1.000:0.933 0/0/0/1:4:267,68:0.20:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,69:0.26:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:365,240:0.39: 1.47:1.000:0.713 0/0/0/1:4:294,53:0.15:-0.59:1.000:0.987 0/0/0/1:4:234,65:0.21:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,73:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,128:0.44:-1.08:1.000:0.972 0/0/1/1:4:135,215:0.58:-0.57:1.000:0.892 0/0/0/1:4:256,128:0.33:-0.30:1.000:0.927 0/0/0/1:4:368,221:0.37: 1.34:1.000:0.558 0/0/0/1:4:363,69:0.16: 0.09:0.993:0.993 0/0/1/1:4:227,154:0.40:-0.32:1.000:0.787 0/0/1/1:4:164,296:0.61: 0.31:1.000:0.720 0/1/1/1:4:141,369:0.67: 0.71:1.000:0.917 0/0/1/1:4:267,186:0.41: 0.25:1.000:0.837 0/0/0/1:4:262,64:0.19:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,68:0.26:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,235:0.59:-0.32:1.000:0.882 0/0/1/1:4:184,115:0.38:-0.97:1.000:0.567 0/0/0/1:4:422,179:0.29: 1.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:240,281:0.53: 0.80:1.000:0.993 0/0/0/1:4:261,134:0.33:-0.21:1.000:0.901 0/0/1/1:4:315,194:0.38: 0.70:1.000:0.521 0/1/1/1:4:170,365:0.64: 0.91:1.000:0.657 0/1/1/1:4:174,407:0.65: 1.27:1.000:0.805 0/0/1/1:4:177,175:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:148,361:0.66: 0.70:1.000:0.857 0/0/0/1:4:235,106:0.31:-0.64:1.000:0.979 0/0/1/1:4:200,145:0.42:-0.61:1.000:0.895 0/1/1/1:4:205,433:0.63: 1.73:1.000:0.623 0/0/0/1:4:319,147:0.31: 0.36:1.000:0.973 0/0/1/1:4:138,130:0.48:-1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:326,216:0.39: 0.96:1.000:0.732 0/0/0/1:4:233,116:0.33:-0.58:1.000:0.931 0/1/1/1:4:186,467:0.66: 1.85:1.000:0.886 0/0/0/1:4:271,145:0.34:-0.04:1.000:0.844 0/0/1/1:4:131,123:0.48:-1.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:170,99:0.36:-1.21:1.000:0.650 0/0/1/1:4:317,224:0.41: 0.96:1.000:0.860 0/0/0/1:4:283,97:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:337,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,353:0.59: 1.19:1.000:0.871 0/0/0/1:4:281,136:0.32:-0.03:0.998:0.951 0/0/1/1:4:272,335:0.54: 1.48:1.000:0.989 0/0/1/1:4:155,147:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,131:0.34:-0.33:1.000:0.870 0/0/1/1:4:233,256:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,117:0.50:-1.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:238,84:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:322,152:0.32: 0.42:1.000:0.963 0/0/0/1:4:306,74:0.19:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,214:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:268,236:0.46: 0.66:1.000:0.990 0/0/1/1:4:281,177:0.38: 0.29:1.000:0.591 0/0/1/1:4:188,117:0.38:-0.93:1.000:0.554 0/0/1/1:4:259,208:0.44: 0.36:1.000:0.968 0/0/0/0:4:274,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,149:0.54:-1.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:194,325:0.59: 0.78:1.000:0.837 0/0/1/1:4:156,285:0.61: 0.16:1.000:0.696 0/0/1/1:4:197,232:0.53: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:247,301:0.53: 1.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:238,142:0.37:-0.33:1.000:0.578 0/0/0/0:4:383,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:271,284:0.51: 1.07:1.000:0.997 0/0/0/0:4:411,1:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,295:0.59: 0.44:1.000:0.875 0/0/1/1:4:217,139:0.39:-0.52:1.000:0.641 -chr2.1 10373459 chr2.1_010373459 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:200,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:167,69:.: 1.19:1.000:. ./.:4:185,62:.: 1.43:1.000:. ./.:4:96,45:.:-0.86:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,63:.: 0.67:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:149,56:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:161,45:.: 0.54:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.06:0.997:. ./.:4:243,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:24,12:.:-3.14:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:158,53:.: 0.65:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:114,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:138,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:159,66:.: 0.95:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:179,75:.: 1.58:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:13,10:.:-3.42:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.40:1.000:. ./.:3:20,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:163,53:.: 0.76:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:146,56:.: 0.46:1.000:. ./.:4:122,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:174,58:.: 1.11:1.000:. ./.:4:130,43:.:-0.17:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:163,62:.: 0.95:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:136,45:.: 0.00:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:131,51:.: 0.02:1.000:. ./.:4:145,49:.: 0.28:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.13:1.000:. ./.:6:108,37:.:-0.78:1.000:. ./.:4:140,46:.: 0.11:1.000:. ./.:4:169,57:.: 0.98:1.000:. ./.:4:137,60:.: 0.35:1.000:. ./.:4:104,41:.:-0.78:1.000:. ./.:4:152,48:.: 0.41:1.000:. ./.:4:142,49:.: 0.22:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.54:0.777:. ./.:4:156,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:168,54:.: 0.89:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:126,42:.:-0.28:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,47:.:-0.47:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:136,49:.: 0.09:1.000:. ./.:4:157,54:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,33:.:-0.58:0.846:. ./.:4:141,53:.: 0.28:1.000:. ./.:4:145,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:149,44:.: 0.26:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.22:1.000:. ./.:3:117,0:.:-1.38:0.964:. ./.:4:148,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:120,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:152,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:124,65:.: 0.18:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:153,56:.: 0.61:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:122,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:73,31:.:-1.66:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:174,68:.: 1.32:1.000:. ./.:4:168,54:.: 0.89:1.000:. ./.:4:144,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:255,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:148,50:.: 0.37:1.000:. ./.:4:98,29:.:-1.17:0.774:. ./.:4:186,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:123,49:.:-0.19:1.000:. ./.:4:115,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:149,48:.: 0.35:1.000:. ./.:4:107,44:.:-0.65:1.000:. ./.:4:117,45:.:-0.41:1.000:. ./.:4:134,34:.:-0.28:0.993:. ./.:4:79,91:.:-0.24:1.000:. ./.:4:114,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:141,44:.: 0.09:1.000:. ./.:4:113,34:.:-0.73:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:91,51:.:-0.84:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:90,45:.:-0.99:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:154,55:.: 0.61:1.000:. ./.:4:154,61:.: 0.74:1.000:. ./.:4:145,64:.: 0.61:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:134,69:.: 0.48:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:229,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:146,37:.: 0.05:0.998:. ./.:4:163,58:.: 0.87:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:109,47:.:-0.54:1.000:. ./.:4:125,53:.:-0.06:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:148,48:.: 0.33:1.000:. ./.:4:138,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:138,59:.: 0.35:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:117,45:.:-0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:132,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:175,48:.: 0.91:1.000:. ./.:4:189,74:.: 1.78:1.000:. ./.:4:127,46:.:-0.17:1.000:. ./.:4:150,50:.: 0.41:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:131,42:.:-0.17:1.000:. ./.:4:145,60:.: 0.52:1.000:. -chr2.1 10623720 chr2.1_010623720 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:71,138:.: 0.46:1.000:. ./.:4:102,96:.: 0.24:1.000:. ./.:4:119,93:.: 0.52:1.000:. ./.:4:53,143:.: 0.20:1.000:. ./.:4:75,177:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.89:1.000:. ./.:4:76,72:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.38:1.000:. ./.:4:120,96:.: 0.59:1.000:. ./.:4:17,31:.:-2.68:1.000:. ./.:4:18,33:.:-2.62:1.000:. ./.:4:118,78:.: 0.20:1.000:. ./.:4:82,141:.: 0.73:1.000:. ./.:4:70,145:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,85:.: 0.03:1.000:. ./.:4:157,126:.: 1.90:1.000:. ./.:4:61,157:.: 0.63:0.997:. ./.:4:79,157:.: 0.98:1.000:. ./.:4:73,164:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.19:1.000:. ./.:4:8,41:.:-2.66:1.000:. ./.:4:126,98:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.09:1.000:. ./.:4:126,98:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,35:.:-2.93:1.000:. ./.:4:92,196:.: 2.00:1.000:. ./.:4:61,148:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,153:.: 0.94:1.000:. ./.:4:141,105:.: 1.18:1.000:. ./.:4:140,95:.: 0.96:1.000:. ./.:4:105,106:.: 0.50:1.000:. ./.:4:18,4:.:-3.18:1.000:. ./.:4:48,25:.:-2.19:1.000:. ./.:3:0,15:.:-3.32:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.17:1.000:. ./.:4:132,113:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,134:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.42:1.000:. ./.:4:50,137:.: 0.03:1.000:. ./.:4:79,152:.: 0.89:1.000:. ./.:4:105,120:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.34:1.000:. ./.:4:116,112:.: 0.83:1.000:. ./.:4:44,101:.:-0.79:1.000:. ./.:4:180,97:.: 1.78:1.000:. ./.:4:58,140:.: 0.24:1.000:. ./.:4:75,137:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.03:1.000:. ./.:4:64,146:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,151:.: 0.32:1.000:. ./.:6:0,110:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.59:1.000:. ./.:4:67,160:.: 0.81:1.000:. ./.:4:63,117:.:-0.11:1.000:. ./.:4:51,119:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.17:1.000:. ./.:4:69,42:.:-1.45:1.000:. ./.:4:66,109:.:-0.20:1.000:. ./.:4:54,123:.:-0.17:0.777:. ./.:4:114,88:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,86:.:-0.91:1.000:. ./.:4:60,166:.: 0.79:1.000:. ./.:4:63,152:.: 0.57:1.000:. ./.:4:65,115:.:-0.11:1.000:. ./.:4:103,72:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,139:.: 0.26:1.000:. ./.:4:40,113:.:-0.63:1.000:. ./.:4:56,124:.:-0.11:1.000:. ./.:4:107,100:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.12:0.846:. ./.:4:124,85:.: 0.46:1.000:. ./.:4:51,123:.:-0.22:1.000:. ./.:4:48,137:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.48:1.000:. ./.:4:57,127:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,100:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,104:.:-0.91:1.000:. ./.:4:85,57:.:-0.85:1.000:. ./.:4:112,99:.: 0.50:1.000:. ./.:3:50,56:.:-1.55:0.964:. ./.:4:64,116:.:-0.11:1.000:. ./.:4:132,125:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.71:1.000:. ./.:4:72,122:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,120:.:-0.30:1.000:. ./.:4:44,86:.:-1.08:1.000:. ./.:4:94,54:.:-0.73:1.000:. ./.:4:61,108:.:-0.32:1.000:. ./.:4:144,102:.: 1.18:1.000:. ./.:4:71,53:.:-1.20:1.000:. ./.:4:65,107:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.72:1.000:. ./.:4:103,88:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,58:.:-0.85:1.000:. ./.:4:59,116:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.38:1.000:. ./.:4:132,85:.: 0.61:1.000:. ./.:4:71,164:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.20:1.000:. ./.:4:46,115:.:-0.48:1.000:. ./.:4:93,159:.: 1.30:1.000:. ./.:4:39,94:.:-1.02:0.999:. ./.:4:59,125:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,90:.:-1.14:0.774:. ./.:4:63,142:.: 0.38:1.000:. ./.:4:57,112:.:-0.32:1.000:. ./.:4:88,72:.:-0.50:1.000:. ./.:4:126,81:.: 0.42:1.000:. ./.:4:82,75:.:-0.55:1.000:. ./.:4:125,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,111:.:-0.57:1.000:. ./.:4:54,128:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,129:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.94:1.000:. ./.:4:59,129:.: 0.05:0.993:. ./.:4:49,89:.:-0.92:1.000:. ./.:4:43,93:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.76:1.000:. ./.:4:103,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:131,85:.: 0.59:1.000:. ./.:4:35,71:.:-1.55:1.000:. ./.:4:52,123:.:-0.20:1.000:. ./.:4:100,81:.:-0.09:1.000:. ./.:4:189,128:.: 2.56:1.000:. ./.:4:49,130:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.14:1.000:. ./.:4:48,84:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.20:1.000:. ./.:4:52,113:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.50:1.000:. ./.:4:52,139:.: 0.11:1.000:. ./.:4:86,55:.:-0.87:1.000:. ./.:4:164,122:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,263:.: 1.51:1.000:. ./.:4:56,138:.: 0.17:1.000:. ./.:4:60,124:.:-0.03:1.000:. ./.:4:151,134:.: 1.94:1.000:. ./.:4:137,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:69,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,143:.: 0.87:1.000:. ./.:4:16,9:.:-3.13:1.000:. ./.:4:86,59:.:-0.79:1.000:. ./.:4:157,96:.: 1.31:1.000:. ./.:4:86,151:.: 1.00:1.000:. ./.:4:152,112:.: 1.53:1.000:. ./.:4:72,146:.: 0.63:1.000:. ./.:4:112,89:.: 0.30:0.998:. ./.:4:74,158:.: 0.91:1.000:. ./.:4:63,146:.: 0.46:1.000:. ./.:4:125,92:.: 0.61:1.000:. ./.:4:136,93:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.24:1.000:. ./.:4:134,110:.: 1.14:1.000:. ./.:4:143,129:.: 1.68:1.000:. ./.:4:68,126:.: 0.17:1.000:. ./.:4:124,94:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.69:1.000:. ./.:4:54,150:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.48:1.000:. ./.:4:121,76:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.85:1.000:. ./.:4:44,105:.:-0.71:1.000:. ./.:4:44,116:.:-0.50:1.000:. ./.:4:73,181:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.07:1.000:. ./.:4:64,154:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,146:.:-0.40:1.000:. ./.:4:63,139:.: 0.32:1.000:. ./.:4:143,122:.: 1.55:1.000:. ./.:4:170,123:.: 2.09:1.000:. ./.:4:127,85:.: 0.52:1.000:. ./.:4:65,127:.: 0.13:1.000:. -chr2.1 10674301 chr2.1_010674301 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,50:.:-1.01:1.000:. ./.:4:15,59:.:-0.51:1.000:. ./.:4:31,42:.:-0.56:1.000:. ./.:4:37,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:34,60:.: 0.31:1.000:. ./.:4:37,43:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.51:1.000:. ./.:4:41,42:.:-0.14:1.000:. ./.:4:19,64:.:-0.14:1.000:. ./.:4:17,41:.:-1.17:1.000:. ./.:4:24,18:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,56:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.93:1.000:. ./.:4:16,64:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.55:0.997:. ./.:4:43,45:.: 0.06:1.000:. ./.:4:15,85:.: 0.55:1.000:. ./.:4:20,57:.:-0.39:1.000:. ./.:4:19,43:.:-1.01:1.000:. ./.:4:16,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:34,38:.:-0.60:1.000:. ./.:4:10,68:.:-0.35:1.000:. ./.:4:10,9:.:-2.77:1.000:. ./.:4:20,97:.: 1.25:1.000:. ./.:4:22,34:.:-1.25:1.000:. ./.:4:13,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,64:.:-0.35:1.000:. ./.:4:56,55:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,124:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,17:.:-2.86:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.84:1.000:. ./.:3:8,19:.:-2.45:1.000:. ./.:4:22,50:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,43:.:-0.43:1.000:. ./.:4:18,54:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,62:.:-0.06:1.000:. ./.:4:39,59:.: 0.47:1.000:. ./.:4:25,70:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,38:.:-0.02:1.000:. ./.:4:21,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:51,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.42:1.000:. ./.:4:48,54:.: 0.64:1.000:. ./.:4:28,56:.:-0.10:1.000:. ./.:4:3,12:.:-2.94:1.000:. ./.:4:21,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.93:1.000:. ./.:4:28,66:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,123:.: 1.50:1.000:. ./.:4:51,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:45,12:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.55:1.000:. ./.:4:42,39:.:-0.23:1.000:. ./.:4:64,48:.: 1.05:1.000:. ./.:4:17,87:.: 0.72:1.000:. ./.:6:48,67:.: 1.17:1.000:. ./.:4:44,68:.: 1.05:1.000:. ./.:4:18,63:.:-0.23:1.000:. ./.:4:24,95:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,62:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,81:.: 0.88:1.000:. ./.:4:23,79:.: 0.64:1.000:. ./.:4:62,69:.: 1.83:0.777:. ./.:4:14,55:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:32,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.91:1.000:. ./.:4:12,46:.:-1.17:1.000:. ./.:4:31,97:.: 1.70:1.000:. ./.:4:29,105:.: 1.95:1.000:. ./.:4:53,38:.: 0.18:1.000:. ./.:4:54,47:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,80:.: 1.29:1.000:. ./.:4:19,91:.: 0.96:1.000:. ./.:4:16,50:.:-0.84:0.846:. ./.:4:0,112:.: 1.05:1.000:. ./.:4:22,108:.: 1.79:1.000:. ./.:4:16,46:.:-1.01:1.000:. ./.:4:71,55:.: 1.62:1.000:. ./.:4:33,80:.: 1.09:1.000:. ./.:4:17,65:.:-0.19:1.000:. ./.:4:17,58:.:-0.47:1.000:. ./.:4:27,81:.: 0.88:1.000:. ./.:4:14,57:.:-0.64:1.000:. ./.:3:25,45:.:-0.68:0.964:. ./.:4:35,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:64,71:.: 1.99:1.000:. ./.:4:30,22:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,146:.: 2.44:1.000:. ./.:4:52,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,114:.: 1.13:1.000:. ./.:4:18,97:.: 1.17:1.000:. ./.:4:25,95:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,126:.: 1.62:1.000:. ./.:4:26,90:.: 1.21:1.000:. ./.:4:26,83:.: 0.92:1.000:. ./.:4:28,102:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.96:1.000:. ./.:4:18,78:.: 0.39:1.000:. ./.:4:10,45:.:-1.30:1.000:. ./.:4:23,75:.: 0.47:1.000:. ./.:4:49,51:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,80:.: 0.88:1.000:. ./.:4:46,36:.:-0.19:1.000:. ./.:4:30,105:.: 1.99:0.999:. ./.:4:17,82:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.84:0.774:. ./.:4:43,76:.: 1.33:1.000:. ./.:4:20,77:.: 0.43:1.000:. ./.:4:22,74:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.14:1.000:. ./.:4:23,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.17:1.000:. ./.:4:52,56:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,45:.:-0.47:1.000:. ./.:4:19,79:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.88:0.993:. ./.:4:17,81:.: 0.47:1.000:. ./.:4:41,49:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,125:.: 1.58:1.000:. ./.:4:11,64:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,57:.:-0.56:1.000:. ./.:4:30,41:.:-0.64:1.000:. ./.:4:11,39:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,67:.:-0.06:1.000:. ./.:4:20,80:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,112:.: 1.05:1.000:. ./.:4:37,59:.: 0.39:1.000:. ./.:4:62,59:.: 1.42:1.000:. ./.:4:43,55:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,34:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.88:1.000:. ./.:4:33,57:.: 0.14:1.000:. ./.:4:34,29:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.56:1.000:. ./.:4:24,71:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,18:.:-2.24:1.000:. ./.:4:11,36:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.02:1.000:. ./.:4:19,55:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,51:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.93:0.998:. ./.:4:26,49:.:-0.47:1.000:. ./.:4:34,23:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,66:.: 0.02:1.000:. ./.:4:18,57:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,28:.:-1.58:1.000:. ./.:4:15,48:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.60:1.000:. ./.:4:16,47:.:-0.97:1.000:. ./.:4:15,44:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.38:1.000:. ./.:4:18,53:.:-0.64:1.000:. ./.:4:14,49:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.72:1.000:. ./.:4:49,65:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,56:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,54:.: 0.55:1.000:. ./.:4:44,43:.: 0.02:1.000:. ./.:4:26,80:.: 0.80:1.000:. ./.:4:12,74:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.43:1.000:. ./.:4:14,67:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.76:1.000:. ./.:4:17,54:.:-0.64:1.000:. ./.:4:12,45:.:-1.21:1.000:. -chr2.1 11003401 chr2.1_011003401 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:27,15:0.28:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,14:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,20:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,20:0.36:-0.53:1.000:0.662 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,18:0.32:-0.53:1.000:0.953 0/0/0/1:4:48,23:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,23:0.32: 0.12:1.000:0.961 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,2:0.05:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,18:0.22: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,14:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,49:0.53: 1.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:33,16:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,25:0.44:-0.43:1.000:0.974 0/0/0/1:4:55,31:0.28: 1.51:0.997:0.995 0/0/0/1:4:50,20:0.22: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,18:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,9:0.55:-2.07:1.000:0.977 0/0/0/1:4:37,18:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,4:0.17:-1.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:86,39:0.24: 3.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,18:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,19:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,29:0.20: 2.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,42:0.58: 0.36:1.000:0.928 0/0/0/1:4:12,5:0.23:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,11:0.30:-1.33:1.000:0.984 0/0/1:3:11,15:0.49:-1.48:1.000:0.700 0/0/0/1:4:48,21:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,27:0.31: 0.71:1.000:0.978 0/0/0/1:4:40,25:0.31: 0.46:1.000:0.979 0/0/1/1:4:41,66:0.53: 2.55:1.000:0.993 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,26:0.29: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:42,20:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.15:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,43:0.65: 0.12:1.000:0.803 0/0/1/1:4:9,16:0.55:-1.53:1.000:0.980 0/0/0/1:4:46,20:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,72:0.44: 4.04:1.000:0.965 0/0/0/1:4:34,23:0.32: 0.07:1.000:0.944 0/0/1/1:4:34,60:0.55: 1.91:1.000:0.982 0/0/1/1:4:29,36:0.47: 0.46:1.000:0.990 0/0/0/1:4:32,23:0.34:-0.03:1.000:0.885 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,30:0.22: 2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,13:0.20:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,23:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,16:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:26,8:0.18:-1.08:1.000:0.971 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,24:0.32: 0.21:1.000:0.953 0/0/1/1:4:47,41:0.38: 1.61:1.000:0.601 0/0/1/1:4:34,45:0.48: 1.16:1.000:0.995 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,30:0.33: 0.86:1.000:0.918 0/0/0/1:4:29,21:0.34:-0.28:1.000:0.874 0/0/0/1:4:23,16:0.33:-0.83:1.000:0.921 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.48:0.777:1.000 0/0/0/1:4:32,14:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,36:0.39: 1.01:1.000:0.689 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,76:0.56: 3.00:1.000:0.958 0/0/1/1:4:17,38:0.60:-0.03:1.000:0.785 0/0/0/1:4:44,26:0.29: 0.71:1.000:0.990 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,33:0.29: 1.66:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,45:0.58: 0.56:1.000:0.908 0/0/1/1:4:16,39:0.62:-0.03:1.000:0.584 0/0/0/1:4:44,16:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,23:0.51:-0.88:0.846:0.996 0/0/0/1:4:17,14:0.37:-1.23:1.000:0.577 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,37:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,7:0.16:-1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,28:0.46:-0.23:1.000:0.988 0/0/1/1:4:20,39:0.57: 0.17:1.000:0.945 0/0/0/1:4:49,24:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/1:3:31,26:0.37: 0.07:0.964:1.000 0/0/1/1:4:16,28:0.55:-0.58:1.000:0.983 0/0/0/1:4:46,28:0.30: 0.91:1.000:0.985 0/0/0/1:4:29,14:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,55:0.60: 1.21:1.000:0.814 0/0/0/1:4:28,16:0.29:-0.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:33,24:0.34: 0.07:1.000:0.868 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.44:-0.48:1.000:0.958 0/0/1/1:4:19,20:0.43:-0.83:1.000:0.938 0/0/1/1:4:31,51:0.53: 1.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:22,13:0.29:-1.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,19:0.43:-0.93:1.000:0.940 0/0/0/1:4:33,20:0.30:-0.13:1.000:0.986 0/0/0/1:4:39,16:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,29:0.36: 0.51:1.000:0.718 0/0/0/1:4:28,15:0.27:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,13:0.18:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,51:0.50: 1.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,25:0.67:-1.13:0.999:0.910 0/0/0/1:4:41,22:0.27: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,25:0.39:-0.13:0.774:0.668 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,27:0.34: 0.41:1.000:0.863 0/0/0/1:4:40,25:0.31: 0.46:1.000:0.979 0/0/0/1:4:39,25:0.31: 0.41:1.000:0.971 0/0/1/1:4:25,35:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,14:0.34:-1.13:1.000:0.848 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,40:0.57: 0.26:1.000:0.957 0/0/0/1:4:33,22:0.32:-0.03:1.000:0.953 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.53:0.993:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.19:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,44:0.59: 0.46:1.000:0.883 0/0/0/1:4:25,16:0.31:-0.73:1.000:0.972 0/0/0/1:4:21,8:0.21:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,11:0.33:-1.43:1.000:0.931 0/0/1/1:4:26,45:0.54: 0.76:1.000:0.985 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,15:0.37:-1.13:1.000:0.540 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,11:0.20:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,17:0.38:-0.93:1.000:0.522 0/0/0/1:4:33,17:0.26:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,24:0.56:-0.93:1.000:0.970 0/0/0/1:4:39,19:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,53:0.44: 2.25:1.000:0.964 0/0/1/1:4:25,44:0.55: 0.66:1.000:0.982 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,11:0.22:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.19:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,10:0.25:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,48:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,15:0.25:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,25:0.43:-0.38:1.000:0.957 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,42:0.75:-0.28:0.998:0.999 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,31:0.49:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,20:0.28: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,17:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,25:0.34: 0.17:1.000:0.851 0/0/0/1:4:55,16:0.17: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,46:0.59: 0.61:1.000:0.885 0/0/1/1:4:30,53:0.55: 1.36:1.000:0.982 0/0/0/1:4:34,14:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,14:0.33:-1.08:1.000:0.915 0/0/0/1:4:35,8:0.14:-0.63:1.000:0.975 0/0/0/1:4:29,16:0.28:-0.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,15:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,16:0.29:-0.58:1.000:0.994 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.18:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,40:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,24:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,32:0.53:-0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:47,14:0.18: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,19:0.23: 0.41:1.000:1.000 -chr2.1 11040841 chr2.1_011040841 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:367,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.11:0.997:. ./.:4:350,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:402,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.04:1.000:. ./.:3:29,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:130,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:218,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.17:0.777:. ./.:4:262,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.10:0.846:. ./.:4:226,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.18:1.000:. ./.:3:158,0:.:-1.07:0.964:. ./.:4:249,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:437,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:237,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:0.774:. ./.:4:200,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.89:0.993:. ./.:4:106,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:444,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:412,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:415,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.43:0.998:. ./.:4:261,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:215,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:408,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:412,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.05:1.000:. -chr2.1 11316362 chr2.1_011316362 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:255,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:210,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:276,80:.: 0.94:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:243,90:.: 0.67:1.000:. ./.:4:281,95:.: 1.17:1.000:. ./.:4:177,92:.:-0.09:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:193,100:.: 0.19:1.000:. ./.:4:284,99:.: 1.26:0.997:. ./.:4:280,78:.: 0.96:1.000:. ./.:4:468,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:297,114:.: 1.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:12,5:.:-3.06:1.000:. ./.:4:341,95:.: 1.88:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:266,88:.: 0.91:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:156,66:.:-0.64:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:20,10:.:-2.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:258,85:.: 0.78:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:271,94:.: 1.04:1.000:. ./.:4:203,63:.:-0.13:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:241,55:.: 0.23:1.000:. ./.:4:230,66:.: 0.23:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:249,77:.: 0.58:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:195,96:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,18:.:-2.38:1.000:. ./.:4:226,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:139,33:.:-1.23:1.000:. ./.:4:194,46:.:-0.43:1.000:. ./.:4:207,94:.: 0.29:1.000:. ./.:4:132,84:.:-0.72:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:255,54:.: 0.38:1.000:. ./.:4:259,85:.: 0.80:1.000:. ./.:4:244,58:.: 0.30:1.000:. ./.:4:222,67:.: 0.15:1.000:. ./.:6:234,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:156,50:.:-0.83:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:279,79:.: 0.96:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:205,90:.: 0.22:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.30:0.777:. ./.:4:220,72:.: 0.18:1.000:. ./.:4:277,96:.: 1.14:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:174,134:.: 0.37:1.000:. ./.:4:167,72:.:-0.44:1.000:. ./.:4:227,76:.: 0.31:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:154,71:.:-0.61:1.000:. ./.:4:189,93:.: 0.06:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:117,126:.:-0.40:0.846:. ./.:4:261,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:172,64:.:-0.48:1.000:. ./.:4:200,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:128,50:.:-1.16:1.000:. ./.:4:142,60:.:-0.88:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.20:1.000:. ./.:3:122,0:.:-1.82:0.964:. ./.:4:132,80:.:-0.76:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:171,64:.:-0.49:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:167,67:.:-0.50:1.000:. ./.:4:204,60:.:-0.15:1.000:. ./.:4:206,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:193,80:.:-0.04:1.000:. ./.:4:111,70:.:-1.13:1.000:. ./.:4:183,97:.: 0.04:1.000:. ./.:4:176,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:251,74:.: 0.57:1.000:. ./.:4:231,55:.: 0.11:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:239,117:.: 0.94:1.000:. ./.:4:150,80:.:-0.55:0.999:. ./.:4:228,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:116,38:.:-1.45:0.774:. ./.:4:338,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,81:.:-0.16:1.000:. ./.:4:197,69:.:-0.13:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:141,68:.:-0.80:1.000:. ./.:4:250,66:.: 0.46:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.36:0.993:. ./.:4:250,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:170,54:.:-0.62:1.000:. ./.:4:119,43:.:-1.35:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,55:.:-0.86:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:221,103:.: 0.56:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:178,69:.:-0.35:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:191,74:.:-0.14:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:187,90:.: 0.00:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:188,92:.: 0.04:1.000:. ./.:4:169,73:.:-0.41:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:255,98:.: 0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:186,71:.:-0.23:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:199,119:.: 0.49:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:85,88:.:-1.22:0.998:. ./.:4:405,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:169,88:.:-0.23:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:305,79:.: 1.27:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:157,113:.:-0.08:1.000:. ./.:4:157,78:.:-0.49:1.000:. ./.:4:228,95:.: 0.55:1.000:. ./.:4:210,93:.: 0.31:1.000:. ./.:4:251,76:.: 0.59:1.000:. ./.:4:214,88:.: 0.30:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:238,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:216,85:.: 0.29:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:468,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:269,80:.: 0.85:1.000:. ./.:4:159,109:.:-0.10:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:216,126:.: 0.77:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:263,82:.: 0.81:1.000:. -chr2.1 11524057 chr2.1_011524057 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:674,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:718,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:543,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:738,69:.: 0.90:1.000:. ./.:4:590,76:.: 0.30:1.000:. ./.:4:658,93:.: 0.66:1.000:. ./.:4:433,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:435,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:62,48:.:-2.10:1.000:. ./.:4:149,39:.:-1.76:1.000:. ./.:4:1074,62:.: 2.32:1.000:. ./.:4:293,48:.:-1.11:1.000:. ./.:4:476,59:.:-0.27:1.000:. ./.:4:453,84:.:-0.26:1.000:. ./.:4:555,62:.: 0.08:1.000:. ./.:4:555,0:.:-0.18:0.997:. ./.:4:487,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:529,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1035,69:.: 2.18:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:347,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:724,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:1015,81:.: 2.15:1.000:. ./.:4:696,72:.: 0.74:1.000:. ./.:4:517,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:678,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:885,54:.: 1.47:1.000:. ./.:4:855,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:655,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:90,33:.:-2.04:1.000:. ./.:4:209,49:.:-1.46:1.000:. ./.:3:60,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:565,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:614,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:736,72:.: 0.91:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:754,60:.: 0.93:1.000:. ./.:4:676,72:.: 0.65:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:956,67:.: 1.83:1.000:. ./.:4:594,75:.: 0.31:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:742,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:587,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:733,68:.: 0.88:1.000:. ./.:4:436,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:566,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:786,97:.: 1.23:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:873,87:.: 1.56:1.000:. ./.:4:499,60:.:-0.17:1.000:. ./.:4:707,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:815,72:.: 1.25:1.000:. ./.:4:705,87:.: 0.84:1.000:. ./.:4:716,83:.: 0.87:1.000:. ./.:6:596,33:.: 0.14:1.000:. ./.:4:806,79:.: 1.24:1.000:. ./.:4:531,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:276,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:638,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:335,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:529,42:.:-0.11:1.000:. ./.:4:653,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:427,2:.:-0.73:0.777:. ./.:4:623,63:.: 0.38:1.000:. ./.:4:730,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:391,33:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1300,77:.: 3.36:1.000:. ./.:4:659,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:660,69:.: 0.57:1.000:. ./.:4:394,79:.:-0.54:1.000:. ./.:4:342,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:572,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:575,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:530,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:819,55:.: 1.19:0.846:. ./.:4:633,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:920,85:.: 1.76:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:770,67:.: 1.03:1.000:. ./.:4:576,61:.: 0.17:1.000:. ./.:4:467,54:.:-0.33:1.000:. ./.:4:452,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:562,68:.: 0.14:1.000:. ./.:4:536,69:.: 0.03:1.000:. ./.:3:543,53:.:-0.01:0.964:. ./.:4:453,63:.:-0.35:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:486,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:315,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:483,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:755,58:.: 0.93:1.000:. ./.:4:632,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:545,74:.: 0.09:1.000:. ./.:4:391,46:.:-0.69:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:557,85:.: 0.19:1.000:. ./.:4:488,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:666,68:.: 0.59:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:523,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:632,83:.: 0.51:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:756,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:682,61:.: 0.63:0.999:. ./.:4:504,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:514,0:.:-0.36:0.774:. ./.:4:618,73:.: 0.40:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:692,72:.: 0.72:1.000:. ./.:4:637,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:734,57:.: 0.83:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:713,70:.: 0.80:1.000:. ./.:4:550,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:529,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:642,0:.: 0.19:0.993:. ./.:4:501,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:638,49:.: 0.39:1.000:. ./.:4:672,67:.: 0.61:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:747,73:.: 0.96:1.000:. ./.:4:670,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1054,80:.: 2.31:1.000:. ./.:4:573,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:516,72:.:-0.04:1.000:. ./.:4:378,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:528,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:847,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:608,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:649,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:362,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1141,88:.: 2.72:1.000:. ./.:4:648,101:.: 0.65:1.000:. ./.:4:752,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:692,69:.: 0.71:1.000:. ./.:4:746,76:.: 0.97:1.000:. ./.:4:299,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:513,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:643,78:.: 0.53:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:410,54:.:-0.57:1.000:. ./.:4:603,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:889,65:.: 1.54:1.000:. ./.:4:457,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:570,0:.:-0.12:0.998:. ./.:4:541,88:.: 0.14:1.000:. ./.:4:327,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:576,62:.: 0.18:1.000:. ./.:4:868,54:.: 1.40:1.000:. ./.:4:607,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:915,76:.: 1.70:1.000:. ./.:4:525,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:600,53:.: 0.24:1.000:. ./.:4:674,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:360,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:672,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:217,74:.:-1.32:1.000:. ./.:4:524,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:689,71:.: 0.70:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:582,61:.: 0.20:1.000:. ./.:4:803,98:.: 1.31:1.000:. ./.:4:517,66:.:-0.06:1.000:. ./.:4:303,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:599,46:.: 0.21:1.000:. ./.:4:876,75:.: 1.52:1.000:. ./.:4:1062,88:.: 2.38:1.000:. ./.:4:750,72:.: 0.97:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:856,81:.: 1.46:1.000:. -chr2.1 12162639 chr2.1_012162639 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:600,304:.: 1.51:1.000:. ./.:4:183,50:.:-1.98:1.000:. ./.:4:383,214:.:-0.09:1.000:. ./.:4:469,201:.: 0.29:1.000:. ./.:4:694,240:.: 1.67:1.000:. ./.:4:707,196:.: 1.51:1.000:. ./.:4:236,176:.:-1.05:1.000:. ./.:4:289,186:.:-0.72:1.000:. ./.:4:493,217:.: 0.50:1.000:. ./.:4:115,70:.:-2.23:1.000:. ./.:4:138,44:.:-2.24:1.000:. ./.:4:388,163:.:-0.32:1.000:. ./.:4:418,141:.:-0.28:1.000:. ./.:4:456,179:.: 0.11:1.000:. ./.:4:400,166:.:-0.25:1.000:. ./.:4:671,321:.: 1.97:1.000:. ./.:4:422,180:.:-0.06:0.997:. ./.:4:422,214:.: 0.12:1.000:. ./.:4:577,216:.: 0.93:1.000:. ./.:4:617,302:.: 1.59:1.000:. ./.:4:106,48:.:-2.39:1.000:. ./.:4:400,201:.:-0.06:1.000:. ./.:4:708,211:.: 1.59:1.000:. ./.:4:372,198:.:-0.23:1.000:. ./.:4:67,29:.:-2.69:1.000:. ./.:4:479,163:.: 0.15:1.000:. ./.:4:507,310:.: 1.06:1.000:. ./.:4:461,213:.: 0.32:1.000:. ./.:4:498,268:.: 0.79:1.000:. ./.:4:661,250:.: 1.55:1.000:. ./.:4:323,104:.:-0.97:1.000:. ./.:4:395,166:.:-0.27:1.000:. ./.:4:44,14:.:-2.89:1.000:. ./.:4:180,73:.:-1.87:1.000:. ./.:3:42,17:.:-2.88:1.000:. ./.:4:466,199:.: 0.27:1.000:. ./.:4:405,195:.:-0.07:1.000:. ./.:4:424,208:.: 0.10:1.000:. ./.:4:421,259:.: 0.35:1.000:. ./.:4:552,228:.: 0.87:1.000:. ./.:4:556,274:.: 1.13:1.000:. ./.:4:575,221:.: 0.95:1.000:. ./.:4:528,324:.: 1.24:1.000:. ./.:4:350,248:.:-0.08:1.000:. ./.:4:444,259:.: 0.47:1.000:. ./.:4:381,136:.:-0.50:1.000:. ./.:4:559,279:.: 1.17:1.000:. ./.:4:128,50:.:-2.26:1.000:. ./.:4:357,239:.:-0.09:1.000:. ./.:4:204,79:.:-1.72:1.000:. ./.:4:213,195:.:-1.07:1.000:. ./.:4:421,150:.:-0.22:1.000:. ./.:4:277,208:.:-0.67:1.000:. ./.:4:626,325:.: 1.76:1.000:. ./.:4:555,268:.: 1.09:1.000:. ./.:4:296,227:.:-0.47:1.000:. ./.:4:549,258:.: 1.01:1.000:. ./.:4:494,171:.: 0.27:1.000:. ./.:4:449,167:.: 0.01:1.000:. ./.:6:375,201:.:-0.19:1.000:. ./.:4:496,255:.: 0.72:1.000:. ./.:4:375,129:.:-0.57:1.000:. ./.:4:327,205:.:-0.42:1.000:. ./.:4:408,150:.:-0.29:1.000:. ./.:4:443,214:.: 0.23:1.000:. ./.:4:530,160:.: 0.40:1.000:. ./.:4:248,96:.:-1.40:1.000:. ./.:4:374,176:.:-0.33:1.000:. ./.:4:450,208:.: 0.23:0.777:. ./.:4:392,277:.: 0.29:1.000:. ./.:4:454,193:.: 0.17:1.000:. ./.:4:150,131:.:-1.73:1.000:. ./.:4:297,167:.:-0.78:1.000:. ./.:4:509,267:.: 0.85:1.000:. ./.:4:368,109:.:-0.71:1.000:. ./.:4:415,144:.:-0.28:1.000:. ./.:4:451,152:.:-0.05:1.000:. ./.:4:492,267:.: 0.76:1.000:. ./.:4:503,287:.: 0.92:1.000:. ./.:4:542,308:.: 1.23:1.000:. ./.:4:240,159:.:-1.11:0.846:. ./.:4:263,227:.:-0.64:1.000:. ./.:4:531,286:.: 1.06:1.000:. ./.:4:426,149:.:-0.20:1.000:. ./.:4:429,201:.: 0.09:1.000:. ./.:4:431,366:.: 0.95:1.000:. ./.:4:255,150:.:-1.08:1.000:. ./.:4:439,203:.: 0.15:1.000:. ./.:4:549,252:.: 0.98:1.000:. ./.:4:554,197:.: 0.72:1.000:. ./.:3:285,165:.:-0.85:0.964:. ./.:4:176,145:.:-1.52:1.000:. ./.:4:527,272:.: 0.97:1.000:. ./.:4:354,178:.:-0.42:1.000:. ./.:4:334,229:.:-0.26:1.000:. ./.:4:344,160:.:-0.57:1.000:. ./.:4:279,154:.:-0.94:1.000:. ./.:4:304,227:.:-0.43:1.000:. ./.:4:514,316:.: 1.13:1.000:. ./.:4:451,175:.: 0.07:1.000:. ./.:4:330,151:.:-0.69:1.000:. ./.:4:626,237:.: 1.30:1.000:. ./.:4:227,192:.:-1.01:1.000:. ./.:4:511,267:.: 0.86:1.000:. ./.:4:329,169:.:-0.60:1.000:. ./.:4:408,220:.: 0.08:1.000:. ./.:4:339,207:.:-0.35:1.000:. ./.:4:509,248:.: 0.75:1.000:. ./.:4:501,160:.: 0.25:1.000:. ./.:4:338,154:.:-0.63:1.000:. ./.:4:404,158:.:-0.27:1.000:. ./.:4:507,353:.: 1.28:1.000:. ./.:4:377,244:.: 0.04:0.999:. ./.:4:607,200:.: 1.01:1.000:. ./.:4:372,171:.:-0.37:0.774:. ./.:4:491,267:.: 0.75:1.000:. ./.:4:290,113:.:-1.09:1.000:. ./.:4:352,149:.:-0.58:1.000:. ./.:4:437,113:.:-0.33:1.000:. ./.:4:221,130:.:-1.36:1.000:. ./.:4:503,300:.: 0.99:1.000:. ./.:4:320,76:.:-1.13:1.000:. ./.:4:405,254:.: 0.24:1.000:. ./.:4:532,271:.: 0.99:1.000:. ./.:4:380,288:.: 0.28:1.000:. ./.:4:565,290:.: 1.26:1.000:. ./.:4:527,243:.: 0.81:0.993:. ./.:4:329,134:.:-0.78:1.000:. ./.:4:234,107:.:-1.42:1.000:. ./.:4:291,89:.:-1.21:1.000:. ./.:4:355,177:.:-0.42:1.000:. ./.:4:394,147:.:-0.38:1.000:. ./.:4:299,76:.:-1.24:1.000:. ./.:4:465,276:.: 0.66:1.000:. ./.:4:409,280:.: 0.39:1.000:. ./.:4:435,369:.: 0.99:1.000:. ./.:4:516,213:.: 0.60:1.000:. ./.:4:363,239:.:-0.06:1.000:. ./.:4:308,222:.:-0.43:1.000:. ./.:4:318,129:.:-0.86:1.000:. ./.:4:432,355:.: 0.90:1.000:. ./.:4:338,326:.: 0.26:1.000:. ./.:4:368,133:.:-0.58:1.000:. ./.:4:298,186:.:-0.67:1.000:. ./.:4:575,228:.: 0.99:1.000:. ./.:4:560,138:.: 0.44:1.000:. ./.:4:494,228:.: 0.56:1.000:. ./.:4:547,163:.: 0.50:1.000:. ./.:4:602,304:.: 1.52:1.000:. ./.:4:262,246:.:-0.55:1.000:. ./.:4:603,335:.: 1.69:1.000:. ./.:4:388,199:.:-0.14:1.000:. ./.:4:88,50:.:-2.47:1.000:. ./.:4:353,81:.:-0.93:1.000:. ./.:4:571,363:.: 1.67:1.000:. ./.:4:348,320:.: 0.28:1.000:. ./.:4:535,287:.: 1.08:1.000:. ./.:4:313,169:.:-0.68:1.000:. ./.:4:380,120:.:-0.59:0.998:. ./.:4:553,326:.: 1.38:1.000:. ./.:4:298,135:.:-0.94:1.000:. ./.:4:381,199:.:-0.17:1.000:. ./.:4:397,250:.: 0.17:1.000:. ./.:4:483,230:.: 0.52:1.000:. ./.:4:353,254:.:-0.03:1.000:. ./.:4:482,258:.: 0.66:1.000:. ./.:4:345,164:.:-0.54:1.000:. ./.:4:353,230:.:-0.16:1.000:. ./.:4:360,338:.: 0.44:1.000:. ./.:4:386,99:.:-0.67:1.000:. ./.:4:420,223:.: 0.15:1.000:. ./.:4:237,122:.:-1.32:1.000:. ./.:4:272,169:.:-0.90:1.000:. ./.:4:457,191:.: 0.18:1.000:. ./.:4:251,150:.:-1.10:1.000:. ./.:4:474,206:.: 0.35:1.000:. ./.:4:542,208:.: 0.71:1.000:. ./.:4:623,261:.: 1.41:1.000:. ./.:4:620,279:.: 1.48:1.000:. ./.:4:460,184:.: 0.16:1.000:. ./.:4:418,318:.: 0.64:1.000:. ./.:4:555,255:.: 1.02:1.000:. ./.:4:618,364:.: 1.92:1.000:. ./.:4:496,165:.: 0.25:1.000:. ./.:4:382,232:.: 0.00:1.000:. -chr2.1 12389610 chr2.1_012389610 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:97,101:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:122,41:0.27:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,116:0.56: 0.24:1.000:0.964 0/1/1/1:4:56,168:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,167:0.71: 0.88:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,267:1.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,95:0.58:-0.61:1.000:0.916 0/1/1/1:4:50,170:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,103:0.52: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,22:0.53:-3.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,46:0.81:-2.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,58:0.35:-0.36:1.000:0.810 0/0/1/1:4:91,98:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,127:0.54: 0.82:1.000:0.988 0/0/1/1:4:87,120:0.56: 0.38:1.000:0.965 0/0/0/1:4:150,65:0.32: 0.55:1.000:0.961 0/0/1/1:4:119,127:0.50: 1.19:0.997:0.997 0/0/1/1:4:150,133:0.46: 1.96:1.000:0.987 0/1/1/1:4:81,231:0.72: 2.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,208:0.75: 1.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,41:0.68:-2.68:1.000:0.947 0/0/1/1:4:98,110:0.51: 0.40:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,239:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,127:0.58: 0.51:1.000:0.921 0/1/1/1:4:4,21:0.83:-3.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:98,119:0.53: 0.59:1.000:0.992 0/1/1/1:4:40,177:0.80: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,175:0.81: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,189:0.75: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,111:0.48: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,107:0.47: 0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:123,56:0.33:-0.20:1.000:0.937 0/1/1/1:4:13,29:0.67:-3.03:1.000:0.932 0/0/0/1:4:43,8:0.19:-2.84:1.000:0.999 0/1/1:3:5,9:0.63:-3.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,179:0.75: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,109:0.48: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,160:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,124:0.56: 0.51:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,256:1.00: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,117:0.77:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,147:0.75: 0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,224:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,161:0.99:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,149:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,152:0.82:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,94:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,76:0.30: 1.58:1.000:0.982 0/1/1/1:4:27,111:0.79:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,64:0.31: 0.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:67,72:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,59:0.29: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:129,66:0.35: 0.14:1.000:0.815 0/1/1/1:4:45,163:0.77: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,189:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,120:0.53: 0.65:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,134:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,168:0.82: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,68:0.50:-1.19:1.000:0.997 0/1/1/1/1/1:6:15,163:0.91:-0.22:1.000:0.801 1/1/1/1:4:0,179:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,149:0.74: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,173:0.74: 0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,93:0.56:-0.55:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,172:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,180:0.78: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,84:0.58:-0.98:1.000:0.923 0/0/1/1:4:91,91:0.48:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,143:0.77:-0.11:0.777:1.000 0/0/0/1:4:114,43:0.29:-0.65:1.000:0.990 0/1/1/1:4:57,168:0.73: 0.76:1.000:0.998 0/1/1/1:4:49,143:0.73: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,50:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,108:0.45: 1.03:1.000:0.974 0/0/1/1:4:83,86:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,143:0.71: 0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:51,137:0.71:-0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,91:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,175:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,95:0.55:-0.46:1.000:0.975 0/0/1/1:4:67,59:0.46:-1.29:0.846:0.986 0/0/1/1:4:89,112:0.54: 0.26:1.000:0.988 0/1/1/1:4:58,174:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,128:0.73:-0.36:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,96:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:80,86:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,71:0.51:-1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,57:0.41:-1.02:1.000:0.852 0/0/1/1:4:90,95:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/1/1:3:37,125:0.75:-0.55:0.964:1.000 0/0/1/1:4:86,95:0.51:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,107:0.45: 0.90:1.000:0.981 0/1/1/1:4:36,126:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,214:0.81: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,96:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,72:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:108,39:0.29:-0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,175:0.76: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,61:0.29: 0.80:1.000:0.993 0/0/0/1:4:109,55:0.34:-0.51:1.000:0.836 0/0/1/1:4:81,121:0.58: 0.28:1.000:0.910 0/1/1/1:4:24,79:0.75:-1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,97:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,85:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:94,98:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,125:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,106:0.53: 0.11:1.000:0.993 0/1/1/1:4:49,156:0.74: 0.34:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,181:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,152:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,128:0.48: 1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,91:0.53:-0.49:0.999:0.991 0/1/1/1:4:49,177:0.77: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,73:0.52:-1.09:0.774:0.995 0/1/1/1:4:48,176:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,144:0.71: 0.20:1.000:0.992 0/0/1/1:4:78,80:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,98:0.55:-0.34:1.000:0.978 0/0/1/1:4:80,98:0.53:-0.22:1.000:0.991 0/0/0/1:4:133,43:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,79:0.57:-1.11:1.000:0.954 0/1/1/1:4:55,171:0.74: 0.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,204:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,78:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,149:0.78:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,136:0.78:-0.36:0.993:1.000 0/1/1/1:4:33,109:0.75:-0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,121:0.82:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,82:0.76:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,36:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,194:0.77: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,70:0.56:-1.40:1.000:0.967 0/1/1/1:4:42,161:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,92:0.52:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:191,81:0.31: 1.73:1.000:0.969 0/1/1/1:4:46,149:0.75: 0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,93:0.58:-0.69:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,148:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,145:0.73: 0.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,130:0.77:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,68:0.54:-1.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:124,140:0.51: 1.56:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,253:1.00: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,131:0.63: 0.28:1.000:0.574 0/1/1/1:4:50,132:0.71:-0.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:164,85:0.35: 1.25:1.000:0.794 0/0/0/1:4:147,53:0.29: 0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,172:0.74: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,110:0.53: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:15,19:0.54:-3.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,83:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:173,54:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,161:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,54:0.28: 0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,188:0.74: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,46:0.30:-0.53:0.998:0.985 0/1/1/1:4:66,190:0.73: 1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,107:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,91:0.53:-0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,90:0.52:-0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,164:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,116:0.47: 1.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:158,71:0.32: 0.84:1.000:0.945 0/0/1/1:4:74,105:0.57:-0.20:1.000:0.950 0/0/0/1:4:135,49:0.29:-0.09:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,148:0.77:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,151:0.71: 0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:58,90:0.59:-0.84:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,172:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,95:0.48: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,124:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,130:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,113:0.72:-0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,187:0.77: 1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,225:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,189:0.71: 1.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,121:0.68:-0.30:1.000:0.948 0/0/1/1:4:78,117:0.58: 0.14:1.000:0.906 0/0/1/1:4:122,145:0.52: 1.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:179,63:0.28: 1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,106:0.55:-0.07:1.000:0.975 0/0/1/1:4:94,113:0.53: 0.38:1.000:0.993 -chr2.1 12736370 chr2.1_012736370 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,82:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.64:1.000:. ./.:4:34,86:.: 0.64:1.000:. ./.:4:39,110:.: 1.76:1.000:. ./.:4:19,78:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.47:1.000:. ./.:4:37,99:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,55:.:-1.85:1.000:. ./.:4:3,73:.:-1.04:1.000:. ./.:4:20,85:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.05:1.000:. ./.:4:23,80:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.87:1.000:. ./.:4:2,118:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.12:0.997:. ./.:4:32,63:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,159:.: 2.18:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.41:1.000:. ./.:4:13,37:.:-2.04:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,119:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,39:.:-2.46:1.000:. ./.:4:1,100:.:-0.09:1.000:. ./.:4:33,98:.: 1.07:1.000:. ./.:4:24,54:.:-0.97:1.000:. ./.:4:23,96:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,152:.: 1.87:1.000:. ./.:4:32,129:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.62:1.000:. ./.:4:11,36:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,57:.:-1.77:1.000:. ./.:3:0,27:.:-2.92:1.000:. ./.:4:28,73:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.57:1.000:. ./.:4:30,62:.:-0.43:1.000:. ./.:4:43,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:25,100:.: 0.84:1.000:. ./.:4:39,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.39:1.000:. ./.:4:36,84:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.37:1.000:. ./.:4:35,76:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,134:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,58:.:-1.74:1.000:. ./.:4:0,77:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.89:1.000:. ./.:4:29,94:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,104:.: 0.07:1.000:. ./.:6:25,75:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,95:.: 0.72:1.000:. ./.:4:27,95:.: 0.72:1.000:. ./.:4:30,83:.: 0.37:1.000:. ./.:4:25,53:.:-0.97:1.000:. ./.:4:25,89:.: 0.41:1.000:. ./.:4:30,50:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.07:0.777:. ./.:4:0,76:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.70:1.000:. ./.:4:28,37:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,60:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,106:.: 0.14:1.000:. ./.:4:18,75:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.51:1.000:. ./.:4:36,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:28,101:.: 0.99:1.000:. ./.:4:24,20:.:-2.27:0.846:. ./.:4:23,83:.: 0.11:1.000:. ./.:4:31,113:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.37:1.000:. ./.:4:27,98:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.11:1.000:. ./.:3:0,75:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,57:.:-1.77:1.000:. ./.:4:30,114:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.85:1.000:. ./.:4:25,85:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,73:.:-1.16:1.000:. ./.:4:31,59:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.58:1.000:. ./.:4:34,95:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,66:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,130:.: 1.03:1.000:. ./.:4:25,82:.: 0.14:1.000:. ./.:4:35,96:.: 1.07:1.000:. ./.:4:22,80:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.58:0.999:. ./.:4:23,105:.: 0.95:1.000:. ./.:4:23,59:.:-0.81:0.774:. ./.:4:29,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.11:1.000:. ./.:4:31,93:.: 0.80:1.000:. ./.:4:20,61:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.14:1.000:. ./.:4:31,78:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,55:.:-0.74:1.000:. ./.:4:28,63:.:-0.47:1.000:. ./.:4:31,102:.: 1.14:0.993:. ./.:4:40,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,73:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,151:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,58:.:-1.74:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,107:.: 1.68:1.000:. ./.:4:25,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,78:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,73:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:19,76:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,143:.: 1.53:1.000:. ./.:4:32,95:.: 0.91:1.000:. ./.:4:26,56:.:-0.81:1.000:. ./.:4:28,88:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,163:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,40:.:-2.43:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.12:1.000:. ./.:4:26,78:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,132:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.76:1.000:. ./.:4:30,71:.:-0.09:0.998:. ./.:4:33,94:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.05:1.000:. ./.:4:23,65:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,97:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,157:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,61:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,62:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.78:1.000:. ./.:4:30,104:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.57:1.000:. ./.:4:22,41:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.05:1.000:. ./.:4:21,94:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,175:.: 2.75:1.000:. ./.:4:27,112:.: 1.37:1.000:. ./.:4:17,101:.: 0.57:1.000:. ./.:4:33,73:.: 0.11:1.000:. ./.:4:34,96:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,160:.: 2.18:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:23,106:.: 0.99:1.000:. ./.:4:37,65:.:-0.05:1.000:. -chr2.1 12870813 chr2.1_012870813 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:286,278:0.49: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:323,105:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:495,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:385,121:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:576,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:441,164:0.27: 1.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:286,107:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:244,245:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:480,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,93:0.45:-2.59:1.000:0.983 0/0/0/1:4:158,83:0.34:-2.23:1.000:0.851 0/0/0/1:4:376,122:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:255,257:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:265,257:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:331,135:0.29: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:248,254:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:139,385:0.72: 0.59:0.997:0.996 0/0/0/1:4:350,112:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:358,345:0.49: 2.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:177,457:0.71: 1.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:213,106:0.33:-1.45:1.000:0.919 0/0/0/1:4:360,117:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:462,146:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:357,114:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,126:0.50:-2.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:281,286:0.51: 1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:343,128:0.27: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:227,207:0.48:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:457,143:0.24: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:518,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:482,144:0.23: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,202:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:148,3:0.02:-3.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,116:0.41:-1.78:1.000:0.831 0/0/1:3:54,40:0.43:-3.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:270,278:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/0:4:534,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,252:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:416,147:0.26: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:379,120:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,246:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:272,232:0.46: 0.39:1.000:0.988 0/0/1/1:4:274,251:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:307,108:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:142,416:0.73: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:391,125:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:288,329:0.53: 1.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:60,21:0.26:-3.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,313:0.73:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,164:0.54:-1.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:192,230:0.54:-0.43:1.000:0.985 0/0/0/1:4:453,152:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:223,175:0.44:-0.66:1.000:0.967 0/0/0/0:4:508,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,102:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,333:0.72:-0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:212,217:0.51:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:291,258:0.47: 0.84:1.000:0.992 0/1/1/1:4:132,331:0.70:-0.02:1.000:0.988 0/0/0/0/1/1:6:253,126:0.33:-0.85:1.000:0.921 0/0/0/1:4:372,136:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:321,106:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:424,132:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,227:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:442,150:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:226,221:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:260,125:0.32:-0.79:1.000:0.946 0/0/1/1:4:231,198:0.46:-0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:363,147:0.29: 0.45:0.777:0.994 0/0/0/1:4:329,110:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:268,250:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:303,110:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:326,298:0.48: 1.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:259,233:0.47: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:395,120:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,184:0.46:-0.63:1.000:0.987 0/0/0/0:4:433,4:0.01:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:384,107:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,209:0.48:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/0:4:506,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,187:0.48:-0.76:0.846:0.995 0/0/0/1:4:350,109:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:386,133:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,231:0.53:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:240,246:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:238,247:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,178:0.49:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:208,175:0.46:-0.81:1.000:0.986 0/0/0/1:4:315,119:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:349,80:0.18:-0.36:1.000:0.999 0/0/1:3:185,107:0.37:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:331,114:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:493,1:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,180:0.49:-0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:239,235:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:383,113:0.22: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,270:0.74:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:313,105:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:404,124:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,222:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:216,238:0.52:-0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:264,251:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,267:0.70:-0.88:1.000:0.984 0/0/0/0:4:438,1:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:275,100:0.26:-0.89:1.000:0.998 0/1/1/1:4:111,307:0.72:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,207:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:362,133:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:467,175:0.27: 1.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:349,133:0.27: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:315,104:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:504,193:0.27: 2.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,179:0.48:-0.94:0.999:0.996 0/0/0/1:4:352,111:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,139:0.50:-1.83:0.774:0.997 0/0/0/1:4:427,135:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,209:0.55:-0.84:1.000:0.982 0/0/0/1:4:339,109:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,126:0.28:-0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:286,106:0.27:-0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:342,122:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,294:0.73:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:414,116:0.22: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:408,150:0.27: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:315,120:0.27:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:117,378:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,233:0.49: 0.09:0.993:0.996 0/0/0/0:4:386,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,83:0.25:-1.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,258:0.71:-1.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:216,211:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,241:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:150,142:0.49:-1.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:343,103:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,109:0.28:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:300,308:0.51: 1.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:372,119:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,211:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:91,247:0.72:-1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:320,85:0.21:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:377,118:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,230:0.54:-0.38:1.000:0.989 0/0/0/1:4:371,129:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,70:0.23:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:566,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:514,184:0.26: 2.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,264:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:500,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,239:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:287,117:0.29:-0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:472,167:0.26: 1.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:131,390:0.74: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:191,68:0.26:-2.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,103:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:290,277:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:374,133:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:336,336:0.50: 2.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:418,157:0.27: 1.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:352,99:0.22:-0.14:0.998:1.000 0/0/0/1:4:436,144:0.25: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:338,105:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:311,97:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:462,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,367:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/0:4:435,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:370,132:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:212,194:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:382,120:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,357:0.73: 0.13:1.000:0.998 0/1/1/1:4:107,348:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:119,342:0.73:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,161:0.48:-1.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:379,133:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,284:0.71:-0.68:1.000:0.989 0/0/0/1:4:346,127:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:322,102:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:454,154:0.25: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:392,142:0.26: 0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:419,123:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:252,206:0.45:-0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:248,294:0.54: 0.77:1.000:0.987 0/0/0/1:4:494,158:0.24: 1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:325,307:0.49: 1.66:1.000:0.996 0/0/0/0:4:412,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:356,115:0.24: 0.06:1.000:1.000 -chr2.1 13045665 chr2.1_013045665 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.84:0.997:. ./.:4:43,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:69,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.12:1.000:. ./.:3:15,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:16,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.97:0.777:. ./.:4:56,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:0.846:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.36:1.000:. ./.:3:18,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.27:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:0.774:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:0.993:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.92:0.998:. ./.:4:44,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:67,1:.: 2.72:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.82:1.000:. -chr2.1 13328742 chr2.1_013328742 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:223,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:256,70:.: 2.44:1.000:. ./.:4:172,73:.: 1.06:1.000:. ./.:4:72,40:.:-1.20:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:208,77:.: 1.74:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:183,66:.: 1.13:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:130,61:.: 0.15:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.47:0.997:. ./.:4:274,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:59,44:.:-1.35:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:133,73:.: 0.40:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:181,60:.: 1.00:1.000:. ./.:4:158,61:.: 0.62:1.000:. ./.:4:139,78:.: 0.59:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:120,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:40,21:.:-2.06:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.43:1.000:. ./.:3:30,26:.:-2.15:1.000:. ./.:4:159,79:.: 0.95:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:142,76:.: 0.61:1.000:. ./.:4:229,53:.: 1.69:1.000:. ./.:4:132,74:.: 0.40:1.000:. ./.:4:136,55:.: 0.15:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,62:.:-1.16:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:61,58:.:-1.08:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:325,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:194,62:.: 1.25:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.20:1.000:. ./.:6:90,52:.:-0.69:1.000:. ./.:4:118,50:.:-0.24:1.000:. ./.:4:80,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:134,52:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,76:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:116,66:.:-0.01:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.13:0.777:. ./.:4:239,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:191,51:.: 1.01:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:170,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:174,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:122,50:.:-0.18:1.000:. ./.:4:214,63:.: 1.61:1.000:. ./.:4:158,37:.: 0.21:0.846:. ./.:4:127,55:.:-0.01:1.000:. ./.:4:112,81:.: 0.18:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:52,72:.:-0.99:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.48:1.000:. ./.:3:105,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:62,41:.:-1.35:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:91,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:147,50:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:118,65:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:168,45:.: 0.52:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:113,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:74,44:.:-1.09:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:144,79:.: 0.69:1.000:. ./.:4:107,59:.:-0.28:1.000:. ./.:4:95,48:.:-0.67:1.000:. ./.:4:377,0:.: 3.31:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:124,60:.: 0.03:1.000:. ./.:4:78,38:.:-1.13:0.774:. ./.:4:134,58:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:110,41:.:-0.53:1.000:. ./.:4:107,49:.:-0.45:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:180,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:139,73:.: 0.50:1.000:. ./.:4:186,58:.: 1.05:1.000:. ./.:4:59,51:.:-1.23:1.000:. ./.:4:66,44:.:-1.23:0.993:. ./.:4:106,81:.: 0.08:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:119,51:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,50:.:-1.45:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:86,45:.:-0.87:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:89,45:.:-0.82:1.000:. ./.:4:318,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:144,64:.: 0.44:1.000:. ./.:4:129,71:.: 0.30:1.000:. ./.:4:183,68:.: 1.17:1.000:. ./.:4:303,1:.: 2.07:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:171,54:.: 0.72:0.998:. ./.:4:155,59:.: 0.54:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:106,46:.:-0.52:1.000:. ./.:4:203,56:.: 1.30:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:113,52:.:-0.30:1.000:. ./.:4:226,60:.: 1.76:0.999:. ./.:4:133,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:47,39:.:-1.64:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:52,50:.:-1.37:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,41:.:-0.69:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:153,71:.: 0.71:1.000:. ./.:4:136,55:.: 0.15:1.000:. ./.:4:139,59:.: 0.27:1.000:. ./.:4:150,70:.: 0.64:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:181,50:.: 0.83:1.000:. ./.:4:213,45:.: 1.29:1.000:. -chr2.1 13554140 chr2.1_013554140 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:63,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.36:0.997:. ./.:4:57,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:108,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.86:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:6:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.72:0.777:. ./.:4:89,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.62:0.846:. ./.:4:52,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.15:1.000:. ./.:3:12,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.12:0.999:. ./.:4:44,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.45:0.774:. ./.:4:28,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.52:0.993:. ./.:4:20,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:120,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:120,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:164,0:.: 3.61:1.000:. ./.:4:126,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.02:0.998:. ./.:4:110,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:90,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.42:1.000:. -chr2.1 13591541 chr2.1_013591541 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:154,556:.: 0.61:1.000:. ./.:4:107,409:.:-0.48:1.000:. ./.:4:242,424:.: 0.36:1.000:. ./.:4:171,612:.: 1.02:1.000:. ./.:4:351,455:.: 1.15:1.000:. ./.:4:298,578:.: 1.55:1.000:. ./.:4:229,618:.: 1.38:1.000:. ./.:4:282,521:.: 1.14:1.000:. ./.:4:256,439:.: 0.53:1.000:. ./.:4:11,171:.:-2.36:1.000:. ./.:4:14,226:.:-2.03:1.000:. ./.:4:159,527:.: 0.48:1.000:. ./.:4:173,548:.: 0.67:1.000:. ./.:4:301,531:.: 1.30:1.000:. ./.:4:209,503:.: 0.62:1.000:. ./.:4:197,505:.: 0.57:1.000:. ./.:4:97,613:.: 0.61:0.997:. ./.:4:390,425:.: 1.20:1.000:. ./.:4:133,811:.: 1.93:1.000:. ./.:4:187,709:.: 1.66:1.000:. ./.:4:19,154:.:-2.41:1.000:. ./.:4:179,498:.: 0.43:1.000:. ./.:4:296,539:.: 1.32:1.000:. ./.:4:79,558:.: 0.20:1.000:. ./.:4:5,133:.:-2.61:1.000:. ./.:4:205,594:.: 1.11:1.000:. ./.:4:220,613:.: 1.30:1.000:. ./.:4:217,416:.: 0.18:1.000:. ./.:4:185,645:.: 1.29:1.000:. ./.:4:282,441:.: 0.69:1.000:. ./.:4:186,541:.: 0.71:1.000:. ./.:4:183,445:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,205:.:-2.20:1.000:. ./.:4:21,214:.:-2.06:1.000:. ./.:3:1,84:.:-2.91:1.000:. ./.:4:238,469:.: 0.60:1.000:. ./.:4:299,458:.: 0.88:1.000:. ./.:4:243,485:.: 0.71:1.000:. ./.:4:230,302:.:-0.39:1.000:. ./.:4:214,465:.: 0.44:1.000:. ./.:4:140,359:.:-0.58:1.000:. ./.:4:174,425:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,556:.: 0.52:1.000:. ./.:4:135,308:.:-0.89:1.000:. ./.:4:87,470:.:-0.25:1.000:. ./.:4:145,466:.: 0.06:1.000:. ./.:4:300,558:.: 1.45:1.000:. ./.:4:108,262:.:-1.30:1.000:. ./.:4:129,422:.:-0.28:1.000:. ./.:4:99,237:.:-1.49:1.000:. ./.:4:68,313:.:-1.24:1.000:. ./.:4:235,500:.: 0.75:1.000:. ./.:4:103,355:.:-0.81:1.000:. ./.:4:232,388:.: 0.11:1.000:. ./.:4:248,469:.: 0.65:1.000:. ./.:4:62,476:.:-0.36:1.000:. ./.:4:156,376:.:-0.39:1.000:. ./.:4:143,431:.:-0.15:1.000:. ./.:4:56,403:.:-0.80:1.000:. ./.:6:93,327:.:-1.02:1.000:. ./.:4:170,420:.:-0.06:1.000:. ./.:4:198,371:.:-0.18:1.000:. ./.:4:162,390:.:-0.28:1.000:. ./.:4:109,309:.:-1.03:1.000:. ./.:4:203,444:.: 0.26:1.000:. ./.:4:143,349:.:-0.61:1.000:. ./.:4:115,412:.:-0.42:1.000:. ./.:4:137,486:.: 0.12:1.000:. ./.:4:101,462:.:-0.21:0.777:. ./.:4:141,422:.:-0.21:1.000:. ./.:4:165,419:.:-0.10:1.000:. ./.:4:114,385:.:-0.58:1.000:. ./.:4:171,441:.: 0.06:1.000:. ./.:4:248,438:.: 0.48:1.000:. ./.:4:93,425:.:-0.47:1.000:. ./.:4:53,394:.:-0.87:1.000:. ./.:4:229,316:.:-0.32:1.000:. ./.:4:225,318:.:-0.33:1.000:. ./.:4:145,378:.:-0.44:1.000:. ./.:4:213,368:.:-0.11:1.000:. ./.:4:157,285:.:-0.90:0.846:. ./.:4:138,404:.:-0.33:1.000:. ./.:4:112,449:.:-0.23:1.000:. ./.:4:60,479:.:-0.35:1.000:. ./.:4:83,358:.:-0.90:1.000:. ./.:4:194,414:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,349:.:-0.95:1.000:. ./.:4:126,358:.:-0.66:1.000:. ./.:4:125,331:.:-0.82:1.000:. ./.:4:142,452:.:-0.04:1.000:. ./.:3:104,279:.:-1.23:1.000:. ./.:4:178,329:.:-0.53:1.000:. ./.:4:200,373:.:-0.16:1.000:. ./.:4:165,366:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,425:.:-0.67:1.000:. ./.:4:213,347:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,360:.:-1.18:1.000:. ./.:4:68,331:.:-1.14:1.000:. ./.:4:109,439:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,541:.: 0.61:1.000:. ./.:4:144,550:.: 0.52:1.000:. ./.:4:185,428:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,298:.:-1.48:1.000:. ./.:4:166,373:.:-0.35:1.000:. ./.:4:78,304:.:-1.23:1.000:. ./.:4:45,397:.:-0.90:1.000:. ./.:4:108,335:.:-0.89:1.000:. ./.:4:199,555:.: 0.86:1.000:. ./.:4:335,628:.: 2.04:1.000:. ./.:4:178,375:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,398:.:-0.64:1.000:. ./.:4:407,455:.: 1.47:1.000:. ./.:4:157,352:.:-0.52:0.999:. ./.:4:219,414:.: 0.18:1.000:. ./.:4:122,274:.:-1.15:0.774:. ./.:4:103,454:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,482:.:-0.37:1.000:. ./.:4:115,399:.:-0.49:1.000:. ./.:4:91,368:.:-0.80:1.000:. ./.:4:89,347:.:-0.93:1.000:. ./.:4:203,410:.: 0.07:1.000:. ./.:4:33,408:.:-0.90:1.000:. ./.:4:109,455:.:-0.21:1.000:. ./.:4:302,561:.: 1.47:1.000:. ./.:4:190,325:.:-0.49:1.000:. ./.:4:97,496:.:-0.05:1.000:. ./.:4:32,421:.:-0.83:0.993:. ./.:4:115,280:.:-1.16:1.000:. ./.:4:60,259:.:-1.59:1.000:. ./.:4:70,314:.:-1.22:1.000:. ./.:4:74,381:.:-0.82:1.000:. ./.:4:85,589:.: 0.41:1.000:. ./.:4:61,305:.:-1.32:1.000:. ./.:4:90,365:.:-0.82:1.000:. ./.:4:128,478:.: 0.03:1.000:. ./.:4:213,629:.: 1.36:1.000:. ./.:4:146,485:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,340:.:-1.07:1.000:. ./.:4:45,377:.:-1.01:1.000:. ./.:4:97,325:.:-1.01:1.000:. ./.:4:113,415:.:-0.41:1.000:. ./.:4:148,385:.:-0.38:1.000:. ./.:4:128,464:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,327:.:-1.14:1.000:. ./.:4:365,574:.: 1.90:1.000:. ./.:4:353,706:.: 2.58:1.000:. ./.:4:265,450:.: 0.64:1.000:. ./.:4:362,391:.: 0.85:1.000:. ./.:4:252,417:.: 0.38:1.000:. ./.:4:216,339:.:-0.26:1.000:. ./.:4:190,646:.: 1.32:1.000:. ./.:4:87,580:.: 0.37:1.000:. ./.:4:9,181:.:-2.31:1.000:. ./.:4:187,495:.: 0.45:1.000:. ./.:4:203,590:.: 1.08:1.000:. ./.:4:309,496:.: 1.15:1.000:. ./.:4:221,655:.: 1.55:1.000:. ./.:4:182,661:.: 1.36:1.000:. ./.:4:350,342:.: 0.51:0.998:. ./.:4:214,681:.: 1.65:1.000:. ./.:4:358,373:.: 0.73:1.000:. ./.:4:173,431:.: 0.02:1.000:. ./.:4:235,388:.: 0.12:1.000:. ./.:4:194,638:.: 1.30:1.000:. ./.:4:325,428:.: 0.85:1.000:. ./.:4:272,420:.: 0.51:1.000:. ./.:4:221,424:.: 0.25:1.000:. ./.:4:134,468:.: 0.00:0.999:. ./.:4:149,567:.: 0.65:1.000:. ./.:4:197,571:.: 0.94:1.000:. ./.:4:70,513:.:-0.10:1.000:. ./.:4:109,390:.:-0.58:1.000:. ./.:4:185,581:.: 0.93:1.000:. ./.:4:130,447:.:-0.14:1.000:. ./.:4:112,412:.:-0.43:1.000:. ./.:4:105,408:.:-0.50:1.000:. ./.:4:198,649:.: 1.38:1.000:. ./.:4:229,530:.: 0.89:1.000:. ./.:4:172,597:.: 0.94:1.000:. ./.:4:209,473:.: 0.45:1.000:. ./.:4:327,589:.: 1.77:1.000:. ./.:4:258,709:.: 2.06:1.000:. ./.:4:108,908:.: 2.33:1.000:. ./.:4:253,407:.: 0.33:1.000:. ./.:4:236,458:.: 0.52:1.000:. -chr2.1 13744405 chr2.1_013744405 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:527,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:296,99:.:-0.29:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:369,130:.: 0.90:1.000:. ./.:4:539,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:256,93:.:-0.81:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:385,121:.: 0.98:1.000:. ./.:4:214,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:181,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:357,112:.: 0.55:1.000:. ./.:4:310,107:.:-0.04:1.000:. ./.:4:362,90:.: 0.36:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.20:0.997:. ./.:4:424,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:610,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:537,3:.: 1.36:1.000:. ./.:4:133,46:.:-2.75:1.000:. ./.:4:329,72:.:-0.22:1.000:. ./.:4:521,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:174,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:404,110:.: 1.07:1.000:. ./.:4:386,107:.: 0.83:1.000:. ./.:4:281,87:.:-0.59:1.000:. ./.:4:103,24:.:-3.34:1.000:. ./.:4:191,40:.:-2.15:1.000:. ./.:3:83,0:.:-3.84:1.000:. ./.:4:447,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:367,88:.: 0.40:1.000:. ./.:4:515,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:361,103:.: 0.50:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:473,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:439,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:533,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:356,100:.: 0.41:1.000:. ./.:4:408,123:.: 1.26:1.000:. ./.:4:128,26:.:-3.03:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:287,93:.:-0.46:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:339,115:.: 0.38:1.000:. ./.:4:278,83:.:-0.67:1.000:. ./.:4:388,110:.: 0.88:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.46:1.000:. ./.:6:384,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:268,96:.:-0.64:1.000:. ./.:4:382,99:.: 0.69:1.000:. ./.:4:310,90:.:-0.23:1.000:. ./.:4:462,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:370,111:.: 0.69:1.000:. ./.:4:476,3:.: 0.67:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.82:0.777:. ./.:4:391,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:482,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:332,95:.: 0.08:1.000:. ./.:4:388,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:324,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:258,79:.:-0.95:1.000:. ./.:4:354,99:.: 0.37:1.000:. ./.:4:443,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:357,109:.: 0.52:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.64:0.846:. ./.:4:338,98:.: 0.18:1.000:. ./.:4:481,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:426,117:.: 1.40:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:263,90:.:-0.77:1.000:. ./.:4:273,70:.:-0.88:1.000:. ./.:4:224,78:.:-1.35:1.000:. ./.:3:184,87:.:-1.70:1.000:. ./.:4:320,100:.: 0.00:1.000:. ./.:4:382,134:.: 1.09:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:350,86:.: 0.18:1.000:. ./.:4:373,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:339,113:.: 0.36:1.000:. ./.:4:298,88:.:-0.39:1.000:. ./.:4:336,123:.: 0.44:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:275,94:.:-0.58:1.000:. ./.:4:310,84:.:-0.30:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:370,103:.: 0.60:1.000:. ./.:4:449,115:.: 1.64:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:423,133:.: 1.54:1.000:. ./.:4:359,105:.: 0.50:0.999:. ./.:4:328,109:.: 0.19:1.000:. ./.:4:228,58:.:-1.53:0.774:. ./.:4:500,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:275,93:.:-0.59:1.000:. ./.:4:301,84:.:-0.40:1.000:. ./.:4:271,90:.:-0.67:1.000:. ./.:4:319,103:.: 0.02:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:472,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:411,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:315,87:.:-0.21:1.000:. ./.:4:446,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.40:0.993:. ./.:4:355,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:259,97:.:-0.73:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:300,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:316,84:.:-0.23:1.000:. ./.:4:472,122:.: 1.98:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:382,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:264,79:.:-0.88:1.000:. ./.:4:415,129:.: 1.41:1.000:. ./.:4:528,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:345,114:.: 0.44:1.000:. ./.:4:296,96:.:-0.32:1.000:. ./.:4:375,132:.: 0.99:1.000:. ./.:4:316,87:.:-0.20:1.000:. ./.:4:573,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:101,29:.:-3.30:1.000:. ./.:4:224,59:.:-1.56:1.000:. ./.:4:380,108:.: 0.77:1.000:. ./.:4:357,106:.: 0.49:1.000:. ./.:4:354,113:.: 0.53:1.000:. ./.:4:563,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:185,161:.:-0.85:0.998:. ./.:4:432,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:343,73:.:-0.05:1.000:. ./.:4:255,84:.:-0.92:1.000:. ./.:4:321,99:.: 0.00:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:289,115:.:-0.19:1.000:. ./.:4:310,81:.:-0.33:1.000:. ./.:4:347,97:.: 0.27:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:419,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:424,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:324,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:345,79:.: 0.04:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:402,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:604,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:356,111:.: 0.53:1.000:. ./.:4:413,132:.: 1.42:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:290,78:.:-0.59:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.04:1.000:. -chr2.1 14078405 chr2.1_014078405 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:159,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.94:0.997:. ./.:4:106,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.36:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.56:1.000:. ./.:6:69,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:0.777:. ./.:4:120,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.79:0.846:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.27:1.000:. ./.:3:54,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:65,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:81,1:.:-0.63:0.999:. ./.:4:97,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.69:0.774:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.79:0.993:. ./.:4:67,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:0.998:. ./.:4:133,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:138,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.75:1.000:. -chr2.1 14328793 chr2.1_014328793 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:87,94:.: 0.09:1.000:. ./.:4:72,104:.:-0.01:1.000:. ./.:4:69,173:.: 1.29:1.000:. ./.:4:67,122:.: 0.25:1.000:. ./.:4:62,221:.: 2.10:1.000:. ./.:4:82,135:.: 0.80:1.000:. ./.:4:39,84:.:-1.05:1.000:. ./.:4:89,74:.:-0.27:1.000:. ./.:4:83,167:.: 1.45:1.000:. ./.:4:39,20:.:-2.31:1.000:. ./.:4:25,46:.:-2.08:1.000:. ./.:4:63,102:.:-0.23:1.000:. ./.:4:84,75:.:-0.34:1.000:. ./.:4:71,97:.:-0.17:1.000:. ./.:4:72,114:.: 0.19:1.000:. ./.:4:70,96:.:-0.21:1.000:. ./.:4:108,33:.:-0.70:0.997:. ./.:4:69,144:.: 0.72:1.000:. ./.:4:132,112:.: 1.33:1.000:. ./.:4:106,52:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,72:.:-1.76:1.000:. ./.:4:62,114:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,153:.: 1.55:1.000:. ./.:4:92,104:.: 0.38:1.000:. ./.:4:16,19:.:-2.79:1.000:. ./.:4:100,76:.:-0.01:1.000:. ./.:4:72,87:.:-0.34:1.000:. ./.:4:71,67:.:-0.76:1.000:. ./.:4:108,157:.: 1.74:1.000:. ./.:4:60,159:.: 0.84:1.000:. ./.:4:67,127:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,71:.:-0.90:1.000:. ./.:4:16,51:.:-2.16:1.000:. ./.:4:33,37:.:-2.10:1.000:. ./.:3:21,23:.:-2.61:1.000:. ./.:4:106,77:.: 0.13:1.000:. ./.:4:72,187:.: 1.62:1.000:. ./.:4:101,94:.: 0.36:1.000:. ./.:4:61,140:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,141:.: 1.35:1.000:. ./.:4:77,66:.:-0.66:1.000:. ./.:4:80,84:.:-0.25:1.000:. ./.:4:99,104:.: 0.52:1.000:. ./.:4:71,115:.: 0.19:1.000:. ./.:4:84,39:.:-1.05:1.000:. ./.:4:55,139:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,124:.: 0.54:1.000:. ./.:4:23,27:.:-2.49:1.000:. ./.:4:66,33:.:-1.53:1.000:. ./.:4:45,51:.:-1.58:1.000:. ./.:4:62,70:.:-0.88:1.000:. ./.:4:83,161:.: 1.33:1.000:. ./.:4:62,71:.:-0.86:1.000:. ./.:4:70,179:.: 1.43:1.000:. ./.:4:87,133:.: 0.86:1.000:. ./.:4:63,30:.:-1.64:1.000:. ./.:4:77,89:.:-0.21:1.000:. ./.:4:86,87:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,31:.:-0.93:1.000:. ./.:6:71,94:.:-0.23:1.000:. ./.:4:91,111:.: 0.50:1.000:. ./.:4:41,118:.:-0.34:1.000:. ./.:4:59,148:.: 0.60:1.000:. ./.:4:46,80:.:-0.99:1.000:. ./.:4:84,111:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,64:.:-0.56:1.000:. ./.:4:63,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:85,84:.:-0.15:1.000:. ./.:4:68,109:.: 0.01:0.777:. ./.:4:78,115:.: 0.32:1.000:. ./.:4:109,93:.: 0.50:1.000:. ./.:4:68,93:.:-0.30:1.000:. ./.:4:86,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:69,93:.:-0.29:1.000:. ./.:4:102,117:.: 0.84:1.000:. ./.:4:77,62:.:-0.74:1.000:. ./.:4:46,139:.: 0.17:1.000:. ./.:4:61,148:.: 0.64:1.000:. ./.:4:116,80:.: 0.38:1.000:. ./.:4:82,180:.: 1.68:1.000:. ./.:4:57,72:.:-0.93:0.846:. ./.:4:54,143:.: 0.40:1.000:. ./.:4:95,120:.: 0.76:1.000:. ./.:4:77,88:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,66:.:-0.44:1.000:. ./.:4:75,128:.: 0.52:1.000:. ./.:4:62,67:.:-0.93:1.000:. ./.:4:57,83:.:-0.72:1.000:. ./.:4:64,155:.: 0.84:1.000:. ./.:4:64,114:.: 0.03:1.000:. ./.:3:56,56:.:-1.27:1.000:. ./.:4:58,141:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,201:.: 1.92:1.000:. ./.:4:59,64:.:-1.05:1.000:. ./.:4:98,97:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,134:.: 0.78:1.000:. ./.:4:64,44:.:-1.35:1.000:. ./.:4:64,123:.: 0.21:1.000:. ./.:4:96,114:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,96:.:-0.21:1.000:. ./.:4:45,79:.:-1.03:1.000:. ./.:4:65,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:65,36:.:-1.49:1.000:. ./.:4:60,184:.: 1.33:1.000:. ./.:4:44,107:.:-0.50:1.000:. ./.:4:91,42:.:-0.86:1.000:. ./.:4:83,77:.:-0.32:1.000:. ./.:4:64,132:.: 0.38:1.000:. ./.:4:68,163:.: 1.07:1.000:. ./.:4:88,130:.: 0.82:1.000:. ./.:4:83,99:.: 0.11:1.000:. ./.:4:82,164:.: 1.37:1.000:. ./.:4:72,100:.:-0.09:0.999:. ./.:4:77,158:.: 1.15:1.000:. ./.:4:35,55:.:-1.70:0.774:. ./.:4:89,137:.: 0.97:1.000:. ./.:4:74,75:.:-0.54:1.000:. ./.:4:38,117:.:-0.42:1.000:. ./.:4:63,149:.: 0.70:1.000:. ./.:4:50,121:.:-0.11:1.000:. ./.:4:51,143:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,42:.:-0.68:1.000:. ./.:4:98,134:.: 1.09:1.000:. ./.:4:68,101:.:-0.15:1.000:. ./.:4:65,153:.: 0.82:1.000:. ./.:4:96,41:.:-0.78:1.000:. ./.:4:83,89:.:-0.09:0.993:. ./.:4:50,114:.:-0.25:1.000:. ./.:4:69,95:.:-0.25:1.000:. ./.:4:55,30:.:-1.80:1.000:. ./.:4:48,102:.:-0.52:1.000:. ./.:4:91,89:.: 0.07:1.000:. ./.:4:56,59:.:-1.21:1.000:. ./.:4:71,114:.: 0.17:1.000:. ./.:4:53,128:.: 0.09:1.000:. ./.:4:93,160:.: 1.51:1.000:. ./.:4:68,121:.: 0.25:1.000:. ./.:4:64,89:.:-0.46:1.000:. ./.:4:77,42:.:-1.13:1.000:. ./.:4:81,138:.: 0.84:1.000:. ./.:4:76,115:.: 0.29:1.000:. ./.:4:76,72:.:-0.56:1.000:. ./.:4:78,124:.: 0.50:1.000:. ./.:4:44,98:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,229:.: 3.04:1.000:. ./.:4:111,152:.: 1.70:1.000:. ./.:4:62,114:.:-0.01:1.000:. ./.:4:55,157:.: 0.70:1.000:. ./.:4:75,112:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,123:.: 0.13:1.000:. ./.:4:100,147:.: 1.39:1.000:. ./.:4:88,32:.:-1.11:1.000:. ./.:4:32,55:.:-1.76:1.000:. ./.:4:44,100:.:-0.64:1.000:. ./.:4:75,93:.:-0.17:1.000:. ./.:4:76,157:.: 1.11:1.000:. ./.:4:86,131:.: 0.80:1.000:. ./.:4:94,172:.: 1.76:1.000:. ./.:4:33,115:.:-0.56:0.998:. ./.:4:115,119:.: 1.13:1.000:. ./.:4:75,133:.: 0.62:1.000:. ./.:4:47,110:.:-0.38:1.000:. ./.:4:61,171:.: 1.09:1.000:. ./.:4:99,43:.:-0.68:1.000:. ./.:4:73,137:.: 0.66:1.000:. ./.:4:65,136:.: 0.48:1.000:. ./.:4:67,99:.:-0.21:1.000:. ./.:4:97,128:.: 0.95:0.999:. ./.:4:93,57:.:-0.52:1.000:. ./.:4:83,35:.:-1.15:1.000:. ./.:4:68,34:.:-1.47:1.000:. ./.:4:61,55:.:-1.19:1.000:. ./.:4:52,124:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,32:.:-1.74:1.000:. ./.:4:75,98:.:-0.07:1.000:. ./.:4:81,111:.: 0.31:1.000:. ./.:4:110,128:.: 1.21:1.000:. ./.:4:119,139:.: 1.60:1.000:. ./.:4:98,137:.: 1.15:1.000:. ./.:4:97,93:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,91:.: 0.05:1.000:. ./.:4:81,176:.: 1.58:1.000:. ./.:4:108,96:.: 0.54:1.000:. ./.:4:59,141:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,115:.: 0.52:1.000:. -chr2.1 15167963 chr2.1_015167963 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,11:.: 1.64:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,8:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,7:.: 0.97:1.000:. ./.:4:5,8:.: 2.32:0.982:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,6:.: 0.97:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,9:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.97:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:6,4:.: 1.31:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,7:.: 0.97:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,8:.: 3.00:1.000:. ./.:6:3,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,7:.: 0.97:1.000:. ./.:4:2,5:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,9:.: 1.31:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.39:0.777:. ./.:4:0,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.63:1.000:. ./.:4:5,6:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:0.846:. ./.:4:3,6:.: 0.97:1.000:. ./.:4:4,7:.: 1.64:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.63:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,9:.: 1.64:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,9:.: 1.98:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,13:.: 2.32:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.63:0.999:. ./.:4:2,7:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:0.774:. ./.:4:1,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:6,7:.: 2.32:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:5,5:.: 1.31:0.993:. ./.:4:0,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,8:.: 1.31:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,10:.: 1.98:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,7:.: 1.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,9:.: 1.31:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:3,6:.: 0.97:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,13:.: 2.32:0.998:. ./.:4:4,5:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.97:0.999:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,8:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.97:1.000:. ./.:4:4,6:.: 1.31:1.000:. ./.:4:11,3:.: 2.66:1.000:. ./.:4:0,13:.: 2.32:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.63:1.000:. -chr2.1 15546760 chr2.1_015546760 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:272,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.32:0.982:. ./.:4:260,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:351,1:.: 2.77:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:262,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:36,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.06:1.000:. ./.:6:140,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.93:0.777:. ./.:4:230,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.83:0.846:. ./.:4:154,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:304,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.69:1.000:. ./.:3:95,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:142,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.93:0.774:. ./.:4:248,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.21:0.993:. ./.:4:110,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:307,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:284,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:338,0:.: 2.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:229,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:239,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:341,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.51:1.000:. -chr2.1 15580772 chr2.1_015580772 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:56,28:0.37: 0.44:1.000:0.534 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,30:0.41: 0.16:1.000:0.862 0/0/1/1:4:43,40:0.47: 0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,32:0.44: 0.04:1.000:0.964 0/0/1/1:4:40,53:0.54: 0.80:1.000:0.984 0/1/1/1:4:22,57:0.70: 0.24:1.000:0.981 0/0/1/1:4:30,34:0.51:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,36:0.44: 0.44:1.000:0.960 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,3:0.25:-2.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,36:0.41: 0.84:1.000:0.833 0/1/1/1:4:20,64:0.74: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,52:0.54: 0.76:1.000:0.988 0/0/1/1:4:44,69:0.59: 1.59:1.000:0.890 0/0/1/1:4:44,66:0.57: 1.47:0.982:0.933 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,87:0.65: 2.19:1.000:0.826 0/1/1/1:4:22,54:0.68: 0.12:1.000:0.964 0/0/1/1:4:4,6:0.57:-2.51:1.000:0.933 0/0/1/1:4:41,60:0.57: 1.11:1.000:0.950 0/0/1/1:4:37,22:0.40:-0.56:1.000:0.779 0/0/0/1:4:61,24:0.34: 0.48:1.000:0.880 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,38:0.40: 1.07:1.000:0.818 0/0/1/1:4:58,36:0.41: 0.84:1.000:0.833 0/0/1/1:4:33,34:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,33:0.42: 0.40:1.000:0.892 0/0/1/1:4:64,39:0.40: 1.19:1.000:0.811 0/0/1/1:4:51,70:0.55: 1.91:1.000:0.976 0/0/1/1:4:41,50:0.52: 0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-2.71:1.000:0.900 0/0/1/1:4:7,12:0.61:-2.15:1.000:0.733 0/0/0:3:4,0:0.00:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,29:0.48:-0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,39:0.40: 1.15:1.000:0.830 0/0/1/1:4:34,32:0.47:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:17,27:0.59:-1.15:1.000:0.874 0/1/1/1:4:26,49:0.63: 0.08:1.000:0.533 0/0/1/1:4:52,28:0.38: 0.28:1.000:0.612 0/0/1/1:4:27,39:0.57:-0.28:1.000:0.957 0/1/1/1:4:15,69:0.80: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,79:0.81: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,61:0.60: 0.99:1.000:0.815 0/1/1/1:4:29,66:0.67: 0.88:1.000:0.917 0/0/1/1:4:23,12:0.38:-1.51:1.000:0.551 0/1/1/1:4:20,67:0.74: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,66:0.55: 1.67:1.000:0.981 0/0/1/1:4:30,18:0.40:-0.99:1.000:0.791 0/0/0/1:4:67,28:0.35: 0.88:1.000:0.822 0/0/1/1:4:37,28:0.44:-0.32:1.000:0.962 0/0/1/1:4:30,39:0.54:-0.16:1.000:0.988 0/0/1/1:4:27,24:0.46:-0.88:1.000:0.990 0/0/1/1:4:44,54:0.53: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,40:0.54:-0.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:24,27:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,58:0.61: 0.72:1.000:0.670 0/0/0/0/1/1:6:26,15:0.39:-1.27:1.000:0.691 0/0/1/1:4:38,28:0.43:-0.28:1.000:0.953 0/1/1/1:4:13,66:0.82: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,53:0.65: 0.24:1.000:0.746 0/1/1/1:4:10,51:0.82:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,21:0.39:-0.60:1.000:0.707 0/0/1/1:4:37,26:0.43:-0.40:1.000:0.933 0/0/1/1:4:20,37:0.62:-0.64:1.000:0.522 0/0/1/1:4:42,35:0.45: 0.16:1.000:0.983 0/0/1/1:4:42,29:0.42:-0.08:0.777:0.923 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,29:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:18,28:0.58:-1.07:1.000:0.900 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,52:0.70:-0.04:1.000:0.982 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,41:0.64:-0.44:1.000:0.636 0/0/1/1:4:14,23:0.60:-1.43:1.000:0.822 0/0/1/1:4:28,24:0.46:-0.84:1.000:0.986 0/0/1/1:4:37,27:0.43:-0.36:1.000:0.950 0/0/1/1:4:52,27:0.38: 0.24:1.000:0.541 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.43:0.846:1.000 0/1/1/1:4:28,62:0.66: 0.68:1.000:0.888 0/0/1/1:4:43,35:0.45: 0.20:1.000:0.979 0/0/1/1:4:33,60:0.62: 0.80:1.000:0.574 0/1/1/1:4:16,56:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,38:0.53:-0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:28,20:0.43:-0.99:1.000:0.941 0/0/1/1:4:21,38:0.62:-0.56:1.000:0.588 0/0/1/1:4:33,28:0.46:-0.48:1.000:0.985 0/0/1/1:4:33,58:0.61: 0.72:1.000:0.670 1/1/1:3:3,32:0.90:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,55:0.55: 0.92:1.000:0.982 0/0/1/1:4:57,34:0.40: 0.72:1.000:0.783 0/0/1/1:4:25,20:0.45:-1.11:1.000:0.976 0/1/1/1:4:26,51:0.64: 0.16:1.000:0.649 0/0/1/1:4:23,31:0.55:-0.76:1.000:0.981 0/0/1/1:4:37,44:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,28:0.40: 0.04:1.000:0.810 0/0/1/1:4:33,55:0.60: 0.60:1.000:0.795 0/0/1/1:4:23,35:0.58:-0.60:1.000:0.921 0/1/1/1:4:13,69:0.82: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,40:0.74:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,18:0.39:-0.88:1.000:0.636 0/0/1/1:4:26,32:0.53:-0.60:1.000:0.993 0/1/1/1:4:32,60:0.63: 0.76:1.000:0.518 0/0/1/1:4:22,16:0.43:-1.39:1.000:0.948 0/0/1/1:4:44,64:0.57: 1.39:1.000:0.953 0/1/1/1:4:36,87:0.68: 1.99:1.000:0.957 0/0/1/1:4:27,28:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,18:0.36:-0.64:1.000:0.682 0/0/1/1:4:38,53:0.56: 0.72:1.000:0.971 0/1/1/1:4:13,35:0.70:-0.99:0.999:0.988 0/1/1/1:4:18,50:0.71:-0.20:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,52:0.85:-0.52:0.774:0.986 0/0/1/1:4:37,26:0.43:-0.40:1.000:0.933 0/1/1/1:4:24,45:0.63:-0.16:1.000:0.518 0/0/1/1:4:45,46:0.49: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,42:0.58:-0.16:1.000:0.900 0/0/1/1:4:32,39:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,36:0.43: 0.56:1.000:0.935 0/0/1/1:4:26,43:0.60:-0.16:1.000:0.810 0/0/0/1:4:40,19:0.36:-0.56:1.000:0.632 0/0/1/1:4:41,31:0.44:-0.04:1.000:0.962 0/0/1/1:4:16,28:0.61:-1.15:1.000:0.682 0/1/1/1:4:23,56:0.68: 0.24:1.000:0.961 0/0/1/1:4:24,40:0.60:-0.36:0.993:0.795 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.50:-1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,44:0.81:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,43:0.57:-0.04:1.000:0.941 0/0/1/1:4:42,58:0.55: 1.07:1.000:0.975 0/0/1/1:4:19,21:0.50:-1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,32:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,51:0.57: 0.52:1.000:0.952 0/0/1/1:4:60,85:0.56: 2.86:1.000:0.966 0/0/1/1:4:38,37:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,52:0.81:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,35:0.61:-0.72:1.000:0.682 0/0/1/1:4:19,34:0.62:-0.80:1.000:0.621 0/0/1/1:4:33,19:0.39:-0.84:1.000:0.730 0/0/1/1:4:19,19:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,29:0.41: 0.08:1.000:0.850 0/0/1/1:4:30,28:0.47:-0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,29:0.39: 0.36:1.000:0.642 0/0/1/1:4:32,42:0.54: 0.04:1.000:0.986 0/1/1/1:4:17,72:0.79: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,29:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,40:0.42: 0.95:1.000:0.932 0/0/0/1:4:44,21:0.37:-0.32:1.000:0.623 0/0/1/1:4:60,31:0.38: 0.72:1.000:0.531 0/1/1/1:4:31,66:0.65: 0.95:1.000:0.832 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,47:0.55: 0.36:1.000:0.982 0/0/1/1:4:41,66:0.59: 1.35:1.000:0.855 0/1/1/1:4:14,69:0.81: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,80:0.61: 2.11:1.000:0.698 0/0/1/1:4:42,33:0.44: 0.08:1.000:0.972 0/1/1/1:4:19,68:0.76: 0.56:0.998:1.000 0/0/1/1:4:45,36:0.45: 0.32:1.000:0.976 0/0/1/1:4:26,31:0.52:-0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,50:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:53,22:0.35: 0.08:1.000:0.830 0/1/1/1:4:27,63:0.67: 0.68:1.000:0.937 0/0/0/1:4:70,31:0.35: 1.11:1.000:0.748 0/0/1/1:4:59,31:0.38: 0.68:1.000:0.565 0/1/1/1:4:15,52:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.08:0.999:1.000 0/1/1/1:4:29,63:0.66: 0.76:1.000:0.863 0/1/1/1:4:18,57:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,66:0.71: 0.68:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,55:0.71: 0.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:44,61:0.56: 1.27:1.000:0.973 0/1/1/1:4:27,54:0.64: 0.32:1.000:0.700 0/0/1/1:4:41,27:0.41:-0.20:1.000:0.890 0/0/1/1:4:41,24:0.40:-0.32:1.000:0.756 0/0/1/1:4:44,48:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,36:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,38:0.41: 1.03:1.000:0.837 0/0/1/1:4:40,28:0.42:-0.20:1.000:0.931 0/0/1/1:4:29,35:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,92:0.56: 3.34:1.000:0.966 0/0/1/1:4:60,87:0.57: 2.94:1.000:0.955 0/0/1/1:4:41,31:0.44:-0.04:1.000:0.962 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 -chr2.1 15674052 chr2.1_015674052 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.94:0.982:. ./.:4:35,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:3:5,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.26:1.000:. ./.:6:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:0.777:. ./.:4:41,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:0.846:. ./.:4:31,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.20:1.000:. ./.:3:22,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:70,0:.: 3.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:0.774:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.62:0.993:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:0.998:. ./.:4:28,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.62:0.999:. ./.:4:42,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.04:1.000:. -chr2.1 15854085 chr2.1_015854085 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:116,48:.:-0.59:1.000:. ./.:4:98,32:.:-1.18:1.000:. ./.:4:71,62:.:-1.13:1.000:. ./.:4:54,81:.:-1.09:1.000:. ./.:4:173,98:.: 1.28:1.000:. ./.:4:154,72:.: 0.49:1.000:. ./.:4:151,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:88,83:.:-0.47:1.000:. ./.:4:186,45:.: 0.58:1.000:. ./.:4:66,15:.:-2.03:1.000:. ./.:4:48,46:.:-1.81:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:109,35:.:-0.94:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:104,31:.:-1.09:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.00:0.982:. ./.:4:60,67:.:-1.23:1.000:. ./.:4:175,51:.: 0.49:1.000:. ./.:4:168,32:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,24:.:-0.97:1.000:. ./.:4:134,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:175,85:.: 1.08:1.000:. ./.:4:120,25:.:-0.92:1.000:. ./.:4:57,44:.:-1.69:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.64:1.000:. ./.:4:143,20:.:-0.61:1.000:. ./.:4:187,32:.: 0.37:1.000:. ./.:4:218,39:.: 1.03:1.000:. ./.:4:69,78:.:-0.88:1.000:. ./.:4:315,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.51:1.000:. ./.:3:26,8:.:-2.85:1.000:. ./.:4:172,31:.: 0.09:1.000:. ./.:4:52,58:.:-1.53:1.000:. ./.:4:199,52:.: 0.93:1.000:. ./.:4:261,58:.: 2.11:1.000:. ./.:4:158,85:.: 0.79:1.000:. ./.:4:199,42:.: 0.75:1.000:. ./.:4:94,75:.:-0.50:1.000:. ./.:4:201,55:.: 1.01:1.000:. ./.:4:182,109:.: 1.62:1.000:. ./.:4:333,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:137,60:.:-0.01:1.000:. ./.:4:131,58:.:-0.15:1.000:. ./.:4:69,31:.:-1.70:1.000:. ./.:4:129,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:146,43:.:-0.15:1.000:. ./.:4:150,38:.:-0.17:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:205,81:.: 1.54:1.000:. ./.:4:38,104:.:-0.97:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:78,84:.:-0.62:1.000:. ./.:4:118,100:.: 0.35:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:167,82:.: 0.89:1.000:. ./.:4:203,99:.: 1.82:1.000:. ./.:4:195,32:.: 0.51:1.000:. ./.:4:238,73:.: 1.97:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:168,75:.: 0.79:1.000:. ./.:4:235,44:.: 1.42:1.000:. ./.:4:127,59:.:-0.21:1.000:. ./.:4:127,42:.:-0.50:1.000:. ./.:4:99,93:.:-0.10:0.777:. ./.:4:89,24:.:-1.48:1.000:. ./.:4:117,107:.: 0.46:1.000:. ./.:4:59,80:.:-1.02:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:126,33:.:-0.68:1.000:. ./.:4:187,32:.: 0.37:1.000:. ./.:4:142,55:.:-0.01:1.000:. ./.:4:153,93:.: 0.84:1.000:. ./.:4:125,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:232,55:.: 1.55:1.000:. ./.:4:252,56:.: 1.92:1.000:. ./.:4:190,45:.: 0.65:0.846:. ./.:4:279,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:271,73:.: 2.55:1.000:. ./.:4:99,39:.:-1.04:1.000:. ./.:4:270,62:.: 2.34:1.000:. ./.:4:128,99:.: 0.51:1.000:. ./.:4:88,39:.:-1.23:1.000:. ./.:4:128,28:.:-0.73:1.000:. ./.:4:129,55:.:-0.24:1.000:. ./.:4:112,41:.:-0.78:1.000:. ./.:3:102,39:.:-0.99:1.000:. ./.:4:118,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:99,101:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,52:.:-1.53:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:122,82:.: 0.11:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:118,66:.:-0.24:1.000:. ./.:4:210,58:.: 1.22:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:137,36:.:-0.43:1.000:. ./.:4:199,38:.: 0.68:1.000:. ./.:4:149,45:.:-0.07:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:178,44:.: 0.42:1.000:. ./.:4:126,37:.:-0.61:1.000:. ./.:4:208,40:.: 0.87:1.000:. ./.:4:167,85:.: 0.94:1.000:. ./.:4:187,51:.: 0.70:1.000:. ./.:4:97,92:.:-0.15:1.000:. ./.:4:179,59:.: 0.70:0.999:. ./.:4:236,40:.: 1.36:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.20:0.774:. ./.:4:226,42:.: 1.22:1.000:. ./.:4:133,59:.:-0.10:1.000:. ./.:4:124,45:.:-0.50:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:108,39:.:-0.88:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:95,98:.:-0.08:1.000:. ./.:4:160,61:.: 0.40:1.000:. ./.:4:194,48:.: 0.77:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.35:0.993:. ./.:4:245,38:.: 1.48:1.000:. ./.:4:62,64:.:-1.25:1.000:. ./.:4:127,49:.:-0.38:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:110,41:.:-0.82:1.000:. ./.:4:117,30:.:-0.88:1.000:. ./.:4:76,83:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:176,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:165,52:.: 0.33:1.000:. ./.:4:213,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:157,90:.: 0.86:1.000:. ./.:4:83,78:.:-0.64:1.000:. ./.:4:113,84:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,85:.:-0.69:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:95,77:.:-0.45:1.000:. ./.:4:166,77:.: 0.79:1.000:. ./.:4:258,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:120,85:.: 0.13:1.000:. ./.:4:113,33:.:-0.90:1.000:. ./.:4:105,29:.:-1.11:1.000:. ./.:4:108,91:.: 0.02:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:46,18:.:-2.33:1.000:. ./.:4:74,18:.:-1.84:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:210,45:.: 1.00:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:82,109:.:-0.12:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.31:0.998:. ./.:4:180,39:.: 0.37:1.000:. ./.:4:61,59:.:-1.36:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:182,26:.: 0.18:1.000:. ./.:4:128,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,61:.:-1.48:1.000:. ./.:4:109,37:.:-0.90:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:153,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:115,36:.:-0.82:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:162,26:.:-0.17:1.000:. ./.:4:130,52:.:-0.28:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:72,69:.:-0.99:1.000:. ./.:4:169,38:.: 0.16:1.000:. ./.:4:88,98:.:-0.21:1.000:. ./.:4:178,83:.: 1.10:1.000:. ./.:4:199,28:.: 0.51:1.000:. ./.:4:187,24:.: 0.23:1.000:. ./.:4:228,38:.: 1.19:1.000:. ./.:4:127,40:.:-0.54:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:173,26:.: 0.02:1.000:. ./.:4:146,37:.:-0.26:1.000:. -chr2.1 16361328 chr2.1_016361328 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:201,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:138,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:131,14:.: 0.28:1.000:. ./.:4:152,7:.: 0.63:1.000:. ./.:4:83,11:.:-0.99:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:90,12:.:-0.79:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:131,6:.: 0.08:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.77:0.982:. ./.:4:193,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:25,8:.:-2.52:1.000:. ./.:4:132,7:.: 0.13:1.000:. ./.:4:150,10:.: 0.65:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:119,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:67,8:.:-1.47:1.000:. ./.:4:161,9:.: 0.90:1.000:. ./.:4:147,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:110,8:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:17,23:.:-2.34:1.000:. ./.:4:31,3:.:-2.49:1.000:. ./.:3:16,5:.:-2.82:1.000:. ./.:4:117,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:135,9:.: 0.25:1.000:. ./.:4:133,10:.: 0.23:1.000:. ./.:4:95,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:114,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:135,12:.: 0.33:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:172,9:.: 1.18:1.000:. ./.:4:107,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:143,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:125,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:143,3:.: 0.30:1.000:. ./.:4:23,6:.:-2.62:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:100,9:.:-0.62:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:171,10:.: 1.18:1.000:. ./.:4:96,6:.:-0.79:1.000:. ./.:4:117,15:.:-0.05:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.15:1.000:. ./.:6:101,6:.:-0.67:1.000:. ./.:4:124,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,10:.:-1.07:1.000:. ./.:4:102,19:.:-0.32:1.000:. ./.:4:83,15:.:-0.89:1.000:. ./.:4:152,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:144,10:.: 0.50:1.000:. ./.:4:121,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.08:0.777:. ./.:4:136,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:187,9:.: 1.55:1.000:. ./.:4:121,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:132,8:.: 0.15:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:82,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:129,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:121,10:.:-0.07:1.000:. ./.:4:88,11:.:-0.87:1.000:. ./.:4:115,4:.:-0.37:0.846:. ./.:4:113,21:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,5:.: 0.85:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:165,5:.: 0.90:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:112,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:116,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:125,7:.:-0.05:1.000:. ./.:3:84,8:.:-1.04:1.000:. ./.:4:120,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:125,10:.: 0.03:1.000:. ./.:4:102,5:.:-0.67:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:119,15:.: 0.00:1.000:. ./.:4:140,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,12:.:-0.37:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:87,18:.:-0.72:1.000:. ./.:4:87,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:92,8:.:-0.84:1.000:. ./.:4:126,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:124,16:.: 0.15:1.000:. ./.:4:113,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:76,8:.:-1.24:1.000:. ./.:4:153,10:.: 0.73:1.000:. ./.:4:127,11:.: 0.10:0.999:. ./.:4:92,18:.:-0.60:1.000:. ./.:4:57,7:.:-1.74:0.774:. ./.:4:146,8:.: 0.50:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:127,8:.: 0.03:1.000:. ./.:4:77,10:.:-1.17:1.000:. ./.:4:75,12:.:-1.17:1.000:. ./.:4:97,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:141,9:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,10:.:-1.09:1.000:. ./.:4:135,7:.: 0.20:1.000:. ./.:4:105,17:.:-0.30:0.993:. ./.:4:76,13:.:-1.12:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:111,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:97,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:135,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:125,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:104,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:98,7:.:-0.72:1.000:. ./.:4:198,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:60,16:.:-1.44:1.000:. ./.:4:158,10:.: 0.85:1.000:. ./.:4:189,8:.: 1.57:1.000:. ./.:4:104,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:87,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:125,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:126,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:49,4:.:-2.02:1.000:. ./.:4:100,10:.:-0.60:1.000:. ./.:4:151,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:95,17:.:-0.55:1.000:. ./.:4:174,6:.: 1.15:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:44,16:.:-1.84:0.998:. ./.:4:183,6:.: 1.38:1.000:. ./.:4:134,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:70,7:.:-1.42:1.000:. ./.:4:84,13:.:-0.92:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:94,5:.:-0.87:1.000:. ./.:4:103,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:80,15:.:-0.97:1.000:. ./.:4:131,6:.: 0.08:0.999:. ./.:4:171,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:89,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:160,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:108,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:112,7:.:-0.37:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:158,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:149,4:.: 0.48:1.000:. ./.:4:107,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:169,8:.: 1.08:1.000:. ./.:4:160,10:.: 0.90:1.000:. ./.:4:223,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:65,6:.:-1.57:1.000:. ./.:4:142,5:.: 0.33:1.000:. -chr2.1 16422728 chr2.1_016422728 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:84,29:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,34:0.34: 0.01:1.000:0.880 0/0/1/1:4:62,52:0.40: 0.86:1.000:0.803 0/0/1/1:4:46,62:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,73:0.53: 1.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,83:0.49: 2.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,61:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,32:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.22:-1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,24:0.75:-1.91:1.000:0.999 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,28:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,34:0.30: 0.33:1.000:0.983 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.59:0.982:1.000 0/0/0/1:4:95,35:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,38:0.27: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,42:0.34: 0.63:1.000:0.844 0/0/1/1:4:10,8:0.39:-2.27:1.000:0.700 0/0/0/1:4:83,28:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,85:0.54: 1.74:1.000:0.990 0/0/0/1:4:47,33:0.36:-0.25:1.000:0.667 0/0/0/1:4:6,3:0.29:-2.57:1.000:0.992 0/0/0/1:4:72,35:0.28: 0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,35:0.23: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,35:0.29: 0.53:1.000:0.990 0/0/0/1:4:74,31:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,82:0.51: 1.80:1.000:0.996 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.44:1.000:1.000 0/1/1:3:4,7:0.57:-2.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:84,46:0.31: 1.38:1.000:0.975 0/0/1/1:4:57,74:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,28:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,26:0.29:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:43,69:0.55: 0.79:1.000:0.981 0/0/0/1:4:64,21:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,55:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:47,24:0.29:-0.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:39,41:0.45:-0.25:1.000:0.982 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,27:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,44:0.31: 1.21:1.000:0.978 0/0/0/1:4:43,18:0.26:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,22:0.29:-0.71:1.000:0.992 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,15:0.18:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,31:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,66:0.60: 0.37:1.000:0.817 0/1/1/1:4:29,93:0.69: 1.12:1.000:0.970 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,51:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,33:0.46:-0.81:1.000:0.989 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:32,28:0.41:-0.90:1.000:0.555 0/0/1/1:4:38,46:0.48:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,23:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,28:0.29:-0.09:1.000:0.993 0/0/0/0:4:67,1:0.01:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,37:0.36: 0.11:1.000:0.728 0/0/0/1:4:62,29:0.28: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,18:0.38:-1.49:1.000:0.522 0/0/0/1:4:51,16:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,48:0.51:-0.15:0.777:0.996 0/0/0/1:4:72,27:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,50:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,33:0.73:-1.52:1.000:0.997 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,27:0.17: 1.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:61,20:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,18:0.27:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,59:0.54: 0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:41,42:0.45:-0.15:1.000:0.976 0/0/0/1:4:72,26:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,34:0.28: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,14:0.25:-1.26:0.846:0.999 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,23:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,32:0.30: 0.17:1.000:0.985 0/0/0/1:4:40,19:0.28:-0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,65:0.63: 0.17:1.000:0.531 0/0/0/1:4:41,22:0.30:-0.81:1.000:0.981 0/0/0/1:4:39,21:0.31:-0.90:1.000:0.980 0/0/0/1:4:55,14:0.18:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,20:0.22:-0.35:1.000:1.000 0/0/1:3:19,22:0.47:-1.52:1.000:0.847 0/0/0/1:4:46,21:0.27:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,53:0.45: 0.50:1.000:0.984 0/0/1/1:4:30,51:0.56:-0.22:1.000:0.964 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,39:0.40:-0.06:1.000:0.782 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,24:0.37:-1.00:1.000:0.569 0/0/0/1:4:55,28:0.29:-0.15:1.000:0.990 0/0/0/0:4:88,1:0.01: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,11:0.22:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,21:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.28:-1.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,20:0.19: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,31:0.26: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:78,40:0.30: 0.99:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,49:0.44: 0.37:1.000:0.961 0/0/0/1:4:63,22:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,91:0.47: 2.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:40,16:0.25:-1.03:0.999:0.999 0/0/0/1:4:59,21:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.43:0.774:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.22:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.22:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,22:0.19: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,51:0.45: 0.37:1.000:0.984 0/0/1/1:4:66,62:0.43: 1.31:1.000:0.938 0/0/0/1:4:58,22:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.64:0.993:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.20:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,30:0.58:-1.36:1.000:0.901 0/0/0/1:4:41,27:0.35:-0.64:1.000:0.811 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,38:0.27: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:33,15:0.27:-1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,42:0.42: 0.04:1.000:0.895 0/0/0/1:4:75,22:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,25:0.19: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,14:0.28:-1.43:1.000:0.996 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,40:0.54:-0.71:1.000:0.988 0/0/1/1:4:34,59:0.57: 0.17:1.000:0.956 0/0/1/1:4:29,45:0.54:-0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:40,48:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,79:0.57: 1.15:1.000:0.936 0/0/1/1:4:37,71:0.59: 0.66:1.000:0.875 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,56:0.45: 0.69:1.000:0.983 0/0/0/1:4:95,32:0.22: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,28:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,94:0.51: 2.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.33:-2.34:1.000:0.929 0/0/0/1:4:72,23:0.21: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,36:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,1:0.01: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,89:0.65: 1.18:1.000:0.749 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.35:0.998:1.000 0/0/1/1:4:65,50:0.38: 0.89:1.000:0.596 0/0/1/1:4:49,66:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,17:0.16: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,32:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,58:0.46: 0.76:1.000:0.989 0/0/0/1:4:94,41:0.26: 1.54:1.000:0.998 0/0/0/0:4:69,1:0.01:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.20:0.999:1.000 0/0/0/1:4:69,36:0.30: 0.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:50,68:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,27:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,28:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,35:0.47:-0.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:73,21:0.19: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,84:0.55: 1.54:1.000:0.975 0/0/1/1:4:45,59:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,29:0.20: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,24:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,36:0.34: 0.14:1.000:0.852 0/0/0/1:4:111,40:0.23: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,35:0.37:-0.19:1.000:0.501 0/0/0/1:4:83,36:0.26: 1.02:1.000:0.999 -chr2.1 16773051 chr2.1_016773051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:196,186:0.47: 0.91:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,178:0.77:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,185:0.69:-0.61:1.000:0.972 0/1/1/1:4:91,253:0.72: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:255,230:0.46: 2.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:187,187:0.49: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,37:0.21:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,177:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,165:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,105:0.65:-1.95:1.000:0.793 0/1/1/1:4:36,92:0.70:-2.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:142,158:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,164:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/0:4:368,1:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,156:0.46: 0.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:249,71:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,95:0.25: 0.64:0.982:0.999 0/1/1/1:4:73,249:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,241:0.52: 1.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:248,105:0.29: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:139,35:0.19:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,184:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,182:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,139:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,88:0.58:-2.06:1.000:0.927 0/0/1/1:4:136,160:0.53:-0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:187,168:0.46: 0.56:1.000:0.987 0/0/0/1:4:240,95:0.27: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,175:0.47: 0.69:1.000:0.991 0/1/1/1:4:61,196:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,126:0.46:-0.60:1.000:0.990 0/0/0/1:4:177,52:0.22:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,36:0.42:-2.89:1.000:0.894 0/0/0/1:4:170,72:0.29:-0.88:1.000:0.994 0/1/1:3:7,12:0.62:-3.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:339,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,211:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,83:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,92:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:163,166:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,157:0.46: 0.27:1.000:0.987 0/0/1/1:4:160,166:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:284,99:0.25: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,150:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:320,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,197:0.46: 1.35:1.000:0.987 0/0/0/1:4:263,110:0.28: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:386,392:0.49: 5.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:212,85:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:191,80:0.28:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,188:0.55: 0.31:1.000:0.982 0/0/1/1:4:221,234:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,63:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,196:0.46: 1.29:1.000:0.989 0/1/1/1:4:80,257:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:178,72:0.28:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,159:0.54:-0.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:133,155:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:199,75:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:162,113:0.40:-0.46:1.000:0.660 0/0/1/1:4:154,160:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:238,87:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:219,87:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:275,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,177:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:234,108:0.30: 0.40:1.000:0.981 0/0/1/1:4:119,129:0.51:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,174:0.55:-0.02:1.000:0.981 0/1/1/1:4:88,222:0.70:-0.01:0.777:0.986 0/1/1/1:4:95,248:0.71: 0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:152,173:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,203:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,78:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:277,97:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,313:0.78: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,127:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,167:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:187,178:0.47: 0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:263,74:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,175:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:173,63:0.26:-0.96:0.846:0.999 0/0/0/1:4:307,83:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,189:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,179:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:220,79:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:220,232:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,137:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:229,78:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,143:0.47:-0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:134,142:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/1:3:99,47:0.31:-2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,177:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:98,290:0.73: 0.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:168,162:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:213,76:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,163:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:212,83:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:77,210:0.72:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,179:0.48: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:236,102:0.29: 0.35:1.000:0.992 0/0/0/1:4:220,69:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:385,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,79:0.29:-0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:167,141:0.44:-0.04:1.000:0.974 0/0/1/1:4:128,114:0.46:-0.88:1.000:0.986 0/0/0/1:4:264,87:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,67:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,160:0.52:-0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:347,132:0.26: 2.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:170,158:0.47: 0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:199,181:0.46: 0.88:1.000:0.989 0/0/1/1:4:189,193:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:252,78:0.23: 0.24:0.999:1.000 0/0/0/1:4:218,88:0.28:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:182,0:0.00:-1.64:0.774:1.000 0/0/1/1:4:179,195:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,132:0.43:-0.20:1.000:0.957 0/0/1/1:4:135,152:0.52:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:198,75:0.26:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:211,71:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,220:0.53: 1.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:261,87:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,244:0.72: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,157:0.52:-0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:266,86:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:340,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,57:0.18:-0.05:0.993:0.999 0/0/1/1:4:103,116:0.52:-1.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,147:0.75:-1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,81:0.29:-0.52:1.000:0.993 0/0/0/1:4:237,89:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,144:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,100:0.51:-1.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,186:0.72:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,164:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:332,120:0.25: 1.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,188:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:207,57:0.21:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,69:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,157:0.46: 0.26:1.000:0.988 0/1/1/1:4:70,283:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,156:0.47: 0.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:84,217:0.71:-0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:177,59:0.24:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,297:0.70: 1.37:1.000:0.981 0/0/1/1:4:249,225:0.46: 2.08:1.000:0.988 0/0/0/0:4:390,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,180:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:211,182:0.45: 1.05:1.000:0.980 0/0/1/1:4:118,135:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,270:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,61:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,51:0.51:-2.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,103:0.53:-1.57:1.000:0.991 0/0/0/1:4:241,76:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:289,76:0.20: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:299,86:0.21: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,252:0.72: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/0:4:277,0:0.00:-0.43:0.998:1.000 0/0/1/1:4:168,161:0.48: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:128,130:0.49:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,76:0.27:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,128:0.45:-0.43:1.000:0.979 0/0/0/1:4:217,73:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,202:0.77:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,141:0.43: 0.10:1.000:0.944 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,138:0.50:-0.57:0.999:0.997 0/0/0/1:4:223,92:0.28: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:125,137:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,71:0.28:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,50:0.22:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,151:0.46: 0.06:1.000:0.990 0/0/0/0:4:269,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,169:0.74:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,134:0.53:-0.83:1.000:0.992 0/1/1/1:4:75,225:0.74:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:196,179:0.46: 0.82:1.000:0.990 0/0/1/1:4:185,145:0.43: 0.24:1.000:0.936 0/0/1/1:4:165,157:0.47: 0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:225,75:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,206:0.54: 0.75:1.000:0.986 0/0/0/1:4:318,102:0.23: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,130:0.50:-0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,197:0.49: 1.01:1.000:0.996 -chr2.1 17012486 chr2.1_017012486 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:44,122:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,120:0.73:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,109:0.52: 1.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,79:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,40:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,63:0.30: 1.38:1.000:0.981 0/1/1/1:4:42,118:0.75:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,100:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,94:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,43:0.66:-2.23:1.000:0.854 0/0/1/1:4:50,40:0.47:-1.73:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,121:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,128:0.73: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,142:0.77: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,116:0.73:-0.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,246:1.00: 1.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 1.11:0.982:1.000 0/0/1/1:4:103,120:0.56: 1.18:1.000:0.972 0/1/1/1:4:64,190:0.76: 1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,146:0.75: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,15:0.38:-2.76:1.000:0.528 0/1/1/1:4:59,139:0.72: 0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:159,39:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,135:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,23:0.50:-2.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,138:0.49: 2.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,134:0.57: 1.57:1.000:0.934 0/0/1/1:4:86,89:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:86,84:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,102:0.47: 1.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:79,176:0.70: 1.88:1.000:0.989 0/1/1/1:4:75,168:0.71: 1.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,24:0.59:-2.78:1.000:0.868 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-2.65:1.000:1.000 0/0/1:3:32,11:0.29:-2.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,156:0.75: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,98:0.44: 1.42:1.000:0.971 0/0/1/1:4:104,100:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,155:0.79: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,51:0.28: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,60:0.46:-0.68:1.000:0.986 0/0/1/1:4:97,83:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,75:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,36:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,129:0.74: 0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,130:0.78: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,132:0.74: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,107:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,103:0.71:-0.48:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,88:0.72:-0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,163:0.79: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,32:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,35:0.22: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,195:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,82:0.46: 0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:110,109:0.52: 1.09:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:91,25:0.25:-1.16:1.000:0.507 0/0/0/1:4:106,45:0.33:-0.40:1.000:0.925 0/0/1/1:4:78,70:0.49:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,85:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,99:0.66:-0.35:1.000:0.886 0/0/0/1:4:132,43:0.28: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,90:0.53: 0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:40,116:0.76:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,121:0.78:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,85:0.50: 0.22:0.777:0.997 0/1/1/1:4:38,114:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,104:0.55: 0.54:1.000:0.974 0/0/1/1:4:61,74:0.57:-0.75:1.000:0.955 0/1/1/1:4:56,164:0.76: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,142:0.72: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,64:0.52:-0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,112:0.77:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,40:0.32:-0.66:1.000:0.955 0/0/1/1:4:65,72:0.54:-0.70:1.000:0.984 0/0/1/1:4:87,106:0.57: 0.52:1.000:0.952 0/0/1/1:4:103,99:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,85:0.58:-0.37:0.846:0.924 0/1/1/1:4:35,105:0.76:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,77:0.46: 0.15:1.000:0.988 0/1/1/1:4:43,116:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,83:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,83:0.58:-0.44:1.000:0.931 0/1/1/1:4:39,96:0.73:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,86:0.74:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,95:0.81:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,98:0.70:-0.57:1.000:0.985 0/1/1:3:30,66:0.70:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,109:0.78:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,86:0.43: 0.89:1.000:0.956 0/0/1/1:4:61,67:0.54:-0.90:1.000:0.986 0/1/1/1:4:42,154:0.80: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,85:0.48: 0.37:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,95:0.74:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,73:0.53:-0.59:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,187:1.00: 0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,100:0.72:-0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,76:0.72:-1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,62:0.49:-0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,83:0.77:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,179:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,91:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,152:0.77: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,144:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,63:0.37: 0.28:1.000:0.506 0/0/1/1:4:52,79:0.62:-0.83:1.000:0.569 0/0/1/1:4:147,132:0.49: 2.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,103:0.82:-0.92:0.999:0.999 0/0/1/1:4:75,83:0.54:-0.24:1.000:0.985 0/1/1/1:4:23,108:0.83:-0.83:0.774:0.997 0/0/1/1:4:82,81:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,105:0.79:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,67:0.73:-1.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,116:0.79:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,104:0.79:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,133:0.75: 0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,89:0.59:-0.29:1.000:0.873 0/0/0/1:4:142,46:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,81:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,106:0.81:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,110:0.75:-0.44:0.993:0.999 0/0/0/1:4:109,45:0.32:-0.33:1.000:0.944 0/0/1/1:4:75,66:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,92:0.74:-0.92:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,167:0.74: 1.35:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,78:0.77:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,73:0.55:-0.70:1.000:0.978 0/1/1/1:4:44,114:0.74:-0.24:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,243:1.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,83:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,57:0.56:-1.38:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,26:0.27:-1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,75:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,66:0.55:-0.96:1.000:0.983 0/0/1/1:4:78,80:0.53:-0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:26,82:0.77:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,125:0.59: 1.11:1.000:0.886 0/0/0/1:4:142,47:0.28: 0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,154:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,51:0.31: 0.39:1.000:0.980 0/1/1/1:4:68,145:0.70: 0.96:1.000:0.981 0/1/1/1:4:43,146:0.78: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,117:0.49: 1.75:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,202:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,35:0.74:-2.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,124:0.72: 0.15:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,240:1.00: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,79:0.44: 0.48:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,203:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,95:0.52: 0.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,115:0.78:-0.42:0.998:1.000 0/0/1/1:4:117,95:0.47: 0.94:1.000:0.992 0/0/1/1:4:119,117:0.52: 1.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,100:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,74:0.44: 0.15:1.000:0.973 0/1/1/1:4:47,147:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,102:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,142:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,131:0.73: 0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,174:0.77: 1.33:0.999:1.000 0/1/1/1:4:40,137:0.79: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,92:0.56: 0.04:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,80:0.48: 0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,140:0.81: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,149:0.80: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,77:0.47: 0.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:100,75:0.45: 0.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:137,114:0.48: 1.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:158,49:0.27: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,120:0.53: 1.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,108:0.53: 0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,83:0.47: 0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:63,169:0.74: 1.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,200:1.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,86:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,83:0.47: 0.35:1.000:0.993 -chr2.1 17248294 chr2.1_017248294 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,24:.: 1.10:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:55,13:.:-0.10:1.000:. ./.:4:65,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:70,29:.: 1.45:1.000:. ./.:4:68,13:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:49,15:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:12,2:.:-2.81:1.000:. ./.:4:28,10:.:-1.61:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:63,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.15:0.982:. ./.:4:75,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:82,24:.: 1.80:1.000:. ./.:4:56,18:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,7:.:-1.91:1.000:. ./.:4:58,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:73,13:.: 0.80:1.000:. ./.:4:77,9:.: 0.80:1.000:. ./.:4:74,20:.: 1.20:1.000:. ./.:4:47,18:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:45,6:.:-0.95:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.86:1.000:. ./.:3:27,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:60,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:42,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:68,15:.: 0.65:1.000:. ./.:4:56,12:.:-0.10:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:33,10:.:-1.35:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:65,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:44,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:59,17:.: 0.30:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,16:.: 0.55:1.000:. ./.:4:64,16:.: 0.50:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:56,12:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.35:1.000:. ./.:6:46,9:.:-0.75:1.000:. ./.:4:37,15:.:-0.90:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:62,9:.: 0.05:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:58,15:.: 0.15:1.000:. ./.:4:52,7:.:-0.55:0.777:. ./.:4:92,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:48,18:.:-0.20:1.000:. ./.:4:35,12:.:-1.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,15:.: 0.35:1.000:. ./.:4:53,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:55,13:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.60:0.846:. ./.:4:77,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:62,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:69,22:.: 1.05:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:36,10:.:-1.20:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.05:1.000:. ./.:3:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:59,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:64,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:62,11:.: 0.15:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:55,10:.:-0.25:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:41,17:.:-0.60:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:59,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:49,12:.:-0.45:1.000:. ./.:4:85,22:.: 1.85:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:78,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.45:0.774:. ./.:4:67,6:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:59,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:61,14:.: 0.25:1.000:. ./.:4:69,17:.: 0.80:1.000:. ./.:4:48,5:.:-0.85:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.00:0.993:. ./.:4:47,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:38,2:.:-1.50:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:31,6:.:-1.66:1.000:. ./.:4:44,7:.:-0.95:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:121,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:47,11:.:-0.60:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:56,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:51,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.25:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:69,17:.: 0.80:1.000:. ./.:4:82,23:.: 1.75:1.000:. ./.:4:112,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:64,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:84,14:.: 1.40:1.000:. ./.:4:70,18:.: 0.90:1.000:. ./.:4:99,15:.: 2.20:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:76,19:.: 1.25:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.35:0.998:. ./.:4:55,17:.: 0.10:1.000:. ./.:4:55,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:46,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:54,17:.: 0.05:1.000:. ./.:4:69,12:.: 0.55:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.40:0.999:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:50,20:.: 0.00:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.40:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.35:1.000:. ./.:4:89,8:.: 1.35:1.000:. ./.:4:71,17:.: 0.90:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.25:1.000:. ./.:4:71,9:.: 0.50:1.000:. ./.:4:51,11:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:132,0:.: 3.10:1.000:. ./.:4:58,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.55:1.000:. -chr2.1 17466740 chr2.1_017466740 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:100,6:.: 0.61:1.000:. ./.:4:97,6:.: 0.53:1.000:. ./.:4:78,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:43,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:66,13:.:-0.11:1.000:. ./.:4:110,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:65,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:109,7:.: 0.88:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.65:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:105,4:.: 0.69:1.000:. ./.:4:125,5:.: 1.26:1.000:. ./.:4:186,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:165,0:.: 2.20:0.982:. ./.:4:120,8:.: 1.21:1.000:. ./.:4:177,4:.: 2.63:1.000:. ./.:4:123,6:.: 1.23:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.91:1.000:. ./.:4:121,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:53,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.94:1.000:. ./.:4:59,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:116,9:.: 1.12:1.000:. ./.:4:65,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:106,6:.: 0.78:1.000:. ./.:4:140,7:.: 1.72:1.000:. ./.:4:173,6:.: 2.58:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.16:1.000:. ./.:3:12,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:124,9:.: 1.34:1.000:. ./.:4:105,3:.: 0.67:1.000:. ./.:4:68,5:.:-0.27:1.000:. ./.:4:121,4:.: 1.12:1.000:. ./.:4:75,13:.: 0.13:1.000:. ./.:4:65,5:.:-0.35:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:81,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:35,8:.:-1.08:1.000:. ./.:4:54,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:93,6:.: 0.43:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:68,5:.:-0.27:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:40,6:.:-1.00:1.000:. ./.:4:48,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:41,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:50,9:.:-0.65:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.40:1.000:. ./.:6:27,9:.:-1.27:1.000:. ./.:4:39,5:.:-1.05:1.000:. ./.:4:66,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:62,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:39,8:.:-0.97:1.000:. ./.:4:41,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:78,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:76,6:.:-0.03:0.777:. ./.:4:80,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:67,11:.:-0.14:1.000:. ./.:4:81,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:59,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:95,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:44,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:56,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:87,5:.: 0.24:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.91:0.846:. ./.:4:106,3:.: 0.69:1.000:. ./.:4:70,8:.:-0.14:1.000:. ./.:4:106,7:.: 0.80:1.000:. ./.:4:86,12:.: 0.40:1.000:. ./.:4:42,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:42,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:102,6:.: 0.67:1.000:. ./.:3:53,4:.:-0.70:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:72,4:.:-0.19:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:99,4:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:59,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:23,3:.:-1.54:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:44,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:64,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:32,3:.:-1.30:1.000:. ./.:4:156,2:.: 2.01:1.000:. ./.:4:146,4:.: 1.80:1.000:. ./.:4:47,8:.:-0.76:1.000:. ./.:4:56,4:.:-0.62:1.000:. ./.:4:75,11:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,3:.:-0.57:0.999:. ./.:4:63,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:45,4:.:-0.92:0.774:. ./.:4:55,5:.:-0.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:82,3:.: 0.05:1.000:. ./.:4:84,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:63,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.13:0.993:. ./.:4:36,7:.:-1.08:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,3:.: 1.18:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:60,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:110,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:197,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:77,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:42,4:.:-1.00:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:33,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:50,5:.:-0.76:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:94,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:51,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.38:1.000:. ./.:4:66,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:93,7:.: 0.45:1.000:. ./.:4:40,7:.:-0.97:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:122,8:.: 1.26:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:27,4:.:-1.40:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:86,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:166,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:91,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,2:.:-0.03:0.998:. ./.:4:105,5:.: 0.72:1.000:. ./.:4:54,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:109,3:.: 0.78:1.000:. ./.:4:87,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:91,7:.: 0.40:1.000:. ./.:4:128,10:.: 1.47:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:102,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:105,4:.: 0.69:0.999:. ./.:4:75,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,5:.:-0.68:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:71,11:.:-0.03:1.000:. ./.:4:104,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:87,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:93,6:.: 0.43:1.000:. ./.:4:88,8:.: 0.34:1.000:. ./.:4:143,5:.: 1.74:1.000:. ./.:4:57,8:.:-0.49:1.000:. ./.:4:117,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:94,7:.: 0.48:1.000:. ./.:4:62,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:182,7:.: 2.85:1.000:. ./.:4:173,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:72,4:.:-0.19:1.000:. ./.:4:61,6:.:-0.44:1.000:. -chr2.1 17523753 chr2.1_017523753 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:171,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.36:0.982:. ./.:4:167,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.62:1.000:. ./.:3:19,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:207,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.52:1.000:. ./.:6:60,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.06:0.777:. ./.:4:136,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:252,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.12:0.846:. ./.:4:115,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:185,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.15:1.000:. ./.:3:41,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:36,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.04:0.774:. ./.:4:95,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:207,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-1.27:0.993:. ./.:4:37,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:205,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:131,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.64:0.998:. ./.:4:77,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.91:0.999:. ./.:4:82,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:90,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.42:1.000:. -chr2.1 17785072 chr2.1_017785072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:149,157:.:-0.69:1.000:. ./.:4:271,64:.:-0.38:1.000:. ./.:4:274,80:.:-0.17:1.000:. ./.:4:309,81:.: 0.21:1.000:. ./.:4:450,94:.: 1.86:1.000:. ./.:4:496,107:.: 2.49:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:241,192:.: 0.67:1.000:. ./.:4:348,66:.: 0.47:1.000:. ./.:4:51,106:.:-2.28:1.000:. ./.:4:234,37:.:-1.06:1.000:. ./.:4:288,75:.:-0.08:1.000:. ./.:4:141,152:.:-0.83:1.000:. ./.:4:355,88:.: 0.78:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:247,89:.:-0.37:1.000:. ./.:4:231,89:.:-0.54:0.982:. ./.:4:213,169:.: 0.13:1.000:. ./.:4:501,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:428,93:.: 1.61:1.000:. ./.:4:181,3:.:-2.00:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:417,106:.: 1.64:1.000:. ./.:4:152,161:.:-0.61:1.000:. ./.:4:53,45:.:-2.92:1.000:. ./.:4:317,185:.: 1.41:1.000:. ./.:4:312,79:.: 0.22:1.000:. ./.:4:233,147:.: 0.10:1.000:. ./.:4:337,88:.: 0.59:1.000:. ./.:4:381,100:.: 1.19:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:138,137:.:-1.02:1.000:. ./.:4:111,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:117,51:.:-2.17:1.000:. ./.:3:114,25:.:-2.48:1.000:. ./.:4:348,91:.: 0.74:1.000:. ./.:4:327,84:.: 0.44:1.000:. ./.:4:273,167:.: 0.75:1.000:. ./.:4:405,79:.: 1.22:1.000:. ./.:4:489,92:.: 2.26:1.000:. ./.:4:279,80:.:-0.12:1.000:. ./.:4:226,155:.: 0.12:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:351,77:.: 0.62:1.000:. ./.:4:324,84:.: 0.40:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:341,103:.: 0.79:1.000:. ./.:4:165,159:.:-0.50:1.000:. ./.:4:284,84:.:-0.02:1.000:. ./.:4:266,97:.:-0.08:1.000:. ./.:4:124,131:.:-1.23:1.000:. ./.:4:176,180:.:-0.15:1.000:. ./.:4:203,67:.:-1.07:1.000:. ./.:4:412,79:.: 1.29:1.000:. ./.:4:341,52:.: 0.24:1.000:. ./.:4:256,65:.:-0.53:1.000:. ./.:4:195,137:.:-0.41:1.000:. ./.:4:299,191:.: 1.28:1.000:. ./.:4:229,77:.:-0.69:1.000:. ./.:6:278,87:.:-0.06:1.000:. ./.:4:332,80:.: 0.45:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:560,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:302,78:.: 0.10:1.000:. ./.:4:380,96:.: 1.13:1.000:. ./.:4:230,136:.:-0.05:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:153,187:.:-0.32:1.000:. ./.:4:332,69:.: 0.33:0.777:. ./.:4:237,60:.:-0.78:1.000:. ./.:4:229,166:.: 0.27:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:310,175:.: 1.23:1.000:. ./.:4:257,74:.:-0.42:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:423,71:.: 1.33:1.000:. ./.:4:211,133:.:-0.28:1.000:. ./.:4:251,168:.: 0.52:1.000:. ./.:4:333,80:.: 0.46:1.000:. ./.:4:259,112:.: 0.01:0.846:. ./.:4:402,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:272,78:.:-0.22:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:670,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:287,160:.: 0.82:1.000:. ./.:4:141,128:.:-1.08:1.000:. ./.:4:247,72:.:-0.55:1.000:. ./.:4:124,131:.:-1.23:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.52:1.000:. ./.:3:269,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:345,98:.: 0.78:1.000:. ./.:4:149,111:.:-1.18:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:267,178:.: 0.80:1.000:. ./.:4:184,54:.:-1.42:1.000:. ./.:4:283,66:.:-0.23:1.000:. ./.:4:367,80:.: 0.82:1.000:. ./.:4:241,81:.:-0.52:1.000:. ./.:4:187,65:.:-1.27:1.000:. ./.:4:377,87:.: 1.00:1.000:. ./.:4:199,63:.:-1.16:1.000:. ./.:4:252,67:.:-0.55:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:222,72:.:-0.82:1.000:. ./.:4:194,133:.:-0.46:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:370,66:.: 0.70:1.000:. ./.:4:258,80:.:-0.35:1.000:. ./.:4:329,181:.: 1.50:1.000:. ./.:4:257,62:.:-0.55:0.999:. ./.:4:408,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:218,56:.:-1.03:0.774:. ./.:4:300,92:.: 0.23:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:270,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:148,155:.:-0.72:1.000:. ./.:4:204,69:.:-1.04:1.000:. ./.:4:311,70:.: 0.12:1.000:. ./.:4:417,84:.: 1.40:1.000:. ./.:4:223,165:.: 0.19:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.10:0.993:. ./.:4:531,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:199,57:.:-1.22:1.000:. ./.:4:197,72:.:-1.08:1.000:. ./.:4:163,62:.:-1.56:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:107,109:.:-1.65:1.000:. ./.:4:266,71:.:-0.36:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:326,115:.: 0.76:1.000:. ./.:4:295,73:.:-0.02:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:179,71:.:-1.29:1.000:. ./.:4:369,89:.: 0.94:1.000:. ./.:4:288,77:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,129:.:-0.71:1.000:. ./.:4:290,57:.:-0.25:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:259,194:.: 0.89:1.000:. ./.:4:437,88:.: 1.66:1.000:. ./.:4:321,85:.: 0.38:1.000:. ./.:4:340,89:.: 0.63:1.000:. ./.:4:177,171:.:-0.24:1.000:. ./.:4:214,70:.:-0.92:1.000:. ./.:4:381,105:.: 1.24:1.000:. ./.:4:184,67:.:-1.28:1.000:. ./.:4:121,2:.:-2.65:1.000:. ./.:4:239,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:312,79:.: 0.22:1.000:. ./.:4:472,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:270,99:.:-0.01:1.000:. ./.:4:354,93:.: 0.82:1.000:. ./.:4:252,53:.:-0.70:0.998:. ./.:4:327,69:.: 0.28:1.000:. ./.:4:179,132:.:-0.63:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:299,77:.: 0.06:1.000:. ./.:4:286,73:.:-0.12:1.000:. ./.:4:305,81:.: 0.17:1.000:. ./.:4:173,150:.:-0.51:1.000:. ./.:4:308,55:.:-0.08:1.000:. ./.:4:295,81:.: 0.06:0.999:. ./.:4:337,69:.: 0.38:1.000:. ./.:4:217,151:.:-0.02:1.000:. ./.:4:190,62:.:-1.27:1.000:. ./.:4:276,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:262,61:.:-0.51:1.000:. ./.:4:301,63:.:-0.07:1.000:. ./.:4:244,71:.:-0.59:1.000:. ./.:4:409,116:.: 1.66:1.000:. ./.:4:452,104:.: 1.99:1.000:. ./.:4:331,94:.: 0.59:1.000:. ./.:4:315,65:.: 0.10:1.000:. ./.:4:285,164:.: 0.84:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:320,89:.: 0.42:1.000:. ./.:4:253,85:.:-0.35:1.000:. ./.:4:348,70:.: 0.51:1.000:. -chr2.1 17880939 chr2.1_017880939 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,87:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.91:1.000:. ./.:4:20,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,118:.: 1.31:1.000:. ./.:4:30,96:.: 1.63:1.000:. ./.:4:5,41:.:-1.55:1.000:. ./.:4:16,63:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,10:.:-2.78:1.000:. ./.:4:4,9:.:-2.86:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.04:1.000:. ./.:4:17,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,61:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,97:.: 1.43:1.000:. ./.:4:29,98:.: 1.67:1.000:. ./.:4:45,48:.: 0.32:0.982:. ./.:4:26,106:.: 1.87:1.000:. ./.:4:51,59:.: 0.99:1.000:. ./.:4:54,59:.: 1.11:1.000:. ./.:4:2,11:.:-2.86:1.000:. ./.:4:21,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:19,65:.:-0.04:1.000:. ./.:4:12,55:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,5:.:-3.14:1.000:. ./.:4:22,66:.: 0.12:1.000:. ./.:4:31,77:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,113:.: 1.11:1.000:. ./.:4:19,76:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.67:1.000:. ./.:4:14,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,63:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,3:.:-3.26:1.000:. ./.:4:1,11:.:-2.90:1.000:. ./.:3:1,4:.:-3.18:1.000:. ./.:4:41,45:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,101:.: 0.67:1.000:. ./.:4:17,57:.:-0.44:1.000:. ./.:4:20,58:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,93:.: 1.27:1.000:. ./.:4:12,66:.:-0.28:1.000:. ./.:4:20,76:.: 0.43:1.000:. ./.:4:39,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:20,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,38:.:-0.60:1.000:. ./.:4:12,71:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,76:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,23:.:-2.47:1.000:. ./.:4:46,54:.: 0.59:1.000:. ./.:4:8,64:.:-0.52:1.000:. ./.:4:20,42:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,129:.: 1.75:1.000:. ./.:4:26,83:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.87:1.000:. ./.:4:19,79:.: 0.51:1.000:. ./.:4:43,47:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,84:.: 1.15:1.000:. ./.:4:17,73:.: 0.20:1.000:. ./.:4:44,44:.: 0.12:1.000:. ./.:6:16,68:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,91:.: 1.15:1.000:. ./.:4:20,68:.: 0.12:1.000:. ./.:4:19,83:.: 0.67:1.000:. ./.:4:10,55:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,67:.: 0.32:1.000:. ./.:4:13,70:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,37:.:-1.47:1.000:. ./.:4:22,69:.: 0.24:1.000:. ./.:4:21,48:.:-0.64:0.777:. ./.:4:0,87:.: 0.08:1.000:. ./.:4:22,73:.: 0.40:1.000:. ./.:4:27,28:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.16:1.000:. ./.:4:18,74:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.67:1.000:. ./.:4:29,53:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,58:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.12:1.000:. ./.:4:15,98:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.20:0.846:. ./.:4:14,91:.: 0.79:1.000:. ./.:4:24,78:.: 0.67:1.000:. ./.:4:36,57:.: 0.32:1.000:. ./.:4:25,39:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.40:1.000:. ./.:4:15,54:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,46:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.56:1.000:. ./.:4:17,74:.: 0.24:1.000:. ./.:3:19,45:.:-0.84:1.000:. ./.:4:20,79:.: 0.55:1.000:. ./.:4:21,81:.: 0.67:1.000:. ./.:4:20,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:44,46:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,45:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,96:.: 1.07:1.000:. ./.:4:15,65:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,19:.:-2.35:1.000:. ./.:4:21,65:.: 0.04:1.000:. ./.:4:26,26:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,46:.:-0.92:1.000:. ./.:4:29,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:22,77:.: 0.55:1.000:. ./.:4:21,49:.:-0.60:1.000:. ./.:4:17,101:.: 1.31:1.000:. ./.:4:23,83:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.67:1.000:. ./.:4:21,68:.: 0.16:0.999:. ./.:4:18,64:.:-0.12:1.000:. ./.:4:20,52:.:-0.52:0.774:. ./.:4:21,77:.: 0.51:1.000:. ./.:4:31,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,61:.:-0.48:1.000:. ./.:4:12,63:.:-0.40:1.000:. ./.:4:10,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.71:1.000:. ./.:4:27,31:.:-1.07:1.000:. ./.:4:21,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:27,95:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.16:1.000:. ./.:4:38,42:.:-0.20:1.000:. ./.:4:38,36:.:-0.44:0.993:. ./.:4:0,80:.:-0.20:1.000:. ./.:4:15,40:.:-1.19:1.000:. ./.:4:24,22:.:-1.55:1.000:. ./.:4:18,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:36,57:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,50:.:-0.84:1.000:. ./.:4:17,63:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,89:.: 1.03:1.000:. ./.:4:27,104:.: 1.83:1.000:. ./.:4:16,69:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,37:.:-0.52:1.000:. ./.:4:39,34:.:-0.48:1.000:. ./.:4:15,56:.:-0.56:1.000:. ./.:4:16,69:.: 0.00:1.000:. ./.:4:14,57:.:-0.56:1.000:. ./.:4:18,58:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,55:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.99:1.000:. ./.:4:31,76:.: 0.87:1.000:. ./.:4:19,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,118:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,143:.: 2.30:1.000:. ./.:4:23,87:.: 0.99:1.000:. ./.:4:32,84:.: 1.23:1.000:. ./.:4:51,50:.: 0.63:1.000:. ./.:4:5,13:.:-2.66:1.000:. ./.:4:16,64:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,73:.: 0.43:1.000:. ./.:4:23,109:.: 1.87:1.000:. ./.:4:25,61:.: 0.04:1.000:. ./.:4:25,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.12:0.998:. ./.:4:0,84:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,130:.: 1.79:1.000:. ./.:4:25,73:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.00:1.000:. ./.:4:40,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.55:1.000:. ./.:4:9,52:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.24:0.999:. ./.:4:32,54:.: 0.04:1.000:. ./.:4:16,61:.:-0.32:1.000:. ./.:4:37,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,56:.:-0.24:1.000:. ./.:4:33,62:.: 0.40:1.000:. ./.:4:14,41:.:-1.19:1.000:. ./.:4:18,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.83:1.000:. ./.:4:17,61:.:-0.28:1.000:. ./.:4:31,82:.: 1.11:1.000:. ./.:4:13,65:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,81:.: 0.67:1.000:. ./.:4:28,73:.: 0.63:1.000:. ./.:4:44,53:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,120:.: 1.39:1.000:. -chr2.1 18114654 chr2.1_018114654 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:160,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.35:0.982:. ./.:4:164,55:.: 1.19:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:260,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.65:1.000:. ./.:3:83,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.50:1.000:. ./.:6:121,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.46:0.777:. ./.:4:156,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.10:0.846:. ./.:4:174,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.29:1.000:. ./.:3:120,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:284,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.08:0.999:. ./.:4:142,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.19:0.774:. ./.:4:148,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.65:0.993:. ./.:4:157,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:276,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.22:0.998:. ./.:4:208,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:281,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:181,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:277,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.19:1.000:. -chr2.1 18170166 chr2.1_018170166 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:81,72:0.47: 0.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:127,28:0.18: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,34:0.28:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,36:0.35:-0.80:1.000:0.805 0/0/0/1:4:68,14:0.17:-1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,54:0.55:-1.03:1.000:0.978 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,27:0.40:-1.69:1.000:0.751 0/0/0/1:4:55,13:0.19:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,37:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,56:0.44:-0.21:1.000:0.971 0/0/1/1:4:90,76:0.46: 0.82:1.000:0.985 0/0/0/1:4:118,34:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,50:0.31: 0.69:1.000:0.974 0/1/1/1:4:64,144:0.64: 1.90:0.982:0.654 0/0/0/1:4:81,32:0.28:-0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,82:0.43: 1.39:1.000:0.957 0/1/1/1:4:22,139:0.76: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,19:0.28:-1.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,34:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,51:0.45:-0.56:1.000:0.983 0/0/1/1:4:53,70:0.55:-0.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:9,14:0.58:-2.85:1.000:0.926 0/0/1/1:4:47,80:0.59:-0.18:1.000:0.851 0/0/0/1:4:89,28:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,31:0.29:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:127,36:0.22: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,38:0.17: 2.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,62:0.44: 0.15:1.000:0.969 0/0/0/1:4:45,8:0.15:-2.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:66,30:0.31:-0.98:1.000:0.970 0/0/1:3:19,4:0.17:-2.85:1.000:0.977 0/1/1/1:4:23,101:0.73:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:160,1:0.01: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,80:0.68:-0.72:1.000:0.959 0/0/1/1:4:94,89:0.48: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,44:0.39:-0.54:1.000:0.669 0/0/0/1:4:81,39:0.32:-0.36:1.000:0.942 0/1/1/1:4:33,71:0.63:-0.77:1.000:0.565 0/1/1/1:4:36,88:0.65:-0.26:1.000:0.789 0/0/1/1:4:51,41:0.44:-1.08:1.000:0.973 0/1/1/1:4:23,112:0.74: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:176,53:0.23: 2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,77:0.45: 0.90:1.000:0.983 0/0/0/1:4:55,11:0.17:-1.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,115:0.78:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,79:0.33: 2.72:1.000:0.927 0/0/1/1:4:96,69:0.42: 0.80:1.000:0.899 0/0/0/1:4:163,45:0.22: 1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,65:0.44: 0.33:1.000:0.968 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,34:0.42:-1.36:1.000:0.906 0/0/1/1:4:61,108:0.60: 0.90:1.000:0.802 0/0/1/1:4:33,67:0.62:-0.87:1.000:0.556 0/1/1/1:4:33,74:0.64:-0.69:1.000:0.648 0/0/1/1:4:73,121:0.59: 1.54:1.000:0.878 0/0/0/0/1/1:6:53,32:0.38:-1.26:1.000:0.808 0/0/0/1:4:62,26:0.30:-1.18:1.000:0.989 0/0/0/1:4:84,31:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:100,36:0.26: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:99,87:0.47: 1.34:1.000:0.990 0/0/0/1:4:89,34:0.28:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,69:0.59:-0.59:1.000:0.886 0/0/0/1:4:82,24:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,62:0.43: 0.28:1.000:0.935 0/0/0/1:4:80,31:0.28:-0.59:0.777:0.996 0/0/0/1:4:111,23:0.17: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,86:0.65:-0.31:1.000:0.756 0/0/1/1:4:39,48:0.54:-1.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:81,77:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,97:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,63:0.47:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:54,29:0.35:-1.31:1.000:0.806 0/0/0/1:4:117,38:0.25: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,84:0.60:-0.08:1.000:0.789 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,47:0.58:-1.46:0.846:0.922 0/0/0/1:4:141,36:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,45:0.32: 0.15:1.000:0.952 0/0/1/1:4:75,65:0.46: 0.15:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,86:0.69:-0.54:1.000:0.968 0/0/0/1:4:116,47:0.29: 0.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,45:0.44:-0.82:1.000:0.966 0/0/1/1:4:64,66:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,37:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,40:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1:3:42,29:0.41:-1.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:137,41:0.23: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,40:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,50:0.61:-1.49:1.000:0.666 0/0/1/1:4:91,90:0.49: 1.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,47:0.29: 0.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:59,89:0.57: 0.36:1.000:0.943 0/0/0/1:4:126,25:0.17: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,31:0.39:-1.41:1.000:0.703 0/0/0/1:4:129,76:0.37: 1.82:1.000:0.569 0/0/0/1:4:49,28:0.36:-1.46:1.000:0.658 0/0/1/1:4:79,87:0.52: 0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,70:0.67:-1.00:1.000:0.918 0/0/0/0:4:151,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,35:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,122:0.60: 1.44:1.000:0.783 0/1/1/1:4:26,72:0.67:-0.92:1.000:0.911 0/0/0/1:4:156,39:0.20: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,34:0.20: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,36:0.37:-0.92:1.000:0.613 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,61:0.42: 0.26:0.999:0.921 0/0/0/1:4:78,37:0.32:-0.49:1.000:0.951 0/0/1/1:4:56,47:0.45:-0.80:0.774:0.984 0/0/0/1:4:106,39:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,55:0.48:-0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:126,27:0.18: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,31:0.19: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,32:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,35:0.22: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,99:0.57: 0.85:1.000:0.958 0/0/0/1:4:90,40:0.31:-0.10:1.000:0.977 0/0/1/1:4:59,37:0.38:-0.98:1.000:0.622 0/0/0/1:4:74,38:0.34:-0.56:1.000:0.879 0/0/1/1:4:41,58:0.56:-0.90:1.000:0.967 0/0/1/1:4:72,64:0.47: 0.05:0.993:0.992 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,21:0.25:-1.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,90:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,69:0.46: 0.41:1.000:0.986 0/0/1/1:4:79,70:0.47: 0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:44,40:0.47:-1.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:81,30:0.27:-0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,24:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,77:0.36: 2.00:1.000:0.664 0/0/0/1:4:110,39:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,70:0.61:-0.69:1.000:0.696 0/0/1/1:4:41,78:0.61:-0.39:1.000:0.686 0/0/0/1:4:62,28:0.31:-1.13:1.000:0.973 0/0/0/1:4:102,35:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,77:0.63:-0.56:1.000:0.611 0/0/0/1:4:87,22:0.20:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,15:0.12:-0.13:1.000:0.673 0/0/0/1:4:102,43:0.30: 0.28:1.000:0.988 0/0/0/1:4:69,39:0.36:-0.67:1.000:0.688 0/0/1/1:4:90,58:0.39: 0.36:1.000:0.697 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,31:0.17: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,48:0.31: 0.51:1.000:0.972 0/0/0/1:4:111,40:0.26: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,102:0.61: 0.57:1.000:0.699 0/0/0/1:4:72,14:0.16:-1.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,20:0.27:-1.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,72:0.48: 0.41:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,79:0.66:-0.62:1.000:0.840 0/0/0/1:4:141,72:0.34: 2.03:1.000:0.886 0/0/0/1:4:107,42:0.28: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:114,20:0.15: 0.00:0.998:0.987 0/0/0/0:4:157,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,31:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,40:0.28: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,113:0.76:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,44:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,53:0.36: 0.28:1.000:0.635 0/0/0/1:4:125,32:0.20: 0.59:0.999:1.000 0/1/1/1:4:21,96:0.73:-0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,60:0.58:-0.95:1.000:0.897 0/0/1/1:4:71,49:0.41:-0.36:1.000:0.843 0/0/1/1:4:31,63:0.62:-1.03:1.000:0.554 0/0/0/1:4:132,39:0.23: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,111:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,41:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:74,21:0.22:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,46:0.33: 0.10:1.000:0.910 0/0/0/1:4:91,24:0.21:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,29:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,70:0.60:-0.62:1.000:0.818 0/0/0/1:4:181,45:0.20: 2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,113:0.59: 1.18:1.000:0.861 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,21:0.18:-0.49:1.000:0.999 -chr2.1 18541904 chr2.1_018541904 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:33,63:0.58: 1.65:1.000:0.896 0/0/1/1:4:31,46:0.55: 0.80:1.000:0.979 0/0/1/1:4:36,49:0.54: 1.16:1.000:0.988 1/1/1/1:4:1,57:0.92:-0.05:1.000:0.975 0/0/1/1:4:33,30:0.46: 0.17:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,14:0.52:-1.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,25:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,58:0.62: 0.93:1.000:0.529 0/0/1/1:4:16,11:0.39:-1.44:1.000:0.643 0/0/1/1:4:6,10:0.57:-1.93:1.000:0.955 0/0/1/1:4:37,65:0.57: 1.92:1.000:0.937 0/0/1/1:4:19,48:0.62: 0.35:1.000:0.592 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,17:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,26:0.33: 0.62:1.000:0.931 0/0/0/1:4:63,24:0.24: 1.25:0.982:1.000 0/0/0/1:4:63,21:0.22: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,25:0.43:-0.14:1.000:0.947 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,1:0.04:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,33:0.39: 0.98:1.000:0.643 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,46:0.58: 0.53:1.000:0.916 0/0/0/0:4:16,1:0.05:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,31:0.53:-0.18:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,24:0.26: 0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,64:0.63: 1.20:1.000:0.614 0/0/1/1:4:29,73:0.62: 1.92:1.000:0.598 0/0/0/1:4:42,21:0.30: 0.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:33,46:0.54: 0.89:1.000:0.986 0/0/0/1:4:9,5:0.33:-2.02:1.000:0.926 0/0/0/1:4:22,9:0.25:-1.26:1.000:0.999 1/1/1:3:0,2:1.00:-2.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,65:0.61: 1.51:1.000:0.710 0/0/0/1:4:66,33:0.30: 1.78:1.000:0.984 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,22:0.28: 0.49:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.41:-0.36:1.000:0.882 0/0/0/0:4:30,1:0.03:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,30:0.52:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,23:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,2:0.12:-2.02:1.000:0.836 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,44:0.57: 0.44:1.000:0.936 0/0/1/1:4:66,60:0.46: 2.99:1.000:0.990 0/0/0/1:4:43,19:0.27: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,33:0.44: 0.58:1.000:0.973 0/0/1/1:4:24,24:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,25:0.33: 0.49:1.000:0.926 0/0/0/1:4:50,25:0.30: 0.71:1.000:0.984 0/0/1/1:4:25,21:0.44:-0.59:1.000:0.970 0/0/0/1:4:57,17:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:23,21:0.47:-0.68:1.000:0.821 0/0/0/1:4:33,18:0.32:-0.36:1.000:0.943 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,29:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,20:0.34:-0.23:1.000:0.844 0/0/0/1:4:38,12:0.21:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,50:0.50: 1.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.04:0.777:1.000 0/0/1/1:4:20,39:0.59:-0.01:1.000:0.882 0/0/0/1:4:43,24:0.33: 0.35:1.000:0.922 0/0/1/1:4:13,13:0.49:-1.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,27:0.33: 0.71:1.000:0.913 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,25:0.48:-0.36:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,27:0.46:-0.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:23,57:0.62: 0.93:1.000:0.620 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.99:0.846:1.000 0/0/0/1:4:43,20:0.28: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,44:0.56: 0.53:1.000:0.961 0/0/1/1:4:23,23:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,23:0.29: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,35:0.55:-0.05:1.000:0.975 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,42:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,17:0.48:-1.08:1.000:0.994 0/0/1:3:21,16:0.41:-0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,15:0.24:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,24:0.37: 0.08:1.000:0.564 0/0/1/1:4:28,26:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:42,21:0.30: 0.17:1.000:0.984 0/0/0/1:4:41,16:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,38:0.58:-0.01:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,11:0.16: 0.08:1.000:0.993 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,43:0.62: 0.04:1.000:0.591 0/0/0/1:4:34,18:0.32:-0.32:1.000:0.963 0/0/0/1:4:52,23:0.27: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,25:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,25:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,19:0.29:-0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,28:0.51:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,40:0.57: 0.22:1.000:0.955 0/0/1/1:4:32,58:0.58: 1.38:1.000:0.924 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.32:0.999:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.61:0.774:1.000 0/0/1/1:4:27,40:0.55: 0.35:1.000:0.979 0/0/1/1:4:16,14:0.45:-1.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:37,25:0.38: 0.13:1.000:0.584 0/0/0/1:4:41,20:0.30: 0.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:14,19:0.54:-1.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:48,50:0.50: 1.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,27:0.38: 0.35:1.000:0.580 0/0/1/1:4:35,69:0.59: 2.00:1.000:0.874 0/0/1/1:4:34,34:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,45:0.60: 0.31:1.000:0.802 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,23:0.48:-0.54:0.993:0.995 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,17:0.21: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,24:0.42:-0.18:1.000:0.909 0/0/1/1:4:26,28:0.51:-0.23:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,23:0.34: 0.13:1.000:0.839 0/0/0/1:4:59,33:0.33: 1.47:1.000:0.919 0/0/1/1:4:28,50:0.58: 0.84:1.000:0.930 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,19:0.21: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,22:0.57:-1.08:1.000:0.950 0/1/1/1:4:14,50:0.65: 0.22:1.000:0.834 0/0/0/1:4:48,23:0.29: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,46:0.62: 0.22:1.000:0.575 0/0/1/1:4:13,17:0.53:-1.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:49,18:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,23:0.36: 0.04:1.000:0.706 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,24:0.39:-0.01:1.000:0.634 0/0/1/1:4:47,41:0.45: 1.29:1.000:0.982 0/0/0/1:4:50,28:0.33: 0.84:1.000:0.918 0/0/1/1:4:35,62:0.57: 1.69:1.000:0.934 0/0/0/0:4:66,1:0.01: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.49:-2.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,23:0.23: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,31:0.24: 2.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,17:0.20: 0.62:0.998:1.000 0/0/1/1:4:26,52:0.59: 0.84:1.000:0.864 0/0/0/1:4:53,22:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,23:0.27: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,48:0.61: 0.44:1.000:0.730 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,68:0.62: 1.60:1.000:0.597 0/0/1/1:4:48,56:0.52: 2.00:1.000:0.995 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,60:0.62: 1.07:0.999:0.545 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,24:0.35: 0.22:1.000:0.802 0/0/1/1:4:21,15:0.40:-1.03:1.000:0.758 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,38:0.57: 0.04:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,62:0.58: 1.65:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,56:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,24:0.22: 1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,30:0.52:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,29:0.33: 0.98:1.000:0.922 0/0/1/1:4:19,45:0.61: 0.22:1.000:0.684 0/0/1/1:4:29,25:0.45:-0.23:1.000:0.979 -chr2.1 18655733 chr2.1_018655733 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:172,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:89,0:.:-0.20:0.982:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:211,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-1.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.32:1.000:. ./.:3:34,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:187,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:157,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.13:0.777:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:98,0:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:83,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.:-0.94:1.000:. ./.:3:47,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:169,0:.: 1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:116,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.29:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.:-0.43:0.774:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:168,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.60:0.993:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:206,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:188,1:.: 2.12:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:172,0:.: 1.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.25:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:134,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:141,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:119,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:115,0:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 18932743 chr2.1_018932743 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:112,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:94,12:.: 0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:112,18:.: 1.35:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,5:.:-1.68:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:55,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:68,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:96,18:.: 0.80:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.53:0.982:. ./.:4:107,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:11,1:.:-2.67:1.000:. ./.:4:106,17:.: 1.11:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:81,7:.:-0.08:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:82,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:104,10:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.61:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:99,13:.: 0.74:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,15:.:-0.18:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:100,12:.: 0.74:1.000:. ./.:4:90,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:7,2:.:-2.78:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,8:.:-0.49:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:136,14:.: 2.03:1.000:. ./.:4:98,14:.: 0.74:1.000:. ./.:4:108,10:.: 0.94:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.60:1.000:. ./.:6:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,10:.: 0.94:1.000:. ./.:4:74,10:.:-0.22:1.000:. ./.:4:87,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,7:.:-1.11:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.36:0.777:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:111,19:.: 1.35:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:81,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:109,13:.: 1.08:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.62:0.846:. ./.:4:99,14:.: 0.77:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:51,15:.:-0.83:1.000:. ./.:4:73,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:124,14:.: 1.62:1.000:. ./.:3:56,9:.:-0.87:1.000:. ./.:4:83,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:178,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:72,10:.:-0.29:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:94,19:.: 0.77:1.000:. ./.:4:40,3:.:-1.62:1.000:. ./.:4:55,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:87,15:.: 0.39:1.000:. ./.:4:60,6:.:-0.83:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:70,11:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,15:.: 1.01:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:99,8:.: 0.57:1.000:. ./.:4:107,13:.: 1.01:1.000:. ./.:4:83,9:.: 0.05:0.999:. ./.:4:78,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,1:.:-1.75:0.774:. ./.:4:123,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:69,10:.:-0.39:1.000:. ./.:4:80,8:.:-0.08:1.000:. ./.:4:86,14:.: 0.33:1.000:. ./.:4:100,19:.: 0.97:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:95,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.08:0.993:. ./.:4:59,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:98,7:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,15:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:129,14:.: 1.79:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:67,13:.:-0.36:1.000:. ./.:4:107,12:.: 0.97:1.000:. ./.:4:133,10:.: 1.79:1.000:. ./.:4:86,15:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:11,3:.:-2.61:1.000:. ./.:4:54,8:.:-0.97:1.000:. ./.:4:91,21:.: 0.74:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:80,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:72,15:.:-0.12:0.998:. ./.:4:97,10:.: 0.57:1.000:. ./.:4:83,16:.: 0.29:1.000:. ./.:4:73,17:.:-0.01:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:69,13:.:-0.29:1.000:. ./.:4:125,14:.: 1.66:1.000:. ./.:4:50,9:.:-1.07:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:69,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:80,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,9:.:-0.32:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:103,8:.: 0.70:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,15:.: 1.59:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:89,16:.: 0.50:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.63:1.000:. -chr2.1 19107884 chr2.1_019107884 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:221,56:.:-0.59:1.000:. ./.:4:157,56:.:-1.05:1.000:. ./.:4:158,40:.:-1.15:1.000:. ./.:4:144,56:.:-1.14:1.000:. ./.:4:260,75:.:-0.18:1.000:. ./.:4:108,29:.:-1.58:1.000:. ./.:4:72,13:.:-1.95:1.000:. ./.:4:139,51:.:-1.21:1.000:. ./.:4:129,35:.:-1.39:1.000:. ./.:4:342,142:.: 0.87:1.000:. ./.:4:327,197:.: 1.16:1.000:. ./.:4:133,56:.:-1.21:1.000:. ./.:4:177,47:.:-0.97:1.000:. ./.:4:179,36:.:-1.03:1.000:. ./.:4:177,54:.:-0.92:1.000:. ./.:4:173,19:.:-1.19:1.000:. ./.:4:199,56:.:-0.75:0.982:. ./.:4:195,40:.:-0.89:1.000:. ./.:4:327,99:.: 0.46:1.000:. ./.:4:247,75:.:-0.27:1.000:. ./.:4:335,168:.: 1.01:1.000:. ./.:4:217,68:.:-0.54:1.000:. ./.:4:201,66:.:-0.66:1.000:. ./.:4:157,36:.:-1.19:1.000:. ./.:4:249,141:.: 0.21:1.000:. ./.:4:154,23:.:-1.30:1.000:. ./.:4:97,37:.:-1.60:1.000:. ./.:4:157,32:.:-1.21:1.000:. ./.:4:282,159:.: 0.57:1.000:. ./.:4:103,20:.:-1.68:1.000:. ./.:4:180,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:121,21:.:-1.55:1.000:. ./.:4:291,91:.: 0.15:1.000:. ./.:4:325,145:.: 0.77:1.000:. ./.:3:93,83:.:-1.31:1.000:. ./.:4:145,43:.:-1.22:1.000:. ./.:4:153,58:.:-1.06:1.000:. ./.:4:205,80:.:-0.54:1.000:. ./.:4:337,100:.: 0.54:1.000:. ./.:4:194,75:.:-0.65:1.000:. ./.:4:293,119:.: 0.36:1.000:. ./.:4:222,68:.:-0.50:1.000:. ./.:4:342,157:.: 0.98:1.000:. ./.:4:384,181:.: 1.45:1.000:. ./.:4:502,160:.: 2.13:1.000:. ./.:4:305,72:.: 0.12:1.000:. ./.:4:246,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:728,217:.: 4.13:1.000:. ./.:4:292,89:.: 0.14:1.000:. ./.:4:381,70:.: 0.64:1.000:. ./.:4:385,93:.: 0.83:1.000:. ./.:4:241,73:.:-0.33:1.000:. ./.:4:295,76:.: 0.07:1.000:. ./.:4:285,110:.: 0.24:1.000:. ./.:4:213,103:.:-0.32:1.000:. ./.:4:387,125:.: 1.07:1.000:. ./.:4:302,123:.: 0.46:1.000:. ./.:4:383,120:.: 1.01:1.000:. ./.:4:367,131:.: 0.97:1.000:. ./.:6:399,199:.: 1.68:1.000:. ./.:4:381,195:.: 1.52:1.000:. ./.:4:239,50:.:-0.51:1.000:. ./.:4:444,191:.: 1.94:1.000:. ./.:4:401,88:.: 0.91:1.000:. ./.:4:349,147:.: 0.96:1.000:. ./.:4:369,151:.: 1.13:1.000:. ./.:4:309,104:.: 0.37:1.000:. ./.:4:310,147:.: 0.68:1.000:. ./.:4:368,102:.: 0.77:0.777:. ./.:4:171,58:.:-0.93:1.000:. ./.:4:446,202:.: 2.03:1.000:. ./.:4:313,107:.: 0.42:1.000:. ./.:4:311,120:.: 0.50:1.000:. ./.:4:233,41:.:-0.61:1.000:. ./.:4:297,134:.: 0.50:1.000:. ./.:4:322,123:.: 0.60:1.000:. ./.:4:274,96:.: 0.07:1.000:. ./.:4:310,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:376,115:.: 0.92:1.000:. ./.:4:345,120:.: 0.74:1.000:. ./.:4:187,89:.:-0.60:0.846:. ./.:4:404,161:.: 1.45:1.000:. ./.:4:392,203:.: 1.66:1.000:. ./.:4:199,78:.:-0.59:1.000:. ./.:4:491,207:.: 2.39:1.000:. ./.:4:432,84:.: 1.10:1.000:. ./.:4:224,69:.:-0.48:1.000:. ./.:4:310,114:.: 0.45:1.000:. ./.:4:337,87:.: 0.45:1.000:. ./.:4:270,47:.:-0.31:1.000:. ./.:3:181,65:.:-0.81:1.000:. ./.:4:311,103:.: 0.38:1.000:. ./.:4:339,126:.: 0.74:1.000:. ./.:4:200,84:.:-0.54:1.000:. ./.:4:379,145:.: 1.16:1.000:. ./.:4:349,99:.: 0.62:1.000:. ./.:4:374,110:.: 0.87:1.000:. ./.:4:254,116:.: 0.07:1.000:. ./.:4:396,135:.: 1.21:1.000:. ./.:4:271,89:.: 0.00:1.000:. ./.:4:264,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:375,114:.: 0.91:1.000:. ./.:4:317,89:.: 0.32:1.000:. ./.:4:400,170:.: 1.48:1.000:. ./.:4:389,142:.: 1.21:1.000:. ./.:4:369,101:.: 0.77:1.000:. ./.:4:290,90:.: 0.14:1.000:. ./.:4:205,75:.:-0.57:1.000:. ./.:4:312,128:.: 0.56:1.000:. ./.:4:267,119:.: 0.18:1.000:. ./.:4:347,130:.: 0.82:1.000:. ./.:4:152,52:.:-1.11:1.000:. ./.:4:354,64:.: 0.41:0.999:. ./.:4:259,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:202,49:.:-0.78:0.774:. ./.:4:408,210:.: 1.82:1.000:. ./.:4:386,125:.: 1.06:1.000:. ./.:4:316,134:.: 0.63:1.000:. ./.:4:384,177:.: 1.42:1.000:. ./.:4:279,64:.:-0.13:1.000:. ./.:4:246,73:.:-0.29:1.000:. ./.:4:436,139:.: 1.52:1.000:. ./.:4:460,227:.: 2.31:1.000:. ./.:4:162,66:.:-0.94:1.000:. ./.:4:317,88:.: 0.31:1.000:. ./.:4:454,137:.: 1.63:1.000:. ./.:4:342,147:.: 0.91:0.993:. ./.:4:209,120:.:-0.22:1.000:. ./.:4:245,69:.:-0.33:1.000:. ./.:4:303,105:.: 0.33:1.000:. ./.:4:334,67:.: 0.29:1.000:. ./.:4:248,63:.:-0.35:1.000:. ./.:4:263,97:.: 0.00:1.000:. ./.:4:332,105:.: 0.54:1.000:. ./.:4:276,78:.:-0.05:1.000:. ./.:4:187,31:.:-1.01:1.000:. ./.:4:303,122:.: 0.46:1.000:. ./.:4:380,134:.: 1.08:1.000:. ./.:4:462,199:.: 2.12:1.000:. ./.:4:388,176:.: 1.44:1.000:. ./.:4:299,185:.: 0.87:1.000:. ./.:4:371,160:.: 1.21:1.000:. ./.:4:195,79:.:-0.61:1.000:. ./.:4:250,103:.:-0.05:1.000:. ./.:4:237,79:.:-0.32:1.000:. ./.:4:323,139:.: 0.72:1.000:. ./.:4:137,29:.:-1.38:1.000:. ./.:4:210,72:.:-0.56:1.000:. ./.:4:196,56:.:-0.77:1.000:. ./.:4:169,40:.:-1.07:1.000:. ./.:4:300,78:.: 0.12:1.000:. ./.:4:191,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:252,156:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,62:.:-1.31:1.000:. ./.:4:245,82:.:-0.24:1.000:. ./.:4:266,122:.: 0.19:1.000:. ./.:4:232,66:.:-0.44:1.000:. ./.:4:226,72:.:-0.44:1.000:. ./.:4:174,51:.:-0.96:0.998:. ./.:4:185,50:.:-0.89:1.000:. ./.:4:131,39:.:-1.35:1.000:. ./.:4:197,67:.:-0.68:1.000:. ./.:4:169,75:.:-0.83:1.000:. ./.:4:212,64:.:-0.60:1.000:. ./.:4:154,40:.:-1.18:1.000:. ./.:4:175,44:.:-1.00:1.000:. ./.:4:196,59:.:-0.75:1.000:. ./.:4:151,48:.:-1.14:0.999:. ./.:4:242,62:.:-0.40:1.000:. ./.:4:192,77:.:-0.65:1.000:. ./.:4:134,60:.:-1.18:1.000:. ./.:4:158,62:.:-1.00:1.000:. ./.:4:245,48:.:-0.48:1.000:. ./.:4:212,80:.:-0.49:1.000:. ./.:4:243,84:.:-0.24:1.000:. ./.:4:176,51:.:-0.95:1.000:. ./.:4:169,28:.:-1.16:1.000:. ./.:4:218,80:.:-0.44:1.000:. ./.:4:186,45:.:-0.92:1.000:. ./.:4:167,54:.:-0.99:1.000:. ./.:4:236,83:.:-0.29:1.000:. ./.:4:195,48:.:-0.83:1.000:. ./.:4:208,58:.:-0.67:1.000:. ./.:4:126,46:.:-1.34:1.000:. ./.:4:138,71:.:-1.07:1.000:. -chr2.1 19230286 chr2.1_019230286 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:0.982:. ./.:4:4,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:1,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:6:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:0.777:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.49:0.846:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:0.774:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:0.993:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:24,0:.: 3.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:19,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:0.998:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.39:0.999:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.05:1.000:. -chr2.1 19555960 chr2.1_019555960 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:320,127:.: 1.25:1.000:. ./.:4:260,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:293,164:.: 1.36:1.000:. ./.:4:254,86:.: 0.08:1.000:. ./.:4:342,80:.: 0.98:1.000:. ./.:4:364,132:.: 1.78:1.000:. ./.:4:207,36:.:-0.98:1.000:. ./.:4:277,147:.: 1.00:1.000:. ./.:4:301,91:.: 0.65:1.000:. ./.:4:58,13:.:-2.85:1.000:. ./.:4:62,11:.:-2.83:1.000:. ./.:4:295,50:.: 0.14:1.000:. ./.:4:290,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:280,103:.: 0.55:1.000:. ./.:4:290,72:.: 0.32:1.000:. ./.:4:326,111:.: 1.14:1.000:. ./.:4:316,78:.: 0.67:0.982:. ./.:4:330,88:.: 0.93:1.000:. ./.:4:382,149:.: 2.17:1.000:. ./.:4:306,68:.: 0.45:1.000:. ./.:4:59,25:.:-2.71:1.000:. ./.:4:293,64:.: 0.27:1.000:. ./.:4:339,137:.: 1.57:1.000:. ./.:4:234,106:.: 0.08:1.000:. ./.:4:22,1:.:-3.38:1.000:. ./.:4:282,87:.: 0.40:1.000:. ./.:4:299,78:.: 0.49:1.000:. ./.:4:307,94:.: 0.75:1.000:. ./.:4:349,54:.: 0.77:1.000:. ./.:4:342,75:.: 0.92:1.000:. ./.:4:297,80:.: 0.49:1.000:. ./.:4:264,140:.: 0.78:1.000:. ./.:4:26,1:.:-3.33:1.000:. ./.:4:73,9:.:-2.73:1.000:. ./.:3:23,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:262,103:.: 0.35:1.000:. ./.:4:273,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:265,56:.:-0.13:1.000:. ./.:4:271,52:.:-0.10:1.000:. ./.:4:330,128:.: 1.37:1.000:. ./.:4:256,21:.:-0.61:1.000:. ./.:4:279,118:.: 0.70:1.000:. ./.:4:290,103:.: 0.66:1.000:. ./.:4:270,64:.: 0.02:1.000:. ./.:4:268,90:.: 0.28:1.000:. ./.:4:264,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:333,195:.: 2.13:1.000:. ./.:4:588,26:.: 3.07:1.000:. ./.:4:255,80:.: 0.03:1.000:. ./.:4:229,14:.:-0.98:1.000:. ./.:4:228,62:.:-0.46:1.000:. ./.:4:363,69:.: 1.09:1.000:. ./.:4:261,81:.: 0.10:1.000:. ./.:4:242,107:.: 0.18:1.000:. ./.:4:268,73:.: 0.09:1.000:. ./.:4:267,46:.:-0.21:1.000:. ./.:4:267,86:.: 0.22:1.000:. ./.:4:256,72:.:-0.05:1.000:. ./.:4:245,120:.: 0.35:1.000:. ./.:6:174,24:.:-1.47:1.000:. ./.:4:236,32:.:-0.70:1.000:. ./.:4:285,69:.: 0.23:1.000:. ./.:4:297,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:249,21:.:-0.68:1.000:. ./.:4:288,131:.: 0.94:1.000:. ./.:4:253,111:.: 0.34:1.000:. ./.:4:202,18:.:-1.23:1.000:. ./.:4:252,129:.: 0.53:1.000:. ./.:4:251,61:.:-0.22:0.777:. ./.:4:263,26:.:-0.48:1.000:. ./.:4:265,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:200,51:.:-0.89:1.000:. ./.:4:265,20:.:-0.52:1.000:. ./.:4:303,77:.: 0.52:1.000:. ./.:4:258,57:.:-0.19:1.000:. ./.:4:236,61:.:-0.39:1.000:. ./.:4:251,50:.:-0.34:1.000:. ./.:4:243,118:.: 0.31:1.000:. ./.:4:266,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:253,77:.:-0.03:1.000:. ./.:4:197,63:.:-0.79:0.846:. ./.:4:287,88:.: 0.46:1.000:. ./.:4:285,76:.: 0.31:1.000:. ./.:4:231,66:.:-0.39:1.000:. ./.:4:263,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:257,56:.:-0.21:1.000:. ./.:4:173,79:.:-0.88:1.000:. ./.:4:203,70:.:-0.65:1.000:. ./.:4:199,42:.:-1.00:1.000:. ./.:4:288,90:.: 0.50:1.000:. ./.:3:162,108:.:-0.68:1.000:. ./.:4:239,56:.:-0.41:1.000:. ./.:4:288,36:.:-0.09:1.000:. ./.:4:193,72:.:-0.74:1.000:. ./.:4:235,55:.:-0.46:1.000:. ./.:4:252,40:.:-0.44:1.000:. ./.:4:158,74:.:-1.10:1.000:. ./.:4:195,64:.:-0.80:1.000:. ./.:4:246,62:.:-0.27:1.000:. ./.:4:301,100:.: 0.75:1.000:. ./.:4:232,50:.:-0.55:1.000:. ./.:4:260,57:.:-0.17:1.000:. ./.:4:117,66:.:-1.63:1.000:. ./.:4:235,86:.:-0.13:1.000:. ./.:4:183,36:.:-1.24:1.000:. ./.:4:237,47:.:-0.53:1.000:. ./.:4:226,93:.:-0.15:1.000:. ./.:4:267,77:.: 0.13:1.000:. ./.:4:350,169:.: 2.03:1.000:. ./.:4:271,87:.: 0.28:1.000:. ./.:4:222,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:342,73:.: 0.90:1.000:. ./.:4:231,55:.:-0.51:0.999:. ./.:4:250,101:.: 0.20:1.000:. ./.:4:200,78:.:-0.60:0.774:. ./.:4:278,79:.: 0.27:1.000:. ./.:4:244,55:.:-0.37:1.000:. ./.:4:260,48:.:-0.27:1.000:. ./.:4:213,57:.:-0.68:1.000:. ./.:4:242,86:.:-0.05:1.000:. ./.:4:255,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:203,49:.:-0.88:1.000:. ./.:4:231,108:.: 0.07:1.000:. ./.:4:323,192:.: 1.99:1.000:. ./.:4:214,73:.:-0.50:1.000:. ./.:4:273,25:.:-0.38:1.000:. ./.:4:243,133:.: 0.47:0.993:. ./.:4:198,58:.:-0.84:1.000:. ./.:4:156,50:.:-1.38:1.000:. ./.:4:187,59:.:-0.94:1.000:. ./.:4:243,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:241,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:162,39:.:-1.44:1.000:. ./.:4:296,79:.: 0.46:1.000:. ./.:4:274,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:364,39:.: 0.77:1.000:. ./.:4:268,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:181,42:.:-1.20:1.000:. ./.:4:183,101:.:-0.53:1.000:. ./.:4:190,42:.:-1.10:1.000:. ./.:4:265,96:.: 0.31:1.000:. ./.:4:218,70:.:-0.49:1.000:. ./.:4:267,63:.:-0.03:1.000:. ./.:4:208,58:.:-0.73:1.000:. ./.:4:314,144:.: 1.37:1.000:. ./.:4:338,52:.: 0.63:1.000:. ./.:4:278,78:.: 0.26:1.000:. ./.:4:313,117:.: 1.06:1.000:. ./.:4:311,113:.: 1.00:1.000:. ./.:4:220,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:292,77:.: 0.40:1.000:. ./.:4:292,91:.: 0.55:1.000:. ./.:4:49,18:.:-2.90:1.000:. ./.:4:271,165:.: 1.13:1.000:. ./.:4:300,126:.: 1.02:1.000:. ./.:4:316,91:.: 0.81:1.000:. ./.:4:329,91:.: 0.95:1.000:. ./.:4:313,87:.: 0.74:1.000:. ./.:4:265,72:.: 0.05:0.998:. ./.:4:355,96:.: 1.29:1.000:. ./.:4:273,53:.:-0.07:1.000:. ./.:4:266,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:242,54:.:-0.40:1.000:. ./.:4:287,112:.: 0.73:1.000:. ./.:4:333,74:.: 0.81:1.000:. ./.:4:273,83:.: 0.26:1.000:. ./.:4:226,84:.:-0.25:1.000:. ./.:4:266,135:.: 0.75:0.999:. ./.:4:284,110:.: 0.67:1.000:. ./.:4:278,79:.: 0.27:1.000:. ./.:4:249,38:.:-0.50:1.000:. ./.:4:243,76:.:-0.15:1.000:. ./.:4:282,147:.: 1.05:1.000:. ./.:4:237,68:.:-0.30:1.000:. ./.:4:224,35:.:-0.80:1.000:. ./.:4:240,88:.:-0.05:1.000:. ./.:4:348,64:.: 0.87:1.000:. ./.:4:307,33:.: 0.08:1.000:. ./.:4:322,101:.: 0.99:1.000:. ./.:4:234,82:.:-0.18:1.000:. ./.:4:310,78:.: 0.61:1.000:. ./.:4:378,107:.: 1.66:1.000:. ./.:4:330,130:.: 1.39:1.000:. ./.:4:292,85:.: 0.49:1.000:. ./.:4:294,83:.: 0.49:1.000:. -chr2.1 19721552 chr2.1_019721552 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:633,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:405,116:.:-0.03:1.000:. ./.:4:393,99:.:-0.31:1.000:. ./.:4:407,126:.: 0.08:1.000:. ./.:4:292,260:.: 0.27:1.000:. ./.:4:334,284:.: 0.91:1.000:. ./.:4:376,149:.: 0.01:1.000:. ./.:4:448,160:.: 0.81:1.000:. ./.:4:411,117:.: 0.03:1.000:. ./.:4:337,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:275,82:.:-1.62:1.000:. ./.:4:410,115:.: 0.01:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:438,138:.: 0.50:1.000:. ./.:4:371,110:.:-0.42:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:646,0:.: 1.18:0.982:. ./.:4:401,120:.:-0.03:1.000:. ./.:4:555,132:.: 1.58:1.000:. ./.:4:508,171:.: 1.50:1.000:. ./.:4:169,181:.:-1.69:1.000:. ./.:4:330,115:.:-0.77:1.000:. ./.:4:287,250:.: 0.12:1.000:. ./.:4:583,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:188,36:.:-2.91:1.000:. ./.:4:561,127:.: 1.59:1.000:. ./.:4:458,144:.: 0.75:1.000:. ./.:4:407,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:507,123:.: 1.02:1.000:. ./.:4:484,161:.: 1.17:1.000:. ./.:4:570,170:.: 2.09:1.000:. ./.:4:511,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:184,41:.:-2.90:1.000:. ./.:4:342,4:.:-1.73:1.000:. ./.:3:88,56:.:-3.69:1.000:. ./.:4:450,132:.: 0.56:1.000:. ./.:4:387,119:.:-0.18:1.000:. ./.:4:432,148:.: 0.54:1.000:. ./.:4:497,136:.: 1.05:1.000:. ./.:4:527,167:.: 1.64:1.000:. ./.:4:413,125:.: 0.13:1.000:. ./.:4:337,88:.:-0.96:1.000:. ./.:4:308,270:.: 0.52:1.000:. ./.:4:260,218:.:-0.45:1.000:. ./.:4:485,114:.: 0.72:1.000:. ./.:4:414,140:.: 0.29:1.000:. ./.:4:481,149:.: 1.02:1.000:. ./.:4:847,255:.: 5.60:1.000:. ./.:4:446,124:.: 0.44:1.000:. ./.:4:486,149:.: 1.07:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:669,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:312,277:.: 0.63:1.000:. ./.:4:272,229:.:-0.23:1.000:. ./.:4:605,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:376,103:.:-0.44:1.000:. ./.:4:430,119:.: 0.24:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.00:1.000:. ./.:6:241,176:.:-1.04:1.000:. ./.:4:269,220:.:-0.34:1.000:. ./.:4:216,218:.:-0.88:1.000:. ./.:4:302,309:.: 0.84:1.000:. ./.:4:281,267:.: 0.23:1.000:. ./.:4:314,240:.: 0.29:1.000:. ./.:4:406,114:.:-0.04:1.000:. ./.:4:428,116:.: 0.19:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:457,139:.: 0.69:0.777:. ./.:4:348,101:.:-0.73:1.000:. ./.:4:443,123:.: 0.40:1.000:. ./.:4:364,105:.:-0.54:1.000:. ./.:4:509,129:.: 1.10:1.000:. ./.:4:410,126:.: 0.11:1.000:. ./.:4:288,234:.:-0.02:1.000:. ./.:4:398,121:.:-0.05:1.000:. ./.:4:244,246:.:-0.33:1.000:. ./.:4:409,122:.: 0.06:1.000:. ./.:4:351,109:.:-0.62:1.000:. ./.:4:446,140:.: 0.60:1.000:. ./.:4:234,197:.:-0.91:0.846:. ./.:4:446,121:.: 0.41:1.000:. ./.:4:497,145:.: 1.14:1.000:. ./.:4:317,97:.:-1.07:1.000:. ./.:4:310,260:.: 0.44:1.000:. ./.:4:487,108:.: 0.68:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:352,96:.:-0.74:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:349,99:.:-0.74:1.000:. ./.:3:272,111:.:-1.37:1.000:. ./.:4:368,138:.:-0.18:1.000:. ./.:4:459,119:.: 0.52:1.000:. ./.:4:301,92:.:-1.27:1.000:. ./.:4:452,127:.: 0.53:1.000:. ./.:4:448,137:.: 0.59:1.000:. ./.:4:442,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:345,114:.:-0.63:1.000:. ./.:4:266,270:.: 0.11:1.000:. ./.:4:574,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:422,150:.: 0.46:1.000:. ./.:4:305,82:.:-1.33:1.000:. ./.:4:405,123:.: 0.03:1.000:. ./.:4:351,108:.:-0.63:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:389,96:.:-0.38:1.000:. ./.:4:410,128:.: 0.13:1.000:. ./.:4:506,134:.: 1.12:1.000:. ./.:4:225,193:.:-1.03:1.000:. ./.:4:370,90:.:-0.62:1.000:. ./.:4:550,149:.: 1.69:1.000:. ./.:4:393,125:.:-0.06:0.999:. ./.:4:251,236:.:-0.36:1.000:. ./.:4:314,84:.:-1.23:0.774:. ./.:4:467,122:.: 0.63:1.000:. ./.:4:399,98:.:-0.27:1.000:. ./.:4:348,104:.:-0.70:1.000:. ./.:4:379,108:.:-0.36:1.000:. ./.:4:331,93:.:-0.97:1.000:. ./.:4:497,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:450,148:.: 0.71:1.000:. ./.:4:293,232:.: 0.01:1.000:. ./.:4:410,109:.:-0.05:1.000:. ./.:4:295,255:.: 0.25:1.000:. ./.:4:438,117:.: 0.30:0.993:. ./.:4:128,348:.:-0.47:1.000:. ./.:4:309,97:.:-1.15:1.000:. ./.:4:289,84:.:-1.47:1.000:. ./.:4:453,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:422,112:.: 0.09:1.000:. ./.:4:376,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:404,131:.: 0.10:1.000:. ./.:4:369,107:.:-0.47:1.000:. ./.:4:763,1:.: 2.32:1.000:. ./.:4:412,134:.: 0.21:1.000:. ./.:4:226,183:.:-1.12:1.000:. ./.:4:420,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:224,197:.:-1.00:1.000:. ./.:4:405,105:.:-0.14:1.000:. ./.:4:401,121:.:-0.02:1.000:. ./.:4:411,119:.: 0.05:1.000:. ./.:4:315,92:.:-1.14:1.000:. ./.:4:494,162:.: 1.28:1.000:. ./.:4:350,306:.: 1.28:1.000:. ./.:4:416,128:.: 0.19:1.000:. ./.:4:252,235:.:-0.36:1.000:. ./.:4:648,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:500,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:501,143:.: 1.16:1.000:. ./.:4:358,121:.:-0.44:1.000:. ./.:4:239,54:.:-2.24:1.000:. ./.:4:307,92:.:-1.22:1.000:. ./.:4:483,151:.: 1.06:1.000:. ./.:4:288,277:.: 0.39:1.000:. ./.:4:632,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:499,168:.: 1.38:1.000:. ./.:4:321,113:.:-0.88:0.998:. ./.:4:479,129:.: 0.81:1.000:. ./.:4:368,110:.:-0.45:1.000:. ./.:4:340,110:.:-0.72:1.000:. ./.:4:367,110:.:-0.46:1.000:. ./.:4:413,121:.: 0.09:1.000:. ./.:4:430,159:.: 0.63:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:405,121:.: 0.01:1.000:. ./.:4:394,129:.:-0.01:0.999:. ./.:4:384,116:.:-0.24:1.000:. ./.:4:384,102:.:-0.37:1.000:. ./.:4:352,109:.:-0.62:1.000:. ./.:4:223,220:.:-0.79:1.000:. ./.:4:415,109:.: 0.00:1.000:. ./.:4:374,109:.:-0.40:1.000:. ./.:4:373,107:.:-0.43:1.000:. ./.:4:359,88:.:-0.75:1.000:. ./.:4:522,165:.: 1.58:1.000:. ./.:4:279,259:.: 0.13:1.000:. ./.:4:417,124:.: 0.16:1.000:. ./.:4:419,106:.: 0.01:1.000:. ./.:4:459,147:.: 0.79:1.000:. ./.:4:543,137:.: 1.51:1.000:. ./.:4:638,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:386,126:.:-0.12:1.000:. ./.:4:266,217:.:-0.40:1.000:. -chr2.1 20026604 chr2.1_020026604 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:195,90:.: 0.71:1.000:. ./.:4:149,59:.:-0.63:1.000:. ./.:4:172,82:.: 0.17:1.000:. ./.:4:167,71:.:-0.11:1.000:. ./.:4:229,126:.: 1.92:1.000:. ./.:4:190,99:.: 0.77:1.000:. ./.:4:89,30:.:-2.17:1.000:. ./.:4:189,106:.: 0.88:1.000:. ./.:4:182,83:.: 0.36:1.000:. ./.:4:107,25:.:-1.94:1.000:. ./.:4:85,28:.:-2.27:1.000:. ./.:4:193,79:.: 0.48:1.000:. ./.:4:153,61:.:-0.52:1.000:. ./.:4:144,71:.:-0.51:1.000:. ./.:4:169,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:189,83:.: 0.48:1.000:. ./.:4:197,73:.: 0.45:0.982:. ./.:4:175,85:.: 0.27:1.000:. ./.:4:275,113:.: 2.49:1.000:. ./.:4:276,127:.: 2.75:1.000:. ./.:4:89,33:.:-2.11:1.000:. ./.:4:178,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:203,86:.: 0.77:1.000:. ./.:4:184,92:.: 0.55:1.000:. ./.:4:79,21:.:-2.49:1.000:. ./.:4:152,66:.:-0.45:1.000:. ./.:4:167,81:.: 0.07:1.000:. ./.:4:141,67:.:-0.63:1.000:. ./.:4:214,111:.: 1.40:1.000:. ./.:4:176,111:.: 0.74:1.000:. ./.:4:150,54:.:-0.70:1.000:. ./.:4:147,70:.:-0.47:1.000:. ./.:4:60,13:.:-2.96:1.000:. ./.:4:77,29:.:-2.39:1.000:. ./.:3:39,25:.:-3.12:1.000:. ./.:4:170,70:.:-0.07:1.000:. ./.:4:151,66:.:-0.47:1.000:. ./.:4:207,97:.: 1.03:1.000:. ./.:4:180,75:.: 0.19:1.000:. ./.:4:221,73:.: 0.86:1.000:. ./.:4:185,96:.: 0.64:1.000:. ./.:4:166,69:.:-0.16:1.000:. ./.:4:227,74:.: 0.98:1.000:. ./.:4:153,55:.:-0.63:1.000:. ./.:4:219,99:.: 1.28:1.000:. ./.:4:203,78:.: 0.64:1.000:. ./.:4:228,104:.: 1.52:1.000:. ./.:4:167,70:.:-0.13:1.000:. ./.:4:137,74:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,47:.:-1.20:1.000:. ./.:4:143,47:.:-0.94:1.000:. ./.:4:204,75:.: 0.60:1.000:. ./.:4:156,79:.:-0.16:1.000:. ./.:4:187,108:.: 0.88:1.000:. ./.:4:156,72:.:-0.28:1.000:. ./.:4:155,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:168,89:.: 0.22:1.000:. ./.:4:183,67:.: 0.10:1.000:. ./.:4:206,68:.: 0.51:1.000:. ./.:6:157,70:.:-0.30:1.000:. ./.:4:191,74:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,64:.:-0.92:1.000:. ./.:4:190,83:.: 0.50:1.000:. ./.:4:167,63:.:-0.25:1.000:. ./.:4:213,90:.: 1.02:1.000:. ./.:4:185,76:.: 0.29:1.000:. ./.:4:145,65:.:-0.59:1.000:. ./.:4:188,96:.: 0.69:1.000:. ./.:4:171,60:.:-0.23:0.777:. ./.:4:167,75:.:-0.04:1.000:. ./.:4:192,79:.: 0.46:1.000:. ./.:4:80,25:.:-2.41:1.000:. ./.:4:177,60:.:-0.13:1.000:. ./.:4:137,84:.:-0.40:1.000:. ./.:4:164,54:.:-0.45:1.000:. ./.:4:149,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:125,54:.:-1.13:1.000:. ./.:4:162,72:.:-0.18:1.000:. ./.:4:222,91:.: 1.19:1.000:. ./.:4:173,69:.:-0.04:1.000:. ./.:4:171,87:.: 0.24:0.846:. ./.:4:184,61:.: 0.01:1.000:. ./.:4:218,90:.: 1.10:1.000:. ./.:4:168,79:.: 0.05:1.000:. ./.:4:131,42:.:-1.23:1.000:. ./.:4:179,88:.: 0.39:1.000:. ./.:4:111,54:.:-1.37:1.000:. ./.:4:132,78:.:-0.59:1.000:. ./.:4:131,73:.:-0.70:1.000:. ./.:4:127,66:.:-0.89:1.000:. ./.:3:85,54:.:-1.82:1.000:. ./.:4:143,63:.:-0.66:1.000:. ./.:4:166,106:.: 0.48:1.000:. ./.:4:130,63:.:-0.89:1.000:. ./.:4:211,83:.: 0.86:1.000:. ./.:4:172,76:.: 0.07:1.000:. ./.:4:155,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:177,72:.: 0.08:1.000:. ./.:4:180,91:.: 0.46:1.000:. ./.:4:185,90:.: 0.53:1.000:. ./.:4:114,64:.:-1.15:1.000:. ./.:4:140,83:.:-0.37:1.000:. ./.:4:137,66:.:-0.71:1.000:. ./.:4:160,90:.: 0.10:1.000:. ./.:4:163,61:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,87:.: 0.20:1.000:. ./.:4:128,58:.:-1.01:1.000:. ./.:4:187,81:.: 0.41:1.000:. ./.:4:215,108:.: 1.36:1.000:. ./.:4:191,83:.: 0.51:1.000:. ./.:4:151,80:.:-0.23:1.000:. ./.:4:204,95:.: 0.95:1.000:. ./.:4:158,96:.: 0.17:0.999:. ./.:4:200,89:.: 0.77:1.000:. ./.:4:104,27:.:-1.96:0.774:. ./.:4:195,89:.: 0.69:1.000:. ./.:4:125,49:.:-1.21:1.000:. ./.:4:120,67:.:-0.99:1.000:. ./.:4:189,77:.: 0.38:1.000:. ./.:4:131,75:.:-0.66:1.000:. ./.:4:159,76:.:-0.16:1.000:. ./.:4:160,79:.:-0.09:1.000:. ./.:4:163,74:.:-0.13:1.000:. ./.:4:210,80:.: 0.79:1.000:. ./.:4:156,75:.:-0.23:1.000:. ./.:4:175,76:.: 0.12:1.000:. ./.:4:214,119:.: 1.54:0.993:. ./.:4:142,63:.:-0.68:1.000:. ./.:4:132,59:.:-0.92:1.000:. ./.:4:147,70:.:-0.47:1.000:. ./.:4:148,67:.:-0.51:1.000:. ./.:4:231,97:.: 1.45:1.000:. ./.:4:105,46:.:-1.61:1.000:. ./.:4:151,49:.:-0.76:1.000:. ./.:4:155,74:.:-0.26:1.000:. ./.:4:246,95:.: 1.67:1.000:. ./.:4:183,62:.: 0.01:1.000:. ./.:4:162,79:.:-0.06:1.000:. ./.:4:147,77:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,72:.:-0.06:1.000:. ./.:4:168,68:.:-0.14:1.000:. ./.:4:197,78:.: 0.53:1.000:. ./.:4:207,95:.: 1.00:1.000:. ./.:4:145,49:.:-0.87:1.000:. ./.:4:197,138:.: 1.57:1.000:. ./.:4:204,85:.: 0.77:1.000:. ./.:4:175,89:.: 0.34:1.000:. ./.:4:167,84:.: 0.12:1.000:. ./.:4:197,68:.: 0.36:1.000:. ./.:4:155,79:.:-0.18:1.000:. ./.:4:308,119:.: 3.16:1.000:. ./.:4:203,93:.: 0.90:1.000:. ./.:4:96,38:.:-1.91:1.000:. ./.:4:121,64:.:-1.02:1.000:. ./.:4:167,71:.:-0.11:1.000:. ./.:4:203,96:.: 0.95:1.000:. ./.:4:216,103:.: 1.29:1.000:. ./.:4:214,100:.: 1.21:1.000:. ./.:4:139,102:.:-0.06:0.998:. ./.:4:159,87:.: 0.03:1.000:. ./.:4:180,86:.: 0.38:1.000:. ./.:4:127,46:.:-1.23:1.000:. ./.:4:188,78:.: 0.38:1.000:. ./.:4:195,90:.: 0.71:1.000:. ./.:4:134,37:.:-1.27:1.000:. ./.:4:192,76:.: 0.41:1.000:. ./.:4:186,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:216,89:.: 1.05:0.999:. ./.:4:172,94:.: 0.38:1.000:. ./.:4:198,85:.: 0.67:1.000:. ./.:4:178,82:.: 0.27:1.000:. ./.:4:126,62:.:-0.97:1.000:. ./.:4:141,71:.:-0.56:1.000:. ./.:4:189,75:.: 0.34:1.000:. ./.:4:146,67:.:-0.54:1.000:. ./.:4:155,85:.:-0.07:1.000:. ./.:4:225,88:.: 1.19:1.000:. ./.:4:220,75:.: 0.88:1.000:. ./.:4:196,85:.: 0.64:1.000:. ./.:4:184,94:.: 0.58:1.000:. ./.:4:216,108:.: 1.38:1.000:. ./.:4:217,96:.: 1.19:1.000:. ./.:4:238,124:.: 2.04:1.000:. ./.:4:160,78:.:-0.11:1.000:. ./.:4:176,74:.: 0.10:1.000:. -chr2.1 20208636 chr2.1_020208636 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:253,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:87,33:.:-2.11:1.000:. ./.:4:176,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:188,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:162,166:.: 2.01:1.000:. ./.:4:179,140:.: 1.83:1.000:. ./.:4:134,29:.:-1.26:1.000:. ./.:4:175,48:.:-0.07:1.000:. ./.:4:181,47:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,1:.:-2.80:1.000:. ./.:4:71,20:.:-2.68:1.000:. ./.:4:142,43:.:-0.82:1.000:. ./.:4:206,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:170,54:.:-0.05:1.000:. ./.:4:177,62:.: 0.25:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.53:0.982:. ./.:4:220,70:.: 1.26:1.000:. ./.:4:230,67:.: 1.40:1.000:. ./.:4:243,85:.: 2.01:1.000:. ./.:4:58,52:.:-2.31:1.000:. ./.:4:151,55:.:-0.41:1.000:. ./.:4:119,103:.:-0.09:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:32,16:.:-3.54:1.000:. ./.:4:195,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:182,62:.: 0.35:1.000:. ./.:4:170,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:220,78:.: 1.42:1.000:. ./.:4:220,54:.: 0.94:1.000:. ./.:4:200,55:.: 0.56:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:76,9:.:-2.80:1.000:. ./.:4:140,1:.:-1.69:1.000:. ./.:3:19,15:.:-3.81:1.000:. ./.:4:174,55:.: 0.05:1.000:. ./.:4:222,42:.: 0.74:1.000:. ./.:4:164,66:.: 0.07:1.000:. ./.:4:215,70:.: 1.16:1.000:. ./.:4:204,74:.: 1.02:1.000:. ./.:4:202,53:.: 0.56:1.000:. ./.:4:174,54:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,124:.: 0.56:1.000:. ./.:4:120,101:.:-0.11:1.000:. ./.:4:196,72:.: 0.82:1.000:. ./.:4:182,61:.: 0.33:1.000:. ./.:4:234,68:.: 1.50:1.000:. ./.:4:221,51:.: 0.90:1.000:. ./.:4:170,50:.:-0.13:1.000:. ./.:4:199,48:.: 0.41:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:143,126:.: 0.84:1.000:. ./.:4:109,100:.:-0.35:1.000:. ./.:4:259,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:177,49:.:-0.01:1.000:. ./.:4:238,59:.: 1.40:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.64:1.000:. ./.:6:142,78:.:-0.13:1.000:. ./.:4:120,99:.:-0.15:1.000:. ./.:4:100,115:.:-0.23:1.000:. ./.:4:160,142:.: 1.50:1.000:. ./.:4:122,130:.: 0.50:1.000:. ./.:4:139,121:.: 0.66:1.000:. ./.:4:182,52:.: 0.15:1.000:. ./.:4:110,44:.:-1.44:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:227,59:.: 1.18:0.777:. ./.:4:152,47:.:-0.54:1.000:. ./.:4:206,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:117,33:.:-1.52:1.000:. ./.:4:207,80:.: 1.20:1.000:. ./.:4:203,57:.: 0.66:1.000:. ./.:4:115,115:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,44:.:-0.80:1.000:. ./.:4:109,97:.:-0.41:1.000:. ./.:4:191,53:.: 0.35:1.000:. ./.:4:217,60:.: 1.00:1.000:. ./.:4:186,62:.: 0.43:1.000:. ./.:4:108,79:.:-0.78:0.846:. ./.:4:197,59:.: 0.58:1.000:. ./.:4:225,64:.: 1.24:1.000:. ./.:4:163,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:114,123:.: 0.21:1.000:. ./.:4:170,53:.:-0.07:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:145,44:.:-0.74:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:159,50:.:-0.35:1.000:. ./.:3:94,46:.:-1.71:1.000:. ./.:4:169,46:.:-0.23:1.000:. ./.:4:216,58:.: 0.94:1.000:. ./.:4:136,33:.:-1.14:1.000:. ./.:4:176,61:.: 0.21:1.000:. ./.:4:189,47:.: 0.19:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:167,56:.:-0.07:1.000:. ./.:4:113,106:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,61:.: 0.72:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:176,44:.:-0.13:1.000:. ./.:4:120,50:.:-1.12:1.000:. ./.:4:174,49:.:-0.07:1.000:. ./.:4:154,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:129,43:.:-1.08:1.000:. ./.:4:183,64:.: 0.41:1.000:. ./.:4:226,62:.: 1.22:1.000:. ./.:4:107,115:.:-0.09:1.000:. ./.:4:193,41:.: 0.15:1.000:. ./.:4:226,53:.: 1.04:1.000:. ./.:4:192,44:.: 0.19:0.999:. ./.:4:123,118:.: 0.29:1.000:. ./.:4:136,25:.:-1.30:0.774:. ./.:4:214,62:.: 0.98:1.000:. ./.:4:128,44:.:-1.08:1.000:. ./.:4:156,42:.:-0.56:1.000:. ./.:4:198,50:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,64:.:-0.58:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:204,51:.: 0.56:1.000:. ./.:4:111,126:.: 0.21:1.000:. ./.:4:185,38:.:-0.07:1.000:. ./.:4:139,115:.: 0.54:1.000:. ./.:4:176,41:.:-0.19:0.993:. ./.:4:50,123:.:-1.06:1.000:. ./.:4:137,50:.:-0.78:1.000:. ./.:4:138,30:.:-1.16:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:189,44:.: 0.13:1.000:. ./.:4:114,22:.:-1.79:1.000:. ./.:4:201,49:.: 0.47:1.000:. ./.:4:170,43:.:-0.27:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:197,56:.: 0.52:1.000:. ./.:4:118,83:.:-0.51:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:93,76:.:-1.14:1.000:. ./.:4:171,54:.:-0.03:1.000:. ./.:4:165,46:.:-0.31:1.000:. ./.:4:171,42:.:-0.27:1.000:. ./.:4:150,44:.:-0.64:1.000:. ./.:4:239,70:.: 1.63:1.000:. ./.:4:140,152:.: 1.30:1.000:. ./.:4:204,53:.: 0.60:1.000:. ./.:4:101,123:.:-0.05:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:231,59:.: 1.26:1.000:. ./.:4:189,58:.: 0.41:1.000:. ./.:4:74,17:.:-2.68:1.000:. ./.:4:150,39:.:-0.74:1.000:. ./.:4:221,69:.: 1.26:1.000:. ./.:4:131,105:.: 0.19:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:200,67:.: 0.80:1.000:. ./.:4:151,46:.:-0.58:0.998:. ./.:4:179,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:184,40:.:-0.05:1.000:. ./.:4:145,50:.:-0.62:1.000:. ./.:4:180,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:217,61:.: 1.02:1.000:. ./.:4:179,52:.: 0.09:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:157,45:.:-0.49:1.000:. ./.:4:148,44:.:-0.68:0.999:. ./.:4:153,47:.:-0.53:1.000:. ./.:4:148,52:.:-0.53:1.000:. ./.:4:137,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:67,80:.:-1.57:1.000:. ./.:4:156,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:171,46:.:-0.19:1.000:. ./.:4:195,44:.: 0.25:1.000:. ./.:4:145,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:230,58:.: 1.22:1.000:. ./.:4:136,131:.: 0.80:1.000:. ./.:4:198,48:.: 0.39:1.000:. ./.:4:160,45:.:-0.43:1.000:. ./.:4:184,62:.: 0.39:1.000:. ./.:4:207,74:.: 1.08:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:123,29:.:-1.48:1.000:. ./.:4:126,119:.: 0.37:1.000:. -chr2.1 20414306 chr2.1_020414306 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:88,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,20:.: 0.38:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:64,17:.: 0.38:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:27,1:.:-1.62:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:74,25:.: 1.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:44,9:.:-0.68:1.000:. ./.:4:64,15:.: 0.30:1.000:. ./.:4:99,16:.: 1.66:1.000:. ./.:4:139,0:.: 2.56:0.982:. ./.:4:89,23:.: 1.55:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.48:1.000:. ./.:4:70,19:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:61,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:89,15:.: 1.25:1.000:. ./.:4:83,22:.: 1.28:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:105,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:79,20:.: 1.06:1.000:. ./.:4:60,13:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.64:1.000:. ./.:4:52,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:70,11:.: 0.38:1.000:. ./.:4:65,22:.: 0.61:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:46,4:.:-0.79:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:63,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:71,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:67,21:.: 0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.42:1.000:. ./.:6:56,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,14:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.75:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:28,4:.:-1.47:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.19:0.777:. ./.:4:80,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:69,13:.: 0.42:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:40,4:.:-1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:58,19:.: 0.23:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.79:0.846:. ./.:4:42,10:.:-0.71:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:67,8:.: 0.15:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:33,7:.:-1.17:1.000:. ./.:4:42,7:.:-0.83:1.000:. ./.:4:55,11:.:-0.19:1.000:. ./.:3:17,11:.:-1.62:1.000:. ./.:4:46,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:54,12:.:-0.19:1.000:. ./.:4:15,3:.:-1.99:1.000:. ./.:4:53,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,5:.:-1.43:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:72,17:.: 0.68:1.000:. ./.:4:79,11:.: 0.72:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:47,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:88,24:.: 1.55:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.45:0.999:. ./.:4:48,7:.:-0.60:1.000:. ./.:4:32,8:.:-1.17:0.774:. ./.:4:55,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.68:1.000:. ./.:4:30,18:.:-0.86:1.000:. ./.:4:56,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:80,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:98,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:31,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.53:0.993:. ./.:4:63,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:70,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,10:.: 0.38:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:67,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:78,19:.: 0.98:1.000:. ./.:4:71,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:73,16:.: 0.68:1.000:. ./.:4:72,14:.: 0.57:1.000:. ./.:4:137,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:54,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:71,13:.: 0.49:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:82,7:.: 0.68:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:77,13:.: 0.72:0.998:. ./.:4:67,28:.: 0.91:1.000:. ./.:4:72,21:.: 0.83:1.000:. ./.:4:75,10:.: 0.53:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,13:.: 0.45:1.000:. ./.:4:51,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:98,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.42:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:61,15:.: 0.19:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:86,17:.: 1.21:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,11:.: 0.42:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:51,11:.:-0.34:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. -chr2.1 20593857 chr2.1_020593857 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:205,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:294,0:.: 2.07:0.982:. ./.:4:212,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.08:1.000:. ./.:3:37,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:359,0:.: 3.40:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:180,1:.:-0.23:1.000:. ./.:6:130,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.45:0.777:. ./.:4:145,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.49:0.846:. ./.:4:212,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.33:1.000:. ./.:3:111,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:222,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:200,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.25:0.774:. ./.:4:205,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.23:0.993:. ./.:4:142,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:253,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:266,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:138,1:.:-1.08:0.998:. ./.:4:182,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:178,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:209,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.48:1.000:. -chr2.1 20847689 chr2.1_020847689 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,218:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,276:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,73:.:-2.65:1.000:. ./.:4:0,76:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.39:1.000:. ./.:4:81,193:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,279:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,53:.:-3.02:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,271:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,37:.:-3.32:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,20:.:-3.63:1.000:. ./.:4:0,74:.:-2.63:1.000:. ./.:3:0,23:.:-3.58:1.000:. ./.:4:1,204:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,270:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,285:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,222:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,294:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,271:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.04:1.000:. ./.:6:0,205:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,278:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,282:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,278:.: 1.15:1.000:. ./.:4:2,212:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.91:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.26:0.777:. ./.:4:2,214:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,297:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1,257:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1,219:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.60:0.846:. ./.:4:0,266:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.03:1.000:. ./.:3:0,149:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,272:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,143:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,155:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,153:.:-1.17:1.000:. ./.:4:2,218:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,281:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,331:.: 2.13:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.00:0.999:. ./.:4:0,308:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.74:0.774:. ./.:4:0,292:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,242:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,270:.: 1.00:1.000:. ./.:4:1,225:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,219:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,281:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.07:0.993:. ./.:4:0,195:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,219:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,203:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,131:.:-1.58:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,298:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,262:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,159:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,295:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1,306:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,325:.: 2.02:1.000:. ./.:4:1,204:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,53:.:-3.02:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,299:.: 1.54:1.000:. ./.:4:1,297:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.11:0.998:. ./.:4:0,269:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.26:0.999:. ./.:4:0,198:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1,208:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,161:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,158:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,158:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,306:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,296:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.24:1.000:. -chr2.1 21057253 chr2.1_021057253 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,65:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,15:.:-2.00:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,39:.: 3.75:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.45:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,13:.:-2.15:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.54:1.000:. ./.:3:0,19:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,15:.:-2.00:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,73:.: 2.39:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.33:1.000:. ./.:6:0,52:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,64:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,58:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.86:0.777:. ./.:4:0,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,56:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,58:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.65:0.693:. ./.:4:0,59:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.04:1.000:. ./.:3:0,25:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,63:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,58:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,57:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,61:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,68:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,74:.: 2.46:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,63:.: 1.63:0.999:. ./.:4:0,29:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.94:0.774:. ./.:4:0,58:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,55:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,64:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,57:.: 1.18:0.993:. ./.:4:0,22:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,58:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,56:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,63:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.11:0.998:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.88:0.999:. ./.:4:0,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.27:1.000:. -chr2.1 21180129 chr2.1_021180129 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.: 2.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 21307327 chr2.1_021307327 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:111,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:248,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:187,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.45:1.000:. ./.:3:12,0:.:-3.84:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:222,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:268,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:342,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:227,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.82:0.777:. ./.:4:245,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.57:0.693:. ./.:4:260,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.46:1.000:. ./.:3:128,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:239,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.66:0.774:. ./.:4:270,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.41:0.993:. ./.:4:179,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.12:0.998:. ./.:4:268,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:250,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:246,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:306,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.16:1.000:. -chr2.1 21715940 chr2.1_021715940 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,64:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,143:.: 2.42:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,114:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,105:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,19:.:-2.00:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.64:1.000:. ./.:3:0,16:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,108:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,135:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.32:1.000:. ./.:6:0,107:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,151:.: 2.70:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,114:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,116:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.07:0.777:. ./.:4:0,41:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,146:.: 2.53:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,158:.: 2.95:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1,82:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,105:.: 1.07:0.693:. ./.:4:0,110:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,125:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,106:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.18:1.000:. ./.:3:0,64:.:-0.39:0.999:. ./.:4:0,76:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,120:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,113:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,132:.: 2.03:0.999:. ./.:4:0,100:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.64:0.774:. ./.:4:0,93:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,111:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.75:0.993:. ./.:4:0,63:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,119:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,147:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,135:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,101:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.85:0.998:. ./.:4:1,84:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1,54:.:-0.71:0.999:. ./.:4:0,91:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1,98:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,107:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.64:1.000:. -chr2.1 21760578 chr2.1_021760578 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,29:0.25:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,81:0.62:-0.53:1.000:0.548 0/0/0/1:4:103,35:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,97:0.49: 1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,75:0.48: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,47:0.53:-1.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:134,42:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,83:0.56:-0.05:1.000:0.962 0/0/0/1:4:72,33:0.31:-1.20:1.000:0.979 0/1/1/1:4:41,73:0.63:-0.94:1.000:0.549 0/0/0/1:4:83,29:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,82:0.47: 0.76:1.000:0.991 0/1/1/1:4:46,127:0.72: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,49:0.27: 0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:139,60:0.29: 1.51:1.000:0.990 0/0/1/1:4:107,102:0.48: 1.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,101:0.45: 2.08:1.000:0.983 0/0/1/1:4:91,82:0.47: 0.76:1.000:0.991 1/1/1/1:4:5,124:0.96:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,105:0.71:-0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,66:0.43: 0.13:1.000:0.945 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,38:0.42:-1.68:1.000:0.929 0/0/1/1:4:95,110:0.53: 1.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,40:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,87:0.54: 0.33:1.000:0.986 0/0/1/1:4:76,95:0.55: 0.70:1.000:0.983 0/0/1/1:4:70,86:0.54: 0.27:1.000:0.986 0/0/1/1:4:55,66:0.54:-0.74:1.000:0.989 0/0/0/0:4:127,1:0.01:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,57:0.81:-2.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,46:0.51:-1.66:1.000:0.996 0/1/1:3:35,53:0.59:-1.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,91:0.52: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,81:0.46: 0.79:1.000:0.986 0/1/1/1:4:37,110:0.73: 0.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,110:0.69: 0.30:1.000:0.969 0/0/1/1:4:91,96:0.51: 1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,29:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,95:0.58: 0.39:1.000:0.898 0/1/1/1:4:45,156:0.76: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,107:0.71: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:55,81:0.59:-0.30:1.000:0.889 0/1/1/1:4:37,116:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,82:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,79:0.53:-0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,80:0.56:-0.19:1.000:0.964 0/0/1/1:4:46,68:0.59:-0.94:1.000:0.884 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,66:0.28: 2.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:112,48:0.29: 0.39:1.000:0.991 0/1/1/1:4:34,133:0.78: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,84:0.45: 1.05:1.000:0.981 0/0/0/1:4:124,59:0.31: 1.05:1.000:0.967 0/0/1/1:4:52,71:0.57:-0.68:1.000:0.952 0/0/0/1:4:131,42:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,50:0.43:-0.94:1.000:0.949 0/1/1/1/1/1:6:26,87:0.76:-0.97:1.000:0.578 0/1/1/1:4:35,105:0.74:-0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,104:0.74:-0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,112:0.81:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,103:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,74:0.45: 0.41:1.000:0.982 0/1/1/1:4:25,55:0.67:-1.91:1.000:0.938 0/0/0/1:4:90,32:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,41:0.32:-0.62:0.777:0.955 0/0/0/1:4:109,38:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,98:0.53: 0.99:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,70:0.57:-0.74:1.000:0.949 0/0/0/1:4:137,51:0.26: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,84:0.46: 0.93:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,100:0.59: 0.62:1.000:0.891 0/0/1/1:4:58,49:0.45:-1.14:1.000:0.980 0/0/1/1:4:81,81:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,64:0.61:-1.25:1.000:0.686 0/0/0/1:4:124,53:0.29: 0.87:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,60:0.42:-0.22:1.000:0.928 0/0/1/1:4:39,59:0.59:-1.40:0.693:0.853 0/1/1/1:4:52,132:0.70: 1.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:72,64:0.46:-0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:76,68:0.46:-0.07:1.000:0.990 0/1/1/1:4:34,113:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,95:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,105:0.81:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,34:0.30:-1.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:70,73:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1:3:25,59:0.69:-1.80:0.999:1.000 0/1/1/1:4:30,107:0.77:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,51:0.25: 1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,58:0.48:-0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,65:0.48:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,84:0.59:-0.22:1.000:0.838 0/0/0/1:4:103,39:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:78,33:0.29:-1.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,63:0.41: 0.07:1.000:0.891 0/1/1/1:4:49,122:0.70: 0.70:1.000:0.985 0/0/0/1:4:64,37:0.36:-1.31:1.000:0.711 0/1/1/1:4:41,110:0.71: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,17:0.23:-2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,85:0.58:-0.05:1.000:0.927 0/1/1/1:4:29,89:0.74:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,52:0.31: 0.44:1.000:0.970 0/0/0/1:4:101,41:0.28:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,120:0.73: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,105:0.53: 1.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,129:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,81:0.58:-0.28:1.000:0.909 0/0/1/1:4:110,134:0.54: 2.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:55,58:0.51:-0.97:0.999:0.997 0/1/1/1:4:28,85:0.74:-0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,33:0.50:-2.35:0.774:0.997 0/0/1/1:4:75,73:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,70:0.42: 0.50:1.000:0.910 0/1/1/1:4:25,109:0.80:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,122:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,75:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:136,51:0.26: 1.16:1.000:0.998 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,76:0.54:-0.25:1.000:0.986 0/1/1/1:4:39,132:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,76:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,140:0.77: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,74:0.55:-0.39:0.993:0.982 0/0/1/1:4:44,52:0.53:-1.45:1.000:0.991 0/0/0/1:4:77,28:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,62:0.60:-1.31:1.000:0.761 0/0/0/1:4:98,28:0.21:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,87:0.56: 0.21:1.000:0.973 0/0/1/1:4:34,50:0.59:-1.80:1.000:0.891 0/0/0/1:4:120,39:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,111:0.80:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,39:0.21: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,60:0.47:-0.59:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,66:0.65:-1.34:1.000:0.774 0/1/1/1:4:28,96:0.76:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,81:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,71:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,59:0.56:-1.25:1.000:0.961 0/0/0/1:4:77,28:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,106:0.48: 2.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,180:0.80: 2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,77:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,122:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,55:0.22: 2.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,41:0.35:-0.88:1.000:0.833 0/0/1/1:4:80,75:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,78:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,48:0.58:-1.86:1.000:0.930 0/1/1/1:4:17,84:0.82:-1.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,186:1.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,126:0.70: 0.85:1.000:0.987 0/0/1/1:4:98,91:0.47: 1.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:135,51:0.27: 1.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,77:0.55:-0.22:0.998:0.984 0/0/1/1:4:71,107:0.59: 0.90:1.000:0.858 0/0/1/1:4:81,70:0.46: 0.13:1.000:0.985 0/1/1/1:4:45,114:0.70: 0.36:1.000:0.988 0/0/1/1:4:62,77:0.55:-0.22:1.000:0.984 0/0/1/1:4:70,97:0.57: 0.59:1.000:0.943 0/0/1/1:4:52,48:0.47:-1.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:133,46:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,105:0.70: 0.01:1.000:0.986 0/0/0/1:4:139,34:0.19: 0.76:0.999:1.000 0/1/1/1:4:24,109:0.81:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,70:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,56:0.55:-1.31:1.000:0.984 0/1/1/1:4:25,125:0.82: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,76:0.61:-0.71:1.000:0.668 0/0/1/1:4:69,71:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,72:0.59:-0.74:1.000:0.892 0/0/0/1:4:68,28:0.28:-1.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,89:0.47: 1.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:90,84:0.48: 0.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:139,45:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,46:0.30: 0.01:1.000:0.981 0/0/1/1:4:72,92:0.55: 0.50:1.000:0.978 0/0/1/1:4:105,97:0.47: 1.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:164,70:0.29: 2.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:28,117:0.79:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,81:0.46: 0.73:1.000:0.989 -chr2.1 22077644 chr2.1_022077644 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:176,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.45:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.23:1.000:. ./.:6:275,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.82:0.777:. ./.:4:180,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.01:0.693:. ./.:4:355,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.26:1.000:. ./.:3:200,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:269,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:311,1:.: 1.04:0.999:. ./.:4:320,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.10:0.774:. ./.:4:329,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.42:0.993:. ./.:4:269,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:322,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.97:0.998:. ./.:4:161,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.07:0.999:. ./.:4:145,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.16:1.000:. -chr2.1 22240561 chr2.1_022240561 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:221,207:.: 0.79:1.000:. ./.:4:166,155:.:-0.42:1.000:. ./.:4:177,177:.:-0.05:1.000:. ./.:4:217,220:.: 0.90:1.000:. ./.:4:98,320:.: 0.68:1.000:. ./.:4:108,334:.: 0.95:1.000:. ./.:4:95,255:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,302:.: 0.31:1.000:. ./.:4:183,210:.: 0.40:1.000:. ./.:4:66,64:.:-2.59:1.000:. ./.:4:27,50:.:-3.19:1.000:. ./.:4:92,312:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,189:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,441:.: 0.94:1.000:. ./.:4:114,276:.: 0.36:1.000:. ./.:4:98,320:.: 0.68:1.000:. ./.:4:114,344:.: 1.13:1.000:. ./.:4:105,287:.: 0.39:1.000:. ./.:4:118,414:.: 1.97:1.000:. ./.:4:2,473:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,72:.:-3.25:1.000:. ./.:4:93,301:.: 0.41:1.000:. ./.:4:131,346:.: 1.35:1.000:. ./.:4:184,196:.: 0.25:1.000:. ./.:4:14,45:.:-3.39:1.000:. ./.:4:105,258:.: 0.06:1.000:. ./.:4:218,221:.: 0.92:1.000:. ./.:4:120,288:.: 0.57:1.000:. ./.:4:224,226:.: 1.04:1.000:. ./.:4:227,205:.: 0.84:1.000:. ./.:4:99,294:.: 0.40:1.000:. ./.:4:174,180:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,21:.:-3.70:1.000:. ./.:4:31,79:.:-2.81:1.000:. ./.:3:13,24:.:-3.64:1.000:. ./.:4:0,368:.: 0.11:1.000:. ./.:4:186,185:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,437:.: 0.92:1.000:. ./.:4:3,377:.: 0.25:1.000:. ./.:4:93,332:.: 0.76:1.000:. ./.:4:189,189:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,268:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,372:.: 0.16:1.000:. ./.:4:73,225:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,470:.: 1.27:1.000:. ./.:4:81,273:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,470:.: 1.28:1.000:. ./.:4:20,54:.:-3.22:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,241:.:-1.33:1.000:. ./.:4:168,176:.:-0.16:1.000:. ./.:4:202,196:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,257:.:-0.26:1.000:. ./.:4:111,264:.: 0.19:1.000:. ./.:4:103,303:.: 0.54:1.000:. ./.:4:87,228:.:-0.49:1.000:. ./.:4:75,226:.:-0.65:1.000:. ./.:4:87,250:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,298:.:-0.68:1.000:. ./.:6:90,212:.:-0.64:1.000:. ./.:4:103,280:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,334:.:-0.26:1.000:. ./.:4:94,278:.: 0.16:1.000:. ./.:4:89,237:.:-0.36:1.000:. ./.:4:82,281:.: 0.06:1.000:. ./.:4:173,175:.:-0.11:1.000:. ./.:4:174,196:.: 0.14:0.777:. ./.:4:163,167:.:-0.32:1.000:. ./.:4:110,312:.: 0.73:1.000:. ./.:4:57,204:.:-1.10:1.000:. ./.:4:95,262:.:-0.01:1.000:. ./.:4:93,321:.: 0.64:1.000:. ./.:4:203,152:.:-0.03:1.000:. ./.:4:58,221:.:-0.90:1.000:. ./.:4:92,243:.:-0.26:1.000:. ./.:4:98,289:.: 0.33:1.000:. ./.:4:88,283:.: 0.15:1.000:. ./.:4:231,213:.: 0.98:1.000:. ./.:4:2,277:.:-0.90:0.693:. ./.:4:96,289:.: 0.31:1.000:. ./.:4:192,195:.: 0.33:1.000:. ./.:4:94,239:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,337:.:-0.23:1.000:. ./.:4:106,303:.: 0.58:1.000:. ./.:4:149,155:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.25:1.000:. ./.:4:188,163:.:-0.08:1.000:. ./.:4:73,245:.:-0.45:1.000:. ./.:3:88,157:.:-1.28:0.999:. ./.:4:73,262:.:-0.26:1.000:. ./.:4:184,230:.: 0.64:1.000:. ./.:4:83,229:.:-0.52:1.000:. ./.:4:107,293:.: 0.48:1.000:. ./.:4:77,271:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,253:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,133:.:-0.82:1.000:. ./.:4:120,326:.: 1.00:1.000:. ./.:4:2,468:.: 1.27:1.000:. ./.:4:101,233:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,306:.: 0.32:1.000:. ./.:4:53,243:.:-0.70:1.000:. ./.:4:191,178:.: 0.12:1.000:. ./.:4:61,218:.:-0.90:1.000:. ./.:4:96,225:.:-0.42:1.000:. ./.:4:79,235:.:-0.50:1.000:. ./.:4:90,312:.: 0.50:1.000:. ./.:4:234,222:.: 1.11:1.000:. ./.:4:94,268:.: 0.05:1.000:. ./.:4:167,152:.:-0.44:1.000:. ./.:4:257,250:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.10:0.999:. ./.:4:0,391:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,258:.:-1.13:0.774:. ./.:4:211,202:.: 0.62:1.000:. ./.:4:86,235:.:-0.42:1.000:. ./.:4:70,246:.:-0.48:1.000:. ./.:4:92,260:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,220:.:-0.70:1.000:. ./.:4:177,186:.: 0.06:1.000:. ./.:4:150,181:.:-0.31:1.000:. ./.:4:199,210:.: 0.58:1.000:. ./.:4:95,319:.: 0.64:1.000:. ./.:4:158,151:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,407:.: 0.57:1.000:. ./.:4:87,273:.: 0.02:0.993:. ./.:4:93,222:.:-0.49:1.000:. ./.:4:146,147:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1,271:.:-0.98:1.000:. ./.:4:84,244:.:-0.34:1.000:. ./.:4:87,258:.:-0.15:1.000:. ./.:4:129,134:.:-1.08:1.000:. ./.:4:208,168:.: 0.20:1.000:. ./.:4:106,264:.: 0.14:1.000:. ./.:4:148,448:.: 2.70:1.000:. ./.:4:209,185:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.27:1.000:. ./.:4:82,222:.:-0.61:1.000:. ./.:4:85,260:.:-0.15:1.000:. ./.:4:199,160:.: 0.01:1.000:. ./.:4:101,262:.: 0.06:1.000:. ./.:4:178,202:.: 0.25:1.000:. ./.:4:143,138:.:-0.87:1.000:. ./.:4:116,345:.: 1.17:1.000:. ./.:4:109,369:.: 1.36:1.000:. ./.:4:2,408:.: 0.59:1.000:. ./.:4:100,227:.:-0.35:1.000:. ./.:4:239,204:.: 0.96:1.000:. ./.:4:101,263:.: 0.07:1.000:. ./.:4:244,255:.: 1.60:1.000:. ./.:4:1,335:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,36:.:-3.39:1.000:. ./.:4:82,259:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,358:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,389:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,388:.: 1.78:1.000:. ./.:4:231,239:.: 1.27:1.000:. ./.:4:89,279:.: 0.11:0.998:. ./.:4:232,212:.: 0.98:1.000:. ./.:4:73,254:.:-0.35:1.000:. ./.:4:78,198:.:-0.93:1.000:. ./.:4:199,178:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,367:.: 0.11:1.000:. ./.:4:193,185:.: 0.23:1.000:. ./.:4:197,192:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,326:.:-0.36:1.000:. ./.:4:184,220:.: 0.52:0.999:. ./.:4:0,377:.: 0.22:1.000:. ./.:4:96,292:.: 0.34:1.000:. ./.:4:77,260:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,279:.:-0.90:1.000:. ./.:4:103,269:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,349:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,220:.:-0.69:1.000:. ./.:4:163,166:.:-0.33:1.000:. ./.:4:256,216:.: 1.29:1.000:. ./.:4:115,345:.: 1.16:1.000:. ./.:4:193,189:.: 0.27:1.000:. ./.:4:206,176:.: 0.27:1.000:. ./.:4:111,322:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,510:.: 1.72:1.000:. ./.:4:129,354:.: 1.42:1.000:. ./.:4:110,257:.: 0.10:1.000:. ./.:4:116,302:.: 0.68:1.000:. -chr2.1 22295500 chr2.1_022295500 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:407,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:144,40:.:-1.82:1.000:. ./.:4:110,37:.:-2.14:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:343,98:.: 0.38:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:249,97:.:-0.43:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:243,138:.:-0.13:1.000:. ./.:4:218,116:.:-0.54:1.000:. ./.:4:124,27:.:-2.10:1.000:. ./.:4:304,87:.:-0.05:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:73,23:.:-2.58:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:367,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:435,120:.: 1.36:1.000:. ./.:4:543,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,13:.:-2.84:1.000:. ./.:4:185,61:.:-1.29:1.000:. ./.:3:56,1:.:-2.91:1.000:. ./.:4:181,90:.:-1.08:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:303,90:.:-0.03:1.000:. ./.:4:352,132:.: 0.75:1.000:. ./.:4:313,92:.: 0.07:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:317,103:.: 0.20:1.000:. ./.:4:234,147:.:-0.13:1.000:. ./.:4:339,118:.: 0.52:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:444,110:.: 1.35:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:1150,0:.: 6.45:1.000:. ./.:4:208,108:.:-0.69:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:586,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:302,128:.: 0.29:1.000:. ./.:4:292,88:.:-0.14:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:199,97:.:-0.86:1.000:. ./.:6:338,74:.: 0.13:1.000:. ./.:4:392,101:.: 0.83:1.000:. ./.:4:269,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:397,127:.: 1.09:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:370,112:.: 0.73:1.000:. ./.:4:330,115:.: 0.41:1.000:. ./.:4:262,76:.:-0.50:1.000:. ./.:4:341,92:.: 0.31:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.35:0.777:. ./.:4:446,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:393,149:.: 1.24:1.000:. ./.:4:155,78:.:-1.40:1.000:. ./.:4:547,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:228,107:.:-0.53:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:509,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:365,1:.:-0.26:0.693:. ./.:4:416,113:.: 1.13:1.000:. ./.:4:442,114:.: 1.36:1.000:. ./.:4:188,78:.:-1.12:1.000:. ./.:4:236,147:.:-0.12:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:279,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:327,98:.: 0.24:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.51:1.000:. ./.:3:324,0:.:-0.62:0.999:. ./.:4:358,111:.: 0.62:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:250,84:.:-0.54:1.000:. ./.:4:253,116:.:-0.24:1.000:. ./.:4:357,127:.: 0.75:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:270,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:379,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:342,125:.: 0.60:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:340,120:.: 0.54:1.000:. ./.:4:195,81:.:-1.03:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:322,102:.: 0.23:1.000:. ./.:4:621,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:313,106:.: 0.19:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:643,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:338,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.75:0.774:. ./.:4:462,126:.: 1.64:1.000:. ./.:4:214,99:.:-0.72:1.000:. ./.:4:429,123:.: 1.33:1.000:. ./.:4:360,119:.: 0.71:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:516,3:.: 1.05:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:419,106:.: 1.10:1.000:. ./.:4:384,114:.: 0.87:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:218,125:.:-0.46:1.000:. ./.:4:247,120:.:-0.25:0.993:. ./.:4:377,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:178,99:.:-1.03:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:208,95:.:-0.80:1.000:. ./.:4:213,66:.:-1.01:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:350,92:.: 0.39:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:403,107:.: 0.97:1.000:. ./.:4:329,101:.: 0.29:1.000:. ./.:4:214,188:.: 0.05:1.000:. ./.:4:306,100:.: 0.08:1.000:. ./.:4:392,107:.: 0.88:1.000:. ./.:4:337,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:327,99:.: 0.25:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:518,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:427,160:.: 1.63:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:421,92:.: 1.00:1.000:. ./.:4:171,94:.:-1.13:1.000:. ./.:4:97,26:.:-2.34:1.000:. ./.:4:302,79:.:-0.13:1.000:. ./.:4:362,100:.: 0.56:1.000:. ./.:4:219,90:.:-0.75:1.000:. ./.:4:373,118:.: 0.81:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.15:0.998:. ./.:4:508,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:382,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:307,83:.:-0.06:1.000:. ./.:4:264,89:.:-0.37:1.000:. ./.:4:204,96:.:-0.83:1.000:. ./.:4:564,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:256,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.23:0.999:. ./.:4:353,105:.: 0.53:1.000:. ./.:4:266,93:.:-0.32:1.000:. ./.:4:203,90:.:-0.89:1.000:. ./.:4:134,69:.:-1.66:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:171,101:.:-1.07:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:555,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:361,92:.: 0.48:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:254,95:.:-0.41:1.000:. ./.:4:312,88:.: 0.03:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.11:1.000:. -chr2.1 22396780 chr2.1_022396780 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:21,35:0.60: 1.24:1.000:0.798 0/0/1/1:4:11,16:0.57:-0.65:1.000:0.942 0/0/0/1:4:28,8:0.22:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,9:0.36:-0.78:1.000:0.709 0/0/1/1:4:33,34:0.50: 1.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,11:0.26: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,8:0.49:-1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,23:0.55: 0.26:1.000:0.984 0/0/1/1:4:13,15:0.52:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:2,3:0.58:-2.08:1.000:0.922 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,14:0.61:-0.98:1.000:0.706 0/1/1/1:4:13,33:0.68: 0.59:1.000:0.945 0/1/1/1:4:9,53:0.81: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,12:0.32: 0.07:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,50:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,35:0.73: 0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,93:0.82: 4.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-0.78:1.000:0.761 0/1/1/1:4:21,41:0.63: 1.63:1.000:0.559 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,9:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,28:0.68: 0.13:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,13:0.21: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.35:-0.19:1.000:0.779 0/0/1/1:4:24,21:0.46: 0.52:1.000:0.988 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,25:0.71:-0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:8,24:0.70:-0.32:1.000:0.989 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-2.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:20,17:0.45: 0.00:1.000:0.983 0/0/0/1:4:27,13:0.32: 0.20:1.000:0.941 0/0/1/1:4:19,27:0.57: 0.59:1.000:0.954 0/1/1/1:4:15,29:0.63: 0.46:1.000:0.535 0/0/1/1:4:33,21:0.39: 1.11:1.000:0.645 0/0/1/1:4:19,13:0.40:-0.32:1.000:0.813 0/0/0/1:4:37,19:0.34: 1.24:1.000:0.879 0/0/0/1:4:32,13:0.29: 0.52:1.000:0.992 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,20:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,13:0.42:-0.39:1.000:0.893 0/1/1/1:4:8,47:0.81: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,12:0.60:-1.17:1.000:0.748 0/1/1/1:4:14,27:0.63: 0.26:1.000:0.529 0/1/1/1:4:3,27:0.87:-0.45:1.000:0.884 0/1/1/1:4:6,28:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,42:0.62: 1.83:1.000:0.608 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,13:0.27: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,15:0.33: 0.59:1.000:0.937 0/1/1/1:4:8,30:0.74: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,24:0.45: 1.04:1.000:0.977 0/0/1/1:4:14,22:0.59:-0.06:1.000:0.879 0/0/1/1:4:18,26:0.57: 0.46:1.000:0.946 0/0/0/0/0/1:6:24,4:0.14:-0.58:1.000:0.994 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,30:0.61: 0.65:1.000:0.688 0/0/1/1:4:27,18:0.40: 0.52:1.000:0.761 0/0/1/1:4:10,18:0.61:-0.58:1.000:0.643 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,17:0.33: 0.91:1.000:0.910 0/0/0/1:4:19,4:0.18:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,15:0.33: 0.59:1.000:0.937 0/0/0/1:4:19,9:0.32:-0.58:0.777:0.951 0/1/1/1:4:6,22:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:33,18:0.35: 0.91:1.000:0.779 0/0/1/1:4:24,15:0.38: 0.13:1.000:0.594 0/1/1/1:4:15,31:0.64: 0.59:1.000:0.693 0/1/1/1:4:9,24:0.69:-0.26:1.000:0.966 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.33:-0.85:1.000:0.910 0/0/0/1:4:30,8:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,35:0.54: 1.70:1.000:0.987 0/0/1/1:4:24,29:0.53: 1.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:23,9:0.28:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,17:0.44: 0.07:0.693:0.971 0/0/0/1:4:16,7:0.30:-0.91:1.000:0.980 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,32:0.53: 1.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,37:0.72: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,16:0.54:-0.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:8,15:0.62:-0.91:1.000:0.543 0/1/1/1:4:7,25:0.73:-0.32:1.000:0.998 0/0/1:3:23,6:0.21:-0.52:0.999:0.999 0/0/0/1:4:17,5:0.23:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,10:0.31:-0.32:1.000:0.969 0/0/0/1:4:28,16:0.36: 0.46:1.000:0.668 0/0/0/1:4:32,7:0.18: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,11:0.32:-0.19:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,15:0.65:-0.98:1.000:0.764 0/0/0/1:4:36,7:0.16: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,37:0.61: 1.37:1.000:0.691 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,31:0.48: 1.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,12:0.49:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,8:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.27:-1.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,22:0.62:-0.19:1.000:0.599 0/0/1/1:4:18,17:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,13:0.40:-0.32:1.000:0.813 0/0/0/1:4:29,15:0.34: 0.46:1.000:0.870 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,10:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,20:0.39: 0.91:1.000:0.682 0/1/1/1:4:5,37:0.85: 0.33:0.999:0.990 0/0/1/1:4:21,24:0.52: 0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,21:0.80:-0.78:0.774:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,7:0.20:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.33:-0.85:1.000:0.910 0/0/0/1:4:18,7:0.28:-0.78:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,14:0.63:-1.04:1.000:0.618 0/0/1/1:4:19,26:0.56: 0.52:1.000:0.968 0/1/1/1:4:12,25:0.64: 0.00:1.000:0.710 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.33:-0.85:1.000:0.910 0/0/0/1:4:26,7:0.21:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,5:0.38:-1.56:0.993:0.594 0/0/0/1:4:12,7:0.37:-1.17:1.000:0.611 0/0/1/1:4:13,11:0.45:-0.85:1.000:0.982 0/1/1/1:4:10,24:0.67:-0.19:1.000:0.909 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.40:-0.45:1.000:0.761 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,9:0.30:-0.45:1.000:0.985 0/0/0/1:4:17,9:0.34:-0.72:1.000:0.835 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.30:-0.65:1.000:0.988 0/0/0/1:4:17,10:0.37:-0.65:1.000:0.587 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,13:0.27: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,6:0.29:-1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,42:0.49: 3.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,45:0.79: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,12:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,47:0.62: 2.35:1.000:0.633 1/1/1/1:4:0,37:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,32:0.61: 0.85:1.000:0.671 0/0/1/1:4:1,1:0.49:-2.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,9:0.33:-0.65:1.000:0.910 0/0/0/1:4:36,19:0.34: 1.17:1.000:0.840 0/0/0/1:4:36,11:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,40:0.70: 1.11:1.000:0.982 0/0/1/1:4:22,14:0.39:-0.06:1.000:0.645 0/0/1/1:4:25,26:0.50: 0.91:0.998:0.997 0/0/0/1:4:29,6:0.17:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,33:0.54: 1.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:13,10:0.43:-0.91:1.000:0.947 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,26:0.62: 0.20:1.000:0.567 0/0/0/1:4:27,11:0.29: 0.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,40:0.67: 1.24:1.000:0.937 0/0/1/1:4:16,25:0.59: 0.26:1.000:0.885 0/0/1/1:4:16,18:0.52:-0.19:0.999:0.995 0/0/1/1:4:13,21:0.59:-0.19:1.000:0.845 0/0/1/1:4:27,18:0.40: 0.52:1.000:0.761 0/0/1/1:4:11,7:0.39:-1.24:1.000:0.645 0/0/0/1:4:25,8:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,16:0.66:-0.91:1.000:0.861 0/0/1/1:4:20,28:0.56: 0.72:1.000:0.960 0/1/1/1:4:8,16:0.63:-0.85:1.000:0.618 0/0/0/1:4:17,6:0.26:-0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,12:0.38:-0.39:1.000:0.624 0/0/0/1:4:32,14:0.30: 0.59:1.000:0.980 0/0/0/1:4:34,13:0.28: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,3:0.14:-1.04:1.000:0.979 0/0/0/1:4:29,14:0.33: 0.39:1.000:0.939 0/1/1/1:4:16,47:0.70: 1.70:1.000:0.986 0/1/1/1:4:10,41:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,16:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,24:0.54: 0.39:1.000:0.986 -chr2.1 22706941 chr2.1_022706941 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:139,333:.: 1.58:1.000:. ./.:4:102,224:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.31:1.000:. ./.:4:141,423:.: 2.45:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.97:1.000:. ./.:4:112,316:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,382:.: 0.73:1.000:. ./.:4:23,62:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,94:.:-2.01:1.000:. ./.:4:201,258:.: 1.46:1.000:. ./.:4:113,327:.: 1.27:1.000:. ./.:4:112,266:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.01:1.000:. ./.:4:118,318:.: 1.24:1.000:. ./.:4:118,247:.: 0.56:1.000:. ./.:4:105,222:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,375:.: 0.66:1.000:. ./.:4:140,332:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,44:.:-2.49:1.000:. ./.:4:0,361:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.86:1.000:. ./.:4:91,310:.: 0.90:1.000:. ./.:4:11,28:.:-2.54:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.35:1.000:. ./.:4:93,336:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,358:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,330:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,267:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,28:.:-2.64:1.000:. ./.:4:22,49:.:-2.23:1.000:. ./.:3:1,25:.:-2.66:1.000:. ./.:4:109,253:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.04:1.000:. ./.:4:98,288:.: 0.76:1.000:. ./.:4:96,225:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,255:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,279:.:-0.26:1.000:. ./.:4:82,194:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,198:.:-1.03:1.000:. ./.:4:121,260:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.37:1.000:. ./.:4:125,296:.: 1.09:1.000:. ./.:4:24,124:.:-1.50:1.000:. ./.:4:94,158:.:-0.51:1.000:. ./.:4:94,116:.:-0.91:1.000:. ./.:4:83,203:.:-0.19:1.000:. ./.:4:129,291:.: 1.08:1.000:. ./.:4:79,170:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,348:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.61:1.000:. ./.:4:111,147:.:-0.45:1.000:. ./.:4:89,271:.: 0.51:1.000:. ./.:4:102,204:.: 0.00:1.000:. ./.:4:107,197:.:-0.02:1.000:. ./.:6:43,199:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,312:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.31:1.000:. ./.:4:110,217:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,155:.:-1.43:1.000:. ./.:4:97,297:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.64:0.777:. ./.:4:100,260:.: 0.51:1.000:. ./.:4:147,294:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,105:.:-1.91:1.000:. ./.:4:213,167:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,142:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.45:1.000:. ./.:4:102,280:.: 0.72:1.000:. ./.:4:99,253:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.43:1.000:. ./.:4:139,152:.:-0.14:0.693:. ./.:4:0,244:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,125:.:-1.72:1.000:. ./.:4:105,307:.: 1.01:1.000:. ./.:4:86,219:.:-0.01:1.000:. ./.:4:92,254:.: 0.38:1.000:. ./.:4:91,240:.: 0.24:1.000:. ./.:4:93,247:.: 0.32:1.000:. ./.:3:0,139:.:-1.59:0.999:. ./.:4:0,212:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.53:1.000:. ./.:4:96,200:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.68:1.000:. ./.:4:91,232:.: 0.16:1.000:. ./.:4:95,191:.:-0.19:1.000:. ./.:4:87,176:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,261:.: 0.54:1.000:. ./.:4:62,151:.:-0.88:1.000:. ./.:4:111,298:.: 0.98:1.000:. ./.:4:90,223:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,299:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.94:1.000:. ./.:4:102,192:.:-0.11:1.000:. ./.:4:96,181:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,366:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,427:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,279:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,464:.: 1.50:1.000:. ./.:4:115,296:.: 1.00:0.999:. ./.:4:0,295:.:-0.10:1.000:. ./.:4:65,127:.:-1.08:0.774:. ./.:4:0,298:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,178:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,188:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,183:.:-1.17:1.000:. ./.:4:104,304:.: 0.97:1.000:. ./.:4:105,227:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,480:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,292:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.94:0.993:. ./.:4:86,160:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,148:.:-1.50:1.000:. ./.:4:80,182:.:-0.42:1.000:. ./.:4:84,199:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,169:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,180:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.64:1.000:. ./.:4:133,340:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.72:1.000:. ./.:4:87,172:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.82:1.000:. ./.:4:128,244:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,299:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,186:.:-1.14:1.000:. ./.:4:118,410:.: 2.11:1.000:. ./.:4:0,414:.: 1.03:1.000:. ./.:4:139,350:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.65:1.000:. ./.:4:107,334:.: 1.28:1.000:. ./.:4:107,251:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,420:.: 1.08:1.000:. ./.:4:104,243:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,51:.:-2.42:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.28:1.000:. ./.:4:122,381:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.92:1.000:. ./.:4:109,347:.: 1.43:0.998:. ./.:4:0,404:.: 0.93:1.000:. ./.:4:89,338:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.31:1.000:. ./.:4:106,280:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.93:1.000:. ./.:4:94,309:.: 0.92:1.000:. ./.:4:102,267:.: 0.60:1.000:. ./.:4:94,310:.: 0.93:0.999:. ./.:4:94,302:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,275:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.01:1.000:. ./.:4:98,244:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,174:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,286:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,450:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,407:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,351:.: 0.43:1.000:. ./.:4:10,324:.: 0.27:1.000:. ./.:4:103,328:.: 1.19:1.000:. ./.:4:120,333:.: 1.40:1.000:. ./.:4:136,398:.: 2.17:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.45:1.000:. ./.:4:106,293:.: 0.89:1.000:. -chr2.1 22860062 chr2.1_022860062 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,3:.: 0.20:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:52,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.28:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,3:.:-1.27:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,3:.:-1.52:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:28,4:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:37,5:.:-0.51:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:33,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:79,7:.: 1.71:1.000:. ./.:4:75,6:.: 1.46:1.000:. ./.:4:52,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:86,12:.: 2.32:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:48,5:.: 0.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:78,4:.: 1.51:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.27:1.000:. ./.:6:80,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:75,6:.: 1.46:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.41:0.777:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:48,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:61,5:.: 0.70:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:76,3:.: 1.36:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.96:0.693:. ./.:4:64,3:.: 0.75:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:62,6:.: 0.81:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:51,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.31:1.000:. ./.:3:38,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:46,4:.:-0.10:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:50,4:.: 0.10:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.93:1.000:. ./.:4:53,3:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,4:.:-0.91:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:91,4:.: 2.17:1.000:. ./.:4:69,7:.: 1.21:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:74,3:.: 1.26:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:61,3:.: 0.60:0.999:. ./.:4:79,3:.: 1.51:1.000:. ./.:4:51,3:.: 0.10:0.985:. ./.:4:74,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:56,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:53,6:.: 0.35:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:95,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:57,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.66:0.993:. ./.:4:49,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,3:.: 1.21:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:52,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:52,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:45,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:54,4:.: 0.30:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.42:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.36:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.71:0.998:. ./.:4:50,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:30,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:38,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.75:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:40,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:27,4:.:-1.06:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.57:1.000:. -chr2.1 22969378 chr2.1_022969378 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:36,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.87:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:49,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.88:1.000:. ./.:6:34,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:0.777:. ./.:4:10,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:0.693:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:3:22,0:.:-0.32:0.999:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.97:0.999:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:0.985:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.04:0.993:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:0.998:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.41:0.999:. ./.:4:18,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. -chr2.1 23268062 chr2.1_023268062 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:12,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:9,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 2.91:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.79:0.777:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 2.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:5,0:.:-1.03:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:0.998:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 23614459 chr2.1_023614459 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:195,160:0.47: 0.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:96,260:0.73: 0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:86,208:0.71:-0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:177,163:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,188:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:229,211:0.50: 1.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,228:0.76:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,75:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,278:0.72: 0.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,28:0.49:-2.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,32:0.49:-2.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,171:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:248,71:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,202:0.53: 0.99:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,304:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,164:0.45: 0.85:1.000:0.981 0/0/1/1:4:206,171:0.47: 0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:169,199:0.55: 0.72:1.000:0.974 0/1/1/1:4:127,411:0.77: 2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:222,265:0.56: 2.00:1.000:0.970 1/1/1/1:4:6,59:0.91:-2.54:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,314:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,197:0.52: 0.93:1.000:0.994 0/0/0/1:4:296,95:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,24:0.44:-2.62:1.000:0.968 0/0/1/1:4:186,193:0.53: 0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:205,205:0.52: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,144:0.46: 0.28:1.000:0.987 0/1/1/1:4:93,293:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,309:0.74: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,276:0.74: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,72:0.26: 0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-2.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,33:0.66:-2.69:1.000:0.841 0/0/1:3:29,21:0.44:-2.70:1.000:0.983 0/0/1/1:4:213,189:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,268:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,280:0.74: 0.88:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,343:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,214:0.49: 1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,139:0.55:-0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:140,149:0.53:-0.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:74,242:0.77: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,180:0.72:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,159:0.51: 0.24:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,298:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,183:0.52: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,33:0.50:-2.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,111:0.47:-0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:126,100:0.46:-0.80:1.000:0.988 0/0/0/1:4:181,52:0.25:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,191:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,120:0.52:-0.69:1.000:0.994 0/1/1/1:4:78,203:0.73:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,140:0.47: 0.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:132,94:0.44:-0.80:1.000:0.959 0/0/1/1:4:123,159:0.58:-0.20:1.000:0.926 0/0/0/1:4:196,62:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,124:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:68,130:0.66:-1.11:1.000:0.919 0/1/1/1:4:69,211:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,194:0.77:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,291:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,185:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,213:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,146:0.58:-0.47:1.000:0.910 0/1/1/1:4:75,226:0.75: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,160:0.54: 0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:101,125:0.57:-0.80:0.777:0.955 0/1/1/1:4:75,205:0.74:-0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:151,169:0.54: 0.21:1.000:0.986 0/1/1/1:4:67,180:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,146:0.54:-0.27:1.000:0.985 0/1/1/1:4:90,251:0.74: 0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,173:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,132:0.53:-0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:128,127:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,64:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,255:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,117:0.56:-0.94:0.693:0.962 0/1/1/1:4:65,225:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,252:0.79: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,201:0.72:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,220:0.79:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,169:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,58:0.27:-0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,160:0.72:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,109:0.56:-1.07:1.000:0.972 0/0/1/1:4:122,138:0.55:-0.44:1.000:0.984 0/1/1:3:52,110:0.69:-1.49:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,235:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,158:0.53: 0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:130,122:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,284:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,127:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,104:0.47:-0.77:1.000:0.993 0/1/1/1:4:65,184:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,131:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,253:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,128:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,132:0.45: 0.02:1.000:0.984 0/0/0/1:4:156,51:0.27:-1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,211:0.75:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,213:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,135:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,47:0.24:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,383:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,274:0.72: 0.92:1.000:0.994 0/1/1/1:4:84,236:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,178:0.74:-0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:132,336:0.72: 1.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,116:0.47:-0.45:0.999:0.991 0/1/1/1:4:74,203:0.74:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,82:0.48:-1.34:0.985:0.996 0/1/1/1:4:78,204:0.73:-0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,196:0.75:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,193:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,185:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,162:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,146:0.49: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:179,65:0.29:-0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:51,186:0.79:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,248:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,182:0.80:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,203:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,223:0.76:-0.08:0.993:1.000 0/1/1/1:4:49,166:0.78:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,108:0.52:-0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,104:0.52:-1.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,102:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,293:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,135:0.69:-1.12:1.000:0.977 0/0/1/1:4:132,110:0.47:-0.63:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,245:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:270,231:0.48: 2.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,221:0.78:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,250:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,147:0.75:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,154:0.71:-0.88:1.000:0.991 0/1/1/1:4:62,190:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,137:0.53:-0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:93,243:0.73: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,86:0.48:-1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:218,200:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,292:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,187:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,197:0.76:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,191:0.48: 1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,162:0.57:-0.09:1.000:0.951 0/1/1/1:4:115,363:0.76: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,179:0.47: 1.03:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,44:0.76:-2.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,352:1.00: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,292:0.75: 0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:134,342:0.72: 1.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:218,209:0.51: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,161:0.54: 0.09:0.998:0.990 0/1/1/1:4:108,271:0.72: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,191:0.49: 1.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,311:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,273:0.80: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,157:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,280:0.78: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,187:0.48: 1.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:96,277:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:115,274:0.71: 0.95:0.999:0.992 0/1/1/1:4:90,228:0.72: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,180:0.52: 0.58:1.000:0.994 0/1/1/1:4:92,211:0.70: 0.02:1.000:0.987 0/1/1/1:4:85,215:0.72:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,276:0.77: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,161:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,244:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,125:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:122,362:0.75: 1.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:245,214:0.48: 1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,199:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,195:0.54: 0.79:1.000:0.989 0/0/1/1:4:213,186:0.48: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,212:0.49: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:252,248:0.51: 2.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,361:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,265:0.80: 0.34:1.000:1.000 -chr2.1 23801041 chr2.1_023801041 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:80,98:0.52: 0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,56:0.71:-1.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:87,85:0.47: 0.72:1.000:0.990 0/0/0/1:4:98,44:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:100,65:0.36: 0.56:1.000:0.666 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,85:0.48: 0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,35:0.65:-1.98:1.000:0.790 0/1/1/1:4:14,28:0.64:-2.21:1.000:0.724 0/0/1/1:4:47,44:0.45:-1.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:86,49:0.33:-0.11:1.000:0.921 0/0/0/1:4:93,43:0.28:-0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,122:0.81: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,70:0.64:-0.79:1.000:0.724 0/1/1/1:4:31,81:0.70:-0.63:1.000:0.986 0/0/1/1:4:84,59:0.38: 0.07:1.000:0.585 0/0/1/1:4:87,130:0.57: 1.73:1.000:0.936 0/0/1/1:4:102,73:0.39: 0.79:1.000:0.644 0/0/1/1:4:15,26:0.61:-2.23:1.000:0.695 0/1/1/1:4:39,149:0.77: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,47:0.30: 0.00:1.000:0.984 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,42:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,43:0.34:-0.54:1.000:0.882 0/0/1/1:4:95,122:0.54: 1.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:91,117:0.54: 1.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,81:0.54: 0.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:73,36:0.30:-0.70:1.000:0.988 0/1/1/1:4:3,14:0.81:-2.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,48:0.96:-2.03:1.000:1.000 0/0/0:3:20,0:0.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,49:0.37:-0.38:1.000:0.609 0/0/1/1:4:69,85:0.53: 0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,94:0.64: 0.02:1.000:0.724 0/1/1/1:4:25,68:0.71:-1.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:61,32:0.31:-1.06:1.000:0.973 0/0/0/1:4:91,41:0.28:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,36:0.39:-1.22:1.000:0.662 0/0/0/1:4:89,29:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,24:0.21:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,51:0.37:-0.29:1.000:0.566 0/1/1/1:4:38,109:0.72: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,57:0.36: 0.09:1.000:0.642 0/0/1/1:4:36,41:0.51:-1.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,25:0.27:-1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,25:0.42:-1.91:1.000:0.931 0/0/0/1:4:71,29:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,93:0.75:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,135:0.77: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,50:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,45:0.63:-1.60:1.000:0.540 0/0/0/1:4:82,35:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,36:0.29:-0.68:1.000:0.990 0/0/0/0/1/1:6:66,44:0.37:-0.68:1.000:0.842 0/0/0/1:4:126,71:0.33: 1.28:1.000:0.932 0/0/0/1:4:88,34:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,85:0.48: 0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:87,34:0.25:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,46:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,37:0.36:-1.01:1.000:0.719 0/1/1/1:4:39,89:0.67:-0.27:1.000:0.931 0/1/1/1:4:33,91:0.71:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/1:4:131,52:0.25: 0.97:0.777:0.999 0/1/1/1:4:26,69:0.70:-1.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:78,45:0.33:-0.38:1.000:0.908 0/0/1/1:4:72,80:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,32:0.52:-1.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,108:0.60: 0.77:1.000:0.824 0/0/1/1:4:56,64:0.51:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,58:0.42:-0.22:1.000:0.896 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,41:0.29:-0.34:1.000:0.990 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,98:0.58: 0.52:1.000:0.929 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-2.05:0.693:1.000 0/0/1/1:4:77,93:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,111:0.50: 1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,78:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,34:0.27:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,53:0.33: 0.14:1.000:0.921 0/0/0/1:4:68,34:0.30:-0.86:1.000:0.986 0/0/1/1:4:41,65:0.59:-0.77:1.000:0.875 0/0/1/1:4:48,79:0.60:-0.29:1.000:0.813 0/0/0/1:4:94,51:0.32: 0.11:1.000:0.958 0/0/1:3:85,45:0.31:-0.22:0.999:1.000 0/1/1/1:4:38,123:0.74: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,53:0.23: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,39:0.43:-1.24:1.000:0.944 0/0/1/1:4:107,133:0.53: 2.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:78,37:0.29:-0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,92:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,81:0.71:-0.68:1.000:0.994 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,109:0.67: 0.38:1.000:0.927 0/1/1/1:4:39,114:0.72: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,31:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,129:0.60: 1.46:1.000:0.748 0/1/1/1:4:31,104:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,91:0.71:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,115:0.66: 0.65:1.000:0.851 0/0/1/1:4:112,140:0.53: 2.52:1.000:0.993 0/0/0/1:4:134,44:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,85:0.53: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:92,74:0.42: 0.59:1.000:0.894 0/0/1/1:4:78,69:0.44: 0.16:0.999:0.967 0/0/0/1:4:142,47:0.22: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,22:0.23:-1.24:0.985:1.000 0/0/1/1:4:100,86:0.43: 1.04:1.000:0.953 0/0/1/1:4:93,108:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,112:0.79:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,74:0.47: 0.20:1.000:0.992 0/0/1/1:4:69,80:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,81:0.62:-0.31:1.000:0.587 0/0/0/1:4:71,39:0.32:-0.68:1.000:0.951 0/0/1/1:4:90,113:0.53: 1.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:127,59:0.28: 1.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,81:0.51: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,55:0.28: 0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,92:0.52: 0.65:0.993:0.995 0/0/0/1:4:62,25:0.25:-1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,27:0.20:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,27:0.34:-1.53:1.000:0.854 0/0/1/1:4:41,74:0.62:-0.56:1.000:0.579 0/0/1/1:4:97,109:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,51:0.47:-0.86:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,23:0.21:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,150:0.81: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,103:0.66: 0.25:1.000:0.863 0/0/1/1:4:75,87:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,95:0.56: 0.50:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,37:0.27:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,85:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,55:0.36: 0.05:1.000:0.743 0/0/1/1:4:96,101:0.48: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:82,29:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,70:0.35: 0.92:1.000:0.749 0/0/0/1:4:162,74:0.28: 2.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,55:0.34: 0.18:1.000:0.876 0/0/0/1:4:98,40:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,106:0.63: 0.52:1.000:0.514 0/0/1/1:4:44,66:0.57:-0.68:1.000:0.933 0/0/1/1:4:96,112:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,57:0.36: 0.14:1.000:0.708 0/0/1/1:4:18,23:0.53:-2.23:1.000:0.990 0/1/1/1:4:43,176:0.79: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,84:0.47: 0.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:138,61:0.27: 1.33:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,41:0.17: 1.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:83,43:0.31:-0.31:0.998:0.977 0/0/1/1:4:96,104:0.49: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,52:0.33: 0.09:1.000:0.929 0/1/1/1:4:33,81:0.69:-0.59:1.000:0.971 0/0/1/1:4:72,83:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,44:0.29:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,53:0.43:-0.54:1.000:0.938 0/1/1/1:4:42,104:0.69: 0.14:1.000:0.974 0/1/1/1:4:45,93:0.65:-0.04:1.000:0.798 0/1/1/1:4:53,100:0.63: 0.29:0.999:0.559 0/0/1/1:4:55,86:0.58: 0.02:1.000:0.893 0/0/0/1:4:119,57:0.29: 0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,89:0.53: 0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:103,40:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,70:0.47: 0.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,36:0.35:-1.06:1.000:0.745 0/0/1/1:4:43,65:0.58:-0.72:1.000:0.927 0/0/0/1:4:116,38:0.22: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,108:0.50: 1.44:1.000:0.997 0/0/0/0:4:214,0:0.00: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,55:0.26: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,52:0.30: 0.36:1.000:0.986 0/0/0/1:4:101,61:0.34: 0.50:1.000:0.842 0/0/0/1:4:106,69:0.36: 0.79:1.000:0.662 0/1/1/1:4:72,136:0.63: 1.53:1.000:0.563 0/1/1/1:4:33,111:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,55:0.36: 0.00:1.000:0.679 -chr2.1 24189918 chr2.1_024189918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.29:1.000:. ./.:3:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:126,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:105,1:.: 2.28:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.09:1.000:. ./.:6:73,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:80,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.01:0.777:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.01:0.693:. ./.:4:76,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:94,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:100,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:3:40,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:64,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:121,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:77,3:.: 1.25:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.97:0.999:. ./.:4:83,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.29:0.985:. ./.:4:61,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:101,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.81:0.993:. ./.:4:50,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:0.998:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.94:0.999:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. -chr2.1 24286528 chr2.1_024286528 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:123,26:.: 0.63:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:111,15:.:-0.04:1.000:. ./.:4:72,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:148,13:.: 0.97:1.000:. ./.:4:32,18:.:-2.24:1.000:. ./.:4:105,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:76,21:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,12:.:-2.50:1.000:. ./.:4:38,4:.:-2.48:1.000:. ./.:4:77,15:.:-1.03:1.000:. ./.:4:76,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:109,24:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:77,35:.:-0.45:1.000:. ./.:4:75,62:.: 0.28:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:104,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:146,34:.: 1.52:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:131,23:.: 0.77:1.000:. ./.:4:115,27:.: 0.42:1.000:. ./.:4:46,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:98,23:.:-0.19:1.000:. ./.:4:83,46:.: 0.05:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:153,19:.: 1.29:1.000:. ./.:4:108,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:62,35:.:-0.88:1.000:. ./.:4:68,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:19,9:.:-2.88:1.000:. ./.:4:43,9:.:-2.19:1.000:. ./.:3:19,6:.:-2.97:1.000:. ./.:4:108,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:59,35:.:-0.97:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:131,25:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:63,53:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:106,31:.: 0.28:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,21:.: 0.19:1.000:. ./.:4:136,19:.: 0.80:1.000:. ./.:4:148,28:.: 1.41:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:78,19:.:-0.88:1.000:. ./.:4:75,18:.:-1.00:1.000:. ./.:4:63,56:.:-0.24:1.000:. ./.:4:163,25:.: 1.76:1.000:. ./.:4:56,52:.:-0.56:1.000:. ./.:4:198,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:115,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:62,43:.:-0.65:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:100,39:.: 0.34:1.000:. ./.:4:88,36:.:-0.10:1.000:. ./.:6:148,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:100,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:99,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:114,22:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,36:.:-0.68:0.777:. ./.:4:64,27:.:-1.06:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:34,25:.:-1.98:1.000:. ./.:4:100,15:.:-0.36:1.000:. ./.:4:85,48:.: 0.16:1.000:. ./.:4:57,42:.:-0.82:1.000:. ./.:4:58,51:.:-0.53:1.000:. ./.:4:108,24:.: 0.13:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:104,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:132,21:.: 0.74:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.28:0.693:. ./.:4:91,37:.: 0.02:1.000:. ./.:4:126,22:.: 0.60:1.000:. ./.:4:80,39:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,24:.:-1.49:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:97,7:.:-0.68:1.000:. ./.:4:101,25:.:-0.04:1.000:. ./.:3:109,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:106,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:103,55:.: 0.89:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:89,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:83,36:.:-0.24:1.000:. ./.:4:60,26:.:-1.20:1.000:. ./.:4:119,28:.: 0.57:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:42,30:.:-1.61:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:147,33:.: 1.52:1.000:. ./.:4:102,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:71,40:.:-0.48:1.000:. ./.:4:100,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:129,14:.: 0.45:1.000:. ./.:4:155,26:.: 1.55:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:99,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:146,23:.: 1.21:1.000:. ./.:4:108,23:.: 0.10:0.999:. ./.:4:121,37:.: 0.89:1.000:. ./.:4:63,15:.:-1.43:0.985:. ./.:4:112,13:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,36:.:-0.97:1.000:. ./.:4:86,16:.:-0.74:1.000:. ./.:4:61,45:.:-0.62:1.000:. ./.:4:85,43:.: 0.02:1.000:. ./.:4:133,17:.: 0.66:1.000:. ./.:4:81,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:124,29:.: 0.74:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:116,23:.: 0.34:1.000:. ./.:4:118,27:.: 0.51:1.000:. ./.:4:75,56:.: 0.10:0.993:. ./.:4:77,25:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,31:.:-1.37:1.000:. ./.:4:81,14:.:-0.94:1.000:. ./.:4:63,56:.:-0.24:1.000:. ./.:4:102,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:73,15:.:-1.14:1.000:. ./.:4:57,26:.:-1.29:1.000:. ./.:4:103,23:.:-0.04:1.000:. ./.:4:85,33:.:-0.27:1.000:. ./.:4:129,31:.: 0.95:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:129,14:.: 0.45:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:116,24:.: 0.37:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:115,19:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,35:.:-0.94:1.000:. ./.:4:213,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:216,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:130,26:.: 0.83:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:113,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:62,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:131,21:.: 0.71:1.000:. ./.:4:148,32:.: 1.52:1.000:. ./.:4:19,28:.:-2.33:1.000:. ./.:4:95,17:.:-0.45:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:122,30:.: 0.71:1.000:. ./.:4:142,22:.: 1.06:1.000:. ./.:4:70,40:.:-0.50:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.04:0.998:. ./.:4:118,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:96,23:.:-0.24:1.000:. ./.:4:118,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:130,36:.: 1.12:1.000:. ./.:4:74,16:.:-1.08:1.000:. ./.:4:93,24:.:-0.30:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:59,42:.:-0.77:0.999:. ./.:4:169,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,41:.:-0.42:1.000:. ./.:4:75,16:.:-1.06:1.000:. ./.:4:60,44:.:-0.68:1.000:. ./.:4:98,17:.:-0.36:1.000:. ./.:4:59,33:.:-1.03:1.000:. ./.:4:56,35:.:-1.06:1.000:. ./.:4:137,21:.: 0.89:1.000:. ./.:4:129,22:.: 0.68:1.000:. ./.:4:73,51:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,50:.: 0.25:1.000:. ./.:4:122,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:140,32:.: 1.29:1.000:. ./.:4:140,23:.: 1.03:1.000:. ./.:4:90,15:.:-0.65:1.000:. ./.:4:133,24:.: 0.86:1.000:. -chr2.1 24528970 chr2.1_024528970 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,4:.: 1.20:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,11:.: 0.77:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:45,17:.: 2.59:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.41:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:6,3:.:-2.02:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.37:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.98:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.51:1.000:. ./.:4:38,7:.: 1.11:1.000:. ./.:4:35,16:.: 1.64:1.000:. ./.:4:15,23:.: 0.51:1.000:. ./.:4:28,23:.: 1.64:1.000:. ./.:4:32,23:.: 1.99:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.19:1.000:. ./.:4:2,3:.:-2.37:1.000:. ./.:4:20,11:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,9:.: 1.38:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:31,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.45:1.000:. ./.:4:33,11:.: 1.03:1.000:. ./.:4:1,5:.:-2.28:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.85:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:26,14:.: 0.68:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.02:1.000:. ./.:4:32,6:.: 0.51:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.71:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:27,16:.: 0.94:1.000:. ./.:4:19,26:.: 1.11:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:31,8:.: 0.59:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:10,11:.:-0.98:1.000:. ./.:4:7,5:.:-1.76:1.000:. ./.:4:29,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:24,10:.: 0.16:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.68:1.000:. ./.:4:16,14:.:-0.19:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:32,10:.: 0.85:1.000:. ./.:4:13,10:.:-0.80:1.000:. ./.:6:20,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:31,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:30,11:.: 0.77:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,7:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.02:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.19:0.777:. ./.:4:45,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:26,13:.: 0.59:1.000:. ./.:4:4,10:.:-1.58:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:35,23:.: 2.25:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:20,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.28:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.37:0.693:. ./.:4:8,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:17,8:.:-0.63:1.000:. ./.:4:10,6:.:-1.41:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.63:1.000:. ./.:3:20,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:31,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:35,11:.: 1.20:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:9,13:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.45:1.000:. ./.:4:24,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:34,11:.: 1.11:1.000:. ./.:4:36,14:.: 1.55:1.000:. ./.:4:7,1:.:-2.11:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.06:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:25,7:.:-0.02:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.68:0.999:. ./.:4:28,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.76:0.985:. ./.:4:28,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,9:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.06:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.10:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:15,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,12:.: 0.07:0.993:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:11,6:.:-1.32:1.000:. ./.:4:11,13:.:-0.71:1.000:. ./.:4:13,9:.:-0.89:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.51:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.89:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.45:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,19:.: 1.81:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.37:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.63:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:36,6:.: 0.85:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.89:1.000:. ./.:4:29,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.45:1.000:. ./.:4:16,8:.:-0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:40,11:.: 1.64:1.000:. ./.:4:29,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.68:1.000:. ./.:4:30,14:.: 1.03:1.000:. ./.:4:23,22:.: 1.11:1.000:. ./.:4:4,5:.:-2.02:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:28,13:.: 0.77:1.000:. ./.:4:23,13:.: 0.33:1.000:. ./.:4:33,12:.: 1.11:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.54:0.998:. ./.:4:50,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,7:.: 0.33:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.10:1.000:. ./.:4:23,15:.: 0.51:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.06:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.77:0.999:. ./.:4:24,6:.:-0.19:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,21:.: 0.59:1.000:. ./.:4:14,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.54:1.000:. ./.:4:8,12:.:-1.06:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:20,11:.:-0.10:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:39,5:.: 1.03:1.000:. ./.:4:26,11:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,11:.: 1.64:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.24:1.000:. -chr2.1 24735928 chr2.1_024735928 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:52,37:0.41: 0.11:1.000:0.841 0/0/0/1:4:48,28:0.34:-0.29:1.000:0.856 0/0/0/1:4:41,26:0.37:-0.57:1.000:0.580 0/0/1/1:4:42,64:0.59: 0.64:1.000:0.890 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,49:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,60:0.78:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,44:0.35: 1.01:1.000:0.810 0/0/1/1:4:55,37:0.39: 0.21:1.000:0.669 0/0/1/1:4:34,27:0.44:-0.76:1.000:0.972 0/0/0/1:4:26,8:0.20:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,23:0.17: 0.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,64:0.42: 2.01:1.000:0.920 0/0/0/1:4:54,31:0.34:-0.01:1.000:0.888 0/1/1/1:4:18,35:0.63:-1.01:1.000:0.504 0/0/1/1:4:58,70:0.54: 1.32:1.000:0.984 0/0/1/1:4:61,85:0.57: 1.88:1.000:0.947 0/0/0/1:4:54,31:0.34:-0.01:1.000:0.888 0/1/1/1:4:16,83:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,44:0.42: 0.55:1.000:0.922 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,32:0.55:-0.85:1.000:0.982 0/0/1/1:4:34,42:0.55:-0.29:1.000:0.981 0/0/1/1:4:85,70:0.46: 2.16:1.000:0.985 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,37:0.45:-0.07:1.000:0.977 0/1/1/1:4:42,89:0.64: 1.42:1.000:0.678 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,35:0.41:-0.07:1.000:0.890 0/0/1/1:4:73,54:0.42: 1.29:1.000:0.912 0/1/1/1:4:17,86:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,72:0.50: 1.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:10,5:0.29:-2.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:28,11:0.23:-1.44:1.000:1.000 0/1/1:3:2,2:0.51:-2.53:1.000:0.679 0/0/1/1:4:49,46:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,73:0.66: 0.55:1.000:0.869 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,39:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,69:0.59: 0.86:1.000:0.863 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,36:0.66:-1.07:1.000:0.856 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,46:0.42: 0.73:1.000:0.892 0/0/1/1:4:24,34:0.57:-0.85:1.000:0.939 0/0/0/1:4:75,43:0.34: 1.01:1.000:0.890 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,32:0.33: 0.11:1.000:0.922 0/0/0/1:4:66,27:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,51:0.42: 1.08:1.000:0.911 0/0/0/1:4:88,34:0.23: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,71:0.59: 0.95:1.000:0.857 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,26:0.41:-0.73:1.000:0.873 0/0/1/1:4:67,87:0.56: 2.13:1.000:0.971 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,30:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,34:0.33: 0.27:1.000:0.909 0/0/0/0/0/0:6:65,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,1:0.01:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,29:0.65:-1.35:1.000:0.764 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,32:0.71:-1.38:1.000:0.992 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,36:0.23: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,64:0.54: 0.98:0.777:0.984 0/1/1/1:4:30,62:0.64: 0.21:1.000:0.630 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,35:0.74:-1.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:86,30:0.21: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,62:0.75:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,74:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,19:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,30:0.21: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,41:0.34: 0.83:1.000:0.877 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.82:0.693:1.000 0/1/1/1:4:17,65:0.72:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,42:0.41: 0.49:1.000:0.843 0/1/1/1:4:7,66:0.85:-0.39:1.000:0.980 0/1/1/1:4:17,34:0.63:-1.07:1.000:0.564 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,55:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,34:0.28: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,32:0.41:-0.29:1.000:0.885 0/0/0:3:52,0:0.00:-1.04:0.999:1.000 0/0/1/1:4:30,30:0.51:-0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,81:0.62: 1.20:1.000:0.563 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,97:0.74: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,62:0.63: 0.24:1.000:0.564 0/0/1/1:4:43,70:0.60: 0.86:1.000:0.820 0/0/1/1:4:49,46:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,35:0.54:-0.66:1.000:0.984 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,44:0.38: 0.83:1.000:0.507 0/0/1/1:4:48,41:0.47: 0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:34,27:0.44:-0.76:1.000:0.972 0/0/1/1:4:50,76:0.58: 1.26:1.000:0.893 0/0/0/1:4:65,28:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,31:0.57:-1.01:1.000:0.942 0/0/1/1:4:57,40:0.40: 0.36:1.000:0.807 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,34:0.35: 0.17:1.000:0.801 0/0/1/1:4:74,54:0.41: 1.32:1.000:0.891 0/0/1/1:4:43,45:0.52: 0.08:0.999:0.995 0/1/1/1:4:9,36:0.73:-1.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,26:0.34:-0.45:0.985:0.876 0/0/1/1:4:54,44:0.45: 0.39:1.000:0.982 0/1/1/1:4:18,51:0.68:-0.51:1.000:0.958 0/0/1/1:4:20,21:0.52:-1.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,75:0.85:-0.07:1.000:0.982 0/1/1/1:4:8,66:0.84:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,36:0.25: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,69:0.51: 1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,38:0.42: 0.11:1.000:0.921 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,43:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,30:0.68:-1.38:1.000:0.944 0/1/1/1:4:15,69:0.74:-0.04:0.993:0.999 0/0/1/1:4:36,26:0.41:-0.73:1.000:0.873 0/1/1/1:4:32,78:0.66: 0.76:1.000:0.871 0/0/0/1:4:33,21:0.37:-0.98:1.000:0.565 0/1/1/1:4:32,64:0.63: 0.33:1.000:0.564 0/0/0/1:4:58,37:0.37: 0.30:1.000:0.554 0/0/1/1:4:33,24:0.41:-0.88:1.000:0.885 0/0/1/1:4:73,67:0.49: 1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,41:0.54:-0.29:1.000:0.988 0/0/1/1:4:64,120:0.62: 3.07:1.000:0.573 0/0/1/1:4:55,48:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,26:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,37:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,34:0.43:-0.20:1.000:0.937 0/1/1/1:4:27,65:0.66: 0.21:1.000:0.859 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,46:0.46: 0.49:1.000:0.988 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,37:0.21: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,81:0.56: 1.76:1.000:0.965 0/0/1/1:4:65,48:0.42: 0.86:1.000:0.909 0/0/1/1:4:51,35:0.39: 0.02:1.000:0.740 0/0/1/1:4:7,13:0.62:-2.03:1.000:0.593 0/0/1/1:4:16,14:0.48:-1.72:1.000:0.994 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,33:0.68:-1.26:1.000:0.947 0/0/1/1:4:63,43:0.39: 0.64:1.000:0.722 0/0/1/1:4:41,77:0.62: 1.01:1.000:0.570 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.39:0.998:1.000 0/0/0/1:4:55,31:0.33: 0.02:1.000:0.916 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,31:0.59:-1.07:1.000:0.875 0/0/0/1:4:52,27:0.31:-0.20:1.000:0.979 0/0/0/1:4:56,30:0.32: 0.02:1.000:0.964 0/0/1/1:4:60,45:0.42: 0.61:1.000:0.929 0/0/0/1:4:84,38:0.26: 1.14:1.000:0.998 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,87:0.64: 1.29:0.999:0.724 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,68:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,23:0.65:-1.63:1.000:0.807 0/1/1/1:4:8,61:0.82:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,36:0.39: 0.11:1.000:0.705 0/1/1/1:4:11,51:0.74:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,74:0.60: 1.04:1.000:0.807 0/0/0/1:4:67,41:0.36: 0.70:1.000:0.720 0/0/1/1:4:51,44:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:44,76:0.61: 1.08:1.000:0.731 0/0/1/1:4:40,68:0.60: 0.70:1.000:0.758 0/0/0/1:4:81,36:0.26: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,44:0.44: 0.45:1.000:0.967 0/0/0/1:4:99,37:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,30:0.57:-1.04:1.000:0.956 0/0/0/1:4:45,28:0.36:-0.39:1.000:0.657 -chr2.1 25104386 chr2.1_025104386 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:479,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:609,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:285,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:174,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:209,1:.:-2.23:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:548,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:610,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:564,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:194,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:152,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:75,0:.:-3.63:1.000:. ./.:4:211,0:.:-2.22:1.000:. ./.:3:140,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:531,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:660,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:546,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:338,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:347,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:645,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:448,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.10:0.777:. ./.:4:494,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:533,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.70:0.693:. ./.:4:584,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:295,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.23:1.000:. ./.:3:268,0:.:-1.63:0.999:. ./.:4:469,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:267,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:457,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:512,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:558,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.40:0.999:. ./.:4:468,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.67:0.985:. ./.:4:462,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:517,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.56:0.993:. ./.:4:325,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:292,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:413,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:619,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:301,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:447,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:528,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:551,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:467,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:300,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:620,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:315,0:.:-1.15:0.998:. ./.:4:443,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:312,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.05:0.999:. ./.:4:474,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:321,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:316,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:409,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:294,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:609,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.58:1.000:. -chr2.1 25246759 chr2.1_025246759 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:133,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:116,21:.:-0.50:1.000:. ./.:4:174,39:.: 1.50:1.000:. ./.:4:106,63:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,84:.: 0.79:1.000:. ./.:4:121,90:.: 1.45:1.000:. ./.:4:84,20:.:-1.38:1.000:. ./.:4:54,99:.:-0.08:1.000:. ./.:4:123,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:36,23:.:-2.56:1.000:. ./.:4:62,5:.:-2.35:1.000:. ./.:4:77,72:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,86:.:-0.87:1.000:. ./.:4:90,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,69:.:-0.06:1.000:. ./.:4:89,92:.: 0.66:1.000:. ./.:4:100,55:.:-0.03:1.000:. ./.:4:158,59:.: 1.61:1.000:. ./.:4:92,92:.: 0.74:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:140,80:.: 1.69:1.000:. ./.:4:37,93:.:-0.69:1.000:. ./.:4:14,27:.:-3.04:1.000:. ./.:4:118,91:.: 1.40:1.000:. ./.:4:87,60:.:-0.24:1.000:. ./.:4:96,64:.: 0.10:1.000:. ./.:4:148,43:.: 0.92:1.000:. ./.:4:121,36:.: 0.02:1.000:. ./.:4:162,66:.: 1.90:1.000:. ./.:4:33,84:.:-1.03:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:55,19:.:-2.17:1.000:. ./.:3:10,12:.:-3.54:1.000:. ./.:4:74,78:.:-0.11:1.000:. ./.:4:102,83:.: 0.76:1.000:. ./.:4:141,25:.: 0.26:1.000:. ./.:4:244,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:115,98:.: 1.50:1.000:. ./.:4:83,76:.: 0.08:1.000:. ./.:4:83,79:.: 0.16:1.000:. ./.:4:147,39:.: 0.79:1.000:. ./.:4:141,37:.: 0.58:1.000:. ./.:4:90,90:.: 0.63:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:111,79:.: 0.90:1.000:. ./.:4:29,18:.:-2.88:1.000:. ./.:4:73,67:.:-0.42:1.000:. ./.:4:107,92:.: 1.13:1.000:. ./.:4:29,99:.:-0.74:1.000:. ./.:4:106,70:.: 0.53:1.000:. ./.:4:80,55:.:-0.56:1.000:. ./.:4:164,36:.: 1.16:1.000:. ./.:4:83,65:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,72:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,67:.:-0.40:1.000:. ./.:4:76,152:.: 1.90:1.000:. ./.:4:71,62:.:-0.61:1.000:. ./.:6:98,42:.:-0.42:1.000:. ./.:4:111,42:.:-0.08:1.000:. ./.:4:110,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:141,51:.: 0.95:1.000:. ./.:4:138,40:.: 0.58:1.000:. ./.:4:90,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:76,24:.:-1.48:1.000:. ./.:4:68,79:.:-0.24:1.000:. ./.:4:92,64:.: 0.00:0.777:. ./.:4:109,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:159,37:.: 1.05:1.000:. ./.:4:79,14:.:-1.67:1.000:. ./.:4:107,88:.: 1.03:1.000:. ./.:4:136,39:.: 0.50:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:101,36:.:-0.50:1.000:. ./.:4:85,68:.:-0.08:1.000:. ./.:4:84,68:.:-0.11:1.000:. ./.:4:35,100:.:-0.56:1.000:. ./.:4:131,38:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,59:.:-0.40:0.693:. ./.:4:124,35:.: 0.08:1.000:. ./.:4:133,35:.: 0.31:1.000:. ./.:4:125,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:169,49:.: 1.63:1.000:. ./.:4:93,74:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,71:.:-1.64:1.000:. ./.:4:107,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:71,76:.:-0.24:1.000:. ./.:4:59,75:.:-0.58:1.000:. ./.:3:89,28:.:-1.03:0.999:. ./.:4:160,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,79:.: 0.21:1.000:. ./.:4:119,35:.:-0.06:1.000:. ./.:4:141,41:.: 0.68:1.000:. ./.:4:87,76:.: 0.18:1.000:. ./.:4:54,62:.:-1.06:1.000:. ./.:4:122,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:81,78:.: 0.08:1.000:. ./.:4:136,36:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,46:.:-1.48:1.000:. ./.:4:82,74:.: 0.00:1.000:. ./.:4:38,91:.:-0.72:1.000:. ./.:4:142,34:.: 0.53:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,62:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,112:.:-0.27:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:141,53:.: 1.00:1.000:. ./.:4:119,20:.:-0.45:1.000:. ./.:4:105,30:.:-0.56:1.000:. ./.:4:207,41:.: 2.43:1.000:. ./.:4:106,68:.: 0.47:0.999:. ./.:4:190,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:70,58:.:-0.74:0.985:. ./.:4:126,45:.: 0.39:1.000:. ./.:4:81,21:.:-1.43:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:118,26:.:-0.32:1.000:. ./.:4:116,21:.:-0.50:1.000:. ./.:4:69,73:.:-0.37:1.000:. ./.:4:34,96:.:-0.69:1.000:. ./.:4:127,46:.: 0.45:1.000:. ./.:4:159,38:.: 1.08:1.000:. ./.:4:132,35:.: 0.29:1.000:. ./.:4:159,52:.: 1.45:1.000:. ./.:4:114,39:.:-0.08:0.993:. ./.:4:134,31:.: 0.24:1.000:. ./.:4:55,59:.:-1.11:1.000:. ./.:4:55,59:.:-1.11:1.000:. ./.:4:86,66:.:-0.11:1.000:. ./.:4:132,36:.: 0.31:1.000:. ./.:4:75,21:.:-1.59:1.000:. ./.:4:39,124:.: 0.18:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:111,86:.: 1.08:1.000:. ./.:4:134,34:.: 0.31:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,53:.:-1.22:1.000:. ./.:4:106,33:.:-0.45:1.000:. ./.:4:119,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:78,51:.:-0.72:1.000:. ./.:4:140,47:.: 0.82:1.000:. ./.:4:58,44:.:-1.43:1.000:. ./.:4:120,89:.: 1.40:1.000:. ./.:4:173,36:.: 1.40:1.000:. ./.:4:98,55:.:-0.08:1.000:. ./.:4:126,35:.: 0.13:1.000:. ./.:4:100,73:.: 0.45:1.000:. ./.:4:90,86:.: 0.53:1.000:. ./.:4:136,38:.: 0.47:1.000:. ./.:4:81,57:.:-0.48:1.000:. ./.:4:72,11:.:-1.93:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:143,29:.: 0.42:1.000:. ./.:4:164,33:.: 1.08:1.000:. ./.:4:81,88:.: 0.34:1.000:. ./.:4:91,80:.: 0.39:0.998:. ./.:4:153,49:.: 1.21:1.000:. ./.:4:88,64:.:-0.11:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:136,32:.: 0.31:1.000:. ./.:4:95,65:.: 0.10:1.000:. ./.:4:132,31:.: 0.18:1.000:. ./.:4:91,71:.: 0.16:1.000:. ./.:4:123,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:129,38:.: 0.29:0.999:. ./.:4:135,39:.: 0.47:1.000:. ./.:4:65,62:.:-0.77:1.000:. ./.:4:107,33:.:-0.42:1.000:. ./.:4:124,29:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,38:.: 0.29:1.000:. ./.:4:77,56:.:-0.61:1.000:. ./.:4:132,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:64,62:.:-0.79:1.000:. ./.:4:152,45:.: 1.08:1.000:. ./.:4:111,94:.: 1.29:1.000:. ./.:4:95,69:.: 0.21:1.000:. ./.:4:85,39:.:-0.85:1.000:. ./.:4:47,122:.: 0.34:1.000:. ./.:4:117,82:.: 1.13:1.000:. ./.:4:83,61:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:163,37:.: 1.16:1.000:. -chr2.1 25346311 chr2.1_025346311 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:59,34:.:-0.44:1.000:. ./.:4:29,31:.:-1.31:1.000:. ./.:4:42,39:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,56:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,72:.: 0.77:1.000:. ./.:4:34,18:.:-1.52:1.000:. ./.:4:20,55:.:-0.91:1.000:. ./.:4:53,37:.:-0.52:1.000:. ./.:4:36,28:.:-1.20:1.000:. ./.:4:69,49:.: 0.22:1.000:. ./.:4:91,33:.: 0.38:1.000:. ./.:4:37,68:.:-0.12:1.000:. ./.:4:41,59:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,66:.: 0.24:1.000:. ./.:4:38,41:.:-0.81:1.000:. ./.:4:45,66:.: 0.03:1.000:. ./.:4:64,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:54,56:.: 0.01:1.000:. ./.:4:53,44:.:-0.33:1.000:. ./.:4:67,52:.: 0.24:1.000:. ./.:4:60,23:.:-0.70:1.000:. ./.:4:61,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:53,34:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:53,39:.:-0.47:1.000:. ./.:4:44,17:.:-1.28:1.000:. ./.:4:55,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,36:.:-0.86:1.000:. ./.:4:97,43:.: 0.80:1.000:. ./.:4:34,22:.:-1.41:1.000:. ./.:4:18,43:.:-1.28:1.000:. ./.:4:30,29:.:-1.33:1.000:. ./.:4:19,27:.:-1.67:1.000:. ./.:4:65,65:.: 0.53:1.000:. ./.:3:18,24:.:-1.78:1.000:. ./.:4:27,30:.:-1.39:1.000:. ./.:4:39,31:.:-1.04:1.000:. ./.:4:44,41:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,34:.:-0.68:1.000:. ./.:4:42,14:.:-1.41:1.000:. ./.:4:72,63:.: 0.67:1.000:. ./.:4:50,20:.:-1.04:1.000:. ./.:4:54,31:.:-0.65:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:80,86:.: 1.48:1.000:. ./.:4:73,68:.: 0.82:1.000:. ./.:4:97,110:.: 2.56:1.000:. ./.:4:69,105:.: 1.69:1.000:. ./.:4:66,49:.: 0.14:1.000:. ./.:4:51,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:73,76:.: 1.03:1.000:. ./.:4:53,100:.: 1.14:1.000:. ./.:4:65,101:.: 1.48:1.000:. ./.:4:60,25:.:-0.65:1.000:. ./.:4:62,30:.:-0.47:1.000:. ./.:4:67,88:.: 1.19:1.000:. ./.:4:52,27:.:-0.81:1.000:. ./.:4:59,60:.: 0.24:1.000:. ./.:4:53,36:.:-0.54:1.000:. ./.:6:70,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:66,60:.: 0.43:1.000:. ./.:4:53,21:.:-0.94:1.000:. ./.:4:64,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:47,25:.:-0.99:1.000:. ./.:4:58,43:.:-0.23:1.000:. ./.:4:77,62:.: 0.77:1.000:. ./.:4:61,49:.: 0.01:0.777:. ./.:4:73,61:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,81:.: 2.24:1.000:. ./.:4:47,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:50,80:.: 0.53:1.000:. ./.:4:81,74:.: 1.19:1.000:. ./.:4:77,57:.: 0.64:1.000:. ./.:4:82,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,33:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,59:.: 0.88:1.000:. ./.:4:53,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:50,53:.:-0.18:1.000:. ./.:4:75,53:.: 0.48:0.693:. ./.:4:76,65:.: 0.82:1.000:. ./.:4:72,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:52,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:64,27:.:-0.49:1.000:. ./.:4:59,45:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,58:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,60:.: 0.43:1.000:. ./.:4:72,98:.: 1.59:1.000:. ./.:4:83,79:.: 1.38:1.000:. ./.:3:63,27:.:-0.52:0.999:. ./.:4:48,39:.:-0.60:1.000:. ./.:4:70,69:.: 0.77:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:52,56:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,34:.:-0.20:1.000:. ./.:4:101,98:.: 2.35:1.000:. ./.:4:88,54:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:82,187:.: 4.19:1.000:. ./.:4:60,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:51,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:93,105:.: 2.32:1.000:. ./.:4:59,50:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,74:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,71:.: 1.03:1.000:. ./.:4:54,51:.:-0.12:1.000:. ./.:4:92,89:.: 1.87:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:62,56:.: 0.22:1.000:. ./.:4:60,60:.: 0.27:1.000:. ./.:4:110,114:.: 3.01:0.999:. ./.:4:78,24:.:-0.20:1.000:. ./.:4:68,83:.: 1.09:0.985:. ./.:4:79,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:57,53:.: 0.01:1.000:. ./.:4:61,57:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,95:.: 1.30:1.000:. ./.:4:56,89:.: 0.93:1.000:. ./.:4:64,70:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,93:.: 2.09:1.000:. ./.:4:67,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.96:1.000:. ./.:4:78,64:.: 0.85:1.000:. ./.:4:93,34:.: 0.45:1.000:. ./.:4:66,44:.: 0.01:0.993:. ./.:4:49,38:.:-0.60:1.000:. ./.:4:46,45:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,40:.:-0.25:1.000:. ./.:4:80,110:.: 2.11:1.000:. ./.:4:45,11:.:-1.41:1.000:. ./.:4:42,17:.:-1.33:1.000:. ./.:4:81,96:.: 1.77:1.000:. ./.:4:68,43:.: 0.03:1.000:. ./.:4:54,75:.: 0.51:1.000:. ./.:4:65,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:106,24:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,84:.: 1.64:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:66,33:.:-0.28:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,14:.:-1.10:1.000:. ./.:4:35,42:.:-0.86:1.000:. ./.:4:82,63:.: 0.93:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:72,77:.: 1.03:1.000:. ./.:4:54,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:57,73:.: 0.53:1.000:. ./.:4:74,115:.: 2.09:1.000:. ./.:4:44,30:.:-0.94:1.000:. ./.:4:49,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:73,57:.: 0.53:1.000:. ./.:4:53,58:.: 0.03:1.000:. ./.:4:61,28:.:-0.54:1.000:. ./.:4:91,33:.: 0.38:1.000:. ./.:4:77,79:.: 1.22:1.000:. ./.:4:55,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:50,59:.:-0.02:0.998:. ./.:4:50,54:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,40:.:-0.75:1.000:. ./.:4:38,30:.:-1.10:1.000:. ./.:4:50,19:.:-1.07:1.000:. ./.:4:44,49:.:-0.44:1.000:. ./.:4:38,37:.:-0.91:1.000:. ./.:4:52,67:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,32:.:-0.94:1.000:. ./.:4:50,47:.:-0.33:1.000:. ./.:4:73,54:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,21:.:-0.41:1.000:. ./.:4:65,51:.: 0.17:1.000:. ./.:4:35,22:.:-1.39:1.000:. ./.:4:63,86:.: 1.03:1.000:. ./.:4:49,54:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,60:.:-0.28:1.000:. ./.:4:31,43:.:-0.94:1.000:. ./.:4:37,41:.:-0.83:1.000:. ./.:4:62,16:.:-0.83:1.000:. ./.:4:47,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:49,40:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,43:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,105:.: 1.66:1.000:. ./.:4:70,45:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,33:.:-1.02:1.000:. ./.:4:73,55:.: 0.48:1.000:. -chr2.1 26011411 chr2.1_026011411 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:243,135:.:-0.07:1.000:. ./.:4:287,35:.:-0.62:1.000:. ./.:4:274,112:.: 0.01:1.000:. ./.:4:271,133:.: 0.18:1.000:. ./.:4:389,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:554,54:.: 2.20:1.000:. ./.:4:428,57:.: 0.98:1.000:. ./.:4:360,52:.: 0.26:1.000:. ./.:4:308,127:.: 0.49:1.000:. ./.:4:86,44:.:-2.52:1.000:. ./.:4:142,35:.:-2.05:1.000:. ./.:4:240,70:.:-0.74:1.000:. ./.:4:208,114:.:-0.62:1.000:. ./.:4:494,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:354,50:.: 0.18:1.000:. ./.:4:350,65:.: 0.29:1.000:. ./.:4:301,64:.:-0.20:1.000:. ./.:4:225,165:.: 0.05:1.000:. ./.:4:533,91:.: 2.35:1.000:. ./.:4:532,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:375,60:.: 0.49:1.000:. ./.:4:499,67:.: 1.78:1.000:. ./.:4:178,110:.:-0.96:1.000:. ./.:4:114,5:.:-2.63:1.000:. ./.:4:499,56:.: 1.67:1.000:. ./.:4:313,93:.: 0.20:1.000:. ./.:4:331,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:290,127:.: 0.31:1.000:. ./.:4:360,96:.: 0.70:1.000:. ./.:4:568,61:.: 2.40:1.000:. ./.:4:195,93:.:-0.96:1.000:. ./.:4:112,12:.:-2.58:1.000:. ./.:4:199,32:.:-1.52:1.000:. ./.:3:196,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:304,128:.: 0.46:1.000:. ./.:4:494,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:354,51:.: 0.19:1.000:. ./.:4:320,56:.:-0.09:1.000:. ./.:4:256,108:.:-0.21:1.000:. ./.:4:241,32:.:-1.11:1.000:. ./.:4:511,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:289,48:.:-0.48:1.000:. ./.:4:501,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:358,43:.: 0.15:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:586,15:.: 2.13:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:153,88:.:-1.42:1.000:. ./.:4:208,137:.:-0.40:1.000:. ./.:4:281,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:410,53:.: 0.77:1.000:. ./.:4:468,63:.: 1.44:1.000:. ./.:4:253,57:.:-0.74:1.000:. ./.:4:247,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:360,63:.: 0.37:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.26:1.000:. ./.:6:251,37:.:-0.96:1.000:. ./.:4:352,60:.: 0.26:1.000:. ./.:4:476,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:537,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:452,55:.: 1.20:1.000:. ./.:4:237,66:.:-0.81:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:121,110:.:-1.52:1.000:. ./.:4:294,101:.: 0.10:0.777:. ./.:4:164,96:.:-1.24:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:309,39:.:-0.37:1.000:. ./.:4:247,50:.:-0.87:1.000:. ./.:4:440,46:.: 0.99:1.000:. ./.:4:268,119:.: 0.02:1.000:. ./.:4:341,45:.: 0.01:1.000:. ./.:4:349,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:305,62:.:-0.18:1.000:. ./.:4:308,58:.:-0.19:1.000:. ./.:4:267,102:.:-0.16:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.80:0.693:. ./.:4:326,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:213,126:.:-0.46:1.000:. ./.:4:296,48:.:-0.41:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:349,33:.:-0.03:1.000:. ./.:4:150,77:.:-1.56:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:201,105:.:-0.78:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.45:1.000:. ./.:3:271,44:.:-0.69:0.999:. ./.:4:278,62:.:-0.45:1.000:. ./.:4:279,118:.: 0.12:1.000:. ./.:4:264,39:.:-0.81:1.000:. ./.:4:308,51:.:-0.26:1.000:. ./.:4:266,48:.:-0.70:1.000:. ./.:4:266,44:.:-0.74:1.000:. ./.:4:140,70:.:-1.73:1.000:. ./.:4:401,47:.: 0.62:1.000:. ./.:4:390,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:311,67:.:-0.07:1.000:. ./.:4:242,62:.:-0.80:1.000:. ./.:4:232,46:.:-1.06:1.000:. ./.:4:251,95:.:-0.39:1.000:. ./.:4:262,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:248,44:.:-0.92:1.000:. ./.:4:297,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:394,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:381,161:.: 1.55:1.000:. ./.:4:411,53:.: 0.78:1.000:. ./.:4:249,102:.:-0.34:1.000:. ./.:4:392,127:.: 1.32:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.68:0.999:. ./.:4:529,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.13:0.985:. ./.:4:248,105:.:-0.32:1.000:. ./.:4:348,44:.: 0.07:1.000:. ./.:4:323,39:.:-0.23:1.000:. ./.:4:337,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:323,52:.:-0.10:1.000:. ./.:4:183,110:.:-0.91:1.000:. ./.:4:172,94:.:-1.18:1.000:. ./.:4:206,100:.:-0.78:1.000:. ./.:4:488,67:.: 1.67:1.000:. ./.:4:211,89:.:-0.84:1.000:. ./.:4:491,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:322,50:.:-0.13:0.993:. ./.:4:271,40:.:-0.73:1.000:. ./.:4:196,87:.:-1.01:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:307,33:.:-0.45:1.000:. ./.:4:234,126:.:-0.25:1.000:. ./.:4:123,69:.:-1.91:1.000:. ./.:4:161,71:.:-1.51:1.000:. ./.:4:294,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:480,68:.: 1.60:1.000:. ./.:4:222,90:.:-0.72:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:91,85:.:-2.06:1.000:. ./.:4:288,42:.:-0.55:1.000:. ./.:4:183,92:.:-1.09:1.000:. ./.:4:229,45:.:-1.10:1.000:. ./.:4:226,108:.:-0.51:1.000:. ./.:4:202,98:.:-0.84:1.000:. ./.:4:438,74:.: 1.25:1.000:. ./.:4:480,70:.: 1.62:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:409,68:.: 0.90:1.000:. ./.:4:211,122:.:-0.52:1.000:. ./.:4:262,34:.:-0.88:1.000:. ./.:4:295,142:.: 0.51:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:215,19:.:-1.49:1.000:. ./.:4:317,46:.:-0.22:1.000:. ./.:4:616,1:.: 2.29:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:389,91:.: 0.93:1.000:. ./.:4:362,119:.: 0.94:1.000:. ./.:4:315,54:.:-0.16:0.998:. ./.:4:335,132:.: 0.81:1.000:. ./.:4:302,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:286,47:.:-0.52:1.000:. ./.:4:215,114:.:-0.56:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:336,76:.: 0.26:1.000:. ./.:4:196,138:.:-0.51:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:221,126:.:-0.38:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:265,59:.:-0.60:1.000:. ./.:4:310,48:.:-0.27:1.000:. ./.:4:407,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:420,58:.: 0.91:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:369,43:.: 0.26:1.000:. ./.:4:218,98:.:-0.68:1.000:. ./.:4:385,144:.: 1.42:1.000:. ./.:4:503,65:.: 1.80:1.000:. ./.:4:316,113:.: 0.43:1.000:. ./.:4:235,106:.:-0.44:1.000:. ./.:4:403,74:.: 0.90:1.000:. ./.:4:647,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:212,160:.:-0.13:1.000:. ./.:4:347,53:.: 0.15:1.000:. ./.:4:325,56:.:-0.04:1.000:. -chr2.1 26194808 chr2.1_026194808 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:220,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:49,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:37,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.42:1.000:. ./.:3:24,0:.:-3.70:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:218,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.58:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.32:1.000:. ./.:6:236,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:229,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.23:0.777:. ./.:4:179,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.30:0.693:. ./.:4:218,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.70:1.000:. ./.:3:159,0:.:-1.05:0.999:. ./.:4:243,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.09:0.999:. ./.:4:266,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.21:0.985:. ./.:4:278,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:209,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.11:0.993:. ./.:4:209,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:56,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.46:0.998:. ./.:4:253,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:167,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.58:1.000:. -chr2.1 26320609 chr2.1_026320609 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:410,187:.:-1.07:1.000:. ./.:4:363,123:.:-1.64:1.000:. ./.:4:547,297:.: 0.20:1.000:. ./.:4:429,239:.:-0.70:1.000:. ./.:4:713,309:.: 1.12:1.000:. ./.:4:565,325:.: 0.44:1.000:. ./.:4:396,238:.:-0.88:1.000:. ./.:4:454,299:.:-0.27:1.000:. ./.:4:606,226:.: 0.14:1.000:. ./.:4:280,113:.:-2.12:1.000:. ./.:4:196,114:.:-2.55:1.000:. ./.:4:400,368:.:-0.19:1.000:. ./.:4:517,321:.: 0.17:1.000:. ./.:4:462,275:.:-0.35:1.000:. ./.:4:461,185:.:-0.82:1.000:. ./.:4:520,283:.:-0.01:1.000:. ./.:4:720,362:.: 1.43:1.000:. ./.:4:503,165:.:-0.70:1.000:. ./.:4:540,441:.: 0.91:1.000:. ./.:4:511,368:.: 0.38:1.000:. ./.:4:162,84:.:-2.88:1.000:. ./.:4:476,290:.:-0.20:1.000:. ./.:4:660,383:.: 1.23:1.000:. ./.:4:491,247:.:-0.34:1.000:. ./.:4:113,26:.:-3.43:1.000:. ./.:4:454,190:.:-0.83:1.000:. ./.:4:615,296:.: 0.55:1.000:. ./.:4:627,311:.: 0.69:1.000:. ./.:4:582,256:.: 0.17:1.000:. ./.:4:643,157:.:-0.02:1.000:. ./.:4:616,285:.: 0.50:1.000:. ./.:4:530,326:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:365,117:.:-1.66:1.000:. ./.:3:80,28:.:-3.59:1.000:. ./.:4:658,251:.: 0.54:1.000:. ./.:4:478,398:.: 0.37:1.000:. ./.:4:499,353:.: 0.24:1.000:. ./.:4:710,301:.: 1.06:1.000:. ./.:4:611,211:.: 0.09:1.000:. ./.:4:642,335:.: 0.89:1.000:. ./.:4:511,386:.: 0.47:1.000:. ./.:4:422,298:.:-0.44:1.000:. ./.:4:500,297:.:-0.04:1.000:. ./.:4:807,352:.: 1.82:1.000:. ./.:4:481,262:.:-0.32:1.000:. ./.:4:680,302:.: 0.91:1.000:. ./.:4:113,27:.:-3.42:1.000:. ./.:4:557,283:.: 0.18:1.000:. ./.:4:436,290:.:-0.41:1.000:. ./.:4:705,301:.: 1.04:1.000:. ./.:4:645,319:.: 0.82:1.000:. ./.:4:519,265:.:-0.11:1.000:. ./.:4:513,427:.: 0.70:1.000:. ./.:4:345,230:.:-1.18:1.000:. ./.:4:708,289:.: 0.99:1.000:. ./.:4:659,319:.: 0.89:1.000:. ./.:4:748,349:.: 1.50:1.000:. ./.:4:649,351:.: 1.00:1.000:. ./.:6:410,311:.:-0.43:1.000:. ./.:4:513,434:.: 0.73:1.000:. ./.:4:518,248:.:-0.20:1.000:. ./.:4:494,334:.: 0.12:1.000:. ./.:4:664,288:.: 0.76:1.000:. ./.:4:397,436:.: 0.14:1.000:. ./.:4:687,193:.: 0.39:1.000:. ./.:4:573,252:.: 0.10:1.000:. ./.:4:496,260:.:-0.25:1.000:. ./.:4:616,323:.: 0.69:0.777:. ./.:4:427,219:.:-0.82:1.000:. ./.:4:523,388:.: 0.55:1.000:. ./.:4:563,292:.: 0.26:1.000:. ./.:4:633,346:.: 0.90:1.000:. ./.:4:469,349:.: 0.07:1.000:. ./.:4:402,373:.:-0.15:1.000:. ./.:4:556,178:.:-0.36:1.000:. ./.:4:603,269:.: 0.35:1.000:. ./.:4:465,316:.:-0.12:1.000:. ./.:4:534,301:.: 0.16:1.000:. ./.:4:805,202:.: 1.04:1.000:. ./.:4:333,228:.:-1.26:0.693:. ./.:4:600,280:.: 0.39:1.000:. ./.:4:558,269:.: 0.11:1.000:. ./.:4:558,343:.: 0.50:1.000:. ./.:4:604,241:.: 0.21:1.000:. ./.:4:666,406:.: 1.38:1.000:. ./.:4:399,187:.:-1.13:1.000:. ./.:4:529,279:.: 0.02:1.000:. ./.:4:557,307:.: 0.30:1.000:. ./.:4:488,189:.:-0.66:1.000:. ./.:3:415,225:.:-0.85:0.999:. ./.:4:620,208:.: 0.12:1.000:. ./.:4:681,318:.: 1.00:1.000:. ./.:4:285,219:.:-1.55:1.000:. ./.:4:821,395:.: 2.12:1.000:. ./.:4:710,396:.: 1.55:1.000:. ./.:4:644,220:.: 0.30:1.000:. ./.:4:497,311:.: 0.02:1.000:. ./.:4:436,376:.: 0.04:1.000:. ./.:4:608,284:.: 0.45:1.000:. ./.:4:549,173:.:-0.43:1.000:. ./.:4:670,302:.: 0.86:1.000:. ./.:4:367,200:.:-1.22:1.000:. ./.:4:656,274:.: 0.64:1.000:. ./.:4:382,255:.:-0.86:1.000:. ./.:4:496,355:.: 0.24:1.000:. ./.:4:509,306:.: 0.05:1.000:. ./.:4:635,252:.: 0.42:1.000:. ./.:4:693,310:.: 1.02:1.000:. ./.:4:472,302:.:-0.16:1.000:. ./.:4:413,360:.:-0.16:1.000:. ./.:4:744,369:.: 1.59:1.000:. ./.:4:578,292:.: 0.34:0.999:. ./.:4:357,336:.:-0.58:1.000:. ./.:4:442,204:.:-0.82:0.985:. ./.:4:586,303:.: 0.43:1.000:. ./.:4:489,339:.: 0.12:1.000:. ./.:4:365,269:.:-0.88:1.000:. ./.:4:652,379:.: 1.16:1.000:. ./.:4:455,250:.:-0.51:1.000:. ./.:4:577,308:.: 0.41:1.000:. ./.:4:625,229:.: 0.25:1.000:. ./.:4:604,392:.: 0.98:1.000:. ./.:4:492,220:.:-0.48:1.000:. ./.:4:627,321:.: 0.74:1.000:. ./.:4:487,335:.: 0.09:1.000:. ./.:4:683,315:.: 0.99:0.993:. ./.:4:412,357:.:-0.18:1.000:. ./.:4:372,327:.:-0.55:1.000:. ./.:4:536,155:.:-0.59:1.000:. ./.:4:473,249:.:-0.43:1.000:. ./.:4:441,256:.:-0.56:1.000:. ./.:4:370,132:.:-1.56:1.000:. ./.:4:518,316:.: 0.15:1.000:. ./.:4:437,280:.:-0.45:1.000:. ./.:4:658,332:.: 0.95:1.000:. ./.:4:634,419:.: 1.28:1.000:. ./.:4:548,234:.:-0.12:1.000:. ./.:4:628,284:.: 0.55:1.000:. ./.:4:361,364:.:-0.41:1.000:. ./.:4:664,298:.: 0.81:1.000:. ./.:4:585,191:.:-0.15:1.000:. ./.:4:489,283:.:-0.17:1.000:. ./.:4:362,236:.:-1.07:1.000:. ./.:4:536,434:.: 0.85:1.000:. ./.:4:609,388:.: 0.99:1.000:. ./.:4:699,265:.: 0.82:1.000:. ./.:4:335,261:.:-1.08:1.000:. ./.:4:752,283:.: 1.19:1.000:. ./.:4:556,195:.:-0.28:1.000:. ./.:4:652,474:.: 1.65:1.000:. ./.:4:537,267:.: 0.00:1.000:. ./.:4:237,69:.:-2.57:1.000:. ./.:4:328,239:.:-1.22:1.000:. ./.:4:589,345:.: 0.67:1.000:. ./.:4:421,296:.:-0.45:1.000:. ./.:4:871,338:.: 2.08:1.000:. ./.:4:479,323:.:-0.01:1.000:. ./.:4:521,265:.:-0.10:0.998:. ./.:4:580,188:.:-0.19:1.000:. ./.:4:452,304:.:-0.25:1.000:. ./.:4:542,251:.:-0.06:1.000:. ./.:4:372,255:.:-0.92:1.000:. ./.:4:545,382:.: 0.63:1.000:. ./.:4:527,276:.:-0.01:1.000:. ./.:4:602,262:.: 0.30:1.000:. ./.:4:385,309:.:-0.57:1.000:. ./.:4:523,318:.: 0.19:1.000:. ./.:4:540,232:.:-0.17:1.000:. ./.:4:583,235:.: 0.07:1.000:. ./.:4:340,291:.:-0.90:1.000:. ./.:4:426,241:.:-0.71:1.000:. ./.:4:437,240:.:-0.66:1.000:. ./.:4:496,234:.:-0.39:1.000:. ./.:4:478,218:.:-0.56:1.000:. ./.:4:508,322:.: 0.13:1.000:. ./.:4:788,414:.: 2.05:1.000:. ./.:4:569,277:.: 0.21:1.000:. ./.:4:640,290:.: 0.64:1.000:. ./.:4:413,328:.:-0.33:1.000:. ./.:4:551,346:.: 0.47:1.000:. ./.:4:514,364:.: 0.38:1.000:. ./.:4:872,410:.: 2.46:1.000:. ./.:4:410,281:.:-0.59:1.000:. ./.:4:421,319:.:-0.33:1.000:. -chr2.1 26547174 chr2.1_026547174 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,52:.: 1.20:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:125,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:148,57:.: 1.31:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:60,22:.:-1.44:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:136,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:17,6:.:-2.76:1.000:. ./.:4:26,14:.:-2.38:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:95,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:73,78:.: 0.10:1.000:. ./.:4:118,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:120,53:.: 0.59:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:179,49:.: 1.82:1.000:. ./.:4:101,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,8:.:-2.85:1.000:. ./.:4:108,91:.: 1.18:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:22,8:.:-2.61:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:116,47:.: 0.37:1.000:. ./.:4:164,55:.: 1.62:1.000:. ./.:4:181,48:.: 1.85:1.000:. ./.:4:102,48:.: 0.08:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:6,4:.:-3.05:1.000:. ./.:4:18,16:.:-2.52:1.000:. ./.:3:5,4:.:-3.08:1.000:. ./.:4:83,46:.:-0.39:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:104,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:98,92:.: 0.97:1.000:. ./.:4:139,56:.: 1.09:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:127,57:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,61:.: 0.42:1.000:. ./.:4:105,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,41:.:-0.35:1.000:. ./.:4:116,78:.: 1.06:1.000:. ./.:4:108,53:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,25:.:-1.46:1.000:. ./.:4:66,37:.:-0.97:1.000:. ./.:4:69,31:.:-1.04:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:134,48:.: 0.80:1.000:. ./.:4:65,30:.:-1.15:1.000:. ./.:4:135,37:.: 0.57:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:86,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:93,42:.:-0.26:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:78,38:.:-0.68:1.000:. ./.:6:75,32:.:-0.88:1.000:. ./.:4:104,47:.: 0.10:1.000:. ./.:4:78,23:.:-1.02:1.000:. ./.:4:82,73:.: 0.19:1.000:. ./.:4:93,44:.:-0.21:1.000:. ./.:4:144,59:.: 1.27:1.000:. ./.:4:88,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:34,56:.:-1.26:1.000:. ./.:4:128,48:.: 0.66:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.08:0.777:. ./.:4:183,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:63,95:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,22:.:-1.55:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:155,50:.: 1.31:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:112,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:85,41:.:-0.46:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:151,65:.: 1.56:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.17:0.693:. ./.:4:131,39:.: 0.53:1.000:. ./.:4:170,53:.: 1.71:1.000:. ./.:4:114,32:.:-0.01:1.000:. ./.:4:93,39:.:-0.32:1.000:. ./.:4:117,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:46,62:.:-0.86:1.000:. ./.:4:93,38:.:-0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:57,27:.:-1.40:0.999:. ./.:4:102,74:.: 0.66:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:94,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:125,92:.: 1.58:1.000:. ./.:4:107,52:.: 0.28:1.000:. ./.:4:66,39:.:-0.93:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:73,103:.: 0.66:1.000:. ./.:4:51,25:.:-1.58:1.000:. ./.:4:96,42:.:-0.19:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:131,37:.: 0.48:1.000:. ./.:4:83,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:85,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:136,85:.: 1.67:1.000:. ./.:4:160,52:.: 1.47:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:119,34:.: 0.15:1.000:. ./.:4:182,68:.: 2.32:1.000:. ./.:4:54,42:.:-1.13:0.999:. ./.:4:91,91:.: 0.80:1.000:. ./.:4:47,33:.:-1.49:0.985:. ./.:4:146,42:.: 0.93:1.000:. ./.:4:84,44:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,76:.: 0.12:1.000:. ./.:4:113,37:.: 0.08:1.000:. ./.:4:102,29:.:-0.35:1.000:. ./.:4:109,48:.: 0.24:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:100,43:.:-0.08:1.000:. ./.:4:117,45:.: 0.35:1.000:. ./.:4:113,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:94,41:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,42:.:-0.03:0.993:. ./.:4:115,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,36:.:-1.53:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.30:1.000:. ./.:4:159,48:.: 1.35:1.000:. ./.:4:77,23:.:-1.04:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:100,76:.: 0.66:1.000:. ./.:4:142,50:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,33:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,79:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,41:.:-0.23:1.000:. ./.:4:92,33:.:-0.48:1.000:. ./.:4:134,59:.: 1.04:1.000:. ./.:4:99,38:.:-0.21:1.000:. ./.:4:144,35:.: 0.73:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:140,44:.: 0.84:1.000:. ./.:4:136,58:.: 1.06:1.000:. ./.:4:109,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:104,42:.:-0.01:1.000:. ./.:4:142,51:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:191,49:.: 2.09:1.000:. ./.:4:106,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,7:.:-2.76:1.000:. ./.:4:94,50:.:-0.05:1.000:. ./.:4:89,99:.: 0.93:1.000:. ./.:4:120,47:.: 0.46:1.000:. ./.:4:122,110:.: 1.91:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:93,29:.:-0.55:0.998:. ./.:4:137,44:.: 0.77:1.000:. ./.:4:112,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,46:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:66,44:.:-0.82:1.000:. ./.:4:129,37:.: 0.44:1.000:. ./.:4:117,44:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,85:.:-0.30:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:65,82:.: 0.01:1.000:. ./.:4:121,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:119,36:.: 0.19:1.000:. ./.:4:75,46:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,33:.:-0.12:1.000:. ./.:4:78,29:.:-0.88:1.000:. ./.:4:94,37:.:-0.35:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:185,42:.: 1.80:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:114,46:.: 0.30:1.000:. ./.:4:179,48:.: 1.80:1.000:. ./.:4:85,86:.: 0.55:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.24:1.000:. -chr2.1 26813682 chr2.1_026813682 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,94:.: 0.73:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:191,66:.:-0.94:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:277,84:.: 0.48:1.000:. ./.:4:252,5:.:-0.94:1.000:. ./.:4:135,36:.:-2.12:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:157,72:.:-1.33:1.000:. ./.:4:172,80:.:-1.01:1.000:. ./.:4:157,19:.:-2.06:1.000:. ./.:4:291,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:235,82:.:-0.12:1.000:. ./.:4:113,136:.:-1.05:1.000:. ./.:4:153,63:.:-1.51:1.000:. ./.:4:235,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:219,78:.:-0.40:1.000:. ./.:4:292,94:.: 0.82:1.000:. ./.:4:264,91:.: 0.40:1.000:. ./.:4:113,140:.:-1.00:1.000:. ./.:4:139,179:.:-0.11:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:157,31:.:-1.89:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:212,68:.:-0.63:1.000:. ./.:4:313,122:.: 1.50:1.000:. ./.:4:170,53:.:-1.41:1.000:. ./.:4:226,66:.:-0.47:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:84,34:.:-2.85:1.000:. ./.:4:146,119:.:-0.84:1.000:. ./.:3:63,15:.:-3.40:1.000:. ./.:4:202,78:.:-0.63:1.000:. ./.:4:277,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:196,83:.:-0.64:1.000:. ./.:4:159,173:.: 0.08:1.000:. ./.:4:252,74:.: 0.00:1.000:. ./.:4:382,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:264,69:.: 0.10:1.000:. ./.:4:289,90:.: 0.73:1.000:. ./.:4:285,70:.: 0.40:1.000:. ./.:4:376,141:.: 2.62:1.000:. ./.:4:182,206:.: 0.85:1.000:. ./.:4:283,107:.: 0.88:1.000:. ./.:4:93,30:.:-2.78:1.000:. ./.:4:226,65:.:-0.48:1.000:. ./.:4:263,69:.: 0.08:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:271,112:.: 0.78:1.000:. ./.:4:238,72:.:-0.22:1.000:. ./.:4:277,86:.: 0.51:1.000:. ./.:4:252,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:298,79:.: 0.70:1.000:. ./.:4:241,87:.: 0.03:1.000:. ./.:4:373,5:.: 0.71:1.000:. ./.:4:288,82:.: 0.60:1.000:. ./.:6:259,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:364,122:.: 2.19:1.000:. ./.:4:233,79:.:-0.19:1.000:. ./.:4:238,223:.: 1.85:1.000:. ./.:4:289,101:.: 0.88:1.000:. ./.:4:279,98:.: 0.70:1.000:. ./.:4:250,84:.: 0.11:1.000:. ./.:4:150,136:.:-0.55:1.000:. ./.:4:270,95:.: 0.54:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.03:0.777:. ./.:4:266,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:223,236:.: 1.82:1.000:. ./.:4:204,66:.:-0.77:1.000:. ./.:4:440,9:.: 1.69:1.000:. ./.:4:259,122:.: 0.75:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:286,86:.: 0.63:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:352,115:.: 1.93:1.000:. ./.:4:385,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:301,96:.: 0.97:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.27:0.693:. ./.:4:299,94:.: 0.92:1.000:. ./.:4:355,108:.: 1.88:1.000:. ./.:4:201,73:.:-0.71:1.000:. ./.:4:291,86:.: 0.70:1.000:. ./.:4:315,109:.: 1.34:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:173,157:.: 0.06:1.000:. ./.:4:276,77:.: 0.37:1.000:. ./.:4:258,77:.: 0.12:1.000:. ./.:3:159,90:.:-1.05:0.999:. ./.:4:140,192:.: 0.08:1.000:. ./.:4:431,2:.: 1.47:1.000:. ./.:4:170,62:.:-1.29:1.000:. ./.:4:221,193:.: 1.21:1.000:. ./.:4:328,89:.: 1.25:1.000:. ./.:4:290,84:.: 0.66:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:426,2:.: 1.40:1.000:. ./.:4:170,208:.: 0.71:1.000:. ./.:4:219,95:.:-0.16:1.000:. ./.:4:323,101:.: 1.34:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:260,120:.: 0.74:1.000:. ./.:4:169,163:.: 0.08:1.000:. ./.:4:246,95:.: 0.21:1.000:. ./.:4:361,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:136,142:.:-0.66:1.000:. ./.:4:295,113:.: 1.13:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:318,96:.: 1.21:1.000:. ./.:4:258,92:.: 0.33:1.000:. ./.:4:324,97:.: 1.30:0.999:. ./.:4:212,185:.: 0.97:1.000:. ./.:4:262,85:.: 0.29:0.985:. ./.:4:315,118:.: 1.47:1.000:. ./.:4:310,87:.: 0.97:1.000:. ./.:4:179,138:.:-0.12:1.000:. ./.:4:284,118:.: 1.04:1.000:. ./.:4:233,63:.:-0.41:1.000:. ./.:4:276,86:.: 0.49:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:278,99:.: 0.70:1.000:. ./.:4:151,71:.:-1.42:1.000:. ./.:4:303,97:.: 1.02:1.000:. ./.:4:319,99:.: 1.26:1.000:. ./.:4:292,127:.: 1.28:0.993:. ./.:4:386,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:209,67:.:-0.68:1.000:. ./.:4:239,85:.:-0.03:1.000:. ./.:4:214,83:.:-0.40:1.000:. ./.:4:218,71:.:-0.51:1.000:. ./.:4:416,7:.: 1.33:1.000:. ./.:4:166,173:.: 0.18:1.000:. ./.:4:236,102:.: 0.17:1.000:. ./.:4:272,96:.: 0.58:1.000:. ./.:4:198,207:.: 1.08:1.000:. ./.:4:258,110:.: 0.58:1.000:. ./.:4:276,85:.: 0.48:1.000:. ./.:4:306,82:.: 0.85:1.000:. ./.:4:293,74:.: 0.56:1.000:. ./.:4:228,74:.:-0.33:1.000:. ./.:4:352,6:.: 0.44:1.000:. ./.:4:268,108:.: 0.69:1.000:. ./.:4:292,104:.: 0.96:1.000:. ./.:4:197,78:.:-0.70:1.000:. ./.:4:250,58:.:-0.25:1.000:. ./.:4:258,95:.: 0.37:1.000:. ./.:4:229,82:.:-0.20:1.000:. ./.:4:259,101:.: 0.47:1.000:. ./.:4:209,64:.:-0.73:1.000:. ./.:4:132,52:.:-1.95:1.000:. ./.:4:105,87:.:-1.84:1.000:. ./.:4:205,196:.: 1.03:1.000:. ./.:4:262,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:173,145:.:-0.11:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:200,76:.:-0.68:0.998:. ./.:4:194,67:.:-0.89:1.000:. ./.:4:214,57:.:-0.75:1.000:. ./.:4:163,45:.:-1.62:1.000:. ./.:4:217,91:.:-0.25:1.000:. ./.:4:193,79:.:-0.74:1.000:. ./.:4:162,63:.:-1.38:1.000:. ./.:4:205,70:.:-0.70:1.000:. ./.:4:146,148:.:-0.44:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:143,102:.:-1.11:1.000:. ./.:4:207,78:.:-0.56:1.000:. ./.:4:169,63:.:-1.29:1.000:. ./.:4:178,73:.:-1.03:1.000:. ./.:4:224,80:.:-0.30:1.000:. ./.:4:186,83:.:-0.78:1.000:. ./.:4:217,64:.:-0.62:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:213,69:.:-0.60:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:264,85:.: 0.32:1.000:. ./.:4:247,72:.:-0.09:1.000:. ./.:4:121,124:.:-1.11:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.94:1.000:. -chr2.1 27033435 chr2.1_027033435 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:904,101:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1153,147:.: 0.88:1.000:. ./.:4:788,72:.:-0.47:1.000:. ./.:4:797,94:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1228,107:.: 0.99:1.000:. ./.:4:1455,179:.: 1.90:1.000:. ./.:4:937,112:.: 0.11:1.000:. ./.:4:926,72:.:-0.04:1.000:. ./.:4:746,79:.:-0.57:1.000:. ./.:4:374,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:590,109:.:-0.96:1.000:. ./.:4:1089,84:.: 0.49:1.000:. ./.:4:542,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:1109,87:.: 0.56:1.000:. ./.:4:872,101:.:-0.12:1.000:. ./.:4:628,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:524,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:1359,104:.: 1.38:1.000:. ./.:4:1050,91:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1154,85:.: 0.69:1.000:. ./.:4:827,158:.:-0.08:1.000:. ./.:4:856,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1474,186:.: 1.98:1.000:. ./.:4:525,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:476,91:.:-1.36:1.000:. ./.:4:1313,201:.: 1.53:1.000:. ./.:4:775,89:.:-0.45:1.000:. ./.:4:935,83:.: 0.02:1.000:. ./.:4:924,107:.: 0.06:1.000:. ./.:4:798,91:.:-0.38:1.000:. ./.:4:869,77:.:-0.20:1.000:. ./.:4:433,2:.:-1.77:1.000:. ./.:4:367,26:.:-1.89:1.000:. ./.:4:378,6:.:-1.92:1.000:. ./.:3:459,72:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1012,109:.: 0.33:1.000:. ./.:4:774,94:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1067,77:.: 0.40:1.000:. ./.:4:873,94:.:-0.14:1.000:. ./.:4:982,91:.: 0.19:1.000:. ./.:4:814,92:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1038,91:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1451,189:.: 1.92:1.000:. ./.:4:1181,169:.: 1.03:1.000:. ./.:4:1149,101:.: 0.73:1.000:. ./.:4:985,76:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1197,86:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1189,171:.: 1.06:1.000:. ./.:4:919,90:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1221,122:.: 1.01:1.000:. ./.:4:475,1:.:-1.64:1.000:. ./.:4:694,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:504,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1459,191:.: 1.95:1.000:. ./.:4:1130,168:.: 0.87:1.000:. ./.:4:559,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:960,80:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1152,112:.: 0.77:1.000:. ./.:4:955,82:.: 0.08:1.000:. ./.:6:1014,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1337,183:.: 1.55:1.000:. ./.:4:1265,165:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1543,192:.: 2.21:1.000:. ./.:4:1229,168:.: 1.18:1.000:. ./.:4:1404,175:.: 1.73:1.000:. ./.:4:1010,96:.: 0.29:1.000:. ./.:4:811,58:.:-0.44:1.000:. ./.:4:545,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:860,92:.:-0.18:0.777:. ./.:4:918,66:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1188,109:.: 0.87:1.000:. ./.:4:746,79:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1356,109:.: 1.38:1.000:. ./.:4:944,81:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1363,184:.: 1.64:1.000:. ./.:4:779,85:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1243,182:.: 1.26:1.000:. ./.:4:1086,79:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1020,75:.: 0.25:1.000:. ./.:4:945,98:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1310,149:.: 1.37:0.693:. ./.:4:945,99:.: 0.10:1.000:. ./.:4:991,92:.: 0.22:1.000:. ./.:4:680,67:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1384,196:.: 1.74:1.000:. ./.:4:1221,118:.: 1.00:1.000:. ./.:4:427,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:1002,82:.: 0.22:1.000:. ./.:4:507,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:957,84:.: 0.09:1.000:. ./.:3:737,68:.:-0.63:0.999:. ./.:4:824,70:.:-0.36:1.000:. ./.:4:907,95:.:-0.03:1.000:. ./.:4:930,143:.: 0.19:1.000:. ./.:4:967,72:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1055,97:.: 0.43:1.000:. ./.:4:511,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:820,64:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1345,179:.: 1.57:1.000:. ./.:4:1097,101:.: 0.57:1.000:. ./.:4:482,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:1159,78:.: 0.69:1.000:. ./.:4:766,43:.:-0.62:1.000:. ./.:4:827,70:.:-0.35:1.000:. ./.:4:749,48:.:-0.66:1.000:. ./.:4:554,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:914,86:.:-0.04:1.000:. ./.:4:806,73:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1065,94:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1329,176:.: 1.51:1.000:. ./.:4:782,84:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1081,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1026,80:.: 0.29:0.999:. ./.:4:1436,182:.: 1.85:1.000:. ./.:4:786,73:.:-0.47:0.985:. ./.:4:979,108:.: 0.23:1.000:. ./.:4:807,78:.:-0.39:1.000:. ./.:4:864,78:.:-0.21:1.000:. ./.:4:899,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:734,80:.:-0.61:1.000:. ./.:4:575,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:476,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:1069,103:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1345,202:.: 1.64:1.000:. ./.:4:869,76:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1441,199:.: 1.92:1.000:. ./.:4:820,71:.:-0.37:0.993:. ./.:4:1247,132:.: 1.12:1.000:. ./.:4:609,65:.:-1.03:1.000:. ./.:4:829,91:.:-0.28:1.000:. ./.:4:535,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:723,84:.:-0.63:1.000:. ./.:4:520,55:.:-1.34:1.000:. ./.:4:468,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:801,86:.:-0.38:1.000:. ./.:4:867,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:872,82:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1212,146:.: 1.06:1.000:. ./.:4:510,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:1197,117:.: 0.92:1.000:. ./.:4:797,78:.:-0.42:1.000:. ./.:4:930,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:743,82:.:-0.57:1.000:. ./.:4:627,71:.:-0.96:1.000:. ./.:4:1303,95:.: 1.18:1.000:. ./.:4:1607,223:.: 2.50:1.000:. ./.:4:1030,58:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1315,174:.: 1.46:1.000:. ./.:4:700,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:514,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:935,85:.: 0.02:1.000:. ./.:4:930,77:.:-0.02:1.000:. ./.:4:543,74:.:-1.21:1.000:. ./.:4:646,64:.:-0.92:1.000:. ./.:4:1391,185:.: 1.72:1.000:. ./.:4:1358,179:.: 1.60:1.000:. ./.:4:791,3:.:-0.67:1.000:. ./.:4:858,66:.:-0.27:1.000:. ./.:4:963,57:.: 0.02:0.998:. ./.:4:914,73:.:-0.08:1.000:. ./.:4:876,74:.:-0.19:1.000:. ./.:4:721,78:.:-0.65:1.000:. ./.:4:683,87:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1003,78:.: 0.21:1.000:. ./.:4:885,74:.:-0.16:1.000:. ./.:4:579,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:947,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:903,88:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1050,86:.: 0.38:1.000:. ./.:4:946,78:.: 0.04:1.000:. ./.:4:682,85:.:-0.75:1.000:. ./.:4:954,145:.: 0.27:1.000:. ./.:4:874,92:.:-0.14:1.000:. ./.:4:884,85:.:-0.13:1.000:. ./.:4:685,60:.:-0.82:1.000:. ./.:4:627,62:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1016,82:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1360,175:.: 1.60:1.000:. ./.:4:840,96:.:-0.23:1.000:. ./.:4:779,88:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1096,72:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1406,91:.: 1.48:1.000:. ./.:4:659,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:671,73:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1410,155:.: 1.69:1.000:. -chr2.1 27367868 chr2.1_027367868 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:208,271:.: 0.32:1.000:. ./.:4:177,181:.:-0.86:1.000:. ./.:4:183,255:.:-0.08:1.000:. ./.:4:205,237:.:-0.04:1.000:. ./.:4:269,324:.: 1.42:1.000:. ./.:4:113,412:.: 0.76:1.000:. ./.:4:157,155:.:-1.31:1.000:. ./.:4:212,280:.: 0.44:1.000:. ./.:4:224,286:.: 0.62:1.000:. ./.:4:129,69:.:-2.42:1.000:. ./.:4:34,71:.:-3.32:1.000:. ./.:4:315,164:.: 0.32:1.000:. ./.:4:316,179:.: 0.47:1.000:. ./.:4:317,109:.:-0.20:1.000:. ./.:4:289,100:.:-0.56:1.000:. ./.:4:389,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:469,49:.: 0.70:1.000:. ./.:4:206,280:.: 0.38:1.000:. ./.:4:422,203:.: 1.74:1.000:. ./.:4:392,205:.: 1.46:1.000:. ./.:4:81,79:.:-2.78:1.000:. ./.:4:298,125:.:-0.23:1.000:. ./.:4:119,459:.: 1.28:1.000:. ./.:4:312,141:.: 0.06:1.000:. ./.:4:33,77:.:-3.27:1.000:. ./.:4:105,311:.:-0.30:1.000:. ./.:4:186,221:.:-0.38:1.000:. ./.:4:204,206:.:-0.35:1.000:. ./.:4:261,331:.: 1.42:1.000:. ./.:4:244,254:.: 0.50:1.000:. ./.:4:295,123:.:-0.28:1.000:. ./.:4:269,133:.:-0.43:1.000:. ./.:4:47,37:.:-3.52:1.000:. ./.:4:170,30:.:-2.40:1.000:. ./.:3:21,10:.:-4.04:1.000:. ./.:4:321,159:.: 0.33:1.000:. ./.:4:179,271:.: 0.03:1.000:. ./.:4:316,132:.: 0.02:1.000:. ./.:4:292,113:.:-0.40:1.000:. ./.:4:189,245:.:-0.12:1.000:. ./.:4:197,291:.: 0.40:1.000:. ./.:4:168,272:.:-0.06:1.000:. ./.:4:183,234:.:-0.29:1.000:. ./.:4:98,295:.:-0.52:1.000:. ./.:4:331,185:.: 0.68:1.000:. ./.:4:332,159:.: 0.43:1.000:. ./.:4:391,152:.: 0.94:1.000:. ./.:4:31,62:.:-3.44:1.000:. ./.:4:288,119:.:-0.38:1.000:. ./.:4:179,72:.:-1.90:1.000:. ./.:4:288,171:.: 0.12:1.000:. ./.:4:312,154:.: 0.19:1.000:. ./.:4:375,65:.:-0.06:1.000:. ./.:4:142,372:.: 0.66:1.000:. ./.:4:103,345:.: 0.02:1.000:. ./.:4:371,66:.:-0.09:1.000:. ./.:4:196,299:.: 0.47:1.000:. ./.:4:176,267:.:-0.03:1.000:. ./.:4:301,168:.: 0.22:1.000:. ./.:6:120,304:.:-0.22:1.000:. ./.:4:124,457:.: 1.31:1.000:. ./.:4:167,185:.:-0.92:1.000:. ./.:4:233,270:.: 0.55:1.000:. ./.:4:212,205:.:-0.29:1.000:. ./.:4:109,349:.: 0.11:1.000:. ./.:4:196,237:.:-0.13:1.000:. ./.:4:314,140:.: 0.07:1.000:. ./.:4:334,203:.: 0.88:1.000:. ./.:4:201,287:.: 0.40:0.777:. ./.:4:282,125:.:-0.38:1.000:. ./.:4:384,182:.: 1.16:1.000:. ./.:4:265,117:.:-0.63:1.000:. ./.:4:330,143:.: 0.26:1.000:. ./.:4:302,104:.:-0.39:1.000:. ./.:4:211,240:.: 0.04:1.000:. ./.:4:297,124:.:-0.25:1.000:. ./.:4:102,326:.:-0.18:1.000:. ./.:4:291,261:.: 1.03:1.000:. ./.:4:228,314:.: 0.93:1.000:. ./.:4:207,273:.: 0.33:1.000:. ./.:4:167,203:.:-0.74:0.693:. ./.:4:321,152:.: 0.26:1.000:. ./.:4:243,313:.: 1.07:1.000:. ./.:4:244,118:.:-0.82:1.000:. ./.:4:179,230:.:-0.36:1.000:. ./.:4:250,255:.: 0.57:1.000:. ./.:4:253,136:.:-0.56:1.000:. ./.:4:281,122:.:-0.42:1.000:. ./.:4:314,172:.: 0.38:1.000:. ./.:4:246,136:.:-0.63:1.000:. ./.:3:87,227:.:-1.29:0.999:. ./.:4:276,113:.:-0.56:1.000:. ./.:4:246,333:.: 1.29:1.000:. ./.:4:66,234:.:-1.42:1.000:. ./.:4:209,311:.: 0.72:1.000:. ./.:4:206,262:.: 0.21:1.000:. ./.:4:452,53:.: 0.57:1.000:. ./.:4:288,176:.: 0.17:1.000:. ./.:4:135,429:.: 1.14:1.000:. ./.:4:350,137:.: 0.39:1.000:. ./.:4:429,34:.: 0.16:1.000:. ./.:4:221,321:.: 0.93:1.000:. ./.:4:185,253:.:-0.08:1.000:. ./.:4:228,286:.: 0.66:1.000:. ./.:4:279,105:.:-0.61:1.000:. ./.:4:373,76:.: 0.02:1.000:. ./.:4:207,251:.: 0.11:1.000:. ./.:4:329,138:.: 0.20:1.000:. ./.:4:294,334:.: 1.77:1.000:. ./.:4:77,362:.:-0.07:1.000:. ./.:4:177,274:.: 0.04:1.000:. ./.:4:283,309:.: 1.42:1.000:. ./.:4:372,143:.: 0.67:0.999:. ./.:4:218,239:.: 0.10:1.000:. ./.:4:157,64:.:-2.19:0.985:. ./.:4:282,328:.: 1.59:1.000:. ./.:4:327,156:.: 0.36:1.000:. ./.:4:279,100:.:-0.66:1.000:. ./.:4:300,137:.:-0.09:1.000:. ./.:4:288,123:.:-0.34:1.000:. ./.:4:303,143:.: 0.00:1.000:. ./.:4:311,208:.: 0.71:1.000:. ./.:4:237,346:.: 1.33:1.000:. ./.:4:105,351:.: 0.09:1.000:. ./.:4:229,272:.: 0.53:1.000:. ./.:4:230,238:.: 0.21:1.000:. ./.:4:311,163:.: 0.27:0.993:. ./.:4:176,195:.:-0.73:1.000:. ./.:4:174,234:.:-0.37:1.000:. ./.:4:278,152:.:-0.16:1.000:. ./.:4:417,60:.: 0.30:1.000:. ./.:4:213,255:.: 0.21:1.000:. ./.:4:143,202:.:-0.99:1.000:. ./.:4:280,123:.:-0.42:1.000:. ./.:4:240,115:.:-0.89:1.000:. ./.:4:513,40:.: 1.04:1.000:. ./.:4:182,225:.:-0.38:1.000:. ./.:4:219,239:.: 0.11:1.000:. ./.:4:288,192:.: 0.33:1.000:. ./.:4:130,343:.: 0.26:1.000:. ./.:4:198,268:.: 0.19:1.000:. ./.:4:236,281:.: 0.69:1.000:. ./.:4:223,273:.: 0.48:1.000:. ./.:4:169,227:.:-0.49:1.000:. ./.:4:276,293:.: 1.19:1.000:. ./.:4:124,459:.: 1.33:1.000:. ./.:4:303,143:.: 0.00:1.000:. ./.:4:94,322:.:-0.30:1.000:. ./.:4:315,182:.: 0.49:1.000:. ./.:4:376,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:254,341:.: 1.44:1.000:. ./.:4:309,142:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,74:.:-2.74:1.000:. ./.:4:282,99:.:-0.64:1.000:. ./.:4:198,217:.:-0.31:1.000:. ./.:4:228,309:.: 0.88:1.000:. ./.:4:528,37:.: 1.15:1.000:. ./.:4:248,313:.: 1.11:1.000:. ./.:4:222,239:.: 0.14:0.998:. ./.:4:240,296:.: 0.87:1.000:. ./.:4:243,242:.: 0.37:1.000:. ./.:4:260,87:.:-0.97:1.000:. ./.:4:188,246:.:-0.12:1.000:. ./.:4:321,136:.: 0.10:1.000:. ./.:4:138,150:.:-1.54:1.000:. ./.:4:335,182:.: 0.69:1.000:. ./.:4:327,125:.: 0.05:1.000:. ./.:4:356,153:.: 0.61:1.000:. ./.:4:301,134:.:-0.11:1.000:. ./.:4:213,278:.: 0.43:1.000:. ./.:4:291,141:.:-0.14:1.000:. ./.:4:158,177:.:-1.08:1.000:. ./.:4:343,142:.: 0.37:1.000:. ./.:4:291,148:.:-0.07:1.000:. ./.:4:257,109:.:-0.78:1.000:. ./.:4:172,227:.:-0.46:1.000:. ./.:4:250,354:.: 1.53:1.000:. ./.:4:132,403:.: 0.86:1.000:. ./.:4:218,255:.: 0.26:1.000:. ./.:4:214,230:.:-0.02:1.000:. ./.:4:244,315:.: 1.09:1.000:. ./.:4:405,166:.: 1.21:1.000:. ./.:4:408,263:.: 2.18:1.000:. ./.:4:282,122:.:-0.41:1.000:. ./.:4:203,197:.:-0.45:1.000:. -chr2.1 27594933 chr2.1_027594933 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:28,11:0.32: 0.76:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.61: 0.16:1.000:0.701 0/0/0/1:4:23,6:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,25:0.67: 0.68:1.000:0.907 0/0/1/1:4:24,20:0.48: 1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,16:0.70:-0.61:1.000:0.986 0/0/1/1:4:21,19:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,24:0.71: 0.33:1.000:0.992 0/0/0/0:4:1,0:0.05:-2.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.18:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,32:0.89: 0.50:1.000:0.520 0/1/1/1:4:12,19:0.63: 0.07:1.000:0.515 0/1/1/1:4:12,24:0.67: 0.50:1.000:0.939 0/0/0/1:4:26,4:0.17:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,14:0.40: 0.68:1.000:0.787 0/0/0/1:4:43,11:0.24: 2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.54: 0.07:1.000:0.988 0/0/0/0:4:1,0:0.05:-2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,16:0.57:-0.10:1.000:0.943 0/0/1/1:4:14,9:0.42:-0.61:1.000:0.920 0/0/0/1:4:15,3:0.21:-1.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:40,32:0.47: 3.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:24,6:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,25:0.62: 0.93:1.000:0.523 0/0/0/1:4:28,8:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,22:0.73:-0.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,43:0.69: 2.83:1.000:0.972 0/0/0/1:4:31,8:0.24: 0.76:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:22,8:0.30:-0.01:1.000:0.984 0/0/0/1:4:18,9:0.37:-0.27:1.000:0.619 0/1/1/1:4:8,19:0.71:-0.27:1.000:0.991 0/1/1/1:4:14,35:0.72: 1.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,19:0.42: 1.62:1.000:0.906 0/0/0/1:4:24,7:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,19:0.54: 0.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:20,19:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,12:0.31: 1.11:1.000:0.968 0/1/1/1:4:10,17:0.64:-0.27:1.000:0.705 0/1/1/1:4:14,25:0.65: 0.76:1.000:0.808 0/1/1/1:4:11,32:0.74: 1.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:5,43:0.90: 1.54:1.000:0.695 0/0/1/1:4:22,34:0.62: 2.22:1.000:0.554 0/0/1/1:4:26,20:0.46: 1.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:13,8:0.41:-0.79:1.000:0.873 0/1/1/1:4:11,27:0.71: 0.68:1.000:0.994 0/1/1/1:4:10,16:0.63:-0.36:1.000:0.545 0/1/1/1:4:12,27:0.70: 0.76:1.000:0.983 0/0/0/1:4:29,10:0.29: 0.76:1.000:0.991 0/0/0/1:4:31,5:0.18: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,15:0.37: 1.19:1.000:0.523 0/0/1/1:4:22,16:0.45: 0.68:1.000:0.980 0/0/1/1:4:18,14:0.47: 0.16:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:18,5:0.25:-0.61:1.000:0.522 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-0.44:1.000:0.707 0/0/1/1:4:16,25:0.62: 0.93:1.000:0.523 0/1/1/1:4:16,35:0.69: 1.79:1.000:0.977 0/1/1/1:4:12,34:0.74: 1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,24:0.49: 1.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,11:0.31: 0.85:1.000:0.974 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-1.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,5:0.18: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,7:0.33:-0.53:0.777:0.937 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.77:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.17:-1.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,20:0.70:-0.10:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.29:-0.27:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,13:0.44: 0.16:1.000:0.960 0/1/1/1:4:3,10:0.77:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.36: 0.59:1.000:0.722 0/1/1/1:4:13,27:0.68: 0.85:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.61:0.693:1.000 0/0/1/1:4:22,12:0.38: 0.33:1.000:0.628 0/0/1/1:4:13,14:0.54:-0.27:1.000:0.987 0/0/0/1:4:14,6:0.33:-0.87:1.000:0.905 0/0/0/1:4:31,9:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,23:0.77:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.25:-1.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,21:0.73:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,14:0.78:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.67:-0.27:1.000:0.939 0/1/1:3:9,13:0.61:-0.70:0.999:0.999 0/0/0/1:4:25,4:0.18:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,6:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,14:0.41: 0.59:1.000:0.859 0/1/1/1:4:4,7:0.65:-1.65:1.000:0.769 0/0/1/1:4:20,14:0.44: 0.33:1.000:0.969 0/0/1/1:4:9,9:0.52:-1.04:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.49:-1.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,27:0.87: 0.07:1.000:0.900 0/1/1/1:4:3,8:0.73:-1.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,17:0.58:-0.01:1.000:0.893 0/0/1/1:4:9,9:0.52:-1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,9:0.48:-0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,6:0.43:-1.30:1.000:0.946 0/0/0/1:4:19,6:0.28:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,9:0.42:-0.61:1.000:0.920 0/1/1/1:4:15,27:0.65: 1.02:1.000:0.821 0/1/1/1:4:15,36:0.71: 1.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,12:0.42: 0.07:1.000:0.903 0/0/1/1:4:8,9:0.55:-1.13:1.000:0.979 0/1/1/1:4:9,34:0.79: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,10:0.64:-1.22:0.999:0.656 0/1/1/1:4:9,27:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,13:0.58:-0.61:0.985:0.899 0/0/0/1:4:13,5:0.31:-1.04:1.000:0.970 0/0/0/1:4:9,4:0.34:-1.47:1.000:0.862 0/1/1/1:4:7,21:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,12:0.54:-0.61:1.000:0.985 0/0/1/1:4:13,13:0.52:-0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,16:0.76:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,8:0.39:-0.70:1.000:0.744 0/0/1/1:4:21,11:0.38: 0.16:1.000:0.513 0/1/1/1:4:10,26:0.72: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,14:0.58:-0.44:1.000:0.919 0/0/1/1:4:18,12:0.43:-0.01:1.000:0.946 0/0/0/1:4:13,3:0.23:-1.22:0.993:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.46:-1.39:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,6:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,16:0.67:-0.53:1.000:0.939 0/0/0/1:4:20,7:0.29:-0.27:1.000:0.989 0/0/0/1:4:12,5:0.33:-1.13:1.000:0.929 0/0/0/1:4:17,3:0.19:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.61:-0.70:1.000:0.729 0/1/1/1:4:10,34:0.77: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,9:0.30: 0.33:1.000:0.985 0/0/1/1:4:12,7:0.40:-0.96:1.000:0.787 0/0/0/1:4:17,4:0.23:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.31:-0.70:1.000:0.977 0/0/0/1:4:12,6:0.37:-1.04:1.000:0.619 0/0/0/1:4:21,10:0.36: 0.07:1.000:0.740 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-0.44:1.000:0.707 0/0/0/1:4:11,2:0.19:-1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,26:0.67: 0.76:1.000:0.939 0/0/0/1:4:31,16:0.37: 1.45:1.000:0.529 0/1/1/1:4:9,25:0.74: 0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,31:0.72: 1.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,27:0.79: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,13:0.39: 0.50:1.000:0.719 0/0/0/1:4:29,3:0.14: 0.16:1.000:0.951 0/0/1/1:4:11,12:0.54:-0.61:1.000:0.985 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:8,21:0.73:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,42:0.67: 2.91:1.000:0.900 0/0/0/1:4:26,7:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,19:0.61: 0.16:1.000:0.701 0/0/0/1:4:23,5:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,26:0.65: 0.93:0.998:0.749 0/1/1/1:4:11,23:0.68: 0.33:1.000:0.962 0/1/1/1:4:3,18:0.86:-0.79:1.000:0.975 0/1/1/1:4:14,24:0.64: 0.68:1.000:0.725 0/0/0/1:4:19,4:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.29: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,26:0.50: 2.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,14:0.49:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,23:0.82:-0.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,28:0.72: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:17,8:0.35:-0.44:1.000:0.765 0/0/1/1:4:16,12:0.46:-0.18:1.000:0.986 0/0/1/1:4:19,13:0.44: 0.16:1.000:0.960 0/1/1/1:4:13,22:0.64: 0.42:1.000:0.694 0/0/1/1:4:23,14:0.41: 0.59:1.000:0.859 0/1/1/1:4:13,21:0.63: 0.33:1.000:0.572 0/0/0/1:4:22,7:0.28:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,31:0.68: 1.36:1.000:0.957 0/1/1/1:4:9,17:0.66:-0.36:1.000:0.889 0/0/0/1:4:23,8:0.29: 0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:17,7:0.33:-0.53:1.000:0.937 0/0/1/1:4:23,14:0.41: 0.59:1.000:0.859 0/1/1/1:4:8,30:0.79: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.33:-0.87:1.000:0.905 0/1/1/1:4:9,20:0.70:-0.10:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.79:1.000:1.000 -chr2.1 28191883 chr2.1_028191883 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,164:.: 0.30:1.000:. ./.:4:47,137:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,149:.:-0.31:1.000:. ./.:4:40,162:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,137:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,137:.:-0.65:1.000:. ./.:4:29,57:.:-2.70:1.000:. ./.:4:20,71:.:-2.60:1.000:. ./.:4:62,163:.: 0.30:1.000:. ./.:4:45,149:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.22:1.000:. ./.:4:51,137:.:-0.50:1.000:. ./.:4:60,186:.: 0.75:1.000:. ./.:4:58,169:.: 0.34:1.000:. ./.:4:42,168:.:-0.03:1.000:. ./.:4:60,191:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,96:.:-2.49:1.000:. ./.:4:60,179:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.43:1.000:. ./.:4:59,131:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,73:.:-2.98:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.11:1.000:. ./.:4:62,164:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,161:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,206:.: 1.68:1.000:. ./.:4:74,183:.: 0.99:1.000:. ./.:4:50,176:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,39:.:-3.31:1.000:. ./.:4:22,92:.:-2.10:1.000:. ./.:3:0,37:.:-3.76:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.33:1.000:. ./.:4:50,158:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,226:.: 0.32:1.000:. ./.:4:55,219:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.66:1.000:. ./.:4:46,164:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,261:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.08:1.000:. ./.:4:53,159:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,418:.: 4.46:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,332:.: 2.61:1.000:. ./.:4:52,121:.:-0.83:1.000:. ./.:4:77,200:.: 1.42:1.000:. ./.:4:59,168:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,260:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.20:1.000:. ./.:4:61,185:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,273:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,226:.: 0.32:1.000:. ./.:6:0,219:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1,255:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.53:1.000:. ./.:4:1,237:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,120:.:-1.97:1.000:. ./.:4:62,144:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,178:.: 0.60:0.777:. ./.:4:94,89:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.19:1.000:. ./.:4:34,109:.:-1.47:1.000:. ./.:4:72,212:.: 1.57:1.000:. ./.:4:46,164:.:-0.03:1.000:. ./.:4:96,108:.:-0.16:1.000:. ./.:4:62,168:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.36:1.000:. ./.:4:56,198:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.13:0.693:. ./.:4:54,186:.: 0.62:1.000:. ./.:4:72,210:.: 1.53:1.000:. ./.:4:36,120:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,265:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,230:.: 0.43:1.000:. ./.:4:45,113:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.50:1.000:. ./.:4:55,155:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.04:1.000:. ./.:3:1,149:.:-1.32:0.999:. ./.:4:47,173:.: 0.19:1.000:. ./.:4:53,189:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.32:1.000:. ./.:4:65,184:.: 0.82:1.000:. ./.:4:1,254:.: 0.95:1.000:. ./.:4:40,136:.:-0.76:1.000:. ./.:4:97,92:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,87:.:-2.21:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.83:1.000:. ./.:4:53,168:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,134:.:-0.37:1.000:. ./.:4:49,157:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.92:1.000:. ./.:4:44,144:.:-0.50:1.000:. ./.:4:79,182:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.38:1.000:. ./.:4:44,172:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,226:.: 1.79:1.000:. ./.:4:53,168:.: 0.21:0.999:. ./.:4:0,246:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.48:0.985:. ./.:4:51,168:.: 0.17:1.000:. ./.:4:38,131:.:-0.91:1.000:. ./.:4:45,138:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,162:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,141:.:-0.52:1.000:. ./.:4:66,191:.: 0.99:1.000:. ./.:4:44,143:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.34:1.000:. ./.:4:55,153:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.43:1.000:. ./.:4:58,166:.: 0.28:0.993:. ./.:4:52,140:.:-0.42:1.000:. ./.:4:47,120:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,162:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,121:.:-1.02:1.000:. ./.:4:33,102:.:-1.65:1.000:. ./.:4:69,202:.: 1.29:1.000:. ./.:4:56,178:.: 0.49:1.000:. ./.:4:65,166:.: 0.43:1.000:. ./.:4:67,171:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,128:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.15:1.000:. ./.:4:55,162:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.29:1.000:. ./.:4:51,129:.:-0.67:1.000:. ./.:4:40,147:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,266:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,266:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.90:1.000:. ./.:4:74,187:.: 1.07:1.000:. ./.:4:50,158:.:-0.07:1.000:. ./.:4:78,183:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,69:.:-2.68:1.000:. ./.:4:38,125:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1,207:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.19:1.000:. ./.:4:52,168:.: 0.19:1.000:. ./.:4:54,141:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.52:0.998:. ./.:4:57,176:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.26:1.000:. ./.:4:60,148:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,142:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1,210:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,191:.: 0.79:1.000:. ./.:4:36,180:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,93:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.06:1.000:. ./.:4:52,151:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.44:1.000:. ./.:4:38,134:.:-0.85:1.000:. ./.:4:52,143:.:-0.35:1.000:. ./.:4:44,197:.: 0.64:1.000:. ./.:4:1,222:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,196:.: 1.14:1.000:. ./.:4:49,153:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,217:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.25:1.000:. ./.:4:59,187:.: 0.75:1.000:. ./.:4:40,144:.:-0.59:1.000:. ./.:4:54,192:.: 0.75:1.000:. -chr2.1 28285508 chr2.1_028285508 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.: 3.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:6:3,0:.: 1.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:0.693:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 3.04:1.000:. ./.:3:1,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,1:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.: 1.81:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:0.993:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.: 3.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 28326010 chr2.1_028326010 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:128,101:0.48: 1.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,83:0.76:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,135:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,143:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,114:0.55: 1.04:1.000:0.983 0/1/1/1:4:68,161:0.74: 1.15:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,106:0.53: 0.86:1.000:0.991 0/1/1/1:4:56,144:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,3:0.20:-2.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,17:0.64:-2.40:1.000:0.741 0/0/1/1:4:80,84:0.55: 0.00:1.000:0.982 0/0/1/1:4:116,89:0.47: 0.72:1.000:0.992 0/1/1/1:4:52,128:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,148:0.75: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,168:0.75: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,94:0.44: 1.18:1.000:0.971 0/0/0/1:4:165,52:0.28: 0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,155:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,118:0.48: 1.75:1.000:0.995 1/1/1/1:4:3,25:0.91:-2.40:1.000:0.925 0/1/1/1:4:56,155:0.77: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,132:0.68: 0.72:1.000:0.960 0/0/1/1:4:100,65:0.43: 0.02:1.000:0.946 0/0/1/1:4:16,9:0.40:-2.45:1.000:0.759 0/1/1/1:4:66,207:0.79: 1.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,191:0.78: 1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,95:0.57: 0.26:1.000:0.955 0/0/1/1:4:132,94:0.45: 1.09:1.000:0.981 0/1/1/1:4:59,145:0.75: 0.71:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,248:1.00: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,107:0.57: 0.63:1.000:0.945 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:16,12:0.46:-2.40:1.000:0.989 1/1/1:3:1,19:0.96:-2.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,96:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,132:0.71: 0.60:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,137:0.79: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,115:0.74: 0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:172,54:0.28: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,91:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,39:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,132:0.72: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,95:0.59: 0.14:1.000:0.873 0/1/1/1:4:41,102:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,105:0.72:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,141:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,190:0.53: 3.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,84:0.53: 0.09:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:60,50:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,115:0.53: 1.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:30,78:0.76:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,133:0.80: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,132:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,86:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,42:0.30:-0.11:1.000:0.980 0/0/1/1:4:80,76:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,46:0.39:-0.62:1.000:0.726 0/0/0/0/1/1:6:72,42:0.40:-0.88:1.000:0.607 0/0/1/1:4:73,72:0.53:-0.34:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,98:0.66:-0.11:1.000:0.857 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,95:0.45: 1.16:1.000:0.978 0/0/0/1:4:117,33:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,39:0.43:-1.16:1.000:0.955 0/0/0/1:4:142,27:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,123:0.78: 0.00:0.777:1.000 0/1/1/1:4:42,107:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,88:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,90:0.68:-0.42:1.000:0.957 0/0/1/1:4:94,85:0.51: 0.26:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,177:1.00: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,113:0.70: 0.14:1.000:0.981 0/1/1/1:4:44,111:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,59:0.57:-0.94:1.000:0.953 0/0/1/1:4:61,58:0.52:-0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,83:0.71:-0.71:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,54:0.51:-0.88:0.693:0.996 0/1/1/1:4:59,92:0.65:-0.23:1.000:0.763 0/1/1/1:4:52,111:0.72:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,87:0.72:-0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,116:0.66: 0.41:1.000:0.858 0/0/1/1:4:72,79:0.56:-0.23:1.000:0.969 0/0/1/1:4:54,54:0.53:-0.99:1.000:0.990 0/1/1/1:4:35,94:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,59:0.46:-0.44:1.000:0.987 0/1/1/1:4:42,140:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/1/1:3:39,72:0.69:-0.94:0.999:1.000 0/1/1/1:4:43,93:0.72:-0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,104:0.78:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,53:0.45:-0.65:1.000:0.982 0/1/1/1:4:31,80:0.76:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,51:0.33: 0.23:1.000:0.934 0/1/1/1:4:22,80:0.81:-1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,71:0.78:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,88:0.80:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,67:0.45:-0.04:1.000:0.979 0/1/1/1:4:41,96:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,24:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,34:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,89:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,55:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,62:0.51:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,61:0.53:-0.74:1.000:0.990 0/1/1/1:4:78,147:0.69: 1.08:1.000:0.977 0/1/1/1:4:71,173:0.75: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,69:0.53:-0.46:1.000:0.990 0/1/1/1:4:36,71:0.70:-1.01:1.000:0.987 0/1/1/1:4:79,201:0.76: 2.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,79:0.71:-0.81:0.999:0.991 0/1/1/1:4:55,121:0.73: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,76:0.78:-1.09:0.985:1.000 0/0/1/1:4:79,74:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,64:0.70:-1.18:1.000:0.984 0/1/1/1:4:53,105:0.70:-0.11:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,85:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,46:0.53:-1.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:131,34:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,194:0.78: 1.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,88:0.73:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,121:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,74:0.70:-0.92:0.993:0.985 0/1/1/1:4:38,92:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,53:0.72:-1.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,42:0.47:-1.20:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,90:0.79:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,88:0.42: 1.13:1.000:0.921 0/0/1/1:4:44,42:0.52:-1.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,75:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,94:0.69:-0.35:1.000:0.976 0/1/1/1:4:71,164:0.74: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,81:0.47: 0.41:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,59:0.75:-1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,22:0.27:-1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,46:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,65:0.43: 0.05:1.000:0.932 0/0/0/1:4:101,20:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,65:0.45:-0.12:1.000:0.979 0/1/1/1:4:23,64:0.77:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,89:0.48: 0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:189,114:0.41: 2.45:1.000:0.878 0/1/1/1:4:44,132:0.78: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,126:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,91:0.53: 0.32:1.000:0.990 0/1/1/1:4:39,100:0.76:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,107:0.46: 1.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:111,101:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,14:0.74:-2.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,110:0.68: 0.12:1.000:0.958 0/1/1/1:4:75,151:0.71: 1.09:1.000:0.990 0/1/1/1:4:57,135:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,107:0.48: 1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,138:0.71: 0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,65:0.44:-0.09:0.998:0.973 0/1/1/1:4:59,186:0.79: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,90:0.52: 0.41:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,165:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,79:0.44: 0.53:1.000:0.971 0/0/1/1:4:101,100:0.53: 0.65:1.000:0.991 0/1/1/1:4:77,161:0.72: 1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,111:0.61: 0.49:1.000:0.633 0/0/1/1:4:95,77:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,113:0.82:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,82:0.48: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:144,38:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,117:0.67: 0.39:1.000:0.909 0/1/1/1:4:36,111:0.79:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,73:0.48: 0.02:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,129:0.82:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,156:0.71: 1.23:1.000:0.989 0/1/1/1:4:57,140:0.75: 0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,145:0.78: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,122:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,82:0.46: 0.49:1.000:0.989 0/1/1/1:4:73,175:0.75: 1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:213,68:0.28: 2.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,106:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,149:0.74: 0.86:1.000:0.999 -chr2.1 28514003 chr2.1_028514003 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:112,4:.: 0.87:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.31:1.000:. ./.:4:87,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.82:1.000:. ./.:4:94,11:.: 0.59:1.000:. ./.:4:94,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:56,8:.:-0.46:1.000:. ./.:4:96,8:.: 0.57:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.67:1.000:. ./.:4:12,3:.:-1.72:1.000:. ./.:4:54,13:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,6:.:-1.90:1.000:. ./.:4:106,7:.: 0.80:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:60,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:62,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:52,4:.:-0.67:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:114,8:.: 1.03:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:110,6:.: 0.87:1.000:. ./.:4:6,9:.:-1.72:1.000:. ./.:4:8,7:.:-1.72:1.000:. ./.:4:101,3:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:68,9:.:-0.13:1.000:. ./.:4:106,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1,8:.:-1.87:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.56:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:51,4:.:-0.69:1.000:. ./.:4:86,7:.: 0.28:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:110,18:.: 1.18:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.08:1.000:. ./.:4:76,14:.: 0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:95,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:84,3:.: 0.13:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:112,7:.: 0.95:1.000:. ./.:4:8,11:.:-1.61:1.000:. ./.:4:76,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,4:.:-0.69:1.000:. ./.:4:6,5:.:-1.82:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.87:1.000:. ./.:4:125,8:.: 1.31:1.000:. ./.:4:83,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:71,6:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,24:.:-0.59:1.000:. ./.:4:64,3:.:-0.38:1.000:. ./.:6:76,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,10:.: 0.36:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:149,4:.: 1.82:1.000:. ./.:4:71,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:37,14:.:-0.79:1.000:. ./.:4:36,7:.:-1.00:0.777:. ./.:4:25,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:109,5:.: 0.82:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:69,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:53,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:67,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.49:0.693:. ./.:4:88,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:76,17:.: 0.28:1.000:. ./.:4:3,7:.:-1.85:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.33:1.000:. ./.:4:30,10:.:-1.08:1.000:. ./.:4:71,7:.:-0.10:1.000:. ./.:3:60,7:.:-0.38:0.999:. ./.:4:79,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:58,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:89,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:105,7:.: 0.77:1.000:. ./.:4:78,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.08:1.000:. ./.:4:28,3:.:-1.31:1.000:. ./.:4:84,11:.: 0.33:1.000:. ./.:4:166,11:.: 2.44:1.000:. ./.:4:38,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:75,19:.: 0.31:1.000:. ./.:4:26,7:.:-1.26:1.000:. ./.:4:83,14:.: 0.39:1.000:. ./.:4:70,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:44,6:.:-0.82:1.000:. ./.:4:36,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:107,8:.: 0.85:1.000:. ./.:4:51,4:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:132,4:.: 1.39:1.000:. ./.:4:41,3:.:-0.97:0.999:. ./.:4:191,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:43,4:.:-0.90:0.985:. ./.:4:77,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:43,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,8:.:-1.74:1.000:. ./.:4:83,18:.: 0.49:1.000:. ./.:4:129,11:.: 1.49:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.31:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.10:0.993:. ./.:4:71,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:29,3:.:-1.28:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:39,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:87,7:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:3,7:.:-1.85:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:63,6:.:-0.33:1.000:. ./.:4:76,5:.:-0.02:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:25,12:.:-1.15:1.000:. ./.:4:71,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:75,8:.: 0.03:1.000:. ./.:4:81,5:.: 0.10:1.000:. ./.:4:104,4:.: 0.67:1.000:. ./.:4:44,4:.:-0.87:1.000:. ./.:4:101,22:.: 1.05:1.000:. ./.:4:144,9:.: 1.82:1.000:. ./.:4:131,8:.: 1.46:1.000:. ./.:4:143,5:.: 1.69:1.000:. ./.:4:64,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.90:1.000:. ./.:4:113,3:.: 0.87:1.000:. ./.:4:98,7:.: 0.59:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:181,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:95,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:73,8:.:-0.02:1.000:. ./.:4:84,14:.: 0.41:0.998:. ./.:4:105,3:.: 0.67:1.000:. ./.:4:94,16:.: 0.72:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:89,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.85:1.000:. ./.:4:57,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,7:.:-0.36:1.000:. ./.:4:130,9:.: 1.46:1.000:. ./.:4:49,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:114,7:.: 1.00:1.000:. ./.:4:82,7:.: 0.18:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:85,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:96,6:.: 0.51:1.000:. ./.:4:149,2:.: 1.77:1.000:. ./.:4:33,4:.:-1.15:1.000:. ./.:4:43,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.51:1.000:. ./.:4:135,6:.: 1.51:1.000:. ./.:4:49,11:.:-0.56:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:94,8:.: 0.51:1.000:. -chr2.1 28922998 chr2.1_028922998 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:6,18:.: 0.40:1.000:. ./.:4:7,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:6,22:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:9,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:3,10:.:-1.12:1.000:. ./.:4:6,18:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.37:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,13:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:10,14:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.95:1.000:. ./.:4:5,26:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,22:.: 1.09:1.000:. ./.:4:12,18:.: 1.23:1.000:. ./.:4:11,15:.: 0.68:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:11,14:.: 0.54:1.000:. ./.:4:6,17:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,16:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:9,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:8,25:.: 1.65:1.000:. ./.:4:3,30:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-2.65:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.79:1.000:. ./.:4:4,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:2,25:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,39:.: 2.48:1.000:. ./.:4:10,25:.: 1.93:1.000:. ./.:4:11,14:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:8,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:14,15:.: 1.09:1.000:. ./.:4:12,14:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:14,16:.: 1.23:1.000:. ./.:4:7,24:.: 1.37:1.000:. ./.:4:17,23:.: 2.62:1.000:. ./.:4:11,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:6,24:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:11,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.99:1.000:. ./.:4:10,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,19:.: 1.23:1.000:. ./.:4:8,13:.:-0.02:1.000:. ./.:6:2,7:.:-1.68:1.000:. ./.:4:21,5:.: 0.68:1.000:. ./.:4:5,21:.: 0.68:1.000:. ./.:4:20,11:.: 1.37:1.000:. ./.:4:6,21:.: 0.82:1.000:. ./.:4:18,18:.: 2.06:1.000:. ./.:4:8,20:.: 0.95:1.000:. ./.:4:13,8:.:-0.02:1.000:. ./.:4:3,15:.:-0.43:1.000:. ./.:4:7,17:.: 0.40:0.777:. ./.:4:5,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:7,12:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,11:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,39:.: 2.48:1.000:. ./.:4:4,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,24:.: 1.51:1.000:. ./.:4:11,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:8,21:.: 1.09:1.000:. ./.:4:5,10:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:21,10:.: 1.37:0.693:. ./.:4:10,15:.: 0.54:1.000:. ./.:4:6,25:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,9:.:-0.71:1.000:. ./.:4:16,11:.: 0.82:1.000:. ./.:4:4,15:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1,19:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.26:1.000:. ./.:4:5,13:.:-0.43:1.000:. ./.:3:4,10:.:-0.99:0.999:. ./.:4:10,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,13:.:-0.29:1.000:. ./.:4:7,6:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:5,21:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,11:.:-1.26:1.000:. ./.:4:10,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:8,12:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,6:.:-0.85:1.000:. ./.:4:10,15:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:15,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:3,27:.: 1.23:1.000:. ./.:4:5,18:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:9,23:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.85:0.999:. ./.:4:5,12:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.99:0.985:. ./.:4:2,11:.:-1.12:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.54:1.000:. ./.:4:10,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:6,13:.:-0.29:1.000:. ./.:4:4,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:9,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.54:0.993:. ./.:4:0,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.82:1.000:. ./.:4:6,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.85:1.000:. ./.:4:13,14:.: 0.82:1.000:. ./.:4:1,10:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:7,16:.: 0.26:1.000:. ./.:4:12,8:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,11:.:-1.26:1.000:. ./.:4:6,11:.:-0.57:1.000:. ./.:4:4,7:.:-1.40:1.000:. ./.:4:3,17:.:-0.15:1.000:. ./.:4:6,11:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.54:1.000:. ./.:4:4,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:11,19:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.40:1.000:. ./.:4:4,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:10,15:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,6:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.65:1.000:. ./.:4:8,6:.:-0.99:1.000:. ./.:4:18,18:.: 2.06:1.000:. ./.:4:4,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.54:1.000:. ./.:4:6,17:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.15:0.998:. ./.:4:0,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:2,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,11:.: 0.95:1.000:. ./.:4:4,20:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:6,22:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:5,11:.:-0.71:1.000:. ./.:4:16,8:.: 0.40:1.000:. ./.:4:7,12:.:-0.29:1.000:. ./.:4:2,23:.: 0.54:1.000:. ./.:4:2,8:.:-1.54:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:5,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:6,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,22:.: 1.09:1.000:. ./.:4:7,16:.: 0.26:1.000:. ./.:4:8,8:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,16:.: 0.12:1.000:. -chr2.1 29212976 chr2.1_029212976 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:37,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.39:1.000:. ./.:3:99,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:191,0:.: 5.09:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:152,0:.: 3.58:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.35:1.000:. ./.:6:82,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:56,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.50:0.777:. ./.:4:37,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:111,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.35:0.693:. ./.:4:36,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.27:1.000:. ./.:3:65,0:.: 0.23:0.999:. ./.:4:35,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:115,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:53,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.35:0.985:. ./.:4:55,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.58:0.993:. ./.:4:80,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.77:0.998:. ./.:4:51,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.27:1.000:. -chr2.1 29400670 chr2.1_029400670 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:387,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:321,76:.:-0.45:1.000:. ./.:4:398,83:.: 0.13:1.000:. ./.:4:352,91:.:-0.13:1.000:. ./.:4:676,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:511,107:.: 1.08:1.000:. ./.:4:284,62:.:-0.80:1.000:. ./.:4:349,103:.:-0.07:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:155,37:.:-1.87:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:389,94:.: 0.15:1.000:. ./.:4:458,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:250,91:.:-0.84:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:545,88:.: 1.19:1.000:. ./.:4:362,123:.: 0.16:1.000:. ./.:4:559,109:.: 1.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:313,92:.:-0.39:1.000:. ./.:4:551,124:.: 1.48:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:127,22:.:-2.17:1.000:. ./.:4:501,86:.: 0.87:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:431,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:362,97:.:-0.02:1.000:. ./.:4:313,100:.:-0.34:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:218,2:.:-1.68:1.000:. ./.:3:68,14:.:-2.63:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:372,68:.:-0.15:1.000:. ./.:4:469,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:585,96:.: 1.52:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:574,117:.: 1.59:1.000:. ./.:4:430,112:.: 0.56:1.000:. ./.:4:489,100:.: 0.88:1.000:. ./.:4:625,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:417,125:.: 0.56:1.000:. ./.:4:529,110:.: 1.23:1.000:. ./.:4:46,17:.:-2.76:1.000:. ./.:4:427,81:.: 0.32:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:474,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:558,130:.: 1.57:1.000:. ./.:4:451,79:.: 0.47:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:529,91:.: 1.10:1.000:. ./.:4:659,102:.: 2.07:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.24:1.000:. ./.:6:508,86:.: 0.92:1.000:. ./.:4:516,133:.: 1.30:1.000:. ./.:4:238,102:.:-0.84:1.000:. ./.:4:515,115:.: 1.16:1.000:. ./.:4:417,97:.: 0.36:1.000:. ./.:4:565,84:.: 1.30:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:351,83:.:-0.19:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:432,130:.: 0.69:0.777:. ./.:4:246,83:.:-0.92:1.000:. ./.:4:553,102:.: 1.34:1.000:. ./.:4:177,63:.:-1.54:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:320,117:.:-0.17:1.000:. ./.:4:195,108:.:-1.10:1.000:. ./.:4:245,91:.:-0.87:1.000:. ./.:4:468,109:.: 0.80:1.000:. ./.:4:583,110:.: 1.60:1.000:. ./.:4:646,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:468,182:.: 1.30:0.693:. ./.:4:293,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:237,83:.:-0.98:1.000:. ./.:4:413,102:.: 0.37:1.000:. ./.:4:648,152:.: 2.34:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:424,107:.: 0.48:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:450,100:.: 0.61:1.000:. ./.:3:307,93:.:-0.43:0.999:. ./.:4:288,107:.:-0.46:1.000:. ./.:4:427,127:.: 0.64:1.000:. ./.:4:320,88:.:-0.37:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:664,85:.: 1.99:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:254,93:.:-0.80:1.000:. ./.:4:532,127:.: 1.37:1.000:. ./.:4:492,115:.: 1.01:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:612,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:464,81:.: 0.58:1.000:. ./.:4:625,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:330,104:.:-0.19:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:292,97:.:-0.50:1.000:. ./.:4:392,118:.: 0.33:1.000:. ./.:4:569,96:.: 1.41:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:478,99:.: 0.80:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:411,129:.: 0.54:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.68:0.985:. ./.:4:480,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:399,97:.: 0.24:1.000:. ./.:4:294,93:.:-0.52:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:244,1:.:-1.50:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:701,101:.: 2.36:1.000:. ./.:4:479,81:.: 0.68:1.000:. ./.:4:411,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:414,150:.: 0.71:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.01:0.993:. ./.:4:328,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:287,80:.:-0.66:1.000:. ./.:4:389,112:.: 0.27:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:350,81:.:-0.21:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:358,89:.:-0.10:1.000:. ./.:4:433,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:455,81:.: 0.51:1.000:. ./.:4:435,108:.: 0.56:1.000:. ./.:4:564,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:374,109:.: 0.15:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:683,132:.: 2.45:1.000:. ./.:4:643,135:.: 2.19:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:452,85:.: 0.52:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:356,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:385,106:.: 0.20:1.000:. ./.:4:473,84:.: 0.66:1.000:. ./.:4:117,19:.:-2.26:1.000:. ./.:4:212,65:.:-1.28:1.000:. ./.:4:402,105:.: 0.31:1.000:. ./.:4:415,101:.: 0.38:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:389,95:.: 0.15:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.63:0.998:. ./.:4:378,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:456,78:.: 0.50:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:341,83:.:-0.26:1.000:. ./.:4:526,83:.: 1.02:1.000:. ./.:4:347,78:.:-0.26:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:272,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:451,88:.: 0.53:1.000:. ./.:4:524,82:.: 1.00:1.000:. ./.:4:313,65:.:-0.58:1.000:. ./.:4:302,87:.:-0.50:1.000:. ./.:4:271,93:.:-0.68:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:213,74:.:-1.21:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:418,82:.: 0.26:1.000:. ./.:4:491,118:.: 1.02:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:617,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:603,113:.: 1.76:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:237,76:.:-1.03:1.000:. ./.:4:356,97:.:-0.06:1.000:. -chr2.1 29479495 chr2.1_029479495 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:105,29:.: 1.40:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:73,35:.: 0.61:1.000:. ./.:4:94,26:.: 0.98:1.000:. ./.:4:112,41:.: 1.97:1.000:. ./.:4:103,29:.: 1.34:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:87,30:.: 0.89:1.000:. ./.:4:108,25:.: 1.37:1.000:. ./.:4:20,9:.:-1.78:1.000:. ./.:4:18,9:.:-1.84:1.000:. ./.:4:53,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:102,28:.: 1.28:1.000:. ./.:4:72,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:57,32:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,36:.: 1.31:1.000:. ./.:4:86,16:.: 0.43:1.000:. ./.:4:7,4:.:-2.32:1.000:. ./.:4:77,27:.: 0.49:1.000:. ./.:4:113,25:.: 1.52:1.000:. ./.:4:81,30:.: 0.70:1.000:. ./.:4:118,35:.: 1.97:1.000:. ./.:4:85,39:.: 1.10:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:68,19:.:-0.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.05:1.000:. ./.:3:10,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:53,22:.:-0.39:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:55,35:.: 0.07:1.000:. ./.:4:96,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:56,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,21:.:-0.93:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:54,21:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,39:.: 1.67:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:83,23:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,39:.: 0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:67,25:.: 0.13:1.000:. ./.:4:30,15:.:-1.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.51:1.000:. ./.:6:61,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:88,17:.: 0.52:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:85,20:.: 0.52:1.000:. ./.:4:103,19:.: 1.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:71,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:85,32:.: 0.89:0.777:. ./.:4:47,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:72,20:.: 0.13:1.000:. ./.:4:58,28:.:-0.05:1.000:. ./.:4:98,21:.: 0.95:1.000:. ./.:4:113,24:.: 1.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:85,37:.: 1.04:1.000:. ./.:4:75,22:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:63,21:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.93:1.000:. ./.:3:51,16:.:-0.63:0.999:. ./.:4:75,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:106,27:.: 1.37:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.69:1.000:. ./.:4:113,28:.: 1.61:1.000:. ./.:4:60,24:.:-0.11:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:70,24:.: 0.19:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:85,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:38,18:.:-0.96:1.000:. ./.:4:79,26:.: 0.52:1.000:. ./.:4:46,21:.:-0.63:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:63,17:.:-0.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:125,34:.: 2.16:1.000:. ./.:4:54,35:.: 0.04:1.000:. ./.:4:93,19:.: 0.73:1.000:. ./.:4:95,31:.: 1.16:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:75,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.78:0.985:. ./.:4:122,24:.: 1.76:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:83,20:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:63,31:.: 0.19:1.000:. ./.:4:93,39:.: 1.34:1.000:. ./.:4:89,22:.: 0.70:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:110,34:.: 1.70:0.993:. ./.:4:51,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:58,18:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:104,43:.: 1.79:1.000:. ./.:4:51,16:.:-0.63:1.000:. ./.:4:60,7:.:-0.63:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:88,27:.: 0.82:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:79,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:62,19:.:-0.20:1.000:. ./.:4:81,26:.: 0.58:1.000:. ./.:4:77,18:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,35:.: 0.92:1.000:. ./.:4:63,9:.:-0.48:1.000:. ./.:4:74,25:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,43:.: 1.73:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:80,28:.: 0.61:1.000:. ./.:4:96,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:104,34:.: 1.52:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:85,28:.: 0.76:1.000:. ./.:4:91,32:.: 1.07:0.998:. ./.:4:119,33:.: 1.94:1.000:. ./.:4:67,23:.: 0.07:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,23:.: 0.76:1.000:. ./.:4:71,35:.: 0.55:1.000:. ./.:4:42,10:.:-1.08:1.000:. ./.:4:73,32:.: 0.52:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:64,33:.: 0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:120,36:.: 2.07:1.000:. ./.:4:84,41:.: 1.13:1.000:. ./.:4:122,27:.: 1.85:1.000:. ./.:4:82,27:.: 0.64:1.000:. ./.:4:104,22:.: 1.16:1.000:. ./.:4:113,31:.: 1.70:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:111,39:.: 1.88:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.05:1.000:. -chr2.1 29876584 chr2.1_029876584 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:128,40:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,58:0.44:-0.56:1.000:0.963 0/0/1/1:4:109,96:0.46: 1.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:36,125:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,105:0.47: 1.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,178:0.74: 1.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,64:0.75:-1.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,128:0.73: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,50:0.28: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,8:0.38:-3.12:1.000:0.524 0/0/1/1:4:21,27:0.56:-2.49:1.000:0.974 0/0/1/1:4:84,58:0.40:-0.30:1.000:0.822 0/1/1/1:4:41,114:0.72: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,93:0.48: 0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:142,54:0.27: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,91:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,96:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,111:0.53: 1.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,101:0.48: 1.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,161:0.80: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,13:0.39:-2.84:1.000:0.685 0/0/0/1:4:142,45:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,172:0.76: 1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,127:0.77: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,21:0.91:-3.07:1.000:0.929 0/1/1/1:4:44,136:0.74: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,86:0.46: 0.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:84,95:0.52: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:166,58:0.26: 1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,90:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,77:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,122:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-3.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,9:0.37:-3.05:1.000:0.554 0/1/1:3:1,4:0.79:-3.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,83:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:49,160:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,82:0.48: 0.35:1.000:0.994 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,125:0.72: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,70:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,128:0.72: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,80:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:58,76:0.56:-0.49:1.000:0.968 0/0/1/1:4:66,75:0.53:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:133,42:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,92:0.46: 0.98:1.000:0.989 0/1/1/1:4:11,39:0.77:-2.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,113:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,42:0.60:-2.00:1.000:0.790 0/1/1/1:4:34,111:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,98:0.44: 1.56:1.000:0.961 0/0/1/1:4:76,57:0.42:-0.51:1.000:0.928 0/0/1/1:4:86,98:0.53: 0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:33,137:0.80: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,90:0.56: 0.12:1.000:0.974 0/1/1/1:4:36,114:0.75:-0.12:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,158:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,81:0.46: 0.42:1.000:0.989 0/0/0/1/1/1:6:57,59:0.50:-0.91:1.000:0.889 0/0/1/1:4:80,87:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,60:0.45:-0.56:1.000:0.982 0/0/0/1:4:132,37:0.22: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,65:0.53:-0.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,90:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,44:0.29:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,60:0.53:-1.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,89:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,124:0.77: 0.07:0.777:1.000 0/0/1/1:4:74,65:0.46:-0.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:66,89:0.57: 0.00:1.000:0.955 0/0/1/1:4:50,61:0.54:-1.02:1.000:0.986 0/0/1/1:4:76,94:0.55: 0.35:1.000:0.983 0/0/1/1:4:113,84:0.42: 0.98:1.000:0.920 0/0/0/1:4:126,51:0.28: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,83:0.57:-0.26:1.000:0.950 0/1/1/1:4:36,87:0.70:-0.75:1.000:0.981 0/1/1/1:4:40,122:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,132:0.79: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,32:0.20: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.26:0.608:1.000 0/0/0/1:4:101,31:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,81:0.54:-0.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:111,28:0.20:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,117:0.71: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,67:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,99:0.74:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,75:0.52:-0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,121:0.80:-0.14:1.000:1.000 0/1/1:3:32,68:0.67:-1.28:0.999:1.000 0/0/1/1:4:75,71:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,168:0.75: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,80:0.58:-0.42:1.000:0.929 0/0/0/1:4:149,55:0.27: 1.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,116:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,69:0.60:-0.98:1.000:0.774 0/0/1/1:4:66,74:0.52:-0.35:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,111:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,89:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,82:0.55:-0.16:1.000:0.983 0/0/1/1:4:78,95:0.54: 0.42:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,76:0.54:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:42,60:0.58:-1.23:1.000:0.913 0/0/1/1:4:82,86:0.51: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,89:0.78:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,91:0.47: 0.88:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,95:0.47: 1.05:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,155:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,27:0.20:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,96:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,74:0.53:-0.42:0.999:0.991 0/0/0/1:4:118,31:0.21:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,50:0.47:-1.16:0.985:0.993 0/0/0/1:4:147,53:0.26: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,126:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,38:0.28:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,23:0.16:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,37:0.29:-0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,78:0.46: 0.26:1.000:0.990 0/1/1/1:4:34,106:0.74:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,146:0.80: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,81:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:95,33:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,86:0.52: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,75:0.56:-0.54:0.993:0.966 0/0/0/1:4:88,28:0.24:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,96:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,73:0.68:-1.16:1.000:0.963 0/0/1/1:4:73,63:0.46:-0.44:1.000:0.986 0/0/1/1:4:94,76:0.44: 0.35:1.000:0.970 0/0/0/1:4:82,29:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,92:0.72:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,119:0.52: 1.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,61:0.32: 0.72:1.000:0.942 0/0/0/1:4:91,31:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,62:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,89:0.56: 0.05:1.000:0.968 0/0/1/1:4:67,86:0.55:-0.05:1.000:0.974 0/0/1/1:4:74,71:0.48:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,87:0.49: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,25:0.25:-1.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,174:0.75: 1.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,100:0.47: 1.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,87:0.48: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,88:0.53: 0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:107,90:0.45: 0.98:1.000:0.981 0/0/1/1:4:73,85:0.53: 0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:107,110:0.50: 1.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,153:0.81: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,21:0.63:-2.84:1.000:0.522 0/0/0/1:4:104,30:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,53:0.25: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,118:0.52: 1.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:162,58:0.26: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,145:0.75: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,82:0.49: 0.28:0.998:0.996 0/0/0/1:4:152,53:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,115:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,43:0.30:-0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:71,63:0.46:-0.49:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,78:0.45: 0.42:1.000:0.975 0/0/1/1:4:99,79:0.44: 0.53:1.000:0.965 0/0/0/1:4:121,41:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,56:0.28: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,64:0.46:-0.40:1.000:0.987 0/1/1/1:4:44,103:0.69:-0.19:1.000:0.972 0/0/1/1:4:79,70:0.46:-0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,84:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,74:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,82:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,68:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,64:0.51:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,106:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,100:0.47: 1.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,94:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,72:0.43: 0.28:1.000:0.936 0/1/1/1:4:53,133:0.70: 0.72:1.000:0.988 0/1/1/1:4:51,181:0.77: 1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,101:0.48: 1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,44:0.32:-0.40:1.000:0.965 0/0/1/1:4:80,95:0.54: 0.46:1.000:0.990 -chr2.1 30067564 chr2.1_030067564 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:506,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:336,2:.:-1.45:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:484,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:343,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:416,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:367,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:367,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:448,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:518,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:602,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:363,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:249,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:573,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:420,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:163,0:.:-3.84:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.69:1.000:. ./.:3:220,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:528,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:536,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:511,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:267,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:487,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:431,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:569,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:564,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.10:1.000:. ./.:6:409,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:547,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:550,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:371,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:539,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.50:0.777:. ./.:4:389,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:619,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:562,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:468,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:408,2:.:-0.47:0.608:. ./.:4:502,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:368,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:413,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:417,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.48:1.000:. ./.:3:313,0:.:-1.79:0.999:. ./.:4:391,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:533,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:312,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:396,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:353,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:448,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:444,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:562,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:472,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:329,0:.:-1.58:0.985:. ./.:4:504,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:370,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:535,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:519,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.02:0.993:. ./.:4:361,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:535,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:350,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:533,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:603,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:354,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:484,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:380,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:519,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:319,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:547,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.74:0.998:. ./.:4:444,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:404,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:389,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:336,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:424,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:377,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:370,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:485,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:572,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:565,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.95:1.000:. -chr2.1 30277703 chr2.1_030277703 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:222,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:172,47:.:-0.91:1.000:. ./.:4:210,50:.:-0.16:1.000:. ./.:4:175,66:.:-0.50:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:168,59:.:-0.76:1.000:. ./.:4:229,69:.: 0.54:1.000:. ./.:4:159,34:.:-1.39:1.000:. ./.:4:122,34:.:-2.07:1.000:. ./.:4:214,83:.: 0.52:1.000:. ./.:4:178,54:.:-0.67:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:196,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:195,56:.:-0.32:1.000:. ./.:4:233,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:270,85:.: 1.59:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:247,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:214,63:.: 0.16:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:185,55:.:-0.52:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:200,65:.:-0.06:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:265,75:.: 1.31:1.000:. ./.:4:238,73:.: 0.78:1.000:. ./.:4:205,65:.: 0.03:1.000:. ./.:4:165,60:.:-0.80:1.000:. ./.:4:75,16:.:-3.26:1.000:. ./.:4:153,42:.:-1.35:1.000:. ./.:3:78,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:181,55:.:-0.60:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:278,59:.: 1.26:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:208,56:.:-0.08:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:219,60:.: 0.19:1.000:. ./.:4:40,0:.:-4.19:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:160,45:.:-1.17:1.000:. ./.:4:203,67:.: 0.03:1.000:. ./.:4:190,64:.:-0.27:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:185,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.60:1.000:. ./.:6:283,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:165,64:.:-0.72:1.000:. ./.:4:395,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:216,75:.: 0.41:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:203,60:.:-0.10:1.000:. ./.:4:153,56:.:-1.09:0.777:. ./.:4:101,92:.:-1.39:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:148,31:.:-1.64:1.000:. ./.:4:177,57:.:-0.63:1.000:. ./.:4:210,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:127,116:.:-0.47:1.000:. ./.:4:196,53:.:-0.36:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:325,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:273,61:.: 1.20:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.15:0.608:. ./.:4:243,72:.: 0.85:1.000:. ./.:4:288,77:.: 1.77:1.000:. ./.:4:186,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:194,61:.:-0.25:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.07:1.000:. ./.:3:186,1:.:-1.50:0.999:. ./.:4:189,63:.:-0.30:1.000:. ./.:4:213,56:.: 0.01:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:289,74:.: 1.74:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:176,52:.:-0.74:1.000:. ./.:4:127,104:.:-0.69:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:236,57:.: 0.45:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:166,53:.:-0.91:1.000:. ./.:4:184,62:.:-0.41:1.000:. ./.:4:178,58:.:-0.60:1.000:. ./.:4:199,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:237,73:.: 0.76:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:251,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:239,60:.: 0.56:1.000:. ./.:4:248,66:.: 0.84:0.999:. ./.:4:380,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.24:0.985:. ./.:4:281,60:.: 1.33:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:191,66:.:-0.21:1.000:. ./.:4:246,47:.: 0.45:1.000:. ./.:4:219,61:.: 0.21:1.000:. ./.:4:213,51:.:-0.08:1.000:. ./.:4:188,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,61:.: 0.28:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:244,69:.: 0.82:0.993:. ./.:4:203,42:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,53:.:-1.59:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:197,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:238,54:.: 0.43:1.000:. ./.:4:162,32:.:-1.37:1.000:. ./.:4:155,63:.:-0.93:1.000:. ./.:4:235,49:.: 0.28:1.000:. ./.:4:234,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:222,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:200,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:217,42:.:-0.17:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:189,55:.:-0.45:1.000:. ./.:4:199,47:.:-0.41:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:237,62:.: 0.56:1.000:. ./.:4:199,70:.: 0.01:1.000:. ./.:4:254,64:.: 0.91:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:116,55:.:-1.79:1.000:. ./.:4:196,44:.:-0.52:1.000:. ./.:4:390,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:267,82:.: 1.48:1.000:. ./.:4:191,64:.:-0.25:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.23:0.998:. ./.:4:260,69:.: 1.11:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:172,66:.:-0.56:1.000:. ./.:4:173,55:.:-0.74:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:168,58:.:-0.78:1.000:. ./.:4:240,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:147,126:.: 0.08:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:215,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:200,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:182,59:.:-0.50:1.000:. ./.:4:272,75:.: 1.44:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:202,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:193,62:.:-0.25:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:271,72:.: 1.37:1.000:. ./.:4:190,58:.:-0.38:1.000:. ./.:4:216,57:.: 0.08:1.000:. -chr2.1 30427151 chr2.1_030427151 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:447,127:.: 0.77:1.000:. ./.:4:287,45:.:-1.42:1.000:. ./.:4:507,58:.: 0.69:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:496,135:.: 1.29:1.000:. ./.:4:576,57:.: 1.31:1.000:. ./.:4:258,37:.:-1.75:1.000:. ./.:4:613,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:442,106:.: 0.54:1.000:. ./.:4:263,49:.:-1.60:1.000:. ./.:4:366,53:.:-0.63:1.000:. ./.:4:351,62:.:-0.68:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:476,123:.: 1.00:1.000:. ./.:4:524,98:.: 1.21:1.000:. ./.:4:354,53:.:-0.74:1.000:. ./.:4:431,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:820,70:.: 3.63:1.000:. ./.:4:423,84:.: 0.17:1.000:. ./.:4:297,99:.:-0.84:1.000:. ./.:4:412,110:.: 0.30:1.000:. ./.:4:655,75:.: 2.18:1.000:. ./.:4:373,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:238,46:.:-1.85:1.000:. ./.:4:394,57:.:-0.34:1.000:. ./.:4:435,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:354,96:.:-0.35:1.000:. ./.:4:381,134:.: 0.24:1.000:. ./.:4:529,55:.: 0.86:1.000:. ./.:4:477,43:.: 0.28:1.000:. ./.:4:334,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:145,97:.:-2.23:1.000:. ./.:4:219,98:.:-1.55:1.000:. ./.:3:236,36:.:-1.96:1.000:. ./.:4:520,117:.: 1.34:1.000:. ./.:4:456,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:480,108:.: 0.90:1.000:. ./.:4:343,157:.: 0.10:1.000:. ./.:4:406,55:.:-0.25:1.000:. ./.:4:301,70:.:-1.06:1.000:. ./.:4:492,67:.: 0.64:1.000:. ./.:4:549,146:.: 1.87:1.000:. ./.:4:269,98:.:-1.10:1.000:. ./.:4:455,161:.: 1.15:1.000:. ./.:4:447,159:.: 1.06:1.000:. ./.:4:586,64:.: 1.46:1.000:. ./.:4:320,57:.:-1.01:1.000:. ./.:4:286,56:.:-1.33:1.000:. ./.:4:469,120:.: 0.91:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:336,71:.:-0.74:1.000:. ./.:4:427,70:.: 0.08:1.000:. ./.:4:315,163:.:-0.10:1.000:. ./.:4:526,46:.: 0.75:1.000:. ./.:4:407,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:389,54:.:-0.41:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:329,119:.:-0.37:1.000:. ./.:6:283,114:.:-0.83:1.000:. ./.:4:303,118:.:-0.61:1.000:. ./.:4:369,63:.:-0.51:1.000:. ./.:4:465,188:.: 1.49:1.000:. ./.:4:296,131:.:-0.56:1.000:. ./.:4:303,121:.:-0.58:1.000:. ./.:4:241,120:.:-1.15:1.000:. ./.:4:280,88:.:-1.09:1.000:. ./.:4:402,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:546,0:.: 0.52:0.777:. ./.:4:476,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:338,125:.:-0.23:1.000:. ./.:4:330,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:538,54:.: 0.93:1.000:. ./.:4:532,60:.: 0.93:1.000:. ./.:4:507,58:.: 0.69:1.000:. ./.:4:479,40:.: 0.27:1.000:. ./.:4:505,48:.: 0.58:1.000:. ./.:4:438,55:.: 0.04:1.000:. ./.:4:317,60:.:-1.01:1.000:. ./.:4:342,117:.:-0.27:1.000:. ./.:4:301,0:.:-1.70:0.608:. ./.:4:330,136:.:-0.20:1.000:. ./.:4:166,220:.:-0.93:1.000:. ./.:4:559,50:.: 1.09:1.000:. ./.:4:289,172:.:-0.25:1.000:. ./.:4:354,62:.:-0.66:1.000:. ./.:4:173,99:.:-1.96:1.000:. ./.:4:271,48:.:-1.53:1.000:. ./.:4:203,54:.:-2.09:1.000:. ./.:4:403,56:.:-0.27:1.000:. ./.:3:317,56:.:-1.05:0.999:. ./.:4:501,61:.: 0.66:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:315,82:.:-0.83:1.000:. ./.:4:332,117:.:-0.36:1.000:. ./.:4:392,61:.:-0.32:1.000:. ./.:4:431,46:.:-0.11:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:552,70:.: 1.21:1.000:. ./.:4:424,131:.: 0.60:1.000:. ./.:4:268,53:.:-1.52:1.000:. ./.:4:429,123:.: 0.57:1.000:. ./.:4:346,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:342,126:.:-0.19:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:403,53:.:-0.29:1.000:. ./.:4:495,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:404,47:.:-0.34:1.000:. ./.:4:636,74:.: 2.00:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:402,111:.: 0.22:1.000:. ./.:4:595,53:.: 1.44:1.000:. ./.:4:358,60:.:-0.64:0.999:. ./.:4:593,173:.: 2.51:1.000:. ./.:4:211,74:.:-1.84:0.985:. ./.:4:471,128:.: 1.00:1.000:. ./.:4:493,57:.: 0.56:1.000:. ./.:4:480,94:.: 0.77:1.000:. ./.:4:415,112:.: 0.35:1.000:. ./.:4:489,100:.: 0.91:1.000:. ./.:4:468,76:.: 0.50:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:330,64:.:-0.86:1.000:. ./.:4:433,108:.: 0.47:1.000:. ./.:4:413,123:.: 0.43:1.000:. ./.:4:466,127:.: 0.94:1.000:. ./.:4:675,47:.: 2.11:0.993:. ./.:4:352,98:.:-0.35:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:398,40:.:-0.46:1.000:. ./.:4:627,45:.: 1.66:1.000:. ./.:4:358,60:.:-0.64:1.000:. ./.:4:326,90:.:-0.66:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:415,153:.: 0.72:1.000:. ./.:4:518,69:.: 0.89:1.000:. ./.:4:318,118:.:-0.48:1.000:. ./.:4:308,145:.:-0.32:1.000:. ./.:4:394,44:.:-0.46:1.000:. ./.:4:419,120:.: 0.46:1.000:. ./.:4:445,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:339,116:.:-0.30:1.000:. ./.:4:526,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:363,89:.:-0.33:1.000:. ./.:4:340,68:.:-0.73:1.000:. ./.:4:459,146:.: 1.05:1.000:. ./.:4:560,112:.: 1.66:1.000:. ./.:4:443,114:.: 0.62:1.000:. ./.:4:430,64:.: 0.05:1.000:. ./.:4:484,63:.: 0.53:1.000:. ./.:4:645,68:.: 2.03:1.000:. ./.:4:506,64:.: 0.74:1.000:. ./.:4:426,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:286,95:.:-0.97:1.000:. ./.:4:351,177:.: 0.36:1.000:. ./.:4:646,61:.: 1.97:1.000:. ./.:4:332,135:.:-0.20:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:376,82:.:-0.28:0.998:. ./.:4:367,129:.: 0.07:1.000:. ./.:4:314,50:.:-1.13:1.000:. ./.:4:457,82:.: 0.46:1.000:. ./.:4:385,51:.:-0.48:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:330,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:431,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:108,144:.:-2.14:1.000:. ./.:4:409,58:.:-0.20:1.000:. ./.:4:424,109:.: 0.40:1.000:. ./.:4:384,52:.:-0.48:1.000:. ./.:4:449,101:.: 0.56:1.000:. ./.:4:411,83:.: 0.05:1.000:. ./.:4:587,60:.: 1.43:1.000:. ./.:4:423,105:.: 0.36:1.000:. ./.:4:423,56:.:-0.09:1.000:. ./.:4:447,47:.: 0.05:1.000:. ./.:4:384,65:.:-0.36:1.000:. ./.:4:354,127:.:-0.07:1.000:. ./.:4:452,57:.: 0.18:1.000:. ./.:4:517,42:.: 0.64:1.000:. ./.:4:391,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:618,60:.: 1.71:1.000:. ./.:4:562,74:.: 1.33:1.000:. ./.:4:333,78:.:-0.70:1.000:. ./.:4:431,71:.: 0.12:1.000:. -chr2.1 30489387 chr2.1_030489387 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:101,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.67:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:90,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:38,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.89:0.777:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:3:36,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:0.999:. ./.:4:71,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.67:0.985:. ./.:4:84,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.08:0.993:. ./.:4:36,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:95,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.33:0.998:. ./.:4:93,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.89:1.000:. -chr2.1 30541502 chr2.1_030541502 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:197,71:0.28: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,124:0.58:-0.34:1.000:0.927 0/0/0/1:4:142,64:0.32:-0.53:1.000:0.942 0/0/1/1:4:112,138:0.56: 0.18:1.000:0.966 0/0/0/1:4:283,91:0.26: 2.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,121:0.48: 0.35:1.000:0.994 0/1/1/1:4:40,129:0.76:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,128:0.55:-0.03:1.000:0.981 0/0/0/0:4:221,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,68:0.57:-1.90:1.000:0.957 0/0/1/1:4:36,28:0.45:-2.84:1.000:0.980 0/0/1/1:4:102,119:0.55:-0.29:1.000:0.982 0/0/1/1:4:125,122:0.51: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,109:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,111:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,104:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,173:0.75:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,182:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,255:0.75: 1.61:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,287:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,74:0.46:-1.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:117,114:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,151:0.49: 1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,98:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,67:0.82:-2.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,105:0.48:-0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,59:0.30:-0.52:1.000:0.986 0/0/0/1:4:147,48:0.26:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,91:0.27: 1.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:154,53:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,88:0.56:-1.30:1.000:0.964 0/0/1/1:4:83,84:0.51:-1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,11:0.17:-2.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,65:0.44:-1.41:1.000:0.967 0/0/1:3:37,29:0.45:-2.81:1.000:0.962 0/1/1/1:4:64,155:0.71:-0.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:111,116:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:125,111:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:168,53:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,141:0.71:-0.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:186,79:0.31: 0.43:1.000:0.971 0/1/1/1:4:62,175:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,207:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,105:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,123:0.47: 0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:136,105:0.45: 0.04:1.000:0.978 0/0/1/1:4:137,181:0.58: 1.29:1.000:0.926 0/0/0/1:4:40,8:0.18:-3.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,206:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,59:0.70:-2.50:1.000:0.981 0/0/1/1:4:138,99:0.43:-0.03:1.000:0.947 0/0/0/1:4:232,69:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,126:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:242,74:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,118:0.53:-0.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:45,133:0.75:-0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,153:0.73:-0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,150:0.71:-0.44:1.000:0.991 0/1/1/1:4:53,171:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:132,108:0.46: 0.02:1.000:0.807 0/0/1/1:4:156,167:0.53: 1.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,115:0.54:-0.35:1.000:0.988 0/0/1/1:4:186,146:0.45: 1.52:1.000:0.982 0/0/1/1:4:132,97:0.44:-0.16:1.000:0.960 0/0/1/1:4:123,125:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,65:0.29:-0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:46,173:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,108:0.48:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,112:0.48: 0.04:0.777:0.994 0/0/1/1:4:100,96:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,208:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,138:0.74:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,99:0.49:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,145:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/0/0/1:4:208,61:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,150:0.76:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,107:0.44: 0.20:1.000:0.965 0/0/1/1:4:161,139:0.48: 1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:122,108:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/0/0:4:302,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,178:1.00:-0.99:0.608:1.000 0/0/1/1:4:155,145:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:273,63:0.20: 1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,160:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,76:0.51:-1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,151:0.46: 1.61:1.000:0.987 0/1/1/1:4:48,162:0.77:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,180:0.72: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:196,39:0.18:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,167:0.71:-0.06:1.000:0.993 0/0/1:3:96,40:0.31:-1.67:0.999:1.000 0/1/1/1:4:68,192:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,160:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,93:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/0:4:308,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,178:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,124:0.44: 0.78:1.000:0.973 0/0/1/1:4:82,81:0.51:-1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:188,171:0.49: 1.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,207:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,105:0.46:-0.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:138,150:0.53: 0.80:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,175:0.74:-0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:247,45:0.16: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,98:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,184:0.77: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,88:0.48:-0.83:1.000:0.995 0/0/0/1:4:177,46:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,100:0.27: 2.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,183:0.74: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:297,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,62:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,149:0.45: 1.68:0.999:0.978 0/0/1/1:4:144,160:0.54: 1.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,45:0.38:-1.87:0.985:0.515 0/0/0/1:4:264,93:0.27: 1.92:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,238:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,130:0.56:-0.01:1.000:0.974 0/0/0/1:4:195,65:0.26: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,42:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,63:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,125:0.44: 0.85:1.000:0.970 0/1/1/1:4:65,202:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,53:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:297,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,243:0.78: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,53:0.21: 0.49:0.993:1.000 0/0/0/1:4:144,33:0.20:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,88:0.48:-0.84:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,198:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,128:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,127:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,41:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,86:0.48:-0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:184,49:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,143:0.51: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,62:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:156,159:0.52: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,128:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,123:0.49: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,136:0.49: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,130:0.46: 0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:117,123:0.52: 0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:186,52:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,177:0.51: 1.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:308,97:0.25: 2.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,110:0.44: 0.31:1.000:0.965 0/0/0/1:4:192,57:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,44:0.20:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,88:0.46:-0.68:1.000:0.987 0/0/1/1:4:146,134:0.49: 0.67:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,236:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,84:0.71:-1.95:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,98:0.58:-1.09:1.000:0.924 0/0/1/1:4:124,109:0.48:-0.09:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,293:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,166:0.51: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,147:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:153,50:0.26:-0.58:0.998:0.999 0/0/0/0:4:284,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,124:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,46:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,103:0.45:-0.09:1.000:0.984 0/1/1/1:4:58,181:0.76: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,30:0.29:-2.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:179,52:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,113:0.57:-0.60:1.000:0.952 0/0/0/1:4:200,48:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,193:0.71: 0.56:1.000:0.991 0/1/1/1:4:54,160:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,163:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,142:0.80:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,98:0.46:-0.35:1.000:0.990 0/1/1/1:4:60,157:0.72:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,98:0.58:-1.10:1.000:0.911 0/0/0/1:4:118,51:0.32:-1.14:1.000:0.964 0/0/0/1:4:183,75:0.30: 0.31:1.000:0.981 0/0/0/1:4:193,73:0.29: 0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:189,53:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,70:0.31:-0.09:1.000:0.967 0/0/1/1:4:139,149:0.53: 0.80:1.000:0.993 0/1/1/1:4:87,224:0.72: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:196,171:0.48: 2.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,111:0.57:-0.65:1.000:0.956 0/0/1/1:4:129,127:0.51: 0.28:1.000:0.996 -chr2.1 30902340 chr2.1_030902340 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:174,523:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,211:0.50:-1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:319,268:0.45:-0.27:1.000:0.984 0/0/0/1:4:427,129:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:364,345:0.48: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:505,173:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:273,100:0.27:-2.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:436,148:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:141,413:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:259,237:0.48:-1.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:224,335:0.60:-0.51:1.000:0.808 0/0/1/1:4:264,300:0.53:-0.47:1.000:0.992 0/0/0/1:4:434,150:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:313,329:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:139,433:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,303:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:325,315:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:486,142:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:371,380:0.50: 1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:446,152:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:172,536:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:149,393:0.73:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:487,152:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:396,133:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:524,71:0.12:-0.19:1.000:0.732 0/0/0/1:4:471,187:0.28: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:308,289:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:316,279:0.47:-0.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:167,498:0.75: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:313,278:0.47:-0.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:302,353:0.54: 0.33:1.000:0.989 0/0/0/1:4:342,112:0.25:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,756:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:176,594:0.77: 1.35:1.000:1.000 0/0/1:3:136,132:0.49:-3.07:1.000:0.660 0/0/1/1:4:298,256:0.46:-0.56:1.000:0.987 0/0/0/1:4:436,153:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:267,309:0.53:-0.36:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,722:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:429,145:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:297,323:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:546,168:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:441,426:0.49: 2.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:304,354:0.54: 0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:445,457:0.50: 2.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:187,477:0.72: 0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:383,319:0.45: 0.75:1.000:0.982 0/0/0/1:4:398,138:0.26:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:481,154:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:548,580:0.51: 4.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:507,181:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:354,384:0.52: 1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:292,281:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:328,361:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:373,129:0.26:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:371,328:0.47: 0.72:1.000:0.991 0/0/0/1:4:467,143:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:951,0:0.00: 2.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:320,292:0.47:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:318,292:0.48:-0.06:1.000:0.858 0/0/1/1:4:294,323:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:303,290:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:219,702:0.76: 2.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:382,388:0.50: 1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:322,326:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:164,444:0.73:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:241,255:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:279,323:0.53:-0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:553,176:0.24: 0.98:0.777:1.000 0/0/1/1:4:306,312:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:386,423:0.52: 1.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:360,344:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:370,411:0.52: 1.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:308,329:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:175,521:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:300,282:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:515,172:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:535,177:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:459,163:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:179,467:0.72: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:444,0:0.00:-1.52:0.608:1.000 0/1/1/1:4:166,609:0.79: 1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,757:1.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:279,289:0.51:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:188,587:0.76: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:511,178:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:207,215:0.51:-1.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:520,155:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:321,328:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:418,152:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/1:3:251,117:0.32:-2.19:0.999:1.000 0/0/1/1:4:283,312:0.52:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:503,167:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:227,244:0.52:-1.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:141,443:0.76:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:476,155:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:312,339:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:283,279:0.49:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:549,190:0.26: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:296,299:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:326,304:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:379,344:0.47: 0.93:1.000:0.993 0/0/0/0:4:498,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:310,362:0.54: 0.48:1.000:0.989 0/0/0/1:4:482,133:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,296:0.53:-0.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:439,149:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:302,265:0.47:-0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:403,396:0.49: 1.60:1.000:0.996 0/0/0/0:4:553,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:151,449:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:400,396:0.50: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:359,360:0.50: 0.90:0.999:0.997 0/1/1/1:4:141,477:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,254:0.50:-0.99:0.985:0.997 0/1/1/1:4:183,561:0.75: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:423,181:0.30:-0.12:1.000:0.987 0/1/1/1:4:162,536:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:164,436:0.73:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:159,478:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:328,312:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:495,156:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:536,167:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:303,267:0.47:-0.41:1.000:0.991 0/1/1/1:4:197,556:0.74: 1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:369,390:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:288,279:0.49:-0.44:0.993:0.996 0/1/1/1:4:161,436:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:343,116:0.25:-1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:422,136:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:310,280:0.47:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:237,217:0.48:-1.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,301:0.74:-1.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:579,188:0.24: 1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,529:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:388,349:0.47: 1.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:155,458:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:182,486:0.73: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:274,270:0.49:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:300,306:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:361,365:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:351,333:0.48: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:267,268:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:173,411:0.70:-0.29:1.000:0.988 0/0/0/1:4:485,161:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:403,400:0.50: 1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:306,317:0.51: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:299,255:0.46:-0.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:304,392:0.56: 0.69:1.000:0.965 0/0/1/1:4:219,254:0.53:-1.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:315,350:0.52: 0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:426,122:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,322:0.54:-0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:90,271:0.75:-2.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:153,467:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:380,133:0.26:-0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:189,496:0.72: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:471,170:0.26: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:244,205:0.45:-1.48:0.998:0.984 0/1/1/1:4:149,498:0.77: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:331,114:0.25:-1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:105,354:0.77:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:287,264:0.48:-0.58:1.000:0.994 0/0/0/0:4:561,1:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:270,265:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:268,276:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:130,362:0.74:-1.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:126,370:0.75:-1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:290,282:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:356,121:0.25:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:243,237:0.49:-1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,198:0.50:-1.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:289,325:0.53:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:263,253:0.49:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:229,253:0.52:-1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:212,241:0.53:-1.44:1.000:0.992 0/0/1/1:4:314,310:0.49: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:310,341:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:359,365:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:232,264:0.53:-1.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:442,145:0.25:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:535,161:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:351,343:0.49: 0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:117,351:0.75:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:281,332:0.54:-0.04:1.000:0.988 -chr2.1 31087764 chr2.1_031087764 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:73,82:0.52: 1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,60:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,61:0.45: 0.56:1.000:0.980 0/0/0/1:4:95,27:0.22: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.48:-0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,46:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,33:0.23: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,100:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,8:0.79:-3.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,1:0.09:-3.05:1.000:0.928 0/1/1/1:4:36,94:0.72: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:90,37:0.29: 0.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:28,117:0.80: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,21:0.17: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,76:0.46: 1.42:1.000:0.988 0/0/0/1:4:95,37:0.28: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:131,49:0.27: 1.95:1.000:0.997 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,35:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,8:0.46:-2.87:1.000:0.989 0/0/0/1:4:93,31:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,73:0.54: 0.53:1.000:0.986 0/0/1/1:4:58,67:0.53: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,5:0.41:-3.02:1.000:0.868 0/0/1/1:4:68,89:0.56: 1.27:1.000:0.972 0/0/1/1:4:69,77:0.52: 0.94:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,145:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,80:0.53: 1.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,91:0.50: 1.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,43:0.30: 0.83:1.000:0.983 0/0/1/1:4:48,71:0.59: 0.15:1.000:0.882 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-3.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-2.90:1.000:0.951 0/0/1:3:2,1:0.33:-3.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,97:0.61: 1.24:1.000:0.664 0/0/0/1:4:84,24:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,98:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,73:0.55: 0.47:1.000:0.978 0/0/1/1:4:69,57:0.44: 0.35:1.000:0.974 0/0/1/1:4:46,61:0.56:-0.21:1.000:0.967 0/0/1/1:4:60,62:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:95,33:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,52:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,97:0.80: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,61:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:78,83:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,19:0.42:-2.04:1.000:0.896 0/0/0/1:4:80,16:0.17:-0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,31:0.42:-1.24:1.000:0.928 0/0/1/1:4:50,39:0.43:-0.74:1.000:0.949 0/1/1/1:4:38,108:0.73: 0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:73,45:0.38: 0.12:1.000:0.532 0/1/1/1:4:40,89:0.68: 0.44:1.000:0.957 0/0/1/1:4:65,92:0.58: 1.27:1.000:0.928 0/0/0/1:4:102,29:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,73:0.48: 1.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,56:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,56:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:32,47:0.59:-1.04:1.000:0.522 0/0/1/1:4:45,61:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/0/1:4:91,22:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,62:0.47: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,47:0.48:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,48:0.45:-0.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:72,68:0.48: 0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,43:0.60:-1.27:1.000:0.823 0/0/1/1:4:59,64:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,29:0.25: 0.15:0.777:0.999 0/0/0/1:4:88,30:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,73:0.52: 0.68:1.000:0.994 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,96:0.71: 0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:80,24:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,22:0.20:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,46:0.45:-0.39:1.000:0.977 0/1/1/1:4:17,81:0.82:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,111:0.84: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,101:0.73: 0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,42:0.47:-0.80:0.608:0.993 0/0/0/1:4:86,31:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:73,75:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,53:0.54:-0.51:1.000:0.990 0/1/1/1:4:27,107:0.79: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,55:0.61:-0.74:1.000:0.708 0/0/1/1:4:46,48:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,69:0.72:-0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,52:0.47:-0.15:1.000:0.991 0/1/1:3:24,65:0.72:-0.74:0.999:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,30:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,41:0.46:-0.77:1.000:0.986 0/1/1/1:4:32,89:0.73: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,62:0.60:-0.39:1.000:0.751 0/0/1/1:4:42,45:0.51:-0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,25:0.27:-0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:47,57:0.54:-0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,59:0.46: 0.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:32,35:0.51:-1.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,92:0.87:-0.27:1.000:0.886 0/1/1/1:4:21,38:0.63:-1.63:1.000:0.627 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,16:0.19:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,34:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,41:0.40:-0.39:1.000:0.795 0/0/1/1:4:51,77:0.59: 0.41:1.000:0.852 0/0/1/1:4:82,70:0.45: 1.12:1.000:0.982 0/0/1/1:4:56,48:0.45:-0.30:1.000:0.983 0/1/1/1:4:31,78:0.71:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,102:0.54: 2.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:49,42:0.45:-0.68:0.999:0.983 0/0/1/1:4:44,64:0.58:-0.18:1.000:0.902 0/1/1/1:4:17,58:0.77:-1.16:0.985:1.000 0/0/1/1:4:69,76:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,20:0.21:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,30:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,55:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,48:0.48:-0.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,92:0.72: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,43:0.45:-0.62:1.000:0.983 0/1/1/1:4:40,70:0.63:-0.12:1.000:0.525 0/1/1/1:4:36,106:0.74: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,71:0.61: 0.00:1.000:0.652 0/0/0/1:4:83,38:0.31: 0.20:1.000:0.968 0/0/1/1:4:56,74:0.56: 0.47:0.993:0.968 0/1/1/1:4:30,73:0.70:-0.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:53,13:0.20:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,26:0.36:-1.27:1.000:0.655 0/0/1/1:4:58,51:0.46:-0.15:1.000:0.987 0/0/0/1:4:97,33:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,40:0.55:-1.24:1.000:0.984 0/0/1/1:4:50,49:0.48:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,39:0.42:-0.65:1.000:0.903 0/0/1/1:4:88,89:0.49: 1.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,59:0.43: 0.59:1.000:0.954 0/0/1/1:4:33,47:0.58:-1.01:1.000:0.923 0/0/1/1:4:51,36:0.41:-0.80:1.000:0.851 0/0/1/1:4:38,46:0.54:-0.89:1.000:0.989 0/0/0/1:4:95,29:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,73:0.70:-0.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:88,31:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,33:0.49:-1.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,126:0.76: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,102:0.70: 0.91:1.000:0.980 0/1/1/1:4:34,88:0.71: 0.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,100:0.77: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,105:0.69: 1.06:1.000:0.976 0/0/1/1:4:50,53:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,48:0.29: 1.48:1.000:0.990 0/0/0/1:4:92,28:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,23:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,55:0.46: 0.12:1.000:0.986 0/0/0/1:4:105,31:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,81:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,45:0.29: 1.21:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-0.30:0.998:1.000 0/1/1/1:4:43,95:0.68: 0.71:1.000:0.953 0/1/1/1:4:29,103:0.77: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,47:0.42:-0.15:1.000:0.930 0/0/0/1:4:83,28:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,66:0.55: 0.09:1.000:0.976 0/1/1/1:4:33,82:0.70: 0.03:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,111:0.71: 1.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,75:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,60:0.46: 0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:49,60:0.54:-0.15:1.000:0.988 0/0/1/1:4:59,52:0.46:-0.09:1.000:0.987 0/0/0/1:4:67,24:0.27:-0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,30:0.29:-0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:114,22:0.16: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,70:0.60: 0.03:1.000:0.798 0/0/0/1:4:85,25:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,46:0.43:-0.27:1.000:0.949 0/0/1/1:4:96,88:0.47: 2.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:28,91:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,71:0.46: 1.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:58,55:0.48:-0.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,106:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,75:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,91:0.51: 1.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:80,23:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,60:0.43: 0.68:1.000:0.949 -chr2.1 31258804 chr2.1_031258804 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:134,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:137,9:.: 0.91:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:211,1:.: 2.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:174,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:169,2:.: 1.51:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.14:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:146,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:109,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.35:1.000:. ./.:6:76,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:136,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.85:0.777:. ./.:4:68,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:99,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:88,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.21:0.608:. ./.:4:78,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:64,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.48:1.000:. ./.:3:84,0:.:-0.57:0.999:. ./.:4:77,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:61,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.57:0.999:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.14:0.985:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:172,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.71:0.993:. ./.:4:57,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:198,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:204,1:.: 2.32:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.77:0.998:. ./.:4:138,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:169,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:134,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:166,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:197,1:.: 2.15:1.000:. ./.:4:211,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.63:1.000:. -chr2.1 31548451 chr2.1_031548451 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:54,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:32,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:35,25:.:-0.40:1.000:. ./.:4:63,30:.: 1.18:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:56,29:.: 0.80:1.000:. ./.:4:36,19:.:-0.64:1.000:. ./.:4:12,5:.:-2.47:1.000:. ./.:4:6,10:.:-2.52:1.000:. ./.:4:38,18:.:-0.60:1.000:. ./.:4:57,23:.: 0.56:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:46,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,27:.: 0.80:1.000:. ./.:4:51,26:.: 0.41:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:66,24:.: 1.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:48,28:.: 0.37:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,15:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:66,37:.: 1.66:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:44,38:.: 0.65:1.000:. ./.:4:31,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:41,33:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:2,8:.:-2.81:1.000:. ./.:4:5,8:.:-2.66:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:33,28:.:-0.35:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:32,26:.:-0.50:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:56,29:.: 0.80:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:57,30:.: 0.90:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:63,20:.: 0.70:1.000:. ./.:4:51,40:.: 1.09:1.000:. ./.:4:55,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:60,29:.: 0.99:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.35:1.000:. ./.:6:68,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:51,31:.: 0.65:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:51,34:.: 0.80:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:91,29:.: 2.48:1.000:. ./.:4:51,41:.: 1.14:0.777:. ./.:4:40,50:.: 1.04:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:26,10:.:-1.56:1.000:. ./.:4:31,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:58,29:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,43:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:54,33:.: 0.90:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.21:0.608:. ./.:4:57,24:.: 0.61:1.000:. ./.:4:47,34:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,17:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,16:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.31:1.000:. ./.:3:41,0:.:-1.32:0.999:. ./.:4:48,26:.: 0.27:1.000:. ./.:4:78,32:.: 2.00:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,27:.: 0.65:1.000:. ./.:4:24,38:.:-0.31:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:30,15:.:-1.12:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:51,31:.: 0.65:1.000:. ./.:4:57,22:.: 0.51:1.000:. ./.:4:59,24:.: 0.70:1.000:. ./.:4:53,28:.: 0.61:1.000:. ./.:4:71,34:.: 1.76:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:51,23:.: 0.27:1.000:. ./.:4:44,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:64,39:.: 1.66:0.999:. ./.:4:83,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.31:0.985:. ./.:4:45,29:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:45,24:.: 0.03:1.000:. ./.:4:48,25:.: 0.22:1.000:. ./.:4:25,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.26:1.000:. ./.:4:59,33:.: 1.14:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,29:.: 0.17:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:53,27:.: 0.56:0.993:. ./.:4:40,21:.:-0.35:1.000:. ./.:4:43,24:.:-0.07:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,33:.: 0.75:1.000:. ./.:4:53,20:.: 0.22:1.000:. ./.:4:37,21:.:-0.50:1.000:. ./.:4:88,29:.: 2.34:1.000:. ./.:4:51,28:.: 0.51:1.000:. ./.:4:65,36:.: 1.57:1.000:. ./.:4:64,32:.: 1.33:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,22:.: 0.94:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:58,21:.: 0.51:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:57,21:.: 0.46:1.000:. ./.:4:48,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:38,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,30:.: 0.56:1.000:. ./.:4:60,33:.: 1.18:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,1:.:-2.90:1.000:. ./.:4:39,18:.:-0.55:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,15:.:-0.16:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.74:0.998:. ./.:4:41,25:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:24,25:.:-0.93:1.000:. ./.:4:47,22:.: 0.03:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:46,34:.: 0.56:1.000:. ./.:4:34,25:.:-0.45:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:30,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:42,28:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:42,15:.:-0.55:1.000:. ./.:4:45,30:.: 0.32:1.000:. ./.:4:36,19:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:40,16:.:-0.60:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.07:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:62,29:.: 1.09:1.000:. ./.:4:25,10:.:-1.61:1.000:. ./.:4:60,24:.: 0.75:1.000:. -chr2.1 31831772 chr2.1_031831772 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:58,78:.:-0.01:1.000:. ./.:4:43,69:.:-0.50:1.000:. ./.:4:60,71:.:-0.12:1.000:. ./.:4:124,67:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.52:1.000:. ./.:4:175,61:.: 2.02:1.000:. ./.:4:119,48:.: 0.62:1.000:. ./.:4:113,50:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.99:1.000:. ./.:4:18,19:.:-2.02:1.000:. ./.:4:34,10:.:-1.88:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.15:1.000:. ./.:4:134,57:.: 1.10:1.000:. ./.:4:61,76:.: 0.01:1.000:. ./.:4:118,61:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,94:.: 0.51:1.000:. ./.:4:136,54:.: 1.08:1.000:. ./.:4:63,77:.: 0.07:1.000:. ./.:4:209,32:.: 2.12:1.000:. ./.:4:216,25:.: 2.12:1.000:. ./.:4:38,13:.:-1.74:1.000:. ./.:4:113,47:.: 0.47:1.000:. ./.:4:156,76:.: 1.94:1.000:. ./.:4:52,71:.:-0.28:1.000:. ./.:4:34,3:.:-2.02:1.000:. ./.:4:151,34:.: 0.98:1.000:. ./.:4:131,36:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.91:1.000:. ./.:4:75,95:.: 0.68:1.000:. ./.:4:66,81:.: 0.21:1.000:. ./.:4:136,25:.: 0.49:1.000:. ./.:4:68,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:6,2:.:-2.61:1.000:. ./.:4:19,17:.:-2.04:1.000:. ./.:3:27,7:.:-2.09:1.000:. ./.:4:134,49:.: 0.94:1.000:. ./.:4:150,45:.: 1.18:1.000:. ./.:4:44,65:.:-0.56:1.000:. ./.:4:87,46:.:-0.08:1.000:. ./.:4:117,37:.: 0.35:1.000:. ./.:4:45,50:.:-0.85:1.000:. ./.:4:60,62:.:-0.30:1.000:. ./.:4:234,15:.: 2.28:1.000:. ./.:4:134,32:.: 0.60:1.000:. ./.:4:64,52:.:-0.42:1.000:. ./.:4:133,42:.: 0.78:1.000:. ./.:4:71,104:.: 0.78:1.000:. ./.:4:15,2:.:-2.43:1.000:. ./.:4:175,20:.: 1.18:1.000:. ./.:4:63,9:.:-1.31:1.000:. ./.:4:60,35:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.68:1.000:. ./.:4:55,47:.:-0.70:1.000:. ./.:4:55,57:.:-0.50:1.000:. ./.:4:124,61:.: 0.98:1.000:. ./.:4:141,43:.: 0.96:1.000:. ./.:4:100,55:.: 0.37:1.000:. ./.:4:166,36:.: 1.33:1.000:. ./.:4:114,32:.: 0.19:1.000:. ./.:6:87,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:125,45:.: 0.68:1.000:. ./.:4:112,35:.: 0.21:1.000:. ./.:4:124,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:132,27:.: 0.45:1.000:. ./.:4:130,44:.: 0.76:1.000:. ./.:4:51,38:.:-0.97:1.000:. ./.:4:75,13:.:-0.99:1.000:. ./.:4:48,76:.:-0.26:1.000:. ./.:4:130,32:.: 0.51:0.777:. ./.:4:51,77:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,51:.: 0.60:1.000:. ./.:4:204,15:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.23:1.000:. ./.:4:147,56:.: 1.35:1.000:. ./.:4:65,50:.:-0.44:1.000:. ./.:4:195,16:.: 1.51:1.000:. ./.:4:120,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:49,66:.:-0.44:1.000:. ./.:4:52,54:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.50:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.03:0.608:. ./.:4:153,39:.: 1.12:1.000:. ./.:4:65,63:.:-0.18:1.000:. ./.:4:150,24:.: 0.76:1.000:. ./.:4:84,13:.:-0.81:1.000:. ./.:4:65,68:.:-0.08:1.000:. ./.:4:101,29:.:-0.14:1.000:. ./.:4:105,39:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,60:.:-1.56:1.000:. ./.:4:100,42:.: 0.11:1.000:. ./.:3:53,40:.:-0.89:0.999:. ./.:4:166,27:.: 1.14:1.000:. ./.:4:126,47:.: 0.74:1.000:. ./.:4:70,23:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,74:.:-1.27:1.000:. ./.:4:111,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:35,50:.:-1.05:1.000:. ./.:4:94,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:134,60:.: 1.16:1.000:. ./.:4:82,62:.: 0.15:1.000:. ./.:4:64,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:73,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.77:1.000:. ./.:4:69,22:.:-0.93:1.000:. ./.:4:124,49:.: 0.74:1.000:. ./.:4:57,50:.:-0.60:1.000:. ./.:4:51,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,96:.: 0.43:1.000:. ./.:4:128,53:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.44:1.000:. ./.:4:88,64:.: 0.31:1.000:. ./.:4:57,64:.:-0.32:0.999:. ./.:4:130,36:.: 0.60:1.000:. ./.:4:35,16:.:-1.74:0.985:. ./.:4:68,76:.: 0.15:1.000:. ./.:4:192,18:.: 1.49:1.000:. ./.:4:112,37:.: 0.25:1.000:. ./.:4:61,45:.:-0.62:1.000:. ./.:4:56,53:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.85:1.000:. ./.:4:36,35:.:-1.33:1.000:. ./.:4:133,39:.: 0.72:1.000:. ./.:4:68,122:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.44:1.000:. ./.:4:176,22:.: 1.24:1.000:. ./.:4:57,57:.:-0.46:0.993:. ./.:4:0,43:.:-1.90:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:117,13:.:-0.14:1.000:. ./.:4:45,44:.:-0.97:1.000:. ./.:4:142,49:.: 1.10:1.000:. ./.:4:34,27:.:-1.54:1.000:. ./.:4:59,40:.:-0.77:1.000:. ./.:4:44,63:.:-0.60:1.000:. ./.:4:58,77:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,72:.:-0.01:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,47:.:-0.87:1.000:. ./.:4:107,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:126,47:.: 0.74:1.000:. ./.:4:44,48:.:-0.91:1.000:. ./.:4:114,29:.: 0.13:1.000:. ./.:4:31,49:.:-1.15:1.000:. ./.:4:68,108:.: 0.80:1.000:. ./.:4:94,109:.: 1.35:1.000:. ./.:4:73,82:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,77:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.05:1.000:. ./.:4:55,54:.:-0.56:1.000:. ./.:4:146,59:.: 1.39:1.000:. ./.:4:196,34:.: 1.89:1.000:. ./.:4:58,5:.:-1.50:1.000:. ./.:4:140,55:.: 1.18:1.000:. ./.:4:129,39:.: 0.64:1.000:. ./.:4:247,28:.: 2.81:1.000:. ./.:4:81,109:.: 1.08:1.000:. ./.:4:136,49:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.20:0.998:. ./.:4:0,115:.:-0.44:1.000:. ./.:4:121,53:.: 0.76:1.000:. ./.:4:57,73:.:-0.14:1.000:. ./.:4:103,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:140,53:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,54:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.62:1.000:. ./.:4:61,71:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.83:1.000:. ./.:4:116,46:.: 0.51:1.000:. ./.:4:126,67:.: 1.14:1.000:. ./.:4:147,26:.: 0.74:1.000:. ./.:4:136,14:.: 0.27:1.000:. ./.:4:106,31:.: 0.01:1.000:. ./.:4:106,45:.: 0.29:1.000:. ./.:4:90,24:.:-0.46:1.000:. ./.:4:48,46:.:-0.87:1.000:. ./.:4:72,55:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,76:.:-0.01:1.000:. ./.:4:69,70:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,79:.:-0.38:1.000:. ./.:4:60,81:.: 0.09:1.000:. ./.:4:169,78:.: 2.24:1.000:. ./.:4:65,105:.: 0.68:1.000:. ./.:4:98,41:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,84:.: 0.09:1.000:. -chr2.1 31944591 chr2.1_031944591 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:558,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:289,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:178,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:105,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:119,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:292,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:629,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:551,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:99,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:100,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:382,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:419,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:545,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:141,0:.:-2.46:1.000:. ./.:3:40,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:356,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:541,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:513,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:504,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:328,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:409,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:426,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:568,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:579,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:509,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:453,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.09:0.777:. ./.:4:368,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:269,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:423,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:340,2:.:-0.53:0.608:. ./.:4:453,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:505,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.85:1.000:. ./.:3:221,0:.:-1.69:0.999:. ./.:4:465,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:185,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:411,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:539,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:488,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.94:0.985:. ./.:4:500,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:269,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:549,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:501,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.09:0.993:. ./.:4:313,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:509,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:530,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:462,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:375,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:286,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:563,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:286,0:.:-1.07:0.998:. ./.:4:372,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:509,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:420,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:437,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:534,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:371,1:.:-0.24:1.000:. -chr2.1 32131303 chr2.1_032131303 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:96,123:.:-0.64:1.000:. ./.:4:252,71:.: 0.56:1.000:. ./.:4:159,116:.: 0.01:1.000:. ./.:4:168,131:.: 0.28:1.000:. ./.:4:271,54:.: 0.58:1.000:. ./.:4:373,108:.: 2.39:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:199,133:.: 0.67:1.000:. ./.:4:164,165:.: 0.63:1.000:. ./.:4:21,20:.:-2.70:1.000:. ./.:4:31,21:.:-2.57:1.000:. ./.:4:264,70:.: 0.69:1.000:. ./.:4:192,125:.: 0.49:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:186,66:.:-0.26:1.000:. ./.:4:281,96:.: 1.19:1.000:. ./.:4:219,80:.: 0.28:1.000:. ./.:4:258,69:.: 0.61:1.000:. ./.:4:236,93:.: 0.63:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:164,68:.:-0.49:1.000:. ./.:4:296,75:.: 1.12:1.000:. ./.:4:186,143:.: 0.63:1.000:. ./.:4:45,4:.:-2.61:1.000:. ./.:4:311,84:.: 1.39:1.000:. ./.:4:177,178:.: 0.93:1.000:. ./.:4:225,73:.: 0.27:1.000:. ./.:4:84,152:.:-0.45:1.000:. ./.:4:204,174:.: 1.20:1.000:. ./.:4:374,108:.: 2.40:1.000:. ./.:4:197,145:.: 0.78:1.000:. ./.:4:21,2:.:-2.91:1.000:. ./.:4:53,21:.:-2.32:1.000:. ./.:3:56,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:177,164:.: 0.77:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:226,79:.: 0.35:1.000:. ./.:4:249,98:.: 0.84:1.000:. ./.:4:164,143:.: 0.38:1.000:. ./.:4:170,57:.:-0.55:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:162,66:.:-0.54:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:261,90:.: 0.89:1.000:. ./.:4:658,0:.: 4.44:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:124,105:.:-0.53:1.000:. ./.:4:192,134:.: 0.60:1.000:. ./.:4:246,59:.: 0.35:1.000:. ./.:4:259,56:.: 0.47:1.000:. ./.:4:237,61:.: 0.27:1.000:. ./.:4:163,98:.:-0.16:1.000:. ./.:4:148,53:.:-0.85:1.000:. ./.:4:266,76:.: 0.78:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:161,46:.:-0.78:1.000:. ./.:4:155,60:.:-0.69:1.000:. ./.:4:234,58:.: 0.20:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:221,61:.: 0.09:1.000:. ./.:4:84,129:.:-0.71:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:69,104:.:-1.17:1.000:. ./.:4:175,132:.: 0.38:0.777:. ./.:4:139,101:.:-0.40:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:154,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:299,88:.: 1.30:1.000:. ./.:4:219,75:.: 0.23:1.000:. ./.:4:146,129:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,76:.:-0.10:1.000:. ./.:4:222,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:229,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:230,52:.: 0.09:1.000:. ./.:4:176,155:.: 0.65:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.04:0.608:. ./.:4:171,56:.:-0.55:1.000:. ./.:4:197,76:.:-0.02:1.000:. ./.:4:133,48:.:-1.08:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:274,70:.: 0.80:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:142,119:.:-0.16:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.10:1.000:. ./.:3:182,57:.:-0.41:0.999:. ./.:4:131,68:.:-0.87:1.000:. ./.:4:173,146:.: 0.51:1.000:. ./.:4:102,31:.:-1.64:1.000:. ./.:4:184,171:.: 0.93:1.000:. ./.:4:196,74:.:-0.05:1.000:. ./.:4:190,47:.:-0.43:1.000:. ./.:4:171,127:.: 0.27:1.000:. ./.:4:262,40:.: 0.32:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:221,56:.: 0.03:1.000:. ./.:4:189,48:.:-0.43:1.000:. ./.:4:186,34:.:-0.63:1.000:. ./.:4:212,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:154,102:.:-0.21:1.000:. ./.:4:161,64:.:-0.57:1.000:. ./.:4:72,105:.:-1.13:1.000:. ./.:4:174,149:.: 0.56:1.000:. ./.:4:157,137:.: 0.23:1.000:. ./.:4:221,61:.: 0.09:1.000:. ./.:4:107,90:.:-0.90:1.000:. ./.:4:239,191:.: 1.80:1.000:. ./.:4:207,53:.:-0.17:0.999:. ./.:4:256,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:245,1:.:-0.33:0.985:. ./.:4:78,112:.:-0.98:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:138,55:.:-0.94:1.000:. ./.:4:240,77:.: 0.49:1.000:. ./.:4:194,56:.:-0.28:1.000:. ./.:4:172,120:.: 0.20:1.000:. ./.:4:113,89:.:-0.84:1.000:. ./.:4:181,43:.:-0.58:1.000:. ./.:4:284,75:.: 0.98:1.000:. ./.:4:145,106:.:-0.27:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:154,116:.:-0.05:0.993:. ./.:4:224,61:.: 0.12:1.000:. ./.:4:201,62:.:-0.13:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:211,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:88,154:.:-0.38:1.000:. ./.:4:49,70:.:-1.80:1.000:. ./.:4:137,101:.:-0.42:1.000:. ./.:4:137,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:323,97:.: 1.68:1.000:. ./.:4:95,136:.:-0.50:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:53,101:.:-1.39:1.000:. ./.:4:131,46:.:-1.13:1.000:. ./.:4:73,100:.:-1.17:1.000:. ./.:4:125,35:.:-1.32:1.000:. ./.:4:80,143:.:-0.60:1.000:. ./.:4:63,88:.:-1.43:1.000:. ./.:4:306,78:.: 1.27:1.000:. ./.:4:278,65:.: 0.79:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:222,51:.:-0.02:1.000:. ./.:4:209,146:.: 0.93:1.000:. ./.:4:255,79:.: 0.69:1.000:. ./.:4:97,178:.: 0.01:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:52,30:.:-2.23:1.000:. ./.:4:138,56:.:-0.93:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:209,87:.: 0.25:1.000:. ./.:4:191,164:.: 0.93:1.000:. ./.:4:234,66:.: 0.30:0.998:. ./.:4:204,155:.: 0.98:1.000:. ./.:4:149,72:.:-0.62:1.000:. ./.:4:214,59:.:-0.02:1.000:. ./.:4:93,150:.:-0.36:1.000:. ./.:4:222,56:.: 0.04:1.000:. ./.:4:214,204:.: 1.66:1.000:. ./.:4:195,175:.: 1.10:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:199,168:.: 1.07:0.999:. ./.:4:240,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:173,68:.:-0.39:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:217,62:.: 0.05:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:240,67:.: 0.38:1.000:. ./.:4:156,138:.: 0.23:1.000:. ./.:4:284,230:.: 2.77:1.000:. ./.:4:310,63:.: 1.14:1.000:. ./.:4:190,167:.: 0.95:1.000:. ./.:4:161,126:.: 0.14:1.000:. ./.:4:276,72:.: 0.85:1.000:. ./.:4:523,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:110,148:.:-0.19:1.000:. ./.:4:172,69:.:-0.39:1.000:. ./.:4:235,67:.: 0.32:1.000:. -chr2.1 32457958 chr2.1_032457958 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:148,130:0.44:-0.16:1.000:0.974 0/0/1/1:4:88,165:0.59:-0.47:1.000:0.861 0/0/0/1:4:189,87:0.30:-0.18:1.000:0.987 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,382:0.68: 2.52:1.000:0.960 0/0/0/1:4:337,126:0.26: 2.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,111:0.45:-0.74:1.000:0.984 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,156:0.57:-0.52:1.000:0.941 0/0/1/1:4:53,66:0.52:-2.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,25:0.17:-1.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,229:0.88:-0.59:1.000:0.834 0/0/0/0:4:249,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,308:0.65: 1.60:1.000:0.822 0/0/1/1:4:105,101:0.47:-1.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:135,192:0.54: 0.47:1.000:0.985 0/0/1/1:4:125,116:0.46:-0.63:1.000:0.986 0/0/1/1:4:128,196:0.56: 0.43:1.000:0.972 0/0/0/1:4:261,35:0.11: 0.07:1.000:0.520 0/0/0/1:4:199,108:0.33: 0.21:1.000:0.909 0/0/1/1:4:44,92:0.61:-1.96:1.000:0.715 0/0/1/1:4:95,116:0.52:-1.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:290,102:0.24: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,76:0.27:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,45:0.36:-2.20:1.000:0.635 0/0/0/1:4:302,113:0.26: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:239,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,257:0.64: 0.82:1.000:0.708 0/0/1/1:4:135,152:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,95:0.30: 0.15:1.000:0.988 0/0/0/1:4:193,96:0.31:-0.02:1.000:0.967 0/0/0/1:4:164,74:0.29:-0.66:1.000:0.990 0/1/1/1:4:8,63:0.77:-2.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,114:0.87:-2.14:1.000:0.927 0/0/1:3:59,48:0.43:-2.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,191:0.61:-0.14:1.000:0.649 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,263:0.62: 1.11:1.000:0.548 0/1/1/1:4:23,241:0.82:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,111:0.35: 0.10:1.000:0.767 0/0/0/1:4:225,84:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,227:0.60: 0.67:1.000:0.812 0/0/0/1:4:225,145:0.37: 1.01:1.000:0.544 0/0/0/1:4:207,114:0.34: 0.39:1.000:0.893 0/1/1/1:4:104,317:0.66: 1.66:1.000:0.883 0/0/1/1:4:121,222:0.59: 0.67:1.000:0.881 0/0/1/1:4:136,225:0.57: 0.90:1.000:0.947 0/1/1/1:4:34,83:0.63:-2.20:1.000:0.581 0/0/0/1:4:174,110:0.37:-0.08:1.000:0.602 0/1/1/1:4:103,248:0.63: 0.77:1.000:0.554 0/0/0/1:4:217,82:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,231:0.55: 1.25:1.000:0.981 0/0/1/1:4:107,156:0.55:-0.35:1.000:0.981 0/0/1/1:4:218,208:0.46: 1.72:1.000:0.990 0/0/0/1:4:240,74:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,95:0.40:-0.82:1.000:0.781 0/0/0/1:4:179,106:0.35:-0.07:1.000:0.772 0/0/0/1:4:351,101:0.21: 2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,192:0.61:-0.07:1.000:0.736 0/0/0/1/1/1:6:135,116:0.44:-0.50:1.000:0.673 0/0/1/1:4:188,134:0.39: 0.40:1.000:0.743 0/0/0/1:4:227,94:0.28: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,223:0.61: 0.48:1.000:0.688 0/0/1/1:4:200,185:0.46: 1.20:1.000:0.986 0/0/1/1:4:209,137:0.38: 0.71:1.000:0.508 0/0/1/1:4:137,117:0.44:-0.46:1.000:0.963 0/1/1/1:4:61,149:0.63:-1.02:1.000:0.582 0/0/1/1:4:117,134:0.51:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/0:4:327,0:0.00: 0.47:0.777:1.000 0/0/1/1:4:118,91:0.41:-1.03:1.000:0.883 0/0/1/1:4:119,267:0.62: 1.22:1.000:0.586 0/0/0/0:4:173,14:0.07:-1.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,342:0.84: 1.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:231,109:0.30: 0.63:1.000:0.983 0/0/0/1:4:137,86:0.37:-0.85:1.000:0.622 0/0/0/0:4:174,22:0.11:-1.20:1.000:0.657 0/0/0/1:4:263,92:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,195:0.51: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:187,169:0.45: 0.83:1.000:0.981 0/0/1/1:4:137,251:0.59: 1.24:1.000:0.882 0/0/1/1:4:143,149:0.49: 0.02:0.608:0.996 0/0/1/1:4:129,162:0.52: 0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,228:0.79:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:173,22:0.11:-1.21:1.000:0.641 0/0/1/1:4:93,215:0.62: 0.23:1.000:0.527 0/0/1/1:4:216,207:0.47: 1.69:1.000:0.990 0/1/1/1:4:53,156:0.66:-1.03:1.000:0.854 0/0/1/1:4:170,188:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,172:0.57:-0.18:1.000:0.947 0/0/1/1:4:193,176:0.45: 1.00:1.000:0.983 0/0/1:3:160,79:0.31:-0.65:0.999:1.000 0/0/0/0:4:193,25:0.11:-0.92:1.000:0.587 0/0/0/0:4:355,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,73:0.31:-0.88:1.000:0.970 0/0/1/1:4:135,184:0.54: 0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:212,122:0.35: 0.56:1.000:0.828 0/0/1/1:4:127,192:0.55: 0.36:1.000:0.975 0/0/1/1:4:93,94:0.48:-1.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:326,113:0.24: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,203:0.62: 0.00:1.000:0.508 0/0/1/1:4:76,144:0.59:-0.89:1.000:0.850 0/0/1/1:4:119,230:0.60: 0.75:1.000:0.828 0/0/0/1:4:194,67:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,256:0.67: 0.61:1.000:0.900 0/0/0/0:4:283,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,96:0.42:-0.96:1.000:0.929 0/0/1/1:4:106,128:0.52:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,92:0.30:-0.07:1.000:0.980 0/0/0/1:4:269,136:0.32: 1.46:1.000:0.960 0/0/0/1:4:281,94:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,191:0.61:-0.08:1.000:0.744 0/0/0/1:4:266,119:0.29: 1.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:113,227:0.60: 0.63:0.999:0.777 0/0/1/1:4:120,207:0.58: 0.47:1.000:0.926 0/1/1/1:4:71,186:0.64:-0.42:0.985:0.706 0/0/1/1:4:129,126:0.47:-0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:150,97:0.37:-0.55:1.000:0.534 0/0/1/1:4:107,116:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,175:0.57:-0.09:1.000:0.955 0/0/1/1:4:92,170:0.59:-0.36:1.000:0.875 0/0/1/1:4:113,206:0.59: 0.36:1.000:0.887 0/0/0/1:4:219,88:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:226,123:0.33: 0.75:1.000:0.906 0/0/1/1:4:184,196:0.49: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,201:0.57: 0.38:1.000:0.937 0/0/0/1:4:217,128:0.35: 0.70:1.000:0.780 0/0/0/1:4:186,77:0.28:-0.35:0.993:0.997 1/1/1/1:4:10,228:0.92:-0.66:1.000:0.976 0/0/0/1:4:148,72:0.31:-0.89:1.000:0.975 0/0/1/1:4:113,88:0.42:-1.13:1.000:0.895 0/0/1/1:4:110,170:0.56:-0.13:1.000:0.970 0/0/0/0:4:189,21:0.09:-1.02:1.000:0.905 0/0/1/1:4:72,64:0.45:-1.96:1.000:0.977 0/0/0/1:4:218,99:0.29: 0.34:1.000:0.989 0/1/1/1:4:14,214:0.88:-0.79:1.000:0.832 0/0/1/1:4:132,229:0.58: 0.90:1.000:0.922 0/0/1/1:4:113,109:0.47:-0.87:1.000:0.991 0/0/1/1:4:103,233:0.62: 0.58:1.000:0.570 0/0/1/1:4:111,106:0.46:-0.93:1.000:0.990 0/0/0/1:4:160,85:0.33:-0.58:1.000:0.928 0/0/0/0:4:220,22:0.09:-0.61:1.000:0.972 0/0/1/1:4:96,195:0.60: 0.01:1.000:0.761 0/0/0/0:4:191,22:0.10:-0.98:1.000:0.859 0/0/1/1:4:78,105:0.53:-1.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:249,228:0.45: 2.37:1.000:0.984 0/0/1/1:4:245,214:0.44: 2.14:1.000:0.972 0/1/1/1:4:106,305:0.65: 1.53:1.000:0.831 0/0/1/1:4:186,190:0.48: 1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,210:0.55: 0.77:1.000:0.978 0/0/1/1:4:120,175:0.55: 0.06:1.000:0.981 0/0/0/0:4:226,22:0.08:-0.54:1.000:0.980 0/0/0/1:4:170,107:0.37:-0.17:1.000:0.615 0/0/0/1:4:100,16:0.13:-2.21:1.000:0.906 0/0/1/1:4:76,71:0.46:-1.82:1.000:0.987 0/0/1/1:4:115,253:0.62: 0.99:1.000:0.624 0/0/0/1:4:235,120:0.32: 0.82:1.000:0.955 0/1/1/1:4:17,251:0.87:-0.28:1.000:0.887 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,237:0.63: 0.56:0.998:0.582 0/0/1/1:4:140,181:0.53: 0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:133,98:0.40:-0.75:1.000:0.813 0/0/1/1:4:104,169:0.57:-0.22:1.000:0.954 0/0/0/1:4:168,25:0.12:-1.24:1.000:0.797 0/0/0/1:4:285,108:0.26: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,197:0.60: 0.10:1.000:0.816 0/0/1/1:4:120,201:0.57: 0.39:1.000:0.941 1/1/1/1:4:0,295:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,185:0.74:-0.97:0.999:0.999 0/0/1/1:4:90,201:0.62: 0.01:1.000:0.595 0/0/1/1:4:157,110:0.39:-0.30:1.000:0.701 0/0/1/1:4:148,102:0.39:-0.51:1.000:0.657 0/0/0/1:4:141,82:0.35:-0.85:1.000:0.809 0/0/0/1:4:193,84:0.29:-0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,175:0.60:-0.36:1.000:0.775 0/0/0/1:4:181,80:0.29:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:164,69:0.28:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:227,92:0.27: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,233:0.52: 1.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:213,98:0.30: 0.26:1.000:0.987 0/0/0/1:4:161,95:0.35:-0.44:1.000:0.780 0/0/1/1:4:197,203:0.48: 1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:215,234:0.50: 2.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,145:0.51:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,114:0.54:-1.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:110,174:0.56:-0.08:1.000:0.963 -chr2.1 32875977 chr2.1_032875977 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:11,13:0.52:-0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,14:0.55:-0.97:1.000:0.976 0/0/1/1:4:14,16:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,13:0.43:-0.49:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,28:0.70:-0.34:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.48:-1.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,20:0.72:-0.88:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,17:0.56:-0.73:1.000:0.973 0/0/0/1:4:46,1:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,39:0.88:-0.05:1.000:0.793 0/0/1/1:4:18,15:0.47:-0.53:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.54:-0.78:1.000:0.985 0/1/1/1:4:6,46:0.85: 0.39:1.000:0.989 0/1/1/1:4:13,26:0.63:-0.24:1.000:0.514 0/0/1/1:4:17,13:0.46:-0.68:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,23:0.56:-0.24:1.000:0.968 0/1/1/1:4:9,26:0.69:-0.44:1.000:0.977 0/1/1/1:4:29,64:0.65: 2.40:1.000:0.744 0/0/1/1:4:8,14:0.60:-1.07:1.000:0.792 0/1/1/1:4:8,37:0.77: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,22:0.71:-0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:56,32:0.42: 2.15:1.000:0.924 0/0/1/1:4:13,17:0.54:-0.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:9,8:0.47:-1.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,28:0.80:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.54:-0.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:10,17:0.59:-0.83:1.000:0.838 0/1/1/1:4:4,26:0.83:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,16:0.79:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,60:0.62: 2.30:1.000:0.571 0/1/1/1:4:9,54:0.81: 0.93:1.000:1.000 1/1/1:3:6,60:0.88: 1.08:1.000:0.976 0/1/1/1:4:5,33:0.83:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,11:0.55:-1.22:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,54:0.85: 0.83:1.000:0.988 0/0/1/1:4:20,17:0.47:-0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:9,32:0.73:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,42:0.74: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,56:0.84: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,19:0.58:-0.63:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,116:1.00: 3.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,42:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,57:0.84: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,159:0.82: 6.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,40:0.88: 0.00:1.000:0.734 1/1/1/1:4:6,90:0.92: 2.54:1.000:0.985 0/1/1/1:4:10,36:0.73: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,42:0.74: 0.44:1.000:0.998 1/1/1/1:4:2,40:0.94:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,42:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,23:0.65:-0.53:1.000:0.816 0/1/1/1:4:6,44:0.84: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,11:0.46:-0.93:1.000:0.988 0/1/1/1:4:13,52:0.74: 1.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,61:0.98: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:7,36:0.79:-0.05:1.000:0.863 0/0/1/1:4:14,17:0.52:-0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,36:0.84:-0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,58:0.72: 1.52:1.000:0.995 1/1/1/1:4:7,81:0.90: 2.15:1.000:0.703 0/1/1/1:4:13,39:0.70: 0.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:16,24:0.57:-0.19:1.000:0.951 0/1/1/1:4:5,28:0.80:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,20:0.59:-0.58:1.000:0.864 0/0/1/1:4:18,26:0.56: 0.00:0.777:0.967 0/0/1/1:4:15,8:0.41:-1.02:1.000:0.891 0/1/1/1:4:13,44:0.72: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,16:0.53:-0.73:1.000:0.993 1/1/1/1:4:4,76:0.93: 1.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,42:0.70: 0.59:1.000:0.984 0/1/1/1:4:10,21:0.64:-0.63:1.000:0.636 0/0/1/1:4:14,19:0.55:-0.53:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,35:0.68: 0.20:1.000:0.956 0/1/1/1:4:8,43:0.80: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,64:0.89: 1.27:1.000:0.546 0/1/1/1:4:5,49:0.88: 0.49:1.000:0.782 0/1/1/1:4:4,32:0.85:-0.39:0.608:0.980 0/1/1/1:4:14,51:0.73: 1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,54:0.80: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,18:0.65:-0.88:1.000:0.780 0/1/1/1:4:17,61:0.73: 1.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,41:0.75: 0.34:1.000:0.999 1/1/1/1:4:3,44:0.92: 0.15:1.000:0.980 0/1/1/1:4:5,41:0.86: 0.10:1.000:0.973 0/1/1/1:4:9,41:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,54:0.89: 0.74:1.000:0.507 0/1/1:3:6,18:0.70:-0.97:0.999:1.000 0/0/1/1:4:14,18:0.54:-0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,20:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,14:0.58:-1.02:1.000:0.930 0/1/1/1:4:9,40:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,34:0.64: 0.30:1.000:0.664 1/1/1/1:4:3,57:0.93: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,18:0.63:-0.83:1.000:0.514 0/1/1/1:4:13,56:0.75: 1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,32:0.67: 0.05:1.000:0.898 1/1/1/1:4:2,38:0.93:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,31:0.74:-0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,35:0.78:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,64:0.96: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,23:0.59:-0.34:1.000:0.881 0/1/1/1:4:7,33:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,10:0.47:-1.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,21:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,35:0.71: 0.10:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,53:0.83: 0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,17:0.46:-0.24:1.000:0.986 1/1/1/1:4:3,63:0.94: 1.08:0.999:1.000 0/1/1/1:4:8,47:0.81: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 1.08:0.985:1.000 0/1/1/1:4:4,20:0.78:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,43:0.94: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,21:0.60:-0.53:1.000:0.792 1/1/1/1:4:3,63:0.94: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,57:0.88: 0.93:1.000:0.843 0/1/1/1:4:10,35:0.72: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,36:0.84:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,14:0.48:-0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,29:0.73:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,43:0.77: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,38:0.85:-0.05:1.000:0.990 0/1/1/1:4:8,30:0.73:-0.29:0.993:0.998 1/1/1/1:4:4,56:0.91: 0.78:1.000:0.964 0/1/1/1:4:5,29:0.81:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,21:0.75:-0.88:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,54:0.95: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-1.46:1.000:0.984 0/1/1/1:4:12,41:0.72: 0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,36:0.74: 0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:4,53:0.91: 0.64:1.000:0.931 0/0/1/1:4:14,15:0.50:-0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,32:0.89:-0.44:1.000:0.546 0/1/1/1:4:7,18:0.67:-0.93:1.000:0.932 0/1/1/1:4:10,20:0.63:-0.68:1.000:0.514 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,33:0.89:-0.39:1.000:0.552 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,22:0.73:-0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,30:0.61: 0.10:1.000:0.649 0/1/1/1:4:15,56:0.73: 1.32:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,28:0.70:-0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:17,27:0.58: 0.00:1.000:0.914 1/1/1/1:4:4,44:0.89: 0.20:1.000:0.552 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,32:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,34:0.66: 0.20:1.000:0.885 0/0/1/1:4:14,13:0.48:-0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,33:0.68: 0.05:1.000:0.964 0/1/1/1:4:10,36:0.73: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,35:0.69: 0.15:1.000:0.979 0/0/1/1:4:9,11:0.52:-1.17:1.000:0.994 1/1/1/1:4:2,48:0.95: 0.30:0.998:1.000 0/0/1/1:4:19,36:0.62: 0.54:1.000:0.624 0/1/1/1:4:6,13:0.64:-1.22:1.000:0.707 1/1/1/1:4:4,46:0.90: 0.30:1.000:0.686 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,26:0.60:-0.14:1.000:0.808 0/1/1/1:4:12,40:0.72: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:8,33:0.75:-0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,24:0.90:-0.88:1.000:0.790 0/1/1/1:4:5,28:0.80:-0.53:0.999:1.000 0/1/1/1:4:11,25:0.65:-0.39:1.000:0.797 0/0/1/1:4:16,13:0.46:-0.73:1.000:0.990 0/1/1/1:4:10,25:0.67:-0.44:1.000:0.911 0/1/1/1:4:6,27:0.76:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,34:0.75:-0.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:5,56:0.89: 0.83:1.000:0.609 0/1/1/1:4:8,34:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,23:0.74:-0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,9:0.57:-1.41:1.000:0.951 0/1/1/1:4:10,38:0.74: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,32:0.71:-0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,26:0.56: 0.00:1.000:0.967 0/1/1/1:4:4,43:0.89: 0.15:1.000:0.521 1/1/1/1:4:4,69:0.93: 1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,15:0.48:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,9:0.44:-1.02:1.000:0.960 0/1/1/1:4:9,20:0.65:-0.73:1.000:0.757 -chr2.1 33068714 chr2.1_033068714 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,47:.: 0.89:1.000:. ./.:4:118,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:118,50:.: 0.11:1.000:. ./.:4:135,42:.: 0.31:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:169,66:.: 1.60:1.000:. ./.:4:79,22:.:-1.38:1.000:. ./.:4:136,34:.: 0.16:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,10:.:-2.84:1.000:. ./.:4:9,12:.:-3.15:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:117,50:.: 0.09:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:103,79:.: 0.42:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:135,47:.: 0.42:1.000:. ./.:4:107,107:.: 1.13:1.000:. ./.:4:108,122:.: 1.49:1.000:. ./.:4:118,99:.: 1.20:1.000:. ./.:4:14,25:.:-2.75:1.000:. ./.:4:99,91:.: 0.60:1.000:. ./.:4:165,42:.: 0.98:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:15,8:.:-3.11:1.000:. ./.:4:125,35:.:-0.07:1.000:. ./.:4:150,49:.: 0.80:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:160,41:.: 0.85:1.000:. ./.:4:122,47:.: 0.13:1.000:. ./.:4:135,39:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:11,11:.:-3.13:1.000:. ./.:4:18,13:.:-2.93:1.000:. ./.:3:8,1:.:-3.42:1.000:. ./.:4:143,44:.: 0.53:1.000:. ./.:4:117,40:.:-0.13:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:105,21:.:-0.82:1.000:. ./.:4:78,98:.: 0.29:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:138,48:.: 0.51:1.000:. ./.:4:118,103:.: 1.29:1.000:. ./.:4:95,83:.: 0.33:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:87,79:.: 0.07:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:37,38:.:-1.95:1.000:. ./.:4:74,70:.:-0.42:1.000:. ./.:4:64,32:.:-1.49:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:173,46:.: 1.24:1.000:. ./.:4:140,35:.: 0.27:1.000:. ./.:4:109,36:.:-0.40:1.000:. ./.:4:89,106:.: 0.71:1.000:. ./.:4:94,39:.:-0.66:1.000:. ./.:4:108,44:.:-0.24:1.000:. ./.:6:69,56:.:-0.84:1.000:. ./.:4:75,75:.:-0.29:1.000:. ./.:4:127,37:.: 0.02:1.000:. ./.:4:90,82:.: 0.20:1.000:. ./.:4:97,32:.:-0.75:1.000:. ./.:4:106,97:.: 0.89:1.000:. ./.:4:116,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:35,34:.:-2.09:1.000:. ./.:4:142,45:.: 0.53:1.000:. ./.:4:109,41:.:-0.29:0.777:. ./.:4:132,47:.: 0.36:1.000:. ./.:4:94,81:.: 0.27:1.000:. ./.:4:40,37:.:-1.91:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:141,48:.: 0.58:1.000:. ./.:4:138,52:.: 0.60:1.000:. ./.:4:69,74:.:-0.44:1.000:. ./.:4:117,34:.:-0.27:1.000:. ./.:4:114,41:.:-0.18:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:70,65:.:-0.62:0.608:. ./.:4:138,37:.: 0.27:1.000:. ./.:4:132,53:.: 0.49:1.000:. ./.:4:81,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:59,61:.:-0.95:1.000:. ./.:4:145,49:.: 0.69:1.000:. ./.:4:110,34:.:-0.42:1.000:. ./.:4:125,33:.:-0.11:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:143,35:.: 0.33:1.000:. ./.:3:64,25:.:-1.64:0.999:. ./.:4:104,96:.: 0.82:1.000:. ./.:4:146,44:.: 0.60:1.000:. ./.:4:68,73:.:-0.49:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,74:.:-0.20:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:87,28:.:-1.06:1.000:. ./.:4:128,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:88,85:.: 0.22:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:148,47:.: 0.71:1.000:. ./.:4:87,36:.:-0.89:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:89,18:.:-1.24:1.000:. ./.:4:143,39:.: 0.42:1.000:. ./.:4:102,37:.:-0.53:1.000:. ./.:4:121,38:.:-0.09:1.000:. ./.:4:194,70:.: 2.24:1.000:. ./.:4:145,61:.: 0.96:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:152,63:.: 1.16:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:83,68:.:-0.27:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.53:0.985:. ./.:4:140,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:71,68:.:-0.53:1.000:. ./.:4:71,56:.:-0.80:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:81,72:.:-0.22:1.000:. ./.:4:148,59:.: 0.98:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:78,86:.: 0.02:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.33:0.993:. ./.:4:123,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:87,23:.:-1.18:1.000:. ./.:4:61,47:.:-1.22:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:85,88:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,34:.:-1.18:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:126,44:.: 0.16:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.04:1.000:. ./.:4:76,72:.:-0.33:1.000:. ./.:4:114,41:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,96:.: 0.36:1.000:. ./.:4:72,78:.:-0.29:1.000:. ./.:4:122,31:.:-0.22:1.000:. ./.:4:93,92:.: 0.49:1.000:. ./.:4:75,34:.:-1.20:1.000:. ./.:4:162,68:.: 1.49:1.000:. ./.:4:199,66:.: 2.27:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:142,52:.: 0.69:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:128,103:.: 1.51:1.000:. ./.:4:89,91:.: 0.38:1.000:. ./.:4:14,16:.:-2.95:1.000:. ./.:4:78,58:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,81:.: 0.00:1.000:. ./.:4:107,111:.: 1.22:1.000:. ./.:4:173,51:.: 1.36:1.000:. ./.:4:151,37:.: 0.56:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.04:0.998:. ./.:4:182,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:82,81:.: 0.00:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:90,76:.: 0.07:1.000:. ./.:4:141,52:.: 0.67:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:112,30:.:-0.46:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:89,86:.: 0.27:1.000:. ./.:4:68,87:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,76:.:-0.35:1.000:. ./.:4:64,77:.:-0.49:1.000:. ./.:4:123,52:.: 0.27:1.000:. ./.:4:114,40:.:-0.20:1.000:. ./.:4:96,28:.:-0.86:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:147,60:.: 0.98:1.000:. ./.:4:141,52:.: 0.67:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:164,44:.: 1.00:1.000:. ./.:4:204,44:.: 1.89:1.000:. ./.:4:92,75:.: 0.09:1.000:. ./.:4:143,48:.: 0.62:1.000:. -chr2.1 33282412 chr2.1_033282412 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:136,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.60:1.000:. ./.:3:49,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:278,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:158,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:131,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:130,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.30:0.777:. ./.:4:120,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:0.608:. ./.:4:184,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.10:1.000:. ./.:3:130,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:107,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:261,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:258,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.74:0.999:. ./.:4:180,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.25:0.985:. ./.:4:158,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.49:0.993:. ./.:4:175,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:250,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.16:0.998:. ./.:4:192,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.92:0.999:. ./.:4:115,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:189,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.19:1.000:. -chr2.1 33688592 chr2.1_033688592 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:335,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:408,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:117,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:283,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:163,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:484,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:67,0:.:-3.58:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.91:1.000:. ./.:3:99,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:362,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:256,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.14:0.777:. ./.:4:278,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.86:0.608:. ./.:4:365,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.09:1.000:. ./.:3:216,1:.:-1.45:0.999:. ./.:4:291,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:238,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:331,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.92:0.985:. ./.:4:340,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.17:0.993:. ./.:4:261,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:471,1:.: 2.18:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:469,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:465,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:239,0:.:-1.13:0.998:. ./.:4:386,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:331,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.23:0.999:. ./.:4:329,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:332,1:.: 0.20:1.000:. -chr2.1 33990110 chr2.1_033990110 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:71,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.99:1.000:. ./.:3:18,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.28:1.000:. ./.:6:44,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.09:0.777:. ./.:4:13,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.31:1.000:. ./.:3:59,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:18,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:100,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.79:0.985:. ./.:4:79,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:116,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.41:0.993:. ./.:4:92,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:123,1:.: 1.58:0.998:. ./.:4:134,0:.: 1.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:108,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:53,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.64:1.000:. -chr2.1 34321384 chr2.1_034321384 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:145,120:0.44: 0.23:1.000:0.971 0/0/0/1:4:151,43:0.21:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,176:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,148:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,141:0.49: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,57:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,100:0.57:-1.11:1.000:0.958 0/1/1/1:4:56,185:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,179:0.77:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,26:0.32:-2.48:1.000:0.953 0/0/1/1:4:25,21:0.45:-2.96:1.000:0.975 0/0/0/1:4:174,52:0.22:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,178:0.77:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,139:0.54: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:100,113:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,158:0.75:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,132:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:180,66:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,144:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,66:0.28:-0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:41,11:0.20:-2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,155:0.55: 0.39:1.000:0.981 0/0/1/1:4:119,143:0.53: 0.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:58,170:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:28,3:0.09:-3.18:1.000:0.908 0/0/1/1:4:133,154:0.52: 0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,130:0.79:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,112:0.54:-0.67:1.000:0.988 0/0/1/1:4:153,139:0.47: 0.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:43,156:0.77:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,279:0.77: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,159:0.77:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,10:0.36:-3.23:1.000:0.678 0/0/0/1:4:47,20:0.29:-2.65:1.000:0.992 0/0/0:3:8,1:0.11:-3.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,41:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,189:0.70: 0.23:1.000:0.982 0/0/1/1:4:98,108:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,177:0.52: 1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:190,75:0.27: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,232:0.78: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,100:0.30: 1.02:1.000:0.980 0/0/0/1:4:239,85:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:219,70:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,202:0.49: 2.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,74:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,214:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:21,8:0.27:-3.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:208,71:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,67:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,173:0.69:-0.07:1.000:0.977 0/1/1/1:4:72,286:0.78: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,159:0.73:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,185:0.52: 1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,110:0.46:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:145,170:0.53: 0.96:1.000:0.993 0/0/0/1:4:207,61:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,188:0.52: 1.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,78:0.28: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:168,63:0.26:-0.26:1.000:0.631 0/0/0/1:4:237,81:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,203:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,80:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,144:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,79:0.28: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,137:0.47: 0.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:141,84:0.36:-0.35:1.000:0.642 0/0/1/1:4:141,154:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,297:0.75: 2.04:0.777:0.999 0/0/1/1:4:109,102:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:258,118:0.31: 1.85:1.000:0.980 0/0/1/1:4:127,132:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:283,93:0.24: 1.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,205:0.76: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,152:0.47: 0.98:1.000:0.992 0/0/1/1:4:151,128:0.45: 0.44:1.000:0.978 0/0/1/1:4:131,137:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,143:0.46: 0.79:1.000:0.988 0/0/1/1:4:142,161:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:76,276:0.77: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:267,0:0.00: 0.26:0.608:1.000 0/0/1/1:4:171,178:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,156:0.48: 1.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,86:0.44:-0.87:1.000:0.974 0/0/0/1:4:193,78:0.28: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,200:0.55: 1.53:1.000:0.977 0/0/0/1:4:157,49:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,129:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:76,209:0.72: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,152:0.54: 0.41:1.000:0.989 0/1/1:3:69,117:0.61:-0.92:0.999:1.000 0/0/1/1:4:134,127:0.48: 0.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:80,260:0.75: 1.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,52:0.26:-0.85:1.000:0.998 0/1/1/1:4:87,263:0.73: 1.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:223,87:0.27: 0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,215:0.79: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,144:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,190:0.51: 1.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:192,73:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,208:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,195:0.52: 1.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,108:0.52:-0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,164:0.52: 0.84:1.000:0.994 0/1/1/1:4:59,185:0.74:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,113:0.46:-0.10:1.000:0.985 0/0/1/1:4:115,112:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,158:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,226:0.69: 1.00:1.000:0.979 0/0/1/1:4:113,129:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,215:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,215:0.71: 0.70:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,244:0.79: 0.79:0.999:1.000 0/0/0/1:4:237,89:0.26: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,127:0.50:-0.03:0.985:0.997 0/0/1/1:4:123,147:0.53: 0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:168,75:0.30:-0.09:1.000:0.985 0/0/1/1:4:145,120:0.44: 0.23:1.000:0.971 0/1/1/1:4:60,226:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,173:0.70:-0.10:1.000:0.984 0/1/1/1:4:68,216:0.74: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,220:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,91:0.28: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,92:0.48:-0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,215:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:241,80:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,236:0.79: 0.61:0.993:1.000 0/0/0/1:4:178,61:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,183:0.74:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:137,58:0.29:-0.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:121,133:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,89:0.51:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,100:0.48:-0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:53,210:0.78: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,62:0.26:-0.32:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,192:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,141:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,68:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,131:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,56:0.26:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:151,116:0.42: 0.26:1.000:0.930 0/0/0/1:4:220,94:0.29: 0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:86,110:0.55:-0.77:1.000:0.981 0/0/1/1:4:110,119:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,152:0.48: 0.92:1.000:0.994 0/1/1/1:4:88,255:0.73: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,124:0.57:-0.51:1.000:0.955 0/0/1/1:4:131,116:0.46:-0.03:1.000:0.987 0/1/1/1:4:69,222:0.75: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,158:0.72:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,123:0.58:-0.60:1.000:0.921 0/0/0/1:4:157,48:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,29:0.40:-2.61:1.000:0.825 0/0/1/1:4:76,80:0.50:-1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:258,101:0.27: 1.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:229,73:0.23: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,129:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,193:0.77:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,100:0.49:-0.70:0.998:0.996 0/1/1/1:4:50,198:0.78:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,42:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,168:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,119:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,127:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,170:0.79:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,161:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,68:0.30:-0.42:1.000:0.985 0/0/0/1:4:133,46:0.25:-1.02:0.999:0.999 0/0/0/1:4:146,73:0.32:-0.44:1.000:0.941 0/0/0/1:4:167,46:0.21:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,46:0.24:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,48:0.28:-1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,199:0.73: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:160,66:0.28:-0.34:1.000:0.994 0/1/1/1:4:66,199:0.73: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,124:0.73:-1.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:60,196:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,138:0.54: 0.00:1.000:0.986 0/1/1/1:4:75,175:0.68: 0.01:1.000:0.963 0/1/1/1:4:59,128:0.67:-0.90:1.000:0.916 0/0/1/1:4:108,107:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,144:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,115:0.47:-0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:87,103:0.53:-0.86:1.000:0.992 0/0/0/1:4:151,61:0.28:-0.54:1.000:0.996 -chr2.1 34395072 chr2.1_034395072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:26,24:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,22:0.59:-1.09:1.000:0.868 0/0/0/1:4:51,11:0.19: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,17:0.27: 1.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,31:0.44: 1.34:1.000:0.973 0/1/1/1:4:14,28:0.65:-0.73:1.000:0.825 0/0/1/1:4:22,18:0.46:-0.87:1.000:0.986 0/0/0/1:4:34,15:0.32:-0.23:1.000:0.956 0/0/0/1:4:41,20:0.34: 0.63:1.000:0.869 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-2.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,12:0.50:-2.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,23:0.55:-0.73:1.000:0.982 0/0/0/1:4:43,9:0.18:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,24:0.39: 0.77:1.000:0.701 0/0/1/1:4:25,19:0.44:-0.59:1.000:0.967 0/0/0/1:4:38,14:0.28:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:34,21:0.39: 0.20:1.000:0.710 0/1/1/1:4:7,38:0.83:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:43,29:0.41: 1.42:1.000:0.875 0/1/1/1:4:14,48:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,29:0.74:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,23:0.42: 0.27:1.000:0.912 0/0/1/1:4:36,28:0.45: 0.84:1.000:0.974 0/0/0/1:4:38,11:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.53:-2.52:1.000:0.992 0/1/1/1:4:15,28:0.64:-0.66:1.000:0.688 0/0/0/1:4:34,5:0.14:-0.95:1.000:0.955 0/0/1/1:4:14,15:0.52:-1.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,30:0.48: 0.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:47,10:0.19: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,9:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,7:0.23:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,7:0.31:-2.02:1.000:0.980 1/1/1:3:1,11:0.91:-2.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,36:0.73:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,13:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,33:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,31:0.61:-0.16:1.000:0.668 0/1/1/1:4:19,36:0.64: 0.20:1.000:0.722 0/0/0/1:4:37,10:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,28:0.68:-0.87:1.000:0.962 0/1/1/1:4:6,25:0.79:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,25:0.68:-1.16:1.000:0.950 0/0/1/1:4:28,23:0.46:-0.09:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,26:0.69:-1.09:1.000:0.967 0/0/0/1:4:48,16:0.27: 0.84:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,17:0.72:-2.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,24:0.59:-0.87:1.000:0.836 0/0/1/1:4:15,18:0.55:-1.37:1.000:0.984 0/0/0/1:4:50,6:0.11: 0.27:1.000:0.620 0/0/0/1:4:43,14:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,12:0.22: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,36:0.51: 1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,21:0.44:-0.23:1.000:0.961 0/0/1/1:4:34,22:0.40: 0.27:1.000:0.810 0/1/1/1:4:10,30:0.73:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,30:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,49:0.83: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:17,31:0.64:-0.30:1.000:0.855 0/1/1/1:4:27,47:0.63: 1.56:1.000:0.505 0/0/0/1:4:41,14:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,51:0.72: 1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,34:0.55: 0.70:1.000:0.982 0/1/1/1:4:17,44:0.70: 0.63:1.000:0.987 0/0/1/1:4:32,22:0.42: 0.13:1.000:0.898 0/1/1/1:4:17,45:0.71: 0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:26,29:0.53: 0.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:54,10:0.17: 0.84:0.777:0.997 0/0/1/1:4:18,23:0.56:-0.80:1.000:0.968 0/1/1/1:4:14,48:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,19:0.44:-0.59:1.000:0.967 0/0/1/1:4:21,28:0.57:-0.23:1.000:0.950 0/0/0/1:4:53,17:0.26: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,22:0.41: 0.20:1.000:0.859 0/0/1/1:4:27,21:0.45:-0.30:1.000:0.974 0/0/1/1:4:37,24:0.40: 0.63:1.000:0.815 0/0/1/1:4:35,26:0.43: 0.63:1.000:0.957 0/0/1/1:4:30,31:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,20:0.33: 0.70:1.000:0.898 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.95:0.608:1.000 0/0/1/1:4:33,31:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,33:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,18:0.45:-0.80:1.000:0.976 0/1/1/1:4:9,31:0.75:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,22:0.40: 0.34:1.000:0.751 0/1/1/1:4:5,33:0.85:-1.02:1.000:0.981 0/0/1/1:4:32,26:0.46: 0.41:1.000:0.985 0/0/0/1:4:40,11:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,21:0.38: 0.34:1.000:0.555 0/0/1:3:30,11:0.28:-0.80:0.999:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.53:-0.73:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,11:0.15: 1.92:1.000:0.986 0/1/1/1:4:7,17:0.69:-2.02:1.000:0.975 0/0/0/1:4:62,20:0.26: 2.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,41:0.69: 0.41:1.000:0.973 0/0/0/1:4:35,13:0.29:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,21:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,34:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,45:0.70: 0.77:1.000:0.982 0/0/0/1:4:42,8:0.17:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,32:0.52: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,36:0.56: 0.84:1.000:0.966 0/0/1/1:4:35,42:0.55: 1.77:1.000:0.984 0/0/0/1:4:29,7:0.21:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,23:0.40: 0.49:1.000:0.786 0/0/0/1:4:34,19:0.37: 0.06:1.000:0.572 0/0/1/1:4:38,22:0.38: 0.56:1.000:0.532 0/0/0/1:4:40,17:0.31: 0.34:1.000:0.971 0/0/0/1:4:31,17:0.37:-0.30:1.000:0.625 0/0/0/1:4:51,14:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,16:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,21:0.34: 0.84:0.999:0.868 0/1/1/1:4:17,41:0.69: 0.41:1.000:0.973 0/0/1/1:4:15,9:0.39:-2.02:0.985:0.635 0/0/0/1:4:48,23:0.34: 1.34:1.000:0.891 0/1/1/1:4:15,46:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,22:0.47:-0.30:1.000:0.990 0/0/0/1:4:51,16:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,6:0.14:-0.37:1.000:0.952 0/0/0/1:4:56,14:0.21: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.29:-0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:16,34:0.67:-0.16:1.000:0.901 0/0/1/1:4:30,27:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,11:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,29:0.68:-0.73:1.000:0.940 0/0/0/1:4:63,16:0.22: 1.92:0.993:1.000 0/0/1/1:4:17,25:0.59:-0.73:1.000:0.864 0/0/0/1:4:36,19:0.36: 0.20:1.000:0.724 0/1/1/1:4:13,34:0.70:-0.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:24,23:0.49:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,22:0.40: 0.34:1.000:0.751 0/0/1/1:4:26,18:0.42:-0.59:1.000:0.905 0/0/0/1:4:29,9:0.25:-1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,34:0.79:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,11:0.21: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,16:0.32: 0.06:1.000:0.965 0/1/1/1:4:18,49:0.71: 1.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,15:0.39:-0.95:1.000:0.738 0/1/1/1:4:13,31:0.69:-0.59:1.000:0.970 0/0/1/1:4:25,31:0.55: 0.27:1.000:0.977 0/1/1/1:4:21,37:0.63: 0.41:1.000:0.538 0/0/1/1:4:36,30:0.46: 0.99:1.000:0.988 0/0/0/1:4:27,15:0.37:-0.73:1.000:0.589 0/0/1/1:4:47,39:0.46: 2.42:1.000:0.988 0/0/0/1:4:43,16:0.29: 0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,44:0.55: 1.99:1.000:0.980 0/0/1/1:4:32,20:0.39:-0.02:1.000:0.738 0/0/0/1:4:52,19:0.28: 1.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,10:0.18: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,31:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,36:0.65: 0.13:1.000:0.825 0/0/1/1:4:12,8:0.41:-2.31:1.000:0.859 0/0/1/1:4:19,19:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,34:0.61: 0.20:1.000:0.686 0/1/1/1:4:17,59:0.75: 1.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,40:0.49: 2.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,7:0.14: 0.13:1.000:0.961 0/0/1/1:4:18,27:0.59:-0.52:0.998:0.836 0/0/0/1:4:39,13:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,46:0.76: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.30:-1.45:1.000:0.989 0/0/1/1:4:30,19:0.40:-0.23:1.000:0.768 0/0/1/1:4:30,34:0.53: 0.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:14,5:0.28:-2.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,13:0.27:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,44:0.61: 1.34:1.000:0.671 0/1/1/1:4:16,45:0.72: 0.63:0.999:0.995 0/1/1/1:4:15,33:0.67:-0.30:1.000:0.930 0/1/1/1:4:18,40:0.67: 0.41:1.000:0.937 0/1/1/1:4:12,26:0.67:-1.02:1.000:0.919 0/1/1/1:4:13,28:0.67:-0.80:1.000:0.914 0/0/0/1:4:26,11:0.31:-1.09:1.000:0.973 0/1/1/1:4:14,37:0.71:-0.09:1.000:0.990 0/0/0/1:4:35,9:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,14:0.32:-0.52:1.000:0.943 0/0/0/1:4:47,12:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,24:0.40: 0.63:1.000:0.815 0/0/0/1:4:43,18:0.31: 0.63:1.000:0.976 0/0/0/1:4:29,10:0.27:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,28:0.47: 0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:44,24:0.36: 1.13:1.000:0.640 0/0/1/1:4:36,28:0.45: 0.84:1.000:0.974 0/0/1/1:4:20,20:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,33:0.60: 0.13:1.000:0.753 -chr2.1 34756443 chr2.1_034756443 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:72,178:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.64:1.000:. ./.:4:46,187:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,265:.: 1.26:1.000:. ./.:4:59,203:.: 1.21:1.000:. ./.:4:87,218:.: 1.97:1.000:. ./.:4:18,82:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.66:1.000:. ./.:4:53,151:.: 0.19:1.000:. ./.:4:7,16:.:-3.01:1.000:. ./.:4:14,16:.:-2.88:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.08:1.000:. ./.:4:60,156:.: 0.40:1.000:. ./.:4:102,121:.: 0.52:1.000:. ./.:4:69,195:.: 1.24:1.000:. ./.:4:62,187:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.93:1.000:. ./.:4:59,223:.: 1.56:1.000:. ./.:4:51,202:.: 1.05:1.000:. ./.:4:7,8:.:-3.15:1.000:. ./.:4:148,116:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,257:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.22:1.000:. ./.:4:7,10:.:-3.11:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.94:1.000:. ./.:4:49,145:.: 0.01:1.000:. ./.:4:55,131:.:-0.13:1.000:. ./.:4:54,169:.: 0.52:1.000:. ./.:4:54,185:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,16:.:-2.97:1.000:. ./.:3:4,7:.:-3.22:1.000:. ./.:4:64,183:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.68:1.000:. ./.:4:50,202:.: 1.03:1.000:. ./.:4:106,127:.: 0.70:1.000:. ./.:4:53,171:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.10:1.000:. ./.:4:52,140:.:-0.03:1.000:. ./.:4:45,154:.: 0.10:1.000:. ./.:4:33,107:.:-0.94:1.000:. ./.:4:28,157:.:-0.15:1.000:. ./.:4:116,104:.: 0.47:1.000:. ./.:4:77,217:.: 1.77:1.000:. ./.:4:141,129:.: 1.35:1.000:. ./.:4:40,114:.:-0.70:1.000:. ./.:4:42,147:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,171:.: 0.63:1.000:. ./.:4:44,125:.:-0.43:1.000:. ./.:4:49,164:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.63:1.000:. ./.:4:50,139:.:-0.08:1.000:. ./.:4:48,130:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.82:1.000:. ./.:4:54,151:.: 0.20:1.000:. ./.:6:34,106:.:-0.94:1.000:. ./.:4:59,160:.: 0.45:1.000:. ./.:4:47,165:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,130:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,163:.: 0.50:1.000:. ./.:4:44,157:.: 0.13:1.000:. ./.:4:54,48:.:-1.61:1.000:. ./.:4:51,142:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,185:.:-0.13:0.777:. ./.:4:0,196:.: 0.04:1.000:. ./.:4:93,105:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,91:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.04:1.000:. ./.:4:71,177:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.06:1.000:. ./.:4:49,137:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.96:1.000:. ./.:4:53,153:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.40:1.000:. ./.:4:47,140:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,154:.:-0.68:0.608:. ./.:4:55,124:.:-0.26:1.000:. ./.:4:102,104:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,151:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,108:.:-0.18:1.000:. ./.:4:46,165:.: 0.31:1.000:. ./.:4:32,91:.:-1.24:1.000:. ./.:4:34,126:.:-0.59:1.000:. ./.:4:31,104:.:-1.03:1.000:. ./.:4:36,135:.:-0.40:1.000:. ./.:3:26,73:.:-1.67:0.999:. ./.:4:35,136:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.86:1.000:. ./.:4:54,129:.:-0.18:1.000:. ./.:4:46,136:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,136:.:-0.10:1.000:. ./.:4:35,109:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.10:1.000:. ./.:4:106,105:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,117:.:-1.00:1.000:. ./.:4:2,211:.: 0.34:1.000:. ./.:4:39,102:.:-0.93:1.000:. ./.:4:33,139:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.15:1.000:. ./.:4:40,142:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,112:.:-0.91:1.000:. ./.:4:69,195:.: 1.24:1.000:. ./.:4:74,178:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,134:.:-0.18:1.000:. ./.:4:66,230:.: 1.81:1.000:. ./.:4:41,126:.:-0.47:1.000:. ./.:4:94,112:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,108:.:-0.77:0.985:. ./.:4:54,143:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,116:.:-0.80:1.000:. ./.:4:78,74:.:-0.73:1.000:. ./.:4:35,130:.:-0.50:1.000:. ./.:4:44,122:.:-0.48:1.000:. ./.:4:51,150:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.06:1.000:. ./.:4:55,156:.: 0.31:1.000:. ./.:4:64,186:.: 1.00:1.000:. ./.:4:37,133:.:-0.41:1.000:. ./.:4:50,142:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.17:0.993:. ./.:4:0,140:.:-0.94:1.000:. ./.:4:42,121:.:-0.54:1.000:. ./.:4:30,117:.:-0.82:1.000:. ./.:4:31,130:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,171:.: 0.75:1.000:. ./.:4:29,90:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.03:1.000:. ./.:4:79,107:.:-0.13:1.000:. ./.:4:71,213:.: 1.60:1.000:. ./.:4:56,173:.: 0.63:1.000:. ./.:4:80,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,123:.:-0.61:1.000:. ./.:4:46,113:.:-0.61:1.000:. ./.:4:45,153:.: 0.08:1.000:. ./.:4:47,116:.:-0.54:1.000:. ./.:4:52,150:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,98:.:-1.17:1.000:. ./.:4:70,195:.: 1.26:1.000:. ./.:4:70,221:.: 1.72:1.000:. ./.:4:50,165:.: 0.38:1.000:. ./.:4:46,180:.: 0.57:1.000:. ./.:4:48,183:.: 0.66:1.000:. ./.:4:43,162:.: 0.20:1.000:. ./.:4:61,186:.: 0.94:1.000:. ./.:4:60,184:.: 0.89:1.000:. ./.:4:4,7:.:-3.22:1.000:. ./.:4:84,82:.:-0.48:1.000:. ./.:4:93,132:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,203:.: 1.17:1.000:. ./.:4:121,124:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.93:1.000:. ./.:4:59,170:.: 0.63:0.998:. ./.:4:61,178:.: 0.80:1.000:. ./.:4:52,141:.:-0.01:1.000:. ./.:4:50,157:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,154:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.68:1.000:. ./.:4:64,203:.: 1.30:1.000:. ./.:4:25,93:.:-1.33:1.000:. ./.:4:44,151:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.79:0.999:. ./.:4:120,108:.: 0.61:1.000:. ./.:4:43,145:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,148:.: 0.03:1.000:. ./.:4:36,112:.:-0.80:1.000:. ./.:4:50,177:.: 0.59:1.000:. ./.:4:51,184:.: 0.73:1.000:. ./.:4:30,131:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.31:1.000:. ./.:4:75,221:.: 1.81:1.000:. ./.:4:47,173:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,226:.: 1.88:1.000:. ./.:4:53,196:.: 0.98:1.000:. ./.:4:76,85:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.29:1.000:. -chr2.1 34925238 chr2.1_034925238 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:41,6:0.20: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,13:0.35: 0.24:1.000:0.803 0/1/1/1:4:13,33:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,20:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:27,30:0.53: 1.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:21,22:0.51: 0.17:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:30,15:0.38: 0.31:1.000:0.516 0/0/1/1:4:25,23:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,35:0.71: 0.77:1.000:0.990 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,24:0.46: 0.90:1.000:0.985 0/0/1/1:4:15,23:0.62:-0.16:1.000:0.533 0/1/1/1:4:13,31:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,22:0.65:-0.36:1.000:0.806 0/0/0/1:4:24,5:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,22:0.55:-0.02:1.000:0.975 0/0/1/1:4:20,21:0.51: 0.04:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.48:-0.89:1.000:0.995 0/1/1/1:4:21,38:0.67: 1.23:1.000:0.924 0/0/1/1:4:27,27:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:28,2:0.11:-0.69:1.000:0.659 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,30:0.60: 0.70:1.000:0.776 0/1/1/1:4:14,26:0.68:-0.02:1.000:0.948 0/0/1/1:4:19,17:0.48:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:45,3:0.10: 0.50:1.000:0.826 0/0/1/1:4:20,20:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,28:0.60: 0.50:1.000:0.826 0/0/0/1:4:21,2:0.14:-1.15:1.000:0.958 0/0/0/1:4:54,16:0.30: 1.96:1.000:0.985 0/0/1/1:4:21,17:0.46:-0.16:1.000:0.986 1/1/1:3:0,16:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,2:0.13:-1.02:1.000:0.872 0/0/1/1:4:14,18:0.57:-0.55:1.000:0.947 0/1/1/1:4:16,27:0.65: 0.17:1.000:0.799 0/0/1/1:4:39,20:0.38: 1.23:1.000:0.570 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,8:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,6:0.32:-1.08:1.000:0.963 0/1/1/1:4:14,28:0.70: 0.11:1.000:0.984 0/1/1/1:4:7,25:0.81:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,32:0.65: 0.70:1.000:0.794 0/1/1/1:4:22,44:0.70: 1.70:1.000:0.984 0/0/1/1:4:20,25:0.56: 0.31:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,103:1.00: 4.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,14:0.43:-0.42:1.000:0.952 0/0/0/1:4:22,5:0.27:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,24:0.47: 0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,21:0.52:-0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,44:0.75: 1.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,22:0.84:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,10:0.41:-0.95:1.000:0.880 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,4:0.29:-1.42:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:12,12:0.50:-1.08:1.000:0.888 0/0/1/1:4:18,21:0.54:-0.09:1.000:0.987 0/1/1/1:4:16,33:0.71: 0.57:1.000:0.990 0/1/1/1:4:15,48:0.80: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,42:0.60: 2.09:1.000:0.826 0/1/1/1:4:19,30:0.63: 0.57:1.000:0.581 0/0/0/1:4:41,4:0.14: 0.31:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.28:-1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,22:0.47: 0.44:0.777:0.993 0/0/0/1:4:33,13:0.34: 0.37:1.000:0.872 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.61:-0.55:1.000:0.708 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,34:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,9:0.26: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,18:0.62:-0.69:1.000:0.617 0/0/1/1:4:26,26:0.50: 0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,42:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,7:0.42:-1.48:1.000:0.896 0/0/0/1:4:39,16:0.35: 0.97:1.000:0.830 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.69:0.608:1.000 0/0/0/1:4:38,6:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,37:0.46: 2.76:1.000:0.988 0/1/1/1:4:11,19:0.66:-0.69:1.000:0.852 0/1/1/1:4:17,59:0.81: 2.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.21:-1.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,30:0.62: 0.64:1.000:0.617 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.04:1.000:1.000 1/1/1:3:0,45:1.00: 0.31:0.999:1.000 0/0/0/1:4:33,16:0.37: 0.57:1.000:0.549 0/0/1/1:4:20,17:0.47:-0.22:1.000:0.991 0/1/1/1:4:13,24:0.68:-0.22:1.000:0.943 0/0/0/1:4:52,13:0.28: 1.63:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,17:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,22:0.45: 0.64:1.000:0.982 0/0/1/1:4:17,26:0.62: 0.17:1.000:0.543 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.56:-0.89:1.000:0.965 0/0/1/1:4:12,9:0.44:-1.28:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,26:0.61: 0.24:1.000:0.744 0/1/1/1:4:14,22:0.63:-0.29:1.000:0.563 0/0/0/1:4:9,3:0.32:-1.88:1.000:0.963 0/0/0/1:4:12,4:0.32:-1.61:1.000:0.963 0/1/1/1:4:22,54:0.75: 2.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,49:0.74: 1.96:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,16:0.31: 1.63:1.000:0.968 0/1/1/1:4:19,47:0.75: 1.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,22:0.59:-0.16:1.000:0.862 0/1/1/1:4:11,28:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.50:-0.55:0.985:0.997 0/0/0/1:4:44,6:0.19: 0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,26:0.72:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,21:0.44: 0.64:1.000:0.964 0/0/0/1:4:40,18:0.36: 1.17:1.000:0.695 0/0/1/1:4:27,16:0.40: 0.17:1.000:0.822 0/0/0/1:4:19,4:0.26:-1.15:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,42:0.74: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,16:0.36: 0.70:1.000:0.666 0/0/1/1:4:17,15:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:26,2:0.11:-0.82:0.993:0.576 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,22:0.70:-0.49:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.46:-1.35:1.000:0.988 0/1/1/1:4:13,21:0.64:-0.42:1.000:0.665 0/0/0/1:4:24,5:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,7:0.39:-1.35:1.000:0.668 0/0/1/1:4:12,14:0.54:-0.95:1.000:0.987 0/1/1/1:4:16,29:0.67: 0.31:1.000:0.925 0/0/0/1:4:21,4:0.25:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,27:0.54: 0.64:1.000:0.986 0/0/0/1:4:8,3:0.33:-1.94:1.000:0.910 0/1/1/1:4:12,32:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.45:-1.02:1.000:0.982 0/0/0/1:4:27,6:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,20:0.45: 0.37:1.000:0.979 0/0/0/1:4:27,5:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,33:0.57: 1.23:1.000:0.956 0/1/1/1:4:22,46:0.71: 1.83:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,19:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,31:0.58: 0.90:1.000:0.895 0/1/1/1:4:15,28:0.68: 0.17:1.000:0.952 0/0/1/1:4:15,22:0.61:-0.22:1.000:0.696 0/0/1/1:4:26,24:0.48: 0.64:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,30:0.74: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,35:0.58: 1.37:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,19:0.43: 0.44:1.000:0.938 0/0/1/1:4:19,29:0.62: 0.50:1.000:0.551 0/1/1/1:4:9,19:0.71:-0.82:0.998:0.993 0/0/1/1:4:29,27:0.48: 1.03:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,16:0.42:-0.02:1.000:0.929 0/0/1/1:4:20,23:0.54: 0.17:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,16:0.39: 0.31:1.000:0.713 0/0/1/1:4:22,20:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,19:0.63:-0.62:1.000:0.592 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.11:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,17:0.46:-0.16:1.000:0.986 0/0/1/1:4:12,17:0.60:-0.75:1.000:0.797 0/1/1/1:4:22,38:0.66: 1.30:1.000:0.852 0/0/0/1:4:19,5:0.29:-1.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,30:0.59: 0.77:1.000:0.877 0/0/0/0:4:23,1:0.07:-1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,45:0.70: 1.76:1.000:0.989 0/1/1/1:4:17,32:0.68: 0.57:1.000:0.958 0/0/0/1:4:34,3:0.13:-0.22:1.000:0.892 0/0/0/1:4:34,4:0.17:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:28,2:0.11:-0.69:1.000:0.659 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,7:0.28:-0.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,28:0.70: 0.11:1.000:0.984 0/0/1/1:4:39,23:0.40: 1.43:1.000:0.816 -chr2.1 35124673 chr2.1_035124673 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:247,35:.: 0.77:1.000:. ./.:4:118,71:.:-0.70:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:156,97:.: 0.31:1.000:. ./.:4:299,44:.: 1.74:1.000:. ./.:4:162,29:.:-0.67:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:171,44:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,14:.:-2.60:1.000:. ./.:4:97,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:55,102:.:-1.21:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:121,72:.:-0.64:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:249,49:.: 1.03:1.000:. ./.:4:237,51:.: 0.87:1.000:. ./.:4:147,96:.: 0.16:1.000:. ./.:4:358,4:.: 2.04:1.000:. ./.:4:243,31:.: 0.65:1.000:. ./.:4:55,17:.:-2.55:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:234,46:.: 0.74:1.000:. ./.:4:198,35:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,21:.:-2.87:1.000:. ./.:4:244,33:.: 0.69:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:175,75:.: 0.27:1.000:. ./.:4:273,50:.: 1.42:1.000:. ./.:4:229,24:.: 0.31:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:202,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:63,21:.:-2.36:1.000:. ./.:3:25,5:.:-3.22:1.000:. ./.:4:175,73:.: 0.23:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:149,88:.: 0.06:1.000:. ./.:4:193,37:.:-0.05:1.000:. ./.:4:258,36:.: 0.96:1.000:. ./.:4:223,23:.: 0.20:1.000:. ./.:4:148,67:.:-0.29:1.000:. ./.:4:203,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:165,24:.:-0.70:1.000:. ./.:4:148,89:.: 0.06:1.000:. ./.:4:208,42:.: 0.27:1.000:. ./.:4:217,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:465,39:.: 4.29:1.000:. ./.:4:191,32:.:-0.16:1.000:. ./.:4:117,52:.:-1.02:1.000:. ./.:4:157,30:.:-0.73:1.000:. ./.:4:235,34:.: 0.57:1.000:. ./.:4:162,26:.:-0.72:1.000:. ./.:4:197,41:.: 0.08:1.000:. ./.:4:174,29:.:-0.48:1.000:. ./.:4:200,24:.:-0.15:1.000:. ./.:4:212,40:.: 0.30:1.000:. ./.:4:178,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:114,74:.:-0.72:1.000:. ./.:6:176,38:.:-0.30:1.000:. ./.:4:190,43:.: 0.00:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:240,33:.: 0.63:1.000:. ./.:4:165,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:239,39:.: 0.71:1.000:. ./.:4:185,39:.:-0.15:1.000:. ./.:4:184,34:.:-0.24:1.000:. ./.:4:167,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.65:0.777:. ./.:4:206,41:.: 0.22:1.000:. ./.:4:222,45:.: 0.54:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,124:.:-0.84:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:199,41:.: 0.11:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:190,35:.:-0.13:1.000:. ./.:4:209,40:.: 0.25:1.000:. ./.:4:131,89:.:-0.21:1.000:. ./.:4:218,44:.: 0.46:1.000:. ./.:4:100,63:.:-1.11:0.608:. ./.:4:190,38:.:-0.08:1.000:. ./.:4:226,38:.: 0.49:1.000:. ./.:4:221,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:214,37:.: 0.28:1.000:. ./.:4:220,42:.: 0.46:1.000:. ./.:4:96,61:.:-1.21:1.000:. ./.:4:150,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:169,41:.:-0.37:1.000:. ./.:4:186,35:.:-0.19:1.000:. ./.:3:193,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:238,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:138,28:.:-1.06:1.000:. ./.:4:184,34:.:-0.24:1.000:. ./.:4:217,42:.: 0.41:1.000:. ./.:4:158,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:187,26:.:-0.32:1.000:. ./.:4:177,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:214,38:.: 0.30:1.000:. ./.:4:148,26:.:-0.94:1.000:. ./.:4:114,77:.:-0.67:1.000:. ./.:4:182,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:119,72:.:-0.67:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:183,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:153,24:.:-0.89:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:196,41:.: 0.06:1.000:. ./.:4:170,31:.:-0.51:1.000:. ./.:4:447,0:.: 3.39:1.000:. ./.:4:157,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:217,36:.: 0.31:1.000:. ./.:4:92,43:.:-1.56:0.985:. ./.:4:185,38:.:-0.16:1.000:. ./.:4:148,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:167,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:147,34:.:-0.83:1.000:. ./.:4:190,40:.:-0.05:1.000:. ./.:4:160,41:.:-0.51:1.000:. ./.:4:208,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:240,48:.: 0.87:1.000:. ./.:4:171,29:.:-0.53:1.000:. ./.:4:191,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:187,29:.:-0.27:0.993:. ./.:4:46,108:.:-1.25:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:157,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:109,61:.:-1.00:1.000:. ./.:4:250,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:140,23:.:-1.11:1.000:. ./.:4:205,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:137,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:258,45:.: 1.11:1.000:. ./.:4:206,28:.: 0.01:1.000:. ./.:4:188,33:.:-0.19:1.000:. ./.:4:153,45:.:-0.56:1.000:. ./.:4:155,36:.:-0.67:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:107,84:.:-0.67:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:175,25:.:-0.53:1.000:. ./.:4:169,115:.: 0.80:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:139,99:.: 0.08:1.000:. ./.:4:224,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:215,40:.: 0.35:1.000:. ./.:4:185,30:.:-0.29:1.000:. ./.:4:363,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:216,32:.: 0.23:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:239,41:.: 0.74:1.000:. ./.:4:224,32:.: 0.36:1.000:. ./.:4:250,38:.: 0.87:1.000:. ./.:4:303,2:.: 1.14:1.000:. ./.:4:106,85:.:-0.67:0.998:. ./.:4:217,34:.: 0.28:1.000:. ./.:4:166,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:172,27:.:-0.54:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:192,49:.: 0.12:1.000:. ./.:4:271,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:232,48:.: 0.74:1.000:. ./.:4:122,89:.:-0.35:1.000:. ./.:4:80,138:.:-0.24:0.999:. ./.:4:203,35:.: 0.08:1.000:. ./.:4:181,28:.:-0.38:1.000:. ./.:4:183,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:181,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:118,73:.:-0.67:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:165,37:.:-0.49:1.000:. ./.:4:401,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:247,51:.: 1.03:1.000:. ./.:4:233,35:.: 0.55:1.000:. ./.:4:187,61:.: 0.23:1.000:. ./.:4:153,93:.: 0.20:1.000:. ./.:4:262,58:.: 1.37:1.000:. ./.:4:268,37:.: 1.14:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:123,66:.:-0.70:1.000:. -chr2.1 35207815 chr2.1_035207815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:545,635:.: 0.71:1.000:. ./.:4:521,381:.:-0.55:1.000:. ./.:4:580,502:.: 0.27:1.000:. ./.:4:626,561:.: 0.74:1.000:. ./.:4:618,716:.: 1.40:1.000:. ./.:4:636,547:.: 0.72:1.000:. ./.:4:423,283:.:-1.43:1.000:. ./.:4:591,542:.: 0.50:1.000:. ./.:4:435,508:.:-0.36:1.000:. ./.:4:255,263:.:-2.28:1.000:. ./.:4:328,243:.:-2.05:1.000:. ./.:4:446,376:.:-0.91:1.000:. ./.:4:576,530:.: 0.37:1.000:. ./.:4:505,493:.:-0.11:1.000:. ./.:4:611,385:.:-0.12:1.000:. ./.:4:498,410:.:-0.52:1.000:. ./.:4:510,457:.:-0.25:1.000:. ./.:4:627,442:.: 0.21:1.000:. ./.:4:842,624:.: 2.00:1.000:. ./.:4:724,507:.: 0.94:1.000:. ./.:4:342,203:.:-2.16:1.000:. ./.:4:584,399:.:-0.18:1.000:. ./.:4:724,710:.: 1.86:1.000:. ./.:4:465,519:.:-0.18:1.000:. ./.:4:328,174:.:-2.36:1.000:. ./.:4:684,534:.: 0.88:1.000:. ./.:4:570,501:.: 0.22:1.000:. ./.:4:433,480:.:-0.50:1.000:. ./.:4:620,642:.: 1.08:1.000:. ./.:4:549,575:.: 0.46:1.000:. ./.:4:647,447:.: 0.32:1.000:. ./.:4:403,416:.:-0.92:1.000:. ./.:4:129,40:.:-3.86:1.000:. ./.:4:303,257:.:-2.09:1.000:. ./.:3:144,86:.:-3.59:1.000:. ./.:4:508,391:.:-0.56:1.000:. ./.:4:571,584:.: 0.60:1.000:. ./.:4:569,488:.: 0.15:1.000:. ./.:4:557,450:.:-0.07:1.000:. ./.:4:698,632:.: 1.39:1.000:. ./.:4:462,526:.:-0.16:1.000:. ./.:4:432,519:.:-0.33:1.000:. ./.:4:674,527:.: 0.80:1.000:. ./.:4:588,560:.: 0.56:1.000:. ./.:4:592,501:.: 0.31:1.000:. ./.:4:598,450:.: 0.11:1.000:. ./.:4:538,491:.: 0.03:1.000:. ./.:4:334,124:.:-2.56:1.000:. ./.:4:519,389:.:-0.52:1.000:. ./.:4:449,326:.:-1.12:1.000:. ./.:4:423,497:.:-0.47:1.000:. ./.:4:573,679:.: 1.03:1.000:. ./.:4:451,395:.:-0.80:1.000:. ./.:4:668,578:.: 1.01:1.000:. ./.:4:605,536:.: 0.53:1.000:. ./.:4:499,430:.:-0.43:1.000:. ./.:4:530,486:.:-0.03:1.000:. ./.:4:636,535:.: 0.67:1.000:. ./.:4:476,396:.:-0.68:1.000:. ./.:6:552,498:.: 0.12:1.000:. ./.:4:660,529:.: 0.75:1.000:. ./.:4:509,387:.:-0.58:1.000:. ./.:4:776,543:.: 1.34:1.000:. ./.:4:610,437:.: 0.11:1.000:. ./.:4:671,662:.: 1.40:1.000:. ./.:4:479,630:.: 0.39:1.000:. ./.:4:574,434:.:-0.07:1.000:. ./.:4:506,542:.: 0.11:1.000:. ./.:4:640,529:.: 0.66:0.777:. ./.:4:530,410:.:-0.38:1.000:. ./.:4:757,523:.: 1.16:1.000:. ./.:4:570,378:.:-0.34:1.000:. ./.:4:508,431:.:-0.38:1.000:. ./.:4:627,475:.: 0.36:1.000:. ./.:4:627,383:.:-0.06:1.000:. ./.:4:489,358:.:-0.80:1.000:. ./.:4:552,465:.:-0.03:1.000:. ./.:4:659,619:.: 1.15:1.000:. ./.:4:567,619:.: 0.74:1.000:. ./.:4:564,603:.: 0.65:1.000:. ./.:4:587,358:.:-0.35:0.608:. ./.:4:563,470:.: 0.04:1.000:. ./.:4:537,514:.: 0.13:1.000:. ./.:4:587,422:.:-0.06:1.000:. ./.:4:682,378:.: 0.17:1.000:. ./.:4:700,660:.: 1.52:1.000:. ./.:4:386,348:.:-1.31:1.000:. ./.:4:520,357:.:-0.66:1.000:. ./.:4:463,577:.: 0.08:1.000:. ./.:4:539,407:.:-0.35:1.000:. ./.:3:402,420:.:-0.91:0.999:. ./.:4:515,409:.:-0.45:1.000:. ./.:4:613,585:.: 0.79:1.000:. ./.:4:480,426:.:-0.53:1.000:. ./.:4:636,651:.: 1.19:1.000:. ./.:4:750,613:.: 1.54:1.000:. ./.:4:408,380:.:-1.06:1.000:. ./.:4:562,330:.:-0.59:1.000:. ./.:4:644,589:.: 0.95:1.000:. ./.:4:654,578:.: 0.94:1.000:. ./.:4:453,370:.:-0.91:1.000:. ./.:4:507,581:.: 0.29:1.000:. ./.:4:461,438:.:-0.56:1.000:. ./.:4:514,597:.: 0.40:1.000:. ./.:4:521,499:.:-0.02:1.000:. ./.:4:439,404:.:-0.82:1.000:. ./.:4:469,496:.:-0.26:1.000:. ./.:4:630,592:.: 0.90:1.000:. ./.:4:814,748:.: 2.44:1.000:. ./.:4:626,566:.: 0.76:1.000:. ./.:4:473,606:.: 0.25:1.000:. ./.:4:773,660:.: 1.85:1.000:. ./.:4:496,501:.:-0.12:1.000:. ./.:4:654,469:.: 0.45:1.000:. ./.:4:354,301:.:-1.67:0.985:. ./.:4:501,669:.: 0.66:1.000:. ./.:4:580,431:.:-0.06:1.000:. ./.:4:590,397:.:-0.16:1.000:. ./.:4:460,470:.:-0.42:1.000:. ./.:4:448,438:.:-0.62:1.000:. ./.:4:518,616:.: 0.50:1.000:. ./.:4:467,560:.: 0.02:1.000:. ./.:4:676,595:.: 1.12:1.000:. ./.:4:569,528:.: 0.33:1.000:. ./.:4:504,537:.: 0.08:1.000:. ./.:4:641,504:.: 0.55:1.000:. ./.:4:466,633:.: 0.34:0.993:. ./.:4:385,300:.:-1.53:1.000:. ./.:4:454,383:.:-0.84:1.000:. ./.:4:481,325:.:-0.98:1.000:. ./.:4:420,389:.:-0.97:1.000:. ./.:4:654,524:.: 0.70:1.000:. ./.:4:340,367:.:-1.43:1.000:. ./.:4:498,542:.: 0.08:1.000:. ./.:4:411,388:.:-1.01:1.000:. ./.:4:682,624:.: 1.28:1.000:. ./.:4:518,572:.: 0.30:1.000:. ./.:4:554,430:.:-0.18:1.000:. ./.:4:398,376:.:-1.13:1.000:. ./.:4:570,479:.: 0.12:1.000:. ./.:4:668,566:.: 0.95:1.000:. ./.:4:443,574:.:-0.03:1.000:. ./.:4:569,506:.: 0.23:1.000:. ./.:4:437,410:.:-0.80:1.000:. ./.:4:588,673:.: 1.07:1.000:. ./.:4:849,739:.: 2.55:1.000:. ./.:4:569,440:.:-0.06:1.000:. ./.:4:534,565:.: 0.34:1.000:. ./.:4:573,661:.: 0.95:1.000:. ./.:4:411,436:.:-0.80:1.000:. ./.:4:733,678:.: 1.75:1.000:. ./.:4:562,411:.:-0.23:1.000:. ./.:4:281,167:.:-2.60:1.000:. ./.:4:420,307:.:-1.34:1.000:. ./.:4:640,433:.: 0.22:1.000:. ./.:4:646,510:.: 0.60:1.000:. ./.:4:578,559:.: 0.51:1.000:. ./.:4:731,637:.: 1.56:1.000:. ./.:4:395,485:.:-0.65:0.998:. ./.:4:545,618:.: 0.63:1.000:. ./.:4:567,487:.: 0.14:1.000:. ./.:4:376,354:.:-1.33:1.000:. ./.:4:603,508:.: 0.40:1.000:. ./.:4:662,557:.: 0.88:1.000:. ./.:4:445,509:.:-0.31:1.000:. ./.:4:478,505:.:-0.18:1.000:. ./.:4:452,407:.:-0.74:1.000:. ./.:4:531,471:.:-0.10:0.999:. ./.:4:547,430:.:-0.21:1.000:. ./.:4:561,532:.: 0.31:1.000:. ./.:4:506,365:.:-0.69:1.000:. ./.:4:450,331:.:-1.10:1.000:. ./.:4:568,443:.:-0.06:1.000:. ./.:4:419,417:.:-0.85:1.000:. ./.:4:584,409:.:-0.14:1.000:. ./.:4:357,442:.:-1.01:1.000:. ./.:4:718,627:.: 1.45:1.000:. ./.:4:765,644:.: 1.74:1.000:. ./.:4:474,545:.:-0.02:1.000:. ./.:4:442,483:.:-0.44:1.000:. ./.:4:549,593:.: 0.54:1.000:. ./.:4:774,496:.: 1.12:1.000:. ./.:4:620,670:.: 1.21:1.000:. ./.:4:565,371:.:-0.39:1.000:. ./.:4:601,457:.: 0.16:1.000:. -chr2.1 35313781 chr2.1_035313781 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1232,249:.: 1.67:1.000:. ./.:4:1099,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:747,205:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1141,269:.: 1.39:1.000:. ./.:4:1192,255:.: 1.54:1.000:. ./.:4:845,250:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1185,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:728,213:.:-0.46:1.000:. ./.:4:777,198:.:-0.33:1.000:. ./.:4:193,49:.:-3.22:1.000:. ./.:4:666,107:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1125,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:897,218:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1133,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1133,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:987,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1238,0:.: 0.71:0.998:. ./.:4:1205,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1223,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1133,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:421,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:1142,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1160,296:.: 1.58:1.000:. ./.:4:888,215:.: 0.18:1.000:. ./.:4:274,60:.:-2.86:1.000:. ./.:4:974,269:.: 0.73:1.000:. ./.:4:991,235:.: 0.67:1.000:. ./.:4:930,241:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1207,277:.: 1.69:1.000:. ./.:4:859,223:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1210,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:677,163:.:-0.86:1.000:. ./.:4:191,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:481,0:.:-2.28:1.000:. ./.:3:327,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:1098,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:932,214:.: 0.35:1.000:. ./.:4:977,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1149,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:957,236:.: 0.54:1.000:. ./.:4:783,215:.:-0.23:1.000:. ./.:4:768,236:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1446,4:.: 1.55:1.000:. ./.:4:671,204:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1190,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1154,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1186,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:2336,1:.: 5.06:1.000:. ./.:4:847,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1289,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:770,182:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1061,271:.: 1.09:1.000:. ./.:4:1013,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:827,261:.: 0.12:1.000:. ./.:4:646,223:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1084,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:789,186:.:-0.33:1.000:. ./.:4:999,273:.: 0.85:1.000:. ./.:4:827,0:.:-0.91:1.000:. ./.:6:642,204:.:-0.84:1.000:. ./.:4:930,249:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1085,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1238,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1176,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:743,254:.:-0.24:1.000:. ./.:4:912,204:.: 0.23:1.000:. ./.:4:915,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:882,206:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1070,273:.: 1.13:0.777:. ./.:4:1032,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1245,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:956,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1371,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1267,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1188,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1040,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:782,220:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1007,244:.: 0.76:1.000:. ./.:4:644,172:.:-0.95:1.000:. ./.:4:934,241:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1132,1:.: 0.30:0.608:. ./.:4:1207,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1197,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:873,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1136,3:.: 0.32:1.000:. ./.:4:793,242:.:-0.09:1.000:. ./.:4:712,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:1077,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:737,228:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1082,2:.: 0.11:1.000:. ./.:3:483,206:.:-1.46:0.999:. ./.:4:1184,3:.: 0.51:1.000:. ./.:4:959,224:.: 0.50:1.000:. ./.:4:826,158:.:-0.29:1.000:. ./.:4:974,239:.: 0.61:1.000:. ./.:4:942,225:.: 0.43:1.000:. ./.:4:904,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1090,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1078,258:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1300,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1162,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1147,243:.: 1.31:1.000:. ./.:4:713,180:.:-0.65:1.000:. ./.:4:861,242:.: 0.18:1.000:. ./.:4:787,199:.:-0.28:1.000:. ./.:4:730,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:619,183:.:-1.01:1.000:. ./.:4:890,216:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1077,293:.: 1.24:1.000:. ./.:4:757,177:.:-0.49:1.000:. ./.:4:735,226:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1060,269:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1103,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1093,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:903,0:.:-0.61:0.985:. ./.:4:1066,274:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1009,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1283,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:946,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1020,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1020,250:.: 0.84:1.000:. ./.:4:812,247:.: 0.01:1.000:. ./.:4:875,249:.: 0.26:1.000:. ./.:4:733,207:.:-0.46:1.000:. ./.:4:772,205:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1181,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:954,263:.: 0.63:0.993:. ./.:4:946,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:699,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:924,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:978,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:738,191:.:-0.51:1.000:. ./.:4:606,166:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1045,284:.: 1.07:1.000:. ./.:4:891,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1407,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:827,236:.: 0.02:1.000:. ./.:4:961,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:946,193:.: 0.32:1.000:. ./.:4:697,208:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1039,233:.: 0.85:1.000:. ./.:4:996,226:.: 0.65:1.000:. ./.:4:669,200:.:-0.74:1.000:. ./.:4:788,178:.:-0.36:1.000:. ./.:4:886,308:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1486,333:.: 3.01:1.000:. ./.:4:911,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:932,226:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1051,260:.: 1.00:1.000:. ./.:4:1024,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:814,258:.: 0.06:1.000:. ./.:4:964,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:410,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:702,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:1150,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:912,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1138,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:786,266:.:-0.02:1.000:. ./.:4:610,198:.:-0.99:0.998:. ./.:4:1069,258:.: 1.07:1.000:. ./.:4:671,176:.:-0.83:1.000:. ./.:4:749,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:862,216:.: 0.08:1.000:. ./.:4:967,261:.: 0.67:1.000:. ./.:4:736,212:.:-0.43:1.000:. ./.:4:626,213:.:-0.86:1.000:. ./.:4:753,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:1080,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:962,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:653,199:.:-0.81:1.000:. ./.:4:804,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:682,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:1269,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:799,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1007,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:562,148:.:-1.37:1.000:. ./.:4:1044,239:.: 0.89:1.000:. ./.:4:971,220:.: 0.53:1.000:. ./.:4:828,219:.:-0.04:1.000:. ./.:4:676,154:.:-0.90:1.000:. ./.:4:787,281:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1110,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:941,289:.: 0.68:1.000:. ./.:4:734,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:1297,1:.: 0.95:1.000:. -chr2.1 35506130 chr2.1_035506130 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,27:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.85:0.998:. ./.:4:0,26:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,33:.: 2.25:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,25:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,25:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.24:1.000:. ./.:3:0,3:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,40:.: 3.24:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,25:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:6:0,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:0.777:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.84:0.608:. ./.:4:0,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.71:1.000:. ./.:3:0,10:.:-0.98:0.999:. ./.:4:0,21:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,29:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.40:0.985:. ./.:4:0,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.12:0.993:. ./.:4:0,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,25:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:0.998:. ./.:4:0,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,32:.: 2.11:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.57:0.999:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,25:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,27:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.99:1.000:. -chr2.1 35577872 chr2.1_035577872 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:204,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:168,29:.: 0.51:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:113,21:.:-0.78:1.000:. ./.:4:146,33:.: 0.14:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:147,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:193,28:.: 1.00:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:142,34:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,43:.: 0.35:0.998:. ./.:4:225,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:200,33:.: 1.25:1.000:. ./.:4:248,33:.: 2.23:1.000:. ./.:4:83,1:.:-1.80:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:138,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:132,34:.:-0.12:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:151,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:169,31:.: 0.57:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:309,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:138,27:.:-0.14:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.17:1.000:. ./.:3:25,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:169,21:.: 0.37:1.000:. ./.:4:136,29:.:-0.14:1.000:. ./.:4:184,26:.: 0.78:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:132,19:.:-0.43:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:132,31:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:175,21:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:128,15:.:-0.59:1.000:. ./.:4:108,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:117,19:.:-0.74:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:101,25:.:-0.94:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:154,19:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,24:.:-0.84:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,26:.:-0.39:1.000:. ./.:4:122,27:.:-0.47:1.000:. ./.:6:169,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:94,27:.:-1.04:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:162,26:.: 0.33:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:105,16:.:-1.04:0.777:. ./.:4:144,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:79,12:.:-1.66:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,35:.:-0.16:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:98,18:.:-1.14:1.000:. ./.:4:103,11:.:-1.19:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:145,12:.:-0.31:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.08:0.608:. ./.:4:114,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:124,27:.:-0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:91,16:.:-1.33:1.000:. ./.:4:139,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:124,23:.:-0.51:1.000:. ./.:3:104,0:.:-1.39:0.999:. ./.:4:124,22:.:-0.53:1.000:. ./.:4:121,26:.:-0.51:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,18:.:-1.41:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:152,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:225,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:77,14:.:-1.66:1.000:. ./.:4:144,22:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:91,19:.:-1.27:1.000:. ./.:4:105,20:.:-0.96:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:153,29:.: 0.20:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:134,31:.:-0.14:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:101,20:.:-1.04:0.985:. ./.:4:177,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,25:.:-1.35:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:111,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:105,14:.:-1.08:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:86,14:.:-1.47:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:286,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:116,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:128,16:.:-0.57:0.993:. ./.:4:141,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:93,12:.:-1.37:1.000:. ./.:4:127,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:121,24:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:88,15:.:-1.41:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,46:.: 1.57:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:209,25:.: 1.27:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:128,19:.:-0.51:1.000:. ./.:4:274,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:201,25:.: 1.10:1.000:. ./.:4:46,5:.:-2.47:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:171,25:.: 0.49:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:188,40:.: 1.14:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.35:0.998:. ./.:4:204,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:107,16:.:-1.00:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:167,31:.: 0.53:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:179,20:.: 0.55:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.10:0.999:. ./.:4:209,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:170,27:.: 0.51:1.000:. ./.:4:128,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:143,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:171,19:.: 0.37:1.000:. ./.:4:112,20:.:-0.82:1.000:. ./.:4:147,20:.:-0.10:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:127,30:.:-0.31:1.000:. ./.:4:182,18:.: 0.57:1.000:. ./.:4:206,24:.: 1.18:1.000:. ./.:4:232,36:.: 1.96:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.65:1.000:. -chr2.1 35829358 chr2.1_035829358 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:585,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:567,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:657,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:705,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:230,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:245,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:504,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:520,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:607,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:590,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:628,1:.: 0.96:0.998:. ./.:4:601,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:715,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:692,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:288,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:609,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:626,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:188,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:633,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:503,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:672,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:619,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:602,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:246,1:.:-2.37:1.000:. ./.:3:86,0:.:-3.78:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:587,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:256,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:673,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:560,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:530,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:508,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:546,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.70:1.000:. ./.:6:448,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:482,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:473,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:626,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:476,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.04:0.777:. ./.:4:487,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:614,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:489,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:633,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:575,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:456,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:487,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:399,0:.:-1.04:0.608:. ./.:4:470,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:613,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:637,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:614,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:363,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.50:1.000:. ./.:3:399,0:.:-1.04:0.999:. ./.:4:425,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:391,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:650,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:596,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:398,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:464,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:398,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:490,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:741,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:723,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:516,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:337,2:.:-1.57:0.985:. ./.:4:599,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:514,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:507,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:484,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:499,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:557,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.06:0.993:. ./.:4:430,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:329,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:441,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:577,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:387,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:730,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:502,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:564,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:390,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:714,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:730,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:467,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:693,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:481,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:683,2:.: 1.45:1.000:. ./.:4:537,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:221,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:705,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:654,2:.: 1.20:1.000:. ./.:4:727,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:680,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.11:0.998:. ./.:4:610,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:577,3:.: 0.54:1.000:. ./.:4:646,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.20:0.999:. ./.:4:527,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:510,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:381,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:721,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:639,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:654,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:737,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:748,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:509,1:.:-0.07:1.000:. -chr2.1 35889815 chr2.1_035889815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:165,50:.: 0.72:1.000:. ./.:4:132,40:.: 0.03:1.000:. ./.:4:107,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:154,45:.: 0.46:1.000:. ./.:4:318,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:146,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:208,51:.: 1.43:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:11,8:.:-2.43:1.000:. ./.:4:179,43:.: 0.83:1.000:. ./.:4:124,46:.: 0.00:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:82,48:.:-0.64:1.000:. ./.:4:224,46:.: 1.60:1.000:. ./.:4:158,46:.: 0.54:0.998:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:73,30:.:-1.08:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:203,41:.: 1.19:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:128,50:.: 0.13:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:172,33:.: 0.56:1.000:. ./.:4:210,66:.: 1.70:1.000:. ./.:4:140,63:.: 0.53:1.000:. ./.:4:155,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:9,3:.:-2.54:1.000:. ./.:4:37,5:.:-2.06:1.000:. ./.:3:11,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:123,50:.: 0.05:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:118,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:184,34:.: 0.77:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:228,53:.: 1.78:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:175,26:.: 0.50:1.000:. ./.:4:253,54:.: 2.20:1.000:. ./.:4:144,37:.: 0.18:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:124,35:.:-0.18:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.03:1.000:. ./.:6:78,9:.:-1.33:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:121,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:118,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:129,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:124,35:.:-0.18:0.777:. ./.:4:69,63:.:-0.61:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:55,28:.:-1.40:1.000:. ./.:4:153,44:.: 0.43:1.000:. ./.:4:143,41:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,63:.:-0.84:1.000:. ./.:4:44,46:.:-1.29:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:190,35:.: 0.88:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.43:0.608:. ./.:4:126,48:.: 0.06:1.000:. ./.:4:139,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:69,39:.:-1.00:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:144,24:.:-0.03:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.74:1.000:. ./.:3:91,0:.:-1.27:0.999:. ./.:4:79,37:.:-0.87:1.000:. ./.:4:130,33:.:-0.11:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:136,29:.:-0.08:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:134,29:.:-0.11:1.000:. ./.:4:40,39:.:-1.46:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:130,25:.:-0.24:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:94,26:.:-0.80:1.000:. ./.:4:107,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:104,25:.:-0.66:1.000:. ./.:4:141,32:.: 0.05:1.000:. ./.:4:169,49:.: 0.77:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:165,31:.: 0.42:1.000:. ./.:4:149,49:.: 0.45:1.000:. ./.:4:177,29:.: 0.58:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.05:0.985:. ./.:4:149,39:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:52,42:.:-1.22:1.000:. ./.:4:160,32:.: 0.35:1.000:. ./.:4:161,39:.: 0.48:1.000:. ./.:4:170,48:.: 0.77:1.000:. ./.:4:148,31:.: 0.14:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:162,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:170,33:.: 0.53:0.993:. ./.:4:122,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:88,21:.:-0.98:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:74,37:.:-0.95:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:178,27:.: 0.56:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:241,62:.: 2.13:1.000:. ./.:4:116,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:98,33:.:-0.63:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:59,28:.:-1.33:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:64,29:.:-1.24:1.000:. ./.:4:79,23:.:-1.09:1.000:. ./.:4:340,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:179,55:.: 1.03:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:204,43:.: 1.23:1.000:. ./.:4:135,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:118,38:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:17,8:.:-2.33:1.000:. ./.:4:82,39:.:-0.79:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:152,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:155,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.91:0.998:. ./.:4:240,58:.: 2.05:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:183,39:.: 0.83:1.000:. ./.:4:59,44:.:-1.08:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:204,55:.: 1.43:1.000:. ./.:4:220,55:.: 1.68:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:208,45:.: 1.33:0.999:. ./.:4:158,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:134,39:.: 0.05:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:105,32:.:-0.53:1.000:. ./.:4:160,39:.: 0.46:1.000:. ./.:4:136,72:.: 0.61:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:226,49:.: 1.68:1.000:. ./.:4:191,57:.: 1.25:1.000:. ./.:4:295,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:181,56:.: 1.07:1.000:. ./.:4:61,40:.:-1.11:1.000:. ./.:4:128,33:.:-0.15:1.000:. -chr2.1 36100298 chr2.1_036100298 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:103,57:0.33: 0.44:1.000:0.939 0/0/0/1:4:52,30:0.34:-1.33:1.000:0.891 0/0/0/1:4:89,54:0.35: 0.06:1.000:0.792 0/0/0/1:4:65,42:0.37:-0.76:1.000:0.596 0/0/1/1:4:88,114:0.55: 1.39:1.000:0.976 0/0/0/1:4:74,45:0.35:-0.49:1.000:0.786 0/1/1/1:4:28,80:0.71:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,47:0.31:-0.10:1.000:0.969 0/0/1/1:4:64,69:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-2.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,38:0.21: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,43:0.36:-0.67:1.000:0.671 0/1/1/1:4:38,144:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,38:0.32:-0.76:1.000:0.943 0/0/1/1:4:72,83:0.53: 0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:136,56:0.25: 1.16:0.998:0.999 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,49:0.33:-0.13:1.000:0.908 0/0/0/1:4:78,36:0.28:-0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,18:0.70:-2.62:1.000:0.980 0/0/0/1:4:91,38:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,97:0.70:-0.15:1.000:0.984 0/0/0/1:4:85,36:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,115:0.68: 0.51:1.000:0.959 0/0/0/1:4:78,46:0.34:-0.37:1.000:0.854 0/0/1/1:4:59,73:0.54:-0.19:1.000:0.986 0/0/0/1:4:148,71:0.29: 1.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:99,33:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,110:0.68: 0.35:1.000:0.958 0/0/0/1:4:94,39:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,11:0.67:-2.82:1.000:0.901 0/0/0/1:4:25,8:0.21:-2.43:1.000:1.000 1/1/1:3:0,6:1.00:-3.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,77:0.53: 0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,75:0.46: 0.42:1.000:0.988 0/1/1/1:4:38,138:0.75: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,91:0.48: 1.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,88:0.47: 0.94:1.000:0.993 0/0/0/1:4:131,54:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,98:0.66: 0.08:1.000:0.864 0/0/1/1:4:65,56:0.45:-0.44:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,149:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,111:0.70: 0.30:1.000:0.981 0/0/1/1:4:89,145:0.60: 2.11:1.000:0.757 0/0/1/1:4:41,30:0.40:-1.57:1.000:0.812 0/0/1/1:4:62,46:0.41:-0.74:1.000:0.841 0/0/1/1:4:88,108:0.54: 1.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:89,50:0.33:-0.04:1.000:0.924 0/0/0/1:4:156,61:0.24: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,95:0.47: 1.32:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,126:0.73: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,87:0.65:-0.26:1.000:0.824 0/0/0/1:4:180,60:0.21: 2.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,54:0.35: 0.06:1.000:0.792 0/0/1/1:4:80,108:0.56: 1.07:1.000:0.963 0/0/0/0/0/1:6:80,26:0.21:-0.78:1.000:0.878 0/0/1/1:4:78,58:0.41:-0.10:1.000:0.846 0/1/1/1:4:40,112:0.71: 0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:41,108:0.70: 0.19:1.000:0.985 1/1/1/1:4:4,156:0.97: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,62:0.39: 0.21:1.000:0.711 0/0/0/1:4:143,54:0.23: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,48:0.33:-0.17:1.000:0.918 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,61:0.36: 0.39:0.777:0.689 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,70:0.39: 0.67:1.000:0.691 0/0/0/1:4:76,46:0.35:-0.42:1.000:0.798 0/0/0/1:4:149,53:0.22: 1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,92:0.68:-0.24:1.000:0.963 0/0/0/1:4:90,58:0.37: 0.17:1.000:0.605 0/0/0/1:4:72,46:0.36:-0.51:1.000:0.636 0/1/1/1:4:37,97:0.70:-0.15:1.000:0.984 0/0/1/1:4:75,53:0.39:-0.28:1.000:0.720 0/0/1/1:4:105,105:0.49: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,146:0.61: 2.07:1.000:0.663 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.73:0.608:1.000 0/0/1/1:4:92,114:0.54: 1.48:1.000:0.985 0/0/1/1:4:87,104:0.54: 1.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:61,31:0.30:-1.10:1.000:0.983 0/1/1/1:4:42,108:0.70: 0.21:1.000:0.980 0/0/0/1:4:93,59:0.36: 0.26:1.000:0.660 0/0/1/1:4:59,98:0.61: 0.37:1.000:0.715 0/1/1/1:4:21,49:0.68:-1.60:1.000:0.945 0/0/0/1:4:120,49:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,96:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/1/1:3:41,56:0.57:-0.99:0.999:0.987 0/0/1/1:4:71,59:0.44:-0.24:1.000:0.966 0/0/0/1:4:96,62:0.37: 0.39:1.000:0.598 0/0/0/1:4:70,32:0.28:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,129:0.53: 2.23:1.000:0.992 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,106:0.60: 0.73:1.000:0.813 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,101:0.68: 0.06:1.000:0.960 0/0/0/1:4:90,54:0.35: 0.08:1.000:0.818 0/0/1/1:4:73,74:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,73:0.46: 0.35:1.000:0.985 0/0/1/1:4:55,44:0.43:-0.94:1.000:0.942 0/0/1/1:4:80,84:0.51: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,46:0.39:-0.67:1.000:0.725 0/0/0/1:4:118,60:0.30: 0.85:1.000:0.983 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,54:0.40:-0.26:1.000:0.773 0/0/0/1:4:99,55:0.33: 0.30:1.000:0.935 0/0/1/1:4:74,50:0.38:-0.37:1.000:0.569 0/0/1/1:4:71,96:0.56: 0.60:1.000:0.962 0/0/0/1:4:84,45:0.32:-0.26:1.000:0.962 0/0/1/1:4:91,79:0.45: 0.67:1.000:0.982 0/1/1/1:4:50,111:0.67: 0.46:1.000:0.909 0/1/1/1:4:39,135:0.75: 0.76:0.985:0.999 0/0/0/1:4:126,61:0.29: 1.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:62,28:0.27:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,49:0.42:-0.67:1.000:0.931 0/1/1/1:4:47,134:0.71: 0.92:1.000:0.993 0/1/1/1:4:35,138:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,45:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,36:0.22: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,75:0.70:-0.83:1.000:0.982 0/0/1/1:4:70,103:0.58: 0.73:1.000:0.908 0/1/1/1:4:41,100:0.69: 0.01:1.000:0.966 0/0/1/1:4:96,110:0.53: 1.48:0.993:0.994 0/0/1/1:4:85,80:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,67:0.70:-1.08:1.000:0.981 0/0/0/1:4:67,31:0.28:-0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,149:0.81: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,29:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,43:0.30:-0.28:1.000:0.984 0/0/1/1:4:76,88:0.53: 0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,119:0.55: 1.66:1.000:0.984 0/0/0/1:4:139,49:0.22: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,87:0.69:-0.44:1.000:0.979 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,50:0.36:-0.26:1.000:0.668 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,41:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,30:0.21:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,117:0.52: 1.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,59:0.37: 0.24:1.000:0.623 0/1/1/1:4:37,147:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,88:0.72:-0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:127,75:0.34: 1.39:1.000:0.851 0/0/1/1:4:85,106:0.54: 1.14:1.000:0.984 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,41:0.34:-0.69:1.000:0.839 0/0/1/1:4:16,12:0.41:-2.55:1.000:0.861 0/0/0/1:4:59,33:0.33:-1.10:1.000:0.929 0/1/1/1:4:51,115:0.67: 0.58:1.000:0.923 0/0/0/1:4:117,54:0.28: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,42:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,36:0.29:-0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:81,61:0.41: 0.03:0.998:0.869 0/0/1/1:4:77,101:0.56: 0.85:1.000:0.973 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,107:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,57:0.41:-0.17:1.000:0.861 0/0/1/1:4:116,137:0.53: 2.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:116,32:0.19: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,122:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,42:0.28:-0.19:0.999:0.995 0/0/1/1:4:45,30:0.38:-1.48:1.000:0.520 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,61:0.62:-1.03:1.000:0.514 0/1/1/1:4:35,79:0.67:-0.60:1.000:0.923 0/1/1/1:4:42,85:0.65:-0.31:1.000:0.783 0/0/1/1:4:82,84:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,93:0.71:-0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,76:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,38:0.29:-0.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:43,105:0.69: 0.17:1.000:0.966 0/0/1/1:4:80,116:0.58: 1.25:1.000:0.921 0/0/1/1:4:64,56:0.45:-0.47:1.000:0.983 0/0/1/1:4:56,88:0.60: 0.08:1.000:0.824 0/1/1/1:4:44,112:0.69: 0.35:1.000:0.978 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,40:0.36:-0.85:1.000:0.657 0/0/0/1:4:70,39:0.33:-0.71:1.000:0.933 -chr2.1 36491870 chr2.1_036491870 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,72:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,98:0.23: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,89:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:281,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,193:0.57: 1.36:1.000:0.944 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,90:0.38: 0.37:1.000:0.598 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,117:0.45: 0.76:1.000:0.983 0/0/1/1:4:96,90:0.43: 0.24:0.998:0.956 1/1/1/1:4:0,187:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,115:0.79:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,89:0.22: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,31:0.59:-1.22:1.000:0.873 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,107:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:230,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:330,111:0.17: 2.88:1.000:0.998 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,84:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,45:0.56:-0.95:1.000:0.969 0/0/0:3:4,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:180,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,91:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,93:0.46: 0.23:1.000:0.990 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,93:0.51: 0.06:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,131:0.32: 1.61:1.000:0.962 0/0/1/1:4:263,329:0.52: 4.45:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,51:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,96:0.15: 2.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:102,75:0.34: 0.15:1.000:0.895 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,66:0.39:-0.19:1.000:0.716 0/0/0/1:4:88,60:0.31:-0.15:1.000:0.980 0/0/1/1:4:69,76:0.50:-0.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:66,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,54:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,64:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.25:0.777:1.000 0/0/0/1:4:144,91:0.28: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,78:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,196:0.60: 1.14:1.000:0.753 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,94:0.54:-0.08:1.000:0.985 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,64:0.31:-0.06:1.000:0.975 0/0/0/1:4:61,46:0.35:-0.58:1.000:0.829 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.83:0.608:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,71:0.25: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,61:0.75:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,76:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,66:0.19: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,81:0.52:-0.21:1.000:0.994 0/0/0:3:123,0:0.00:-0.41:0.999:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,66:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,56:0.41:-0.45:1.000:0.877 0/0/0/1:4:97,62:0.28:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,73:0.42:-0.09:1.000:0.905 0/0/0/1:4:136,84:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,64:0.41:-0.28:1.000:0.877 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,75:0.37: 0.05:1.000:0.527 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,69:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,60:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:292,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:379,0:0.00: 2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,71:0.43:-0.16:1.000:0.953 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:342,0:0.00: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,54:0.30:-0.30:1.000:0.984 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,49:0.51:-0.75:0.985:0.996 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,87:0.18: 1.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,60:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,62:0.45:-0.38:1.000:0.977 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,62:0.54:-0.60:1.000:0.990 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,49:0.39:-0.58:1.000:0.709 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,1:0.02:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,79:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,82:0.52:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:258,133:0.23: 2.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,52:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,44:0.29:-0.54:1.000:0.991 0/0/0/0:4:180,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,128:0.26: 1.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:430,0:0.00: 2.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,95:0.46: 0.28:1.000:0.988 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:302,99:0.17: 2.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,76:0.31: 0.25:1.000:0.977 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,95:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:261,145:0.24: 2.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,85:0.24: 0.79:0.998:1.000 0/0/0/0:4:332,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,94:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,99:0.48: 0.32:1.000:0.994 0/0/0/0:4:310,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,113:0.19: 2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,66:0.42:-0.25:1.000:0.911 0/0/1/1:4:87,198:0.59: 1.27:0.999:0.854 0/0/1/1:4:101,93:0.43: 0.32:1.000:0.937 0/0/1/1:4:96,112:0.51: 0.47:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,77:0.42:-0.01:1.000:0.914 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:311,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:232,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,33:0.13: 0.15:1.000:0.858 0/0/1/1:4:100,117:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,142:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:250,135:0.24: 2.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,111:0.48: 0.55:1.000:0.995 -chr2.1 36610401 chr2.1_036610401 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:74,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.05:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:143,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:183,1:.: 2.41:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.40:1.000:. ./.:3:45,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,0:.: 0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:214,0:.: 3.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:12,1:.:-1.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:183,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:66,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.50:0.777:. ./.:4:79,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:190,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:131,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.05:1.000:. ./.:3:49,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:108,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:114,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:155,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.15:0.985:. ./.:4:64,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:39,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.75:0.998:. ./.:4:129,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:150,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:56,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.53:1.000:. -chr2.1 36858792 chr2.1_036858792 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:139,57:.: 0.48:1.000:. ./.:4:123,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:91,118:.: 0.76:1.000:. ./.:4:97,98:.: 0.46:1.000:. ./.:4:162,67:.: 1.19:1.000:. ./.:4:109,114:.: 1.06:1.000:. ./.:4:78,31:.:-1.37:1.000:. ./.:4:80,101:.: 0.16:1.000:. ./.:4:127,37:.:-0.20:1.000:. ./.:4:14,6:.:-3.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:152,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:69,128:.: 0.51:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:138,65:.: 0.63:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.38:0.998:. ./.:4:138,66:.: 0.65:1.000:. ./.:4:154,58:.: 0.83:1.000:. ./.:4:166,63:.: 1.19:1.000:. ./.:4:21,2:.:-3.21:1.000:. ./.:4:156,59:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,101:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:6,7:.:-3.42:1.000:. ./.:4:88,114:.: 0.61:1.000:. ./.:4:89,132:.: 1.02:1.000:. ./.:4:129,59:.: 0.31:1.000:. ./.:4:139,51:.: 0.36:1.000:. ./.:4:129,64:.: 0.42:1.000:. ./.:4:165,64:.: 1.19:1.000:. ./.:4:128,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.23:1.000:. ./.:3:0,1:.:-3.68:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:91,109:.: 0.57:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:90,99:.: 0.33:1.000:. ./.:4:124,46:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,51:.:-0.11:1.000:. ./.:4:129,51:.: 0.14:1.000:. ./.:4:93,123:.: 0.91:1.000:. ./.:4:146,48:.: 0.44:1.000:. ./.:4:140,53:.: 0.42:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:33,15:.:-2.68:1.000:. ./.:4:119,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:122,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:167,52:.: 0.97:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:137,58:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,122:.: 0.51:1.000:. ./.:4:189,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:145,58:.: 0.63:1.000:. ./.:4:74,92:.:-0.16:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:75,83:.:-0.33:1.000:. ./.:4:91,114:.: 0.68:1.000:. ./.:4:145,59:.: 0.65:1.000:. ./.:4:127,38:.:-0.18:1.000:. ./.:4:97,43:.:-0.71:1.000:. ./.:4:109,106:.: 0.89:1.000:. ./.:4:140,48:.: 0.31:1.000:. ./.:4:83,22:.:-1.46:1.000:. ./.:4:123,54:.: 0.08:1.000:. ./.:4:78,111:.: 0.33:0.777:. ./.:4:131,50:.: 0.16:1.000:. ./.:4:135,58:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,23:.:-1.82:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:173,56:.: 1.19:1.000:. ./.:4:84,100:.: 0.23:1.000:. ./.:4:141,49:.: 0.36:1.000:. ./.:4:70,96:.:-0.16:1.000:. ./.:4:101,102:.: 0.63:1.000:. ./.:4:155,64:.: 0.97:1.000:. ./.:4:147,59:.: 0.70:1.000:. ./.:4:111,43:.:-0.41:0.608:. ./.:4:162,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:133,50:.: 0.21:1.000:. ./.:4:110,28:.:-0.75:1.000:. ./.:4:92,102:.: 0.44:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:99,47:.:-0.58:1.000:. ./.:4:117,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:132,47:.: 0.12:1.000:. ./.:3:40,65:.:-1.46:0.999:. ./.:4:123,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:118,118:.: 1.34:1.000:. ./.:4:68,77:.:-0.61:1.000:. ./.:4:143,45:.: 0.31:1.000:. ./.:4:97,93:.: 0.36:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:108,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:90,117:.: 0.72:1.000:. ./.:4:132,53:.: 0.25:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:128,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:57,65:.:-1.10:1.000:. ./.:4:129,66:.: 0.46:1.000:. ./.:4:54,75:.:-0.95:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:133,46:.: 0.12:1.000:. ./.:4:88,90:.: 0.10:1.000:. ./.:4:112,103:.: 0.89:1.000:. ./.:4:84,111:.: 0.46:1.000:. ./.:4:125,43:.:-0.11:1.000:. ./.:4:105,115:.: 1.00:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:162,56:.: 0.95:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.78:0.985:. ./.:4:137,49:.: 0.27:1.000:. ./.:4:98,29:.:-0.99:1.000:. ./.:4:115,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:126,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:111,35:.:-0.58:1.000:. ./.:4:108,132:.: 1.42:1.000:. ./.:4:78,117:.: 0.46:1.000:. ./.:4:134,36:.:-0.07:1.000:. ./.:4:149,63:.: 0.83:1.000:. ./.:4:116,42:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:96,28:.:-1.05:1.000:. ./.:4:76,23:.:-1.59:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:82,100:.: 0.18:1.000:. ./.:4:63,66:.:-0.95:1.000:. ./.:4:126,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:179,67:.: 1.55:1.000:. ./.:4:102,25:.:-0.99:1.000:. ./.:4:119,71:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,95:.:-0.50:1.000:. ./.:4:82,96:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,79:.:-0.75:1.000:. ./.:4:117,33:.:-0.50:1.000:. ./.:4:161,59:.: 1.00:1.000:. ./.:4:124,155:.: 2.26:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:108,114:.: 1.04:1.000:. ./.:4:151,61:.: 0.83:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:110,139:.: 1.62:1.000:. ./.:4:129,47:.: 0.06:1.000:. ./.:4:14,8:.:-3.23:1.000:. ./.:4:115,41:.:-0.37:1.000:. ./.:4:148,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:132,70:.: 0.61:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:105,104:.: 0.76:1.000:. ./.:4:118,47:.:-0.18:0.998:. ./.:4:142,56:.: 0.53:1.000:. ./.:4:74,97:.:-0.05:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,94:.:-0.14:1.000:. ./.:4:85,116:.: 0.59:1.000:. ./.:4:148,79:.: 1.15:1.000:. ./.:4:134,61:.: 0.46:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:113,56:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,98:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,51:.:-0.48:1.000:. ./.:4:148,39:.: 0.29:1.000:. ./.:4:125,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:122,50:.:-0.03:1.000:. ./.:4:127,53:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,103:.: 0.46:1.000:. ./.:4:94,98:.: 0.40:1.000:. ./.:4:124,84:.: 0.74:1.000:. ./.:4:119,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:145,47:.: 0.40:1.000:. ./.:4:156,80:.: 1.34:1.000:. ./.:4:152,60:.: 0.83:1.000:. ./.:4:114,37:.:-0.48:1.000:. ./.:4:156,68:.: 1.08:1.000:. -chr2.1 36971213 chr2.1_036971213 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:65,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:88,4:.: 0.97:1.000:. ./.:4:54,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:66,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:137,7:.: 2.62:1.000:. ./.:4:58,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.81:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:59,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:66,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,8:.:-1.43:0.998:. ./.:4:60,7:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,4:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:59,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:107,2:.: 1.51:1.000:. ./.:4:5,3:.:-1.69:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:124,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:61,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:56,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.62:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.84:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.81:1.000:. ./.:3:36,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:61,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:88,6:.: 1.04:1.000:. ./.:4:71,6:.: 0.50:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:56,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:123,4:.: 2.08:1.000:. ./.:4:92,12:.: 1.35:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:123,3:.: 2.05:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.78:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:61,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:59,6:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,4:.:-1.27:1.000:. ./.:4:12,10:.:-1.24:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.46:1.000:. ./.:4:102,2:.: 1.35:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:8,4:.:-1.56:1.000:. ./.:4:46,11:.:-0.14:1.000:. ./.:4:73,8:.: 0.62:1.000:. ./.:4:59,6:.: 0.12:1.000:. ./.:6:61,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,6:.: 1.38:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,5:.: 2.52:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:112,2:.: 1.67:1.000:. ./.:4:53,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:65,8:.: 0.37:1.000:. ./.:4:2,9:.:-1.59:1.000:. ./.:4:71,4:.: 0.43:0.777:. ./.:4:51,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:64,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:108,4:.: 1.60:1.000:. ./.:4:59,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:83,3:.: 0.78:1.000:. ./.:4:49,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,2:.: 0.53:1.000:. ./.:4:49,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:80,5:.: 0.75:0.608:. ./.:4:72,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:43,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:119,5:.: 1.98:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:37,6:.:-0.58:1.000:. ./.:4:45,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:8,10:.:-1.37:1.000:. ./.:4:58,3:.:-0.01:1.000:. ./.:3:45,6:.:-0.33:0.999:. ./.:4:39,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:82,2:.: 0.72:1.000:. ./.:4:64,4:.: 0.21:1.000:. ./.:4:51,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.69:1.000:. ./.:4:58,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:91,2:.: 1.00:1.000:. ./.:4:60,9:.: 0.24:1.000:. ./.:4:12,2:.:-1.50:1.000:. ./.:4:57,8:.: 0.12:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.62:1.000:. ./.:4:2,6:.:-1.69:1.000:. ./.:4:54,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:82,2:.: 0.72:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.31:1.000:. ./.:4:125,3:.: 2.11:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.48:0.985:. ./.:4:64,4:.: 0.21:1.000:. ./.:4:61,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:4,4:.:-1.69:1.000:. ./.:4:8,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:52,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:124,3:.: 2.08:1.000:. ./.:4:56,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:111,2:.: 1.64:1.000:. ./.:4:47,4:.:-0.33:1.000:. ./.:4:114,2:.: 1.73:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:67,4:.: 0.31:1.000:. ./.:4:75,5:.: 0.59:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.78:1.000:. ./.:4:56,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:48,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,3:.: 1.04:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.69:1.000:. ./.:4:87,3:.: 0.91:1.000:. ./.:4:57,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,3:.:-0.45:1.000:. ./.:4:48,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:70,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:59,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:95,3:.: 1.16:1.000:. ./.:4:4,10:.:-1.50:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.31:1.000:. ./.:4:66,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:40,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:113,7:.: 1.86:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.72:1.000:. ./.:4:90,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:56,2:.:-0.10:0.998:. ./.:4:70,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:60,4:.: 0.09:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:54,4:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:67,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:4,5:.:-1.65:1.000:. ./.:4:62,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.42:0.999:. ./.:4:45,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:61,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:102,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.75:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:87,6:.: 1.00:1.000:. ./.:4:116,3:.: 1.83:1.000:. ./.:4:63,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:60,4:.: 0.09:1.000:. ./.:4:71,7:.: 0.53:1.000:. ./.:4:80,3:.: 0.69:1.000:. ./.:4:2,5:.:-1.72:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.04:1.000:. -chr2.1 37242148 chr2.1_037242148 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:227,77:.: 0.39:1.000:. ./.:4:195,79:.:-0.08:1.000:. ./.:4:228,79:.: 0.43:1.000:. ./.:4:141,116:.:-0.34:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:138,35:.:-1.64:1.000:. ./.:4:166,145:.: 0.49:1.000:. ./.:4:217,60:.:-0.03:1.000:. ./.:4:69,16:.:-3.00:1.000:. ./.:4:127,33:.:-1.84:1.000:. ./.:4:235,58:.: 0.22:1.000:. ./.:4:159,152:.: 0.49:1.000:. ./.:4:262,77:.: 0.93:1.000:. ./.:4:225,76:.: 0.34:1.000:. ./.:4:286,85:.: 1.42:1.000:. ./.:4:199,180:.: 1.54:0.998:. ./.:4:365,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:196,169:.: 1.33:1.000:. ./.:4:296,100:.: 1.81:1.000:. ./.:4:122,1:.:-2.41:1.000:. ./.:4:233,66:.: 0.31:1.000:. ./.:4:235,81:.: 0.57:1.000:. ./.:4:164,129:.: 0.22:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:212,64:.:-0.05:1.000:. ./.:4:174,150:.: 0.69:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:245,90:.: 0.86:1.000:. ./.:4:250,101:.: 1.11:1.000:. ./.:4:181,178:.: 1.23:1.000:. ./.:4:168,117:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,18:.:-3.24:1.000:. ./.:4:110,21:.:-2.29:1.000:. ./.:3:52,1:.:-3.49:1.000:. ./.:4:260,72:.: 0.82:1.000:. ./.:4:152,125:.:-0.03:1.000:. ./.:4:228,70:.: 0.29:1.000:. ./.:4:221,69:.: 0.17:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:137,118:.:-0.37:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:235,71:.: 0.42:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:222,64:.: 0.11:1.000:. ./.:4:283,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:164,144:.: 0.45:1.000:. ./.:4:414,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:177,57:.:-0.70:1.000:. ./.:4:264,65:.: 0.77:1.000:. ./.:4:146,98:.:-0.54:1.000:. ./.:4:295,86:.: 1.57:1.000:. ./.:4:148,124:.:-0.11:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:200,58:.:-0.32:1.000:. ./.:4:174,129:.: 0.37:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:212,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:229,67:.: 0.26:1.000:. ./.:6:256,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:133,116:.:-0.46:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:243,64:.: 0.43:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:232,64:.: 0.26:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:204,64:.:-0.17:1.000:. ./.:4:146,134:.: 0.01:0.777:. ./.:4:110,109:.:-0.93:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:94,86:.:-1.53:1.000:. ./.:4:230,81:.: 0.49:1.000:. ./.:4:188,151:.: 0.93:1.000:. ./.:4:239,63:.: 0.35:1.000:. ./.:4:152,143:.: 0.25:1.000:. ./.:4:131,47:.:-1.56:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:223,62:.: 0.09:1.000:. ./.:4:230,83:.: 0.52:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.57:0.608:. ./.:4:153,140:.: 0.22:1.000:. ./.:4:260,71:.: 0.80:1.000:. ./.:4:130,110:.:-0.60:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:143,40:.:-1.48:1.000:. ./.:4:176,58:.:-0.70:1.000:. ./.:4:203,49:.:-0.42:1.000:. ./.:4:211,60:.:-0.12:1.000:. ./.:3:180,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:170,117:.: 0.12:1.000:. ./.:4:154,163:.: 0.59:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:270,67:.: 0.89:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:131,106:.:-0.65:1.000:. ./.:4:120,120:.:-0.60:1.000:. ./.:4:235,54:.: 0.15:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:98,78:.:-1.59:1.000:. ./.:4:201,74:.:-0.06:1.000:. ./.:4:162,37:.:-1.24:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:108,90:.:-1.25:1.000:. ./.:4:149,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:194,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:221,77:.: 0.29:1.000:. ./.:4:266,90:.: 1.19:1.000:. ./.:4:240,67:.: 0.43:1.000:. ./.:4:215,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:339,97:.: 2.42:1.000:. ./.:4:138,100:.:-0.63:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:174,47:.:-0.90:0.985:. ./.:4:225,54:.: 0.00:1.000:. ./.:4:149,45:.:-1.31:1.000:. ./.:4:233,61:.: 0.23:1.000:. ./.:4:148,105:.:-0.40:1.000:. ./.:4:124,115:.:-0.62:1.000:. ./.:4:203,70:.:-0.09:1.000:. ./.:4:113,95:.:-1.10:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:185,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:186,68:.:-0.39:1.000:. ./.:4:145,121:.:-0.20:1.000:. ./.:4:160,62:.:-0.88:1.000:. ./.:4:107,100:.:-1.11:1.000:. ./.:4:164,47:.:-1.05:1.000:. ./.:4:195,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:240,68:.: 0.45:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:149,146:.: 0.25:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:301,100:.: 1.88:1.000:. ./.:4:230,57:.: 0.12:1.000:. ./.:4:257,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:176,42:.:-0.94:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:217,51:.:-0.17:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:209,64:.:-0.09:1.000:. ./.:4:149,68:.:-0.96:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:242,84:.: 0.72:1.000:. ./.:4:258,63:.: 0.65:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:264,71:.: 0.86:1.000:. ./.:4:122,117:.:-0.62:1.000:. ./.:4:275,73:.: 1.06:1.000:. ./.:4:258,74:.: 0.82:1.000:. ./.:4:66,41:.:-2.66:1.000:. ./.:4:151,42:.:-1.33:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:262,68:.: 0.79:1.000:. ./.:4:274,76:.: 1.10:1.000:. ./.:4:189,177:.: 1.34:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.60:0.998:. ./.:4:244,74:.: 0.60:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:134,106:.:-0.60:1.000:. ./.:4:224,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:225,64:.: 0.15:1.000:. ./.:4:282,77:.: 1.23:1.000:. ./.:4:166,138:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,71:.:-0.42:1.000:. ./.:4:213,67:.: 0.01:0.999:. ./.:4:279,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:167,69:.:-0.66:1.000:. ./.:4:171,75:.:-0.51:1.000:. ./.:4:130,121:.:-0.43:1.000:. ./.:4:145,111:.:-0.36:1.000:. ./.:4:132,120:.:-0.42:1.000:. ./.:4:100,111:.:-1.05:1.000:. ./.:4:302,95:.: 1.82:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:148,134:.: 0.05:1.000:. ./.:4:160,125:.: 0.09:1.000:. ./.:4:246,73:.: 0.62:1.000:. ./.:4:320,92:.: 2.05:1.000:. ./.:4:259,70:.: 0.77:1.000:. ./.:4:194,54:.:-0.48:1.000:. ./.:4:191,57:.:-0.48:1.000:. -chr2.1 37380587 chr2.1_037380587 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:63,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.84:0.998:. ./.:4:55,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.44:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:45,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:59,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.91:1.000:. ./.:6:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.28:0.777:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:71,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:0.608:. ./.:4:43,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.91:1.000:. ./.:3:17,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:0.985:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:0.998:. ./.:4:60,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:53,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.67:1.000:. -chr2.1 38305718 chr2.1_038305718 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:26,0:.: 3.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,1:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./.:6:6,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:0.608:. ./.:4:8,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.28:0.985:. ./.:4:16,0:.: 1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.56:0.998:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.02:1.000:. -chr2.1 38589238 chr2.1_038589238 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,103:.: 0.48:1.000:. ./.:4:19,66:.:-0.01:1.000:. ./.:4:18,75:.: 0.21:1.000:. ./.:4:29,103:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.26:1.000:. ./.:4:39,110:.: 1.74:1.000:. ./.:4:16,40:.:-0.81:1.000:. ./.:4:34,89:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,123:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.85:1.000:. ./.:4:3,5:.:-2.12:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,93:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1,116:.: 0.87:1.000:. ./.:4:34,98:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,151:.: 1.80:1.000:. ./.:4:1,122:.: 1.03:0.998:. ./.:4:34,108:.: 1.55:1.000:. ./.:4:32,86:.: 0.89:1.000:. ./.:4:33,94:.: 1.14:1.000:. ./.:4:5,13:.:-1.85:1.000:. ./.:4:25,81:.: 0.56:1.000:. ./.:4:19,74:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,15:.:-1.71:1.000:. ./.:4:40,102:.: 1.55:1.000:. ./.:4:27,93:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,126:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,128:.: 1.17:1.000:. ./.:4:34,122:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,164:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.09:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.82:1.000:. ./.:3:10,3:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,139:.: 1.47:1.000:. ./.:4:36,84:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.89:1.000:. ./.:4:34,117:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.26:1.000:. ./.:4:23,62:.:-0.01:1.000:. ./.:4:26,54:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,43:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,66:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.78:1.000:. ./.:4:2,5:.:-2.15:1.000:. ./.:4:21,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.05:1.000:. ./.:4:23,58:.:-0.12:1.000:. ./.:4:20,79:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,49:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,76:.:-0.23:1.000:. ./.:6:6,33:.:-1.27:1.000:. ./.:4:18,36:.:-0.86:1.000:. ./.:4:21,46:.:-0.50:1.000:. ./.:4:26,66:.: 0.18:1.000:. ./.:4:25,64:.: 0.10:1.000:. ./.:4:33,78:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,24:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.42:1.000:. ./.:4:27,50:.:-0.23:0.777:. ./.:4:13,66:.:-0.18:1.000:. ./.:4:22,56:.:-0.20:1.000:. ./.:4:12,32:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.73:1.000:. ./.:4:26,69:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:28,72:.: 0.40:1.000:. ./.:4:24,52:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,45:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,39:.:-0.89:0.608:. ./.:4:0,65:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.10:1.000:. ./.:4:28,57:.:-0.01:1.000:. ./.:4:30,80:.: 0.67:1.000:. ./.:4:21,53:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.19:1.000:. ./.:4:11,31:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.97:1.000:. ./.:4:20,43:.:-0.61:1.000:. ./.:3:15,21:.:-1.35:1.000:. ./.:4:12,58:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,54:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,61:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.10:1.000:. ./.:4:26,60:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.16:1.000:. ./.:4:13,34:.:-1.05:1.000:. ./.:4:21,29:.:-0.97:1.000:. ./.:4:26,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.07:1.000:. ./.:4:9,22:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.30:1.000:. ./.:4:15,40:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.11:1.000:. ./.:4:27,105:.: 1.28:1.000:. ./.:4:28,82:.: 0.67:1.000:. ./.:4:27,65:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.22:1.000:. ./.:4:51,141:.: 2.92:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.22:1.000:. ./.:4:19,52:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.92:0.985:. ./.:4:0,50:.:-0.97:1.000:. ./.:4:15,25:.:-1.24:1.000:. ./.:4:17,33:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.92:1.000:. ./.:4:20,45:.:-0.56:1.000:. ./.:4:35,89:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,38:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,29:.:-1.22:1.000:. ./.:4:12,31:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.78:1.000:. ./.:4:32,111:.: 1.58:1.000:. ./.:4:12,32:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,159:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,33:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,49:.:-1.00:1.000:. ./.:4:8,43:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,37:.:-0.92:1.000:. ./.:4:1,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:35,71:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,126:.: 1.11:1.000:. ./.:4:32,87:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,128:.: 1.17:1.000:. ./.:4:26,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,123:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.45:1.000:. ./.:4:34,100:.: 1.33:1.000:. ./.:4:34,108:.: 1.55:1.000:. ./.:4:5,6:.:-2.04:1.000:. ./.:4:22,51:.:-0.34:1.000:. ./.:4:39,102:.: 1.52:1.000:. ./.:4:20,69:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,149:.: 1.74:1.000:. ./.:4:41,88:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.15:0.998:. ./.:4:0,109:.: 0.65:1.000:. ./.:4:18,106:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.59:1.000:. ./.:4:26,94:.: 0.95:1.000:. ./.:4:26,96:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,126:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.95:0.999:. ./.:4:18,81:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:27,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:22,66:.: 0.07:1.000:. ./.:4:26,44:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.81:1.000:. ./.:4:20,66:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.31:1.000:. ./.:4:39,113:.: 1.82:1.000:. ./.:4:19,63:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.67:1.000:. ./.:4:28,103:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.30:1.000:. ./.:4:31,73:.: 0.51:1.000:. ./.:4:26,77:.: 0.48:1.000:. -chr2.1 38804616 chr2.1_038804616 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:137,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:113,0:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.75:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,0:.: 1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:198,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.65:1.000:. ./.:6:87,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:129,0:.: 0.67:0.777:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:121,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:124,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.62:1.000:. ./.:3:139,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:77,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:128,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:127,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:95,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:133,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:145,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:141,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:101,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:123,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:92,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.09:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:78,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:127,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:147,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:147,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 39514617 chr2.1_039514617 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:44,116:.: 1.00:1.000:. ./.:4:34,65:.:-0.65:1.000:. ./.:4:46,100:.: 0.62:1.000:. ./.:4:40,109:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,173:.: 1.35:1.000:. ./.:4:89,83:.: 1.32:1.000:. ./.:4:18,55:.:-1.36:1.000:. ./.:4:43,129:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,19:.:-2.66:1.000:. ./.:4:21,9:.:-2.52:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,111:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1,140:.: 0.48:1.000:. ./.:4:66,59:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.40:1.000:. ./.:4:38,106:.: 0.56:0.998:. ./.:4:102,80:.: 1.59:1.000:. ./.:4:90,70:.: 1.00:1.000:. ./.:4:90,72:.: 1.05:1.000:. ./.:4:25,7:.:-2.47:1.000:. ./.:4:73,81:.: 0.83:1.000:. ./.:4:55,124:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.10:1.000:. ./.:4:7,4:.:-3.04:1.000:. ./.:4:43,112:.: 0.86:1.000:. ./.:4:42,112:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.59:1.000:. ./.:4:26,113:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.43:1.000:. ./.:4:38,97:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.11:1.000:. ./.:4:4,12:.:-2.90:1.000:. ./.:4:10,28:.:-2.31:1.000:. ./.:3:3,9:.:-3.01:1.000:. ./.:4:56,98:.: 0.83:1.000:. ./.:4:38,107:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,62:.:-0.76:1.000:. ./.:4:81,61:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,93:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,77:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,40:.:-0.84:1.000:. ./.:4:29,71:.:-0.63:1.000:. ./.:4:69,73:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.81:1.000:. ./.:4:74,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:58,64:.:-0.03:1.000:. ./.:4:34,47:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,81:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,174:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.36:1.000:. ./.:4:68,61:.: 0.16:1.000:. ./.:4:49,100:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,84:.:-0.41:1.000:. ./.:4:30,102:.: 0.24:1.000:. ./.:4:31,76:.:-0.44:1.000:. ./.:4:34,81:.:-0.22:1.000:. ./.:6:50,56:.:-0.47:1.000:. ./.:4:85,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:34,107:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,73:.:-0.71:1.000:. ./.:4:99,74:.: 1.35:1.000:. ./.:4:42,83:.: 0.05:1.000:. ./.:4:35,35:.:-1.44:1.000:. ./.:4:37,91:.: 0.13:1.000:. ./.:4:35,79:.:-0.25:0.777:. ./.:4:42,111:.: 0.81:1.000:. ./.:4:71,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,27:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.38:1.000:. ./.:4:35,133:.: 1.21:1.000:. ./.:4:64,45:.:-0.38:1.000:. ./.:4:57,56:.:-0.28:1.000:. ./.:4:33,93:.: 0.08:1.000:. ./.:4:26,95:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.52:1.000:. ./.:4:37,65:.:-0.57:0.608:. ./.:4:42,69:.:-0.33:1.000:. ./.:4:38,94:.: 0.24:1.000:. ./.:4:55,49:.:-0.52:1.000:. ./.:4:56,36:.:-0.84:1.000:. ./.:4:25,71:.:-0.74:1.000:. ./.:4:21,69:.:-0.90:1.000:. ./.:4:23,68:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,91:.: 0.18:1.000:. ./.:3:17,35:.:-1.93:1.000:. ./.:4:70,63:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,98:.: 0.21:1.000:. ./.:4:53,62:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.68:1.000:. ./.:4:75,62:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,78:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,97:.: 0.29:1.000:. ./.:4:65,53:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,45:.:-2.12:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.29:1.000:. ./.:4:24,53:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.17:1.000:. ./.:4:29,54:.:-1.09:1.000:. ./.:4:30,100:.: 0.18:1.000:. ./.:4:26,82:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,105:.: 0.64:1.000:. ./.:4:39,128:.: 1.19:1.000:. ./.:4:39,94:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,118:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.36:1.000:. ./.:4:78,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,81:.:-1.14:0.985:. ./.:4:31,81:.:-0.30:1.000:. ./.:4:53,47:.:-0.63:1.000:. ./.:4:56,49:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,81:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.63:1.000:. ./.:4:80,54:.: 0.29:1.000:. ./.:4:63,123:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.60:1.000:. ./.:4:73,50:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.95:1.000:. ./.:4:24,53:.:-1.25:1.000:. ./.:4:42,42:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.57:1.000:. ./.:4:87,82:.: 1.24:1.000:. ./.:4:44,34:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.01:1.000:. ./.:4:36,98:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,117:.: 1.13:1.000:. ./.:4:27,100:.: 0.10:1.000:. ./.:4:48,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:28,62:.:-0.90:1.000:. ./.:4:54,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,40:.:-0.49:1.000:. ./.:4:29,75:.:-0.52:1.000:. ./.:4:64,64:.: 0.13:1.000:. ./.:4:27,53:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,156:.: 0.91:1.000:. ./.:4:49,126:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,161:.: 1.02:1.000:. ./.:4:46,124:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,168:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.09:1.000:. ./.:4:102,74:.: 1.43:1.000:. ./.:4:83,72:.: 0.86:1.000:. ./.:4:5,13:.:-2.85:1.000:. ./.:4:50,49:.:-0.65:1.000:. ./.:4:89,69:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,71:.: 1.10:1.000:. ./.:4:45,141:.: 1.70:1.000:. ./.:4:45,121:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.38:0.998:. ./.:4:0,155:.: 0.86:1.000:. ./.:4:66,65:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,66:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,115:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,165:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.32:0.999:. ./.:4:92,67:.: 0.97:1.000:. ./.:4:76,60:.: 0.35:1.000:. ./.:4:69,64:.: 0.27:1.000:. ./.:4:66,62:.: 0.13:1.000:. ./.:4:48,82:.: 0.18:1.000:. ./.:4:39,91:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,63:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.28:1.000:. ./.:4:73,120:.: 1.89:1.000:. ./.:4:46,104:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.73:1.000:. ./.:4:56,157:.: 2.43:1.000:. ./.:4:46,145:.: 1.83:1.000:. ./.:4:76,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:49,132:.: 1.56:1.000:. -chr2.1 39860975 chr2.1_039860975 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,86:.: 0.53:1.000:. ./.:4:116,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:172,56:.: 1.68:1.000:. ./.:4:115,84:.: 0.90:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:118,46:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,10:.:-2.05:1.000:. ./.:4:47,10:.:-2.91:1.000:. ./.:4:144,30:.: 0.23:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,34:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:157,52:.: 1.17:1.000:. ./.:4:152,44:.: 0.82:0.998:. ./.:4:194,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:155,50:.: 1.06:1.000:. ./.:4:134,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:29,10:.:-3.40:1.000:. ./.:4:138,37:.: 0.26:1.000:. ./.:4:140,48:.: 0.61:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:36,7:.:-3.29:1.000:. ./.:4:125,45:.: 0.12:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:117,40:.:-0.23:1.000:. ./.:4:96,62:.:-0.20:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:16,4:.:-3.91:1.000:. ./.:4:69,17:.:-2.13:1.000:. ./.:3:45,2:.:-3.18:1.000:. ./.:4:97,69:.: 0.02:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:132,34:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,72:.:-0.23:1.000:. ./.:4:143,46:.: 0.63:1.000:. ./.:4:117,25:.:-0.63:1.000:. ./.:4:88,58:.:-0.52:1.000:. ./.:4:95,82:.: 0.31:1.000:. ./.:4:67,62:.:-0.98:1.000:. ./.:4:119,36:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,76:.:-0.14:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:138,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:97,41:.:-0.74:1.000:. ./.:4:84,59:.:-0.60:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:94,79:.: 0.20:1.000:. ./.:4:139,32:.: 0.15:1.000:. ./.:4:141,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,94:.: 0.77:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:97,87:.: 0.50:1.000:. ./.:6:100,51:.:-0.39:1.000:. ./.:4:114,69:.: 0.47:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:89,73:.:-0.09:1.000:. ./.:4:117,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:101,105:.: 1.09:1.000:. ./.:4:85,74:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,10:.:-2.89:1.000:. ./.:4:139,39:.: 0.34:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.12:0.777:. ./.:4:157,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:151,46:.: 0.85:1.000:. ./.:4:44,11:.:-2.97:1.000:. ./.:4:158,18:.: 0.29:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:112,38:.:-0.41:1.000:. ./.:4:137,33:.: 0.12:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:160,57:.: 1.39:1.000:. ./.:4:157,35:.: 0.71:1.000:. ./.:4:121,31:.:-0.36:0.608:. ./.:4:118,71:.: 0.63:1.000:. ./.:4:110,100:.: 1.20:1.000:. ./.:4:101,27:.:-1.00:1.000:. ./.:4:87,61:.:-0.47:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:69,50:.:-1.25:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.04:1.000:. ./.:3:98,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:127,36:.:-0.06:1.000:. ./.:4:252,1:.: 2.35:1.000:. ./.:4:63,66:.:-0.98:1.000:. ./.:4:163,51:.: 1.31:1.000:. ./.:4:159,36:.: 0.80:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:141,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:160,38:.: 0.88:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:130,49:.: 0.37:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:136,40:.: 0.29:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:114,35:.:-0.44:1.000:. ./.:4:148,43:.: 0.69:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:131,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:117,88:.: 1.06:1.000:. ./.:4:129,31:.:-0.14:0.985:. ./.:4:107,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:92,20:.:-1.43:1.000:. ./.:4:111,42:.:-0.33:1.000:. ./.:4:145,55:.: 0.93:1.000:. ./.:4:125,26:.:-0.39:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:149,42:.: 0.69:1.000:. ./.:4:148,39:.: 0.58:1.000:. ./.:4:130,39:.: 0.10:1.000:. ./.:4:95,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:136,38:.: 0.23:1.000:. ./.:4:88,54:.:-0.63:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,28:.:-0.92:1.000:. ./.:4:138,30:.: 0.07:1.000:. ./.:4:127,35:.:-0.09:1.000:. ./.:4:58,48:.:-1.60:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:94,69:.:-0.06:1.000:. ./.:4:169,41:.: 1.20:1.000:. ./.:4:107,79:.: 0.55:1.000:. ./.:4:68,60:.:-1.00:1.000:. ./.:4:138,37:.: 0.26:1.000:. ./.:4:83,75:.:-0.20:1.000:. ./.:4:116,39:.:-0.28:1.000:. ./.:4:82,73:.:-0.28:1.000:. ./.:4:124,26:.:-0.41:1.000:. ./.:4:65,58:.:-1.14:1.000:. ./.:4:148,36:.: 0.50:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:140,39:.: 0.37:1.000:. ./.:4:119,49:.: 0.07:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:151,45:.: 0.82:1.000:. ./.:4:166,49:.: 1.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:112,28:.:-0.68:1.000:. ./.:4:114,77:.: 0.69:1.000:. ./.:4:149,35:.: 0.50:1.000:. ./.:4:126,54:.: 0.39:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:129,43:.: 0.18:0.998:. ./.:4:157,40:.: 0.85:1.000:. ./.:4:100,37:.:-0.76:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:130,35:.:-0.01:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:150,44:.: 0.77:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:128,32:.:-0.14:1.000:. ./.:4:127,42:.: 0.10:0.999:. ./.:4:117,40:.:-0.23:1.000:. ./.:4:125,32:.:-0.23:1.000:. ./.:4:102,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:85,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,33:.:-0.12:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:131,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:133,40:.: 0.20:1.000:. ./.:4:135,35:.: 0.12:1.000:. ./.:4:143,47:.: 0.66:1.000:. ./.:4:138,37:.: 0.26:1.000:. ./.:4:246,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:152,48:.: 0.93:1.000:. ./.:4:113,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:116,31:.:-0.49:1.000:. -chr2.1 40034152 chr2.1_040034152 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:338,12:.: 0.55:1.000:. ./.:4:304,9:.: 0.18:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:340,20:.: 0.66:1.000:. ./.:4:269,16:.:-0.11:1.000:. ./.:4:431,14:.: 1.53:1.000:. ./.:4:200,7:.:-0.91:1.000:. ./.:4:327,13:.: 0.45:1.000:. ./.:4:199,11:.:-0.88:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:322,13:.: 0.40:1.000:. ./.:4:311,7:.: 0.23:1.000:. ./.:4:161,27:.:-1.10:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:148,34:.:-1.16:1.000:. ./.:4:344,10:.: 0.59:0.998:. ./.:4:356,11:.: 0.73:1.000:. ./.:4:449,19:.: 1.76:1.000:. ./.:4:428,24:.: 1.60:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:253,30:.:-0.13:1.000:. ./.:4:336,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:230,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:360,8:.: 0.74:1.000:. ./.:4:219,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:416,12:.: 1.35:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:257,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:266,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.78:1.000:. ./.:3:28,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:242,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:349,6:.: 0.60:1.000:. ./.:4:138,20:.:-1.41:1.000:. ./.:4:246,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:198,17:.:-0.83:1.000:. ./.:4:322,5:.: 0.32:1.000:. ./.:4:235,20:.:-0.42:1.000:. ./.:4:272,8:.:-0.16:1.000:. ./.:4:161,26:.:-1.11:1.000:. ./.:4:266,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:339,9:.: 0.53:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:323,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:194,4:.:-1.00:1.000:. ./.:4:293,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:266,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:275,10:.:-0.11:1.000:. ./.:4:172,26:.:-1.00:1.000:. ./.:4:330,3:.: 0.38:1.000:. ./.:4:265,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:368,7:.: 0.81:1.000:. ./.:4:229,15:.:-0.53:1.000:. ./.:6:261,5:.:-0.31:1.000:. ./.:4:296,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:255,14:.:-0.27:1.000:. ./.:4:140,17:.:-1.42:1.000:. ./.:4:300,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:301,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:359,6:.: 0.71:0.777:. ./.:4:360,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:293,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:328,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:243,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:303,8:.: 0.15:1.000:. ./.:4:212,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:208,22:.:-0.67:1.000:. ./.:4:238,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:253,8:.:-0.36:0.608:. ./.:4:242,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:272,7:.:-0.17:1.000:. ./.:4:289,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:289,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:181,17:.:-1.00:1.000:. ./.:4:250,11:.:-0.36:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:253,7:.:-0.37:1.000:. ./.:3:227,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:323,3:.: 0.31:1.000:. ./.:4:351,9:.: 0.66:1.000:. ./.:4:238,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:221,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:223,9:.:-0.65:1.000:. ./.:4:396,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:249,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:258,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:201,13:.:-0.84:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:247,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:275,7:.:-0.14:1.000:. ./.:4:325,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:481,1:.: 1.90:1.000:. ./.:4:294,20:.: 0.19:1.000:. ./.:4:205,10:.:-0.83:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:238,14:.:-0.45:1.000:. ./.:4:260,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:102,12:.:-1.86:0.985:. ./.:4:382,12:.: 1.00:1.000:. ./.:4:319,6:.: 0.30:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:147,14:.:-1.38:1.000:. ./.:4:135,13:.:-1.51:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:286,9:.:-0.01:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:239,22:.:-0.36:1.000:. ./.:4:221,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:224,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:202,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:189,10:.:-0.99:1.000:. ./.:4:207,7:.:-0.84:1.000:. ./.:4:269,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:130,10:.:-1.59:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:172,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:316,4:.: 0.25:1.000:. ./.:4:187,7:.:-1.04:1.000:. ./.:4:487,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:301,5:.: 0.10:1.000:. ./.:4:214,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:271,9:.:-0.16:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:337,5:.: 0.47:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:237,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:309,27:.: 0.41:1.000:. ./.:4:509,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:152,20:.:-1.27:1.000:. ./.:4:201,13:.:-0.84:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:232,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:466,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:326,13:.: 0.44:1.000:. ./.:4:52,1:.:-2.48:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:263,19:.:-0.14:1.000:. ./.:4:403,12:.: 1.22:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:392,24:.: 1.23:1.000:. ./.:4:231,12:.:-0.54:0.998:. ./.:4:258,16:.:-0.22:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:92,19:.:-1.89:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:313,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:231,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:362,11:.: 0.79:1.000:. ./.:4:126,24:.:-1.49:1.000:. ./.:4:350,15:.: 0.71:0.999:. ./.:4:392,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:191,22:.:-0.85:1.000:. ./.:4:153,20:.:-1.26:1.000:. ./.:4:246,16:.:-0.35:1.000:. ./.:4:301,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:238,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:158,23:.:-1.17:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:271,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:211,28:.:-0.58:1.000:. ./.:4:232,16:.:-0.49:1.000:. ./.:4:240,27:.:-0.30:1.000:. ./.:4:352,16:.: 0.74:1.000:. ./.:4:574,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:353,17:.: 0.76:1.000:. -chr2.1 40166628 chr2.1_040166628 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:221,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:325,1:.: 2.04:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:258,2:.: 1.17:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:53,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:254,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:263,3:.: 1.25:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.92:0.998:. ./.:4:250,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:218,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:242,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.38:1.000:. ./.:3:61,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:560,2:.: 5.16:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:123,1:.:-0.63:1.000:. ./.:6:78,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.44:0.777:. ./.:4:185,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.77:0.608:. ./.:4:95,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.05:1.000:. ./.:3:88,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.09:0.985:. ./.:4:116,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:83,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.31:0.998:. ./.:4:257,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:325,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.68:0.999:. ./.:4:204,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.80:1.000:. -chr2.1 40366311 chr2.1_040366311 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:304,325:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,472:.:-0.92:1.000:. ./.:4:264,277:.:-0.29:1.000:. ./.:4:166,472:.: 0.60:1.000:. ./.:4:294,363:.: 0.77:1.000:. ./.:4:350,382:.: 1.45:1.000:. ./.:4:129,382:.:-0.56:1.000:. ./.:4:128,446:.: 0.01:1.000:. ./.:4:273,260:.:-0.36:1.000:. ./.:4:203,221:.:-1.35:1.000:. ./.:4:214,183:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,533:.:-0.36:1.000:. ./.:4:144,438:.: 0.09:1.000:. ./.:4:169,496:.: 0.84:1.000:. ./.:4:304,270:.: 0.01:1.000:. ./.:4:162,464:.: 0.49:1.000:. ./.:4:178,496:.: 0.92:0.998:. ./.:4:0,590:.: 0.16:1.000:. ./.:4:191,615:.: 2.13:1.000:. ./.:4:168,550:.: 1.33:1.000:. ./.:4:177,252:.:-1.31:1.000:. ./.:4:248,294:.:-0.28:1.000:. ./.:4:147,530:.: 0.95:1.000:. ./.:4:146,441:.: 0.13:1.000:. ./.:4:133,135:.:-2.77:1.000:. ./.:4:186,560:.: 1.58:1.000:. ./.:4:157,456:.: 0.37:1.000:. ./.:4:298,309:.: 0.31:1.000:. ./.:4:397,387:.: 1.93:1.000:. ./.:4:276,327:.: 0.28:1.000:. ./.:4:168,497:.: 0.84:1.000:. ./.:4:131,404:.:-0.34:1.000:. ./.:4:159,110:.:-2.77:1.000:. ./.:4:185,215:.:-1.57:1.000:. ./.:3:54,113:.:-3.69:1.000:. ./.:4:149,433:.: 0.09:1.000:. ./.:4:153,459:.: 0.36:1.000:. ./.:4:155,473:.: 0.51:1.000:. ./.:4:354,330:.: 1.02:1.000:. ./.:4:331,355:.: 1.03:1.000:. ./.:4:140,460:.: 0.25:1.000:. ./.:4:316,299:.: 0.39:1.000:. ./.:4:162,536:.: 1.14:1.000:. ./.:4:260,279:.:-0.31:1.000:. ./.:4:151,508:.: 0.79:1.000:. ./.:4:301,297:.: 0.23:1.000:. ./.:4:150,533:.: 1.01:1.000:. ./.:4:525,511:.: 4.22:1.000:. ./.:4:115,413:.:-0.41:1.000:. ./.:4:230,612:.: 2.46:1.000:. ./.:4:118,357:.:-0.89:1.000:. ./.:4:346,358:.: 1.20:1.000:. ./.:4:114,349:.:-1.00:1.000:. ./.:4:303,314:.: 0.41:1.000:. ./.:4:122,391:.:-0.54:1.000:. ./.:4:166,458:.: 0.47:1.000:. ./.:4:279,252:.:-0.38:1.000:. ./.:4:178,521:.: 1.15:1.000:. ./.:4:125,411:.:-0.33:1.000:. ./.:6:239,239:.:-0.86:1.000:. ./.:4:264,303:.:-0.05:1.000:. ./.:4:107,416:.:-0.45:1.000:. ./.:4:323,336:.: 0.79:1.000:. ./.:4:152,462:.: 0.38:1.000:. ./.:4:277,323:.: 0.25:1.000:. ./.:4:265,293:.:-0.13:1.000:. ./.:4:253,248:.:-0.65:1.000:. ./.:4:290,252:.:-0.28:1.000:. ./.:4:145,473:.: 0.41:0.777:. ./.:4:0,571:.:-0.01:1.000:. ./.:4:324,375:.: 1.15:1.000:. ./.:4:118,403:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,711:.: 1.26:1.000:. ./.:4:146,429:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,590:.: 0.16:1.000:. ./.:4:160,411:.:-0.01:1.000:. ./.:4:116,405:.:-0.47:1.000:. ./.:4:278,281:.:-0.12:1.000:. ./.:4:161,400:.:-0.10:1.000:. ./.:4:306,322:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,453:.:-1.09:0.608:. ./.:4:157,443:.: 0.25:1.000:. ./.:4:350,370:.: 1.34:1.000:. ./.:4:125,382:.:-0.60:1.000:. ./.:4:333,293:.: 0.49:1.000:. ./.:4:312,325:.: 0.59:1.000:. ./.:4:107,334:.:-1.20:1.000:. ./.:4:153,367:.:-0.48:1.000:. ./.:4:257,252:.:-0.58:1.000:. ./.:4:108,382:.:-0.75:1.000:. ./.:3:248,113:.:-1.93:1.000:. ./.:4:142,412:.:-0.17:1.000:. ./.:4:149,453:.: 0.27:1.000:. ./.:4:213,237:.:-1.12:1.000:. ./.:4:286,309:.: 0.20:1.000:. ./.:4:282,317:.: 0.24:1.000:. ./.:4:117,328:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:153,504:.: 0.77:1.000:. ./.:4:277,281:.:-0.13:1.000:. ./.:4:116,398:.:-0.53:1.000:. ./.:4:166,469:.: 0.57:1.000:. ./.:4:197,226:.:-1.36:1.000:. ./.:4:256,255:.:-0.56:1.000:. ./.:4:111,323:.:-1.26:1.000:. ./.:4:120,365:.:-0.80:1.000:. ./.:4:235,234:.:-0.94:1.000:. ./.:4:300,314:.: 0.38:1.000:. ./.:4:345,390:.: 1.48:1.000:. ./.:4:128,402:.:-0.39:1.000:. ./.:4:232,265:.:-0.69:1.000:. ./.:4:411,447:.: 2.60:1.000:. ./.:4:136,447:.: 0.10:1.000:. ./.:4:290,336:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,313:.:-1.33:0.985:. ./.:4:298,364:.: 0.82:1.000:. ./.:4:131,417:.:-0.22:1.000:. ./.:4:259,269:.:-0.41:1.000:. ./.:4:120,391:.:-0.56:1.000:. ./.:4:135,369:.:-0.62:1.000:. ./.:4:282,313:.: 0.20:1.000:. ./.:4:146,435:.: 0.08:1.000:. ./.:4:325,313:.: 0.60:1.000:. ./.:4:300,311:.: 0.35:1.000:. ./.:4:272,274:.:-0.24:1.000:. ./.:4:172,483:.: 0.75:1.000:. ./.:4:145,431:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,499:.:-0.67:1.000:. ./.:4:119,317:.:-1.24:1.000:. ./.:4:125,324:.:-1.13:1.000:. ./.:4:127,411:.:-0.31:1.000:. ./.:4:257,274:.:-0.38:1.000:. ./.:4:152,168:.:-2.30:1.000:. ./.:4:158,436:.: 0.20:1.000:. ./.:4:256,258:.:-0.53:1.000:. ./.:4:368,402:.: 1.80:1.000:. ./.:4:297,305:.: 0.27:1.000:. ./.:4:231,285:.:-0.51:1.000:. ./.:4:242,264:.:-0.61:1.000:. ./.:4:203,256:.:-1.03:1.000:. ./.:4:287,308:.: 0.20:1.000:. ./.:4:224,237:.:-1.02:1.000:. ./.:4:269,260:.:-0.40:1.000:. ./.:4:214,209:.:-1.36:1.000:. ./.:4:357,367:.: 1.38:1.000:. ./.:4:398,403:.: 2.08:1.000:. ./.:4:144,458:.: 0.27:1.000:. ./.:4:246,297:.:-0.27:1.000:. ./.:4:294,269:.:-0.09:1.000:. ./.:4:148,345:.:-0.72:1.000:. ./.:4:355,343:.: 1.14:1.000:. ./.:4:143,445:.: 0.14:1.000:. ./.:4:93,236:.:-2.22:1.000:. ./.:4:276,248:.:-0.44:1.000:. ./.:4:312,316:.: 0.51:1.000:. ./.:4:156,414:.:-0.02:1.000:. ./.:4:302,351:.: 0.73:1.000:. ./.:4:173,478:.: 0.72:1.000:. ./.:4:275,270:.:-0.25:0.998:. ./.:4:298,333:.: 0.53:1.000:. ./.:4:243,261:.:-0.62:1.000:. ./.:4:121,358:.:-0.85:1.000:. ./.:4:285,271:.:-0.15:1.000:. ./.:4:155,453:.: 0.32:1.000:. ./.:4:337,324:.: 0.81:1.000:. ./.:4:139,401:.:-0.30:1.000:. ./.:4:134,392:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,517:.:-0.51:0.999:. ./.:4:244,312:.:-0.15:1.000:. ./.:4:277,275:.:-0.19:1.000:. ./.:4:143,384:.:-0.41:1.000:. ./.:4:108,324:.:-1.28:1.000:. ./.:4:162,480:.: 0.63:1.000:. ./.:4:135,366:.:-0.65:1.000:. ./.:4:127,403:.:-0.39:1.000:. ./.:4:124,331:.:-1.07:1.000:. ./.:4:363,394:.: 1.68:1.000:. ./.:4:277,320:.: 0.22:1.000:. ./.:4:134,460:.: 0.20:1.000:. ./.:4:120,441:.:-0.10:1.000:. ./.:4:156,511:.: 0.86:1.000:. ./.:4:188,610:.: 2.05:1.000:. ./.:4:344,401:.: 1.57:1.000:. ./.:4:259,244:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,593:.: 0.20:1.000:. -chr2.1 40506359 chr2.1_040506359 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:57,105:0.64:-0.12:1.000:0.680 0/0/1/1:4:57,91:0.61:-0.40:1.000:0.740 0/1/1/1:4:39,88:0.68:-0.83:1.000:0.965 0/1/1/1:4:33,103:0.75:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,134:0.57: 1.31:1.000:0.953 0/1/1/1:4:64,179:0.73: 1.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,25:0.18:-0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,111:0.65: 0.00:1.000:0.811 0/1/1/1:4:55,111:0.66:-0.04:1.000:0.870 0/0/0/1:4:36,11:0.21:-2.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,31:0.68:-2.51:1.000:0.956 0/0/0/1:4:103,53:0.32:-0.24:1.000:0.953 0/0/1/1:4:57,77:0.56:-0.69:1.000:0.959 0/0/0/1:4:155,52:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,44:0.33:-0.83:1.000:0.932 0/0/0/1:4:157,60:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.09:0.998:1.000 0/0/1/1:4:124,108:0.45: 1.31:1.000:0.982 0/0/0/1:4:146,84:0.35: 1.27:1.000:0.820 0/0/0/1:4:199,79:0.26: 2.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,19:0.38:-2.45:1.000:0.556 0/0/0/1:4:110,47:0.28:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,166:0.79: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,44:0.31:-0.69:1.000:0.976 0/0/1/1:4:18,18:0.49:-2.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,189:0.78: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,97:0.62:-0.30:1.000:0.505 0/0/1/1:4:122,120:0.48: 1.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,104:0.63:-0.10:1.000:0.550 0/0/0/1:4:119,63:0.33: 0.29:1.000:0.933 0/0/0/1:4:138,48:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,52:0.31:-0.22:1.000:0.972 0/0/0/1:4:15,6:0.26:-3.00:1.000:0.998 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-2.63:1.000:1.000 0/1/1:3:9,17:0.65:-2.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,53:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,90:0.62:-0.53:1.000:0.507 0/0/0/1:4:166,53:0.22: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,53:0.33:-0.30:1.000:0.932 0/0/1/1:4:130,141:0.51: 2.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,116:0.72:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,97:0.47: 0.70:1.000:0.991 0/0/1/1:4:113,122:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,144:0.72: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,98:0.47: 0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:109,99:0.46: 0.82:1.000:0.989 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.23:-2.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,56:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:163,56:0.23: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,41:0.33:-1.06:1.000:0.900 0/0/0/1:4:123,68:0.34: 0.47:1.000:0.886 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,114:0.45: 1.56:1.000:0.983 0/1/1/1:4:49,165:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,123:0.58: 0.86:1.000:0.930 0/0/1/1:4:106,94:0.46: 0.66:1.000:0.985 0/0/0/1:4:147,51:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:39,119:0.75:-0.20:1.000:0.520 0/1/1/1:4:38,143:0.78: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,47:0.34:-0.73:1.000:0.886 0/0/1/1:4:120,109:0.46: 1.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:98,101:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,170:0.74: 1.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:60,114:0.65: 0.13:1.000:0.759 0/0/0/1:4:105,41:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,55:0.34:-0.28:1.000:0.879 0/1/1/1:4:50,99:0.66:-0.38:0.777:0.841 0/0/1/1:4:38,43:0.52:-1.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:159,63:0.26: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,41:0.35:-1.14:1.000:0.812 0/0/1/1:4:96,64:0.38:-0.16:1.000:0.612 0/0/1/1:4:93,60:0.38:-0.30:1.000:0.505 0/1/1/1:4:39,95:0.70:-0.69:1.000:0.986 0/0/0/1:4:107,48:0.29:-0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,133:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,92:0.46: 0.54:1.000:0.988 0/0/1/1:4:104,106:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,113:0.66: 0.03:1.000:0.870 0/0/1/1:4:83,76:0.47:-0.18:0.608:0.990 0/0/0/1:4:99,61:0.36:-0.16:1.000:0.645 0/0/0/1:4:112,65:0.35: 0.19:1.000:0.802 0/0/0/1:4:85,43:0.32:-0.81:1.000:0.963 0/0/0/1:4:165,58:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,126:0.53: 1.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:111,36:0.22:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,41:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,34:0.28:-1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,41:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/1/1:3:45,82:0.64:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,63:0.41:-0.42:1.000:0.883 0/1/1/1:4:58,129:0.68: 0.39:1.000:0.958 0/1/1/1:4:35,109:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,131:0.64: 0.68:1.000:0.722 0/0/1/1:4:122,102:0.44: 1.15:1.000:0.969 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,43:0.45:-1.53:1.000:0.979 0/1/1/1:4:47,190:0.79: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,59:0.22: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,111:0.53: 0.74:1.000:0.991 0/1/1/1:4:30,64:0.67:-1.51:1.000:0.931 0/0/1/1:4:78,104:0.56: 0.29:1.000:0.965 0/1/1/1:4:35,80:0.69:-1.08:1.000:0.970 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,47:0.31:-0.55:1.000:0.968 0/1/1/1:4:51,125:0.70: 0.17:1.000:0.987 0/1/1/1:4:66,144:0.68: 0.86:1.000:0.947 0/0/1/1:4:109,114:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,81:0.61:-0.77:1.000:0.647 0/1/1/1:4:72,153:0.67: 1.17:1.000:0.928 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,114:0.52: 0.92:1.000:0.994 0/0/0/1:4:125,42:0.23:-0.02:0.985:1.000 0/1/1/1:4:62,135:0.68: 0.60:1.000:0.946 0/0/0/1:4:124,32:0.19:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,31:0.28:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,44:0.30:-0.63:1.000:0.985 0/0/0/1:4:83,52:0.37:-0.67:1.000:0.592 0/0/0/1:4:110,46:0.27:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,52:0.37:-0.67:1.000:0.592 0/0/1/1:4:96,117:0.54: 0.92:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,162:0.78: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,104:0.67:-0.30:1.000:0.927 0/0/1/1:4:111,106:0.48: 1.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,142:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,69:0.62:-1.18:1.000:0.594 0/0/0/1:4:69,34:0.31:-1.32:1.000:0.974 0/0/0/1:4:98,33:0.23:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,49:0.27: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,121:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,121:0.74:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,52:0.32:-0.34:1.000:0.939 0/0/0/1:4:161,57:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:211,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,109:0.68:-0.20:1.000:0.958 0/0/1/1:4:78,75:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,48:0.32:-0.51:1.000:0.963 0/1/1/1:4:58,136:0.69: 0.54:1.000:0.978 0/1/1/1:4:50,93:0.64:-0.51:1.000:0.706 0/0/1/1:4:94,80:0.45: 0.13:1.000:0.976 0/1/1/1:4:41,95:0.69:-0.65:1.000:0.974 0/1/1/1:4:38,92:0.70:-0.77:1.000:0.985 0/0/1/1:4:112,149:0.56: 1.90:1.000:0.966 0/1/1/1:4:60,110:0.64: 0.05:1.000:0.667 0/0/0/1:4:150,54:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,167:0.74: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,74:0.39: 0.33:1.000:0.640 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,134:0.68: 0.58:1.000:0.941 0/0/0/1:4:116,57:0.31: 0.11:1.000:0.974 0/1/1/1:4:8,19:0.70:-2.87:1.000:0.981 0/0/0/1:4:85,32:0.25:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,116:0.47: 1.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:130,37:0.20:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,121:0.72:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,86:0.49: 0.07:0.998:0.996 0/1/1/1:4:54,99:0.64:-0.30:1.000:0.667 0/0/1/1:4:110,104:0.47: 0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:78,56:0.40:-0.69:1.000:0.809 0/1/1/1:4:63,117:0.64: 0.25:1.000:0.702 0/0/1/1:4:96,97:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,116:0.67: 0.07:1.000:0.921 0/0/0/1:4:110,59:0.33: 0.03:1.000:0.921 0/0/0/1:4:135,56:0.27: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,49:0.37:-0.85:0.999:0.541 0/0/0/1:4:120,55:0.29: 0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:106,98:0.47: 0.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,84:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,80:0.43: 0.23:1.000:0.953 0/0/0/1:4:92,32:0.24:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,42:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,107:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,148:0.66: 1.13:1.000:0.835 0/1/1/1:4:77,167:0.68: 1.56:1.000:0.943 0/1/1/1:4:52,120:0.69: 0.09:1.000:0.973 0/0/1/1:4:60,91:0.59:-0.34:1.000:0.845 0/0/1/1:4:126,128:0.49: 1.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,67:0.25: 1.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,54:0.33:-0.26:1.000:0.924 0/0/0/1:4:90,38:0.28:-0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,102:0.69:-0.44:1.000:0.974 -chr2.1 41045050 chr2.1_041045050 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:133,150:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,103:0.53:-0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,121:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,191:0.71: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:135,148:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,80:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,72:0.43:-0.96:1.000:0.951 0/1/1/1:4:64,207:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,118:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,23:0.68:-2.86:1.000:0.963 0/0/1/1:4:9,8:0.45:-3.10:1.000:0.983 0/1/1/1:4:62,199:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,207:0.70: 0.96:1.000:0.984 0/0/1/1:4:142,171:0.53: 1.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:174,64:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,147:0.52: 0.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:64,242:0.78: 1.18:0.998:1.000 0/1/1/1:4:64,192:0.74: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,180:0.52: 1.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,205:0.53: 2.19:1.000:0.993 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-2.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,62:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,171:0.53: 1.23:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,300:1.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.23:-3.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,127:0.56:-0.09:1.000:0.969 0/1/1/1:4:55,198:0.77: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,114:0.46: 0.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:147,171:0.52: 1.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:84,237:0.73: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,135:0.53: 0.31:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,232:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,1:0.08:-3.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,17:0.44:-2.80:1.000:0.972 0/1/1:3:4,6:0.58:-3.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,125:0.54:-0.05:1.000:0.987 0/1/1/1:4:59,199:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,158:0.48: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,62:0.30:-0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:141,161:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,153:0.73:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,95:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,40:0.20:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,48:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,72:0.29: 0.28:1.000:0.992 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,237:0.76: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,22:0.25:-2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,87:0.47:-0.68:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,72:0.52:-1.36:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,218:0.72: 1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,176:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,143:0.53: 0.47:1.000:0.990 0/1/1/1:4:51,179:0.77: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,116:0.48: 0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,105:0.71:-1.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:97,121:0.54:-0.12:1.000:0.990 0/0/0/0/1/1:6:129,60:0.31:-0.55:1.000:0.903 0/0/0/1:4:172,68:0.28: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,114:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,40:0.23:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,60:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,116:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:143,54:0.27:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,182:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,136:0.77:-0.77:0.777:1.000 0/1/1/1:4:58,139:0.69:-0.43:1.000:0.978 0/0/0/1:4:178,70:0.28: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,76:0.49:-1.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,134:0.73:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,149:0.52: 0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,89:0.45:-0.50:1.000:0.976 0/0/1/1:4:88,98:0.51:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,91:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,126:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:63,215:0.76: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,125:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,80:0.50:-1.08:0.608:0.997 0/0/1/1:4:100,99:0.48:-0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:175,77:0.30: 0.38:1.000:0.985 0/0/1/1:4:96,100:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:128,43:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,141:0.48: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,100:0.47:-0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,101:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,152:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,116:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1:3:86,60:0.40:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,89:0.47:-0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:55,213:0.79: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,49:0.29:-0.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:138,181:0.55: 1.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:117,104:0.45:-0.08:1.000:0.983 0/1/1/1:4:54,134:0.70:-0.56:1.000:0.986 0/1/1/1:4:50,139:0.72:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,143:0.51: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:192,81:0.29: 0.70:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,98:0.74:-1.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,155:0.72:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,95:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,99:0.45:-0.22:1.000:0.982 0/1/1/1:4:33,113:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,179:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,154:0.72:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,148:0.47: 1.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,150:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,194:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,105:0.47:-0.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:160,169:0.49: 1.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,192:0.77: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:247,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,101:0.57:-0.79:0.985:0.956 0/0/1/1:4:135,120:0.45: 0.43:1.000:0.983 0/0/1/1:4:88,121:0.56:-0.25:1.000:0.966 0/0/0/1:4:102,44:0.30:-1.19:1.000:0.988 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:82,109:0.55:-0.52:1.000:0.978 0/1/1/1:4:63,189:0.74: 0.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,142:0.51: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,59:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,94:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,48:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,108:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,71:0.41:-0.88:1.000:0.871 0/0/1/1:4:93,78:0.44:-0.82:1.000:0.967 0/0/1/1:4:61,73:0.53:-1.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,101:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,135:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,44:0.30:-1.20:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,213:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,55:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,161:0.47: 1.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:129,109:0.44: 0.18:1.000:0.970 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,148:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,43:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,101:0.47:-0.25:1.000:0.990 0/0/1/1:4:104,91:0.45:-0.46:1.000:0.980 0/0/1/1:4:125,136:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,77:0.45:-0.89:1.000:0.977 0/0/1/1:4:150,175:0.52: 1.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,154:0.53: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:128,144:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,67:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,224:0.72: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,204:0.77: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,180:0.51: 1.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,153:0.49: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,4:0.39:-3.20:1.000:0.667 0/0/0/1:4:172,57:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:243,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,167:0.53: 1.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:160,175:0.50: 1.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,228:0.74: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,119:0.48: 0.15:0.998:0.996 0/0/1/1:4:128,161:0.54: 0.93:1.000:0.989 0/0/1/1:4:117,138:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,86:0.48:-0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,111:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,212:0.81: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,150:0.50: 0.92:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,269:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,128:0.53: 0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:64,210:0.76: 0.71:0.999:1.000 0/0/0/1:4:162,63:0.28:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,144:0.46: 1.14:1.000:0.986 0/0/0/1:4:162,42:0.20:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,74:0.29: 0.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:127,95:0.41:-0.06:1.000:0.885 0/1/1/1:4:43,184:0.80: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,101:0.53:-0.62:1.000:0.992 0/1/1/1:4:57,206:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,168:0.53: 1.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:219,90:0.29: 1.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:67,185:0.72: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,124:0.60:-0.36:1.000:0.814 0/1/1/1:4:67,229:0.76: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,181:0.48: 2.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,233:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,62:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,131:0.52: 0.22:1.000:0.994 -chr2.1 41375928 chr2.1_041375928 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:100,131:.: 0.31:1.000:. ./.:4:82,97:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,193:.: 0.19:1.000:. ./.:4:67,283:.: 1.63:1.000:. ./.:4:151,111:.: 0.65:1.000:. ./.:4:143,150:.: 1.00:1.000:. ./.:4:77,162:.: 0.40:1.000:. ./.:4:69,315:.: 2.01:1.000:. ./.:4:77,169:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,22:.:-1.70:1.000:. ./.:4:6,72:.:-1.39:1.000:. ./.:4:134,65:.:-0.05:1.000:. ./.:4:100,205:.: 1.13:1.000:. ./.:4:128,153:.: 0.86:1.000:. ./.:4:32,138:.:-0.37:1.000:. ./.:4:155,201:.: 1.70:1.000:. ./.:4:119,198:.: 1.26:0.998:. ./.:4:154,89:.: 0.44:1.000:. ./.:4:80,297:.: 1.93:1.000:. ./.:4:162,175:.: 1.49:1.000:. ./.:4:10,14:.:-1.99:1.000:. ./.:4:23,133:.:-0.52:1.000:. ./.:4:112,214:.: 1.36:1.000:. ./.:4:107,214:.: 1.31:1.000:. ./.:4:21,7:.:-1.95:1.000:. ./.:4:109,298:.: 2.26:1.000:. ./.:4:87,356:.: 2.66:1.000:. ./.:4:110,102:.: 0.10:1.000:. ./.:4:101,127:.: 0.28:1.000:. ./.:4:94,172:.: 0.70:1.000:. ./.:4:34,277:.: 1.20:1.000:. ./.:4:93,195:.: 0.94:1.000:. ./.:4:8,16:.:-1.99:1.000:. ./.:4:9,17:.:-1.97:1.000:. ./.:3:9,4:.:-2.11:1.000:. ./.:4:160,143:.: 1.11:1.000:. ./.:4:73,305:.: 1.94:1.000:. ./.:4:119,157:.: 0.81:1.000:. ./.:4:40,103:.:-0.67:1.000:. ./.:4:123,77:.:-0.04:1.000:. ./.:4:52,134:.:-0.19:1.000:. ./.:4:117,40:.:-0.51:1.000:. ./.:4:72,134:.: 0.03:1.000:. ./.:4:64,83:.:-0.62:1.000:. ./.:4:34,122:.:-0.52:1.000:. ./.:4:54,98:.:-0.57:1.000:. ./.:4:87,212:.: 1.06:1.000:. ./.:4:134,145:.: 0.84:1.000:. ./.:4:113,127:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,78:.:-0.32:1.000:. ./.:4:75,123:.:-0.06:1.000:. ./.:4:102,183:.: 0.91:1.000:. ./.:4:46,114:.:-0.48:1.000:. ./.:4:45,74:.:-0.93:1.000:. ./.:4:62,124:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,172:.: 0.96:1.000:. ./.:4:113,35:.:-0.61:1.000:. ./.:4:108,188:.: 1.03:1.000:. ./.:4:107,78:.:-0.20:1.000:. ./.:6:33,55:.:-1.28:1.000:. ./.:4:48,40:.:-1.28:1.000:. ./.:4:21,194:.: 0.13:1.000:. ./.:4:48,68:.:-0.97:1.000:. ./.:4:38,108:.:-0.63:1.000:. ./.:4:65,88:.:-0.56:1.000:. ./.:4:82,126:.: 0.05:1.000:. ./.:4:54,48:.:-1.12:1.000:. ./.:4:70,91:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,138:.:-0.21:0.777:. ./.:4:59,167:.: 0.25:1.000:. ./.:4:71,87:.:-0.50:1.000:. ./.:4:39,161:.:-0.04:1.000:. ./.:4:183,135:.: 1.28:1.000:. ./.:4:33,280:.: 1.22:1.000:. ./.:4:51,145:.:-0.08:1.000:. ./.:4:40,154:.:-0.10:1.000:. ./.:4:54,128:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,53:.:-1.19:1.000:. ./.:4:114,105:.: 0.18:1.000:. ./.:4:41,130:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,28:.:-0.98:0.608:. ./.:4:64,128:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,80:.:-0.82:1.000:. ./.:4:53,183:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,67:.:-1.01:1.000:. ./.:4:49,87:.:-0.75:1.000:. ./.:4:93,60:.:-0.56:1.000:. ./.:4:53,117:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,87:.:-0.66:1.000:. ./.:4:63,123:.:-0.19:1.000:. ./.:3:6,64:.:-1.48:1.000:. ./.:4:47,144:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,204:.: 0.40:1.000:. ./.:4:63,61:.:-0.88:1.000:. ./.:4:40,77:.:-0.96:1.000:. ./.:4:101,82:.:-0.22:1.000:. ./.:4:43,100:.:-0.67:1.000:. ./.:4:37,108:.:-0.65:1.000:. ./.:4:47,93:.:-0.70:1.000:. ./.:4:78,79:.:-0.51:1.000:. ./.:4:64,135:.:-0.05:1.000:. ./.:4:88,89:.:-0.29:1.000:. ./.:4:14,67:.:-1.36:1.000:. ./.:4:62,38:.:-1.15:1.000:. ./.:4:33,109:.:-0.68:1.000:. ./.:4:78,124:.:-0.01:1.000:. ./.:4:47,59:.:-1.08:1.000:. ./.:4:32,190:.: 0.21:1.000:. ./.:4:48,208:.: 0.59:1.000:. ./.:4:100,185:.: 0.91:1.000:. ./.:4:38,84:.:-0.90:1.000:. ./.:4:49,311:.: 1.74:1.000:. ./.:4:40,109:.:-0.60:1.000:. ./.:4:43,59:.:-1.12:1.000:. ./.:4:44,57:.:-1.13:0.985:. ./.:4:62,90:.:-0.57:1.000:. ./.:4:63,115:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,135:.:-0.56:1.000:. ./.:4:26,97:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,129:.:-0.43:1.000:. ./.:4:70,128:.:-0.06:1.000:. ./.:4:51,125:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,55:.:-0.79:1.000:. ./.:4:79,201:.: 0.85:1.000:. ./.:4:39,105:.:-0.66:1.000:. ./.:4:55,95:.:-0.59:1.000:. ./.:4:41,92:.:-0.78:1.000:. ./.:4:81,62:.:-0.67:1.000:. ./.:4:15,102:.:-0.96:1.000:. ./.:4:47,71:.:-0.95:1.000:. ./.:4:71,83:.:-0.55:1.000:. ./.:4:70,164:.: 0.34:1.000:. ./.:4:35,42:.:-1.40:1.000:. ./.:4:42,104:.:-0.63:1.000:. ./.:4:64,24:.:-1.28:1.000:. ./.:4:113,149:.: 0.65:1.000:. ./.:4:69,79:.:-0.61:1.000:. ./.:4:22,36:.:-1.61:1.000:. ./.:4:33,56:.:-1.27:1.000:. ./.:4:41,41:.:-1.35:1.000:. ./.:4:44,108:.:-0.57:1.000:. ./.:4:73,24:.:-1.18:1.000:. ./.:4:28,142:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,39:.:-1.49:1.000:. ./.:4:146,120:.: 0.70:1.000:. ./.:4:31,228:.: 0.62:1.000:. ./.:4:158,188:.: 1.59:1.000:. ./.:4:53,109:.:-0.46:1.000:. ./.:4:98,187:.: 0.91:1.000:. ./.:4:77,142:.: 0.18:1.000:. ./.:4:55,214:.: 0.73:1.000:. ./.:4:139,220:.: 1.73:1.000:. ./.:4:10,48:.:-1.61:1.000:. ./.:4:22,119:.:-0.69:1.000:. ./.:4:57,117:.:-0.32:1.000:. ./.:4:141,161:.: 1.10:1.000:. ./.:4:104,146:.: 0.52:1.000:. ./.:4:72,304:.: 1.92:1.000:. ./.:4:105,69:.:-0.32:0.998:. ./.:4:68,191:.: 0.62:1.000:. ./.:4:112,120:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,214:.: 0.78:1.000:. ./.:4:51,155:.: 0.03:1.000:. ./.:4:147,242:.: 2.06:1.000:. ./.:4:61,172:.: 0.33:1.000:. ./.:4:161,236:.: 2.15:1.000:. ./.:4:103,137:.: 0.41:1.000:. ./.:4:116,83:.:-0.05:0.999:. ./.:4:105,105:.: 0.08:1.000:. ./.:4:137,98:.: 0.35:1.000:. ./.:4:94,186:.: 0.85:1.000:. ./.:4:73,138:.: 0.09:1.000:. ./.:4:25,248:.: 0.78:1.000:. ./.:4:77,126:.: 0.00:1.000:. ./.:4:21,185:.: 0.03:1.000:. ./.:4:73,167:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,295:.: 1.48:1.000:. ./.:4:62,113:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,289:.: 2.21:1.000:. ./.:4:53,185:.: 0.39:1.000:. ./.:4:197,194:.: 2.09:1.000:. ./.:4:154,245:.: 2.18:1.000:. ./.:4:191,174:.: 1.80:1.000:. ./.:4:27,134:.:-0.47:1.000:. ./.:4:103,127:.: 0.30:1.000:. -chr2.1 41649168 chr2.1_041649168 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:501,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:509,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:416,6:.: 0.46:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:624,8:.: 2.01:1.000:. ./.:4:367,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:557,11:.: 1.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:49,1:.:-2.28:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:345,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:620,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:608,8:.: 1.89:1.000:. ./.:4:620,5:.: 1.96:0.998:. ./.:4:351,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:538,7:.: 1.37:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:602,10:.: 1.86:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:335,9:.:-0.11:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:463,6:.: 0.81:1.000:. ./.:4:411,5:.: 0.42:1.000:. ./.:4:257,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:453,6:.: 0.73:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:50,1:.:-2.27:1.000:. ./.:3:11,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:275,9:.:-0.56:1.000:. ./.:4:393,10:.: 0.32:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:582,3:.: 1.66:1.000:. ./.:4:274,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:353,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:479,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:98,4:.:-1.90:1.000:. ./.:4:442,3:.: 0.63:1.000:. ./.:4:336,4:.:-0.14:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:600,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:269,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:413,4:.: 0.42:1.000:. ./.:4:498,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:481,5:.: 0.93:1.000:. ./.:4:338,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.01:1.000:. ./.:6:261,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:264,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:385,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:270,4:.:-0.63:0.777:. ./.:4:431,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:305,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:349,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.23:0.608:. ./.:4:355,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:431,4:.: 0.56:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:287,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:432,4:.: 0.57:1.000:. ./.:4:236,3:.:-0.89:1.000:. ./.:4:283,4:.:-0.53:1.000:. ./.:4:268,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:273,1:.:-0.63:1.000:. ./.:3:231,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:320,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:285,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:400,5:.: 0.34:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:326,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:240,3:.:-0.86:1.000:. ./.:4:547,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:109,6:.:-1.80:1.000:. ./.:4:393,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:263,3:.:-0.69:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:358,6:.: 0.03:1.000:. ./.:4:381,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:534,5:.: 1.32:1.000:. ./.:4:613,9:.: 1.94:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:437,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:558,5:.: 1.50:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.11:0.985:. ./.:4:249,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:287,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:344,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:338,5:.:-0.12:1.000:. ./.:4:246,11:.:-0.75:1.000:. ./.:4:491,5:.: 1.01:1.000:. ./.:4:325,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:303,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:296,3:.:-0.45:1.000:. ./.:4:263,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:195,3:.:-1.19:1.000:. ./.:4:642,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:217,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:384,3:.: 0.20:1.000:. ./.:4:528,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:426,3:.: 0.51:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:301,8:.:-0.37:1.000:. ./.:4:375,8:.: 0.17:1.000:. ./.:4:427,8:.: 0.56:1.000:. ./.:4:207,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:404,6:.: 0.37:1.000:. ./.:4:474,4:.: 0.87:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:451,5:.: 0.71:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:449,13:.: 0.76:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:49,2:.:-2.27:1.000:. ./.:4:390,3:.: 0.25:1.000:. ./.:4:335,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:426,11:.: 0.57:1.000:. ./.:4:541,2:.: 1.35:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:354,7:.: 0.01:0.998:. ./.:4:292,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:418,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:223,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:402,9:.: 0.38:1.000:. ./.:4:605,7:.: 1.86:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:386,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:291,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:552,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:426,7:.: 0.54:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:463,7:.: 0.82:1.000:. ./.:4:435,9:.: 0.62:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:519,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:273,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:389,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:496,0:.: 1.01:1.000:. -chr2.1 41830665 chr2.1_041830665 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,156:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,164:.: 1.45:1.000:. ./.:4:45,116:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,180:.: 1.85:1.000:. ./.:4:19,57:.:-0.75:1.000:. ./.:4:42,97:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,168:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,11:.:-2.37:1.000:. ./.:4:0,17:.:-2.22:1.000:. ./.:4:1,74:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,101:.: 0.88:1.000:. ./.:4:29,82:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.98:1.000:. ./.:4:55,90:.: 0.98:1.000:. ./.:4:36,89:.: 0.48:0.998:. ./.:4:48,64:.: 0.15:1.000:. ./.:4:55,131:.: 2.00:1.000:. ./.:4:42,79:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.42:1.000:. ./.:4:0,154:.: 1.20:1.000:. ./.:4:41,108:.: 1.08:1.000:. ./.:4:30,74:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.45:1.000:. ./.:4:33,119:.: 1.15:1.000:. ./.:4:51,145:.: 2.25:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.80:1.000:. ./.:4:56,145:.: 2.38:1.000:. ./.:4:33,82:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,13:.:-2.32:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.42:1.000:. ./.:3:2,2:.:-2.55:1.000:. ./.:4:42,81:.: 0.43:1.000:. ./.:4:44,102:.: 1.00:1.000:. ./.:4:43,80:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1,125:.: 0.50:1.000:. ./.:4:32,102:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.75:1.000:. ./.:4:30,100:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.32:1.000:. ./.:4:33,100:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.95:1.000:. ./.:4:40,74:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.53:1.000:. ./.:4:29,44:.:-0.82:1.000:. ./.:4:28,53:.:-0.62:1.000:. ./.:4:21,45:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.25:1.000:. ./.:4:20,46:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,93:.: 0.88:1.000:. ./.:4:26,72:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.67:1.000:. ./.:4:25,35:.:-1.15:1.000:. ./.:4:32,65:.:-0.22:1.000:. ./.:6:0,74:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,96:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.05:1.000:. ./.:4:24,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.80:1.000:. ./.:4:36,87:.: 0.43:0.777:. ./.:4:0,82:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.30:1.000:. ./.:4:22,51:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.65:1.000:. ./.:4:34,93:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.05:1.000:. ./.:4:30,87:.: 0.28:1.000:. ./.:4:21,76:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.87:1.000:. ./.:4:33,66:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.60:0.608:. ./.:4:26,65:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.45:1.000:. ./.:4:44,90:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.40:1.000:. ./.:4:27,49:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,40:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,50:.:-0.35:1.000:. ./.:3:0,76:.:-0.75:1.000:. ./.:4:27,83:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,88:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,152:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.52:1.000:. ./.:4:16,49:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,61:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.07:1.000:. ./.:4:23,43:.:-1.00:1.000:. ./.:4:27,53:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.10:1.000:. ./.:4:15,50:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,56:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.95:1.000:. ./.:4:38,58:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1,197:.: 2.30:1.000:. ./.:4:21,34:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,45:.:-1.00:0.985:. ./.:4:0,89:.:-0.42:1.000:. ./.:4:19,31:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.27:1.000:. ./.:4:23,69:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,50:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.77:1.000:. ./.:4:22,46:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,188:.: 2.05:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:26,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:26,71:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,73:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,74:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,34:.:-1.30:1.000:. ./.:4:27,44:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.62:1.000:. ./.:4:31,55:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,156:.: 1.25:1.000:. ./.:4:38,68:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.13:1.000:. ./.:4:27,52:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,161:.: 1.38:1.000:. ./.:4:48,80:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,1:.:-2.50:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,177:.: 1.78:1.000:. ./.:4:42,66:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,103:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.47:0.998:. ./.:4:0,156:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.52:1.000:. ./.:4:34,84:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,151:.: 1.13:1.000:. ./.:4:35,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,210:.: 2.60:1.000:. ./.:4:34,72:.: 0.00:1.000:. ./.:4:26,65:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.47:0.999:. ./.:4:0,110:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.10:1.000:. ./.:4:30,102:.: 0.65:1.000:. ./.:4:40,94:.: 0.70:1.000:. ./.:4:35,106:.: 0.88:1.000:. ./.:4:25,61:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,82:.: 0.20:1.000:. ./.:4:40,96:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,192:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,156:.: 1.25:1.000:. ./.:4:45,138:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,95:.: 0.83:1.000:. ./.:4:47,98:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.85:1.000:. -chr2.1 42506293 chr2.1_042506293 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:367,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:157,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:156,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:294,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.36:0.998:. ./.:4:303,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:167,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:140,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:248,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:107,1:.:-3.28:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.07:1.000:. ./.:3:99,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:330,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:375,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:367,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:270,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:320,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.22:0.777:. ./.:4:273,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.96:0.608:. ./.:4:297,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.33:1.000:. ./.:3:157,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:172,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:365,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:386,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.65:0.999:. ./.:4:276,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.07:0.985:. ./.:4:343,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:351,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:354,2:.: 1.65:1.000:. ./.:4:400,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:268,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:129,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.32:0.998:. ./.:4:292,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:268,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:271,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:260,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.65:1.000:. -chr2.1 42739112 chr2.1_042739112 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:5,9:0.57:-0.51:1.000:0.941 0/0/1/1:4:6,5:0.42:-0.90:1.000:0.900 0/0/1/1:4:5,6:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,6:0.21: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.65:-0.77:1.000:0.805 0/0/1/1:4:14,12:0.42: 1.04:1.000:0.926 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,7:0.34: 0.13:1.000:0.883 0/0/1/1:4:4,9:0.61:-0.64:1.000:0.706 0/0/0/1:4:27,8:0.21: 2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.47: 2.73:1.000:0.992 0/0/0/0:4:14,1:0.06:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,14:0.67: 0.00:1.000:0.929 0/0/0/1:4:5,2:0.26:-1.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.42: 0.78:1.000:0.915 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.25:0.998:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.46:-0.77:1.000:0.987 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,2:0.08: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,4:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:20,3:0.12: 0.65:1.000:0.753 0/0/1/1:4:10,16:0.55: 1.04:1.000:0.978 0/0/0/1:4:16,11:0.37: 1.17:1.000:0.517 0/0/1/1:4:5,8:0.55:-0.64:1.000:0.978 0/0/1/1:4:14,13:0.44: 1.17:1.000:0.969 0/1/1/1:4:2,12:0.73:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.43:-0.13:1.000:0.950 0/0/0/1:4:25,12:0.30: 2.47:1.000:0.987 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1:3:5,7:0.53:-0.77:1.000:0.867 0/0/0/1:4:18,4:0.17: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,5:0.46:-1.03:1.000:0.987 0/0/1/1:4:9,9:0.46: 0.00:1.000:0.987 0/0/1/1:4:7,5:0.38:-0.77:1.000:0.595 0/0/0/1:4:23,8:0.24: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.31:-0.38:1.000:0.979 0/0/1/1:4:8,8:0.46:-0.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:19,6:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,16:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,9:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,2:0.14:-0.64:1.000:0.970 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 2.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,13:0.24: 4.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.48: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,7:0.49:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.38: 0.78:1.000:0.595 0/0/1/1:4:5,9:0.57:-0.51:1.000:0.941 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,7:0.18: 2.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,7:0.20: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:17,9:0.32: 1.04:1.000:0.913 0/0/0/1:4:21,12:0.33: 1.95:1.000:0.906 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,3:0.09: 1.82:1.000:0.970 0/0/1/1:4:11,8:0.39: 0.13:1.000:0.645 0/0/1/1:4:15,17:0.49: 1.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,9:0.26: 1.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,5:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,18:0.59: 1.17:0.777:0.866 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,7:0.20: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,1:0.04: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,11:0.40: 0.91:1.000:0.818 0/0/1/1:4:6,11:0.58:-0.13:1.000:0.931 0/0/1/1:4:5,10:0.59:-0.38:1.000:0.866 0/0/0/1:4:14,4:0.20: 0.00:0.608:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.29:-0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:10,9:0.43: 0.13:1.000:0.956 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,1:0.04: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:10,2:0.15:-0.77:1.000:0.991 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1:3:5,2:0.26:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,3:0.16:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,8:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,19:0.71: 0.65:1.000:0.991 0/0/0/1:4:14,9:0.36: 0.65:1.000:0.703 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,13:0.40: 1.56:1.000:0.766 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,20:0.59: 1.56:1.000:0.866 0/0/1/1:4:8,6:0.39:-0.51:1.000:0.723 0/1/1/1:4:0,10:0.85:-1.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:12,2:0.13:-0.51:1.000:0.918 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.29: 0.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:7,7:0.46:-0.51:1.000:0.987 0/0/1/1:4:5,10:0.59:-0.38:1.000:0.866 0/0/0/1:4:10,4:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,6:0.85:-1.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:6,6:0.46:-0.77:1.000:0.987 0/0/0/1:4:14,2:0.11:-0.25:0.999:0.625 0/0/0/1:4:8,5:0.35:-0.64:1.000:0.768 0/0/0/1:4:13,7:0.32: 0.26:0.985:0.951 0/0/1/1:4:14,12:0.42: 1.04:1.000:0.926 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:3,4:0.52:-1.42:1.000:0.995 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.38: 0.78:1.000:0.595 0/0/0/1:4:17,10:0.34: 1.17:1.000:0.872 0/1/1/1:4:1,10:0.77:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,11:0.61:-0.25:1.000:0.743 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,10:0.59:-0.38:1.000:0.866 0/0/1/1:4:8,12:0.54: 0.26:1.000:0.987 0/0/0/0:4:12,1:0.07:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.28:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,6:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,6:0.42:-0.64:1.000:0.926 0/0/0/1:4:6,1:0.13:-1.42:1.000:0.918 0/0/0/1:4:10,3:0.21:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.42: 0.78:1.000:0.915 0/0/0/1:4:12,5:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:19,2:0.09: 0.39:1.000:0.963 0/0/0/1:4:17,7:0.27: 0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:21,6:0.20: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,9:0.33: 0.91:1.000:0.921 0/1/1/1:4:2,8:0.69:-1.03:1.000:0.971 0/0/0/1:4:8,3:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,6:0.31: 0.00:1.000:0.979 0/0/1/1:4:4,6:0.54:-1.03:1.000:0.987 0/0/0/1:4:7,4:0.33:-0.90:1.000:0.906 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.29: 0.52:1.000:0.991 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,12:0.73:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.33: 0.52:1.000:0.906 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,6:0.73:-1.42:0.998:0.998 0/0/1/1:4:5,11:0.61:-0.25:1.000:0.743 0/0/0/1:4:13,2:0.12:-0.38:1.000:0.806 0/0/0/1:4:9,5:0.33:-0.51:1.000:0.931 0/0/0/0:4:10,1:0.08:-0.90:1.000:0.980 0/0/0/1:4:8,3:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,6:0.65:-1.29:1.000:0.805 0/0/1/1:4:12,10:0.42: 0.52:1.000:0.900 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-1.81:1.000:0.987 0/0/0/1:4:13,5:0.25: 0.00:0.999:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,2:0.11:-0.13:1.000:0.584 0/0/0/1:4:23,7:0.21: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.29:-0.25:1.000:0.993 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,1:0.05: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,3:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.67:-1.16:1.000:0.929 0/0/1/1:4:6,10:0.56:-0.25:1.000:0.969 0/1/1/1:4:3,8:0.63:-0.90:1.000:0.623 0/1/1/1:4:5,15:0.65: 0.26:1.000:0.805 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,9:0.33: 0.91:1.000:0.921 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,9:0.32: 1.04:1.000:0.960 -chr2.1 42778272 chr2.1_042778272 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,143:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,125:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,83:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,48:.:-2.49:1.000:. ./.:4:0,41:.:-2.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,118:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.24:0.998:. ./.:4:0,108:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,173:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,42:.:-2.67:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,29:.:-3.08:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,70:.:-1.80:1.000:. ./.:4:0,16:.:-3.48:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.86:1.000:. ./.:3:0,12:.:-3.61:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,190:.: 1.94:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,172:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,27:.:-3.14:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,160:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.35:1.000:. ./.:6:0,140:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,161:.: 1.03:0.777:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,156:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,134:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,124:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,175:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,161:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,195:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,89:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.29:1.000:. ./.:3:0,121:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,174:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,2:.:-3.92:1.000:. ./.:4:0,173:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,165:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.78:0.999:. ./.:4:0,161:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.37:0.985:. ./.:4:0,138:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,171:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,163:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,166:.: 1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,126:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,175:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,173:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1,134:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,53:.:-2.33:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.05:0.998:. ./.:4:0,128:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,100:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,196:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 43006909 chr2.1_043006909 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:567,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:640,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:574,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:123,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:672,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:543,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.60:0.998:. ./.:4:700,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:646,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:594,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:55,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:588,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:629,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.84:1.000:. ./.:3:41,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:527,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:354,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:715,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:744,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:589,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.38:1.000:. ./.:6:291,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:327,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.95:0.777:. ./.:4:618,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:597,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:604,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:352,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.54:0.608:. ./.:4:457,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:456,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.23:1.000:. ./.:3:221,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:281,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:480,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:560,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:734,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:711,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:417,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:315,0:.:-1.13:0.993:. ./.:4:467,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:445,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:306,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:609,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:763,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:308,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:665,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:670,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:693,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:734,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.03:0.998:. ./.:4:483,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:681,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:726,1:.: 1.89:0.999:. ./.:4:500,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:333,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:405,3:.:-0.45:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:586,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:613,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:726,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:762,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:628,0:.: 1.17:1.000:. -chr2.1 43201762 chr2.1_043201762 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,201:.: 0.81:1.000:. ./.:4:16,171:.: 0.34:1.000:. ./.:4:24,124:.:-0.43:1.000:. ./.:4:15,181:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,91:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,190:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,77:.:-1.63:1.000:. ./.:4:23,197:.: 0.99:1.000:. ./.:4:25,118:.:-0.52:1.000:. ./.:4:19,25:.:-2.47:1.000:. ./.:4:6,36:.:-2.51:1.000:. ./.:4:24,120:.:-0.50:1.000:. ./.:4:9,185:.: 0.48:1.000:. ./.:4:33,167:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,198:.: 0.76:1.000:. ./.:4:23,128:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,266:.: 1.90:0.998:. ./.:4:24,148:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,339:.: 3.33:1.000:. ./.:4:17,224:.: 1.40:1.000:. ./.:4:9,74:.:-1.71:1.000:. ./.:4:11,180:.: 0.42:1.000:. ./.:4:12,211:.: 1.05:1.000:. ./.:4:26,112:.:-0.62:1.000:. ./.:4:17,17:.:-2.67:1.000:. ./.:4:12,234:.: 1.50:1.000:. ./.:4:6,180:.: 0.32:1.000:. ./.:4:27,65:.:-1.53:1.000:. ./.:4:14,213:.: 1.13:1.000:. ./.:4:26,62:.:-1.61:1.000:. ./.:4:11,197:.: 0.76:1.000:. ./.:4:22,88:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,25:.:-2.85:1.000:. ./.:4:25,45:.:-1.96:1.000:. ./.:3:3,31:.:-2.67:1.000:. ./.:4:9,201:.: 0.79:1.000:. ./.:4:14,193:.: 0.74:1.000:. ./.:4:24,153:.: 0.14:1.000:. ./.:4:18,203:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,175:.: 0.91:1.000:. ./.:4:14,148:.:-0.15:1.000:. ./.:4:33,134:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,301:.: 2.59:1.000:. ./.:4:12,155:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,171:.: 0.30:1.000:. ./.:4:21,212:.: 1.25:1.000:. ./.:4:29,146:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,199:.: 0.72:1.000:. ./.:4:7,179:.: 0.32:1.000:. ./.:4:3,186:.: 0.38:1.000:. ./.:4:27,107:.:-0.70:1.000:. ./.:4:59,93:.:-0.35:1.000:. ./.:4:31,95:.:-0.86:1.000:. ./.:4:27,192:.: 0.97:1.000:. ./.:4:8,174:.: 0.24:1.000:. ./.:4:12,208:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,114:.:-0.54:1.000:. ./.:4:20,128:.:-0.43:1.000:. ./.:4:12,173:.: 0.30:1.000:. ./.:6:7,122:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,159:.: 0.13:1.000:. ./.:4:14,129:.:-0.52:1.000:. ./.:4:24,203:.: 1.13:1.000:. ./.:4:16,188:.: 0.68:1.000:. ./.:4:10,177:.: 0.34:1.000:. ./.:4:13,170:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,82:.:-1.31:1.000:. ./.:4:33,100:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,162:.:-0.07:0.777:. ./.:4:14,155:.:-0.01:1.000:. ./.:4:42,131:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.93:1.000:. ./.:4:14,215:.: 1.17:1.000:. ./.:4:25,225:.: 1.58:1.000:. ./.:4:16,175:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,223:.: 1.05:1.000:. ./.:4:13,204:.: 0.93:1.000:. ./.:4:55,61:.:-1.06:1.000:. ./.:4:49,129:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,167:.: 0.70:1.000:. ./.:4:18,81:.:-1.39:0.608:. ./.:4:0,272:.: 2.02:1.000:. ./.:4:21,184:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,254:.: 1.66:1.000:. ./.:4:29,146:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,77:.:-0.86:1.000:. ./.:4:6,129:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,120:.:-0.64:1.000:. ./.:4:40,60:.:-1.37:1.000:. ./.:4:29,112:.:-0.56:1.000:. ./.:3:20,34:.:-2.28:1.000:. ./.:4:0,221:.: 1.01:1.000:. ./.:4:22,223:.: 1.48:1.000:. ./.:4:10,145:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,148:.: 0.30:1.000:. ./.:4:41,110:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,136:.:-0.25:1.000:. ./.:4:10,162:.: 0.05:1.000:. ./.:4:19,179:.: 0.56:1.000:. ./.:4:36,150:.: 0.32:1.000:. ./.:4:24,95:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,136:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,79:.:-1.23:1.000:. ./.:4:58,62:.:-0.98:1.000:. ./.:4:8,130:.:-0.62:1.000:. ./.:4:22,174:.: 0.52:1.000:. ./.:4:33,95:.:-0.82:1.000:. ./.:4:11,190:.: 0.62:1.000:. ./.:4:40,209:.: 1.56:1.000:. ./.:4:22,110:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,136:.:-0.05:1.000:. ./.:4:23,173:.: 0.52:1.000:. ./.:4:61,77:.:-0.62:0.999:. ./.:4:15,192:.: 0.74:1.000:. ./.:4:11,69:.:-1.76:0.993:. ./.:4:16,202:.: 0.95:1.000:. ./.:4:11,167:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,176:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,177:.: 0.64:1.000:. ./.:4:18,173:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,147:.: 0.01:1.000:. ./.:4:29,103:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:20,126:.:-0.47:1.000:. ./.:4:25,107:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,233:.: 1.25:1.000:. ./.:4:11,146:.:-0.25:1.000:. ./.:4:10,111:.:-0.96:1.000:. ./.:4:8,124:.:-0.74:1.000:. ./.:4:7,143:.:-0.39:1.000:. ./.:4:20,97:.:-1.04:1.000:. ./.:4:9,185:.: 0.48:1.000:. ./.:4:8,108:.:-1.06:1.000:. ./.:4:19,116:.:-0.68:1.000:. ./.:4:26,120:.:-0.47:1.000:. ./.:4:23,174:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,201:.: 0.87:1.000:. ./.:4:11,151:.:-0.15:1.000:. ./.:4:20,88:.:-1.21:1.000:. ./.:4:13,136:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,165:.: 0.34:1.000:. ./.:4:16,159:.: 0.11:1.000:. ./.:4:9,159:.:-0.03:1.000:. ./.:4:7,119:.:-0.86:1.000:. ./.:4:76,96:.: 0.05:1.000:. ./.:4:43,171:.: 0.87:1.000:. ./.:4:37,145:.: 0.24:1.000:. ./.:4:34,120:.:-0.31:1.000:. ./.:4:37,174:.: 0.81:1.000:. ./.:4:39,132:.: 0.03:1.000:. ./.:4:20,235:.: 1.68:1.000:. ./.:4:13,192:.: 0.70:1.000:. ./.:4:6,49:.:-2.26:1.000:. ./.:4:8,109:.:-1.04:1.000:. ./.:4:9,216:.: 1.09:1.000:. ./.:4:25,213:.: 1.35:1.000:. ./.:4:31,164:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,231:.: 1.46:1.000:. ./.:4:27,54:.:-1.74:0.998:. ./.:4:35,154:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,116:.:-0.54:1.000:. ./.:4:8,167:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,127:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,102:.:-0.92:1.000:. ./.:4:6,128:.:-0.70:1.000:. ./.:4:22,130:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,117:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,158:.: 0.40:0.999:. ./.:4:23,122:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,81:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,224:.: 1.07:1.000:. ./.:4:8,164:.: 0.05:1.000:. ./.:4:14,210:.: 1.07:1.000:. ./.:4:12,171:.: 0.26:1.000:. ./.:4:14,129:.:-0.52:1.000:. ./.:4:23,139:.:-0.15:1.000:. ./.:4:38,144:.: 0.24:1.000:. ./.:4:8,197:.: 0.70:1.000:. ./.:4:18,111:.:-0.80:1.000:. ./.:4:29,138:.:-0.05:1.000:. ./.:4:24,151:.: 0.11:1.000:. ./.:4:30,172:.: 0.64:1.000:. ./.:4:10,180:.: 0.40:1.000:. ./.:4:21,204:.: 1.09:1.000:. -chr2.1 43489993 chr2.1_043489993 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1500,17:.: 0.87:1.000:. ./.:4:880,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1541,34:.: 1.02:1.000:. ./.:4:1263,17:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1905,15:.: 1.95:1.000:. ./.:4:1296,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:901,9:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1478,13:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1096,36:.:-0.16:1.000:. ./.:4:189,3:.:-2.68:1.000:. ./.:4:186,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:792,18:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1249,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1286,12:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1243,38:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1589,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1602,12:.: 1.13:0.998:. ./.:4:1327,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1704,19:.: 1.42:1.000:. ./.:4:1602,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:225,4:.:-2.58:1.000:. ./.:4:1440,27:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1252,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1085,16:.:-0.25:1.000:. ./.:4:119,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:1361,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1270,14:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1396,9:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1356,30:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1316,12:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1349,30:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1189,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:77,1:.:-2.99:1.000:. ./.:4:221,3:.:-2.60:1.000:. ./.:3:72,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:1226,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1503,17:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1619,14:.: 1.18:1.000:. ./.:4:1146,27:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1595,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1225,16:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1353,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1689,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:1253,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1521,11:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1313,20:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1527,29:.: 0.97:1.000:. ./.:4:136,1:.:-2.83:1.000:. ./.:4:1084,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:451,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:1049,13:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1742,30:.: 1.55:1.000:. ./.:4:1107,36:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1465,12:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1320,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1038,20:.:-0.36:1.000:. ./.:4:942,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1223,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1072,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:921,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1119,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1386,44:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1482,8:.: 0.79:1.000:. ./.:4:930,17:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1330,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1326,15:.: 0.39:1.000:. ./.:4:704,3:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1242,17:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1238,0:.: 0.12:0.777:. ./.:4:1025,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1173,13:.:-0.02:1.000:. ./.:4:708,11:.:-1.27:1.000:. ./.:4:1016,14:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1682,37:.: 1.41:1.000:. ./.:4:1012,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1202,10:.: 0.05:1.000:. ./.:4:996,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1414,10:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1255,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:1361,29:.: 0.53:1.000:. ./.:4:667,0:.:-1.41:0.608:. ./.:4:1306,18:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1423,36:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1193,10:.: 0.03:1.000:. ./.:4:952,9:.:-0.62:1.000:. ./.:4:1309,12:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1004,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1248,7:.: 0.16:1.000:. ./.:4:991,20:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1223,12:.: 0.11:1.000:. ./.:3:824,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:1394,18:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1631,16:.: 1.21:1.000:. ./.:4:924,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1125,34:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1097,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:979,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:656,24:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1277,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1638,21:.: 1.25:1.000:. ./.:4:654,11:.:-1.42:1.000:. ./.:4:1255,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:665,14:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1400,10:.: 0.58:1.000:. ./.:4:962,8:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1270,8:.: 0.23:1.000:. ./.:4:961,19:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1200,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1890,34:.: 1.96:1.000:. ./.:4:1506,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1035,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1968,27:.: 2.15:1.000:. ./.:4:1269,25:.: 0.27:0.999:. ./.:4:1465,16:.: 0.77:1.000:. ./.:4:577,9:.:-1.63:0.993:. ./.:4:1082,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:859,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1001,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1074,30:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1004,27:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1606,45:.: 1.23:1.000:. ./.:4:977,7:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1442,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1439,16:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1182,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1154,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1158,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:478,7:.:-1.90:1.000:. ./.:4:828,29:.:-0.90:1.000:. ./.:4:726,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1059,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1205,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:746,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:1271,13:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1258,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1630,40:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1260,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1019,15:.:-0.43:1.000:. ./.:4:740,15:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1146,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1078,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:924,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1149,20:.:-0.07:1.000:. ./.:4:713,13:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1812,19:.: 1.71:1.000:. ./.:4:1971,32:.: 2.17:1.000:. ./.:4:1666,14:.: 1.30:1.000:. ./.:4:1407,14:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1760,19:.: 1.57:1.000:. ./.:4:1333,41:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1587,13:.: 1.09:1.000:. ./.:4:1489,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:133,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:950,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1706,26:.: 1.44:1.000:. ./.:4:1342,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1462,36:.: 0.82:1.000:. ./.:4:1417,21:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1236,18:.: 0.16:0.998:. ./.:4:1687,21:.: 1.38:1.000:. ./.:4:1343,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1387,25:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1181,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1406,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1019,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1124,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1203,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:978,15:.:-0.54:0.999:. ./.:4:1432,22:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1086,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1023,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:995,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1330,29:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1147,21:.:-0.07:1.000:. ./.:4:993,24:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1151,12:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1719,33:.: 1.50:1.000:. ./.:4:1515,11:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1150,15:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1168,29:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1209,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1567,19:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1475,19:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1000,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1063,18:.:-0.30:1.000:. -chr2.1 43689452 chr2.1_043689452 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1048,425:.: 1.97:1.000:. ./.:4:481,177:.:-1.28:1.000:. ./.:4:691,119:.:-0.67:1.000:. ./.:4:723,138:.:-0.47:1.000:. ./.:4:940,139:.: 0.40:1.000:. ./.:4:693,146:.:-0.56:1.000:. ./.:4:503,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:692,118:.:-0.67:1.000:. ./.:4:858,239:.: 0.47:1.000:. ./.:4:615,78:.:-1.14:1.000:. ./.:4:799,239:.: 0.24:1.000:. ./.:4:599,195:.:-0.73:1.000:. ./.:4:704,124:.:-0.60:1.000:. ./.:4:865,136:.: 0.09:1.000:. ./.:4:636,233:.:-0.44:1.000:. ./.:4:694,125:.:-0.64:1.000:. ./.:4:754,264:.: 0.16:0.998:. ./.:4:478,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:911,320:.: 1.00:1.000:. ./.:4:696,143:.:-0.56:1.000:. ./.:4:774,222:.: 0.07:1.000:. ./.:4:719,235:.:-0.10:1.000:. ./.:4:847,128:.:-0.01:1.000:. ./.:4:805,99:.:-0.30:1.000:. ./.:4:420,73:.:-1.93:1.000:. ./.:4:851,136:.: 0.03:1.000:. ./.:4:628,130:.:-0.88:1.000:. ./.:4:754,119:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1084,443:.: 2.18:1.000:. ./.:4:824,131:.:-0.09:1.000:. ./.:4:775,155:.:-0.19:1.000:. ./.:4:648,93:.:-0.95:1.000:. ./.:4:470,139:.:-1.47:1.000:. ./.:4:634,160:.:-0.73:1.000:. ./.:3:253,15:.:-2.83:1.000:. ./.:4:742,230:.:-0.03:1.000:. ./.:4:691,148:.:-0.56:1.000:. ./.:4:844,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1075,472:.: 2.26:1.000:. ./.:4:603,122:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1115,278:.: 1.65:1.000:. ./.:4:961,273:.: 1.02:1.000:. ./.:4:929,283:.: 0.93:1.000:. ./.:4:825,269:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1050,178:.: 0.99:1.000:. ./.:4:915,301:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1010,144:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1181,187:.: 1.55:1.000:. ./.:4:684,153:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1390,355:.: 3.05:1.000:. ./.:4:894,133:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1053,143:.: 0.86:1.000:. ./.:4:821,137:.:-0.08:1.000:. ./.:4:894,284:.: 0.79:1.000:. ./.:4:676,119:.:-0.73:1.000:. ./.:4:979,276:.: 1.10:1.000:. ./.:4:812,248:.: 0.32:1.000:. ./.:4:773,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:902,274:.: 0.79:1.000:. ./.:6:801,253:.: 0.30:1.000:. ./.:4:952,299:.: 1.08:1.000:. ./.:4:701,112:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1114,316:.: 1.80:1.000:. ./.:4:873,137:.: 0.12:1.000:. ./.:4:879,309:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1070,412:.: 2.00:1.000:. ./.:4:571,93:.:-1.25:1.000:. ./.:4:884,255:.: 0.64:1.000:. ./.:4:979,171:.: 0.68:0.777:. ./.:4:580,213:.:-0.74:1.000:. ./.:4:839,150:.: 0.04:1.000:. ./.:4:602,207:.:-0.68:1.000:. ./.:4:851,370:.: 0.96:1.000:. ./.:4:739,103:.:-0.54:1.000:. ./.:4:479,144:.:-1.42:1.000:. ./.:4:728,288:.: 0.15:1.000:. ./.:4:785,131:.:-0.25:1.000:. ./.:4:816,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:941,131:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1143,278:.: 1.76:1.000:. ./.:4:522,124:.:-1.32:0.608:. ./.:4:1094,391:.: 2.01:1.000:. ./.:4:1295,472:.: 3.14:1.000:. ./.:4:617,212:.:-0.60:1.000:. ./.:4:804,172:.:-0.01:1.000:. ./.:4:744,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:717,205:.:-0.23:1.000:. ./.:4:631,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:929,123:.: 0.29:1.000:. ./.:4:619,106:.:-1.01:1.000:. ./.:3:520,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:807,254:.: 0.33:1.000:. ./.:4:860,138:.: 0.08:1.000:. ./.:4:571,180:.:-0.91:1.000:. ./.:4:1052,250:.: 1.29:1.000:. ./.:4:818,157:.:-0.01:1.000:. ./.:4:852,120:.:-0.03:1.000:. ./.:4:617,228:.:-0.53:1.000:. ./.:4:962,176:.: 0.63:1.000:. ./.:4:665,109:.:-0.81:1.000:. ./.:4:763,136:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1056,151:.: 0.91:1.000:. ./.:4:614,119:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1027,153:.: 0.80:1.000:. ./.:4:741,96:.:-0.56:1.000:. ./.:4:840,245:.: 0.42:1.000:. ./.:4:738,235:.:-0.02:1.000:. ./.:4:946,254:.: 0.88:1.000:. ./.:4:912,148:.: 0.32:1.000:. ./.:4:657,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:1071,262:.: 1.41:1.000:. ./.:4:827,146:.:-0.02:1.000:. ./.:4:990,177:.: 0.75:0.999:. ./.:4:807,290:.: 0.47:1.000:. ./.:4:865,119:.: 0.02:0.993:. ./.:4:1189,424:.: 2.52:1.000:. ./.:4:704,132:.:-0.57:1.000:. ./.:4:785,247:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1003,260:.: 1.13:1.000:. ./.:4:953,238:.: 0.84:1.000:. ./.:4:894,121:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1017,135:.: 0.69:1.000:. ./.:4:827,158:.: 0.03:1.000:. ./.:4:685,118:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1075,246:.: 1.36:1.000:. ./.:4:917,266:.: 0.81:1.000:. ./.:4:897,148:.: 0.26:1.000:. ./.:4:906,374:.: 1.20:1.000:. ./.:4:581,107:.:-1.16:1.000:. ./.:4:596,97:.:-1.14:1.000:. ./.:4:930,127:.: 0.31:1.000:. ./.:4:629,228:.:-0.48:1.000:. ./.:4:559,153:.:-1.06:1.000:. ./.:4:968,174:.: 0.65:1.000:. ./.:4:779,212:.: 0.05:1.000:. ./.:4:970,291:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1080,420:.: 2.07:1.000:. ./.:4:795,252:.: 0.27:1.000:. ./.:4:879,250:.: 0.60:1.000:. ./.:4:837,248:.: 0.42:1.000:. ./.:4:892,281:.: 0.77:1.000:. ./.:4:949,278:.: 0.99:1.000:. ./.:4:627,230:.:-0.48:1.000:. ./.:4:909,358:.: 1.15:1.000:. ./.:4:939,148:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1055,167:.: 0.97:1.000:. ./.:4:779,114:.:-0.34:1.000:. ./.:4:804,149:.:-0.10:1.000:. ./.:4:783,132:.:-0.25:1.000:. ./.:4:747,102:.:-0.52:1.000:. ./.:4:837,295:.: 0.61:1.000:. ./.:4:571,98:.:-1.23:1.000:. ./.:4:441,125:.:-1.64:1.000:. ./.:4:499,206:.:-1.09:1.000:. ./.:4:775,249:.: 0.18:1.000:. ./.:4:664,137:.:-0.71:1.000:. ./.:4:891,250:.: 0.65:1.000:. ./.:4:703,241:.:-0.14:1.000:. ./.:4:734,113:.:-0.52:0.998:. ./.:4:834,157:.: 0.05:1.000:. ./.:4:513,122:.:-1.37:1.000:. ./.:4:560,81:.:-1.34:1.000:. ./.:4:591,103:.:-1.13:1.000:. ./.:4:628,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:976,227:.: 0.89:1.000:. ./.:4:742,118:.:-0.47:1.000:. ./.:4:674,139:.:-0.66:1.000:. ./.:4:455,94:.:-1.71:0.999:. ./.:4:591,125:.:-1.05:1.000:. ./.:4:526,120:.:-1.32:1.000:. ./.:4:571,200:.:-0.83:1.000:. ./.:4:506,201:.:-1.08:1.000:. ./.:4:774,131:.:-0.29:1.000:. ./.:4:797,211:.: 0.12:1.000:. ./.:4:758,110:.:-0.44:1.000:. ./.:4:807,236:.: 0.26:1.000:. ./.:4:776,137:.:-0.26:1.000:. ./.:4:794,134:.:-0.20:1.000:. ./.:4:874,255:.: 0.60:1.000:. ./.:4:676,185:.:-0.47:1.000:. ./.:4:918,165:.: 0.42:1.000:. ./.:4:746,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:965,408:.: 1.57:1.000:. ./.:4:521,212:.:-0.98:1.000:. ./.:4:589,236:.:-0.61:1.000:. -chr2.1 44946110 chr2.1_044946110 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:0.998:. ./.:4:1,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.17:1.000:. ./.:6:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:0.777:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:0.608:. ./.:4:19,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:3:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:31,0:.: 3.54:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.35:0.999:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:0.993:. ./.:4:25,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:28,0:.: 3.00:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.08:0.998:. ./.:4:9,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.57:0.999:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:20,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.26:1.000:. -chr2.1 45022364 chr2.1_045022364 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,596:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,453:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,487:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,514:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,610:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,614:.: 0.84:1.000:. ./.:4:58,448:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,535:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,518:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,244:.:-2.25:1.000:. ./.:4:0,333:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,469:.:-0.38:1.000:. ./.:4:40,532:.: 0.49:1.000:. ./.:4:35,628:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,479:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,578:.: 0.54:1.000:. ./.:4:66,646:.: 1.66:0.998:. ./.:4:0,464:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,679:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,696:.: 1.52:1.000:. ./.:4:6,259:.:-2.09:1.000:. ./.:4:0,511:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,623:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,472:.:-0.35:1.000:. ./.:4:6,250:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,605:.: 0.76:1.000:. ./.:4:70,637:.: 1.62:1.000:. ./.:4:1,582:.: 0.58:1.000:. ./.:4:52,662:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,694:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,737:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,548:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,228:.:-2.40:1.000:. ./.:4:0,330:.:-1.54:1.000:. ./.:3:0,121:.:-3.30:1.000:. ./.:4:60,549:.: 0.80:1.000:. ./.:4:36,438:.:-0.34:1.000:. ./.:4:48,524:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,592:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,715:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,540:.: 0.22:1.000:. ./.:4:28,518:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,563:.: 0.41:1.000:. ./.:4:28,397:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,657:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,514:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,593:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,1094:.: 4.86:1.000:. ./.:4:0,494:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,572:.: 0.49:1.000:. ./.:4:21,398:.:-0.80:1.000:. ./.:4:39,530:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,432:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,508:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,531:.: 0.14:1.000:. ./.:4:29,390:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,545:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,492:.:-0.19:1.000:. ./.:6:7,408:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,457:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,440:.:-0.62:1.000:. ./.:4:70,597:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,525:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,526:.: 0.10:1.000:. ./.:4:16,453:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,573:.: 0.49:1.000:. ./.:4:36,551:.: 0.61:1.000:. ./.:4:34,583:.: 0.86:0.777:. ./.:4:1,405:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,668:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,457:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,500:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,388:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,451:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,371:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,521:.: 0.06:1.000:. ./.:4:27,505:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,462:.:-0.44:1.000:. ./.:4:35,581:.: 0.85:1.000:. ./.:4:2,331:.:-1.52:0.608:. ./.:4:32,480:.:-0.02:1.000:. ./.:4:2,513:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,464:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,605:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,552:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,353:.:-1.35:1.000:. ./.:4:14,430:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,438:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,444:.:-0.59:1.000:. ./.:3:0,335:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,479:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,519:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,334:.:-1.51:1.000:. ./.:4:30,510:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,465:.:-0.06:1.000:. ./.:4:26,394:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,388:.:-1.06:1.000:. ./.:4:28,426:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,496:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,490:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,555:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,378:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,451:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,476:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,418:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,496:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,643:.: 1.08:1.000:. ./.:4:64,611:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,501:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,445:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,658:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,487:.:-0.23:0.999:. ./.:4:0,499:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,438:.:-0.52:0.993:. ./.:4:26,520:.: 0.27:1.000:. ./.:4:27,389:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,468:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,469:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,411:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,476:.:-0.32:1.000:. ./.:4:20,443:.:-0.43:1.000:. ./.:4:33,444:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,600:.: 0.72:1.000:. ./.:4:24,417:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,542:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,508:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,396:.:-0.99:1.000:. ./.:4:16,352:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,387:.:-1.07:1.000:. ./.:4:17,402:.:-0.80:1.000:. ./.:4:58,633:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,347:.:-1.40:1.000:. ./.:4:33,536:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.97:1.000:. ./.:4:68,780:.: 2.80:1.000:. ./.:4:0,505:.:-0.08:1.000:. ./.:4:21,448:.:-0.38:1.000:. ./.:4:24,405:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,445:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,447:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,603:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,577:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,371:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,686:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,590:.: 0.64:1.000:. ./.:4:50,458:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,498:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,616:.: 0.85:1.000:. ./.:4:40,516:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,677:.: 1.37:1.000:. ./.:4:46,450:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,252:.:-2.20:1.000:. ./.:4:44,314:.:-1.31:1.000:. ./.:4:44,548:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,497:.:-0.14:1.000:. ./.:4:63,540:.: 0.75:1.000:. ./.:4:58,615:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,441:.:-0.61:0.998:. ./.:4:0,558:.: 0.37:1.000:. ./.:4:48,506:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,346:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,529:.: 0.12:1.000:. ./.:4:87,450:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,627:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,532:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,407:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,401:.:-0.95:0.999:. ./.:4:0,470:.:-0.37:1.000:. ./.:4:48,518:.: 0.43:1.000:. ./.:4:48,451:.:-0.13:1.000:. ./.:4:40,398:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,483:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,514:.: 0.00:1.000:. ./.:4:39,515:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,489:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,767:.: 2.12:1.000:. ./.:4:45,612:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,557:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,535:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,729:.: 1.80:1.000:. ./.:4:63,684:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,422:.:-0.77:1.000:. -chr2.1 45298116 chr2.1_045298116 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,28:.: 0.52:1.000:. ./.:4:69,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:45,68:.: 1.27:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,13:.:-1.55:1.000:. ./.:4:47,56:.: 0.91:1.000:. ./.:4:64,38:.: 0.88:1.000:. ./.:4:7,13:.:-2.05:1.000:. ./.:4:5,7:.:-2.34:1.000:. ./.:4:58,45:.: 0.91:1.000:. ./.:4:66,29:.: 0.63:1.000:. ./.:4:57,24:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:74,30:.: 0.95:1.000:. ./.:4:42,64:.: 1.02:0.998:. ./.:4:52,79:.: 1.92:1.000:. ./.:4:43,86:.: 1.84:1.000:. ./.:4:59,38:.: 0.70:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.59:1.000:. ./.:4:65,37:.: 0.88:1.000:. ./.:4:58,34:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:64,28:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,70:.: 1.52:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:57,32:.: 0.41:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:40,54:.: 0.59:1.000:. ./.:4:46,69:.: 1.34:1.000:. ./.:4:3,3:.:-2.56:1.000:. ./.:4:6,5:.:-2.38:1.000:. ./.:3:2,5:.:-2.52:1.000:. ./.:4:65,36:.: 0.84:1.000:. ./.:4:38,66:.: 0.95:1.000:. ./.:4:64,29:.: 0.56:1.000:. ./.:4:47,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,44:.: 0.16:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:46,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:51,24:.:-0.09:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:40,69:.: 1.13:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:66,20:.: 0.31:1.000:. ./.:4:30,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:28,25:.:-0.87:1.000:. ./.:4:79,42:.: 1.56:1.000:. ./.:4:35,49:.: 0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,30:.: 1.02:1.000:. ./.:4:30,38:.:-0.34:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:50,28:.: 0.02:1.000:. ./.:6:44,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:28,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:43,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:54,27:.: 0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:51,28:.: 0.06:1.000:. ./.:4:45,28:.:-0.16:0.777:. ./.:4:39,52:.: 0.48:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,15:.:-1.84:1.000:. ./.:4:49,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:54,49:.: 0.91:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:16,30:.:-1.12:1.000:. ./.:4:26,55:.: 0.13:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:79,27:.: 1.02:1.000:. ./.:4:52,30:.: 0.16:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.84:0.608:. ./.:4:25,48:.:-0.16:1.000:. ./.:4:55,35:.: 0.45:1.000:. ./.:4:70,35:.: 0.99:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:47,15:.:-0.55:1.000:. ./.:4:41,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,10:.:-1.20:1.000:. ./.:4:51,26:.:-0.02:1.000:. ./.:3:34,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:37,47:.: 0.23:1.000:. ./.:4:29,70:.: 0.77:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,23:.: 0.56:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:27,35:.:-0.55:1.000:. ./.:4:25,28:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,31:.: 0.02:1.000:. ./.:4:66,28:.: 0.59:1.000:. ./.:4:13,23:.:-1.48:1.000:. ./.:4:41,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:30,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:32,24:.:-0.77:1.000:. ./.:4:21,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:48,23:.:-0.23:1.000:. ./.:4:39,58:.: 0.70:1.000:. ./.:4:79,44:.: 1.63:1.000:. ./.:4:61,17:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,27:.: 0.09:1.000:. ./.:4:84,32:.: 1.38:1.000:. ./.:4:50,31:.: 0.13:0.999:. ./.:4:67,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,5:.:-1.63:0.993:. ./.:4:36,35:.:-0.23:1.000:. ./.:4:32,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:38,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:32,46:.: 0.02:1.000:. ./.:4:22,24:.:-1.12:1.000:. ./.:4:34,59:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,34:.:-0.66:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:56,26:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,28:.:-0.52:1.000:. ./.:4:30,25:.:-0.80:1.000:. ./.:4:48,20:.:-0.34:1.000:. ./.:4:20,30:.:-0.98:1.000:. ./.:4:24,26:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,21:.:-0.59:1.000:. ./.:4:67,26:.: 0.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:27,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,29:.: 1.41:1.000:. ./.:4:51,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:34,18:.:-0.91:1.000:. ./.:4:28,20:.:-1.05:1.000:. ./.:4:50,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:25,6:.:-1.66:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:69,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:81,27:.: 1.09:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:52,59:.: 1.20:1.000:. ./.:4:81,41:.: 1.59:1.000:. ./.:4:82,43:.: 1.70:1.000:. ./.:4:1,5:.:-2.56:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.19:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,43:.: 0.95:1.000:. ./.:4:82,42:.: 1.66:1.000:. ./.:4:43,67:.: 1.16:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.20:0.998:. ./.:4:103,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:35,54:.: 0.41:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,33:.: 0.73:1.000:. ./.:4:49,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,75:.: 1.56:1.000:. ./.:4:40,31:.:-0.23:1.000:. ./.:4:55,31:.: 0.31:0.999:. ./.:4:87,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,31:.: 0.73:1.000:. ./.:4:53,26:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,56:.: 0.38:1.000:. ./.:4:42,51:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,37:.:-0.84:1.000:. ./.:4:50,59:.: 1.13:1.000:. ./.:4:79,51:.: 1.88:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:52,64:.: 1.38:1.000:. ./.:4:62,26:.: 0.38:1.000:. ./.:4:64,34:.: 0.73:1.000:. ./.:4:69,44:.: 1.27:1.000:. ./.:4:61,46:.: 1.06:1.000:. ./.:4:54,42:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,28:.: 0.73:1.000:. -chr2.1 45368921 chr2.1_045368921 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:129,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:99,33:.: 0.67:1.000:. ./.:4:84,60:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,98:.: 0.91:1.000:. ./.:4:127,19:.: 1.04:1.000:. ./.:4:124,38:.: 1.45:1.000:. ./.:4:15,35:.:-1.46:1.000:. ./.:4:73,65:.: 0.83:1.000:. ./.:4:111,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.50:1.000:. ./.:4:11,3:.:-2.40:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:71,61:.: 0.67:1.000:. ./.:4:63,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:61,54:.: 0.23:1.000:. ./.:4:127,30:.: 1.32:1.000:. ./.:4:88,88:.: 1.82:0.998:. ./.:4:108,29:.: 0.80:1.000:. ./.:4:76,76:.: 1.19:1.000:. ./.:4:89,58:.: 1.06:1.000:. ./.:4:5,1:.:-2.61:1.000:. ./.:4:69,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:68,68:.: 0.78:1.000:. ./.:4:87,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:9,2:.:-2.47:1.000:. ./.:4:78,62:.: 0.88:1.000:. ./.:4:91,81:.: 1.71:1.000:. ./.:4:103,23:.: 0.52:1.000:. ./.:4:109,13:.: 0.41:1.000:. ./.:4:117,33:.: 1.14:1.000:. ./.:4:50,100:.: 1.14:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.78:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:15,2:.:-2.32:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.74:1.000:. ./.:4:111,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:87,61:.: 1.09:1.000:. ./.:4:107,69:.: 1.82:1.000:. ./.:4:108,21:.: 0.59:1.000:. ./.:4:125,34:.: 1.38:1.000:. ./.:4:77,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:77,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:92,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:26,57:.:-0.60:1.000:. ./.:4:50,53:.:-0.08:1.000:. ./.:4:69,53:.: 0.41:1.000:. ./.:4:18,8:.:-2.08:1.000:. ./.:4:56,50:.: 0.00:1.000:. ./.:4:66,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:39,38:.:-0.76:1.000:. ./.:4:63,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:58,47:.:-0.03:1.000:. ./.:4:82,23:.:-0.03:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:59,43:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,31:.: 0.02:1.000:. ./.:6:44,18:.:-1.15:1.000:. ./.:4:78,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:27,80:.: 0.02:1.000:. ./.:4:109,28:.: 0.80:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:25,23:.:-1.51:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:50,44:.:-0.32:0.777:. ./.:4:92,23:.: 0.23:1.000:. ./.:4:50,53:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,20:.:-1.43:1.000:. ./.:4:76,32:.: 0.05:1.000:. ./.:4:27,89:.: 0.26:1.000:. ./.:4:57,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:54,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:44,47:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:78,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:100,33:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,23:.:-0.94:0.608:. ./.:4:61,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:59,34:.:-0.34:1.000:. ./.:4:53,42:.:-0.29:1.000:. ./.:4:47,12:.:-1.23:1.000:. ./.:4:18,44:.:-1.15:1.000:. ./.:4:60,14:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,47:.:-0.08:1.000:. ./.:3:14,39:.:-1.38:1.000:. ./.:4:58,44:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,23:.: 0.07:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.71:1.000:. ./.:4:70,21:.:-0.39:1.000:. ./.:4:47,36:.:-0.60:1.000:. ./.:4:57,19:.:-0.78:1.000:. ./.:4:49,36:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,51:.: 0.13:1.000:. ./.:4:25,19:.:-1.62:1.000:. ./.:4:78,30:.: 0.05:1.000:. ./.:4:37,24:.:-1.17:1.000:. ./.:4:53,16:.:-0.97:1.000:. ./.:4:35,28:.:-1.12:1.000:. ./.:4:77,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:111,32:.: 0.96:1.000:. ./.:4:77,58:.: 0.75:1.000:. ./.:4:57,57:.: 0.20:1.000:. ./.:4:68,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:98,84:.: 1.97:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.94:0.999:. ./.:4:45,37:.:-0.63:1.000:. ./.:4:27,34:.:-1.17:0.993:. ./.:4:112,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:21,32:.:-1.38:1.000:. ./.:4:36,25:.:-1.17:1.000:. ./.:4:45,31:.:-0.78:1.000:. ./.:4:33,32:.:-1.07:1.000:. ./.:4:50,45:.:-0.29:1.000:. ./.:4:49,19:.:-0.99:1.000:. ./.:4:79,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:91,75:.: 1.56:1.000:. ./.:4:71,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:49,52:.:-0.13:1.000:. ./.:4:41,46:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:43,25:.:-0.99:1.000:. ./.:4:40,22:.:-1.15:1.000:. ./.:4:43,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:117,37:.: 1.25:1.000:. ./.:4:38,25:.:-1.12:1.000:. ./.:4:71,31:.:-0.11:1.000:. ./.:4:78,26:.:-0.06:1.000:. ./.:4:172,35:.: 2.62:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:39,38:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:57,21:.:-0.73:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:76,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:62,54:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:141,28:.: 1.64:1.000:. ./.:4:77,58:.: 0.75:1.000:. ./.:4:70,73:.: 0.96:1.000:. ./.:4:66,60:.: 0.52:1.000:. ./.:4:63,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:77,43:.: 0.36:1.000:. ./.:4:158,38:.: 2.34:1.000:. ./.:4:87,67:.: 1.25:1.000:. ./.:4:1,6:.:-2.58:1.000:. ./.:4:40,32:.:-0.89:1.000:. ./.:4:84,59:.: 0.96:1.000:. ./.:4:79,74:.: 1.22:1.000:. ./.:4:95,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:67,54:.: 0.39:1.000:. ./.:4:100,16:.: 0.26:0.998:. ./.:4:77,63:.: 0.88:1.000:. ./.:4:92,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:31,70:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,33:.: 0.91:1.000:. ./.:4:74,68:.: 0.93:1.000:. ./.:4:129,37:.: 1.56:1.000:. ./.:4:91,29:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,21:.: 0.49:0.999:. ./.:4:72,48:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,20:.:-0.11:1.000:. ./.:4:60,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:50,43:.:-0.34:1.000:. ./.:4:32,47:.:-0.71:1.000:. ./.:4:96,35:.: 0.65:1.000:. ./.:4:59,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:87,24:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,80:.: 1.79:1.000:. ./.:4:72,50:.: 0.41:1.000:. ./.:4:118,34:.: 1.19:1.000:. ./.:4:120,27:.: 1.06:1.000:. ./.:4:110,35:.: 1.01:1.000:. ./.:4:54,95:.: 1.12:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:60,33:.:-0.34:1.000:. ./.:4:106,37:.: 0.96:1.000:. -chr2.1 45540090 chr2.1_045540090 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:153,13:.: 0.57:1.000:. ./.:4:103,11:.:-0.57:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:170,28:.: 1.27:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:120,17:.:-0.07:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:83,11:.:-1.01:1.000:. ./.:4:140,10:.: 0.22:1.000:. ./.:4:155,8:.: 0.50:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:129,11:.: 0.00:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.27:0.998:. ./.:4:210,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:28,2:.:-2.42:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:178,21:.: 1.30:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:119,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:108,10:.:-0.48:1.000:. ./.:4:164,14:.: 0.83:1.000:. ./.:4:112,24:.:-0.09:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:23,1:.:-2.55:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:138,21:.: 0.42:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:142,29:.: 0.68:1.000:. ./.:4:102,10:.:-0.62:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:120,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:121,8:.:-0.24:1.000:. ./.:4:131,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:81,10:.:-1.08:1.000:. ./.:4:109,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:165,12:.: 0.81:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:72,5:.:-1.38:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:153,8:.: 0.46:1.000:. ./.:4:116,18:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:101,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,9:.:-0.77:1.000:. ./.:6:100,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:108,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:101,11:.:-0.62:1.000:. ./.:4:71,11:.:-1.27:1.000:. ./.:4:136,17:.: 0.29:1.000:. ./.:4:115,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:90,7:.:-0.95:0.777:. ./.:4:171,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:94,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:128,6:.:-0.13:1.000:. ./.:4:130,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:82,7:.:-1.12:0.608:. ./.:4:120,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:145,14:.: 0.42:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:78,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.07:1.000:. ./.:3:64,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:93,8:.:-0.86:1.000:. ./.:4:137,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:118,12:.:-0.22:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:136,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:90,10:.:-0.88:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:122,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:237,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:122,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.44:0.999:. ./.:4:128,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:69,15:.:-1.23:0.993:. ./.:4:122,13:.:-0.11:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:99,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:98,9:.:-0.73:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:116,15:.:-0.20:1.000:. ./.:4:126,11:.:-0.07:1.000:. ./.:4:107,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:102,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,12:.:-1.89:1.000:. ./.:4:71,9:.:-1.32:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:91,12:.:-0.81:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,7:.:-1.47:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,10:.:-0.37:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:118,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:99,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:93,15:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,7:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,13:.:-0.62:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:69,3:.:-1.49:1.000:. ./.:4:180,26:.: 1.45:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:162,16:.: 0.83:1.000:. ./.:4:136,12:.: 0.18:1.000:. ./.:4:180,11:.: 1.12:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:131,12:.: 0.07:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:130,20:.: 0.22:0.998:. ./.:4:147,20:.: 0.59:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:125,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:111,13:.:-0.35:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.16:0.999:. ./.:4:175,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:112,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:102,7:.:-0.68:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:91,13:.:-0.79:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:160,18:.: 0.83:1.000:. ./.:4:151,19:.: 0.66:1.000:. ./.:4:141,16:.: 0.37:1.000:. ./.:4:152,19:.: 0.68:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:183,18:.: 1.34:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:146,14:.: 0.44:1.000:. -chr2.1 45723615 chr2.1_045723615 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:110,33:0.23: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,57:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,32:0.53:-1.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:81,37:0.32: 0.53:1.000:0.956 0/0/1/1:4:59,42:0.42:-0.03:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,125:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,41:0.67:-1.31:1.000:0.908 0/0/0/1:4:71,32:0.32: 0.04:1.000:0.962 0/0/0/0:4:78,1:0.01:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,3:0.07:-1.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,20:0.52:-2.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,71:0.51: 1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,22:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,30:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,48:0.62:-0.75:1.000:0.631 0/0/0/1:4:64,34:0.35:-0.13:1.000:0.757 0/0/1/1:4:65,71:0.53: 1.12:0.998:0.991 0/1/1/1:4:33,126:0.79: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,78:0.43: 2.80:1.000:0.936 0/1/1/1:4:56,106:0.66: 1.98:1.000:0.871 0/0/0/1:4:38,20:0.35:-1.44:1.000:0.778 0/1/1/1:4:40,84:0.68: 0.73:1.000:0.960 0/0/0/1:4:85,40:0.33: 0.76:1.000:0.936 0/0/0/1:4:75,33:0.31: 0.20:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-2.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,34:0.38:-0.33:1.000:0.531 0/0/1/1:4:58,40:0.42:-0.13:1.000:0.901 0/0/1/1:4:36,41:0.54:-0.82:1.000:0.986 0/0/1/1:4:83,52:0.39: 1.09:1.000:0.727 0/0/1/1:4:41,43:0.52:-0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:63,22:0.26:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,34:0.38:-0.33:1.000:0.531 0/0/0/1:4:13,4:0.24:-2.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.49:-1.71:1.000:0.996 0/0/1:3:12,2:0.14:-2.89:1.000:0.526 0/0/1/1:4:73,63:0.47: 1.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:60,39:0.40:-0.09:1.000:0.810 0/0/1/1:4:61,43:0.42: 0.07:1.000:0.923 0/0/0/1:4:87,25:0.23: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,1:0.01: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,62:0.64:-0.13:1.000:0.681 0/0/1/1:4:78,90:0.55: 2.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:54,61:0.54: 0.43:1.000:0.987 0/0/0/1:4:108,30:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,81:0.67: 0.63:1.000:0.939 0/0/0/1:4:77,44:0.37: 0.63:1.000:0.550 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-2.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,86:0.67: 0.89:1.000:0.930 0/0/1/1:4:36,35:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,28:0.27: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,33:0.47:-0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:54,27:0.34:-0.69:1.000:0.871 0/0/1/1:4:43,60:0.59: 0.04:1.000:0.858 0/0/0/1:4:63,36:0.37:-0.09:1.000:0.550 0/0/1/1:4:55,60:0.53: 0.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,67:0.68:-0.06:1.000:0.941 0/1/1/1:4:42,79:0.66: 0.63:1.000:0.862 0/0/1/1:4:90,62:0.42: 1.65:1.000:0.900 0/0/1/1/1/1:6:29,58:0.67:-0.49:1.000:0.921 0/1/1/1:4:37,88:0.71: 0.76:1.000:0.991 0/0/0/1:4:48,23:0.33:-1.02:1.000:0.921 0/1/1/1:4:46,80:0.64: 0.79:1.000:0.707 0/0/0/1:4:70,35:0.34: 0.10:1.000:0.871 0/1/1/1:4:38,72:0.66: 0.27:1.000:0.873 0/0/0/1:4:82,40:0.33: 0.66:1.000:0.903 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,87:0.69: 0.83:1.000:0.974 0/0/0/1:4:95,36:0.28: 0.96:0.777:0.996 0/0/1/1:4:61,61:0.51: 0.66:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,129:1.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,36:0.57:-1.25:1.000:0.942 0/0/1/1:4:101,82:0.46: 2.67:1.000:0.986 0/0/0/1:4:73,35:0.33: 0.20:1.000:0.920 0/1/1/1:4:33,112:0.78: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,50:0.46: 0.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:58,27:0.32:-0.56:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,49:0.39: 0.89:1.000:0.666 0/0/0/0:4:79,1:0.01:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,93:0.74: 0.83:0.608:0.998 0/0/0/1:4:110,36:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,35:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,71:0.53: 1.16:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,45:0.41: 0.37:1.000:0.843 0/0/1/1:4:42,54:0.57:-0.19:1.000:0.942 0/0/1/1:4:26,38:0.60:-1.25:1.000:0.775 0/1/1/1:4:27,88:0.77: 0.43:1.000:1.000 1/1/1:3:0,26:1.00:-2.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,76:0.50: 1.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,37:0.32: 0.56:1.000:0.962 0/1/1/1:4:25,58:0.70:-0.62:1.000:0.988 0/0/0/0:4:90,2:0.02:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,38:0.40:-0.19:1.000:0.825 0/0/1/1:4:73,66:0.49: 1.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,36:0.33: 0.27:1.000:0.906 0/1/1/1:4:38,109:0.74: 1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,25:0.31:-0.62:1.000:0.978 0/0/0/1:4:65,35:0.36:-0.06:1.000:0.724 0/0/1/1:4:31,33:0.53:-1.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,36:0.48:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,28:0.28:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,64:0.58: 0.33:1.000:0.913 0/1/1/1:4:29,47:0.63:-0.85:1.000:0.505 0/0/0/0:4:107,1:0.01: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,57:0.56: 0.04:1.000:0.962 0/0/1/1:4:37,57:0.61:-0.26:1.000:0.645 0/0/0/0:4:67,2:0.03:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,48:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,36:0.52:-1.05:0.999:0.994 0/0/1/1:4:50,60:0.56: 0.27:1.000:0.974 0/0/1/1:4:27,16:0.38:-1.94:0.993:0.566 0/0/0/1:4:94,37:0.29: 0.96:1.000:0.993 0/1/1/1:4:26,60:0.70:-0.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:31,50:0.62:-0.69:1.000:0.510 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,1:0.01:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,32:0.28: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,29:0.30:-0.13:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,38:0.47:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,80:0.53: 1.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:81,30:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,37:0.30: 0.73:1.000:0.982 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,73:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,28:0.28:-0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:41,74:0.65: 0.43:1.000:0.791 0/0/1/1:4:33,37:0.54:-1.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:62,22:0.27:-0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,57:0.66:-0.49:1.000:0.876 0/0/1/1:4:43,66:0.61: 0.23:1.000:0.655 0/0/0/1:4:58,29:0.34:-0.49:1.000:0.871 0/1/1/1:4:36,67:0.66: 0.04:1.000:0.846 0/0/1/1:4:38,61:0.62:-0.09:1.000:0.524 0/1/1/1:4:26,66:0.72:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,29:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,67:0.52: 0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,64:0.62: 0.07:1.000:0.534 0/0/0/1:4:53,27:0.34:-0.72:1.000:0.842 0/0/1/1:4:57,40:0.42:-0.16:1.000:0.919 0/0/1/1:4:48,41:0.47:-0.42:1.000:0.993 0/0/0/1:4:83,32:0.28: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,32:0.42:-0.79:1.000:0.911 0/0/1/1:4:32,27:0.47:-1.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:77,26:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,84:0.62: 1.16:1.000:0.563 0/1/1/1:4:36,97:0.73: 1.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,7:0.19:-2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,56:0.61:-0.29:1.000:0.693 0/1/1/1:4:34,58:0.64:-0.33:1.000:0.656 0/1/1/1:4:37,84:0.70: 0.63:1.000:0.984 0/1/1/1:4:45,83:0.65: 0.86:1.000:0.831 0/0/1/1:4:76,75:0.51: 1.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,41:0.49:-0.52:0.998:0.996 0/0/1/1:4:48,40:0.46:-0.46:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,38:0.41:-0.26:1.000:0.881 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,77:0.66: 0.53:1.000:0.860 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,26:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,35:0.42:-0.52:1.000:0.895 0/1/1/1:4:34,105:0.76: 1.22:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,74:0.49: 1.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,43:0.46:-0.19:1.000:0.986 0/0/0/1:4:78,29:0.28: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,63:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,34:0.37:-0.29:1.000:0.523 0/0/0/0:4:92,1:0.01:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,39:0.45:-0.46:1.000:0.983 0/0/1/1:4:42,35:0.46:-0.82:1.000:0.990 0/0/0/0:4:104,1:0.01: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,15:0.19:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,37:0.31: 0.60:1.000:0.967 0/0/1/1:4:53,72:0.58: 0.76:1.000:0.893 0/0/0/1:4:102,41:0.29: 1.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:30,55:0.65:-0.56:1.000:0.821 0/0/1/1:4:91,72:0.45: 2.01:1.000:0.981 -chr2.1 46035946 chr2.1_046035946 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:106,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.62:0.998:. ./.:4:94,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.58:1.000:. ./.:3:3,0:.:-3.57:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.80:1.000:. ./.:6:57,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.76:0.777:. ./.:4:80,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:0.608:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.91:1.000:. ./.:3:58,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:84,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:84,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:0.993:. ./.:4:108,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:78,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.13:0.998:. ./.:4:94,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:86,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:88,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. -chr2.1 46354459 chr2.1_046354459 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:56,118:0.61: 0.22:1.000:0.662 0/0/1/1:4:64,83:0.49:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,152:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,104:0.49: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,205:0.79: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,148:0.56: 1.51:1.000:0.970 0/0/1/1:4:53,85:0.55:-0.53:1.000:0.983 0/0/1/1:4:78,127:0.55: 0.86:1.000:0.980 0/1/1/1:4:30,187:0.82: 1.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:4,48:0.90:-2.31:1.000:0.815 0/1/1/1:4:9,29:0.70:-2.60:1.000:0.988 0/1/1/1:4:36,150:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,47:0.28: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,107:0.49: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,106:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,120:0.59: 0.39:1.000:0.849 0/0/0/1:4:116,58:0.32: 0.22:0.998:0.959 0/0/0/1:4:102,62:0.35: 0.01:1.000:0.778 0/0/0/1:4:147,83:0.34: 1.38:1.000:0.878 0/0/0/1:4:156,72:0.30: 1.34:1.000:0.981 0/0/1/1:4:9,20:0.62:-2.79:1.000:0.505 0/0/1/1:4:68,100:0.52: 0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:112,53:0.31: 0.03:1.000:0.976 0/1/1/1:4:29,156:0.80: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,45:0.72:-2.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:103,60:0.34:-0.01:1.000:0.842 0/0/1/1:4:73,105:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,136:0.81:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,131:0.59: 0.72:1.000:0.832 0/1/1/1:4:38,178:0.77: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,113:0.56: 0.34:1.000:0.969 0/1/1/1:4:34,139:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,30:0.82:-2.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,50:0.77:-2.12:1.000:1.000 0/1/1:3:7,14:0.60:-2.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,55:0.30: 0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:71,107:0.53: 0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,104:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,95:0.57:-0.32:1.000:0.936 0/0/1/1:4:76,102:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,98:0.56:-0.17:1.000:0.961 0/0/1/1:4:61,98:0.55:-0.09:1.000:0.983 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,31:0.27:-1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,59:0.37:-0.36:1.000:0.544 0/0/0/1:4:108,46:0.29:-0.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:45,197:0.76: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,40:0.57:-2.08:1.000:0.955 0/0/0/1:4:98,58:0.35:-0.15:1.000:0.820 0/0/1/1:4:40,28:0.38:-1.98:1.000:0.533 0/1/1/1:4:18,128:0.84:-0.36:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,126:0.74:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,63:0.38:-0.26:1.000:0.587 0/0/0/1:4:109,54:0.32:-0.01:1.000:0.963 0/0/1/1:4:40,89:0.63:-0.71:1.000:0.501 0/0/1/1:4:67,94:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,75:0.55:-0.88:1.000:0.980 0/0/0/1:4:74,40:0.33:-1.02:1.000:0.917 0/0/0/0/1/1:6:78,51:0.36:-0.71:1.000:0.855 0/0/0/1:4:75,46:0.35:-0.88:1.000:0.762 0/0/1/1:4:72,99:0.51: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,48:0.33:-0.59:1.000:0.900 0/0/0/1:4:74,44:0.35:-0.94:1.000:0.813 0/0/0/1:4:102,48:0.31:-0.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:65,106:0.55: 0.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:47,74:0.54:-0.88:1.000:0.987 0/1/1/1:4:34,166:0.78: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,68:0.36: 0.22:0.777:0.673 0/1/1/1:4:30,161:0.80: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,112:0.57: 0.24:1.000:0.942 0/0/0/1:4:66,33:0.32:-1.34:1.000:0.959 0/0/1/1:4:72,117:0.55: 0.53:1.000:0.981 0/0/1/1:4:79,113:0.52: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,111:0.60: 0.07:1.000:0.806 0/0/0/1:4:87,44:0.32:-0.67:1.000:0.955 0/0/1/1:4:62,100:0.55:-0.03:1.000:0.982 0/1/1/1:4:35,127:0.73:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,129:0.55: 0.90:1.000:0.976 0/1/1/1:4:34,145:0.75: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,63:0.54:-1.25:0.608:0.987 0/0/0/1:4:82,37:0.30:-0.92:1.000:0.985 0/0/1/1:4:51,112:0.62:-0.01:1.000:0.541 0/0/0/1:4:105,34:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,105:0.62:-0.19:1.000:0.614 0/1/1/1:4:45,180:0.74: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,40:0.34:-1.09:1.000:0.881 0/0/1/1:4:61,101:0.55:-0.03:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,186:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,56:0.33:-0.07:1.000:0.920 0/1/1:3:19,80:0.75:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,42:0.30:-0.53:1.000:0.989 0/0/1/1:4:71,120:0.56: 0.57:1.000:0.968 0/0/0/1:4:88,41:0.31:-0.71:1.000:0.979 0/1/1/1:4:26,166:0.83: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,111:0.61: 0.01:1.000:0.678 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,131:0.83:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:97,57:0.35:-0.19:1.000:0.830 0/0/0/1:4:113,48:0.29:-0.05:1.000:0.991 0/1/1/1:4:32,130:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,130:0.58: 0.78:1.000:0.918 0/1/1/1:4:17,100:0.81:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,130:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,57:0.48:-1.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,91:0.58:-0.49:1.000:0.904 0/1/1/1:4:33,134:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,114:0.54: 0.51:1.000:0.990 0/1/1/1:4:58,212:0.73: 2.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,98:0.47: 0.45:1.000:0.991 0/1/1/1:4:21,144:0.84: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,219:0.74: 2.29:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,213:1.00: 1.03:0.999:1.000 0/0/0/1:4:92,52:0.34:-0.40:1.000:0.877 0/0/1/1:4:33,45:0.50:-1.77:0.993:0.997 0/0/1/1:4:63,109:0.56: 0.18:1.000:0.958 0/0/0/1:4:97,58:0.35:-0.17:1.000:0.804 0/0/1/1:4:63,81:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,73:0.48:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,82:0.55:-0.63:1.000:0.983 0/1/1/1:4:38,151:0.74: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,142:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,98:0.61:-0.38:1.000:0.690 0/0/1/1:4:73,109:0.53: 0.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,146:0.80: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,47:0.34:-0.67:1.000:0.887 0/0/1/1:4:48,82:0.56:-0.69:1.000:0.964 0/0/1/1:4:40,60:0.53:-1.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:69,28:0.28:-1.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,74:0.53:-0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,102:0.56:-0.01:1.000:0.972 0/0/0/1:4:51,27:0.33:-1.77:1.000:0.931 0/1/1/1:4:17,132:0.85:-0.30:1.000:0.984 0/0/1/1:4:65,103:0.54: 0.10:1.000:0.986 0/1/1/1:4:53,198:0.73: 1.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,93:0.55:-0.26:1.000:0.983 0/0/0/1:4:77,29:0.27:-1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,100:0.76:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,47:0.36:-0.88:1.000:0.695 0/0/1/1:4:60,97:0.55:-0.13:1.000:0.982 0/0/0/1:4:83,40:0.31:-0.84:1.000:0.971 0/0/1/1:4:81,123:0.53: 0.84:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,64:0.55:-1.25:1.000:0.978 0/1/1/1:4:49,220:0.76: 2.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,223:0.80: 2.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,118:0.54: 0.63:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,126:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,123:0.53: 0.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,125:0.71:-0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,146:0.54: 1.57:1.000:0.987 0/0/0/1:4:137,55:0.28: 0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,34:0.68:-2.44:1.000:0.948 0/0/1/1:4:64,75:0.47:-0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,58:0.37:-0.40:1.000:0.558 0/0/0/1:4:131,59:0.30: 0.55:1.000:0.985 0/1/1/1:4:43,211:0.78: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,51:0.28: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,146:0.79: 0.24:0.998:1.000 0/0/1/1:4:107,127:0.48: 1.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,122:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,95:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,101:0.47: 0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,114:0.53: 0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,122:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,181:0.74: 1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,104:0.57:-0.03:1.000:0.936 0/1/1/1:4:42,168:0.74: 0.97:0.999:0.999 0/0/1/1:4:87,125:0.52: 1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,116:0.52: 0.66:1.000:0.994 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,185:0.79: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,101:0.48: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,120:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,83:0.54:-0.55:1.000:0.990 0/1/1/1:4:46,189:0.75: 1.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,105:0.46: 0.82:1.000:0.986 0/0/1/1:4:84,119:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,132:0.73: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,156:0.55: 1.84:1.000:0.981 0/0/1/1:4:99,129:0.49: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,158:0.51: 2.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,89:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:80,108:0.50: 0.51:1.000:0.997 -chr2.1 46857023 chr2.1_046857023 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:236,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:149,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:187,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:152,48:.: 0.18:1.000:. ./.:4:235,28:.: 1.16:1.000:. ./.:4:88,61:.:-0.61:1.000:. ./.:4:261,40:.: 1.75:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:87,38:.:-0.98:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:108,81:.: 0.01:1.000:. ./.:4:129,33:.:-0.40:1.000:. ./.:4:34,81:.:-1.13:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:99,70:.:-0.30:1.000:. ./.:4:221,49:.: 1.27:0.998:. ./.:4:276,39:.: 1.96:1.000:. ./.:4:261,52:.: 1.93:1.000:. ./.:4:163,88:.: 0.97:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:236,35:.: 1.28:1.000:. ./.:4:151,76:.: 0.60:1.000:. ./.:4:52,9:.:-1.97:1.000:. ./.:4:227,29:.: 1.05:1.000:. ./.:4:253,41:.: 1.64:1.000:. ./.:4:104,43:.:-0.64:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:134,42:.:-0.19:1.000:. ./.:4:179,26:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,81:.: 0.90:1.000:. ./.:4:21,3:.:-2.54:1.000:. ./.:4:48,19:.:-1.88:1.000:. ./.:3:41,1:.:-2.26:1.000:. ./.:4:64,81:.:-0.67:1.000:. ./.:4:270,42:.: 1.92:1.000:. ./.:4:43,86:.:-0.92:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:226,37:.: 1.16:1.000:. ./.:4:184,46:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:132,36:.:-0.31:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:105,30:.:-0.82:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:79,79:.:-0.47:1.000:. ./.:4:60,24:.:-1.61:1.000:. ./.:4:80,59:.:-0.76:1.000:. ./.:4:21,26:.:-2.18:1.000:. ./.:4:131,55:.:-0.03:1.000:. ./.:4:194,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:72,64:.:-0.81:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:188,41:.: 0.63:1.000:. ./.:4:95,63:.:-0.47:1.000:. ./.:4:117,38:.:-0.51:1.000:. ./.:4:147,65:.: 0.37:1.000:. ./.:4:54,62:.:-1.12:1.000:. ./.:6:153,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:155,37:.: 0.06:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:84,30:.:-1.15:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:83,24:.:-1.26:1.000:. ./.:4:192,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:184,31:.: 0.42:0.777:. ./.:4:217,34:.: 0.97:1.000:. ./.:4:127,31:.:-0.47:1.000:. ./.:4:181,33:.: 0.40:1.000:. ./.:4:173,30:.: 0.23:1.000:. ./.:4:203,44:.: 0.91:1.000:. ./.:4:213,35:.: 0.93:1.000:. ./.:4:171,32:.: 0.23:1.000:. ./.:4:227,34:.: 1.13:1.000:. ./.:4:165,31:.: 0.12:1.000:. ./.:4:107,68:.:-0.20:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:70,51:.:-1.04:0.608:. ./.:4:122,27:.:-0.61:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:111,66:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,28:.:-1.01:1.000:. ./.:4:170,50:.: 0.49:1.000:. ./.:4:54,49:.:-1.32:1.000:. ./.:4:73,61:.:-0.84:1.000:. ./.:4:120,34:.:-0.53:1.000:. ./.:4:91,76:.:-0.33:1.000:. ./.:3:147,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:170,31:.: 0.20:1.000:. ./.:4:235,33:.: 1.24:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:211,40:.: 0.97:1.000:. ./.:4:123,31:.:-0.53:1.000:. ./.:4:185,20:.: 0.26:1.000:. ./.:4:178,33:.: 0.35:1.000:. ./.:4:101,74:.:-0.20:1.000:. ./.:4:54,66:.:-1.05:1.000:. ./.:4:102,80:.:-0.10:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:107,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:193,26:.: 0.48:1.000:. ./.:4:98,78:.:-0.19:1.000:. ./.:4:159,26:.:-0.05:1.000:. ./.:4:221,29:.: 0.96:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:191,81:.: 1.30:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:345,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:135,25:.:-0.44:0.999:. ./.:4:171,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:8,38:.:-2.20:0.993:. ./.:4:267,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:99,66:.:-0.36:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,39:.:-0.61:1.000:. ./.:4:87,28:.:-1.13:1.000:. ./.:4:83,75:.:-0.47:1.000:. ./.:4:143,62:.: 0.26:1.000:. ./.:4:183,37:.: 0.49:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:133,31:.:-0.37:1.000:. ./.:4:189,22:.: 0.35:1.000:. ./.:4:94,30:.:-0.99:1.000:. ./.:4:73,23:.:-1.43:1.000:. ./.:4:80,55:.:-0.82:1.000:. ./.:4:21,83:.:-1.30:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:146,67:.: 0.38:1.000:. ./.:4:39,23:.:-1.95:1.000:. ./.:4:141,35:.:-0.19:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:144,23:.:-0.33:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:41,51:.:-1.49:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:150,46:.: 0.12:1.000:. ./.:4:355,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:36,87:.:-1.01:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:71,64:.:-0.82:1.000:. ./.:4:392,0:.: 3.16:1.000:. ./.:4:135,64:.: 0.17:1.000:. ./.:4:54,1:.:-2.06:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:113,64:.:-0.17:1.000:. ./.:4:144,43:.:-0.02:1.000:. ./.:4:250,28:.: 1.39:1.000:. ./.:4:116,30:.:-0.65:0.998:. ./.:4:213,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:206,44:.: 0.96:1.000:. ./.:4:143,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,29:.: 0.00:1.000:. ./.:4:185,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:153,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:31,80:.:-1.19:1.000:. ./.:4:157,58:.: 0.42:0.999:. ./.:4:111,45:.:-0.50:1.000:. ./.:4:192,29:.: 0.51:1.000:. ./.:4:110,25:.:-0.82:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.78:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:52,46:.:-1.40:1.000:. ./.:4:169,28:.: 0.14:1.000:. ./.:4:352,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:204,37:.: 0.82:1.000:. ./.:4:205,12:.: 0.45:1.000:. ./.:4:168,101:.: 1.25:1.000:. ./.:4:122,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:314,1:.: 1.96:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:233,39:.: 1.30:1.000:. -chr2.1 47039760 chr2.1_047039760 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:142,780:.: 1.05:1.000:. ./.:4:104,468:.:-0.99:1.000:. ./.:4:205,568:.: 0.18:1.000:. ./.:4:215,703:.: 1.03:1.000:. ./.:4:141,791:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,968:.: 1.32:1.000:. ./.:4:52,354:.:-1.95:1.000:. ./.:4:95,632:.:-0.08:1.000:. ./.:4:178,426:.:-0.80:1.000:. ./.:4:94,229:.:-2.43:1.000:. ./.:4:35,337:.:-2.15:1.000:. ./.:4:88,527:.:-0.74:1.000:. ./.:4:104,664:.: 0.16:1.000:. ./.:4:129,865:.: 1.47:1.000:. ./.:4:188,498:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,903:.: 0.95:1.000:. ./.:4:128,784:.: 0.99:0.998:. ./.:4:85,567:.:-0.52:1.000:. ./.:4:146,901:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,940:.: 1.16:1.000:. ./.:4:94,103:.:-3.17:1.000:. ./.:4:213,652:.: 0.72:1.000:. ./.:4:2,1040:.: 1.75:1.000:. ./.:4:110,674:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,209:.:-3.10:1.000:. ./.:4:1,754:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,780:.: 0.84:1.000:. ./.:4:86,753:.: 0.57:1.000:. ./.:4:260,677:.: 1.14:1.000:. ./.:4:89,613:.:-0.23:1.000:. ./.:4:194,484:.:-0.37:1.000:. ./.:4:85,560:.:-0.56:1.000:. ./.:4:44,128:.:-3.31:1.000:. ./.:4:77,172:.:-2.86:1.000:. ./.:3:8,175:.:-3.25:1.000:. ./.:4:0,679:.:-0.36:1.000:. ./.:4:114,694:.: 0.39:1.000:. ./.:4:114,686:.: 0.34:1.000:. ./.:4:226,563:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,916:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,717:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,729:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,757:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,607:.:-0.78:1.000:. ./.:4:142,572:.:-0.16:1.000:. ./.:4:102,658:.: 0.11:1.000:. ./.:4:232,791:.: 1.64:1.000:. ./.:4:60,501:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,625:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1,717:.:-0.14:1.000:. ./.:4:88,679:.: 0.15:1.000:. ./.:4:264,759:.: 1.64:1.000:. ./.:4:185,479:.:-0.45:1.000:. ./.:4:133,675:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,618:.:-0.72:1.000:. ./.:4:119,532:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,612:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,888:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,644:.:-0.57:1.000:. ./.:6:28,631:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,822:.: 0.47:1.000:. ./.:4:153,493:.:-0.55:1.000:. ./.:4:113,734:.: 0.61:1.000:. ./.:4:125,609:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,835:.: 0.54:1.000:. ./.:4:90,673:.: 0.13:1.000:. ./.:4:84,541:.:-0.68:1.000:. ./.:4:114,599:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,742:.: 0.01:0.777:. ./.:4:179,543:.:-0.11:1.000:. ./.:4:139,713:.: 0.64:1.000:. ./.:4:82,532:.:-0.74:1.000:. ./.:4:113,635:.: 0.04:1.000:. ./.:4:196,631:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,712:.: 0.45:1.000:. ./.:4:70,535:.:-0.79:1.000:. ./.:4:92,582:.:-0.39:1.000:. ./.:4:123,871:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,665:.:-0.44:1.000:. ./.:4:213,634:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,584:.:-0.92:0.608:. ./.:4:109,663:.: 0.18:1.000:. ./.:4:217,583:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,756:.: 0.09:1.000:. ./.:4:101,598:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,773:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,520:.:-1.29:1.000:. ./.:4:104,594:.:-0.25:1.000:. ./.:4:214,537:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,616:.:-0.73:1.000:. ./.:3:81,504:.:-0.91:1.000:. ./.:4:113,753:.: 0.73:1.000:. ./.:4:102,673:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,620:.:-0.70:1.000:. ./.:4:215,648:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,698:.:-0.25:1.000:. ./.:4:180,539:.:-0.13:1.000:. ./.:4:189,407:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,753:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,818:.: 0.45:1.000:. ./.:4:72,700:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,842:.: 0.59:1.000:. ./.:4:210,509:.:-0.13:1.000:. ./.:4:123,753:.: 0.78:1.000:. ./.:4:115,635:.: 0.05:1.000:. ./.:4:76,612:.:-0.31:1.000:. ./.:4:109,527:.:-0.61:1.000:. ./.:4:104,702:.: 0.38:1.000:. ./.:4:228,665:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1,804:.: 0.37:1.000:. ./.:4:205,557:.: 0.12:1.000:. ./.:4:263,865:.: 2.25:1.000:. ./.:4:233,629:.: 0.70:0.999:. ./.:4:104,661:.: 0.14:1.000:. ./.:4:61,371:.:-1.80:0.993:. ./.:4:123,782:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,689:.:-0.30:1.000:. ./.:4:203,493:.:-0.26:1.000:. ./.:4:225,471:.:-0.26:1.000:. ./.:4:187,479:.:-0.44:1.000:. ./.:4:229,750:.: 1.38:1.000:. ./.:4:115,717:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,872:.: 0.76:1.000:. ./.:4:94,734:.: 0.50:1.000:. ./.:4:210,553:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,761:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,725:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,423:.:-1.38:1.000:. ./.:4:183,357:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,602:.:-0.81:1.000:. ./.:4:113,703:.: 0.43:1.000:. ./.:4:89,694:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,499:.:-1.41:1.000:. ./.:4:91,636:.:-0.08:1.000:. ./.:4:103,618:.:-0.12:1.000:. ./.:4:256,749:.: 1.53:1.000:. ./.:4:118,633:.: 0.06:1.000:. ./.:4:134,657:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,653:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,738:.:-0.02:1.000:. ./.:4:116,758:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,690:.:-0.30:1.000:. ./.:4:194,524:.:-0.14:1.000:. ./.:4:90,486:.:-0.96:1.000:. ./.:4:115,899:.: 1.59:1.000:. ./.:4:256,904:.: 2.44:1.000:. ./.:4:124,744:.: 0.74:1.000:. ./.:4:98,619:.:-0.14:1.000:. ./.:4:104,736:.: 0.57:1.000:. ./.:4:183,566:.: 0.04:1.000:. ./.:4:121,756:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,692:.:-0.29:1.000:. ./.:4:32,215:.:-2.88:1.000:. ./.:4:110,334:.:-1.73:1.000:. ./.:4:117,652:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,825:.: 0.49:1.000:. ./.:4:263,726:.: 1.44:1.000:. ./.:4:126,718:.: 0.60:1.000:. ./.:4:86,590:.:-0.38:0.998:. ./.:4:80,695:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,657:.:-0.48:1.000:. ./.:4:157,444:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,757:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,837:.: 0.56:1.000:. ./.:4:249,650:.: 0.92:1.000:. ./.:4:132,714:.: 0.61:1.000:. ./.:4:122,656:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,615:.:-0.17:0.999:. ./.:4:103,809:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,691:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,621:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,497:.:-1.42:1.000:. ./.:4:190,609:.: 0.34:1.000:. ./.:4:83,607:.:-0.30:1.000:. ./.:4:198,467:.:-0.44:1.000:. ./.:4:74,459:.:-1.21:1.000:. ./.:4:279,705:.: 1.41:1.000:. ./.:4:136,897:.: 1.70:1.000:. ./.:4:103,639:.: 0.00:1.000:. ./.:4:170,505:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,780:.: 0.24:1.000:. ./.:4:142,903:.: 1.77:1.000:. ./.:4:113,958:.: 1.92:1.000:. ./.:4:183,384:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,673:.: 0.16:1.000:. -chr2.1 47884563 chr2.1_047884563 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,144:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,84:.: 0.07:1.000:. ./.:4:28,109:.: 0.37:1.000:. ./.:4:29,119:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.94:1.000:. ./.:4:26,79:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.42:1.000:. ./.:4:31,102:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,10:.:-3.09:1.000:. ./.:4:0,33:.:-2.48:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,77:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,117:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,172:.: 1.33:0.998:. ./.:4:22,118:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,212:.: 2.42:1.000:. ./.:4:0,193:.: 1.90:1.000:. ./.:4:2,2:.:-3.28:1.000:. ./.:4:27,97:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,164:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,11:.:-3.09:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,161:.: 1.02:1.000:. ./.:4:24,92:.:-0.21:1.000:. ./.:4:40,123:.: 1.08:1.000:. ./.:4:37,117:.: 0.83:1.000:. ./.:4:38,121:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,3:.:-3.31:1.000:. ./.:4:5,18:.:-2.76:1.000:. ./.:3:0,5:.:-3.25:1.000:. ./.:4:0,161:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.56:1.000:. ./.:4:37,114:.: 0.75:1.000:. ./.:4:35,110:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,201:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.46:1.000:. ./.:4:44,105:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,99:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,135:.: 1.38:1.000:. ./.:4:4,22:.:-2.68:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.76:1.000:. ./.:4:40,134:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.57:1.000:. ./.:4:29,123:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.04:1.000:. ./.:6:0,93:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,96:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,135:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.64:1.000:. ./.:4:28,77:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.21:0.777:. ./.:4:0,101:.:-0.62:1.000:. ./.:4:28,99:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.59:1.000:. ./.:4:29,110:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,70:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.81:1.000:. ./.:4:36,102:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.54:0.608:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:41,93:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,74:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,117:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,80:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,72:.:-0.62:1.000:. ./.:4:1,108:.:-0.40:1.000:. ./.:3:30,56:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.76:1.000:. ./.:4:43,96:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.01:1.000:. ./.:4:31,68:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.05:1.000:. ./.:4:21,69:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.39:1.000:. ./.:4:17,87:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,92:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,121:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:20,88:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,177:.: 1.46:1.000:. ./.:4:38,77:.:-0.24:0.999:. ./.:4:25,92:.:-0.18:1.000:. ./.:4:15,70:.:-1.06:0.993:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,74:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,78:.:-0.57:1.000:. ./.:4:33,77:.:-0.37:1.000:. ./.:4:26,90:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,91:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,78:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,52:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,79:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.69:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.21:1.000:. ./.:4:34,92:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,147:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.64:1.000:. ./.:4:21,73:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.62:1.000:. ./.:4:40,101:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.14:1.000:. ./.:4:40,134:.: 1.38:1.000:. ./.:4:34,111:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,103:.: 0.48:1.000:. ./.:4:25,100:.: 0.04:1.000:. ./.:4:49,125:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,187:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,13:.:-3.03:1.000:. ./.:4:34,76:.:-0.37:1.000:. ./.:4:23,102:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.45:1.000:. ./.:4:52,120:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,163:.: 1.08:1.000:. ./.:4:38,88:.: 0.07:0.998:. ./.:4:35,128:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.15:1.000:. ./.:4:27,88:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.67:1.000:. ./.:4:19,97:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.56:1.000:. ./.:4:27,107:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.67:0.999:. ./.:4:34,86:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,93:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,129:.: 1.41:1.000:. ./.:4:35,124:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.53:1.000:. ./.:4:22,103:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,138:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.49:1.000:. ./.:4:17,66:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.86:1.000:. -chr2.1 48550212 chr2.1_048550212 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,6:.: 1.22:1.000:. ./.:4:96,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:50,7:.:-0.95:1.000:. ./.:4:76,11:.: 0.19:1.000:. ./.:4:94,9:.: 0.80:1.000:. ./.:4:66,15:.:-0.03:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:68,10:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.96:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:123,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:34,4:.:-1.67:1.000:. ./.:4:85,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:91,5:.: 0.54:0.998:. ./.:4:66,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:94,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:127,7:.: 1.98:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:98,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:68,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:96,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.93:1.000:. ./.:4:78,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:41,16:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,4:.: 0.58:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:82,5:.: 0.19:1.000:. ./.:4:114,4:.: 1.37:1.000:. ./.:4:91,6:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.47:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:97,5:.: 0.77:1.000:. ./.:4:58,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:98,4:.: 0.77:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:67,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:60,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:92,5:.: 0.58:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,6:.:-0.76:1.000:. ./.:4:74,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:91,4:.: 0.50:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:48,3:.:-1.18:1.000:. ./.:4:84,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:90,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,4:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:100,6:.: 0.92:1.000:. ./.:4:58,6:.:-0.68:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:69,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,5:.:-0.68:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.19:1.000:. ./.:6:61,8:.:-0.49:1.000:. ./.:4:76,9:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:50,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:100,6:.: 0.92:1.000:. ./.:4:91,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,8:.: 0.31:1.000:. ./.:4:57,6:.:-0.72:0.777:. ./.:4:71,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:92,5:.: 0.58:1.000:. ./.:4:46,2:.:-1.29:1.000:. ./.:4:84,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:71,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:53,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:72,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,12:.:-0.38:1.000:. ./.:4:108,4:.: 1.15:1.000:. ./.:4:84,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,6:.:-0.68:0.608:. ./.:4:123,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:67,6:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:59,12:.:-0.41:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:74,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:99,7:.: 0.92:1.000:. ./.:3:21,8:.:-2.01:1.000:. ./.:4:77,7:.: 0.08:1.000:. ./.:4:65,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,9:.:-1.21:1.000:. ./.:4:83,4:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:70,15:.: 0.12:1.000:. ./.:4:105,4:.: 1.03:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:91,4:.: 0.50:1.000:. ./.:4:52,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:93,9:.: 0.77:1.000:. ./.:4:44,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:78,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:78,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:65,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,15:.: 0.00:1.000:. ./.:4:66,7:.:-0.34:1.000:. ./.:4:79,11:.: 0.31:1.000:. ./.:4:91,3:.: 0.46:0.999:. ./.:4:80,4:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,7:.:-1.14:0.993:. ./.:4:90,5:.: 0.50:1.000:. ./.:4:79,4:.: 0.04:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:76,4:.:-0.07:1.000:. ./.:4:66,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:77,10:.: 0.19:1.000:. ./.:4:58,3:.:-0.79:1.000:. ./.:4:45,11:.:-0.98:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:63,11:.:-0.30:1.000:. ./.:4:31,6:.:-1.71:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:93,5:.: 0.61:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:95,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:83,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:86,9:.: 0.50:1.000:. ./.:4:54,8:.:-0.76:1.000:. ./.:4:97,5:.: 0.77:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:73,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:65,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:97,4:.: 0.73:1.000:. ./.:4:64,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:61,6:.:-0.57:1.000:. ./.:4:53,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:68,6:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,19:.:-0.03:1.000:. ./.:4:104,5:.: 1.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:46,4:.:-1.21:1.000:. ./.:4:118,2:.: 1.45:1.000:. ./.:4:87,4:.: 0.35:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:79,5:.: 0.08:1.000:. ./.:4:78,3:.:-0.03:0.998:. ./.:4:74,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,6:.: 0.23:1.000:. ./.:4:63,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,11:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,14:.: 0.19:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:82,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:81,4:.: 0.12:0.999:. ./.:4:54,9:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,11:.:-0.57:1.000:. ./.:4:67,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,4:.:-0.79:1.000:. ./.:4:43,8:.:-1.18:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:64,7:.:-0.41:1.000:. ./.:4:61,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:108,3:.: 1.11:1.000:. ./.:4:91,7:.: 0.61:1.000:. ./.:4:73,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:127,7:.: 1.98:1.000:. ./.:4:55,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:61,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:83,4:.: 0.19:1.000:. -chr2.1 48603552 chr2.1_048603552 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:0.998:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:26,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.94:1.000:. ./.:6:18,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:0.777:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.73:0.608:. ./.:4:17,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:3:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:32,0:.: 3.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:0.993:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:0.998:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:0.999:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. -chr2.1 48837289 chr2.1_048837289 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:184,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.84:0.998:. ./.:4:145,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:234,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:103,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:33,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.98:1.000:. ./.:3:28,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:164,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.03:1.000:. ./.:6:121,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.38:0.777:. ./.:4:200,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:183,2:.: 0.89:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.06:0.608:. ./.:4:190,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.76:1.000:. ./.:3:81,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:131,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:252,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:154,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.82:0.993:. ./.:4:180,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:192,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:205,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:230,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.25:0.998:. ./.:4:178,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.29:0.999:. ./.:4:136,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:230,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.27:1.000:. -chr2.1 49014621 chr2.1_049014621 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:295,71:.:-0.72:1.000:. ./.:4:307,154:.: 0.11:1.000:. ./.:4:263,234:.: 0.42:1.000:. ./.:4:345,227:.: 1.07:1.000:. ./.:4:319,279:.: 1.29:1.000:. ./.:4:394,306:.: 2.18:1.000:. ./.:4:224,225:.: 0.00:1.000:. ./.:4:269,218:.: 0.33:1.000:. ./.:4:292,160:.: 0.03:1.000:. ./.:4:145,55:.:-2.16:1.000:. ./.:4:123,42:.:-2.46:1.000:. ./.:4:274,161:.:-0.12:1.000:. ./.:4:314,246:.: 0.96:1.000:. ./.:4:337,228:.: 1.01:1.000:. ./.:4:290,156:.:-0.02:1.000:. ./.:4:313,251:.: 1.00:1.000:. ./.:4:310,149:.: 0.09:0.998:. ./.:4:273,314:.: 1.20:1.000:. ./.:4:389,194:.: 1.16:1.000:. ./.:4:354,260:.: 1.43:1.000:. ./.:4:101,27:.:-2.78:1.000:. ./.:4:273,172:.:-0.03:1.000:. ./.:4:317,265:.: 1.15:1.000:. ./.:4:275,215:.: 0.36:1.000:. ./.:4:73,23:.:-3.06:1.000:. ./.:4:435,267:.: 2.19:1.000:. ./.:4:337,269:.: 1.36:1.000:. ./.:4:264,244:.: 0.51:1.000:. ./.:4:326,166:.: 0.37:1.000:. ./.:4:281,251:.: 0.72:1.000:. ./.:4:355,218:.: 1.08:1.000:. ./.:4:264,187:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,11:.:-3.26:1.000:. ./.:4:121,38:.:-2.51:1.000:. ./.:3:62,29:.:-3.10:1.000:. ./.:4:310,212:.: 0.63:1.000:. ./.:4:282,250:.: 0.72:1.000:. ./.:4:320,318:.: 1.64:1.000:. ./.:4:382,69:.: 0.02:1.000:. ./.:4:293,222:.: 0.57:1.000:. ./.:4:205,179:.:-0.56:1.000:. ./.:4:273,160:.:-0.14:1.000:. ./.:4:357,153:.: 0.53:1.000:. ./.:4:272,139:.:-0.33:1.000:. ./.:4:366,236:.: 1.33:1.000:. ./.:4:346,150:.: 0.41:1.000:. ./.:4:344,219:.: 0.99:1.000:. ./.:4:290,58:.:-0.87:1.000:. ./.:4:307,197:.: 0.48:1.000:. ./.:4:393,142:.: 0.75:1.000:. ./.:4:211,171:.:-0.58:1.000:. ./.:4:381,270:.: 1.75:1.000:. ./.:4:261,94:.:-0.81:1.000:. ./.:4:330,142:.: 0.20:1.000:. ./.:4:241,224:.: 0.14:1.000:. ./.:4:325,149:.: 0.22:1.000:. ./.:4:258,142:.:-0.42:1.000:. ./.:4:291,241:.: 0.72:1.000:. ./.:4:307,130:.:-0.10:1.000:. ./.:6:225,112:.:-0.97:1.000:. ./.:4:263,104:.:-0.71:1.000:. ./.:4:290,192:.: 0.29:1.000:. ./.:4:363,150:.: 0.56:1.000:. ./.:4:279,194:.: 0.21:1.000:. ./.:4:297,154:.: 0.02:1.000:. ./.:4:266,74:.:-0.94:1.000:. ./.:4:230,149:.:-0.60:1.000:. ./.:4:246,129:.:-0.64:1.000:. ./.:4:245,245:.: 0.36:0.777:. ./.:4:282,131:.:-0.31:1.000:. ./.:4:348,220:.: 1.03:1.000:. ./.:4:280,135:.:-0.29:1.000:. ./.:4:347,167:.: 0.57:1.000:. ./.:4:294,220:.: 0.57:1.000:. ./.:4:306,211:.: 0.59:1.000:. ./.:4:253,139:.:-0.49:1.000:. ./.:4:291,113:.:-0.39:1.000:. ./.:4:275,265:.: 0.79:1.000:. ./.:4:268,194:.: 0.11:1.000:. ./.:4:273,141:.:-0.30:1.000:. ./.:4:262,162:.:-0.21:0.608:. ./.:4:294,63:.:-0.80:1.000:. ./.:4:352,74:.:-0.20:1.000:. ./.:4:286,199:.: 0.31:1.000:. ./.:4:311,205:.: 0.58:1.000:. ./.:4:259,272:.: 0.71:1.000:. ./.:4:213,106:.:-1.12:1.000:. ./.:4:244,234:.: 0.25:1.000:. ./.:4:272,212:.: 0.31:1.000:. ./.:4:280,173:.: 0.04:1.000:. ./.:3:156,174:.:-1.03:1.000:. ./.:4:235,129:.:-0.73:1.000:. ./.:4:250,199:.: 0.00:1.000:. ./.:4:217,118:.:-0.99:1.000:. ./.:4:257,124:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,236:.: 0.32:1.000:. ./.:4:193,153:.:-0.89:1.000:. ./.:4:217,127:.:-0.91:1.000:. ./.:4:260,211:.: 0.19:1.000:. ./.:4:301,200:.: 0.45:1.000:. ./.:4:246,234:.: 0.27:1.000:. ./.:4:287,215:.: 0.46:1.000:. ./.:4:196,81:.:-1.49:1.000:. ./.:4:261,192:.: 0.04:1.000:. ./.:4:198,177:.:-0.64:1.000:. ./.:4:266,121:.:-0.54:1.000:. ./.:4:245,124:.:-0.69:1.000:. ./.:4:295,147:.:-0.06:1.000:. ./.:4:345,282:.: 1.54:1.000:. ./.:4:247,263:.: 0.53:1.000:. ./.:4:237,112:.:-0.86:1.000:. ./.:4:392,225:.: 1.46:1.000:. ./.:4:234,153:.:-0.54:0.999:. ./.:4:300,136:.:-0.11:1.000:. ./.:4:209,148:.:-0.80:0.993:. ./.:4:264,83:.:-0.88:1.000:. ./.:4:223,185:.:-0.35:1.000:. ./.:4:288,130:.:-0.27:1.000:. ./.:4:284,141:.:-0.21:1.000:. ./.:4:272,92:.:-0.73:1.000:. ./.:4:349,200:.: 0.87:1.000:. ./.:4:236,195:.:-0.15:1.000:. ./.:4:251,172:.:-0.22:1.000:. ./.:4:304,231:.: 0.75:1.000:. ./.:4:255,105:.:-0.77:1.000:. ./.:4:296,127:.:-0.22:1.000:. ./.:4:236,168:.:-0.39:1.000:. ./.:4:271,68:.:-0.95:1.000:. ./.:4:202,85:.:-1.40:1.000:. ./.:4:190,142:.:-1.01:1.000:. ./.:4:278,135:.:-0.31:1.000:. ./.:4:260,146:.:-0.37:1.000:. ./.:4:132,89:.:-1.97:1.000:. ./.:4:245,188:.:-0.14:1.000:. ./.:4:237,201:.:-0.09:1.000:. ./.:4:426,208:.: 1.61:1.000:. ./.:4:243,66:.:-1.21:1.000:. ./.:4:209,91:.:-1.29:1.000:. ./.:4:204,87:.:-1.37:1.000:. ./.:4:238,101:.:-0.95:1.000:. ./.:4:288,133:.:-0.24:1.000:. ./.:4:224,117:.:-0.93:1.000:. ./.:4:285,110:.:-0.47:1.000:. ./.:4:191,39:.:-1.90:1.000:. ./.:4:349,246:.: 1.27:1.000:. ./.:4:313,277:.: 1.22:1.000:. ./.:4:357,233:.: 1.22:1.000:. ./.:4:297,233:.: 0.70:1.000:. ./.:4:328,263:.: 1.23:1.000:. ./.:4:234,168:.:-0.41:1.000:. ./.:4:332,189:.: 0.63:1.000:. ./.:4:319,242:.: 0.97:1.000:. ./.:4:91,39:.:-2.76:1.000:. ./.:4:227,119:.:-0.89:1.000:. ./.:4:338,176:.: 0.57:1.000:. ./.:4:332,218:.: 0.88:1.000:. ./.:4:393,188:.: 1.15:1.000:. ./.:4:382,147:.: 0.70:1.000:. ./.:4:250,179:.:-0.17:0.998:. ./.:4:313,232:.: 0.83:1.000:. ./.:4:259,207:.: 0.15:1.000:. ./.:4:266,185:.: 0.02:1.000:. ./.:4:266,220:.: 0.32:1.000:. ./.:4:278,297:.: 1.09:1.000:. ./.:4:342,155:.: 0.42:1.000:. ./.:4:288,199:.: 0.33:1.000:. ./.:4:278,173:.: 0.02:1.000:. ./.:4:312,203:.: 0.57:0.999:. ./.:4:258,281:.: 0.78:1.000:. ./.:4:255,194:.: 0.00:1.000:. ./.:4:281,137:.:-0.27:1.000:. ./.:4:274,115:.:-0.52:1.000:. ./.:4:243,223:.: 0.15:1.000:. ./.:4:221,129:.:-0.86:1.000:. ./.:4:247,176:.:-0.22:1.000:. ./.:4:200,108:.:-1.22:1.000:. ./.:4:319,266:.: 1.18:1.000:. ./.:4:313,243:.: 0.93:1.000:. ./.:4:296,184:.: 0.27:1.000:. ./.:4:275,146:.:-0.24:1.000:. ./.:4:286,234:.: 0.62:1.000:. ./.:4:450,367:.: 3.19:1.000:. ./.:4:316,224:.: 0.79:1.000:. ./.:4:274,137:.:-0.33:1.000:. ./.:4:326,166:.: 0.37:1.000:. -chr2.1 49264926 chr2.1_049264926 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,37:0.71: 0.08:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,60:0.76: 1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,70:0.82: 1.55:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,23:0.52:-0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,28:0.82:-0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,43:0.70: 0.53:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,2:0.32:-1.91:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,42:0.67: 0.57:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,17:0.44:-0.49:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,38:0.65: 0.35:0.998:0.805 0/1/1/1:4:35,77:0.78: 2.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,71:0.76: 2.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,45:0.64: 0.92:1.000:0.743 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,42:0.63: 0.75:1.000:0.579 0/0/1/1:4:30,31:0.57: 0.08:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,3:0.38:-2.04:1.000:0.515 0/0/1/1:4:22,21:0.54:-0.71:1.000:0.986 0/1/1/1:4:25,35:0.67: 0.04:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:10,54:0.89: 0.22:1.000:0.582 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,7:0.44:-1.73:1.000:0.969 1/1/1/1:4:3,36:0.95:-0.89:1.000:1.000 0/1/1:3:3,6:0.77:-2.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,43:0.58: 1.06:1.000:0.901 0/1/1/1:4:26,40:0.71: 0.30:1.000:0.989 0/1/1/1:4:25,71:0.82: 1.63:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.56:-0.94:1.000:0.970 0/1/1/1:4:26,50:0.76: 0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,25:0.48: 0.04:1.000:0.994 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,43:0.62: 0.88:1.000:0.574 0/0/1/1:4:30,31:0.57: 0.08:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,121:1.00: 2.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,26:0.53:-0.23:1.000:0.991 0/1/1/1:4:19,46:0.80: 0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00: 0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,26:0.48: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,29:0.62:-0.27:1.000:0.522 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,20:0.56:-0.85:1.000:0.970 0/0/1/1:4:32,33:0.57: 0.26:1.000:0.950 0/0/0/0/1/1:6:25,7:0.37:-1.20:1.000:0.837 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,55:0.84: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,25:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,37:0.62: 0.39:1.000:0.578 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,17:0.58:-1.16:1.000:0.918 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,30:0.62:-0.18:0.777:0.554 0/1/1/1:4:33,63:0.76: 1.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,56:0.73: 1.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,26:0.77:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,40:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,84:0.81: 2.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,40:0.48: 1.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,45:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,40:0.69: 0.35:1.000:0.978 0/1/1/1:4:34,45:0.65: 0.88:1.000:0.833 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,42:0.79: 0.04:0.608:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,43:0.68: 0.61:1.000:0.958 0/0/1/1:4:33,34:0.57: 0.35:1.000:0.951 0/1/1/1:4:37,53:0.68: 1.37:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,80:0.82: 2.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,46:0.81: 0.17:1.000:1.000 0/0/1:3:28,13:0.42:-0.80:1.000:0.994 0/1/1/1:4:25,56:0.79: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,63:0.77: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,29:0.49: 0.30:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,58:0.67: 1.81:1.000:0.918 0/0/1/1:4:35,25:0.48: 0.04:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,45:0.70: 0.70:1.000:0.982 0/1/1/1:4:20,34:0.74:-0.23:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,41:0.58: 0.88:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,56:0.85: 0.57:1.000:0.991 0/1/1/1:4:32,58:0.75: 1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,33:0.68:-0.14:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 0.57:0.999:1.000 0/0/1/1:4:37,34:0.53: 0.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,37:0.65: 0.26:0.993:0.829 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,30:0.68:-0.36:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00: 0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 1.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,17:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,39:0.66: 0.39:1.000:0.871 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,19:0.48:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,29:0.49: 0.26:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,41:0.64: 0.61:1.000:0.730 1/1/1/1:4:0,82:1.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,31:0.53: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,25:0.50:-0.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,48:0.70: 0.92:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,64:0.74: 1.90:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,19:0.44:-0.23:1.000:0.970 0/0/1/1:4:34,21:0.46:-0.18:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,23:0.47:-0.05:1.000:0.991 0/1/1/1:4:25,46:0.76: 0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,36:0.66: 0.17:1.000:0.851 0/0/1/1:4:18,20:0.59:-0.94:1.000:0.834 0/1/1/1:4:36,54:0.70: 1.37:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,41:0.65: 0.57:1.000:0.831 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 1.15:0.998:1.000 0/0/1/1:4:29,25:0.51:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,26:0.53:-0.23:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,63:0.86: 0.88:1.000:0.967 0/0/1/1:4:30,15:0.43:-0.63:1.000:0.951 0/1/1/1:4:26,59:0.79: 1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,76:0.84: 1.77:0.999:0.995 0/1/1/1:4:33,52:0.71: 1.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,24:0.54:-0.45:1.000:0.985 0/0/1/1:4:26,22:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,18:0.64:-1.20:1.000:0.743 0/1/1/1:4:22,46:0.78: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,20:0.46:-0.36:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,36:0.74:-0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:8,44:0.89:-0.32:1.000:0.634 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,76:0.83: 1.86:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,41:0.70: 0.39:1.000:0.986 0/1/1/1:4:25,50:0.77: 0.70:1.000:1.000 -chr2.1 49539929 chr2.1_049539929 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:187,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:128,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.27:0.998:. ./.:4:154,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:180,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.57:1.000:. ./.:3:8,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:225,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.08:1.000:. ./.:6:139,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:146,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.08:0.777:. ./.:4:159,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:199,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.46:0.608:. ./.:4:145,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.46:1.000:. ./.:3:93,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:208,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:144,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.00:0.993:. ./.:4:179,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:169,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.43:0.998:. ./.:4:119,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:130,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.69:1.000:. -chr2.1 49573583 chr2.1_049573583 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:191,79:.: 0.87:1.000:. ./.:4:148,60:.:-0.14:1.000:. ./.:4:272,2:.: 0.93:1.000:. ./.:4:258,4:.: 0.74:1.000:. ./.:4:229,77:.: 1.45:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:266,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:197,69:.: 0.80:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:159,58:.: 0.01:1.000:. ./.:4:191,66:.: 0.66:1.000:. ./.:4:215,3:.: 0.03:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:218,68:.: 1.13:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.62:0.998:. ./.:4:191,76:.: 0.82:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:293,5:.: 1.32:1.000:. ./.:4:60,1:.:-2.52:1.000:. ./.:4:265,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:258,88:.: 2.10:1.000:. ./.:4:264,3:.: 0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:241,76:.: 1.63:1.000:. ./.:4:278,4:.: 1.06:1.000:. ./.:4:206,63:.: 0.85:1.000:. ./.:4:213,80:.: 1.24:1.000:. ./.:4:205,74:.: 1.01:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:233,3:.: 0.32:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.21:1.000:. ./.:3:20,5:.:-3.10:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:284,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:159,62:.: 0.07:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:182,76:.: 0.67:1.000:. ./.:4:185,67:.: 0.58:1.000:. ./.:4:153,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:173,42:.:-0.02:1.000:. ./.:4:167,62:.: 0.20:1.000:. ./.:4:302,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:147,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:166,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:171,62:.: 0.27:1.000:. ./.:4:189,70:.: 0.69:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:158,54:.:-0.07:1.000:. ./.:4:215,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,66:.: 0.27:1.000:. ./.:6:115,30:.:-1.16:1.000:. ./.:4:170,55:.: 0.14:1.000:. ./.:4:222,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:154,51:.:-0.18:1.000:. ./.:4:141,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:189,73:.: 0.74:1.000:. ./.:4:164,74:.: 0.35:1.000:. ./.:4:129,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:148,64:.:-0.07:0.777:. ./.:4:224,5:.: 0.20:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:144,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:168,62:.: 0.22:1.000:. ./.:4:251,5:.: 0.64:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:181,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:187,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:145,63:.:-0.14:1.000:. ./.:4:128,42:.:-0.75:1.000:. ./.:4:114,43:.:-0.96:0.608:. ./.:4:146,51:.:-0.31:1.000:. ./.:4:173,55:.: 0.19:1.000:. ./.:4:216,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:104,30:.:-1.33:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:229,4:.: 0.27:1.000:. ./.:3:106,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:143,68:.:-0.09:1.000:. ./.:4:160,53:.:-0.06:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:139,36:.:-0.67:1.000:. ./.:4:210,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:157,46:.:-0.22:1.000:. ./.:4:122,36:.:-0.95:1.000:. ./.:4:143,64:.:-0.15:1.000:. ./.:4:119,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:188,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:214,81:.: 1.27:1.000:. ./.:4:291,3:.: 1.26:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:135,52:.:-0.48:1.000:. ./.:4:345,2:.: 2.11:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.54:0.999:. ./.:4:168,52:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,45:.:-0.96:0.993:. ./.:4:148,56:.:-0.20:1.000:. ./.:4:140,3:.:-1.19:1.000:. ./.:4:188,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:116,34:.:-1.07:1.000:. ./.:4:125,43:.:-0.78:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:217,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:228,68:.: 1.29:1.000:. ./.:4:131,46:.:-0.64:1.000:. ./.:4:165,54:.: 0.04:1.000:. ./.:4:125,50:.:-0.67:1.000:. ./.:4:77,78:.:-0.99:1.000:. ./.:4:99,29:.:-1.43:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:122,52:.:-0.69:1.000:. ./.:4:238,5:.: 0.43:1.000:. ./.:4:84,32:.:-1.62:1.000:. ./.:4:206,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:142,63:.:-0.18:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:168,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:95,40:.:-1.32:1.000:. ./.:4:118,43:.:-0.90:1.000:. ./.:4:129,45:.:-0.69:1.000:. ./.:4:119,48:.:-0.80:1.000:. ./.:4:140,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:223,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,34:.:-1.46:1.000:. ./.:4:240,83:.: 1.72:1.000:. ./.:4:353,4:.: 2.28:1.000:. ./.:4:201,57:.: 0.67:1.000:. ./.:4:205,59:.: 0.77:1.000:. ./.:4:223,78:.: 1.37:1.000:. ./.:4:219,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:192,65:.: 0.66:1.000:. ./.:4:251,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:284,3:.: 1.14:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.41:0.998:. ./.:4:238,78:.: 1.61:1.000:. ./.:4:199,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:280,4:.: 1.09:1.000:. ./.:4:201,70:.: 0.88:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:151,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:222,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:174,51:.: 0.14:1.000:. ./.:4:132,44:.:-0.65:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:175,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:133,65:.:-0.30:1.000:. ./.:4:312,4:.: 1.61:1.000:. ./.:4:191,59:.: 0.54:1.000:. ./.:4:191,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:190,49:.: 0.37:1.000:. ./.:4:212,73:.: 1.11:1.000:. ./.:4:317,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:236,88:.: 1.74:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:225,88:.: 1.56:1.000:. -chr2.1 49720757 chr2.1_049720757 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:162,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:46,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:211,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:125,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:53,5:.:-0.91:1.000:. ./.:4:43,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:110,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:61,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:111,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.12:0.998:. ./.:4:115,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:72,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:101,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:146,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:61,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.18:1.000:. ./.:3:25,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:61,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:149,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:123,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:62,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:138,12:.: 0.97:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:116,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:47,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:52,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:70,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.30:1.000:. ./.:6:113,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:152,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:48,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:183,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:201,2:.: 2.06:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.21:0.777:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:113,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.52:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:52,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.06:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:50,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:115,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:44,1:.:-1.18:0.608:. ./.:4:123,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:153,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:39,2:.:-1.26:1.000:. ./.:4:120,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:49,1:.:-1.07:1.000:. ./.:3:112,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.08:1.000:. ./.:4:114,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:48,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.21:0.999:. ./.:4:182,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.36:0.993:. ./.:4:169,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,4:.:-0.87:1.000:. ./.:4:56,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:139,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:127,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:194,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:203,1:.: 2.08:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:221,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.64:0.998:. ./.:4:178,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.91:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.06:0.999:. ./.:4:84,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:123,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,3:.:-1.01:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:150,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:200,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.10:1.000:. -chr2.1 49809886 chr2.1_049809886 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:261,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:206,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:194,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.20:0.998:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:324,2:.: 1.27:1.000:. ./.:4:328,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:65,1:.:-2.77:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:383,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:38,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.47:1.000:. ./.:3:49,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:192,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:268,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:213,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.11:1.000:. ./.:6:247,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:284,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:319,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:316,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:286,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.54:0.777:. ./.:4:201,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:332,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:259,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:266,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.50:0.608:. ./.:4:285,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.03:1.000:. ./.:3:162,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:214,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:332,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:343,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:202,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:297,3:.: 0.87:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:344,2:.: 1.58:1.000:. ./.:4:319,1:.: 1.18:0.999:. ./.:4:320,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.79:0.993:. ./.:4:329,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:198,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:290,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:396,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:337,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:238,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:233,1:.:-0.16:0.998:. ./.:4:287,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:267,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:175,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:228,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:328,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:204,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.12:1.000:. -chr2.1 50058158 chr2.1_050058158 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:299,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:302,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.77:0.998:. ./.:4:212,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:399,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:430,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:53,1:.:-3.04:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.65:1.000:. ./.:3:23,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:147,1:.:-1.60:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:231,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.02:0.777:. ./.:4:230,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.64:0.608:. ./.:4:280,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:305,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.01:1.000:. ./.:3:167,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:304,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:290,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.73:0.993:. ./.:4:303,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:165,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:389,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:49,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.04:0.998:. ./.:4:306,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:211,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:295,1:.: 0.65:1.000:. -chr2.1 51108088 chr2.1_051108088 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:125,49:0.30: 0.79:1.000:0.988 0/0/0/1:4:109,34:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,45:0.24: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,42:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,85:0.46: 1.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:116,109:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,54:0.45:-0.27:1.000:0.982 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,49:0.31: 0.60:1.000:0.971 0/0/1/1:4:6,8:0.55:-2.52:1.000:0.980 0/0/0/1:4:22,5:0.20:-2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,72:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,40:0.27: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,63:0.45: 0.17:1.000:0.980 0/0/1/1:4:81,77:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,49:0.25: 1.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,53:0.27: 1.55:0.998:0.998 0/0/0/1:4:151,39:0.22: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,64:0.32: 1.47:1.000:0.943 0/0/1/1:4:106,104:0.50: 1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:10,4:0.30:-2.52:1.000:0.985 0/0/1/1:4:83,91:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,40:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,6:0.35:-2.44:1.000:0.813 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,70:0.43: 0.69:1.000:0.940 0/0/1/1:4:82,67:0.46: 0.27:1.000:0.989 0/0/1/1:4:98,103:0.51: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,55:0.29: 1.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,52:0.33: 0.56:1.000:0.905 0/1/1/1:4:0,6:0.82:-2.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,15:0.68:-2.42:1.000:0.950 0/0/1:3:7,2:0.24:-2.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,92:0.48: 1.24:1.000:0.995 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,85:0.48: 0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,74:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,97:0.49: 1.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,64:0.53:-0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:104,30:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,37:0.32:-0.33:1.000:0.945 0/0/0/1:4:90,30:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,45:0.42:-0.53:1.000:0.924 0/0/1/1:4:103,79:0.45: 0.95:1.000:0.977 0/0/1/1:4:32,52:0.58:-1.07:1.000:0.922 0/0/1/1:4:68,67:0.51:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,53:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,18:0.20:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,88:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,46:0.47:-0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:72,71:0.51: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,38:0.38:-0.64:1.000:0.515 0/0/1/1:4:69,51:0.44:-0.33:1.000:0.964 0/0/1/1:4:79,61:0.45: 0.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:57,73:0.54:-0.12:1.000:0.985 0/0/0/0/0/1:6:58,14:0.21:-1.32:1.000:0.892 0/0/0/1:4:88,33:0.29:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:104,44:0.31: 0.25:1.000:0.970 0/0/1/1:4:69,66:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,28:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,41:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,44:0.36:-0.16:1.000:0.712 0/1/1/1:4:19,53:0.65:-1.32:1.000:0.765 0/0/1/1:4:68,61:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.41:0.777:1.000 0/0/0/1:4:119,36:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,99:0.63: 0.09:1.000:0.563 0/0/0/1:4:84,17:0.18:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,22:0.21:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,59:0.32: 1.16:1.000:0.948 0/0/0/1:4:102,29:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,34:0.31:-0.45:1.000:0.969 0/0/0/1:4:87,18:0.18:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,50:0.43:-0.35:1.000:0.955 0/0/0/1:4:118,21:0.16: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,28:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,51:0.53:-0.82:0.608:0.994 0/0/0/1:4:92,28:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,43:0.40:-0.51:1.000:0.800 0/0/1/1:4:71,73:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,62:0.64:-1.03:1.000:0.666 0/0/1/1:4:64,62:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,46:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,35:0.46:-1.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:52,42:0.46:-0.87:1.000:0.987 0/0/1/1:4:65,51:0.45:-0.41:1.000:0.982 0/0/1:3:55,19:0.27:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,34:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,33:0.27:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,37:0.29:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:62,69:0.52:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:32,33:0.51:-1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,25:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,89:0.53: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,29:0.45:-1.42:1.000:0.975 0/0/0/1:4:81,22:0.23:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,16:0.22:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,38:0.44:-0.99:1.000:0.974 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,56:0.48:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,37:0.48:-1.15:1.000:0.994 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,41:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:115,36:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,21:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,64:0.28: 2.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,39:0.46:-0.99:0.999:0.985 0/0/1/1:4:61,63:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,19:0.24:-1.07:0.993:1.000 0/0/0/1:4:91,16:0.16:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,34:0.46:-1.24:1.000:0.988 0/0/1/1:4:45,47:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,22:0.29:-1.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,20:0.23:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,65:0.43: 0.42:1.000:0.947 0/0/0/1:4:78,22:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,47:0.44:-0.51:1.000:0.961 0/0/0/1:4:171,44:0.22: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,20:0.19:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,28:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,24:0.27:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,22:0.27:-1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,44:0.51:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,34:0.48:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,46:0.29: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,10:0.15:-1.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:105,30:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,55:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,182:0.70: 1.78:1.000:0.982 0/0/0/1:4:110,29:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,44:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,56:0.53:-0.66:1.000:0.992 0/0/0/1:4:78,16:0.18:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,41:0.45:-0.89:1.000:0.983 0/0/1/1:4:36,49:0.55:-1.05:1.000:0.977 0/0/1/1:4:79,88:0.52: 0.64:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,22:0.31:-1.28:1.000:0.970 0/0/1/1:4:103,85:0.46: 1.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:165,32:0.17: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,84:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:115,44:0.29: 0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:147,34:0.20: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,55:0.45:-0.20:1.000:0.979 0/0/0/1:4:178,42:0.20: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,104:0.55: 1.00:1.000:0.983 0/0/0/1:4:6,2:0.27:-2.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:85,63:0.44: 0.25:1.000:0.965 0/0/1/1:4:90,86:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,40:0.33:-0.16:1.000:0.932 0/1/1/1:4:43,141:0.66: 1.00:1.000:0.898 0/0/0/1:4:142,37:0.22: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,76:0.50: 0.37:0.998:0.997 0/0/0/1:4:152,42:0.23: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,71:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,32:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,102:0.54: 0.93:1.000:0.984 0/0/0/1:4:122,37:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:133,38:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,35:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,72:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,80:0.50: 0.58:0.999:0.997 0/0/1/1:4:74,87:0.53: 0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,79:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,35:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,28:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,31:0.21: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,37:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,60:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,55:0.25: 1.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,84:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,48:0.31: 0.52:1.000:0.969 0/0/0/1:4:114,51:0.32: 0.60:1.000:0.943 0/0/1/1:4:98,103:0.51: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,53:0.23: 2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,64:0.46: 0.17:1.000:0.986 0/0/0/1:4:126,50:0.30: 0.83:1.000:0.986 -chr2.1 51165676 chr2.1_051165676 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:167,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:219,1:.: 1.24:0.998:. ./.:4:144,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:173,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.34:1.000:. ./.:3:77,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:72,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:149,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:269,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.09:0.777:. ./.:4:118,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.16:0.608:. ./.:4:227,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.42:1.000:. ./.:3:121,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.07:0.999:. ./.:4:202,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.96:0.993:. ./.:4:210,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:228,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:261,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:166,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.85:0.998:. ./.:4:206,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:167,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.88:1.000:. -chr2.1 51224634 chr2.1_051224634 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:327,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:119,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.58:0.998:. ./.:4:321,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:66,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.28:1.000:. ./.:3:39,0:.:-3.56:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:206,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.63:1.000:. ./.:6:232,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:242,1:.:-0.08:0.777:. ./.:4:281,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:245,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.02:0.608:. ./.:4:268,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.19:1.000:. ./.:3:158,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:261,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.82:0.993:. ./.:4:277,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:406,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:97,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.08:0.998:. ./.:4:253,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.16:0.999:. ./.:4:280,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.39:1.000:. -chr2.1 51587388 chr2.1_051587388 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:59,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.15:0.998:. ./.:4:73,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.90:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:100,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.10:1.000:. ./.:6:37,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.47:0.777:. ./.:4:50,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.88:0.608:. ./.:4:94,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.06:1.000:. ./.:3:27,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.21:0.999:. ./.:4:72,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.54:0.993:. ./.:4:83,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:105,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.42:0.998:. ./.:4:52,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.62:0.999:. ./.:4:39,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. -chr2.1 51751007 chr2.1_051751007 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:293,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:252,89:.: 0.19:1.000:. ./.:4:272,95:.: 0.55:1.000:. ./.:4:275,91:.: 0.54:1.000:. ./.:4:367,119:.: 2.20:1.000:. ./.:4:192,56:.:-1.10:1.000:. ./.:4:355,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:263,80:.: 0.22:1.000:. ./.:4:124,27:.:-2.44:1.000:. ./.:4:92,21:.:-2.97:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:278,82:.: 0.45:1.000:. ./.:4:302,92:.: 0.93:1.000:. ./.:4:178,172:.: 0.32:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:274,78:.: 0.34:0.998:. ./.:4:408,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:316,133:.: 1.69:1.000:. ./.:4:343,126:.: 1.97:1.000:. ./.:4:81,54:.:-2.67:1.000:. ./.:4:174,174:.: 0.29:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:72,31:.:-3.11:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:258,76:.: 0.09:1.000:. ./.:4:214,200:.: 1.20:1.000:. ./.:4:279,79:.: 0.43:1.000:. ./.:4:266,98:.: 0.51:1.000:. ./.:4:358,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,46:.:-3.41:1.000:. ./.:4:89,74:.:-2.28:1.000:. ./.:3:48,11:.:-3.72:1.000:. ./.:4:272,80:.: 0.34:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:251,91:.: 0.21:1.000:. ./.:4:167,133:.:-0.38:1.000:. ./.:4:251,90:.: 0.19:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:239,66:.:-0.31:1.000:. ./.:4:209,71:.:-0.65:1.000:. ./.:4:183,53:.:-1.26:1.000:. ./.:4:262,69:.: 0.05:1.000:. ./.:4:146,167:.:-0.20:1.000:. ./.:4:294,104:.: 0.98:1.000:. ./.:4:134,110:.:-1.15:1.000:. ./.:4:177,59:.:-1.26:1.000:. ./.:4:142,51:.:-1.86:1.000:. ./.:4:253,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:287,113:.: 1.01:1.000:. ./.:4:249,99:.: 0.29:1.000:. ./.:4:177,179:.: 0.40:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:255,71:.:-0.02:1.000:. ./.:4:228,81:.:-0.25:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:211,61:.:-0.77:1.000:. ./.:6:232,62:.:-0.46:1.000:. ./.:4:291,83:.: 0.65:1.000:. ./.:4:274,76:.: 0.32:1.000:. ./.:4:156,150:.:-0.29:1.000:. ./.:4:172,50:.:-1.46:1.000:. ./.:4:282,86:.: 0.57:1.000:. ./.:4:185,77:.:-0.90:1.000:. ./.:4:146,146:.:-0.49:1.000:. ./.:4:275,106:.: 0.75:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.69:0.777:. ./.:4:287,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:167,142:.:-0.25:1.000:. ./.:4:157,40:.:-1.81:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:260,113:.: 0.64:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:263,76:.: 0.16:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:276,78:.: 0.37:1.000:. ./.:4:311,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:262,81:.: 0.22:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.07:0.608:. ./.:4:252,79:.: 0.05:1.000:. ./.:4:208,208:.: 1.23:1.000:. ./.:4:220,88:.:-0.27:1.000:. ./.:4:154,164:.:-0.13:1.000:. ./.:4:274,94:.: 0.57:1.000:. ./.:4:215,72:.:-0.56:1.000:. ./.:4:172,73:.:-1.14:1.000:. ./.:4:252,77:.: 0.03:1.000:. ./.:4:274,74:.: 0.29:1.000:. ./.:3:179,81:.:-0.93:1.000:. ./.:4:230,67:.:-0.42:1.000:. ./.:4:367,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:196,69:.:-0.86:1.000:. ./.:4:279,91:.: 0.59:1.000:. ./.:4:251,70:.:-0.09:1.000:. ./.:4:241,83:.:-0.04:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:273,94:.: 0.55:1.000:. ./.:4:215,62:.:-0.70:1.000:. ./.:4:404,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:190,73:.:-0.89:1.000:. ./.:4:268,98:.: 0.54:1.000:. ./.:4:223,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:222,52:.:-0.74:1.000:. ./.:4:244,73:.:-0.14:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:318,110:.: 1.40:1.000:. ./.:4:339,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:223,94:.:-0.14:1.000:. ./.:4:334,113:.: 1.66:1.000:. ./.:4:268,92:.: 0.45:0.999:. ./.:4:195,169:.: 0.51:1.000:. ./.:4:211,62:.:-0.75:0.993:. ./.:4:301,102:.: 1.05:1.000:. ./.:4:249,70:.:-0.11:1.000:. ./.:4:118,121:.:-1.22:1.000:. ./.:4:263,78:.: 0.19:1.000:. ./.:4:232,74:.:-0.29:1.000:. ./.:4:221,65:.:-0.57:1.000:. ./.:4:298,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:246,95:.: 0.19:1.000:. ./.:4:321,102:.: 1.33:1.000:. ./.:4:211,75:.:-0.57:1.000:. ./.:4:281,79:.: 0.45:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:249,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:194,64:.:-0.96:1.000:. ./.:4:208,66:.:-0.74:1.000:. ./.:4:248,73:.:-0.09:1.000:. ./.:4:289,70:.: 0.44:1.000:. ./.:4:181,76:.:-0.97:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:190,152:.: 0.21:1.000:. ./.:4:218,201:.: 1.27:1.000:. ./.:4:299,97:.: 0.95:1.000:. ./.:4:156,139:.:-0.45:1.000:. ./.:4:236,69:.:-0.31:1.000:. ./.:4:224,65:.:-0.53:1.000:. ./.:4:273,70:.: 0.22:1.000:. ./.:4:270,72:.: 0.21:1.000:. ./.:4:172,159:.: 0.05:1.000:. ./.:4:188,57:.:-1.14:1.000:. ./.:4:278,92:.: 0.59:1.000:. ./.:4:308,103:.: 1.16:1.000:. ./.:4:264,77:.: 0.19:1.000:. ./.:4:248,68:.:-0.16:1.000:. ./.:4:300,91:.: 0.88:1.000:. ./.:4:226,70:.:-0.43:1.000:. ./.:4:311,106:.: 1.25:1.000:. ./.:4:279,93:.: 0.62:1.000:. ./.:4:136,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:149,149:.:-0.40:1.000:. ./.:4:178,168:.: 0.26:1.000:. ./.:4:369,112:.: 2.13:1.000:. ./.:4:211,200:.: 1.16:1.000:. ./.:4:324,98:.: 1.31:1.000:. ./.:4:262,100:.: 0.48:0.998:. ./.:4:293,113:.: 1.09:1.000:. ./.:4:250,89:.: 0.16:1.000:. ./.:4:166,55:.:-1.47:1.000:. ./.:4:253,78:.: 0.05:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:315,93:.: 1.12:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:261,81:.: 0.21:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.45:0.999:. ./.:4:262,101:.: 0.50:1.000:. ./.:4:248,70:.:-0.13:1.000:. ./.:4:224,75:.:-0.39:1.000:. ./.:4:228,84:.:-0.21:1.000:. ./.:4:222,104:.:-0.02:1.000:. ./.:4:251,82:.: 0.08:1.000:. ./.:4:213,59:.:-0.77:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:331,99:.: 1.43:1.000:. ./.:4:295,101:.: 0.95:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:266,76:.: 0.21:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:377,137:.: 2.59:1.000:. ./.:4:337,100:.: 1.52:1.000:. ./.:4:146,151:.:-0.42:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.47:1.000:. -chr2.1 52243977 chr2.1_052243977 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:27,76:0.73: 1.87:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,46:0.66: 0.25:1.000:0.882 0/0/0/1:4:38,18:0.34:-0.37:1.000:0.895 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,71:0.77: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.32:-1.95:1.000:0.954 0/0/0/1:4:64,18:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,40:0.65:-0.14:1.000:0.805 0/0/0/1:4:10,5:0.35:-2.33:1.000:0.822 0/0/0/1:4:10,5:0.35:-2.33:1.000:0.822 0/1/1/1:4:19,47:0.71: 0.10:1.000:0.990 0/0/0/1:4:33,16:0.34:-0.71:1.000:0.868 0/0/0/1:4:47,20:0.31: 0.15:1.000:0.966 0/0/0/1:4:43,24:0.37: 0.15:1.000:0.571 0/1/1/1:4:23,49:0.68: 0.39:1.000:0.941 0/0/0/1:4:53,20:0.29: 0.44:0.998:0.991 0/0/0/1:4:70,25:0.28: 1.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,25:0.27: 1.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,53:0.55: 1.59:1.000:0.984 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-2.57:1.000:0.851 0/1/1/1:4:9,40:0.81:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,29:0.37: 0.77:1.000:0.519 0/1/1/1:4:15,49:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.66:-2.77:1.000:0.882 0/0/1/1:4:34,38:0.53: 0.39:1.000:0.993 0/0/0/1:4:65,14:0.19: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,22:0.31: 0.49:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,81:1.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,1:0.03:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.54: 0.15:1.000:0.990 0/1/1/1:4:1,8:0.89:-2.62:1.000:0.618 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-2.29:1.000:0.997 1/1/1:3:0,2:1.00:-2.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,37:0.56: 0.10:1.000:0.969 0/0/0/1:4:61,18:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,21:0.43:-0.71:1.000:0.956 0/0/1/1:4:26,29:0.53:-0.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,46:0.68: 0.15:1.000:0.957 0/0/1/1:4:30,44:0.59: 0.49:1.000:0.851 1/1/1/1:4:0,88:1.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,43:0.52: 0.87:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,50:0.69: 0.39:1.000:0.972 0/0/1/1:4:39,26:0.41: 0.06:1.000:0.851 0/1/1/1:4:18,31:0.63:-0.71:1.000:0.550 0/0/0/1:4:46,25:0.36: 0.34:1.000:0.643 0/0/1/1:4:3,5:0.62:-2.67:1.000:0.549 0/0/1/1:4:40,38:0.49: 0.68:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,43:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,53:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,36:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,37:0.60:-0.14:1.000:0.758 0/0/1/1:4:38,40:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,32:0.57:-0.37:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,55:0.88:-0.09:1.000:0.669 0/0/1/1:4:27,32:0.54:-0.23:1.000:0.987 0/0/1/1/1/1:6:21,32:0.60:-0.52:1.000:0.652 0/1/1/1:4:19,47:0.71: 0.10:1.000:0.990 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,12:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,36:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,46:0.56: 0.87:1.000:0.968 0/1/1/1:4:19,36:0.65:-0.42:1.000:0.795 0/1/1/1:4:6,26:0.81:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,66:0.66: 1.68:1.000:0.882 0/0/1/1:4:35,27:0.44:-0.09:0.777:0.968 0/0/0/1:4:54,22:0.31: 0.58:1.000:0.979 0/1/1/1:4:14,48:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.25:-1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,17:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.33:-0.52:1.000:0.898 0/0/0/1:4:40,13:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,17:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,48:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,75:0.78: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,19:0.35:-0.37:1.000:0.774 0/1/1/1:4:14,48:0.77:-0.09:0.608:1.000 0/0/1/1:4:55,35:0.40: 1.25:1.000:0.770 0/0/1/1:4:27,38:0.58: 0.06:1.000:0.904 0/0/1/1:4:35,41:0.54: 0.58:1.000:0.989 0/1/1/1:4:6,20:0.76:-1.81:0.825:1.000 0/1/1/1:4:13,44:0.77:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,55:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,16:0.40:-1.09:1.000:0.781 0/0/1/1:4:24,15:0.39:-1.19:1.000:0.732 0/0/1/1:4:36,37:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/1/1:3:14,18:0.56:-1.52:1.000:0.983 0/0/0/1:4:61,26:0.31: 1.11:1.000:0.965 0/0/0/1:4:48,26:0.36: 0.49:1.000:0.652 1/1/1/1:4:5,50:0.91:-0.42:1.000:0.910 0/1/1/1:4:19,50:0.72: 0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,40:0.64:-0.09:1.000:0.702 0/1/1/1:4:16,48:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,13:0.27:-0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,48:0.57: 0.96:1.000:0.948 0/0/1/1:4:48,53:0.52: 1.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,12:0.46:-1.81:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,66:0.79: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,31:0.67:-0.85:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,13:0.23:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,37:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,52:0.81: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,31:0.47: 0.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,22:0.34: 0.15:1.000:0.856 0/0/1/1:4:43,46:0.52: 1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,40:0.66:-0.18:1.000:0.882 0/0/1/1:4:61,46:0.44: 2.06:1.000:0.959 0/1/1/1:4:19,50:0.72: 0.25:0.999:0.995 0/1/1/1:4:16,34:0.68:-0.66:1.000:0.939 0/1/1/1:4:6,16:0.72:-2.00:0.993:0.996 0/1/1/1:4:19,70:0.78: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,21:0.41:-0.57:1.000:0.873 0/1/1/1:4:18,38:0.67:-0.37:1.000:0.935 0/0/1/1:4:28,26:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:41,16:0.30:-0.33:1.000:0.987 0/0/1/1:4:37,28:0.44: 0.06:1.000:0.961 0/0/1/1:4:39,34:0.47: 0.44:1.000:0.992 0/1/1/1:4:17,51:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,46:0.71: 0.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,25:0.67:-1.28:1.000:0.924 0/0/1/1:4:31,31:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,27:0.38: 0.44:1.000:0.571 0/1/1/1:4:17,42:0.71:-0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,21:0.49:-1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,27:0.53:-0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,37:0.60:-0.14:1.000:0.758 0/0/1/1:4:42,50:0.54: 1.35:1.000:0.986 0/1/1/1:4:10,51:0.83:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,27:0.51:-0.52:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,48:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,65:0.83: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,31:0.60:-0.61:1.000:0.746 1/1/1/1:4:0,73:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,60:0.85: 0.29:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,62:0.78: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,14:0.31:-0.76:1.000:0.976 0/1/1/1:4:8,46:0.85:-0.47:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,26:0.31: 1.11:1.000:0.965 0/1/1/1:4:28,59:0.67: 1.11:1.000:0.933 0/1/1/1:4:22,47:0.68: 0.25:1.000:0.943 0/1/1/1:4:18,47:0.72: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,40:0.58: 0.25:1.000:0.923 0/0/1/1:4:43,55:0.56: 1.63:1.000:0.968 0/0/1/1:4:38,32:0.46: 0.29:1.000:0.988 0/1/1/1:4:2,8:0.79:-2.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,15:0.30:-0.47:1.000:0.989 0/1/1/1:4:11,27:0.70:-1.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:31,40:0.56: 0.34:1.000:0.964 0/0/1/1:4:28,39:0.58: 0.15:1.000:0.915 0/0/0/1:4:60,16:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,36:0.66:-0.47:0.998:0.882 0/1/1/1:4:20,53:0.72: 0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,53:0.63: 0.92:1.000:0.625 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,52:0.72: 0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,46:0.47: 1.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:13,5:0.30:-2.19:1.000:0.989 0/0/1/1:4:45,55:0.55: 1.73:1.000:0.981 0/1/1/1:4:17,37:0.68:-0.47:1.000:0.954 0/0/1/1:4:37,40:0.52: 0.63:0.999:0.995 0/1/1/1:4:18,58:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,58:0.81: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,34:0.47: 0.44:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,33:0.56:-0.23:1.000:0.971 0/0/1/1:4:34,42:0.55: 0.58:1.000:0.979 0/0/1/1:4:45,35:0.44: 0.77:1.000:0.971 0/0/1/1:4:22,18:0.45:-1.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:31,40:0.56: 0.34:1.000:0.964 0/0/0/1:4:46,23:0.35: 0.25:1.000:0.822 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,49:0.53: 1.35:1.000:0.992 0/1/1/1:4:21,43:0.67: 0.01:1.000:0.908 0/1/1/1:4:15,60:0.79: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,23:0.41:-0.33:1.000:0.871 0/1/1/1:4:26,81:0.75: 2.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,20:0.34:-0.09:1.000:0.889 0/0/1/1:4:46,46:0.50: 1.35:1.000:0.997 -chr2.1 52278775 chr2.1_052278775 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:302,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:219,70:.: 0.02:1.000:. ./.:4:262,78:.: 0.63:1.000:. ./.:4:255,71:.: 0.46:1.000:. ./.:4:446,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:145,49:.:-1.12:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:226,78:.: 0.20:1.000:. ./.:4:125,21:.:-1.70:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:194,61:.:-0.39:1.000:. ./.:4:271,83:.: 0.80:1.000:. ./.:4:281,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:408,1:.: 1.46:0.998:. ./.:4:320,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:461,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:108,33:.:-1.76:1.000:. ./.:4:253,69:.: 0.41:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:220,62:.:-0.07:1.000:. ./.:4:275,69:.: 0.68:1.000:. ./.:4:307,100:.: 1.43:1.000:. ./.:4:402,97:.: 2.54:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:154,33:.:-1.21:1.000:. ./.:4:144,42:.:-1.22:1.000:. ./.:3:50,25:.:-2.55:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:275,84:.: 0.86:1.000:. ./.:4:339,75:.: 1.52:1.000:. ./.:4:478,1:.: 2.30:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:188,48:.:-0.62:1.000:. ./.:4:205,62:.:-0.25:1.000:. ./.:4:256,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:500,144:.: 4.28:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:256,78:.: 0.56:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:174,70:.:-0.52:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.58:1.000:. ./.:6:223,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:202,72:.:-0.16:1.000:. ./.:4:347,93:.: 1.83:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:173,61:.:-0.64:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.25:0.777:. ./.:4:233,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:251,79:.: 0.51:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:228,73:.: 0.16:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:181,41:.:-0.79:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:243,62:.: 0.21:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.36:0.608:. ./.:4:330,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:225,74:.: 0.14:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:340,105:.: 1.89:0.825:. ./.:4:205,66:.:-0.20:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:143,42:.:-1.23:1.000:. ./.:4:189,60:.:-0.46:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.40:1.000:. ./.:3:128,66:.:-1.12:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:325,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:259,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:166,47:.:-0.89:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:157,30:.:-1.21:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:110,35:.:-1.71:1.000:. ./.:4:197,44:.:-0.56:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:304,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:260,76:.: 0.58:1.000:. ./.:4:276,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:175,56:.:-0.68:1.000:. ./.:4:460,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:151,33:.:-1.24:0.999:. ./.:4:229,67:.: 0.10:1.000:. ./.:4:124,37:.:-1.52:0.993:. ./.:4:270,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:178,49:.:-0.73:1.000:. ./.:4:201,58:.:-0.34:1.000:. ./.:4:184,59:.:-0.53:1.000:. ./.:4:242,70:.: 0.29:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:255,72:.: 0.47:1.000:. ./.:4:161,53:.:-0.88:1.000:. ./.:4:267,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:158,44:.:-1.03:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:178,51:.:-0.70:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:155,50:.:-0.99:1.000:. ./.:4:360,128:.: 2.41:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:143,43:.:-1.22:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:190,57:.:-0.49:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:253,105:.: 0.85:1.000:. ./.:4:298,83:.: 1.12:1.000:. ./.:4:296,98:.: 1.28:1.000:. ./.:4:149,52:.:-1.04:1.000:. ./.:4:314,94:.: 1.45:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:421,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:107,35:.:-1.75:1.000:. ./.:4:304,81:.: 1.17:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:261,75:.: 0.58:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:183,49:.:-0.67:0.998:. ./.:4:249,80:.: 0.50:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:186,62:.:-0.47:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:269,80:.: 0.74:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:251,78:.: 0.50:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:196,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:251,85:.: 0.58:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:353,104:.: 2.03:1.000:. ./.:4:306,95:.: 1.36:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:213,44:.:-0.37:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:316,90:.: 1.42:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:193,72:.:-0.27:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.33:1.000:. -chr2.1 52530989 chr2.1_052530989 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:59,20:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,9:0.26:-1.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,5:0.10:-0.58:1.000:0.806 0/0/0/1:4:51,9:0.16:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,41:0.60: 0.13:1.000:0.788 0/0/0/1:4:38,14:0.28:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,8:0.20:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,16:0.40:-1.14:1.000:0.818 0/0/0/1:4:30,17:0.37:-0.83:1.000:0.510 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,37:0.64:-0.43:1.000:0.666 0/0/1/1:4:28,18:0.40:-0.88:1.000:0.826 0/0/0/1:4:44,18:0.30:-0.07:1.000:0.984 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,27:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.78:0.998:1.000 0/0/1/1:4:25,19:0.45:-0.99:1.000:0.976 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,14:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,12:0.30:-1.14:1.000:0.982 0/0/1/1:4:23,22:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,16:0.34:-0.73:1.000:0.882 0/0/1/1:4:28,16:0.38:-0.99:1.000:0.517 0/0/0/1:4:48,9:0.16:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,19:0.66:-1.85:1.000:0.874 0/0/0/1:4:47,19:0.30: 0.13:1.000:0.987 0/1/1/1:4:12,23:0.63:-1.44:1.000:0.519 0/0/0/1:4:27,6:0.19:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.17:-1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,21:0.66:-1.70:1.000:0.856 0/1/1/1:4:6,13:0.65:-2.25:1.000:0.759 0/1/1:3:14,14:0.51:-1.80:1.000:0.682 0/0/0/1:4:40,14:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,18:0.45:-1.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:23,17:0.44:-1.19:1.000:0.966 0/0/0/1:4:27,7:0.21:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,32:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,19:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,9:0.16:-0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:47,22:0.33: 0.28:1.000:0.921 0/0/1/1:4:46,29:0.40: 0.59:1.000:0.788 0/0/1/1:4:39,33:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:20,8:0.30:-1.80:1.000:0.988 0/0/0/1:4:50,13:0.21:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,15:0.33:-0.83:1.000:0.919 0/0/0/1:4:60,21:0.27: 0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:49,21:0.31: 0.33:1.000:0.972 0/0/0/1:4:60,14:0.20: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,31:0.43: 0.53:1.000:0.953 0/0/0/1:4:47,15:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,12:0.26:-0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,36:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,22:0.29: 0.74:1.000:0.991 0/0/0/1:4:56,14:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:63,13:0.18: 0.64:1.000:0.976 0/0/0/1:4:90,33:0.28: 3.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,6:0.12:-0.58:1.000:0.756 0/0/0/1:4:63,18:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,7:0.13:-0.48:1.000:0.943 0/0/0/1:4:57,19:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,16:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,28:0.37: 0.74:1.000:0.547 0/0/0/1:4:58,14:0.20: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,15:0.22: 0.33:0.777:1.000 0/0/0/1:4:42,12:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,31:0.42: 0.69:1.000:0.897 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,19:0.24: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,10:0.18:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,19:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,39:0.47: 1.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:46,37:0.46: 0.99:1.000:0.988 0/0/0/0:4:54,5:0.09:-0.23:1.000:0.960 0/0/1/1:4:26,45:0.61: 0.38:0.608:0.697 0/0/0/1:4:62,13:0.18: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,36:0.39: 1.60:1.000:0.711 0/0/0/1:4:51,12:0.20:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,16:0.32:-0.63:0.825:0.940 0/0/1/1:4:36,21:0.38:-0.33:1.000:0.581 0/0/1/1:4:44,36:0.46: 0.84:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,25:0.42:-0.12:1.000:0.927 0/0/1/1:4:33,31:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,12:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0:3:52,8:0.14:-0.18:1.000:0.687 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,4:0.14:-1.70:1.000:0.961 0/0/0/1:4:64,34:0.36: 1.75:1.000:0.702 0/0/0/1:4:58,10:0.15: 0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,23:0.40:-0.23:1.000:0.815 0/0/0/1:4:51,13:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,24:0.19: 3.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,10:0.15: 0.28:1.000:0.988 0/0/0/1:4:43,24:0.37: 0.18:1.000:0.557 0/0/1/1:4:69,46:0.41: 2.61:1.000:0.883 0/0/1/1:4:46,35:0.45: 0.89:1.000:0.976 0/1/1/1:4:25,84:0.71: 2.31:1.000:0.992 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,10:0.24:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,19:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,11:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,4:0.05: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,8:0.17:-0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,19:0.39:-0.68:1.000:0.722 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,47:0.45: 2.21:0.999:0.983 0/0/1/1:4:39,26:0.41: 0.08:1.000:0.883 0/0/0/1:4:29,16:0.37:-0.94:0.993:0.593 0/0/0/1:4:67,27:0.30: 1.55:1.000:0.987 0/0/0/1:4:63,25:0.29: 1.24:1.000:0.989 0/1/1/1:4:14,44:0.70:-0.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:44,29:0.41: 0.48:1.000:0.867 0/0/0/1:4:38,20:0.36:-0.28:1.000:0.726 0/0/1/1:4:33,30:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,29:0.29: 2.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:93,15:0.14: 2.26:1.000:0.978 0/0/1/1:4:35,22:0.40:-0.33:1.000:0.782 0/0/1/1:4:34,27:0.46:-0.12:1.000:0.986 0/0/0/1:4:61,13:0.18: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,21:0.20: 2.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,39:0.65:-0.33:1.000:0.759 0/0/1/1:4:31,26:0.47:-0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,12:0.19: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,52:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,14:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:52,5:0.09:-0.33:1.000:0.937 0/1/1/1:4:13,28:0.65:-1.14:1.000:0.749 0/0/0/1:4:38,16:0.31:-0.48:1.000:0.978 0/0/0/1:4:45,15:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,30:0.38: 0.94:1.000:0.547 0/0/1/1:4:43,36:0.47: 0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:64,19:0.24: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,42:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,40:0.40: 2.06:1.000:0.769 0/0/0/0:4:43,1:0.02:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,20:0.31: 0.18:1.000:0.975 0/0/1/1:4:34,37:0.53: 0.38:1.000:0.993 0/0/0/0:4:97,11:0.11: 2.26:1.000:0.651 0/0/1/1:4:19,31:0.60:-0.68:1.000:0.796 0/0/0/1:4:40,21:0.36:-0.12:1.000:0.732 0/0/1/1:4:24,18:0.44:-1.09:1.000:0.971 0/0/0/1:4:50,13:0.21:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,12:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,21:0.45:-0.78:1.000:0.982 0/0/0/0:4:49,5:0.10:-0.48:1.000:0.875 0/0/1/1:4:27,20:0.44:-0.83:1.000:0.966 0/0/0/1:4:66,15:0.19: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,34:0.42: 0.99:1.000:0.926 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,17:0.30:-0.28:0.998:0.982 0/0/0/1:4:41,21:0.35:-0.07:1.000:0.789 0/0/0/1:4:58,21:0.28: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/0:4:34,1:0.03:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,11:0.27:-1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,13:0.20: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.44:-2.15:1.000:0.971 0/0/0/1:4:51,14:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,36:0.72:-0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:33,26:0.46:-0.23:0.999:0.984 0/0/1/1:4:29,17:0.38:-0.88:1.000:0.596 0/0/0/1:4:43,15:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:52,7:0.12:-0.23:1.000:0.822 0/0/0/1:4:35,9:0.21:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,17:0.49:-1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,16:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:43,3:0.07:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,39:0.61:-0.12:1.000:0.650 0/0/0/0:4:49,4:0.08:-0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:27,17:0.40:-0.99:1.000:0.785 0/0/1/1:4:27,39:0.58: 0.13:1.000:0.921 0/0/1/1:4:30,22:0.44:-0.58:1.000:0.962 0/0/0/1:4:82,17:0.18: 1.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,2:0.05:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,40:0.52: 0.79:1.000:0.996 -chr2.1 52899289 chr2.1_052899289 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:137,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.76:0.998:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:190,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.22:1.000:. ./.:3:26,0:.:-3.55:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:157,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:198,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.15:1.000:. ./.:6:121,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:0.777:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:212,0:.: 3.13:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.11:0.608:. ./.:4:129,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.40:0.825:. ./.:4:145,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.89:1.000:. ./.:3:64,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:138,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.25:0.993:. ./.:4:141,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.60:0.998:. ./.:4:150,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:122,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:186,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.11:1.000:. -chr2.1 52980656 chr2.1_052980656 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:252,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.82:0.998:. ./.:4:180,49:.: 0.32:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:326,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:82,2:.:-2.41:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:334,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.92:1.000:. ./.:3:27,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.25:1.000:. ./.:6:191,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.02:0.777:. ./.:4:191,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.41:0.608:. ./.:4:170,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.49:0.825:. ./.:4:266,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.05:1.000:. ./.:3:135,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:229,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.72:0.993:. ./.:4:258,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:355,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:336,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.10:0.998:. ./.:4:236,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.58:0.999:. ./.:4:238,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:334,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:335,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.19:1.000:. -chr2.1 53361957 chr2.1_053361957 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:74,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:131,1:.: 2.11:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.51:0.998:. ./.:4:70,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:140,1:.: 2.42:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:132,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:78,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:54,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:132,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.93:0.777:. ./.:4:77,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:132,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:88,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.71:0.608:. ./.:4:52,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.33:0.825:. ./.:4:84,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:3:79,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:84,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:133,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:57,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.36:0.993:. ./.:4:70,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.96:0.998:. ./.:4:102,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:97,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:58,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.32:1.000:. -chr2.1 53515611 chr2.1_053515611 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:36,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.02:0.998:. ./.:4:0,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:24,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:32,3:.: 0.91:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.74:1.000:. ./.:6:18,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.66:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:42,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.72:0.777:. ./.:4:27,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:63,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.74:0.608:. ./.:4:18,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:0.825:. ./.:4:43,0:.: 1.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:21,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:15,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.80:1.000:. ./.:4:56,1:.: 2.62:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:37,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:56,0:.: 2.54:0.999:. ./.:4:25,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.10:0.993:. ./.:4:45,0:.: 1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:41,2:.: 1.53:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:32,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:0.998:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:30,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.88:1.000:. -chr2.1 53691014 chr2.1_053691014 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:104,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.66:0.998:. ./.:4:105,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.49:1.000:. ./.:3:28,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:193,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.47:1.000:. ./.:6:135,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:214,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:164,1:.: 1.39:0.777:. ./.:4:56,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.84:0.608:. ./.:4:141,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.20:0.825:. ./.:4:148,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.59:1.000:. ./.:3:85,0:.:-0.54:0.999:. ./.:4:124,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:130,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.93:0.993:. ./.:4:160,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:191,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:208,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:219,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.98:0.998:. ./.:4:100,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:102,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.25:1.000:. -chr2.1 54603199 chr2.1_054603199 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:455,172:.:-0.27:1.000:. ./.:4:377,73:.:-1.51:1.000:. ./.:4:438,173:.:-0.38:1.000:. ./.:4:405,372:.: 0.78:1.000:. ./.:4:673,134:.: 0.99:1.000:. ./.:4:525,204:.: 0.45:1.000:. ./.:4:267,187:.:-1.48:1.000:. ./.:4:487,273:.: 0.66:1.000:. ./.:4:380,370:.: 0.59:1.000:. ./.:4:242,186:.:-1.66:1.000:. ./.:4:256,104:.:-2.14:1.000:. ./.:4:537,85:.:-0.30:1.000:. ./.:4:479,282:.: 0.67:1.000:. ./.:4:438,418:.: 1.34:1.000:. ./.:4:466,165:.:-0.24:1.000:. ./.:4:560,218:.: 0.79:1.000:. ./.:4:434,393:.: 1.13:0.998:. ./.:4:655,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:631,369:.: 2.34:1.000:. ./.:4:479,441:.: 1.78:1.000:. ./.:4:188,129:.:-2.44:1.000:. ./.:4:429,203:.:-0.23:1.000:. ./.:4:529,343:.: 1.45:1.000:. ./.:4:422,190:.:-0.37:1.000:. ./.:4:210,18:.:-3.06:1.000:. ./.:4:736,175:.: 1.72:1.000:. ./.:4:516,279:.: 0.91:1.000:. ./.:4:500,86:.:-0.56:1.000:. ./.:4:448,450:.: 1.63:1.000:. ./.:4:556,105:.:-0.03:1.000:. ./.:4:348,382:.: 0.45:1.000:. ./.:4:413,251:.:-0.01:1.000:. ./.:4:148,19:.:-3.49:1.000:. ./.:4:223,118:.:-2.27:1.000:. ./.:3:101,59:.:-3.54:1.000:. ./.:4:407,287:.: 0.20:1.000:. ./.:4:436,257:.: 0.19:1.000:. ./.:4:461,308:.: 0.73:1.000:. ./.:4:403,272:.: 0.07:1.000:. ./.:4:599,102:.: 0.25:1.000:. ./.:4:438,158:.:-0.49:1.000:. ./.:4:530,71:.:-0.45:1.000:. ./.:4:506,272:.: 0.79:1.000:. ./.:4:514,68:.:-0.58:1.000:. ./.:4:427,291:.: 0.37:1.000:. ./.:4:490,188:.: 0.09:1.000:. ./.:4:521,396:.: 1.76:1.000:. ./.:4:701,378:.: 2.90:1.000:. ./.:4:361,298:.:-0.04:1.000:. ./.:4:595,79:.: 0.06:1.000:. ./.:4:382,157:.:-0.89:1.000:. ./.:4:565,218:.: 0.82:1.000:. ./.:4:307,361:.: 0.02:1.000:. ./.:4:485,191:.: 0.07:1.000:. ./.:4:450,201:.:-0.10:1.000:. ./.:4:406,399:.: 0.98:1.000:. ./.:4:490,103:.:-0.51:1.000:. ./.:4:547,88:.:-0.21:1.000:. ./.:4:427,284:.: 0.32:1.000:. ./.:6:467,113:.:-0.60:1.000:. ./.:4:568,96:.:-0.01:1.000:. ./.:4:352,335:.: 0.15:1.000:. ./.:4:486,266:.: 0.61:1.000:. ./.:4:361,248:.:-0.39:1.000:. ./.:4:532,315:.: 1.27:1.000:. ./.:4:474,171:.:-0.14:1.000:. ./.:4:336,172:.:-1.10:1.000:. ./.:4:427,189:.:-0.35:1.000:. ./.:4:546,158:.: 0.27:0.777:. ./.:4:397,148:.:-0.84:1.000:. ./.:4:533,218:.: 0.60:1.000:. ./.:4:351,337:.: 0.16:1.000:. ./.:4:537,176:.: 0.33:1.000:. ./.:4:405,435:.: 1.22:1.000:. ./.:4:575,88:.:-0.02:1.000:. ./.:4:376,349:.: 0.42:1.000:. ./.:4:363,343:.: 0.28:1.000:. ./.:4:526,94:.:-0.32:1.000:. ./.:4:569,219:.: 0.86:1.000:. ./.:4:524,206:.: 0.45:1.000:. ./.:4:525,0:.:-0.98:0.608:. ./.:4:445,436:.: 1.51:1.000:. ./.:4:482,341:.: 1.10:1.000:. ./.:4:385,231:.:-0.35:1.000:. ./.:4:480,206:.: 0.14:0.825:. ./.:4:591,120:.: 0.32:1.000:. ./.:4:366,210:.:-0.63:1.000:. ./.:4:417,237:.:-0.08:1.000:. ./.:4:344,323:.: 0.01:1.000:. ./.:4:337,260:.:-0.48:1.000:. ./.:3:412,92:.:-1.13:0.999:. ./.:4:327,337:.:-0.01:1.000:. ./.:4:559,308:.: 1.41:1.000:. ./.:4:404,71:.:-1.33:1.000:. ./.:4:485,259:.: 0.55:1.000:. ./.:4:596,100:.: 0.21:1.000:. ./.:4:374,159:.:-0.93:1.000:. ./.:4:410,165:.:-0.63:1.000:. ./.:4:614,206:.: 1.08:1.000:. ./.:4:440,323:.: 0.68:1.000:. ./.:4:441,249:.: 0.17:1.000:. ./.:4:538,175:.: 0.33:1.000:. ./.:4:308,140:.:-1.52:1.000:. ./.:4:513,94:.:-0.41:1.000:. ./.:4:315,214:.:-0.96:1.000:. ./.:4:363,364:.: 0.43:1.000:. ./.:4:374,169:.:-0.86:1.000:. ./.:4:406,268:.: 0.06:1.000:. ./.:4:551,218:.: 0.73:1.000:. ./.:4:525,228:.: 0.61:1.000:. ./.:4:469,145:.:-0.36:1.000:. ./.:4:541,212:.: 0.61:1.000:. ./.:4:434,192:.:-0.28:0.999:. ./.:4:437,225:.:-0.02:1.000:. ./.:4:350,58:.:-1.80:0.993:. ./.:4:489,220:.: 0.31:1.000:. ./.:4:462,279:.: 0.53:1.000:. ./.:4:444,160:.:-0.43:1.000:. ./.:4:324,351:.: 0.07:1.000:. ./.:4:330,353:.: 0.12:1.000:. ./.:4:381,331:.: 0.33:1.000:. ./.:4:486,231:.: 0.36:1.000:. ./.:4:562,101:.:-0.02:1.000:. ./.:4:561,106:.: 0.01:1.000:. ./.:4:451,155:.:-0.42:1.000:. ./.:4:518,307:.: 1.12:1.000:. ./.:4:480,177:.:-0.06:1.000:. ./.:4:430,67:.:-1.18:1.000:. ./.:4:284,272:.:-0.77:1.000:. ./.:4:319,232:.:-0.80:1.000:. ./.:4:488,271:.: 0.66:1.000:. ./.:4:444,189:.:-0.23:1.000:. ./.:4:307,61:.:-2.08:1.000:. ./.:4:435,258:.: 0.19:1.000:. ./.:4:474,88:.:-0.72:1.000:. ./.:4:510,401:.: 1.72:1.000:. ./.:4:524,194:.: 0.37:1.000:. ./.:4:439,165:.:-0.43:1.000:. ./.:4:534,176:.: 0.31:1.000:. ./.:4:357,160:.:-1.04:1.000:. ./.:4:482,199:.: 0.11:1.000:. ./.:4:372,271:.:-0.16:1.000:. ./.:4:324,263:.:-0.55:1.000:. ./.:4:392,84:.:-1.33:1.000:. ./.:4:727,108:.: 1.19:1.000:. ./.:4:685,225:.: 1.71:1.000:. ./.:4:458,318:.: 0.78:1.000:. ./.:4:538,87:.:-0.28:1.000:. ./.:4:673,120:.: 0.89:1.000:. ./.:4:402,265:.: 0.01:1.000:. ./.:4:533,200:.: 0.47:1.000:. ./.:4:408,289:.: 0.22:1.000:. ./.:4:195,136:.:-2.34:1.000:. ./.:4:263,185:.:-1.52:1.000:. ./.:4:563,220:.: 0.82:1.000:. ./.:4:485,200:.: 0.14:1.000:. ./.:4:424,355:.: 0.80:1.000:. ./.:4:397,471:.: 1.42:1.000:. ./.:4:365,148:.:-1.07:0.998:. ./.:4:596,95:.: 0.18:1.000:. ./.:4:445,261:.: 0.28:1.000:. ./.:4:345,273:.:-0.33:1.000:. ./.:4:408,89:.:-1.18:1.000:. ./.:4:517,165:.: 0.12:1.000:. ./.:4:435,453:.: 1.56:1.000:. ./.:4:506,273:.: 0.80:1.000:. ./.:4:395,268:.:-0.02:1.000:. ./.:4:504,105:.:-0.39:0.999:. ./.:4:497,90:.:-0.55:1.000:. ./.:4:464,89:.:-0.79:1.000:. ./.:4:376,205:.:-0.59:1.000:. ./.:4:372,210:.:-0.58:1.000:. ./.:4:369,165:.:-0.92:1.000:. ./.:4:361,193:.:-0.78:1.000:. ./.:4:311,286:.:-0.48:1.000:. ./.:4:304,217:.:-1.01:1.000:. ./.:4:545,214:.: 0.66:1.000:. ./.:4:574,100:.: 0.06:1.000:. ./.:4:510,278:.: 0.86:1.000:. ./.:4:448,160:.:-0.40:1.000:. ./.:4:630,188:.: 1.07:1.000:. ./.:4:633,377:.: 2.41:1.000:. ./.:4:728,123:.: 1.30:1.000:. ./.:4:361,257:.:-0.33:1.000:. ./.:4:532,93:.:-0.28:1.000:. -chr2.1 54729177 chr2.1_054729177 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:114,146:0.55: 1.37:1.000:0.976 0/1/1/1:4:45,149:0.79: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,49:0.31:-0.20:1.000:0.967 0/0/0/1:4:105,43:0.30:-0.36:1.000:0.988 0/1/1/1:4:87,169:0.68: 1.31:1.000:0.947 0/0/1/1:4:157,223:0.59: 3.22:1.000:0.890 0/0/1/1:4:54,52:0.47:-1.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:150,36:0.20: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,127:0.56: 0.81:1.000:0.967 0/1/1/1:4:8,13:0.63:-2.32:1.000:0.507 0/0/0/1:4:11,3:0.22:-2.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,230:0.89: 1.43:1.000:0.610 0/0/1/1:4:70,71:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,111:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,137:0.53: 1.25:1.000:0.992 0/1/1/1:4:79,181:0.72: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,83:0.39: 0.58:0.998:0.706 0/1/1/1:4:82,212:0.75: 1.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,158:0.63: 1.26:1.000:0.598 0/1/1/1:4:117,190:0.63: 2.09:1.000:0.505 0/0/1/1:4:12,18:0.60:-2.18:1.000:0.775 0/0/1/1:4:104,109:0.49: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,33:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,148:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,4:0.28:-2.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,83:0.46: 0.09:1.000:0.984 0/0/0/1:4:144,46:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,153:0.63: 1.15:1.000:0.556 0/0/1/1:4:110,112:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,213:0.74: 2.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,48:0.29:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:105,112:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,4:0.31:-2.44:1.000:0.971 0/0/1/1:4:11,11:0.48:-2.30:1.000:0.995 1/1/1:3:0,7:1.00:-2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,112:0.54: 0.49:1.000:0.987 0/0/0/1:4:112,50:0.31:-0.14:1.000:0.969 0/0/1/1:4:79,69:0.45:-0.36:1.000:0.982 0/0/1/1:4:100,151:0.60: 1.23:1.000:0.756 0/0/1/1:4:133,116:0.45: 1.20:1.000:0.982 0/0/1/1:4:88,66:0.42:-0.27:1.000:0.911 0/1/1/1:4:68,170:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,60:0.47:-0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,66:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,54:0.49:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,93:0.54:-0.05:1.000:0.985 0/0/1/1:4:97,129:0.57: 0.84:1.000:0.958 0/1/1/1:4:68,130:0.67: 0.41:1.000:0.933 0/1/1/1:4:60,117:0.68: 0.09:1.000:0.950 0/1/1/1:4:55,126:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,76:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,128:0.46: 1.52:1.000:0.988 0/1/1/1:4:65,119:0.66: 0.20:1.000:0.873 0/0/1/1:4:68,66:0.48:-0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:94,54:0.36:-0.36:1.000:0.657 0/1/1/1:4:77,129:0.63: 0.54:1.000:0.626 0/1/1/1:4:58,133:0.72: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,71:0.53:-0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,83:0.56:-0.39:1.000:0.963 0/0/0/1/1/1:6:48,65:0.57:-0.90:1.000:0.597 0/0/1/1:4:72,75:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,29:0.23:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,68:0.48:-0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,88:0.58:-0.30:1.000:0.931 0/0/1/1:4:78,113:0.59: 0.30:1.000:0.856 0/0/1/1:4:79,119:0.60: 0.41:1.000:0.763 0/1/1/1:4:35,68:0.68:-1.05:1.000:0.947 0/0/1/1:4:94,127:0.57: 0.77:1.000:0.947 0/0/0/1:4:72,43:0.37:-0.87:0.777:0.554 0/1/1/1:4:69,140:0.69: 0.58:1.000:0.973 0/1/1/1:4:63,107:0.64:-0.02:1.000:0.675 0/0/1/1:4:68,53:0.43:-0.77:1.000:0.941 0/0/1/1:4:86,106:0.54: 0.32:1.000:0.987 0/0/0/1:4:122,33:0.22:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,76:0.56:-0.56:1.000:0.974 0/0/0/1:4:83,49:0.37:-0.61:1.000:0.586 0/0/1/1:4:75,56:0.42:-0.62:1.000:0.907 0/0/1/1:4:56,55:0.48:-0.93:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,143:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,29:0.20:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,108:0.87:-0.70:0.608:0.872 0/1/1/1:4:69,115:0.63: 0.20:1.000:0.606 0/1/1/1:4:88,148:0.64: 1.00:1.000:0.640 0/0/1/1:4:68,85:0.55:-0.28:1.000:0.984 0/0/1/1:4:69,83:0.53:-0.30:0.825:0.991 0/0/1/1:4:90,79:0.45:-0.03:1.000:0.983 0/1/1/1:4:34,110:0.79:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,44:0.47:-1.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,70:0.54:-0.68:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,79:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0:3:47,0:0.00:-1.92:0.999:1.000 0/0/1/1:4:65,54:0.44:-0.81:1.000:0.970 0/0/0/1:4:115,38:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,105:0.55: 0.26:1.000:0.980 0/0/1/1:4:90,82:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:71,69:0.48:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,52:0.43:-0.84:1.000:0.955 0/0/1/1:4:55,82:0.60:-0.53:1.000:0.791 0/0/1/1:4:60,48:0.43:-0.98:1.000:0.955 0/0/1/1:4:93,113:0.54: 0.54:1.000:0.989 0/0/0/1:4:45,24:0.35:-1.58:1.000:0.815 0/1/1/1:4:41,108:0.76:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,46:0.46:-1.13:1.000:0.985 0/1/1/1:4:41,95:0.73:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,29:0.32:-1.22:1.000:0.958 0/0/1/1:4:83,134:0.62: 0.71:1.000:0.518 0/0/1/1:4:75,86:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,121:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,60:0.28: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,75:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:72,61:0.45:-0.59:1.000:0.976 0/0/1/1:4:197,132:0.39: 2.43:1.000:0.744 0/0/1/1:4:49,68:0.58:-0.84:0.999:0.921 0/0/1/1:4:51,78:0.61:-0.65:1.000:0.717 0/0/1/1:4:41,41:0.48:-1.38:0.993:0.995 0/0/1/1:4:87,125:0.59: 0.63:1.000:0.871 0/0/1/1:4:55,80:0.59:-0.56:1.000:0.848 0/1/1/1:4:45,108:0.74:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,92:0.55:-0.11:1.000:0.977 0/0/1/1:4:65,67:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,111:0.67:-0.03:1.000:0.934 0/0/1/1:4:61,65:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,70:0.41:-0.07:1.000:0.870 0/0/0/1:4:99,52:0.34:-0.31:1.000:0.839 0/0/1/1:4:66,71:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,76:0.61:-0.70:1.000:0.736 0/0/1/1:4:52,42:0.44:-1.19:1.000:0.959 0/1/1/1:4:21,127:0.87:-0.36:1.000:0.861 0/0/1/1:4:48,57:0.53:-1.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:44,51:0.52:-1.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,69:0.69:-1.05:1.000:0.973 0/0/1/1:4:151,92:0.37: 1.11:1.000:0.501 0/0/1/1:4:51,47:0.46:-1.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,73:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,124:0.73: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,209:0.56: 3.08:1.000:0.973 0/0/1/1:4:98,130:0.56: 0.88:1.000:0.960 0/0/1/1:4:44,62:0.58:-1.01:1.000:0.902 0/1/1/1:4:36,80:0.71:-0.85:1.000:0.994 0/1/1/1:4:42,72:0.64:-0.88:1.000:0.707 0/1/1/1:4:34,138:0.82: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,131:0.83:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:119,57:0.33: 0.07:1.000:0.936 0/0/1/1:4:57,57:0.48:-0.88:1.000:0.995 0/1/1/1:4:87,170:0.68: 1.32:1.000:0.952 0/0/0/1:4:163,50:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,147:0.74: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,62:0.36:-0.02:1.000:0.659 0/0/1/1:4:117,83:0.41: 0.44:1.000:0.847 0/0/1/1:4:87,98:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,105:0.37: 1.72:1.000:0.588 0/0/1/1:4:82,104:0.55: 0.23:1.000:0.979 0/0/0/1:4:13,7:0.35:-2.33:1.000:0.798 0/0/0/1:4:92,54:0.37:-0.39:1.000:0.601 0/0/1/1:4:77,115:0.60: 0.32:1.000:0.786 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:145,198:0.57: 2.65:1.000:0.938 0/0/1/1:4:132,93:0.41: 0.83:1.000:0.836 0/0/1/1:4:94,99:0.49: 0.34:0.998:0.997 0/0/1/1:4:124,81:0.39: 0.52:1.000:0.687 0/0/1/1:4:86,110:0.55: 0.38:1.000:0.977 0/0/0/1:4:103,35:0.26:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,95:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,70:0.39: 0.06:1.000:0.733 0/0/1/1:4:85,110:0.56: 0.37:1.000:0.972 0/0/1/1:4:98,121:0.54: 0.74:1.000:0.986 0/1/1/1:4:58,134:0.73: 0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,175:0.77: 1.01:0.999:1.000 0/0/1/1:4:94,68:0.41:-0.14:1.000:0.873 0/0/1/1:4:100,95:0.47: 0.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,91:0.61:-0.33:1.000:0.689 0/0/1/1:4:71,87:0.54:-0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:96,63:0.39:-0.19:1.000:0.698 0/0/1/1:4:102,78:0.42: 0.14:1.000:0.927 0/0/1/1:4:60,80:0.57:-0.48:1.000:0.956 0/0/1/1:4:77,72:0.47:-0.34:1.000:0.991 0/0/0/1:4:190,65:0.26: 1.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,139:0.59: 0.97:1.000:0.836 0/0/1/1:4:131,133:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,101:0.46: 0.63:1.000:0.989 0/1/1/1:4:73,139:0.67: 0.63:1.000:0.928 0/0/1/1:4:110,87:0.43: 0.40:1.000:0.949 0/0/1/1:4:120,150:0.55: 1.52:1.000:0.984 0/0/1/1:4:96,66:0.40:-0.14:1.000:0.795 0/1/1/1:4:58,181:0.79: 1.04:1.000:1.000 -chr2.1 54904224 chr2.1_054904224 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:54,43:0.47: 1.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,22:0.69:-1.74:1.000:0.967 0/0/0/1:4:39,19:0.37:-0.53:1.000:0.590 0/1/1/1:4:6,32:0.84:-1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,77:0.70: 1.89:1.000:0.982 0/0/0/1:4:53,25:0.36: 0.40:1.000:0.670 1/1/1/1:4:2,25:0.92:-1.98:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,24:0.42:-0.30:1.000:0.896 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,10:0.27:-1.09:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,35:0.77:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.34:-0.06:1.000:0.882 0/0/1/1:4:31,36:0.55:-0.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:28,27:0.51:-0.67:0.998:0.996 0/1/1/1:4:12,39:0.75:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,36:0.48: 0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,55:0.60: 1.10:1.000:0.773 0/1/1/1:4:19,47:0.71:-0.16:1.000:0.991 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:39,31:0.47: 0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,23:0.41:-0.34:1.000:0.844 0/0/0/1:4:35,7:0.22:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,17:0.51:-1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,15:0.40:-1.32:1.000:0.810 0/1/1/1:4:21,40:0.66:-0.39:1.000:0.858 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,30:0.61:-0.90:1.000:0.696 0/1/1/1:4:6,19:0.75:-2.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,35:0.66:-0.76:1.000:0.883 0/1/1/1:4:11,21:0.66:-1.74:1.000:0.861 0/0/1/1:4:16,22:0.59:-1.46:1.000:0.857 1/1/1:3:2,15:0.88:-2.44:1.000:0.956 0/0/1/1:4:24,19:0.47:-1.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:23,23:0.52:-1.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:8,40:0.83:-1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,31:0.65:-1.00:1.000:0.789 0/0/0/1:4:42,11:0.26:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,16:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,38:0.46: 0.87:1.000:0.988 0/1/1/1:4:8,62:0.88: 0.03:1.000:0.748 0/0/0/1:4:70,14:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,57:0.82:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,39:0.59:-0.06:1.000:0.884 1/1/1/1:4:0,88:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,9:0.41:-2.12:1.000:0.867 0/1/1/1:4:17,36:0.68:-0.76:1.000:0.951 0/0/1/1:4:23,13:0.40:-1.56:1.000:0.773 0/0/1/1:4:43,33:0.46: 0.31:1.000:0.990 0/1/1/1:4:36,66:0.65: 1.52:1.000:0.799 0/0/1/1:4:37,42:0.55: 0.45:1.000:0.980 0/0/1/1:4:49,41:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,27:0.46:-0.30:1.000:0.987 0/1/1/1:4:13,39:0.74:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,36:0.41: 1.29:1.000:0.845 0/0/0/1:4:61,19:0.29: 0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,28:0.46:-0.20:1.000:0.988 0/0/0/0/1/1:6:66,22:0.30: 0.87:1.000:0.864 0/0/0/1:4:78,19:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,39:0.80:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,54:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,47:0.55: 0.87:1.000:0.978 0/0/1/1:4:52,34:0.43: 0.77:1.000:0.943 0/0/0/1:4:60,26:0.35: 0.77:1.000:0.832 0/0/1/1:4:31,25:0.47:-0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,37:0.45: 0.91:1.000:0.977 0/0/1/1:4:45,24:0.39:-0.02:0.777:0.646 0/1/1/1:4:9,48:0.84:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,76:0.66: 2.13:1.000:0.886 0/0/1/1:4:38,21:0.39:-0.48:1.000:0.728 0/1/1/1:4:11,49:0.81:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,36:0.69:-0.81:1.000:0.974 0/0/1/1:4:27,31:0.55:-0.53:1.000:0.977 0/0/1/1:4:43,35:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,24:0.42:-0.30:1.000:0.896 0/0/1/1:4:38,42:0.54: 0.49:1.000:0.985 0/1/1/1:4:31,52:0.63: 0.63:1.000:0.599 0/0/1/1:4:37,29:0.47:-0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,47:0.76:-0.39:0.608:1.000 0/0/1/1:4:39,63:0.63: 1.52:1.000:0.503 0/1/1/1:4:31,81:0.72: 1.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,31:0.44: 0.31:1.000:0.967 0/0/1/1:4:35,23:0.43:-0.53:0.825:0.946 0/0/1/1:4:40,48:0.56: 0.87:1.000:0.964 0/1/1/1:4:19,44:0.70:-0.30:1.000:0.981 0/1/1/1:4:14,39:0.73:-0.76:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,12:0.19: 1.05:1.000:1.000 0/0/1:3:38,13:0.30:-0.86:0.999:1.000 0/0/1/1:4:35,27:0.46:-0.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:46,34:0.46: 0.49:1.000:0.984 0/0/0/1:4:52,12:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,51:0.54: 1.29:1.000:0.984 0/0/0/1:4:74,24:0.29: 1.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:28,54:0.66: 0.59:1.000:0.874 0/1/1/1:4:11,40:0.77:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,44:0.52: 0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,21:0.31: 0.45:1.000:0.970 0/1/1/1:4:8,39:0.82:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,53:0.61: 0.87:1.000:0.674 0/1/1/1:4:31,56:0.65: 0.82:1.000:0.772 0/1/1/1:4:40,75:0.66: 2.13:1.000:0.836 0/0/1/1:4:26,31:0.56:-0.58:1.000:0.966 0/0/1/1:4:33,41:0.57: 0.21:1.000:0.948 0/0/1/1:4:45,29:0.43: 0.21:1.000:0.934 0/1/1/1:4:25,42:0.63:-0.11:1.000:0.603 0/0/1/1:4:48,46:0.51: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,43:0.54: 0.63:1.000:0.989 0/1/1/1:4:29,69:0.70: 1.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:87,22:0.26: 1.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,65:0.64: 1.57:0.999:0.650 0/0/1/1:4:40,52:0.58: 1.05:1.000:0.917 0/0/1/1:4:23,18:0.47:-1.32:0.993:0.991 0/0/1/1:4:60,44:0.45: 1.61:1.000:0.983 0/0/1/1:4:49,36:0.45: 0.73:1.000:0.983 0/1/1/1:4:19,61:0.75: 0.49:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,68:0.66: 1.57:1.000:0.882 0/0/0/1:4:72,20:0.27: 1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,29:0.40: 0.49:1.000:0.785 0/1/1/1:4:29,60:0.67: 0.91:1.000:0.937 0/0/1/1:4:58,40:0.44: 1.33:1.000:0.968 0/0/1/1:4:39,36:0.50: 0.26:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,24:0.45:-0.58:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,81:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,8:0.20:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,11:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,22:0.63:-1.60:1.000:0.622 0/1/1/1:4:24,40:0.63:-0.25:1.000:0.582 0/1/1/1:4:20,39:0.66:-0.48:1.000:0.887 0/0/0/1:4:48,24:0.37: 0.12:1.000:0.522 0/0/1/1:4:36,52:0.60: 0.87:1.000:0.777 0/1/1/1:4:29,58:0.67: 0.82:1.000:0.912 0/0/1/1:4:39,49:0.57: 0.87:1.000:0.942 0/1/1/1:4:32,63:0.66: 1.19:1.000:0.897 0/1/1/1:4:31,56:0.65: 0.82:1.000:0.772 0/0/1/1:4:49,39:0.47: 0.87:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,19:0.30: 0.21:1.000:0.981 0/0/1/1:4:46,73:0.62: 2.31:1.000:0.552 0/0/1/1:4:51,52:0.53: 1.57:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,32:0.45: 0.31:1.000:0.982 0/0/1/1:4:37,31:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,42:0.68:-0.34:1.000:0.946 0/0/0/1:4:77,17:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,28:0.43: 0.03:1.000:0.954 0/1/1/1:4:17,29:0.64:-1.09:1.000:0.643 0/0/1/1:4:51,31:0.41: 0.59:1.000:0.882 0/0/1/1:4:29,34:0.56:-0.30:1.000:0.972 0/0/1/1:4:43,46:0.54: 0.91:1.000:0.989 0/1/1/1:4:29,69:0.70: 1.33:1.000:0.986 0/0/1/1:4:45,27:0.41: 0.12:1.000:0.867 0/1/1/1:4:23,61:0.72: 0.68:0.998:0.996 0/0/1/1:4:37,29:0.47:-0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:45,26:0.40: 0.07:1.000:0.812 0/1/1/1:4:4,30:0.88:-1.65:1.000:0.817 0/0/0/1:4:45,10:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,40:0.48: 0.87:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-2.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,35:0.63:-0.62:1.000:0.582 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,46:0.88:-0.81:0.999:0.772 0/0/1/1:4:29,37:0.58:-0.16:1.000:0.932 0/0/0/1:4:60,16:0.26: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,43:0.57: 0.40:1.000:0.954 0/0/1/1:4:36,19:0.38:-0.67:1.000:0.620 0/0/0/1:4:73,13:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,12:0.24:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,30:0.54:-0.53:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,19:0.48:-1.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,63:0.70: 0.91:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,51:0.62: 0.63:1.000:0.540 0/1/1/1:4:11,35:0.75:-1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,51:0.71: 0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,49:0.87:-0.62:1.000:0.914 0/0/0/1:4:86,21:0.25: 1.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,23:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,42:0.74:-0.62:1.000:0.999 -chr2.1 55016679 chr2.1_055016679 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:416,453:.: 1.68:1.000:. ./.:4:330,287:.: 0.18:1.000:. ./.:4:285,313:.: 0.06:1.000:. ./.:4:254,430:.: 0.58:1.000:. ./.:4:353,314:.: 0.47:1.000:. ./.:4:431,167:.: 0.06:1.000:. ./.:4:241,251:.:-0.57:1.000:. ./.:4:286,542:.: 1.44:1.000:. ./.:4:264,347:.: 0.14:1.000:. ./.:4:96,70:.:-2.52:1.000:. ./.:4:95,112:.:-2.27:1.000:. ./.:4:372,230:.: 0.09:1.000:. ./.:4:296,374:.: 0.49:1.000:. ./.:4:303,518:.: 1.39:1.000:. ./.:4:338,411:.: 0.96:1.000:. ./.:4:238,386:.: 0.22:1.000:. ./.:4:270,586:.: 1.60:0.998:. ./.:4:325,270:.: 0.04:1.000:. ./.:4:334,652:.: 2.38:1.000:. ./.:4:354,465:.: 1.38:1.000:. ./.:4:106,47:.:-2.59:1.000:. ./.:4:344,256:.: 0.07:1.000:. ./.:4:351,400:.: 0.98:1.000:. ./.:4:331,343:.: 0.52:1.000:. ./.:4:78,42:.:-2.79:1.000:. ./.:4:298,497:.: 1.24:1.000:. ./.:4:257,319:.:-0.07:1.000:. ./.:4:344,286:.: 0.25:1.000:. ./.:4:305,614:.: 1.98:1.000:. ./.:4:348,315:.: 0.45:1.000:. ./.:4:309,507:.: 1.36:1.000:. ./.:4:231,352:.:-0.03:1.000:. ./.:4:69,34:.:-2.89:1.000:. ./.:4:119,91:.:-2.25:1.000:. ./.:3:16,30:.:-3.23:1.000:. ./.:4:252,394:.: 0.35:1.000:. ./.:4:277,400:.: 0.53:1.000:. ./.:4:290,391:.: 0.56:1.000:. ./.:4:352,422:.: 1.11:1.000:. ./.:4:381,220:.: 0.08:1.000:. ./.:4:363,137:.:-0.52:1.000:. ./.:4:304,170:.:-0.68:1.000:. ./.:4:291,395:.: 0.59:1.000:. ./.:4:306,286:.: 0.03:1.000:. ./.:4:283,240:.:-0.39:1.000:. ./.:4:317,287:.: 0.10:1.000:. ./.:4:374,552:.: 2.02:1.000:. ./.:4:243,655:.: 1.85:1.000:. ./.:4:212,319:.:-0.34:1.000:. ./.:4:328,260:.: 0.00:1.000:. ./.:4:241,104:.:-1.45:1.000:. ./.:4:396,367:.: 1.05:1.000:. ./.:4:193,268:.:-0.76:1.000:. ./.:4:339,328:.: 0.47:1.000:. ./.:4:241,414:.: 0.40:1.000:. ./.:4:230,341:.:-0.10:1.000:. ./.:4:300,334:.: 0.28:1.000:. ./.:4:300,274:.:-0.08:1.000:. ./.:4:210,260:.:-0.70:1.000:. ./.:6:210,117:.:-1.56:1.000:. ./.:4:285,162:.:-0.84:1.000:. ./.:4:229,299:.:-0.36:1.000:. ./.:4:273,458:.: 0.86:1.000:. ./.:4:214,272:.:-0.61:1.000:. ./.:4:252,368:.: 0.19:1.000:. ./.:4:292,405:.: 0.65:1.000:. ./.:4:318,220:.:-0.30:1.000:. ./.:4:316,317:.: 0.27:1.000:. ./.:4:276,403:.: 0.55:0.777:. ./.:4:310,183:.:-0.56:1.000:. ./.:4:366,228:.: 0.04:1.000:. ./.:4:189,162:.:-1.41:1.000:. ./.:4:375,217:.: 0.03:1.000:. ./.:4:272,439:.: 0.74:1.000:. ./.:4:316,176:.:-0.57:1.000:. ./.:4:239,373:.: 0.15:1.000:. ./.:4:188,415:.: 0.09:1.000:. ./.:4:285,285:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,387:.: 0.03:1.000:. ./.:4:362,272:.: 0.28:1.000:. ./.:4:222,190:.:-1.05:0.608:. ./.:4:225,372:.: 0.06:1.000:. ./.:4:334,365:.: 0.67:1.000:. ./.:4:211,279:.:-0.58:1.000:. ./.:4:426,314:.: 0.91:0.825:. ./.:4:359,310:.: 0.49:1.000:. ./.:4:197,337:.:-0.32:1.000:. ./.:4:235,318:.:-0.21:1.000:. ./.:4:188,273:.:-0.76:1.000:. ./.:4:265,265:.:-0.34:1.000:. ./.:3:226,294:.:-0.40:0.999:. ./.:4:204,273:.:-0.66:1.000:. ./.:4:249,400:.: 0.37:1.000:. ./.:4:252,320:.:-0.09:1.000:. ./.:4:309,240:.:-0.23:1.000:. ./.:4:315,328:.: 0.33:1.000:. ./.:4:240,102:.:-1.47:1.000:. ./.:4:212,145:.:-1.38:1.000:. ./.:4:207,425:.: 0.27:1.000:. ./.:4:239,269:.:-0.48:1.000:. ./.:4:254,303:.:-0.18:1.000:. ./.:4:236,541:.: 1.13:1.000:. ./.:4:215,239:.:-0.80:1.000:. ./.:4:256,245:.:-0.52:1.000:. ./.:4:204,251:.:-0.79:1.000:. ./.:4:180,328:.:-0.48:1.000:. ./.:4:237,151:.:-1.19:1.000:. ./.:4:277,357:.: 0.28:1.000:. ./.:4:466,477:.: 2.12:1.000:. ./.:4:267,435:.: 0.68:1.000:. ./.:4:272,255:.:-0.36:1.000:. ./.:4:470,520:.: 2.40:1.000:. ./.:4:276,223:.:-0.53:0.999:. ./.:4:315,151:.:-0.73:1.000:. ./.:4:241,150:.:-1.17:0.993:. ./.:4:289,233:.:-0.39:1.000:. ./.:4:201,196:.:-1.14:1.000:. ./.:4:289,279:.:-0.12:1.000:. ./.:4:208,356:.:-0.14:1.000:. ./.:4:171,267:.:-0.89:1.000:. ./.:4:245,257:.:-0.51:1.000:. ./.:4:163,321:.:-0.62:1.000:. ./.:4:275,175:.:-0.82:1.000:. ./.:4:318,143:.:-0.76:1.000:. ./.:4:270,225:.:-0.55:1.000:. ./.:4:225,216:.:-0.88:1.000:. ./.:4:203,254:.:-0.78:1.000:. ./.:4:272,100:.:-1.29:1.000:. ./.:4:166,246:.:-1.05:1.000:. ./.:4:156,349:.:-0.49:1.000:. ./.:4:203,321:.:-0.38:1.000:. ./.:4:373,460:.: 1.47:1.000:. ./.:4:175,150:.:-1.57:1.000:. ./.:4:204,429:.: 0.27:1.000:. ./.:4:278,199:.:-0.66:1.000:. ./.:4:491,513:.: 2.49:1.000:. ./.:4:316,316:.: 0.27:1.000:. ./.:4:274,281:.:-0.19:1.000:. ./.:4:203,261:.:-0.74:1.000:. ./.:4:234,219:.:-0.80:1.000:. ./.:4:251,221:.:-0.69:1.000:. ./.:4:204,379:.:-0.03:1.000:. ./.:4:350,180:.:-0.34:1.000:. ./.:4:210,157:.:-1.32:1.000:. ./.:4:455,196:.: 0.38:1.000:. ./.:4:437,367:.: 1.29:1.000:. ./.:4:266,317:.:-0.03:1.000:. ./.:4:337,368:.: 0.70:1.000:. ./.:4:369,373:.: 0.92:1.000:. ./.:4:238,438:.: 0.53:1.000:. ./.:4:397,424:.: 1.39:1.000:. ./.:4:234,463:.: 0.65:1.000:. ./.:4:68,62:.:-2.73:1.000:. ./.:4:298,251:.:-0.23:1.000:. ./.:4:412,393:.: 1.30:1.000:. ./.:4:329,349:.: 0.54:1.000:. ./.:4:422,184:.: 0.11:1.000:. ./.:4:323,483:.: 1.30:1.000:. ./.:4:353,146:.:-0.53:0.998:. ./.:4:424,277:.: 0.68:1.000:. ./.:4:242,326:.:-0.12:1.000:. ./.:4:206,297:.:-0.51:1.000:. ./.:4:345,310:.: 0.40:1.000:. ./.:4:275,528:.: 1.29:1.000:. ./.:4:310,335:.: 0.34:1.000:. ./.:4:275,207:.:-0.63:1.000:. ./.:4:266,458:.: 0.81:1.000:. ./.:4:361,256:.: 0.18:0.999:. ./.:4:356,179:.:-0.31:1.000:. ./.:4:335,256:.: 0.02:1.000:. ./.:4:219,393:.: 0.15:1.000:. ./.:4:202,294:.:-0.55:1.000:. ./.:4:352,438:.: 1.21:1.000:. ./.:4:355,188:.:-0.27:1.000:. ./.:4:229,357:.:-0.01:1.000:. ./.:4:205,361:.:-0.13:1.000:. ./.:4:439,415:.: 1.59:1.000:. ./.:4:433,314:.: 0.95:1.000:. ./.:4:296,437:.: 0.87:1.000:. ./.:4:313,270:.:-0.03:1.000:. ./.:4:281,482:.: 1.05:1.000:. ./.:4:351,508:.: 1.62:1.000:. ./.:4:460,239:.: 0.67:1.000:. ./.:4:315,298:.: 0.15:1.000:. ./.:4:341,230:.:-0.10:1.000:. -chr2.1 55260894 chr2.1_055260894 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,157:.: 0.76:1.000:. ./.:4:90,205:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,233:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,242:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,379:.: 0.86:1.000:. ./.:4:245,238:.: 2.38:1.000:. ./.:4:0,197:.:-1.79:1.000:. ./.:4:109,226:.: 0.22:1.000:. ./.:4:98,233:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,84:.:-3.06:1.000:. ./.:4:88,62:.:-2.47:1.000:. ./.:4:85,219:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.29:1.000:. ./.:4:109,253:.: 0.62:1.000:. ./.:4:181,169:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.01:1.000:. ./.:4:196,182:.: 0.85:0.998:. ./.:4:0,350:.: 0.44:1.000:. ./.:4:127,326:.: 1.94:1.000:. ./.:4:173,182:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,46:.:-2.57:1.000:. ./.:4:91,242:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,234:.: 0.27:1.000:. ./.:4:176,161:.: 0.25:1.000:. ./.:4:22,56:.:-3.52:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.22:1.000:. ./.:4:79,253:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.22:1.000:. ./.:4:119,274:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,348:.: 0.41:1.000:. ./.:4:103,234:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,249:.: 0.27:1.000:. ./.:4:20,39:.:-3.80:1.000:. ./.:4:92,47:.:-2.63:1.000:. ./.:3:0,37:.:-4.12:1.000:. ./.:4:83,228:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,231:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.22:1.000:. ./.:4:207,168:.: 0.81:1.000:. ./.:4:119,261:.: 0.88:1.000:. ./.:4:186,144:.: 0.15:1.000:. ./.:4:101,272:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.37:1.000:. ./.:4:94,238:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.28:1.000:. ./.:4:120,267:.: 0.98:1.000:. ./.:4:119,259:.: 0.85:1.000:. ./.:4:43,97:.:-2.62:1.000:. ./.:4:172,127:.:-0.30:1.000:. ./.:4:108,223:.: 0.17:1.000:. ./.:4:99,174:.:-0.68:1.000:. ./.:4:116,315:.: 1.62:1.000:. ./.:4:177,129:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,249:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.78:1.000:. ./.:4:222,158:.: 0.88:1.000:. ./.:4:86,232:.:-0.02:1.000:. ./.:4:126,258:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,220:.:-0.10:1.000:. ./.:6:98,201:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,258:.: 0.91:1.000:. ./.:4:74,161:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.49:1.000:. ./.:4:96,187:.:-0.53:1.000:. ./.:4:101,228:.: 0.14:1.000:. ./.:4:216,173:.: 1.01:1.000:. ./.:4:71,171:.:-1.13:1.000:. ./.:4:197,165:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,310:.:-0.14:0.777:. ./.:4:150,139:.:-0.45:1.000:. ./.:4:137,262:.: 1.16:1.000:. ./.:4:168,111:.:-0.59:1.000:. ./.:4:239,145:.: 0.94:1.000:. ./.:4:104,253:.: 0.54:1.000:. ./.:4:111,244:.: 0.51:1.000:. ./.:4:199,125:.: 0.06:1.000:. ./.:4:206,132:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.25:1.000:. ./.:4:109,244:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,244:.:-1.10:0.608:. ./.:4:226,153:.: 0.86:1.000:. ./.:4:220,199:.: 1.45:1.000:. ./.:4:97,193:.:-0.43:1.000:. ./.:4:92,238:.: 0.15:0.825:. ./.:4:0,351:.: 0.46:1.000:. ./.:4:64,185:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.71:1.000:. ./.:4:106,222:.: 0.12:1.000:. ./.:4:101,232:.: 0.19:1.000:. ./.:3:0,190:.:-1.89:0.999:. ./.:4:197,125:.: 0.03:1.000:. ./.:4:128,269:.: 1.13:1.000:. ./.:4:76,177:.:-0.97:1.000:. ./.:4:104,260:.: 0.65:1.000:. ./.:4:137,248:.: 0.95:1.000:. ./.:4:99,227:.: 0.09:1.000:. ./.:4:196,153:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.34:1.000:. ./.:4:113,205:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.02:1.000:. ./.:4:84,154:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,316:.:-0.05:1.000:. ./.:4:89,197:.:-0.49:1.000:. ./.:4:165,150:.:-0.07:1.000:. ./.:4:186,145:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,216:.:-0.11:1.000:. ./.:4:119,283:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.00:1.000:. ./.:4:124,259:.: 0.92:1.000:. ./.:4:230,193:.: 1.51:1.000:. ./.:4:109,235:.: 0.35:0.999:. ./.:4:119,239:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,222:.:-1.42:0.993:. ./.:4:208,177:.: 0.95:1.000:. ./.:4:91,200:.:-0.42:1.000:. ./.:4:106,240:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,225:.: 0.03:1.000:. ./.:4:104,226:.: 0.15:1.000:. ./.:4:92,237:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,223:.: 0.31:1.000:. ./.:4:128,276:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.49:1.000:. ./.:4:107,256:.: 0.63:1.000:. ./.:4:115,244:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.20:1.000:. ./.:4:80,195:.:-0.65:1.000:. ./.:4:65,179:.:-1.10:1.000:. ./.:4:73,203:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,297:.:-0.33:1.000:. ./.:4:196,167:.: 0.63:1.000:. ./.:4:72,148:.:-1.45:1.000:. ./.:4:106,239:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,293:.:-0.39:1.000:. ./.:4:229,190:.: 1.45:1.000:. ./.:4:240,174:.: 1.37:1.000:. ./.:4:107,211:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.68:1.000:. ./.:4:87,217:.:-0.23:1.000:. ./.:4:96,238:.: 0.21:1.000:. ./.:4:99,226:.: 0.08:1.000:. ./.:4:161,141:.:-0.26:1.000:. ./.:4:66,184:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,400:.: 1.17:1.000:. ./.:4:124,306:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,333:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,400:.: 1.17:1.000:. ./.:4:75,218:.:-0.39:1.000:. ./.:4:215,164:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,240:.: 0.35:1.000:. ./.:4:55,54:.:-3.07:1.000:. ./.:4:132,101:.:-1.26:1.000:. ./.:4:104,263:.: 0.69:1.000:. ./.:4:109,222:.: 0.17:1.000:. ./.:4:246,172:.: 1.43:1.000:. ./.:4:218,187:.: 1.24:1.000:. ./.:4:84,217:.:-0.27:0.998:. ./.:4:0,341:.: 0.31:1.000:. ./.:4:94,191:.:-0.51:1.000:. ./.:4:73,190:.:-0.83:1.000:. ./.:4:81,210:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,220:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,269:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.36:1.000:. ./.:4:91,223:.:-0.08:0.999:. ./.:4:0,324:.: 0.06:1.000:. ./.:4:85,213:.:-0.32:1.000:. ./.:4:68,199:.:-0.77:1.000:. ./.:4:85,182:.:-0.77:1.000:. ./.:4:194,162:.: 0.53:1.000:. ./.:4:188,128:.:-0.05:1.000:. ./.:4:81,190:.:-0.71:1.000:. ./.:4:67,186:.:-0.97:1.000:. ./.:4:106,255:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,355:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,229:.: 0.09:1.000:. ./.:4:83,242:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,388:.: 1.00:1.000:. ./.:4:106,242:.: 0.41:1.000:. ./.:4:136,117:.:-0.97:1.000:. ./.:4:89,230:.:-0.01:1.000:. -chr2.1 55455133 chr2.1_055455133 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:130,121:0.52:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,194:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,205:0.77:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,231:0.80:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:147,289:0.65: 1.46:1.000:0.809 0/1/1/1:4:65,293:0.78: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,315:0.85: 0.71:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,373:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,119:0.55:-0.58:1.000:0.977 0/1/1/1:4:6,45:0.86:-2.24:1.000:0.974 0/1/1/1:4:6,31:0.80:-2.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,194:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,213:0.66: 0.28:1.000:0.890 0/1/1/1:4:73,280:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,102:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,375:0.81: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,241:0.71: 0.40:0.998:0.991 0/1/1/1:4:83,266:0.73: 0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,474:0.81: 2.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,342:0.75: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,29:0.52:-2.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:112,183:0.62: 0.10:1.000:0.570 1/1/1/1:4:0,404:1.00: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,211:0.70: 0.07:1.000:0.982 0/1/1/1:4:4,23:0.82:-2.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,417:0.85: 1.86:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,344:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,210:0.63: 0.47:1.000:0.532 0/0/1/1:4:160,141:0.51: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:123,276:0.67: 1.10:1.000:0.934 0/1/1/1:4:58,257:0.78: 0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,249:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.46:-2.53:1.000:0.985 0/0/1/1:4:26,29:0.55:-2.20:1.000:0.980 0/1/1:3:6,26:0.77:-2.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,344:0.79: 1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,322:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,390:0.86: 1.52:1.000:0.980 0/0/0/1:4:202,1:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,382:0.83: 1.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,194:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,180:0.58: 0.34:1.000:0.927 0/0/1/1:4:128,210:0.62: 0.51:1.000:0.561 0/0/1/1:4:102,144:0.59:-0.37:1.000:0.840 0/1/1/1:4:86,161:0.64:-0.36:1.000:0.729 0/0/1/1:4:212,105:0.43: 0.31:1.000:0.944 0/1/1/1:4:73,247:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,21:0.85:-2.50:1.000:0.989 0/1/1/1:4:61,158:0.70:-0.63:1.000:0.981 0/0/1/1:4:46,67:0.60:-1.65:1.000:0.797 0/1/1/1:4:49,218:0.78:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,241:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,156:0.71:-0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:151,70:0.42:-0.61:1.000:0.918 0/1/1/1:4:50,338:0.84: 0.99:1.000:0.993 0/1/1/1:4:72,184:0.69:-0.27:1.000:0.979 0/0/1/1:4:108,166:0.61:-0.10:1.000:0.702 0/1/1/1:4:69,265:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,168:0.62:-0.16:1.000:0.506 0/0/1/1/1/1:6:86,135:0.61:-0.61:1.000:0.738 0/0/1/1:4:112,183:0.62: 0.10:1.000:0.570 0/1/1/1:4:40,176:0.78:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,209:0.65: 0.29:1.000:0.813 0/0/1/1:4:124,196:0.61: 0.34:1.000:0.645 0/1/1/1:4:129,227:0.63: 0.69:1.000:0.601 0/0/1/1:4:99,80:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:107,221:0.66: 0.42:1.000:0.869 0/1/1/1:4:66,219:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,245:0.74: 0.26:0.777:0.999 1/1/1/1:4:0,181:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,125:0.45: 0.55:1.000:0.978 0/1/1/1:4:50,208:0.77:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,187:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,252:0.76: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,217:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,152:0.75:-0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,151:0.69:-0.70:1.000:0.972 0/1/1/1:4:46,241:0.81: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,335:0.82: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,200:0.77:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,177:0.80:-0.69:0.608:1.000 0/0/1/1:4:138,86:0.46:-0.58:1.000:0.986 0/0/0/0:4:177,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,332:0.82: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,140:0.61:-0.53:0.825:0.655 0/1/1/1:4:53,337:0.84: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,160:0.64:-0.37:1.000:0.717 0/1/1/1:4:43,234:0.81:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,150:0.73:-0.87:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,268:0.79: 0.39:1.000:1.000 1/1/1:3:0,254:1.00:-0.29:0.999:1.000 0/1/1/1:4:57,181:0.73:-0.45:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,300:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,176:0.61: 0.07:1.000:0.727 0/0/1/1:4:111,100:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,296:0.78: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,147:0.73:-0.89:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,273:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,391:0.78: 1.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:29,301:0.89: 0.44:1.000:0.630 0/1/1/1:4:58,283:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,77:0.58:-1.44:1.000:0.904 0/1/1/1:4:110,200:0.64: 0.25:1.000:0.672 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,177:0.68:-0.32:1.000:0.962 0/1/1/1:4:51,155:0.72:-0.75:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,262:0.78: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,283:0.75: 0.70:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,326:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,79:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,304:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,196:0.76:-0.38:0.999:1.000 0/0/1/1:4:179,125:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,77:0.62:-1.54:0.993:0.564 0/0/1/1:4:130,90:0.47:-0.62:1.000:0.993 0/1/1/1:4:67,326:0.79: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,85:0.46:-0.62:1.000:0.987 0/0/1/1:4:110,95:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,84:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,214:0.72: 0.00:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,250:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,330:0.82: 0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:107,220:0.66: 0.41:1.000:0.865 0/0/1/1:4:103,88:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:100,177:0.63:-0.07:1.000:0.614 0/1/1/1:4:61,308:0.80: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,47:0.48:-1.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,66:0.58:-1.62:1.000:0.909 0/1/1/1:4:42,199:0.79:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,122:0.57:-0.62:1.000:0.945 0/1/1/1:4:57,264:0.79: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,119:0.64:-0.97:1.000:0.716 1/1/1/1:4:0,215:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,188:0.62: 0.15:1.000:0.508 0/0/1/1:4:185,153:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,95:0.47:-0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:149,87:0.45:-0.47:1.000:0.979 0/1/1/1:4:46,182:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,80:0.44:-0.58:1.000:0.972 0/0/1/1:4:184,96:0.44:-0.04:1.000:0.959 0/0/1/1:4:108,178:0.62: 0.01:1.000:0.550 0/0/1/1:4:116,91:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,110:0.59:-0.92:1.000:0.857 0/0/1/1:4:196,329:0.62: 2.31:1.000:0.508 0/1/1/1:4:84,311:0.75: 1.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:132,261:0.65: 1.04:1.000:0.817 0/1/1/1:4:117,199:0.63: 0.30:1.000:0.523 0/0/1/1:4:162,268:0.62: 1.40:1.000:0.542 1/1/1/1:4:0,285:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,307:0.74: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,358:0.81: 1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,58:0.50:-1.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:226,110:0.43: 0.49:1.000:0.938 0/0/1/1:4:148,249:0.63: 1.08:1.000:0.502 0/0/1/1:4:149,162:0.55: 0.25:1.000:0.984 0/1/1/1:4:82,283:0.74: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,208:0.79:-0.31:0.998:1.000 0/1/1/1:4:149,262:0.63: 1.22:1.000:0.600 0/1/1/1:4:66,314:0.79: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,168:0.78:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,309:0.79: 0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,510:1.00: 2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,76:0.59:-1.47:1.000:0.866 1/1/1/1:4:2,361:0.99: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,266:0.69: 0.86:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,479:1.00: 1.87:0.999:1.000 0/1/1/1:4:49,324:0.84: 0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,322:0.79: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,159:0.59:-0.12:1.000:0.845 0/0/1/1:4:118,159:0.59:-0.07:1.000:0.891 0/1/1/1:4:62,208:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,204:0.78:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,175:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,167:0.77:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,276:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:155,292:0.64: 1.56:1.000:0.740 0/1/1/1:4:62,259:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,166:0.64:-0.26:1.000:0.678 0/1/1/1:4:72,410:0.82: 1.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,380:0.80: 1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:186,319:0.63: 2.12:1.000:0.543 0/0/1/1:4:102,101:0.53:-0.78:1.000:0.993 0/1/1/1:4:80,216:0.70: 0.11:1.000:0.987 -chr2.1 55552178 chr2.1_055552178 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:59,67:0.54:-0.84:1.000:0.989 0/0/1/1:4:55,85:0.62:-0.63:1.000:0.575 0/0/1/1:4:77,56:0.42:-0.73:1.000:0.914 0/0/0/1:4:136,49:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,65:0.25: 1.04:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,55:0.39:-0.61:1.000:0.660 0/0/1/1:4:54,62:0.54:-1.00:1.000:0.987 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,24:0.46:-1.98:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,91:0.60:-0.41:1.000:0.773 0/0/0/1:4:203,49:0.19: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,61:0.27: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,45:0.35:-0.81:1.000:0.823 0/0/0/1:4:138,44:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,127:0.60: 0.51:0.998:0.746 0/1/1/1:4:91,150:0.64: 0.93:1.000:0.641 0/1/1/1:4:84,233:0.76: 2.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,118:0.63: 0.14:1.000:0.623 0/1/1/1:4:8,48:0.87:-1.92:1.000:0.920 0/1/1/1:4:73,179:0.73: 1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,59:0.45:-0.77:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,70:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,35:0.38:-1.37:1.000:0.530 0/0/0/1:4:138,50:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:246,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,52:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,47:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,51:0.44:-1.00:1.000:0.967 0/1/1/1:4:16,49:0.77:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,51:0.60:-1.46:1.000:0.751 0/1/1:3:14,29:0.69:-2.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,117:0.64: 0.08:1.000:0.725 0/0/1/1:4:61,47:0.44:-1.12:1.000:0.958 0/0/1/1:4:108,94:0.47: 0.33:1.000:0.991 0/0/0/1:4:161,58:0.25: 0.59:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,135:0.66: 0.42:1.000:0.897 0/0/0/1:4:247,100:0.28: 2.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,138:0.68: 0.40:1.000:0.963 0/0/0/1:4:228,88:0.27: 2.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,147:0.50: 1.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:175,64:0.26: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,14:0.72:-2.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,146:0.73: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,176:0.68: 1.33:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,68:0.44:-0.40:1.000:0.965 0/0/1/1:4:67,100:0.61:-0.21:1.000:0.685 0/0/1/1:4:139,137:0.50: 1.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,46:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,164:0.68: 1.00:1.000:0.963 0/1/1/1:4:62,134:0.70: 0.24:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,119:0.42: 1.60:1.000:0.898 0/1/1/1/1/1:6:32,99:0.78:-0.77:1.000:0.780 0/1/1/1:4:72,118:0.63: 0.14:1.000:0.623 0/0/0/1:4:131,54:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:248,81:0.24: 2.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,150:0.54: 1.53:1.000:0.986 0/0/1/1:4:152,154:0.51: 1.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,84:0.53:-0.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:47,131:0.76:-0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,56:0.27: 0.33:0.777:0.998 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,174:0.51: 2.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,106:0.65:-0.23:1.000:0.822 1/1/1/1:4:0,199:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,61:0.29: 0.33:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,136:0.67: 0.42:1.000:0.921 0/1/1/1:4:69,133:0.67: 0.33:1.000:0.939 0/1/1/1:4:55,137:0.73: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:147,60:0.28: 0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,73:0.54:-0.66:1.000:0.990 0/1/1/1:4:57,158:0.76: 0.53:0.608:1.000 0/0/0/1:4:152,82:0.35: 0.82:1.000:0.833 0/0/0/1:4:166,81:0.32: 1.02:1.000:0.950 0/1/1/1:4:48,124:0.74:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,250:0.76: 2.45:0.825:1.000 0/0/1/1:4:87,113:0.57: 0.30:1.000:0.935 0/0/1/1:4:95,99:0.52: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,124:0.53: 0.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:117,69:0.37: 0.08:1.000:0.602 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1:3:52,62:0.55:-1.03:0.999:0.969 0/0/1/1:4:71,110:0.62: 0.00:1.000:0.566 0/0/1/1:4:76,62:0.45:-0.66:1.000:0.980 0/1/1/1:4:50,80:0.63:-0.78:1.000:0.543 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,239:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,58:0.50:-1.00:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,58:0.34:-0.20:1.000:0.871 0/1/1/1:4:81,182:0.71: 1.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,81:0.47:-0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:151,55:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,60:0.33:-0.03:1.000:0.925 0/0/1/1:4:55,61:0.53:-1.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,130:0.62: 0.51:1.000:0.570 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,75:0.43:-0.12:1.000:0.955 0/0/1/1:4:68,106:0.62:-0.10:1.000:0.546 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,51:0.44:-1.00:0.999:0.967 0/0/1/1:4:153,123:0.45: 1.47:1.000:0.976 0/0/0/1:4:108,56:0.34:-0.26:0.993:0.894 0/0/1/1:4:57,71:0.56:-0.81:1.000:0.962 0/1/1/1:4:52,178:0.79: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,117:0.45: 1.19:1.000:0.984 0/0/0/0:4:175,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,72:0.31: 0.67:1.000:0.966 0/0/1/1:4:73,50:0.40:-0.89:1.000:0.828 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,41:0.22: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,156:0.52: 1.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:114,64:0.35:-0.04:1.000:0.745 0/0/0/1:4:110,57:0.34:-0.21:1.000:0.895 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,164:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,63:0.23: 1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,88:0.74:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,56:0.45:-0.86:1.000:0.979 0/0/0/1:4:105,52:0.32:-0.37:1.000:0.940 0/1/1/1:4:82,167:0.69: 1.05:1.000:0.971 0/0/1/1:4:71,62:0.47:-0.73:1.000:0.991 0/0/1/1:4:144,127:0.47: 1.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:122,60:0.32: 0.02:1.000:0.945 0/0/1/1:4:132,134:0.51: 1.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,132:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,121:0.48: 1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,90:0.62:-0.49:1.000:0.617 0/1/1/1:4:45,90:0.68:-0.70:1.000:0.963 0/0/0/1:4:171,78:0.31: 1.05:1.000:0.979 0/0/1/1:4:82,75:0.48:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:204,42:0.16: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,42:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,60:0.23: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,51:0.44:-1.00:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,125:0.71: 0.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,34:0.70:-2.01:1.000:0.984 0/0/1/1:4:58,82:0.60:-0.63:1.000:0.820 0/0/1/1:4:192,148:0.44: 2.45:1.000:0.959 0/1/1/1:4:80,154:0.67: 0.82:1.000:0.938 0/1/1/1:4:72,123:0.65: 0.22:1.000:0.745 0/1/1/1:4:61,128:0.70: 0.13:1.000:0.980 0/0/1/1:4:51,48:0.49:-1.26:0.998:0.996 0/0/0/1:4:134,54:0.28: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,140:0.71: 0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:117,54:0.31:-0.15:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,107:0.62:-0.07:1.000:0.563 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,56:0.48:-0.97:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-0.26:0.999:1.000 0/1/1/1:4:53,103:0.68:-0.38:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,85:0.47: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:108,79:0.42: 0.10:1.000:0.920 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,95:0.99:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,58:0.34:-0.21:1.000:0.857 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,52:0.39:-0.75:1.000:0.706 0/0/0/1:4:169,72:0.29: 0.93:1.000:0.992 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,33:0.23:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,51:0.23: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,115:0.42: 1.45:1.000:0.901 0/0/1/1:4:76,100:0.58:-0.07:1.000:0.923 0/0/1/1:4:53,71:0.58:-0.87:1.000:0.904 0/0/1/1:4:77,110:0.60: 0.10:1.000:0.798 -chr2.1 55673290 chr2.1_055673290 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:287,151:.: 0.58:1.000:. ./.:4:87,274:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,242:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,346:.: 0.41:1.000:. ./.:4:308,146:.: 0.77:1.000:. ./.:4:201,296:.: 1.27:1.000:. ./.:4:59,317:.:-0.15:1.000:. ./.:4:73,384:.: 0.80:1.000:. ./.:4:150,244:.: 0.06:1.000:. ./.:4:38,117:.:-2.75:1.000:. ./.:4:64,72:.:-2.97:1.000:. ./.:4:80,326:.: 0.20:1.000:. ./.:4:173,257:.: 0.48:1.000:. ./.:4:88,443:.: 1.67:1.000:. ./.:4:256,112:.:-0.25:1.000:. ./.:4:204,269:.: 0.99:1.000:. ./.:4:110,439:.: 1.88:0.998:. ./.:4:215,260:.: 1.01:1.000:. ./.:4:108,475:.: 2.28:1.000:. ./.:4:99,467:.: 2.08:1.000:. ./.:4:77,100:.:-2.49:1.000:. ./.:4:180,210:.: 0.01:1.000:. ./.:4:92,387:.: 1.06:1.000:. ./.:4:163,241:.: 0.18:1.000:. ./.:4:26,76:.:-3.37:1.000:. ./.:4:177,300:.: 1.04:1.000:. ./.:4:80,417:.: 1.27:1.000:. ./.:4:230,128:.:-0.36:1.000:. ./.:4:204,282:.: 1.14:1.000:. ./.:4:218,137:.:-0.40:1.000:. ./.:4:86,446:.: 1.68:1.000:. ./.:4:81,320:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,90:.:-2.57:1.000:. ./.:3:14,46:.:-3.86:1.000:. ./.:4:68,402:.: 0.95:1.000:. ./.:4:89,409:.: 1.28:1.000:. ./.:4:82,430:.: 1.45:1.000:. ./.:4:277,131:.: 0.22:1.000:. ./.:4:184,250:.: 0.53:1.000:. ./.:4:145,241:.:-0.03:1.000:. ./.:4:256,118:.:-0.17:1.000:. ./.:4:214,257:.: 0.96:1.000:. ./.:4:274,108:.:-0.08:1.000:. ./.:4:179,257:.: 0.55:1.000:. ./.:4:237,107:.:-0.53:1.000:. ./.:4:100,381:.: 1.08:1.000:. ./.:4:49,309:.:-0.36:1.000:. ./.:4:77,323:.: 0.13:1.000:. ./.:4:232,112:.:-0.53:1.000:. ./.:4:151,176:.:-0.73:1.000:. ./.:4:252,260:.: 1.45:1.000:. ./.:4:81,333:.: 0.30:1.000:. ./.:4:254,122:.:-0.15:1.000:. ./.:4:145,221:.:-0.27:1.000:. ./.:4:77,340:.: 0.33:1.000:. ./.:4:232,114:.:-0.50:1.000:. ./.:4:201,262:.: 0.87:1.000:. ./.:4:138,239:.:-0.14:1.000:. ./.:6:192,123:.:-0.87:1.000:. ./.:4:233,95:.:-0.72:1.000:. ./.:4:70,330:.: 0.13:1.000:. ./.:4:194,263:.: 0.80:1.000:. ./.:4:180,236:.: 0.32:1.000:. ./.:4:173,269:.: 0.62:1.000:. ./.:4:249,118:.:-0.26:1.000:. ./.:4:129,223:.:-0.43:1.000:. ./.:4:156,208:.:-0.29:1.000:. ./.:4:155,238:.: 0.05:0.777:. ./.:4:0,450:.: 0.72:1.000:. ./.:4:250,131:.:-0.09:1.000:. ./.:4:92,294:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,532:.: 1.68:1.000:. ./.:4:97,366:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,444:.: 0.65:1.000:. ./.:4:64,299:.:-0.30:1.000:. ./.:4:71,318:.: 0.00:1.000:. ./.:4:157,240:.: 0.10:1.000:. ./.:4:165,253:.: 0.34:1.000:. ./.:4:69,358:.: 0.45:1.000:. ./.:4:58,271:.:-0.70:0.608:. ./.:4:172,212:.:-0.06:1.000:. ./.:4:288,126:.: 0.30:1.000:. ./.:4:82,318:.: 0.13:1.000:. ./.:4:148,278:.: 0.44:0.825:. ./.:4:178,210:.:-0.01:1.000:. ./.:4:127,152:.:-1.29:1.000:. ./.:4:76,291:.:-0.26:1.000:. ./.:4:81,303:.:-0.06:1.000:. ./.:4:171,222:.: 0.05:1.000:. ./.:3:69,195:.:-1.47:0.999:. ./.:4:72,312:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,369:.: 0.77:1.000:. ./.:4:206,96:.:-1.02:1.000:. ./.:4:253,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:154,259:.: 0.28:1.000:. ./.:4:136,185:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.15:1.000:. ./.:4:179,228:.: 0.21:1.000:. ./.:4:102,365:.: 0.92:1.000:. ./.:4:90,346:.: 0.55:1.000:. ./.:4:171,241:.: 0.27:1.000:. ./.:4:176,81:.:-1.55:1.000:. ./.:4:201,113:.:-0.88:1.000:. ./.:4:69,275:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,298:.:-0.16:1.000:. ./.:4:143,203:.:-0.50:1.000:. ./.:4:152,239:.: 0.02:1.000:. ./.:4:193,248:.: 0.61:1.000:. ./.:4:95,330:.: 0.42:1.000:. ./.:4:229,95:.:-0.76:1.000:. ./.:4:226,315:.: 1.79:1.000:. ./.:4:162,180:.:-0.55:0.999:. ./.:4:251,109:.:-0.34:1.000:. ./.:4:177,79:.:-1.56:0.993:. ./.:4:255,130:.:-0.05:1.000:. ./.:4:75,305:.:-0.10:1.000:. ./.:4:204,82:.:-1.21:1.000:. ./.:4:135,214:.:-0.47:1.000:. ./.:4:136,191:.:-0.73:1.000:. ./.:4:75,329:.: 0.18:1.000:. ./.:4:74,268:.:-0.55:1.000:. ./.:4:169,219:.:-0.01:1.000:. ./.:4:249,116:.:-0.28:1.000:. ./.:4:200,97:.:-1.08:1.000:. ./.:4:200,237:.: 0.57:1.000:. ./.:4:169,233:.: 0.15:1.000:. ./.:4:132,208:.:-0.57:1.000:. ./.:4:104,190:.:-1.11:1.000:. ./.:4:70,240:.:-0.93:1.000:. ./.:4:122,194:.:-0.86:1.000:. ./.:4:180,276:.: 0.79:1.000:. ./.:4:158,82:.:-1.75:1.000:. ./.:4:87,331:.: 0.34:1.000:. ./.:4:243,85:.:-0.72:1.000:. ./.:4:195,326:.: 1.55:1.000:. ./.:4:233,99:.:-0.67:1.000:. ./.:4:211,103:.:-0.88:1.000:. ./.:4:115,193:.:-0.95:1.000:. ./.:4:210,99:.:-0.94:1.000:. ./.:4:265,117:.:-0.08:1.000:. ./.:4:164,197:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,231:.:-0.19:1.000:. ./.:4:175,79:.:-1.58:1.000:. ./.:4:335,141:.: 1.02:1.000:. ./.:4:217,291:.: 1.40:1.000:. ./.:4:156,280:.: 0.55:1.000:. ./.:4:254,115:.:-0.23:1.000:. ./.:4:278,124:.: 0.15:1.000:. ./.:4:69,324:.: 0.05:1.000:. ./.:4:168,277:.: 0.66:1.000:. ./.:4:79,363:.: 0.62:1.000:. ./.:4:23,129:.:-2.78:1.000:. ./.:4:133,162:.:-1.10:1.000:. ./.:4:248,130:.:-0.13:1.000:. ./.:4:165,246:.: 0.26:1.000:. ./.:4:184,271:.: 0.78:1.000:. ./.:4:90,399:.: 1.18:1.000:. ./.:4:136,201:.:-0.61:0.998:. ./.:4:286,157:.: 0.64:1.000:. ./.:4:73,358:.: 0.49:1.000:. ./.:4:72,296:.:-0.25:1.000:. ./.:4:138,239:.:-0.14:1.000:. ./.:4:71,357:.: 0.46:1.000:. ./.:4:163,266:.: 0.47:1.000:. ./.:4:95,386:.: 1.08:1.000:. ./.:4:147,256:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,471:.: 0.96:0.999:. ./.:4:171,286:.: 0.80:1.000:. ./.:4:148,204:.:-0.43:1.000:. ./.:4:122,220:.:-0.55:1.000:. ./.:4:132,194:.:-0.74:1.000:. ./.:4:165,215:.:-0.10:1.000:. ./.:4:142,208:.:-0.46:1.000:. ./.:4:58,355:.: 0.28:1.000:. ./.:4:146,207:.:-0.42:1.000:. ./.:4:175,311:.: 1.14:1.000:. ./.:4:266,147:.: 0.28:1.000:. ./.:4:179,283:.: 0.86:1.000:. ./.:4:187,180:.:-0.26:1.000:. ./.:4:181,238:.: 0.35:1.000:. ./.:4:95,445:.: 1.78:1.000:. ./.:4:319,151:.: 0.95:1.000:. ./.:4:149,231:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,353:.: 0.78:1.000:. -chr2.1 55772890 chr2.1_055772890 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:97,263:.: 1.03:1.000:. ./.:4:58,182:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.32:1.000:. ./.:4:126,285:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,319:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,144:.:-2.03:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.51:1.000:. ./.:4:73,194:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,54:.:-3.31:1.000:. ./.:4:0,71:.:-3.07:1.000:. ./.:4:66,162:.:-0.84:1.000:. ./.:4:66,234:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.22:1.000:. ./.:4:75,209:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,242:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.55:0.998:. ./.:4:158,153:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,368:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,351:.: 0.90:1.000:. ./.:4:1,50:.:-3.35:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,50:.:-3.36:1.000:. ./.:4:104,241:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,316:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,222:.: 0.21:1.000:. ./.:4:82,244:.: 0.55:1.000:. ./.:4:68,205:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,365:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,15:.:-3.86:1.000:. ./.:4:0,90:.:-2.80:1.000:. ./.:3:0,23:.:-3.75:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.14:1.000:. ./.:4:109,284:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.22:1.000:. ./.:4:105,238:.: 0.79:1.000:. ./.:4:117,297:.: 1.80:1.000:. ./.:4:93,237:.: 0.61:1.000:. ./.:4:95,264:.: 1.02:1.000:. ./.:4:94,271:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,428:.: 2.00:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.24:1.000:. ./.:4:124,275:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,361:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,269:.:-0.26:1.000:. ./.:4:118,270:.: 1.43:1.000:. ./.:4:97,199:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,312:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,190:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.39:1.000:. ./.:4:78,231:.: 0.31:1.000:. ./.:6:41,196:.:-0.71:1.000:. ./.:4:77,243:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.24:1.000:. ./.:4:99,241:.: 0.75:1.000:. ./.:4:86,219:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,232:.: 0.48:1.000:. ./.:4:112,210:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,199:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,330:.: 0.61:1.000:. ./.:4:118,242:.: 1.03:0.777:. ./.:4:0,254:.:-0.47:1.000:. ./.:4:132,262:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,213:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,286:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.49:1.000:. ./.:4:99,245:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.59:1.000:. ./.:4:80,142:.:-0.92:0.608:. ./.:4:91,251:.: 0.78:1.000:. ./.:4:88,246:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.48:0.825:. ./.:4:0,302:.: 0.21:1.000:. ./.:4:44,129:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.27:1.000:. ./.:3:0,165:.:-1.73:0.999:. ./.:4:0,306:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.71:1.000:. ./.:4:86,172:.:-0.41:1.000:. ./.:4:89,220:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,304:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,279:.:-0.12:1.000:. ./.:4:97,218:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.95:1.000:. ./.:4:92,236:.: 0.58:1.000:. ./.:4:70,159:.:-0.83:1.000:. ./.:4:75,188:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.73:1.000:. ./.:4:87,214:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,379:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.15:1.000:. ./.:4:79,215:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,401:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.32:0.999:. ./.:4:91,224:.: 0.39:1.000:. ./.:4:70,157:.:-0.85:0.993:. ./.:4:88,253:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1,214:.:-1.02:1.000:. ./.:4:82,205:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,185:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,207:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,317:.: 0.42:1.000:. ./.:4:78,234:.: 0.35:1.000:. ./.:4:101,257:.: 1.00:1.000:. ./.:4:104,213:.: 0.42:1.000:. ./.:4:87,232:.: 0.45:1.000:. ./.:4:153,119:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,172:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,197:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,115:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.04:1.000:. ./.:4:85,215:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,397:.: 1.56:1.000:. ./.:4:89,231:.: 0.47:1.000:. ./.:4:56,215:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,194:.:-0.24:1.000:. ./.:4:78,202:.:-0.10:1.000:. ./.:4:87,246:.: 0.65:1.000:. ./.:4:83,215:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.14:1.000:. ./.:4:66,171:.:-0.71:1.000:. ./.:4:109,255:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,382:.: 1.34:1.000:. ./.:4:81,222:.: 0.22:1.000:. ./.:4:81,236:.: 0.42:1.000:. ./.:4:95,250:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,319:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,60:.:-3.22:1.000:. ./.:4:0,179:.:-1.53:1.000:. ./.:4:78,252:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.73:0.998:. ./.:4:104,257:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,295:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,286:.:-0.02:1.000:. ./.:4:96,222:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.37:1.000:. ./.:4:62,191:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.47:0.999:. ./.:4:0,297:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.88:1.000:. ./.:4:67,165:.:-0.78:1.000:. ./.:4:72,164:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,174:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.62:1.000:. ./.:4:83,253:.: 0.69:1.000:. ./.:4:77,260:.: 0.71:1.000:. ./.:4:61,187:.:-0.56:1.000:. ./.:4:85,218:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.49:1.000:. ./.:4:69,233:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.63:1.000:. ./.:4:96,221:.: 0.42:1.000:. -chr2.1 56115106 chr2.1_056115106 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:88,90:.: 0.66:1.000:. ./.:4:115,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,29:.: 0.29:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:103,81:.: 0.79:1.000:. ./.:4:186,41:.: 1.71:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:144,32:.: 0.61:1.000:. ./.:4:148,29:.: 0.63:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:128,39:.: 0.42:1.000:. ./.:4:123,40:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:91,66:.: 0.20:1.000:. ./.:4:105,78:.: 0.76:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.57:0.998:. ./.:4:173,42:.: 1.45:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:222,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:171,33:.: 1.22:1.000:. ./.:4:141,28:.: 0.46:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:78,60:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,29:.: 0.48:1.000:. ./.:4:92,84:.: 0.61:1.000:. ./.:4:165,26:.: 0.94:1.000:. ./.:4:92,63:.: 0.16:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:121,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.68:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:137,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:134,31:.: 0.38:1.000:. ./.:4:114,42:.: 0.18:1.000:. ./.:4:117,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:91,73:.: 0.35:1.000:. ./.:4:137,29:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,42:.:-0.89:1.000:. ./.:4:101,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:131,37:.: 0.44:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:99,54:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,14:.:-1.13:1.000:. ./.:4:178,37:.: 1.45:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:150,30:.: 0.70:1.000:. ./.:4:98,73:.: 0.51:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:89,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:107,14:.:-0.57:1.000:. ./.:4:119,25:.:-0.08:1.000:. ./.:6:75,41:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,26:.: 0.18:1.000:. ./.:4:112,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:126,37:.: 0.33:1.000:. ./.:4:77,56:.:-0.31:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:110,28:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,48:.:-0.68:0.777:. ./.:4:183,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:119,29:.: 0.01:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:113,26:.:-0.18:1.000:. ./.:4:90,54:.:-0.08:1.000:. ./.:4:112,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:88,33:.:-0.57:0.608:. ./.:4:85,17:.:-0.98:1.000:. ./.:4:115,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.23:0.825:. ./.:4:111,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:84,20:.:-0.94:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:138,29:.: 0.42:1.000:. ./.:3:59,18:.:-1.52:0.999:. ./.:4:146,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:115,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:76,54:.:-0.38:1.000:. ./.:4:86,58:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,24:.:-0.55:1.000:. ./.:4:105,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:76,52:.:-0.42:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:90,52:.:-0.12:1.000:. ./.:4:40,36:.:-1.54:1.000:. ./.:4:56,52:.:-0.85:1.000:. ./.:4:69,26:.:-1.13:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:105,17:.:-0.55:1.000:. ./.:4:87,70:.: 0.20:1.000:. ./.:4:156,37:.: 0.98:1.000:. ./.:4:158,34:.: 0.96:1.000:. ./.:4:62,48:.:-0.81:1.000:. ./.:4:183,45:.: 1.73:1.000:. ./.:4:105,27:.:-0.33:0.999:. ./.:4:114,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,54:.:-0.21:0.993:. ./.:4:85,77:.: 0.31:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:110,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:97,27:.:-0.51:1.000:. ./.:4:92,14:.:-0.89:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:114,23:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,30:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,79:.: 0.53:1.000:. ./.:4:91,50:.:-0.14:1.000:. ./.:4:122,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:66,45:.:-0.79:1.000:. ./.:4:65,28:.:-1.17:1.000:. ./.:4:72,15:.:-1.30:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:104,24:.:-0.42:1.000:. ./.:4:117,36:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,45:.:-1.13:1.000:. ./.:4:122,36:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,60:.:-0.25:1.000:. ./.:4:269,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:86,77:.: 0.33:1.000:. ./.:4:98,17:.:-0.70:1.000:. ./.:4:58,45:.:-0.96:1.000:. ./.:4:104,26:.:-0.38:1.000:. ./.:4:121,28:.: 0.03:1.000:. ./.:4:113,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:47,24:.:-1.65:1.000:. ./.:4:121,81:.: 1.17:1.000:. ./.:4:176,46:.: 1.60:1.000:. ./.:4:140,34:.: 0.57:1.000:. ./.:4:99,64:.: 0.33:1.000:. ./.:4:118,79:.: 1.07:1.000:. ./.:4:125,29:.: 0.14:1.000:. ./.:4:156,31:.: 0.85:1.000:. ./.:4:202,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:128,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:216,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:121,31:.: 0.10:0.998:. ./.:4:92,83:.: 0.59:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:116,22:.:-0.21:1.000:. ./.:4:103,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:219,60:.: 2.83:1.000:. ./.:4:151,37:.: 0.87:1.000:. ./.:4:122,21:.:-0.10:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:155,29:.: 0.79:1.000:. ./.:4:124,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:132,25:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,33:.:-0.29:1.000:. ./.:4:149,41:.: 0.91:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:71,52:.:-0.53:1.000:. ./.:4:139,34:.: 0.55:1.000:. ./.:4:89,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:106,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:117,55:.: 0.53:1.000:. ./.:4:106,76:.: 0.74:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:119,88:.: 1.28:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:151,42:.: 0.98:1.000:. -chr2.1 56309720 chr2.1_056309720 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:31,7:0.19:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.53:-1.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,24:0.40: 1.73:1.000:0.799 0/0/1/1:4:23,18:0.47:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:50,7:0.13: 1.16:1.000:0.915 0/0/1/1:4:27,23:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,9:0.40:-1.55:1.000:0.799 0/0/1/1:4:25,29:0.54: 0.91:1.000:0.990 0/0/0/1:4:38,13:0.26: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,4:0.48:-2.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:2,1:0.35:-3.27:1.000:0.762 0/0/1/1:4:11,29:0.62:-0.24:1.000:0.539 0/0/0/1:4:45,10:0.19: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.47:-0.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:28,13:0.33:-0.16:1.000:0.900 0/0/0/1:4:26,8:0.24:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,33:0.54: 1.40:0.998:0.987 0/0/1/1:4:18,48:0.62: 1.90:1.000:0.525 0/0/1/1:4:33,29:0.50: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,27:0.58: 0.01:1.000:0.925 0/0/1/1:4:6,5:0.49:-2.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,20:0.42: 0.67:1.000:0.916 0/0/1/1:4:33,22:0.43: 0.99:1.000:0.945 0/0/1/1:4:26,21:0.48: 0.34:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:35,18:0.36: 0.83:1.000:0.684 0/0/1/1:4:14,28:0.60:-0.07:1.000:0.829 0/0/0/1:4:39,18:0.33: 1.16:1.000:0.907 0/0/0/1:4:40,14:0.27: 0.91:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,11:0.21: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,23:0.45: 0.99:1.000:0.980 0/0/1/1:4:27,27:0.52: 0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-2.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-2.45:1.000:0.997 1/1/1:3:0,7:1.00:-2.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,20:0.44: 0.50:1.000:0.965 0/0/1/1:4:22,32:0.56: 0.91:1.000:0.966 0/0/1/1:4:20,15:0.46:-0.65:1.000:0.989 0/0/0/1:4:37,5:0.13:-0.07:1.000:0.877 0/0/1/1:4:14,18:0.55:-0.89:1.000:0.983 0/0/1/1:4:27,15:0.38:-0.07:1.000:0.575 0/0/0/1:4:26,6:0.19:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,11:0.29:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:31,11:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,14:0.27: 0.91:1.000:0.998 0/0/0/1:4:37,12:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,31:0.55: 0.99:1.000:0.982 0/0/1/1:4:2,4:0.60:-3.03:1.000:0.829 0/0/1/1:4:17,18:0.52:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:12,6:0.35:-2.04:1.000:0.762 0/0/1/1:4:16,16:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,18:0.45: 0.01:1.000:0.981 0/0/1/1:4:20,18:0.51:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,14:0.29: 0.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:46,14:0.24: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,27:0.56: 0.26:1.000:0.970 0/0/0/1:4:37,14:0.29: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,18:0.51:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,11:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:26,11:0.31:-0.48:1.000:0.904 0/0/0/1:4:33,9:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,21:0.39: 1.24:1.000:0.646 0/0/0/1:4:41,14:0.26: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:28,9:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,16:0.27: 1.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:41,9:0.19: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-1.06:1.000:0.981 0/0/1/1:4:22,23:0.52: 0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:45,6:0.13: 0.67:0.777:0.859 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,15:0.32: 0.50:1.000:0.948 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-2.04:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,17:0.48:-0.40:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,48:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,20:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,17:0.48:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,10:0.19: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,20:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,24:0.58:-0.40:0.608:0.918 0/0/0/1:4:36,10:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,18:0.25: 2.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,21:0.41: 0.99:1.000:0.856 0/0/1/1:4:16,20:0.54:-0.57:0.825:0.985 0/0/1/1:4:21,19:0.51:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,6:0.20:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,13:0.42:-0.81:1.000:0.924 0/0/1/1:4:25,20:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,30:0.52: 1.32:1.000:0.995 0/0/1:3:29,11:0.29:-0.24:0.999:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.47:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:22,19:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,7:0.22:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,13:0.26: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,17:0.48:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,21:0.53:-0.24:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,9:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,16:0.47:-0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:26,13:0.35:-0.32:1.000:0.762 0/0/0/1:4:32,14:0.32: 0.26:1.000:0.954 0/0/0/1:4:33,8:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,10:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,26:0.55: 0.17:1.000:0.976 0/0/1/1:4:21,16:0.47:-0.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,23:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:33,8:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,21:0.49: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,27:0.55: 0.34:1.000:0.977 0/0/0/1:4:26,7:0.22:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.45:-0.16:1.000:0.976 0/0/1/1:4:20,19:0.51:-0.32:0.999:0.996 0/0/0/1:4:35,14:0.30: 0.50:1.000:0.986 0/0/0/1:4:16,4:0.21:-1.88:0.993:1.000 0/0/0/1:4:40,15:0.28: 0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,11:0.29:-0.32:1.000:0.989 0/0/0/1:4:22,4:0.16:-1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,11:0.28:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,10:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,15:0.39:-0.16:1.000:0.696 0/0/1/1:4:28,21:0.46: 0.50:1.000:0.989 0/0/1/1:4:24,16:0.43:-0.24:1.000:0.945 0/0/0/1:4:48,12:0.21: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,10:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,10:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,5:0.13:-0.07:1.000:0.877 0/0/1/1:4:24,21:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,16:0.41:-0.07:1.000:0.850 0/0/1/1:4:23,15:0.42:-0.40:1.000:0.927 0/0/0/1:4:31,13:0.31: 0.09:1.000:0.974 0/0/1/1:4:34,20:0.40: 0.91:1.000:0.750 0/0/0/1:4:22,9:0.30:-0.98:1.000:0.981 0/0/1/1:4:7,18:0.62:-1.47:1.000:0.569 0/0/0/1:4:29,6:0.18:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,25:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,11:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,13:0.38:-0.57:1.000:0.633 0/0/0/1:4:44,7:0.14: 0.67:1.000:0.980 0/0/0/1:4:20,10:0.35:-1.06:1.000:0.762 0/0/0/1:4:30,14:0.34: 0.09:1.000:0.893 0/0/0/1:4:24,12:0.35:-0.57:1.000:0.762 0/0/1/1:4:33,24:0.45: 1.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:27,4:0.14:-0.98:1.000:0.955 0/0/0/1:4:45,10:0.19: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,26:0.44: 1.73:1.000:0.961 0/0/0/1:4:36,17:0.34: 0.83:1.000:0.877 0/0/0/1:4:41,9:0.19: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,4:0.11:-0.32:1.000:0.503 0/0/1/1:4:14,16:0.53:-1.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:26,28:0.53: 0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:20,21:0.52:-0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,5:0.54:-2.78:1.000:0.985 0/0/1/1:4:29,18:0.41: 0.34:1.000:0.864 0/0/0/1:4:31,15:0.34: 0.26:1.000:0.835 0/0/1/1:4:28,23:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,22:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,24:0.57:-0.32:1.000:0.943 0/0/1/1:4:14,15:0.53:-1.14:0.998:0.994 0/0/0/1:4:37,15:0.30: 0.75:1.000:0.983 0/0/0/1:4:27,10:0.28:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,25:0.52: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,16:0.38: 0.17:1.000:0.551 0/0/1/1:4:33,25:0.47: 1.24:1.000:0.990 0/0/0/1:4:20,3:0.14:-1.63:1.000:0.961 0/0/0/1:4:30,15:0.35: 0.17:1.000:0.762 0/0/0/1:4:42,7:0.15: 0.50:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.07:0.999:1.000 0/0/1/1:4:33,19:0.39: 0.75:1.000:0.690 0/0/0/1:4:26,11:0.31:-0.48:1.000:0.970 0/0/0/1:4:36,13:0.28: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,6:0.13: 0.42:1.000:0.932 0/0/0/1:4:29,11:0.29:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,18:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,11:0.52:-1.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,7:0.21:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,30:0.56: 0.67:1.000:0.969 0/0/0/1:4:30,12:0.30:-0.07:1.000:0.986 0/0/0/1:4:53,12:0.19: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,15:0.35: 0.17:1.000:0.762 0/0/0/1:4:37,11:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,25:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,13:0.23: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,35:0.59: 0.83:1.000:0.849 -chr2.1 56400517 chr2.1_056400517 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:0.998:. ./.:4:61,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.08:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.90:0.995:. ./.:4:65,0:.: 1.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:6:19,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,1:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.67:0.593:. ./.:4:36,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:0.825:. ./.:4:33,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:123,0:.: 4.36:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.05:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.95:0.999:. ./.:4:31,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.36:1.000:. -chr2.1 56640940 chr2.1_056640940 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.32:0.998:. ./.:4:44,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:74,0:.: 3.13:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.46:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.67:0.995:. ./.:4:45,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:6:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.43:0.777:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.98:0.593:. ./.:4:9,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.01:0.825:. ./.:4:41,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.08:1.000:. ./.:3:23,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:22,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:29,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:0.993:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:0.998:. ./.:4:47,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.49:0.999:. ./.:4:61,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.12:1.000:. -chr2.1 56859414 chr2.1_056859414 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:280,83:.:-0.22:1.000:. ./.:4:254,69:.:-0.82:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:316,113:.: 0.77:1.000:. ./.:4:442,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:297,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:276,89:.:-0.19:1.000:. ./.:4:193,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:179,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:266,92:.:-0.29:1.000:. ./.:4:255,91:.:-0.47:1.000:. ./.:4:376,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:293,92:.: 0.11:1.000:. ./.:4:296,107:.: 0.38:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.44:0.998:. ./.:4:290,90:.: 0.04:1.000:. ./.:4:577,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:178,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:129,0:.:-3.72:1.000:. ./.:4:331,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:255,86:.:-0.55:1.000:. ./.:4:355,125:.: 1.53:1.000:. ./.:4:350,87:.: 0.89:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:117,0:.:-3.90:1.000:. ./.:4:214,2:.:-2.42:1.000:. ./.:3:105,0:.:-4.08:0.995:. ./.:4:438,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:379,109:.: 1.65:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:309,84:.: 0.23:1.000:. ./.:4:307,91:.: 0.31:1.000:. ./.:4:304,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:305,101:.: 0.43:1.000:. ./.:4:327,76:.: 0.38:1.000:. ./.:4:471,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:269,97:.:-0.17:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:255,108:.:-0.22:1.000:. ./.:4:273,95:.:-0.14:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:297,81:.: 0.01:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:295,81:.:-0.02:1.000:. ./.:6:271,58:.:-0.73:1.000:. ./.:4:276,87:.:-0.22:1.000:. ./.:4:320,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:341,119:.: 1.23:1.000:. ./.:4:298,112:.: 0.49:1.000:. ./.:4:313,95:.: 0.46:1.000:. ./.:4:308,78:.: 0.13:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:303,97:.: 0.34:0.777:. ./.:4:320,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:316,113:.: 0.77:1.000:. ./.:4:294,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:349,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:303,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:337,96:.: 0.83:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:270,71:.:-0.55:0.593:. ./.:4:292,106:.: 0.31:1.000:. ./.:4:341,109:.: 1.08:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.52:0.825:. ./.:4:451,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:212,79:.:-1.30:1.000:. ./.:4:376,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.08:1.000:. ./.:3:261,0:.:-1.75:0.999:. ./.:4:364,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:208,70:.:-1.49:1.000:. ./.:4:304,108:.: 0.52:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:333,108:.: 0.95:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:311,85:.: 0.28:1.000:. ./.:4:197,65:.:-1.73:1.000:. ./.:4:321,90:.: 0.50:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:310,100:.: 0.49:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:302,93:.: 0.26:1.000:. ./.:4:523,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.20:0.999:. ./.:4:317,83:.: 0.34:1.000:. ./.:4:212,78:.:-1.31:0.993:. ./.:4:316,74:.: 0.19:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:305,93:.: 0.31:1.000:. ./.:4:305,80:.: 0.11:1.000:. ./.:4:243,87:.:-0.71:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:331,109:.: 0.94:1.000:. ./.:4:280,92:.:-0.08:1.000:. ./.:4:313,93:.: 0.43:1.000:. ./.:4:284,83:.:-0.16:1.000:. ./.:4:190,184:.:-0.05:1.000:. ./.:4:246,67:.:-0.97:1.000:. ./.:4:335,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:320,84:.: 0.40:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:208,62:.:-1.61:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:253,85:.:-0.59:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:328,118:.: 1.03:1.000:. ./.:4:245,129:.:-0.05:1.000:. ./.:4:251,82:.:-0.67:1.000:. ./.:4:284,74:.:-0.29:1.000:. ./.:4:306,117:.: 0.68:1.000:. ./.:4:283,94:.:-0.01:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:252,71:.:-0.82:1.000:. ./.:4:295,114:.: 0.47:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:277,86:.:-0.22:1.000:. ./.:4:268,77:.:-0.49:1.000:. ./.:4:302,100:.: 0.37:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:192,1:.:-2.77:1.000:. ./.:4:344,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:339,107:.: 1.03:1.000:. ./.:4:416,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:430,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.34:0.998:. ./.:4:330,94:.: 0.70:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:261,82:.:-0.52:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:249,93:.:-0.53:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.68:0.999:. ./.:4:396,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:234,83:.:-0.91:1.000:. ./.:4:256,97:.:-0.37:1.000:. ./.:4:372,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:234,76:.:-1.01:1.000:. ./.:4:479,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:330,107:.: 0.89:1.000:. ./.:4:304,113:.: 0.59:1.000:. ./.:4:289,80:.:-0.13:1.000:. ./.:4:322,101:.: 0.68:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:360,106:.: 1.32:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:295,95:.: 0.19:1.000:. -chr2.1 57453849 chr2.1_057453849 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:18,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:9,6:.:-1.38:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.66:1.000:. ./.:4:28,13:.: 0.71:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.02:1.000:. ./.:4:19,12:.:-0.10:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.35:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,13:.: 0.47:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:27,7:.: 0.14:1.000:. ./.:4:13,24:.: 0.39:0.998:. ./.:4:32,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:23,19:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,15:.:-0.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:41,19:.: 2.24:1.000:. ./.:4:17,5:.:-0.82:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:30,18:.: 1.27:1.000:. ./.:4:38,13:.: 1.51:1.000:. ./.:4:53,20:.: 3.28:1.000:. ./.:4:16,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.35:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.11:0.995:. ./.:4:17,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:27,19:.: 1.11:1.000:. ./.:4:35,15:.: 1.43:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,3:.: 1.43:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,19:.: 2.48:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,14:.: 1.67:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:16,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.63:1.000:. ./.:4:17,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:10,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:16,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.14:1.000:. ./.:4:29,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:54,3:.: 2.00:1.000:. ./.:4:28,17:.: 1.03:1.000:. ./.:6:19,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:37,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.06:1.000:. ./.:4:35,12:.: 1.19:1.000:. ./.:4:27,20:.: 1.19:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,4:.: 1.27:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.34:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.22:0.777:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:53,8:.: 2.32:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.14:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:16,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,15:.:-0.34:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:40,13:.: 1.67:1.000:. ./.:4:26,18:.: 0.95:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.22:0.593:. ./.:4:11,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:10,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.55:0.825:. ./.:4:47,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:16,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:25,17:.: 0.79:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.10:1.000:. ./.:3:19,10:.:-0.26:0.999:. ./.:4:13,11:.:-0.66:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:42,6:.: 1.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.31:1.000:. ./.:4:11,14:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:40,12:.: 1.59:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:24,11:.: 0.22:1.000:. ./.:4:8,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:19,15:.: 0.14:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:28,10:.: 0.47:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:42,2:.: 0.95:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.74:0.993:. ./.:4:28,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:22,28:.: 1.43:1.000:. ./.:4:30,4:.: 0.14:1.000:. ./.:4:19,12:.:-0.10:1.000:. ./.:4:12,7:.:-1.06:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.58:1.000:. ./.:4:26,9:.: 0.22:1.000:. ./.:4:45,4:.: 1.35:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.74:1.000:. ./.:4:37,4:.: 0.71:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.66:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.98:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.38:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.58:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:16,15:.:-0.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:23,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:31,15:.: 1.11:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:24,15:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,2:.:-2.03:1.000:. ./.:4:15,4:.:-1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:37,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:16,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.90:0.998:. ./.:4:40,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,17:.: 0.31:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,5:.: 0.31:1.000:. ./.:4:40,10:.: 1.43:1.000:. ./.:4:12,4:.:-1.30:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:55,10:.: 2.64:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:24,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:35,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:19,10:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,14:.: 0.55:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:39,9:.: 1.27:1.000:. ./.:4:20,11:.:-0.10:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.26:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:39,11:.: 1.43:1.000:. ./.:4:33,11:.: 0.95:1.000:. ./.:4:38,5:.: 0.87:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.98:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.47:1.000:. -chr2.1 57595958 chr2.1_057595958 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:249,91:.:-0.92:1.000:. ./.:4:221,295:.: 0.34:1.000:. ./.:4:295,183:.: 0.07:1.000:. ./.:4:303,179:.: 0.10:1.000:. ./.:4:495,243:.: 1.93:1.000:. ./.:4:446,118:.: 0.69:1.000:. ./.:4:270,181:.:-0.12:1.000:. ./.:4:226,185:.:-0.41:1.000:. ./.:4:279,85:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,34:.:-2.50:1.000:. ./.:4:55,51:.:-2.60:1.000:. ./.:4:363,270:.: 1.18:1.000:. ./.:4:221,256:.: 0.06:1.000:. ./.:4:522,92:.: 1.04:1.000:. ./.:4:231,187:.:-0.36:1.000:. ./.:4:369,170:.: 0.51:1.000:. ./.:4:282,204:.: 0.13:0.998:. ./.:4:275,531:.: 2.42:1.000:. ./.:4:447,273:.: 1.80:1.000:. ./.:4:455,224:.: 1.51:1.000:. ./.:4:68,36:.:-2.61:1.000:. ./.:4:340,179:.: 0.36:1.000:. ./.:4:279,191:.: 0.01:1.000:. ./.:4:369,65:.:-0.25:1.000:. ./.:4:43,77:.:-2.50:1.000:. ./.:4:190,346:.: 0.48:1.000:. ./.:4:236,182:.:-0.36:1.000:. ./.:4:375,201:.: 0.77:1.000:. ./.:4:328,111:.:-0.21:1.000:. ./.:4:415,177:.: 0.89:1.000:. ./.:4:365,187:.: 0.60:1.000:. ./.:4:346,84:.:-0.28:1.000:. ./.:4:34,4:.:-3.09:1.000:. ./.:4:127,63:.:-2.00:1.000:. ./.:3:35,23:.:-2.94:0.995:. ./.:4:285,203:.: 0.14:1.000:. ./.:4:225,206:.:-0.27:1.000:. ./.:4:412,184:.: 0.91:1.000:. ./.:4:311,119:.:-0.28:1.000:. ./.:4:398,322:.: 1.80:1.000:. ./.:4:195,66:.:-1.49:1.000:. ./.:4:333,193:.: 0.41:1.000:. ./.:4:258,320:.: 0.79:1.000:. ./.:4:152,242:.:-0.53:1.000:. ./.:4:215,330:.: 0.55:1.000:. ./.:4:215,269:.: 0.11:1.000:. ./.:4:542,139:.: 1.52:1.000:. ./.:4:90,68:.:-2.23:1.000:. ./.:4:298,209:.: 0.28:1.000:. ./.:4:266,187:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,191:.:-0.51:1.000:. ./.:4:454,124:.: 0.79:1.000:. ./.:4:325,86:.:-0.41:1.000:. ./.:4:222,277:.: 0.22:1.000:. ./.:4:149,304:.:-0.11:1.000:. ./.:4:350,122:.: 0.03:1.000:. ./.:4:270,247:.: 0.35:1.000:. ./.:4:288,362:.: 1.30:1.000:. ./.:4:154,266:.:-0.35:1.000:. ./.:6:142,205:.:-0.87:1.000:. ./.:4:152,278:.:-0.28:1.000:. ./.:4:249,198:.:-0.15:1.000:. ./.:4:251,340:.: 0.88:1.000:. ./.:4:166,338:.: 0.26:1.000:. ./.:4:159,265:.:-0.32:1.000:. ./.:4:238,91:.:-1.00:1.000:. ./.:4:257,188:.:-0.17:1.000:. ./.:4:345,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:129,246:.:-0.67:0.777:. ./.:4:250,218:.: 0.00:1.000:. ./.:4:467,371:.: 2.65:1.000:. ./.:4:189,163:.:-0.83:1.000:. ./.:4:315,331:.: 1.27:1.000:. ./.:4:284,185:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,267:.:-0.07:1.000:. ./.:4:191,159:.:-0.85:1.000:. ./.:4:194,201:.:-0.53:1.000:. ./.:4:329,274:.: 0.97:1.000:. ./.:4:343,192:.: 0.48:1.000:. ./.:4:263,108:.:-0.70:1.000:. ./.:4:195,447:.: 1.24:0.593:. ./.:4:277,104:.:-0.63:1.000:. ./.:4:331,99:.:-0.28:1.000:. ./.:4:234,162:.:-0.52:1.000:. ./.:4:336,209:.: 0.55:0.825:. ./.:4:379,303:.: 1.53:1.000:. ./.:4:221,158:.:-0.64:1.000:. ./.:4:278,242:.: 0.37:1.000:. ./.:4:362,94:.:-0.09:1.000:. ./.:4:266,262:.: 0.43:1.000:. ./.:3:106,155:.:-1.49:0.999:. ./.:4:200,175:.:-0.67:1.000:. ./.:4:243,225:.: 0.00:1.000:. ./.:4:144,223:.:-0.73:1.000:. ./.:4:357,108:.:-0.02:1.000:. ./.:4:308,303:.: 1.02:1.000:. ./.:4:359,96:.:-0.10:1.000:. ./.:4:261,265:.: 0.41:1.000:. ./.:4:184,324:.: 0.28:1.000:. ./.:4:331,294:.: 1.12:1.000:. ./.:4:253,137:.:-0.56:1.000:. ./.:4:316,200:.: 0.34:1.000:. ./.:4:210,244:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:115,211:.:-1.02:1.000:. ./.:4:313,103:.:-0.38:1.000:. ./.:4:338,99:.:-0.22:1.000:. ./.:4:257,179:.:-0.23:1.000:. ./.:4:400,221:.: 1.09:1.000:. ./.:4:267,302:.: 0.72:1.000:. ./.:4:288,84:.:-0.69:1.000:. ./.:4:327,243:.: 0.73:1.000:. ./.:4:441,95:.: 0.48:0.999:. ./.:4:253,301:.: 0.61:1.000:. ./.:4:142,209:.:-0.84:0.993:. ./.:4:224,91:.:-1.10:1.000:. ./.:4:274,286:.: 0.66:1.000:. ./.:4:285,172:.:-0.08:1.000:. ./.:4:275,99:.:-0.68:1.000:. ./.:4:238,84:.:-1.05:1.000:. ./.:4:460,107:.: 0.71:1.000:. ./.:4:337,101:.:-0.22:1.000:. ./.:4:315,282:.: 0.92:1.000:. ./.:4:194,273:.:-0.01:1.000:. ./.:4:286,95:.:-0.63:1.000:. ./.:4:169,282:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,174:.:-1.04:1.000:. ./.:4:151,225:.:-0.66:1.000:. ./.:4:209,149:.:-0.79:1.000:. ./.:4:185,208:.:-0.54:1.000:. ./.:4:309,162:.: 0.02:1.000:. ./.:4:238,153:.:-0.55:1.000:. ./.:4:111,208:.:-1.07:1.000:. ./.:4:353,111:.:-0.03:1.000:. ./.:4:379,179:.: 0.64:1.000:. ./.:4:571,124:.: 1.62:1.000:. ./.:4:249,83:.:-0.98:1.000:. ./.:4:198,283:.: 0.09:1.000:. ./.:4:227,160:.:-0.58:1.000:. ./.:4:210,253:.:-0.04:1.000:. ./.:4:360,225:.: 0.84:1.000:. ./.:4:277,201:.: 0.07:1.000:. ./.:4:269,149:.:-0.36:1.000:. ./.:4:116,107:.:-1.76:1.000:. ./.:4:462,225:.: 1.57:1.000:. ./.:4:353,245:.: 0.93:1.000:. ./.:4:412,181:.: 0.89:1.000:. ./.:4:239,253:.: 0.17:1.000:. ./.:4:284,295:.: 0.79:1.000:. ./.:4:378,66:.:-0.17:1.000:. ./.:4:277,197:.: 0.04:1.000:. ./.:4:302,237:.: 0.51:1.000:. ./.:4:46,48:.:-2.68:1.000:. ./.:4:203,118:.:-1.06:1.000:. ./.:4:259,315:.: 0.76:1.000:. ./.:4:415,297:.: 1.75:1.000:. ./.:4:547,114:.: 1.38:1.000:. ./.:4:250,210:.:-0.06:1.000:. ./.:4:376,80:.:-0.09:0.998:. ./.:4:264,205:.: 0.00:1.000:. ./.:4:308,266:.: 0.76:1.000:. ./.:4:233,54:.:-1.30:1.000:. ./.:4:311,168:.: 0.08:1.000:. ./.:4:296,294:.: 0.87:1.000:. ./.:4:294,98:.:-0.55:1.000:. ./.:4:409,124:.: 0.46:1.000:. ./.:4:293,131:.:-0.32:1.000:. ./.:4:309,369:.: 1.50:0.999:. ./.:4:270,240:.: 0.30:1.000:. ./.:4:319,241:.: 0.66:1.000:. ./.:4:126,240:.:-0.73:1.000:. ./.:4:110,217:.:-1.01:1.000:. ./.:4:188,185:.:-0.68:1.000:. ./.:4:217,169:.:-0.59:1.000:. ./.:4:450,100:.: 0.59:1.000:. ./.:4:177,70:.:-1.59:1.000:. ./.:4:431,249:.: 1.52:1.000:. ./.:4:423,244:.: 1.42:1.000:. ./.:4:234,73:.:-1.16:1.000:. ./.:4:287,139:.:-0.30:1.000:. ./.:4:329,178:.: 0.28:1.000:. ./.:4:498,345:.: 2.69:1.000:. ./.:4:198,326:.: 0.40:1.000:. ./.:4:260,166:.:-0.30:1.000:. ./.:4:228,388:.: 1.06:1.000:. -chr2.1 57755046 chr2.1_057755046 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:216,210:0.49: 2.48:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,195:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,100:0.51:-0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,166:0.99:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,111:0.48: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:248,117:0.40: 1.79:1.000:0.812 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,161:0.58: 0.80:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,253:1.00: 0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,18:0.40:-1.69:1.000:0.815 1/1/1/1:4:1,245:1.00: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,192:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,211:0.51: 2.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,180:0.58: 1.16:1.000:0.918 0/0/1/1:4:129,195:0.60: 1.33:0.998:0.751 1/1/1/1:4:0,241:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,58:0.39:-0.09:1.000:0.682 0/0/1/1:4:134,203:0.60: 1.48:1.000:0.745 0/0/1/1:4:11,10:0.48:-2.08:1.000:0.994 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,205:0.63: 1.38:1.000:0.622 0/0/1/1:4:214,98:0.40: 1.20:1.000:0.786 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,143:0.54: 0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:122,172:0.58: 0.99:1.000:0.904 0/0/1/1:4:95,99:0.49:-0.13:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,329:1.00: 1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,192:1.00:-0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,158:0.59: 0.70:1.000:0.874 0/0/1/1:4:13,5:0.38:-2.12:1.000:0.594 0/0/1/1:4:34,23:0.44:-1.68:1.000:0.971 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:73,48:0.44:-0.96:1.000:0.966 0/0/1/1:4:114,150:0.56: 0.65:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,193:0.64: 1.13:1.000:0.712 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,69:0.39: 0.28:1.000:0.713 0/0/1/1:4:143,63:0.40: 0.00:1.000:0.749 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,81:0.41: 0.38:1.000:0.869 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,85:0.48:-0.31:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,183:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,48:0.52:-1.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,106:0.61:-0.36:1.000:0.646 0/0/1/1:4:244,103:0.39: 1.59:1.000:0.704 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,125:0.42: 1.56:1.000:0.926 0/1/1/1:4:82,144:0.65: 0.23:1.000:0.797 0/0/1/1:4:72,97:0.57:-0.42:1.000:0.952 0/0/1/1:4:91,132:0.59: 0.19:1.000:0.856 0/0/1/1:4:111,147:0.56: 0.59:1.000:0.963 0/0/1/1:4:185,107:0.42: 0.97:1.000:0.931 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,136:0.65: 0.09:1.000:0.777 0/0/0/1/1/1:6:133,76:0.42: 0.04:1.000:0.548 0/0/1/1:4:186,95:0.41: 0.85:1.000:0.870 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,144:0.66: 0.19:1.000:0.879 0/0/1/1:4:117,135:0.52: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,178:0.56: 1.20:1.000:0.961 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,91:0.41: 0.69:1.000:0.878 0/1/1/1:4:85,153:0.66: 0.36:0.777:0.855 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,114:0.52: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,110:0.52:-0.02:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,188:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,122:0.56: 0.10:1.000:0.968 0/0/1/1:4:90,111:0.54:-0.05:1.000:0.988 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,146:0.61: 0.38:1.000:0.659 0/0/1/1:4:103,155:0.60: 0.59:1.000:0.765 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-1.41:0.593:1.000 0/1/1/1:4:94,229:0.74: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,187:0.63: 1.06:1.000:0.595 0/0/1/1:4:72,38:0.41:-1.08:1.000:0.890 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-1.08:0.825:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,108:0.55:-0.14:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1:3:65,32:0.41:-1.23:0.999:0.998 0/0/1/1:4:77,98:0.55:-0.35:1.000:0.980 0/0/1/1:4:100,122:0.54: 0.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:144,65:0.40: 0.04:1.000:0.773 0/1/1/1:4:112,234:0.70: 1.58:1.000:0.986 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,60:0.51:-1.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,172:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,88:0.41: 0.67:1.000:0.852 0/0/1/1:4:107,49:0.40:-0.56:1.000:0.786 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,136:0.58: 0.32:1.000:0.924 0/1/1/1:4:55,127:0.73:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,57:0.44:-0.74:1.000:0.974 0/0/1/1:4:64,95:0.60:-0.53:1.000:0.803 0/0/1/1:4:81,117:0.59:-0.09:1.000:0.864 0/0/1/1:4:166,85:0.41: 0.51:1.000:0.872 0/1/1/1:4:111,295:0.76: 2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,125:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,44:0.43:-1.03:1.000:0.956 0/1/1/1:4:68,157:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:255,133:0.41: 2.05:1.000:0.883 0/0/1/1:4:85,79:0.48:-0.47:0.999:0.995 0/0/1/1:4:104,95:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,79:0.49:-0.57:0.993:0.997 0/0/1/1:4:203,197:0.49: 2.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,36:0.37:-0.78:1.000:0.502 0/0/1/1:4:66,71:0.50:-0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,223:1.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,108:0.67:-0.45:1.000:0.912 0/0/0/0:4:189,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,126:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,130:0.66:-0.05:1.000:0.887 0/1/1/1:4:79,149:0.67: 0.25:1.000:0.928 0/1/1/1:4:74,120:0.63:-0.13:1.000:0.512 1/1/1/1:4:0,234:1.00: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,40:0.44:-1.22:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,115:0.41: 1.44:1.000:0.887 0/0/1/1:4:117,72:0.43:-0.19:1.000:0.951 0/0/1/1:4:92,131:0.59: 0.19:1.000:0.889 0/0/1/1:4:91,107:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,125:0.46: 0.84:1.000:0.989 0/0/1/1:4:164,208:0.55: 1.87:1.000:0.981 0/0/1/1:4:55,71:0.55:-0.90:1.000:0.975 0/0/1/1:4:69,105:0.61:-0.36:1.000:0.730 0/0/1/1:4:56,70:0.54:-0.90:1.000:0.985 0/0/1/1:4:88,98:0.51:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,120:0.61:-0.10:1.000:0.647 0/0/1/1:4:96,110:0.52: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,82:0.44: 0.02:1.000:0.964 0/0/1/1:4:120,183:0.61: 1.09:1.000:0.723 0/0/1/1:4:120,99:0.47: 0.15:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,109:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,123:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,169:0.65: 0.65:1.000:0.829 0/0/1/1:4:256,150:0.43: 2.25:1.000:0.936 0/0/1/1:4:91,53:0.43:-0.70:1.000:0.934 0/0/1/1:4:22,16:0.45:-1.89:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,134:0.47: 0.91:1.000:0.993 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,138:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,199:0.59: 1.48:1.000:0.867 0/0/1/1:4:96,88:0.48:-0.25:0.998:0.995 0/0/1/1:4:106,125:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,51:0.40:-0.46:1.000:0.764 1/1/1/1:4:0,123:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,1:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,54:0.44:-0.78:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,291:1.00: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,171:0.63: 0.78:1.000:0.569 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-0.46:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:90,80:0.48:-0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:217,1:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,86:0.48:-0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,139:0.60: 0.28:1.000:0.753 0/0/1/1:4:184,99:0.42: 0.87:1.000:0.900 0/0/1/1:4:187,118:0.43: 1.12:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,266:0.79: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,143:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,128:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,282:0.75: 2.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,183:0.69: 0.77:1.000:0.974 0/0/1/1:4:108,169:0.62: 0.80:1.000:0.631 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,136:0.42: 1.94:1.000:0.920 0/0/1/1:4:90,109:0.53:-0.08:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 0.13:1.000:1.000 -chr2.1 58002281 chr2.1_058002281 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:219,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:138,81:.:-0.03:1.000:. ./.:4:134,63:.:-0.45:1.000:. ./.:4:193,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:190,57:.: 0.49:1.000:. ./.:4:196,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:107,45:.:-1.29:1.000:. ./.:4:154,44:.:-0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:77,29:.:-2.15:1.000:. ./.:4:81,35:.:-1.96:1.000:. ./.:4:182,71:.: 0.60:1.000:. ./.:4:183,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:188,41:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:158,42:.:-0.39:1.000:. ./.:4:223,50:.: 0.98:0.998:. ./.:4:205,152:.: 2.55:1.000:. ./.:4:217,62:.: 1.09:1.000:. ./.:4:207,86:.: 1.35:1.000:. ./.:4:97,25:.:-1.85:1.000:. ./.:4:158,43:.:-0.37:1.000:. ./.:4:205,54:.: 0.71:1.000:. ./.:4:169,37:.:-0.28:1.000:. ./.:4:48,36:.:-2.56:1.000:. ./.:4:177,43:.:-0.02:1.000:. ./.:4:157,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:187,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:207,50:.: 0.68:1.000:. ./.:4:221,56:.: 1.05:1.000:. ./.:4:150,24:.:-0.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:86,23:.:-2.09:1.000:. ./.:3:33,5:.:-3.42:0.995:. ./.:4:195,40:.: 0.27:1.000:. ./.:4:172,44:.:-0.09:1.000:. ./.:4:155,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:217,131:.: 2.38:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:170,48:.:-0.05:1.000:. ./.:4:217,63:.: 1.11:1.000:. ./.:4:180,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:217,64:.: 1.13:1.000:. ./.:4:211,41:.: 0.58:1.000:. ./.:4:216,60:.: 1.03:1.000:. ./.:4:20,6:.:-3.64:1.000:. ./.:4:184,77:.: 0.75:1.000:. ./.:4:161,33:.:-0.50:1.000:. ./.:4:181,52:.: 0.23:1.000:. ./.:4:219,62:.: 1.13:1.000:. ./.:4:168,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:205,51:.: 0.66:1.000:. ./.:4:173,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:194,50:.: 0.43:1.000:. ./.:4:165,90:.: 0.64:1.000:. ./.:4:209,107:.: 1.78:1.000:. ./.:4:178,40:.:-0.05:1.000:. ./.:6:185,45:.: 0.17:1.000:. ./.:4:188,45:.: 0.23:1.000:. ./.:4:167,39:.:-0.28:1.000:. ./.:4:235,41:.: 1.03:1.000:. ./.:4:196,57:.: 0.60:1.000:. ./.:4:208,52:.: 0.73:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:135,66:.:-0.37:1.000:. ./.:4:166,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:184,41:.: 0.08:0.777:. ./.:4:185,78:.: 0.79:1.000:. ./.:4:203,108:.: 1.69:1.000:. ./.:4:119,27:.:-1.40:1.000:. ./.:4:229,93:.: 1.89:1.000:. ./.:4:176,61:.: 0.30:1.000:. ./.:4:177,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:153,41:.:-0.50:1.000:. ./.:4:184,32:.:-0.09:1.000:. ./.:4:208,97:.: 1.57:1.000:. ./.:4:193,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:158,163:.: 1.87:0.593:. ./.:4:207,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:179,31:.:-0.20:1.000:. ./.:4:178,48:.: 0.10:0.825:. ./.:4:197,106:.: 1.54:1.000:. ./.:4:120,26:.:-1.40:1.000:. ./.:4:152,92:.: 0.43:1.000:. ./.:4:153,36:.:-0.60:1.000:. ./.:4:160,81:.: 0.38:1.000:. ./.:3:120,27:.:-1.38:0.999:. ./.:4:190,47:.: 0.30:1.000:. ./.:4:196,38:.: 0.25:1.000:. ./.:4:123,28:.:-1.31:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:178,95:.: 0.98:1.000:. ./.:4:174,44:.:-0.05:1.000:. ./.:4:165,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:211,49:.: 0.73:1.000:. ./.:4:217,106:.: 1.91:1.000:. ./.:4:137,42:.:-0.78:1.000:. ./.:4:180,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:133,55:.:-0.61:1.000:. ./.:4:194,45:.: 0.34:1.000:. ./.:4:171,36:.:-0.26:1.000:. ./.:4:197,45:.: 0.40:1.000:. ./.:4:157,35:.:-0.54:1.000:. ./.:4:189,54:.: 0.41:1.000:. ./.:4:243,59:.: 1.52:1.000:. ./.:4:197,88:.: 1.20:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:232,59:.: 1.31:1.000:. ./.:4:220,40:.: 0.73:0.999:. ./.:4:185,45:.: 0.17:1.000:. ./.:4:121,31:.:-1.29:0.993:. ./.:4:167,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:161,59:.:-0.02:1.000:. ./.:4:176,50:.: 0.10:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:143,1:.:-1.44:1.000:. ./.:4:184,44:.: 0.13:1.000:. ./.:4:172,45:.:-0.07:1.000:. ./.:4:190,67:.: 0.68:1.000:. ./.:4:161,50:.:-0.18:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:214,42:.: 0.66:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:156,45:.:-0.37:1.000:. ./.:4:133,22:.:-1.23:1.000:. ./.:4:157,69:.: 0.10:1.000:. ./.:4:204,43:.: 0.49:1.000:. ./.:4:176,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,25:.:-1.89:1.000:. ./.:4:188,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:167,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:197,45:.: 0.40:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:190,51:.: 0.38:1.000:. ./.:4:159,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:180,33:.:-0.15:1.000:. ./.:4:188,45:.: 0.23:1.000:. ./.:4:183,47:.: 0.17:1.000:. ./.:4:172,38:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:237,55:.: 1.33:1.000:. ./.:4:221,57:.: 1.07:1.000:. ./.:4:203,54:.: 0.68:1.000:. ./.:4:229,52:.: 1.13:1.000:. ./.:4:222,46:.: 0.88:1.000:. ./.:4:141,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:206,54:.: 0.73:1.000:. ./.:4:166,91:.: 0.68:1.000:. ./.:4:87,29:.:-1.96:1.000:. ./.:4:143,48:.:-0.56:1.000:. ./.:4:200,49:.: 0.53:1.000:. ./.:4:181,93:.: 0.99:1.000:. ./.:4:233,51:.: 1.18:1.000:. ./.:4:193,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:184,35:.:-0.03:0.998:. ./.:4:218,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:163,86:.: 0.53:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:149,37:.:-0.65:1.000:. ./.:4:145,87:.: 0.21:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:186,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:144,28:.:-0.91:1.000:. ./.:4:166,89:.: 0.64:0.999:. ./.:4:192,86:.: 1.07:1.000:. ./.:4:196,84:.: 1.11:1.000:. ./.:4:155,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:138,43:.:-0.75:1.000:. ./.:4:160,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:191,44:.: 0.27:1.000:. ./.:4:156,35:.:-0.56:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:195,57:.: 0.58:1.000:. ./.:4:222,52:.: 0.99:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:191,11:.:-0.35:1.000:. ./.:4:197,45:.: 0.40:1.000:. ./.:4:192,112:.: 1.56:1.000:. ./.:4:209,57:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,34:.:-0.46:1.000:. ./.:4:181,82:.: 0.79:1.000:. -chr2.1 58157464 chr2.1_058157464 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,15:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.56:1.000:. ./.:4:29,87:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.05:1.000:. ./.:4:37,77:.: 1.57:1.000:. ./.:4:25,44:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.19:1.000:. ./.:4:22,52:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.39:1.000:. ./.:4:6,29:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,113:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.22:1.000:. ./.:4:16,65:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.25:0.998:. ./.:4:24,82:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,110:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.94:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.42:1.000:. ./.:4:31,69:.: 1.01:1.000:. ./.:4:17,19:.:-1.51:1.000:. ./.:4:10,34:.:-1.19:1.000:. ./.:4:21,68:.: 0.58:1.000:. ./.:4:22,55:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,70:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,109:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,116:.: 1.64:1.000:. ./.:4:14,55:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.23:1.000:. ./.:3:0,42:.:-1.27:0.995:. ./.:4:0,92:.: 0.70:1.000:. ./.:4:29,73:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.59:1.000:. ./.:4:13,35:.:-1.04:1.000:. ./.:4:21,26:.:-1.07:1.000:. ./.:4:17,37:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,77:.: 0.70:1.000:. ./.:4:13,46:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,37:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,54:.:-0.33:1.000:. ./.:4:20,49:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.54:1.000:. ./.:4:20,57:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,33:.:-1.00:1.000:. ./.:4:27,51:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.21:1.000:. ./.:6:18,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:20,42:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,3:.:-2.26:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:14,69:.: 0.34:0.777:. ./.:4:0,52:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.05:1.000:. ./.:4:21,100:.: 1.84:1.000:. ./.:4:30,74:.: 1.17:1.000:. ./.:4:18,56:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.01:0.593:. ./.:4:0,31:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.30:0.825:. ./.:4:19,98:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,133:.: 2.31:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.66:1.000:. ./.:4:33,77:.: 1.41:1.000:. ./.:3:26,70:.: 0.86:0.999:. ./.:4:0,58:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,58:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,29:.:-1.19:1.000:. ./.:4:16,37:.:-0.84:1.000:. ./.:4:24,62:.: 0.46:1.000:. ./.:4:19,58:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.56:1.000:. ./.:4:24,39:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,120:.: 1.80:1.000:. ./.:4:20,83:.: 1.13:1.000:. ./.:4:21,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:23,85:.: 1.33:1.000:. ./.:4:12,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:18,38:.:-0.72:1.000:. ./.:4:13,33:.:-1.11:1.000:. ./.:4:29,79:.: 1.33:1.000:. ./.:4:22,85:.: 1.29:1.000:. ./.:4:14,23:.:-1.47:1.000:. ./.:4:31,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:20,58:.: 0.15:0.999:. ./.:4:0,70:.:-0.17:1.000:. ./.:4:12,55:.:-0.29:0.993:. ./.:4:28,8:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,118:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.27:1.000:. ./.:4:21,64:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,77:.: 1.01:1.000:. ./.:4:29,77:.: 1.25:1.000:. ./.:4:18,34:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.90:1.000:. ./.:4:18,59:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,133:.: 2.31:1.000:. ./.:4:22,48:.:-0.17:1.000:. ./.:4:17,20:.:-1.47:1.000:. ./.:4:16,41:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,41:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:18,5:.:-2.02:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.52:1.000:. ./.:4:18,48:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:19,29:.:-1.04:1.000:. ./.:4:22,85:.: 1.29:1.000:. ./.:4:15,95:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.46:1.000:. ./.:4:17,68:.: 0.42:1.000:. ./.:4:14,73:.: 0.50:1.000:. ./.:4:22,33:.:-0.76:1.000:. ./.:4:23,33:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.34:1.000:. ./.:4:4,45:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,103:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,56:.: 0.34:0.998:. ./.:4:28,76:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.13:1.000:. ./.:4:18,45:.:-0.44:1.000:. ./.:4:15,93:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:18,57:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,116:.: 1.64:0.999:. ./.:4:21,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:14,59:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.27:1.000:. ./.:4:22,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,25:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,35:.:-0.84:1.000:. ./.:4:26,76:.: 1.09:1.000:. ./.:4:25,103:.: 2.12:1.000:. ./.:4:19,43:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,50:.:-0.52:1.000:. ./.:4:23,63:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,155:.: 3.18:1.000:. ./.:4:29,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.56:1.000:. -chr2.1 58523773 chr2.1_058523773 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:36,59:0.55: 1.03:1.000:0.984 0/0/0/1:4:60,26:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.44: 0.54:1.000:0.963 0/0/0/1:4:84,40:0.28: 2.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,25:0.20: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.29:-1.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:116,24:0.15: 2.61:1.000:0.983 0/0/0/1:4:48,21:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:120,3:0.02: 2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,48:0.57: 0.29:1.000:0.955 0/0/0/1:4:78,33:0.25: 1.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,27:0.20: 1.80:0.998:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.23: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,40:0.27: 2.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:128,22:0.13: 2.96:1.000:0.858 0/0/1/1:4:5,8:0.54:-1.85:1.000:0.987 0/0/0/1:4:48,17:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,30:0.33: 0.47:1.000:0.915 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,17:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,29:0.39:-0.03:1.000:0.728 0/0/0/1:4:67,32:0.28: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,29:0.22: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,4:0.35:-1.96:1.000:0.789 0/0/0/1:4:17,3:0.13:-1.61:1.000:0.893 0/0/0:3:3,0:0.00:-2.20:0.995:1.000 0/0/0/1:4:82,23:0.19: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,43:0.47: 0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:46,19:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,14:0.20:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,43:0.53: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,10:0.38:-1.50:1.000:0.605 0/1/1/1:4:2,35:0.80:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,15:0.37:-1.04:1.000:0.617 0/1/1/1:4:7,25:0.67:-1.18:1.000:0.907 0/0/0/0:4:119,2:0.01: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,9:0.31:-1.43:1.000:0.968 0/0/0/1:4:74,14:0.14: 0.78:1.000:0.951 0/0/1/1:4:19,22:0.48:-0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,13:0.27:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,25:0.26: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,22:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,40:0.73:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,19:0.33:-0.55:1.000:0.913 0/0/0/1:4:68,16:0.16: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,32:0.46:-0.13:1.000:0.987 0/0/0/1:4:47,21:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,46:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:15,16:0.46:-1.22:1.000:0.790 0/1/1/1:4:9,29:0.65:-0.97:1.000:0.819 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,18:0.28:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,27:0.48:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,38:0.41: 0.57:1.000:0.861 0/0/1/1:4:33,32:0.44:-0.03:1.000:0.961 0/0/0/1:4:39,10:0.17:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,9:0.11: 0.08:1.000:0.584 0/0/0/1:4:28,18:0.34:-0.69:0.777:0.854 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,34:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,11:0.21:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,14:0.19:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,17:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,27:0.21: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,14:0.21:-0.34:0.593:1.000 0/0/0/1:4:62,30:0.28: 0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,40:0.47: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:54,15:0.19: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,16:0.37:-0.97:0.825:0.564 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,20:0.29:-0.20:1.000:0.993 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,19:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/0/0:3:26,0:0.00:-1.39:0.999:1.000 0/0/0/1:4:58,15:0.18: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,35:0.76:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,16:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,16:0.29:-0.66:1.000:0.989 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,26:0.62:-1.04:1.000:0.541 0/0/0/1:4:45,21:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,11:0.29:-1.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:52,31:0.33: 0.61:1.000:0.937 0/0/0/1:4:23,8:0.22:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,19:0.31:-0.45:1.000:0.971 0/0/0/1:4:22,7:0.21:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,14:0.13: 0.96:1.000:0.898 0/0/0/1:4:36,14:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,27:0.21: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,10:0.34:-1.39:1.000:0.892 0/0/0/1:4:55,32:0.32: 0.75:1.000:0.953 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.01:0.999:1.000 0/1/1/1:4:8,46:0.72:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,13:0.59:-1.64:0.993:0.842 0/0/1/1:4:29,37:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,17:0.30:-0.59:1.000:0.984 0/0/1/1:4:28,26:0.43:-0.41:1.000:0.936 0/0/0/1:4:52,20:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.21:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,17:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,27:0.56:-0.83:1.000:0.963 0/0/0/1:4:26,16:0.33:-0.83:1.000:0.909 0/0/1/1:4:31,34:0.47:-0.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:32,18:0.31:-0.55:1.000:0.968 0/0/0/1:4:46,29:0.34: 0.33:1.000:0.882 0/0/0/0:4:41,4:0.08:-0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:35,8:0.16:-0.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,14:0.19:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,30:0.30: 0.71:1.000:0.983 0/0/1/1:4:6,9:0.53:-1.78:1.000:0.992 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.29:-0.55:1.000:0.989 0/0/0/1:4:78,28:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,35:0.53:-0.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:7,17:0.61:-1.47:1.000:0.672 0/0/0/1:4:44,9:0.15:-0.45:1.000:0.980 0/1/1/1:4:2,25:0.78:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,22:0.44:-0.76:1.000:0.972 0/0/0/1:4:37,21:0.32:-0.27:1.000:0.965 0/0/0/1:4:37,23:0.33:-0.20:1.000:0.899 0/1/1/1:4:4,12:0.64:-1.75:1.000:0.724 0/0/0/1:4:56,31:0.31: 0.75:1.000:0.974 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,32:0.36: 0.47:1.000:0.743 0/0/1/1:4:14,27:0.57:-0.87:1.000:0.935 0/0/1/1:4:16,26:0.54:-0.83:1.000:0.985 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,48:0.48: 0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,22:0.17: 1.70:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,41:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,29:0.30: 0.61:1.000:0.982 0/0/0/1:4:70,32:0.27: 1.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,25:0.21: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.54:0.998:1.000 0/0/1/1:4:18,20:0.47:-0.97:1.000:0.992 0/0/0/1:4:77,30:0.24: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,25:0.33: 0.05:1.000:0.938 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,18:0.14: 1.52:1.000:0.971 0/0/0/0:4:93,1:0.01: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,27:0.23: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.64:0.999:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,25:0.35:-0.13:1.000:0.760 0/1/1/1:4:5,41:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,48:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,19:0.31:-0.45:1.000:0.971 0/0/0/1:4:32,22:0.36:-0.41:1.000:0.720 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,21:0.22: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,28:0.35: 0.19:1.000:0.833 0/0/0/1:4:74,28:0.23: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,23:0.28: 0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:80,22:0.18: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,74:0.71: 0.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,27:0.28: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,22:0.19: 1.10:1.000:1.000 -chr2.1 58592683 chr2.1_058592683 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:26,13:.:-0.10:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,9:.: 0.65:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.91:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.35:1.000:. ./.:4:20,13:.:-0.47:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.03:0.998:. ./.:4:36,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:13,10:.:-1.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:11,10:.:-1.22:1.000:. ./.:4:45,11:.: 0.96:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:3:18,0:.:-1.40:0.995:. ./.:4:22,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:22,20:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:23,11:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,20:.: 1.46:1.000:. ./.:4:35,13:.: 0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:10,5:.:-1.59:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:49,12:.: 1.27:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:31,14:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:32,15:.: 0.40:1.000:. ./.:6:36,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,13:.: 0.77:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:49,19:.: 1.71:1.000:. ./.:4:36,6:.: 0.09:1.000:. ./.:4:32,11:.: 0.15:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:35,20:.: 0.90:0.578:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:50,18:.: 1.71:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:41,20:.: 1.27:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,18:.: 0.96:0.593:. ./.:4:50,34:.: 2.70:1.000:. ./.:4:82,16:.: 3.58:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.15:0.825:. ./.:4:55,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./.:3:37,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:40,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:15,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:60,22:.: 2.58:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:44,26:.: 1.83:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:35,12:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,15:.: 2.14:1.000:. ./.:4:77,29:.: 4.07:1.000:. ./.:4:22,14:.:-0.28:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:55,26:.: 2.52:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:82,0:.: 2.58:0.999:. ./.:4:35,24:.: 1.15:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.28:0.993:. ./.:4:45,21:.: 1.58:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:31,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:56,15:.: 1.89:1.000:. ./.:4:52,20:.: 1.96:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:50,14:.: 1.46:1.000:. ./.:4:38,17:.: 0.90:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.04:1.000:. ./.:4:14,35:.: 0.52:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:33,16:.: 0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,9:.:-0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:45,17:.: 1.33:1.000:. ./.:4:36,21:.: 1.02:1.000:. ./.:4:34,16:.: 0.59:1.000:. ./.:4:28,10:.:-0.16:1.000:. ./.:4:44,16:.: 1.21:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,7:.: 0.34:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:23,12:.:-0.35:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,14:.:-0.28:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.15:0.998:. ./.:4:31,12:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.09:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:15,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.91:1.000:. ./.:4:27,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,7:.:-0.28:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.72:1.000:. -chr2.1 58853678 chr2.1_058853678 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:164,256:.: 1.09:1.000:. ./.:4:136,211:.: 0.20:1.000:. ./.:4:161,191:.: 0.26:1.000:. ./.:4:94,265:.: 0.35:1.000:. ./.:4:152,205:.: 0.32:1.000:. ./.:4:158,200:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,130:.:-1.86:1.000:. ./.:4:118,186:.:-0.32:1.000:. ./.:4:72,258:.:-0.01:1.000:. ./.:4:18,67:.:-3.00:1.000:. ./.:4:42,37:.:-3.07:1.000:. ./.:4:154,216:.: 0.48:1.000:. ./.:4:89,209:.:-0.40:1.000:. ./.:4:67,227:.:-0.44:1.000:. ./.:4:121,157:.:-0.64:1.000:. ./.:4:119,217:.: 0.07:1.000:. ./.:4:105,315:.: 1.09:0.998:. ./.:4:144,250:.: 0.78:1.000:. ./.:4:117,308:.: 1.15:1.000:. ./.:4:95,261:.: 0.31:1.000:. ./.:4:23,40:.:-3.26:1.000:. ./.:4:87,243:.:-0.01:1.000:. ./.:4:133,204:.: 0.08:1.000:. ./.:4:109,146:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,25:.:-3.52:1.000:. ./.:4:167,217:.: 0.65:1.000:. ./.:4:113,208:.:-0.11:1.000:. ./.:4:134,175:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,261:.: 0.26:1.000:. ./.:4:98,242:.: 0.12:1.000:. ./.:4:118,292:.: 0.97:1.000:. ./.:4:122,220:.: 0.14:1.000:. ./.:4:18,40:.:-3.33:1.000:. ./.:4:53,69:.:-2.54:1.000:. ./.:3:10,33:.:-3.51:0.995:. ./.:4:96,261:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,208:.: 0.29:1.000:. ./.:4:92,272:.: 0.41:1.000:. ./.:4:126,313:.: 1.33:1.000:. ./.:4:152,241:.: 0.76:1.000:. ./.:4:151,280:.: 1.23:1.000:. ./.:4:157,224:.: 0.62:1.000:. ./.:4:168,207:.: 0.54:1.000:. ./.:4:138,220:.: 0.34:1.000:. ./.:4:128,303:.: 1.23:1.000:. ./.:4:96,259:.: 0.30:1.000:. ./.:4:101,263:.: 0.41:1.000:. ./.:4:9,8:.:-3.83:1.000:. ./.:4:92,277:.: 0.47:1.000:. ./.:4:168,198:.: 0.43:1.000:. ./.:4:141,194:.: 0.06:1.000:. ./.:4:149,273:.: 1.12:1.000:. ./.:4:100,241:.: 0.13:1.000:. ./.:4:111,312:.: 1.13:1.000:. ./.:4:128,209:.: 0.08:1.000:. ./.:4:101,285:.: 0.68:1.000:. ./.:4:114,200:.:-0.20:1.000:. ./.:4:145,198:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,319:.: 1.15:1.000:. ./.:6:113,203:.:-0.18:1.000:. ./.:4:152,217:.: 0.47:1.000:. ./.:4:86,245:.: 0.01:1.000:. ./.:4:121,319:.: 1.34:1.000:. ./.:4:136,275:.: 0.98:1.000:. ./.:4:102,288:.: 0.73:1.000:. ./.:4:149,232:.: 0.62:1.000:. ./.:4:58,171:.:-1.24:1.000:. ./.:4:120,197:.:-0.16:1.000:. ./.:4:143,242:.: 0.67:0.578:. ./.:4:174,249:.: 1.13:1.000:. ./.:4:97,269:.: 0.43:1.000:. ./.:4:62,109:.:-1.95:1.000:. ./.:4:220,251:.: 1.72:1.000:. ./.:4:116,263:.: 0.59:1.000:. ./.:4:174,218:.: 0.75:1.000:. ./.:4:96,232:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,238:.: 0.02:1.000:. ./.:4:126,232:.: 0.34:1.000:. ./.:4:171,307:.: 1.80:1.000:. ./.:4:169,278:.: 1.42:1.000:. ./.:4:173,219:.: 0.75:0.593:. ./.:4:106,248:.: 0.29:1.000:. ./.:4:101,284:.: 0.67:1.000:. ./.:4:76,213:.:-0.51:1.000:. ./.:4:125,237:.: 0.39:0.825:. ./.:4:160,228:.: 0.70:1.000:. ./.:4:57,160:.:-1.38:1.000:. ./.:4:88,224:.:-0.22:1.000:. ./.:4:58,206:.:-0.81:1.000:. ./.:4:127,213:.: 0.12:1.000:. ./.:3:86,133:.:-1.36:0.999:. ./.:4:91,266:.: 0.32:1.000:. ./.:4:192,286:.: 1.80:1.000:. ./.:4:102,168:.:-0.74:1.000:. ./.:4:118,205:.:-0.09:1.000:. ./.:4:183,239:.: 1.12:1.000:. ./.:4:116,176:.:-0.47:1.000:. ./.:4:201,263:.: 1.63:1.000:. ./.:4:148,181:.:-0.02:1.000:. ./.:4:81,256:.: 0.08:1.000:. ./.:4:53,105:.:-2.10:1.000:. ./.:4:151,233:.: 0.65:1.000:. ./.:4:122,189:.:-0.24:1.000:. ./.:4:131,201:.: 0.02:1.000:. ./.:4:103,194:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,305:.: 0.76:1.000:. ./.:4:142,191:.: 0.03:1.000:. ./.:4:135,234:.: 0.47:1.000:. ./.:4:140,244:.: 0.65:1.000:. ./.:4:153,225:.: 0.58:1.000:. ./.:4:130,201:.: 0.01:1.000:. ./.:4:177,268:.: 1.40:1.000:. ./.:4:157,210:.: 0.45:0.999:. ./.:4:112,239:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,203:.:-0.18:1.000:. ./.:4:143,188:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,151:.:-1.41:1.000:. ./.:4:80,176:.:-0.91:1.000:. ./.:4:75,208:.:-0.58:1.000:. ./.:4:71,212:.:-0.58:1.000:. ./.:4:109,304:.: 1.01:1.000:. ./.:4:123,219:.: 0.14:1.000:. ./.:4:150,219:.: 0.47:1.000:. ./.:4:123,182:.:-0.31:1.000:. ./.:4:147,183:.:-0.01:1.000:. ./.:4:88,235:.:-0.09:1.000:. ./.:4:133,234:.: 0.45:1.000:. ./.:4:175,243:.: 1.07:1.000:. ./.:4:75,223:.:-0.40:1.000:. ./.:4:76,197:.:-0.70:1.000:. ./.:4:93,241:.: 0.04:1.000:. ./.:4:116,207:.:-0.09:1.000:. ./.:4:92,140:.:-1.20:1.000:. ./.:4:123,220:.: 0.15:1.000:. ./.:4:118,218:.: 0.07:1.000:. ./.:4:113,305:.: 1.07:1.000:. ./.:4:154,248:.: 0.87:1.000:. ./.:4:94,236:.:-0.01:1.000:. ./.:4:146,213:.: 0.35:1.000:. ./.:4:81,286:.: 0.45:1.000:. ./.:4:100,211:.:-0.24:1.000:. ./.:4:97,221:.:-0.15:1.000:. ./.:4:93,229:.:-0.10:1.000:. ./.:4:115,149:.:-0.81:1.000:. ./.:4:142,230:.: 0.51:1.000:. ./.:4:147,207:.: 0.29:1.000:. ./.:4:90,257:.: 0.20:1.000:. ./.:4:126,209:.: 0.06:1.000:. ./.:4:146,242:.: 0.70:1.000:. ./.:4:135,243:.: 0.58:1.000:. ./.:4:149,215:.: 0.41:1.000:. ./.:4:72,255:.:-0.04:1.000:. ./.:4:40,58:.:-2.84:1.000:. ./.:4:59,164:.:-1.31:1.000:. ./.:4:82,256:.: 0.09:1.000:. ./.:4:95,215:.:-0.25:1.000:. ./.:4:80,233:.:-0.21:1.000:. ./.:4:75,239:.:-0.20:1.000:. ./.:4:119,177:.:-0.42:0.998:. ./.:4:114,192:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,203:.:-0.60:1.000:. ./.:4:75,274:.: 0.23:1.000:. ./.:4:133,249:.: 0.63:1.000:. ./.:4:132,196:.:-0.03:1.000:. ./.:4:77,223:.:-0.37:1.000:. ./.:4:114,180:.:-0.44:1.000:. ./.:4:79,182:.:-0.85:1.000:. ./.:4:185,233:.: 1.07:0.999:. ./.:4:124,186:.:-0.25:1.000:. ./.:4:112,149:.:-0.85:1.000:. ./.:4:64,209:.:-0.70:1.000:. ./.:4:66,201:.:-0.77:1.000:. ./.:4:141,184:.:-0.07:1.000:. ./.:4:159,235:.: 0.78:1.000:. ./.:4:95,254:.: 0.23:1.000:. ./.:4:129,202:.: 0.01:1.000:. ./.:4:142,222:.: 0.41:1.000:. ./.:4:152,199:.: 0.25:1.000:. ./.:4:153,194:.: 0.20:1.000:. ./.:4:127,204:.: 0.01:1.000:. ./.:4:141,177:.:-0.15:1.000:. ./.:4:106,254:.: 0.36:1.000:. ./.:4:135,208:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,178:.:-0.87:1.000:. ./.:4:172,246:.: 1.07:1.000:. -chr2.1 59121840 chr2.1_059121840 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:26,39:.:-1.11:1.000:. ./.:4:24,52:.:-0.90:1.000:. ./.:4:48,51:.:-0.45:1.000:. ./.:4:21,68:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,22:.:-1.64:1.000:. ./.:4:20,19:.:-1.62:1.000:. ./.:4:31,58:.:-0.64:1.000:. ./.:4:22,40:.:-1.17:1.000:. ./.:4:32,66:.:-0.47:1.000:. ./.:4:31,84:.:-0.14:1.000:. ./.:4:34,49:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,44:.:-0.80:1.000:. ./.:4:37,50:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,39:.:-1.29:1.000:. ./.:4:14,37:.:-1.39:1.000:. ./.:4:45,33:.:-0.86:1.000:. ./.:4:20,33:.:-1.35:1.000:. ./.:4:74,43:.:-0.10:1.000:. ./.:4:65,64:.: 0.14:1.000:. ./.:4:31,60:.:-0.60:1.000:. ./.:4:35,32:.:-1.07:1.000:. ./.:4:69,97:.: 0.86:1.000:. ./.:4:45,47:.:-0.59:1.000:. ./.:4:30,63:.:-0.57:1.000:. ./.:4:16,36:.:-1.37:1.000:. ./.:4:24,31:.:-1.31:1.000:. ./.:4:15,39:.:-1.33:1.000:. ./.:4:52,98:.: 0.55:1.000:. ./.:4:19,19:.:-1.64:1.000:. ./.:4:29,29:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,30:.:-1.37:1.000:. ./.:4:18,24:.:-1.56:1.000:. ./.:4:34,44:.:-0.86:1.000:. ./.:3:27,41:.:-1.05:0.995:. ./.:4:31,32:.:-1.15:1.000:. ./.:4:31,42:.:-0.96:1.000:. ./.:4:49,62:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,34:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,35:.:-1.17:1.000:. ./.:4:72,77:.: 0.53:1.000:. ./.:4:37,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:19,56:.:-0.92:1.000:. ./.:4:30,72:.:-0.39:1.000:. ./.:4:93,122:.: 1.82:1.000:. ./.:4:65,61:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,85:.: 0.65:1.000:. ./.:4:204,196:.: 5.43:1.000:. ./.:4:95,68:.: 0.80:1.000:. ./.:4:39,76:.:-0.14:1.000:. ./.:4:81,101:.: 1.17:1.000:. ./.:4:53,67:.:-0.04:1.000:. ./.:4:85,114:.: 1.50:1.000:. ./.:4:62,56:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:85,51:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,75:.:-0.21:1.000:. ./.:4:94,91:.: 1.23:1.000:. ./.:4:93,79:.: 0.98:1.000:. ./.:6:99,108:.: 1.66:1.000:. ./.:4:61,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,91:.: 0.82:1.000:. ./.:4:69,71:.: 0.35:1.000:. ./.:4:53,67:.:-0.04:1.000:. ./.:4:43,93:.: 0.27:1.000:. ./.:4:94,88:.: 1.17:1.000:. ./.:4:71,94:.: 0.84:1.000:. ./.:4:62,115:.: 1.07:0.578:. ./.:4:68,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:75,56:.: 0.18:1.000:. ./.:4:94,74:.: 0.90:1.000:. ./.:4:78,75:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,53:.:-0.14:1.000:. ./.:4:106,105:.: 1.74:1.000:. ./.:4:78,63:.: 0.37:1.000:. ./.:4:68,66:.: 0.24:1.000:. ./.:4:73,146:.: 1.90:1.000:. ./.:4:67,143:.: 1.72:1.000:. ./.:4:80,144:.: 1.99:1.000:. ./.:4:66,100:.: 0.86:0.593:. ./.:4:88,101:.: 1.31:1.000:. ./.:4:68,76:.: 0.43:1.000:. ./.:4:66,57:.: 0.02:1.000:. ./.:4:75,76:.: 0.57:0.825:. ./.:4:66,118:.: 1.21:1.000:. ./.:4:63,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,80:.: 0.65:1.000:. ./.:4:86,110:.: 1.45:1.000:. ./.:4:58,72:.: 0.16:1.000:. ./.:3:48,71:.:-0.06:0.999:. ./.:4:77,62:.: 0.33:1.000:. ./.:4:89,129:.: 1.88:1.000:. ./.:4:27,51:.:-0.86:1.000:. ./.:4:36,125:.: 0.76:1.000:. ./.:4:79,108:.: 1.27:1.000:. ./.:4:47,84:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,107:.: 1.64:1.000:. ./.:4:112,125:.: 2.25:1.000:. ./.:4:87,57:.: 0.43:1.000:. ./.:4:72,73:.: 0.45:1.000:. ./.:4:59,93:.: 0.59:1.000:. ./.:4:39,105:.: 0.43:1.000:. ./.:4:39,135:.: 1.02:1.000:. ./.:4:48,104:.: 0.59:1.000:. ./.:4:70,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,116:.: 1.52:1.000:. ./.:4:20,65:.:-0.72:1.000:. ./.:4:38,96:.: 0.24:1.000:. ./.:4:66,91:.: 0.68:1.000:. ./.:4:37,99:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,44:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,161:.: 2.34:0.999:. ./.:4:59,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,108:.: 0.18:1.000:. ./.:4:62,97:.: 0.72:1.000:. ./.:4:93,104:.: 1.47:1.000:. ./.:4:61,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,97:.: 0.82:1.000:. ./.:4:57,89:.: 0.47:1.000:. ./.:4:55,75:.: 0.16:1.000:. ./.:4:81,158:.: 2.29:1.000:. ./.:4:104,116:.: 1.91:1.000:. ./.:4:10,37:.:-1.46:1.000:. ./.:4:19,132:.: 0.57:1.000:. ./.:4:83,70:.: 0.61:1.000:. ./.:4:55,123:.: 1.09:1.000:. ./.:4:44,81:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,63:.:-0.53:1.000:. ./.:4:89,75:.: 0.82:1.000:. ./.:4:53,80:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,58:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,73:.:-0.19:1.000:. ./.:4:50,88:.: 0.31:1.000:. ./.:4:15,75:.:-0.62:1.000:. ./.:4:59,58:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:45,122:.: 0.88:1.000:. ./.:4:55,58:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,50:.:-0.29:1.000:. ./.:4:76,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:47,36:.:-0.76:1.000:. ./.:4:41,55:.:-0.51:1.000:. ./.:4:22,72:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,117:.: 1.07:1.000:. ./.:4:30,56:.:-0.70:1.000:. ./.:4:44,62:.:-0.31:1.000:. ./.:4:10,66:.:-0.90:1.000:. ./.:4:59,78:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,41:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,32:.:-0.82:1.000:. ./.:4:42,82:.: 0.04:1.000:. ./.:4:43,47:.:-0.62:1.000:. ./.:4:32,35:.:-1.07:1.000:. ./.:4:56,52:.:-0.27:1.000:. ./.:4:46,46:.:-0.59:1.000:. ./.:4:80,67:.: 0.49:1.000:. ./.:4:32,62:.:-0.55:0.998:. ./.:4:12,39:.:-1.39:1.000:. ./.:4:59,47:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,49:.:-0.62:1.000:. ./.:4:31,42:.:-0.96:1.000:. ./.:4:35,66:.:-0.41:1.000:. ./.:4:30,71:.:-0.41:1.000:. ./.:4:34,64:.:-0.47:1.000:. ./.:4:22,38:.:-1.21:1.000:. ./.:4:52,54:.:-0.31:0.999:. ./.:4:19,59:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,49:.:-0.39:1.000:. ./.:4:27,33:.:-1.21:1.000:. ./.:4:19,37:.:-1.29:1.000:. ./.:4:51,67:.:-0.08:1.000:. ./.:4:53,69:.: 0.00:1.000:. ./.:4:43,63:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,44:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,27:.:-1.52:1.000:. ./.:4:27,67:.:-0.55:1.000:. ./.:4:25,45:.:-1.01:1.000:. ./.:4:22,36:.:-1.25:1.000:. ./.:4:28,59:.:-0.68:1.000:. ./.:4:94,68:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,42:.:-0.98:1.000:. ./.:4:41,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:39,70:.:-0.25:1.000:. -chr2.1 59711171 chr2.1_059711171 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:227,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:303,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:300,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:296,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.31:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.02:0.995:. ./.:4:71,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.40:1.000:. ./.:6:75,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.39:0.578:. ./.:4:170,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.12:0.593:. ./.:4:110,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.15:0.825:. ./.:4:197,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.42:1.000:. ./.:3:51,0:.:-1.51:0.999:. ./.:4:48,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.49:0.999:. ./.:4:133,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:164,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.76:0.998:. ./.:4:233,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:197,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:327,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.84:1.000:. -chr2.1 59915667 chr2.1_059915667 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:203,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:261,11:.: 0.74:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:188,7:.:-0.37:1.000:. ./.:4:192,5:.:-0.34:1.000:. ./.:4:160,5:.:-0.80:1.000:. ./.:4:109,6:.:-1.52:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:177,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:259,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,5:.:-1.59:1.000:. ./.:4:240,7:.: 0.38:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:335,16:.: 1.88:1.000:. ./.:4:299,8:.: 1.24:1.000:. ./.:4:136,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:360,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:189,9:.:-0.32:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:107,10:.:-1.49:1.000:. ./.:4:174,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:207,13:.:-0.01:1.000:. ./.:4:160,3:.:-0.83:1.000:. ./.:4:230,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:149,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.06:1.000:. ./.:3:67,8:.:-2.10:0.995:. ./.:4:256,5:.: 0.58:1.000:. ./.:4:198,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:264,3:.: 0.67:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:216,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:315,9:.: 1.49:1.000:. ./.:4:289,5:.: 1.06:1.000:. ./.:4:238,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:253,8:.: 0.58:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:112,8:.:-1.45:1.000:. ./.:4:266,13:.: 0.84:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:183,12:.:-0.37:1.000:. ./.:6:202,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:256,10:.: 0.65:1.000:. ./.:4:216,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:161,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:190,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:177,5:.:-0.56:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:122,17:.:-1.17:0.578:. ./.:4:360,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:163,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:255,10:.: 0.64:1.000:. ./.:4:362,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:239,12:.: 0.44:1.000:. ./.:4:235,14:.: 0.41:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:131,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:198,8:.:-0.21:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.02:0.593:. ./.:4:219,14:.: 0.18:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:223,8:.: 0.15:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.52:0.825:. ./.:4:286,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:178,9:.:-0.48:1.000:. ./.:4:240,16:.: 0.51:1.000:. ./.:4:253,10:.: 0.61:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.08:1.000:. ./.:3:69,7:.:-2.08:0.999:. ./.:4:246,11:.: 0.52:1.000:. ./.:4:238,13:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:281,13:.: 1.06:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:116,12:.:-1.33:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:103,12:.:-1.52:1.000:. ./.:4:255,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:95,8:.:-1.69:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:151,5:.:-0.93:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:218,1:.:-0.02:0.999:. ./.:4:264,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:255,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:169,15:.:-0.53:1.000:. ./.:4:150,10:.:-0.87:1.000:. ./.:4:271,16:.: 0.96:1.000:. ./.:4:202,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:171,10:.:-0.57:1.000:. ./.:4:111,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:129,7:.:-1.22:1.000:. ./.:4:203,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:176,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:417,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:83,14:.:-1.78:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:174,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:172,6:.:-0.61:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:177,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:241,8:.: 0.41:1.000:. ./.:4:78,13:.:-1.87:1.000:. ./.:4:201,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:398,1:.: 2.57:1.000:. ./.:4:411,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:268,4:.: 0.74:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.07:0.998:. ./.:4:184,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:249,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:226,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:191,12:.:-0.25:1.000:. ./.:4:168,4:.:-0.70:1.000:. ./.:4:177,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:148,11:.:-0.89:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:226,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,6:.:-0.94:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:214,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,7:.:-2.11:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,6:.:-1.69:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:120,12:.:-1.28:1.000:. ./.:4:349,9:.: 1.98:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:207,9:.:-0.07:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.16:1.000:. -chr2.1 60009912 chr2.1_060009912 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:514,120:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:417,90:0.22:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:288,155:0.42:-0.91:1.000:0.927 0/0/1/1:4:285,154:0.42:-0.93:1.000:0.930 0/0/0/1:4:589,141:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:492,89:0.19: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,79:0.36:-2.17:1.000:0.685 0/1/1/1:4:144,245:0.65:-1.29:1.000:0.824 0/0/0/1:4:418,83:0.21:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:286,102:0.32:-1.30:1.000:0.949 0/0/1/1:4:170,141:0.53:-1.85:1.000:0.993 0/0/0/0:4:558,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:294,193:0.48:-0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:499,102:0.21: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:447,67:0.16:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:270,138:0.41:-1.16:1.000:0.862 0/0/1/1:4:310,152:0.40:-0.77:1.000:0.782 0/0/1/1:4:294,209:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:432,225:0.41: 0.63:1.000:0.890 0/0/0/1:4:513,105:0.21: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:437,9:0.03:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:422,86:0.21:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:198,309:0.64:-0.45:1.000:0.678 0/0/0/1:4:443,76:0.18:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,122:0.49:-1.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:168,288:0.65:-0.81:1.000:0.834 0/0/1/1:4:124,168:0.61:-1.99:1.000:0.638 0/0/0/1:4:444,72:0.17:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:565,125:0.22: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:413,72:0.18:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:276,181:0.48:-0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:198,123:0.46:-1.78:1.000:0.989 0/0/0/1:4:209,26:0.14:-2.40:1.000:0.957 0/0/0/0:4:603,1:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1:3:92,16:0.18:-3.31:0.995:0.992 0/0/1/1:4:259,168:0.47:-1.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:140,309:0.70:-0.86:1.000:0.981 0/0/1/1:4:310,170:0.43:-0.64:1.000:0.942 0/0/0/0:4:734,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:316,208:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:392,236:0.45: 0.42:1.000:0.983 0/0/0/1:4:510,118:0.23: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:410,300:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:332,255:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:488,344:0.50: 1.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:586,150:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:572,124:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,74:0.40:-2.48:1.000:0.796 0/0/0/1:4:470,137:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:733,208:0.27: 2.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:352,301:0.53: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:582,140:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:414,108:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:638,122:0.20: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:150,238:0.64:-1.30:1.000:0.710 0/0/0/1:4:479,126:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:507,106:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:447,332:0.51: 1.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:383,257:0.48: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:315,227:0.50:-0.20:1.000:0.889 0/0/1/1:4:420,287:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:294,242:0.53:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:489,317:0.47: 1.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:464,235:0.41: 0.93:1.000:0.847 0/0/1/1:4:386,269:0.49: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:542,123:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,199:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:536,121:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:173,401:0.70: 0.03:0.578:0.988 0/0/0/1:4:450,118:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:859,0:0.00: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:318,280:0.54: 0.21:1.000:0.989 0/0/0/1:4:705,170:0.24: 2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:328,224:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:388,276:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:353,188:0.42:-0.20:1.000:0.916 0/0/1/1:4:384,263:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:386,301:0.52: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:364,235:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:194,351:0.66:-0.17:1.000:0.892 0/0/0/1:4:452,103:0.23:-0.10:0.593:1.000 0/0/0/1:4:631,136:0.22: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:762,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,185:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:619,130:0.22: 1.29:0.825:1.000 0/0/1/1:4:412,292:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:356,103:0.28:-0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:405,282:0.49: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:592,156:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:326,214:0.48:-0.21:1.000:0.994 1/1/1:3:0,324:1.00:-1.76:0.999:1.000 0/0/1/1:4:326,225:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:218,420:0.67: 0.49:1.000:0.936 0/0/1/1:4:234,162:0.49:-1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:627,157:0.25: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:402,248:0.46: 0.58:1.000:0.988 0/0/0/1:4:599,110:0.19: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:486,104:0.22: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:417,299:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:328,201:0.46:-0.29:1.000:0.987 0/0/0/1:4:437,111:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:426,326:0.51: 1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:494,108:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:580,130:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:181,398:0.69: 0.07:1.000:0.980 0/0/0/1:4:483,119:0.25: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:457,115:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:311,170:0.43:-0.63:1.000:0.940 0/0/1/1:4:382,265:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:158,347:0.69:-0.46:1.000:0.980 0/0/0/1:4:536,124:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:413,201:0.40: 0.32:1.000:0.764 0/0/0/1:4:605,136:0.23: 1.23:0.999:1.000 0/0/0/1:4:546,105:0.20: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:273,215:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:661,165:0.25: 1.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:363,261:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:760,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:579,156:0.26: 1.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:495,139:0.27: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:559,149:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:343,271:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:390,273:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:258,139:0.42:-1.24:1.000:0.928 0/0/0/1:4:538,126:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:440,316:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:209,371:0.66: 0.08:1.000:0.874 0/0/0/0:4:637,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:487,123:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:335,212:0.47:-0.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:497,148:0.28: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:231,120:0.41:-1.57:1.000:0.886 0/0/1/1:4:193,154:0.52:-1.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:579,136:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:443,94:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:831,0:0.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:505,120:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:537,119:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:330,225:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:564,120:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:788,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:630,126:0.21: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:499,88:0.19: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:315,211:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:648,142:0.22: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:381,270:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:344,180:0.42:-0.32:1.000:0.896 0/0/1/1:4:324,205:0.47:-0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:306,209:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:306,193:0.47:-0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:361,197:0.43:-0.08:1.000:0.938 0/0/1/1:4:241,157:0.48:-1.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:187,139:0.51:-1.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:188,115:0.46:-1.91:1.000:0.986 0/0/0/1:4:475,108:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:465,111:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:768,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:348,185:0.42:-0.26:1.000:0.914 0/0/0/1:4:407,88:0.22:-0.53:0.998:1.000 0/0/1/1:4:317,181:0.44:-0.51:1.000:0.966 0/0/1/1:4:261,137:0.42:-1.23:1.000:0.900 0/0/1/1:4:239,167:0.50:-1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:296,151:0.41:-0.88:1.000:0.859 0/1/1/1:4:159,235:0.63:-1.26:1.000:0.560 0/0/0/1:4:439,71:0.17:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:306,188:0.46:-0.54:1.000:0.987 0/0/0/1:4:437,72:0.18:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:357,189:0.42:-0.17:0.999:0.910 0/0/1/1:4:303,186:0.46:-0.58:1.000:0.987 0/0/1/1:4:234,147:0.47:-1.35:1.000:0.990 0/0/0/1:4:378,75:0.21:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,157:0.46:-1.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:328,194:0.45:-0.34:1.000:0.979 0/0/1/1:4:349,186:0.42:-0.25:1.000:0.917 0/0/0/1:4:403,86:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,136:0.42:-1.29:1.000:0.922 0/0/1/1:4:336,173:0.41:-0.43:1.000:0.874 0/0/0/1:4:583,117:0.21: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:288,165:0.44:-0.83:1.000:0.967 0/0/0/1:4:403,104:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:333,183:0.43:-0.38:1.000:0.944 0/0/1/1:4:353,220:0.46: 0.03:1.000:0.989 0/0/1/1:4:372,192:0.41:-0.04:1.000:0.877 0/0/1/1:4:287,146:0.41:-0.98:1.000:0.855 0/0/0/1:4:422,109:0.25:-0.27:1.000:0.999 -chr2.1 60253680 chr2.1_060253680 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:458,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:333,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:552,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:307,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:199,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:153,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:597,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:630,1:.: 1.96:1.000:. ./.:4:146,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:494,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:566,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:558,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-3.91:1.000:. ./.:4:193,0:.:-2.51:1.000:. ./.:3:87,0:.:-3.59:0.995:. ./.:4:472,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:582,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:480,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:600,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.01:1.000:. ./.:6:374,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:451,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.40:0.578:. ./.:4:372,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.77:0.593:. ./.:4:495,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:361,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.31:0.825:. ./.:4:537,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.19:1.000:. ./.:3:326,0:.:-1.15:0.999:. ./.:4:386,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:544,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:337,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:572,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:397,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:324,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:569,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:542,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:579,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:341,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:547,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:339,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:639,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:324,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:628,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:545,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:557,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:575,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:138,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:461,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:541,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.38:0.998:. ./.:4:494,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:472,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:336,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:446,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:574,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:627,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:638,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.44:1.000:. -chr2.1 60565140 chr2.1_060565140 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:177,422:.: 0.43:1.000:. ./.:4:117,352:.:-0.67:1.000:. ./.:4:17,451:.:-0.68:1.000:. ./.:4:15,489:.:-0.37:1.000:. ./.:4:190,544:.: 1.58:1.000:. ./.:4:31,614:.: 0.82:1.000:. ./.:4:12,424:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,512:.:-0.12:1.000:. ./.:4:113,381:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,166:.:-3.21:1.000:. ./.:4:31,232:.:-2.41:1.000:. ./.:4:143,364:.:-0.35:1.000:. ./.:4:131,357:.:-0.51:1.000:. ./.:4:4,501:.:-0.36:1.000:. ./.:4:152,363:.:-0.28:1.000:. ./.:4:145,400:.:-0.02:1.000:. ./.:4:24,606:.: 0.70:1.000:. ./.:4:158,409:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,694:.: 1.52:1.000:. ./.:4:3,624:.: 0.67:1.000:. ./.:4:13,212:.:-2.73:1.000:. ./.:4:31,479:.:-0.32:1.000:. ./.:4:30,580:.: 0.53:1.000:. ./.:4:23,475:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,171:.:-3.00:1.000:. ./.:4:173,500:.: 1.06:1.000:. ./.:4:25,527:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,388:.:-0.09:1.000:. ./.:4:141,455:.: 0.41:1.000:. ./.:4:145,486:.: 0.70:1.000:. ./.:4:18,671:.: 1.20:1.000:. ./.:4:13,452:.:-0.70:1.000:. ./.:4:20,112:.:-3.52:1.000:. ./.:4:9,213:.:-2.76:1.000:. ./.:3:2,65:.:-4.07:0.995:. ./.:4:26,538:.: 0.14:1.000:. ./.:4:35,546:.: 0.28:1.000:. ./.:4:16,537:.: 0.04:1.000:. ./.:4:187,479:.: 1.00:1.000:. ./.:4:51,648:.: 1.28:1.000:. ./.:4:65,632:.: 1.26:1.000:. ./.:4:181,400:.: 0.28:1.000:. ./.:4:208,430:.: 0.76:1.000:. ./.:4:176,373:.: 0.01:1.000:. ./.:4:204,539:.: 1.65:1.000:. ./.:4:173,388:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,615:.: 0.57:1.000:. ./.:4:58,895:.: 3.43:1.000:. ./.:4:19,477:.:-0.44:1.000:. ./.:4:241,499:.: 1.63:1.000:. ./.:4:65,520:.: 0.32:1.000:. ./.:4:37,595:.: 0.71:1.000:. ./.:4:19,487:.:-0.35:1.000:. ./.:4:191,495:.: 1.17:1.000:. ./.:4:154,360:.:-0.29:1.000:. ./.:4:13,556:.: 0.18:1.000:. ./.:4:159,337:.:-0.44:1.000:. ./.:4:65,686:.: 1.72:1.000:. ./.:4:181,398:.: 0.26:1.000:. ./.:6:140,423:.: 0.13:1.000:. ./.:4:222,466:.: 1.19:1.000:. ./.:4:10,326:.:-1.79:1.000:. ./.:4:218,500:.: 1.44:1.000:. ./.:4:213,433:.: 0.83:1.000:. ./.:4:169,441:.: 0.53:1.000:. ./.:4:149,444:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,505:.:-0.07:1.000:. ./.:4:42,551:.: 0.38:1.000:. ./.:4:194,512:.: 1.34:0.578:. ./.:4:18,431:.:-0.84:1.000:. ./.:4:186,498:.: 1.15:1.000:. ./.:4:34,449:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,620:.: 0.79:1.000:. ./.:4:11,517:.:-0.17:1.000:. ./.:4:32,524:.: 0.07:1.000:. ./.:4:38,462:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,553:.: 0.42:1.000:. ./.:4:48,581:.: 0.69:1.000:. ./.:4:182,454:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,639:.: 1.00:1.000:. ./.:4:117,349:.:-0.69:0.593:. ./.:4:163,406:.: 0.18:1.000:. ./.:4:187,463:.: 0.87:1.000:. ./.:4:35,446:.:-0.57:1.000:. ./.:4:30,715:.: 1.67:0.825:. ./.:4:35,554:.: 0.35:1.000:. ./.:4:114,303:.:-1.11:1.000:. ./.:4:18,477:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,482:.:-0.50:1.000:. ./.:4:48,466:.:-0.29:1.000:. ./.:3:33,389:.:-1.06:0.999:. ./.:4:30,528:.: 0.09:1.000:. ./.:4:63,572:.: 0.74:1.000:. ./.:4:121,272:.:-1.31:1.000:. ./.:4:176,377:.: 0.04:1.000:. ./.:4:62,567:.: 0.69:1.000:. ./.:4:22,452:.:-0.62:1.000:. ./.:4:19,476:.:-0.45:1.000:. ./.:4:74,614:.: 1.19:1.000:. ./.:4:40,534:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,493:.:-0.22:1.000:. ./.:4:164,412:.: 0.24:1.000:. ./.:4:122,307:.:-1.01:1.000:. ./.:4:196,376:.: 0.21:1.000:. ./.:4:187,368:.: 0.06:1.000:. ./.:4:14,470:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,456:.:-0.48:1.000:. ./.:4:169,412:.: 0.28:1.000:. ./.:4:46,673:.: 1.45:1.000:. ./.:4:37,523:.: 0.10:1.000:. ./.:4:142,377:.:-0.24:1.000:. ./.:4:45,689:.: 1.58:1.000:. ./.:4:18,544:.: 0.12:0.999:. ./.:4:175,411:.: 0.32:1.000:. ./.:4:139,311:.:-0.83:1.000:. ./.:4:212,435:.: 0.84:1.000:. ./.:4:43,461:.:-0.37:1.000:. ./.:4:159,343:.:-0.39:1.000:. ./.:4:133,405:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,379:.:-0.42:1.000:. ./.:4:3,480:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,471:.:-0.46:1.000:. ./.:4:64,623:.: 1.18:1.000:. ./.:4:169,387:.: 0.07:1.000:. ./.:4:172,401:.: 0.21:1.000:. ./.:4:216,441:.: 0.92:1.000:. ./.:4:212,474:.: 1.17:1.000:. ./.:4:290,227:.:-0.26:1.000:. ./.:4:124,374:.:-0.42:1.000:. ./.:4:37,464:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,366:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,478:.:-0.09:1.000:. ./.:4:140,298:.:-0.93:1.000:. ./.:4:14,571:.: 0.32:1.000:. ./.:4:151,355:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,675:.: 1.21:1.000:. ./.:4:186,419:.: 0.48:1.000:. ./.:4:171,373:.:-0.03:1.000:. ./.:4:127,344:.:-0.65:1.000:. ./.:4:195,402:.: 0.42:1.000:. ./.:4:151,398:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,364:.: 0.05:1.000:. ./.:4:31,498:.:-0.16:1.000:. ./.:4:163,351:.:-0.29:1.000:. ./.:4:179,513:.: 1.22:1.000:. ./.:4:41,663:.: 1.32:1.000:. ./.:4:122,410:.:-0.13:1.000:. ./.:4:146,332:.:-0.59:1.000:. ./.:4:166,431:.: 0.42:1.000:. ./.:4:12,524:.:-0.10:1.000:. ./.:4:44,635:.: 1.11:1.000:. ./.:4:24,484:.:-0.34:1.000:. ./.:4:9,182:.:-3.02:1.000:. ./.:4:9,353:.:-1.57:1.000:. ./.:4:174,414:.: 0.34:1.000:. ./.:4:25,562:.: 0.33:1.000:. ./.:4:15,588:.: 0.47:1.000:. ./.:4:16,587:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,450:.:-0.73:0.998:. ./.:4:159,427:.: 0.32:1.000:. ./.:4:34,457:.:-0.48:1.000:. ./.:4:13,428:.:-0.90:1.000:. ./.:4:29,491:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,535:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,434:.: 0.34:1.000:. ./.:4:20,501:.:-0.23:1.000:. ./.:4:136,359:.:-0.45:1.000:. ./.:4:146,366:.:-0.30:0.999:. ./.:4:29,471:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,460:.:-0.36:1.000:. ./.:4:154,348:.:-0.39:1.000:. ./.:4:129,289:.:-1.10:1.000:. ./.:4:44,514:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,437:.:-0.70:1.000:. ./.:4:3,505:.:-0.34:1.000:. ./.:4:139,337:.:-0.61:1.000:. ./.:4:25,655:.: 1.12:1.000:. ./.:4:163,402:.: 0.15:1.000:. ./.:4:157,373:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,361:.:-0.40:1.000:. ./.:4:164,408:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,654:.: 1.19:1.000:. ./.:4:199,500:.: 1.28:1.000:. ./.:4:17,360:.:-1.45:1.000:. ./.:4:124,361:.:-0.53:1.000:. -chr2.1 60643873 chr2.1_060643873 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:103,120:.: 1.33:1.000:. ./.:4:111,48:.:-0.20:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:155,47:.: 0.82:1.000:. ./.:4:174,72:.: 1.88:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:105,38:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:43,23:.:-2.43:1.000:. ./.:4:115,43:.:-0.23:1.000:. ./.:4:153,48:.: 0.80:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:78,91:.: 0.04:1.000:. ./.:4:152,69:.: 1.28:1.000:. ./.:4:125,54:.: 0.27:1.000:. ./.:4:147,63:.: 1.02:1.000:. ./.:4:161,60:.: 1.28:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:42,38:.:-2.09:1.000:. ./.:4:146,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:108,34:.:-0.61:1.000:. ./.:4:40,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:145,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:112,86:.: 0.73:1.000:. ./.:4:164,46:.: 1.02:1.000:. ./.:4:113,62:.: 0.18:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:33,6:.:-3.07:1.000:. ./.:4:47,22:.:-2.36:1.000:. ./.:3:24,4:.:-3.34:0.995:. ./.:4:132,52:.: 0.39:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,100:.:-0.35:1.000:. ./.:4:120,50:.: 0.06:1.000:. ./.:4:150,46:.: 0.68:1.000:. ./.:4:85,101:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,52:.: 0.80:1.000:. ./.:4:72,86:.:-0.23:1.000:. ./.:4:143,48:.: 0.56:1.000:. ./.:4:110,91:.: 0.80:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:31,26:.:-2.64:1.000:. ./.:4:93,53:.:-0.51:1.000:. ./.:4:44,90:.:-0.80:1.000:. ./.:4:118,43:.:-0.16:1.000:. ./.:4:141,69:.: 1.02:1.000:. ./.:4:129,48:.: 0.23:1.000:. ./.:4:92,83:.: 0.18:1.000:. ./.:4:139,46:.: 0.42:1.000:. ./.:4:102,53:.:-0.30:1.000:. ./.:4:120,116:.: 1.64:1.000:. ./.:4:102,50:.:-0.37:1.000:. ./.:4:88,82:.: 0.06:1.000:. ./.:6:89,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:79,77:.:-0.28:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,55:.: 0.80:1.000:. ./.:4:70,78:.:-0.47:1.000:. ./.:4:98,109:.: 0.94:1.000:. ./.:4:69,92:.:-0.16:1.000:. ./.:4:69,20:.:-1.88:1.000:. ./.:4:117,35:.:-0.37:1.000:. ./.:4:109,32:.:-0.63:0.578:. ./.:4:182,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:84,101:.: 0.42:1.000:. ./.:4:58,36:.:-1.76:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:97,45:.:-0.61:1.000:. ./.:4:120,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:136,43:.: 0.27:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:81,35:.:-1.23:0.593:. ./.:4:84,88:.: 0.11:1.000:. ./.:4:103,103:.: 0.92:1.000:. ./.:4:140,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:101,26:.:-0.97:0.825:. ./.:4:198,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:46,79:.:-1.02:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:142,47:.: 0.51:1.000:. ./.:3:120,0:.:-1.14:0.999:. ./.:4:132,51:.: 0.37:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:72,58:.:-0.90:1.000:. ./.:4:125,39:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,43:.:-0.49:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:146,55:.: 0.80:1.000:. ./.:4:156,45:.: 0.80:1.000:. ./.:4:80,34:.:-1.28:1.000:. ./.:4:152,44:.: 0.68:1.000:. ./.:4:94,31:.:-1.02:1.000:. ./.:4:144,41:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,27:.:-0.83:1.000:. ./.:4:117,46:.:-0.11:1.000:. ./.:4:94,55:.:-0.44:1.000:. ./.:4:141,55:.: 0.68:1.000:. ./.:4:262,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,44:.: 0.23:1.000:. ./.:4:174,68:.: 1.78:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:100,95:.: 0.66:1.000:. ./.:4:98,37:.:-0.78:1.000:. ./.:4:84,99:.: 0.37:1.000:. ./.:4:122,40:.:-0.13:1.000:. ./.:4:62,79:.:-0.63:1.000:. ./.:4:132,53:.: 0.42:1.000:. ./.:4:113,52:.:-0.06:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,37:.:-0.13:1.000:. ./.:4:146,52:.: 0.73:1.000:. ./.:4:121,45:.:-0.04:1.000:. ./.:4:94,101:.: 0.66:1.000:. ./.:4:123,41:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,57:.:-1.73:1.000:. ./.:4:88,34:.:-1.09:1.000:. ./.:4:109,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:99,40:.:-0.68:1.000:. ./.:4:140,54:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,54:.:-1.18:1.000:. ./.:4:127,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:129,50:.: 0.27:1.000:. ./.:4:173,58:.: 1.52:1.000:. ./.:4:81,105:.: 0.44:1.000:. ./.:4:91,84:.: 0.18:1.000:. ./.:4:120,36:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,66:.:-0.61:1.000:. ./.:4:107,109:.: 1.16:1.000:. ./.:4:76,92:.: 0.01:1.000:. ./.:4:131,36:.:-0.01:1.000:. ./.:4:70,68:.:-0.71:1.000:. ./.:4:184,59:.: 1.81:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:135,52:.: 0.47:1.000:. ./.:4:176,61:.: 1.66:1.000:. ./.:4:184,63:.: 1.90:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:159,56:.: 1.14:1.000:. ./.:4:140,43:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:93,85:.: 0.25:1.000:. ./.:4:156,45:.: 0.80:1.000:. ./.:4:155,59:.: 1.11:1.000:. ./.:4:132,45:.: 0.23:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.01:0.998:. ./.:4:141,52:.: 0.61:1.000:. ./.:4:81,86:.:-0.01:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:117,40:.:-0.25:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:116,37:.:-0.35:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:100,27:.:-0.97:1.000:. ./.:4:147,38:.: 0.42:0.999:. ./.:4:196,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:85,39:.:-1.04:1.000:. ./.:4:100,72:.: 0.11:1.000:. ./.:4:64,83:.:-0.49:1.000:. ./.:4:106,22:.:-0.95:1.000:. ./.:4:139,43:.: 0.35:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:90,36:.:-0.99:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:129,50:.: 0.27:1.000:. ./.:4:154,69:.: 1.33:1.000:. ./.:4:139,55:.: 0.63:1.000:. ./.:4:131,42:.: 0.13:1.000:. ./.:4:131,60:.: 0.56:1.000:. ./.:4:120,126:.: 1.88:1.000:. ./.:4:116,36:.:-0.37:1.000:. ./.:4:158,49:.: 0.94:1.000:. -chr2.1 60724660 chr2.1_060724660 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:71,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:44,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:159,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.87:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.05:0.995:. ./.:4:95,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:122,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.58:1.000:. ./.:6:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.74:0.578:. ./.:4:136,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:158,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:164,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.14:0.593:. ./.:4:78,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.55:0.825:. ./.:4:133,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.92:1.000:. ./.:3:82,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:97,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:166,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:48,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.50:0.999:. ./.:4:48,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:159,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.09:0.998:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:92,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.44:1.000:. -chr2.1 60976699 chr2.1_060976699 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:47,149:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,78:0.48:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,91:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,47:0.29:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:103,94:0.47: 0.73:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,31:0.27:-1.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:104,89:0.46: 0.63:1.000:0.986 0/0/0/1:4:126,52:0.29: 0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:18,22:0.55:-3.11:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,48:0.79:-2.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,115:0.70:-0.08:1.000:0.985 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,90:0.47: 0.55:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,139:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,89:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,91:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:109,104:0.48: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,112:0.46: 1.80:1.000:0.989 0/0/1/1:4:115,107:0.48: 1.34:1.000:0.995 1/1/1/1:4:5,47:0.90:-2.82:1.000:0.874 0/0/1/1:4:102,79:0.43: 0.33:1.000:0.957 0/1/1/1:4:42,152:0.78: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,16:0.64:-3.48:1.000:0.665 0/0/0/1:4:123,46:0.28: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,69:0.47:-0.50:1.000:0.991 0/1/1/1:4:34,143:0.81: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,48:0.25: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,56:0.29: 0.68:1.000:0.992 0/0/0/1:4:140,39:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,111:0.72:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,13:0.45:-3.38:1.000:0.975 0/1/1/1:4:9,58:0.87:-2.45:1.000:0.942 0/1/1:3:13,17:0.56:-3.36:0.995:0.986 0/0/1/1:4:88,69:0.44:-0.25:1.000:0.962 0/0/1/1:4:87,83:0.48: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,40:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,107:0.56: 0.55:1.000:0.967 0/1/1/1:4:53,159:0.75: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,123:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,119:0.71:-0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:123,54:0.31: 0.24:1.000:0.977 0/0/1/1:4:76,96:0.55: 0.11:1.000:0.975 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,45:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,101:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,15:0.53:-3.41:1.000:0.992 0/1/1/1:4:28,116:0.81:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,58:0.70:-2.06:1.000:0.983 0/1/1/1:4:39,113:0.74:-0.37:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,228:1.00: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,139:0.74: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,44:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,39:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,132:0.76: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,85:0.48: 0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,134:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,42:0.28:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:55,93:0.63:-0.47:1.000:0.816 0/0/1/1:4:78,104:0.57: 0.36:1.000:0.951 0/0/0/1:4:117,21:0.15:-0.72:1.000:0.992 0/0/0/0:4:175,2:0.01: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,39:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,65:0.30: 1.21:1.000:0.983 0/1/1/1:4:49,144:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,63:0.51:-1.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,35:0.21:-0.03:0.578:1.000 0/1/1/1:4:34,124:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,108:0.55: 0.70:1.000:0.982 0/0/1/1:4:66,61:0.48:-0.99:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,114:0.71:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:153,58:0.28: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,95:0.52: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,79:0.46: 0.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:85,91:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,103:0.54: 0.55:1.000:0.988 0/0/1/1:4:103,89:0.46: 0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:81,101:0.55: 0.36:1.000:0.978 0/0/1/1:4:47,55:0.54:-1.60:0.593:0.990 0/0/1/1:4:89,97:0.52: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:125,84:0.40: 1.02:1.000:0.799 0/0/1/1:4:79,84:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,72:0.55:-0.91:0.825:0.979 0/0/1/1:4:105,83:0.44: 0.51:1.000:0.966 0/0/1/1:4:55,74:0.57:-0.94:1.000:0.945 0/0/0/1:4:98,32:0.25:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,79:0.51:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,105:0.70:-0.42:1.000:0.984 0/0/1:3:87,33:0.28:-1.16:0.999:1.000 0/0/1/1:4:83,85:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,99:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,74:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,92:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,142:0.78: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,123:0.79:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,114:0.71:-0.15:1.000:0.990 0/1/1/1:4:45,170:0.79: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,100:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,74:0.54:-0.77:1.000:0.987 0/0/1/1:4:98,89:0.47: 0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,85:0.58:-0.52:1.000:0.917 0/0/1/1:4:106,113:0.51: 1.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,33:0.29:-1.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:40,116:0.74:-0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,94:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,120:0.49: 1.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,96:0.52: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:127,51:0.29: 0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,172:0.78: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,138:0.80: 0.11:0.999:1.000 0/0/0/1:4:142,59:0.30: 0.82:1.000:0.988 0/0/0/1:4:74,28:0.28:-1.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,167:0.81: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,93:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,81:0.54:-0.45:1.000:0.988 0/0/0/1:4:142,37:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,33:0.23:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,84:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,103:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,162:0.74: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,56:0.29: 0.63:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,90:0.52: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:109,50:0.32:-0.20:1.000:0.962 0/0/0/1:4:126,40:0.25:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,73:0.61:-1.18:1.000:0.680 0/0/0/1:4:96,33:0.26:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,69:0.54:-0.96:1.000:0.990 0/0/0/1:4:137,40:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,141:0.73: 0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,59:0.49:-1.16:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,145:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,78:0.47:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:63,170:0.73: 1.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,138:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,29:0.23:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,71:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,32:0.22:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,83:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,80:0.47: 0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,88:0.58:-0.37:1.000:0.929 0/0/1/1:4:58,63:0.52:-1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,129:0.51: 2.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,114:0.48: 1.73:1.000:0.994 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,42:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,52:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,110:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,188:0.74: 2.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,92:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,40:0.77:-2.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,38:0.27:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,46:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,123:0.56: 1.21:1.000:0.961 0/1/1/1:4:41,143:0.78: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,103:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,128:0.75: 0.09:0.998:0.999 0/0/0/1:4:133,54:0.29: 0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:144,43:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,38:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,121:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,100:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,44:0.28:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,104:0.52: 0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,41:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,50:0.30: 0.07:0.999:0.988 0/0/1/1:4:69,79:0.53:-0.47:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,128:0.72: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,33:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,31:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,111:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,112:0.76:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,76:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,69:0.52:-0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:115,101:0.46: 1.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:116,93:0.44: 1.02:1.000:0.971 0/0/1/1:4:108,99:0.47: 0.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,75:0.46:-0.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:84,113:0.57: 0.73:1.000:0.945 0/0/1/1:4:106,104:0.49: 1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,87:0.46: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:60,84:0.58:-0.57:1.000:0.912 0/0/1/1:4:98,114:0.53: 1.09:1.000:0.991 -chr2.1 61111570 chr2.1_061111570 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:51,7:0.18: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,9:0.32:-0.82:1.000:0.962 0/0/0/1:4:40,7:0.22:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,9:0.25: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,10:0.20: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,2:0.05: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,3:0.30:-2.23:1.000:0.984 0/0/0/0:4:66,3:0.07: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,7:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,3:0.12:-0.64:1.000:0.648 0/0/1/1:4:26,22:0.48:-0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,6:0.16: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,8:0.30:-0.94:1.000:0.980 0/0/0/0:4:71,5:0.10: 1.62:1.000:0.829 0/0/0/1:4:41,9:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,8:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,10:0.32:-0.64:1.000:0.949 0/0/0/1:4:50,17:0.32: 1.07:1.000:0.955 0/0/0/1:4:44,14:0.31: 0.52:1.000:0.974 0/0/0/1:4:68,7:0.14: 1.56:1.000:0.967 0/0/0/1:4:27,9:0.32:-0.82:1.000:0.962 0/0/1/1:4:23,15:0.43:-0.70:1.000:0.952 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,2:0.05: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,8:0.41:-1.68:1.000:0.846 0/0/0/1:4:23,5:0.26:-1.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:53,2:0.05: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,6:0.17: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/0:4:71,3:0.06: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,8:0.35:-1.37:1.000:0.759 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,11:0.56:-1.92:1.000:0.962 0/0/1/1:4:30,20:0.44: 0.03:1.000:0.961 0/0/1:3:8,7:0.49:-2.11:0.995:0.669 0/0/0/1:4:39,9:0.27:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/0:4:47,2:0.06:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,9:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,14:0.50:-1.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:40,1:0.04:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,13:0.30: 0.52:1.000:0.988 0/0/0/1:4:46,10:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,24:0.54:-0.39:1.000:0.989 0/0/1/1:4:17,20:0.53:-0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,17:0.49:-0.82:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,4:0.08: 1.38:1.000:0.980 0/0/1/1:4:23,12:0.39:-0.88:1.000:0.699 0/0/0/1:4:60,8:0.18: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,9:0.33:-0.94:1.000:0.928 0/0/0/1:4:37,11:0.30:-0.09:1.000:0.985 0/0/0/0:4:77,5:0.09: 1.99:1.000:0.933 0/0/0/0:4:71,4:0.08: 1.56:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,4:0.11: 0.22:1.000:0.585 0/0/0/1:4:46,5:0.15: 0.09:1.000:0.984 0/0/0/1:4:51,12:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,12:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,13:0.38:-0.64:1.000:0.608 0/0/0/1/1/1:6:25,16:0.43:-0.52:1.000:0.590 0/0/1/1:4:29,14:0.38:-0.39:1.000:0.528 0/0/0/1:4:31,5:0.21:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.53: 0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:17,15:0.49:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,18:0.45:-0.39:1.000:0.981 0/0/0/1:4:51,9:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.27:-1.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:81,7:0.12: 2.36:1.000:0.747 0/0/0/1:4:36,7:0.24:-0.39:0.578:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,26:0.54:-0.21:1.000:0.987 0/0/0/1:4:20,8:0.35:-1.31:1.000:0.834 0/0/0/1:4:64,7:0.15: 1.32:1.000:0.985 0/0/0/1:4:51,10:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,20:0.35: 1.26:1.000:0.834 0/0/0/1:4:35,11:0.31:-0.21:1.000:0.977 0/0/0/0:4:43,1:0.03:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,18:0.34: 0.89:1.000:0.859 0/0/0/0:4:73,5:0.10: 1.74:1.000:0.874 0/0/0/0:4:52,1:0.03: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,8:0.26:-0.27:0.593:0.999 0/0/0/1:4:40,17:0.36: 0.46:1.000:0.743 0/0/1/1:4:17,29:0.57:-0.21:1.000:0.940 0/0/0/1:4:44,19:0.36: 0.83:1.000:0.715 0/0/1/1:4:14,10:0.45:-1.56:0.825:0.979 0/0/0/1:4:32,14:0.36:-0.21:1.000:0.690 0/0/0/1:4:33,8:0.27:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,11:0.28: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,10:0.21: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,12:0.28: 0.58:1.000:0.996 0/0/1:3:26,5:0.24:-1.13:0.999:1.000 0/0/0/1:4:55,11:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,13:0.24: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,16:0.60:-1.62:1.000:0.757 0/0/0/1:4:48,8:0.21: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,8:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,7:0.14: 1.56:1.000:0.967 0/0/0/0:4:45,3:0.09:-0.09:1.000:0.908 0/0/0/1:4:52,15:0.30: 1.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:50,7:0.18: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,15:0.52:-1.25:1.000:0.995 0/0/0/0:4:76,6:0.11: 1.99:1.000:0.523 0/0/0/1:4:25,8:0.31:-1.01:1.000:0.973 0/0/0/1:4:53,20:0.34: 1.44:1.000:0.894 0/0/1/1:4:23,17:0.46:-0.58:1.000:0.985 0/0/0/1:4:51,9:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,6:0.13: 1.32:1.000:0.875 0/0/0/0:4:58,3:0.07: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,13:0.26: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:67,2:0.04: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,20:0.44:-0.03:1.000:0.971 0/0/0/1:4:52,11:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,8:0.14: 2.05:0.999:0.979 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,16:0.59:-1.56:1.000:0.865 0/0/0/1:4:55,11:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,13:0.31: 0.34:1.000:0.979 0/0/1/1:4:27,13:0.38:-0.58:1.000:0.522 0/0/1/1:4:29,15:0.39:-0.33:1.000:0.681 0/0/0/1:4:39,9:0.27:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,7:0.16: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,5:0.20:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,14:0.37:-0.33:1.000:0.551 0/0/0/1:4:39,14:0.33: 0.22:1.000:0.929 0/0/1/1:4:21,21:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,9:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,9:0.28:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,8:0.29:-0.76:1.000:0.992 0/0/0/1:4:33,6:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,9:0.27:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,10:0.27: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,14:0.47:-1.07:1.000:0.991 0/0/0/0:4:43,1:0.03:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,3:0.12:-0.82:1.000:0.852 0/0/0/1:4:34,8:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,7:0.22:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,8:0.17: 1.38:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,21:0.53:-0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:40,20:0.38: 0.64:1.000:0.608 0/0/1/1:4:24,19:0.47:-0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:14,13:0.50:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,7:0.14: 1.44:1.000:0.978 0/0/0/1:4:55,6:0.15: 0.71:1.000:0.984 0/0/1/1:4:19,11:0.41:-1.19:1.000:0.862 0/0/1/1:4:22,14:0.43:-0.82:1.000:0.939 0/0/0/1:4:17,6:0.33:-1.62:1.000:0.939 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,14:0.32: 0.40:1.000:0.962 0/0/0/1:4:40,8:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,11:0.29: 0.09:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,22:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:53,13:0.27: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,7:0.20: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,5:0.10: 1.38:0.998:0.695 0/0/1/1:4:28,16:0.41:-0.33:1.000:0.846 0/0/1/1:4:28,16:0.41:-0.33:1.000:0.846 0/0/0/1:4:37,3:0.11:-0.58:1.000:0.563 0/0/0/1:4:42,8:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,1:0.02: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,4:0.21:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,5:0.11: 1.26:1.000:0.606 0/0/0/1:4:32,7:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,9:0.36:-1.19:0.999:0.729 0/0/0/1:4:40,9:0.26:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,8:0.25:-0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,12:0.30: 0.09:1.000:0.980 0/0/0/1:4:37,6:0.21:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,1:0.03:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,6:0.12: 1.50:1.000:0.795 0/0/0/1:4:38,8:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,15:0.33: 0.40:1.000:0.918 0/0/0/0:4:69,5:0.10: 1.50:1.000:0.770 0/0/0/1:4:38,8:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,3:0.06: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,6:0.17: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,17:0.46:-0.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:37,5:0.18:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,9:0.27:-0.15:1.000:0.998 -chr2.1 61258903 chr2.1_061258903 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:339,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:537,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:620,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:664,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:414,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:223,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:192,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.66:1.000:. ./.:3:239,0:.:-0.98:0.995:. ./.:4:265,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:438,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:704,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:825,0:.: 3.27:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:500,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.47:1.000:. ./.:6:400,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:547,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:874,0:.: 3.63:1.000:. ./.:4:571,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:702,0:.: 2.38:0.578:. ./.:4:116,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:536,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:522,2:.: 1.09:1.000:. ./.:4:246,2:.:-0.92:0.593:. ./.:4:365,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.10:0.825:. ./.:4:541,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.75:1.000:. ./.:3:426,0:.: 0.37:0.999:. ./.:4:268,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:517,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:335,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:505,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:675,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:551,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:499,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:516,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:639,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:385,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:293,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:438,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:550,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:596,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:587,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:542,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:648,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.96:0.998:. ./.:4:601,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:447,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.04:0.999:. ./.:4:423,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:582,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:518,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.69:1.000:. -chr2.1 61404621 chr2.1_061404621 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:389,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:584,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.03:1.000:. ./.:3:50,0:.:-2.21:0.995:. ./.:4:412,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:287,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:521,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.67:1.000:. ./.:6:405,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.33:0.578:. ./.:4:444,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:566,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.08:0.593:. ./.:4:280,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.26:0.825:. ./.:4:451,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:471,0:.: 1.20:1.000:. ./.:3:242,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:343,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:471,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:583,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:481,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:515,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:641,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.96:0.999:. ./.:4:253,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:543,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:484,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:487,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:622,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:469,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.41:0.998:. ./.:4:268,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:363,1:.: 0.33:0.999:. ./.:4:353,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:550,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:505,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:491,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:521,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.18:1.000:. -chr2.1 61664787 chr2.1_061664787 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:236,0:.: 2.92:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:163,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.88:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.12:0.995:. ./.:4:125,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.43:1.000:. ./.:6:118,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:0.578:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:150,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:77,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.71:0.593:. ./.:4:143,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.85:0.825:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.43:1.000:. ./.:3:31,0:.:-1.47:0.999:. ./.:4:135,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:144,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:157,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:195,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.40:0.998:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:176,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.54:0.999:. ./.:4:82,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:248,0:.: 3.18:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.52:1.000:. -chr2.1 61948846 chr2.1_061948846 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,81:.:-0.48:1.000:. ./.:4:151,133:.:-1.23:1.000:. ./.:4:288,88:.:-0.39:1.000:. ./.:4:257,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:385,93:.: 0.53:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:161,49:.:-1.90:1.000:. ./.:4:274,90:.:-0.50:1.000:. ./.:4:226,99:.:-0.85:1.000:. ./.:4:272,3:.:-1.31:1.000:. ./.:4:181,49:.:-1.71:1.000:. ./.:4:241,88:.:-0.82:1.000:. ./.:4:166,163:.:-0.82:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:232,88:.:-0.90:1.000:. ./.:4:231,92:.:-0.87:1.000:. ./.:4:324,101:.: 0.05:1.000:. ./.:4:170,142:.:-0.97:1.000:. ./.:4:421,117:.: 1.08:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:260,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:270,94:.:-0.50:1.000:. ./.:4:394,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:157,21:.:-2.19:1.000:. ./.:4:283,219:.: 0.75:1.000:. ./.:4:211,59:.:-1.35:1.000:. ./.:4:228,70:.:-1.10:1.000:. ./.:4:382,106:.: 0.62:1.000:. ./.:4:230,99:.:-0.82:1.000:. ./.:4:339,105:.: 0.22:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:96,27:.:-2.68:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.16:1.000:. ./.:3:93,19:.:-2.78:0.995:. ./.:4:210,84:.:-1.13:1.000:. ./.:4:299,86:.:-0.31:1.000:. ./.:4:282,96:.:-0.37:1.000:. ./.:4:462,178:.: 2.00:1.000:. ./.:4:365,133:.: 0.71:1.000:. ./.:4:383,129:.: 0.84:1.000:. ./.:4:374,115:.: 0.63:1.000:. ./.:4:323,290:.: 1.76:1.000:. ./.:4:253,236:.: 0.63:1.000:. ./.:4:331,316:.: 2.06:1.000:. ./.:4:276,225:.: 0.74:1.000:. ./.:4:342,124:.: 0.42:1.000:. ./.:4:89,29:.:-2.73:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:504,129:.: 1.94:1.000:. ./.:4:329,111:.: 0.19:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:259,212:.: 0.47:1.000:. ./.:4:170,172:.:-0.70:1.000:. ./.:4:580,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:302,91:.:-0.24:1.000:. ./.:4:480,145:.: 1.86:1.000:. ./.:4:265,201:.: 0.42:1.000:. ./.:6:268,159:.: 0.07:1.000:. ./.:4:289,219:.: 0.80:1.000:. ./.:4:300,96:.:-0.21:1.000:. ./.:4:328,312:.: 2.00:1.000:. ./.:4:313,286:.: 1.63:1.000:. ./.:4:217,254:.: 0.47:1.000:. ./.:4:367,119:.: 0.61:1.000:. ./.:4:317,92:.:-0.09:1.000:. ./.:4:424,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:297,270:.: 1.34:0.578:. ./.:4:216,76:.:-1.15:1.000:. ./.:4:488,124:.: 1.75:1.000:. ./.:4:308,97:.:-0.13:1.000:. ./.:4:471,155:.: 1.87:1.000:. ./.:4:302,100:.:-0.16:1.000:. ./.:4:272,226:.: 0.71:1.000:. ./.:4:336,95:.: 0.11:1.000:. ./.:4:338,88:.: 0.06:1.000:. ./.:4:424,122:.: 1.15:1.000:. ./.:4:373,128:.: 0.74:1.000:. ./.:4:389,122:.: 0.83:1.000:. ./.:4:182,177:.:-0.55:0.593:. ./.:4:452,122:.: 1.40:1.000:. ./.:4:426,117:.: 1.12:1.000:. ./.:4:212,91:.:-1.05:1.000:. ./.:4:459,140:.: 1.63:0.825:. ./.:4:383,147:.: 1.00:1.000:. ./.:4:261,86:.:-0.65:1.000:. ./.:4:287,90:.:-0.38:1.000:. ./.:4:534,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:281,88:.:-0.46:1.000:. ./.:3:227,110:.:-0.75:0.999:. ./.:4:349,92:.: 0.20:1.000:. ./.:4:435,124:.: 1.27:1.000:. ./.:4:142,126:.:-1.37:1.000:. ./.:4:442,158:.: 1.64:1.000:. ./.:4:442,159:.: 1.65:1.000:. ./.:4:462,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:370,113:.: 0.58:1.000:. ./.:4:443,137:.: 1.46:1.000:. ./.:4:415,115:.: 1.00:1.000:. ./.:4:289,115:.:-0.14:1.000:. ./.:4:405,123:.: 0.99:1.000:. ./.:4:297,99:.:-0.21:1.000:. ./.:4:438,122:.: 1.28:1.000:. ./.:4:255,210:.: 0.41:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:299,106:.:-0.13:1.000:. ./.:4:383,104:.: 0.61:1.000:. ./.:4:282,100:.:-0.34:1.000:. ./.:4:235,202:.: 0.16:1.000:. ./.:4:285,103:.:-0.28:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.55:0.999:. ./.:4:266,257:.: 0.94:1.000:. ./.:4:225,229:.: 0.32:1.000:. ./.:4:465,155:.: 1.82:1.000:. ./.:4:349,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:354,91:.: 0.23:1.000:. ./.:4:397,124:.: 0.92:1.000:. ./.:4:367,98:.: 0.41:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:523,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:438,142:.: 1.46:1.000:. ./.:4:133,129:.:-1.42:1.000:. ./.:4:394,121:.: 0.87:1.000:. ./.:4:275,258:.: 1.03:1.000:. ./.:4:236,251:.: 0.61:1.000:. ./.:4:253,204:.: 0.34:1.000:. ./.:4:279,94:.:-0.42:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:387,104:.: 0.65:1.000:. ./.:4:210,89:.:-1.09:1.000:. ./.:4:183,157:.:-0.72:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:288,116:.:-0.14:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:388,123:.: 0.83:1.000:. ./.:4:249,258:.: 0.80:1.000:. ./.:4:326,106:.: 0.12:1.000:. ./.:4:227,211:.: 0.17:1.000:. ./.:4:432,122:.: 1.22:1.000:. ./.:4:400,110:.: 0.82:1.000:. ./.:4:255,86:.:-0.71:1.000:. ./.:4:221,210:.: 0.11:1.000:. ./.:4:440,117:.: 1.25:1.000:. ./.:4:382,99:.: 0.56:1.000:. ./.:4:178,187:.:-0.49:1.000:. ./.:4:196,163:.:-0.55:1.000:. ./.:4:231,232:.: 0.40:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:243,79:.:-0.88:1.000:. ./.:4:244,74:.:-0.92:1.000:. ./.:4:191,2:.:-2.05:1.000:. ./.:4:181,49:.:-1.71:1.000:. ./.:4:242,212:.: 0.32:1.000:. ./.:4:336,107:.: 0.22:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:292,102:.:-0.23:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.63:0.998:. ./.:4:194,145:.:-0.73:1.000:. ./.:4:151,148:.:-1.09:1.000:. ./.:4:245,74:.:-0.91:1.000:. ./.:4:258,97:.:-0.58:1.000:. ./.:4:298,94:.:-0.25:1.000:. ./.:4:236,70:.:-1.03:1.000:. ./.:4:228,91:.:-0.91:1.000:. ./.:4:254,78:.:-0.79:1.000:. ./.:4:77,272:.:-0.64:0.999:. ./.:4:237,74:.:-0.98:1.000:. ./.:4:222,68:.:-1.17:1.000:. ./.:4:106,135:.:-1.62:1.000:. ./.:4:134,175:.:-1.00:1.000:. ./.:4:272,94:.:-0.48:1.000:. ./.:4:227,66:.:-1.14:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:235,69:.:-1.04:1.000:. ./.:4:291,115:.:-0.12:1.000:. ./.:4:386,112:.: 0.71:1.000:. ./.:4:259,69:.:-0.83:1.000:. ./.:4:200,90:.:-1.17:1.000:. ./.:4:273,111:.:-0.32:1.000:. ./.:4:327,122:.: 0.27:1.000:. ./.:4:170,188:.:-0.55:1.000:. ./.:4:205,63:.:-1.37:1.000:. ./.:4:176,193:.:-0.46:1.000:. -chr2.1 62106966 chr2.1_062106966 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:179,51:.: 0.93:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:160,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:136,40:.:-0.44:1.000:. ./.:4:193,70:.: 1.76:1.000:. ./.:4:193,52:.: 1.31:1.000:. ./.:4:141,31:.:-0.54:1.000:. ./.:4:108,94:.: 0.22:1.000:. ./.:4:167,50:.: 0.60:1.000:. ./.:4:85,22:.:-2.19:1.000:. ./.:4:84,28:.:-2.07:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:147,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:174,59:.: 1.00:1.000:. ./.:4:135,52:.:-0.16:1.000:. ./.:4:111,96:.: 0.34:1.000:. ./.:4:174,47:.: 0.70:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:199,62:.: 1.71:1.000:. ./.:4:208,65:.: 2.02:1.000:. ./.:4:152,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:117,104:.: 0.70:1.000:. ./.:4:140,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,22:.:-2.62:1.000:. ./.:4:118,104:.: 0.72:1.000:. ./.:4:77,99:.:-0.44:1.000:. ./.:4:160,42:.: 0.22:1.000:. ./.:4:155,51:.: 0.32:1.000:. ./.:4:187,50:.: 1.11:1.000:. ./.:4:199,71:.: 1.94:1.000:. ./.:4:89,101:.:-0.09:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:153,1:.:-1.00:1.000:. ./.:3:56,19:.:-3.00:0.995:. ./.:4:187,58:.: 1.31:1.000:. ./.:4:102,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.57:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:212,49:.: 1.71:1.000:. ./.:4:145,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:161,50:.: 0.45:1.000:. ./.:4:157,62:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,34:.:-0.97:1.000:. ./.:4:195,58:.: 1.51:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:178,41:.: 0.65:1.000:. ./.:4:98,28:.:-1.71:1.000:. ./.:4:141,43:.:-0.24:1.000:. ./.:4:141,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:127,40:.:-0.67:1.000:. ./.:4:162,57:.: 0.65:1.000:. ./.:4:127,46:.:-0.52:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:78,88:.:-0.70:1.000:. ./.:4:153,39:.:-0.04:1.000:. ./.:4:137,39:.:-0.44:1.000:. ./.:4:184,53:.: 1.11:1.000:. ./.:4:146,41:.:-0.16:1.000:. ./.:6:135,48:.:-0.26:1.000:. ./.:4:139,56:.: 0.04:1.000:. ./.:4:133,44:.:-0.42:1.000:. ./.:4:198,48:.: 1.33:1.000:. ./.:4:153,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:168,53:.: 0.70:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.47:1.000:. ./.:4:122,46:.:-0.65:1.000:. ./.:4:145,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:105,96:.: 0.19:0.578:. ./.:4:190,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:114,39:.:-1.03:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:154,46:.: 0.17:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:154,43:.: 0.09:1.000:. ./.:4:153,58:.: 0.45:1.000:. ./.:4:130,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:125,88:.: 0.50:1.000:. ./.:4:127,97:.: 0.78:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.70:0.593:. ./.:4:161,43:.: 0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:134,43:.:-0.42:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.22:0.825:. ./.:4:182,57:.: 1.16:1.000:. ./.:4:107,32:.:-1.38:1.000:. ./.:4:116,34:.:-1.10:1.000:. ./.:4:136,46:.:-0.29:1.000:. ./.:4:131,39:.:-0.59:1.000:. ./.:3:39,77:.:-1.96:0.999:. ./.:4:121,45:.:-0.70:1.000:. ./.:4:121,106:.: 0.85:1.000:. ./.:4:85,30:.:-1.99:1.000:. ./.:4:181,54:.: 1.05:1.000:. ./.:4:151,33:.:-0.24:1.000:. ./.:4:102,46:.:-1.15:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:166,52:.: 0.62:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:95,88:.:-0.26:1.000:. ./.:4:94,28:.:-1.81:1.000:. ./.:4:158,54:.: 0.47:1.000:. ./.:4:95,77:.:-0.54:1.000:. ./.:4:131,46:.:-0.42:1.000:. ./.:4:113,45:.:-0.90:1.000:. ./.:4:107,106:.: 0.50:1.000:. ./.:4:204,54:.: 1.64:1.000:. ./.:4:96,88:.:-0.24:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.47:1.000:. ./.:4:208,73:.: 2.22:1.000:. ./.:4:125,43:.:-0.65:0.999:. ./.:4:189,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:73,23:.:-2.47:1.000:. ./.:4:169,52:.: 0.70:1.000:. ./.:4:122,46:.:-0.65:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:139,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:125,33:.:-0.90:1.000:. ./.:4:137,49:.:-0.19:1.000:. ./.:4:83,81:.:-0.75:1.000:. ./.:4:148,51:.: 0.14:1.000:. ./.:4:167,56:.: 0.75:1.000:. ./.:4:124,30:.:-1.00:1.000:. ./.:4:137,43:.:-0.34:1.000:. ./.:4:98,100:.: 0.12:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:107,36:.:-1.28:1.000:. ./.:4:92,34:.:-1.71:1.000:. ./.:4:130,36:.:-0.70:1.000:. ./.:4:158,52:.: 0.42:1.000:. ./.:4:89,29:.:-1.91:1.000:. ./.:4:151,43:.: 0.01:1.000:. ./.:4:107,35:.:-1.30:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:165,45:.: 0.42:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:79,79:.:-0.90:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:141,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:117,35:.:-1.05:1.000:. ./.:4:180,67:.: 1.36:1.000:. ./.:4:188,60:.: 1.38:1.000:. ./.:4:157,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:147,54:.: 0.19:1.000:. ./.:4:165,52:.: 0.60:1.000:. ./.:4:96,105:.: 0.19:1.000:. ./.:4:223,51:.: 2.04:1.000:. ./.:4:150,43:.:-0.01:1.000:. ./.:4:87,58:.:-1.23:1.000:. ./.:4:109,35:.:-1.25:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:161,37:.: 0.12:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:184,45:.: 0.90:1.000:. ./.:4:152,48:.: 0.17:0.998:. ./.:4:178,51:.: 0.90:1.000:. ./.:4:186,50:.: 1.08:1.000:. ./.:4:124,39:.:-0.77:1.000:. ./.:4:156,61:.: 0.60:1.000:. ./.:4:121,93:.: 0.52:1.000:. ./.:4:102,22:.:-1.76:1.000:. ./.:4:125,89:.: 0.52:1.000:. ./.:4:150,50:.: 0.17:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:159,43:.: 0.22:1.000:. ./.:4:136,38:.:-0.49:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:147,41:.:-0.14:1.000:. ./.:4:143,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:121,35:.:-0.95:1.000:. ./.:4:85,87:.:-0.54:1.000:. ./.:4:226,64:.: 2.45:1.000:. ./.:4:191,58:.: 1.41:1.000:. ./.:4:100,100:.: 0.17:1.000:. ./.:4:160,43:.: 0.24:1.000:. ./.:4:119,122:.: 1.21:1.000:. ./.:4:149,58:.: 0.34:1.000:. ./.:4:213,66:.: 2.17:1.000:. ./.:4:139,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:236,1:.: 1.11:1.000:. -chr2.1 62392216 chr2.1_062392216 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:69,61:0.47: 0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:56,13:0.19:-1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,23:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,29:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,36:0.28: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:75,27:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,20:0.26:-1.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,16:0.15:-0.45:1.000:0.990 0/0/1/1:4:53,48:0.48:-0.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:74,13:0.15:-1.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:64,64:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,16:0.15:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:57,51:0.47:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:95,26:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,57:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,48:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,42:0.42:-0.68:1.000:0.902 0/0/0/1:4:89,29:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,69:0.45: 1.33:1.000:0.979 0/0/0/1:4:115,27:0.19: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,44:0.27: 1.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,32:0.30:-0.37:1.000:0.988 0/0/0/1:4:97,27:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,30:0.28:-0.45:1.000:0.994 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,43:0.42:-0.64:1.000:0.925 0/0/0/1:4:107,26:0.20: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,49:0.43:-0.22:1.000:0.958 0/0/1/1:4:80,64:0.45: 0.95:1.000:0.975 0/0/1/1:4:50,46:0.48:-0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,20:0.25:-1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,17:0.23:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,67:0.36: 2.51:1.000:0.635 0/0/0/1:4:84,41:0.33: 0.23:1.000:0.917 0/0/1:3:51,14:0.22:-2.04:0.995:1.000 0/0/1/1:4:56,49:0.47:-0.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:64,19:0.23:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,20:0.20:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,61:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,33:0.30:-0.30:1.000:0.985 0/0/0/1:4:88,30:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,66:0.53: 0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:103,36:0.26: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,63:0.53:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,62:0.53:-0.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:60,92:0.59: 1.26:1.000:0.860 0/0/0/1:4:105,20:0.16: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,143:0.46: 7.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:59,60:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,87:0.61: 0.72:1.000:0.666 0/0/0/1:4:100,38:0.28: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,41:0.31: 0.57:1.000:0.975 0/0/1/1:4:69,70:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,101:0.62: 1.52:1.000:0.616 0/0/1/1:4:65,50:0.44:-0.15:1.000:0.960 0/0/1/1:4:70,84:0.54: 1.33:1.000:0.988 0/1/1/1:4:38,83:0.66: 0.08:1.000:0.869 0/0/0/1:4:104,40:0.28: 0.95:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,104:0.78: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:64,68:0.51: 0.50:1.000:0.880 0/1/1/1:4:43,80:0.63: 0.16:1.000:0.555 0/0/0/1:4:80,25:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,57:0.42: 0.61:1.000:0.927 0/1/1/1:4:30,124:0.76: 1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,94:0.71: 0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:61,78:0.55: 0.76:1.000:0.977 0/0/1/1:4:35,40:0.53:-1.66:1.000:0.993 0/0/0/1:4:81,38:0.32: 0.00:1.000:0.947 0/0/1/1:4:66,66:0.50: 0.50:0.578:0.997 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,95:0.57: 1.75:1.000:0.958 0/0/1/1:4:40,69:0.61:-0.37:1.000:0.639 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,26:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,55:0.52:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,74:0.57: 0.35:1.000:0.953 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,62:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,35:0.27: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,27:0.26:-0.56:0.593:0.998 0/1/1/1:4:33,98:0.71: 0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,70:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,49:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,62:0.35: 2.24:0.825:0.785 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,75:0.67:-0.45:1.000:0.932 0/0/0/1:4:87,26:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,32:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,49:0.41: 0.08:1.000:0.842 0/0/1:3:51,30:0.37:-1.44:0.999:1.000 0/0/1/1:4:53,63:0.54:-0.11:1.000:0.989 0/0/0/1:4:97,25:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,37:0.50:-1.70:1.000:0.997 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,45:0.34: 0.57:1.000:0.878 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,57:0.38: 1.26:1.000:0.531 0/0/1/1:4:60,57:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,33:0.33:-0.64:1.000:0.934 0/0/1/1:4:73,57:0.44: 0.42:1.000:0.966 0/0/0/1:4:77,23:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,43:0.32: 0.69:1.000:0.961 0/0/1/1:4:46,48:0.51:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,83:0.57: 0.95:1.000:0.957 0/0/0/1:4:80,25:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,48:0.46:-0.56:1.000:0.989 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,20:0.19:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,27:0.21: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,46:0.27: 2.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.65:0.999:1.000 0/0/1/1:4:60,79:0.56: 0.76:1.000:0.969 0/0/0/1:4:56,23:0.29:-1.51:1.000:0.989 0/0/1/1:4:70,69:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,70:0.52: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,66:0.53: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,65:0.47: 0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,59:0.54:-0.45:1.000:0.985 0/0/0/1:4:84,23:0.22:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,27:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,62:0.42: 1.07:1.000:0.926 0/0/0/1:4:87,35:0.29: 0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,20:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,92:0.70: 0.23:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,49:0.47:-0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:56,41:0.42:-0.83:1.000:0.929 0/0/1/1:4:49,44:0.47:-0.98:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,55:0.53:-0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,69:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,38:0.35:-0.41:1.000:0.751 0/0/1/1:4:47,53:0.53:-0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:94,48:0.34: 0.88:1.000:0.864 0/0/0/1:4:83,22:0.21:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,44:0.23: 2.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,68:0.57:-0.11:1.000:0.935 0/0/1/1:4:42,58:0.57:-0.72:1.000:0.950 0/0/1/1:4:43,65:0.59:-0.41:1.000:0.878 0/0/1/1:4:53,53:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,52:0.44: 0.00:1.000:0.964 0/0/1/1:4:43,71:0.61:-0.19:1.000:0.738 0/0/0/1:4:65,29:0.31:-0.94:1.000:0.971 0/0/1/1:4:55,60:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:116,29:0.20: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,53:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,35:0.30: 0.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,23:0.18: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,29:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,30:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,42:0.49:-1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,50:0.37: 0.61:1.000:0.530 0/0/0/1:4:53,20:0.28:-1.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,87:0.73:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,34:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,70:0.51: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.72:0.998:1.000 0/0/0/1:4:73,25:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,90:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,13:0.19:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,21:0.22:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,20:0.21:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,42:0.45:-0.94:1.000:0.977 0/0/0/1:4:83,26:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,48:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,27:0.30:-1.09:0.999:0.982 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,29:0.29:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,53:0.54:-0.87:1.000:0.984 0/0/0/1:4:61,35:0.37:-0.87:1.000:0.604 0/0/0/1:4:92,34:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,22:0.19:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,20:0.20:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,47:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,43:0.32: 0.57:1.000:0.943 0/0/1/1:4:54,48:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/0/0/1:4:76,24:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,51:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,84:0.49: 1.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,68:0.46: 1.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:48,44:0.48:-1.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,34:0.26: 0.46:1.000:0.998 -chr2.1 62686943 chr2.1_062686943 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:139,428:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,100:0.23:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,135:0.28:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:330,111:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,355:0.55: 0.44:1.000:0.984 0/0/1/1:4:232,320:0.56:-0.05:1.000:0.968 0/0/0/1:4:213,85:0.27:-1.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:264,258:0.47:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:209,271:0.54:-0.52:1.000:0.985 0/0/0/1:4:205,86:0.28:-1.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:130,248:0.64:-1.18:1.000:0.690 0/0/0/1:4:329,133:0.27:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:232,201:0.44:-0.82:1.000:0.970 0/0/0/1:4:394,146:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,365:0.77:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,384:0.74:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:247,287:0.52:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:441,130:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:314,328:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:344,115:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,87:0.25:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:346,128:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:286,309:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,242:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,102:0.40:-2.06:1.000:0.775 0/1/1/1:4:150,438:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:217,242:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:112,387:0.76:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,309:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:215,277:0.54:-0.44:1.000:0.986 0/0/0/1:4:386,135:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,218:0.49:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,108:0.51:-2.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:280,153:0.33:-0.82:1.000:0.909 0/0/1:3:41,15:0.25:-3.28:0.995:1.000 0/0/1/1:4:244,252:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:239,297:0.53:-0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:375,148:0.26:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:284,368:0.54: 0.60:1.000:0.985 0/0/1/1:4:260,276:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:291,319:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:148,457:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:340,387:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:155,504:0.75: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:407,449:0.50: 1.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:283,331:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:395,165:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:790,967:0.53: 7.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:294,328:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:252,743:0.74: 2.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:355,341:0.47: 0.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:343,333:0.47: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:280,277:0.47:-0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:313,308:0.47: 0.40:1.000:0.993 0/1/1/1:4:120,393:0.76:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:379,405:0.49: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:130,385:0.74:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:428,415:0.47: 1.85:1.000:0.992 0/1/1/1:4:141,460:0.75: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:160,319:0.65:-0.52:1.000:0.900 0/1/1/1:4:164,503:0.74: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:413,126:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:412,461:0.51: 2.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:185,577:0.75: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:134,447:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:154,511:0.76: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,235:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:257,272:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:156,536:0.76: 0.86:0.578:1.000 0/0/0/0:4:410,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:374,411:0.50: 1.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:303,325:0.49: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:673,1:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:381,146:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:617,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,267:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:336,354:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:582,184:0.22: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:136,482:0.77: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,317:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:395,119:0.21:-0.29:0.593:1.000 0/1/1/1:4:191,553:0.73: 1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:340,325:0.47: 0.69:1.000:0.991 0/0/1/1:4:225,241:0.49:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:502,181:0.25: 0.81:0.825:1.000 0/0/0/1:4:476,203:0.28: 0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,358:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:431,152:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:476,164:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:284,298:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/1/1:3:150,266:0.62:-0.93:0.999:1.000 0/0/1/1:4:255,284:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:320,323:0.48: 0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:114,295:0.71:-0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:472,179:0.26: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:331,359:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:418,146:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:510,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:475,179:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:248,271:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:453,148:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:162,579:0.77: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,246:0.51:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:309,352:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:142,447:0.75: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:265,275:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:301,344:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:102,338:0.76:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:535,202:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:259,300:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:297,336:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,337:0.55: 0.18:1.000:0.976 0/0/0/1:4:470,150:0.22: 0.40:0.999:1.000 0/0/1/1:4:300,314:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:289,294:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:193,551:0.73: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:320,316:0.47: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:366,355:0.47: 1.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:311,343:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:311,344:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:432,185:0.28: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:280,330:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:311,320:0.48: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:215,230:0.49:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:369,361:0.47: 1.11:1.000:0.993 0/1/1/1:4:181,499:0.72: 0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:131,455:0.77: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,300:0.54:-0.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:258,264:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:208,251:0.53:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:281,291:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,209:0.52:-1.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:104,330:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:318,372:0.52: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:233,283:0.53:-0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:421,174:0.27: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:156,502:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:304,301:0.47: 0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:125,387:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:305,282:0.46: 0.18:1.000:0.986 0/0/1/1:4:378,376:0.48: 1.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:309,350:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:309,114:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:132,378:0.73:-0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:300,366:0.53: 0.70:1.000:0.993 0/0/0/1:4:434,186:0.28: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:232,271:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:272,269:0.47:-0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:140,445:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:240,276:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:244,308:0.54:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:203,226:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,165:0.66:-2.05:1.000:0.877 0/0/0/1:4:209,95:0.29:-1.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:128,441:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:369,147:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:409,165:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:288,293:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:263,103:0.26:-1.26:0.998:0.999 0/0/0/1:4:381,145:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,358:0.77:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:351,122:0.24:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,241:0.52:-0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:238,282:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:245,260:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:249,292:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:192,223:0.52:-0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:312,94:0.21:-1.00:0.999:1.000 0/0/0/1:4:331,115:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,219:0.48:-0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:216,197:0.45:-0.95:1.000:0.984 0/0/1/1:4:186,223:0.52:-0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:258,249:0.47:-0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:194,214:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:365,136:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,288:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:360,160:0.29:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:248,298:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:229,300:0.55:-0.20:1.000:0.983 0/0/1/1:4:215,220:0.48:-0.81:1.000:0.995 0/1/1/1:4:115,392:0.76:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:310,293:0.46: 0.29:1.000:0.989 0/1/1/1:4:151,442:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:217,213:0.47:-0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:382,135:0.24:-0.27:1.000:1.000 -chr2.1 62903490 chr2.1_062903490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:73,7:.:-1.16:1.000:. ./.:4:188,3:.: 0.65:1.000:. ./.:4:209,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:218,3:.: 1.13:1.000:. ./.:4:80,13:.:-0.95:1.000:. ./.:4:128,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:213,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:118,6:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:77,9:.:-1.06:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:115,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:219,2:.: 1.13:1.000:. ./.:4:68,10:.:-1.19:1.000:. ./.:4:127,6:.:-0.30:1.000:. ./.:4:239,5:.: 1.51:1.000:. ./.:4:207,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:264,3:.: 1.88:1.000:. ./.:4:226,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:72,11:.:-1.11:1.000:. ./.:4:129,8:.:-0.23:1.000:. ./.:4:279,3:.: 2.12:1.000:. ./.:4:134,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:144,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:171,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:58,9:.:-1.37:1.000:. ./.:4:166,6:.: 0.34:1.000:. ./.:4:132,6:.:-0.22:1.000:. ./.:4:216,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:81,2:.:-1.11:1.000:. ./.:3:24,0:.:-2.07:0.995:. ./.:4:194,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:237,2:.: 1.43:1.000:. ./.:4:203,6:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:148,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:148,6:.: 0.04:1.000:. ./.:4:89,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:69,14:.:-1.11:1.000:. ./.:4:77,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:165,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:74,6:.:-1.16:1.000:. ./.:4:240,4:.: 1.51:1.000:. ./.:4:42,4:.:-1.71:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:85,16:.:-0.82:1.000:. ./.:4:114,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:201,10:.: 0.97:1.000:. ./.:4:224,4:.: 1.25:1.000:. ./.:4:79,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:134,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:135,6:.:-0.17:1.000:. ./.:4:177,10:.: 0.58:1.000:. ./.:4:152,13:.: 0.22:1.000:. ./.:6:86,8:.:-0.93:1.000:. ./.:4:89,8:.:-0.88:1.000:. ./.:4:171,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:191,12:.: 0.84:1.000:. ./.:4:146,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:72,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:220,2:.: 1.15:1.000:. ./.:4:151,5:.: 0.08:1.000:. ./.:4:163,7:.: 0.30:0.578:. ./.:4:226,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:94,10:.:-0.77:1.000:. ./.:4:198,4:.: 0.82:1.000:. ./.:4:367,0:.: 3.51:1.000:. ./.:4:212,3:.: 1.04:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:223,6:.: 1.26:1.000:. ./.:4:210,4:.: 1.02:1.000:. ./.:4:156,3:.: 0.13:1.000:. ./.:4:148,6:.: 0.04:1.000:. ./.:4:238,6:.: 1.51:1.000:. ./.:4:170,3:.: 0.35:0.593:. ./.:4:145,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,9:.:-0.96:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:138,3:.:-0.17:0.825:. ./.:4:178,9:.: 0.58:1.000:. ./.:4:137,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:219,5:.: 1.18:1.000:. ./.:4:133,6:.:-0.20:1.000:. ./.:3:136,7:.:-0.13:0.999:. ./.:4:179,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:234,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:40,6:.:-1.71:1.000:. ./.:4:171,9:.: 0.47:1.000:. ./.:4:159,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:134,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:173,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:297,4:.: 2.43:1.000:. ./.:4:129,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:173,7:.: 0.47:1.000:. ./.:4:58,8:.:-1.39:1.000:. ./.:4:69,11:.:-1.16:1.000:. ./.:4:123,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:217,8:.: 1.20:1.000:. ./.:4:121,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:135,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:190,4:.: 0.69:1.000:. ./.:4:221,3:.: 1.18:1.000:. ./.:4:67,13:.:-1.16:1.000:. ./.:4:164,13:.: 0.42:1.000:. ./.:4:176,7:.: 0.52:0.999:. ./.:4:76,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:54,4:.:-1.52:1.000:. ./.:4:70,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:190,3:.: 0.68:1.000:. ./.:4:72,5:.:-1.21:1.000:. ./.:4:141,9:.:-0.02:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:203,4:.: 0.91:1.000:. ./.:4:201,3:.: 0.86:1.000:. ./.:4:173,6:.: 0.45:1.000:. ./.:4:67,9:.:-1.22:1.000:. ./.:4:57,9:.:-1.39:1.000:. ./.:4:143,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:166,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:138,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:175,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:159,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:124,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:48,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:141,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:60,5:.:-1.40:1.000:. ./.:4:158,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:73,11:.:-1.09:1.000:. ./.:4:53,7:.:-1.48:1.000:. ./.:4:115,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,12:.:-1.42:1.000:. ./.:4:82,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:228,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:123,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:60,2:.:-1.45:1.000:. ./.:4:101,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:182,7:.: 0.61:1.000:. ./.:4:141,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:83,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:73,6:.:-1.17:1.000:. ./.:4:221,3:.: 1.18:1.000:. ./.:4:149,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:51,1:.:-1.61:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,24:.:-2.07:1.000:. ./.:4:144,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:158,6:.: 0.21:1.000:. ./.:4:234,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:119,3:.:-0.48:0.998:. ./.:4:117,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:136,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:170,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:117,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:243,6:.: 1.59:1.000:. ./.:4:129,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:126,4:.:-0.35:1.000:. ./.:4:186,3:.: 0.61:0.999:. ./.:4:141,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,4:.:-1.58:1.000:. ./.:4:45,4:.:-1.66:1.000:. ./.:4:123,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:139,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:187,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:171,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:76,11:.:-1.04:1.000:. ./.:4:204,3:.: 0.91:1.000:. ./.:4:89,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:131,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:247,2:.: 1.59:1.000:. ./.:4:79,13:.:-0.96:1.000:. ./.:4:161,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:204,4:.: 0.92:1.000:. -chr2.1 63400783 chr2.1_063400783 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:40,58:0.58: 0.27:1.000:0.909 0/0/0/1:4:38,17:0.32:-1.03:1.000:0.948 0/0/0/1:4:55,14:0.22:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,20:0.32:-0.69:1.000:0.962 0/1/1/1:4:14,71:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.30:-0.78:1.000:0.986 0/0/0/1:4:22,5:0.20:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,23:0.32:-0.45:1.000:0.943 0/0/1/1:4:20,34:0.61:-1.06:1.000:0.672 0/0/0/1:4:85,13:0.14: 0.27:1.000:0.970 0/0/0/1:4:96,19:0.18: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,9:0.23:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,32:0.52:-0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:50,19:0.29:-0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:36,33:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,25:0.52:-1.21:1.000:0.996 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,12:0.23:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,20:0.30:-0.54:1.000:0.989 0/0/0/0:4:79,7:0.09:-0.09:1.000:0.968 0/0/0/1:4:42,15:0.28:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,9:0.16:-0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,17:0.40:-1.36:1.000:0.772 0/0/0/1:4:46,19:0.31:-0.72:1.000:0.979 0/0/1/1:4:38,38:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,15:0.30:-1.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:19,34:0.62:-1.09:1.000:0.553 0/0/1/1:4:42,43:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,28:0.48:-0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,12:0.20:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.29:-1.18:1.000:0.990 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,9:0.12:-0.36:1.000:0.840 0/0/1:3:39,14:0.28:-1.09:0.995:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,15:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,65:0.50: 1.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,19:0.30:-0.66:1.000:0.987 0/0/0/1:4:94,39:0.31: 1.33:1.000:0.978 0/0/0/1:4:54,30:0.37:-0.15:1.000:0.572 0/1/1/1:4:26,101:0.74: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,55:0.45: 1.09:1.000:0.980 0/0/1/1:4:73,50:0.42: 1.03:1.000:0.904 0/0/1/1:4:72,77:0.52: 1.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,35:0.37: 0.24:1.000:0.524 0/0/0/0:4:240,0:0.00: 4.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,66:0.45: 1.87:1.000:0.977 0/0/0/1:4:86,28:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,24:0.28: 0.00:1.000:0.994 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,66:0.52: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,27:0.43:-0.75:1.000:0.953 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 2.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,25:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:122,41:0.27: 2.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:94,36:0.29: 1.24:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:77,49:0.40: 1.12:1.000:0.642 0/0/1/1:4:58,52:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:67,22:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,88:0.55: 2.15:1.000:0.982 0/0/0/1:4:128,28:0.19: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,23:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,62:0.46: 1.48:1.000:0.987 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,28:0.29: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:60,45:0.44: 0.48:0.578:0.966 0/0/0/0:4:63,1:0.02:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,73:0.49: 1.90:1.000:0.996 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,22:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,57:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,81:0.49: 2.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:110,32:0.24: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,12:0.20:-0.72:0.593:1.000 0/0/0/1:4:112,26:0.20: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,48:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,31:0.19: 2.66:0.825:1.000 0/0/1/1:4:57,63:0.53: 0.94:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,16:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,16:0.20:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,19:0.20: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,28:0.31: 0.18:1.000:0.976 0/0/1:3:34,12:0.28:-1.30:0.993:1.000 0/0/0/0:4:120,1:0.01: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,32:0.25: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,28:0.47:-0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,57:0.47: 1.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:113,29:0.22: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,53:0.56: 0.15:1.000:0.969 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,30:0.22: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,10:0.24:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,37:0.40: 0.18:1.000:0.799 0/1/1/1:4:25,55:0.66:-0.27:1.000:0.857 0/1/1/1:4:35,80:0.66: 0.79:1.000:0.896 0/0/1/1:4:73,55:0.44: 1.18:1.000:0.968 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,34:0.28: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,22:0.45:-1.18:1.000:0.980 0/0/1/1:4:51,54:0.52: 0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,20:0.26:-0.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,93:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,14:0.22:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,58:0.41: 1.66:0.999:0.886 0/0/1/1:4:50,50:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,62:0.65: 0.09:1.000:0.767 0/0/1/1:4:44,54:0.55: 0.27:1.000:0.981 0/0/0/0:4:108,1:0.01: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,57:0.55: 0.42:1.000:0.979 0/0/1/1:4:53,41:0.45: 0.15:1.000:0.976 0/0/1/1:4:58,51:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:81,26:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,26:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,27:0.24: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,51:0.73:-0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,65:0.64: 0.27:1.000:0.674 0/0/0/1:4:94,26:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,27:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,42:0.53:-0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,34:0.48:-0.48:1.000:0.994 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,29:0.35:-0.09:1.000:0.794 0/0/0/1:4:48,19:0.30:-0.66:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,36:0.57:-0.81:1.000:0.940 0/0/0/1:4:85,22:0.22: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,65:0.72:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,18:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,46:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,53:0.47: 0.82:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,42:0.45: 0.21:1.000:0.978 0/0/1/1:4:44,41:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,44:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,19:0.36:-1.06:1.000:0.639 0/0/1/1:4:39,34:0.48:-0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,66:0.70: 0.03:1.000:0.980 0/0/1/1:4:53,38:0.43: 0.06:1.000:0.943 0/0/1/1:4:34,55:0.60: 0.00:1.000:0.770 0/1/1/1:4:15,64:0.76:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,42:0.56:-0.42:1.000:0.973 0/0/0/1:4:77,19:0.21: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,23:0.37:-0.72:1.000:0.614 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,9:0.10: 0.21:1.000:0.810 0/0/0/1:4:30,8:0.22:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,52:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,24:0.47:-1.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:52,13:0.21:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,30:0.51:-0.90:0.998:0.996 0/0/1/1:4:38,35:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,11:0.29:-1.48:1.000:0.992 0/0/0/1:4:56,13:0.20:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,12:0.19:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,16:0.27:-0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,21:0.52:-1.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,16:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,25:0.46:-1.00:1.000:0.985 0/0/0/1:4:38,16:0.31:-1.06:0.999:0.974 0/0/1/1:4:34,33:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,12:0.25:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,30:0.61:-1.24:1.000:0.714 0/0/1/1:4:36,25:0.42:-0.84:1.000:0.918 0/0/0/1:4:58,27:0.33:-0.12:1.000:0.918 0/0/0/1:4:55,24:0.32:-0.30:1.000:0.961 0/0/0/1:4:58,29:0.35:-0.06:1.000:0.826 0/0/1/1:4:34,37:0.52:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,35:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,56:0.65:-0.18:1.000:0.773 0/0/0/1:4:50,13:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,38:0.64:-0.97:1.000:0.705 0/0/1/1:4:35,33:0.49:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,26:0.44:-0.87:1.000:0.973 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,13:0.26:-1.06:1.000:0.999 -chr2.1 63597346 chr2.1_063597346 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:453,165:.: 0.86:1.000:. ./.:4:371,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:683,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:376,141:.: 0.04:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:483,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:121,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:82,79:.:-2.82:1.000:. ./.:4:487,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:566,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:359,120:.:-0.26:1.000:. ./.:4:429,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:423,121:.: 0.26:1.000:. ./.:4:356,123:.:-0.26:1.000:. ./.:4:484,182:.: 1.24:1.000:. ./.:4:622,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:98,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:364,133:.:-0.12:1.000:. ./.:4:716,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:349,139:.:-0.19:1.000:. ./.:4:135,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:565,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:351,144:.:-0.13:1.000:. ./.:4:694,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:315,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:52,21:.:-3.52:1.000:. ./.:4:131,58:.:-2.59:1.000:. ./.:3:21,1:.:-3.93:0.995:. ./.:4:317,120:.:-0.60:1.000:. ./.:4:363,129:.:-0.16:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:382,134:.: 0.04:1.000:. ./.:4:401,138:.: 0.22:1.000:. ./.:4:454,146:.: 0.71:1.000:. ./.:4:440,154:.: 0.66:1.000:. ./.:4:640,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:368,128:.:-0.12:1.000:. ./.:4:684,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:416,146:.: 0.41:1.000:. ./.:4:654,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:371,164:.: 0.19:1.000:. ./.:4:348,132:.:-0.25:1.000:. ./.:4:460,175:.: 0.99:1.000:. ./.:4:385,114:.:-0.10:1.000:. ./.:4:507,185:.: 1.45:1.000:. ./.:4:388,134:.: 0.08:1.000:. ./.:4:500,143:.: 1.06:1.000:. ./.:4:474,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:432,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:395,128:.: 0.09:1.000:. ./.:4:474,174:.: 1.10:1.000:. ./.:4:328,123:.:-0.49:1.000:. ./.:6:342,116:.:-0.43:1.000:. ./.:4:482,145:.: 0.93:1.000:. ./.:4:492,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:594,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:335,134:.:-0.34:1.000:. ./.:4:448,176:.: 0.90:1.000:. ./.:4:380,125:.:-0.05:1.000:. ./.:4:502,160:.: 1.21:1.000:. ./.:4:396,153:.: 0.30:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.74:0.578:. ./.:4:452,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:522,162:.: 1.39:1.000:. ./.:4:445,162:.: 0.77:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:315,126:.:-0.57:1.000:. ./.:4:361,117:.:-0.27:1.000:. ./.:4:562,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.34:0.593:. ./.:4:448,151:.: 0.70:1.000:. ./.:4:474,169:.: 1.06:1.000:. ./.:4:304,113:.:-0.76:1.000:. ./.:4:426,127:.: 0.33:0.825:. ./.:4:576,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:324,121:.:-0.53:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:370,120:.:-0.17:1.000:. ./.:3:347,0:.:-1.32:0.993:. ./.:4:383,123:.:-0.04:1.000:. ./.:4:574,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:323,108:.:-0.65:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:370,151:.: 0.08:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:432,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:498,150:.: 1.10:1.000:. ./.:4:406,138:.: 0.26:1.000:. ./.:4:490,180:.: 1.27:1.000:. ./.:4:655,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:588,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:303,118:.:-0.73:1.000:. ./.:4:311,136:.:-0.52:1.000:. ./.:4:497,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:722,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:444,122:.: 0.44:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:416,181:.: 0.69:1.000:. ./.:4:488,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:470,174:.: 1.07:1.000:. ./.:4:375,150:.: 0.11:1.000:. ./.:4:384,148:.: 0.17:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:589,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:553,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:423,146:.: 0.46:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:536,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:500,184:.: 1.39:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:489,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:379,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:315,102:.:-0.76:1.000:. ./.:4:396,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:293,102:.:-0.94:1.000:. ./.:4:289,93:.:-1.04:1.000:. ./.:4:466,172:.: 1.02:1.000:. ./.:4:563,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:563,169:.: 1.77:1.000:. ./.:4:482,158:.: 1.03:1.000:. ./.:4:337,139:.:-0.28:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:375,104:.:-0.26:1.000:. ./.:4:461,142:.: 0.74:1.000:. ./.:4:426,149:.: 0.51:1.000:. ./.:4:386,127:.: 0.01:1.000:. ./.:4:345,114:.:-0.42:1.000:. ./.:4:728,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:862,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:395,136:.: 0.16:1.000:. ./.:4:495,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:386,148:.: 0.18:1.000:. ./.:4:335,89:.:-0.70:1.000:. ./.:4:145,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:426,166:.: 0.65:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:469,144:.: 0.82:1.000:. ./.:4:453,154:.: 0.77:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.38:0.998:. ./.:4:629,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:311,121:.:-0.64:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:345,120:.:-0.37:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:434,1:.:-0.61:0.999:. ./.:4:524,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:340,117:.:-0.44:1.000:. ./.:4:328,110:.:-0.59:1.000:. ./.:4:224,82:.:-1.65:1.000:. ./.:4:441,135:.: 0.52:1.000:. ./.:4:312,122:.:-0.62:1.000:. ./.:4:475,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:500,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:540,182:.: 1.69:1.000:. ./.:4:563,203:.: 2.05:1.000:. ./.:4:275,127:.:-0.88:1.000:. ./.:4:541,1:.: 0.25:1.000:. -chr2.1 63806235 chr2.1_063806235 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:104,84:0.46:-0.06:1.000:0.988 0/1/1/1:4:39,99:0.73:-0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,109:0.55: 0.20:1.000:0.976 0/0/1/1:4:84,77:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,43:0.20: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,115:0.70:-0.44:1.000:0.987 0/0/0/1:4:56,29:0.36:-1.94:1.000:0.721 0/0/1/1:4:91,97:0.53:-0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:105,32:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,27:0.50:-2.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,58:0.74:-2.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,112:0.78:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,37:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,90:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,76:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,27:0.20:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,155:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,118:0.69:-0.32:1.000:0.976 0/1/1/1:4:44,174:0.81: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,99:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,17:0.45:-2.78:1.000:0.981 0/1/1/1:4:53,144:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,90:0.45: 0.27:1.000:0.981 0/1/1/1:4:46,94:0.69:-0.94:1.000:0.965 0/0/1/1:4:12,12:0.51:-3.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,57:0.29: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,69:0.49:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,83:0.57:-0.77:1.000:0.944 0/0/0/1:4:181,55:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,32:0.24:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,109:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,68:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,18:0.83:-3.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,41:0.65:-2.32:1.000:0.830 0/0/1:3:10,8:0.46:-3.16:0.995:0.939 0/1/1/1:4:60,100:0.64:-0.57:1.000:0.675 0/1/1/1:4:55,107:0.67:-0.53:1.000:0.937 0/0/1/1:4:94,90:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,126:0.53: 0.96:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,155:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,194:0.74: 1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,124:0.53: 0.87:1.000:0.991 0/0/0/1:4:187,73:0.30: 1.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:117,110:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,71:0.30: 1.09:1.000:0.986 0/0/1/1:4:135,119:0.48: 1.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,84:0.43: 0.18:1.000:0.954 0/1/1/1:4:18,48:0.74:-2.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,124:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,94:0.53:-0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,160:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,183:0.77: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,158:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,134:0.52: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,43:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,199:0.78: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,91:0.46: 0.21:1.000:0.989 0/1/1/1:4:66,196:0.76: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,118:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:96,144:0.61: 0.89:1.000:0.746 0/0/1/1:4:121,116:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,109:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:208,63:0.25: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,109:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,107:0.47: 0.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:123,99:0.46: 0.56:1.000:0.988 0/1/1/1:4:43,82:0.67:-1.21:1.000:0.920 0/1/1/1:4:56,156:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,66:0.29: 0.85:0.578:0.990 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,131:0.47: 1.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,93:0.72:-1.10:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,242:1.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,94:0.49: 0.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,269:1.00: 1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,160:0.73: 0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:61,151:0.73: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,101:0.46: 0.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:238,63:0.23: 2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,126:0.45: 1.77:1.000:0.982 0/1/1/1:4:53,132:0.73:-0.11:0.593:0.997 0/0/1/1:4:111,115:0.52: 0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:131,148:0.54: 1.60:1.000:0.984 0/1/1/1:4:37,119:0.77:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,227:0.79: 1.86:0.825:1.000 0/0/1/1:4:150,134:0.49: 1.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,59:0.43:-0.92:1.000:0.955 0/0/1/1:4:103,93:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,114:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,155:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/0/1:3:83,41:0.35:-1.23:0.993:1.000 0/1/1/1:4:40,145:0.79:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,167:0.55: 2.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:68,72:0.53:-0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:147,126:0.48: 1.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,217:0.77: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,99:0.51: 0.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,195:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,181:0.77: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,136:0.72: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,102:0.79:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,39:0.17: 1.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:137,45:0.26:-0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,56:0.26: 0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:165,46:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,175:0.72: 1.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,138:0.68: 0.29:1.000:0.955 0/0/0/1:4:123,37:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,110:0.54: 0.32:1.000:0.987 0/0/1/1:4:101,88:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:176,52:0.25: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,126:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,109:0.50: 0.60:0.999:0.997 0/0/1/1:4:141,110:0.45: 1.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:143,45:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,119:0.47: 1.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:30,134:0.83:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,118:0.54: 0.60:1.000:0.987 0/0/0/1:4:158,47:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,45:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,89:0.46: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:111,93:0.47: 0.23:1.000:0.992 0/1/1/1:4:59,208:0.79: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,38:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,55:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,114:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,114:0.47: 1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:110,117:0.53: 0.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:134,37:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,122:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:192,57:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,113:0.77:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,70:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,124:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,46:0.27:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,155:0.73: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:113,120:0.53: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:112,111:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,54:0.29: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,103:0.53: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:113,102:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,189:0.79: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,120:0.71:-0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,79:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,45:0.20: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,123:0.48: 1.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,37:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,37:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,84:0.49:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,116:0.54: 0.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:40,121:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,108:0.77:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,30:0.47:-2.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:52,57:0.54:-1.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:175,68:0.30: 0.94:1.000:0.988 0/0/1/1:4:90,91:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,129:0.80:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,105:0.70:-0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:87,84:0.51:-0.37:0.998:0.997 0/0/1/1:4:84,77:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,65:0.47:-0.90:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,73:0.51:-0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,118:0.68:-0.26:1.000:0.955 0/0/1/1:4:93,78:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:161,60:0.29: 0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,66:0.47:-0.83:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,28:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,87:0.72:-1.23:0.999:0.994 0/0/1/1:4:84,64:0.45:-0.79:1.000:0.977 0/1/1/1:4:40,97:0.72:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,61:0.53:-1.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:60,75:0.57:-1.03:1.000:0.948 0/1/1/1:4:37,126:0.78:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,122:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,108:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,48:0.32:-0.63:1.000:0.948 0/0/1/1:4:97,96:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,60:0.28: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,93:0.47: 0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,66:0.44:-0.63:1.000:0.959 0/0/0/1:4:141,33:0.21:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,157:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,74:0.44:-0.33:1.000:0.971 0/1/1/1:4:37,93:0.73:-1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,112:0.71:-0.55:1.000:0.991 -chr2.1 63981014 chr2.1_063981014 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,45:.: 1.29:1.000:. ./.:4:61,30:.:-0.79:1.000:. ./.:4:82,52:.: 0.70:1.000:. ./.:4:97,47:.: 1.05:1.000:. ./.:4:113,33:.: 1.12:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:58,26:.:-1.03:1.000:. ./.:4:61,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,52:.:-0.55:1.000:. ./.:4:49,21:.:-1.52:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:97,26:.: 0.32:1.000:. ./.:4:57,73:.: 0.56:1.000:. ./.:4:87,41:.: 0.49:1.000:. ./.:4:84,28:.:-0.06:1.000:. ./.:4:54,78:.: 0.63:1.000:. ./.:4:96,34:.: 0.56:1.000:. ./.:4:80,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:107,45:.: 1.33:1.000:. ./.:4:118,50:.: 1.88:1.000:. ./.:4:43,21:.:-1.73:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,34:.: 0.91:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:23,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:35,61:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:69,36:.:-0.30:1.000:. ./.:4:91,94:.: 2.47:1.000:. ./.:4:63,94:.: 1.50:1.000:. ./.:4:61,34:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,31:.:-1.49:1.000:. ./.:4:16,17:.:-2.81:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.96:1.000:. ./.:3:18,5:.:-3.15:0.995:. ./.:4:75,49:.: 0.36:1.000:. ./.:4:59,27:.:-0.96:1.000:. ./.:4:86,35:.: 0.25:1.000:. ./.:4:66,28:.:-0.69:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:68,32:.:-0.48:1.000:. ./.:4:72,24:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,17:.:-1.49:1.000:. ./.:4:78,75:.: 1.36:1.000:. ./.:4:78,39:.: 0.11:1.000:. ./.:4:121,46:.: 1.85:1.000:. ./.:4:35,28:.:-1.76:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.76:1.000:. ./.:4:24,6:.:-2.91:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:98,38:.: 0.77:1.000:. ./.:4:81,38:.: 0.18:1.000:. ./.:4:49,80:.: 0.53:1.000:. ./.:4:54,21:.:-1.35:1.000:. ./.:4:48,79:.: 0.46:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:50,70:.: 0.22:1.000:. ./.:6:77,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,45:.: 1.64:1.000:. ./.:4:68,34:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,72:.: 0.60:1.000:. ./.:4:40,59:.:-0.51:1.000:. ./.:4:62,80:.: 0.98:1.000:. ./.:4:68,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:90,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,63:.:-0.34:0.578:. ./.:4:95,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:106,38:.: 1.05:1.000:. ./.:4:48,14:.:-1.80:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:70,40:.:-0.13:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:61,76:.: 0.81:1.000:. ./.:4:95,50:.: 1.09:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.34:0.593:. ./.:4:59,75:.: 0.70:1.000:. ./.:4:110,36:.: 1.12:1.000:. ./.:4:66,41:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.21:0.825:. ./.:4:129,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:32,52:.:-1.03:1.000:. ./.:4:92,35:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.14:1.000:. ./.:3:50,28:.:-1.24:0.993:. ./.:4:74,33:.:-0.23:1.000:. ./.:4:85,55:.: 0.91:1.000:. ./.:4:54,18:.:-1.45:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,49:.: 1.36:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:62,73:.: 0.74:1.000:. ./.:4:87,26:.:-0.03:1.000:. ./.:4:96,31:.: 0.46:1.000:. ./.:4:48,46:.:-0.69:1.000:. ./.:4:85,41:.: 0.43:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:57,77:.: 0.70:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:85,39:.: 0.36:1.000:. ./.:4:87,31:.: 0.15:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.54:0.999:. ./.:4:97,31:.: 0.49:1.000:. ./.:4:56,7:.:-1.76:1.000:. ./.:4:107,39:.: 1.12:1.000:. ./.:4:81,27:.:-0.20:1.000:. ./.:4:63,32:.:-0.65:1.000:. ./.:4:51,70:.: 0.25:1.000:. ./.:4:47,64:.:-0.10:1.000:. ./.:4:91,40:.: 0.60:1.000:. ./.:4:79,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:93,34:.: 0.46:1.000:. ./.:4:86,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,66:.: 0.43:1.000:. ./.:4:120,38:.: 1.54:1.000:. ./.:4:39,49:.:-0.89:1.000:. ./.:4:42,57:.:-0.51:1.000:. ./.:4:76,36:.:-0.06:1.000:. ./.:4:49,72:.: 0.25:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:59,21:.:-1.17:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:71,30:.:-0.44:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,33:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,79:.: 1.05:1.000:. ./.:4:96,49:.: 1.09:1.000:. ./.:4:76,32:.:-0.20:1.000:. ./.:4:88,38:.: 0.43:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:73,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:107,43:.: 1.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:59,73:.: 0.63:1.000:. ./.:4:74,24:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,27:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,47:.: 0.29:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:95,39:.: 0.70:1.000:. ./.:4:51,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:75,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:48,50:.:-0.55:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:87,31:.: 0.15:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.20:0.998:. ./.:4:97,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,71:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,35:.:-0.76:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:82,39:.: 0.25:1.000:. ./.:4:26,27:.:-2.11:1.000:. ./.:4:84,47:.: 0.60:1.000:. ./.:4:63,66:.: 0.53:1.000:. ./.:4:101,43:.: 1.05:0.999:. ./.:4:104,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:95,30:.: 0.39:1.000:. ./.:4:51,31:.:-1.10:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:51,35:.:-0.96:1.000:. ./.:4:56,65:.: 0.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:91,36:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:81,86:.: 1.85:1.000:. ./.:4:112,71:.: 2.41:1.000:. ./.:4:117,49:.: 1.81:1.000:. ./.:4:91,39:.: 0.56:1.000:. ./.:4:91,35:.: 0.43:1.000:. -chr2.1 64241380 chr2.1_064241380 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:3:14,0:.:-0.82:0.995:. ./.:4:10,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.66:1.000:. ./.:6:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.68:0.578:. ./.:4:7,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.39:0.593:. ./.:4:75,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:0.825:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:3:19,0:.:-0.67:0.993:. ./.:4:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:80,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:76,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:156,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.82:0.998:. ./.:4:7,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.69:0.999:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.94:1.000:. -chr2.1 64602891 chr2.1_064602891 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:240,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.24:1.000:. ./.:3:50,0:.:-2.76:0.995:. ./.:4:294,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.51:1.000:. ./.:6:238,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.76:0.578:. ./.:4:227,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:333,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.24:0.593:. ./.:4:229,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.17:0.825:. ./.:4:317,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.75:1.000:. ./.:3:205,0:.:-0.63:0.993:. ./.:4:267,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:208,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:379,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.21:0.999:. ./.:4:255,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:402,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:323,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.21:0.998:. ./.:4:357,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.21:0.999:. ./.:4:269,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:347,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.09:1.000:. -chr2.1 64769324 chr2.1_064769324 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:39,41:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,24:.: 1.25:1.000:. ./.:4:73,25:.: 1.63:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.64:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:41,14:.:-0.39:1.000:. ./.:4:31,43:.: 0.50:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.55:1.000:. ./.:4:18,2:.:-2.04:1.000:. ./.:4:31,39:.: 0.31:1.000:. ./.:4:48,26:.: 0.50:1.000:. ./.:4:56,18:.: 0.50:1.000:. ./.:4:45,31:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,18:.: 1.20:1.000:. ./.:4:50,17:.: 0.17:1.000:. ./.:4:64,19:.: 0.92:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:77,22:.: 1.67:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:81,27:.: 2.10:1.000:. ./.:4:70,15:.: 1.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:45,15:.:-0.16:1.000:. ./.:4:67,20:.: 1.11:1.000:. ./.:4:45,25:.: 0.31:1.000:. ./.:4:47,42:.: 1.20:1.000:. ./.:4:66,14:.: 0.78:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:49,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:8,6:.:-2.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:21,30:.:-0.58:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:39,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,14:.: 0.03:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:25,14:.:-1.14:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.39:1.000:. ./.:4:53,14:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.86:1.000:. ./.:4:17,5:.:-1.94:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:68,17:.: 1.02:1.000:. ./.:4:43,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:53,20:.: 0.45:1.000:. ./.:4:61,25:.: 1.06:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.08:1.000:. ./.:4:42,22:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,6:.:-1.14:1.000:. ./.:4:32,13:.:-0.86:1.000:. ./.:6:29,7:.:-1.29:1.000:. ./.:4:46,5:.:-0.58:1.000:. ./.:4:53,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:43,13:.:-0.35:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:33,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:30,13:.:-0.96:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.16:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.25:0.578:. ./.:4:35,39:.: 0.50:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:31,14:.:-0.86:1.000:. ./.:4:69,15:.: 0.97:1.000:. ./.:4:50,14:.: 0.03:1.000:. ./.:4:38,9:.:-0.77:1.000:. ./.:4:42,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,18:.: 0.26:1.000:. ./.:4:47,24:.: 0.36:1.000:. ./.:4:37,10:.:-0.77:0.593:. ./.:4:42,31:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,25:.:-0.16:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.96:0.825:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:43,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,14:.:-0.91:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. ./.:3:31,0:.:-1.52:0.993:. ./.:4:59,6:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,14:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.53:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.72:1.000:. ./.:4:24,9:.:-1.43:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:55,18:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:33,18:.:-0.58:1.000:. ./.:4:32,9:.:-1.05:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.58:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:38,33:.: 0.36:1.000:. ./.:4:89,22:.: 2.24:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:48,12:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,25:.: 1.49:1.000:. ./.:4:44,11:.:-0.39:0.999:. ./.:4:41,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:25,10:.:-1.33:1.000:. ./.:4:37,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:51,11:.:-0.06:1.000:. ./.:4:30,29:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,26:.:-0.86:1.000:. ./.:4:44,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:17,19:.:-1.29:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:81,27:.: 2.10:1.000:. ./.:4:25,30:.:-0.39:1.000:. ./.:4:43,16:.:-0.21:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:8,28:.:-1.29:1.000:. ./.:4:19,18:.:-1.24:1.000:. ./.:4:31,6:.:-1.24:1.000:. ./.:4:31,10:.:-1.05:1.000:. ./.:4:63,17:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,7:.:-1.33:1.000:. ./.:4:24,12:.:-1.29:1.000:. ./.:4:58,24:.: 0.88:1.000:. ./.:4:72,19:.: 1.30:1.000:. ./.:4:29,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.91:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:43,6:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,14:.:-0.72:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,16:.:-0.44:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.67:1.000:. ./.:4:87,27:.: 2.38:1.000:. ./.:4:90,19:.: 2.14:1.000:. ./.:4:65,21:.: 1.06:1.000:. ./.:4:64,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:77,35:.: 2.28:1.000:. ./.:4:44,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,28:.: 2.05:1.000:. ./.:4:68,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,3:.:-2.32:1.000:. ./.:4:48,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:34,29:.:-0.02:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:84,14:.: 1.63:1.000:. ./.:4:69,17:.: 1.06:1.000:. ./.:4:46,18:.: 0.03:0.998:. ./.:4:91,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:58,29:.: 1.11:1.000:. ./.:4:54,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:47,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:56,15:.: 0.36:1.000:. ./.:4:52,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:82,22:.: 1.91:0.999:. ./.:4:54,23:.: 0.64:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:56,17:.: 0.45:1.000:. ./.:4:53,21:.: 0.50:1.000:. ./.:4:54,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:53,12:.: 0.08:1.000:. ./.:4:42,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:31,26:.:-0.30:1.000:. ./.:4:49,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:65,23:.: 1.16:1.000:. ./.:4:69,13:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,39:.: 0.26:1.000:. ./.:4:62,28:.: 1.25:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:90,26:.: 2.47:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,41:.: 0.83:1.000:. -chr2.1 64883289 chr2.1_064883289 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:46,154:0.72: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,41:0.26:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,39:0.28:-0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,40:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,74:0.27: 1.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,197:0.75: 2.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,87:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:82,45:0.32:-0.72:1.000:0.959 0/0/0/1:4:101,19:0.14:-0.88:1.000:0.963 0/1/1/1:4:22,133:0.81:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,27:0.24:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,41:0.20: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,147:0.78: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,69:0.29: 1.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,101:0.54: 0.38:1.000:0.990 0/0/0/1:4:143,55:0.24: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,67:0.30: 0.88:1.000:0.981 0/0/0/1:4:120,26:0.16:-0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:106,36:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,36:0.21:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,99:0.47: 0.79:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,131:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,19:0.14:-0.83:1.000:0.954 0/0/0/1:4:118,42:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,82:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,92:0.57:-0.19:1.000:0.946 0/0/0/1:4:120,73:0.34: 0.79:1.000:0.862 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,56:0.46:-1.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:65,11:0.13:-1.88:1.000:0.878 0/0/1/1:4:42,57:0.53:-1.36:1.000:0.991 0/0/0:3:136,0:0.00:-0.51:0.995:1.000 0/0/0/1:4:118,50:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,93:0.48: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,75:0.47:-0.26:1.000:0.992 0/0/0/1:4:99,62:0.35: 0.06:1.000:0.812 0/1/1/1:4:26,98:0.74:-0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,119:0.52: 1.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:136,55:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,76:0.46:-0.17:1.000:0.989 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,55:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:327,110:0.22: 6.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,76:0.58:-0.86:1.000:0.895 0/0/1/1:4:70,94:0.53: 0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,96:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,191:0.72: 2.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,71:0.46:-0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:136,51:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,28:0.20:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,100:0.56: 0.19:1.000:0.973 0/0/0/1:4:90,37:0.26:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,108:0.55: 0.56:1.000:0.982 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:42,112:0.68:-0.10:1.000:0.915 0/1/1/1:4:29,117:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,46:0.31:-0.56:1.000:0.978 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,58:0.30: 0.35:1.000:0.987 0/0/0/1:4:108,35:0.21:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,136:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,25:0.25:-1.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,107:0.72:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,34:0.31:-1.36:0.578:0.978 0/0/1/1:4:64,103:0.57: 0.19:1.000:0.937 0/0/0/1:4:118,51:0.27: 0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,125:0.74:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,96:0.52: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:138,55:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,50:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,63:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,95:0.45: 0.77:1.000:0.984 0/0/0/1:4:100,40:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,48:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,93:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-1.38:0.593:1.000 0/0/1/1:4:97,135:0.54: 1.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:72,96:0.53: 0.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:128,53:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,44:0.25:-0.03:0.825:0.999 0/0/0/1:4:150,62:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,40:0.37:-1.38:1.000:0.559 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,45:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,59:0.41:-0.60:1.000:0.853 0/0/1:3:47,29:0.34:-1.88:0.993:1.000 0/0/1/1:4:76,104:0.54: 0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:89,107:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,76:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,102:0.58: 0.10:1.000:0.905 0/0/1/1:4:93,106:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,109:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,82:0.48:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,57:0.29: 0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:134,55:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,29:0.20:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,49:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,53:0.47:-1.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:122,40:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,45:0.30:-0.54:1.000:0.987 0/0/1/1:4:79,104:0.53: 0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:35,149:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,72:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,124:0.50: 1.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,41:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,55:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,194:0.77: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,70:0.43:-0.22:0.999:0.948 0/0/0/1:4:98,41:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,30:0.26:-1.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,150:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,39:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,47:0.28:-0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:133,58:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,58:0.32: 0.08:1.000:0.950 0/0/0/1:4:124,51:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,83:0.41: 0.56:1.000:0.890 0/0/1/1:4:82,86:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:108,44:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,119:0.51: 1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,51:0.26: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,32:0.21:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,31:0.27:-1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,34:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,55:0.51:-1.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,118:0.68: 0.10:1.000:0.946 0/0/1/1:4:44,42:0.45:-1.65:1.000:0.978 0/1/1/1:4:33,137:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,34:0.21:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,145:0.57: 1.75:1.000:0.936 0/1/1/1:4:41,120:0.70: 0.06:1.000:0.983 0/0/0/1:4:152,52:0.22: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,30:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,53:0.22: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,42:0.21: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,70:0.60:-1.13:1.000:0.807 0/0/1/1:4:59,81:0.54:-0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:185,64:0.23: 2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,127:0.49: 1.84:1.000:0.996 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,41:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,143:0.52: 2.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,74:0.53:-0.65:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,126:0.68: 0.33:1.000:0.957 0/0/0/1:4:120,48:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,26:0.27:-1.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,18:0.25:-2.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,46:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,49:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,91:0.41: 0.97:1.000:0.885 0/0/1/1:4:98,104:0.47: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,63:0.52:-1.04:0.998:0.996 0/0/0/1:4:121,33:0.19:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,34:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,45:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,62:0.49:-0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,44:0.30:-0.63:1.000:0.985 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,108:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.15:0.999:1.000 0/0/1/1:4:73,79:0.48:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,65:0.52:-0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,26:0.25:-1.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,36:0.22:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,93:0.74:-0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,118:0.68: 0.10:1.000:0.946 0/0/0/1:4:90,35:0.25:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,46:0.49:-1.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,115:0.55: 0.81:1.000:0.980 0/0/1/1:4:95,106:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,115:0.52: 1.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,65:0.37: 0.06:1.000:0.616 0/0/0/1:4:118,32:0.19:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,52:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,95:0.47: 0.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:73,81:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,51:0.28: 0.13:1.000:0.997 -chr2.1 65045514 chr2.1_065045514 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.72:-0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,12:0.41:-0.68:1.000:0.887 0/0/1/1:4:18,15:0.48:-0.78:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,10:0.45:-1.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:11,15:0.59:-1.11:1.000:0.843 0/1/1/1:4:9,19:0.70:-1.01:1.000:0.983 0/1/1/1:4:18,56:0.78: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,60:0.71: 1.75:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,10:0.40:-0.87:1.000:0.807 0/1/1/1:4:10,21:0.70:-0.87:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,23:0.72:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,17:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,33:0.71:-0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:29,17:0.43:-0.17:1.000:0.947 0/1/1/1:4:12,26:0.70:-0.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:22,45:0.69: 0.82:1.000:0.975 0/1/1/1:4:13,31:0.72:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,38:0.63: 0.58:1.000:0.566 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,48:0.85: 0.35:1.000:0.981 0/0/1/1:4:21,16:0.47:-0.59:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,12:0.45:-0.92:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,51:0.84: 0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,8:0.63:-1.71:1.000:0.600 0/0/1/1:4:14,8:0.43:-1.29:1.000:0.937 1/1/1/1:4:1,12:0.93:-1.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,29:0.57: 0.11:1.000:0.937 1/1/1/1:4:1,82:0.99: 1.56:1.000:1.000 0/0/1:3:33,15:0.40:-0.07:0.995:0.999 0/0/1/1:4:14,13:0.50:-1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,19:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,14:0.44:-0.59:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.78:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,46:0.75: 0.63:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,38:0.79:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,40:0.72: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,32:0.47: 1.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,42:0.72: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,23:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,73:0.49: 4.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,40:0.86:-0.12:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,118:1.00: 3.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,37:0.72: 0.16:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,52:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,51:0.75: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,25:0.60:-0.31:1.000:0.809 0/1/1/1:4:20,50:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,38:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,71:0.83: 1.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,35:0.64: 0.30:1.000:0.719 0/1/1/1/1/1:6:8,60:0.89: 0.86:1.000:0.956 0/1/1/1:4:23,86:0.81: 2.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,22:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,42:0.57: 1.24:1.000:0.951 0/1/1/1:4:18,32:0.66: 0.02:1.000:0.857 0/0/1/1:4:29,18:0.44:-0.12:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,18:0.91:-1.39:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,38:0.57: 0.86:0.578:0.934 0/1/1/1:4:11,24:0.71:-0.68:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,98:0.99: 2.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,29:0.78:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,60:0.81: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,23:0.53:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,25:0.50: 0.07:1.000:0.997 1/1/1/1:4:4,38:0.91:-0.36:1.000:0.960 0/0/1/1:4:26,28:0.53: 0.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,58:0.73: 1.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,46:0.59: 1.42:1.000:0.857 0/0/1/1:4:34,23:0.45: 0.35:1.000:0.980 0/1/1/1:4:22,40:0.66: 0.58:0.593:0.890 0/1/1/1:4:17,55:0.78: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,16:0.46:-0.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:23,52:0.71: 1.19:0.825:0.993 0/1/1/1:4:16,40:0.73: 0.30:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,39:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,29:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,48:0.72: 0.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,29:0.82:-0.64:1.000:0.999 0/0/1:3:25,10:0.38:-0.68:0.993:1.000 0/0/1/1:4:18,25:0.60:-0.31:1.000:0.809 0/0/1/1:4:33,38:0.55: 1.00:1.000:0.980 0/1/1/1:4:7,16:0.72:-1.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,52:0.76: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,38:0.76: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,40:0.77: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,70:0.75: 2.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,24:0.54:-0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:13,39:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,48:0.76: 0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 2.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,37:0.61: 0.58:1.000:0.649 0/1/1/1:4:22,42:0.67: 0.67:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,16:0.63:-1.11:1.000:0.600 0/0/1/1:4:19,29:0.62:-0.07:1.000:0.553 0/0/1/1:4:25,22:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,45:0.79: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,22:0.61:-0.59:1.000:0.676 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 1.61:0.999:1.000 0/1/1/1:4:15,38:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,59:0.77: 1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,39:0.58: 0.91:1.000:0.909 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,62:0.84: 1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,62:0.78: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,43:0.81: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,60:0.83: 1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,41:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,20:0.69:-0.92:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,42:0.67: 0.67:1.000:0.939 0/0/1/1:4:29,34:0.55: 0.63:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,37:0.80:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,40:0.82: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,39:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.59:-1.11:1.000:0.843 0/1/1/1:4:11,37:0.79:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,57:0.89: 0.72:1.000:0.597 0/0/1/1:4:33,43:0.58: 1.24:1.000:0.907 0/0/1/1:4:23,34:0.61: 0.35:1.000:0.653 1/1/1/1:4:0,68:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,35:0.56: 0.67:1.000:0.963 0/1/1/1:4:10,19:0.67:-0.97:1.000:0.935 0/1/1/1:4:13,49:0.81: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,31:0.61: 0.11:1.000:0.657 0/0/0/1:4:27,2:0.25:-0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,23:0.74:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,30:0.77:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,40:0.85:-0.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,22:0.71:-0.82:1.000:0.990 0/0/1/1:4:29,15:0.41:-0.26:1.000:0.880 0/1/1/1:4:13,51:0.81: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,16:0.49:-0.73:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,33:0.74:-0.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.59:-1.11:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.68:0.998:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.78:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.55:-0.03:1.000:0.984 0/0/1/1:4:9,11:0.57:-1.39:1.000:0.957 0/1/1/1:4:4,15:0.81:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,22:0.44: 0.30:1.000:0.973 0/1/1/1:4:7,13:0.67:-1.39:1.000:0.914 0/0/1/1:4:21,14:0.45:-0.68:1.000:0.978 0/1/1/1:4:5,14:0.76:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,13:0.38:-0.22:0.999:0.591 0/0/1/1:4:11,12:0.54:-1.25:1.000:0.990 0/1/1/1:4:14,22:0.63:-0.64:1.000:0.542 0/1/1/1:4:11,20:0.66:-0.87:1.000:0.890 0/0/1/1:4:14,14:0.51:-1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,21:0.60:-0.64:1.000:0.793 0/1/1/1:4:5,25:0.85:-0.92:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,16:0.82:-1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,13:0.56:-1.20:1.000:0.972 0/0/1/1:4:6,7:0.55:-1.71:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,11:0.43:-0.92:1.000:0.942 1/1/1/1:4:2,23:0.93:-1.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,19:0.70:-1.01:1.000:0.983 0/0/1/1:4:29,23:0.47: 0.11:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,34:0.64: 0.25:1.000:0.636 0/0/0/1:4:18,6:0.36:-1.20:1.000:0.707 0/1/1/1:4:13,22:0.65:-0.68:1.000:0.758 -chr2.1 65155040 chr2.1_065155040 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:3:37,0:.: 0.22:0.995:. ./.:4:34,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,1:.: 1.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.03:1.000:. ./.:6:22,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:69,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.65:0.578:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.47:0.825:. ./.:4:26,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.03:1.000:. ./.:3:31,0:.:-0.15:0.993:. ./.:4:45,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:53,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.96:0.998:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr2.1 65247188 chr2.1_065247188 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:93,12:.:-0.01:1.000:. ./.:4:135,12:.: 1.18:1.000:. ./.:4:118,10:.: 0.64:1.000:. ./.:4:132,20:.: 1.32:1.000:. ./.:4:97,31:.: 0.64:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:75,19:.:-0.32:1.000:. ./.:4:110,8:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,2:.:-2.45:1.000:. ./.:4:7,5:.:-2.65:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:110,6:.: 0.30:1.000:. ./.:4:63,19:.:-0.66:1.000:. ./.:4:133,9:.: 1.03:1.000:. ./.:4:136,15:.: 1.29:0.998:. ./.:4:117,13:.: 0.70:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:154,11:.: 1.69:1.000:. ./.:4:12,3:.:-2.56:1.000:. ./.:4:140,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:76,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:70,12:.:-0.66:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:111,14:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,20:.: 0.19:1.000:. ./.:4:106,6:.: 0.19:1.000:. ./.:4:123,10:.: 0.78:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:181,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:100,21:.: 0.44:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:22,4:.:-2.25:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.87:0.995:. ./.:4:145,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:120,12:.: 0.75:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:99,8:.: 0.04:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:100,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:83,10:.:-0.35:1.000:. ./.:4:85,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:84,10:.:-0.32:1.000:. ./.:4:46,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:65,6:.:-0.98:1.000:. ./.:4:77,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:118,8:.: 0.58:1.000:. ./.:4:111,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:102,5:.: 0.04:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.46:1.000:. ./.:6:50,23:.:-0.92:1.000:. ./.:4:70,19:.:-0.47:1.000:. ./.:4:97,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:67,31:.:-0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:62,19:.:-0.69:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.81:0.578:. ./.:4:61,8:.:-1.03:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,4:.:-1.74:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:117,12:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,8:.:-0.24:1.000:. ./.:4:76,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:81,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:95,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:111,11:.: 0.47:1.000:. ./.:4:128,13:.: 1.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.58:0.593:. ./.:4:80,12:.:-0.38:1.000:. ./.:4:111,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.10:0.825:. ./.:4:96,11:.: 0.04:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:82,9:.:-0.41:1.000:. ./.:4:94,4:.:-0.21:1.000:. ./.:3:43,6:.:-1.60:0.993:. ./.:4:96,6:.:-0.10:1.000:. ./.:4:73,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,5:.:-0.66:1.000:. ./.:4:80,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:96,9:.:-0.01:1.000:. ./.:4:69,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:81,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:46,17:.:-1.20:1.000:. ./.:4:76,9:.:-0.58:1.000:. ./.:4:65,9:.:-0.89:1.000:. ./.:4:105,9:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,11:.:-1.20:1.000:. ./.:4:76,16:.:-0.38:1.000:. ./.:4:72,26:.:-0.21:1.000:. ./.:4:111,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:95,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:97,31:.: 0.64:1.000:. ./.:4:69,30:.:-0.18:0.999:. ./.:4:169,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:50,6:.:-1.40:1.000:. ./.:4:67,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:81,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:71,4:.:-0.86:1.000:. ./.:4:90,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:51,21:.:-0.95:1.000:. ./.:4:108,13:.: 0.44:1.000:. ./.:4:123,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:42,16:.:-1.34:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:116,8:.: 0.53:1.000:. ./.:4:90,6:.:-0.27:1.000:. ./.:4:59,12:.:-0.98:1.000:. ./.:4:88,9:.:-0.24:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:70,3:.:-0.92:1.000:. ./.:4:70,8:.:-0.78:1.000:. ./.:4:95,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:160,7:.: 1.74:1.000:. ./.:4:73,14:.:-0.52:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:81,11:.:-0.38:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:112,7:.: 0.38:1.000:. ./.:4:75,10:.:-0.58:1.000:. ./.:4:135,7:.: 1.03:1.000:. ./.:4:79,16:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:107,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:116,8:.: 0.53:1.000:. ./.:4:78,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:103,29:.: 0.75:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.59:1.000:. ./.:4:97,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:139,9:.: 1.20:1.000:. ./.:4:134,6:.: 0.98:1.000:. ./.:4:113,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:65,21:.:-0.55:0.998:. ./.:4:122,15:.: 0.89:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:97,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:101,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:104,9:.: 0.21:1.000:. ./.:4:157,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.86:0.999:. ./.:4:73,12:.:-0.58:1.000:. ./.:4:109,11:.: 0.41:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:74,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:86,12:.:-0.21:1.000:. ./.:4:96,7:.:-0.07:1.000:. ./.:4:79,16:.:-0.30:1.000:. ./.:4:99,37:.: 0.87:1.000:. ./.:4:94,18:.: 0.19:1.000:. ./.:4:93,18:.: 0.16:1.000:. ./.:4:87,23:.: 0.13:1.000:. ./.:4:106,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:137,13:.: 1.26:1.000:. ./.:4:80,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:89,4:.:-0.35:1.000:. -chr2.1 65466152 chr2.1_065466152 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,302:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.47:1.000:. ./.:4:70,204:.: 0.63:1.000:. ./.:4:79,212:.: 0.94:1.000:. ./.:4:83,229:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.21:1.000:. ./.:4:54,121:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,270:.: 0.58:1.000:. ./.:4:58,171:.:-0.18:1.000:. ./.:4:19,58:.:-2.92:1.000:. ./.:4:5,99:.:-2.44:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.27:1.000:. ./.:4:74,189:.: 0.44:1.000:. ./.:4:81,208:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1,242:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.56:0.998:. ./.:4:1,296:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1,315:.: 1.39:1.000:. ./.:4:75,220:.: 1.01:1.000:. ./.:4:30,61:.:-2.67:1.000:. ./.:4:75,191:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,331:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.52:1.000:. ./.:4:11,45:.:-3.30:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,293:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.24:1.000:. ./.:4:83,239:.: 1.50:1.000:. ./.:4:56,157:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,151:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.76:1.000:. ./.:4:2,61:.:-3.18:1.000:. ./.:4:29,91:.:-2.15:1.000:. ./.:3:4,35:.:-3.61:0.995:. ./.:4:0,254:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,183:.: 0.40:1.000:. ./.:4:56,164:.:-0.34:1.000:. ./.:4:72,193:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.15:1.000:. ./.:4:67,180:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.88:1.000:. ./.:4:66,188:.: 0.27:1.000:. ./.:4:57,198:.: 0.29:1.000:. ./.:4:65,222:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,82:.:-2.83:1.000:. ./.:4:0,175:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,149:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1,329:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.25:1.000:. ./.:4:63,198:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,155:.:-0.41:1.000:. ./.:6:0,225:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.76:1.000:. ./.:4:52,166:.:-0.38:1.000:. ./.:4:55,212:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,287:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,175:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.47:1.000:. ./.:4:66,165:.:-0.14:0.578:. ./.:4:0,224:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,191:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,148:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.02:1.000:. ./.:4:87,201:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.07:1.000:. ./.:4:74,169:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.17:1.000:. ./.:4:74,192:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1,263:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.63:0.593:. ./.:4:0,263:.: 0.44:1.000:. ./.:4:77,216:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.81:1.000:. ./.:4:61,152:.:-0.47:0.825:. ./.:4:62,186:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.36:1.000:. ./.:4:55,174:.:-0.18:1.000:. ./.:4:68,160:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.60:1.000:. ./.:3:0,150:.:-1.61:0.993:. ./.:4:0,249:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,159:.:-1.44:1.000:. ./.:4:88,204:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.43:1.000:. ./.:4:56,155:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,181:.:-1.05:1.000:. ./.:4:63,225:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,174:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,140:.:-1.03:1.000:. ./.:4:67,205:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.11:1.000:. ./.:4:80,221:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.02:1.000:. ./.:4:60,214:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,296:.: 1.03:1.000:. ./.:4:76,185:.: 0.40:0.999:. ./.:4:75,228:.: 1.16:1.000:. ./.:4:52,124:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.52:1.000:. ./.:4:49,172:.:-0.32:1.000:. ./.:4:64,191:.: 0.29:1.000:. ./.:4:59,172:.:-0.14:1.000:. ./.:4:71,183:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.36:1.000:. ./.:4:94,214:.: 1.25:1.000:. ./.:4:50,186:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,179:.:-1.08:1.000:. ./.:4:52,133:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.97:1.000:. ./.:4:78,174:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,142:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.18:1.000:. ./.:4:76,209:.: 0.83:1.000:. ./.:4:74,217:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.29:1.000:. ./.:4:55,152:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.14:1.000:. ./.:4:69,172:.: 0.04:1.000:. ./.:4:75,202:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.43:1.000:. ./.:4:63,179:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.70:1.000:. ./.:4:67,252:.: 1.45:1.000:. ./.:4:111,264:.: 2.46:1.000:. ./.:4:63,170:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,208:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,299:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,74:.:-2.98:1.000:. ./.:4:68,183:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,191:.: 0.17:1.000:. ./.:4:80,212:.: 0.96:1.000:. ./.:4:83,259:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.45:1.000:. ./.:4:72,168:.: 0.02:0.998:. ./.:4:98,241:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.18:1.000:. ./.:4:38,131:.:-1.26:1.000:. ./.:4:70,170:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.38:1.000:. ./.:4:57,173:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.22:1.000:. ./.:4:77,162:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.03:0.999:. ./.:4:62,174:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.56:1.000:. ./.:4:53,164:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,174:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.58:1.000:. ./.:4:41,135:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.14:1.000:. ./.:4:92,228:.: 1.47:1.000:. ./.:4:80,214:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.12:1.000:. ./.:4:43,217:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,259:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,315:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,353:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.71:1.000:. -chr2.1 65717581 chr2.1_065717581 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:80,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,23:.:-0.20:1.000:. ./.:4:85,21:.: 0.63:1.000:. ./.:4:81,47:.: 1.35:1.000:. ./.:4:91,15:.: 0.63:1.000:. ./.:4:14,12:.:-2.02:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.53:1.000:. ./.:4:44,31:.:-0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:36,6:.:-1.49:1.000:. ./.:4:63,14:.:-0.33:1.000:. ./.:4:59,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:92,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.82:0.998:. ./.:4:99,8:.: 0.66:1.000:. ./.:4:121,10:.: 1.45:1.000:. ./.:4:61,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:26,9:.:-1.72:1.000:. ./.:4:34,33:.:-0.66:1.000:. ./.:4:69,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:54,4:.:-0.96:1.000:. ./.:4:8,7:.:-2.38:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:77,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:92,25:.: 0.99:1.000:. ./.:4:26,25:.:-1.19:1.000:. ./.:4:37,16:.:-1.13:1.000:. ./.:4:86,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:25,5:.:-1.89:1.000:. ./.:4:34,15:.:-1.26:1.000:. ./.:3:9,8:.:-2.32:0.995:. ./.:4:93,3:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:61,32:.: 0.20:1.000:. ./.:4:82,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:45,32:.:-0.33:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:101,37:.: 1.68:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:104,44:.: 2.01:1.000:. ./.:4:48,26:.:-0.43:1.000:. ./.:4:194,11:.: 3.90:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:65,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:136,6:.: 1.82:1.000:. ./.:4:83,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:81,25:.: 0.63:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:85,3:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.96:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:75,30:.: 0.59:1.000:. ./.:6:98,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.20:1.000:. ./.:4:87,33:.: 1.09:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:36,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:54,3:.:-0.99:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.83:0.578:. ./.:4:73,4:.:-0.33:1.000:. ./.:4:44,27:.:-0.53:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:91,5:.: 0.30:1.000:. ./.:4:106,37:.: 1.85:1.000:. ./.:4:72,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:48,15:.:-0.80:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.86:1.000:. ./.:4:100,7:.: 0.66:1.000:. ./.:4:75,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,8:.:-1.72:0.593:. ./.:4:134,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:67,19:.:-0.04:1.000:. ./.:4:90,7:.: 0.33:1.000:. ./.:4:62,41:.: 0.53:0.825:. ./.:4:65,28:.: 0.20:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.95:1.000:. ./.:4:52,29:.:-0.20:1.000:. ./.:4:42,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:57,3:.:-0.89:1.000:. ./.:3:32,0:.:-1.82:0.993:. ./.:4:132,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:81,35:.: 0.96:1.000:. ./.:4:89,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:65,45:.: 0.76:1.000:. ./.:4:69,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:49,33:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,5:.: 0.66:1.000:. ./.:4:20,17:.:-1.66:1.000:. ./.:4:73,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,18:.:-0.63:1.000:. ./.:4:34,21:.:-1.06:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:110,8:.: 1.02:1.000:. ./.:4:99,9:.: 0.69:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:115,25:.: 1.75:1.000:. ./.:4:79,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,30:.: 0.79:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:45,20:.:-0.73:0.999:. ./.:4:82,30:.: 0.82:1.000:. ./.:4:40,7:.:-1.32:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:70,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:38,26:.:-0.76:1.000:. ./.:4:79,37:.: 0.96:1.000:. ./.:4:75,29:.: 0.56:1.000:. ./.:4:67,50:.: 0.99:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:62,5:.:-0.66:1.000:. ./.:4:54,23:.:-0.33:1.000:. ./.:4:90,43:.: 1.52:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:59,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,4:.:-1.59:1.000:. ./.:4:53,23:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:41,31:.:-0.50:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,42:.: 1.22:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:75,24:.: 0.39:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:81,23:.: 0.56:1.000:. ./.:4:66,35:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:45,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:78,45:.: 1.19:1.000:. ./.:4:125,31:.: 2.28:1.000:. ./.:4:98,36:.: 1.55:1.000:. ./.:4:70,27:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:64,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:82,5:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:30,5:.:-1.72:1.000:. ./.:4:77,39:.: 0.96:1.000:. ./.:4:54,33:.: 0.00:1.000:. ./.:4:79,34:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:43,21:.:-0.76:0.998:. ./.:4:42,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:88,31:.: 1.06:1.000:. ./.:4:44,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:62,4:.:-0.70:1.000:. ./.:4:36,26:.:-0.83:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:46,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:70,6:.:-0.37:0.999:. ./.:4:55,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:52,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:36,10:.:-1.36:1.000:. ./.:4:71,18:.: 0.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:52,23:.:-0.40:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:87,27:.: 0.89:1.000:. ./.:4:64,25:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:82,15:.: 0.33:1.000:. ./.:4:50,3:.:-1.13:1.000:. ./.:4:72,6:.:-0.30:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:79,7:.:-0.04:1.000:. -chr2.1 66001759 chr2.1_066001759 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:2,4:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:2,1:0.35:-0.91:1.000:0.797 0/0/0/1:4:33,6:0.27: 1.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,5:0.26: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,2:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,10:0.54:-0.21:1.000:0.990 0/0/0/1:4:17,3:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,6:0.56:-0.59:1.000:0.963 0/0/0/1:4:51,4:0.16: 2.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:12,1:0.17:-0.27:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.68:-0.46:1.000:0.939 0/0/0/1:4:32,2:0.13: 1.07:1.000:0.912 0/0/0/1:4:37,4:0.22: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.29:-0.78:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.45:-0.40:0.998:0.975 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,2:0.12: 1.26:1.000:0.756 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,4:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,8:0.48:-0.27:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.49:-0.40:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,3:0.16: 1.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:55,7:0.25: 2.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,3:0.12: 2.42:1.000:0.779 0/0/1/1:4:6,14:0.52: 0.18:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,1:0.18:-0.34:1.000:0.999 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.04:0.995:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.41:-0.27:1.000:0.847 0/0/0/1:4:45,6:0.25: 2.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,5:0.25: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:2,1:0.35:-0.91:1.000:0.797 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,6:0.28: 1.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,6:0.33: 0.24:1.000:0.929 0/0/0/1:4:19,7:0.32: 0.56:1.000:0.952 0/0/0/1:4:19,4:0.28: 0.37:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,30:1.00: 0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,3:0.56:-0.85:1.000:0.963 0/0/0/1:4:14,3:0.28:-0.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-0.72:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,1:0.09: 0.56:1.000:0.974 1/1/1/1/1/1:6:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,4:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,2:0.21: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.47:-0.78:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.54:-0.66:1.000:0.990 0/0/0/1:4:28,2:0.15: 0.82:0.578:0.985 0/0/1/1:4:4,3:0.39:-0.66:1.000:0.719 0/0/0/1:4:29,6:0.28: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:2,1:0.35:-0.91:1.000:0.797 0/0/1/1:4:3,5:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,5:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,5:0.62:-0.72:1.000:0.503 0/0/0/1:4:29,2:0.14: 0.88:1.000:0.975 0/0/1/1:4:2,4:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.98:0.593:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.42:-0.85:1.000:0.931 0/0/0/1:4:22,8:0.32: 0.82:1.000:0.955 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:22,3:0.25: 0.50:0.825:0.999 0/0/0/0:4:27,1:0.08: 0.69:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,2:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,1:0.17:-0.27:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1:3:0,4:1.00:-0.85:0.993:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,4:0.60:-0.78:1.000:0.791 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.31:-0.02:1.000:0.980 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.32:-0.40:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,2:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.31: 0.18:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,4:0.60:-0.78:1.000:0.791 0/0/1/1:4:1,2:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:2,1:0.35:-0.91:1.000:0.797 0/0/0/0:4:35,1:0.06: 1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,2:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.46:-0.21:1.000:0.986 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.46:0.999:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,3:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,2:0.50:-0.91:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,2:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.30: 0.37:1.000:0.987 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,1:0.07: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,2:0.42:-0.85:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,9:0.28: 2.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,2:0.21: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,3:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,2:0.42:-0.85:1.000:0.931 0/0/0/1:4:24,3:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,5:0.54:-0.66:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.38:-0.78:1.000:0.564 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,4:0.16: 2.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,6:0.47:-0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:14,3:0.28:-0.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.34:1.000:0.797 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,1:0.08: 0.69:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,6:0.28: 1.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,3:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,8:0.27: 2.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,5:0.26: 1.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,7:0.44:-0.27:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.72:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:24,5:0.28: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,4:0.16: 2.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:34,4:0.23: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,4:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.54:-0.66:1.000:0.990 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 1.52:0.998:1.000 0/0/0/1:4:40,8:0.27: 1.97:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,3:0.17: 1.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,2:0.23: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,10:0.29: 2.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:4,2:0.35:-0.72:1.000:0.797 0/0/0/1:4:31,4:0.25: 1.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.91:0.999:1.000 0/0/0/1:4:42,4:0.19: 1.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,5:0.27: 1.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,2:0.17: 0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:1,3:0.56:-0.85:1.000:0.963 0/0/1/1:4:1,4:0.60:-0.78:1.000:0.791 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.31:-0.59:1.000:0.970 0/0/0/1:4:76,6:0.16: 4.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,2:0.12: 1.33:1.000:0.680 0/0/1/1:4:2,7:0.58:-0.53:1.000:0.900 0/0/0/1:4:35,2:0.12: 1.26:1.000:0.756 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.47:-0.78:1.000:0.992 -chr2.1 66106257 chr2.1_066106257 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,62:0.54: 2.82:1.000:0.987 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,26:0.53: 0.16:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,33:0.57: 0.31:1.000:0.939 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,49:0.56: 1.63:1.000:0.974 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,44:0.51: 1.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,25:0.45: 0.70:1.000:0.981 0/0/1/1:4:35,35:0.54: 0.74:1.000:0.987 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,17:0.44:-0.11:1.000:0.974 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,17:0.34: 0.93:1.000:0.858 0/0/1/1:4:27,17:0.47:-0.27:1.000:0.992 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,30:0.55: 0.27:1.000:0.980 0/0/1:3:23,12:0.44:-0.61:0.995:0.987 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:40,37:0.53: 1.01:1.000:0.992 1/1/1/1:4:1,30:0.92:-0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,25:0.51: 0.20:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,37:0.44: 2.09:1.000:0.972 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.77:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.30:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.89:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.88:0.578:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,41:0.48: 1.97:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.92:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:57,39:0.49: 1.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 1.66:0.593:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,25:0.51: 0.24:0.825:0.996 0/0/1/1:4:67,49:0.50: 2.51:1.000:0.997 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,25:0.44: 0.85:1.000:0.959 0/0/1/1:4:54,39:0.50: 1.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,25:0.42: 1.05:1.000:0.903 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,52:0.53: 2.24:1.000:0.993 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,30:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,58:0.51: 3.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.77:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:61,48:0.51: 2.24:0.999:0.996 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,25:0.48: 0.47:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,41:0.48: 1.97:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.34:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,38:0.53: 1.09:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,21:0.42: 0.55:1.000:0.912 0/0/1/1:4:62,41:0.48: 2.01:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.92:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,24:0.40: 1.16:1.000:0.773 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.96:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:52,53:0.54: 2.09:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.34:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,37:0.49: 1.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,39:0.47: 1.90:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.50:0.998:1.000 0/0/1/1:4:44,32:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,34:0.47: 1.43:1.000:0.992 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,10:0.47:-0.96:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:34,34:0.54: 0.66:1.000:0.987 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.54:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.77:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:26,21:0.51:-0.15:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,54:0.53: 2.36:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:4,18:0.71:-1.11:1.000:0.992 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 -chr2.1 66472368 chr2.1_066472368 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,134:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,134:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,120:.: 1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,70:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.80:0.998:. ./.:4:0,87:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,110:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,71:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.50:1.000:. ./.:3:0,11:.:-1.56:0.995:. ./.:4:0,65:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,107:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,113:.: 1.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,63:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,134:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.:-0.83:1.000:. ./.:6:0,1:.:-1.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.92:0.578:. ./.:4:0,68:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,148:.: 2.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,87:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,120:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.52:0.593:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,57:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,106:.: 1.08:0.825:. ./.:4:0,120:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,107:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,116:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,104:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,112:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,64:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.80:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,110:.: 1.22:0.999:. ./.:4:0,41:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,63:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,53:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,92:.: 0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,46:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,155:.: 2.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,106:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,147:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,73:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,68:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,116:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,147:.: 2.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.:-0.56:0.998:. ./.:4:0,124:.: 1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,107:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,119:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.39:0.999:. ./.:4:0,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,94:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,130:.: 1.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,74:.: 0.19:1.000:. -chr2.1 66683600 chr2.1_066683600 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:281,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:152,38:.:-0.34:1.000:. ./.:4:165,25:.:-0.34:1.000:. ./.:4:158,12:.:-0.75:1.000:. ./.:4:154,79:.: 0.56:1.000:. ./.:4:220,78:.: 1.91:1.000:. ./.:4:98,49:.:-1.23:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:189,26:.: 0.18:1.000:. ./.:4:50,36:.:-2.50:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:133,93:.: 0.41:1.000:. ./.:4:178,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:114,67:.:-0.52:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:177,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.45:0.998:. ./.:4:205,44:.: 0.89:1.000:. ./.:4:238,58:.: 1.87:1.000:. ./.:4:146,82:.: 0.45:1.000:. ./.:4:88,59:.:-1.23:1.000:. ./.:4:127,65:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,49:.: 0.22:1.000:. ./.:4:191,45:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,17:.:-3.37:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:175,31:.:-0.01:1.000:. ./.:4:207,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:144,89:.: 0.56:1.000:. ./.:4:133,71:.:-0.05:1.000:. ./.:4:157,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:53,20:.:-2.77:1.000:. ./.:4:51,53:.:-2.13:1.000:. ./.:3:31,22:.:-3.19:0.995:. ./.:4:189,44:.: 0.56:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:118,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:200,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:139,69:.: 0.04:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:184,24:.: 0.04:1.000:. ./.:4:168,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:215,16:.: 0.51:1.000:. ./.:4:197,13:.: 0.08:1.000:. ./.:4:131,67:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,28:.:-1.61:1.000:. ./.:4:164,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:106,29:.:-1.48:1.000:. ./.:4:143,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:203,38:.: 0.72:1.000:. ./.:4:163,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:213,28:.: 0.72:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:157,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:162,34:.:-0.21:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:185,17:.:-0.09:1.000:. ./.:6:168,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:172,18:.:-0.34:1.000:. ./.:4:217,23:.: 0.70:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:137,42:.:-0.57:1.000:. ./.:4:170,43:.: 0.14:1.000:. ./.:4:180,15:.:-0.23:0.578:. ./.:4:141,32:.:-0.69:1.000:. ./.:4:138,75:.: 0.14:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:208,55:.: 1.18:1.000:. ./.:4:198,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:179,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:177,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:110,81:.:-0.32:1.000:. ./.:4:178,35:.: 0.14:1.000:. ./.:4:178,39:.: 0.22:1.000:. ./.:4:107,88:.:-0.23:0.593:. ./.:4:245,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:223,25:.: 0.87:1.000:. ./.:4:147,50:.:-0.19:1.000:. ./.:4:115,83:.:-0.17:0.825:. ./.:4:134,64:.:-0.17:1.000:. ./.:4:139,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:109,55:.:-0.88:1.000:. ./.:4:107,62:.:-0.77:1.000:. ./.:4:172,34:.:-0.01:1.000:. ./.:3:165,0:.:-0.86:0.993:. ./.:4:166,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:182,21:.:-0.07:1.000:. ./.:4:208,45:.: 0.97:1.000:. ./.:4:98,57:.:-1.07:1.000:. ./.:4:152,39:.:-0.32:1.000:. ./.:4:136,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:148,45:.:-0.28:1.000:. ./.:4:107,56:.:-0.90:1.000:. ./.:4:222,41:.: 1.18:1.000:. ./.:4:161,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:112,78:.:-0.34:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:157,56:.: 0.14:1.000:. ./.:4:168,46:.: 0.16:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:234,20:.: 0.99:1.000:. ./.:4:187,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:381,0:.: 3.63:1.000:. ./.:4:134,63:.:-0.19:0.999:. ./.:4:183,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:100,10:.:-2.00:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:155,42:.:-0.19:1.000:. ./.:4:116,48:.:-0.88:1.000:. ./.:4:138,14:.:-1.13:1.000:. ./.:4:160,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:106,64:.:-0.75:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:190,48:.: 0.66:1.000:. ./.:4:177,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:213,18:.: 0.51:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:177,44:.: 0.31:1.000:. ./.:4:158,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,8:.:-1.23:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:119,56:.:-0.65:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:119,29:.:-1.21:1.000:. ./.:4:101,45:.:-1.25:1.000:. ./.:4:137,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:157,19:.:-0.63:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,12:.:-1.21:1.000:. ./.:4:105,50:.:-1.07:1.000:. ./.:4:160,49:.: 0.06:1.000:. ./.:4:184,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:156,78:.: 0.58:1.000:. ./.:4:215,33:.: 0.87:1.000:. ./.:4:194,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,18:.:-0.36:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:156,44:.:-0.13:1.000:. ./.:4:252,29:.: 1.55:1.000:. ./.:4:187,40:.: 0.43:1.000:. ./.:4:92,46:.:-1.42:1.000:. ./.:4:144,9:.:-1.11:1.000:. ./.:4:176,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:133,78:.: 0.10:1.000:. ./.:4:134,88:.: 0.33:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:183,25:.: 0.04:0.998:. ./.:4:130,77:.: 0.02:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:146,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:116,64:.:-0.55:1.000:. ./.:4:181,50:.: 0.51:1.000:. ./.:4:64,36:.:-2.21:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:112,72:.:-0.46:1.000:. ./.:4:217,48:.: 1.22:0.999:. ./.:4:174,26:.:-0.13:1.000:. ./.:4:197,54:.: 0.93:1.000:. ./.:4:197,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:125,23:.:-1.21:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:96,51:.:-1.23:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:243,27:.: 1.33:1.000:. ./.:4:143,89:.: 0.54:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:195,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:234,54:.: 1.70:1.000:. ./.:4:237,51:.: 1.70:1.000:. ./.:4:361,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:167,42:.: 0.06:1.000:. -chr2.1 66838977 chr2.1_066838977 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:105,7:.: 0.92:1.000:. ./.:4:54,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,9:.: 0.92:1.000:. ./.:4:85,16:.: 0.56:1.000:. ./.:4:91,14:.: 0.69:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:30,5:.:-1.62:1.000:. ./.:4:101,7:.: 0.79:1.000:. ./.:4:101,13:.: 0.99:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:11,2:.:-2.35:1.000:. ./.:4:79,9:.: 0.13:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.03:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:88,16:.: 0.66:1.000:. ./.:4:104,15:.: 1.15:1.000:. ./.:4:125,6:.: 1.55:0.998:. ./.:4:64,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,15:.: 1.48:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:103,9:.: 0.92:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:74,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:124,13:.: 1.75:1.000:. ./.:4:85,17:.: 0.59:1.000:. ./.:4:81,10:.: 0.23:1.000:. ./.:4:89,11:.: 0.52:1.000:. ./.:4:100,5:.: 0.69:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.41:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.61:0.995:. ./.:4:87,14:.: 0.56:1.000:. ./.:4:87,12:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,10:.: 0.79:1.000:. ./.:4:91,7:.: 0.46:1.000:. ./.:4:130,10:.: 1.84:1.000:. ./.:4:75,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:74,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,20:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,14:.:-0.96:1.000:. ./.:4:47,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,6:.: 0.13:1.000:. ./.:4:69,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:48,7:.:-0.96:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.03:1.000:. ./.:4:47,21:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:86,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:53,11:.:-0.66:1.000:. ./.:6:70,9:.:-0.17:1.000:. ./.:4:85,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:90,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:44,15:.:-0.83:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.83:1.000:. ./.:4:72,14:.: 0.06:1.000:. ./.:4:71,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,3:.:-1.36:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.73:0.578:. ./.:4:66,10:.:-0.27:1.000:. ./.:4:79,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:29,3:.:-1.72:1.000:. ./.:4:96,6:.: 0.59:1.000:. ./.:4:108,9:.: 1.09:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:77,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:62,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:58,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:75,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,13:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,7:.:-1.19:0.593:. ./.:4:76,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:65,6:.:-0.43:1.000:. ./.:4:70,11:.:-0.10:1.000:. ./.:4:91,7:.: 0.46:0.825:. ./.:4:68,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:39,8:.:-1.22:1.000:. ./.:4:64,4:.:-0.53:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:73,4:.:-0.23:1.000:. ./.:3:48,17:.:-0.63:0.993:. ./.:4:64,8:.:-0.40:1.000:. ./.:4:81,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:93,9:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,6:.:-1.06:1.000:. ./.:4:61,7:.:-0.53:1.000:. ./.:4:82,7:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,4:.:-1.49:1.000:. ./.:4:60,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,3:.:-1.29:1.000:. ./.:4:49,9:.:-0.86:1.000:. ./.:4:31,4:.:-1.62:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:104,15:.: 1.15:1.000:. ./.:4:93,11:.: 0.66:1.000:. ./.:4:72,11:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:116,8:.: 1.32:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.14:0.999:. ./.:4:49,23:.:-0.40:1.000:. ./.:4:35,25:.:-0.80:1.000:. ./.:4:59,7:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,5:.:-1.26:1.000:. ./.:4:64,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:71,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,6:.:-0.76:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:58,12:.:-0.47:1.000:. ./.:4:79,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:73,30:.: 0.62:1.000:. ./.:4:62,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.86:1.000:. ./.:4:60,10:.:-0.47:1.000:. ./.:4:51,7:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:47,5:.:-1.06:1.000:. ./.:4:64,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:111,11:.: 1.25:1.000:. ./.:4:29,9:.:-1.52:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:83,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:97,7:.: 0.66:1.000:. ./.:4:42,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.89:1.000:. ./.:4:29,12:.:-1.42:1.000:. ./.:4:63,6:.:-0.50:1.000:. ./.:4:51,6:.:-0.89:1.000:. ./.:4:108,6:.: 0.99:1.000:. ./.:4:29,7:.:-1.59:1.000:. ./.:4:96,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:106,13:.: 1.15:1.000:. ./.:4:63,29:.: 0.26:1.000:. ./.:4:67,19:.: 0.06:1.000:. ./.:4:70,22:.: 0.26:1.000:. ./.:4:118,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:128,29:.: 2.41:1.000:. ./.:4:111,16:.: 1.42:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:63,14:.:-0.23:1.000:. ./.:4:70,17:.: 0.10:1.000:. ./.:4:98,17:.: 1.02:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:88,11:.: 0.49:1.000:. ./.:4:93,13:.: 0.72:0.998:. ./.:4:94,13:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:82,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,6:.: 0.76:1.000:. ./.:4:85,9:.: 0.33:1.000:. ./.:4:117,7:.: 1.32:1.000:. ./.:4:90,15:.: 0.69:1.000:. ./.:4:69,6:.:-0.30:1.000:. ./.:4:33,43:.:-0.27:0.999:. ./.:4:97,10:.: 0.76:1.000:. ./.:4:81,12:.: 0.29:1.000:. ./.:4:56,21:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,19:.:-0.80:1.000:. ./.:4:90,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:81,7:.: 0.13:1.000:. ./.:4:122,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:86,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:141,16:.: 2.41:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:96,10:.: 0.72:1.000:. ./.:4:72,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:83,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:119,12:.: 1.55:1.000:. ./.:4:65,30:.: 0.36:1.000:. ./.:4:74,15:.: 0.16:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.04:1.000:. -chr2.1 67135012 chr2.1_067135012 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,416:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,244:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,86:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:344,102:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:123,364:0.77: 1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,493:1.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:318,91:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,232:0.53: 0.75:1.000:0.991 0/0/1/1:4:237,222:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,50:0.48:-2.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,51:0.65:-3.09:1.000:0.824 1/1/1/1:4:0,420:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:342,110:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:274,222:0.48: 1.12:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,421:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,317:0.76: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,245:0.50: 1.37:0.998:0.997 0/1/1/1:4:134,384:0.76: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:336,292:0.49: 2.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:312,252:0.48: 1.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,48:0.44:-2.74:1.000:0.970 0/0/1/1:4:239,211:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:140,377:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,332:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,36:0.36:-2.82:1.000:0.707 0/0/1/1:4:261,244:0.51: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:229,237:0.54: 0.81:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,381:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:287,266:0.51: 1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:269,230:0.49: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:247,250:0.53: 1.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:101,268:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,26:0.59:-3.45:1.000:0.853 0/1/1/1:4:61,94:0.63:-2.34:1.000:0.582 0/0/0:3:37,5:0.14:-3.49:0.995:0.524 0/0/1/1:4:241,188:0.47: 0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:253,211:0.48: 0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:358,102:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,276:0.73: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:246,223:0.51: 0.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,260:0.73:-0.19:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,380:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,182:0.49: 0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,237:0.76:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,106:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:202,179:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:391,129:0.27: 1.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,80:0.58:-2.44:1.000:0.919 0/1/1/1:4:93,257:0.75:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,311:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,185:0.73:-1.28:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,477:1.00: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,270:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:229,196:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,263:0.71:-0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:105,289:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,269:0.73:-0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,255:0.73:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:284,81:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:88,196:0.71:-1.03:1.000:0.815 0/1/1/1:4:111,273:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:277,106:0.30:-0.03:1.000:0.985 0/0/0/1:4:320,101:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,159:0.47:-0.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:206,207:0.53: 0.28:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,380:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,239:0.76:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,380:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,85:0.25:-0.11:0.578:0.999 0/1/1/1:4:85,236:0.76:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,290:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,256:0.76:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,294:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,113:0.27: 0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,161:0.45:-0.01:1.000:0.976 0/0/1/1:4:177,160:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,182:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:176,165:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,261:0.76:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,184:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:77,198:0.74:-1.12:0.593:0.999 0/1/1/1:4:128,253:0.69:-0.05:1.000:0.968 0/1/1/1:4:124,339:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,159:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:227,190:0.49: 0.32:0.825:0.996 0/0/1/1:4:258,195:0.46: 0.68:1.000:0.987 0/1/1/1:4:88,233:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:273,75:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,167:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:93,276:0.77:-0.17:1.000:1.000 0/0/1:3:202,79:0.30:-1.06:0.993:1.000 0/0/1/1:4:170,154:0.51:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,202:0.54: 0.06:1.000:0.985 0/1/1/1:4:77,202:0.74:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,184:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:94,280:0.77:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,229:0.73:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:84,212:0.74:-0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:181,168:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,196:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:192,169:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:116,290:0.74: 0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:75,200:0.75:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:98,286:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,128:0.50:-1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,269:0.77:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,330:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,327:0.79: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:289,296:0.53: 2.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:206,195:0.52: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,173:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:145,366:0.74: 1.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:98,232:0.72:-0.57:0.999:0.997 0/0/1/1:4:222,191:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,137:0.48:-0.83:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,394:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,164:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,227:0.73:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:196,150:0.46:-0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:180,143:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:239,189:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:78,238:0.77:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,273:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,195:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,272:0.76:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,185:0.53:-0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:180,152:0.49:-0.55:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,272:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,146:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,169:0.73:-1.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:193,128:0.43:-0.66:1.000:0.936 0/1/1/1:4:110,291:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,188:0.77:-1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,330:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,272:0.78:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:178,431:0.73: 2.27:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,373:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,158:0.56:-0.90:1.000:0.968 0/0/1/1:4:171,131:0.46:-0.85:1.000:0.989 0/0/0/1:4:267,74:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,236:0.73:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:181,151:0.48:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,162:0.47:-0.15:1.000:0.990 0/1/1/1:4:72,206:0.76:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:155,374:0.73: 1.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:297,268:0.50: 1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:303,107:0.28: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:211,208:0.53: 0.34:1.000:0.994 0/1/1/1:4:135,391:0.76: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,294:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:275,261:0.52: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:219,197:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,61:0.65:-2.92:1.000:0.762 0/0/0/1:4:270,83:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:129,340:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:224,261:0.57: 1.01:1.000:0.957 0/1/1/1:4:132,383:0.76: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:244,247:0.53: 1.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:178,184:0.54:-0.24:0.998:0.989 0/0/1/1:4:252,220:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:218,221:0.53: 0.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:276,77:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,197:0.51: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:221,228:0.54: 0.64:1.000:0.990 0/0/1/1:4:198,212:0.55: 0.25:1.000:0.984 0/0/1/1:4:220,189:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,207:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:220,215:0.52: 0.50:0.999:0.994 0/0/1/1:4:217,170:0.47: 0.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:102,275:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,182:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:203,178:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,265:0.76:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,259:0.74:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,160:0.46:-0.11:1.000:0.984 0/1/1/1:4:93,269:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:284,248:0.50: 1.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:129,334:0.74: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:265,212:0.47: 0.93:1.000:0.993 0/1/1/1:4:106,265:0.74:-0.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:130,348:0.75: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:285,294:0.54: 1.96:1.000:0.990 0/1/1/1:4:142,418:0.77: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,193:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:133,369:0.76: 1.18:1.000:1.000 -chr2.1 67373166 chr2.1_067373166 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:162,73:.: 0.74:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:153,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:150,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:155,73:.: 0.60:1.000:. ./.:4:133,44:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,119:.: 1.00:1.000:. ./.:4:162,55:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,11:.:-3.08:1.000:. ./.:4:39,9:.:-3.02:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:155,62:.: 0.38:1.000:. ./.:4:154,67:.: 0.46:1.000:. ./.:4:172,56:.: 0.60:1.000:. ./.:4:123,131:.: 1.12:1.000:. ./.:4:166,63:.: 0.62:0.998:. ./.:4:182,74:.: 1.16:1.000:. ./.:4:185,86:.: 1.46:1.000:. ./.:4:197,77:.: 1.52:1.000:. ./.:4:40,15:.:-2.88:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:95,138:.: 0.70:1.000:. ./.:4:142,46:.:-0.21:1.000:. ./.:4:20,8:.:-3.42:1.000:. ./.:4:130,130:.: 1.24:1.000:. ./.:4:105,107:.: 0.28:1.000:. ./.:4:166,54:.: 0.44:1.000:. ./.:4:159,78:.: 0.78:1.000:. ./.:4:174,51:.: 0.54:1.000:. ./.:4:116,131:.: 0.98:1.000:. ./.:4:88,114:.: 0.08:1.000:. ./.:4:12,10:.:-3.54:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.96:1.000:. ./.:3:10,7:.:-3.64:0.995:. ./.:4:166,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:175,60:.: 0.74:1.000:. ./.:4:138,53:.:-0.15:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:122,74:.:-0.05:1.000:. ./.:4:158,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:161,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:117,54:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,55:.:-0.29:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:185,58:.: 0.90:1.000:. ./.:4:79,26:.:-1.87:1.000:. ./.:4:136,49:.:-0.27:1.000:. ./.:4:146,65:.: 0.26:1.000:. ./.:4:100,44:.:-1.09:1.000:. ./.:4:204,83:.: 1.78:1.000:. ./.:4:164,57:.: 0.46:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:108,121:.: 0.62:1.000:. ./.:4:193,55:.: 1.00:1.000:. ./.:4:165,60:.: 0.54:1.000:. ./.:4:154,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:135,50:.:-0.27:1.000:. ./.:6:115,39:.:-0.89:1.000:. ./.:4:146,48:.:-0.09:1.000:. ./.:4:145,62:.: 0.18:1.000:. ./.:4:156,60:.: 0.36:1.000:. ./.:4:121,33:.:-0.89:1.000:. ./.:4:165,64:.: 0.62:1.000:. ./.:4:130,49:.:-0.39:1.000:. ./.:4:97,29:.:-1.45:1.000:. ./.:4:131,50:.:-0.35:1.000:. ./.:4:137,48:.:-0.27:0.578:. ./.:4:181,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:164,58:.: 0.48:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:157,53:.: 0.24:1.000:. ./.:4:126,55:.:-0.35:1.000:. ./.:4:127,125:.: 1.08:1.000:. ./.:4:118,125:.: 0.90:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.95:0.593:. ./.:4:152,74:.: 0.56:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:139,55:.:-0.09:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.31:0.825:. ./.:4:168,61:.: 0.62:1.000:. ./.:4:124,41:.:-0.67:1.000:. ./.:4:94,64:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,42:.:-0.65:1.000:. ./.:4:138,55:.:-0.11:1.000:. ./.:3:50,95:.:-1.07:0.993:. ./.:4:145,46:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,129:.: 1.16:1.000:. ./.:4:140,70:.: 0.24:1.000:. ./.:4:153,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:141,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:145,52:.:-0.03:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:168,64:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,1:.:-1.89:1.000:. ./.:4:92,105:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,33:.:-1.65:1.000:. ./.:4:162,57:.: 0.42:1.000:. ./.:4:72,75:.:-1.03:1.000:. ./.:4:107,53:.:-0.77:1.000:. ./.:4:153,57:.: 0.24:1.000:. ./.:4:94,105:.: 0.01:1.000:. ./.:4:216,91:.: 2.18:1.000:. ./.:4:114,114:.: 0.60:1.000:. ./.:4:139,52:.:-0.15:1.000:. ./.:4:216,64:.: 1.64:1.000:. ./.:4:146,69:.: 0.34:0.999:. ./.:4:189,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:136,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:160,55:.: 0.34:1.000:. ./.:4:85,35:.:-1.57:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:146,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:139,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:150,70:.: 0.44:1.000:. ./.:4:84,102:.:-0.25:1.000:. ./.:4:153,64:.: 0.38:1.000:. ./.:4:164,75:.: 0.82:1.000:. ./.:4:145,57:.: 0.08:1.000:. ./.:4:170,55:.: 0.54:1.000:. ./.:4:100,120:.: 0.44:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:92,42:.:-1.29:1.000:. ./.:4:86,49:.:-1.27:1.000:. ./.:4:145,55:.: 0.04:1.000:. ./.:4:162,45:.: 0.18:1.000:. ./.:4:98,35:.:-1.31:1.000:. ./.:4:148,50:.:-0.01:1.000:. ./.:4:163,57:.: 0.44:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:147,74:.: 0.46:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:86,109:.:-0.07:1.000:. ./.:4:136,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:131,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,40:.:-1.11:1.000:. ./.:4:214,71:.: 1.74:1.000:. ./.:4:199,56:.: 1.14:1.000:. ./.:4:167,63:.: 0.64:1.000:. ./.:4:193,56:.: 1.02:1.000:. ./.:4:205,84:.: 1.82:1.000:. ./.:4:96,117:.: 0.30:1.000:. ./.:4:196,68:.: 1.32:1.000:. ./.:4:163,53:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,23:.:-3.16:1.000:. ./.:4:149,62:.: 0.26:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:174,64:.: 0.80:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:166,61:.: 0.58:1.000:. ./.:4:109,45:.:-0.89:0.998:. ./.:4:184,59:.: 0.90:1.000:. ./.:4:144,60:.: 0.12:1.000:. ./.:4:143,68:.: 0.26:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:114,106:.: 0.44:1.000:. ./.:4:148,61:.: 0.22:1.000:. ./.:4:114,132:.: 0.96:1.000:. ./.:4:133,47:.:-0.37:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:150,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:132,53:.:-0.27:1.000:. ./.:4:146,60:.: 0.16:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:166,60:.: 0.56:1.000:. ./.:4:134,50:.:-0.29:1.000:. ./.:4:125,41:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,96:.:-0.15:1.000:. ./.:4:185,56:.: 0.86:1.000:. ./.:4:151,58:.: 0.22:1.000:. ./.:4:124,132:.: 1.16:1.000:. ./.:4:158,50:.: 0.20:1.000:. ./.:4:118,124:.: 0.88:1.000:. ./.:4:175,76:.: 1.06:1.000:. ./.:4:196,72:.: 1.40:1.000:. ./.:4:145,51:.:-0.05:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.14:1.000:. -chr2.1 67447855 chr2.1_067447855 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:252,300:.: 0.48:1.000:. ./.:4:344,110:.:-0.40:1.000:. ./.:4:348,165:.: 0.13:1.000:. ./.:4:400,134:.: 0.32:1.000:. ./.:4:418,180:.: 0.90:1.000:. ./.:4:324,357:.: 1.65:1.000:. ./.:4:513,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:398,149:.: 0.44:1.000:. ./.:4:409,143:.: 0.48:1.000:. ./.:4:111,63:.:-2.93:1.000:. ./.:4:150,153:.:-1.77:1.000:. ./.:4:431,145:.: 0.70:1.000:. ./.:4:526,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:414,152:.: 0.61:1.000:. ./.:4:255,228:.:-0.14:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:306,324:.: 1.19:0.998:. ./.:4:423,129:.: 0.48:1.000:. ./.:4:522,215:.: 2.16:1.000:. ./.:4:408,183:.: 0.84:1.000:. ./.:4:131,45:.:-2.92:1.000:. ./.:4:368,125:.:-0.05:1.000:. ./.:4:448,154:.: 0.94:1.000:. ./.:4:285,261:.: 0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:662,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:415,152:.: 0.62:1.000:. ./.:4:342,120:.:-0.33:1.000:. ./.:4:453,163:.: 1.06:1.000:. ./.:4:683,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:646,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:370,128:.: 0.00:1.000:. ./.:4:103,30:.:-3.30:1.000:. ./.:4:137,126:.:-2.13:1.000:. ./.:3:129,2:.:-3.32:0.995:. ./.:4:445,129:.: 0.68:1.000:. ./.:4:285,288:.: 0.67:1.000:. ./.:4:577,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:309,281:.: 0.83:1.000:. ./.:4:516,182:.: 1.80:1.000:. ./.:4:251,274:.: 0.24:1.000:. ./.:4:406,137:.: 0.40:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:330,125:.:-0.39:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:370,137:.: 0.08:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:231,73:.:-1.76:1.000:. ./.:4:243,302:.: 0.42:1.000:. ./.:4:459,150:.: 1.00:1.000:. ./.:4:272,94:.:-1.20:1.000:. ./.:4:261,292:.: 0.49:1.000:. ./.:4:202,233:.:-0.57:1.000:. ./.:4:400,143:.: 0.40:1.000:. ./.:4:486,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:304,318:.: 1.12:1.000:. ./.:4:307,132:.:-0.54:1.000:. ./.:4:476,164:.: 1.28:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:177,217:.:-0.94:1.000:. ./.:4:222,245:.:-0.28:1.000:. ./.:4:369,142:.: 0.11:1.000:. ./.:4:588,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:413,164:.: 0.71:1.000:. ./.:4:419,128:.: 0.44:1.000:. ./.:4:224,296:.: 0.20:1.000:. ./.:4:395,141:.: 0.34:1.000:. ./.:4:266,248:.: 0.14:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.34:0.578:. ./.:4:212,245:.:-0.37:1.000:. ./.:4:430,153:.: 0.76:1.000:. ./.:4:116,456:.: 0.67:1.000:. ./.:4:467,165:.: 1.21:1.000:. ./.:4:367,126:.:-0.05:1.000:. ./.:4:363,126:.:-0.09:1.000:. ./.:4:225,264:.:-0.09:1.000:. ./.:4:222,286:.: 0.09:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:564,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.83:0.593:. ./.:4:301,296:.: 0.89:1.000:. ./.:4:291,281:.: 0.67:1.000:. ./.:4:261,111:.:-1.14:1.000:. ./.:4:470,138:.: 0.99:0.825:. ./.:4:561,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:289,99:.:-1.00:1.000:. ./.:4:379,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:372,118:.:-0.08:1.000:. ./.:4:350,132:.:-0.15:1.000:. ./.:3:364,1:.:-1.21:0.993:. ./.:4:167,241:.:-0.82:1.000:. ./.:4:377,137:.: 0.14:1.000:. ./.:4:290,82:.:-1.14:1.000:. ./.:4:385,154:.: 0.37:1.000:. ./.:4:417,151:.: 0.63:1.000:. ./.:4:231,101:.:-1.50:1.000:. ./.:4:206,217:.:-0.68:1.000:. ./.:4:375,125:.: 0.01:1.000:. ./.:4:398,154:.: 0.48:1.000:. ./.:4:341,103:.:-0.49:1.000:. ./.:4:562,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:239,91:.:-1.52:1.000:. ./.:4:423,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:210,267:.:-0.19:1.000:. ./.:4:213,239:.:-0.42:1.000:. ./.:4:439,131:.: 0.65:1.000:. ./.:4:488,176:.: 1.50:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:352,389:.: 2.19:1.000:. ./.:4:343,138:.:-0.16:0.999:. ./.:4:372,121:.:-0.05:1.000:. ./.:4:349,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:227,324:.: 0.48:1.000:. ./.:4:328,124:.:-0.42:1.000:. ./.:4:313,141:.:-0.40:1.000:. ./.:4:366,132:.: 0.00:1.000:. ./.:4:283,130:.:-0.77:1.000:. ./.:4:360,124:.:-0.13:1.000:. ./.:4:328,101:.:-0.63:1.000:. ./.:4:316,136:.:-0.42:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:319,125:.:-0.49:1.000:. ./.:4:387,138:.: 0.24:1.000:. ./.:4:428,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:362,103:.:-0.30:1.000:. ./.:4:249,109:.:-1.27:1.000:. ./.:4:190,226:.:-0.75:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:219,261:.:-0.17:1.000:. ./.:4:203,76:.:-1.98:1.000:. ./.:4:264,259:.: 0.22:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:342,336:.: 1.62:1.000:. ./.:4:222,253:.:-0.21:1.000:. ./.:4:292,115:.:-0.83:1.000:. ./.:4:373,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:386,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:363,132:.:-0.03:1.000:. ./.:4:307,137:.:-0.49:1.000:. ./.:4:259,260:.: 0.19:1.000:. ./.:4:234,86:.:-1.61:1.000:. ./.:4:618,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:476,154:.: 1.19:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:430,152:.: 0.76:1.000:. ./.:4:336,106:.:-0.51:1.000:. ./.:4:491,198:.: 1.72:1.000:. ./.:4:387,117:.: 0.05:1.000:. ./.:4:165,39:.:-2.66:1.000:. ./.:4:254,92:.:-1.38:1.000:. ./.:4:426,149:.: 0.69:1.000:. ./.:4:519,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:316,368:.: 1.68:1.000:. ./.:4:299,284:.: 0.76:1.000:. ./.:4:321,121:.:-0.51:0.998:. ./.:4:590,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:333,140:.:-0.23:1.000:. ./.:4:301,119:.:-0.71:1.000:. ./.:4:329,157:.:-0.11:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:421,143:.: 0.59:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:491,1:.:-0.06:0.999:. ./.:4:367,135:.: 0.03:1.000:. ./.:4:381,138:.: 0.19:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:326,107:.:-0.59:1.000:. ./.:4:270,279:.: 0.46:1.000:. ./.:4:216,247:.:-0.32:1.000:. ./.:4:386,112:.: 0.00:1.000:. ./.:4:335,143:.:-0.18:1.000:. ./.:4:520,205:.: 2.05:1.000:. ./.:4:453,147:.: 0.92:1.000:. ./.:4:398,137:.: 0.33:1.000:. ./.:4:375,98:.:-0.23:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:495,212:.: 1.89:1.000:. ./.:4:475,191:.: 1.52:1.000:. ./.:4:266,262:.: 0.27:1.000:. ./.:4:341,127:.:-0.27:1.000:. -chr2.1 67626412 chr2.1_067626412 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:237,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:221,4:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:169,55:.: 0.21:1.000:. ./.:4:195,75:.: 1.05:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:144,45:.:-0.42:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:187,57:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,9:.:-3.05:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:167,71:.: 0.47:1.000:. ./.:4:185,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:257,3:.: 0.86:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.99:0.998:. ./.:4:294,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:213,66:.: 1.21:1.000:. ./.:4:47,7:.:-2.87:1.000:. ./.:4:161,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:223,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:21,8:.:-3.32:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:222,83:.: 1.68:1.000:. ./.:4:161,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:62,12:.:-2.51:1.000:. ./.:3:14,4:.:-3.52:0.995:. ./.:4:221,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:191,61:.: 0.72:1.000:. ./.:4:143,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:178,54:.: 0.36:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:176,73:.: 0.66:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:144,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:182,58:.: 0.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.29:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:211,70:.: 1.25:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:148,48:.:-0.30:1.000:. ./.:6:169,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:175,52:.: 0.27:1.000:. ./.:4:183,50:.: 0.37:1.000:. ./.:4:170,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:154,49:.:-0.17:0.578:. ./.:4:219,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:185,65:.: 0.68:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:248,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:226,67:.: 1.46:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:132,65:.:-0.28:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:158,58:.: 0.07:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.68:0.593:. ./.:4:222,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:213,60:.: 1.10:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,54:.:-0.99:0.825:. ./.:4:182,55:.: 0.45:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:145,41:.:-0.48:1.000:. ./.:4:171,50:.: 0.16:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.30:1.000:. ./.:3:148,0:.:-1.17:0.993:. ./.:4:180,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:153,47:.:-0.22:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:140,52:.:-0.37:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:177,59:.: 0.43:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:114,46:.:-0.95:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:88,28:.:-1.75:1.000:. ./.:4:156,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:257,70:.: 2.08:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:165,60:.: 0.23:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:144,51:.:-0.31:0.999:. ./.:4:174,55:.: 0.30:1.000:. ./.:4:123,40:.:-0.89:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:133,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:135,57:.:-0.37:1.000:. ./.:4:141,47:.:-0.44:1.000:. ./.:4:166,64:.: 0.32:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:182,65:.: 0.63:1.000:. ./.:4:161,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:205,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:104,32:.:-1.38:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:118,47:.:-0.86:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:171,57:.: 0.28:1.000:. ./.:4:215,81:.: 1.52:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:126,47:.:-0.71:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:145,47:.:-0.37:1.000:. ./.:4:153,43:.:-0.30:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:138,57:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:232,78:.: 1.77:1.000:. ./.:4:233,82:.: 1.86:1.000:. ./.:4:182,55:.: 0.45:1.000:. ./.:4:180,62:.: 0.54:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:199,76:.: 1.14:1.000:. ./.:4:213,4:.: 0.08:1.000:. ./.:4:40,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:201,54:.: 0.77:1.000:. ./.:4:193,62:.: 0.77:1.000:. ./.:4:199,63:.: 0.90:1.000:. ./.:4:216,74:.: 1.41:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:147,48:.:-0.31:0.998:. ./.:4:199,66:.: 0.95:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:155,42:.:-0.28:1.000:. ./.:4:141,51:.:-0.37:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:189,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:149,40:.:-0.42:1.000:. ./.:4:209,3:.:-0.01:0.999:. ./.:4:152,62:.: 0.03:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,52:.:-0.37:1.000:. ./.:4:148,49:.:-0.28:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:141,30:.:-0.75:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:213,58:.: 1.06:1.000:. ./.:4:169,64:.: 0.37:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:161,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.94:1.000:. -chr2.1 67661499 chr2.1_067661499 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,8:0.68:-0.24:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,28:0.85: 2.80:1.000:0.982 0/1/1/1:4:1,5:0.81:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.64:-0.38:1.000:0.734 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,14:0.64: 1.06:1.000:0.734 0/1/1/1:4:3,8:0.68:-0.24:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.48:-0.24:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:1,20:0.94: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,14:0.69: 0.92:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.54: 0.05:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.65: 0.63:1.000:0.805 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,5:0.38: 0.49:1.000:0.620 0/1/1/1:4:2,15:0.86: 0.63:1.000:0.957 1/1/1/1:4:1,13:0.92: 0.20:1.000:0.980 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/1/1:4:3,5:0.55:-0.67:1.000:0.978 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1:3:0,14:1.00: 0.20:0.995:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.96:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:1,13:0.92: 0.20:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,10:0.60: 0.34:1.000:0.764 0/1/1/1:4:1,8:0.87:-0.53:1.000:0.906 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.45: 1.50:1.000:0.984 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.72: 1.21:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 2.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,12:0.77: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.41: 0.92:1.000:0.851 0/0/1/1:4:7,13:0.58: 1.06:1.000:0.904 0/0/1/1:4:10,6:0.41: 0.49:1.000:0.868 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.71:-0.67:1.000:0.989 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,9:0.63: 0.05:1.000:0.623 0/0/0/0/0/0:6:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.63: 0.49:1.000:0.546 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,7:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,9:0.88:-0.38:1.000:0.683 0/0/1/1:4:11,7:0.42: 0.77:0.578:0.900 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.73: 2.51:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,11:0.82: 0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 0.63:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:3,23:0.87: 1.93:1.000:0.943 0/0/1/1:4:11,10:0.45: 1.21:1.000:0.983 0/0/1/1:4:8,14:0.57: 1.35:1.000:0.957 0/1/1/1:4:3,14:0.79: 0.63:0.593:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,10:0.55: 0.49:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 1.64:0.825:1.000 0/1/1/1:4:11,26:0.65: 3.52:1.000:0.768 0/1/1/1:4:3,7:0.64:-0.38:1.000:0.734 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/0:3:5,0:0.00:-1.11:0.993:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.54: 0.05:1.000:0.988 0/1/1/1:4:3,9:0.71:-0.09:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,20:0.94: 1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,28:0.96: 2.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.44: 0.49:1.000:0.963 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/1/1:4:10,14:0.50: 1.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.45: 0.34:1.000:0.980 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,13:0.58: 1.06:1.000:0.904 0/0/1/1:4:5,7:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,14:0.92: 0.34:0.999:0.992 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/0/1:4:8,2:0.34:-0.38:1.000:0.894 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.73: 0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,10:0.73: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.24:1.000:0.957 0/0/1/1:4:7,10:0.51: 0.63:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.71: 0.49:1.000:0.989 0/0/1/1:4:10,7:0.43: 0.63:1.000:0.937 0/1/1/1:4:5,12:0.65: 0.63:1.000:0.805 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.52:-1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,6:0.45: 0.05:1.000:0.978 0/1/1/1:4:2,10:0.81:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.73: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.46:-0.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,20:0.55: 2.80:1.000:0.978 1/1/1/1:4:1,21:0.95: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.57: 0.20:1.000:0.937 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.71:-0.09:1.000:0.989 0/1/1/1:4:6,19:0.72: 1.79:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.77:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,22:0.72: 2.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,16:0.64: 1.50:1.000:0.674 0/0/1/1:4:7,7:0.46: 0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,11:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.45: 0.92:1.000:0.983 0/1/1/1:4:2,6:0.71:-0.67:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,13:0.84: 0.34:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,14:0.79: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,21:0.85: 1.64:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 2.08:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.96:0.998:1.000 1/1/1/1:4:1,15:0.93: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.55:-0.67:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.96:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,8:0.77:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.84: 0.34:0.999:0.993 0/1/1/1:4:1,7:0.85:-0.67:1.000:0.982 0/0/1/1:4:4,8:0.60:-0.09:1.000:0.764 0/0/1/1:4:8,5:0.41: 0.05:1.000:0.891 0/0/1/1:4:3,5:0.55:-0.67:1.000:0.978 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,15:0.93: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.71:-0.67:1.000:0.989 0/1/1/1:4:5,18:0.75: 1.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.46: 0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:6,12:0.60: 0.77:1.000:0.764 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:6,10:0.55: 0.49:1.000:0.978 -chr2.1 67882260 chr2.1_067882260 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:51,59:0.55: 0.08:1.000:0.977 0/0/0/1:4:73,27:0.30:-0.26:1.000:0.984 0/0/1/1:4:60,42:0.44:-0.19:1.000:0.964 0/0/1/1:4:53,34:0.42:-0.71:1.000:0.904 0/0/1/1:4:83,60:0.45: 1.22:1.000:0.975 0/0/0/1:4:143,42:0.26: 2.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,17:0.50:-2.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,55:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,60:0.67:-0.61:1.000:0.908 0/0/1/1:4:23,20:0.49:-2.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,10:0.25:-2.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,16:0.31:-1.75:1.000:0.971 0/1/1/1:4:29,79:0.72: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,36:0.40:-0.37:1.000:0.779 0/0/1/1:4:58,59:0.52: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,78:0.60: 0.88:1.000:0.818 0/0/0/1:4:119,28:0.22: 1.36:0.998:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,65:0.45: 1.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:69,57:0.48: 0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,30:0.68:-2.20:1.000:0.955 0/0/0/1:4:92,19:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,57:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,19:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,15:0.44:-2.47:1.000:0.971 0/1/1/1:4:39,105:0.72: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,57:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,59:0.51: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,83:0.69: 0.43:1.000:0.972 0/1/1/1:4:25,90:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,42:0.43:-0.09:1.000:0.937 0/0/0/1:4:53,28:0.37:-0.92:1.000:0.508 0/0/0/1:4:24,5:0.20:-2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,12:0.21:-1.47:1.000:1.000 0/0/1:3:17,14:0.48:-2.65:0.995:0.829 0/0/0/1:4:96,30:0.27: 0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,22:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,63:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,58:0.46: 0.84:1.000:0.990 0/0/0/1:4:118,28:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,24:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,51:0.42: 0.81:1.000:0.898 0/1/1/1:4:35,99:0.73: 0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,43:0.44:-0.09:1.000:0.959 0/1/1/1:4:19,62:0.75:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,49:0.46: 0.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:64,61:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,34:0.26: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,30:0.28: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,50:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,32:0.31: 0.22:1.000:0.971 0/0/0/1:4:94,35:0.30: 0.74:1.000:0.983 0/0/0/1:4:83,24:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,52:0.49: 0.12:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:126,33:0.24: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,65:0.62:-0.02:1.000:0.631 0/0/1/1:4:67,61:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,68:0.65:-0.09:1.000:0.796 0/0/0/0/1/1:6:63,21:0.28:-0.82:1.000:0.777 0/0/0/1:4:70,22:0.27:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,54:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,88:0.72: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,39:0.42:-0.26:1.000:0.901 0/0/1/1:4:65,50:0.46: 0.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:137,32:0.22: 2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,18:0.33:-1.68:1.000:0.898 0/0/0/1:4:82,11:0.14:-0.51:1.000:0.952 0/1/1/1:4:25,61:0.70:-0.75:0.578:0.989 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,45:0.39: 0.56:1.000:0.700 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,30:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,45:0.42: 0.22:1.000:0.920 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,16:0.23:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,21:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,44:0.44:-0.06:1.000:0.969 0/1/1/1:4:29,93:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,58:0.42: 1.36:1.000:0.919 0/0/0/1:4:49,11:0.21:-1.65:0.593:1.000 0/0/1/1:4:75,66:0.49: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,51:0.45: 0.43:1.000:0.980 0/0/0/1:4:97,20:0.20: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,28:0.26: 0.53:0.825:0.999 0/0/1/1:4:72,49:0.43: 0.46:1.000:0.950 0/0/1/1:4:29,36:0.57:-1.47:1.000:0.951 0/0/1/1:4:55,36:0.42:-0.57:1.000:0.923 0/0/0/1:4:78,23:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,21:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/1/1:3:22,33:0.61:-1.82:0.993:0.999 0/0/0/1:4:99,27:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,68:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,37:0.43:-0.54:1.000:0.943 0/0/1/1:4:60,61:0.52: 0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:97,29:0.26: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,60:0.54: 0.25:1.000:0.988 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,26:0.21: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,26:0.21: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,11:0.19:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,69:0.69:-0.30:1.000:0.978 0/1/1/1:4:24,43:0.65:-1.40:1.000:0.746 0/1/1/1:4:39,73:0.65: 0.15:1.000:0.826 0/1/1/1:4:24,62:0.71:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:90,23:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,36:0.31: 0.81:1.000:0.979 0/1/1/1:4:27,57:0.68:-0.82:1.000:0.947 0/0/1/1:4:78,63:0.47: 1.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,71:0.51: 1.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,64:0.72:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,45:0.31: 1.77:1.000:0.967 0/0/1/1:4:66,43:0.42: 0.05:0.999:0.919 0/0/1/1:4:60,45:0.45:-0.09:1.000:0.983 0/1/1/1:4:16,49:0.74:-1.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,49:0.45: 0.29:1.000:0.978 0/0/0/1:4:82,20:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,38:0.44:-0.54:1.000:0.966 0/1/1/1:4:24,59:0.71:-0.85:1.000:0.989 0/1/1/1:4:22,74:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,70:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,68:0.68:-0.30:1.000:0.964 0/0/0/1:4:89,30:0.28: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,69:0.70:-0.33:1.000:0.985 0/1/1/1:4:34,84:0.71: 0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,66:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,52:0.43: 0.70:1.000:0.953 0/0/1/1:4:34,37:0.54:-1.27:1.000:0.988 0/1/1/1:4:24,52:0.68:-1.09:1.000:0.960 0/0/1/1:4:38,26:0.43:-1.51:1.000:0.953 0/1/1/1:4:27,68:0.71:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:79,25:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,36:0.53:-1.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:94,23:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,67:0.71:-0.47:1.000:0.990 0/0/0/1:4:120,23:0.19: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,54:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,45:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,58:0.69:-0.82:1.000:0.970 0/1/1/1:4:39,73:0.65: 0.15:1.000:0.826 0/0/1/1:4:74,52:0.44: 0.63:1.000:0.965 0/0/0/1:4:81,19:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,21:0.25:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,46:0.52:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,106:0.74: 1.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,64:0.46: 1.32:1.000:0.990 0/1/1/1:4:39,78:0.67: 0.32:1.000:0.908 0/1/1/1:4:24,75:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,68:0.44: 1.95:1.000:0.968 0/0/1/1:4:66,49:0.45: 0.25:1.000:0.981 0/0/1/1:4:74,50:0.43: 0.56:1.000:0.946 0/0/0/1:4:85,30:0.29: 0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,13:0.50:-2.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,36:0.70:-1.96:1.000:0.986 0/1/1/1:4:33,75:0.69: 0.01:1.000:0.976 0/0/1/1:4:62,42:0.43:-0.13:1.000:0.947 0/0/0/1:4:113,34:0.26: 1.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,32:0.28: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,44:0.52:-0.64:0.998:0.996 0/0/1/1:4:46,50:0.54:-0.40:1.000:0.988 0/0/1/1:4:53,40:0.46:-0.51:1.000:0.985 0/0/1/1:4:77,63:0.47: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:73,25:0.29:-0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,53:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,83:0.78:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,54:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,62:0.74:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,33:0.28: 0.81:0.999:0.994 0/0/1/1:4:52,55:0.53:-0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,16:0.22:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,46:0.81:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,48:0.46: 0.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:64,19:0.26:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,25:0.28:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,33:0.40:-0.68:1.000:0.811 0/1/1/1:4:16,51:0.75:-1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,54:0.47: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,54:0.55:-0.19:1.000:0.983 0/0/1/1:4:74,53:0.44: 0.67:1.000:0.972 0/1/1/1:4:33,85:0.71: 0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,83:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,29:0.23: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,77:0.55: 1.26:1.000:0.978 0/0/0/1:4:90,14:0.16:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:90,20:0.21: 0.08:1.000:1.000 -chr2.1 68078282 chr2.1_068078282 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:41,22:.: 2.31:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.25:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,25:.: 1.91:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:20,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:17,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,17:.:-0.06:1.000:. ./.:4:37,21:.: 1.91:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.09:0.998:. ./.:4:45,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:37,16:.: 1.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,3:.:-2.28:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:24,19:.: 0.73:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:34,13:.: 1.04:1.000:. ./.:4:17,16:.:-0.06:1.000:. ./.:4:32,18:.: 1.28:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.28:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.59:0.995:. ./.:4:49,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:13,27:.: 0.49:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,20:.: 1.44:1.000:. ./.:4:19,21:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,17:.: 1.28:1.000:. ./.:4:12,14:.:-0.62:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.30:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:32,40:.: 3.02:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:25,25:.: 1.28:1.000:. ./.:4:29,19:.: 1.12:1.000:. ./.:4:16,18:.: 0.01:1.000:. ./.:6:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:25,15:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:46,10:.: 1.75:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:22,14:.: 0.17:0.578:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:18,14:.:-0.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:33,22:.: 1.67:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,12:.: 1.04:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,16:.: 0.17:0.593:. ./.:4:22,16:.: 0.33:1.000:. ./.:4:23,11:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.01:0.825:. ./.:4:17,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:13,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.70:1.000:. ./.:3:20,0:.:-1.09:0.993:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:27,16:.: 0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:24,15:.: 0.41:1.000:. ./.:4:12,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:20,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.25:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:11,9:.:-1.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:0.999:. ./.:4:9,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,8:.:-1.25:1.000:. ./.:4:24,17:.: 0.57:1.000:. ./.:4:24,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,17:.: 0.25:1.000:. ./.:4:11,15:.:-0.62:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:26,14:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:27,17:.: 0.80:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:11,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.93:1.000:. ./.:4:16,15:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:20,14:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,15:.: 0.57:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:34,26:.: 2.07:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.93:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:7,7:.:-1.57:1.000:. ./.:4:5,14:.:-1.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:15,14:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,20:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:25,15:.: 0.49:1.000:. ./.:4:19,15:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.25:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.80:1.000:. ./.:4:10,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:9,49:.: 1.91:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.01:0.998:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:25,15:.: 0.49:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:24,20:.: 0.80:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:10,15:.:-0.70:1.000:. ./.:4:38,20:.: 1.91:0.999:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:13,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:22,20:.: 0.65:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,19:.: 0.49:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,20:.: 0.09:1.000:. ./.:4:41,13:.: 1.60:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:26,12:.: 0.33:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,15:.: 0.65:1.000:. -chr2.1 68273884 chr2.1_068273884 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:115,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:101,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,41:.: 0.99:1.000:. ./.:4:86,35:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,45:.: 2.35:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:47,26:.:-1.22:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,28:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,2:.:-2.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:71,20:.:-0.76:1.000:. ./.:4:114,41:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:174,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.50:0.998:. ./.:4:148,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:144,47:.: 1.81:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.91:1.000:. ./.:4:128,41:.: 1.24:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:73,30:.:-0.45:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:107,43:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,39:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,2:.:-2.93:1.000:. ./.:3:1,1:.:-3.04:0.995:. ./.:4:152,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:151,46:.: 1.96:1.000:. ./.:4:78,39:.:-0.09:1.000:. ./.:4:143,52:.: 1.91:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,30:.:-0.11:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,50:.: 0.50:1.000:. ./.:4:131,44:.: 1.40:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:119,45:.: 1.12:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:83,45:.: 0.19:1.000:. ./.:6:78,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:80,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:54,38:.:-0.73:0.578:. ./.:4:134,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:102,35:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.40:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:73,29:.:-0.47:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:102,31:.: 0.32:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.24:0.593:. ./.:4:81,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:135,42:.: 1.45:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:82,31:.:-0.19:0.825:. ./.:4:102,43:.: 0.63:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,21:.:-0.78:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.17:1.000:. ./.:3:69,0:.:-1.32:0.993:. ./.:4:84,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:91,40:.: 0.27:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.73:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:95,32:.: 0.17:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:52,17:.:-1.32:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:51,22:.:-1.22:1.000:. ./.:4:79,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:96,39:.: 0.37:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:72,32:.:-0.42:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:89,39:.: 0.19:0.999:. ./.:4:105,36:.: 0.53:1.000:. ./.:4:56,26:.:-0.99:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:88,20:.:-0.32:1.000:. ./.:4:68,30:.:-0.58:1.000:. ./.:4:78,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:113,33:.: 0.65:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:98,41:.: 0.48:1.000:. ./.:4:76,34:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:50,24:.:-1.19:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:84,41:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:127,53:.: 1.53:1.000:. ./.:4:163,53:.: 2.45:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:73,32:.:-0.40:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:53,30:.:-0.96:1.000:. ./.:4:99,39:.: 0.45:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:73,32:.:-0.40:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:143,36:.: 1.50:1.000:. ./.:4:96,31:.: 0.17:1.000:. ./.:4:116,37:.: 0.83:1.000:. ./.:4:86,43:.: 0.22:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:115,47:.: 1.07:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:85,30:.:-0.14:1.000:. ./.:4:76,44:.:-0.01:1.000:. ./.:4:129,46:.: 1.40:1.000:. ./.:4:151,39:.: 1.78:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:80,33:.:-0.19:0.998:. ./.:4:99,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:68,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:98,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:138,39:.: 1.45:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,47:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:88,32:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:66,32:.:-0.58:1.000:. ./.:4:68,32:.:-0.52:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:114,41:.: 0.89:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:104,51:.: 0.89:1.000:. ./.:4:131,39:.: 1.27:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:98,38:.: 0.40:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.14:1.000:. -chr2.1 68488669 chr2.1_068488669 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.85:0.998:. ./.:4:86,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.95:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.47:0.995:. ./.:4:50,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.14:1.000:. ./.:6:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.90:0.578:. ./.:4:78,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.20:0.593:. ./.:4:49,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.52:0.825:. ./.:4:80,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.15:1.000:. ./.:3:25,0:.:-1.47:0.993:. ./.:4:63,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:76,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.01:0.998:. ./.:4:75,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.48:1.000:. -chr2.1 68647559 chr2.1_068647559 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:168,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:103,17:.:-0.45:1.000:. ./.:4:91,15:.:-0.76:1.000:. ./.:4:195,35:.: 1.91:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:87,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,27:.: 0.84:1.000:. ./.:4:21,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:132,34:.: 0.54:1.000:. ./.:4:99,27:.:-0.32:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:198,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:178,2:.: 0.84:0.998:. ./.:4:83,23:.:-0.76:1.000:. ./.:4:293,3:.: 3.34:1.000:. ./.:4:121,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:49,12:.:-1.72:1.000:. ./.:4:104,23:.:-0.30:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:165,41:.: 1.40:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:207,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:180,33:.: 1.55:1.000:. ./.:4:172,23:.: 1.16:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:35,13:.:-2.00:1.000:. ./.:3:34,0:.:-2.31:0.995:. ./.:4:202,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:124,29:.: 0.26:1.000:. ./.:4:178,24:.: 1.31:1.000:. ./.:4:137,40:.: 0.77:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:136,35:.: 0.64:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:126,22:.: 0.15:1.000:. ./.:4:110,39:.: 0.17:1.000:. ./.:4:178,4:.: 0.88:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:130,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:154,29:.: 0.90:1.000:. ./.:4:237,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:169,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:162,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:145,21:.: 0.54:1.000:. ./.:6:94,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:87,18:.:-0.78:1.000:. ./.:4:174,34:.: 1.44:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:143,22:.: 0.52:0.578:. ./.:4:77,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:138,36:.: 0.71:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:200,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:110,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:74,15:.:-1.12:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,26:.:-1.06:1.000:. ./.:4:169,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:134,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.14:0.593:. ./.:4:184,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:158,28:.: 0.97:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:108,21:.:-0.26:0.825:. ./.:4:87,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:71,16:.:-1.16:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.97:1.000:. ./.:3:89,0:.:-1.12:0.993:. ./.:4:133,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:84,39:.:-0.39:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:41,21:.:-1.70:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:79,27:.:-0.76:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:88,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:71,20:.:-1.08:1.000:. ./.:4:113,18:.:-0.22:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:94,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:99,21:.:-0.45:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:107,20:.:-0.30:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:51,15:.:-1.62:0.999:. ./.:4:135,21:.: 0.32:1.000:. ./.:4:70,17:.:-1.16:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:108,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:140,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:113,33:.: 0.11:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.99:1.000:. ./.:4:130,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:130,32:.: 0.45:1.000:. ./.:4:76,20:.:-0.97:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,18:.:-0.30:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:107,14:.:-0.43:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:93,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:97,14:.:-0.65:1.000:. ./.:4:146,46:.: 1.10:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:137,14:.: 0.21:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:116,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:138,22:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:95,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:127,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:171,33:.: 1.35:1.000:. ./.:4:95,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:156,39:.: 1.16:1.000:. ./.:4:118,23:.: 0.00:1.000:. ./.:4:258,1:.: 2.54:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:109,31:.:-0.02:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:39,1:.:-2.18:1.000:. ./.:4:103,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:239,22:.: 2.58:1.000:. ./.:4:96,35:.:-0.22:1.000:. ./.:4:160,42:.: 1.31:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:66,28:.:-1.01:0.998:. ./.:4:102,39:.: 0.00:1.000:. ./.:4:202,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:82,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:122,23:.: 0.08:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:158,28:.: 0.97:1.000:. ./.:4:146,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:155,34:.: 1.03:1.000:. ./.:4:167,2:.: 0.60:0.999:. ./.:4:72,26:.:-0.93:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,27:.: 0.17:1.000:. ./.:4:122,11:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:73,23:.:-0.97:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:117,34:.: 0.21:1.000:. ./.:4:92,36:.:-0.28:1.000:. ./.:4:168,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:152,28:.: 0.84:1.000:. ./.:4:207,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:262,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.52:1.000:. -chr2.1 68811538 chr2.1_068811538 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:0.998:. ./.:4:160,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.30:1.000:. ./.:3:33,0:.:-1.03:0.995:. ./.:4:92,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.79:1.000:. ./.:6:28,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.89:0.578:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.92:0.593:. ./.:4:11,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.17:0.825:. ./.:4:143,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.54:1.000:. ./.:3:35,0:.:-0.98:0.993:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:95,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.03:0.998:. ./.:4:161,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.33:0.999:. ./.:4:77,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.70:1.000:. -chr2.1 69084772 chr2.1_069084772 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:248,238:.: 0.61:1.000:. ./.:4:103,274:.:-0.42:1.000:. ./.:4:323,92:.:-0.06:1.000:. ./.:4:238,243:.: 0.57:1.000:. ./.:4:480,133:.: 1.82:1.000:. ./.:4:453,145:.: 1.68:1.000:. ./.:4:266,100:.:-0.53:1.000:. ./.:4:251,193:.: 0.22:1.000:. ./.:4:210,223:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,63:.:-2.92:1.000:. ./.:4:96,110:.:-2.04:1.000:. ./.:4:231,205:.: 0.14:1.000:. ./.:4:229,241:.: 0.46:1.000:. ./.:4:421,125:.: 1.18:1.000:. ./.:4:219,247:.: 0.42:1.000:. ./.:4:446,142:.: 1.58:1.000:. ./.:4:244,263:.: 0.81:0.998:. ./.:4:250,275:.: 0.98:1.000:. ./.:4:439,145:.: 1.54:1.000:. ./.:4:411,141:.: 1.24:1.000:. ./.:4:103,94:.:-2.13:1.000:. ./.:4:319,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:442,152:.: 1.64:1.000:. ./.:4:234,238:.: 0.48:1.000:. ./.:4:60,29:.:-3.15:1.000:. ./.:4:265,266:.: 1.04:1.000:. ./.:4:265,275:.: 1.13:1.000:. ./.:4:310,105:.:-0.06:1.000:. ./.:4:286,276:.: 1.34:1.000:. ./.:4:390,147:.: 1.10:1.000:. ./.:4:392,145:.: 1.10:1.000:. ./.:4:283,114:.:-0.23:1.000:. ./.:4:101,13:.:-2.92:1.000:. ./.:4:145,44:.:-2.21:1.000:. ./.:3:51,5:.:-3.47:0.995:. ./.:4:388,122:.: 0.84:1.000:. ./.:4:241,223:.: 0.41:1.000:. ./.:4:327,129:.: 0.33:1.000:. ./.:4:239,204:.: 0.21:1.000:. ./.:4:430,119:.: 1.21:1.000:. ./.:4:207,180:.:-0.33:1.000:. ./.:4:349,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:231,253:.: 0.60:1.000:. ./.:4:188,136:.:-0.92:1.000:. ./.:4:203,196:.:-0.21:1.000:. ./.:4:211,199:.:-0.11:1.000:. ./.:4:466,137:.: 1.73:1.000:. ./.:4:147,43:.:-2.20:1.000:. ./.:4:278,75:.:-0.65:1.000:. ./.:4:234,78:.:-1.04:1.000:. ./.:4:224,73:.:-1.18:1.000:. ./.:4:417,139:.: 1.28:1.000:. ./.:4:292,106:.:-0.22:1.000:. ./.:4:253,224:.: 0.53:1.000:. ./.:4:232,217:.: 0.26:1.000:. ./.:4:317,91:.:-0.13:1.000:. ./.:4:311,120:.: 0.09:1.000:. ./.:4:207,191:.:-0.22:1.000:. ./.:4:190,170:.:-0.58:1.000:. ./.:6:143,149:.:-1.23:1.000:. ./.:4:193,202:.:-0.25:1.000:. ./.:4:203,204:.:-0.14:1.000:. ./.:4:247,243:.: 0.65:1.000:. ./.:4:177,169:.:-0.71:1.000:. ./.:4:223,227:.: 0.27:1.000:. ./.:4:164,187:.:-0.67:1.000:. ./.:4:280,88:.:-0.51:1.000:. ./.:4:331,98:.: 0.07:1.000:. ./.:4:217,187:.:-0.16:0.578:. ./.:4:96,278:.:-0.45:1.000:. ./.:4:354,122:.: 0.52:1.000:. ./.:4:149,165:.:-1.02:1.000:. ./.:4:112,314:.: 0.04:1.000:. ./.:4:234,233:.: 0.43:1.000:. ./.:4:120,292:.:-0.09:1.000:. ./.:4:180,168:.:-0.70:1.000:. ./.:4:220,205:.: 0.04:1.000:. ./.:4:309,113:.: 0.01:1.000:. ./.:4:314,111:.: 0.04:1.000:. ./.:4:342,96:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,167:.:-0.62:0.727:. ./.:4:219,248:.: 0.43:1.000:. ./.:4:334,115:.: 0.26:1.000:. ./.:4:293,97:.:-0.30:1.000:. ./.:4:319,113:.: 0.10:0.825:. ./.:4:235,241:.: 0.52:1.000:. ./.:4:218,54:.:-1.42:1.000:. ./.:4:274,84:.:-0.60:1.000:. ./.:4:260,88:.:-0.70:1.000:. ./.:4:272,86:.:-0.60:1.000:. ./.:3:195,86:.:-1.33:0.993:. ./.:4:177,198:.:-0.44:1.000:. ./.:4:240,241:.: 0.57:1.000:. ./.:4:155,178:.:-0.84:1.000:. ./.:4:231,247:.: 0.54:1.000:. ./.:4:292,80:.:-0.47:1.000:. ./.:4:227,84:.:-1.05:1.000:. ./.:4:79,234:.:-1.03:1.000:. ./.:4:359,113:.: 0.48:1.000:. ./.:4:370,120:.: 0.65:1.000:. ./.:4:265,82:.:-0.71:1.000:. ./.:4:308,89:.:-0.23:1.000:. ./.:4:163,152:.:-1.01:1.000:. ./.:4:326,86:.:-0.09:1.000:. ./.:4:176,156:.:-0.85:1.000:. ./.:4:296,83:.:-0.40:1.000:. ./.:4:276,85:.:-0.57:1.000:. ./.:4:237,221:.: 0.35:1.000:. ./.:4:298,299:.: 1.67:1.000:. ./.:4:318,129:.: 0.24:1.000:. ./.:4:191,170:.:-0.57:1.000:. ./.:4:275,311:.: 1.56:1.000:. ./.:4:279,91:.:-0.49:0.999:. ./.:4:229,226:.: 0.32:1.000:. ./.:4:128,129:.:-1.56:1.000:. ./.:4:207,234:.: 0.19:1.000:. ./.:4:277,98:.:-0.44:1.000:. ./.:4:260,99:.:-0.59:1.000:. ./.:4:185,199:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,187:.:-0.62:1.000:. ./.:4:314,112:.: 0.04:1.000:. ./.:4:186,172:.:-0.60:1.000:. ./.:4:336,94:.: 0.08:1.000:. ./.:4:233,237:.: 0.46:1.000:. ./.:4:199,215:.:-0.07:1.000:. ./.:4:268,247:.: 0.89:1.000:. ./.:4:295,102:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,247:.:-0.93:1.000:. ./.:4:154,154:.:-1.08:1.000:. ./.:4:153,166:.:-0.97:1.000:. ./.:4:271,94:.:-0.53:1.000:. ./.:4:223,219:.: 0.20:1.000:. ./.:4:121,116:.:-1.75:1.000:. ./.:4:317,87:.:-0.16:1.000:. ./.:4:279,102:.:-0.38:1.000:. ./.:4:481,144:.: 1.93:1.000:. ./.:4:231,190:.: 0.00:1.000:. ./.:4:178,157:.:-0.82:1.000:. ./.:4:186,144:.:-0.87:1.000:. ./.:4:195,209:.:-0.16:1.000:. ./.:4:287,104:.:-0.29:1.000:. ./.:4:289,108:.:-0.23:1.000:. ./.:4:247,207:.: 0.31:1.000:. ./.:4:123,136:.:-1.54:1.000:. ./.:4:435,158:.: 1.63:1.000:. ./.:4:312,297:.: 1.78:1.000:. ./.:4:241,236:.: 0.53:1.000:. ./.:4:206,203:.:-0.12:1.000:. ./.:4:281,251:.: 1.05:1.000:. ./.:4:205,207:.:-0.09:1.000:. ./.:4:303,286:.: 1.59:1.000:. ./.:4:327,110:.: 0.15:1.000:. ./.:4:102,25:.:-2.79:1.000:. ./.:4:163,198:.:-0.57:1.000:. ./.:4:237,241:.: 0.54:1.000:. ./.:4:445,141:.: 1.56:1.000:. ./.:4:477,148:.: 1.93:1.000:. ./.:4:259,300:.: 1.31:1.000:. ./.:4:217,217:.: 0.12:0.998:. ./.:4:404,137:.: 1.14:1.000:. ./.:4:204,218:.: 0.01:1.000:. ./.:4:201,192:.:-0.27:1.000:. ./.:4:301,98:.:-0.21:1.000:. ./.:4:385,110:.: 0.70:1.000:. ./.:4:334,106:.: 0.18:1.000:. ./.:4:233,259:.: 0.67:1.000:. ./.:4:340,111:.: 0.28:1.000:. ./.:4:141,352:.: 0.68:0.999:. ./.:4:249,217:.: 0.42:1.000:. ./.:4:345,112:.: 0.34:1.000:. ./.:4:203,178:.:-0.38:1.000:. ./.:4:192,169:.:-0.57:1.000:. ./.:4:238,204:.: 0.20:1.000:. ./.:4:186,193:.:-0.40:1.000:. ./.:4:304,111:.:-0.06:1.000:. ./.:4:160,191:.:-0.67:1.000:. ./.:4:259,274:.: 1.06:1.000:. ./.:4:433,145:.: 1.49:1.000:. ./.:4:251,249:.: 0.75:1.000:. ./.:4:194,238:.: 0.10:1.000:. ./.:4:384,129:.: 0.87:1.000:. ./.:4:487,157:.: 2.11:1.000:. ./.:4:303,315:.: 1.87:1.000:. ./.:4:210,194:.:-0.16:1.000:. ./.:4:134,335:.: 0.45:1.000:. -chr2.1 69285127 chr2.1_069285127 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:202,234:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/0:4:296,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:238,105:0.26:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:292,120:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:314,98:0.20: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,245:0.49: 1.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,84:0.25:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,186:0.45: 0.27:1.000:0.975 0/0/0/1:4:264,102:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,63:0.26:-2.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,100:0.61:-2.82:1.000:0.727 0/0/0/0:4:312,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,97:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:262,124:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,186:0.46: 0.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:163,236:0.55: 0.59:1.000:0.979 0/0/1/1:4:200,244:0.50: 1.23:0.998:0.997 0/0/0/1:4:301,108:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,277:0.55: 1.58:1.000:0.981 0/0/0/1:4:298,137:0.27: 1.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,32:0.17:-2.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:213,91:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,265:0.54: 1.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:160,173:0.47:-0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:93,21:0.16:-3.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:277,89:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,187:0.45: 0.24:1.000:0.981 0/0/1/1:4:179,214:0.49: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:317,134:0.26: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,98:0.21: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,228:0.55: 0.38:1.000:0.976 0/0/1/1:4:186,192:0.46: 0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:35,62:0.61:-3.66:1.000:0.697 0/0/0/1:4:144,38:0.18:-2.46:1.000:0.999 0/0/1:3:37,14:0.24:-4.31:0.995:1.000 0/0/1/1:4:188,238:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,211:0.48: 0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:254,115:0.27: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:251,107:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,117:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:212,198:0.43: 0.75:1.000:0.957 0/0/1/1:4:185,174:0.44: 0.03:1.000:0.961 0/0/0/1:4:303,102:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,183:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,258:0.55: 1.16:1.000:0.984 0/0/0/1:4:291,130:0.27: 0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:305,125:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,240:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,178:0.47:-0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:146,171:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,212:0.53: 0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:249,243:0.45: 1.90:1.000:0.974 0/0/1/1:4:174,239:0.53: 0.79:1.000:0.990 0/0/0/1:4:283,107:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,211:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,213:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,192:0.47: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:175,167:0.44:-0.21:1.000:0.967 0/0/0/1:4:237,98:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:160,170:0.47:-0.38:1.000:0.822 0/0/1/1:4:155,226:0.55: 0.34:1.000:0.977 0/0/0/1:4:266,76:0.19:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,136:0.26: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:155,202:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:177,232:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,217:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,158:0.55:-1.27:1.000:0.979 0/0/1/1:4:134,216:0.58:-0.10:1.000:0.905 0/0/0/1:4:255,117:0.27: 0.21:0.578:0.997 0/0/0/0:4:305,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,127:0.30: 0.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:132,115:0.42:-1.55:1.000:0.905 0/0/0/0:4:357,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,128:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:364,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,118:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,193:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:245,93:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,233:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:163,217:0.53: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/0:4:286,1:0.00:-0.98:0.727:1.000 0/0/1/1:4:170,222:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:294,110:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,192:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:239,126:0.30: 0.11:0.825:0.983 0/0/0/1:4:270,118:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,158:0.48:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:208,86:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,168:0.47:-0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:161,211:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/1/1:3:74,225:0.75:-0.82:0.993:1.000 0/0/1/1:4:174,195:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,211:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,159:0.51:-1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:242,93:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,208:0.52: 0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:214,107:0.29:-0.51:1.000:0.992 0/0/0/0:4:261,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:278,121:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,197:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,94:0.30:-1.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:197,220:0.48: 0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:195,82:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:270,95:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,187:0.54:-0.51:1.000:0.988 0/0/1/1:4:153,228:0.56: 0.34:1.000:0.969 0/0/1/1:4:130,160:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,209:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:376,122:0.21: 1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,203:0.47: 0.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:240,84:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:233,288:0.50: 2.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:260,115:0.26: 0.26:0.999:0.998 0/0/0/1:4:269,112:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,72:0.22:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,235:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,184:0.49:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:236,87:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,75:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,82:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,83:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,170:0.47:-0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:143,242:0.60: 0.40:1.000:0.821 0/0/0/1:4:291,110:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,98:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,186:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:173,189:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/0:4:263,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,81:0.27:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,166:0.55:-1.08:1.000:0.978 0/0/0/1:4:261,84:0.21:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,241:0.55: 0.75:1.000:0.984 0/0/1/1:4:116,123:0.47:-1.66:1.000:0.990 0/0/1/1:4:152,201:0.52:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:245,101:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:306,152:0.29: 1.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:181,217:0.49: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:239,98:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,171:0.49:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:228,86:0.24:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,93:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,223:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:219,92:0.25:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,175:0.56:-0.89:1.000:0.974 0/0/0/1:4:363,130:0.23: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:349,134:0.24: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,108:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:271,101:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,235:0.49: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,187:0.48:-0.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:279,137:0.29: 0.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:162,205:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,74:0.39:-2.62:1.000:0.648 0/0/1/1:4:151,203:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:290,126:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:271,110:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:305,113:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,236:0.54: 0.69:1.000:0.989 0/0/0/1:4:239,68:0.19:-0.70:0.998:1.000 0/0/0/1:4:278,111:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,186:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,69:0.20:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,106:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,214:0.47: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:237,118:0.29:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:164,214:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:204,94:0.27:-0.83:1.000:0.997 0/0/0/0:4:287,0:0.00:-0.98:0.999:1.000 0/0/0/1:4:223,117:0.30:-0.24:1.000:0.984 0/0/1/1:4:167,169:0.45:-0.29:1.000:0.983 0/0/0/1:4:206,91:0.26:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:202,74:0.23:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,200:0.47: 0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:154,182:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:208,96:0.27:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,203:0.56:-0.22:1.000:0.974 0/0/0/1:4:305,140:0.27: 1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:290,123:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,229:0.47: 1.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:255,89:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,222:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:202,262:0.52: 1.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:212,260:0.50: 1.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,171:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/0:4:396,1:0.00: 0.57:1.000:1.000 -chr2.1 69452021 chr2.1_069452021 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:295,95:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:283,99:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,224:0.58:-0.01:1.000:0.930 0/1/1/1:4:189,323:0.63: 1.22:1.000:0.515 0/0/0/1:4:266,112:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:407,128:0.19: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,197:0.56:-0.39:1.000:0.963 0/0/1/1:4:257,214:0.45: 0.80:1.000:0.981 0/1/1/1:4:152,326:0.67: 0.87:1.000:0.929 0/1/1/1:4:60,184:0.74:-1.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,45:0.24:-2.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:302,90:0.19: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,226:0.58: 0.01:1.000:0.923 0/0/1/1:4:206,315:0.60: 1.31:1.000:0.765 0/0/0/1:4:314,91:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:386,1:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:316,266:0.46: 1.92:0.998:0.984 0/0/0/0:4:384,2:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:347,162:0.26: 1.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:185,379:0.66: 1.74:1.000:0.888 0/1/1/1:4:46,153:0.75:-1.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:267,120:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:271,223:0.45: 1.03:1.000:0.977 0/0/0/1:4:335,105:0.19: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,32:0.32:-3.04:1.000:0.951 0/0/0/1:4:316,162:0.29: 0.87:1.000:0.990 0/0/1/1:4:288,226:0.43: 1.24:1.000:0.950 0/0/0/1:4:240,98:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:148,381:0.71: 1.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:206,245:0.55: 0.60:1.000:0.982 0/0/0/1:4:351,125:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,231:0.45: 1.19:1.000:0.980 0/0/1/1:4:72,55:0.42:-2.66:1.000:0.922 0/0/1/1:4:100,137:0.58:-1.55:1.000:0.918 0/1/1:3:20,30:0.60:-3.43:0.995:0.999 0/0/0/1:4:302,109:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:282,255:0.48: 1.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:191,231:0.55: 0.31:1.000:0.978 0/0/1/1:4:292,246:0.46: 1.48:1.000:0.984 0/0/0/1:4:335,143:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,88:0.18: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:317,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,136:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:317,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,122:0.30:-0.36:1.000:0.986 0/0/0/1:4:227,109:0.27:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,212:0.55: 0.01:1.000:0.984 0/0/0/1:4:338,160:0.27: 1.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:211,166:0.43:-0.14:1.000:0.952 0/0/0/0:4:322,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:222,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:334,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,186:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:232,126:0.31:-0.33:1.000:0.972 0/0/0/1:4:196,94:0.27:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:261,281:0.53: 1.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:226,111:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:322,164:0.29: 0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:173,250:0.59: 0.32:1.000:0.860 0/0/0/0/0/1:6:265,79:0.19:-0.47:1.000:0.961 0/0/0/1:4:295,112:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:143,349:0.70: 1.01:1.000:0.982 0/0/1/1:4:177,275:0.61: 0.61:1.000:0.732 0/0/0/1:4:239,150:0.36:-0.02:1.000:0.724 0/0/0/1:4:275,116:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:336,126:0.22: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,85:0.31:-1.48:1.000:0.979 0/0/0/1:4:279,99:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,229:0.57: 0.09:0.578:0.935 0/0/0/1:4:285,169:0.34: 0.63:1.000:0.878 0/0/0/1:4:257,147:0.33: 0.13:1.000:0.932 0/0/0/1:4:288,96:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:403,144:0.21: 1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:170,300:0.63: 0.79:1.000:0.603 0/0/0/1:4:282,112:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,224:0.48: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:256,206:0.44: 0.71:1.000:0.967 0/0/0/1:4:238,100:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,137:0.32:-0.09:1.000:0.954 0/0/0/1:4:295,141:0.27: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:271,0:0.00:-1.21:0.727:1.000 0/0/1/1:4:291,259:0.47: 1.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:258,137:0.30: 0.04:1.000:0.982 0/0/0/1:4:184,93:0.29:-1.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:287,131:0.26: 0.27:0.825:0.999 0/0/1/1:4:296,251:0.46: 1.57:1.000:0.986 0/0/0/1:4:199,79:0.23:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,187:0.57:-0.61:1.000:0.953 0/0/1/1:4:207,252:0.55: 0.68:1.000:0.977 0/0/0/0:4:301,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1:3:123,100:0.44:-1.69:0.993:0.978 0/0/1/1:4:206,179:0.47:-0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:277,216:0.43: 1.02:1.000:0.944 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:222,230:0.52: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/0:4:389,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,158:0.48:-0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:300,183:0.35: 0.92:1.000:0.813 0/0/0/1:4:221,111:0.29:-0.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:259,110:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,95:0.32:-1.26:1.000:0.959 0/0/0/1:4:237,127:0.31:-0.27:1.000:0.978 0/0/1/1:4:130,163:0.56:-0.99:1.000:0.968 0/0/1/1:4:204,137:0.38:-0.51:1.000:0.558 0/0/0/1:4:167,104:0.35:-1.21:1.000:0.750 0/0/1/1:4:213,206:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:311,114:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:258,232:0.48: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:288,258:0.48: 1.56:1.000:0.994 0/0/0/0:4:352,2:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,106:0.32:-0.95:1.000:0.960 0/0/0/1:4:443,164:0.22: 2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,217:0.53: 0.28:0.999:0.994 0/0/0/1:4:259,138:0.30: 0.06:1.000:0.980 0/0/0/1:4:213,105:0.28:-0.74:1.000:0.995 0/0/0/1:4:335,133:0.23: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,100:0.30:-1.02:1.000:0.984 0/0/0/1:4:192,125:0.37:-0.75:1.000:0.578 0/1/1/1:4:117,338:0.73: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:131,285:0.67: 0.25:1.000:0.939 0/1/1/1:4:161,288:0.64: 0.58:1.000:0.639 0/0/1/1:4:194,198:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:290,2:0.01:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,114:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,196:0.47: 0.31:1.000:0.990 0/0/0/0:4:297,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,108:0.31:-0.82:1.000:0.979 0/0/0/1:4:278,92:0.20:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,263:0.68:-0.10:1.000:0.953 0/0/1/1:4:188,165:0.47:-0.38:1.000:0.992 0/1/1/1:4:113,195:0.63:-0.84:1.000:0.542 0/0/0/1:4:311,104:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,123:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,98:0.28:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:336,277:0.45: 2.23:1.000:0.978 0/0/1/1:4:262,238:0.48: 1.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:171,110:0.36:-1.11:1.000:0.629 0/0/0/1:4:178,87:0.28:-1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,181:0.57:-0.76:1.000:0.934 0/0/0/1:4:235,116:0.28:-0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,89:0.33:-1.50:1.000:0.910 0/0/1/1:4:234,188:0.44: 0.31:1.000:0.966 0/0/0/0:4:221,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,169:0.31: 0.85:1.000:0.965 0/0/1/1:4:262,251:0.50: 1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,204:0.57:-0.29:1.000:0.956 0/0/0/1:4:226,102:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:273,145:0.30: 0.27:1.000:0.982 0/0/1/1:4:224,215:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:286,135:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:182,232:0.56: 0.23:1.000:0.961 0/0/1/1:4:94,116:0.56:-1.82:1.000:0.973 0/0/0/1:4:182,90:0.28:-1.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:271,144:0.30: 0.24:1.000:0.981 0/0/0/1:4:285,113:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:289,274:0.50: 1.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:269,265:0.51: 1.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,181:0.46: 0.00:0.998:0.989 0/0/0/1:4:323,125:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,120:0.32:-0.60:1.000:0.943 0/1/1/1:4:150,279:0.64: 0.38:1.000:0.732 0/0/0/1:4:271,94:0.21:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,91:0.20:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,259:0.57: 0.68:1.000:0.954 0/0/1/1:4:262,220:0.45: 0.91:1.000:0.984 0/0/1/1:4:154,210:0.58:-0.27:1.000:0.921 0/0/0/0:4:314,0:0.00:-0.78:0.999:1.000 0/0/1/1:4:242,191:0.43: 0.42:1.000:0.954 0/0/0/0:4:301,1:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,92:0.28:-1.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:225,99:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:271,100:0.22:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,95:0.19: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,286:0.62: 0.65:1.000:0.528 0/0/1/1:4:220,173:0.43: 0.02:1.000:0.951 0/0/1/1:4:352,315:0.48: 2.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:281,220:0.43: 1.10:1.000:0.948 0/0/1/1:4:264,227:0.46: 1.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:213,156:0.41:-0.22:1.000:0.851 0/0/0/1:4:179,103:0.33:-1.10:1.000:0.925 0/0/0/1:4:319,147:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:427,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,219:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,96:0.21:-0.16:1.000:1.000 -chr2.1 69751074 chr2.1_069751074 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:174,138:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,210:0.75:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,127:0.52:-0.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:227,58:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,261:0.72: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:233,165:0.46: 1.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:133,132:0.54:-0.63:1.000:0.986 0/0/0/1:4:262,63:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,75:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,30:0.29:-2.68:1.000:0.990 0/0/1/1:4:53,39:0.47:-3.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:72,212:0.77:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,138:0.53:-0.35:1.000:0.992 0/0/0/1:4:274,82:0.26: 0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,147:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:111,249:0.72: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:196,154:0.49: 0.54:0.998:0.996 0/1/1/1:4:118,260:0.71: 0.93:1.000:0.993 0/1/1/1:4:100,269:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:285,71:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,18:0.18:-2.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,168:0.69:-0.78:1.000:0.972 0/0/0/1:4:244,83:0.29: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:153,142:0.53:-0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,22:0.44:-3.51:1.000:0.963 0/0/1/1:4:161,148:0.53:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:247,74:0.26: 0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:77,184:0.73:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:295,74:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,155:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,143:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:204,48:0.22:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,33:0.79:-3.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,51:0.48:-2.64:1.000:0.994 0/1/1:3:12,10:0.50:-3.98:0.995:0.552 0/1/1/1:4:97,222:0.72: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,148:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,118:0.47:-0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:185,110:0.42:-0.22:1.000:0.897 0/1/1/1:4:91,198:0.71:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:166,157:0.53: 0.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:95,213:0.72:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:194,154:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,179:0.70:-0.64:1.000:0.988 0/0/1/1:4:212,152:0.46: 0.73:1.000:0.990 0/1/1/1:4:91,194:0.71:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:163,141:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:134,335:0.74: 2.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:165,107:0.44:-0.53:1.000:0.964 0/1/1/1:4:96,230:0.73: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:84,213:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:123,295:0.73: 1.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:177,141:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,232:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,204:0.77:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,169:0.46: 1.38:1.000:0.986 0/1/1/1:4:94,226:0.73: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:281,180:0.43: 2.07:1.000:0.958 0/0/1/1:4:178,145:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:182,120:0.44:-0.12:1.000:0.694 0/0/1/1:4:180,131:0.47: 0.00:1.000:0.991 0/0/0/1:4:263,77:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:252,202:0.49: 1.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:97,241:0.74: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,227:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,125:0.46:-0.12:1.000:0.988 0/1/1/1:4:97,165:0.66:-0.67:1.000:0.872 0/0/1/1:4:172,107:0.43:-0.44:1.000:0.940 0/0/1/1:4:188,157:0.50: 0.47:0.578:0.997 0/0/1/1:4:155,121:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:117,245:0.70: 0.71:1.000:0.987 0/1/1/1:4:127,205:0.65: 0.29:1.000:0.787 0/1/1/1:4:136,274:0.70: 1.37:1.000:0.980 0/0/0/1:4:297,86:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,241:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,139:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:220,135:0.42: 0.61:1.000:0.929 0/0/1/1:4:199,121:0.42: 0.13:1.000:0.920 0/0/1/1:4:191,144:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:200,154:0.48: 0.60:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-1.11:0.727:1.000 0/0/1/1:4:273,177:0.44: 1.92:1.000:0.964 0/1/1/1:4:107,272:0.74: 0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,159:0.70:-1.03:1.000:0.985 0/1/1/1:4:103,233:0.72: 0.35:0.825:0.995 0/0/0/1:4:294,84:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,168:0.72:-0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,132:0.48:-0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:179,136:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,226:0.74: 0.09:1.000:0.998 0/0/1:3:201,77:0.31:-0.45:0.993:1.000 0/0/1/1:4:172,129:0.48:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:356,96:0.24: 1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,156:0.71:-1.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:289,94:0.28: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:101,217:0.71: 0.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:282,72:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,121:0.46:-0.29:1.000:0.990 0/1/1/1:4:130,217:0.66: 0.50:1.000:0.845 0/1/1/1:4:87,251:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,204:0.68: 0.04:1.000:0.949 0/0/1/1:4:208,139:0.45: 0.50:1.000:0.975 0/0/0/1:4:205,50:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,136:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:180,108:0.42:-0.31:1.000:0.907 0/0/1/1:4:196,137:0.46: 0.31:1.000:0.986 0/0/1/1:4:195,142:0.47: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:214,61:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:360,93:0.24: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,175:0.56: 0.35:1.000:0.963 0/0/1/1:4:206,142:0.45: 0.51:1.000:0.983 0/0/1/1:4:187,157:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:291,82:0.25: 0.86:0.999:0.999 0/1/1/1:4:83,230:0.75: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,116:0.48:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:240,161:0.45: 1.24:1.000:0.976 0/1/1/1:4:118,272:0.72: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,197:0.72:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:299,73:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,81:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:283,74:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,150:0.48: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:91,205:0.72:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,127:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:310,73:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,232:0.68: 0.61:1.000:0.958 0/0/1/1:4:200,138:0.45: 0.38:1.000:0.983 0/1/1/1:4:97,176:0.67:-0.52:1.000:0.935 0/0/0/1:4:195,63:0.28:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,86:0.46:-1.40:1.000:0.986 0/0/1/1:4:198,140:0.46: 0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:145,115:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,165:0.77:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,165:0.44: 1.49:1.000:0.965 0/0/1/1:4:158,124:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:243,198:0.50: 1.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:183,144:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,211:0.74:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,107:0.47:-0.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:174,137:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:121,221:0.68: 0.43:1.000:0.940 0/1/1/1:4:110,215:0.69: 0.20:1.000:0.972 0/0/1/1:4:154,106:0.45:-0.70:1.000:0.983 0/1/1/1:4:98,147:0.63:-0.91:1.000:0.612 0/0/1/1:4:213,202:0.53: 1.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:352,91:0.24: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,159:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,145:0.54:-0.24:1.000:0.988 0/1/1/1:4:141,263:0.68: 1.28:1.000:0.952 0/0/0/1:4:249,71:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,144:0.48: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:153,145:0.53:-0.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:54,13:0.23:-3.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,116:0.53:-0.96:1.000:0.993 0/1/1/1:4:97,218:0.72: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:178,132:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:203,164:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,174:0.56: 0.31:1.000:0.960 0/0/0/1:4:168,52:0.27:-1.25:0.998:0.998 0/0/1/1:4:187,163:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:96,218:0.72: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:222,68:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,167:0.74:-1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:186,144:0.48: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,135:0.48:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:311,84:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,130:0.52:-0.48:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,264:1.00:-0.63:0.999:1.000 0/0/0/1:4:204,58:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,185:0.76:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,108:0.52:-1.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,190:0.74:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,111:0.52:-1.02:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:227,58:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,61:0.32:-1.29:1.000:0.960 0/0/0/1:4:284,80:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:299,64:0.21: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,85:0.28: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,92:0.39:-0.60:1.000:0.640 0/0/1/1:4:190,151:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,262:0.72: 0.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,235:0.74: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:170,123:0.47:-0.24:1.000:0.991 0/1/1/1:4:83,213:0.74:-0.20:1.000:0.999 -chr2.1 69941140 chr2.1_069941140 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:86,104:0.54: 0.56:1.000:0.989 0/0/0/1:4:118,34:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,92:0.48: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,170:0.78: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,67:0.30: 1.29:1.000:0.986 0/0/1/1:4:124,154:0.54: 2.41:1.000:0.985 0/0/1/1:4:57,75:0.56:-0.66:1.000:0.969 0/1/1/1:4:57,161:0.73: 1.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:65,159:0.71: 1.27:1.000:0.989 0/1/1/1:4:11,37:0.77:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,60:0.59:-1.33:1.000:0.853 0/0/0/1:4:126,31:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,112:0.51: 1.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,180:0.76: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,113:0.54: 0.87:1.000:0.987 0/0/0/1:4:162,71:0.31: 1.46:1.000:0.979 0/0/1/1:4:124,110:0.46: 1.48:0.998:0.988 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,66:0.26: 2.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,162:0.76: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,30:0.58:-2.36:1.000:0.915 0/0/0/1:4:158,46:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,158:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,95:0.48: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,31:0.41:-1.86:1.000:0.851 0/0/1/1:4:91,105:0.53: 0.69:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,189:0.73: 1.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:168,45:0.21: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,155:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,113:0.56: 0.75:1.000:0.969 0/0/1/1:4:95,113:0.53: 0.94:1.000:0.991 0/1/1/1:4:55,142:0.72: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:26,12:0.32:-2.63:1.000:0.963 0/0/1/1:4:60,51:0.45:-1.10:1.000:0.981 0/1/1:3:11,32:0.74:-2.53:0.995:1.000 0/0/0/1:4:143,52:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,100:0.47: 0.92:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,106:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,89:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,51:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,89:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,36:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,76:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,22:0.18:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,69:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,43:0.29:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:122,106:0.46: 1.36:1.000:0.985 0/0/0/1:4:69,19:0.22:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,75:0.47:-0.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:126,32:0.21:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,43:0.32:-0.57:1.000:0.962 0/0/0/1:4:159,57:0.27: 1.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,73:0.47:-0.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:116,44:0.28:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,38:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,86:0.55:-0.20:1.000:0.981 0/0/0/1:4:87,36:0.29:-0.85:1.000:0.989 0/0/1/1:4:81,61:0.42:-0.45:1.000:0.926 0/0/1/1:4:70,81:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:63,61:0.48:-0.83:1.000:0.871 0/0/1/1:4:67,56:0.45:-0.85:1.000:0.977 0/1/1/1:4:38,129:0.77: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,78:0.54:-0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:87,22:0.21:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,34:0.23:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,77:0.44: 0.18:1.000:0.968 0/0/0/1:4:80,30:0.28:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,91:0.52: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,84:0.52:-0.13:0.578:0.994 0/0/1/1:4:90,68:0.42:-0.11:1.000:0.929 0/0/0/1:4:133,36:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,21:0.22:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,48:0.27: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,140:0.73: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,34:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,58:0.44:-0.68:1.000:0.960 0/0/1/1:4:88,89:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,66:0.48:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,76:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,92:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.72:0.727:1.000 0/0/1/1:4:60,67:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,36:0.27:-0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,48:0.29: 0.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:138,46:0.25: 0.43:0.825:0.999 0/1/1/1:4:53,138:0.72: 0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,24:0.26:-1.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,46:0.44:-1.27:1.000:0.966 0/0/1/1:4:67,75:0.52:-0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,32:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/1/1:3:25,62:0.71:-1.60:0.993:1.000 0/0/1/1:4:73,59:0.44:-0.66:1.000:0.967 0/1/1/1:4:40,109:0.73:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,35:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,107:0.79:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,35:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,111:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,59:0.47:-0.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:104,35:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,42:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,26:0.27:-1.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,82:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,66:0.75:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,65:0.52:-0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,55:0.47:-0.99:1.000:0.990 0/0/1/1:4:66,60:0.47:-0.78:1.000:0.991 0/0/1/1:4:47,63:0.56:-1.12:1.000:0.961 0/1/1/1:4:40,150:0.79: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,166:0.73: 1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,94:0.53: 0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,67:0.56:-0.95:1.000:0.969 0/0/1/1:4:122,118:0.48: 1.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,85:0.72:-0.95:0.999:0.994 0/0/0/1:4:89,42:0.32:-0.68:1.000:0.952 0/0/1/1:4:64,43:0.40:-1.18:1.000:0.766 0/0/1/1:4:67,70:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,22:0.22:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,27:0.19:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,79:0.69:-1.04:1.000:0.970 0/1/1/1:4:36,91:0.71:-0.76:1.000:0.993 0/1/1/1:4:45,135:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,66:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,33:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,114:0.48: 1.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,76:0.71:-1.18:1.000:0.989 0/0/0/1:4:127,32:0.20:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,56:0.48:-1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,27:0.27:-1.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,66:0.78:-1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,55:0.50:-1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,61:0.44:-0.55:1.000:0.964 0/0/1/1:4:110,102:0.47: 1.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:78,19:0.20:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,65:0.46:-0.53:1.000:0.989 0/0/1/1:4:59,77:0.56:-0.57:1.000:0.972 0/0/1/1:4:121,152:0.55: 2.30:1.000:0.982 0/0/1/1:4:76,86:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:89,24:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,55:0.51:-1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,53:0.49:-1.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,41:0.28:-0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,35:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,90:0.55:-0.03:1.000:0.983 0/0/0/1:4:93,27:0.23:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,110:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,188:0.76: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,103:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,104:0.53: 0.58:1.000:0.990 0/0/0/1:4:155,48:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,108:0.74:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,130:0.52: 1.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,103:0.52: 0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,40:0.66:-2.17:1.000:0.873 0/0/1/1:4:58,68:0.53:-0.78:1.000:0.992 0/0/0/1:4:151,52:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,84:0.48: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,112:0.47: 1.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:105,103:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,138:0.75: 0.43:0.998:0.999 0/0/0/1:4:188,51:0.22: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,55:0.30: 0.48:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,136:0.79: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,55:0.28: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:98,95:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,117:0.52: 1.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,156:0.75: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,91:0.55:-0.03:1.000:0.977 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 0.79:0.999:1.000 0/1/1/1:4:44,137:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,43:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,93:0.54: 0.12:1.000:0.987 0/0/0/1:4:101,34:0.26:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,94:0.47: 0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,86:0.48: 0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,105:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,110:0.77:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,154:0.70: 1.17:1.000:0.983 0/1/1/1:4:58,177:0.75: 1.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,166:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,104:0.63: 0.01:1.000:0.524 0/0/1/1:4:114,106:0.47: 1.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:161,66:0.29: 1.34:1.000:0.990 0/0/0/1:4:175,68:0.28: 1.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,83:0.45: 0.39:1.000:0.978 0/0/0/1:4:145,52:0.27: 0.71:1.000:0.998 -chr2.1 70070056 chr2.1_070070056 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:52,57:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,58:0.62:-0.36:1.000:0.590 0/0/0/1:4:70,23:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,30:0.27: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,54:0.42: 1.13:1.000:0.927 0/0/1/1:4:59,61:0.49: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,10:0.13:-0.81:1.000:0.863 0/0/0/1:4:59,29:0.32:-0.36:1.000:0.954 0/0/1/1:4:51,53:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:37,4:0.09:-2.31:1.000:0.898 0/0/0/0:4:38,4:0.09:-2.26:1.000:0.925 0/1/1/1:4:24,75:0.70: 0.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:64,27:0.29:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:49,55:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,51:0.56:-0.44:1.000:0.959 0/0/1/1:4:57,60:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,28:0.29:-0.07:0.998:0.994 0/1/1/1:4:29,82:0.68: 0.59:1.000:0.961 0/0/1/1:4:65,73:0.51: 1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,65:0.47: 1.55:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,33:0.71:-2.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:60,25:0.29:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,62:0.48: 1.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,40:0.33: 0.88:1.000:0.924 0/0/0/1:4:24,4:0.14:-2.84:1.000:0.961 0/0/0/1:4:72,20:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,23:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,43:0.54:-0.81:1.000:0.990 0/0/1/1:4:64,88:0.55: 2.29:1.000:0.977 0/0/0/1:4:79,48:0.37: 1.26:1.000:0.600 0/0/0/1:4:63,31:0.32:-0.11:1.000:0.953 0/0/1/1:4:48,39:0.44:-0.40:1.000:0.960 0/0/1/1:4:6,8:0.55:-3.42:1.000:0.983 0/0/0/1:4:25,11:0.30:-2.51:1.000:0.988 0/1/1:3:18,53:0.69:-1.06:0.995:1.000 0/0/0/1:4:92,26:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,25:0.22: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,28:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,59:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,48:0.35: 1.55:1.000:0.811 0/0/0/1:4:56,22:0.27:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,48:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,27:0.28:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:66,26:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,29:0.21: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,30:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,38:0.26: 1.79:1.000:0.998 0/0/0/0:4:29,3:0.09:-2.68:1.000:0.938 0/0/1/1:4:49,49:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,42:0.54:-0.90:1.000:0.989 0/0/0/1:4:84,15:0.15: 0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:56,52:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,57:0.57:-0.07:1.000:0.946 0/0/0/1:4:84,28:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,61:0.59: 0.05:1.000:0.873 0/0/1/1:4:49,45:0.47:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:47,37:0.43:-0.52:1.000:0.942 0/0/0/1:4:69,24:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,29:0.29: 0.05:1.000:0.993 0/0/0/0/0/1:6:67,22:0.24:-0.32:1.000:0.637 0/0/0/1:4:69,18:0.20:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,16:0.22:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,30:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,28:0.26: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,24:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,16:0.18:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,44:0.57:-0.98:1.000:0.940 0/0/1/1:4:51,39:0.42:-0.28:1.000:0.919 0/0/0/1:4:73,19:0.20:-0.19:0.578:1.000 0/1/1/1:4:17,84:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,51:0.42: 0.92:1.000:0.900 0/0/0/1:4:65,16:0.19:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,57:0.54: 0.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:60,30:0.32:-0.28:1.000:0.944 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:55,16:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,22:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,25:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,52:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,28:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,68:0.74:-0.52:0.727:0.999 0/0/1/1:4:49,64:0.54: 0.68:1.000:0.986 0/0/1/1:4:53,59:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,33:0.36:-0.28:1.000:0.732 0/0/0/1:4:83,29:0.25: 0.63:0.825:0.999 0/0/0/1:4:77,26:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,36:0.45:-0.77:1.000:0.979 0/0/0/1:4:61,23:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,46:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,14:0.19:-1.06:1.000:1.000 0/0/0:3:58,0:0.00:-1.60:0.993:1.000 0/0/0/1:4:66,20:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,27:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,21:0.29:-1.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:80,21:0.20: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,50:0.56:-0.48:1.000:0.966 0/1/1/1:4:12,81:0.82:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,28:0.21: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,25:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,21:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,64:0.57: 0.39:1.000:0.937 0/0/1/1:4:30,40:0.55:-1.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:52,48:0.47: 0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,17:0.22:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,61:0.56: 0.26:1.000:0.960 0/0/1/1:4:39,40:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,48:0.44: 0.39:1.000:0.968 0/0/1/1:4:71,66:0.47: 1.67:1.000:0.992 0/0/0/1:4:62,32:0.33:-0.11:1.000:0.919 0/0/0/1:4:78,25:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,55:0.31: 3.08:1.000:0.970 0/0/1/1:4:46,47:0.49:-0.15:0.999:0.996 0/0/0/1:4:83,29:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,17:0.32:-1.89:1.000:0.944 0/0/1/1:4:51,70:0.55: 1.01:1.000:0.977 0/0/1/1:4:47,54:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,59:0.56: 0.18:1.000:0.971 0/0/1/1:4:43,37:0.45:-0.69:1.000:0.980 0/0/1/1:4:44,46:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,58:0.52: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,55:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,29:0.33:-0.44:1.000:0.931 0/0/0/1:4:91,32:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,41:0.41: 0.01:1.000:0.869 0/0/0/1:4:62,29:0.31:-0.24:1.000:0.975 0/0/0/1:4:74,26:0.25: 0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,32:0.52:-1.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:34,30:0.46:-1.35:1.000:0.985 0/0/1/1:4:31,55:0.60:-0.44:1.000:0.769 0/0/0/1:4:63,32:0.33:-0.07:1.000:0.932 0/0/0/1:4:41,16:0.27:-1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,50:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,40:0.55:-1.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:83,84:0.49: 2.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,46:0.46: 0.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:67,23:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,27:0.29:-0.32:1.000:0.989 0/0/0/1:4:68,29:0.29: 0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:44,53:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:64,21:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,30:0.26: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,18:0.24:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,70:0.47: 1.96:1.000:0.993 0/0/0/1:4:104,37:0.25: 1.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,35:0.31: 0.51:1.000:0.971 0/0/0/1:4:77,31:0.28: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,34:0.27: 1.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,33:0.45:-1.06:1.000:0.982 0/0/0/1:4:96,34:0.25: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,35:0.34: 0.14:1.000:0.870 0/1/1/1:4:11,25:0.65:-2.51:1.000:0.766 0/0/1/1:4:47,31:0.39:-0.77:1.000:0.648 0/0/1/1:4:47,55:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:91,30:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,70:0.51: 1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,25:0.21: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,20:0.29:-1.23:0.998:0.992 0/0/0/1:4:70,41:0.36: 0.59:1.000:0.702 0/0/0/1:4:83,25:0.22: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,26:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,21:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,28:0.32:-0.48:1.000:0.954 0/0/1/1:4:51,46:0.46: 0.01:1.000:0.988 0/0/0/1:4:90,33:0.26: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,60:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,58:0.56: 0.05:0.999:0.961 0/0/0/1:4:59,21:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,26:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,24:0.29:-0.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,17:0.23:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,16:0.20:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,15:0.20:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,45:0.51:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,33:0.45:-1.06:1.000:0.982 0/0/0/1:4:111,24:0.17: 1.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,48:0.42: 0.59:1.000:0.916 0/0/0/1:4:94,21:0.18: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,56:0.58:-0.19:1.000:0.924 0/0/1/1:4:59,76:0.54: 1.59:1.000:0.988 0/0/0/1:4:109,34:0.23: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,28:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,20:0.20: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,91:0.81: 0.34:1.000:0.999 -chr2.1 70426284 chr2.1_070426284 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:57,33:0.37: 0.18:1.000:0.557 0/0/1/1:4:48,49:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,34:0.30: 1.09:1.000:0.986 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,62:0.58: 0.56:1.000:0.926 0/0/1/1:4:72,79:0.51: 2.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,19:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,31:0.29: 0.94:1.000:0.993 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,57:0.48: 1.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,15:0.16: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:83,34:0.30: 1.03:1.000:0.982 0/0/0/1:4:76,30:0.30: 0.69:1.000:0.988 0/1/1/1:4:18,83:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,22:0.20: 1.19:0.998:1.000 0/0/0/1:4:114,44:0.29: 2.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,81:0.61: 1.25:1.000:0.650 0/0/0/1:4:108,39:0.28: 1.97:1.000:0.995 0/0/0/0:4:14,1:0.07:-2.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,52:0.45: 0.97:1.000:0.976 0/0/0/1:4:93,41:0.32: 1.56:1.000:0.961 0/0/0/1:4:79,19:0.21: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,5:0.21:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.28: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,90:0.70: 1.09:1.000:0.982 0/0/0/1:4:70,10:0.14:-0.13:1.000:0.948 0/0/1/1:4:52,53:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,46:0.35: 1.53:1.000:0.774 0/0/1/1:4:76,48:0.39: 1.25:1.000:0.675 0/0/0/1:4:10,3:0.25:-2.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,11:0.55:-2.04:1.000:0.976 0/0/1:3:10,7:0.41:-2.11:0.995:0.998 0/0/1/1:4:64,69:0.50: 1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,23:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,35:0.30: 1.19:1.000:0.985 0/0/1/1:4:52,35:0.40: 0.09:1.000:0.808 0/0/1/1:4:59,55:0.47: 0.94:1.000:0.993 0/0/0/0:4:82,6:0.07: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,50:0.58:-0.10:1.000:0.894 0/0/0/1:4:82,17:0.19: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,14:0.32:-1.20:1.000:0.964 0/0/0/1:4:66,8:0.12:-0.32:1.000:0.695 0/0/0/1:4:49,27:0.36:-0.26:1.000:0.684 0/0/0/1:4:99,34:0.27: 1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,13:0.35:-1.45:1.000:0.804 0/0/1/1:4:42,43:0.49: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,30:0.69:-1.38:1.000:0.976 0/0/0/1:4:42,22:0.35:-0.63:1.000:0.791 0/1/1/1:4:33,79:0.66: 0.87:1.000:0.840 0/0/1/1:4:41,32:0.43:-0.35:1.000:0.956 0/0/0/1:4:40,16:0.30:-0.88:1.000:0.986 0/0/1/1:4:31,45:0.56:-0.26:1.000:0.960 0/0/0/1:4:53,30:0.37:-0.04:1.000:0.617 0/0/1/1:4:32,48:0.57:-0.13:1.000:0.945 0/0/0/0:4:88,9:0.10: 0.40:1.000:0.790 0/0/0/1:4:70,11:0.15:-0.10:1.000:0.984 0/0/0/0/0/1:6:41,4:0.10:-1.23:1.000:0.878 0/0/0/1:4:41,7:0.16:-1.13:1.000:0.994 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,13:0.16: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,10:0.26:-1.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,30:0.35: 0.06:1.000:0.747 0/0/0/1:4:61,10:0.15:-0.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:24,21:0.46:-1.23:1.000:0.987 0/0/0/1:4:44,22:0.34:-0.57:1.000:0.863 0/0/0/1:4:55,10:0.17:-0.60:0.578:0.997 0/0/0/1:4:77,25:0.26: 0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,33:0.64:-1.13:1.000:0.704 0/0/0/1:4:23,8:0.27:-1.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,10:0.12: 0.12:1.000:0.822 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,32:0.33: 0.50:1.000:0.924 0/0/0/1:4:74,12:0.15: 0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:61,12:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,11:0.15:-0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,32:0.39:-0.04:1.000:0.659 0/0/0/1:4:57,18:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,49:0.70:-0.60:0.727:0.980 0/0/0/1:4:43,15:0.27:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,43:0.56:-0.35:1.000:0.964 0/0/0/1:4:62,34:0.36: 0.37:1.000:0.696 0/0/1/1:4:42,37:0.46:-0.16:0.825:0.988 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.51:-1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,10:0.18:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,38:0.49:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,36:0.44:-0.13:1.000:0.973 0/0/0:3:51,0:0.00:-1.04:0.993:1.000 0/0/0/1:4:54,8:0.14:-0.69:1.000:0.966 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,20:0.34:-0.73:1.000:0.892 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,35:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,19:0.35:-0.88:1.000:0.825 0/0/0/1:4:53,13:0.21:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,21:0.34:-0.66:1.000:0.863 0/0/0/1:4:52,27:0.35:-0.16:1.000:0.807 0/0/1/1:4:16,17:0.50:-1.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,39:0.46:-0.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:30,10:0.27:-1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,23:0.40:-0.85:1.000:0.816 0/0/0/1:4:42,8:0.17:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,21:0.33:-0.60:1.000:0.913 0/0/1/1:4:24,28:0.52:-1.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,20:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,21:0.17: 1.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,20:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,5:0.08:-0.57:1.000:0.984 0/0/0/1:4:113,24:0.19: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,20:0.30:-0.41:0.999:0.989 0/0/0/1:4:38,10:0.23:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,8:0.15:-0.88:1.000:0.992 0/0/0/1:4:43,15:0.27:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,21:0.58:-1.57:1.000:0.892 0/1/1/1:4:15,32:0.64:-1.16:1.000:0.640 0/0/0/1:4:53,9:0.16:-0.69:1.000:0.994 0/0/0/0:4:46,5:0.11:-1.04:1.000:0.635 0/0/0/1:4:78,26:0.27: 0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,13:0.31:-1.26:1.000:0.977 0/0/1/1:4:40,30:0.43:-0.44:1.000:0.933 0/0/0/1:4:88,21:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,7:0.13:-0.76:1.000:0.871 0/0/0/1:4:50,16:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,9:0.14:-0.41:1.000:0.957 0/1/1/1:4:11,31:0.68:-1.32:1.000:0.959 0/0/0/0:4:27,2:0.07:-1.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:36,12:0.27:-1.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,25:0.36:-0.44:1.000:0.665 0/0/0/1:4:95,20:0.19: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,10:0.39:-1.82:1.000:0.649 0/0/1/1:4:38,35:0.47:-0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,50:0.46: 0.72:1.000:0.987 0/0/1/1:4:69,77:0.51: 1.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,24:0.40:-0.76:1.000:0.791 0/0/0/1:4:24,6:0.22:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,6:0.12:-0.88:1.000:0.667 0/0/0/1:4:47,7:0.14:-0.95:1.000:0.968 0/0/1/1:4:23,29:0.54:-1.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:25,25:0.49:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:89,9:0.10: 0.43:1.000:0.812 0/0/0/1:4:30,11:0.28:-1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,52:0.43: 1.09:1.000:0.953 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,11:0.11: 0.75:1.000:0.505 0/0/0/1:4:109,18:0.15: 1.34:1.000:0.991 0/0/0/1:4:68,36:0.35: 0.62:1.000:0.771 0/0/0/1:4:77,15:0.18: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,21:0.18: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,40:0.34: 1.12:1.000:0.863 0/0/0/1:4:28,9:0.26:-1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,12:0.19:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,48:0.55:-0.04:1.000:0.977 0/0/0/1:4:82,40:0.34: 1.19:1.000:0.892 0/0/1/1:4:57,60:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,21:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.78:0.998:1.000 0/0/1/1:4:57,44:0.43: 0.53:1.000:0.951 0/0/0/1:4:65,36:0.36: 0.53:1.000:0.672 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,36:0.42: 0.03:1.000:0.917 0/0/0/1:4:73,43:0.37: 1.00:1.000:0.510 0/0/1/1:4:41,39:0.48:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,48:0.48: 0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,52:0.42: 1.19:0.999:0.926 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,47:0.49: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,21:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,39:0.39: 0.53:1.000:0.665 0/0/0/1:4:76,18:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,8:0.12:-0.32:1.000:0.695 0/0/0/1:4:54,20:0.29:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:73,16:0.19: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,33:0.27: 1.53:1.000:0.998 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,23:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,71:0.51: 1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,59:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,41:0.37: 0.87:1.000:0.564 0/0/0/1:4:64,14:0.19:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,64:0.54: 0.94:1.000:0.988 -chr2.1 70778290 chr2.1_070778290 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:145,175:0.55: 0.18:1.000:0.974 0/1/1/1:4:75,206:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:97,242:0.72: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,232:0.78:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,268:0.73: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,215:0.52: 1.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,174:0.74:-1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,165:0.53: 0.09:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,304:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,105:0.77:-2.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,70:0.42:-2.06:1.000:0.904 0/1/1/1:4:78,226:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,242:0.76: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,352:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,175:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,187:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,205:0.54: 1.18:0.998:0.988 0/1/1/1:4:87,286:0.77: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,311:0.77: 1.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,405:1.00: 1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,178:0.99:-1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,157:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,286:0.79: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,62:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,45:0.50:-3.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,187:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,159:0.51: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,246:0.81:-0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,372:1.00: 0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,332:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,190:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,226:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,73:0.56:-2.67:1.000:0.972 0/1/1/1:4:45,114:0.72:-2.28:1.000:0.997 0/1/1:3:29,32:0.53:-3.77:0.995:0.899 0/0/1/1:4:176,196:0.53: 0.97:1.000:0.990 0/0/1/1:4:161,160:0.51: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,247:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,233:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,178:0.46: 1.29:1.000:0.989 0/0/0/1:4:237,89:0.29: 0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:173,137:0.45: 0.03:1.000:0.983 0/0/1/1:4:178,178:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:207,74:0.28:-0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,150:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,163:0.53: 0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:95,214:0.70: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:337,260:0.45: 4.40:1.000:0.977 0/1/1/1:4:67,181:0.74:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,180:0.46: 1.37:1.000:0.989 0/0/0/1:4:170,61:0.29:-1.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:169,189:0.54: 0.76:1.000:0.990 0/1/1/1:4:67,254:0.80: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,169:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,200:0.72:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,292:0.76: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,249:0.78: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,179:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,242:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:201,67:0.27:-0.61:1.000:0.699 0/0/0/1:4:253,99:0.30: 0.67:1.000:0.984 0/1/1/1:4:71,231:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,266:0.73: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,132:0.46:-0.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:185,169:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:243,100:0.31: 0.53:1.000:0.972 0/1/1/1:4:58,177:0.76:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,150:0.49: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,232:0.77:-0.05:0.578:1.000 0/1/1/1:4:59,183:0.76:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,268:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:223,80:0.29:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:205,201:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,266:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,149:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,179:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,155:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,151:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,247:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,194:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,179:0.75:-1.01:0.727:0.999 0/1/1/1:4:98,254:0.73: 0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,254:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,124:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:211,174:0.46: 1.17:0.825:0.989 0/0/1/1:4:174,169:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,187:0.74:-0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,212:0.76:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,226:0.77:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,61:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/1:3:179,84:0.34:-0.69:0.993:1.000 0/0/1/1:4:143,148:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:197,192:0.50: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:151,51:0.27:-1.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,232:0.53: 2.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:303,85:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,158:0.69:-1.15:1.000:0.967 0/1/1/1:4:68,188:0.74:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,175:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,138:0.48:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,124:0.54:-1.16:1.000:0.986 0/1/1/1:4:86,235:0.74: 0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,154:0.71:-1.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,217:0.72:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,127:0.51:-0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,230:0.71: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:180,150:0.46: 0.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:83,240:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,277:0.74: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,80:0.27: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:151,146:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:296,113:0.30: 1.53:1.000:0.988 0/1/1/1:4:76,227:0.76:-0.08:0.999:1.000 0/0/1/1:4:173,149:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,108:0.47:-1.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:188,161:0.47: 0.62:1.000:0.993 0/1/1/1:4:90,253:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,198:0.74:-0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,314:1.00: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,256:1.00:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,282:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,198:0.77:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,69:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,158:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:68,187:0.74:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:277,79:0.25: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,143:0.46: 0.13:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,259:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,179:0.73:-0.90:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,295:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,57:0.24:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,62:0.32:-1.57:1.000:0.950 0/0/1/1:4:155,151:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,195:0.73:-0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:98,299:0.76: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,226:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,119:0.47:-0.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:119,113:0.50:-1.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,176:0.70:-0.83:1.000:0.986 0/1/1/1:4:79,248:0.77: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,135:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,120:0.47:-0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:191,46:0.22:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,303:0.81: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,149:0.48: 0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:76,222:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,148:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,193:0.52: 1.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:83,217:0.73:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:193,168:0.48: 0.80:1.000:0.994 0/1/1/1:4:79,244:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,107:0.74:-2.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,110:0.50:-1.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,251:0.71: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:145,180:0.56: 0.25:1.000:0.964 0/1/1/1:4:98,283:0.75: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,180:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,120:0.50:-0.98:0.998:0.997 0/0/1/1:4:169,185:0.53: 0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:169,169:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,199:0.71:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:144,152:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,146:0.48: 0.03:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,338:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,167:0.52: 0.27:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,291:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,139:0.47:-0.10:0.999:0.992 0/0/1/1:4:123,130:0.52:-0.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:224,75:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,110:0.50:-1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,156:0.56:-0.35:1.000:0.974 0/0/0/1:4:202,79:0.30:-0.42:1.000:0.984 0/0/0/1:4:202,64:0.26:-0.64:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,274:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,182:0.73:-0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:205,192:0.49: 1.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,262:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,187:0.55: 0.59:1.000:0.983 0/1/1/1:4:77,190:0.72:-0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,236:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,232:0.54: 1.98:1.000:0.989 0/0/0/1:4:284,95:0.27: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,158:0.55:-0.26:1.000:0.979 0/1/1/1:4:58,206:0.79:-0.67:1.000:1.000 -chr2.1 70813755 chr2.1_070813755 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:8,20:0.64: 0.54:1.000:0.645 0/0/0/1:4:11,1:0.12:-1.25:1.000:0.809 0/0/0/1:4:29,5:0.22: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.30:-0.69:1.000:0.988 0/0/0/1:4:40,4:0.13: 2.33:1.000:0.936 0/1/1/1:4:2,13:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.65:-0.13:1.000:0.752 0/0/0/1:4:21,4:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.70:-1.47:1.000:0.984 0/1/1/1:4:3,21:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.32:-0.47:1.000:0.964 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.14:-0.24:1.000:0.966 0/0/1/1:4:7,11:0.56:-0.58:1.000:0.965 0/0/1/1:4:17,11:0.41: 0.54:1.000:0.840 0/0/1/1:4:12,11:0.47:-0.02:0.998:0.991 0/0/0/1:4:26,7:0.28: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,4:0.18: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,5:0.20: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,1:0.11:-1.14:1.000:0.576 0/0/0/0:4:13,1:0.10:-1.03:1.000:0.675 0/0/0/1:4:24,12:0.36: 1.44:1.000:0.634 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.54:-0.69:1.000:0.984 0/0/0/1:4:13,5:0.33:-0.58:1.000:0.938 0/0/1/1:4:8,17:0.61: 0.20:1.000:0.674 0/0/0/0:4:22,1:0.06:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,2:0.07: 2.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-1.36:1.000:0.642 0/0/1/1:4:9,6:0.41:-0.92:1.000:0.872 0/0/1/1:4:4,4:0.48:-1.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,1:0.16:-1.59:1.000:0.996 0/1/1:3:5,8:0.56:-1.14:0.995:0.987 0/0/0/1:4:17,6:0.31:-0.02:1.000:0.967 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.80:1.000:0.732 0/0/0/0:4:33,1:0.04: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.46:-0.92:1.000:0.986 0/0/0/1:4:11,5:0.35:-0.80:1.000:0.794 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.48: 2.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,16:0.56: 0.32:1.000:0.959 0/1/1/1:4:3,14:0.72:-0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,13:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:24,8:0.31: 0.99:1.000:0.979 0/0/0/1:4:36,3:0.11: 1.77:1.000:0.576 0/0/0/1:4:12,5:0.34:-0.69:1.000:0.887 0/0/0/1:4:15,6:0.33:-0.24:1.000:0.916 0/0/0/1:4:14,5:0.32:-0.47:1.000:0.964 0/0/1/1:4:8,15:0.59:-0.02:1.000:0.856 0/0/1/1:4:21,17:0.44: 1.66:1.000:0.974 0/0/1/1:4:12,7:0.39:-0.47:1.000:0.682 0/0/0/1:4:25,4:0.20: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,2:0.12: 0.09:1.000:0.809 0/0/0/1:4:11,4:0.32:-0.92:1.000:0.959 0/0/0/0:4:19,1:0.07:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,15:0.54: 0.32:1.000:0.989 0/0/0/1:4:19,4:0.25:-0.02:1.000:0.999 1/1/1/1/1/1:6:0,16:1.00:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.30:-0.69:1.000:0.988 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.28:-1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:20,7:0.31: 0.43:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.27:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,16:0.62:-0.02:1.000:0.532 0/0/0/1:4:19,3:0.20:-0.13:0.578:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.52:-1.59:1.000:0.995 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,10:0.57:-0.80:1.000:0.942 0/0/0/1:4:13,6:0.35:-0.47:1.000:0.772 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.80:1.000:0.732 0/0/0/1:4:12,6:0.36:-0.58:1.000:0.634 0/0/1/1:4:11,16:0.55: 0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:31,19:0.40: 3.00:1.000:0.766 0/0/0/1:4:22,8:0.32: 0.76:1.000:0.959 0/0/1/1:4:18,14:0.44: 0.99:1.000:0.963 0/0/0/0:4:31,1:0.05: 0.99:0.727:1.000 0/0/0/1:4:20,5:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,6:0.23: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,5:0.33:-0.58:1.000:0.938 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-1.14:0.825:0.795 0/0/1/1:4:8,17:0.61: 0.20:1.000:0.674 0/0/0/1:4:21,2:0.13:-0.02:1.000:0.886 0/0/0/1:4:20,4:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.34:-0.36:1.000:0.862 0/1/1/1:4:2,17:0.80:-0.47:1.000:1.000 0/1/1:3:5,10:0.60:-0.92:0.993:0.999 0/0/1/1:4:8,7:0.46:-0.92:1.000:0.986 0/0/1/1:4:11,16:0.55: 0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:11,12:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,14:0.56:-0.02:1.000:0.967 0/0/1/1:4:11,20:0.59: 0.88:1.000:0.885 0/0/1/1:4:15,12:0.44: 0.43:1.000:0.971 0/0/1/1:4:4,6:0.55:-1.47:1.000:0.976 0/0/0/1:4:18,6:0.31: 0.09:1.000:0.979 0/0/0/1:4:25,5:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-1.25:1.000:0.634 0/0/0/1:4:18,9:0.36: 0.43:1.000:0.634 0/0/1/1:4:7,11:0.56:-0.58:1.000:0.965 0/0/0/1:4:30,11:0.32: 2.00:1.000:0.957 0/0/1/1:4:7,10:0.54:-0.69:1.000:0.984 0/0/1/1:4:12,7:0.39:-0.47:1.000:0.682 0/0/1/1:4:10,16:0.56: 0.32:1.000:0.959 0/0/1/1:4:11,7:0.40:-0.58:1.000:0.819 0/0/1/1:4:29,16:0.38: 2.44:1.000:0.571 0/1/1/1:4:8,32:0.70: 1.88:1.000:0.984 0/0/1/1:4:9,10:0.50:-0.47:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,9:0.35: 0.65:0.999:0.807 0/0/0/1:4:15,6:0.33:-0.24:1.000:0.916 0/0/1/1:4:7,9:0.53:-0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,18:0.55: 0.76:1.000:0.976 0/0/0/0:4:26,1:0.05: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,1:0.06: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,2:0.11: 0.43:1.000:0.556 0/0/0/1:4:22,2:0.12: 0.09:1.000:0.809 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.66:-1.25:1.000:0.883 0/0/1/1:4:20,16:0.44: 1.44:1.000:0.971 0/0/1/1:4:17,13:0.43: 0.76:1.000:0.957 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-1.14:1.000:0.795 0/0/0/1:4:19,8:0.34: 0.43:1.000:0.878 0/0/0/1:4:16,4:0.27:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/0:4:13,1:0.10:-1.03:1.000:0.675 0/0/1/1:4:11,6:0.38:-0.69:1.000:0.547 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.64:-1.81:1.000:0.645 0/0/1/1:4:3,6:0.60:-1.59:1.000:0.775 0/0/0/1:4:21,6:0.29: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:18,2:0.15:-0.36:1.000:0.983 0/0/0/1:4:10,5:0.36:-0.92:1.000:0.634 0/0/0/1:4:19,3:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.44: 0.99:1.000:0.963 0/0/0/1:4:27,3:0.15: 0.76:1.000:0.983 0/0/0/0:4:39,3:0.10: 2.11:1.000:0.675 0/0/0/1:4:10,5:0.36:-0.92:1.000:0.634 0/0/1/1:4:4,8:0.60:-1.25:1.000:0.775 0/0/1/1:4:10,12:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,11:0.29: 2.89:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,18:0.62: 0.32:1.000:0.564 0/0/0/1:4:30,3:0.13: 1.10:1.000:0.936 0/0/1/1:4:14,13:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,7:0.34: 0.09:1.000:0.896 0/0/1/1:4:9,11:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,18:0.42: 2.22:1.000:0.930 0/0/0/0:4:28,2:0.10: 0.76:1.000:0.844 0/1/1/1:4:5,16:0.67:-0.24:1.000:0.925 0/0/1/1:4:18,20:0.50: 1.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,3:0.18: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,11:0.40: 0.65:1.000:0.762 0/0/0/1:4:20,2:0.13:-0.13:1.000:0.936 0/0/1/1:4:12,9:0.43:-0.24:1.000:0.950 0/0/1/1:4:13,12:0.47: 0.20:0.998:0.991 0/0/1/1:4:20,11:0.38: 0.88:1.000:0.564 0/0/0/1:4:15,5:0.31:-0.36:1.000:0.979 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.80:1.000:0.732 0/0/0/1:4:10,2:0.24:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,17:0.41: 2.22:1.000:0.852 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,4:0.24: 0.09:0.999:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.48:-0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,14:0.60:-0.24:1.000:0.775 0/0/0/1:4:15,8:0.37:-0.02:1.000:0.501 0/0/0/1:4:12,1:0.11:-1.14:1.000:0.576 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,1:0.10:-1.03:1.000:0.675 0/0/0/1:4:13,3:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,11:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:14,5:0.32:-0.47:1.000:0.964 0/1/1/1:4:6,19:0.67: 0.20:1.000:0.919 0/0/0/1:4:16,5:0.30:-0.24:1.000:0.987 0/0/0/1:4:23,12:0.37: 1.32:1.000:0.548 0/0/0/1:4:18,3:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,18:0.60: 0.43:1.000:0.775 0/0/1/1:4:4,7:0.58:-1.36:1.000:0.915 0/0/0/1:4:32,7:0.26: 1.77:1.000:0.999 -chr2.1 71006912 chr2.1_071006912 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:51,0:.: 3.27:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.26:0.998:. ./.:4:38,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.86:1.000:. ./.:6:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.06:0.578:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,1:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.36:0.727:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.16:0.825:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:39,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.15:0.998:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:10,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:28,1:.: 1.06:1.000:. -chr2.1 71240581 chr2.1_071240581 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:162,154:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,140:0.53:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:139,147:0.52: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,153:0.54: 0.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:197,153:0.44: 1.22:1.000:0.974 0/0/0/1:4:235,68:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,86:0.53:-1.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:135,140:0.52: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,149:0.55: 0.08:1.000:0.980 0/0/1/1:4:62,82:0.58:-1.92:1.000:0.926 0/0/1/1:4:47,73:0.61:-2.28:1.000:0.645 0/0/0/1:4:221,90:0.29: 0.62:1.000:0.993 0/1/1/1:4:75,237:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,85:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,167:0.54: 0.67:1.000:0.987 0/0/1/1:4:135,133:0.51:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:214,76:0.26: 0.31:0.998:0.999 0/0/0/1:4:210,78:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:262,91:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:270,111:0.29: 1.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:65,60:0.49:-2.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,177:0.54: 0.94:1.000:0.986 0/0/0/1:4:315,88:0.22: 2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,130:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,69:0.76:-2.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,157:0.75:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,126:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,61:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,170:0.45: 1.72:1.000:0.981 0/0/1/1:4:124,132:0.53:-0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,98:0.53:-1.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:133,53:0.28:-1.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:25,13:0.34:-3.53:1.000:0.844 0/0/0/1:4:98,35:0.26:-2.08:1.000:0.999 0/0/1:3:33,17:0.34:-3.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,87:0.29: 0.41:1.000:0.991 0/0/0/1:4:191,66:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,161:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,84:0.48:-1.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,126:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,148:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,133:0.50: 0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,210:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,170:0.78:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,184:0.73:-0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:70,160:0.70:-0.61:1.000:0.983 0/0/1/1:4:172,199:0.54: 1.54:1.000:0.984 0/0/0/1:4:33,16:0.33:-3.36:1.000:0.932 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,65:0.50:-2.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,101:0.41:-0.32:1.000:0.870 0/0/1/1:4:135,151:0.54: 0.24:1.000:0.989 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,209:0.73: 0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:155,130:0.46: 0.23:1.000:0.990 0/0/0/0:4:243,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,76:0.26: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,162:0.78:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,194:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:121,121:0.51:-0.43:1.000:0.883 0/0/1/1:4:185,145:0.45: 0.91:1.000:0.976 0/0/1/1:4:130,149:0.54: 0.14:1.000:0.986 0/1/1/1:4:74,205:0.74: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,97:0.53:-1.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:183,154:0.47: 1.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,117:0.57:-0.96:1.000:0.939 0/0/0/1:4:219,74:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:246,75:0.23: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,172:0.69:-0.32:0.578:0.978 0/0/0/1:4:206,61:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,171:0.55: 0.69:1.000:0.979 0/0/0/1:4:127,58:0.31:-1.29:1.000:0.968 0/1/1/1:4:37,163:0.81:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,147:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,125:0.53:-0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:102,114:0.54:-0.82:1.000:0.989 0/0/0/1:4:188,62:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,233:0.72: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,107:0.42:-0.15:1.000:0.903 0/0/1/1:4:157,146:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,121:0.52:-0.50:0.727:0.995 0/0/0/1:4:239,63:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,172:0.48: 1.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:205,64:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,111:0.47:-0.47:0.825:0.993 0/1/1/1:4:88,257:0.75: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,44:0.19:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,113:0.47:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/0:4:242,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,136:0.48: 0.29:1.000:0.995 0/1/1:3:75,133:0.64:-0.94:0.993:1.000 0/0/0/1:4:151,55:0.26:-0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:151,161:0.53: 0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:49,164:0.77:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,251:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,144:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,133:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:192,75:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,151:0.53: 0.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:255,77:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,101:0.45:-0.64:1.000:0.980 0/0/1/1:4:168,151:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,175:0.75:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,188:0.71:-0.06:1.000:0.991 0/1/1/1:4:70,120:0.64:-1.22:1.000:0.644 0/0/0/0:4:283,1:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,63:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,164:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,286:0.76: 1.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,210:0.74: 0.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,278:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,132:0.47: 0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:75,234:0.76: 0.59:0.999:1.000 0/1/1/1:4:81,215:0.73: 0.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,193:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,182:0.54: 1.11:1.000:0.988 0/0/0/1:4:222,57:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,96:0.58:-1.54:1.000:0.931 0/0/1/1:4:137,161:0.55: 0.43:1.000:0.981 0/0/1/1:4:127,135:0.52:-0.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:193,83:0.30: 0.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:176,46:0.20:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,140:0.49: 0.37:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,296:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,199:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,216:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,135:0.47: 0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:107,96:0.48:-1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,105:0.48:-0.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:166,59:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,106:0.46:-0.56:1.000:0.989 0/0/1/1:4:192,162:0.47: 1.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,147:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:199,57:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,250:0.78: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,109:0.26: 2.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:250,85:0.25: 0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,205:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,206:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,191:0.72:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,120:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:220,72:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,156:0.54: 0.34:1.000:0.986 0/1/1/1:4:58,148:0.72:-0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:102,244:0.71: 1.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:98,254:0.72: 1.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,255:0.78: 0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,288:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,176:0.52: 1.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:164,131:0.45: 0.38:1.000:0.982 1/1/1/1:4:2,350:0.99: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,76:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,25:0.25:-2.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,144:0.69:-0.91:1.000:0.971 0/1/1/1:4:82,210:0.72: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,279:0.76: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,91:0.27: 1.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:264,74:0.22: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,228:0.71: 0.79:0.998:0.992 0/0/1/1:4:157,159:0.51: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,159:0.53: 0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:132,100:0.44:-0.58:1.000:0.964 0/0/1/1:4:136,126:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,147:0.54: 0.12:1.000:0.989 0/0/1/1:4:137,131:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,133:0.48: 0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:146,160:0.53: 0.55:1.000:0.991 0/1/1/1:4:80,240:0.75: 0.76:0.999:0.999 0/1/1/1:4:71,243:0.77: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,126:0.48:-0.01:1.000:0.994 1/1/1/1:4:2,263:0.99:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,172:0.77:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,115:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,161:0.54: 0.53:1.000:0.989 0/0/0/1:4:151,52:0.25:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,133:0.56:-0.43:1.000:0.971 0/1/1/1:4:81,216:0.73: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,148:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,160:0.49: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,201:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,171:0.52: 0.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:320,117:0.26: 2.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:95,285:0.75: 1.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,57:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,168:0.52: 0.85:1.000:0.994 -chr2.1 71273181 chr2.1_071273181 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:126,39:0.28: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,52:0.47:-0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:34,102:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,71:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:122,41:0.29: 0.93:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,99:0.51: 1.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,66:0.77:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,104:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,37:0.27: 0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,10:0.39:-2.09:1.000:0.724 0/1/1/1:4:10,19:0.67:-2.07:1.000:0.931 0/1/1/1:4:43,120:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,72:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,52:0.46: 0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:106,45:0.34: 0.66:1.000:0.895 0/0/1/1:4:90,88:0.52: 1.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,67:0.47: 0.70:0.998:0.993 0/0/1/1:4:75,68:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,89:0.52: 1.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,72:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,4:0.22:-2.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,81:0.59: 0.50:1.000:0.878 0/1/1/1:4:41,95:0.71: 0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:66,56:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,26:0.80:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,39:0.31: 0.55:1.000:0.979 0/1/1/1:4:55,157:0.75: 2.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,76:0.47: 1.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:107,31:0.26: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,76:0.55: 0.52:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,145:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,125:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,19:0.69:-2.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:30,16:0.38:-1.69:1.000:0.620 1/1/1:3:1,18:0.95:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,116:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,78:0.54: 0.70:1.000:0.988 0/1/1/1:4:28,107:0.80: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,64:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,47:0.44:-0.15:1.000:0.972 0/0/1/1:4:74,50:0.44: 0.06:1.000:0.963 0/0/1/1:4:69,56:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,57:0.53:-0.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:27,73:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,28:0.26: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,109:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:98,277:0.75: 5.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,56:0.53:-0.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,44:0.43:-0.24:1.000:0.950 0/1/1/1:4:38,77:0.69:-0.15:1.000:0.966 0/0/1/1:4:67,65:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,54:0.58:-0.53:1.000:0.925 0/0/0/1:4:104,32:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,34:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,44:0.49:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,82:0.56: 0.75:1.000:0.972 0/1/1/1:4:24,74:0.76:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,48:0.53:-0.55:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:39,31:0.48:-1.15:1.000:0.858 0/0/1/1:4:39,39:0.53:-0.97:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,61:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,48:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,32:0.45:-0.99:1.000:0.980 0/0/1/1:4:67,58:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,58:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,41:0.62:-1.19:1.000:0.508 0/0/1/1:4:67,51:0.47:-0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,42:0.53:-0.84:0.578:0.992 0/0/1/1:4:87,65:0.46: 0.68:1.000:0.988 0/0/0/1:4:88,21:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,15:0.27:-1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,55:0.54:-0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:75,77:0.54: 0.68:1.000:0.990 0/1/1/1:4:27,74:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,48:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,46:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,67:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,100:0.77: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,52:0.68:-0.97:0.727:0.961 0/0/0/1:4:86,19:0.22:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,30:0.29:-0.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:30,99:0.78: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,47:0.51:-0.53:0.825:0.996 0/0/1/1:4:58,41:0.45:-0.50:1.000:0.978 0/0/1/1:4:33,39:0.57:-1.11:1.000:0.951 0/1/1/1:4:25,66:0.74:-0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:43,37:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,62:0.77:-0.88:1.000:1.000 1/1/1:3:0,64:1.00:-1.28:0.993:1.000 0/0/1/1:4:73,57:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,66:0.74:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,76:0.53: 0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,53:0.54:-0.41:1.000:0.985 0/1/1/1:4:18,62:0.78:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,31:0.44:-0.99:1.000:0.962 0/0/1/1:4:60,37:0.42:-0.55:1.000:0.900 0/0/1/1:4:44,30:0.44:-1.06:1.000:0.967 0/1/1/1:4:42,83:0.68: 0.08:1.000:0.955 0/0/1/1:4:24,30:0.58:-1.51:1.000:0.909 0/1/1/1:4:33,81:0.72:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,17:0.25:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,36:0.45:-0.77:1.000:0.978 0/1/1/1:4:20,63:0.77:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,31:0.43:-0.95:1.000:0.939 0/0/1/1:4:49,42:0.49:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,73:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:132,45:0.29: 1.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,39:0.49:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,101:0.54: 1.66:1.000:0.985 0/0/0/1:4:78,25:0.28:-0.41:0.999:0.995 0/0/0/1:4:79,21:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,30:0.50:-1.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,11:0.14:-0.64:1.000:0.970 0/0/1/1:4:40,24:0.41:-1.28:1.000:0.866 0/0/0/1:4:81,14:0.18:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,14:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,11:0.15:-0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:73,53:0.45: 0.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:63,23:0.31:-0.79:1.000:0.979 0/1/1/1:4:25,70:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,96:0.52: 1.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,20:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,52:0.52:-0.32:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,16:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,15:0.26:-1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,12:0.18:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,49:0.57:-0.68:1.000:0.957 0/0/1/1:4:63,70:0.55: 0.26:1.000:0.975 0/0/1/1:4:26,30:0.56:-1.46:1.000:0.962 0/0/1/1:4:71,54:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:71,50:0.45:-0.01:1.000:0.977 0/0/0/1:4:157,41:0.25: 1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,22:0.20: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,15:0.22:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,59:0.67:-0.68:1.000:0.904 0/0/1/1:4:47,39:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,24:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,64:0.68:-0.57:1.000:0.961 0/0/0/1:4:109,26:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,31:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,75:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,95:0.51: 1.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,76:0.48: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,59:0.45: 0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:119,95:0.48: 2.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,65:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,92:0.52: 1.51:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.53:-2.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:41,109:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,98:0.72: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:153,39:0.24: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,67:0.47: 0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:70,67:0.52: 0.35:0.998:0.995 0/0/1/1:4:93,83:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,63:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,67:0.52: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,55:0.49:-0.01:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,101:0.53: 1.82:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,104:0.70: 0.66:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,47:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,120:0.74: 0.95:0.999:0.999 0/0/1/1:4:90,79:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,99:0.70: 0.50:1.000:0.987 0/0/1/1:4:65,55:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,32:0.30: 0.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:65,50:0.47:-0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:60,64:0.54: 0.06:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,34:0.39:-0.57:1.000:0.693 0/0/1/1:4:64,46:0.45:-0.26:1.000:0.982 0/0/1/1:4:92,86:0.51: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,57:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,119:0.78: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,42:0.39:-0.08:1.000:0.712 0/1/1/1:4:34,120:0.79: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,134:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,85:0.51: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,58:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,60:0.48: 0.28:1.000:0.995 -chr2.1 71379437 chr2.1_071379437 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:125,98:.:-0.29:1.000:. ./.:4:113,100:.:-0.45:1.000:. ./.:4:177,63:.:-0.03:1.000:. ./.:4:123,141:.: 0.35:1.000:. ./.:4:163,129:.: 0.79:1.000:. ./.:4:209,75:.: 0.67:1.000:. ./.:4:178,57:.:-0.10:1.000:. ./.:4:220,63:.: 0.65:1.000:. ./.:4:63,167:.:-0.18:1.000:. ./.:4:15,21:.:-3.24:1.000:. ./.:4:15,13:.:-3.37:1.000:. ./.:4:199,64:.: 0.34:1.000:. ./.:4:139,100:.:-0.04:1.000:. ./.:4:135,139:.: 0.51:1.000:. ./.:4:111,91:.:-0.62:1.000:. ./.:4:231,52:.: 0.65:1.000:. ./.:4:234,60:.: 0.83:0.998:. ./.:4:284,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:268,82:.: 1.71:1.000:. ./.:4:204,153:.: 1.82:1.000:. ./.:4:13,33:.:-3.08:1.000:. ./.:4:222,63:.: 0.68:1.000:. ./.:4:227,76:.: 0.97:1.000:. ./.:4:197,60:.: 0.24:1.000:. ./.:4:19,3:.:-3.46:1.000:. ./.:4:123,135:.: 0.26:1.000:. ./.:4:171,59:.:-0.18:1.000:. ./.:4:221,49:.: 0.45:1.000:. ./.:4:83,229:.: 1.11:1.000:. ./.:4:136,122:.: 0.26:1.000:. ./.:4:280,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:206,55:.: 0.31:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.54:1.000:. ./.:4:35,27:.:-2.83:1.000:. ./.:3:12,3:.:-3.57:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:191,50:.:-0.01:1.000:. ./.:4:237,82:.: 1.22:1.000:. ./.:4:61,159:.:-0.34:1.000:. ./.:4:218,63:.: 0.62:1.000:. ./.:4:194,57:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,48:.:-0.48:1.000:. ./.:4:137,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:154,42:.:-0.72:1.000:. ./.:4:211,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:134,117:.: 0.15:1.000:. ./.:4:228,72:.: 0.92:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:158,41:.:-0.67:1.000:. ./.:4:106,26:.:-1.73:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:196,65:.: 0.31:1.000:. ./.:4:178,46:.:-0.28:1.000:. ./.:4:152,133:.: 0.68:1.000:. ./.:4:146,154:.: 0.92:1.000:. ./.:4:172,49:.:-0.32:1.000:. ./.:4:199,66:.: 0.37:1.000:. ./.:4:151,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:149,102:.: 0.15:1.000:. ./.:6:160,61:.:-0.32:1.000:. ./.:4:214,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:126,105:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,131:.: 0.15:1.000:. ./.:4:157,51:.:-0.53:1.000:. ./.:4:225,65:.: 0.76:1.000:. ./.:4:179,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:203,70:.: 0.49:1.000:. ./.:4:205,69:.: 0.51:1.000:. ./.:4:130,116:.: 0.07:0.578:. ./.:4:116,119:.:-0.10:1.000:. ./.:4:167,139:.: 1.01:1.000:. ./.:4:161,39:.:-0.66:1.000:. ./.:4:124,130:.: 0.20:1.000:. ./.:4:125,135:.: 0.29:1.000:. ./.:4:171,50:.:-0.32:1.000:. ./.:4:200,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:150,54:.:-0.59:1.000:. ./.:4:195,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:226,81:.: 1.03:1.000:. ./.:4:321,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:132,40:.:-1.10:0.727:. ./.:4:135,107:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,140:.: 1.03:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:158,53:.:-0.48:0.825:. ./.:4:153,160:.: 1.13:1.000:. ./.:4:157,39:.:-0.72:1.000:. ./.:4:142,37:.:-0.99:1.000:. ./.:4:171,54:.:-0.26:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.13:1.000:. ./.:3:171,0:.:-1.11:0.993:. ./.:4:166,49:.:-0.42:1.000:. ./.:4:249,77:.: 1.33:1.000:. ./.:4:120,48:.:-1.16:1.000:. ./.:4:175,144:.: 1.22:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:116,101:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,96:.:-0.92:1.000:. ./.:4:220,56:.: 0.54:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:190,50:.:-0.03:1.000:. ./.:4:199,57:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,137:.:-0.91:1.000:. ./.:4:141,97:.:-0.06:1.000:. ./.:4:161,38:.:-0.67:1.000:. ./.:4:206,59:.: 0.37:1.000:. ./.:4:154,51:.:-0.58:1.000:. ./.:4:148,107:.: 0.21:1.000:. ./.:4:71,188:.: 0.27:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:127,104:.:-0.17:1.000:. ./.:4:258,78:.: 1.49:1.000:. ./.:4:65,183:.: 0.10:0.999:. ./.:4:134,125:.: 0.27:1.000:. ./.:4:77,74:.:-1.43:1.000:. ./.:4:151,124:.: 0.53:1.000:. ./.:4:174,62:.:-0.09:1.000:. ./.:4:109,98:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,162:.:-0.25:1.000:. ./.:4:45,148:.:-0.77:1.000:. ./.:4:128,112:.:-0.03:1.000:. ./.:4:110,92:.:-0.62:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:137,124:.: 0.31:1.000:. ./.:4:61,158:.:-0.36:1.000:. ./.:4:187,59:.: 0.07:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:56,146:.:-0.62:1.000:. ./.:4:46,130:.:-1.03:1.000:. ./.:4:104,86:.:-0.81:1.000:. ./.:4:116,108:.:-0.28:1.000:. ./.:4:191,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:139,38:.:-1.02:1.000:. ./.:4:162,46:.:-0.53:1.000:. ./.:4:147,103:.: 0.13:1.000:. ./.:4:200,175:.: 2.10:1.000:. ./.:4:123,115:.:-0.06:1.000:. ./.:4:117,91:.:-0.53:1.000:. ./.:4:165,53:.:-0.37:1.000:. ./.:4:101,78:.:-0.99:1.000:. ./.:4:134,101:.:-0.10:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:136,110:.: 0.07:1.000:. ./.:4:137,45:.:-0.94:1.000:. ./.:4:177,157:.: 1.46:1.000:. ./.:4:158,158:.: 1.17:1.000:. ./.:4:147,124:.: 0.46:1.000:. ./.:4:144,123:.: 0.40:1.000:. ./.:4:224,76:.: 0.92:1.000:. ./.:4:139,128:.: 0.40:1.000:. ./.:4:159,143:.: 0.95:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:30,14:.:-3.11:1.000:. ./.:4:123,43:.:-1.19:1.000:. ./.:4:84,217:.: 0.94:1.000:. ./.:4:246,66:.: 1.11:1.000:. ./.:4:166,145:.: 1.09:1.000:. ./.:4:225,81:.: 1.01:1.000:. ./.:4:118,100:.:-0.37:0.998:. ./.:4:250,62:.: 1.11:1.000:. ./.:4:224,65:.: 0.75:1.000:. ./.:4:95,110:.:-0.58:1.000:. ./.:4:192,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:137,84:.:-0.32:1.000:. ./.:4:202,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:119,123:.: 0.01:1.000:. ./.:4:222,67:.: 0.75:0.999:. ./.:4:127,117:.: 0.04:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:98,120:.:-0.37:1.000:. ./.:4:112,115:.:-0.23:1.000:. ./.:4:187,69:.: 0.23:1.000:. ./.:4:181,57:.:-0.06:1.000:. ./.:4:124,97:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,102:.:-0.26:1.000:. ./.:4:175,169:.: 1.61:1.000:. ./.:4:176,139:.: 1.16:1.000:. ./.:4:213,66:.: 0.59:1.000:. ./.:4:96,186:.: 0.64:1.000:. ./.:4:224,71:.: 0.84:1.000:. ./.:4:350,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:256,67:.: 1.28:1.000:. ./.:4:182,58:.:-0.03:1.000:. ./.:4:138,124:.: 0.32:1.000:. -chr2.1 71631466 chr2.1_071631466 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:384,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:216,51:.:-0.54:1.000:. ./.:4:158,108:.:-0.55:1.000:. ./.:4:298,69:.: 0.94:1.000:. ./.:4:289,81:.: 0.98:1.000:. ./.:4:332,64:.: 1.36:1.000:. ./.:4:129,77:.:-1.44:1.000:. ./.:4:260,62:.: 0.27:1.000:. ./.:4:276,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:171,45:.:-1.29:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:153,117:.:-0.49:1.000:. ./.:4:269,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:184,124:.: 0.07:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:286,61:.: 0.64:1.000:. ./.:4:350,52:.: 1.45:0.998:. ./.:4:274,65:.: 0.52:1.000:. ./.:4:238,156:.: 1.33:1.000:. ./.:4:226,161:.: 1.23:1.000:. ./.:4:148,29:.:-1.87:1.000:. ./.:4:257,60:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,108:.:-0.11:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:85,11:.:-3.06:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:251,50:.:-0.04:1.000:. ./.:4:173,101:.:-0.44:1.000:. ./.:4:291,65:.: 0.77:1.000:. ./.:4:220,125:.: 0.61:1.000:. ./.:4:207,138:.: 0.61:1.000:. ./.:4:146,86:.:-1.06:1.000:. ./.:4:52,44:.:-3.06:1.000:. ./.:4:175,21:.:-1.59:1.000:. ./.:3:23,35:.:-3.62:1.000:. ./.:4:184,106:.:-0.20:1.000:. ./.:4:248,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:179,123:.:-0.02:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:277,61:.: 0.51:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:275,60:.: 0.46:1.000:. ./.:4:358,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:264,63:.: 0.35:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:195,105:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,24:.:-3.44:1.000:. ./.:4:164,79:.:-0.89:1.000:. ./.:4:147,19:.:-2.03:1.000:. ./.:4:235,54:.:-0.21:1.000:. ./.:4:343,65:.: 1.54:1.000:. ./.:4:150,117:.:-0.54:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:245,44:.:-0.21:1.000:. ./.:4:130,78:.:-1.41:1.000:. ./.:4:171,103:.:-0.44:1.000:. ./.:4:265,61:.: 0.33:1.000:. ./.:4:237,44:.:-0.33:1.000:. ./.:6:274,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:209,48:.:-0.69:1.000:. ./.:4:271,63:.: 0.45:1.000:. ./.:4:266,54:.: 0.24:1.000:. ./.:4:246,49:.:-0.13:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:159,103:.:-0.61:1.000:. ./.:4:267,54:.: 0.26:1.000:. ./.:4:253,51:.: 0.01:0.578:. ./.:4:225,65:.:-0.20:1.000:. ./.:4:324,66:.: 1.27:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:281,59:.: 0.54:1.000:. ./.:4:219,52:.:-0.48:1.000:. ./.:4:226,50:.:-0.41:1.000:. ./.:4:262,43:.: 0.02:1.000:. ./.:4:271,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:222,139:.: 0.85:1.000:. ./.:4:184,139:.: 0.29:1.000:. ./.:4:162,127:.:-0.21:0.727:. ./.:4:274,46:.: 0.24:1.000:. ./.:4:293,64:.: 0.79:1.000:. ./.:4:154,101:.:-0.72:1.000:. ./.:4:253,40:.:-0.16:0.825:. ./.:4:408,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:105,61:.:-2.03:1.000:. ./.:4:133,87:.:-1.23:1.000:. ./.:4:147,106:.:-0.75:1.000:. ./.:4:229,46:.:-0.42:1.000:. ./.:3:147,32:.:-1.84:0.993:. ./.:4:243,59:.:-0.02:1.000:. ./.:4:336,56:.: 1.30:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:379,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:263,80:.: 0.58:1.000:. ./.:4:234,50:.:-0.29:1.000:. ./.:4:262,51:.: 0.14:1.000:. ./.:4:325,61:.: 1.22:1.000:. ./.:4:175,149:.: 0.30:1.000:. ./.:4:222,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:180,111:.:-0.19:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:254,49:.:-0.01:1.000:. ./.:4:210,46:.:-0.70:1.000:. ./.:4:160,122:.:-0.32:1.000:. ./.:4:218,72:.:-0.20:1.000:. ./.:4:248,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:238,75:.: 0.14:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:448,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.27:0.999:. ./.:4:367,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:148,97:.:-0.86:1.000:. ./.:4:189,58:.:-0.83:1.000:. ./.:4:254,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:224,40:.:-0.58:1.000:. ./.:4:169,114:.:-0.30:1.000:. ./.:4:226,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:301,73:.: 1.04:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,110:.:-0.19:1.000:. ./.:4:212,53:.:-0.57:1.000:. ./.:4:213,44:.:-0.69:1.000:. ./.:4:177,43:.:-1.23:1.000:. ./.:4:165,107:.:-0.47:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:164,39:.:-1.48:1.000:. ./.:4:246,47:.:-0.16:1.000:. ./.:4:233,48:.:-0.33:1.000:. ./.:4:312,66:.: 1.10:1.000:. ./.:4:274,53:.: 0.35:1.000:. ./.:4:314,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:225,51:.:-0.41:1.000:. ./.:4:226,51:.:-0.39:1.000:. ./.:4:262,65:.: 0.35:1.000:. ./.:4:177,88:.:-0.57:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:318,83:.: 1.44:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:264,57:.: 0.26:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:271,59:.: 0.39:1.000:. ./.:4:244,51:.:-0.13:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:79,160:.:-0.95:1.000:. ./.:4:104,28:.:-2.53:1.000:. ./.:4:191,37:.:-1.11:1.000:. ./.:4:393,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:267,74:.: 0.55:1.000:. ./.:4:341,73:.: 1.63:1.000:. ./.:4:266,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.05:0.998:. ./.:4:276,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:212,56:.:-0.52:1.000:. ./.:4:204,40:.:-0.88:1.000:. ./.:4:239,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:153,89:.:-0.91:1.000:. ./.:4:132,67:.:-1.54:1.000:. ./.:4:275,53:.: 0.36:1.000:. ./.:4:164,113:.:-0.39:1.000:. ./.:4:255,61:.: 0.18:0.999:. ./.:4:334,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:261,61:.: 0.27:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,93:.:-0.72:1.000:. ./.:4:198,55:.:-0.75:1.000:. ./.:4:478,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:306,68:.: 1.04:1.000:. ./.:4:268,40:.: 0.07:1.000:. ./.:4:355,14:.: 0.96:1.000:. ./.:4:178,128:.: 0.04:1.000:. ./.:4:207,162:.: 0.96:1.000:. ./.:4:463,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:213,46:.:-0.66:1.000:. ./.:4:245,68:.: 0.14:1.000:. -chr2.1 71735044 chr2.1_071735044 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:384,199:0.35: 0.92:1.000:0.779 0/0/0/1:4:196,32:0.13:-1.76:1.000:0.865 0/0/1/1:4:221,132:0.40:-0.82:1.000:0.814 0/0/1/1:4:261,180:0.46:-0.16:1.000:0.985 0/0/0/0:4:561,30:0.04: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,196:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,91:0.44:-1.76:1.000:0.967 0/1/1/1:4:114,294:0.72:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,156:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,102:0.54:-1.91:1.000:0.986 0/0/1/1:4:103,70:0.45:-2.18:1.000:0.981 0/0/0/1:4:109,59:0.37:-2.22:1.000:0.603 0/0/0/1:4:348,158:0.31: 0.33:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,366:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:368,173:0.32: 0.60:1.000:0.960 0/0/0/1:4:333,173:0.35: 0.33:1.000:0.771 0/0/0/1:4:344,166:0.33: 0.36:0.998:0.934 0/0/0/1:4:254,40:0.12:-1.27:1.000:0.804 0/0/0/1:4:464,211:0.31: 1.61:1.000:0.979 0/1/1/1:4:118,229:0.67:-0.87:1.000:0.934 0/0/1/1:4:91,96:0.56:-2.07:1.000:0.967 0/0/0/0:4:439,19:0.04:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,389:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:315,181:0.39: 0.26:1.000:0.675 0/1/1/1:4:49,83:0.65:-2.49:1.000:0.787 0/0/0/0:4:571,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,288:0.73:-0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:367,146:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:433,184:0.28: 1.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:212,124:0.40:-0.95:1.000:0.745 0/1/1/1:4:106,270:0.72:-0.65:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,54:0.61:-2.77:1.000:0.720 0/0/0/1:4:149,51:0.23:-1.97:1.000:1.000 0/1/1:3:42,34:0.51:-2.91:1.000:0.647 0/0/0/1:4:326,151:0.31: 0.12:1.000:0.970 0/0/0/1:4:335,148:0.30: 0.16:1.000:0.988 0/0/1/1:4:223,150:0.45:-0.67:1.000:0.977 0/0/0/0:4:424,25:0.05:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:436,17:0.03:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:406,205:0.34: 1.13:1.000:0.854 0/0/1/1:4:343,198:0.39: 0.60:1.000:0.694 0/0/1/1:4:359,199:0.38: 0.73:1.000:0.510 0/0/0/1:4:444,146:0.22: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,381:0.61: 1.48:1.000:0.681 0/0/0/0:4:698,1:0.00: 1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:298,182:0.41: 0.14:1.000:0.870 0/0/0/1:4:160,87:0.37:-1.62:1.000:0.582 0/0/1/1:4:220,193:0.52:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:275,167:0.41:-0.15:1.000:0.857 0/0/1/1:4:341,211:0.42: 0.68:1.000:0.896 0/0/0/1:4:460,200:0.29: 1.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:218,225:0.56:-0.14:1.000:0.973 0/0/0/0:4:675,1:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:463,134:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,175:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:365,158:0.29: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:381,160:0.28: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:319,151:0.32: 0.06:1.000:0.954 0/0/0/1/1/1:6:307,199:0.43: 0.33:1.000:0.628 0/0/1/1:4:393,286:0.48: 1.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:236,137:0.39:-0.67:1.000:0.717 0/0/0/1:4:396,166:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:411,144:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:490,186:0.25: 1.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:353,201:0.39: 0.70:1.000:0.636 0/0/1/1:4:222,135:0.41:-0.79:1.000:0.860 0/0/0/1:4:370,78:0.16:-0.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:344,135:0.26: 0.13:0.578:0.999 0/0/0/1:4:118,62:0.36:-2.13:1.000:0.730 0/0/0/0:4:537,58:0.09: 1.01:1.000:0.965 0/0/0/0:4:429,33:0.06: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:406,27:0.06:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,163:0.48:-0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:247,75:0.21:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:383,34:0.07:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:340,200:0.40: 0.59:1.000:0.765 0/0/1/1:4:304,271:0.53: 0.85:1.000:0.993 0/1/1/1:4:110,384:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:127,395:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,118:0.60:-1.91:0.727:0.775 0/0/1/1:4:406,227:0.38: 1.29:1.000:0.551 0/0/0/0:4:573,57:0.08: 1.27:1.000:0.987 0/0/0/1:4:257,131:0.35:-0.56:1.000:0.830 0/0/0/0:4:470,32:0.06: 0.30:0.825:1.000 0/0/1/1:4:267,251:0.54: 0.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:293,155:0.36:-0.10:1.000:0.703 0/0/1/1:4:236,196:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:245,242:0.55: 0.19:1.000:0.982 0/0/0/1:4:368,196:0.36: 0.77:1.000:0.675 0/1/1:3:101,265:0.72:-0.72:0.993:1.000 0/0/1/1:4:333,187:0.38: 0.44:1.000:0.572 0/1/1/1:4:142,389:0.73: 0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:377,134:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,241:0.57:-0.01:1.000:0.951 0/0/1/1:4:350,204:0.39: 0.70:1.000:0.732 0/1/1/1:4:100,286:0.74:-0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,95:0.48:-1.80:1.000:0.996 0/0/0/0:4:652,81:0.10: 2.05:1.000:0.825 0/0/0/1:4:358,191:0.36: 0.66:1.000:0.668 0/0/0/0:4:388,31:0.07:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:150,435:0.74: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,205:0.56:-0.44:1.000:0.972 0/0/1/1:4:292,273:0.54: 0.78:1.000:0.989 0/0/1/1:4:219,287:0.60: 0.33:1.000:0.775 0/0/1/1:4:222,203:0.53:-0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:176,215:0.59:-0.53:1.000:0.874 0/1/1/1:4:98,291:0.74:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:283,203:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:117,341:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:394,168:0.28: 0.76:1.000:0.994 0/0/0/1:4:399,214:0.36: 1.14:1.000:0.645 0/0/1/1:4:250,277:0.57: 0.49:0.999:0.948 0/0/0/0:4:599,1:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:302,122:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:427,291:0.45: 1.93:1.000:0.982 0/0/0/1:4:336,173:0.35: 0.36:1.000:0.800 0/0/0/0:4:395,28:0.06:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,201:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:354,163:0.31: 0.42:1.000:0.973 0/1/1/1:4:127,215:0.65:-0.90:1.000:0.786 0/0/0/1:4:402,218:0.37: 1.19:1.000:0.595 0/0/1/1:4:387,244:0.42: 1.28:1.000:0.925 0/0/0/1:4:319,134:0.28:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:262,247:0.54: 0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:586,222:0.25: 2.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:122,387:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,59:0.21:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,148:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:286,179:0.42: 0.02:1.000:0.914 0/0/1/1:4:228,176:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:328,157:0.32: 0.18:1.000:0.944 0/0/0/1:4:305,89:0.20:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,225:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,170:0.51:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/0:4:504,43:0.07: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:391,170:0.29: 0.75:1.000:0.991 0/0/0/0:4:606,1:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,280:0.58: 0.41:1.000:0.902 0/0/0/1:4:376,152:0.27: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/0:4:531,32:0.05: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:412,209:0.34: 1.20:1.000:0.843 0/0/0/0:4:444,23:0.04: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:382,153:0.26: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:325,225:0.46: 0.67:1.000:0.986 0/0/1/1:4:322,262:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:365,157:0.29: 0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:317,174:0.37: 0.22:1.000:0.537 0/0/0/1:4:533,145:0.19: 1.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,305:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:411,167:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,270:0.72:-0.65:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,150:0.99:-2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,210:0.62:-0.83:1.000:0.510 0/0/0/0:4:607,3:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,158:0.41:-0.36:1.000:0.891 0/0/0/0:4:410,53:0.10: 0.01:1.000:0.741 0/0/1/1:4:343,191:0.38: 0.55:1.000:0.532 0/0/1/1:4:208,182:0.52:-0.54:0.998:0.994 0/0/0/0:4:507,17:0.03: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,118:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:194,120:0.42:-1.11:1.000:0.895 0/0/0/0:4:374,17:0.04:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:117,310:0.72:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:239,147:0.41:-0.57:1.000:0.885 0/1/1/1:4:125,276:0.70:-0.46:1.000:0.981 0/0/1/1:4:190,142:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/0:4:369,18:0.04:-0.56:0.999:1.000 0/0/1/1:4:261,171:0.44:-0.22:1.000:0.962 0/0/0/1:4:299,152:0.34:-0.08:1.000:0.837 0/0/0/1:4:296,134:0.30:-0.24:1.000:0.981 0/0/0/0:4:405,1:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:304,178:0.40: 0.15:1.000:0.749 0/0/0/1:4:323,167:0.35: 0.21:1.000:0.787 0/1/1/1:4:95,168:0.66:-1.50:1.000:0.850 0/1/1/1:4:82,258:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:258,174:0.45:-0.22:1.000:0.978 0/1/1/1:4:139,253:0.66:-0.53:1.000:0.883 0/1/1/1:4:121,299:0.71:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/0:4:361,29:0.07:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:119,341:0.74:-0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:431,215:0.34: 1.39:1.000:0.881 0/0/0/1:4:656,200:0.21: 2.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,121:0.29:-0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:245,55:0.16:-1.22:1.000:0.997 -chr2.1 71996153 chr2.1_071996153 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:506,347:.: 1.06:1.000:. ./.:4:410,207:.:-0.25:1.000:. ./.:4:615,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:485,200:.: 0.13:1.000:. ./.:4:484,206:.: 0.16:1.000:. ./.:4:694,294:.: 1.81:1.000:. ./.:4:429,74:.:-0.88:1.000:. ./.:4:399,265:.: 0.01:1.000:. ./.:4:577,191:.: 0.59:1.000:. ./.:4:160,71:.:-2.39:1.000:. ./.:4:199,166:.:-1.64:1.000:. ./.:4:471,164:.:-0.15:1.000:. ./.:4:369,148:.:-0.80:1.000:. ./.:4:457,171:.:-0.19:1.000:. ./.:4:484,320:.: 0.79:1.000:. ./.:4:585,301:.: 1.25:1.000:. ./.:4:627,299:.: 1.47:0.998:. ./.:4:442,179:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1132,241:.: 3.95:1.000:. ./.:4:850,112:.: 1.67:1.000:. ./.:4:238,92:.:-1.84:1.000:. ./.:4:678,154:.: 0.95:1.000:. ./.:4:634,199:.: 0.95:1.000:. ./.:4:448,311:.: 0.54:1.000:. ./.:4:124,69:.:-2.60:1.000:. ./.:4:341,293:.:-0.15:1.000:. ./.:4:469,295:.: 0.57:1.000:. ./.:4:454,175:.:-0.18:1.000:. ./.:4:517,169:.: 0.14:1.000:. ./.:4:690,115:.: 0.80:1.000:. ./.:4:545,206:.: 0.50:1.000:. ./.:4:454,157:.:-0.28:1.000:. ./.:4:89,33:.:-2.99:1.000:. ./.:4:268,103:.:-1.61:1.000:. ./.:3:149,18:.:-2.74:1.000:. ./.:4:641,194:.: 0.96:1.000:. ./.:4:530,261:.: 0.72:1.000:. ./.:4:474,96:.:-0.51:1.000:. ./.:4:562,327:.: 1.26:1.000:. ./.:4:891,206:.: 2.42:1.000:. ./.:4:294,334:.:-0.19:1.000:. ./.:4:511,255:.: 0.58:1.000:. ./.:4:516,275:.: 0.72:1.000:. ./.:4:472,317:.: 0.71:1.000:. ./.:4:446,276:.: 0.34:1.000:. ./.:4:519,259:.: 0.65:1.000:. ./.:4:430,109:.:-0.68:1.000:. ./.:4:205,50:.:-2.26:1.000:. ./.:4:551,132:.: 0.12:1.000:. ./.:4:527,278:.: 0.80:1.000:. ./.:4:223,211:.:-1.26:1.000:. ./.:4:385,263:.:-0.07:1.000:. ./.:4:380,142:.:-0.77:1.000:. ./.:4:508,255:.: 0.56:1.000:. ./.:4:372,244:.:-0.25:1.000:. ./.:4:532,170:.: 0.23:1.000:. ./.:4:565,150:.: 0.30:1.000:. ./.:4:654,194:.: 1.04:1.000:. ./.:4:519,152:.: 0.05:1.000:. ./.:6:360,249:.:-0.29:1.000:. ./.:4:458,314:.: 0.61:1.000:. ./.:4:324,152:.:-1.03:1.000:. ./.:4:709,190:.: 1.32:1.000:. ./.:4:571,296:.: 1.14:1.000:. ./.:4:513,258:.: 0.61:1.000:. ./.:4:332,319:.:-0.06:1.000:. ./.:4:570,147:.: 0.31:1.000:. ./.:4:379,187:.:-0.53:1.000:. ./.:4:464,160:.:-0.21:0.578:. ./.:4:381,214:.:-0.37:1.000:. ./.:4:644,203:.: 1.03:1.000:. ./.:4:275,231:.:-0.86:1.000:. ./.:4:345,411:.: 0.52:1.000:. ./.:4:435,155:.:-0.40:1.000:. ./.:4:381,190:.:-0.50:1.000:. ./.:4:420,105:.:-0.76:1.000:. ./.:4:358,226:.:-0.43:1.000:. ./.:4:487,174:.: 0.00:1.000:. ./.:4:533,184:.: 0.31:1.000:. ./.:4:457,198:.:-0.04:1.000:. ./.:4:462,114:.:-0.47:0.727:. ./.:4:359,255:.:-0.26:1.000:. ./.:4:531,191:.: 0.34:1.000:. ./.:4:663,128:.: 0.72:1.000:. ./.:4:568,179:.: 0.47:0.825:. ./.:4:466,282:.: 0.48:1.000:. ./.:4:309,117:.:-1.31:1.000:. ./.:4:361,68:.:-1.29:1.000:. ./.:4:414,156:.:-0.51:1.000:. ./.:4:481,192:.: 0.06:1.000:. ./.:3:468,122:.:-0.40:0.993:. ./.:4:405,209:.:-0.26:1.000:. ./.:4:541,279:.: 0.88:1.000:. ./.:4:377,256:.:-0.16:1.000:. ./.:4:422,263:.: 0.13:1.000:. ./.:4:686,303:.: 1.82:1.000:. ./.:4:265,136:.:-1.44:1.000:. ./.:4:400,225:.:-0.20:1.000:. ./.:4:467,146:.:-0.27:1.000:. ./.:4:822,160:.: 1.78:1.000:. ./.:4:249,135:.:-1.54:1.000:. ./.:4:498,161:.:-0.01:1.000:. ./.:4:327,181:.:-0.85:1.000:. ./.:4:272,134:.:-1.42:1.000:. ./.:4:308,199:.:-0.86:1.000:. ./.:4:512,185:.: 0.20:1.000:. ./.:4:513,221:.: 0.40:1.000:. ./.:4:520,303:.: 0.90:1.000:. ./.:4:443,284:.: 0.36:1.000:. ./.:4:637,250:.: 1.25:1.000:. ./.:4:235,200:.:-1.26:1.000:. ./.:4:441,487:.: 1.48:1.000:. ./.:4:334,227:.:-0.56:0.999:. ./.:4:489,234:.: 0.34:1.000:. ./.:4:143,159:.:-1.99:1.000:. ./.:4:507,366:.: 1.17:1.000:. ./.:4:474,131:.:-0.31:1.000:. ./.:4:498,143:.:-0.11:1.000:. ./.:4:434,185:.:-0.24:1.000:. ./.:4:272,204:.:-1.03:1.000:. ./.:4:596,95:.: 0.16:1.000:. ./.:4:172,210:.:-1.55:1.000:. ./.:4:565,263:.: 0.92:1.000:. ./.:4:429,261:.: 0.16:1.000:. ./.:4:337,224:.:-0.56:1.000:. ./.:4:519,341:.: 1.10:1.000:. ./.:4:478,160:.:-0.13:1.000:. ./.:4:328,224:.:-0.61:1.000:. ./.:4:354,142:.:-0.92:1.000:. ./.:4:458,196:.:-0.04:1.000:. ./.:4:274,72:.:-1.75:1.000:. ./.:4:575,323:.: 1.31:1.000:. ./.:4:398,151:.:-0.62:1.000:. ./.:4:370,270:.:-0.12:1.000:. ./.:4:410,156:.:-0.53:1.000:. ./.:4:446,264:.: 0.27:1.000:. ./.:4:539,242:.: 0.66:1.000:. ./.:4:513,217:.: 0.38:1.000:. ./.:4:339,186:.:-0.76:1.000:. ./.:4:429,163:.:-0.39:1.000:. ./.:4:488,136:.:-0.21:1.000:. ./.:4:414,166:.:-0.45:1.000:. ./.:4:494,239:.: 0.40:1.000:. ./.:4:378,242:.:-0.23:1.000:. ./.:4:556,316:.: 1.17:1.000:. ./.:4:452,257:.: 0.26:1.000:. ./.:4:333,174:.:-0.86:1.000:. ./.:4:302,224:.:-0.75:1.000:. ./.:4:510,335:.: 1.02:1.000:. ./.:4:200,209:.:-1.40:1.000:. ./.:4:790,350:.: 2.66:1.000:. ./.:4:598,86:.: 0.13:1.000:. ./.:4:198,79:.:-2.13:1.000:. ./.:4:429,142:.:-0.50:1.000:. ./.:4:541,273:.: 0.85:1.000:. ./.:4:625,152:.: 0.64:1.000:. ./.:4:655,215:.: 1.16:1.000:. ./.:4:569,311:.: 1.21:1.000:. ./.:4:396,210:.:-0.31:0.998:. ./.:4:348,187:.:-0.70:1.000:. ./.:4:418,252:.: 0.05:1.000:. ./.:4:280,141:.:-1.33:1.000:. ./.:4:593,163:.: 0.52:1.000:. ./.:4:497,162:.:-0.01:1.000:. ./.:4:496,93:.:-0.40:1.000:. ./.:4:532,250:.: 0.67:1.000:. ./.:4:458,165:.:-0.21:1.000:. ./.:4:443,255:.: 0.20:0.999:. ./.:4:400,221:.:-0.22:1.000:. ./.:4:532,230:.: 0.56:1.000:. ./.:4:356,191:.:-0.63:1.000:. ./.:4:307,214:.:-0.78:1.000:. ./.:4:231,291:.:-0.77:1.000:. ./.:4:403,308:.: 0.28:1.000:. ./.:4:423,70:.:-0.93:1.000:. ./.:4:350,218:.:-0.52:1.000:. ./.:4:392,326:.: 0.31:1.000:. ./.:4:535,193:.: 0.37:1.000:. ./.:4:355,264:.:-0.24:1.000:. ./.:4:282,235:.:-0.80:1.000:. ./.:4:552,185:.: 0.42:1.000:. ./.:4:843,210:.: 2.17:1.000:. ./.:4:566,383:.: 1.60:1.000:. ./.:4:486,217:.: 0.23:1.000:. ./.:4:425,250:.: 0.08:1.000:. -chr2.1 72279166 chr2.1_072279166 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:531,224:.: 0.93:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:543,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:636,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:782,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:555,204:.: 0.96:1.000:. ./.:4:331,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:474,183:.: 0.23:1.000:. ./.:4:558,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:293,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:194,132:.:-2.13:1.000:. ./.:4:467,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:606,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:534,181:.: 0.65:1.000:. ./.:4:480,179:.: 0.25:1.000:. ./.:4:494,169:.: 0.28:1.000:. ./.:4:710,0:.: 0.61:0.998:. ./.:4:490,211:.: 0.55:1.000:. ./.:4:845,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:690,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:315,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:612,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:725,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:426,155:.:-0.31:1.000:. ./.:4:140,99:.:-2.76:1.000:. ./.:4:750,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:413,178:.:-0.24:1.000:. ./.:4:614,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:801,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:476,153:.: 0.03:1.000:. ./.:4:392,161:.:-0.51:1.000:. ./.:4:126,0:.:-3.56:1.000:. ./.:4:276,0:.:-2.49:1.000:. ./.:3:76,0:.:-3.92:1.000:. ./.:4:653,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:600,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:614,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:686,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:679,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:532,190:.: 0.70:1.000:. ./.:4:560,216:.: 1.08:1.000:. ./.:4:604,241:.: 1.58:1.000:. ./.:4:457,216:.: 0.35:1.000:. ./.:4:544,237:.: 1.12:1.000:. ./.:4:700,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:738,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:154,1:.:-3.36:1.000:. ./.:4:646,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:517,211:.: 0.74:1.000:. ./.:4:436,195:.: 0.05:1.000:. ./.:4:607,253:.: 1.68:1.000:. ./.:4:535,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:728,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:580,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:715,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:521,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:709,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:600,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:364,146:.:-0.82:1.000:. ./.:4:467,228:.: 0.50:1.000:. ./.:4:577,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:808,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:640,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:643,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:506,210:.: 0.65:1.000:. ./.:4:481,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:553,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:601,0:.:-0.17:0.578:. ./.:4:608,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:768,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:589,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:779,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:727,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:736,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:526,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:618,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:529,211:.: 0.83:1.000:. ./.:4:484,192:.: 0.37:1.000:. ./.:4:548,200:.: 0.88:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.90:0.727:. ./.:4:763,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:672,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:569,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:620,0:.:-0.03:0.825:. ./.:4:541,221:.: 0.98:1.000:. ./.:4:472,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:627,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:578,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:422,182:.:-0.15:1.000:. ./.:3:226,145:.:-1.81:0.993:. ./.:4:684,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:570,207:.: 1.09:1.000:. ./.:4:338,124:.:-1.16:1.000:. ./.:4:462,177:.: 0.10:1.000:. ./.:4:540,211:.: 0.91:1.000:. ./.:4:509,187:.: 0.51:1.000:. ./.:4:582,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:703,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:690,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:546,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:525,206:.: 0.76:1.000:. ./.:4:450,158:.:-0.12:1.000:. ./.:4:447,200:.: 0.16:1.000:. ./.:4:417,155:.:-0.37:1.000:. ./.:4:581,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:415,209:.: 0.00:1.000:. ./.:4:451,170:.:-0.02:1.000:. ./.:4:664,245:.: 2.04:1.000:. ./.:4:351,349:.: 0.54:1.000:. ./.:4:509,212:.: 0.69:1.000:. ./.:4:612,231:.: 1.56:1.000:. ./.:4:541,220:.: 0.98:0.999:. ./.:4:651,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:310,131:.:-1.31:1.000:. ./.:4:544,239:.: 1.13:1.000:. ./.:4:584,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:596,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:651,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:607,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:733,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:676,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:529,183:.: 0.63:1.000:. ./.:4:444,183:.: 0.02:1.000:. ./.:4:494,199:.: 0.49:1.000:. ./.:4:555,215:.: 1.04:1.000:. ./.:4:474,210:.: 0.43:1.000:. ./.:4:510,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:430,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:518,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:596,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:417,148:.:-0.42:1.000:. ./.:4:414,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:452,216:.: 0.31:1.000:. ./.:4:446,178:.: 0.00:1.000:. ./.:4:782,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:681,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:629,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:431,165:.:-0.20:1.000:. ./.:4:598,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:717,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:651,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:537,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:398,146:.:-0.58:1.000:. ./.:4:626,218:.: 1.57:1.000:. ./.:4:732,264:.: 2.66:1.000:. ./.:4:701,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:447,185:.: 0.05:1.000:. ./.:4:810,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:401,177:.:-0.33:1.000:. ./.:4:500,213:.: 0.63:1.000:. ./.:4:583,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:153,63:.:-2.92:1.000:. ./.:4:279,119:.:-1.62:1.000:. ./.:4:799,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:559,204:.: 0.99:1.000:. ./.:4:783,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:726,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:370,143:.:-0.80:0.998:. ./.:4:613,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:544,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:570,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:605,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:441,163:.:-0.15:1.000:. ./.:4:577,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:431,163:.:-0.22:1.000:. ./.:4:521,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:558,1:.:-0.47:0.999:. ./.:4:435,175:.:-0.10:1.000:. ./.:4:373,147:.:-0.75:1.000:. ./.:4:370,130:.:-0.89:1.000:. ./.:4:476,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:426,197:.:-0.01:1.000:. ./.:4:431,172:.:-0.15:1.000:. ./.:4:538,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:326,138:.:-1.15:1.000:. ./.:4:547,193:.: 0.83:1.000:. ./.:4:537,197:.: 0.78:1.000:. ./.:4:481,180:.: 0.26:1.000:. ./.:4:522,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:495,164:.: 0.25:1.000:. ./.:4:784,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:542,227:.: 1.03:1.000:. ./.:4:500,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:645,0:.: 0.15:1.000:. -chr2.1 72374957 chr2.1_072374957 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:194,57:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,48:0.28:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,111:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,114:0.52:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,119:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:200,78:0.29: 1.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:65,77:0.55:-1.96:1.000:0.978 0/0/0/1:4:168,66:0.30: 0.10:1.000:0.989 0/0/0/1:4:180,74:0.30: 0.55:1.000:0.980 0/0/1/1:4:69,71:0.52:-2.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,57:0.46:-2.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:168,57:0.27:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,94:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/0:4:239,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,51:0.27:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:158,55:0.27:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,142:0.51: 1.31:0.998:0.996 0/0/1/1:4:114,131:0.55: 0.35:1.000:0.984 0/0/0/1:4:248,82:0.26: 2.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:242,74:0.25: 1.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,23:0.24:-2.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,161:0.71:-0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:178,54:0.25: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,105:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,34:0.28:-2.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,155:0.69:-0.19:1.000:0.977 0/0/0/1:4:142,70:0.34:-0.39:1.000:0.840 0/0/0/1:4:177,53:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,107:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,53:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,65:0.22: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,2:0.01:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,75:0.57:-2.18:1.000:0.933 0/0/1/1:4:83,105:0.57:-0.93:1.000:0.955 0/0/1:3:45,24:0.36:-3.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,110:0.55:-0.57:1.000:0.981 0/0/1/1:4:119,117:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,118:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,142:0.48: 1.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:94,253:0.72: 2.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,114:0.47: 0.48:1.000:0.992 0/0/0/1:4:177,56:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,122:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,110:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:218,62:0.23: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,193:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,112:0.46: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:59,69:0.55:-2.27:1.000:0.981 0/0/0/1:4:175,53:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,64:0.22: 1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,98:0.47:-0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:225,62:0.23: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,32:0.17:-0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:70,185:0.71: 0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:168,56:0.26:-0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,56:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,52:0.28:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,127:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,113:0.55:-0.46:1.000:0.979 0/0/0/1/1/1:6:116,93:0.46:-0.46:1.000:0.801 0/0/1/1:4:126,115:0.49: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,89:0.47:-0.73:1.000:0.991 0/0/1/1:4:155,158:0.52: 1.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:152,110:0.44: 0.73:1.000:0.958 0/0/1/1:4:119,132:0.54: 0.48:1.000:0.989 0/0/1/1:4:130,104:0.46: 0.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:159,48:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,127:0.52: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,119:0.49: 0.52:0.578:0.996 0/0/0/1:4:147,45:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,157:0.54: 1.49:1.000:0.987 0/1/1/1:4:45,104:0.69:-1.80:1.000:0.973 0/0/1/1:4:146,139:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,104:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,106:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,159:0.71:-0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:99,108:0.53:-0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:114,94:0.47:-0.48:1.000:0.991 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,57:0.21: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.86:0.727:1.000 0/0/0/1:4:169,49:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,126:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,81:0.47:-1.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:74,184:0.70: 0.64:0.825:0.988 0/0/1/1:4:145,115:0.46: 0.68:1.000:0.986 0/0/0/1:4:136,34:0.21:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,91:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:174,58:0.26: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,111:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1:3:83,48:0.38:-2.20:0.993:1.000 0/0/1/1:4:107,80:0.44:-0.95:1.000:0.972 0/0/0/1:4:203,54:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,69:0.48:-1.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:152,124:0.47: 1.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,130:0.48: 1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:168,54:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,60:0.23: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,202:0.70: 1.24:1.000:0.985 0/0/1/1:4:103,115:0.54:-0.26:1.000:0.988 0/1/1/1:4:42,139:0.75:-1.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:246,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,39:0.22:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,60:0.28:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:165,58:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,43:0.22:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,46:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:272,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,65:0.24: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,64:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,104:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,147:0.51: 1.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:175,58:0.26: 0.08:0.999:0.999 0/1/1/1:4:60,183:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,92:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,56:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,50:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,93:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:188,56:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,51:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,60:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,42:0.20:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,106:0.46: 0.26:1.000:0.985 0/0/1/1:4:120,103:0.48:-0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:176,64:0.28: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,124:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,47:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:222,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,55:0.31:-0.95:1.000:0.977 0/0/0/1:4:147,51:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:144,42:0.24:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,125:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,87:0.55:-1.51:1.000:0.982 0/0/0/1:4:189,55:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,55:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,140:0.49: 1.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:185,68:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,167:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,54:0.30:-0.93:1.000:0.985 0/0/1/1:4:103,99:0.51:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,122:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,119:0.47: 0.70:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,151:0.78:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,82:0.46:-1.00:1.000:0.987 0/0/0/1:4:219,73:0.26: 1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:152,125:0.47: 1.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:116,127:0.53: 0.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:117,101:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,135:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,148:0.46: 2.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:185,59:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,48:0.33:-1.71:1.000:0.931 0/0/1/1:4:133,121:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,102:0.45: 0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:155,115:0.44: 0.90:1.000:0.969 0/0/1/1:4:146,151:0.52: 1.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,114:0.57:-0.64:0.998:0.935 0/1/1/1:4:54,169:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,62:0.28: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,97:0.53:-0.91:1.000:0.993 0/1/1/1:4:78,181:0.69: 0.66:1.000:0.974 0/0/0/1:4:148,43:0.24:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,59:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:179,61:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:127,112:0.48: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,119:0.54:-0.08:0.999:0.989 0/0/1/1:4:103,89:0.48:-0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,104:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,100:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,130:0.71:-1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,89:0.48:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,91:0.46:-0.59:1.000:0.990 0/0/0/1:4:201,58:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,157:0.50: 2.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:190,63:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,68:0.29: 0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:117,115:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,125:0.48: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:129,133:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,110:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,46:0.21: 0.01:1.000:1.000 -chr2.1 72464009 chr2.1_072464009 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:99,65:0.37: 1.07:1.000:0.539 0/0/0/1:4:69,34:0.31:-0.14:1.000:0.974 0/1/1/1:4:18,108:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,55:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,116:0.52: 1.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,155:0.76: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,46:0.72:-1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,42:0.59:-0.88:1.000:0.887 0/0/0/1:4:80,32:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,15:0.75:-1.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,80:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,58:0.35: 0.89:1.000:0.784 0/1/1/1:4:21,108:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,70:0.41: 0.97:1.000:0.882 0/0/1/1:4:71,118:0.58: 1.57:1.000:0.929 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.33:0.998:1.000 0/1/1/1:4:11,93:0.84:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,57:0.35: 0.87:1.000:0.817 0/1/1/1:4:27,112:0.73: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.47:-2.15:1.000:0.992 0/1/1/1:4:17,109:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,63:0.58:-0.20:1.000:0.911 0/0/1/1:4:31,46:0.55:-0.66:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,57:0.37: 0.69:1.000:0.580 0/0/1/1:4:36,58:0.57:-0.32:1.000:0.947 0/0/0/1:4:95,60:0.36: 0.89:1.000:0.652 0/0/0/1:4:101,53:0.32: 0.87:1.000:0.947 0/0/1/1:4:91,102:0.50: 1.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,117:0.82: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,107:0.82: 0.22:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.97:1.000:1.000 1/1/1:3:0,2:1.00:-2.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,65:0.58:-0.12:1.000:0.927 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,117:0.81: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,54:0.41: 0.30:1.000:0.834 0/1/1/1:4:12,111:0.85: 0.26:1.000:0.985 0/0/1/1:4:26,36:0.54:-0.96:1.000:0.988 0/0/1/1:4:63,112:0.59: 1.29:1.000:0.870 0/0/1/1:4:64,94:0.55: 0.95:1.000:0.978 0/0/1/1:4:65,48:0.40: 0.06:1.000:0.779 0/0/1/1:4:63,49:0.41: 0.04:1.000:0.868 0/0/0/1:4:77,48:0.36: 0.30:1.000:0.687 0/1/1/1:4:25,140:0.77: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,79:0.67:-0.06:1.000:0.922 0/1/1/1:4:18,49:0.66:-0.86:1.000:0.895 0/0/1/1:4:63,84:0.53: 0.73:1.000:0.991 0/1/1/1:4:10,66:0.80:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,137:0.55: 2.36:1.000:0.975 0/1/1/1:4:17,39:0.64:-1.08:1.000:0.635 0/0/1/1:4:92,74:0.42: 1.11:1.000:0.907 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,60:0.66:-0.56:1.000:0.896 0/0/1/1:4:63,54:0.43: 0.14:1.000:0.954 0/0/0/1:4:64,35:0.33:-0.22:1.000:0.915 0/0/1/1:4:71,51:0.39: 0.24:1.000:0.716 0/0/1/1/1/1:6:12,31:0.66:-1.33:1.000:0.910 0/0/1/1:4:22,42:0.60:-0.92:1.000:0.770 0/0/1/1:4:29,55:0.60:-0.52:1.000:0.781 0/0/1/1:4:58,47:0.42:-0.10:1.000:0.915 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,49:0.65:-0.82:1.000:0.763 0/0/0/1:4:42,24:0.34:-0.88:1.000:0.863 0/1/1/1:4:15,110:0.82: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,30:0.36:-0.62:0.578:0.732 0/0/1/1:4:30,46:0.56:-0.68:1.000:0.967 0/0/1/1:4:66,82:0.52: 0.75:1.000:0.995 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,70:0.64:-0.20:1.000:0.671 0/1/1/1:4:13,60:0.74:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,101:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,122:0.89: 0.44:1.000:0.630 0/0/1/1:4:74,107:0.55: 1.41:1.000:0.981 0/1/1/1:4:15,115:0.83: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,76:0.56: 0.30:0.727:0.963 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,94:0.55: 0.99:1.000:0.984 0/0/1/1:4:32,46:0.55:-0.64:1.000:0.982 0/1/1/1:4:17,86:0.75:-0.14:0.825:0.999 0/1/1/1:4:15,79:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,34:0.33:-0.26:1.000:0.926 0/1/1/1:4:13,85:0.80:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,41:0.60:-0.94:1.000:0.809 0/1/1/1:4:14,89:0.79:-0.14:1.000:1.000 0/1/1:3:14,37:0.66:-1.17:0.993:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,46:0.60:-0.80:1.000:0.763 0/0/0/1:4:69,37:0.33:-0.08:1.000:0.932 0/1/1/1:4:20,92:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,85:0.80:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:7,124:0.92: 0.42:1.000:0.987 0/0/1/1:4:24,29:0.51:-1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,87:0.73:-0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,41:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,70:0.74:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,109:0.57: 1.29:1.000:0.933 0/0/1/1:4:45,52:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,135:0.72: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,23:0.26:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,37:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,77:0.86:-0.50:1.000:0.975 0/0/0/1:4:87,57:0.37: 0.67:1.000:0.546 0/0/1/1:4:87,136:0.56: 2.25:1.000:0.960 1/1/1/1:4:9,180:0.93: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,65:0.54: 0.02:1.000:0.985 0/1/1/1:4:22,70:0.69:-0.36:1.000:0.972 0/1/1/1:4:32,78:0.65: 0.00:0.999:0.754 0/0/1/1:4:58,45:0.41:-0.14:1.000:0.864 0/0/1/1:4:56,91:0.57: 0.73:1.000:0.942 0/0/1/1:4:72,53:0.40: 0.30:1.000:0.772 0/0/0/1:4:60,33:0.33:-0.34:1.000:0.909 0/0/1/1:4:61,74:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,27:0.32:-0.60:1.000:0.962 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,87:0.73:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,93:0.80:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,121:0.49: 2.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,77:0.55: 0.40:1.000:0.980 0/0/1/1:4:58,40:0.38:-0.24:1.000:0.607 0/1/1/1:4:18,73:0.72:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,35:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,35:0.38:-0.48:1.000:0.593 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,89:0.54: 0.83:1.000:0.985 0/0/1/1:4:38,51:0.53:-0.42:1.000:0.991 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,94:0.83:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,149:0.61: 2.27:1.000:0.694 0/1/1/1:4:33,164:0.75: 1.73:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,36:0.40:-0.50:1.000:0.768 0/0/0/1:4:57,36:0.36:-0.34:1.000:0.652 0/0/1/1:4:59,41:0.38:-0.20:1.000:0.629 0/0/1/1:4:51,74:0.55: 0.30:1.000:0.981 0/1/1/1:4:10,36:0.71:-1.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:35,49:0.54:-0.52:1.000:0.986 0/0/0/1:4:36,21:0.35:-1.06:1.000:0.830 0/0/1/1:4:107,105:0.47: 2.03:1.000:0.990 0/1/1/1:4:27,132:0.75: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,69:0.37: 1.27:1.000:0.537 0/0/1/1:4:84,125:0.55: 1.97:1.000:0.975 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,49:0.42: 0.00:1.000:0.906 0/0/1/1:4:95,137:0.55: 2.42:1.000:0.982 0/0/1/1:4:33,62:0.60:-0.30:1.000:0.796 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,42:0.37:-0.08:1.000:0.541 0/0/0/1:4:146,60:0.27: 1.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,175:0.89: 1.57:1.000:0.554 0/1/1/1:4:29,124:0.73: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,97:0.73: 0.18:0.998:0.998 0/1/1/1:4:18,102:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,49:0.66:-0.84:1.000:0.838 0/1/1/1:4:14,80:0.77:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,101:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,166:0.56: 3.22:1.000:0.959 0/0/1/1:4:41,62:0.56:-0.14:1.000:0.971 0/0/0/1:4:65,41:0.36:-0.08:1.000:0.655 0/0/0/1:4:84,53:0.36: 0.54:0.999:0.654 0/1/1/1:4:24,109:0.74: 0.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,99:0.71: 0.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:56,77:0.54: 0.46:1.000:0.988 0/0/0/1:4:71,47:0.37: 0.16:1.000:0.515 0/0/1/1:4:37,48:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,43:0.60:-0.88:1.000:0.804 0/1/1/1:4:8,89:0.88:-0.26:1.000:0.851 0/0/1/1:4:54,51:0.46:-0.10:1.000:0.985 0/1/1/1:4:23,99:0.73: 0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,141:0.85: 0.91:1.000:0.981 0/1/1/1:4:23,52:0.63:-0.70:1.000:0.603 0/0/0/1:4:88,48:0.33: 0.52:1.000:0.917 0/0/1/1:4:79,106:0.53: 1.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,64:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:104,62:0.35: 1.11:1.000:0.790 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,65:0.42: 0.69:1.000:0.917 -chr2.1 72855319 chr2.1_072855319 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:3,3:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,5:.: 1.01:1.000:. ./.:4:4,6:.: 2.75:1.000:. ./.:4:6,2:.: 1.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,5:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,4:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:0.998:. ./.:4:5,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,2:.: 3.61:1.000:. ./.:4:10,1:.: 3.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,4:.: 2.75:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,4:.: 2.75:1.000:. ./.:4:4,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:5,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.29:1.000:. ./.:6:3,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:0.578:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:3,3:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,5:.: 1.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:0.727:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.58:1.000:. ./.:3:0,1:.:-1.15:0.993:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,3:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:4,4:.: 1.88:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,3:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,6:.: 2.31:1.000:. ./.:4:1,6:.: 1.45:0.999:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,5:.: 2.31:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:4,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,3:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,5:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:3,3:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:2,4:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,4:.: 1.01:0.998:. ./.:4:0,4:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:4,4:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.58:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,7:.: 2.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,5:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.72:1.000:. -chr2.1 73079552 chr2.1_073079552 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:291,89:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,134:0.52:-1.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,242:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:105,269:0.72: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,217:0.55: 0.86:1.000:0.977 0/0/0/0:4:392,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,185:0.76:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,169:0.47: 0.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:98,297:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,104:0.76:-3.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,91:0.46:-2.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:252,84:0.25:-0.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,294:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:363,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,95:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:291,82:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,175:0.50: 0.27:0.998:0.997 0/1/1/1:4:89,269:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,261:0.56: 1.99:1.000:0.971 0/0/1/1:4:237,206:0.47: 1.56:1.000:0.992 0/1/1/1:4:27,95:0.78:-3.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,160:0.48:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:307,95:0.24: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,77:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,31:0.29:-3.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:98,290:0.75: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,176:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:197,183:0.49: 0.62:1.000:0.996 1/1/1/1:4:3,350:0.99: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,300:0.76: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,187:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:248,81:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,53:0.55:-3.57:1.000:0.984 0/0/0/1:4:124,36:0.22:-2.64:1.000:1.000 0/1/1:3:9,26:0.74:-4.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,155:0.47:-0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:167,170:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,269:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,208:0.52: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:192,192:0.51: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:281,96:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:224,171:0.44: 0.85:1.000:0.963 0/1/1/1:4:104,333:0.76: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,184:0.53: 0.18:1.000:0.992 0/1/1/1:4:90,311:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,251:0.73: 0.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,273:0.72: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:261,208:0.45: 1.95:1.000:0.978 0/0/0/1:4:230,81:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:301,101:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,87:0.26:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:335,96:0.22: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,77:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,284:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,234:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,89:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,162:0.54:-0.55:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,395:1.00: 0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,362:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:227,61:0.21:-0.74:1.000:0.868 0/0/0/1:4:221,83:0.27:-0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,262:0.73: 0.30:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,377:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,245:0.77:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,260:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:266,94:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,111:0.47:-1.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:298,91:0.23: 0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,384:1.00: 0.70:0.578:1.000 0/0/0/1:4:247,76:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,215:0.53: 1.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:166,60:0.27:-1.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:99,262:0.72: 0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:119,262:0.69: 0.64:1.000:0.970 0/0/1/1:4:171,198:0.54: 0.46:1.000:0.987 0/0/1/1:4:168,169:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,173:0.54:-0.25:1.000:0.985 0/0/1/1:4:210,201:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,178:0.48: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,198:0.52: 0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:215,74:0.26:-0.73:0.727:0.999 0/0/1/1:4:205,182:0.48: 0.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:201,180:0.48: 0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:176,172:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:167,170:0.51:-0.02:0.825:0.996 0/0/1/1:4:207,170:0.46: 0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:145,125:0.47:-1.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:81,241:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,79:0.26:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:229,89:0.28:-0.30:1.000:0.995 0/1/1:3:73,152:0.68:-1.68:0.993:1.000 0/0/1/1:4:160,164:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,192:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,132:0.52:-1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,190:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,95:0.26: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:239,66:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,95:0.27: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:167,151:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:175,179:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,131:0.48:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,196:0.53: 0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:128,142:0.53:-1.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:180,167:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,230:0.73:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:240,89:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:319,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,173:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,233:0.49: 2.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:262,81:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,291:0.76: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:325,115:0.26: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,193:0.53: 0.49:0.999:0.994 0/1/1/1:4:88,270:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,202:0.76:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,87:0.22: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,135:0.51:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:170,128:0.43:-0.59:1.000:0.956 0/1/1/1:4:66,251:0.79:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,141:0.48:-0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:167,170:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:202,181:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:284,104:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:97,285:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,178:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,186:0.52: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,167:0.46: 0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:175,161:0.48:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,198:0.76:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,166:0.56:-0.61:1.000:0.962 0/1/1/1:4:89,216:0.71:-0.49:1.000:0.991 0/0/0/1:4:258,87:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,176:0.76:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:349,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,158:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:320,105:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,165:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,213:0.69:-0.46:1.000:0.979 0/1/1/1:4:83,224:0.73:-0.46:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,353:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,167:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,184:0.53: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:156,160:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,135:0.46:-0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:285,101:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:263,215:0.45: 2.08:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,330:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,223:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,307:0.74: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:157,153:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:102,295:0.74: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,262:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,31:0.24:-3.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,203:0.80:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,278:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,189:0.53: 0.28:1.000:0.990 0/0/0/1:4:280,119:0.30: 0.91:1.000:0.986 0/0/1/1:4:188,199:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,128:0.49:-1.08:0.998:0.996 0/0/1/1:4:200,193:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,159:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,206:0.74:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,188:0.54: 0.16:1.000:0.985 0/0/1/1:4:185,166:0.48: 0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:84,273:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,173:0.54:-0.25:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,301:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,245:0.72: 0.04:0.999:0.995 0/0/1/1:4:194,178:0.48: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,69:0.24:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,218:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,186:0.72:-1.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:275,82:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,75:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,161:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,141:0.48:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:213,197:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:301,86:0.22: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,191:0.52: 0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:145,204:0.59: 0.16:1.000:0.876 0/0/1/1:4:178,192:0.52: 0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:221,211:0.49: 1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:203,205:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,138:0.51:-0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:194,183:0.49: 0.58:1.000:0.996 -chr2.1 73425434 chr2.1_073425434 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,10:0.28: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,14:0.32: 0.81:1.000:0.947 0/0/1/1:4:20,18:0.52:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:19,31:0.59: 0.64:1.000:0.887 0/0/1/1:4:15,22:0.57:-0.09:1.000:0.932 0/0/0/1:4:16,4:0.25:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,13:0.34: 0.42:1.000:0.846 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.51:-1.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,3:0.21:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,7:0.13: 1.55:1.000:0.930 0/0/1/1:4:28,20:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,10:0.41:-0.55:1.000:0.885 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.52:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,12:0.34: 0.25:0.998:0.873 0/0/0/0:4:69,5:0.08: 2.00:1.000:0.976 0/0/1/1:4:22,31:0.57: 0.81:1.000:0.945 0/0/1/1:4:14,14:0.53:-0.60:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,10:0.22: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,14:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,15:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,10:0.37:-0.32:1.000:0.608 0/0/0/1:4:21,8:0.34:-0.55:1.000:0.894 0/0/1/1:4:22,20:0.52: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:36,16:0.37: 0.76:1.000:0.539 0/0/1/1:4:18,15:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,8:0.16: 1.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:11,8:0.50:-1.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.48:-1.90:1.000:0.994 0/0/0:3:3,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,11:0.36:-0.09:1.000:0.688 0/0/0/1:4:33,13:0.34: 0.42:1.000:0.846 0/0/0/1:4:46,11:0.24: 1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,11:0.25: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,16:0.39: 0.64:1.000:0.642 0/0/1/1:4:21,16:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,13:0.25: 1.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,9:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,10:0.29: 0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,9:0.21: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,14:0.29: 1.15:1.000:0.991 0/0/0/0:4:31,1:0.04:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,24:0.60:-0.09:1.000:0.805 0/0/1/1:4:11,9:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:57,5:0.10: 1.32:1.000:0.783 0/0/1/1:4:20,13:0.47:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:13,10:0.51:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,17:0.37: 0.93:1.000:0.518 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,12:0.42:-0.26:1.000:0.925 0/0/1/1:4:20,14:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,5:0.15: 0.19:1.000:0.986 0/0/0/1:4:43,19:0.37: 1.32:1.000:0.558 0/0/0/0/1/1:6:20,7:0.32:-0.66:1.000:0.913 0/0/0/1:4:41,7:0.18: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,15:0.39: 0.42:1.000:0.720 0/0/0/1:4:43,11:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,12:0.36: 0.08:1.000:0.651 0/0/1/1:4:37,17:0.38: 0.87:1.000:0.568 0/0/0/1:4:41,13:0.30: 0.87:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,9:0.52:-1.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,20:0.52: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:37,11:0.28: 0.53:0.578:0.995 0/0/0/0:4:58,5:0.10: 1.38:1.000:0.818 0/0/1/1:4:16,16:0.53:-0.38:1.000:0.991 0/0/0/1:4:11,3:0.27:-1.40:1.000:0.998 0/0/0/0:4:75,5:0.08: 2.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,16:0.39: 0.64:1.000:0.642 0/0/0/0:4:114,6:0.06: 4.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,4:0.09: 0.87:1.000:0.921 0/0/0/1:4:46,12:0.26: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,12:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,12:0.48:-0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:46,6:0.14: 0.76:1.000:0.978 0/0/0/1:4:28,8:0.28:-0.15:0.727:0.997 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.45:-1.00:1.000:0.984 0/0/0/1:4:66,11:0.18: 2.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,3:0.08: 0.47:0.825:0.989 0/0/0/1:4:44,8:0.19: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,9:0.42:-0.72:1.000:0.893 0/0/0/1:4:46,5:0.12: 0.70:1.000:0.812 0/0/0/1:4:15,6:0.35:-1.00:1.000:0.819 0/0/0/1:4:45,10:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/1:3:19,3:0.17:-0.94:0.993:0.965 0/0/1/1:4:38,21:0.43: 1.15:1.000:0.936 0/0/1/1:4:39,19:0.39: 1.10:1.000:0.737 0/0/0/1:4:34,8:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,18:0.43: 0.64:1.000:0.949 0/0/0/1:4:44,9:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,16:0.56:-0.55:1.000:0.972 0/0/0/1:4:46,7:0.17: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:53,7:0.15: 1.21:1.000:0.982 0/0/0/1:4:44,10:0.23: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,3:0.14:-0.66:1.000:0.963 0/0/1/1:4:18,13:0.50:-0.43:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,20:0.57:-0.26:1.000:0.941 0/0/0/1:4:30,5:0.18:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,7:0.53:-1.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:13,8:0.45:-1.00:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,10:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:41,11:0.26: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,24:0.41: 1.77:1.000:0.873 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.00:0.999:1.000 0/0/0/1:4:41,16:0.34: 1.04:1.000:0.861 0/0/0/1:4:26,4:0.17:-0.49:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,17:0.57:-0.55:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,11:0.45:-0.55:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,8:0.21: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,21:0.50: 0.64:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,16:0.42: 0.42:1.000:0.902 0/0/0/1:4:48,6:0.14: 0.87:1.000:0.963 0/0/1/1:4:10,10:0.53:-1.06:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,16:0.55:-0.49:1.000:0.981 0/0/0/1:4:18,5:0.27:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,8:0.39:-0.77:1.000:0.642 0/0/0/1:4:14,5:0.32:-1.11:1.000:0.950 0/0/1/1:4:11,16:0.57:-0.66:1.000:0.935 0/0/1/1:4:19,12:0.46:-0.43:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,9:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,19:0.43: 0.81:1.000:0.945 0/0/0/1:4:39,16:0.35: 0.93:1.000:0.766 0/0/1/1:4:20,16:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,10:0.19: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,6:0.27:-0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,13:0.41:-0.04:1.000:0.868 0/0/1/1:4:20,14:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,21:0.38: 1.60:1.000:0.547 0/0/1/1:4:25,18:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,20:0.44: 0.87:1.000:0.971 0/0/0/1:4:32,12:0.33: 0.30:1.000:0.911 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,13:0.44:-0.21:1.000:0.973 0/0/0/1:4:41,8:0.20: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.61:-2.02:1.000:0.734 0/0/1/1:4:20,12:0.45:-0.38:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,11:0.22: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,18:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,9:0.31:-0.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:28,13:0.38: 0.13:0.998:0.600 0/0/0/1:4:41,10:0.25: 0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,9:0.19: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,8:0.19: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,15:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,15:0.44: 0.13:1.000:0.963 0/0/1/1:4:18,16:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/0:4:63,1:0.02: 1.43:0.999:1.000 0/0/0/1:4:33,14:0.36: 0.47:1.000:0.680 0/0/0/1:4:31,4:0.14:-0.21:1.000:0.975 0/0/1/1:4:22,16:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,13:0.47:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,21:0.47: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,17:0.45: 0.36:1.000:0.981 0/0/1/1:4:12,15:0.56:-0.66:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.53:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,22:0.58:-0.15:1.000:0.905 0/0/0/1:4:35,12:0.31: 0.47:1.000:0.969 0/0/1/1:4:17,12:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,15:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/0/0/1:4:50,17:0.31: 1.60:1.000:0.972 0/0/1/1:4:28,16:0.44: 0.30:1.000:0.958 0/0/0/1:4:23,9:0.34:-0.38:1.000:0.857 0/0/0/1:4:42,8:0.20: 0.64:1.000:1.000 -chr2.1 73482886 chr2.1_073482886 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:374,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:415,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:0.998:. ./.:4:136,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.57:1.000:. ./.:3:14,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:462,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.01:1.000:. ./.:6:188,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.30:0.578:. ./.:4:202,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:177,0:.:-0.41:0.727:. ./.:4:333,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.14:0.825:. ./.:4:280,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:208,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:448,0:.: 2.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:222,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:351,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:430,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:476,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.38:0.998:. ./.:4:256,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:216,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.27:0.999:. ./.:4:226,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. -chr2.1 73570461 chr2.1_073570461 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:104,32:.: 0.83:1.000:. ./.:4:78,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,15:.:-0.73:1.000:. ./.:4:70,21:.:-0.36:1.000:. ./.:4:85,47:.: 0.73:1.000:. ./.:4:47,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.73:1.000:. ./.:4:50,33:.:-0.57:1.000:. ./.:4:73,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.40:1.000:. ./.:4:21,3:.:-2.13:1.000:. ./.:4:58,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:67,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:62,50:.: 0.20:1.000:. ./.:4:56,34:.:-0.39:1.000:. ./.:4:43,28:.:-0.89:1.000:. ./.:4:101,25:.: 0.57:0.998:. ./.:4:60,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.01:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.91:1.000:. ./.:4:6,2:.:-2.55:1.000:. ./.:4:74,26:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,31:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,6:.:-2.55:1.000:. ./.:4:111,21:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,27:.:-0.99:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.83:1.000:. ./.:4:90,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:46,19:.:-1.05:1.000:. ./.:4:36,32:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,52:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:19,12:.:-1.95:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:71,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:80,17:.:-0.20:1.000:. ./.:4:65,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:150,37:.: 2.18:1.000:. ./.:4:105,30:.: 0.81:1.000:. ./.:4:118,65:.: 2.08:1.000:. ./.:4:47,32:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.83:1.000:. ./.:4:96,26:.: 0.46:1.000:. ./.:4:108,22:.: 0.67:1.000:. ./.:4:131,20:.: 1.23:1.000:. ./.:4:82,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.58:1.000:. ./.:4:72,32:.:-0.01:1.000:. ./.:4:48,17:.:-1.05:1.000:. ./.:4:50,44:.:-0.28:1.000:. ./.:4:89,47:.: 0.83:1.000:. ./.:4:54,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,30:.: 2.21:1.000:. ./.:4:101,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:69,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:57,20:.:-0.73:1.000:. ./.:4:111,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:122,11:.: 0.75:1.000:. ./.:6:84,48:.: 0.73:1.000:. ./.:4:95,38:.: 0.75:1.000:. ./.:4:88,17:.: 0.01:1.000:. ./.:4:136,9:.: 1.07:1.000:. ./.:4:114,12:.: 0.57:1.000:. ./.:4:114,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:102,46:.: 1.15:1.000:. ./.:4:54,23:.:-0.73:1.000:. ./.:4:122,35:.: 1.39:1.000:. ./.:4:118,16:.: 0.78:0.578:. ./.:4:76,31:.: 0.06:1.000:. ./.:4:133,38:.: 1.76:1.000:. ./.:4:68,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,10:.: 1.36:1.000:. ./.:4:83,28:.: 0.17:1.000:. ./.:4:99,22:.: 0.44:1.000:. ./.:4:83,22:.: 0.01:1.000:. ./.:4:91,13:.:-0.01:1.000:. ./.:4:99,35:.: 0.78:1.000:. ./.:4:32,26:.:-1.23:1.000:. ./.:4:49,52:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,29:.:-0.36:0.727:. ./.:4:107,29:.: 0.83:1.000:. ./.:4:147,48:.: 2.39:1.000:. ./.:4:53,19:.:-0.86:1.000:. ./.:4:120,35:.: 1.33:0.825:. ./.:4:92,70:.: 1.52:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.70:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.68:1.000:. ./.:4:57,43:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,31:.:-0.20:1.000:. ./.:3:24,22:.:-1.55:0.993:. ./.:4:116,21:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,51:.: 0.36:1.000:. ./.:4:64,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:129,72:.: 2.55:1.000:. ./.:4:79,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:63,59:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,33:.: 0.54:1.000:. ./.:4:122,44:.: 1.63:1.000:. ./.:4:99,16:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:47,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:87,44:.: 0.70:1.000:. ./.:4:78,73:.: 1.23:1.000:. ./.:4:68,39:.: 0.06:1.000:. ./.:4:59,29:.:-0.44:1.000:. ./.:4:62,52:.: 0.25:1.000:. ./.:4:62,29:.:-0.36:1.000:. ./.:4:100,63:.: 1.55:1.000:. ./.:4:42,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:94,36:.: 0.67:1.000:. ./.:4:105,46:.: 1.23:1.000:. ./.:4:132,64:.: 2.42:0.999:. ./.:4:144,23:.: 1.65:1.000:. ./.:4:85,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:133,50:.: 2.08:1.000:. ./.:4:54,22:.:-0.76:1.000:. ./.:4:86,21:.: 0.06:1.000:. ./.:4:133,23:.: 1.36:1.000:. ./.:4:92,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:80,34:.: 0.25:1.000:. ./.:4:86,22:.: 0.09:1.000:. ./.:4:81,54:.: 0.81:1.000:. ./.:4:72,28:.:-0.12:1.000:. ./.:4:105,41:.: 1.10:1.000:. ./.:4:103,39:.: 0.99:1.000:. ./.:4:31,29:.:-1.18:1.000:. ./.:4:97,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,24:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,21:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:79,38:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,4:.:-1.18:1.000:. ./.:4:53,47:.:-0.12:1.000:. ./.:4:69,29:.:-0.17:1.000:. ./.:4:97,30:.: 0.59:1.000:. ./.:4:104,23:.: 0.59:1.000:. ./.:4:138,30:.: 1.68:1.000:. ./.:4:68,27:.:-0.25:1.000:. ./.:4:105,18:.: 0.49:1.000:. ./.:4:83,30:.: 0.22:1.000:. ./.:4:88,28:.: 0.30:1.000:. ./.:4:107,31:.: 0.88:1.000:. ./.:4:95,32:.: 0.59:1.000:. ./.:4:78,32:.: 0.14:1.000:. ./.:4:90,38:.: 0.62:1.000:. ./.:4:91,4:.:-0.25:1.000:. ./.:4:89,24:.: 0.22:1.000:. ./.:4:81,4:.:-0.52:1.000:. ./.:4:66,42:.: 0.09:1.000:. ./.:4:76,30:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,8:.:-1.71:1.000:. ./.:4:7,8:.:-2.37:1.000:. ./.:4:34,12:.:-1.55:1.000:. ./.:4:141,21:.: 1.52:1.000:. ./.:4:62,42:.:-0.01:1.000:. ./.:4:78,39:.: 0.33:1.000:. ./.:4:79,5:.:-0.54:1.000:. ./.:4:68,37:.: 0.01:0.998:. ./.:4:70,28:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,11:.:-0.44:1.000:. ./.:4:60,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:86,40:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,26:.:-1.23:1.000:. ./.:4:46,8:.:-1.34:1.000:. ./.:4:46,23:.:-0.94:1.000:. ./.:4:74,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:90,5:.:-0.25:0.999:. ./.:4:75,36:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,30:.:-0.83:1.000:. ./.:4:64,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:70,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:84,28:.: 0.20:1.000:. ./.:4:81,29:.: 0.14:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,35:.:-0.17:1.000:. ./.:4:83,36:.: 0.38:1.000:. ./.:4:78,53:.: 0.70:1.000:. ./.:4:77,19:.:-0.23:1.000:. ./.:4:96,25:.: 0.44:1.000:. ./.:4:30,32:.:-1.13:1.000:. ./.:4:68,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:80,27:.: 0.06:1.000:. ./.:4:53,11:.:-1.07:1.000:. ./.:4:98,21:.: 0.38:1.000:. -chr2.1 73847072 chr2.1_073847072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:120,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.77:0.998:. ./.:4:157,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.08:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.85:1.000:. ./.:6:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.39:0.578:. ./.:4:151,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:0.727:. ./.:4:86,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.14:0.825:. ./.:4:155,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.07:1.000:. ./.:3:40,0:.:-1.22:0.993:. ./.:4:77,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:153,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.30:0.998:. ./.:4:127,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:160,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.95:1.000:. -chr2.1 73931457 chr2.1_073931457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:140,49:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,42:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,84:0.45: 0.50:1.000:0.977 0/0/1/1:4:95,95:0.48: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:169,46:0.21: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,101:0.46: 1.27:1.000:0.986 0/0/1/1:4:46,38:0.44:-1.86:1.000:0.964 0/0/1/1:4:78,100:0.54: 0.40:1.000:0.987 0/0/0/1:4:99,33:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,26:0.36:-2.19:1.000:0.697 0/0/0/1:4:55,14:0.20:-2.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,72:0.51:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:133,43:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,79:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:136,59:0.29: 0.81:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,96:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,53:0.25: 0.98:0.998:0.999 0/0/1/1:4:81,101:0.53: 0.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,105:0.52: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,94:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,11:0.29:-2.99:1.000:0.993 0/0/0/1:4:145,45:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,86:0.46: 0.52:1.000:0.984 0/0/0/1:4:80,35:0.29:-1.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,15:0.39:-2.99:1.000:0.717 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,129:0.50: 2.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,109:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:151,48:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,98:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,134:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,132:0.70: 0.38:1.000:0.988 0/0/0/1:4:33,13:0.27:-2.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,18:0.29:-2.43:1.000:0.992 0/0/1:3:20,14:0.40:-3.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,44:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,53:0.29: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,78:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,53:0.28: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,53:0.28: 0.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,125:0.70: 0.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:118,43:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,86:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,95:0.48: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,190:0.53: 4.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:72,81:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,78:0.53:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:71,74:0.49:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,96:0.49: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,82:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,46:0.28:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,83:0.49: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,72:0.51:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,50:0.27: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:130,40:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:84,29:0.25:-1.16:1.000:0.550 0/0/0/1:4:154,52:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,51:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,51:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,33:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:170,48:0.21: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,40:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,36:0.43:-1.93:1.000:0.948 0/0/0/1:4:138,45:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,31:0.18: 0.04:0.578:0.999 0/0/0/1:4:119,53:0.30: 0.26:1.000:0.987 0/0/0/1:4:131,37:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-2.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,61:0.29: 1.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:113,49:0.29: 0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:124,36:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,43:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,50:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,125:0.71: 0.12:1.000:0.992 0/1/1/1:4:46,140:0.71: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,69:0.50:-0.68:0.727:0.997 0/0/0/1:4:101,46:0.30:-0.34:1.000:0.983 0/0/0/1:4:149,55:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,86:0.47: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:89,43:0.31:-0.70:0.825:0.965 0/0/0/1:4:114,40:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,52:0.53:-1.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:68,81:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,65:0.48:-0.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,90:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1:3:35,73:0.64:-1.28:0.993:1.000 0/0/0/1:4:101,43:0.29:-0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,123:0.54: 1.44:1.000:0.990 0/0/0/1:4:111,33:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,43:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,71:0.43:-0.05:1.000:0.952 0/0/1/1:4:50,70:0.56:-0.99:1.000:0.967 0/0/0/1:4:100,32:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,44:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:89,87:0.48: 0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:50,18:0.26:-2.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,131:0.71: 0.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:92,26:0.21:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,83:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,67:0.53:-0.94:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,85:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,78:0.46: 0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:95,101:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,48:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,146:0.72: 0.74:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,33:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,61:0.26: 1.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,55:0.30: 0.45:0.999:0.989 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,48:0.32:-0.41:1.000:0.948 0/0/0/1:4:121,63:0.33: 0.55:1.000:0.917 0/0/1/1:4:48,46:0.47:-1.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:115,39:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,35:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,40:0.28:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,88:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,39:0.28:-0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,98:0.49: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,41:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,34:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,42:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,113:0.73:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,38:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,25:0.25:-1.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,27:0.28:-1.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,75:0.42: 0.31:1.000:0.903 0/0/0/1:4:132,66:0.32: 0.88:1.000:0.948 0/0/0/1:4:79,30:0.27:-1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,102:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,96:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,45:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,57:0.28: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,88:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,36:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,48:0.31:-0.27:1.000:0.975 0/0/1/1:4:61,81:0.55:-0.46:1.000:0.981 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,33:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,93:0.47: 0.74:1.000:0.992 0/0/0/1:4:140,61:0.29: 0.96:1.000:0.990 0/0/0/1:4:118,43:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,42:0.25: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,63:0.30: 0.96:1.000:0.983 0/0/1/1:4:88,87:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:149,56:0.26: 1.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,140:0.70: 0.64:1.000:0.988 0/1/1/1:4:12,48:0.75:-2.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,74:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,100:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,38:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,23:0.16:-0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:106,57:0.34: 0.04:0.998:0.881 0/0/0/1:4:130,49:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:110,34:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,41:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,43:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,148:0.68: 1.10:1.000:0.944 0/0/1/1:4:142,126:0.46: 2.57:1.000:0.985 0/0/1/1:4:87,94:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,20:0.16:-1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,33:0.25:-0.87:0.999:0.999 0/0/0/1:4:143,51:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,78:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:124,40:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,47:0.30:-0.22:1.000:0.986 0/0/0/1:4:123,43:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,63:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,82:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:151,49:0.24: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,89:0.55:-0.15:1.000:0.978 0/0/0/1:4:129,33:0.20: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,8:0.06:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,123:0.70: 0.14:1.000:0.981 0/0/1/1:4:89,115:0.54: 1.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:140,42:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,31:0.25:-0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,41:0.21: 0.69:1.000:1.000 -chr2.1 74381285 chr2.1_074381285 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:98,271:0.71: 1.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:153,129:0.43: 0.31:1.000:0.947 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:261,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,120:0.25: 2.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,171:0.52: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,140:0.62:-0.55:1.000:0.561 0/0/1/1:4:77,141:0.63:-0.55:1.000:0.501 0/0/0/1:4:42,24:0.33:-2.61:1.000:0.932 0/0/0/1:4:54,36:0.37:-2.29:1.000:0.602 0/0/0/1:4:202,65:0.21: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,98:0.40:-0.42:1.000:0.789 0/0/1/1:4:164,164:0.48: 0.94:1.000:0.994 0/1/1/1:4:72,245:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,152:0.42: 1.06:1.000:0.925 0/0/0/1:4:178,71:0.24:-0.13:0.998:1.000 0/0/0/1:4:175,72:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,113:0.34: 0.61:1.000:0.893 0/0/0/1:4:156,87:0.32:-0.22:1.000:0.951 0/1/1/1:4:23,55:0.68:-2.45:1.000:0.962 0/0/0/0:4:336,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,97:0.29: 0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:137,151:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,19:0.22:-2.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,102:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,171:0.65:-0.04:1.000:0.757 0/0/0/1:4:160,70:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,91:0.29: 0.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:133,88:0.37:-0.51:1.000:0.627 0/0/0/1:4:162,64:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,149:0.73:-0.82:1.000:0.998 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-3.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,27:0.21:-2.03:1.000:1.000 0/0/0:3:33,1:0.03:-3.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,88:0.31:-0.09:1.000:0.971 0/0/0/1:4:168,84:0.29:-0.09:1.000:0.990 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,154:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/0:4:299,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,143:0.44: 0.68:1.000:0.960 0/1/1/1:4:89,180:0.65: 0.14:1.000:0.769 0/0/1/1:4:183,180:0.47: 1.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:205,58:0.19: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,156:0.64:-0.31:1.000:0.681 0/0/0/1:4:274,81:0.19: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:301,2:0.01: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:405,0:0.00: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,77:0.29:-0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:145,135:0.46: 0.29:1.000:0.986 0/0/0/1:4:187,62:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,203:0.52: 1.55:1.000:0.994 0/0/0/1:4:154,61:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,81:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,158:0.68:-0.46:1.000:0.955 0/0/0/1:4:138,67:0.29:-0.73:1.000:0.993 0/0/0/1:4:144,64:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:154,74:0.28:-0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:149,66:0.26:-0.59:1.000:0.998 0/0/0/1/1/1:6:129,146:0.51: 0.22:1.000:0.884 0/0/1/1:4:156,135:0.44: 0.43:1.000:0.962 0/0/0/1:4:118,63:0.31:-1.06:1.000:0.973 0/0/0/1:4:170,92:0.31: 0.04:1.000:0.968 0/0/0/1:4:144,80:0.32:-0.47:1.000:0.954 0/0/0/1:4:210,103:0.29: 0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:169,148:0.44: 0.79:1.000:0.968 0/0/1/1:4:75,60:0.42:-1.68:1.000:0.895 0/0/0/1:4:231,81:0.22: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,74:0.31:-0.61:0.578:0.977 0/0/1/1:4:157,150:0.46: 0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:261,79:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,54:0.23:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,162:0.40: 1.61:1.000:0.776 0/0/0/1:4:160,78:0.29:-0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:218,84:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:238,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,66:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,145:0.62:-0.43:1.000:0.605 0/0/0/1:4:162,86:0.31:-0.15:1.000:0.975 0/0/1/1:4:128,120:0.46:-0.15:0.727:0.987 0/1/1/1:4:90,186:0.65: 0.23:1.000:0.812 0/0/0/1:4:241,90:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:207,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 0.57:0.825:1.000 0/0/1/1:4:161,166:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,68:0.39:-1.31:1.000:0.677 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,53:0.25:-1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,70:0.22: 0.22:1.000:1.000 0/1/1:3:51,56:0.50:-2.06:0.993:0.535 0/0/0/1:4:130,66:0.30:-0.85:1.000:0.987 0/1/1/1:4:78,164:0.66:-0.23:1.000:0.842 0/0/1/1:4:117,123:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,141:0.43: 0.65:1.000:0.952 0/0/0/1:4:250,82:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,133:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,139:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:348,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:261,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,156:0.67:-0.43:1.000:0.900 0/1/1/1:4:54,177:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,130:0.45: 0.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:72,126:0.61:-0.82:1.000:0.635 0/0/0/1:4:150,63:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,148:0.51: 0.26:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,226:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,279:0.71: 1.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:170,135:0.41: 0.62:1.000:0.885 0/0/1/1:4:158,154:0.47: 0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:191,184:0.47: 1.57:1.000:0.991 0/1/1/1:4:83,200:0.68: 0.33:0.999:0.965 0/0/0/1:4:238,79:0.21: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,119:0.47:-0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,235:0.70: 0.91:1.000:0.984 0/0/0/1:4:133,62:0.28:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:194,68:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,129:0.65:-0.89:1.000:0.761 0/0/1/1:4:73,127:0.61:-0.80:1.000:0.652 0/0/0/1:4:155,68:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:72,150:0.65:-0.50:1.000:0.826 0/0/0/1:4:236,74:0.20: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,148:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,220:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:166,161:0.47: 0.92:1.000:0.992 0/0/0/1:4:162,75:0.28:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,188:0.70: 0.01:1.000:0.986 0/1/1/1:4:49,103:0.66:-1.45:1.000:0.841 0/1/1/1:4:62,125:0.65:-0.97:1.000:0.762 0/0/0/1:4:135,70:0.30:-0.73:1.000:0.982 0/0/1/1:4:134,153:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,51:0.30:-1.46:1.000:0.986 0/0/1/1:4:171,176:0.48: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,149:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:331,108:0.21: 2.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,173:0.66:-0.09:1.000:0.897 0/0/0/1:4:200,73:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,104:0.65:-1.41:1.000:0.786 0/0/0/1:4:140,75:0.31:-0.59:1.000:0.972 0/0/0/1:4:240,69:0.19: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:245,1:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,80:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,113:0.47:-0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:208,199:0.46: 2.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:212,209:0.47: 2.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:163,83:0.30:-0.17:1.000:0.986 0/0/1/1:4:164,140:0.43: 0.61:1.000:0.955 0/0/0/1:4:167,94:0.32: 0.03:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,195:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,200:0.47: 1.97:1.000:0.993 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,38:0.66:-2.75:1.000:0.848 0/1/1/1:4:53,99:0.63:-1.45:1.000:0.559 0/0/1/1:4:169,175:0.49: 1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:253,94:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,100:0.22: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,85:0.30:-0.12:1.000:0.984 0/0/1/1:4:132,125:0.46:-0.03:0.998:0.989 0/0/0/0:4:306,1:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,138:0.67:-0.81:1.000:0.928 0/0/0/1:4:144,64:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,92:0.33:-0.12:1.000:0.913 0/0/0/1:4:154,78:0.30:-0.36:1.000:0.987 0/1/1/1:4:79,166:0.66:-0.19:1.000:0.841 0/0/0/1:4:119,67:0.32:-0.99:1.000:0.944 0/0/0/1:4:219,91:0.25: 0.69:0.999:0.999 0/0/1/1:4:148,167:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,63:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,123:0.42: 0.23:1.000:0.902 0/0/0/1:4:195,61:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,162:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,168:0.53: 0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:144,66:0.27:-0.66:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,193:0.99:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,182:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,169:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,86:0.31:-0.20:1.000:0.965 0/0/1/1:4:147,134:0.45: 0.30:1.000:0.981 0/1/1/1:4:72,140:0.64:-0.64:1.000:0.674 0/0/0/0:4:296,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,209:0.53: 1.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:132,68:0.30:-0.80:1.000:0.984 0/0/1/1:4:174,181:0.49: 1.30:1.000:0.996 -chr2.1 74504073 chr2.1_074504073 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:381,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:451,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:299,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:183,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:538,0:.: 1.05:0.998:. ./.:4:417,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:680,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:207,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:100,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:470,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:614,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:94,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:196,0:.:-2.24:1.000:. ./.:3:48,0:.:-3.67:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:611,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:585,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:124,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:669,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:664,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:544,0:.: 1.11:1.000:. ./.:6:396,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:459,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:626,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:541,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.81:0.578:. ./.:4:403,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:718,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.58:0.727:. ./.:4:553,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:627,1:.: 1.91:0.825:. ./.:4:566,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.89:1.000:. ./.:3:270,0:.:-1.53:0.993:. ./.:4:459,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:611,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:535,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.16:0.999:. ./.:4:436,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:545,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:402,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:165,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:423,1:.:-0.05:0.998:. ./.:4:444,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:396,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:629,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:536,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:557,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.72:1.000:. -chr2.1 74664094 chr2.1_074664094 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:272,228:.:-0.10:1.000:. ./.:4:207,245:.:-0.48:1.000:. ./.:4:385,216:.: 0.69:1.000:. ./.:4:430,202:.: 0.94:1.000:. ./.:4:205,408:.: 0.79:1.000:. ./.:4:309,272:.: 0.54:1.000:. ./.:4:309,196:.:-0.07:1.000:. ./.:4:412,197:.: 0.76:1.000:. ./.:4:483,90:.: 0.47:1.000:. ./.:4:191,103:.:-1.73:1.000:. ./.:4:110,129:.:-2.17:1.000:. ./.:4:351,207:.: 0.35:1.000:. ./.:4:432,219:.: 1.09:1.000:. ./.:4:345,106:.:-0.49:1.000:. ./.:4:354,109:.:-0.40:1.000:. ./.:4:156,238:.:-0.94:1.000:. ./.:4:420,228:.: 1.06:0.998:. ./.:4:275,301:.: 0.50:1.000:. ./.:4:222,445:.: 1.22:1.000:. ./.:4:462,276:.: 1.78:1.000:. ./.:4:116,125:.:-2.15:1.000:. ./.:4:372,194:.: 0.42:1.000:. ./.:4:317,367:.: 1.35:1.000:. ./.:4:375,101:.:-0.29:1.000:. ./.:4:72,61:.:-3.01:1.000:. ./.:4:355,256:.: 0.77:1.000:. ./.:4:510,100:.: 0.76:1.000:. ./.:4:251,196:.:-0.52:1.000:. ./.:4:419,397:.: 2.39:1.000:. ./.:4:269,343:.: 0.78:1.000:. ./.:4:260,310:.: 0.45:1.000:. ./.:4:173,266:.:-0.59:1.000:. ./.:4:72,100:.:-2.70:1.000:. ./.:4:115,111:.:-2.27:1.000:. ./.:3:59,72:.:-3.02:1.000:. ./.:4:506,111:.: 0.82:1.000:. ./.:4:344,294:.: 0.99:1.000:. ./.:4:347,344:.: 1.40:1.000:. ./.:4:261,215:.:-0.29:1.000:. ./.:4:444,120:.: 0.40:1.000:. ./.:4:336,215:.: 0.30:1.000:. ./.:4:273,221:.:-0.15:1.000:. ./.:4:353,222:.: 0.49:1.000:. ./.:4:259,219:.:-0.28:1.000:. ./.:4:398,256:.: 1.11:1.000:. ./.:4:272,289:.: 0.38:1.000:. ./.:4:561,273:.: 2.54:1.000:. ./.:4:114,135:.:-2.09:1.000:. ./.:4:245,195:.:-0.58:1.000:. ./.:4:111,175:.:-1.80:1.000:. ./.:4:240,86:.:-1.48:1.000:. ./.:4:197,215:.:-0.80:1.000:. ./.:4:309,177:.:-0.22:1.000:. ./.:4:338,215:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,295:.:-0.50:1.000:. ./.:4:219,323:.: 0.23:1.000:. ./.:4:231,195:.:-0.69:1.000:. ./.:4:366,186:.: 0.31:1.000:. ./.:4:401,101:.:-0.09:1.000:. ./.:6:249,210:.:-0.43:1.000:. ./.:4:329,200:.: 0.12:1.000:. ./.:4:459,201:.: 1.16:1.000:. ./.:4:340,334:.: 1.27:1.000:. ./.:4:308,103:.:-0.81:1.000:. ./.:4:338,281:.: 0.84:1.000:. ./.:4:306,178:.:-0.23:1.000:. ./.:4:232,98:.:-1.45:1.000:. ./.:4:440,94:.: 0.16:1.000:. ./.:4:376,205:.: 0.54:0.578:. ./.:4:276,278:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,333:.: 0.01:1.000:. ./.:4:203,136:.:-1.38:1.000:. ./.:4:292,307:.: 0.68:1.000:. ./.:4:543,218:.: 1.96:1.000:. ./.:4:400,209:.: 0.76:1.000:. ./.:4:335,86:.:-0.73:1.000:. ./.:4:390,213:.: 0.71:1.000:. ./.:4:328,227:.: 0.33:1.000:. ./.:4:320,102:.:-0.72:1.000:. ./.:4:252,332:.: 0.56:1.000:. ./.:4:123,249:.:-1.12:0.727:. ./.:4:393,116:.:-0.03:1.000:. ./.:4:299,242:.: 0.22:1.000:. ./.:4:420,107:.: 0.11:1.000:. ./.:4:291,277:.: 0.43:0.825:. ./.:4:380,376:.: 1.92:1.000:. ./.:4:125,226:.:-1.28:1.000:. ./.:4:302,258:.: 0.37:1.000:. ./.:4:284,194:.:-0.28:1.000:. ./.:4:213,188:.:-0.89:1.000:. ./.:3:277,113:.:-0.97:0.993:. ./.:4:388,192:.: 0.53:1.000:. ./.:4:499,108:.: 0.74:1.000:. ./.:4:121,220:.:-1.36:1.000:. ./.:4:470,105:.: 0.49:1.000:. ./.:4:203,217:.:-0.74:1.000:. ./.:4:263,158:.:-0.73:1.000:. ./.:4:232,250:.:-0.25:1.000:. ./.:4:258,326:.: 0.56:1.000:. ./.:4:386,231:.: 0.82:1.000:. ./.:4:328,87:.:-0.78:1.000:. ./.:4:341,104:.:-0.54:1.000:. ./.:4:271,85:.:-1.24:1.000:. ./.:4:238,228:.:-0.37:1.000:. ./.:4:160,246:.:-0.85:1.000:. ./.:4:202,260:.:-0.41:1.000:. ./.:4:214,161:.:-1.09:1.000:. ./.:4:413,123:.: 0.18:1.000:. ./.:4:304,401:.: 1.52:1.000:. ./.:4:307,125:.:-0.64:1.000:. ./.:4:221,279:.:-0.10:1.000:. ./.:4:307,403:.: 1.56:1.000:. ./.:4:407,104:.:-0.02:0.999:. ./.:4:336,205:.: 0.22:1.000:. ./.:4:200,146:.:-1.32:1.000:. ./.:4:235,123:.:-1.23:1.000:. ./.:4:166,329:.:-0.14:1.000:. ./.:4:203,163:.:-1.16:1.000:. ./.:4:420,98:.: 0.04:1.000:. ./.:4:272,190:.:-0.41:1.000:. ./.:4:404,187:.: 0.61:1.000:. ./.:4:283,182:.:-0.38:1.000:. ./.:4:263,225:.:-0.20:1.000:. ./.:4:305,385:.: 1.40:1.000:. ./.:4:209,266:.:-0.30:1.000:. ./.:4:260,205:.:-0.38:1.000:. ./.:4:373,89:.:-0.41:1.000:. ./.:4:164,176:.:-1.37:1.000:. ./.:4:314,79:.:-0.95:1.000:. ./.:4:233,151:.:-1.02:1.000:. ./.:4:218,278:.:-0.14:1.000:. ./.:4:307,218:.: 0.09:1.000:. ./.:4:199,117:.:-1.56:1.000:. ./.:4:247,225:.:-0.33:1.000:. ./.:4:223,160:.:-1.03:1.000:. ./.:4:439,234:.: 1.26:1.000:. ./.:4:428,103:.: 0.14:1.000:. ./.:4:313,95:.:-0.83:1.000:. ./.:4:346,80:.:-0.69:1.000:. ./.:4:402,87:.:-0.19:1.000:. ./.:4:236,211:.:-0.52:1.000:. ./.:4:312,201:.: 0.00:1.000:. ./.:4:334,287:.: 0.85:1.000:. ./.:4:162,141:.:-1.66:1.000:. ./.:4:216,249:.:-0.38:1.000:. ./.:4:576,279:.: 2.70:1.000:. ./.:4:355,320:.: 1.28:1.000:. ./.:4:243,317:.: 0.37:1.000:. ./.:4:374,215:.: 0.60:1.000:. ./.:4:327,191:.: 0.04:1.000:. ./.:4:416,222:.: 0.99:1.000:. ./.:4:442,188:.: 0.92:1.000:. ./.:4:170,39:.:-2.40:1.000:. ./.:4:239,284:.: 0.08:1.000:. ./.:4:184,304:.:-0.20:1.000:. ./.:4:366,250:.: 0.81:1.000:. ./.:4:538,124:.: 1.18:1.000:. ./.:4:363,240:.: 0.71:1.000:. ./.:4:328,191:.: 0.05:0.998:. ./.:4:362,232:.: 0.64:1.000:. ./.:4:314,181:.:-0.14:1.000:. ./.:4:346,253:.: 0.68:1.000:. ./.:4:332,211:.: 0.24:1.000:. ./.:4:237,300:.: 0.19:1.000:. ./.:4:262,313:.: 0.49:1.000:. ./.:4:441,191:.: 0.94:1.000:. ./.:4:415,96:.:-0.02:1.000:. ./.:4:158,387:.: 0.25:0.999:. ./.:4:488,108:.: 0.65:1.000:. ./.:4:226,228:.:-0.47:1.000:. ./.:4:363,91:.:-0.47:1.000:. ./.:4:194,205:.:-0.90:1.000:. ./.:4:348,228:.: 0.50:1.000:. ./.:4:365,100:.:-0.38:1.000:. ./.:4:409,91:.:-0.10:1.000:. ./.:4:261,195:.:-0.45:1.000:. ./.:4:482,274:.: 1.92:1.000:. ./.:4:270,367:.: 0.98:1.000:. ./.:4:352,354:.: 1.52:1.000:. ./.:4:354,157:.:-0.02:1.000:. ./.:4:309,235:.: 0.24:1.000:. ./.:4:532,145:.: 1.29:1.000:. ./.:4:326,251:.: 0.50:1.000:. ./.:4:307,258:.: 0.41:1.000:. ./.:4:273,306:.: 0.52:1.000:. -chr2.1 75135596 chr2.1_075135596 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:181,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:134,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.12:0.998:. ./.:4:184,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:76,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:177,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:109,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:44,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.88:1.000:. ./.:3:60,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.94:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:135,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.86:0.578:. ./.:4:156,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:160,1:.: 0.21:0.727:. ./.:4:200,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.93:0.825:. ./.:4:183,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.70:1.000:. ./.:3:99,0:.:-1.73:0.993:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:208,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:161,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:154,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:193,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:173,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:223,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:117,1:.:-1.13:0.998:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:158,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.14:1.000:. -chr2.1 75183312 chr2.1_075183312 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:91,5:.: 2.09:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:95,2:.: 2.13:1.000:. ./.:4:91,2:.: 1.96:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:65,4:.: 0.92:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.53:0.998:. ./.:4:54,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:88,2:.: 1.83:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:70,2:.: 1.05:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:66,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:28,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:45,6:.: 0.14:1.000:. ./.:4:57,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:57,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.51:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:77,2:.: 1.35:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:64,4:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.03:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:82,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:52,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.38:1.000:. ./.:6:34,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.21:0.578:. ./.:4:64,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:97,1:.: 2.18:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.01:0.727:. ./.:4:24,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:81,2:.: 1.53:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.88:0.825:. ./.:4:64,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.86:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:13,1:.:-1.46:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.73:1.000:. ./.:4:54,5:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.20:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:49,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:28,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:52,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:12,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,3:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.03:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:47,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:48,4:.: 0.18:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:64,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:33,6:.:-0.38:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.99:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:99,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:16,7:.:-1.07:1.000:. ./.:4:70,1:.: 1.01:0.998:. ./.:4:95,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:56,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:82,3:.: 1.61:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.07:0.999:. ./.:4:59,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:61,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:70,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:20,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:70,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.51:1.000:. -chr2.1 75539465 chr2.1_075539465 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:202,78:.: 0.28:1.000:. ./.:4:157,119:.: 0.23:1.000:. ./.:4:140,125:.: 0.09:1.000:. ./.:4:166,118:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,45:.:-0.22:1.000:. ./.:4:212,176:.: 1.63:1.000:. ./.:4:108,89:.:-0.76:1.000:. ./.:4:169,136:.: 0.59:1.000:. ./.:4:179,82:.: 0.04:1.000:. ./.:4:21,21:.:-2.70:1.000:. ./.:4:9,11:.:-2.97:1.000:. ./.:4:156,136:.: 0.43:1.000:. ./.:4:157,154:.: 0.67:1.000:. ./.:4:152,125:.: 0.24:1.000:. ./.:4:175,87:.: 0.05:1.000:. ./.:4:209,126:.: 0.97:1.000:. ./.:4:202,42:.:-0.17:0.998:. ./.:4:397,150:.: 3.62:1.000:. ./.:4:212,50:.: 0.05:1.000:. ./.:4:215,138:.: 1.19:1.000:. ./.:4:23,22:.:-2.66:1.000:. ./.:4:163,112:.: 0.22:1.000:. ./.:4:170,134:.: 0.58:1.000:. ./.:4:158,82:.:-0.22:1.000:. ./.:4:8,4:.:-3.07:1.000:. ./.:4:232,97:.: 0.89:1.000:. ./.:4:182,143:.: 0.84:1.000:. ./.:4:216,90:.: 0.60:1.000:. ./.:4:171,104:.: 0.22:1.000:. ./.:4:177,132:.: 0.64:1.000:. ./.:4:221,181:.: 1.80:1.000:. ./.:4:186,117:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,21:.:-2.67:1.000:. ./.:3:11,9:.:-2.97:1.000:. ./.:4:210,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:173,149:.: 0.80:1.000:. ./.:4:188,128:.: 0.73:1.000:. ./.:4:176,113:.: 0.39:1.000:. ./.:4:208,85:.: 0.44:1.000:. ./.:4:151,138:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,144:.: 0.84:1.000:. ./.:4:189,102:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,24:.:-1.26:1.000:. ./.:4:153,61:.:-0.55:1.000:. ./.:4:185,114:.: 0.52:1.000:. ./.:4:168,40:.:-0.62:1.000:. ./.:4:37,22:.:-2.49:1.000:. ./.:4:169,70:.:-0.23:1.000:. ./.:4:136,104:.:-0.22:1.000:. ./.:4:130,87:.:-0.51:1.000:. ./.:4:238,216:.: 2.45:1.000:. ./.:4:135,66:.:-0.71:1.000:. ./.:4:176,111:.: 0.37:1.000:. ./.:4:166,81:.:-0.13:1.000:. ./.:4:158,101:.: 0.02:1.000:. ./.:4:156,169:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,86:.:-0.12:1.000:. ./.:4:167,107:.: 0.20:1.000:. ./.:6:137,119:.:-0.02:1.000:. ./.:4:145,135:.: 0.28:1.000:. ./.:4:194,143:.: 0.99:1.000:. ./.:4:165,86:.:-0.08:1.000:. ./.:4:151,69:.:-0.47:1.000:. ./.:4:149,158:.: 0.62:1.000:. ./.:4:177,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:88,44:.:-1.57:1.000:. ./.:4:162,180:.: 1.05:1.000:. ./.:4:151,77:.:-0.37:0.578:. ./.:4:153,93:.:-0.15:1.000:. ./.:4:176,164:.: 1.03:1.000:. ./.:4:112,55:.:-1.14:1.000:. ./.:4:170,80:.:-0.10:1.000:. ./.:4:179,124:.: 0.57:1.000:. ./.:4:144,97:.:-0.21:1.000:. ./.:4:135,45:.:-0.97:1.000:. ./.:4:164,63:.:-0.38:1.000:. ./.:4:148,118:.: 0.10:1.000:. ./.:4:183,84:.: 0.12:1.000:. ./.:4:204,113:.: 0.74:1.000:. ./.:4:113,88:.:-0.71:0.727:. ./.:4:153,83:.:-0.27:1.000:. ./.:4:162,127:.: 0.39:1.000:. ./.:4:149,116:.: 0.09:1.000:. ./.:4:137,105:.:-0.20:0.825:. ./.:4:173,147:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,58:.:-1.21:1.000:. ./.:4:120,97:.:-0.51:1.000:. ./.:4:135,72:.:-0.63:1.000:. ./.:4:190,125:.: 0.72:1.000:. ./.:3:90,87:.:-1.01:0.993:. ./.:4:155,129:.: 0.33:1.000:. ./.:4:178,133:.: 0.67:1.000:. ./.:4:136,144:.: 0.28:1.000:. ./.:4:171,87:.: 0.00:1.000:. ./.:4:146,70:.:-0.52:1.000:. ./.:4:112,154:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,99:.:-0.40:1.000:. ./.:4:141,73:.:-0.55:1.000:. ./.:4:186,128:.: 0.70:1.000:. ./.:4:83,38:.:-1.71:1.000:. ./.:4:146,93:.:-0.23:1.000:. ./.:4:80,90:.:-1.10:1.000:. ./.:4:142,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,48:.:-1.21:1.000:. ./.:4:140,82:.:-0.45:1.000:. ./.:4:144,96:.:-0.22:1.000:. ./.:4:181,167:.: 1.13:1.000:. ./.:4:202,165:.: 1.37:1.000:. ./.:4:171,123:.: 0.45:1.000:. ./.:4:171,99:.: 0.15:1.000:. ./.:4:285,109:.: 1.70:1.000:. ./.:4:160,110:.: 0.15:0.999:. ./.:4:153,110:.: 0.07:1.000:. ./.:4:129,71:.:-0.72:1.000:. ./.:4:160,130:.: 0.40:1.000:. ./.:4:116,59:.:-1.04:1.000:. ./.:4:126,60:.:-0.90:1.000:. ./.:4:124,98:.:-0.45:1.000:. ./.:4:149,54:.:-0.69:1.000:. ./.:4:200,92:.: 0.43:1.000:. ./.:4:146,57:.:-0.69:1.000:. ./.:4:163,86:.:-0.11:1.000:. ./.:4:204,136:.: 1.03:1.000:. ./.:4:143,56:.:-0.74:1.000:. ./.:4:145,167:.: 0.68:1.000:. ./.:4:156,154:.: 0.65:1.000:. ./.:4:134,81:.:-0.53:1.000:. ./.:4:97,56:.:-1.31:1.000:. ./.:4:117,21:.:-1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:170,134:.: 0.58:1.000:. ./.:4:76,51:.:-1.64:1.000:. ./.:4:159,79:.:-0.25:1.000:. ./.:4:151,118:.: 0.14:1.000:. ./.:4:220,121:.: 1.04:1.000:. ./.:4:175,164:.: 1.02:1.000:. ./.:4:140,96:.:-0.27:1.000:. ./.:4:114,66:.:-0.97:1.000:. ./.:4:147,36:.:-0.94:1.000:. ./.:4:176,108:.: 0.33:1.000:. ./.:4:135,110:.:-0.16:1.000:. ./.:4:170,73:.:-0.18:1.000:. ./.:4:98,47:.:-1.41:1.000:. ./.:4:196,161:.: 1.24:1.000:. ./.:4:212,143:.: 1.22:1.000:. ./.:4:182,135:.: 0.74:1.000:. ./.:4:208,94:.: 0.55:1.000:. ./.:4:205,151:.: 1.23:1.000:. ./.:4:156,74:.:-0.35:1.000:. ./.:4:275,144:.: 2.02:1.000:. ./.:4:188,140:.: 0.88:1.000:. ./.:4:14,20:.:-2.80:1.000:. ./.:4:123,59:.:-0.95:1.000:. ./.:4:185,125:.: 0.65:1.000:. ./.:4:185,133:.: 0.75:1.000:. ./.:4:184,145:.: 0.89:1.000:. ./.:4:186,101:.: 0.37:1.000:. ./.:4:130,106:.:-0.27:0.998:. ./.:4:193,80:.: 0.19:1.000:. ./.:4:190,115:.: 0.59:1.000:. ./.:4:147,73:.:-0.47:1.000:. ./.:4:162,89:.:-0.08:1.000:. ./.:4:170,96:.: 0.10:1.000:. ./.:4:169,71:.:-0.22:1.000:. ./.:4:174,167:.: 1.04:1.000:. ./.:4:159,73:.:-0.32:1.000:. ./.:4:183,127:.: 0.65:0.999:. ./.:4:144,130:.: 0.20:1.000:. ./.:4:146,154:.: 0.53:1.000:. ./.:4:133,112:.:-0.16:1.000:. ./.:4:160,79:.:-0.23:1.000:. ./.:4:156,82:.:-0.25:1.000:. ./.:4:158,82:.:-0.22:1.000:. ./.:4:135,96:.:-0.33:1.000:. ./.:4:151,84:.:-0.28:1.000:. ./.:4:241,111:.: 1.18:1.000:. ./.:4:177,127:.: 0.58:1.000:. ./.:4:201,153:.: 1.20:1.000:. ./.:4:172,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:215,145:.: 1.28:1.000:. ./.:4:188,133:.: 0.79:1.000:. ./.:4:201,121:.: 0.80:1.000:. ./.:4:167,172:.: 1.02:1.000:. ./.:4:161,80:.:-0.21:1.000:. -chr2.1 75671787 chr2.1_075671787 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:54,30:0.37: 1.03:1.000:0.603 0/0/0/1:4:38,18:0.31:-0.16:1.000:0.970 0/0/0/1:4:51,19:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,33:0.38: 1.33:1.000:0.509 0/0/1/1:4:58,44:0.48: 1.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,30:0.31: 1.46:1.000:0.975 0/0/1/1:4:19,25:0.57:-0.67:1.000:0.941 0/0/0/0:4:62,1:0.01: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,29:0.45: 0.48:1.000:0.975 0/0/0/1:4:5,2:0.26:-2.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,11:0.44:-1.39:1.000:0.973 0/0/1/1:4:41,37:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,25:0.30: 0.82:1.000:0.981 0/0/0/1:4:44,11:0.18:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,13:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,30:0.30: 1.55:1.000:0.986 0/0/0/1:4:51,26:0.34: 0.74:0.998:0.886 0/0/1/1:4:38,28:0.47: 0.27:1.000:0.992 0/0/0/1:4:56,30:0.35: 1.12:1.000:0.752 0/0/1/1:4:67,50:0.47: 2.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,7:0.58:-2.03:1.000:0.911 0/0/1/1:4:47,37:0.49: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,47:0.54: 1.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:46,13:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-2.42:1.000:0.919 0/0/1/1:4:38,30:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,47:0.50: 1.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,8:0.12:-0.03:1.000:0.777 0/0/1/1:4:63,46:0.47: 2.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:34,20:0.39:-0.24:1.000:0.660 0/0/1/1:4:40,44:0.55: 1.03:1.000:0.983 0/1/1/1:4:1,7:0.75:-2.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,5:0.41:-1.99:1.000:0.858 0/0/0:3:4,0:0.00:-2.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,20:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,29:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,52:0.53: 1.93:1.000:0.992 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,45:0.54: 1.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:47,18:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,6:0.14:-0.97:1.000:0.979 0/0/0/1:4:35,12:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,18:0.41:-0.54:1.000:0.842 0/0/1/1:4:36,29:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,14:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,26:0.34: 0.69:1.000:0.842 0/0/1/1:4:37,41:0.55: 0.78:1.000:0.982 0/0/1/1:4:15,18:0.56:-1.14:1.000:0.969 0/0/1/1:4:24,17:0.46:-0.80:1.000:0.984 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,21:0.30: 0.31:1.000:0.985 0/0/0/1:4:35,14:0.26:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,26:0.37: 0.52:1.000:0.523 0/0/0/1:4:29,6:0.15:-1.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:38,29:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:33,8:0.17:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,12:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:25,19:0.48:-0.67:1.000:0.870 0/0/1/1:4:55,38:0.45: 1.42:1.000:0.975 0/0/1/1:4:18,15:0.51:-1.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,11:0.21:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.24:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,32:0.35: 1.38:1.000:0.767 0/0/0/0:4:37,5:0.11:-0.75:1.000:0.642 0/0/0/1:4:26,12:0.30:-0.92:1.000:0.982 0/0/0/1:4:51,20:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,22:0.41:-0.12:0.578:0.871 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:36,4:0.09:-0.84:1.000:0.953 0/0/1/1:4:7,6:0.51:-1.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,10:0.25:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,34:0.43: 1.08:1.000:0.953 0/0/1/1:4:29,24:0.51:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,7:0.17:-1.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,4:0.10:-1.05:1.000:0.760 0/0/0/1:4:44,13:0.20:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,26:0.43: 0.23:1.000:0.953 0/0/1/1:4:27,27:0.53:-0.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:35,18:0.34:-0.29:0.727:0.868 0/0/0/1:4:40,11:0.19:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,9:0.17:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,19:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,8:0.23:-1.22:0.825:1.000 0/0/0/1:4:36,18:0.33:-0.24:1.000:0.919 0/0/1/1:4:25,23:0.52:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,22:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,29:0.56:-0.29:1.000:0.967 0/0/0/1:4:47,21:0.29: 0.35:1.000:0.990 0/0/1:3:22,14:0.42:-1.01:0.993:0.997 0/0/1/1:4:37,27:0.47: 0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:35,24:0.44:-0.03:1.000:0.972 0/0/0/1:4:31,13:0.27:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,21:0.27: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,26:0.38: 0.48:1.000:0.580 0/0/0/1:4:36,15:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,5:0.16:-1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,27:0.44: 0.31:1.000:0.962 0/0/0/1:4:53,8:0.12: 0.05:1.000:0.685 0/0/0/1:4:21,9:0.28:-1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,16:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,13:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,25:0.47:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,21:0.39:-0.16:1.000:0.738 0/0/1/1:4:31,25:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,26:0.40: 0.40:1.000:0.765 0/0/1/1:4:45,53:0.56: 1.63:1.000:0.973 0/0/0/1:4:46,23:0.33: 0.40:1.000:0.919 0/0/0/1:4:45,19:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,25:0.27: 1.08:1.000:0.998 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.54:0.999:1.000 0/0/1/1:4:45,26:0.38: 0.48:1.000:0.580 0/0/0/0:4:29,1:0.03:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,37:0.44: 1.38:1.000:0.960 0/1/1/1:4:11,25:0.65:-1.01:1.000:0.747 0/0/0/1:4:27,12:0.29:-0.88:1.000:0.991 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,15:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,19:0.38:-0.33:1.000:0.564 0/0/0/1:4:25,9:0.24:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,8:0.19:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,38:0.34: 2.18:1.000:0.840 0/0/1/1:4:31,23:0.47:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/0:4:46,6:0.10:-0.33:1.000:0.735 0/0/0/1:4:28,8:0.20:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,13:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,12:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,7:0.17:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,32:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,21:0.20: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,11:0.24:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,5:0.10:-0.71:1.000:0.714 0/0/0/1:4:43,11:0.18:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,29:0.42: 0.61:1.000:0.915 0/0/0/1:4:39,10:0.18:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,21:0.46:-0.41:1.000:0.989 0/0/0/1:4:51,14:0.19: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,18:0.39:-0.50:1.000:0.738 0/0/0/1:4:43,20:0.31: 0.14:1.000:0.979 0/0/0/1:4:27,10:0.24:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,10:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,17:0.36:-0.50:1.000:0.660 0/0/1/1:4:64,49:0.48: 2.27:1.000:0.996 0/0/0/0:4:55,4:0.06:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,38:0.40: 1.72:1.000:0.808 0/0/0/1:4:47,20:0.28: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/0:4:41,5:0.10:-0.58:1.000:0.864 0/0/1/1:4:45,27:0.39: 0.52:1.000:0.738 0/0/0/1:4:72,32:0.29: 1.89:1.000:0.991 0/0/0/1:4:52,13:0.18: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,4:0.50:-2.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,21:0.27: 0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,8:0.12:-0.03:1.000:0.777 0/0/0/1:4:41,13:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,29:0.40: 0.69:1.000:0.826 0/0/1/1:4:45,32:0.46: 0.74:1.000:0.985 0/0/1/1:4:42,34:0.50: 0.69:0.998:0.997 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,60:0.53: 2.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,18:0.43:-0.63:1.000:0.953 0/0/0/1:4:41,22:0.35: 0.14:1.000:0.746 0/0/1/1:4:47,30:0.42: 0.74:1.000:0.900 0/0/1/1:4:23,21:0.52:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,10:0.14: 0.23:1.000:0.955 0/0/0/1:4:51,11:0.16: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,27:0.40: 0.48:0.999:0.811 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,49:0.51: 2.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,35:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,34:0.57: 0.05:1.000:0.956 0/0/1/1:4:36,21:0.38:-0.12:1.000:0.624 0/0/0/1:4:46,24:0.35: 0.44:1.000:0.834 0/0/0/1:4:37,17:0.30:-0.24:1.000:0.983 0/0/0/0:4:63,7:0.09: 0.44:1.000:0.953 0/0/0/1:4:67,16:0.17: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,14:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,33:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,21:0.28: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,12:0.16: 0.35:1.000:0.994 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,71:0.55: 3.21:1.000:0.982 0/0/1/1:4:36,32:0.52: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,30:0.48: 0.44:1.000:0.994 -chr2.1 75950164 chr2.1_075950164 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,64:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,32:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,44:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,35:.:-0.80:1.000:. ./.:4:49,44:.: 0.63:1.000:. ./.:4:32,31:.:-0.90:1.000:. ./.:4:13,24:.:-2.23:1.000:. ./.:4:16,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:35,40:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,36:.:-1.51:1.000:. ./.:4:19,51:.:-0.54:1.000:. ./.:4:43,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:20,43:.:-0.90:1.000:. ./.:4:37,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:15,49:.:-0.85:1.000:. ./.:4:18,54:.:-0.44:1.000:. ./.:4:17,44:.:-1.00:0.998:. ./.:4:17,67:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,75:.: 0.73:1.000:. ./.:4:63,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:28,36:.:-0.85:1.000:. ./.:4:29,53:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,50:.:-0.80:1.000:. ./.:4:14,35:.:-1.61:1.000:. ./.:4:14,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:16,55:.:-0.49:1.000:. ./.:4:13,53:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,68:.: 0.78:1.000:. ./.:4:25,38:.:-0.90:1.000:. ./.:4:10,32:.:-1.97:1.000:. ./.:4:17,19:.:-2.28:1.000:. ./.:4:1,48:.:-1.61:1.000:. ./.:4:14,20:.:-2.38:1.000:. ./.:3:11,7:.:-3.19:1.000:. ./.:4:27,42:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,51:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,52:.: 0.12:1.000:. ./.:4:34,51:.: 0.22:1.000:. ./.:4:32,40:.:-0.44:1.000:. ./.:4:18,77:.: 0.73:1.000:. ./.:4:19,62:.: 0.02:1.000:. ./.:4:26,91:.: 1.85:1.000:. ./.:4:17,68:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,117:.: 1.85:1.000:. ./.:4:11,82:.: 0.63:1.000:. ./.:4:33,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:31,118:.: 3.48:1.000:. ./.:4:28,41:.:-0.60:1.000:. ./.:4:15,82:.: 0.83:1.000:. ./.:4:24,79:.: 1.14:1.000:. ./.:4:16,79:.: 0.73:1.000:. ./.:4:27,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:12,77:.: 0.42:1.000:. ./.:4:8,78:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,49:.:-0.14:1.000:. ./.:4:16,51:.:-0.70:1.000:. ./.:4:20,98:.: 1.90:1.000:. ./.:4:13,90:.: 1.14:1.000:. ./.:6:18,66:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,100:.: 1.75:1.000:. ./.:4:31,39:.:-0.54:1.000:. ./.:4:15,99:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,131:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,127:.: 2.36:1.000:. ./.:4:17,77:.: 0.68:1.000:. ./.:4:25,76:.: 1.04:1.000:. ./.:4:43,30:.:-0.39:1.000:. ./.:4:22,87:.: 1.44:0.578:. ./.:4:44,15:.:-1.10:1.000:. ./.:4:31,82:.: 1.65:1.000:. ./.:4:11,72:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,79:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,43:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,44:.:-0.49:1.000:. ./.:4:20,71:.: 0.53:1.000:. ./.:4:27,52:.:-0.09:1.000:. ./.:4:14,75:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,68:.: 0.53:1.000:. ./.:4:48,20:.:-0.65:0.727:. ./.:4:19,85:.: 1.19:1.000:. ./.:4:39,45:.: 0.17:1.000:. ./.:4:19,68:.: 0.32:1.000:. ./.:4:46,62:.: 1.39:0.825:. ./.:4:30,50:.:-0.03:1.000:. ./.:4:16,63:.:-0.09:1.000:. ./.:4:28,44:.:-0.44:1.000:. ./.:4:32,64:.: 0.78:1.000:. ./.:4:7,57:.:-0.85:1.000:. ./.:3:0,77:.:-0.19:0.993:. ./.:4:12,62:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,86:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,60:.:-1.05:1.000:. ./.:4:44,57:.: 1.04:1.000:. ./.:4:18,76:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,27:.:-1.00:1.000:. ./.:4:42,20:.:-0.95:1.000:. ./.:4:37,59:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,85:.: 1.09:1.000:. ./.:4:25,54:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,79:.: 0.93:1.000:. ./.:4:18,29:.:-1.72:1.000:. ./.:4:31,82:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,63:.: 0.68:1.000:. ./.:4:27,47:.:-0.34:1.000:. ./.:4:12,73:.: 0.22:1.000:. ./.:4:23,65:.: 0.37:1.000:. ./.:4:24,66:.: 0.47:1.000:. ./.:4:20,70:.: 0.47:1.000:. ./.:4:22,61:.: 0.12:1.000:. ./.:4:26,66:.: 0.58:0.999:. ./.:4:20,85:.: 1.24:1.000:. ./.:4:10,50:.:-1.05:1.000:. ./.:4:20,86:.: 1.29:1.000:. ./.:4:14,83:.: 0.83:1.000:. ./.:4:29,51:.:-0.03:1.000:. ./.:4:35,51:.: 0.27:1.000:. ./.:4:14,74:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,28:.: 0.12:1.000:. ./.:4:20,78:.: 0.88:1.000:. ./.:4:17,84:.: 1.04:1.000:. ./.:4:9,51:.:-1.05:1.000:. ./.:4:24,65:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,111:.: 1.55:1.000:. ./.:4:5,87:.: 0.58:1.000:. ./.:4:18,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:24,33:.:-1.21:1.000:. ./.:4:11,69:.:-0.03:1.000:. ./.:4:18,39:.:-1.21:1.000:. ./.:4:14,42:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.19:1.000:. ./.:4:24,45:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,43:.:-0.75:1.000:. ./.:4:82,30:.: 1.60:1.000:. ./.:4:15,71:.: 0.27:1.000:. ./.:4:12,63:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,117:.: 1.85:1.000:. ./.:4:20,68:.: 0.37:1.000:. ./.:4:31,46:.:-0.19:1.000:. ./.:4:18,91:.: 1.44:1.000:. ./.:4:32,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.78:1.000:. ./.:4:25,76:.: 1.04:1.000:. ./.:4:38,60:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,64:.: 0.22:1.000:. ./.:4:15,76:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,104:.: 1.19:1.000:. ./.:4:20,67:.: 0.32:1.000:. ./.:4:21,73:.: 0.68:1.000:. ./.:4:17,43:.:-1.05:1.000:. ./.:4:17,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,58:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,98:.: 0.88:1.000:. ./.:4:36,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,33:.:-0.85:0.998:. ./.:4:45,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,58:.: 0.12:1.000:. ./.:4:24,26:.:-1.56:1.000:. ./.:4:45,46:.: 0.53:1.000:. ./.:4:16,71:.: 0.32:1.000:. ./.:4:34,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,61:.:-0.14:1.000:. ./.:4:13,38:.:-1.51:1.000:. ./.:4:21,50:.:-0.49:0.999:. ./.:4:25,38:.:-0.90:1.000:. ./.:4:15,53:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,62:.:-0.24:1.000:. ./.:4:8,48:.:-1.26:1.000:. ./.:4:15,64:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,49:.:-1.10:1.000:. ./.:4:42,23:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,51:.:-0.75:1.000:. ./.:4:32,33:.:-0.80:1.000:. ./.:4:49,21:.:-0.54:1.000:. ./.:4:18,57:.:-0.29:1.000:. ./.:4:27,46:.:-0.39:1.000:. ./.:4:10,66:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,76:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.83:1.000:. ./.:4:12,44:.:-1.26:1.000:. ./.:4:28,50:.:-0.14:1.000:. -chr2.1 76029897 chr2.1_076029897 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:246,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,64:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,154:0.71:-0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,136:0.68:-0.35:1.000:0.952 0/0/0/0:4:185,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,101:0.66:-1.15:1.000:0.843 0/0/1/1:4:116,137:0.51: 0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,83:0.35:-0.10:1.000:0.750 0/1/1/1:4:19,52:0.70:-2.51:1.000:0.981 0/0/0/1:4:32,22:0.36:-2.81:1.000:0.743 0/0/0/1:4:164,79:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,148:0.68:-0.02:1.000:0.941 0/0/0/0:4:227,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:208,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:218,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,168:0.55: 1.41:0.998:0.977 0/1/1/1:4:59,216:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:233,80:0.20: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,89:0.37: 0.05:1.000:0.570 0/0/1/1:4:24,20:0.41:-3.00:1.000:0.864 0/0/0/1:4:95,68:0.37:-0.84:1.000:0.610 0/0/0/1:4:154,87:0.30: 0.58:1.000:0.984 0/0/0/1:4:170,80:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,13:0.18:-2.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,97:0.38: 0.34:1.000:0.518 0/0/1/1:4:105,130:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,68:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,152:0.70:-0.04:1.000:0.983 0/0/0/1:4:128,74:0.31:-0.13:1.000:0.978 0/0/1/1:4:127,181:0.55: 1.79:1.000:0.975 0/0/0/1:4:191,74:0.22: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.53:-3.18:1.000:0.993 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-2.80:1.000:1.000 0/0/1:3:7,7:0.46:-3.54:1.000:0.922 0/0/1/1:4:138,168:0.52: 1.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,137:0.47: 1.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:66,159:0.67: 0.29:1.000:0.924 0/0/0/1:4:120,81:0.35:-0.15:1.000:0.794 0/0/1/1:4:109,85:0.39:-0.28:1.000:0.702 0/0/0/1:4:182,68:0.21: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,85:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,90:0.38: 0.00:1.000:0.597 0/0/1/1:4:99,79:0.40:-0.57:1.000:0.769 0/0/1/1:4:129,142:0.49: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,87:0.38:-0.11:1.000:0.566 0/1/1/1:4:60,146:0.67:-0.06:1.000:0.931 0/0/1/1:4:31,30:0.45:-2.69:1.000:0.983 0/0/0/1:4:172,74:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,72:0.26: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,64:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,77:0.28: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,78:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,69:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,160:0.66: 0.39:1.000:0.849 0/1/1/1:4:67,171:0.68: 0.52:1.000:0.959 0/0/0/0/1/1:6:149,73:0.26: 0.23:1.000:0.620 0/0/0/1:4:200,76:0.22: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,147:0.70:-0.19:1.000:0.987 0/1/1/1:4:55,133:0.67:-0.39:1.000:0.927 0/0/1/1:4:98,134:0.54: 0.41:1.000:0.984 0/0/1/1:4:106,126:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,67:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,42:0.25:-1.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:204,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,147:0.67:-0.02:0.578:0.924 0/0/0/1:4:161,63:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,61:0.35:-1.04:1.000:0.811 0/0/1/1:4:135,167:0.52: 1.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,142:0.67:-0.15:1.000:0.923 0/0/1/1:4:129,150:0.51: 1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,70:0.39:-0.91:1.000:0.728 0/0/1/1:4:110,112:0.47: 0.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:107,69:0.34:-0.60:1.000:0.886 0/0/0/1:4:186,95:0.27: 1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,141:0.47: 1.25:1.000:0.993 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.19:0.727:1.000 0/0/0/1:4:160,77:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:206,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,120:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,63:0.26:-0.31:0.825:0.999 0/0/0/1:4:122,82:0.35:-0.10:1.000:0.804 0/0/0/1:4:120,55:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,127:0.71:-0.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:142,69:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,63:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/1/1:3:29,97:0.73:-1.51:0.993:1.000 0/0/1/1:4:125,116:0.44: 0.58:1.000:0.969 0/0/1/1:4:153,157:0.47: 1.83:1.000:0.992 0/0/0/1:4:126,52:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,88:0.36: 0.05:1.000:0.640 0/0/0/1:4:184,77:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,73:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,69:0.35:-0.68:1.000:0.812 0/0/1/1:4:156,135:0.42: 1.48:1.000:0.918 0/0/0/1:4:73,46:0.33:-1.64:1.000:0.918 0/0/0/1:4:175,82:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,108:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,71:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:201,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,69:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:201,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,69:0.20: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,71:0.34:-0.53:1.000:0.870 0/0/0/1:4:240,92:0.22: 2.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:185,0:0.00:-0.44:0.999:1.000 0/0/0/1:4:131,81:0.33: 0.05:1.000:0.938 0/0/0/1:4:101,53:0.28:-1.00:1.000:0.995 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,65:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,61:0.29:-0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:144,53:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,55:0.27:-0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:164,50:0.18: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,91:0.29: 0.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:117,65:0.30:-0.49:1.000:0.988 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,73:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,150:0.53: 1.06:1.000:0.993 0/0/0/0:4:202,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,51:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,56:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,65:0.30:-0.51:1.000:0.986 0/0/0/1:4:199,72:0.21: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,94:0.55:-0.89:1.000:0.975 0/0/0/0:4:228,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,74:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,63:0.34:-0.91:1.000:0.856 0/0/1/1:4:93,119:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,141:0.71:-0.37:1.000:0.991 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,139:0.52: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:113,74:0.34:-0.40:1.000:0.860 0/0/0/1:4:129,60:0.25:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,87:0.30: 0.61:1.000:0.987 0/1/1/1:4:63,138:0.65:-0.15:1.000:0.802 0/0/0/1:4:106,71:0.35:-0.58:1.000:0.812 0/0/1/1:4:124,167:0.54: 1.48:1.000:0.987 0/0/0/1:4:164,62:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,72:0.29:-0.11:1.000:0.990 0/1/1/1:4:58,219:0.75: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,19:0.26:-2.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,112:0.56:-0.37:1.000:0.968 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,84:0.42:-0.49:1.000:0.907 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,151:0.52: 1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,165:0.72: 0.18:0.998:0.994 0/0/0/1:4:118,84:0.36:-0.13:1.000:0.629 0/0/0/1:4:154,80:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,124:0.65:-0.51:1.000:0.789 0/0/0/1:4:111,80:0.37:-0.33:1.000:0.584 0/0/1/1:4:120,147:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,83:0.39:-0.39:1.000:0.743 0/0/1/1:4:124,137:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,127:0.69:-0.60:1.000:0.965 0/0/1/1:4:115,138:0.51: 0.79:0.999:0.996 0/0/1/1:4:99,75:0.38:-0.64:1.000:0.603 0/0/0/1:4:127,76:0.32:-0.11:1.000:0.962 0/0/0/1:4:115,63:0.29:-0.57:1.000:0.990 0/0/0/1:4:98,59:0.32:-0.95:1.000:0.958 0/0/0/1:4:182,65:0.21: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,63:0.21: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,50:0.29:-1.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,75:0.29: 0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:137,107:0.39: 0.63:1.000:0.706 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,159:0.51: 1.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:187,28:0.10: 0.10:1.000:0.739 0/0/0/1:4:172,64:0.21: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,157:0.49: 1.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,85:0.24: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,132:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:160,68:0.23: 0.34:1.000:1.000 -chr2.1 76438134 chr2.1_076438134 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:197,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:299,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.74:0.998:. ./.:4:206,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:29,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:111,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.23:0.578:. ./.:4:176,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.49:0.727:. ./.:4:163,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.70:0.825:. ./.:4:175,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.98:1.000:. ./.:3:96,0:.:-1.68:0.993:. ./.:4:172,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:305,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:183,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:167,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:136,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:295,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.23:0.998:. ./.:4:234,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.29:0.999:. ./.:4:193,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:313,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:312,1:.: 2.42:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.45:1.000:. -chr3.1 619360 chr3.1_000619360 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:180,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:56,42:.:-0.66:1.000:. ./.:4:136,52:.: 1.26:1.000:. ./.:4:113,54:.: 0.81:1.000:. ./.:4:129,83:.: 1.77:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:16,15:.:-2.09:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:144,56:.: 1.52:1.000:. ./.:4:149,42:.: 1.32:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:120,55:.: 0.98:1.000:. ./.:4:146,73:.: 1.92:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:108,75:.: 1.15:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:136,56:.: 1.35:1.000:. ./.:4:41,24:.:-1.36:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:56,43:.:-0.64:1.000:. ./.:4:137,65:.: 1.56:1.000:. ./.:4:99,62:.: 0.68:1.000:. ./.:4:119,57:.: 1.00:1.000:. ./.:4:79,46:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:55,7:.:-1.43:1.000:. ./.:3:17,6:.:-2.26:0.993:. ./.:4:69,62:.: 0.04:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:93,52:.: 0.34:1.000:. ./.:4:62,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:129,46:.: 0.98:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:82,33:.:-0.30:1.000:. ./.:4:109,41:.: 0.45:1.000:. ./.:4:45,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:136,69:.: 1.62:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,51:.:-0.21:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:31,35:.:-1.34:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:103,47:.: 0.45:1.000:. ./.:4:188,54:.: 2.41:1.000:. ./.:4:90,40:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:87,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:136,39:.: 0.98:1.000:. ./.:6:109,23:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,43:.: 0.36:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:103,38:.: 0.26:1.000:. ./.:4:119,49:.: 0.83:1.000:. ./.:4:57,33:.:-0.83:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:93,60:.: 0.51:1.000:. ./.:5:110,45:.: 0.56:0.993:. ./.:4:193,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:88,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,29:.:-1.43:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,36:.: 0.36:1.000:. ./.:4:96,46:.: 0.28:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:114,46:.: 0.66:1.000:. ./.:5:99,0:.:-0.64:0.990:. ./.:4:94,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.09:1.000:. ./.:5:165,38:.: 1.58:0.928:. ./.:4:143,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:75,28:.:-0.55:1.000:. ./.:4:76,38:.:-0.32:1.000:. ./.:4:68,33:.:-0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.89:0.976:. ./.:4:102,39:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,54:.:-0.32:1.000:. ./.:4:47,54:.:-0.60:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,39:.:-0.98:1.000:. ./.:4:51,38:.:-0.85:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,46:.: 0.39:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:30,31:.:-1.45:1.000:. ./.:4:80,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:90,51:.: 0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.38:1.000:. ./.:3:78,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:93,50:.: 0.30:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:90,80:.: 0.88:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.04:0.999:. ./.:4:131,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,37:.:-0.60:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:117,43:.: 0.66:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:72,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,32:.:-1.24:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:79,34:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:94,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:94,62:.: 0.58:1.000:. ./.:4:89,54:.: 0.30:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:97,32:.: 0.00:1.000:. ./.:4:127,46:.: 0.94:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.17:0.998:. ./.:4:95,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:132,77:.: 1.71:1.000:. ./.:4:145,45:.: 1.30:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:65,34:.:-0.64:1.000:. ./.:4:60,57:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:144,65:.: 1.71:1.000:. ./.:4:158,80:.: 2.33:1.000:. ./.:4:61,67:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,86:.: 1.64:1.000:. ./.:4:113,38:.: 0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,12:.:-2.00:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,67:.: 2.05:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:77,74:.: 0.47:1.000:. ./.:4:124,69:.: 1.37:1.000:. ./.:4:53,51:.:-0.53:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:107,59:.: 0.79:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:73,55:.:-0.02:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:113,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:174,46:.: 1.94:1.000:. ./.:4:117,47:.: 0.75:1.000:. ./.:4:63,48:.:-0.38:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:126,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:134,75:.: 1.71:1.000:. ./.:4:145,67:.: 1.77:1.000:. ./.:4:112,55:.: 0.81:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.09:1.000:. ./.:3:78,59:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:232,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:97,49:.: 0.36:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.83:1.000:. -chr3.1 695673 chr3.1_000695673 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:390,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:222,111:.: 0.11:1.000:. ./.:4:279,106:.: 0.72:1.000:. ./.:4:276,120:.: 0.85:1.000:. ./.:4:321,131:.: 1.50:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:219,90:.:-0.17:1.000:. ./.:4:255,112:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,44:.:-2.30:1.000:. ./.:4:144,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:213,224:.: 1.33:1.000:. ./.:4:229,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:277,117:.: 0.82:1.000:. ./.:4:257,109:.: 0.50:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:321,134:.: 1.54:1.000:. ./.:4:374,138:.: 2.21:1.000:. ./.:4:120,32:.:-2.01:1.000:. ./.:4:264,107:.: 0.55:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:201,222:.: 1.16:1.000:. ./.:4:48,75:.:-2.35:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:311,114:.: 1.19:1.000:. ./.:4:266,82:.: 0.29:1.000:. ./.:4:290,97:.: 0.74:1.000:. ./.:4:303,154:.: 1.56:1.000:. ./.:4:203,122:.: 0.02:1.000:. ./.:4:217,82:.:-0.29:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:115,46:.:-1.90:1.000:. ./.:3:35,65:.:-2.62:0.993:. ./.:4:210,193:.: 0.93:1.000:. ./.:4:234,94:.: 0.05:1.000:. ./.:4:307,105:.: 1.03:1.000:. ./.:4:132,187:.:-0.05:1.000:. ./.:4:221,113:.: 0.12:1.000:. ./.:4:221,74:.:-0.34:1.000:. ./.:4:190,86:.:-0.56:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:142,86:.:-1.12:1.000:. ./.:4:255,94:.: 0.30:1.000:. ./.:4:151,183:.: 0.12:1.000:. ./.:4:320,103:.: 1.16:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:146,72:.:-1.24:1.000:. ./.:4:142,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:139,142:.:-0.50:1.000:. ./.:4:238,93:.: 0.09:1.000:. ./.:4:194,82:.:-0.56:1.000:. ./.:4:223,101:.: 0.00:1.000:. ./.:4:268,95:.: 0.46:1.000:. ./.:4:177,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:209,87:.:-0.32:1.000:. ./.:4:158,84:.:-0.96:1.000:. ./.:4:170,94:.:-0.70:1.000:. ./.:6:192,76:.:-0.65:1.000:. ./.:4:230,85:.:-0.10:1.000:. ./.:4:179,81:.:-0.74:1.000:. ./.:4:211,91:.:-0.25:1.000:. ./.:4:159,81:.:-0.98:1.000:. ./.:4:236,104:.: 0.19:1.000:. ./.:4:203,72:.:-0.57:1.000:. ./.:4:231,94:.: 0.02:1.000:. ./.:4:233,89:.:-0.02:1.000:. ./.:5:208,88:.:-0.32:0.993:. ./.:4:319,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:246,127:.: 0.58:1.000:. ./.:4:74,108:.:-1.66:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:264,106:.: 0.54:1.000:. ./.:4:263,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:181,108:.:-0.41:1.000:. ./.:4:172,70:.:-0.96:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:220,89:.:-0.17:1.000:. ./.:4:257,97:.: 0.36:1.000:. ./.:5:190,0:.:-1.56:0.990:. ./.:4:121,185:.:-0.21:1.000:. ./.:4:253,102:.: 0.37:1.000:. ./.:4:209,77:.:-0.44:1.000:. ./.:5:241,90:.: 0.09:0.928:. ./.:4:261,108:.: 0.53:1.000:. ./.:4:102,148:.:-0.86:1.000:. ./.:4:203,54:.:-0.78:1.000:. ./.:4:193,72:.:-0.69:1.000:. ./.:4:196,91:.:-0.43:1.000:. ./.:4:197,69:.:-0.67:0.976:. ./.:4:139,192:.: 0.09:1.000:. ./.:4:245,114:.: 0.41:1.000:. ./.:4:163,67:.:-1.10:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:136,236:.: 0.57:1.000:. ./.:4:148,175:.:-0.01:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:232,103:.: 0.13:1.000:. ./.:4:294,96:.: 0.78:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:212,71:.:-0.48:1.000:. ./.:4:189,94:.:-0.48:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:200,90:.:-0.39:1.000:. ./.:4:162,79:.:-0.97:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.07:1.000:. ./.:3:329,110:.: 1.35:1.000:. ./.:4:156,182:.: 0.17:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:250,281:.: 2.43:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.11:0.999:. ./.:4:249,109:.: 0.40:1.000:. ./.:4:166,70:.:-1.03:1.000:. ./.:4:186,93:.:-0.52:1.000:. ./.:4:212,87:.:-0.29:1.000:. ./.:4:142,67:.:-1.34:1.000:. ./.:4:170,192:.: 0.45:1.000:. ./.:4:157,64:.:-1.20:1.000:. ./.:4:240,97:.: 0.16:1.000:. ./.:4:149,167:.:-0.09:1.000:. ./.:4:245,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:313,123:.: 1.32:1.000:. ./.:4:123,149:.:-0.60:1.000:. ./.:4:243,97:.: 0.19:1.000:. ./.:4:232,113:.: 0.25:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:217,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:186,52:.:-1.00:1.000:. ./.:4:206,90:.:-0.32:1.000:. ./.:4:344,110:.: 1.53:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.21:0.998:. ./.:4:240,87:.: 0.04:1.000:. ./.:4:235,86:.:-0.03:1.000:. ./.:4:354,123:.: 1.80:1.000:. ./.:4:226,107:.: 0.11:1.000:. ./.:4:172,92:.:-0.70:1.000:. ./.:4:195,66:.:-0.73:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:238,75:.:-0.12:1.000:. ./.:4:155,152:.:-0.19:1.000:. ./.:4:320,109:.: 1.23:1.000:. ./.:4:118,123:.:-0.97:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:325,129:.: 1.53:1.000:. ./.:4:335,121:.: 1.55:1.000:. ./.:4:188,177:.: 0.48:1.000:. ./.:4:188,238:.: 1.20:1.000:. ./.:4:125,160:.:-0.45:1.000:. ./.:4:379,136:.: 2.24:1.000:. ./.:4:318,91:.: 1.00:1.000:. ./.:4:88,30:.:-2.41:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:281,131:.: 1.03:1.000:. ./.:4:305,126:.: 1.26:1.000:. ./.:4:358,125:.: 1.87:1.000:. ./.:4:305,116:.: 1.14:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:205,214:.: 1.12:1.000:. ./.:4:269,77:.: 0.26:1.000:. ./.:4:172,68:.:-0.98:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:254,120:.: 0.59:1.000:. ./.:4:262,89:.: 0.32:1.000:. ./.:4:256,108:.: 0.47:1.000:. ./.:4:289,89:.: 0.64:1.000:. ./.:4:410,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:241,83:.: 0.00:1.000:. ./.:4:274,99:.: 0.58:1.000:. ./.:4:176,209:.: 0.72:1.000:. ./.:4:231,73:.:-0.23:1.000:. ./.:4:291,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:280,97:.: 0.62:1.000:. ./.:4:151,75:.:-1.14:1.000:. ./.:4:222,98:.:-0.04:1.000:. ./.:4:339,117:.: 1.55:1.000:. ./.:4:314,115:.: 1.23:1.000:. ./.:4:272,102:.: 0.59:1.000:. ./.:4:272,74:.: 0.26:1.000:. ./.:3:345,131:.: 1.78:1.000:. ./.:4:329,124:.: 1.51:1.000:. ./.:4:360,150:.: 2.18:1.000:. ./.:4:242,96:.: 0.17:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.12:1.000:. -chr3.1 890340 chr3.1_000890340 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:19,0:.:-1.57:0.993:. ./.:4:73,0:.: 0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:100,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.52:1.000:. ./.:6:42,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.99:1.000:. ./.:5:116,0:.: 1.74:0.993:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,0:.: 2.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.: 1.16:1.000:. ./.:5:27,1:.:-1.27:0.990:. ./.:4:40,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:57,0:.:-0.28:0.928:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:120,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:167,0:.: 3.48:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.27:1.000:. ./.:3:100,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.17:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.41:0.998:. ./.:4:42,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:59,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.10:0.999:. ./.:4:66,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.85:1.000:. ./.:3:79,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. -chr3.1 1112364 chr3.1_001112364 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:153,197:0.55: 0.89:1.000:0.980 0/0/1/1:4:120,124:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:185,82:0.30:-0.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:160,159:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:273,99:0.26: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,222:0.55: 1.43:1.000:0.982 0/0/0/1:4:216,62:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,176:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:158,182:0.52: 0.77:1.000:0.994 0/0/0/1:4:41,6:0.12:-2.66:1.000:0.823 0/0/1/1:4:32,29:0.46:-2.49:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,326:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,186:0.57: 0.50:1.000:0.939 0/1/1/1:4:86,240:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,166:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,288:0.72: 1.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,285:0.74: 1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:106,287:0.71: 1.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:203,221:0.51: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,96:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,34:0.72:-2.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,150:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:239,90:0.26: 0.64:1.000:0.998 0/1/1/1:4:65,240:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,11:0.32:-2.82:1.000:0.944 0/0/0/1:4:303,119:0.27: 1.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,179:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:211,90:0.29: 0.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:250,110:0.30: 1.00:1.000:0.988 0/0/0/1:4:262,104:0.27: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,212:0.50: 1.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,157:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:30,9:0.22:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,22:0.48:-2.68:1.000:0.994 0/0/0:3:15,0:0.00:-3.03:0.993:1.000 0/0/1/1:4:158,191:0.53: 0.88:1.000:0.990 0/1/1/1:4:86,257:0.73: 0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:76,280:0.77: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,225:0.71: 0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:287,95:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,225:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,156:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,171:0.52: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:191,68:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,144:0.56:-0.26:1.000:0.970 0/0/1/1:4:120,131:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:276,91:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,210:0.52: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,130:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,140:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,108:0.53:-0.89:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,287:0.75: 1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,155:0.73:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,148:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,140:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:157,142:0.46: 0.29:1.000:0.990 0/1/1/1:4:67,247:0.77: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,134:0.49:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,119:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:78,79:0.49:-1.37:1.000:0.885 0/0/1/1:4:102,116:0.52:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,124:0.47:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:119,134:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,118:0.55:-0.76:1.000:0.978 0/0/0/1:4:211,80:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,225:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,112:0.59:-1.04:1.000:0.859 0/0/0/1:4:177,63:0.25:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:138,125:0.46:-0.13:0.993:0.807 1/1/1/1:4:0,273:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,147:0.53:-0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,91:0.46:-0.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:168,154:0.47: 0.56:1.000:0.991 0/1/1/1:4:65,232:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,194:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,115:0.47:-0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:138,135:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,134:0.58:-0.56:1.000:0.919 0/1/1/1:4:63,209:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,151:0.51: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1/1:5:44,179:0.79:-0.60:0.990:0.989 0/1/1/1:4:58,182:0.74:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,219:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,195:0.72:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:147,226:0.59: 1.16:0.928:0.967 0/1/1/1:4:70,240:0.75: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,138:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,129:0.60:-0.76:1.000:0.771 0/0/0/1:4:169,47:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,171:0.69:-0.40:1.000:0.979 0/1/1/1:4:53,149:0.72:-0.84:0.976:0.995 0/1/1/1:4:70,162:0.68:-0.49:1.000:0.955 0/0/0/1:4:190,79:0.28:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:176,45:0.20:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,134:0.53:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:133,160:0.53: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,92:0.46:-0.90:1.000:0.985 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:51,181:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,145:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,109:0.48:-0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:192,68:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,40:0.23:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,43:0.22:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,104:0.53:-0.98:1.000:0.990 0/0/0/1:4:207,67:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,116:0.47:-0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:240,100:0.28: 0.77:1.000:0.994 0/0/1:3:238,249:0.50: 2.49:1.000:0.502 0/1/1/1:4:68,210:0.74: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:98,95:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:241,297:0.54: 3.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:173,59:0.25:-0.49:0.999:1.000 0/1/1/1:4:71,212:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,49:0.29:-1.28:1.000:0.993 0/1/1/1:4:58,121:0.66:-1.11:1.000:0.862 0/0/1/1:4:85,89:0.50:-1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,147:0.68:-0.74:1.000:0.951 0/1/1/1:4:52,197:0.77:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,57:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,134:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,169:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,157:0.55: 0.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:138,169:0.54: 0.38:1.000:0.989 0/1/1/1:4:50,188:0.77:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,120:0.46:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:94,115:0.54:-0.76:1.000:0.989 0/0/1/1:4:90,115:0.55:-0.81:1.000:0.982 0/0/0/1:4:106,31:0.22:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,90:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,94:0.49:-1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,242:0.77: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,40:0.29:-1.64:0.998:0.992 0/1/1/1:4:70,193:0.71:-0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,140:0.53:-0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:215,241:0.52: 2.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:146,149:0.49: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,107:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,131:0.71:-1.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:160,65:0.28:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,115:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,153:0.69:-0.68:1.000:0.974 0/0/0/1:4:183,75:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,88:0.51:-1.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,91:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,203:0.49: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,161:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,150:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:91,312:0.75: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,171:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,303:0.75: 1.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,277:0.78: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,15:0.32:-2.67:1.000:0.962 0/0/0/1:4:203,83:0.28: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:202,182:0.46: 1.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:144,140:0.48: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:205,208:0.49: 1.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,284:0.76: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,132:0.51:-0.26:0.999:0.996 0/0/1/1:4:167,173:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,141:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,68:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,82:0.28: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,165:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,281:0.78: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,97:0.27: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,153:0.54: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:134,157:0.53: 0.20:1.000:0.993 0/1/1/1:4:77,203:0.71: 0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:161,145:0.46: 0.37:1.000:0.989 0/1/1/1:4:68,218:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,67:0.29:-0.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:201,73:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,223:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,205:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,208:0.78:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:294,108:0.26: 1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,179:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,167:0.51: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,203:0.68: 0.22:1.000:0.940 0/0/1:3:273,104:0.27: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,213:0.50: 1.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,311:0.77: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,143:0.57:-0.34:1.000:0.947 0/1/1/1:4:82,220:0.71: 0.33:1.000:0.992 -chr3.1 1430610 chr3.1_001430610 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:138,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:60,3:.:-2.08:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:56,2:.:-2.20:1.000:. ./.:3:15,0:.:-3.20:0.993:. ./.:4:87,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:128,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:189,3:.: 0.95:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:253,2:.: 2.42:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:188,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:168,5:.: 0.50:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:166,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.78:1.000:. ./.:6:172,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:208,2:.: 1.37:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:188,0:.: 0.85:0.993:. ./.:4:155,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:242,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:137,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.95:1.000:. ./.:5:132,0:.:-0.46:0.990:. ./.:4:211,2:.: 1.44:1.000:. ./.:4:202,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.05:1.000:. ./.:5:275,0:.: 2.89:0.928:. ./.:4:208,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.09:0.976:. ./.:4:172,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:202,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:206,3:.: 1.34:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.74:1.000:. ./.:3:163,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:138,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.51:0.999:. ./.:4:182,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:143,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:170,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:225,2:.: 1.77:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:178,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.77:0.998:. ./.:4:180,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:191,4:.: 1.02:1.000:. ./.:4:219,4:.: 1.67:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:130,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:129,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.12:1.000:. ./.:3:129,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.20:1.000:. -chr3.1 1541394 chr3.1_001541394 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:126,69:0.32:-0.63:1.000:0.954 0/0/0/1:4:101,56:0.32:-1.06:1.000:0.944 0/0/1/1:4:145,174:0.54: 0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:158,125:0.43: 0.38:1.000:0.939 0/0/1/1:4:209,145:0.39: 1.19:1.000:0.669 0/0/1/1:4:208,182:0.46: 1.60:1.000:0.986 0/0/0/1:4:80,36:0.27:-1.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:156,58:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,91:0.45:-0.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:48,70:0.58:-1.50:1.000:0.930 0/0/0/0:4:43,2:0.04:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,51:0.29:-1.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:99,49:0.29:-1.16:1.000:0.991 0/1/1/1:4:123,250:0.64: 1.40:1.000:0.675 0/0/1/1:4:134,102:0.42:-0.16:1.000:0.895 0/0/1/1:4:102,112:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,54:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,65:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,139:0.36: 1.21:1.000:0.633 0/0/1/1:4:213,211:0.50: 1.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,49:0.66:-2.04:1.000:0.836 0/0/1/1:4:156,109:0.39: 0.17:1.000:0.693 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,223:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,37:0.59:-2.15:1.000:0.884 0/0/0/0:4:218,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,113:0.56:-0.60:1.000:0.968 0/0/0/1:4:227,115:0.30: 1.05:1.000:0.986 0/0/0/1:4:243,131:0.32: 1.42:1.000:0.964 0/0/0/1:4:242,111:0.27: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,199:0.60: 0.82:1.000:0.824 0/0/1/1:4:89,133:0.58:-0.32:1.000:0.912 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,43:0.40:-1.69:1.000:0.813 0/0/1:3:16,14:0.46:-2.51:0.993:0.944 0/0/1/1:4:170,154:0.47: 0.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:114,109:0.48:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,134:0.46: 0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:156,187:0.54: 1.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:198,151:0.42: 1.13:1.000:0.898 0/0/0/1:4:105,46:0.26:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,219:0.52: 1.89:1.000:0.995 0/0/0/0:4:197,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,119:0.42: 0.26:1.000:0.915 0/0/1/1:4:187,134:0.40: 0.81:1.000:0.770 0/0/1/1:4:171,187:0.52: 1.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:272,130:0.28: 1.74:1.000:0.995 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,97:0.39:-0.13:1.000:0.639 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,150:0.59:-0.04:1.000:0.869 0/1/1/1:4:68,157:0.66:-0.28:1.000:0.878 0/0/1/1:4:100,122:0.54:-0.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:194,217:0.52: 1.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:157,121:0.42: 0.32:1.000:0.912 0/0/1/1:4:167,195:0.53: 1.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:107,61:0.33:-0.93:1.000:0.916 0/0/0/1:4:180,114:0.36: 0.50:1.000:0.673 0/0/1/1:4:170,166:0.49: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:169,105:0.36: 0.28:1.000:0.885 0/0/1/1:4:191,127:0.38: 0.78:1.000:0.510 0/0/1/1:4:100,115:0.53:-0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,222:0.62: 1.05:1.000:0.550 0/0/1/1:4:193,168:0.46: 1.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:174,118:0.38: 0.48:1.000:0.586 0/1/1/1:4:57,130:0.66:-0.72:1.000:0.865 0/0/0/1:4:86,43:0.29:-1.38:1.000:0.989 0/0/0/1:4:225,112:0.29: 0.99:1.000:0.990 0/0/0/1/1:5:185,124:0.38: 0.67:0.993:0.963 0/0/1/1:4:93,72:0.42:-0.97:1.000:0.917 0/0/1/1:4:140,208:0.58: 1.12:1.000:0.917 0/1/1/1:4:63,142:0.66:-0.51:1.000:0.851 0/0/0/1:4:205,69:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,57:0.31:-0.97:1.000:0.974 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,107:0.41: 0.02:1.000:0.840 0/0/0/1:4:161,102:0.36: 0.15:1.000:0.672 0/0/0/1:4:167,68:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,73:0.35:-0.66:1.000:0.773 0/0/1/1:4:201,141:0.39: 1.05:1.000:0.706 0/0/0/0/1:5:137,55:0.24:-0.66:0.990:0.953 0/1/1/1:4:60,217:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,148:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,46:0.19:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:245,213:0.46: 2.37:0.928:0.854 0/0/1/1:4:127,117:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:85,163:0.63:-0.02:1.000:0.539 0/0/1/1:4:132,154:0.53: 0.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:132,86:0.37:-0.36:1.000:0.569 0/0/1/1:4:101,113:0.52:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:85,86:0.50:-0.90:0.976:0.997 0/0/1/1:4:128,158:0.54: 0.41:1.000:0.986 0/0/0/1:4:254,147:0.34: 1.72:1.000:0.895 0/0/1/1:4:148,140:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/0/0/0:4:184,1:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:126,266:0.65: 1.62:1.000:0.751 0/0/1/1:4:160,153:0.48: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,47:0.29:-1.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:97,143:0.58:-0.11:1.000:0.923 0/0/1/1:4:209,210:0.50: 1.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,42:0.29:-1.39:1.000:0.993 0/0/0/0:4:247,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,125:0.35: 0.95:1.000:0.825 0/0/0/1:4:185,90:0.29: 0.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:142,52:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,186:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:153,59:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:266,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1:3:127,56:0.26:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,262:0.67: 1.39:1.000:0.907 0/0/0/1:4:162,54:0.21:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,216:0.49: 2.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,58:0.19: 0.09:0.999:1.000 0/0/0/1:4:169,53:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,85:0.28: 0.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,141:0.68:-0.63:1.000:0.959 0/0/0/1:4:142,84:0.34:-0.27:1.000:0.858 0/1/1/1:4:39,108:0.69:-1.17:1.000:0.976 0/1/1/1:4:47,258:0.79: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,100:0.44:-0.33:1.000:0.968 0/0/0/1:4:168,56:0.21:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,201:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,62:0.22:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,53:0.26:-0.89:1.000:0.998 0/1/1/1:4:94,188:0.64: 0.37:1.000:0.639 0/0/1/1:4:189,134:0.39: 0.83:1.000:0.739 0/0/1/1:4:161,213:0.56: 1.42:1.000:0.973 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,51:0.23:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,94:0.39:-0.23:1.000:0.656 0/0/1/1:4:158,179:0.52: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,127:0.54:-0.24:1.000:0.985 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-1.42:0.998:1.000 0/0/0/1:4:117,64:0.32:-0.79:1.000:0.955 0/0/0/1:4:165,57:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,160:0.42: 1.35:1.000:0.909 0/0/1/1:4:175,191:0.52: 1.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,107:0.47:-0.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:107,52:0.29:-1.04:1.000:0.993 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,58:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,105:0.64:-1.07:1.000:0.702 0/0/0/1:4:238,145:0.35: 1.52:1.000:0.791 0/0/1/1:4:96,180:0.62: 0.30:1.000:0.517 0/0/0/0:4:200,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,141:0.39: 1.09:1.000:0.656 0/0/1/1:4:116,188:0.60: 0.62:1.000:0.821 0/1/1/1:4:120,256:0.65: 1.44:1.000:0.770 0/1/1/1:4:70,290:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,223:0.66: 0.78:1.000:0.894 0/0/0/1:4:159,80:0.30:-0.12:1.000:0.988 0/1/1/1:4:57,126:0.65:-0.76:1.000:0.825 0/0/0/1:4:50,18:0.22:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,135:0.55:-0.09:1.000:0.983 0/0/1/1:4:96,116:0.54:-0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:126,187:0.58: 0.72:1.000:0.918 0/0/1/1:4:133,102:0.42:-0.17:1.000:0.905 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-1.16:0.999:1.000 0/0/1/1:4:160,148:0.47: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,160:0.59: 0.16:1.000:0.886 0/0/0/1:4:185,101:0.32: 0.41:1.000:0.956 0/0/0/0:4:187,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,179:0.53: 0.91:1.000:0.991 0/0/0/1:4:131,74:0.33:-0.51:1.000:0.926 0/0/1/1:4:140,169:0.54: 0.67:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,45:0.26:-1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,51:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,116:0.53:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,157:0.62:-0.10:1.000:0.524 0/1/1/1:4:90,213:0.67: 0.61:1.000:0.901 0/0/1/1:4:127,100:0.43:-0.26:1.000:0.935 0/0/0/1:4:168,53:0.20:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,118:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,94:0.60:-1.14:1.000:0.763 0/0/0/1:4:105,43:0.24:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,118:0.28: 1.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,226:0.55: 1.77:1.000:0.983 0/0/1/1:4:166,179:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,104:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/1:3:187,104:0.32: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,77:0.30:-0.26:1.000:0.983 0/1/1/1:4:65,136:0.64:-0.56:1.000:0.734 0/0/1/1:4:78,132:0.60:-0.45:1.000:0.748 0/0/0/1:4:114,62:0.32:-0.84:1.000:0.959 -chr3.1 2070122 chr3.1_002070122 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:55,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.31:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.72:0.993:. ./.:4:17,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.98:1.000:. ./.:6:40,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.86:1.000:. ./.:5:22,0:.:-0.60:0.993:. ./.:4:19,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:5:16,0:.:-0.95:0.990:. ./.:4:68,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:5:56,0:.: 1.39:0.928:. ./.:4:71,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.81:0.976:. ./.:4:26,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.84:1.000:. ./.:3:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.92:0.999:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.78:0.998:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:85,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:31,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.04:1.000:. ./.:3:17,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.25:1.000:. -chr3.1 2221858 chr3.1_002221858 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:58,176:.:-0.74:1.000:. ./.:4:69,167:.:-0.71:1.000:. ./.:4:50,240:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.06:1.000:. ./.:4:102,214:.: 0.43:1.000:. ./.:4:87,312:.: 1.61:1.000:. ./.:4:50,207:.:-0.41:1.000:. ./.:4:64,273:.: 0.73:1.000:. ./.:4:151,188:.: 0.76:1.000:. ./.:4:34,133:.:-1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,166:.:-0.89:1.000:. ./.:4:76,164:.:-0.65:1.000:. ./.:4:159,205:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,264:.:-0.31:1.000:. ./.:4:151,172:.: 0.53:1.000:. ./.:4:66,196:.:-0.34:1.000:. ./.:4:205,111:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,373:.: 1.24:1.000:. ./.:4:67,333:.: 1.62:1.000:. ./.:4:84,131:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,269:.:-0.24:1.000:. ./.:4:117,72:.:-1.37:1.000:. ./.:4:41,62:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,395:.: 1.55:1.000:. ./.:4:143,151:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,367:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,406:.: 1.71:1.000:. ./.:4:72,196:.:-0.25:1.000:. ./.:4:64,175:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,111:.:-2.48:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.73:1.000:. ./.:3:14,82:.:-2.70:0.993:. ./.:4:69,326:.: 1.55:1.000:. ./.:4:148,164:.: 0.37:1.000:. ./.:4:153,207:.: 1.05:1.000:. ./.:4:89,201:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,170:.:-0.64:1.000:. ./.:4:98,278:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.90:1.000:. ./.:4:66,266:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,378:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,176:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.69:1.000:. ./.:4:47,113:.:-1.79:1.000:. ./.:4:62,142:.:-1.16:1.000:. ./.:4:180,92:.:-0.20:1.000:. ./.:4:112,156:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,293:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.68:1.000:. ./.:4:59,268:.: 0.59:1.000:. ./.:4:73,195:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.00:1.000:. ./.:4:69,297:.: 1.14:1.000:. ./.:6:37,180:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,291:.: 0.07:1.000:. ./.:4:150,151:.: 0.22:1.000:. ./.:4:89,220:.: 0.33:1.000:. ./.:4:63,280:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.04:1.000:. ./.:4:178,94:.:-0.20:1.000:. ./.:4:51,146:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,376:.: 1.28:1.000:. ./.:5:0,258:.:-0.39:0.993:. ./.:4:61,145:.:-1.13:1.000:. ./.:4:92,198:.: 0.06:1.000:. ./.:4:81,126:.:-1.12:1.000:. ./.:4:90,325:.: 1.84:1.000:. ./.:4:60,162:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,167:.:-1.69:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,267:.: 0.69:1.000:. ./.:4:80,211:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.34:1.000:. ./.:5:50,206:.:-0.42:0.990:. ./.:4:138,79:.:-0.98:1.000:. ./.:4:159,209:.: 1.17:1.000:. ./.:4:37,213:.:-0.51:1.000:. ./.:5:57,401:.: 2.45:0.928:. ./.:4:171,206:.: 1.30:1.000:. ./.:4:101,134:.:-0.72:1.000:. ./.:4:64,229:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.42:1.000:. ./.:4:133,167:.: 0.20:1.000:. ./.:4:112,131:.:-0.61:0.976:. ./.:4:70,146:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,400:.: 1.62:1.000:. ./.:4:67,176:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,312:.: 0.37:1.000:. ./.:4:145,191:.: 0.71:1.000:. ./.:4:65,229:.: 0.12:1.000:. ./.:4:48,161:.:-1.09:1.000:. ./.:4:143,199:.: 0.80:1.000:. ./.:4:63,236:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,146:.:-1.32:1.000:. ./.:4:1,386:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,409:.: 1.75:1.000:. ./.:4:55,229:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,233:.: 0.59:1.000:. ./.:4:57,220:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,360:.: 1.05:1.000:. ./.:3:102,223:.: 0.56:1.000:. ./.:4:142,169:.: 0.36:1.000:. ./.:4:63,252:.: 0.42:1.000:. ./.:4:98,416:.: 3.24:1.000:. ./.:4:67,277:.: 0.83:0.999:. ./.:4:82,285:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.99:1.000:. ./.:4:146,93:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,226:.:-0.83:1.000:. ./.:4:148,76:.:-0.88:1.000:. ./.:4:148,104:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.95:1.000:. ./.:4:70,257:.: 0.59:1.000:. ./.:4:131,86:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,273:.: 0.96:1.000:. ./.:4:73,179:.:-0.48:1.000:. ./.:4:76,193:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,280:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.28:1.000:. ./.:4:62,236:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,194:.:-1.30:1.000:. ./.:4:44,238:.:-0.05:1.000:. ./.:4:141,187:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,170:.:-1.64:0.998:. ./.:4:63,152:.:-1.01:1.000:. ./.:4:56,231:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,264:.: 0.97:1.000:. ./.:4:114,169:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,130:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.66:1.000:. ./.:4:71,289:.: 1.05:1.000:. ./.:4:149,80:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,383:.: 1.38:1.000:. ./.:4:121,137:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.40:1.000:. ./.:4:79,204:.:-0.04:1.000:. ./.:4:141,140:.:-0.07:1.000:. ./.:4:158,104:.:-0.34:1.000:. ./.:4:127,166:.: 0.10:1.000:. ./.:4:87,225:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,105:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,128:.:-2.23:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.73:1.000:. ./.:4:146,185:.: 0.64:1.000:. ./.:4:164,196:.: 1.05:1.000:. ./.:4:78,187:.:-0.30:1.000:. ./.:4:169,202:.: 1.21:1.000:. ./.:4:1,279:.:-0.08:0.999:. ./.:4:78,298:.: 1.28:1.000:. ./.:4:56,158:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.49:1.000:. ./.:4:77,204:.:-0.07:1.000:. ./.:4:56,132:.:-1.39:1.000:. ./.:4:60,278:.: 0.74:1.000:. ./.:4:65,200:.:-0.30:1.000:. ./.:4:68,274:.: 0.80:1.000:. ./.:4:140,165:.: 0.27:1.000:. ./.:4:65,141:.:-1.13:1.000:. ./.:4:95,144:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,211:.:-1.06:1.000:. ./.:4:69,309:.: 1.31:1.000:. ./.:4:132,164:.: 0.15:1.000:. ./.:4:130,76:.:-1.13:1.000:. ./.:4:57,165:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,428:.: 2.02:1.000:. ./.:4:60,327:.: 1.44:1.000:. ./.:4:65,273:.: 0.74:1.000:. ./.:4:127,174:.: 0.22:1.000:. ./.:3:0,300:.: 0.20:1.000:. ./.:4:100,208:.: 0.32:1.000:. ./.:4:178,115:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,162:.:-1.18:1.000:. ./.:4:82,161:.:-0.61:1.000:. -chr3.1 2338008 chr3.1_002338008 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1009,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:956,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1072,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:307,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:794,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1051,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:690,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:830,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1448,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:778,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:863,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1383,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:1366,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:732,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1551,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:333,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1098,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:568,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1352,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:316,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:959,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:770,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.85:1.000:. ./.:3:39,0:.:-1.82:0.993:. ./.:4:560,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1182,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:1450,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:502,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:570,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:520,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:949,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:815,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:335,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:858,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:577,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1712,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:1434,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:1170,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:1151,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:689,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:358,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:909,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:498,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:1490,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:1106,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:821,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:579,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1306,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:473,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:364,0:.:-1.04:1.000:. ./.:5:345,0:.:-1.08:0.993:. ./.:4:797,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:757,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1034,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1324,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:546,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:308,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:1139,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:523,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.89:1.000:. ./.:5:956,1:.: 0.39:0.990:. ./.:4:1267,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1640,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:629,0:.:-0.40:1.000:. ./.:5:991,0:.: 0.47:0.928:. ./.:4:1394,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:951,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:961,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1348,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:1006,0:.: 0.51:0.976:. ./.:4:474,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:686,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:939,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1520,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:688,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:814,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1476,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:1165,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:726,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:582,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:358,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:834,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1116,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:886,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:526,0:.:-0.65:1.000:. ./.:3:1102,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1318,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:1056,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:765,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1333,0:.: 1.29:0.999:. ./.:4:586,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:285,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:1560,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:1164,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1048,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:928,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:996,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:995,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:768,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:523,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1124,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:489,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1025,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:756,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1201,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:318,0:.:-1.15:0.998:. ./.:4:666,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:690,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1008,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1369,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:628,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:367,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:732,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1443,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:484,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1110,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:636,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:381,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:802,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1359,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:1464,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1332,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:532,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:998,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:310,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:1812,1:.: 2.45:1.000:. ./.:4:1564,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:846,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1476,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:295,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:714,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:910,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:980,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1234,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:523,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1223,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:1214,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:746,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1025,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:352,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1020,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1377,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:1039,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:328,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1189,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1034,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1122,0:.: 0.78:1.000:. ./.:3:468,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1068,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1272,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:829,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1040,0:.: 0.59:1.000:. -chr3.1 2587746 chr3.1_002587746 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,204:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,245:.: 1.05:1.000:. ./.:4:76,148:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.21:1.000:. ./.:4:86,232:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.23:1.000:. ./.:4:61,198:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,34:.:-2.04:1.000:. ./.:4:32,48:.:-1.37:1.000:. ./.:4:102,46:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,154:.: 0.49:1.000:. ./.:4:69,138:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,218:.: 1.63:1.000:. ./.:4:66,128:.: 0.30:1.000:. ./.:4:148,149:.: 1.81:1.000:. ./.:4:60,139:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,266:.: 1.36:1.000:. ./.:4:14,28:.:-1.92:1.000:. ./.:4:52,122:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.39:1.000:. ./.:4:14,33:.:-1.85:1.000:. ./.:4:88,272:.: 2.73:1.000:. ./.:4:0,345:.: 2.51:1.000:. ./.:4:51,166:.: 0.64:1.000:. ./.:4:66,207:.: 1.46:1.000:. ./.:4:58,169:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.20:1.000:. ./.:4:16,30:.:-1.86:1.000:. ./.:4:14,28:.:-1.92:1.000:. ./.:3:12,17:.:-2.11:0.993:. ./.:4:57,205:.: 1.30:1.000:. ./.:4:61,209:.: 1.42:1.000:. ./.:4:70,171:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,97:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.08:1.000:. ./.:4:29,73:.:-1.04:1.000:. ./.:4:40,156:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,91:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.40:1.000:. ./.:4:30,62:.:-1.19:1.000:. ./.:4:46,148:.: 0.30:1.000:. ./.:4:57,178:.: 0.90:1.000:. ./.:4:144,292:.: 3.85:1.000:. ./.:4:41,101:.:-0.46:1.000:. ./.:4:58,130:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,81:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.52:1.000:. ./.:4:47,112:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,153:.: 0.35:1.000:. ./.:4:44,104:.:-0.37:1.000:. ./.:4:55,207:.: 1.30:1.000:. ./.:4:42,104:.:-0.40:1.000:. ./.:4:54,108:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,131:.:-0.02:1.000:. ./.:6:17,105:.:-0.75:1.000:. ./.:4:43,97:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.87:1.000:. ./.:4:19,118:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,73:.:-1.47:1.000:. ./.:4:46,129:.: 0.02:1.000:. ./.:5:51,121:.:-0.02:0.993:. ./.:4:81,43:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,190:.: 1.08:1.000:. ./.:4:64,110:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,54:.:-1.18:1.000:. ./.:4:42,114:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,100:.:-0.43:1.000:. ./.:4:41,115:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,66:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,84:.:-0.96:1.000:. ./.:5:59,81:.:-0.49:0.990:. ./.:4:0,139:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,121:.:-0.24:1.000:. ./.:4:45,157:.: 0.42:1.000:. ./.:5:95,143:.: 0.95:0.928:. ./.:4:36,103:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,79:.:-0.94:1.000:. ./.:4:25,108:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,88:.:-1.25:1.000:. ./.:4:39,144:.: 0.14:1.000:. ./.:4:39,118:.:-0.24:0.976:. ./.:4:42,83:.:-0.71:1.000:. ./.:4:38,159:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,62:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,189:.: 0.24:1.000:. ./.:4:24,91:.:-0.85:1.000:. ./.:4:48,32:.:-1.37:1.000:. ./.:4:28,85:.:-0.88:1.000:. ./.:4:43,106:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,140:.: 0.14:1.000:. ./.:4:10,61:.:-1.50:1.000:. ./.:4:36,140:.: 0.04:1.000:. ./.:4:17,98:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.44:1.000:. ./.:4:36,115:.:-0.33:1.000:. ./.:4:52,173:.: 0.76:1.000:. ./.:3:0,212:.: 0.57:1.000:. ./.:4:37,145:.: 0.13:1.000:. ./.:4:17,120:.:-0.53:1.000:. ./.:4:83,248:.: 2.31:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.80:0.999:. ./.:4:71,74:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,127:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.39:1.000:. ./.:4:22,65:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,147:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.83:1.000:. ./.:4:46,152:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,253:.: 1.17:1.000:. ./.:4:47,66:.:-0.88:1.000:. ./.:4:39,92:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,113:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,83:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.37:1.000:. ./.:4:26,67:.:-1.18:1.000:. ./.:4:29,106:.:-0.56:1.000:. ./.:4:44,157:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,65:.:-1.59:0.998:. ./.:4:47,88:.:-0.56:1.000:. ./.:4:46,158:.: 0.45:1.000:. ./.:4:58,109:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,183:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.83:1.000:. ./.:4:33,70:.:-1.03:1.000:. ./.:4:24,92:.:-0.84:1.000:. ./.:4:27,137:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.97:1.000:. ./.:4:52,142:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,72:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.02:1.000:. ./.:4:68,149:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,165:.: 0.52:1.000:. ./.:4:57,147:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,23:.:-2.20:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,301:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,160:.: 0.64:1.000:. ./.:4:46,127:.:-0.01:0.999:. ./.:4:67,212:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.28:1.000:. ./.:4:46,151:.: 0.35:1.000:. ./.:4:55,168:.: 0.73:1.000:. ./.:4:65,259:.: 2.21:1.000:. ./.:4:89,195:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,156:.: 0.30:1.000:. ./.:4:78,220:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.24:1.000:. ./.:4:63,173:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,267:.: 1.37:1.000:. ./.:4:48,146:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.74:1.000:. ./.:4:51,89:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,226:.: 2.18:1.000:. ./.:4:49,142:.: 0.26:1.000:. ./.:4:59,204:.: 1.31:1.000:. ./.:4:43,186:.: 0.81:1.000:. ./.:3:1,223:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,244:.: 1.03:1.000:. ./.:4:1,264:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.71:1.000:. ./.:4:66,155:.: 0.70:1.000:. -chr3.1 3296425 chr3.1_003296425 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,107:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,184:.: 1.27:1.000:. ./.:4:1,88:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,193:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,213:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,55:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,104:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,124:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,208:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:0,190:.: 1.38:1.000:. ./.:4:1,174:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,208:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.06:1.000:. ./.:3:0,32:.:-1.51:0.993:. ./.:4:1,117:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,195:.: 1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,105:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,87:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,106:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,105:.:-0.16:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.06:1.000:. ./.:6:0,29:.:-1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,165:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,192:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,100:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.03:1.000:. ./.:5:0,106:.:-0.16:0.993:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,117:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,63:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,191:.: 1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,101:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,86:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,103:.:-0.19:1.000:. ./.:5:0,94:.:-0.38:0.990:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,93:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,72:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,148:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.08:0.976:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,201:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,96:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,220:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,200:.: 1.56:1.000:. ./.:3:0,219:.: 1.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,71:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,177:.: 1.14:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,72:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,61:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,145:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,201:.: 1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,191:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,202:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,106:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,163:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,125:.: 0.19:0.998:. ./.:4:0,73:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,89:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,65:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,202:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,266:.: 2.77:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,111:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,111:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,182:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.71:0.999:. ./.:4:0,101:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,170:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,180:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,189:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,115:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.57:1.000:. ./.:3:0,219:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,241:.: 2.31:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:1,99:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.39:1.000:. -chr3.1 3544214 chr3.1_003544214 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:120,69:0.41: 1.23:1.000:0.889 0/0/0/1:4:150,35:0.22: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,3:0.02: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,35:0.48:-1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,124:0.59: 1.64:1.000:0.883 0/0/0/0:4:121,9:0.08:-0.03:1.000:0.991 0/0/0/1:4:133,35:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,41:0.30: 0.50:1.000:0.984 0/0/0/1:4:152,29:0.18: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,11:0.27:-1.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,23:0.63:-2.09:1.000:0.582 0/0/1/1:4:59,42:0.47:-0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:99,55:0.41: 0.48:1.000:0.834 0/0/1/1:4:70,42:0.43:-0.42:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,37:0.38:-0.44:1.000:0.551 0/0/1/1:4:61,82:0.57: 0.25:1.000:0.935 0/0/1/1:4:58,37:0.44:-0.78:1.000:0.970 0/0/1/1:4:54,48:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:158,47:0.26: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,9:0.24:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,37:0.47:-0.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:143,84:0.42: 2.05:1.000:0.914 0/0/1/1:4:58,55:0.53:-0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:13,5:0.32:-2.44:1.000:0.963 0/0/0/1:4:118,46:0.32: 0.70:1.000:0.956 0/0/0/1:4:140,28:0.19: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,5:0.07:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,52:0.44: 0.05:1.000:0.968 0/0/1/1:4:45,29:0.44:-1.23:1.000:0.974 0/0/0/1:4:123,58:0.36: 1.06:1.000:0.640 0/0/1/1:4:66,38:0.41:-0.59:1.000:0.890 0/0/0/0:4:37,2:0.06:-1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,24:0.75:-2.24:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:50,23:0.36:-1.26:1.000:0.712 0/0/1/1:4:57,75:0.57: 0.01:1.000:0.944 0/0/0/1:4:112,39:0.29: 0.42:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,41:0.27: 0.83:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,49:0.53:-0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,81:0.54: 0.55:1.000:0.986 0/0/1/1:4:60,75:0.56: 0.07:1.000:0.960 0/0/1/1:4:70,42:0.43:-0.42:1.000:0.934 0/0/1/1:4:78,44:0.41:-0.20:1.000:0.860 0/0/1/1:4:70,51:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,33:0.52:-1.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,33:0.43:-0.93:1.000:0.934 0/0/1/1:4:76,76:0.53: 0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,47:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,83:0.36: 2.82:1.000:0.706 0/0/0/1:4:136,46:0.29: 1.08:1.000:0.993 0/0/0/0:4:154,13:0.09: 0.76:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,4:0.03:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,79:0.56: 0.25:1.000:0.963 0/0/1/1:4:75,46:0.43:-0.23:1.000:0.950 0/0/1/1:4:62,37:0.42:-0.70:1.000:0.929 0/0/1/1/1/1:6:42,63:0.59:-0.57:1.000:0.553 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,44:0.21: 2.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,43:0.23: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,44:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:120,33:0.25: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,114:0.62: 0.89:1.000:0.547 0/0/1/1:4:53,78:0.59:-0.01:1.000:0.885 0/0/1/1:4:57,56:0.53:-0.40:1.000:0.992 0/0/0/1/1:5:86,40:0.36:-0.12:0.993:0.934 0/0/1/1:4:43,39:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,84:0.54: 0.68:1.000:0.987 0/0/0/1:4:111,33:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:252,6:0.03: 2.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,74:0.56: 0.03:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,40:0.38:-0.29:1.000:0.632 0/0/0/1:4:121,41:0.29: 0.65:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,48:0.46:-0.29:1.000:0.988 0/0/0/0/1:5:91,10:0.11:-0.66:0.990:0.919 0/0/1/1:4:76,62:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:166,51:0.27: 1.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,58:0.53:-0.27:1.000:0.993 0/0/0/1/1:5:100,41:0.33: 0.20:0.928:0.797 0/0/0/1:4:152,46:0.26: 1.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,37:0.46:-0.87:1.000:0.988 0/0/0/1:4:101,11:0.11:-0.42:1.000:0.543 0/0/0/1:4:95,30:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,53:0.33: 1.08:1.000:0.917 0/0/1/1:4:69,84:0.56: 0.46:0.976:0.967 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,14:0.11: 0.31:1.000:0.541 0/0/0/0:4:116,4:0.04:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,73:0.53: 0.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:133,50:0.31: 1.11:1.000:0.972 0/0/1/1:4:47,25:0.39:-1.28:1.000:0.737 0/0/1/1:4:40,37:0.52:-1.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,78:0.55: 0.29:1.000:0.975 0/0/0/0:4:125,7:0.06: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,60:0.34: 1.43:1.000:0.839 0/0/0/1:4:170,41:0.22: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,8:0.08:-0.46:1.000:0.982 0/0/1/1:4:77,45:0.42:-0.20:1.000:0.909 0/0/0/1:4:82,29:0.30:-0.44:1.000:0.987 0/0/0/1:4:121,32:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,21:0.18: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,32:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/1:3:150,64:0.34: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,45:0.46:-0.42:1.000:0.985 0/0/0/1:4:117,29:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,45:0.44:-0.35:1.000:0.973 0/0/0/1:4:172,27:0.15: 1.45:0.999:0.992 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,27:0.31:-0.72:1.000:0.968 0/0/0/1:4:131,41:0.27: 0.87:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,54:0.37: 0.78:1.000:0.626 0/0/1/1:4:59,70:0.56:-0.05:1.000:0.972 0/0/0/1:4:114,28:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,41:0.31: 0.44:1.000:0.978 0/0/1/1:4:52,41:0.50:-0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,46:0.28: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,56:0.43: 0.33:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,26:0.35:-1.02:1.000:0.777 0/0/0/0:4:130,6:0.05: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,34:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,13:0.10: 0.27:1.000:0.733 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,38:0.42:-0.63:1.000:0.925 0/0/1/1:4:50,57:0.55:-0.53:1.000:0.979 0/0/1/1:4:76,48:0.44:-0.16:0.998:0.966 0/0/1/1:4:64,62:0.53:-0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:69,65:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,44:0.43:-0.31:1.000:0.938 0/0/1/1:4:70,48:0.46:-0.29:1.000:0.988 0/0/1/1:4:83,41:0.38:-0.16:1.000:0.510 0/0/1/1:4:53,35:0.45:-0.93:1.000:0.981 0/0/1/1:4:58,40:0.46:-0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:69,69:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:124,52:0.34: 0.96:1.000:0.894 0/0/0/0:4:83,4:0.05:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,27:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,80:0.38: 2.35:1.000:0.530 0/0/0/1:4:75,34:0.35:-0.48:1.000:0.750 0/0/1/1:4:53,53:0.53:-0.55:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,44:0.29: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,81:0.53: 0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,35:0.40:-0.70:1.000:0.803 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,82:0.60: 0.05:1.000:0.827 0/0/0/1:4:20,4:0.19:-2.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,35:0.31:-0.10:1.000:0.968 0/0/0/1:4:231,52:0.21: 3.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,78:0.38: 2.18:1.000:0.572 0/0/0/1:4:117,33:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,46:0.33: 0.55:1.000:0.908 0/0/1/1:4:62,54:0.51:-0.33:0.999:0.996 0/0/1/1:4:70,43:0.43:-0.40:1.000:0.951 0/0/0/1:4:100,39:0.32: 0.16:1.000:0.956 0/0/0/0:4:79,3:0.04:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,35:0.32:-0.12:1.000:0.963 0/0/0/1:4:102,11:0.11:-0.40:1.000:0.512 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,113:0.63: 0.80:1.000:0.525 0/0/0/0:4:168,3:0.02: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,36:0.31: 0.01:1.000:0.973 0/0/1/1:4:60,68:0.55:-0.08:1.000:0.979 0/0/0/1:4:47,22:0.36:-1.34:1.000:0.663 0/0/0/1:4:93,34:0.30:-0.10:1.000:0.981 0/0/0/1:4:177,33:0.18: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,35:0.27: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,84:0.60: 0.05:1.000:0.756 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,59:0.55:-0.40:1.000:0.984 0/0/0/0:4:124,8:0.07: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/0:4:115,8:0.07:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,46:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/1:3:106,38:0.30: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,78:0.38: 2.14:1.000:0.613 0/0/1/1:4:70,116:0.60: 1.17:1.000:0.773 0/0/0/1:4:94,24:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,31:0.22: 0.57:1.000:1.000 -chr3.1 3630998 chr3.1_003630998 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:25,34:0.53:-0.59:1.000:0.991 0/1/1/1:4:17,66:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,76:0.78: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,20:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,26:0.26: 1.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,56:0.52: 1.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,42:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,18:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,68:0.76: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.39:-2.57:1.000:0.734 0/0/0/1:4:20,7:0.24:-2.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,16:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,55:0.58: 0.93:1.000:0.908 0/0/0/1:4:47,19:0.26:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,49:0.51: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,19:0.29:-0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:57,53:0.44: 2.08:1.000:0.972 0/0/0/1:4:72,27:0.25: 1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,55:0.49: 1.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,8:0.32:-2.47:1.000:0.955 0/0/0/1:4:46,26:0.33: 0.09:1.000:0.914 0/0/1/1:4:35,44:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,11:0.19:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-2.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,40:0.44: 0.67:1.000:0.972 0/1/1/1:4:17,41:0.66:-0.64:1.000:0.888 0/0/1/1:4:30,38:0.52:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,23:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,19:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,44:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,37:0.43: 0.46:1.000:0.948 0/0/1/1:4:9,9:0.46:-2.73:1.000:0.988 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0:3:9,0:0.00:-3.20:0.993:1.000 0/0/0/1:4:56,27:0.30: 0.67:1.000:0.986 0/0/0/1:4:45,27:0.34: 0.09:1.000:0.838 0/0/1/1:4:35,56:0.57: 1.09:1.000:0.941 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,54:0.56: 0.98:1.000:0.961 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,18:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,18:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,12:0.24:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,22:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,23:0.35:-0.48:1.000:0.823 0/0/0/1:4:39,26:0.37:-0.27:1.000:0.595 0/0/0/1:4:8,2:0.18:-3.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,19:0.31:-0.74:1.000:0.971 0/0/1/1:4:17,13:0.40:-2.10:1.000:0.777 0/0/0/1:4:36,16:0.28:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,50:0.57: 0.62:1.000:0.955 0/0/1/1:4:51,45:0.43: 1.35:1.000:0.949 0/0/1/1:4:44,45:0.47: 0.98:1.000:0.990 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,42:0.59:-0.22:1.000:0.846 0/0/1/1:4:40,31:0.40: 0.04:1.000:0.803 0/0/0/1:4:63,17:0.19: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,15:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:48,9:0.14:-0.69:1.000:0.994 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,64:0.69: 0.88:1.000:0.976 0/0/1/1:4:49,35:0.38: 0.72:1.000:0.608 0/0/0/1:4:38,11:0.21:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,52:0.53: 1.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:48,11:0.17:-0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,16:0.33:-1.32:1.000:0.934 0/0/0/1:4:46,14:0.21:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:58,15:0.19: 0.15:0.993:0.998 0/0/0/1:4:37,10:0.20:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,17:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,23:0.52:-1.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,71:0.75: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,18:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,1:0.01: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,17:0.22:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,42:0.44: 0.88:1.000:0.973 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,24:0.28: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/1/1:5:33,29:0.43:-0.43:0.990:0.940 0/0/0/1:4:61,28:0.29: 0.98:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,60:0.52: 1.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:33,21:0.36:-0.85:1.000:0.719 0/0/0/0/1:5:64,13:0.15: 0.35:0.928:0.998 0/0/1/1:4:50,44:0.43: 1.24:1.000:0.948 0/0/0/1:4:48,18:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,34:0.60:-0.90:1.000:0.808 0/0/1/1:4:33,37:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,42:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,18:0.27:-0.48:0.976:0.998 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,53:0.49: 1.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,47:0.81:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,23:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,50:0.52: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:50,16:0.22:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,11:0.20:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,16:0.21:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.43: 0.35:1.000:0.947 0/0/1/1:4:27,32:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,49:0.53: 0.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,29:0.47:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:66,19:0.20: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,27:0.40:-0.43:1.000:0.794 0/0/1/1:4:44,54:0.51: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,46:0.58: 0.20:1.000:0.921 0/0/1/1:4:30,37:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1:3:48,56:0.50: 1.77:1.000:0.575 0/0/0/1:4:44,18:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,45:0.67:-0.38:1.000:0.923 0/0/0/1:4:61,25:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,50:0.67:-0.01:0.999:0.923 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,11:0.32:-2.00:1.000:0.964 0/1/1/1:4:22,56:0.67: 0.41:1.000:0.937 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,44:0.59:-0.06:1.000:0.837 0/0/0/1:4:56,22:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,38:0.52:-0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,39:0.45: 0.46:1.000:0.984 0/0/0/1:4:53,18:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,33:0.41: 0.20:1.000:0.864 0/0/1/1:4:39,43:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,22:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,37:0.44: 0.35:1.000:0.970 0/0/1/1:4:25,33:0.53:-0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,41:0.73:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,20:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,23:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,18:0.54:-2.05:0.998:0.989 0/0/0/1:4:49,16:0.23:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,16:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,19:0.31:-0.74:1.000:0.971 0/0/0/1:4:42,23:0.32:-0.27:1.000:0.939 0/0/1/1:4:31,24:0.40:-0.79:1.000:0.801 0/0/0/1:4:56,17:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,13:0.21:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,18:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,37:0.47: 0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:29,35:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,28:0.42:-0.43:1.000:0.893 0/0/1/1:4:40,54:0.53: 1.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,31:0.28: 1.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,19:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,47:0.64:-0.06:1.000:0.659 0/0/0/1:4:57,25:0.28: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,16:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,18:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,7:0.27:-2.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,31:0.54:-0.90:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,84:0.73: 1.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,42:0.59:-0.22:1.000:0.846 0/0/1/1:4:41,58:0.54: 1.50:1.000:0.986 0/0/1/1:4:33,54:0.58: 0.88:1.000:0.925 0/0/0/1:4:47,25:0.32: 0.09:0.999:0.957 0/0/0/1:4:46,26:0.33: 0.09:1.000:0.914 0/0/1/1:4:30,33:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,37:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,39:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,43:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,61:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,24:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,65:0.70: 0.88:1.000:0.988 0/0/1/1:4:42,36:0.42: 0.41:1.000:0.930 0/0/0/1:4:47,15:0.22:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,17:0.26:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,36:0.47: 0.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:22,72:0.72: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,50:0.57: 0.56:1.000:0.936 0/0/1/1:4:28,24:0.42:-0.95:1.000:0.930 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,31:0.31: 1.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:33,56:0.59: 0.98:1.000:0.888 0/0/1/1:4:36,52:0.55: 0.93:1.000:0.982 0/0/0/1:4:44,29:0.37: 0.15:1.000:0.627 0/0/1:3:45,53:0.50: 1.45:1.000:0.539 0/0/1/1:4:36,49:0.53: 0.77:1.000:0.991 0/0/0/1:4:75,39:0.31: 2.29:1.000:0.967 0/0/1/1:4:39,39:0.46: 0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,37:0.49:-0.06:1.000:0.997 -chr3.1 3759869 chr3.1_003759869 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.56:1.000:. ./.:3:16,0:.:-1.34:0.993:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:125,0:.: 3.65:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.40:1.000:. ./.:6:95,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.05:1.000:. ./.:5:79,0:.: 1.55:0.993:. ./.:4:43,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.46:1.000:. ./.:5:55,0:.: 0.45:0.990:. ./.:4:77,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:5:49,0:.: 0.18:0.928:. ./.:4:63,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:0.976:. ./.:4:52,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.88:1.000:. ./.:3:70,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.50:0.999:. ./.:4:57,2:.: 0.63:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:0.998:. ./.:4:37,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:28,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:3:39,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. -chr3.1 3920560 chr3.1_003920560 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:133,386:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,324:.:-0.17:1.000:. ./.:4:112,310:.:-0.43:1.000:. ./.:4:214,240:.:-0.16:1.000:. ./.:4:158,437:.: 1.04:1.000:. ./.:4:164,435:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,501:.: 0.24:1.000:. ./.:4:170,408:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,550:.: 0.66:1.000:. ./.:4:62,151:.:-2.22:1.000:. ./.:4:56,121:.:-2.53:1.000:. ./.:4:167,401:.: 0.81:1.000:. ./.:4:141,401:.: 0.59:1.000:. ./.:4:151,432:.: 0.94:1.000:. ./.:4:289,253:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,611:.: 1.18:1.000:. ./.:4:156,437:.: 1.03:1.000:. ./.:4:141,366:.: 0.29:1.000:. ./.:4:436,320:.: 2.42:1.000:. ./.:4:154,512:.: 1.65:1.000:. ./.:4:5,187:.:-2.40:1.000:. ./.:4:290,239:.: 0.48:1.000:. ./.:4:172,411:.: 0.94:1.000:. ./.:4:287,279:.: 0.80:1.000:. ./.:4:27,134:.:-2.66:1.000:. ./.:4:0,607:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,580:.: 0.92:1.000:. ./.:4:148,378:.: 0.45:1.000:. ./.:4:145,450:.: 1.04:1.000:. ./.:4:168,455:.: 1.28:1.000:. ./.:4:370,362:.: 2.21:1.000:. ./.:4:229,222:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,71:.:-3.34:1.000:. ./.:4:95,117:.:-2.23:1.000:. ./.:3:34,72:.:-3.13:0.993:. ./.:4:159,422:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,533:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,579:.: 0.91:1.000:. ./.:4:270,266:.: 0.54:1.000:. ./.:4:344,282:.: 1.31:1.000:. ./.:4:128,334:.:-0.09:1.000:. ./.:4:108,324:.:-0.35:1.000:. ./.:4:110,375:.: 0.10:1.000:. ./.:4:210,235:.:-0.24:1.000:. ./.:4:278,255:.: 0.51:1.000:. ./.:4:106,320:.:-0.40:1.000:. ./.:4:152,417:.: 0.82:1.000:. ./.:4:119,378:.: 0.21:1.000:. ./.:4:241,250:.: 0.16:1.000:. ./.:4:146,402:.: 0.64:1.000:. ./.:4:215,178:.:-0.68:1.000:. ./.:4:146,405:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,386:.:-0.74:1.000:. ./.:4:121,362:.: 0.09:1.000:. ./.:4:226,204:.:-0.37:1.000:. ./.:4:129,415:.: 0.61:1.000:. ./.:4:123,321:.:-0.25:1.000:. ./.:4:284,235:.: 0.39:1.000:. ./.:4:126,314:.:-0.28:1.000:. ./.:6:123,203:.:-1.25:1.000:. ./.:4:242,201:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,450:.:-0.19:1.000:. ./.:4:289,278:.: 0.80:1.000:. ./.:4:120,338:.:-0.13:1.000:. ./.:4:265,231:.: 0.20:1.000:. ./.:4:123,323:.:-0.23:1.000:. ./.:4:146,406:.: 0.68:1.000:. ./.:4:114,329:.:-0.25:1.000:. ./.:5:279,253:.: 0.51:0.993:. ./.:4:102,302:.:-0.59:1.000:. ./.:4:270,256:.: 0.45:1.000:. ./.:4:94,278:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,548:.: 0.64:1.000:. ./.:4:154,397:.: 0.67:1.000:. ./.:4:271,209:.: 0.06:1.000:. ./.:4:222,195:.:-0.48:1.000:. ./.:4:234,208:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.63:1.000:. ./.:4:117,326:.:-0.25:1.000:. ./.:4:273,241:.: 0.35:1.000:. ./.:5:0,319:.:-1.31:0.990:. ./.:4:242,245:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,501:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,436:.:-0.31:1.000:. ./.:5:121,523:.: 1.46:0.928:. ./.:4:0,468:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,258:.:-1.01:1.000:. ./.:4:89,260:.:-1.06:1.000:. ./.:4:215,194:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,414:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,446:.:-0.23:0.976:. ./.:4:218,200:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,333:.:-0.26:1.000:. ./.:4:93,261:.:-1.01:1.000:. ./.:4:123,356:.: 0.05:1.000:. ./.:4:128,414:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,203:.:-1.59:1.000:. ./.:4:106,280:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,461:.:-0.10:1.000:. ./.:4:117,363:.: 0.06:1.000:. ./.:4:138,407:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,492:.: 0.16:1.000:. ./.:4:81,188:.:-1.74:1.000:. ./.:4:97,269:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,364:.:-0.93:1.000:. ./.:4:101,285:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,412:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,576:.: 0.88:1.000:. ./.:3:152,444:.: 1.05:1.000:. ./.:4:127,317:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,347:.:-1.07:1.000:. ./.:4:178,505:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,379:.:-0.80:0.999:. ./.:4:0,460:.:-0.11:1.000:. ./.:4:79,234:.:-1.36:1.000:. ./.:4:1,354:.:-1.01:1.000:. ./.:4:184,187:.:-0.87:1.000:. ./.:4:96,318:.:-0.50:1.000:. ./.:4:182,196:.:-0.81:1.000:. ./.:4:201,195:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,418:.:-0.47:1.000:. ./.:4:170,171:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,491:.: 0.16:1.000:. ./.:4:140,425:.: 0.79:1.000:. ./.:4:188,187:.:-0.83:1.000:. ./.:4:254,234:.: 0.13:1.000:. ./.:4:117,317:.:-0.33:1.000:. ./.:4:97,312:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,304:.:-1.44:1.000:. ./.:4:179,154:.:-1.19:1.000:. ./.:4:73,262:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.47:1.000:. ./.:4:85,207:.:-1.54:0.998:. ./.:4:107,294:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,433:.:-0.34:1.000:. ./.:4:349,376:.: 2.15:1.000:. ./.:4:130,396:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,338:.:-1.15:1.000:. ./.:4:90,246:.:-1.17:1.000:. ./.:4:76,230:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,446:.:-0.23:1.000:. ./.:4:101,287:.:-0.72:1.000:. ./.:4:124,367:.: 0.16:1.000:. ./.:4:96,252:.:-1.07:1.000:. ./.:4:163,469:.: 1.36:1.000:. ./.:4:287,313:.: 1.09:1.000:. ./.:4:271,272:.: 0.60:1.000:. ./.:4:97,360:.:-0.13:1.000:. ./.:4:324,296:.: 1.26:1.000:. ./.:4:113,377:.: 0.15:1.000:. ./.:4:170,438:.: 1.15:1.000:. ./.:4:120,388:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,92:.:-2.83:1.000:. ./.:4:98,272:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,602:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,495:.: 0.19:1.000:. ./.:4:298,294:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,644:.: 1.46:1.000:. ./.:4:106,343:.:-0.20:0.999:. ./.:4:157,443:.: 1.09:1.000:. ./.:4:263,236:.: 0.22:1.000:. ./.:4:100,321:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,513:.: 0.34:1.000:. ./.:4:150,399:.: 0.65:1.000:. ./.:4:151,447:.: 1.07:1.000:. ./.:4:124,423:.: 0.63:1.000:. ./.:4:150,375:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,480:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,475:.: 0.02:1.000:. ./.:4:244,261:.: 0.27:1.000:. ./.:4:115,368:.: 0.09:1.000:. ./.:4:202,214:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,499:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,462:.:-0.09:1.000:. ./.:4:112,314:.:-0.40:1.000:. ./.:4:125,330:.:-0.15:1.000:. ./.:4:204,521:.: 2.15:1.000:. ./.:4:130,449:.: 0.91:1.000:. ./.:4:127,385:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,471:.:-0.02:1.000:. ./.:3:306,306:.: 1.19:1.000:. ./.:4:185,542:.: 2.17:1.000:. ./.:4:205,473:.: 1.75:1.000:. ./.:4:244,248:.: 0.16:1.000:. ./.:4:124,352:.: 0.03:1.000:. -chr3.1 4000939 chr3.1_004000939 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,303:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,305:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,370:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,67:.:-2.98:1.000:. ./.:4:0,68:.:-2.97:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,368:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,354:.: 1.07:1.000:. ./.:4:88,190:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,388:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,354:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,60:.:-3.08:1.000:. ./.:4:1,296:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,291:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,25:.:-3.58:1.000:. ./.:4:0,412:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,366:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,394:.: 1.63:1.000:. ./.:4:1,296:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,34:.:-3.45:1.000:. ./.:4:0,53:.:-3.18:1.000:. ./.:3:0,22:.:-3.62:0.993:. ./.:4:0,301:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,361:.: 1.17:1.000:. ./.:4:1,352:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,363:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,287:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.43:1.000:. ./.:4:2,463:.: 2.64:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,348:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,357:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,204:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,373:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.08:1.000:. ./.:6:0,215:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,201:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.08:1.000:. ./.:5:0,298:.: 0.28:0.993:. ./.:4:0,249:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.64:1.000:. ./.:4:1,183:.:-1.33:1.000:. ./.:4:1,376:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,274:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1,310:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.91:1.000:. ./.:5:0,241:.:-0.53:0.990:. ./.:4:0,327:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.54:1.000:. ./.:5:0,424:.: 2.06:0.928:. ./.:4:0,288:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.87:0.976:. ./.:4:0,259:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,348:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,275:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,180:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,325:.: 0.66:1.000:. ./.:3:0,323:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,295:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,368:.: 1.27:1.000:. ./.:4:1,227:.:-0.71:0.999:. ./.:4:1,317:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,200:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,269:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,203:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,310:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,157:.:-1.71:0.998:. ./.:4:0,270:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,303:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,275:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,201:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,360:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,355:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,43:.:-3.32:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,387:.: 1.53:1.000:. ./.:4:1,288:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,328:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.36:0.999:. ./.:4:0,318:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,301:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,273:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,263:.:-0.22:1.000:. ./.:4:2,233:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,264:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,393:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.40:1.000:. ./.:3:0,309:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,410:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,275:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.05:1.000:. -chr3.1 4179505 chr3.1_004179505 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:65,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:77,14:.: 1.51:1.000:. ./.:4:82,12:.: 1.62:1.000:. ./.:4:36,21:.: 0.25:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.42:1.000:. ./.:4:23,16:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.20:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:56,13:.: 0.69:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:11,22:.:-0.64:1.000:. ./.:4:77,16:.: 1.58:1.000:. ./.:4:33,27:.: 0.36:1.000:. ./.:4:77,22:.: 1.81:1.000:. ./.:4:36,15:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,20:.: 1.18:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.79:1.000:. ./.:4:68,14:.: 1.18:1.000:. ./.:4:115,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:57,13:.: 0.73:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.68:1.000:. ./.:4:45,19:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,19:.: 0.47:1.000:. ./.:4:32,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.16:1.000:. ./.:4:33,10:.:-0.27:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.42:1.000:. ./.:3:2,2:.:-1.72:0.993:. ./.:4:13,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:21,23:.:-0.24:1.000:. ./.:4:29,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:79,21:.: 1.84:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:45,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.87:1.000:. ./.:4:87,7:.: 1.62:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:45,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:12,21:.:-0.64:1.000:. ./.:4:23,12:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:49,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:62,11:.: 0.84:1.000:. ./.:4:44,8:.: 0.06:1.000:. ./.:4:97,7:.: 1.99:1.000:. ./.:4:15,9:.:-0.98:1.000:. ./.:4:24,10:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,10:.: 0.92:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.94:1.000:. ./.:4:67,13:.: 1.10:1.000:. ./.:4:60,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:25,8:.:-0.64:1.000:. ./.:6:27,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:59,8:.: 0.62:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:15,6:.:-1.09:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:69,7:.: 0.95:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:15,8:.:-1.01:1.000:. ./.:5:55,5:.: 0.36:0.993:. ./.:4:71,20:.: 1.51:1.000:. ./.:4:53,8:.: 0.40:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.24:1.000:. ./.:4:26,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:69,20:.: 1.44:1.000:. ./.:4:94,4:.: 1.77:1.000:. ./.:4:45,10:.: 0.17:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.53:1.000:. ./.:4:64,15:.: 1.06:1.000:. ./.:4:66,9:.: 0.92:1.000:. ./.:5:11,11:.:-1.05:0.990:. ./.:4:42,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:22,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,16:.:-0.35:1.000:. ./.:5:12,20:.:-0.68:0.928:. ./.:4:21,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:12,12:.:-0.98:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.79:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:18,15:.:-0.64:1.000:. ./.:4:8,9:.:-1.24:0.976:. ./.:4:45,10:.: 0.17:1.000:. ./.:4:30,11:.:-0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:57,10:.: 0.62:1.000:. ./.:4:17,4:.:-1.09:1.000:. ./.:4:12,14:.:-0.90:1.000:. ./.:4:47,13:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,10:.:-1.05:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.57:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.75:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.50:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.13:1.000:. ./.:4:17,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,15:.:-0.53:1.000:. ./.:4:42,7:.:-0.05:1.000:. ./.:3:97,9:.: 2.07:1.000:. ./.:4:12,19:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.01:1.000:. ./.:4:25,38:.: 0.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:12,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:11,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:14,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:38,3:.:-0.35:1.000:. ./.:4:54,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:32,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,14:.:-0.57:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.57:1.000:. ./.:4:16,24:.:-0.38:1.000:. ./.:4:104,9:.: 2.33:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:49,5:.: 0.14:1.000:. ./.:4:11,6:.:-1.24:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.12:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.42:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:9,11:.:-1.13:1.000:. ./.:4:24,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.16:0.998:. ./.:4:60,25:.: 1.29:1.000:. ./.:4:23,13:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,9:.: 1.32:1.000:. ./.:4:24,12:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,3:.:-1.09:1.000:. ./.:4:30,8:.:-0.46:1.000:. ./.:4:11,5:.:-1.27:1.000:. ./.:4:19,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:38,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:19,10:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.13:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:64,8:.: 0.80:1.000:. ./.:4:91,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:14,3:.:-1.24:1.000:. ./.:4:83,13:.: 1.70:1.000:. ./.:4:8,18:.:-0.90:1.000:. ./.:4:86,19:.: 2.03:1.000:. ./.:4:89,11:.: 1.84:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:72,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:36,15:.: 0.02:1.000:. ./.:4:32,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:20,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:66,7:.: 0.84:0.999:. ./.:4:9,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:30,12:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:29,11:.:-0.38:1.000:. ./.:4:76,31:.: 2.10:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:64,8:.: 0.80:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,20:.:-0.12:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,15:.:-1.01:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,20:.:-0.01:1.000:. ./.:4:66,10:.: 0.95:1.000:. ./.:4:62,18:.: 1.10:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:29,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.68:1.000:. ./.:4:31,19:.:-0.01:1.000:. ./.:3:68,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:97,15:.: 2.29:1.000:. ./.:4:78,12:.: 1.47:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:72,13:.: 1.29:1.000:. -chr3.1 4703056 chr3.1_004703056 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,0:.: 3.96:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:6:7,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./.:5:15,0:.:-0.17:0.993:. ./.:4:53,0:.: 3.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.02:1.000:. ./.:5:25,0:.: 0.89:0.990:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./.:5:33,0:.: 1.74:0.928:. ./.:4:27,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.27:0.976:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:44,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:31,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.70:0.999:. ./.:4:13,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.95:1.000:. -chr3.1 4885531 chr3.1_004885531 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:334,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:452,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:277,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:127,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:403,2:.: 1.58:1.000:. ./.:4:281,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:421,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:371,2:.: 1.14:1.000:. ./.:4:337,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:355,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:334,2:.: 0.63:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:129,0:.:-2.22:1.000:. ./.:3:93,0:.:-2.72:0.993:. ./.:4:330,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:338,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.20:1.000:. ./.:6:208,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.22:1.000:. ./.:5:258,0:.:-0.45:0.993:. ./.:4:258,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.75:1.000:. ./.:5:198,0:.:-1.27:0.990:. ./.:4:310,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.28:1.000:. ./.:5:325,0:.: 0.48:0.928:. ./.:4:303,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.67:0.976:. ./.:4:239,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:319,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:368,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.13:1.000:. ./.:3:385,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:481,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:313,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:217,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:272,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:264,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.70:0.998:. ./.:4:301,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:459,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:407,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:133,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:451,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:378,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:340,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:444,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:373,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.51:1.000:. ./.:3:316,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:452,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.22:1.000:. -chr3.1 4945725 chr3.1_004945725 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:83,33:.: 0.34:1.000:. ./.:4:68,29:.:-0.42:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,31:.: 0.26:1.000:. ./.:4:111,27:.: 1.24:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:46,31:.:-1.23:1.000:. ./.:4:90,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:81,32:.: 0.22:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:67,36:.:-0.18:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,40:.: 0.43:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:110,36:.: 1.56:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:76,34:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,38:.: 0.63:1.000:. ./.:4:85,39:.: 0.67:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,36:.: 0.95:1.000:. ./.:4:65,26:.:-0.67:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:27,27:.:-2.17:1.000:. ./.:3:19,0:.:-3.58:0.993:. ./.:4:127,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:86,42:.: 0.83:1.000:. ./.:4:90,37:.: 0.79:1.000:. ./.:4:84,26:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:87,38:.: 0.71:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:105,33:.: 1.24:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:103,42:.: 1.52:1.000:. ./.:4:65,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:75,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:77,29:.:-0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:81,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:86,32:.: 0.43:1.000:. ./.:4:70,40:.: 0.10:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:61,11:.:-1.44:1.000:. ./.:4:83,39:.: 0.59:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,39:.: 0.63:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:78,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:105,48:.: 1.84:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.07:1.000:. ./.:5:88,33:.: 0.55:0.993:. ./.:4:63,18:.:-1.07:1.000:. ./.:4:92,45:.: 1.19:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:77,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:59,58:.: 0.39:1.000:. ./.:4:71,26:.:-0.42:1.000:. ./.:4:76,39:.: 0.30:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:94,34:.: 0.83:1.000:. ./.:4:90,46:.: 1.15:1.000:. ./.:5:97,0:.:-0.42:0.990:. ./.:4:84,39:.: 0.63:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.87:1.000:. ./.:5:108,0:.: 0.02:0.928:. ./.:4:148,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,28:.:-0.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.39:0.976:. ./.:4:64,29:.:-0.59:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:86,38:.: 0.67:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:69,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:73,38:.: 0.14:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:139,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.34:1.000:. ./.:3:111,26:.: 1.19:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.55:0.999:. ./.:4:130,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:80,34:.: 0.26:1.000:. ./.:4:57,23:.:-1.11:1.000:. ./.:4:91,32:.: 0.63:1.000:. ./.:4:79,20:.:-0.34:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:88,35:.: 0.63:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:91,27:.: 0.43:1.000:. ./.:4:83,32:.: 0.30:1.000:. ./.:4:84,25:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:66,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:59,23:.:-1.03:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:54,28:.:-1.03:0.998:. ./.:4:57,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:108,38:.: 1.56:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:75,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:86,37:.: 0.63:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:99,33:.: 0.99:1.000:. ./.:4:110,44:.: 1.88:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:98,47:.: 1.52:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:104,53:.: 2.00:1.000:. ./.:4:68,25:.:-0.59:1.000:. ./.:4:26,19:.:-2.53:1.000:. ./.:4:49,24:.:-1.40:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:106,50:.: 1.96:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:75,27:.:-0.22:0.999:. ./.:4:136,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:98,36:.: 1.07:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,11:.:-2.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:97,39:.: 1.15:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:91,34:.: 0.71:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:60,29:.:-0.75:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:58,29:.:-0.83:1.000:. ./.:4:66,35:.:-0.26:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.22:1.000:. ./.:3:105,41:.: 1.56:1.000:. ./.:4:101,41:.: 1.40:1.000:. ./.:4:105,47:.: 1.80:1.000:. ./.:4:91,35:.: 0.75:1.000:. ./.:4:77,26:.:-0.18:1.000:. -chr3.1 5156054 chr3.1_005156054 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:108,2:0.09: 1.90:1.000:0.938 0/0/0/1:4:35,6:0.29:-0.47:1.000:0.992 0/0/0/1:4:83,5:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,2:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,5:0.26: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,2:0.17: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,1:0.16:-0.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:29,1:0.17:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.51:-1.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,7:0.31:-0.57:1.000:0.979 0/0/0/0:4:77,1:0.06: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,1:0.07: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,4:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:6,1:0.29:-1.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:39,2:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,4:0.28:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:144,2:0.07: 3.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,2:0.12: 1.07:1.000:0.673 0/0/0/1:4:39,5:0.28:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.33:-1.74:1.000:0.903 0/0/0/1:4:38,3:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,2:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,2:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,4:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,1:0.06: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,1:0.04: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,1:0.07: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:2,1:0.37:-1.77:1.000:0.578 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-1.64:1.000:0.802 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:46,4:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,1:0.11:-0.30:1.000:0.557 0/0/0/1:4:47,8:0.29: 0.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:36,3:0.26:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,4:0.27:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,6:0.29:-0.50:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,2:0.17: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:32,9:0.32:-0.47:1.000:0.951 0/0/0/1:4:29,6:0.30:-0.68:1.000:0.984 0/0/0/1:4:86,3:0.17: 1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,8:0.42:-1.26:1.000:0.894 0/0/0/1:4:29,4:0.28:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,7:0.44:-1.40:1.000:0.965 0/0/0/1:4:39,4:0.27:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:61,2:0.16: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,1:0.05: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,1:0.06: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,7:0.59:-1.57:1.000:0.844 0/0/0/1:4:64,4:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:100,1:0.05: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:52,1:0.09:-0.06:1.000:0.856 0/0/0/1:4:59,2:0.16: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,6:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:73,2:0.13: 0.70:1.000:0.935 0/0/0/1:4:83,2:0.12: 1.04:1.000:0.708 0/0/0/1:4:41,7:0.29:-0.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:74,3:0.19: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.28:-1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,4:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:45,5:0.27:-0.16:0.993:0.812 0/0/0/1:4:36,3:0.26:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,4:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,1:0.08: 0.18:1.000:0.980 0/0/0/1:4:55,7:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,2:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,3:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,5:0.28:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:82,5:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,9:0.31:-0.26:1.000:0.974 0/0/0/1:4:46,3:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:35,6:0.29:-0.47:0.990:0.623 0/0/0/1:4:78,2:0.12: 0.87:1.000:0.852 0/0/0/1:4:61,2:0.16: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:126,2:0.08: 2.52:0.928:0.836 0/0/0/0:4:76,1:0.06: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,2:0.22:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,3:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,1:0.20:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,1:0.12:-0.40:1.000:0.673 0/0/0/1:4:79,3:0.18: 0.94:0.976:0.999 0/0/0/1:4:37,3:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,2:0.19:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,4:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,6:0.29:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:90,4:0.21: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,2:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,4:0.27:-0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:71,2:0.14: 0.63:1.000:0.955 0/0/0/0:4:89,2:0.11: 1.25:1.000:0.519 0/0/0/1:4:38,1:0.13:-0.54:1.000:0.892 0/0/0/1:4:38,2:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,4:0.31:-1.16:1.000:0.975 0/0/0/1:4:69,5:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/0:4:61,1:0.08: 0.25:1.000:0.987 0/0/0/0:4:102,2:0.10: 1.69:1.000:0.874 0/0/1/1:4:3,3:0.44:-1.67:1.000:0.965 0/0/0/1:4:28,5:0.29:-0.74:1.000:0.990 0/0/1:3:5,4:0.42:-1.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:87,1:0.06: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,2:0.15: 0.35:1.000:0.992 0/0/0/1:4:57,8:0.28: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:77,3:0.19: 0.87:0.999:1.000 0/0/0/1:4:41,2:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,2:0.19:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,1:0.16:-0.81:1.000:0.996 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,4:0.27:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,4:0.37:-1.47:1.000:0.578 0/0/0/1:4:69,5:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,4:0.51:-1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:3,4:0.47:-1.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,4:0.29:-0.88:1.000:0.993 0/0/0/1:4:35,4:0.27:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/0:4:69,1:0.07: 0.53:1.000:0.998 0/1/1/1:4:0,7:0.75:-1.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,5:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,2:0.13: 0.70:1.000:0.935 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.29:0.998:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.33:-1.74:1.000:0.903 0/0/0/1:4:43,1:0.11:-0.37:1.000:0.597 0/0/0/1:4:55,3:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,3:0.13: 2.14:1.000:0.892 0/0/0/0:4:70,1:0.07: 0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,3:0.48:-1.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,4:0.27:-0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:3,5:0.49:-1.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,2:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,3:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,2:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 2.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,1:0.06: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,3:0.13: 2.00:1.000:0.932 0/0/0/0:4:84,1:0.06: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,5:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.35:-1.53:1.000:0.745 0/0/0/1:4:31,3:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/0:4:59,1:0.08: 0.18:1.000:0.980 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,1:0.06: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,1:0.12:-0.40:1.000:0.673 0/0/0/1:4:29,3:0.27:-0.78:0.999:0.998 0/0/0/1:4:42,3:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,3:0.26:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,3:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:97,2:0.10: 1.52:1.000:0.778 0/0/0/0:4:48,1:0.10:-0.20:1.000:0.753 0/0/0/0:4:77,1:0.06: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,5:0.28:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:31,1:0.16:-0.78:1.000:0.993 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,2:0.11: 1.21:1.000:0.520 0/0/0/1:4:35,2:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:72,1:0.07: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,3:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,2:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,6:0.26: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,7:0.27: 0.90:1.000:0.998 0/0/0/0:4:80,1:0.06: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,1:0.09: 0.05:1.000:0.951 0/0/1:3:41,3:0.26:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.33:-1.74:1.000:0.903 0/0/0/0:4:85,1:0.06: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,4:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,2:0.20:-0.20:1.000:1.000 -chr3.1 5267797 chr3.1_005267797 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:661,139:0.22: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,338:0.77:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:467,136:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:440,353:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:226,509:0.72: 0.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:551,136:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:491,111:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:174,419:0.73:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:316,248:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,28:0.18:-2.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,83:0.45:-2.66:1.000:0.976 0/1/1/1:4:197,402:0.70:-0.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:539,149:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:353,315:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:325,256:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:379,323:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:164,455:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:544,144:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:495,384:0.48: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:704,194:0.26: 1.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,49:0.38:-3.06:1.000:0.569 0/0/1/1:4:358,267:0.47: 0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:429,310:0.47: 0.83:1.000:0.991 0/0/1/1:4:309,264:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,77:0.48:-2.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:369,308:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:436,302:0.46: 0.82:1.000:0.985 0/0/1/1:4:331,257:0.48:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:435,337:0.48: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:431,325:0.48: 0.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:627,183:0.27: 1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:272,248:0.52:-0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:88,40:0.36:-3.19:1.000:0.701 0/0/1/1:4:134,90:0.45:-2.56:1.000:0.979 0/1/1:3:30,28:0.53:-3.65:0.993:0.862 0/1/1/1:4:150,337:0.72:-0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:320,280:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:350,296:0.51: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:229,504:0.71: 0.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:434,290:0.45: 0.73:1.000:0.977 0/1/1/1:4:195,410:0.70:-0.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:527,133:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:402,351:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:302,272:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:414,272:0.44: 0.48:1.000:0.973 0/1/1/1:4:189,483:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:408,375:0.52: 1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:803,624:0.48: 5.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:333,262:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:218,501:0.72: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:160,426:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:410,340:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:300,252:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:541,137:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:302,260:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:643,165:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:154,339:0.71:-0.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:384,300:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:506,118:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:307,255:0.50:-0.33:1.000:0.889 0/0/1/1:4:343,307:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:362,231:0.44:-0.13:1.000:0.961 0/0/0/1:4:594,157:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:506,143:0.27: 0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:398,324:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:311,250:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:143,365:0.74:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:334,282:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:404,312:0.48: 0.68:0.993:0.662 0/1/1/1:4:168,409:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:196,495:0.74: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:320,237:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:192,483:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:182,432:0.73: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:171,396:0.72:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:312,268:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:337,263:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:549,149:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:140,378:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:357,283:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:128,287:0.72:-1.30:0.990:0.700 0/0/1/1:4:356,286:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:404,296:0.47: 0.57:1.000:0.992 0/1/1/1:4:155,385:0.74:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:598,310:0.39: 1.94:0.928:0.970 0/0/0/1:4:572,147:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:238,179:0.48:-1.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:428,120:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:305,248:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:334,233:0.46:-0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:347,247:0.46:-0.12:0.976:0.989 0/1/1/1:4:159,389:0.73:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:369,282:0.48: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:413,100:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:365,277:0.48: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:349,297:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:158,346:0.71:-0.71:1.000:0.993 0/1/1/1:4:135,323:0.73:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:365,312:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:564,148:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:575,121:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:368,287:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:225,201:0.52:-1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:376,293:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:471,117:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:468,135:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:117,333:0.76:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:393,297:0.48: 0.51:1.000:0.994 0/1/1:3:245,556:0.72: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:295,252:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:463,117:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:259,531:0.70: 1.17:1.000:0.984 0/0/0/1:4:577,159:0.26: 0.81:0.999:0.999 0/1/1/1:4:204,420:0.70: 0.07:1.000:0.985 0/0/0/1:4:456,105:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:387,150:0.33:-0.50:1.000:0.938 0/0/1/1:4:341,249:0.47:-0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:296,252:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:324,224:0.46:-0.43:1.000:0.985 0/0/1/1:4:294,230:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:181,469:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:323,263:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:191,460:0.73: 0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:198,415:0.70: 0.00:1.000:0.988 0/1/1/1:4:154,381:0.74:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:346,281:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:480,128:0.26:-0.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,446:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:343,106:0.28:-1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:256,202:0.49:-1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:446,111:0.25:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:297,260:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:218,158:0.47:-1.56:0.998:0.991 0/1/1/1:4:180,446:0.74: 0.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:156,394:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:502,379:0.48: 1.76:1.000:0.994 0/0/0/1:4:589,183:0.28: 1.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:328,290:0.52: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:161,370:0.72:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:273,220:0.49:-0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:181,461:0.74: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:335,248:0.47:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:291,245:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:249,194:0.49:-1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:657,187:0.27: 1.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:515,420:0.50: 2.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:544,155:0.27: 0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:337,262:0.48:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:399,332:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:305,251:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:201,544:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:333,254:0.48:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,79:0.41:-2.61:1.000:0.879 0/0/1/1:4:244,179:0.47:-1.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:365,344:0.53: 0.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:346,290:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:638,141:0.23: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:414,358:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:311,238:0.48:-0.42:0.999:0.995 0/1/1/1:4:201,459:0.72: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:474,120:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:293,248:0.51:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:373,269:0.47: 0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:553,140:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:186,439:0.73: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:518,155:0.28: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:147,385:0.75:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:133,317:0.73:-1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:321,284:0.52:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:467,132:0.27:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:494,114:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:268,196:0.47:-0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:572,135:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:309,240:0.48:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:322,219:0.45:-0.47:1.000:0.982 0/1/1/1:4:147,397:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:426,323:0.48: 0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:583,183:0.28: 1.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:514,114:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,258:0.58:-0.87:1.000:0.929 0/0/1:3:370,304:0.50: 0.40:1.000:0.523 0/1/1/1:4:214,547:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:447,347:0.48: 1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:463,109:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:171,481:0.76: 0.26:1.000:1.000 -chr3.1 5484673 chr3.1_005484673 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.92:1.000:. ./.:3:14,0:.:-2.73:0.993:. ./.:4:57,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:76,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.00:1.000:. ./.:5:93,0:.: 0.36:0.993:. ./.:4:121,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.75:1.000:. ./.:5:103,0:.: 0.75:0.990:. ./.:4:60,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.66:1.000:. ./.:5:124,0:.: 1.57:0.928:. ./.:4:109,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.43:0.976:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.08:1.000:. ./.:3:120,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:120,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.16:0.998:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:71,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:3:69,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.36:1.000:. -chr3.1 6085857 chr3.1_006085857 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:58,413:.: 0.38:1.000:. ./.:4:127,750:.: 2.79:1.000:. ./.:4:64,357:.: 0.08:1.000:. ./.:4:57,522:.: 1.02:1.000:. ./.:4:56,503:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,388:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,155:.:-1.28:1.000:. ./.:4:1,483:.: 0.46:1.000:. ./.:4:63,370:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,109:.:-1.77:1.000:. ./.:4:16,76:.:-1.87:1.000:. ./.:4:58,769:.: 2.49:1.000:. ./.:4:54,225:.:-0.76:1.000:. ./.:4:59,376:.: 0.17:1.000:. ./.:4:53,495:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1,160:.:-1.46:1.000:. ./.:4:46,439:.: 0.46:1.000:. ./.:4:172,231:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,757:.: 2.08:1.000:. ./.:4:0,507:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.91:1.000:. ./.:4:73,650:.: 1.87:1.000:. ./.:4:62,538:.: 1.14:1.000:. ./.:4:66,430:.: 0.53:1.000:. ./.:4:19,62:.:-1.93:1.000:. ./.:4:67,283:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,278:.:-0.32:1.000:. ./.:4:78,447:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,457:.: 0.68:1.000:. ./.:4:87,433:.: 0.67:1.000:. ./.:4:69,308:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,411:.: 0.44:1.000:. ./.:4:16,35:.:-2.11:1.000:. ./.:4:16,143:.:-1.47:1.000:. ./.:3:6,41:.:-2.14:0.993:. ./.:4:65,610:.: 1.59:1.000:. ./.:4:53,211:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,389:.:-0.11:1.000:. ./.:4:63,495:.: 0.89:1.000:. ./.:4:70,456:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,308:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.53:1.000:. ./.:4:62,430:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,466:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,514:.: 0.63:1.000:. ./.:4:53,493:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,495:.: 0.52:1.000:. ./.:4:10,189:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,439:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,377:.: 0.31:1.000:. ./.:4:45,117:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,338:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,419:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.53:1.000:. ./.:4:53,292:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,393:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,306:.:-0.59:1.000:. ./.:6:0,439:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,654:.: 1.47:1.000:. ./.:4:43,150:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,478:.: 0.42:1.000:. ./.:4:67,386:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,623:.: 1.29:1.000:. ./.:4:54,152:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,415:.: 0.05:1.000:. ./.:4:62,403:.: 0.34:1.000:. ./.:5:57,590:.: 1.42:0.993:. ./.:4:49,644:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,521:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,227:.:-1.07:1.000:. ./.:4:64,872:.: 3.14:1.000:. ./.:4:68,480:.: 0.84:1.000:. ./.:4:56,531:.: 1.07:1.000:. ./.:4:54,390:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,428:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,190:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,664:.: 1.89:1.000:. ./.:5:98,614:.: 1.81:0.990:. ./.:4:0,359:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,436:.: 0.17:1.000:. ./.:5:1,374:.:-0.19:0.928:. ./.:4:0,192:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,209:.:-1.17:1.000:. ./.:4:49,307:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,382:.:-0.15:1.000:. ./.:4:38,283:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,104:.:-1.80:0.976:. ./.:4:47,434:.: 0.44:1.000:. ./.:4:64,565:.: 1.32:1.000:. ./.:4:52,269:.:-0.51:1.000:. ./.:4:72,313:.:-0.13:1.000:. ./.:4:64,425:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,377:.:-0.18:1.000:. ./.:4:122,450:.: 0.98:1.000:. ./.:4:47,256:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,348:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,145:.:-1.55:1.000:. ./.:4:69,444:.: 0.63:1.000:. ./.:4:35,388:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,388:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,232:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,230:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,390:.: 0.37:1.000:. ./.:3:0,320:.:-0.52:1.000:. ./.:4:61,270:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.62:1.000:. ./.:4:69,752:.: 2.45:1.000:. ./.:4:0,132:.:-1.63:0.999:. ./.:4:0,383:.:-0.14:1.000:. ./.:4:39,221:.:-0.87:1.000:. ./.:4:58,254:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,233:.:-1.03:1.000:. ./.:4:37,291:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,275:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,301:.:-0.63:1.000:. ./.:4:55,457:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,207:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,357:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,352:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,496:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,518:.: 0.66:1.000:. ./.:4:59,266:.:-0.49:1.000:. ./.:4:52,507:.: 0.90:1.000:. ./.:4:1,303:.:-0.61:1.000:. ./.:4:60,355:.: 0.05:1.000:. ./.:4:68,343:.: 0.02:1.000:. ./.:4:60,215:.:-0.78:1.000:. ./.:4:45,188:.:-1.03:0.998:. ./.:4:54,367:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,418:.: 0.06:1.000:. ./.:4:68,705:.: 2.17:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.62:1.000:. ./.:4:43,281:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,513:.: 0.63:1.000:. ./.:4:70,301:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,358:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,550:.: 0.85:1.000:. ./.:4:38,211:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,282:.:-0.74:1.000:. ./.:4:85,735:.: 2.45:1.000:. ./.:4:0,432:.: 0.15:1.000:. ./.:4:47,400:.: 0.24:1.000:. ./.:4:82,336:.: 0.06:1.000:. ./.:4:54,418:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,425:.: 0.11:1.000:. ./.:4:73,219:.:-0.68:1.000:. ./.:4:14,169:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,179:.:-1.35:1.000:. ./.:4:65,235:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,229:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,421:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,392:.:-0.09:0.999:. ./.:4:57,398:.: 0.28:1.000:. ./.:4:64,408:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,482:.: 0.45:1.000:. ./.:4:49,254:.:-0.62:1.000:. ./.:4:65,397:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,393:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.29:1.000:. ./.:4:143,576:.: 1.85:1.000:. ./.:4:1,387:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,466:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,450:.: 0.26:1.000:. ./.:4:43,346:.:-0.11:1.000:. ./.:4:59,234:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.53:1.000:. ./.:4:44,164:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,373:.:-0.20:1.000:. ./.:4:86,739:.: 2.48:1.000:. ./.:4:77,546:.: 1.28:1.000:. ./.:4:84,344:.: 0.12:1.000:. ./.:4:26,354:.:-0.16:1.000:. ./.:3:0,657:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,577:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,457:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,282:.:-0.74:1.000:. ./.:4:74,543:.: 1.24:1.000:. -chr3.1 6538706 chr3.1_006538706 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 2.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.: 3.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:6:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:5:2,0:.:-0.79:0.993:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:5:1,0:.:-1.21:0.928:. ./.:4:9,0:.: 2.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:0.976:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.69:1.000:. ./.:3:4,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 2.10:0.999:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:10,0:.: 2.52:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.38:1.000:. ./.:3:7,0:.: 1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr3.1 6575541 chr3.1_006575541 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:306,303:0.49: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:543,306:0.36: 1.64:1.000:0.726 0/0/1/1:4:281,344:0.55: 0.27:1.000:0.982 0/1/1/1:4:208,558:0.73: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:503,272:0.35: 1.18:1.000:0.817 0/1/1/1:4:123,439:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:405,203:0.33: 0.17:1.000:0.921 0/0/1/1:4:216,245:0.53:-0.73:1.000:0.993 0/0/0/1:4:386,225:0.36: 0.18:1.000:0.634 0/0/0/1:4:135,52:0.27:-2.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,262:0.77:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:306,418:0.57: 0.87:1.000:0.933 0/0/1/1:4:386,349:0.47: 0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:337,356:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:287,409:0.59: 0.70:1.000:0.891 0/0/1/1:4:238,260:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:257,547:0.68: 1.36:1.000:0.950 0/0/1/1:4:435,350:0.44: 1.25:1.000:0.971 0/1/1/1:4:159,594:0.79: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:415,151:0.26:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,135:0.53:-2.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:312,427:0.58: 0.96:1.000:0.931 0/0/1/1:4:442,374:0.45: 1.43:1.000:0.984 0/0/1/1:4:341,341:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,141:0.57:-2.04:1.000:0.951 0/0/1/1:4:380,414:0.52: 1.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:447,235:0.34: 0.62:1.000:0.864 0/0/1/1:4:280,459:0.62: 0.96:1.000:0.583 0/0/1/1:4:531,376:0.41: 1.99:1.000:0.870 0/0/1/1:4:489,415:0.46: 1.97:1.000:0.985 0/0/1/1:4:401,497:0.55: 1.94:1.000:0.979 0/1/1/1:4:201,446:0.69: 0.40:1.000:0.970 0/1/1/1:4:111,187:0.63:-1.73:1.000:0.502 0/1/1/1:4:67,387:0.85:-0.77:1.000:0.985 0/0/1:3:152,110:0.42:-1.95:0.993:0.996 0/0/1/1:4:483,384:0.44: 1.75:1.000:0.966 0/0/1/1:4:311,357:0.53: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:318,227:0.41:-0.22:1.000:0.881 0/1/1/1:4:223,481:0.68: 0.75:1.000:0.958 0/1/1/1:4:128,762:0.86: 1.89:1.000:0.979 0/0/0/1:4:303,111:0.26:-1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:295,204:0.41:-0.50:1.000:0.833 0/0/1/1:4:337,531:0.61: 1.75:1.000:0.697 0/0/1/1:4:171,207:0.54:-1.24:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,526:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:292,342:0.54: 0.32:1.000:0.989 0/0/1/1:4:372,255:0.40: 0.28:1.000:0.817 0/1/1/1:4:177,418:0.70: 0.09:1.000:0.986 1/1/1/1:4:1,430:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,231:0.44:-0.39:1.000:0.972 0/0/1/1:4:265,189:0.41:-0.77:1.000:0.880 0/0/1/1:4:353,366:0.51: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:263,291:0.52:-0.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:109,342:0.76:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,301:0.73:-1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:129,389:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:170,391:0.70:-0.12:1.000:0.981 0/0/1/1:4:321,485:0.60: 1.37:1.000:0.796 0/0/1/1:4:212,195:0.48:-1.06:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:208,179:0.46:-1.18:1.000:0.793 0/1/1/1:4:178,309:0.63:-0.57:1.000:0.595 0/0/0/1:4:450,194:0.30: 0.39:1.000:0.987 0/1/1/1:4:115,406:0.78:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:372,304:0.45: 0.58:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,489:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:461,207:0.31: 0.53:1.000:0.979 0/0/0/1:4:369,122:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:363,343:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/1/1/1/1:5:213,618:0.74: 1.53:0.993:0.897 0/0/1/1:4:211,326:0.60:-0.27:1.000:0.746 0/0/1/1:4:322,283:0.46: 0.15:1.000:0.990 0/0/0/1:4:279,125:0.31:-1.08:1.000:0.980 0/0/0/1:4:501,256:0.33: 1.07:1.000:0.901 0/0/1/1:4:302,324:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:292,480:0.62: 1.17:1.000:0.574 0/1/1/1:4:167,466:0.74: 0.32:1.000:0.998 0/1/1/1:4:96,431:0.82:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:239,298:0.55:-0.27:1.000:0.978 0/0/1/1:4:232,236:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:201,554:0.73: 1.06:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:359,331:0.48: 0.67:0.990:0.720 0/0/1/1:4:300,264:0.46:-0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:357,235:0.39: 0.07:1.000:0.728 0/0/0/1:4:237,104:0.30:-1.46:1.000:0.984 0/0/1/1/1:5:302,402:0.57: 0.75:0.928:0.937 0/0/1/1:4:334,246:0.42:-0.01:1.000:0.917 0/0/1/1:4:161,192:0.54:-1.39:1.000:0.987 0/1/1/1:4:203,348:0.63:-0.18:1.000:0.557 0/1/1/1:4:87,284:0.76:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:368,298:0.44: 0.52:1.000:0.973 0/0/0/1:4:305,111:0.26:-1.01:0.976:0.998 0/1/1/1:4:153,331:0.68:-0.59:1.000:0.959 0/1/1/1:4:203,488:0.70: 0.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:300,244:0.45:-0.23:1.000:0.974 0/1/1/1:4:238,447:0.65: 0.64:1.000:0.799 0/0/0/1:4:519,251:0.32: 1.15:1.000:0.948 0/0/1/1:4:241,176:0.42:-1.00:1.000:0.908 0/0/1/1:4:374,468:0.55: 1.59:1.000:0.977 0/0/0/1:4:478,241:0.33: 0.84:1.000:0.915 0/0/1/1:4:320,476:0.60: 1.31:1.000:0.826 0/0/1/1:4:183,196:0.51:-1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:423,329:0.43: 1.04:1.000:0.956 0/0/1/1:4:220,332:0.60:-0.18:1.000:0.798 0/0/1/1:4:198,240:0.55:-0.87:1.000:0.984 0/0/1/1:4:239,270:0.53:-0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:272,86:0.24:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,191:0.44:-0.91:1.000:0.967 0/0/1/1:4:411,330:0.44: 0.98:1.000:0.970 0/0/1:3:378,241:0.39: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:292,319:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:178,168:0.48:-1.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:523,472:0.47: 2.53:1.000:0.993 0/0/0/1:4:349,99:0.22:-0.81:0.999:1.000 0/0/1/1:4:173,212:0.55:-1.20:1.000:0.982 0/0/1/1:4:202,251:0.55:-0.78:1.000:0.978 0/0/1/1:4:341,218:0.39:-0.13:1.000:0.649 0/1/1/1:4:184,329:0.64:-0.41:1.000:0.681 0/0/1/1:4:267,304:0.53:-0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:202,207:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:159,305:0.66:-0.71:1.000:0.838 0/0/1/1:4:347,306:0.47: 0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:163,179:0.52:-1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:210,230:0.52:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:203,263:0.56:-0.70:1.000:0.964 0/1/1/1:4:77,299:0.79:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,451:0.83:-0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:197,382:0.66:-0.01:1.000:0.856 0/0/1/1:4:321,287:0.47: 0.17:1.000:0.992 0/0/0/1:4:226,77:0.25:-1.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,363:0.60: 0.14:1.000:0.802 0/0/1/1:4:266,318:0.54: 0.02:1.000:0.987 0/0/0/1:4:392,214:0.35: 0.15:1.000:0.798 0/0/1/1:4:243,226:0.48:-0.68:0.998:0.995 0/1/1/1:4:165,406:0.71:-0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:333,77:0.18:-1.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:249,728:0.74: 2.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:295,224:0.43:-0.38:1.000:0.942 0/0/0/0:4:412,1:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:169,316:0.65:-0.59:1.000:0.789 0/0/1/1:4:152,164:0.52:-1.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:290,297:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:365,331:0.47: 0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:207,330:0.61:-0.27:1.000:0.665 0/0/0/1:4:342,170:0.33:-0.42:1.000:0.928 0/0/0/1:4:333,130:0.28:-0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:129,706:0.84: 1.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:204,223:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:422,218:0.34: 0.36:1.000:0.888 0/0/1/1:4:351,363:0.51: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:309,313:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:347,285:0.45: 0.31:1.000:0.977 0/0/0/1:4:487,247:0.33: 0.93:1.000:0.909 0/1/1/1:4:92,239:0.72:-1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:211,160:0.43:-1.28:1.000:0.941 0/0/0/1:4:447,253:0.36: 0.73:1.000:0.715 0/0/0/1:4:377,119:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,272:0.55:-0.55:1.000:0.977 0/0/1/1:4:374,245:0.39: 0.23:1.000:0.716 0/1/1/1:4:105,276:0.72:-1.22:0.999:0.996 0/0/1/1:4:454,395:0.46: 1.64:1.000:0.989 0/1/1/1:4:211,423:0.67: 0.32:1.000:0.900 0/1/1/1:4:131,284:0.68:-1.01:1.000:0.960 0/0/1/1:4:277,322:0.53: 0.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:331,411:0.55: 0.98:1.000:0.979 0/0/1/1:4:339,274:0.44: 0.20:1.000:0.972 0/0/1/1:4:351,245:0.41: 0.09:1.000:0.848 0/0/0/1:4:417,108:0.20:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:482,333:0.41: 1.43:1.000:0.831 0/0/1/1:4:191,221:0.53:-1.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:215,218:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,197:0.56:-1.39:1.000:0.974 0/1/1/1:4:153,374:0.71:-0.33:1.000:0.991 0/0/0/1:4:430,240:0.35: 0.54:1.000:0.749 0/0/1/1:4:176,179:0.50:-1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:383,209:0.35: 0.07:1.000:0.799 0/0/1/1:4:244,199:0.45:-0.84:1.000:0.975 0/0/1/1:4:470,466:0.49: 2.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:362,498:0.58: 1.70:1.000:0.927 0/0/1/1:4:315,481:0.60: 1.31:1.000:0.773 0/0/0/1:4:321,144:0.31:-0.71:1.000:0.979 0/1/1:3:124,416:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:420,342:0.45: 1.11:1.000:0.975 0/0/0/1:4:391,143:0.26:-0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:90,322:0.78:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:393,305:0.43: 0.71:1.000:0.955 -chr3.1 6730575 chr3.1_006730575 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,409:.: 1.23:1.000:. ./.:4:304,187:.: 1.03:1.000:. ./.:4:203,287:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,395:.: 1.11:1.000:. ./.:4:283,217:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,356:.:-0.35:1.000:. ./.:4:141,231:.:-0.19:1.000:. ./.:4:152,161:.:-0.79:1.000:. ./.:4:257,182:.: 0.50:1.000:. ./.:4:45,96:.:-2.55:1.000:. ./.:4:28,174:.:-1.93:1.000:. ./.:4:105,371:.: 0.88:1.000:. ./.:4:80,331:.: 0.21:1.000:. ./.:4:199,269:.: 0.80:1.000:. ./.:4:84,367:.: 0.62:1.000:. ./.:4:94,275:.:-0.22:1.000:. ./.:4:187,289:.: 0.88:1.000:. ./.:4:109,387:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,462:.: 0.74:1.000:. ./.:4:126,386:.: 1.25:1.000:. ./.:4:26,133:.:-2.37:1.000:. ./.:4:83,329:.: 0.22:1.000:. ./.:4:226,316:.: 1.55:1.000:. ./.:4:207,276:.: 0.95:1.000:. ./.:4:47,79:.:-2.71:1.000:. ./.:4:131,314:.: 0.56:1.000:. ./.:4:292,198:.: 1.02:1.000:. ./.:4:179,279:.: 0.69:1.000:. ./.:4:239,403:.: 2.58:1.000:. ./.:4:223,303:.: 1.39:1.000:. ./.:4:88,354:.: 0.53:1.000:. ./.:4:159,234:.: 0.03:1.000:. ./.:4:19,57:.:-3.22:1.000:. ./.:4:29,164:.:-2.02:1.000:. ./.:3:16,28:.:-3.55:0.993:. ./.:4:254,144:.: 0.08:1.000:. ./.:4:156,273:.: 0.40:1.000:. ./.:4:96,297:.: 0.03:1.000:. ./.:4:135,244:.:-0.11:1.000:. ./.:4:102,437:.: 1.52:1.000:. ./.:4:82,267:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.75:1.000:. ./.:4:84,368:.: 0.63:1.000:. ./.:4:80,225:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.03:1.000:. ./.:4:223,163:.:-0.04:1.000:. ./.:4:128,337:.: 0.77:1.000:. ./.:4:25,95:.:-2.77:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,113:.:-1.96:1.000:. ./.:4:133,176:.:-0.83:1.000:. ./.:4:193,325:.: 1.31:1.000:. ./.:4:172,214:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,335:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,285:.:-1.08:1.000:. ./.:4:142,262:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,336:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.69:1.000:. ./.:6:46,257:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.56:1.000:. ./.:4:194,171:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,437:.: 0.48:1.000:. ./.:4:62,326:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,423:.: 0.34:1.000:. ./.:4:121,210:.:-0.61:1.000:. ./.:4:169,219:.:-0.02:1.000:. ./.:4:181,271:.: 0.63:1.000:. ./.:5:72,343:.: 0.25:0.993:. ./.:4:86,309:.: 0.05:1.000:. ./.:4:178,211:.:-0.01:1.000:. ./.:4:103,145:.:-1.46:1.000:. ./.:4:179,193:.:-0.19:1.000:. ./.:4:200,285:.: 0.97:1.000:. ./.:4:78,349:.: 0.38:1.000:. ./.:4:83,288:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.87:1.000:. ./.:4:71,416:.: 0.99:1.000:. ./.:4:74,252:.:-0.66:1.000:. ./.:4:96,363:.: 0.70:1.000:. ./.:5:183,227:.: 0.20:0.990:. ./.:4:74,270:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,322:.: 0.51:1.000:. ./.:4:143,168:.:-0.81:1.000:. ./.:5:0,314:.:-0.78:0.928:. ./.:4:1,376:.:-0.14:1.000:. ./.:4:72,218:.:-1.03:1.000:. ./.:4:74,307:.:-0.09:1.000:. ./.:4:80,252:.:-0.60:1.000:. ./.:4:139,271:.: 0.20:1.000:. ./.:4:62,216:.:-1.15:0.976:. ./.:4:157,231:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,313:.: 1.08:1.000:. ./.:4:126,188:.:-0.78:1.000:. ./.:4:94,398:.: 1.04:1.000:. ./.:4:215,197:.: 0.22:1.000:. ./.:4:139,149:.:-1.05:1.000:. ./.:4:132,290:.: 0.33:1.000:. ./.:4:176,317:.: 1.05:1.000:. ./.:4:110,400:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.58:1.000:. ./.:4:150,234:.:-0.06:1.000:. ./.:4:132,219:.:-0.40:1.000:. ./.:4:80,245:.:-0.67:1.000:. ./.:4:52,305:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,208:.:-1.18:1.000:. ./.:4:144,147:.:-1.02:1.000:. ./.:4:195,342:.: 1.50:1.000:. ./.:3:193,226:.: 0.29:1.000:. ./.:4:185,239:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,355:.:-0.36:1.000:. ./.:4:302,245:.: 1.61:1.000:. ./.:4:75,304:.:-0.11:0.999:. ./.:4:84,297:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,208:.:-1.35:1.000:. ./.:4:227,218:.: 0.56:1.000:. ./.:4:4,329:.:-0.59:1.000:. ./.:4:115,217:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,322:.:-0.70:1.000:. ./.:4:71,219:.:-1.03:1.000:. ./.:4:228,165:.: 0.03:1.000:. ./.:4:93,241:.:-0.58:1.000:. ./.:4:165,201:.:-0.25:1.000:. ./.:4:222,244:.: 0.78:1.000:. ./.:4:60,245:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.32:1.000:. ./.:4:87,380:.: 0.79:1.000:. ./.:4:185,144:.:-0.63:1.000:. ./.:4:61,255:.:-0.76:1.000:. ./.:4:71,282:.:-0.38:1.000:. ./.:4:72,301:.:-0.18:1.000:. ./.:4:221,272:.: 1.05:1.000:. ./.:4:131,174:.:-0.87:0.998:. ./.:4:131,216:.:-0.44:1.000:. ./.:4:194,169:.:-0.28:1.000:. ./.:4:116,467:.: 1.97:1.000:. ./.:4:1,322:.:-0.69:1.000:. ./.:4:142,198:.:-0.51:1.000:. ./.:4:151,239:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,239:.:-0.64:1.000:. ./.:4:206,179:.:-0.05:1.000:. ./.:4:178,310:.: 1.00:1.000:. ./.:4:111,313:.: 0.35:1.000:. ./.:4:208,139:.:-0.44:1.000:. ./.:4:138,349:.: 0.99:1.000:. ./.:4:100,436:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,388:.:-0.02:1.000:. ./.:4:228,176:.: 0.14:1.000:. ./.:4:236,328:.: 1.78:1.000:. ./.:4:166,265:.: 0.42:1.000:. ./.:4:132,363:.: 1.07:1.000:. ./.:4:195,317:.: 1.25:1.000:. ./.:4:38,117:.:-2.41:1.000:. ./.:4:73,228:.:-0.91:1.000:. ./.:4:266,224:.: 1.02:1.000:. ./.:4:241,198:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,467:.: 0.79:1.000:. ./.:4:109,313:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,338:.:-0.53:0.999:. ./.:4:288,189:.: 0.89:1.000:. ./.:4:90,351:.: 0.52:1.000:. ./.:4:71,200:.:-1.22:1.000:. ./.:4:183,264:.: 0.58:1.000:. ./.:4:86,349:.: 0.46:1.000:. ./.:4:83,202:.:-1.08:1.000:. ./.:4:78,287:.:-0.26:1.000:. ./.:4:184,188:.:-0.19:1.000:. ./.:4:397,201:.: 2.13:1.000:. ./.:4:71,246:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,386:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,378:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,224:.:-0.31:1.000:. ./.:4:138,266:.: 0.14:1.000:. ./.:4:99,238:.:-0.54:1.000:. ./.:4:109,235:.:-0.47:1.000:. ./.:4:86,258:.:-0.47:1.000:. ./.:4:259,360:.: 2.34:1.000:. ./.:4:104,421:.: 1.38:1.000:. ./.:4:104,380:.: 0.96:1.000:. ./.:4:136,245:.:-0.09:1.000:. ./.:3:112,345:.: 0.68:1.000:. ./.:4:265,228:.: 1.05:1.000:. ./.:4:139,350:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.65:1.000:. ./.:4:197,252:.: 0.60:1.000:. -chr3.1 7002282 chr3.1_007002282 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:46,44:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,61:0.76:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,72:0.85:-0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,42:0.47: 0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:60,72:0.55: 1.71:1.000:0.976 0/0/1/1:4:51,33:0.41: 0.01:1.000:0.887 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,16:0.17: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,60:0.57: 0.79:1.000:0.945 0/0/1/1:4:10,14:0.58:-2.11:1.000:0.892 0/1/1/1:4:14,37:0.70:-1.15:1.000:0.986 0/0/1/1:4:65,42:0.41: 0.83:1.000:0.886 0/1/1/1:4:22,67:0.72: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,34:0.29: 1.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:50,36:0.44: 0.08:1.000:0.966 0/0/0/1:4:82,31:0.30: 1.04:1.000:0.987 0/0/0/1:4:114,25:0.20: 1.96:0.999:1.000 0/0/0/1:4:93,50:0.37: 2.10:1.000:0.542 0/0/0/1:4:81,16:0.18: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,51:0.72:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,28:0.54:-1.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:48,21:0.33:-0.52:1.000:0.932 0/1/1/1:4:26,71:0.71: 0.47:1.000:0.990 0/0/0/1:4:81,30:0.29: 0.97:1.000:0.990 0/0/0/1:4:33,16:0.35:-1.22:1.000:0.803 0/1/1/1:4:20,59:0.72:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,54:0.47: 1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,45:0.55:-0.02:1.000:0.979 0/1/1/1:4:25,91:0.75: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,47:0.60:-0.20:1.000:0.785 0/1/1/1:4:21,39:0.64:-0.84:1.000:0.684 0/0/1/1:4:28,38:0.58:-0.62:1.000:0.919 0/1/1/1:4:3,14:0.80:-2.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,30:0.63:-1.30:1.000:0.563 0/1/1:3:19,32:0.62:-1.15:0.993:1.000 0/0/0/1:4:100,23:0.21: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,60:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,28:0.27: 1.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,17:0.16: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,36:0.43: 0.15:1.000:0.947 0/0/1/1:4:52,31:0.40:-0.02:1.000:0.746 0/0/1/1:4:34,41:0.55:-0.31:1.000:0.975 0/1/1/1:4:28,55:0.65:-0.02:1.000:0.792 0/0/1/1:4:31,30:0.51:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,13:0.28:-1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,29:0.26: 1.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,46:0.53: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,37:0.49:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,11:0.24:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,15:0.29:-0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:54,16:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,49:0.44: 1.14:1.000:0.972 0/0/1/1:4:54,40:0.45: 0.37:1.000:0.976 0/0/1/1:4:28,36:0.57:-0.69:1.000:0.952 0/0/0/1:4:42,15:0.29:-0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,30:0.52:-0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,30:0.34: 0.44:1.000:0.898 0/0/1/1:4:42,36:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,37:0.53:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/0/1/1:6:35,11:0.26:-1.33:1.000:0.614 0/0/1/1:4:32,18:0.38:-1.19:1.000:0.593 0/0/1/1:4:66,47:0.44: 1.04:1.000:0.962 0/0/1/1:4:25,41:0.62:-0.62:1.000:0.621 0/0/1/1:4:32,37:0.55:-0.52:1.000:0.983 0/0/0/1:4:43,11:0.23:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,48:0.53: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,21:0.40:-0.98:1.000:0.760 0/1/1/1:4:25,46:0.64:-0.45:1.000:0.663 0/0/0/1/1:5:37,26:0.43:-0.73:0.993:0.932 0/0/1/1:4:42,25:0.39:-0.59:1.000:0.742 0/0/0/1:4:84,14:0.16: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,29:0.42:-0.41:1.000:0.929 0/1/1/1:4:11,88:0.87: 0.54:1.000:0.899 0/0/0/1:4:100,35:0.28: 1.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,31:0.45:-0.38:1.000:0.975 0/0/1/1:4:35,24:0.43:-0.87:1.000:0.941 0/0/0/1:4:50,10:0.18:-0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,50:0.82:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,17:0.18: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,31:0.45:-0.41:1.000:0.981 0/0/1/1/1:5:32,57:0.63: 0.19:0.990:0.950 0/0/0/1:4:70,11:0.15:-0.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:69,31:0.33: 0.58:1.000:0.910 0/0/1/1:4:55,37:0.42: 0.30:1.000:0.927 0/0/0/1/1:5:35,21:0.40:-0.98:0.928:0.971 0/1/1/1:4:21,53:0.69:-0.34:1.000:0.979 0/0/0/1:4:53,11:0.19:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,38:0.60:-0.73:1.000:0.781 0/0/1/1:4:21,29:0.58:-1.19:1.000:0.905 0/0/1/1:4:60,48:0.46: 0.86:1.000:0.990 0/0/1/1:4:59,40:0.43: 0.54:0.976:0.933 0/0/0/1:4:89,13:0.14: 0.65:1.000:0.970 0/0/1/1:4:30,46:0.60:-0.27:1.000:0.765 0/1/1/1:4:9,45:0.81:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,43:0.56:-0.23:1.000:0.959 0/0/1/1:4:52,58:0.54: 0.93:1.000:0.988 0/0/0/1:4:66,14:0.19:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,43:0.60:-0.41:1.000:0.821 0/0/1/1:4:60,54:0.49: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,73:0.61: 1.21:1.000:0.647 0/1/1/1:4:8,48:0.83:-0.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,78:0.77: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,33:0.67:-1.26:1.000:0.922 0/0/1/1:4:26,27:0.52:-1.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,43:0.71:-0.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,32:0.66:-1.30:1.000:0.897 0/0/0/1:4:54,28:0.36:-0.06:1.000:0.646 0/1/1/1:4:13,55:0.78:-0.55:1.000:1.000 0/0/1:3:96,46:0.35: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,46:0.34: 2.20:1.000:0.884 0/1/1/1:4:15,33:0.67:-1.26:1.000:0.922 0/0/0/1:4:140,35:0.22: 3.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.59:0.999:1.000 0/0/0/1:4:54,20:0.29:-0.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:17,23:0.58:-1.54:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,13:0.25:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,39:0.51:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,24:0.50:-1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,39:0.65:-0.87:1.000:0.780 0/0/1/1:4:66,45:0.43: 0.97:1.000:0.937 0/0/0/1:4:51,13:0.22:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,24:0.28: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,40:0.38: 1.00:1.000:0.556 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,27:0.54:-1.15:1.000:0.987 0/0/1/1:4:34,46:0.58:-0.13:1.000:0.922 0/1/1/1:4:19,37:0.65:-0.98:1.000:0.777 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,25:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,42:0.57:-0.34:1.000:0.941 0/0/1/1:4:85,48:0.38: 1.74:1.000:0.604 0/1/1/1:4:11,31:0.71:-1.47:0.998:0.993 0/0/0/1:4:66,20:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,29:0.34: 0.30:1.000:0.883 0/0/0/1:4:85,31:0.29: 1.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,29:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,19:0.43:-1.33:1.000:0.956 0/0/0/1:4:49,18:0.29:-0.59:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,22:0.56:-1.54:1.000:0.971 0/0/1/1:4:47,43:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,35:0.43: 0.05:1.000:0.953 0/0/1/1:4:35,37:0.53:-0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:44,37:0.48:-0.09:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,46:0.39: 1.46:1.000:0.688 0/0/1/1:4:38,33:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,55:0.49: 1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,41:0.32: 1.85:1.000:0.942 0/0/1/1:4:67,38:0.38: 0.75:1.000:0.617 0/0/0/1:4:116,21:0.17: 1.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,44:0.41: 1.04:1.000:0.869 0/1/1/1:4:8,27:0.74:-1.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,43:0.65:-0.66:1.000:0.784 0/0/1/1:4:67,63:0.50: 1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,52:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,75:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,38:0.29: 2.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,28:0.42:-0.45:0.999:0.895 0/0/0/1:4:115,34:0.25: 2.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,50:0.57: 0.19:1.000:0.953 0/0/1/1:4:21,18:0.48:-1.58:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,63:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,59:0.63: 0.33:1.000:0.520 0/0/0/1:4:71,10:0.14:-0.09:1.000:0.953 0/1/1/1:4:15,50:0.74:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,37:0.40: 0.51:1.000:0.783 0/1/1/1:4:22,83:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,32:0.35: 0.54:1.000:0.829 0/0/1/1:4:29,41:0.59:-0.48:1.000:0.882 0/0/1/1:4:39,30:0.46:-0.52:1.000:0.985 0/0/1/1:4:27,44:0.61:-0.45:1.000:0.636 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,37:0.37: 0.79:1.000:0.549 0/0/0/1:4:45,24:0.37:-0.52:1.000:0.565 0/0/0/1:4:60,18:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,57:0.59: 0.44:1.000:0.842 0/0/1/1:4:48,47:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,49:0.56: 0.15:1.000:0.962 0/0/1/1:4:63,40:0.41: 0.68:1.000:0.862 0/1/1:3:39,38:0.51:-0.23:1.000:0.677 0/0/0/1:4:125,19:0.15: 2.13:1.000:0.982 0/0/0/1:4:90,46:0.36: 1.85:1.000:0.684 0/0/1/1:4:26,21:0.47:-1.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,47:0.53: 0.22:1.000:0.990 -chr3.1 7096643 chr3.1_007096643 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:0.999:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:195,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:272,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.02:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.26:0.993:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.46:1.000:. ./.:6:80,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:5:109,0:.:-0.17:0.993:. ./.:4:163,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:96,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.36:1.000:. ./.:6:172,0:.: 1.08:0.990:. ./.:4:35,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.19:1.000:. ./.:5:153,0:.: 0.70:0.928:. ./.:4:172,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:0.976:. ./.:4:68,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:247,0:.: 2.57:1.000:. ./.:3:83,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:125,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.75:0.923:. ./.:4:109,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:134,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.54:1.000:. ./.:3:79,0:.:-0.77:0.998:. ./.:4:98,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:140,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.01:0.999:. ./.:4:149,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.69:1.000:. ./.:6:257,1:.: 2.79:0.997:. ./.:4:131,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:206,1:.: 1.78:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.42:1.000:. ./.:3:91,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. -chr3.1 7656071 chr3.1_007656071 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:306,50:.: 0.90:1.000:. ./.:4:322,119:.: 1.57:1.000:. ./.:4:327,82:.: 1.32:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:251,82:.: 0.71:1.000:. ./.:4:301,52:.: 0.87:0.999:. ./.:4:262,57:.: 0.60:1.000:. ./.:4:57,61:.:-1.00:1.000:. ./.:4:335,110:.: 1.60:1.000:. ./.:4:8,4:.:-1.84:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:274,55:.: 0.68:1.000:. ./.:4:390,66:.: 1.69:1.000:. ./.:4:245,90:.: 0.73:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:263,86:.: 0.84:1.000:. ./.:4:416,35:.: 1.65:0.999:. ./.:4:338,121:.: 1.71:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:93,101:.:-0.39:1.000:. ./.:4:18,9:.:-1.72:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:408,39:.: 1.62:1.000:. ./.:4:245,64:.: 0.52:1.000:. ./.:4:11,3:.:-1.82:1.000:. ./.:4:435,37:.: 1.82:1.000:. ./.:4:412,116:.: 2.26:1.000:. ./.:4:352,26:.: 1.07:1.000:. ./.:4:395,33:.: 1.47:1.000:. ./.:4:238,35:.: 0.24:1.000:. ./.:4:289,49:.: 0.75:1.000:. ./.:4:371,18:.: 1.16:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.85:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:3,1:.:-1.90:0.993:. ./.:4:250,72:.: 0.63:1.000:. ./.:4:399,97:.: 2.01:1.000:. ./.:4:222,86:.: 0.51:1.000:. ./.:4:177,21:.:-0.36:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:69,86:.:-0.70:1.000:. ./.:4:103,49:.:-0.73:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:73,24:.:-1.16:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:156,56:.:-0.25:1.000:. ./.:4:91,44:.:-0.86:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:69,24:.:-1.20:1.000:. ./.:4:34,46:.:-1.30:1.000:. ./.:4:366,90:.: 1.69:1.000:. ./.:4:234,63:.: 0.43:1.000:. ./.:4:189,63:.: 0.07:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:161,45:.:-0.30:1.000:. ./.:4:252,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:93,62:.:-0.70:1.000:. ./.:6:34,21:.:-1.50:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:253,86:.: 0.76:1.000:. ./.:4:169,39:.:-0.28:1.000:. ./.:4:163,48:.:-0.26:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:139,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,47:.:-1.37:1.000:. ./.:4:145,38:.:-0.48:1.000:. ./.:5:261,0:.: 0.14:0.993:. ./.:4:229,56:.: 0.33:1.000:. ./.:4:41,51:.:-1.20:1.000:. ./.:4:33,65:.:-1.16:1.000:. ./.:4:150,120:.: 0.21:1.000:. ./.:4:268,36:.: 0.48:1.000:. ./.:4:176,57:.:-0.08:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:247,64:.: 0.54:1.000:. ./.:4:67,26:.:-1.20:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.41:1.000:. ./.:6:206,61:.: 0.19:0.990:. ./.:4:62,77:.:-0.83:1.000:. ./.:4:158,83:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,57:.:-1.03:1.000:. ./.:5:70,34:.:-1.11:0.928:. ./.:4:182,61:.: 0.00:1.000:. ./.:4:50,61:.:-1.05:1.000:. ./.:4:214,55:.: 0.20:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:299,77:.: 1.06:1.000:. ./.:4:40,63:.:-1.12:0.976:. ./.:4:171,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:260,27:.: 0.35:1.000:. ./.:4:244,61:.: 0.49:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:140,91:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,50:.:-1.40:1.000:. ./.:4:235,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:121,92:.:-0.24:1.000:. ./.:4:342,88:.: 1.48:1.000:. ./.:4:136,50:.:-0.46:1.000:. ./.:4:239,46:.: 0.33:1.000:. ./.:4:132,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:48,18:.:-1.41:1.000:. ./.:4:198,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:72,83:.:-0.70:1.000:. ./.:4:86,32:.:-1.00:1.000:. ./.:4:341,29:.: 1.01:1.000:. ./.:3:210,69:.: 0.28:1.000:. ./.:4:232,76:.: 0.51:1.000:. ./.:4:134,51:.:-0.46:1.000:. ./.:4:275,76:.: 0.86:1.000:. ./.:4:99,79:.:-0.52:0.999:. ./.:4:65,33:.:-1.16:1.000:. ./.:4:113,41:.:-0.71:1.000:. ./.:4:212,50:.: 0.15:1.000:. ./.:4:67,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:209,74:.: 0.32:1.000:. ./.:4:72,54:.:-0.93:1.000:. ./.:4:131,20:.:-0.73:1.000:. ./.:4:260,71:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,66:.:-1.12:1.000:. ./.:4:117,55:.:-0.57:1.000:. ./.:4:207,58:.: 0.17:1.000:. ./.:4:46,27:.:-1.35:1.000:. ./.:4:151,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:208,55:.: 0.16:1.000:. ./.:4:98,27:.:-0.94:1.000:. ./.:4:68,60:.:-0.92:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:159,36:.:-0.38:1.000:. ./.:4:223,91:.: 0.56:1.000:. ./.:4:129,19:.:-0.76:0.923:. ./.:4:164,31:.:-0.38:1.000:. ./.:4:38,37:.:-1.34:1.000:. ./.:4:536,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:79,73:.:-0.73:1.000:. ./.:4:34,97:.:-0.89:1.000:. ./.:4:149,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:38,18:.:-1.49:1.000:. ./.:4:205,57:.: 0.15:1.000:. ./.:4:197,79:.: 0.26:1.000:. ./.:4:175,35:.:-0.26:1.000:. ./.:4:83,63:.:-0.77:1.000:. ./.:4:277,111:.: 1.15:1.000:. ./.:4:450,1:.: 1.65:1.000:. ./.:3:133,63:.:-0.38:0.998:. ./.:4:194,129:.: 0.63:1.000:. ./.:4:267,87:.: 0.88:1.000:. ./.:4:215,82:.: 0.43:1.000:. ./.:4:103,37:.:-0.82:1.000:. ./.:4:283,91:.: 1.04:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:166,18:.:-0.47:1.000:. ./.:4:362,125:.: 1.94:1.000:. ./.:4:237,142:.: 1.08:1.000:. ./.:4:326,59:.: 1.13:1.000:. ./.:4:273,103:.: 1.06:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:219,84:.: 0.47:1.000:. ./.:4:403,60:.: 1.75:1.000:. ./.:4:164,41:.:-0.30:1.000:. ./.:4:301,25:.: 0.66:1.000:. ./.:4:429,62:.: 1.97:1.000:. ./.:4:93,29:.:-0.96:1.000:. ./.:4:244,84:.: 0.67:1.000:. ./.:4:45,57:.:-1.12:1.000:. ./.:6:365,120:.: 1.92:0.997:. ./.:4:234,95:.: 0.68:1.000:. ./.:4:130,52:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,55:.:-0.64:1.000:. ./.:4:299,41:.: 0.77:1.000:. ./.:4:308,79:.: 1.14:1.000:. ./.:4:187,81:.: 0.20:1.000:. ./.:4:148,82:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,27:.:-1.16:1.000:. ./.:4:301,37:.: 0.75:1.000:. ./.:4:432,62:.: 1.99:1.000:. ./.:4:380,50:.: 1.48:1.000:. ./.:4:149,93:.:-0.01:1.000:. ./.:3:250,51:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,75:.:-0.78:1.000:. ./.:4:125,96:.:-0.18:1.000:. ./.:4:243,65:.: 0.51:1.000:. ./.:4:259,120:.: 1.08:1.000:. -chr3.1 7692184 chr3.1_007692184 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:13,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,4:.:-1.00:0.999:. ./.:4:7,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:116,0:.: 3.75:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:12,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:8,5:.:-0.91:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:39,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:38,10:.: 0.67:1.000:. ./.:3:46,0:.: 0.58:0.993:. ./.:4:10,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:33,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:23,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,12:.: 0.63:1.000:. ./.:4:33,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:14,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:186,0:.: 6.92:1.000:. ./.:4:28,9:.: 0.18:1.000:. ./.:4:111,0:.: 3.52:1.000:. ./.:4:14,12:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,6:.: 0.40:1.000:. ./.:4:19,9:.:-0.23:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:75,19:.: 2.76:1.000:. ./.:4:29,11:.: 0.31:1.000:. ./.:6:38,5:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,12:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:26,12:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,26:.: 2.17:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:35,2:.: 0.18:1.000:. ./.:5:42,14:.: 1.04:0.993:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:25,15:.: 0.31:1.000:. ./.:4:10,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,10:.: 1.31:1.000:. ./.:4:33,12:.: 0.54:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:49,13:.: 1.31:1.000:. ./.:6:40,0:.: 0.31:0.990:. ./.:4:14,10:.:-0.41:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.46:1.000:. ./.:5:63,9:.: 1.76:0.928:. ./.:4:26,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,9:.: 0.40:1.000:. ./.:4:35,7:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.05:0.976:. ./.:4:34,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:52,6:.: 1.13:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:27,15:.: 0.40:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.32:1.000:. ./.:4:80,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,8:.: 0.13:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:68,11:.: 2.08:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.14:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:3:23,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:16,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:58,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:49,20:.: 1.62:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,8:.: 0.95:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.27:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:9,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,10:.: 0.22:1.000:. ./.:4:34,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:33,8:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,5:.: 0.13:1.000:. ./.:4:37,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:0.923:. ./.:4:40,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:29,10:.: 0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:36,11:.: 0.63:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:14,6:.:-0.59:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.59:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.32:1.000:. ./.:3:7,6:.:-0.91:0.998:. ./.:4:6,6:.:-0.95:1.000:. ./.:4:10,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:23,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.05:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.46:0.999:. ./.:4:25,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:11,6:.:-0.73:1.000:. ./.:4:11,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.95:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:16,0:.:-0.77:0.997:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.14:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,3:.:-1.09:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,5:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.77:1.000:. ./.:3:14,10:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:6,3:.:-1.09:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. -chr3.1 7867764 chr3.1_007867764 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:136,5:.:-0.31:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:186,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:149,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:154,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:37,2:.:-2.12:1.000:. ./.:4:53,8:.:-1.73:1.000:. ./.:4:107,3:.:-0.86:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:201,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:185,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:174,2:.: 0.30:0.999:. ./.:4:65,1:.:-1.64:1.000:. ./.:4:221,2:.: 1.14:1.000:. ./.:4:300,1:.: 2.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:249,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:189,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:328,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:57,4:.:-1.73:1.000:. ./.:3:27,0:.:-2.33:0.993:. ./.:4:276,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:151,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:145,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:158,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:145,4:.:-0.17:1.000:. ./.:4:117,3:.:-0.69:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:214,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:281,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:62,2:.:-1.68:1.000:. ./.:4:95,4:.:-1.06:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:115,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:112,4:.:-0.76:1.000:. ./.:4:140,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:157,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:117,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:145,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:124,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.53:1.000:. ./.:6:119,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:138,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:125,4:.:-0.53:1.000:. ./.:4:163,3:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:128,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.60:1.000:. ./.:5:107,1:.:-0.90:0.993:. ./.:4:112,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:202,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:87,3:.:-1.22:1.000:. ./.:4:122,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:50,3:.:-1.87:1.000:. ./.:4:112,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:126,3:.:-0.53:1.000:. ./.:4:147,4:.:-0.14:1.000:. ./.:4:180,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:165,4:.: 0.18:1.000:. ./.:6:123,2:.:-0.60:0.990:. ./.:4:116,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:151,4:.:-0.07:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.71:1.000:. ./.:5:152,2:.:-0.08:0.928:. ./.:4:175,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:154,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:132,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:129,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:92,1:.:-1.16:0.976:. ./.:4:138,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:190,6:.: 0.66:1.000:. ./.:4:156,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:98,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:215,4:.: 1.07:1.000:. ./.:4:71,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:158,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.72:1.000:. ./.:3:207,5:.: 0.94:1.000:. ./.:4:202,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:141,4:.:-0.24:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:164,3:.: 0.15:0.999:. ./.:4:243,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:95,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:115,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:143,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:62,4:.:-1.64:1.000:. ./.:4:102,5:.:-0.92:1.000:. ./.:4:113,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:98,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:194,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:203,3:.: 0.84:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:101,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:126,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:138,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:194,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:105,3:.:-0.90:0.923:. ./.:4:124,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:282,3:.: 2.23:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:134,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:122,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:101,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:140,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:230,3:.: 1.31:1.000:. ./.:4:247,1:.: 1.58:1.000:. ./.:3:152,1:.:-0.10:0.998:. ./.:4:179,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:169,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:219,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:142,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:35,1:.:-2.17:1.000:. ./.:4:117,3:.:-0.69:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:178,4:.: 0.41:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:161,2:.: 0.07:0.999:. ./.:4:222,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:123,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:159,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:157,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:162,2:.: 0.09:1.000:. ./.:6:192,3:.: 0.64:0.997:. ./.:4:172,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:187,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:78,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:303,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.19:1.000:. ./.:3:220,3:.: 1.14:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:165,4:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:127,3:.:-0.51:1.000:. -chr3.1 8069655 chr3.1_008069655 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:48,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:118,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.18:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.61:0.993:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:39,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.18:1.000:. ./.:6:71,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.49:1.000:. ./.:5:69,1:.: 0.30:0.993:. ./.:4:86,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:86,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.26:1.000:. ./.:6:77,0:.: 0.63:0.990:. ./.:4:55,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.25:1.000:. ./.:5:40,0:.:-1.08:0.928:. ./.:4:63,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.21:0.976:. ./.:4:68,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:134,0:.: 3.26:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.72:1.000:. ./.:3:100,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.51:0.999:. ./.:4:64,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:0.923:. ./.:4:40,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:124,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.67:1.000:. ./.:3:51,0:.:-0.57:0.998:. ./.:4:67,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:63,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.35:1.000:. ./.:2:56,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:69,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./.:6:101,0:.: 1.74:0.997:. ./.:4:61,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./.:3:55,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:107,0:.: 2.01:1.000:. -chr3.1 8431851 chr3.1_008431851 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,7:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.41: 0.30:0.999:0.835 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,20:0.24: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,8:0.59:-1.20:1.000:0.849 0/0/1/1:4:32,27:0.40: 1.06:1.000:0.780 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,11:0.14: 1.48:1.000:0.953 0/0/1/1:4:12,24:0.56:-0.02:1.000:0.971 0/0/0/1:4:66,20:0.20: 2.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.25: 0.87:0.999:1.000 0/0/0/1:4:43,25:0.32: 1.48:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.45:-0.45:1.000:0.984 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,20:0.26: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 2.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,16:0.24: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,17:0.31: 0.49:1.000:0.973 0/0/0/1:4:57,17:0.19: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.19:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.44:-1.53:1.000:0.963 0/0/0:3:5,0:0.00:-1.48:0.993:1.000 0/0/0/1:4:65,13:0.14: 1.95:1.000:0.969 0/0/0/0:4:59,8:0.10: 1.43:1.000:0.783 0/0/0/1:4:44,21:0.27: 1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,13:0.28: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,17:0.44:-0.12:1.000:0.963 0/0/0/1:4:18,7:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,12:0.40:-0.49:1.000:0.810 0/0/1/1:4:11,15:0.51:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,13:0.35:-0.21:1.000:0.779 0/0/0/1:4:24,18:0.37: 0.26:1.000:0.537 0/0/0/1:4:17,8:0.27:-0.54:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,15:0.20: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,18:0.48:-0.16:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,10:0.32:-0.45:1.000:0.958 0/0/0/1:4:13,8:0.33:-0.73:1.000:0.928 0/0/1/1:4:4,10:0.58:-1.06:1.000:0.892 0/0/1/1:4:21,16:0.38: 0.02:1.000:0.510 0/0/0/0/1/1:6:11,6:0.30:-0.92:1.000:0.879 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,12:0.28:-0.02:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,11:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:4,5:0.49:-1.29:0.993:0.609 0/0/1/1:4:20,27:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,10:0.08: 3.21:1.000:0.988 0/0/0/1:4:35,19:0.30: 0.82:1.000:0.984 0/0/0/1:4:24,15:0.33: 0.12:1.000:0.914 0/0/1/1:4:9,17:0.55:-0.49:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.30:-0.77:1.000:0.985 0/0/0/1:4:15,11:0.37:-0.49:1.000:0.603 0/0/1/1:4:10,11:0.46:-0.73:1.000:0.987 0/0/0/0/1/1:6:30,19:0.33: 0.59:0.990:0.920 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,14:0.26: 0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,10:0.16: 0.77:1.000:0.995 0/0/1/1/1:5:17,24:0.51: 0.21:0.928:0.601 0/0/1/1:4:18,21:0.47: 0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:17,8:0.27:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,11:0.28:-0.12:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,11:0.16: 0.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,8:0.24:-0.40:0.976:1.000 0/0/0/0:4:33,4:0.09: 0.02:1.000:0.934 0/0/0/1:4:25,16:0.34: 0.21:1.000:0.889 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.44:-1.15:1.000:0.963 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.41:-1.01:1.000:0.845 0/0/1/1:4:16,21:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,9:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,12:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,8:0.18: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,12:0.44:-0.59:1.000:0.963 0/0/1/1:4:4,13:0.61:-0.92:1.000:0.645 0/0/0/1:4:14,10:0.36:-0.59:1.000:0.677 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,9:0.22:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,18:0.28: 0.82:1.000:0.994 0/0:2:52,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,12:0.21: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,10:0.36:-0.59:1.000:0.677 0/0/0/1:4:76,19:0.17: 2.74:1.000:0.998 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.01:0.999:1.000 0/1/1/1:4:7,27:0.63:-0.12:1.000:0.576 0/0/0/1:4:18,11:0.33:-0.35:1.000:0.934 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,10:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,19:0.45: 0.02:1.000:0.980 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.44:-0.49:1.000:0.963 0/0/0/1:4:11,7:0.34:-0.87:1.000:0.896 0/0/0/1:4:23,12:0.29:-0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:31,5:0.12:-0.02:1.000:0.698 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,11:0.28:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:67,15:0.15: 2.13:1.000:0.992 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.29:0.923:1.000 0/0/0/1:4:25,10:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,7:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,13:0.38:-0.31:1.000:0.521 0/0/0/1:4:18,11:0.33:-0.35:1.000:0.934 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.22:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,10:0.65:-1.15:1.000:0.823 0/0/0/1:4:25,11:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.39:-0.77:1.000:0.710 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.40:-0.68:1.000:0.753 0/0/0:3:27,0:0.00:-0.45:0.998:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,12:0.18: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,19:0.28: 0.96:1.000:0.994 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 2.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,18:0.19: 1.99:1.000:1.000 1/1:2:0,8:1.00:-1.34:0.999:1.000 0/0/0/1:4:38,11:0.19: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,12:0.29:-0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:37,14:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,12:0.21: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,8:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:76,12:0.12: 2.42:0.997:0.974 0/0/0/1:4:35,12:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,19:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,15:0.30: 0.30:1.000:0.986 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,16:0.36: 0.12:1.000:0.743 0/0/0/1:4:39,23:0.32: 1.20:1.000:0.956 0/0/0/1:4:46,19:0.25: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,14:0.21: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,11:0.19: 0.54:1.000:1.000 0/0/0:3:19,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,14:0.19: 1.15:1.000:1.000 -chr3.1 8637528 chr3.1_008637528 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:157,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.18:0.999:. ./.:4:188,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.45:0.999:. ./.:4:240,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:364,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:36,1:.:-2.04:0.993:. ./.:4:304,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:365,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.25:1.000:. ./.:6:107,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.13:1.000:. ./.:5:209,0:.: 0.14:0.993:. ./.:4:235,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:377,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.19:1.000:. ./.:6:319,0:.: 1.54:0.990:. ./.:4:138,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:5:226,0:.: 0.36:0.928:. ./.:4:184,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.59:0.976:. ./.:4:248,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.71:1.000:. ./.:2:227,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:362,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:212,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.09:0.923:. ./.:4:241,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.70:1.000:. ./.:3:60,0:.:-1.75:0.998:. ./.:4:252,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:406,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.07:1.000:. ./.:2:118,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:294,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.73:1.000:. ./.:6:357,0:.: 2.02:0.997:. ./.:4:245,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.09:1.000:. ./.:3:137,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.80:1.000:. -chr3.1 8820784 chr3.1_008820784 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,302:.: 1.02:1.000:. ./.:4:26,267:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.89:1.000:. ./.:4:28,302:.: 0.99:1.000:. ./.:4:34,254:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,354:.: 1.31:0.999:. ./.:4:0,149:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,93:.:-2.11:1.000:. ./.:4:7,86:.:-2.11:1.000:. ./.:4:31,217:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,243:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.09:1.000:. ./.:4:37,232:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,369:.: 1.50:1.000:. ./.:4:35,331:.: 1.46:0.999:. ./.:4:0,330:.: 0.99:1.000:. ./.:4:37,311:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,81:.:-2.26:1.000:. ./.:4:40,275:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,257:.: 0.61:1.000:. ./.:4:25,216:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,59:.:-2.55:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,414:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,328:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,334:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,365:.: 1.45:1.000:. ./.:4:39,331:.: 1.52:1.000:. ./.:4:39,317:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,75:.:-2.34:1.000:. ./.:4:13,74:.:-2.18:1.000:. ./.:3:0,50:.:-2.67:0.993:. ./.:4:0,374:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.94:1.000:. ./.:4:45,284:.: 0.98:1.000:. ./.:4:49,332:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,256:.: 0.54:1.000:. ./.:4:21,180:.:-0.69:1.000:. ./.:4:29,185:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.39:1.000:. ./.:4:85,542:.: 4.88:1.000:. ./.:4:20,201:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.50:1.000:. ./.:4:52,295:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.20:1.000:. ./.:4:39,200:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.31:1.000:. ./.:4:29,221:.:-0.05:1.000:. ./.:4:22,239:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.12:1.000:. ./.:6:10,173:.:-0.93:1.000:. ./.:4:31,180:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.21:1.000:. ./.:4:27,219:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.58:1.000:. ./.:4:34,272:.: 0.68:1.000:. ./.:4:24,280:.: 0.65:1.000:. ./.:4:15,117:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.05:1.000:. ./.:5:29,260:.: 0.46:0.993:. ./.:4:45,205:.:-0.05:1.000:. ./.:4:31,228:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,108:.:-1.91:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,234:.: 0.35:1.000:. ./.:4:60,202:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,224:.:-0.09:1.000:. ./.:4:26,184:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.01:1.000:. ./.:4:31,226:.: 0.04:1.000:. ./.:4:36,271:.: 0.69:1.000:. ./.:6:0,225:.:-0.38:0.990:. ./.:4:16,222:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,226:.:-0.35:1.000:. ./.:5:0,299:.: 0.59:0.928:. ./.:4:0,235:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.88:1.000:. ./.:4:25,163:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1,252:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,163:.:-1.19:0.976:. ./.:4:35,204:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.54:1.000:. ./.:4:38,212:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,165:.:-1.16:1.000:. ./.:4:22,242:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,94:.:-2.09:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,152:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,166:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,343:.: 1.16:1.000:. ./.:2:41,241:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1,270:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,173:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,424:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.52:0.999:. ./.:4:0,252:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.60:1.000:. ./.:4:14,112:.:-1.67:1.000:. ./.:4:21,167:.:-0.86:1.000:. ./.:4:22,140:.:-1.20:1.000:. ./.:4:29,169:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.38:1.000:. ./.:4:39,292:.: 1.01:1.000:. ./.:4:22,189:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.60:1.000:. ./.:4:21,186:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,167:.:-1.14:1.000:. ./.:4:19,185:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.44:1.000:. ./.:4:18,165:.:-0.93:0.923:. ./.:4:34,219:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.11:1.000:. ./.:4:49,313:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,171:.:-1.09:1.000:. ./.:4:30,183:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,172:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,177:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,173:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,262:.: 0.55:1.000:. ./.:3:39,240:.: 0.33:0.998:. ./.:4:0,275:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,271:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,301:.: 1.28:1.000:. ./.:4:36,283:.: 0.85:1.000:. ./.:4:8,67:.:-2.34:1.000:. ./.:4:19,172:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,261:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.17:1.000:. ./.:2:30,182:.:-0.55:0.999:. ./.:4:0,288:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,238:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,337:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,375:.: 2.18:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.08:1.000:. ./.:4:21,224:.:-0.12:1.000:. ./.:6:1,303:.: 0.65:0.997:. ./.:4:0,255:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,194:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,190:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,244:.: 0.38:1.000:. ./.:4:28,203:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,407:.: 2.00:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,316:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.59:1.000:. ./.:3:41,250:.: 0.48:1.000:. ./.:4:29,326:.: 1.32:1.000:. ./.:4:51,283:.: 1.05:1.000:. ./.:4:24,163:.:-0.88:1.000:. ./.:4:39,249:.: 0.44:1.000:. -chr3.1 8984137 chr3.1_008984137 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,151:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.94:1.000:. ./.:4:69,239:.: 1.66:1.000:. ./.:4:54,194:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.66:1.000:. ./.:4:68,152:.: 0.29:0.999:. ./.:4:0,195:.:-0.11:1.000:. ./.:4:53,142:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,60:.:-2.22:1.000:. ./.:4:0,59:.:-2.23:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.05:1.000:. ./.:4:65,223:.: 1.35:1.000:. ./.:4:72,112:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,330:.: 2.01:0.999:. ./.:4:65,218:.: 1.27:1.000:. ./.:4:88,171:.: 0.90:1.000:. ./.:4:64,150:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,79:.:-1.92:1.000:. ./.:4:65,123:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,200:.: 0.86:1.000:. ./.:4:9,70:.:-1.92:1.000:. ./.:4:0,282:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.85:1.000:. ./.:4:60,185:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.68:1.000:. ./.:4:68,152:.: 0.29:1.000:. ./.:4:91,158:.: 0.74:1.000:. ./.:4:58,175:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,57:.:-2.26:1.000:. ./.:4:18,77:.:-1.67:1.000:. ./.:3:0,48:.:-2.41:0.993:. ./.:4:57,176:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,304:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.25:1.000:. ./.:4:70,213:.: 1.27:1.000:. ./.:4:100,231:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.84:1.000:. ./.:4:85,85:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,65:.:-1.09:1.000:. ./.:4:76,132:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,187:.: 0.72:1.000:. ./.:4:76,86:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.97:1.000:. ./.:4:77,94:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.26:1.000:. ./.:4:52,147:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,312:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.74:1.000:. ./.:4:79,144:.: 0.33:1.000:. ./.:4:61,47:.:-1.47:1.000:. ./.:4:86,151:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.33:1.000:. ./.:4:80,125:.: 0.05:1.000:. ./.:4:85,88:.:-0.45:1.000:. ./.:6:35,78:.:-1.39:1.000:. ./.:4:67,68:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.24:1.000:. ./.:4:98,159:.: 0.86:1.000:. ./.:4:75,186:.: 0.93:1.000:. ./.:4:94,110:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,108:.:-1.47:1.000:. ./.:4:72,164:.: 0.54:1.000:. ./.:6:80,179:.: 0.90:0.992:. ./.:4:0,147:.:-0.86:1.000:. ./.:4:104,167:.: 1.08:1.000:. ./.:4:56,105:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,308:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,135:.:-1.04:1.000:. ./.:4:73,117:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,109:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.93:1.000:. ./.:4:84,179:.: 0.96:1.000:. ./.:6:0,228:.: 0.41:0.990:. ./.:4:63,156:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,109:.:-1.45:1.000:. ./.:5:97,177:.: 1.13:0.928:. ./.:4:95,132:.: 0.40:1.000:. ./.:4:73,128:.:-0.01:1.000:. ./.:4:55,144:.:-0.04:1.000:. ./.:4:63,111:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.84:0.976:. ./.:4:0,214:.: 0.19:1.000:. ./.:4:77,238:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.63:1.000:. ./.:4:104,284:.: 2.91:1.000:. ./.:4:56,111:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.30:1.000:. ./.:4:88,200:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,102:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.28:1.000:. ./.:4:58,127:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,73:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.87:1.000:. ./.:4:69,97:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.24:1.000:. ./.:2:0,228:.: 0.41:1.000:. ./.:4:67,201:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,117:.:-1.33:1.000:. ./.:4:75,229:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.06:0.999:. ./.:4:0,149:.:-0.82:1.000:. ./.:4:62,105:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.14:1.000:. ./.:4:62,51:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,77:.:-0.84:1.000:. ./.:4:60,91:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.79:1.000:. ./.:4:67,86:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.48:1.000:. ./.:4:61,100:.:-0.64:1.000:. ./.:4:89,140:.: 0.43:1.000:. ./.:4:61,184:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.22:1.000:. ./.:4:52,92:.:-0.90:1.000:. ./.:4:74,129:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.18:0.923:. ./.:4:0,194:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.89:1.000:. ./.:4:77,187:.: 0.97:1.000:. ./.:4:69,75:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,123:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.23:1.000:. ./.:4:58,63:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.80:1.000:. ./.:4:52,152:.: 0.04:1.000:. ./.:4:65,168:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,171:.: 0.72:1.000:. ./.:3:84,74:.:-0.68:0.998:. ./.:4:57,198:.: 0.83:1.000:. ./.:4:86,265:.: 2.34:1.000:. ./.:4:67,217:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.20:1.000:. ./.:4:8,78:.:-1.81:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,327:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,267:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.87:1.000:. ./.:4:73,151:.: 0.35:1.000:. ./.:2:0,106:.:-1.50:0.999:. ./.:4:56,196:.: 0.79:1.000:. ./.:4:54,202:.: 0.85:1.000:. ./.:4:57,117:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.32:1.000:. ./.:4:64,210:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.67:1.000:. ./.:4:64,171:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.98:1.000:. ./.:6:0,265:.: 0.99:0.997:. ./.:4:0,168:.:-0.53:1.000:. ./.:4:48,87:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,69:.:-1.00:1.000:. ./.:4:49,175:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,101:.:-1.58:1.000:. ./.:4:71,211:.: 1.26:1.000:. ./.:4:85,244:.: 1.99:1.000:. ./.:4:60,239:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.86:1.000:. ./.:3:68,148:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,184:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.62:1.000:. ./.:4:56,111:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.32:1.000:. -chr3.1 9441649 chr3.1_009441649 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:12,10:0.47: 0.52:1.000:0.990 0/0/0/1:4:11,5:0.36:-0.39:1.000:0.736 0/0/1/1:4:15,15:0.50: 1.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,7:0.35: 0.67:1.000:0.798 0/1/1/1:4:3,8:0.68:-1.15:0.999:0.962 0/0/0/1:4:7,1:0.18:-1.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,6:0.70:-1.61:1.000:0.987 0/0/0/1:4:13,6:0.36: 0.07:1.000:0.709 0/0/0/1:4:17,7:0.34: 0.83:1.000:0.871 0/0/1/1:4:19,10:0.38: 1.59:1.000:0.577 0/0/1/1:4:7,13:0.62: 0.22:1.000:0.554 0/0/0/1:4:26,4:0.19: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.40: 0.07:1.000:0.780 0/0/1/1:4:8,11:0.56: 0.07:1.000:0.961 0/0/0/1:4:11,2:0.22:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.39:-0.69:0.999:0.692 0/0/0/1:4:5,1:0.24:-1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.73:-0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,14:0.66: 0.22:1.000:0.878 0/0/1/1:4:11,12:0.52: 0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,11:0.52: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,5:0.78:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.61:-1.15:1.000:0.690 0/0/1/1:4:5,8:0.59:-0.85:1.000:0.843 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,8:0.63:-1.00:1.000:0.623 0/0/0/1:4:15,5:0.31: 0.22:1.000:0.977 0/0/1/1:4:10,7:0.43:-0.24:1.000:0.952 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,11:0.59:-0.09:1.000:0.866 0/0/1:3:10,7:0.43:-0.24:0.993:0.990 0/0/1/1:4:10,8:0.46:-0.09:1.000:0.986 0/0/0/1:4:12,5:0.34:-0.24:1.000:0.859 0/0/0/1:4:18,2:0.14: 0.22:1.000:0.975 0/0/1/1:4:7,10:0.57:-0.24:1.000:0.943 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,3:0.35:-1.30:1.000:0.826 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-0.09:1.000:0.984 0/0/1/1:4:7,10:0.57:-0.24:1.000:0.943 0/1/1/1:4:3,19:0.82: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,19:0.66: 1.28:1.000:0.895 0/1/1/1:4:3,8:0.68:-1.15:1.000:0.962 0/0/0/1:4:33,6:0.22: 3.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,11:0.89:-1.00:1.000:0.536 0/0/1/1:4:11,13:0.53: 0.83:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:14,3:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,5:0.31: 0.22:1.000:0.977 0/0/1/1:4:7,8:0.53:-0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:5,8:0.59:-0.85:1.000:0.843 0/0/0/1:4:13,4:0.30:-0.24:1.000:0.988 0/0/1/1:4:12,7:0.40: 0.07:1.000:0.780 0/0/1/1:4:19,18:0.49: 2.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,5:0.37:-0.54:1.000:0.540 0/0/0/1/1/1:6:12,14:0.53: 1.13:1.000:0.835 0/1/1/1:4:6,13:0.65: 0.07:1.000:0.781 0/0/0/1:4:14,7:0.37: 0.37:1.000:0.540 0/0/1/1:4:8,13:0.60: 0.37:1.000:0.822 0/0/0/1:4:14,7:0.37: 0.37:1.000:0.540 0/1/1/1:4:9,26:0.70: 2.50:1.000:0.981 0/0/0/1:4:14,3:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,6:0.58:-1.30:1.000:0.911 0/0/1/1:4:8,13:0.60: 0.37:1.000:0.822 0/0/0/1/1/1:6:20,15:0.45: 2.50:0.992:0.713 0/0/1/1:4:7,10:0.57:-0.24:1.000:0.943 1/1/1/1:4:2,22:0.89: 0.83:1.000:0.536 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-1.30:1.000:0.925 0/0/1/1:4:14,11:0.45: 0.98:1.000:0.983 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,14:0.53: 1.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:6,11:0.62:-0.24:1.000:0.585 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-1.15:1.000:0.989 0/0/0/1:4:26,5:0.23: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,14:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,16:0.59: 1.13:1.000:0.843 0/0/1/1/1/1:6:7,15:0.65: 0.52:0.990:0.892 0/0/1/1:4:16,14:0.47: 1.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,9:0.46: 0.22:1.000:0.988 0/1/1/1:4:4,10:0.67:-0.69:1.000:0.933 0/0/1/1/1:5:8,11:0.56: 0.07:0.928:0.926 0/0/1/1:4:11,9:0.46: 0.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,6:0.40:-0.39:1.000:0.822 0/0/0/1:4:16,8:0.37: 0.83:1.000:0.540 0/1/1/1:4:5,13:0.68:-0.09:1.000:0.952 0/0/0/1:4:14,2:0.18:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,5:0.41:-0.85:0.976:0.871 0/0/0/1:4:15,2:0.17:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,20:0.60: 2.04:1.000:0.783 0/0/0/1:4:17,4:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,11:0.44: 1.13:1.000:0.968 0/0/1/1:4:15,9:0.40: 0.83:1.000:0.822 0/1/1/1:4:6,17:0.69: 0.67:1.000:0.978 0/0/1/1:4:13,17:0.55: 1.74:1.000:0.976 0/0/1/1:4:15,12:0.46: 1.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,7:0.45:-0.39:1.000:0.982 0/0/0/1:4:7,2:0.29:-1.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,12:0.47: 1.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,9:0.45: 0.37:1.000:0.974 0/1/1/1:4:5,15:0.70: 0.22:1.000:0.987 0/0/0/1:4:15,3:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.40:-0.39:1.000:0.822 0/0/1/1:4:10,9:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,14:0.63: 0.37:1.000:0.623 0/1:2:7,7:0.50:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.70:-0.39:1.000:0.987 0/0/0/0:4:13,1:0.10:-0.69:1.000:0.755 0/0/1/1:4:14,16:0.53: 1.74:1.000:0.993 0/0/0/1:4:25,4:0.20: 1.59:0.999:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,4:0.32:-0.54:1.000:0.953 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,15:0.67: 0.37:1.000:0.933 0/0/0/1:4:24,4:0.20: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,12:0.48: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,15:0.70: 0.22:1.000:0.987 0/0/0/1:4:23,6:0.27: 1.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,10:0.60:-0.39:1.000:0.783 0/0/1/1:4:9,8:0.48:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-1.15:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.46: 1.59:1.000:0.988 0/0/0/1:4:9,4:0.35:-0.85:1.000:0.774 0/1/1/1:4:7,15:0.65: 0.52:1.000:0.763 0/0/1/1:4:10,6:0.40:-0.39:1.000:0.822 0/1/1/1:4:6,16:0.68: 0.52:1.000:0.962 0/0/1/1:4:16,9:0.39: 0.98:1.000:0.716 0/0/0/1:4:17,4:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,6:0.40:-0.39:0.923:0.822 0/0/1/1:4:11,9:0.46: 0.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,12:0.52: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:6,2:0.31:-1.61:1.000:0.977 0/0/0/1:4:15,7:0.36: 0.52:1.000:0.688 0/0/1/1:4:14,9:0.42: 0.67:1.000:0.898 0/1/1/1:4:2,10:0.78:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,13:0.60: 0.37:1.000:0.822 0/0/0/1:4:25,4:0.20: 1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,15:0.92:-0.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:14,10:0.44: 0.83:1.000:0.960 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-2.06:1.000:0.925 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-0.69:1.000:0.974 0/1/1:3:7,8:0.53:-0.54:0.998:0.858 0/0/1/1:4:9,7:0.45:-0.39:1.000:0.982 0/0/0/1:4:8,3:0.33:-1.15:1.000:0.939 0/0/0/1:4:16,7:0.35: 0.67:1.000:0.798 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,7:0.38: 0.22:1.000:0.627 0/1/1/1:4:10,19:0.63: 1.59:1.000:0.501 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,3:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,2:0.15: 0.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:12,3:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,8:0.41: 0.37:1.000:0.854 0/1:2:5,8:0.59:-0.85:0.999:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-0.69:1.000:0.974 0/0/1/1:4:9,13:0.57: 0.52:1.000:0.937 0/0/1/1:4:3,5:0.60:-1.61:1.000:0.783 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-1.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:11,6:0.39:-0.24:1.000:0.655 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-1.46:1.000:0.986 0/0/0/1:4:9,3:0.31:-1.00:1.000:0.977 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:12,12:0.50: 0.83:0.997:0.889 0/0/0/1:4:10,2:0.24:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-0.69:1.000:0.974 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-0.09:1.000:0.984 0/1/1/1:4:3,7:0.66:-1.30:1.000:0.878 0/0/0/1:4:17,5:0.29: 0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,4:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,3:0.37:-1.46:1.000:0.540 0/0/1/1:4:7,13:0.62: 0.22:1.000:0.554 0/0/1/1:4:17,10:0.40: 1.28:1.000:0.793 0/0/1/1:4:9,6:0.42:-0.54:1.000:0.925 0/0/1/1:4:9,6:0.42:-0.54:1.000:0.925 1/1/1:3:1,12:0.90:-0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,15:0.70: 0.22:1.000:0.987 0/0/0/1:4:17,4:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-1.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.09:1.000:0.997 -chr3.1 9753903 chr3.1_009753903 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,402:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,345:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,361:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,493:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.40:0.999:. ./.:4:0,337:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,107:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,85:.:-2.83:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,380:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,491:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,358:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,510:.: 1.71:0.999:. ./.:4:141,212:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,455:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,417:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,103:.:-2.64:1.000:. ./.:4:0,444:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,497:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,21:.:-3.51:1.000:. ./.:4:0,444:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,391:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,482:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,429:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,543:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,320:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,46:.:-3.25:1.000:. ./.:4:0,152:.:-2.12:1.000:. ./.:3:0,19:.:-3.54:0.993:. ./.:4:0,384:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1,392:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,343:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,451:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,446:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,321:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,441:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,292:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,363:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,387:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,29:.:-3.43:1.000:. ./.:4:0,339:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,533:.: 1.95:1.000:. ./.:4:1,364:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,344:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,467:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.04:1.000:. ./.:6:0,247:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,337:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,451:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1,372:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,376:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,345:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,373:.: 0.24:1.000:. ./.:6:0,403:.: 0.56:0.992:. ./.:4:0,334:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,424:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,224:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,481:.: 1.40:1.000:. ./.:4:1,387:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,378:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,378:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,382:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,342:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,469:.: 1.27:1.000:. ./.:6:0,425:.: 0.80:0.990:. ./.:4:0,353:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,356:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.97:1.000:. ./.:5:1,402:.: 0.56:0.928:. ./.:4:0,396:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,231:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,342:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,262:.:-0.94:0.976:. ./.:4:1,350:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,481:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,476:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,441:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,423:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,489:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,434:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,343:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,392:.: 0.45:1.000:. ./.:2:0,377:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,379:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,465:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,335:.:-0.16:0.999:. ./.:4:0,355:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,372:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,240:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,298:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,332:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,257:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,382:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,265:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,332:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,238:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,321:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,382:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,261:.:-0.94:0.923:. ./.:4:0,352:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,493:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,299:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,333:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,316:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,372:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,361:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,392:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,481:.: 1.40:1.000:. ./.:3:0,302:.:-0.51:0.998:. ./.:4:0,340:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,423:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,358:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,65:.:-3.05:1.000:. ./.:4:0,198:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,433:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,328:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,360:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.29:1.000:. ./.:2:0,275:.:-0.80:0.999:. ./.:4:1,468:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,370:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,288:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,280:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,267:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,301:.:-0.53:1.000:. ./.:6:1,503:.: 1.64:0.997:. ./.:4:0,300:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,269:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,338:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,421:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,507:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,508:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.44:1.000:. ./.:3:0,344:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,409:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,267:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,419:.: 0.73:1.000:. -chr3.1 10139925 chr3.1_010139925 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:370,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:695,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.08:0.999:. ./.:4:384,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:443,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:292,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:269,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:198,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:138,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:120,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:687,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:712,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:172,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.50:1.000:. ./.:3:139,0:.:-2.31:0.993:. ./.:4:570,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:456,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:289,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:683,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:566,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:593,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:757,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:609,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:705,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:704,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.83:1.000:. ./.:6:429,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:484,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:663,0:.: 1.49:1.000:. ./.:6:630,0:.: 1.25:0.992:. ./.:4:347,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:720,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:832,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:486,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:482,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:685,0:.: 1.65:1.000:. ./.:6:562,0:.: 0.76:0.990:. ./.:4:382,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:379,3:.:-0.55:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.52:1.000:. ./.:5:544,0:.: 0.63:0.928:. ./.:4:364,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:640,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:368,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:281,0:.:-1.28:0.976:. ./.:4:411,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:861,0:.: 2.93:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:648,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:572,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:804,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:619,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:574,0:.: 0.85:1.000:. ./.:2:607,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:724,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:486,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:344,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:673,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:564,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.19:0.923:. ./.:4:486,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:725,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:713,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.07:1.000:. ./.:3:292,0:.:-1.20:0.998:. ./.:4:536,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:675,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.95:1.000:. ./.:2:343,0:.:-0.83:0.999:. ./.:4:559,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:576,0:.: 0.86:0.997:. ./.:4:242,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:248,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:306,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:650,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:471,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:306,0:.:-1.10:1.000:. ./.:3:499,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:599,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:240,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.22:1.000:. -chr3.1 10261844 chr3.1_010261844 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,38:.: 1.60:1.000:. ./.:4:153,27:.: 1.28:1.000:. ./.:4:109,25:.: 0.22:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:210,8:.: 2.15:1.000:. ./.:4:82,42:.:-0.02:0.999:. ./.:4:56,10:.:-1.35:1.000:. ./.:4:166,4:.: 1.05:1.000:. ./.:4:112,44:.: 0.72:1.000:. ./.:4:10,8:.:-2.46:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:131,29:.: 0.81:1.000:. ./.:4:138,33:.: 1.07:1.000:. ./.:4:142,33:.: 1.16:1.000:. ./.:4:187,5:.: 1.55:1.000:. ./.:4:85,49:.: 0.22:1.000:. ./.:4:145,4:.: 0.56:0.999:. ./.:4:117,25:.: 0.40:1.000:. ./.:4:149,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:118,36:.: 0.68:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:179,3:.: 1.32:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:130,21:.: 0.61:1.000:. ./.:4:14,3:.:-2.48:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:132,37:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,4:.: 0.68:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:127,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:183,43:.: 2.34:1.000:. ./.:4:135,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.67:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.44:0.993:. ./.:4:177,6:.: 1.34:1.000:. ./.:4:117,46:.: 0.88:1.000:. ./.:4:68,25:.:-0.73:1.000:. ./.:4:185,6:.: 1.53:1.000:. ./.:4:185,2:.: 1.44:1.000:. ./.:4:94,25:.:-0.13:1.000:. ./.:4:89,27:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:128,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:126,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:90,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:86,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:67,23:.:-0.80:1.000:. ./.:4:105,26:.: 0.15:1.000:. ./.:4:67,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,40:.:-0.78:1.000:. ./.:4:123,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,33:.:-0.91:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:161,3:.: 0.91:1.000:. ./.:4:76,31:.:-0.41:1.000:. ./.:6:68,8:.:-1.12:1.000:. ./.:4:117,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:97,33:.: 0.12:1.000:. ./.:4:58,33:.:-0.78:1.000:. ./.:4:107,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:108,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.26:1.000:. ./.:4:75,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.81:1.000:. ./.:6:125,0:.: 0.01:0.992:. ./.:4:147,29:.: 1.18:1.000:. ./.:4:104,7:.:-0.31:1.000:. ./.:4:46,13:.:-1.51:1.000:. ./.:4:111,27:.: 0.31:1.000:. ./.:4:162,6:.: 1.00:1.000:. ./.:4:107,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:67,33:.:-0.57:1.000:. ./.:4:121,7:.: 0.08:1.000:. ./.:4:139,6:.: 0.47:1.000:. ./.:6:139,20:.: 0.79:0.990:. ./.:4:104,28:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,32:.: 0.05:1.000:. ./.:4:123,1:.:-0.02:1.000:. ./.:5:97,33:.: 0.12:0.928:. ./.:4:67,30:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,31:.:-1.17:1.000:. ./.:4:91,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:72,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:100,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:68,19:.:-0.87:0.976:. ./.:4:80,33:.:-0.27:1.000:. ./.:4:119,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:90,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:129,34:.: 0.88:1.000:. ./.:4:74,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:101,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:96,26:.:-0.06:1.000:. ./.:4:94,31:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,17:.:-1.79:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:76,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:115,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:72,20:.:-0.75:1.000:. ./.:4:88,32:.:-0.11:1.000:. ./.:4:63,5:.:-1.31:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.45:1.000:. ./.:2:108,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:150,31:.: 1.30:1.000:. ./.:4:54,30:.:-0.94:1.000:. ./.:4:216,4:.: 2.20:1.000:. ./.:4:78,30:.:-0.38:0.999:. ./.:4:120,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:109,29:.: 0.31:1.000:. ./.:4:65,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:92,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:69,17:.:-0.89:1.000:. ./.:4:96,21:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,4:.:-1.33:1.000:. ./.:4:113,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:80,26:.:-0.43:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:114,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,26:.:-0.73:1.000:. ./.:4:84,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:116,21:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,17:.:-1.65:1.000:. ./.:4:82,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:86,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:152,32:.: 1.37:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.19:0.923:. ./.:4:89,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:206,3:.: 1.94:1.000:. ./.:4:92,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.91:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:88,4:.:-0.75:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:76,33:.:-0.36:1.000:. ./.:4:101,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:74,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:88,36:.:-0.02:1.000:. ./.:4:136,3:.: 0.33:1.000:. ./.:3:128,37:.: 0.93:0.998:. ./.:4:138,37:.: 1.16:1.000:. ./.:4:167,30:.: 1.67:1.000:. ./.:4:124,29:.: 0.65:1.000:. ./.:4:155,5:.: 0.81:1.000:. ./.:4:180,3:.: 1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:159,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:60,29:.:-0.82:1.000:. ./.:4:90,39:.: 0.10:1.000:. ./.:4:118,30:.: 0.54:1.000:. ./.:2:83,38:.:-0.08:0.999:. ./.:4:209,7:.: 2.11:1.000:. ./.:4:113,43:.: 0.72:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:97,34:.: 0.15:1.000:. ./.:4:184,2:.: 1.41:1.000:. ./.:4:76,35:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:162,30:.: 1.55:0.997:. ./.:4:69,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:110,37:.: 0.52:1.000:. ./.:4:92,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:88,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,36:.:-0.38:1.000:. ./.:4:106,29:.: 0.24:1.000:. ./.:4:151,3:.: 0.68:1.000:. ./.:4:227,4:.: 2.45:1.000:. ./.:4:121,38:.: 0.79:1.000:. ./.:4:115,32:.: 0.52:1.000:. ./.:4:131,32:.: 0.88:1.000:. ./.:3:118,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:167,3:.: 1.05:1.000:. ./.:4:143,34:.: 1.21:1.000:. ./.:4:60,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:141,31:.: 1.09:1.000:. -chr3.1 10508284 chr3.1_010508284 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:21,10:0.31:-0.58:1.000:0.979 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,22:0.42: 0.53:1.000:0.927 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,16:0.23: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-1.64:0.999:0.988 0/0/0/1:4:17,9:0.33:-0.84:1.000:0.906 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,15:0.33: 0.11:1.000:0.932 0/0/0/1:4:85,17:0.15: 3.18:1.000:0.989 0/1/1/1:4:12,41:0.64: 0.59:1.000:0.681 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,17:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.52:-1.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:23,8:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,10:0.53:-1.27:0.999:0.991 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,12:0.18: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,21:0.31: 1.17:1.000:0.970 0/0/0/1:4:14,7:0.32:-1.11:1.000:0.958 0/0/1/1:4:17,32:0.58: 0.37:1.000:0.912 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,21:0.53:-0.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:33,11:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.43:-1.11:1.000:0.946 0/0/1/1:4:30,41:0.54: 1.54:1.000:0.985 0/0/1/1:4:6,14:0.60:-1.16:1.000:0.760 0/0/0/1:4:25,6:0.18:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,9:0.43:-1.11:1.000:0.946 0/0/1/1:4:22,37:0.57: 0.90:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1:3:14,8:0.35:-1.06:0.993:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.27:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,13:0.27: 0.16:1.000:0.998 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,12:0.15: 1.59:1.000:0.989 0/0/0/1:4:36,10:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,32:0.62: 0.06:1.000:0.503 0/0/0/1:4:32,11:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,18:0.41: 0.11:1.000:0.846 0/0/0/1:4:31,8:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,39:0.60: 0.75:1.000:0.776 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,18:0.36: 0.37:1.000:0.709 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,11:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,19:0.30: 0.96:1.000:0.986 0/0/1/1:4:25,23:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,23:0.62:-0.58:1.000:0.518 0/0/0/1:4:27,14:0.33:-0.05:1.000:0.929 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,17:0.58:-0.84:1.000:0.911 0/0/0/1:4:38,15:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:35,25:0.42: 0.96:1.000:0.512 0/0/1/1:4:12,11:0.49:-1.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,16:0.21: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,23:0.52: 0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,13:0.22: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,17:0.20: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,11:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,14:0.26: 0.37:1.000:0.999 1/1/1/1/1/1:6:0,30:1.00:-0.63:0.992:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,11:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.51:-0.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,34:0.49: 1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,12:0.25: 0.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:36,0:0.00:-0.31:0.990:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,24:0.38: 1.06:1.000:0.587 0/0/0/1:4:27,11:0.27:-0.21:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:22,11:0.32:-0.47:0.928:0.693 0/0/1/1:4:22,21:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,21:0.26: 1.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,26:0.51: 0.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,24:0.40: 0.96:1.000:0.759 0/0/0/1:4:50,17:0.23: 1.33:0.976:1.000 0/0/0/1:4:32,10:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,30:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,10:0.32:-0.63:1.000:0.958 0/0/1/1:4:18,50:0.62: 1.38:1.000:0.561 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,33:0.55: 0.75:1.000:0.981 0/0/1/1:4:22,14:0.38:-0.31:1.000:0.613 0/0/1/1:4:31,21:0.40: 0.53:1.000:0.799 0/0/1/1:4:42,41:0.50: 2.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,18:0.51:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,21:0.36: 0.80:1.000:0.695 0/0/1/1:4:37,33:0.48: 1.49:1.000:0.995 0/0/0/0:4:58,8:0.11: 1.28:1.000:0.510 0/0/1/1:4:46,30:0.39: 1.81:1.000:0.695 0/0/0/1:4:24,14:0.36:-0.21:1.000:0.695 0/1:2:35,17:0.31: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,45:0.52: 2.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,16:0.13: 3.50:0.999:0.944 0/0/1/1:4:31,20:0.39: 0.48:1.000:0.660 0/0/0/1:4:22,12:0.34:-0.42:1.000:0.860 0/0/1/1:4:47,39:0.46: 2.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:9,23:0.61:-0.53:1.000:0.662 0/0/0/1:4:38,12:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,26:0.43: 1.01:1.000:0.939 0/0/0/1:4:40,21:0.33: 1.01:1.000:0.916 0/0/1/1:4:37,23:0.38: 0.96:1.000:0.529 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,25:0.33: 1.65:1.000:0.925 0/0/0/1:4:21,12:0.35:-0.47:1.000:0.755 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,20:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,18:0.42: 0.06:1.000:0.907 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,34:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,10:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,9:0.15: 0.75:1.000:0.982 0/0/0/1:4:30,11:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,20:0.43: 0.27:0.923:0.936 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,12:0.21: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,9:0.18: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,19:0.20: 2.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,25:0.58:-0.21:1.000:0.902 0/0/0/1:4:46,10:0.16: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,21:0.34: 0.96:1.000:0.882 0/0/0/1:4:55,22:0.26: 1.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,14:0.49:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,37:0.45: 2.18:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1:3:19,11:0.36:-0.63:0.998:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,9:0.20:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.56:-1.00:1.000:0.969 0/0/0/1:4:22,12:0.34:-0.42:1.000:0.860 0/0/0/1:4:32,18:0.35: 0.43:1.000:0.796 0/0/1/1:4:21,21:0.51: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,8:0.21:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,13:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,26:0.52: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1:2:38,26:0.40: 1.17:0.999:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,17:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,17:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,15:0.33: 0.11:1.000:0.932 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-0.90:1.000:0.759 0/0/0/1:4:14,7:0.32:-1.11:1.000:0.958 0/0/1/1:4:22,21:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,6:0.16:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/0/0/0:6:31,0:0.00:-0.58:0.997:1.000 0/0/0/1:4:19,10:0.33:-0.69:1.000:0.913 0/0/0/1:4:21,4:0.15:-0.90:1.000:0.981 0/0/0/1:4:28,9:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-0.90:1.000:0.759 0/0/1/1:4:31,26:0.46: 0.80:1.000:0.989 0/0/0/1:4:25,9:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,12:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.30:-0.90:1.000:0.983 0/0/0/1:4:15,7:0.30:-1.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:20,14:0.41:-0.42:1.000:0.866 0/0/1/1:4:13,13:0.51:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,9:0.17: 0.27:1.000:0.999 0/0/1:3:15,14:0.49:-0.69:1.000:0.608 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,13:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,11:0.41:-0.79:1.000:0.832 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 -chr3.1 10791523 chr3.1_010791523 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:240,15:.: 1.02:1.000:. ./.:4:153,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:95,20:.:-1.03:1.000:. ./.:4:228,13:.: 0.81:1.000:. ./.:4:324,14:.: 2.23:1.000:. ./.:4:169,7:.:-0.14:0.999:. ./.:4:142,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:332,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:159,7:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,8:.:-1.48:1.000:. ./.:4:101,36:.:-0.71:1.000:. ./.:4:183,10:.: 0.11:1.000:. ./.:4:135,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:166,16:.:-0.05:1.000:. ./.:4:284,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:156,12:.:-0.25:1.000:. ./.:4:233,15:.: 0.91:0.999:. ./.:4:82,198:.: 1.38:1.000:. ./.:4:300,9:.: 1.80:1.000:. ./.:4:295,9:.: 1.73:1.000:. ./.:4:62,57:.:-0.97:1.000:. ./.:4:249,6:.: 1.02:1.000:. ./.:4:247,10:.: 1.04:1.000:. ./.:4:198,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:69,42:.:-1.08:1.000:. ./.:4:238,14:.: 0.97:1.000:. ./.:4:186,10:.: 0.15:1.000:. ./.:4:220,15:.: 0.72:1.000:. ./.:4:290,18:.: 1.79:1.000:. ./.:4:260,16:.: 1.32:1.000:. ./.:4:232,14:.: 0.88:1.000:. ./.:4:169,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:95,40:.:-0.73:1.000:. ./.:4:46,29:.:-1.61:1.000:. ./.:3:60,20:.:-1.54:0.993:. ./.:4:286,4:.: 1.53:1.000:. ./.:4:159,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:126,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:183,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:213,16:.: 0.64:1.000:. ./.:4:155,9:.:-0.31:1.000:. ./.:4:157,10:.:-0.27:1.000:. ./.:4:169,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:160,20:.:-0.08:1.000:. ./.:4:349,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:279,68:.: 2.36:1.000:. ./.:4:162,12:.:-0.17:1.000:. ./.:4:154,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:118,8:.:-0.87:1.000:. ./.:4:127,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:77,36:.:-1.06:1.000:. ./.:4:121,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,22:.:-0.87:1.000:. ./.:4:128,12:.:-0.66:1.000:. ./.:4:213,13:.: 0.59:1.000:. ./.:4:129,12:.:-0.65:1.000:. ./.:6:135,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:91,19:.:-1.10:1.000:. ./.:4:88,34:.:-0.92:1.000:. ./.:4:111,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:207,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:148,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:230,10:.: 0.80:1.000:. ./.:6:153,26:.:-0.09:0.992:. ./.:4:189,19:.: 0.33:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,10:.:-0.88:1.000:. ./.:4:153,40:.: 0.11:1.000:. ./.:4:239,6:.: 0.87:1.000:. ./.:4:154,18:.:-0.20:1.000:. ./.:4:188,13:.: 0.23:1.000:. ./.:4:147,11:.:-0.40:1.000:. ./.:4:74,31:.:-1.17:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:178,25:.: 0.26:1.000:. ./.:6:122,39:.:-0.36:0.990:. ./.:4:127,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:112,21:.:-0.76:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.52:1.000:. ./.:5:133,34:.:-0.27:0.928:. ./.:4:90,22:.:-1.07:1.000:. ./.:4:100,19:.:-0.97:1.000:. ./.:4:113,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:115,16:.:-0.79:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.88:1.000:. ./.:4:127,17:.:-0.60:0.976:. ./.:4:80,24:.:-1.19:1.000:. ./.:4:138,26:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.71:1.000:. ./.:4:127,22:.:-0.53:1.000:. ./.:4:141,34:.:-0.15:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:104,29:.:-0.76:1.000:. ./.:4:78,40:.:-0.98:1.000:. ./.:4:135,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:108,18:.:-0.87:1.000:. ./.:4:147,20:.:-0.27:1.000:. ./.:4:73,14:.:-1.43:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:74,19:.:-1.35:1.000:. ./.:4:99,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:106,13:.:-0.97:1.000:. ./.:4:243,15:.: 1.06:1.000:. ./.:2:263,10:.: 1.28:1.000:. ./.:4:144,15:.:-0.38:1.000:. ./.:4:98,17:.:-1.03:1.000:. ./.:4:365,15:.: 2.84:1.000:. ./.:4:116,12:.:-0.84:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:119,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:51,36:.:-1.43:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:78,31:.:-1.11:1.000:. ./.:4:131,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:123,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:192,18:.: 0.36:1.000:. ./.:4:119,9:.:-0.84:1.000:. ./.:4:142,7:.:-0.53:1.000:. ./.:4:248,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:126,20:.:-0.57:1.000:. ./.:4:85,33:.:-0.98:1.000:. ./.:4:139,35:.:-0.17:1.000:. ./.:4:64,9:.:-1.64:1.000:. ./.:4:81,21:.:-1.22:1.000:. ./.:4:117,17:.:-0.75:1.000:. ./.:4:229,14:.: 0.84:1.000:. ./.:4:73,13:.:-1.45:0.923:. ./.:4:139,14:.:-0.47:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:319,7:.: 2.05:1.000:. ./.:4:149,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:99,14:.:-1.06:1.000:. ./.:4:98,16:.:-1.04:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:134,21:.:-0.44:1.000:. ./.:4:75,23:.:-1.27:1.000:. ./.:4:215,8:.: 0.55:1.000:. ./.:4:95,18:.:-1.06:1.000:. ./.:4:190,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:329,19:.: 2.37:1.000:. ./.:3:211,10:.: 0.52:0.998:. ./.:4:195,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:203,22:.: 0.58:1.000:. ./.:4:164,15:.:-0.09:1.000:. ./.:4:300,2:.: 1.70:1.000:. ./.:4:313,4:.: 1.92:1.000:. ./.:4:45,47:.:-1.36:1.000:. ./.:4:238,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:197,25:.: 0.53:1.000:. ./.:4:142,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:204,13:.: 0.46:1.000:. ./.:4:241,8:.: 0.93:1.000:. ./.:2:142,17:.:-0.38:0.999:. ./.:4:336,6:.: 2.28:1.000:. ./.:4:150,24:.:-0.17:1.000:. ./.:4:199,4:.: 0.26:1.000:. ./.:4:191,15:.: 0.30:1.000:. ./.:4:131,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:147,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.96:1.000:. ./.:6:225,29:.: 1.00:0.997:. ./.:4:123,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:223,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:205,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:160,9:.:-0.24:1.000:. ./.:4:123,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:121,8:.:-0.82:1.000:. ./.:4:140,16:.:-0.43:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:373,3:.: 2.78:1.000:. ./.:4:144,24:.:-0.25:1.000:. ./.:4:140,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:189,3:.: 0.10:1.000:. ./.:3:257,8:.: 1.16:1.000:. ./.:4:376,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:325,8:.: 2.15:1.000:. ./.:4:117,8:.:-0.88:1.000:. ./.:4:241,21:.: 1.12:1.000:. -chr3.1 10956413 chr3.1_010956413 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:397,911:.: 0.52:1.000:. ./.:4:332,749:.:-0.28:1.000:. ./.:4:341,701:.:-0.42:1.000:. ./.:4:464,800:.: 0.36:1.000:. ./.:4:344,880:.: 0.22:1.000:. ./.:4:518,870:.: 0.80:0.999:. ./.:4:261,839:.:-0.21:1.000:. ./.:4:264,543:.:-1.25:1.000:. ./.:4:258,626:.:-0.97:1.000:. ./.:4:75,324:.:-2.68:1.000:. ./.:4:285,465:.:-1.45:1.000:. ./.:4:622,752:.: 0.75:1.000:. ./.:4:489,922:.: 0.88:1.000:. ./.:4:404,590:.:-0.59:1.000:. ./.:4:381,775:.:-0.02:1.000:. ./.:4:500,737:.: 0.27:1.000:. ./.:4:489,635:.:-0.13:0.999:. ./.:4:529,837:.: 0.72:1.000:. ./.:4:630,994:.: 1.63:1.000:. ./.:4:196,986:.: 0.07:1.000:. ./.:4:274,444:.:-1.56:1.000:. ./.:4:355,715:.:-0.32:1.000:. ./.:4:593,1130:.: 1.98:1.000:. ./.:4:333,489:.:-1.19:1.000:. ./.:4:143,225:.:-2.79:1.000:. ./.:4:380,977:.: 0.69:1.000:. ./.:4:283,656:.:-0.78:1.000:. ./.:4:344,730:.:-0.31:1.000:. ./.:4:472,1130:.: 1.55:1.000:. ./.:4:460,943:.: 0.85:1.000:. ./.:4:329,756:.:-0.27:1.000:. ./.:4:314,579:.:-0.94:1.000:. ./.:4:116,343:.:-2.47:1.000:. ./.:4:247,447:.:-1.64:1.000:. ./.:3:11,166:.:-3.46:0.993:. ./.:4:223,472:.:-1.64:1.000:. ./.:4:462,725:.: 0.09:1.000:. ./.:4:467,753:.: 0.21:1.000:. ./.:4:392,494:.:-0.97:1.000:. ./.:4:500,779:.: 0.42:1.000:. ./.:4:405,675:.:-0.28:1.000:. ./.:4:448,813:.: 0.35:1.000:. ./.:4:574,1139:.: 1.94:1.000:. ./.:4:195,775:.:-0.67:1.000:. ./.:4:545,784:.: 0.59:1.000:. ./.:4:361,871:.: 0.25:1.000:. ./.:4:342,868:.: 0.17:1.000:. ./.:4:175,260:.:-2.55:1.000:. ./.:4:501,743:.: 0.29:1.000:. ./.:4:383,798:.: 0.07:1.000:. ./.:4:211,577:.:-1.31:1.000:. ./.:4:503,835:.: 0.62:1.000:. ./.:4:515,721:.: 0.26:1.000:. ./.:4:534,837:.: 0.74:1.000:. ./.:4:409,825:.: 0.26:1.000:. ./.:4:424,886:.: 0.52:1.000:. ./.:4:523,689:.: 0.18:1.000:. ./.:4:453,962:.: 0.89:1.000:. ./.:4:365,747:.:-0.17:1.000:. ./.:6:341,735:.:-0.30:1.000:. ./.:4:467,817:.: 0.43:1.000:. ./.:4:330,669:.:-0.57:1.000:. ./.:4:617,1134:.: 2.08:1.000:. ./.:4:354,822:.: 0.05:1.000:. ./.:4:470,868:.: 0.62:1.000:. ./.:4:351,681:.:-0.45:1.000:. ./.:4:382,752:.:-0.09:1.000:. ./.:4:254,854:.:-0.19:1.000:. ./.:6:526,924:.: 1.02:0.992:. ./.:4:616,734:.: 0.66:1.000:. ./.:4:358,699:.:-0.37:1.000:. ./.:4:225,625:.:-1.09:1.000:. ./.:4:348,1139:.: 1.15:1.000:. ./.:4:409,735:.:-0.06:1.000:. ./.:4:682,936:.: 1.61:1.000:. ./.:4:376,709:.:-0.27:1.000:. ./.:4:492,832:.: 0.57:1.000:. ./.:4:531,1143:.: 1.80:1.000:. ./.:4:450,741:.: 0.11:1.000:. ./.:4:483,787:.: 0.38:1.000:. ./.:6:382,769:.:-0.04:0.990:. ./.:4:388,658:.:-0.40:1.000:. ./.:4:524,841:.: 0.72:1.000:. ./.:4:236,660:.:-0.93:1.000:. ./.:5:692,1015:.: 1.92:0.928:. ./.:4:620,922:.: 1.34:1.000:. ./.:4:320,644:.:-0.69:1.000:. ./.:4:408,889:.: 0.48:1.000:. ./.:4:596,799:.: 0.82:1.000:. ./.:4:479,665:.:-0.06:1.000:. ./.:4:334,667:.:-0.56:0.976:. ./.:4:533,737:.: 0.38:1.000:. ./.:4:457,940:.: 0.83:1.000:. ./.:4:226,603:.:-1.17:1.000:. ./.:4:665,1146:.: 2.29:1.000:. ./.:4:251,599:.:-1.09:1.000:. ./.:4:220,530:.:-1.45:1.000:. ./.:4:598,760:.: 0.69:1.000:. ./.:4:622,958:.: 1.47:1.000:. ./.:4:515,845:.: 0.70:1.000:. ./.:4:541,1175:.: 1.95:1.000:. ./.:4:426,1159:.: 1.49:1.000:. ./.:4:321,667:.:-0.61:1.000:. ./.:4:355,972:.: 0.58:1.000:. ./.:4:461,997:.: 1.04:1.000:. ./.:4:270,779:.:-0.39:1.000:. ./.:4:368,764:.:-0.10:1.000:. ./.:4:372,750:.:-0.14:1.000:. ./.:2:563,933:.: 1.18:1.000:. ./.:4:410,515:.:-0.83:1.000:. ./.:4:488,1058:.: 1.35:1.000:. ./.:4:292,613:.:-0.90:1.000:. ./.:4:271,619:.:-0.95:1.000:. ./.:4:469,802:.: 0.39:1.000:. ./.:4:270,527:.:-1.28:1.000:. ./.:4:394,908:.: 0.50:1.000:. ./.:4:442,915:.: 0.69:1.000:. ./.:4:442,765:.: 0.16:1.000:. ./.:4:387,863:.: 0.31:1.000:. ./.:4:468,824:.: 0.46:1.000:. ./.:4:339,768:.:-0.19:1.000:. ./.:4:424,560:.:-0.62:1.000:. ./.:4:418,842:.: 0.35:1.000:. ./.:4:403,714:.:-0.15:1.000:. ./.:4:379,530:.:-0.89:1.000:. ./.:4:560,984:.: 1.35:1.000:. ./.:4:476,912:.: 0.80:1.000:. ./.:4:498,782:.: 0.42:1.000:. ./.:4:253,848:.:-0.21:1.000:. ./.:4:360,673:.:-0.45:1.000:. ./.:4:302,788:.:-0.25:1.000:. ./.:4:335,615:.:-0.74:1.000:. ./.:4:252,716:.:-0.68:0.923:. ./.:4:547,813:.: 0.70:1.000:. ./.:4:202,675:.:-1.00:1.000:. ./.:4:656,970:.: 1.64:1.000:. ./.:4:382,750:.:-0.10:1.000:. ./.:4:298,782:.:-0.28:1.000:. ./.:4:473,691:.: 0.01:1.000:. ./.:4:257,855:.:-0.17:1.000:. ./.:4:451,917:.: 0.73:1.000:. ./.:4:562,867:.: 0.94:1.000:. ./.:4:333,772:.:-0.20:1.000:. ./.:4:214,427:.:-1.83:1.000:. ./.:4:392,1271:.: 1.77:1.000:. ./.:4:661,1188:.: 2.42:1.000:. ./.:3:342,760:.:-0.21:0.998:. ./.:4:187,562:.:-1.45:1.000:. ./.:4:444,934:.: 0.76:1.000:. ./.:4:291,457:.:-1.45:1.000:. ./.:4:564,757:.: 0.56:1.000:. ./.:4:437,637:.:-0.31:1.000:. ./.:4:219,381:.:-1.97:1.000:. ./.:4:315,701:.:-0.51:1.000:. ./.:4:324,786:.:-0.18:1.000:. ./.:4:391,824:.: 0.19:1.000:. ./.:4:573,1194:.: 2.13:1.000:. ./.:4:445,617:.:-0.35:1.000:. ./.:2:279,858:.:-0.08:0.999:. ./.:4:283,569:.:-1.09:1.000:. ./.:4:419,750:.: 0.03:1.000:. ./.:4:264,838:.:-0.21:1.000:. ./.:4:330,883:.: 0.18:1.000:. ./.:4:467,743:.: 0.17:1.000:. ./.:4:372,598:.:-0.67:1.000:. ./.:4:324,850:.: 0.05:1.000:. ./.:4:241,627:.:-1.03:1.000:. ./.:6:356,789:.:-0.06:0.997:. ./.:4:410,640:.:-0.39:1.000:. ./.:4:310,653:.:-0.70:1.000:. ./.:4:330,623:.:-0.73:1.000:. ./.:4:282,662:.:-0.76:1.000:. ./.:4:376,1058:.: 0.96:1.000:. ./.:4:384,568:.:-0.73:1.000:. ./.:4:331,652:.:-0.63:1.000:. ./.:4:270,576:.:-1.11:1.000:. ./.:4:228,886:.:-0.17:1.000:. ./.:4:582,922:.: 1.21:1.000:. ./.:4:482,822:.: 0.50:1.000:. ./.:4:275,651:.:-0.83:1.000:. ./.:3:340,880:.: 0.21:1.000:. ./.:4:258,644:.:-0.91:1.000:. ./.:4:450,889:.: 0.63:1.000:. ./.:4:411,636:.:-0.40:1.000:. ./.:4:543,870:.: 0.89:1.000:. -chr3.1 11481016 chr3.1_011481016 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:525,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:627,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:380,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:183,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:228,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:535,2:.: 0.92:0.999:. ./.:4:538,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:507,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:174,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:486,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:555,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:156,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:551,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:117,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:200,0:.:-2.38:1.000:. ./.:3:117,0:.:-3.19:0.993:. ./.:4:521,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:501,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:395,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:402,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:557,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:574,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:603,2:.: 1.59:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:640,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:339,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:439,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:445,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:435,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:510,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:334,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.38:1.000:. ./.:6:512,0:.: 0.68:0.992:. ./.:4:479,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:544,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:522,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:535,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.74:1.000:. ./.:6:426,0:.:-0.16:0.990:. ./.:4:435,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:301,0:.:-1.39:1.000:. ./.:5:564,1:.: 1.20:0.928:. ./.:4:497,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:435,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.59:0.976:. ./.:4:418,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:616,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:565,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:307,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:618,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.39:1.000:. ./.:2:447,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:732,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:455,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:428,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:340,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:440,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:445,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:410,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:297,0:.:-1.43:0.923:. ./.:4:472,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:642,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:452,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:649,0:.: 2.02:1.000:. ./.:3:422,0:.:-0.20:0.998:. ./.:4:460,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:570,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:519,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:182,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.34:1.000:. ./.:2:347,0:.:-0.94:0.999:. ./.:4:540,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:435,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.49:1.000:. ./.:6:582,0:.: 1.37:0.997:. ./.:4:354,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:639,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.20:1.000:. ./.:3:435,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:336,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.06:1.000:. -chr3.1 11632610 chr3.1_011632610 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:168,26:.: 2.07:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,32:.: 0.47:1.000:. ./.:4:152,24:.: 1.59:1.000:. ./.:4:126,29:.: 1.04:1.000:. ./.:4:110,30:.: 0.65:0.999:. ./.:4:57,34:.:-0.64:1.000:. ./.:4:78,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:103,19:.: 0.18:1.000:. ./.:4:38,1:.:-2.00:1.000:. ./.:4:71,21:.:-0.61:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:91,46:.: 0.57:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:88,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,21:.:-0.14:0.999:. ./.:4:149,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:125,34:.: 1.15:1.000:. ./.:4:139,36:.: 1.57:1.000:. ./.:4:31,16:.:-1.79:1.000:. ./.:4:113,15:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,76:.: 1.80:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:84,39:.: 0.20:1.000:. ./.:4:154,34:.: 1.91:1.000:. ./.:4:136,22:.: 1.12:1.000:. ./.:4:115,53:.: 1.38:1.000:. ./.:4:84,51:.: 0.52:1.000:. ./.:4:73,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:81,15:.:-0.51:1.000:. ./.:4:45,32:.:-1.00:1.000:. ./.:4:46,3:.:-1.74:1.000:. ./.:3:4,6:.:-2.76:0.993:. ./.:4:149,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,21:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,30:.: 0.75:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:89,11:.:-0.40:1.000:. ./.:4:82,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.82:1.000:. ./.:4:65,35:.:-0.40:1.000:. ./.:4:68,16:.:-0.82:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,22:.:-0.19:1.000:. ./.:4:94,27:.: 0.15:1.000:. ./.:4:188,79:.: 3.98:1.000:. ./.:4:53,13:.:-1.29:1.000:. ./.:4:72,13:.:-0.79:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:117,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:98,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,27:.: 0.07:1.000:. ./.:4:82,25:.:-0.22:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:85,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:93,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:62,24:.:-0.77:1.000:. ./.:6:50,13:.:-1.37:1.000:. ./.:4:76,23:.:-0.43:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:78,19:.:-0.48:1.000:. ./.:4:74,14:.:-0.72:1.000:. ./.:4:93,24:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:59,34:.:-0.58:1.000:. ./.:4:107,17:.: 0.23:1.000:. ./.:6:81,26:.:-0.22:0.992:. ./.:4:136,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:133,20:.: 0.99:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:85,15:.:-0.40:1.000:. ./.:4:58,18:.:-1.03:1.000:. ./.:4:81,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:80,29:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.32:1.000:. ./.:6:113,0:.:-0.06:0.990:. ./.:4:88,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:71,14:.:-0.79:1.000:. ./.:4:86,25:.:-0.11:1.000:. ./.:5:73,24:.:-0.48:0.928:. ./.:4:81,22:.:-0.32:1.000:. ./.:4:39,17:.:-1.56:1.000:. ./.:4:81,17:.:-0.45:1.000:. ./.:4:60,15:.:-1.06:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,27:.:-0.95:0.976:. ./.:4:68,15:.:-0.85:1.000:. ./.:4:97,15:.:-0.09:1.000:. ./.:4:72,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:73,45:.: 0.07:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:95,28:.: 0.20:1.000:. ./.:4:120,25:.: 0.78:1.000:. ./.:4:53,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,41:.: 0.23:1.000:. ./.:4:84,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,26:.:-0.32:1.000:. ./.:4:50,41:.:-0.64:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.87:1.000:. ./.:4:53,17:.:-1.19:1.000:. ./.:4:117,27:.: 0.75:1.000:. ./.:2:128,22:.: 0.91:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:52,39:.:-0.64:1.000:. ./.:4:213,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:69,25:.:-0.56:1.000:. ./.:4:70,13:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,29:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:84,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.87:1.000:. ./.:4:63,14:.:-1.00:1.000:. ./.:4:105,20:.: 0.26:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:78,21:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,26:.: 0.54:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:85,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:111,19:.: 0.39:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,36:.:-0.85:1.000:. ./.:4:65,13:.:-0.98:1.000:. ./.:4:79,29:.:-0.19:1.000:. ./.:4:141,29:.: 1.44:1.000:. ./.:4:44,19:.:-1.37:0.923:. ./.:4:67,8:.:-1.06:1.000:. ./.:4:65,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:204,60:.: 3.90:1.000:. ./.:4:67,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:68,20:.:-0.72:1.000:. ./.:4:82,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:60,25:.:-0.79:1.000:. ./.:4:77,17:.:-0.56:1.000:. ./.:4:77,51:.: 0.33:1.000:. ./.:4:88,26:.:-0.03:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:78,65:.: 0.73:1.000:. ./.:4:178,32:.: 2.49:1.000:. ./.:3:109,26:.: 0.52:0.998:. ./.:4:126,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:151,25:.: 1.59:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:123,41:.: 1.28:1.000:. ./.:4:114,21:.: 0.52:1.000:. ./.:4:62,10:.:-1.14:1.000:. ./.:4:59,41:.:-0.40:1.000:. ./.:4:98,20:.: 0.07:1.000:. ./.:4:100,23:.: 0.20:1.000:. ./.:4:81,79:.: 1.17:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.23:1.000:. ./.:2:49,37:.:-0.77:0.999:. ./.:4:158,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:142,31:.: 1.52:1.000:. ./.:4:33,36:.:-1.21:1.000:. ./.:4:81,47:.: 0.33:1.000:. ./.:4:130,21:.: 0.94:1.000:. ./.:4:83,29:.:-0.09:1.000:. ./.:4:78,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,24:.:-0.32:1.000:. ./.:6:230,0:.: 3.01:0.997:. ./.:4:80,24:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:100,27:.: 0.31:1.000:. ./.:4:88,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:75,39:.:-0.03:1.000:. ./.:4:98,25:.: 0.20:1.000:. ./.:4:67,20:.:-0.74:1.000:. ./.:4:67,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:120,28:.: 0.86:1.000:. ./.:4:157,26:.: 1.78:1.000:. ./.:4:138,23:.: 1.20:1.000:. ./.:4:120,19:.: 0.62:1.000:. ./.:3:102,35:.: 0.57:1.000:. ./.:2:142,0:.: 0.70:0.992:. ./.:4:165,47:.: 2.54:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.33:1.000:. -chr3.1 11935321 chr3.1_011935321 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:356,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.79:0.999:. ./.:4:216,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:442,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:327,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:140,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:41,1:.:-2.38:1.000:. ./.:3:36,0:.:-2.45:0.993:. ./.:4:220,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:664,0:.: 4.48:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.61:1.000:. ./.:6:173,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:150,0:.:-1.19:0.992:. ./.:4:296,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.12:1.000:. ./.:6:286,0:.: 0.31:0.990:. ./.:4:313,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.18:1.000:. ./.:5:293,0:.: 0.39:0.928:. ./.:4:231,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.27:0.976:. ./.:4:336,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.81:1.000:. ./.:2:377,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.20:0.923:. ./.:4:235,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:220,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:318,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:476,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.59:1.000:. ./.:3:346,0:.: 0.97:0.998:. ./.:4:223,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:447,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.62:1.000:. ./.:2:316,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:217,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.54:1.000:. ./.:6:209,0:.:-0.54:0.997:. ./.:4:348,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.14:1.000:. ./.:3:170,0:.:-0.97:1.000:. ./.:2:249,1:.:-0.09:0.992:. ./.:4:512,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.79:1.000:. -chr3.1 12823703 chr3.1_012823703 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:151,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:138,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.31:0.999:. ./.:4:149,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:218,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.27:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.54:0.993:. ./.:4:156,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.00:1.000:. ./.:6:100,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.19:1.000:. ./.:6:198,0:.: 1.76:0.992:. ./.:4:117,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.92:1.000:. ./.:6:115,0:.:-0.23:0.990:. ./.:4:116,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.47:1.000:. ./.:5:116,0:.:-0.21:0.928:. ./.:4:116,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.91:0.976:. ./.:4:131,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:192,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.92:1.000:. ./.:2:187,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.62:0.923:. ./.:4:126,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:230,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:78,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:252,0:.: 3.06:1.000:. ./.:3:129,0:.: 0.10:0.998:. ./.:4:174,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.47:1.000:. ./.:2:75,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:197,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.00:1.000:. ./.:6:183,0:.: 1.40:0.997:. ./.:4:94,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.28:1.000:. ./.:3:151,0:.: 0.63:1.000:. ./.:2:123,0:.:-0.04:0.992:. ./.:4:133,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.18:1.000:. -chr3.1 13341410 chr3.1_013341410 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:151,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:78,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:102,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:99,24:.: 0.61:0.999:. ./.:4:70,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:19,1:.:-2.30:1.000:. ./.:4:78,45:.: 0.61:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:84,33:.: 0.44:1.000:. ./.:4:108,16:.: 0.64:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:80,25:.: 0.10:0.999:. ./.:4:134,21:.: 1.51:1.000:. ./.:4:122,24:.: 1.26:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:102,17:.: 0.50:1.000:. ./.:4:116,24:.: 1.09:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.78:1.000:. ./.:4:129,18:.: 1.29:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:108,17:.: 0.67:1.000:. ./.:4:137,27:.: 1.77:1.000:. ./.:4:131,22:.: 1.46:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:22,1:.:-2.21:1.000:. ./.:3:8,1:.:-2.61:0.993:. ./.:4:89,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:99,20:.: 0.50:1.000:. ./.:4:57,19:.:-0.72:1.000:. ./.:4:59,25:.:-0.49:1.000:. ./.:4:124,17:.: 1.12:1.000:. ./.:4:52,26:.:-0.66:1.000:. ./.:4:91,18:.: 0.22:1.000:. ./.:4:112,17:.: 0.78:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,22:.:-0.91:1.000:. ./.:4:112,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:95,23:.: 0.47:1.000:. ./.:4:25,15:.:-1.73:1.000:. ./.:4:82,16:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,9:.:-1.25:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:101,17:.: 0.47:1.000:. ./.:4:80,28:.: 0.19:1.000:. ./.:4:100,32:.: 0.87:1.000:. ./.:4:69,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:86,15:.:-0.01:1.000:. ./.:4:128,16:.: 1.20:1.000:. ./.:4:75,15:.:-0.32:1.000:. ./.:6:65,7:.:-0.83:1.000:. ./.:4:72,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:103,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:46,13:.:-1.19:1.000:. ./.:4:103,30:.: 0.89:1.000:. ./.:6:78,19:.:-0.12:0.992:. ./.:4:90,49:.: 1.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:98,9:.: 0.16:1.000:. ./.:4:83,21:.: 0.08:1.000:. ./.:4:83,19:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:65,15:.:-0.60:1.000:. ./.:4:108,19:.: 0.72:1.000:. ./.:4:75,20:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,22:.: 1.01:1.000:. ./.:6:78,16:.:-0.21:0.990:. ./.:4:74,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:56,16:.:-0.83:1.000:. ./.:4:51,20:.:-0.86:1.000:. ./.:5:60,27:.:-0.40:0.928:. ./.:4:82,23:.: 0.10:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:94,8:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,12:.:-0.72:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:42,9:.:-1.42:0.976:. ./.:4:115,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,20:.: 1.20:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:130,20:.: 1.37:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:35,9:.:-1.62:1.000:. ./.:4:74,25:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,11:.: 1.23:1.000:. ./.:4:120,20:.: 1.09:1.000:. ./.:4:67,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:116,20:.: 0.98:1.000:. ./.:4:72,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:89,16:.: 0.10:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:54,14:.:-0.94:1.000:. ./.:4:111,13:.: 0.64:1.000:. ./.:2:111,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:120,13:.: 0.89:1.000:. ./.:4:91,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,25:.: 1.57:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:42,27:.:-0.91:1.000:. ./.:4:56,11:.:-0.97:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,21:.:-0.04:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:86,22:.: 0.19:1.000:. ./.:4:57,14:.:-0.86:1.000:. ./.:4:55,17:.:-0.83:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:50,19:.:-0.91:1.000:. ./.:4:74,21:.:-0.18:1.000:. ./.:4:103,17:.: 0.53:1.000:. ./.:4:67,9:.:-0.72:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:73,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:81,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.72:0.923:. ./.:4:70,9:.:-0.63:1.000:. ./.:4:46,17:.:-1.08:1.000:. ./.:4:141,31:.: 1.99:1.000:. ./.:4:95,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:61,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:52,23:.:-0.74:1.000:. ./.:4:88,18:.: 0.13:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:57,21:.:-0.66:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:147,35:.: 2.28:1.000:. ./.:3:125,0:.: 0.67:0.998:. ./.:4:130,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:210,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:75,19:.:-0.21:1.000:. ./.:4:67,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:108,15:.: 0.61:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:62,16:.:-0.66:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.83:1.000:. ./.:2:90,0:.:-0.32:0.999:. ./.:4:85,24:.: 0.22:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:84,17:.:-0.01:1.000:. ./.:4:107,14:.: 0.55:1.000:. ./.:4:109,15:.: 0.64:1.000:. ./.:4:44,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.60:1.000:. ./.:6:123,55:.: 2.16:0.997:. ./.:4:62,21:.:-0.52:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:85,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:67,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:36,18:.:-1.34:1.000:. ./.:4:138,24:.: 1.71:1.000:. ./.:4:129,28:.: 1.57:1.000:. ./.:4:143,21:.: 1.77:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.43:1.000:. ./.:3:119,0:.: 0.50:1.000:. ./.:2:105,0:.: 0.10:0.992:. ./.:4:119,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,24:.: 1.26:1.000:. -chr3.1 13597345 chr3.1_013597345 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:95,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:58,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.16:0.999:. ./.:4:86,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.40:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.74:0.993:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.64:1.000:. ./.:6:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:124,0:.: 1.37:0.992:. ./.:4:105,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.78:1.000:. ./.:6:116,0:.: 1.09:0.990:. ./.:4:84,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.22:1.000:. ./.:5:97,0:.: 0.44:0.928:. ./.:4:83,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.19:0.976:. ./.:4:95,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.78:1.000:. ./.:2:107,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:93,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.36:0.923:. ./.:4:75,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.20:1.000:. ./.:3:60,0:.:-0.84:0.998:. ./.:4:87,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.33:1.000:. ./.:2:70,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:112,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.50:1.000:. ./.:6:154,0:.: 2.40:0.997:. ./.:4:70,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.57:1.000:. ./.:3:104,0:.: 0.68:1.000:. ./.:2:75,0:.:-0.32:0.992:. ./.:4:73,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.75:1.000:. -chr3.1 13719083 chr3.1_013719083 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:124,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.07:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:139,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:142,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.67:1.000:. ./.:6:89,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:130,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.55:1.000:. ./.:6:84,0:.: 0.49:0.992:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:133,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:108,1:.: 1.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.12:1.000:. ./.:6:0,1:.:-1.86:0.990:. ./.:4:119,0:.: 1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:52,0:.:-0.41:0.928:. ./.:4:51,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:65,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,1:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.44:1.000:. ./.:2:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:94,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.95:0.923:. ./.:4:44,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:77,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:129,0:.: 1.77:1.000:. ./.:3:125,0:.: 1.65:0.998:. ./.:4:119,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:140,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:120,1:.: 1.54:1.000:. ./.:2:134,0:.: 1.91:0.992:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.04:1.000:. -chr3.1 13905640 chr3.1_013905640 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:4,280:0.97: 1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,198:0.97:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,110:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,122:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:72,162:0.67: 0.34:1.000:0.918 0/0/1/1:4:90,116:0.52:-0.13:0.999:0.995 0/1/1/1:4:29,136:0.81:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,194:0.96:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,180:0.73: 0.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,75:0.68:-1.77:1.000:0.952 0/0/1/1:4:52,83:0.58:-1.31:1.000:0.921 0/0/1/1:4:105,149:0.55: 0.67:1.000:0.984 0/1/1/1:4:35,190:0.83: 0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:86,237:0.72: 1.81:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,163:0.72: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,73:0.36:-0.24:1.000:0.692 0/0/0/1:4:141,57:0.30:-0.26:0.999:0.986 0/0/1/1:4:127,138:0.48: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,93:0.44:-0.23:1.000:0.959 1/1/1/1:4:2,303:0.98: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,44:0.31:-1.14:1.000:0.973 0/1/1/1:4:65,167:0.70: 0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:106,137:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,196:0.81: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,77:0.69:-1.75:1.000:0.978 0/0/1/1:4:77,108:0.54:-0.48:1.000:0.986 0/0/1/1:4:71,112:0.58:-0.51:1.000:0.932 0/0/1/1:4:80,105:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:120,174:0.55: 1.33:1.000:0.978 0/0/1/1:4:106,136:0.52: 0.47:1.000:0.996 1/1/1/1:4:3,206:0.97:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,105:0.71:-1.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,32:0.46:-2.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:77,113:0.55:-0.39:1.000:0.975 0/1/1:3:22,44:0.64:-2.45:0.993:1.000 0/0/1/1:4:98,116:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,118:0.46: 0.44:1.000:0.985 0/0/0/1:4:145,80:0.35: 0.19:1.000:0.783 0/0/1/1:4:97,128:0.52: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,139:0.53: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,128:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,202:0.77: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,136:0.55: 0.25:1.000:0.976 0/1/1/1:4:19,110:0.84:-1.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:143,86:0.37: 0.25:1.000:0.609 0/0/1/1:4:104,156:0.56: 0.77:1.000:0.966 0/1/1/1:4:65,171:0.71: 0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:56,75:0.53:-1.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:73,44:0.37:-1.60:1.000:0.604 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-2.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,119:0.68:-0.74:1.000:0.961 0/0/1/1:4:108,132:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,127:0.44: 0.88:1.000:0.973 0/0/1/1:4:123,187:0.56: 1.60:1.000:0.959 0/1/1/1:4:46,125:0.71:-0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,112:0.49:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,68:0.32:-0.03:1.000:0.942 0/1/1/1:4:64,198:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,214:0.83: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:75,105:0.54:-0.56:1.000:0.791 0/1/1/1:4:50,193:0.78: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,98:0.47:-0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,170:0.72: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,246:0.85: 1.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:110,67:0.37:-0.61:1.000:0.579 0/1/1/1:4:66,181:0.72: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,80:0.42:-0.59:1.000:0.928 0/1/1/1:4:40,190:0.81: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:123,148:0.50: 0.95:0.992:0.889 0/0/1/1:4:94,123:0.52: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,79:0.46:-0.92:1.000:0.989 0/1/1/1:4:34,82:0.69:-1.62:1.000:0.967 0/0/1/1:4:68,113:0.59:-0.54:1.000:0.867 0/0/1/1:4:88,112:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,106:0.58:-0.69:1.000:0.914 0/1/1/1:4:44,166:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,62:0.37:-0.82:1.000:0.584 0/1/1/1:4:90,235:0.71: 1.85:1.000:0.989 0/0/1/1:4:109,71:0.38:-0.56:1.000:0.583 0/0/1/1:4:103,126:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:95,163:0.60: 0.74:0.990:0.631 0/1/1/1:4:68,137:0.64:-0.14:1.000:0.701 0/0/0/1:4:199,82:0.30: 1.12:1.000:0.984 0/0/0/1:4:84,51:0.37:-1.31:1.000:0.587 0/0/0/1/1:5:140,115:0.42: 0.69:0.928:0.950 0/0/1/1:4:98,165:0.59: 0.82:1.000:0.844 0/0/1/1:4:108,76:0.40:-0.49:1.000:0.749 0/0/1/1:4:95,126:0.53: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,73:0.41:-0.74:1.000:0.865 0/0/1/1:4:124,115:0.45: 0.42:1.000:0.978 0/0/1/1:4:85,102:0.50:-0.44:0.976:0.997 0/0/1/1:4:92,129:0.54: 0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:100,153:0.57: 0.65:1.000:0.955 0/0/1/1:4:78,82:0.47:-0.89:1.000:0.993 0/1/1/1:4:81,266:0.76: 2.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,218:0.80: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,78:0.43:-0.74:1.000:0.954 0/0/1/1:4:103,171:0.59: 1.00:1.000:0.869 0/1/1/1:4:130,248:0.63: 2.73:1.000:0.520 0/1/1/1:4:100,246:0.69: 2.20:1.000:0.975 0/0/1/1:4:52,95:0.62:-1.11:1.000:0.630 0/0/1/1:4:110,149:0.53: 0.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:99,127:0.52: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,185:0.72: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,176:0.61: 1.00:1.000:0.685 1/1/1/1:4:11,169:0.93:-0.56:1.000:0.995 0/0/0/0:4:157,1:0.01:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,170:0.62: 0.80:1.000:0.592 0/0:2:134,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,276:0.81: 2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,124:0.52: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,168:0.55: 1.20:1.000:0.983 0/0/1/1:4:76,139:0.62: 0.02:1.000:0.627 0/0/0/1:4:132,78:0.36:-0.06:1.000:0.649 0/1/1/1:4:19,166:0.88:-0.48:1.000:0.661 0/1/1/1:4:65,235:0.77: 1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,138:0.71:-0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,100:0.49:-0.48:1.000:0.997 1/1/1/1:4:9,156:0.93:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,60:0.29: 0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,123:0.49: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:175,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,75:0.40:-0.56:1.000:0.776 0/0/1/1:4:100,170:0.60: 0.93:1.000:0.826 0/0/1/1:4:120,217:0.61: 2.05:1.000:0.663 0/1/1/1:4:50,117:0.68:-0.77:1.000:0.951 0/1/1/1:4:44,90:0.64:-1.32:1.000:0.744 0/1/1/1:4:35,256:0.87: 1.28:1.000:0.934 0/1/1/1:4:80,184:0.67: 0.84:1.000:0.938 0/1/1/1:4:61,223:0.77: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,124:0.65:-0.49:0.923:0.770 0/0/0/1:4:102,60:0.36:-0.86:1.000:0.659 0/0/1/1:4:79,58:0.40:-1.27:1.000:0.819 0/0/1/1:4:104,147:0.54: 0.62:1.000:0.985 0/1/1/1:4:52,186:0.77: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,126:0.66:-0.49:1.000:0.872 0/0/1/1:4:95,142:0.56: 0.39:1.000:0.967 0/1/1/1:4:58,144:0.69:-0.19:1.000:0.978 0/0/0/1:4:128,68:0.34:-0.29:1.000:0.839 0/1/1/1:4:64,249:0.78: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,62:0.38:-0.91:1.000:0.538 0/1/1/1:4:49,195:0.79: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,161:0.69: 0.20:1.000:0.977 0/0/1/1:4:125,165:0.52: 1.27:1.000:0.994 1/1/1:3:6,215:0.96: 0.12:0.998:1.000 0/1/1/1:4:49,131:0.71:-0.56:1.000:0.992 1/1/1/1:4:5,266:0.97: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,173:0.63: 0.80:1.000:0.585 0/0/0/0:4:188,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,118:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,69:0.53:-1.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,48:0.48:-2.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,43:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,58:0.44:-1.52:1.000:0.973 0/1/1/1:4:73,161:0.66: 0.34:1.000:0.894 0/0/1/1:4:131,154:0.49: 1.18:1.000:0.997 0/1:2:55,120:0.66:-0.64:0.999:1.000 0/0/1/1:4:111,139:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,229:0.78: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,47:0.40:-1.69:1.000:0.796 0/0/1/1:4:85,145:0.60: 0.27:1.000:0.818 0/1/1/1:4:89,198:0.67: 1.22:1.000:0.905 0/0/0/1:4:45,28:0.37:-2.33:1.000:0.528 0/1/1/1:4:48,130:0.71:-0.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:60,138:0.67:-0.26:1.000:0.938 0/0/0/1/1/1:6:117,140:0.50: 0.72:0.997:0.889 0/0/0/1:4:145,52:0.28:-0.28:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,219:0.98: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,194:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,100:0.70:-1.24:1.000:0.986 0/1/1/1:4:51,228:0.81: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,71:0.32: 0.19:1.000:0.954 0/1/1/1:4:47,173:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,57:0.37:-1.07:1.000:0.538 0/1/1/1:4:56,230:0.79: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,236:0.61: 2.56:1.000:0.698 0/1/1/1:4:90,209:0.68: 1.42:1.000:0.946 0/0/1/1:4:96,133:0.54: 0.25:1.000:0.989 0/1:2:50,73:0.55:-1.50:1.000:1.000 0/1:2:62,79:0.51:-1.21:0.992:1.000 0/0/1/1:4:125,83:0.38:-0.09:1.000:0.628 0/1/1/1:4:30,101:0.76:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,142:0.65:-0.08:1.000:0.827 -chr3.1 14234776 chr3.1_014234776 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:95,4:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,4:.:-0.48:1.000:. ./.:4:108,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:99,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:44,4:.:-1.34:1.000:. ./.:4:48,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:61,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,4:.:-2.11:1.000:. ./.:4:39,4:.:-1.48:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:110,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:143,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:127,4:.: 0.96:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:90,7:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:78,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,12:.:-0.23:1.000:. ./.:4:81,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:115,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:78,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:7,6:.:-2.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.31:1.000:. ./.:3:23,1:.:-2.00:0.993:. ./.:4:109,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:63,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:135,3:.: 1.15:1.000:. ./.:4:58,5:.:-0.92:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:148,7:.: 1.62:1.000:. ./.:4:42,6:.:-1.34:1.000:. ./.:4:19,1:.:-2.11:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:65,4:.:-0.76:1.000:. ./.:4:88,8:.:-0.01:1.000:. ./.:4:202,0:.: 2.92:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:71,3:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:135,6:.: 1.23:1.000:. ./.:4:79,4:.:-0.37:1.000:. ./.:6:68,6:.:-0.62:1.000:. ./.:4:84,9:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:96,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:132,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:153,5:.: 1.70:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,10:.:-0.48:1.000:. ./.:6:146,0:.: 1.37:0.992:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:102,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:101,7:.: 0.32:1.000:. ./.:4:134,4:.: 1.15:1.000:. ./.:4:188,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:128,6:.: 1.04:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:105,3:.: 0.32:1.000:. ./.:4:184,0:.: 2.42:1.000:. ./.:6:91,3:.:-0.07:0.990:. ./.:4:160,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:45,3:.:-1.34:1.000:. ./.:5:124,0:.: 0.76:0.928:. ./.:4:143,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:81,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:138,6:.: 1.31:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:75,5:.:-0.45:0.976:. ./.:4:100,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:158,7:.: 1.89:1.000:. ./.:4:73,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:156,8:.: 1.87:1.000:. ./.:4:120,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:95,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:124,4:.: 0.87:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:76,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:92,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:59,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:94,4:.: 0.04:1.000:. ./.:4:70,9:.:-0.48:1.000:. ./.:4:89,4:.:-0.09:1.000:. ./.:4:75,2:.:-0.54:1.000:. ./.:2:91,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:124,2:.: 0.82:1.000:. ./.:4:90,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:119,5:.: 0.76:1.000:. ./.:4:83,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:97,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:87,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:59,7:.:-0.84:1.000:. ./.:4:87,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:93,8:.: 0.13:1.000:. ./.:4:40,2:.:-1.50:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:49,6:.:-1.14:1.000:. ./.:4:69,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:58,9:.:-0.81:1.000:. ./.:4:57,6:.:-0.92:0.923:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:101,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:47,12:.:-1.03:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:60,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:134,3:.: 1.12:1.000:. ./.:4:117,4:.: 0.68:1.000:. ./.:4:44,1:.:-1.42:1.000:. ./.:4:95,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,8:.:-0.67:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.84:1.000:. ./.:3:55,2:.:-1.09:0.998:. ./.:4:82,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:116,6:.: 0.71:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:26,4:.:-1.83:1.000:. ./.:4:118,4:.: 0.71:1.000:. ./.:4:84,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,4:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.56:1.000:. ./.:2:29,8:.:-1.64:0.999:. ./.:4:103,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:50,5:.:-1.14:1.000:. ./.:4:69,5:.:-0.62:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:71,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,4:.:-1.61:1.000:. ./.:4:56,3:.:-1.03:1.000:. ./.:6:73,4:.:-0.54:0.997:. ./.:4:67,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:60,3:.:-0.92:1.000:. ./.:4:43,5:.:-1.34:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:73,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:75,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:74,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:55,5:.:-1.01:1.000:. ./.:2:63,1:.:-0.90:1.000:. ./.:2:94,2:.:-0.01:0.992:. ./.:4:98,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. -chr3.1 14352896 chr3.1_014352896 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:323,1:.: 2.47:1.000:. ./.:4:314,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:177,28:.: 0.27:1.000:. ./.:4:178,21:.: 0.16:1.000:. ./.:4:362,0:.: 3.18:1.000:. ./.:4:142,40:.:-0.16:0.999:. ./.:4:138,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:217,11:.: 0.69:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:64,3:.:-2.29:1.000:. ./.:4:165,44:.: 0.34:1.000:. ./.:4:217,10:.: 0.67:1.000:. ./.:4:239,12:.: 1.12:1.000:. ./.:4:246,18:.: 1.36:1.000:. ./.:4:128,25:.:-0.70:1.000:. ./.:4:214,20:.: 0.80:0.999:. ./.:4:201,40:.: 0.93:1.000:. ./.:4:130,27:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:21,2:.:-3.11:1.000:. ./.:4:230,13:.: 0.97:1.000:. ./.:4:201,28:.: 0.71:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:63,3:.:-2.31:1.000:. ./.:4:152,19:.:-0.36:1.000:. ./.:4:209,4:.: 0.41:1.000:. ./.:4:172,28:.: 0.17:1.000:. ./.:4:197,25:.: 0.58:1.000:. ./.:4:172,23:.: 0.08:1.000:. ./.:4:235,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:188,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:64,14:.:-2.09:1.000:. ./.:3:41,2:.:-2.74:0.993:. ./.:4:195,15:.: 0.36:1.000:. ./.:4:130,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:121,25:.:-0.83:1.000:. ./.:4:192,7:.: 0.16:1.000:. ./.:4:150,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:193,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:177,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:181,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:205,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:182,26:.: 0.32:1.000:. ./.:4:202,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:68,28:.:-1.75:1.000:. ./.:4:98,16:.:-1.42:1.000:. ./.:4:82,19:.:-1.66:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:260,5:.: 1.38:1.000:. ./.:4:154,16:.:-0.38:1.000:. ./.:4:124,32:.:-0.64:1.000:. ./.:4:160,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:110,16:.:-1.20:1.000:. ./.:4:159,17:.:-0.27:1.000:. ./.:4:156,9:.:-0.48:1.000:. ./.:4:147,14:.:-0.55:1.000:. ./.:6:157,12:.:-0.40:1.000:. ./.:4:187,17:.: 0.25:1.000:. ./.:4:233,7:.: 0.92:1.000:. ./.:4:167,9:.:-0.27:1.000:. ./.:4:195,9:.: 0.25:1.000:. ./.:4:131,24:.:-0.66:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:113,7:.:-1.31:1.000:. ./.:4:231,15:.: 1.03:1.000:. ./.:6:166,23:.:-0.03:0.992:. ./.:4:191,24:.: 0.45:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:184,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:244,10:.: 1.18:1.000:. ./.:4:229,6:.: 0.82:1.000:. ./.:4:204,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:104,27:.:-1.11:1.000:. ./.:4:168,28:.: 0.10:1.000:. ./.:4:188,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:198,32:.: 0.73:1.000:. ./.:6:178,31:.: 0.34:0.990:. ./.:4:214,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:119,24:.:-0.88:1.000:. ./.:4:184,15:.: 0.16:1.000:. ./.:5:72,16:.:-1.90:0.928:. ./.:4:108,23:.:-1.11:1.000:. ./.:4:131,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:194,13:.: 0.30:1.000:. ./.:4:109,23:.:-1.09:1.000:. ./.:4:167,24:.: 0.01:1.000:. ./.:4:126,10:.:-1.01:0.976:. ./.:4:230,8:.: 0.88:1.000:. ./.:4:169,24:.: 0.04:1.000:. ./.:4:191,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:197,9:.: 0.29:1.000:. ./.:4:173,21:.: 0.06:1.000:. ./.:4:175,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:190,26:.: 0.47:1.000:. ./.:4:187,24:.: 0.38:1.000:. ./.:4:77,14:.:-1.85:1.000:. ./.:4:181,26:.: 0.30:1.000:. ./.:4:134,19:.:-0.70:1.000:. ./.:4:188,21:.: 0.34:1.000:. ./.:4:148,16:.:-0.49:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:96,13:.:-1.51:1.000:. ./.:4:172,26:.: 0.14:1.000:. ./.:2:215,12:.: 0.67:1.000:. ./.:4:242,11:.: 1.16:1.000:. ./.:4:103,22:.:-1.22:1.000:. ./.:4:274,19:.: 1.90:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:164,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:118,11:.:-1.14:1.000:. ./.:4:168,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,6:.:-1.37:1.000:. ./.:4:185,30:.: 0.45:1.000:. ./.:4:188,18:.: 0.29:1.000:. ./.:4:111,18:.:-1.14:1.000:. ./.:4:215,13:.: 0.69:1.000:. ./.:4:150,13:.:-0.51:1.000:. ./.:4:145,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:157,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:137,8:.:-0.85:1.000:. ./.:4:111,8:.:-1.33:1.000:. ./.:4:128,13:.:-0.92:1.000:. ./.:4:160,29:.:-0.03:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:149,2:.:-0.73:0.923:. ./.:4:156,17:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,6:.:-0.57:1.000:. ./.:4:207,28:.: 0.82:1.000:. ./.:4:179,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:214,14:.: 0.69:1.000:. ./.:4:154,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:178,23:.: 0.19:1.000:. ./.:4:208,7:.: 0.45:1.000:. ./.:4:112,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:214,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:216,12:.: 0.69:1.000:. ./.:4:212,30:.: 0.95:1.000:. ./.:3:257,0:.: 1.23:0.998:. ./.:4:218,10:.: 0.69:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:222,15:.: 0.86:1.000:. ./.:4:141,34:.:-0.29:1.000:. ./.:4:245,17:.: 1.32:1.000:. ./.:4:75,1:.:-2.13:1.000:. ./.:4:142,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:175,21:.: 0.10:1.000:. ./.:4:163,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:171,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:155,20:.:-0.29:1.000:. ./.:2:141,4:.:-0.85:0.999:. ./.:4:257,16:.: 1.53:1.000:. ./.:4:183,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:97,16:.:-1.44:1.000:. ./.:4:165,22:.:-0.07:1.000:. ./.:4:184,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:158,15:.:-0.33:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.20:1.000:. ./.:6:238,38:.: 1.58:0.997:. ./.:4:135,40:.:-0.29:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:169,12:.:-0.18:1.000:. ./.:4:178,7:.:-0.10:1.000:. ./.:4:248,13:.: 1.30:1.000:. ./.:4:109,28:.:-0.99:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:145,18:.:-0.51:1.000:. ./.:4:238,14:.: 1.14:1.000:. ./.:4:228,33:.: 1.30:1.000:. ./.:4:171,16:.:-0.07:1.000:. ./.:4:184,14:.: 0.14:1.000:. ./.:2:197,5:.: 0.21:1.000:. ./.:2:268,0:.: 1.43:0.992:. ./.:4:225,10:.: 0.82:1.000:. ./.:4:151,7:.:-0.60:1.000:. ./.:4:253,18:.: 1.49:1.000:. -chr3.1 14662831 chr3.1_014662831 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:38,39:0.47: 0.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:55,35:0.39: 1.02:1.000:0.639 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,4:0.06: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,45:0.52: 0.58:0.999:0.995 0/0/1/1:4:23,19:0.43:-0.61:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,45:0.42: 1.43:1.000:0.925 0/0/1/1:4:9,28:0.62:-0.79:1.000:0.629 0/0/0/1:4:28,3:0.12:-0.99:1.000:0.783 0/0/1/1:4:27,42:0.53: 0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:59,44:0.41: 1.47:1.000:0.881 0/0/0/1:4:62,36:0.37: 1.30:1.000:0.562 0/0/0/1:4:19,3:0.17:-1.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,45:0.40: 1.71:1.000:0.791 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 1.02:0.999:1.000 0/0/1/1:4:34,37:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,12:0.44:-1.16:1.000:0.963 0/0/0/1:4:23,8:0.29:-0.99:1.000:0.991 0/0/0/1:4:56,7:0.14: 0.10:1.000:0.963 0/0/1/1:4:23,38:0.54: 0.03:1.000:0.987 0/0/1/1:4:11,23:0.57:-0.89:1.000:0.944 0/0/0/0:4:79,1:0.02: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,39:0.31: 2.73:1.000:0.978 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,2:0.04: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,4:0.08: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:33,43:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,6:0.35:-1.43:1.000:0.829 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-1.98:0.993:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,40:0.36: 1.81:1.000:0.683 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,42:0.40: 1.50:1.000:0.757 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,7:0.13: 0.27:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,2:0.06:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,21:0.41:-0.34:1.000:0.850 0/0/0/1:4:116,42:0.30: 3.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:56,38:0.40: 1.16:1.000:0.759 0/0/1/1:4:39,49:0.50: 0.96:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,37:0.52: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,2:0.07:-0.89:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:7,1:0.16:-1.78:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,38:0.32: 2.25:1.000:0.946 0/0/1/1:4:28,32:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,31:0.44: 0.21:1.000:0.972 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,45:0.47: 0.96:1.000:0.993 0/0/0/0:4:14,1:0.08:-1.54:1.000:0.980 0/0/0/0:4:32,2:0.07:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/0/0/0:6:50,0:0.00:-0.34:0.992:1.000 0/0/1/1:4:33,44:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,20:0.62:-1.16:1.000:0.540 0/0/1/1:4:33,41:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:56,2:0.04:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,28:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,8:0.30:-1.02:1.000:0.987 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,40:0.43: 0.96:1.000:0.953 0/0/0/1:4:41,7:0.18:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:45,31:0.40: 0.55:0.990:0.652 0/0/1/1:4:34,43:0.51: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,44:0.37: 1.98:1.000:0.510 0/0/0/1:4:22,8:0.30:-1.02:1.000:0.987 0/0/1/1/1:5:18,29:0.54:-0.44:0.928:0.820 0/0/1/1:4:34,44:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,27:0.38: 0.41:1.000:0.511 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,35:0.31: 2.12:1.000:0.970 0/0/1/1:4:27,26:0.46:-0.24:0.976:0.987 0/0/1/1:4:79,49:0.38: 2.32:1.000:0.584 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,19:0.26: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,58:0.55: 1.02:1.000:0.977 0/0/0/1:4:57,34:0.37: 1.06:1.000:0.502 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,26:0.38: 0.31:1.000:0.528 0/0/1/1:4:52,51:0.46: 1.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:42,36:0.44: 0.61:1.000:0.963 0/0/1/1:4:14,27:0.56:-0.65:1.000:0.966 0/0/0/0:4:45,1:0.03:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,38:0.41: 1.02:1.000:0.860 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0:2:62,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,44:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,25:0.43:-0.14:1.000:0.938 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,40:0.53: 0.24:1.000:0.993 0/0/0/0:4:37,2:0.06:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,30:0.53:-0.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:60,35:0.37: 1.20:1.000:0.552 0/0/1/1:4:1,2:0.57:-1.95:1.000:0.957 0/0/0/1:4:77,21:0.26: 1.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,27:0.47:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,41:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,42:0.43: 1.16:1.000:0.938 0/0/1/1:4:15,19:0.51:-0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,18:0.42:-0.65:1.000:0.920 0/0/1/1:4:15,26:0.55:-0.65:1.000:0.982 0/0/0/1:4:62,31:0.35: 1.13:1.000:0.829 0/0/1/1:4:62,40:0.39: 1.43:1.000:0.667 0/0/0/1:4:33,4:0.14:-0.79:0.923:0.946 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,7:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,32:0.53:-0.24:1.000:0.992 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,38:0.46: 0.61:1.000:0.985 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,26:0.45:-0.17:1.000:0.975 0/0/1/1:4:37,44:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 1/1/1:3:0,40:1.00:-0.68:0.998:1.000 0/0/0/1:4:62,9:0.16: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,47:0.55: 0.44:1.000:0.977 0/0/1/1:4:47,41:0.44: 0.96:1.000:0.968 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,7:0.12: 0.55:1.000:0.641 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,3:0.16:-1.23:1.000:0.993 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,30:0.33: 1.20:1.000:0.907 0/0/1/1:4:33,61:0.56: 1.16:1.000:0.973 0/0/1/1:4:33,40:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/1:2:30,36:0.50: 0.21:0.999:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,39:0.40: 1.16:1.000:0.824 0/0/0/1:4:29,6:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,2:0.05:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,31:0.36: 0.99:1.000:0.729 0/0/0/1:4:28,7:0.25:-0.85:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,35:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/0/0/0:6:58,0:0.00:-0.07:0.997:1.000 0/0/1/1:4:49,38:0.42: 0.92:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,48:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,48:0.44: 1.43:1.000:0.973 0/0/1/1:4:52,43:0.43: 1.20:1.000:0.950 0/0/1/1:4:36,36:0.47: 0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:25,3:0.13:-1.09:1.000:0.939 0/0/0/1:4:35,4:0.13:-0.72:1.000:0.892 0/0/1/1:4:54,46:0.44: 1.37:1.000:0.961 0/0/0/1:4:57,21:0.30: 0.61:1.000:0.985 0/0/1/1:4:29,36:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0:2:34,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0:2:34,0:0.00:-0.89:0.992:1.000 0/0/0/1:4:79,41:0.35: 2.05:1.000:0.777 0/0/1/1:4:21,37:0.55:-0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:25,32:0.51:-0.10:1.000:0.996 -chr3.1 14912585 chr3.1_014912585 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:391,326:.:-0.08:1.000:. ./.:4:353,234:.:-0.75:1.000:. ./.:4:398,260:.:-0.38:1.000:. ./.:4:369,248:.:-0.59:1.000:. ./.:4:469,353:.: 0.45:1.000:. ./.:4:383,318:.:-0.16:0.999:. ./.:4:253,162:.:-1.62:1.000:. ./.:4:284,241:.:-1.06:1.000:. ./.:4:376,284:.:-0.37:1.000:. ./.:4:114,192:.:-2.18:1.000:. ./.:4:239,112:.:-1.95:1.000:. ./.:4:321,296:.:-0.59:1.000:. ./.:4:386,247:.:-0.51:1.000:. ./.:4:370,305:.:-0.30:1.000:. ./.:4:355,284:.:-0.48:1.000:. ./.:4:311,251:.:-0.87:1.000:. ./.:4:468,305:.: 0.20:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:457,310:.: 0.17:1.000:. ./.:4:307,248:.:-0.91:1.000:. ./.:4:195,148:.:-1.99:1.000:. ./.:4:320,254:.:-0.81:1.000:. ./.:4:479,327:.: 0.37:1.000:. ./.:4:278,220:.:-1.20:1.000:. ./.:4:204,88:.:-2.25:1.000:. ./.:4:467,355:.: 0.45:1.000:. ./.:4:390,238:.:-0.54:1.000:. ./.:4:408,255:.:-0.36:1.000:. ./.:4:540,342:.: 0.76:1.000:. ./.:4:326,253:.:-0.79:1.000:. ./.:4:385,257:.:-0.47:1.000:. ./.:4:343,217:.:-0.88:1.000:. ./.:4:69,169:.:-2.53:1.000:. ./.:4:269,204:.:-1.33:1.000:. ./.:3:75,114:.:-2.78:0.993:. ./.:4:332,232:.:-0.86:1.000:. ./.:4:462,314:.: 0.22:1.000:. ./.:4:355,285:.:-0.48:1.000:. ./.:4:469,358:.: 0.48:1.000:. ./.:4:438,284:.:-0.06:1.000:. ./.:4:419,379:.: 0.33:1.000:. ./.:4:366,387:.: 0.10:1.000:. ./.:4:641,445:.: 1.80:1.000:. ./.:4:408,389:.: 0.33:1.000:. ./.:4:486,500:.: 1.29:1.000:. ./.:4:568,375:.: 1.07:1.000:. ./.:4:323,411:.: 0.00:1.000:. ./.:4:252,197:.:-1.45:1.000:. ./.:4:411,367:.: 0.23:1.000:. ./.:4:694,615:.: 2.94:1.000:. ./.:4:409,433:.: 0.56:1.000:. ./.:4:590,411:.: 1.37:1.000:. ./.:4:502,294:.: 0.32:1.000:. ./.:4:427,391:.: 0.43:1.000:. ./.:4:251,250:.:-1.19:1.000:. ./.:4:607,502:.: 1.92:1.000:. ./.:4:484,294:.: 0.23:1.000:. ./.:4:724,618:.: 3.11:1.000:. ./.:4:385,382:.: 0.17:1.000:. ./.:6:366,337:.:-0.15:1.000:. ./.:4:395,454:.: 0.59:1.000:. ./.:4:484,307:.: 0.30:1.000:. ./.:4:631,559:.: 2.33:1.000:. ./.:4:691,507:.: 2.37:1.000:. ./.:4:406,381:.: 0.27:1.000:. ./.:4:454,362:.: 0.42:1.000:. ./.:4:249,249:.:-1.20:1.000:. ./.:4:392,300:.:-0.21:1.000:. ./.:6:610,424:.: 1.54:0.992:. ./.:4:324,303:.:-0.54:1.000:. ./.:4:461,503:.: 1.18:1.000:. ./.:4:383,349:.:-0.01:1.000:. ./.:4:709,578:.: 2.83:1.000:. ./.:4:427,328:.: 0.11:1.000:. ./.:4:508,466:.: 1.23:1.000:. ./.:4:462,350:.: 0.40:1.000:. ./.:4:494,470:.: 1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:399,371:.: 0.19:1.000:. ./.:4:517,374:.: 0.81:1.000:. ./.:6:418,317:.: 0.01:0.990:. ./.:4:428,443:.: 0.70:1.000:. ./.:4:470,445:.: 0.93:1.000:. ./.:4:283,279:.:-0.87:1.000:. ./.:5:663,483:.: 2.11:0.928:. ./.:4:457,392:.: 0.59:1.000:. ./.:4:336,274:.:-0.63:1.000:. ./.:4:526,353:.: 0.74:1.000:. ./.:4:481,417:.: 0.84:1.000:. ./.:4:486,302:.: 0.28:1.000:. ./.:4:383,310:.:-0.20:0.976:. ./.:4:496,334:.: 0.49:1.000:. ./.:4:585,440:.: 1.49:1.000:. ./.:4:357,243:.:-0.68:1.000:. ./.:4:410,337:.: 0.07:1.000:. ./.:4:560,407:.: 1.19:1.000:. ./.:4:381,390:.: 0.19:1.000:. ./.:4:521,368:.: 0.80:1.000:. ./.:4:609,461:.: 1.72:1.000:. ./.:4:451,271:.:-0.06:1.000:. ./.:4:438,295:.: 0.00:1.000:. ./.:4:569,406:.: 1.23:1.000:. ./.:4:418,317:.: 0.01:1.000:. ./.:4:394,397:.: 0.30:1.000:. ./.:4:523,334:.: 0.63:1.000:. ./.:4:330,318:.:-0.43:1.000:. ./.:4:453,400:.: 0.61:1.000:. ./.:4:387,245:.:-0.52:1.000:. ./.:2:531,375:.: 0.88:1.000:. ./.:4:388,289:.:-0.29:1.000:. ./.:4:420,393:.: 0.41:1.000:. ./.:4:427,319:.: 0.07:1.000:. ./.:4:375,438:.: 0.41:1.000:. ./.:4:355,344:.:-0.17:1.000:. ./.:4:426,340:.: 0.17:1.000:. ./.:4:400,437:.: 0.53:1.000:. ./.:4:381,357:.: 0.02:1.000:. ./.:4:603,480:.: 1.79:1.000:. ./.:4:377,380:.: 0.12:1.000:. ./.:4:445,354:.: 0.34:1.000:. ./.:4:477,337:.: 0.41:1.000:. ./.:4:368,421:.: 0.29:1.000:. ./.:4:478,354:.: 0.50:1.000:. ./.:4:367,243:.:-0.63:1.000:. ./.:4:397,421:.: 0.43:1.000:. ./.:4:509,421:.: 1.01:1.000:. ./.:4:508,373:.: 0.75:1.000:. ./.:4:487,371:.: 0.64:1.000:. ./.:4:365,301:.:-0.34:1.000:. ./.:4:390,312:.:-0.16:1.000:. ./.:4:559,422:.: 1.27:1.000:. ./.:4:325,229:.:-0.91:1.000:. ./.:4:345,276:.:-0.57:0.923:. ./.:4:580,416:.: 1.34:1.000:. ./.:4:271,287:.:-0.89:1.000:. ./.:4:519,363:.: 0.76:1.000:. ./.:4:313,332:.:-0.45:1.000:. ./.:4:421,450:.: 0.70:1.000:. ./.:4:415,342:.: 0.12:1.000:. ./.:4:356,394:.: 0.09:1.000:. ./.:4:595,402:.: 1.35:1.000:. ./.:4:534,436:.: 1.21:1.000:. ./.:4:321,228:.:-0.94:1.000:. ./.:4:398,347:.: 0.06:1.000:. ./.:4:441,371:.: 0.40:1.000:. ./.:4:624,406:.: 1.52:1.000:. ./.:3:285,245:.:-1.04:0.998:. ./.:4:445,314:.: 0.13:1.000:. ./.:4:421,319:.: 0.03:1.000:. ./.:4:357,278:.:-0.50:1.000:. ./.:4:332,268:.:-0.68:1.000:. ./.:4:331,257:.:-0.74:1.000:. ./.:4:227,107:.:-2.04:1.000:. ./.:4:247,197:.:-1.48:1.000:. ./.:4:508,309:.: 0.43:1.000:. ./.:4:437,297:.: 0.00:1.000:. ./.:4:386,304:.:-0.22:1.000:. ./.:4:292,272:.:-0.86:1.000:. ./.:2:333,252:.:-0.76:0.999:. ./.:4:415,319:.: 0.00:1.000:. ./.:4:351,238:.:-0.74:1.000:. ./.:4:342,249:.:-0.73:1.000:. ./.:4:374,218:.:-0.72:1.000:. ./.:4:402,280:.:-0.26:1.000:. ./.:4:355,283:.:-0.49:1.000:. ./.:4:267,258:.:-1.06:1.000:. ./.:4:257,238:.:-1.22:1.000:. ./.:6:369,245:.:-0.61:0.997:. ./.:4:333,247:.:-0.78:1.000:. ./.:4:244,236:.:-1.29:1.000:. ./.:4:205,190:.:-1.73:1.000:. ./.:4:310,225:.:-1.01:1.000:. ./.:4:478,257:.: 0.01:1.000:. ./.:4:289,247:.:-1.01:1.000:. ./.:4:350,249:.:-0.68:1.000:. ./.:4:215,199:.:-1.63:1.000:. ./.:4:350,278:.:-0.54:1.000:. ./.:4:466,316:.: 0.25:1.000:. ./.:4:398,287:.:-0.25:1.000:. ./.:4:242,251:.:-1.23:1.000:. ./.:2:356,299:.:-0.40:1.000:. ./.:2:339,332:.:-0.32:0.992:. ./.:4:409,324:.: 0.00:1.000:. ./.:4:246,241:.:-1.26:1.000:. ./.:4:451,300:.: 0.09:1.000:. -chr3.1 14955794 chr3.1_014955794 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:275,969:.: 0.83:1.000:. ./.:4:255,1049:.: 0.94:1.000:. ./.:4:155,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:276,1236:.: 1.34:1.000:. ./.:4:249,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:114,538:.:-0.30:1.000:. ./.:4:76,1062:.: 0.62:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:229,1037:.: 0.87:1.000:. ./.:4:184,918:.: 0.55:1.000:. ./.:4:219,1071:.: 0.91:1.000:. ./.:4:285,1181:.: 1.25:0.999:. ./.:4:120,1866:.: 2.24:1.000:. ./.:4:248,1342:.: 1.48:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:58,461:.:-0.56:1.000:. ./.:4:199,990:.: 0.72:0.999:. ./.:4:234,1159:.: 1.11:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:82,384:.:-0.66:1.000:. ./.:4:260,1139:.: 1.12:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:254,920:.: 0.69:1.000:. ./.:4:245,1204:.: 1.22:1.000:. ./.:4:290,1215:.: 1.32:1.000:. ./.:4:278,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:105,420:.:-0.55:1.000:. ./.:3:32,205:.:-1.09:0.993:. ./.:4:225,1032:.: 0.85:1.000:. ./.:4:247,1049:.: 0.92:1.000:. ./.:4:201,1021:.: 0.78:1.000:. ./.:4:204,1067:.: 0.88:1.000:. ./.:4:307,1237:.: 1.40:1.000:. ./.:4:138,915:.: 0.46:1.000:. ./.:4:137,898:.: 0.43:1.000:. ./.:4:180,992:.: 0.69:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:131,1096:.: 0.79:1.000:. ./.:4:204,932:.: 0.62:1.000:. ./.:4:151,1058:.: 0.76:1.000:. ./.:4:266,1359:.: 1.55:1.000:. ./.:4:158,841:.: 0.36:1.000:. ./.:4:175,1243:.: 1.16:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:171,834:.: 0.37:1.000:. ./.:4:186,1043:.: 0.80:1.000:. ./.:4:121,869:.: 0.34:1.000:. ./.:4:205,1100:.: 0.94:1.000:. ./.:4:146,829:.: 0.31:1.000:. ./.:4:193,1052:.: 0.83:1.000:. ./.:4:128,876:.: 0.37:1.000:. ./.:6:74,511:.:-0.43:1.000:. ./.:4:134,1000:.: 0.62:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:158,841:.: 0.36:1.000:. ./.:4:190,1049:.: 0.82:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:74,786:.: 0.09:1.000:. ./.:4:149,893:.: 0.44:1.000:. ./.:6:231,1069:.: 0.93:0.992:. ./.:4:50,1472:.: 1.36:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:79,1058:.: 0.62:1.000:. ./.:4:165,937:.: 0.55:1.000:. ./.:4:29,825:.: 0.08:1.000:. ./.:4:213,1000:.: 0.77:1.000:. ./.:4:161,856:.: 0.39:1.000:. ./.:4:172,840:.: 0.38:1.000:. ./.:4:81,838:.: 0.21:1.000:. ./.:4:230,1017:.: 0.83:1.000:. ./.:6:95,1420:.: 1.34:0.990:. ./.:4:116,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:160,986:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,709:.:-0.03:1.000:. ./.:5:204,2338:.: 3.30:0.928:. ./.:4:153,974:.: 0.60:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:149,703:.: 0.08:1.000:. ./.:4:148,861:.: 0.38:1.000:. ./.:4:168,834:.: 0.36:1.000:. ./.:4:93,811:.: 0.18:0.976:. ./.:4:159,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:210,916:.: 0.60:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:80,695:.:-0.07:1.000:. ./.:4:105,1626:.: 1.75:1.000:. ./.:4:175,953:.: 0.60:1.000:. ./.:4:224,947:.: 0.69:1.000:. ./.:4:113,678:.:-0.04:1.000:. ./.:4:204,908:.: 0.57:1.000:. ./.:4:122,676:.:-0.02:1.000:. ./.:4:76,783:.: 0.09:1.000:. ./.:4:142,712:.: 0.08:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:109,751:.: 0.09:1.000:. ./.:4:247,1023:.: 0.87:1.000:. ./.:2:176,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:170,888:.: 0.47:1.000:. ./.:4:111,727:.: 0.05:1.000:. ./.:4:284,1276:.: 1.43:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:81,994:.: 0.50:1.000:. ./.:4:122,761:.: 0.14:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:91,685:.:-0.07:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:160,860:.: 0.40:1.000:. ./.:4:111,796:.: 0.18:1.000:. ./.:4:146,968:.: 0.58:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:87,727:.: 0.01:1.000:. ./.:4:148,824:.: 0.31:1.000:. ./.:4:165,897:.: 0.48:1.000:. ./.:4:43,895:.: 0.24:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:118,742:.: 0.09:1.000:. ./.:4:182,761:.: 0.25:1.000:. ./.:4:205,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.31:0.923:. ./.:4:148,839:.: 0.34:1.000:. ./.:4:81,809:.: 0.15:1.000:. ./.:4:360,1283:.: 1.59:1.000:. ./.:4:132,1008:.: 0.63:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:118,710:.: 0.03:1.000:. ./.:4:72,741:.: 0.00:1.000:. ./.:4:161,886:.: 0.45:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:170,892:.: 0.48:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:264,1194:.: 1.23:1.000:. ./.:3:141,0:.:-1.28:0.998:. ./.:4:181,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:149,924:.: 0.50:1.000:. ./.:4:209,1272:.: 1.28:1.000:. ./.:4:191,901:.: 0.54:1.000:. ./.:4:113,2:.:-1.33:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:343,1194:.: 1.38:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:183,1129:.: 0.95:1.000:. ./.:2:134,0:.:-1.29:0.999:. ./.:4:199,1052:.: 0.84:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:122,832:.: 0.27:1.000:. ./.:4:237,995:.: 0.80:1.000:. ./.:4:257,984:.: 0.82:1.000:. ./.:4:156,1217:.: 1.07:1.000:. ./.:4:175,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:87,1:.:-1.38:1.000:. ./.:6:123,1677:.: 1.88:0.997:. ./.:4:138,848:.: 0.33:1.000:. ./.:4:178,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:161,906:.: 0.49:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:197,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:127,850:.: 0.32:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:78,892:.: 0.30:1.000:. ./.:4:266,1322:.: 1.48:1.000:. ./.:4:264,1061:.: 0.98:1.000:. ./.:4:283,1160:.: 1.20:1.000:. ./.:4:123,1108:.: 0.80:1.000:. ./.:2:245,1:.:-1.08:1.000:. ./.:2:188,0:.:-1.19:0.992:. ./.:4:224,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:59,949:.: 0.38:1.000:. -chr3.1 15437240 chr3.1_015437240 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:182,51:.: 0.76:1.000:. ./.:4:184,40:.: 0.58:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:179,68:.: 1.02:1.000:. ./.:4:109,20:.:-1.24:1.000:. ./.:4:156,48:.: 0.20:1.000:. ./.:4:205,41:.: 1.01:1.000:. ./.:4:31,5:.:-3.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:172,41:.: 0.37:1.000:. ./.:4:208,50:.: 1.24:1.000:. ./.:4:185,48:.: 0.76:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:154,53:.: 0.26:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.41:0.999:. ./.:4:222,54:.: 1.58:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:180,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:59,14:.:-2.31:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:302,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:167,42:.: 0.30:1.000:. ./.:4:60,11:.:-2.35:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:198,46:.: 0.97:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:174,50:.: 0.58:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.33:1.000:. ./.:3:61,0:.:-2.54:0.993:. ./.:4:262,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:203,54:.: 1.22:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:118,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:153,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:119,37:.:-0.72:1.000:. ./.:4:224,65:.: 1.83:1.000:. ./.:4:169,50:.: 0.49:1.000:. ./.:4:153,49:.: 0.16:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:103,39:.:-0.99:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:152,37:.:-0.09:1.000:. ./.:6:136,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:182,34:.: 0.43:1.000:. ./.:4:134,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:137,26:.:-0.58:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:168,35:.: 0.18:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:173,0:.:-0.39:0.992:. ./.:4:160,36:.: 0.05:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:80,26:.:-1.68:1.000:. ./.:4:177,42:.: 0.49:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:165,54:.: 0.49:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:148,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.06:1.000:. ./.:6:191,36:.: 0.64:0.990:. ./.:4:125,49:.:-0.37:1.000:. ./.:4:148,58:.: 0.24:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.68:1.000:. ./.:5:165,31:.: 0.05:0.928:. ./.:4:148,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,28:.:-1.24:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:169,55:.: 0.58:1.000:. ./.:4:110,27:.:-1.08:0.976:. ./.:4:163,51:.: 0.39:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:129,25:.:-0.76:1.000:. ./.:4:188,46:.: 0.78:1.000:. ./.:4:199,51:.: 1.08:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:177,29:.: 0.24:1.000:. ./.:4:177,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:193,43:.: 0.81:1.000:. ./.:4:80,30:.:-1.60:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:118,35:.:-0.78:1.000:. ./.:4:147,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.47:1.000:. ./.:2:241,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:168,41:.: 0.30:1.000:. ./.:4:132,26:.:-0.68:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:103,42:.:-0.93:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:110,41:.:-0.81:1.000:. ./.:4:88,60:.:-0.87:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:145,28:.:-0.39:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:120,31:.:-0.81:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:129,45:.:-0.37:1.000:. ./.:4:168,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:145,44:.:-0.09:1.000:. ./.:4:87,21:.:-1.64:1.000:. ./.:4:103,32:.:-1.12:1.000:. ./.:4:150,27:.:-0.32:1.000:. ./.:4:198,63:.: 1.29:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.93:0.923:. ./.:4:163,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:119,46:.:-0.55:1.000:. ./.:4:103,29:.:-1.18:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:132,25:.:-0.70:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:97,35:.:-1.18:1.000:. ./.:4:193,44:.: 0.83:1.000:. ./.:4:300,0:.: 2.04:1.000:. ./.:3:145,41:.:-0.14:0.998:. ./.:4:230,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:220,48:.: 1.43:1.000:. ./.:4:141,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:134,42:.:-0.34:1.000:. ./.:4:164,59:.: 0.56:1.000:. ./.:4:131,49:.:-0.26:1.000:. ./.:2:135,31:.:-0.53:0.999:. ./.:4:249,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:191,44:.: 0.79:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:220,49:.: 1.45:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:161,58:.: 0.49:1.000:. ./.:4:128,41:.:-0.47:1.000:. ./.:6:294,1:.: 1.94:0.997:. ./.:4:126,42:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,29:.:-1.24:1.000:. ./.:4:131,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:154,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:130,46:.:-0.34:1.000:. ./.:4:152,26:.:-0.30:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:192,42:.: 0.78:1.000:. ./.:4:199,60:.: 1.25:1.000:. ./.:4:159,39:.: 0.09:1.000:. ./.:2:196,0:.: 0.05:1.000:. ./.:2:219,0:.: 0.49:0.992:. ./.:4:224,61:.: 1.75:1.000:. ./.:4:125,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:178,50:.: 0.66:1.000:. -chr3.1 15689906 chr3.1_015689906 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:293,772:.: 0.80:1.000:. ./.:4:68,985:.: 0.74:1.000:. ./.:4:226,693:.: 0.10:1.000:. ./.:4:272,780:.: 0.74:1.000:. ./.:4:239,1119:.: 2.22:1.000:. ./.:4:423,364:.:-0.54:1.000:. ./.:4:204,617:.:-0.38:1.000:. ./.:4:248,482:.:-0.82:1.000:. ./.:4:241,728:.: 0.34:1.000:. ./.:4:243,462:.:-0.94:1.000:. ./.:4:301,572:.:-0.13:1.000:. ./.:4:166,803:.: 0.34:1.000:. ./.:4:228,606:.:-0.32:1.000:. ./.:4:409,629:.: 0.67:1.000:. ./.:4:254,748:.: 0.50:1.000:. ./.:4:335,293:.:-1.31:1.000:. ./.:4:295,797:.: 0.93:0.999:. ./.:4:303,727:.: 0.63:1.000:. ./.:4:342,712:.: 0.75:1.000:. ./.:4:285,527:.:-0.42:1.000:. ./.:4:330,226:.:-1.66:1.000:. ./.:4:222,713:.: 0.17:0.999:. ./.:4:299,835:.: 1.14:1.000:. ./.:4:265,637:.: 0.01:1.000:. ./.:4:217,360:.:-1.56:1.000:. ./.:4:330,907:.: 1.63:1.000:. ./.:4:252,732:.: 0.41:1.000:. ./.:4:241,793:.: 0.65:1.000:. ./.:4:293,1009:.: 1.95:1.000:. ./.:4:291,880:.: 1.31:1.000:. ./.:4:271,766:.: 0.67:1.000:. ./.:4:121,712:.:-0.32:1.000:. ./.:4:90,432:.:-1.83:1.000:. ./.:4:259,698:.: 0.28:1.000:. ./.:3:175,456:.:-1.30:0.993:. ./.:4:267,823:.: 0.92:1.000:. ./.:4:360,502:.:-0.18:1.000:. ./.:4:285,549:.:-0.32:1.000:. ./.:4:263,793:.: 0.76:1.000:. ./.:4:261,789:.: 0.73:1.000:. ./.:4:378,298:.:-1.08:1.000:. ./.:4:414,323:.:-0.78:1.000:. ./.:4:315,902:.: 1.54:1.000:. ./.:4:161,674:.:-0.31:1.000:. ./.:4:345,713:.: 0.77:1.000:. ./.:4:301,833:.: 1.14:1.000:. ./.:4:287,740:.: 0.62:1.000:. ./.:4:519,1235:.: 4.13:1.000:. ./.:4:264,490:.:-0.70:1.000:. ./.:4:394,757:.: 1.22:1.000:. ./.:4:273,463:.:-0.79:1.000:. ./.:4:303,751:.: 0.75:1.000:. ./.:4:378,459:.:-0.30:1.000:. ./.:4:409,323:.:-0.81:1.000:. ./.:4:215,387:.:-1.44:1.000:. ./.:4:386,303:.:-1.02:1.000:. ./.:4:264,629:.:-0.03:1.000:. ./.:4:373,955:.: 2.07:1.000:. ./.:4:337,265:.:-1.44:1.000:. ./.:6:256,515:.:-0.62:1.000:. ./.:4:303,564:.:-0.16:1.000:. ./.:4:278,619:.:-0.01:1.000:. ./.:4:401,544:.: 0.22:1.000:. ./.:4:400,625:.: 0.61:1.000:. ./.:4:276,486:.:-0.66:1.000:. ./.:4:274,592:.:-0.16:1.000:. ./.:4:248,555:.:-0.47:1.000:. ./.:4:257,766:.: 0.60:1.000:. ./.:6:300,832:.: 1.13:0.992:. ./.:4:229,583:.:-0.42:1.000:. ./.:4:255,870:.: 1.09:1.000:. ./.:4:200,386:.:-1.52:1.000:. ./.:4:222,1048:.: 1.79:1.000:. ./.:4:233,740:.: 0.36:1.000:. ./.:4:202,757:.: 0.29:1.000:. ./.:4:255,708:.: 0.31:1.000:. ./.:4:301,475:.:-0.60:1.000:. ./.:4:371,500:.:-0.14:1.000:. ./.:4:268,557:.:-0.36:1.000:. ./.:4:286,777:.: 0.79:1.000:. ./.:6:225,806:.: 0.64:0.990:. ./.:4:329,534:.:-0.18:1.000:. ./.:4:438,365:.:-0.47:1.000:. ./.:4:197,477:.:-1.09:1.000:. ./.:5:628,502:.: 1.12:0.928:. ./.:4:461,351:.:-0.42:1.000:. ./.:4:234,370:.:-1.43:1.000:. ./.:4:296,741:.: 0.67:1.000:. ./.:4:269,487:.:-0.69:1.000:. ./.:4:350,460:.:-0.43:1.000:. ./.:4:350,296:.:-1.23:0.976:. ./.:4:272,607:.:-0.10:1.000:. ./.:4:345,869:.: 1.52:1.000:. ./.:4:172,489:.:-1.15:1.000:. ./.:4:331,819:.: 1.21:1.000:. ./.:4:321,740:.: 0.78:1.000:. ./.:4:273,464:.:-0.78:1.000:. ./.:4:250,852:.: 0.98:1.000:. ./.:4:501,642:.: 1.18:1.000:. ./.:4:385,559:.: 0.22:1.000:. ./.:4:291,267:.:-1.65:1.000:. ./.:4:343,897:.: 1.65:1.000:. ./.:4:231,618:.:-0.24:1.000:. ./.:4:315,676:.: 0.44:1.000:. ./.:4:326,447:.:-0.61:1.000:. ./.:4:244,430:.:-1.09:1.000:. ./.:4:215,409:.:-1.33:1.000:. ./.:4:239,811:.: 0.73:1.000:. ./.:2:218,916:.: 1.14:1.000:. ./.:4:356,478:.:-0.32:1.000:. ./.:4:368,299:.:-1.12:1.000:. ./.:4:341,1109:.: 2.66:1.000:. ./.:4:334,586:.: 0.10:1.000:. ./.:4:305,557:.:-0.18:1.000:. ./.:4:296,437:.:-0.80:1.000:. ./.:4:352,429:.:-0.57:1.000:. ./.:4:285,544:.:-0.34:1.000:. ./.:4:272,579:.:-0.23:1.000:. ./.:4:193,699:.:-0.04:1.000:. ./.:4:177,597:.:-0.61:1.000:. ./.:4:310,771:.: 0.88:1.000:. ./.:4:380,297:.:-1.08:1.000:. ./.:4:307,614:.: 0.11:1.000:. ./.:4:169,647:.:-0.40:1.000:. ./.:4:281,542:.:-0.37:1.000:. ./.:4:428,341:.:-0.63:1.000:. ./.:4:403,562:.: 0.32:1.000:. ./.:4:218,617:.:-0.31:1.000:. ./.:4:216,397:.:-1.38:1.000:. ./.:4:297,458:.:-0.70:1.000:. ./.:4:339,505:.:-0.27:1.000:. ./.:4:222,686:.: 0.04:1.000:. ./.:4:130,610:.:-0.77:0.923:. ./.:4:299,793:.: 0.93:1.000:. ./.:4:255,502:.:-0.69:1.000:. ./.:4:323,943:.: 1.77:1.000:. ./.:4:373,321:.:-0.99:1.000:. ./.:4:290,472:.:-0.66:1.000:. ./.:4:221,671:.:-0.04:1.000:. ./.:4:266,503:.:-0.63:1.000:. ./.:4:309,868:.: 1.34:1.000:. ./.:4:301,659:.: 0.29:1.000:. ./.:4:253,582:.:-0.31:1.000:. ./.:4:242,586:.:-0.34:1.000:. ./.:4:305,580:.:-0.07:1.000:. ./.:4:363,1002:.: 2.25:1.000:. ./.:3:253,458:.:-0.91:0.998:. ./.:4:175,918:.: 0.94:1.000:. ./.:4:295,760:.: 0.75:1.000:. ./.:4:345,501:.:-0.26:1.000:. ./.:4:300,616:.: 0.08:1.000:. ./.:4:230,706:.: 0.18:1.000:. ./.:4:149,686:.:-0.31:1.000:. ./.:4:125,456:.:-1.54:1.000:. ./.:4:324,848:.: 1.32:1.000:. ./.:4:285,541:.:-0.35:1.000:. ./.:4:335,473:.:-0.44:1.000:. ./.:4:396,412:.:-0.44:1.000:. ./.:2:219,424:.:-1.24:0.999:. ./.:4:328,945:.: 1.81:1.000:. ./.:4:233,555:.:-0.54:1.000:. ./.:4:231,461:.:-1.00:1.000:. ./.:4:248,749:.: 0.47:1.000:. ./.:4:329,519:.:-0.25:1.000:. ./.:4:257,576:.:-0.32:1.000:. ./.:4:231,504:.:-0.79:1.000:. ./.:4:223,367:.:-1.50:1.000:. ./.:6:140,1152:.: 1.90:0.997:. ./.:4:314,281:.:-1.47:1.000:. ./.:4:237,384:.:-1.35:1.000:. ./.:4:269,243:.:-1.87:1.000:. ./.:4:146,643:.:-0.53:1.000:. ./.:4:276,704:.: 0.39:1.000:. ./.:4:286,234:.:-1.83:1.000:. ./.:4:278,518:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,433:.:-1.34:1.000:. ./.:4:289,998:.: 1.88:1.000:. ./.:4:406,669:.: 0.85:1.000:. ./.:4:382,510:.:-0.04:1.000:. ./.:4:272,427:.:-0.97:1.000:. ./.:2:216,794:.: 0.54:1.000:. ./.:2:200,846:.: 0.71:0.992:. ./.:4:352,568:.: 0.10:1.000:. ./.:4:192,370:.:-1.63:1.000:. ./.:4:170,791:.: 0.30:1.000:. -chr3.1 16188956 chr3.1_016188956 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,115:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1,113:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,158:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,40:.:-2.02:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,7:.:-3.14:1.000:. ./.:4:0,17:.:-2.80:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,69:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.30:0.999:. ./.:4:0,146:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,7:.:-3.14:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.43:0.999:. ./.:4:0,123:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,7:.:-3.14:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,170:.: 2.35:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,132:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,7:.:-3.14:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.83:1.000:. ./.:3:0,5:.:-3.20:0.993:. ./.:4:0,108:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,149:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,132:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,11:.:-3.00:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,137:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,137:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,142:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.97:1.000:. ./.:6:0,71:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,104:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,149:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.74:1.000:. ./.:6:0,128:.: 0.94:0.992:. ./.:4:0,110:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,130:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.70:1.000:. ./.:6:0,111:.: 0.37:0.990:. ./.:4:0,112:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.30:1.000:. ./.:5:0,92:.:-0.27:0.928:. ./.:4:0,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,104:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.12:0.976:. ./.:4:0,109:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,135:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,39:.:-2.06:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.70:1.000:. ./.:2:0,111:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,130:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,141:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,57:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.58:0.923:. ./.:4:0,123:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,104:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.11:1.000:. ./.:3:0,80:.:-0.68:0.998:. ./.:4:0,144:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,159:.: 1.98:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,104:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,23:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.12:1.000:. ./.:2:0,68:.:-1.08:0.999:. ./.:4:0,122:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.48:1.000:. ./.:6:0,130:.: 1.01:0.997:. ./.:4:0,81:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.51:1.000:. ./.:2:0,84:.:-0.54:1.000:. ./.:2:0,117:.: 0.57:0.992:. ./.:4:0,103:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.06:1.000:. -chr3.1 16610875 chr3.1_016610875 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,359:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.46:1.000:. ./.:4:66,305:.: 1.06:1.000:. ./.:4:84,299:.: 1.22:1.000:. ./.:4:79,277:.: 0.85:1.000:. ./.:4:85,263:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,235:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,292:.:-0.02:1.000:. ./.:4:66,298:.: 0.96:1.000:. ./.:4:39,90:.:-2.25:1.000:. ./.:4:25,166:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.27:1.000:. ./.:4:81,244:.: 0.43:1.000:. ./.:4:65,279:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,382:.: 1.21:1.000:. ./.:4:112,140:.:-0.57:1.000:. ./.:4:156,248:.: 1.51:0.999:. ./.:4:70,262:.: 0.53:1.000:. ./.:4:73,261:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,352:.: 0.80:1.000:. ./.:4:66,59:.:-2.30:1.000:. ./.:4:2,311:.: 0.27:0.999:. ./.:4:82,332:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,346:.: 0.72:1.000:. ./.:4:18,86:.:-2.59:1.000:. ./.:4:74,385:.: 2.26:1.000:. ./.:4:126,226:.: 0.80:1.000:. ./.:4:60,254:.: 0.28:1.000:. ./.:4:74,344:.: 1.70:1.000:. ./.:4:82,303:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,428:.: 1.84:1.000:. ./.:4:55,274:.: 0.49:1.000:. ./.:4:42,77:.:-2.38:1.000:. ./.:4:33,136:.:-1.70:1.000:. ./.:3:13,14:.:-3.64:0.993:. ./.:4:76,304:.: 1.18:1.000:. ./.:4:161,249:.: 1.59:1.000:. ./.:4:121,134:.:-0.52:1.000:. ./.:4:69,312:.: 1.20:1.000:. ./.:4:69,315:.: 1.24:1.000:. ./.:4:105,129:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.03:1.000:. ./.:4:80,318:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,278:.:-0.21:1.000:. ./.:4:55,237:.:-0.02:1.000:. ./.:4:73,315:.: 1.29:1.000:. ./.:4:68,228:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,197:.:-0.76:1.000:. ./.:4:71,214:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,163:.: 0.25:1.000:. ./.:4:61,187:.:-0.62:1.000:. ./.:4:162,232:.: 1.37:1.000:. ./.:4:105,200:.: 0.16:1.000:. ./.:4:64,196:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,220:.:-1.00:1.000:. ./.:4:62,257:.: 0.35:1.000:. ./.:4:94,150:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,393:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.47:1.000:. ./.:6:14,193:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.66:1.000:. ./.:4:128,190:.: 0.34:1.000:. ./.:4:74,223:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,343:.: 0.69:1.000:. ./.:4:69,220:.:-0.06:1.000:. ./.:4:79,260:.: 0.62:1.000:. ./.:4:50,154:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.20:1.000:. ./.:6:61,284:.: 0.70:0.992:. ./.:4:0,298:.: 0.06:1.000:. ./.:4:67,230:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,245:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,483:.: 2.59:1.000:. ./.:4:55,265:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,368:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,375:.: 1.11:1.000:. ./.:4:74,211:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,247:.: 0.16:1.000:. ./.:4:55,170:.:-0.93:1.000:. ./.:4:65,261:.: 0.45:1.000:. ./.:6:0,327:.: 0.46:0.990:. ./.:4:54,212:.:-0.37:1.000:. ./.:4:155,157:.: 0.25:1.000:. ./.:4:63,160:.:-0.96:1.000:. ./.:5:58,332:.: 1.32:0.928:. ./.:4:60,188:.:-0.62:1.000:. ./.:4:81,108:.:-1.43:1.000:. ./.:4:58,235:.:-0.01:1.000:. ./.:4:49,191:.:-0.73:1.000:. ./.:4:138,164:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,182:.:-0.72:0.976:. ./.:4:107,157:.:-0.40:1.000:. ./.:4:59,282:.: 0.65:1.000:. ./.:4:94,146:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,296:.: 0.80:1.000:. ./.:4:51,155:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.81:1.000:. ./.:4:53,239:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,312:.: 0.25:1.000:. ./.:4:53,184:.:-0.77:1.000:. ./.:4:63,235:.: 0.06:1.000:. ./.:4:44,184:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,220:.:-1.00:1.000:. ./.:4:42,220:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.46:1.000:. ./.:4:101,108:.:-1.15:1.000:. ./.:4:73,286:.: 0.90:1.000:. ./.:2:160,174:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.06:1.000:. ./.:4:47,151:.:-1.30:1.000:. ./.:4:72,349:.: 1.74:1.000:. ./.:4:60,138:.:-1.30:1.000:. ./.:4:60,168:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,190:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,251:.:-0.57:1.000:. ./.:4:150,190:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.62:1.000:. ./.:4:106,105:.:-1.13:1.000:. ./.:4:121,209:.: 0.50:1.000:. ./.:4:116,110:.:-0.92:1.000:. ./.:4:126,141:.:-0.36:1.000:. ./.:4:168,150:.: 0.34:1.000:. ./.:4:61,194:.:-0.52:1.000:. ./.:4:71,175:.:-0.65:1.000:. ./.:4:55,204:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,292:.:-0.01:1.000:. ./.:4:41,150:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.77:1.000:. ./.:4:67,259:.: 0.45:1.000:. ./.:4:58,287:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,160:.:-1.28:0.923:. ./.:4:114,179:.:-0.01:1.000:. ./.:4:55,165:.:-1.00:1.000:. ./.:4:97,354:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.80:1.000:. ./.:4:58,138:.:-1.33:1.000:. ./.:4:52,203:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,189:.:-1.43:1.000:. ./.:4:107,194:.: 0.10:1.000:. ./.:4:54,225:.:-0.20:1.000:. ./.:4:58,142:.:-1.28:1.000:. ./.:4:44,192:.:-0.78:1.000:. ./.:4:86,252:.: 0.61:1.000:. ./.:4:94,369:.: 2.32:1.000:. ./.:3:0,265:.:-0.39:0.998:. ./.:4:69,247:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,400:.: 1.46:1.000:. ./.:4:42,200:.:-0.70:1.000:. ./.:4:162,158:.: 0.36:1.000:. ./.:4:62,266:.: 0.47:1.000:. ./.:4:26,103:.:-2.25:1.000:. ./.:4:54,184:.:-0.76:1.000:. ./.:4:156,238:.: 1.37:1.000:. ./.:4:122,132:.:-0.54:1.000:. ./.:4:84,234:.: 0.34:1.000:. ./.:4:71,216:.:-0.09:1.000:. ./.:2:58,159:.:-1.04:0.999:. ./.:4:74,280:.: 0.83:1.000:. ./.:4:123,211:.: 0.55:1.000:. ./.:4:50,201:.:-0.58:1.000:. ./.:4:40,249:.:-0.06:1.000:. ./.:4:71,259:.: 0.50:1.000:. ./.:4:67,222:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,255:.:-0.51:1.000:. ./.:4:54,183:.:-0.77:1.000:. ./.:6:0,345:.: 0.70:0.997:. ./.:4:105,130:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,235:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.72:1.000:. ./.:4:57,223:.:-0.18:1.000:. ./.:4:60,278:.: 0.61:1.000:. ./.:4:94,122:.:-1.06:1.000:. ./.:4:46,263:.: 0.21:1.000:. ./.:4:50,156:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,461:.: 2.30:1.000:. ./.:4:74,285:.: 0.90:1.000:. ./.:4:67,295:.: 0.94:1.000:. ./.:4:41,200:.:-0.72:1.000:. ./.:2:83,196:.:-0.20:1.000:. ./.:2:104,267:.: 1.06:0.992:. ./.:4:143,175:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,199:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.62:1.000:. -chr3.1 16794891 chr3.1_016794891 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:19,77:.: 0.81:1.000:. ./.:4:52,25:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,60:.: 0.12:1.000:. ./.:4:32,89:.: 1.71:1.000:. ./.:4:66,46:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,102:.: 1.03:1.000:. ./.:4:10,24:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:28,51:.: 0.20:1.000:. ./.:4:3,7:.:-2.30:1.000:. ./.:4:10,6:.:-2.08:1.000:. ./.:4:20,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:26,87:.: 1.42:1.000:. ./.:4:62,48:.: 1.32:1.000:. ./.:4:29,49:.: 0.16:1.000:. ./.:4:30,61:.: 0.63:1.000:. ./.:4:65,56:.: 1.71:0.999:. ./.:4:72,80:.: 2.83:1.000:. ./.:4:0,104:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,106:.: 1.17:1.000:. ./.:4:9,7:.:-2.08:1.000:. ./.:4:28,71:.: 0.92:0.999:. ./.:4:22,83:.: 1.13:1.000:. ./.:4:17,73:.: 0.59:1.000:. ./.:4:14,10:.:-1.79:1.000:. ./.:4:27,57:.: 0.38:1.000:. ./.:4:59,46:.: 1.13:1.000:. ./.:4:26,51:.: 0.12:1.000:. ./.:4:32,61:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,87:.: 1.68:1.000:. ./.:4:21,82:.: 1.06:1.000:. ./.:4:19,65:.: 0.38:1.000:. ./.:4:3,2:.:-2.48:1.000:. ./.:4:8,10:.:-2.01:1.000:. ./.:3:1,4:.:-2.48:0.993:. ./.:4:52,54:.: 1.17:1.000:. ./.:4:56,63:.: 1.64:1.000:. ./.:4:27,64:.: 0.63:1.000:. ./.:4:48,50:.: 0.88:1.000:. ./.:4:15,84:.: 0.92:1.000:. ./.:4:16,29:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.09:1.000:. ./.:4:24,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.29:1.000:. ./.:4:23,47:.:-0.13:1.000:. ./.:4:33,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:28,44:.:-0.06:1.000:. ./.:4:22,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.36:1.000:. ./.:4:16,20:.:-1.36:1.000:. ./.:4:15,32:.:-0.96:1.000:. ./.:4:63,61:.: 1.82:1.000:. ./.:4:45,43:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.71:1.000:. ./.:4:47,46:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,44:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.35:1.000:. ./.:6:16,40:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.20:1.000:. ./.:4:58,32:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.09:1.000:. ./.:4:52,51:.: 1.06:1.000:. ./.:4:15,27:.:-1.14:1.000:. ./.:4:19,39:.:-0.56:1.000:. ./.:6:22,67:.: 0.56:0.992:. ./.:4:20,70:.: 0.59:1.000:. ./.:4:20,24:.:-1.07:1.000:. ./.:4:7,24:.:-1.54:1.000:. ./.:4:23,20:.:-1.10:1.000:. ./.:4:62,52:.: 1.46:1.000:. ./.:4:19,50:.:-0.17:1.000:. ./.:4:15,48:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,63:.: 0.59:1.000:. ./.:4:42,73:.: 1.50:1.000:. ./.:4:31,87:.: 1.60:1.000:. ./.:6:28,35:.:-0.38:0.990:. ./.:4:21,53:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,44:.:-0.09:1.000:. ./.:4:24,29:.:-0.74:1.000:. ./.:5:0,31:.:-1.54:0.928:. ./.:4:0,61:.:-0.45:1.000:. ./.:4:14,24:.:-1.29:1.000:. ./.:4:24,28:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.67:1.000:. ./.:4:45,41:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,38:.:-0.45:0.976:. ./.:4:34,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,54:.: 0.02:1.000:. ./.:4:33,19:.:-0.78:1.000:. ./.:4:27,87:.: 1.46:1.000:. ./.:4:19,43:.:-0.42:1.000:. ./.:4:18,19:.:-1.32:1.000:. ./.:4:46,43:.: 0.56:1.000:. ./.:4:19,65:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,51:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,37:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,41:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.92:1.000:. ./.:4:25,25:.:-0.85:1.000:. ./.:4:31,60:.: 0.63:1.000:. ./.:2:22,48:.:-0.13:1.000:. ./.:4:29,78:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.29:1.000:. ./.:4:80,49:.: 2.00:1.000:. ./.:4:18,39:.:-0.60:1.000:. ./.:4:30,61:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,39:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.67:1.000:. ./.:4:20,32:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,29:.: 0.12:1.000:. ./.:4:22,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:29,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:21,52:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,38:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.74:1.000:. ./.:4:23,69:.: 0.67:1.000:. ./.:4:21,40:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.54:1.000:. ./.:4:21,38:.:-0.53:1.000:. ./.:4:16,62:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,42:.: 0.88:1.000:. ./.:4:14,30:.:-1.07:0.923:. ./.:4:37,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:21,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,94:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.27:1.000:. ./.:4:17,31:.:-0.92:1.000:. ./.:4:49,52:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.43:1.000:. ./.:4:49,41:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,37:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.89:1.000:. ./.:4:23,19:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.53:1.000:. ./.:4:24,78:.: 1.03:1.000:. ./.:3:0,92:.: 0.67:0.998:. ./.:4:14,48:.:-0.42:1.000:. ./.:4:27,86:.: 1.42:1.000:. ./.:4:41,60:.: 0.99:1.000:. ./.:4:33,76:.: 1.28:1.000:. ./.:4:57,73:.: 2.04:1.000:. ./.:4:10,8:.:-2.01:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.96:1.000:. ./.:4:46,35:.: 0.27:1.000:. ./.:4:30,36:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.48:1.000:. ./.:4:25,55:.: 0.23:1.000:. ./.:2:0,56:.:-0.64:0.999:. ./.:4:56,45:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,65:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:24,70:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,52:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:31,52:.: 0.34:1.000:. ./.:6:54,38:.: 0.67:0.997:. ./.:4:21,47:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.35:1.000:. ./.:4:31,51:.: 0.30:1.000:. ./.:4:27,43:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,58:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,42:.: 0.41:1.000:. ./.:4:25,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,78:.: 1.35:1.000:. ./.:4:37,86:.: 1.78:1.000:. ./.:4:25,84:.: 1.28:1.000:. ./.:4:29,53:.: 0.30:1.000:. ./.:2:0,50:.:-0.85:1.000:. ./.:2:21,57:.: 0.16:0.992:. ./.:4:38,74:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,58:.: 0.45:1.000:. -chr3.1 16909645 chr3.1_016909645 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:170,274:0.60: 0.93:1.000:0.800 0/0/1/1:4:210,222:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,224:0.58: 0.11:1.000:0.898 0/0/1/1:4:159,272:0.61: 0.78:1.000:0.671 0/0/0/1:4:379,101:0.21: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,329:0.71: 0.96:1.000:0.991 0/0/1/1:4:201,137:0.40:-0.29:1.000:0.772 0/0/1/1:4:183,183:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,170:0.40: 0.65:1.000:0.766 0/0/0/1:4:75,35:0.31:-2.92:1.000:0.970 0/0/1/1:4:107,85:0.43:-1.98:1.000:0.957 0/1/1/1:4:143,268:0.63: 0.55:1.000:0.577 0/0/1/1:4:213,161:0.42: 0.12:1.000:0.924 0/1/1/1:4:114,320:0.71: 0.81:1.000:0.991 0/0/1/1:4:172,244:0.57: 0.60:1.000:0.944 0/0/1/1:4:196,175:0.46: 0.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:234,170:0.41: 0.46:0.999:0.881 0/1/1/1:4:82,329:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,203:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,181:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,59:0.63:-3.14:1.000:0.532 0/0/1/1:4:162,279:0.61: 0.89:0.999:0.654 0/0/1/1:4:290,189:0.39: 1.33:1.000:0.660 0/0/1/1:4:158,243:0.59: 0.43:1.000:0.871 0/1/1/1:4:11,94:0.86:-2.98:1.000:0.970 0/0/0/1:4:313,189:0.37: 1.59:1.000:0.570 0/0/1/1:4:257,177:0.40: 0.81:1.000:0.793 0/0/1/1:4:168,267:0.60: 0.82:1.000:0.824 0/0/0/1:4:268,162:0.37: 0.76:1.000:0.566 0/0/0/1:4:283,163:0.36: 0.95:1.000:0.704 0/0/1/1:4:176,274:0.59: 0.99:1.000:0.855 0/0/1/1:4:205,144:0.40:-0.17:1.000:0.830 0/0/1/1:4:34,22:0.39:-3.54:1.000:0.640 0/1/1/1:4:46,102:0.67:-2.48:1.000:0.899 0/1/1:3:11,50:0.79:-3.48:0.993:1.000 0/0/1/1:4:169,265:0.59: 0.81:1.000:0.845 0/0/1/1:4:153,237:0.59: 0.30:1.000:0.862 0/0/0/1:4:218,94:0.30:-0.59:1.000:0.988 0/0/1/1:4:191,266:0.57: 1.07:1.000:0.954 0/0/1/1:4:189,256:0.56: 0.94:1.000:0.966 0/0/1/1:4:170,175:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,290:0.72: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:315,219:0.40: 1.96:1.000:0.812 0/0/0/1:4:228,69:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,186:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:180,262:0.58: 0.90:1.000:0.927 0/0/1/1:4:172,188:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,128:0.41:-0.67:1.000:0.875 0/0/1/1:4:144,156:0.51:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:252,79:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,160:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:332,174:0.34: 1.64:1.000:0.884 0/0/1/1:4:150,208:0.57:-0.06:1.000:0.956 0/1/1/1:4:95,293:0.73: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:167,149:0.46:-0.55:1.000:0.989 0/1/1/1:4:92,289:0.73: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:249,153:0.37: 0.44:1.000:0.516 0/0/1/1:4:203,287:0.57: 1.45:1.000:0.946 0/1/1/1:4:79,263:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:176,114:0.39:-0.85:1.000:0.747 0/0/1/1:4:172,150:0.46:-0.48:1.000:0.986 0/0/1/1:4:255,180:0.41: 0.82:1.000:0.839 0/0/1/1:4:169,176:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:84,328:0.76: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,148:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:261,168:0.38: 0.75:1.000:0.625 0/0/0/1:4:158,53:0.25:-1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:167,250:0.58: 0.61:1.000:0.902 0/0/0/1/1/1:6:207,262:0.55: 1.21:0.992:0.771 0/1/1/1:4:66,318:0.79: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,82:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,86:0.49:-2.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:176,306:0.62: 1.36:1.000:0.630 0/0/0/1:4:290,176:0.37: 1.18:1.000:0.554 0/1/1/1:4:146,273:0.63: 0.64:1.000:0.571 0/0/1/1:4:140,222:0.60:-0.02:1.000:0.828 0/0/1/1:4:140,163:0.53:-0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:203,273:0.56: 1.29:1.000:0.969 0/0/0/1:4:267,81:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,293:0.59: 1.37:1.000:0.868 0/1/1/1/1/1:6:77,360:0.79: 0.84:0.990:0.881 0/0/1/1:4:180,176:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,209:0.48: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,65:0.26:-1.40:1.000:0.998 0/1/1/1/1:5:104,372:0.75: 1.29:0.928:0.928 0/1/1/1:4:95,275:0.71: 0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:194,69:0.26:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,224:0.60: 0.02:1.000:0.825 0/0/1/1:4:144,155:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,251:0.58: 0.63:1.000:0.898 0/0/1/1:4:133,131:0.49:-1.15:0.976:0.996 0/0/0/1:4:251,145:0.36: 0.37:1.000:0.696 0/0/1/1:4:172,255:0.58: 0.73:1.000:0.911 0/0/0/1:4:214,117:0.35:-0.38:1.000:0.819 0/0/1/1:4:162,254:0.59: 0.60:1.000:0.845 0/0/1/1:4:170,284:0.61: 1.04:1.000:0.727 0/0/1/1:4:148,133:0.46:-0.95:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,375:0.83: 0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:98,352:0.75: 0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,322:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,130:0.51:-1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:291,183:0.38: 1.27:1.000:0.555 0/0/1/1:4:114,185:0.60:-0.74:1.000:0.787 0/0/1/1:4:169,160:0.48:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,223:0.61:-0.13:1.000:0.644 0/0/1/1:4:163,147:0.47:-0.62:1.000:0.990 0/0/0/1:4:217,87:0.28:-0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:150,238:0.60: 0.28:1.000:0.827 0/0:2:392,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,281:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,167:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,298:0.56: 1.77:1.000:0.965 0/0/1/1:4:174,159:0.47:-0.35:1.000:0.992 0/0/0/1:4:262,101:0.27:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:102,297:0.72: 0.41:1.000:0.994 0/1/1/1:4:108,282:0.70: 0.30:1.000:0.982 0/0/1/1:4:123,126:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,154:0.40: 0.17:1.000:0.790 0/0/0/1:4:229,87:0.27:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/0:4:312,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,145:0.35: 0.45:1.000:0.763 0/0/1/1:4:165,156:0.48:-0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:271,73:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:316,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,170:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,267:0.72:-0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:96,322:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,310:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,54:0.24:-1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,252:0.76:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,323:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,154:0.38: 0.41:1.000:0.554 0/0/0/1:4:216,47:0.18:-1.16:0.923:0.999 0/0/1/1:4:238,192:0.44: 0.76:1.000:0.964 0/0/0/1:4:189,53:0.21:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,326:0.59: 2.01:1.000:0.872 0/1/1/1:4:95,264:0.71:-0.05:1.000:0.991 0/0/0/1:4:193,66:0.25:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,221:0.57: 0.17:1.000:0.949 0/0/1/1:4:131,144:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:261,170:0.39: 0.78:1.000:0.658 0/0/1/1:4:249,182:0.41: 0.78:1.000:0.889 0/0/1/1:4:163,123:0.42:-0.89:1.000:0.922 0/0/1/1:4:133,223:0.61:-0.09:1.000:0.719 0/0/0/1:4:313,107:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,299:0.56: 1.80:1.000:0.967 0/1/1:3:157,163:0.50:-0.50:0.998:0.500 0/0/0/1:4:329,83:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,258:0.56: 0.94:1.000:0.959 0/1/1/1:4:79,326:0.77: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,96:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:231,167:0.41: 0.40:1.000:0.875 0/0/1/1:4:53,64:0.53:-2.84:1.000:0.990 0/0/0/0:4:271,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:255,162:0.38: 0.61:1.000:0.586 0/0/0/1:4:247,86:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:278,89:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,252:0.69:-0.13:1.000:0.973 0/1:2:229,69:0.23:-0.76:0.999:0.866 0/0/1/1:4:195,264:0.56: 1.10:1.000:0.966 0/0/1/1:4:198,146:0.42:-0.23:1.000:0.899 0/0/0/1:4:191,74:0.27:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:236,154:0.39: 0.30:1.000:0.664 0/1/1/1:4:83,323:0.76: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,100:0.27: 0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:153,169:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,71:0.26:-1.15:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:142,310:0.66: 1.02:0.997:0.917 0/0/1/1:4:167,148:0.46:-0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:152,148:0.48:-0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,213:0.71:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:188,134:0.41:-0.48:1.000:0.854 0/0/1/1:4:233,175:0.42: 0.51:1.000:0.918 0/0/1/1:4:162,134:0.44:-0.78:1.000:0.973 0/0/1/1:4:209,164:0.43: 0.11:1.000:0.950 0/0/0/1:4:225,84:0.27:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:170,255:0.58: 0.71:1.000:0.900 0/1/1/1:4:85,335:0.77: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,344:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,182:0.54:-0.42:1.000:0.985 0/1:2:256,97:0.27:-0.12:1.000:0.999 0/1:2:267,109:0.28: 0.14:0.992:1.000 0/0/0/1:4:296,109:0.26: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:145,154:0.51:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,216:0.53: 0.38:1.000:0.992 -chr3.1 17226890 chr3.1_017226890 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:355,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:294,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.36:0.999:. ./.:4:333,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:302,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:406,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:50,0:.:-2.40:0.993:. ./.:4:374,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:423,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.36:1.000:. ./.:6:131,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:289,0:.: 0.56:0.992:. ./.:4:275,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:208,0:.:-0.45:0.990:. ./.:4:196,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.56:1.000:. ./.:5:310,0:.: 0.82:0.928:. ./.:4:206,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.03:0.976:. ./.:4:255,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:310,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.51:1.000:. ./.:2:287,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:476,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.44:0.923:. ./.:4:227,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.35:1.000:. ./.:3:278,0:.: 0.42:0.998:. ./.:4:310,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.31:1.000:. ./.:5:261,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:355,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:367,0:.: 1.52:0.997:. ./.:4:237,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:449,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:410,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.21:1.000:. ./.:2:266,0:.: 0.27:1.000:. ./.:2:318,0:.: 0.91:0.992:. ./.:4:320,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.73:1.000:. -chr3.1 17319408 chr3.1_017319408 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:64,268:.: 0.48:1.000:. ./.:4:185,164:.: 0.72:1.000:. ./.:4:151,220:.: 1.02:1.000:. ./.:4:122,202:.: 0.37:1.000:. ./.:4:160,241:.: 1.44:1.000:. ./.:4:60,239:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,203:.:-0.74:1.000:. ./.:4:75,189:.:-0.47:1.000:. ./.:4:79,292:.: 1.02:1.000:. ./.:4:31,57:.:-2.91:1.000:. ./.:4:45,68:.:-2.56:1.000:. ./.:4:184,139:.: 0.35:1.000:. ./.:4:58,281:.: 0.58:1.000:. ./.:4:60,245:.: 0.10:1.000:. ./.:4:113,181:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,221:.:-0.12:1.000:. ./.:4:145,238:.: 1.19:0.999:. ./.:4:143,299:.: 2.01:1.000:. ./.:4:163,180:.: 0.63:1.000:. ./.:4:82,229:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,88:.:-2.56:1.000:. ./.:4:114,183:.:-0.01:0.999:. ./.:4:134,252:.: 1.23:1.000:. ./.:4:71,268:.: 0.58:1.000:. ./.:4:32,43:.:-3.09:1.000:. ./.:4:143,263:.: 1.51:1.000:. ./.:4:76,283:.: 0.85:1.000:. ./.:4:124,195:.: 0.30:1.000:. ./.:4:148,245:.: 1.33:1.000:. ./.:4:146,264:.: 1.56:1.000:. ./.:4:74,273:.: 0.69:1.000:. ./.:4:121,234:.: 0.80:1.000:. ./.:4:26,46:.:-3.13:1.000:. ./.:4:64,71:.:-2.26:1.000:. ./.:3:23,24:.:-3.48:0.993:. ./.:4:124,212:.: 0.54:1.000:. ./.:4:73,268:.: 0.60:1.000:. ./.:4:160,150:.: 0.17:1.000:. ./.:4:149,223:.: 1.04:1.000:. ./.:4:144,239:.: 1.19:1.000:. ./.:4:65,173:.:-0.83:1.000:. ./.:4:55,188:.:-0.76:1.000:. ./.:4:160,214:.: 1.06:1.000:. ./.:4:121,119:.:-0.80:1.000:. ./.:4:158,156:.: 0.23:1.000:. ./.:4:139,197:.: 0.54:1.000:. ./.:4:153,158:.: 0.19:1.000:. ./.:4:62,101:.:-1.87:1.000:. ./.:4:108,134:.:-0.77:1.000:. ./.:4:106,127:.:-0.90:1.000:. ./.:4:53,138:.:-1.48:1.000:. ./.:4:76,315:.: 1.30:1.000:. ./.:4:61,222:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,190:.:-0.51:1.000:. ./.:4:125,149:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,203:.:-0.44:1.000:. ./.:4:140,191:.: 0.47:1.000:. ./.:4:185,212:.: 1.38:1.000:. ./.:4:59,223:.:-0.22:1.000:. ./.:6:132,134:.:-0.44:1.000:. ./.:4:124,148:.:-0.35:1.000:. ./.:4:61,231:.:-0.08:1.000:. ./.:4:72,225:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,244:.: 0.27:1.000:. ./.:4:129,155:.:-0.19:1.000:. ./.:4:63,277:.: 0.59:1.000:. ./.:4:111,134:.:-0.73:1.000:. ./.:4:148,204:.: 0.76:1.000:. ./.:6:153,228:.: 1.16:0.992:. ./.:4:152,124:.:-0.30:1.000:. ./.:4:170,164:.: 0.51:1.000:. ./.:4:66,117:.:-1.59:1.000:. ./.:4:232,135:.: 0.97:1.000:. ./.:4:128,211:.: 0.58:1.000:. ./.:4:204,137:.: 0.60:1.000:. ./.:4:107,164:.:-0.37:1.000:. ./.:4:131,118:.:-0.67:1.000:. ./.:4:69,268:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,213:.:-0.27:1.000:. ./.:4:138,216:.: 0.79:1.000:. ./.:6:170,165:.: 0.52:0.990:. ./.:4:70,210:.:-0.24:1.000:. ./.:4:73,242:.: 0.24:1.000:. ./.:4:116,130:.:-0.72:1.000:. ./.:5:102,169:.:-0.37:0.928:. ./.:4:79,209:.:-0.13:1.000:. ./.:4:70,168:.:-0.83:1.000:. ./.:4:100,161:.:-0.51:1.000:. ./.:4:115,149:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,255:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,199:.:-0.55:0.976:. ./.:4:74,239:.: 0.22:1.000:. ./.:4:174,218:.: 1.31:1.000:. ./.:4:52,197:.:-0.67:1.000:. ./.:4:73,292:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,262:.: 0.80:1.000:. ./.:4:101,108:.:-1.23:1.000:. ./.:4:188,196:.: 1.20:1.000:. ./.:4:57,270:.: 0.41:1.000:. ./.:4:68,308:.: 1.09:1.000:. ./.:4:45,152:.:-1.40:1.000:. ./.:4:127,218:.: 0.66:1.000:. ./.:4:96,137:.:-0.90:1.000:. ./.:4:146,127:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,242:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,166:.:-0.97:1.000:. ./.:4:124,132:.:-0.58:1.000:. ./.:4:135,214:.: 0.72:1.000:. ./.:2:162,200:.: 0.90:1.000:. ./.:4:73,281:.: 0.79:1.000:. ./.:4:69,205:.:-0.33:1.000:. ./.:4:186,283:.: 2.38:1.000:. ./.:4:71,189:.:-0.52:1.000:. ./.:4:109,158:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,179:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.37:1.000:. ./.:4:115,114:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,250:.: 0.13:1.000:. ./.:4:134,151:.:-0.17:1.000:. ./.:4:143,120:.:-0.48:1.000:. ./.:4:142,229:.: 1.02:1.000:. ./.:4:52,212:.:-0.47:1.000:. ./.:4:151,152:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,140:.:-0.44:1.000:. ./.:4:126,127:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,239:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,283:.: 0.73:1.000:. ./.:4:181,94:.:-0.31:1.000:. ./.:4:59,162:.:-1.06:1.000:. ./.:4:50,192:.:-0.77:1.000:. ./.:4:54,226:.:-0.24:1.000:. ./.:4:78,266:.: 0.65:1.000:. ./.:4:88,142:.:-0.94:0.923:. ./.:4:116,235:.: 0.74:1.000:. ./.:4:102,139:.:-0.78:1.000:. ./.:4:164,261:.: 1.77:1.000:. ./.:4:70,217:.:-0.15:1.000:. ./.:4:79,200:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,231:.: 0.15:1.000:. ./.:4:152,96:.:-0.69:1.000:. ./.:4:140,202:.: 0.62:1.000:. ./.:4:71,302:.: 1.05:1.000:. ./.:4:122,130:.:-0.63:1.000:. ./.:4:57,189:.:-0.72:1.000:. ./.:4:92,211:.: 0.08:1.000:. ./.:4:129,251:.: 1.15:1.000:. ./.:3:64,237:.: 0.05:0.998:. ./.:4:147,183:.: 0.45:1.000:. ./.:4:68,275:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,241:.: 0.10:1.000:. ./.:4:188,185:.: 1.05:1.000:. ./.:4:128,207:.: 0.52:1.000:. ./.:4:52,57:.:-2.62:1.000:. ./.:4:96,101:.:-1.40:1.000:. ./.:4:133,238:.: 1.02:1.000:. ./.:4:72,236:.: 0.15:1.000:. ./.:4:79,265:.: 0.65:1.000:. ./.:4:61,236:.:-0.01:1.000:. ./.:5:65,189:.:-0.60:0.999:. ./.:4:142,222:.: 0.92:1.000:. ./.:4:76,285:.: 0.88:1.000:. ./.:4:121,114:.:-0.87:1.000:. ./.:4:137,203:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,263:.: 0.34:1.000:. ./.:4:91,106:.:-1.40:1.000:. ./.:4:90,211:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,186:.:-0.81:1.000:. ./.:6:308,156:.: 2.31:0.997:. ./.:4:53,175:.:-0.97:1.000:. ./.:4:65,171:.:-0.85:1.000:. ./.:4:69,196:.:-0.45:1.000:. ./.:4:114,144:.:-0.55:1.000:. ./.:4:67,295:.: 0.90:1.000:. ./.:4:53,200:.:-0.62:1.000:. ./.:4:61,226:.:-0.15:1.000:. ./.:4:50,180:.:-0.94:1.000:. ./.:4:200,247:.: 2.08:1.000:. ./.:4:73,304:.: 1.11:1.000:. ./.:4:54,286:.: 0.59:1.000:. ./.:4:113,188:.: 0.05:1.000:. ./.:2:152,166:.: 0.29:1.000:. ./.:2:166,199:.: 0.94:0.992:. ./.:4:79,250:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,184:.:-0.81:1.000:. ./.:4:192,117:.: 0.16:1.000:. -chr3.1 18689569 chr3.1_018689569 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:63,4:.: 0.34:1.000:. ./.:4:84,5:.: 1.41:1.000:. ./.:4:69,5:.: 0.68:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:114,2:.: 2.73:1.000:. ./.:4:69,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:80,4:.: 1.17:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:66,4:.: 0.49:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:68,7:.: 0.73:1.000:. ./.:4:63,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.78:0.999:. ./.:4:99,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:28,8:.:-1.17:1.000:. ./.:4:72,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:63,2:.: 0.24:0.999:. ./.:4:43,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:63,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.44:1.000:. ./.:4:77,7:.: 1.17:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:49,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:34,6:.:-0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.86:1.000:. ./.:3:43,0:.:-0.83:0.993:. ./.:4:80,5:.: 1.22:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:47,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,8:.:-0.05:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:60,10:.: 0.49:1.000:. ./.:4:72,11:.: 1.12:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,3:.:-2.20:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:58,7:.: 0.24:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.39:1.000:. ./.:6:47,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:76,9:.: 1.22:1.000:. ./.:4:37,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:79,3:.: 1.07:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:66,6:.: 0.58:1.000:. ./.:4:63,7:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,3:.: 2.78:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,8:.: 0.14:1.000:. ./.:4:23,3:.:-1.66:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:39,3:.:-0.88:1.000:. ./.:6:60,3:.: 0.14:0.990:. ./.:4:56,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:72,3:.: 0.73:1.000:. ./.:5:48,5:.:-0.34:0.928:. ./.:4:53,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:63,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:54,4:.:-0.10:0.976:. ./.:4:80,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:55,8:.: 0.14:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:93,3:.: 1.76:1.000:. ./.:4:80,6:.: 1.27:1.000:. ./.:4:53,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:70,3:.: 0.63:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:83,4:.: 1.32:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:115,3:.: 2.83:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:89,5:.: 1.66:1.000:. ./.:4:72,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,4:.:-0.78:1.000:. ./.:2:57,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:90,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:94,7:.: 2.00:1.000:. ./.:4:84,4:.: 1.37:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:52,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.15:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:73,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:51,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:71,4:.: 0.73:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:57,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:104,6:.: 2.44:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.93:0.923:. ./.:4:24,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:60,4:.: 0.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:91,5:.: 1.76:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:66,9:.: 0.73:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:48,5:.:-0.34:1.000:. ./.:4:57,5:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,6:.: 1.32:1.000:. ./.:4:34,2:.:-1.17:1.000:. ./.:3:60,1:.: 0.05:0.998:. ./.:4:45,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:61,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:31,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:79,5:.: 1.17:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,4:.: 0.19:1.000:. ./.:5:63,3:.: 0.29:0.999:. ./.:4:77,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:47,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:51,7:.:-0.10:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.73:1.000:. ./.:6:93,3:.: 1.76:0.997:. ./.:4:45,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:64,5:.: 0.44:1.000:. ./.:4:59,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,3:.: 1.17:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:89,13:.: 2.05:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:52,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.37:1.000:. ./.:2:52,5:.:-0.15:1.000:. ./.:2:55,7:.: 0.10:0.992:. ./.:4:57,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.56:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.10:1.000:. -chr3.1 19592330 chr3.1_019592330 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:65,0:.: 1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-2.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.17:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-2.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.: 1.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:80,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-2.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:28,0:.:-1.08:0.928:. ./.:4:51,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./.:2:59,0:.: 0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-1.21:0.923:. ./.:4:32,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.: 1.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:48,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:48,0:.: 0.17:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:2:64,0:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr3.1 19665408 chr3.1_019665408 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,7:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,6:.: 1.11:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,1:.: 1.94:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:9,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.84:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:10,5:.: 2.22:0.999:. ./.:4:9,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,5:.: 0.83:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.67:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.67:0.993:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:7,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:8,3:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,3:.: 1.94:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:12,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:12,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:8,4:.: 1.39:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:3,7:.: 0.83:1.000:. ./.:6:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:8,3:.: 1.11:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:9,5:.: 1.94:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:10,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:7,4:.: 1.11:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,2:.: 3.33:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:9,3:.: 1.39:1.000:. ./.:6:9,0:.: 0.55:0.990:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.55:1.000:. ./.:5:3,0:.:-1.12:0.928:. ./.:4:3,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:10,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.83:0.976:. ./.:4:9,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:7,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:2:4,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:9,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:8,3:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.84:0.923:. ./.:4:7,4:.: 1.11:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,1:.: 1.39:1.000:. ./.:3:0,3:.:-1.12:0.998:. ./.:4:7,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,6:.: 3.05:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,5:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:5:3,6:.: 0.55:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.39:1.000:. ./.:6:10,0:.: 0.83:0.997:. ./.:4:6,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.84:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:9,3:.: 1.39:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:10,2:.: 1.39:1.000:. ./.:2:1,1:.:-1.39:1.000:. ./.:2:2,2:.:-0.84:0.992:. ./.:4:7,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.39:1.000:. -chr3.1 20093449 chr3.1_020093449 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:80,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.16:0.999:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.90:0.999:. ./.:4:66,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.13:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.55:0.993:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:96,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.27:1.000:. ./.:6:38,0:.:-0.62:0.990:. ./.:4:68,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.04:1.000:. ./.:5:45,0:.:-0.25:0.928:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.30:0.976:. ./.:4:50,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:124,0:.: 3.89:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.35:1.000:. ./.:2:60,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:0.923:. ./.:4:62,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.32:1.000:. ./.:3:62,0:.: 0.64:0.998:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.41:1.000:. ./.:5:34,0:.:-0.83:0.999:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.35:1.000:. ./.:2:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:2:61,0:.: 0.59:0.992:. ./.:4:74,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.15:1.000:. -chr3.1 20356815 chr3.1_020356815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 6.08:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.44:-0.07:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0:2:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.44:-0.07:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.07:0.923:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr3.1 20401615 chr3.1_020401615 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.99:0.999:. ./.:4:37,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.71:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.40:1.000:. ./.:6:10,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:13,0:.:-0.11:0.990:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.17:1.000:. ./.:5:12,0:.:-0.23:0.928:. ./.:4:9,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:0.976:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.35:1.000:. ./.:2:9,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:0.923:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./.:3:8,0:.:-0.70:0.998:. ./.:4:28,0:.: 1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.94:1.000:. ./.:5:18,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:15,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.41:1.000:. ./.:2:9,0:.:-0.58:1.000:. ./.:2:10,0:.:-0.46:0.992:. ./.:4:28,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.41:1.000:. -chr3.1 20614448 chr3.1_020614448 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:47,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:67,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.26:0.999:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.44:0.993:. ./.:4:42,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:6:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:6:25,0:.:-0.21:0.990:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.20:1.000:. ./.:5:7,0:.:-1.26:0.928:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:0.976:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.68:1.000:. ./.:2:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:76,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:50,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.62:0.923:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:82,0:.: 3.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.21:1.000:. ./.:5:52,0:.: 1.38:0.999:. ./.:4:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.85:1.000:. ./.:2:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:2:31,0:.: 0.15:0.992:. ./.:4:60,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.97:1.000:. -chr3.1 20706777 chr3.1_020706777 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:303,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:105,1:.:-1.83:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:321,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:301,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.26:1.000:. ./.:3:10,0:.:-3.16:0.993:. ./.:4:247,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:185,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:317,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:329,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:301,1:.: 0.87:1.000:. ./.:6:241,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:309,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.14:1.000:. ./.:6:205,0:.:-0.47:0.990:. ./.:4:313,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.79:1.000:. ./.:5:406,1:.: 2.31:0.928:. ./.:4:310,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.39:0.976:. ./.:4:184,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:148,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.43:1.000:. ./.:2:240,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:283,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.67:0.993:. ./.:4:264,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.12:1.000:. ./.:5:176,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:243,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:258,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:258,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:258,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:299,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.04:1.000:. ./.:2:198,0:.:-0.57:1.000:. ./.:2:260,0:.: 0.29:0.992:. ./.:4:323,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.28:1.000:. -chr3.1 20822805 chr3.1_020822805 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:229,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.69:0.999:. ./.:4:104,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:263,2:.: 2.58:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:95,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:244,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:15,0:.:-2.46:0.993:. ./.:4:165,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.49:1.000:. ./.:6:117,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.77:1.000:. ./.:6:94,1:.:-0.85:0.990:. ./.:4:199,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:5:126,0:.:-0.22:0.928:. ./.:4:132,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.15:0.976:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.47:1.000:. ./.:2:111,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:229,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.70:0.993:. ./.:4:94,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:261,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:212,1:.: 1.53:1.000:. ./.:5:126,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:168,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:73,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:134,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.93:1.000:. ./.:2:100,0:.:-0.75:1.000:. ./.:2:224,0:.: 1.75:0.992:. ./.:4:196,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.57:1.000:. -chr3.1 21290180 chr3.1_021290180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.72:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.56:0.999:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:3:5,0:.:-1.41:0.993:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:26,1:.: 2.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:6:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:6:14,0:.: 0.00:0.990:. ./.:4:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:5:25,0:.: 1.72:0.928:. ./.:4:23,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:0.976:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:2:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.41:0.993:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:5:12,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:23,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:2:7,0:.:-1.10:1.000:. ./.:2:6,0:.:-1.25:0.992:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.88:1.000:. -chr3.1 21907485 chr3.1_021907485 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:265,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.13:0.999:. ./.:4:229,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.44:0.999:. ./.:4:195,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.95:1.000:. ./.:3:30,0:.:-2.74:0.993:. ./.:4:216,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.54:1.000:. ./.:6:197,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.99:1.000:. ./.:6:285,0:.: 1.66:0.990:. ./.:4:211,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:5:182,0:.:-0.12:0.928:. ./.:4:153,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.74:0.976:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:261,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:218,1:.: 0.52:1.000:. ./.:2:209,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:151,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.17:0.993:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.13:1.000:. ./.:5:131,0:.:-1.00:0.999:. ./.:4:277,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:315,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.19:1.000:. ./.:2:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:2:233,0:.: 0.77:0.992:. ./.:4:156,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.65:1.000:. -chr3.1 21987096 chr3.1_021987096 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:0.999:. ./.:4:101,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.78:0.999:. ./.:4:109,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.60:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.83:0.993:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:140,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:36,0:.:-0.90:0.990:. ./.:4:65,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.09:1.000:. ./.:5:60,0:.:-0.22:0.928:. ./.:4:115,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.18:0.976:. ./.:4:70,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.61:1.000:. ./.:2:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.33:0.993:. ./.:4:29,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:177,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:140,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:179,0:.: 3.15:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.10:1.000:. ./.:5:122,0:.: 1.54:0.999:. ./.:4:2,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.36:1.000:. ./.:2:60,0:.:-0.22:1.000:. ./.:2:2,0:.:-1.86:0.992:. ./.:4:129,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. -chr3.1 22338664 chr3.1_022338664 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.: 0.18:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,15:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.: 1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,10:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,18:.: 2.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,15:.: 1.13:1.000:. ./.:6:0,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,4:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,20:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,17:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:0,19:.: 2.09:0.928:. ./.:4:1,13:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,17:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,15:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,4:.:-1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.: 2.33:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.:-1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,9:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:2:0,9:.:-0.30:1.000:. ./.:2:0,11:.: 0.18:0.992:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,4:.:-1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr3.1 22503573 chr3.1_022503573 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:139,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.03:0.999:. ./.:4:85,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.14:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:176,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:190,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.05:1.000:. ./.:6:129,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:127,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:223,0:.: 3.16:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:136,0:.: 0.75:0.990:. ./.:4:110,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.22:1.000:. ./.:5:127,0:.: 0.50:0.928:. ./.:4:73,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:0.976:. ./.:4:123,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.30:1.000:. ./.:2:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.44:0.993:. ./.:4:132,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.06:1.000:. ./.:5:94,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.64:1.000:. ./.:2:79,0:.:-0.83:1.000:. ./.:2:129,0:.: 0.56:0.992:. ./.:4:116,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:176,1:.: 1.89:1.000:. -chr3.1 22654519 chr3.1_022654519 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:353,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,131:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:178,184:0.54: 0.07:1.000:0.985 0/0/0/1:4:374,83:0.19: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,193:0.68:-0.68:1.000:0.960 0/0/1/1:4:300,165:0.39: 1.05:1.000:0.638 0/0/1/1:4:81,80:0.53:-1.85:1.000:0.990 0/0/0/1:4:245,66:0.22:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,158:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,30:0.41:-2.62:1.000:0.855 0/0/0/1:4:108,53:0.36:-1.85:1.000:0.734 0/0/1/1:4:226,152:0.44: 0.22:1.000:0.967 0/0/0/1:4:241,73:0.25:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:269,155:0.40: 0.66:1.000:0.771 0/0/1/1:4:238,138:0.40: 0.20:1.000:0.786 0/0/1/1:4:201,236:0.57: 0.78:1.000:0.948 0/0/1/1:4:218,270:0.58: 1.27:0.999:0.914 0/0/1/1:4:232,145:0.42: 0.21:1.000:0.913 0/0/1/1:4:321,203:0.42: 1.61:1.000:0.925 0/0/0/0:4:397,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,45:0.54:-2.52:1.000:0.989 0/0/0/1:4:306,67:0.19: 0.17:0.999:1.000 0/0/1/1:4:236,139:0.40: 0.19:1.000:0.820 0/0/0/0:4:302,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,32:0.33:-2.40:1.000:0.899 0/0/1/1:4:194,280:0.61: 1.13:1.000:0.686 0/1/1/1:4:89,265:0.74:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,176:0.55:-0.16:1.000:0.976 0/0/1/1:4:183,235:0.59: 0.60:1.000:0.879 0/0/1/1:4:308,205:0.44: 1.51:1.000:0.962 0/0/0/0:4:440,1:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,176:0.54:-0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:40,31:0.48:-2.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:114,47:0.31:-1.85:1.000:0.968 0/1/1:3:24,37:0.62:-2.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,238:0.59: 0.62:1.000:0.858 0/0/1/1:4:199,255:0.59: 0.94:1.000:0.882 0/0/1/1:4:175,212:0.58: 0.31:1.000:0.930 0/0/1/1:4:352,222:0.42: 2.09:1.000:0.922 0/0/1/1:4:330,204:0.42: 1.71:1.000:0.900 0/0/1/1:4:166,174:0.55:-0.14:1.000:0.983 0/0/0/1:4:343,78:0.20: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:323,191:0.40: 1.52:1.000:0.828 0/0/0/1:4:240,84:0.28:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:285,150:0.37: 0.76:1.000:0.511 0/0/1/1:4:176,238:0.60: 0.56:1.000:0.811 0/0/1/1:4:193,239:0.58: 0.73:1.000:0.914 0/0/1/1:4:566,362:0.43: 5.46:1.000:0.935 0/0/0/1:4:232,113:0.35:-0.09:1.000:0.753 0/1/1/1:4:127,401:0.75: 1.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,111:0.48:-0.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:293,91:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,173:0.58:-0.43:1.000:0.897 0/0/0/1:4:271,141:0.37: 0.54:1.000:0.551 0/0/0/1:4:300,56:0.17: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:259,177:0.44: 0.77:1.000:0.973 0/0/1/1:4:165,191:0.57: 0.01:1.000:0.955 0/0/0/1:4:403,75:0.17: 1.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:273,59:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:197,75:0.29:-0.79:1.000:0.849 0/0/0/1:4:337,66:0.17: 0.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,193:0.75:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:234,172:0.46: 0.49:1.000:0.990 0/0/0/1:4:409,80:0.17: 1.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:356,60:0.15: 0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:268,147:0.38: 0.57:1.000:0.629 0/0/1/1:4:176,94:0.38:-0.81:1.000:0.540 0/0/1/1:4:243,131:0.38: 0.18:1.000:0.572 0/0/1/1:4:243,155:0.43: 0.41:1.000:0.933 0/0/0/1:4:292,124:0.32: 0.58:1.000:0.953 0/0/1/1:4:204,168:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,85:0.52:-1.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:170,260:0.62: 0.72:1.000:0.546 0/0/1/1:4:249,151:0.41: 0.43:1.000:0.873 0/0/0/1:4:287,54:0.17:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,124:0.40:-0.19:1.000:0.816 0/0/1/1:4:210,119:0.39:-0.25:1.000:0.727 0/0/1/1:4:240,131:0.38: 0.15:1.000:0.613 0/0/0/1:4:273,137:0.36: 0.52:1.000:0.669 0/0/1/1:4:282,167:0.41: 0.90:1.000:0.831 0/0/0/1/1/1:6:193,153:0.49:-0.09:0.990:0.878 0/0/0/1:4:272,67:0.21:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,249:0.60: 0.73:1.000:0.801 0/0/1/1:4:132,200:0.62:-0.22:1.000:0.570 0/0/0/1/1:5:390,256:0.43: 2.77:0.928:0.934 0/0/1/1:4:259,158:0.41: 0.59:1.000:0.882 0/1/1/1:4:57,154:0.72:-1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,155:0.59:-0.74:1.000:0.891 0/0/1/1:4:241,133:0.39: 0.18:1.000:0.649 0/0/1/1:4:137,198:0.61:-0.19:1.000:0.683 0/0/1/1:4:177,109:0.42:-0.66:0.976:0.895 0/1/1/1:4:73,194:0.72:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,225:0.60: 0.30:1.000:0.753 0/1/1/1:4:85,161:0.66:-1.04:1.000:0.882 0/0/0/0:4:344,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,160:0.53:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:137,181:0.59:-0.35:1.000:0.845 0/0/1/1:4:222,208:0.52: 0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:213,145:0.44: 0.03:1.000:0.972 0/0/0/1:4:286,103:0.28: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,78:0.42:-1.47:1.000:0.927 0/0/1/1:4:146,220:0.62: 0.11:1.000:0.584 0/0/1/1:4:120,176:0.61:-0.56:1.000:0.649 0/0/0/1:4:199,102:0.37:-0.51:1.000:0.601 0/0/0/1:4:262,127:0.35: 0.32:1.000:0.766 0/0/1/1:4:151,132:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,207:0.59: 0.11:1.000:0.864 0/0/1/1:4:183,252:0.60: 0.76:1.000:0.780 0/1:2:104,255:0.71: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,67:0.19: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:224,134:0.41: 0.03:1.000:0.850 0/1/1/1:4:106,417:0.78: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,111:0.47:-0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:253,147:0.40: 0.43:1.000:0.791 0/0/0/1:4:223,60:0.22:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,58:0.26:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:269,46:0.15:-0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:158,125:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:241,65:0.22:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,178:0.72:-1.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,285:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:249,128:0.37: 0.21:1.000:0.592 0/1/1/1:4:73,262:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,219:0.71:-0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:161,211:0.59: 0.16:1.000:0.855 0/0/0/1:4:278,130:0.34: 0.51:1.000:0.843 0/0/1/1:4:218,118:0.38:-0.18:1.000:0.585 0/0/1/1:4:229,209:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:205,54:0.22:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,49:0.19:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,115:0.42:-0.56:1.000:0.929 0/0/1/1:4:194,158:0.49:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,92:0.51:-1.52:0.993:0.996 0/0/1/1:4:159,235:0.62: 0.37:1.000:0.631 0/0/1/1:4:148,210:0.61: 0.03:1.000:0.723 0/0/0/1:4:338,165:0.35: 1.41:1.000:0.748 0/0/0/1:4:357,89:0.21: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,125:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:203,99:0.35:-0.50:1.000:0.750 0/0/0/1:4:205,107:0.37:-0.41:1.000:0.540 0/1/1/1:4:94,275:0.74: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:207,48:0.20:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,182:0.55:-0.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:121,94:0.48:-1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,168:0.54:-0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:304,182:0.41: 1.25:1.000:0.851 0/0/0/1:4:370,69:0.17: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,121:0.48:-0.74:1.000:0.995 0/0/0/0:4:381,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,134:0.45:-0.26:1.000:0.977 0/0/1/1:4:199,281:0.61: 1.19:1.000:0.733 0/0/1/1:4:265,148:0.39: 0.55:1.000:0.686 0/0/1/1:4:63,39:0.42:-2.41:1.000:0.901 0/0/1/1:4:80,80:0.54:-1.86:1.000:0.989 0/1/1/1:4:93,323:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,214:0.71:-0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:303,104:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:285,142:0.36: 0.69:1.000:0.691 0/0/0/1/1:5:139,99:0.46:-1.11:0.999:0.854 0/0/1/1:4:183,231:0.58: 0.56:1.000:0.897 0/0/1/1:4:135,114:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,163:0.59:-0.61:1.000:0.888 0/0/1/1:4:156,237:0.62: 0.36:1.000:0.563 0/0/0/1:4:286,147:0.37: 0.74:1.000:0.592 0/0/1/1:4:270,159:0.40: 0.71:1.000:0.820 0/0/0/1:4:234,58:0.21:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,87:0.29:-0.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:159,288:0.65: 0.88:1.000:0.826 0/0/0/1:4:245,116:0.35: 0.06:1.000:0.819 0/0/0/0:4:311,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,57:0.19:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,113:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,124:0.48:-0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:139,182:0.59:-0.32:1.000:0.856 0/0/0/1:4:233,78:0.27:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:200,124:0.42:-0.29:1.000:0.903 0/0/1/1:4:349,202:0.40: 1.87:1.000:0.782 0/0/0/1:4:330,158:0.35: 1.27:1.000:0.795 0/0/1/1:4:264,143:0.38: 0.50:1.000:0.588 0/0/1/1:4:216,161:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/1:2:182,126:0.45:-0.45:1.000:1.000 0/1:2:200,186:0.52: 0.30:0.992:1.000 0/0/1/1:4:177,157:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:203,65:0.26:-0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:236,126:0.38: 0.07:1.000:0.539 -chr3.1 23421160 chr3.1_023421160 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:40,48:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,60:0.81:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,57:0.61: 0.26:1.000:0.644 0/0/1/1:4:40,50:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,36:0.34: 1.42:1.000:0.895 0/0/1/1:4:45,60:0.52: 1.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,45:0.75:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,76:0.73: 0.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,73:0.69: 0.84:1.000:0.970 0/1/1/1:4:3,12:0.75:-2.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,12:0.50:-2.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,63:0.73: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,57:0.62: 0.21:1.000:0.546 0/0/1/1:4:40,51:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,79:0.77: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,53:0.48: 0.93:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,34:0.33: 1.24:0.999:0.918 0/0/1/1:4:53,67:0.51: 1.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,30:0.31: 1.11:1.000:0.974 0/0/1/1:4:43,61:0.54: 1.06:1.000:0.988 0/0/0/1:4:12,2:0.18:-2.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,46:0.50: 0.17:0.999:0.997 0/0/1/1:4:45,56:0.51: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,34:0.44:-0.28:1.000:0.960 0/0/1/1:4:9,10:0.48:-2.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,94:0.75: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,27:0.27: 1.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,39:0.44: 0.17:1.000:0.966 0/1/1/1:4:21,77:0.74: 0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,52:0.54: 0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,65:0.62: 0.75:1.000:0.552 0/0/1/1:4:33,47:0.54:-0.01:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,21:0.70:-2.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:19,3:0.17:-2.59:1.000:0.998 0/1/1:3:2,8:0.75:-3.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,56:0.63: 0.13:1.000:0.508 0/0/0/1:4:60,32:0.35: 0.53:1.000:0.746 0/0/0/1:4:62,15:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,23:0.30: 0.21:1.000:0.986 0/0/0/1:4:76,23:0.27: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,36:0.45:-0.19:1.000:0.976 0/0/1/1:4:40,61:0.56: 0.93:1.000:0.973 0/1/1/1:4:28,65:0.65: 0.57:1.000:0.791 0/0/1/1:4:49,46:0.45: 0.66:1.000:0.983 0/0/0/1:4:67,23:0.29: 0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,46:0.45: 0.70:1.000:0.980 0/0/1/1:4:48,62:0.52: 1.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,74:0.53: 2.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,15:0.26:-0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,36:0.47:-0.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,32:0.51:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,53:0.46: 1.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:30,38:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,42:0.46: 0.26:1.000:0.986 0/0/1/1:4:45,51:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,49:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,28:0.36:-0.10:1.000:0.654 0/0/1/1:4:39,43:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,64:0.79:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:28,38:0.53:-0.63:1.000:0.845 0/0/1/1:4:26,52:0.62:-0.10:1.000:0.596 0/0/1/1:4:38,50:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,42:0.53:-0.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,67:0.84:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,48:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,74:0.81: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,28:0.49:-1.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,51:0.78:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,19:0.35:-1.12:1.000:0.764 0/1/1/1:4:10,70:0.84:-0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,27:0.37:-0.37:1.000:0.503 0/0/1/1:4:20,30:0.55:-1.35:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,40:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,36:0.46:-0.28:1.000:0.985 0/0/0/1:4:38,17:0.33:-1.12:1.000:0.934 0/0/0/1:4:50,19:0.30:-0.50:1.000:0.983 0/1/1/1:4:12,70:0.82: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,79:0.77: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,30:0.34: 0.57:1.000:0.890 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,19:0.33:-0.86:1.000:0.927 0/0/1/1:4:47,32:0.40:-0.05:1.000:0.758 0/1/1/1:4:16,87:0.81: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:33,48:0.54: 0.04:0.928:0.856 0/0/1/1:4:30,49:0.57:-0.05:1.000:0.941 0/0/1/1:4:22,33:0.55:-1.12:1.000:0.978 0/0/1/1:4:21,31:0.55:-1.26:1.000:0.982 0/0/0/1:4:50,19:0.30:-0.50:1.000:0.983 0/0/1/1:4:30,54:0.59: 0.17:1.000:0.835 0/1/1/1:4:12,48:0.75:-0.90:0.976:0.999 0/0/1/1:4:26,47:0.60:-0.32:1.000:0.828 0/0/1/1:4:42,59:0.54: 0.93:1.000:0.990 0/0/1/1:4:23,45:0.61:-0.54:1.000:0.656 0/0/1/1:4:40,39:0.46:-0.05:1.000:0.988 0/1/1/1:4:24,53:0.64:-0.14:1.000:0.681 0/0/1/1:4:25,37:0.55:-0.81:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,41:0.56:-0.59:1.000:0.961 0/0/1/1:4:46,58:0.51: 1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,26:0.74:-2.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,76:0.79: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,29:0.57:-1.48:1.000:0.950 0/1/1/1:4:12,75:0.83: 0.30:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,53:0.74:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,61:0.71:-0.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,54:0.73:-0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,55:0.58: 0.35:1.000:0.927 0/1:2:64,35:0.36: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,86:0.75: 1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,74:0.81: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,65:0.54: 1.33:1.000:0.986 0/0/1/1:4:31,46:0.55:-0.14:1.000:0.981 0/0/1/1:4:36,38:0.48:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:9,46:0.80:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,37:0.64:-1.17:1.000:0.644 0/0/1/1:4:38,25:0.39:-0.77:1.000:0.696 0/0/1/1:4:37,43:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,11:0.25:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,39:0.46:-0.01:1.000:0.985 0/1/1/1:4:18,68:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,36:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,20:0.30:-0.28:1.000:0.986 0/0/0/1:4:38,20:0.35:-0.99:1.000:0.768 0/0/1/1:4:41,58:0.54: 0.84:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,44:0.61:-0.59:1.000:0.713 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,55:0.79:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,47:0.80:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,37:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,84:0.82: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,18:0.48:-2.01:0.993:0.994 0/0/1/1:4:56,36:0.39: 0.53:1.000:0.649 0/1/1/1:4:16,70:0.77: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,33:0.32: 1.33:1.000:0.954 0/1/1/1:4:20,74:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,38:0.71:-1.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,31:0.52:-1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,58:0.79:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,37:0.54:-0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:28,41:0.55:-0.50:1.000:0.983 0/1/1/1:4:25,59:0.65: 0.17:1.000:0.821 0/0/1/1:4:16,28:0.59:-1.61:1.000:0.876 0/1/1/1:4:14,96:0.84: 1.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,35:0.36: 0.79:1.000:0.670 0/0/1/1:4:39,71:0.60: 1.33:1.000:0.816 0/0/1/1:4:37,48:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,60:0.51: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,53:0.60: 0.08:1.000:0.809 0/0/0/1:4:86,32:0.30: 1.69:1.000:0.986 0/0/1/1:4:48,46:0.46: 0.62:1.000:0.986 0/0/0/1:4:17,2:0.13:-2.73:1.000:0.902 0/0/1/1:4:25,44:0.59:-0.50:1.000:0.869 0/0/1/1:4:32,41:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,75:0.59: 1.64:1.000:0.848 0/0/1/1:4:50,73:0.55: 1.91:1.000:0.984 0/0/1/1:4:42,41:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/1/1/1/1:5:16,77:0.78: 0.57:0.999:0.989 0/0/1/1:4:48,61:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,25:0.30: 0.44:1.000:0.981 0/1/1/1:4:16,69:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,77:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,62:0.58: 0.84:1.000:0.922 0/0/1/1:4:37,43:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,65:0.58: 1.06:1.000:0.927 0/0/1/1:4:28,38:0.53:-0.63:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,104:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,52:0.47: 1.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,39:0.47:-0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,76:0.81: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,29:0.37:-0.05:1.000:0.579 0/1/1/1:4:18,73:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,66:0.62: 0.79:1.000:0.508 0/1/1/1:4:20,44:0.64:-0.72:1.000:0.672 0/1/1/1:4:18,67:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,90:0.72: 1.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,59:0.54: 0.88:1.000:0.986 0/0/1/1:4:27,34:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,71:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1:2:55,27:0.34: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,38:0.38: 0.93:1.000:0.509 0/0/0/1:4:62,26:0.32: 0.35:1.000:0.961 0/0/0/1:4:45,21:0.33:-0.63:1.000:0.907 0/1/1/1:4:21,80:0.74: 0.93:1.000:0.999 -chr3.1 23567227 chr3.1_023567227 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:314,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:226,61:.: 0.87:1.000:. ./.:4:183,57:.: 0.00:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:241,87:.: 1.63:1.000:. ./.:4:121,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:124,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:72,20:.:-2.73:1.000:. ./.:4:168,58:.:-0.26:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:159,55:.:-0.48:1.000:. ./.:4:164,68:.:-0.15:1.000:. ./.:4:209,66:.: 0.65:1.000:. ./.:4:184,76:.: 0.37:0.999:. ./.:4:245,77:.: 1.52:1.000:. ./.:4:239,79:.: 1.44:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:75,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:196,57:.: 0.24:0.999:. ./.:4:202,81:.: 0.80:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,15:.:-3.01:1.000:. ./.:4:225,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:212,80:.: 0.96:1.000:. ./.:4:240,74:.: 1.37:1.000:. ./.:4:208,62:.: 0.55:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:40,0:.:-3.69:1.000:. ./.:4:92,17:.:-2.42:1.000:. ./.:3:32,27:.:-3.34:1.000:. ./.:4:201,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:175,57:.:-0.15:1.000:. ./.:4:172,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:180,55:.:-0.09:1.000:. ./.:4:222,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:232,66:.: 1.07:1.000:. ./.:4:171,68:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,61:.: 0.07:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:203,61:.: 0.44:1.000:. ./.:4:228,71:.: 1.09:1.000:. ./.:4:205,91:.: 1.04:1.000:. ./.:4:28,24:.:-3.47:1.000:. ./.:4:160,39:.:-0.76:1.000:. ./.:4:130,46:.:-1.18:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:194,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:210,60:.: 0.55:1.000:. ./.:4:191,56:.: 0.13:1.000:. ./.:4:184,41:.:-0.28:1.000:. ./.:4:172,65:.:-0.05:1.000:. ./.:4:201,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:197,68:.: 0.46:1.000:. ./.:6:208,41:.: 0.17:1.000:. ./.:4:174,65:.:-0.02:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:181,58:.:-0.02:1.000:. ./.:4:201,68:.: 0.54:1.000:. ./.:4:191,71:.: 0.41:1.000:. ./.:4:108,34:.:-1.81:1.000:. ./.:4:183,64:.: 0.13:1.000:. ./.:4:180,50:.:-0.18:1.000:. ./.:4:130,117:.: 0.13:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:215,64:.: 0.72:1.000:. ./.:4:202,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:167,77:.: 0.07:1.000:. ./.:4:179,52:.:-0.17:1.000:. ./.:4:153,48:.:-0.72:1.000:. ./.:4:200,80:.: 0.74:1.000:. ./.:4:215,69:.: 0.81:1.000:. ./.:4:207,65:.: 0.59:1.000:. ./.:4:86,97:.:-1.05:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:225,72:.: 1.05:1.000:. ./.:4:183,45:.:-0.22:1.000:. ./.:5:151,93:.: 0.07:0.928:. ./.:4:213,57:.: 0.55:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:171,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:175,45:.:-0.37:1.000:. ./.:4:191,64:.: 0.28:1.000:. ./.:4:159,47:.:-0.63:0.976:. ./.:4:256,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:224,55:.: 0.72:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:162,70:.:-0.15:1.000:. ./.:4:100,95:.:-0.83:1.000:. ./.:4:182,68:.: 0.19:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:120,29:.:-1.68:1.000:. ./.:4:189,63:.: 0.22:1.000:. ./.:4:135,36:.:-1.27:1.000:. ./.:4:201,73:.: 0.63:1.000:. ./.:4:186,61:.: 0.13:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:164,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:193,60:.: 0.24:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:195,62:.: 0.31:1.000:. ./.:4:260,88:.: 2.00:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:203,61:.: 0.44:1.000:. ./.:4:118,45:.:-1.42:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:139,53:.:-0.89:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:213,64:.: 0.68:1.000:. ./.:4:147,50:.:-0.79:1.000:. ./.:4:214,65:.: 0.72:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:198,59:.: 0.31:1.000:. ./.:4:203,64:.: 0.50:1.000:. ./.:4:194,67:.: 0.39:1.000:. ./.:4:114,95:.:-0.57:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:147,43:.:-0.92:1.000:. ./.:4:196,72:.: 0.52:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.46:0.993:. ./.:4:190,66:.: 0.30:1.000:. ./.:4:194,74:.: 0.52:1.000:. ./.:4:236,87:.: 1.53:1.000:. ./.:4:228,61:.: 0.91:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:164,68:.:-0.15:1.000:. ./.:4:182,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:215,59:.: 0.63:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:160,53:.:-0.50:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:227,88:.: 1.39:1.000:. ./.:4:198,72:.: 0.55:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:181,58:.:-0.02:1.000:. ./.:4:233,81:.: 1.37:1.000:. ./.:4:195,69:.: 0.44:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:173,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:212,67:.: 0.72:1.000:. ./.:5:241,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:200,80:.: 0.74:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:170,53:.:-0.31:1.000:. ./.:4:198,51:.: 0.17:1.000:. ./.:4:200,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:151,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:215,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:117,127:.: 0.07:1.000:. ./.:4:190,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:156,42:.:-0.77:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:149,69:.:-0.41:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:170,50:.:-0.37:1.000:. ./.:4:229,72:.: 1.13:1.000:. ./.:4:217,56:.: 0.61:1.000:. ./.:4:228,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:188,63:.: 0.20:1.000:. ./.:5:261,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:161,44:.:-0.65:1.000:. ./.:4:215,73:.: 0.89:1.000:. -chr3.1 23630612 chr3.1_023630612 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,39:.:-0.56:1.000:. ./.:4:101,8:.: 0.86:1.000:. ./.:4:66,33:.: 0.52:1.000:. ./.:4:81,28:.: 0.86:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.73:1.000:. ./.:4:63,77:.: 1.92:1.000:. ./.:4:31,22:.:-1.04:1.000:. ./.:4:25,44:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,61:.: 0.46:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.47:1.000:. ./.:4:28,15:.:-1.38:1.000:. ./.:4:92,18:.: 0.90:1.000:. ./.:4:32,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,32:.: 0.01:1.000:. ./.:4:75,24:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,46:.: 0.05:1.000:. ./.:4:94,22:.: 1.10:0.999:. ./.:4:111,17:.: 1.51:1.000:. ./.:4:84,54:.: 1.85:1.000:. ./.:4:31,60:.: 0.25:1.000:. ./.:4:20,3:.:-2.06:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.42:0.999:. ./.:4:83,42:.: 1.41:1.000:. ./.:4:37,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:108,36:.: 2.05:1.000:. ./.:4:88,13:.: 0.59:1.000:. ./.:4:57,36:.: 0.32:1.000:. ./.:4:92,36:.: 1.51:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.86:1.000:. ./.:4:48,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:78,35:.: 1.00:1.000:. ./.:4:5,5:.:-2.50:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.99:1.000:. ./.:3:10,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:76,16:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,19:.: 0.49:1.000:. ./.:4:60,12:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,12:.: 0.52:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.73:1.000:. ./.:4:32,24:.:-0.94:1.000:. ./.:4:74,33:.: 0.80:1.000:. ./.:4:111,27:.: 1.85:1.000:. ./.:4:70,28:.: 0.49:1.000:. ./.:4:84,12:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,39:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:46,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:80,26:.: 0.76:1.000:. ./.:4:105,12:.: 1.14:1.000:. ./.:4:29,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:45,24:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,14:.:-1.41:1.000:. ./.:4:29,46:.:-0.29:1.000:. ./.:4:89,29:.: 1.17:1.000:. ./.:4:50,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:47,12:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,24:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,38:.:-0.26:1.000:. ./.:6:49,16:.:-0.63:1.000:. ./.:4:48,23:.:-0.43:1.000:. ./.:4:50,15:.:-0.63:1.000:. ./.:4:44,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,19:.:-1.18:1.000:. ./.:4:89,35:.: 1.37:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.87:1.000:. ./.:4:63,9:.:-0.39:1.000:. ./.:4:60,25:.: 0.05:1.000:. ./.:4:81,31:.: 0.97:1.000:. ./.:4:85,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,11:.: 0.32:1.000:. ./.:4:38,15:.:-1.04:1.000:. ./.:4:134,11:.: 2.09:1.000:. ./.:4:92,14:.: 0.76:1.000:. ./.:4:109,17:.: 1.44:1.000:. ./.:4:94,28:.: 1.31:1.000:. ./.:4:86,24:.: 0.90:1.000:. ./.:4:30,39:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,34:.:-0.50:1.000:. ./.:4:75,30:.: 0.73:1.000:. ./.:4:71,15:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,28:.:-0.77:1.000:. ./.:4:41,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:53,6:.:-0.84:1.000:. ./.:5:90,32:.: 1.31:0.928:. ./.:4:30,44:.:-0.33:1.000:. ./.:4:23,25:.:-1.21:1.000:. ./.:4:43,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:54,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,34:.:-0.60:1.000:. ./.:4:39,25:.:-0.67:0.976:. ./.:4:31,21:.:-1.07:1.000:. ./.:4:75,32:.: 0.80:1.000:. ./.:4:34,29:.:-0.70:1.000:. ./.:4:39,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:33,53:.: 0.08:1.000:. ./.:4:35,14:.:-1.18:1.000:. ./.:4:71,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:21,30:.:-1.11:1.000:. ./.:4:66,33:.: 0.52:1.000:. ./.:4:23,40:.:-0.70:1.000:. ./.:4:85,32:.: 1.14:1.000:. ./.:4:47,27:.:-0.33:1.000:. ./.:4:50,27:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,25:.:-1.11:1.000:. ./.:4:22,45:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,30:.: 0.46:1.000:. ./.:4:105,17:.: 1.31:1.000:. ./.:4:36,51:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,42:.:-0.84:1.000:. ./.:4:101,26:.: 1.48:1.000:. ./.:4:25,21:.:-1.28:1.000:. ./.:4:70,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:30,22:.:-1.07:1.000:. ./.:4:37,10:.:-1.24:1.000:. ./.:4:47,19:.:-0.60:1.000:. ./.:4:25,23:.:-1.21:1.000:. ./.:4:57,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:50,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:54,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:23,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:69,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:56,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:41,30:.:-0.43:1.000:. ./.:4:23,36:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,11:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,26:.:-1.24:1.000:. ./.:4:16,39:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,46:.:-0.19:1.000:. ./.:4:41,35:.:-0.26:1.000:. ./.:4:38,18:.:-0.94:0.993:. ./.:4:36,12:.:-1.21:1.000:. ./.:4:70,12:.:-0.05:1.000:. ./.:4:91,44:.: 1.75:1.000:. ./.:4:40,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:24,18:.:-1.41:1.000:. ./.:4:19,24:.:-1.38:1.000:. ./.:4:50,15:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:23,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:73,36:.: 0.86:1.000:. ./.:4:27,18:.:-1.31:1.000:. ./.:4:49,58:.: 0.80:1.000:. ./.:4:94,59:.: 2.36:1.000:. ./.:4:63,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:68,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:46,51:.: 0.46:1.000:. ./.:4:24,10:.:-1.69:1.000:. ./.:4:75,13:.: 0.15:1.000:. ./.:4:46,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:24,2:.:-1.96:1.000:. ./.:4:61,27:.: 0.15:1.000:. ./.:4:97,14:.: 0.93:1.000:. ./.:4:40,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:39,65:.: 0.69:1.000:. ./.:4:44,35:.:-0.16:1.000:. ./.:5:32,58:.: 0.22:0.999:. ./.:4:79,31:.: 0.90:1.000:. ./.:4:27,36:.:-0.70:1.000:. ./.:4:68,39:.: 0.80:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.66:1.000:. ./.:4:34,57:.: 0.25:1.000:. ./.:4:127,18:.: 2.09:1.000:. ./.:4:89,22:.: 0.93:1.000:. ./.:4:20,29:.:-1.18:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:41,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:26,52:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:49,24:.:-0.36:1.000:. ./.:4:44,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,26:.:-0.94:1.000:. ./.:4:38,28:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:95,40:.: 1.75:1.000:. ./.:4:36,68:.: 0.69:1.000:. ./.:4:51,65:.: 1.10:1.000:. ./.:4:42,21:.:-0.70:1.000:. ./.:5:90,45:.: 1.75:1.000:. ./.:4:107,23:.: 1.58:1.000:. ./.:4:33,43:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,46:.: 1.41:1.000:. ./.:4:112,13:.: 1.41:1.000:. -chr3.1 23935665 chr3.1_023935665 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:208,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:116,39:.:-0.10:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:77,38:.:-0.89:1.000:. ./.:4:172,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:101,20:.:-0.77:1.000:. ./.:4:139,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:84,31:.:-0.89:1.000:. ./.:4:38,4:.:-2.35:1.000:. ./.:4:66,9:.:-1.69:1.000:. ./.:4:177,18:.: 0.70:1.000:. ./.:4:175,24:.: 0.78:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:170,23:.: 0.66:1.000:. ./.:4:135,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:154,10:.: 0.08:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:214,24:.: 1.56:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:53,5:.:-2.03:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.60:0.999:. ./.:4:211,16:.: 1.34:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:101,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:127,13:.:-0.39:1.000:. ./.:4:109,32:.:-0.37:1.000:. ./.:4:119,41:.: 0.00:1.000:. ./.:4:173,15:.: 0.56:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:107,42:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,7:.:-2.45:1.000:. ./.:4:87,8:.:-1.29:1.000:. ./.:3:26,1:.:-2.64:1.000:. ./.:4:112,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:140,22:.: 0.04:1.000:. ./.:4:172,23:.: 0.70:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:194,20:.: 1.08:1.000:. ./.:4:114,20:.:-0.51:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:218,10:.: 1.36:1.000:. ./.:4:143,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:128,28:.:-0.08:1.000:. ./.:4:116,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:132,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:148,10:.:-0.04:1.000:. ./.:4:58,19:.:-1.65:1.000:. ./.:4:87,8:.:-1.29:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:92,10:.:-1.15:1.000:. ./.:4:192,19:.: 1.02:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:196,17:.: 1.06:1.000:. ./.:4:129,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.36:1.000:. ./.:6:168,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:51,25:.:-1.67:1.000:. ./.:4:123,24:.:-0.26:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:275,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:175,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:219,17:.: 1.52:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:154,23:.: 0.34:1.000:. ./.:4:72,8:.:-1.59:1.000:. ./.:4:140,35:.: 0.30:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:265,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:175,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:162,14:.: 0.32:1.000:. ./.:4:176,15:.: 0.62:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:224,22:.: 1.72:1.000:. ./.:4:168,13:.: 0.42:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:138,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,18:.:-1.09:1.000:. ./.:5:269,8:.: 2.33:0.928:. ./.:4:182,26:.: 0.96:1.000:. ./.:4:50,40:.:-1.39:1.000:. ./.:4:118,37:.:-0.10:1.000:. ./.:4:162,17:.: 0.38:1.000:. ./.:4:112,14:.:-0.67:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.43:0.976:. ./.:4:49,21:.:-1.79:1.000:. ./.:4:144,35:.: 0.38:1.000:. ./.:4:39,22:.:-1.97:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:130,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:97,10:.:-1.05:1.000:. ./.:4:170,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:176,20:.: 0.72:1.000:. ./.:4:134,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:130,14:.:-0.32:1.000:. ./.:4:120,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:79,26:.:-1.09:1.000:. ./.:4:165,24:.: 0.58:1.000:. ./.:4:147,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:91,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:116,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:104,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,37:.:-1.17:1.000:. ./.:4:125,15:.:-0.39:1.000:. ./.:4:138,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:105,16:.:-0.77:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:124,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:163,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:56,36:.:-1.35:1.000:. ./.:4:49,26:.:-1.69:1.000:. ./.:4:164,15:.: 0.38:1.000:. ./.:4:75,25:.:-1.19:1.000:. ./.:4:78,28:.:-1.07:1.000:. ./.:4:135,14:.:-0.22:1.000:. ./.:4:191,12:.: 0.86:1.000:. ./.:4:165,21:.: 0.52:1.000:. ./.:4:181,25:.: 0.92:1.000:. ./.:4:108,7:.:-0.89:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:197,11:.: 0.96:1.000:. ./.:4:107,23:.:-0.59:1.000:. ./.:4:74,17:.:-1.37:0.993:. ./.:4:148,13:.: 0.02:1.000:. ./.:4:110,17:.:-0.65:1.000:. ./.:4:215,21:.: 1.52:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:86,16:.:-1.15:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:146,19:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,33:.:-1.39:1.000:. ./.:4:166,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:91,26:.:-0.85:1.000:. ./.:4:68,17:.:-1.49:1.000:. ./.:4:109,33:.:-0.35:1.000:. ./.:4:238,17:.: 1.89:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:102,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:145,23:.: 0.16:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,9:.:-2.27:1.000:. ./.:4:79,26:.:-1.09:1.000:. ./.:4:83,39:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,36:.:-1.51:1.000:. ./.:4:187,14:.: 0.82:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.06:1.000:. ./.:5:79,30:.:-1.01:0.999:. ./.:4:149,9:.:-0.04:1.000:. ./.:4:85,21:.:-1.07:1.000:. ./.:4:83,41:.:-0.71:1.000:. ./.:4:108,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:180,19:.: 0.78:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:159,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:109,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:80,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:134,20:.:-0.12:1.000:. ./.:4:135,20:.:-0.10:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:198,30:.: 1.36:1.000:. ./.:4:160,19:.: 0.38:1.000:. ./.:4:159,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:126,5:.:-0.57:1.000:. ./.:5:134,40:.: 0.28:1.000:. ./.:4:136,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:139,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:150,15:.: 0.10:1.000:. ./.:4:187,24:.: 1.02:1.000:. -chr3.1 24031730 chr3.1_024031730 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,406:.: 0.83:1.000:. ./.:4:163,181:.: 0.13:1.000:. ./.:4:161,179:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,394:.: 0.70:1.000:. ./.:4:191,216:.: 0.84:1.000:. ./.:4:144,427:.: 2.70:1.000:. ./.:4:100,323:.: 1.02:1.000:. ./.:4:92,342:.: 1.15:1.000:. ./.:4:181,179:.: 0.31:1.000:. ./.:4:79,135:.:-1.35:1.000:. ./.:4:53,239:.:-0.46:1.000:. ./.:4:113,301:.: 0.92:1.000:. ./.:4:100,289:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,464:.: 1.49:1.000:. ./.:4:80,264:.: 0.13:1.000:. ./.:4:100,322:.: 1.01:1.000:. ./.:4:97,300:.: 0.73:1.000:. ./.:4:100,308:.: 0.85:1.000:. ./.:4:132,377:.: 2.00:1.000:. ./.:4:0,540:.: 2.35:1.000:. ./.:4:77,159:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.30:0.999:. ./.:4:104,393:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,404:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,314:.:-0.21:1.000:. ./.:4:175,183:.: 0.29:1.000:. ./.:4:107,330:.: 1.18:1.000:. ./.:4:180,221:.: 0.77:1.000:. ./.:4:205,233:.: 1.19:1.000:. ./.:4:117,390:.: 1.98:1.000:. ./.:4:0,471:.: 1.57:1.000:. ./.:4:162,184:.: 0.15:1.000:. ./.:4:135,111:.:-0.98:1.000:. ./.:4:48,230:.:-0.62:1.000:. ./.:3:8,112:.:-2.41:1.000:. ./.:4:108,296:.: 0.81:1.000:. ./.:4:85,269:.: 0.24:1.000:. ./.:4:105,294:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.11:1.000:. ./.:4:83,298:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,194:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,324:.:-0.10:1.000:. ./.:4:89,257:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,185:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.35:1.000:. ./.:4:118,186:.:-0.33:1.000:. ./.:4:99,331:.: 1.10:1.000:. ./.:4:38,164:.:-1.48:1.000:. ./.:4:68,205:.:-0.68:1.000:. ./.:4:156,150:.:-0.30:1.000:. ./.:4:54,177:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,361:.: 0.32:1.000:. ./.:4:67,177:.:-1.01:1.000:. ./.:4:74,250:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1,334:.: 0.03:1.000:. ./.:4:81,239:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,219:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,301:.:-0.36:1.000:. ./.:6:10,203:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.17:1.000:. ./.:4:148,151:.:-0.38:1.000:. ./.:4:128,189:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,383:.: 0.57:1.000:. ./.:4:69,234:.:-0.34:1.000:. ./.:4:94,215:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.34:1.000:. ./.:4:85,246:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,172:.:-1.03:1.000:. ./.:4:127,158:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1,358:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.20:1.000:. ./.:4:88,249:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,248:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,227:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.59:1.000:. ./.:4:79,248:.:-0.07:1.000:. ./.:4:48,152:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.86:1.000:. ./.:4:83,225:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,243:.:-0.16:1.000:. ./.:5:92,326:.: 0.97:0.928:. ./.:4:183,171:.: 0.24:1.000:. ./.:4:112,120:.:-1.14:1.000:. ./.:4:107,140:.:-0.97:1.000:. ./.:4:74,173:.:-0.97:1.000:. ./.:4:81,223:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.52:0.976:. ./.:4:97,124:.:-1.27:1.000:. ./.:4:135,144:.:-0.61:1.000:. ./.:4:141,137:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,329:.:-0.04:1.000:. ./.:4:146,187:.: 0.00:1.000:. ./.:4:66,135:.:-1.50:1.000:. ./.:4:64,182:.:-0.98:1.000:. ./.:4:51,212:.:-0.79:1.000:. ./.:4:84,297:.: 0.55:1.000:. ./.:4:81,213:.:-0.44:1.000:. ./.:4:73,289:.: 0.33:1.000:. ./.:4:95,125:.:-1.28:1.000:. ./.:4:53,225:.:-0.62:1.000:. ./.:4:48,178:.:-1.21:1.000:. ./.:4:127,139:.:-0.76:1.000:. ./.:4:60,205:.:-0.77:1.000:. ./.:4:228,232:.: 1.44:1.000:. ./.:4:219,227:.: 1.29:1.000:. ./.:4:71,255:.:-0.08:1.000:. ./.:4:55,188:.:-1.02:1.000:. ./.:4:262,235:.: 1.86:1.000:. ./.:4:60,195:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,224:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,235:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.11:1.000:. ./.:4:54,188:.:-1.03:1.000:. ./.:4:57,197:.:-0.89:1.000:. ./.:4:130,79:.:-1.40:1.000:. ./.:4:121,126:.:-0.97:1.000:. ./.:4:59,159:.:-1.30:1.000:. ./.:4:150,150:.:-0.37:1.000:. ./.:4:224,208:.: 1.13:1.000:. ./.:4:52,216:.:-0.73:1.000:. ./.:4:75,218:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,196:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,214:.:-0.75:1.000:. ./.:4:56,135:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,237:.:-1.09:1.000:. ./.:4:68,184:.:-0.92:1.000:. ./.:4:81,265:.: 0.15:1.000:. ./.:4:80,110:.:-1.62:0.993:. ./.:4:63,149:.:-1.37:1.000:. ./.:4:58,180:.:-1.08:1.000:. ./.:4:155,419:.: 2.74:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.17:1.000:. ./.:4:49,152:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,209:.:-1.40:1.000:. ./.:4:45,166:.:-1.38:1.000:. ./.:4:128,112:.:-1.05:1.000:. ./.:4:58,202:.:-0.83:1.000:. ./.:4:175,187:.: 0.33:1.000:. ./.:4:111,118:.:-1.18:1.000:. ./.:4:202,195:.: 0.73:1.000:. ./.:4:134,401:.: 2.30:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.91:1.000:. ./.:4:170,159:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,436:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,279:.:-0.61:1.000:. ./.:4:126,355:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,400:.: 0.76:1.000:. ./.:4:104,104:.:-1.42:1.000:. ./.:4:194,189:.: 0.57:1.000:. ./.:4:212,226:.: 1.19:1.000:. ./.:4:171,183:.: 0.24:1.000:. ./.:4:134,349:.: 1.71:1.000:. ./.:4:1,459:.: 1.44:1.000:. ./.:5:160,164:.:-0.10:0.999:. ./.:4:109,359:.: 1.54:1.000:. ./.:4:81,283:.: 0.35:1.000:. ./.:4:148,131:.:-0.61:1.000:. ./.:4:176,191:.: 0.39:1.000:. ./.:4:74,270:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,473:.: 1.59:1.000:. ./.:4:98,317:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,231:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,332:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,422:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,325:.:-0.09:1.000:. ./.:4:157,152:.:-0.27:1.000:. ./.:4:84,278:.: 0.33:1.000:. ./.:4:65,239:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.88:1.000:. ./.:4:1,273:.:-0.67:1.000:. ./.:4:105,397:.: 1.92:1.000:. ./.:4:111,301:.: 0.90:1.000:. ./.:4:108,271:.: 0.53:1.000:. ./.:4:39,339:.: 0.51:1.000:. ./.:5:219,234:.: 1.36:1.000:. ./.:4:111,405:.: 2.08:1.000:. ./.:4:135,390:.: 2.18:1.000:. ./.:4:94,294:.: 0.63:1.000:. ./.:4:82,311:.: 0.68:1.000:. -chr3.1 24337262 chr3.1_024337262 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,62:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,58:0.30: 0.58:1.000:0.987 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,62:0.20: 2.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,10:0.24:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,52:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,50:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,46:0.25: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,54:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,65:0.38: 0.35:1.000:0.520 0/0/0/1:4:195,51:0.16: 2.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:161,63:0.21: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,51:0.29: 0.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:93,39:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,2:0.10:-2.08:1.000:0.762 0/0/0/1:4:98,64:0.32: 0.73:1.000:0.964 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,69:0.26: 1.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,58:0.29: 0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:109,58:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,16:0.34:-1.64:1.000:0.865 0/1/1:3:3,7:0.57:-2.17:1.000:0.992 0/0/0/1:4:66,47:0.34:-0.20:1.000:0.895 0/0/0/1:4:69,53:0.35:-0.03:1.000:0.758 0/0/0/1:4:73,58:0.36: 0.14:1.000:0.669 0/0/1/1:4:68,58:0.38: 0.04:1.000:0.553 0/0/0/1:4:154,58:0.21: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,55:0.31: 0.33:1.000:0.973 0/0/0/1:4:80,59:0.34: 0.29:1.000:0.843 0/0/0/1:4:92,62:0.32: 0.58:1.000:0.946 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,49:0.36:-0.22:1.000:0.727 0/0/0/1:4:136,58:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,67:0.35: 0.62:1.000:0.803 0/0/1/1:4:138,116:0.38: 2.49:1.000:0.506 0/0/0/1:4:95,42:0.23: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,69:0.37: 0.56:1.000:0.568 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,2:0.03:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,46:0.28: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:151,50:0.19: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,58:0.28: 0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:146,50:0.19: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,39:0.33:-0.55:1.000:0.919 0/0/0/1:4:101,60:0.29: 0.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:132,51:0.21: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:52,25:0.25:-0.89:1.000:0.549 0/0/0/1:4:82,48:0.29: 0.12:1.000:0.992 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,40:0.32:-0.43:1.000:0.962 0/0/0/1:4:117,60:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,45:0.29:-0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,32:0.46:-1.24:1.000:0.987 0/0/0/1:4:88,35:0.22:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,56:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,86:0.61:-0.20:1.000:0.706 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,51:0.60:-1.07:1.000:0.775 0/0/1/1:4:33,57:0.53:-0.64:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,55:0.57:-0.85:1.000:0.950 0/0/0/1:4:106,34:0.19: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,48:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,45:0.22: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,49:0.39:-0.40:1.000:0.731 0/0/0/1:4:139,45:0.19: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,66:0.56:-0.51:1.000:0.969 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,46:0.25: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,63:0.54:-0.53:1.000:0.985 0/0/0/0/1:5:164,95:0.29: 2.59:0.928:0.652 0/0/0/1:4:143,54:0.21: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,33:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,57:0.30: 0.54:1.000:0.988 0/0/0/1:4:82,40:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,30:0.25:-0.63:0.976:0.999 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,60:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,28:0.26:-0.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,81:0.62:-0.36:1.000:0.632 0/0/0/1:4:153,44:0.17: 1.40:1.000:0.998 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,33:0.21:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,47:0.20: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,28:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,37:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,32:0.19: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,34:0.45:-1.14:1.000:0.977 0/0/0/1:4:141,62:0.23: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,47:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,67:0.33: 0.77:1.000:0.927 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,46:0.48:-0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,46:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,40:0.28:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,45:0.32:-0.20:1.000:0.958 0/0/0/1:4:104,50:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,50:0.34:-0.07:1.000:0.891 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,50:0.42:-0.47:1.000:0.922 0/0/0/1:4:160,60:0.21: 1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,53:0.22: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,88:0.61:-0.15:1.000:0.722 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,27:0.17:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,51:0.20: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.20:0.993:1.000 0/0/0/1:4:70,49:0.33:-0.09:1.000:0.914 0/0/1/1:4:18,44:0.58:-1.18:1.000:0.926 0/0/0/1:4:170,73:0.23: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,51:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,34:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,47:0.30: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:62,55:0.39:-0.13:1.000:0.671 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,48:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,65:0.22: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,56:0.29: 0.52:1.000:0.991 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,40:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,56:0.36: 0.06:1.000:0.690 0/0/1/1:4:39,55:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-2.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,57:0.32: 0.37:1.000:0.957 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,57:0.28: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/0/0:5:128,0:0.00: 0.08:0.999:1.000 0/0/0/1:4:97,40:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,45:0.28: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,64:0.33: 0.66:1.000:0.939 0/0/0/1:4:154,53:0.20: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,72:0.55:-0.30:1.000:0.979 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,98:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,48:0.26: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,55:0.28: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,45:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,45:0.42:-0.64:1.000:0.902 0/0/0/1:4:107,76:0.33: 1.13:1.000:0.898 0/0/0/1:4:170,52:0.18: 1.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,56:0.19: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,58:0.40:-0.05:1.000:0.766 0/0/0/0/0:5:142,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,46:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,33:0.47:-1.24:1.000:0.994 -chr3.1 24635691 chr3.1_024635691 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:119,130:.: 1.16:1.000:. ./.:4:106,39:.:-0.97:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:152,69:.: 0.59:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:172,62:.: 0.86:1.000:. ./.:4:58,79:.:-1.13:1.000:. ./.:4:85,99:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,104:.: 0.02:1.000:. ./.:4:28,32:.:-2.71:1.000:. ./.:4:25,11:.:-3.20:1.000:. ./.:4:138,51:.:-0.07:1.000:. ./.:4:116,89:.: 0.26:1.000:. ./.:4:145,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:127,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,55:.: 0.63:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:131,119:.: 1.18:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:133,138:.: 1.61:1.000:. ./.:4:29,17:.:-3.00:1.000:. ./.:4:163,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:205,70:.: 1.70:1.000:. ./.:4:97,120:.: 0.51:1.000:. ./.:4:23,7:.:-3.32:1.000:. ./.:4:140,65:.: 0.26:1.000:. ./.:4:149,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:179,61:.: 0.98:1.000:. ./.:4:145,60:.: 0.26:1.000:. ./.:4:84,96:.:-0.25:1.000:. ./.:4:135,46:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,2:.:-3.59:1.000:. ./.:4:58,2:.:-2.71:1.000:. ./.:3:16,3:.:-3.55:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:203,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:145,40:.:-0.15:1.000:. ./.:4:165,47:.: 0.41:1.000:. ./.:4:164,54:.: 0.53:1.000:. ./.:4:113,55:.:-0.50:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:14,6:.:-3.53:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:119,45:.:-0.58:1.000:. ./.:4:148,157:.: 2.31:1.000:. ./.:4:161,63:.: 0.65:1.000:. ./.:4:162,48:.: 0.36:1.000:. ./.:4:156,61:.: 0.51:1.000:. ./.:4:123,53:.:-0.33:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:115,33:.:-0.91:1.000:. ./.:4:109,117:.: 0.69:1.000:. ./.:6:137,48:.:-0.15:1.000:. ./.:4:156,75:.: 0.79:1.000:. ./.:4:158,49:.: 0.30:1.000:. ./.:4:127,57:.:-0.17:1.000:. ./.:4:72,66:.:-1.11:1.000:. ./.:4:181,48:.: 0.75:1.000:. ./.:4:97,109:.: 0.28:1.000:. ./.:4:98,36:.:-1.19:1.000:. ./.:4:148,51:.: 0.14:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:122,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:80,33:.:-1.62:1.000:. ./.:4:126,49:.:-0.35:1.000:. ./.:4:192,67:.: 1.37:1.000:. ./.:4:119,48:.:-0.52:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:95,121:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,114:.: 1.06:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:118,45:.:-0.60:1.000:. ./.:4:152,58:.: 0.36:1.000:. ./.:4:204,65:.: 1.57:1.000:. ./.:4:137,50:.:-0.11:1.000:. ./.:5:171,40:.: 0.38:0.928:. ./.:4:197,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:102,39:.:-1.05:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:135,62:.: 0.10:1.000:. ./.:4:88,111:.: 0.14:0.976:. ./.:4:129,52:.:-0.23:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:112,36:.:-0.91:1.000:. ./.:4:114,122:.: 0.90:1.000:. ./.:4:136,48:.:-0.17:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:114,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:172,61:.: 0.84:1.000:. ./.:4:136,59:.: 0.06:1.000:. ./.:4:68,78:.:-0.95:1.000:. ./.:4:111,123:.: 0.86:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:152,52:.: 0.24:1.000:. ./.:4:82,73:.:-0.76:1.000:. ./.:4:69,120:.:-0.07:1.000:. ./.:4:132,57:.:-0.07:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:99,118:.: 0.51:1.000:. ./.:4:92,92:.:-0.17:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:164,61:.: 0.67:0.999:. ./.:4:186,62:.: 1.14:1.000:. ./.:4:98,85:.:-0.19:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,42:.:-0.58:1.000:. ./.:4:110,45:.:-0.76:1.000:. ./.:4:133,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,50:.:-0.56:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,96:.:-0.09:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:157,67:.: 0.65:1.000:. ./.:4:147,62:.: 0.34:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,64:.:-1.09:1.000:. ./.:4:85,92:.:-0.31:1.000:. ./.:4:146,56:.: 0.20:1.000:. ./.:4:98,121:.: 0.55:1.000:. ./.:4:87,36:.:-1.42:0.993:. ./.:4:247,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:157,68:.: 0.67:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:134,128:.: 1.43:1.000:. ./.:4:89,87:.:-0.33:1.000:. ./.:4:140,52:.: 0.00:1.000:. ./.:4:140,45:.:-0.15:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:93,114:.: 0.30:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:119,46:.:-0.56:1.000:. ./.:4:121,150:.: 1.61:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:148,48:.: 0.08:1.000:. ./.:4:147,64:.: 0.38:1.000:. ./.:4:120,136:.: 1.31:1.000:. ./.:4:167,56:.: 0.63:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:178,61:.: 0.96:1.000:. ./.:4:42,1:.:-3.06:1.000:. ./.:4:117,51:.:-0.50:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:168,60:.: 0.73:1.000:. ./.:4:123,106:.: 0.75:1.000:. ./.:4:168,44:.: 0.41:1.000:. ./.:5:108,114:.: 0.61:0.999:. ./.:4:170,70:.: 0.98:1.000:. ./.:4:117,67:.:-0.17:1.000:. ./.:4:112,53:.:-0.56:1.000:. ./.:4:117,48:.:-0.56:1.000:. ./.:4:124,74:.: 0.12:1.000:. ./.:4:191,64:.: 1.29:1.000:. ./.:4:164,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,83:.:-0.50:1.000:. ./.:4:150,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:150,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:104,113:.: 0.51:1.000:. ./.:4:99,86:.:-0.15:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:100,106:.: 0.28:1.000:. ./.:4:149,51:.: 0.16:1.000:. ./.:4:78,93:.:-0.44:1.000:. ./.:4:105,92:.: 0.10:1.000:. ./.:4:166,57:.: 0.63:1.000:. ./.:4:170,61:.: 0.79:1.000:. ./.:4:172,56:.: 0.73:1.000:. ./.:4:128,78:.: 0.28:1.000:. ./.:5:219,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:185,65:.: 1.18:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:153,51:.: 0.24:1.000:. -chr3.1 25197475 chr3.1_025197475 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,65:1.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,40:0.38: 2.36:1.000:0.561 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,70:0.50: 2.97:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,53:0.49: 1.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.20:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,45:0.48: 1.39:1.000:0.994 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,42:0.74:-0.56:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,42:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-1.75:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/1:3:3,2:0.43:-1.93:1.000:0.990 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.63:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,49:0.49: 1.53:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,1:0.03: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,73:1.00: 0.52:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.49:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1/1/1:6:17,54:0.63: 0.45:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.20:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,64:0.49: 2.68:1.000:0.996 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.89:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.45:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.78:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:57,54:0.49: 1.89:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,81:0.51: 3.51:1.000:0.996 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.56:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.53:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,74:1.00: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,47:0.52: 1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,46:0.48: 1.46:1.000:0.994 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,62:0.54: 1.71:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,45:0.52: 0.84:0.993:0.994 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.16:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,73:1.00: 0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,64:0.51: 2.36:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.33:-1.39:1.000:0.921 0/0/1/1:4:59,58:0.50: 2.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0/0:5:43,0:0.00:-0.56:0.999:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,57:0.54: 1.49:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.20:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:25,28:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.74:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:63,71:0.52: 2.72:1.000:0.648 0/0/1/1:4:60,72:0.52: 2.65:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,58:0.50: 2.11:1.000:0.997 -chr3.1 26035367 chr3.1_026035367 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:7,42:0.81: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,7:0.19: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,15:0.35: 0.58:1.000:0.803 0/0/1/1:4:22,16:0.42: 0.18:1.000:0.918 0/0/0/1:4:34,17:0.33: 1.22:1.000:0.906 0/0/1/1:4:27,35:0.55: 2.10:1.000:0.978 0/0/1/1:4:17,14:0.45:-0.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:18,23:0.55: 0.42:1.000:0.981 0/0/1/1:4:20,36:0.61: 1.62:1.000:0.635 0/0/1/1:4:7,9:0.55:-1.57:1.000:0.980 0/1/1/1:4:3,10:0.72:-1.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:24,14:0.37: 0.18:1.000:0.584 0/1/1/1:4:8,35:0.75: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,15:0.39: 0.18:1.000:0.742 0/0/0/1:4:28,13:0.32: 0.42:1.000:0.961 0/0/1/1:4:17,29:0.60: 0.82:1.000:0.746 0/0/1/1:4:18,12:0.40:-0.46:1.000:0.791 0/1/1/1:4:15,32:0.65: 0.90:1.000:0.748 0/0/1/1:4:23,14:0.38: 0.10:1.000:0.548 0/1/1/1:4:22,48:0.65: 2.74:1.000:0.786 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,13:0.42:-0.38:1.000:0.911 0/1/1/1:4:8,34:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,20:0.54: 0.02:1.000:0.984 0/1/1/1:4:1,4:0.74:-2.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,14:0.42:-0.22:1.000:0.930 0/0/0/1:4:29,17:0.37: 0.82:1.000:0.569 0/0/0/1:4:34,18:0.35: 1.30:1.000:0.825 0/0/1/1:4:36,26:0.42: 2.10:1.000:0.911 0/1/1/1:4:13,26:0.63: 0.26:1.000:0.615 0/1/1/1:4:7,22:0.71:-0.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:22,17:0.44: 0.26:1.000:0.960 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-2.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-2.45:1.000:1.000 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.58:-0.30:1.000:0.931 0/0/1/1:4:23,16:0.41: 0.26:1.000:0.866 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.40:-0.46:1.000:0.791 0/1/1/1:4:11,22:0.63:-0.22:1.000:0.615 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-1.25:1.000:0.791 0/0/1/1:4:17,21:0.54: 0.18:1.000:0.986 0/0/0/1:4:23,6:0.21:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,45:0.71: 1.86:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,9:0.35:-0.78:1.000:0.825 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-1.25:1.000:0.791 0/0/0/1:4:29,9:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,26:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,17:0.60:-0.70:1.000:0.752 0/1/1/1:4:15,35:0.66: 1.14:1.000:0.874 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.86:1.000:0.954 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-1.09:1.000:0.938 0/0/0/1:4:18,8:0.31:-0.78:1.000:0.977 0/0/1/1:4:13,8:0.38:-1.17:1.000:0.582 0/1/1/1:4:11,25:0.66: 0.02:1.000:0.844 0/0/0/0/1/1:6:16,9:0.36:-0.86:1.000:0.872 0/0/1/1:4:15,15:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,23:0.55: 0.42:1.000:0.981 0/1/1/1:4:13,29:0.65: 0.50:1.000:0.819 0/1/1/1:4:9,20:0.65:-0.54:1.000:0.814 0/0/1/1:4:13,9:0.41:-1.09:1.000:0.858 0/0/1/1:4:12,14:0.53:-0.78:1.000:0.992 0/0/0/1:4:10,5:0.33:-1.65:1.000:0.906 0/0/1/1:4:18,18:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,12:0.43:-0.62:1.000:0.943 0/0/1/1:4:13,15:0.53:-0.62:1.000:0.993 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-2.29:1.000:0.971 0/0/0/1:4:22,8:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,5:0.20:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,13:0.34: 0.18:1.000:0.855 0/0/0/1:4:22,10:0.31:-0.30:1.000:0.969 0/1/1/1:4:11,21:0.63:-0.30:1.000:0.505 1/1/1/1:4:2,37:0.93: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,26:0.60: 0.50:1.000:0.826 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.86:1.000:0.954 0/0/0/1:4:24,11:0.31:-0.06:1.000:0.966 0/0/1/1:4:16,16:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,23:0.56: 0.34:1.000:0.967 0/0/0/1:4:33,11:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:7,20:0.69:-0.70:0.928:0.566 0/0/0/1:4:16,9:0.36:-0.86:1.000:0.688 0/0/1/1:4:19,19:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,5:0.22:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,9:0.36:-0.86:1.000:0.688 0/0/1/1:4:22,22:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,14:0.51:-0.70:0.976:0.996 0/1/1/1:4:14,30:0.65: 0.66:1.000:0.755 0/0/1/1:4:29,18:0.38: 0.90:1.000:0.608 0/0/1/1:4:15,26:0.61: 0.42:1.000:0.715 0/0/1/1:4:16,20:0.54: 0.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:14,23:0.60: 0.10:1.000:0.810 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,23:0.58: 0.18:1.000:0.894 0/0/0/1:4:36,9:0.20: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,24:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,46:0.85: 1.30:1.000:0.990 0/0/0/1:4:24,9:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,14:0.31: 0.74:1.000:0.972 0/1/1/1:4:6,32:0.79: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,32:0.73: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,6:0.30:-1.25:1.000:0.985 0/0/0/1:4:40,14:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,20:0.35: 1.70:1.000:0.784 0/0/1/1:4:29,37:0.55: 2.42:1.000:0.981 0/1/1/1:4:8,27:0.72:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,16:0.31: 1.22:1.000:0.967 0/0/1/1:4:19,17:0.47: 0.02:0.999:0.993 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-1.09:1.000:0.938 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.23:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,19:0.53:-0.06:1.000:0.990 0/0/0/1:4:27,15:0.36: 0.50:1.000:0.721 0/0/0/1:4:24,8:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,11:0.31:-0.06:1.000:0.966 0/1/1/1:4:8,45:0.80: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,8:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,15:0.29: 1.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:19,9:0.32:-0.62:1.000:0.950 0/1/1/1:4:4,23:0.80:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,23:0.63:-0.06:1.000:0.514 0/0/0/1:4:25,9:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,19:0.52: 0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,21:0.72:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,26:0.61: 0.42:1.000:0.715 0/0/1/1:4:29,25:0.46: 1.46:1.000:0.989 0/0/1/1:4:14,10:0.42:-0.94:0.993:0.900 0/0/0/1:4:15,8:0.35:-1.01:1.000:0.811 0/0/0/1:4:24,9:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,27:0.59: 0.66:1.000:0.856 0/1/1/1:4:11,22:0.63:-0.22:1.000:0.615 0/0/1/1:4:26,24:0.48: 1.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,16:0.46:-0.06:1.000:0.986 0/0/0/1:4:24,7:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.43:-0.06:1.000:0.943 0/1/1/1:4:2,21:0.88:-1.01:1.000:0.638 0/0/0/1:4:25,9:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,14:0.45:-0.38:1.000:0.981 0/1/1/1:4:17,44:0.68: 2.02:1.000:0.948 0/0/0/1:4:30,17:0.36: 0.90:1.000:0.668 0/0/1/1:4:12,11:0.48:-1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,24:0.55: 0.58:1.000:0.983 0/0/1/1:4:13,24:0.62: 0.10:1.000:0.576 0/0/0/1:4:18,9:0.33:-0.70:1.000:0.906 0/0/1/1:4:19,13:0.41:-0.30:1.000:0.840 0/0/0/1:4:26,15:0.37: 0.42:1.000:0.617 0/0/1/1:4:4,6:0.58:-2.05:1.000:0.912 0/1/1/1:4:10,29:0.70: 0.26:1.000:0.981 0/0/0/1:4:25,10:0.29:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,22:0.46: 0.98:1.000:0.987 0/1/1/1:4:13,61:0.77: 3.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,12:0.39:-0.38:1.000:0.658 0/0/1/1/1:5:25,33:0.56: 1.78:0.999:0.901 0/0/0/1:4:31,14:0.31: 0.74:1.000:0.972 0/0/1/1:4:21,35:0.60: 1.62:1.000:0.787 0/0/1/1:4:23,23:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,20:0.53: 0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,29:0.62: 0.74:1.000:0.619 0/0/1/1:4:14,11:0.44:-0.86:1.000:0.967 0/0/0/1:4:39,15:0.28: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,13:0.53:-0.94:1.000:0.991 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.35:-0.14:1.000:0.765 0/0/1/1:4:23,25:0.52: 0.98:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,25:0.61: 0.26:1.000:0.653 0/0/1/1:4:26,17:0.40: 0.58:1.000:0.748 0/0/1/1:4:16,23:0.57: 0.26:1.000:0.941 0/0/1/1:4:25,19:0.43: 0.66:1.000:0.951 0/1/1/1:4:4,19:0.77:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,18:0.55:-0.30:1.000:0.980 0/0/0/1:4:40,10:0.20: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,28:0.59: 0.82:1.000:0.879 0/0/1/1:4:17,17:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,19:0.58:-0.30:1.000:0.931 0/0/0/1/1:5:28,14:0.33: 0.50:1.000:0.817 0/0/0/0:4:49,1:0.02: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,37:0.58: 2.10:1.000:0.923 0/0/0/1:4:14,6:0.30:-1.25:1.000:0.985 0/0/0/1:4:31,9:0.22: 0.34:1.000:1.000 -chr3.1 26163286 chr3.1_026163286 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.39:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:20,0:.:-3.02:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.56:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.12:1.000:. ./.:6:87,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.26:1.000:. ./.:5:184,0:.: 2.50:0.928:. ./.:4:130,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.38:0.976:. ./.:4:112,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:125,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.17:0.993:. ./.:4:80,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:173,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.41:1.000:. ./.:5:104,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:119,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:186,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.13:1.000:. ./.:5:132,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.21:1.000:. -chr3.1 26620370 chr3.1_026620370 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:532,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:478,117:.:-0.69:1.000:. ./.:4:913,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:879,168:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1242,193:.: 2.21:1.000:. ./.:4:709,191:.: 0.36:1.000:. ./.:4:698,114:.: 0.06:1.000:. ./.:4:609,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:173,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:359,80:.:-1.23:1.000:. ./.:4:940,135:.: 0.97:1.000:. ./.:4:709,175:.: 0.31:1.000:. ./.:4:272,169:.:-1.22:1.000:. ./.:4:604,159:.:-0.11:1.000:. ./.:4:833,160:.: 0.68:1.000:. ./.:4:533,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:539,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:1148,2:.: 1.22:1.000:. ./.:4:665,175:.: 0.16:1.000:. ./.:4:800,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:603,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1631,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:971,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:168,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:846,145:.: 0.68:1.000:. ./.:4:612,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:479,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:647,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1054,159:.: 1.44:1.000:. ./.:4:960,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:602,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:173,49:.:-1.97:1.000:. ./.:4:470,85:.:-0.83:1.000:. ./.:3:132,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:677,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:785,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:967,170:.: 1.18:1.000:. ./.:4:643,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:295,128:.:-1.28:1.000:. ./.:4:726,134:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1075,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:755,154:.: 0.39:1.000:. ./.:4:572,110:.:-0.39:1.000:. ./.:4:488,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:419,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1129,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:711,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:581,115:.:-0.34:1.000:. ./.:4:348,87:.:-1.24:1.000:. ./.:4:558,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:971,139:.: 1.09:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:844,156:.: 0.71:1.000:. ./.:4:604,164:.:-0.09:1.000:. ./.:4:765,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:891,143:.: 0.82:1.000:. ./.:4:463,134:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1011,121:.: 1.16:1.000:. ./.:6:880,80:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1140,171:.: 1.78:1.000:. ./.:4:588,151:.:-0.19:1.000:. ./.:4:655,154:.: 0.05:1.000:. ./.:4:398,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:1157,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:356,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:542,124:.:-0.44:1.000:. ./.:4:754,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:595,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:316,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:397,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:1325,168:.: 2.41:1.000:. ./.:4:599,142:.:-0.19:1.000:. ./.:4:855,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:918,148:.: 0.94:1.000:. ./.:4:718,137:.: 0.21:1.000:. ./.:4:562,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1046,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:458,165:.:-0.59:1.000:. ./.:4:500,164:.:-0.45:1.000:. ./.:4:968,253:.: 1.47:1.000:. ./.:4:633,168:.: 0.02:1.000:. ./.:4:347,168:.:-0.96:1.000:. ./.:4:565,0:.:-0.79:1.000:. ./.:5:858,140:.: 0.70:0.928:. ./.:4:686,156:.: 0.16:1.000:. ./.:4:484,125:.:-0.64:1.000:. ./.:4:750,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:847,150:.: 0.70:1.000:. ./.:4:412,156:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1033,152:.: 1.35:0.976:. ./.:4:764,119:.: 0.30:1.000:. ./.:4:464,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:599,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:472,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:757,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:917,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:733,105:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1254,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:754,131:.: 0.31:1.000:. ./.:4:839,161:.: 0.71:1.000:. ./.:4:682,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:501,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:641,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:543,118:.:-0.46:1.000:. ./.:4:475,107:.:-0.73:1.000:. ./.:4:507,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:828,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1237,210:.: 2.25:1.000:. ./.:4:531,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:831,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:950,209:.: 1.26:1.000:. ./.:4:864,169:.: 0.82:0.999:. ./.:4:1209,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:448,92:.:-0.88:1.000:. ./.:4:687,172:.: 0.22:1.000:. ./.:4:962,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:589,115:.:-0.31:1.000:. ./.:4:648,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:726,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:665,134:.: 0.01:1.000:. ./.:4:592,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:293,154:.:-1.20:1.000:. ./.:4:755,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:637,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:983,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:938,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:640,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:374,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:369,123:.:-1.04:1.000:. ./.:4:979,163:.: 1.20:1.000:. ./.:4:642,146:.:-0.02:1.000:. ./.:4:270,0:.:-1.81:0.993:. ./.:4:1013,159:.: 1.30:1.000:. ./.:4:589,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:863,196:.: 0.91:1.000:. ./.:4:565,155:.:-0.26:1.000:. ./.:4:517,110:.:-0.58:1.000:. ./.:4:813,128:.: 0.50:1.000:. ./.:4:774,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:993,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:938,146:.: 1.00:1.000:. ./.:4:651,112:.:-0.11:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:897,225:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1362,233:.: 2.76:1.000:. ./.:4:458,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:1037,146:.: 1.34:1.000:. ./.:4:727,170:.: 0.35:1.000:. ./.:4:688,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1046,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:542,145:.:-0.37:1.000:. ./.:4:498,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:854,182:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1485,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:690,183:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1290,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:443,0:.:-1.21:1.000:. ./.:5:707,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:1325,174:.: 2.43:1.000:. ./.:4:581,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:438,107:.:-0.86:1.000:. ./.:4:753,126:.: 0.29:1.000:. ./.:4:810,150:.: 0.57:1.000:. ./.:4:747,185:.: 0.47:1.000:. ./.:4:871,170:.: 0.85:1.000:. ./.:4:782,163:.: 0.52:1.000:. ./.:4:857,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:734,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:634,155:.:-0.02:1.000:. ./.:4:477,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:555,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:935,149:.: 1.00:1.000:. ./.:4:654,133:.:-0.03:1.000:. ./.:4:454,110:.:-0.80:1.000:. ./.:4:504,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:1147,177:.: 1.82:1.000:. ./.:4:531,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:523,178:.:-0.32:1.000:. ./.:4:562,115:.:-0.41:1.000:. ./.:5:1073,154:.: 1.49:1.000:. ./.:4:1024,190:.: 1.45:1.000:. ./.:4:693,205:.: 0.36:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:957,155:.: 1.09:1.000:. -chr3.1 27034933 chr3.1_027034933 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:90,34:.: 0.91:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:13,6:.:-2.84:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:75,27:.: 0.12:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:90,31:.: 0.80:1.000:. ./.:4:84,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,6:.:-2.44:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:3,4:.:-3.27:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.66:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.80:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:86,32:.: 0.70:1.000:. ./.:4:91,22:.: 0.52:1.000:. ./.:4:93,36:.: 1.09:1.000:. ./.:4:77,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.84:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:63,15:.:-0.73:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:79,26:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,21:.:-0.37:1.000:. ./.:4:53,10:.:-1.27:1.000:. ./.:4:96,36:.: 1.20:1.000:. ./.:4:91,31:.: 0.84:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.20:1.000:. ./.:6:74,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:70,32:.: 0.12:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:62,17:.:-0.70:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:86,28:.: 0.55:1.000:. ./.:4:21,12:.:-2.34:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:95,28:.: 0.87:1.000:. ./.:4:57,11:.:-1.09:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:85,37:.: 0.84:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,23:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,36:.: 0.91:1.000:. ./.:4:61,14:.:-0.84:1.000:. ./.:5:162,0:.: 2.27:0.928:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:58,25:.:-0.55:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:95,37:.: 1.20:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.45:0.976:. ./.:4:60,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:47,19:.:-1.16:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.73:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:85,27:.: 0.48:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:91,20:.: 0.45:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:97,31:.: 1.05:1.000:. ./.:4:80,30:.: 0.41:0.999:. ./.:4:69,25:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:63,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:68,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:82,34:.: 0.62:1.000:. ./.:4:73,22:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,22:.:-0.34:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,32:.: 0.16:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.73:0.993:. ./.:4:62,27:.:-0.34:1.000:. ./.:4:56,31:.:-0.41:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.70:1.000:. ./.:4:65,20:.:-0.48:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:62,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:125,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:63,20:.:-0.55:1.000:. ./.:4:103,37:.: 1.48:1.000:. ./.:4:100,26:.: 0.98:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:98,33:.: 1.16:1.000:. ./.:4:103,36:.: 1.45:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.37:1.000:. ./.:5:95,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:135,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:83,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:80,23:.: 0.16:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:79,23:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:81,31:.: 0.48:1.000:. ./.:4:61,25:.:-0.45:1.000:. ./.:4:75,35:.: 0.41:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:83,21:.: 0.20:1.000:. ./.:5:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:93,41:.: 1.27:1.000:. ./.:4:98,35:.: 1.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.23:1.000:. -chr3.1 27536476 chr3.1_027536476 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,8:.:-0.69:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.39:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:72,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:135,37:.: 2.39:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:20,5:.:-2.00:1.000:. ./.:4:50,5:.:-1.11:1.000:. ./.:4:62,7:.:-0.69:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:76,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:20,1:.:-2.12:1.000:. ./.:4:54,11:.:-0.81:1.000:. ./.:4:107,16:.: 0.92:1.000:. ./.:4:31,7:.:-1.61:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:60,6:.:-0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:50,10:.:-0.96:1.000:. ./.:4:44,17:.:-0.93:1.000:. ./.:4:49,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:22,2:.:-2.03:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:82,12:.: 0.06:1.000:. ./.:4:78,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:68,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:43,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.39:1.000:. ./.:4:133,29:.: 2.09:1.000:. ./.:4:61,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:63,24:.:-0.15:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:185,21:.: 3.40:1.000:. ./.:4:57,23:.:-0.36:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:151,29:.: 2.63:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:57,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:91,15:.: 0.42:1.000:. ./.:4:56,18:.:-0.54:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:63,17:.:-0.36:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.87:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:59,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:56,11:.:-0.75:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.51:1.000:. ./.:4:78,23:.: 0.27:1.000:. ./.:4:74,17:.:-0.03:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:47,22:.:-0.69:1.000:. ./.:4:67,49:.: 0.71:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.93:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:68,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:102,24:.: 1.01:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.34:1.000:. ./.:5:94,0:.: 0.06:0.928:. ./.:4:115,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:54,23:.:-0.45:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.21:0.976:. ./.:4:147,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:67,25:.: 0.00:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,17:.:-0.03:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:74,14:.:-0.12:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:124,25:.: 1.70:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:94,17:.: 0.57:1.000:. ./.:4:53,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:29,23:.:-1.20:1.000:. ./.:4:55,8:.:-0.87:1.000:. ./.:4:110,18:.: 1.07:1.000:. ./.:4:52,20:.:-0.60:1.000:. ./.:4:99,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:55,5:.:-0.96:1.000:. ./.:4:94,21:.: 0.68:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,14:.:-0.60:0.993:. ./.:4:94,16:.: 0.54:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:105,14:.: 0.80:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:91,16:.: 0.45:1.000:. ./.:4:65,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:95,13:.: 0.48:1.000:. ./.:4:83,17:.: 0.24:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:98,10:.: 0.48:1.000:. ./.:4:70,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:16,3:.:-2.18:1.000:. ./.:4:49,7:.:-1.08:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:102,14:.: 0.71:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:5:105,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:84,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:66,10:.:-0.48:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:90,13:.: 0.33:1.000:. ./.:4:38,11:.:-1.29:1.000:. ./.:4:74,10:.:-0.24:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:46,9:.:-1.11:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:39,5:.:-1.43:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,10:.: 0.36:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.68:1.000:. ./.:5:51,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,14:.:-0.27:1.000:. ./.:4:95,12:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.49:1.000:. ./.:4:76,7:.:-0.27:1.000:. -chr3.1 27683010 chr3.1_027683010 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:31,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:58,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:6:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:5:63,0:.: 1.63:0.928:. ./.:4:52,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:0.976:. ./.:4:61,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:48,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:58,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:48,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.10:0.993:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.00:1.000:. ./.:5:38,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:66,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:40,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.00:1.000:. ./.:5:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.67:1.000:. -chr3.1 28104831 chr3.1_028104831 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:309,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:308,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:233,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:61,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:316,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.93:1.000:. ./.:3:13,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:305,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:173,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.64:1.000:. ./.:5:159,0:.:-0.43:0.928:. ./.:4:196,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.79:0.976:. ./.:4:235,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:365,1:.: 2.43:1.000:. ./.:4:266,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.56:0.999:. ./.:4:163,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:253,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.40:0.993:. ./.:4:172,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:489,0:.: 4.13:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:389,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:350,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:382,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:91,1:.:-1.36:1.000:. ./.:5:285,0:.: 1.31:0.999:. ./.:4:181,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:231,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.75:1.000:. ./.:5:267,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.35:1.000:. -chr3.1 28312597 chr3.1_028312597 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.11:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.25:1.000:. ./.:6:39,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:5:69,0:.: 0.66:0.928:. ./.:4:65,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:0.976:. ./.:4:40,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.02:0.999:. ./.:4:75,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:0.993:. ./.:4:43,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.08:1.000:. ./.:5:58,0:.: 0.04:0.999:. ./.:4:69,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.13:1.000:. ./.:5:62,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.66:1.000:. -chr3.1 28434787 chr3.1_028434787 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:93,78:0.44: 0.06:1.000:0.965 0/1/1/1:4:35,115:0.74:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,88:0.47: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:131,34:0.20:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,107:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:131,57:0.29: 0.48:1.000:0.990 0/0/1/1:4:50,50:0.48:-1.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,78:0.45:-0.09:1.000:0.984 0/0/0/1:4:119,47:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:25,2:0.07:-3.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,6:0.18:-3.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,81:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:117,42:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,43:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,92:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,52:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,121:0.53: 1.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:102,100:0.48: 0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,20:0.48:-3.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,84:0.42: 0.55:1.000:0.927 0/0/0/1:4:162,60:0.26: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,78:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-3.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,37:0.17: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,85:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,81:0.48:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:142,50:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,36:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,102:0.46: 1.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:82,83:0.48:-0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:1,1:0.48:-4.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,36:0.68:-2.88:1.000:0.949 0/1/1:3:7,16:0.67:-3.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,108:0.53: 0.65:1.000:0.991 0/0/0/1:4:135,55:0.28: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:127,57:0.30: 0.38:1.000:0.985 0/0/1/1:4:113,100:0.45: 1.09:1.000:0.981 0/0/1/1:4:74,109:0.57: 0.35:1.000:0.940 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,105:0.57: 0.23:1.000:0.954 0/0/0/1:4:165,52:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,121:0.66: 0.18:1.000:0.873 0/0/1/1:4:77,135:0.61: 1.06:1.000:0.670 0/0/0/1:4:159,50:0.23: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,110:0.48: 1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:119,34:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,113:0.55: 0.75:1.000:0.984 0/0/0/1:4:150,64:0.29: 1.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,93:0.53:-0.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:175,41:0.18: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,52:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,76:0.53:-0.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,98:0.47: 0.77:1.000:0.993 0/0/0/1:4:99,46:0.31:-0.58:1.000:0.978 0/0/1/1:4:90,103:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,51:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:70,72:0.49:-0.65:1.000:0.880 0/0/1/1:4:110,110:0.48: 1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,43:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,111:0.49: 1.24:1.000:0.996 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,109:0.53: 0.67:1.000:0.991 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,29:0.27:-1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,82:0.47: 0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:97,105:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,37:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,167:0.76: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,58:0.47:-1.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:90,86:0.47: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:90,83:0.46: 0.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:77,100:0.54: 0.21:1.000:0.986 0/0/1/1:4:84,95:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:137,39:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,43:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,28:0.20:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,114:0.57: 0.60:1.000:0.953 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,36:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:159,53:0.24: 1.06:0.928:0.950 0/0/1/1:4:87,113:0.54: 0.77:1.000:0.986 0/0/0/1:4:102,23:0.18:-1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,95:0.53: 0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,85:0.52:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.31:0.976:1.000 0/0/0/1:4:130,44:0.25: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,108:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,29:0.21:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,111:0.54: 0.67:1.000:0.985 0/0/1/1:4:107,83:0.42: 0.53:1.000:0.916 0/0/1/1:4:95,112:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:129,39:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,52:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,160:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:119,1:0.01:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,68:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,67:0.40:-0.19:1.000:0.799 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,47:0.28:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:112,40:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,105:0.54: 0.48:1.000:0.989 0/0/1/1:4:104,98:0.47: 0.82:1.000:0.991 0/0/1/1:4:78,94:0.53: 0.08:1.000:0.994 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,56:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,104:0.57: 0.13:0.999:0.934 0/0/0/1:4:145,52:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,49:0.27: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,134:0.69: 0.45:1.000:0.971 0/0/1/1:4:67,87:0.54:-0.36:1.000:0.986 0/0/0/1:4:130,42:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,131:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,113:0.61: 0.26:1.000:0.728 0/0/0/1:4:115,47:0.28:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,38:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,90:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,41:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,51:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,39:0.21: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,55:0.43:-1.09:1.000:0.938 0/0/1/1:4:85,89:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,50:0.28: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,37:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,60:0.50:-1.31:0.993:0.997 0/0/0/1:4:110,45:0.28:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,45:0.28:-0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,88:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:136,52:0.27: 0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:111,44:0.28:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,39:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,96:0.58:-0.26:1.000:0.897 0/0/1/1:4:81,89:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,48:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,87:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,76:0.53:-0.77:1.000:0.991 0/0/0/1:4:140,62:0.30: 0.82:1.000:0.987 0/0/1/1:4:114,122:0.50: 1.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,96:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,77:0.45:-0.14:1.000:0.984 0/0/1/1:4:123,100:0.43: 1.33:1.000:0.951 0/0/0/1:4:132,48:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,42:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,45:0.30:-0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:7,8:0.51:-3.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,55:0.49:-1.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,51:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,35:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,51:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,49:0.29:-0.09:1.000:0.993 0/0/0/0/1:5:108,31:0.22:-0.73:0.999:0.988 0/0/1/1:4:83,84:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,41:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,39:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,41:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,46:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:170,43:0.20: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,117:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,50:0.34:-0.60:1.000:0.896 0/0/1/1:4:90,87:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:112,44:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,76:0.47:-0.28:1.000:0.990 0/0/0/1:4:116,43:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,99:0.77:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,94:0.47: 0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:137,50:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,39:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,95:0.43: 1.11:1.000:0.939 0/0/0/1:4:123,51:0.28: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:150,37:0.19: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,10:0.06:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:44,144:0.74: 0.48:1.000:0.861 0/1/1/1:4:76,167:0.66: 1.83:1.000:0.871 0/0/0/1:4:138,63:0.30: 0.80:1.000:0.982 0/0/1/1:4:54,57:0.49:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,107:0.55: 0.43:1.000:0.977 -chr3.1 29854967 chr3.1_029854967 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:220,208:0.54: 0.93:1.000:0.985 0/0/0/1:4:258,75:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,133:0.48:-0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:106,233:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:275,202:0.48: 1.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:141,309:0.74: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,103:0.46:-1.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:218,170:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:121,253:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,128:0.80:-2.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,174:0.83:-1.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:189,133:0.47:-0.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:107,227:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:127,287:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,164:0.50: 0.29:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,362:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,299:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,283:0.77: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:305,257:0.52: 2.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:273,221:0.51: 1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,63:0.45:-2.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:228,141:0.43: 0.26:1.000:0.952 0/1/1/1:4:132,293:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,168:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,77:0.72:-2.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:125,283:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:286,178:0.43: 1.34:1.000:0.956 0/0/0/1:4:312,90:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:151,333:0.74: 1.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:120,291:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:271,215:0.50: 1.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,157:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,31:0.57:-3.26:1.000:0.956 0/0/1/1:4:88,86:0.55:-1.97:1.000:0.978 0/1/1:3:35,61:0.69:-2.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,166:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:117,269:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,291:0.80: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,178:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:239,184:0.49: 0.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,331:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:239,197:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:132,272:0.73: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:278,72:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,156:0.47: 0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:87,222:0.77:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,221:0.53: 1.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:89,162:0.70:-1.09:1.000:0.985 0/0/1/1:4:172,137:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,209:0.74:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,143:0.55:-0.65:1.000:0.979 0/1/1/1:4:139,313:0.75: 1.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,251:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,237:0.71: 0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:187,168:0.53: 0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:218,149:0.46: 0.23:1.000:0.987 0/1/1/1:4:91,220:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:258,161:0.43: 0.83:1.000:0.957 0/1/1/1:4:78,233:0.79:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:163,145:0.53:-0.44:1.000:0.841 0/0/1/1:4:206,127:0.43:-0.16:1.000:0.950 0/1/1/1:4:107,218:0.73:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,179:0.52: 0.48:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,308:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,170:0.46: 0.78:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,330:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,141:0.72:-1.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,154:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:189,163:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:90,234:0.77:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:332,99:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,99:0.43:-0.98:1.000:0.944 0/0/1/1:4:224,176:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:240,172:0.47: 0.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:190,162:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:159,117:0.48:-0.81:1.000:0.995 0/1/1/1:4:102,219:0.74:-0.29:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,297:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,321:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,257:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,175:0.74:-1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:217,151:0.46: 0.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,349:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,203:0.74:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1/1:5:91,285:0.80: 0.34:0.928:0.996 0/0/1/1:4:225,181:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,167:0.77:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,122:0.51:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,133:0.48:-0.38:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,277:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,220:1.00:-1.45:0.976:1.000 0/1/1/1:4:78,233:0.79:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,146:0.46: 0.11:1.000:0.990 0/1/1/1:4:83,194:0.75:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,136:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,150:0.44: 0.44:1.000:0.968 0/0/1/1:4:163,126:0.49:-0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,202:0.79:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,245:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:349,102:0.25: 1.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,217:1.00:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,354:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,112:0.48:-0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:186,172:0.54: 0.13:1.000:0.988 1/1/1/1:4:1,237:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,223:0.76:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,171:0.73:-1.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:255,181:0.47: 1.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:263,245:0.54: 1.85:1.000:0.987 0/0/1/1:4:195,163:0.51: 0.13:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,300:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:162,346:0.74: 1.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:196,149:0.49:-0.02:0.999:0.996 0/1/1/1:4:114,192:0.68:-0.46:1.000:0.960 0/1/1/1:4:82,139:0.68:-1.44:1.000:0.963 0/0/0/1:4:211,84:0.32:-0.59:1.000:0.953 0/0/1/1:4:170,151:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:86,186:0.74:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:248,75:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,118:0.45:-0.56:1.000:0.978 0/1/1/1:4:100,237:0.76:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,334:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,239:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,159:0.51: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,203:0.74:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,256:0.74: 0.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,305:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,166:0.74:-1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,107:0.54:-1.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:141,106:0.49:-1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,181:0.75:-0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,222:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,81:0.48:-1.77:0.993:0.994 0/1/1/1:4:103,203:0.72:-0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:93,202:0.74:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:302,249:0.51: 2.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,244:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,221:0.78:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,197:0.77:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,124:0.51:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:205,165:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:81,216:0.78:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,174:0.54: 0.13:1.000:0.985 0/0/1/1:4:141,108:0.49:-1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:158,331:0.73: 1.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:324,239:0.48: 2.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,187:0.48: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:211,203:0.55: 0.77:1.000:0.981 0/0/1/1:4:238,253:0.57: 1.65:1.000:0.939 0/1/1/1:4:89,198:0.74:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:141,345:0.76: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,277:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,24:0.20:-2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,143:0.53:-0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:128,280:0.74: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:120,281:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:177,346:0.72: 2.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:149,313:0.73: 1.32:1.000:0.998 0/1/1/1/1:5:92,218:0.76:-0.42:0.999:0.946 0/0/1/1:4:256,187:0.48: 1.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:122,234:0.71: 0.11:1.000:0.993 0/1/1/1:4:92,194:0.73:-0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:118,220:0.71:-0.10:1.000:0.989 0/1/1/1:4:120,272:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,245:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,94:0.27: 0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:99,214:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,169:0.57:-0.19:1.000:0.948 0/1/1/1:4:110,265:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,166:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,215:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,55:0.23:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,162:0.49: 0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,233:0.76:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,238:0.77:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,295:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:294,214:0.48: 1.85:1.000:0.994 0/1/1/1:4:116,289:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,259:0.74: 0.32:1.000:0.999 1/1/1/1:4:37,276:0.90:-0.38:1.000:0.856 0/0/0/0/1:5:411,105:0.23: 1.94:1.000:0.974 0/0/0/1:4:441,116:0.23: 2.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:139,354:0.77: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,171:0.53: 0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:248,176:0.47: 0.89:1.000:0.992 -chr3.1 30104569 chr3.1_030104569 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.29:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.18:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.90:1.000:. ./.:6:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.51:1.000:. ./.:5:53,0:.:-0.53:0.928:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:0.976:. ./.:4:66,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.12:0.999:. ./.:4:77,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.97:0.993:. ./.:4:45,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:100,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.68:1.000:. ./.:5:74,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.13:1.000:. ./.:5:70,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.35:1.000:. -chr3.1 30246951 chr3.1_030246951 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,5:.: 2.42:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:39,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:72,15:.: 0.27:1.000:. ./.:4:97,14:.: 1.06:1.000:. ./.:4:46,20:.:-0.41:1.000:. ./.:4:58,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,4:.: 0.92:1.000:. ./.:4:100,9:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:36,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:90,4:.: 0.50:1.000:. ./.:4:118,11:.: 1.64:1.000:. ./.:4:28,23:.:-0.90:1.000:. ./.:4:69,15:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,24:.:-0.70:1.000:. ./.:4:37,21:.:-0.67:1.000:. ./.:4:141,5:.: 2.20:1.000:. ./.:4:30,19:.:-0.97:1.000:. ./.:4:123,7:.: 1.67:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.62:1.000:. ./.:4:79,17:.: 0.57:1.000:. ./.:4:96,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:85,10:.: 0.53:1.000:. ./.:4:14,3:.:-2.01:1.000:. ./.:4:122,9:.: 1.71:1.000:. ./.:4:120,11:.: 1.71:1.000:. ./.:4:97,17:.: 1.15:1.000:. ./.:4:81,8:.: 0.34:1.000:. ./.:4:88,18:.: 0.89:1.000:. ./.:4:121,4:.: 1.51:1.000:. ./.:4:105,7:.: 1.09:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:18,4:.:-1.85:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:37,25:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,14:.:-0.84:1.000:. ./.:4:40,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:43,18:.:-0.57:1.000:. ./.:4:44,24:.:-0.35:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:103,8:.: 1.06:1.000:. ./.:4:118,10:.: 1.61:1.000:. ./.:4:122,3:.: 1.51:1.000:. ./.:4:43,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:86,8:.: 0.50:1.000:. ./.:4:41,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:69,13:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,20:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:70,11:.: 0.08:1.000:. ./.:4:169,9:.: 3.24:1.000:. ./.:4:34,6:.:-1.26:1.000:. ./.:4:50,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:27,9:.:-1.39:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.90:1.000:. ./.:4:33,10:.:-1.16:1.000:. ./.:4:71,15:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,13:.: 0.40:1.000:. ./.:6:72,10:.: 0.11:1.000:. ./.:4:75,8:.: 0.14:1.000:. ./.:4:76,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:86,12:.: 0.63:1.000:. ./.:4:83,6:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,8:.: 0.96:1.000:. ./.:4:83,5:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:75,11:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:80,14:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,8:.: 0.50:1.000:. ./.:4:44,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:119,5:.: 1.48:1.000:. ./.:4:92,10:.: 0.76:1.000:. ./.:4:93,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:22,6:.:-1.65:1.000:. ./.:4:33,6:.:-1.29:1.000:. ./.:4:79,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:79,10:.: 0.34:1.000:. ./.:4:39,9:.:-1.00:1.000:. ./.:4:48,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,13:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,14:.:-1.13:1.000:. ./.:4:76,10:.: 0.24:1.000:. ./.:5:40,12:.:-0.87:0.928:. ./.:4:43,15:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:23,9:.:-1.52:1.000:. ./.:4:25,10:.:-1.42:1.000:. ./.:4:31,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:66,7:.:-0.18:0.976:. ./.:4:83,11:.: 0.50:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:59,11:.:-0.28:1.000:. ./.:4:89,7:.: 0.57:1.000:. ./.:4:80,8:.: 0.31:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:38,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:119,5:.: 1.48:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:92,5:.: 0.60:1.000:. ./.:4:18,9:.:-1.68:1.000:. ./.:4:80,7:.: 0.27:1.000:. ./.:4:74,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:66,6:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:87,11:.: 0.63:1.000:. ./.:4:113,4:.: 1.25:1.000:. ./.:4:70,5:.:-0.12:1.000:. ./.:4:45,19:.:-0.48:1.000:. ./.:4:77,8:.: 0.21:0.999:. ./.:4:71,15:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,7:.:-0.97:1.000:. ./.:4:41,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:49,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:59,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:105,6:.: 1.06:1.000:. ./.:4:109,2:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,17:.:-0.44:1.000:. ./.:4:70,5:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,14:.:-1.13:1.000:. ./.:4:86,11:.: 0.60:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.87:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.87:1.000:. ./.:4:36,12:.:-1.00:1.000:. ./.:4:61,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:71,5:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,11:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:83,8:.: 0.40:1.000:. ./.:4:63,3:.:-0.41:0.993:. ./.:4:39,12:.:-0.90:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,23:.:-0.64:1.000:. ./.:4:94,9:.: 0.79:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:34,6:.:-1.26:1.000:. ./.:4:126,3:.: 1.64:1.000:. ./.:4:34,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:124,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:34,9:.:-1.16:1.000:. ./.:4:52,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:133,3:.: 1.87:1.000:. ./.:4:42,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,16:.: 0.14:1.000:. ./.:4:125,5:.: 1.67:1.000:. ./.:4:126,12:.: 1.94:1.000:. ./.:4:33,11:.:-1.13:1.000:. ./.:4:54,27:.: 0.08:1.000:. ./.:4:110,6:.: 1.22:1.000:. ./.:4:42,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:65,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:40,10:.:-0.93:1.000:. ./.:4:60,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,8:.: 1.67:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.87:1.000:. ./.:5:76,3:.: 0.01:0.999:. ./.:4:88,20:.: 0.96:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.31:1.000:. ./.:4:59,11:.:-0.28:1.000:. ./.:4:79,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:44,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,20:.: 0.66:1.000:. ./.:4:119,6:.: 1.51:1.000:. ./.:4:83,8:.: 0.40:1.000:. ./.:4:59,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:44,21:.:-0.44:1.000:. ./.:4:87,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:54,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:117,10:.: 1.58:1.000:. ./.:4:71,15:.: 0.24:1.000:. ./.:4:92,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:72,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:80,10:.: 0.37:1.000:. ./.:4:32,11:.:-1.16:1.000:. ./.:4:34,19:.:-0.84:1.000:. ./.:4:77,11:.: 0.31:1.000:. ./.:5:69,6:.:-0.12:1.000:. ./.:4:85,19:.: 0.83:1.000:. ./.:4:84,10:.: 0.50:1.000:. ./.:4:20,11:.:-1.55:1.000:. ./.:4:130,7:.: 1.90:1.000:. -chr3.1 30359276 chr3.1_030359276 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:84,268:.:-0.61:1.000:. ./.:4:207,107:.:-1.09:1.000:. ./.:4:82,296:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,258:.:-0.83:1.000:. ./.:4:190,239:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,513:.: 1.42:1.000:. ./.:4:52,231:.:-1.48:1.000:. ./.:4:74,325:.:-0.02:1.000:. ./.:4:79,295:.:-0.34:1.000:. ./.:4:45,177:.:-2.25:1.000:. ./.:4:55,225:.:-1.52:1.000:. ./.:4:154,209:.:-0.47:1.000:. ./.:4:74,326:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,435:.: 0.43:1.000:. ./.:4:79,260:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.02:1.000:. ./.:4:103,344:.: 0.59:1.000:. ./.:4:83,325:.: 0.09:1.000:. ./.:4:100,374:.: 0.93:1.000:. ./.:4:95,342:.: 0.46:1.000:. ./.:4:120,128:.:-1.92:1.000:. ./.:4:101,286:.:-0.17:1.000:. ./.:4:93,297:.:-0.13:1.000:. ./.:4:82,308:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,227:.:-2.19:1.000:. ./.:4:78,356:.: 0.42:1.000:. ./.:4:119,187:.:-1.19:1.000:. ./.:4:156,197:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,340:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,352:.: 0.28:1.000:. ./.:4:108,418:.: 1.58:1.000:. ./.:4:132,179:.:-1.13:1.000:. ./.:4:59,122:.:-2.77:1.000:. ./.:4:59,275:.:-0.84:1.000:. ./.:3:19,80:.:-3.80:1.000:. ./.:4:73,340:.: 0.16:1.000:. ./.:4:86,310:.:-0.06:1.000:. ./.:4:96,323:.: 0.23:1.000:. ./.:4:116,367:.: 1.04:1.000:. ./.:4:100,401:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,439:.: 0.48:1.000:. ./.:4:97,325:.: 0.27:1.000:. ./.:4:124,350:.: 0.93:1.000:. ./.:4:192,231:.: 0.28:1.000:. ./.:4:127,456:.: 2.30:1.000:. ./.:4:106,327:.: 0.41:1.000:. ./.:4:95,327:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,140:.:-3.01:1.000:. ./.:4:90,304:.:-0.08:1.000:. ./.:4:142,478:.: 2.77:1.000:. ./.:4:94,281:.:-0.32:1.000:. ./.:4:99,331:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,390:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,496:.: 1.20:1.000:. ./.:4:59,266:.:-0.95:1.000:. ./.:4:129,376:.: 1.32:1.000:. ./.:4:79,291:.:-0.39:1.000:. ./.:4:149,428:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,477:.: 0.96:1.000:. ./.:6:113,235:.:-0.66:1.000:. ./.:4:89,324:.: 0.16:1.000:. ./.:4:90,281:.:-0.37:1.000:. ./.:4:119,428:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,488:.: 1.10:1.000:. ./.:4:108,316:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.38:1.000:. ./.:4:93,340:.: 0.41:1.000:. ./.:4:120,316:.: 0.45:1.000:. ./.:4:106,414:.: 1.51:1.000:. ./.:4:84,261:.:-0.70:1.000:. ./.:4:243,281:.: 1.56:1.000:. ./.:4:71,261:.:-0.87:1.000:. ./.:4:260,298:.: 1.99:1.000:. ./.:4:75,285:.:-0.51:1.000:. ./.:4:205,215:.: 0.24:1.000:. ./.:4:76,290:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,425:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,454:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,428:.: 0.35:1.000:. ./.:4:92,374:.: 0.82:1.000:. ./.:4:90,296:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,329:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,557:.: 1.97:1.000:. ./.:4:72,218:.:-1.40:1.000:. ./.:5:0,687:.: 3.61:0.928:. ./.:4:104,384:.: 1.10:1.000:. ./.:4:70,224:.:-1.34:1.000:. ./.:4:97,288:.:-0.20:1.000:. ./.:4:111,288:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,348:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,391:.:-0.11:0.976:. ./.:4:91,295:.:-0.18:1.000:. ./.:4:121,389:.: 1.38:1.000:. ./.:4:54,231:.:-1.46:1.000:. ./.:4:95,349:.: 0.55:1.000:. ./.:4:88,344:.: 0.40:1.000:. ./.:4:102,283:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,305:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,465:.: 0.82:1.000:. ./.:4:173,216:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,397:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,438:.: 0.47:1.000:. ./.:4:83,246:.:-0.90:1.000:. ./.:4:90,380:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1,432:.: 0.41:1.000:. ./.:4:83,291:.:-0.34:1.000:. ./.:4:100,304:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,281:.:-0.30:1.000:. ./.:4:205,231:.: 0.45:1.000:. ./.:4:113,316:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,352:.:-0.61:1.000:. ./.:4:94,456:.: 1.88:1.000:. ./.:4:95,311:.: 0.07:0.999:. ./.:4:106,306:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,355:.:-0.58:1.000:. ./.:4:120,226:.:-0.69:1.000:. ./.:4:78,260:.:-0.79:1.000:. ./.:4:79,324:.: 0.03:1.000:. ./.:4:195,227:.: 0.27:1.000:. ./.:4:165,209:.:-0.34:1.000:. ./.:4:103,323:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,427:.: 0.33:1.000:. ./.:4:91,369:.: 0.75:1.000:. ./.:4:146,205:.:-0.63:1.000:. ./.:4:95,324:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,495:.: 1.19:1.000:. ./.:4:1,425:.: 0.32:1.000:. ./.:4:102,307:.: 0.11:1.000:. ./.:4:82,295:.:-0.30:1.000:. ./.:4:84,278:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,382:.:-0.23:1.000:. ./.:4:59,272:.:-0.88:1.000:. ./.:4:132,138:.:-1.65:0.993:. ./.:4:85,317:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,261:.:-0.95:1.000:. ./.:4:122,365:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,484:.: 1.05:1.000:. ./.:4:88,295:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.49:1.000:. ./.:4:88,343:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,338:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,336:.: 0.59:1.000:. ./.:4:85,305:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,299:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,354:.: 0.89:1.000:. ./.:4:100,356:.: 0.70:1.000:. ./.:4:82,311:.:-0.10:1.000:. ./.:4:151,188:.:-0.78:1.000:. ./.:4:83,372:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.12:1.000:. ./.:4:93,345:.: 0.47:1.000:. ./.:4:77,311:.:-0.16:1.000:. ./.:4:55,106:.:-3.02:1.000:. ./.:4:92,133:.:-2.21:1.000:. ./.:4:89,384:.: 0.91:1.000:. ./.:4:91,302:.:-0.10:1.000:. ./.:4:98,323:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,472:.: 0.90:1.000:. ./.:5:70,262:.:-0.87:0.999:. ./.:4:83,317:.:-0.01:1.000:. ./.:4:59,274:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,247:.:-1.27:1.000:. ./.:4:74,284:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,384:.:-0.21:1.000:. ./.:4:80,298:.:-0.29:1.000:. ./.:4:172,210:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,313:.: 0.00:1.000:. ./.:4:183,213:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,415:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,295:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,315:.:-1.08:1.000:. ./.:4:154,146:.:-1.27:1.000:. ./.:4:80,325:.: 0.06:1.000:. ./.:4:79,285:.:-0.46:1.000:. ./.:4:93,295:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,335:.:-0.81:1.000:. ./.:4:109,390:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,452:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1,413:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,351:.:-0.34:1.000:. ./.:5:178,227:.: 0.06:1.000:. ./.:4:198,251:.: 0.61:1.000:. ./.:4:93,351:.: 0.55:1.000:. ./.:4:78,261:.:-0.78:1.000:. ./.:4:190,205:.:-0.07:1.000:. -chr3.1 30593835 chr3.1_030593835 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:72,161:0.67: 1.11:1.000:0.914 0/1/1/1:4:34,209:0.83: 1.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,157:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,68:0.61:-0.93:1.000:0.645 0/1/1/1:4:51,172:0.73: 0.95:1.000:0.998 0/1/1/1:4:53,201:0.75: 1.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,208:0.81: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,238:0.78: 2.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,316:1.00: 2.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,56:0.77:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,149:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,219:0.84: 1.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,74:0.58:-0.62:1.000:0.926 0/1/1/1:4:49,146:0.72: 0.49:1.000:0.994 1/1/1/1:4:1,152:0.99:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,90:0.64:-0.49:1.000:0.741 1/1/1/1:4:0,241:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,191:0.74: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,181:0.56: 2.63:1.000:0.968 0/1/1/1:4:13,54:0.77:-1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,79:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,153:0.77: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,145:0.65: 0.86:1.000:0.769 0/1/1/1:4:10,19:0.64:-2.25:1.000:0.682 0/1/1/1:4:34,222:0.84: 1.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,149:0.73: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:81,155:0.64: 1.16:1.000:0.697 1/1/1/1:4:3,265:0.99: 1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,179:0.79: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,166:0.67: 1.21:1.000:0.926 0/1/1/1:4:36,211:0.83: 1.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,44:0.86:-1.90:1.000:0.977 0/0/1/1:4:25,25:0.51:-1.90:1.000:0.996 1/1/1:3:0,15:1.00:-2.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,78:0.64:-0.77:1.000:0.684 0/1/1/1:4:42,92:0.66:-0.52:1.000:0.897 0/1/1/1:4:49,88:0.63:-0.47:1.000:0.550 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,90:0.52: 0.21:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,139:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,82:0.55:-0.26:1.000:0.979 0/1/1/1:4:35,125:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,118:0.68: 0.04:1.000:0.948 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,188:0.99: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,80:0.61:-0.62:1.000:0.634 0/0/1/1:4:30,50:0.61:-1.41:1.000:0.634 0/0/1/1:4:65,44:0.42:-0.93:1.000:0.903 1/1/1/1:4:1,69:0.98:-1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,107:0.85:-0.72:1.000:0.984 0/1/1/1:4:48,155:0.73: 0.62:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,93:0.99:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,130:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,67:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,105:0.71:-0.40:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,75:0.64:-0.85:1.000:0.707 0/0/1/1:4:63,59:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,135:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:36,49:0.58:-1.33:1.000:0.558 0/0/1/1:4:66,62:0.50:-0.62:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,182:0.75: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,124:0.97:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,65:0.44:-0.22:1.000:0.970 1/1/1/1:4:1,135:0.99:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,67:0.65:-1.06:1.000:0.755 0/1/1/1:4:34,122:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,59:0.48:-0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,72:0.65:-0.95:1.000:0.781 0/0/1/1:4:105,73:0.42: 0.21:1.000:0.929 0/1/1/1:4:27,102:0.75:-0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,158:0.99:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,69:0.43:-0.01:1.000:0.952 0/0/1/1:4:62,53:0.48:-0.83:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,60:0.54:-0.86:1.000:0.988 0/1/1/1:4:27,119:0.78:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,133:0.97:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,80:0.62:-0.63:1.000:0.584 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,55:0.45:-0.63:1.000:0.978 1/1/1/1:4:5,131:0.96:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,124:0.99:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:24,121:0.80:-0.34:0.928:0.996 0/1/1/1:4:38,156:0.77: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,143:0.99:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,108:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,60:0.49:-0.65:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,106:0.99:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,127:0.97:-0.58:0.976:1.000 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,129:0.61: 0.73:1.000:0.733 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,157:0.63: 1.28:1.000:0.590 0/1/1/1:4:40,206:0.81: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,54:0.61:-1.28:1.000:0.738 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,109:0.73:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,129:0.59: 0.83:1.000:0.849 1/1/1/1:4:2,165:0.99: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,211:0.99: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,108:0.72:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,111:0.69:-0.17:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,224:1.00: 0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,92:0.96:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,203:0.84: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,164:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,216:0.76: 1.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,170:0.99: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,211:0.98: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,106:0.73:-0.44:0.999:0.997 0/1/1/1:4:41,75:0.63:-0.82:1.000:0.595 0/1/1/1:4:21,71:0.73:-1.21:1.000:0.998 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,50:0.43:-0.77:1.000:0.957 0/1/1/1:4:29,92:0.72:-0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,111:0.63: 0.14:1.000:0.502 0/1/1/1:4:28,87:0.72:-0.83:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,122:0.99:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,154:0.98:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,135:0.99:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,171:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,52:0.53:-1.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,144:0.78: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,127:0.96:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,132:0.78:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,109:0.74:-0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,110:0.76:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,265:1.00: 1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,134:0.84:-0.17:0.993:0.996 0/1/1/1:4:29,55:0.64:-1.34:1.000:0.678 1/1/1/1:4:4,114:0.96:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,194:0.73: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,124:0.74:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,100:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,56:0.62:-1.26:1.000:0.591 0/1/1/1:4:33,166:0.80: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,121:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,158:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,135:0.72: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,131:0.73: 0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,369:1.00: 3.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,88:0.53: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,79:0.47: 0.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,206:0.83: 1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,173:0.66: 1.46:1.000:0.872 0/1/1/1:4:34,63:0.63:-1.13:1.000:0.625 0/0/1/1:4:60,94:0.60:-0.19:1.000:0.764 0/1/1/1:4:27,169:0.84: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,56:0.63:-1.29:1.000:0.564 0/1/1/1:4:34,176:0.81: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,153:0.98:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,239:0.99: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,266:0.79: 2.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,80:0.62:-0.63:1.000:0.584 1/1/1/1/1:5:0,237:1.00: 1.18:0.999:1.000 0/1/1/1:4:45,181:0.76: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,130:0.74: 0.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,179:0.99: 0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,225:0.98: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,144:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,54:0.68:-1.46:1.000:0.945 0/0/1/1:4:100,175:0.62: 1.80:1.000:0.515 0/1/1/1:4:47,133:0.71: 0.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:3,159:0.98:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,71:0.64:-0.93:1.000:0.644 0/1/1/1:4:72,145:0.65: 0.85:1.000:0.792 0/1/1/1:4:48,132:0.70: 0.24:1.000:0.987 0/1/1/1:4:60,138:0.67: 0.54:1.000:0.934 0/1/1/1:4:41,203:0.80: 1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,183:0.99: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,119:0.75:-0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,178:0.76: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,170:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,150:0.75: 0.42:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:93,168:0.63: 1.57:1.000:0.953 0/0/1/1:4:129,114:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,191:0.72: 1.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,74:0.55:-0.47:1.000:0.983 0/1/1/1:4:44,115:0.69:-0.11:1.000:0.980 -chr3.1 30850490 chr3.1_030850490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:7,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,2:.: 2.02:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.58:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:23,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:18,4:.: 0.78:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.96:1.000:. ./.:6:12,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:3,4:.:-1.08:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.21:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:5:16,0:.: 0.04:0.928:. ./.:4:20,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.08:0.976:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,2:.: 2.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:42,3:.: 3.64:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.65:0.999:. ./.:4:5,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:28,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.46:0.993:. ./.:4:6,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:42,0:.: 3.27:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:23,3:.: 1.28:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.09:1.000:. ./.:5:26,0:.: 1.28:0.999:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:5:22,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,2:.: 1.28:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.66:1.000:. -chr3.1 31127384 chr3.1_031127384 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.40:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:6:71,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:5:74,0:.:-0.46:0.928:. ./.:4:94,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.08:0.976:. ./.:4:83,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:94,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.16:0.993:. ./.:4:87,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:136,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.57:1.000:. ./.:5:87,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.12:1.000:. ./.:5:125,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. -chr3.1 31335056 chr3.1_031335056 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.80:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,5:.: 0.61:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:12,2:.:-1.98:1.000:. ./.:4:3,3:.:-2.72:1.000:. ./.:4:39,3:.: 0.61:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:49,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:40,6:.: 0.98:1.000:. ./.:4:12,2:.:-1.98:1.000:. ./.:4:36,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,5:.: 0.61:1.000:. ./.:4:47,2:.: 1.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:34,5:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:48,3:.: 1.44:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:45,6:.: 1.44:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.17:1.000:. ./.:3:3,1:.:-2.91:1.000:. ./.:4:33,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:29,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:41,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:48,4:.: 1.53:1.000:. ./.:4:42,7:.: 1.26:1.000:. ./.:4:43,8:.: 1.44:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,4:.:-1.52:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:37,5:.: 0.61:1.000:. ./.:4:52,6:.: 2.09:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:48,5:.: 1.62:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,6:.: 0.52:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.61:1.000:. ./.:6:44,3:.: 1.07:1.000:. ./.:4:32,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:34,4:.: 0.24:1.000:. ./.:4:48,11:.: 2.18:1.000:. ./.:4:37,9:.: 0.98:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,3:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:40,6:.: 0.98:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:42,5:.: 1.07:1.000:. ./.:4:27,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,7:.: 3.01:1.000:. ./.:4:40,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:35,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:35,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:50,6:.: 1.90:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.78:1.000:. ./.:5:62,1:.: 2.55:0.928:. ./.:4:54,5:.: 2.18:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:33,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.87:0.976:. ./.:4:49,4:.: 1.62:1.000:. ./.:4:50,7:.: 1.99:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:40,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:44,6:.: 1.35:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:38,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:40,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:47,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:46,9:.: 1.81:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,4:.: 0.52:1.000:. ./.:4:44,2:.: 0.98:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:45,2:.: 1.07:0.999:. ./.:4:32,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:11,1:.:-2.17:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:37,4:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,5:.: 0.61:1.000:. ./.:4:31,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:37,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:42,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:29,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.69:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.24:0.993:. ./.:4:29,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:42,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:41,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:35,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.04:1.000:. ./.:4:44,4:.: 1.16:1.000:. ./.:4:52,2:.: 1.72:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:38,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:40,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:8,6:.:-1.98:1.000:. ./.:4:21,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:40,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:34,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:38,3:.: 0.52:1.000:. ./.:5:22,2:.:-1.06:0.999:. ./.:4:28,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.15:1.000:. ./.:4:21,3:.:-1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.89:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.52:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:36,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:32,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:13,1:.:-1.98:1.000:. ./.:5:44,3:.: 1.07:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:41,3:.: 0.79:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.59:1.000:. -chr3.1 31597411 chr3.1_031597411 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.63:1.000:. ./.:3:8,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./.:6:7,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.64:1.000:. ./.:5:15,0:.:-0.64:0.928:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:0.976:. ./.:4:36,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:63,1:.: 2.84:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.28:0.993:. ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,1:.: 1.00:1.000:. ./.:5:21,0:.:-0.21:0.999:. ./.:4:41,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.92:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:5:50,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:82,0:.: 4.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. -chr3.1 31823210 chr3.1_031823210 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:11,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:44,9:.: 1.82:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:7,4:.:-1.63:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,4:.: 1.00:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:3:15,3:.:-1.06:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.40:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:23,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,8:.: 1.08:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,3:.: 1.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:19,14:.: 0.18:1.000:. ./.:4:28,8:.: 0.42:1.000:. ./.:4:31,6:.: 0.50:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:6:29,4:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:35,6:.: 0.83:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:33,5:.: 0.59:1.000:. ./.:4:40,2:.: 0.92:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:39,6:.: 1.16:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:33,5:.: 0.59:1.000:. ./.:4:28,13:.: 0.83:1.000:. ./.:4:9,6:.:-1.31:1.000:. ./.:5:35,0:.: 0.34:0.928:. ./.:4:67,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:42,4:.: 1.25:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:27,8:.: 0.34:1.000:. ./.:4:27,7:.: 0.26:0.976:. ./.:4:36,4:.: 0.75:1.000:. ./.:4:70,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:70,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:38,10:.: 1.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:52,6:.: 2.23:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:60,11:.: 3.30:0.999:. ./.:4:37,8:.: 1.16:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:43,8:.: 1.66:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.75:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:31,8:.: 0.67:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:47,5:.: 1.74:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:35,8:.: 1.00:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:25,11:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.92:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.00:0.993:. ./.:4:16,11:.:-0.32:1.000:. ./.:4:12,3:.:-1.31:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:37,6:.: 1.00:1.000:. ./.:4:42,9:.: 1.66:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,2:.: 0.67:1.000:. ./.:5:25,0:.:-0.48:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:28,5:.: 0.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.56:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:15,3:.:-1.06:1.000:. ./.:5:34,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.18:1.000:. -chr3.1 31882813 chr3.1_031882813 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:96,106:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,142:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.35:1.000:. ./.:4:44,170:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,268:.: 1.69:1.000:. ./.:4:45,178:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,111:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,133:.: 0.51:1.000:. ./.:4:93,111:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,36:.:-2.62:1.000:. ./.:4:8,58:.:-2.56:1.000:. ./.:4:41,158:.: 0.24:1.000:. ./.:4:96,133:.: 0.87:1.000:. ./.:4:24,147:.:-0.35:1.000:. ./.:4:40,202:.: 1.15:1.000:. ./.:4:53,201:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.39:1.000:. ./.:4:54,175:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,282:.: 1.99:1.000:. ./.:4:98,154:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,66:.:-2.56:1.000:. ./.:4:43,155:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,171:.: 0.75:1.000:. ./.:4:74,102:.:-0.24:1.000:. ./.:4:7,46:.:-2.83:1.000:. ./.:4:84,150:.: 0.98:1.000:. ./.:4:42,194:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.60:1.000:. ./.:4:44,195:.: 1.08:1.000:. ./.:4:45,196:.: 1.13:1.000:. ./.:4:84,119:.: 0.33:1.000:. ./.:4:47,153:.: 0.26:1.000:. ./.:4:7,32:.:-3.13:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.95:1.000:. ./.:3:3,18:.:-3.51:1.000:. ./.:4:0,240:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,250:.: 1.31:1.000:. ./.:4:35,121:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,132:.:-0.16:1.000:. ./.:4:41,158:.: 0.24:1.000:. ./.:4:44,145:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.20:1.000:. ./.:4:51,155:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,252:.: 1.36:1.000:. ./.:4:52,197:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.43:1.000:. ./.:4:26,117:.:-0.94:1.000:. ./.:4:101,110:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,132:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,169:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,259:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.35:1.000:. ./.:4:45,149:.: 0.14:1.000:. ./.:4:82,91:.:-0.31:1.000:. ./.:6:31,96:.:-1.28:1.000:. ./.:4:41,111:.:-0.75:1.000:. ./.:4:54,162:.: 0.60:1.000:. ./.:4:42,153:.: 0.16:1.000:. ./.:4:79,75:.:-0.71:1.000:. ./.:4:45,156:.: 0.28:1.000:. ./.:4:97,95:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,94:.:-1.57:1.000:. ./.:4:35,152:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,122:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,115:.:-1.02:1.000:. ./.:4:42,182:.: 0.77:1.000:. ./.:4:46,158:.: 0.35:1.000:. ./.:4:41,147:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.47:1.000:. ./.:4:38,161:.: 0.24:1.000:. ./.:4:76,79:.:-0.69:1.000:. ./.:4:96,94:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.14:1.000:. ./.:4:34,102:.:-1.09:1.000:. ./.:4:41,135:.:-0.24:1.000:. ./.:4:37,161:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,146:.:-0.05:1.000:. ./.:5:32,177:.: 0.45:0.928:. ./.:4:0,198:.: 0.22:1.000:. ./.:4:37,109:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.69:1.000:. ./.:4:36,150:.:-0.03:1.000:. ./.:4:74,69:.:-0.94:0.976:. ./.:4:40,124:.:-0.50:1.000:. ./.:4:53,148:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,163:.: 0.41:1.000:. ./.:4:74,88:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,161:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.85:1.000:. ./.:4:42,108:.:-0.79:1.000:. ./.:4:40,153:.: 0.11:1.000:. ./.:4:47,158:.: 0.37:1.000:. ./.:4:61,80:.:-0.98:1.000:. ./.:4:90,98:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,131:.:-1.19:1.000:. ./.:4:30,117:.:-0.85:1.000:. ./.:4:63,61:.:-1.34:1.000:. ./.:4:77,89:.:-0.45:1.000:. ./.:4:43,133:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,282:.: 1.99:1.000:. ./.:4:90,90:.:-0.16:1.000:. ./.:4:71,91:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,274:.: 1.82:1.000:. ./.:4:34,130:.:-0.50:0.999:. ./.:4:42,121:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,87:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.98:1.000:. ./.:4:31,116:.:-0.85:1.000:. ./.:4:39,116:.:-0.69:1.000:. ./.:4:29,103:.:-1.17:1.000:. ./.:4:29,126:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.07:1.000:. ./.:4:77,84:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,253:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.85:1.000:. ./.:4:34,119:.:-0.73:1.000:. ./.:4:37,117:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,102:.:-1.11:1.000:. ./.:4:45,74:.:-1.44:1.000:. ./.:4:29,108:.:-1.06:1.000:. ./.:4:29,108:.:-1.06:1.000:. ./.:4:72,109:.:-0.14:1.000:. ./.:4:18,98:.:-1.51:0.993:. ./.:4:0,173:.:-0.31:1.000:. ./.:4:46,136:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,290:.: 2.16:1.000:. ./.:4:98,120:.: 0.64:1.000:. ./.:4:63,68:.:-1.19:1.000:. ./.:4:41,87:.:-1.25:1.000:. ./.:4:57,93:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,192:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,70:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,108:.:-1.11:1.000:. ./.:4:111,152:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,281:.: 1.97:1.000:. ./.:4:57,159:.: 0.60:1.000:. ./.:4:53,173:.: 0.81:1.000:. ./.:4:105,168:.: 1.80:1.000:. ./.:4:44,117:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,246:.: 1.23:1.000:. ./.:4:101,85:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,83:.:-2.20:1.000:. ./.:4:41,191:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,235:.: 1.00:1.000:. ./.:4:47,180:.: 0.83:1.000:. ./.:4:104,162:.: 1.65:1.000:. ./.:4:37,189:.: 0.81:1.000:. ./.:5:88,108:.: 0.18:0.999:. ./.:4:41,199:.: 1.10:1.000:. ./.:4:43,167:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,174:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,139:.:-0.33:1.000:. ./.:4:57,189:.: 1.23:1.000:. ./.:4:50,160:.: 0.47:1.000:. ./.:4:44,178:.: 0.73:1.000:. ./.:4:52,80:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,159:.: 0.26:1.000:. ./.:4:83,100:.:-0.10:1.000:. ./.:4:82,92:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.07:1.000:. ./.:4:83,120:.: 0.33:1.000:. ./.:4:44,169:.: 0.54:1.000:. ./.:4:64,79:.:-0.94:1.000:. ./.:4:89,84:.:-0.31:1.000:. ./.:4:50,211:.: 1.55:1.000:. ./.:4:31,151:.:-0.12:1.000:. ./.:4:54,182:.: 1.02:1.000:. ./.:4:78,125:.: 0.33:1.000:. ./.:5:0,246:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,246:.: 1.23:1.000:. ./.:4:60,203:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.07:1.000:. ./.:4:62,178:.: 1.10:1.000:. -chr3.1 32087755 chr3.1_032087755 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:193,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.96:1.000:. ./.:3:40,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:300,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.50:1.000:. ./.:6:231,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.36:1.000:. ./.:5:362,0:.: 2.24:0.928:. ./.:4:208,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.36:0.976:. ./.:4:197,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:349,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:290,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.49:0.993:. ./.:4:280,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:379,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:350,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:357,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.15:1.000:. ./.:5:149,0:.:-1.34:0.999:. ./.:4:282,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:348,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.56:1.000:. ./.:5:239,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.48:1.000:. -chr3.1 32189111 chr3.1_032189111 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:411,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:217,75:.:-0.30:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:300,90:.: 0.96:1.000:. ./.:4:334,114:.: 1.70:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:249,84:.: 0.23:1.000:. ./.:4:108,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:120,51:.:-1.85:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:270,86:.: 0.52:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:271,76:.: 0.41:1.000:. ./.:4:238,75:.:-0.03:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:371,108:.: 2.10:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:109,27:.:-2.30:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:297,88:.: 0.89:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:138,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:232,67:.:-0.21:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:276,87:.: 0.61:1.000:. ./.:4:320,97:.: 1.30:1.000:. ./.:4:285,97:.: 0.85:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:237,67:.:-0.15:1.000:. ./.:4:79,19:.:-2.79:1.000:. ./.:4:84,40:.:-2.45:1.000:. ./.:3:60,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:244,92:.: 0.27:1.000:. ./.:4:292,80:.: 0.73:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:236,77:.:-0.03:1.000:. ./.:4:255,67:.: 0.09:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:265,78:.: 0.35:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:227,88:.: 0.00:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:219,62:.:-0.44:1.000:. ./.:4:164,53:.:-1.26:1.000:. ./.:4:227,61:.:-0.35:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:207,64:.:-0.57:1.000:. ./.:4:248,79:.: 0.15:1.000:. ./.:4:243,78:.: 0.07:1.000:. ./.:4:196,69:.:-0.65:1.000:. ./.:4:227,65:.:-0.30:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.29:1.000:. ./.:6:268,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:234,76:.:-0.07:1.000:. ./.:4:237,83:.: 0.06:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:219,74:.:-0.29:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:167,45:.:-1.32:1.000:. ./.:4:203,67:.:-0.58:1.000:. ./.:4:255,71:.: 0.14:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:250,57:.:-0.11:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:256,92:.: 0.42:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.31:1.000:. ./.:5:318,60:.: 0.80:0.928:. ./.:4:242,73:.: 0.00:1.000:. ./.:4:185,48:.:-1.06:1.000:. ./.:4:193,44:.:-1.00:1.000:. ./.:4:220,60:.:-0.45:1.000:. ./.:4:214,50:.:-0.66:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.36:0.976:. ./.:4:211,57:.:-0.61:1.000:. ./.:4:232,71:.:-0.16:1.000:. ./.:4:224,60:.:-0.40:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:187,77:.:-0.66:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:253,79:.: 0.21:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:181,48:.:-1.11:1.000:. ./.:4:246,67:.:-0.03:1.000:. ./.:4:197,57:.:-0.79:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:172,52:.:-1.17:1.000:. ./.:4:193,61:.:-0.79:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:299,104:.: 1.12:1.000:. ./.:4:327,113:.: 1.60:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:228,69:.:-0.23:1.000:. ./.:4:341,108:.: 1.71:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:291,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:183,57:.:-0.97:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:240,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:235,75:.:-0.07:1.000:. ./.:4:229,73:.:-0.17:1.000:. ./.:4:310,112:.: 1.37:1.000:. ./.:4:264,81:.: 0.38:1.000:. ./.:4:264,91:.: 0.51:1.000:. ./.:4:208,72:.:-0.45:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:204,49:.:-0.80:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:161,49:.:-1.35:0.993:. ./.:4:239,67:.:-0.12:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:355,120:.: 2.05:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:241,73:.:-0.02:1.000:. ./.:4:233,76:.:-0.08:1.000:. ./.:4:218,82:.:-0.20:1.000:. ./.:4:162,47:.:-1.36:1.000:. ./.:4:319,89:.: 1.19:1.000:. ./.:4:372,103:.: 2.05:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:265,87:.: 0.47:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:369,107:.: 2.06:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:128,23:.:-2.11:1.000:. ./.:4:268,74:.: 0.34:1.000:. ./.:4:228,86:.:-0.02:1.000:. ./.:4:250,85:.: 0.25:1.000:. ./.:4:361,104:.: 1.92:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.10:1.000:. ./.:5:258,84:.: 0.34:0.999:. ./.:4:407,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:271,77:.: 0.42:1.000:. ./.:4:197,73:.:-0.58:1.000:. ./.:4:237,78:.: 0.00:1.000:. ./.:4:244,84:.: 0.16:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:399,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,55:.:-1.03:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:250,71:.: 0.07:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:299,82:.: 0.84:1.000:. ./.:4:278,87:.: 0.64:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.30:1.000:. ./.:5:332,114:.: 1.68:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:433,144:.: 3.35:1.000:. ./.:4:251,75:.: 0.14:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.74:1.000:. -chr3.1 32527655 chr3.1_032527655 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:263,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:398,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:441,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:278,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:218,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:476,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.09:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.35:1.000:. ./.:6:155,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.13:1.000:. ./.:5:303,0:.: 0.56:0.928:. ./.:4:201,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.01:0.976:. ./.:4:250,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:442,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:359,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:185,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:166,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.57:0.993:. ./.:4:135,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:387,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:586,0:.: 3.58:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.15:1.000:. ./.:5:345,1:.: 1.02:0.999:. ./.:4:360,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:308,1:.: 0.62:1.000:. -chr3.1 32963065 chr3.1_032963065 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,218:1.00: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,118:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,145:0.83:-0.13:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,128:0.65: 0.22:1.000:0.791 0/0/1/1:4:100,106:0.50: 0.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,78:0.73:-1.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-2.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,35:0.59:-2.19:1.000:0.835 0/1/1/1:4:43,123:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,151:0.86:-0.11:1.000:0.975 0/1/1/1:4:46,155:0.78: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,98:0.66:-0.61:1.000:0.869 0/0/1/1:4:69,96:0.57:-0.32:1.000:0.946 0/0/1/1:4:98,103:0.49: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,103:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,56:0.38:-0.70:1.000:0.533 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,57:0.95:-2.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,179:0.83: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,172:0.53: 2.32:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.77:-2.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,123:0.78:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,92:0.74:-1.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:136,78:0.35: 0.54:1.000:0.782 0/0/1/1:4:67,69:0.49:-0.82:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,70:0.68:-1.40:1.000:0.953 0/1/1/1:4:7,25:0.79:-2.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,48:0.55:-1.71:1.000:0.979 1/1/1:3:1,8:0.89:-3.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,81:0.65:-1.03:1.000:0.793 0/1/1/1:4:44,106:0.71:-0.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,109:0.56: 0.10:1.000:0.959 0/1/1/1:4:40,143:0.79: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,96:0.54:-0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:112,107:0.47: 0.62:1.000:0.992 0/1/1/1:4:45,170:0.80: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,129:0.51: 1.06:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,186:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,191:0.76: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,54:0.28: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,140:0.73: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,10:0.32:-2.67:1.000:0.951 0/0/1/1:4:83,82:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,41:0.38:-1.40:1.000:0.614 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,288:1.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,137:0.52: 1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,119:0.55: 0.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:96,105:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,58:0.33:-0.21:1.000:0.933 0/0/1/1:4:97,114:0.52: 0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,175:0.78: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,168:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:45,175:0.80: 0.64:1.000:0.928 0/1/1/1:4:59,234:0.80: 1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,96:0.62:-0.51:1.000:0.612 0/1/1/1:4:51,112:0.69:-0.35:1.000:0.970 0/1/1/1:4:39,187:0.83: 0.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,197:0.79: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,158:0.80: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,137:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,122:0.74:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,133:0.56: 0.89:1.000:0.974 0/0/1/1:4:95,108:0.51: 0.35:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,214:1.00: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,54:0.56:-1.54:1.000:0.974 0/1/1/1:4:65,190:0.75: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,188:0.79: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,112:0.46: 0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:101,109:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,158:0.53: 1.85:1.000:0.992 0/1/1/1:4:57,175:0.76: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,113:0.53: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:100,49:0.32:-0.60:1.000:0.961 1/1/1/1:4:1,233:1.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,174:0.55: 2.23:1.000:0.984 0/1/1/1:4:42,94:0.69:-0.82:1.000:0.977 0/0/0/1/1:5:124,123:0.48: 1.11:0.928:0.692 0/1/1/1:4:52,122:0.70:-0.16:1.000:0.988 0/0/1/1:4:53,89:0.62:-0.72:1.000:0.563 0/0/1/1:4:93,60:0.38:-0.53:1.000:0.540 0/0/1/1:4:103,132:0.55: 0.90:1.000:0.982 0/0/1/1:4:106,124:0.52: 0.82:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,226:0.81: 1.69:0.976:1.000 0/1/1/1:4:47,131:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,226:0.78: 1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,73:0.70:-1.38:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,280:1.00: 1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,121:0.65: 0.01:1.000:0.834 0/1/1/1:4:58,128:0.69: 0.05:1.000:0.972 0/0/0/1:4:75,43:0.35:-1.14:1.000:0.783 0/0/1/1:4:108,140:0.55: 1.13:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,104:0.54: 0.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:105,123:0.52: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:82,48:0.36:-0.93:1.000:0.737 0/1/1/1:4:70,134:0.65: 0.36:1.000:0.827 0/0/1/1:4:90,102:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,103:0.64:-0.42:1.000:0.733 0/1/1/1:4:58,117:0.67:-0.14:1.000:0.909 0/0/0/1:4:96,36:0.26:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,117:0.60: 0.15:1.000:0.782 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,118:0.54: 0.52:1.000:0.988 0/0/0/1:4:76,48:0.37:-1.03:1.000:0.525 1/1/1/1:4:0,208:1.00: 0.43:0.999:1.000 0/1/1/1:4:67,221:0.77: 1.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,138:0.81:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,206:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,194:0.80: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,181:0.82: 0.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,169:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,48:0.28:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,121:0.52: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:153,70:0.30: 0.69:1.000:0.983 0/0/1/1:4:73,107:0.58:-0.06:1.000:0.895 0/0/1/1:4:83,114:0.57: 0.24:1.000:0.954 0/0/1/1:4:101,159:0.60: 1.34:1.000:0.760 0/0/1/1:4:95,130:0.57: 0.73:1.000:0.957 0/0/0/1:4:89,40:0.30:-0.95:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,131:0.49: 1.31:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,81:0.71:-1.21:0.993:0.994 0/0/1/1:4:108,141:0.55: 1.15:1.000:0.977 0/1/1/1:4:53,97:0.64:-0.58:1.000:0.719 0/0/0/1:4:111,62:0.35:-0.18:1.000:0.832 0/1/1/1:4:49,208:0.81: 1.29:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,208:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,163:0.82: 0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,169:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,71:0.35: 0.19:1.000:0.768 0/1/1/1:4:53,161:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,49:0.34:-0.79:1.000:0.856 0/1/1/1:4:38,89:0.70:-0.98:1.000:0.988 0/1/1/1:4:71,163:0.70: 0.89:1.000:0.984 0/0/1/1:4:149,187:0.54: 2.67:1.000:0.986 0/1/1/1:4:41,171:0.81: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,128:0.75:-0.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:22,233:0.92: 1.25:1.000:0.979 0/1/1/1:4:44,159:0.79: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,92:0.47: 0.07:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,29:0.52:-2.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,107:0.62:-0.21:1.000:0.578 0/0/0/1:4:116,68:0.36: 0.01:1.000:0.733 0/0/1/1:4:86,131:0.59: 0.59:1.000:0.833 0/1/1/1:4:80,198:0.72: 1.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,141:0.79:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:45,113:0.72:-0.44:0.999:0.728 0/1/1/1:4:52,109:0.68:-0.39:1.000:0.944 0/1/1/1:4:38,130:0.78:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,34:0.31:-1.33:1.000:0.979 0/0/0/1:4:74,40:0.34:-1.21:1.000:0.881 0/0/1/1:4:102,95:0.46: 0.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,210:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,120:0.73:-0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,199:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,141:0.80:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,78:0.71:-1.26:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,174:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,96:0.64:-0.58:1.000:0.631 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,121:0.70:-0.16:1.000:0.983 0/1/1/1:4:31,80:0.73:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,137:0.57: 0.89:1.000:0.934 0/0/1/1:4:89,115:0.55: 0.36:1.000:0.980 0/1/1/1:4:39,110:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,138:0.75: 0.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,225:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,169:0.81: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,91:0.58:-0.53:1.000:0.893 0/1/1/1:4:48,119:0.72:-0.28:1.000:0.994 -chr3.1 33334412 chr3.1_033334412 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,39:.: 2.18:1.000:. ./.:4:7,32:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:23,39:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,61:.: 1.47:1.000:. ./.:4:14,30:.: 0.37:1.000:. ./.:4:7,6:.:-1.63:1.000:. ./.:4:24,22:.: 0.50:1.000:. ./.:4:21,22:.: 0.30:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.95:1.000:. ./.:4:1,6:.:-2.02:1.000:. ./.:4:8,22:.:-0.53:1.000:. ./.:4:29,23:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:13,32:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,56:.: 2.24:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.88:1.000:. ./.:4:8,28:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.37:1.000:. ./.:4:18,31:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.21:1.000:. ./.:4:9,37:.: 0.50:1.000:. ./.:4:15,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.34:1.000:. ./.:4:33,23:.: 1.14:1.000:. ./.:4:25,65:.: 3.34:1.000:. ./.:4:0,67:.: 1.85:1.000:. ./.:4:17,30:.: 0.56:1.000:. ./.:4:10,42:.: 0.88:1.000:. ./.:4:23,27:.: 0.76:1.000:. ./.:4:10,51:.: 1.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.08:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,64:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,57:.: 1.21:1.000:. ./.:4:7,27:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,28:.: 0.18:1.000:. ./.:4:7,27:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.76:1.000:. ./.:4:6,14:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1,28:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:8,23:.:-0.47:1.000:. ./.:4:23,28:.: 0.82:1.000:. ./.:4:15,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,27:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.02:1.000:. ./.:4:4,21:.:-0.86:1.000:. ./.:4:18,26:.: 0.37:1.000:. ./.:6:10,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,50:.: 1.21:1.000:. ./.:4:6,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:8,28:.:-0.15:1.000:. ./.:4:14,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,32:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,11:.:-0.34:1.000:. ./.:4:2,12:.:-1.57:1.000:. ./.:4:22,26:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.28:1.000:. ./.:4:9,10:.:-1.24:1.000:. ./.:4:14,34:.: 0.63:1.000:. ./.:4:10,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.60:1.000:. ./.:4:6,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,21:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,9:.:-1.31:1.000:. ./.:4:6,19:.:-0.86:1.000:. ./.:4:7,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:10,26:.:-0.15:1.000:. ./.:5:5,27:.:-0.41:0.928:. ./.:4:0,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,16:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,8:.:-1.50:0.976:. ./.:4:12,22:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,28:.: 0.30:1.000:. ./.:4:12,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,25:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:13,22:.:-0.21:1.000:. ./.:4:6,26:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,42:.: 1.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:17,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:13,30:.: 0.30:1.000:. ./.:4:17,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:19,28:.: 0.56:1.000:. ./.:4:9,23:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,56:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,26:.: 0.30:1.000:. ./.:4:16,13:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,71:.: 2.11:1.000:. ./.:4:6,22:.:-0.66:0.999:. ./.:4:8,14:.:-1.05:1.000:. ./.:4:15,13:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.86:1.000:. ./.:4:4,4:.:-1.95:1.000:. ./.:4:5,12:.:-1.37:1.000:. ./.:4:7,23:.:-0.53:1.000:. ./.:4:13,27:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:15,14:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,72:.: 2.18:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,19:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,17:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,11:.:-1.24:1.000:. ./.:4:8,15:.:-0.99:1.000:. ./.:4:5,25:.:-0.53:1.000:. ./.:4:7,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,34:.: 1.72:1.000:. ./.:4:3,20:.:-0.99:0.993:. ./.:4:0,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,41:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,63:.: 1.59:1.000:. ./.:4:35,18:.: 0.95:1.000:. ./.:4:19,19:.:-0.02:1.000:. ./.:4:11,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,20:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:19,26:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.56:1.000:. ./.:4:2,14:.:-1.44:1.000:. ./.:4:22,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,35:.: 0.76:1.000:. ./.:4:11,49:.: 1.40:1.000:. ./.:4:29,26:.: 1.08:1.000:. ./.:4:11,18:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.63:1.000:. ./.:4:26,32:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.15:1.000:. ./.:4:12,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.56:1.000:. ./.:4:10,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,22:.: 0.95:1.000:. ./.:4:9,26:.:-0.21:1.000:. ./.:5:25,26:.: 0.82:0.999:. ./.:4:15,39:.: 1.01:1.000:. ./.:4:8,27:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,39:.: 0.76:1.000:. ./.:4:13,35:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,57:.: 2.43:1.000:. ./.:4:11,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:10,14:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:10,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:22,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.37:1.000:. ./.:4:23,27:.: 0.76:1.000:. ./.:4:15,47:.: 1.53:1.000:. ./.:4:20,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:23,19:.: 0.24:1.000:. ./.:4:13,38:.: 0.82:1.000:. ./.:4:10,21:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:29,24:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,70:.: 2.05:1.000:. ./.:4:12,41:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,32:.: 0.63:1.000:. -chr3.1 33850264 chr3.1_033850264 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:180,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:260,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.79:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.39:1.000:. ./.:3:10,0:.:-4.01:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:269,1:.: 2.45:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:211,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:155,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:203,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:122,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:194,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:189,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.48:1.000:. ./.:5:282,0:.: 2.75:0.928:. ./.:4:186,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:0.976:. ./.:4:169,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.28:0.999:. ./.:4:184,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.30:0.993:. ./.:4:174,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:227,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:253,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.34:1.000:. ./.:5:145,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:176,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.02:1.000:. -chr3.1 34111507 chr3.1_034111507 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:1,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.72:1.000:. ./.:6:17,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.85:1.000:. ./.:5:32,0:.: 0.22:0.928:. ./.:4:40,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:0.976:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:0.999:. ./.:4:34,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.28:0.993:. ./.:4:17,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:5:39,0:.: 0.97:0.999:. ./.:4:39,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.11:1.000:. -chr3.1 34394143 chr3.1_034394143 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:46,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:11,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:35,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:36,6:.: 1.25:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.99:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:35,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.25:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:28,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.08:1.000:. ./.:6:29,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:44,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:34,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.31:1.000:. ./.:5:22,1:.:-0.37:0.928:. ./.:4:23,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:0.976:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:68,0:.: 3.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:31,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:8,6:.:-1.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:25,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:27,2:.: 0.14:0.999:. ./.:4:42,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:0.993:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:11,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:40,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:31,3:.: 0.57:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.45:1.000:. ./.:5:37,1:.: 0.91:0.999:. ./.:4:20,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:26,2:.: 0.06:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.99:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.23:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:10,3:.:-1.22:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.28:1.000:. -chr3.1 34491941 chr3.1_034491941 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:117,104:.:-0.59:1.000:. ./.:4:151,59:.:-0.72:1.000:. ./.:4:180,160:.: 0.86:1.000:. ./.:4:169,68:.:-0.39:1.000:. ./.:4:242,162:.: 1.64:1.000:. ./.:4:132,82:.:-0.67:1.000:. ./.:4:64,71:.:-1.64:1.000:. ./.:4:98,85:.:-1.05:1.000:. ./.:4:102,100:.:-0.82:1.000:. ./.:4:49,20:.:-2.44:1.000:. ./.:4:22,36:.:-2.58:1.000:. ./.:4:153,76:.:-0.49:1.000:. ./.:4:79,134:.:-0.69:1.000:. ./.:4:151,51:.:-0.82:1.000:. ./.:4:126,115:.:-0.34:1.000:. ./.:4:141,115:.:-0.16:1.000:. ./.:4:178,108:.: 0.20:1.000:. ./.:4:98,97:.:-0.91:1.000:. ./.:4:270,25:.: 0.31:1.000:. ./.:4:100,125:.:-0.54:1.000:. ./.:4:79,57:.:-1.62:1.000:. ./.:4:175,125:.: 0.37:1.000:. ./.:4:193,145:.: 0.84:1.000:. ./.:4:98,144:.:-0.33:1.000:. ./.:4:17,31:.:-2.70:1.000:. ./.:4:116,141:.:-0.15:1.000:. ./.:4:129,60:.:-0.98:1.000:. ./.:4:205,103:.: 0.47:1.000:. ./.:4:176,143:.: 0.61:1.000:. ./.:4:114,97:.:-0.71:1.000:. ./.:4:117,111:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,84:.:-1.25:1.000:. ./.:4:17,11:.:-2.94:1.000:. ./.:4:112,48:.:-1.33:1.000:. ./.:3:16,14:.:-2.92:1.000:. ./.:4:188,95:.: 0.17:1.000:. ./.:4:187,140:.: 0.70:1.000:. ./.:4:200,23:.:-0.56:1.000:. ./.:4:220,118:.: 0.84:1.000:. ./.:4:214,91:.: 0.44:1.000:. ./.:4:175,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:196,74:.: 0.01:1.000:. ./.:4:201,127:.: 0.72:1.000:. ./.:4:161,155:.: 0.57:1.000:. ./.:4:331,182:.: 2.97:1.000:. ./.:4:195,134:.: 0.73:1.000:. ./.:4:246,130:.: 1.30:1.000:. ./.:4:155,101:.:-0.16:1.000:. ./.:4:214,152:.: 1.18:1.000:. ./.:4:229,107:.: 0.81:1.000:. ./.:4:181,14:.:-0.91:1.000:. ./.:4:127,68:.:-0.91:1.000:. ./.:4:145,211:.: 1.06:1.000:. ./.:4:188,130:.: 0.59:1.000:. ./.:4:216,113:.: 0.73:1.000:. ./.:4:235,101:.: 0.81:1.000:. ./.:4:241,153:.: 1.52:1.000:. ./.:4:188,94:.: 0.15:1.000:. ./.:4:127,106:.:-0.44:1.000:. ./.:6:182,75:.:-0.15:1.000:. ./.:4:178,84:.:-0.09:1.000:. ./.:4:169,122:.: 0.26:1.000:. ./.:4:225,134:.: 1.09:1.000:. ./.:4:141,65:.:-0.77:1.000:. ./.:4:196,124:.: 0.62:1.000:. ./.:4:109,148:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,96:.:-0.56:1.000:. ./.:4:124,188:.: 0.52:1.000:. ./.:4:255,116:.: 1.24:1.000:. ./.:4:164,100:.:-0.06:1.000:. ./.:4:253,134:.: 1.43:1.000:. ./.:4:91,36:.:-1.73:1.000:. ./.:4:179,159:.: 0.84:1.000:. ./.:4:191,179:.: 1.23:1.000:. ./.:4:175,97:.: 0.03:1.000:. ./.:4:211,148:.: 1.09:1.000:. ./.:4:165,91:.:-0.16:1.000:. ./.:4:132,134:.:-0.04:1.000:. ./.:4:113,120:.:-0.44:1.000:. ./.:4:263,81:.: 0.91:1.000:. ./.:4:145,103:.:-0.26:1.000:. ./.:4:160,127:.: 0.22:1.000:. ./.:4:229,141:.: 1.23:1.000:. ./.:4:148,90:.:-0.38:1.000:. ./.:5:245,49:.: 0.30:0.928:. ./.:4:279,148:.: 1.92:1.000:. ./.:4:139,135:.: 0.06:1.000:. ./.:4:188,147:.: 0.80:1.000:. ./.:4:225,127:.: 1.01:1.000:. ./.:4:167,106:.: 0.05:1.000:. ./.:4:105,120:.:-0.54:0.976:. ./.:4:157,120:.: 0.09:1.000:. ./.:4:216,130:.: 0.93:1.000:. ./.:4:136,37:.:-1.17:1.000:. ./.:4:143,215:.: 1.08:1.000:. ./.:4:131,128:.:-0.13:1.000:. ./.:4:256,121:.: 1.31:1.000:. ./.:4:168,66:.:-0.43:1.000:. ./.:4:207,93:.: 0.37:1.000:. ./.:4:209,81:.: 0.25:1.000:. ./.:4:69,55:.:-1.77:1.000:. ./.:4:125,93:.:-0.63:1.000:. ./.:4:206,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:203,209:.: 1.74:1.000:. ./.:4:102,94:.:-0.89:1.000:. ./.:4:112,89:.:-0.83:1.000:. ./.:4:155,52:.:-0.76:1.000:. ./.:4:189,19:.:-0.75:1.000:. ./.:4:258,75:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,61:.:-1.28:1.000:. ./.:4:98,181:.: 0.12:1.000:. ./.:4:205,154:.: 1.09:1.000:. ./.:4:220,84:.: 0.42:0.999:. ./.:4:177,112:.: 0.24:1.000:. ./.:4:109,142:.:-0.22:1.000:. ./.:4:240,172:.: 1.74:1.000:. ./.:4:160,67:.:-0.52:1.000:. ./.:4:162,96:.:-0.14:1.000:. ./.:4:181,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:169,111:.: 0.13:1.000:. ./.:4:282,132:.: 1.76:1.000:. ./.:4:113,136:.:-0.25:1.000:. ./.:4:267,192:.: 2.31:1.000:. ./.:4:198,131:.: 0.73:1.000:. ./.:4:217,183:.: 1.59:1.000:. ./.:4:192,140:.: 0.76:1.000:. ./.:4:194,203:.: 1.56:1.000:. ./.:4:152,109:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,200:.: 0.08:1.000:. ./.:4:151,110:.:-0.10:1.000:. ./.:4:159,96:.:-0.17:1.000:. ./.:4:87,121:.:-0.75:1.000:. ./.:4:122,117:.:-0.37:0.993:. ./.:4:214,95:.: 0.48:1.000:. ./.:4:157,103:.:-0.11:1.000:. ./.:4:304,144:.: 2.18:1.000:. ./.:4:141,65:.:-0.77:1.000:. ./.:4:128,135:.:-0.08:1.000:. ./.:4:169,148:.: 0.58:1.000:. ./.:4:117,168:.: 0.19:1.000:. ./.:4:281,197:.: 2.54:1.000:. ./.:4:147,127:.: 0.06:1.000:. ./.:4:196,53:.:-0.25:1.000:. ./.:4:125,91:.:-0.65:1.000:. ./.:4:143,146:.: 0.24:1.000:. ./.:4:306,129:.: 2.02:1.000:. ./.:4:142,103:.:-0.30:1.000:. ./.:4:152,129:.: 0.14:1.000:. ./.:4:137,92:.:-0.49:1.000:. ./.:4:172,110:.: 0.15:1.000:. ./.:4:216,127:.: 0.90:1.000:. ./.:4:95,93:.:-0.99:1.000:. ./.:4:70,47:.:-1.86:1.000:. ./.:4:142,17:.:-1.34:1.000:. ./.:4:245,111:.: 1.06:1.000:. ./.:4:173,108:.: 0.14:1.000:. ./.:4:120,126:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,103:.:-0.03:1.000:. ./.:5:103,93:.:-0.89:0.999:. ./.:4:154,96:.:-0.24:1.000:. ./.:4:144,109:.:-0.20:1.000:. ./.:4:123,88:.:-0.71:1.000:. ./.:4:144,122:.:-0.04:1.000:. ./.:4:180,107:.: 0.22:1.000:. ./.:4:157,99:.:-0.16:1.000:. ./.:4:151,102:.:-0.20:1.000:. ./.:4:78,51:.:-1.71:1.000:. ./.:4:192,122:.: 0.54:1.000:. ./.:4:159,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:111,47:.:-1.36:1.000:. ./.:4:86,95:.:-1.08:1.000:. ./.:4:124,75:.:-0.86:1.000:. ./.:4:112,136:.:-0.26:1.000:. ./.:4:155,87:.:-0.33:1.000:. ./.:4:105,94:.:-0.86:1.000:. ./.:4:97,91:.:-0.99:1.000:. ./.:4:159,176:.: 0.80:1.000:. ./.:4:171,34:.:-0.78:1.000:. ./.:4:141,87:.:-0.50:1.000:. ./.:4:111,108:.:-0.61:1.000:. ./.:4:232,97:.: 0.73:1.000:. ./.:4:316,139:.: 2.26:1.000:. ./.:4:140,99:.:-0.37:1.000:. ./.:4:166,111:.: 0.09:1.000:. ./.:4:162,113:.: 0.07:1.000:. -chr3.1 34811838 chr3.1_034811838 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:112,103:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,30:0.25:-1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,116:0.69:-0.54:1.000:0.974 0/0/0/1:4:127,58:0.33:-0.05:1.000:0.929 0/0/1/1:4:134,94:0.42: 0.89:1.000:0.928 0/0/1/1:4:63,52:0.46:-1.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:85,63:0.44:-0.87:1.000:0.961 0/0/0/1:4:131,39:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,29:0.22:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,105:0.59:-0.21:1.000:0.891 0/0/0/1:4:134,45:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,64:0.46:-0.97:1.000:0.986 0/0/0/1:4:135,34:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,43:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:92,22:0.21:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,75:0.54:-1.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:93,41:0.32:-1.17:1.000:0.952 0/0/1/1:4:124,110:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,109:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,103:0.55:-0.03:1.000:0.975 0/0/1/1:4:76,72:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,92:0.48: 0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,72:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/0:4:143,9:0.06:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,75:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:88,31:0.28:-1.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,89:0.74:-1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:206,62:0.25: 1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,79:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,41:0.43:-1.94:1.000:0.934 0/0/1/1:4:50,60:0.55:-1.70:1.000:0.983 0/0/1/1:4:50,36:0.43:-2.22:1.000:0.946 0/0/1/1:4:66,86:0.56:-0.78:1.000:0.959 0/0/0:3:100,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,38:0.30:-1.19:1.000:0.984 0/0/1/1:4:77,63:0.46:-1.04:1.000:0.988 0/0/1/1:4:91,83:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,91:0.54:-0.36:1.000:0.990 0/1/1/1:4:40,108:0.71:-0.87:1.000:0.989 0/0/0/1:4:152,56:0.28: 0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,99:0.51: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,118:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,87:0.48:-0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:144,151:0.52: 2.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:166,48:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,53:0.28: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,43:0.45:-1.98:1.000:0.983 0/1/1/1:4:37,135:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,31:0.24:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,52:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:152,24:0.15:-0.25:1.000:0.982 0/0/0/1:4:134,52:0.29:-0.03:1.000:0.989 0/0/1/1:4:116,97:0.47: 0.56:1.000:0.990 0/1/1/1:4:37,124:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,83:0.44: 0.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:80,90:0.53:-0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:162,143:0.48: 2.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:159,36:0.20: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:167,80:0.34: 1.30:1.000:0.917 0/0/1/1:4:124,121:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,43:0.28:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:200,141:0.42: 3.36:1.000:0.932 0/0/0/0:4:291,0:0.00: 2.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,118:0.53: 0.84:1.000:0.993 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,130:0.50: 1.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,44:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,103:0.47: 0.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:126,46:0.28:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:149,138:0.49: 2.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,26:0.18:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:273,1:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,93:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,105:0.59:-0.21:1.000:0.891 0/1/1/1:4:49,108:0.67:-0.67:1.000:0.919 0/0/1/1:4:124,97:0.45: 0.73:1.000:0.979 0/0/0/1:4:186,51:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,1:0.01: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,95:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:176,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,123:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:205,57:0.23: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:157,85:0.36: 1.19:0.928:0.943 0/1/1/1:4:42,157:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,49:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,100:0.56:-0.19:1.000:0.970 0/1/1/1:4:44,141:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:110,41:0.29:-0.80:1.000:0.993 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 0.80:0.976:1.000 0/0/0/1:4:160,53:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,154:0.67: 0.76:1.000:0.938 0/0/0/1:4:123,30:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,99:0.47: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:190,48:0.22: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,44:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,112:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,113:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:192,67:0.27: 1.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:185,61:0.26: 1.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,100:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:235,67:0.24: 2.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,38:0.20: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,35:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,77:0.49:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,122:0.46: 1.78:1.000:0.990 0/0/0/1:4:154,30:0.17:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,49:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,58:0.30: 0.43:1.000:0.989 0/0/0/1:4:188,61:0.26: 1.35:0.999:0.999 0/0/0/1:4:190,49:0.22: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,18:0.24:-2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,132:0.61: 0.58:1.000:0.710 0/0/1/1:4:123,119:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,97:0.46: 0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:105,101:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,56:0.26: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,43:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,49:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,52:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,94:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,93:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,102:0.55:-0.01:1.000:0.983 0/0/0/1:4:140,70:0.35: 0.49:1.000:0.817 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,32:0.21:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,41:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,87:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,64:0.56:-1.63:0.993:0.958 0/0/1/1:4:72,75:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,68:0.52:-1.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:154,38:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,53:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,37:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,40:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,122:0.55: 0.78:1.000:0.981 0/0/1/1:4:140,116:0.46: 1.50:1.000:0.989 0/0/1/1:4:96,101:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,78:0.43:-0.05:1.000:0.953 0/0/0/1:4:179,46:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,181:0.70: 1.39:1.000:0.983 0/0/1/1:4:94,101:0.52: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:83,96:0.54:-0.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:116,74:0.40: 0.05:1.000:0.804 0/0/0/1:4:129,51:0.30:-0.16:1.000:0.986 0/0/1/1:4:101,93:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,87:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,78:0.66:-1.57:1.000:0.843 0/0/1/1:4:75,79:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:129,47:0.28:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,61:0.30: 0.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,106:0.48: 0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:170,54:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:138,43:0.25:-0.14:0.999:0.911 0/0/0/1:4:142,46:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,84:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,35:0.29:-1.35:1.000:0.990 0/0/0/1:4:127,44:0.27:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,89:0.46: 0.23:1.000:0.987 0/0/0/1:4:38,8:0.19:-3.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,83:0.57:-0.91:1.000:0.954 0/0/0/1:4:122,38:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,30:0.22:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,73:0.44:-0.41:1.000:0.971 0/0/0/1:4:135,40:0.25:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,100:0.75:-1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,39:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,35:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,41:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,51:0.28: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,99:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,67:0.48:-0.97:1.000:0.995 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,129:0.69:-0.12:1.000:0.970 0/0/1/1:4:96,88:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,113:0.48: 1.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,95:0.67:-1.11:1.000:0.937 0/0/0/1:4:146,49:0.27: 0.16:1.000:0.998 -chr3.1 34893744 chr3.1_034893744 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:230,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:296,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:285,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.79:1.000:. ./.:3:28,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.72:1.000:. ./.:6:142,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:287,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.31:1.000:. ./.:5:122,0:.:-0.63:0.928:. ./.:4:146,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.53:0.976:. ./.:4:190,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:300,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:288,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.95:0.999:. ./.:4:140,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.49:0.993:. ./.:4:39,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:357,1:.: 3.25:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.43:1.000:. ./.:5:226,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:228,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.88:1.000:. -chr3.1 35149155 chr3.1_035149155 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,29:0.50: 1.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,12:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,20:0.28: 2.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,26:0.64: 0.53:1.000:0.637 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,16:0.56:-0.33:1.000:0.972 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.69:-1.82:1.000:0.977 0/0/0/1:4:15,9:0.35:-0.57:1.000:0.799 0/0/0/1:4:17,11:0.37:-0.25:1.000:0.602 0/0/0/1:4:17,9:0.32:-0.41:1.000:0.952 0/0/0/1:4:23,8:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,22:0.66:-0.02:1.000:0.854 0/0/1/1:4:15,21:0.55: 0.38:1.000:0.981 0/0/0/1:4:29,17:0.34: 1.16:1.000:0.842 0/1/1/1:4:19,42:0.64: 2.34:1.000:0.682 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-2.21:1.000:0.976 0/0/1/1:4:18,18:0.47: 0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,25:0.61: 0.53:1.000:0.656 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.40:-0.80:1.000:0.811 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,11:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,23:0.65: 0.14:1.000:0.762 0/0/1/1:4:16,23:0.55: 0.61:1.000:0.975 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,14:0.47:-0.25:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.65:-1.66:1.000:0.787 1/1/1:3:0,2:1.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.19: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.14: 0.06:1.000:0.973 0/0/1/1:4:21,26:0.52: 1.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:15,9:0.35:-0.57:1.000:0.799 0/0/1/1:4:15,20:0.54: 0.30:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,21:0.65:-0.09:1.000:0.787 0/0/1/1:4:21,16:0.41: 0.45:1.000:0.840 0/1/1/1:4:9,27:0.69: 0.38:1.000:0.977 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.30: 0.45:1.000:0.986 0/0/1/1:4:11,21:0.61: 0.06:1.000:0.673 0/0/0/1:4:47,17:0.24: 2.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.65:-1.66:1.000:0.787 0/0/0/1:4:26,16:0.36: 0.85:1.000:0.742 0/0/1/1:4:8,8:0.47:-1.19:1.000:0.993 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,22:0.62: 0.14:1.000:0.561 0/1/1/1:4:10,24:0.65: 0.22:1.000:0.830 0/0/1/1:4:27,21:0.41: 1.32:1.000:0.872 0/0/1/1:4:22,22:0.47: 1.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,22:0.42: 1.39:1.000:0.924 0/0/0/1:4:17,5:0.21:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.59:-0.96:1.000:0.862 0/0/0/0/0/1:6:22,6:0.19:-0.25:1.000:0.940 0/0/0/1:4:22,7:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,14:0.39: 0.22:1.000:0.642 0/0/0/1:4:26,13:0.31: 0.61:1.000:0.976 0/0/1/1:4:7,9:0.53:-1.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:28,19:0.38: 1.24:1.000:0.548 0/0/1/1:4:10,9:0.45:-0.96:1.000:0.977 0/0/0/1:4:11,5:0.29:-1.19:1.000:0.993 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.47: 0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,12:0.40:-0.25:1.000:0.811 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.42:-1.04:1.000:0.907 0/0/0/1:4:27,14:0.32: 0.77:1.000:0.963 0/0/0/1:4:22,12:0.33: 0.22:1.000:0.931 0/0/1/1:4:18,18:0.47: 0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,22:0.62: 0.14:1.000:0.561 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,15:0.41: 0.22:1.000:0.892 0/0/0/1:4:35,19:0.33: 1.79:1.000:0.935 0/1/1/1:4:4,20:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,24:0.74:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,12:0.54:-0.80:1.000:0.988 0/1/1/1/1:5:3,28:0.87:-0.02:0.928:0.985 0/0/0/1:4:39,9:0.17: 1.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:25,12:0.30: 0.45:1.000:0.986 0/0/1/1:4:20,24:0.52: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,36:0.68: 1.39:1.000:0.952 0/1/1/1:4:9,21:0.65:-0.09:1.000:0.787 0/0/1/1:4:5,10:0.62:-1.27:0.976:0.561 0/0/0/1:4:16,4:0.18:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,11:0.29: 0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:18,5:0.20:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.56:-0.72:1.000:0.974 0/0/0/1:4:30,16:0.32: 1.16:1.000:0.947 0/1/1/1:4:5,27:0.79: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,26:0.62: 0.61:1.000:0.561 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,15:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,15:0.26: 1.63:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.44:-1.27:1.000:0.968 0/0/0/1:4:27,6:0.17: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,24:0.55: 0.77:1.000:0.979 0/0/0/1:4:48,7:0.12: 1.86:1.000:0.657 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,31:0.52: 1.94:1.000:0.994 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.33:0.999:1.000 0/0/0/1:4:32,14:0.28: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,14:0.59:-0.72:1.000:0.834 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,11:0.35:-0.17:1.000:0.758 0/0/1/1:4:14,10:0.39:-0.57:1.000:0.699 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,33:0.54: 2.02:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,23:0.42: 1.63:1.000:0.897 0/0/0/1:4:33,13:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,17:0.39: 0.77:1.000:0.676 0/0/1/1:4:12,20:0.58: 0.06:1.000:0.893 0/1/1/1:4:10,21:0.63:-0.02:1.000:0.562 0/0/1/1:4:9,10:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,28:0.68: 0.53:1.000:0.956 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,10:0.36:-0.41:0.993:0.702 0/0/1/1:4:12,20:0.58: 0.06:1.000:0.893 0/0/0/1:4:24,6:0.18:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,22:0.44: 1.24:1.000:0.970 0/0/1/1:4:9,13:0.56:-0.72:1.000:0.974 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,14:0.40: 0.14:1.000:0.775 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,19:0.43: 0.85:1.000:0.936 0/1/1/1:4:5,13:0.67:-1.04:1.000:0.915 0/0/1/1:4:16,24:0.56: 0.69:1.000:0.962 0/0/0/1:4:18,3:0.13:-0.80:1.000:0.908 0/0/1/1:4:16,16:0.47: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,22:0.43: 1.32:1.000:0.952 0/0/0/1:4:19,12:0.36:-0.02:1.000:0.673 0/0/0/1:4:21,14:0.37: 0.30:1.000:0.508 0/0/0/1:4:19,4:0.16:-0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,21:0.59: 0.14:1.000:0.834 0/0/1/1:4:25,18:0.39: 0.92:1.000:0.720 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,14:0.43:-0.02:1.000:0.933 0/0/1/1:4:24,22:0.45: 1.16:1.000:0.982 0/0/0/1:4:26,15:0.34: 0.77:1.000:0.868 0/0/0/1:4:18,11:0.35:-0.17:1.000:0.758 0/0/0/1:4:32,14:0.28: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,14:0.57:-0.64:1.000:0.945 0/0/0/1:4:28,12:0.27: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,20:0.42: 1.08:1.000:0.907 0/1/1/1:4:6,24:0.74:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,18:0.60:-0.25:1.000:0.790 0/1/1/1:4:8,19:0.65:-0.33:1.000:0.815 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,12:0.31: 0.38:1.000:0.976 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.39:-0.57:1.000:0.699 0/0/0/1:4:28,11:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,14:0.40: 0.14:1.000:0.775 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,15:0.31: 1.08:1.000:0.976 0/1/1/1:4:7,27:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,33:0.64: 1.32:1.000:0.672 0/0/1/1:4:7,11:0.57:-1.04:1.000:0.939 0/0/0/1:4:38,7:0.14: 1.08:1.000:0.971 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,11:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,20:0.45: 0.85:1.000:0.980 0/0/1/1:4:22,18:0.42: 0.69:1.000:0.928 -chr3.1 35290918 chr3.1_035290918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:137,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:253,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.57:0.998:. ./.:4:149,17:.: 0.61:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.11:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:137,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:122,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:5:165,0:.: 0.59:0.928:. ./.:4:101,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.69:0.976:. ./.:4:122,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:242,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.81:0.993:. ./.:4:109,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:158,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:241,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:247,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.52:1.000:. -chr3.1 35402823 chr3.1_035402823 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:300,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:208,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.53:0.998:. ./.:4:174,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.49:1.000:. ./.:3:22,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.14:1.000:. ./.:6:244,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:400,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.82:1.000:. ./.:5:256,0:.:-0.01:0.928:. ./.:4:313,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.96:0.976:. ./.:4:305,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:400,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:410,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.01:0.999:. ./.:4:244,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.65:0.993:. ./.:4:280,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.19:1.000:. -chr3.1 36506595 chr3.1_036506595 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:149,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.08:0.998:. ./.:4:105,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:196,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.89:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:6:99,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.63:1.000:. ./.:5:114,0:.: 0.24:0.928:. ./.:4:103,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.31:0.976:. ./.:4:111,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:146,2:.: 1.33:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:178,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:181,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.31:1.000:. -chr3.1 36767886 chr3.1_036767886 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:44,63:0.60:-0.80:1.000:0.800 0/1/1/1:4:39,125:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,144:0.85: 0.21:1.000:0.987 0/0/1/1:4:62,62:0.52:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,149:0.58: 1.83:1.000:0.913 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,45:0.60:-1.31:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.69:-2.10:1.000:0.976 0/1/1/1:4:14,51:0.77:-1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,108:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,62:0.68:-1.07:1.000:0.944 0/1/1/1:4:46,121:0.71: 0.21:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,190:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,128:0.77: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,111:0.63: 0.36:0.998:0.615 0/1/1/1:4:38,158:0.79: 0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,317:1.00: 2.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,90:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,33:0.71:-1.83:1.000:0.990 0/1/1/1:4:33,94:0.73:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,159:0.74: 0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,69:0.66:-0.84:1.000:0.843 0/1/1/1:4:3,21:0.86:-2.20:1.000:0.948 0/0/1/1:4:33,50:0.61:-1.21:1.000:0.688 0/0/1/1:4:60,59:0.52:-0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,190:0.83: 1.19:1.000:0.998 1/1/1/1:4:2,241:0.99: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,106:0.79:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,52:0.63:-1.21:1.000:0.570 0/1/1/1:4:21,91:0.80:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,38:0.85:-1.87:1.000:0.985 0/1/1/1:4:13,64:0.82:-1.31:1.000:0.999 0/1/1:3:2,13:0.86:-2.36:1.000:0.512 0/1/1/1:4:29,189:0.86: 1.07:1.000:0.978 0/1/1/1:4:55,114:0.67: 0.25:1.000:0.924 0/0/1/1:4:75,113:0.61: 0.57:1.000:0.700 0/1/1/1:4:60,98:0.63: 0.06:1.000:0.500 0/1/1/1:4:22,181:0.88: 0.82:1.000:0.702 0/1/1/1:4:34,132:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,122:0.71: 0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,114:0.73:-0.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,82:0.72:-0.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:83,161:0.66: 1.51:1.000:0.859 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,235:0.84: 2.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,43:0.78:-1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,143:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,149:0.83: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,96:0.78:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,130:0.74: 0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,192:0.81: 1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,244:1.00: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,150:0.68: 1.11:1.000:0.945 0/1/1/1:4:35,102:0.73:-0.30:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,126:0.99:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:52,111:0.68: 0.14:1.000:0.919 0/1/1/1:4:37,98:0.71:-0.33:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,102:0.70:-0.19:1.000:0.988 1/1/1/1:4:1,187:0.99: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,48:0.59:-1.21:1.000:0.863 0/1/1/1:4:29,130:0.80: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,63:0.64:-0.95:1.000:0.735 0/1/1/1:4:27,77:0.73:-0.85:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,120:0.99:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,111:0.62: 0.45:1.000:0.577 0/1/1/1:4:31,131:0.79: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,127:0.59: 1.07:1.000:0.840 0/1/1/1:4:21,88:0.79:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,127:0.70: 0.41:1.000:0.985 0/0/1/1:4:69,56:0.48:-0.50:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,150:0.82: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,129:0.77: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,60:0.63:-0.99:1.000:0.553 0/0/1/1:4:77,122:0.62: 0.75:1.000:0.579 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,74:0.45: 0.36:1.000:0.976 0/1/1/1:4:53,139:0.71: 0.63:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,116:0.78:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1/1:5:1,267:1.00: 1.92:0.928:1.000 0/1/1/1:4:57,227:0.78: 2.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,97:0.74:-0.45:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,173:0.84: 0.80:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,130:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,60:0.63:-0.99:0.976:0.553 0/1/1/1:4:42,112:0.71:-0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:41,139:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,110:0.76:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,66:0.54:-0.48:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,185:0.81: 1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,143:0.71: 0.75:1.000:0.991 1/1/1/1:4:3,112:0.97:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,138:0.99:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,97:0.70:-0.31:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,222:1.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,173:0.61: 2.26:1.000:0.704 1/1/1/1:4:1,137:0.99:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,102:0.99:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,202:0.86: 1.29:1.000:0.951 0/1/1/1:4:48,129:0.72: 0.38:0.999:0.994 0/0/1/1:4:67,63:0.51:-0.41:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,91:0.99:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,61:0.46:-0.24:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,108:0.70:-0.03:1.000:0.982 0/0/1/1:4:66,56:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,103:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,64:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,218:0.79: 1.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,200:0.83: 1.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,125:0.62: 0.80:1.000:0.516 0/0/1/1:4:78,112:0.60: 0.60:1.000:0.795 1/1/1/1:4:0,208:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,123:0.75: 0.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,71:0.98:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,94:0.72:-0.45:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,169:0.99: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,50:0.64:-1.28:1.000:0.639 0/1/1/1:4:24,81:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,122:0.59: 0.94:1.000:0.849 0/1/1/1:4:31,112:0.77:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,326:1.00: 2.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,100:0.76:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,108:0.99:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,277:1.00: 2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,52:0.56:-0.99:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,240:1.00: 1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,186:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,278:0.80: 3.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,112:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,136:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,106:0.71:-0.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,90:0.70:-0.48:1.000:0.988 0/1/1/1:4:64,134:0.67: 0.74:1.000:0.931 0/1/1/1:4:32,54:0.63:-1.16:1.000:0.585 0/1/1/1:4:11,50:0.80:-1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,111:0.79:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,168:0.79: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,121:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,69:0.60:-0.65:1.000:0.754 0/1/1/1:4:32,125:0.78: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,204:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,67:0.53:-0.38:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,146:1.00:-0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,177:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,45:0.46:-0.85:1.000:0.987 0/1/1/1:4:37,118:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,225:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,110:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,71:0.64:-0.73:1.000:0.706 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,96:0.61: 0.06:1.000:0.637 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,103:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,33:0.63:-1.71:1.000:0.527 1/1/1/1:4:0,192:1.00: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,208:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,72:0.70:-0.89:1.000:0.982 0/1/1/1:4:34,192:0.84: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,162:0.62: 1.82:1.000:0.521 0/0/1/1:4:114,93:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,144:0.77: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,114:0.69: 0.14:1.000:0.976 -chr3.1 37140532 chr3.1_037140532 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:302,105:.: 0.62:1.000:. ./.:4:225,92:.:-0.50:1.000:. ./.:4:267,72:.:-0.23:1.000:. ./.:4:262,86:.:-0.12:1.000:. ./.:4:334,110:.: 1.08:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:216,64:.:-0.96:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:138,52:.:-2.08:1.000:. ./.:4:247,79:.:-0.39:1.000:. ./.:4:240,87:.:-0.38:1.000:. ./.:4:368,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:346,103:.: 1.14:0.998:. ./.:4:177,175:.:-0.07:1.000:. ./.:4:506,3:.: 1.89:1.000:. ./.:4:330,119:.: 1.14:1.000:. ./.:4:98,55:.:-2.54:1.000:. ./.:4:255,102:.: 0.00:1.000:. ./.:4:314,103:.: 0.74:1.000:. ./.:4:301,76:.: 0.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:337,101:.: 1.00:1.000:. ./.:4:263,86:.:-0.10:1.000:. ./.:4:252,99:.:-0.08:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:338,116:.: 1.20:1.000:. ./.:4:354,124:.: 1.50:1.000:. ./.:4:276,67:.:-0.18:1.000:. ./.:4:49,27:.:-3.50:1.000:. ./.:4:88,36:.:-2.90:1.000:. ./.:3:60,0:.:-3.70:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:253,106:.: 0.02:1.000:. ./.:4:316,96:.: 0.68:1.000:. ./.:4:312,116:.: 0.88:1.000:. ./.:4:406,129:.: 2.21:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:269,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:304,107:.: 0.67:1.000:. ./.:4:237,87:.:-0.41:1.000:. ./.:4:347,133:.: 1.53:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:367,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:179,61:.:-1.46:1.000:. ./.:4:239,98:.:-0.25:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:302,104:.: 0.61:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:228,92:.:-0.46:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:271,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:340,115:.: 1.22:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.12:1.000:. ./.:6:279,90:.: 0.15:1.000:. ./.:4:261,93:.:-0.04:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:313,102:.: 0.72:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:249,94:.:-0.18:1.000:. ./.:4:373,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:343,103:.: 1.10:1.000:. ./.:4:224,85:.:-0.60:1.000:. ./.:4:368,125:.: 1.69:1.000:. ./.:4:248,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:506,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:297,94:.: 0.42:1.000:. ./.:4:211,184:.: 0.47:1.000:. ./.:4:279,98:.: 0.25:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:320,105:.: 0.84:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:309,110:.: 0.77:1.000:. ./.:4:488,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.40:1.000:. ./.:5:585,0:.: 2.83:0.928:. ./.:4:323,113:.: 0.98:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:271,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:271,89:.: 0.03:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.59:0.976:. ./.:4:317,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:297,100:.: 0.49:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:340,111:.: 1.17:1.000:. ./.:4:395,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:307,116:.: 0.82:1.000:. ./.:4:271,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:311,99:.: 0.66:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:500,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:311,112:.: 0.82:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:218,118:.:-0.27:1.000:. ./.:4:239,82:.:-0.45:1.000:. ./.:4:236,80:.:-0.51:1.000:. ./.:4:255,87:.:-0.19:1.000:. ./.:4:198,83:.:-0.95:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:284,99:.: 0.32:1.000:. ./.:4:240,76:.:-0.51:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:275,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:226,89:.:-0.53:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:181,83:.:-1.16:1.000:. ./.:4:271,97:.: 0.13:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:278,99:.: 0.25:1.000:. ./.:4:336,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:276,105:.: 0.29:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:270,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:276,112:.: 0.38:1.000:. ./.:4:278,97:.: 0.22:1.000:. ./.:4:209,90:.:-0.73:1.000:. ./.:4:362,104:.: 1.35:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:350,110:.: 1.28:1.000:. ./.:4:277,95:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,48:.:-2.98:1.000:. ./.:4:158,63:.:-1.70:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:323,125:.: 1.13:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:235,81:.:-0.51:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:237,100:.:-0.25:1.000:. ./.:4:247,82:.:-0.35:1.000:. ./.:4:291,93:.: 0.33:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:263,90:.:-0.05:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:194,70:.:-1.16:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:280,91:.: 0.17:1.000:. ./.:4:332,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:518,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:279,118:.: 0.49:1.000:. ./.:4:336,126:.: 1.30:1.000:. ./.:4:345,114:.: 1.27:1.000:. ./.:4:227,89:.:-0.51:1.000:. ./.:4:265,98:.: 0.07:1.000:. -chr3.1 37355724 chr3.1_037355724 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.12:1.000:. ./.:4:14,41:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:19,67:.: 2.31:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.06:1.000:. ./.:4:2,3:.:-2.01:1.000:. ./.:4:12,27:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.36:1.000:. ./.:4:9,49:.: 0.82:1.000:. ./.:4:11,37:.: 0.28:1.000:. ./.:4:16,52:.: 1.35:1.000:. ./.:4:16,52:.: 1.35:0.998:. ./.:4:17,78:.: 2.79:1.000:. ./.:4:21,50:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,21:.:-0.52:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.17:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:9,28:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-2.12:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:15,74:.: 2.47:1.000:. ./.:4:0,64:.: 1.14:1.000:. ./.:4:19,32:.: 0.44:1.000:. ./.:4:13,32:.: 0.12:1.000:. ./.:4:14,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,39:.: 0.34:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,10:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.89:1.000:. ./.:4:17,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:15,24:.:-0.20:1.000:. ./.:4:14,50:.: 1.14:1.000:. ./.:4:14,20:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,50:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:14,67:.: 2.04:1.000:. ./.:4:20,36:.: 0.71:1.000:. ./.:4:7,43:.: 0.39:1.000:. ./.:4:10,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,8:.:-1.58:1.000:. ./.:4:7,28:.:-0.41:1.000:. ./.:6:4,8:.:-1.64:1.000:. ./.:4:9,16:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,75:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,18:.:-0.73:1.000:. ./.:4:13,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:13,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:19,17:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.00:1.000:. ./.:4:9,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:27,18:.: 0.12:1.000:. ./.:4:5,12:.:-1.37:1.000:. ./.:4:9,21:.:-0.68:1.000:. ./.:4:14,30:.: 0.07:1.000:. ./.:4:10,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:12,33:.: 0.12:1.000:. ./.:4:25,24:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:7,47:.: 0.60:1.000:. ./.:4:14,33:.: 0.23:1.000:. ./.:5:17,33:.: 0.39:0.928:. ./.:4:0,44:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.23:1.000:. ./.:4:6,20:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,23:.:-1.00:1.000:. ./.:4:9,54:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.14:0.976:. ./.:4:0,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:10,35:.: 0.12:1.000:. ./.:4:8,25:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,40:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:4,12:.:-1.42:1.000:. ./.:4:11,21:.:-0.57:1.000:. ./.:4:3,17:.:-1.21:1.000:. ./.:4:7,23:.:-0.68:1.000:. ./.:4:5,20:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:15,51:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,65:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,62:.: 1.03:1.000:. ./.:4:11,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,90:.: 3.69:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.36:0.999:. ./.:4:17,11:.:-0.78:1.000:. ./.:4:9,18:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.78:1.000:. ./.:4:5,4:.:-1.80:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.21:1.000:. ./.:4:16,57:.: 1.62:1.000:. ./.:4:5,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:6,34:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,66:.: 1.30:1.000:. ./.:4:5,30:.:-0.41:1.000:. ./.:4:8,28:.:-0.36:1.000:. ./.:4:8,34:.:-0.04:1.000:. ./.:4:18,18:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,29:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.00:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.37:1.000:. ./.:4:7,22:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,32:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,61:.: 2.20:1.000:. ./.:4:7,30:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1,20:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:17,47:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.94:1.000:. ./.:4:14,51:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.32:1.000:. ./.:4:1,61:.: 1.03:1.000:. ./.:4:16,44:.: 0.92:1.000:. ./.:4:13,15:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,47:.: 0.55:1.000:. ./.:4:13,50:.: 1.08:1.000:. ./.:4:17,35:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.12:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,49:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1,67:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.12:1.000:. ./.:4:16,43:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.55:1.000:. ./.:4:17,29:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:17,46:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1,40:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,36:.: 0.71:1.000:. ./.:4:22,50:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,80:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,33:.: 0.23:1.000:. ./.:4:16,41:.: 0.76:1.000:. ./.:4:12,57:.: 1.40:1.000:. ./.:4:13,67:.: 1.99:1.000:. ./.:4:21,38:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,62:.: 1.03:1.000:. ./.:4:15,28:.: 0.02:1.000:. ./.:4:19,40:.: 0.87:1.000:. -chr3.1 37388128 chr3.1_037388128 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:663,157:.: 0.27:1.000:. ./.:4:250,147:.:-1.83:1.000:. ./.:4:536,178:.:-0.26:1.000:. ./.:4:692,175:.: 0.50:1.000:. ./.:4:530,203:.:-0.16:1.000:. ./.:4:639,308:.: 0.89:1.000:. ./.:4:413,105:.:-1.23:1.000:. ./.:4:692,276:.: 1.00:1.000:. ./.:4:725,79:.: 0.19:1.000:. ./.:4:178,64:.:-2.59:1.000:. ./.:4:169,33:.:-2.79:1.000:. ./.:4:353,122:.:-1.44:1.000:. ./.:4:731,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:580,360:.: 0.86:1.000:. ./.:4:689,275:.: 0.98:1.000:. ./.:4:704,176:.: 0.56:1.000:. ./.:4:565,190:.:-0.06:0.998:. ./.:4:518,228:.:-0.10:1.000:. ./.:4:680,424:.: 1.67:1.000:. ./.:4:824,171:.: 1.13:1.000:. ./.:4:143,56:.:-2.81:1.000:. ./.:4:726,225:.: 0.91:1.000:. ./.:4:883,88:.: 1.01:1.000:. ./.:4:602,127:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,59:.:-3.15:1.000:. ./.:4:794,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:711,167:.: 0.55:1.000:. ./.:4:369,200:.:-0.98:1.000:. ./.:4:867,170:.: 1.34:1.000:. ./.:4:783,92:.: 0.54:1.000:. ./.:4:698,165:.: 0.48:1.000:. ./.:4:654,91:.:-0.10:1.000:. ./.:4:98,14:.:-3.24:1.000:. ./.:4:176,98:.:-2.44:1.000:. ./.:3:77,37:.:-3.23:1.000:. ./.:4:506,470:.: 1.04:1.000:. ./.:4:476,260:.:-0.15:1.000:. ./.:4:571,175:.:-0.10:1.000:. ./.:4:459,341:.: 0.17:1.000:. ./.:4:598,276:.: 0.53:1.000:. ./.:4:572,168:.:-0.13:1.000:. ./.:4:667,220:.: 0.60:1.000:. ./.:4:825,100:.: 0.79:1.000:. ./.:4:552,215:.: 0.00:1.000:. ./.:4:437,319:.:-0.05:1.000:. ./.:4:777,159:.: 0.84:1.000:. ./.:4:522,405:.: 0.80:1.000:. ./.:4:312,22:.:-2.14:1.000:. ./.:4:417,208:.:-0.70:1.000:. ./.:4:583,211:.: 0.14:1.000:. ./.:4:378,261:.:-0.63:1.000:. ./.:4:884,108:.: 1.12:1.000:. ./.:4:574,175:.:-0.09:1.000:. ./.:4:602,236:.: 0.36:1.000:. ./.:4:463,225:.:-0.39:1.000:. ./.:4:555,324:.: 0.56:1.000:. ./.:4:492,164:.:-0.55:1.000:. ./.:4:735,273:.: 1.20:1.000:. ./.:4:820,253:.: 1.52:1.000:. ./.:6:604,183:.: 0.10:1.000:. ./.:4:705,230:.: 0.84:1.000:. ./.:4:523,155:.:-0.44:1.000:. ./.:4:572,251:.: 0.28:1.000:. ./.:4:738,162:.: 0.66:1.000:. ./.:4:784,252:.: 1.34:1.000:. ./.:4:846,202:.: 1.39:1.000:. ./.:4:398,151:.:-1.07:1.000:. ./.:4:666,201:.: 0.50:1.000:. ./.:4:457,148:.:-0.80:1.000:. ./.:4:381,119:.:-1.32:1.000:. ./.:4:462,383:.: 0.39:1.000:. ./.:4:357,283:.:-0.62:1.000:. ./.:4:471,266:.:-0.14:1.000:. ./.:4:705,258:.: 0.97:1.000:. ./.:4:317,61:.:-1.92:1.000:. ./.:4:439,224:.:-0.51:1.000:. ./.:4:585,173:.:-0.04:1.000:. ./.:4:833,88:.: 0.77:1.000:. ./.:4:876,167:.: 1.37:1.000:. ./.:4:630,205:.: 0.34:1.000:. ./.:4:370,185:.:-1.05:1.000:. ./.:4:514,278:.: 0.13:1.000:. ./.:4:780,209:.: 1.10:1.000:. ./.:4:579,182:.:-0.03:1.000:. ./.:5:710,314:.: 1.28:0.928:. ./.:4:453,241:.:-0.36:1.000:. ./.:4:385,136:.:-1.21:1.000:. ./.:4:618,116:.:-0.16:1.000:. ./.:4:450,190:.:-0.62:1.000:. ./.:4:544,170:.:-0.26:1.000:. ./.:4:607,130:.:-0.14:0.976:. ./.:4:478,130:.:-0.78:1.000:. ./.:4:544,207:.:-0.08:1.000:. ./.:4:366,124:.:-1.37:1.000:. ./.:4:512,289:.: 0.17:1.000:. ./.:4:813,81:.: 0.63:1.000:. ./.:4:401,316:.:-0.24:1.000:. ./.:4:408,206:.:-0.75:1.000:. ./.:4:616,276:.: 0.62:1.000:. ./.:4:658,204:.: 0.47:1.000:. ./.:4:598,65:.:-0.51:1.000:. ./.:4:892,74:.: 0.99:1.000:. ./.:4:363,238:.:-0.82:1.000:. ./.:4:767,319:.: 1.58:1.000:. ./.:4:713,70:.: 0.08:1.000:. ./.:4:812,83:.: 0.64:1.000:. ./.:4:722,258:.: 1.06:1.000:. ./.:4:528,314:.: 0.38:1.000:. ./.:4:589,201:.: 0.12:1.000:. ./.:4:717,274:.: 1.11:1.000:. ./.:4:818,87:.: 0.69:1.000:. ./.:4:678,314:.: 1.12:1.000:. ./.:4:411,301:.:-0.27:0.999:. ./.:4:747,185:.: 0.82:1.000:. ./.:4:662,178:.: 0.37:1.000:. ./.:4:344,272:.:-0.74:1.000:. ./.:4:651,210:.: 0.47:1.000:. ./.:4:428,83:.:-1.26:1.000:. ./.:4:664,223:.: 0.60:1.000:. ./.:4:597,153:.:-0.08:1.000:. ./.:4:529,231:.:-0.03:1.000:. ./.:4:807,63:.: 0.51:1.000:. ./.:4:628,243:.: 0.52:1.000:. ./.:4:451,194:.:-0.60:1.000:. ./.:4:479,154:.:-0.66:1.000:. ./.:4:623,245:.: 0.50:1.000:. ./.:4:621,160:.: 0.07:1.000:. ./.:4:406,202:.:-0.78:1.000:. ./.:4:615,172:.: 0.10:1.000:. ./.:4:325,223:.:-1.08:1.000:. ./.:4:442,244:.:-0.40:1.000:. ./.:4:715,139:.: 0.43:1.000:. ./.:4:414,33:.:-1.58:1.000:. ./.:4:528,147:.:-0.45:1.000:. ./.:4:643,218:.: 0.47:1.000:. ./.:4:663,403:.: 1.48:1.000:. ./.:4:807,226:.: 1.32:1.000:. ./.:4:617,77:.:-0.36:1.000:. ./.:4:409,263:.:-0.47:1.000:. ./.:4:637,191:.: 0.31:1.000:. ./.:4:569,273:.: 0.38:1.000:. ./.:4:713,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:453,242:.:-0.35:1.000:. ./.:4:396,173:.:-0.98:1.000:. ./.:4:972,102:.: 1.52:1.000:. ./.:4:569,263:.: 0.33:1.000:. ./.:4:693,222:.: 0.74:1.000:. ./.:4:676,83:.:-0.04:1.000:. ./.:4:946,227:.: 2.01:1.000:. ./.:4:603,159:.:-0.02:1.000:. ./.:4:595,259:.: 0.43:1.000:. ./.:4:713,170:.: 0.58:1.000:. ./.:4:123,65:.:-2.86:1.000:. ./.:4:502,56:.:-1.03:1.000:. ./.:4:603,282:.: 0.59:1.000:. ./.:4:569,207:.: 0.05:1.000:. ./.:4:814,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:551,366:.: 0.75:1.000:. ./.:4:729,63:.: 0.13:1.000:. ./.:4:797,339:.: 1.83:1.000:. ./.:4:518,73:.:-0.87:1.000:. ./.:4:675,120:.: 0.14:1.000:. ./.:4:682,133:.: 0.24:1.000:. ./.:4:549,180:.:-0.18:1.000:. ./.:4:729,199:.: 0.80:1.000:. ./.:4:723,164:.: 0.60:1.000:. ./.:4:600,72:.:-0.47:1.000:. ./.:4:441,278:.:-0.23:1.000:. ./.:4:410,266:.:-0.45:1.000:. ./.:4:565,141:.:-0.30:1.000:. ./.:4:613,182:.: 0.14:1.000:. ./.:4:383,146:.:-1.17:1.000:. ./.:4:581,206:.: 0.10:1.000:. ./.:4:491,150:.:-0.62:1.000:. ./.:4:592,70:.:-0.52:1.000:. ./.:4:591,134:.:-0.20:1.000:. ./.:4:898,392:.: 2.59:1.000:. ./.:4:631,266:.: 0.65:1.000:. ./.:4:647,253:.: 0.66:1.000:. ./.:4:645,193:.: 0.36:1.000:. ./.:4:404,224:.:-0.68:1.000:. ./.:4:516,462:.: 1.05:1.000:. ./.:4:644,119:.:-0.02:1.000:. ./.:4:455,198:.:-0.56:1.000:. ./.:4:363,159:.:-1.21:1.000:. -chr3.1 37652507 chr3.1_037652507 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:187,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:353,48:.: 2.10:1.000:. ./.:4:106,22:.:-1.03:1.000:. ./.:4:217,48:.: 0.54:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:339,46:.: 1.92:1.000:. ./.:4:243,37:.: 0.72:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.44:0.998:. ./.:4:408,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:270,57:.: 1.25:1.000:. ./.:4:216,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:266,43:.: 1.05:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:175,34:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,1:.:-2.03:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:45,42:.:-1.50:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:199,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:43,4:.:-1.96:1.000:. ./.:3:25,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:189,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:46,36:.:-1.56:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:204,43:.: 0.34:1.000:. ./.:4:204,47:.: 0.38:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:203,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:82,28:.:-1.24:1.000:. ./.:4:134,28:.:-0.64:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:192,40:.: 0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:157,28:.:-0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:81,21:.:-1.33:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:270,35:.: 1.00:1.000:. ./.:4:183,44:.: 0.11:1.000:. ./.:4:162,22:.:-0.39:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:176,25:.:-0.19:1.000:. ./.:4:296,36:.: 1.31:1.000:. ./.:6:149,10:.:-0.67:1.000:. ./.:4:215,48:.: 0.52:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:109,28:.:-0.93:1.000:. ./.:4:284,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:260,50:.: 1.06:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:119,12:.:-1.00:1.000:. ./.:4:149,43:.:-0.30:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:48,27:.:-1.64:1.000:. ./.:4:80,22:.:-1.33:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:254,43:.: 0.91:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:193,30:.: 0.06:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:398,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:127,39:.:-0.59:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.21:1.000:. ./.:5:356,29:.: 1.92:0.928:. ./.:4:58,23:.:-1.57:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:154,27:.:-0.42:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.36:0.976:. ./.:4:163,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:170,45:.:-0.03:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:136,41:.:-0.47:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:103,20:.:-1.09:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:261,24:.: 0.77:1.000:. ./.:4:97,37:.:-0.96:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:108,30:.:-0.91:1.000:. ./.:4:218,33:.: 0.38:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:190,35:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:176,34:.:-0.09:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:123,24:.:-0.81:0.999:. ./.:4:295,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:163,17:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,29:.:-1.65:1.000:. ./.:4:180,29:.:-0.10:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:187,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:242,27:.: 0.59:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:138,21:.:-0.67:1.000:. ./.:4:82,20:.:-1.33:1.000:. ./.:4:154,31:.:-0.38:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:233,51:.: 0.76:1.000:. ./.:4:354,33:.: 1.94:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:227,34:.: 0.50:1.000:. ./.:4:143,32:.:-0.49:1.000:. ./.:4:152,31:.:-0.40:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:202,51:.: 0.41:1.000:. ./.:4:90,25:.:-1.18:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:207,46:.: 0.41:1.000:. ./.:4:230,33:.: 0.52:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:278,40:.: 1.15:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:217,55:.: 0.62:1.000:. ./.:4:205,50:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,2:.:-2.26:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:272,53:.: 1.23:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:269,35:.: 0.99:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:327,32:.: 1.62:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:303,2:.: 1.00:1.000:. ./.:4:242,41:.: 0.75:1.000:. ./.:4:196,35:.: 0.15:1.000:. ./.:4:165,26:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:177,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:313,47:.: 1.63:1.000:. ./.:4:320,46:.: 1.70:1.000:. ./.:4:285,48:.: 1.32:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:51,45:.:-1.40:1.000:. ./.:4:53,49:.:-1.33:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:178,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.07:1.000:. -chr3.1 38238006 chr3.1_038238006 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:188,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:153,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.19:0.998:. ./.:4:92,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:88,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:41,1:.:-2.56:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.64:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.31:1.000:. ./.:6:112,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.61:1.000:. ./.:5:103,0:.:-0.73:0.928:. ./.:4:155,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.43:0.976:. ./.:4:166,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:113,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:142,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:210,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.09:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:120,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:113,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:196,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:167,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:161,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:158,1:.: 0.94:1.000:. -chr3.1 38303519 chr3.1_038303519 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:143,40:0.31: 0.69:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,28:0.29:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/0:4:184,12:0.10: 0.95:1.000:0.778 0/0/1/1:4:79,40:0.40:-0.60:1.000:0.822 0/0/0/1:4:130,36:0.30: 0.35:1.000:0.981 0/0/0/1:4:100,27:0.30:-0.44:1.000:0.984 0/0/0/1:4:136,23:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,37:0.37:-0.52:1.000:0.505 0/0/0/0:4:37,1:0.04:-2.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,5:0.22:-2.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,32:0.43:-1.24:1.000:0.947 0/0/1/1:4:67,39:0.43:-0.86:1.000:0.947 0/0/0/0:4:190,11:0.09: 1.05:1.000:0.943 0/0/0/0:4:185,9:0.08: 0.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,23:0.28:-0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:120,22:0.25:-0.13:0.998:0.999 0/0/0/1:4:139,42:0.32: 0.65:1.000:0.961 0/0/0/1:4:138,36:0.30: 0.51:1.000:0.988 0/0/0/1:4:174,30:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.31:-2.16:1.000:0.978 0/0/0/0:4:191,8:0.07: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,39:0.29: 0.89:1.000:0.991 0/0/0/1:4:109,20:0.25:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,7:0.21:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,36:0.41:-0.86:1.000:0.843 0/0/0/1:4:116,26:0.28:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,36:0.41:-0.92:1.000:0.891 0/0/0/1:4:173,22:0.19: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,17:0.20:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,28:0.29:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,24:0.36:-1.32:1.000:0.632 0/0/1/1:4:17,13:0.48:-2.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,7:0.16:-1.54:1.000:0.995 0/0/0:3:21,0:0.00:-2.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,14:0.12: 0.93:1.000:0.728 0/0/1/1:4:59,39:0.46:-1.02:1.000:0.984 0/0/0/1:4:134,34:0.29: 0.39:1.000:0.991 0/0/0/0:4:176,7:0.06: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,16:0.20:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,21:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:223,10:0.07: 1.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:167,27:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,25:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:247,11:0.07: 2.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:171,24:0.20: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:220,15:0.11: 1.73:1.000:0.662 0/0/0/1:4:14,4:0.31:-2.62:1.000:0.975 0/0/0/1:4:146,24:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,8:0.12:-0.84:1.000:0.826 0/0/0/1:4:101,17:0.24:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,39:0.27: 1.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:127,23:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:179,20:0.17: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,20:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,13:0.13: 0.31:1.000:0.917 0/0/0/1:4:139,27:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:200,8:0.06: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:184,6:0.05: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:152,11:0.11: 0.29:1.000:0.965 0/0/0/1:4:208,17:0.12: 1.53:1.000:0.847 0/0/1/1:4:52,24:0.39:-1.46:1.000:0.655 0/0/0/1:4:61,26:0.37:-1.24:1.000:0.527 0/0/0/0:4:161,7:0.07: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:201,10:0.08: 1.25:1.000:0.992 0/0/0/0:4:205,11:0.08: 1.35:1.000:0.978 0/0/0/0:4:143,7:0.08: 0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:131,25:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,21:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,25:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,24:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,20:0.26:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,40:0.46:-0.98:1.000:0.986 0/0/0/0:4:239,17:0.11: 2.15:1.000:0.529 0/0/0/1:4:67,26:0.36:-1.12:1.000:0.726 0/0/0/1:4:104,14:0.20:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,22:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,22:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:207,7:0.05: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,22:0.25:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,23:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,24:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,24:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,20:0.15: 1.43:1.000:0.988 0/0/0/0/0:5:167,9:0.08: 0.55:0.928:0.688 0/0/1/1:4:60,36:0.44:-1.06:1.000:0.960 0/0/1/1:4:51,30:0.43:-1.36:1.000:0.952 0/0/0/1:4:111,31:0.31:-0.13:1.000:0.979 0/0/0/1:4:134,18:0.20: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,25:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,26:0.28:-0.17:0.976:0.996 0/0/1/1:4:62,35:0.42:-1.04:1.000:0.930 0/0/1/1:4:75,33:0.38:-0.82:1.000:0.547 0/0/1/1:4:53,27:0.40:-1.38:1.000:0.830 0/0/0/1:4:143,23:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,23:0.30:-0.78:1.000:0.987 0/0/0/0:4:183,8:0.07: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,34:0.32:-0.05:1.000:0.959 0/0/0/1:4:144,24:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,8:0.11:-0.66:1.000:0.602 0/0/0/1:4:129,30:0.28: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:176,25:0.21: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,20:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/0:4:256,14:0.09: 2.43:1.000:0.972 0/0/0/1:4:118,24:0.26:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,61:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,13:0.11: 0.89:1.000:0.521 0/0/0/1:4:150,24:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,58:0.45:-0.01:1.000:0.980 0/0/0/1:4:172,38:0.27: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:168,24:0.21: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,25:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,22:0.23: 0.21:0.999:1.000 0/0/0/0:4:199,8:0.06: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:162,11:0.10: 0.49:1.000:0.674 0/0/0/1:4:150,17:0.17: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:208,19:0.14: 1.57:1.000:0.960 0/0/1/1:4:57,33:0.43:-1.18:1.000:0.945 0/0/0/0:4:174,10:0.09: 0.71:1.000:0.948 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:143,19:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,33:0.31: 0.03:1.000:0.978 0/0/0/1:4:144,22:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,39:0.53:-1.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:139,24:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,18:0.19: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,21:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,18:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,18:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,21:0.28:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,22:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,37:0.31: 0.35:1.000:0.974 0/0/0/1:4:51,19:0.35:-1.58:1.000:0.793 0/0/0/1:4:109,11:0.15:-0.58:1.000:0.989 0/0/0/1:4:129,21:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,27:0.21: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,8:0.06: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,12:0.16:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:168,7:0.07: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,25:0.27:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,32:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,27:0.38:-1.22:1.000:0.561 0/0/0/1:4:125,25:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,26:0.43:-1.56:1.000:0.944 0/0/0/1:4:94,33:0.34:-0.44:1.000:0.867 0/0/0/1:4:215,36:0.24: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,9:0.07: 0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,40:0.44:-0.84:1.000:0.958 0/0/0/1:4:226,42:0.25: 2.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,21:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,29:0.28: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,23:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,8:0.47:-2.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,39:0.51:-1.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,20:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,44:0.43:-0.56:1.000:0.937 0/0/1/1:4:77,59:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:198,15:0.12: 1.29:1.000:0.670 0/0/1/1:4:62,34:0.42:-1.06:1.000:0.909 0/0/0/1:4:232,19:0.12: 2.05:1.000:0.850 0/0/1/1:4:45,36:0.49:-1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,22:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,16:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,33:0.30: 0.13:1.000:0.984 0/0/0/1:4:119,22:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,33:0.29: 0.39:1.000:0.993 0/0/0/1:4:100,23:0.28:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,20:0.21: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,12:0.10: 0.83:1.000:0.694 0/0/0/1:4:125,17:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,33:0.28: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,30:0.49:-1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,33:0.31: 0.03:1.000:0.978 0/0/1/1:4:58,33:0.43:-1.16:1.000:0.935 0/0/0/1:4:93,25:0.30:-0.62:1.000:0.985 0/0/0/1:4:174,21:0.18: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:198,20:0.15: 1.39:1.000:0.989 0/0/0/1:4:146,40:0.30: 0.75:1.000:0.982 0/0/0/1:4:124,32:0.29: 0.15:1.000:0.989 0/0/0/1:4:169,13:0.12: 0.67:1.000:0.713 0/0/1/1:4:66,46:0.47:-0.74:1.000:0.991 0/0/0/1:4:150,30:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,55:0.52:-0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,25:0.28:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,44:0.47:-0.84:1.000:0.991 -chr3.1 38840261 chr3.1_038840261 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,179:0.62: 1.01:1.000:0.559 0/0/1/1:4:118,132:0.47: 1.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,161:0.56: 1.05:1.000:0.964 0/0/1/1:4:81,156:0.57: 0.81:1.000:0.934 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,59:0.36:-0.75:1.000:0.680 0/0/1/1:4:28,51:0.56:-1.90:1.000:0.958 0/0/1/1:4:60,65:0.46:-1.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:80,54:0.36:-0.96:1.000:0.691 0/0/0/1:4:131,69:0.31: 0.17:1.000:0.976 0/0/1/1:4:88,140:0.54: 0.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:119,62:0.31:-0.15:1.000:0.979 0/1/1/1:4:8,226:0.82: 0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,221:0.65: 1.78:0.998:0.752 0/1/1/1:4:8,219:0.81: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,154:0.57: 0.81:1.000:0.951 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,43:0.54:-2.05:1.000:0.987 0/0/0/1:4:164,56:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,153:0.50: 1.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,65:0.56:-1.51:1.000:0.969 0/0/1/1:4:65,117:0.56:-0.14:1.000:0.962 0/0/0/1:4:148,57:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,56:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,156:0.57: 0.82:1.000:0.940 0/0/1/1:4:135,151:0.47: 1.65:1.000:0.993 0/0/0/0:4:236,2:0.01: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,66:0.30: 0.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:45,45:0.45:-1.71:1.000:0.976 0/0/0/1:4:77,52:0.36:-1.04:1.000:0.690 0/1/1:3:22,42:0.57:-2.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:63,127:0.58: 0.00:1.000:0.904 0/0/0/1:4:124,68:0.32: 0.04:1.000:0.962 0/1/1/1:4:63,178:0.64: 0.88:1.000:0.638 0/0/1/1:4:137,131:0.44: 1.34:1.000:0.960 0/0/1/1:4:166,143:0.41: 2.04:1.000:0.881 0/1/1/1:4:10,188:0.80: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,74:0.23: 1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,154:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,171:0.51: 1.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,154:0.61: 0.50:1.000:0.704 0/0/1/1:4:67,140:0.59: 0.29:1.000:0.874 0/0/1/1:4:240,261:0.46: 5.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:124,134:0.46: 1.17:1.000:0.989 0/1/1/1:4:7,260:0.82: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,64:0.46:-1.13:1.000:0.988 0/0/0/1:4:144,77:0.31: 0.53:1.000:0.972 0/1/1/1:4:11,160:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,160:0.60: 0.72:1.000:0.803 0/0/1/1:4:112,114:0.45: 0.62:1.000:0.980 0/0/1/1:4:69,128:0.57: 0.12:1.000:0.951 0/0/1/1:4:66,160:0.61: 0.62:1.000:0.663 0/0/0/1:4:226,65:0.20: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,77:0.34: 0.21:1.000:0.867 0/0/0/0/0/1:6:140,48:0.23:-0.03:1.000:0.748 0/0/0/1:4:186,69:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,131:0.58: 0.12:1.000:0.915 0/0/1/1:4:94,71:0.38:-0.43:1.000:0.622 0/0/1/1:4:71,101:0.52:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:194,58:0.21: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,133:0.57: 0.26:1.000:0.953 0/0/0/1:4:133,38:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,192:0.64: 1.15:1.000:0.715 0/0/1/1:4:53,107:0.58:-0.51:1.000:0.903 0/0/1/1:4:118,136:0.48: 1.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:65,27:0.26:-1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,55:0.60:-1.88:1.000:0.816 0/0/0/1:4:170,60:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,53:0.29:-0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:117,102:0.42: 0.50:1.000:0.895 0/1/1/1:4:3,163:0.83:-0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,108:0.54:-0.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,133:0.58: 0.19:1.000:0.925 0/1/1/1:4:67,227:0.66: 1.78:1.000:0.878 0/1/1/1:4:13,92:0.74:-1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,48:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,170:0.81:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,109:0.57:-0.39:1.000:0.946 0/0/1/1/1:5:82,233:0.64: 2.14:0.928:0.941 0/0/0/1:4:135,67:0.30: 0.21:1.000:0.988 0/1/1/1:4:12,76:0.73:-1.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,96:0.54:-0.60:1.000:0.984 0/0/1/1:4:107,102:0.44: 0.33:1.000:0.959 0/1/1/1:4:9,169:0.80:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,58:0.45:-1.28:0.976:0.980 0/1/1/1:4:21,106:0.71:-1.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:132,67:0.30: 0.16:1.000:0.984 0/1/1/1:4:14,104:0.74:-1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,54:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,59:0.36:-0.73:1.000:0.708 0/0/1/1:4:68,106:0.54:-0.27:1.000:0.989 0/1/1/1:4:14,96:0.74:-1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,124:0.53: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/0:4:180,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,83:0.52:-0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,148:0.60: 0.40:1.000:0.769 0/0/1/1:4:57,101:0.56:-0.55:1.000:0.967 0/0/0/1:4:112,56:0.30:-0.38:1.000:0.987 0/0/1/1:4:54,113:0.59:-0.39:1.000:0.872 0/0/1/1:4:57,57:0.45:-1.30:1.000:0.976 0/0/1/1:4:61,110:0.56:-0.32:1.000:0.962 0/0/1/1:4:73,119:0.55: 0.04:1.000:0.984 0/0/1/1:4:78,170:0.60: 0.99:1.000:0.828 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,106:0.56:-0.41:1.000:0.968 0/1/1/1:4:18,286:0.79: 1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,64:0.43:-0.96:0.999:0.936 0/0/1/1:4:98,131:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,54:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,72:0.34:-0.05:1.000:0.843 0/0/1/1:4:89,111:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,126:0.61:-0.17:1.000:0.730 0/0/0/1:4:133,55:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,54:0.32:-0.65:1.000:0.960 0/1/1/1:4:7,182:0.81:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,140:0.60: 0.19:1.000:0.757 0/1/1/1:4:12,176:0.79:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,145:0.54: 0.82:1.000:0.989 0/1/1/1:4:48,168:0.67: 0.45:1.000:0.901 0/0/1/1:4:74,142:0.57: 0.45:1.000:0.935 0/1/1/1:4:9,176:0.80:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,120:0.76:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,48:0.44:-1.59:1.000:0.970 0/0/1/1:4:82,129:0.54: 0.36:1.000:0.988 0/0/0/1:4:80,57:0.37:-0.91:1.000:0.544 0/0/0/1:4:63,42:0.36:-1.45:1.000:0.721 0/1/1/1:4:62,201:0.66: 1.25:1.000:0.837 0/0/1/1:4:88,78:0.42:-0.41:1.000:0.911 0/0/1/1:4:93,163:0.56: 1.13:1.000:0.970 0/0/0/1:4:141,70:0.30: 0.36:1.000:0.988 0/0/0/1:4:108,68:0.34:-0.24:1.000:0.834 0/0/1/1:4:48,97:0.58:-0.77:1.000:0.902 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,133:0.57: 0.21:1.000:0.933 0/0/0/1:4:112,54:0.29:-0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:57,101:0.56:-0.55:1.000:0.967 0/0/1/1:4:56,50:0.42:-1.44:1.000:0.918 0/0/1/1:4:91,71:0.39:-0.48:1.000:0.705 0/0/1/1:4:161,133:0.40: 1.78:1.000:0.821 0/0/0/1:4:172,50:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,67:0.31: 0.04:1.000:0.971 0/0/0/1:4:204,38:0.14: 0.89:1.000:0.968 0/1/1/1:4:20,159:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,154:0.43: 2.21:1.000:0.949 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,24:0.25:-1.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,44:0.27:-0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,203:0.81: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,139:0.72:-0.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:135,71:0.31: 0.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:74,112:0.53:-0.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:73,52:0.37:-1.11:1.000:0.545 0/0/0/1:4:140,61:0.27: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,102:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,113:0.57:-0.26:1.000:0.958 0/0/1/1:4:69,115:0.55:-0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:75,110:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:130,67:0.30: 0.12:1.000:0.981 0/0/0/1:4:143,64:0.28: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,49:0.31:-0.82:1.000:0.976 0/1/1/1:4:24,104:0.69:-1.06:1.000:0.977 0/0/1/1:4:75,118:0.54: 0.05:1.000:0.988 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,112:0.54:-0.12:1.000:0.988 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,121:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,47:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,121:0.55: 0.07:1.000:0.981 0/0/0/1:4:168,85:0.30: 1.08:1.000:0.985 0/0/1/1:4:74,124:0.55: 0.14:1.000:0.980 0/0/1/1:4:80,124:0.54: 0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:61,122:0.58:-0.12:1.000:0.910 0/0/0/1:4:143,63:0.27: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:176,80:0.28: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,144:0.54: 0.79:1.000:0.989 0/0/1/1:4:99,88:0.42:-0.05:1.000:0.914 0/0/0/1:4:78,55:0.37:-0.97:1.000:0.574 -chr3.1 39266956 chr3.1_039266956 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:294,170:.: 0.30:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:473,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:266,164:.:-0.02:1.000:. ./.:4:185,136:.:-1.03:1.000:. ./.:4:211,137:.:-0.78:1.000:. ./.:4:306,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:272,146:.:-0.13:1.000:. ./.:4:375,132:.: 0.70:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.17:0.998:. ./.:4:276,169:.: 0.12:1.000:. ./.:4:432,166:.: 1.55:1.000:. ./.:4:326,164:.: 0.55:1.000:. ./.:4:401,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:361,164:.: 0.87:1.000:. ./.:4:629,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:262,121:.:-0.45:1.000:. ./.:4:179,84:.:-1.57:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:456,2:.: 0.25:1.000:. ./.:4:370,133:.: 0.67:1.000:. ./.:4:638,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:245,155:.:-0.30:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:301,120:.:-0.10:1.000:. ./.:3:230,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:362,162:.: 0.86:1.000:. ./.:4:339,138:.: 0.42:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:324,142:.: 0.32:1.000:. ./.:4:315,174:.: 0.54:1.000:. ./.:4:359,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:370,163:.: 0.95:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:290,152:.: 0.10:1.000:. ./.:4:463,191:.: 2.08:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:440,176:.: 1.72:1.000:. ./.:4:1053,4:.: 5.84:1.000:. ./.:4:289,127:.:-0.15:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:237,139:.:-0.52:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:289,164:.: 0.20:1.000:. ./.:4:348,129:.: 0.42:1.000:. ./.:4:374,192:.: 1.25:1.000:. ./.:4:405,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:321,199:.: 0.83:1.000:. ./.:4:207,143:.:-0.76:1.000:. ./.:6:390,113:.: 0.67:1.000:. ./.:4:379,158:.: 0.98:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:268,166:.: 0.02:1.000:. ./.:4:293,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:417,181:.: 1.55:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:270,152:.:-0.09:1.000:. ./.:4:288,144:.: 0.00:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:374,191:.: 1.25:1.000:. ./.:4:199,162:.:-0.66:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:381,152:.: 0.95:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:332,134:.: 0.32:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:288,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:279,157:.: 0.04:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.03:1.000:. ./.:5:392,188:.: 1.39:0.928:. ./.:4:412,141:.: 1.13:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:383,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:348,153:.: 0.65:1.000:. ./.:4:308,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:319,0:.:-1.05:0.976:. ./.:4:298,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:241,155:.:-0.33:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:289,156:.: 0.12:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:363,132:.: 0.59:1.000:. ./.:4:309,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:303,173:.: 0.41:1.000:. ./.:4:370,139:.: 0.72:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:304,110:.:-0.16:1.000:. ./.:4:408,161:.: 1.28:1.000:. ./.:4:271,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:320,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:322,122:.: 0.12:1.000:. ./.:4:644,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:200,151:.:-0.75:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:598,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:256,162:.:-0.13:0.999:. ./.:4:516,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:180,122:.:-1.21:1.000:. ./.:4:284,211:.: 0.59:1.000:. ./.:4:478,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:361,133:.: 0.58:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:464,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:571,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:292,157:.: 0.16:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:277,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:159,96:.:-1.65:1.000:. ./.:4:202,144:.:-0.80:1.000:. ./.:4:352,146:.: 0.62:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:454,185:.: 1.94:1.000:. ./.:4:290,165:.: 0.22:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:235,152:.:-0.42:1.000:. ./.:4:245,162:.:-0.23:1.000:. ./.:4:412,168:.: 1.39:1.000:. ./.:4:391,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:374,128:.: 0.66:1.000:. ./.:4:231,96:.:-0.98:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:521,209:.: 2.79:1.000:. ./.:4:392,163:.: 1.15:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:319,178:.: 0.61:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:390,175:.: 1.25:1.000:. ./.:4:187,141:.:-0.97:1.000:. ./.:4:289,124:.:-0.17:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:262,161:.:-0.08:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:361,161:.: 0.84:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:222,166:.:-0.41:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:474,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:292,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:224,142:.:-0.61:1.000:. ./.:4:231,131:.:-0.65:1.000:. ./.:4:218,116:.:-0.91:1.000:. ./.:4:335,3:.:-0.87:1.000:. ./.:4:253,151:.:-0.26:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:275,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:380,162:.: 1.03:1.000:. ./.:4:211,156:.:-0.60:1.000:. ./.:4:240,154:.:-0.35:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:368,172:.: 1.01:1.000:. ./.:4:486,180:.: 2.19:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:311,115:.:-0.05:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.61:1.000:. -chr3.1 39722494 chr3.1_039722494 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:188,56:.: 0.89:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:130,52:.:-0.27:1.000:. ./.:4:123,108:.: 0.65:1.000:. ./.:4:167,54:.: 0.46:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:119,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:185,51:.: 0.74:1.000:. ./.:4:123,58:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,14:.:-3.12:1.000:. ./.:4:15,13:.:-3.14:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:125,47:.:-0.45:1.000:. ./.:4:193,44:.: 0.76:1.000:. ./.:4:166,52:.: 0.41:1.000:. ./.:4:105,59:.:-0.60:1.000:. ./.:4:130,56:.:-0.19:0.998:. ./.:4:196,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:236,60:.: 1.86:1.000:. ./.:4:16,11:.:-3.16:1.000:. ./.:4:202,52:.: 1.08:1.000:. ./.:4:139,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:198,50:.: 0.97:1.000:. ./.:4:27,20:.:-2.78:1.000:. ./.:4:132,48:.:-0.30:1.000:. ./.:4:116,98:.: 0.33:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:152,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:114,57:.:-0.47:1.000:. ./.:4:181,55:.: 0.74:1.000:. ./.:4:123,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,4:.:-3.27:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.67:1.000:. ./.:3:8,5:.:-3.42:1.000:. ./.:4:180,59:.: 0.80:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:146,48:.:-0.04:1.000:. ./.:4:221,59:.: 1.56:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:115,58:.:-0.43:1.000:. ./.:4:193,51:.: 0.89:1.000:. ./.:4:159,55:.: 0.33:1.000:. ./.:4:180,38:.: 0.41:1.000:. ./.:4:254,54:.: 2.08:1.000:. ./.:4:151,61:.: 0.29:1.000:. ./.:4:227,54:.: 1.58:1.000:. ./.:4:68,15:.:-2.11:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:93,30:.:-1.37:1.000:. ./.:4:171,46:.: 0.39:1.000:. ./.:4:131,104:.: 0.72:1.000:. ./.:4:95,49:.:-0.97:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:115,64:.:-0.32:1.000:. ./.:4:170,57:.: 0.57:1.000:. ./.:4:215,60:.: 1.47:1.000:. ./.:6:123,68:.:-0.10:1.000:. ./.:4:209,42:.: 1.02:1.000:. ./.:4:113,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:111,93:.: 0.14:1.000:. ./.:4:220,63:.: 1.62:1.000:. ./.:4:140,100:.: 0.82:1.000:. ./.:4:165,25:.:-0.12:1.000:. ./.:4:184,54:.: 0.78:1.000:. ./.:4:139,52:.:-0.10:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:211,45:.: 1.11:1.000:. ./.:4:135,17:.:-0.82:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:219,39:.: 1.15:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:121,42:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,54:.:-0.38:1.000:. ./.:4:127,121:.: 0.97:1.000:. ./.:4:143,67:.: 0.26:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:197,51:.: 0.97:1.000:. ./.:4:116,64:.:-0.30:1.000:. ./.:4:108,99:.: 0.20:1.000:. ./.:5:226,0:.: 0.55:0.928:. ./.:4:204,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:114,35:.:-0.88:1.000:. ./.:4:111,37:.:-0.90:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:129,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:124,80:.: 0.14:0.976:. ./.:4:112,34:.:-0.94:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:74,34:.:-1.65:1.000:. ./.:4:204,50:.: 1.08:1.000:. ./.:4:140,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:194,70:.: 1.26:1.000:. ./.:4:118,36:.:-0.79:1.000:. ./.:4:165,73:.: 0.78:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:161,45:.: 0.18:1.000:. ./.:4:105,56:.:-0.66:1.000:. ./.:4:118,43:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,82:.:-0.40:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:155,44:.: 0.05:1.000:. ./.:4:176,46:.: 0.48:1.000:. ./.:4:117,60:.:-0.36:1.000:. ./.:4:159,68:.: 0.57:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.37:0.999:. ./.:4:126,108:.: 0.70:1.000:. ./.:4:138,38:.:-0.38:1.000:. ./.:4:160,44:.: 0.14:1.000:. ./.:4:100,39:.:-1.07:1.000:. ./.:4:106,30:.:-1.12:1.000:. ./.:4:180,56:.: 0.74:1.000:. ./.:4:118,75:.:-0.06:1.000:. ./.:4:130,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:120,55:.:-0.40:1.000:. ./.:4:131,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:158,59:.: 0.39:1.000:. ./.:4:134,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:138,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:143,36:.:-0.32:1.000:. ./.:4:141,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:117,133:.: 1.00:1.000:. ./.:4:90,26:.:-1.50:1.000:. ./.:4:122,43:.:-0.58:1.000:. ./.:4:106,92:.: 0.03:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:175,58:.: 0.69:1.000:. ./.:4:109,102:.: 0.28:1.000:. ./.:4:164,33:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,60:.: 0.57:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:107,50:.:-0.73:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:158,62:.: 0.44:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:209,53:.: 1.23:1.000:. ./.:4:114,61:.:-0.40:1.000:. ./.:4:176,44:.: 0.44:1.000:. ./.:4:100,53:.:-0.81:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:155,61:.: 0.37:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:99,32:.:-1.22:1.000:. ./.:4:140,37:.:-0.36:1.000:. ./.:4:128,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:138,61:.: 0.05:1.000:. ./.:4:199,69:.: 1.34:1.000:. ./.:4:123,65:.:-0.15:1.000:. ./.:4:204,58:.: 1.23:1.000:. ./.:4:102,38:.:-1.05:1.000:. ./.:4:102,35:.:-1.10:1.000:. ./.:4:100,46:.:-0.94:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:112,72:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,110:.: 0.54:1.000:. ./.:4:100,113:.: 0.31:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:196,54:.: 1.00:1.000:. ./.:4:154,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:178,52:.: 0.63:1.000:. ./.:4:92,43:.:-1.14:1.000:. ./.:4:196,61:.: 1.13:1.000:. ./.:4:109,52:.:-0.66:1.000:. ./.:4:119,87:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,91:.:-0.12:1.000:. ./.:4:209,69:.: 1.52:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:146,98:.: 0.89:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:268,54:.: 2.34:1.000:. ./.:4:148,47:.:-0.02:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.06:1.000:. -chr3.1 40152033 chr3.1_040152033 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:76,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.35:0.998:. ./.:4:182,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:238,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.35:1.000:. ./.:3:14,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.06:1.000:. ./.:6:102,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.55:1.000:. ./.:5:183,0:.: 0.86:0.928:. ./.:4:104,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.63:0.976:. ./.:4:162,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:266,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:158,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:152,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:237,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.30:1.000:. -chr3.1 40218014 chr3.1_040218014 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:190,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.82:0.998:. ./.:4:201,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:229,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.82:1.000:. ./.:3:21,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.38:1.000:. ./.:6:117,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:185,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.41:1.000:. ./.:5:172,0:.: 0.63:0.928:. ./.:4:160,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.18:0.976:. ./.:4:130,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.62:0.999:. ./.:4:161,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:232,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.09:1.000:. -chr3.1 40466885 chr3.1_040466885 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:179,183:0.52: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,221:0.72:-0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,232:0.80:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,345:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,311:0.77: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:355,109:0.25: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,139:0.45:-0.03:1.000:0.982 0/0/1/1:4:183,180:0.51: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,201:0.49: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,31:0.75:-2.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,27:0.83:-2.98:1.000:0.998 0/1/1/1:4:94,261:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:190,193:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:211,260:0.56: 1.60:1.000:0.960 0/1/1/1:4:82,249:0.77: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,200:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,286:0.75: 0.75:0.998:0.999 0/0/1/1:4:205,158:0.45: 0.47:1.000:0.976 0/0/1/1:4:230,283:0.56: 2.04:1.000:0.961 0/0/1/1:4:223,241:0.53: 1.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,24:0.57:-2.87:1.000:0.946 0/1/1/1:4:99,232:0.72: 0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:106,324:0.77: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,188:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,11:0.59:-3.13:1.000:0.853 0/0/1/1:4:217,211:0.50: 1.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,350:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,161:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,302:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,291:0.74: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:222,226:0.52: 1.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,288:0.77: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,20:0.84:-3.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,20:0.47:-2.86:1.000:0.990 1/1/1:3:1,13:0.93:-3.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,292:0.73: 0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:186,198:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/1/1/1:4:110,278:0.73: 0.73:1.000:0.998 0/1/1/1:4:99,243:0.73: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:240,228:0.50: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,137:0.48:-0.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:89,237:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,223:0.72:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,200:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,223:0.76:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,267:0.77: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,264:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,99:0.77:-1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,129:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,186:0.73:-0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:132,115:0.48:-0.74:1.000:0.994 0/1/1/1:4:111,292:0.74: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:166,139:0.47:-0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:155,146:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,158:0.47: 0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:151,178:0.55: 0.12:1.000:0.977 0/1/1/1:4:70,227:0.78:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,183:0.72:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,155:0.51:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1/1/1:6:46,199:0.82:-0.76:1.000:0.978 0/1/1/1:4:75,207:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,150:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:260,95:0.28: 0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,201:0.72:-0.33:1.000:0.995 0/1/1/1:4:99,256:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,133:0.47:-0.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:93,231:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:146,154:0.52:-0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:84,188:0.71:-0.48:1.000:0.990 0/1/1/1:4:79,195:0.73:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,234:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,97:0.46:-1.07:1.000:0.988 0/1/1/1:4:78,236:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,283:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,185:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,159:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:120,132:0.53:-0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:147,142:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,236:0.73: 0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,283:0.77: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,152:0.77:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,125:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:225,205:0.49: 1.17:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,278:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:242,177:0.43: 1.06:0.928:0.932 0/0/1/1:4:182,180:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,126:0.55:-0.89:1.000:0.977 0/1/1/1:4:61,161:0.74:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,137:0.53:-0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,149:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,184:0.78:-0.81:0.976:1.000 0/0/1/1:4:158,154:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,84:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,122:0.47:-0.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:203,169:0.47: 0.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:179,138:0.45:-0.01:1.000:0.976 0/0/1/1:4:125,109:0.48:-0.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,175:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,83:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:111,317:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,142:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:189,137:0.43: 0.08:1.000:0.951 0/0/1/1:4:105,100:0.50:-1.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,214:0.75:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,119:0.54:-0.97:1.000:0.987 0/0/1/1:4:152,151:0.51:-0.16:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,260:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,183:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:91,310:0.79: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,144:0.45: 0.11:1.000:0.980 0/0/1/1:4:116,145:0.57:-0.60:1.000:0.952 0/1/1/1:4:140,360:0.74: 1.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,131:0.52:-0.65:0.999:0.994 1/1/1/1:4:0,293:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,104:0.55:-1.30:1.000:0.982 0/1/1/1:4:88,166:0.67:-0.67:1.000:0.914 0/1/1/1:4:67,200:0.77:-0.53:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:78,195:0.73:-0.47:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,245:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,218:0.72:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,134:0.54:-0.67:1.000:0.988 0/1/1/1:4:93,245:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,260:0.76: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,170:0.71:-0.77:1.000:0.993 0/0/0/1:4:253,68:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,144:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,180:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,113:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,98:0.48:-1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:145,133:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:120,268:0.71: 0.73:1.000:0.990 0/1/1/1:4:55,138:0.73:-1.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,177:0.78:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,287:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,281:0.52: 2.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,155:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,203:0.78:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,116:0.46:-0.63:1.000:0.988 0/0/1/1:4:119,126:0.53:-0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:140,129:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,150:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,183:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,52:0.27:-1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:223,215:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:213,183:0.47: 0.82:1.000:0.993 0/1/1/1:4:97,266:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,210:0.76:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,285:0.58: 1.93:1.000:0.918 0/0/1/1:4:151,150:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:239,260:0.53: 1.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:178,171:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,11:0.33:-2.96:1.000:0.929 0/1/1/1:4:60,149:0.73:-1.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:107,275:0.74: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:185,204:0.54: 0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:224,205:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,209:0.49: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,149:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,309:0.76: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,179:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:101,207:0.69:-0.10:1.000:0.969 0/1/1/1:4:86,306:0.79: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:278,96:0.27: 0.59:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,396:1.00: 0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,334:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,183:0.51: 0.48:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,355:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,155:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,177:0.54: 0.15:1.000:0.985 0/0/1/1:4:166,134:0.46:-0.19:1.000:0.986 0/1/1/1:4:86,202:0.72:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:185,153:0.46: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:155,171:0.54: 0.08:1.000:0.990 0/1/1/1:4:87,227:0.74:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,242:0.77: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,377:0.75: 2.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,141:0.33: 1.38:1.000:0.933 0/0/0/1:4:318,107:0.27: 1.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:85,289:0.79: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,197:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:145,351:0.72: 1.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:237,218:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:206,167:0.46: 0.58:1.000:0.987 0/1/1/1:4:104,246:0.72: 0.34:1.000:0.995 -chr3.1 40725640 chr3.1_040725640 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,232:.: 0.81:1.000:. ./.:4:99,96:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,161:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,88:.:-2.43:1.000:. ./.:4:59,152:.: 0.34:1.000:. ./.:4:54,157:.: 0.34:1.000:. ./.:4:19,49:.:-2.88:1.000:. ./.:4:0,53:.:-3.22:1.000:. ./.:4:48,150:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,150:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.85:0.998:. ./.:4:0,211:.: 0.34:1.000:. ./.:4:81,194:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.61:1.000:. ./.:4:9,47:.:-3.15:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,66:.:-2.93:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.07:1.000:. ./.:4:61,133:.:-0.05:1.000:. ./.:4:55,134:.:-0.16:1.000:. ./.:4:53,179:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,250:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,245:.: 1.10:1.000:. ./.:4:57,168:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,22:.:-3.76:1.000:. ./.:4:0,72:.:-2.79:1.000:. ./.:3:0,30:.:-3.74:1.000:. ./.:4:65,161:.: 0.67:1.000:. ./.:4:60,156:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,244:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,265:.: 1.55:1.000:. ./.:4:56,178:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.79:1.000:. ./.:4:65,167:.: 0.81:1.000:. ./.:4:76,159:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.05:1.000:. ./.:4:77,141:.: 0.49:1.000:. ./.:4:50,122:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.43:1.000:. ./.:4:66,172:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.49:1.000:. ./.:6:15,176:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.05:1.000:. ./.:4:65,181:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,248:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.62:1.000:. ./.:4:61,160:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,204:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.45:1.000:. ./.:4:19,64:.:-2.54:1.000:. ./.:4:137,121:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,246:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.56:1.000:. ./.:4:99,70:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.74:1.000:. ./.:4:48,143:.:-0.11:1.000:. ./.:5:0,192:.:-0.09:0.928:. ./.:4:67,147:.: 0.40:1.000:. ./.:4:42,95:.:-1.33:1.000:. ./.:4:37,134:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.18:1.000:. ./.:4:43,123:.:-0.68:0.976:. ./.:4:57,126:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.83:1.000:. ./.:4:37,91:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.04:1.000:. ./.:4:60,143:.: 0.16:1.000:. ./.:4:50,149:.: 0.07:1.000:. ./.:4:45,134:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.27:1.000:. ./.:4:56,177:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,112:.:-1.89:1.000:. ./.:4:0,200:.: 0.09:1.000:. ./.:4:34,123:.:-0.88:1.000:. ./.:4:47,143:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.25:1.000:. ./.:4:59,140:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,138:.:-0.02:1.000:. ./.:4:62,174:.: 0.90:1.000:. ./.:4:67,176:.: 1.06:1.000:. ./.:4:56,142:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.02:1.000:. ./.:4:69,197:.: 1.58:1.000:. ./.:4:69,129:.: 0.04:0.999:. ./.:4:0,183:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,148:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.86:1.000:. ./.:4:47,148:.:-0.02:1.000:. ./.:4:43,133:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,156:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,200:.: 0.11:1.000:. ./.:4:66,166:.: 0.81:1.000:. ./.:4:79,163:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.38:1.000:. ./.:4:51,148:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,110:.:-0.97:1.000:. ./.:4:50,112:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,168:.: 0.63:1.000:. ./.:4:23,76:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.11:1.000:. ./.:4:55,142:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,175:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.16:1.000:. ./.:4:61,157:.: 0.49:1.000:. ./.:4:55,165:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.07:1.000:. ./.:4:52,132:.:-0.27:1.000:. ./.:4:46,119:.:-0.70:1.000:. ./.:4:77,167:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.92:1.000:. ./.:4:55,168:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,243:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1,181:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,35:.:-3.42:1.000:. ./.:4:35,109:.:-1.17:1.000:. ./.:4:59,132:.:-0.11:1.000:. ./.:4:62,119:.:-0.34:1.000:. ./.:4:2,219:.: 0.56:1.000:. ./.:4:53,149:.: 0.13:1.000:. ./.:4:57,142:.: 0.07:1.000:. ./.:4:54,168:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.81:1.000:. ./.:4:40,147:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,157:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.45:1.000:. ./.:4:52,146:.: 0.04:1.000:. ./.:4:62,162:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.86:1.000:. ./.:4:97,108:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,105:.:-0.81:1.000:. ./.:4:53,149:.: 0.13:1.000:. ./.:4:45,130:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,166:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.43:1.000:. ./.:4:78,191:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.29:1.000:. ./.:4:17,196:.: 0.38:1.000:. ./.:4:46,160:.: 0.22:1.000:. ./.:4:66,159:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.14:1.000:. ./.:4:62,176:.: 0.94:1.000:. -chr3.1 40891924 chr3.1_040891924 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,47:.: 1.28:1.000:. ./.:4:111,32:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,116:.: 0.57:1.000:. ./.:4:106,69:.: 0.75:1.000:. ./.:4:94,94:.: 1.09:1.000:. ./.:4:150,63:.: 1.75:1.000:. ./.:4:109,40:.: 0.06:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:142,48:.: 1.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:14,29:.:-2.73:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:95,85:.: 0.88:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,61:.: 0.30:1.000:. ./.:4:83,91:.: 0.72:0.998:. ./.:4:157,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,59:.: 0.72:1.000:. ./.:4:195,83:.: 3.46:1.000:. ./.:4:22,40:.:-2.23:1.000:. ./.:4:98,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:59,102:.: 0.38:1.000:. ./.:4:122,50:.: 0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:78,105:.: 0.96:1.000:. ./.:4:129,52:.: 0.91:1.000:. ./.:4:88,82:.: 0.62:1.000:. ./.:4:113,70:.: 0.96:1.000:. ./.:4:54,101:.: 0.22:1.000:. ./.:4:157,47:.: 1.51:1.000:. ./.:4:79,93:.: 0.67:1.000:. ./.:4:17,13:.:-3.07:1.000:. ./.:4:27,41:.:-2.07:1.000:. ./.:3:19,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,93:.: 1.17:1.000:. ./.:4:42,88:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,37:.:-0.17:1.000:. ./.:4:57,114:.: 0.64:1.000:. ./.:4:99,50:.: 0.06:1.000:. ./.:4:100,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:51,80:.:-0.41:1.000:. ./.:4:101,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:104,42:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,67:.:-0.99:1.000:. ./.:4:44,83:.:-0.51:1.000:. ./.:4:80,27:.:-1.04:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:104,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:86,37:.:-0.62:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:53,98:.: 0.12:1.000:. ./.:4:72,44:.:-0.80:1.000:. ./.:4:43,94:.:-0.25:1.000:. ./.:4:110,41:.: 0.12:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.38:1.000:. ./.:6:96,33:.:-0.46:1.000:. ./.:4:107,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:72,67:.:-0.20:1.000:. ./.:4:137,46:.: 0.96:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:81,50:.:-0.41:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:109,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:66,75:.:-0.15:1.000:. ./.:4:57,35:.:-1.44:1.000:. ./.:4:141,46:.: 1.07:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,51:.:-0.15:1.000:. ./.:4:33,77:.:-0.96:1.000:. ./.:4:53,89:.:-0.12:1.000:. ./.:4:104,42:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,49:.: 0.12:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:56,96:.: 0.14:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:118,43:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,47:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.86:1.000:. ./.:5:122,34:.: 0.25:0.928:. ./.:4:94,78:.: 0.67:1.000:. ./.:4:95,35:.:-0.44:1.000:. ./.:4:74,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:53,71:.:-0.59:1.000:. ./.:4:106,45:.: 0.12:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.33:0.976:. ./.:4:105,38:.:-0.09:1.000:. ./.:4:73,89:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,35:.:-1.28:1.000:. ./.:4:129,59:.: 1.09:1.000:. ./.:4:124,28:.: 0.14:1.000:. ./.:4:82,29:.:-0.94:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:100,50:.: 0.09:1.000:. ./.:4:129,50:.: 0.86:1.000:. ./.:4:86,28:.:-0.86:1.000:. ./.:4:110,53:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,31:.:-0.99:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:72,33:.:-1.09:1.000:. ./.:4:124,41:.: 0.49:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:100,45:.:-0.04:1.000:. ./.:4:98,121:.: 1.91:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,39:.:-0.41:1.000:. ./.:4:114,61:.: 0.75:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:85,41:.:-0.54:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:100,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:50,74:.:-0.59:1.000:. ./.:4:67,75:.:-0.12:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:96,38:.:-0.33:1.000:. ./.:4:96,45:.:-0.15:1.000:. ./.:4:78,35:.:-0.88:1.000:. ./.:4:80,34:.:-0.86:1.000:. ./.:4:98,117:.: 1.80:1.000:. ./.:4:42,78:.:-0.70:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,43:.:-0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:69,65:.:-0.33:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:56,55:.:-0.94:1.000:. ./.:4:30,81:.:-0.94:1.000:. ./.:4:108,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:120,81:.: 1.44:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:104,28:.:-0.38:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,33:.:-1.04:1.000:. ./.:4:83,74:.: 0.28:1.000:. ./.:4:92,42:.:-0.33:1.000:. ./.:4:95,35:.:-0.44:1.000:. ./.:4:170,71:.: 2.49:1.000:. ./.:4:60,147:.: 1.59:1.000:. ./.:4:102,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:76,78:.: 0.20:1.000:. ./.:4:121,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:93,45:.:-0.22:1.000:. ./.:4:70,126:.: 1.30:1.000:. ./.:4:139,56:.: 1.28:1.000:. ./.:4:24,39:.:-2.20:1.000:. ./.:4:54,65:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:126,54:.: 0.88:1.000:. ./.:4:104,119:.: 2.01:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:118,41:.: 0.33:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:83,90:.: 0.70:1.000:. ./.:4:63,41:.:-1.12:1.000:. ./.:4:101,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:105,44:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:132,50:.: 0.93:1.000:. ./.:4:121,44:.: 0.49:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:118,50:.: 0.57:1.000:. ./.:4:89,52:.:-0.15:1.000:. ./.:4:57,105:.: 0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:104,44:.: 0.04:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.36:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:96,40:.:-0.28:1.000:. ./.:4:97,48:.:-0.04:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:119,118:.: 2.38:1.000:. ./.:4:177,70:.: 2.65:1.000:. ./.:4:124,118:.: 2.52:1.000:. ./.:4:44,93:.:-0.25:1.000:. ./.:4:88,49:.:-0.25:1.000:. -chr3.1 41090026 chr3.1_041090026 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:55,32:0.35: 0.31:1.000:0.781 0/0/1/1:4:40,35:0.45:-0.12:1.000:0.982 0/0/0/1:4:53,31:0.35: 0.21:1.000:0.769 0/0/0/1:4:80,23:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,58:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,40:0.37: 0.88:1.000:0.533 0/0/0/1:4:39,14:0.25:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,60:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,32:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,8:0.56:-2.29:1.000:0.968 0/0/0/1:4:10,4:0.27:-2.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:52,21:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,32:0.30: 0.85:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,54:0.62: 0.28:1.000:0.607 0/1/1/1:4:22,54:0.70:-0.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:59,40:0.39: 0.74:1.000:0.673 0/0/1/1:4:66,68:0.49: 1.99:0.998:0.997 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,64:0.68: 0.53:1.000:0.949 0/0/0/1:4:88,34:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,3:0.36:-2.51:1.000:0.705 0/0/0/1:4:56,27:0.31: 0.17:1.000:0.977 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,21:0.23: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,25:0.21: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,71:0.56: 1.67:1.000:0.973 0/0/1/1:4:60,63:0.50: 1.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,31:0.43:-0.29:1.000:0.942 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,32:0.24: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,40:0.28: 1.96:1.000:0.995 0/0/0/1:4:5,2:0.27:-2.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,10:0.70:-2.29:1.000:0.989 0/0/1:3:2,2:0.49:-2.65:1.000:0.706 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,54:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,30:0.32: 0.35:1.000:0.944 0/1/1/1:4:24,50:0.67:-0.15:1.000:0.901 0/0/0/1:4:62,38:0.36: 0.78:1.000:0.644 0/0/0/1:4:44,25:0.35:-0.33:1.000:0.830 0/0/1/1:4:36,26:0.40:-0.58:1.000:0.824 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,51:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,59:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,24:0.34:-0.40:1.000:0.860 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,28:0.33: 0.10:1.000:0.927 0/1/1/1:4:12,27:0.68:-1.40:1.000:0.960 0/1/1/1:4:15,80:0.84: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,27:0.29: 0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:37,16:0.28:-0.90:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,56:0.66: 0.17:1.000:0.896 0/0/0/1:4:57,34:0.36: 0.46:1.000:0.721 0/0/1/1:4:23,32:0.57:-0.83:1.000:0.946 0/0/0/1:4:35,20:0.35:-0.83:1.000:0.819 0/0/0/1:4:36,22:0.36:-0.72:1.000:0.653 0/0/0/1:4:53,26:0.31: 0.03:1.000:0.971 0/0/0/0/1/1:6:28,19:0.39:-1.12:1.000:0.729 0/0/0/1:4:45,23:0.32:-0.37:1.000:0.951 0/0/0/1:4:71,22:0.22: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,42:0.44: 0.49:1.000:0.971 0/0/1/1:4:36,38:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,41:0.42: 0.60:1.000:0.899 0/1/1/1:4:25,46:0.64:-0.26:1.000:0.657 0/0/0/1:4:27,12:0.29:-1.40:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,58:0.65: 0.35:1.000:0.781 0/0/0/1:4:42,18:0.28:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,51:0.63: 0.06:1.000:0.521 0/1/1/1:4:13,33:0.71:-1.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:25,43:0.62:-0.37:1.000:0.549 0/0/0/1:4:53,28:0.33: 0.10:1.000:0.927 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,16:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,20:0.34:-0.79:1.000:0.868 0/0/0/0:4:58,2:0.03:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,27:0.32: 0.03:1.000:0.941 0/0/0/1:4:53,32:0.36: 0.24:1.000:0.688 0/1/1/1:4:14,38:0.72:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,44:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,31:0.43:-0.29:1.000:0.942 0/1/1/1:4:24,51:0.67:-0.12:1.000:0.921 0/0/0/1/1:5:40,19:0.30:-0.69:0.928:0.539 0/0/1/1:4:41,44:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,34:0.59:-0.76:1.000:0.891 0/0/0/1:4:34,12:0.24:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,27:0.39:-0.44:1.000:0.730 0/0/0/1:4:46,29:0.37:-0.12:1.000:0.556 0/0/1/1:4:28,36:0.55:-0.51:0.976:0.979 0/0/1/1:4:42,48:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,20:0.21: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,43:0.39: 0.99:1.000:0.692 0/0/1/1:4:34,44:0.55:-0.01:1.000:0.978 0/0/0/1:4:53,25:0.30:-0.01:1.000:0.983 0/0/1/1:4:24,41:0.62:-0.47:1.000:0.570 0/0/1/1:4:18,24:0.56:-1.29:1.000:0.968 0/0/1/1:4:40,31:0.42:-0.26:1.000:0.921 0/0/1/1:4:71,62:0.45: 1.96:1.000:0.982 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,33:0.74:-1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,44:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/0:4:54,2:0.03:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,17:0.19: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,38:0.66:-0.76:1.000:0.845 0/1/1/1:4:29,57:0.65: 0.28:1.000:0.814 0/0/1/1:4:45,63:0.57: 1.06:1.000:0.942 0/0/1/1:4:61,61:0.49: 1.56:1.000:0.996 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,104:0.76: 2.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,59:0.75:-0.01:0.999:0.999 0/0/1/1:4:29,25:0.45:-0.87:1.000:0.979 0/0/1/1:4:26,17:0.38:-1.26:1.000:0.562 0/0/1/1:4:34,49:0.58: 0.17:1.000:0.919 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,6:0.10:-0.83:1.000:0.771 0/1/1/1:4:16,52:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,32:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,45:0.60:-0.15:1.000:0.816 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,47:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,88:0.58: 2.56:1.000:0.932 0/0/1/1:4:33,33:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,30:0.40:-0.22:1.000:0.802 0/0/0/1:4:33,19:0.35:-0.94:1.000:0.804 0/1/1/1:4:12,21:0.63:-1.62:1.000:0.505 0/0/1/1:4:26,32:0.54:-0.72:1.000:0.988 0/1/1/1:4:18,55:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,18:0.38:-1.15:1.000:0.507 0/0/1/1:4:53,57:0.51: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,14:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,19:0.27:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,53:0.53: 0.71:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,81:0.73: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,31:0.39:-0.08:1.000:0.717 0/0/0/1:4:56,14:0.19:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,48:0.71:-0.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:31,43:0.57:-0.15:1.000:0.948 0/1/1/1:4:18,47:0.71:-0.47:1.000:0.993 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,56:0.67: 0.13:1.000:0.932 0/0/1/1:4:24,29:0.53:-0.90:1.000:0.990 0/0/0/1:4:85,27:0.22: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,41:0.42: 0.60:1.000:0.899 0/0/0/1:4:64,29:0.29: 0.53:1.000:0.990 0/0/0/1:4:84,34:0.27: 1.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,30:0.23: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,24:0.32:-0.22:1.000:0.963 0/0/0/1:4:73,42:0.35: 1.31:1.000:0.805 0/0/0/1:4:100,33:0.23: 1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.17:-2.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,18:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,49:0.73:-0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,54:0.56: 0.60:1.000:0.972 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,82:0.76: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,26:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,61:0.72: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,25:0.21: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,28:0.34: 0.03:1.000:0.884 0/0/0/1:4:57,21:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,35:0.34: 0.71:1.000:0.868 0/0/1/1:4:43,46:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,58:0.48: 1.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,49:0.53: 0.42:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,61:0.70: 0.28:1.000:0.985 0/0/0/1:4:64,17:0.19: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,31:0.30: 0.71:1.000:0.987 0/0/1/1:4:40,49:0.54: 0.38:1.000:0.989 0/0/1/1:4:37,53:0.58: 0.42:1.000:0.924 0/0/1/1:4:55,55:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,19:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,27:0.35:-0.15:1.000:0.809 0/1/1/1:4:29,74:0.71: 0.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,30:0.33: 0.31:1.000:0.930 0/0/0/1:4:55,30:0.34: 0.24:1.000:0.893 0/0/1/1:4:54,36:0.38: 0.42:1.000:0.623 0/0/1/1:4:51,59:0.52: 1.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,103:0.79: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,37:0.28: 1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,32:0.41:-0.12:1.000:0.873 0/0/0/1:4:70,37:0.33: 1.03:1.000:0.926 -chr3.1 41369407 chr3.1_041369407 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:331,88:.: 0.53:1.000:. ./.:4:143,146:.:-1.06:1.000:. ./.:4:189,142:.:-0.55:1.000:. ./.:4:197,158:.:-0.25:1.000:. ./.:4:252,211:.: 1.06:1.000:. ./.:4:363,120:.: 1.31:1.000:. ./.:4:121,133:.:-1.49:1.000:. ./.:4:265,93:.:-0.22:1.000:. ./.:4:277,80:.:-0.23:1.000:. ./.:4:101,69:.:-2.51:1.000:. ./.:4:144,59:.:-2.11:1.000:. ./.:4:187,169:.:-0.24:1.000:. ./.:4:86,248:.:-0.51:1.000:. ./.:4:239,182:.: 0.55:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:237,198:.: 0.72:1.000:. ./.:4:174,158:.:-0.54:0.998:. ./.:4:210,185:.: 0.23:1.000:. ./.:4:493,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:199,204:.: 0.33:1.000:. ./.:4:110,110:.:-1.90:1.000:. ./.:4:317,91:.: 0.39:1.000:. ./.:4:410,97:.: 1.60:1.000:. ./.:4:185,211:.: 0.25:1.000:. ./.:4:40,88:.:-3.02:1.000:. ./.:4:122,267:.: 0.16:1.000:. ./.:4:188,182:.:-0.07:1.000:. ./.:4:263,104:.:-0.11:1.000:. ./.:4:541,2:.: 2.04:1.000:. ./.:4:236,104:.:-0.44:1.000:. ./.:4:176,119:.:-0.99:1.000:. ./.:4:196,56:.:-1.51:1.000:. ./.:4:57,46:.:-3.33:1.000:. ./.:4:142,51:.:-2.23:1.000:. ./.:3:61,34:.:-3.43:1.000:. ./.:4:213,196:.: 0.40:1.000:. ./.:4:308,89:.: 0.26:1.000:. ./.:4:221,169:.: 0.17:1.000:. ./.:4:196,165:.:-0.18:1.000:. ./.:4:321,80:.: 0.31:1.000:. ./.:4:206,169:.:-0.01:1.000:. ./.:4:328,84:.: 0.44:1.000:. ./.:4:311,86:.: 0.26:1.000:. ./.:4:224,86:.:-0.80:1.000:. ./.:4:237,194:.: 0.67:1.000:. ./.:4:460,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:399,123:.: 1.78:1.000:. ./.:4:101,39:.:-2.88:1.000:. ./.:4:284,86:.:-0.07:1.000:. ./.:4:276,76:.:-0.29:1.000:. ./.:4:164,135:.:-0.94:1.000:. ./.:4:367,91:.: 1.00:1.000:. ./.:4:186,144:.:-0.56:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:279,83:.:-0.17:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:242,151:.: 0.21:1.000:. ./.:4:336,91:.: 0.62:1.000:. ./.:4:295,87:.: 0.07:1.000:. ./.:6:253,93:.:-0.36:1.000:. ./.:4:360,76:.: 0.73:1.000:. ./.:4:173,163:.:-0.49:1.000:. ./.:4:357,99:.: 0.98:1.000:. ./.:4:183,174:.:-0.23:1.000:. ./.:4:343,91:.: 0.71:1.000:. ./.:4:203,147:.:-0.32:1.000:. ./.:4:211,60:.:-1.28:1.000:. ./.:4:351,92:.: 0.82:1.000:. ./.:4:204,163:.:-0.11:1.000:. ./.:4:189,157:.:-0.36:1.000:. ./.:4:265,187:.: 0.93:1.000:. ./.:4:187,137:.:-0.63:1.000:. ./.:4:321,100:.: 0.55:1.000:. ./.:4:325,85:.: 0.42:1.000:. ./.:4:112,242:.:-0.27:1.000:. ./.:4:268,73:.:-0.43:1.000:. ./.:4:219,149:.:-0.10:1.000:. ./.:4:289,71:.:-0.19:1.000:. ./.:4:223,150:.:-0.04:1.000:. ./.:4:249,157:.: 0.37:1.000:. ./.:4:269,64:.:-0.52:1.000:. ./.:4:127,266:.: 0.21:1.000:. ./.:4:248,173:.: 0.55:1.000:. ./.:4:247,82:.:-0.57:1.000:. ./.:5:427,71:.: 1.49:0.928:. ./.:4:379,101:.: 1.27:1.000:. ./.:4:165,125:.:-1.05:1.000:. ./.:4:405,5:.: 0.42:1.000:. ./.:4:317,78:.: 0.23:1.000:. ./.:4:202,138:.:-0.44:1.000:. ./.:4:171,134:.:-0.86:0.976:. ./.:4:192,168:.:-0.19:1.000:. ./.:4:208,158:.:-0.12:1.000:. ./.:4:100,95:.:-2.21:1.000:. ./.:4:108,255:.:-0.16:1.000:. ./.:4:288,78:.:-0.12:1.000:. ./.:4:412,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:269,56:.:-0.62:1.000:. ./.:4:426,77:.: 1.55:1.000:. ./.:4:344,91:.: 0.72:1.000:. ./.:4:289,68:.:-0.23:1.000:. ./.:4:349,85:.: 0.71:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:250,76:.:-0.61:1.000:. ./.:4:263,82:.:-0.38:1.000:. ./.:4:274,63:.:-0.47:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:309,229:.: 1.98:1.000:. ./.:4:312,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:300,96:.: 0.25:1.000:. ./.:4:386,136:.: 1.78:1.000:. ./.:4:238,179:.: 0.50:0.999:. ./.:4:220,151:.:-0.06:1.000:. ./.:4:264,49:.:-0.77:1.000:. ./.:4:148,204:.:-0.29:1.000:. ./.:4:326,79:.: 0.36:1.000:. ./.:4:89,187:.:-1.22:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:207,159:.:-0.12:1.000:. ./.:4:340,82:.: 0.56:1.000:. ./.:4:313,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:322,92:.: 0.47:1.000:. ./.:4:194,192:.: 0.12:1.000:. ./.:4:219,205:.: 0.59:1.000:. ./.:4:386,98:.: 1.32:1.000:. ./.:4:218,136:.:-0.27:1.000:. ./.:4:261,60:.:-0.67:1.000:. ./.:4:235,62:.:-0.96:1.000:. ./.:4:141,113:.:-1.49:1.000:. ./.:4:310,75:.: 0.11:1.000:. ./.:4:160,172:.:-0.54:1.000:. ./.:4:229,51:.:-1.17:1.000:. ./.:4:250,187:.: 0.75:1.000:. ./.:4:215,141:.:-0.24:1.000:. ./.:4:630,0:.: 3.10:1.000:. ./.:4:340,81:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,225:.:-0.57:1.000:. ./.:4:216,167:.: 0.09:1.000:. ./.:4:328,85:.: 0.45:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:214,170:.: 0.10:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:270,53:.:-0.65:1.000:. ./.:4:440,105:.: 2.06:1.000:. ./.:4:442,109:.: 2.14:1.000:. ./.:4:338,92:.: 0.66:1.000:. ./.:4:338,103:.: 0.79:1.000:. ./.:4:240,194:.: 0.71:1.000:. ./.:4:194,140:.:-0.51:1.000:. ./.:4:354,100:.: 0.95:1.000:. ./.:4:178,155:.:-0.52:1.000:. ./.:4:148,77:.:-1.84:1.000:. ./.:4:253,79:.:-0.54:1.000:. ./.:4:295,93:.: 0.15:1.000:. ./.:4:234,189:.: 0.58:1.000:. ./.:4:240,214:.: 0.95:1.000:. ./.:4:250,189:.: 0.77:1.000:. ./.:4:281,76:.:-0.23:1.000:. ./.:4:495,5:.: 1.51:1.000:. ./.:4:103,248:.:-0.30:1.000:. ./.:4:256,70:.:-0.61:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:309,83:.: 0.20:1.000:. ./.:4:213,140:.:-0.28:1.000:. ./.:4:192,202:.: 0.22:1.000:. ./.:4:114,217:.:-0.55:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:207,188:.: 0.23:1.000:. ./.:4:175,164:.:-0.45:1.000:. ./.:4:146,133:.:-1.18:1.000:. ./.:4:144,144:.:-1.07:1.000:. ./.:4:280,74:.:-0.27:1.000:. ./.:4:171,157:.:-0.58:1.000:. ./.:4:65,196:.:-1.40:1.000:. ./.:4:223,48:.:-1.28:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:369,116:.: 1.33:1.000:. ./.:4:336,105:.: 0.79:1.000:. ./.:4:232,133:.:-0.13:1.000:. ./.:4:330,98:.: 0.64:1.000:. ./.:4:268,210:.: 1.25:1.000:. ./.:4:143,343:.: 1.34:1.000:. ./.:4:296,94:.: 0.17:1.000:. ./.:4:213,166:.: 0.04:1.000:. -chr3.1 41495216 chr3.1_041495216 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:133,151:0.57: 0.51:1.000:0.939 0/1/1/1:4:75,139:0.68:-0.63:1.000:0.962 0/0/1/1:4:142,115:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,127:0.67:-0.86:1.000:0.921 0/0/1/1:4:166,123:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,94:0.54:-1.04:1.000:0.987 0/0/1/1:4:115,94:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,151:0.74:-0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,126:0.75:-1.27:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,98:0.99:-2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,58:0.61:-2.47:1.000:0.719 1/1/1/1:4:1,209:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,112:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,187:0.78:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,159:0.70:-0.21:1.000:0.981 0/1/1/1:4:50,115:0.73:-1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,123:0.51: 0.19:0.998:0.996 0/1/1/1:4:77,178:0.73: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:162,123:0.48: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:189,136:0.46: 1.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:85,54:0.43:-1.86:1.000:0.946 0/0/1/1:4:147,107:0.46: 0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:170,144:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,94:0.46:-0.44:1.000:0.987 0/1/1/1:4:25,63:0.75:-2.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,87:0.47:-0.81:1.000:0.993 0/1/1/1:4:43,84:0.69:-2.06:1.000:0.980 0/0/0/1:4:176,47:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,228:0.74: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:121,76:0.43:-0.91:1.000:0.938 0/0/1/1:4:129,85:0.44:-0.63:1.000:0.966 0/0/1/1:4:74,67:0.52:-1.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,22:0.47:-3.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:90,40:0.34:-2.01:1.000:0.844 1/1/1:3:0,65:1.00:-3.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,126:0.73:-1.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:184,40:0.21:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,104:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:160,97:0.42: 0.07:1.000:0.906 0/0/0/1:4:245,52:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,176:0.70: 0.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:145,124:0.51: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,116:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,100:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:192,192:0.54: 2.15:1.000:0.986 0/1/1/1:4:73,203:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,200:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,29:0.51:-3.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:191,62:0.28: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,148:0.74:-0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,181:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:195,135:0.45: 1.27:1.000:0.981 0/1/1/1:4:89,233:0.75: 1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,216:0.72: 1.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:191,63:0.28: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,116:0.46: 0.42:1.000:0.988 0/0/1/1:4:157,159:0.55: 1.04:1.000:0.984 0/0/1/1:4:145,106:0.47:-0.03:1.000:0.991 0/1/1/1:4:73,193:0.75: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:107,148:0.62: 0.04:1.000:0.774 0/0/1/1:4:190,160:0.50: 1.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:206,56:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,156:0.57: 0.73:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,229:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,127:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,164:0.74:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,135:0.52: 0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:85,240:0.77: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,120:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,127:0.72:-1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:185,153:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,184:0.76: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,228:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,141:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,119:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:230,68:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,153:0.78:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,239:0.80: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,263:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,144:0.55: 0.53:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,240:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,172:0.57: 1.18:1.000:0.945 0/1/1/1:4:87,279:0.79: 1.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:171,185:0.56: 1.69:0.928:0.920 0/0/0/1:4:241,70:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,157:0.72:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,204:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,67:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,183:0.72: 0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,262:1.00: 0.15:0.976:1.000 0/1/1/1:4:71,218:0.78: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,78:0.28: 0.99:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,103:0.70:-1.61:1.000:0.987 0/0/1/1:4:185,168:0.52: 1.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:77,215:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,122:0.52: 0.06:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,203:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,189:0.52: 2.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:175,127:0.46: 0.81:1.000:0.990 0/1/1/1:4:73,211:0.77: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,240:0.81: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,126:0.53: 0.09:1.000:0.991 0/1/1/1:4:80,241:0.78: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,177:0.79:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,184:0.76: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,101:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:191,159:0.50: 1.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,214:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,240:0.81: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,172:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,241:0.79: 1.05:0.999:1.000 0/1/1/1:4:107,247:0.73: 1.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,157:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,82:0.37:-0.06:1.000:0.606 0/0/1/1:4:172,149:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,117:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:103,231:0.72: 1.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,203:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,190:0.77: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,210:0.79: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,247:0.79: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,67:0.40:-1.12:1.000:0.822 0/0/1/1:4:166,150:0.52: 1.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,137:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,250:0.82: 1.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,224:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,151:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,169:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,63:0.25: 0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,192:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,103:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,92:0.47:-0.62:1.000:0.993 0/1/1/1:4:70,192:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,143:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,205:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,196:0.74: 0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,209:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,180:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,158:0.52: 1.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:163,180:0.57: 1.48:1.000:0.955 0/0/1/1:4:129,108:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,101:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,188:0.73: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:284,86:0.26: 1.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:144,113:0.48: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,138:0.53: 0.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:165,114:0.45: 0.43:1.000:0.981 0/1/1/1:4:88,200:0.73: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:233,64:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,86:0.45:-0.68:1.000:0.980 0/0/1/1:4:71,37:0.38:-2.37:1.000:0.581 0/0/1/1:4:134,109:0.49:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,180:0.79:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,226:0.76: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,133:0.55: 0.19:1.000:0.983 0/1/1/1:4:89,184:0.71: 0.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:60,147:0.74:-0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,191:0.73: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,118:0.49: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,81:0.47:-1.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:40,145:0.81:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,107:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,111:0.72:-1.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,159:0.75:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,94:0.44:-0.24:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,169:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,156:0.71:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:155,105:0.45: 0.12:1.000:0.976 0/0/1/1:4:117,89:0.48:-0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,98:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:72,168:0.73:-0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:65,152:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,134:0.70:-0.83:1.000:0.982 0/1/1/1:4:68,138:0.70:-0.76:1.000:0.987 0/1/1/1:4:89,145:0.66:-0.31:1.000:0.838 0/0/1/1:4:165,132:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,112:0.47: 0.17:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,181:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,60:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,153:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,132:0.52: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:180,43:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,205:0.73: 0.69:1.000:0.997 -chr3.1 41830393 chr3.1_041830393 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:241,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:211,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.06:0.998:. ./.:4:240,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.53:1.000:. ./.:3:22,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:253,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:122,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:353,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:182,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.48:1.000:. ./.:5:369,0:.: 2.47:0.928:. ./.:4:151,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.50:0.976:. ./.:4:84,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.27:0.999:. ./.:4:202,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:160,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:332,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:355,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:453,0:.: 3.45:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.73:1.000:. -chr3.1 42153532 chr3.1_042153532 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:354,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:143,50:.:-0.94:1.000:. ./.:4:263,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:242,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:262,40:.: 0.31:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:254,21:.: 0.00:1.000:. ./.:4:251,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:56,5:.:-2.46:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:216,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:256,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:292,20:.: 0.42:1.000:. ./.:4:231,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:238,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:237,50:.: 0.14:0.998:. ./.:4:339,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:400,26:.: 1.73:1.000:. ./.:4:511,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:74,15:.:-2.14:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:363,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:317,26:.: 0.78:1.000:. ./.:4:138,38:.:-1.14:1.000:. ./.:4:271,22:.: 0.20:1.000:. ./.:4:313,12:.: 0.57:1.000:. ./.:4:419,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:406,3:.: 1.54:1.000:. ./.:4:238,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.58:1.000:. ./.:3:31,9:.:-2.70:1.000:. ./.:4:208,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:280,18:.: 0.26:1.000:. ./.:4:311,19:.: 0.63:1.000:. ./.:4:190,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:513,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:220,17:.:-0.44:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:224,12:.:-0.45:1.000:. ./.:4:281,20:.: 0.30:1.000:. ./.:4:239,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:174,24:.:-0.89:1.000:. ./.:4:104,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:134,58:.:-0.96:1.000:. ./.:4:129,14:.:-1.52:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:162,42:.:-0.82:1.000:. ./.:4:288,14:.: 0.31:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:278,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:265,15:.: 0.06:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.68:1.000:. ./.:6:248,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:313,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:248,20:.:-0.08:1.000:. ./.:4:225,12:.:-0.44:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:212,10:.:-0.61:1.000:. ./.:4:462,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:245,13:.:-0.20:1.000:. ./.:4:280,17:.: 0.25:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:341,19:.: 0.97:1.000:. ./.:4:142,28:.:-1.21:1.000:. ./.:4:121,28:.:-1.45:1.000:. ./.:4:344,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:361,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:212,15:.:-0.55:1.000:. ./.:4:320,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:267,16:.: 0.09:1.000:. ./.:4:310,20:.: 0.63:1.000:. ./.:4:91,13:.:-1.97:1.000:. ./.:4:168,23:.:-0.97:1.000:. ./.:4:275,25:.: 0.29:1.000:. ./.:4:163,24:.:-1.01:1.000:. ./.:5:413,1:.: 1.60:0.928:. ./.:4:364,19:.: 1.24:1.000:. ./.:4:139,25:.:-1.28:1.000:. ./.:4:245,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:220,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:163,36:.:-0.88:0.976:. ./.:4:125,17:.:-1.53:1.000:. ./.:4:409,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:92,21:.:-1.86:1.000:. ./.:4:353,23:.: 1.16:1.000:. ./.:4:268,21:.: 0.16:1.000:. ./.:4:228,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:209,21:.:-0.52:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:315,23:.: 0.72:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:372,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:186,9:.:-0.92:1.000:. ./.:4:276,19:.: 0.23:1.000:. ./.:4:273,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:231,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:168,41:.:-0.76:1.000:. ./.:4:275,18:.: 0.20:1.000:. ./.:4:248,41:.: 0.16:1.000:. ./.:4:242,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:343,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:229,57:.: 0.12:1.000:. ./.:4:156,31:.:-1.01:0.999:. ./.:4:288,7:.: 0.23:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:240,11:.:-0.28:1.000:. ./.:4:412,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:189,9:.:-0.89:1.000:. ./.:4:284,19:.: 0.32:1.000:. ./.:4:141,32:.:-1.17:1.000:. ./.:4:139,26:.:-1.27:1.000:. ./.:4:260,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:220,29:.:-0.30:1.000:. ./.:4:176,25:.:-0.85:1.000:. ./.:4:213,14:.:-0.55:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:254,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:169,13:.:-1.07:1.000:. ./.:4:218,12:.:-0.52:1.000:. ./.:4:116,18:.:-1.62:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:141,34:.:-1.15:1.000:. ./.:4:210,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:276,21:.: 0.25:1.000:. ./.:4:151,29:.:-1.09:1.000:. ./.:4:344,51:.: 1.38:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:230,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:217,14:.:-0.51:1.000:. ./.:4:245,11:.:-0.22:1.000:. ./.:4:268,12:.: 0.06:1.000:. ./.:4:392,2:.: 1.37:1.000:. ./.:4:287,20:.: 0.37:1.000:. ./.:4:178,6:.:-1.05:1.000:. ./.:4:325,19:.: 0.79:1.000:. ./.:4:306,27:.: 0.66:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:282,21:.: 0.32:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:253,19:.:-0.04:1.000:. ./.:4:491,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:230,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:203,57:.:-0.17:1.000:. ./.:4:183,41:.:-0.59:1.000:. ./.:4:305,20:.: 0.57:1.000:. ./.:4:201,58:.:-0.19:1.000:. ./.:4:244,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:318,25:.: 0.78:1.000:. ./.:4:274,21:.: 0.23:1.000:. ./.:4:227,16:.:-0.37:1.000:. ./.:4:261,13:.:-0.01:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:161,67:.:-0.54:1.000:. ./.:4:169,42:.:-0.74:1.000:. ./.:4:247,20:.:-0.09:1.000:. ./.:4:171,36:.:-0.78:1.000:. ./.:4:207,19:.:-0.56:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:152,26:.:-1.12:1.000:. ./.:4:256,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:151,23:.:-1.16:1.000:. ./.:4:202,20:.:-0.61:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:316,27:.: 0.78:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:196,21:.:-0.67:1.000:. ./.:4:231,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:285,72:.: 0.94:1.000:. ./.:4:343,19:.: 1.00:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:229,18:.:-0.32:1.000:. -chr3.1 42188167 chr3.1_042188167 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:391,87:.: 1.29:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:446,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:293,107:.: 0.26:1.000:. ./.:4:178,62:.:-1.86:1.000:. ./.:4:276,90:.:-0.19:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:190,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:174,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:268,81:.:-0.42:1.000:. ./.:4:316,99:.: 0.46:1.000:. ./.:4:310,97:.: 0.35:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.21:0.998:. ./.:4:400,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:343,105:.: 0.89:1.000:. ./.:4:398,103:.: 1.60:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:295,94:.: 0.11:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:297,89:.: 0.07:1.000:. ./.:4:100,19:.:-3.46:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:280,89:.:-0.15:1.000:. ./.:4:462,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:266,86:.:-0.38:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:105,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:123,51:.:-2.74:1.000:. ./.:3:130,1:.:-3.31:1.000:. ./.:4:297,88:.: 0.06:1.000:. ./.:4:296,90:.: 0.07:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:308,80:.: 0.10:1.000:. ./.:4:297,89:.: 0.07:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:300,78:.:-0.03:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:265,81:.:-0.46:1.000:. ./.:4:340,115:.: 0.99:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:369,107:.: 1.26:1.000:. ./.:4:615,0:.: 3.11:1.000:. ./.:4:240,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:260,76:.:-0.59:1.000:. ./.:4:336,111:.: 0.88:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:319,84:.: 0.30:1.000:. ./.:4:289,87:.:-0.06:1.000:. ./.:4:274,74:.:-0.43:1.000:. ./.:4:281,88:.:-0.15:1.000:. ./.:4:290,96:.: 0.07:1.000:. ./.:4:276,75:.:-0.39:1.000:. ./.:6:278,48:.:-0.72:1.000:. ./.:4:268,89:.:-0.31:1.000:. ./.:4:247,79:.:-0.72:1.000:. ./.:4:344,86:.: 0.65:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:311,115:.: 0.60:1.000:. ./.:4:291,86:.:-0.05:1.000:. ./.:4:227,70:.:-1.11:1.000:. ./.:4:304,75:.:-0.02:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:414,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:271,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:299,95:.: 0.18:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:231,77:.:-0.96:1.000:. ./.:4:329,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:435,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:289,102:.: 0.14:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.01:1.000:. ./.:5:302,84:.: 0.07:0.928:. ./.:4:323,107:.: 0.65:1.000:. ./.:4:301,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:263,95:.:-0.30:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:274,1:.:-1.40:0.976:. ./.:4:378,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:288,106:.: 0.18:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:314,108:.: 0.55:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:268,96:.:-0.22:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:321,90:.: 0.40:1.000:. ./.:4:354,109:.: 1.09:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:259,75:.:-0.62:1.000:. ./.:4:315,112:.: 0.62:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:332,80:.: 0.42:1.000:. ./.:4:512,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:337,83:.: 0.52:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:506,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:297,95:.: 0.15:0.999:. ./.:4:416,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:206,64:.:-1.46:1.000:. ./.:4:226,109:.:-0.60:1.000:. ./.:4:422,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:334,84:.: 0.50:1.000:. ./.:4:328,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:307,89:.: 0.20:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:233,62:.:-1.13:1.000:. ./.:4:280,80:.:-0.27:1.000:. ./.:4:254,88:.:-0.51:1.000:. ./.:4:436,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:286,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:435,141:.: 2.59:1.000:. ./.:4:320,97:.: 0.48:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:267,89:.:-0.33:1.000:. ./.:4:288,85:.:-0.10:1.000:. ./.:4:290,97:.: 0.09:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:340,97:.: 0.75:1.000:. ./.:4:176,67:.:-1.82:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:470,138:.: 3.01:1.000:. ./.:4:317,101:.: 0.50:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:391,109:.: 1.58:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:381,114:.: 1.52:1.000:. ./.:4:301,75:.:-0.06:1.000:. ./.:4:144,36:.:-2.66:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:433,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:372,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:376,113:.: 1.44:1.000:. ./.:4:347,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:367,99:.: 1.13:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:310,91:.: 0.27:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:254,84:.:-0.56:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:296,107:.: 0.30:1.000:. ./.:4:265,97:.:-0.25:1.000:. ./.:4:279,98:.:-0.05:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:304,76:.:-0.01:1.000:. ./.:4:379,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:235,81:.:-0.85:1.000:. ./.:4:329,111:.: 0.79:1.000:. ./.:4:383,82:.: 1.12:1.000:. ./.:4:247,84:.:-0.66:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:322,82:.: 0.31:1.000:. ./.:4:369,110:.: 1.30:1.000:. ./.:4:508,2:.: 1.71:1.000:. ./.:4:259,83:.:-0.51:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.60:1.000:. -chr3.1 42573209 chr3.1_042573209 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:163,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.62:0.998:. ./.:4:153,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:267,0:.: 3.34:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.85:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.59:1.000:. ./.:6:96,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:5:170,0:.: 0.96:0.928:. ./.:4:165,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.62:0.976:. ./.:4:152,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:259,0:.: 3.15:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.23:0.999:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:220,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. -chr3.1 42621440 chr3.1_042621440 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:316,88:.: 0.89:1.000:. ./.:4:228,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:286,127:.: 0.99:1.000:. ./.:4:281,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:304,69:.: 0.53:1.000:. ./.:4:367,133:.: 2.00:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:243,42:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:153,42:.:-1.52:1.000:. ./.:4:229,57:.:-0.47:1.000:. ./.:4:239,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:281,60:.: 0.16:1.000:. ./.:4:258,56:.:-0.15:1.000:. ./.:4:307,137:.: 1.35:1.000:. ./.:4:306,72:.: 0.59:0.998:. ./.:4:190,74:.:-0.72:1.000:. ./.:4:362,144:.: 2.07:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:99,18:.:-2.42:1.000:. ./.:4:301,51:.: 0.29:1.000:. ./.:4:316,113:.: 1.18:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:111,14:.:-2.33:1.000:. ./.:4:286,68:.: 0.31:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:307,72:.: 0.60:1.000:. ./.:4:326,156:.: 1.79:1.000:. ./.:4:309,132:.: 1.32:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:284,55:.: 0.14:1.000:. ./.:4:76,12:.:-2.75:1.000:. ./.:4:119,41:.:-1.92:1.000:. ./.:3:46,11:.:-3.11:1.000:. ./.:4:276,56:.: 0.06:1.000:. ./.:4:307,57:.: 0.43:1.000:. ./.:4:284,140:.: 1.12:1.000:. ./.:4:316,55:.: 0.51:1.000:. ./.:4:325,151:.: 1.72:1.000:. ./.:4:312,156:.: 1.63:1.000:. ./.:4:275,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:279,141:.: 1.07:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:286,68:.: 0.31:1.000:. ./.:4:325,123:.: 1.40:1.000:. ./.:4:322,87:.: 0.95:1.000:. ./.:4:234,74:.:-0.22:1.000:. ./.:4:268,120:.: 0.70:1.000:. ./.:4:261,79:.: 0.15:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:325,73:.: 0.82:1.000:. ./.:4:229,46:.:-0.60:1.000:. ./.:4:318,86:.: 0.89:1.000:. ./.:4:264,105:.: 0.49:1.000:. ./.:4:297,116:.: 0.99:1.000:. ./.:4:278,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:302,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:259,70:.: 0.02:1.000:. ./.:6:288,24:.:-0.17:1.000:. ./.:4:286,72:.: 0.36:1.000:. ./.:4:232,54:.:-0.47:1.000:. ./.:4:262,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:245,45:.:-0.42:1.000:. ./.:4:274,63:.: 0.12:1.000:. ./.:4:265,70:.: 0.09:1.000:. ./.:4:176,25:.:-1.45:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:295,109:.: 0.89:1.000:. ./.:4:250,121:.: 0.51:1.000:. ./.:4:295,132:.: 1.15:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:306,55:.: 0.39:1.000:. ./.:4:302,78:.: 0.61:1.000:. ./.:4:249,64:.:-0.16:1.000:. ./.:4:245,107:.: 0.29:1.000:. ./.:4:237,103:.: 0.15:1.000:. ./.:4:259,117:.: 0.57:1.000:. ./.:4:285,64:.: 0.26:1.000:. ./.:4:315,117:.: 1.21:1.000:. ./.:4:232,44:.:-0.59:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:321,151:.: 1.67:1.000:. ./.:4:271,45:.:-0.13:1.000:. ./.:5:379,190:.: 2.79:0.928:. ./.:4:313,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:166,38:.:-1.42:1.000:. ./.:4:207,89:.:-0.36:1.000:. ./.:4:259,114:.: 0.53:1.000:. ./.:4:263,113:.: 0.57:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.24:0.976:. ./.:4:251,70:.:-0.07:1.000:. ./.:4:347,85:.: 1.21:1.000:. ./.:4:220,36:.:-0.82:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:300,59:.: 0.37:1.000:. ./.:4:248,88:.: 0.11:1.000:. ./.:4:310,100:.: 0.96:1.000:. ./.:4:262,113:.: 0.56:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:143,54:.:-1.50:1.000:. ./.:4:277,110:.: 0.69:1.000:. ./.:4:183,39:.:-1.21:1.000:. ./.:4:231,60:.:-0.41:1.000:. ./.:4:249,104:.: 0.30:1.000:. ./.:4:262,79:.: 0.16:1.000:. ./.:4:219,65:.:-0.49:1.000:. ./.:4:316,116:.: 1.21:1.000:. ./.:4:281,70:.: 0.28:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:224,116:.: 0.15:1.000:. ./.:4:397,180:.: 2.88:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:257,68:.:-0.02:1.000:. ./.:4:198,49:.:-0.92:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:190,76:.:-0.70:1.000:. ./.:4:289,50:.: 0.14:1.000:. ./.:4:231,56:.:-0.46:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:287,115:.: 0.87:1.000:. ./.:4:229,123:.: 0.29:1.000:. ./.:4:303,123:.: 1.14:1.000:. ./.:4:307,65:.: 0.52:1.000:. ./.:4:279,106:.: 0.67:1.000:. ./.:4:255,124:.: 0.60:1.000:. ./.:4:278,117:.: 0.79:1.000:. ./.:4:261,98:.: 0.37:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:234,107:.: 0.16:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:176,29:.:-1.40:1.000:. ./.:4:262,123:.: 0.67:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:350,133:.: 1.80:1.000:. ./.:4:268,49:.:-0.11:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:243,52:.:-0.37:1.000:. ./.:4:251,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:260,112:.: 0.52:1.000:. ./.:4:252,48:.:-0.31:1.000:. ./.:4:266,137:.: 0.88:1.000:. ./.:4:203,45:.:-0.91:1.000:. ./.:4:336,77:.: 0.99:1.000:. ./.:4:301,63:.: 0.43:1.000:. ./.:4:312,69:.: 0.62:1.000:. ./.:4:244,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:266,123:.: 0.72:1.000:. ./.:4:365,165:.: 2.34:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:117,17:.:-2.22:1.000:. ./.:4:198,53:.:-0.87:1.000:. ./.:4:304,108:.: 0.98:1.000:. ./.:4:283,55:.: 0.13:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:262,45:.:-0.23:1.000:. ./.:4:276,53:.: 0.02:1.000:. ./.:4:237,56:.:-0.39:1.000:. ./.:4:231,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:244,122:.: 0.45:1.000:. ./.:4:292,106:.: 0.82:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:269,109:.: 0.59:1.000:. ./.:4:283,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:212,44:.:-0.82:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:260,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:245,59:.:-0.26:1.000:. ./.:4:368,92:.: 1.53:1.000:. ./.:4:296,123:.: 1.06:1.000:. ./.:4:299,124:.: 1.11:1.000:. ./.:4:254,70:.:-0.03:1.000:. ./.:4:257,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:298,69:.: 0.46:1.000:. ./.:4:212,86:.:-0.33:1.000:. ./.:4:314,55:.: 0.49:1.000:. -chr3.1 43123005 chr3.1_043123005 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:11,4:.: 0.62:0.998:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:9,6:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.09:1.000:. ./.:3:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.14:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,7:.: 1.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:14,5:.: 1.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:6,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.79:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:9,7:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:13,4:.: 0.96:1.000:. ./.:4:11,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:13,9:.: 1.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,6:.: 1.14:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:13,5:.: 1.14:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:5:13,0:.: 0.28:0.928:. ./.:4:8,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.82:0.976:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,9:.: 1.65:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:26,7:.: 3.70:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:13,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.31:0.999:. ./.:4:33,7:.: 4.90:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,3:.: 1.31:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:20,6:.: 2.51:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,5:.: 2.51:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:20,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:16,3:.: 1.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:13,7:.: 1.48:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.26:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:13,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:15,4:.: 1.31:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:13,4:.: 0.96:1.000:. -chr3.1 43749631 chr3.1_043749631 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.09:0.998:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:134,0:.: 3.10:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.34:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.73:1.000:. ./.:6:49,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.08:1.000:. ./.:5:58,0:.: 0.04:0.928:. ./.:4:99,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.46:0.976:. ./.:4:65,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:112,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:113,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:84,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.60:1.000:. -chr3.1 44366628 chr3.1_044366628 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:518,124:.: 0.58:1.000:. ./.:4:323,175:.:-0.36:1.000:. ./.:4:354,146:.:-0.35:1.000:. ./.:4:490,193:.: 0.85:1.000:. ./.:4:535,323:.: 2.00:1.000:. ./.:4:500,146:.: 0.61:1.000:. ./.:4:374,133:.:-0.30:1.000:. ./.:4:413,157:.: 0.11:1.000:. ./.:4:407,207:.: 0.40:1.000:. ./.:4:98,35:.:-2.75:1.000:. ./.:4:77,34:.:-2.90:1.000:. ./.:4:467,204:.: 0.77:1.000:. ./.:4:425,194:.: 0.43:1.000:. ./.:4:438,141:.: 0.17:1.000:. ./.:4:426,138:.: 0.07:1.000:. ./.:4:451,171:.: 0.45:1.000:. ./.:4:463,209:.: 0.78:0.998:. ./.:4:401,215:.: 0.41:1.000:. ./.:4:488,149:.: 0.55:1.000:. ./.:4:516,228:.: 1.25:1.000:. ./.:4:132,47:.:-2.45:1.000:. ./.:4:413,128:.:-0.08:1.000:. ./.:4:587,252:.: 1.87:1.000:. ./.:4:369,170:.:-0.09:1.000:. ./.:4:40,19:.:-3.24:1.000:. ./.:4:414,173:.: 0.22:1.000:. ./.:4:521,292:.: 1.70:1.000:. ./.:4:386,175:.: 0.05:1.000:. ./.:4:647,231:.: 2.13:1.000:. ./.:4:389,134:.:-0.20:1.000:. ./.:4:370,141:.:-0.28:1.000:. ./.:4:345,164:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,49:.:-2.95:1.000:. ./.:4:114,32:.:-2.67:1.000:. ./.:3:39,21:.:-3.23:1.000:. ./.:4:412,117:.:-0.16:1.000:. ./.:4:373,187:.: 0.05:1.000:. ./.:4:443,167:.: 0.37:1.000:. ./.:4:296,64:.:-1.27:1.000:. ./.:4:332,78:.:-0.94:1.000:. ./.:4:451,166:.: 0.42:1.000:. ./.:4:374,106:.:-0.48:1.000:. ./.:4:429,147:.: 0.15:1.000:. ./.:4:321,120:.:-0.73:1.000:. ./.:4:392,97:.:-0.42:1.000:. ./.:4:438,155:.: 0.26:1.000:. ./.:4:544,177:.: 1.10:1.000:. ./.:4:663,154:.: 1.73:1.000:. ./.:4:292,68:.:-1.27:1.000:. ./.:4:279,71:.:-1.33:1.000:. ./.:4:303,160:.:-0.59:1.000:. ./.:4:455,139:.: 0.27:1.000:. ./.:4:324,206:.:-0.15:1.000:. ./.:4:467,202:.: 0.76:1.000:. ./.:4:464,130:.: 0.27:1.000:. ./.:4:332,76:.:-0.95:1.000:. ./.:4:412,118:.:-0.15:1.000:. ./.:4:350,69:.:-0.88:1.000:. ./.:4:310,93:.:-0.98:1.000:. ./.:6:365,100:.:-0.58:1.000:. ./.:4:433,142:.: 0.14:1.000:. ./.:4:406,162:.: 0.10:1.000:. ./.:4:344,158:.:-0.33:1.000:. ./.:4:280,111:.:-1.06:1.000:. ./.:4:419,135:.: 0.01:1.000:. ./.:4:323,91:.:-0.91:1.000:. ./.:4:263,78:.:-1.39:1.000:. ./.:4:397,205:.: 0.32:1.000:. ./.:4:451,148:.: 0.30:1.000:. ./.:4:440,126:.: 0.08:1.000:. ./.:4:457,174:.: 0.51:1.000:. ./.:4:275,161:.:-0.77:1.000:. ./.:4:376,119:.:-0.38:1.000:. ./.:4:429,123:.:-0.01:1.000:. ./.:4:414,174:.: 0.23:1.000:. ./.:4:288,93:.:-1.13:1.000:. ./.:4:409,132:.:-0.08:1.000:. ./.:4:454,176:.: 0.50:1.000:. ./.:4:402,184:.: 0.22:1.000:. ./.:4:454,161:.: 0.41:1.000:. ./.:4:346,128:.:-0.52:1.000:. ./.:4:357,149:.:-0.31:1.000:. ./.:4:461,183:.: 0.60:1.000:. ./.:4:385,168:.: 0.00:1.000:. ./.:5:406,62:.:-0.56:0.928:. ./.:4:457,211:.: 0.75:1.000:. ./.:4:344,163:.:-0.30:1.000:. ./.:4:396,147:.:-0.07:1.000:. ./.:4:344,76:.:-0.87:1.000:. ./.:4:465,184:.: 0.63:1.000:. ./.:4:409,186:.: 0.27:0.976:. ./.:4:329,202:.:-0.14:1.000:. ./.:4:399,163:.: 0.06:1.000:. ./.:4:379,190:.: 0.10:1.000:. ./.:4:379,156:.:-0.12:1.000:. ./.:4:350,202:.:-0.01:1.000:. ./.:4:358,87:.:-0.71:1.000:. ./.:4:286,88:.:-1.17:1.000:. ./.:4:488,196:.: 0.86:1.000:. ./.:4:403,184:.: 0.22:1.000:. ./.:4:432,180:.: 0.39:1.000:. ./.:4:525,206:.: 1.17:1.000:. ./.:4:263,133:.:-1.03:1.000:. ./.:4:436,125:.: 0.05:1.000:. ./.:4:302,131:.:-0.79:1.000:. ./.:4:307,180:.:-0.43:1.000:. ./.:4:333,158:.:-0.41:1.000:. ./.:4:434,114:.:-0.03:1.000:. ./.:4:631,348:.: 2.79:1.000:. ./.:4:390,186:.: 0.15:1.000:. ./.:4:350,125:.:-0.51:1.000:. ./.:4:466,201:.: 0.75:1.000:. ./.:4:414,182:.: 0.28:0.999:. ./.:4:478,191:.: 0.76:1.000:. ./.:4:317,64:.:-1.13:1.000:. ./.:4:329,108:.:-0.76:1.000:. ./.:4:373,141:.:-0.26:1.000:. ./.:4:358,159:.:-0.24:1.000:. ./.:4:359,92:.:-0.67:1.000:. ./.:4:340,185:.:-0.18:1.000:. ./.:4:429,177:.: 0.35:1.000:. ./.:4:403,162:.: 0.08:1.000:. ./.:4:389,181:.: 0.11:1.000:. ./.:4:498,289:.: 1.53:1.000:. ./.:4:396,143:.:-0.09:1.000:. ./.:4:505,161:.: 0.74:1.000:. ./.:4:424,179:.: 0.33:1.000:. ./.:4:325,71:.:-1.03:1.000:. ./.:4:236,93:.:-1.47:1.000:. ./.:4:298,137:.:-0.77:1.000:. ./.:4:355,81:.:-0.77:1.000:. ./.:4:357,222:.: 0.17:1.000:. ./.:4:246,149:.:-1.04:1.000:. ./.:4:421,131:.:-0.01:1.000:. ./.:4:479,185:.: 0.73:1.000:. ./.:4:479,148:.: 0.48:1.000:. ./.:4:437,117:.: 0.01:1.000:. ./.:4:380,183:.: 0.07:1.000:. ./.:4:409,112:.:-0.21:1.000:. ./.:4:367,135:.:-0.33:1.000:. ./.:4:444,111:.: 0.01:1.000:. ./.:4:444,191:.: 0.54:1.000:. ./.:4:411,126:.:-0.11:1.000:. ./.:4:296,137:.:-0.79:1.000:. ./.:4:569,337:.: 2.31:1.000:. ./.:4:669,180:.: 1.94:1.000:. ./.:4:430,144:.: 0.14:1.000:. ./.:4:473,259:.: 1.17:1.000:. ./.:4:379,203:.: 0.19:1.000:. ./.:4:384,145:.:-0.16:1.000:. ./.:4:457,153:.: 0.37:1.000:. ./.:4:367,161:.:-0.16:1.000:. ./.:4:73,39:.:-2.89:1.000:. ./.:4:466,268:.: 1.19:1.000:. ./.:4:454,154:.: 0.36:1.000:. ./.:4:464,256:.: 1.09:1.000:. ./.:4:594,341:.: 2.50:1.000:. ./.:4:421,216:.: 0.55:1.000:. ./.:4:420,284:.: 0.99:1.000:. ./.:4:524,156:.: 0.83:1.000:. ./.:4:355,204:.: 0.04:1.000:. ./.:4:329,176:.:-0.32:1.000:. ./.:4:360,209:.: 0.10:1.000:. ./.:4:485,142:.: 0.48:1.000:. ./.:4:527,222:.: 1.28:1.000:. ./.:4:474,264:.: 1.21:1.000:. ./.:4:328,157:.:-0.45:1.000:. ./.:4:407,120:.:-0.17:0.999:. ./.:4:424,126:.:-0.02:1.000:. ./.:4:418,193:.: 0.38:1.000:. ./.:4:393,178:.: 0.12:1.000:. ./.:4:293,161:.:-0.65:1.000:. ./.:4:460,205:.: 0.73:1.000:. ./.:4:358,237:.: 0.27:1.000:. ./.:4:315,156:.:-0.54:1.000:. ./.:4:342,113:.:-0.64:1.000:. ./.:4:420,142:.: 0.06:1.000:. ./.:4:428,168:.: 0.28:1.000:. ./.:4:417,126:.:-0.07:1.000:. ./.:4:401,168:.: 0.10:1.000:. ./.:4:480,205:.: 0.86:1.000:. ./.:4:566,221:.: 1.53:1.000:. ./.:4:639,367:.: 2.97:1.000:. ./.:4:310,85:.:-1.04:1.000:. ./.:4:524,228:.: 1.30:1.000:. -chr3.1 44534339 chr3.1_044534339 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:82,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:351,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:345,0:.: 2.44:0.998:. ./.:4:78,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:377,1:.: 2.93:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:214,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.87:1.000:. ./.:3:75,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.58:1.000:. ./.:6:110,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:158,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:148,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.70:1.000:. ./.:5:162,1:.:-0.27:0.928:. ./.:4:249,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.22:0.976:. ./.:4:256,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:383,0:.: 3.00:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.77:0.999:. ./.:4:146,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:324,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:149,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:339,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:146,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:337,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.74:1.000:. -chr3.1 44716808 chr3.1_044716808 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,459:.: 0.97:1.000:. ./.:4:1,352:.:-0.34:1.000:. ./.:4:114,290:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,425:.: 0.55:1.000:. ./.:4:130,363:.: 1.40:1.000:. ./.:4:126,384:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,295:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1,175:.:-2.55:1.000:. ./.:4:49,142:.:-2.36:1.000:. ./.:4:0,404:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,415:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,427:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.15:1.000:. ./.:4:97,325:.: 0.51:1.000:. ./.:4:114,382:.: 1.43:0.998:. ./.:4:0,405:.: 0.30:1.000:. ./.:4:138,421:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,523:.: 1.77:1.000:. ./.:4:44,161:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,422:.: 0.51:1.000:. ./.:4:127,323:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,430:.: 0.61:1.000:. ./.:4:40,110:.:-2.87:1.000:. ./.:4:104,348:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,427:.: 0.58:1.000:. ./.:4:101,285:.: 0.07:1.000:. ./.:4:110,372:.: 1.26:1.000:. ./.:4:89,364:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,470:.: 1.11:1.000:. ./.:4:97,298:.: 0.18:1.000:. ./.:4:38,105:.:-2.96:1.000:. ./.:4:43,120:.:-2.71:1.000:. ./.:3:0,103:.:-3.45:1.000:. ./.:4:0,445:.: 0.80:1.000:. ./.:4:85,328:.: 0.40:1.000:. ./.:4:100,311:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,453:.: 0.90:1.000:. ./.:4:119,390:.: 1.59:1.000:. ./.:4:98,294:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.26:1.000:. ./.:4:94,343:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.56:1.000:. ./.:4:88,331:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,470:.: 1.12:1.000:. ./.:4:57,192:.:-1.64:1.000:. ./.:4:88,285:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,204:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,489:.: 1.35:1.000:. ./.:4:82,262:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,439:.: 0.72:1.000:. ./.:4:79,291:.:-0.13:1.000:. ./.:4:79,274:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,404:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,371:.:-0.12:1.000:. ./.:6:0,354:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,350:.:-0.38:1.000:. ./.:4:87,247:.:-0.58:1.000:. ./.:4:124,337:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,401:.: 0.26:1.000:. ./.:4:102,310:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,367:.:-0.17:1.000:. ./.:4:98,327:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1,483:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,400:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,322:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,265:.:-0.46:1.000:. ./.:4:96,276:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,364:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,325:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,380:.:-0.01:1.000:. ./.:4:108,345:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.87:1.000:. ./.:5:88,429:.: 1.69:0.928:. ./.:4:97,318:.: 0.43:1.000:. ./.:4:69,215:.:-1.20:1.000:. ./.:4:88,247:.:-0.57:1.000:. ./.:4:90,246:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,260:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,337:.:-0.54:0.976:. ./.:4:90,289:.:-0.02:1.000:. ./.:4:92,303:.: 0.18:1.000:. ./.:4:71,184:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.31:1.000:. ./.:4:81,285:.:-0.18:1.000:. ./.:4:74,244:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,297:.:-1.04:1.000:. ./.:4:90,285:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,392:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,232:.:-1.07:1.000:. ./.:4:99,312:.: 0.38:1.000:. ./.:4:80,224:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,360:.:-0.26:1.000:. ./.:4:74,244:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,275:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,360:.: 1.02:1.000:. ./.:4:131,388:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.30:1.000:. ./.:4:72,221:.:-1.09:1.000:. ./.:4:124,437:.: 2.24:1.000:. ./.:4:1,388:.: 0.10:0.999:. ./.:4:0,412:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,234:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.98:1.000:. ./.:4:72,245:.:-0.79:1.000:. ./.:4:91,222:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,360:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.78:1.000:. ./.:4:79,287:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,279:.:-0.38:1.000:. ./.:4:81,341:.: 0.51:1.000:. ./.:4:118,346:.: 1.04:1.000:. ./.:4:83,305:.: 0.09:1.000:. ./.:4:103,310:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,345:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,345:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,261:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,290:.:-1.13:1.000:. ./.:4:86,228:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,411:.: 0.38:1.000:. ./.:4:51,184:.:-1.81:1.000:. ./.:4:77,264:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.84:1.000:. ./.:4:108,396:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,329:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,335:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1,317:.:-0.78:1.000:. ./.:4:79,250:.:-0.64:1.000:. ./.:4:74,237:.:-0.87:1.000:. ./.:4:88,308:.: 0.19:1.000:. ./.:4:55,208:.:-1.46:1.000:. ./.:4:111,335:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,502:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.56:1.000:. ./.:4:90,275:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,386:.: 0.07:1.000:. ./.:4:85,266:.:-0.37:1.000:. ./.:4:110,361:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,395:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,179:.:-2.51:1.000:. ./.:4:88,279:.:-0.17:1.000:. ./.:4:105,345:.: 0.86:1.000:. ./.:4:96,305:.: 0.25:1.000:. ./.:4:2,504:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,451:.: 0.87:1.000:. ./.:4:94,243:.:-0.54:1.000:. ./.:4:2,436:.: 0.71:1.000:. ./.:4:79,302:.: 0.00:1.000:. ./.:4:70,239:.:-0.89:1.000:. ./.:4:78,309:.: 0.08:1.000:. ./.:4:99,326:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,409:.: 0.35:1.000:. ./.:4:2,380:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,379:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,412:.: 0.39:0.999:. ./.:4:0,365:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,356:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,228:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,387:.: 0.08:1.000:. ./.:4:90,294:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,352:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,546:.: 2.05:1.000:. ./.:4:122,361:.: 1.27:1.000:. ./.:4:92,336:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,384:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,501:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,582:.: 2.50:1.000:. ./.:4:125,356:.: 1.25:1.000:. ./.:4:85,267:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.00:1.000:. -chr3.1 44911019 chr3.1_044911019 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:134,106:0.48: 0.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,119:0.74:-1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,93:0.47:-0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,103:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,185:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,49:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,66:0.47:-1.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:131,96:0.46: 0.17:1.000:0.985 0/1/1/1:4:70,140:0.68:-0.18:1.000:0.958 0/0/0/1:4:63,32:0.36:-2.61:1.000:0.645 0/1/1/1:4:16,52:0.77:-3.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,50:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:159,49:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:264,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,99:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,56:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,134:0.69:-0.42:0.998:0.970 0/0/0/1:4:172,56:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:164,141:0.50: 1.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,118:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,108:0.85:-1.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:112,83:0.46:-0.50:1.000:0.987 0/1/1/1:4:82,161:0.68: 0.51:1.000:0.949 0/0/1/1:4:122,100:0.48: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,32:0.35:-2.53:1.000:0.801 0/0/1/1:4:109,119:0.55: 0.20:1.000:0.978 0/1/1/1:4:62,141:0.71:-0.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:49,131:0.74:-0.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:82,191:0.71: 1.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,166:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,78:0.44:-0.61:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-1.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-3.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,61:0.44:-1.45:1.000:0.964 0/0/1:3:27,20:0.46:-3.63:1.000:0.942 0/0/0/0:4:276,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,163:0.72: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,90:0.43: 0.17:1.000:0.939 0/0/0/1:4:179,55:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,99:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:182,63:0.28: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,109:0.48: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,187:0.74: 0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,137:0.76:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,61:0.21: 1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,178:0.74: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,56:0.20: 1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,54:0.86:-3.29:1.000:0.962 0/0/1/1:4:112,91:0.48:-0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,54:0.50:-2.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,42:0.25:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,107:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,106:0.47: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:116,140:0.57: 0.79:1.000:0.935 0/0/1/1:4:125,91:0.45:-0.06:1.000:0.983 0/0/1/1:4:114,109:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,54:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,141:0.53: 1.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:205,53:0.22: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:94,95:0.53:-0.63:1.000:0.823 0/0/1/1:4:133,114:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,107:0.56:-0.35:1.000:0.969 0/0/1/1:4:177,159:0.51: 2.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:199,76:0.30: 1.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:124,110:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,41:0.23:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,131:0.56: 0.55:1.000:0.962 0/0/0/1:4:178,60:0.27: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:178,36:0.18:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,130:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,91:0.61:-1.37:1.000:0.649 0/0/1/1:4:129,117:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,97:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,88:0.46:-0.27:1.000:0.988 0/0/1/1:4:96,106:0.55:-0.35:1.000:0.975 0/0/0/1:4:175,73:0.32: 0.62:1.000:0.958 0/0/1/1:4:150,122:0.48: 1.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:190,58:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,93:0.47:-0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,99:0.53:-0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:200,64:0.26: 0.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:192,78:0.31: 1.08:1.000:0.970 0/0/1/1:4:119,89:0.46:-0.23:1.000:0.988 0/0/0/0/1:5:183,53:0.24: 0.36:0.928:0.948 0/1/1/1:4:62,174:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,75:0.46:-0.88:1.000:0.985 0/1/1/1:4:50,157:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,102:0.48: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,50:0.28:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,111:0.54:-0.02:0.976:0.988 0/0/1/1:4:110,121:0.55: 0.26:1.000:0.976 0/0/1/1:4:126,115:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,80:0.53:-1.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:176,47:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,185:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,100:0.46: 0.32:1.000:0.988 0/0/0/1:4:149,50:0.27:-0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,131:0.49: 1.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,168:0.73: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,102:0.47: 0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:125,120:0.52: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,104:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,128:0.47: 1.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,115:0.54: 0.13:1.000:0.986 0/1/1/1:4:50,157:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,98:0.52:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,95:0.48:-0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:84,192:0.71: 1.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:127,106:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,134:0.55: 0.79:1.000:0.977 0/0/1/1:4:147,125:0.49: 1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,63:0.26: 0.85:0.999:0.998 0/0/1/1:4:85,93:0.55:-0.86:1.000:0.978 0/0/0/1:4:103,30:0.24:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,61:0.32:-0.29:1.000:0.949 0/1/1/1:4:65,188:0.75: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,70:0.46:-1.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:123,149:0.57: 1.12:1.000:0.933 0/1/1/1:4:59,135:0.71:-0.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:142,110:0.47: 0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:112,123:0.55: 0.34:1.000:0.977 0/0/1/1:4:127,124:0.53: 0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:45,162:0.79:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,104:0.55:-0.40:1.000:0.980 0/0/1/1:4:146,117:0.48: 0.93:1.000:0.995 0/0/0/1:4:203,58:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,93:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,40:0.24:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,108:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,98:0.50:-0.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,163:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,116:0.55: 0.05:1.000:0.975 0/1/1/1:4:68,146:0.70:-0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:134,128:0.52: 0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,50:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,106:0.52: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,39:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,104:0.47: 0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:135,122:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,196:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,90:0.45:-0.04:1.000:0.976 0/0/1/1:4:104,107:0.54:-0.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:71,191:0.74: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:215,75:0.28: 1.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,105:0.44: 0.83:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,193:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,142:0.68:-0.10:1.000:0.951 0/0/0/1:4:140,47:0.27:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,118:0.45: 1.29:1.000:0.983 0/0/1/1:4:115,78:0.44:-0.54:1.000:0.959 0/0/0/1:4:70,32:0.34:-2.46:1.000:0.876 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,81:0.46:-0.63:1.000:0.988 0/0/1/1:4:134,114:0.49: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,113:0.46: 1.02:1.000:0.985 0/0/0/1:4:202,58:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,132:0.75:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,106:0.51: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,91:0.51:-0.54:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,139:1.00:-1.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,194:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,49:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,77:0.70:-2.25:1.000:0.986 0/1/1/1:4:64,151:0.71:-0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:160,43:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,101:0.51:-0.14:0.999:0.996 0/0/0/0:4:281,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,92:0.46:-0.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:115,72:0.42:-0.67:1.000:0.892 0/1/1/1:4:52,117:0.70:-1.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:131,103:0.47: 0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,103:0.48: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,91:0.52:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:158,55:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,118:0.43: 1.65:1.000:0.942 0/0/1/1:4:132,121:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:207,55:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,53:0.26:-0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,111:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,102:0.46: 0.47:1.000:0.985 0/0/1/1:4:160,120:0.46: 1.29:1.000:0.988 0/0/1/1:4:114,66:0.40:-0.82:1.000:0.749 0/0/1/1:4:121,109:0.51: 0.24:1.000:0.996 -chr3.1 45221007 chr3.1_045221007 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:16,2:0.17:-0.46:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,1:0.04: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,2:0.09: 0.69:1.000:0.966 0/0/0/1:4:15,4:0.30:-0.39:1.000:0.981 0/0/0/1:4:18,4:0.27:-0.20:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.52:-1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,8:0.53:-0.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:22,3:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.46:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:27,4:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,2:0.12:-0.01:1.000:0.852 0/0/0/1:4:33,4:0.17: 0.75:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,4:0.26:-0.08:0.998:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,3:0.13: 0.69:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.60:-0.71:1.000:0.761 0/0/0/1:4:13,3:0.28:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,4:0.24: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.67:-1.28:1.000:0.912 0/0/0/1:4:25,3:0.17: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,7:0.42:-0.20:1.000:0.918 0/0/0/1:4:19,3:0.21:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.32:-1.03:1.000:0.960 0/0/0:3:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,1:0.04: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,1:0.05: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,4:0.11: 2.08:1.000:0.587 0/0/0/1:4:28,3:0.15: 0.37:1.000:0.989 0/0/0/1:4:36,8:0.27: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,5:0.28: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,10:0.33: 1.13:1.000:0.927 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,2:0.06: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.33: 0.81:1.000:0.907 0/0/0/1:4:38,4:0.15: 1.07:1.000:0.986 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,2:0.05: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,6:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,15:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,7:0.29: 0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,10:0.38: 0.69:1.000:0.534 0/0/0/1:4:45,5:0.16: 1.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:17,4:0.28:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,8:0.38: 0.24:1.000:0.506 0/0/0/0:4:42,3:0.10: 1.26:1.000:0.695 0/0/0/1:4:32,3:0.13: 0.62:1.000:0.939 0/0/0/1:4:21,6:0.32: 0.12:1.000:0.960 0/0/0/0/1/1:6:19,8:0.40: 0.12:1.000:0.666 0/0/0/1:4:21,6:0.32: 0.12:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.27: 3.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,3:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,11:0.33: 1.39:1.000:0.921 0/0/1/1:4:19,9:0.42: 0.18:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,6:0.15: 2.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:22,2:0.13:-0.08:1.000:0.912 0/0/0/1:4:49,4:0.12: 1.77:1.000:0.715 0/0/1/1:4:15,9:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,24:0.49: 2.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,2:0.18:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,5:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,7:0.38:-0.01:1.000:0.566 0/0/0/1:4:42,10:0.28: 1.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:25,8:0.34: 0.50:1.000:0.875 0/0/0/1:4:46,7:0.21: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.36: 0.37:1.000:0.733 0/0/0/1:4:35,8:0.28: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,7:0.16: 2.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:19,3:0.21:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:30,17:0.47: 1.39:0.928:0.782 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,8:0.42:-0.01:1.000:0.925 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.30: 0.88:1.000:0.986 0/0/0/1:4:33,8:0.29: 1.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:21,6:0.32: 0.12:0.976:0.960 0/0/0/1:4:28,6:0.27: 0.56:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,9:0.39: 0.37:1.000:0.701 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,6:0.31: 0.18:1.000:0.975 0/0/0/1:4:39,6:0.21: 1.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,8:0.41: 0.05:1.000:0.862 0/0/1/1:4:20,8:0.39: 0.18:1.000:0.643 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,10:0.44: 0.31:1.000:0.963 0/0/1/1:4:20,16:0.52: 0.69:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,4:0.14: 1.19:1.000:0.973 0/0/0/1:4:15,5:0.35:-0.33:1.000:0.816 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,6:0.32: 0.12:1.000:0.960 0/0/0/1:4:49,6:0.17: 1.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,10:0.45: 0.24:0.999:0.980 0/0/0/0:4:57,1:0.03: 2.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.35:-0.33:1.000:0.816 0/0/0/1:4:15,3:0.26:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,7:0.37: 0.05:1.000:0.589 0/0/0/1:4:31,9:0.32: 0.94:1.000:0.953 0/0/1/1:4:21,15:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,6:0.35:-0.08:1.000:0.816 0/0/0/1:4:45,5:0.16: 1.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,10:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:50,9:0.24: 2.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,3:0.11: 1.13:1.000:0.547 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,4:0.16: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,10:0.28: 1.83:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,5:0.41:-0.58:1.000:0.891 0/0/1/1:4:20,11:0.46: 0.37:1.000:0.988 0/0/0/1:4:25,3:0.17: 0.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.29:-0.96:1.000:0.990 0/0/0/0:4:14,1:0.10:-0.65:1.000:0.695 0/0/0/1:4:16,5:0.33:-0.27:1.000:0.901 0/0/0/1:4:16,4:0.29:-0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:10,11:0.55:-0.27:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,11:0.41: 0.69:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.49:-0.27:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,2:0.10: 0.31:1.000:0.695 0/0/1/1:4:14,9:0.50:-0.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,5:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.28:-0.27:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,4:0.13: 1.39:1.000:0.933 0/0/1/1:4:11,5:0.41:-0.58:1.000:0.891 0/0/0/1:4:13,2:0.21:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.32:-0.20:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,4:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,3:0.25:-0.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,3:0.52:-1.16:1.000:0.996 0/0/0/0:4:18,1:0.08:-0.39:1.000:0.983 0/0/0/1:4:13,2:0.21:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,1:0.08:-0.33:0.999:0.992 0/0/0/0:4:30,2:0.10: 0.43:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.29:-0.65:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.46:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/0:4:19,1:0.08:-0.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,6:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,4:0.20: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,1:0.07:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,5:0.30:-0.08:1.000:0.983 0/0/0/0:4:27,1:0.06: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,4:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,4:0.28:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,9:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:13,1:0.11:-0.71:1.000:0.535 0/0/0/1:4:16,2:0.17:-0.46:1.000:0.999 -chr3.1 45391318 chr3.1_045391318 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:79,11:.: 0.77:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:47,24:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,32:.: 0.72:1.000:. ./.:4:99,19:.: 1.94:1.000:. ./.:4:70,19:.: 0.72:1.000:. ./.:4:33,1:.:-1.58:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.75:1.000:. ./.:4:46,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,28:.: 0.01:1.000:. ./.:4:66,13:.: 0.31:1.000:. ./.:4:37,35:.: 0.01:1.000:. ./.:4:58,4:.:-0.41:0.998:. ./.:4:85,20:.: 1.39:1.000:. ./.:4:82,9:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,8:.: 1.06:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:75,14:.: 0.72:1.000:. ./.:4:80,14:.: 0.93:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.83:1.000:. ./.:4:51,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:86,28:.: 1.77:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:72,18:.: 0.77:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.22:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.58:1.000:. ./.:3:0,2:.:-2.92:1.000:. ./.:4:38,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:55,28:.: 0.47:1.000:. ./.:4:24,21:.:-1.12:1.000:. ./.:4:74,12:.: 0.60:1.000:. ./.:4:40,20:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,11:.: 0.39:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:41,25:.:-0.24:1.000:. ./.:4:78,8:.: 0.60:1.000:. ./.:4:39,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:15,2:.:-2.29:1.000:. ./.:4:37,19:.:-0.66:1.000:. ./.:4:27,11:.:-1.41:1.000:. ./.:4:40,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:86,15:.: 1.23:1.000:. ./.:4:62,8:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,20:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:36,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,6:.:-0.03:1.000:. ./.:4:46,11:.:-0.62:1.000:. ./.:6:38,12:.:-0.91:1.000:. ./.:4:69,14:.: 0.47:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:24,15:.:-1.37:1.000:. ./.:4:81,11:.: 0.85:1.000:. ./.:4:45,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:22,5:.:-1.87:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:38,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:49,29:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,16:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,3:.:-1.66:1.000:. ./.:4:53,8:.:-0.45:1.000:. ./.:4:109,15:.: 2.19:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.24:1.000:. ./.:4:51,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,10:.:-1.20:1.000:. ./.:4:77,5:.: 0.43:1.000:. ./.:4:52,26:.: 0.26:1.000:. ./.:4:45,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:38,8:.:-1.08:1.000:. ./.:4:71,12:.: 0.47:1.000:. ./.:4:37,21:.:-0.57:1.000:. ./.:4:51,24:.: 0.14:1.000:. ./.:5:49,15:.:-0.32:0.928:. ./.:4:97,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:55,7:.:-0.41:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:65,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,24:.:-0.07:1.000:. ./.:4:63,7:.:-0.07:0.976:. ./.:4:56,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:62,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:55,8:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,15:.:-0.99:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:41,5:.:-1.08:1.000:. ./.:4:70,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:77,10:.: 0.64:1.000:. ./.:4:42,7:.:-0.95:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:41,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:65,10:.: 0.14:1.000:. ./.:4:132,1:.: 2.57:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:50,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:49,36:.: 0.56:1.000:. ./.:4:58,12:.:-0.07:0.999:. ./.:4:54,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:49,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:66,9:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,10:.:-0.74:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,9:.:-0.66:1.000:. ./.:4:66,11:.: 0.22:1.000:. ./.:4:58,30:.: 0.68:1.000:. ./.:4:36,11:.:-1.03:1.000:. ./.:4:60,33:.: 0.89:1.000:. ./.:4:68,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:50,17:.:-0.20:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:23,14:.:-1.45:1.000:. ./.:4:35,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:39,5:.:-1.16:1.000:. ./.:4:57,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:64,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:62,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,11:.: 0.93:1.000:. ./.:4:84,9:.: 0.89:1.000:. ./.:4:77,10:.: 0.64:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:44,6:.:-0.91:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:62,7:.:-0.11:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:58,16:.: 0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:121,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:67,34:.: 1.23:1.000:. ./.:4:78,23:.: 1.23:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:97,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:35,22:.:-0.62:1.000:. ./.:4:79,17:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:41,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:60,22:.: 0.43:1.000:. ./.:4:87,22:.: 1.56:1.000:. ./.:4:79,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:72,12:.: 0.52:1.000:. ./.:4:70,12:.: 0.43:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:82,10:.: 0.85:1.000:. ./.:4:67,19:.: 0.60:1.000:. ./.:4:63,9:.: 0.01:1.000:. ./.:4:73,5:.: 0.26:1.000:. ./.:4:41,29:.:-0.07:0.999:. ./.:4:43,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.24:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:61,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:53,12:.:-0.28:1.000:. ./.:4:65,17:.: 0.43:1.000:. ./.:4:39,32:.:-0.03:1.000:. ./.:4:70,14:.: 0.52:1.000:. ./.:4:48,23:.:-0.03:1.000:. ./.:4:70,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,25:.: 1.52:1.000:. ./.:4:88,19:.: 1.48:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.78:1.000:. ./.:4:90,19:.: 1.56:1.000:. -chr3.1 46074525 chr3.1_046074525 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:22,59:.: 0.36:1.000:. ./.:4:20,43:.:-0.49:1.000:. ./.:4:20,74:.: 0.97:1.000:. ./.:4:20,61:.: 0.36:1.000:. ./.:4:22,61:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.07:1.000:. ./.:4:19,34:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.71:1.000:. ./.:4:6,11:.:-2.66:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.55:1.000:. ./.:4:24,80:.: 1.45:0.998:. ./.:4:0,107:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.31:1.000:. ./.:4:28,85:.: 1.87:1.000:. ./.:4:6,24:.:-2.05:1.000:. ./.:4:24,60:.: 0.50:1.000:. ./.:4:33,62:.: 1.02:1.000:. ./.:4:21,57:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,12:.:-2.90:1.000:. ./.:4:22,61:.: 0.45:1.000:. ./.:4:26,63:.: 0.74:1.000:. ./.:4:23,66:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,99:.: 1.21:1.000:. ./.:4:30,71:.: 1.31:1.000:. ./.:4:23,83:.: 1.54:1.000:. ./.:4:24,45:.:-0.21:1.000:. ./.:4:3,8:.:-2.95:1.000:. ./.:4:10,14:.:-2.33:1.000:. ./.:3:0,1:.:-3.42:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,54:.: 0.22:1.000:. ./.:4:19,62:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,102:.: 1.35:1.000:. ./.:4:38,93:.: 2.72:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:13,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,59:.: 0.60:1.000:. ./.:4:25,55:.: 0.31:1.000:. ./.:4:17,44:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.02:1.000:. ./.:4:9,22:.:-2.00:1.000:. ./.:4:19,51:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,52:.:-1.01:1.000:. ./.:4:25,69:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,55:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,63:.: 0.55:1.000:. ./.:4:21,56:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.63:1.000:. ./.:6:20,60:.: 0.31:1.000:. ./.:4:23,70:.: 0.93:1.000:. ./.:4:15,45:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.27:1.000:. ./.:4:19,59:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.77:1.000:. ./.:4:12,46:.:-0.73:1.000:. ./.:4:26,63:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:24,72:.: 1.07:1.000:. ./.:4:32,28:.:-0.63:1.000:. ./.:4:19,59:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:22,69:.: 0.83:1.000:. ./.:4:20,43:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.20:1.000:. ./.:5:0,91:.: 0.83:0.928:. ./.:4:24,67:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.25:1.000:. ./.:4:18,38:.:-0.82:1.000:. ./.:4:16,61:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.58:0.988:. ./.:4:0,66:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,76:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.39:1.000:. ./.:4:25,60:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.30:1.000:. ./.:4:24,66:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.91:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,73:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,98:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.63:0.999:. ./.:4:23,71:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.72:1.000:. ./.:4:12,46:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,38:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,52:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.35:1.000:. ./.:4:23,55:.: 0.22:1.000:. ./.:4:13,52:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.82:1.000:. ./.:4:21,46:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.12:1.000:. ./.:4:13,31:.:-1.39:1.000:. ./.:4:11,50:.:-0.58:1.000:. ./.:4:17,51:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,122:.: 2.30:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.64:1.000:. ./.:4:15,42:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.44:1.000:. ./.:4:14,45:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.93:1.000:. ./.:4:18,55:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,61:.: 0.79:1.000:. ./.:4:21,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:26,66:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.12:1.000:. ./.:4:40,79:.: 2.16:1.000:. ./.:4:18,56:.: 0.03:1.000:. ./.:4:3,5:.:-3.09:1.000:. ./.:4:31,24:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,97:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.97:1.000:. ./.:4:27,74:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,51:.: 0.31:1.000:. ./.:4:16,47:.:-0.49:1.000:. ./.:4:9,61:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.27:1.000:. ./.:4:20,68:.: 0.69:1.000:. ./.:4:20,55:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.45:0.999:. ./.:4:0,59:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,61:.: 0.60:1.000:. ./.:4:15,39:.:-0.92:1.000:. ./.:4:19,43:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.35:1.000:. ./.:4:23,66:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.54:1.000:. ./.:4:27,70:.: 1.12:1.000:. ./.:4:33,82:.: 1.97:1.000:. ./.:4:23,55:.: 0.22:1.000:. ./.:4:11,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,54:.: 0.08:1.000:. -chr3.1 46559528 chr3.1_046559528 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:0.998:. ./.:4:3,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,1:.: 3.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:12,1:.: 1.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:5,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,1:.: 1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:11,1:.: 1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:5:4,0:.:-0.52:0.928:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:0.988:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:4,2:.: 0.03:0.999:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,2:.: 1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:4,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:21,0:.: 4.11:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.52:1.000:. -chr3.1 46666645 chr3.1_046666645 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:326,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.26:0.998:. ./.:4:62,1:.:-1.69:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.04:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:260,2:.: 1.19:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.91:1.000:. ./.:6:111,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:143,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:144,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.44:1.000:. ./.:5:147,1:.:-0.46:0.928:. ./.:4:283,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.40:0.988:. ./.:4:239,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:351,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.44:0.999:. ./.:4:140,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:130,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:412,0:.: 3.36:1.000:. ./.:4:103,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:272,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:308,2:.: 1.89:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:338,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.78:0.999:. ./.:4:187,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:326,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:380,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.04:1.000:. -chr3.1 47052565 chr3.1_047052565 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,38:.: 0.32:1.000:. ./.:4:39,103:.: 0.46:1.000:. ./.:4:98,12:.:-0.44:1.000:. ./.:4:118,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:79,74:.: 0.78:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:51,15:.:-1.69:1.000:. ./.:4:108,32:.: 0.41:1.000:. ./.:4:146,43:.: 1.80:1.000:. ./.:4:16,9:.:-2.85:1.000:. ./.:4:36,8:.:-2.32:1.000:. ./.:4:114,37:.: 0.72:1.000:. ./.:4:119,35:.: 0.81:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:59,65:.:-0.05:0.998:. ./.:4:144,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:130,34:.: 1.09:1.000:. ./.:4:112,44:.: 0.86:1.000:. ./.:4:7,7:.:-3.17:1.000:. ./.:4:97,41:.: 0.35:1.000:. ./.:4:127,31:.: 0.92:1.000:. ./.:4:100,43:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:103,31:.: 0.24:1.000:. ./.:4:89,72:.: 1.00:1.000:. ./.:4:70,69:.: 0.38:1.000:. ./.:4:96,34:.: 0.12:1.000:. ./.:4:128,35:.: 1.06:1.000:. ./.:4:130,38:.: 1.20:1.000:. ./.:4:69,63:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,3:.:-3.25:1.000:. ./.:4:23,4:.:-2.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:191,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:91,64:.: 0.83:1.000:. ./.:4:73,85:.: 0.92:1.000:. ./.:4:110,37:.: 0.61:1.000:. ./.:4:131,38:.: 1.23:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:84,30:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,36:.: 0.86:1.000:. ./.:4:82,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:95,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:95,34:.: 0.10:1.000:. ./.:4:91,48:.: 0.38:1.000:. ./.:4:150,60:.: 2.39:1.000:. ./.:4:91,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:98,41:.: 0.38:1.000:. ./.:4:67,17:.:-1.18:1.000:. ./.:4:101,36:.: 0.32:1.000:. ./.:4:68,25:.:-0.93:1.000:. ./.:4:92,36:.: 0.07:1.000:. ./.:4:113,45:.: 0.92:1.000:. ./.:4:121,35:.: 0.86:1.000:. ./.:4:124,29:.: 0.78:1.000:. ./.:4:83,24:.:-0.53:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.52:1.000:. ./.:6:70,23:.:-0.93:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.16:1.000:. ./.:4:105,26:.: 0.15:1.000:. ./.:4:102,24:.: 0.01:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:110,29:.: 0.38:1.000:. ./.:4:77,22:.:-0.76:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:121,31:.: 0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:85,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:102,38:.: 0.41:1.000:. ./.:4:51,14:.:-1.72:1.000:. ./.:4:81,85:.: 1.15:1.000:. ./.:4:81,29:.:-0.44:1.000:. ./.:4:64,54:.:-0.22:1.000:. ./.:4:73,21:.:-0.90:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:101,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:30,68:.:-0.78:1.000:. ./.:4:89,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:96,27:.:-0.07:1.000:. ./.:5:159,0:.: 0.95:0.928:. ./.:4:68,67:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,45:.:-1.01:1.000:. ./.:4:46,42:.:-1.07:1.000:. ./.:4:83,21:.:-0.61:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:59,23:.:-1.24:0.988:. ./.:4:82,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:94,21:.:-0.30:1.000:. ./.:4:71,29:.:-0.73:1.000:. ./.:4:121,28:.: 0.66:1.000:. ./.:4:105,29:.: 0.24:1.000:. ./.:4:69,29:.:-0.78:1.000:. ./.:4:96,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:53,16:.:-1.61:1.000:. ./.:4:60,57:.:-0.24:1.000:. ./.:4:64,20:.:-1.18:1.000:. ./.:4:70,62:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,20:.:-1.01:1.000:. ./.:4:112,31:.: 0.49:1.000:. ./.:4:85,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:101,22:.:-0.07:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:140,55:.: 1.97:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.16:0.999:. ./.:4:91,35:.: 0.01:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,37:.:-0.73:1.000:. ./.:4:67,18:.:-1.15:1.000:. ./.:4:72,27:.:-0.76:1.000:. ./.:4:85,24:.:-0.47:1.000:. ./.:4:50,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:85,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:95,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,66:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:73,34:.:-0.53:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:69,17:.:-1.12:1.000:. ./.:4:89,23:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,16:.:-1.18:1.000:. ./.:4:105,34:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,45:.:-1.41:1.000:. ./.:4:97,37:.: 0.24:1.000:. ./.:4:57,53:.:-0.44:1.000:. ./.:4:137,51:.: 1.77:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,28:.:-1.35:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:69,17:.:-1.12:1.000:. ./.:4:106,29:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:116,34:.: 0.69:1.000:. ./.:4:69,15:.:-1.18:1.000:. ./.:4:113,27:.: 0.41:1.000:. ./.:4:139,35:.: 1.37:1.000:. ./.:4:109,38:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,47:.:-0.47:1.000:. ./.:4:84,73:.: 0.89:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:127,40:.: 1.17:1.000:. ./.:4:112,36:.: 0.64:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:53,48:.:-0.70:1.000:. ./.:4:132,38:.: 1.26:1.000:. ./.:4:108,31:.: 0.38:1.000:. ./.:4:111,44:.: 0.83:1.000:. ./.:4:127,39:.: 1.15:1.000:. ./.:4:112,22:.: 0.24:1.000:. ./.:4:116,28:.: 0.52:1.000:. ./.:4:96,23:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,53:.:-0.39:1.000:. ./.:4:64,61:.:-0.02:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:73,84:.: 0.89:1.000:. ./.:4:61,47:.:-0.50:1.000:. ./.:4:76,33:.:-0.47:1.000:. ./.:4:87,62:.: 0.66:0.999:. ./.:4:176,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:106,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,34:.: 0.41:1.000:. ./.:4:55,53:.:-0.50:1.000:. ./.:4:109,36:.: 0.55:1.000:. ./.:4:120,37:.: 0.89:1.000:. ./.:4:85,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:137,50:.: 1.74:1.000:. ./.:4:90,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:151,18:.: 1.23:1.000:. ./.:4:67,68:.: 0.27:1.000:. ./.:4:121,61:.: 1.60:1.000:. ./.:4:136,42:.: 1.49:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,69:.: 0.38:1.000:. -chr3.1 47175528 chr3.1_047175528 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:312,8:.: 0.13:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:271,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:179,15:.:-1.44:1.000:. ./.:4:346,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:238,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:325,11:.: 0.33:1.000:. ./.:4:278,9:.:-0.28:1.000:. ./.:4:116,26:.:-2.09:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:264,3:.:-0.53:1.000:. ./.:4:318,3:.: 0.14:1.000:. ./.:4:288,5:.:-0.21:1.000:. ./.:4:272,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:363,9:.: 0.78:0.998:. ./.:4:455,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:336,13:.: 0.49:1.000:. ./.:4:131,24:.:-1.92:1.000:. ./.:4:308,9:.: 0.09:1.000:. ./.:4:339,15:.: 0.55:1.000:. ./.:4:272,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:145,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:451,9:.: 1.87:1.000:. ./.:4:237,18:.:-0.68:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:341,14:.: 0.57:1.000:. ./.:4:321,7:.: 0.23:1.000:. ./.:4:336,6:.: 0.41:1.000:. ./.:4:270,6:.:-0.42:1.000:. ./.:4:77,15:.:-2.71:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.35:1.000:. ./.:3:62,22:.:-2.81:1.000:. ./.:4:299,15:.: 0.06:1.000:. ./.:4:390,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:289,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:287,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:390,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:264,15:.:-0.38:1.000:. ./.:4:333,18:.: 0.52:1.000:. ./.:4:359,19:.: 0.85:1.000:. ./.:4:295,14:.:-0.01:1.000:. ./.:4:314,14:.: 0.23:1.000:. ./.:4:292,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:309,14:.: 0.17:1.000:. ./.:4:465,18:.: 2.16:1.000:. ./.:4:289,10:.:-0.13:1.000:. ./.:4:350,21:.: 0.77:1.000:. ./.:4:227,10:.:-0.90:1.000:. ./.:4:359,9:.: 0.73:1.000:. ./.:4:266,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:198,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:533,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:275,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:394,14:.: 1.23:1.000:. ./.:4:278,11:.:-0.26:1.000:. ./.:6:230,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:286,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:471,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:183,28:.:-1.23:1.000:. ./.:4:364,21:.: 0.94:1.000:. ./.:4:301,10:.: 0.02:1.000:. ./.:4:202,5:.:-1.28:1.000:. ./.:4:252,7:.:-0.63:1.000:. ./.:4:289,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:356,22:.: 0.85:1.000:. ./.:4:135,24:.:-1.87:1.000:. ./.:4:523,1:.: 2.67:1.000:. ./.:4:330,15:.: 0.44:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:311,16:.: 0.22:1.000:. ./.:4:280,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:181,17:.:-1.39:1.000:. ./.:4:282,11:.:-0.21:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:328,14:.: 0.41:1.000:. ./.:4:307,14:.: 0.14:1.000:. ./.:4:255,7:.:-0.59:1.000:. ./.:5:529,0:.: 2.73:0.928:. ./.:4:394,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:259,13:.:-0.47:1.000:. ./.:4:263,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:301,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:197,24:.:-1.10:0.988:. ./.:4:264,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:217,10:.:-1.03:1.000:. ./.:4:286,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:296,17:.: 0.04:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:447,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:273,6:.:-0.38:1.000:. ./.:4:245,8:.:-0.70:1.000:. ./.:4:304,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:360,18:.: 0.85:1.000:. ./.:4:190,11:.:-1.35:1.000:. ./.:4:253,6:.:-0.63:1.000:. ./.:4:203,21:.:-1.06:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:395,8:.: 1.16:1.000:. ./.:4:280,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:305,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:334,12:.: 0.45:1.000:. ./.:4:294,19:.: 0.04:0.999:. ./.:4:185,31:.:-1.16:1.000:. ./.:4:282,12:.:-0.19:1.000:. ./.:4:242,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:299,18:.: 0.09:1.000:. ./.:4:291,15:.:-0.04:1.000:. ./.:4:275,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:180,33:.:-1.20:1.000:. ./.:4:263,17:.:-0.37:1.000:. ./.:4:269,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:309,11:.: 0.13:1.000:. ./.:4:295,11:.:-0.04:1.000:. ./.:4:284,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:164,29:.:-1.45:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:222,14:.:-0.92:1.000:. ./.:4:216,11:.:-1.03:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:166,18:.:-1.56:1.000:. ./.:4:205,12:.:-1.15:1.000:. ./.:4:218,10:.:-1.01:1.000:. ./.:4:178,16:.:-1.44:1.000:. ./.:4:470,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:334,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:173,23:.:-1.41:1.000:. ./.:4:234,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:263,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:418,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:271,12:.:-0.33:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:364,9:.: 0.79:1.000:. ./.:4:400,9:.: 1.24:1.000:. ./.:4:285,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:298,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:340,16:.: 0.58:1.000:. ./.:4:259,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:280,7:.:-0.28:1.000:. ./.:4:157,26:.:-1.58:1.000:. ./.:4:232,6:.:-0.89:1.000:. ./.:4:478,1:.: 2.11:1.000:. ./.:4:332,12:.: 0.43:1.000:. ./.:4:217,17:.:-0.94:1.000:. ./.:4:294,7:.:-0.11:1.000:. ./.:4:246,10:.:-0.67:1.000:. ./.:4:383,10:.: 1.04:1.000:. ./.:4:300,9:.:-0.01:1.000:. ./.:4:243,6:.:-0.75:1.000:. ./.:4:256,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:338,11:.: 0.49:1.000:. ./.:4:213,16:.:-1.00:1.000:. ./.:4:228,7:.:-0.93:1.000:. ./.:4:295,1:.:-0.17:0.999:. ./.:4:274,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:261,10:.:-0.48:1.000:. ./.:4:259,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:247,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:271,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:212,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:159,13:.:-1.71:1.000:. ./.:4:259,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:351,8:.: 0.62:1.000:. ./.:4:320,18:.: 0.36:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:184,11:.:-1.43:1.000:. ./.:4:314,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:386,9:.: 1.07:1.000:. ./.:4:380,15:.: 1.07:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.26:1.000:. -chr3.1 47237168 chr3.1_047237168 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:164,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:83,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:124,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:144,3:.: 1.04:1.000:. ./.:4:46,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:49,2:.:-1.45:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:50,4:.:-1.37:1.000:. ./.:4:104,2:.:-0.02:0.998:. ./.:4:39,4:.:-1.66:1.000:. ./.:4:109,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:113,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:86,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:121,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:88,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:96,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:58,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.93:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:96,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:127,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:208,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:123,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:72,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:184,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.29:1.000:. ./.:6:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:65,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:198,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:84,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:104,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:102,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:165,3:.: 1.58:1.000:. ./.:4:133,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:101,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.55:1.000:. ./.:5:101,0:.:-0.15:0.928:. ./.:4:135,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:88,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:105,3:.: 0.03:0.988:. ./.:4:83,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:92,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:59,2:.:-1.19:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:105,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:128,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:87,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:61,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:134,2:.: 0.75:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:102,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.91:0.999:. ./.:4:190,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:94,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:70,3:.:-0.88:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:70,2:.:-0.91:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:85,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:93,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:122,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:143,4:.: 1.04:1.000:. ./.:4:103,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:79,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:73,5:.:-0.75:1.000:. ./.:4:85,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:194,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:66,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:98,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:116,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:117,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:42,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:86,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:100,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:65,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:90,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:78,3:.:-0.67:1.000:. ./.:4:90,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:109,3:.: 0.13:1.000:. ./.:4:56,2:.:-1.27:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.23:1.000:. -chr3.1 47494037 chr3.1_047494037 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:292,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.62:0.998:. ./.:4:313,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:412,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:24,0:.:-3.47:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.89:1.000:. ./.:3:22,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:285,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.52:1.000:. ./.:6:233,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.24:1.000:. ./.:5:247,0:.:-0.11:0.928:. ./.:4:262,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.13:0.988:. ./.:4:206,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:248,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:245,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:246,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:412,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:253,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:333,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:391,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.37:1.000:. -chr3.1 47768231 chr3.1_047768231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:129,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.34:0.998:. ./.:4:127,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.60:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:6:101,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:5:105,0:.: 0.16:0.928:. ./.:4:95,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.99:0.988:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.61:0.999:. ./.:4:102,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:99,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:157,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.86:1.000:. -chr3.1 47831715 chr3.1_047831715 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:88,86:0.49: 0.66:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,57:0.49:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,90:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,111:0.49: 2.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,97:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,60:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,89:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,93:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,10:0.54:-3.09:1.000:0.986 0/0/1/1:4:26,15:0.41:-2.52:1.000:0.871 1/1/1/1:4:0,158:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,88:0.53: 0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:88,66:0.45: 0.18:1.000:0.981 0/0/1/1:4:85,97:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,87:0.52: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,102:0.52: 1.04:0.998:0.995 0/0/1/1:4:121,91:0.45: 1.57:1.000:0.982 0/0/1/1:4:109,115:0.50: 1.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,106:0.52: 1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:14,6:0.37:-3.02:1.000:0.576 0/0/1/1:4:81,68:0.47: 0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:93,87:0.49: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,100:0.55: 0.52:1.000:0.983 0/0/1/1:4:13,8:0.42:-2.99:1.000:0.918 0/0/1/1:4:102,95:0.49: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,103:0.52: 1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,74:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,95:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,77:0.47: 0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:91,88:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,74:0.48: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,4:0.37:-3.18:1.000:0.511 0/0/1/1:4:10,6:0.42:-3.11:1.000:0.902 0/0/1:3:8,1:0.25:-3.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,85:0.47: 0.97:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,80:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,81:0.48: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,89:0.53: 0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,79:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,77:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,72:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,107:0.55: 0.80:1.000:0.983 0/0/1/1:4:76,61:0.46:-0.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:82,79:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,88:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,85:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,79:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,87:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,81:0.56:-0.39:1.000:0.966 0/0/1/1:4:60,59:0.49:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,83:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,60:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,72:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,60:0.46:-0.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:72,104:0.54: 0.71:1.000:0.985 0/0/1/1:4:77,70:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,58:0.44:-0.15:1.000:0.971 0/0/1/1:4:73,68:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:38,56:0.55:-1.25:1.000:0.763 0/0/1/1:4:77,66:0.47:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,72:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,87:0.54: 0.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:65,67:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,93:0.54: 0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:71,70:0.49:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,55:0.49:-0.82:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:71,61:0.47:-0.34:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,60:0.44:-0.06:1.000:0.973 0/0/1/1:4:41,73:0.57:-0.77:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,233:1.00: 2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,67:0.48:-0.08:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,73:0.55:-0.63:1.000:0.977 0/0/1/1:4:79,69:0.48: 0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,61:0.52:-0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,70:0.47: 0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,65:0.45: 0.21:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,87:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,92:0.52: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,72:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:50,104:0.59: 0.18:0.928:0.965 0/0/1/1:4:83,93:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,84:0.52: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,62:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,60:0.47:-0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:72,62:0.47:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,61:0.54:-0.96:0.988:0.990 0/0/1/1:4:75,76:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,82:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,59:0.55:-1.18:1.000:0.977 0/0/1/1:4:64,82:0.53:-0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,82:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,63:0.52:-0.77:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,63:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,59:0.48:-0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,51:0.51:-1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,77:0.45: 0.76:1.000:0.983 0/0/1/1:4:39,55:0.54:-1.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:59,69:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,56:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,66:0.47:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,62:0.51:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,62:0.46:-0.15:1.000:0.988 0/0/1/1:4:89,112:0.53: 1.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,80:0.53:-0.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:61,60:0.49:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,102:0.50: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,63:0.47:-0.17:0.999:0.991 0/0/1/1:4:68,61:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,53:0.51:-1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,34:0.38:-0.92:1.000:0.550 0/0/1/1:4:58,64:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,51:0.46:-0.70:1.000:0.985 0/0/1/1:4:63,61:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,70:0.53:-0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,67:0.47: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:57,58:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,73:0.48: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,93:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,64:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,68:0.48:-0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,62:0.51:-0.68:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,55:0.54:-1.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:46,49:0.51:-1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,54:0.49:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,92:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,33:0.44:-1.61:1.000:0.974 0/0/1/1:4:71,48:0.44:-0.65:1.000:0.959 0/0/1/1:4:77,65:0.47:-0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,114:0.50: 1.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,69:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,59:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,47:0.46:-0.99:1.000:0.990 0/0/1/1:4:59,75:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,70:0.54:-0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:70,62:0.48:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,71:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:44,50:0.51:-1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,100:0.46: 1.93:1.000:0.987 0/0/1/1:4:101,104:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,85:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,94:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,85:0.46: 1.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:75,76:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,89:0.48: 1.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:83,93:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,2:0.25:-3.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,68:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,74:0.47: 0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,94:0.48: 1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,134:0.53: 2.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,108:0.52: 1.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,97:0.56: 0.21:1.000:0.964 0/0/1/1:4:96,93:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,96:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,89:0.53: 0.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:66,78:0.52:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,92:0.52: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,96:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,88:0.49: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,96:0.52: 0.69:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.13:0.999:1.000 0/0/1/1:4:89,80:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,88:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,78:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,78:0.52:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,110:0.56: 0.76:1.000:0.970 0/0/1/1:4:72,74:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,76:0.54:-0.37:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,66:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,82:0.45: 1.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:93,78:0.47: 0.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,70:0.48: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,97:0.56: 0.26:1.000:0.970 0/0/1/1:4:75,97:0.53: 0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,119:0.52: 1.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,110:0.50: 1.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,56:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,164:0.75: 0.45:1.000:0.999 -chr3.1 48199144 chr3.1_048199144 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:103,159:0.62: 0.92:1.000:0.632 0/0/0/1:4:130,58:0.36:-0.38:1.000:0.693 0/1/1/1:4:64,114:0.65:-0.55:1.000:0.800 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,93:0.37: 1.29:1.000:0.504 0/0/0/1:4:193,69:0.33: 0.92:1.000:0.935 0/0/1/1:4:44,54:0.56:-1.96:1.000:0.974 0/0/0/1:4:143,60:0.35:-0.11:1.000:0.792 0/0/0/1:4:130,54:0.35:-0.45:1.000:0.805 0/1/1/1:4:21,56:0.74:-2.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,73:0.58:-1.43:1.000:0.929 0/0/1/1:4:61,79:0.57:-1.22:1.000:0.948 0/0/0/1:4:149,61:0.35: 0.01:1.000:0.824 0/0/1/1:4:80,99:0.56:-0.53:1.000:0.971 0/0/1/1:4:143,80:0.40: 0.24:1.000:0.760 0/0/1/1:4:94,105:0.53:-0.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:206,60:0.30: 0.99:0.998:0.986 0/0/0/1:4:166,57:0.32: 0.24:1.000:0.952 0/0/0/1:4:334,54:0.23: 3.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,139:0.58: 0.55:1.000:0.902 0/0/1/1:4:33,51:0.62:-2.20:1.000:0.629 0/0/1/1:4:72,96:0.58:-0.73:1.000:0.925 0/1/1/1:4:79,144:0.66: 0.24:1.000:0.845 0/0/1/1:4:64,95:0.61:-0.88:1.000:0.744 0/0/0/1:4:34,16:0.37:-2.80:1.000:0.588 0/0/1/1:4:71,106:0.61:-0.57:1.000:0.729 0/0/1/1:4:97,148:0.61: 0.62:1.000:0.668 0/0/0/1:4:281,45:0.23: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,86:0.36: 1.15:1.000:0.656 0/1/1/1:4:86,142:0.63: 0.33:1.000:0.590 0/0/1/1:4:102,121:0.55: 0.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:151,77:0.38: 0.33:1.000:0.584 0/0/1/1:4:31,43:0.59:-2.38:1.000:0.878 0/0/1/1:4:56,57:0.51:-1.69:1.000:0.997 0/1/1:3:10,52:0.85:-2.59:1.000:0.720 0/0/1/1:4:84,97:0.54:-0.50:1.000:0.988 0/0/0/1:4:236,38:0.23: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,96:0.39: 1.12:1.000:0.707 0/0/1/1:4:166,108:0.42: 1.13:1.000:0.924 0/0/1/1:4:209,105:0.38: 1.84:1.000:0.552 0/0/1/1:4:82,113:0.59:-0.25:1.000:0.888 0/0/1/1:4:82,120:0.60:-0.13:1.000:0.779 0/1/1/1:4:86,146:0.64: 0.40:1.000:0.677 0/1/1/1:4:66,132:0.68:-0.20:1.000:0.951 0/1/1/1:4:87,177:0.68: 0.96:1.000:0.960 0/0/1/1:4:143,87:0.41: 0.36:1.000:0.870 0/0/1/1:4:191,94:0.38: 1.33:1.000:0.508 0/1/1/1:4:80,231:0.76: 1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,122:0.71:-0.59:1.000:0.990 0/0/1/1:4:190,129:0.43: 1.92:1.000:0.947 0/0/1/1:4:108,88:0.46:-0.24:1.000:0.989 0/1/1/1:4:83,166:0.68: 0.69:1.000:0.951 0/0/1/1:4:124,67:0.39:-0.32:1.000:0.700 0/1/1/1:4:75,165:0.70: 0.54:1.000:0.986 0/0/0/1:4:147,66:0.36: 0.06:1.000:0.681 0/0/0/1:4:219,47:0.26: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,108:0.62:-0.57:1.000:0.588 0/1/1/1:4:76,209:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,129:0.66:-0.17:1.000:0.840 0/1/1/1/1/1:6:20,185:0.91:-0.08:1.000:0.817 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,61:0.36:-0.27:1.000:0.641 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,186:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,136:0.62: 0.22:1.000:0.554 0/0/1/1:4:156,78:0.38: 0.43:1.000:0.542 0/0/1/1:4:44,70:0.62:-1.67:1.000:0.534 0/0/1/1:4:140,72:0.38: 0.05:1.000:0.602 0/1/1/1:4:54,131:0.72:-0.43:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,145:0.67: 0.19:1.000:0.924 0/1/1/1:4:40,86:0.70:-1.46:1.000:0.981 0/0/1/1:4:150,74:0.38: 0.26:1.000:0.513 0/1/1/1:4:84,149:0.65: 0.41:1.000:0.791 1/1/1/1:4:0,162:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,69:0.44:-0.80:1.000:0.971 0/0/1/1:4:70,109:0.62:-0.53:1.000:0.605 0/1/1/1:4:74,129:0.65:-0.11:1.000:0.749 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,187:0.70: 1.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:141,46:0.31:-0.39:1.000:0.968 0/0/1/1:4:125,88:0.44: 0.06:1.000:0.961 0/0/1/1:4:76,110:0.60:-0.41:1.000:0.803 0/0/1/1:4:139,79:0.40: 0.15:1.000:0.785 0/0/0/1/1:5:161,138:0.47: 1.57:0.928:0.751 0/0/0/1:4:261,43:0.23: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,57:0.43:-1.17:1.000:0.935 0/0/1/1:4:105,79:0.45:-0.45:1.000:0.978 0/0/1/1:4:127,107:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:57,95:0.63:-1.01:1.000:0.620 0/1/1/1:4:50,103:0.69:-0.99:0.988:0.966 0/0/1/1:4:145,82:0.40: 0.31:1.000:0.777 0/1/1/1:4:83,161:0.67: 0.61:1.000:0.927 0/0/0/1:4:113,48:0.35:-0.85:1.000:0.774 0/0/0/1:4:164,74:0.36: 0.50:1.000:0.672 0/0/1/1:4:133,78:0.40: 0.03:1.000:0.828 0/0/0/1:4:184,23:0.21:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,106:0.57:-0.36:1.000:0.956 0/0/0/1:4:209,26:0.21: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,101:0.41: 1.10:1.000:0.837 0/1/1/1:4:20,67:0.78:-2.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,138:0.66: 0.08:1.000:0.838 0/0/1/1:4:109,59:0.39:-0.73:1.000:0.703 0/0/1/1:4:124,79:0.42:-0.11:1.000:0.910 0/0/1/1:4:133,118:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,82:0.42:-0.02:1.000:0.925 0/1/1/1:4:64,121:0.67:-0.43:1.000:0.900 0/0/0/1:4:277,48:0.24: 2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,95:0.38: 1.29:1.000:0.565 0/0/1/1:4:144,73:0.38: 0.13:1.000:0.571 0/1/1/1:4:58,133:0.71:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:186,115:0.41: 1.61:1.000:0.885 0/0/0/1:4:151,71:0.37: 0.22:0.999:0.590 1/1/1/1:4:0,192:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,145:0.71:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,91:0.60:-0.99:1.000:0.772 0/1/1/1:4:43,82:0.67:-1.48:1.000:0.910 0/1/1/1:4:53,96:0.65:-1.06:1.000:0.834 0/0/1/1:4:129,88:0.43: 0.13:1.000:0.949 0/1/1/1:4:55,125:0.71:-0.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:141,84:0.41: 0.27:1.000:0.847 0/1/1/1:4:55,107:0.67:-0.83:1.000:0.930 0/0/1/1:4:152,85:0.40: 0.48:1.000:0.760 0/0/0/1:4:192,90:0.37: 1.27:1.000:0.597 0/0/1/1:4:77,116:0.61:-0.29:1.000:0.705 0/0/0/1:4:234,28:0.20: 0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,166:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,68:0.44:-0.78:1.000:0.960 0/0/0/1:4:123,54:0.36:-0.57:1.000:0.721 0/0/1/1:4:117,96:0.46: 0.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,107:0.56:-0.31:1.000:0.964 0/0/1/1:4:104,65:0.42:-0.71:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,230:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,136:0.64: 0.13:1.000:0.643 0/0/0/1:4:364,35:0.19: 3.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,140:0.65: 0.19:1.000:0.759 1/1/1/1:4:0,178:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,108:0.69:-0.88:1.000:0.977 0/0/0/1:4:151,61:0.34: 0.05:1.000:0.839 0/0/0/1:4:201,34:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,105:0.57:-0.41:1.000:0.947 0/0/0/1:4:249,37:0.22: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,20:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,77:0.38: 0.33:1.000:0.584 0/1/1/1:4:89,157:0.65: 0.64:1.000:0.778 0/0/1/1:4:85,118:0.59:-0.11:1.000:0.877 0/0/1/1:4:133,71:0.39:-0.10:1.000:0.677 0/0/0/1:4:161,73:0.36: 0.43:1.000:0.663 0/0/1/1:4:74,102:0.59:-0.59:1.000:0.887 0/0/1/1:4:203,111:0.39: 1.84:1.000:0.722 0/0/1/1:4:81,109:0.58:-0.34:1.000:0.916 0/1/1/1:4:28,56:0.68:-2.20:1.000:0.951 0/0/0/1:4:115,52:0.36:-0.74:1.000:0.668 0/0/0/1:4:242,46:0.25: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,55:0.31: 0.36:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,70:0.33: 0.87:1.000:0.915 0/0/0/1:4:147,64:0.36: 0.03:1.000:0.735 0/0/1/1:4:159,90:0.40: 0.69:1.000:0.779 0/0/1/1:4:81,79:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:149,55:0.33:-0.10:1.000:0.917 0/0/1/1:4:169,87:0.38: 0.82:1.000:0.604 0/0/0/1:4:177,52:0.30: 0.34:1.000:0.985 0/0/1/1:4:197,99:0.38: 1.52:1.000:0.553 0/1/1/1:4:64,117:0.66:-0.50:1.000:0.850 0/1/1/1:4:56,92:0.63:-1.08:1.000:0.573 0/0/0/1:4:163,74:0.36: 0.48:0.999:0.661 0/1/1/1:4:59,100:0.64:-0.88:1.000:0.672 0/0/1/1:4:67,78:0.54:-1.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:86,81:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,47:0.33:-0.57:1.000:0.929 0/0/1/1:4:162,84:0.38: 0.64:1.000:0.619 0/0/0/1:4:151,66:0.36: 0.13:1.000:0.729 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,67:0.36: 0.10:1.000:0.666 0/0/0/1:4:215,103:0.37: 1.91:1.000:0.551 0/0/1/1:4:176,108:0.41: 1.31:1.000:0.878 0/0/0/1:4:172,54:0.31: 0.29:1.000:0.976 0/1/1/1:4:36,136:0.80:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,127:0.61: 0.05:1.000:0.727 0/0/1/1:4:108,113:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,115:0.59:-0.24:1.000:0.841 0/0/0/1:4:130,63:0.37:-0.29:1.000:0.526 0/0/1/1:4:84,105:0.56:-0.36:1.000:0.967 -chr3.1 48307328 chr3.1_048307328 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,430:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.84:1.000:. ./.:4:105,246:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.02:1.000:. ./.:4:143,390:.: 1.96:1.000:. ./.:4:129,321:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,236:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,344:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,391:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,51:.:-3.54:1.000:. ./.:4:48,32:.:-3.20:1.000:. ./.:4:0,351:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,355:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.05:1.000:. ./.:4:118,284:.: 0.47:1.000:. ./.:4:118,298:.: 0.63:0.998:. ./.:4:258,212:.: 1.25:1.000:. ./.:4:141,341:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,40:.:-3.09:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.18:1.000:. ./.:4:128,358:.: 1.43:1.000:. ./.:4:1,368:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,18:.:-3.48:1.000:. ./.:4:83,290:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,388:.: 0.32:1.000:. ./.:4:125,287:.: 0.58:1.000:. ./.:4:134,359:.: 1.51:1.000:. ./.:4:106,240:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,328:.:-0.37:1.000:. ./.:4:90,255:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,25:.:-3.47:1.000:. ./.:4:72,63:.:-2.58:1.000:. ./.:3:0,16:.:-3.93:1.000:. ./.:4:0,351:.:-0.11:1.000:. ./.:4:103,288:.: 0.34:1.000:. ./.:4:127,265:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.59:1.000:. ./.:4:97,254:.:-0.11:1.000:. ./.:4:107,293:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,437:.: 0.87:1.000:. ./.:4:137,292:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.46:1.000:. ./.:4:117,296:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.60:1.000:. ./.:4:97,102:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.64:1.000:. ./.:4:127,230:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,476:.: 1.31:1.000:. ./.:4:104,283:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,264:.: 0.39:1.000:. ./.:4:114,248:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,350:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,329:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,337:.:-0.27:1.000:. ./.:6:26,299:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,353:.:-0.09:1.000:. ./.:4:116,274:.: 0.33:1.000:. ./.:4:140,276:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,356:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,268:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.12:1.000:. ./.:4:128,270:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,342:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,299:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,292:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,325:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,418:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1,376:.: 0.18:1.000:. ./.:4:100,206:.:-0.63:1.000:. ./.:4:132,283:.: 0.62:1.000:. ./.:4:134,259:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,368:.: 0.08:1.000:. ./.:4:142,290:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.60:1.000:. ./.:4:128,279:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.02:1.000:. ./.:5:130,333:.: 1.17:0.928:. ./.:4:147,322:.: 1.23:1.000:. ./.:4:99,227:.:-0.40:1.000:. ./.:4:113,266:.: 0.21:1.000:. ./.:4:112,255:.: 0.07:1.000:. ./.:4:120,320:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,260:.:-1.15:0.988:. ./.:4:107,238:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.32:1.000:. ./.:4:85,254:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.23:1.000:. ./.:4:111,236:.:-0.16:1.000:. ./.:4:120,290:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,272:.:-1.01:1.000:. ./.:4:129,320:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.31:1.000:. ./.:4:126,319:.: 0.96:1.000:. ./.:4:84,225:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.18:1.000:. ./.:4:107,217:.:-0.42:1.000:. ./.:4:112,286:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.80:1.000:. ./.:4:101,275:.: 0.17:1.000:. ./.:4:131,417:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.46:1.000:. ./.:4:115,285:.: 0.45:1.000:. ./.:4:137,303:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,379:.: 0.21:0.999:. ./.:4:0,388:.: 0.31:1.000:. ./.:4:81,184:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.52:1.000:. ./.:4:132,275:.: 0.53:1.000:. ./.:4:101,267:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,297:.: 0.65:1.000:. ./.:4:133,282:.: 0.62:1.000:. ./.:4:110,304:.: 0.61:1.000:. ./.:4:95,269:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,317:.: 0.85:1.000:. ./.:4:123,307:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,316:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,272:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,257:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,297:.:-0.73:1.000:. ./.:4:113,235:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,338:.:-0.26:1.000:. ./.:4:85,196:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,338:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.23:1.000:. ./.:4:130,373:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,368:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,329:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,337:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.48:1.000:. ./.:4:153,279:.: 0.81:1.000:. ./.:4:110,338:.: 0.99:1.000:. ./.:4:96,265:.: 0.00:1.000:. ./.:4:93,162:.:-1.21:1.000:. ./.:4:148,366:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,528:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,405:.: 0.50:1.000:. ./.:4:114,310:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,425:.: 0.73:1.000:. ./.:4:81,227:.:-0.60:1.000:. ./.:4:121,316:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,29:.:-3.77:1.000:. ./.:4:82,197:.:-0.93:1.000:. ./.:4:116,287:.: 0.48:1.000:. ./.:4:101,296:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,487:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,436:.: 0.86:1.000:. ./.:4:85,212:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,404:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,241:.:-0.32:1.000:. ./.:4:103,239:.:-0.21:1.000:. ./.:4:87,249:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,249:.:-0.11:1.000:. ./.:4:115,254:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,418:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,358:.:-0.03:0.999:. ./.:4:0,351:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,355:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,298:.:-0.72:1.000:. ./.:4:82,216:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,320:.:-0.47:1.000:. ./.:4:92,264:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.97:1.000:. ./.:4:78,205:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,424:.: 0.72:1.000:. ./.:4:119,345:.: 1.18:1.000:. ./.:4:134,301:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,364:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,432:.: 0.82:1.000:. ./.:4:155,353:.: 1.68:1.000:. ./.:4:91,223:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,392:.: 0.36:1.000:. -chr3.1 48653253 chr3.1_048653253 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:96,278:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,233:0.78:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,297:0.74: 1.00:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,375:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,296:0.72: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:334,104:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,191:0.55: 0.36:1.000:0.976 0/0/1/1:4:140,190:0.59: 0.12:1.000:0.891 0/0/1/1:4:153,170:0.54: 0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:26,33:0.57:-3.02:1.000:0.950 0/0/1/1:4:100,66:0.41:-1.78:1.000:0.862 0/0/1/1:4:171,185:0.53: 0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:169,182:0.53: 0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:158,194:0.56: 0.37:1.000:0.966 0/1/1/1:4:103,256:0.72: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,195:0.55: 0.51:1.000:0.984 0/0/1/1:4:233,220:0.50: 1.54:0.998:0.997 0/0/1/1:4:203,231:0.54: 1.32:1.000:0.986 0/0/1/1:4:264,244:0.49: 2.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,309:0.77: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,38:0.49:-2.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,222:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,298:0.71: 1.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:151,178:0.55: 0.11:1.000:0.979 0/0/0/1:4:62,16:0.22:-2.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,243:0.50: 2.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,344:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,176:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:131,314:0.71: 1.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,355:0.78: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,248:0.55: 1.62:1.000:0.981 0/1/1/1:4:102,252:0.72: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,22:0.43:-3.10:1.000:0.957 0/0/1/1:4:68,45:0.41:-2.39:1.000:0.866 0/1/1:3:6,34:0.85:-3.24:1.000:0.535 0/0/1/1:4:185,187:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:200,207:0.52: 1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,265:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,313:0.76: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,232:0.54: 1.39:1.000:0.989 0/0/1/1:4:174,130:0.44:-0.18:1.000:0.966 0/1/1/1:4:85,252:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,298:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,255:0.79: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,269:0.78: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,249:0.72: 0.37:1.000:0.994 0/1/1/1:4:101,286:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,24:0.53:-3.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:101,225:0.70: 0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:89,173:0.67:-0.67:1.000:0.917 0/0/1/1:4:95,85:0.48:-1.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:84,290:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,106:0.42:-0.73:1.000:0.929 1/1/1/1:4:0,344:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,151:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,197:0.49: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:80,225:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,307:0.74: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,157:0.45: 0.39:1.000:0.984 0/1/1/1/1/1:6:27,196:0.88:-1.12:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,232:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,77:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:314,93:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,253:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,321:0.79: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,246:0.79:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,138:0.54:-0.70:1.000:0.986 0/0/1/1:4:160,145:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,171:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,214:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,303:0.75: 1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,219:0.80:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,354:0.80: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,274:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,297:0.80: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,145:0.46: 0.02:1.000:0.988 0/0/1/1:4:149,136:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,118:0.51:-0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,248:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,267:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,194:0.76:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,143:0.45: 0.05:1.000:0.982 0/0/1/1:4:182,149:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:81,182:0.70:-0.66:1.000:0.986 0/0/0/1/1:5:230,166:0.43: 0.88:0.928:0.939 0/0/1/1:4:181,188:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,209:0.79:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,195:0.73:-0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:149,151:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,123:0.45:-0.44:1.000:0.977 0/1/1/1:4:61,227:0.80:-0.37:0.988:1.000 0/0/1/1:4:167,163:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,182:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,99:0.42:-0.91:1.000:0.924 0/0/1/1:4:126,159:0.57:-0.40:1.000:0.953 0/0/1/1:4:168,155:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,59:0.27:-1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,152:0.72:-1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,155:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,232:0.75:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,149:0.55:-0.51:1.000:0.980 0/0/1/1:4:165,154:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,113:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,204:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,181:0.75:-0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,197:0.72:-0.52:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,276:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,150:0.45: 0.21:1.000:0.984 0/1/1/1:4:122,300:0.72: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,161:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,126:0.51:-0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:153,355:0.71: 2.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:121,132:0.53:-0.77:0.999:0.992 1/1/1/1:4:0,307:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,86:0.48:-1.56:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,142:0.68:-1.24:1.000:0.941 0/1/1/1:4:69,198:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,157:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,204:0.79:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,268:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,206:0.72:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:139,113:0.46:-0.78:1.000:0.987 0/1/1/1:4:86,261:0.76: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,297:0.73: 1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:77,200:0.73:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:272,86:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,164:0.71:-1.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:135,146:0.53:-0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:96,106:0.53:-1.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:121,111:0.49:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,152:0.55:-0.43:1.000:0.983 0/1/1/1:4:79,257:0.77: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,124:0.69:-1.61:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,255:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,246:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:336,94:0.23: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,134:0.48:-0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,166:0.71:-0.96:1.000:0.991 0/0/1/1:4:108,126:0.55:-0.99:1.000:0.982 0/0/1/1:4:122,135:0.53:-0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:168,144:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:152,108:0.43:-0.69:1.000:0.938 0/0/1/1:4:176,156:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:160,37:0.20:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,207:0.51: 1.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:127,304:0.71: 1.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:86,231:0.74:-0.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:90,237:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:92,249:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,138:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:211,228:0.53: 1.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:183,183:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:68,31:0.33:-2.55:1.000:0.932 0/1/1/1:4:106,235:0.70: 0.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:230,187:0.46: 1.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:209,174:0.47: 0.73:1.000:0.990 0/1/1/1:4:123,301:0.72: 1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:186,186:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,141:0.47:-0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:110,286:0.73: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,161:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,213:0.72:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,253:0.73: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:275,108:0.30: 0.73:1.000:0.988 0/1/1/1:4:100,209:0.69:-0.13:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,384:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,179:0.56: 0.04:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,316:1.00:-0.05:0.999:1.000 0/0/1/1:4:152,160:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:175,178:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:178,179:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,171:0.70:-0.82:1.000:0.981 0/0/1/1:4:170,165:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,150:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,206:0.77:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,74:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:118,343:0.75: 1.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:116,333:0.75: 1.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:293,95:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,240:0.79:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,388:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:246,178:0.43: 1.20:1.000:0.950 0/0/1/1:4:212,194:0.49: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,154:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,267:0.75: 0.45:1.000:0.999 -chr3.1 48830809 chr3.1_048830809 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:83,60:.:-0.11:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:93,38:.:-0.52:1.000:. ./.:4:64,61:.:-0.72:1.000:. ./.:4:149,36:.: 1.32:1.000:. ./.:4:154,33:.: 1.39:1.000:. ./.:4:52,53:.:-1.41:1.000:. ./.:4:71,62:.:-0.45:1.000:. ./.:4:78,71:.: 0.10:1.000:. ./.:4:60,35:.:-1.75:1.000:. ./.:4:63,14:.:-2.36:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:64,59:.:-0.79:1.000:. ./.:4:90,64:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:110,22:.:-0.49:1.000:. ./.:4:107,26:.:-0.45:0.998:. ./.:4:136,35:.: 0.85:1.000:. ./.:4:146,34:.: 1.15:1.000:. ./.:4:107,99:.: 2.04:1.000:. ./.:4:85,12:.:-1.68:1.000:. ./.:4:75,62:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,42:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,64:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,11:.:-2.43:1.000:. ./.:4:110,31:.:-0.18:1.000:. ./.:4:87,54:.:-0.18:1.000:. ./.:4:107,27:.:-0.42:1.000:. ./.:4:166,38:.: 1.97:1.000:. ./.:4:134,37:.: 0.85:1.000:. ./.:4:75,60:.:-0.38:1.000:. ./.:4:83,20:.:-1.48:1.000:. ./.:4:38,2:.:-3.63:1.000:. ./.:4:82,23:.:-1.41:1.000:. ./.:3:50,6:.:-3.08:1.000:. ./.:4:35,55:.:-1.92:1.000:. ./.:4:97,38:.:-0.38:1.000:. ./.:4:101,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:82,67:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,39:.: 0.68:1.000:. ./.:4:117,26:.:-0.11:1.000:. ./.:4:75,69:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,23:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,50:.:-1.00:1.000:. ./.:4:108,76:.: 1.29:1.000:. ./.:4:131,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,72:.: 0.61:1.000:. ./.:4:60,13:.:-2.50:1.000:. ./.:4:66,46:.:-1.17:1.000:. ./.:4:77,16:.:-1.82:1.000:. ./.:4:101,66:.: 0.71:1.000:. ./.:4:78,76:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,36:.: 0.10:1.000:. ./.:4:89,97:.: 1.36:1.000:. ./.:4:121,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:109,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,59:.:-0.72:1.000:. ./.:4:80,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:87,74:.: 0.51:1.000:. ./.:6:86,40:.:-0.69:1.000:. ./.:4:89,67:.: 0.33:1.000:. ./.:4:116,30:.:-0.01:1.000:. ./.:4:156,36:.: 1.56:1.000:. ./.:4:96,81:.: 1.05:1.000:. ./.:4:101,64:.: 0.64:1.000:. ./.:4:78,60:.:-0.28:1.000:. ./.:4:79,44:.:-0.79:1.000:. ./.:4:87,67:.: 0.27:1.000:. ./.:4:139,41:.: 1.15:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:163,32:.: 1.67:1.000:. ./.:4:49,30:.:-2.30:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:78,66:.:-0.08:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:106,16:.:-0.83:1.000:. ./.:4:101,25:.:-0.69:1.000:. ./.:4:143,30:.: 0.91:1.000:. ./.:4:78,73:.: 0.16:1.000:. ./.:4:123,30:.: 0.23:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:113,61:.: 0.95:1.000:. ./.:4:149,50:.: 1.80:1.000:. ./.:4:76,63:.:-0.25:1.000:. ./.:5:154,35:.: 1.46:0.928:. ./.:4:112,45:.: 0.37:1.000:. ./.:4:87,23:.:-1.24:1.000:. ./.:4:124,38:.: 0.54:1.000:. ./.:4:115,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:120,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:73,57:.:-0.55:0.988:. ./.:4:108,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,69:.: 1.29:1.000:. ./.:4:76,26:.:-1.51:1.000:. ./.:4:101,85:.: 1.36:1.000:. ./.:4:128,30:.: 0.40:1.000:. ./.:4:116,39:.: 0.30:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:150,35:.: 1.32:1.000:. ./.:4:81,77:.: 0.40:1.000:. ./.:4:77,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:114,37:.: 0.16:1.000:. ./.:4:97,15:.:-1.17:1.000:. ./.:4:81,77:.: 0.40:1.000:. ./.:4:112,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:125,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:77,62:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,31:.:-0.28:1.000:. ./.:4:161,33:.: 1.63:1.000:. ./.:4:73,63:.:-0.35:1.000:. ./.:4:144,37:.: 1.19:1.000:. ./.:4:152,44:.: 1.70:1.000:. ./.:4:95,73:.: 0.74:0.999:. ./.:4:85,68:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,23:.:-1.61:1.000:. ./.:4:46,83:.:-0.59:1.000:. ./.:4:142,30:.: 0.88:1.000:. ./.:4:125,30:.: 0.30:1.000:. ./.:4:95,59:.: 0.27:1.000:. ./.:4:72,73:.:-0.04:1.000:. ./.:4:113,28:.:-0.18:1.000:. ./.:4:129,30:.: 0.44:1.000:. ./.:4:133,46:.: 1.12:1.000:. ./.:4:129,24:.: 0.23:1.000:. ./.:4:117,37:.: 0.27:1.000:. ./.:4:156,31:.: 1.39:1.000:. ./.:4:88,65:.: 0.23:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:60,53:.:-1.13:1.000:. ./.:4:88,39:.:-0.66:1.000:. ./.:4:113,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:96,72:.: 0.74:1.000:. ./.:4:69,20:.:-1.95:1.000:. ./.:4:81,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:96,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:151,46:.: 1.73:1.000:. ./.:4:67,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:69,55:.:-0.76:1.000:. ./.:4:76,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:79,67:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,31:.: 0.78:1.000:. ./.:4:137,28:.: 0.64:1.000:. ./.:4:109,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:111,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:145,50:.: 1.67:1.000:. ./.:4:103,69:.: 0.88:1.000:. ./.:4:88,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:122,38:.: 0.47:1.000:. ./.:4:87,76:.: 0.57:1.000:. ./.:4:114,31:.:-0.04:1.000:. ./.:4:145,41:.: 1.36:1.000:. ./.:4:70,75:.:-0.04:1.000:. ./.:4:50,17:.:-2.71:1.000:. ./.:4:115,23:.:-0.28:1.000:. ./.:4:113,23:.:-0.35:1.000:. ./.:4:129,40:.: 0.78:1.000:. ./.:4:93,74:.: 0.71:1.000:. ./.:4:96,68:.: 0.61:1.000:. ./.:4:104,41:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,80:.: 0.71:1.000:. ./.:4:115,34:.: 0.10:1.000:. ./.:4:108,22:.:-0.55:1.000:. ./.:4:98,26:.:-0.76:1.000:. ./.:4:131,32:.: 0.57:1.000:. ./.:4:76,28:.:-1.44:1.000:. ./.:4:71,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,49:.:-1.34:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:60,62:.:-0.83:1.000:. ./.:4:77,69:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,57:.:-0.55:1.000:. ./.:4:90,24:.:-1.10:1.000:. ./.:4:76,62:.:-0.28:1.000:. ./.:4:116,30:.:-0.01:1.000:. ./.:4:61,58:.:-0.93:1.000:. ./.:4:106,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,88:.: 0.88:1.000:. ./.:4:144,41:.: 1.32:1.000:. ./.:4:110,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:86,54:.:-0.21:1.000:. ./.:4:95,77:.: 0.88:1.000:. ./.:4:77,83:.: 0.47:1.000:. ./.:4:165,40:.: 2.01:1.000:. ./.:4:91,44:.:-0.38:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.71:1.000:. -chr3.1 49070031 chr3.1_049070031 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:267,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:124,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.41:0.998:. ./.:4:192,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:117,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.97:1.000:. ./.:3:31,0:.:-4.20:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.50:1.000:. ./.:6:188,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:233,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.79:1.000:. ./.:5:316,0:.: 2.03:0.928:. ./.:4:260,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:0.988:. ./.:4:234,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:249,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:93,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:207,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.02:1.000:. -chr3.1 49527032 chr3.1_049527032 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:243,9:.: 1.08:1.000:. ./.:4:157,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:188,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:249,17:.: 1.36:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:108,6:.:-1.66:1.000:. ./.:4:164,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:190,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:195,5:.: 0.05:0.998:. ./.:4:166,46:.: 0.29:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:247,13:.: 1.24:1.000:. ./.:4:51,10:.:-2.72:1.000:. ./.:4:194,11:.: 0.15:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:168,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:73,7:.:-2.34:1.000:. ./.:3:20,0:.:-3.54:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:201,11:.: 0.29:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:194,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:239,7:.: 0.96:1.000:. ./.:4:201,8:.: 0.23:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:166,10:.:-0.43:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:179,10:.:-0.17:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:223,17:.: 0.84:1.000:. ./.:4:153,12:.:-0.65:1.000:. ./.:4:191,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:181,22:.: 0.11:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.19:1.000:. ./.:6:169,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:213,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:186,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:166,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:204,17:.: 0.47:1.000:. ./.:4:186,11:.:-0.01:1.000:. ./.:4:212,17:.: 0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:235,9:.: 0.92:1.000:. ./.:4:187,10:.:-0.01:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:233,9:.: 0.88:1.000:. ./.:4:191,13:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.85:0.999:. ./.:4:251,17:.: 1.40:1.000:. ./.:4:224,8:.: 0.68:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.05:1.000:. ./.:5:181,0:.:-0.33:0.928:. ./.:4:246,14:.: 1.24:1.000:. ./.:4:158,15:.:-0.49:1.000:. ./.:4:181,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:221,20:.: 0.86:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:121,12:.:-1.29:0.988:. ./.:4:196,12:.: 0.21:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:147,7:.:-0.87:1.000:. ./.:4:283,14:.: 1.98:1.000:. ./.:4:175,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:221,13:.: 0.72:1.000:. ./.:4:154,10:.:-0.67:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:242,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:215,8:.: 0.51:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:252,13:.: 1.34:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:183,8:.:-0.13:1.000:. ./.:4:158,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:186,9:.:-0.05:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:201,9:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,20:.: 0.68:1.000:. ./.:4:291,8:.: 2.02:1.000:. ./.:4:267,12:.: 1.62:0.999:. ./.:4:204,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:125,5:.:-1.35:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:164,14:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:213,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:142,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:186,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:195,10:.: 0.15:1.000:. ./.:4:233,7:.: 0.84:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:152,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:196,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:211,10:.: 0.47:1.000:. ./.:4:184,16:.: 0.05:1.000:. ./.:4:290,13:.: 2.10:1.000:. ./.:4:194,16:.: 0.25:1.000:. ./.:4:194,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:186,9:.:-0.05:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:211,19:.: 0.64:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:162,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:267,9:.: 1.56:1.000:. ./.:4:263,17:.: 1.64:1.000:. ./.:4:232,14:.: 0.96:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:239,10:.: 1.02:1.000:. ./.:4:194,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:287,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:175,12:.:-0.21:1.000:. ./.:4:222,13:.: 0.74:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:218,13:.: 0.66:1.000:. ./.:4:206,16:.: 0.49:1.000:. ./.:4:162,9:.:-0.53:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:206,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:125,5:.:-1.35:1.000:. ./.:4:206,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:169,10:.:-0.37:1.000:. ./.:4:217,8:.: 0.55:0.999:. ./.:4:241,7:.: 1.00:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:157,7:.:-0.67:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:229,7:.: 0.76:1.000:. ./.:4:206,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:233,14:.: 0.98:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:142,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:232,9:.: 0.86:1.000:. -chr3.1 49635432 chr3.1_049635432 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:135,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:45,1:.:-2.18:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.88:0.998:. ./.:4:230,1:.: 3.54:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.10:1.000:. ./.:3:24,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.33:1.000:. ./.:6:101,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:152,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.08:1.000:. ./.:5:150,0:.: 1.04:0.928:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:83,1:.:-1.00:0.988:. ./.:4:117,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.33:0.999:. ./.:4:120,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:60,1:.:-1.71:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:137,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.10:1.000:. -chr3.1 49953293 chr3.1_049953293 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:35,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.62:0.998:. ./.:4:158,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:87,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.76:1.000:. ./.:6:13,0:.:-1.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:135,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:170,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:91,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.11:1.000:. ./.:5:153,0:.: 2.32:0.928:. ./.:4:116,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.82:0.988:. ./.:4:80,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.28:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:160,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:173,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:95,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.63:1.000:. -chr3.1 50007209 chr3.1_050007209 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,116:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.73:1.000:. ./.:4:55,76:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.76:1.000:. ./.:4:66,120:.: 2.25:1.000:. ./.:4:75,90:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,28:.:-2.51:1.000:. ./.:4:17,55:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.40:1.000:. ./.:4:59,84:.: 0.95:1.000:. ./.:4:54,78:.: 0.62:0.998:. ./.:4:0,109:.:-0.07:1.000:. ./.:4:89,112:.: 2.70:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,42:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.01:1.000:. ./.:4:57,91:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,29:.:-1.76:1.000:. ./.:4:84,80:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.01:1.000:. ./.:4:71,67:.: 0.80:1.000:. ./.:4:78,99:.: 1.98:1.000:. ./.:4:69,93:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.97:1.000:. ./.:4:62,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:8,15:.:-2.66:1.000:. ./.:4:9,23:.:-2.39:1.000:. ./.:3:0,22:.:-2.69:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,74:.: 0.89:1.000:. ./.:4:66,94:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,60:.:-1.54:1.000:. ./.:4:67,70:.: 0.77:1.000:. ./.:4:44,60:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.76:1.000:. ./.:4:73,73:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.40:1.000:. ./.:4:56,72:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.26:1.000:. ./.:4:40,99:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.31:1.000:. ./.:4:63,75:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,72:.: 0.80:1.000:. ./.:4:62,70:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.97:1.000:. ./.:6:9,80:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.25:1.000:. ./.:4:59,67:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,76:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.19:1.000:. ./.:4:71,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,72:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.40:1.000:. ./.:4:50,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:55,67:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,78:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.64:1.000:. ./.:4:54,74:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1,86:.:-0.73:0.999:. ./.:4:0,91:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,82:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.11:1.000:. ./.:5:53,76:.: 0.53:0.928:. ./.:4:52,90:.: 0.92:1.000:. ./.:4:49,62:.:-0.01:1.000:. ./.:4:39,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,71:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,52:.:-1.79:0.988:. ./.:4:60,72:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.55:1.000:. ./.:4:40,67:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.07:1.000:. ./.:4:69,62:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,69:.:-1.27:1.000:. ./.:4:61,80:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.45:1.000:. ./.:4:57,58:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,56:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,68:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,75:.:-1.09:1.000:. ./.:4:47,97:.: 0.98:1.000:. ./.:4:77,97:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.05:1.000:. ./.:4:54,75:.: 0.53:1.000:. ./.:4:72,101:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.10:0.999:. ./.:4:0,78:.:-1.00:1.000:. ./.:4:46,64:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.88:1.000:. ./.:4:52,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:35,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,78:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.37:1.000:. ./.:4:51,68:.: 0.23:1.000:. ./.:4:65,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,75:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,94:.: 1.49:1.000:. ./.:4:58,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:46,58:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.70:1.000:. ./.:4:44,63:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,60:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.58:1.000:. ./.:4:87,116:.: 2.76:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,78:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.58:1.000:. ./.:4:52,70:.: 0.32:1.000:. ./.:4:47,73:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,70:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,45:.:-0.64:1.000:. ./.:4:74,136:.: 2.97:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.74:1.000:. ./.:4:53,76:.: 0.53:1.000:. ./.:4:68,85:.: 1.25:1.000:. ./.:4:56,89:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,37:.:-2.24:1.000:. ./.:4:44,64:.:-0.10:1.000:. ./.:4:71,69:.: 0.86:1.000:. ./.:4:60,65:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,148:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.59:1.000:. ./.:4:42,77:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.19:1.000:. ./.:4:58,95:.: 1.25:1.000:. ./.:4:49,64:.: 0.05:1.000:. ./.:4:44,79:.: 0.35:1.000:. ./.:4:57,78:.: 0.71:1.000:. ./.:4:58,67:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.17:0.999:. ./.:4:0,122:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.02:1.000:. ./.:4:36,55:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.59:1.000:. ./.:4:60,72:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.30:1.000:. ./.:4:42,58:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.22:1.000:. ./.:4:58,76:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,103:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.71:1.000:. ./.:4:107,123:.: 3.57:1.000:. ./.:4:57,70:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,116:.: 0.17:1.000:. -chr3.1 50189320 chr3.1_050189320 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:53,16:0.27: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,19:0.56:-0.35:1.000:0.959 0/0/1/1:4:37,36:0.48: 1.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:33,25:0.43: 0.75:1.000:0.948 0/1/1/1:4:28,58:0.67: 1.99:1.000:0.919 0/0/0/1:4:45,19:0.32: 1.02:1.000:0.954 0/0/1/1:4:17,13:0.43:-0.48:1.000:0.952 0/1/1/1:4:12,22:0.64:-0.31:1.000:0.692 0/1/1/1:4:13,39:0.75: 0.49:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.38:-1.32:1.000:0.504 0/0/1/1:4:18,19:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,32:0.66: 0.31:1.000:0.876 0/0/1/1:4:26,15:0.38: 0.00:1.000:0.528 0/0/1/1:4:21,24:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,48:0.75: 1.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,42:1.00: 0.05:0.998:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,34:0.45: 1.46:1.000:0.983 0/0/0/1:4:64,26:0.31: 2.17:1.000:0.968 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-1.59:1.000:0.863 0/0/0/1:4:54,14:0.24: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,25:0.37: 1.28:1.000:0.568 0/0/0/1:4:35,13:0.30: 0.31:1.000:0.986 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,32:0.63: 0.40:1.000:0.600 0/1/1/1:4:22,67:0.75: 2.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,31:0.45: 1.19:1.000:0.981 0/1/1/1:4:13,61:0.82: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,53:0.59: 2.08:1.000:0.848 0/0/0/1:4:26,11:0.32:-0.17:1.000:0.953 0/1/1/1:4:24,57:0.70: 1.77:1.000:0.986 0/0/0/1:4:2,1:0.35:-1.67:1.000:0.792 0/0/0/1:4:5,1:0.20:-1.54:1.000:1.000 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,22:0.41: 0.58:1.000:0.870 0/0/0/1:4:36,19:0.36: 0.62:1.000:0.688 0/1/1/1:4:21,61:0.74: 1.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,12:0.33:-0.09:1.000:0.925 0/0/0/1:4:38,19:0.35: 0.71:1.000:0.792 0/0/1/1:4:10,11:0.51:-0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,11:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,23:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:25,6:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,6:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,21:0.67:-0.44:1.000:0.931 0/0/1/1:4:28,36:0.55: 1.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:23,28:0.54: 0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,16:0.45:-0.26:1.000:0.982 0/0/0/1:4:16,8:0.35:-0.75:1.000:0.792 0/1/1/1:4:4,12:0.75:-1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,17:0.28: 1.15:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,27:0.64: 0.05:1.000:0.638 0/0/0/1:4:32,14:0.33: 0.22:1.000:0.935 0/0/1/1:4:21,14:0.40:-0.26:1.000:0.830 0/0/0/1:4:32,7:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,3:0.10:-0.31:1.000:0.697 0/0/1/1:4:5,7:0.57:-1.28:1.000:0.940 0/0/0/0/1/1:6:19,8:0.32:-0.62:1.000:0.916 0/0/1/1:4:16,14:0.46:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:26,11:0.32:-0.17:1.000:0.953 0/0/1/1:4:10,15:0.59:-0.70:1.000:0.863 0/0/1/1:4:6,10:0.62:-1.10:1.000:0.610 0/0/0/1:4:31,17:0.37: 0.31:1.000:0.600 0/0/1/1:4:19,14:0.42:-0.35:1.000:0.932 0/0/1/1:4:8,6:0.43:-1.19:1.000:0.943 0/1/1/1:4:7,18:0.72:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,18:0.53:-0.35:1.000:0.991 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,12:0.32:-0.04:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.53:-0.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,13:0.22: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,5:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,19:0.58:-0.39:1.000:0.899 0/0/1/1:4:10,14:0.57:-0.75:1.000:0.940 0/1/1/1:4:6,19:0.76:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,16:0.32: 0.53:1.000:0.942 0/0/1/1:4:8,5:0.39:-1.23:0.999:0.717 0/1/1/1:4:5,10:0.66:-1.14:1.000:0.876 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,21:0.41: 0.44:1.000:0.890 0/0/0/0/1:5:22,5:0.22:-0.62:0.928:0.987 0/0/1/1:4:19,22:0.52: 0.00:1.000:0.994 0/1/1/1:4:8,21:0.72:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,20:0.83:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,5:0.19:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,18:0.64:-0.57:1.000:0.638 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.19:0.988:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,5:0.19:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.72:-1.01:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.46:-1.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-1.37:1.000:0.947 0/0/1/1:4:15,14:0.47:-0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:22,29:0.56: 0.44:1.000:0.972 0/0/1/1:4:8,6:0.43:-1.19:1.000:0.943 0/0/1/1:4:14,15:0.50:-0.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,7:0.30:-0.66:1.000:0.987 0/0/1/1:4:5,7:0.57:-1.28:1.000:0.940 0/0/1/1:4:16,16:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,18:0.69:-0.66:1.000:0.971 0/0/1/1:4:41,39:0.48: 1.72:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,53:0.69: 1.55:1.000:0.979 0/0/1/1:4:10,15:0.59:-0.70:1.000:0.863 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-1.10:1.000:0.962 0/1/1/1:4:25,72:0.74: 2.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,9:0.49:-1.01:0.999:0.996 0/0/1/1:4:12,18:0.59:-0.48:1.000:0.863 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-1.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:14,4:0.26:-1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,11:0.30:-0.04:1.000:0.983 0/0/1/1:4:13,18:0.57:-0.44:1.000:0.948 0/0/1/1:4:17,13:0.43:-0.48:1.000:0.952 0/1/1/1:4:13,27:0.67:-0.04:1.000:0.921 0/0/1/1:4:20,28:0.57: 0.31:1.000:0.940 0/0/1/1:4:9,14:0.60:-0.79:1.000:0.796 0/0/1/1:4:14,18:0.55:-0.39:1.000:0.980 0/1/1/1:4:34,64:0.65: 2.52:1.000:0.761 0/0/1/1:4:13,11:0.45:-0.75:1.000:0.983 0/1/1/1:4:8,17:0.68:-0.70:1.000:0.941 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-1.41:1.000:0.876 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.62:-1.45:1.000:0.610 0/1/1/1:4:3,10:0.77:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.26:-0.26:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,38:0.97:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.58:-0.84:1.000:0.912 0/0/1/1:4:21,12:0.38:-0.35:1.000:0.504 0/1/1/1:4:12,24:0.66:-0.22:1.000:0.876 0/1/1/1:4:14,42:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,10:0.32:-0.31:1.000:0.959 0/0/1/1:4:6,8:0.56:-1.19:1.000:0.968 0/0/0/1:4:13,2:0.16:-1.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,11:0.54:-0.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:8,6:0.43:-1.19:1.000:0.943 0/0/1/1:4:10,8:0.44:-1.01:1.000:0.970 0/0/1/1:4:33,26:0.44: 0.80:1.000:0.965 0/0/1/1:4:7,11:0.60:-1.01:1.000:0.773 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,18:0.30: 1.06:1.000:0.982 0/0/0/1:4:55,24:0.33: 1.68:1.000:0.937 0/1/1/1:4:13,43:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,38:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,27:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,19:0.26: 1.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,10:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.24:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,48:0.73: 1.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,32:0.56: 0.66:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,48:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,43:0.59: 1.37:1.000:0.880 0/1/1/1:4:21,38:0.64: 0.80:1.000:0.654 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,26:0.40: 1.15:1.000:0.746 0/0/1/1:4:28,37:0.56: 1.06:1.000:0.971 0/0/1/1:4:23,39:0.62: 0.93:1.000:0.555 0/0/1/1:4:23,36:0.60: 0.80:1.000:0.782 0/0/0/1:4:22,11:0.35:-0.35:1.000:0.792 0/1/1/1:4:20,57:0.74: 1.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,47:0.72: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,10:0.33:-0.39:1.000:0.908 0/0/1/1:4:40,31:0.44: 1.33:0.999:0.958 0/0/1/1:4:24,16:0.40:-0.04:1.000:0.830 0/0/1/1:4:40,23:0.38: 0.97:1.000:0.519 0/0/0/1:4:32,18:0.37: 0.40:1.000:0.536 0/1/1/1:4:19,36:0.65: 0.62:1.000:0.776 0/0/1/1:4:22,21:0.48: 0.09:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.62:-0.97:1.000:0.519 0/0/1/1:4:26,15:0.38: 0.00:1.000:0.528 0/0/1/1:4:40,50:0.54: 2.17:1.000:0.986 0/1/1/1:4:15,43:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,24:0.45: 0.53:1.000:0.978 0/0/1/1:4:26,31:0.53: 0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:32,61:0.65: 2.30:1.000:0.790 0/0/0/1:4:58,19:0.28: 1.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,34:0.60: 0.66:1.000:0.809 0/0/0/1:4:50,13:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.53: 0.40:1.000:0.993 -chr3.1 50397980 chr3.1_050397980 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:89,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:30,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:57,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:53,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:30,13:.:-1.50:1.000:. ./.:4:54,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:56,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:55,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:54,20:.:-0.38:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:44,12:.:-1.03:0.998:. ./.:4:65,28:.: 0.30:1.000:. ./.:4:82,27:.: 0.88:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:31,14:.:-1.42:1.000:. ./.:4:52,14:.:-0.67:1.000:. ./.:4:52,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:32,11:.:-1.50:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.81:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.59:1.000:. ./.:3:25,16:.:-1.57:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:39,13:.:-1.17:1.000:. ./.:4:39,15:.:-1.10:1.000:. ./.:4:83,22:.: 0.73:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:154,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:88,22:.: 0.91:1.000:. ./.:4:85,21:.: 0.77:1.000:. ./.:4:248,0:.: 5.88:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,21:.: 1.17:1.000:. ./.:4:83,35:.: 1.20:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:70,22:.: 0.27:1.000:. ./.:4:74,31:.: 0.73:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,23:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.91:1.000:. ./.:6:139,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.52:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:86,32:.: 1.20:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:35,16:.:-1.21:1.000:. ./.:4:69,54:.: 1.38:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:133,2:.: 1.81:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:35,24:.:-0.92:0.999:. ./.:4:74,24:.: 0.48:1.000:. ./.:4:62,21:.:-0.06:1.000:. ./.:4:69,16:.: 0.01:1.000:. ./.:5:186,0:.: 3.65:0.928:. ./.:4:96,27:.: 1.38:1.000:. ./.:4:35,18:.:-1.14:1.000:. ./.:4:54,20:.:-0.38:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.85:0.988:. ./.:4:53,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:41,13:.:-1.10:1.000:. ./.:4:84,30:.: 1.06:1.000:. ./.:4:63,27:.: 0.19:1.000:. ./.:4:42,23:.:-0.70:1.000:. ./.:4:87,21:.: 0.84:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.27:1.000:. ./.:4:71,30:.: 0.59:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:48,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:68,26:.: 0.34:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.01:1.000:. ./.:4:72,31:.: 0.66:1.000:. ./.:4:48,17:.:-0.70:1.000:. ./.:4:44,27:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:57,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,20:.: 1.42:0.999:. ./.:4:87,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:70,24:.: 0.34:1.000:. ./.:4:40,19:.:-0.92:1.000:. ./.:4:60,19:.:-0.20:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:68,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,20:.:-1.24:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:70,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:52,15:.:-0.63:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.31:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:31,22:.:-1.14:1.000:. ./.:4:49,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:54,20:.:-0.38:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:68,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:60,14:.:-0.38:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,14:.:-0.85:1.000:. ./.:4:64,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:56,21:.:-0.27:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,15:.:-1.21:1.000:. ./.:4:53,22:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:25,10:.:-1.78:1.000:. ./.:4:80,17:.: 0.45:1.000:. ./.:4:49,21:.:-0.52:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:65,22:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,19:.:-0.74:1.000:. ./.:4:72,19:.: 0.23:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:42,12:.:-1.10:1.000:. ./.:4:39,11:.:-1.24:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:40,12:.:-1.17:1.000:. ./.:4:33,15:.:-1.32:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:64,34:.: 0.48:0.999:. ./.:4:115,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:23,10:.:-1.86:1.000:. ./.:4:63,26:.: 0.16:1.000:. ./.:4:57,24:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:55,11:.:-0.67:1.000:. ./.:4:59,23:.:-0.09:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,9:.:-0.20:1.000:. ./.:4:36,19:.:-1.06:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:54,14:.:-0.60:1.000:. -chr3.1 50483190 chr3.1_050483190 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:0.998:. ./.:4:11,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:69,0:.: 4.25:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:56,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:5:51,0:.: 2.58:0.928:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.14:0.988:. ./.:4:20,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 1.09:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:33,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.24:1.000:. -chr3.1 50906611 chr3.1_050906611 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:94,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.46:0.998:. ./.:4:43,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:124,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.20:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:108,0:.: 2.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.09:1.000:. ./.:6:49,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:23,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.91:1.000:. ./.:5:20,0:.:-0.91:0.928:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.42:0.988:. ./.:4:4,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:69,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:54,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:44,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.46:1.000:. -chr3.1 51270614 chr3.1_051270614 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,69:0.62:-0.22:1.000:0.579 0/0/0/1:4:110,85:0.33: 1.44:1.000:0.912 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,20:0.51:-1.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:220,0:0.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:180,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,62:0.18: 2.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,109:0.41: 1.91:0.998:0.889 0/0/0/1:4:196,66:0.17: 2.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,94:0.38: 1.57:1.000:0.518 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.63:-1.64:1.000:0.516 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,76:0.38: 0.89:1.000:0.537 0/0/0/0:4:80,1:0.01:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,10:0.21:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,90:0.48: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,49:0.67:-0.82:1.000:0.937 0/0/1/1:4:79,80:0.43: 0.82:1.000:0.953 0/0/1/1:4:87,94:0.46: 1.20:1.000:0.986 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,58:0.72:-0.70:1.000:0.994 0/1/1/1:4:0,6:0.87:-1.83:1.000:0.889 0/0/1/1:4:14,16:0.48:-1.41:1.000:0.994 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,68:0.74:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,74:0.61:-0.08:1.000:0.633 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,82:0.41: 0.96:1.000:0.889 0/0/0/1:4:138,64:0.21: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,63:0.45: 0.18:1.000:0.982 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,56:0.41: 0.06:1.000:0.855 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,31:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,71:0.29: 1.08:1.000:0.992 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,53:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,79:0.43: 0.80:1.000:0.941 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:51,14:0.14:-0.81:1.000:0.994 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,65:0.42: 0.34:1.000:0.923 0/0/0/1:4:83,50:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,59:0.19: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,79:0.41: 0.86:1.000:0.887 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,54:0.45:-0.11:1.000:0.979 0/0/0/1:4:127,61:0.21: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,58:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,68:0.40: 0.51:1.000:0.803 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.82:0.999:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,80:0.41: 0.91:1.000:0.862 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:225,69:0.15: 3.16:0.928:0.997 0/1/1/1:4:20,79:0.70:-0.22:1.000:0.985 0/1/1/1:4:12,67:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,44:0.69:-0.96:1.000:0.974 0/0/1/1:4:55,48:0.38:-0.15:1.000:0.532 0/0/0/1:4:124,58:0.21: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.27:0.988:1.000 0/0/0/1:4:78,58:0.32: 0.42:1.000:0.959 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,50:0.31: 0.11:1.000:0.967 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,71:0.27: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:71,44:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,55:0.72:-0.77:1.000:0.995 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,63:0.20: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,40:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,45:0.45:-0.41:1.000:0.974 0/1/1/1:4:13,57:0.71:-0.72:1.000:0.993 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,67:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,76:0.73:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,65:0.22: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,91:0.30: 1.88:1.000:0.986 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.41:0.999:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,56:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,62:0.53:-0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,60:0.41: 0.20:1.000:0.862 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,57:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,53:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,74:0.41: 0.68:1.000:0.882 0/1/1/1:4:23,77:0.68:-0.20:1.000:0.948 0/0/0/1:4:65,55:0.37: 0.15:1.000:0.620 0/0/1/1:4:66,65:0.42: 0.34:1.000:0.923 0/0/0/0:4:138,1:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,58:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,97:0.34: 1.89:1.000:0.889 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,67:0.29: 0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:63,65:0.44: 0.28:1.000:0.967 0/0/1/1:4:74,73:0.42: 0.61:1.000:0.925 0/0/0/1:4:64,51:0.34: 0.06:1.000:0.846 0/0/0/1:4:98,82:0.36: 1.18:1.000:0.671 0/0/0/0:4:77,1:0.01:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,63:0.73:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,74:0.22: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,84:0.32: 1.44:1.000:0.941 0/0/0/1:4:101,74:0.31: 1.10:1.000:0.969 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,53:0.68:-0.74:1.000:0.943 0/0/0/1:4:92,76:0.36: 0.98:1.000:0.725 0/0/0/1:4:101,84:0.36: 1.27:1.000:0.697 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,58:0.28: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,66:0.30: 0.84:1.000:0.988 0/1/1/1:4:3,59:0.83:-0.86:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,57:0.72:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,68:0.40: 0.53:1.000:0.758 0/1/1/1:4:24,89:0.69: 0.02:1.000:0.976 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.61:0.999:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.45: 0.75:1.000:0.982 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,74:0.65:-0.20:1.000:0.825 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,52:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,68:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,88:0.34: 1.53:1.000:0.880 0/0/0/1:4:178,64:0.17: 2.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,91:0.37: 1.50:1.000:0.596 0/0/1/1:4:62,74:0.49: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 -chr3.1 51418183 chr3.1_051418183 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:234,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:185,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:322,57:.: 1.77:1.000:. ./.:4:336,48:.: 1.82:1.000:. ./.:4:256,21:.: 0.61:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:277,44:.: 1.11:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.28:0.998:. ./.:4:114,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,6:.:-1.92:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:304,54:.: 1.53:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:220,48:.: 0.51:1.000:. ./.:4:293,30:.: 1.13:1.000:. ./.:4:151,44:.:-0.31:1.000:. ./.:4:312,47:.: 1.54:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:315,35:.: 1.44:1.000:. ./.:4:21,3:.:-2.24:1.000:. ./.:4:48,7:.:-1.89:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:382,43:.: 2.28:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:176,41:.:-0.06:1.000:. ./.:4:430,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:181,57:.: 0.17:1.000:. ./.:4:203,38:.: 0.21:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:276,33:.: 0.98:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:325,40:.: 1.61:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:114,31:.:-0.87:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:162,23:.:-0.42:1.000:. ./.:4:272,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:227,35:.: 0.45:1.000:. ./.:4:65,46:.:-1.26:1.000:. ./.:4:200,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:169,42:.:-0.13:1.000:. ./.:6:110,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:195,40:.: 0.14:1.000:. ./.:4:282,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:191,42:.: 0.12:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:336,37:.: 1.70:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:164,26:.:-0.37:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:273,36:.: 0.98:1.000:. ./.:4:172,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:167,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:271,36:.: 0.95:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:138,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:219,33:.: 0.33:1.000:. ./.:5:194,28:.:-0.01:0.928:. ./.:4:173,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:156,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:161,37:.:-0.28:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.64:0.988:. ./.:4:183,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:225,46:.: 0.55:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:131,24:.:-0.76:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:269,42:.: 1.00:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:232,44:.: 0.60:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:197,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:252,42:.: 0.81:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:229,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:223,29:.: 0.33:0.999:. ./.:4:177,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:105,17:.:-1.13:1.000:. ./.:4:245,26:.: 0.55:1.000:. ./.:4:88,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:87,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:74,29:.:-1.35:1.000:. ./.:4:205,35:.: 0.20:1.000:. ./.:4:446,46:.: 3.04:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:88,34:.:-1.13:1.000:. ./.:4:268,29:.: 0.84:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:130,30:.:-0.71:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:200,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:169,29:.:-0.28:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:204,35:.: 0.19:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:241,48:.: 0.75:1.000:. ./.:4:168,49:.:-0.06:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:140,53:.:-0.33:1.000:. ./.:4:52,9:.:-1.82:1.000:. ./.:4:244,23:.: 0.50:1.000:. ./.:4:381,38:.: 2.22:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:377,60:.: 2.42:1.000:. ./.:4:295,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:197,43:.: 0.20:1.000:. ./.:4:370,46:.: 2.18:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:245,25:.: 0.54:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:190,38:.: 0.06:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:145,57:.:-0.23:1.000:. ./.:4:178,61:.: 0.19:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:267,47:.: 1.03:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:147,44:.:-0.36:1.000:. ./.:4:314,57:.: 1.68:1.000:. ./.:4:288,54:.: 1.35:1.000:. ./.:4:179,45:.: 0.02:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:294,52:.: 1.39:1.000:. ./.:4:294,39:.: 1.25:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.01:1.000:. -chr3.1 51569473 chr3.1_051569473 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:49,51:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,63:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,45:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,52:0.52: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,57:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,34:0.23: 2.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,37:0.45:-0.06:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,63:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,59:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,12:0.53:-1.97:1.000:0.993 0/0/0/1:4:29,6:0.19:-1.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,25:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,22:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,61:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,22:0.22: 0.90:0.998:1.000 0/0/0/1:4:78,33:0.31: 0.97:1.000:0.976 0/0/0/1:4:87,29:0.27: 1.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,49:0.43: 1.04:1.000:0.944 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-1.71:1.000:0.983 0/0/1/1:4:35,42:0.53:-0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,50:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,57:0.46: 1.30:1.000:0.989 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,29:0.32: 0.34:1.000:0.942 0/1/1/1:4:35,111:0.72: 2.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,40:0.38: 0.84:1.000:0.517 0/0/1/1:4:56,41:0.42: 0.51:1.000:0.911 0/0/1/1:4:63,57:0.47: 1.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,62:0.52: 1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,65:0.60: 0.74:1.000:0.809 1/1/1/1:4:1,31:0.91:-1.64:1.000:0.953 0/0/0/1:4:24,5:0.19:-1.74:1.000:1.000 0/0/1:3:8,4:0.34:-2.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.44:-0.19:1.000:0.969 0/0/1/1:4:72,50:0.41: 1.33:1.000:0.850 0/0/0/1:4:63,12:0.17:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,21:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,50:0.52: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,35:0.43:-0.06:1.000:0.952 0/0/1/1:4:43,27:0.39:-0.39:1.000:0.651 0/0/0/1:4:61,18:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,39:0.46: 0.08:1.000:0.985 0/0/0/1:4:85,20:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,49:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,38:0.49:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,9:0.15:-0.55:1.000:0.987 0/0/0/1:4:43,9:0.19:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,57:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,20:0.29:-0.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,34:0.42:-0.02:1.000:0.899 0/0/0/1:4:64,27:0.31: 0.31:1.000:0.976 0/0/0/1:4:40,13:0.26:-0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,14:0.21:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,37:0.53:-0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:49,20:0.30:-0.42:1.000:0.983 0/0/0/1/1/1:6:21,18:0.45:-1.41:1.000:0.764 0/0/1/1:4:28,32:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,15:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,15:0.29:-0.92:1.000:0.991 0/0/0/1:4:39,18:0.32:-0.82:1.000:0.940 0/0/1/1:4:42,46:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,18:0.27:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,6:0.13:-1.08:1.000:0.929 0/0/1/1:4:34,40:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,30:0.37: 0.04:1.000:0.626 0/0/0/1:4:50,21:0.31:-0.35:1.000:0.978 0/0/1/1:4:20,15:0.42:-1.54:1.000:0.930 0/0/1/1:4:39,34:0.46:-0.29:1.000:0.986 0/0/1/1:4:43,40:0.47: 0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:54,17:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,15:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,22:0.35:-0.59:1.000:0.797 0/0/0/1:4:52,21:0.30:-0.29:1.000:0.985 0/0/0/1:4:46,25:0.36:-0.35:1.000:0.724 0/1/1/1:4:14,29:0.64:-1.28:0.999:0.705 0/0/0/1:4:47,13:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,17:0.37:-1.15:1.000:0.624 0/0/0/1:4:63,20:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/0/0:5:76,0:0.00:-0.19:0.928:1.000 0/0/1/1:4:51,45:0.46: 0.47:1.000:0.988 0/1/1/1:4:16,33:0.64:-1.08:1.000:0.695 0/1/1/1:4:13,49:0.74:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,12:0.28:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,29:0.53:-0.95:0.988:0.993 0/0/0/1:4:56,17:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,21:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,18:0.28:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:45,18:0.30:-0.62:1.000:0.987 0/0/1/1:4:33,39:0.52:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:32,11:0.27:-1.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,11:0.24:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,35:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,55:0.62: 0.08:1.000:0.516 0/0/0/1:4:45,20:0.32:-0.55:1.000:0.959 0/0/0/1:4:48,17:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,7:0.16:-1.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,46:0.71:-0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,25:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,53:0.71:-0.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:18,30:0.60:-1.11:1.000:0.809 0/0/1/1:4:63,53:0.45: 1.13:1.000:0.979 0/1/1/1:4:37,80:0.65: 1.17:1.000:0.789 0/0/1/1:4:43,42:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:41,14:0.27:-0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,29:0.23: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,10:0.20:-0.95:0.999:1.000 0/0/1/1:4:29,30:0.49:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,12:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,11:0.29:-1.41:1.000:0.989 0/1/1/1:4:23,45:0.63:-0.45:1.000:0.566 0/0/0/1:4:49,10:0.18:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,25:0.52:-1.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,42:0.71:-0.85:1.000:0.991 0/0/0/1:4:51,13:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,23:0.42:-0.92:1.000:0.922 0/0/0/1:4:51,16:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,51:0.43: 1.13:1.000:0.956 0/0/0/1:4:40,10:0.22:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,15:0.21:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,14:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,14:0.42:-1.61:1.000:0.916 0/0/0/1:4:41,9:0.19:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.27:-0.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,41:0.44: 0.34:1.000:0.966 0/1/1/1:4:14,31:0.65:-1.21:1.000:0.828 0/0/1/1:4:23,34:0.57:-0.82:1.000:0.939 0/1/1/1:4:16,51:0.72:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,28:0.22: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,24:0.32:-0.19:1.000:0.940 0/0/1/1:4:24,18:0.42:-1.31:1.000:0.930 0/0/0/1:4:36,11:0.25:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,27:0.47:-0.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:38,15:0.30:-0.95:1.000:0.988 0/0/1/1:4:25,31:0.53:-0.85:1.000:0.990 0/0/0/1:4:68,14:0.18: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,11:0.22:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,63:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,25:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,61:0.53: 0.97:1.000:0.992 0/1/1/1:4:26,62:0.67: 0.21:1.000:0.912 0/1/1/1:4:28,73:0.68: 0.64:1.000:0.963 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,45:0.28: 2.89:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,26:0.23: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,15:0.62:-1.94:1.000:0.546 0/1/1/1:4:23,70:0.71: 0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:74,16:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,15:0.15: 0.84:1.000:0.990 0/0/1/1:4:80,64:0.44: 2.06:1.000:0.964 0/0/0/1:4:83,28:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,19:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,45:0.44: 0.64:1.000:0.966 0/0/0/1:4:93,23:0.21: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,69:0.67: 0.51:1.000:0.936 0/0/1/1:4:32,61:0.63: 0.37:1.000:0.502 0/0/0/1:4:85,24:0.24: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,31:0.40:-0.12:1.000:0.763 0/1/1/1:4:34,88:0.68: 1.33:1.000:0.960 0/0/0/1:4:84,21:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,58:0.54: 0.74:0.999:0.989 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,25:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,37:0.38: 0.54:1.000:0.561 0/0/1/1:4:49,44:0.46: 0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:45,37:0.44: 0.01:1.000:0.973 0/0/0/1:4:76,10:0.13: 0.14:1.000:0.863 0/0/1/1:4:36,34:0.47:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,55:0.46: 1.17:1.000:0.988 0/0/0/1:4:86,14:0.15: 0.61:1.000:0.989 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,29:0.29: 0.77:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,98:0.68: 1.80:1.000:0.959 0/0/0/1:4:108,30:0.24: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,44:0.29: 2.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:70,28:0.30: 0.54:1.000:0.987 0/0/1/1:4:54,50:0.47: 0.74:1.000:0.992 -chr3.1 52207570 chr3.1_052207570 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,134:.: 0.77:1.000:. ./.:4:106,68:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,139:.: 0.99:1.000:. ./.:4:122,135:.: 1.17:1.000:. ./.:4:144,66:.: 0.39:1.000:. ./.:4:110,31:.:-0.75:1.000:. ./.:4:72,73:.:-0.69:1.000:. ./.:4:102,109:.: 0.41:1.000:. ./.:4:106,76:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,51:.:-1.28:1.000:. ./.:4:58,22:.:-1.76:1.000:. ./.:4:129,36:.:-0.35:1.000:. ./.:4:93,50:.:-0.72:1.000:. ./.:4:114,67:.:-0.09:1.000:. ./.:4:93,23:.:-1.17:1.000:. ./.:4:118,126:.: 0.96:1.000:. ./.:4:143,100:.: 0.94:0.998:. ./.:4:103,127:.: 0.72:1.000:. ./.:4:154,134:.: 1.69:1.000:. ./.:4:123,89:.: 0.43:1.000:. ./.:4:34,18:.:-2.23:1.000:. ./.:4:79,110:.: 0.04:1.000:. ./.:4:144,70:.: 0.46:1.000:. ./.:4:96,111:.: 0.34:1.000:. ./.:4:37,17:.:-2.20:1.000:. ./.:4:95,89:.:-0.04:1.000:. ./.:4:118,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:94,86:.:-0.11:1.000:. ./.:4:176,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:118,108:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,110:.: 0.76:1.000:. ./.:4:106,89:.: 0.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:42,21:.:-2.05:1.000:. ./.:3:16,6:.:-2.73:1.000:. ./.:4:122,104:.: 0.66:1.000:. ./.:4:119,170:.: 1.70:1.000:. ./.:4:120,63:.:-0.06:1.000:. ./.:4:93,22:.:-1.18:1.000:. ./.:4:104,164:.: 1.35:1.000:. ./.:4:140,130:.: 1.39:1.000:. ./.:4:93,23:.:-1.17:1.000:. ./.:4:86,149:.: 0.81:1.000:. ./.:4:95,146:.: 0.91:1.000:. ./.:4:112,150:.: 1.25:1.000:. ./.:4:103,51:.:-0.54:1.000:. ./.:4:137,95:.: 0.76:1.000:. ./.:4:39,61:.:-1.43:1.000:. ./.:4:91,123:.: 0.46:1.000:. ./.:4:36,11:.:-2.31:1.000:. ./.:4:96,77:.:-0.22:1.000:. ./.:4:117,73:.: 0.06:1.000:. ./.:4:88,57:.:-0.69:1.000:. ./.:4:132,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:81,78:.:-0.45:1.000:. ./.:4:85,121:.: 0.33:1.000:. ./.:4:83,52:.:-0.85:1.000:. ./.:4:90,46:.:-0.84:1.000:. ./.:4:91,81:.:-0.24:1.000:. ./.:6:102,66:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,96:.: 0.56:1.000:. ./.:4:75,79:.:-0.54:1.000:. ./.:4:120,250:.: 3.05:1.000:. ./.:4:83,50:.:-0.89:1.000:. ./.:4:90,146:.: 0.82:1.000:. ./.:4:97,118:.: 0.47:1.000:. ./.:4:93,80:.:-0.22:1.000:. ./.:4:102,101:.: 0.28:1.000:. ./.:4:119,98:.: 0.51:1.000:. ./.:4:100,52:.:-0.57:1.000:. ./.:4:114,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:66,40:.:-1.33:1.000:. ./.:4:116,83:.: 0.21:1.000:. ./.:4:100,88:.: 0.03:1.000:. ./.:4:97,30:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,97:.:-0.16:1.000:. ./.:4:96,109:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,105:.: 0.59:1.000:. ./.:4:150,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,135:.: 0.67:1.000:. ./.:4:93,49:.:-0.74:0.999:. ./.:4:86,140:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,158:.: 1.55:1.000:. ./.:4:91,44:.:-0.85:1.000:. ./.:5:96,44:.:-0.77:0.928:. ./.:4:85,115:.: 0.23:1.000:. ./.:4:75,97:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,133:.: 0.56:1.000:. ./.:4:85,20:.:-1.35:1.000:. ./.:4:117,74:.: 0.08:1.000:. ./.:4:80,56:.:-0.84:0.988:. ./.:4:124,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:88,125:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,63:.:-0.84:1.000:. ./.:4:103,125:.: 0.69:1.000:. ./.:4:97,76:.:-0.22:1.000:. ./.:4:95,100:.: 0.14:1.000:. ./.:4:91,26:.:-1.15:1.000:. ./.:4:78,145:.: 0.61:1.000:. ./.:4:72,105:.:-0.16:1.000:. ./.:4:92,126:.: 0.52:1.000:. ./.:4:136,137:.: 1.44:1.000:. ./.:4:109,95:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,66:.:-0.80:1.000:. ./.:4:96,134:.: 0.72:1.000:. ./.:4:101,141:.: 0.92:1.000:. ./.:4:91,85:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,102:.: 0.29:1.000:. ./.:4:164,169:.: 2.43:1.000:. ./.:4:86,137:.: 0.61:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.82:1.000:. ./.:4:173,136:.: 2.03:1.000:. ./.:4:112,73:.:-0.02:0.999:. ./.:4:90,25:.:-1.18:1.000:. ./.:4:43,62:.:-1.35:1.000:. ./.:4:60,92:.:-0.57:1.000:. ./.:4:78,67:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,106:.: 0.01:1.000:. ./.:4:103,86:.: 0.04:1.000:. ./.:4:77,77:.:-0.54:1.000:. ./.:4:108,82:.: 0.06:1.000:. ./.:4:105,77:.:-0.07:1.000:. ./.:4:107,60:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,69:.:-0.11:1.000:. ./.:4:113,171:.: 1.62:1.000:. ./.:4:106,55:.:-0.42:1.000:. ./.:4:115,76:.: 0.08:1.000:. ./.:4:98,25:.:-1.05:1.000:. ./.:4:62,53:.:-1.18:1.000:. ./.:4:62,18:.:-1.76:1.000:. ./.:4:91,119:.: 0.39:1.000:. ./.:4:142,83:.: 0.64:1.000:. ./.:4:59,24:.:-1.71:1.000:. ./.:4:75,121:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,52:.:-0.44:1.000:. ./.:4:143,126:.: 1.37:1.000:. ./.:4:89,23:.:-1.23:1.000:. ./.:4:101,83:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,53:.:-0.60:1.000:. ./.:4:103,69:.:-0.24:1.000:. ./.:4:76,22:.:-1.47:1.000:. ./.:4:108,87:.: 0.14:1.000:. ./.:4:130,64:.: 0.13:1.000:. ./.:4:81,23:.:-1.37:1.000:. ./.:4:175,226:.: 3.56:1.000:. ./.:4:113,77:.: 0.06:1.000:. ./.:4:111,113:.: 0.62:1.000:. ./.:4:88,92:.:-0.11:1.000:. ./.:4:81,120:.: 0.24:1.000:. ./.:4:110,153:.: 1.27:1.000:. ./.:4:133,93:.: 0.66:1.000:. ./.:4:108,129:.: 0.84:1.000:. ./.:4:41,20:.:-2.08:1.000:. ./.:4:84,48:.:-0.90:1.000:. ./.:4:101,97:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,64:.:-0.12:1.000:. ./.:4:141,121:.: 1.25:1.000:. ./.:4:129,182:.: 2.07:1.000:. ./.:4:107,69:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,28:.:-1.05:1.000:. ./.:4:118,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,71:.:-0.69:1.000:. ./.:4:83,108:.: 0.08:1.000:. ./.:4:120,127:.: 1.01:1.000:. ./.:4:64,62:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,120:.: 0.33:1.000:. ./.:4:162,110:.: 1.42:0.999:. ./.:4:114,73:.: 0.01:1.000:. ./.:4:96,121:.: 0.51:1.000:. ./.:4:82,46:.:-0.97:1.000:. ./.:4:79,123:.: 0.26:1.000:. ./.:4:88,74:.:-0.40:1.000:. ./.:4:127,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:89,94:.:-0.06:1.000:. ./.:4:96,87:.:-0.06:1.000:. ./.:4:151,150:.: 1.90:1.000:. ./.:4:160,124:.: 1.62:1.000:. ./.:4:106,54:.:-0.44:1.000:. ./.:4:125,100:.: 0.64:1.000:. ./.:4:110,117:.: 0.67:1.000:. ./.:4:128,56:.:-0.04:1.000:. ./.:4:156,140:.: 1.82:1.000:. ./.:4:84,57:.:-0.75:1.000:. ./.:4:117,61:.:-0.14:1.000:. -chr3.1 52446364 chr3.1_052446364 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,79:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.45:1.000:. ./.:4:56,68:.: 1.88:1.000:. ./.:4:52,46:.: 0.89:1.000:. ./.:4:66,82:.: 2.80:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:11,14:.:-1.91:1.000:. ./.:4:1,11:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,61:.: 1.69:1.000:. ./.:4:54,36:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,58:.: 1.27:1.000:. ./.:4:62,53:.: 1.54:0.998:. ./.:4:0,89:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,72:.:-0.07:1.000:. ./.:4:4,7:.:-2.45:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.56:1.000:. ./.:4:61,49:.: 1.35:1.000:. ./.:4:47,60:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.56:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.53:1.000:. ./.:3:7,2:.:-2.53:1.000:. ./.:4:29,43:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,42:.: 0.54:1.000:. ./.:4:45,47:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.11:1.000:. ./.:4:45,38:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.99:1.000:. ./.:4:49,50:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.76:1.000:. ./.:4:59,56:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.26:1.000:. ./.:4:35,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,33:.:-0.53:1.000:. ./.:4:44,47:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.24:1.000:. ./.:4:43,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,69:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:46,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.49:1.000:. ./.:6:27,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:55,50:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.53:1.000:. ./.:4:44,34:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,56:.:-0.69:1.000:. ./.:4:59,50:.: 1.31:1.000:. ./.:4:25,25:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,68:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.61:1.000:. ./.:4:38,40:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.11:1.000:. ./.:4:56,48:.: 1.12:1.000:. ./.:4:52,50:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.07:0.999:. ./.:4:51,48:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,44:.: 0.43:1.000:. ./.:5:0,60:.:-0.57:0.928:. ./.:4:0,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:29,42:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.76:1.000:. ./.:4:46,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:35,40:.: 0.01:0.988:. ./.:4:42,50:.: 0.66:1.000:. ./.:4:63,59:.: 1.81:1.000:. ./.:4:32,32:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,36:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1,43:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.38:1.000:. ./.:4:46,30:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,48:.: 0.77:1.000:. ./.:4:48,36:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,64:.: 1.27:1.000:. ./.:4:46,46:.: 0.66:0.999:. ./.:4:45,55:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.57:1.000:. ./.:4:46,34:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,58:.:-0.61:1.000:. ./.:4:43,40:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.42:1.000:. ./.:4:25,49:.:-0.03:1.000:. ./.:4:42,43:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.22:1.000:. ./.:4:41,53:.: 0.73:1.000:. ./.:4:55,63:.: 1.65:1.000:. ./.:4:47,47:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.76:1.000:. ./.:4:51,47:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.38:1.000:. ./.:4:43,41:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.07:1.000:. ./.:4:59,44:.: 1.08:1.000:. ./.:4:32,25:.:-0.69:1.000:. ./.:4:21,27:.:-1.03:1.000:. ./.:4:27,40:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.76:1.000:. ./.:4:56,47:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.07:1.000:. ./.:4:32,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,62:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.93:1.000:. ./.:4:59,77:.: 2.34:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,49:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.49:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.22:1.000:. ./.:4:42,68:.: 1.35:1.000:. ./.:4:73,69:.: 2.57:1.000:. ./.:4:42,53:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:45,56:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.22:1.000:. ./.:4:51,38:.: 0.54:1.000:. ./.:4:67,48:.: 1.54:1.000:. ./.:4:49,54:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.24:0.999:. ./.:4:47,54:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:25,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:35,31:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.07:1.000:. ./.:4:56,46:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,63:.: 1.27:1.000:. ./.:4:63,70:.: 2.23:1.000:. ./.:4:60,69:.: 2.08:1.000:. ./.:4:72,68:.: 2.50:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,83:.: 0.35:1.000:. -chr3.1 52635497 chr3.1_052635497 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:49,153:0.76: 1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,78:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,81:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,75:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,154:0.73: 1.41:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,171:1.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,177:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,17:0.61:-2.94:1.000:0.662 0/0/0/1:4:48,24:0.37:-1.92:1.000:0.505 0/1/1/1:4:41,107:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,134:0.73: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:89,108:0.58: 1.01:1.000:0.918 0/1/1/1:4:39,147:0.80: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,41:0.28: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,87:0.53: 0.52:0.998:0.992 0/0/0/1:4:136,31:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,143:0.60: 2.31:1.000:0.823 0/1/1/1:4:52,157:0.76: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,16:0.34:-2.37:1.000:0.850 0/1/1/1:4:43,136:0.77: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,90:0.53: 0.64:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,177:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,20:0.59:-2.77:1.000:0.889 0/0/1/1:4:97,72:0.47: 0.36:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,134:0.74: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,136:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,80:0.47: 0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,94:0.50: 1.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,110:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,7:0.66:-3.36:1.000:0.847 0/0/1/1:4:59,33:0.40:-1.45:1.000:0.790 0/0/1:3:27,3:0.15:-2.91:1.000:0.566 0/0/1/1:4:85,102:0.58: 0.78:1.000:0.927 0/1/1/1:4:54,150:0.74: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,80:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:112,106:0.52: 1.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,126:0.62: 1.39:1.000:0.605 0/0/0/1:4:118,24:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,129:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,66:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,96:0.70:-0.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:83,104:0.59: 0.78:1.000:0.886 0/0/1/1:4:102,64:0.43: 0.29:1.000:0.938 0/0/1/1:4:89,108:0.58: 1.01:1.000:0.918 0/0/1/1:4:21,23:0.56:-2.58:1.000:0.972 0/0/0/1:4:84,42:0.37:-0.65:1.000:0.505 0/0/1/1:4:85,62:0.46:-0.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:32,87:0.74:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,152:0.77: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,63:0.49:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,63:0.53:-0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:96,112:0.57: 1.27:1.000:0.945 0/0/1/1:4:92,85:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,100:0.56: 0.85:1.000:0.967 0/1/1/1:4:36,104:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,121:0.72: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:75,35:0.36:-1.03:1.000:0.875 0/0/1/1:4:73,55:0.47:-0.61:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,104:0.80:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,132:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,57:0.51:-0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,156:0.78: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,98:0.57: 0.69:1.000:0.952 0/1/1/1:4:33,101:0.76:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,35:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,73:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:140,41:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,57:0.77:-1.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,95:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,125:0.71: 0.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:68,57:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,155:0.81: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,23:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,49:0.43:-0.68:1.000:0.955 0/0/1/1:4:85,62:0.46:-0.16:1.000:0.989 0/0/0/1:4:139,36:0.25: 0.50:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.98:0.999:1.000 0/1/1/1:4:48,98:0.69:-0.18:1.000:0.969 0/1/1/1:4:52,104:0.68: 0.05:1.000:0.961 0/0/1/1:4:74,98:0.60: 0.43:1.000:0.807 0/0/0/1/1:5:139,82:0.41: 1.58:0.928:0.965 0/1/1/1:4:49,132:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,43:0.45:-1.12:1.000:0.977 0/1/1/1:4:24,69:0.75:-1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,51:0.49:-0.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,38:0.29:-0.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,83:0.65:-0.51:0.988:0.792 0/0/1/1:4:85,46:0.39:-0.54:1.000:0.717 0/1/1/1:4:39,155:0.80: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,49:0.51:-1.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,142:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,101:0.65: 0.17:1.000:0.781 0/1/1/1:4:40,95:0.72:-0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,49:0.40:-0.42:1.000:0.803 0/1/1/1:4:23,129:0.85:-0.04:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,110:0.78:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,62:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,34:0.46:-1.69:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,69:0.59:-0.75:1.000:0.835 0/1/1/1:4:49,128:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,57:0.41:-0.02:1.000:0.885 0/1/1/1:4:45,161:0.79: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,118:0.71: 0.38:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,67:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,50:0.26: 1.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,94:0.77:-0.73:0.999:1.000 0/0/1/1:4:87,59:0.45:-0.18:1.000:0.975 0/0/1/1:4:64,56:0.51:-0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,86:0.71:-0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:69,45:0.44:-0.94:1.000:0.960 0/0/1/1:4:77,59:0.48:-0.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,114:0.78:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,95:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,35:0.29:-0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,56:0.47:-0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:128,30:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,79:0.48: 0.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,27:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,114:0.77:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,49:0.42:-0.61:1.000:0.929 0/0/1/1:4:71,43:0.42:-0.94:1.000:0.908 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,98:0.78:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,58:0.45:-0.26:1.000:0.977 0/1/1/1:4:39,117:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,37:0.42:-1.31:1.000:0.909 0/0/1/1:4:58,52:0.51:-1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,107:0.72:-0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,187:0.77: 2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,110:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,68:0.70:-1.29:1.000:0.986 0/1/1/1:4:33,80:0.72:-0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,81:0.72:-0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,106:0.67: 0.19:1.000:0.930 0/1/1/1:4:28,87:0.76:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,81:0.60:-0.26:1.000:0.830 0/1/1/1:4:44,88:0.68:-0.51:1.000:0.961 0/1/1/1:4:48,121:0.73: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,113:0.57: 1.30:1.000:0.940 0/1/1/1:4:38,134:0.79: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,110:0.74:-0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,219:1.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,16:0.16:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,120:0.52: 2.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,152:0.76: 1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-2.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,88:0.74:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,117:0.59: 1.27:1.000:0.854 0/0/1/1:4:88,72:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,118:0.68: 0.57:1.000:0.954 0/1/1/1:4:43,161:0.80: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,103:0.68: 0.03:1.000:0.957 0/1/1/1:4:44,164:0.79: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,65:0.43: 0.31:1.000:0.948 0/1/1/1:4:35,88:0.73:-0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,108:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,101:0.53: 1.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:104,74:0.46: 0.57:1.000:0.986 0/1/1/1:4:25,110:0.82:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,119:0.84:-0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,86:0.55: 0.33:0.999:0.982 0/0/1/1:4:74,100:0.60: 0.47:1.000:0.769 0/1/1/1:4:40,133:0.78: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,60:0.50:-0.54:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,63:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,89:0.72:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,86:0.60:-0.09:1.000:0.780 0/1/1/1:4:51,197:0.80: 2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,45:0.28: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,121:0.57: 1.63:1.000:0.935 0/0/1/1:4:78,76:0.53: 0.00:1.000:0.992 0/1/1/1:4:41,124:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,183:0.79: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,88:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,103:0.58: 0.80:1.000:0.919 0/1/1/1:4:41,110:0.74:-0.07:1.000:0.999 -chr3.1 52775383 chr3.1_052775383 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,37:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,46:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,57:.: 2.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,54:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.29:1.000:. ./.:6:0,20:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,46:.: 1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-1.90:1.000:. ./.:4:2,37:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,48:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,46:.: 1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.:-0.22:0.988:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,32:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,32:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1,37:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.:-1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,36:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,37:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,48:.: 1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,55:.: 1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,32:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,52:.: 1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr3.1 52963824 chr3.1_052963824 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:160,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:61,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:90,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.41:0.998:. ./.:4:241,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:243,2:.: 1.75:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:124,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:94,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.87:1.000:. ./.:3:64,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:228,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:117,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:256,1:.: 1.98:1.000:. ./.:4:32,1:.:-2.31:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.49:1.000:. ./.:6:84,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:84,4:.:-1.26:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:228,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:99,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:208,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:158,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:156,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.68:0.999:. ./.:4:220,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.31:1.000:. ./.:5:284,1:.: 2.52:0.928:. ./.:4:186,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:132,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.66:0.988:. ./.:4:202,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:143,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:205,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:117,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:133,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:166,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:92,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:84,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:149,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:154,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:163,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:86,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:116,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:210,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:94,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:254,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:264,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:136,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:183,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:92,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:234,2:.: 1.58:0.996:. ./.:4:205,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:272,1:.: 2.29:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.37:1.000:. -chr3.1 53066321 chr3.1_053066321 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.68:0.998:. ./.:4:83,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.51:1.000:. ./.:3:13,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:6:56,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.56:1.000:. ./.:5:124,0:.: 1.71:0.928:. ./.:4:109,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:0.988:. ./.:4:82,0:.: 0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:142,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:76,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:169,0:.: 3.09:0.996:. ./.:4:59,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.92:1.000:. -chr3.1 53205775 chr3.1_053205775 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:45,91:0.66: 0.07:1.000:0.864 0/0/0/1:4:86,20:0.17:-0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,67:0.74:-1.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,96:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:110,38:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,32:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,41:0.47:-1.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:88,30:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,31:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,16:0.13:-0.41:1.000:0.861 0/1/1/1:4:17,47:0.73:-1.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,40:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,34:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,51:0.44:-0.54:1.000:0.970 0/0/0/1:4:97,22:0.17:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.27:0.998:1.000 0/0/1/1:4:87,73:0.44: 0.67:1.000:0.971 0/0/0/1:4:96,38:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,116:0.73: 0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,45:0.41:-0.67:1.000:0.833 0/1/1/1:4:37,84:0.68:-0.31:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,51:0.42:-0.39:1.000:0.903 0/0/0/1:4:35,8:0.17:-2.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,21:0.27:-1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,62:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,26:0.28:-1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,87:0.69:-0.21:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,52:0.53:-0.92:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,48:0.71:-1.68:1.000:0.990 0/0/1/1:4:43,51:0.53:-1.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:46,73:0.60:-0.36:1.000:0.763 0/0/0:3:46,8:0.14:-2.01:1.000:0.750 0/0/0/1:4:87,18:0.16:-0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:55,24:0.28:-1.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,26:0.27:-1.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,28:0.18: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,47:0.63:-1.53:1.000:0.612 0/0/0/1:4:96,37:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,116:0.71: 0.72:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,94:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,123:0.47: 3.10:1.000:0.991 0/1/1/1:4:45,87:0.65:-0.04:1.000:0.785 0/0/0/1:4:144,29:0.15: 1.00:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,70:0.64:-0.67:1.000:0.736 0/0/0/1:4:117,66:0.34: 1.25:1.000:0.851 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,116:0.76: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,112:0.52: 1.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,59:0.68:-1.22:1.000:0.964 0/0/0/1:4:82,26:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,58:0.41: 0.07:1.000:0.873 0/1/1/1:4:60,128:0.67: 1.38:1.000:0.925 0/0/1/1:4:73,64:0.45: 0.09:1.000:0.983 0/0/1/1/1/1:6:42,128:0.74: 0.93:1.000:0.546 0/1/1/1:4:50,175:0.77: 2.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,26:0.29:-1.27:1.000:0.990 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,73:0.38: 1.25:1.000:0.604 0/1/1/1:4:43,113:0.71: 0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,37:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,55:0.43:-0.26:1.000:0.954 0/0/0/1:4:115,39:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,37:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,82:0.74:-0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,110:0.63: 0.98:1.000:0.556 0/0/0/1:4:77,25:0.23:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,39:0.21: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,121:0.81: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,110:0.71: 0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,68:0.52:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,31:0.27:-0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,113:0.64: 1.00:1.000:0.724 0/0/1/1:4:89,82:0.47: 0.95:1.000:0.991 0/1/1/1:4:40,76:0.65:-0.44:1.000:0.746 0/0/0/1:4:120,41:0.23: 0.70:0.999:1.000 0/0/0/0:4:217,1:0.00: 2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,53:0.28: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,26:0.20:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:93,60:0.38: 0.50:0.712:0.960 0/0/0/1:4:93,46:0.31: 0.14:1.000:0.971 0/0/0/1:4:84,32:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,70:0.55:-0.21:1.000:0.981 0/0/1/1:4:65,90:0.57: 0.55:1.000:0.946 0/0/0/1:4:71,30:0.28:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,40:0.21: 0.95:0.999:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,56:0.25: 1.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,21:0.28:-1.60:1.000:0.996 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,38:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,78:0.45: 0.85:1.000:0.983 0/0/0/1:4:121,69:0.35: 1.43:1.000:0.832 0/0/1/1:4:74,76:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,72:0.44: 0.67:1.000:0.960 0/0/1/1:4:65,99:0.59: 0.77:1.000:0.843 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,123:0.49: 2.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,78:0.66:-0.44:1.000:0.885 0/0/1/1:4:46,80:0.62:-0.19:1.000:0.506 0/0/1/1:4:90,92:0.49: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,27:0.19:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,79:0.64:-0.29:1.000:0.659 0/0/0/1:4:104,34:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,94:0.65: 0.24:1.000:0.768 0/0/0/1:4:81,42:0.32:-0.26:1.000:0.947 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 3.45:0.999:1.000 0/1/1/1:4:41,130:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,91:0.68:-0.04:1.000:0.953 0/0/0/1:4:115,70:0.36: 1.30:1.000:0.674 1/1/1/1:4:1,113:0.99:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,36:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,105:0.52: 1.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,73:0.41: 0.98:1.000:0.860 0/0/0/1:4:68,33:0.31:-0.82:1.000:0.977 0/1/1/1:4:53,115:0.67: 0.87:1.000:0.938 0/0/1/1:4:85,55:0.38: 0.17:1.000:0.521 0/0/0/1:4:75,22:0.21:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,48:0.33: 0.14:1.000:0.934 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,100:0.45: 2.04:1.000:0.984 0/0/1/1:4:92,83:0.46: 1.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:110,23:0.16:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,97:0.69: 0.14:1.000:0.971 0/0/0/1:4:94,26:0.20:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,70:0.44: 0.50:1.000:0.973 0/1/1/1:4:25,96:0.79:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,60:0.46:-0.16:1.000:0.987 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,66:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:143,76:0.33: 2.16:1.000:0.927 0/0/1/1:4:107,85:0.43: 1.48:1.000:0.943 0/0/0/1:4:167,44:0.19: 1.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,125:0.69: 1.15:1.000:0.971 0/0/0/1:4:72,36:0.31:-0.64:1.000:0.967 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,44:0.30: 0.07:1.000:0.981 0/0/1/1:4:96,88:0.47: 1.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,102:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,64:0.64:-0.89:1.000:0.723 0/0/1/1:4:82,82:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,44:0.34:-0.29:1.000:0.851 0/1/1/1:4:39,77:0.65:-0.44:1.000:0.825 0/0/0/1:4:57,23:0.27:-1.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,52:0.53:-0.95:1.000:0.992 0/1/1/1:4:31,72:0.69:-0.77:1.000:0.973 0/0/0/1:4:72,31:0.28:-0.77:1.000:0.995 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,81:0.47: 0.90:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,39:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,66:0.48: 0.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,25:0.29:-1.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:20,44:0.68:-1.75:1.000:0.948 0/0/1/1:4:33,52:0.60:-1.22:1.000:0.778 0/0/0/1:4:52,27:0.32:-1.38:1.000:0.946 0/0/0/1:4:47,29:0.36:-1.45:1.000:0.634 0/0/1/1:4:75,55:0.41:-0.09:1.000:0.851 0/0/0/1:4:76,19:0.18:-0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,58:0.46:-0.26:0.996:0.987 0/0/0/1:4:96,27:0.20:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,25:0.22:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,55:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,25:0.37:-1.73:1.000:0.593 0/0/0/1:4:84,31:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,50:0.44:-0.59:1.000:0.968 0/0/0/1:4:61,23:0.25:-1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,60:0.46:-0.14:1.000:0.985 0/0/0/1:4:83,39:0.30:-0.29:1.000:0.985 0/0/0/1:4:62,24:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,43:0.40:-0.77:1.000:0.808 0/0/1/1:4:73,78:0.51: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,36:0.21: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,42:0.31:-0.16:1.000:0.971 0/1/1/1:4:22,60:0.72:-1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,72:0.46: 0.50:1.000:0.986 -chr3.1 53349663 chr3.1_053349663 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:170,53:.: 0.71:1.000:. ./.:4:136,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:173,63:.: 0.97:1.000:. ./.:4:156,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:173,53:.: 0.77:1.000:. ./.:4:212,60:.: 1.70:1.000:. ./.:4:115,27:.:-0.93:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:38,12:.:-2.80:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.57:0.998:. ./.:4:225,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:181,53:.: 0.93:1.000:. ./.:4:38,3:.:-2.98:1.000:. ./.:4:162,38:.: 0.24:1.000:. ./.:4:210,55:.: 1.56:1.000:. ./.:4:158,34:.: 0.08:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:173,54:.: 0.79:1.000:. ./.:4:205,42:.: 1.20:1.000:. ./.:4:163,48:.: 0.47:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:177,47:.: 0.73:1.000:. ./.:4:207,63:.: 1.66:1.000:. ./.:4:166,55:.: 0.67:1.000:. ./.:4:16,7:.:-3.34:1.000:. ./.:4:41,6:.:-2.86:1.000:. ./.:3:22,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:171,45:.: 0.57:1.000:. ./.:4:155,40:.: 0.14:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:163,71:.: 0.93:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:141,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:149,52:.: 0.26:1.000:. ./.:4:127,49:.:-0.24:1.000:. ./.:4:141,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:60,22:.:-2.15:1.000:. ./.:4:121,43:.:-0.49:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:194,55:.: 1.24:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:143,37:.:-0.16:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:160,39:.: 0.22:1.000:. ./.:4:163,37:.: 0.24:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.26:1.000:. ./.:6:112,30:.:-0.93:1.000:. ./.:4:147,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:150,41:.: 0.06:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:165,52:.: 0.59:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:145,33:.:-0.20:1.000:. ./.:4:152,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:196,58:.: 1.34:1.000:. ./.:4:139,30:.:-0.38:1.000:. ./.:4:141,34:.:-0.26:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:156,43:.: 0.22:1.000:. ./.:4:116,28:.:-0.89:0.999:. ./.:4:211,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:175,1:.:-0.24:1.000:. ./.:5:194,0:.: 0.12:0.712:. ./.:4:135,42:.:-0.22:1.000:. ./.:4:106,25:.:-1.15:1.000:. ./.:4:116,34:.:-0.77:1.000:. ./.:4:115,39:.:-0.69:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:163,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:166,57:.: 0.71:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:132,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:151,44:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:144,35:.:-0.18:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:137,48:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:177,42:.: 0.63:1.000:. ./.:4:199,62:.: 1.48:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:299,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.45:0.999:. ./.:4:154,40:.: 0.12:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:108,39:.:-0.83:1.000:. ./.:4:99,25:.:-1.30:1.000:. ./.:4:127,30:.:-0.63:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:133,41:.:-0.28:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:206,45:.: 1.28:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:133,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:130,49:.:-0.18:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:164,36:.: 0.24:1.000:. ./.:4:150,53:.: 0.30:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:118,32:.:-0.77:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:124,35:.:-0.59:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:206,50:.: 1.38:1.000:. ./.:4:149,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:152,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:185,57:.: 1.10:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:180,78:.: 1.42:1.000:. ./.:4:169,55:.: 0.73:1.000:. ./.:4:32,5:.:-3.06:1.000:. ./.:4:181,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:164,40:.: 0.33:1.000:. ./.:4:156,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:239,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:193,57:.: 1.26:1.000:. ./.:4:150,50:.: 0.24:1.000:. ./.:4:137,49:.:-0.04:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:170,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:166,55:.: 0.67:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.55:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:0.996:. ./.:4:219,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:146,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:149,46:.: 0.14:1.000:. ./.:4:138,39:.:-0.22:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:114,44:.:-0.61:1.000:. ./.:4:182,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:238,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:172,45:.: 0.59:1.000:. ./.:4:214,52:.: 1.58:1.000:. ./.:4:192,58:.: 1.26:1.000:. ./.:4:137,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:151,37:.: 0.00:1.000:. -chr3.1 53603314 chr3.1_053603314 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:128,142:.: 1.25:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:100,97:.: 0.01:1.000:. ./.:4:123,116:.: 0.72:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:311,1:.: 1.96:1.000:. ./.:4:151,35:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,52:.: 0.36:1.000:. ./.:4:180,70:.: 0.91:1.000:. ./.:4:57,42:.:-1.66:1.000:. ./.:4:43,17:.:-2.32:1.000:. ./.:4:173,61:.: 0.63:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:188,56:.: 0.80:1.000:. ./.:4:115,104:.: 0.38:1.000:. ./.:4:217,70:.: 1.53:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.63:0.998:. ./.:4:83,187:.: 1.25:1.000:. ./.:4:236,59:.: 1.67:1.000:. ./.:4:146,128:.: 1.31:1.000:. ./.:4:48,1:.:-2.51:1.000:. ./.:4:100,113:.: 0.28:1.000:. ./.:4:124,130:.: 0.97:1.000:. ./.:4:184,48:.: 0.60:1.000:. ./.:4:23,3:.:-2.90:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:196,72:.: 1.21:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:147,136:.: 1.47:1.000:. ./.:4:118,113:.: 0.58:1.000:. ./.:4:163,65:.: 0.53:1.000:. ./.:4:128,52:.:-0.28:1.000:. ./.:4:14,8:.:-2.97:1.000:. ./.:4:34,19:.:-2.44:1.000:. ./.:3:25,7:.:-2.80:1.000:. ./.:4:219,58:.: 1.36:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:225,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:143,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:161,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:102,100:.: 0.09:1.000:. ./.:4:136,101:.: 0.69:1.000:. ./.:4:79,101:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,46:.:-0.20:1.000:. ./.:4:87,87:.:-0.38:1.000:. ./.:4:187,69:.: 1.01:1.000:. ./.:4:38,38:.:-2.05:1.000:. ./.:4:82,87:.:-0.47:1.000:. ./.:4:103,35:.:-1.00:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:144,109:.: 0.96:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:104,85:.:-0.13:1.000:. ./.:4:178,65:.: 0.79:1.000:. ./.:4:137,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:150,61:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,81:.:-0.64:1.000:. ./.:4:95,71:.:-0.52:1.000:. ./.:6:87,64:.:-0.78:1.000:. ./.:4:85,84:.:-0.47:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:57,87:.:-0.89:1.000:. ./.:4:100,105:.: 0.14:1.000:. ./.:4:120,54:.:-0.38:1.000:. ./.:4:57,68:.:-1.22:1.000:. ./.:4:146,45:.:-0.10:1.000:. ./.:4:133,38:.:-0.44:1.000:. ./.:4:97,114:.: 0.24:1.000:. ./.:4:167,53:.: 0.40:1.000:. ./.:4:97,30:.:-1.18:1.000:. ./.:4:139,31:.:-0.45:1.000:. ./.:4:120,122:.: 0.77:1.000:. ./.:4:121,76:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,32:.:-1.30:1.000:. ./.:4:119,40:.:-0.64:1.000:. ./.:4:75,81:.:-0.69:1.000:. ./.:4:82,82:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,45:.:-0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:166,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:143,45:.:-0.15:1.000:. ./.:4:149,41:.:-0.11:1.000:. ./.:5:113,65:.:-0.32:0.712:. ./.:4:210,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:94,42:.:-1.03:1.000:. ./.:4:111,44:.:-0.71:1.000:. ./.:4:157,49:.: 0.16:1.000:. ./.:4:116,43:.:-0.64:0.999:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:134,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:175,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,43:.:-0.55:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,62:.:-1.42:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:169,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:91,75:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,81:.:-0.05:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:135,44:.:-0.30:1.000:. ./.:4:81,64:.:-0.88:1.000:. ./.:4:124,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:74,78:.:-0.76:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:253,75:.: 2.23:1.000:. ./.:4:167,50:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,72:.:-0.71:1.000:. ./.:4:245,79:.: 2.16:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.74:0.999:. ./.:4:81,101:.:-0.25:1.000:. ./.:4:57,46:.:-1.59:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:76,86:.:-0.59:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:87,96:.:-0.23:1.000:. ./.:4:121,40:.:-0.61:1.000:. ./.:4:169,47:.: 0.33:1.000:. ./.:4:87,82:.:-0.47:1.000:. ./.:4:145,43:.:-0.15:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:128,48:.:-0.35:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,83:.:-0.64:1.000:. ./.:4:74,68:.:-0.93:1.000:. ./.:4:92,36:.:-1.17:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:145,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:157,49:.: 0.16:1.000:. ./.:4:65,50:.:-1.39:1.000:. ./.:4:110,91:.: 0.07:1.000:. ./.:4:145,44:.:-0.13:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:121,84:.: 0.14:1.000:. ./.:4:114,50:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,88:.:-0.79:1.000:. ./.:4:111,45:.:-0.69:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:139,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:170,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:238,78:.: 2.03:1.000:. ./.:4:250,64:.: 1.99:1.000:. ./.:4:111,93:.: 0.12:1.000:. ./.:4:112,126:.: 0.70:1.000:. ./.:4:216,54:.: 1.25:1.000:. ./.:4:153,60:.: 0.28:1.000:. ./.:4:222,72:.: 1.65:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:21,12:.:-2.78:1.000:. ./.:4:161,44:.: 0.14:1.000:. ./.:4:184,51:.: 0.65:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:242,68:.: 1.93:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:122,113:.: 0.65:1.000:. ./.:4:253,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:157,38:.:-0.03:1.000:. ./.:4:145,56:.: 0.07:1.000:. ./.:4:166,61:.: 0.52:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:203,49:.: 0.94:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:94,107:.: 0.07:0.996:. ./.:4:200,57:.: 1.02:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:150,46:.:-0.01:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:157,46:.: 0.11:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:126,37:.:-0.57:1.000:. ./.:4:115,50:.:-0.54:1.000:. ./.:4:141,132:.: 1.30:1.000:. ./.:4:199,56:.: 0.99:1.000:. ./.:4:214,53:.: 1.19:1.000:. ./.:4:87,117:.: 0.12:1.000:. ./.:4:210,49:.: 1.06:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:335,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:149,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:179,57:.: 0.67:1.000:. -chr3.1 53722459 chr3.1_053722459 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:268,149:.: 1.29:1.000:. ./.:4:84,189:.:-0.48:1.000:. ./.:4:152,136:.:-0.30:1.000:. ./.:4:177,135:.: 0.00:1.000:. ./.:4:127,244:.: 0.72:1.000:. ./.:4:250,146:.: 1.03:1.000:. ./.:4:113,92:.:-1.32:1.000:. ./.:4:151,206:.: 0.55:1.000:. ./.:4:161,204:.: 0.65:1.000:. ./.:4:46,44:.:-2.74:1.000:. ./.:4:52,14:.:-3.04:1.000:. ./.:4:135,153:.:-0.30:1.000:. ./.:4:126,257:.: 0.87:1.000:. ./.:4:165,120:.:-0.34:1.000:. ./.:4:154,155:.:-0.04:1.000:. ./.:4:180,72:.:-0.74:1.000:. ./.:4:121,171:.:-0.25:0.998:. ./.:4:180,144:.: 0.14:1.000:. ./.:4:246,182:.: 1.43:1.000:. ./.:4:242,148:.: 0.96:1.000:. ./.:4:33,27:.:-3.11:1.000:. ./.:4:237,129:.: 0.66:1.000:. ./.:4:269,115:.: 0.88:1.000:. ./.:4:225,142:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,9:.:-3.22:1.000:. ./.:4:174,160:.: 0.27:1.000:. ./.:4:120,169:.:-0.29:1.000:. ./.:4:157,167:.: 0.14:1.000:. ./.:4:210,140:.: 0.47:1.000:. ./.:4:223,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:237,168:.: 1.14:1.000:. ./.:4:167,160:.: 0.18:1.000:. ./.:4:39,19:.:-3.14:1.000:. ./.:4:86,33:.:-2.39:1.000:. ./.:3:20,10:.:-3.48:1.000:. ./.:4:167,135:.:-0.13:1.000:. ./.:4:161,191:.: 0.49:1.000:. ./.:4:118,218:.: 0.29:1.000:. ./.:4:137,171:.:-0.05:1.000:. ./.:4:234,79:.: 0.01:1.000:. ./.:4:161,92:.:-0.73:1.000:. ./.:4:218,126:.: 0.39:1.000:. ./.:4:220,103:.: 0.13:1.000:. ./.:4:224,153:.: 0.80:1.000:. ./.:4:201,159:.: 0.59:1.000:. ./.:4:175,132:.:-0.07:1.000:. ./.:4:123,207:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,23:.:-2.63:1.000:. ./.:4:170,132:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,118:.:-1.19:1.000:. ./.:4:92,208:.:-0.15:1.000:. ./.:4:293,201:.: 2.24:1.000:. ./.:4:99,167:.:-0.57:1.000:. ./.:4:98,248:.: 0.42:1.000:. ./.:4:198,84:.:-0.37:1.000:. ./.:4:188,143:.: 0.23:1.000:. ./.:4:156,150:.:-0.08:1.000:. ./.:4:233,139:.: 0.74:1.000:. ./.:4:266,155:.: 1.34:1.000:. ./.:6:156,107:.:-0.61:1.000:. ./.:4:204,124:.: 0.19:1.000:. ./.:4:211,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:180,199:.: 0.82:1.000:. ./.:4:141,118:.:-0.66:1.000:. ./.:4:242,157:.: 1.07:1.000:. ./.:4:129,211:.: 0.34:1.000:. ./.:4:107,67:.:-1.71:1.000:. ./.:4:169,231:.: 1.08:1.000:. ./.:4:173,106:.:-0.41:1.000:. ./.:4:220,90:.:-0.03:1.000:. ./.:4:212,95:.:-0.07:1.000:. ./.:4:65,117:.:-1.61:1.000:. ./.:4:163,268:.: 1.46:1.000:. ./.:4:276,138:.: 1.25:1.000:. ./.:4:202,91:.:-0.24:1.000:. ./.:4:193,123:.: 0.05:1.000:. ./.:4:163,78:.:-0.88:1.000:. ./.:4:251,89:.: 0.34:1.000:. ./.:4:183,137:.: 0.09:1.000:. ./.:4:181,94:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,200:.:-0.31:0.999:. ./.:4:123,274:.: 1.04:1.000:. ./.:4:223,228:.: 1.71:1.000:. ./.:4:122,146:.:-0.55:1.000:. ./.:5:250,73:.: 0.13:0.712:. ./.:4:200,231:.: 1.46:1.000:. ./.:4:80,160:.:-0.89:1.000:. ./.:4:167,159:.: 0.17:1.000:. ./.:4:203,86:.:-0.29:1.000:. ./.:4:155,95:.:-0.77:1.000:. ./.:4:72,133:.:-1.32:0.999:. ./.:4:112,176:.:-0.30:1.000:. ./.:4:201,215:.: 1.28:1.000:. ./.:4:135,70:.:-1.32:1.000:. ./.:4:126,252:.: 0.81:1.000:. ./.:4:187,174:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,173:.: 0.27:1.000:. ./.:4:177,130:.:-0.07:1.000:. ./.:4:211,205:.: 1.28:1.000:. ./.:4:168,258:.: 1.40:1.000:. ./.:4:162,93:.:-0.71:1.000:. ./.:4:228,97:.: 0.16:1.000:. ./.:4:100,133:.:-0.98:1.000:. ./.:4:188,236:.: 1.38:1.000:. ./.:4:154,126:.:-0.40:1.000:. ./.:4:152,168:.: 0.09:1.000:. ./.:4:133,191:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,215:.: 0.13:1.000:. ./.:4:196,239:.: 1.51:1.000:. ./.:4:196,276:.: 1.97:1.000:. ./.:4:222,94:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,147:.:-0.48:1.000:. ./.:4:132,245:.: 0.80:0.999:. ./.:4:199,180:.: 0.82:1.000:. ./.:4:211,77:.:-0.30:1.000:. ./.:4:132,148:.:-0.40:1.000:. ./.:4:173,69:.:-0.87:1.000:. ./.:4:180,126:.:-0.08:1.000:. ./.:4:173,209:.: 0.86:1.000:. ./.:4:107,220:.: 0.18:1.000:. ./.:4:140,168:.:-0.05:1.000:. ./.:4:215,71:.:-0.32:1.000:. ./.:4:181,103:.:-0.35:1.000:. ./.:4:111,145:.:-0.69:1.000:. ./.:4:128,120:.:-0.79:1.000:. ./.:4:181,186:.: 0.67:1.000:. ./.:4:187,154:.: 0.35:1.000:. ./.:4:196,76:.:-0.50:1.000:. ./.:4:130,155:.:-0.34:1.000:. ./.:4:91,156:.:-0.81:1.000:. ./.:4:179,84:.:-0.61:1.000:. ./.:4:82,214:.:-0.20:1.000:. ./.:4:92,120:.:-1.24:1.000:. ./.:4:186,138:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,240:.: 0.44:1.000:. ./.:4:239,207:.: 1.65:1.000:. ./.:4:261,157:.: 1.30:1.000:. ./.:4:160,159:.: 0.08:1.000:. ./.:4:216,121:.: 0.30:1.000:. ./.:4:130,223:.: 0.50:1.000:. ./.:4:200,214:.: 1.25:1.000:. ./.:4:249,139:.: 0.93:1.000:. ./.:4:155,144:.:-0.16:1.000:. ./.:4:142,136:.:-0.42:1.000:. ./.:4:224,252:.: 2.02:1.000:. ./.:4:187,179:.: 0.66:1.000:. ./.:4:249,161:.: 1.21:1.000:. ./.:4:220,89:.:-0.04:1.000:. ./.:4:199,260:.: 1.81:1.000:. ./.:4:154,100:.:-0.72:1.000:. ./.:4:257,101:.: 0.56:1.000:. ./.:4:209,132:.: 0.35:1.000:. ./.:4:62,36:.:-2.64:1.000:. ./.:4:102,129:.:-1.00:1.000:. ./.:4:200,148:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,215:.: 0.80:1.000:. ./.:4:182,210:.: 0.98:1.000:. ./.:4:117,216:.: 0.26:1.000:. ./.:4:159,190:.: 0.45:1.000:. ./.:4:149,170:.: 0.08:1.000:. ./.:4:149,127:.:-0.45:1.000:. ./.:4:127,141:.:-0.55:1.000:. ./.:4:146,162:.:-0.05:1.000:. ./.:4:155,120:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,135:.:-0.60:1.000:. ./.:4:100,215:.: 0.03:1.000:. ./.:4:133,124:.:-0.68:1.000:. ./.:4:105,179:.:-0.35:0.996:. ./.:4:140,134:.:-0.47:1.000:. ./.:4:194,112:.:-0.08:1.000:. ./.:4:176,142:.: 0.07:1.000:. ./.:4:82,156:.:-0.92:1.000:. ./.:4:159,213:.: 0.74:1.000:. ./.:4:97,181:.:-0.42:1.000:. ./.:4:129,139:.:-0.55:1.000:. ./.:4:196,84:.:-0.40:1.000:. ./.:4:176,178:.: 0.51:1.000:. ./.:4:109,149:.:-0.67:1.000:. ./.:4:208,84:.:-0.25:1.000:. ./.:4:163,104:.:-0.56:1.000:. ./.:4:93,236:.: 0.21:1.000:. ./.:4:195,218:.: 1.24:1.000:. ./.:4:233,157:.: 0.96:1.000:. ./.:4:192,75:.:-0.56:1.000:. ./.:4:186,178:.: 0.64:1.000:. -chr3.1 53868941 chr3.1_053868941 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:384,221:.: 1.29:1.000:. ./.:4:248,160:.:-0.76:1.000:. ./.:4:216,187:.:-0.81:1.000:. ./.:4:328,179:.: 0.27:1.000:. ./.:4:336,344:.: 2.07:1.000:. ./.:4:262,264:.: 0.47:1.000:. ./.:4:138,140:.:-2.11:1.000:. ./.:4:304,176:.:-0.01:1.000:. ./.:4:199,222:.:-0.62:1.000:. ./.:4:146,122:.:-2.21:1.000:. ./.:4:272,157:.:-0.54:1.000:. ./.:4:285,178:.:-0.19:1.000:. ./.:4:304,163:.:-0.14:1.000:. ./.:4:332,239:.: 0.94:1.000:. ./.:4:222,272:.: 0.14:1.000:. ./.:4:307,164:.:-0.10:1.000:. ./.:4:213,312:.: 0.46:0.998:. ./.:4:253,274:.: 0.48:1.000:. ./.:4:347,327:.: 2.01:1.000:. ./.:4:366,231:.: 1.21:1.000:. ./.:4:335,274:.: 1.33:1.000:. ./.:4:206,211:.:-0.66:1.000:. ./.:4:321,222:.: 0.64:1.000:. ./.:4:218,226:.:-0.38:1.000:. ./.:4:242,99:.:-1.45:1.000:. ./.:4:237,139:.:-1.09:1.000:. ./.:4:251,142:.:-0.91:1.000:. ./.:4:312,213:.: 0.46:1.000:. ./.:4:233,334:.: 0.89:1.000:. ./.:4:188,181:.:-1.16:1.000:. ./.:4:158,176:.:-1.53:1.000:. ./.:4:197,128:.:-1.62:1.000:. ./.:4:130,230:.:-1.26:1.000:. ./.:4:246,126:.:-1.13:1.000:. ./.:3:131,33:.:-3.29:1.000:. ./.:4:234,248:.: 0.01:1.000:. ./.:4:205,274:.:-0.02:1.000:. ./.:4:296,189:.: 0.04:1.000:. ./.:4:175,212:.:-0.98:1.000:. ./.:4:275,150:.:-0.58:1.000:. ./.:4:242,245:.: 0.06:1.000:. ./.:4:251,270:.: 0.42:1.000:. ./.:4:349,207:.: 0.78:1.000:. ./.:4:216,221:.:-0.46:1.000:. ./.:4:307,382:.: 2.16:1.000:. ./.:4:301,234:.: 0.56:1.000:. ./.:4:270,315:.: 1.08:1.000:. ./.:4:94,91:.:-3.07:1.000:. ./.:4:239,154:.:-0.91:1.000:. ./.:4:244,155:.:-0.85:1.000:. ./.:4:300,206:.: 0.26:1.000:. ./.:4:364,240:.: 1.28:1.000:. ./.:4:210,250:.:-0.22:1.000:. ./.:4:259,362:.: 1.45:1.000:. ./.:4:231,267:.: 0.18:1.000:. ./.:4:252,164:.:-0.67:1.000:. ./.:4:246,272:.: 0.39:1.000:. ./.:4:362,220:.: 1.05:1.000:. ./.:4:193,203:.:-0.88:1.000:. ./.:6:217,189:.:-0.78:1.000:. ./.:4:260,320:.: 1.03:1.000:. ./.:4:270,201:.:-0.10:1.000:. ./.:4:270,328:.: 1.22:1.000:. ./.:4:205,256:.:-0.21:1.000:. ./.:4:233,253:.: 0.05:1.000:. ./.:4:279,185:.:-0.18:1.000:. ./.:4:196,215:.:-0.73:1.000:. ./.:4:223,260:.: 0.02:1.000:. ./.:4:322,230:.: 0.74:1.000:. ./.:4:390,141:.: 0.52:1.000:. ./.:4:226,271:.: 0.17:1.000:. ./.:4:197,211:.:-0.76:1.000:. ./.:4:327,194:.: 0.42:1.000:. ./.:4:320,211:.: 0.52:1.000:. ./.:4:313,233:.: 0.68:1.000:. ./.:4:236,148:.:-1.01:1.000:. ./.:4:265,209:.:-0.07:1.000:. ./.:4:240,316:.: 0.78:1.000:. ./.:4:295,210:.: 0.25:1.000:. ./.:4:273,224:.: 0.17:1.000:. ./.:4:167,207:.:-1.11:0.999:. ./.:4:305,249:.: 0.76:1.000:. ./.:4:278,308:.: 1.09:1.000:. ./.:4:218,250:.:-0.13:1.000:. ./.:5:267,222:.: 0.08:0.712:. ./.:4:260,307:.: 0.89:1.000:. ./.:4:150,210:.:-1.26:1.000:. ./.:4:307,215:.: 0.43:1.000:. ./.:4:212,296:.: 0.28:1.000:. ./.:4:206,290:.: 0.16:1.000:. ./.:4:191,215:.:-0.78:0.999:. ./.:4:236,237:.:-0.08:1.000:. ./.:4:307,236:.: 0.64:1.000:. ./.:4:248,148:.:-0.88:1.000:. ./.:4:253,190:.:-0.39:1.000:. ./.:4:224,235:.:-0.23:1.000:. ./.:4:214,323:.: 0.58:1.000:. ./.:4:242,139:.:-1.04:1.000:. ./.:4:340,279:.: 1.43:1.000:. ./.:4:305,227:.: 0.53:1.000:. ./.:4:215,287:.: 0.22:1.000:. ./.:4:268,317:.: 1.08:1.000:. ./.:4:239,169:.:-0.76:1.000:. ./.:4:276,213:.: 0.08:1.000:. ./.:4:230,254:.: 0.03:1.000:. ./.:4:300,210:.: 0.30:1.000:. ./.:4:245,207:.:-0.30:1.000:. ./.:4:206,221:.:-0.56:1.000:. ./.:4:347,402:.: 2.78:1.000:. ./.:4:313,226:.: 0.60:1.000:. ./.:4:237,311:.: 0.70:1.000:. ./.:4:261,259:.: 0.41:1.000:. ./.:4:282,213:.: 0.15:0.999:. ./.:4:227,259:.: 0.05:1.000:. ./.:4:145,206:.:-1.35:1.000:. ./.:4:176,322:.: 0.18:1.000:. ./.:4:216,306:.: 0.43:1.000:. ./.:4:300,183:.: 0.02:1.000:. ./.:4:288,198:.: 0.05:1.000:. ./.:4:228,296:.: 0.45:1.000:. ./.:4:338,225:.: 0.85:1.000:. ./.:4:239,302:.: 0.62:1.000:. ./.:4:279,191:.:-0.11:1.000:. ./.:4:204,193:.:-0.87:1.000:. ./.:4:258,296:.: 0.76:1.000:. ./.:4:267,324:.: 1.14:1.000:. ./.:4:201,275:.:-0.05:1.000:. ./.:4:171,199:.:-1.15:1.000:. ./.:4:238,151:.:-0.95:1.000:. ./.:4:174,240:.:-0.69:1.000:. ./.:4:237,256:.: 0.13:1.000:. ./.:4:258,139:.:-0.87:1.000:. ./.:4:167,144:.:-1.76:1.000:. ./.:4:323,266:.: 1.12:1.000:. ./.:4:305,196:.: 0.21:1.000:. ./.:4:470,286:.: 2.86:1.000:. ./.:4:293,211:.: 0.24:1.000:. ./.:4:231,308:.: 0.60:1.000:. ./.:4:178,221:.:-0.85:1.000:. ./.:4:293,190:.: 0.02:1.000:. ./.:4:251,290:.: 0.62:1.000:. ./.:4:298,347:.: 1.70:1.000:. ./.:4:218,242:.:-0.22:1.000:. ./.:4:234,164:.:-0.86:1.000:. ./.:4:424,267:.: 2.18:1.000:. ./.:4:387,386:.: 3.03:1.000:. ./.:4:324,189:.: 0.33:1.000:. ./.:4:332,204:.: 0.57:1.000:. ./.:4:296,315:.: 1.35:1.000:. ./.:4:201,209:.:-0.74:1.000:. ./.:4:254,265:.: 0.40:1.000:. ./.:4:281,188:.:-0.12:1.000:. ./.:4:236,123:.:-1.27:1.000:. ./.:4:136,161:.:-1.91:1.000:. ./.:4:300,176:.:-0.05:1.000:. ./.:4:320,183:.: 0.23:1.000:. ./.:4:305,353:.: 1.84:1.000:. ./.:4:339,245:.: 1.07:1.000:. ./.:4:177,179:.:-1.30:1.000:. ./.:4:213,274:.: 0.06:1.000:. ./.:4:257,160:.:-0.66:1.000:. ./.:4:239,162:.:-0.83:1.000:. ./.:4:236,169:.:-0.79:1.000:. ./.:4:233,250:.: 0.02:1.000:. ./.:4:231,103:.:-1.53:1.000:. ./.:4:242,253:.: 0.15:1.000:. ./.:4:268,143:.:-0.73:1.000:. ./.:4:398,120:.: 0.39:0.996:. ./.:4:281,201:.: 0.01:1.000:. ./.:4:233,152:.:-1.00:1.000:. ./.:4:206,122:.:-1.59:1.000:. ./.:4:171,186:.:-1.29:1.000:. ./.:4:197,236:.:-0.50:1.000:. ./.:4:266,173:.:-0.44:1.000:. ./.:4:155,219:.:-1.11:1.000:. ./.:4:203,158:.:-1.25:1.000:. ./.:4:238,239:.:-0.04:1.000:. ./.:4:269,298:.: 0.89:1.000:. ./.:4:258,243:.: 0.21:1.000:. ./.:4:226,196:.:-0.61:1.000:. ./.:4:247,259:.: 0.26:1.000:. ./.:4:323,181:.: 0.24:1.000:. ./.:4:353,331:.: 2.11:1.000:. ./.:4:208,201:.:-0.75:1.000:. ./.:4:345,194:.: 0.60:1.000:. -chr3.1 53985956 chr3.1_053985956 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:37,14:0.39: 0.30:1.000:0.715 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,9:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,7:0.16: 0.82:1.000:0.993 0/0/0/1:4:37,13:0.37: 0.26:1.000:0.544 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,13:0.66:-1.08:1.000:0.866 0/0/1/1:4:6,8:0.59:-1.20:1.000:0.891 0/0/0/1:4:23,3:0.16:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,6:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,6:0.12: 1.19:1.000:0.702 0/0/0/1:4:27,7:0.29:-0.39:1.000:0.989 0/0/0/0:4:55,4:0.10: 0.62:1.000:0.863 0/0/1/1:4:30,14:0.45: 0.01:0.998:0.984 0/0/0/1:4:65,6:0.12: 1.11:1.000:0.778 0/0/1/1:4:32,13:0.41: 0.06:1.000:0.880 0/0/1/1:4:23,10:0.43:-0.43:1.000:0.954 0/0/1/1:4:5,3:0.51:-1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,9:0.35:-0.27:1.000:0.814 0/0/0/1:4:32,9:0.31:-0.11:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,5:0.42:-1.08:1.000:0.915 0/0/1/1:4:28,12:0.43:-0.15:1.000:0.943 0/0/0/1:4:26,3:0.15:-0.59:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,13:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,6:0.26:-0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,11:0.60:-1.04:1.000:0.787 0/0/1:3:6,1:0.20:-1.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:50,3:0.08: 0.38:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,8:0.22: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,17:0.27: 1.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:27,8:0.33:-0.35:1.000:0.934 0/0/0/1:4:82,11:0.17: 2.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,9:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,14:0.33: 0.70:1.000:0.929 0/0/0/1:4:41,14:0.36: 0.46:1.000:0.645 0/0/0/1:4:81,18:0.26: 2.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,12:0.32: 0.38:1.000:0.944 0/0/0/1:4:66,7:0.14: 1.19:1.000:0.955 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,19:0.36: 1.31:1.000:0.721 0/0/0/1:4:57,5:0.12: 0.74:1.000:0.643 0/0/0/1:4:35,9:0.29: 0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:45,17:0.39: 0.74:1.000:0.710 0/0/1/1:4:23,9:0.40:-0.47:1.000:0.806 0/0/0/1:4:91,13:0.18: 2.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,12:0.40:-0.03:1.000:0.779 0/0/0/1:4:40,14:0.37: 0.42:1.000:0.558 0/0/0/1:4:73,7:0.12: 1.47:1.000:0.852 0/0/1/1:4:36,14:0.40: 0.26:1.000:0.791 0/0/1/1:4:31,13:0.42: 0.01:1.000:0.922 0/0/0/0/1/1:6:55,13:0.27: 0.99:1.000:0.711 0/0/0/1:4:84,15:0.22: 2.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,12:0.21: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,13:0.37: 0.26:1.000:0.544 0/0/0/0:4:68,5:0.10: 1.19:1.000:0.845 0/0/0/1:4:20,4:0.24:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,4:0.09: 0.74:1.000:0.926 0/0/0/0:4:65,4:0.08: 1.03:1.000:0.982 0/0/0/1:4:75,9:0.15: 1.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,7:0.54:-1.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:35,15:0.43: 0.26:1.000:0.943 0/0/0/1:4:31,11:0.37:-0.07:1.000:0.508 0/0/0/1:4:84,12:0.18: 2.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,13:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:71,8:0.14: 1.43:1.000:0.979 0/0/1/1:4:33,15:0.45: 0.18:1.000:0.976 0/0/0/1:4:81,14:0.21: 2.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,16:0.20: 2.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.40:0.999:1.000 0/0/1/1:4:26,14:0.50:-0.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,9:0.17: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:67,12:0.22: 1.43:0.712:0.988 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,13:0.50:-0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,14:0.41: 0.22:1.000:0.852 0/0/0/1:4:69,8:0.15: 1.35:1.000:0.986 0/0/1/1:4:24,10:0.42:-0.39:0.999:0.915 0/0/0/1:4:36,12:0.36: 0.18:1.000:0.721 0/0/1/1:4:42,22:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,5:0.13: 0.54:1.000:0.856 0/0/1/1:4:35,16:0.45: 0.30:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,9:0.16: 1.39:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,7:0.52:-1.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,18:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,15:0.54:-0.43:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,18:0.52: 0.01:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,8:0.15: 1.35:1.000:0.986 0/0/0/1:4:36,8:0.26: 0.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.35: 0.38:1.000:0.789 0/0/0/1:4:53,5:0.12: 0.58:1.000:0.823 0/0/1/1:4:41,23:0.50: 0.82:0.999:0.997 0/0/0/1:4:65,8:0.16: 1.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:38,7:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,7:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,12:0.41:-0.07:1.000:0.852 0/0/1/1:4:34,13:0.40: 0.14:1.000:0.746 0/0/1/1:4:32,12:0.39: 0.01:1.000:0.687 0/0/1/1:4:41,22:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,13:0.21: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,19:0.47: 0.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:69,10:0.18: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,3:0.09: 0.26:1.000:0.971 0/0/0/1:4:62,11:0.22: 1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,7:0.15: 0.86:1.000:0.992 0/0/0/1:4:52,6:0.15: 0.58:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,13:0.52:-0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:66,10:0.19: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,5:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,12:0.27: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:90,7:0.10: 2.16:1.000:0.725 0/0/0/1:4:43,6:0.17: 0.22:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,12:0.31: 0.46:1.000:0.971 0/0/1/1:4:31,14:0.44: 0.06:1.000:0.974 0/0/1/1:4:38,16:0.42: 0.42:1.000:0.926 0/0/0/1:4:31,9:0.32:-0.15:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,11:0.44:-0.31:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,11:0.15: 2.56:1.000:0.983 0/0/0/1:4:38,10:0.30: 0.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:29,9:0.34:-0.23:1.000:0.879 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,10:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.28: 0.10:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,6:0.22:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,13:0.46:-0.15:1.000:0.990 0/0/0/1:4:41,8:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,8:0.46:-0.75:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,8:0.30:-0.23:1.000:0.984 0/0/0/1:4:31,7:0.26:-0.23:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,13:0.46:-0.15:1.000:0.990 0/0/0/1:4:20,4:0.24:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.52:-0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,9:0.34:-0.23:1.000:0.879 0/0/0/1:4:63,7:0.14: 1.07:0.996:0.975 0/0/0/0:4:68,5:0.10: 1.19:1.000:0.845 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,9:0.44:-0.59:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,4:0.17:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,10:0.45:-0.47:1.000:0.976 0/0/1/1:4:27,12:0.44:-0.19:1.000:0.966 0/0/1/1:4:20,12:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,7:0.16: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,7:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/0:4:52,2:0.05: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,14:0.41: 0.22:1.000:0.852 0/0/0/1:4:36,8:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,6:0.27:-0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,8:0.42:-0.67:1.000:0.926 0/0/0/1:4:37,13:0.37: 0.26:1.000:0.544 -chr3.1 54075311 chr3.1_054075311 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:300,127:0.31: 1.04:1.000:0.973 0/0/1/1:4:118,139:0.55:-0.61:1.000:0.983 0/0/0/1:4:263,81:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:319,99:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:236,212:0.49: 1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:382,134:0.27: 1.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:220,87:0.30:-0.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:183,183:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:216,204:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,41:0.62:-2.49:1.000:0.536 0/0/0/1:4:74,35:0.33:-2.06:1.000:0.902 0/0/0/1:4:271,123:0.33: 0.72:1.000:0.939 0/0/0/1:4:300,91:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:398,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,184:0.47: 0.82:1.000:0.992 0/0/0/1:4:310,106:0.27: 0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:184,153:0.47: 0.17:0.998:0.992 0/0/0/1:4:275,110:0.30: 0.63:1.000:0.987 0/0/1/1:4:284,253:0.49: 2.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:401,135:0.26: 2.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,29:0.55:-2.60:1.000:0.977 0/0/0/1:4:266,89:0.26: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:237,249:0.52: 1.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:264,99:0.29: 0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:34,5:0.13:-2.74:1.000:0.943 0/0/0/1:4:186,75:0.30:-0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:234,234:0.51: 1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:273,87:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:126,328:0.70: 1.31:1.000:0.985 0/0/1/1:4:234,250:0.53: 1.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:248,114:0.33: 0.41:1.000:0.929 0/1/1/1:4:73,260:0.75: 0.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,12:0.19:-2.48:1.000:1.000 0/1/1:3:10,10:0.51:-2.93:1.000:0.701 0/0/0/0:4:348,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,184:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,185:0.52: 0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:291,53:0.16: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:278,92:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:215,76:0.27:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:235,69:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,135:0.53:-0.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:190,59:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:331,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,233:0.70: 0.04:1.000:0.982 0/0/0/1:4:384,118:0.25: 1.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,228:0.57: 0.83:1.000:0.957 0/0/0/1:4:194,62:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,72:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,45:0.18:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:289,99:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:122,131:0.53:-0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:217,144:0.41: 0.40:1.000:0.881 0/0/0/1:4:283,96:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,143:0.46: 0.02:1.000:0.987 0/0/0/0:4:315,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,62:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:192,57:0.24:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:191,42:0.19:-0.85:1.000:0.955 0/0/0/1:4:266,62:0.20: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,61:0.27:-0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:149,137:0.49:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:220,56:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:294,98:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:239,45:0.17:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:197,65:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,133:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:236,73:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:265,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,67:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,95:0.55:-1.42:1.000:0.978 0/0/1/1:4:135,110:0.46:-0.73:1.000:0.990 0/0/0/1:4:260,99:0.29: 0.38:1.000:0.993 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:293,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,65:0.23:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,133:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:244,70:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,78:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,85:0.52:-1.49:0.999:0.995 0/0/0/1:4:252,62:0.21:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,190:0.73:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:271,81:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:254,64:0.21:-0.02:0.712:0.991 0/0/1/1:4:153,135:0.48:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,91:0.46:-1.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:53,157:0.72:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:192,54:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,63:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,126:0.47:-0.45:0.999:0.994 0/0/1/1:4:131,113:0.48:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/0:4:323,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,67:0.28:-0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:236,82:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,173:0.74:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,94:0.47:-1.10:1.000:0.992 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,125:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:187,175:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,64:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:152,125:0.47:-0.42:1.000:0.991 0/0/0/1:4:125,69:0.37:-1.23:1.000:0.575 0/0/1/1:4:135,120:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,148:0.66:-0.97:1.000:0.836 0/1/1/1:4:51,186:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,96:0.37:-0.51:1.000:0.541 0/0/0/1:4:265,79:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,330:0.71: 1.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:146,153:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,106:0.46:-0.82:1.000:0.990 0/0/1/1:4:244,206:0.47: 1.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:234,58:0.21:-0.27:0.999:1.000 0/0/0/1:4:245,67:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,111:0.52:-1.01:1.000:0.994 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,91:0.42:-0.93:1.000:0.908 0/0/0/1:4:203,62:0.25:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,138:0.45:-0.04:1.000:0.981 0/0/1/1:4:144,108:0.44:-0.66:1.000:0.972 0/0/1/1:4:194,144:0.44: 0.18:1.000:0.968 0/0/1/1:4:107,95:0.49:-1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:269,70:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:269,244:0.49: 1.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,141:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,121:0.45:-0.43:1.000:0.983 0/0/0/1:4:250,59:0.20:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:205,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,86:0.47:-1.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:180,41:0.19:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,47:0.18:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,201:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,89:0.40:-0.87:1.000:0.783 0/0/0/1:4:254,103:0.30: 0.36:1.000:0.984 0/0/1/1:4:162,153:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:245,248:0.52: 1.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:286,71:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,40:0.20:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,63:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,101:0.49:-1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,115:0.47:-0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,119:0.57:-1.07:1.000:0.950 0/0/1/1:4:187,165:0.48: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,81:0.45:-1.29:1.000:0.975 0/1/1/1:4:90,327:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:554,0:0.00: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,102:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,163:0.54:-0.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:228,244:0.53: 1.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:258,73:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:360,107:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,116:0.31: 0.67:1.000:0.972 0/0/0/1:4:32,10:0.25:-2.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,336:0.74: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,226:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,185:0.47: 0.87:1.000:0.991 0/0/0/1:4:343,104:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:354,100:0.23: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,206:0.56: 0.51:1.000:0.970 0/0/1/1:4:243,212:0.48: 1.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:258,99:0.29: 0.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:57,211:0.76:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,211:0.72:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:215,191:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:222,225:0.52: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,218:0.53: 1.00:1.000:0.994 0/0/0/0:4:324,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,191:0.47: 0.95:0.996:0.993 0/0/0/0:4:378,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,119:0.30: 0.93:1.000:0.986 0/0/0/1:4:234,77:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,156:0.56:-0.39:1.000:0.966 0/0/1/1:4:175,151:0.48: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:166,173:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:172,56:0.26:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:230,75:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:253,243:0.50: 1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:212,163:0.45: 0.54:1.000:0.979 0/0/0/1:4:293,126:0.31: 0.97:1.000:0.968 0/0/0/1:4:271,118:0.32: 0.67:1.000:0.963 0/0/1/1:4:213,237:0.54: 1.27:1.000:0.990 0/0/0/0:4:487,2:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,147:0.30: 1.89:1.000:0.986 0/0/0/1:4:277,100:0.28: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:289,95:0.26: 0.62:1.000:0.999 -chr3.1 54346561 chr3.1_054346561 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:301,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:180,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.16:0.998:. ./.:4:127,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:333,2:.: 1.35:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:283,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:333,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:38,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:460,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.58:1.000:. ./.:6:222,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:327,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.03:0.999:. ./.:4:210,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.45:1.000:. ./.:5:226,0:.:-0.01:0.712:. ./.:4:314,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:160,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:144,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:396,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:166,1:.:-0.75:0.999:. ./.:4:346,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:222,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:187,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:132,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:179,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:172,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.57:1.000:. -chr3.1 54613403 chr3.1_054613403 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:29,66:0.71: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:44,46:0.54: 0.11:1.000:0.988 0/1/1/1:4:25,89:0.79: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,95:0.76: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,60:0.54: 1.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,102:0.71: 1.97:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,37:0.74:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,66:0.60: 0.89:1.000:0.764 0/0/1/1:4:83,47:0.40: 1.41:1.000:0.752 0/1/1/1:4:3,6:0.69:-2.53:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,65:0.70: 0.27:1.000:0.987 0/0/0/1:4:71,36:0.37: 0.66:1.000:0.544 0/0/1/1:4:56,45:0.48: 0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,45:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,83:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,56:0.47: 1.38:0.998:0.991 0/0/1/1:4:53,39:0.46: 0.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:70,48:0.44: 1.02:1.000:0.966 0/1/1/1:4:39,103:0.74: 1.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,6:0.53:-2.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,63:0.65: 0.47:1.000:0.744 1/1/1/1:4:0,92:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,73:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.86:-2.60:1.000:0.946 0/1/1/1:4:31,73:0.72: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,70:0.55: 1.54:1.000:0.980 0/1/1/1:4:32,88:0.75: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,69:0.72: 0.37:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 2.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,87:0.72: 1.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,91:0.81: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-2.50:1.000:0.954 0/1/1/1:4:7,18:0.74:-2.01:1.000:0.998 0/0/0:3:2,0:0.05:-2.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,57:0.47: 1.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,45:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,57:0.54: 0.79:1.000:0.987 0/0/0/1:4:66,21:0.28: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,79:0.79: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,64:0.79:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,57:0.77:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,57:0.74:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,34:0.45:-0.15:1.000:0.977 0/1/1/1:4:23,62:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,20:0.24: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-2.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,55:0.83:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,9:0.31:-1.75:1.000:0.974 0/0/0/1:4:44,15:0.29:-0.90:1.000:0.991 0/1/1/1:4:23,78:0.78: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,27:0.54:-1.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,41:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,73:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,31:0.47:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,32:0.45:-0.31:1.000:0.978 0/1/1/1:4:13,50:0.80:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,60:0.81:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:11,48:0.82:-0.90:1.000:0.977 0/1/1/1:4:29,60:0.69: 0.08:1.000:0.977 0/1/1/1:4:21,56:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,46:0.57:-0.05:1.000:0.953 0/1/1/1:4:19,36:0.67:-1.03:1.000:0.936 0/1/1/1:4:37,71:0.68: 0.70:1.000:0.944 0/0/0/1:4:57,11:0.20:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,43:0.74:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,47:0.46: 0.76:1.000:0.987 0/1/1/1:4:18,46:0.73:-0.74:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,69:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.59:-2.30:1.000:0.878 0/0/1/1:4:40,31:0.47:-0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,65:0.75: 0.04:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,30:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,45:0.67:-0.57:1.000:0.928 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,80:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,64:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,34:0.57:-0.77:0.999:0.956 0/0/0/1:4:58,20:0.29:-0.28:1.000:0.990 0/1/1/1:4:16,70:0.82:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,22:0.30:-0.12:1.000:0.983 0/1/1/1/1:5:17,64:0.80:-0.18:0.712:0.996 0/0/1/1:4:47,47:0.53: 0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,36:0.56:-0.61:1.000:0.972 0/1/1/1:4:15,41:0.75:-1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,42:0.74:-0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,72:0.80: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,33:0.50:-0.54:0.999:0.997 0/0/1/1:4:44,39:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,57:0.49: 1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,51:0.76:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,22:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,62:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,25:0.46:-0.90:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,40:0.55:-0.31:1.000:0.982 0/0/1/1:4:48,56:0.57: 0.57:1.000:0.958 0/1/1/1:4:12,31:0.74:-1.42:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,34:0.48:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,36:0.47:-0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:19,38:0.69:-0.97:1.000:0.965 0/1/1/1:4:22,75:0.79: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,24:0.45:-0.93:1.000:0.976 0/0/0/1:4:95,36:0.31: 1.45:1.000:0.971 0/1/1/1:4:28,66:0.72: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,45:0.49: 0.40:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,67:0.46: 2.23:1.000:0.990 0/0/0/1:4:77,23:0.27: 0.44:0.999:0.998 0/1/1/1:4:23,55:0.72:-0.28:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,24:0.39:-0.64:1.000:0.719 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,49:0.79:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,39:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,25:0.46:-0.90:1.000:0.985 0/0/0/1:4:75,23:0.27: 0.37:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,58:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,58:0.53: 0.92:1.000:0.991 0/0/1/1:4:25,36:0.61:-0.84:1.000:0.651 0/1/1/1:4:29,48:0.64:-0.31:1.000:0.740 0/1/1/1:4:21,55:0.74:-0.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,29:0.52:-0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,12:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,56:0.72:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,66:0.51: 1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,21:0.57:-1.55:1.000:0.958 0/1/1/1:4:14,51:0.80:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,46:0.57:-0.05:1.000:0.953 0/0/1/1:4:61,52:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,69:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,63:0.72: 0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,53:0.77:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,39:0.53:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,37:0.54:-0.44:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,48:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,29:0.55:-1.00:1.000:0.984 0/1/1/1:4:28,85:0.77: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,50:0.52: 0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,101:0.79: 1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,54:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,60:0.72:-0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,112:0.76: 2.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,97:0.75: 1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,5:0.84:-2.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,74:0.81: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,41:0.44: 0.47:1.000:0.965 0/0/1/1:4:43,54:0.58: 0.34:1.000:0.905 0/1/1/1:4:32,91:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,27:0.30: 0.53:1.000:0.986 0/0/1/1:4:51,59:0.56: 0.76:1.000:0.962 0/0/1/1:4:61,45:0.46: 0.63:1.000:0.986 0/1/1/1:4:33,71:0.70: 0.57:1.000:0.985 0/1/1/1:4:17,66:0.81:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,86:0.77: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,54:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,47:0.53: 0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,45:0.59:-0.22:1.000:0.878 0/0/1/1:4:70,51:0.45: 1.12:1.000:0.983 0/0/1/1:4:37,38:0.54:-0.38:0.996:0.990 0/0/1/1:4:65,53:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,92:0.81: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,75:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,46:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:56,47:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,40:0.46: 0.24:1.000:0.986 0/1/1/1:4:26,66:0.73: 0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,71:0.72: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,71:0.53: 1.77:1.000:0.991 0/0/1/1:4:53,54:0.53: 0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,82:0.73: 0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,81:0.71: 0.99:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,56:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,63:0.48: 1.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,96:0.74: 1.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,63:0.73: 0.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,88:0.82: 0.73:1.000:0.999 -chr3.1 54989876 chr3.1_054989876 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:154,50:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,139:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:220,58:0.22: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,136:0.47: 2.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,93:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,143:0.64: 0.43:1.000:0.638 0/1/1/1:4:57,168:0.71: 0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:80,17:0.18:-2.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,39:0.29:-1.52:1.000:0.992 0/1/1/1:4:48,144:0.72:-0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,85:0.45:-0.26:1.000:0.979 0/0/1/1:4:123,97:0.44: 0.50:1.000:0.968 0/0/0/1:4:166,50:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,41:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,124:0.51: 1.02:0.998:0.996 0/0/1/1:4:113,124:0.52: 0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,127:0.48: 1.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:200,74:0.28: 1.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,29:0.21:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,47:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:238,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,100:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,36:0.43:-2.87:1.000:0.956 0/0/0/1:4:198,57:0.23: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,108:0.47: 0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,90:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:199,62:0.25: 1.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:238,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,112:0.55: 0.03:1.000:0.982 0/0/0/1:4:159,43:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,26:0.26:-2.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,27:0.23:-1.96:1.000:1.000 0/0/0:3:101,9:0.08:-2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,105:0.48: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,101:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,56:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,104:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,45:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,47:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,58:0.29: 0.06:1.000:0.990 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,41:0.24:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,43:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,44:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,143:0.56: 1.24:1.000:0.967 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,84:0.50:-0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,120:0.69:-0.83:1.000:0.976 0/0/0/1:4:192,62:0.25: 1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,88:0.45:-0.09:1.000:0.978 0/0/0/1:4:160,47:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,43:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,136:0.59: 0.65:1.000:0.886 0/0/0/1:4:143,45:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,47:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,78:0.46:-0.71:1.000:0.984 0/0/0/0/0/0:6:170,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,92:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,154:0.69: 0.30:1.000:0.980 0/0/0/1:4:132,53:0.29:-0.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:158,46:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,101:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,79:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,125:0.68:-0.56:1.000:0.945 0/0/0/1:4:155,53:0.26: 0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,37:0.21:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:245,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,109:0.57:-0.31:1.000:0.948 0/1/1/1:4:51,151:0.71: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:181,49:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,34:0.21:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,83:0.48:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:145,44:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,56:0.31:-0.39:1.000:0.973 0/0/0/1:4:144,68:0.33: 0.30:1.000:0.936 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,110:0.70:-1.25:0.999:0.989 0/1/1/1:4:48,186:0.75: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,106:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,159:0.69: 0.55:1.000:0.966 0/0/0/1/1:5:133,100:0.43: 0.82:0.712:0.941 0/0/1/1:4:126,126:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:133,46:0.27:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:139,34:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,35:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,49:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:89,80:0.47:-0.75:0.999:0.993 0/0/1/1:4:108,93:0.46: 0.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:127,110:0.46: 0.92:1.000:0.989 0/0/0/1:4:114,42:0.28:-1.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,154:0.70: 0.25:1.000:0.986 0/0/1/1:4:93,97:0.51:-0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,143:0.72:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,50:0.30:-0.75:1.000:0.983 0/0/1/1:4:152,103:0.41: 1.36:1.000:0.834 0/0/1/1:4:100,116:0.53: 0.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:112,75:0.40:-0.31:1.000:0.814 0/0/0/1:4:155,57:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,56:0.47:-2.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,124:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,45:0.27:-0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,48:0.26:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:141,40:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,101:0.55:-0.51:1.000:0.976 0/0/0/1:4:218,74:0.26: 2.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,149:0.79:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,33:0.18:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,70:0.27: 1.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,149:0.69: 0.18:0.999:0.972 0/0/0/0:4:247,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,39:0.31:-1.79:1.000:0.968 0/0/0/1:4:108,58:0.35:-0.83:1.000:0.760 0/0/0/0:4:228,3:0.01: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,38:0.26:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,86:0.52:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:132,50:0.28:-0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,96:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:137,32:0.20:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,48:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,73:0.31: 1.04:1.000:0.977 0/0/0/1:4:133,49:0.28:-0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,176:0.73: 0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:153,57:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,73:0.51:-1.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,114:0.73:-1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,77:0.56:-1.59:1.000:0.969 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,94:0.46: 0.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:102,35:0.26:-1.54:1.000:0.998 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,41:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,231:0.76: 2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,93:0.46: 0.03:1.000:0.988 0/0/0/1:4:132,40:0.24:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,92:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,92:0.53:-0.73:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,143:0.71:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:104,35:0.26:-1.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,72:0.42:-0.71:1.000:0.921 0/1/1/1:4:33,97:0.71:-1.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:140,123:0.47: 1.56:1.000:0.991 0/0/0/1:4:222,69:0.25: 2.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,45:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,112:0.47: 0.99:1.000:0.990 0/0/0/1:4:144,43:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,119:0.46: 1.43:1.000:0.988 0/0/1/1:4:103,108:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,64:0.57:-2.23:1.000:0.937 0/0/0/1:4:125,38:0.24:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,101:0.42: 0.94:1.000:0.932 0/0/1/1:4:137,118:0.46: 1.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:232,66:0.23: 2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,131:0.46: 2.10:1.000:0.987 0/1/1/1:4:49,123:0.68:-0.68:1.000:0.964 0/0/1/1:4:116,108:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:183,58:0.25: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,56:0.32:-0.56:1.000:0.948 0/0/0/1:4:145,39:0.22:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,112:0.52: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,55:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:147,58:0.29: 0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,78:0.47:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:108,101:0.48: 0.23:0.996:0.995 0/0/1/1:4:114,98:0.46: 0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:107,102:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,81:0.48:-0.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:137,60:0.31:-0.07:1.000:0.972 0/1/1/1:4:50,131:0.69:-0.46:1.000:0.977 0/0/1/1:4:79,89:0.52:-0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,39:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,90:0.55:-0.95:1.000:0.981 0/0/1/1:4:114,133:0.53: 1.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:187,60:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,115:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:152,61:0.29: 0.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:184,52:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,124:0.43: 2.17:1.000:0.949 0/0/0/1:4:212,76:0.27: 2.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:188,45:0.20: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,118:0.53: 0.50:1.000:0.993 -chr3.1 55321736 chr3.1_055321736 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:107,134:0.55: 0.39:1.000:0.976 0/1/1/1:4:60,186:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,67:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,68:0.29: 0.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:164,63:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,181:0.55: 1.72:1.000:0.979 0/0/1/1:4:50,80:0.61:-1.32:1.000:0.660 0/1/1/1:4:60,182:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,211:0.79: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,23:0.51:-2.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,16:0.48:-2.81:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,266:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,182:0.71: 0.64:1.000:0.989 0/1/1/1:4:60,184:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,129:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:142,161:0.53: 1.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:162,150:0.48: 1.48:0.998:0.994 0/1/1/1:4:59,194:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,236:0.76: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,154:0.49: 1.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,7:0.15:-2.58:1.000:0.980 0/0/1/1:4:115,133:0.53: 0.50:1.000:0.991 0/0/0/1:4:211,60:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,118:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-2.92:1.000:0.660 0/0/0/1:4:224,80:0.26: 1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,142:0.55: 0.67:1.000:0.984 0/0/1/1:4:107,127:0.54: 0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:143,149:0.51: 1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:231,93:0.29: 1.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:139,152:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:183,51:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,7:0.28:-2.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,29:0.51:-2.44:1.000:0.997 0/1/1:3:7,12:0.63:-3.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,171:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,122:0.47: 0.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:203,71:0.26: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,190:0.74: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,157:0.48: 1.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,131:0.55: 0.30:1.000:0.975 0/0/1/1:4:103,116:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/0/0/1:4:149,65:0.30:-0.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:79,100:0.56:-0.56:1.000:0.973 0/0/1/1:4:101,109:0.52:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,132:0.56: 0.27:1.000:0.961 0/1/1/1:4:73,218:0.75: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,28:0.27:-1.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,54:0.28:-0.41:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,107:0.71:-0.99:1.000:0.990 0/1/1/1:4:39,95:0.71:-1.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:114,111:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,81:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,124:0.59:-0.09:1.000:0.877 0/0/1/1:4:113,114:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,163:0.73: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,102:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,88:0.47:-0.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,167:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:104,36:0.26:-1.16:1.000:0.548 0/0/0/1:4:130,53:0.29:-0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:93,104:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:61,174:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,145:0.60: 0.39:1.000:0.800 0/0/1/1:4:115,112:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,159:0.74:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,120:0.77:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,151:0.81:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,117:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,106:0.52:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:171,61:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,77:0.51:-1.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,233:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,118:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,145:0.82:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,133:0.73:-0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,95:0.57:-0.75:1.000:0.956 0/0/1/1:4:88,84:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,112:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:169,65:0.28: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,128:0.73:-0.62:0.999:0.997 0/1/1/1:4:51,151:0.75:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,125:0.51: 0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,154:0.72:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:49,221:0.82: 0.84:0.712:0.998 0/0/1/1:4:110,103:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:115,33:0.22:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,56:0.33:-0.72:1.000:0.921 0/0/1/1:4:83,83:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,102:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,95:0.57:-0.76:0.999:0.948 0/0/1/1:4:97,101:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,131:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,81:0.53:-0.96:1.000:0.993 0/1/1/1:4:64,158:0.71: 0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:116,121:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,90:0.71:-1.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,160:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,96:0.45:-0.04:1.000:0.978 0/0/1/1:4:139,105:0.43: 0.44:1.000:0.941 0/1/1/1:4:31,92:0.75:-1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,101:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,59:0.46:-1.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:81,86:0.51:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,71:0.45:-0.90:1.000:0.980 0/0/0/1:4:117,61:0.34:-0.58:1.000:0.861 0/0/1/1:4:80,102:0.56:-0.52:1.000:0.971 0/0/1/1:4:137,145:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:219,67:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,153:0.72:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,91:0.54:-0.75:1.000:0.986 0/0/1/1:4:183,174:0.48: 2.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,135:0.76:-0.59:0.999:1.000 0/0/0/1:4:170,62:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,70:0.50:-1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,56:0.39:-1.10:1.000:0.656 0/0/0/1:4:134,40:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,35:0.24:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,154:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,49:0.28:-0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,139:0.73:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,78:0.46:-0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:124,134:0.52: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,123:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,72:0.45:-0.86:1.000:0.977 0/1/1/1:4:41,145:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,98:0.51:-0.39:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,97:0.79:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,80:0.57:-1.18:1.000:0.939 0/0/0/1:4:114,54:0.32:-0.73:1.000:0.953 0/0/1/1:4:129,139:0.52: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,60:0.46:-1.30:1.000:0.985 0/0/0/1:4:111,53:0.32:-0.79:1.000:0.949 0/0/0/1:4:167,53:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,224:0.78: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,192:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,51:0.31:-0.76:1.000:0.979 0/1/1/1:4:45,142:0.76:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,79:0.53:-1.04:1.000:0.992 0/1/1/1:4:50,158:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,93:0.57:-0.84:1.000:0.933 0/1/1/1:4:73,187:0.72: 0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,90:0.75:-1.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,135:0.47: 1.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:128,122:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,136:0.48: 1.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:154,73:0.32: 0.18:1.000:0.953 0/0/1/1:4:120,130:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,96:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,240:0.78: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,166:0.56: 1.25:1.000:0.973 0/0/0/1:4:22,8:0.27:-2.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:120,32:0.21:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,208:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,126:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:224,91:0.29: 1.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,131:0.47: 0.98:1.000:0.991 0/1/1/1:4:45,199:0.81: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,211:0.75: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,61:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,46:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,71:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/1/1/1:4:61,187:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,64:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,65:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,153:0.56: 0.90:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,282:1.00: 1.02:0.996:1.000 0/1/1/1:4:53,209:0.80: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,123:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,110:0.53:-0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:159,59:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,162:0.73: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:114,111:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,55:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,181:0.72: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,290:0.78: 2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,154:0.55: 0.95:1.000:0.977 0/1/1/1:4:71,226:0.76: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,185:0.64: 1.10:1.000:0.712 0/0/0/1:4:206,67:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,255:0.77: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,95:0.30: 1.55:1.000:0.986 0/0/1/1:4:110,126:0.53: 0.31:1.000:0.992 0/1/1/1:4:59,155:0.72:-0.02:1.000:0.996 -chr3.1 55361915 chr3.1_055361915 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.93:0.998:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:163,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:211,1:.: 2.08:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.63:1.000:. ./.:3:8,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.08:1.000:. ./.:6:105,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.20:0.999:. ./.:4:83,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:94,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:213,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.57:0.999:. ./.:4:157,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:251,0:.: 2.85:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:277,0:.: 3.36:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.16:0.996:. ./.:4:56,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:151,1:.: 0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:182,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:112,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:163,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.19:1.000:. -chr3.1 55879521 chr3.1_055879521 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:7,1:0.09:-0.99:1.000:0.930 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.40: 0.97:1.000:0.820 0/0/0/1:4:13,4:0.17: 0.48:1.000:0.998 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.75:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.40:-1.98:1.000:0.820 0/0/0/1:4:14,4:0.16: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,8:0.44: 0.15:1.000:0.960 0/0/0/1:4:13,7:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,15:0.44: 2.28:1.000:0.964 0/0/1/1:4:9,9:0.40: 0.65:1.000:0.820 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 1.14:0.998:1.000 0/1/1/1:4:5,19:0.66: 1.63:1.000:0.885 0/0/0/1:4:14,6:0.22: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,5:0.29:-0.17:1.000:0.990 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.18:-1.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.40:-0.01:1.000:0.820 0/0/0/1:4:13,4:0.17: 0.48:1.000:0.998 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.18:-0.99:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:13,10:0.34: 1.46:1.000:0.864 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,8:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,4:0.15: 0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,7:0.40:-0.01:1.000:0.820 0/0/0/1:4:14,4:0.16: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,5:0.29:-0.17:1.000:0.990 0/0/0/1:4:12,9:0.33: 1.14:1.000:0.899 0/0/1/1:4:9,12:0.47: 1.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:9,4:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.67:-1.48:1.000:0.919 0/0/0/1:4:7,4:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.40:-1.32:1.000:0.820 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.48: 1.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,13:0.30: 3.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:10,8:0.35: 0.65:1.000:0.791 0/0/0/1:4:10,3:0.17:-0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:15,5:0.18: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,9:0.43: 0.48:1.000:0.951 0/0/0/1:4:9,5:0.27:-0.01:1.000:0.998 0/0/0/1/1/1:6:6,7:0.44:-0.17:1.000:0.683 0/0/1/1:4:6,6:0.40:-0.34:1.000:0.820 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.43: 0.81:1.000:0.944 0/0/0/1:4:14,5:0.19: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,8:0.56:-0.34:1.000:0.972 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,11:0.22: 3.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,9:0.32: 1.30:1.000:0.963 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,5:0.27:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,9:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,16:0.51: 1.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,12:0.47: 1.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:15,8:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,8:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,4:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.17:0.999:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:5,12:0.59: 0.48:0.712:0.966 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,9:0.30: 1.46:1.000:0.986 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.48:0.999:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.15: 0.15:1.000:0.983 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,17:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.16:-0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,19:0.57: 2.28:1.000:0.955 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,5:0.36:-0.50:1.000:0.690 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.46:-0.83:1.000:0.986 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,15:0.60: 1.14:1.000:0.816 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.01:0.999:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.20:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,5:0.27:-0.01:1.000:0.998 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.15: 0.15:1.000:0.983 0/0/1/1:4:8,8:0.40: 0.32:1.000:0.820 0/0/1/1:4:7,13:0.54: 0.97:1.000:0.986 0/0/1/1:4:4,7:0.53:-0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:6,8:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.44: 0.15:1.000:0.960 0/0/1/1:4:6,8:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,4:0.16: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.28: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:6,2:0.18:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.24:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,6:0.37:-0.17:1.000:0.608 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.38: 0.48:1.000:0.507 0/0/0/1:4:13,6:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,4:0.35:-0.83:1.000:0.791 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,8:0.33: 0.81:1.000:0.930 0/0/0/1:4:9,2:0.13:-0.50:1.000:0.936 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,12:0.33: 2.28:1.000:0.899 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.24: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.21:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,13:0.57: 0.81:0.996:0.943 0/0/0/1:4:7,5:0.32:-0.34:1.000:0.944 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,4:0.31:-0.67:1.000:0.977 0/0/0/1:4:15,13:0.37: 2.28:1.000:0.573 0/0/0/1:4:9,2:0.13:-0.50:1.000:0.936 0/0/0/1:4:10,7:0.32: 0.48:1.000:0.957 0/0/0/1:4:10,4:0.21:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.38: 0.48:1.000:0.507 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,6:0.33:-0.01:1.000:0.899 -chr3.1 56033516 chr3.1_056033516 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,75:.: 1.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,48:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,50:.: 0.04:0.998:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.:-2.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,59:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,13:.:-2.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,5:.:-2.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,64:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,57:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,38:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,56:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,95:.: 2.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,92:.: 2.60:0.999:. ./.:4:0,62:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.:-1.49:0.999:. ./.:4:0,44:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,72:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,54:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,54:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,67:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.45:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,72:.: 1.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,51:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,51:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,55:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,123:.: 4.49:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,68:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.:-0.20:1.000:. -chr3.1 56270557 chr3.1_056270557 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:86,33:0.32:-0.51:1.000:0.955 0/1/1/1:4:20,65:0.73:-0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,166:0.65: 1.16:1.000:0.752 0/1/1/1:4:73,175:0.68: 1.11:1.000:0.957 0/0/1/1:4:52,70:0.58:-0.48:1.000:0.909 0/1/1/1:4:74,271:0.74: 2.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,27:0.35:-0.90:1.000:0.814 0/0/1/1:4:72,60:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,202:0.78: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.55:-1.85:1.000:0.975 0/1/1/1:4:10,39:0.75:-1.40:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,244:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,217:0.76: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,224:0.74: 1.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,187:0.71: 1.16:1.000:0.991 0/1/1/1:4:34,253:0.85: 1.61:1.000:0.980 0/1/1/1:4:26,210:0.87: 0.96:0.998:0.945 1/1/1/1:4:0,282:1.00: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,296:0.87: 2.15:1.000:0.867 0/0/0/1:4:114,39:0.30:-0.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:12,64:0.81:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,22:0.27:-0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,185:0.75: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,35:0.35:-0.59:1.000:0.790 0/1/1/1:4:5,23:0.78:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,39:0.45:-0.83:1.000:0.980 0/0/1/1:4:54,57:0.54:-0.61:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,56:0.54:-0.66:1.000:0.986 0/1/1/1:4:24,215:0.88: 1.00:1.000:0.819 0/1/1/1:4:56,204:0.74: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,20:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,180:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,29:0.82:-1.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,39:0.69:-1.33:1.000:0.979 0/1/1:3:4,13:0.73:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,51:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,45:0.53:-0.90:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,55:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,137:0.71: 0.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,37:0.51:-1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,160:0.86: 0.26:1.000:0.951 0/1/1/1:4:69,144:0.66: 0.67:1.000:0.862 0/1/1/1:4:39,172:0.77: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,112:0.64: 0.14:1.000:0.722 0/0/0/1:4:79,21:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,164:0.86: 0.33:1.000:0.980 0/1/1/1:4:52,214:0.76: 1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,103:0.94:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,20:0.28:-0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,132:0.71: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,25:0.52:-1.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:82,197:0.68: 1.50:1.000:0.958 0/1/1/1:4:21,200:0.88: 0.77:1.000:0.673 0/0/1/1:4:31,51:0.62:-0.98:1.000:0.597 0/0/1/1:4:49,57:0.55:-0.68:1.000:0.976 0/1/1/1:4:20,181:0.88: 0.52:1.000:0.798 0/1/1/1:4:70,158:0.67: 0.86:1.000:0.928 0/0/0/1:4:74,18:0.24:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,35:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:34,45:0.58:-1.02:1.000:0.536 0/0/0/1:4:50,11:0.23:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,188:0.74: 1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,57:0.69:-1.02:1.000:0.978 0/1/1/1:4:28,119:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,149:0.69: 0.61:1.000:0.973 0/1/1/1:4:53,173:0.73: 0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,103:0.73:-0.32:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,147:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,46:0.66:-1.16:1.000:0.864 0/0/1/1:4:41,47:0.55:-0.90:1.000:0.979 0/1/1/1:4:49,163:0.73: 0.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:34,143:0.76: 0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,33:0.32:-0.54:1.000:0.943 1/1/1/1:4:22,267:0.91: 1.63:1.000:0.915 0/0/1/1:4:34,27:0.48:-1.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,152:0.83: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,151:0.86: 0.13:1.000:0.955 0/1/1/1:4:43,188:0.77: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,53:0.55:-0.77:1.000:0.978 1/1/1/1:4:12,201:0.93: 0.67:0.999:0.998 0/0/1/1:4:34,29:0.49:-1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,69:0.72:-0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,164:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:37,141:0.75: 0.23:0.712:0.917 0/1/1/1:4:54,182:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,128:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,135:0.83:-0.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,118:0.72:-0.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,79:0.73:-0.73:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,146:0.74: 0.36:0.999:0.998 0/1/1/1:4:20,169:0.87: 0.37:1.000:0.905 0/0/0/1:4:53,13:0.24:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,160:0.83: 0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,150:0.79: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,53:0.65:-1.01:1.000:0.780 0/1/1/1:4:15,38:0.69:-1.35:1.000:0.974 0/1/1/1:4:14,40:0.71:-1.33:1.000:0.991 0/1/1/1:4:34,153:0.78: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,27:0.29:-0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:33,38:0.55:-1.12:1.000:0.978 0/1/1/1:4:20,183:0.88: 0.55:1.000:0.775 1/1/1/1:4:7,96:0.92:-0.72:1.000:0.981 0/0/0/1:4:44,14:0.29:-1.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,36:0.73:-1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,172:0.79: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,127:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,160:0.67: 0.89:1.000:0.935 0/1/1/1:4:82,271:0.73: 2.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,177:0.74: 0.84:1.000:0.999 1/1/1/1:4:12,134:0.90:-0.17:1.000:0.788 0/1/1/1:4:34,116:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,144:0.75: 0.27:0.999:0.999 0/1/1/1:4:55,117:0.66: 0.16:1.000:0.882 0/1/1/1:4:16,118:0.85:-0.32:1.000:0.982 0/1/1/1:4:60,116:0.65: 0.21:1.000:0.755 0/0/1/1:4:29,23:0.48:-1.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,93:0.66:-0.30:1.000:0.897 0/1/1/1:4:28,141:0.80: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,18:0.35:-1.27:1.000:0.828 0/1/1/1:4:42,172:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,49:0.73:-1.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,58:0.75:-1.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:22,232:0.89: 1.19:1.000:0.641 0/1/1/1:4:11,44:0.76:-1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:10,175:0.93: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,31:0.50:-1.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,162:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,85:0.71:-0.56:1.000:0.990 1/1/1/1:4:10,125:0.91:-0.31:1.000:0.940 0/1/1/1:4:30,129:0.77:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,219:0.86: 1.10:1.000:0.963 0/0/1/1:4:22,22:0.53:-1.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,21:0.32:-1.07:1.000:0.948 0/0/0/1:4:83,20:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,328:0.86: 2.68:1.000:0.980 0/1/1/1:4:36,176:0.79: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,93:0.67:-0.31:1.000:0.915 0/1/1/1:4:34,106:0.72:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,132:0.80:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,45:0.70:-1.23:1.000:0.982 0/1/1/1:4:14,124:0.88:-0.27:1.000:0.839 0/1/1/1:4:33,62:0.64:-0.82:1.000:0.702 1/1/1/1:4:9,99:0.90:-0.65:1.000:0.754 0/1/1/1:4:34,294:0.87: 2.12:1.000:0.877 0/0/0/1:4:99,28:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,164:0.62: 1.33:1.000:0.627 0/1/1/1:4:54,211:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,33:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,62:0.73:-0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,297:0.89: 2.11:1.000:0.557 0/1/1/1:4:56,217:0.75: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,4:0.31:-1.83:1.000:0.975 0/0/1/1:4:53,49:0.51:-0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,210:0.87: 0.96:1.000:0.945 0/1/1/1:4:25,94:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,37:0.33:-0.37:1.000:0.935 0/0/0/1:4:105,37:0.30:-0.22:1.000:0.982 0/1/1/1:4:25,195:0.86: 0.76:1.000:0.964 0/0/1/1:4:71,62:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,204:0.70: 1.50:1.000:0.986 0/0/1/1:4:63,47:0.46:-0.63:1.000:0.989 0/1/1/1:4:48,151:0.72: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,238:0.85: 1.40:1.000:0.987 0/1/1/1:4:55,183:0.73: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,37:0.37:-0.59:1.000:0.601 0/0/0/1:4:65,18:0.26:-0.97:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,264:1.00: 1.32:0.996:1.000 0/0/1/1:4:52,54:0.53:-0.68:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,68:0.58:-0.53:1.000:0.901 0/1/1/1:4:65,163:0.69: 0.86:1.000:0.971 0/1/1/1:4:43,153:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,46:0.55:-0.93:1.000:0.978 0/1/1/1:4:25,209:0.87: 0.94:1.000:0.916 0/1/1/1:4:52,115:0.67: 0.09:1.000:0.915 1/1/1/1:4:17,189:0.90: 0.58:1.000:0.778 0/1/1/1:4:65,246:0.75: 1.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,88:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,243:0.86: 1.45:1.000:0.974 0/1/1/1:4:43,88:0.66:-0.36:1.000:0.839 0/0/0/1:4:101,26:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,245:0.80: 1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,78:0.55:-0.17:1.000:0.979 0/1/1/1:4:72,183:0.69: 1.20:1.000:0.974 0/1/1/1:4:26,230:0.88: 1.21:1.000:0.841 -chr3.1 56507630 chr3.1_056507630 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:82,40:0.34: 0.69:1.000:0.883 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,53:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,67:0.57: 0.24:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,141:1.00: 1.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,75:0.70:-0.15:1.000:0.988 0/0/1/1:4:28,42:0.57:-1.61:1.000:0.954 0/0/1/1:4:55,71:0.53: 0.86:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,52:0.56:-0.82:1.000:0.971 0/0/1/1:4:28,35:0.52:-1.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,26:0.40:-1.92:1.000:0.819 0/1/1/1:4:17,93:0.83: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,61:0.52: 0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,80:0.55: 1.35:1.000:0.980 0/0/1/1:4:58,73:0.52: 1.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,89:0.75: 0.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,120:1.00: 0.60:0.998:1.000 0/0/1/1:4:59,75:0.52: 1.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,85:0.52: 2.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,41:0.34: 0.86:1.000:0.894 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,31:0.32:-0.15:1.000:0.961 0/0/1/1:4:54,66:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,63:0.54: 0.11:1.000:0.985 0/1/1/1:4:14,37:0.70:-2.46:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,95:0.76: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,78:0.77:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,80:0.53: 1.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:49,54:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,56:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,75:0.80:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,17:0.84:-3.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,26:0.39:-1.84:1.000:0.730 0/1/1:3:14,21:0.57:-3.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:42,60:0.55:-0.20:1.000:0.975 0/1/1/1:4:22,91:0.79: 0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,39:0.47:-1.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,58:0.55:-0.29:1.000:0.984 0/1/1/1:4:35,88:0.69: 0.73:1.000:0.974 0/0/0/1:4:93,31:0.28: 0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,90:0.73: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:62,28:0.32:-0.73:1.000:0.940 0/0/1/1:4:51,69:0.54: 0.60:1.000:0.987 0/0/1/1:4:62,47:0.42: 0.11:1.000:0.905 0/0/1/1:4:57,67:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,47:0.43:-0.11:1.000:0.956 0/0/1/1:4:40,52:0.53:-0.64:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,36:0.45:-1.35:1.000:0.981 0/1/1/1:4:29,78:0.70: 0.02:1.000:0.989 0/0/0/1:4:94,32:0.28: 0.86:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,77:0.48: 1.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,69:0.55: 0.55:1.000:0.984 0/0/1/1:4:50,64:0.53: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,48:0.45:-0.20:1.000:0.978 0/0/0/1:4:81,24:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,30:0.35:-0.82:1.000:0.812 0/0/0/1/1/1:6:46,58:0.52:-0.11:1.000:0.862 0/0/1/1:4:54,77:0.55: 1.09:1.000:0.976 0/1/1/1:4:26,92:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,79:0.69: 0.16:1.000:0.978 0/0/1/1:4:41,54:0.53:-0.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:79,26:0.28:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,58:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:51,25:0.34:-1.35:1.000:0.878 0/0/1/1:4:56,58:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,86:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,82:0.72: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,120:0.75: 2.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,56:0.70:-1.30:1.000:0.987 0/1/1/1:4:28,96:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,36:0.32: 0.42:1.000:0.942 0/0/1/1:4:62,69:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,23:0.32:-1.30:1.000:0.965 0/1/1/1:4:37,77:0.65: 0.33:1.000:0.769 0/0/1/1:4:47,60:0.53: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,48:0.45:-0.24:1.000:0.982 0/1/1/1:4:15,57:0.77:-1.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 0.47:0.999:1.000 0/1/1/1:4:26,81:0.73: 0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,100:0.74: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,81:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:37,67:0.61:-0.11:0.712:0.969 0/1/1/1:4:31,85:0.71: 0.42:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,78:0.76:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,55:0.49:-0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,68:0.79:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,53:0.80:-1.84:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,121:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,96:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,71:0.74:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,78:0.72:-0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,66:0.76:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,77:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,50:0.48:-0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,98:0.80: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,61:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,19:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,32:0.32: 0.02:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,55:0.49:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,36:0.41:-0.91:1.000:0.852 0/1/1/1:4:18,59:0.74:-1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,40:0.50:-1.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,86:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,129:0.78: 2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,48:0.54:-1.04:1.000:0.985 0/0/1/1:4:54,66:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,125:0.85: 1.71:1.000:0.989 0/1/1/1:4:33,98:0.73: 1.09:0.999:0.997 0/0/1/1:4:55,53:0.46: 0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:25,31:0.52:-2.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,71:0.61: 0.20:1.000:0.699 0/0/1/1:4:53,53:0.47:-0.02:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,120:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,27:0.30:-0.46:1.000:0.984 0/1/1/1:4:19,83:0.80:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,55:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,55:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,85:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,102:0.81: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,77:0.81:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,96:0.73: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,39:0.44:-0.99:1.000:0.972 0/0/1/1:4:40,28:0.40:-1.70:1.000:0.813 0/0/1/1:4:43,44:0.48:-0.86:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,72:0.62: 0.20:1.000:0.583 1/1/1/1:4:0,108:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,41:0.54:-1.57:1.000:0.986 0/0/1/1:4:39,50:0.53:-0.77:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,86:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,101:0.74: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,39:0.38:-0.20:1.000:0.569 0/1/1/1:4:29,84:0.72: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,65:0.54: 0.29:1.000:0.987 0/1/1/1:4:23,91:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,80:0.69: 0.24:1.000:0.972 0/0/1/1:4:54,54:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,62:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,72:0.84:-0.99:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,106:0.75: 1.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,82:0.48: 2.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:88,29:0.28: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,73:0.56: 0.73:1.000:0.967 0/0/1/1:4:53,75:0.55: 0.95:1.000:0.978 0/1/1/1:4:18,86:0.81:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,63:0.54: 0.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:31,74:0.68:-0.07:1.000:0.951 0/0/1/1:4:31,39:0.52:-1.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,93:0.79: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,48:0.43: 0.02:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,134:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,129:0.73: 2.86:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,81:0.77:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,77:0.72:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,27:0.29:-0.15:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,64:0.72:-0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,85:0.80:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,61:0.51: 0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,88:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,73:0.73:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,77:0.57: 0.91:0.996:0.936 0/0/1/1:4:59,59:0.47: 0.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:23,97:0.79: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,64:0.54: 0.24:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,65:0.58:-0.02:1.000:0.910 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,66:0.82:-1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,64:0.55: 0.16:1.000:0.982 0/0/0/1:4:98,27:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,84:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,69:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,64:0.58:-0.11:1.000:0.899 0/1/1/1:4:34,92:0.71: 0.86:1.000:0.990 0/0/1/1:4:67,66:0.47: 1.17:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,57:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,101:0.76: 1.04:1.000:1.000 -chr3.1 56630807 chr3.1_056630807 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:468,199:.: 0.22:1.000:. ./.:4:453,112:.:-0.35:1.000:. ./.:4:370,130:.:-0.72:1.000:. ./.:4:404,144:.:-0.45:1.000:. ./.:4:659,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:424,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:405,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:543,146:.: 0.35:1.000:. ./.:4:497,133:.: 0.01:1.000:. ./.:4:291,65:.:-1.53:1.000:. ./.:4:330,63:.:-1.32:1.000:. ./.:4:406,144:.:-0.44:1.000:. ./.:4:387,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:495,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:376,130:.:-0.69:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:621,143:.: 0.77:0.998:. ./.:4:375,265:.: 0.07:1.000:. ./.:4:544,206:.: 0.69:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:429,77:.:-0.69:1.000:. ./.:4:487,167:.: 0.15:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:495,139:.: 0.04:1.000:. ./.:4:237,2:.:-2.19:1.000:. ./.:4:536,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:362,141:.:-0.70:1.000:. ./.:4:435,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:598,179:.: 0.84:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:620,131:.: 0.70:1.000:. ./.:4:314,87:.:-1.28:1.000:. ./.:4:260,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:324,109:.:-1.10:1.000:. ./.:3:131,8:.:-2.76:1.000:. ./.:4:332,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:482,126:.:-0.11:1.000:. ./.:4:576,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:555,124:.: 0.29:1.000:. ./.:4:413,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:596,182:.: 0.85:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:976,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:537,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:734,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:609,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:563,177:.: 0.63:1.000:. ./.:4:428,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:479,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:660,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:695,133:.: 1.13:1.000:. ./.:4:536,149:.: 0.32:1.000:. ./.:4:640,142:.: 0.87:1.000:. ./.:4:675,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:368,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:693,128:.: 1.09:1.000:. ./.:4:449,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:748,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:600,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:533,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:618,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:580,122:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1029,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:614,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:603,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:526,143:.: 0.23:1.000:. ./.:4:740,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:748,143:.: 1.49:1.000:. ./.:4:699,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:373,272:.: 0.10:1.000:. ./.:4:754,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:636,118:.: 0.71:1.000:. ./.:4:755,149:.: 1.56:1.000:. ./.:4:449,139:.:-0.22:1.000:. ./.:4:374,157:.:-0.55:1.000:. ./.:4:496,109:.:-0.13:1.000:. ./.:4:498,132:.: 0.01:1.000:. ./.:4:646,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:569,161:.: 0.58:1.000:. ./.:4:653,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:886,152:.: 2.32:1.000:. ./.:4:936,209:.: 2.92:1.000:. ./.:4:573,0:.:-0.31:1.000:. ./.:5:828,0:.: 1.13:0.712:. ./.:4:884,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:580,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:703,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:533,119:.: 0.14:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:664,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:671,175:.: 1.23:1.000:. ./.:4:781,161:.: 1.77:1.000:. ./.:4:339,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:859,166:.: 2.24:1.000:. ./.:4:897,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:674,164:.: 1.19:1.000:. ./.:4:329,287:.:-0.07:1.000:. ./.:4:840,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:741,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:527,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:637,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:589,133:.: 0.53:1.000:. ./.:4:852,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:591,136:.: 0.56:1.000:. ./.:4:616,125:.: 0.64:1.000:. ./.:4:506,126:.: 0.02:1.000:. ./.:4:619,141:.: 0.75:1.000:. ./.:4:760,224:.: 2.01:1.000:. ./.:4:625,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:572,162:.: 0.60:1.000:. ./.:4:470,158:.: 0.00:1.000:. ./.:4:827,180:.: 2.14:0.999:. ./.:4:578,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:705,215:.: 1.65:1.000:. ./.:4:525,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:744,143:.: 1.46:1.000:. ./.:4:523,153:.: 0.27:1.000:. ./.:4:740,156:.: 1.51:1.000:. ./.:4:510,167:.: 0.28:1.000:. ./.:4:522,138:.: 0.18:1.000:. ./.:4:609,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:351,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:738,158:.: 1.51:1.000:. ./.:4:802,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:635,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:344,135:.:-0.84:1.000:. ./.:4:609,138:.: 0.67:1.000:. ./.:4:669,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:526,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:476,136:.:-0.09:1.000:. ./.:4:394,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:487,147:.: 0.04:1.000:. ./.:4:591,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:717,191:.: 1.58:1.000:. ./.:4:562,143:.: 0.44:1.000:. ./.:4:734,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:774,146:.: 1.65:1.000:. ./.:4:712,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:812,172:.: 2.01:1.000:. ./.:4:608,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:454,182:.: 0.05:1.000:. ./.:4:647,129:.: 0.84:1.000:. ./.:4:762,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:666,203:.: 1.36:1.000:. ./.:4:406,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:413,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:562,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:457,126:.:-0.25:1.000:. ./.:4:405,183:.:-0.22:1.000:. ./.:4:405,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:324,29:.:-1.55:1.000:. ./.:4:412,111:.:-0.59:1.000:. ./.:4:524,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:645,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:655,188:.: 1.22:1.000:. ./.:4:619,140:.: 0.74:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:448,104:.:-0.43:1.000:. ./.:4:634,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:429,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:505,148:.: 0.14:1.000:. ./.:4:437,132:.:-0.33:1.000:. ./.:4:487,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:244,140:.:-1.37:0.996:. ./.:4:359,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:491,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:435,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:411,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:626,173:.: 0.97:1.000:. ./.:4:549,145:.: 0.37:1.000:. ./.:4:639,109:.: 0.68:1.000:. ./.:4:388,122:.:-0.66:1.000:. ./.:4:390,170:.:-0.38:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:358,131:.:-0.78:1.000:. ./.:4:316,139:.:-0.97:1.000:. ./.:4:565,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:541,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:615,168:.: 0.88:1.000:. ./.:4:282,108:.:-1.34:1.000:. ./.:4:460,184:.: 0.09:1.000:. -chr3.1 56852572 chr3.1_056852572 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:80,111:.: 0.95:1.000:. ./.:4:17,104:.:-0.64:1.000:. ./.:4:74,106:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,110:.: 0.83:1.000:. ./.:4:45,141:.: 0.83:1.000:. ./.:4:41,196:.: 1.99:1.000:. ./.:4:25,118:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.24:1.000:. ./.:4:9,31:.:-2.47:1.000:. ./.:4:13,24:.:-2.54:1.000:. ./.:4:31,130:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,116:.:-0.01:1.000:. ./.:4:33,128:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,136:.: 0.52:1.000:. ./.:4:58,168:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,214:.: 1.47:0.998:. ./.:4:84,116:.: 1.15:1.000:. ./.:4:48,189:.: 1.99:1.000:. ./.:4:77,79:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,39:.:-2.45:1.000:. ./.:4:78,103:.: 0.72:1.000:. ./.:4:73,109:.: 0.74:1.000:. ./.:4:28,122:.: 0.02:1.000:. ./.:4:5,23:.:-2.74:1.000:. ./.:4:45,165:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,205:.: 1.26:1.000:. ./.:4:30,131:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,151:.: 0.88:1.000:. ./.:4:87,99:.: 0.83:1.000:. ./.:4:45,155:.: 1.15:1.000:. ./.:4:43,139:.: 0.74:1.000:. ./.:4:2,10:.:-3.11:1.000:. ./.:4:20,23:.:-2.40:1.000:. ./.:3:0,20:.:-2.93:1.000:. ./.:4:23,150:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,141:.: 0.81:1.000:. ./.:4:34,147:.: 0.72:1.000:. ./.:4:34,122:.: 0.15:1.000:. ./.:4:88,100:.: 0.88:1.000:. ./.:4:29,108:.:-0.28:1.000:. ./.:4:41,57:.:-1.16:1.000:. ./.:4:31,130:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,68:.:-0.80:1.000:. ./.:4:51,90:.:-0.19:1.000:. ./.:4:36,137:.: 0.54:1.000:. ./.:4:43,158:.: 1.17:1.000:. ./.:4:24,54:.:-1.61:1.000:. ./.:4:70,82:.: 0.06:1.000:. ./.:4:35,137:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.68:1.000:. ./.:4:99,111:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.10:1.000:. ./.:4:35,124:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,92:.: 0.42:1.000:. ./.:4:28,164:.: 0.97:1.000:. ./.:4:71,80:.: 0.04:1.000:. ./.:4:69,86:.: 0.13:1.000:. ./.:4:24,115:.:-0.23:1.000:. ./.:6:53,57:.:-0.89:1.000:. ./.:4:46,73:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,103:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.58:1.000:. ./.:4:23,103:.:-0.53:1.000:. ./.:4:69,95:.: 0.33:1.000:. ./.:4:26,135:.: 0.27:1.000:. ./.:4:16,75:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.28:1.000:. ./.:4:23,118:.:-0.19:1.000:. ./.:4:101,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:73,81:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,130:.: 0.61:1.000:. ./.:4:100,99:.: 1.13:1.000:. ./.:4:84,31:.:-0.77:1.000:. ./.:4:30,90:.:-0.66:1.000:. ./.:4:26,121:.:-0.05:1.000:. ./.:4:30,108:.:-0.25:1.000:. ./.:4:25,120:.:-0.10:1.000:. ./.:4:66,88:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,81:.:-1.07:0.999:. ./.:4:0,123:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,174:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.06:1.000:. ./.:5:46,110:.: 0.15:0.712:. ./.:4:25,120:.:-0.10:1.000:. ./.:4:23,97:.:-0.66:1.000:. ./.:4:22,72:.:-1.25:1.000:. ./.:4:38,70:.:-0.93:1.000:. ./.:4:23,100:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,137:.:-0.23:0.999:. ./.:4:0,149:.:-0.01:1.000:. ./.:4:33,124:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,71:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,92:.:-1.30:1.000:. ./.:4:60,32:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,106:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,125:.: 0.18:1.000:. ./.:4:18,67:.:-1.45:1.000:. ./.:4:32,97:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,72:.:-1.75:1.000:. ./.:4:19,82:.:-1.09:1.000:. ./.:4:23,79:.:-1.07:1.000:. ./.:4:19,102:.:-0.64:1.000:. ./.:4:24,117:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,137:.: 0.38:1.000:. ./.:4:54,185:.: 2.03:1.000:. ./.:4:1,161:.: 0.29:1.000:. ./.:4:35,124:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,198:.: 2.39:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.48:0.999:. ./.:4:67,84:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,96:.:-0.55:1.000:. ./.:4:28,63:.:-1.32:1.000:. ./.:4:51,71:.:-0.62:1.000:. ./.:4:24,102:.:-0.53:1.000:. ./.:4:20,114:.:-0.34:1.000:. ./.:4:29,97:.:-0.53:1.000:. ./.:4:30,127:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,94:.:-0.73:1.000:. ./.:4:27,111:.:-0.25:1.000:. ./.:4:35,142:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,97:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,110:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,38:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,89:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,90:.:-1.34:1.000:. ./.:4:52,60:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.31:1.000:. ./.:4:15,72:.:-1.41:1.000:. ./.:4:59,70:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,101:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,239:.: 2.03:1.000:. ./.:4:34,110:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,102:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,103:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.67:1.000:. ./.:4:29,95:.:-0.57:1.000:. ./.:4:28,123:.: 0.04:1.000:. ./.:4:18,76:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,215:.: 1.49:1.000:. ./.:4:86,94:.: 0.70:1.000:. ./.:4:80,86:.: 0.38:1.000:. ./.:4:81,95:.: 0.61:1.000:. ./.:4:50,197:.: 2.21:1.000:. ./.:4:37,113:.: 0.02:1.000:. ./.:4:34,173:.: 1.31:1.000:. ./.:4:41,144:.: 0.81:1.000:. ./.:4:3,27:.:-2.70:1.000:. ./.:4:26,104:.:-0.44:1.000:. ./.:4:36,140:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,206:.: 1.28:1.000:. ./.:4:37,156:.: 0.99:1.000:. ./.:4:32,103:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.06:1.000:. ./.:4:30,135:.: 0.36:1.000:. ./.:4:41,134:.: 0.58:1.000:. ./.:4:47,146:.: 0.99:1.000:. ./.:4:29,134:.: 0.31:1.000:. ./.:4:31,151:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,166:.: 1.31:1.000:. ./.:4:33,160:.: 0.99:1.000:. ./.:4:22,121:.:-0.14:1.000:. ./.:4:82,89:.: 0.49:0.996:. ./.:4:31,128:.: 0.22:1.000:. ./.:4:37,139:.: 0.61:1.000:. ./.:4:19,107:.:-0.53:1.000:. ./.:4:29,117:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.45:1.000:. ./.:4:22,90:.:-0.84:1.000:. ./.:4:27,115:.:-0.16:1.000:. ./.:4:45,183:.: 1.78:1.000:. ./.:4:42,143:.: 0.81:1.000:. ./.:4:45,170:.: 1.49:1.000:. ./.:4:28,106:.:-0.34:1.000:. ./.:4:32,146:.: 0.65:1.000:. ./.:4:42,144:.: 0.83:1.000:. ./.:4:48,166:.: 1.47:1.000:. ./.:4:62,85:.:-0.05:1.000:. ./.:4:92,92:.: 0.79:1.000:. -chr3.1 56927846 chr3.1_056927846 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:226,64:.: 0.62:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:229,60:.: 0.61:1.000:. ./.:4:201,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:224,82:.: 0.92:1.000:. ./.:4:241,64:.: 0.91:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:48,33:.:-3.30:1.000:. ./.:4:44,33:.:-3.38:1.000:. ./.:4:204,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:209,56:.: 0.15:1.000:. ./.:4:200,53:.:-0.07:1.000:. ./.:4:180,48:.:-0.54:1.000:. ./.:4:137,121:.: 0.02:1.000:. ./.:4:255,79:.: 1.45:0.998:. ./.:4:242,58:.: 0.81:1.000:. ./.:4:203,150:.: 1.81:1.000:. ./.:4:275,61:.: 1.49:1.000:. ./.:4:62,28:.:-3.13:1.000:. ./.:4:213,58:.: 0.27:1.000:. ./.:4:142,124:.: 0.17:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:27,30:.:-3.75:1.000:. ./.:4:196,74:.: 0.25:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:220,62:.: 0.47:1.000:. ./.:4:144,127:.: 0.27:1.000:. ./.:4:162,143:.: 0.91:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:224,58:.: 0.47:1.000:. ./.:4:48,16:.:-3.62:1.000:. ./.:4:65,55:.:-2.57:1.000:. ./.:3:34,13:.:-3.94:1.000:. ./.:4:204,58:.: 0.10:1.000:. ./.:4:211,67:.: 0.40:1.000:. ./.:4:244,75:.: 1.17:1.000:. ./.:4:235,67:.: 0.85:1.000:. ./.:4:162,163:.: 1.28:1.000:. ./.:4:139,142:.: 0.46:1.000:. ./.:4:184,62:.:-0.20:1.000:. ./.:4:203,85:.: 0.59:1.000:. ./.:4:191,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:226,56:.: 0.47:1.000:. ./.:4:139,136:.: 0.34:1.000:. ./.:4:257,56:.: 1.06:1.000:. ./.:4:92,55:.:-2.06:1.000:. ./.:4:191,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:194,53:.:-0.18:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:240,63:.: 0.87:1.000:. ./.:4:189,68:.: 0.00:1.000:. ./.:4:239,57:.: 0.74:1.000:. ./.:4:139,113:.:-0.09:1.000:. ./.:4:141,135:.: 0.36:1.000:. ./.:4:197,56:.:-0.07:1.000:. ./.:4:204,63:.: 0.19:1.000:. ./.:4:232,73:.: 0.91:1.000:. ./.:6:152,65:.:-0.75:1.000:. ./.:4:203,55:.: 0.02:1.000:. ./.:4:195,57:.:-0.09:1.000:. ./.:4:224,75:.: 0.79:1.000:. ./.:4:214,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:225,60:.: 0.53:1.000:. ./.:4:227,64:.: 0.64:1.000:. ./.:4:169,42:.:-0.86:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:150,139:.: 0.61:1.000:. ./.:4:135,47:.:-1.40:1.000:. ./.:4:149,141:.: 0.62:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:223,62:.: 0.53:1.000:. ./.:4:195,52:.:-0.18:1.000:. ./.:4:138,113:.:-0.11:1.000:. ./.:4:164,45:.:-0.90:1.000:. ./.:4:110,97:.:-0.93:1.000:. ./.:4:120,111:.:-0.48:1.000:. ./.:4:260,46:.: 0.92:1.000:. ./.:4:168,137:.: 0.91:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:278,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:217,76:.: 0.68:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.16:1.000:. ./.:5:196,121:.: 1.13:0.712:. ./.:4:212,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:154,57:.:-0.86:1.000:. ./.:4:147,61:.:-0.92:1.000:. ./.:4:126,105:.:-0.48:1.000:. ./.:4:128,105:.:-0.45:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:160,66:.:-0.58:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:103,90:.:-1.20:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:202,97:.: 0.79:1.000:. ./.:4:197,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:115,100:.:-0.78:1.000:. ./.:4:231,72:.: 0.87:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,56:.:-0.88:1.000:. ./.:4:196,58:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,50:.:-1.29:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:129,119:.:-0.16:1.000:. ./.:4:186,72:.: 0.02:1.000:. ./.:4:220,67:.: 0.57:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:220,75:.: 0.72:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:129,133:.: 0.10:1.000:. ./.:4:168,166:.: 1.45:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:214,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:113,107:.:-0.69:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:114,114:.:-0.54:1.000:. ./.:4:161,46:.:-0.93:1.000:. ./.:4:211,54:.: 0.15:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:212,40:.:-0.09:1.000:. ./.:4:108,131:.:-0.33:1.000:. ./.:4:144,135:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,135:.: 0.76:1.000:. ./.:4:128,128:.:-0.01:1.000:. ./.:4:211,78:.: 0.61:1.000:. ./.:4:198,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:121,102:.:-0.63:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:169,43:.:-0.84:1.000:. ./.:4:134,115:.:-0.15:1.000:. ./.:4:212,64:.: 0.36:1.000:. ./.:4:116,45:.:-1.80:1.000:. ./.:4:165,63:.:-0.54:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:254,91:.: 1.66:1.000:. ./.:4:226,59:.: 0.53:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:187,75:.: 0.10:1.000:. ./.:4:124,98:.:-0.65:1.000:. ./.:4:144,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:140,45:.:-1.35:1.000:. ./.:4:278,63:.: 1.58:1.000:. ./.:4:232,47:.: 0.42:1.000:. ./.:4:225,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:139,113:.:-0.09:1.000:. ./.:4:321,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:135,125:.: 0.06:1.000:. ./.:4:164,146:.: 1.00:1.000:. ./.:4:184,71:.:-0.03:1.000:. ./.:4:108,1:.:-2.78:1.000:. ./.:4:162,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:138,149:.: 0.57:1.000:. ./.:4:203,67:.: 0.25:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:169,76:.:-0.22:1.000:. ./.:4:201,58:.: 0.04:1.000:. ./.:4:201,64:.: 0.15:1.000:. ./.:4:170,58:.:-0.54:1.000:. ./.:4:214,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:170,115:.: 0.53:1.000:. ./.:4:231,77:.: 0.96:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:158,109:.: 0.19:0.996:. ./.:4:212,50:.: 0.10:1.000:. ./.:4:200,62:.: 0.10:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:179,75:.:-0.05:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:220,68:.: 0.59:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:138,137:.: 0.34:1.000:. ./.:4:265,65:.: 1.38:1.000:. ./.:4:166,152:.: 1.15:1.000:. ./.:4:139,138:.: 0.38:1.000:. ./.:4:192,57:.:-0.15:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:244,85:.: 1.36:1.000:. ./.:4:215,85:.: 0.81:1.000:. ./.:4:107,94:.:-1.05:1.000:. ./.:4:186,45:.:-0.48:1.000:. -chr3.1 57063532 chr3.1_057063532 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:256,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:162,10:.:-0.16:1.000:. ./.:4:172,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:161,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:201,17:.: 0.62:1.000:. ./.:4:135,23:.:-0.40:1.000:. ./.:4:155,19:.:-0.13:1.000:. ./.:4:205,13:.: 0.62:1.000:. ./.:4:204,9:.: 0.53:1.000:. ./.:4:68,12:.:-1.73:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:76,30:.:-1.28:1.000:. ./.:4:162,12:.:-0.13:1.000:. ./.:4:112,26:.:-0.74:1.000:. ./.:4:139,11:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,31:.:-1.90:1.000:. ./.:4:112,31:.:-0.66:0.998:. ./.:4:77,28:.:-1.30:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:86,5:.:-1.54:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:185,18:.: 0.36:1.000:. ./.:4:28,4:.:-2.54:1.000:. ./.:4:86,42:.:-0.91:1.000:. ./.:4:118,32:.:-0.54:1.000:. ./.:4:146,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:319,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.20:1.000:. ./.:3:37,3:.:-2.41:1.000:. ./.:4:88,40:.:-0.91:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:176,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:183,25:.: 0.45:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:37,32:.:-1.91:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:182,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:211,25:.: 0.93:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:203,20:.: 0.70:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:154,20:.:-0.13:1.000:. ./.:4:155,31:.: 0.08:1.000:. ./.:4:142,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:121,44:.:-0.28:1.000:. ./.:4:193,20:.: 0.53:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:150,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:194,29:.: 0.70:1.000:. ./.:6:115,11:.:-0.94:1.000:. ./.:4:181,34:.: 0.57:1.000:. ./.:4:177,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:204,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:107,51:.:-0.40:1.000:. ./.:4:312,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:163,15:.:-0.06:1.000:. ./.:4:198,17:.: 0.57:1.000:. ./.:4:263,17:.: 1.67:1.000:. ./.:4:63,50:.:-1.17:1.000:. ./.:4:160,15:.:-0.11:1.000:. ./.:4:167,26:.: 0.19:1.000:. ./.:4:116,41:.:-0.42:1.000:. ./.:4:165,20:.: 0.06:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:147,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:179,20:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,55:.:-1.34:1.000:. ./.:4:150,22:.:-0.16:1.000:. ./.:4:114,57:.:-0.18:1.000:. ./.:4:133,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:211,16:.: 0.77:0.999:. ./.:4:156,42:.: 0.28:1.000:. ./.:4:178,20:.: 0.28:1.000:. ./.:4:122,26:.:-0.57:1.000:. ./.:5:231,25:.: 1.27:0.712:. ./.:4:273,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:119,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,35:.:-1.66:1.000:. ./.:4:167,37:.: 0.38:0.999:. ./.:4:100,41:.:-0.69:1.000:. ./.:4:183,52:.: 0.91:1.000:. ./.:4:63,11:.:-1.83:1.000:. ./.:4:157,52:.: 0.47:1.000:. ./.:4:214,28:.: 1.03:1.000:. ./.:4:165,30:.: 0.23:1.000:. ./.:4:119,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:325,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:207,25:.: 0.86:1.000:. ./.:4:181,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,33:.:-1.10:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:164,21:.: 0.06:1.000:. ./.:4:188,17:.: 0.40:1.000:. ./.:4:314,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:227,19:.: 1.10:1.000:. ./.:4:104,21:.:-0.96:1.000:. ./.:4:139,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:158,31:.: 0.13:0.999:. ./.:4:204,22:.: 0.76:1.000:. ./.:4:105,23:.:-0.91:1.000:. ./.:4:168,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:97,41:.:-0.74:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:243,15:.: 1.30:1.000:. ./.:4:147,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:130,24:.:-0.47:1.000:. ./.:4:54,33:.:-1.61:1.000:. ./.:4:111,23:.:-0.81:1.000:. ./.:4:112,23:.:-0.79:1.000:. ./.:4:228,24:.: 1.20:1.000:. ./.:4:98,38:.:-0.77:1.000:. ./.:4:53,44:.:-1.44:1.000:. ./.:4:188,17:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,30:.:-1.25:1.000:. ./.:4:150,22:.:-0.16:1.000:. ./.:4:87,26:.:-1.17:1.000:. ./.:4:140,11:.:-0.52:1.000:. ./.:4:178,15:.: 0.19:1.000:. ./.:4:214,21:.: 0.91:1.000:. ./.:4:191,17:.: 0.45:1.000:. ./.:4:191,18:.: 0.47:1.000:. ./.:4:157,41:.: 0.28:1.000:. ./.:4:219,20:.: 0.98:1.000:. ./.:4:123,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:169,23:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:137,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:218,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:241,26:.: 1.45:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:44,32:.:-1.79:1.000:. ./.:4:112,13:.:-0.96:1.000:. ./.:4:158,10:.:-0.23:1.000:. ./.:4:54,15:.:-1.91:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:106,33:.:-0.72:1.000:. ./.:4:149,37:.: 0.08:1.000:. ./.:4:210,13:.: 0.70:1.000:. ./.:4:158,22:.:-0.03:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:79,23:.:-1.35:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:139,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:184,20:.: 0.38:1.000:. ./.:4:139,26:.:-0.28:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.49:0.996:. ./.:4:89,31:.:-1.05:1.000:. ./.:4:157,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:204,6:.: 0.48:1.000:. ./.:4:141,15:.:-0.43:1.000:. ./.:4:228,13:.: 1.01:1.000:. ./.:4:78,28:.:-1.28:1.000:. ./.:4:112,29:.:-0.69:1.000:. ./.:4:99,12:.:-1.20:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:141,20:.:-0.35:1.000:. ./.:4:126,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:92,23:.:-1.13:1.000:. ./.:4:206,14:.: 0.65:1.000:. ./.:4:115,43:.:-0.40:1.000:. ./.:4:97,34:.:-0.86:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:160,15:.:-0.11:1.000:. -chr3.1 57149346 chr3.1_057149346 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:238,102:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:232,105:.: 0.52:1.000:. ./.:4:241,107:.: 0.65:1.000:. ./.:4:240,114:.: 0.73:1.000:. ./.:4:321,109:.: 1.67:1.000:. ./.:4:226,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:65,43:.:-2.31:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:318,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:411,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.95:0.998:. ./.:4:282,136:.: 1.52:1.000:. ./.:4:433,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:275,106:.: 1.06:1.000:. ./.:4:90,40:.:-2.04:1.000:. ./.:4:217,101:.: 0.28:1.000:. ./.:4:288,114:.: 1.32:1.000:. ./.:4:235,94:.: 0.42:1.000:. ./.:4:63,2:.:-2.84:1.000:. ./.:4:350,142:.: 2.43:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:254,96:.: 0.68:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:271,114:.: 1.11:1.000:. ./.:4:270,109:.: 1.04:1.000:. ./.:4:230,98:.: 0.41:1.000:. ./.:4:37,24:.:-2.89:1.000:. ./.:4:75,32:.:-2.32:1.000:. ./.:3:52,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:244,104:.: 0.65:1.000:. ./.:4:227,135:.: 0.83:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:258,118:.: 1.00:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:178,88:.:-0.36:1.000:. ./.:4:257,113:.: 0.93:1.000:. ./.:4:211,89:.: 0.06:1.000:. ./.:4:233,73:.: 0.14:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:192,53:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,99:.: 0.41:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:258,101:.: 0.79:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:221,86:.: 0.15:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:190,107:.: 0.02:1.000:. ./.:4:236,97:.: 0.47:1.000:. ./.:4:278,1:.:-0.20:1.000:. ./.:6:160,69:.:-0.82:1.000:. ./.:4:190,74:.:-0.38:1.000:. ./.:4:219,96:.: 0.25:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:208,113:.: 0.32:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:206,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,161:.:-0.22:1.000:. ./.:4:259,117:.: 1.00:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:238,114:.: 0.70:1.000:. ./.:4:199,81:.:-0.19:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:237,98:.: 0.49:1.000:. ./.:4:162,48:.:-1.05:0.999:. ./.:4:330,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.38:1.000:. ./.:5:219,90:.: 0.17:0.712:. ./.:4:219,88:.: 0.15:1.000:. ./.:4:179,67:.:-0.61:1.000:. ./.:4:140,81:.:-0.91:1.000:. ./.:4:165,68:.:-0.77:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:232,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:248,100:.: 0.65:1.000:. ./.:4:149,89:.:-0.70:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:150,71:.:-0.91:1.000:. ./.:4:175,101:.:-0.23:1.000:. ./.:4:225,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:266,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:190,111:.: 0.07:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:179,90:.:-0.32:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:203,100:.: 0.10:1.000:. ./.:4:299,138:.: 1.75:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:480,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.74:0.999:. ./.:4:232,121:.: 0.72:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:124,91:.:-0.99:1.000:. ./.:4:211,107:.: 0.28:1.000:. ./.:4:173,75:.:-0.58:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:181,78:.:-0.45:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:159,76:.:-0.74:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:208,84:.:-0.04:1.000:. ./.:4:197,87:.:-0.14:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:132,76:.:-1.08:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,50:.:-1.61:1.000:. ./.:4:388,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:328,149:.: 2.25:1.000:. ./.:4:234,101:.: 0.49:1.000:. ./.:4:222,86:.: 0.16:1.000:. ./.:4:285,135:.: 1.54:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:423,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:255,95:.: 0.68:1.000:. ./.:4:99,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:181,70:.:-0.54:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:297,144:.: 1.80:1.000:. ./.:4:271,108:.: 1.04:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:237,106:.: 0.59:1.000:. ./.:4:201,93:.:-0.01:1.000:. ./.:4:221,89:.: 0.19:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:283,133:.: 1.50:1.000:. ./.:4:296,103:.: 1.29:1.000:. ./.:4:217,97:.: 0.23:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.23:0.996:. ./.:4:279,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:207,114:.: 0.32:1.000:. ./.:4:201,84:.:-0.12:1.000:. ./.:4:189,80:.:-0.32:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:192,76:.:-0.33:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:321,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:274,125:.: 1.29:1.000:. ./.:4:409,2:.: 1.43:1.000:. ./.:4:327,149:.: 2.24:1.000:. ./.:4:233,98:.: 0.44:1.000:. ./.:4:243,103:.: 0.63:1.000:. -chr3.1 57360963 chr3.1_057360963 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:59,55:.:-0.66:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:100,80:.: 1.10:1.000:. ./.:4:97,40:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:79,36:.:-0.63:1.000:. ./.:4:65,32:.:-1.11:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:40,13:.:-2.28:1.000:. ./.:4:89,27:.:-0.60:1.000:. ./.:4:98,16:.:-0.66:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:110,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:89,27:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,66:.:-0.10:0.998:. ./.:4:115,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:86,77:.: 0.65:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:15,21:.:-2.73:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:132,24:.: 0.46:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,9:.:-2.89:1.000:. ./.:4:92,33:.:-0.36:1.000:. ./.:4:77,19:.:-1.14:1.000:. ./.:4:72,17:.:-1.32:1.000:. ./.:4:80,73:.: 0.38:1.000:. ./.:4:65,17:.:-1.51:1.000:. ./.:4:108,32:.: 0.03:1.000:. ./.:4:58,43:.:-1.00:1.000:. ./.:4:16,11:.:-2.97:1.000:. ./.:4:40,23:.:-2.01:1.000:. ./.:3:15,11:.:-3.00:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:36,54:.:-1.30:1.000:. ./.:4:90,61:.: 0.33:1.000:. ./.:4:123,40:.: 0.65:1.000:. ./.:4:83,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:131,38:.: 0.81:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:126,52:.: 1.05:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:89,85:.: 0.94:1.000:. ./.:4:134,41:.: 0.97:1.000:. ./.:4:20,5:.:-3.03:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:81,23:.:-0.92:1.000:. ./.:4:123,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:97,77:.: 0.94:1.000:. ./.:4:122,36:.: 0.51:1.000:. ./.:4:127,23:.: 0.30:1.000:. ./.:4:70,58:.:-0.28:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.19:1.000:. ./.:6:135,15:.: 0.30:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:110,31:.: 0.06:1.000:. ./.:4:116,108:.: 2.27:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:111,32:.: 0.11:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:109,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:132,39:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,13:.:-1.56:1.000:. ./.:4:80,74:.: 0.41:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:106,22:.:-0.28:1.000:. ./.:4:143,31:.: 0.94:1.000:. ./.:4:199,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:143,69:.: 1.95:1.000:. ./.:4:64,46:.:-0.76:0.999:. ./.:4:112,61:.: 0.91:1.000:. ./.:4:123,70:.: 1.45:1.000:. ./.:4:106,30:.:-0.07:1.000:. ./.:5:163,28:.: 1.39:0.712:. ./.:4:93,104:.: 1.55:1.000:. ./.:4:67,49:.:-0.60:1.000:. ./.:4:78,79:.: 0.49:1.000:. ./.:4:135,39:.: 0.94:1.000:. ./.:4:98,34:.:-0.18:1.000:. ./.:4:103,22:.:-0.36:0.999:. ./.:4:79,77:.: 0.46:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:84,28:.:-0.71:1.000:. ./.:4:151,51:.: 1.69:1.000:. ./.:4:78,82:.: 0.57:1.000:. ./.:4:81,74:.: 0.43:1.000:. ./.:4:134,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:84,73:.: 0.49:1.000:. ./.:4:112,51:.: 0.65:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:74,63:.:-0.04:1.000:. ./.:4:144,42:.: 1.26:1.000:. ./.:4:72,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,87:.: 0.73:1.000:. ./.:4:134,43:.: 1.02:1.000:. ./.:4:97,27:.:-0.39:1.000:. ./.:4:73,79:.: 0.35:1.000:. ./.:4:111,43:.: 0.41:1.000:. ./.:4:124,30:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,62:.: 0.09:1.000:. ./.:4:155,27:.: 1.15:0.999:. ./.:4:161,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.52:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:89,28:.:-0.58:1.000:. ./.:4:95,22:.:-0.58:1.000:. ./.:4:130,53:.: 1.18:1.000:. ./.:4:107,41:.: 0.25:1.000:. ./.:4:129,47:.: 0.99:1.000:. ./.:4:123,30:.: 0.38:1.000:. ./.:4:149,43:.: 1.42:1.000:. ./.:4:54,38:.:-1.24:1.000:. ./.:4:92,75:.: 0.75:1.000:. ./.:4:99,85:.: 1.21:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,35:.:-0.36:1.000:. ./.:4:84,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,60:.:-0.36:1.000:. ./.:4:85,32:.:-0.58:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:120,22:.: 0.09:1.000:. ./.:4:90,79:.: 0.81:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:119,27:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,48:.: 0.65:1.000:. ./.:4:89,94:.: 1.18:1.000:. ./.:4:141,40:.: 1.13:1.000:. ./.:4:89,52:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,30:.:-0.42:1.000:. ./.:4:80,85:.: 0.70:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,32:.: 0.03:1.000:. ./.:4:113,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:101,25:.:-0.34:1.000:. ./.:4:89,29:.:-0.55:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:27,17:.:-2.52:1.000:. ./.:4:80,78:.: 0.51:1.000:. ./.:4:95,81:.: 0.99:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:107,38:.: 0.17:1.000:. ./.:4:78,55:.:-0.15:1.000:. ./.:4:90,27:.:-0.58:1.000:. ./.:4:85,22:.:-0.84:1.000:. ./.:4:60,52:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:66,49:.:-0.63:1.000:. ./.:4:56,49:.:-0.90:1.000:. ./.:4:85,27:.:-0.71:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:70,58:.:-0.28:0.996:. ./.:4:133,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.95:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:54,43:.:-1.11:1.000:. ./.:4:116,16:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,24:.:-1.08:1.000:. ./.:4:98,38:.:-0.07:1.000:. ./.:4:82,83:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,39:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,9:.:-0.74:1.000:. ./.:4:100,25:.:-0.36:1.000:. ./.:4:179,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:117,33:.: 0.30:1.000:. ./.:4:77,24:.:-1.00:1.000:. ./.:4:108,28:.:-0.07:1.000:. -chr3.1 57640794 chr3.1_057640794 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:32,11:0.37: 1.50:1.000:0.620 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,7:0.43:-0.24:1.000:0.938 0/0/1/1:4:19,11:0.47: 0.42:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.57:-0.08:1.000:0.934 0/0/1/1:4:30,20:0.51: 2.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,7:0.39: 0.01:1.000:0.684 0/0/0/1:4:24,5:0.28: 0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:33,9:0.32: 1.42:1.000:0.940 0/0/0/1:4:18,5:0.33:-0.16:1.000:0.929 0/0/0/1:4:15,4:0.32:-0.49:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.99:0.998:1.000 0/0/1/1:4:18,11:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,6:0.30: 0.50:1.000:0.981 0/0/0/1:4:36,4:0.18: 1.25:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,34:0.98: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.37:-0.16:1.000:0.556 0/0/1/1:4:25,14:0.47: 1.17:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,17:0.51: 1.42:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,22:0.59: 1.83:1.000:0.889 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,20:0.72: 0.75:1.000:0.996 0/1/1:3:7,12:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,4:0.29:-0.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,18:0.67: 0.67:1.000:0.935 0/1/1/1:4:10,11:0.65:-0.32:1.000:0.783 0/0/1/1:4:15,15:0.62: 0.42:1.000:0.544 0/0/1/1:4:22,12:0.46: 0.75:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,11:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,24:0.75: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,14:0.52: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,16:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,9:0.26: 2.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,12:0.78:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,13:0.73:-0.24:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.55:-0.16:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.54: 0.84:1.000:0.987 0/0/1/1:4:25,10:0.39: 0.84:1.000:0.744 0/0/1/1:4:19,17:0.59: 0.92:1.000:0.862 0/0/1/1:4:16,8:0.44:-0.08:1.000:0.970 0/1/1/1:4:18,22:0.68: 1.25:1.000:0.950 0/1/1/1:4:19,20:0.64: 1.17:1.000:0.646 0/0/1/1/1/1:6:21,32:0.74: 2.33:1.000:0.586 0/1/1/1:4:20,28:0.72: 1.92:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,20:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,10:0.59:-0.32:1.000:0.832 0/0/1/1:4:15,13:0.58: 0.26:1.000:0.909 0/1/1/1:4:10,14:0.72:-0.08:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,20:0.64: 1.17:1.000:0.646 0/1/1/1:4:9,10:0.65:-0.49:1.000:0.809 0/0/1/1:4:20,16:0.56: 0.92:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.59: 1.09:1.000:0.852 0/0/1/1:4:16,15:0.60: 0.50:1.000:0.759 0/0/1/1:4:17,13:0.55: 0.42:1.000:0.983 0/0/1/1:4:26,16:0.49: 1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,8:0.44:-0.08:1.000:0.970 0/0/1/1:4:19,19:0.62: 1.09:1.000:0.544 0/1/1/1:4:16,18:0.66: 0.75:1.000:0.837 0/0/1/1:4:26,24:0.60: 2.08:1.000:0.798 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.32:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:16,31:0.78: 1.83:0.712:0.986 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,25:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,11:0.60:-0.16:1.000:0.814 1/1/1/1:4:0,30:1.00: 0.42:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,16:0.57: 0.84:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,13:0.48: 0.84:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,39:1.00: 1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,22:0.62: 1.58:1.000:0.544 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,11:0.65:-0.32:1.000:0.783 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,20:0.70: 0.84:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,23:0.71: 1.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:20,6:0.34: 0.09:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,29:1.00: 0.34:0.999:1.000 0/0/1/1:4:26,11:0.41: 1.00:1.000:0.840 0/1/1/1:4:15,17:0.66: 0.59:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,20:0.67: 1.00:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.54: 0.84:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,10:0.46: 0.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,18:0.62: 0.92:1.000:0.544 0/1/1/1:4:17,19:0.65: 0.92:1.000:0.822 0/0/0/1:4:20,6:0.34: 0.09:1.000:0.862 0/0/1/1:4:17,11:0.50: 0.26:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,16:0.70: 0.26:1.000:0.988 0/0/0/1:4:17,5:0.34:-0.24:1.000:0.883 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,12:0.60: 0.01:1.000:0.798 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,9:0.77:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,21:0.78: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,7:0.39: 0.01:1.000:0.684 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,20:0.56: 1.67:1.000:0.969 0/0/1/1:4:19,12:0.49: 0.50:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,15:0.47: 1.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:26,6:0.30: 0.59:1.000:0.986 0/0/0/1:4:28,8:0.33: 0.92:1.000:0.909 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,9:0.38: 0.67:1.000:0.598 0/0/1/1:4:19,8:0.41: 0.17:1.000:0.833 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,17:0.68: 0.50:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,8:0.43: 0.01:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,30:1.00: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,10:0.48: 0.17:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,3:0.29:-0.66:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,5:0.17: 2.41:0.996:0.998 0/0/0/1:4:30,8:0.32: 1.09:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,7:0.41:-0.16:1.000:0.882 0/0/0/1:4:14,2:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,9:0.31: 1.67:1.000:0.972 0/0/0/1:4:18,6:0.36:-0.08:1.000:0.690 0/0/1/1:4:16,7:0.41:-0.16:1.000:0.882 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.25: 0.34:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,4:0.28:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,12:0.44: 0.92:1.000:0.970 -chr3.1 57758445 chr3.1_057758445 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:113,76:0.49: 1.13:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,65:0.48: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,67:0.44: 1.15:1.000:0.969 0/0/0/1:4:118,29:0.29: 0.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:122,13:0.20: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,7:0.21:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,18:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,18:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,7:0.50:-2.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,12:0.49:-2.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,84:0.50: 1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,73:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,67:0.48: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,92:0.52: 1.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:137,18:0.22: 0.43:0.998:1.000 0/0/1/1:4:75,93:0.57: 0.69:1.000:0.942 0/0/1/1:4:168,94:0.45: 2.62:1.000:0.976 0/0/1/1:4:152,94:0.47: 2.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:10,4:0.38:-2.46:1.000:0.542 0/0/1/1:4:91,65:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,77:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,17:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.69:-2.46:1.000:0.977 0/0/0/1:4:121,11:0.19:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,18:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,20:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,69:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,79:0.46: 1.64:1.000:0.985 0/0/0/1:4:103,15:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,13:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,2:0.23:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,26:0.61:-1.91:1.000:0.650 1/1/1:3:0,6:1.00:-2.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,69:0.44: 1.27:1.000:0.968 0/0/0/1:4:103,11:0.20:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,20:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,73:0.46: 1.29:1.000:0.986 0/0/1/1:4:115,94:0.52: 1.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,68:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,73:0.54: 0.33:1.000:0.989 0/0/0/1:4:109,10:0.19:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,66:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,73:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,62:0.52: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,84:0.51: 1.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,50:0.70:-1.46:1.000:0.982 0/0/1/1:4:100,70:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,78:0.58: 0.10:1.000:0.930 0/0/0/1:4:76,15:0.26:-0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,63:0.45: 0.80:1.000:0.982 0/0/0/1:4:81,10:0.21:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,87:0.52: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,68:0.52: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,67:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,74:0.52: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,59:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,54:0.43: 0.47:1.000:0.953 0/0/0/1/1/1:6:75,47:0.47:-0.25:1.000:0.844 0/0/1/1:4:94,53:0.45: 0.26:1.000:0.978 0/0/0/1:4:85,13:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,20:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,69:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,63:0.43: 1.04:1.000:0.945 0/0/1/1:4:97,71:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,36:0.45:-0.74:1.000:0.984 0/0/0/1:4:81,18:0.28:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,70:0.53: 0.31:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,83:0.51: 1.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,9:0.26:-1.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,75:0.51: 0.78:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,52:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,62:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,54:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,76:0.49: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,85:0.53: 0.98:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-2.12:0.999:1.000 0/0/0/1:4:115,19:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,12:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,16:0.27:-0.78:1.000:0.998 0/0/1/1/1:5:71,78:0.56: 0.31:0.712:0.903 0/0/0/1:4:124,22:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,12:0.23:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,17:0.28:-0.88:1.000:0.994 0/0/1/1:4:72,52:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,47:0.44:-0.04:1.000:0.973 0/0/0/1:4:77,15:0.26:-0.86:0.999:0.999 0/0/0/1:4:82,15:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,15:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,47:0.45:-0.08:1.000:0.979 0/0/0/1:4:134,33:0.29: 0.67:1.000:0.989 0/0/0/1:4:102,15:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,13:0.25:-1.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,15:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,21:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,37:0.46:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:91,59:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,14:0.28:-1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,14:0.26:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,59:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,13:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,39:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,15:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,34:0.30: 0.61:1.000:0.981 0/0/0/1:4:126,15:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,54:0.47: 0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:153,93:0.46: 2.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:94,18:0.26:-0.45:0.999:0.999 0/0/1/1:4:135,69:0.43: 1.43:1.000:0.939 0/0/1/1:4:57,32:0.45:-0.93:1.000:0.977 0/0/0/1:4:107,9:0.19:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,47:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,10:0.26:-1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,56:0.46: 0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:67,7:0.20:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,86:0.52: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,63:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,87:0.54: 0.94:1.000:0.990 0/0/1/1:4:99,85:0.52: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,58:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,14:0.26:-1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,76:0.50: 1.00:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,16:0.27:-0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,10:0.24:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,53:0.48: 0.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:133,15:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,46:0.52:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,51:0.45: 0.12:1.000:0.982 0/0/0/1:4:85,16:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,20:0.22: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,60:0.48: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,17:0.26:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,9:0.21:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,10:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,20:0.27:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,59:0.47: 0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:87,64:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,8:0.22:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,21:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,85:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,70:0.42: 1.66:1.000:0.894 0/0/1/1:4:93,62:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,22:0.26: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,86:0.53: 0.92:1.000:0.991 0/0/1/1:4:132,90:0.49: 1.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,27:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,22:0.60:-2.01:1.000:0.776 0/0/0/1:4:60,17:0.32:-1.17:1.000:0.961 0/0/1/1:4:116,83:0.50: 1.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,20:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,20:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,26:0.27: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,13:0.22:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,70:0.47: 1.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:93,32:0.35:-0.19:1.000:0.793 0/0/0/1:4:87,11:0.22:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,15:0.22:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,59:0.43: 0.84:1.000:0.936 0/0/0/1:4:106,15:0.23:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,19:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,15:0.22:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.72:0.996:1.000 0/0/1/1:4:103,66:0.48: 0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:101,16:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,26:0.31:-0.21:1.000:0.979 0/0/0/1:4:64,15:0.29:-1.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:107,19:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,18:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,10:0.21:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,65:0.52: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:150,119:0.51: 2.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,89:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,76:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,75:0.54: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:109,21:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,80:0.45: 1.82:1.000:0.976 0/0/0/1:4:155,27:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,69:0.51: 0.57:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.05:1.000:1.000 -chr3.1 57983297 chr3.1_057983297 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:140,372:0.75: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:367,90:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:117,290:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:139,338:0.73: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:158,381:0.73: 1.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:133,347:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,234:0.73:-1.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:238,226:0.51: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:253,202:0.47: 0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,78:0.73:-3.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,116:0.78:-2.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:495,1:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,200:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:252,227:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:246,233:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:285,244:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:260,240:0.50: 0.61:0.998:0.997 0/0/0/1:4:393,109:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:316,288:0.50: 1.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:168,454:0.75: 1.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,80:0.60:-3.02:1.000:0.799 0/1/1/1:4:126,346:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,402:0.75: 1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,312:0.78:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,43:0.60:-3.67:1.000:0.817 0/1/1/1:4:130,388:0.77: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,229:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:128,334:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:287,269:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:132,381:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,370:0.78: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,283:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,62:0.56:-3.25:1.000:0.970 0/1/1/1:4:49,136:0.76:-2.56:1.000:1.000 0/0/1:3:33,18:0.38:-3.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,235:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:135,319:0.73: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:131,373:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:270,257:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:157,378:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/0/1/1:4:232,211:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:118,312:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:133,345:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,289:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:115,368:0.78: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,236:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:334,276:0.48: 1.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:116,243:0.70:-0.81:1.000:0.985 0/1/1/1:4:110,283:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:261,196:0.46: 0.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:189,209:0.55:-0.42:1.000:0.981 0/1/1/1:4:140,409:0.77: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,165:0.48:-0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:276,230:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/1/1/1:4:136,305:0.72: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:256,230:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,305:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,308:0.73:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:239,220:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:115,276:0.73:-0.49:1.000:0.689 0/1/1/1:4:119,307:0.74:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:130,306:0.73:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:274,262:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,197:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:143,338:0.73: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:244,218:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,188:0.53:-0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:231,186:0.47:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:292,212:0.45: 0.65:1.000:0.977 0/0/1/1:4:217,206:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:142,369:0.75: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:194,130:0.43:-1.16:1.000:0.944 0/0/0/0:4:523,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,331:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:405,123:0.27: 0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:203,200:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:215,199:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:263,197:0.45: 0.21:1.000:0.984 0/0/1/1:4:241,189:0.47:-0.10:1.000:0.990 0/1/1/1:4:131,372:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:278,73:0.25:-0.89:0.999:0.999 0/0/1/1:4:252,226:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:274,230:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:216,185:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:311,357:0.56: 2.30:0.712:0.909 0/1/1/1:4:146,388:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,254:0.72:-0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:99,277:0.76:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:131,305:0.72:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,190:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:208,185:0.49:-0.47:0.999:0.997 0/0/1/1:4:231,212:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:119,320:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:106,295:0.76:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,248:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:259,224:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,184:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:276,74:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:128,312:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:136,356:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,154:0.52:-1.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,241:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,160:0.51:-1.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,311:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,167:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,307:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,164:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:115,307:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:143,371:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,234:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,196:0.49:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:333,319:0.51: 2.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:236,221:0.51: 0.18:0.999:0.996 0/1/1/1:4:128,369:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,158:0.49:-1.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,342:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,304:0.75:-0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,299:0.78:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,204:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,229:0.76:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:227,250:0.55: 0.38:1.000:0.982 0/0/1/1:4:238,177:0.45:-0.25:1.000:0.982 0/0/1/1:4:264,220:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:282,246:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:223,197:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:237,222:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,201:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:415,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,168:0.55:-1.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:165,177:0.54:-0.98:1.000:0.987 0/1/1/1:4:88,266:0.77:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,229:0.54: 0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:137,128:0.51:-1.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:149,324:0.71: 0.34:1.000:0.991 0/1/1/1:4:104,291:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:313,273:0.49: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,223:0.51: 0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:96,282:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,192:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:203,203:0.52:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:239,228:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,193:0.47:-0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:239,198:0.48:-0.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,241:0.77:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,284:0.51: 1.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:184,482:0.75: 2.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:142,345:0.73: 0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:119,329:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,351:0.78: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,189:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:293,252:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:110,265:0.73:-0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,40:0.44:-3.44:1.000:0.966 0/1/1/1:4:102,253:0.74:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:272,266:0.52: 0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:258,254:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:184,401:0.71: 1.46:1.000:0.991 0/1/1/1:4:153,404:0.75: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:216,204:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:219,242:0.55: 0.22:1.000:0.981 0/1/1/1:4:99,342:0.79: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,300:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,332:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:263,235:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:126,358:0.76: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,378:0.80: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,300:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:499,2:0.00: 0.62:0.996:1.000 0/0/1/1:4:247,192:0.46:-0.01:1.000:0.989 0/1/1/1:4:107,277:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:123,252:0.70:-0.65:1.000:0.981 0/1/1/1:4:113,268:0.73:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:242,213:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:226,186:0.48:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:103,292:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,198:0.53:-0.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:298,270:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:286,248:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:255,231:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:275,170:0.41: 0.05:1.000:0.869 0/1/1/1:4:145,399:0.76: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:332,292:0.49: 1.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:141,402:0.76: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,303:0.73:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:387,108:0.26: 0.56:1.000:0.999 -chr3.1 58234082 chr3.1_058234082 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:89,269:0.77: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:310,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,128:0.48:-0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:211,174:0.47: 0.42:1.000:0.993 0/0/0/1:4:353,172:0.34: 2.09:1.000:0.848 0/0/1/1:4:228,208:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,115:0.46:-1.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:195,148:0.45:-0.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:205,145:0.43: 0.00:1.000:0.954 0/0/1/1:4:59,53:0.49:-2.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,126:0.82:-2.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:302,77:0.21: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,160:0.52:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:202,165:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:184,150:0.47:-0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:198,198:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:255,108:0.31: 0.16:0.998:0.970 0/0/1/1:4:189,180:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:147,387:0.74: 2.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:129,310:0.72: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,94:0.52:-1.94:1.000:0.994 0/1/1/1:4:80,217:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:121,332:0.75: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,165:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,143:0.81:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,123:0.36: 0.09:1.000:0.681 0/0/0/1:4:286,74:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,198:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:105,369:0.80: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,274:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,49:0.18:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,152:0.56:-0.81:1.000:0.969 0/1/1/1:4:26,107:0.82:-2.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,161:0.84:-1.85:1.000:0.993 0/1/1:3:28,69:0.73:-3.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,136:0.43:-0.21:1.000:0.942 0/0/1/1:4:160,179:0.55:-0.13:1.000:0.982 0/0/0/1:4:280,120:0.31: 0.60:1.000:0.966 0/0/1/1:4:165,109:0.42:-0.90:1.000:0.896 0/1/1/1:4:78,205:0.74:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:182,229:0.58: 0.73:1.000:0.926 0/1/1/1:4:90,230:0.74:-0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:171,200:0.56: 0.25:1.000:0.969 0/1/1/1:4:81,215:0.74:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:217,186:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:102,284:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:232,199:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,50:0.81:-3.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,131:0.48:-0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,63:0.40:-2.22:1.000:0.805 0/0/0/1:4:242,96:0.30:-0.14:1.000:0.987 0/1/1/1:4:89,237:0.74:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:248,116:0.33: 0.17:1.000:0.903 0/0/1/1:4:238,221:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,250:0.72: 0.10:1.000:0.994 0/1/1/1:4:77,208:0.75:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,146:0.46:-0.22:1.000:0.988 0/1/1/1:4:76,239:0.78:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,187:0.70:-0.89:1.000:0.983 0/0/0/1/1/1:6:151,159:0.53:-0.47:1.000:0.826 0/0/1/1:4:190,195:0.53: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:185,178:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,191:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,90:0.48:-1.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,236:0.74:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,129:0.42:-0.38:1.000:0.929 0/1/1/1:4:74,232:0.78:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,163:0.45: 0.37:1.000:0.977 0/0/1/1:4:199,180:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:292,91:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,231:0.55: 1.02:1.000:0.979 0/0/0/1:4:165,67:0.30:-1.40:1.000:0.982 0/0/0/1:4:196,58:0.24:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,249:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:280,91:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,185:0.79:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,182:0.54: 0.00:1.000:0.987 0/1/1/1:4:114,277:0.73: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,157:0.45: 0.16:1.000:0.982 0/0/1/1:4:213,228:0.54: 1.09:1.000:0.989 0/0/0/0:4:332,0:0.00:-0.21:0.999:1.000 0/0/0/1:4:319,76:0.20: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,222:0.54: 0.95:1.000:0.989 0/0/0/1:4:266,80:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:133,228:0.65: 0.13:0.712:0.903 0/0/1/1:4:221,253:0.55: 1.48:1.000:0.976 0/0/0/1:4:213,105:0.35:-0.38:1.000:0.828 0/0/1/1:4:185,192:0.53: 0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:68,282:0.82: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,193:0.57: 0.03:1.000:0.951 0/0/0/1:4:205,73:0.28:-0.86:0.999:0.997 0/0/0/1:4:281,119:0.31: 0.60:1.000:0.970 0/0/0/1:4:308,71:0.20: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,157:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:259,83:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,195:0.55: 0.24:1.000:0.982 0/0/1/1:4:187,188:0.52: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:158,135:0.48:-0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,286:0.55: 2.23:1.000:0.977 0/0/1/1:4:226,183:0.47: 0.71:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,222:0.73:-0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,248:0.72: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:258,106:0.31: 0.17:1.000:0.980 0/0/1/1:4:196,174:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,225:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,249:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,111:0.46:-1.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:304,77:0.21: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:273,273:0.52: 2.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,130:0.42:-0.35:1.000:0.931 0/1/1/1:4:84,292:0.79: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:284,265:0.50: 2.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:295,77:0.22: 0.27:0.999:1.000 0/0/1/1:4:167,156:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,161:0.74:-1.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:231,106:0.33:-0.15:1.000:0.923 0/1/1/1:4:87,255:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,114:0.35:-0.15:1.000:0.752 0/1/1/1:4:75,244:0.78:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,62:0.21:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,250:0.73: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,288:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,210:0.54: 0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:225,207:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,249:0.59: 1.04:1.000:0.869 0/0/1/1:4:229,265:0.56: 1.72:1.000:0.972 0/0/1/1:4:174,177:0.52: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:134,138:0.53:-0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:137,111:0.47:-1.21:1.000:0.991 0/0/0/1:4:230,112:0.34:-0.09:1.000:0.849 0/0/1/1:4:183,174:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,92:0.33:-0.74:1.000:0.899 0/0/1/1:4:120,101:0.48:-1.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:160,121:0.45:-0.82:1.000:0.980 0/0/0/1:4:251,60:0.20:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,239:0.50: 1.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,226:0.78:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,81:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,142:0.46:-0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:261,89:0.27: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:208,213:0.53: 0.85:1.000:0.993 0/1/1/1:4:123,314:0.74: 1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:94,259:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,165:0.57:-0.58:1.000:0.952 0/0/1/1:4:240,265:0.54: 1.85:1.000:0.984 0/0/1/1:4:274,246:0.49: 2.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:119,273:0.71: 0.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:101,293:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,182:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,152:0.51:-0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:114,337:0.76: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,190:0.54: 0.19:1.000:0.988 0/1/1/1:4:33,85:0.74:-2.76:1.000:0.998 0/1/1/1:4:92,260:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,227:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:334,124:0.28: 1.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:267,226:0.48: 1.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:310,78:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,155:0.49:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,262:0.73: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:290,117:0.30: 0.68:1.000:0.984 0/0/1/1:4:142,169:0.56:-0.46:1.000:0.961 0/0/1/1:4:170,165:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,285:0.78: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,85:0.31:-0.70:1.000:0.979 0/0/0/1:4:314,105:0.26: 0.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:234,73:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,149:0.44: 0.03:0.996:0.971 0/0/1/1:4:219,152:0.43: 0.25:1.000:0.942 0/0/1/1:4:190,203:0.54: 0.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:184,168:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:202,81:0.30:-0.80:1.000:0.985 0/0/1/1:4:219,152:0.43: 0.25:1.000:0.942 0/0/0/1:4:303,116:0.29: 0.83:1.000:0.992 0/0/0/1:4:205,49:0.20:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,228:0.74:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,229:0.70:-0.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:216,239:0.55: 1.26:1.000:0.984 0/1/1/1:4:109,244:0.71: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:180,134:0.45:-0.43:1.000:0.975 0/0/0/1:4:363,89:0.21: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,172:0.46: 0.52:1.000:0.986 0/0/0/1:4:411,162:0.30: 2.66:1.000:0.988 0/1/1/1:4:68,231:0.79:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:322,82:0.21: 0.65:1.000:1.000 -chr3.1 58435025 chr3.1_058435025 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:41,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.82:0.998:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.61:1.000:. ./.:6:20,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:68,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.45:0.999:. ./.:4:81,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:67,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.64:1.000:. ./.:5:54,0:.: 0.64:0.712:. ./.:4:48,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:48,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.93:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:45,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:36,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:80,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.65:0.996:. ./.:4:36,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.13:1.000:. -chr3.1 58489131 chr3.1_058489131 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:179,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:122,41:.:-0.01:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:169,62:.: 1.38:1.000:. ./.:4:119,129:.: 1.73:1.000:. ./.:4:102,41:.:-0.42:1.000:. ./.:4:134,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:135,49:.: 0.42:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:10,5:.:-3.05:1.000:. ./.:4:85,107:.: 0.58:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,70:.: 1.30:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:125,120:.: 1.67:1.000:. ./.:4:105,106:.: 0.97:0.998:. ./.:4:88,94:.: 0.38:1.000:. ./.:4:168,64:.: 1.40:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:13,10:.:-2.88:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:142,54:.: 0.66:1.000:. ./.:4:127,56:.: 0.40:1.000:. ./.:4:6,5:.:-3.13:1.000:. ./.:4:94,123:.: 1.09:1.000:. ./.:4:181,63:.: 1.65:1.000:. ./.:4:84,110:.: 0.62:1.000:. ./.:4:154,65:.: 1.14:1.000:. ./.:4:128,45:.: 0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:119,50:.: 0.11:1.000:. ./.:4:6,2:.:-3.19:1.000:. ./.:4:20,4:.:-2.86:1.000:. ./.:3:2,1:.:-3.29:1.000:. ./.:4:145,51:.: 0.66:1.000:. ./.:4:141,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:153,59:.: 0.99:1.000:. ./.:4:112,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:158,44:.: 0.79:1.000:. ./.:4:71,89:.:-0.07:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,97:.: 0.15:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:138,43:.: 0.36:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:167,57:.: 1.24:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,28:.:-1.18:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:62,90:.:-0.24:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:127,37:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,47:.:-0.46:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:130,37:.: 0.07:1.000:. ./.:6:96,12:.:-1.14:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:61,82:.:-0.42:1.000:. ./.:4:75,90:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:146,48:.: 0.62:1.000:. ./.:4:64,86:.:-0.28:1.000:. ./.:4:131,36:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,58:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,31:.:-0.81:1.000:. ./.:4:99,44:.:-0.42:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:64,84:.:-0.32:1.000:. ./.:4:83,26:.:-1.12:1.000:. ./.:4:70,59:.:-0.71:1.000:. ./.:4:77,75:.:-0.24:1.000:. ./.:4:118,67:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,22:.:-1.12:0.999:. ./.:4:126,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:83,99:.: 0.38:1.000:. ./.:4:78,35:.:-1.04:1.000:. ./.:5:110,85:.: 0.64:0.712:. ./.:4:136,49:.: 0.44:1.000:. ./.:4:86,27:.:-1.04:1.000:. ./.:4:87,38:.:-0.79:1.000:. ./.:4:99,38:.:-0.55:1.000:. ./.:4:71,67:.:-0.53:1.000:. ./.:4:85,27:.:-1.06:0.999:. ./.:4:65,79:.:-0.40:1.000:. ./.:4:125,46:.: 0.15:1.000:. ./.:4:92,40:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,54:.:-0.28:1.000:. ./.:4:81,97:.: 0.30:1.000:. ./.:4:55,63:.:-0.94:1.000:. ./.:4:79,35:.:-1.02:1.000:. ./.:4:114,70:.: 0.42:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:76,50:.:-0.77:1.000:. ./.:4:132,39:.: 0.15:1.000:. ./.:4:48,60:.:-1.14:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:89,36:.:-0.79:1.000:. ./.:4:119,38:.:-0.14:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:156,70:.: 1.28:1.000:. ./.:4:121,57:.: 0.30:1.000:. ./.:4:78,86:.: 0.01:1.000:. ./.:4:166,82:.: 1.73:1.000:. ./.:4:106,42:.:-0.32:0.999:. ./.:4:185,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:59,81:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:96,40:.:-0.57:1.000:. ./.:4:61,71:.:-0.65:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:79,85:.: 0.01:1.000:. ./.:4:75,99:.: 0.21:1.000:. ./.:4:136,47:.: 0.40:1.000:. ./.:4:118,39:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,100:.: 0.56:1.000:. ./.:4:121,47:.: 0.09:1.000:. ./.:4:52,67:.:-0.92:1.000:. ./.:4:80,31:.:-1.08:1.000:. ./.:4:57,71:.:-0.73:1.000:. ./.:4:100,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:102,97:.: 0.73:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:131,151:.: 2.43:1.000:. ./.:4:121,47:.: 0.09:1.000:. ./.:4:103,46:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,32:.:-1.12:1.000:. ./.:4:109,35:.:-0.40:1.000:. ./.:4:74,87:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,82:.:-0.32:1.000:. ./.:4:135,45:.: 0.34:1.000:. ./.:4:52,62:.:-1.02:1.000:. ./.:4:134,126:.: 1.98:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:135,36:.: 0.15:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:79,93:.: 0.17:1.000:. ./.:4:138,128:.: 2.10:1.000:. ./.:4:92,82:.: 0.21:1.000:. ./.:4:9,7:.:-3.03:1.000:. ./.:4:110,50:.:-0.07:1.000:. ./.:4:150,57:.: 0.89:1.000:. ./.:4:86,116:.: 0.79:1.000:. ./.:4:155,65:.: 1.16:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:88,95:.: 0.40:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:84,120:.: 0.83:1.000:. ./.:4:118,35:.:-0.22:1.000:. ./.:4:123,33:.:-0.16:1.000:. ./.:4:143,54:.: 0.68:1.000:. ./.:4:170,55:.: 1.26:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:129,43:.: 0.17:1.000:. ./.:4:222,1:.: 1.22:0.996:. ./.:4:122,53:.: 0.23:1.000:. ./.:4:102,93:.: 0.64:1.000:. ./.:4:129,53:.: 0.38:1.000:. ./.:4:88,43:.:-0.67:1.000:. ./.:4:122,47:.: 0.11:1.000:. ./.:4:80,114:.: 0.62:1.000:. ./.:4:88,42:.:-0.69:1.000:. ./.:4:70,84:.:-0.20:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:155,74:.: 1.34:1.000:. ./.:4:73,99:.: 0.17:1.000:. ./.:4:157,50:.: 0.89:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:150,63:.: 1.01:1.000:. ./.:4:120,156:.: 2.31:1.000:. ./.:4:116,51:.: 0.07:1.000:. ./.:4:133,52:.: 0.44:1.000:. -chr3.1 58546385 chr3.1_058546385 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:197,46:0.22: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,47:0.28: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:174,52:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,60:0.31: 0.44:1.000:0.967 0/0/0/1:4:178,58:0.28: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,118:0.46: 1.57:1.000:0.986 0/0/0/1:4:123,35:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,42:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,55:0.26: 0.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,7:0.16:-2.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,10:0.33:-2.76:1.000:0.936 0/1/1/1:4:56,158:0.73: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:154,40:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,99:0.46: 0.75:1.000:0.988 0/0/0/1:4:158,45:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,157:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,111:0.48: 1.04:0.998:0.995 1/1/1/1:4:0,213:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,121:0.47: 1.57:1.000:0.992 0/0/0/1:4:219,50:0.21: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,6:0.19:-2.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,54:0.28: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,103:0.47: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:162,45:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,26:0.71:-2.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:136,109:0.48: 1.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:162,47:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,94:0.54:-0.09:1.000:0.989 0/0/1/1:4:118,87:0.45: 0.30:1.000:0.984 0/0/1/1:4:140,125:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/0:4:258,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,57:0.29: 0.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:31,5:0.16:-2.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:23,10:0.33:-2.78:1.000:0.899 0/0/1:3:21,7:0.28:-2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,97:0.48: 0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:167,59:0.29: 0.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:178,45:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,84:0.43: 0.41:1.000:0.944 0/0/1/1:4:133,105:0.47: 0.89:1.000:0.993 0/1/1/1:4:67,127:0.66: 0.10:1.000:0.842 0/0/0/1:4:136,46:0.29:-0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:128,81:0.42: 0.37:1.000:0.908 0/0/0/1:4:151,39:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,37:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,95:0.51: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,63:0.28: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,15:0.51:-2.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,30:0.19:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,19:0.19:-1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,29:0.24:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,61:0.28: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,59:0.45:-0.86:1.000:0.982 0/0/0/1:4:146,45:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,108:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,89:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,43:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,43:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,71:0.44:-0.27:1.000:0.969 0/0/0/0/1/1:6:91,36:0.32:-1.10:1.000:0.910 0/0/0/1:4:138,34:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,82:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,67:0.39:-0.02:1.000:0.686 0/0/1/1:4:96,53:0.39:-0.70:1.000:0.656 0/0/0/1:4:185,38:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,45:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,53:0.49:-1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,43:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,119:0.66:-0.13:1.000:0.859 0/0/1/1:4:109,95:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,93:0.52:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,22:0.27:-1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,111:0.46: 1.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:177,59:0.28: 0.86:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,143:0.74: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,86:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,107:0.70:-0.67:1.000:0.986 0/1/1/1:4:40,103:0.71:-0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,79:0.46:-0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:110,91:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:136,28:0.20:-0.43:0.999:1.000 0/0/0/1:4:147,54:0.30: 0.23:1.000:0.984 0/0/1/1:4:105,60:0.39:-0.42:1.000:0.743 0/0/0/1:4:131,47:0.30:-0.18:1.000:0.988 0/0/1/1/1:5:86,99:0.56:-0.06:0.712:0.900 0/0/0/1:4:173,37:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,25:0.22:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,32:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,78:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,117:0.66:-0.20:1.000:0.878 0/0/0/1:4:112,39:0.29:-0.67:0.999:0.992 0/0/1/1:4:104,78:0.46:-0.11:1.000:0.987 0/0/0/1:4:164,41:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,50:0.43:-1.15:1.000:0.956 0/0/0/1:4:146,37:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,77:0.47:-0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:88,58:0.43:-0.76:1.000:0.941 0/1/1/1:4:43,104:0.70:-0.74:1.000:0.986 0/0/0/1:4:148,31:0.20:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,55:0.46:-1.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:100,91:0.51: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,53:0.45:-1.10:1.000:0.978 0/0/0/0:4:187,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,50:0.41:-1.03:1.000:0.879 0/0/1/1:4:91,73:0.48:-0.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:124,35:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:220,49:0.21: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,62:0.28: 1.04:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,98:0.68:-0.81:1.000:0.958 0/0/1/1:4:162,129:0.47: 1.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:132,36:0.25:-0.36:0.999:0.999 0/0/0/1:4:166,30:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,66:0.68:-1.65:1.000:0.962 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,50:0.47:-1.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:93,83:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,22:0.17:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,28:0.19:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,85:0.74:-1.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,101:0.68:-0.70:1.000:0.941 0/0/1/1:4:122,100:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,53:0.35:-0.43:1.000:0.746 0/0/1/1:4:102,73:0.45:-0.24:1.000:0.978 0/0/1/1:4:99,66:0.43:-0.42:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,28:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,57:0.50:-1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,65:0.47:-0.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,100:0.47: 0.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:116,24:0.20:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,44:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,139:0.54: 1.39:1.000:0.985 0/0/1/1:4:115,93:0.48: 0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:112,34:0.27:-0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,29:0.25:-0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,28:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,75:0.53:-0.74:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,95:0.69:-0.94:1.000:0.978 0/0/1/1:4:113,108:0.52: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,43:0.42:-1.40:1.000:0.921 0/0/1/1:4:141,115:0.48: 1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:215,49:0.21: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,62:0.26: 1.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,104:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,117:0.69:-0.36:1.000:0.975 0/1/1/1:4:67,205:0.74: 1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,123:0.53: 0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:17,11:0.42:-2.87:1.000:0.928 0/0/1/1:4:108,100:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,101:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,114:0.53: 0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:137,150:0.54: 1.77:1.000:0.985 0/0/0/0:4:221,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,93:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,42:0.20: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,100:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,53:0.31: 0.05:1.000:0.974 0/0/0/1:4:149,35:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,102:0.47: 0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:173,26:0.15: 0.19:1.000:0.988 0/0/0/0:4:221,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,38:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,104:0.50: 0.60:0.996:0.997 0/0/1/1:4:129,98:0.46: 0.69:1.000:0.989 0/0/1/1:4:105,96:0.51: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:166,34:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,37:0.26:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,53:0.30: 0.21:1.000:0.987 0/0/1/1:4:108,82:0.46: 0.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:164,33:0.19: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,116:0.70:-0.42:1.000:0.982 0/0/0/1:4:222,63:0.25: 1.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,125:0.52: 1.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:73,153:0.67: 0.68:1.000:0.939 0/0/1/1:4:124,110:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/0:4:256,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,125:0.44: 2.06:1.000:0.972 0/0/1/1:4:159,160:0.53: 2.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,86:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,100:0.51: 0.32:1.000:0.996 -chr3.1 58741122 chr3.1_058741122 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:162,33:0.21: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,51:0.44:-0.49:1.000:0.969 0/0/0/1:4:116,30:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,35:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:170,45:0.26: 1.76:1.000:0.999 0/0/0/0:4:207,1:0.01: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,33:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,30:0.22: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,15:0.45:-2.84:1.000:0.978 0/0/0/1:4:49,18:0.32:-2.06:1.000:0.960 0/0/1/1:4:64,59:0.52:-0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,44:0.44:-0.93:1.000:0.966 0/0/0/1:4:118,29:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,67:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:176,47:0.26: 1.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,29:0.20: 0.86:0.998:1.000 0/0/0/1:4:103,32:0.29:-0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,79:0.43: 1.45:1.000:0.953 0/0/0/1:4:166,37:0.23: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,5:0.17:-2.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,32:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:117,35:0.28: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,6:0.33:-3.25:1.000:0.905 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,36:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:196,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,77:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:142,35:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,23:0.18: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,27:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,10:0.32:-2.84:1.000:0.957 0/0/1/1:4:24,12:0.38:-2.86:1.000:0.558 0/0/0:3:18,2:0.13:-3.28:1.000:0.930 0/0/0/1:4:132,35:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,28:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,23:0.17: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,62:0.43: 0.39:1.000:0.936 0/0/0/1:4:156,24:0.17: 0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,30:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,22:0.17: 0.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,34:0.31:-0.41:1.000:0.976 0/0/0/1:4:111,37:0.30: 0.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:87,62:0.46: 0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:84,68:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,59:0.33: 1.71:1.000:0.939 0/0/0/1:4:108,26:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,51:0.46:-0.62:1.000:0.986 0/0/0/1:4:110,24:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,46:0.29: 1.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:124,22:0.19:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,66:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:137,29:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,72:0.54:-0.10:1.000:0.989 0/0/0/1:4:124,22:0.19:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,39:0.32:-0.05:1.000:0.960 0/0/0/1:4:122,26:0.22: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:78,28:0.31:-1.05:1.000:0.906 0/0/0/1:4:120,27:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,37:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,30:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,25:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,64:0.46: 0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:90,16:0.19:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,23:0.21:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,30:0.29:-0.56:1.000:0.992 0/0/0/1:4:126,31:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,43:0.30: 0.70:1.000:0.988 0/0/0/1:4:71,24:0.30:-1.34:1.000:0.983 0/1/1/1:4:45,94:0.68:-0.20:1.000:0.959 0/0/0/1:4:169,42:0.25: 1.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,25:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,20:0.22:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,31:0.25: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,25:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,47:0.28: 1.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,35:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,45:0.46:-1.00:0.999:0.987 0/0/0/1:4:123,34:0.27: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,37:0.28: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,33:0.27: 0.16:1.000:0.998 0/0/0/0/1:5:143,24:0.18: 0.52:0.712:0.998 0/0/0/1:4:150,40:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,20:0.26:-1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,23:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,29:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,29:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,19:0.23:-1.16:0.999:1.000 0/0/0/1:4:131,33:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,36:0.30:-0.12:1.000:0.983 0/0/0/1:4:128,28:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,24:0.19: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,19:0.18:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,57:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,24:0.20: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,29:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,16:0.22:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,34:0.26: 0.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,16:0.18:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,26:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,47:0.48:-1.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:117,38:0.29: 0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:55,62:0.56:-0.77:1.000:0.969 0/0/0/1:4:144,22:0.17: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,36:0.22: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,27:0.21: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,32:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,69:0.39: 1.35:1.000:0.713 0/0/0/1:4:123,32:0.26: 0.21:0.999:0.999 0/0/0/1:4:114,27:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,19:0.25:-1.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,23:0.29:-1.29:1.000:0.993 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,50:0.47:-0.77:1.000:0.992 0/0/0/1:4:102,22:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,65:0.46: 0.26:1.000:0.985 0/0/0/1:4:106,32:0.28:-0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,25:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,75:0.47: 0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:69,65:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:105,28:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,28:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,43:0.45:-1.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:86,21:0.25:-1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,19:0.23:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,28:0.28:-0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,39:0.30: 0.26:1.000:0.987 0/0/1/1:4:40,32:0.49:-1.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,26:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,27:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,42:0.24: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,32:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.22:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,28:0.28:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,31:0.28:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,30:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,50:0.45:-0.59:1.000:0.975 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,30:0.21: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,39:0.24: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,42:0.27: 1.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:135,35:0.26: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,41:0.23: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,19:0.17:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,45:0.29: 1.01:1.000:0.991 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,7:0.29:-3.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:83,15:0.19:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,64:0.44: 0.39:1.000:0.964 0/0/0/1:4:138,32:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,28:0.18: 1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,31:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,16:0.17:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,61:0.45: 0.03:1.000:0.984 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,15:0.11: 0.63:1.000:0.501 0/0/0/1:4:135,37:0.27: 0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,77:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,18:0.19:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,36:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.38:0.996:1.000 0/0/0/1:4:121,29:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,23:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,24:0.20: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,32:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,12:0.17:-1.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,89:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,78:0.52: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,34:0.22: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,50:0.37: 0.24:1.000:0.604 0/0/0/1:4:134,29:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,31:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,27:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,64:0.44: 0.34:1.000:0.971 -chr3.1 58780248 chr3.1_058780248 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:397,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:336,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:323,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:100,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.06:0.998:. ./.:4:416,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:97,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:67,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:59,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:141,0:.:-2.37:1.000:. ./.:3:28,0:.:-3.66:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:65,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:477,3:.: 1.50:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.42:1.000:. ./.:6:287,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:430,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.39:1.000:. ./.:5:323,0:.:-0.29:0.712:. ./.:4:301,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:327,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:260,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:518,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:444,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:538,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:556,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:512,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:93,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:468,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:469,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.01:0.996:. ./.:4:354,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:278,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:556,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:490,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:378,3:.: 0.37:1.000:. -chr3.1 58989121 chr3.1_058989121 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:27,7:.: 0.44:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.89:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:2,2:.:-2.40:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:13,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:23,7:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,6:.: 1.10:1.000:. ./.:4:17,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:0.998:. ./.:4:27,5:.: 0.25:1.000:. ./.:4:27,6:.: 0.35:1.000:. ./.:4:26,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.82:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.40:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:32,9:.: 1.10:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:5,2:.:-2.12:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.69:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,7:.: 1.01:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.03:1.000:. ./.:4:28,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.35:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.31:1.000:. ./.:4:24,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:40,10:.: 1.96:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:31,6:.: 0.72:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.32:1.000:. ./.:4:34,7:.: 1.10:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.32:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.22:1.000:. ./.:6:15,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:21,9:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:23,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,10:.: 1.20:1.000:. ./.:4:8,5:.:-1.55:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,9:.: 0.06:1.000:. ./.:4:29,5:.: 0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:43,11:.: 2.34:1.000:. ./.:4:37,7:.: 1.39:1.000:. ./.:4:34,11:.: 1.48:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.44:1.000:. ./.:4:28,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:33,8:.: 1.10:1.000:. ./.:4:33,11:.: 1.39:1.000:. ./.:4:35,10:.: 1.48:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.25:0.999:. ./.:4:42,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.25:1.000:. ./.:5:42,3:.: 1.48:0.712:. ./.:4:49,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.03:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.55:0.999:. ./.:4:37,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,14:.:-0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.74:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:21,9:.: 0.06:1.000:. ./.:4:26,9:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.82:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:32,4:.: 0.63:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:38,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.70:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:27,5:.: 0.25:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:32,6:.: 0.82:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.41:1.000:. ./.:4:34,7:.: 1.10:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.72:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,9:.:-1.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.32:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.32:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.89:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:34,5:.: 0.91:1.000:. ./.:4:36,11:.: 1.67:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.93:1.000:. ./.:4:2,2:.:-2.40:1.000:. ./.:4:31,10:.: 1.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:32,6:.: 0.82:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,6:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.70:0.996:. ./.:4:26,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:10,4:.:-1.45:1.000:. ./.:4:27,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:39,9:.: 1.77:1.000:. ./.:4:36,6:.: 1.20:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:31,11:.: 1.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.35:1.000:. -chr3.1 59175868 chr3.1_059175868 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:182,251:.: 1.16:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:256,94:.:-0.07:1.000:. ./.:4:249,93:.:-0.19:1.000:. ./.:4:434,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:364,113:.: 1.81:1.000:. ./.:4:99,110:.:-2.16:1.000:. ./.:4:216,206:.: 1.00:1.000:. ./.:4:195,207:.: 0.70:1.000:. ./.:4:166,53:.:-2.02:1.000:. ./.:4:197,55:.:-1.53:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:241,102:.:-0.18:1.000:. ./.:4:240,113:.:-0.03:1.000:. ./.:4:236,100:.:-0.28:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.38:0.998:. ./.:4:345,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:288,127:.: 0.89:1.000:. ./.:4:162,255:.: 0.92:1.000:. ./.:4:219,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:130,199:.:-0.38:1.000:. ./.:4:223,107:.:-0.37:1.000:. ./.:4:185,197:.: 0.40:1.000:. ./.:4:131,45:.:-2.65:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:316,105:.: 0.98:1.000:. ./.:4:325,123:.: 1.38:1.000:. ./.:4:279,111:.: 0.52:1.000:. ./.:4:231,113:.:-0.16:1.000:. ./.:4:304,121:.: 1.04:1.000:. ./.:4:256,103:.: 0.06:1.000:. ./.:4:114,23:.:-3.23:1.000:. ./.:4:199,53:.:-1.53:1.000:. ./.:3:92,1:.:-3.89:1.000:. ./.:4:260,129:.: 0.51:1.000:. ./.:4:289,117:.: 0.76:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:239,88:.:-0.41:1.000:. ./.:4:261,121:.: 0.40:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:134,192:.:-0.43:1.000:. ./.:4:307,101:.: 0.79:1.000:. ./.:4:171,208:.: 0.36:1.000:. ./.:4:285,107:.: 0.55:1.000:. ./.:4:260,105:.: 0.15:1.000:. ./.:4:306,115:.: 0.98:1.000:. ./.:4:213,56:.:-1.27:1.000:. ./.:4:202,80:.:-1.08:1.000:. ./.:4:182,69:.:-1.54:1.000:. ./.:4:287,87:.: 0.29:1.000:. ./.:4:162,230:.: 0.55:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:275,101:.: 0.31:1.000:. ./.:4:218,83:.:-0.80:1.000:. ./.:4:219,107:.:-0.43:1.000:. ./.:4:217,99:.:-0.58:1.000:. ./.:4:177,216:.: 0.57:1.000:. ./.:4:144,217:.: 0.09:1.000:. ./.:6:290,58:.:-0.10:1.000:. ./.:4:262,104:.: 0.17:1.000:. ./.:4:265,86:.:-0.06:1.000:. ./.:4:369,103:.: 1.74:1.000:. ./.:4:219,104:.:-0.47:1.000:. ./.:4:171,225:.: 0.61:1.000:. ./.:4:260,81:.:-0.20:1.000:. ./.:4:87,124:.:-2.13:1.000:. ./.:4:185,220:.: 0.75:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:150,53:.:-2.25:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:127,180:.:-0.71:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:142,199:.:-0.20:1.000:. ./.:4:323,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:253,126:.: 0.36:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:312,120:.: 1.15:1.000:. ./.:4:337,123:.: 1.56:1.000:. ./.:4:244,101:.:-0.15:1.000:. ./.:5:323,115:.: 1.24:0.712:. ./.:4:355,102:.: 1.52:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:264,92:.: 0.02:1.000:. ./.:4:209,92:.:-0.80:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:211,81:.:-0.93:0.999:. ./.:4:342,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:359,92:.: 1.43:1.000:. ./.:4:246,1:.:-1.60:1.000:. ./.:4:285,98:.: 0.42:1.000:. ./.:4:308,91:.: 0.66:1.000:. ./.:4:293,91:.: 0.43:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:355,122:.: 1.81:1.000:. ./.:4:175,208:.: 0.42:1.000:. ./.:4:108,135:.:-1.66:1.000:. ./.:4:179,212:.: 0.54:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:195,189:.: 0.43:1.000:. ./.:4:217,95:.:-0.64:1.000:. ./.:4:204,92:.:-0.87:1.000:. ./.:4:215,86:.:-0.80:1.000:. ./.:4:323,105:.: 1.09:1.000:. ./.:4:356,121:.: 1.81:1.000:. ./.:4:189,189:.: 0.34:1.000:. ./.:4:268,99:.: 0.18:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:300,90:.: 0.52:0.999:. ./.:4:278,106:.: 0.43:1.000:. ./.:4:175,71:.:-1.62:1.000:. ./.:4:211,95:.:-0.72:1.000:. ./.:4:220,76:.:-0.87:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:146,205:.:-0.06:1.000:. ./.:4:233,83:.:-0.58:1.000:. ./.:4:119,197:.:-0.58:1.000:. ./.:4:220,111:.:-0.35:1.000:. ./.:4:320,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:318,129:.: 1.37:1.000:. ./.:4:240,99:.:-0.23:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:121,166:.:-1.01:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:164,69:.:-1.81:1.000:. ./.:4:221,81:.:-0.78:1.000:. ./.:4:273,107:.: 0.37:1.000:. ./.:4:375,132:.: 2.26:1.000:. ./.:4:152,222:.: 0.29:1.000:. ./.:4:311,101:.: 0.85:1.000:. ./.:4:161,219:.: 0.37:1.000:. ./.:4:272,88:.: 0.08:1.000:. ./.:4:300,114:.: 0.88:1.000:. ./.:4:237,107:.:-0.16:1.000:. ./.:4:224,99:.:-0.47:1.000:. ./.:4:253,85:.:-0.25:1.000:. ./.:4:337,110:.: 1.37:1.000:. ./.:4:309,122:.: 1.13:1.000:. ./.:4:152,209:.: 0.09:1.000:. ./.:4:232,101:.:-0.32:1.000:. ./.:4:204,204:.: 0.79:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:297,127:.: 1.03:1.000:. ./.:4:314,103:.: 0.92:1.000:. ./.:4:112,79:.:-2.43:1.000:. ./.:4:157,73:.:-1.85:1.000:. ./.:4:272,114:.: 0.46:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:287,118:.: 0.75:1.000:. ./.:4:305,103:.: 0.79:1.000:. ./.:4:317,90:.: 0.78:1.000:. ./.:4:135,189:.:-0.46:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:236,90:.:-0.43:1.000:. ./.:4:285,96:.: 0.39:1.000:. ./.:4:220,112:.:-0.34:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:315,96:.: 0.83:1.000:. ./.:4:274,96:.: 0.23:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.92:0.996:. ./.:4:238,108:.:-0.13:1.000:. ./.:4:294,100:.: 0.58:1.000:. ./.:4:194,211:.: 0.75:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:299,89:.: 0.49:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:249,97:.:-0.13:1.000:. ./.:4:211,88:.:-0.83:1.000:. ./.:4:162,283:.: 1.34:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:251,113:.: 0.14:1.000:. ./.:4:337,104:.: 1.28:1.000:. ./.:4:331,112:.: 1.31:1.000:. ./.:4:290,123:.: 0.86:1.000:. ./.:4:495,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:222,71:.:-0.92:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.34:1.000:. -chr3.1 59307087 chr3.1_059307087 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:148,193:0.54: 1.12:1.000:0.988 0/1/1/1:4:72,209:0.72: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,214:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,233:0.74: 0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,358:1.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,203:0.48: 2.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:167,39:0.25:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,83:0.31: 0.51:1.000:0.965 0/0/0/1:4:229,92:0.32: 0.82:1.000:0.948 0/1/1/1:4:15,57:0.77:-2.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,100:0.83:-2.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,128:0.48:-0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,203:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,155:0.57:-0.09:1.000:0.938 0/1/1/1:4:74,245:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,253:0.77: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,208:0.74: 0.11:0.998:0.999 0/0/1/1:4:141,174:0.53: 0.73:1.000:0.993 0/1/1/1:4:90,289:0.74: 1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,160:0.50: 0.59:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,78:0.99:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,139:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,225:0.77: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,75:0.34:-0.39:1.000:0.855 0/1/1/1:4:10,36:0.76:-3.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,282:0.75: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,143:0.47: 0.48:1.000:0.990 0/0/1/1:4:136,164:0.52: 0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,272:0.78: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,229:0.74: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,249:0.73: 0.95:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,248:0.79: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:6,57:0.90:-2.99:1.000:0.702 0/1/1/1:4:21,67:0.74:-2.62:1.000:0.999 1/1/1:3:0,40:1.00:-3.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,186:0.53: 1.03:1.000:0.993 0/1/1/1:4:72,238:0.75: 0.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,295:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,221:0.75: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,233:0.71: 0.78:1.000:0.992 0/1/1/1:4:56,224:0.78: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,162:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,161:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,136:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,243:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,265:0.77: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,274:0.78: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,192:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,254:0.80: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,245:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,130:0.55:-0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:158,194:0.52: 1.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,183:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,258:0.77: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,210:0.77:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,227:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,209:0.79:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,129:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:154,71:0.34:-0.60:1.000:0.845 0/1/1/1/1/1:6:27,192:0.87:-0.68:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,211:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,168:0.55: 0.42:1.000:0.984 0/0/1/1:4:115,135:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,109:0.45:-0.39:1.000:0.977 0/0/1/1:4:116,144:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:65,248:0.77: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,51:0.36:-1.69:1.000:0.690 0/0/0/1:4:173,65:0.31:-0.40:1.000:0.970 0/1/1/1:4:71,209:0.72: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,230:0.72: 0.64:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,309:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,68:0.49:-1.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,216:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,152:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,134:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,69:0.33:-0.52:1.000:0.912 0/1/1/1:4:68,228:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,205:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,130:0.49:-0.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,309:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,187:0.78:-0.46:0.999:1.000 0/0/1/1:4:118,139:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,142:0.53:-0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:118,135:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:144,231:0.59: 1.62:0.712:0.967 0/1/1/1:4:66,244:0.77: 0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,202:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,180:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,223:0.80: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,230:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,103:0.53:-1.19:0.999:0.992 0/1/1/1:4:65,212:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,162:0.50: 0.63:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,212:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,97:0.49:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,147:0.52: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,115:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,181:0.76:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,219:0.74: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,141:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,44:0.33:-1.73:1.000:0.921 0/0/0/1:4:181,89:0.35: 0.07:1.000:0.755 0/1/1/1:4:45,133:0.73:-1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,97:0.47:-1.00:1.000:0.993 0/1/1/1:4:56,156:0.71:-0.79:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,202:0.78:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,157:0.72:-0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:87,252:0.72: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:103,304:0.73: 2.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:220,83:0.31: 0.56:1.000:0.969 0/0/1/1:4:122,126:0.49:-0.26:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,389:1.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,126:0.48:-0.21:0.999:0.995 0/1/1/1:4:59,186:0.74:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,106:0.49:-0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,144:0.69:-0.95:1.000:0.979 0/1/1/1:4:39,132:0.75:-1.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,177:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,88:0.45:-1.08:1.000:0.979 0/1/1/1:4:56,170:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:135,129:0.47:-0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:105,136:0.54:-0.36:1.000:0.989 0/1/1/1:4:62,219:0.76: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,345:1.00: 1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,291:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,140:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,127:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,108:0.57:-1.25:1.000:0.943 0/0/0/1:4:131,42:0.29:-1.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,178:0.81:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,243:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,190:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,109:0.85:-2.06:1.000:0.984 0/1/1/1:4:43,219:0.82:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,186:0.74:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:187,211:0.50: 1.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:179,71:0.32:-0.23:1.000:0.953 0/0/1/1:4:88,117:0.54:-0.89:1.000:0.984 0/0/0/1:4:145,48:0.29:-1.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:105,116:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,138:0.51:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,133:0.53:-0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:76,206:0.71: 0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:81,99:0.52:-1.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:159,199:0.53: 1.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:77,296:0.77: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,162:0.56: 0.14:1.000:0.961 0/1/1/1:4:78,241:0.73: 0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,200:0.50: 1.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,167:0.78:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,186:0.55: 0.84:1.000:0.978 0/0/1/1:4:136,160:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,32:0.47:-2.94:1.000:0.992 0/1/1/1:4:59,161:0.71:-0.67:1.000:0.992 0/1/1/1:4:70,271:0.78: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,256:0.77: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,197:0.54: 1.25:1.000:0.989 0/1/1/1:4:79,241:0.73: 0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,129:0.53:-0.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:128,142:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,207:0.71: 0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:73,238:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,190:0.72:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,212:0.76: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,338:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,243:0.72: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,120:0.54:-0.79:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,255:1.00:-0.15:0.996:1.000 0/0/1/1:4:139,161:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,131:0.53:-0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:169,56:0.29:-0.60:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,239:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,161:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,184:0.71:-0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:112,121:0.49:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,123:0.51:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,168:0.49: 0.93:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,336:1.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,155:0.45: 1.12:1.000:0.976 0/0/1/1:4:116,176:0.58: 0.39:1.000:0.923 0/1/1/1:4:84,259:0.73: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:165,180:0.50: 1.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,260:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,175:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,230:0.75: 0.48:1.000:0.999 -chr3.1 59769343 chr3.1_059769343 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:129,168:0.57: 0.66:1.000:0.954 0/0/0/1:4:178,68:0.28:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,139:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,170:0.52: 1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:150,125:0.46: 0.28:1.000:0.985 0/1/1/1:4:92,240:0.73: 1.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,176:0.82:-0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,203:0.79: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,210:0.74: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,58:0.50:-2.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,53:0.54:-2.76:1.000:0.990 0/0/1/1:4:132,145:0.52: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:151,127:0.46: 0.33:1.000:0.986 0/1/1/1:4:64,232:0.79: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,126:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,206:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,222:0.77: 0.55:0.998:1.000 0/1/1/1:4:80,222:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,171:0.49: 1.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,208:0.56: 1.97:1.000:0.969 0/0/1/1:4:53,67:0.56:-2.40:1.000:0.968 0/0/1/1:4:130,121:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:159,171:0.52: 1.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,203:0.71: 0.50:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,61:0.85:-3.23:1.000:0.980 0/1/1/1:4:76,216:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,225:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,187:0.80:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,168:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,151:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,144:0.51: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,122:0.54:-0.59:1.000:0.986 0/0/0/1:4:59,34:0.37:-2.86:1.000:0.559 0/0/0/1:4:78,44:0.37:-2.36:1.000:0.620 0/1/1:3:29,42:0.59:-3.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:77,196:0.72: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,119:0.51:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,139:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,145:0.54: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:147,140:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,149:0.73:-0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,147:0.60:-0.21:1.000:0.813 0/1/1/1:4:66,191:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,128:0.49: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,166:0.52: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,143:0.52: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:187,186:0.50: 1.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,23:0.45:-3.59:1.000:0.982 0/0/1/1:4:122,117:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,82:0.47:-1.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:74,206:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,138:0.48: 0.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:63,169:0.73:-0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,108:0.46:-0.45:1.000:0.990 0/0/1/1:4:128,134:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,127:0.48: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,128:0.58:-0.64:1.000:0.921 0/0/1/1:4:146,147:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,163:0.78:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:110,123:0.53:-0.45:1.000:0.845 0/0/1/1:4:151,175:0.54: 1.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:66,166:0.72:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:115,232:0.67: 1.52:1.000:0.932 0/1/1/1:4:65,203:0.76: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,147:0.52: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,111:0.54:-0.93:1.000:0.986 0/1/1/1:4:50,155:0.76:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,181:0.71:-0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:59,169:0.75:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,61:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:162,181:0.53: 1.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:65,175:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:224,74:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,152:0.53: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,110:0.48:-0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:74,168:0.70:-0.29:1.000:0.985 0/1/1/1:4:57,161:0.75:-0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,187:0.71: 0.14:1.000:0.989 0/1/1/1:4:54,208:0.80: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,147:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,60:0.27:-0.52:0.999:0.997 0/1/1/1:4:56,204:0.79: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,202:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,168:0.78:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:91,142:0.61:-0.45:0.712:0.970 0/0/1/1:4:148,139:0.48: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,106:0.52:-0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:135,89:0.40:-0.60:1.000:0.797 0/0/1/1:4:143,134:0.48: 0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,175:0.80:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,199:0.72: 0.35:0.999:0.995 0/1/1/1:4:50,168:0.78:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,206:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,91:0.45:-0.98:1.000:0.981 0/1/1/1:4:68,209:0.76: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,195:0.72: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,175:0.80:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,51:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,153:0.52: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,150:0.54: 0.36:1.000:0.990 0/1/1/1:4:81,223:0.74: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,193:0.81:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,171:0.77:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,154:0.49: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,101:0.42:-0.29:1.000:0.914 0/0/1/1:4:102,108:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,112:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,123:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,155:0.49: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,166:0.72:-0.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,191:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:195,185:0.49: 2.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,190:0.72: 0.10:0.999:0.996 0/0/1/1:4:153,150:0.49: 0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,118:0.79:-1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,137:0.67:-0.91:1.000:0.918 0/0/1/1:4:147,151:0.51: 0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,182:0.72:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,141:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,125:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:122,129:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,163:0.78:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,220:0.76: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,145:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,124:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:70,223:0.77: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,178:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,118:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,130:0.62:-0.83:1.000:0.584 0/1/1/1:4:45,132:0.75:-1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,105:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,219:0.79: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,92:0.52:-1.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,148:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,108:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:104,244:0.71: 1.54:1.000:0.990 0/1/1/1:4:55,215:0.80: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,164:0.69:-0.36:1.000:0.979 0/1/1/1:4:56,149:0.73:-0.93:1.000:0.998 0/1/1/1:4:70,182:0.73:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,185:0.68: 0.24:1.000:0.959 0/1/1/1:4:71,193:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,139:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:70,170:0.71:-0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:93,243:0.73: 1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:188,195:0.51: 2.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,148:0.49: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,118:0.44: 0.16:1.000:0.970 0/0/1/1:4:149,168:0.53: 1.00:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,159:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,278:0.76: 1.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,225:0.79: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,65:0.68:-2.81:1.000:0.958 0/0/1/1:4:89,119:0.57:-0.88:1.000:0.937 0/0/1/1:4:132,133:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,235:0.77: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,289:0.79: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,138:0.47: 0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:68,183:0.74:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:148,159:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,210:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:117,98:0.46:-0.76:1.000:0.986 0/0/1/1:4:137,131:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,167:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,112:0.47:-0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:117,134:0.53:-0.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:80,196:0.72: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 0.60:0.996:1.000 0/1/1/1:4:45,187:0.81:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,213:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,188:0.80:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,109:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,210:0.72: 0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,191:0.81:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,189:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,145:0.76:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,172:0.47: 1.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:153,148:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,229:0.78: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,155:0.63:-0.22:1.000:0.606 0/0/1/1:4:173,153:0.47: 1.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:72,284:0.81: 1.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,274:0.73: 2.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:139,112:0.45:-0.14:1.000:0.977 0/0/0/1:4:194,73:0.28: 0.14:1.000:0.995 -chr3.1 60023594 chr3.1_060023594 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:334,0:0.00: 2.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,67:0.46:-0.56:1.000:0.987 0/0/0/0:4:208,15:0.07: 0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:189,28:0.13: 0.74:1.000:0.943 0/0/1/1:4:68,67:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:168,41:0.20: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:218,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,25:0.11: 0.93:1.000:0.616 0/0/0/1:4:136,42:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,2:0.21:-2.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,14:0.25:-1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,69:0.45:-0.42:1.000:0.979 0/0/0/1:4:127,51:0.29: 0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:133,60:0.31: 0.33:1.000:0.968 0/0/0/1:4:146,47:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,77:0.50:-0.46:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-1.31:0.998:1.000 0/0/1/1:4:87,91:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,60:0.28: 0.74:1.000:0.995 0/0/0/0:4:385,1:0.00: 3.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.16:-2.75:1.000:0.995 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:262,24:0.09: 1.92:1.000:0.962 0/0/0/1:4:227,28:0.11: 1.39:1.000:0.621 0/0/1/1:4:5,8:0.55:-2.75:1.000:0.979 0/0/1/1:4:77,77:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,67:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:137,47:0.26: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:166,61:0.28: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/0:4:206,24:0.11: 0.96:1.000:0.556 0/0/0/1:4:165,62:0.28: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:136,36:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,4:0.23:-2.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.21:-2.30:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:151,49:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,61:0.28: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,68:0.48:-0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:151,48:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:239,29:0.11: 1.61:1.000:0.571 0/0/1/1:4:71,69:0.48:-0.57:1.000:0.994 0/0/0/0:4:249,0:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,59:0.31: 0.37:1.000:0.979 0/0/0/0:4:227,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,39:0.16: 1.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,53:0.31: 0.02:1.000:0.979 0/0/0/1:4:154,61:0.29: 0.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,6:0.18:-2.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,24:0.12: 0.57:1.000:0.780 0/0/1/1:4:133,87:0.39: 0.79:1.000:0.676 0/0/1/1:4:39,71:0.57:-1.09:1.000:0.953 0/0/0/0:4:268,1:0.00: 1.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,60:0.29: 0.64:1.000:0.992 0/0/0/0:4:191,18:0.09: 0.61:1.000:0.947 0/0/0/1:4:149,53:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,32:0.16: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/0:4:283,0:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,33:0.16: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/0/0/1:6:146,32:0.19: 0.08:1.000:0.959 0/0/0/0:4:226,18:0.08: 1.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:129,49:0.28: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,81:0.55:-0.68:1.000:0.984 0/0/0/1:4:105,39:0.28:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/0:4:252,1:0.00: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,52:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,19:0.12:-0.11:1.000:0.730 0/0/0/1:4:120,43:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,70:0.52:-0.80:1.000:0.995 0/0/0/0:4:201,19:0.09: 0.79:1.000:0.945 0/0/0/1:4:172,58:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,76:0.58:-1.04:1.000:0.906 0/0/1/1:4:92,85:0.46: 0.06:1.000:0.990 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,52:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,28:0.15: 0.47:1.000:0.980 0/0/1/1:4:71,80:0.51:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,80:0.53:-0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:116,62:0.35: 0.08:1.000:0.821 0/0/0/1:4:146,67:0.32: 0.67:1.000:0.962 0/0/1/1:4:62,45:0.41:-1.14:0.999:0.870 0/0/1/1:4:49,73:0.54:-0.88:1.000:0.986 0/0/1/1:4:54,103:0.57:-0.28:1.000:0.938 0/0/1/1:4:53,41:0.42:-1.36:1.000:0.932 0/0/0/0/1:5:208,65:0.25: 1.70:0.712:0.934 0/0/0/1:4:134,72:0.35: 0.55:1.000:0.812 0/0/1/1:4:53,52:0.48:-1.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:103,48:0.32:-0.39:1.000:0.955 0/0/0/1:4:153,29:0.17: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,96:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,87:0.60:-0.85:0.999:0.811 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,63:0.32: 0.43:1.000:0.958 0/0/0/1:4:93,35:0.28:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,73:0.53:-0.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,76:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,70:0.56:-1.09:1.000:0.963 0/0/0/1:4:195,26:0.12: 0.81:1.000:0.813 0/0/0/1:4:119,44:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,28:0.13: 0.86:1.000:0.912 0/0/0/1:4:140,27:0.17:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:182,36:0.17: 0.76:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,65:0.75:-1.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,29:0.15: 0.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:97,39:0.29:-0.64:1.000:0.991 0/0/0/1:4:160,20:0.12: 0.11:1.000:0.660 0/0/0/1:4:106,32:0.24:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,51:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,46:0.27: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:114,46:0.29:-0.23:1.000:0.990 0/0/0/1:4:116,67:0.36: 0.16:1.000:0.659 0/0/1/1:4:94,87:0.46: 0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,79:0.54:-0.69:0.999:0.988 0/0/0/1:4:131,52:0.29: 0.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:111,58:0.34:-0.08:1.000:0.855 0/0/0/1:4:136,29:0.18:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,34:0.17: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,57:0.48:-1.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:140,25:0.16:-0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:97,39:0.29:-0.64:1.000:0.991 0/0/0/1:4:170,26:0.14: 0.38:1.000:0.961 0/0/0/1:4:99,58:0.37:-0.28:1.000:0.622 0/0/1/1:4:69,71:0.49:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,80:0.53:-0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,73:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,76:0.55:-0.83:1.000:0.982 0/0/0/1:4:125,47:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,47:0.28:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,34:0.26:-0.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,47:0.29:-0.18:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,38:0.34:-1.04:1.000:0.893 0/0/0/1:4:165,22:0.12: 0.23:1.000:0.813 0/0/0/1:4:108,41:0.28:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,120:0.53: 0.57:1.000:0.992 0/0/0/1:4:184,22:0.11: 0.55:1.000:0.526 0/0/0/1:4:102,38:0.28:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,37:0.30:-0.85:1.000:0.983 0/0/1/1:4:43,71:0.56:-1.02:1.000:0.974 0/0/1/1:4:49,71:0.54:-0.92:1.000:0.989 0/0/0/1:4:96,46:0.32:-0.54:1.000:0.939 0/0/0/1:4:121,46:0.28:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:83,39:0.32:-0.88:1.000:0.951 0/0/1/1:4:95,94:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:287,38:0.12: 2.59:1.000:0.800 0/0/0/0:4:215,23:0.10: 1.10:1.000:0.785 0/0/0/1:4:182,28:0.14: 0.62:1.000:0.963 0/0/0/0:4:197,18:0.09: 0.71:1.000:0.964 0/0/1/1:4:73,70:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/0/0/1:4:158,52:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,44:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,3:0.12:-2.52:1.000:0.768 0/0/0/0:4:158,15:0.09:-0.01:1.000:0.942 0/0/0/1:4:156,59:0.28: 0.71:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,46:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,40:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,62:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:192,29:0.14: 0.81:1.000:0.954 0/0/1/1:4:75,52:0.40:-0.80:1.000:0.800 0/0/0/1:4:135,39:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,41:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,46:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,105:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,46:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,53:0.28: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:140,43:0.24: 0.16:0.996:1.000 0/0/0/1:4:129,41:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,47:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:191,14:0.07: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,54:0.46:-1.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:74,80:0.50:-0.34:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,57:0.34:-0.13:1.000:0.854 0/0/0/1:4:122,41:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:270,26:0.09: 2.09:1.000:0.932 0/0/1/1:4:89,76:0.45:-0.15:1.000:0.976 0/0/0/1:4:153,56:0.28: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,82:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,52:0.26: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,67:0.29: 1.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,89:0.47: 0.18:1.000:0.991 0/0/0/0:4:189,15:0.08: 0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:134,50:0.28: 0.18:1.000:0.996 -chr3.1 60184339 chr3.1_060184339 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:14,25:0.70: 0.54:1.000:0.984 0/0/1/1:4:22,15:0.43: 0.36:1.000:0.956 0/1/1/1:4:10,23:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,28:0.71: 0.92:1.000:0.993 0/1/1/1:4:19,29:0.65: 1.39:1.000:0.799 0/0/1/1:4:28,22:0.46: 1.58:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,10:0.51:-1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,20:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/1/1/1:4:13,26:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:1,1:0.51:-2.95:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-3.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,20:0.46: 1.20:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,27:0.66: 1.02:1.000:0.888 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,20:0.70:-0.21:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,35:0.84: 1.02:0.998:0.995 0/1/1/1:4:15,31:0.74: 1.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,19:0.77:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,28:0.78: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,21:0.65: 0.17:1.000:0.747 0/0/0/1:4:30,14:0.36: 1.02:1.000:0.629 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-3.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,13:0.35: 1.02:1.000:0.819 0/0/1/1:4:15,20:0.61: 0.17:1.000:0.713 0/0/1/1:4:28,21:0.45: 1.49:1.000:0.982 1/1/1/1:4:1,35:0.98: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,23:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,36:0.82: 1.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,28:0.77: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.09:-3.04:1.000:0.918 0/1/1/1:4:2,3:0.65:-2.66:1.000:0.747 1/1/1:3:0,3:1.00:-2.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,30:0.82: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,25:0.79: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,19:0.57: 0.17:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.60: 0.54:1.000:0.804 0/1/1/1:4:5,27:0.88:-0.12:1.000:0.805 0/1/1/1:4:14,25:0.70: 0.54:1.000:0.984 0/0/1/1:4:28,14:0.38: 0.83:1.000:0.529 0/1/1/1:4:5,20:0.84:-0.78:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,25:0.83:-0.12:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.78:-1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,18:0.67:-0.40:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,17:0.72:-0.68:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,29:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,25:0.85:-0.21:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,23:0.54: 1.02:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,28:0.73: 0.83:1.000:0.998 1/1/1/1:4:2,20:0.93:-1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,29:0.72: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:9,14:0.66:-0.97:1.000:0.911 0/1/1/1:4:8,22:0.79:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,18:0.42: 1.20:1.000:0.925 0/1/1/1:4:13,22:0.68: 0.17:1.000:0.960 0/1/1/1:4:12,24:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,32:0.84: 0.64:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.48:-1.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,28:0.78: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,21:0.78:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,6:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,20:0.73:-0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,11:0.58:-1.25:1.000:0.914 0/1/1/1:4:14,31:0.76: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,31:0.80: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,7:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,19:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,14:0.59:-0.78:1.000:0.844 0/1/1/1:4:11,22:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,33:0.83: 0.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,33:0.77: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,25:0.66: 0.73:0.999:0.856 0/1/1/1:4:12,20:0.68:-0.12:1.000:0.948 0/1/1/1:4:8,30:0.84: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,19:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:16,23:0.63: 0.54:0.712:0.950 0/1/1/1:4:19,27:0.63: 1.20:1.000:0.541 0/1/1/1:4:13,21:0.67: 0.07:1.000:0.914 0/1/1/1:4:7,19:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.73:-0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,28:0.83: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,18:0.70:-0.49:0.999:0.986 0/1/1/1:4:6,21:0.83:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,17:0.45: 0.64:1.000:0.979 0/1/1/1:4:9,22:0.77:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,30:0.82: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,17:0.56:-0.12:1.000:0.973 1/1/1/1:4:3,19:0.89:-1.06:1.000:0.623 0/0/1/1:4:16,17:0.53:-0.02:1.000:0.990 0/1/1/1:4:12,23:0.72: 0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,24:0.79:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,10:0.63:-1.53:1.000:0.563 0/1/1/1:4:9,23:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,13:0.85:-1.63:1.000:0.983 0/1/1/1:4:8,14:0.69:-1.06:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,23:0.67: 0.36:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,29:0.80: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,39:0.85: 1.39:1.000:0.983 0/1/1/1:4:12,23:0.72: 0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,21:0.75:-0.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,11:0.66:-1.44:0.999:0.868 0/1/1/1:4:11,21:0.72:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,17:0.68:-0.59:1.000:0.963 0/1/1/1:4:12,24:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,9:0.49:-1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,10:0.38:-0.30:1.000:0.529 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,27:0.82: 0.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,16:0.67:-0.68:1.000:0.900 0/1/1/1:4:14,27:0.72: 0.73:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.57:-0.87:1.000:0.949 0/1/1/1:4:10,27:0.79: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,13:0.54:-0.78:1.000:0.987 0/1/1/1:4:7,15:0.75:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,15:0.62:-0.68:1.000:0.630 0/1/1/1:4:8,30:0.84: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,21:0.67: 0.07:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,15:0.65:-0.78:1.000:0.747 0/1/1/1:4:13,24:0.71: 0.36:1.000:0.991 0/1/1/1:4:23,33:0.63: 2.15:1.000:0.581 0/1/1/1:4:9,24:0.79:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,13:0.43:-0.12:1.000:0.957 0/1/1/1:4:9,19:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,16:0.88:-1.34:1.000:0.827 0/1/1/1:4:8,24:0.80:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,17:0.68:-0.59:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,39:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,9:0.37:-0.49:1.000:0.596 0/1/1/1:4:14,33:0.77: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,20:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,35:0.72: 1.86:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,25:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,28:0.67: 1.11:1.000:0.937 0/1/1/1:4:6,28:0.86: 0.07:1.000:0.960 0/1/1/1:4:16,31:0.72: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,10:0.38:-0.30:1.000:0.529 0/0/1/1:4:1,1:0.51:-2.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,14:0.59:-0.78:1.000:0.844 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,16:0.58:-0.40:1.000:0.904 0/1/1/1:4:16,25:0.66: 0.73:1.000:0.856 0/1/1/1:4:10,23:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,27:0.70: 0.83:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,11:0.38:-0.02:1.000:0.529 0/1/1/1:4:9,15:0.68:-0.87:1.000:0.948 0/1/1/1:4:12,29:0.77: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,37:0.81: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,22:0.71: 0.07:1.000:0.990 0/1/1/1:4:13,20:0.65:-0.02:1.000:0.820 1/1/1/1:4:0,42:1.00: 0.83:0.996:1.000 0/1/1/1:4:9,22:0.77:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,14:0.36: 1.02:1.000:0.629 0/0/1/1:4:21,18:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,19:0.66:-0.21:1.000:0.882 0/1/1/1:4:11,23:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,19:0.61:-0.02:1.000:0.649 0/0/0/1:4:31,14:0.36: 1.11:1.000:0.696 0/1/1/1:4:13,21:0.67: 0.07:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,24:0.67: 0.54:1.000:0.900 0/1/1/1:4:9,26:0.80: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,21:0.72:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,29:0.58: 1.86:1.000:0.927 0/0/1/1:4:16,10:0.42:-0.68:1.000:0.904 0/1/1/1:4:13,19:0.64:-0.12:1.000:0.655 0/0/1/1:4:23,21:0.49: 1.02:1.000:0.996 -chr3.1 60345893 chr3.1_060345893 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,60:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,95:.: 0.24:1.000:. ./.:4:33,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,115:.: 1.23:1.000:. ./.:4:60,23:.:-0.97:1.000:. ./.:4:68,68:.: 0.72:1.000:. ./.:4:69,71:.: 0.85:1.000:. ./.:4:3,4:.:-3.40:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.53:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.31:1.000:. ./.:4:24,106:.: 0.53:1.000:. ./.:4:39,88:.: 0.43:1.000:. ./.:4:33,82:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.56:0.998:. ./.:4:0,113:.:-0.01:1.000:. ./.:4:46,114:.: 1.49:1.000:. ./.:4:101,73:.: 1.94:1.000:. ./.:4:0,4:.:-3.50:1.000:. ./.:4:68,60:.: 0.47:1.000:. ./.:4:45,102:.: 1.07:1.000:. ./.:4:58,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,2:.:-3.47:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.98:1.000:. ./.:4:45,77:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,84:.: 0.24:1.000:. ./.:4:32,95:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,74:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,111:.: 1.07:1.000:. ./.:4:44,82:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,2:.:-3.31:1.000:. ./.:3:0,1:.:-3.59:1.000:. ./.:4:50,86:.: 0.72:1.000:. ./.:4:38,104:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.24:1.000:. ./.:4:42,90:.: 0.59:1.000:. ./.:4:37,95:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.68:1.000:. ./.:4:64,56:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,97:.: 0.53:1.000:. ./.:4:48,52:.:-0.43:1.000:. ./.:4:25,81:.:-0.24:1.000:. ./.:4:37,86:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,109:.: 1.23:1.000:. ./.:4:23,30:.:-1.93:1.000:. ./.:4:32,75:.:-0.21:1.000:. ./.:4:39,68:.:-0.21:1.000:. ./.:4:16,71:.:-0.84:1.000:. ./.:4:55,62:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,106:.: 1.07:1.000:. ./.:4:31,96:.: 0.43:1.000:. ./.:4:35,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:28,105:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,71:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,55:.: 0.24:1.000:. ./.:6:18,79:.:-0.53:1.000:. ./.:4:31,87:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,90:.: 0.24:1.000:. ./.:4:32,85:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,53:.:-1.16:1.000:. ./.:4:97,77:.: 1.94:1.000:. ./.:4:30,65:.:-0.59:1.000:. ./.:4:61,48:.:-0.14:1.000:. ./.:4:51,50:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,55:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,76:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.15:1.000:. ./.:4:80,41:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.37:1.000:. ./.:4:52,102:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,74:.:-1.26:0.999:. ./.:4:24,67:.:-0.72:1.000:. ./.:4:30,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:31,92:.: 0.31:1.000:. ./.:5:29,97:.: 0.40:0.712:. ./.:4:31,95:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,79:.:-1.10:1.000:. ./.:4:20,86:.:-0.24:1.000:. ./.:4:32,87:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,146:.: 1.04:1.000:. ./.:4:36,81:.: 0.11:0.999:. ./.:4:0,130:.: 0.53:1.000:. ./.:4:36,83:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.81:1.000:. ./.:4:42,86:.: 0.47:1.000:. ./.:4:35,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,53:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,91:.: 0.31:1.000:. ./.:4:73,48:.: 0.24:1.000:. ./.:4:62,50:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,78:.:-1.13:1.000:. ./.:4:66,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:19,67:.:-0.88:1.000:. ./.:4:22,81:.:-0.33:1.000:. ./.:4:29,75:.:-0.30:1.000:. ./.:4:22,91:.:-0.01:1.000:. ./.:4:33,102:.: 0.69:1.000:. ./.:4:56,64:.: 0.21:1.000:. ./.:4:15,81:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.79:1.000:. ./.:4:28,96:.: 0.34:0.999:. ./.:4:28,100:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,69:.:-0.75:1.000:. ./.:4:39,67:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,66:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,46:.:-0.33:1.000:. ./.:4:31,67:.:-0.49:1.000:. ./.:4:58,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:23,74:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1,125:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.65:1.000:. ./.:4:26,64:.:-0.75:1.000:. ./.:4:31,94:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.59:1.000:. ./.:4:51,54:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.01:1.000:. ./.:4:14,47:.:-1.68:1.000:. ./.:4:33,77:.:-0.11:1.000:. ./.:4:25,85:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,142:.: 2.86:1.000:. ./.:4:62,67:.: 0.50:1.000:. ./.:4:23,63:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,45:.:-0.72:1.000:. ./.:4:21,80:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,76:.:-0.27:1.000:. ./.:4:25,59:.:-0.94:1.000:. ./.:4:43,101:.: 0.98:1.000:. ./.:4:23,73:.:-0.56:1.000:. ./.:4:24,97:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,105:.: 0.69:1.000:. ./.:4:38,85:.: 0.31:1.000:. ./.:4:24,109:.: 0.63:1.000:. ./.:4:82,70:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,96:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,91:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,6:.:-3.34:1.000:. ./.:4:33,81:.: 0.02:1.000:. ./.:4:30,100:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.11:1.000:. ./.:4:47,112:.: 1.46:1.000:. ./.:4:43,90:.: 0.63:1.000:. ./.:4:39,91:.: 0.53:1.000:. ./.:4:103,56:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.46:1.000:. ./.:4:32,87:.: 0.18:1.000:. ./.:4:32,80:.:-0.05:1.000:. ./.:4:30,61:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,189:.: 2.42:1.000:. ./.:4:31,96:.: 0.43:1.000:. ./.:4:38,80:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.01:0.996:. ./.:4:41,69:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,96:.: 0.31:1.000:. ./.:4:61,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.21:1.000:. ./.:4:24,72:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.05:1.000:. ./.:4:26,81:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,80:.:-0.46:1.000:. ./.:4:94,62:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.47:1.000:. ./.:4:32,97:.: 0.50:1.000:. ./.:4:36,84:.: 0.21:1.000:. ./.:4:57,110:.: 1.71:1.000:. ./.:4:43,128:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,86:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.21:1.000:. -chr3.1 60627172 chr3.1_060627172 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,7:0.15: 3.07:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,6:0.20: 1.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,4:0.13: 1.57:1.000:0.935 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,6:0.24: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,5:0.23: 0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,3:0.11: 1.26:1.000:0.563 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,6:0.20: 1.57:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,4:0.12: 1.75:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.65:-0.27:1.000:0.756 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.06:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,5:0.22: 0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,7:0.25: 1.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,6:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/0:4:58,1:0.05: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.60:-0.76:1.000:0.776 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1:3:2,10:0.69:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,7:0.26: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,3:0.12: 1.17:1.000:0.688 0/0/0/1:4:68,3:0.13: 0.99:1.000:0.875 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,4:0.19: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,4:0.18: 0.90:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,39:1.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,29:0.55: 0.90:1.000:0.978 0/0/0/1:4:34,5:0.31: 0.01:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,10:0.39: 0.44:1.000:0.638 0/0/0/1:4:49,8:0.32: 0.56:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,11:0.39: 0.56:1.000:0.702 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,16:1.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,12:0.38: 0.81:1.000:0.572 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,12:0.43: 0.47:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,10:0.30: 1.33:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,7:0.33: 0.32:1.000:0.934 0/0/0/1:4:96,17:0.34: 2.28:1.000:0.891 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,7:0.22: 1.72:0.999:1.000 0/0/1/1:4:57,14:0.40: 0.99:1.000:0.758 0/0/1/1:4:59,16:0.42: 1.11:1.000:0.902 0/0/0/1:4:45,6:0.29: 0.38:1.000:0.989 1/1/1/1/1:5:0,16:1.00:-0.70:0.712:1.000 0/0/0/1:4:66,6:0.25: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,6:0.33: 0.10:1.000:0.934 0/0/1/1:4:40,18:0.51: 0.59:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,13:0.45: 0.47:0.999:0.982 0/0/0/1:4:41,5:0.28: 0.22:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,14:0.39: 1.02:1.000:0.723 0/0/0/1:4:43,9:0.37: 0.41:1.000:0.623 0/0/1/1:4:50,14:0.42: 0.77:1.000:0.929 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,12:0.41: 0.59:1.000:0.857 0/0/0/0:4:62,2:0.09: 0.77:1.000:0.908 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,8:0.40: 0.04:1.000:0.791 0/0/0/1:4:48,9:0.35: 0.56:1.000:0.827 0/0/0/1:4:31,5:0.32:-0.08:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,19:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,5:0.20: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,6:0.20: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,3:0.11: 1.26:1.000:0.563 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,4:0.12: 1.75:1.000:0.852 0/0/1/1:4:39,15:0.50: 0.47:0.999:0.997 0/0/0/1:4:61,11:0.34: 1.02:1.000:0.873 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,11:0.36: 0.81:1.000:0.683 0/0/0/1:4:55,6:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,9:0.32: 0.81:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,2:0.07: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,14:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,9:0.33: 0.71:1.000:0.923 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,11:0.46: 0.19:1.000:0.986 0/0/0/1:4:36,7:0.35: 0.13:1.000:0.772 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,9:0.28: 1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,6:0.37:-0.14:1.000:0.566 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,2:0.11: 0.53:1.000:0.606 0/0/0/1:4:96,7:0.20: 1.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,3:0.18: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,13:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,7:0.32: 0.38:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,2:0.08: 0.99:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,4:0.16: 1.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.69:-1.00:1.000:0.977 0/0/0/1:4:82,4:0.14: 1.45:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,7:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,4:0.16: 1.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,3:0.12: 1.14:1.000:0.727 0/0/0/1:4:69,3:0.12: 1.02:1.000:0.852 0/0/0/1:4:68,8:0.28: 1.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,3:0.14: 0.84:1.000:0.953 0/0/0/1:4:58,6:0.26: 0.77:1.000:0.998 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,8:0.29: 1.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,6:0.21: 1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.66:-1.06:1.000:0.889 0/0/0/0:4:137,4:0.09: 3.13:0.996:0.974 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,3:0.14: 0.84:1.000:0.953 0/0/0/1:4:66,5:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,2:0.10: 0.71:1.000:0.864 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,6:0.17: 2.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,9:0.30: 1.11:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,3:0.12: 1.02:1.000:0.852 0/0/0/1:4:66,8:0.28: 1.08:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:0.994:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,3:0.18: 0.38:1.000:0.999 -chr3.1 60774942 chr3.1_060774942 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:58,59:0.52:-0.13:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,32:0.27: 0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,37:0.28: 0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,81:0.52: 0.85:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,35:0.45:-0.86:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,20:0.26:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,23:0.30:-0.91:1.000:0.984 0/0/1/1:4:48,55:0.54:-0.46:1.000:0.990 0/0/0/1:4:113,35:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,52:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:110,50:0.34: 0.87:1.000:0.849 0/0/0/1:4:86,28:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,54:0.52:-0.32:0.998:0.995 0/0/0/1:4:135,39:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,80:0.53: 0.71:1.000:0.992 0/0/1/1:4:60,65:0.53: 0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,26:0.47:-1.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:69,63:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,75:0.53: 0.50:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,12:0.31:-1.87:1.000:0.978 0/0/1/1:4:56,60:0.53:-0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,39:0.50:-0.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,76:0.48: 1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,48:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,49:0.47:-0.18:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-2.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,33:0.56:-1.57:1.000:0.964 0/0/1:3:64,10:0.16:-1.14:1.000:0.902 0/0/0/1:4:113,26:0.21: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,61:0.55:-0.32:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,22:0.17: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:149,37:0.22: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,69:0.51: 0.43:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,55:0.47: 0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:170,42:0.22: 2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,65:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,47:0.27: 1.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,17:0.53:-2.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:108,32:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,17:0.18:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,57:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,70:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,58:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:148,43:0.25: 1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,67:0.55:-0.11:1.000:0.978 0/0/1/1:4:99,62:0.42: 0.90:1.000:0.920 0/0/0/1:4:141,44:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,55:0.43: 0.41:1.000:0.946 0/0/1/1:4:66,39:0.41:-0.42:1.000:0.843 0/0/0/0/0/1:6:140,41:0.25: 1.37:1.000:0.523 0/0/0/1:4:124,60:0.36: 1.44:1.000:0.715 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,34:0.23: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,54:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:133,39:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,51:0.46:-0.06:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,35:0.21: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,47:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:194,51:0.23: 2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,55:0.55:-0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:100,73:0.46: 1.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:64,55:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,52:0.47:-0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,68:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,48:0.27: 1.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:151,51:0.28: 1.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,39:0.21: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,65:0.31: 2.59:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.52:0.999:1.000 0/0/1/1:4:84,73:0.50: 0.80:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,52:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1/1:5:85,66:0.48: 0.66:0.712:0.709 0/1/1/1:4:1,102:0.81:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,51:0.50:-0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,53:0.42: 0.34:1.000:0.927 0/0/0/1:4:151,55:0.29: 1.95:1.000:0.990 0/0/1/1:4:61,51:0.50:-0.25:0.999:0.997 0/0/1/1:4:85,60:0.45: 0.52:1.000:0.982 0/0/1/1:4:99,83:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:100,27:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,67:0.44: 1.02:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,32:0.24: 0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,57:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,53:0.45: 0.17:1.000:0.975 0/0/1/1:4:71,55:0.48: 0.08:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,33:0.46:-1.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:73,62:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,47:0.29: 1.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,59:0.55:-0.39:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,68:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,43:0.29: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,70:0.53: 0.22:0.999:0.991 0/0/1/1:4:69,72:0.53: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,48:0.54:-0.84:1.000:0.985 0/0/0/1:4:91,46:0.37: 0.34:1.000:0.588 0/0/1/1:4:69,76:0.53: 0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,37:0.41:-0.58:1.000:0.883 0/0/1/1:4:94,69:0.46: 0.95:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,59:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,80:0.53: 0.69:1.000:0.991 0/0/1/1:4:77,67:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:143,49:0.28: 1.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,31:0.32:-0.42:1.000:0.942 0/0/0/1:4:145,33:0.21: 1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,45:0.29: 1.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:107,21:0.19: 0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,38:0.46:-0.77:1.000:0.989 0/0/0/1:4:141,30:0.20: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,46:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,31:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,33:0.22: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,48:0.50:-0.42:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,52:0.42: 0.29:1.000:0.920 0/0/1/1:4:63,53:0.50:-0.16:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,43:0.44:-0.37:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,70:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,59:0.53:-0.25:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,47:0.25: 1.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,66:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,58:0.50: 0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,35:0.27: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,50:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,64:0.75:-1.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,24:0.42:-1.40:1.000:0.901 0/0/1/1:4:28,37:0.55:-1.35:1.000:0.977 0/0/1/1:4:98,70:0.46: 1.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:71,80:0.53: 0.66:1.000:0.991 0/0/0/1:4:136,48:0.29: 1.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,62:0.47: 0.52:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,70:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,64:0.54:-0.09:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,52:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,44:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,50:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,56:0.56:-0.63:1.000:0.968 0/0/0/1:4:98,37:0.30: 0.29:0.999:0.984 0/0/0/1:4:107,37:0.28: 0.50:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,37:0.40:-0.49:1.000:0.767 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,42:0.34: 0.26:1.000:0.842 0/0/1/1:4:62,44:0.45:-0.39:1.000:0.983 0/0/1/1:4:41,34:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,64:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,49:0.27: 1.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,66:0.53: 0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,40:0.46:-0.63:1.000:0.985 0/0/1/1:4:74,61:0.49: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,50:0.26: 2.12:0.994:0.999 0/0/1/1:4:75,69:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,47:0.51:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,50:0.55:-0.77:1.000:0.983 -chr3.1 61067045 chr3.1_061067045 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:137,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.53:0.998:. ./.:4:123,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.92:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:215,0:.: 4.43:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.13:1.000:. ./.:6:63,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.99:0.999:. ./.:4:73,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.54:1.000:. ./.:5:112,0:.: 0.97:0.712:. ./.:4:87,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.35:0.999:. ./.:4:81,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:56,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:101,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.97:0.994:. ./.:4:146,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.38:1.000:. -chr3.1 61145399 chr3.1_061145399 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:113,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:94,3:.:-0.36:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:0.998:. ./.:4:106,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:32,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.20:1.000:. ./.:3:16,0:.:-3.74:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:112,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:100,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.87:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.39:1.000:. ./.:6:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:78,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:140,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:5:127,0:.: 0.89:0.712:. ./.:4:141,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.18:0.999:. ./.:4:111,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:105,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:130,1:.: 1.06:0.999:. ./.:4:91,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:109,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:129,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:67,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:126,2:.: 0.93:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:96,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:118,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:0.994:. ./.:4:135,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.28:1.000:. -chr3.1 61393310 chr3.1_061393310 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:52,155:0.74: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,36:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,104:0.53: 1.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,102:0.53: 1.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:109,109:0.53: 1.32:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,141:0.72: 0.82:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,64:0.67:-1.45:1.000:0.933 0/1/1/1:4:67,129:0.67: 0.82:1.000:0.902 0/0/1/1:4:86,62:0.46:-0.27:1.000:0.985 0/0/0/1:4:21,4:0.20:-3.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,18:0.62:-2.95:1.000:0.619 0/0/0/0:4:145,1:0.01:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,43:0.28: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,91:0.54: 0.39:1.000:0.986 0/0/0/1:4:153,31:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,52:0.29: 1.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:168,48:0.27: 1.27:0.998:0.998 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,73:0.41: 0.84:1.000:0.866 0/1/1/1:4:58,125:0.69: 0.52:1.000:0.969 0/0/0/1:4:28,7:0.25:-2.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,132:0.73: 0.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,134:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,101:0.69:-0.32:1.000:0.980 0/0/0/1:4:10,5:0.37:-3.29:1.000:0.502 0/0/1/1:4:99,87:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,48:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,128:0.74: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,93:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,137:0.70: 0.79:1.000:0.988 0/0/1/1:4:108,77:0.45: 0.57:1.000:0.984 0/1/1/1:4:63,145:0.70: 1.09:1.000:0.984 0/1/1/1:4:6,11:0.66:-3.24:1.000:0.844 0/1/1/1:4:10,28:0.73:-2.76:1.000:0.998 0/0/1:3:8,2:0.25:-3.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,40:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,149:0.78: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,110:0.56: 1.00:1.000:0.960 0/0/1/1:4:95,66:0.45: 0.02:1.000:0.978 0/0/0/1:4:169,38:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,34:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,116:0.67: 0.32:1.000:0.933 0/1/1/1:4:51,116:0.70: 0.16:1.000:0.982 0/1/1/1:4:36,112:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,60:0.48:-0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,71:0.45: 0.30:1.000:0.978 0/0/0/1:4:178,45:0.25: 1.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,161:0.73: 1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,64:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:127,34:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,23:0.23:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,135:0.72: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,27:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,37:0.22: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,105:0.69:-0.14:1.000:0.967 0/0/1/1:4:100,64:0.43: 0.09:1.000:0.945 0/0/1/1:4:81,90:0.55: 0.25:1.000:0.976 0/1/1/1:4:50,100:0.67:-0.23:1.000:0.933 0/0/1/1:4:94,56:0.41:-0.23:1.000:0.881 0/0/0/1/1/1:6:61,62:0.53:-0.84:1.000:0.823 0/0/1/1:4:72,85:0.57:-0.07:1.000:0.956 0/1/1/1:4:36,114:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,110:0.78:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,73:0.45: 0.36:1.000:0.982 0/1/1/1:4:68,140:0.68: 1.09:1.000:0.950 0/0/0/1:4:134,25:0.19:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,24:0.36:-1.93:1.000:0.667 0/0/1/1:4:110,65:0.41: 0.34:1.000:0.871 0/0/0/1:4:143,44:0.28: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,80:0.48: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,67:0.44: 0.16:1.000:0.967 0/0/0/1:4:83,15:0.19:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,145:0.68: 1.22:1.000:0.959 0/0/0/1:4:137,53:0.32: 0.68:1.000:0.947 0/0/1/1:4:85,77:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,38:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:138,39:0.27: 0.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:150,29:0.20: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,73:0.46: 0.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:116,44:0.32: 0.00:0.999:0.957 0/0/0/1:4:122,34:0.26:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,66:0.43: 0.25:1.000:0.932 0/0/0/1:4:132,34:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:101,121:0.57: 1.41:0.817:0.608 0/1/1/1:4:51,106:0.68:-0.07:1.000:0.954 0/0/1/1:4:64,56:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,87:0.78:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,90:0.71:-0.75:1.000:0.991 0/0/0/1:4:130,27:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,21:0.20:-0.63:0.999:1.000 0/0/0/1:4:125,25:0.20:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,85:0.47: 0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,64:0.55:-0.84:1.000:0.982 0/0/0/1:4:128,30:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,53:0.41:-0.34:1.000:0.834 0/0/1/1:4:71,47:0.44:-0.95:1.000:0.962 0/0/0/1:4:105,41:0.32:-0.32:1.000:0.942 0/1/1/1:4:41,96:0.70:-0.52:1.000:0.987 0/1/1/1:4:46,91:0.67:-0.52:1.000:0.925 0/0/0/1:4:58,21:0.31:-1.84:1.000:0.974 0/0/1/1:4:89,53:0.41:-0.41:1.000:0.881 0/0/0/1:4:75,19:0.25:-1.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,113:0.72:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,69:0.56:-0.72:1.000:0.960 0/1/1/1:4:42,106:0.72:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,24:0.21:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,74:0.47: 0.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,153:0.76: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,56:0.44:-0.50:1.000:0.973 0/0/1/1:4:63,47:0.46:-1.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:202,51:0.25: 2.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,38:0.27: 0.30:0.999:0.998 0/0/1/1:4:92,75:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,77:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,78:0.62:-0.70:1.000:0.568 0/1/1/1:4:29,56:0.67:-1.70:1.000:0.905 0/0/1/1:4:76,74:0.53:-0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:80,58:0.46:-0.50:1.000:0.986 0/0/1/1:4:79,51:0.43:-0.68:1.000:0.950 0/0/1/1:4:100,70:0.45: 0.23:1.000:0.980 0/0/1/1:4:67,57:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,44:0.28: 0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,51:0.29: 1.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:115,26:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,67:0.44: 0.14:1.000:0.970 0/0/0/1:4:115,27:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,43:0.43:-1.16:1.000:0.954 0/0/0/1:4:114,30:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,60:0.45:-0.32:1.000:0.979 0/0/0/1:4:160,25:0.17: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,14:0.17:-1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,72:0.47: 0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:109,84:0.47: 0.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:140,102:0.46: 1.86:1.000:0.987 0/0/1/1:4:110,84:0.47: 0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,51:0.44:-0.72:1.000:0.962 0/0/1/1:4:69,67:0.52:-0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:115,36:0.28:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:90,60:0.44:-0.23:1.000:0.965 0/0/1/1:4:84,50:0.41:-0.59:1.000:0.880 0/0/1/1:4:105,53:0.38:-0.04:1.000:0.525 0/1/1/1:4:20,63:0.75:-1.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,95:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,99:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,120:0.70: 0.27:1.000:0.985 0/1/1/1:4:46,121:0.72: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,131:0.71: 0.59:1.000:0.989 0/0/0/1:4:115,46:0.33: 0.02:1.000:0.925 0/0/1/1:4:107,95:0.51: 0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,128:0.72: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,8:0.46:-3.19:1.000:0.987 0/1/1/1:4:37,72:0.67:-1.16:1.000:0.911 0/0/1/1:4:105,99:0.52: 1.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:148,43:0.27: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,29:0.18: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,88:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,73:0.53:-0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:109,82:0.47: 0.70:1.000:0.991 0/0/1/1:4:97,59:0.42:-0.09:1.000:0.904 0/1/1/1:4:43,121:0.73: 0.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,132:0.74: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,76:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,100:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,85:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,64:0.46:-0.16:1.000:0.985 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.73:0.999:1.000 0/0/0/1:4:145,39:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,92:0.68:-0.54:1.000:0.957 0/1/1/1:4:38,99:0.72:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,47:0.40:-0.70:1.000:0.826 0/0/1/1:4:88,75:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,64:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,62:0.47:-0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:134,91:0.44: 1.47:1.000:0.971 0/0/0/1:4:145,30:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,140:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:162,32:0.20: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,59:0.43:-0.18:1.000:0.939 0/0/0/1:4:168,51:0.28: 1.34:0.994:0.996 0/0/1/1:4:110,96:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,67:0.68:-1.36:1.000:0.942 0/0/0/1:4:138,46:0.29: 0.54:1.000:0.989 -chr3.1 61528782 chr3.1_061528782 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:60,147:.:-0.85:1.000:. ./.:4:85,177:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,127:.:-0.38:1.000:. ./.:4:132,166:.: 0.28:1.000:. ./.:4:251,165:.: 1.75:1.000:. ./.:4:270,92:.: 1.08:1.000:. ./.:4:40,107:.:-1.60:1.000:. ./.:4:181,91:.:-0.04:1.000:. ./.:4:190,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:46,23:.:-2.57:1.000:. ./.:4:42,26:.:-2.59:1.000:. ./.:4:191,101:.: 0.21:1.000:. ./.:4:138,99:.:-0.48:1.000:. ./.:4:233,94:.: 0.64:1.000:. ./.:4:126,95:.:-0.68:1.000:. ./.:4:329,80:.: 1.66:1.000:. ./.:4:353,66:.: 1.79:0.998:. ./.:4:284,43:.: 0.64:1.000:. ./.:4:164,162:.: 0.63:1.000:. ./.:4:87,183:.:-0.07:1.000:. ./.:4:74,35:.:-2.07:1.000:. ./.:4:60,133:.:-1.03:1.000:. ./.:4:159,157:.: 0.51:1.000:. ./.:4:174,90:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,2:.:-2.16:1.000:. ./.:4:407,106:.: 2.96:1.000:. ./.:4:270,59:.: 0.67:1.000:. ./.:4:227,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:175,154:.: 0.67:1.000:. ./.:4:140,192:.: 0.70:1.000:. ./.:4:149,163:.: 0.46:1.000:. ./.:4:97,128:.:-0.63:1.000:. ./.:4:30,19:.:-2.82:1.000:. ./.:4:49,57:.:-2.11:1.000:. ./.:3:49,19:.:-2.59:1.000:. ./.:4:205,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:120,158:.: 0.03:1.000:. ./.:4:235,156:.: 1.44:1.000:. ./.:4:298,68:.: 1.13:1.000:. ./.:4:315,82:.: 1.52:1.000:. ./.:4:303,61:.: 1.10:1.000:. ./.:4:48,141:.:-1.08:1.000:. ./.:4:262,98:.: 1.05:1.000:. ./.:4:57,137:.:-1.01:1.000:. ./.:4:156,182:.: 0.78:1.000:. ./.:4:132,103:.:-0.50:1.000:. ./.:4:160,148:.: 0.41:1.000:. ./.:4:47,73:.:-1.94:1.000:. ./.:4:140,147:.: 0.14:1.000:. ./.:4:148,65:.:-0.78:1.000:. ./.:4:228,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:54,187:.:-0.43:1.000:. ./.:4:224,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:127,103:.:-0.57:1.000:. ./.:4:99,159:.:-0.22:1.000:. ./.:4:155,112:.:-0.11:1.000:. ./.:4:101,110:.:-0.80:1.000:. ./.:4:72,182:.:-0.27:1.000:. ./.:4:161,44:.:-0.88:1.000:. ./.:6:139,97:.:-0.49:1.000:. ./.:4:118,133:.:-0.30:1.000:. ./.:4:204,81:.: 0.12:1.000:. ./.:4:196,171:.: 1.14:1.000:. ./.:4:248,110:.: 1.03:1.000:. ./.:4:72,158:.:-0.57:1.000:. ./.:4:118,102:.:-0.69:1.000:. ./.:4:170,53:.:-0.65:1.000:. ./.:4:158,42:.:-0.94:1.000:. ./.:4:303,53:.: 1.00:1.000:. ./.:4:100,190:.: 0.18:1.000:. ./.:4:249,144:.: 1.47:1.000:. ./.:4:157,50:.:-0.85:1.000:. ./.:4:150,182:.: 0.70:1.000:. ./.:4:50,146:.:-0.99:1.000:. ./.:4:191,146:.: 0.77:1.000:. ./.:4:134,47:.:-1.18:1.000:. ./.:4:332,54:.: 1.38:1.000:. ./.:4:325,55:.: 1.30:1.000:. ./.:4:225,41:.:-0.12:1.000:. ./.:4:187,150:.: 0.77:1.000:. ./.:4:100,164:.:-0.14:0.999:. ./.:4:244,56:.: 0.31:1.000:. ./.:4:261,68:.: 0.67:1.000:. ./.:4:203,60:.:-0.16:1.000:. ./.:6:299,157:.: 2.25:0.817:. ./.:4:156,168:.: 0.61:1.000:. ./.:4:137,111:.:-0.34:1.000:. ./.:4:131,99:.:-0.57:1.000:. ./.:4:129,137:.:-0.12:1.000:. ./.:4:275,53:.: 0.66:1.000:. ./.:4:188,41:.:-0.58:0.999:. ./.:4:310,48:.: 1.03:1.000:. ./.:4:260,83:.: 0.84:1.000:. ./.:4:174,127:.: 0.32:1.000:. ./.:4:213,35:.:-0.34:1.000:. ./.:4:245,53:.: 0.28:1.000:. ./.:4:182,42:.:-0.64:1.000:. ./.:4:100,171:.:-0.06:1.000:. ./.:4:144,134:.: 0.03:1.000:. ./.:4:76,184:.:-0.19:1.000:. ./.:4:201,40:.:-0.43:1.000:. ./.:4:145,56:.:-0.93:1.000:. ./.:4:160,39:.:-0.95:1.000:. ./.:4:58,123:.:-1.18:1.000:. ./.:4:125,107:.:-0.54:1.000:. ./.:4:119,132:.:-0.30:1.000:. ./.:4:117,82:.:-0.95:1.000:. ./.:4:146,181:.: 0.64:1.000:. ./.:4:153,172:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,34:.:-1.05:1.000:. ./.:4:267,48:.: 0.49:1.000:. ./.:4:254,164:.: 1.78:1.000:. ./.:4:242,51:.: 0.22:0.999:. ./.:4:118,137:.:-0.25:1.000:. ./.:4:190,21:.:-0.80:1.000:. ./.:4:139,84:.:-0.65:1.000:. ./.:4:106,121:.:-0.60:1.000:. ./.:4:285,57:.: 0.83:1.000:. ./.:4:162,45:.:-0.85:1.000:. ./.:4:112,121:.:-0.53:1.000:. ./.:4:56,116:.:-1.29:1.000:. ./.:4:249,53:.: 0.33:1.000:. ./.:4:362,74:.: 2.00:1.000:. ./.:4:205,138:.: 0.84:1.000:. ./.:4:183,97:.: 0.06:1.000:. ./.:4:266,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:224,50:.:-0.02:1.000:. ./.:4:206,66:.:-0.04:1.000:. ./.:4:113,31:.:-1.64:1.000:. ./.:4:246,44:.: 0.18:1.000:. ./.:4:186,134:.: 0.56:1.000:. ./.:4:330,67:.: 1.52:1.000:. ./.:4:91,58:.:-1.58:1.000:. ./.:4:169,160:.: 0.67:1.000:. ./.:4:102,118:.:-0.69:1.000:. ./.:4:280,54:.: 0.73:1.000:. ./.:4:141,54:.:-1.00:1.000:. ./.:4:185,68:.:-0.28:1.000:. ./.:4:133,40:.:-1.28:1.000:. ./.:4:205,39:.:-0.39:1.000:. ./.:4:229,52:.: 0.07:1.000:. ./.:4:234,45:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,123:.:-0.50:1.000:. ./.:4:188,63:.:-0.30:1.000:. ./.:4:275,81:.: 1.00:1.000:. ./.:4:159,192:.: 0.94:1.000:. ./.:4:150,157:.: 0.39:1.000:. ./.:4:131,124:.:-0.25:1.000:. ./.:4:55,150:.:-0.88:1.000:. ./.:4:271,57:.: 0.66:1.000:. ./.:4:308,93:.: 1.56:1.000:. ./.:4:206,77:.: 0.09:1.000:. ./.:4:60,5:.:-2.62:1.000:. ./.:4:71,78:.:-1.58:1.000:. ./.:4:138,121:.:-0.20:1.000:. ./.:4:349,51:.: 1.55:1.000:. ./.:4:277,79:.: 1.00:1.000:. ./.:4:142,168:.: 0.43:1.000:. ./.:4:184,54:.:-0.47:1.000:. ./.:4:62,122:.:-1.14:1.000:. ./.:4:273,79:.: 0.95:1.000:. ./.:4:107,122:.:-0.58:1.000:. ./.:4:151,146:.: 0.27:1.000:. ./.:4:138,128:.:-0.12:1.000:. ./.:4:242,135:.: 1.27:1.000:. ./.:4:126,155:.: 0.07:1.000:. ./.:4:217,102:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1,250:.:-0.30:0.999:. ./.:4:265,61:.: 0.63:1.000:. ./.:4:207,87:.: 0.23:1.000:. ./.:4:149,72:.:-0.68:1.000:. ./.:4:151,117:.:-0.09:1.000:. ./.:4:260,54:.: 0.48:1.000:. ./.:4:273,58:.: 0.69:1.000:. ./.:4:200,92:.: 0.21:1.000:. ./.:4:203,49:.:-0.29:1.000:. ./.:4:61,159:.:-0.69:1.000:. ./.:4:231,141:.: 1.20:1.000:. ./.:4:161,148:.: 0.42:1.000:. ./.:4:197,82:.: 0.04:1.000:. ./.:4:146,178:.: 0.61:1.000:. ./.:4:264,66:.: 0.68:0.994:. ./.:4:409,113:.: 3.07:1.000:. ./.:4:138,129:.:-0.11:1.000:. ./.:4:98,237:.: 0.74:1.000:. -chr3.1 61623018 chr3.1_061623018 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,22:.: 0.59:1.000:. ./.:4:29,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,15:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.16:1.000:. ./.:4:29,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:20,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:15,4:.:-2.20:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.64:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:36,9:.:-0.13:1.000:. ./.:4:29,9:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,10:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.27:0.998:. ./.:4:55,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:43,15:.: 0.91:1.000:. ./.:4:19,23:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:30,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:42,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:17,18:.:-0.93:1.000:. ./.:4:22,9:.:-1.24:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,7:.:-0.29:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:30,11:.:-0.45:1.000:. ./.:4:22,3:.:-1.72:1.000:. ./.:4:15,9:.:-1.80:1.000:. ./.:4:15,7:.:-1.96:1.000:. ./.:3:18,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:42,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:42,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:26,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:26,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:72,13:.: 3.06:1.000:. ./.:4:37,22:.: 0.99:1.000:. ./.:4:48,7:.: 0.67:1.000:. ./.:4:52,17:.: 1.78:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.85:1.000:. ./.:4:45,10:.: 0.67:1.000:. ./.:4:36,7:.:-0.29:1.000:. ./.:4:65,12:.: 2.42:1.000:. ./.:4:34,4:.:-0.69:1.000:. ./.:4:42,14:.: 0.75:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:48,10:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,5:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,8:.: 0.59:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.05:1.000:. ./.:4:41,25:.: 1.54:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.77:1.000:. ./.:6:49,6:.: 0.67:1.000:. ./.:4:47,10:.: 0.83:1.000:. ./.:4:31,15:.:-0.05:1.000:. ./.:4:59,17:.: 2.34:1.000:. ./.:4:46,10:.: 0.75:1.000:. ./.:4:26,38:.: 1.38:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,19:.:-0.53:1.000:. ./.:4:21,23:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.85:1.000:. ./.:4:96,0:.: 3.93:1.000:. ./.:4:40,20:.: 1.07:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:57,6:.: 1.30:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:57,11:.: 1.70:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:39,8:.: 0.03:1.000:. ./.:6:61,14:.: 2.26:0.817:. ./.:4:36,15:.: 0.35:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:49,9:.: 0.91:0.999:. ./.:4:63,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:48,12:.: 1.07:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.05:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:45,11:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,13:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,17:.: 0.43:1.000:. ./.:4:22,7:.:-1.40:1.000:. ./.:4:26,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:42,7:.: 0.19:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:30,12:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,5:.:-0.85:1.000:. ./.:4:56,10:.: 1.54:1.000:. ./.:4:20,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:41,8:.: 0.19:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:30,11:.:-0.45:0.999:. ./.:4:50,8:.: 0.91:1.000:. ./.:4:19,7:.:-1.64:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.29:1.000:. ./.:4:53,6:.: 0.99:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:22,18:.:-0.53:1.000:. ./.:4:42,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:22,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:27,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.13:1.000:. ./.:4:42,11:.: 0.51:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:18,10:.:-1.48:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.72:1.000:. ./.:4:31,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:41,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,25:.: 0.43:1.000:. ./.:4:27,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:22,16:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.01:1.000:. ./.:4:49,11:.: 1.07:1.000:. ./.:4:59,12:.: 1.94:1.000:. ./.:4:32,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:32,10:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,29:.: 1.86:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:35,20:.: 0.67:1.000:. ./.:4:18,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:12,8:.:-2.12:1.000:. ./.:4:38,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.13:1.000:. ./.:4:29,4:.:-1.08:1.000:. ./.:4:27,26:.: 0.51:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:31,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:32,7:.:-0.61:1.000:. ./.:4:34,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:29,9:.:-0.69:1.000:. ./.:4:34,7:.:-0.45:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:35,5:.:-0.53:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.21:1.000:. ./.:4:20,12:.:-1.16:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:29,12:.:-0.45:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:29,5:.:-1.01:1.000:. ./.:4:33,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:32,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:25,5:.:-1.32:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:52,11:.: 1.30:0.994:. ./.:4:63,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:31,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.19:1.000:. -chr3.1 61786370 chr3.1_061786370 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,7:.: 1.52:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,3:.: 1.26:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.16:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.47:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:0.998:. ./.:4:14,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,3:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:9,5:.: 1.26:1.000:. ./.:4:10,5:.: 1.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:13,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:13,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:11,3:.: 1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:15,3:.: 2.31:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:7,3:.: 0.20:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.20:1.000:. ./.:6:6,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.11:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.99:0.999:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.73:1.000:. ./.:6:8,1:.:-0.06:0.817:. ./.:4:7,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.20:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.11:0.999:. ./.:4:14,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:11,3:.: 1.26:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.: 3.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:0.999:. ./.:4:10,4:.: 1.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:13,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:5,5:.: 0.20:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:14,3:.: 2.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:12,2:.: 1.26:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.20:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,6:.: 1.52:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:14,1:.: 1.52:0.994:. ./.:4:8,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.: 2.57:1.000:. -chr3.1 61911846 chr3.1_061911846 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.96:0.998:. ./.:4:112,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:39,1:.:-1.44:1.000:. ./.:3:15,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:52,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:185,0:.: 3.32:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.63:0.999:. ./.:4:80,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:135,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:108,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:86,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:123,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:0.999:. ./.:4:79,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:41,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:41,2:.:-1.34:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:58,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.32:0.999:. ./.:4:45,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:0.994:. ./.:4:89,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.16:1.000:. -chr3.1 62442788 chr3.1_062442788 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:82,77:0.47: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,72:0.47: 0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,69:0.53: 0.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,73:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,145:0.80: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,84:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,43:0.50:-1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,76:0.57: 0.14:1.000:0.953 0/1/1/1:4:27,86:0.73:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,8:0.58:-2.90:1.000:0.915 0/0/1/1:4:11,5:0.39:-2.82:1.000:0.728 0/0/1/1:4:93,43:0.40: 0.41:1.000:0.746 0/1/1/1:4:44,115:0.69: 1.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:67,78:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,107:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,74:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,84:0.74:-0.32:0.998:0.999 0/0/1/1:4:74,74:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,155:0.71: 2.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:66,74:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,15:0.76:-2.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,72:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,105:0.57: 1.37:1.000:0.933 0/0/1/1:4:62,65:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,3:0.40:-3.01:1.000:0.818 0/0/1/1:4:65,68:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,124:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,74:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,138:0.75: 1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,64:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,105:0.81: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,98:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.48:-3.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-3.06:1.000:0.955 1/1/1:3:0,7:1.00:-3.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,76:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,106:0.78: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,123:0.69: 1.29:1.000:0.979 0/1/1/1:4:34,92:0.70: 0.14:1.000:0.982 0/0/1/1:4:51,53:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,55:0.49:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,64:0.56:-0.35:1.000:0.972 0/0/1/1:4:68,79:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,47:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,61:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,91:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,131:0.80: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,124:0.51: 2.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,56:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,62:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,67:0.80:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,92:0.52: 1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,90:0.69: 0.08:1.000:0.977 0/1/1/1:4:30,115:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,67:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,88:0.73:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,66:0.46: 0.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:45,51:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,60:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:35,38:0.49:-1.29:1.000:0.886 0/0/1/1:4:53,49:0.47:-0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,62:0.46: 0.35:1.000:0.990 0/1/1/1:4:24,93:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,50:0.55:-0.94:1.000:0.984 0/0/1/1:4:60,82:0.54: 0.57:1.000:0.987 0/1/1/1:4:31,100:0.73: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,33:0.49:-1.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,105:0.71: 0.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,80:0.57: 0.27:1.000:0.932 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,55:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,57:0.74:-1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,54:0.62:-1.02:1.000:0.626 0/0/1/1:4:79,86:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,1:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,50:0.48:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,63:0.52:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,75:0.58: 0.03:1.000:0.918 0/0/1/1:4:63,73:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,70:0.48: 0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,66:0.59:-0.43:0.999:0.844 0/1/1/1:4:27,94:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,125:0.74: 1.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,67:0.66:-0.67:1.000:0.891 0/0/0/1/1/1:6:50,42:0.46:-0.78:0.817:0.806 0/1/1/1:4:24,109:0.79: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,79:0.80:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,85:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,55:0.54:-0.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:65,73:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,67:0.72:-0.86:0.999:0.995 0/1/1/1:4:13,100:0.87:-0.21:1.000:0.928 0/0/1/1:4:61,74:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,64:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,88:0.80:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,76:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,97:0.78:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,88:0.80:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,118:0.74: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,52:0.56:-0.91:1.000:0.964 0/0/1/1:4:59,61:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,62:0.72:-1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,87:0.79:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,75:0.83:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,53:0.45: 0.08:1.000:0.978 0/1/1/1:4:19,66:0.74:-0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,74:0.58:-0.02:1.000:0.910 0/1/1/1:4:47,132:0.70: 1.56:1.000:0.988 0/1/1/1:4:35,108:0.72: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,61:0.53:-0.37:1.000:0.991 0/1/1/1:4:29,122:0.78: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,99:0.82:-0.11:0.999:0.999 0/1/1/1:4:24,98:0.77: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,56:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,76:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,55:0.52:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,47:0.57:-1.18:1.000:0.933 0/0/1/1:4:54,47:0.47:-0.54:1.000:0.991 0/1/1/1:4:25,104:0.78: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,115:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,63:0.53:-0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,79:0.54: 0.41:1.000:0.985 0/1/1/1:4:31,96:0.72: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,86:0.73:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,101:0.81: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,62:0.49:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,72:0.66:-0.48:1.000:0.897 0/1/1/1:4:12,54:0.79:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,65:0.52:-0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,108:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,50:0.71:-1.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:49,61:0.52:-0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,128:0.80: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,164:0.76: 2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,81:0.55: 0.49:1.000:0.983 0/1/1/1:4:35,68:0.63:-0.48:1.000:0.501 0/1/1/1:4:24,75:0.72:-0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,70:0.70:-0.70:1.000:0.988 0/1/1/1:4:29,87:0.72:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,47:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,107:0.75: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,46:0.53:-1.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:41,142:0.74: 1.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,91:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,88:0.53: 0.92:1.000:0.992 0/0/1/1:4:93,72:0.45: 1.19:1.000:0.982 0/1/1/1:4:33,147:0.79: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,87:0.54: 0.84:1.000:0.990 0/1/1/1:4:36,128:0.75: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,88:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,8:0.53:-2.88:1.000:0.990 0/0/1/1:4:43,49:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,107:0.74: 0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,118:0.74: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,80:0.49: 0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,116:0.79: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,97:0.72: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,145:0.76: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,110:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,54:0.48:-0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,117:0.80: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,128:0.78: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,95:0.72: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,63:0.58:-0.51:1.000:0.906 0/0/1/1:4:72,73:0.48: 0.65:0.999:0.996 0/0/1/1:4:71,82:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,64:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,59:0.53:-0.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,73:0.73:-0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,96:0.75: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,111:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,52:0.47:-0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,54:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,106:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,99:0.72: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,90:0.52: 1.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,103:0.72: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,105:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,101:0.59: 1.08:0.994:0.852 0/0/1/1:4:79,93:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,75:0.58: 0.00:1.000:0.895 0/0/1/1:4:99,39:0.38: 0.46:1.000:0.559 -chr3.1 62616485 chr3.1_062616485 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:175,144:0.45: 0.22:1.000:0.980 0/0/0/1:4:207,60:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,158:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,148:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,174:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:193,175:0.47: 1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,108:0.49:-1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,167:0.52: 0.17:1.000:0.994 0/0/0/0:4:279,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,65:0.51:-2.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,116:0.78:-2.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,74:0.30:-0.88:1.000:0.987 0/0/0/1:4:219,67:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,71:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:285,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,136:0.46:-0.14:1.000:0.985 0/0/0/1:4:253,76:0.24: 0.38:0.998:1.000 0/0/1/1:4:205,177:0.46: 1.25:1.000:0.988 0/0/1/1:4:209,184:0.47: 1.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:170,189:0.52: 0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,90:0.61:-2.65:1.000:0.661 0/0/1/1:4:134,139:0.51:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,254:0.72: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:193,61:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,66:0.63:-3.34:1.000:0.603 0/0/1/1:4:193,158:0.45: 0.74:1.000:0.979 0/0/0/0:4:321,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,135:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:183,158:0.46: 0.58:1.000:0.988 0/1/1/1:4:85,247:0.72: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:246,83:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,127:0.48:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,48:0.57:-3.65:1.000:0.948 0/1/1/1:4:39,132:0.75:-2.21:1.000:0.999 0/1/1:3:30,37:0.55:-3.91:1.000:0.954 0/0/0/1:4:235,90:0.28: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,178:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:146,162:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:262,88:0.26: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,86:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,161:0.52: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,164:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,155:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,93:0.45:-1.64:1.000:0.980 0/0/1/1:4:172,187:0.52: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,155:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:286,88:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,67:0.69:-3.46:1.000:0.968 0/0/1/1:4:164,173:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:216,93:0.31: 0.05:1.000:0.980 0/0/0/0:4:300,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,217:0.51: 1.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,80:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,111:0.30: 1.15:1.000:0.985 0/1/1/1:4:87,247:0.72: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:152,152:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,149:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,185:0.46: 1.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:225,66:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:123,145:0.53:-0.62:1.000:0.820 0/0/1/1:4:175,144:0.45: 0.22:1.000:0.980 0/0/1/1:4:152,151:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,212:0.52: 1.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:226,87:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:189,179:0.48: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,67:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,66:0.27:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/0:4:311,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,180:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,188:0.72:-0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:95,260:0.71: 0.81:1.000:0.993 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,86:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,147:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:174,137:0.44: 0.09:1.000:0.966 0/0/0/1:4:215,70:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,155:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,173:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:248,71:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,241:0.72: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:217,71:0.25:-0.29:0.999:0.999 0/0/0/0:4:329,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,79:0.25: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:308,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:177,238:0.57: 1.79:0.817:0.641 0/0/1/1:4:182,186:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,138:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,158:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:94,218:0.68: 0.10:1.000:0.956 0/0/1/1:4:175,149:0.46: 0.30:1.000:0.986 0/0/0/0:4:301,0:0.00:-0.08:0.999:1.000 0/0/0/1:4:225,69:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,92:0.26: 0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:49,180:0.76:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:340,1:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,85:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:225,68:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,210:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,198:0.50: 1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:229,78:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:204,53:0.21:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,73:0.22: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:252,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:240,105:0.31: 0.64:1.000:0.976 0/0/1/1:4:175,146:0.45: 0.25:1.000:0.983 0/1/1/1:4:64,232:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,73:0.22: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,69:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,246:0.53: 2.45:1.000:0.990 0/0/0/0:4:295,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,157:0.47: 0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:187,187:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:386,0:0.00: 1.32:0.999:1.000 0/0/0/1:4:201,74:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,99:0.47:-1.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:159,80:0.34:-1.09:1.000:0.883 0/1/1/1:4:75,241:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,166:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:249,67:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,80:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,76:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:190,151:0.44: 0.58:1.000:0.970 0/0/1/1:4:193,167:0.46: 0.89:1.000:0.989 0/0/1/1:4:203,152:0.43: 0.81:1.000:0.940 0/0/1/1:4:150,153:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:270,92:0.26: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:269,64:0.20: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,126:0.48:-0.75:1.000:0.995 0/0/0/0:4:262,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,64:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:87,214:0.69:-0.08:1.000:0.977 0/0/0/1:4:224,83:0.28: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:174,72:0.30:-0.98:1.000:0.987 0/0/1/1:4:195,189:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:220,64:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,97:0.26: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,96:0.29: 0.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:227,64:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:278,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:291,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:257,113:0.31: 1.05:1.000:0.974 0/0/1/1:4:165,171:0.51: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,145:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,146:0.56:-0.77:1.000:0.973 0/0/0/1:4:309,95:0.24: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,188:0.44: 2.06:1.000:0.959 0/1/1/1:4:74,247:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,229:0.68: 0.37:1.000:0.955 0/0/0/1:4:267,96:0.27: 0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,162:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:249,78:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,135:0.45:-0.06:1.000:0.975 0/0/0/1:4:115,44:0.28:-2.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,165:0.70:-1.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:176,172:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,86:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,82:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:283,78:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,71:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:255,81:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,133:0.43: 0.01:1.000:0.956 0/0/1/1:4:139,138:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,147:0.54:-0.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:147,142:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,151:0.57:-0.73:1.000:0.947 0/0/0/1:4:224,85:0.28: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:211,73:0.26:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,152:0.54:-0.47:0.999:0.986 0/0/0/1:4:233,70:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,125:0.45:-0.50:1.000:0.983 0/0/0/1:4:194,58:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,139:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:243,62:0.21:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,67:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,120:0.50:-1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:246,86:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:157,149:0.48: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,248:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,30:0.12:-0.63:1.000:0.646 0/0/0/1:4:236,79:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:285,82:0.23: 1.01:0.994:1.000 0/0/1/1:4:191,228:0.54: 1.86:1.000:0.989 0/1/1/1:4:72,168:0.68:-1.08:1.000:0.959 0/0/1/1:4:138,152:0.52:-0.26:1.000:0.995 -chr3.1 63046982 chr3.1_063046982 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:46,47:0.52: 1.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,39:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,56:0.80: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,43:0.72:-0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,36:0.52: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,6:0.51:-2.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,32:0.53: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,20:0.35: 0.24:1.000:0.827 0/0/1/1:4:15,17:0.54:-1.65:1.000:0.986 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:31,22:0.44:-0.45:1.000:0.964 0/1/1/1:4:9,40:0.82:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,31:0.55:-0.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:27,22:0.47:-0.68:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,47:0.67: 0.58:1.000:0.915 0/1/1/1:4:24,63:0.73: 1.49:0.998:0.997 0/0/0/1:4:56,26:0.35: 1.21:1.000:0.754 0/1/1/1:4:19,58:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,38:0.57: 0.41:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-2.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,40:0.55: 0.75:1.000:0.978 0/1/1/1:4:17,46:0.73: 0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,22:0.40:-0.11:1.000:0.806 0/0/1/1:4:5,6:0.56:-2.85:1.000:0.973 0/1/1/1:4:14,42:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,42:0.56: 0.86:1.000:0.962 0/0/1/1:4:38,25:0.42: 0.12:1.000:0.923 0/1/1/1:4:21,45:0.69: 0.29:1.000:0.970 0/1/1/1:4:20,59:0.75: 1.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,56:0.77: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,46:0.71: 0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:2,10:0.84:-2.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,33:0.77:-1.02:1.000:1.000 1/1/1:3:0,16:1.00:-2.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,34:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,44:0.71: 0.06:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,35:0.48: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,39:0.46: 1.55:1.000:0.989 0/1/1/1:4:25,59:0.71: 1.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,24:0.40: 0.24:1.000:0.779 0/0/0/1:4:47,24:0.37: 0.58:1.000:0.538 0/0/1/1:4:38,26:0.43: 0.18:1.000:0.948 0/1/1/1:4:11,42:0.80:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,67:0.74: 1.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,44:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,10:0.72:-2.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,42:0.73:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,34:0.78:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,25:0.47:-0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,55:0.55: 2.41:1.000:0.984 0/1/1/1:4:27,63:0.71: 1.66:1.000:0.989 0/1/1/1:4:24,66:0.74: 1.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,49:0.82:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,32:0.84:-1.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,56:0.78: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,33:0.51: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,14:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:10,41:0.81:-0.57:1.000:0.945 0/1/1/1:4:16,44:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,40:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,55:0.82: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,33:0.56:-0.05:1.000:0.966 0/0/1/1:4:42,41:0.51: 1.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,49:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.30:-1.88:1.000:0.988 0/0/0/1:4:48,13:0.26: 0.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,47:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,56:0.80: 0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.47:-2.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,39:0.78:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,46:0.58: 1.09:1.000:0.893 0/0/1/1:4:32,23:0.44:-0.34:1.000:0.968 0/0/0/1:4:42,8:0.22:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,35:0.64:-0.34:1.000:0.732 0/1/1/1:4:21,56:0.73: 0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,54:0.54: 2.35:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,32:0.64:-0.57:0.999:0.631 0/0/1/1:4:29,44:0.61: 0.69:1.000:0.676 0/0/1/1:4:45,39:0.48: 1.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:33,33:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:27,32:0.55:-0.11:0.817:0.725 0/1/1/1:4:24,50:0.68: 0.75:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,34:0.73:-0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,36:0.72:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,35:0.72:-0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,16:0.38:-0.85:0.999:0.574 0/1/1/1:4:19,63:0.77: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,53:0.56: 2.01:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,23:0.41: 0.01:1.000:0.834 0/0/1/1:4:39,34:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,35:0.48: 0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,43:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,49:0.73: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,43:0.57: 0.92:1.000:0.950 0/0/0/1:4:18,5:0.27:-2.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,15:0.30:-0.11:1.000:0.985 0/1/1/1:4:23,39:0.64: 0.06:1.000:0.650 0/0/1/1:4:35,32:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,31:0.74:-1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,59:0.74: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,49:0.74: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,26:0.46:-0.11:1.000:0.988 0/1/1/1:4:17,69:0.81: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,19:0.25: 2.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,30:0.53:-0.16:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,25:0.46:-0.28:0.999:0.990 0/1/1/1:4:17,49:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,23:0.53:-0.97:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,33:0.69:-0.74:1.000:0.978 0/1/1/1:4:9,25:0.74:-1.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,29:0.79:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,19:0.33: 0.29:1.000:0.925 0/1/1/1:4:12,42:0.78:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,37:0.57: 0.29:1.000:0.945 0/0/1/1:4:31,35:0.54: 0.29:1.000:0.987 0/1/1/1:4:10,55:0.85: 0.24:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,35:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,27:0.45: 0.12:1.000:0.979 0/0/1/1:4:16,24:0.61:-1.19:1.000:0.705 0/0/1/1:4:28,17:0.41:-0.91:1.000:0.838 0/1/1/1:4:11,48:0.82:-0.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,55:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,24:0.80:-1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,56:0.73: 0.92:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,55:0.73: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,46:0.59: 1.04:1.000:0.854 0/0/0/1:4:74,19:0.26: 1.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,30:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:44,14:0.29:-0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:33,27:0.47:-0.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:29,27:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,31:0.54:-0.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:8,33:0.81:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,25:0.55:-0.85:1.000:0.975 0/0/1/1:4:35,32:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,66:0.78: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,49:0.79: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,66:0.85: 0.98:1.000:0.989 0/0/1/1:4:41,36:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,66:0.80: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,51:0.59: 1.55:1.000:0.870 0/0/1/1:4:33,28:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,13:0.45:-1.77:1.000:0.983 0/1/1/1:4:14,32:0.70:-0.85:1.000:0.986 0/1/1/1:4:8,42:0.84:-0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,47:0.79:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,23:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,46:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,34:0.56: 0.06:1.000:0.969 0/0/1/1:4:27,28:0.52:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,44:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,40:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,36:0.58: 0.12:1.000:0.909 0/1/1/1:4:18,50:0.74: 0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,39:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,23:0.52:-0.91:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.11:0.999:1.000 0/0/1/1:4:37,21:0.39:-0.16:1.000:0.719 0/0/1/1:4:26,22:0.48:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,14:0.31:-0.45:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,29:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,40:0.65: 0.06:1.000:0.813 0/0/1/1:4:24,15:0.41:-1.25:1.000:0.875 0/0/1/1:4:34,38:0.54: 0.64:1.000:0.988 0/0/1/1:4:33,33:0.51: 0.29:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,48:0.66: 0.69:1.000:0.894 0/1/1/1:4:16,32:0.67:-0.74:1.000:0.933 0/1/1/1:4:12,48:0.80:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,28:0.54:-0.45:0.994:0.988 0/1/1/1:4:15,48:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,47:0.81:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,44:0.83:-0.45:1.000:0.998 -chr3.1 63321831 chr3.1_063321831 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:128,27:.:-0.68:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:168,12:.:-0.22:1.000:. ./.:4:210,10:.: 0.52:1.000:. ./.:4:309,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:207,13:.: 0.52:1.000:. ./.:4:70,6:.:-2.15:1.000:. ./.:4:137,18:.:-0.68:1.000:. ./.:4:133,23:.:-0.66:1.000:. ./.:4:51,23:.:-2.18:1.000:. ./.:4:80,5:.:-1.98:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:195,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:168,22:.:-0.03:1.000:. ./.:4:171,12:.:-0.16:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.99:0.998:. ./.:4:284,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:264,17:.: 1.65:1.000:. ./.:4:135,23:.:-0.63:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:136,20:.:-0.66:1.000:. ./.:4:188,17:.: 0.24:1.000:. ./.:4:112,23:.:-1.05:1.000:. ./.:4:26,8:.:-2.92:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:213,10:.: 0.58:1.000:. ./.:4:174,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:233,6:.: 0.87:1.000:. ./.:4:155,17:.:-0.37:1.000:. ./.:4:187,6:.: 0.02:1.000:. ./.:4:165,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:47,8:.:-2.53:1.000:. ./.:4:96,5:.:-1.68:1.000:. ./.:3:21,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:182,8:.:-0.03:1.000:. ./.:4:178,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:206,10:.: 0.45:1.000:. ./.:4:190,5:.: 0.06:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:130,23:.:-0.72:1.000:. ./.:4:231,11:.: 0.93:1.000:. ./.:4:114,30:.:-0.89:1.000:. ./.:4:213,17:.: 0.71:1.000:. ./.:4:206,10:.: 0.45:1.000:. ./.:4:257,6:.: 1.32:1.000:. ./.:4:205,30:.: 0.80:1.000:. ./.:4:149,13:.:-0.55:1.000:. ./.:4:188,12:.: 0.15:1.000:. ./.:4:168,18:.:-0.11:1.000:. ./.:4:126,15:.:-0.94:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:218,15:.: 0.76:1.000:. ./.:4:186,10:.: 0.08:1.000:. ./.:4:180,8:.:-0.07:1.000:. ./.:4:171,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,21:.:-1.14:1.000:. ./.:4:101,30:.:-1.13:1.000:. ./.:6:182,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:197,16:.: 0.39:1.000:. ./.:4:173,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:217,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:147,17:.:-0.51:1.000:. ./.:4:130,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:165,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:68,18:.:-1.96:1.000:. ./.:4:112,28:.:-0.96:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:97,8:.:-1.61:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:126,19:.:-0.87:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:92,17:.:-1.53:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:219,23:.: 0.93:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:194,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:195,16:.: 0.36:1.000:. ./.:4:164,14:.:-0.26:1.000:. ./.:6:236,12:.: 1.04:0.817:. ./.:4:195,18:.: 0.39:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:155,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:200,13:.: 0.39:1.000:. ./.:4:218,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:126,3:.:-1.16:0.999:. ./.:4:230,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:195,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:187,11:.: 0.11:1.000:. ./.:4:193,17:.: 0.34:1.000:. ./.:4:155,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:211,14:.: 0.62:1.000:. ./.:4:132,23:.:-0.68:1.000:. ./.:4:90,13:.:-1.64:1.000:. ./.:4:127,27:.:-0.70:1.000:. ./.:4:133,20:.:-0.72:1.000:. ./.:4:140,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:159,14:.:-0.35:1.000:. ./.:4:187,12:.: 0.13:1.000:. ./.:4:175,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:193,21:.: 0.41:1.000:. ./.:4:264,8:.: 1.49:1.000:. ./.:4:125,20:.:-0.87:1.000:. ./.:4:170,18:.:-0.07:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:208,15:.: 0.58:0.999:. ./.:4:201,13:.: 0.41:1.000:. ./.:4:111,10:.:-1.31:1.000:. ./.:4:128,12:.:-0.96:1.000:. ./.:4:134,8:.:-0.92:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:119,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:149,13:.:-0.55:1.000:. ./.:4:143,12:.:-0.68:1.000:. ./.:4:187,17:.: 0.23:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:192,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:168,12:.:-0.22:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:77,17:.:-1.81:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:112,10:.:-1.29:1.000:. ./.:4:180,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:183,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:303,11:.: 2.26:1.000:. ./.:4:125,18:.:-0.90:1.000:. ./.:4:168,17:.:-0.13:1.000:. ./.:4:106,25:.:-1.13:1.000:. ./.:4:172,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:201,20:.: 0.54:1.000:. ./.:4:167,10:.:-0.27:1.000:. ./.:4:189,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:141,15:.:-0.66:1.000:. ./.:4:268,7:.: 1.54:1.000:. ./.:4:298,12:.: 2.19:1.000:. ./.:4:182,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:165,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:158,24:.:-0.18:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:226,14:.: 0.89:1.000:. ./.:4:214,13:.: 0.65:1.000:. ./.:4:33,16:.:-2.65:1.000:. ./.:4:150,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:170,15:.:-0.13:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:207,11:.: 0.49:1.000:. ./.:4:184,15:.: 0.13:1.000:. ./.:4:160,11:.:-0.39:1.000:. ./.:4:139,25:.:-0.51:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:163,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:170,9:.:-0.24:1.000:. ./.:4:166,16:.:-0.18:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:206,11:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:168,10:.:-0.26:1.000:. ./.:4:177,18:.: 0.06:1.000:. ./.:4:88,21:.:-1.53:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:174,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:144,8:.:-0.74:1.000:. ./.:4:122,10:.:-1.11:1.000:. ./.:4:133,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:198,6:.: 0.23:1.000:. ./.:4:173,4:.:-0.27:1.000:. ./.:4:205,9:.: 0.41:1.000:. ./.:4:255,13:.: 1.41:0.994:. ./.:4:331,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:164,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.28:1.000:. -chr3.1 63663170 chr3.1_063663170 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:154,101:0.43: 1.16:1.000:0.950 0/0/0/1:4:130,48:0.31:-0.26:1.000:0.979 0/0/1/1:4:96,79:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,98:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:241,69:0.26: 2.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,89:0.40: 0.99:1.000:0.765 0/0/1/1:4:66,64:0.52:-1.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:109,103:0.52: 0.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,161:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,9:0.29:-2.89:1.000:0.990 0/0/0/0:4:22,1:0.05:-3.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,111:0.53: 0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:83,76:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,169:0.73: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,124:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,102:0.52: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,82:0.45: 0.11:0.998:0.979 0/0/0/1:4:175,44:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,62:0.24: 2.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,129:0.45: 2.21:1.000:0.978 0/0/0/1:4:19,2:0.11:-3.15:1.000:0.528 0/0/1/1:4:119,90:0.47: 0.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:192,44:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,128:0.69:-0.08:1.000:0.980 0/1/1/1:4:7,11:0.63:-3.21:1.000:0.587 0/0/1/1:4:112,79:0.45:-0.02:1.000:0.978 0/1/1/1:4:71,154:0.70: 0.61:1.000:0.983 0/0/1/1:4:110,91:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,74:0.29: 1.84:1.000:0.992 0/0/0/1:4:199,51:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,91:0.46: 0.38:1.000:0.989 0/0/0/1:4:159,44:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,20:0.84:-3.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:35,7:0.19:-2.76:1.000:1.000 0/1/1:3:8,12:0.62:-3.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,141:0.73: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:168,53:0.28: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:202,57:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,97:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,158:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,98:0.53: 0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:92,77:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,95:0.46: 0.59:1.000:0.987 0/0/1/1:4:89,69:0.47:-0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:131,86:0.43: 0.46:1.000:0.950 0/0/0/1:4:170,42:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,119:0.52: 0.96:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,19:0.21:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,65:0.45:-0.67:1.000:0.981 0/0/1/1:4:114,59:0.38:-0.35:1.000:0.523 0/1/1/1:4:30,161:0.85:-0.02:1.000:0.985 0/0/1/1:4:119,82:0.44: 0.16:1.000:0.972 0/0/1/1:4:85,81:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,74:0.46:-0.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:162,50:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,29:0.20:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,68:0.43:-0.33:1.000:0.935 0/0/1/1:4:88,76:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,128:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1/1/1:6:95,66:0.44:-0.57:1.000:0.712 0/0/1/1:4:109,100:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,57:0.44:-0.94:1.000:0.966 0/0/0/1:4:177,53:0.27: 0.70:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,132:0.73:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,88:0.46: 0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:111,70:0.42:-0.21:1.000:0.921 0/1/1/1:4:56,155:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,131:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,87:0.52:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:167,45:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:178,32:0.18: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,82:0.75:-1.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,48:0.27: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,89:0.45: 0.46:1.000:0.974 0/0/1/1:4:90,66:0.46:-0.67:1.000:0.986 0/1/1/1:4:32,81:0.73:-1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,80:0.54:-0.67:1.000:0.986 0/0/1/1:4:129,103:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,132:0.69: 0.09:1.000:0.965 0/0/0/1:4:165,42:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,33:0.26:-0.87:0.999:0.998 0/1/1/1:4:58,155:0.74: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,94:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,122:0.66:-0.06:1.000:0.887 0/0/0/1/1/1:6:102,81:0.48:-0.17:0.817:0.861 0/0/0/1:4:200,51:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,36:0.26:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,46:0.30:-0.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:149,33:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,98:0.53: 0.05:1.000:0.991 0/1/1/1:4:39,112:0.75:-0.76:0.999:0.999 0/0/1/1:4:105,94:0.51: 0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,140:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:142,33:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,131:0.72:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,88:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,101:0.57:-0.11:1.000:0.946 0/0/0/1:4:129,32:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,38:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,120:0.48: 1.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,112:0.77:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,146:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,111:0.73:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,84:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,35:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,46:0.28:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,81:0.58:-0.83:1.000:0.924 0/1/1/1:4:67,162:0.72: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:228,63:0.25: 1.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,134:0.70: 0.07:1.000:0.983 0/0/0/1:4:145,42:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:224,72:0.28: 1.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,163:0.75: 0.53:0.999:0.999 0/0/1/1:4:94,78:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,65:0.47:-0.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,87:0.62:-0.85:1.000:0.594 0/0/0/1:4:121,40:0.28:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,63:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,149:0.78: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,56:0.43:-0.92:1.000:0.945 0/0/1/1:4:126,103:0.48: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,82:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,97:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/0/0/1:4:159,45:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,45:0.29:-0.33:1.000:0.989 0/0/1/1:4:113,90:0.48: 0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,144:0.74: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,67:0.46:-0.67:1.000:0.990 0/1/1/1:4:34,79:0.71:-1.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:90,52:0.40:-0.92:1.000:0.803 0/0/0/1:4:123,36:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,109:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,48:0.41:-1.18:1.000:0.865 0/0/1/1:4:82,68:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,79:0.48:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:180,138:0.47: 2.32:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,121:0.75:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,136:0.74:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,111:0.74:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,128:0.73:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,89:0.48: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,117:0.53: 0.83:1.000:0.994 0/0/0/1:4:202,45:0.21: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,74:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,136:0.52: 1.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,110:0.44: 1.51:1.000:0.961 0/0/0/1:4:218,76:0.29: 1.88:1.000:0.989 0/0/0/1:4:175,48:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,97:0.46: 0.66:1.000:0.988 0/0/1/1:4:125,87:0.45: 0.37:1.000:0.975 0/0/1/1:4:165,137:0.49: 2.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,72:0.43:-0.15:1.000:0.937 1/1/1/1:4:1,13:0.94:-3.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,23:0.20:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,33:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,113:0.56: 0.37:1.000:0.965 0/1/1/1:4:91,183:0.68: 1.51:1.000:0.961 0/0/1/1:4:125,112:0.51: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,106:0.52: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,91:0.51: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,86:0.45: 0.27:1.000:0.980 0/0/0/1:4:135,33:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,92:0.46: 0.44:1.000:0.988 0/0/0/1:4:193,49:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,38:0.20: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,93:0.46: 0.48:1.000:0.988 0/1/1/1:4:56,131:0.71:-0.09:1.000:0.993 0/0/0/0:4:265,0:0.00: 1.34:0.999:1.000 0/1/1/1:4:60,135:0.71: 0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:127,89:0.45: 0.44:1.000:0.977 0/1/1/1:4:50,145:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,29:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,78:0.45:-0.11:1.000:0.984 0/1/1/1:4:65,130:0.68: 0.05:1.000:0.959 0/1/1/1:4:54,129:0.72:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,64:0.40:-0.28:1.000:0.763 0/0/1/1:4:151,117:0.47: 1.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:192,42:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,44:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,99:0.56:-0.08:1.000:0.974 0/0/1/1:4:133,88:0.43: 0.53:1.000:0.954 0/1/1/1:4:79,160:0.68: 0.86:0.994:0.964 0/0/1/1:4:132,124:0.52: 1.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:149,45:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:205,62:0.27: 1.38:1.000:0.998 -chr3.1 63745435 chr3.1_063745435 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:231,89:0.31:-0.40:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,354:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,160:0.48:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,194:0.51: 0.19:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,502:1.00: 2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,330:0.74: 1.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:207,87:0.32:-0.77:1.000:0.955 0/0/0/1:4:262,89:0.29: 0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:183,182:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:155,41:0.25:-2.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,56:0.40:-2.89:1.000:0.751 0/1/1/1:4:70,282:0.78: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,166:0.47:-0.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:105,333:0.74: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,284:0.78: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,293:0.77: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,434:1.00: 1.22:0.998:1.000 0/0/1/1:4:164,192:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:204,234:0.51: 1.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:319,142:0.33: 1.58:1.000:0.925 1/1/1/1:4:1,193:0.99:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,93:0.29: 0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:177,229:0.54: 0.81:1.000:0.986 0/0/1/1:4:179,197:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,70:0.55:-3.19:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,398:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,274:0.72: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,264:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,209:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,248:0.57: 1.02:1.000:0.953 0/1/1/1:4:87,306:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,226:0.72:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,68:0.72:-3.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,91:0.50:-2.47:1.000:0.997 0/1/1:3:11,69:0.85:-3.78:1.000:0.665 0/0/1/1:4:184,232:0.54: 0.95:1.000:0.990 0/1/1/1:4:82,291:0.76: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,426:1.00: 1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,274:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,196:0.54:-0.04:1.000:0.984 0/1/1/1:4:75,288:0.78: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,85:0.32:-0.87:1.000:0.955 0/1/1/1:4:63,309:0.82: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:238,61:0.25:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,241:0.55: 1.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:151,199:0.55: 0.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:173,239:0.56: 0.89:1.000:0.970 0/0/0/1:4:60,18:0.27:-3.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:132,147:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,93:0.44:-1.99:1.000:0.970 0/1/1/1:4:84,296:0.76: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,93:0.29: 0.08:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,410:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,218:0.53: 0.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:152,166:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,163:0.46:-0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:146,167:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,91:0.30:-0.25:1.000:0.983 0/0/0/1:4:217,83:0.30:-0.68:1.000:0.981 0/0/0/1/1/1:6:133,189:0.57:-0.37:1.000:0.638 0/0/1/1:4:180,192:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,212:0.71:-0.82:1.000:0.992 0/1/1/1:4:83,341:0.79: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,280:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,84:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,164:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:295,99:0.28: 0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,205:0.55: 0.16:1.000:0.982 0/1/1/1:4:81,269:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,238:0.76:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,332:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,206:0.72:-0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,280:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:257,86:0.28:-0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,246:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:228,83:0.30:-0.53:1.000:0.988 0/1/1/1:4:74,268:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,307:0.73: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,207:0.57: 0.03:1.000:0.951 0/1/1/1:4:71,277:0.78:-0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,316:1.00:-0.46:0.999:1.000 0/1/1/1:4:77,279:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,339:0.76: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,239:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:160,253:0.59: 0.91:0.817:0.574 0/1/1/1:4:108,283:0.70: 0.60:1.000:0.988 1/1/1/1:4:1,267:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,259:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,171:0.53:-0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:79,251:0.74:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,286:0.76: 0.29:0.999:1.000 1/1/1/1:4:1,324:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,331:0.77: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,207:0.73:-1.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:108,349:0.74: 1.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,332:0.78: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,259:0.73:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,143:0.48:-0.82:1.000:0.994 0/1/1/1:4:96,300:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,211:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:292,97:0.28: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:270,117:0.32: 0.54:1.000:0.941 0/1/1/1:4:85,242:0.72:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:199,203:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,156:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,181:0.49: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,188:0.54:-0.20:1.000:0.987 0/1/1/1:4:88,314:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,344:0.77: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,162:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,186:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:106,350:0.75: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,297:0.73: 0.67:0.999:0.998 0/1/1/1:4:73,304:0.79: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,93:0.43:-1.93:1.000:0.958 0/1/1/1:4:84,199:0.68:-0.92:1.000:0.960 0/0/1/1:4:147,167:0.51:-0.49:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,285:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,98:0.31:-0.05:1.000:0.974 0/1/1/1:4:96,244:0.70:-0.12:1.000:0.983 0/0/0/1:4:239,96:0.31:-0.19:1.000:0.971 0/0/1/1:4:149,185:0.53:-0.20:1.000:0.991 0/1/1/1:4:101,317:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,289:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,265:0.78:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,332:0.78: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,198:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,132:0.50:-1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,149:0.55:-1.23:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,342:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,260:0.72: 0.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,382:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,106:0.50:-2.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,178:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,257:0.77:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,374:0.73: 2.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:253,96:0.30: 0.01:1.000:0.983 0/1/1/1:4:97,299:0.74: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:146,155:0.49:-0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,265:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:90,288:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,212:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,172:0.49:-0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,247:0.74:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,357:0.76: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,222:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,221:0.52: 0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,176:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,216:0.53: 0.60:1.000:0.992 0/1/1/1:4:83,251:0.73:-0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:104,340:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,300:0.78: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,66:0.32:-1.79:1.000:0.950 0/0/1/1:4:107,163:0.58:-1.10:1.000:0.904 0/0/1/1:4:155,193:0.53:-0.01:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,389:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,221:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,303:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,243:0.71:-0.19:1.000:0.989 0/0/0/1:4:281,107:0.30: 0.56:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,379:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,196:0.75:-1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,257:0.76:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,164:0.48:-0.26:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,244:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,302:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,293:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,209:0.56: 0.13:0.999:0.963 0/0/1/1:4:146,205:0.56: 0.03:1.000:0.963 0/1/1/1:4:94,264:0.72: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:132,158:0.52:-0.82:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,275:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,249:0.71:-0.09:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,375:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,233:0.73:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:132,171:0.54:-0.64:1.000:0.986 0/0/0/1:4:299,132:0.33: 1.16:1.000:0.930 0/1/1/1:4:98,341:0.76: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,196:0.53: 0.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:99,298:0.73: 0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:90,300:0.75: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,229:0.54: 0.79:0.994:0.985 1/1/1/1:4:0,497:1.00: 2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,178:0.52:-0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:79,270:0.75: 0.01:1.000:1.000 -chr3.1 63964007 chr3.1_063964007 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:84,201:.: 0.38:1.000:. ./.:4:177,48:.:-0.64:1.000:. ./.:4:151,132:.: 0.35:1.000:. ./.:4:111,98:.:-0.92:1.000:. ./.:4:218,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:121,146:.: 0.07:1.000:. ./.:4:47,116:.:-1.70:1.000:. ./.:4:77,170:.:-0.27:1.000:. ./.:4:140,96:.:-0.46:1.000:. ./.:4:46,86:.:-2.23:1.000:. ./.:4:93,69:.:-1.72:1.000:. ./.:4:243,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:189,52:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,110:.:-0.10:1.000:. ./.:4:222,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:284,1:.: 0.38:0.998:. ./.:4:159,106:.: 0.04:1.000:. ./.:4:224,79:.: 0.69:1.000:. ./.:4:82,204:.: 0.40:1.000:. ./.:4:110,24:.:-2.20:1.000:. ./.:4:99,174:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,122:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,162:.:-0.52:1.000:. ./.:4:64,17:.:-3.10:1.000:. ./.:4:241,76:.: 0.93:1.000:. ./.:4:173,65:.:-0.42:1.000:. ./.:4:106,84:.:-1.24:1.000:. ./.:4:238,59:.: 0.59:1.000:. ./.:4:107,116:.:-0.68:1.000:. ./.:4:142,111:.:-0.17:1.000:. ./.:4:98,101:.:-1.09:1.000:. ./.:4:47,48:.:-2.86:1.000:. ./.:4:126,25:.:-1.91:1.000:. ./.:3:52,0:.:-3.60:1.000:. ./.:4:242,56:.: 0.60:1.000:. ./.:4:143,127:.: 0.12:1.000:. ./.:4:205,73:.: 0.26:1.000:. ./.:4:246,64:.: 0.81:1.000:. ./.:4:230,76:.: 0.74:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:89,219:.: 0.77:1.000:. ./.:4:158,145:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,183:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,159:.: 1.51:1.000:. ./.:4:218,62:.: 0.30:1.000:. ./.:4:243,60:.: 0.69:1.000:. ./.:4:62,71:.:-2.21:1.000:. ./.:4:168,128:.: 0.57:1.000:. ./.:4:289,77:.: 1.76:1.000:. ./.:4:222,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:100,268:.: 1.80:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:250,70:.: 0.98:1.000:. ./.:4:105,121:.:-0.63:1.000:. ./.:4:246,80:.: 1.08:1.000:. ./.:4:137,137:.: 0.19:1.000:. ./.:4:114,252:.: 1.76:1.000:. ./.:4:159,138:.: 0.59:1.000:. ./.:6:158,99:.:-0.10:1.000:. ./.:4:196,107:.: 0.69:1.000:. ./.:4:114,124:.:-0.42:1.000:. ./.:4:173,146:.: 0.96:1.000:. ./.:4:176,114:.: 0.47:1.000:. ./.:4:95,180:.: 0.21:1.000:. ./.:4:294,75:.: 1.81:1.000:. ./.:4:114,60:.:-1.51:1.000:. ./.:4:164,102:.: 0.06:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:132,124:.:-0.11:1.000:. ./.:4:286,73:.: 1.64:1.000:. ./.:4:203,43:.:-0.28:1.000:. ./.:4:411,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:72,207:.: 0.28:1.000:. ./.:4:261,60:.: 1.00:1.000:. ./.:4:179,138:.: 0.93:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:262,67:.: 1.13:1.000:. ./.:4:228,85:.: 0.86:1.000:. ./.:4:233,65:.: 0.60:0.999:. ./.:4:279,51:.: 1.15:1.000:. ./.:4:244,61:.: 0.72:1.000:. ./.:4:197,38:.:-0.47:1.000:. ./.:6:282,129:.: 2.53:0.817:. ./.:4:131,130:.:-0.03:1.000:. ./.:4:164,57:.:-0.71:1.000:. ./.:4:126,112:.:-0.42:1.000:. ./.:4:120,111:.:-0.54:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:246,55:.: 0.65:0.999:. ./.:4:280,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:210,153:.: 1.71:1.000:. ./.:4:143,51:.:-1.17:1.000:. ./.:4:285,44:.: 1.13:1.000:. ./.:4:240,59:.: 0.62:1.000:. ./.:4:177,59:.:-0.46:1.000:. ./.:4:221,70:.: 0.48:1.000:. ./.:4:116,118:.:-0.49:1.000:. ./.:4:78,183:.:-0.03:1.000:. ./.:4:163,98:.:-0.03:1.000:. ./.:4:170,93:.: 0.01:1.000:. ./.:4:209,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:98,194:.: 0.50:1.000:. ./.:4:160,49:.:-0.92:1.000:. ./.:4:133,117:.:-0.22:1.000:. ./.:4:240,53:.: 0.52:1.000:. ./.:4:144,112:.:-0.11:1.000:. ./.:4:188,144:.: 1.18:1.000:. ./.:4:154,126:.: 0.30:1.000:. ./.:4:194,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:260,65:.: 1.06:0.999:. ./.:4:185,135:.: 0.98:1.000:. ./.:4:180,49:.:-0.57:1.000:. ./.:4:83,140:.:-0.68:1.000:. ./.:4:108,129:.:-0.44:1.000:. ./.:4:234,71:.: 0.72:1.000:. ./.:4:181,116:.: 0.59:1.000:. ./.:4:169,89:.:-0.08:1.000:. ./.:4:137,117:.:-0.15:1.000:. ./.:4:149,56:.:-0.98:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:215,57:.: 0.16:1.000:. ./.:4:242,58:.: 0.64:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:127,85:.:-0.86:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:253,66:.: 0.96:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:132,31:.:-1.70:1.000:. ./.:4:157,140:.: 0.59:1.000:. ./.:4:140,123:.: 0.01:1.000:. ./.:4:243,72:.: 0.89:1.000:. ./.:4:168,115:.: 0.35:1.000:. ./.:4:159,98:.:-0.10:1.000:. ./.:4:138,92:.:-0.56:1.000:. ./.:4:236,50:.: 0.40:1.000:. ./.:4:227,63:.: 0.47:1.000:. ./.:4:170,48:.:-0.76:1.000:. ./.:4:141,63:.:-1.00:1.000:. ./.:4:83,106:.:-1.26:1.000:. ./.:4:220,77:.: 0.59:1.000:. ./.:4:196,157:.: 1.54:1.000:. ./.:4:94,120:.:-0.83:1.000:. ./.:4:99,118:.:-0.78:1.000:. ./.:4:87,220:.: 0.76:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:206,68:.: 0.19:1.000:. ./.:4:99,99:.:-1.10:1.000:. ./.:4:49,31:.:-3.12:1.000:. ./.:4:65,80:.:-2.01:1.000:. ./.:4:214,66:.: 0.30:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:260,78:.: 1.29:1.000:. ./.:4:157,126:.: 0.35:1.000:. ./.:4:170,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:139,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:162,50:.:-0.86:1.000:. ./.:4:99,121:.:-0.73:1.000:. ./.:4:87,113:.:-1.07:1.000:. ./.:4:180,56:.:-0.46:1.000:. ./.:4:221,56:.: 0.24:1.000:. ./.:4:104,103:.:-0.95:1.000:. ./.:4:123,96:.:-0.75:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.13:0.999:. ./.:4:201,42:.:-0.34:1.000:. ./.:4:81,104:.:-1.33:1.000:. ./.:4:46,121:.:-1.63:1.000:. ./.:4:131,52:.:-1.36:1.000:. ./.:4:183,52:.:-0.47:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:126,119:.:-0.30:1.000:. ./.:4:145,46:.:-1.22:1.000:. ./.:4:179,149:.: 1.11:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:138,137:.: 0.21:1.000:. ./.:4:212,36:.:-0.25:1.000:. ./.:4:143,122:.: 0.04:1.000:. ./.:4:264,74:.: 1.29:0.994:. ./.:4:206,100:.: 0.74:1.000:. ./.:4:113,86:.:-1.09:1.000:. ./.:4:229,55:.: 0.36:1.000:. -chr3.1 64193990 chr3.1_064193990 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:48,49:0.52: 1.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,13:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,17:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,21:0.27: 0.77:1.000:0.998 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,45:0.41: 1.98:1.000:0.850 0/0/1/1:4:36,28:0.46:-0.16:1.000:0.988 0/0/1/1:4:59,35:0.40: 1.05:1.000:0.751 0/1/1/1:4:33,64:0.64: 1.18:1.000:0.730 0/0/0/1:4:4,1:0.22:-2.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,1:0.09:-2.25:1.000:0.925 0/0/1/1:4:47,50:0.53: 1.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:74,18:0.22: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,46:0.52: 0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,44:0.47: 1.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:77,19:0.22: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,28:0.28: 1.70:0.998:0.996 0/0/1/1:4:58,34:0.39: 0.97:1.000:0.723 0/0/0/1:4:63,25:0.31: 0.81:1.000:0.977 0/0/0/1:4:59,18:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,43:0.46: 1.26:1.000:0.986 0/0/0/1:4:76,25:0.27: 1.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,67:0.74: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,4:0.22:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,17:0.18: 1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,49:0.49: 1.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,53:0.56: 1.14:1.000:0.969 0/0/0/1:4:53,24:0.34: 0.37:1.000:0.896 0/0/0/1:4:77,18:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,23:0.24: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,17:0.26: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.22:-2.33:1.000:1.000 0/0/0:3:7,0:0.00:-2.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,41:0.44: 1.22:1.000:0.969 0/0/0/1:4:66,23:0.28: 0.85:1.000:0.995 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,32:0.43: 0.45:1.000:0.942 0/0/1/1:4:39,33:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,14:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,23:0.41:-0.32:1.000:0.842 0/0/1/1:4:29,40:0.58: 0.05:1.000:0.911 0/0/1/1:4:37,24:0.42:-0.28:1.000:0.899 0/0/0/1:4:42,12:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,12:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,23:0.33: 0.25:1.000:0.901 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:58,16:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,8:0.15:-0.32:1.000:0.984 0/0/1/1:4:23,22:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,39:0.46: 0.89:1.000:0.985 0/0/0/1:4:44,9:0.19:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,10:0.17:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:55,22:0.31: 0.37:1.000:0.974 0/0/0/1:4:59,18:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,17:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,20:0.36:-0.36:1.000:0.659 0/1/1/1:4:10,33:0.73:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/0/0/1:6:38,6:0.15:-0.96:1.000:0.993 0/0/0/1:4:37,9:0.22:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,40:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,11:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,29:0.46:-0.03:1.000:0.985 0/0/1/1:4:38,30:0.46: 0.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:45,19:0.32:-0.16:1.000:0.952 0/0/1/1:4:12,18:0.60:-1.53:1.000:0.818 0/1/1/1:4:13,52:0.75:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,17:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,27:0.31: 1.01:1.000:0.967 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,25:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,15:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,41:0.46: 1.05:1.000:0.987 0/0/1/1:4:42,27:0.41: 0.05:1.000:0.889 0/0/1/1:4:26,39:0.60:-0.11:1.000:0.818 0/0/0/1:4:50,10:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,9:0.22:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,26:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,9:0.17:-0.44:0.999:0.999 0/0/1/1:4:37,25:0.43:-0.24:1.000:0.936 0/0/1/1:4:33,28:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,23:0.49:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:33,23:0.43:-0.48:0.817:0.632 0/0/0/1:4:45,20:0.33:-0.11:1.000:0.915 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,6:0.15:-0.92:1.000:0.984 0/0/0/1:4:32,15:0.34:-0.84:1.000:0.851 0/0/0/1:4:58,14:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,21:0.50:-0.96:0.999:0.997 0/0/0/1:4:46,13:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,37:0.58:-0.16:1.000:0.916 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,23:0.49:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,21:0.40:-0.48:1.000:0.776 0/0/1/1:4:26,15:0.39:-1.08:1.000:0.682 0/0/0/1:4:32,12:0.30:-0.96:1.000:0.988 0/0/0/1:4:47,11:0.21:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,34:0.45: 0.49:1.000:0.978 0/1/1/1:4:4,30:0.83:-1.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,51:0.70: 0.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:25,13:0.37:-1.20:1.000:0.621 0/0/0/1:4:37,19:0.36:-0.48:1.000:0.655 0/0/0/1:4:30,8:0.23:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,22:0.37:-0.20:1.000:0.528 0/0/0/1:4:42,13:0.26:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,35:0.47: 0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,25:0.29: 1.01:1.000:0.990 0/1/1/1:4:22,56:0.69: 0.41:1.000:0.973 0/0/0/1:4:34,13:0.30:-0.84:1.000:0.985 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 2.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,15:0.36:-0.96:0.999:0.636 0/0/0/1:4:55,18:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,23:0.60:-1.20:1.000:0.784 0/0/0/1:4:28,13:0.34:-1.08:1.000:0.865 0/0/0/1:4:35,11:0.26:-0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,12:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,45:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,8:0.27:-1.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,30:0.47:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,14:0.45:-1.41:1.000:0.977 0/0/0/0:4:55,6:0.11:-0.28:1.000:0.552 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,29:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,17:0.41:-0.96:1.000:0.862 0/0/1/1:4:19,22:0.55:-1.08:1.000:0.983 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-1.69:1.000:0.705 0/0/0/1:4:31,8:0.23:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,17:0.22: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,10:0.33:-1.41:1.000:0.933 0/0/0/1:4:27,12:0.33:-1.16:1.000:0.915 0/0/0/1:4:59,11:0.17: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,48:0.46: 1.66:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,41:0.69:-0.44:1.000:0.974 0/0/1/1:4:13,10:0.46:-1.81:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,29:0.70:-1.12:1.000:0.980 0/0/1/1:4:24,29:0.56:-0.60:1.000:0.974 0/0/1/1:4:24,32:0.57:-0.48:1.000:0.935 0/0/1/1:4:19,15:0.46:-1.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:57,15:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,18:0.55:-1.41:1.000:0.976 0/0/1/1:4:46,38:0.48: 0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:75,22:0.25: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,23:0.27: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,12:0.17: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,39:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:59,16:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,52:0.56: 1.01:1.000:0.959 0/0/1/1:4:37,48:0.57: 0.69:1.000:0.949 0/0/1/1:4:2,2:0.52:-2.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,20:0.31: 0.05:1.000:0.967 0/0/0/1:4:62,19:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,23:0.28: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,42:0.55: 0.41:1.000:0.982 0/0/0/1:4:63,11:0.16: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,44:0.56: 0.45:1.000:0.962 0/0/1/1:4:51,51:0.52: 1.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,18:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,28:0.31: 1.22:1.000:0.974 0/0/1/1:4:49,40:0.47: 0.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:65,18:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,22:0.29: 0.57:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,37:0.55: 0.05:1.000:0.983 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.65:0.999:1.000 0/0/1/1:4:35,45:0.57: 0.49:1.000:0.954 0/0/1/1:4:43,28:0.42: 0.13:1.000:0.904 0/1/1/1:4:17,58:0.73: 0.29:1.000:0.998 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,31:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,12:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,24:0.63:-1.24:1.000:0.627 0/0/1/1:4:26,30:0.55:-0.48:1.000:0.983 0/0/1/1:4:58,54:0.50: 1.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,18:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,34:0.43: 0.65:1.000:0.941 0/0/0/1:4:83,18:0.20: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,57:0.49: 2.18:0.994:0.996 0/0/0/1:4:66,27:0.31: 1.01:1.000:0.967 0/0/0/1:4:50,26:0.37: 0.33:1.000:0.621 0/0/0/1:4:77,33:0.32: 1.70:1.000:0.943 -chr3.1 64334225 chr3.1_064334225 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:139,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:93,49:.:-0.73:1.000:. ./.:4:93,38:.:-0.91:1.000:. ./.:4:98,28:.:-0.99:1.000:. ./.:4:214,60:.: 1.40:1.000:. ./.:4:120,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:32,18:.:-2.22:1.000:. ./.:4:115,44:.:-0.46:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:33,21:.:-2.16:1.000:. ./.:4:57,19:.:-1.80:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:120,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.33:0.998:. ./.:4:211,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:118,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:39,8:.:-2.27:1.000:. ./.:4:131,58:.: 0.03:1.000:. ./.:4:126,47:.:-0.23:1.000:. ./.:4:106,33:.:-0.78:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:148,64:.: 0.40:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:97,35:.:-0.90:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:86,37:.:-1.04:1.000:. ./.:4:148,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:90,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:23,10:.:-2.50:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.11:1.000:. ./.:3:18,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:149,42:.: 0.06:1.000:. ./.:4:121,59:.:-0.12:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:219,76:.: 1.74:1.000:. ./.:4:237,77:.: 2.05:1.000:. ./.:4:171,70:.: 0.87:1.000:. ./.:4:169,85:.: 1.08:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:95,27:.:-1.06:1.000:. ./.:4:170,65:.: 0.77:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:207,74:.: 1.51:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:117,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:142,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:196,87:.: 1.55:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.82:1.000:. ./.:6:149,41:.: 0.04:1.000:. ./.:4:154,50:.: 0.27:1.000:. ./.:4:148,64:.: 0.40:1.000:. ./.:4:225,101:.: 2.24:1.000:. ./.:4:170,73:.: 0.90:1.000:. ./.:4:147,68:.: 0.45:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:98,83:.:-0.10:1.000:. ./.:4:197,94:.: 1.67:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:290,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:145,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:160,69:.: 0.67:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:227,88:.: 2.06:1.000:. ./.:4:110,44:.:-0.54:0.999:. ./.:4:279,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:318,80:.: 3.40:0.817:. ./.:4:215,80:.: 1.74:1.000:. ./.:4:119,59:.:-0.15:1.000:. ./.:4:149,50:.: 0.19:1.000:. ./.:4:171,50:.: 0.54:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:226,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:204,84:.: 1.63:1.000:. ./.:4:114,31:.:-0.69:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:164,70:.: 0.75:1.000:. ./.:4:186,74:.: 1.17:1.000:. ./.:4:159,60:.: 0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:163,66:.: 0.67:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:166,62:.: 0.66:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:103,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:180,58:.: 0.82:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.75:0.999:. ./.:4:155,70:.: 0.61:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:116,66:.:-0.09:1.000:. ./.:4:111,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:163,60:.: 0.58:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:179,52:.: 0.70:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:156,60:.: 0.46:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:124,60:.:-0.05:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:146,59:.: 0.28:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:257,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:111,63:.:-0.22:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:158,57:.: 0.45:1.000:. ./.:4:106,36:.:-0.73:1.000:. ./.:4:148,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:179,52:.: 0.70:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:98,40:.:-0.80:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:44,14:.:-2.09:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:123,49:.:-0.25:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:99,32:.:-0.91:1.000:. ./.:4:134,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:126,45:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:85,45:.:-0.93:1.000:. ./.:4:125,39:.:-0.38:1.000:. ./.:4:96,41:.:-0.81:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:134,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:66,30:.:-1.48:1.000:. ./.:4:70,33:.:-1.36:1.000:. ./.:4:120,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:155,62:.: 0.48:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:134,47:.:-0.10:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:90,32:.:-1.06:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.43:0.994:. ./.:4:110,37:.:-0.65:1.000:. ./.:4:88,20:.:-1.28:1.000:. ./.:4:131,47:.:-0.15:1.000:. -chr3.1 64377714 chr3.1_064377714 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:18,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.32:0.998:. ./.:4:15,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:26,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,1:.: 1.05:1.000:. ./.:6:16,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:20,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,3:.: 0.90:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:18,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:6:17,0:.: 0.46:0.817:. ./.:4:26,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:0.999:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:17,2:.: 0.76:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:25,1:.: 1.78:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:21,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.56:0.994:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. -chr3.1 64643112 chr3.1_064643112 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:84,149:.: 1.08:1.000:. ./.:4:29,121:.:-1.03:1.000:. ./.:4:55,118:.:-0.44:1.000:. ./.:4:80,97:.:-0.34:1.000:. ./.:4:114,161:.: 2.15:1.000:. ./.:4:90,103:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,80:.:-1.21:1.000:. ./.:4:86,141:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,78:.:-1.54:1.000:. ./.:4:61,92:.:-0.95:1.000:. ./.:4:40,144:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,130:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,178:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.22:1.000:. ./.:4:87,139:.: 0.91:1.000:. ./.:4:44,174:.: 0.70:0.998:. ./.:4:150,89:.: 1.24:1.000:. ./.:4:130,177:.: 2.97:1.000:. ./.:4:96,177:.: 2.10:1.000:. ./.:4:42,93:.:-1.41:1.000:. ./.:4:57,110:.:-0.60:1.000:. ./.:4:135,76:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,112:.:-1.00:1.000:. ./.:4:36,59:.:-2.43:1.000:. ./.:4:97,116:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.55:1.000:. ./.:4:85,119:.: 0.35:1.000:. ./.:4:112,137:.: 1.49:1.000:. ./.:4:116,75:.: 0.01:1.000:. ./.:4:65,99:.:-0.67:1.000:. ./.:4:61,94:.:-0.90:1.000:. ./.:4:34,91:.:-1.66:1.000:. ./.:4:37,99:.:-1.38:1.000:. ./.:3:28,26:.:-3.47:1.000:. ./.:4:36,155:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,115:.:-0.21:1.000:. ./.:4:91,122:.: 0.57:1.000:. ./.:4:42,142:.:-0.16:1.000:. ./.:4:33,152:.:-0.14:1.000:. ./.:4:74,100:.:-0.42:1.000:. ./.:4:80,118:.: 0.19:1.000:. ./.:4:91,143:.: 1.11:1.000:. ./.:4:63,113:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,151:.: 1.01:1.000:. ./.:4:82,142:.: 0.85:1.000:. ./.:4:58,161:.: 0.73:1.000:. ./.:4:135,128:.: 1.85:1.000:. ./.:4:79,124:.: 0.32:1.000:. ./.:4:44,154:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.80:1.000:. ./.:4:100,145:.: 1.39:1.000:. ./.:4:23,138:.:-0.75:1.000:. ./.:4:47,197:.: 1.36:1.000:. ./.:4:128,76:.: 0.35:1.000:. ./.:4:80,128:.: 0.45:1.000:. ./.:4:81,91:.:-0.47:1.000:. ./.:4:103,156:.: 1.74:1.000:. ./.:4:35,147:.:-0.21:1.000:. ./.:6:60,84:.:-1.18:1.000:. ./.:4:56,107:.:-0.70:1.000:. ./.:4:68,94:.:-0.72:1.000:. ./.:4:86,132:.: 0.70:1.000:. ./.:4:44,162:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,123:.: 0.27:1.000:. ./.:4:62,183:.: 1.39:1.000:. ./.:4:27,138:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,174:.:-0.39:1.000:. ./.:4:107,113:.: 0.75:1.000:. ./.:4:97,73:.:-0.52:1.000:. ./.:4:116,108:.: 0.85:1.000:. ./.:4:19,118:.:-1.36:1.000:. ./.:4:49,169:.: 0.70:1.000:. ./.:4:99,149:.: 1.46:1.000:. ./.:4:93,103:.: 0.14:1.000:. ./.:4:43,151:.: 0.09:1.000:. ./.:4:92,113:.: 0.37:1.000:. ./.:4:85,123:.: 0.45:1.000:. ./.:4:48,176:.: 0.85:1.000:. ./.:4:122,90:.: 0.55:1.000:. ./.:4:27,119:.:-1.13:0.999:. ./.:4:0,228:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,164:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.49:1.000:. ./.:6:135,105:.: 1.26:0.817:. ./.:4:87,119:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,101:.:-0.75:1.000:. ./.:4:59,104:.:-0.70:1.000:. ./.:4:74,127:.: 0.27:1.000:. ./.:4:76,114:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.57:0.999:. ./.:4:33,153:.:-0.11:1.000:. ./.:4:35,182:.: 0.68:1.000:. ./.:4:98,65:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.45:1.000:. ./.:4:48,159:.: 0.42:1.000:. ./.:4:20,116:.:-1.38:1.000:. ./.:4:83,68:.:-1.00:1.000:. ./.:4:56,144:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,203:.: 1.39:1.000:. ./.:4:45,119:.:-0.67:1.000:. ./.:4:42,162:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,110:.:-2.05:1.000:. ./.:4:31,151:.:-0.21:1.000:. ./.:4:63,76:.:-1.31:1.000:. ./.:4:95,79:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,125:.:-0.62:1.000:. ./.:4:37,135:.:-0.47:1.000:. ./.:4:119,164:.: 2.36:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.98:1.000:. ./.:4:60,103:.:-0.70:1.000:. ./.:4:99,157:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.37:0.999:. ./.:4:29,155:.:-0.16:1.000:. ./.:4:46,74:.:-1.79:1.000:. ./.:4:43,146:.:-0.04:1.000:. ./.:4:129,62:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,118:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,138:.:-0.37:1.000:. ./.:4:28,126:.:-0.93:1.000:. ./.:4:38,154:.: 0.04:1.000:. ./.:4:71,116:.:-0.09:1.000:. ./.:4:95,130:.: 0.88:1.000:. ./.:4:99,124:.: 0.83:1.000:. ./.:4:64,106:.:-0.52:1.000:. ./.:4:40,156:.: 0.14:1.000:. ./.:4:28,134:.:-0.72:1.000:. ./.:4:54,94:.:-1.08:1.000:. ./.:4:14,117:.:-1.51:1.000:. ./.:4:26,109:.:-1.41:1.000:. ./.:4:101,66:.:-0.60:1.000:. ./.:4:34,164:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,81:.:-2.12:1.000:. ./.:4:68,109:.:-0.34:1.000:. ./.:4:33,142:.:-0.39:1.000:. ./.:4:47,177:.: 0.85:1.000:. ./.:4:43,132:.:-0.39:1.000:. ./.:4:25,112:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,130:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,137:.:-1.36:1.000:. ./.:4:44,160:.: 0.35:1.000:. ./.:4:60,103:.:-0.70:1.000:. ./.:4:72,91:.:-0.70:1.000:. ./.:4:39,78:.:-1.87:1.000:. ./.:4:50,200:.: 1.52:1.000:. ./.:4:100,175:.: 2.15:1.000:. ./.:4:138,80:.: 0.70:1.000:. ./.:4:128,77:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,174:.: 0.73:1.000:. ./.:4:71,95:.:-0.62:1.000:. ./.:4:47,197:.: 1.36:1.000:. ./.:4:100,122:.: 0.80:1.000:. ./.:4:23,100:.:-1.72:1.000:. ./.:4:77,68:.:-1.16:1.000:. ./.:4:99,140:.: 1.24:1.000:. ./.:4:32,159:.: 0.01:1.000:. ./.:4:57,217:.: 2.13:1.000:. ./.:4:40,184:.: 0.85:1.000:. ./.:4:43,146:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,180:.: 0.52:1.000:. ./.:4:75,127:.: 0.29:1.000:. ./.:4:61,92:.:-0.95:1.000:. ./.:4:78,103:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,111:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,105:.:-0.70:1.000:. ./.:4:48,171:.: 0.73:1.000:. ./.:4:26,123:.:-1.05:1.000:. ./.:4:84,123:.: 0.42:0.999:. ./.:4:28,152:.:-0.27:1.000:. ./.:4:78,119:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,137:.:-0.44:1.000:. ./.:4:71,67:.:-1.33:1.000:. ./.:4:51,165:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.37:1.000:. ./.:4:30,152:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,121:.:-0.93:1.000:. ./.:4:43,143:.:-0.11:1.000:. ./.:4:93,124:.: 0.68:1.000:. ./.:4:105,70:.:-0.39:1.000:. ./.:4:19,181:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,205:.: 1.44:1.000:. ./.:4:36,161:.: 0.17:0.994:. ./.:4:110,152:.: 1.82:1.000:. ./.:4:121,69:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,125:.: 0.93:1.000:. -chr3.1 64834597 chr3.1_064834597 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,2:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:42,2:.: 0.87:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.43:0.998:. ./.:4:58,0:.: 1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:37,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,3:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:40,1:.: 0.72:1.000:. ./.:6:0,3:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:34,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:66,3:.: 2.08:1.000:. ./.:4:24,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:46,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:32,2:.: 0.39:1.000:. ./.:6:36,0:.: 0.48:0.817:. ./.:4:2,1:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.68:0.999:. ./.:4:32,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:47,1:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:45,1:.: 0.97:0.999:. ./.:4:1,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:48,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,2:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:48,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.16:0.999:. ./.:4:33,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:60,2:.: 1.74:0.994:. ./.:4:60,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.21:1.000:. -chr3.1 65062082 chr3.1_065062082 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:88,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.36:0.998:. ./.:4:138,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:112,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.42:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:6:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:105,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.00:1.000:. ./.:6:98,0:.: 0.41:0.817:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:108,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:80,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.08:0.999:. ./.:4:100,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.69:0.994:. ./.:4:91,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.08:1.000:. -chr3.1 65262411 chr3.1_065262411 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,13:.: 0.50:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:32,17:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,33:.: 1.40:1.000:. ./.:4:38,17:.: 0.44:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:15,9:.:-1.54:1.000:. ./.:4:49,8:.: 0.57:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.96:1.000:. ./.:4:41,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:17,17:.:-0.90:1.000:. ./.:4:39,13:.: 0.25:1.000:. ./.:4:50,17:.: 1.21:1.000:. ./.:4:35,33:.: 1.27:1.000:. ./.:4:50,15:.: 1.08:0.998:. ./.:4:43,25:.: 1.27:1.000:. ./.:4:66,11:.: 1.84:1.000:. ./.:4:44,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,7:.:-1.41:1.000:. ./.:4:38,8:.:-0.13:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.13:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:27,3:.:-1.15:1.000:. ./.:4:33,30:.: 0.95:1.000:. ./.:4:61,15:.: 1.78:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:40,16:.: 0.50:1.000:. ./.:4:42,14:.: 0.50:1.000:. ./.:4:48,11:.: 0.70:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:20,7:.:-1.35:1.000:. ./.:3:7,5:.:-2.30:1.000:. ./.:4:35,33:.: 1.27:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:52,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:45,26:.: 1.46:1.000:. ./.:4:15,13:.:-1.28:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:46,9:.: 0.44:1.000:. ./.:4:17,11:.:-1.28:1.000:. ./.:4:43,16:.: 0.70:1.000:. ./.:4:23,28:.: 0.19:1.000:. ./.:4:65,10:.: 1.72:1.000:. ./.:4:25,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:25,26:.: 0.19:1.000:. ./.:4:24,4:.:-1.28:1.000:. ./.:4:61,14:.: 1.72:1.000:. ./.:4:43,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:26,20:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,17:.: 0.89:1.000:. ./.:4:12,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:38,17:.: 0.44:1.000:. ./.:4:41,15:.: 0.50:1.000:. ./.:6:23,23:.:-0.13:1.000:. ./.:4:22,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:31,11:.:-0.39:1.000:. ./.:4:28,19:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,23:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,5:.:-1.15:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,17:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,5:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,24:.: 0.76:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:65,28:.: 2.87:1.000:. ./.:4:47,12:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,11:.: 0.19:1.000:. ./.:4:28,9:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,24:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,7:.:-1.28:1.000:. ./.:4:29,27:.: 0.50:1.000:. ./.:4:22,15:.:-0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.35:0.999:. ./.:4:33,10:.:-0.32:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.20:1.000:. ./.:6:57,23:.: 2.04:0.817:. ./.:4:46,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,6:.:-1.22:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:19,11:.:-1.15:1.000:. ./.:4:26,25:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,7:.:-0.96:0.999:. ./.:4:37,10:.:-0.07:1.000:. ./.:4:50,15:.: 1.08:1.000:. ./.:4:26,26:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:22,14:.:-0.77:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:19,12:.:-1.09:1.000:. ./.:4:44,7:.: 0.19:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.47:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,13:.:-1.15:1.000:. ./.:4:51,14:.: 1.08:1.000:. ./.:4:31,28:.: 0.70:1.000:. ./.:4:44,11:.: 0.44:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:29,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:56,45:.: 3.38:1.000:. ./.:4:16,4:.:-1.79:0.999:. ./.:4:32,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.79:1.000:. ./.:4:22,6:.:-1.28:1.000:. ./.:4:33,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:38,9:.:-0.07:1.000:. ./.:4:31,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:23,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:36,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:23,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:25,24:.: 0.06:1.000:. ./.:4:33,28:.: 0.82:1.000:. ./.:4:18,23:.:-0.45:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:16,18:.:-0.90:1.000:. ./.:4:16,27:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,4:.:-1.60:1.000:. ./.:4:18,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:22,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,8:.: 0.06:1.000:. ./.:4:13,8:.:-1.73:1.000:. ./.:4:14,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:39,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:24,7:.:-1.09:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:34,5:.:-0.58:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:18,13:.:-1.09:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:33,31:.: 1.01:1.000:. ./.:4:45,11:.: 0.50:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:13,23:.:-0.77:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:28,11:.:-0.58:1.000:. ./.:4:62,16:.: 1.91:1.000:. ./.:4:39,10:.: 0.06:1.000:. ./.:4:23,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,15:.: 1.08:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:42,17:.: 0.70:1.000:. ./.:4:54,10:.: 1.01:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:28,12:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:27,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.89:1.000:. ./.:4:20,18:.:-0.64:0.999:. ./.:4:20,13:.:-0.96:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:43,13:.: 0.50:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:21,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.03:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:64,20:.: 2.29:1.000:. ./.:4:23,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,24:.: 1.78:1.000:. ./.:4:31,15:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,13:.: 0.89:1.000:. ./.:4:28,28:.: 0.50:0.994:. ./.:4:56,10:.: 1.14:1.000:. ./.:4:37,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:53,8:.: 0.82:1.000:. -chr3.1 65325157 chr3.1_065325157 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.61:0.998:. ./.:4:24,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:38,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:46,0:.: 3.02:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:38,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:17,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.06:1.000:. ./.:6:23,0:.: 0.52:0.817:. ./.:4:26,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.14:0.999:. ./.:4:28,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:0.999:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.03:0.999:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:44,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.14:0.994:. ./.:4:20,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. -chr3.1 65419775 chr3.1_065419775 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:66,1:0.08: 0.21:1.000:0.988 0/0/0/1:4:56,5:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,3:0.18: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,3:0.19: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,8:0.28:-0.52:1.000:0.994 0/0/0/0:4:137,2:0.08: 2.68:1.000:0.993 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,1:0.06: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,1:0.05: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,1:0.16:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,3:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,2:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,2:0.11: 1.20:1.000:0.547 0/0/0/1:4:61,4:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,7:0.28:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,6:0.28:-0.72:0.998:0.996 0/0/0/1:4:84,5:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,8:0.29:-0.62:1.000:0.993 0/0/0/0:4:103,1:0.05: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.27:-1.83:1.000:0.998 0/0/0/0:4:126,2:0.08: 2.31:1.000:0.978 0/0/0/1:4:70,6:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,1:0.20:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,6:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,4:0.19: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,6:0.28:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,3:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,4:0.27:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:61,6:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-1.65:1.000:0.957 0/0/0/1:4:8,2:0.29:-1.76:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:61,4:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,2:0.15: 0.41:1.000:0.984 0/0/0/1:4:18,3:0.28:-1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,3:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,4:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,3:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,1:0.05: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,4:0.27:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:37,2:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,3:0.26:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,3:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,3:0.28:-1.52:1.000:0.994 0/0/0/0:4:53,1:0.10:-0.24:1.000:0.811 0/0/0/1:4:108,3:0.15: 1.72:1.000:0.981 0/0/0/1:4:30,2:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,4:0.27:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,4:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,1:0.20:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,2:0.13: 0.76:1.000:0.905 0/0/0/0:4:94,1:0.06: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:40,1:0.13:-0.69:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,4:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,1:0.05: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,1:0.09:-0.07:1.000:0.936 0/0/0/0:4:81,1:0.07: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/0:4:74,1:0.07: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,4:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,2:0.26:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,3:0.16: 1.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:29,4:0.27:-0.97:1.000:0.998 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,1:0.18:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,1:0.07: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,3:0.26:-1.07:1.000:0.998 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,5:0.28:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.48:0.999:1.000 0/0/0/1:4:64,2:0.16: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:50,1:0.11:-0.35:1.000:0.660 0/0/0/0:4:62,1:0.09: 0.07:1.000:0.973 0/0/0/0/0/0:6:69,0:0.00: 0.27:0.817:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,1:0.25:-1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,4:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,4:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,1:0.10:-0.17:1.000:0.877 0/0/0/1:4:43,2:0.24:-0.55:0.999:1.000 0/0/0/1:4:30,2:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 2.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.29:-1.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:34,1:0.15:-0.90:1.000:0.991 0/0/0/1:4:65,2:0.16: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,3:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,4:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:104,1:0.05: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,1:0.12:-0.59:1.000:0.805 0/0/0/1:4:105,4:0.20: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,2:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,3:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,3:0.26:-1.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:85,3:0.18: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,7:0.26: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:119,1:0.04: 2.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,5:0.28:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,8:0.50:-1.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,2:0.15: 0.31:0.999:0.991 0/0/0/0:4:78,1:0.07: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,2:0.15: 0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:41,2:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,2:0.20:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,4:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,3:0.21: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,2:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,11:0.50:-1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,5:0.50:-1.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,4:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,1:0.09:-0.04:1.000:0.948 0/0/0/1:4:28,1:0.19:-1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,2:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,4:0.26:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:21,6:0.30:-1.17:1.000:0.988 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,1:0.08: 0.21:1.000:0.988 0/0/0/1:4:88,2:0.12: 1.00:1.000:0.750 0/0/0/1:4:87,3:0.18: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:86,1:0.06: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,1:0.07: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,2:0.19:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,3:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:62,1:0.09: 0.07:1.000:0.973 0/0/0/1:4:36,2:0.25:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,4:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,9:0.26: 0.89:1.000:0.998 0/0/0/0:4:61,1:0.09: 0.03:1.000:0.966 0/0/0/1:4:60,5:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:108,1:0.05: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,6:0.28:-0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,4:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,3:0.13: 2.24:1.000:0.889 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,2:0.22:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,3:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,6:0.27:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,3:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,4:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,1:0.07: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,2:0.15: 0.38:1.000:0.987 0/0/0/0:4:75,1:0.07: 0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:35,5:0.27:-0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,4:0.28:-1.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,3:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,2:0.14: 0.55:1.000:0.966 0/0/1/1:4:0,10:0.50:-1.76:0.999:0.997 0/0/0/1:4:69,2:0.15: 0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,4:0.20: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 2.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,5:0.28:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,2:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,6:0.27:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,2:0.18: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,3:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,4:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,5:0.50:-1.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:79,1:0.07: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,3:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,6:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,5:0.25: 1.31:0.994:0.999 0/0/0/1:4:69,7:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,2:0.18:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,3:0.22: 0.38:1.000:1.000 -chr3.1 65613215 chr3.1_065613215 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:380,98:.: 1.13:1.000:. ./.:4:91,235:.:-1.04:1.000:. ./.:4:310,92:.: 0.04:1.000:. ./.:4:307,102:.: 0.14:1.000:. ./.:4:268,258:.: 1.82:1.000:. ./.:4:400,132:.: 1.90:1.000:. ./.:4:212,64:.:-1.76:1.000:. ./.:4:312,104:.: 0.24:1.000:. ./.:4:310,78:.:-0.16:1.000:. ./.:4:219,80:.:-1.43:1.000:. ./.:4:250,67:.:-1.17:1.000:. ./.:4:302,94:.:-0.04:1.000:. ./.:4:316,93:.: 0.14:1.000:. ./.:4:344,89:.: 0.49:1.000:. ./.:4:287,78:.:-0.48:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:321,108:.: 0.43:0.998:. ./.:4:442,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:415,132:.: 2.12:1.000:. ./.:4:386,129:.: 1.66:1.000:. ./.:4:159,132:.:-1.54:1.000:. ./.:4:302,115:.: 0.26:1.000:. ./.:4:326,112:.: 0.56:1.000:. ./.:4:318,111:.: 0.43:1.000:. ./.:4:231,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:299,102:.: 0.03:1.000:. ./.:4:294,109:.: 0.06:1.000:. ./.:4:349,118:.: 0.97:1.000:. ./.:4:314,103:.: 0.26:1.000:. ./.:4:225,233:.: 0.85:1.000:. ./.:4:191,174:.:-0.48:1.000:. ./.:4:114,121:.:-2.34:1.000:. ./.:4:236,60:.:-1.47:1.000:. ./.:3:115,38:.:-3.51:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:189,200:.:-0.14:1.000:. ./.:4:241,206:.: 0.69:1.000:. ./.:4:354,102:.: 0.82:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:200,202:.: 0.04:1.000:. ./.:4:381,106:.: 1.26:1.000:. ./.:4:301,93:.:-0.07:1.000:. ./.:4:311,125:.: 0.53:1.000:. ./.:4:337,110:.: 0.69:1.000:. ./.:4:357,106:.: 0.92:1.000:. ./.:4:282,91:.:-0.37:1.000:. ./.:4:307,102:.: 0.14:1.000:. ./.:4:278,92:.:-0.41:1.000:. ./.:4:299,81:.:-0.27:1.000:. ./.:4:336,119:.: 0.80:1.000:. ./.:4:306,78:.:-0.21:1.000:. ./.:4:376,100:.: 1.10:1.000:. ./.:4:234,77:.:-1.26:1.000:. ./.:4:307,89:.:-0.04:1.000:. ./.:4:258,96:.:-0.64:1.000:. ./.:4:389,144:.: 1.92:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.33:1.000:. ./.:6:280,75:.:-0.63:1.000:. ./.:4:347,94:.: 0.60:1.000:. ./.:4:308,101:.: 0.14:1.000:. ./.:4:259,269:.: 1.85:1.000:. ./.:4:358,119:.: 1.12:1.000:. ./.:4:326,110:.: 0.53:1.000:. ./.:4:322,102:.: 0.36:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:302,115:.: 0.26:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:183,186:.:-0.43:1.000:. ./.:4:391,106:.: 1.40:1.000:. ./.:4:246,99:.:-0.77:1.000:. ./.:4:288,254:.: 2.05:1.000:. ./.:4:307,100:.: 0.12:1.000:. ./.:4:332,98:.: 0.45:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:340,88:.: 0.42:1.000:. ./.:4:84,219:.:-1.37:0.999:. ./.:4:329,108:.: 0.55:1.000:. ./.:4:342,124:.: 0.96:1.000:. ./.:4:276,83:.:-0.57:1.000:. ./.:6:475,107:.: 2.62:0.817:. ./.:4:216,204:.: 0.30:1.000:. ./.:4:127,130:.:-2.03:1.000:. ./.:4:201,172:.:-0.37:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:236,95:.:-0.97:0.999:. ./.:4:287,90:.:-0.31:1.000:. ./.:4:346,97:.: 0.63:1.000:. ./.:4:214,66:.:-1.70:1.000:. ./.:4:317,108:.: 0.37:1.000:. ./.:4:350,94:.: 0.65:1.000:. ./.:4:279,89:.:-0.44:1.000:. ./.:4:299,80:.:-0.28:1.000:. ./.:4:223,220:.: 0.63:1.000:. ./.:4:213,221:.: 0.50:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:227,76:.:-1.37:1.000:. ./.:4:170,172:.:-0.81:1.000:. ./.:4:286,90:.:-0.33:1.000:. ./.:4:249,85:.:-0.93:1.000:. ./.:4:267,83:.:-0.70:1.000:. ./.:4:320,102:.: 0.33:1.000:. ./.:4:246,250:.: 1.39:1.000:. ./.:4:306,96:.: 0.04:1.000:. ./.:4:309,105:.: 0.22:1.000:. ./.:4:457,145:.: 2.90:1.000:. ./.:4:296,103:.: 0.00:0.999:. ./.:4:208,175:.:-0.23:1.000:. ./.:4:316,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:230,96:.:-1.04:1.000:. ./.:4:256,100:.:-0.61:1.000:. ./.:4:280,96:.:-0.33:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:182,177:.:-0.57:1.000:. ./.:4:289,123:.: 0.19:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:298,101:.: 0.00:1.000:. ./.:4:286,113:.: 0.00:1.000:. ./.:4:317,104:.: 0.32:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:274,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:240,83:.:-1.08:1.000:. ./.:4:302,86:.:-0.16:1.000:. ./.:4:336,95:.: 0.46:1.000:. ./.:4:165,59:.:-2.50:1.000:. ./.:4:259,88:.:-0.74:1.000:. ./.:4:187,174:.:-0.54:1.000:. ./.:4:361,116:.: 1.12:1.000:. ./.:4:299,108:.: 0.12:1.000:. ./.:4:247,84:.:-0.97:1.000:. ./.:4:251,77:.:-1.01:1.000:. ./.:4:297,82:.:-0.28:1.000:. ./.:4:310,80:.:-0.13:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:314,87:.: 0.03:1.000:. ./.:4:232,87:.:-1.14:1.000:. ./.:4:367,113:.: 1.16:1.000:. ./.:4:399,138:.: 1.97:1.000:. ./.:4:353,126:.: 1.15:1.000:. ./.:4:308,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:234,213:.: 0.69:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:394,124:.: 1.70:1.000:. ./.:4:293,84:.:-0.31:1.000:. ./.:4:255,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:219,60:.:-1.71:1.000:. ./.:4:373,98:.: 1.03:1.000:. ./.:4:278,104:.:-0.24:1.000:. ./.:4:535,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:209,235:.: 0.65:1.000:. ./.:4:265,78:.:-0.80:1.000:. ./.:4:304,93:.:-0.03:1.000:. ./.:4:234,96:.:-0.98:1.000:. ./.:4:169,156:.:-1.06:1.000:. ./.:4:294,87:.:-0.26:1.000:. ./.:4:291,97:.:-0.16:1.000:. ./.:4:194,168:.:-0.53:1.000:. ./.:4:300,91:.:-0.11:1.000:. ./.:4:309,85:.:-0.07:1.000:. ./.:4:232,191:.: 0.35:0.999:. ./.:4:402,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:296,82:.:-0.30:1.000:. ./.:4:269,75:.:-0.78:1.000:. ./.:4:144,154:.:-1.44:1.000:. ./.:4:296,88:.:-0.21:1.000:. ./.:4:274,77:.:-0.68:1.000:. ./.:4:299,84:.:-0.23:1.000:. ./.:4:269,83:.:-0.67:1.000:. ./.:4:409,115:.: 1.79:1.000:. ./.:4:380,99:.: 1.15:1.000:. ./.:4:258,99:.:-0.60:1.000:. ./.:4:283,102:.:-0.20:1.000:. ./.:4:252,233:.: 1.23:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.79:0.994:. ./.:4:363,123:.: 1.25:1.000:. ./.:4:260,84:.:-0.78:1.000:. ./.:4:185,208:.:-0.08:1.000:. -chr3.1 65815376 chr3.1_065815376 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:411,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:282,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:413,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:485,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:452,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:392,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:342,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:326,2:.:-1.05:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:315,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.21:0.998:. ./.:4:417,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:479,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:505,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:276,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:420,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:254,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:439,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:424,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:210,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:295,2:.:-1.47:1.000:. ./.:3:225,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:542,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:566,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:659,1:.: 3.47:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:493,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:473,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:572,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.34:1.000:. ./.:6:393,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:551,1:.: 2.00:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:490,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:422,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:413,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:512,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:377,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:289,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:472,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:440,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:484,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:416,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:496,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:274,0:.:-1.79:1.000:. ./.:6:727,2:.: 4.41:0.817:. ./.:4:438,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:313,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:388,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:369,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:511,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:305,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:470,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:356,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:392,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:469,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:433,1:.: 0.39:0.999:. ./.:4:423,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:350,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:250,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:419,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:338,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:289,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:456,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:297,2:.:-1.45:0.999:. ./.:4:358,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:380,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:296,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:443,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:313,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:433,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.40:0.994:. ./.:4:457,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:306,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.47:1.000:. -chr3.1 66048994 chr3.1_066048994 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:15,31:0.71:-0.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:46,14:0.27: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,17:0.39:-0.18:1.000:0.735 0/0/1/1:4:33,20:0.40: 0.29:1.000:0.803 0/0/0/1:4:53,19:0.29: 1.55:1.000:0.990 0/1/1/1:4:21,47:0.73: 1.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,22:0.70:-1.04:1.000:0.984 0/1/1/1:4:19,29:0.63:-0.05:1.000:0.586 0/1/1/1:4:15,32:0.71:-0.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,14:0.70:-1.84:1.000:0.984 0/1/1/1:4:7,14:0.70:-1.84:1.000:0.984 0/1/1/1:4:23,35:0.63: 0.62:1.000:0.576 0/0/1/1:4:30,21:0.43: 0.15:1.000:0.956 0/0/1/1:4:29,16:0.38:-0.25:1.000:0.580 0/0/1/1:4:23,20:0.48:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,45:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,25:0.42: 0.95:0.998:0.914 0/1/1/1:4:18,30:0.65:-0.05:1.000:0.827 0/1/1/1:4:25,62:0.75: 2.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,43:0.73: 0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-2.44:1.000:0.691 0/1/1/1:4:18,28:0.64:-0.18:1.000:0.648 0/1/1/1:4:13,40:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,34:0.73: 0.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-3.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,22:0.66:-0.91:1.000:0.856 0/0/0/1:4:31,16:0.37:-0.11:1.000:0.609 0/1/1/1:4:20,41:0.70: 0.82:1.000:0.989 0/1/1/1:4:22,47:0.71: 1.35:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,40:0.71: 0.68:1.000:0.992 0/0/0/1:4:38,17:0.34: 0.42:1.000:0.888 0/0/1/1:4:24,23:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/0:4:1,0:0.04:-3.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,12:0.63:-1.91:1.000:0.527 0/1/1:3:1,1:0.52:-3.10:1.000:0.791 0/1/1/1:4:11,27:0.75:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,15:0.38:-0.44:1.000:0.599 0/0/0/1:4:40,12:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,27:0.73:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,23:0.77:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,35:0.62: 0.68:1.000:0.569 0/0/1/1:4:22,32:0.62: 0.35:1.000:0.578 0/1/1/1:4:17,27:0.64:-0.31:1.000:0.710 0/1/1/1:4:3,18:0.88:-1.84:1.000:0.852 0/0/1/1:4:34,29:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/1/1/1:4:21,32:0.63: 0.29:1.000:0.581 0/0/0/1:4:43,23:0.37: 1.15:1.000:0.509 0/1/1/1:4:8,23:0.77:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,10:0.31:-0.91:1.000:0.965 0/0/1/1:4:11,10:0.50:-1.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,10:0.38:-1.37:1.000:0.599 0/1/1/1:4:10,34:0.80:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,29:0.46: 1.15:1.000:0.988 0/0/0/1:4:40,20:0.36: 0.75:1.000:0.691 0/1/1/1:4:11,32:0.78:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,30:0.80:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,25:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,14:0.67:-1.77:1.000:0.904 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:23,31:0.60: 0.35:1.000:0.641 0/0/0/1:4:38,17:0.34: 0.42:1.000:0.888 0/1/1/1:4:16,33:0.71: 0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:35,23:0.42: 0.62:1.000:0.912 0/0/0/1:4:33,14:0.33:-0.11:1.000:0.935 0/1/1/1:4:12,20:0.65:-1.11:1.000:0.827 0/0/1/1:4:22,18:0.47:-0.58:1.000:0.992 1/1/1/1:4:1,31:0.97:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,27:0.66:-0.38:1.000:0.851 0/1/1/1:4:27,41:0.63: 1.28:1.000:0.569 0/0/1/1:4:33,20:0.40: 0.29:1.000:0.803 0/0/1/1:4:35,31:0.49: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,15:0.60:-1.51:1.000:0.769 0/0/1/1:4:23,18:0.46:-0.51:1.000:0.987 0/1/1/1:4:9,20:0.72:-1.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,26:0.66:-0.51:1.000:0.892 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,28:0.62:-0.11:1.000:0.534 0/1/1/1:4:23,43:0.68: 1.15:1.000:0.960 0/1/1/1:4:14,28:0.70:-0.44:1.000:0.984 0/0/1/1:4:34,31:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,7:0.19:-0.25:0.999:1.000 0/0/0/1:4:41,20:0.35: 0.82:1.000:0.748 0/1/1/1:4:20,43:0.72: 0.95:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,11:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:9,31:0.80:-0.58:0.817:0.934 0/0/1/1:4:38,38:0.52: 1.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,11:0.26:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,32:0.55: 0.82:1.000:0.983 1/1/1/1:4:1,39:0.98:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,31:0.69:-0.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:37,23:0.41: 0.75:0.999:0.845 0/0/1/1:4:34,29:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,25:0.41: 1.08:1.000:0.853 0/0/1/1:4:17,15:0.49:-1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,20:0.32: 1.28:1.000:0.947 0/0/1/1:4:21,29:0.61: 0.09:1.000:0.736 0/1/1/1:4:15,32:0.71:-0.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,20:0.63:-1.04:1.000:0.612 0/0/1/1:4:37,24:0.42: 0.82:1.000:0.900 0/0/1/1:4:38,24:0.41: 0.88:1.000:0.868 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,14:0.38:-0.58:1.000:0.510 0/0/0/1:4:43,22:0.36: 1.08:1.000:0.633 0/1/1/1:4:14,38:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,28:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:25,13:0.37:-0.71:1.000:0.589 0/0/1/1:4:25,20:0.46:-0.25:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,29:0.44: 1.42:1.000:0.961 0/1/1/1:4:17,36:0.71: 0.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,41:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,40:0.58: 1.55:1.000:0.916 0/0/1/1:4:41,22:0.37: 0.95:0.999:0.500 0/0/0/1:4:47,5:0.13: 0.22:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,9:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,49:0.85: 0.68:1.000:0.986 0/0/1/1:4:21,23:0.54:-0.31:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,5:0.14:-0.11:1.000:0.977 0/1/1/1:4:12,18:0.63:-1.24:1.000:0.527 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,41:0.68: 0.95:1.000:0.958 0/0/1/1:4:37,32:0.48: 1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:27,29:0.54: 0.49:1.000:0.988 0/1/1/1:4:16,29:0.68:-0.25:1.000:0.939 0/0/1/1:4:19,18:0.51:-0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,20:0.41: 0.22:1.000:0.853 0/0/1/1:4:29,27:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,29:0.49: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,18:0.52:-0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,25:0.61:-0.38:1.000:0.721 0/0/0/1:4:40,5:0.15:-0.25:1.000:0.985 0/1/1/1:4:13,44:0.80: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,33:0.91:-0.78:1.000:0.897 0/0/0/1:4:29,13:0.34:-0.44:1.000:0.886 0/1/1/1:4:11,25:0.73:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,12:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,41:0.69: 0.88:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,40:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,34:0.83:-0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,42:0.69: 1.02:1.000:0.970 0/0/0/1:4:50,19:0.30: 1.35:1.000:0.980 0/1/1/1:4:13,37:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,30:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,28:0.53: 0.42:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,41:0.81: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,47:0.64: 1.88:1.000:0.670 0/1/1/1:4:21,45:0.72: 1.15:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,32:0.76:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,30:0.58: 0.35:1.000:0.916 0/0/1/1:4:27,33:0.57: 0.75:1.000:0.937 0/1/1/1:4:23,52:0.73: 1.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,13:0.24: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,61:0.83: 1.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,40:0.70: 0.75:1.000:0.984 0/0/1/1:4:25,19:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/0/1/1:4:24,17:0.44:-0.51:1.000:0.961 0/1/1/1:4:10,36:0.81:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,36:0.80:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,11:0.28:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,13:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,13:0.33:-0.38:1.000:0.919 0/0/1/1:4:35,30:0.48: 1.08:0.999:0.995 0/1/1/1:4:10,23:0.73:-1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,39:0.68: 0.75:1.000:0.956 0/1/1/1:4:15,32:0.71:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,14:0.36:-0.44:1.000:0.691 0/1/1/1:4:19,43:0.73: 0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,15:0.35:-0.11:1.000:0.824 0/0/1/1:4:15,22:0.62:-0.78:1.000:0.550 0/0/1/1:4:23,24:0.53:-0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:20,38:0.69: 0.62:1.000:0.968 0/0/1/1:4:37,44:0.57: 2.15:1.000:0.955 0/1/1/1:4:16,30:0.68:-0.18:1.000:0.961 0/0/1/1:4:27,21:0.46:-0.05:1.000:0.987 0/0/0/1:4:52,13:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,43:0.70: 1.02:0.994:0.989 0/0/1/1:4:27,33:0.57: 0.75:1.000:0.937 0/1/1/1:4:13,38:0.78: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,19:0.41: 0.02:1.000:0.872 -chr3.1 66254938 chr3.1_066254938 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,349:.: 2.25:1.000:. ./.:4:81,104:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,173:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.65:1.000:. ./.:4:41,254:.: 1.15:1.000:. ./.:4:1,305:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,126:.:-2.28:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,197:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,179:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.79:1.000:. ./.:4:49,198:.: 0.18:1.000:. ./.:4:44,179:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,299:.: 1.23:1.000:. ./.:4:51,180:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,298:.: 1.21:1.000:. ./.:4:32,162:.:-0.90:0.998:. ./.:4:48,221:.: 0.62:1.000:. ./.:4:49,258:.: 1.40:1.000:. ./.:4:1,318:.: 1.64:1.000:. ./.:4:22,107:.:-2.22:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,287:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,132:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.90:1.000:. ./.:4:68,200:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1,251:.: 0.28:1.000:. ./.:4:58,222:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.09:1.000:. ./.:4:49,151:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,163:.:-0.74:1.000:. ./.:4:12,56:.:-3.46:1.000:. ./.:4:28,138:.:-1.47:1.000:. ./.:3:22,43:.:-3.52:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.79:1.000:. ./.:4:43,194:.:-0.03:1.000:. ./.:4:48,207:.: 0.34:1.000:. ./.:4:31,170:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.95:1.000:. ./.:4:47,217:.: 0.52:1.000:. ./.:4:35,232:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,138:.:-2.04:1.000:. ./.:4:0,182:.:-1.14:1.000:. ./.:4:37,183:.:-0.37:1.000:. ./.:4:34,209:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,324:.: 1.74:1.000:. ./.:4:40,190:.:-0.17:1.000:. ./.:4:45,194:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,276:.: 0.79:1.000:. ./.:4:42,175:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,256:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.25:1.000:. ./.:6:1,247:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.38:1.000:. ./.:4:27,202:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,275:.: 0.77:1.000:. ./.:4:26,178:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,152:.:-1.73:1.000:. ./.:4:32,171:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.79:1.000:. ./.:4:20,100:.:-2.40:1.000:. ./.:4:52,114:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,299:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,264:.: 0.54:1.000:. ./.:4:68,107:.:-1.29:0.999:. ./.:4:37,232:.: 0.62:1.000:. ./.:4:55,208:.: 0.50:1.000:. ./.:4:43,199:.: 0.08:1.000:. ./.:6:0,310:.: 1.46:0.817:. ./.:4:28,244:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,154:.:-1.10:1.000:. ./.:4:44,206:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,142:.:-1.27:0.999:. ./.:4:40,137:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,204:.:-0.68:1.000:. ./.:4:43,179:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,197:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,200:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.13:1.000:. ./.:4:52,239:.: 1.07:1.000:. ./.:4:48,207:.: 0.34:1.000:. ./.:4:2,219:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,298:.: 1.21:1.000:. ./.:4:20,153:.:-1.33:1.000:. ./.:4:42,205:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,136:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.04:1.000:. ./.:4:23,206:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,246:.: 1.34:1.000:. ./.:4:40,204:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,180:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,229:.: 1.40:1.000:. ./.:4:38,203:.: 0.06:0.999:. ./.:4:43,208:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.52:1.000:. ./.:4:26,210:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,235:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1,239:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,215:.: 0.54:1.000:. ./.:4:49,195:.: 0.12:1.000:. ./.:4:46,217:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.45:1.000:. ./.:4:27,149:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.21:1.000:. ./.:4:55,167:.:-0.33:1.000:. ./.:4:21,120:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,296:.: 1.17:1.000:. ./.:4:44,200:.: 0.12:1.000:. ./.:4:72,281:.: 2.33:1.000:. ./.:4:40,209:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.52:1.000:. ./.:4:31,179:.:-0.57:1.000:. ./.:4:38,167:.:-0.68:1.000:. ./.:4:54,268:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,323:.: 1.72:1.000:. ./.:4:32,168:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.15:1.000:. ./.:4:61,273:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,331:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,302:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.60:1.000:. ./.:4:63,228:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.44:1.000:. ./.:4:51,236:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,117:.:-2.45:1.000:. ./.:4:1,174:.:-1.29:1.000:. ./.:4:44,189:.:-0.11:1.000:. ./.:4:44,195:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,302:.: 1.30:1.000:. ./.:4:43,189:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,175:.:-0.13:1.000:. ./.:4:52,215:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,157:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.19:1.000:. ./.:4:40,181:.:-0.35:1.000:. ./.:4:47,207:.: 0.32:1.000:. ./.:4:53,206:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.17:1.000:. ./.:4:72,115:.:-1.04:0.999:. ./.:4:0,243:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,229:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,151:.:-1.08:1.000:. ./.:4:27,193:.:-0.37:1.000:. ./.:4:36,154:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,170:.:-1.39:1.000:. ./.:4:43,148:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,245:.: 1.11:1.000:. ./.:4:43,203:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.56:1.000:. ./.:4:50,192:.: 0.08:1.000:. ./.:4:62,215:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.54:0.994:. ./.:4:0,330:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.33:1.000:. ./.:4:50,235:.: 0.95:1.000:. -chr3.1 66407281 chr3.1_066407281 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:83,16:.: 1.44:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:54,37:.: 1.11:1.000:. ./.:4:59,30:.: 1.03:1.000:. ./.:4:90,12:.: 1.56:1.000:. ./.:4:60,16:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,5:.:-1.35:1.000:. ./.:4:58,15:.: 0.37:1.000:. ./.:4:19,22:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,3:.:-2.33:1.000:. ./.:4:42,7:.:-0.61:1.000:. ./.:4:50,32:.: 0.74:1.000:. ./.:4:27,22:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,31:.:-0.61:1.000:. ./.:4:69,25:.: 1.23:1.000:. ./.:4:71,40:.: 1.93:0.998:. ./.:4:91,6:.: 1.36:1.000:. ./.:4:77,5:.: 0.74:1.000:. ./.:4:57,21:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.49:1.000:. ./.:4:53,11:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,5:.: 1.44:1.000:. ./.:4:25,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:57,32:.: 1.03:1.000:. ./.:4:31,42:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,10:.: 0.82:1.000:. ./.:4:95,11:.: 1.73:1.000:. ./.:4:77,25:.: 1.56:1.000:. ./.:4:93,12:.: 1.69:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:6,4:.:-2.21:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:19,37:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,9:.: 1.52:1.000:. ./.:4:78,22:.: 1.48:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:30,44:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,17:.:-0.40:1.000:. ./.:4:47,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,19:.: 0.87:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.53:1.000:. ./.:4:33,22:.:-0.36:1.000:. ./.:4:81,12:.: 1.19:1.000:. ./.:4:55,23:.: 0.58:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:50,26:.: 0.50:1.000:. ./.:4:46,26:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,18:.:-1.35:1.000:. ./.:4:76,24:.: 1.48:1.000:. ./.:4:29,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:52,36:.: 0.99:1.000:. ./.:4:75,6:.: 0.70:1.000:. ./.:4:68,6:.: 0.42:1.000:. ./.:4:40,15:.:-0.36:1.000:. ./.:4:42,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:20,24:.:-0.81:1.000:. ./.:6:49,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,23:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,12:.:-0.24:1.000:. ./.:4:64,10:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,34:.: 0.01:1.000:. ./.:4:73,25:.: 1.40:1.000:. ./.:4:48,28:.: 0.50:1.000:. ./.:4:8,7:.:-2.00:1.000:. ./.:4:53,16:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,22:.:-0.49:1.000:. ./.:4:63,4:.: 0.13:1.000:. ./.:4:74,22:.: 1.32:1.000:. ./.:4:21,6:.:-1.51:1.000:. ./.:4:70,6:.: 0.50:1.000:. ./.:4:55,26:.: 0.70:1.000:. ./.:4:42,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,15:.:-1.02:1.000:. ./.:4:37,14:.:-0.53:1.000:. ./.:4:39,37:.: 0.50:1.000:. ./.:4:27,44:.: 0.29:1.000:. ./.:4:85,19:.: 1.64:1.000:. ./.:4:56,7:.:-0.04:0.999:. ./.:4:14,22:.:-1.14:1.000:. ./.:4:56,9:.: 0.05:1.000:. ./.:4:19,32:.:-0.53:1.000:. ./.:6:67,8:.: 0.46:0.817:. ./.:4:57,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:43,6:.:-0.61:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:24,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:18,18:.:-1.14:0.999:. ./.:4:55,23:.: 0.58:1.000:. ./.:4:34,38:.: 0.33:1.000:. ./.:4:44,12:.:-0.32:1.000:. ./.:4:50,20:.: 0.25:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.16:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:56,7:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,9:.:-0.28:1.000:. ./.:4:56,26:.: 0.74:1.000:. ./.:4:7,4:.:-2.17:1.000:. ./.:4:21,33:.:-0.40:1.000:. ./.:4:17,23:.:-0.98:1.000:. ./.:4:34,8:.:-0.90:1.000:. ./.:4:55,7:.:-0.08:1.000:. ./.:4:72,10:.: 0.74:1.000:. ./.:4:46,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,44:.: 0.50:1.000:. ./.:4:76,14:.: 1.07:1.000:. ./.:4:19,26:.:-0.77:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.45:1.000:. ./.:4:89,27:.: 2.14:1.000:. ./.:4:22,27:.:-0.61:0.999:. ./.:4:49,17:.: 0.09:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.77:1.000:. ./.:4:24,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,14:.:-0.45:1.000:. ./.:4:13,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:29,12:.:-0.94:1.000:. ./.:4:59,33:.: 1.15:1.000:. ./.:4:74,19:.: 1.19:1.000:. ./.:4:60,13:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,10:.:-0.57:1.000:. ./.:4:16,29:.:-0.77:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,15:.:-1.59:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.08:1.000:. ./.:4:40,28:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,14:.:-0.90:1.000:. ./.:4:48,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:46,29:.: 0.46:1.000:. ./.:4:61,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:28,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:12,27:.:-1.02:1.000:. ./.:4:14,11:.:-1.59:1.000:. ./.:4:24,25:.:-0.61:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.02:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.02:1.000:. ./.:4:68,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:31,6:.:-1.10:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.61:1.000:. ./.:4:49,29:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,14:.: 1.32:1.000:. ./.:4:57,6:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,6:.:-0.16:1.000:. ./.:4:61,37:.: 1.40:1.000:. ./.:4:67,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:49,20:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.49:1.000:. ./.:4:50,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:86,14:.: 1.48:1.000:. ./.:4:54,30:.: 0.82:1.000:. ./.:4:29,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:53,16:.: 0.21:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.98:1.000:. ./.:4:52,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:40,15:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,9:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,35:.: 1.73:1.000:. ./.:4:86,7:.: 1.19:1.000:. ./.:4:90,35:.: 2.50:1.000:. ./.:4:43,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,29:.:-0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:20,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:37,10:.:-0.69:1.000:. ./.:4:9,25:.:-1.22:1.000:. ./.:4:50,14:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,50:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,46:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.37:1.000:. ./.:4:71,23:.: 1.23:1.000:. ./.:4:87,18:.: 1.69:1.000:. ./.:4:81,11:.: 1.15:1.000:. ./.:4:41,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:46,25:.: 0.29:1.000:. ./.:4:38,36:.: 0.42:0.994:. ./.:4:55,23:.: 0.58:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:84,16:.: 1.48:1.000:. -chr3.1 66575975 chr3.1_066575975 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:41,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:32,8:.:-1.25:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.58:1.000:. ./.:4:44,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:63,16:.: 1.69:1.000:. ./.:4:38,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,9:.:-1.48:1.000:. ./.:4:58,11:.: 0.93:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:53,15:.: 0.86:1.000:. ./.:4:42,14:.:-0.05:1.000:. ./.:4:22,8:.:-2.01:1.000:. ./.:4:36,8:.:-0.95:1.000:. ./.:4:37,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:43,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,9:.:-1.25:1.000:. ./.:4:39,14:.:-0.27:0.998:. ./.:4:39,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:49,20:.: 0.93:1.000:. ./.:4:44,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,22:.: 0.86:1.000:. ./.:4:45,15:.: 0.25:1.000:. ./.:4:39,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.33:1.000:. ./.:4:25,16:.:-1.18:1.000:. ./.:4:41,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.80:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,10:.: 1.01:1.000:. ./.:4:49,10:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,8:.:-1.03:1.000:. ./.:4:36,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,21:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,23:.: 0.93:1.000:. ./.:3:34,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:30,11:.:-1.18:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,13:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,15:.: 0.10:1.000:. ./.:4:35,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:44,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,22:.: 1.99:1.000:. ./.:4:48,19:.: 0.78:1.000:. ./.:4:47,22:.: 0.93:1.000:. ./.:4:53,18:.: 1.09:1.000:. ./.:4:59,14:.: 1.24:1.000:. ./.:4:28,9:.:-1.48:1.000:. ./.:4:43,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,15:.: 0.56:1.000:. ./.:4:56,11:.: 0.78:1.000:. ./.:4:54,17:.: 1.09:1.000:. ./.:4:41,15:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,20:.: 1.46:1.000:. ./.:4:49,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:36,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:42,21:.: 0.48:1.000:. ./.:4:65,15:.: 1.76:1.000:. ./.:4:64,26:.: 2.52:1.000:. ./.:6:36,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:52,18:.: 1.01:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.35:1.000:. ./.:4:61,22:.: 1.99:1.000:. ./.:4:52,14:.: 0.71:1.000:. ./.:4:43,17:.: 0.25:1.000:. ./.:4:50,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:25,9:.:-1.71:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.20:1.000:. ./.:4:43,13:.:-0.05:1.000:. ./.:4:44,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,27:.: 1.54:1.000:. ./.:4:26,16:.:-1.10:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.63:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.41:1.000:. ./.:4:52,19:.: 1.09:1.000:. ./.:4:45,16:.: 0.33:1.000:. ./.:4:38,18:.:-0.05:1.000:. ./.:4:52,17:.: 0.93:1.000:. ./.:4:73,21:.: 2.82:1.000:. ./.:4:49,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:45,11:.:-0.05:0.999:. ./.:4:53,21:.: 1.31:1.000:. ./.:4:58,20:.: 1.61:1.000:. ./.:4:38,8:.:-0.80:1.000:. ./.:6:55,27:.: 1.92:0.817:. ./.:4:58,22:.: 1.76:1.000:. ./.:4:28,15:.:-1.03:1.000:. ./.:4:48,17:.: 0.63:1.000:. ./.:4:43,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.35:1.000:. ./.:4:38,7:.:-0.88:0.999:. ./.:4:40,26:.: 0.71:1.000:. ./.:4:63,20:.: 1.99:1.000:. ./.:4:39,12:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:45,20:.: 0.63:1.000:. ./.:4:57,16:.: 1.24:1.000:. ./.:4:39,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:52,21:.: 1.24:1.000:. ./.:4:51,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,10:.:-1.48:1.000:. ./.:4:46,25:.: 1.09:1.000:. ./.:4:29,10:.:-1.33:1.000:. ./.:4:55,14:.: 0.93:1.000:. ./.:4:42,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,18:.: 1.39:1.000:. ./.:4:38,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:28,10:.:-1.41:1.000:. ./.:4:45,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:57,13:.: 1.01:1.000:. ./.:4:44,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,12:.: 0.71:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.41:0.999:. ./.:4:53,15:.: 0.86:1.000:. ./.:4:18,5:.:-2.54:1.000:. ./.:4:45,19:.: 0.56:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.88:1.000:. ./.:4:33,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,13:.: 0.10:1.000:. ./.:4:44,19:.: 0.48:1.000:. ./.:4:58,14:.: 1.16:1.000:. ./.:4:59,15:.: 1.31:1.000:. ./.:4:41,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,10:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,14:.: 0.41:1.000:. ./.:4:48,18:.: 0.71:1.000:. ./.:4:42,17:.: 0.18:1.000:. ./.:4:31,9:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,11:.:-1.78:1.000:. ./.:4:41,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.20:1.000:. ./.:4:29,12:.:-1.18:1.000:. ./.:4:32,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:50,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:29,15:.:-0.95:1.000:. ./.:4:44,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,13:.: 0.18:1.000:. ./.:4:21,5:.:-2.31:1.000:. ./.:4:42,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:46,23:.: 0.93:1.000:. ./.:4:39,11:.:-0.50:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:63,12:.: 1.39:1.000:. ./.:4:50,17:.: 0.78:1.000:. ./.:4:42,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,9:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:38,11:.:-0.58:1.000:. ./.:4:39,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:32,16:.:-0.65:1.000:. ./.:4:24,3:.:-2.24:1.000:. ./.:4:44,13:.: 0.03:1.000:. ./.:4:50,21:.: 1.09:1.000:. ./.:4:61,12:.: 1.24:1.000:. ./.:4:45,13:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:49,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,13:.: 0.56:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:31,5:.:-1.56:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:25,3:.:-2.16:1.000:. ./.:4:30,9:.:-1.33:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:61,19:.: 1.76:0.999:. ./.:4:41,8:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,7:.:-0.58:1.000:. ./.:4:37,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:32,4:.:-1.56:1.000:. ./.:4:33,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.35:1.000:. ./.:4:29,9:.:-1.41:1.000:. ./.:4:48,7:.:-0.12:1.000:. ./.:4:51,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:56,13:.: 0.93:1.000:. ./.:4:30,14:.:-0.95:0.994:. ./.:4:48,12:.: 0.25:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:53,12:.: 0.63:1.000:. -chr3.1 66635815 chr3.1_066635815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:72,11:.: 1.02:1.000:. ./.:4:18,15:.:-1.62:1.000:. ./.:4:65,10:.: 0.60:1.000:. ./.:4:54,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,29:.: 1.28:1.000:. ./.:4:64,17:.: 0.91:1.000:. ./.:4:30,7:.:-1.41:1.000:. ./.:4:55,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,8:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,1:.:-2.62:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.62:1.000:. ./.:4:52,8:.:-0.19:1.000:. ./.:4:65,6:.: 0.38:1.000:. ./.:4:63,12:.: 0.60:1.000:. ./.:4:71,13:.: 1.07:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:75,17:.: 1.49:0.998:. ./.:4:53,15:.: 0.23:1.000:. ./.:4:83,14:.: 1.75:1.000:. ./.:4:65,7:.: 0.44:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.78:1.000:. ./.:4:68,12:.: 0.86:1.000:. ./.:4:64,10:.: 0.54:1.000:. ./.:4:61,8:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:46,6:.:-0.62:1.000:. ./.:4:47,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:67,12:.: 0.81:1.000:. ./.:4:63,9:.: 0.44:1.000:. ./.:4:42,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-3.30:1.000:. ./.:4:6,3:.:-2.88:1.000:. ./.:3:8,2:.:-2.83:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:38,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:54,10:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,18:.: 0.28:1.000:. ./.:4:64,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:50,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:56,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:56,13:.: 0.28:1.000:. ./.:4:74,14:.: 1.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:38,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:37,7:.:-1.04:1.000:. ./.:4:51,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:60,10:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,12:.: 0.23:1.000:. ./.:4:83,11:.: 1.60:1.000:. ./.:4:57,6:.:-0.04:1.000:. ./.:4:65,5:.: 0.33:1.000:. ./.:4:70,10:.: 0.86:1.000:. ./.:4:53,6:.:-0.25:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.23:1.000:. ./.:6:40,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:62,11:.: 0.49:1.000:. ./.:4:49,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:42,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:70,12:.: 0.96:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.96:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:53,15:.: 0.23:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.93:1.000:. ./.:4:42,29:.: 0.38:1.000:. ./.:4:60,13:.: 0.49:1.000:. ./.:4:47,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:68,14:.: 0.96:1.000:. ./.:4:13,22:.:-1.51:0.999:. ./.:4:56,15:.: 0.38:1.000:. ./.:4:63,23:.: 1.17:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.25:1.000:. ./.:6:54,9:.:-0.04:0.817:. ./.:4:44,30:.: 0.54:1.000:. ./.:4:22,12:.:-1.56:1.000:. ./.:4:38,29:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:51,9:.:-0.19:0.999:. ./.:4:58,8:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,15:.: 1.65:1.000:. ./.:4:41,9:.:-0.72:1.000:. ./.:4:66,11:.: 0.70:1.000:. ./.:4:52,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.35:1.000:. ./.:4:41,24:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:46,7:.:-0.56:1.000:. ./.:4:49,27:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:70,21:.: 1.44:1.000:. ./.:4:56,6:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:48,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:72,9:.: 0.91:1.000:. ./.:4:58,10:.: 0.23:1.000:. ./.:4:70,9:.: 0.81:1.000:. ./.:4:66,7:.: 0.49:0.999:. ./.:4:40,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:38,12:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,7:.:-0.25:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:33,8:.:-1.20:1.000:. ./.:4:62,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:62,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:49,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:55,7:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,10:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,2:.:-1.56:1.000:. ./.:4:54,6:.:-0.19:1.000:. ./.:4:36,9:.:-0.98:1.000:. ./.:4:69,12:.: 0.91:1.000:. ./.:4:66,13:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,9:.: 0.23:1.000:. ./.:4:55,14:.: 0.28:1.000:. ./.:4:65,10:.: 0.60:1.000:. ./.:4:52,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:55,7:.:-0.09:1.000:. ./.:4:49,8:.:-0.35:1.000:. ./.:4:82,15:.: 1.75:1.000:. ./.:4:71,12:.: 1.02:1.000:. ./.:4:85,9:.: 1.60:1.000:. ./.:4:73,8:.: 0.91:1.000:. ./.:4:33,18:.:-0.67:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:71,9:.: 0.86:1.000:. ./.:4:49,11:.:-0.19:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.83:1.000:. ./.:4:66,11:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,7:.: 1.02:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:47,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:53,8:.:-0.14:1.000:. ./.:4:54,8:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:30,9:.:-1.30:1.000:. ./.:4:42,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:67,9:.: 0.65:1.000:. ./.:4:19,9:.:-1.88:1.000:. ./.:4:41,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:54,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:46,21:.: 0.17:0.999:. ./.:4:72,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,11:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.30:1.000:. ./.:4:54,8:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,10:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:47,6:.:-0.56:1.000:. ./.:4:76,9:.: 1.12:1.000:. ./.:4:58,15:.: 0.49:1.000:. ./.:4:58,6:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,6:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,14:.:-0.98:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.81:0.994:. ./.:4:69,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:33,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.14:1.000:. -chr3.1 66686768 chr3.1_066686768 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,84:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,89:.: 0.00:1.000:. ./.:4:21,92:.: 0.11:1.000:. ./.:4:79,91:.: 2.14:1.000:. ./.:4:29,94:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,72:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,21:.:-3.17:1.000:. ./.:4:0,21:.:-3.17:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.00:1.000:. ./.:4:28,86:.: 0.15:1.000:. ./.:4:30,105:.: 0.89:1.000:. ./.:4:35,85:.: 0.36:1.000:. ./.:4:50,46:.:-0.50:1.000:. ./.:4:48,60:.:-0.07:0.998:. ./.:4:0,126:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,104:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,147:.: 1.32:1.000:. ./.:4:7,9:.:-3.35:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.32:1.000:. ./.:4:32,100:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,20:.:-2.95:1.000:. ./.:4:58,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:24,71:.:-0.53:1.000:. ./.:4:22,85:.:-0.10:1.000:. ./.:4:25,126:.: 1.46:1.000:. ./.:4:24,78:.:-0.28:1.000:. ./.:4:54,44:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,83:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,15:.:-3.38:1.000:. ./.:4:5,29:.:-2.70:1.000:. ./.:3:22,10:.:-2.78:1.000:. ./.:4:23,88:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,64:.:-0.60:1.000:. ./.:4:49,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:20,97:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,98:.: 0.32:1.000:. ./.:4:44,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,142:.: 1.14:1.000:. ./.:4:36,119:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.82:1.000:. ./.:4:32,103:.: 0.89:1.000:. ./.:4:39,103:.: 1.14:1.000:. ./.:4:29,94:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,5:.:-3.70:1.000:. ./.:4:16,97:.: 0.11:1.000:. ./.:4:20,49:.:-1.46:1.000:. ./.:4:22,86:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.57:1.000:. ./.:4:60,65:.: 0.54:1.000:. ./.:4:38,113:.: 1.46:1.000:. ./.:4:25,89:.: 0.15:1.000:. ./.:4:26,77:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,77:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,140:.: 1.07:1.000:. ./.:6:25,80:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,102:.: 1.04:1.000:. ./.:4:19,90:.:-0.03:1.000:. ./.:4:31,89:.: 0.36:1.000:. ./.:4:33,100:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.47:1.000:. ./.:4:37,74:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,58:.:-1.85:1.000:. ./.:4:41,87:.: 0.65:1.000:. ./.:4:52,58:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.15:1.000:. ./.:4:61,76:.: 0.97:1.000:. ./.:4:15,63:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,153:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.78:1.000:. ./.:4:58,74:.: 0.79:1.000:. ./.:4:53,77:.: 0.72:1.000:. ./.:4:24,84:.:-0.07:1.000:. ./.:4:63,58:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,105:.:-0.10:0.999:. ./.:4:36,106:.: 1.14:1.000:. ./.:4:27,115:.: 1.14:1.000:. ./.:4:31,93:.: 0.50:1.000:. ./.:6:8,98:.:-0.14:0.817:. ./.:4:32,87:.: 0.32:1.000:. ./.:4:45,43:.:-0.78:1.000:. ./.:4:19,93:.: 0.07:1.000:. ./.:4:30,72:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,90:.: 0.04:1.000:. ./.:4:17,48:.:-1.60:0.999:. ./.:4:50,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:21,92:.: 0.11:1.000:. ./.:4:56,46:.:-0.28:1.000:. ./.:4:23,80:.:-0.25:1.000:. ./.:4:33,102:.: 0.89:1.000:. ./.:4:21,95:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.11:1.000:. ./.:4:39,107:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,147:.: 1.32:1.000:. ./.:4:27,79:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.25:1.000:. ./.:4:22,77:.:-0.39:1.000:. ./.:4:23,69:.:-0.64:1.000:. ./.:4:29,66:.:-0.53:1.000:. ./.:4:21,82:.:-0.25:1.000:. ./.:4:39,120:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,80:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,95:.: 2.14:1.000:. ./.:4:37,112:.: 1.39:0.999:. ./.:4:30,77:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,42:.:-1.71:1.000:. ./.:4:36,70:.:-0.14:1.000:. ./.:4:23,53:.:-1.21:1.000:. ./.:4:64,68:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,86:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.32:1.000:. ./.:4:32,66:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,44:.:-0.21:1.000:. ./.:4:71,71:.: 1.14:1.000:. ./.:4:60,60:.: 0.36:1.000:. ./.:4:31,87:.: 0.29:1.000:. ./.:4:38,104:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,68:.: 0.36:1.000:. ./.:4:46,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:25,54:.:-1.10:1.000:. ./.:4:20,72:.:-0.64:1.000:. ./.:4:27,77:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,104:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,88:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.17:1.000:. ./.:4:20,87:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,81:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,83:.: 0.32:1.000:. ./.:4:27,78:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,68:.:-0.85:1.000:. ./.:4:46,106:.: 1.50:1.000:. ./.:4:44,109:.: 1.54:1.000:. ./.:4:28,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:34,94:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.00:1.000:. ./.:4:46,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:25,115:.: 1.07:1.000:. ./.:4:27,84:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,38:.:-2.56:1.000:. ./.:4:27,69:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,85:.:-0.35:1.000:. ./.:4:58,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:30,111:.: 1.11:1.000:. ./.:4:20,107:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,85:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.40:1.000:. ./.:4:50,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:22,63:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,77:.:-0.64:1.000:. ./.:4:34,85:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,21:.:-2.13:1.000:. ./.:4:23,94:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.43:0.999:. ./.:4:32,81:.: 0.11:1.000:. ./.:4:14,75:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,47:.:-1.10:1.000:. ./.:4:29,83:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,59:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,69:.:-0.74:1.000:. ./.:4:17,84:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.65:1.000:. ./.:4:65,70:.: 0.89:1.000:. ./.:4:17,84:.:-0.32:1.000:. ./.:4:24,103:.: 0.61:1.000:. ./.:4:23,104:.: 0.61:1.000:. ./.:4:30,82:.: 0.07:0.994:. ./.:4:59,74:.: 0.82:1.000:. ./.:4:20,80:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.18:1.000:. -chr3.1 66873285 chr3.1_066873285 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:240,75:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,176:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,155:0.56: 0.23:1.000:0.969 0/0/1/1:4:154,144:0.50: 0.46:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,275:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,199:0.56: 1.69:1.000:0.961 0/0/0/1:4:146,72:0.34:-1.04:1.000:0.864 0/0/0/1:4:202,60:0.23:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,66:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,32:0.29:-3.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:102,62:0.39:-2.05:1.000:0.709 0/0/0/1:4:176,58:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,167:0.56: 0.63:1.000:0.966 0/0/1/1:4:143,166:0.55: 0.66:1.000:0.975 0/0/1/1:4:141,133:0.51: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,159:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:82,237:0.75: 0.85:0.998:0.999 0/0/1/1:4:138,149:0.54: 0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:188,193:0.53: 2.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:251,88:0.27: 1.22:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-2.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,56:0.22:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,157:0.48: 1.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:204,76:0.28: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,18:0.16:-2.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,164:0.54: 0.81:1.000:0.990 0/0/1/1:4:158,143:0.49: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,131:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,164:0.51: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,185:0.56: 1.22:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,313:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,199:0.77:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,87:0.71:-2.77:1.000:0.989 0/0/1/1:4:99,65:0.41:-2.05:1.000:0.870 0/1/1:3:24,56:0.71:-3.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,76:0.26: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:77,243:0.77: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,276:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,137:0.47: 0.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:225,89:0.29: 0.76:1.000:0.991 0/0/1/1:4:149,112:0.45:-0.23:1.000:0.975 0/0/0/1:4:254,67:0.21: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,125:0.42: 0.72:1.000:0.895 0/0/0/1:4:195,60:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,133:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,142:0.46: 0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:169,171:0.52: 1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,122:0.48:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,118:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:202,161:0.46: 1.67:1.000:0.988 0/0/1/1:4:132,110:0.47:-0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:277,96:0.26: 1.86:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,185:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,135:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,115:0.48:-0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:157,152:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,99:0.41:-0.40:1.000:0.847 0/0/0/1:4:257,77:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:286,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:105,114:0.54:-1.02:1.000:0.804 0/0/1/1:4:172,122:0.43: 0.38:1.000:0.949 0/0/1/1:4:146,117:0.46:-0.20:1.000:0.989 0/1/1/1:4:76,185:0.72:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,111:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:211,70:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,130:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,48:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,150:0.56: 0.05:1.000:0.967 0/0/1/1:4:148,122:0.47:-0.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:83,225:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,95:0.42:-0.76:1.000:0.926 0/0/1/1:4:159,155:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:233,81:0.26: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:244,63:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:297,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,111:0.44:-0.18:1.000:0.961 0/0/1/1:4:145,114:0.46:-0.27:1.000:0.986 0/0/0/1:4:221,51:0.19:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,220:0.73: 0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,142:0.67:-1.06:0.999:0.902 0/0/1/1:4:157,129:0.47: 0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:164,111:0.42: 0.03:1.000:0.909 0/0/1/1:4:140,116:0.47:-0.33:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:211,160:0.45: 1.82:0.817:0.733 0/1/1/1:4:68,231:0.78: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,194:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,163:0.69:-0.63:1.000:0.973 0/0/0/1:4:217,47:0.18:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,66:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,138:0.54:-0.16:0.999:0.988 0/1/1/1:4:83,155:0.66:-0.66:1.000:0.886 0/0/1/1:4:175,139:0.46: 0.76:1.000:0.988 0/1/1/1:4:44,155:0.78:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,148:0.52: 0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,143:0.52: 0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:131,113:0.48:-0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:181,51:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,185:0.68: 0.05:1.000:0.956 0/0/1/1:4:145,146:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:313,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,88:0.43:-1.15:1.000:0.949 0/0/1/1:4:130,117:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,99:0.46:-0.94:1.000:0.989 0/0/1/1:4:160,132:0.47: 0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:135,123:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,124:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:102,257:0.72: 1.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:209,87:0.30: 0.42:1.000:0.983 0/0/1/1:4:125,119:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:99,313:0.77: 2.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,135:0.48: 0.33:0.999:0.995 0/1/1/1:4:87,214:0.72: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:181,45:0.20:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,140:0.70:-1.30:1.000:0.981 0/0/1/1:4:142,103:0.44:-0.53:1.000:0.961 0/1/1/1:4:65,185:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:263,2:0.01:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,167:0.72:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:202,80:0.29: 0.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:189,55:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,120:0.51:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,242:0.78: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,194:0.75:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,143:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:225,63:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:228,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,142:0.75:-1.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,164:0.71:-0.74:1.000:0.992 0/1/1/1:4:56,200:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,74:0.48:-2.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:149,121:0.47:-0.07:1.000:0.991 0/1/1/1:4:57,163:0.75:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,202:0.51: 2.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,77:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,109:0.47:-0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:179,47:0.21:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,127:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,135:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:194,64:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,130:0.55:-0.55:1.000:0.980 0/0/1/1:4:104,99:0.51:-1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,160:0.52: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,173:0.50: 1.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,151:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,112:0.47:-0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:171,154:0.49: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,143:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:198,159:0.46: 1.56:1.000:0.989 0/0/1/1:4:172,139:0.46: 0.70:1.000:0.990 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,105:0.53:-1.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:159,150:0.51: 0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,260:0.75: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:269,106:0.29: 1.90:1.000:0.992 0/1/1/1:4:69,238:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,137:0.53:-0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:215,89:0.30: 0.57:1.000:0.984 0/1/1/1:4:75,206:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,168:0.74:-0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:132,121:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,161:0.55: 0.51:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,305:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,234:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,143:0.55:-0.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:137,137:0.52: 0.01:0.999:0.995 0/0/0/1:4:226,66:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,144:0.54: 0.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:166,55:0.25:-0.98:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,237:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,114:0.46:-0.31:1.000:0.988 0/1/1/1:4:55,178:0.77:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,118:0.53:-0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,129:0.57:-0.76:1.000:0.946 0/0/0/1:4:230,112:0.34: 1.28:1.000:0.883 0/1/1/1:4:83,248:0.76: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,166:0.52: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,146:0.55: 0.05:1.000:0.983 0/1/1/1:4:84,251:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,85:0.25: 1.43:0.994:0.999 0/1/1/1:4:72,266:0.79: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,115:0.54:-0.96:1.000:0.990 0/0/1/1:4:144,121:0.48:-0.16:1.000:0.994 -chr3.1 67244188 chr3.1_067244188 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,82:.: 1.89:1.000:. ./.:4:15,27:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,29:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,32:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,25:.:-2.06:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.88:1.000:. ./.:4:5,22:.:-1.92:1.000:. ./.:4:10,44:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,39:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.47:1.000:. ./.:4:11,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:14,41:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,38:.: 0.71:0.998:. ./.:4:2,43:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,40:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,87:.: 2.23:1.000:. ./.:4:13,14:.:-1.92:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,55:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.02:1.000:. ./.:4:5,14:.:-2.47:1.000:. ./.:4:12,52:.: 0.64:1.000:. ./.:4:13,33:.:-0.60:1.000:. ./.:4:17,30:.:-0.54:1.000:. ./.:4:25,39:.: 0.64:1.000:. ./.:4:13,34:.:-0.54:1.000:. ./.:4:13,16:.:-1.78:1.000:. ./.:4:18,28:.:-0.60:1.000:. ./.:4:11,5:.:-2.68:1.000:. ./.:4:14,25:.:-1.09:1.000:. ./.:3:0,7:.:-3.30:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,23:.:-0.19:1.000:. ./.:4:20,32:.:-0.19:1.000:. ./.:4:24,25:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,59:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,82:.: 1.89:1.000:. ./.:4:27,30:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,51:.: 0.99:1.000:. ./.:4:4,29:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.99:1.000:. ./.:4:5,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:13,50:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,33:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,79:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.36:1.000:. ./.:6:2,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:7,31:.:-1.16:1.000:. ./.:4:26,44:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,48:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.54:1.000:. ./.:4:11,52:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,53:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:17,42:.: 0.30:1.000:. ./.:4:13,17:.:-1.71:1.000:. ./.:4:27,40:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,36:.:-0.40:1.000:. ./.:4:14,59:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,76:.: 1.47:1.000:. ./.:4:11,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:16,19:.:-1.37:0.999:. ./.:4:11,58:.: 0.99:1.000:. ./.:4:32,31:.: 0.57:1.000:. ./.:4:5,35:.:-1.02:1.000:. ./.:6:10,68:.: 1.61:0.817:. ./.:4:34,35:.: 0.99:1.000:. ./.:4:10,19:.:-1.78:1.000:. ./.:4:24,28:.:-0.19:1.000:. ./.:4:17,62:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.23:1.000:. ./.:4:6,36:.:-0.88:0.999:. ./.:4:26,32:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,74:.: 1.33:1.000:. ./.:4:12,29:.:-0.95:1.000:. ./.:4:10,53:.: 0.57:1.000:. ./.:4:27,41:.: 0.92:1.000:. ./.:4:27,34:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,71:.: 1.13:1.000:. ./.:4:31,36:.: 0.85:1.000:. ./.:4:14,50:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:8,30:.:-1.16:1.000:. ./.:4:14,56:.: 1.06:1.000:. ./.:4:22,34:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:11,37:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.54:1.000:. ./.:4:31,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:9,34:.:-0.81:1.000:. ./.:4:21,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:27,45:.: 1.20:1.000:. ./.:4:12,63:.: 1.40:0.999:. ./.:4:7,51:.: 0.23:1.000:. ./.:4:8,22:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,41:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,47:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,73:.: 1.26:1.000:. ./.:4:10,41:.:-0.26:1.000:. ./.:4:16,46:.: 0.50:1.000:. ./.:4:16,57:.: 1.26:1.000:. ./.:4:17,61:.: 1.61:1.000:. ./.:4:22,20:.:-0.88:1.000:. ./.:4:23,38:.: 0.43:1.000:. ./.:4:15,30:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.60:1.000:. ./.:4:24,16:.:-1.02:1.000:. ./.:4:11,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:23,38:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,24:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,23:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.64:1.000:. ./.:4:8,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:4,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:31,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:10,53:.: 0.57:1.000:. ./.:4:23,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:9,47:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,37:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.96:1.000:. ./.:4:22,56:.: 1.61:1.000:. ./.:4:10,45:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,48:.: 0.71:1.000:. ./.:4:9,50:.: 0.30:1.000:. ./.:4:22,32:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.85:1.000:. ./.:4:6,31:.:-1.23:1.000:. ./.:4:17,33:.:-0.33:1.000:. ./.:4:19,36:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,73:.: 1.26:1.000:. ./.:4:14,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,21:.:-1.23:1.000:. ./.:4:17,46:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,56:.: 0.99:1.000:. ./.:4:20,33:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,39:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:6,15:.:-2.34:1.000:. ./.:4:12,44:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:27,37:.: 0.64:0.999:. ./.:4:0,65:.: 0.71:1.000:. ./.:4:11,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.74:1.000:. ./.:4:18,18:.:-1.30:1.000:. ./.:4:28,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:8,34:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.88:1.000:. ./.:4:9,10:.:-2.47:1.000:. ./.:4:10,46:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,28:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,39:.:-0.54:1.000:. ./.:4:11,30:.:-0.95:1.000:. ./.:4:20,40:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.05:0.994:. ./.:4:17,54:.: 1.13:1.000:. ./.:4:11,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:17,49:.: 0.78:1.000:. -chr3.1 67477150 chr3.1_067477150 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,48:0.63: 0.02:1.000:0.569 1/1/1/1:4:0,92:1.00: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,40:0.45: 0.80:1.000:0.976 0/1/1/1:4:46,102:0.74: 2.42:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,111:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,77:0.83: 0.50:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.75:-2.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,79:0.85: 0.50:1.000:0.986 0/1/1/1:4:27,51:0.70:-0.16:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,42:0.73:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,56:0.65: 0.39:1.000:0.821 0/0/1/1:4:64,29:0.38: 0.39:0.998:0.555 0/1/1/1:4:30,100:0.81: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,61:0.57: 1.35:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,150:1.00: 2.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.35:-2.53:1.000:0.746 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,108:0.77: 2.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.60:-2.64:1.000:0.801 0/0/1/1:4:37,37:0.56:-0.31:1.000:0.974 0/1/1/1:4:18,59:0.80:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,101:0.81: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,50:0.56: 0.58:1.000:0.958 0/1/1/1:4:36,85:0.75: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,26:0.46:-0.64:1.000:0.988 0/0/1/1:4:48,47:0.55: 0.47:1.000:0.980 0/0/1/1:4:4,5:0.61:-2.71:1.000:0.708 0/0/1/1:4:16,10:0.45:-2.08:1.000:0.976 0/0/1:3:7,2:0.30:-2.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,40:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:66,27:0.36: 0.39:1.000:0.700 0/0/1/1:4:41,31:0.49:-0.38:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,80:0.99:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,47:0.74:-0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,63:0.71: 0.50:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,57:0.63: 0.58:1.000:0.610 0/1/1/1:4:20,56:0.78:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,40:0.82:-1.16:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,29:0.67:-1.31:1.000:0.911 0/1/1/1:4:17,38:0.74:-1.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,106:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,21:0.38:-0.61:1.000:0.630 0/1/1/1:4:23,40:0.68:-0.72:1.000:0.965 0/1/1/1:4:26,68:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,26:0.48:-0.75:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.01:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:4,46:0.93:-1.20:1.000:0.784 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,71:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,40:0.47: 0.58:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,45:0.78:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,81:0.78: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,41:0.66:-0.57:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,35:0.59:-0.64:1.000:0.851 0/1/1/1:4:17,23:0.63:-1.57:1.000:0.527 0/0/1/1:4:39,41:0.57:-0.09:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,98:0.99: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,42:0.65:-0.46:1.000:0.804 0/1/1/1:4:25,48:0.71:-0.35:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,92:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,45:0.57: 0.21:1.000:0.956 0/0/1/1:4:50,37:0.48: 0.17:0.999:0.996 0/1/1/1:4:16,41:0.76:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,58:0.53: 1.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:17,45:0.77:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:23,72:0.80: 0.47:0.817:0.909 0/0/1/1:4:54,49:0.53: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,27:0.45:-0.49:1.000:0.982 0/0/1/1:4:47,32:0.47:-0.12:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,58:0.70: 0.24:1.000:0.986 0/1/1/1:4:23,41:0.69:-0.68:1.000:0.974 0/1/1/1:4:20,35:0.69:-1.01:0.999:0.967 0/0/1/1:4:42,31:0.48:-0.35:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,36:0.66:-0.86:1.000:0.876 0/1/1/1:4:29,71:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,62:0.64: 0.87:1.000:0.650 0/0/1/1:4:36,27:0.49:-0.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,39:0.53:-0.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,72:0.82: 0.32:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,36:0.63:-0.75:1.000:0.598 0/1/1/1:4:28,70:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,31:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,78:0.77: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,37:0.76:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,59:0.58: 1.09:1.000:0.911 0/1/1/1:4:22,85:0.83: 0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,37:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,29:0.36: 0.61:1.000:0.672 0/1/1/1:4:30,46:0.66:-0.24:0.999:0.844 0/1/1/1:4:21,37:0.69:-0.90:1.000:0.970 0/1/1/1:4:17,40:0.75:-0.94:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,64:0.78: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,35:0.70:-1.05:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,32:0.76:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,71:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,58:0.72: 0.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,60:0.63: 0.80:1.000:0.551 0/0/1/1:4:58,38:0.46: 0.50:1.000:0.985 0/0/0/1:4:48,10:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,34:0.49:-0.16:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,19:0.37:-0.68:1.000:0.627 0/1/1/1:4:29,45:0.66:-0.31:1.000:0.863 0/0/0/1:4:65,25:0.35: 0.28:1.000:0.815 0/1/1/1:4:19,40:0.73:-0.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,47:0.83:-0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,58:0.56: 1.17:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,74:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,45:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,47:0.58: 0.28:1.000:0.927 0/1/1/1:4:29,57:0.71: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,63:0.60: 1.24:1.000:0.819 0/1/1/1:4:17,62:0.82:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,49:0.56: 0.54:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,81:0.73: 1.32:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,74:0.73: 0.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,74:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,42:0.63:-0.35:1.000:0.531 0/0/1/1:4:79,87:0.58: 3.09:1.000:0.921 0/1/1/1:4:41,88:0.73: 1.72:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-2.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,77:0.84: 0.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:37,56:0.65: 0.39:1.000:0.821 0/0/0/1:4:70,30:0.37: 0.65:1.000:0.590 1/1/1/1:4:1,104:0.99: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,46:0.70:-0.42:1.000:0.983 0/0/1/1:4:52,52:0.56: 0.80:1.000:0.974 1/1/1/1:4:13,93:0.90: 0.87:1.000:0.726 0/1/1/1:4:26,55:0.73:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,46:0.61: 0.02:1.000:0.722 1/1/1/1:4:11,93:0.91: 0.80:1.000:0.954 0/0/1/1:4:55,53:0.55: 0.95:1.000:0.983 0/0/0/1:4:47,17:0.34:-0.68:1.000:0.892 0/1/1/1:4:22,58:0.77:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,60:0.58: 1.17:0.999:0.913 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,88:0.78: 1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,105:0.99: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,19:0.38:-0.83:1.000:0.612 0/0/1/1:4:59,64:0.57: 1.50:1.000:0.933 0/0/1/1:4:22,23:0.57:-1.38:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,52:0.55: 0.84:1.000:0.979 0/1/1/1:4:23,108:0.85: 1.80:1.000:0.984 0/0/1/1:4:63,37:0.43: 0.65:1.000:0.953 0/1/1/1:4:33,86:0.77: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,62:0.72: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,61:0.71: 0.36:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 1.09:0.994:1.000 0/1/1/1:4:46,70:0.65: 1.24:1.000:0.831 0/1/1/1:4:21,74:0.81: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,65:0.75: 0.36:1.000:0.999 -chr3.1 67540142 chr3.1_067540142 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:5,18:0.66: 0.32:1.000:0.845 0/1/1/1:4:2,19:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,18:0.71: 0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,8:0.62:-0.59:1.000:0.627 0/0/1/1:4:9,22:0.60: 0.92:1.000:0.769 0/0/1/1:4:29,26:0.46: 2.74:1.000:0.986 0/1/1/1:4:1,11:0.77:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.65: 0.54:1.000:0.759 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,15:0.63: 0.09:1.000:0.593 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.92:0.998:1.000 0/0/1/1:4:7,16:0.59: 0.32:1.000:0.851 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.64: 0.16:1.000:0.701 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,13:0.68:-0.21:1.000:0.950 0/0/1/1:4:10,23:0.59: 1.07:1.000:0.845 0/1/1/1:4:4,18:0.68: 0.24:1.000:0.960 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,23:0.47: 1.98:1.000:0.993 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,13:0.37: 2.13:1.000:0.550 0/0/1/1:4:39,26:0.43: 3.49:1.000:0.932 0/0/1/1:4:20,22:0.48: 1.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,2:0.47:-1.12:1.000:0.992 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,24:0.50: 1.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,19:0.48: 1.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,13:0.64:-0.14:1.000:0.724 0/0/1/1:4:22,20:0.46: 1.75:1.000:0.987 0/1/1/1:4:1,18:0.86: 0.01:1.000:0.979 0/1/1/1:4:2,13:0.72:-0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.47: 1.45:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,18:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:8,22:0.62: 0.84:1.000:0.570 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:19,10:0.40: 0.77:1.000:0.798 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.72:-0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,19:0.72: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:3,11:0.66:-0.37:1.000:0.914 0/1/1/1:4:1,15:0.83:-0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,25:0.55: 1.53:1.000:0.978 0/0/1/1:4:14,10:0.43: 0.39:1.000:0.952 0/1/1/1:4:2,16:0.74:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,15:0.66: 0.01:1.000:0.878 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,46:0.78: 2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,7:0.40: 0.09:1.000:0.817 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:4,26:0.72: 0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,15:0.83:-0.21:1.000:0.998 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,21:0.52: 1.22:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,24:0.89: 0.47:0.999:0.523 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:18,17:0.46: 1.22:0.817:0.809 0/0/1/1:4:13,11:0.45: 0.39:1.000:0.980 0/0/1/1:4:10,5:0.40:-0.29:1.000:0.753 0/0/1/1:4:5,10:0.57:-0.29:1.000:0.945 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:0.999:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.45: 0.77:1.000:0.976 0/1/1/1:4:4,21:0.70: 0.47:1.000:0.984 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.67:-0.67:1.000:0.918 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,26:0.51: 1.90:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,23:0.89: 0.39:1.000:0.618 0/0/1/1:4:20,27:0.50: 2.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,16:0.84:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,6:0.47:-0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:14,13:0.46: 0.62:1.000:0.988 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,21:0.76: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,8:0.74:-0.74:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.47:-0.21:1.000:0.992 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,20:0.44: 1.98:1.000:0.974 0/0/1/1:4:15,13:0.45: 0.69:1.000:0.983 0/0/1/1:4:8,22:0.62: 0.84:1.000:0.570 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,20:0.49: 1.37:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:11,13:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,15:0.46: 0.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:16,20:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,34:0.52: 2.89:1.000:0.995 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.48: 2.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,20:0.87: 0.16:1.000:0.916 0/1/1/1:4:4,19:0.69: 0.32:1.000:0.971 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.35:0.999:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,20:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,14:0.72:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,17:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,13:0.80:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,15:0.48: 0.77:1.000:0.994 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,22:0.68: 0.62:1.000:0.954 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.82:0.994:1.000 0/0/1/1:4:12,22:0.56: 1.15:1.000:0.973 0/0/1/1:4:22,18:0.45: 1.60:1.000:0.977 0/1/1/1:4:2,21:0.76: 0.32:1.000:1.000 -chr3.1 67921079 chr3.1_067921079 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:4,8:0.67:-1.11:1.000:0.937 0/0/1/1:4:22,16:0.44: 0.11:1.000:0.972 0/1/1/1:4:12,29:0.72: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-0.55:1.000:0.985 0/0/1/1:4:13,18:0.58:-0.22:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,23:0.80:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,25:0.72:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,24:0.69:-0.03:1.000:0.979 0/1/1/1:4:4,15:0.80:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,24:0.72:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,14:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,11:0.55:-0.74:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,22:0.63:-0.03:1.000:0.620 0/1/1/1:4:9,25:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,36:0.86: 0.29:0.998:0.955 0/0/1/1:4:27,30:0.53: 0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:18,12:0.43:-0.27:1.000:0.941 0/1/1/1:4:10,26:0.73: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,12:0.57:-0.69:1.000:0.933 0/1/1/1:4:5,16:0.77:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,16:0.81:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,18:0.73:-0.50:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,28:0.64: 0.39:1.000:0.718 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,35:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,41:0.74: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,41:0.88: 0.53:1.000:0.809 0/1/1/1:4:4,24:0.86:-0.36:1.000:0.955 0/0/1/1:4:10,13:0.57:-0.60:1.000:0.951 0/1/1:3:14,15:0.52:-0.32:1.000:0.769 0/1/1/1:4:7,38:0.85: 0.43:1.000:0.987 0/0/1/1:4:14,20:0.59:-0.08:1.000:0.850 0/1/1/1:4:11,23:0.68:-0.08:1.000:0.964 0/1/1/1:4:15,49:0.78: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,37:0.72: 0.76:1.000:0.996 1/1/1/1:4:4,31:0.89:-0.03:1.000:0.531 0/1/1/1:4:12,38:0.77: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,31:0.65: 0.57:1.000:0.814 0/1/1/1:4:13,33:0.73: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,19:0.40: 0.81:1.000:0.771 0/0/1/1:4:8,11:0.58:-0.78:1.000:0.903 0/1/1/1:4:81,180:0.70:10.54:1.000:0.984 0/1/1/1:4:18,33:0.65: 0.71:1.000:0.824 0/0/1/1:4:45,39:0.47: 2.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,25:0.70: 0.01:1.000:0.988 0/1/1/1:4:15,31:0.68: 0.48:1.000:0.958 0/1/1/1:4:12,36:0.76: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,33:0.64: 0.76:1.000:0.697 0/1/1/1:4:5,20:0.81:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,19:0.40: 0.81:1.000:0.771 0/1/1/1:4:9,23:0.73:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,51:0.78: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,34:0.72: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:10,24:0.72:-0.08:1.000:0.796 0/1/1/1:4:8,15:0.66:-0.60:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,29:0.74: 0.20:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,34:0.80: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,24:0.57: 0.29:1.000:0.933 0/1/1/1:4:2,15:0.89:-0.88:1.000:0.571 0/1/1/1:4:4,21:0.85:-0.50:1.000:0.991 0/1/1/1:4:18,35:0.67: 0.81:1.000:0.911 0/1/1/1:4:5,17:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,23:0.58: 0.20:1.000:0.920 0/0/1/1:4:13,20:0.61:-0.13:1.000:0.682 0/0/0/1:4:55,10:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,15:0.76:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,30:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,60:0.77: 2.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,43:0.82: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,23:0.83:-0.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,29:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,38:0.63: 1.18:1.000:0.544 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-0.36:0.999:0.997 0/1/1/1:4:8,35:0.82: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,35:0.79: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,19:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:18,74:0.81: 2.63:0.817:0.959 0/1/1/1:4:8,20:0.72:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,12:0.64:-0.78:1.000:0.659 0/1/1/1:4:5,26:0.85:-0.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,34:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,33:0.78: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,40:0.86: 0.53:0.999:0.975 0/1/1/1:4:7,23:0.78:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,14:0.71:-0.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,19:0.58:-0.13:1.000:0.917 0/1/1/1:4:8,48:0.86: 0.95:1.000:0.955 0/1/1/1:4:5,17:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,27:0.83:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,17:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,13:0.69:-0.78:1.000:0.977 0/1/1/1:4:7,27:0.80:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,13:0.77:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,24:0.67: 0.01:1.000:0.937 0/0/1/1:4:19,17:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,32:0.59: 0.90:1.000:0.889 0/0/1/1:4:28,16:0.40: 0.39:1.000:0.804 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,26:0.82:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,21:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,18:0.41: 0.57:1.000:0.862 0/1/1/1:4:5,24:0.83:-0.32:0.999:0.997 0/1/1/1:4:10,22:0.70:-0.18:1.000:0.981 0/1/1/1:4:9,24:0.74:-0.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.78:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,18:0.73:-0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,16:0.57:-0.36:1.000:0.933 0/0/1/1:4:15,10:0.43:-0.50:1.000:0.941 0/1/1/1:4:10,17:0.64:-0.41:1.000:0.634 0/0/1/1:4:13,20:0.61:-0.13:1.000:0.682 0/0/1/1:4:19,17:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,14:0.48:-0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,28:0.81:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.78:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,17:0.45: 0.20:1.000:0.975 0/1/1/1:4:8,17:0.69:-0.50:1.000:0.971 0/1/1/1:4:4,12:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,19:0.64:-0.27:1.000:0.681 0/1/1/1:4:5,23:0.83:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,14:0.56:-0.50:1.000:0.962 0/0/1/1:4:13,20:0.61:-0.13:1.000:0.682 0/1/1/1:4:5,13:0.73:-0.83:1.000:0.998 1/1/1/1:4:2,17:0.90:-0.78:1.000:0.781 0/1/1/1:4:7,21:0.76:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,17:0.69:-0.50:1.000:0.971 0/1/1/1:4:8,19:0.71:-0.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,19:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,11:0.74:-0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,15:0.48:-0.18:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,20:0.67:-0.27:1.000:0.937 1/1/1/1:4:2,16:0.89:-0.83:1.000:0.627 1/1/1/1:4:3,24:0.89:-0.41:1.000:0.627 0/1/1/1:4:4,22:0.85:-0.46:1.000:0.984 0/1/1/1:4:11,24:0.69:-0.03:1.000:0.979 0/1/1/1:4:12,31:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,21:0.64:-0.13:1.000:0.718 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,25:0.81:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,16:0.81:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,27:0.47: 1.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,25:0.87:-0.32:1.000:0.928 0/1/1/1:4:5,13:0.73:-0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,13:0.57:-0.60:1.000:0.951 0/1/1/1:4:6,18:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,19:0.48: 0.20:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,17:0.72:-0.55:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,19:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,37:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,21:0.73:-0.32:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.88:0.999:1.000 0/0/1/1:4:12,18:0.60:-0.27:1.000:0.749 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,21:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,17:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,14:0.75:-0.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,22:0.74:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,21:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,21:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,34:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.53:-0.78:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,26:0.80:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,25:0.84:-0.27:0.994:0.995 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,15:0.63:-0.55:1.000:0.572 0/0/1/1:4:10,14:0.59:-0.55:1.000:0.881 -chr3.1 68002100 chr3.1_068002100 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:103,34:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,68:0.53:-0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,42:0.28:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:77,39:0.31:-0.62:1.000:0.977 0/0/0/1:4:139,72:0.31: 2.10:1.000:0.970 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,37:0.28:-0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:126,35:0.20: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,29:0.21:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,30:0.22:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,33:0.37:-1.60:1.000:0.588 0/0/1/1:4:56,66:0.49:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,76:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,31:0.22:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,18:0.18:-1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,34:0.23: 0.01:0.998:1.000 0/0/1/1:4:69,88:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,91:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,37:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,33:0.39:-1.74:1.000:0.713 0/0/0/1:4:102,37:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,56:0.27: 1.53:1.000:0.998 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,24:0.55:-2.77:1.000:0.980 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,27:0.31:-1.66:1.000:0.975 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,111:0.48: 2.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,28:0.28:-1.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:111,39:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,28:0.24:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-3.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,49:0.38:-0.54:1.000:0.525 0/1/1:3:8,13:0.59:-3.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:95,43:0.28: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,32:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,35:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,29:0.20:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,25:0.17:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,51:0.32: 0.27:1.000:0.960 0/0/0/1:4:125,43:0.23: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,30:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,64:0.33: 1.13:1.000:0.918 0/0/1/1:4:73,88:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,90:0.52: 0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:6,3:0.30:-3.69:1.000:0.980 0/0/0/1:4:85,43:0.31:-0.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:26,33:0.52:-2.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,45:0.28: 0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:147,64:0.28: 2.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,39:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,91:0.46: 1.24:1.000:0.988 0/0/0/1:4:98,30:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,69:0.56:-0.59:1.000:0.974 0/0/0/1:4:116,37:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,40:0.21: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,44:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:90,36:0.26:-0.34:1.000:0.599 0/0/0/1:4:145,57:0.26: 1.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,40:0.21: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,49:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,71:0.47: 0.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:82,29:0.24:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,35:0.20: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,35:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,34:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,36:0.19: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,21:0.21:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,129:0.78: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,54:0.29: 0.92:1.000:0.992 0/0/0/1:4:117,42:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,42:0.29:-0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:86,50:0.34:-0.05:1.000:0.891 0/0/0/1:4:100,55:0.32: 0.49:1.000:0.941 0/0/0/1:4:133,35:0.19: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,34:0.21: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,79:0.55:-0.11:0.999:0.974 0/0/0/1:4:111,47:0.27: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,32:0.17: 0.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,40:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:102,19:0.14:-0.48:0.817:0.994 0/0/0/1:4:126,50:0.26: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,49:0.35:-0.25:1.000:0.815 0/0/0/1:4:133,39:0.21: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,35:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,36:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,31:0.20: 0.09:0.999:1.000 0/0/0/1:4:120,36:0.21: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.24:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,43:0.22: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,41:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,39:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,55:0.47:-0.88:1.000:0.992 0/0/0/1:4:143,41:0.20: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,54:0.25: 1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,48:0.26: 0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:122,47:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,30:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,44:0.22: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,52:0.46:-1.00:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,34:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,71:0.43: 0.38:1.000:0.947 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,64:0.28: 2.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,37:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,63:0.45:-0.25:1.000:0.976 0/0/1/1:4:72,87:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,49:0.26: 0.92:0.999:0.998 0/0/0/1:4:112,50:0.28: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:67,24:0.24:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,40:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,33:0.19: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,33:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,99:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,38:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,39:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,68:0.58:-0.74:1.000:0.924 0/0/1/1:4:54,82:0.57:-0.05:1.000:0.941 0/0/0/1:4:126,48:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,39:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,76:0.51: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,21:0.18:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,29:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,46:0.29: 0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:64,43:0.37:-0.88:1.000:0.595 0/0/1/1:4:40,47:0.49:-1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,35:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,42:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,56:0.31: 0.72:1.000:0.966 0/0/0/1:4:115,50:0.28: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/0:4:181,1:0.01: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,40:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,39:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,37:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,43:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,69:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,70:0.31: 1.96:1.000:0.972 0/0/0/1:4:156,50:0.22: 1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,27:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,33:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,42:0.28:-0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,35:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,47:0.26: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,19:0.22:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,33:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,95:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,52:0.30: 0.67:1.000:0.989 0/0/0/1:4:144,46:0.22: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,43:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,34:0.26:-0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,86:0.52: 0.41:1.000:0.994 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,35:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,81:0.47: 0.58:1.000:0.992 0/0/0/1:4:55,16:0.21:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,37:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,144:1.00: 0.18:0.999:1.000 0/0/0/1:4:73,31:0.27:-0.97:1.000:0.997 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,37:0.29:-0.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,44:0.28: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:68,33:0.30:-1.05:1.000:0.986 0/0/0/0:4:102,1:0.01:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,36:0.33:-1.05:1.000:0.936 0/0/1/1:4:71,73:0.46: 0.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:75,91:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:120,59:0.30: 1.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,70:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,43:0.29:-0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:124,51:0.27: 1.07:0.994:0.998 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,22:0.21:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,96:0.59: 0.52:1.000:0.876 -chr3.1 68178068 chr3.1_068178068 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:519,324:.: 0.24:1.000:. ./.:4:493,252:.:-0.40:1.000:. ./.:4:427,253:.:-0.82:1.000:. ./.:4:524,293:.: 0.07:1.000:. ./.:4:611,320:.: 0.82:1.000:. ./.:4:656,352:.: 1.32:1.000:. ./.:4:449,189:.:-1.10:1.000:. ./.:4:528,272:.:-0.04:1.000:. ./.:4:533,373:.: 0.65:1.000:. ./.:4:285,261:.:-1.70:1.000:. ./.:4:303,261:.:-1.58:1.000:. ./.:4:449,305:.:-0.34:1.000:. ./.:4:514,340:.: 0.31:1.000:. ./.:4:561,289:.: 0.29:1.000:. ./.:4:416,358:.:-0.21:1.000:. ./.:4:574,416:.: 1.20:1.000:. ./.:4:578,377:.: 0.97:0.998:. ./.:4:504,410:.: 0.71:1.000:. ./.:4:727,484:.: 2.65:1.000:. ./.:4:670,326:.: 1.24:1.000:. ./.:4:373,306:.:-0.83:1.000:. ./.:4:543,250:.:-0.08:1.000:. ./.:4:647,343:.: 1.20:1.000:. ./.:4:536,263:.:-0.04:1.000:. ./.:4:185,289:.:-2.17:1.000:. ./.:4:509,323:.: 0.17:1.000:. ./.:4:577,351:.: 0.80:1.000:. ./.:4:475,267:.:-0.42:1.000:. ./.:4:620,421:.: 1.54:1.000:. ./.:4:556,307:.: 0.37:1.000:. ./.:4:560,303:.: 0.37:1.000:. ./.:4:404,239:.:-1.06:1.000:. ./.:4:198,186:.:-2.75:1.000:. ./.:4:328,309:.:-1.10:1.000:. ./.:3:196,159:.:-2.94:1.000:. ./.:4:553,395:.: 0.93:1.000:. ./.:4:492,272:.:-0.27:1.000:. ./.:4:542,263:.:-0.01:1.000:. ./.:4:581,428:.: 1.33:1.000:. ./.:4:613,417:.: 1.46:1.000:. ./.:4:488,382:.: 0.42:1.000:. ./.:4:450,267:.:-0.58:1.000:. ./.:4:533,333:.: 0.39:1.000:. ./.:4:413,269:.:-0.81:1.000:. ./.:4:598,283:.: 0.49:1.000:. ./.:4:526,386:.: 0.69:1.000:. ./.:4:585,440:.: 1.43:1.000:. ./.:4:652,295:.: 0.92:1.000:. ./.:4:396,255:.:-1.01:1.000:. ./.:4:760,421:.: 2.45:1.000:. ./.:4:501,334:.: 0.19:1.000:. ./.:4:607,347:.: 0.97:1.000:. ./.:4:467,293:.:-0.30:1.000:. ./.:4:526,371:.: 0.60:1.000:. ./.:4:457,310:.:-0.25:1.000:. ./.:4:457,396:.: 0.31:1.000:. ./.:4:443,232:.:-0.85:1.000:. ./.:4:607,337:.: 0.90:1.000:. ./.:4:437,294:.:-0.49:1.000:. ./.:6:437,209:.:-1.04:1.000:. ./.:4:469,228:.:-0.71:1.000:. ./.:4:395,228:.:-1.19:1.000:. ./.:4:606,334:.: 0.88:1.000:. ./.:4:582,260:.: 0.24:1.000:. ./.:4:541,285:.: 0.13:1.000:. ./.:4:469,308:.:-0.19:1.000:. ./.:4:514,295:.: 0.02:1.000:. ./.:4:466,312:.:-0.18:1.000:. ./.:4:471,327:.:-0.05:1.000:. ./.:4:403,160:.:-1.58:1.000:. ./.:4:544,256:.:-0.04:1.000:. ./.:4:441,303:.:-0.40:1.000:. ./.:4:596,408:.: 1.29:1.000:. ./.:4:486,312:.:-0.05:1.000:. ./.:4:468,243:.:-0.62:1.000:. ./.:4:473,326:.:-0.04:1.000:. ./.:4:462,334:.:-0.06:1.000:. ./.:4:527,343:.: 0.42:1.000:. ./.:4:496,346:.: 0.24:1.000:. ./.:4:557,261:.: 0.08:1.000:. ./.:4:354,161:.:-1.90:0.999:. ./.:4:553,348:.: 0.62:1.000:. ./.:4:556,408:.: 1.03:1.000:. ./.:4:437,294:.:-0.49:1.000:. ./.:6:705,365:.: 1.72:0.817:. ./.:4:572,293:.: 0.39:1.000:. ./.:4:378,167:.:-1.70:1.000:. ./.:4:444,216:.:-0.95:1.000:. ./.:4:463,312:.:-0.20:1.000:. ./.:4:447,304:.:-0.36:1.000:. ./.:4:488,273:.:-0.29:0.999:. ./.:4:385,325:.:-0.63:1.000:. ./.:4:558,264:.: 0.11:1.000:. ./.:4:397,232:.:-1.15:1.000:. ./.:4:551,378:.: 0.80:1.000:. ./.:4:533,385:.: 0.73:1.000:. ./.:4:415,283:.:-0.70:1.000:. ./.:4:427,199:.:-1.17:1.000:. ./.:4:530,260:.:-0.10:1.000:. ./.:4:534,290:.: 0.12:1.000:. ./.:4:564,274:.: 0.21:1.000:. ./.:4:516,337:.: 0.31:1.000:. ./.:4:419,214:.:-1.13:1.000:. ./.:4:542,241:.:-0.15:1.000:. ./.:4:496,297:.:-0.08:1.000:. ./.:4:471,257:.:-0.51:1.000:. ./.:4:396,301:.:-0.71:1.000:. ./.:4:556,247:.:-0.02:1.000:. ./.:4:652,404:.: 1.63:1.000:. ./.:4:452,356:.: 0.01:1.000:. ./.:4:480,347:.: 0.14:1.000:. ./.:4:632,488:.: 2.05:1.000:. ./.:4:436,276:.:-0.61:0.999:. ./.:4:489,280:.:-0.24:1.000:. ./.:4:411,251:.:-0.94:1.000:. ./.:4:391,181:.:-1.53:1.000:. ./.:4:473,257:.:-0.49:1.000:. ./.:4:453,248:.:-0.68:1.000:. ./.:4:546,287:.: 0.18:1.000:. ./.:4:423,240:.:-0.93:1.000:. ./.:4:521,357:.: 0.47:1.000:. ./.:4:514,278:.:-0.09:1.000:. ./.:4:544,349:.: 0.57:1.000:. ./.:4:498,387:.: 0.52:1.000:. ./.:4:471,338:.: 0.02:1.000:. ./.:4:516,362:.: 0.47:1.000:. ./.:4:503,351:.: 0.31:1.000:. ./.:4:456,270:.:-0.52:1.000:. ./.:4:354,248:.:-1.33:1.000:. ./.:4:374,214:.:-1.42:1.000:. ./.:4:431,249:.:-0.82:1.000:. ./.:4:486,362:.: 0.28:1.000:. ./.:4:314,217:.:-1.79:1.000:. ./.:4:524,314:.: 0.21:1.000:. ./.:4:417,242:.:-0.96:1.000:. ./.:4:713,499:.: 2.65:1.000:. ./.:4:531,387:.: 0.73:1.000:. ./.:4:427,226:.:-1.00:1.000:. ./.:4:410,251:.:-0.95:1.000:. ./.:4:426,237:.:-0.93:1.000:. ./.:4:521,369:.: 0.55:1.000:. ./.:4:480,304:.:-0.14:1.000:. ./.:4:456,354:.: 0.03:1.000:. ./.:4:417,204:.:-1.21:1.000:. ./.:4:623,491:.: 2.01:1.000:. ./.:4:668,425:.: 1.87:1.000:. ./.:4:533,271:.:-0.01:1.000:. ./.:4:444,272:.:-0.59:1.000:. ./.:4:626,339:.: 1.04:1.000:. ./.:4:444,337:.:-0.16:1.000:. ./.:4:629,434:.: 1.68:1.000:. ./.:4:489,276:.:-0.27:1.000:. ./.:4:282,258:.:-1.73:1.000:. ./.:4:330,200:.:-1.80:1.000:. ./.:4:570,449:.: 1.39:1.000:. ./.:4:578,380:.: 0.99:1.000:. ./.:4:637,405:.: 1.54:1.000:. ./.:4:635,322:.: 0.99:1.000:. ./.:4:448,297:.:-0.40:1.000:. ./.:4:561,466:.: 1.44:1.000:. ./.:4:462,236:.:-0.70:1.000:. ./.:4:418,217:.:-1.11:1.000:. ./.:4:386,199:.:-1.44:1.000:. ./.:4:536,389:.: 0.78:1.000:. ./.:4:502,299:.:-0.03:1.000:. ./.:4:522,314:.: 0.20:1.000:. ./.:4:528,247:.:-0.20:1.000:. ./.:4:497,321:.: 0.08:0.999:. ./.:4:513,365:.: 0.47:1.000:. ./.:4:517,256:.:-0.21:1.000:. ./.:4:447,228:.:-0.85:1.000:. ./.:4:418,198:.:-1.24:1.000:. ./.:4:535,348:.: 0.50:1.000:. ./.:4:419,315:.:-0.47:1.000:. ./.:4:426,232:.:-0.96:1.000:. ./.:4:369,266:.:-1.11:1.000:. ./.:4:681,419:.: 1.92:1.000:. ./.:4:636,487:.: 2.07:1.000:. ./.:4:516,307:.: 0.11:1.000:. ./.:4:492,317:.: 0.02:1.000:. ./.:4:534,304:.: 0.21:1.000:. ./.:4:672,449:.: 2.06:0.994:. ./.:4:650,313:.: 1.03:1.000:. ./.:4:464,244:.:-0.64:1.000:. ./.:4:525,291:.: 0.07:1.000:. -chr3.1 68442838 chr3.1_068442838 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:165,7:.: 0.92:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:112,17:.:-0.06:1.000:. ./.:4:137,17:.: 0.51:1.000:. ./.:4:168,16:.: 1.19:1.000:. ./.:4:192,10:.: 1.61:1.000:. ./.:4:96,17:.:-0.43:1.000:. ./.:4:101,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:125,16:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,12:.:-2.06:1.000:. ./.:4:58,13:.:-1.39:1.000:. ./.:4:229,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:103,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:127,24:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:167,10:.: 1.03:1.000:. ./.:4:167,10:.: 1.03:0.998:. ./.:4:223,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:224,13:.: 2.41:1.000:. ./.:4:154,25:.: 1.08:1.000:. ./.:4:44,5:.:-1.90:1.000:. ./.:4:90,20:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,13:.: 1.61:1.000:. ./.:4:124,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:45,7:.:-1.83:1.000:. ./.:4:172,8:.: 1.10:1.000:. ./.:4:123,12:.: 0.07:1.000:. ./.:4:167,5:.: 0.92:1.000:. ./.:4:142,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:226,7:.: 2.31:1.000:. ./.:4:194,4:.: 1.51:1.000:. ./.:4:149,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:24,4:.:-2.38:1.000:. ./.:4:56,12:.:-1.46:1.000:. ./.:3:20,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:128,27:.: 0.53:1.000:. ./.:4:158,10:.: 0.83:1.000:. ./.:4:177,12:.: 1.31:1.000:. ./.:4:163,7:.: 0.87:1.000:. ./.:4:110,22:.: 0.00:1.000:. ./.:4:128,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,23:.:-0.36:1.000:. ./.:4:140,13:.: 0.48:1.000:. ./.:4:88,20:.:-0.55:1.000:. ./.:4:87,17:.:-0.64:1.000:. ./.:4:117,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:114,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:75,9:.:-1.09:1.000:. ./.:4:58,15:.:-1.35:1.000:. ./.:4:75,12:.:-1.03:1.000:. ./.:4:95,14:.:-0.52:1.000:. ./.:4:111,10:.:-0.25:1.000:. ./.:4:113,25:.: 0.14:1.000:. ./.:4:149,6:.: 0.53:1.000:. ./.:4:102,21:.:-0.20:1.000:. ./.:4:80,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:74,32:.:-0.59:1.000:. ./.:4:96,22:.:-0.32:1.000:. ./.:6:78,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:69,17:.:-1.05:1.000:. ./.:4:115,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:150,14:.: 0.74:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:88,22:.:-0.50:1.000:. ./.:4:74,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:101,21:.:-0.22:1.000:. ./.:4:149,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:133,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:129,7:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:92,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:82,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:113,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:105,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,22:.:-0.45:1.000:. ./.:4:160,9:.: 0.85:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:74,17:.:-0.93:1.000:. ./.:4:119,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,12:.:-0.55:1.000:. ./.:6:171,4:.: 0.99:0.817:. ./.:4:120,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:105,10:.:-0.39:1.000:. ./.:4:110,9:.:-0.29:1.000:. ./.:4:113,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:70,15:.:-1.07:1.000:. ./.:4:66,22:.:-1.00:0.999:. ./.:4:121,9:.:-0.04:1.000:. ./.:4:75,18:.:-0.89:1.000:. ./.:4:111,11:.:-0.22:1.000:. ./.:4:94,19:.:-0.43:1.000:. ./.:4:138,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:95,11:.:-0.59:1.000:. ./.:4:124,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:108,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:90,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:95,19:.:-0.41:1.000:. ./.:4:92,21:.:-0.43:1.000:. ./.:4:66,22:.:-1.00:1.000:. ./.:4:71,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:100,9:.:-0.52:1.000:. ./.:4:125,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,16:.:-1.39:1.000:. ./.:4:117,15:.: 0.00:1.000:. ./.:4:192,12:.: 1.65:1.000:. ./.:4:82,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:111,6:.:-0.34:1.000:. ./.:4:216,16:.: 2.29:1.000:. ./.:4:66,23:.:-0.98:0.999:. ./.:4:68,23:.:-0.93:1.000:. ./.:4:84,6:.:-0.96:1.000:. ./.:4:51,19:.:-1.41:1.000:. ./.:4:116,12:.:-0.09:1.000:. ./.:4:92,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:65,18:.:-1.12:1.000:. ./.:4:75,19:.:-0.87:1.000:. ./.:4:90,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:100,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:147,10:.: 0.58:1.000:. ./.:4:189,11:.: 1.56:1.000:. ./.:4:100,11:.:-0.48:1.000:. ./.:4:110,12:.:-0.22:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.87:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:85,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:90,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:85,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:184,9:.: 1.40:1.000:. ./.:4:66,13:.:-1.21:1.000:. ./.:4:67,11:.:-1.23:1.000:. ./.:4:77,10:.:-1.03:1.000:. ./.:4:205,13:.: 1.97:1.000:. ./.:4:85,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:56,16:.:-1.37:1.000:. ./.:4:71,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:73,14:.:-1.03:1.000:. ./.:4:122,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:94,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:164,10:.: 0.96:1.000:. ./.:4:113,6:.:-0.29:1.000:. ./.:4:187,11:.: 1.51:1.000:. ./.:4:117,24:.: 0.21:1.000:. ./.:4:162,7:.: 0.85:1.000:. ./.:4:137,7:.: 0.28:1.000:. ./.:4:116,20:.: 0.10:1.000:. ./.:4:138,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:251,10:.: 2.96:1.000:. ./.:4:152,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,4:.:-2.10:1.000:. ./.:4:116,9:.:-0.16:1.000:. ./.:4:156,9:.: 0.76:1.000:. ./.:4:115,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:113,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:118,18:.: 0.10:1.000:. ./.:4:142,9:.: 0.44:1.000:. ./.:4:115,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:164,10:.: 0.96:1.000:. ./.:4:116,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:144,7:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:102,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:101,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:115,24:.: 0.16:1.000:. ./.:4:248,0:.: 2.66:0.999:. ./.:4:98,29:.:-0.11:1.000:. ./.:4:162,10:.: 0.92:1.000:. ./.:4:127,24:.: 0.44:1.000:. ./.:4:136,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:163,8:.: 0.90:1.000:. ./.:4:102,13:.:-0.39:1.000:. ./.:4:86,15:.:-0.71:1.000:. ./.:4:157,9:.: 0.78:1.000:. ./.:4:154,21:.: 0.99:1.000:. ./.:4:164,15:.: 1.08:1.000:. ./.:4:183,5:.: 1.29:1.000:. ./.:4:126,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:110,31:.: 0.21:1.000:. ./.:4:128,24:.: 0.46:0.994:. ./.:4:241,16:.: 2.86:1.000:. ./.:4:152,8:.: 0.64:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.02:1.000:. -chr3.1 68500656 chr3.1_068500656 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:49,16:0.27: 1.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,4:0.13:-1.18:1.000:0.921 0/0/1/1:4:28,19:0.43:-0.05:1.000:0.940 0/0/1/1:4:27,21:0.46: 0.03:1.000:0.988 0/0/0/1:4:51,12:0.21: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,14:0.36:-0.53:1.000:0.650 0/0/1/1:4:13,17:0.58:-1.42:1.000:0.918 0/0/1/1:4:19,16:0.48:-1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,30:0.65:-0.13:1.000:0.817 0/0/0/1:4:21,11:0.37:-1.26:1.000:0.621 0/0/0/1:4:78,13:0.15: 3.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,15:0.39:-0.53:1.000:0.670 0/0/0/1:4:26,8:0.25:-1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,23:0.59:-0.61:1.000:0.886 0/1/1/1:4:8,23:0.73:-1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,12:0.45:-1.58:1.000:0.982 0/0/1/1:4:23,22:0.51:-0.21:0.998:0.996 0/0/1/1:4:25,16:0.41:-0.53:1.000:0.882 0/0/0/1:4:57,10:0.16: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,29:0.46: 1.49:1.000:0.989 0/0/0/1:4:41,18:0.33: 0.92:1.000:0.936 0/0/1/1:4:29,19:0.42: 0.03:1.000:0.909 0/0/0/1:4:42,16:0.30: 0.84:1.000:0.988 0/1/1/1:4:13,24:0.65:-0.85:1.000:0.790 0/0/1/1:4:39,28:0.44: 1.57:1.000:0.969 0/0/0/1:4:21,11:0.37:-1.26:1.000:0.621 0/0/1/1:4:15,21:0.59:-0.93:1.000:0.842 0/0/1/1:4:22,21:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,12:0.19: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,10:0.29:-0.85:1.000:0.992 0/0/0/0:4:25,2:0.08:-1.66:1.000:0.988 0/0/0/1:4:18,9:0.35:-1.66:1.000:0.745 0/0/0/0:4:54,5:0.09: 0.92:1.000:0.929 0/0/0/1:4:42,17:0.31: 0.92:1.000:0.975 0/0/1:3:27,6:0.20:-1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,15:0.51:-1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,12:0.36:-1.01:1.000:0.633 0/0/0/1:4:39,12:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,22:0.48: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,28:0.74:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,16:0.35: 0.03:1.000:0.745 0/0/1/1:4:28,25:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,23:0.49: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,24:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,29:0.44: 1.73:1.000:0.973 0/0/0/1:4:39,15:0.30: 0.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:32,20:0.41: 0.36:1.000:0.847 0/0/0/1:4:63,23:0.29: 3.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,15:0.39:-0.53:1.000:0.670 0/0/0/1:4:29,10:0.28:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,27:0.63:-0.37:1.000:0.587 0/0/0/1:4:30,13:0.32:-0.37:1.000:0.945 0/0/1/1:4:26,15:0.39:-0.53:1.000:0.670 0/0/1/1:4:40,26:0.42: 1.49:1.000:0.900 0/0/0/1:4:39,7:0.16:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,15:0.34:-0.05:1.000:0.867 0/0/1/1:4:15,15:0.52:-1.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,25:0.35: 2.38:1.000:0.826 0/1/1/1:4:13,34:0.71:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:32,27:0.48: 0.92:1.000:0.871 0/0/1/1:4:39,24:0.40: 1.25:1.000:0.820 0/0/1/1:4:23,17:0.45:-0.61:1.000:0.978 0/0/0/1:4:62,12:0.18: 2.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,34:0.69: 0.12:1.000:0.972 0/0/1/1:4:25,26:0.53: 0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,21:0.44: 0.28:1.000:0.958 0/1/1/1:4:14,26:0.65:-0.61:1.000:0.801 0/0/1/1:4:28,25:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,23:0.47: 0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:41,10:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,15:0.25: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,19:0.56:-1.01:1.000:0.970 0/0/0/1:4:39,14:0.28: 0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,20:0.44: 0.03:1.000:0.967 0/0/1/1:4:37,38:0.53: 2.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,28:0.65:-0.37:1.000:0.809 0/0/1/1:4:27,24:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,35:0.51: 1.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,25:0.62:-0.53:1.000:0.618 0/0/0/1:4:55,8:0.14: 1.25:1.000:0.958 0/0/0/1:4:34,9:0.23:-0.37:0.999:1.000 0/1/1/1:4:17,30:0.64:-0.05:1.000:0.698 0/0/1/1:4:37,31:0.48: 1.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,26:0.58:-0.13:1.000:0.923 0/0/0/0/1/1:6:53,28:0.37: 2.70:0.817:0.844 0/0/0/1:4:42,13:0.26: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,14:0.38:-0.69:1.000:0.584 0/0/0/1:4:41,13:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,21:0.38: 0.84:1.000:0.624 0/1/1/1:4:12,22:0.65:-1.10:1.000:0.777 0/1/1/1:4:18,34:0.65: 0.36:0.999:0.828 0/0/1/1:4:25,27:0.54: 0.36:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,31:0.66:-0.05:1.000:0.864 0/0/0/1:4:44,9:0.18: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,25:0.54: 0.03:1.000:0.988 0/0/0/1:4:34,15:0.33: 0.12:1.000:0.932 0/0/1/1:4:29,20:0.43: 0.12:1.000:0.950 0/0/0/1:4:53,10:0.17: 1.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,13:0.22: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,16:0.35: 0.03:1.000:0.745 0/1/1/1:4:11,30:0.72:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,40:0.71: 0.68:1.000:0.990 0/1/1/1:4:10,30:0.74:-0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,33:0.55: 1.16:1.000:0.981 0/0/0/1:4:27,11:0.31:-0.77:1.000:0.973 0/0/0/1:4:30,10:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,23:0.46: 0.44:1.000:0.986 0/0/1/1:4:24,29:0.56: 0.44:1.000:0.964 0/0/0/1:4:53,13:0.21: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,28:0.63:-0.21:1.000:0.522 0/0/0/1:4:22,9:0.31:-1.34:1.000:0.972 0/0/0/1:4:39,9:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,39:0.75: 0.28:0.999:0.999 0/1/1/1:4:16,28:0.64:-0.29:1.000:0.679 0/0/1/1:4:15,11:0.45:-1.74:1.000:0.976 0/1/1/1:4:13,28:0.68:-0.53:1.000:0.952 0/0/0/1:4:41,12:0.25: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,18:0.45:-0.45:1.000:0.982 0/0/1/1:4:22,22:0.52:-0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,11:0.42:-1.58:1.000:0.895 0/0/1/1:4:33,33:0.52: 1.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,19:0.47:-0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:26,22:0.48: 0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,8:0.17: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,18:0.30: 1.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:24,22:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,31:0.68:-0.21:1.000:0.964 0/0/1/1:4:23,17:0.45:-0.61:1.000:0.978 0/1/1/1:4:13,27:0.67:-0.61:1.000:0.931 0/0/1/1:4:16,18:0.55:-1.10:1.000:0.983 0/0/0/1:4:42,8:0.17: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,22:0.44: 0.44:1.000:0.965 0/0/0/1:4:23,8:0.28:-1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,10:0.29:-0.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:15,11:0.45:-1.74:1.000:0.976 0/0/1/1:4:24,26:0.54: 0.20:1.000:0.988 0/1/1/1:4:13,33:0.71:-0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,34:0.69: 0.12:1.000:0.972 0/1/1/1:4:12,31:0.71:-0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,34:0.68: 0.20:1.000:0.945 0/0/0/1:4:40,18:0.33: 0.84:1.000:0.915 0/0/1/1:4:19,20:0.53:-0.69:1.000:0.991 0/0/0/1:4:46,13:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.52:-1.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,37:0.53: 2.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,34:0.50: 1.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,9:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,18:0.43:-0.29:1.000:0.952 0/0/0/1:4:36,14:0.30: 0.20:1.000:0.985 0/0/1/1:4:24,19:0.47:-0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,28:0.49: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,13:0.43:-1.26:1.000:0.945 0/1/1/1:4:17,44:0.71: 1.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,13:0.35:-0.61:1.000:0.823 0/0/0/1:4:40,5:0.12:-0.21:1.000:0.770 0/1/1/1:4:13,34:0.71:-0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,39:0.67: 0.84:1.000:0.922 0/0/1/1:4:20,25:0.57:-0.21:1.000:0.948 0/0/1/1:4:18,26:0.60:-0.29:1.000:0.792 0/0/1/1:4:19,17:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,18:0.39: 0.12:1.000:0.688 0/0/0/1:4:20,6:0.25:-1.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,12:0.36:-1.01:1.000:0.633 0/0/0/1:4:42,6:0.14: 0.03:1.000:0.948 0/0/1/1:4:17,10:0.39:-1.66:1.000:0.722 0/0/1/1:4:24,21:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,18:0.55:-1.10:1.000:0.983 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.05:0.999:1.000 0/1/1/1:4:16,30:0.65:-0.13:1.000:0.817 0/0/1/1:4:20,20:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,28:0.64:-0.29:1.000:0.679 0/0/0/1:4:23,6:0.22:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,13:0.42:-1.18:1.000:0.900 0/1/1/1:4:13,24:0.65:-0.85:1.000:0.790 0/1/1/1:4:7,28:0.78:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,22:0.60:-0.85:1.000:0.763 0/0/1/1:4:28,17:0.40:-0.21:1.000:0.794 0/0/0/1:4:41,7:0.16: 0.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:31,4:0.12:-1.01:1.000:0.834 0/0/1/1:4:19,25:0.58:-0.29:1.000:0.913 0/0/0/1:4:35,17:0.35: 0.36:1.000:0.807 0/1/1/1:4:11,38:0.76: 0.12:0.994:1.000 0/0/1/1:4:35,27:0.46: 1.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:24,7:0.24:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.30: 0.20:1.000:0.985 -chr3.1 68656342 chr3.1_068656342 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,21:.:-0.81:1.000:. ./.:4:42,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:58,20:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,10:.:-0.95:1.000:. ./.:4:71,18:.: 0.68:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:42,23:.:-0.19:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:7,3:.:-2.18:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.75:0.998:. ./.:4:66,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:47,26:.: 0.10:1.000:. ./.:4:6,7:.:-2.07:1.000:. ./.:4:53,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.66:1.000:. ./.:4:29,18:.:-0.84:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.81:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:53,25:.: 0.28:1.000:. ./.:4:102,32:.: 2.31:1.000:. ./.:4:40,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.71:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:45,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:37,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:139,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:61,19:.: 0.35:1.000:. ./.:4:65,31:.: 0.93:1.000:. ./.:4:86,23:.: 1.41:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.43:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:46,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:6,3:.:-2.22:1.000:. ./.:4:55,18:.: 0.10:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:80,26:.: 1.30:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.88:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:62,25:.: 0.61:1.000:. ./.:4:92,30:.: 1.88:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.90:1.000:. ./.:6:60,19:.: 0.32:1.000:. ./.:4:60,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:74,20:.: 0.86:1.000:. ./.:4:76,30:.: 1.30:1.000:. ./.:4:89,30:.: 1.77:1.000:. ./.:4:65,22:.: 0.61:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,27:.:-0.77:1.000:. ./.:4:80,20:.: 1.08:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:63,18:.: 0.39:1.000:. ./.:4:62,30:.: 0.79:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,49:.: 2.53:1.000:. ./.:4:38,17:.:-0.55:0.999:. ./.:4:66,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.48:1.000:. ./.:6:126,31:.: 3.14:0.817:. ./.:4:78,22:.: 1.08:1.000:. ./.:4:50,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:39,28:.:-0.12:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:95,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:88,33:.: 1.84:1.000:. ./.:4:33,11:.:-0.95:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:79,28:.: 1.33:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.57:1.000:. ./.:4:47,24:.: 0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:70,23:.: 0.83:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:56,25:.: 0.39:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:43,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:57,17:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:60,17:.: 0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:47,24:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,28:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,17:.: 0.21:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:58,32:.: 0.72:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:73,31:.: 1.22:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:53,24:.: 0.25:1.000:. ./.:4:45,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:51,23:.: 0.14:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:40,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:31,15:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.33:1.000:. ./.:4:30,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.06:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.71:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:31,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,9:.:-1.13:1.000:. ./.:4:55,18:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:34,22:.:-0.52:1.000:. ./.:4:37,13:.:-0.73:1.000:. ./.:4:21,15:.:-1.24:1.000:. ./.:4:23,14:.:-1.20:0.999:. ./.:4:44,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:31,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:36,16:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:91,21:.: 1.51:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:38,27:.:-0.19:1.000:. ./.:4:43,4:.:-0.84:1.000:. ./.:4:48,16:.:-0.23:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.59:0.994:. ./.:4:37,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.66:1.000:. -chr3.1 69231202 chr3.1_069231202 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:60,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:90,0:.: 2.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.92:1.000:. ./.:6:54,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.12:1.000:. ./.:6:44,0:.: 0.17:0.817:. ./.:4:53,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.22:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:66,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:60,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:82,0:.: 2.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:0.999:. ./.:4:26,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:0.994:. ./.:4:2,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. -chr3.1 69450464 chr3.1_069450464 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:43,43:0.46: 1.00:1.000:0.988 0/0/0/1:4:44,18:0.27:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,48:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,44:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,26:0.30: 0.71:1.000:0.982 0/0/1/1:4:59,58:0.46: 2.32:1.000:0.986 0/1/1/1:4:10,38:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,85:0.81: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,47:0.57: 0.62:1.000:0.957 0/1/1/1:4:5,11:0.64:-1.96:1.000:0.682 0/0/1/1:4:11,11:0.46:-1.71:1.000:0.988 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,19:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,43:0.58: 0.28:1.000:0.922 0/0/0/1:4:62,18:0.21: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 1.13:0.998:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,26:0.28: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,91:0.75: 2.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,7:0.43:-2.01:1.000:0.947 0/1/1/1:4:17,43:0.67:-0.10:1.000:0.910 0/0/1/1:4:30,41:0.53: 0.37:1.000:0.991 0/1/1/1:4:14,50:0.73: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,4:0.62:-2.39:1.000:0.576 0/0/0/0:4:68,1:0.01: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,16:0.16: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,47:0.52: 0.88:1.000:0.994 0/0/0/1:4:47,20:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,62:0.50: 2.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,43:0.44: 1.17:1.000:0.968 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-2.39:1.000:0.977 0/0/0/1:4:8,3:0.25:-2.18:1.000:0.999 0/0/0:3:4,0:0.00:-2.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,27:0.29: 1.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,32:0.46: 0.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:75,21:0.20: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,29:0.34: 0.71:1.000:0.879 0/0/0/1:4:64,32:0.31: 1.43:1.000:0.977 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,58:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,37:0.53: 0.07:1.000:0.990 0/1/1/1:4:15,48:0.71: 0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:27,35:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,18:0.31:-0.39:1.000:0.969 0/0/1/1:4:32,48:0.56: 0.75:1.000:0.974 0/1/1/1:4:5,20:0.75:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,28:0.42:-0.01:1.000:0.899 0/0/1/1:4:17,16:0.45:-1.24:1.000:0.977 0/0/1/1:4:23,16:0.38:-0.99:1.000:0.546 0/1/1/1:4:17,73:0.76: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,25:0.30: 0.62:1.000:0.986 0/0/1/1:4:35,41:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,26:0.34: 0.37:1.000:0.884 0/0/1/1:4:35,49:0.54: 0.92:1.000:0.988 0/1/1/1:4:24,65:0.68: 1.13:1.000:0.955 0/0/1/1:4:36,32:0.43: 0.24:1.000:0.956 0/0/0/0/1/1:6:22,15:0.37:-1.07:1.000:0.816 0/0/0/1:4:38,25:0.37: 0.03:1.000:0.618 0/0/1/1:4:38,31:0.41: 0.28:1.000:0.888 0/0/1/1:4:25,34:0.53:-0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:26,36:0.54:-0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,24:0.43:-0.44:1.000:0.934 0/0/0/1:4:34,12:0.24:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.52:-1.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,15:0.27:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,38:0.52: 0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,24:0.40:-0.31:1.000:0.810 0/0/0/0:4:26,3:0.10:-1.41:1.000:0.888 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,79:0.77: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,11:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,34:0.45: 0.28:1.000:0.984 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,22:0.34:-0.10:1.000:0.882 0/0/0/1:4:49,19:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,9:0.28:-1.37:0.999:0.996 0/0/0/1:4:40,13:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,16:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,20:0.30:-0.01:1.000:0.987 0/0/0/0/1/1:6:45,34:0.40: 0.71:0.817:0.670 0/0/1/1:4:22,25:0.49:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,12:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,44:0.71:-0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:30,11:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,11:0.24:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,12:0.27:-0.90:0.999:0.998 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,36:0.47: 0.37:1.000:0.991 0/0/0/1:4:44,10:0.17:-0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,17:0.39:-0.95:1.000:0.712 0/0/0/1:4:47,24:0.31: 0.37:1.000:0.971 0/0/0/1:4:22,9:0.27:-1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,18:0.40:-0.90:1.000:0.829 0/0/1/1:4:21,26:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,62:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,18:0.52:-1.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,30:0.53:-0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:17,12:0.38:-1.41:1.000:0.589 0/1/1/1:4:6,43:0.82:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,7:0.25:-1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,45:0.58: 0.41:1.000:0.916 0/0/0/1:4:37,16:0.28:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,44:0.55: 0.50:1.000:0.979 0/0/1/1:4:39,60:0.56: 1.56:1.000:0.965 0/0/1/1:4:34,36:0.47: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,14:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,17:0.33:-0.65:0.999:0.906 0/0/1/1:4:37,32:0.43: 0.28:1.000:0.940 0/0/1/1:4:15,13:0.43:-1.45:1.000:0.942 0/1/1/1:4:11,34:0.70:-0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:17,21:0.51:-1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,7:0.16:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,22:0.47:-0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:18,22:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,43:0.60: 0.16:1.000:0.745 0/0/0/1:4:27,10:0.25:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,5:0.14:-1.24:1.000:0.965 0/0/1/1:4:20,14:0.38:-1.20:1.000:0.564 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,24:0.52:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,13:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.23:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,32:0.45: 0.16:1.000:0.977 0/0/1/1:4:24,42:0.59: 0.16:1.000:0.861 0/0/0/1:4:52,13:0.18: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,21:0.33:-0.14:1.000:0.929 0/0/1/1:4:21,26:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,23:0.61:-1.16:1.000:0.688 0/0/0/1:4:26,6:0.17:-1.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:32,9:0.20:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,9:0.24:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,21:0.34:-0.23:1.000:0.872 0/0/1/1:4:11,21:0.61:-1.28:1.000:0.697 0/0/0/1:4:63,24:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,36:0.47: 0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:46,54:0.50: 1.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,51:0.54: 1.09:1.000:0.990 0/1/1/1:4:19,76:0.75: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,35:0.29: 2.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:43,47:0.48: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,7:0.54:-2.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:19,32:0.58:-0.48:1.000:0.906 0/0/0/1:4:62,21:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,21:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,28:0.24: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,39:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:37,20:0.32:-0.23:1.000:0.944 0/0/1/1:4:33,43:0.52: 0.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:65,18:0.20: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,37:0.45: 0.54:1.000:0.984 0/0/1/1:4:27,39:0.55: 0.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:58,22:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,24:0.29: 0.54:1.000:0.989 0/0/1/1:4:29,41:0.54: 0.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:38,26:0.37: 0.07:1.000:0.503 0/0/0/1:4:50,27:0.32: 0.62:0.999:0.945 0/0/0/1:4:55,18:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,36:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,57:0.79: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,20:0.29: 0.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:36,16:0.28:-0.44:1.000:0.994 0/0/0/0:4:70,1:0.01: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,40:0.59: 0.03:1.000:0.870 0/0/0/1:4:42,12:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,53:0.43: 2.15:1.000:0.953 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,47:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,21:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,40:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,28:0.24: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.41: 0.58:1.000:0.879 0/0/0/1:4:42,23:0.33: 0.11:1.000:0.936 -chr3.1 69591327 chr3.1_069591327 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:136,146:.: 0.69:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:180,71:.: 0.19:1.000:. ./.:4:199,78:.: 0.61:1.000:. ./.:4:242,67:.: 1.12:1.000:. ./.:4:269,94:.: 1.98:1.000:. ./.:4:169,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:209,64:.: 0.55:1.000:. ./.:4:205,67:.: 0.53:1.000:. ./.:4:77,7:.:-2.47:1.000:. ./.:4:56,64:.:-1.90:1.000:. ./.:4:171,67:.:-0.01:1.000:. ./.:4:179,74:.: 0.23:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:144,159:.: 1.03:1.000:. ./.:4:243,83:.: 1.39:0.998:. ./.:4:139,121:.: 0.34:1.000:. ./.:4:180,185:.: 2.02:1.000:. ./.:4:264,81:.: 1.70:1.000:. ./.:4:68,30:.:-2.25:1.000:. ./.:4:186,71:.: 0.29:1.000:. ./.:4:204,57:.: 0.35:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,30:.:-2.75:1.000:. ./.:4:143,145:.: 0.79:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:204,74:.: 0.63:1.000:. ./.:4:133,137:.: 0.50:1.000:. ./.:4:163,171:.: 1.52:1.000:. ./.:4:160,148:.: 1.11:1.000:. ./.:4:228,74:.: 1.01:1.000:. ./.:4:34,35:.:-2.71:1.000:. ./.:4:54,46:.:-2.22:1.000:. ./.:3:24,28:.:-2.99:1.000:. ./.:4:224,86:.: 1.14:1.000:. ./.:4:221,74:.: 0.90:1.000:. ./.:4:203,88:.: 0.83:1.000:. ./.:4:203,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:235,76:.: 1.15:1.000:. ./.:4:117,110:.:-0.19:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:202,62:.: 0.40:1.000:. ./.:4:135,45:.:-0.94:1.000:. ./.:4:161,40:.:-0.60:1.000:. ./.:4:113,119:.:-0.11:1.000:. ./.:4:214,65:.: 0.64:1.000:. ./.:4:241,228:.: 3.68:1.000:. ./.:4:188,47:.:-0.06:1.000:. ./.:4:176,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:250,83:.: 1.50:1.000:. ./.:4:172,47:.:-0.32:1.000:. ./.:4:186,54:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,134:.: 0.75:1.000:. ./.:4:171,143:.: 1.20:1.000:. ./.:4:155,47:.:-0.59:1.000:. ./.:4:201,52:.: 0.23:1.000:. ./.:4:194,46:.: 0.02:1.000:. ./.:6:109,66:.:-1.02:1.000:. ./.:4:140,38:.:-0.97:1.000:. ./.:4:169,60:.:-0.16:1.000:. ./.:4:183,72:.: 0.26:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:214,64:.: 0.63:1.000:. ./.:4:183,55:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,53:.:-0.76:1.000:. ./.:4:167,51:.:-0.33:1.000:. ./.:4:122,126:.: 0.15:1.000:. ./.:4:151,44:.:-0.70:1.000:. ./.:4:130,120:.: 0.18:1.000:. ./.:4:147,44:.:-0.76:1.000:. ./.:4:237,75:.: 1.17:1.000:. ./.:4:204,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:155,50:.:-0.54:1.000:. ./.:4:177,51:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,95:.:-0.68:1.000:. ./.:4:94,100:.:-0.72:1.000:. ./.:4:174,65:.: 0.00:1.000:. ./.:4:138,158:.: 0.91:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.00:0.999:. ./.:4:237,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:181,58:.: 0.00:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.02:1.000:. ./.:6:193,132:.: 1.38:0.817:. ./.:4:185,73:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,55:.:-1.07:1.000:. ./.:4:139,42:.:-0.92:1.000:. ./.:4:84,105:.:-0.80:1.000:. ./.:4:157,57:.:-0.40:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:167,55:.:-0.27:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:97,91:.:-0.81:1.000:. ./.:4:194,59:.: 0.23:1.000:. ./.:4:206,55:.: 0.35:1.000:. ./.:4:112,35:.:-1.47:1.000:. ./.:4:90,107:.:-0.67:1.000:. ./.:4:162,42:.:-0.56:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:127,45:.:-1.07:1.000:. ./.:4:180,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:99,93:.:-0.75:1.000:. ./.:4:130,126:.: 0.27:1.000:. ./.:4:158,56:.:-0.40:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:218,80:.: 0.95:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:96,86:.:-0.91:1.000:. ./.:4:187,193:.: 2.26:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:255,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:84,83:.:-1.15:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:114,100:.:-0.40:1.000:. ./.:4:141,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:174,48:.:-0.27:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:203,57:.: 0.34:1.000:. ./.:4:93,70:.:-1.21:1.000:. ./.:4:124,131:.: 0.26:1.000:. ./.:4:121,131:.: 0.21:1.000:. ./.:4:104,92:.:-0.68:1.000:. ./.:4:171,48:.:-0.32:1.000:. ./.:4:164,51:.:-0.38:1.000:. ./.:4:98,104:.:-0.59:1.000:. ./.:4:120,31:.:-1.40:1.000:. ./.:4:127,41:.:-1.13:1.000:. ./.:4:97,87:.:-0.88:1.000:. ./.:4:196,87:.: 0.71:1.000:. ./.:4:100,36:.:-1.64:1.000:. ./.:4:182,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:264,93:.: 1.89:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:153,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,45:.:-0.76:1.000:. ./.:4:73,69:.:-1.55:1.000:. ./.:4:127,97:.:-0.24:1.000:. ./.:4:108,38:.:-1.48:1.000:. ./.:4:226,79:.: 1.06:1.000:. ./.:4:223,77:.: 0.98:1.000:. ./.:4:126,136:.: 0.37:1.000:. ./.:4:113,146:.: 0.32:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:104,130:.:-0.08:1.000:. ./.:4:233,94:.: 1.41:1.000:. ./.:4:218,69:.: 0.77:1.000:. ./.:4:61,28:.:-2.39:1.000:. ./.:4:101,91:.:-0.75:1.000:. ./.:4:163,132:.: 0.90:1.000:. ./.:4:268,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:222,78:.: 0.98:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:165,66:.:-0.12:1.000:. ./.:4:202,68:.: 0.50:1.000:. ./.:4:194,63:.: 0.29:1.000:. ./.:4:181,74:.: 0.26:1.000:. ./.:4:206,59:.: 0.42:1.000:. ./.:4:129,122:.: 0.19:1.000:. ./.:4:232,67:.: 0.96:1.000:. ./.:4:195,64:.: 0.32:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,121:.: 0.29:0.999:. ./.:4:174,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:190,59:.: 0.16:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,50:.:-0.44:1.000:. ./.:4:182,56:.:-0.01:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:137,39:.:-1.00:1.000:. ./.:4:285,73:.: 1.90:1.000:. ./.:4:139,125:.: 0.40:1.000:. ./.:4:221,83:.: 1.04:1.000:. ./.:4:213,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:274,87:.: 1.95:1.000:. ./.:4:151,169:.: 1.30:1.000:. ./.:4:128,127:.: 0.26:1.000:. ./.:4:206,67:.: 0.55:1.000:. -chr3.1 69669859 chr3.1_069669859 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:167,34:0.18: 1.65:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,39:0.29: 0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:90,47:0.35: 0.11:1.000:0.780 0/0/1/1:4:67,91:0.57: 0.61:1.000:0.948 0/0/0/1:4:99,54:0.36: 0.49:1.000:0.679 0/0/0/1:4:87,23:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,30:0.20: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,22:0.16: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,4:0.13:-2.42:1.000:0.924 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-2.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,122:0.66: 1.14:1.000:0.870 0/0/0/1:4:90,38:0.31:-0.11:1.000:0.977 0/1/1/1:4:32,79:0.69:-0.52:1.000:0.974 0/1/1/1:4:32,66:0.66:-0.83:1.000:0.844 0/0/0/1:4:85,35:0.30:-0.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:52,65:0.55:-0.37:0.998:0.979 0/0/1/1:4:91,79:0.47: 0.90:1.000:0.991 0/0/0/1:4:154,43:0.23: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,54:0.23: 2.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,7:0.24:-2.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,37:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,87:0.43: 1.70:1.000:0.954 0/0/1/1:4:91,61:0.41: 0.47:1.000:0.846 0/0/0/1:4:12,6:0.34:-2.76:1.000:0.856 0/0/0/1:4:64,34:0.36:-0.83:1.000:0.743 0/0/1/1:4:49,64:0.56:-0.47:1.000:0.966 0/0/1/1:4:88,69:0.44: 0.59:1.000:0.973 0/0/0/1:4:142,42:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,34:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,39:0.34:-0.37:1.000:0.856 0/0/1/1:4:69,63:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,15:0.59:-2.59:1.000:0.860 0/0/0/0:4:68,7:0.10:-1.39:1.000:0.835 0/1/1:3:6,12:0.65:-2.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,34:0.26: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,66:0.45: 0.40:1.000:0.977 0/0/1/1:4:50,81:0.61:-0.04:1.000:0.723 0/0/1/1:4:67,60:0.48:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,31:0.28:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,32:0.30:-0.52:1.000:0.986 0/0/1/1:4:92,74:0.45: 0.81:1.000:0.980 0/0/1/1:4:72,60:0.46:-0.01:1.000:0.986 0/0/0/1:4:99,29:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,30:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,25:0.17: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:130,58:0.32: 1.34:1.000:0.958 0/0/0/0:4:12,1:0.08:-2.88:1.000:0.986 0/0/0/1:4:62,23:0.28:-1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,6:0.28:-2.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,54:0.59:-1.02:1.000:0.860 0/0/0/1:4:145,47:0.26: 1.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,58:0.67:-1.17:1.000:0.927 0/0/0/1:4:90,27:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,43:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,25:0.22:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,44:0.31: 0.40:1.000:0.979 0/0/0/1:4:87,30:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,36:0.27: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:72,34:0.33:-0.64:1.000:0.921 0/0/0/1:4:100,43:0.31: 0.25:1.000:0.972 0/0/1/1:4:58,82:0.58: 0.18:1.000:0.922 0/0/1/1:4:85,51:0.38: 0.08:1.000:0.594 0/1/1/1:4:23,52:0.67:-1.39:1.000:0.936 0/0/1/1:4:64,45:0.42:-0.57:1.000:0.906 0/0/0/1:4:74,32:0.31:-0.64:1.000:0.970 0/0/0/1:4:104,34:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,89:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,35:0.35:-0.69:1.000:0.833 0/1/1/1:4:33,116:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,46:0.33: 0.30:1.000:0.934 0/0/1/1:4:45,42:0.49:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,56:0.62:-1.05:1.000:0.611 0/0/0/1:4:147,47:0.25: 1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,87:0.68:-0.21:1.000:0.957 0/0/0/1:4:98,15:0.14:-0.47:1.000:0.967 0/0/0/1:4:76,34:0.32:-0.54:1.000:0.957 0/0/0/1:4:90,41:0.32:-0.04:1.000:0.947 0/0/0/1:4:92,39:0.31:-0.04:1.000:0.976 0/0/0/1:4:75,21:0.23:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,138:1.00: 0.13:0.999:1.000 0/1/1/1:4:44,82:0.64:-0.16:1.000:0.641 0/0/1/1:4:104,80:0.44: 1.24:1.000:0.966 0/0/1/1:4:49,53:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:70,51:0.43:-0.28:0.817:0.573 0/0/1/1:4:92,96:0.51: 1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,57:0.59:-0.88:1.000:0.891 0/0/1/1:4:75,74:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,28:0.19: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,19:0.20:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,72:0.71:-0.83:0.999:0.992 0/0/1/1:4:40,62:0.60:-0.74:1.000:0.810 0/1/1/1:4:34,78:0.68:-0.49:1.000:0.945 0/0/1/1:4:53,33:0.39:-1.12:1.000:0.695 0/0/0/1:4:99,35:0.27: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,67:0.44: 0.54:1.000:0.961 0/0/1/1:4:86,58:0.41: 0.28:1.000:0.855 0/0/1/1:4:75,49:0.40:-0.21:1.000:0.801 0/0/1/1:4:73,79:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,83:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,35:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,33:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,57:0.55:-0.71:1.000:0.981 0/0/1/1:4:90,70:0.44: 0.66:1.000:0.970 0/0/0/1:4:82,27:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,26:0.19: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,33:0.33:-0.71:1.000:0.922 0/0/1/1:4:68,85:0.55: 0.49:1.000:0.979 0/0/1/1:4:112,85:0.44: 1.55:1.000:0.960 0/0/1/1:4:87,84:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,40:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,48:0.36: 0.13:1.000:0.734 0/1/1/1:4:42,86:0.65:-0.11:0.999:0.833 0/0/1/1:4:52,79:0.59:-0.04:1.000:0.842 0/0/0/1:4:64,14:0.19:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,36:0.46:-1.29:1.000:0.987 0/0/0/1:4:93,34:0.28:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,64:0.66:-0.90:1.000:0.845 0/0/0/1:4:134,33:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,56:0.60:-1.00:1.000:0.750 0/0/0/1:4:140,43:0.25: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,33:0.26:-0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,41:0.36:-0.35:1.000:0.738 0/0/0/1:4:114,49:0.31: 0.73:1.000:0.972 0/0/0/1:4:78,29:0.28:-0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,81:0.47: 1.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:85,41:0.33:-0.16:1.000:0.901 0/0/1/1:4:47,48:0.51:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,27:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,56:0.62:-1.05:1.000:0.611 0/0/0/1:4:62,33:0.36:-0.90:1.000:0.739 0/1/1/1:4:31,83:0.70:-0.45:1.000:0.989 0/0/1/1:4:43,30:0.42:-1.43:1.000:0.898 0/0/0/1:4:70,37:0.35:-0.62:1.000:0.754 0/0/1/1:4:56,88:0.60: 0.28:1.000:0.785 0/0/1/1:4:98,67:0.41: 0.78:1.000:0.874 0/0/1/1:4:73,102:0.58: 1.02:1.000:0.931 0/1/1/1:4:39,82:0.66:-0.28:1.000:0.869 0/0/1/1:4:73,64:0.47: 0.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,73:0.60:-0.30:1.000:0.806 0/0/1/1:4:103,87:0.46: 1.38:1.000:0.988 0/0/0/1:4:121,32:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,33:0.20: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,47:0.47:-0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:105,79:0.43: 1.24:1.000:0.956 0/0/0/1:4:126,49:0.29: 1.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:165,41:0.21: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,31:0.19: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,83:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,27:0.30:-0.95:1.000:0.984 0/0/1/1:4:101,86:0.46: 1.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:100,70:0.42: 0.90:1.000:0.902 0/0/0/1:4:45,7:0.14:-1.94:1.000:0.973 0/0/0/1:4:125,28:0.19: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,39:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,82:0.58: 0.16:1.000:0.907 0/0/0/1:4:154,44:0.23: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,95:0.62: 0.42:1.000:0.563 0/0/1/1:4:105,96:0.48: 1.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:151,47:0.25: 1.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,71:0.66:-0.69:1.000:0.895 0/0/1/1:4:47,56:0.54:-0.71:1.000:0.987 0/0/1/1:4:71,71:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,27:0.17: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,33:0.56:-1.80:1.000:0.962 0/0/0/1:4:90,40:0.32:-0.06:1.000:0.960 0/1/1/1:4:42,79:0.64:-0.28:1.000:0.664 0/0/1/1:4:108,77:0.42: 1.26:0.999:0.919 0/0/0/1:4:94,29:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,63:0.39: 0.76:1.000:0.699 0/0/1/1:4:94,66:0.42: 0.66:1.000:0.905 0/1/1/1:4:27,66:0.69:-0.95:1.000:0.971 0/0/1/1:4:86,77:0.48: 0.73:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,47:0.56:-1.19:1.000:0.966 0/0/1/1:4:72,73:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,39:0.21: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,39:0.31:-0.01:1.000:0.979 0/0/1/1:4:99,77:0.44: 1.05:1.000:0.970 0/0/1/1:4:60,76:0.55: 0.08:1.000:0.976 0/1/1/1:4:54,102:0.64: 0.56:1.000:0.674 0/0/0/1:4:129,51:0.29: 1.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:128,42:0.26: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,32:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,105:0.66: 0.52:1.000:0.891 -chr3.1 69820753 chr3.1_069820753 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:320,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:393,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:124,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:326,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:378,1:.: 1.32:0.998:. ./.:4:331,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:456,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:102,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:72,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:356,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:136,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:75,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:421,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:240,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:299,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:296,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.62:1.000:. ./.:6:398,0:.: 1.60:0.817:. ./.:4:306,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.46:0.999:. ./.:4:261,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:255,2:.:-0.50:0.999:. ./.:4:295,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:299,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:132,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:344,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:247,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:268,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:246,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:441,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.07:1.000:. -chr3.1 70224611 chr3.1_070224611 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:194,62:.: 0.48:1.000:. ./.:4:100,113:.:-0.28:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:239,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:160,150:.: 1.42:1.000:. ./.:4:272,82:.: 2.20:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:185,70:.: 0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:52,17:.:-2.80:1.000:. ./.:4:193,63:.: 0.48:1.000:. ./.:4:163,89:.: 0.41:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,49:.: 0.00:1.000:. ./.:4:195,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:133,136:.: 0.71:0.998:. ./.:4:239,76:.: 1.51:1.000:. ./.:4:224,75:.: 1.23:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:37,27:.:-2.89:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:177,168:.: 2.04:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:36,9:.:-3.22:1.000:. ./.:4:170,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:180,54:.: 0.09:1.000:. ./.:4:179,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:147,145:.: 1.11:1.000:. ./.:4:198,62:.: 0.55:1.000:. ./.:4:127,131:.: 0.51:1.000:. ./.:4:119,129:.: 0.34:1.000:. ./.:4:28,30:.:-2.99:1.000:. ./.:4:29,29:.:-2.99:1.000:. ./.:3:16,12:.:-3.52:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:115,158:.: 0.78:1.000:. ./.:4:123,152:.: 0.81:1.000:. ./.:4:135,138:.: 0.78:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:165,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:160,75:.: 0.11:1.000:. ./.:4:182,60:.: 0.23:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:135,115:.: 0.37:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:57,16:.:-2.73:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:131,43:.:-0.96:1.000:. ./.:4:150,48:.:-0.54:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:89,129:.:-0.19:1.000:. ./.:4:187,68:.: 0.46:1.000:. ./.:4:176,79:.: 0.46:1.000:. ./.:4:110,117:.:-0.03:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.08:1.000:. ./.:6:157,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:186,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:120,119:.: 0.18:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:183,61:.: 0.27:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:126,123:.: 0.36:1.000:. ./.:4:163,75:.: 0.16:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:174,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:66,79:.:-1.47:1.000:. ./.:4:111,110:.:-0.14:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:127,54:.:-0.84:1.000:. ./.:4:161,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:190,89:.: 0.88:1.000:. ./.:4:75,95:.:-1.03:0.999:. ./.:4:172,61:.: 0.07:1.000:. ./.:4:163,137:.: 1.25:1.000:. ./.:4:149,56:.:-0.42:1.000:. ./.:6:205,60:.: 0.64:0.817:. ./.:4:135,143:.: 0.86:1.000:. ./.:4:70,78:.:-1.42:1.000:. ./.:4:94,124:.:-0.19:1.000:. ./.:4:159,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:174,49:.:-0.10:0.999:. ./.:4:113,116:.: 0.00:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:134,42:.:-0.93:1.000:. ./.:4:207,68:.: 0.81:1.000:. ./.:4:109,118:.:-0.03:1.000:. ./.:4:88,94:.:-0.82:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:113,126:.: 0.18:1.000:. ./.:4:186,80:.: 0.65:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:128,48:.:-0.93:1.000:. ./.:4:187,50:.: 0.14:1.000:. ./.:4:82,108:.:-0.68:1.000:. ./.:4:175,65:.: 0.20:1.000:. ./.:4:132,52:.:-0.78:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:144,136:.: 0.90:1.000:. ./.:4:219,78:.: 1.20:1.000:. ./.:4:91,122:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,150:.: 1.49:1.000:. ./.:4:174,57:.: 0.04:0.999:. ./.:4:205,56:.: 0.57:1.000:. ./.:4:129,36:.:-1.12:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:124,56:.:-0.85:1.000:. ./.:4:141,38:.:-0.87:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:177,78:.: 0.46:1.000:. ./.:4:143,55:.:-0.54:1.000:. ./.:4:184,73:.: 0.50:1.000:. ./.:4:123,128:.: 0.39:1.000:. ./.:4:82,125:.:-0.38:1.000:. ./.:4:116,117:.: 0.07:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:87,88:.:-0.94:1.000:. ./.:4:164,62:.:-0.05:1.000:. ./.:4:126,147:.: 0.78:1.000:. ./.:4:109,44:.:-1.33:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:177,64:.: 0.21:1.000:. ./.:4:162,173:.: 1.86:1.000:. ./.:4:166,71:.: 0.14:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:156,66:.:-0.12:1.000:. ./.:4:152,46:.:-0.54:1.000:. ./.:4:114,122:.: 0.13:1.000:. ./.:4:153,47:.:-0.50:1.000:. ./.:4:107,125:.: 0.06:1.000:. ./.:4:111,51:.:-1.17:1.000:. ./.:4:150,149:.: 1.23:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:208,72:.: 0.90:1.000:. ./.:4:173,61:.: 0.09:1.000:. ./.:4:236,97:.: 1.83:1.000:. ./.:4:165,77:.: 0.23:1.000:. ./.:4:144,146:.: 1.07:1.000:. ./.:4:194,62:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:127,61:.:-0.71:1.000:. ./.:4:151,148:.: 1.23:1.000:. ./.:4:195,56:.: 0.39:1.000:. ./.:4:315,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:207,61:.: 0.69:1.000:. ./.:4:115,119:.: 0.09:1.000:. ./.:4:191,81:.: 0.76:1.000:. ./.:4:163,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:102,103:.:-0.42:1.000:. ./.:4:209,49:.: 0.51:1.000:. ./.:4:128,143:.: 0.74:1.000:. ./.:4:141,155:.: 1.18:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:173,65:.: 0.16:0.999:. ./.:4:253,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:187,71:.: 0.51:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:97,108:.:-0.42:1.000:. ./.:4:104,136:.: 0.20:1.000:. ./.:4:149,59:.:-0.36:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:116,96:.:-0.29:1.000:. ./.:4:217,72:.: 1.06:1.000:. ./.:4:117,174:.: 1.09:1.000:. ./.:4:108,118:.:-0.05:1.000:. ./.:4:179,72:.: 0.39:1.000:. ./.:4:175,71:.: 0.30:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:230,86:.: 1.53:1.000:. ./.:4:156,64:.:-0.15:1.000:. ./.:4:173,79:.: 0.41:1.000:. -chr3.1 70543405 chr3.1_070543405 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:29,7:0.22:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,16:0.80:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,5:0.14: 0.01:1.000:0.969 0/0/0/0:4:37,3:0.08: 0.01:1.000:0.977 0/0/0/1:4:34,8:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.26:-1.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.48:-2.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,5:0.36:-1.66:1.000:0.667 0/0/1/1:4:9,7:0.43:-1.54:1.000:0.942 0/1/1/1:4:7,15:0.68:-1.15:1.000:0.948 0/1/1/1:4:8,16:0.66:-1.02:1.000:0.873 0/0/0/1:4:33,4:0.12:-0.18:1.000:0.795 0/0/0/1:4:23,3:0.13:-0.89:1.000:0.908 0/0/0/1:4:26,4:0.15:-0.63:1.000:0.988 0/0/0/1:4:20,8:0.30:-0.76:1.000:0.983 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,4:0.10: 0.34:0.998:0.801 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.29:-0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:14,7:0.34:-1.21:1.000:0.855 0/0/0/1:4:17,2:0.12:-1.34:1.000:0.727 0/0/1/1:4:13,13:0.48:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,12:0.62:-1.34:1.000:0.553 0/0/0/1:4:14,4:0.25:-1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,9:0.36:-0.95:1.000:0.638 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,3:0.15:-1.08:1.000:0.983 0/0/0/1:4:21,7:0.27:-0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,12:0.25: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,3:0.12:-0.70:1.000:0.675 0/0/0/1:4:28,4:0.14:-0.50:1.000:0.969 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-1.86:1.000:0.747 0/1/1/1:4:6,13:0.68:-1.34:1.000:0.955 0/0/1/1:4:9,6:0.40:-1.60:1.000:0.767 0/0/1:3:11,3:0.24:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.46:-1.34:1.000:0.987 0/0/0/1:4:37,6:0.16: 0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:46,17:0.29: 1.50:1.000:0.992 0/0/0/1:4:44,5:0.11: 0.59:1.000:0.631 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,21:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,17:0.30: 1.24:1.000:0.980 0/0/0/1:4:44,20:0.32: 1.56:1.000:0.940 0/0/1/1:4:25,15:0.38: 0.01:1.000:0.525 0/0/0/1:4:48,14:0.25: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,8:0.29:-0.70:1.000:0.989 0/0/0/1:4:26,8:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,21:0.44: 0.47:1.000:0.960 0/0/1/1:4:14,22:0.60:-0.24:1.000:0.806 0/0/0/1:4:42,5:0.12: 0.47:1.000:0.756 0/0/0/1:4:31,9:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,14:0.38:-0.18:1.000:0.562 0/0/0/1:4:37,12:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,12:0.30: 0.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:24,31:0.54: 0.98:1.000:0.984 0/0/0/1:4:34,9:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:37,24:0.39: 1.37:1.000:0.706 0/0/0/1:4:31,17:0.36: 0.53:1.000:0.696 0/0/0/1:4:27,7:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,35:0.63: 0.98:1.000:0.518 0/0/0/1:4:49,21:0.31: 1.95:1.000:0.966 0/0/0/1:4:36,9:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,17:0.30: 1.24:1.000:0.980 0/0/0/1:4:29,12:0.31: 0.08:1.000:0.976 0/0/0/1:4:23,6:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,6:0.24:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,13:0.18: 2.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,16:0.40: 0.01:1.000:0.767 0/0/0/1:4:41,9:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.60:-0.89:1.000:0.764 0/0/0/0:4:48,3:0.07: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,23:0.37: 1.43:1.000:0.519 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,12:0.18: 2.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:53,4:0.08: 1.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:10,11:0.50:-1.21:0.999:0.997 0/0/0/1:4:39,18:0.33: 1.11:1.000:0.930 0/0/0/1:4:42,16:0.29: 1.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:18,5:0.24:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:70,23:0.27: 3.43:0.817:0.691 0/0/1/1:4:25,30:0.52: 0.98:1.000:0.994 0/0/0/1:4:22,9:0.31:-0.57:1.000:0.978 0/0/1/1:4:13,10:0.43:-1.08:1.000:0.936 0/0/0/0:4:53,4:0.08: 1.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:44,9:0.19: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,12:0.37:-0.44:0.999:0.599 0/0/0/1:4:50,7:0.14: 1.11:1.000:0.960 0/0/0/1:4:37,17:0.33: 0.92:1.000:0.933 0/0/0/1:4:26,3:0.12:-0.70:1.000:0.675 0/0/0/1:4:42,15:0.28: 1.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,20:0.40: 0.66:1.000:0.767 0/0/0/1:4:24,11:0.33:-0.31:1.000:0.935 0/0/0/1:4:49,7:0.14: 1.05:1.000:0.969 0/0/1/1:4:19,33:0.62: 0.79:1.000:0.508 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,11:0.28: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,17:0.31: 1.17:1.000:0.975 0/0/0/1:4:20,9:0.32:-0.70:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,44:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,18:0.37: 0.59:1.000:0.559 0/0/0/1:4:37,12:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,11:0.28: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:31,6:0.18:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-0.95:1.000:0.767 0/1/1/1:4:12,22:0.64:-0.37:1.000:0.673 0/0/0/1:4:38,20:0.35: 1.17:1.000:0.777 0/0/0/0:4:42,3:0.07: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:31,12:0.30: 0.21:0.999:0.987 0/0/1/1:4:16,26:0.61: 0.14:1.000:0.723 0/0/0/0:4:28,3:0.11:-0.57:1.000:0.552 0/0/1/1:4:15,21:0.57:-0.24:1.000:0.954 0/0/0/1:4:28,14:0.34: 0.14:1.000:0.855 0/0/0/1:4:32,10:0.26: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,34:0.46: 2.01:1.000:0.989 0/1/1/1:4:13,27:0.67: 0.01:1.000:0.921 0/0/1/1:4:16,16:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,14:0.23: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,7:0.18: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,11:0.30:-0.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:40,5:0.12: 0.34:1.000:0.852 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,14:0.35: 0.08:1.000:0.803 0/0/0/1:4:31,9:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,7:0.14: 1.17:1.000:0.950 0/0/0/0:4:48,3:0.07: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,9:0.31:-0.63:1.000:0.966 0/0/0/1:4:16,9:0.36:-0.95:1.000:0.638 0/0/0/1:4:17,8:0.33:-0.95:1.000:0.916 0/0/0/1:4:33,8:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.54:-0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:16,12:0.42:-0.76:1.000:0.918 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-0.63:1.000:0.982 0/0/0/1:4:35,12:0.28: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,16:0.35: 0.40:1.000:0.753 0/0/0/0:4:42,4:0.10: 0.40:1.000:0.845 0/0/0/1:4:22,10:0.32:-0.50:1.000:0.940 0/0/0/1:4:29,10:0.28:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,11:0.22: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,19:0.36: 0.85:1.000:0.653 0/0/0/1:4:30,7:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,4:0.12:-0.24:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,6:0.15: 0.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:23,5:0.20:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,7:0.39:-1.41:1.000:0.671 0/0/0/1:4:25,5:0.19:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,7:0.20: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,11:0.29: 0.01:1.000:0.990 0/0/0/0:4:55,3:0.06: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,11:0.37:-0.63:1.000:0.567 0/0/0/1:4:17,8:0.33:-0.95:1.000:0.916 0/0/1/1:4:14,14:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/0:4:57,3:0.06: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.44:-0.70:1.000:0.963 0/0/0/1:4:34,5:0.14:-0.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:16,5:0.26:-1.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:13,6:0.33:-1.34:1.000:0.930 0/0/0/0:4:26,2:0.08:-0.76:1.000:0.988 0/0/0/1:4:28,12:0.31: 0.01:1.000:0.966 0/0/0/1:4:26,9:0.28:-0.31:0.999:0.996 0/0/0/0:4:39,3:0.08: 0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:32,5:0.15:-0.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:15,6:0.30:-1.21:1.000:0.983 0/0/0/1:4:20,4:0.19:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,10:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/0:4:38,2:0.06: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.19:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,3:0.15:-1.08:1.000:0.983 0/0/0/1:4:12,3:0.23:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,4:0.07: 1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,9:0.46:-1.34:1.000:0.987 0/0/0/1:4:30,5:0.16:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,8:0.48:-1.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,7:0.13: 1.43:1.000:0.878 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,9:0.35:-0.89:1.000:0.767 0/0/0/1:4:28,10:0.28:-0.12:1.000:0.994 -chr3.1 70849199 chr3.1_070849199 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:32,23:0.43:-0.10:1.000:0.944 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,28:0.42: 0.55:1.000:0.922 0/0/0/1:4:43,24:0.37: 0.50:1.000:0.625 0/0/0/1:4:101,20:0.17: 3.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,30:0.43: 0.70:1.000:0.955 0/0/0/1:4:32,9:0.22:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,37:0.58: 0.30:1.000:0.918 0/0/1/1:4:39,29:0.44: 0.55:1.000:0.964 0/0/1/1:4:15,26:0.61:-0.79:1.000:0.633 0/0/0/1:4:19,5:0.21:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,9:0.17:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,23:0.38: 0.25:1.000:0.553 0/0/0/1:4:45,15:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,8:0.16:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,21:0.26: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,10:0.14: 0.60:0.998:0.980 0/0/1/1:4:10,17:0.61:-1.49:1.000:0.675 0/0/1/1:4:33,44:0.57: 1.00:1.000:0.955 0/0/1/1:4:44,34:0.45: 1.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:31,6:0.16:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,29:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,29:0.35: 1.40:1.000:0.818 0/0/0/1:4:32,14:0.31:-0.55:1.000:0.977 0/0/1/1:4:6,9:0.59:-2.09:1.000:0.872 0/0/1/1:4:27,26:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,10:0.16: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,16:0.36:-0.60:1.000:0.660 0/0/1/1:4:27,36:0.57: 0.30:1.000:0.955 0/0/1/1:4:44,35:0.46: 1.10:1.000:0.985 0/0/0/1:4:42,15:0.26: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,17:0.31:-0.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:26,10:0.28:-1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,16:0.55:-1.39:1.000:0.978 0/0/1:3:9,3:0.25:-2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.52:-1.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,26:0.31: 1.35:1.000:0.968 0/0/0/0:4:79,8:0.09: 1.49:1.000:0.928 0/0/0/1:4:61,23:0.28: 1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,15:0.52:-1.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,14:0.51:-1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,22:0.27: 1.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,27:0.35: 1.10:1.000:0.812 0/0/1/1:4:27,21:0.45:-0.45:1.000:0.979 0/0/0/1:4:52,16:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,26:0.39: 0.55:1.000:0.701 0/0/0/1:4:51,17:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,18:0.60:-1.39:1.000:0.748 0/0/0/1:4:37,7:0.16:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,14:0.29:-0.45:1.000:0.989 0/0/0/0:4:48,1:0.02:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,41:0.53: 1.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:37,8:0.18:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,24:0.34: 0.75:1.000:0.877 0/0/1/1:4:26,22:0.47:-0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:30,24:0.46:-0.15:1.000:0.986 0/0/0/1:4:49,22:0.31: 0.70:1.000:0.967 0/0/1/1:4:27,30:0.53: 0.00:1.000:0.992 0/1/1/1:4:6,34:0.79:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:29,10:0.26:-0.89:1.000:0.552 0/0/0/1:4:35,10:0.22:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,19:0.43:-0.60:1.000:0.955 0/0/0/1:4:67,20:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,8:0.14: 0.10:1.000:0.949 0/0/1/1:4:39,26:0.41: 0.40:1.000:0.862 0/0/0/1:4:43,18:0.30: 0.20:1.000:0.987 0/1/1/1:4:5,13:0.68:-1.94:1.000:0.960 0/0/1/1:4:30,18:0.38:-0.45:1.000:0.609 0/0/1/1:4:18,14:0.45:-1.24:1.000:0.979 0/0/0/1:4:48,10:0.17: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,19:0.30: 0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:26,11:0.30:-0.99:1.000:0.985 0/0/0/1:4:83,13:0.14: 1.94:1.000:0.948 0/0/1/1:4:21,23:0.53:-0.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,9:0.17:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,25:0.75:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,19:0.60:-1.29:1.000:0.803 0/0/1/1:4:21,14:0.41:-1.09:1.000:0.862 0/0/1/1:4:22,39:0.62: 0.20:1.000:0.583 0/0/1/1:4:45,27:0.38: 0.75:1.000:0.609 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.55:0.999:1.000 0/0/0/1:4:46,17:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,29:0.47: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:50,8:0.14: 0.05:1.000:0.959 0/0/0/1/1/1:6:36,25:0.42: 0.20:0.817:0.521 0/0/0/1:4:60,34:0.37: 1.84:1.000:0.577 0/0/0/1:4:56,9:0.14: 0.40:1.000:0.962 0/0/0/1:4:44,16:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,19:0.58:-1.24:1.000:0.897 0/0/1/1:4:18,15:0.47:-1.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:48,6:0.11:-0.15:0.999:0.520 0/0/0/1:4:45,9:0.17:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,16:0.20: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,11:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,34:0.36: 1.94:1.000:0.678 0/0/1/1:4:43,32:0.44: 0.90:1.000:0.964 0/0/0/1:4:36,15:0.30:-0.30:1.000:0.988 0/0/0/1:4:37,15:0.29:-0.25:1.000:0.991 0/0/0/1:4:59,21:0.26: 1.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,16:0.17: 1.89:1.000:0.998 0/1/1/1:4:2,24:0.86:-1.54:1.000:0.979 0/1/1/1:4:6,26:0.75:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,11:0.28:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,15:0.20: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.54:-0.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,32:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,13:0.36:-0.99:1.000:0.713 0/0/0/1:4:47,6:0.11:-0.20:1.000:0.585 0/0/0/1:4:83,25:0.23: 2.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,26:0.41: 0.40:1.000:0.862 0/0/0/1:4:30,17:0.37:-0.50:1.000:0.577 0/0/1/1:4:55,37:0.41: 1.74:1.000:0.876 0/0/0/1:4:42,9:0.18:-0.30:0.999:0.999 0/0/0/1:4:76,12:0.14: 1.54:1.000:0.953 0/0/1/1:4:6,11:0.62:-1.99:1.000:0.504 0/0/0/1:4:52,12:0.19: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,24:0.52:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/0:4:37,2:0.05:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,24:0.63:-0.99:1.000:0.512 0/0/0/0:4:67,5:0.07: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,34:0.52: 0.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,29:0.75:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,20:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:46,18:0.28: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,26:0.45: 0.15:1.000:0.974 0/0/0/1:4:36,10:0.22:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.60:-1.69:1.000:0.828 0/0/1/1:4:14,19:0.57:-1.19:1.000:0.947 0/1/1/1:4:8,19:0.67:-1.49:1.000:0.915 0/0/0/1:4:31,11:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,16:0.42:-0.89:1.000:0.916 0/0/0/1:4:46,12:0.21: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.28:-1.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,12:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,8:0.13: 0.30:1.000:0.878 0/0/0/1:4:55,27:0.33: 1.25:1.000:0.901 0/0/0/1:4:45,14:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,4:0.08:-0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:32,14:0.31:-0.55:1.000:0.977 0/0/0/1:4:35,11:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,18:0.40:-0.55:1.000:0.795 0/1/1/1:4:9,22:0.67:-1.29:1.000:0.933 0/0/1/1:4:26,27:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,13:0.40:-1.19:1.000:0.817 0/0/0/1:4:56,28:0.34: 1.35:1.000:0.877 0/0/0/1:4:39,17:0.31:-0.05:1.000:0.978 0/0/1/1:4:39,39:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,17:0.31:-0.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:78,23:0.23: 2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,16:0.44:-0.99:1.000:0.973 0/0/0/1:4:53,23:0.31: 0.95:1.000:0.979 0/0/0/1:4:44,18:0.29: 0.25:1.000:0.990 0/0/1/1:4:9,12:0.57:-1.79:1.000:0.955 0/0/1/1:4:22,14:0.40:-1.04:1.000:0.772 0/0/1/1:4:48,33:0.42: 1.20:1.000:0.904 0/0/0/1:4:56,12:0.18: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,28:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,26:0.29: 1.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,22:0.39: 0.05:1.000:0.665 0/0/1/1:4:25,22:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:57,11:0.16: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,17:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,18:0.27: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,32:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/0:4:77,5:0.06: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,15:0.30:-0.30:1.000:0.988 0/0/0/1:4:49,7:0.12:-0.05:1.000:0.852 0/0/0/1:4:53,11:0.17: 0.35:0.999:0.998 0/0/1/1:4:14,23:0.61:-0.99:1.000:0.741 0/0/0/1:4:34,17:0.34:-0.30:1.000:0.877 0/0/1/1:4:20,14:0.42:-1.14:1.000:0.922 0/0/0/1:4:50,10:0.17: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,14:0.34:-0.74:1.000:0.877 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.17:-0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,14:0.30:-0.50:1.000:0.984 0/0/1/1:4:38,44:0.54: 1.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:53,26:0.33: 1.10:1.000:0.902 0/0/0/1:4:71,28:0.28: 2.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:55,14:0.20: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,11:0.12: 1.59:1.000:0.830 0/0/1/1:4:25,19:0.44:-0.65:1.000:0.972 0/1/1/1:4:10,35:0.73:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,30:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/0/0:4:78,8:0.09: 1.45:1.000:0.916 -chr3.1 70951996 chr3.1_070951996 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:27,35:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,18:0.31:-0.86:1.000:0.978 0/0/0/1:4:41,25:0.34: 0.10:1.000:0.893 0/0/1/1:4:45,39:0.41: 1.34:1.000:0.875 0/0/1/1:4:26,48:0.61: 0.65:1.000:0.695 0/1/1/1:4:14,39:0.72:-0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,51:0.62: 0.93:1.000:0.616 0/0/1/1:4:26,28:0.46:-0.72:1.000:0.988 0/0/1/1:4:25,29:0.48:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,22:0.56:-1.96:1.000:0.965 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,19:0.31:-0.72:1.000:0.970 0/0/0/1:4:42,20:0.29:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:32,18:0.32:-1.00:1.000:0.956 0/0/0/1:4:51,20:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,15:0.19: 0.31:0.998:1.000 0/0/0/1:4:32,17:0.31:-1.06:1.000:0.977 0/0/1/1:4:47,60:0.50: 2.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,54:0.58: 1.47:1.000:0.901 0/0/0/1:4:41,14:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,48:0.61: 0.65:1.000:0.695 0/0/1/1:4:31,43:0.52: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,31:0.45:-0.24:1.000:0.981 0/0/1/1:4:18,24:0.51:-1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,13:0.33:-2.02:1.000:0.923 0/0/0/1:4:35,23:0.35:-0.45:1.000:0.777 0/0/1/1:4:30,42:0.53: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:33,48:0.54: 1.13:1.000:0.989 0/1/1/1:4:19,38:0.63:-0.51:1.000:0.601 0/0/1/1:4:22,22:0.44:-1.41:1.000:0.972 0/1/1/1:4:19,39:0.64:-0.45:1.000:0.692 0/0/1/1:4:23,25:0.46:-1.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:15,27:0.60:-1.54:1.000:0.771 0/0/0:3:19,3:0.12:-2.92:1.000:0.967 0/0/0/1:4:52,17:0.22: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,40:0.58:-0.03:1.000:0.917 0/0/0/1:4:37,22:0.33:-0.38:1.000:0.918 0/0/1/1:4:28,32:0.47:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:35,21:0.33:-0.58:1.000:0.910 0/0/0/1:4:40,16:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,53:0.67: 0.79:1.000:0.930 0/0/1/1:4:19,36:0.62:-0.65:1.000:0.604 0/0/1/1:4:30,30:0.44:-0.31:1.000:0.972 0/0/0/1:4:46,13:0.20:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,45:0.46: 1.54:1.000:0.987 0/0/0/1:4:52,24:0.28: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,76:0.58: 3.94:1.000:0.927 0/0/0/1:4:27,13:0.29:-1.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:43,18:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,21:0.33:-0.51:1.000:0.933 0/0/1/1:4:30,51:0.59: 1.13:1.000:0.891 0/0/0/1:4:49,32:0.35: 1.13:1.000:0.789 0/0/1/1:4:32,25:0.39:-0.51:1.000:0.681 0/0/1/1:4:22,34:0.56:-0.58:1.000:0.973 0/0/1/1:4:36,34:0.43: 0.38:1.000:0.949 0/0/0/1:4:44,29:0.35: 0.58:1.000:0.770 0/0/1/1:4:23,37:0.57:-0.31:1.000:0.950 0/1/1/1:4:28,56:0.63: 1.34:1.000:0.601 0/0/0/0/1/1:6:42,20:0.29:-0.17:1.000:0.804 0/0/0/1:4:48,25:0.30: 0.58:1.000:0.982 0/1/1/1:4:16,38:0.68:-0.72:1.000:0.955 0/0/1/1:4:30,52:0.59: 1.20:1.000:0.858 0/0/0/1:4:44,17:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,23:0.30: 0.24:1.000:0.985 0/0/0/1:4:47,17:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,32:0.63:-1.13:1.000:0.601 0/0/1/1:4:31,55:0.60: 1.47:1.000:0.808 0/0/0/1:4:47,8:0.13:-0.65:1.000:0.899 0/0/0/0:4:62,1:0.01:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,21:0.30:-0.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:18,23:0.50:-1.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,49:0.68: 0.38:1.000:0.942 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,41:0.45: 1.06:1.000:0.984 0/0/0/1:4:49,17:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,22:0.29: 0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,25:0.23: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,24:0.30: 0.38:1.000:0.981 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.38:0.999:1.000 0/0/0/1:4:46,29:0.34: 0.72:1.000:0.849 0/0/1/1:4:34,59:0.59: 1.95:1.000:0.856 0/0/0/1:4:26,15:0.32:-1.61:1.000:0.941 0/0/0/0/1/1:6:63,33:0.30: 2.16:0.817:0.887 0/0/1/1:4:36,45:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,21:0.34:-0.65:1.000:0.878 0/0/1/1:4:17,32:0.62:-1.06:1.000:0.628 0/0/1/1:4:26,31:0.48:-0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,27:0.36: 0.17:1.000:0.718 0/0/0/1:4:50,23:0.28: 0.58:0.999:0.996 0/0/0/1:4:43,20:0.28:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,30:0.34: 0.99:1.000:0.888 0/0/0/1:4:28,13:0.28:-1.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,25:0.28: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,49:0.49: 1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,35:0.58:-0.58:1.000:0.917 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,53:0.61: 1.20:1.000:0.727 0/0/1/1:4:31,49:0.56: 1.06:1.000:0.962 0/0/1/1:4:23,31:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,44:0.61: 0.24:1.000:0.717 0/0/0/1:4:35,10:0.20:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,48:0.54: 1.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:21,39:0.61:-0.31:1.000:0.675 0/0/1/1:4:35,49:0.53: 1.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:53,19:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,18:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,46:0.52: 0.99:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,47:0.64: 0.38:1.000:0.677 0/0/1/1:4:36,48:0.51: 1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,22:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,15:0.20: 0.17:0.999:1.000 0/0/0/1:4:49,21:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,36:0.55:-0.31:1.000:0.983 0/0/1/1:4:24,28:0.48:-0.86:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,39:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,14:0.26:-1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,57:0.64: 1.41:1.000:0.664 0/0/0/1:4:30,13:0.27:-1.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,37:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,34:0.76:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,25:0.33: 0.24:1.000:0.936 0/0/0/1:4:37,18:0.29:-0.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:38,18:0.28:-0.58:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,43:0.64:-0.03:1.000:0.684 0/0/0/1:4:46,26:0.32: 0.51:1.000:0.953 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,33:0.56:-0.72:1.000:0.965 0/0/0/1:4:33,21:0.34:-0.72:1.000:0.835 0/0/0/1:4:44,30:0.36: 0.65:1.000:0.694 0/0/0/1:4:41,25:0.34: 0.10:1.000:0.893 0/0/0/1:4:42,14:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,23:0.35:-0.45:1.000:0.777 0/0/0/1:4:38,17:0.27:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,53:0.66: 0.86:1.000:0.874 0/0/1/1:4:33,37:0.47: 0.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:37,19:0.30:-0.58:1.000:0.984 0/0/1/1:4:23,43:0.61: 0.10:1.000:0.653 0/0/1/1:4:41,34:0.40: 0.72:1.000:0.809 0/0/1/1:4:33,38:0.47: 0.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,50:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,46:0.63: 0.31:1.000:0.601 0/0/1/1:4:23,28:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,59:0.61: 1.82:1.000:0.699 0/0/0/1:4:46,28:0.34: 0.65:1.000:0.895 0/0/1/1:4:36,55:0.55: 1.82:1.000:0.977 0/1/1/1:4:19,54:0.73: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,53:0.57: 1.47:1.000:0.952 0/0/0/1:4:46,17:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,68:0.59: 2.91:1.000:0.846 0/1/1/1:4:23,50:0.66: 0.58:1.000:0.845 0/0/0/1:4:32,17:0.31:-1.06:1.000:0.977 0/1/1/1:4:15,39:0.70:-0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,47:0.58: 0.72:1.000:0.908 0/0/0/1:4:50,32:0.35: 1.20:1.000:0.825 0/0/0/1:4:46,29:0.34: 0.72:1.000:0.849 0/0/1/1:4:28,44:0.56: 0.51:1.000:0.965 0/0/1/1:4:32,28:0.41:-0.31:1.000:0.886 0/0/1/1:4:27,46:0.59: 0.58:1.000:0.887 0/0/0/1:4:50,25:0.30: 0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:17,29:0.59:-1.27:1.000:0.885 0/0/1/1:4:29,29:0.44:-0.45:1.000:0.972 0/1/1/1:4:18,43:0.68:-0.24:1.000:0.959 0/0/0/1:4:37,21:0.32:-0.45:1.000:0.951 0/0/0/1:4:34,18:0.31:-0.86:1.000:0.978 0/0/0/1:4:37,17:0.28:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.06:0.999:1.000 0/0/0/1:4:37,12:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,37:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,37:0.54:-0.17:1.000:0.986 0/0/0/1:4:30,17:0.32:-1.20:1.000:0.952 0/0/1/1:4:26,41:0.56: 0.17:1.000:0.963 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,18:0.29:-0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,41:0.59: 0.03:1.000:0.883 0/0/1/1:4:23,41:0.60:-0.03:1.000:0.797 0/0/0/1:4:51,24:0.28: 0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,36:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,12:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,24:0.29: 0.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:46,23:0.30: 0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:50,14:0.19:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,30:0.60:-1.20:1.000:0.821 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 -chr3.1 71286896 chr3.1_071286896 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:0.998:. ./.:4:82,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.58:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:6:45,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:96,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.59:0.999:. ./.:4:84,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.07:1.000:. ./.:6:71,0:.: 0.97:0.897:. ./.:4:50,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:0.999:. ./.:4:69,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.18:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.32:1.000:. -chr3.1 71432239 chr3.1_071432239 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:145,3:.:-0.66:0.998:. ./.:4:154,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:359,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:147,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.35:1.000:. ./.:3:30,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:243,2:.: 0.82:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:377,0:.: 2.85:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:343,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.42:1.000:. ./.:6:147,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:151,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:124,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:118,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:103,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:257,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:104,1:.:-1.32:0.999:. ./.:4:222,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:202,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.53:1.000:. ./.:6:280,0:.: 1.36:0.897:. ./.:4:290,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:170,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:145,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:215,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:335,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:185,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:172,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:123,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:355,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:256,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:240,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:122,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:294,2:.: 1.60:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:202,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:68,3:.:-1.85:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:111,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:226,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:234,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:225,3:.: 0.56:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:362,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:161,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:186,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:176,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:148,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:122,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:111,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:114,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:193,2:.: 0.06:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.77:1.000:. -chr3.1 71605426 chr3.1_071605426 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:65,198:.: 0.17:1.000:. ./.:4:55,190:.:-0.16:1.000:. ./.:4:150,111:.: 0.14:1.000:. ./.:4:135,133:.: 0.26:1.000:. ./.:4:137,141:.: 0.45:1.000:. ./.:4:90,267:.: 1.90:1.000:. ./.:4:43,99:.:-2.05:1.000:. ./.:4:85,208:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.31:1.000:. ./.:4:33,84:.:-2.51:1.000:. ./.:4:39,82:.:-2.44:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.16:1.000:. ./.:4:73,178:.:-0.05:1.000:. ./.:4:150,142:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,186:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,226:.: 0.80:1.000:. ./.:4:83,219:.: 0.89:0.998:. ./.:4:0,266:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,295:.: 0.76:1.000:. ./.:4:79,170:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,38:.:-2.83:1.000:. ./.:4:69,174:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,186:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,180:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,76:.:-3.27:1.000:. ./.:4:60,184:.:-0.18:1.000:. ./.:4:72,223:.: 0.76:1.000:. ./.:4:70,185:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.67:1.000:. ./.:4:67,200:.: 0.25:1.000:. ./.:4:73,227:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,187:.: 0.26:1.000:. ./.:4:19,45:.:-3.49:1.000:. ./.:4:0,105:.:-2.73:1.000:. ./.:3:8,35:.:-3.87:1.000:. ./.:4:95,230:.: 1.31:1.000:. ./.:4:70,172:.:-0.21:1.000:. ./.:4:163,113:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.27:1.000:. ./.:4:88,221:.: 1.02:1.000:. ./.:4:75,184:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,224:.: 0.58:1.000:. ./.:4:97,209:.: 0.96:1.000:. ./.:4:59,158:.:-0.67:1.000:. ./.:4:173,172:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.32:1.000:. ./.:4:145,158:.: 0.91:1.000:. ./.:4:102,346:.: 3.57:1.000:. ./.:4:131,119:.:-0.07:1.000:. ./.:4:88,290:.: 2.29:1.000:. ./.:4:79,187:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,253:.: 1.59:1.000:. ./.:4:66,148:.:-0.73:1.000:. ./.:4:89,198:.: 0.61:1.000:. ./.:4:61,171:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.12:1.000:. ./.:4:137,118:.: 0.03:1.000:. ./.:4:99,264:.: 2.01:1.000:. ./.:4:1,237:.:-0.29:1.000:. ./.:6:123,127:.:-0.07:1.000:. ./.:4:146,116:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,199:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,238:.: 1.22:1.000:. ./.:4:162,116:.: 0.45:1.000:. ./.:4:171,171:.: 1.63:1.000:. ./.:4:65,178:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,131:.:-2.26:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,173:.: 0.01:1.000:. ./.:4:132,114:.:-0.14:1.000:. ./.:4:154,117:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,180:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,305:.: 0.94:1.000:. ./.:4:52,178:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.40:1.000:. ./.:4:86,185:.: 0.32:1.000:. ./.:4:85,210:.: 0.76:1.000:. ./.:4:81,198:.: 0.47:1.000:. ./.:4:161,145:.: 0.96:1.000:. ./.:4:49,147:.:-1.06:0.999:. ./.:4:85,186:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,286:.: 0.61:1.000:. ./.:4:59,179:.:-0.29:1.000:. ./.:6:74,237:.: 1.05:0.897:. ./.:4:70,199:.: 0.28:1.000:. ./.:4:102,81:.:-1.30:1.000:. ./.:4:53,165:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.38:1.000:. ./.:4:69,201:.: 0.30:1.000:. ./.:4:59,156:.:-0.71:0.999:. ./.:4:75,205:.: 0.48:1.000:. ./.:4:171,167:.: 1.55:1.000:. ./.:4:105,97:.:-0.95:1.000:. ./.:4:82,190:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.42:1.000:. ./.:4:62,176:.:-0.29:1.000:. ./.:4:79,173:.:-0.03:1.000:. ./.:4:66,213:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.26:1.000:. ./.:4:73,143:.:-0.69:1.000:. ./.:4:75,213:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.18:1.000:. ./.:4:50,178:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,199:.: 0.08:1.000:. ./.:4:150,146:.: 0.78:1.000:. ./.:4:81,232:.: 1.09:1.000:. ./.:4:1,277:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.88:1.000:. ./.:4:91,245:.: 1.51:1.000:. ./.:4:88,188:.: 0.41:0.999:. ./.:4:156,111:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.89:1.000:. ./.:4:146,72:.:-0.66:1.000:. ./.:4:54,156:.:-0.80:1.000:. ./.:4:122,127:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.42:1.000:. ./.:4:132,129:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.40:1.000:. ./.:4:70,208:.: 0.45:1.000:. ./.:4:96,202:.: 0.82:1.000:. ./.:4:73,152:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,203:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.89:1.000:. ./.:4:55,128:.:-1.30:1.000:. ./.:4:131,116:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,170:.:-0.47:1.000:. ./.:4:47,125:.:-1.50:1.000:. ./.:4:163,152:.: 1.13:1.000:. ./.:4:125,143:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,310:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.07:1.000:. ./.:4:175,139:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.67:1.000:. ./.:4:74,172:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.88:1.000:. ./.:4:54,141:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.26:1.000:. ./.:4:135,172:.: 0.98:1.000:. ./.:4:70,207:.: 0.43:1.000:. ./.:4:76,182:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,210:.: 0.74:1.000:. ./.:4:55,128:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,310:.: 1.04:1.000:. ./.:4:75,188:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,115:.:-2.55:1.000:. ./.:4:53,118:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.30:1.000:. ./.:4:66,187:.:-0.01:1.000:. ./.:4:92,229:.: 1.24:1.000:. ./.:4:67,207:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,195:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.04:1.000:. ./.:4:129,102:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,161:.:-0.71:1.000:. ./.:4:68,209:.: 0.43:1.000:. ./.:4:74,173:.:-0.12:1.000:. ./.:4:135,108:.:-0.20:1.000:. ./.:4:131,132:.: 0.17:1.000:. ./.:4:130,134:.: 0.19:1.000:. ./.:4:50,209:.: 0.10:0.999:. ./.:4:63,196:.: 0.10:1.000:. ./.:4:56,171:.:-0.49:1.000:. ./.:4:68,161:.:-0.45:1.000:. ./.:4:128,104:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.03:1.000:. ./.:4:117,138:.: 0.03:1.000:. ./.:4:119,98:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,306:.: 0.98:1.000:. ./.:4:78,212:.: 0.67:1.000:. ./.:4:76,189:.: 0.21:1.000:. ./.:4:74,191:.: 0.21:1.000:. ./.:4:161,135:.: 0.78:1.000:. ./.:4:79,253:.: 1.44:1.000:. ./.:4:88,198:.: 0.60:1.000:. ./.:4:55,163:.:-0.66:1.000:. ./.:4:71,197:.: 0.26:1.000:. -chr3.1 71758890 chr3.1_071758890 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:88,43:.: 0.31:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:109,38:.: 0.65:1.000:. ./.:4:182,54:.: 2.52:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:24,19:.:-1.54:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:152,58:.: 1.97:1.000:. ./.:4:156,47:.: 1.83:0.998:. ./.:4:90,47:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,15:.:-1.43:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:160,50:.: 1.97:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:28,16:.:-1.52:1.000:. ./.:4:114,59:.: 1.20:1.000:. ./.:4:271,0:.: 3.25:1.000:. ./.:4:111,41:.: 0.75:1.000:. ./.:4:105,51:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,57:.: 0.94:1.000:. ./.:4:113,61:.: 1.22:1.000:. ./.:4:146,44:.: 1.55:1.000:. ./.:4:26,8:.:-1.73:1.000:. ./.:4:21,11:.:-1.77:1.000:. ./.:3:2,7:.:-2.25:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:148,46:.: 1.64:1.000:. ./.:4:139,43:.: 1.38:1.000:. ./.:4:95,26:.: 0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:55,29:.:-0.67:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:89,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:86,67:.: 0.77:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:65,30:.:-0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:63,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:86,40:.: 0.21:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.65:1.000:. ./.:6:43,9:.:-1.35:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,31:.:-0.32:1.000:. ./.:4:78,21:.:-0.36:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:104,26:.: 0.29:1.000:. ./.:4:61,29:.:-0.55:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:70,34:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,12:.:-0.93:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:54,24:.:-0.80:1.000:. ./.:4:43,18:.:-1.16:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,17:.:-0.89:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.32:0.999:. ./.:4:93,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:101,28:.: 0.27:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:80,29:.:-0.15:0.897:. ./.:4:66,17:.:-0.70:1.000:. ./.:4:65,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:63,17:.:-0.76:1.000:. ./.:4:39,21:.:-1.18:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:74,20:.:-0.46:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:47,26:.:-0.91:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:107,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:52,10:.:-1.14:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:72,28:.:-0.34:1.000:. ./.:4:127,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:46,22:.:-1.01:1.000:. ./.:4:36,20:.:-1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:123,49:.: 1.17:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,17:.:-1.05:1.000:. ./.:4:140,65:.: 1.87:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:103,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:37,34:.:-0.95:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:37,24:.:-1.16:1.000:. ./.:4:69,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:36,29:.:-1.07:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:124,55:.: 1.32:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.84:1.000:. ./.:4:75,36:.:-0.11:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:68,18:.:-0.63:1.000:. ./.:4:42,16:.:-1.22:1.000:. ./.:4:146,38:.: 1.43:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:170,61:.: 2.41:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:81,18:.:-0.36:1.000:. ./.:4:26,15:.:-1.58:1.000:. ./.:4:114,39:.: 0.77:1.000:. ./.:4:53,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:132,41:.: 1.20:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:104,55:.: 0.90:1.000:. ./.:4:64,35:.:-0.36:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:46,21:.:-1.03:1.000:. ./.:4:182,53:.: 2.50:1.000:. ./.:4:115,35:.: 0.71:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:85,45:.: 0.29:1.000:. ./.:4:86,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:139,34:.: 1.20:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:87,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.42:1.000:. ./.:4:97,42:.: 0.48:1.000:. ./.:4:95,37:.: 0.33:1.000:. ./.:4:211,55:.: 3.15:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.95:0.999:. ./.:4:135,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:121,40:.: 0.94:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:95,27:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,34:.: 0.82:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,26:.: 0.10:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:99,36:.: 0.40:1.000:. ./.:4:139,39:.: 1.30:1.000:. ./.:4:144,33:.: 1.28:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:103,63:.: 1.05:1.000:. ./.:4:51,23:.:-0.89:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.14:1.000:. -chr3.1 71793071 chr3.1_071793071 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:23,44:.: 1.04:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,17:.:-0.01:1.000:. ./.:4:40,30:.: 1.20:1.000:. ./.:4:20,38:.: 0.57:1.000:. ./.:4:33,69:.: 2.88:1.000:. ./.:4:43,30:.: 1.36:1.000:. ./.:4:30,28:.: 0.57:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:3,5:.:-2.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,24:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,26:.: 1.57:1.000:. ./.:4:52,24:.: 1.52:0.998:. ./.:4:45,28:.: 1.36:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:41,20:.: 0.72:1.000:. ./.:4:15,8:.:-1.28:1.000:. ./.:4:26,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:16,57:.: 1.36:1.000:. ./.:4:25,22:.:-0.01:1.000:. ./.:4:15,8:.:-1.28:1.000:. ./.:4:56,29:.: 1.99:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:18,50:.: 1.09:1.000:. ./.:4:34,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,64:.: 2.94:1.000:. ./.:4:48,30:.: 1.62:1.000:. ./.:4:21,49:.: 1.20:1.000:. ./.:4:10,2:.:-1.86:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.65:1.000:. ./.:3:3,14:.:-1.59:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:26,44:.: 1.20:1.000:. ./.:4:27,36:.: 0.83:1.000:. ./.:4:38,23:.: 0.72:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:29,12:.:-0.33:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.86:1.000:. ./.:4:21,44:.: 0.94:1.000:. ./.:4:23,18:.:-0.33:1.000:. ./.:4:26,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:25,15:.:-0.38:1.000:. ./.:4:29,20:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,25:.:-0.80:1.000:. ./.:4:35,16:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:32,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,8:.:-1.28:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:14,40:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,24:.: 1.15:1.000:. ./.:4:18,23:.:-0.33:1.000:. ./.:4:50,23:.: 1.36:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:6:8,14:.:-1.33:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.54:1.000:. ./.:4:12,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:24,43:.: 1.04:1.000:. ./.:4:44,14:.: 0.57:1.000:. ./.:4:34,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:24,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,16:.:-0.54:1.000:. ./.:4:16,33:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,34:.: 0.78:1.000:. ./.:4:26,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:23,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:12,37:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,20:.: 0.04:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,15:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:6:31,27:.: 0.57:0.897:. ./.:4:24,21:.:-0.12:1.000:. ./.:4:11,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:7,23:.:-0.91:1.000:. ./.:4:18,13:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:26,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,9:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,25:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:36,16:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,8:.:-1.43:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,20:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,19:.: 0.25:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:22,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:23,34:.: 0.51:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:45,30:.: 1.46:1.000:. ./.:4:26,65:.: 2.31:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,16:.:-0.49:1.000:. ./.:4:52,28:.: 1.73:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.12:0.999:. ./.:4:22,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,4:.:-1.75:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,28:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:19,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:24,17:.:-0.33:1.000:. ./.:4:47,28:.: 1.46:1.000:. ./.:4:19,11:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,8:.:-1.17:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:18,9:.:-1.07:1.000:. ./.:4:9,22:.:-0.86:1.000:. ./.:4:46,25:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:16,7:.:-1.28:1.000:. ./.:4:20,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:36,26:.: 0.78:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:11,4:.:-1.70:1.000:. ./.:4:41,18:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,16:.:-1.17:1.000:. ./.:4:40,21:.: 0.72:1.000:. ./.:4:35,22:.: 0.51:1.000:. ./.:4:19,39:.: 0.57:1.000:. ./.:4:15,47:.: 0.78:1.000:. ./.:4:32,17:.: 0.09:1.000:. ./.:4:26,24:.: 0.15:1.000:. ./.:4:43,36:.: 1.67:1.000:. ./.:4:31,54:.: 1.99:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:24,46:.: 1.20:1.000:. ./.:4:49,20:.: 1.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:38,28:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:28,47:.: 1.46:1.000:. ./.:4:16,35:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,42:.: 1.04:1.000:. ./.:4:29,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:14,32:.:-0.07:1.000:. ./.:4:39,23:.: 0.78:1.000:. ./.:4:29,22:.: 0.20:1.000:. ./.:4:31,26:.: 0.51:0.999:. ./.:4:36,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:27,45:.: 1.30:1.000:. ./.:4:26,22:.: 0.04:1.000:. ./.:4:25,47:.: 1.30:1.000:. ./.:4:33,15:.: 0.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:29,20:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:29,22:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,46:.: 1.78:1.000:. ./.:4:31,25:.: 0.46:1.000:. ./.:4:42,27:.: 1.15:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:48,34:.: 1.83:1.000:. ./.:4:27,49:.: 1.52:1.000:. ./.:4:26,18:.:-0.17:1.000:. -chr3.1 72014851 chr3.1_072014851 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:289,253:.: 0.48:1.000:. ./.:4:348,107:.:-0.35:1.000:. ./.:4:397,99:.: 0.04:1.000:. ./.:4:420,113:.: 0.39:1.000:. ./.:4:296,282:.: 0.82:1.000:. ./.:4:258,234:.: 0.00:1.000:. ./.:4:302,88:.:-0.96:1.000:. ./.:4:405,118:.: 0.30:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:147,63:.:-2.67:1.000:. ./.:4:183,131:.:-1.68:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:465,118:.: 0.86:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:374,107:.:-0.10:1.000:. ./.:4:452,134:.: 0.89:0.998:. ./.:4:440,117:.: 0.62:1.000:. ./.:4:758,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:543,107:.: 1.50:1.000:. ./.:4:109,82:.:-2.85:1.000:. ./.:4:412,113:.: 0.32:1.000:. ./.:4:333,221:.: 0.59:1.000:. ./.:4:416,99:.: 0.22:1.000:. ./.:4:140,51:.:-2.85:1.000:. ./.:4:527,122:.: 1.49:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:248,182:.:-0.58:1.000:. ./.:4:464,112:.: 0.80:1.000:. ./.:4:277,219:.: 0.04:1.000:. ./.:4:465,101:.: 0.70:1.000:. ./.:4:231,216:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,66:.:-3.61:1.000:. ./.:4:246,41:.:-1.94:1.000:. ./.:3:83,25:.:-3.63:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:289,211:.: 0.08:1.000:. ./.:4:288,204:.: 0.00:1.000:. ./.:4:450,113:.: 0.68:1.000:. ./.:4:645,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:413,98:.: 0.18:1.000:. ./.:4:425,104:.: 0.35:1.000:. ./.:4:471,116:.: 0.90:1.000:. ./.:4:417,78:.: 0.03:1.000:. ./.:4:460,108:.: 0.72:1.000:. ./.:4:435,109:.: 0.50:1.000:. ./.:4:478,130:.: 1.10:1.000:. ./.:4:42,38:.:-3.90:1.000:. ./.:4:413,100:.: 0.20:1.000:. ./.:4:592,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:509,119:.: 1.29:1.000:. ./.:4:373,75:.:-0.41:1.000:. ./.:4:616,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:242,167:.:-0.78:1.000:. ./.:4:452,79:.: 0.37:1.000:. ./.:4:376,80:.:-0.34:1.000:. ./.:4:444,82:.: 0.33:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.16:1.000:. ./.:6:306,93:.:-0.88:1.000:. ./.:4:410,87:.: 0.05:1.000:. ./.:4:241,165:.:-0.81:1.000:. ./.:4:344,213:.: 0.62:1.000:. ./.:4:367,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:444,98:.: 0.48:1.000:. ./.:4:530,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:420,89:.: 0.16:1.000:. ./.:4:494,97:.: 0.94:1.000:. ./.:4:228,199:.:-0.61:1.000:. ./.:4:319,206:.: 0.32:1.000:. ./.:4:324,47:.:-1.14:1.000:. ./.:4:696,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:424,101:.: 0.32:1.000:. ./.:4:631,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:402,95:.: 0.05:1.000:. ./.:4:407,105:.: 0.19:1.000:. ./.:4:491,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:325,181:.: 0.14:1.000:. ./.:4:317,87:.:-0.83:0.999:. ./.:4:635,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:474,115:.: 0.92:1.000:. ./.:4:385,0:.:-1.01:1.000:. ./.:6:498,133:.: 1.32:0.897:. ./.:4:339,224:.: 0.68:1.000:. ./.:4:206,134:.:-1.44:1.000:. ./.:4:233,191:.:-0.64:1.000:. ./.:4:393,81:.:-0.17:1.000:. ./.:4:501,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:402,104:.: 0.14:1.000:. ./.:4:470,91:.: 0.66:1.000:. ./.:4:182,143:.:-1.58:1.000:. ./.:4:626,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:462,93:.: 0.60:1.000:. ./.:4:378,75:.:-0.37:1.000:. ./.:4:349,85:.:-0.55:1.000:. ./.:4:296,176:.:-0.19:1.000:. ./.:4:433,103:.: 0.42:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:625,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:380,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:386,107:.: 0.01:1.000:. ./.:4:334,80:.:-0.73:1.000:. ./.:4:249,192:.:-0.48:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:388,113:.: 0.09:1.000:. ./.:4:315,273:.: 0.91:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:430,99:.: 0.35:1.000:. ./.:4:515,129:.: 1.44:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.63:0.999:. ./.:4:453,85:.: 0.44:1.000:. ./.:4:292,35:.:-1.56:1.000:. ./.:4:318,98:.:-0.72:1.000:. ./.:4:286,151:.:-0.52:1.000:. ./.:4:232,159:.:-0.95:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:339,88:.:-0.61:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:423,108:.: 0.37:1.000:. ./.:4:442,95:.: 0.43:1.000:. ./.:4:391,115:.: 0.14:1.000:. ./.:4:387,95:.:-0.09:1.000:. ./.:4:466,82:.: 0.53:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:354,59:.:-0.74:1.000:. ./.:4:239,188:.:-0.61:1.000:. ./.:4:354,102:.:-0.34:1.000:. ./.:4:342,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:390,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:348,61:.:-0.78:1.000:. ./.:4:487,112:.: 1.02:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:369,84:.:-0.37:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:474,108:.: 0.86:1.000:. ./.:4:365,84:.:-0.40:1.000:. ./.:4:358,100:.:-0.32:1.000:. ./.:4:191,135:.:-1.57:1.000:. ./.:4:472,128:.: 1.03:1.000:. ./.:4:561,142:.: 2.00:1.000:. ./.:4:297,199:.: 0.04:1.000:. ./.:4:290,236:.: 0.33:1.000:. ./.:4:468,120:.: 0.91:1.000:. ./.:4:368,81:.:-0.40:1.000:. ./.:4:450,138:.: 0.91:1.000:. ./.:4:224,173:.:-0.90:1.000:. ./.:4:252,2:.:-2.25:1.000:. ./.:4:201,159:.:-1.25:1.000:. ./.:4:471,122:.: 0.96:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:655,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:447,117:.: 0.68:1.000:. ./.:4:325,77:.:-0.85:1.000:. ./.:4:607,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:231,215:.:-0.43:1.000:. ./.:4:214,176:.:-0.96:1.000:. ./.:4:254,219:.:-0.18:1.000:. ./.:4:390,104:.: 0.02:1.000:. ./.:4:261,143:.:-0.83:1.000:. ./.:4:413,105:.: 0.25:1.000:. ./.:4:323,82:.:-0.82:1.000:. ./.:4:356,101:.:-0.33:0.999:. ./.:4:487,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:259,220:.:-0.12:1.000:. ./.:4:325,81:.:-0.81:1.000:. ./.:4:184,168:.:-1.32:1.000:. ./.:4:420,92:.: 0.19:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:363,68:.:-0.57:1.000:. ./.:4:333,82:.:-0.73:1.000:. ./.:4:604,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:503,129:.: 1.33:1.000:. ./.:4:290,203:.: 0.01:1.000:. ./.:4:379,96:.:-0.16:1.000:. ./.:4:473,108:.: 0.85:1.000:. ./.:4:696,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:470,143:.: 1.15:1.000:. ./.:4:238,191:.:-0.59:1.000:. ./.:4:385,112:.: 0.05:1.000:. -chr3.1 72122893 chr3.1_072122893 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:100,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.49:0.998:. ./.:4:72,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.52:1.000:. ./.:6:65,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:132,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:125,2:.: 1.06:1.000:. ./.:6:95,0:.: 0.10:0.897:. ./.:4:80,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.61:0.999:. ./.:4:96,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:128,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:166,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:88,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.62:0.999:. ./.:4:93,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.91:1.000:. -chr3.1 72363790 chr3.1_072363790 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,138:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,108:.:-0.85:1.000:. ./.:4:91,73:.: 0.02:1.000:. ./.:4:70,78:.:-0.38:1.000:. ./.:4:115,109:.: 1.51:1.000:. ./.:4:48,163:.: 1.19:1.000:. ./.:4:42,101:.:-0.50:1.000:. ./.:4:43,139:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.08:1.000:. ./.:4:6,41:.:-2.89:1.000:. ./.:4:28,24:.:-2.76:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.15:1.000:. ./.:4:31,122:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,103:.: 0.44:1.000:. ./.:4:29,131:.:-0.08:1.000:. ./.:4:30,129:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,146:.: 0.72:0.998:. ./.:4:0,236:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,207:.: 1.09:1.000:. ./.:4:39,154:.: 0.74:1.000:. ./.:4:35,26:.:-2.54:1.000:. ./.:4:41,129:.: 0.17:1.000:. ./.:4:40,137:.: 0.34:1.000:. ./.:4:34,129:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,30:.:-3.31:1.000:. ./.:4:54,165:.: 1.39:1.000:. ./.:4:25,122:.:-0.40:1.000:. ./.:4:38,135:.: 0.24:1.000:. ./.:4:39,150:.: 0.64:1.000:. ./.:4:31,140:.: 0.19:1.000:. ./.:4:46,157:.: 0.99:1.000:. ./.:4:35,91:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,29:.:-3.14:1.000:. ./.:4:0,62:.:-2.52:1.000:. ./.:3:3,11:.:-3.71:1.000:. ./.:4:35,142:.: 0.34:1.000:. ./.:4:39,131:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,102:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.17:1.000:. ./.:4:48,124:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,120:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,153:.: 1.44:1.000:. ./.:4:3,212:.: 1.29:1.000:. ./.:4:47,98:.:-0.45:1.000:. ./.:4:89,89:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.05:1.000:. ./.:4:88,102:.: 0.67:1.000:. ./.:4:61,164:.: 1.54:1.000:. ./.:4:112,93:.: 1.04:1.000:. ./.:4:56,156:.: 1.21:1.000:. ./.:4:48,126:.: 0.27:1.000:. ./.:4:69,146:.: 1.29:1.000:. ./.:4:58,140:.: 0.87:1.000:. ./.:4:59,166:.: 1.54:1.000:. ./.:4:40,117:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,219:.: 1.39:1.000:. ./.:4:88,94:.: 0.47:1.000:. ./.:4:61,108:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,164:.: 0.07:1.000:. ./.:6:106,56:.:-0.03:1.000:. ./.:4:98,47:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,129:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,137:.: 1.29:1.000:. ./.:4:92,69:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,104:.: 0.57:1.000:. ./.:4:60,140:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,96:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,127:.: 0.87:1.000:. ./.:4:83,89:.: 0.22:1.000:. ./.:4:122,92:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,232:.: 1.71:1.000:. ./.:4:42,140:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,120:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,87:.:-0.73:1.000:. ./.:4:47,144:.: 0.69:1.000:. ./.:4:111,83:.: 0.77:1.000:. ./.:4:29,128:.:-0.15:0.999:. ./.:4:62,119:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,117:.:-0.23:1.000:. ./.:6:61,177:.: 1.86:0.897:. ./.:4:66,146:.: 1.21:1.000:. ./.:4:89,87:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,102:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.73:1.000:. ./.:4:50,110:.:-0.08:1.000:. ./.:4:52,118:.: 0.17:0.999:. ./.:4:53,130:.: 0.49:1.000:. ./.:4:115,88:.: 0.99:1.000:. ./.:4:76,66:.:-0.53:1.000:. ./.:4:55,128:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,112:.:-1.27:1.000:. ./.:4:55,111:.: 0.07:1.000:. ./.:4:66,102:.: 0.12:1.000:. ./.:4:40,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,92:.:-1.77:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,92:.:-0.92:1.000:. ./.:4:53,113:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,115:.:-1.20:1.000:. ./.:4:55,97:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,120:.: 0.24:1.000:. ./.:4:62,102:.: 0.02:1.000:. ./.:4:40,183:.: 1.49:1.000:. ./.:4:5,201:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.55:1.000:. ./.:4:46,173:.: 1.39:1.000:. ./.:4:65,94:.:-0.10:0.999:. ./.:4:100,86:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.25:1.000:. ./.:4:115,36:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,98:.:-0.38:1.000:. ./.:4:101,69:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.97:1.000:. ./.:4:98,86:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,100:.:-1.57:1.000:. ./.:4:53,123:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,120:.:-0.58:1.000:. ./.:4:48,120:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.74:1.000:. ./.:4:40,94:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,136:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.80:1.000:. ./.:4:32,105:.:-0.65:1.000:. ./.:4:101,53:.:-0.23:1.000:. ./.:4:18,105:.:-1.00:1.000:. ./.:4:44,76:.:-1.07:1.000:. ./.:4:80,58:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,84:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,206:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.18:1.000:. ./.:4:94,52:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.65:1.000:. ./.:4:54,118:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.17:1.000:. ./.:4:2,142:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.60:1.000:. ./.:4:42,72:.:-1.22:1.000:. ./.:4:1,225:.: 1.56:1.000:. ./.:4:94,109:.: 0.99:1.000:. ./.:4:39,145:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,130:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,183:.: 1.44:1.000:. ./.:4:45,111:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.44:1.000:. ./.:4:23,125:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,38:.:-3.11:1.000:. ./.:4:21,100:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1,246:.: 2.08:1.000:. ./.:4:46,144:.: 0.67:1.000:. ./.:4:45,141:.: 0.57:1.000:. ./.:4:48,124:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,183:.: 0.49:1.000:. ./.:4:57,73:.:-0.83:1.000:. ./.:4:48,127:.: 0.29:1.000:. ./.:4:38,103:.:-0.55:1.000:. ./.:4:36,131:.: 0.09:1.000:. ./.:4:73,77:.:-0.33:1.000:. ./.:4:78,87:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,75:.:-0.73:1.000:. ./.:4:31,105:.:-0.68:0.999:. ./.:4:45,106:.:-0.30:1.000:. ./.:4:30,106:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,108:.:-0.75:1.000:. ./.:4:65,90:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,164:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,81:.:-0.45:1.000:. ./.:4:79,66:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,230:.: 1.66:1.000:. ./.:4:40,150:.: 0.67:1.000:. ./.:4:39,133:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,113:.:-0.53:1.000:. ./.:4:71,106:.: 0.34:1.000:. ./.:4:35,158:.: 0.74:1.000:. ./.:4:38,154:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,108:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,130:.: 0.17:1.000:. -chr3.1 72611357 chr3.1_072611357 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:202,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.30:0.998:. ./.:4:123,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:137,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.41:1.000:. ./.:3:43,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.55:1.000:. ./.:6:101,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:134,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.45:0.999:. ./.:4:207,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.18:1.000:. ./.:6:156,0:.: 0.24:0.897:. ./.:4:182,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.09:0.999:. ./.:4:163,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:104,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:146,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:202,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:132,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:224,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:190,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:134,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:132,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:230,1:.: 2.35:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.06:1.000:. -chr3.1 72804612 chr3.1_072804612 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:238,23:.: 1.04:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:163,18:.:-0.36:1.000:. ./.:4:190,14:.: 0.04:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:224,16:.: 0.67:1.000:. ./.:4:101,21:.:-1.39:1.000:. ./.:4:119,39:.:-0.76:1.000:. ./.:4:152,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,54:.:-1.99:1.000:. ./.:4:75,16:.:-1.94:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:180,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:229,14:.: 0.72:1.000:. ./.:4:198,18:.: 0.25:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.81:0.998:. ./.:4:249,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:197,47:.: 0.74:1.000:. ./.:4:156,40:.:-0.10:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:120,40:.:-0.73:1.000:. ./.:4:237,24:.: 1.04:1.000:. ./.:4:129,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:36,12:.:-2.69:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:188,17:.: 0.06:1.000:. ./.:4:206,17:.: 0.37:1.000:. ./.:4:268,30:.: 1.68:1.000:. ./.:4:195,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:137,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:46,31:.:-2.18:1.000:. ./.:4:120,21:.:-1.06:1.000:. ./.:3:19,1:.:-3.18:1.000:. ./.:4:186,21:.: 0.09:1.000:. ./.:4:206,12:.: 0.29:1.000:. ./.:4:295,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:188,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:183,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:107,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:186,28:.: 0.22:1.000:. ./.:4:93,48:.:-1.06:1.000:. ./.:4:211,23:.: 0.57:1.000:. ./.:4:188,25:.: 0.20:1.000:. ./.:4:262,23:.: 1.46:1.000:. ./.:4:37,17:.:-2.58:1.000:. ./.:4:113,22:.:-1.17:1.000:. ./.:4:95,13:.:-1.64:1.000:. ./.:4:150,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:147,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:190,30:.: 0.32:1.000:. ./.:4:169,21:.:-0.20:1.000:. ./.:4:130,25:.:-0.82:1.000:. ./.:4:163,14:.:-0.43:1.000:. ./.:4:81,32:.:-1.55:1.000:. ./.:4:93,40:.:-1.20:1.000:. ./.:6:153,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:204,28:.: 0.53:1.000:. ./.:4:89,28:.:-1.48:1.000:. ./.:4:217,21:.: 0.64:1.000:. ./.:4:149,22:.:-0.54:1.000:. ./.:4:178,16:.:-0.13:1.000:. ./.:4:169,17:.:-0.27:1.000:. ./.:4:98,43:.:-1.06:1.000:. ./.:4:159,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:139,18:.:-0.78:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:165,40:.: 0.06:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:97,43:.:-1.08:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:181,21:.: 0.01:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:187,28:.: 0.23:1.000:. ./.:4:224,23:.: 0.79:1.000:. ./.:4:166,17:.:-0.33:1.000:. ./.:6:173,21:.:-0.13:0.897:. ./.:4:205,28:.: 0.55:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:184,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:162,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:161,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:148,18:.:-0.62:0.999:. ./.:4:202,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:208,19:.: 0.44:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:209,33:.: 0.71:1.000:. ./.:4:154,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:197,17:.: 0.22:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:211,30:.: 0.69:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.61:1.000:. ./.:4:90,50:.:-1.08:1.000:. ./.:4:133,61:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:126,63:.:-0.22:1.000:. ./.:4:149,28:.:-0.43:1.000:. ./.:4:160,21:.:-0.36:1.000:. ./.:4:130,15:.:-0.99:1.000:. ./.:4:179,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:270,40:.: 1.89:1.000:. ./.:4:191,41:.: 0.53:1.000:. ./.:4:160,27:.:-0.26:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:201,27:.: 0.46:0.999:. ./.:4:171,30:.:-0.01:1.000:. ./.:4:82,9:.:-1.94:1.000:. ./.:4:128,28:.:-0.80:1.000:. ./.:4:195,18:.: 0.20:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:140,58:.:-0.06:1.000:. ./.:4:139,23:.:-0.69:1.000:. ./.:4:112,42:.:-0.83:1.000:. ./.:4:182,21:.: 0.02:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:173,26:.:-0.05:1.000:. ./.:4:191,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:88,26:.:-1.53:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:111,17:.:-1.29:1.000:. ./.:4:153,15:.:-0.59:1.000:. ./.:4:158,19:.:-0.43:1.000:. ./.:4:272,30:.: 1.75:1.000:. ./.:4:118,38:.:-0.80:1.000:. ./.:4:189,27:.: 0.25:1.000:. ./.:4:115,34:.:-0.92:1.000:. ./.:4:172,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:167,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:176,22:.:-0.06:1.000:. ./.:4:218,12:.: 0.50:1.000:. ./.:4:114,20:.:-1.18:1.000:. ./.:4:311,29:.: 2.42:1.000:. ./.:4:270,35:.: 1.81:1.000:. ./.:4:198,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:189,24:.: 0.20:1.000:. ./.:4:156,32:.:-0.24:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:272,31:.: 1.77:1.000:. ./.:4:224,28:.: 0.88:1.000:. ./.:4:23,44:.:-2.36:1.000:. ./.:4:195,15:.: 0.15:1.000:. ./.:4:208,12:.: 0.32:1.000:. ./.:4:233,20:.: 0.90:1.000:. ./.:4:264,26:.: 1.54:1.000:. ./.:4:155,43:.:-0.06:1.000:. ./.:4:151,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:134,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:264,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:152,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:166,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:241,17:.: 0.98:1.000:. ./.:4:216,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.84:0.999:. ./.:4:178,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:123,27:.:-0.90:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:149,27:.:-0.45:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,16:.:-1.13:1.000:. ./.:4:181,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:166,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:330,1:.: 2.26:1.000:. ./.:4:199,14:.: 0.20:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:221,17:.: 0.64:1.000:. ./.:4:270,26:.: 1.65:1.000:. ./.:4:356,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:220,27:.: 0.79:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.88:1.000:. -chr3.1 72858585 chr3.1_072858585 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:86,279:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,298:.:-0.71:1.000:. ./.:4:1,326:.:-0.29:1.000:. ./.:4:109,317:.: 1.14:1.000:. ./.:4:103,346:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,298:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,373:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,192:.:-2.25:1.000:. ./.:4:50,132:.:-2.39:1.000:. ./.:4:0,361:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,334:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,328:.:-0.28:1.000:. ./.:4:113,257:.: 0.33:1.000:. ./.:4:86,286:.: 0.36:0.998:. ./.:4:0,409:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,493:.: 2.11:1.000:. ./.:4:0,421:.: 1.07:1.000:. ./.:4:30,134:.:-2.66:1.000:. ./.:4:0,320:.:-0.39:1.000:. ./.:4:116,269:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.74:1.000:. ./.:4:28,114:.:-2.97:1.000:. ./.:4:94,297:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.17:1.000:. ./.:4:87,237:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,324:.: 1.00:1.000:. ./.:4:94,326:.: 1.06:1.000:. ./.:4:122,291:.: 0.95:1.000:. ./.:4:68,212:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,65:.:-3.63:1.000:. ./.:4:39,147:.:-2.34:1.000:. ./.:3:12,51:.:-4.12:1.000:. ./.:4:0,337:.:-0.15:1.000:. ./.:4:95,258:.: 0.08:1.000:. ./.:4:91,268:.: 0.17:1.000:. ./.:4:105,258:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,380:.: 0.48:1.000:. ./.:4:93,248:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,355:.: 0.11:1.000:. ./.:4:94,296:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,325:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.81:1.000:. ./.:4:90,250:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,414:.: 0.97:1.000:. ./.:4:103,370:.: 1.82:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,343:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,436:.: 1.29:1.000:. ./.:4:84,301:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,391:.: 0.65:1.000:. ./.:4:103,237:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,283:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,348:.: 0.01:1.000:. ./.:6:22,320:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,382:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,343:.:-0.06:1.000:. ./.:4:107,300:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,335:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,342:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,251:.:-1.39:1.000:. ./.:4:86,258:.:-0.05:1.000:. ./.:4:80,295:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.76:1.000:. ./.:4:141,329:.: 1.78:1.000:. ./.:4:55,218:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,416:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,379:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.16:1.000:. ./.:4:84,244:.:-0.28:1.000:. ./.:4:81,265:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.39:1.000:. ./.:4:107,341:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.76:0.999:. ./.:4:0,434:.: 1.26:1.000:. ./.:4:118,343:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,333:.:-0.21:1.000:. ./.:6:95,352:.: 1.45:0.897:. ./.:4:103,271:.: 0.39:1.000:. ./.:4:75,189:.:-1.21:1.000:. ./.:4:90,211:.:-0.67:1.000:. ./.:4:88,256:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,340:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,335:.:-0.18:0.999:. ./.:4:98,249:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,450:.: 1.49:1.000:. ./.:4:41,211:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,424:.: 1.11:1.000:. ./.:4:112,294:.: 0.85:1.000:. ./.:4:86,240:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,293:.:-0.79:1.000:. ./.:4:94,332:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,254:.:-1.35:1.000:. ./.:4:1,392:.: 0.66:1.000:. ./.:4:75,200:.:-1.05:1.000:. ./.:4:92,273:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.29:1.000:. ./.:4:119,386:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.35:1.000:. ./.:4:78,248:.:-0.31:1.000:. ./.:4:123,305:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.59:0.999:. ./.:4:0,370:.: 0.33:1.000:. ./.:4:80,207:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.63:1.000:. ./.:4:96,269:.: 0.26:1.000:. ./.:4:76,214:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,338:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,387:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.10:1.000:. ./.:4:84,248:.:-0.22:1.000:. ./.:4:107,293:.: 0.77:1.000:. ./.:4:106,245:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,251:.:-0.05:1.000:. ./.:4:97,308:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,355:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.92:1.000:. ./.:4:62,176:.:-1.58:1.000:. ./.:4:94,284:.: 0.45:1.000:. ./.:4:106,259:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,232:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,356:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.83:1.000:. ./.:4:130,356:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,337:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,314:.:-0.48:1.000:. ./.:4:95,291:.: 0.56:1.000:. ./.:4:83,282:.: 0.26:1.000:. ./.:4:78,236:.:-0.48:1.000:. ./.:4:74,225:.:-0.70:1.000:. ./.:4:132,328:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,440:.: 1.35:1.000:. ./.:4:93,259:.: 0.07:1.000:. ./.:4:78,255:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,478:.: 1.90:1.000:. ./.:4:99,254:.: 0.08:1.000:. ./.:4:97,339:.: 1.29:1.000:. ./.:4:88,227:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,140:.:-2.99:1.000:. ./.:4:93,232:.:-0.32:1.000:. ./.:4:103,284:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,401:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,409:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,420:.: 1.06:1.000:. ./.:4:76,225:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,286:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,209:.:-0.92:1.000:. ./.:4:67,223:.:-0.83:1.000:. ./.:4:89,268:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,258:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,344:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,326:.:-0.31:0.999:. ./.:4:0,312:.:-0.51:1.000:. ./.:4:92,251:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,269:.:-1.13:1.000:. ./.:4:76,227:.:-0.64:1.000:. ./.:4:77,232:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.55:1.000:. ./.:4:78,198:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1,441:.: 1.37:1.000:. ./.:4:112,318:.: 1.20:1.000:. ./.:4:105,260:.: 0.26:1.000:. ./.:4:76,261:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,368:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,441:.: 1.36:1.000:. ./.:4:110,329:.: 1.33:1.000:. ./.:4:80,250:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,332:.:-0.22:1.000:. -chr3.1 73188967 chr3.1_073188967 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:162,17:.: 0.63:1.000:. ./.:4:133,4:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:150,26:.: 0.58:1.000:. ./.:4:184,33:.: 1.36:1.000:. ./.:4:63,45:.:-0.72:1.000:. ./.:4:98,12:.:-0.68:1.000:. ./.:4:113,13:.:-0.38:1.000:. ./.:4:103,15:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,31:.:-0.95:1.000:. ./.:4:69,13:.:-1.22:1.000:. ./.:4:101,21:.:-0.45:1.000:. ./.:4:117,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:66,23:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,25:.:-1.50:1.000:. ./.:4:86,23:.:-0.70:0.998:. ./.:4:217,5:.: 1.45:1.000:. ./.:4:166,28:.: 0.92:1.000:. ./.:4:161,21:.: 0.69:1.000:. ./.:4:75,14:.:-1.08:1.000:. ./.:4:147,31:.: 0.61:1.000:. ./.:4:178,27:.: 1.13:1.000:. ./.:4:70,28:.:-0.91:1.000:. ./.:4:19,24:.:-1.96:1.000:. ./.:4:74,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:54,27:.:-1.24:1.000:. ./.:4:56,22:.:-1.29:1.000:. ./.:4:182,31:.: 1.28:1.000:. ./.:4:117,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:147,13:.: 0.27:1.000:. ./.:4:83,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:35,11:.:-1.90:1.000:. ./.:4:66,16:.:-1.22:1.000:. ./.:3:26,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:56,30:.:-1.14:1.000:. ./.:4:137,19:.: 0.19:1.000:. ./.:4:120,24:.:-0.03:1.000:. ./.:4:92,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:65,19:.:-1.18:1.000:. ./.:4:86,44:.:-0.30:1.000:. ./.:4:209,24:.: 1.66:1.000:. ./.:4:107,41:.: 0.04:1.000:. ./.:4:158,21:.: 0.63:1.000:. ./.:4:203,26:.: 1.59:1.000:. ./.:4:199,26:.: 1.51:1.000:. ./.:4:201,34:.: 1.70:1.000:. ./.:4:346,17:.: 4.14:1.000:. ./.:4:175,20:.: 0.94:1.000:. ./.:4:221,13:.: 1.68:1.000:. ./.:4:79,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:208,17:.: 1.51:1.000:. ./.:4:100,31:.:-0.28:1.000:. ./.:4:192,27:.: 1.40:1.000:. ./.:4:140,22:.: 0.31:1.000:. ./.:4:200,16:.: 1.34:1.000:. ./.:4:142,27:.: 0.44:1.000:. ./.:4:201,23:.: 1.49:1.000:. ./.:4:71,22:.:-1.01:1.000:. ./.:6:138,29:.: 0.40:1.000:. ./.:4:163,35:.: 1.00:1.000:. ./.:4:90,42:.:-0.26:1.000:. ./.:4:219,39:.: 2.14:1.000:. ./.:4:68,24:.:-1.03:1.000:. ./.:4:195,33:.: 1.57:1.000:. ./.:4:157,22:.: 0.63:1.000:. ./.:4:60,27:.:-1.12:1.000:. ./.:4:73,43:.:-0.57:1.000:. ./.:4:103,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:195,7:.: 1.07:1.000:. ./.:4:206,42:.: 1.95:1.000:. ./.:4:70,19:.:-1.08:1.000:. ./.:4:283,9:.: 2.79:1.000:. ./.:4:158,22:.: 0.65:1.000:. ./.:4:212,16:.: 1.57:1.000:. ./.:4:83,29:.:-0.64:1.000:. ./.:4:77,31:.:-0.72:1.000:. ./.:4:91,36:.:-0.36:1.000:. ./.:4:75,42:.:-0.55:1.000:. ./.:4:178,18:.: 0.96:1.000:. ./.:4:201,12:.: 1.28:0.999:. ./.:4:106,35:.:-0.09:1.000:. ./.:4:94,47:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,44:.:-0.47:1.000:. ./.:6:216,31:.: 1.93:0.897:. ./.:4:180,32:.: 1.26:1.000:. ./.:4:119,23:.:-0.07:1.000:. ./.:4:159,25:.: 0.73:1.000:. ./.:4:67,30:.:-0.93:1.000:. ./.:4:71,39:.:-0.68:1.000:. ./.:4:105,34:.:-0.13:0.999:. ./.:4:79,28:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,56:.:-0.05:1.000:. ./.:4:131,10:.:-0.09:1.000:. ./.:4:143,31:.: 0.54:1.000:. ./.:4:103,29:.:-0.26:1.000:. ./.:4:66,42:.:-0.72:1.000:. ./.:4:188,7:.: 0.94:1.000:. ./.:4:204,33:.: 1.74:1.000:. ./.:4:135,16:.: 0.10:1.000:. ./.:4:100,39:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,43:.:-0.09:1.000:. ./.:4:86,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:147,29:.: 0.58:1.000:. ./.:4:160,32:.: 0.88:1.000:. ./.:4:151,28:.: 0.63:1.000:. ./.:4:171,26:.: 0.98:1.000:. ./.:4:64,30:.:-0.99:1.000:. ./.:4:202,39:.: 1.82:1.000:. ./.:4:61,32:.:-1.01:1.000:. ./.:4:165,16:.: 0.67:1.000:. ./.:4:150,21:.: 0.48:1.000:. ./.:4:89,49:.:-0.15:0.999:. ./.:4:178,24:.: 1.07:1.000:. ./.:4:91,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:103,29:.:-0.26:1.000:. ./.:4:161,30:.: 0.86:1.000:. ./.:4:90,23:.:-0.63:1.000:. ./.:4:77,34:.:-0.66:1.000:. ./.:4:139,22:.: 0.29:1.000:. ./.:4:141,19:.: 0.27:1.000:. ./.:4:89,37:.:-0.38:1.000:. ./.:4:88,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:94,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:176,33:.: 1.21:1.000:. ./.:4:89,45:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,34:.:-0.63:1.000:. ./.:4:143,19:.: 0.31:1.000:. ./.:4:44,30:.:-1.37:1.000:. ./.:4:62,39:.:-0.85:1.000:. ./.:4:183,26:.: 1.21:1.000:. ./.:4:45,25:.:-1.45:1.000:. ./.:4:113,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:192,13:.: 1.13:1.000:. ./.:4:153,18:.: 0.48:1.000:. ./.:4:79,30:.:-0.70:1.000:. ./.:4:120,34:.: 0.16:1.000:. ./.:4:72,37:.:-0.70:1.000:. ./.:4:85,45:.:-0.30:1.000:. ./.:4:86,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:101,38:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:129,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,38:.:-0.47:1.000:. ./.:4:94,44:.:-0.15:1.000:. ./.:4:208,23:.: 1.63:1.000:. ./.:4:107,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:146,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:146,11:.: 0.21:1.000:. ./.:4:84,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:68,27:.:-0.97:1.000:. ./.:4:55,32:.:-1.12:1.000:. ./.:4:30,21:.:-1.81:1.000:. ./.:4:94,23:.:-0.55:1.000:. ./.:4:185,22:.: 1.17:1.000:. ./.:4:82,28:.:-0.68:1.000:. ./.:4:72,46:.:-0.53:1.000:. ./.:4:130,16:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,27:.: 0.52:1.000:. ./.:4:44,28:.:-1.41:1.000:. ./.:4:111,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:58,18:.:-1.33:1.000:. ./.:4:152,24:.: 0.58:1.000:. ./.:4:157,13:.: 0.46:1.000:. ./.:4:128,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,24:.:-1.27:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.45:0.999:. ./.:4:71,35:.:-0.76:1.000:. ./.:4:72,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,28:.:-0.97:1.000:. ./.:4:102,17:.:-0.51:1.000:. ./.:4:90,30:.:-0.49:1.000:. ./.:4:56,23:.:-1.27:1.000:. ./.:4:75,17:.:-1.03:1.000:. ./.:4:60,24:.:-1.18:1.000:. ./.:4:125,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:139,20:.: 0.25:1.000:. ./.:4:104,20:.:-0.42:1.000:. ./.:4:89,8:.:-0.93:1.000:. ./.:4:150,20:.: 0.46:1.000:. ./.:4:81,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:85,42:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,22:.:-0.70:1.000:. ./.:4:218,9:.: 1.55:1.000:. -chr3.1 73400352 chr3.1_073400352 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:50,162:0.75: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,82:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,147:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,142:0.74: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,181:0.81: 1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,147:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,82:0.60:-0.56:1.000:0.790 0/0/1/1:4:75,102:0.55: 0.45:1.000:0.977 0/0/0/1:4:125,30:0.22:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,25:0.70:-2.73:1.000:0.983 0/1/1/1:4:6,16:0.71:-3.03:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,112:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,87:0.54:-0.06:1.000:0.987 0/1/1/1:4:40,152:0.78: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,83:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:51,159:0.74: 1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,175:0.76: 1.53:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,204:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,54:0.27: 1.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,120:0.50: 1.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,27:0.86:-2.82:1.000:0.956 0/0/1/1:4:69,96:0.56: 0.18:1.000:0.969 0/0/1/1:4:83,115:0.56: 0.92:1.000:0.970 0/0/1/1:4:65,93:0.57: 0.02:1.000:0.956 0/1/1/1:4:2,15:0.88:-3.14:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,101:0.56: 0.38:1.000:0.971 0/1/1/1:4:45,143:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,119:0.51: 1.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,150:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,142:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,84:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:2,1:0.34:-3.45:1.000:0.869 0/0/1/1:4:15,19:0.53:-2.76:1.000:0.990 0/1/1:3:3,12:0.79:-3.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,140:0.72: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,98:0.58: 0.14:1.000:0.917 0/1/1/1:4:50,147:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,84:0.47: 0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,144:0.76: 0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,53:0.34: 0.02:1.000:0.857 0/0/1/1:4:74,100:0.55: 0.38:1.000:0.978 0/0/1/1:4:65,71:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,102:0.63: 0.02:1.000:0.504 0/0/1/1:4:72,96:0.55: 0.25:1.000:0.982 0/1/1/1:4:58,180:0.74: 1.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,41:0.81:-2.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,131:0.78: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,44:0.45:-1.41:1.000:0.982 0/0/1/1:4:57,66:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,102:0.47: 1.10:1.000:0.994 0/1/1/1:4:28,112:0.79:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,80:0.45: 0.29:1.000:0.984 0/1/1/1:4:45,121:0.71: 0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,79:0.53:-0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:35,118:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,90:0.56:-0.04:1.000:0.971 0/0/1/1:4:67,80:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/1/1/1/1/1:6:26,114:0.80:-0.38:1.000:0.932 0/1/1/1:4:40,128:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,92:0.56: 0.02:1.000:0.968 0/0/1/1:4:75,97:0.54: 0.34:1.000:0.987 0/1/1/1:4:29,131:0.81: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,160:0.75: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,65:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,62:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,78:0.51:-0.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,171:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,42:0.43:-1.39:1.000:0.948 0/0/1/1:4:67,78:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,86:0.47: 0.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,113:0.73:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,65:0.51:-0.81:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,139:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,146:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,127:0.74: 0.25:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,172:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,66:0.51:-0.74:0.999:0.996 0/0/1/1:4:75,97:0.54: 0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:97,73:0.42: 0.29:1.000:0.914 0/0/1/1:4:87,88:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1/1/1:6:34,123:0.77: 0.00:0.897:0.730 0/0/1/1:4:73,78:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,78:0.76:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,69:0.57:-0.89:1.000:0.953 0/1/1/1:4:27,114:0.80:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,120:0.73: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,53:0.46:-1.01:0.999:0.985 0/1/1/1:4:34,123:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,116:0.75:-0.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,81:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,73:0.52:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,60:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,108:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,100:0.53: 0.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:127,58:0.32: 0.63:1.000:0.944 0/0/1/1:4:45,54:0.52:-1.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,66:0.48:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,68:0.53:-0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:97,42:0.31:-0.40:1.000:0.967 0/0/1/1:4:45,41:0.46:-1.59:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,132:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,61:0.46:-0.63:1.000:0.985 0/1/1/1:4:48,161:0.76: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,99:0.47: 1.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:138,50:0.28: 0.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,64:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,203:0.75: 2.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,80:0.49: 0.00:0.999:0.996 0/0/1/1:4:88,80:0.46: 0.25:1.000:0.987 0/1/1/1:4:25,82:0.75:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,82:0.66:-0.83:1.000:0.898 0/1/1/1:4:31,101:0.75:-0.56:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,77:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,57:0.49:-1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,49:0.37:-0.56:1.000:0.543 0/1/1/1:4:36,117:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,130:0.72: 0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,145:0.72: 0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,96:0.79:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,70:0.43: 0.00:1.000:0.955 0/1/1/1:4:35,96:0.72:-0.58:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,53:0.53:-1.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:26,82:0.74:-1.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,143:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,42:0.43:-1.39:1.000:0.948 0/1/1/1:4:27,110:0.79:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,89:0.53: 0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:102,113:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,41:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,96:0.79:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,35:0.28:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,68:0.46:-0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:60,81:0.55:-0.36:1.000:0.979 0/1/1/1:4:25,103:0.79:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,86:0.54:-0.11:1.000:0.986 0/1/1/1:4:24,74:0.74:-1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,114:0.52: 1.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,188:0.80: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,166:0.76: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,116:0.78:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,60:0.28: 1.53:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,115:0.50: 1.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,146:0.70: 1.03:1.000:0.987 0/0/0/1:4:20,8:0.30:-2.89:1.000:0.985 0/1/1/1:4:29,108:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,103:0.51: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,95:0.54: 0.27:1.000:0.989 0/1/1/1:4:48,159:0.75: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,38:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,78:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:132,53:0.30: 0.63:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,100:0.56: 0.34:1.000:0.969 0/1/1/1:4:50,126:0.70: 0.43:1.000:0.984 0/1/1/1:4:41,131:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,151:0.81: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,135:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,110:0.67: 0.05:1.000:0.935 0/1/1/1:4:53,136:0.70: 0.72:0.999:0.987 0/1/1/1:4:31,141:0.81: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,121:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,85:0.54:-0.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:44,114:0.70: 0.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:76,79:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,124:0.74: 0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,115:0.79:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,69:0.48:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,57:0.27: 1.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,149:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,117:0.56: 0.99:1.000:0.968 0/1/1/1:4:45,138:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,111:0.52: 1.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,151:0.72: 1.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,130:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,132:0.68: 0.72:1.000:0.955 -chr3.1 73435393 chr3.1_073435393 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:752,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:238,324:.:-0.71:1.000:. ./.:4:506,155:.:-0.05:1.000:. ./.:4:489,197:.: 0.11:1.000:. ./.:4:420,377:.: 0.85:1.000:. ./.:4:791,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:629,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:684,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:473,201:.: 0.03:1.000:. ./.:4:239,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:402,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:462,191:.:-0.11:1.000:. ./.:4:352,369:.: 0.34:1.000:. ./.:4:511,185:.: 0.18:1.000:. ./.:4:311,297:.:-0.41:1.000:. ./.:4:310,372:.: 0.09:1.000:. ./.:4:347,426:.: 0.69:0.998:. ./.:4:696,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:650,236:.: 1.44:1.000:. ./.:4:766,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:88,132:.:-2.98:1.000:. ./.:4:717,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:599,197:.: 0.84:1.000:. ./.:4:652,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:140,3:.:-3.49:1.000:. ./.:4:574,192:.: 0.64:1.000:. ./.:4:374,375:.: 0.53:1.000:. ./.:4:637,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:646,218:.: 1.29:1.000:. ./.:4:657,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:343,424:.: 0.65:1.000:. ./.:4:429,150:.:-0.60:1.000:. ./.:4:109,23:.:-3.57:1.000:. ./.:4:222,123:.:-2.15:1.000:. ./.:3:34,88:.:-3.63:1.000:. ./.:4:511,201:.: 0.28:1.000:. ./.:4:512,202:.: 0.30:1.000:. ./.:4:348,349:.: 0.19:1.000:. ./.:4:518,200:.: 0.32:1.000:. ./.:4:579,233:.: 0.95:1.000:. ./.:4:454,166:.:-0.33:1.000:. ./.:4:547,136:.: 0.09:1.000:. ./.:4:595,210:.: 0.90:1.000:. ./.:4:644,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:544,232:.: 0.71:1.000:. ./.:4:528,159:.: 0.12:1.000:. ./.:4:588,199:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1516,1:.: 5.63:1.000:. ./.:4:485,144:.:-0.27:1.000:. ./.:4:373,349:.: 0.35:1.000:. ./.:4:321,339:.:-0.06:1.000:. ./.:4:809,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:291,305:.:-0.49:1.000:. ./.:4:411,339:.: 0.54:1.000:. ./.:4:620,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:560,183:.: 0.49:1.000:. ./.:4:447,158:.:-0.43:1.000:. ./.:4:896,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:642,0:.:-0.18:1.000:. ./.:6:429,148:.:-0.61:1.000:. ./.:4:572,169:.: 0.48:1.000:. ./.:4:640,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:593,212:.: 0.90:1.000:. ./.:4:501,177:.: 0.06:1.000:. ./.:4:550,180:.: 0.40:1.000:. ./.:4:371,328:.: 0.20:1.000:. ./.:4:625,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:461,174:.:-0.23:1.000:. ./.:4:518,216:.: 0.43:1.000:. ./.:4:520,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:532,231:.: 0.62:1.000:. ./.:4:490,169:.:-0.07:1.000:. ./.:4:428,433:.: 1.27:1.000:. ./.:4:729,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:512,172:.: 0.10:1.000:. ./.:4:645,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:443,185:.:-0.27:1.000:. ./.:4:507,222:.: 0.40:1.000:. ./.:4:480,149:.:-0.27:1.000:. ./.:4:503,182:.: 0.11:1.000:. ./.:4:245,260:.:-1.09:0.999:. ./.:4:431,415:.: 1.17:1.000:. ./.:4:613,227:.: 1.13:1.000:. ./.:4:292,321:.:-0.37:1.000:. ./.:6:900,0:.: 1.53:0.897:. ./.:4:562,225:.: 0.78:1.000:. ./.:4:251,259:.:-1.06:1.000:. ./.:4:466,154:.:-0.33:1.000:. ./.:4:662,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:484,175:.:-0.07:1.000:. ./.:4:342,332:.: 0.03:0.999:. ./.:4:248,319:.:-0.68:1.000:. ./.:4:538,194:.: 0.42:1.000:. ./.:4:321,130:.:-1.45:1.000:. ./.:4:377,396:.: 0.69:1.000:. ./.:4:588,221:.: 0.93:1.000:. ./.:4:453,138:.:-0.52:1.000:. ./.:4:379,147:.:-0.95:1.000:. ./.:4:580,206:.: 0.78:1.000:. ./.:4:557,168:.: 0.37:1.000:. ./.:4:657,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:778,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:256,252:.:-1.07:1.000:. ./.:4:552,188:.: 0.47:1.000:. ./.:4:458,179:.:-0.21:1.000:. ./.:4:592,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:289,296:.:-0.56:1.000:. ./.:4:488,210:.: 0.19:1.000:. ./.:4:670,233:.: 1.55:1.000:. ./.:4:481,149:.:-0.26:1.000:. ./.:4:438,179:.:-0.35:1.000:. ./.:4:420,449:.: 1.33:1.000:. ./.:4:386,334:.: 0.34:0.999:. ./.:4:394,416:.: 0.94:1.000:. ./.:4:504,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:417,207:.:-0.30:1.000:. ./.:4:657,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:475,175:.:-0.13:1.000:. ./.:4:681,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:330,302:.:-0.25:1.000:. ./.:4:516,160:.: 0.05:1.000:. ./.:4:655,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:552,197:.: 0.53:1.000:. ./.:4:362,387:.: 0.53:1.000:. ./.:4:292,351:.:-0.17:1.000:. ./.:4:559,162:.: 0.34:1.000:. ./.:4:501,174:.: 0.04:1.000:. ./.:4:566,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:510,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:262,327:.:-0.53:1.000:. ./.:4:437,134:.:-0.65:1.000:. ./.:4:275,309:.:-0.57:1.000:. ./.:4:200,225:.:-1.62:1.000:. ./.:4:541,190:.: 0.41:1.000:. ./.:4:344,282:.:-0.29:1.000:. ./.:4:673,254:.: 1.71:1.000:. ./.:4:587,181:.: 0.66:1.000:. ./.:4:452,156:.:-0.41:1.000:. ./.:4:438,133:.:-0.65:1.000:. ./.:4:309,313:.:-0.31:1.000:. ./.:4:523,181:.: 0.23:1.000:. ./.:4:656,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:483,180:.:-0.04:1.000:. ./.:4:473,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:601,234:.: 1.10:1.000:. ./.:4:714,224:.: 1.79:1.000:. ./.:4:689,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:620,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:571,212:.: 0.76:1.000:. ./.:4:491,136:.:-0.28:1.000:. ./.:4:566,234:.: 0.87:1.000:. ./.:4:618,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:308,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:493,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:576,188:.: 0.63:1.000:. ./.:4:337,336:.: 0.03:1.000:. ./.:4:640,199:.: 1.13:1.000:. ./.:4:544,239:.: 0.76:1.000:. ./.:4:466,163:.:-0.27:1.000:. ./.:4:592,204:.: 0.84:1.000:. ./.:4:441,119:.:-0.72:1.000:. ./.:4:401,124:.:-0.96:1.000:. ./.:4:595,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:330,344:.: 0.03:1.000:. ./.:4:373,378:.: 0.54:1.000:. ./.:4:494,205:.: 0.20:1.000:. ./.:4:467,153:.:-0.33:1.000:. ./.:4:411,118:.:-0.93:0.999:. ./.:4:478,171:.:-0.13:1.000:. ./.:4:608,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:567,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:244,251:.:-1.16:1.000:. ./.:4:567,201:.: 0.66:1.000:. ./.:4:144,458:.:-0.45:1.000:. ./.:4:425,145:.:-0.66:1.000:. ./.:4:379,131:.:-1.06:1.000:. ./.:4:567,229:.: 0.84:1.000:. ./.:4:386,396:.: 0.75:1.000:. ./.:4:509,200:.: 0.26:1.000:. ./.:4:299,263:.:-0.71:1.000:. ./.:4:372,405:.: 0.72:1.000:. ./.:4:680,245:.: 1.70:1.000:. ./.:4:611,232:.: 1.15:1.000:. ./.:4:515,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:483,190:.: 0.03:1.000:. -chr3.1 73527322 chr3.1_073527322 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:184,82:0.45: 1.03:1.000:0.980 0/0/0/1:4:117,13:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,75:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,99:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,25:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,70:0.44: 0.72:1.000:0.967 0/0/1/1:4:123,96:0.53: 0.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:161,137:0.54: 1.35:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,55:0.55:-0.49:1.000:0.978 0/0/1/1:4:81,33:0.43:-0.48:1.000:0.951 0/1/1/1:4:1,34:0.75:-1.27:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,85:0.47: 0.92:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.35:0.998:1.000 0/0/0/1:4:303,21:0.22: 1.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,207:0.57: 2.33:1.000:0.954 0/0/0/1:4:64,13:0.31:-0.85:1.000:0.967 0/0/1/1:4:169,120:0.52: 1.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:192,89:0.46: 1.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:161,121:0.53: 1.19:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,70:0.45: 0.65:1.000:0.979 0/0/1/1:4:219,115:0.49: 1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,77:0.47: 0.70:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,59:0.44: 0.38:1.000:0.960 0/0/1/1:4:53,16:0.38:-0.93:1.000:0.511 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1:3:2,1:0.47:-1.59:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,72:0.46: 0.62:1.000:0.989 0/0/0/1:4:199,13:0.21: 0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,155:0.56: 1.48:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,133:0.54: 1.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:240,144:0.51: 2.21:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,94:0.47: 1.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:20,17:0.54:-1.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:150,65:0.44: 0.52:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,159:0.53: 2.08:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,90:0.51: 0.66:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,97:0.53: 0.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:199,164:0.54: 2.00:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:162,78:0.47: 0.77:1.000:0.826 0/0/1/1:4:199,96:0.47: 1.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:171,128:0.53: 1.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:224,109:0.47: 1.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:200,94:0.46: 1.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:182,104:0.50: 1.23:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,10:0.19: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,39:0.30: 0.92:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,147:0.54: 1.54:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,28:0.27: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,19:0.26: 0.03:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:187,61:0.39: 0.85:0.897:0.724 0/0/1/1:4:179,99:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,15:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,73:0.48: 0.50:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.61:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,95:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,13:0.24:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,13:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,136:0.52: 1.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,164:0.55: 1.82:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,172:1.00: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,203:0.58: 1.99:1.000:0.904 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,85:0.51: 0.59:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,89:0.51: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:222,113:0.48: 1.72:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.77:0.999:1.000 0/0/1/1:4:165,92:0.50: 0.94:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,104:0.47: 1.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:158,89:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:155,28:0.30: 0.21:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,187:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,51:0.42: 0.23:1.000:0.901 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,138:0.55: 1.19:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,20:0.27: 0.01:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,65:0.44: 0.59:1.000:0.958 0/0/1/1:4:129,71:0.50: 0.37:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,112:0.52: 1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,84:0.50: 0.64:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,128:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,135:0.50: 2.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:170,80:0.46: 0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:151,73:0.47: 0.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:164,134:0.54: 1.35:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,98:0.52: 0.72:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,78:0.49: 0.63:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,166:0.55: 1.82:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,20:0.28:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,59:0.46: 0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:175,61:0.40: 0.73:1.000:0.804 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,10:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,79:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,78:0.45: 0.90:1.000:0.980 0/0/0/1:4:156,18:0.25: 0.12:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,77:0.47: 0.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:155,138:0.55: 1.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:102,10:0.24:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,71:0.50: 0.29:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,88:0.49: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,18:0.54:-1.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:192,98:0.48: 1.27:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,71:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,13:0.22: 0.21:1.000:1.000 -chr3.1 73688611 chr3.1_073688611 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:157,147:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,144:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,140:0.72:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,180:0.75: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,203:0.71: 1.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:226,70:0.25: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,85:0.51:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,104:0.48: 0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,115:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,29:0.55:-2.48:1.000:0.975 0/0/1/1:4:24,26:0.55:-2.55:1.000:0.982 0/0/1/1:4:130,93:0.44: 0.07:1.000:0.973 0/1/1/1:4:80,172:0.70: 0.51:1.000:0.987 0/0/1/1:4:123,108:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,101:0.47: 0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:147,132:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,111:0.47: 0.49:0.998:0.992 0/0/1/1:4:142,144:0.53: 1.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:178,147:0.48: 1.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:145,128:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,22:0.71:-2.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:133,112:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,141:0.48: 1.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:163,37:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,3:0.14:-2.96:1.000:0.964 0/0/1/1:4:135,99:0.45: 0.23:1.000:0.980 0/0/1/1:4:114,85:0.45:-0.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:202,53:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,166:0.49: 2.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,124:0.53: 0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:51,106:0.70:-0.93:1.000:0.981 0/0/1/1:4:96,100:0.54:-0.34:1.000:0.989 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-3.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,30:0.48:-2.30:1.000:0.994 0/1/1:3:4,6:0.62:-3.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,101:0.48: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,106:0.48: 0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,145:0.74:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,41:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,73:0.39:-0.30:1.000:0.697 0/0/1/1:4:112,86:0.46:-0.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:138,118:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:190,59:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,80:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,133:0.68:-0.25:1.000:0.953 0/0/1/1:4:101,114:0.56:-0.05:1.000:0.971 0/1/1/1:4:77,198:0.74: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,9:0.62:-3.08:1.000:0.518 0/1/1/1:4:43,134:0.77:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,66:0.64:-1.69:1.000:0.688 0/0/1/1:4:106,84:0.47:-0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:176,167:0.52: 1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,118:0.52: 0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,174:0.73: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,156:0.57: 1.05:1.000:0.951 0/0/1/1:4:105,101:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,140:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,89:0.46:-0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:154,50:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:41,120:0.76:-0.87:1.000:0.656 0/1/1/1:4:57,166:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,50:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,120:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,76:0.49:-0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,167:0.72: 0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,178:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,30:0.25:-1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,55:0.26: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,76:0.46:-0.64:1.000:0.987 0/1/1/1:4:52,182:0.79: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,140:0.69:-0.16:1.000:0.979 0/0/0/1:4:141,46:0.26:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,147:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,159:0.54: 1.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:129,93:0.45: 0.05:1.000:0.975 0/0/0/1:4:153,42:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,72:0.46:-0.78:1.000:0.987 0/0/1/1:4:111,82:0.45:-0.39:1.000:0.982 0/0/1/1:4:145,109:0.46: 0.54:1.000:0.985 0/1/1/1:4:53,139:0.74:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,119:0.79:-0.99:0.999:1.000 0/0/1/1:4:150,84:0.38: 0.23:1.000:0.597 0/0/0/1:4:252,64:0.22: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,108:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:138,78:0.38:-0.04:0.897:0.756 0/0/1/1:4:135,115:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,100:0.73:-1.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,110:0.55:-0.10:1.000:0.983 0/0/0/1:4:135,40:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,89:0.46:-0.19:1.000:0.987 0/0/1/1:4:104,63:0.40:-0.78:0.999:0.803 0/0/1/1:4:103,93:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,138:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,138:0.71:-0.28:1.000:0.992 0/1/1/1:4:68,133:0.68:-0.27:1.000:0.960 0/0/0/1:4:159,40:0.21:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,48:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,117:0.71:-0.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:149,130:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,156:0.56: 1.16:1.000:0.973 0/0/0/1:4:141,44:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,80:0.30: 0.95:1.000:0.982 0/0/1/1:4:76,59:0.46:-1.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:116,138:0.57: 0.54:1.000:0.947 0/0/1/1:4:87,67:0.46:-0.98:1.000:0.989 0/0/1/1:4:134,135:0.53: 0.76:1.000:0.992 0/1/1/1:4:76,157:0.69: 0.22:1.000:0.979 0/0/1/1:4:119,88:0.45:-0.17:1.000:0.982 0/0/1/1:4:215,176:0.48: 2.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:179,59:0.26: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,109:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,184:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,117:0.52: 0.31:0.999:0.995 0/1/1/1:4:70,153:0.71: 0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:108,33:0.25:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,114:0.62:-0.42:1.000:0.557 0/0/1/1:4:110,109:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,67:0.45:-0.92:1.000:0.981 0/0/0/1:4:158,55:0.28:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,169:0.70: 0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:115,156:0.60: 0.80:1.000:0.785 0/0/0/1:4:182,51:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,81:0.39: 0.02:1.000:0.712 0/1/1/1:4:73,178:0.73: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,150:0.79:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,63:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,78:0.40:-0.19:1.000:0.815 0/0/1/1:4:69,78:0.56:-1.08:1.000:0.971 0/0/1/1:4:63,71:0.56:-1.28:1.000:0.972 0/0/1/1:4:73,53:0.45:-1.40:1.000:0.977 0/1/1/1:4:60,164:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,106:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,89:0.74:-1.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,147:0.72:-0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,142:0.72:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:277,87:0.25: 2.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:214,56:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,88:0.48:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:171,37:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,74:0.43:-0.52:1.000:0.941 0/0/0/1:4:179,61:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:191,60:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,108:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,39:0.29:-1.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:293,110:0.29: 2.79:1.000:0.991 0/1/1/1:4:93,254:0.75: 1.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,126:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,147:0.59: 0.63:1.000:0.859 0/0/1/1:4:184,196:0.54: 2.45:1.000:0.985 0/0/1/1:4:117,102:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:199,56:0.23: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,54:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,8:0.14:-2.36:1.000:0.948 0/0/1/1:4:111,99:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,137:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,140:0.47: 1.54:1.000:0.990 0/0/1/1:4:163,128:0.47: 1.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:126,104:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:161,70:0.32: 0.19:1.000:0.946 0/0/1/1:4:155,134:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,92:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,98:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,42:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,159:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,125:0.64:-0.24:1.000:0.677 0/1/1/1:4:61,172:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,70:0.44:-0.72:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,242:1.00: 0.36:0.999:1.000 0/0/1/1:4:109,91:0.48:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:181,64:0.28: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,54:0.29:-0.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:59,127:0.70:-0.49:1.000:0.988 0/0/0/1:4:177,59:0.27: 0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,158:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,65:0.46:-1.05:1.000:0.990 0/0/0/1:4:139,42:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,115:0.47: 0.67:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,139:0.76:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,142:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,112:0.59:-0.31:1.000:0.857 0/1/1/1:4:78,163:0.70: 0.34:1.000:0.982 0/0/1/1:4:174,143:0.48: 1.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:163,129:0.47: 1.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:119,80:0.43:-0.30:1.000:0.940 0/1/1/1:4:85,220:0.74: 1.31:1.000:0.999 -chr3.1 73802878 chr3.1_073802878 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:45,117:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,90:0.71:-0.64:1.000:0.989 0/1/1/1:4:42,111:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,96:0.72:-0.52:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,54:0.44:-0.69:1.000:0.974 0/0/1/1:4:55,61:0.55:-1.01:1.000:0.981 0/0/1/1:4:71,70:0.52:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,69:0.54:-0.59:1.000:0.986 0/1/1/1:4:17,40:0.72:-2.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,33:0.69:-2.65:1.000:0.977 0/0/1/1:4:78,92:0.56: 0.31:1.000:0.961 0/1/1/1:4:33,99:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,71:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,91:0.59: 0.09:1.000:0.881 0/1/1/1:4:30,80:0.74:-1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,129:0.75: 0.48:0.998:0.999 0/1/1/1:4:41,128:0.77: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,90:0.47: 1.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,92:0.55: 0.46:1.000:0.984 1/1/1/1:4:3,60:0.96:-2.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,71:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,137:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,36:0.29:-0.42:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,17:0.65:-3.19:1.000:0.790 0/1/1/1:4:51,164:0.78: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,64:0.69:-1.50:1.000:0.966 0/0/1/1:4:72,64:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,163:0.75: 1.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,88:0.74:-0.89:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,146:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,76:0.72:-1.18:1.000:0.994 1/1/1/1:4:1,14:0.94:-3.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,28:0.62:-2.70:1.000:0.610 1/1/1:3:0,9:1.00:-3.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,66:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,125:0.75: 0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,96:0.54: 0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:70,74:0.54:-0.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:47,138:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,101:0.51: 1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,119:0.53: 1.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,75:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,159:0.77: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,131:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,147:0.78: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.83:-3.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,106:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,74:0.75:-1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,68:0.47:-0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,102:0.54: 0.95:1.000:0.985 0/1/1/1:4:59,119:0.69: 0.51:1.000:0.970 0/1/1/1:4:56,165:0.76: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,99:0.78:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,120:0.81:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,103:0.72:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,103:0.53: 1.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:127,34:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:38,128:0.79: 0.21:1.000:0.854 0/1/1/1:4:54,128:0.72: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,34:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,147:0.74: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,82:0.48: 0.61:1.000:0.994 0/1/1/1:4:53,141:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,115:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,42:0.29: 0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:98,72:0.45: 0.31:1.000:0.980 0/1/1/1:4:58,143:0.73: 1.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,151:0.80: 0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,213:1.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,61:0.46:-0.45:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,168:0.76: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,69:0.47:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:88,97:0.55: 0.68:1.000:0.982 0/0/0/1:4:119,57:0.35: 0.46:1.000:0.759 0/1/1/1:4:59,118:0.69: 0.48:1.000:0.966 0/1/1/1:4:51,146:0.76: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,106:0.56: 1.02:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,106:0.75:-0.30:0.999:0.999 0/0/1/1:4:101,96:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,114:0.54: 1.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:77,70:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:69,91:0.59: 0.07:0.897:0.568 0/1/1/1:4:55,139:0.73: 0.90:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,122:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,85:0.54: 0.14:1.000:0.985 0/0/1/1:4:83,96:0.56: 0.53:1.000:0.969 0/0/1/1:4:61,68:0.55:-0.69:0.999:0.980 0/1/1/1:4:53,99:0.67:-0.13:1.000:0.924 0/0/1/1:4:113,78:0.44: 0.83:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,123:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,114:0.71: 0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:97,71:0.45: 0.26:1.000:0.979 0/0/1/1:4:94,75:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,102:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,155:0.72: 1.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,72:0.47: 0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:134,49:0.30: 0.63:1.000:0.986 0/0/0/1:4:160,48:0.26: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,79:0.53:-0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,89:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,116:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,124:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,137:0.83: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,81:0.56:-0.13:1.000:0.973 0/1/1/1:4:47,160:0.79: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,45:0.31: 0.14:1.000:0.977 0/1/1/1:4:45,130:0.76: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,88:0.45: 1.29:0.999:0.975 0/1/1/1:4:56,133:0.72: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,37:0.51:-1.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,97:0.63: 0.07:1.000:0.524 0/1/1/1:4:57,106:0.67: 0.14:1.000:0.920 0/1/1/1:4:42,121:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,48:0.28: 0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,118:0.74: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:85,90:0.54: 0.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:107,86:0.47: 0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,94:0.50: 0.95:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,83:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,93:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,67:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,59:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,100:0.70:-0.25:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,179:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,106:0.78:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,78:0.77:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,116:0.87:-0.57:1.000:0.860 0/1/1/1:4:46,96:0.69:-0.37:1.000:0.980 0/0/1/1:4:90,78:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,49:0.31: 0.39:1.000:0.966 0/0/1/1:4:93,82:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,48:0.30: 0.48:1.000:0.983 0/0/1/1:4:110,75:0.43: 0.68:1.000:0.952 0/0/1/1:4:97,88:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,76:0.44: 0.68:1.000:0.963 0/1/1/1:4:38,121:0.78: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,55:0.45:-0.69:1.000:0.982 0/0/1/1:4:114,94:0.48: 1.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,149:0.71: 1.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,112:0.72: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,155:0.77: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,79:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,109:0.75:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,82:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,73:0.58:-0.62:1.000:0.931 0/0/0/1:4:29,14:0.36:-2.80:1.000:0.742 0/1/1/1:4:30,93:0.77:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,157:0.83: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,70:0.45: 0.24:1.000:0.975 0/0/1/1:4:84,99:0.56: 0.63:1.000:0.961 0/0/1/1:4:82,66:0.47:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:78,75:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,72:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,102:0.76:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,83:0.78:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,60:0.49:-0.67:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-2.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,114:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,62:0.50:-0.64:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.47:0.999:1.000 0/0/1/1:4:70,81:0.56:-0.15:1.000:0.969 0/0/1/1:4:63,61:0.52:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,29:0.25:-0.59:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,89:0.58: 0.04:1.000:0.907 0/1/1/1:4:34,99:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,72:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:58,60:0.53:-0.96:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,84:0.57:-0.13:1.000:0.933 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,146:0.78: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,115:0.81:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,97:0.67:-0.18:1.000:0.904 0/0/1/1:4:115,115:0.52: 1.78:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,131:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,85:0.75:-1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,123:0.75: 0.24:1.000:0.999 -chr3.1 74095973 chr3.1_074095973 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:57,173:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,131:.:-0.31:1.000:. ./.:4:96,110:.: 0.42:1.000:. ./.:4:86,98:.:-0.08:1.000:. ./.:4:99,116:.: 0.62:1.000:. ./.:4:50,197:.: 1.35:1.000:. ./.:4:34,97:.:-1.29:1.000:. ./.:4:48,145:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,235:.: 1.08:1.000:. ./.:4:12,47:.:-2.94:1.000:. ./.:4:5,36:.:-3.35:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,139:.:-0.15:1.000:. ./.:4:99,113:.: 0.55:1.000:. ./.:4:31,149:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,149:.: 0.33:1.000:. ./.:4:53,187:.: 1.19:0.998:. ./.:4:87,113:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,276:.: 2.01:1.000:. ./.:4:51,185:.: 1.10:1.000:. ./.:4:22,41:.:-2.85:1.000:. ./.:4:48,136:.:-0.08:1.000:. ./.:4:47,167:.: 0.60:1.000:. ./.:4:44,147:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,37:.:-3.44:1.000:. ./.:4:65,165:.: 0.96:1.000:. ./.:4:45,193:.: 1.15:1.000:. ./.:4:51,159:.: 0.51:1.000:. ./.:4:46,182:.: 0.92:1.000:. ./.:4:47,159:.: 0.42:1.000:. ./.:4:46,168:.: 0.60:1.000:. ./.:4:39,171:.: 0.51:1.000:. ./.:4:2,56:.:-2.96:1.000:. ./.:4:0,80:.:-2.46:1.000:. ./.:3:3,38:.:-3.35:1.000:. ./.:4:55,177:.: 1.01:1.000:. ./.:4:45,145:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,98:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.21:1.000:. ./.:4:57,169:.: 0.87:1.000:. ./.:4:42,146:.: 0.01:1.000:. ./.:4:44,134:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,242:.: 1.24:1.000:. ./.:4:33,143:.:-0.27:1.000:. ./.:4:91,106:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.53:1.000:. ./.:4:122,121:.: 1.26:1.000:. ./.:4:9,40:.:-3.16:1.000:. ./.:4:73,90:.:-0.56:1.000:. ./.:4:13,111:.:-1.45:1.000:. ./.:4:25,117:.:-1.04:1.000:. ./.:4:39,199:.: 1.15:1.000:. ./.:4:32,141:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,161:.: 0.46:1.000:. ./.:4:32,139:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,89:.:-0.82:1.000:. ./.:4:43,176:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.90:1.000:. ./.:6:63,78:.:-1.07:1.000:. ./.:4:97,94:.: 0.07:1.000:. ./.:4:32,152:.:-0.08:1.000:. ./.:4:54,181:.: 1.08:1.000:. ./.:4:86,107:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,93:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,145:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.58:1.000:. ./.:4:41,154:.: 0.17:1.000:. ./.:4:87,88:.:-0.29:1.000:. ./.:4:104,110:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,239:.: 1.17:1.000:. ./.:4:45,137:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.46:1.000:. ./.:4:48,147:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,145:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,189:.: 0.90:1.000:. ./.:4:78,90:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,127:.:-0.56:0.999:. ./.:4:42,156:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.49:1.000:. ./.:4:43,138:.:-0.15:1.000:. ./.:6:47,229:.: 2.01:0.897:. ./.:4:44,144:.: 0.01:1.000:. ./.:4:62,66:.:-1.36:1.000:. ./.:4:31,132:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,154:.: 0.12:1.000:. ./.:4:27,107:.:-1.23:0.999:. ./.:4:37,135:.:-0.36:1.000:. ./.:4:80,112:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,78:.:-1.39:1.000:. ./.:4:44,162:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,233:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.47:1.000:. ./.:4:36,130:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,144:.:-0.20:1.000:. ./.:4:45,151:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,143:.:-0.40:1.000:. ./.:4:50,151:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.40:1.000:. ./.:4:35,157:.: 0.10:1.000:. ./.:4:36,126:.:-0.59:1.000:. ./.:4:94,119:.: 0.58:1.000:. ./.:4:54,179:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,237:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,216:.: 2.13:1.000:. ./.:4:48,166:.: 0.60:0.999:. ./.:4:76,97:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,106:.:-1.86:1.000:. ./.:4:88,54:.:-1.04:1.000:. ./.:4:36,99:.:-1.20:1.000:. ./.:4:81,82:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.33:1.000:. ./.:4:59,62:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,169:.: 0.42:1.000:. ./.:4:43,147:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,137:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.85:1.000:. ./.:4:33,156:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.86:1.000:. ./.:4:28,111:.:-1.11:1.000:. ./.:4:29,131:.:-0.63:1.000:. ./.:4:71,112:.:-0.11:1.000:. ./.:4:50,170:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,102:.:-1.39:1.000:. ./.:4:69,93:.:-0.59:1.000:. ./.:4:81,96:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.65:1.000:. ./.:4:77,84:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.38:1.000:. ./.:4:43,142:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,238:.: 1.15:1.000:. ./.:4:42,131:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,236:.: 1.10:1.000:. ./.:4:88,104:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,169:.: 0.69:1.000:. ./.:4:39,143:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,163:.: 0.60:1.000:. ./.:4:46,153:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,243:.: 1.26:1.000:. ./.:4:39,174:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,88:.:-2.25:1.000:. ./.:4:33,103:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.12:1.000:. ./.:4:37,171:.: 0.46:1.000:. ./.:4:53,199:.: 1.47:1.000:. ./.:4:58,178:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.58:1.000:. ./.:4:86,90:.:-0.27:1.000:. ./.:4:42,134:.:-0.27:1.000:. ./.:4:54,144:.: 0.23:1.000:. ./.:4:40,152:.: 0.10:1.000:. ./.:4:51,96:.:-0.93:1.000:. ./.:4:81,98:.:-0.20:1.000:. ./.:4:102,106:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,165:.: 0.35:0.999:. ./.:4:36,165:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,128:.:-0.27:1.000:. ./.:4:30,127:.:-0.70:1.000:. ./.:4:84,70:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,124:.: 0.92:1.000:. ./.:4:84,91:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,270:.: 1.88:1.000:. ./.:4:50,172:.: 0.78:1.000:. ./.:4:39,180:.: 0.71:1.000:. ./.:4:45,160:.: 0.39:1.000:. ./.:4:98,97:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,193:.: 1.19:1.000:. ./.:4:56,210:.: 1.79:1.000:. ./.:4:39,164:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,154:.: 0.19:1.000:. -chr3.1 74150027 chr3.1_074150027 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:167,44:.: 1.54:1.000:. ./.:4:70,84:.: 0.20:1.000:. ./.:4:87,74:.: 0.37:1.000:. ./.:4:94,75:.: 0.55:1.000:. ./.:4:126,78:.: 1.38:1.000:. ./.:4:118,81:.: 1.26:1.000:. ./.:4:110,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:111,45:.: 0.25:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:25,17:.:-2.43:1.000:. ./.:4:94,70:.: 0.44:1.000:. ./.:4:126,24:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,122:.: 0.70:1.000:. ./.:4:73,86:.: 0.32:1.000:. ./.:4:87,71:.: 0.30:1.000:. ./.:4:102,83:.: 0.93:0.998:. ./.:4:133,35:.: 0.53:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:170,51:.: 1.78:1.000:. ./.:4:13,9:.:-2.90:1.000:. ./.:4:122,28:.: 0.11:1.000:. ./.:4:168,26:.: 1.14:1.000:. ./.:4:93,69:.: 0.39:1.000:. ./.:4:7,1:.:-3.23:1.000:. ./.:4:121,88:.: 1.50:1.000:. ./.:4:81,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,74:.: 0.63:1.000:. ./.:4:127,34:.: 0.37:1.000:. ./.:4:148,46:.: 1.14:1.000:. ./.:4:164,52:.: 1.66:1.000:. ./.:4:137,36:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,1:.:-3.21:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.90:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:91,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:139,35:.: 0.67:1.000:. ./.:4:94,85:.: 0.79:1.000:. ./.:4:142,33:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,117:.: 1.54:1.000:. ./.:4:83,70:.: 0.18:1.000:. ./.:4:109,34:.:-0.06:1.000:. ./.:4:127,46:.: 0.65:1.000:. ./.:4:125,28:.: 0.18:1.000:. ./.:4:94,68:.: 0.39:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,85:.: 0.39:1.000:. ./.:4:34,16:.:-2.24:1.000:. ./.:4:80,67:.: 0.04:1.000:. ./.:4:107,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,53:.:-0.60:1.000:. ./.:4:140,47:.: 0.98:1.000:. ./.:4:74,48:.:-0.55:1.000:. ./.:4:150,31:.: 0.84:1.000:. ./.:4:114,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:85,54:.:-0.15:1.000:. ./.:4:106,34:.:-0.13:1.000:. ./.:4:101,46:.: 0.04:1.000:. ./.:6:50,51:.:-1.04:1.000:. ./.:4:77,39:.:-0.69:1.000:. ./.:4:77,73:.: 0.11:1.000:. ./.:4:106,38:.:-0.03:1.000:. ./.:4:32,75:.:-0.90:1.000:. ./.:4:85,60:.:-0.01:1.000:. ./.:4:108,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:98,27:.:-0.48:1.000:. ./.:4:115,31:.: 0.01:1.000:. ./.:4:66,68:.:-0.27:1.000:. ./.:4:41,91:.:-0.32:1.000:. ./.:4:77,82:.: 0.32:1.000:. ./.:4:54,20:.:-1.68:1.000:. ./.:4:121,40:.: 0.37:1.000:. ./.:4:140,27:.: 0.51:1.000:. ./.:4:73,74:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,39:.: 0.13:1.000:. ./.:4:90,66:.: 0.25:1.000:. ./.:4:79,60:.:-0.15:1.000:. ./.:4:89,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,85:.: 0.58:1.000:. ./.:4:40,51:.:-1.28:0.999:. ./.:4:87,61:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,37:.: 0.41:1.000:. ./.:4:64,77:.:-0.10:1.000:. ./.:6:107,74:.: 0.84:0.897:. ./.:4:122,41:.: 0.41:1.000:. ./.:4:55,54:.:-0.86:1.000:. ./.:4:91,26:.:-0.67:1.000:. ./.:4:91,36:.:-0.43:1.000:. ./.:4:79,63:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,51:.:-0.57:0.999:. ./.:4:68,77:.:-0.01:1.000:. ./.:4:32,106:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,44:.:-0.72:1.000:. ./.:4:122,34:.: 0.25:1.000:. ./.:4:106,33:.:-0.15:1.000:. ./.:4:93,36:.:-0.39:1.000:. ./.:4:69,69:.:-0.17:1.000:. ./.:4:83,20:.:-1.00:1.000:. ./.:4:150,37:.: 0.98:1.000:. ./.:4:71,23:.:-1.21:1.000:. ./.:4:110,36:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,43:.:-1.28:1.000:. ./.:4:100,29:.:-0.39:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,35:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,25:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,122:.: 0.48:1.000:. ./.:4:143,39:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,32:.:-0.03:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:176,57:.: 2.06:1.000:. ./.:4:70,58:.:-0.41:0.999:. ./.:4:67,58:.:-0.48:1.000:. ./.:4:91,22:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,59:.:-1.16:1.000:. ./.:4:85,26:.:-0.81:1.000:. ./.:4:26,72:.:-1.12:1.000:. ./.:4:91,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,50:.:-1.28:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:92,27:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,57:.:-0.27:1.000:. ./.:4:110,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:118,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.39:1.000:. ./.:4:79,56:.:-0.25:1.000:. ./.:4:75,63:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,27:.:-0.90:1.000:. ./.:4:75,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,48:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,77:.: 0.20:1.000:. ./.:4:53,19:.:-1.73:1.000:. ./.:4:65,50:.:-0.72:1.000:. ./.:4:66,69:.:-0.25:1.000:. ./.:4:169,57:.: 1.90:1.000:. ./.:4:122,38:.: 0.34:1.000:. ./.:4:33,74:.:-0.90:1.000:. ./.:4:77,19:.:-1.16:1.000:. ./.:4:49,43:.:-1.26:1.000:. ./.:4:93,27:.:-0.60:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.17:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:49,50:.:-1.09:1.000:. ./.:4:152,34:.: 0.95:1.000:. ./.:4:66,76:.:-0.08:1.000:. ./.:4:143,37:.: 0.81:1.000:. ./.:4:121,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:140,46:.: 0.95:1.000:. ./.:4:79,67:.: 0.01:1.000:. ./.:4:162,56:.: 1.71:1.000:. ./.:4:84,76:.: 0.34:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:130,34:.: 0.44:1.000:. ./.:4:213,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:79,87:.: 0.48:1.000:. ./.:4:100,88:.: 1.00:1.000:. ./.:4:156,37:.: 1.12:1.000:. ./.:4:106,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:39,93:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,30:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,84:.: 0.95:1.000:. ./.:4:145,38:.: 0.88:1.000:. ./.:4:80,83:.: 0.41:1.000:. ./.:4:92,65:.: 0.27:1.000:. ./.:4:38,75:.:-0.76:1.000:. ./.:4:111,35:.: 0.01:0.999:. ./.:4:89,82:.: 0.60:1.000:. ./.:4:89,65:.: 0.20:1.000:. ./.:4:83,74:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,61:.:-0.32:1.000:. ./.:4:158,50:.: 1.47:1.000:. ./.:4:38,98:.:-0.22:1.000:. ./.:4:40,109:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,35:.: 0.37:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:146,38:.: 0.91:1.000:. ./.:4:127,37:.: 0.44:1.000:. ./.:4:93,62:.: 0.23:1.000:. ./.:4:102,88:.: 1.05:1.000:. ./.:4:116,102:.: 1.71:1.000:. ./.:4:117,91:.: 1.47:1.000:. ./.:4:102,43:.:-0.01:1.000:. ./.:4:80,71:.: 0.13:1.000:. -chr3.1 74356792 chr3.1_074356792 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:250,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.76:0.998:. ./.:4:197,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:20,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:447,0:.: 5.12:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.94:1.000:. ./.:6:110,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:124,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:210,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:130,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.32:1.000:. ./.:6:182,0:.: 0.30:0.897:. ./.:4:174,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.83:0.999:. ./.:4:156,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:246,2:.: 1.50:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:147,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:234,2:.: 1.28:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:205,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:285,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.50:1.000:. -chr3.1 74764341 chr3.1_074764341 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:15,25:0.59: 0.03:1.000:0.883 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,16:0.28: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,11:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,8:0.18: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,26:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,18:0.46:-0.20:1.000:0.984 0/0/1/1:4:29,23:0.42: 0.97:1.000:0.897 0/0/1/1:4:9,16:0.60:-1.14:1.000:0.779 0/0/0/1:4:3,1:0.24:-2.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-2.55:1.000:0.966 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,15:0.43:-0.51:1.000:0.938 0/0/0/0:4:60,6:0.09: 2.07:1.000:0.954 0/0/1/1:4:22,15:0.38:-0.20:1.000:0.610 0/0/1/1:4:18,12:0.38:-0.75:1.000:0.548 0/0/0/1:4:31,18:0.35: 0.74:0.998:0.799 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,27:0.55: 0.50:1.000:0.980 0/0/1/1:4:28,37:0.53: 1.99:1.000:0.991 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,31:0.58: 0.81:1.000:0.907 0/1/1/1:4:10,20:0.63:-0.75:1.000:0.530 0/0/1/1:4:29,20:0.39: 0.74:1.000:0.641 0/1/1/1:4:1,2:0.63:-2.86:1.000:0.530 0/0/0/1:4:45,10:0.18: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,7:0.28:-1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,28:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,26:0.66:-0.20:1.000:0.886 0/0/1/1:4:29,26:0.44: 1.21:1.000:0.972 0/0/0/1:4:28,16:0.35: 0.35:1.000:0.826 0/0/1/1:4:13,22:0.59:-0.36:1.000:0.863 0/0/0/1:4:3,1:0.24:-2.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.85:-2.31:1.000:0.984 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:37,7:0.16: 0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:9,21:0.66:-0.75:1.000:0.870 0/0/0/1:4:24,14:0.35:-0.12:1.000:0.790 0/1/1/1:4:14,42:0.71: 1.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:40,13:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,12:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,24:0.59:-0.12:1.000:0.844 0/1/1/1:4:12,24:0.63:-0.28:1.000:0.530 0/0/1/1:4:26,27:0.48: 1.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:41,11:0.21: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,23:0.51: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,14:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.32:-2.86:1.000:0.956 0/0/0/1:4:45,11:0.19: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.23:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,11:0.29:-0.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:30,26:0.44: 1.28:1.000:0.959 0/0/0/1:4:17,6:0.25:-1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,15:0.32: 0.42:1.000:0.956 0/0/1/1:4:22,16:0.40:-0.12:1.000:0.765 0/1/1/1:4:10,23:0.66:-0.51:1.000:0.850 0/0/0/1:4:41,9:0.18: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,21:0.47: 0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:35,19:0.34: 1.13:1.000:0.895 0/0/0/0/0/1:6:35,9:0.20: 0.35:1.000:0.923 0/0/0/1:4:37,18:0.31: 1.21:1.000:0.967 0/0/1/1:4:28,20:0.39: 0.66:1.000:0.726 0/0/1/1:4:18,19:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,10:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,14:0.28: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,9:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,21:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,15:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,9:0.20: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,16:0.21: 2.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.44:-1.77:1.000:0.969 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,21:0.42: 0.58:1.000:0.914 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.39: 0.27:1.000:0.744 0/0/0/1:4:28,9:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,9:0.22: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.28: 1.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,20:0.32: 1.52:1.000:0.942 0/0/0/0:4:26,1:0.04:-0.98:0.999:1.000 0/0/0/1:4:33,9:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,25:0.64:-0.20:1.000:0.644 0/0/0/1:4:26,6:0.18:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:34,17:0.32: 0.89:0.897:0.915 0/0/1/1:4:19,35:0.61: 1.13:1.000:0.699 0/0/0/1:4:22,10:0.30:-0.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:17,17:0.47:-0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:15,25:0.59: 0.03:1.000:0.883 0/0/0/1:4:39,10:0.20: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,13:0.32:-0.05:0.999:0.956 0/0/0/1:4:17,8:0.31:-1.14:1.000:0.977 0/0/0/1:4:42,10:0.19: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,10:0.33:-0.83:1.000:0.924 0/0/0/1:4:40,10:0.20: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,30:0.67: 0.19:1.000:0.936 0/0/1/1:4:16,14:0.44:-0.75:1.000:0.963 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,20:0.67:-0.91:1.000:0.936 0/0/1/1:4:17,25:0.56: 0.19:1.000:0.971 0/0/1/1:4:19,16:0.43:-0.36:1.000:0.945 0/0/1/1:4:24,28:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,11:0.32:-0.51:1.000:0.956 0/1/1/1:4:10,21:0.64:-0.67:1.000:0.665 0/1/1/1:4:14,29:0.64: 0.27:1.000:0.629 0/0/1/1:4:19,22:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,8:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,10:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,30:0.57: 0.74:1.000:0.935 0/0/1/1:4:15,21:0.55:-0.28:1.000:0.984 0/1/1/1:4:8,28:0.74:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:34,17:0.32: 0.89:1.000:0.956 0/0/0/1:4:28,11:0.27:-0.05:0.999:0.997 0/0/0/1:4:33,9:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.40:-1.45:1.000:0.822 0/0/0/1:4:22,9:0.28:-0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,22:0.38: 1.13:1.000:0.633 0/0/0/1:4:28,9:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,24:0.48: 0.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:26,13:0.32:-0.05:1.000:0.956 0/0/1/1:4:14,27:0.62: 0.11:1.000:0.576 0/0/0/1:4:27,16:0.35: 0.27:1.000:0.759 0/0/0/1:4:46,16:0.25: 1.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,9:0.29:-0.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:20,12:0.36:-0.59:1.000:0.732 0/0/1/1:4:15,28:0.61: 0.27:1.000:0.665 0/0/0/1:4:31,11:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,22:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,13:0.44:-0.91:1.000:0.959 0/0/0/1:4:36,14:0.27: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,13:0.30: 0.19:1.000:0.987 0/0/0/1:4:16,6:0.27:-1.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,10:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,8:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,23:0.58:-0.20:1.000:0.900 0/1/1/1:4:13,37:0.70: 0.81:1.000:0.985 0/0/0/1:4:38,9:0.19: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.48:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,8:0.21:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,24:0.58:-0.05:1.000:0.925 0/0/1/1:4:28,21:0.40: 0.74:1.000:0.822 0/0/1/1:4:15,26:0.60: 0.11:1.000:0.826 0/0/0/1:4:15,9:0.36:-1.22:1.000:0.732 0/0/1/1:4:22,21:0.46: 0.27:1.000:0.986 0/0/0/1:4:51,24:0.31: 2.77:1.000:0.977 0/0/1/1:4:18,32:0.60: 0.81:1.000:0.779 0/0/1/1:4:17,15:0.44:-0.59:1.000:0.966 0/1/1/1:4:15,30:0.63: 0.42:1.000:0.530 0/0/0/1:4:34,10:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,27:0.53: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,24:0.48: 0.58:1.000:0.994 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.45:-0.98:1.000:0.981 0/1/1/1:4:13,33:0.68: 0.50:1.000:0.946 0/0/0/1:4:29,15:0.33: 0.35:1.000:0.937 0/0/0/1:4:30,12:0.28: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,23:0.52: 0.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:9,21:0.66:-0.75:1.000:0.870 0/0/1/1:4:15,27:0.60: 0.19:1.000:0.753 0/0/0/1:4:31,17:0.34: 0.66:1.000:0.884 0/1/1/1:4:5,19:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,21:0.41: 0.66:1.000:0.874 0/0/0/1:4:27,11:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,6:0.40:-2.00:1.000:0.822 0/0/0/1:4:30,15:0.32: 0.42:1.000:0.956 0/0/0/1:4:33,7:0.17: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.03:0.999:1.000 0/0/0/1:4:34,13:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,17:0.42:-0.12:1.000:0.916 0/0/1/1:4:17,20:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,13:0.36:-0.44:1.000:0.657 0/1/1/1:4:9,28:0.72:-0.20:1.000:0.994 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,13:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,18:0.58:-0.83:1.000:0.904 0/0/1/1:4:13,23:0.60:-0.28:1.000:0.789 0/0/0/1:4:39,12:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,25:0.65:-0.28:1.000:0.832 0/0/0/1:4:21,10:0.31:-0.67:1.000:0.974 0/0/1/1:4:17,15:0.44:-0.59:1.000:0.966 0/0/0/1:4:46,8:0.14: 1.13:1.000:0.980 0/0/0/1:4:45,13:0.22: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,21:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 -chr3.1 74943903 chr3.1_074943903 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:238,72:0.27: 1.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,148:0.71:-0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:159,53:0.29:-0.67:1.000:0.990 0/0/0/1:4:202,62:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:242,63:0.25: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:234,56:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,42:0.28:-1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:224,54:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,113:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:122,23:0.19:-2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,20:0.13:-1.26:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,186:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,122:0.53: 0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:202,64:0.28: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,104:0.46: 0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:144,110:0.48: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:154,89:0.41:-0.01:0.998:0.862 0/1/1/1:4:76,173:0.70: 0.12:1.000:0.983 0/0/1/1:4:142,121:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:205,44:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,17:0.13:-1.77:1.000:0.880 0/0/0/1:4:188,41:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,49:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,41:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,27:0.28:-2.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,98:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,110:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:233,60:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,61:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,48:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,91:0.47:-0.61:1.000:0.991 0/0/0/1:4:161,32:0.20:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,21:0.23:-2.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,70:0.51:-2.01:1.000:0.996 0/0/1:3:116,33:0.26:-2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,110:0.47: 0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:226,61:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:208,54:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,104:0.52:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:127,95:0.47:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:101,126:0.58:-0.35:1.000:0.905 0/0/0/1:4:233,68:0.27: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:139,125:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,65:0.35:-0.67:1.000:0.796 0/0/0/1:4:262,82:0.28: 2.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,135:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:235,46:0.20: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,72:0.23: 2.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,40:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,100:0.45: 0.06:1.000:0.980 0/0/1/1:4:118,125:0.55:-0.01:1.000:0.981 0/0/0/1:4:262,62:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,111:0.57:-0.85:1.000:0.938 0/0/1/1:4:152,139:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:200,52:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,109:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,67:0.30: 0.47:1.000:0.989 0/0/0/1:4:188,59:0.28: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,122:0.53: 0.04:1.000:0.990 0/0/0/0/1/1:6:169,46:0.26:-0.61:1.000:0.548 0/0/0/1:4:210,55:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:176,51:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:213,52:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,37:0.23:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,56:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,97:0.45:-0.05:1.000:0.976 0/0/1/1:4:71,57:0.49:-2.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,141:0.58: 0.32:1.000:0.932 0/0/1/1:4:148,119:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,113:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:244,48:0.20: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,79:0.50:-1.56:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,220:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,66:0.27: 0.90:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,220:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,105:0.53:-0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:149,103:0.45: 0.19:1.000:0.982 0/0/1/1:4:150,122:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,110:0.52:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:217,57:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,143:0.73:-1.02:0.999:0.997 0/0/1/1:4:146,103:0.46: 0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:146,139:0.53: 0.90:1.000:0.993 0/0/1/1:4:132,104:0.48:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:202,107:0.39: 1.42:0.897:0.722 0/0/0/1:4:213,63:0.27: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,51:0.31:-1.17:1.000:0.969 0/0/0/1:4:183,63:0.30: 0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:119,123:0.54:-0.03:1.000:0.985 0/0/1/1:4:141,111:0.48: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,89:0.50:-1.00:0.999:0.997 0/0/1/1:4:121,113:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:187,64:0.30: 0.17:1.000:0.987 0/0/0/1:4:195,49:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,91:0.53:-1.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:131,97:0.47:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:130,95:0.47:-0.39:1.000:0.991 0/1/1/1:4:65,124:0.67:-1.17:1.000:0.903 0/0/0/1:4:236,57:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,48:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,100:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,143:0.53: 1.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:101,85:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,52:0.26:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,89:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,60:0.35:-0.98:1.000:0.826 0/0/1/1:4:98,101:0.54:-0.95:1.000:0.986 0/0/0/1:4:202,59:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:309,71:0.23: 2.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,114:0.52:-0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,106:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,131:0.48: 1.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,115:0.51: 0.08:0.999:0.996 0/0/0/1:4:171,45:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,99:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/0/0:4:234,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,52:0.28:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,42:0.24:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,94:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,52:0.28:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,120:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,109:0.54:-0.57:1.000:0.989 0/0/1/1:4:130,91:0.46:-0.48:1.000:0.985 0/0/1/1:4:172,113:0.44: 0.90:1.000:0.967 0/0/1/1:4:147,116:0.48: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,108:0.46: 0.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:109,117:0.55:-0.37:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,35:0.24:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,79:0.47:-1.26:1.000:0.992 0/0/0/1:4:196,64:0.29: 0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:131,79:0.42:-0.72:1.000:0.913 0/0/1/1:4:99,68:0.45:-1.64:1.000:0.981 0/0/0/1:4:227,87:0.32: 1.52:1.000:0.954 0/0/0/1:4:190,61:0.29: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:168,144:0.50: 1.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,89:0.42:-0.16:1.000:0.916 0/0/0/1:4:204,70:0.30: 0.66:1.000:0.987 0/0/1/1:4:111,106:0.53:-0.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:129,117:0.52: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,131:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,151:0.56: 0.94:1.000:0.970 0/0/1/1:4:140,121:0.51: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,36:0.24:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,142:0.49: 1.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:269,101:0.32: 2.73:1.000:0.963 0/0/0/1:4:217,55:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,66:0.27: 1.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:253,63:0.24: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,97:0.47:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:139,127:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:238,58:0.24: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,53:0.39:-1.95:1.000:0.688 0/0/0/1:4:217,59:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,131:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:178,108:0.42: 0.92:1.000:0.918 0/0/1/1:4:159,172:0.55: 1.89:1.000:0.977 0/0/0/1:4:214,41:0.19: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,92:0.46:-0.46:1.000:0.986 0/0/1/1:4:148,129:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,42:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,47:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,57:0.31:-0.67:1.000:0.971 0/0/1/1:4:117,111:0.53:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:183,62:0.30: 0.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:202,66:0.29: 0.53:1.000:0.992 0/0/0/1:4:137,34:0.24:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,158:0.69:-0.29:0.999:0.976 0/0/1/1:4:130,88:0.45:-0.54:1.000:0.977 0/0/1/1:4:146,93:0.43:-0.09:1.000:0.953 0/0/0/1:4:219,52:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,48:0.27:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,122:0.52: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,98:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,36:0.25:-1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,91:0.49:-0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,100:0.45: 0.08:1.000:0.978 0/0/1/1:4:134,109:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:217,55:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,111:0.53:-0.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:222,50:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,142:0.47: 2.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:186,144:0.48: 1.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:197,52:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,198:0.72: 0.66:1.000:0.996 -chr3.1 75317772 chr3.1_075317772 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,17:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.93:1.000:. ./.:4:29,21:.: 2.08:1.000:. ./.:4:15,38:.: 2.36:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.93:1.000:. ./.:4:9,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.12:1.000:. ./.:4:1,8:.:-1.83:1.000:. ./.:4:6,20:.:-0.21:1.000:. ./.:4:9,27:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:9,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,17:.: 1.12:1.000:. ./.:4:24,23:.: 1.79:0.998:. ./.:4:15,36:.: 2.17:1.000:. ./.:4:11,32:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:30,15:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,33:.: 2.46:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:24,9:.: 0.46:1.000:. ./.:4:13,34:.: 1.79:1.000:. ./.:4:24,15:.: 1.03:1.000:. ./.:4:18,13:.: 0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,1:.:-2.41:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.84:1.000:. ./.:4:20,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,12:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.17:1.000:. ./.:4:11,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:12,24:.: 0.74:1.000:. ./.:4:21,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.26:1.000:. ./.:4:11,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:3,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.55:1.000:. ./.:4:7,10:.:-1.07:1.000:. ./.:4:8,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.21:1.000:. ./.:4:16,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,25:.: 1.12:1.000:. ./.:4:8,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,12:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.98:1.000:. ./.:6:0,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:16,10:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:7,17:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:18,19:.: 0.84:1.000:. ./.:4:14,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:12,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:12,6:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.93:1.000:. ./.:4:8,23:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.27:1.000:. ./.:4:7,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.31:0.999:. ./.:4:6,15:.:-0.69:1.000:. ./.:4:19,19:.: 0.93:1.000:. ./.:4:12,19:.: 0.27:1.000:. ./.:6:5,9:.:-1.36:0.897:. ./.:4:20,8:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:10,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.07:1.000:. ./.:4:9,18:.:-0.12:0.999:. ./.:4:13,12:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,13:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:21,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.17:1.000:. ./.:4:17,14:.: 0.27:1.000:. ./.:4:13,17:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.88:1.000:. ./.:4:9,9:.:-0.98:1.000:. ./.:4:9,19:.:-0.02:1.000:. ./.:4:14,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:8,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:6,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:1,39:.: 1.12:1.000:. ./.:4:25,25:.: 2.08:1.000:. ./.:4:13,19:.: 0.36:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.31:1.000:. ./.:4:29,19:.: 1.89:1.000:. ./.:4:9,13:.:-0.59:0.999:. ./.:4:9,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:6,21:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.69:1.000:. ./.:4:8,14:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,14:.:-0.78:1.000:. ./.:4:12,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:10,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.12:1.000:. ./.:4:24,13:.: 0.84:1.000:. ./.:4:14,7:.:-0.69:1.000:. ./.:4:19,18:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.74:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.64:1.000:. ./.:4:14,6:.:-0.78:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:28,19:.: 1.79:1.000:. ./.:4:3,13:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.74:1.000:. ./.:4:11,4:.:-1.26:1.000:. ./.:4:26,25:.: 2.17:1.000:. ./.:4:13,17:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.69:1.000:. ./.:4:8,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:10,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:19,14:.: 0.46:1.000:. ./.:4:6,11:.:-1.07:1.000:. ./.:4:19,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.69:1.000:. ./.:4:5,28:.: 0.46:1.000:. ./.:4:7,23:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,21:.: 0.74:1.000:. ./.:4:14,24:.: 0.93:1.000:. ./.:4:30,23:.: 2.36:1.000:. ./.:4:7,21:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,28:.: 1.03:1.000:. ./.:4:24,14:.: 0.93:1.000:. ./.:4:14,29:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,44:.: 1.51:1.000:. ./.:4:10,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:16,19:.: 0.65:1.000:. ./.:4:13,18:.: 0.27:1.000:. ./.:4:27,14:.: 1.22:1.000:. ./.:4:10,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:12,30:.: 1.32:0.999:. ./.:4:1,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:24,14:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.26:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.27:1.000:. ./.:4:10,26:.: 0.74:1.000:. ./.:4:22,18:.: 1.12:1.000:. ./.:4:28,17:.: 1.60:1.000:. ./.:4:23,22:.: 1.60:1.000:. ./.:4:8,16:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,45:.: 1.60:1.000:. ./.:4:13,37:.: 2.08:1.000:. ./.:4:8,23:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,27:.: 0.46:1.000:. -chr3.1 75626145 chr3.1_075626145 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:81,28:0.27: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,43:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,24:0.29: 0.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,23:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,98:0.74: 1.72:1.000:0.998 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,19:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-2.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.14:-2.60:1.000:0.964 0/0/0/1:4:80,20:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,44:0.49: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,24:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,46:0.46: 0.81:1.000:0.986 0/1/1/1:4:30,70:0.66: 0.77:1.000:0.882 0/1/1/1:4:27,92:0.72: 1.52:0.998:0.996 0/0/1/1:4:73,53:0.42: 1.80:1.000:0.928 0/0/0/1:4:97,22:0.19: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,10:0.77:-2.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,44:0.47: 0.53:1.000:0.992 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.22:-2.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,39:0.46: 0.21:1.000:0.984 0/0/1/1:4:65,55:0.46: 1.56:1.000:0.988 0/0/0/1:4:76,25:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,73:0.67: 0.84:1.000:0.939 0/0/0/1:4:75,24:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,57:0.60: 0.41:1.000:0.769 0/0/1/1:4:34,37:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-2.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,17:0.49:-1.81:1.000:0.996 0/1/1:3:3,8:0.68:-2.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,24:0.25: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,41:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,67:0.81:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,39:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,21:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,43:0.47: 0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:48,22:0.32:-0.42:1.000:0.949 0/0/1/1:4:47,40:0.46: 0.25:1.000:0.988 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,12:0.21:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,44:0.55:-0.11:1.000:0.978 0/0/0/1:4:85,33:0.29: 1.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:41,14:0.26:-1.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,21:0.28:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,16:0.44:-1.73:1.000:0.958 0/0/1/1:4:34,27:0.44:-0.78:1.000:0.974 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,57:0.71:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:58,41:0.42: 0.73:1.000:0.904 0/0/0/1:4:74,31:0.30: 0.96:1.000:0.982 0/0/1/1:4:30,26:0.47:-0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:51,24:0.33:-0.23:1.000:0.932 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:49,20:0.30:-0.46:1.000:0.864 0/0/0/1:4:74,27:0.28: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,38:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,15:0.29:-1.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:78,22:0.23: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,33:0.40: 0.13:1.000:0.765 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,43:0.45: 0.61:1.000:0.980 0/0/1/1:4:50,36:0.42: 0.21:1.000:0.921 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,38:0.53:-0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:13,7:0.36:-2.40:1.000:0.733 0/0/1/1:4:49,32:0.40: 0.01:1.000:0.784 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,18:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,37:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,45:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:69,24:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,43:0.54:-0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,29:0.45:-0.62:0.999:0.978 0/0/1/1:4:32,33:0.51:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,38:0.44: 0.21:1.000:0.973 0/0/1/1:4:35,41:0.53:-0.19:1.000:0.991 0/0/0/0/0/1:6:68,19:0.23: 0.25:0.897:0.750 0/0/1/1:4:31,38:0.54:-0.46:1.000:0.987 0/1/1/1:4:9,41:0.76:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,36:0.52:-0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:53,15:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,17:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,19:0.25:-0.11:0.999:0.999 0/1/1/1:4:19,61:0.71:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,22:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,30:0.44:-0.50:1.000:0.972 0/0/1/1:4:43,36:0.46:-0.07:1.000:0.986 0/0/1/1:4:30,39:0.55:-0.46:1.000:0.977 0/0/1/1:4:34,27:0.44:-0.78:1.000:0.974 0/0/0/1:4:47,12:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,36:0.54:-0.58:1.000:0.989 0/0/0/1:4:71,18:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,24:0.44:-1.02:1.000:0.965 0/0/0/1:4:54,20:0.28:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,31:0.51:-0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,12:0.18:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,39:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:92,19:0.18: 1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,53:0.49: 1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,17:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,43:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,78:0.67: 1.16:1.000:0.919 0/0/1/1:4:42,43:0.50: 0.17:0.999:0.997 0/0/1/1:4:49,34:0.41: 0.09:1.000:0.883 0/0/0/1:4:36,11:0.24:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,22:0.37:-0.82:1.000:0.537 0/0/0/1:4:28,12:0.31:-1.61:1.000:0.976 0/0/1/1:4:30,33:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,23:0.40:-0.90:1.000:0.797 0/0/0/1:4:60,21:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,20:0.28:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,26:0.22: 1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,102:0.64: 2.83:1.000:0.673 0/1/1/1:4:18,50:0.69:-0.50:1.000:0.975 0/0/1/1:4:34,48:0.57: 0.05:1.000:0.949 0/0/0/1:4:64,15:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,1:0.02:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,31:0.68:-1.49:1.000:0.951 0/0/1/1:4:36,38:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,70:0.64: 0.96:1.000:0.629 0/0/0/1:4:45,24:0.35:-0.46:1.000:0.755 0/0/0/1:4:45,20:0.32:-0.62:1.000:0.964 0/0/1/1:4:30,42:0.57:-0.34:1.000:0.953 0/0/1/1:4:60,61:0.50: 1.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,27:0.32: 0.17:1.000:0.939 0/0/0/1:4:51,10:0.17:-0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:48,15:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,27:0.38:-0.34:1.000:0.569 0/0/1/1:4:43,30:0.41:-0.30:1.000:0.889 0/0/0/1:4:41,10:0.20:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,42:0.52: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,13:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,53:0.49: 1.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,29:0.30: 0.81:1.000:0.988 0/0/0/1:4:82,30:0.28: 1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,16:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,24:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.47:-0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,60:0.44: 2.23:1.000:0.968 0/0/0/1:4:87,20:0.20: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-2.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,25:0.33:-0.11:1.000:0.930 0/0/1/1:4:44,53:0.54: 0.65:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,41:0.45: 0.41:1.000:0.982 0/0/0/1:4:100,27:0.22: 1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,21:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,41:0.45: 0.45:1.000:0.978 0/0/0/1:4:74,20:0.22: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,48:0.55: 0.17:1.000:0.977 0/0/0/1:4:39,20:0.35:-0.86:1.000:0.831 0/0/0/1:4:62,31:0.34: 0.49:1.000:0.869 0/1/1/1:4:27,81:0.70: 1.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:38,38:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:61,23:0.28: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,23:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,21:0.19: 1.32:0.999:1.000 0/0/0/1:4:80,26:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,40:0.48: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,51:0.74:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,48:0.52: 0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,71:0.68: 0.69:1.000:0.958 0/0/0/1:4:46,13:0.23:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,41:0.45: 0.45:1.000:0.978 0/0/0/1:4:97,28:0.23: 1.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,84:0.70: 1.28:1.000:0.983 0/0/1/1:4:40,44:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,54:0.57: 0.49:1.000:0.957 0/0/1/1:4:48,39:0.45: 0.25:1.000:0.980 0/0/0/1:4:76,22:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,50:0.46: 1.16:1.000:0.985 0/0/0/1:4:47,9:0.17:-0.98:1.000:0.998 0/0/0/1:4:85,28:0.26: 1.28:1.000:0.999 -chr3.1 75789251 chr3.1_075789251 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-0.06:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,5:0.56:-0.57:1.000:0.963 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,2:0.32:-0.83:1.000:0.950 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.14:-0.31:1.000:0.963 0/0/0/1:4:10,1:0.11: 0.20:1.000:0.597 0/0/1/1:4:6,8:0.54: 0.97:1.000:0.990 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-2.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:12,1:0.10: 0.72:1.000:0.874 0/1/1/1:4:1,9:0.70:-0.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:3,7:0.60:-0.06:1.000:0.791 0/0/0/1:4:7,2:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.83:0.998:1.000 0/0/1/1:4:4,10:0.61: 0.97:1.000:0.723 0/0/0/1:4:10,3:0.28: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-0.57:1.000:0.753 0/0/0/1:4:5,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.36:-1.09:1.000:0.675 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.55:-1.34:1.000:0.980 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.16:-0.57:1.000:0.993 0/0/0/1:4:17,3:0.19: 2.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/0/0/1:4:8,1:0.14:-0.31:1.000:0.963 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,1:0.11: 0.20:1.000:0.597 0/0/0/1:4:12,2:0.18: 0.97:1.000:0.999 0/0/0:3:12,1:0.10: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-0.57:1.000:0.753 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.14:-0.31:1.000:0.963 0/0/0/1:4:5,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.52: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:11,2:0.19: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,1:0.10: 0.72:1.000:0.874 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-0.83:1.000:0.968 0/0/1/1:4:8,6:0.44: 0.97:1.000:0.968 0/0/0/1:4:8,1:0.14:-0.31:1.000:0.963 0/0/1/1:4:6,5:0.46: 0.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:14,8:0.39: 3.03:1.000:0.649 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-0.06:1.000:0.906 0/0/1/1:4:11,7:0.41: 2.00:1.000:0.848 0/0/0/1:4:6,2:0.29:-0.57:1.000:0.991 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/0/0/0:4:12,1:0.10: 0.72:1.000:0.874 0/0/0/1:4:9,1:0.12:-0.06:1.000:0.852 0/0/0/1:4:5,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.58:-0.31:1.000:0.900 0/0/0/1:4:9,4:0.34: 0.72:1.000:0.871 0/0/0/1:4:13,4:0.28: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:8,8:0.50: 1.49:1.000:0.889 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,3:0.31: 0.20:1.000:0.973 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-0.57:1.000:0.753 0/0/0/1:4:6,2:0.29:-0.57:1.000:0.991 0/0/0/1:4:15,4:0.26: 2.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,2:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:10,2:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.16:-0.57:1.000:0.993 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.50: 2.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,1:0.29:-1.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:8,4:0.36: 0.46:1.000:0.675 0/0/1/1:4:3,7:0.60:-0.06:1.000:0.791 0/0/0/1:4:10,1:0.11: 0.20:1.000:0.597 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-0.83:1.000:0.990 0/0/0/1:4:10,2:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.32:-0.83:1.000:0.950 0/0/1/1:4:8,5:0.40: 0.72:0.999:0.822 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,1:0.09: 0.97:1.000:0.951 0/0/0/1/1/1:6:5,9:0.57: 0.97:0.897:0.591 0/0/0/1:4:11,3:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.34:1.000:0.900 0/0/0/1:4:7,2:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:9,1:0.12:-0.06:0.999:0.852 0/0/0/0:4:14,1:0.08: 1.23:1.000:0.980 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,1:0.16:-0.57:1.000:0.993 0/0/0/0:4:13,1:0.09: 0.97:1.000:0.951 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-0.06:1.000:0.906 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.55:-1.34:1.000:0.980 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-0.06:1.000:0.906 0/0/0/1:4:8,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-0.57:1.000:0.753 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,3:0.29: 0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:13,2:0.17: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,3:0.31: 0.20:1.000:0.973 0/0/1/1:4:8,5:0.40: 0.72:1.000:0.822 0/0/0/1:4:14,3:0.22: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-0.57:1.000:0.753 0/0/0/0:4:16,1:0.07: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,2:0.19: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.16:-0.57:1.000:0.993 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-0.06:1.000:0.906 0/0/0/1:4:6,1:0.18:-0.83:0.999:0.999 0/0/0/1:4:7,2:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:4,1:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,1:0.12:-0.06:1.000:0.852 0/0/0/1:4:4,2:0.36:-1.09:1.000:0.675 0/0/1/1:4:9,7:0.45: 1.49:1.000:0.978 0/0/1/1:4:5,8:0.56: 0.72:1.000:0.971 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.36:-1.09:1.000:0.675 0/0/0/1:4:9,3:0.29: 0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:9,5:0.38: 0.97:1.000:0.582 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.19: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/1/1/1:4:0,8:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.34:1.000:0.900 0/0/0/1:4:13,2:0.17: 1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,5:0.43: 0.46:1.000:0.948 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,5:0.46: 0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:4,2:0.36:-1.09:1.000:0.675 0/0/0/1:4:8,1:0.14:-0.31:1.000:0.963 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.17: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,4:0.36: 0.46:1.000:0.675 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,1:0.16:-0.57:1.000:0.993 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.29: 0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:16,7:0.34: 3.29:1.000:0.887 0/0/1/1:4:5,7:0.54: 0.46:1.000:0.987 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/0/1/1:4:9,5:0.38: 0.97:1.000:0.582 0/0/0/1:4:10,2:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.32: 0.97:1.000:0.950 0/0/1/1:4:3,5:0.56:-0.57:1.000:0.963 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.55:-0.06:1.000:0.980 0/0/0/1:4:13,3:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.07: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:8,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,1:0.16:-0.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-0.57:1.000:0.753 0/0/0/1:4:7,2:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,1:0.12:-0.06:1.000:0.852 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/0/0/1:4:8,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,9:0.57: 0.97:0.999:0.943 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/0/0/1:4:8,2:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,4:0.39: 0.20:1.000:0.649 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.29:-1.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:5,6:0.52: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:8,1:0.14:-0.31:1.000:0.963 0/0/0/1:4:8,1:0.14:-0.31:1.000:0.963 0/0/0/1:4:14,2:0.16: 1.49:1.000:0.993 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-0.06:1.000:0.906 0/0/0/1:4:13,3:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.36: 1.23:1.000:0.675 0/0/1/1:4:7,6:0.47: 0.72:1.000:0.991 0/0/0/1:4:10,4:0.32: 0.97:1.000:0.950 0/0/1/1:4:6,6:0.50: 0.46:1.000:0.997 -chr3.1 75872371 chr3.1_075872371 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:17,76:0.82: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,60:0.60: 0.39:1.000:0.829 0/0/1/1:4:59,42:0.41: 0.42:1.000:0.884 0/0/1/1:4:58,55:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,61:0.56: 0.58:1.000:0.959 0/0/1/1:4:90,77:0.46: 2.14:1.000:0.985 0/0/1/1:4:36,44:0.54:-0.13:1.000:0.985 0/0/1/1:4:57,60:0.51: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,32:0.26: 1.04:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.40:-1.95:1.000:0.778 0/1/1/1:4:23,75:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,26:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,74:0.53: 1.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,26:0.23: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,72:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,69:0.53: 1.15:0.998:0.993 1/1/1/1:4:0,136:1.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,39:0.25: 1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,85:0.50: 2.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-1.97:1.000:0.893 0/0/1/1:4:52,38:0.42: 0.13:1.000:0.912 0/0/1/1:4:54,63:0.53: 0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,65:0.52: 1.02:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,96:0.69: 1.38:1.000:0.979 0/0/0/1:4:114,44:0.28: 1.90:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,82:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,46:0.46: 0.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:41,93:0.69: 1.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:62,71:0.53: 1.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:67,64:0.48: 1.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:3,1:0.26:-2.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,8:0.66:-1.89:1.000:0.893 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:73,64:0.46: 1.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:55,61:0.52: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,75:0.60: 1.04:1.000:0.829 0/0/1/1:4:59,47:0.44: 0.55:1.000:0.966 0/0/1/1:4:74,69:0.48: 1.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,49:0.73:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,20:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,43:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,37:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,27:0.53:-0.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:40,26:0.39:-0.49:1.000:0.723 0/0/1/1:4:59,68:0.53: 1.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,17:0.71:-1.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,43:0.58:-0.31:1.000:0.897 0/0/0/1:4:61,18:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,14:0.34:-1.14:1.000:0.846 0/0/1/1:4:56,55:0.49: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,30:0.62:-0.96:1.000:0.556 0/0/0/1:4:60,12:0.18:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,70:0.70: 0.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:45,41:0.47: 0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,26:0.42:-0.59:1.000:0.900 0/0/1/1:4:40,37:0.47:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,31:0.53:-0.70:1.000:0.993 0/0/1/1/1/1:6:13,37:0.74:-0.91:1.000:0.589 0/0/1/1:4:31,27:0.46:-0.70:1.000:0.988 0/0/1/1:4:38,51:0.57: 0.11:1.000:0.953 0/1/1/1:4:25,46:0.64:-0.36:1.000:0.740 0/0/1/1:4:38,46:0.54:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:48,43:0.47: 0.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,21:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,37:0.68:-0.80:1.000:0.961 0/0/1/1:4:28,30:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,49:0.77:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,49:0.80:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,24:0.44:-0.80:1.000:0.968 0/0/1/1:4:64,46:0.42: 0.65:1.000:0.895 0/0/1/1:4:39,53:0.57: 0.19:1.000:0.945 0/0/1/1:4:30,48:0.61:-0.18:1.000:0.679 0/0/1/1:4:38,51:0.57: 0.11:1.000:0.953 0/1/1/1:4:17,47:0.73:-0.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,27:0.66:-1.14:1.000:0.839 0/0/1/1:4:34,24:0.41:-0.70:1.000:0.873 0/1/1/1:4:10,46:0.82:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,31:0.53:-0.70:0.999:0.993 0/0/0/1:4:48,20:0.30:-0.44:1.000:0.986 0/0/1/1:4:31,34:0.52:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,17:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:14,102:0.88: 0.81:0.897:0.983 0/0/1/1:4:36,27:0.43:-0.57:1.000:0.934 0/0/1/1:4:22,30:0.57:-0.85:1.000:0.943 0/0/1/1:4:21,27:0.56:-0.96:1.000:0.972 0/1/1/1:4:18,39:0.68:-0.72:1.000:0.959 0/0/1/1:4:32,37:0.53:-0.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:42,19:0.32:-0.62:0.999:0.964 0/0/1/1:4:38,32:0.45:-0.39:1.000:0.982 0/1/1/1:4:21,46:0.68:-0.46:1.000:0.964 0/1/1/1:4:23,64:0.74: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:33,11:0.26:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,33:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,20:0.64:-1.40:1.000:0.709 0/1/1/1:4:16,46:0.74:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,31:0.58:-0.83:1.000:0.915 0/0/0/1:4:47,24:0.34:-0.36:1.000:0.868 0/1/1/1:4:9,33:0.79:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,40:0.53:-0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:18,6:0.26:-1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,12:0.24:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,22:0.57:-1.22:1.000:0.937 0/1/1/1:4:18,55:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,17:0.31:-0.75:1.000:0.977 0/0/1/1:4:57,67:0.53: 1.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:53,48:0.47: 0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:46,14:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,21:0.48:-1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,97:0.51: 2.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,12:0.30:-1.17:0.999:0.981 0/0/0/1:4:38,15:0.29:-0.83:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,38:0.78:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,22:0.47:-1.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,38:0.73:-0.85:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,33:0.72:-1.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,28:0.41:-0.44:1.000:0.862 0/0/0/1:4:33,11:0.26:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,22:0.32:-0.41:1.000:0.948 0/1/1/1:4:8,33:0.80:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,43:0.54:-0.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,72:0.51: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,29:0.52:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,24:0.45:-0.83:1.000:0.978 0/0/1/1:4:26,16:0.38:-1.11:1.000:0.578 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,29:0.61:-0.98:1.000:0.659 0/0/1/1:4:19,23:0.54:-1.11:1.000:0.987 0/1/1/1:4:10,36:0.78:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,66:0.48: 1.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:17,7:0.30:-1.58:1.000:0.988 0/0/1/1:4:24,37:0.60:-0.62:1.000:0.773 0/0/0/1:4:47,14:0.24:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,69:0.46: 1.62:1.000:0.990 0/0/0/1:4:60,17:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,28:0.65:-1.09:1.000:0.774 0/0/0/1:4:24,11:0.32:-1.30:1.000:0.959 0/0/0/1:4:30,10:0.26:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,24:0.49:-0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,31:0.79:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,38:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,27:0.75:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,56:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,74:0.55: 1.28:1.000:0.983 0/1/1/1:4:36,102:0.74: 1.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,96:0.86: 0.71:1.000:0.975 0/0/0/1:4:94,27:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,68:0.77: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,57:0.45: 1.07:1.000:0.978 0/1/1/1:4:35,85:0.71: 0.91:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,3:0.38:-2.00:1.000:0.504 0/1/1/1:4:19,70:0.79: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,64:0.48: 1.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:71,27:0.28: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,79:0.52: 1.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:84,30:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,37:0.40: 0.21:1.000:0.760 0/0/0/1:4:87,29:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,85:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,49:0.54: 0.13:1.000:0.989 0/1/1/1:4:31,83:0.73: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,50:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,100:0.73: 1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,48:0.42: 0.76:1.000:0.907 0/0/1/1:4:50,56:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,90:0.73: 0.99:0.999:0.998 0/0/1/1:4:60,64:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,50:0.41: 0.94:1.000:0.870 0/0/1/1:4:52,63:0.54: 0.78:1.000:0.987 0/0/1/1:4:46,45:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,51:0.45: 0.71:1.000:0.981 0/0/0/1:4:64,12:0.17:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,37:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,40:0.48:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:125,29:0.20: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,66:0.53: 0.97:1.000:0.991 0/0/1/1:4:65,68:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,59:0.53: 0.63:1.000:0.990 0/0/0/1:4:101,33:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,73:0.48: 1.72:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,134:0.82: 2.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,73:0.73: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,80:0.73: 0.65:1.000:0.997 -chr3.1 75963488 chr3.1_075963488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:217,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.19:0.998:. ./.:4:207,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.78:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:26,0:.:-3.97:1.000:. ./.:4:84,0:.:-2.55:1.000:. ./.:3:30,0:.:-3.88:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.51:1.000:. ./.:6:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.90:0.999:. ./.:4:231,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.08:1.000:. ./.:6:216,0:.: 0.69:0.897:. ./.:4:229,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:215,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:283,1:.: 2.36:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:239,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:131,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:171,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:173,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.22:1.000:. -chr3.1 76196038 chr3.1_076196038 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,55:.: 0.55:1.000:. ./.:4:153,45:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,108:.:-0.12:1.000:. ./.:4:102,133:.: 0.50:1.000:. ./.:4:147,140:.: 1.39:1.000:. ./.:4:249,78:.: 2.08:1.000:. ./.:4:113,55:.:-0.66:1.000:. ./.:4:171,69:.: 0.58:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:73,18:.:-1.98:1.000:. ./.:4:76,20:.:-1.89:1.000:. ./.:4:217,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:158,68:.: 0.34:1.000:. ./.:4:126,104:.: 0.41:1.000:. ./.:4:180,69:.: 0.74:1.000:. ./.:4:205,51:.: 0.86:1.000:. ./.:4:210,73:.: 1.32:0.998:. ./.:4:149,141:.: 1.44:1.000:. ./.:4:312,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:226,81:.: 1.73:1.000:. ./.:4:53,46:.:-1.84:1.000:. ./.:4:145,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:208,67:.: 1.18:1.000:. ./.:4:166,43:.: 0.05:1.000:. ./.:4:75,2:.:-2.22:1.000:. ./.:4:188,65:.: 0.81:1.000:. ./.:4:216,69:.: 1.36:1.000:. ./.:4:172,58:.: 0.41:1.000:. ./.:4:134,137:.: 1.11:1.000:. ./.:4:229,65:.: 1.51:1.000:. ./.:4:196,54:.: 0.75:1.000:. ./.:4:150,41:.:-0.26:1.000:. ./.:4:53,13:.:-2.41:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.74:1.000:. ./.:3:23,8:.:-3.01:1.000:. ./.:4:196,78:.: 1.17:1.000:. ./.:4:193,51:.: 0.65:1.000:. ./.:4:122,114:.: 0.51:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:198,70:.: 1.06:1.000:. ./.:4:144,46:.:-0.28:1.000:. ./.:4:143,42:.:-0.36:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:137,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:96,107:.:-0.05:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:111,125:.: 0.51:1.000:. ./.:4:332,93:.: 3.76:1.000:. ./.:4:117,69:.:-0.35:1.000:. ./.:4:189,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:143,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:248,75:.: 2.01:1.000:. ./.:4:144,50:.:-0.21:1.000:. ./.:4:185,34:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,46:.: 0.14:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,73:.:-0.88:1.000:. ./.:4:181,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.47:1.000:. ./.:6:61,42:.:-1.77:1.000:. ./.:4:81,96:.:-0.50:1.000:. ./.:4:154,60:.: 0.14:1.000:. ./.:4:158,56:.: 0.14:1.000:. ./.:4:78,90:.:-0.66:1.000:. ./.:4:100,98:.:-0.14:1.000:. ./.:4:159,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:139,39:.:-0.48:1.000:. ./.:4:107,101:.: 0.03:1.000:. ./.:4:98,86:.:-0.38:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:195,56:.: 0.77:1.000:. ./.:4:198,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:135,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:143,48:.:-0.26:1.000:. ./.:4:168,39:.: 0.02:1.000:. ./.:4:129,109:.: 0.55:1.000:. ./.:4:108,24:.:-1.27:0.999:. ./.:4:144,42:.:-0.35:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:181,55:.: 0.51:1.000:. ./.:6:200,37:.: 0.53:0.897:. ./.:4:179,48:.: 0.36:1.000:. ./.:4:61,76:.:-1.19:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.67:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:150,44:.:-0.21:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:142,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,98:.: 0.20:1.000:. ./.:4:107,87:.:-0.21:1.000:. ./.:4:147,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:109,31:.:-1.14:1.000:. ./.:4:158,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:179,70:.: 0.74:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:107,18:.:-1.39:1.000:. ./.:4:107,37:.:-1.07:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:161,40:.:-0.09:1.000:. ./.:4:130,29:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,124:.: 0.34:1.000:. ./.:4:257,78:.: 2.21:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:233,76:.: 1.77:1.000:. ./.:4:133,45:.:-0.48:0.999:. ./.:4:77,85:.:-0.76:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:52,88:.:-1.14:1.000:. ./.:4:139,45:.:-0.38:1.000:. ./.:4:94,70:.:-0.72:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:86,72:.:-0.83:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:147,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:141,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:167,54:.: 0.26:1.000:. ./.:4:138,45:.:-0.40:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:135,48:.:-0.40:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:97,33:.:-1.31:1.000:. ./.:4:119,36:.:-0.88:1.000:. ./.:4:80,69:.:-0.98:1.000:. ./.:4:177,56:.: 0.46:1.000:. ./.:4:80,30:.:-1.65:1.000:. ./.:4:104,107:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,103:.: 0.05:1.000:. ./.:4:307,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:62,62:.:-1.41:1.000:. ./.:4:105,34:.:-1.15:1.000:. ./.:4:100,36:.:-1.21:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:163,28:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,39:.:-0.78:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:148,140:.: 1.41:1.000:. ./.:4:204,52:.: 0.86:1.000:. ./.:4:175,53:.: 0.38:1.000:. ./.:4:229,75:.: 1.68:1.000:. ./.:4:139,45:.:-0.38:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:184,62:.: 0.69:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:290,2:.: 1.48:1.000:. ./.:4:196,59:.: 0.84:1.000:. ./.:4:230,64:.: 1.51:1.000:. ./.:4:194,66:.: 0.93:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:131,137:.: 1.06:1.000:. ./.:4:168,53:.: 0.26:1.000:. ./.:4:135,49:.:-0.38:1.000:. ./.:4:170,59:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,183:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,131:.: 0.84:1.000:. ./.:4:106,99:.:-0.02:1.000:. ./.:4:168,48:.: 0.17:0.999:. ./.:4:153,58:.: 0.08:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:139,48:.:-0.33:1.000:. ./.:4:106,87:.:-0.23:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,112:.:-0.04:1.000:. ./.:4:101,78:.:-0.47:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:327,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:167,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:227,60:.: 1.39:1.000:. ./.:4:147,49:.:-0.17:1.000:. ./.:4:122,120:.: 0.62:1.000:. ./.:4:217,72:.: 1.42:1.000:. ./.:4:232,77:.: 1.77:1.000:. ./.:4:149,60:.: 0.05:1.000:. ./.:4:173,52:.: 0.32:1.000:. -chr3.1 76343830 chr3.1_076343830 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:245,61:.: 0.24:1.000:. ./.:4:121,113:.:-1.03:1.000:. ./.:4:209,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:214,59:.:-0.34:1.000:. ./.:4:264,89:.: 1.06:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:170,54:.:-1.20:1.000:. ./.:4:254,82:.: 0.77:1.000:. ./.:4:171,153:.: 0.55:1.000:. ./.:4:118,34:.:-2.47:1.000:. ./.:4:122,41:.:-2.28:1.000:. ./.:4:146,149:.: 0.04:1.000:. ./.:4:142,129:.:-0.38:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:222,75:.: 0.08:1.000:. ./.:4:228,80:.: 0.27:1.000:. ./.:4:249,79:.: 0.62:0.998:. ./.:4:173,167:.: 0.84:1.000:. ./.:4:199,186:.: 1.63:1.000:. ./.:4:257,90:.: 0.96:1.000:. ./.:4:174,38:.:-1.42:1.000:. ./.:4:203,56:.:-0.59:1.000:. ./.:4:262,72:.: 0.73:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:77,26:.:-3.33:1.000:. ./.:4:272,84:.: 1.12:1.000:. ./.:4:212,71:.:-0.17:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:251,71:.: 0.52:1.000:. ./.:4:263,82:.: 0.92:1.000:. ./.:4:144,148:.:-0.01:1.000:. ./.:4:206,61:.:-0.45:1.000:. ./.:4:54,20:.:-3.84:1.000:. ./.:4:77,72:.:-2.52:1.000:. ./.:3:32,37:.:-3.93:1.000:. ./.:4:210,80:.:-0.04:1.000:. ./.:4:240,71:.: 0.33:1.000:. ./.:4:220,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:218,84:.: 0.17:1.000:. ./.:4:267,73:.: 0.84:1.000:. ./.:4:210,72:.:-0.18:1.000:. ./.:4:257,66:.: 0.54:1.000:. ./.:4:273,92:.: 1.28:1.000:. ./.:4:226,74:.: 0.13:1.000:. ./.:4:302,93:.: 1.80:1.000:. ./.:4:177,165:.: 0.87:1.000:. ./.:4:262,87:.: 0.99:1.000:. ./.:4:62,24:.:-3.63:1.000:. ./.:4:230,69:.: 0.11:1.000:. ./.:4:146,136:.:-0.18:1.000:. ./.:4:165,67:.:-1.06:1.000:. ./.:4:255,79:.: 0.73:1.000:. ./.:4:172,66:.:-0.96:1.000:. ./.:4:161,164:.: 0.57:1.000:. ./.:4:242,76:.: 0.45:1.000:. ./.:4:166,158:.: 0.55:1.000:. ./.:4:234,86:.: 0.48:1.000:. ./.:4:248,74:.: 0.52:1.000:. ./.:4:209,91:.: 0.13:1.000:. ./.:6:208,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:223,76:.: 0.11:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:236,85:.: 0.50:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:241,79:.: 0.48:1.000:. ./.:4:174,150:.: 0.55:1.000:. ./.:4:148,48:.:-1.70:1.000:. ./.:4:231,73:.: 0.20:1.000:. ./.:4:265,72:.: 0.78:1.000:. ./.:4:197,74:.:-0.38:1.000:. ./.:4:294,85:.: 1.52:1.000:. ./.:4:168,70:.:-0.96:1.000:. ./.:4:88,222:.: 0.31:1.000:. ./.:4:223,69:.:-0.01:1.000:. ./.:4:145,142:.:-0.10:1.000:. ./.:4:193,54:.:-0.80:1.000:. ./.:4:217,67:.:-0.15:1.000:. ./.:4:258,75:.: 0.71:1.000:. ./.:4:219,75:.: 0.03:1.000:. ./.:4:227,81:.: 0.27:1.000:. ./.:4:134,139:.:-0.34:0.999:. ./.:4:233,79:.: 0.34:1.000:. ./.:4:288,79:.: 1.31:1.000:. ./.:4:169,67:.:-0.99:1.000:. ./.:6:278,82:.: 1.19:0.897:. ./.:4:240,82:.: 0.52:1.000:. ./.:4:217,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:222,88:.: 0.31:1.000:. ./.:4:199,54:.:-0.69:1.000:. ./.:4:209,70:.:-0.24:1.000:. ./.:4:175,41:.:-1.35:0.999:. ./.:4:216,75:.:-0.03:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:166,56:.:-1.24:1.000:. ./.:4:193,160:.: 1.06:1.000:. ./.:4:217,81:.: 0.10:1.000:. ./.:4:229,80:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,118:.:-0.85:1.000:. ./.:4:255,96:.: 1.03:1.000:. ./.:4:237,70:.: 0.26:1.000:. ./.:4:168,38:.:-1.52:1.000:. ./.:4:256,85:.: 0.85:1.000:. ./.:4:173,54:.:-1.15:1.000:. ./.:4:224,71:.: 0.04:1.000:. ./.:4:131,108:.:-0.94:1.000:. ./.:4:193,68:.:-0.55:1.000:. ./.:4:168,141:.: 0.29:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:301,94:.: 1.80:1.000:. ./.:4:237,55:.:-0.01:1.000:. ./.:4:173,139:.: 0.34:1.000:. ./.:4:193,208:.: 1.91:1.000:. ./.:4:233,77:.: 0.31:0.999:. ./.:4:247,59:.: 0.24:1.000:. ./.:4:167,59:.:-1.17:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:200,69:.:-0.41:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:208,69:.:-0.27:1.000:. ./.:4:182,69:.:-0.73:1.000:. ./.:4:159,142:.: 0.15:1.000:. ./.:4:214,80:.: 0.03:1.000:. ./.:4:234,77:.: 0.33:1.000:. ./.:4:189,145:.: 0.73:1.000:. ./.:4:164,150:.: 0.38:1.000:. ./.:4:271,81:.: 1.05:1.000:. ./.:4:267,76:.: 0.89:1.000:. ./.:4:167,148:.: 0.40:1.000:. ./.:4:206,59:.:-0.48:1.000:. ./.:4:158,64:.:-1.24:1.000:. ./.:4:229,69:.: 0.10:1.000:. ./.:4:228,61:.:-0.06:1.000:. ./.:4:111,97:.:-1.49:1.000:. ./.:4:248,77:.: 0.57:1.000:. ./.:4:212,82:.: 0.03:1.000:. ./.:4:306,111:.: 2.19:1.000:. ./.:4:235,85:.: 0.48:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:189,67:.:-0.64:1.000:. ./.:4:192,73:.:-0.48:1.000:. ./.:4:229,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:188,77:.:-0.48:1.000:. ./.:4:192,64:.:-0.64:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:322,93:.: 2.16:1.000:. ./.:4:309,97:.: 2.00:1.000:. ./.:4:213,81:.: 0.03:1.000:. ./.:4:224,93:.: 0.43:1.000:. ./.:4:263,90:.: 1.06:1.000:. ./.:4:191,61:.:-0.71:1.000:. ./.:4:248,90:.: 0.80:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:103,49:.:-2.47:1.000:. ./.:4:207,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:156,144:.: 0.13:1.000:. ./.:4:269,91:.: 1.19:1.000:. ./.:4:281,84:.: 1.28:1.000:. ./.:4:234,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:210,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:162,164:.: 0.59:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:208,53:.:-0.55:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,157:.: 0.06:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:237,83:.: 0.48:1.000:. ./.:4:286,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,214:.:-0.04:0.999:. ./.:4:205,77:.:-0.18:1.000:. ./.:4:210,65:.:-0.31:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:197,49:.:-0.82:1.000:. ./.:4:212,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:205,69:.:-0.33:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:187,62:.:-0.77:1.000:. ./.:4:166,129:.: 0.04:1.000:. ./.:4:148,150:.: 0.10:1.000:. ./.:4:254,88:.: 0.87:1.000:. ./.:4:208,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:277,81:.: 1.15:1.000:. ./.:4:265,99:.: 1.26:1.000:. ./.:4:330,85:.: 2.16:1.000:. ./.:4:236,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:151,157:.: 0.27:1.000:. -chr3.1 76448210 chr3.1_076448210 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:274,102:.: 1.16:1.000:. ./.:4:180,59:.:-0.72:1.000:. ./.:4:133,146:.:-0.17:1.000:. ./.:4:169,178:.: 0.76:1.000:. ./.:4:206,199:.: 1.56:1.000:. ./.:4:248,100:.: 0.78:1.000:. ./.:4:165,51:.:-1.04:1.000:. ./.:4:206,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,24:.:-3.06:1.000:. ./.:4:59,29:.:-2.80:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:216,85:.: 0.13:1.000:. ./.:4:144,155:.: 0.10:1.000:. ./.:4:229,78:.: 0.21:1.000:. ./.:4:245,70:.: 0.32:1.000:. ./.:4:256,110:.: 1.02:0.998:. ./.:4:252,83:.: 0.60:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:218,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:39,59:.:-2.66:1.000:. ./.:4:200,75:.:-0.23:1.000:. ./.:4:231,101:.: 0.56:1.000:. ./.:4:224,66:.:-0.02:1.000:. ./.:4:71,2:.:-3.00:1.000:. ./.:4:260,93:.: 0.85:1.000:. ./.:4:238,105:.: 0.71:1.000:. ./.:4:225,100:.: 0.46:1.000:. ./.:4:172,206:.: 1.19:1.000:. ./.:4:247,80:.: 0.49:1.000:. ./.:4:289,93:.: 1.24:1.000:. ./.:4:193,64:.:-0.47:1.000:. ./.:4:41,31:.:-3.01:1.000:. ./.:4:111,5:.:-2.41:1.000:. ./.:3:26,26:.:-3.29:1.000:. ./.:4:225,72:.: 0.08:1.000:. ./.:4:259,72:.: 0.54:1.000:. ./.:4:124,154:.:-0.18:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:245,74:.: 0.38:1.000:. ./.:4:258,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:258,95:.: 0.85:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:210,97:.: 0.21:1.000:. ./.:4:173,156:.: 0.52:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:157,195:.: 0.83:1.000:. ./.:4:504,172:.: 5.28:1.000:. ./.:4:147,175:.: 0.42:1.000:. ./.:4:262,78:.: 0.67:1.000:. ./.:4:195,62:.:-0.47:1.000:. ./.:4:331,123:.: 2.23:1.000:. ./.:4:219,66:.:-0.09:1.000:. ./.:4:275,93:.: 1.05:1.000:. ./.:4:189,91:.:-0.16:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,136:.:-0.01:1.000:. ./.:4:244,91:.: 0.60:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.42:1.000:. ./.:6:118,123:.:-0.69:1.000:. ./.:4:140,158:.: 0.09:1.000:. ./.:4:235,77:.: 0.28:1.000:. ./.:4:252,91:.: 0.71:1.000:. ./.:4:112,173:.:-0.09:1.000:. ./.:4:171,188:.: 0.93:1.000:. ./.:4:229,91:.: 0.39:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:243,84:.: 0.49:1.000:. ./.:4:141,175:.: 0.34:1.000:. ./.:4:166,197:.: 0.98:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:263,110:.: 1.12:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:251,93:.: 0.72:1.000:. ./.:4:212,73:.:-0.09:1.000:. ./.:4:237,89:.: 0.47:1.000:. ./.:4:159,168:.: 0.49:1.000:. ./.:4:176,62:.:-0.73:0.999:. ./.:4:233,84:.: 0.35:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:219,63:.:-0.13:1.000:. ./.:6:306,87:.: 1.40:0.897:. ./.:4:210,77:.:-0.06:1.000:. ./.:4:105,116:.:-0.97:1.000:. ./.:4:192,58:.:-0.57:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:208,74:.:-0.13:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:219,86:.: 0.19:1.000:. ./.:4:176,164:.: 0.67:1.000:. ./.:4:128,167:.: 0.05:1.000:. ./.:4:192,75:.:-0.34:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:142,94:.:-0.76:1.000:. ./.:4:195,85:.:-0.16:1.000:. ./.:4:292,81:.: 1.12:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:127,67:.:-1.34:1.000:. ./.:4:213,64:.:-0.20:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:190,93:.:-0.12:1.000:. ./.:4:211,59:.:-0.29:1.000:. ./.:4:161,155:.: 0.34:1.000:. ./.:4:289,109:.: 1.46:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:326,75:.: 1.51:1.000:. ./.:4:170,78:.:-0.60:0.999:. ./.:4:129,166:.: 0.05:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:84,159:.:-0.67:1.000:. ./.:4:186,50:.:-0.76:1.000:. ./.:4:129,155:.:-0.10:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:139,147:.:-0.07:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:213,90:.: 0.16:1.000:. ./.:4:220,88:.: 0.23:1.000:. ./.:4:187,71:.:-0.46:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:193,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:137,48:.:-1.46:1.000:. ./.:4:175,63:.:-0.73:1.000:. ./.:4:120,131:.:-0.56:1.000:. ./.:4:211,76:.:-0.06:1.000:. ./.:4:145,57:.:-1.23:1.000:. ./.:4:146,180:.: 0.47:1.000:. ./.:4:144,135:.:-0.17:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:301,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:138,111:.:-0.58:1.000:. ./.:4:167,74:.:-0.69:1.000:. ./.:4:180,69:.:-0.58:1.000:. ./.:4:289,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:190,75:.:-0.36:1.000:. ./.:4:147,51:.:-1.28:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:199,223:.: 1.79:1.000:. ./.:4:227,93:.: 0.39:1.000:. ./.:4:247,76:.: 0.43:1.000:. ./.:4:266,102:.: 1.05:1.000:. ./.:4:219,84:.: 0.16:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:211,68:.:-0.17:1.000:. ./.:4:49,1:.:-3.32:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:201,81:.:-0.13:1.000:. ./.:4:275,109:.: 1.27:1.000:. ./.:4:228,72:.: 0.12:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,154:.:-0.10:1.000:. ./.:4:194,67:.:-0.42:1.000:. ./.:4:248,80:.: 0.50:1.000:. ./.:4:249,92:.: 0.68:1.000:. ./.:4:79,263:.: 0.69:1.000:. ./.:4:135,125:.:-0.43:1.000:. ./.:4:113,125:.:-0.73:1.000:. ./.:4:193,85:.:-0.18:0.999:. ./.:4:199,80:.:-0.17:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:193,49:.:-0.68:1.000:. ./.:4:125,120:.:-0.64:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:126,135:.:-0.42:1.000:. ./.:4:143,157:.: 0.12:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:233,75:.: 0.23:1.000:. ./.:4:224,77:.: 0.13:1.000:. ./.:4:215,78:.: 0.02:1.000:. ./.:4:159,156:.: 0.32:1.000:. ./.:4:284,105:.: 1.34:1.000:. ./.:4:242,97:.: 0.65:1.000:. ./.:4:186,65:.:-0.56:1.000:. ./.:4:281,77:.: 0.91:1.000:. -chr3.1 76555403 chr3.1_076555403 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:123,397:0.74: 1.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:170,205:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:109,380:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,368:0.80: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,443:0.77: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,272:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,204:0.52:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:231,235:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:308,127:0.30: 0.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:170,149:0.45:-1.43:1.000:0.979 0/1/1/1:4:52,274:0.82:-1.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,304:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:190,213:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:105,350:0.74: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,241:0.52: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,306:0.73:-0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:110,389:0.75: 0.82:0.998:0.999 0/1/1/1:4:119,384:0.74: 0.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:389,171:0.31: 1.58:1.000:0.970 0/0/1/1:4:236,264:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,314:0.86:-0.92:1.000:0.977 0/0/1/1:4:195,233:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:246,270:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,200:0.48:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,216:0.80:-2.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,564:1.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,239:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:87,301:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:119,464:0.77: 1.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,372:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:142,441:0.73: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:192,215:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,47:0.43:-4.10:1.000:0.954 0/0/1/1:4:132,134:0.48:-2.09:1.000:0.995 0/1/1:3:61,98:0.59:-3.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:102,332:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:262,263:0.48: 1.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:111,364:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:231,252:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:123,373:0.72: 0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,444:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,129:0.31:-0.08:1.000:0.974 0/0/1/1:4:225,281:0.53: 0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:209,215:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:107,395:0.76: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,225:0.51:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:137,433:0.73: 1.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,256:0.80:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,317:0.74:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,153:0.48:-1.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:158,196:0.53:-0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:206,284:0.55: 0.71:1.000:0.977 0/1/1/1:4:100,310:0.73:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:225,237:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,293:0.74:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:233,274:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,301:0.74:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,308:0.52: 1.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:211,275:0.54: 0.66:1.000:0.988 0/1/1/1/1/1:6:44,344:0.87:-0.57:1.000:0.989 0/1/1/1:4:98,367:0.76: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,215:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:230,337:0.57: 1.67:1.000:0.953 0/1/1/1:4:142,371:0.70: 1.00:1.000:0.981 0/1/1/1:4:122,402:0.74: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,256:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:166,210:0.53:-0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:193,214:0.50:-0.33:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,520:1.00: 1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,415:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,574:1.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,190:0.46:-0.52:1.000:0.990 0/0/1/1:4:281,308:0.50: 1.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:207,212:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:111,388:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:301,128:0.31:-0.05:1.000:0.979 1/1/1/1:4:1,451:1.00: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,436:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,341:0.77:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,506:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,216:0.53:-0.54:0.999:0.993 0/0/1/1:4:229,265:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:234,296:0.53: 1.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:166,179:0.49:-1.10:1.000:0.996 0/1/1/1/1/1:6:110,485:0.79: 2.02:0.897:0.890 0/0/1/1:4:207,249:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,274:0.76:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,202:0.49:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:102,353:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,339:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:281,114:0.30:-0.48:0.999:0.987 0/1/1/1:4:94,327:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,421:0.76: 1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,248:1.00:-2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,242:0.53: 0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:136,410:0.72: 1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,187:0.53:-1.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:81,302:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,234:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:262,119:0.32:-0.65:1.000:0.958 0/0/1/1:4:170,236:0.55:-0.34:1.000:0.975 0/0/1/1:4:222,207:0.46:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:134,175:0.54:-1.55:1.000:0.988 0/0/0/1:4:227,119:0.34:-1.09:1.000:0.835 0/0/1/1:4:180,210:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,320:0.76:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,237:0.56:-0.37:1.000:0.968 0/1/1/1:4:94,352:0.76: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,280:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:264,108:0.30:-0.77:1.000:0.986 0/0/1/1:4:188,206:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:127,474:0.76: 2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,235:0.59:-0.67:0.999:0.855 0/0/1/1:4:210,277:0.54: 0.67:1.000:0.986 0/1/1/1:4:57,228:0.78:-1.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,268:0.69:-0.72:1.000:0.966 0/1/1/1:4:88,324:0.76:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,488:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,217:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,231:0.57:-0.58:1.000:0.947 0/0/0/1:4:265,111:0.30:-0.72:1.000:0.982 0/1/1/1:4:84,299:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:116,350:0.72: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,399:0.76: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,346:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,239:0.52: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,321:0.75:-0.23:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,441:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,206:0.56:-1.00:1.000:0.972 0/1/1/1:4:80,254:0.73:-1.24:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,462:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,352:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,127:0.48:-2.27:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,325:0.77:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,207:0.52:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:257,286:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:321,97:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,322:0.78:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,95:0.28:-0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,187:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:215,237:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,299:0.80:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,206:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:82,284:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:345,150:0.31: 0.77:1.000:0.973 0/1/1/1:4:141,482:0.75: 2.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,350:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,327:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,122:0.29: 0.12:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,413:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,266:0.48: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:95,360:0.77: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,153:0.49:-1.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,284:0.74:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:226,230:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:221,238:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:136,403:0.72: 1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:345,128:0.28: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:185,205:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:350,139:0.29: 0.70:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,448:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,218:0.53:-0.49:1.000:0.993 0/1/1/1:4:97,293:0.72:-0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:113,337:0.72: 0.21:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,362:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,360:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:79,313:0.77:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,312:0.78:-0.58:0.999:1.000 0/1/1/1:4:102,365:0.75: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,215:0.52:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:174,204:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,297:0.73:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,217:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,307:0.77:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,320:0.78:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,168:0.48:-1.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:359,167:0.32: 1.16:1.000:0.947 0/1/1/1:4:107,371:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:236,255:0.49: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,303:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,251:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:137,460:0.74: 2.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,568:1.00: 1.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,326:0.79:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,332:0.72: 0.12:1.000:0.996 -chr3.1 76707181 chr3.1_076707181 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,408:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,364:.:-0.64:1.000:. ./.:4:200,169:.:-0.59:1.000:. ./.:4:200,294:.: 0.59:1.000:. ./.:4:151,480:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,632:.: 1.89:1.000:. ./.:4:74,305:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,325:.:-0.17:1.000:. ./.:4:94,284:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,124:.:-2.67:1.000:. ./.:4:38,148:.:-2.32:1.000:. ./.:4:112,373:.: 0.50:1.000:. ./.:4:224,270:.: 0.59:1.000:. ./.:4:137,408:.: 1.07:1.000:. ./.:4:106,336:.: 0.10:1.000:. ./.:4:130,429:.: 1.20:1.000:. ./.:4:107,351:.: 0.25:0.998:. ./.:4:226,252:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,442:.: 1.62:1.000:. ./.:4:135,492:.: 1.85:1.000:. ./.:4:48,173:.:-1.99:1.000:. ./.:4:115,354:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,644:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,430:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,132:.:-2.67:1.000:. ./.:4:179,194:.:-0.56:1.000:. ./.:4:130,407:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,500:.: 0.64:1.000:. ./.:4:157,509:.: 2.21:1.000:. ./.:4:101,324:.:-0.06:1.000:. ./.:4:166,223:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,387:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,129:.:-2.86:1.000:. ./.:4:46,158:.:-2.15:1.000:. ./.:3:30,54:.:-3.29:1.000:. ./.:4:216,270:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,435:.: 0.03:1.000:. ./.:4:123,393:.: 0.80:1.000:. ./.:4:2,345:.:-0.80:1.000:. ./.:4:207,185:.:-0.38:1.000:. ./.:4:162,210:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,454:.: 0.21:1.000:. ./.:4:64,218:.:-1.42:1.000:. ./.:4:195,233:.:-0.04:1.000:. ./.:4:92,325:.:-0.14:1.000:. ./.:4:306,318:.: 1.82:1.000:. ./.:4:120,439:.: 1.20:1.000:. ./.:4:126,159:.:-1.39:1.000:. ./.:4:111,150:.:-1.61:1.000:. ./.:4:87,323:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,412:.: 1.15:1.000:. ./.:4:118,306:.:-0.07:1.000:. ./.:4:194,251:.: 0.12:1.000:. ./.:4:120,346:.: 0.32:1.000:. ./.:4:70,275:.:-0.82:1.000:. ./.:4:170,207:.:-0.52:1.000:. ./.:4:54,283:.:-0.90:1.000:. ./.:4:77,233:.:-1.15:1.000:. ./.:6:166,180:.:-0.81:1.000:. ./.:4:195,246:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,432:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,469:.: 0.35:1.000:. ./.:4:64,242:.:-1.19:1.000:. ./.:4:210,238:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,182:.:-1.15:1.000:. ./.:4:80,312:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,428:.:-0.04:1.000:. ./.:4:218,233:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,307:.:-0.21:1.000:. ./.:4:211,223:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,332:.:-0.93:1.000:. ./.:4:74,251:.:-1.01:1.000:. ./.:4:113,446:.: 1.20:1.000:. ./.:4:85,310:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,360:.:-0.68:1.000:. ./.:4:185,233:.:-0.13:1.000:. ./.:4:195,279:.: 0.40:1.000:. ./.:4:173,220:.:-0.37:1.000:. ./.:4:193,237:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,317:.:-1.09:0.999:. ./.:4:101,341:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,514:.: 0.79:1.000:. ./.:4:92,324:.:-0.15:1.000:. ./.:6:88,451:.: 1.01:0.897:. ./.:4:1,525:.: 0.89:1.000:. ./.:4:63,224:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,344:.:-0.83:1.000:. ./.:4:107,329:.: 0.04:1.000:. ./.:4:191,227:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1,468:.: 0.35:0.999:. ./.:4:83,272:.:-0.73:1.000:. ./.:4:116,355:.: 0.37:1.000:. ./.:4:181,182:.:-0.65:1.000:. ./.:4:173,227:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,281:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,429:.:-0.03:1.000:. ./.:4:60,273:.:-0.93:1.000:. ./.:4:1,480:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,531:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,361:.: 0.01:1.000:. ./.:4:104,368:.: 0.38:1.000:. ./.:4:60,247:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,551:.: 1.13:1.000:. ./.:4:68,233:.:-1.24:1.000:. ./.:4:72,255:.:-0.99:1.000:. ./.:4:162,190:.:-0.75:1.000:. ./.:4:92,409:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,656:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,477:.: 0.43:1.000:. ./.:4:90,320:.:-0.21:1.000:. ./.:4:278,265:.: 1.05:1.000:. ./.:4:116,384:.: 0.64:0.999:. ./.:4:74,336:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,219:.:-1.37:1.000:. ./.:4:107,306:.:-0.18:1.000:. ./.:4:88,326:.:-0.17:1.000:. ./.:4:76,266:.:-0.85:1.000:. ./.:4:94,327:.:-0.10:1.000:. ./.:4:109,291:.:-0.30:1.000:. ./.:4:85,355:.: 0.08:1.000:. ./.:4:96,312:.:-0.22:1.000:. ./.:4:179,242:.:-0.10:1.000:. ./.:4:234,295:.: 0.92:1.000:. ./.:4:183,199:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,548:.: 1.10:1.000:. ./.:4:218,211:.:-0.03:1.000:. ./.:4:109,138:.:-1.75:1.000:. ./.:4:63,261:.:-1.02:1.000:. ./.:4:81,264:.:-0.82:1.000:. ./.:4:161,219:.:-0.49:1.000:. ./.:4:87,345:.: 0.00:1.000:. ./.:4:134,171:.:-1.20:1.000:. ./.:4:196,258:.: 0.21:1.000:. ./.:4:109,341:.: 0.17:1.000:. ./.:4:1,611:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,465:.: 0.31:1.000:. ./.:4:98,331:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,366:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,309:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,469:.: 0.35:1.000:. ./.:4:92,376:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,478:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,379:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,680:.: 2.35:1.000:. ./.:4:296,348:.: 2.01:1.000:. ./.:4:115,376:.: 0.56:1.000:. ./.:4:116,335:.: 0.18:1.000:. ./.:4:2,517:.: 0.82:1.000:. ./.:4:179,180:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,544:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,467:.: 0.33:1.000:. ./.:4:32,160:.:-2.27:1.000:. ./.:4:117,312:.:-0.03:1.000:. ./.:4:130,397:.: 0.90:1.000:. ./.:4:131,433:.: 1.25:1.000:. ./.:4:297,332:.: 1.86:1.000:. ./.:4:1,543:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,440:.: 0.08:1.000:. ./.:4:122,439:.: 1.22:1.000:. ./.:4:126,324:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,324:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,457:.: 0.24:1.000:. ./.:4:250,246:.: 0.61:1.000:. ./.:4:106,412:.: 0.81:1.000:. ./.:4:216,201:.:-0.14:1.000:. ./.:4:104,306:.:-0.21:1.000:. ./.:4:234,249:.: 0.48:0.999:. ./.:4:213,241:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1,470:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,396:.:-0.34:1.000:. ./.:4:87,289:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,469:.: 0.35:1.000:. ./.:4:181,201:.:-0.47:1.000:. ./.:4:69,267:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,347:.:-0.80:1.000:. ./.:4:121,474:.: 1.54:1.000:. ./.:4:252,294:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,474:.: 0.40:1.000:. ./.:4:126,316:.: 0.10:1.000:. ./.:4:126,432:.: 1.19:1.000:. ./.:4:263,364:.: 1.85:1.000:. ./.:4:284,287:.: 1.32:1.000:. ./.:4:78,275:.:-0.74:1.000:. ./.:4:127,397:.: 0.87:1.000:. -chr3.1 77056566 chr3.1_077056566 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,158:.: 0.36:1.000:. ./.:4:30,106:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.88:1.000:. ./.:4:48,148:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,77:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,39:.:-2.86:1.000:. ./.:4:0,37:.:-2.91:1.000:. ./.:4:64,75:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.34:1.000:. ./.:4:36,136:.: 0.74:1.000:. ./.:4:29,105:.:-0.29:1.000:. ./.:4:47,90:.:-0.20:1.000:. ./.:4:38,113:.: 0.17:0.998:. ./.:4:58,131:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,200:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,38:.:-2.88:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.04:1.000:. ./.:4:35,92:.:-0.48:1.000:. ./.:4:3,16:.:-3.40:1.000:. ./.:4:37,132:.: 0.66:1.000:. ./.:4:37,128:.: 0.55:1.000:. ./.:4:33,104:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,187:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,12:.:-3.59:1.000:. ./.:4:0,45:.:-2.69:1.000:. ./.:3:0,4:.:-3.80:1.000:. ./.:4:29,111:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,183:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.15:1.000:. ./.:4:44,163:.: 1.69:1.000:. ./.:4:42,142:.: 1.07:1.000:. ./.:4:35,121:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,128:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,198:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,57:.:-2.37:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,174:.: 0.80:1.000:. ./.:4:35,105:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,211:.: 1.80:1.000:. ./.:4:41,107:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,184:.: 1.07:1.000:. ./.:4:34,112:.: 0.04:1.000:. ./.:6:0,116:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,155:.: 0.31:1.000:. ./.:4:44,117:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,197:.: 1.42:1.000:. ./.:4:42,128:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.69:1.000:. ./.:4:18,78:.:-1.31:1.000:. ./.:4:35,95:.:-0.39:1.000:. ./.:4:31,137:.: 0.63:1.000:. ./.:4:29,101:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,203:.: 1.58:1.000:. ./.:4:21,74:.:-1.34:1.000:. ./.:4:41,155:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.47:1.000:. ./.:4:62,69:.:-0.37:1.000:. ./.:4:28,99:.:-0.48:1.000:. ./.:4:35,101:.:-0.23:1.000:. ./.:4:37,108:.: 0.01:1.000:. ./.:4:38,147:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,192:.: 1.28:1.000:. ./.:4:37,92:.:-0.42:0.999:. ./.:4:40,159:.: 1.47:1.000:. ./.:4:35,135:.: 0.69:1.000:. ./.:4:26,97:.:-0.58:1.000:. ./.:6:33,177:.: 1.77:0.897:. ./.:4:0,161:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.20:1.000:. ./.:4:36,98:.:-0.29:1.000:. ./.:4:27,102:.:-0.42:1.000:. ./.:4:24,109:.:-0.31:0.999:. ./.:4:29,121:.: 0.15:1.000:. ./.:4:38,141:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.66:1.000:. ./.:4:42,140:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,104:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,108:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.58:1.000:. ./.:4:22,74:.:-1.31:1.000:. ./.:4:37,127:.: 0.53:1.000:. ./.:4:22,68:.:-1.48:1.000:. ./.:4:1,153:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,112:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,192:.: 1.28:1.000:. ./.:4:34,128:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,201:.: 1.53:1.000:. ./.:4:41,112:.: 0.23:0.999:. ./.:4:0,171:.: 0.72:1.000:. ./.:4:17,78:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.36:1.000:. ./.:4:34,115:.: 0.12:1.000:. ./.:4:34,144:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,119:.: 0.26:1.000:. ./.:4:48,122:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.20:1.000:. ./.:4:44,114:.: 0.36:1.000:. ./.:4:36,110:.: 0.04:1.000:. ./.:4:56,58:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.56:1.000:. ./.:4:29,87:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.10:1.000:. ./.:4:34,117:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.67:1.000:. ./.:4:48,169:.: 1.96:1.000:. ./.:4:33,133:.: 0.58:1.000:. ./.:4:32,100:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,117:.: 0.20:1.000:. ./.:4:41,101:.:-0.07:1.000:. ./.:4:18,105:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.69:1.000:. ./.:4:25,90:.:-0.80:1.000:. ./.:4:39,127:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,191:.: 1.26:1.000:. ./.:4:20,100:.:-0.67:1.000:. ./.:4:39,124:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,98:.:-0.26:1.000:. ./.:4:9,31:.:-2.83:1.000:. ./.:4:19,62:.:-1.72:1.000:. ./.:4:1,167:.: 0.63:1.000:. ./.:4:35,112:.: 0.07:1.000:. ./.:4:26,131:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,187:.: 1.15:1.000:. ./.:4:19,87:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.07:1.000:. ./.:4:24,101:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,115:.:-0.04:1.000:. ./.:4:1,140:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.36:1.000:. ./.:4:35,107:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.26:0.999:. ./.:4:23,93:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,99:.:-0.23:1.000:. ./.:4:19,88:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.80:1.000:. ./.:4:29,124:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,107:.:-0.31:1.000:. ./.:4:30,105:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,72:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1,186:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,94:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.10:1.000:. ./.:4:50,132:.: 1.01:1.000:. ./.:4:38,118:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.56:1.000:. ./.:4:33,105:.:-0.18:1.000:. -chr3.1 77281257 chr3.1_077281257 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:72,63:0.49: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,41:0.41:-0.12:1.000:0.870 0/1/1/1:4:30,90:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,86:0.74: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,57:0.44: 0.88:1.000:0.970 0/0/1/1:4:83,80:0.51: 1.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,30:0.47:-1.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,50:0.39: 0.88:1.000:0.708 0/0/0/1:4:91,26:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,7:0.52:-3.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,10:0.44:-2.81:1.000:0.961 0/1/1/1:4:33,90:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,39:0.40:-0.22:1.000:0.817 0/1/1/1:4:29,90:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,59:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,36:0.27: 1.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,56:0.45: 0.71:0.998:0.980 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,30:0.20: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,77:0.52: 1.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,8:0.36:-2.81:1.000:0.738 0/0/1/1:4:59,52:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,26:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,43:0.44:-0.18:1.000:0.962 0/0/0/1:4:21,3:0.15:-2.81:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,110:0.71: 1.68:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,67:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,68:0.52: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,50:0.46: 0.15:1.000:0.988 0/0/1/1:4:82,63:0.45: 1.21:1.000:0.983 0/0/1/1:4:89,77:0.48: 1.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,31:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:20,1:0.08:-2.91:1.000:0.991 0/0/0/1:4:23,7:0.26:-2.61:1.000:0.999 0/1/1:3:4,4:0.52:-3.34:1.000:0.765 0/1/1/1:4:28,82:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,34:0.26: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,68:0.52: 0.88:1.000:0.995 0/0/0/1:4:124,31:0.23: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,93:0.74: 0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,79:0.78:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,33:0.31: 0.28:1.000:0.979 0/0/0/1:4:94,44:0.34: 0.98:1.000:0.860 0/0/1/1:4:67,64:0.51: 0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,80:0.75:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,24:0.20: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,89:0.79: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,70:0.53: 0.95:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,80:0.75:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,53:0.40: 1.01:1.000:0.809 0/0/1/1:4:37,45:0.57:-0.88:1.000:0.956 0/0/1/1:4:65,69:0.53: 0.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,23:0.44:-1.78:1.000:0.964 0/0/1/1:4:61,64:0.53: 0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:55,41:0.45:-0.42:1.000:0.976 0/0/0/1:4:105,31:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,58:0.69:-0.75:1.000:0.973 0/0/1/1:4:64,60:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,58:0.47: 0.65:1.000:0.993 0/1/1/1/1/1:6:22,61:0.75:-0.85:1.000:0.514 0/1/1/1:4:31,61:0.68:-0.55:1.000:0.950 0/0/1/1:4:50,51:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:102,23:0.21: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,63:0.70:-0.55:1.000:0.985 0/1/1/1:4:34,82:0.72: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,60:0.55: 0.11:1.000:0.977 0/0/1/1:4:33,28:0.48:-1.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,40:0.34: 0.55:1.000:0.852 0/1/1/1:4:33,80:0.72: 0.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,78:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,20:0.25:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,68:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,61:0.49: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,85:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,24:0.27:-0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,66:0.77:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,68:0.71:-0.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:30,67:0.71:-0.38:1.000:0.989 0/1/1/1:4:35,82:0.72: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,44:0.42: 0.01:0.999:0.928 0/0/1/1:4:46,57:0.57:-0.18:1.000:0.946 0/0/0/1:4:90,24:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,36:0.37:-0.18:1.000:0.546 0/0/1/1/1/1:6:66,86:0.58: 1.44:0.897:0.500 0/0/0/1:4:84,26:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,31:0.44:-1.15:1.000:0.965 0/0/0/1:4:69,16:0.21:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,38:0.47:-0.82:1.000:0.993 0/1/1/1:4:30,75:0.73:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,14:0.24:-1.45:0.999:1.000 0/0/1/1:4:72,53:0.44: 0.55:1.000:0.972 0/1/1/1:4:28,76:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,53:0.70:-1.05:1.000:0.988 0/0/1/1:4:51,41:0.46:-0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:53,57:0.54: 0.05:1.000:0.990 0/0/0/1:4:65,25:0.30:-0.62:1.000:0.984 0/1/1/1:4:24,67:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,22:0.26:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,30:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,30:0.45:-1.28:1.000:0.978 0/0/1/1:4:50,47:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,35:0.49:-1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,16:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,28:0.32:-0.52:1.000:0.942 0/0/1/1:4:57,42:0.44:-0.32:1.000:0.973 0/0/1/1:4:39,36:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,86:0.79: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,29:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,34:0.31: 0.35:1.000:0.975 0/0/0/1:4:68,14:0.20:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,73:0.47: 1.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,46:0.43: 0.15:0.999:0.939 0/0/1/1:4:60,65:0.54: 0.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:45,48:0.53:-0.52:1.000:0.991 0/1/1/1:4:26,53:0.69:-0.98:1.000:0.967 0/0/1/1:4:53,43:0.47:-0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,67:0.70:-0.35:1.000:0.984 0/0/1/1:4:46,46:0.52:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,43:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,30:0.31:-0.15:1.000:0.970 0/0/1/1:4:56,50:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,76:0.73:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,74:0.55: 0.98:1.000:0.976 0/0/1/1:4:54,37:0.43:-0.58:1.000:0.937 0/0/0/1:4:95,21:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,68:0.72:-0.42:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,34:0.46:-1.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:50,34:0.42:-0.82:1.000:0.932 0/1/1/1:4:26,64:0.73:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,67:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,30:0.44:-1.25:1.000:0.970 0/1/1/1:4:24,67:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,54:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,51:0.32: 2.01:1.000:0.940 0/0/0/1:4:69,26:0.30:-0.45:1.000:0.987 0/1/1/1:4:19,49:0.74:-1.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,26:0.31:-0.62:1.000:0.970 0/0/1/1:4:41,39:0.51:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,17:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,40:0.48:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,25:0.28:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,39:0.58:-1.32:1.000:0.906 0/0/0/1:4:105,27:0.23: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,103:0.74: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,69:0.48: 1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:58,61:0.53: 0.35:1.000:0.992 0/0/0/1:4:82,35:0.32: 0.28:1.000:0.947 0/1/1/1:4:33,57:0.65:-0.62:1.000:0.785 0/0/0/1:4:116,18:0.16: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,60:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,7:0.49:-3.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,35:0.44:-0.82:1.000:0.961 0/0/0/1:4:109,22:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,40:0.37: 0.18:1.000:0.529 0/1/1/1:4:32,100:0.77: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,29:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,30:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,37:0.30: 0.88:1.000:0.987 0/1/1/1:4:23,76:0.78:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,26:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,53:0.45: 0.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:56,50:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,93:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,90:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,68:0.70:-0.28:1.000:0.980 0/1/1/1:4:17,86:0.84:-0.18:0.999:0.993 0/1/1/1:4:33,86:0.74: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:94,34:0.29: 0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,62:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,57:0.52: 0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:114,30:0.23: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,70:0.74:-0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,76:0.73:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,30:0.29: 0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:139,29:0.20: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,59:0.53: 0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:100,27:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,53:0.46: 0.41:1.000:0.986 0/0/1/1:4:72,72:0.52: 1.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,105:0.69: 1.54:1.000:0.977 0/1/1/1:4:39,95:0.72: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,40:0.43:-0.35:1.000:0.942 0/1/1/1:4:31,74:0.72:-0.12:1.000:0.995 -chr3.1 77420146 chr3.1_077420146 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.92:0.998:. ./.:4:38,0:.: 4.40:1.000:. ./.:4:23,1:.: 2.18:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:6:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:35,0:.: 3.92:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:6:6,0:.:-0.66:0.897:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:16,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:33,0:.: 3.61:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:19,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 2.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.23:0.999:. ./.:4:8,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.76:1.000:. -chr3.1 77539853 chr3.1_077539853 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:38,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:89,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:0.998:. ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:74,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.64:1.000:. ./.:3:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:75,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.11:1.000:. ./.:6:43,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:89,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:85,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:55,0:.:-0.11:0.897:. ./.:4:76,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.16:0.999:. ./.:4:59,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:0.999:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.04:1.000:. -chr3.1 77747393 chr3.1_077747393 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:57,21:.: 1.01:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:17,3:.:-2.45:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:59,18:.: 0.95:1.000:. ./.:4:64,14:.: 1.01:0.998:. ./.:4:52,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:112,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:23,10:.:-1.68:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:51,12:.: 0.11:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.99:1.000:. ./.:4:43,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:51,19:.: 0.53:1.000:. ./.:4:53,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:64,20:.: 1.37:1.000:. ./.:4:57,23:.: 1.13:1.000:. ./.:4:43,23:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,5:.:-3.29:1.000:. ./.:4:23,10:.:-1.68:1.000:. ./.:3:8,4:.:-2.93:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:46,17:.: 0.11:1.000:. ./.:4:64,12:.: 0.89:1.000:. ./.:4:40,23:.: 0.11:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.24:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,12:.:-0.06:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:42,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:25,14:.:-1.32:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:49,16:.: 0.23:1.000:. ./.:4:32,9:.:-1.20:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:6:48,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:45,11:.:-0.30:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:39,22:.: 0.00:1.000:. ./.:4:58,17:.: 0.83:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:51,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:23,3:.:-2.09:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:47,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.96:0.999:. ./.:4:62,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:52,27:.: 1.07:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.11:1.000:. ./.:6:43,16:.:-0.12:0.897:. ./.:4:39,15:.:-0.42:1.000:. ./.:4:27,17:.:-1.02:1.000:. ./.:4:39,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:32,20:.:-0.54:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.56:0.999:. ./.:4:46,17:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.14:1.000:. ./.:4:95,1:.: 2.08:1.000:. ./.:4:52,21:.: 0.71:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:43,15:.:-0.18:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:63,19:.: 1.25:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:46,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,20:.: 2.56:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.71:0.999:. ./.:4:63,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,13:.:-1.62:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:25,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:50,11:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:53,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.24:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,12:.:-1.02:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.60:1.000:. ./.:4:67,24:.: 1.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:59,28:.: 1.55:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,21:.:-0.06:1.000:. ./.:4:45,16:.: 0.00:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,20:.: 1.25:1.000:. ./.:4:48,22:.: 0.53:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:82,23:.: 2.62:1.000:. ./.:4:51,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,11:.:-1.20:1.000:. ./.:4:42,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:40,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:58,18:.: 0.89:1.000:. ./.:4:33,20:.:-0.48:1.000:. ./.:4:44,12:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,14:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.37:0.999:. ./.:4:64,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:42,20:.: 0.05:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,11:.:-0.36:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.05:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:99,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:59,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:67,24:.: 1.79:1.000:. ./.:4:52,16:.: 0.41:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:65,28:.: 1.91:1.000:. ./.:4:42,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.83:1.000:. -chr3.1 77962709 chr3.1_077962709 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,109:.: 0.89:1.000:. ./.:4:75,128:.:-0.87:1.000:. ./.:4:149,98:.:-0.23:1.000:. ./.:4:177,93:.: 0.10:1.000:. ./.:4:204,130:.: 1.03:1.000:. ./.:4:314,61:.: 1.63:1.000:. ./.:4:163,91:.:-0.13:1.000:. ./.:4:172,100:.: 0.13:1.000:. ./.:4:159,100:.:-0.06:1.000:. ./.:4:22,14:.:-3.31:1.000:. ./.:4:26,34:.:-2.96:1.000:. ./.:4:189,99:.: 0.36:1.000:. ./.:4:164,104:.: 0.07:1.000:. ./.:4:261,48:.: 0.67:1.000:. ./.:4:262,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:268,52:.: 0.83:1.000:. ./.:4:287,44:.: 0.99:0.998:. ./.:4:97,160:.:-0.09:1.000:. ./.:4:236,118:.: 1.32:1.000:. ./.:4:175,123:.: 0.51:1.000:. ./.:4:43,24:.:-2.86:1.000:. ./.:4:130,91:.:-0.61:1.000:. ./.:4:199,96:.: 0.47:1.000:. ./.:4:255,40:.: 0.47:1.000:. ./.:4:22,2:.:-3.48:1.000:. ./.:4:325,61:.: 1.79:1.000:. ./.:4:275,58:.: 1.02:1.000:. ./.:4:255,40:.: 0.47:1.000:. ./.:4:217,134:.: 1.28:1.000:. ./.:4:214,124:.: 1.09:1.000:. ./.:4:202,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:154,64:.:-0.66:1.000:. ./.:4:30,12:.:-3.22:1.000:. ./.:4:34,30:.:-2.90:1.000:. ./.:3:5,12:.:-3.58:1.000:. ./.:4:249,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:176,99:.: 0.17:1.000:. ./.:4:171,97:.: 0.07:1.000:. ./.:4:243,49:.: 0.42:1.000:. ./.:4:303,40:.: 1.16:1.000:. ./.:4:222,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:157,107:.: 0.01:1.000:. ./.:4:249,55:.: 0.60:1.000:. ./.:4:112,90:.:-0.89:1.000:. ./.:4:166,116:.: 0.28:1.000:. ./.:4:137,99:.:-0.39:1.000:. ./.:4:224,100:.: 0.89:1.000:. ./.:4:358,118:.: 3.10:1.000:. ./.:4:155,98:.:-0.15:1.000:. ./.:4:155,86:.:-0.32:1.000:. ./.:4:164,36:.:-0.92:1.000:. ./.:4:198,141:.: 1.11:1.000:. ./.:4:235,51:.: 0.33:1.000:. ./.:4:194,102:.: 0.48:1.000:. ./.:4:169,90:.:-0.06:1.000:. ./.:4:171,118:.: 0.38:1.000:. ./.:4:148,117:.: 0.03:1.000:. ./.:4:149,120:.: 0.09:1.000:. ./.:4:230,47:.: 0.20:1.000:. ./.:6:113,102:.:-0.70:1.000:. ./.:4:123,102:.:-0.55:1.000:. ./.:4:217,42:.:-0.06:1.000:. ./.:4:133,147:.: 0.25:1.000:. ./.:4:214,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:173,97:.: 0.10:1.000:. ./.:4:151,111:.:-0.02:1.000:. ./.:4:194,45:.:-0.35:1.000:. ./.:4:203,54:.:-0.09:1.000:. ./.:4:270,55:.: 0.90:1.000:. ./.:4:83,105:.:-1.09:1.000:. ./.:4:178,140:.: 0.80:1.000:. ./.:4:180,52:.:-0.45:1.000:. ./.:4:87,176:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,109:.: 0.54:1.000:. ./.:4:152,69:.:-0.61:1.000:. ./.:4:173,38:.:-0.76:1.000:. ./.:4:243,67:.: 0.68:1.000:. ./.:4:212,51:.: 0.00:1.000:. ./.:4:213,72:.: 0.32:1.000:. ./.:4:179,92:.: 0.12:1.000:. ./.:4:52,136:.:-1.09:0.999:. ./.:4:262,45:.: 0.64:1.000:. ./.:4:270,41:.: 0.70:1.000:. ./.:4:240,51:.: 0.41:1.000:. ./.:6:286,82:.: 1.53:0.897:. ./.:4:162,105:.: 0.06:1.000:. ./.:4:123,84:.:-0.82:1.000:. ./.:4:135,93:.:-0.51:1.000:. ./.:4:197,54:.:-0.18:1.000:. ./.:4:233,54:.: 0.35:1.000:. ./.:4:194,39:.:-0.44:0.999:. ./.:4:238,47:.: 0.32:1.000:. ./.:4:229,54:.: 0.29:1.000:. ./.:4:128,80:.:-0.80:1.000:. ./.:4:143,132:.: 0.17:1.000:. ./.:4:243,70:.: 0.73:1.000:. ./.:4:167,45:.:-0.74:1.000:. ./.:4:72,108:.:-1.21:1.000:. ./.:4:139,121:.:-0.04:1.000:. ./.:4:178,115:.: 0.44:1.000:. ./.:4:205,30:.:-0.41:1.000:. ./.:4:237,42:.: 0.23:1.000:. ./.:4:130,47:.:-1.25:1.000:. ./.:4:121,102:.:-0.58:1.000:. ./.:4:103,67:.:-1.36:1.000:. ./.:4:120,97:.:-0.67:1.000:. ./.:4:141,93:.:-0.42:1.000:. ./.:4:262,48:.: 0.68:1.000:. ./.:4:234,146:.: 1.70:1.000:. ./.:4:244,56:.: 0.54:1.000:. ./.:4:128,85:.:-0.73:1.000:. ./.:4:232,115:.: 1.22:1.000:. ./.:4:185,54:.:-0.35:0.999:. ./.:4:150,106:.:-0.10:1.000:. ./.:4:193,34:.:-0.53:1.000:. ./.:4:142,56:.:-0.95:1.000:. ./.:4:131,106:.:-0.38:1.000:. ./.:4:220,45:.: 0.03:1.000:. ./.:4:222,63:.: 0.32:1.000:. ./.:4:143,85:.:-0.51:1.000:. ./.:4:152,113:.: 0.03:1.000:. ./.:4:164,58:.:-0.60:1.000:. ./.:4:218,69:.: 0.35:1.000:. ./.:4:184,88:.: 0.13:1.000:. ./.:4:171,104:.: 0.17:1.000:. ./.:4:231,43:.: 0.16:1.000:. ./.:4:203,48:.:-0.18:1.000:. ./.:4:134,78:.:-0.74:1.000:. ./.:4:102,74:.:-1.27:1.000:. ./.:4:167,42:.:-0.79:1.000:. ./.:4:155,91:.:-0.25:1.000:. ./.:4:165,79:.:-0.28:1.000:. ./.:4:108,59:.:-1.40:1.000:. ./.:4:147,76:.:-0.58:1.000:. ./.:4:163,88:.:-0.18:1.000:. ./.:4:284,51:.: 1.05:1.000:. ./.:4:264,37:.: 0.55:1.000:. ./.:4:199,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:101,97:.:-0.95:1.000:. ./.:4:164,48:.:-0.74:1.000:. ./.:4:209,43:.:-0.16:1.000:. ./.:4:212,60:.: 0.13:1.000:. ./.:4:152,90:.:-0.31:1.000:. ./.:4:133,31:.:-1.44:1.000:. ./.:4:337,67:.: 2.05:1.000:. ./.:4:216,148:.: 1.47:1.000:. ./.:4:184,114:.: 0.51:1.000:. ./.:4:181,98:.: 0.23:1.000:. ./.:4:223,136:.: 1.40:1.000:. ./.:4:188,53:.:-0.32:1.000:. ./.:4:287,52:.: 1.11:1.000:. ./.:4:227,49:.: 0.19:1.000:. ./.:4:29,9:.:-3.28:1.000:. ./.:4:267,51:.: 0.80:1.000:. ./.:4:208,100:.: 0.65:1.000:. ./.:4:300,57:.: 1.37:1.000:. ./.:4:341,70:.: 2.15:1.000:. ./.:4:214,131:.: 1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:207,112:.: 0.81:1.000:. ./.:4:242,62:.: 0.60:1.000:. ./.:4:145,78:.:-0.58:1.000:. ./.:4:219,40:.:-0.06:1.000:. ./.:4:134,118:.:-0.16:1.000:. ./.:4:172,92:.: 0.01:1.000:. ./.:4:186,111:.: 0.49:1.000:. ./.:4:218,31:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.66:0.999:. ./.:4:237,49:.: 0.33:1.000:. ./.:4:225,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:191,41:.:-0.45:1.000:. ./.:4:138,81:.:-0.64:1.000:. ./.:4:257,56:.: 0.73:1.000:. ./.:4:216,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:216,33:.:-0.20:1.000:. ./.:4:197,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:211,118:.: 0.96:1.000:. ./.:4:166,100:.: 0.04:1.000:. ./.:4:193,101:.: 0.45:1.000:. ./.:4:166,82:.:-0.22:1.000:. ./.:4:185,102:.: 0.35:1.000:. ./.:4:301,45:.: 1.21:1.000:. ./.:4:315,66:.: 1.72:1.000:. ./.:4:163,121:.: 0.30:1.000:. ./.:4:107,181:.: 0.36:1.000:. -chr3.1 78077889 chr3.1_078077889 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,423:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,332:.:-0.07:1.000:. ./.:4:12,337:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,411:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,606:.: 2.46:1.000:. ./.:4:24,257:.:-0.54:1.000:. ./.:4:22,241:.:-0.71:1.000:. ./.:4:16,258:.:-0.61:1.000:. ./.:4:17,207:.:-1.07:1.000:. ./.:4:23,30:.:-2.64:1.000:. ./.:4:24,83:.:-2.15:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.61:1.000:. ./.:4:15,373:.: 0.45:1.000:. ./.:4:12,361:.: 0.31:1.000:. ./.:4:8,339:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,357:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,477:.: 1.28:0.998:. ./.:4:0,545:.: 1.90:1.000:. ./.:4:26,242:.:-0.66:1.000:. ./.:4:20,255:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,87:.:-2.33:1.000:. ./.:4:24,251:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,393:.: 0.70:1.000:. ./.:4:13,243:.:-0.77:1.000:. ./.:4:14,30:.:-2.73:1.000:. ./.:4:0,502:.: 1.50:1.000:. ./.:4:8,460:.: 1.18:1.000:. ./.:4:10,353:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,575:.: 2.17:1.000:. ./.:4:9,321:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,541:.: 1.86:1.000:. ./.:4:10,296:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,48:.:-2.66:1.000:. ./.:4:5,79:.:-2.36:1.000:. ./.:3:3,24:.:-2.88:1.000:. ./.:4:11,362:.: 0.31:1.000:. ./.:4:6,322:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,373:.: 0.31:1.000:. ./.:4:10,254:.:-0.70:1.000:. ./.:4:7,255:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,397:.: 0.54:1.000:. ./.:4:18,266:.:-0.51:1.000:. ./.:4:9,367:.: 0.34:1.000:. ./.:4:20,218:.:-0.94:1.000:. ./.:4:13,333:.: 0.06:1.000:. ./.:4:11,362:.: 0.31:1.000:. ./.:4:12,433:.: 0.97:1.000:. ./.:4:24,182:.:-1.23:1.000:. ./.:4:7,298:.:-0.32:1.000:. ./.:4:24,283:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,284:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,286:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,412:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,370:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,366:.: 0.35:1.000:. ./.:4:15,362:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,310:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,242:.:-0.64:1.000:. ./.:4:18,174:.:-1.36:1.000:. ./.:6:7,375:.: 0.39:1.000:. ./.:4:13,425:.: 0.91:1.000:. ./.:4:25,251:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,302:.:-0.26:1.000:. ./.:4:13,238:.:-0.82:1.000:. ./.:4:20,421:.: 0.94:1.000:. ./.:4:12,345:.: 0.16:1.000:. ./.:4:17,108:.:-1.98:1.000:. ./.:4:15,343:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,532:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,459:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,465:.: 1.16:1.000:. ./.:4:12,195:.:-1.22:1.000:. ./.:4:1,418:.: 0.73:1.000:. ./.:4:22,241:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,478:.: 1.28:1.000:. ./.:4:22,190:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1,522:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,470:.: 1.20:1.000:. ./.:4:14,309:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,432:.: 0.85:0.999:. ./.:4:13,367:.: 0.37:1.000:. ./.:4:21,397:.: 0.72:1.000:. ./.:4:8,294:.:-0.35:1.000:. ./.:6:14,376:.: 0.47:0.897:. ./.:4:10,306:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,356:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,289:.:-0.35:1.000:. ./.:4:18,315:.:-0.06:1.000:. ./.:4:20,363:.: 0.40:1.000:. ./.:4:18,173:.:-1.37:0.999:. ./.:4:0,433:.: 0.86:1.000:. ./.:4:9,335:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,391:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,273:.:-0.53:1.000:. ./.:4:9,317:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,282:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,335:.:-0.04:1.000:. ./.:4:13,402:.: 0.70:1.000:. ./.:4:22,198:.:-1.10:1.000:. ./.:4:29,235:.:-0.70:1.000:. ./.:4:28,264:.:-0.44:1.000:. ./.:4:6,252:.:-0.75:1.000:. ./.:4:24,272:.:-0.40:1.000:. ./.:4:12,256:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,255:.:-0.70:1.000:. ./.:4:16,307:.:-0.15:1.000:. ./.:4:6,330:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,415:.: 0.80:1.000:. ./.:4:11,181:.:-1.36:1.000:. ./.:4:11,358:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,468:.: 1.18:1.000:. ./.:4:10,352:.: 0.21:0.999:. ./.:4:12,312:.:-0.14:1.000:. ./.:4:17,282:.:-0.37:1.000:. ./.:4:15,253:.:-0.66:1.000:. ./.:4:14,238:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1,387:.: 0.45:1.000:. ./.:4:21,192:.:-1.17:1.000:. ./.:4:13,256:.:-0.65:1.000:. ./.:4:24,218:.:-0.90:1.000:. ./.:4:12,342:.: 0.13:1.000:. ./.:4:16,329:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,537:.: 1.82:1.000:. ./.:4:1,478:.: 1.29:1.000:. ./.:4:12,416:.: 0.82:1.000:. ./.:4:11,348:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,378:.: 0.35:1.000:. ./.:4:11,99:.:-2.12:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,423:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,437:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,218:.:-1.01:1.000:. ./.:4:8,408:.: 0.70:1.000:. ./.:4:3,377:.: 0.37:1.000:. ./.:4:14,386:.: 0.56:1.000:. ./.:4:21,265:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,303:.:-0.26:1.000:. ./.:4:32,237:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,286:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,222:.:-0.90:1.000:. ./.:4:8,322:.:-0.09:1.000:. ./.:4:4,321:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,202:.:-1.17:1.000:. ./.:4:28,291:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,531:.: 1.96:1.000:. ./.:4:10,328:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,393:.: 0.57:1.000:. ./.:4:24,167:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.80:1.000:. ./.:4:8,384:.: 0.48:1.000:. ./.:4:10,355:.: 0.23:1.000:. ./.:4:16,37:.:-2.64:1.000:. ./.:4:17,359:.: 0.34:1.000:. ./.:4:12,362:.: 0.32:1.000:. ./.:4:15,387:.: 0.58:1.000:. ./.:4:15,378:.: 0.49:1.000:. ./.:4:11,199:.:-1.20:1.000:. ./.:4:5,355:.: 0.19:1.000:. ./.:4:27,272:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.46:1.000:. ./.:4:14,251:.:-0.69:1.000:. ./.:4:14,259:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,579:.: 2.21:1.000:. ./.:4:1,509:.: 1.57:1.000:. ./.:4:12,382:.: 0.50:1.000:. ./.:4:6,281:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,352:.: 0.11:0.999:. ./.:4:2,541:.: 1.88:1.000:. ./.:4:11,351:.: 0.21:1.000:. ./.:4:23,226:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.01:1.000:. ./.:4:8,395:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,422:.: 0.76:1.000:. ./.:4:12,221:.:-0.98:1.000:. ./.:4:9,289:.:-0.38:1.000:. ./.:4:12,254:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.84:1.000:. ./.:4:8,376:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,431:.: 0.85:1.000:. ./.:4:10,398:.: 0.63:1.000:. ./.:4:12,428:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,589:.: 2.30:1.000:. ./.:4:4,266:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,499:.: 1.47:1.000:. -chr3.1 78529969 chr3.1_078529969 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:0.998:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.01:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:6:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:6:24,0:.: 0.07:0.897:. ./.:4:37,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.55:0.999:. ./.:4:31,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.74:0.999:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.95:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. -chr3.1 78721100 chr3.1_078721100 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:590,103:.: 0.56:1.000:. ./.:4:132,367:.:-1.02:1.000:. ./.:4:480,67:.:-0.63:1.000:. ./.:4:582,71:.: 0.24:1.000:. ./.:4:530,246:.: 1.24:1.000:. ./.:4:479,206:.: 0.50:1.000:. ./.:4:408,42:.:-1.42:1.000:. ./.:4:534,59:.:-0.25:1.000:. ./.:4:372,193:.:-0.48:1.000:. ./.:4:251,35:.:-2.75:1.000:. ./.:4:328,55:.:-1.96:1.000:. ./.:4:162,384:.:-0.63:1.000:. ./.:4:407,158:.:-0.48:1.000:. ./.:4:495,193:.: 0.52:1.000:. ./.:4:308,336:.: 0.16:1.000:. ./.:4:276,284:.:-0.52:1.000:. ./.:4:351,354:.: 0.66:0.998:. ./.:4:402,249:.: 0.22:1.000:. ./.:4:538,325:.: 1.95:1.000:. ./.:4:635,52:.: 0.51:1.000:. ./.:4:258,114:.:-2.05:1.000:. ./.:4:533,111:.: 0.16:1.000:. ./.:4:516,192:.: 0.68:1.000:. ./.:4:400,177:.:-0.38:1.000:. ./.:4:145,86:.:-3.20:1.000:. ./.:4:506,219:.: 0.82:1.000:. ./.:4:248,304:.:-0.59:1.000:. ./.:4:425,193:.:-0.05:1.000:. ./.:4:484,263:.: 1.00:1.000:. ./.:4:506,56:.:-0.50:1.000:. ./.:4:482,220:.: 0.64:1.000:. ./.:4:313,142:.:-1.38:1.000:. ./.:4:174,65:.:-3.14:1.000:. ./.:4:235,118:.:-2.21:1.000:. ./.:3:163,97:.:-2.96:1.000:. ./.:4:355,196:.:-0.59:1.000:. ./.:4:422,191:.:-0.09:1.000:. ./.:4:390,198:.:-0.29:1.000:. ./.:4:316,385:.: 0.63:1.000:. ./.:4:461,176:.: 0.11:1.000:. ./.:4:481,225:.: 0.67:1.000:. ./.:4:435,285:.: 0.78:1.000:. ./.:4:294,434:.: 0.85:1.000:. ./.:4:592,85:.: 0.43:1.000:. ./.:4:686,194:.: 2.09:1.000:. ./.:4:459,262:.: 0.79:1.000:. ./.:4:723,84:.: 1.49:1.000:. ./.:4:358,166:.:-0.81:1.000:. ./.:4:505,73:.:-0.37:1.000:. ./.:4:536,241:.: 1.25:1.000:. ./.:4:259,327:.:-0.31:1.000:. ./.:4:715,125:.: 1.76:1.000:. ./.:4:299,321:.:-0.03:1.000:. ./.:4:492,305:.: 1.41:1.000:. ./.:4:504,62:.:-0.47:1.000:. ./.:4:469,291:.: 1.11:1.000:. ./.:4:482,101:.:-0.33:1.000:. ./.:4:706,139:.: 1.80:1.000:. ./.:4:402,223:.: 0.01:1.000:. ./.:6:450,120:.:-0.44:1.000:. ./.:4:593,136:.: 0.86:1.000:. ./.:4:408,161:.:-0.45:1.000:. ./.:4:544,327:.: 2.01:1.000:. ./.:4:440,221:.: 0.30:1.000:. ./.:4:725,90:.: 1.56:1.000:. ./.:4:460,234:.: 0.57:1.000:. ./.:4:379,213:.:-0.26:1.000:. ./.:4:281,308:.:-0.28:1.000:. ./.:4:477,280:.: 1.08:1.000:. ./.:4:379,190:.:-0.45:1.000:. ./.:4:663,107:.: 1.19:1.000:. ./.:4:264,290:.:-0.57:1.000:. ./.:4:179,482:.: 0.30:1.000:. ./.:4:611,61:.: 0.39:1.000:. ./.:4:191,492:.: 0.48:1.000:. ./.:4:397,226:.:-0.01:1.000:. ./.:4:411,233:.: 0.16:1.000:. ./.:4:438,302:.: 0.95:1.000:. ./.:4:471,174:.: 0.17:1.000:. ./.:4:522,200:.: 0.80:1.000:. ./.:4:173,404:.:-0.38:0.999:. ./.:4:382,383:.: 1.15:1.000:. ./.:4:324,426:.: 1.03:1.000:. ./.:4:272,265:.:-0.71:1.000:. ./.:6:628,245:.: 2.03:0.897:. ./.:4:391,274:.: 0.33:1.000:. ./.:4:324,198:.:-0.83:1.000:. ./.:4:362,188:.:-0.60:1.000:. ./.:4:475,241:.: 0.75:1.000:. ./.:4:388,206:.:-0.24:1.000:. ./.:4:272,314:.:-0.31:1.000:. ./.:4:274,321:.:-0.24:1.000:. ./.:4:500,244:.: 0.98:1.000:. ./.:4:363,57:.:-1.66:1.000:. ./.:4:460,201:.: 0.30:1.000:. ./.:4:522,229:.: 1.03:1.000:. ./.:4:324,311:.: 0.09:1.000:. ./.:4:216,377:.:-0.25:1.000:. ./.:4:465,391:.: 1.89:1.000:. ./.:4:429,266:.: 0.58:1.000:. ./.:4:417,216:.: 0.07:1.000:. ./.:4:475,272:.: 1.00:1.000:. ./.:4:228,279:.:-0.95:1.000:. ./.:4:535,234:.: 1.18:1.000:. ./.:4:451,154:.:-0.15:1.000:. ./.:4:469,101:.:-0.44:1.000:. ./.:4:357,285:.: 0.15:1.000:. ./.:4:414,244:.: 0.28:1.000:. ./.:4:573,268:.: 1.77:1.000:. ./.:4:292,305:.:-0.22:1.000:. ./.:4:466,191:.: 0.27:1.000:. ./.:4:530,230:.: 1.11:1.000:. ./.:4:262,441:.: 0.64:0.999:. ./.:4:492,162:.: 0.24:1.000:. ./.:4:339,210:.:-0.61:1.000:. ./.:4:474,100:.:-0.41:1.000:. ./.:4:539,78:.:-0.06:1.000:. ./.:4:410,193:.:-0.17:1.000:. ./.:4:432,255:.: 0.51:1.000:. ./.:4:388,215:.:-0.17:1.000:. ./.:4:453,234:.: 0.51:1.000:. ./.:4:416,272:.: 0.52:1.000:. ./.:4:425,282:.: 0.68:1.000:. ./.:4:388,195:.:-0.33:1.000:. ./.:4:486,207:.: 0.56:1.000:. ./.:4:337,348:.: 0.50:1.000:. ./.:4:446,190:.: 0.10:1.000:. ./.:4:279,286:.:-0.48:1.000:. ./.:4:395,57:.:-1.40:1.000:. ./.:4:168,165:.:-2.37:1.000:. ./.:4:499,158:.: 0.27:1.000:. ./.:4:375,182:.:-0.55:1.000:. ./.:4:270,193:.:-1.31:1.000:. ./.:4:546,189:.: 0.90:1.000:. ./.:4:357,253:.:-0.11:1.000:. ./.:4:386,401:.: 1.33:1.000:. ./.:4:325,366:.: 0.55:1.000:. ./.:4:360,262:.:-0.02:1.000:. ./.:4:376,181:.:-0.55:1.000:. ./.:4:312,319:.: 0.06:1.000:. ./.:4:346,334:.: 0.46:1.000:. ./.:4:370,286:.: 0.26:1.000:. ./.:4:344,260:.:-0.16:1.000:. ./.:4:375,183:.:-0.54:1.000:. ./.:4:385,346:.: 0.87:1.000:. ./.:4:741,160:.: 2.26:1.000:. ./.:4:501,41:.:-0.67:1.000:. ./.:4:493,90:.:-0.33:1.000:. ./.:4:456,273:.: 0.86:1.000:. ./.:4:369,169:.:-0.70:1.000:. ./.:4:335,358:.: 0.56:1.000:. ./.:4:378,182:.:-0.52:1.000:. ./.:4:205,93:.:-2.65:1.000:. ./.:4:286,157:.:-1.47:1.000:. ./.:4:438,211:.: 0.20:1.000:. ./.:4:305,342:.: 0.19:1.000:. ./.:4:474,265:.: 0.94:1.000:. ./.:4:480,214:.: 0.57:1.000:. ./.:4:265,239:.:-0.98:1.000:. ./.:4:421,248:.: 0.37:1.000:. ./.:4:342,146:.:-1.11:1.000:. ./.:4:298,179:.:-1.20:1.000:. ./.:4:311,160:.:-1.25:1.000:. ./.:4:404,164:.:-0.46:1.000:. ./.:4:556,77:.: 0.07:1.000:. ./.:4:496,105:.:-0.19:1.000:. ./.:4:371,149:.:-0.85:1.000:. ./.:4:377,186:.:-0.50:0.999:. ./.:4:408,210:.:-0.05:1.000:. ./.:4:304,256:.:-0.52:1.000:. ./.:4:327,122:.:-1.42:1.000:. ./.:4:310,118:.:-1.60:1.000:. ./.:4:343,297:.: 0.13:1.000:. ./.:4:232,236:.:-1.27:1.000:. ./.:4:384,174:.:-0.54:1.000:. ./.:4:180,272:.:-1.40:1.000:. ./.:4:478,231:.: 0.69:1.000:. ./.:4:428,263:.: 0.55:1.000:. ./.:4:440,195:.: 0.09:1.000:. ./.:4:290,218:.:-0.94:1.000:. ./.:4:479,250:.: 0.86:1.000:. ./.:4:534,214:.: 1.01:1.000:. ./.:4:498,212:.: 0.70:1.000:. ./.:4:485,15:.:-1.01:1.000:. ./.:4:251,290:.:-0.68:1.000:. -chr3.1 78962615 chr3.1_078962615 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:48,1:.: 2.22:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.95:0.998:. ./.:4:21,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:49,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.32:1.000:. ./.:6:12,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.95:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:21,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:46,1:.: 2.06:1.000:. ./.:4:48,1:.: 2.22:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.51:0.999:. ./.:4:29,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.03:1.000:. ./.:6:40,1:.: 1.58:0.897:. ./.:4:45,2:.: 2.06:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:36,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:49,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.40:0.999:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:48,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:54,1:.: 2.69:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.19:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:20,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.19:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:47,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.95:1.000:. -chr3.1 79060435 chr3.1_079060435 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:308,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:58,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.61:0.998:. ./.:4:263,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.39:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.84:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.43:1.000:. ./.:3:13,0:.:-3.86:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:61,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:229,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:290,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:291,0:.: 0.81:0.897:. ./.:4:310,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.86:0.999:. ./.:4:292,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:319,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:256,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.58:1.000:. -chr3.1 79446360 chr3.1_079446360 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:250,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:49,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:250,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.68:0.998:. ./.:4:212,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:449,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:467,1:.: 2.77:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.47:1.000:. ./.:3:24,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:419,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:374,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:301,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.66:1.000:. ./.:6:232,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:317,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:226,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.47:0.999:. ./.:4:292,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.81:1.000:. ./.:6:238,0:.:-0.16:0.897:. ./.:4:274,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:442,2:.: 2.47:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:286,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:325,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:321,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:428,1:.: 2.28:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:290,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:419,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.23:1.000:. -chr3.1 79478584 chr3.1_079478584 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:25,8:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,4:0.14:-0.62:1.000:0.956 0/0/1/1:4:20,12:0.38:-0.42:1.000:0.629 0/0/1/1:4:16,18:0.54:-0.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:33,8:0.20: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,8:0.46:-1.77:1.000:0.985 0/0/0/1:4:28,10:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,14:0.33: 0.73:1.000:0.934 0/0/0/1:4:12,5:0.30:-1.87:1.000:0.983 0/0/1/1:4:17,10:0.38:-0.90:1.000:0.569 0/0/1/1:4:23,22:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,18:0.54:-0.23:1.000:0.989 0/1/1/1:4:10,24:0.70:-0.23:1.000:0.983 0/0/1/1:4:14,13:0.49:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,9:0.32:-0.71:1.000:0.957 0/0/1/1:4:32,25:0.45: 1.98:0.998:0.980 0/0/0/1:4:33,12:0.27: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,26:0.51: 1.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,30:0.57: 1.59:1.000:0.944 0/0/0/0:4:17,1:0.06:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,25:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,7:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,24:0.72:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,4:0.37:-2.44:1.000:0.522 0/0/1/1:4:9,14:0.61:-1.29:1.000:0.698 0/1/1/1:4:5,14:0.73:-1.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,13:0.57:-1.29:1.000:0.946 0/0/1/1:4:23,15:0.40: 0.15:1.000:0.830 0/0/0/1:4:16,9:0.37:-1.10:1.000:0.571 0/0/0/1:4:22,8:0.27:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,9:0.29:-0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:5,2:0.29:-2.83:1.000:0.990 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-1.58:1.000:0.999 0/0/0:3:19,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,25:0.71:-0.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:15,6:0.29:-1.48:1.000:0.990 0/0/0/1:4:35,10:0.23: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.56:-1.58:1.000:0.973 0/1/1/1:4:8,26:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,19:0.45: 0.63:1.000:0.983 0/0/1/1:4:19,13:0.42:-0.42:1.000:0.900 0/0/1/1:4:17,12:0.42:-0.71:1.000:0.930 0/0/1/1:4:24,20:0.47: 0.73:1.000:0.991 0/0/1/1:4:27,24:0.48: 1.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,8:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.45: 0.25:1.000:0.977 0/0/0/1:4:14,4:0.23:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.32:-1.67:1.000:0.942 0/0/1/1:4:8,9:0.54:-1.87:1.000:0.989 0/1/1/1:4:10,19:0.65:-0.71:1.000:0.806 0/0/1/1:4:23,24:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,17:0.47: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,16:0.44: 0.06:1.000:0.972 0/0/0/1:4:22,9:0.30:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/0:4:36,4:0.10: 0.34:1.000:0.734 0/0/0/1:4:25,9:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,21:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,22:0.68:-0.42:1.000:0.956 0/0/0/0/1/1:6:29,13:0.32: 0.54:1.000:0.913 0/0/1/1:4:20,20:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,29:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,12:0.19: 2.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,34:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.44:-0.14:1.000:0.966 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-1.19:1.000:0.514 0/1/1/1:4:8,26:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,21:0.46: 1.02:1.000:0.986 0/0/1/1:4:22,14:0.40:-0.04:1.000:0.781 0/0/0/1:4:27,10:0.28: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,12:0.34:-0.04:1.000:0.855 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-2.25:1.000:0.963 0/0/0/1:4:30,15:0.34: 0.83:1.000:0.855 0/1/1/1:4:10,19:0.65:-0.71:1.000:0.806 0/0/1/1:4:18,22:0.56: 0.34:1.000:0.973 0/1/1/1:4:5,27:0.83:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,13:0.40:-0.33:1.000:0.824 0/0/1/1:4:24,19:0.45: 0.63:1.000:0.983 0/1/1/1:4:12,33:0.72: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,12:0.33: 0.06:1.000:0.908 0/0/0/1:4:30,7:0.19: 0.06:0.999:1.000 0/1/1/1:4:6,25:0.79:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,27:0.49: 1.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,24:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:29,13:0.32: 0.54:0.897:0.913 0/0/0/1:4:37,6:0.14: 0.63:1.000:0.977 0/0/0/1:4:28,9:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,11:0.34:-0.33:1.000:0.855 0/0/0/1:4:28,9:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,26:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,26:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:28,15:0.36: 0.63:1.000:0.712 0/1/1/1:4:14,32:0.69: 0.92:1.000:0.971 0/0/0/0:4:17,2:0.11:-1.67:1.000:0.573 0/0/1/1:4:21,21:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,18:0.38: 1.21:1.000:0.528 0/0/1/1:4:21,17:0.46: 0.15:1.000:0.987 0/0/0/1:4:26,9:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/0:4:41,4:0.09: 0.83:1.000:0.934 0/0/1/1:4:20,18:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,13:0.65:-1.58:1.000:0.763 0/0/1/1:4:17,26:0.61: 0.63:1.000:0.736 0/0/1/1:4:15,21:0.59:-0.04:1.000:0.884 0/0/0/1:4:37,17:0.32: 1.69:1.000:0.945 0/0/0/1:4:41,6:0.13: 1.02:1.000:0.920 0/0/0/1:4:31,11:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,15:0.39: 0.25:1.000:0.740 0/1/1/1:4:13,41:0.75: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,8:0.19: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,38:0.89: 0.54:1.000:0.539 0/0/0/1:4:29,12:0.30: 0.44:1.000:0.985 0/0/0/1:4:40,17:0.31: 1.98:1.000:0.979 0/1/1/1:4:13,24:0.65: 0.06:0.999:0.750 0/0/1/1:4:23,22:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,12:0.63:-1.67:1.000:0.566 0/1/1/1:4:15,28:0.65: 0.63:1.000:0.773 0/0/0/1:4:36,5:0.13: 0.44:1.000:0.856 0/0/0/1:4:23,7:0.24:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,25:0.69:-0.04:1.000:0.969 0/0/1/1:4:14,15:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:20,16:0.46:-0.04:1.000:0.985 0/0/0/1:4:29,16:0.36: 0.83:1.000:0.630 0/0/1/1:4:17,18:0.52:-0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:22,9:0.30:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:25,4:0.14:-0.71:1.000:0.972 0/0/0/1:4:26,13:0.34: 0.25:1.000:0.855 0/1/1/1:4:18,38:0.67: 1.88:1.000:0.931 0/0/1/1:4:12,15:0.56:-0.90:1.000:0.965 0/0/1/1:4:14,15:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:17,18:0.52:-0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,7:0.21:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,17:0.30: 2.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,16:0.44: 0.06:1.000:0.972 0/0/1/1:4:11,9:0.46:-1.58:1.000:0.988 0/0/1/1:4:11,16:0.59:-0.90:1.000:0.831 0/0/1/1:4:31,19:0.39: 1.31:1.000:0.690 0/1/1/1:4:10,19:0.65:-0.71:1.000:0.806 0/1/1/1:4:14,27:0.65: 0.44:1.000:0.831 0/0/1/1:4:18,22:0.56: 0.34:1.000:0.973 0/1/1/1:4:10,25:0.71:-0.14:1.000:0.989 0/1/1/1:4:15,34:0.69: 1.21:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,14:0.38: 0.15:1.000:0.543 0/0/1/1:4:29,19:0.41: 1.11:1.000:0.838 0/0/1/1:4:14,13:0.49:-0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,29:0.67: 0.63:1.000:0.916 0/0/1/1:4:20,22:0.53: 0.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:41,10:0.20: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,9:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,21:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,17:0.47: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,23:0.41: 2.07:1.000:0.843 0/0/1/1:4:19,14:0.44:-0.33:1.000:0.958 0/1/1/1:4:4,23:0.84:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,14:0.46:-0.52:1.000:0.989 0/0/0/1:4:20,10:0.34:-0.62:1.000:0.855 0/1/1/1:4:7,27:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,40:0.71: 1.88:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,21:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,23:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,15:0.32: 1.11:1.000:0.952 0/0/1/1:4:20,19:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,5:0.18:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,13:0.53:-1.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:34,8:0.20: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,1:0.09:-2.35:1.000:0.971 0/0/1/1:4:15,12:0.46:-0.90:1.000:0.985 0/1/1/1:4:9,29:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.59:0.999:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.58:-0.81:1.000:0.930 0/0/1/1:4:24,20:0.47: 0.73:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,35:0.68: 1.40:1.000:0.953 0/0/0/1:4:22,10:0.32:-0.42:1.000:0.952 0/0/1/1:4:16,12:0.44:-0.81:1.000:0.966 0/1/1/1:4:8,24:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,15:0.74:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,14:0.41:-0.14:1.000:0.866 0/0/1/1:4:15,13:0.48:-0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,11:0.22: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,12:0.32: 0.25:1.000:0.963 0/0/0/1:4:36,11:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,19:0.48: 0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:10,25:0.71:-0.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:26,26:0.51: 1.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,8:0.26:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,5:0.12: 0.63:1.000:0.752 -chr3.1 79561614 chr3.1_079561614 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:164,49:.: 0.65:1.000:. ./.:4:36,130:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,51:.: 0.38:1.000:. ./.:4:105,104:.: 0.57:1.000:. ./.:4:209,75:.: 2.14:1.000:. ./.:4:136,37:.:-0.19:1.000:. ./.:4:187,50:.: 1.15:1.000:. ./.:4:164,69:.: 1.07:1.000:. ./.:4:63,17:.:-2.14:1.000:. ./.:4:47,11:.:-2.60:1.000:. ./.:4:134,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:147,61:.: 0.55:1.000:. ./.:4:164,62:.: 0.92:1.000:. ./.:4:171,63:.: 1.09:1.000:. ./.:4:155,64:.: 0.78:1.000:. ./.:4:158,62:.: 0.80:0.998:. ./.:4:113,156:.: 1.83:1.000:. ./.:4:168,60:.: 0.97:1.000:. ./.:4:179,58:.: 1.15:1.000:. ./.:4:42,27:.:-2.37:1.000:. ./.:4:137,54:.: 0.19:1.000:. ./.:4:95,132:.: 0.95:1.000:. ./.:4:130,66:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:180,68:.: 1.39:1.000:. ./.:4:144,49:.: 0.23:1.000:. ./.:4:115,101:.: 0.71:1.000:. ./.:4:164,68:.: 1.05:1.000:. ./.:4:150,48:.: 0.34:1.000:. ./.:4:115,96:.: 0.61:1.000:. ./.:4:26,15:.:-2.95:1.000:. ./.:4:50,5:.:-2.66:1.000:. ./.:3:33,22:.:-2.66:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:101,121:.: 0.84:1.000:. ./.:4:120,109:.: 0.99:1.000:. ./.:4:123,40:.:-0.40:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:93,113:.: 0.50:1.000:. ./.:4:139,54:.: 0.23:1.000:. ./.:4:106,39:.:-0.77:1.000:. ./.:4:130,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:132,52:.: 0.04:1.000:. ./.:4:189,48:.: 1.15:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.82:1.000:. ./.:4:131,43:.:-0.17:1.000:. ./.:4:86,42:.:-1.13:1.000:. ./.:4:111,37:.:-0.71:1.000:. ./.:4:184,58:.: 1.26:1.000:. ./.:4:123,36:.:-0.48:1.000:. ./.:4:153,48:.: 0.40:1.000:. ./.:4:131,53:.: 0.04:1.000:. ./.:4:122,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:146,43:.: 0.15:1.000:. ./.:4:119,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:99,45:.:-0.80:1.000:. ./.:4:130,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:135,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:93,97:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:159,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:144,39:.: 0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:131,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:98,90:.: 0.13:1.000:. ./.:4:131,43:.:-0.17:1.000:. ./.:4:107,29:.:-0.96:1.000:. ./.:4:92,117:.: 0.57:1.000:. ./.:4:145,54:.: 0.36:1.000:. ./.:4:171,40:.: 0.61:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:134,43:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,98:.:-0.92:0.999:. ./.:4:134,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:146,49:.: 0.27:1.000:. ./.:4:126,39:.:-0.35:1.000:. ./.:6:178,47:.: 0.90:0.897:. ./.:4:92,104:.: 0.30:1.000:. ./.:4:70,79:.:-0.69:1.000:. ./.:4:66,83:.:-0.69:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:111,44:.:-0.56:1.000:. ./.:4:115,39:.:-0.59:1.000:. ./.:4:106,33:.:-0.90:1.000:. ./.:4:104,35:.:-0.90:1.000:. ./.:4:121,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:109,32:.:-0.86:1.000:. ./.:4:79,70:.:-0.69:1.000:. ./.:4:87,87:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,111:.: 0.40:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:78,26:.:-1.63:1.000:. ./.:4:67,83:.:-0.67:1.000:. ./.:4:81,41:.:-1.26:1.000:. ./.:4:138,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:119,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:152,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:112,118:.: 1.01:1.000:. ./.:4:148,36:.: 0.04:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.44:1.000:. ./.:4:225,73:.: 2.43:1.000:. ./.:4:102,32:.:-1.00:0.999:. ./.:4:82,99:.:-0.02:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:91,38:.:-1.11:1.000:. ./.:4:127,37:.:-0.38:1.000:. ./.:4:133,38:.:-0.23:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:53,71:.:-1.21:1.000:. ./.:4:127,45:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:176,58:.: 1.09:1.000:. ./.:4:101,40:.:-0.86:1.000:. ./.:4:144,46:.: 0.17:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:87,23:.:-1.51:1.000:. ./.:4:98,32:.:-1.09:1.000:. ./.:4:138,39:.:-0.10:1.000:. ./.:4:96,92:.: 0.13:1.000:. ./.:4:64,23:.:-1.99:1.000:. ./.:4:101,39:.:-0.88:1.000:. ./.:4:84,83:.:-0.31:1.000:. ./.:4:216,62:.: 2.01:1.000:. ./.:4:130,40:.:-0.25:1.000:. ./.:4:85,25:.:-1.51:1.000:. ./.:4:79,61:.:-0.88:1.000:. ./.:4:127,39:.:-0.33:1.000:. ./.:4:121,43:.:-0.38:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:121,97:.: 0.76:1.000:. ./.:4:85,25:.:-1.51:1.000:. ./.:4:177,64:.: 1.24:1.000:. ./.:4:185,58:.: 1.28:1.000:. ./.:4:163,61:.: 0.88:1.000:. ./.:4:165,62:.: 0.95:1.000:. ./.:4:152,96:.: 1.39:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:191,58:.: 1.41:1.000:. ./.:4:178,58:.: 1.13:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:183,67:.: 1.43:1.000:. ./.:4:162,46:.: 0.55:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:116,103:.: 0.78:1.000:. ./.:4:125,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:173,56:.: 0.99:1.000:. ./.:4:155,48:.: 0.44:1.000:. ./.:4:95,108:.: 0.44:1.000:. ./.:4:143,45:.: 0.13:1.000:. ./.:4:144,52:.: 0.30:1.000:. ./.:4:104,122:.: 0.92:1.000:. ./.:4:173,61:.: 1.09:1.000:. ./.:4:130,35:.:-0.35:1.000:. ./.:4:101,114:.: 0.69:0.999:. ./.:4:174,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:162,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:149,55:.: 0.46:1.000:. ./.:4:81,100:.:-0.02:1.000:. ./.:4:153,46:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,44:.:-0.02:1.000:. ./.:4:83,32:.:-1.40:1.000:. ./.:4:139,50:.: 0.15:1.000:. ./.:4:181,56:.: 1.15:1.000:. ./.:4:195,48:.: 1.28:1.000:. ./.:4:124,136:.: 1.64:1.000:. ./.:4:154,56:.: 0.59:1.000:. ./.:4:109,104:.: 0.65:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:148,45:.: 0.23:1.000:. ./.:4:99,97:.: 0.30:1.000:. -chr3.1 79706180 chr3.1_079706180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,222:.: 1.12:1.000:. ./.:4:152,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:48,183:.: 0.10:1.000:. ./.:4:71,211:.: 0.87:1.000:. ./.:4:165,171:.: 1.68:1.000:. ./.:4:65,244:.: 1.27:1.000:. ./.:4:50,166:.:-0.12:1.000:. ./.:4:55,192:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,192:.: 0.39:1.000:. ./.:4:14,36:.:-2.62:1.000:. ./.:4:13,41:.:-2.56:1.000:. ./.:4:76,179:.: 0.46:1.000:. ./.:4:66,164:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,189:.: 0.39:1.000:. ./.:4:69,177:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,239:.: 1.06:1.000:. ./.:4:68,212:.: 0.84:0.998:. ./.:4:134,144:.: 0.81:1.000:. ./.:4:82,257:.: 1.72:1.000:. ./.:4:94,263:.: 1.99:1.000:. ./.:4:37,39:.:-2.23:1.000:. ./.:4:71,173:.: 0.30:1.000:. ./.:4:149,148:.: 1.09:1.000:. ./.:4:63,170:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,32:.:-2.87:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,265:.: 1.75:1.000:. ./.:4:71,188:.: 0.52:1.000:. ./.:4:145,162:.: 1.24:1.000:. ./.:4:73,218:.: 1.00:1.000:. ./.:4:75,197:.: 0.72:1.000:. ./.:4:114,133:.: 0.34:1.000:. ./.:4:18,45:.:-2.42:1.000:. ./.:4:27,55:.:-2.14:1.000:. ./.:3:13,6:.:-3.08:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.79:1.000:. ./.:4:107,128:.: 0.16:1.000:. ./.:4:154,154:.: 1.26:1.000:. ./.:4:43,140:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,101:.:-0.52:1.000:. ./.:4:52,164:.:-0.12:1.000:. ./.:4:26,137:.:-0.92:1.000:. ./.:4:47,175:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,138:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,239:.: 1.39:1.000:. ./.:4:66,204:.: 0.69:1.000:. ./.:4:43,138:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,113:.:-1.16:1.000:. ./.:4:37,142:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,201:.: 0.70:1.000:. ./.:4:49,136:.:-0.59:1.000:. ./.:4:60,163:.:-0.02:1.000:. ./.:4:61,188:.: 0.37:1.000:. ./.:4:48,137:.:-0.59:1.000:. ./.:4:49,163:.:-0.19:1.000:. ./.:4:48,129:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.40:1.000:. ./.:6:47,133:.:-0.67:1.000:. ./.:4:52,173:.: 0.01:1.000:. ./.:4:45,136:.:-0.65:1.000:. ./.:4:98,93:.:-0.50:1.000:. ./.:4:47,108:.:-1.04:1.000:. ./.:4:60,182:.: 0.27:1.000:. ./.:4:53,166:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.58:1.000:. ./.:4:57,168:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.62:1.000:. ./.:4:100,135:.: 0.16:1.000:. ./.:4:60,174:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,106:.:-1.31:1.000:. ./.:4:78,93:.:-0.80:1.000:. ./.:4:70,209:.: 0.82:1.000:. ./.:4:44,131:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,146:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,197:.: 0.37:1.000:. ./.:4:137,38:.:-0.74:0.999:. ./.:4:35,157:.:-0.49:1.000:. ./.:4:62,190:.: 0.42:1.000:. ./.:4:41,172:.:-0.17:1.000:. ./.:6:44,155:.:-0.38:0.897:. ./.:4:118,113:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,87:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,90:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.49:1.000:. ./.:4:47,138:.:-0.59:1.000:. ./.:4:54,140:.:-0.46:1.000:. ./.:4:50,156:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,122:.:-0.94:1.000:. ./.:4:38,186:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.59:1.000:. ./.:4:42,140:.:-0.64:1.000:. ./.:4:76,84:.:-0.97:1.000:. ./.:4:106,114:.:-0.06:1.000:. ./.:4:104,131:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,125:.:-0.98:1.000:. ./.:4:94,108:.:-0.34:1.000:. ./.:4:54,127:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,141:.:-0.65:1.000:. ./.:4:58,115:.:-0.77:1.000:. ./.:4:89,205:.: 1.05:1.000:. ./.:4:146,174:.: 1.44:1.000:. ./.:4:45,201:.: 0.33:1.000:. ./.:4:49,134:.:-0.62:1.000:. ./.:4:81,229:.: 1.29:1.000:. ./.:4:43,161:.:-0.31:0.999:. ./.:4:105,89:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,148:.:-1.15:1.000:. ./.:4:47,119:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,143:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,125:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.23:1.000:. ./.:4:83,97:.:-0.67:1.000:. ./.:4:60,168:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.37:1.000:. ./.:4:69,228:.: 1.09:1.000:. ./.:4:50,150:.:-0.37:1.000:. ./.:4:43,146:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,141:.:-1.25:1.000:. ./.:4:33,100:.:-1.37:1.000:. ./.:4:47,117:.:-0.91:1.000:. ./.:4:38,107:.:-1.19:1.000:. ./.:4:128,158:.: 0.93:1.000:. ./.:4:39,107:.:-1.18:1.000:. ./.:4:35,124:.:-0.98:1.000:. ./.:4:83,94:.:-0.71:1.000:. ./.:4:89,330:.: 2.92:1.000:. ./.:4:61,164:.: 0.01:1.000:. ./.:4:51,159:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,86:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,135:.:-0.74:1.000:. ./.:4:38,154:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.22:1.000:. ./.:4:114,137:.: 0.40:1.000:. ./.:4:36,108:.:-1.21:1.000:. ./.:4:73,251:.: 1.50:1.000:. ./.:4:90,235:.: 1.51:1.000:. ./.:4:76,219:.: 1.06:1.000:. ./.:4:60,192:.: 0.42:1.000:. ./.:4:155,174:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,271:.: 1.84:1.000:. ./.:4:56,239:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,51:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.28:1.000:. ./.:4:55,200:.: 0.46:1.000:. ./.:4:69,200:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,329:.: 1.57:1.000:. ./.:4:161,133:.: 1.05:1.000:. ./.:4:52,202:.: 0.45:1.000:. ./.:4:69,197:.: 0.63:1.000:. ./.:4:66,214:.: 0.84:1.000:. ./.:4:102,109:.:-0.20:1.000:. ./.:4:67,198:.: 0.61:1.000:. ./.:4:65,183:.: 0.36:1.000:. ./.:4:133,148:.: 0.85:1.000:. ./.:4:52,205:.: 0.49:1.000:. ./.:4:56,185:.: 0.25:1.000:. ./.:4:128,144:.: 0.72:0.999:. ./.:4:0,294:.: 1.05:1.000:. ./.:4:72,218:.: 0.99:1.000:. ./.:4:61,199:.: 0.54:1.000:. ./.:4:89,108:.:-0.41:1.000:. ./.:4:63,167:.: 0.09:1.000:. ./.:4:59,177:.: 0.18:1.000:. ./.:4:47,129:.:-0.73:1.000:. ./.:4:52,178:.: 0.09:1.000:. ./.:4:87,264:.: 1.90:1.000:. ./.:4:74,237:.: 1.30:1.000:. ./.:4:137,156:.: 1.03:1.000:. ./.:4:76,212:.: 0.96:1.000:. ./.:4:148,158:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,332:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,417:.: 2.89:1.000:. ./.:4:41,157:.:-0.40:1.000:. ./.:4:137,151:.: 0.96:1.000:. -chr3.1 79815199 chr3.1_079815199 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:17,24:0.58: 0.55:1.000:0.912 0/0/1/1:4:19,20:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,15:0.41: 0.27:1.000:0.852 0/0/1/1:4:16,20:0.56: 0.08:1.000:0.972 0/0/0/1:4:22,11:0.35:-0.20:1.000:0.825 0/0/1/1:4:23,28:0.55: 1.48:1.000:0.979 0/0/1/1:4:11,9:0.46:-1.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,27:0.59: 0.92:1.000:0.850 0/0/0/1:4:23,11:0.34:-0.11:1.000:0.891 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-2.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,34:0.72: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:25,10:0.30:-0.01:1.000:0.987 0/0/1/1:4:23,24:0.52: 1.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,7:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,16:0.43: 0.27:1.000:0.957 0/0/0/1:4:38,9:0.20: 1.10:0.998:1.000 0/1/1/1:4:17,32:0.64: 1.29:1.000:0.628 0/0/0/1:4:29,16:0.37: 0.92:1.000:0.582 0/0/1/1:4:27,21:0.45: 1.20:1.000:0.981 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-2.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,16:0.43: 0.27:1.000:0.957 0/0/0/1:4:26,7:0.22:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,21:0.47: 1.01:1.000:0.992 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-2.25:1.000:0.885 0/1/1/1:4:16,31:0.64: 1.10:1.000:0.692 0/0/0/1:4:25,7:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,20:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,6:0.14: 0.92:1.000:0.967 0/0/1/1:4:30,23:0.45: 1.66:1.000:0.978 0/0/0/1:4:31,11:0.27: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,12:0.32: 0.36:1.000:0.953 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.71:-2.53:1.000:0.993 0/0/0:3:1,0:0.00:-3.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,16:0.45: 0.17:1.000:0.976 0/0/0/1:4:31,12:0.29: 0.73:1.000:0.991 0/0/0/1:4:41,13:0.25: 1.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,7:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,24:0.54: 0.92:1.000:0.988 0/0/1/1:4:20,18:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,10:0.31:-0.11:1.000:0.978 0/0/0/1:4:29,13:0.32: 0.64:1.000:0.948 0/0/0/1:4:20,9:0.32:-0.57:1.000:0.946 0/0/1/1:4:25,18:0.43: 0.73:1.000:0.952 0/0/0/1:4:26,5:0.17:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,19:0.53: 0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:2,7:0.74:-2.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,13:0.56:-1.13:1.000:0.960 0/0/0/1:4:9,5:0.37:-1.97:1.000:0.561 0/0/0/0:4:19,2:0.10:-1.32:1.000:0.801 0/0/1/1:4:15,16:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/0:4:33,3:0.09: 0.08:1.000:0.962 0/0/0/1:4:24,13:0.36: 0.17:1.000:0.636 0/1/1/1:4:7,13:0.63:-1.41:1.000:0.597 0/0/0/1:4:26,9:0.27:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,17:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,12:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:19,12:0.40:-0.39:1.000:0.795 0/0/0/1/1/1:6:18,17:0.50:-0.01:1.000:0.889 0/0/1/1:4:24,22:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,16:0.42: 0.36:1.000:0.928 0/0/0/1:4:31,10:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,17:0.45: 0.36:1.000:0.980 0/1/1/1:4:10,18:0.63:-0.66:1.000:0.521 0/0/0/1:4:23,13:0.37: 0.08:1.000:0.507 0/0/1/1:4:22,18:0.46: 0.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:23,6:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,18:0.52:-0.01:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,21:0.54: 0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-1.78:1.000:0.671 0/0/1/1:4:17,17:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,18:0.43: 0.73:1.000:0.952 0/1/1/1:4:6,28:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.53: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:24,15:0.40: 0.36:1.000:0.773 0/0/1/1:4:13,16:0.55:-0.57:1.000:0.976 0/0/1/1:4:21,15:0.43: 0.08:1.000:0.947 0/0/1/1:4:16,16:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,14:0.47:-0.39:0.999:0.990 0/0/0/1:4:34,7:0.18: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,9:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,7:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:11,16:0.59:-0.76:0.897:0.531 0/0/0/1:4:25,11:0.32: 0.08:1.000:0.958 0/0/0/1:4:27,6:0.19:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,7:0.18: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,20:0.60:-0.20:1.000:0.815 0/0/1/1:4:17,16:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,10:0.38:-0.76:1.000:0.615 0/0/1/1:4:17,22:0.56: 0.36:1.000:0.961 0/0/1/1:4:11,14:0.56:-0.94:1.000:0.967 0/0/0/1:4:26,12:0.33: 0.27:1.000:0.927 0/0/1/1:4:21,19:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,7:0.16: 1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,16:0.72:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,7:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,7:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,12:0.55:-1.22:1.000:0.982 0/0/1/1:4:26,15:0.38: 0.55:1.000:0.556 0/0/0/1:4:21,10:0.34:-0.39:1.000:0.896 0/0/0/1:4:33,7:0.18: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,10:0.38:-0.76:1.000:0.615 0/0/1/1:4:19,19:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,10:0.28: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,20:0.44: 1.10:1.000:0.966 0/0/0/1:4:43,7:0.15: 1.38:1.000:0.984 0/0/0/1:4:31,10:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,8:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,15:0.25: 2.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,3:0.12:-0.85:0.999:0.786 0/0/0/1:4:31,6:0.17: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,8:0.48:-1.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,20:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,15:0.57:-0.85:1.000:0.936 0/0/1/1:4:14,13:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,18:0.43: 0.73:1.000:0.952 0/0/0/1:4:18,7:0.29:-0.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:31,8:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.44:-0.01:1.000:0.971 0/0/1/1:4:21,20:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,15:0.35: 0.82:1.000:0.756 0/0/0/1:4:25,6:0.20:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,13:0.35: 0.36:1.000:0.825 0/0/0/1:4:35,14:0.30: 1.29:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.55:-1.04:1.000:0.984 0/0/0/1:4:25,8:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,12:0.39:-0.29:1.000:0.671 0/0/0/1:4:46,12:0.22: 2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,3:0.16:-1.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,13:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,3:0.13:-1.04:1.000:0.920 0/0/0/1:4:21,6:0.23:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,7:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.55:-1.04:1.000:0.984 0/0/0/1:4:31,9:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.27:-0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,13:0.34: 0.45:1.000:0.883 0/0/1/1:4:12,12:0.51:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,7:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,16:0.54:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:35,7:0.17: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,16:0.46: 0.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:18,25:0.58: 0.73:1.000:0.925 0/0/1/1:4:12,16:0.57:-0.66:1.000:0.949 0/0/0/1:4:33,8:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,34:0.62: 1.76:1.000:0.619 0/0/0/1:4:32,15:0.33: 1.10:1.000:0.913 0/0/1/1:4:20,16:0.46: 0.08:1.000:0.987 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.44:-0.01:1.000:0.971 0/0/0/1:4:28,9:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,14:0.32: 0.92:1.000:0.943 0/0/1/1:4:22,24:0.53: 1.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:35,15:0.31: 1.38:1.000:0.969 0/0/0/1:4:28,6:0.19:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,10:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,16:0.37: 0.92:1.000:0.582 0/0/0/1:4:31,6:0.17: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,21:0.53: 0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:36,8:0.19: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.62:-1.50:1.000:0.599 0/0/1/1:4:21,19:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,26:0.57: 0.92:1.000:0.934 0/1/1/1:4:10,33:0.73: 0.73:0.999:0.997 0/0/1/1:4:19,21:0.53: 0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:24,8:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,19:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,14:0.35: 0.55:1.000:0.750 0/0/0/1:4:31,12:0.29: 0.73:1.000:0.991 0/0/0/1:4:25,8:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,14:0.54:-0.85:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,7:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,11:0.23: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,14:0.39: 0.17:1.000:0.710 0/0/0/1:4:46,14:0.25: 2.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,13:0.29: 1.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:39,10:0.21: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,19:0.46: 0.73:1.000:0.985 0/0/1/1:4:20,25:0.56: 0.92:1.000:0.972 0/0/1/1:4:18,15:0.47:-0.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,32:0.69: 0.82:1.000:0.980 -chr3.1 79911889 chr3.1_079911889 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:32,9:0.28: 0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,12:0.43:-0.69:1.000:0.953 0/0/0/1:4:36,6:0.20: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,5:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,12:0.31: 1.24:1.000:0.978 0/0/0/1:4:17,7:0.33:-1.09:1.000:0.908 0/0/0/1:4:12,3:0.27:-2.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,10:0.38:-0.69:1.000:0.577 0/0/1/1:4:6,12:0.62:-1.70:1.000:0.614 0/0/1/1:4:11,19:0.59:-0.48:1.000:0.865 0/0/1/1:4:18,17:0.47: 0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:22,4:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.29:-0.48:1.000:0.992 0/0/0/1:4:37,5:0.17: 0.73:1.000:0.998 0/0/0/1:4:25,5:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,18:0.62:-0.79:1.000:0.614 0/0/1/1:4:23,13:0.38: 0.12:0.998:0.614 0/0/0/1:4:21,11:0.37:-0.28:1.000:0.552 0/0/1/1:4:12,14:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,11:0.29: 1.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,10:0.47:-1.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:37,13:0.31: 1.54:1.000:0.974 0/1/1/1:4:10,22:0.63:-0.28:1.000:0.605 0/0/0/1:4:29,5:0.21:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.67:-1.30:1.000:0.898 0/0/0/0:4:25,1:0.05:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.26:-1.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,12:0.39:-0.18:1.000:0.637 0/0/0/1:4:35,9:0.27: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,10:0.33:-0.08:1.000:0.899 0/0/0/1:4:18,7:0.32:-0.99:1.000:0.941 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-1.90:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.56:-0.99:1.000:0.962 0/0/1:3:3,3:0.48:-2.92:1.000:0.736 0/0/0/1:4:35,6:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.65:-2.11:1.000:0.831 0/0/0/1:4:35,8:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,20:0.68:-0.79:1.000:0.942 0/0/0/1:4:39,4:0.13: 0.83:1.000:0.917 0/0/0/1:4:42,8:0.22: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,25:0.67:-0.08:1.000:0.927 0/0/1/1:4:11,17:0.57:-0.69:1.000:0.949 0/0/0/1:4:21,6:0.28:-0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,8:0.20: 2.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,36:0.82: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,4:0.12: 1.34:1.000:0.696 0/0/0/1:4:19,4:0.24:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,15:0.47:-0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:22,3:0.17:-0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,10:0.36:-0.48:1.000:0.650 0/0/0/1:4:28,15:0.37: 0.83:1.000:0.503 0/0/1/1:4:24,15:0.40: 0.43:1.000:0.796 0/0/1/1:4:25,14:0.38: 0.43:1.000:0.594 0/0/1/1:4:14,17:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:39,8:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,22:0.48: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,11:0.34: 0.12:1.000:0.849 0/0/0/0/0/1:6:36,4:0.14: 0.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:36,4:0.14: 0.53:1.000:0.969 0/0/1/1:4:17,10:0.39:-0.79:1.000:0.694 0/1/1/1:4:10,25:0.65: 0.02:1.000:0.831 0/0/0/0:4:49,4:0.11: 1.85:1.000:0.637 0/0/0/1:4:32,5:0.19: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.44:-1.19:1.000:0.962 0/0/0/1:4:32,9:0.28: 0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,22:0.63:-0.28:1.000:0.605 0/0/0/1:4:47,9:0.23: 2.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,13:0.32: 1.34:1.000:0.959 0/1/1/1:4:3,15:0.75:-1.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,20:0.48: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,8:0.37:-1.19:1.000:0.513 0/0/0/1:4:37,8:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,5:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,4:0.14: 0.53:1.000:0.969 0/0/0/1:4:48,7:0.18: 2.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,4:0.12: 1.24:1.000:0.756 0/0/0/1:4:40,5:0.16: 1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,9:0.39:-1.09:0.999:0.730 0/0/1/1:4:23,19:0.45: 0.73:1.000:0.980 0/0/1/1:4:23,27:0.52: 1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:17,7:0.33:-1.09:1.000:0.908 0/0/0/0/1/1:6:39,10:0.27: 1.44:0.897:0.676 0/0/1/1:4:11,21:0.61:-0.28:1.000:0.712 0/0/0/1:4:22,9:0.33:-0.38:1.000:0.912 0/0/1/1:4:13,15:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,16:0.47:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:33,6:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,17:0.63:-0.99:1.000:0.526 0/0/0/1:4:21,5:0.26:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,7:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,6:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,14:0.33: 1.44:1.000:0.926 0/0/1/1:4:13,15:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,25:0.67:-0.08:1.000:0.927 0/0/0/1:4:38,7:0.22: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,28:0.67: 0.33:1.000:0.931 0/0/1/1:4:16,19:0.52: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:20,10:0.36:-0.48:1.000:0.650 0/0/1/1:4:17,15:0.46:-0.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,19:0.45: 0.73:1.000:0.980 0/0/1/1:4:17,35:0.62: 1.75:1.000:0.548 0/0/1/1:4:10,21:0.63:-0.38:1.000:0.502 0/0/0/1:4:23,8:0.31:-0.38:1.000:0.976 0/0/1/1:4:21,16:0.44: 0.23:1.000:0.959 0/0/0/1:4:36,5:0.17: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,17:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,20:0.60:-0.38:1.000:0.797 0/1/1/1:4:7,30:0.73: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,15:0.40: 0.43:1.000:0.796 0/0/1/1:4:39,28:0.42: 3.27:0.999:0.932 0/0/0/1:4:26,13:0.36: 0.43:1.000:0.650 0/0/1/1:4:13,10:0.44:-1.19:1.000:0.962 0/0/0/1:4:25,12:0.36: 0.23:1.000:0.726 0/0/1/1:4:23,16:0.42: 0.43:1.000:0.911 0/0/0/1:4:24,9:0.32:-0.18:1.000:0.956 0/0/0/1:4:25,13:0.37: 0.33:1.000:0.568 0/0/1/1:4:17,12:0.42:-0.59:1.000:0.921 0/1/1/1:4:11,24:0.63: 0.02:1.000:0.586 0/0/1/1:4:24,14:0.39: 0.33:1.000:0.678 0/0/0/1:4:59,8:0.17: 3.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,8:0.33:-0.69:1.000:0.926 0/0/1/1:4:29,19:0.41: 1.34:1.000:0.856 0/1/1/1:4:4,32:0.83: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,5:0.19: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,11:0.38:-0.38:1.000:0.555 0/0/1/1:4:19,17:0.46: 0.12:1.000:0.990 0/0/0/1:4:28,4:0.18:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,13:0.38: 0.12:1.000:0.614 0/0/1/1:4:16,10:0.40:-0.89:1.000:0.796 0/0/0/1:4:26,4:0.19:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.44:-0.79:1.000:0.973 0/1/1/1:4:8,20:0.65:-0.69:1.000:0.831 0/1/1/1:4:9,19:0.63:-0.69:1.000:0.511 0/0/0/1:4:27,7:0.27:-0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,28:0.63: 0.63:1.000:0.557 0/0/1/1:4:25,20:0.44: 1.04:1.000:0.973 0/0/1/1:4:13,22:0.59: 0.02:1.000:0.886 0/0/0/1:4:34,12:0.31: 1.14:1.000:0.973 0/1/1/1:4:6,16:0.67:-1.30:1.000:0.898 0/0/1/1:4:13,14:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,26:0.59: 0.63:1.000:0.861 0/0/0/1:4:40,8:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,11:0.29: 1.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:15,15:0.48:-0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,23:0.66:-0.28:1.000:0.857 0/0/0/1:4:32,7:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,25:0.58: 0.53:1.000:0.900 0/0/0/1:4:20,5:0.27:-0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:7,13:0.60:-1.50:1.000:0.762 0/0/0/1:4:20,8:0.33:-0.69:1.000:0.926 0/1/1/1:4:7,26:0.71:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,11:0.33: 0.33:1.000:0.915 0/0/0/1:4:37,9:0.26: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,14:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,14:0.53:-0.99:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,23:0.61: 0.02:1.000:0.704 0/0/0/1:4:29,6:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.50:-1.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,16:0.44: 0.23:1.000:0.959 0/0/0/1:4:36,15:0.33: 1.64:1.000:0.899 0/0/0/1:4:19,2:0.13:-1.40:1.000:0.939 0/0/0/1:4:26,7:0.28:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:37,1:0.04: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,5:0.19: 0.33:0.999:0.999 0/0/0/1:4:30,4:0.17:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,18:0.53:-0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:27,6:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,6:0.34:-1.50:1.000:0.875 0/0/1/1:4:9,12:0.54:-1.40:1.000:0.987 0/0/0/1:4:35,12:0.31: 1.24:1.000:0.978 0/0/0/1:4:37,4:0.14: 0.63:1.000:0.956 0/0/1/1:4:10,11:0.50:-1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,11:0.47:-1.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,16:0.48:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,14:0.45:-0.38:1.000:0.979 0/0/0/1:4:28,6:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,15:0.34: 1.54:1.000:0.875 0/0/0/1:4:42,8:0.22: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,4:0.14: 0.43:1.000:0.978 0/0/1/1:4:13,7:0.38:-1.50:1.000:0.509 0/0/0/1:4:32,3:0.12: 0.02:1.000:0.774 -chr3.1 80288011 chr3.1_080288011 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 2.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.66:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.: 0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,28:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.30:1.000:. ./.:3:0,8:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,9:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,56:.: 4.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 1.53:0.999:. ./.:4:0,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,4:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.19:0.999:. ./.:4:0,20:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.10:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.88:1.000:. -chr3.1 80384140 chr3.1_080384140 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,9:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.39:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,17:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,1:.:-2.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.: 2.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,16:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,17:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.: 0.39:0.999:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.16:0.999:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,10:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,20:.: 1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,6:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,24:.: 2.73:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,6:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,6:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.: 0.39:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,21:.: 2.03:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.: 0.63:1.000:. -chr3.1 80583225 chr3.1_080583225 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:97,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:0.998:. ./.:4:67,49:.: 1.65:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:116,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:118,1:.: 1.78:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.82:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.15:1.000:. ./.:6:52,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:91,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:83,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.11:1.000:. ./.:6:58,0:.:-0.84:0.897:. ./.:4:86,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:133,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:115,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:85,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:107,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:0.999:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.79:1.000:. -chr3.1 80714973 chr3.1_080714973 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:74,526:.: 0.28:1.000:. ./.:4:213,344:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,552:.: 0.56:1.000:. ./.:4:80,630:.: 0.83:1.000:. ./.:4:181,504:.: 0.71:1.000:. ./.:4:132,808:.: 1.97:1.000:. ./.:4:70,589:.: 0.58:1.000:. ./.:4:104,681:.: 1.20:1.000:. ./.:4:96,611:.: 0.82:1.000:. ./.:4:12,49:.:-2.39:1.000:. ./.:4:11,110:.:-2.10:1.000:. ./.:4:92,581:.: 0.65:1.000:. ./.:4:95,674:.: 1.12:1.000:. ./.:4:88,578:.: 0.61:1.000:. ./.:4:98,605:.: 0.80:1.000:. ./.:4:113,710:.: 1.39:1.000:. ./.:4:107,659:.: 1.11:0.998:. ./.:4:101,629:.: 0.93:1.000:. ./.:4:120,778:.: 1.77:1.000:. ./.:4:104,799:.: 1.79:1.000:. ./.:4:25,94:.:-2.11:1.000:. ./.:4:76,544:.: 0.38:1.000:. ./.:4:195,641:.: 1.46:1.000:. ./.:4:106,615:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,109:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,925:.: 1.90:1.000:. ./.:4:107,782:.: 1.72:1.000:. ./.:4:60,545:.: 0.31:1.000:. ./.:4:201,519:.: 0.88:1.000:. ./.:4:100,713:.: 1.34:1.000:. ./.:4:95,722:.: 1.36:1.000:. ./.:4:181,509:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,30:.:-2.50:1.000:. ./.:4:7,86:.:-2.24:1.000:. ./.:3:5,79:.:-2.28:1.000:. ./.:4:0,747:.: 1.01:1.000:. ./.:4:183,562:.: 1.00:1.000:. ./.:4:178,524:.: 0.79:1.000:. ./.:4:72,440:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,685:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,375:.:-0.83:1.000:. ./.:4:131,361:.:-0.25:1.000:. ./.:4:74,432:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,406:.:-0.42:1.000:. ./.:4:52,288:.:-1.01:1.000:. ./.:4:50,427:.:-0.33:1.000:. ./.:4:88,582:.: 0.63:1.000:. ./.:4:152,971:.: 2.88:1.000:. ./.:4:53,372:.:-0.59:1.000:. ./.:4:39,407:.:-0.48:1.000:. ./.:4:45,275:.:-1.11:1.000:. ./.:4:92,547:.: 0.48:1.000:. ./.:4:48,321:.:-0.86:1.000:. ./.:4:80,456:.:-0.03:1.000:. ./.:4:77,532:.: 0.33:1.000:. ./.:4:75,429:.:-0.19:1.000:. ./.:4:67,414:.:-0.31:1.000:. ./.:4:49,399:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,433:.:-0.55:1.000:. ./.:6:39,281:.:-1.11:1.000:. ./.:4:67,350:.:-0.63:1.000:. ./.:4:76,448:.:-0.09:1.000:. ./.:4:106,347:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,275:.:-1.15:1.000:. ./.:4:77,493:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,439:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,325:.:-1.08:1.000:. ./.:4:77,394:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,463:.:-0.40:1.000:. ./.:4:104,334:.:-0.52:1.000:. ./.:4:53,415:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,405:.:-0.36:1.000:. ./.:4:120,451:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,624:.: 0.94:1.000:. ./.:4:55,409:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,505:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,458:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,429:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,452:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,423:.:-0.26:1.000:. ./.:4:125,191:.:-1.13:0.999:. ./.:4:79,423:.:-0.20:1.000:. ./.:4:91,431:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,394:.:-0.45:1.000:. ./.:6:50,536:.: 0.21:0.897:. ./.:4:135,332:.:-0.38:1.000:. ./.:4:102,238:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,286:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,455:.:-0.44:1.000:. ./.:4:70,391:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,367:.:-0.54:1.000:. ./.:4:77,442:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,349:.:-0.67:1.000:. ./.:4:66,382:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,487:.:-0.28:1.000:. ./.:4:41,262:.:-1.19:1.000:. ./.:4:95,223:.:-1.12:1.000:. ./.:4:112,265:.:-0.82:1.000:. ./.:4:167,426:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,415:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,479:.:-0.32:1.000:. ./.:4:49,214:.:-1.39:1.000:. ./.:4:112,283:.:-0.73:1.000:. ./.:4:31,258:.:-1.26:1.000:. ./.:4:53,427:.:-0.31:1.000:. ./.:4:53,328:.:-0.80:1.000:. ./.:4:87,548:.: 0.46:1.000:. ./.:4:192,579:.: 1.13:1.000:. ./.:4:95,451:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,294:.:-0.96:1.000:. ./.:4:116,825:.: 1.98:1.000:. ./.:4:47,323:.:-0.86:0.999:. ./.:4:161,404:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,349:.:-0.96:1.000:. ./.:4:56,265:.:-1.10:1.000:. ./.:4:39,342:.:-0.80:1.000:. ./.:4:54,345:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,393:.:-0.74:1.000:. ./.:4:106,267:.:-0.84:1.000:. ./.:4:88,443:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,341:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,499:.:-0.22:1.000:. ./.:4:109,692:.: 1.28:1.000:. ./.:4:53,316:.:-0.86:1.000:. ./.:4:61,389:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,418:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,361:.:-0.90:1.000:. ./.:4:30,281:.:-1.15:1.000:. ./.:4:45,243:.:-1.27:1.000:. ./.:4:57,344:.:-0.70:1.000:. ./.:4:181,515:.: 0.76:1.000:. ./.:4:40,235:.:-1.33:1.000:. ./.:4:53,407:.:-0.41:1.000:. ./.:4:135,359:.:-0.24:1.000:. ./.:4:123,783:.: 1.80:1.000:. ./.:4:83,479:.: 0.10:1.000:. ./.:4:29,265:.:-1.24:1.000:. ./.:4:80,251:.:-1.05:1.000:. ./.:4:43,319:.:-0.90:1.000:. ./.:4:68,373:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,368:.:-0.87:1.000:. ./.:4:158,389:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,255:.:-1.24:1.000:. ./.:4:125,733:.: 1.57:1.000:. ./.:4:95,750:.: 1.50:1.000:. ./.:4:87,530:.: 0.37:1.000:. ./.:4:79,450:.:-0.07:1.000:. ./.:4:170,660:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,467:.:-0.38:1.000:. ./.:4:119,761:.: 1.68:1.000:. ./.:4:66,590:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,111:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,543:.: 0.00:1.000:. ./.:4:117,677:.: 1.25:1.000:. ./.:4:104,622:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,847:.: 1.51:1.000:. ./.:4:208,634:.: 1.49:1.000:. ./.:4:92,520:.: 0.34:1.000:. ./.:4:109,733:.: 1.49:1.000:. ./.:4:74,560:.: 0.45:1.000:. ./.:4:152,417:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,484:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,601:.: 0.75:1.000:. ./.:4:185,632:.: 1.36:1.000:. ./.:4:77,594:.: 0.64:1.000:. ./.:4:67,512:.: 0.18:1.000:. ./.:4:168,475:.: 0.50:0.999:. ./.:4:0,611:.: 0.34:1.000:. ./.:4:110,597:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,473:.:-0.05:1.000:. ./.:4:156,415:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,455:.:-0.02:1.000:. ./.:4:80,462:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,412:.:-0.41:1.000:. ./.:4:64,395:.:-0.42:1.000:. ./.:4:109,825:.: 1.94:1.000:. ./.:4:92,582:.: 0.65:1.000:. ./.:4:200,563:.: 1.09:1.000:. ./.:4:87,565:.: 0.54:1.000:. ./.:4:205,564:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,928:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,873:.: 1.64:1.000:. ./.:4:77,552:.: 0.43:1.000:. ./.:4:155,452:.: 0.32:1.000:. -chr3.1 80826259 chr3.1_080826259 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:17,17:0.62: 0.97:1.000:0.540 0/0/1/1:4:11,8:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,21:0.80: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,21:0.60: 1.89:1.000:0.778 0/1/1/1:4:17,20:0.69: 1.28:1.000:0.980 0/1/1/1:4:16,18:0.67: 0.97:1.000:0.939 0/1/1/1:4:5,9:0.79:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,14:0.77:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.54:-1.38:1.000:0.987 0/0/1/1:4:4,2:0.43:-1.90:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.82: 0.56:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,19:0.56: 1.69:1.000:0.972 0/1/1/1:4:4,6:0.77:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,17:0.55: 1.28:1.000:0.980 0/1/1/1:4:14,18:0.73: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,12:0.75:-0.36:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,7:0.47:-0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:18,28:0.77: 2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.58: 1.38:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,11:0.75:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.31:1.000:1.000 1/1/1:3:0,3:1.00:-2.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,16:0.71: 0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,18:0.76: 0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,18:0.79: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,14:0.76:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,14:0.54: 0.66:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,26:0.68: 2.51:1.000:0.945 0/1/1/1:4:5,10:0.81:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,11:0.48: 0.25:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,21:0.69: 1.48:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,21:0.79: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,20:0.75: 1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,18:0.76: 0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:14,13:0.59: 0.25:1.000:0.555 0/0/1/1:4:15,15:0.62: 0.56:1.000:0.540 0/0/1/1:4:11,9:0.53:-0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:20,12:0.46: 0.77:1.000:0.989 0/1/1/1:4:21,23:0.66: 2.00:1.000:0.886 0/1/1/1:4:17,18:0.65: 1.07:1.000:0.772 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,10:0.41: 0.87:1.000:0.881 0/0/1/1:4:16,15:0.59: 0.66:1.000:0.842 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.56: 0.36:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,15:0.54: 0.87:1.000:0.987 0/0/1/1:4:14,12:0.55: 0.15:0.999:0.976 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:13,20:0.77: 0.87:0.897:0.733 0/0/1/1:4:24,18:0.50: 1.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,18:0.77: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.49:-0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,22:0.66: 1.79:1.000:0.897 0/0/1/1:4:13,11:0.55:-0.05:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,12:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,15:0.54: 0.87:1.000:0.987 0/1/1/1:4:19,28:0.76: 2.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,10:0.42: 0.77:1.000:0.911 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,16:0.68: 0.56:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,24:0.79: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,24:0.78: 1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 0.05:0.999:1.000 0/1/1/1:4:14,16:0.68: 0.56:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,8:0.40: 0.36:1.000:0.801 0/0/1/1:4:11,10:0.58:-0.36:1.000:0.916 0/0/1/1:4:15,14:0.59: 0.46:1.000:0.855 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.45: 0.87:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.84:-0.67:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.51:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,17:0.68: 0.77:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,12:0.75:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,8:0.44:-0.16:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,19:0.67: 1.18:1.000:0.928 0/0/1/1:4:25,11:0.41: 1.18:1.000:0.890 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,22:0.77: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,8:0.37: 0.87:1.000:0.539 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,25:0.59: 2.82:1.000:0.877 0/1/1/1:4:16,28:0.79: 2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,19:0.76: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,20:0.72: 1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.62: 0.77:1.000:0.540 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,23:0.78: 1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,14:0.66: 0.25:1.000:0.837 0/1/1/1:4:7,8:0.68:-0.97:1.000:0.958 0/1/1/1:4:13,25:0.80: 1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,1:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,11:0.66:-0.36:1.000:0.897 0/1/1/1:4:13,21:0.78: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,20:0.65: 1.48:0.999:0.745 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,14:0.79:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,11:0.75:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.62:-0.26:1.000:0.540 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,14:0.66: 0.25:1.000:0.837 1/1/1/1:4:2,23:0.95: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,17:0.65: 0.87:1.000:0.786 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,11:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,21:0.74: 1.28:1.000:0.999 -chr3.1 80980552 chr3.1_080980552 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:52,199:.: 0.56:1.000:. ./.:4:37,133:.:-1.36:1.000:. ./.:4:46,199:.: 0.42:1.000:. ./.:4:44,183:.:-0.01:1.000:. ./.:4:83,259:.: 2.72:1.000:. ./.:4:34,168:.:-0.60:1.000:. ./.:4:30,100:.:-2.31:1.000:. ./.:4:53,189:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.98:1.000:. ./.:4:26,125:.:-1.81:1.000:. ./.:4:30,145:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.23:1.000:. ./.:4:61,183:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.16:0.998:. ./.:4:4,258:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,303:.: 1.80:1.000:. ./.:4:66,202:.: 0.97:1.000:. ./.:4:33,140:.:-1.29:1.000:. ./.:4:55,165:.:-0.17:1.000:. ./.:4:50,236:.: 1.39:1.000:. ./.:4:58,155:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,140:.:-2.07:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.47:1.000:. ./.:4:62,191:.: 0.61:1.000:. ./.:4:61,205:.: 0.92:1.000:. ./.:4:45,190:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,172:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,86:.:-2.67:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.43:1.000:. ./.:3:0,117:.:-2.62:1.000:. ./.:4:1,244:.: 0.42:1.000:. ./.:4:52,175:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,175:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.20:1.000:. ./.:4:51,176:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,274:.: 1.11:1.000:. ./.:4:32,150:.:-1.08:1.000:. ./.:4:54,206:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.13:1.000:. ./.:4:67,213:.: 1.25:1.000:. ./.:4:38,184:.:-0.13:1.000:. ./.:4:46,180:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,246:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.56:1.000:. ./.:4:75,240:.: 2.08:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.90:1.000:. ./.:4:42,161:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,279:.: 1.23:1.000:. ./.:4:43,177:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,223:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.06:1.000:. ./.:6:19,159:.:-1.17:1.000:. ./.:4:44,153:.:-0.72:1.000:. ./.:4:37,168:.:-0.53:1.000:. ./.:4:54,198:.: 0.59:1.000:. ./.:4:45,193:.: 0.25:1.000:. ./.:4:51,174:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,103:.:-0.29:1.000:. ./.:4:60,187:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.74:1.000:. ./.:4:1,319:.: 2.20:1.000:. ./.:4:56,222:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,174:.: 0.14:1.000:. ./.:4:37,144:.:-1.10:0.999:. ./.:4:0,284:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.22:1.000:. ./.:6:45,272:.: 2.13:0.897:. ./.:4:57,224:.: 1.28:1.000:. ./.:4:30,113:.:-2.00:1.000:. ./.:4:47,172:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,167:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.25:1.000:. ./.:4:58,211:.: 0.99:1.000:. ./.:4:42,162:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.09:1.000:. ./.:4:49,154:.:-0.58:1.000:. ./.:4:41,185:.:-0.03:1.000:. ./.:4:49,179:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,169:.:-1.39:1.000:. ./.:4:53,198:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,180:.:-1.12:1.000:. ./.:4:42,181:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.46:1.000:. ./.:4:50,163:.:-0.34:1.000:. ./.:4:62,217:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,284:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,291:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.85:0.999:. ./.:4:49,167:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,141:.:-2.05:1.000:. ./.:4:45,134:.:-1.15:1.000:. ./.:4:43,162:.:-0.53:1.000:. ./.:4:44,187:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.15:1.000:. ./.:4:42,163:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,272:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,280:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.61:1.000:. ./.:4:2,250:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,174:.:-1.27:1.000:. ./.:4:30,105:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,184:.:-1.03:1.000:. ./.:4:52,173:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,169:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,129:.:-2.34:1.000:. ./.:4:46,199:.: 0.42:1.000:. ./.:4:52,179:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,284:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.53:1.000:. ./.:4:26,172:.:-0.70:1.000:. ./.:4:34,144:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,168:.:-0.43:1.000:. ./.:4:23,120:.:-2.00:1.000:. ./.:4:0,288:.: 1.44:1.000:. ./.:4:77,233:.: 1.96:1.000:. ./.:4:54,182:.: 0.21:1.000:. ./.:4:43,186:.: 0.04:1.000:. ./.:4:60,220:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.66:1.000:. ./.:4:54,181:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.84:1.000:. ./.:4:0,156:.:-1.69:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,297:.: 1.66:1.000:. ./.:4:40,184:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.73:1.000:. ./.:4:45,156:.:-0.63:1.000:. ./.:4:38,154:.:-0.84:1.000:. ./.:4:42,155:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.16:1.000:. ./.:4:97,99:.:-0.74:1.000:. ./.:4:59,208:.: 0.94:1.000:. ./.:4:43,152:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,158:.:-0.53:0.999:. ./.:4:0,236:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.16:1.000:. ./.:4:54,139:.:-0.82:1.000:. ./.:4:42,149:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,161:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,157:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,292:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,217:.: 1.18:1.000:. ./.:4:10,199:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,206:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,281:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,305:.: 1.85:1.000:. ./.:4:47,153:.:-0.65:1.000:. ./.:4:49,175:.:-0.08:1.000:. -chr3.1 81395244 chr3.1_081395244 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:60,63:.:-0.57:1.000:. ./.:4:145,46:.: 0.82:1.000:. ./.:4:87,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:107,50:.: 0.13:1.000:. ./.:4:153,88:.: 1.85:1.000:. ./.:4:234,61:.: 2.95:1.000:. ./.:4:46,25:.:-1.63:1.000:. ./.:4:113,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,21:.:-2.17:1.000:. ./.:4:16,48:.:-1.78:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:126,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:163,18:.: 0.62:1.000:. ./.:4:178,16:.: 0.88:1.000:. ./.:4:179,16:.: 0.90:0.998:. ./.:4:112,61:.: 0.45:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:140,53:.: 0.86:1.000:. ./.:4:15,38:.:-2.00:1.000:. ./.:4:49,50:.:-1.06:1.000:. ./.:4:132,64:.: 0.92:1.000:. ./.:4:170,50:.: 1.42:1.000:. ./.:4:24,2:.:-2.56:1.000:. ./.:4:115,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:244,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:133,61:.: 0.88:1.000:. ./.:4:195,61:.: 2.15:1.000:. ./.:4:64,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:96,9:.:-0.94:1.000:. ./.:4:98,53:.: 0.00:1.000:. ./.:4:30,27:.:-1.92:1.000:. ./.:4:56,9:.:-1.76:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:101,58:.: 0.17:1.000:. ./.:4:120,78:.: 0.96:1.000:. ./.:4:152,3:.: 0.08:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:110,14:.:-0.55:1.000:. ./.:4:192,56:.: 1.99:1.000:. ./.:4:178,9:.: 0.74:1.000:. ./.:4:93,53:.:-0.10:1.000:. ./.:4:116,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:114,11:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,67:.: 0.39:1.000:. ./.:4:36,38:.:-1.57:1.000:. ./.:4:87,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:131,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:119,56:.: 0.49:1.000:. ./.:4:127,12:.:-0.24:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:59,53:.:-0.80:1.000:. ./.:4:101,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:77,47:.:-0.55:1.000:. ./.:4:102,73:.: 0.49:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.21:1.000:. ./.:6:66,49:.:-0.73:1.000:. ./.:4:79,40:.:-0.65:1.000:. ./.:4:132,53:.: 0.70:1.000:. ./.:4:58,63:.:-0.61:1.000:. ./.:4:125,43:.: 0.35:1.000:. ./.:4:117,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:128,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:80,8:.:-1.29:1.000:. ./.:4:53,109:.: 0.23:1.000:. ./.:4:38,41:.:-1.47:1.000:. ./.:4:96,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:185,4:.: 0.78:1.000:. ./.:4:116,50:.: 0.31:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:128,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,16:.:-1.21:1.000:. ./.:4:88,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:38,52:.:-1.25:1.000:. ./.:4:136,34:.: 0.39:0.999:. ./.:4:218,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:137,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.11:1.000:. ./.:6:83,54:.:-0.28:0.897:. ./.:4:93,74:.: 0.33:1.000:. ./.:4:66,44:.:-0.84:1.000:. ./.:4:128,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:83,10:.:-1.18:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:151,15:.: 0.31:1.000:. ./.:4:165,46:.: 1.23:1.000:. ./.:4:37,46:.:-1.39:1.000:. ./.:4:113,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:103,15:.:-0.67:1.000:. ./.:4:126,3:.:-0.45:1.000:. ./.:4:90,44:.:-0.35:1.000:. ./.:4:118,54:.: 0.43:1.000:. ./.:4:150,50:.: 1.01:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:154,5:.: 0.17:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:140,67:.: 1.15:1.000:. ./.:4:77,13:.:-1.25:1.000:. ./.:4:38,65:.:-0.98:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:167,51:.: 1.37:1.000:. ./.:4:140,64:.: 1.09:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:92,12:.:-0.96:1.000:. ./.:4:130,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.45:0.999:. ./.:4:154,48:.: 1.05:1.000:. ./.:4:72,15:.:-1.31:1.000:. ./.:4:122,60:.: 0.64:1.000:. ./.:4:38,52:.:-1.25:1.000:. ./.:4:88,65:.: 0.04:1.000:. ./.:4:132,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:123,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,17:.:-0.75:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:122,7:.:-0.45:1.000:. ./.:4:94,14:.:-0.88:1.000:. ./.:4:158,12:.: 0.39:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,2:.:-1.84:1.000:. ./.:4:74,36:.:-0.84:1.000:. ./.:4:109,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,57:.:-1.25:1.000:. ./.:4:92,53:.:-0.12:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:99,42:.:-0.20:1.000:. ./.:4:159,48:.: 1.15:1.000:. ./.:4:227,22:.: 2.01:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:127,32:.: 0.17:1.000:. ./.:4:127,50:.: 0.54:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:75,13:.:-1.29:1.000:. ./.:4:106,67:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,51:.:-0.28:1.000:. ./.:4:289,1:.: 2.85:1.000:. ./.:4:130,66:.: 0.92:1.000:. ./.:4:66,70:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,60:.:-0.80:1.000:. ./.:4:183,52:.: 1.72:1.000:. ./.:4:90,8:.:-1.08:1.000:. ./.:4:186,21:.: 1.15:1.000:. ./.:4:113,65:.: 0.56:1.000:. ./.:4:101,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:69,17:.:-1.33:1.000:. ./.:4:95,8:.:-0.98:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:177,53:.: 1.62:1.000:. ./.:4:131,7:.:-0.26:1.000:. ./.:4:163,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:105,69:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,50:.:-0.47:1.000:. ./.:4:97,51:.:-0.06:1.000:. ./.:4:105,11:.:-0.71:1.000:. ./.:4:45,94:.:-0.24:1.000:. ./.:4:118,55:.: 0.45:1.000:. ./.:4:133,45:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,55:.:-0.90:0.999:. ./.:4:111,14:.:-0.53:1.000:. ./.:4:157,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:148,52:.: 1.01:1.000:. ./.:4:86,46:.:-0.39:1.000:. ./.:4:152,9:.: 0.21:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:144,32:.: 0.51:1.000:. ./.:4:132,8:.:-0.22:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,18:.:-0.51:1.000:. ./.:4:109,67:.: 0.51:1.000:. ./.:4:145,26:.: 0.41:1.000:. ./.:4:180,62:.: 1.87:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:145,15:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,48:.:-1.21:1.000:. ./.:4:113,64:.: 0.54:1.000:. -chr3.1 81480698 chr3.1_081480698 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:94,65:.:-0.14:1.000:. ./.:4:69,46:.:-1.09:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:113,57:.: 0.10:1.000:. ./.:4:70,42:.:-1.16:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:97,31:.:-0.81:1.000:. ./.:4:78,87:.:-0.01:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,62:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,79:.:-0.64:1.000:. ./.:4:62,87:.:-0.36:1.000:. ./.:4:55,112:.: 0.03:0.998:. ./.:4:118,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:106,39:.:-0.44:1.000:. ./.:4:80,65:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,62:.:-0.40:1.000:. ./.:4:76,50:.:-0.86:1.000:. ./.:4:54,40:.:-1.55:1.000:. ./.:4:43,77:.:-0.99:1.000:. ./.:4:101,56:.:-0.18:1.000:. ./.:4:47,102:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:49,42:.:-1.62:1.000:. ./.:4:67,38:.:-1.31:1.000:. ./.:4:50,35:.:-1.75:1.000:. ./.:4:40,15:.:-2.40:1.000:. ./.:4:81,40:.:-0.96:1.000:. ./.:3:44,14:.:-2.33:1.000:. ./.:4:94,35:.:-0.79:1.000:. ./.:4:82,47:.:-0.79:1.000:. ./.:4:101,55:.:-0.20:1.000:. ./.:4:77,112:.: 0.51:1.000:. ./.:4:80,40:.:-0.99:1.000:. ./.:4:106,132:.: 1.57:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:72,116:.: 0.49:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:156,63:.: 1.16:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:83,19:.:-1.38:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,80:.: 1.31:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:98,104:.: 0.79:1.000:. ./.:4:240,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:90,56:.:-0.42:1.000:. ./.:4:132,86:.: 1.14:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:132,46:.: 0.27:1.000:. ./.:6:181,19:.: 0.75:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:74,43:.:-1.05:1.000:. ./.:4:163,79:.: 1.66:1.000:. ./.:4:135,56:.: 0.55:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:100,39:.:-0.57:1.000:. ./.:4:90,131:.: 1.21:1.000:. ./.:4:98,127:.: 1.29:1.000:. ./.:4:62,67:.:-0.79:1.000:. ./.:4:128,65:.: 0.60:1.000:. ./.:4:65,66:.:-0.75:1.000:. ./.:4:145,49:.: 0.62:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:89,117:.: 0.88:1.000:. ./.:4:96,33:.:-0.79:1.000:. ./.:4:69,109:.: 0.27:1.000:. ./.:4:101,141:.: 1.66:1.000:. ./.:4:167,69:.: 1.53:1.000:. ./.:4:111,64:.: 0.21:1.000:. ./.:4:98,38:.:-0.64:0.999:. ./.:4:179,63:.: 1.66:1.000:. ./.:4:113,144:.: 1.99:1.000:. ./.:4:121,39:.:-0.12:1.000:. ./.:6:115,95:.: 0.97:0.897:. ./.:4:147,60:.: 0.90:1.000:. ./.:4:101,42:.:-0.49:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:107,129:.: 1.53:1.000:. ./.:4:124,42:.: 0.01:1.000:. ./.:4:101,42:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,91:.: 0.06:1.000:. ./.:4:149,74:.: 1.25:1.000:. ./.:4:68,37:.:-1.31:1.000:. ./.:4:249,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:94,135:.: 1.38:1.000:. ./.:4:119,111:.: 1.40:1.000:. ./.:4:137,67:.: 0.84:1.000:. ./.:4:194,71:.: 2.16:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:91,44:.:-0.66:1.000:. ./.:4:150,63:.: 1.03:1.000:. ./.:4:141,66:.: 0.90:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:145,56:.: 0.77:1.000:. ./.:4:109,64:.: 0.16:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:56,38:.:-1.55:1.000:. ./.:4:136,71:.: 0.90:1.000:. ./.:4:135,49:.: 0.40:1.000:. ./.:4:161,78:.: 1.60:1.000:. ./.:4:125,72:.: 0.68:1.000:. ./.:4:188,82:.: 2.27:0.999:. ./.:4:163,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,86:.:-0.16:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:126,45:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,100:.:-0.14:1.000:. ./.:4:148,70:.: 1.14:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:98,127:.: 1.29:1.000:. ./.:4:129,69:.: 0.71:1.000:. ./.:4:86,55:.:-0.53:1.000:. ./.:4:156,55:.: 0.99:1.000:. ./.:4:114,152:.: 2.18:1.000:. ./.:4:187,77:.: 2.14:1.000:. ./.:4:78,101:.: 0.29:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,99:.: 0.51:1.000:. ./.:4:132,66:.: 0.71:1.000:. ./.:4:75,41:.:-1.07:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,133:.: 0.97:1.000:. ./.:4:118,62:.: 0.32:1.000:. ./.:4:119,69:.: 0.49:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:154,70:.: 1.27:1.000:. ./.:4:160,61:.: 1.21:1.000:. ./.:4:112,138:.: 1.83:1.000:. ./.:4:86,48:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,111:.: 0.25:1.000:. ./.:4:141,65:.: 0.88:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:91,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:88,52:.:-0.55:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:74,95:.: 0.08:1.000:. ./.:4:85,116:.: 0.77:1.000:. ./.:4:47,99:.:-0.42:1.000:. ./.:4:82,26:.:-1.25:1.000:. ./.:4:53,65:.:-1.03:1.000:. ./.:4:87,50:.:-0.62:1.000:. ./.:4:120,62:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,66:.: 0.81:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,95:.: 0.34:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:35,89:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,35:.:-1.70:1.000:. ./.:4:36,87:.:-0.92:1.000:. ./.:4:131,69:.: 0.75:1.000:. ./.:4:22,28:.:-2.50:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:68,49:.:-1.05:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.83:0.999:. ./.:4:84,101:.: 0.42:1.000:. ./.:4:58,97:.:-0.23:1.000:. ./.:4:64,51:.:-1.09:1.000:. ./.:4:51,35:.:-1.72:1.000:. ./.:4:56,103:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,36:.:-0.83:1.000:. ./.:4:83,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:76,119:.: 0.64:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:136,57:.: 0.60:1.000:. ./.:4:79,40:.:-1.01:1.000:. ./.:4:94,72:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:122,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:87,137:.: 1.27:1.000:. ./.:4:55,32:.:-1.70:1.000:. ./.:4:99,57:.:-0.20:1.000:. -chr3.1 81798620 chr3.1_081798620 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:145,161:0.53: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:352,71:0.19: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,65:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:229,96:0.32: 0.23:1.000:0.962 0/0/0/1:4:267,71:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,210:0.53: 0.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:172,163:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,178:0.54: 0.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:279,160:0.38: 1.17:1.000:0.552 0/0/1/1:4:29,23:0.45:-2.04:1.000:0.979 0/0/1/1:4:45,54:0.55:-1.65:1.000:0.984 0/0/1/1:4:286,172:0.39: 1.33:1.000:0.677 0/0/0/1:4:293,78:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,170:0.57:-0.02:1.000:0.933 0/0/1/1:4:242,175:0.43: 0.99:1.000:0.943 0/0/1/1:4:214,316:0.59: 1.93:1.000:0.837 0/0/1/1:4:303,187:0.39: 1.60:0.998:0.736 0/1/1/1:4:85,239:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:313,182:0.38: 1.64:1.000:0.590 0/0/1/1:4:166,183:0.52: 0.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,17:0.18:-1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,127:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:240,145:0.39: 0.73:1.000:0.688 0/1/1/1:4:82,232:0.73: 0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,41:0.80:-2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,230:0.49: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:324,221:0.42: 2.05:1.000:0.895 0/1/1/1:4:78,244:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,73:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,236:0.51: 1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:479,139:0.25: 2.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:288,202:0.42: 1.60:1.000:0.921 0/0/0/1:4:35,7:0.19:-2.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,57:0.47:-1.46:1.000:0.993 0/1/1:3:31,35:0.53:-1.92:1.000:0.884 0/0/0/1:4:293,93:0.27: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:266,173:0.41: 1.17:1.000:0.834 0/0/0/1:4:310,75:0.22: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,257:0.61: 0.99:1.000:0.652 0/0/1/1:4:198,199:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,117:0.55:-0.70:1.000:0.981 0/0/1/1:4:123,96:0.45:-0.65:1.000:0.975 0/0/1/1:4:164,246:0.60: 0.93:1.000:0.810 0/0/1/1:4:107,162:0.60:-0.24:1.000:0.792 0/0/0/1:4:196,64:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,141:0.47: 0.07:1.000:0.991 0/0/0/1:4:206,71:0.28:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:309,370:0.54: 3.17:1.000:0.985 0/0/0/1:4:195,74:0.30:-0.24:1.000:0.987 0/0/0/1:4:288,76:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,84:0.41:-0.71:1.000:0.847 0/0/1/1:4:131,130:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,84:0.42:-0.79:1.000:0.926 0/0/0/1:4:230,41:0.17:-0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,132:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:248,136:0.37: 0.72:1.000:0.571 0/0/0/1:4:137,42:0.26:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,164:0.55:-0.01:1.000:0.978 0/1/1/1:4:76,190:0.71:-0.26:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:132,44:0.28:-1.01:1.000:0.729 0/0/0/1:4:150,50:0.28:-0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,161:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,154:0.55:-0.13:1.000:0.984 0/0/1/1:4:133,119:0.48:-0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:192,56:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,64:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,159:0.74:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,169:0.62:-0.20:1.000:0.619 0/0/1/1:4:127,133:0.51:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:167,61:0.29:-0.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:194,60:0.26:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:131,204:0.61: 0.31:1.000:0.731 0/0/0/1:4:477,95:0.19: 2.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,151:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,130:0.43: 0.11:1.000:0.938 0/1/1/1:4:51,193:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,132:0.54:-0.44:1.000:0.988 0/0/1/1:4:73,82:0.53:-1.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:116,105:0.48:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:160,66:0.31:-0.60:1.000:0.968 0/0/0/1:4:191,41:0.20:-0.55:0.999:1.000 0/0/1/1:4:153,106:0.42:-0.32:1.000:0.911 0/0/1/1:4:122,173:0.58:-0.02:1.000:0.894 0/0/1/1:4:155,125:0.45:-0.15:1.000:0.982 0/0/1/1/1/1:6:89,223:0.71: 0.12:0.897:0.834 0/0/1/1:4:162,130:0.45:-0.05:1.000:0.981 0/0/0/1:4:176,38:0.20:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,35:0.20:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,158:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,123:0.54:-0.57:1.000:0.989 0/1/1/1:4:93,163:0.63:-0.35:1.000:0.604 0/0/1/1:4:164,105:0.40:-0.24:1.000:0.808 0/0/1/1:4:104,121:0.54:-0.60:1.000:0.989 0/0/0/1:4:150,80:0.36:-0.56:1.000:0.644 0/0/0/1:4:202,82:0.31:-0.11:1.000:0.973 0/1/1/1:4:63,187:0.74:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,113:0.65:-1.04:1.000:0.783 0/0/0/1:4:184,67:0.29:-0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:153,89:0.38:-0.46:1.000:0.591 0/0/1/1:4:177,127:0.43: 0.05:1.000:0.938 0/1/1/1:4:52,150:0.74:-0.79:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,147:0.78:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,53:0.38:-1.26:1.000:0.535 0/0/1/1:4:108,91:0.46:-0.82:1.000:0.989 0/0/1/1:4:161,99:0.39:-0.31:1.000:0.728 0/0/1/1:4:81,108:0.57:-0.90:1.000:0.946 0/0/0/1:4:165,50:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,200:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:253,165:0.41: 1.00:1.000:0.838 0/0/1/1:4:130,159:0.55:-0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:135,77:0.38:-0.71:1.000:0.537 0/0/0/1:4:522,135:0.23: 2.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,83:0.43:-0.83:0.999:0.942 0/0/0/1:4:184,55:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,137:0.80:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,52:0.38:-1.28:1.000:0.512 0/0/1/1:4:90,91:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,97:0.48:-0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,150:0.77:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,48:0.27:-0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:137,125:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,136:0.75:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,92:0.44:-0.72:1.000:0.972 0/0/0/1:4:396,88:0.20: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,55:0.27:-0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,132:0.58:-0.59:1.000:0.915 0/0/1/1:4:71,84:0.54:-1.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:127,115:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,79:0.54:-1.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:129,86:0.41:-0.69:1.000:0.869 0/0/0/1:4:117,34:0.25:-1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:358,73:0.19: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,34:0.23:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,47:0.29:-1.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:139,49:0.28:-0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:249,388:0.61: 2.82:1.000:0.729 0/0/1/1:4:133,178:0.57: 0.11:1.000:0.944 0/0/1/1:4:64,64:0.50:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,79:0.47:-1.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:100,76:0.44:-1.01:1.000:0.966 0/0/1/1:4:92,148:0.61:-0.48:1.000:0.648 0/1/1/1:4:29,103:0.77:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,137:0.41: 0.39:1.000:0.852 0/1/1/1:4:38,94:0.71:-1.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:159,249:0.61: 0.92:1.000:0.717 0/0/0/1:4:198,85:0.32:-0.12:1.000:0.952 0/0/1/1:4:159,190:0.54: 0.43:1.000:0.985 0/0/1/1:4:97,120:0.55:-0.67:1.000:0.977 0/0/1/1:4:270,212:0.45: 1.53:1.000:0.976 0/0/1/1:4:102,115:0.53:-0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:214,345:0.61: 2.17:1.000:0.642 0/1/1/1:4:76,291:0.78: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,29:0.58:-2.06:1.000:0.920 0/1/1/1:4:61,168:0.73:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:287,166:0.38: 1.29:1.000:0.576 0/0/1/1:4:226,130:0.38: 0.48:1.000:0.561 0/0/1/1:4:164,204:0.55: 0.58:1.000:0.976 0/0/1/1:4:263,184:0.42: 1.24:1.000:0.919 0/0/1/1:4:138,193:0.58: 0.28:1.000:0.908 0/0/1/1:4:240,178:0.43: 1.00:1.000:0.956 0/0/1/1:4:161,152:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,146:0.45: 0.29:1.000:0.975 0/1/1/1:4:71,252:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:276,62:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,114:0.30: 0.88:1.000:0.981 0/0/0/1:4:271,76:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,152:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:409,0:0.00: 0.92:0.999:1.000 0/0/1/1:4:129,154:0.54:-0.12:1.000:0.985 0/1/1/1:4:155,267:0.63: 1.03:1.000:0.553 0/1/1/1:4:80,214:0.72:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:294,75:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,201:0.58: 0.39:1.000:0.910 0/0/0/1:4:237,55:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,119:0.48:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:158,185:0.54: 0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:397,244:0.39: 2.85:1.000:0.727 0/0/0/1:4:290,75:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,168:0.40: 1.07:1.000:0.830 0/0/0/1:4:255,143:0.37: 0.83:1.000:0.510 0/0/0/1:4:355,97:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,207:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:192,204:0.52: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,168:0.54: 0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:273,71:0.23: 0.39:1.000:1.000 -chr3.1 81840609 chr3.1_081840609 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:162,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.50:0.998:. ./.:4:70,76:.: 0.09:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.98:1.000:. ./.:3:28,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:183,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.23:1.000:. ./.:6:96,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:140,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.11:0.999:. ./.:4:159,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.54:1.000:. ./.:6:129,0:.:-0.30:0.897:. ./.:4:185,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:100,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:278,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:165,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:239,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:212,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:235,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:207,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.72:0.999:. ./.:4:142,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:159,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.50:1.000:. -chr3.1 82188829 chr3.1_082188829 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:200,4:.: 0.03:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:208,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:237,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:216,5:.: 0.30:1.000:. ./.:4:254,2:.: 0.87:1.000:. ./.:4:139,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:209,4:.: 0.17:1.000:. ./.:4:218,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:45,5:.:-2.45:1.000:. ./.:4:136,9:.:-0.92:1.000:. ./.:4:214,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:192,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:281,7:.: 1.38:0.998:. ./.:4:174,5:.:-0.37:1.000:. ./.:4:283,6:.: 1.40:1.000:. ./.:4:246,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:124,3:.:-1.21:1.000:. ./.:4:176,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:201,4:.: 0.04:1.000:. ./.:4:203,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:86,8:.:-1.74:1.000:. ./.:4:250,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:273,3:.: 1.19:1.000:. ./.:4:211,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:248,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:354,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:287,2:.: 1.40:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:95,13:.:-1.52:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.95:1.000:. ./.:3:42,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:219,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:194,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:337,6:.: 2.27:1.000:. ./.:4:232,4:.: 0.54:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:197,8:.: 0.04:1.000:. ./.:4:220,6:.: 0.38:1.000:. ./.:4:216,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:188,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:189,14:.: 0.01:1.000:. ./.:4:188,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:744,0:.: 8.73:1.000:. ./.:4:207,7:.: 0.19:1.000:. ./.:4:238,18:.: 0.87:1.000:. ./.:4:164,5:.:-0.54:1.000:. ./.:4:231,4:.: 0.53:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:200,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:228,10:.: 0.58:1.000:. ./.:4:195,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:214,22:.: 0.54:1.000:. ./.:4:199,12:.: 0.14:1.000:. ./.:6:155,9:.:-0.62:1.000:. ./.:4:194,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:231,12:.: 0.66:1.000:. ./.:4:244,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:250,9:.: 0.91:1.000:. ./.:4:145,6:.:-0.83:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:239,7:.: 0.71:1.000:. ./.:4:158,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:249,21:.: 1.09:1.000:. ./.:4:90,5:.:-1.73:1.000:. ./.:4:203,21:.: 0.35:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:190,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:218,9:.: 0.40:1.000:. ./.:4:206,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:196,10:.: 0.06:1.000:. ./.:4:265,3:.: 1.06:1.000:. ./.:4:171,3:.:-0.45:0.999:. ./.:4:227,7:.: 0.51:1.000:. ./.:4:230,4:.: 0.51:1.000:. ./.:4:135,2:.:-1.05:1.000:. ./.:6:262,10:.: 1.12:0.897:. ./.:4:148,12:.:-0.68:1.000:. ./.:4:163,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:152,8:.:-0.68:1.000:. ./.:4:193,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:175,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:147,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:246,15:.: 0.95:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:160,13:.:-0.47:1.000:. ./.:4:239,14:.: 0.82:1.000:. ./.:4:135,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:176,7:.:-0.31:1.000:. ./.:4:172,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:212,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:173,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:120,4:.:-1.26:1.000:. ./.:4:190,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:168,11:.:-0.37:1.000:. ./.:4:214,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:158,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:205,8:.: 0.17:1.000:. ./.:4:158,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:146,9:.:-0.76:1.000:. ./.:4:288,4:.: 1.45:1.000:. ./.:4:156,3:.:-0.70:0.999:. ./.:4:190,7:.:-0.08:1.000:. ./.:4:159,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:164,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:176,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:151,6:.:-0.73:1.000:. ./.:4:215,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:134,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:175,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:178,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,4:.: 0.72:1.000:. ./.:4:183,4:.:-0.25:1.000:. ./.:4:179,4:.:-0.31:1.000:. ./.:4:183,4:.:-0.25:1.000:. ./.:4:199,10:.: 0.11:1.000:. ./.:4:182,5:.:-0.25:1.000:. ./.:4:168,5:.:-0.47:1.000:. ./.:4:192,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:183,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:138,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:180,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:140,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:256,4:.: 0.93:1.000:. ./.:4:212,8:.: 0.29:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:139,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:148,6:.:-0.78:1.000:. ./.:4:164,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:138,5:.:-0.95:1.000:. ./.:4:169,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:132,5:.:-1.05:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:238,4:.: 0.64:1.000:. ./.:4:185,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:160,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:243,4:.: 0.72:1.000:. ./.:4:210,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:214,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:108,5:.:-1.44:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:281,5:.: 1.35:1.000:. ./.:4:177,6:.:-0.31:1.000:. ./.:4:207,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:197,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:153,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:229,4:.: 0.50:1.000:. ./.:4:147,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:168,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:197,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:128,4:.:-1.13:1.000:. ./.:4:172,8:.:-0.36:0.999:. ./.:4:203,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:184,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:208,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:183,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:156,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:172,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:206,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:339,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:202,5:.: 0.08:1.000:. ./.:4:174,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:238,8:.: 0.71:1.000:. ./.:4:207,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:201,4:.: 0.04:1.000:. -chr3.1 82394450 chr3.1_082394450 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:7,5:0.36: 1.15:1.000:0.640 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.26: 4.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,7:0.48: 1.15:1.000:0.994 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:1,1:0.42:-1.51:1.000:0.918 0/0/1/1:4:5,8:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,6:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:2,3:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:1,1:0.42:-1.51:1.000:0.918 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.53:-0.45:1.000:0.991 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.45:1.000:0.978 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,1:0.09: 0.88:1.000:0.938 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:0.998:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.55: 0.62:1.000:0.974 0/0/1/1:4:3,6:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:7,6:0.39: 1.41:1.000:0.742 0/0/1/1:4:4,4:0.42: 0.09:1.000:0.918 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.77:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.27: 1.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,7:0.36: 2.48:1.000:0.681 0/0/1/1:4:1,4:0.62:-0.71:1.000:0.569 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.42: 0.09:1.000:0.918 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,4:0.35: 0.62:1.000:0.768 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.24:1.000:0.978 0/0/1/1:4:4,4:0.42: 0.09:1.000:0.918 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,7:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.09:1.000:0.895 0/0/1/1:4:1,2:0.53:-1.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:7,2:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.31: 0.35:1.000:0.978 0/0/0/0:4:9,1:0.10: 0.62:1.000:0.801 0/0/0/1:4:11,2:0.15: 1.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:7,1:0.12: 0.09:1.000:0.852 0/0/0/1:4:3,2:0.35:-0.71:1.000:0.768 0/0/1/1:4:4,4:0.42: 0.09:1.000:0.918 0/0/1/1:4:3,6:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.28: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:2,4:0.53:-0.45:1.000:0.991 0/0/0/1:4:11,3:0.21: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.42: 0.09:1.000:0.918 0/0/1/1:4:2,4:0.53:-0.45:1.000:0.991 0/0/0/0/0/1:6:7,1:0.12: 0.09:1.000:0.987 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,7:0.45: 1.41:1.000:0.977 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,4:0.31: 1.15:1.000:0.978 0/0/0/1:4:8,4:0.31: 1.15:1.000:0.978 0/0/0/1:4:7,4:0.33: 0.88:1.000:0.930 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.69: 0.62:1.000:0.965 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.56:-0.18:1.000:0.960 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.45:1.000:0.978 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:0.999:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.12: 0.09:1.000:0.852 0/0/1/1:4:6,5:0.39: 0.88:1.000:0.691 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:7,0:0.00:-0.18:0.897:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.42: 1.15:1.000:0.918 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.13: 1.95:1.000:0.935 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.11: 0.35:1.000:0.520 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.42: 0.62:1.000:0.918 0/0/1/1:4:3,6:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-1.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,6:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:8,1:0.11: 0.35:1.000:0.520 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.42:-0.45:1.000:0.918 0/0/1/1:4:3,3:0.42:-0.45:1.000:0.918 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.24:1.000:0.978 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-0.18:1.000:0.975 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.09:0.999:0.999 0/0/0/1:4:7,5:0.36: 1.15:1.000:0.640 0/0/1/1:4:2,2:0.42:-0.98:1.000:0.918 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.28: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.42:-0.45:1.000:0.918 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.39: 0.88:1.000:0.691 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.09:1.000:0.895 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.45:1.000:0.978 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,5:0.42: 0.62:1.000:0.918 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.64:-0.45:1.000:0.708 0/0/0/1:4:3,2:0.35:-0.71:1.000:0.768 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-0.45:1.000:0.978 0/0/1/1:4:5,6:0.45: 0.88:1.000:0.982 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.42: 0.62:1.000:0.918 0/0/0/1:4:7,4:0.33: 0.88:1.000:0.930 0/0/0/1:4:13,4:0.24: 2.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,3:0.37:-0.18:1.000:0.534 0/0/1/1:4:5,13:0.57: 2.74:1.000:0.948 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.17: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,2:0.35:-0.71:1.000:0.768 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,3:0.37:-0.18:1.000:0.534 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,1:0.08: 1.15:1.000:0.980 0/0/1/1:4:3,7:0.55: 0.62:1.000:0.974 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,7:0.55: 0.62:1.000:0.974 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.31:-1.24:1.000:0.978 0/0/1/1:4:4,4:0.42: 0.09:1.000:0.918 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.51: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,3:0.34: 0.09:1.000:0.895 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.45:0.999:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,8:0.53: 1.15:1.000:0.991 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.98:1.000:0.879 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.42: 0.09:1.000:0.918 0/0/0/1:4:7,5:0.36: 1.15:1.000:0.640 0/1/1/1:4:3,15:0.64: 2.74:1.000:0.708 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,8:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 -chr3.1 82510290 chr3.1_082510290 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:58,211:0.78: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,151:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,184:0.71: 0.79:1.000:0.991 0/1/1/1:4:59,195:0.76: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,129:0.49: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,69:0.47:-1.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:118,113:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,121:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,27:0.45:-3.33:1.000:0.977 0/1/1/1:4:10,59:0.85:-3.16:1.000:0.988 0/0/1/1:4:118,117:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,189:0.76: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,148:0.51: 1.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,173:0.76: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,126:0.53: 0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:56,178:0.75: 0.31:0.998:0.999 0/1/1/1:4:66,167:0.71: 0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:155,154:0.50: 1.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,162:0.51: 2.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-2.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,197:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,211:0.78: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,61:0.30: 0.05:1.000:0.987 0/1/1/1:4:11,52:0.82:-3.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,185:0.72: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,124:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,126:0.54: 0.31:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,201:0.76: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,221:0.80: 1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,299:1.00: 1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,168:0.76:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,49:0.74:-3.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,86:0.75:-2.22:1.000:0.999 1/1/1:3:3,26:0.89:-4.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,202:0.74: 1.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,171:0.73: 0.29:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,245:1.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,133:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,141:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,170:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,111:0.57:-0.58:1.000:0.936 0/0/1/1:4:119,128:0.52: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,114:0.51: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,195:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,161:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,200:0.78: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,83:0.67:-2.05:1.000:0.933 0/1/1/1:4:40,145:0.78:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,165:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,86:0.44:-0.49:1.000:0.972 0/0/1/1:4:121,129:0.51: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,148:0.73:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,168:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,155:0.74:-0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,196:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,139:0.72:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,115:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:153,46:0.26:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:37,179:0.82:-0.07:1.000:0.975 0/1/1/1:4:47,189:0.79: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,50:0.28:-0.56:1.000:0.994 0/1/1/1:4:72,220:0.74: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,103:0.45: 0.22:1.000:0.981 0/1/1/1:4:69,183:0.72: 0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,181:0.74: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,50:0.30:-0.79:1.000:0.987 0/0/1/1:4:113,127:0.53: 0.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:56,168:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,118:0.70:-1.10:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,268:1.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,68:0.48:-1.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,180:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,125:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,92:0.46:-0.35:1.000:0.985 0/0/0/1:4:162,44:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,151:0.72:-0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,200:0.75: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,109:0.47: 0.31:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,218:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,129:0.69:-0.72:0.999:0.973 0/0/1/1:4:108,144:0.57: 0.68:1.000:0.953 0/0/1/1:4:143,125:0.47: 1.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,117:0.57:-0.30:1.000:0.955 0/0/1/1/1/1:6:117,186:0.61: 1.76:0.897:0.708 0/1/1/1:4:53,210:0.79: 0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,152:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,159:0.78:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,81:0.46:-0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:95,91:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,44:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,174:0.77: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,121:0.49: 0.60:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,227:0.78: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,122:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,91:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,147:0.72:-0.35:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,192:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,131:0.49: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,42:0.31:-1.56:1.000:0.972 0/0/0/1:4:154,64:0.31:-0.03:1.000:0.966 0/0/1/1:4:90,91:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,124:0.53: 0.24:1.000:0.991 0/1/1/1:4:44,136:0.75:-0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,161:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,143:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,117:0.47: 0.64:1.000:0.992 0/1/1/1:4:58,213:0.78: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,47:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,167:0.74: 0.10:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,295:1.00: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,126:0.54: 0.29:0.999:0.989 0/1/1/1:4:55,193:0.77: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.51:-1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,129:0.68:-0.64:1.000:0.940 0/1/1/1:4:50,140:0.73:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,145:0.76:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,49:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,132:0.71:-0.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:91,106:0.53:-0.47:1.000:0.990 0/0/1/1:4:88,104:0.54:-0.58:1.000:0.989 0/0/1/1:4:114,112:0.49: 0.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,214:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,105:0.46: 0.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:122,125:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,94:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,94:0.55:-1.06:1.000:0.977 0/1/1/1:4:60,144:0.70:-0.32:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,267:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,124:0.72:-1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,151:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,170:0.74: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,153:0.54: 1.25:1.000:0.984 0/0/0/1:4:188,56:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,113:0.54:-0.26:1.000:0.986 0/0/1/1:4:82,100:0.55:-0.79:1.000:0.984 0/0/1/1:4:98,99:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,60:0.29: 0.03:1.000:0.989 0/0/1/1:4:84,108:0.56:-0.58:1.000:0.969 0/1/1/1:4:47,151:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,93:0.52:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:193,50:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,226:0.79: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,185:0.76: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,172:0.76: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,154:0.57: 0.98:1.000:0.934 0/1/1/1:4:41,149:0.78:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,123:0.47: 0.94:1.000:0.991 0/0/1/1:4:129,98:0.44: 0.16:1.000:0.962 0/0/0/1:4:74,28:0.30:-2.47:1.000:0.987 0/0/1/1:4:78,85:0.52:-1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,190:0.76: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,125:0.52: 0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,133:0.55: 0.43:1.000:0.979 0/0/1/1:4:135,156:0.53: 1.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:89,85:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,131:0.53: 0.52:1.000:0.991 0/1/1/1:4:45,163:0.78:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,143:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,108:0.47: 0.22:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,243:1.00: 0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,243:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,164:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:84,118:0.58:-0.37:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,260:1.00: 0.85:0.999:1.000 0/1/1/1:4:57,163:0.73: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:117,96:0.45:-0.13:1.000:0.983 0/0/0/1:4:145,54:0.29:-0.43:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,194:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,120:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,180:0.79: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,110:0.55:-0.43:1.000:0.981 0/0/1/1:4:114,116:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,138:0.47: 1.57:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,280:1.00: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,153:0.74:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,187:0.78: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,180:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,143:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,193:0.72: 0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,160:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,146:0.71:-0.32:1.000:0.990 -chr3.1 82769154 chr3.1_082769154 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:201,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.86:0.998:. ./.:4:259,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:308,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.53:1.000:. ./.:3:15,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.27:1.000:. ./.:6:135,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:298,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:241,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:241,0:.: 0.97:0.897:. ./.:4:180,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:189,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:259,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:174,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.62:1.000:. -chr3.1 83068634 chr3.1_083068634 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,165:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,138:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,115:.:-1.34:1.000:. ./.:4:18,201:.: 1.18:1.000:. ./.:4:1,170:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,99:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,103:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,120:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,173:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.55:1.000:. ./.:4:16,161:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,138:.:-0.61:1.000:. ./.:4:19,156:.: 0.11:0.998:. ./.:4:0,182:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,221:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,167:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,160:.:-0.22:1.000:. ./.:4:12,141:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,104:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,138:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.98:1.000:. ./.:4:29,208:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.78:1.000:. ./.:4:8,96:.:-1.61:1.000:. ./.:4:12,102:.:-1.36:1.000:. ./.:4:10,51:.:-2.65:1.000:. ./.:4:11,131:.:-0.69:1.000:. ./.:3:7,47:.:-2.82:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.30:1.000:. ./.:4:29,155:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,173:.: 0.38:1.000:. ./.:4:16,155:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.04:1.000:. ./.:4:13,159:.: 0.04:1.000:. ./.:4:25,211:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.33:1.000:. ./.:4:18,179:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.83:1.000:. ./.:4:19,153:.: 0.04:1.000:. ./.:4:15,165:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.60:1.000:. ./.:4:11,132:.:-0.66:1.000:. ./.:4:24,182:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.54:1.000:. ./.:4:13,168:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.21:1.000:. ./.:6:0,142:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,117:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,244:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,235:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.27:1.000:. ./.:4:15,194:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.93:1.000:. ./.:4:23,177:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,174:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,116:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,253:.: 2.00:1.000:. ./.:4:13,186:.: 0.70:1.000:. ./.:4:55,201:.: 2.08:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.47:1.000:. ./.:4:17,146:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,232:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.79:1.000:. ./.:4:16,117:.:-0.90:0.999:. ./.:4:25,237:.: 2.22:1.000:. ./.:4:15,178:.: 0.55:1.000:. ./.:4:9,137:.:-0.59:1.000:. ./.:6:0,302:.: 3.19:0.897:. ./.:4:30,242:.: 2.47:1.000:. ./.:4:6,118:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,137:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,219:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.04:1.000:. ./.:4:13,131:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,155:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,236:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.88:1.000:. ./.:4:19,226:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,163:.: 0.09:1.000:. ./.:4:17,176:.: 0.55:1.000:. ./.:4:17,194:.: 0.99:1.000:. ./.:4:21,223:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,121:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.30:1.000:. ./.:4:27,160:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,209:.: 1.28:1.000:. ./.:4:20,161:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.74:1.000:. ./.:4:10,146:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.95:1.000:. ./.:4:12,191:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,186:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,171:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,227:.: 2.03:1.000:. ./.:4:13,194:.: 0.89:0.999:. ./.:4:17,222:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,90:.:-1.95:1.000:. ./.:4:1,152:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,212:.: 1.04:1.000:. ./.:4:25,172:.: 0.65:1.000:. ./.:4:29,167:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,220:.: 1.23:1.000:. ./.:4:18,121:.:-0.76:1.000:. ./.:4:13,147:.:-0.25:1.000:. ./.:4:24,167:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,120:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,89:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,128:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,179:.: 0.48:1.000:. ./.:4:6,107:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,102:.:-1.65:1.000:. ./.:4:8,117:.:-1.10:1.000:. ./.:4:15,154:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,196:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,183:.: 0.31:1.000:. ./.:4:14,147:.:-0.22:1.000:. ./.:4:25,182:.: 0.89:1.000:. ./.:4:25,165:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,160:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.12:1.000:. ./.:4:26,186:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,217:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.52:1.000:. ./.:4:11,198:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,174:.: 0.09:1.000:. ./.:4:16,165:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,103:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,88:.:-1.99:1.000:. ./.:4:12,152:.:-0.15:1.000:. ./.:4:14,141:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.87:1.000:. ./.:4:26,201:.: 1.37:1.000:. ./.:4:14,109:.:-1.15:1.000:. ./.:4:23,149:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.05:1.000:. ./.:4:12,137:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,191:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,102:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.52:1.000:. ./.:4:11,169:.: 0.24:0.999:. ./.:4:0,133:.:-0.90:1.000:. ./.:4:11,138:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,99:.:-1.73:1.000:. ./.:4:5,125:.:-0.98:1.000:. ./.:4:15,128:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,159:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.20:1.000:. ./.:4:12,112:.:-1.12:1.000:. ./.:4:12,158:.:-0.01:1.000:. ./.:4:35,202:.: 1.62:1.000:. ./.:4:14,140:.:-0.39:1.000:. ./.:4:15,128:.:-0.66:1.000:. ./.:4:14,162:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,109:.:-1.12:1.000:. -chr3.1 83296752 chr3.1_083296752 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:89,105:0.54: 0.44:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,97:0.72:-0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,152:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,160:0.78: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,198:0.81: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,112:0.47: 1.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,71:0.46:-0.42:1.000:0.986 0/0/1/1:4:102,112:0.52: 0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,96:0.53: 0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,22:0.42:-2.59:1.000:0.918 0/0/1/1:4:22,27:0.55:-2.66:1.000:0.981 0/0/1/1:4:79,92:0.53:-0.05:1.000:0.990 0/1/1/1:4:51,159:0.76: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,105:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,97:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,61:0.26: 1.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,113:0.48: 1.27:0.998:0.995 0/0/0/1:4:185,51:0.22: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,133:0.50: 1.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,142:0.53: 1.93:1.000:0.990 0/1/1/1:4:14,37:0.73:-2.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,106:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,113:0.52: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:137,46:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,10:0.25:-2.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,88:0.42: 0.69:1.000:0.932 0/0/1/1:4:116,107:0.48: 1.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:126,57:0.31: 0.20:1.000:0.970 0/1/1/1:4:52,181:0.78: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,96:0.45: 0.82:1.000:0.980 0/1/1/1:4:52,151:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,83:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-3.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,27:0.53:-2.61:1.000:0.993 0/0/1:3:8,4:0.33:-3.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,159:0.78: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,68:0.40:-0.12:1.000:0.817 0/1/1/1:4:47,151:0.77: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,50:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,107:0.47: 1.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:83,85:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,84:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:137,53:0.28: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,77:0.54:-0.65:1.000:0.990 0/1/1/1:4:35,115:0.77:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,81:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,131:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,50:0.51:-1.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,133:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,90:0.79:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,68:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,114:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,82:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,143:0.74: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,83:0.43: 0.37:1.000:0.952 0/0/1/1:4:79,104:0.57: 0.20:1.000:0.955 0/1/1/1:4:46,128:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,70:0.42:-0.16:1.000:0.912 0/0/0/1:4:137,57:0.30: 0.44:1.000:0.989 0/0/1/1/1/1:6:40,115:0.75:-0.39:1.000:0.514 0/1/1/1:4:55,144:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,38:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,87:0.53:-0.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:100,77:0.43: 0.08:1.000:0.953 0/1/1/1:4:61,149:0.71: 0.78:1.000:0.993 0/1/1/1:4:60,142:0.71: 0.61:1.000:0.990 0/0/0/1:4:99,27:0.22:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,33:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,78:0.52:-0.54:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,102:0.79:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,148:0.79: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,49:0.29:-0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,132:0.79:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,115:0.53: 0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:89,74:0.45:-0.22:1.000:0.981 0/0/0/1:4:133,45:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,79:0.51:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,98:0.61:-0.29:1.000:0.666 0/0/1/1:4:89,83:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,148:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,87:0.72:-1.10:0.999:0.995 0/0/1/1:4:116,85:0.42: 0.59:1.000:0.917 0/0/0/1:4:143,52:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,61:0.49:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:133,84:0.39: 0.93:0.897:0.746 0/0/1/1:4:87,115:0.57: 0.61:1.000:0.953 0/1/1/1:4:34,115:0.78:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,102:0.73:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,37:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,85:0.47: 0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:113,32:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,75:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,97:0.47: 0.65:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,84:0.70:-1.14:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,166:0.79: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,40:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,37:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,110:0.74:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,97:0.55: 0.05:1.000:0.981 0/0/1/1:4:96,100:0.51: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,30:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,38:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,42:0.48:-1.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,79:0.55:-0.67:1.000:0.976 0/0/1/1:4:60,53:0.47:-1.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:97,85:0.46: 0.18:1.000:0.990 0/1/1/1:4:46,148:0.77: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,91:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,126:0.52: 1.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:129,48:0.27: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,87:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,190:0.74: 1.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,80:0.49:-0.27:0.999:0.996 0/1/1/1:4:44,125:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,32:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,96:0.73:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,82:0.54:-0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,77:0.46:-0.14:1.000:0.986 0/0/0/1:4:126,44:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,107:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,81:0.47:-0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:97,38:0.28:-0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,94:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,167:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,122:0.82:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,37:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,78:0.44: 0.03:1.000:0.972 0/0/1/1:4:72,51:0.41:-1.08:1.000:0.880 0/0/1/1:4:71,54:0.43:-1.03:1.000:0.946 0/0/1/1:4:46,53:0.53:-1.59:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,127:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,141:0.74: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,58:0.66:-1.82:1.000:0.873 0/1/1/1:4:42,112:0.73:-0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,115:0.69:-0.14:1.000:0.975 0/0/0/1:4:197,70:0.26: 2.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:143,41:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,59:0.46:-0.97:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,73:0.53:-0.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,60:0.55:-1.40:1.000:0.977 0/0/0/1:4:121,45:0.27:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,28:0.23:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,85:0.56:-0.46:1.000:0.972 0/0/0/1:4:79,23:0.23:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,65:0.25: 1.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,132:0.72: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,112:0.53: 0.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:96,103:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,124:0.48: 1.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,78:0.43: 0.12:1.000:0.954 0/0/0/1:4:153,64:0.30: 0.93:1.000:0.988 0/0/0/1:4:161,47:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,19:0.38:-2.63:1.000:0.557 0/0/0/1:4:118,42:0.26:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,119:0.50: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,104:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,125:0.51: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,100:0.54: 0.22:1.000:0.987 0/0/0/1:4:117,44:0.28:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,120:0.50: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,99:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,79:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,56:0.35:-0.27:1.000:0.812 0/1/1/1:4:38,128:0.78:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,152:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,162:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,90:0.50: 0.08:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.10:0.999:1.000 0/0/1/1:4:65,80:0.55:-0.61:1.000:0.981 0/0/0/1:4:158,50:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,34:0.24:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,131:0.77:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,44:0.28:-0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,107:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,76:0.45:-0.16:1.000:0.984 0/0/0/1:4:109,26:0.20:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,133:0.50: 1.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,161:0.77: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,123:0.54: 1.10:1.000:0.985 0/0/1/1:4:72,98:0.57:-0.07:1.000:0.933 0/1/1/1:4:43,165:0.80: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,144:0.51: 2.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,114:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,107:0.56: 0.37:1.000:0.970 0/1/1/1:4:48,140:0.75: 0.31:1.000:0.999 -chr3.1 83372410 chr3.1_083372410 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:329,92:.: 0.72:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:167,180:.:-0.34:1.000:. ./.:4:176,183:.:-0.16:1.000:. ./.:4:349,92:.: 1.00:1.000:. ./.:4:353,85:.: 0.96:1.000:. ./.:4:222,58:.:-1.29:1.000:. ./.:4:305,82:.: 0.23:1.000:. ./.:4:315,79:.: 0.33:1.000:. ./.:4:136,57:.:-2.53:1.000:. ./.:4:158,34:.:-2.54:1.000:. ./.:4:295,98:.: 0.32:1.000:. ./.:4:168,177:.:-0.36:1.000:. ./.:4:288,80:.:-0.04:1.000:. ./.:4:333,82:.: 0.63:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:288,81:.:-0.02:0.998:. ./.:4:105,260:.:-0.08:1.000:. ./.:4:402,86:.: 1.67:1.000:. ./.:4:375,93:.: 1.39:1.000:. ./.:4:134,27:.:-2.98:1.000:. ./.:4:266,77:.:-0.39:1.000:. ./.:4:428,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:106,16:.:-3.54:1.000:. ./.:4:199,178:.: 0.09:1.000:. ./.:4:351,100:.: 1.14:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:340,110:.: 1.13:1.000:. ./.:4:327,96:.: 0.75:1.000:. ./.:4:198,159:.:-0.19:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:134,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:169,49:.:-2.17:1.000:. ./.:3:57,10:.:-4.32:1.000:. ./.:4:100,232:.:-0.55:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:285,104:.: 0.26:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:217,177:.: 0.33:1.000:. ./.:4:171,163:.:-0.52:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:300,96:.: 0.36:1.000:. ./.:4:266,217:.: 1.60:1.000:. ./.:4:356,78:.: 0.90:1.000:. ./.:4:233,192:.: 0.77:1.000:. ./.:4:205,49:.:-1.66:1.000:. ./.:4:204,158:.:-0.12:1.000:. ./.:4:213,171:.: 0.19:1.000:. ./.:4:287,78:.:-0.08:1.000:. ./.:4:332,102:.: 0.90:1.000:. ./.:4:288,88:.: 0.08:1.000:. ./.:4:240,171:.: 0.57:1.000:. ./.:4:267,74:.:-0.42:1.000:. ./.:4:341,80:.: 0.72:1.000:. ./.:4:193,190:.: 0.18:1.000:. ./.:4:335,107:.: 1.02:1.000:. ./.:4:301,104:.: 0.49:1.000:. ./.:6:185,144:.:-0.59:1.000:. ./.:4:216,180:.: 0.36:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:355,115:.: 1.41:1.000:. ./.:4:298,100:.: 0.39:1.000:. ./.:4:203,185:.: 0.25:1.000:. ./.:4:173,174:.:-0.34:1.000:. ./.:4:253,58:.:-0.85:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:193,193:.: 0.22:1.000:. ./.:4:320,74:.: 0.33:1.000:. ./.:4:214,202:.: 0.65:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:382,84:.: 1.36:1.000:. ./.:4:355,100:.: 1.20:1.000:. ./.:4:282,102:.: 0.19:1.000:. ./.:4:234,81:.:-0.79:1.000:. ./.:4:195,171:.:-0.07:1.000:. ./.:4:181,168:.:-0.31:1.000:. ./.:4:213,179:.: 0.30:1.000:. ./.:4:175,151:.:-0.63:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.80:0.999:. ./.:4:286,96:.: 0.16:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:238,57:.:-1.08:1.000:. ./.:6:385,55:.: 0.99:0.897:. ./.:4:433,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:226,65:.:-1.13:1.000:. ./.:4:268,72:.:-0.44:1.000:. ./.:4:259,81:.:-0.44:1.000:. ./.:4:170,149:.:-0.73:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:283,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:369,68:.: 0.94:1.000:. ./.:4:120,141:.:-1.56:1.000:. ./.:4:219,196:.: 0.63:1.000:. ./.:4:306,81:.: 0.23:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:253,79:.:-0.55:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:227,83:.:-0.86:1.000:. ./.:4:303,106:.: 0.55:1.000:. ./.:4:224,67:.:-1.13:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:262,88:.:-0.29:1.000:. ./.:4:274,76:.:-0.29:1.000:. ./.:4:181,154:.:-0.51:1.000:. ./.:4:279,83:.:-0.12:1.000:. ./.:4:479,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:359,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:290,84:.: 0.05:1.000:. ./.:4:261,196:.: 1.23:1.000:. ./.:4:290,81:.: 0.01:0.999:. ./.:4:302,97:.: 0.40:1.000:. ./.:4:242,61:.:-0.96:1.000:. ./.:4:230,97:.:-0.62:1.000:. ./.:4:280,86:.:-0.07:1.000:. ./.:4:279,92:.: 0.01:1.000:. ./.:4:287,96:.: 0.18:1.000:. ./.:4:262,68:.:-0.58:1.000:. ./.:4:305,94:.: 0.40:1.000:. ./.:4:312,91:.: 0.46:1.000:. ./.:4:198,175:.: 0.03:1.000:. ./.:4:236,220:.: 1.21:1.000:. ./.:4:204,163:.:-0.05:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:190,176:.:-0.07:1.000:. ./.:4:184,160:.:-0.38:1.000:. ./.:4:228,57:.:-1.22:1.000:. ./.:4:233,70:.:-0.96:1.000:. ./.:4:193,166:.:-0.16:1.000:. ./.:4:267,85:.:-0.26:1.000:. ./.:4:114,130:.:-1.80:1.000:. ./.:4:209,180:.: 0.26:1.000:. ./.:4:283,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:574,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:267,79:.:-0.35:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:288,81:.:-0.02:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:281,83:.:-0.09:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:256,268:.: 2.18:1.000:. ./.:4:310,85:.: 0.35:1.000:. ./.:4:292,94:.: 0.22:1.000:. ./.:4:522,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:169,135:.:-0.95:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:148,25:.:-2.81:1.000:. ./.:4:239,71:.:-0.86:1.000:. ./.:4:314,66:.: 0.13:1.000:. ./.:4:301,88:.: 0.26:1.000:. ./.:4:217,212:.: 0.83:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:354,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:310,92:.: 0.45:1.000:. ./.:4:213,73:.:-1.20:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:199,164:.:-0.11:1.000:. ./.:4:297,85:.: 0.16:1.000:. ./.:4:206,170:.: 0.08:1.000:. ./.:4:264,79:.:-0.39:1.000:. ./.:4:194,180:.: 0.05:0.999:. ./.:4:218,196:.: 0.62:1.000:. ./.:4:342,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:310,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:227,75:.:-0.98:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:177,169:.:-0.35:1.000:. ./.:4:254,56:.:-0.86:1.000:. ./.:4:307,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:356,78:.: 0.90:1.000:. ./.:4:196,178:.: 0.05:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:272,89:.:-0.14:1.000:. ./.:4:279,112:.: 0.29:1.000:. ./.:4:228,198:.: 0.79:1.000:. ./.:4:241,194:.: 0.92:1.000:. ./.:4:241,74:.:-0.79:1.000:. ./.:4:319,75:.: 0.33:1.000:. -chr3.1 83413539 chr3.1_083413539 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:233,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:237,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.47:0.998:. ./.:4:258,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:116,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:308,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:43,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:309,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.58:1.000:. ./.:4:111,0:.:-2.22:1.000:. ./.:3:39,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:251,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:38,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:200,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:233,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:237,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:263,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.78:1.000:. ./.:6:327,0:.: 1.66:0.897:. ./.:4:301,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:111,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:256,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:144,1:.:-1.61:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:353,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:239,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:272,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:293,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:215,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:354,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.60:1.000:. -chr3.1 83724512 chr3.1_083724512 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:139,6:.: 0.33:1.000:. ./.:4:232,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:158,4:.: 0.66:1.000:. ./.:4:140,4:.: 0.31:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:109,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:71,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:87,11:.:-0.58:1.000:. ./.:4:128,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:32,9:.:-1.68:1.000:. ./.:4:72,4:.:-1.00:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:174,3:.: 0.95:1.000:. ./.:4:93,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:170,5:.: 0.91:1.000:. ./.:4:188,1:.: 1.18:0.998:. ./.:4:59,11:.:-1.12:1.000:. ./.:4:153,6:.: 0.60:1.000:. ./.:4:105,3:.:-0.38:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:136,5:.: 0.25:1.000:. ./.:4:203,3:.: 1.51:1.000:. ./.:4:47,3:.:-1.51:1.000:. ./.:4:29,1:.:-1.89:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:141,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:95,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:191,5:.: 1.32:1.000:. ./.:4:145,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:37,3:.:-1.70:1.000:. ./.:4:75,1:.:-1.00:1.000:. ./.:3:65,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:152,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:194,3:.: 1.34:1.000:. ./.:4:246,1:.: 2.30:1.000:. ./.:4:130,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,5:.:-0.73:1.000:. ./.:4:68,4:.:-1.08:1.000:. ./.:4:138,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:149,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:95,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:153,4:.: 0.56:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:119,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:116,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:158,4:.: 0.66:1.000:. ./.:4:89,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:142,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:116,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:190,4:.: 1.28:1.000:. ./.:4:111,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:91,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:30,5:.:-1.80:1.000:. ./.:6:107,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:108,4:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,6:.:-1.52:1.000:. ./.:4:145,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:70,3:.:-1.06:1.000:. ./.:4:150,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:149,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:37,4:.:-1.68:1.000:. ./.:4:134,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:113,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:99,6:.:-0.44:1.000:. ./.:4:125,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:47,4:.:-1.49:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:93,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.31:0.999:. ./.:4:116,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:113,2:.:-0.25:1.000:. ./.:6:97,3:.:-0.54:0.897:. ./.:4:157,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:63,4:.:-1.18:1.000:. ./.:4:89,4:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,5:.:-1.27:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:152,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:88,5:.:-0.67:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:125,5:.: 0.04:1.000:. ./.:4:28,8:.:-1.78:1.000:. ./.:4:42,7:.:-1.52:1.000:. ./.:4:66,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:111,12:.:-0.09:1.000:. ./.:4:130,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:122,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:125,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:76,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:213,2:.: 1.68:1.000:. ./.:4:86,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:283,0:.: 3.00:1.000:. ./.:4:106,5:.:-0.33:0.999:. ./.:4:163,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:49,2:.:-1.49:1.000:. ./.:4:97,6:.:-0.48:1.000:. ./.:4:103,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:113,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:38,7:.:-1.60:1.000:. ./.:4:107,3:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:81,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:92,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:285,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:134,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:61,2:.:-1.25:1.000:. ./.:4:62,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:44,6:.:-1.51:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:246,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:78,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:147,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:167,7:.: 0.89:1.000:. ./.:4:80,5:.:-0.83:1.000:. ./.:4:66,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:94,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:68,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:77,5:.:-0.89:1.000:. ./.:4:59,7:.:-1.20:1.000:. ./.:4:169,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:54,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:102,7:.:-0.36:1.000:. ./.:4:186,9:.: 1.30:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:124,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:165,7:.: 0.85:1.000:. ./.:4:125,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:203,8:.: 1.61:1.000:. ./.:4:91,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,3:.:-1.80:1.000:. ./.:4:74,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:196,2:.: 1.36:1.000:. ./.:4:145,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:121,6:.:-0.02:1.000:. ./.:4:140,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:128,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:187,4:.: 1.22:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:141,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,3:.:-0.91:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:159,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:88,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.86:0.999:. ./.:4:134,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:44,4:.:-1.54:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:132,6:.: 0.20:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:123,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:163,5:.: 0.78:1.000:. ./.:4:237,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:194,3:.: 1.34:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:185,4:.: 1.18:1.000:. ./.:4:133,4:.: 0.18:1.000:. ./.:4:177,5:.: 1.05:1.000:. ./.:4:140,4:.: 0.31:1.000:. ./.:4:195,1:.: 1.32:1.000:. -chr3.1 84119445 chr3.1_084119445 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:316,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:401,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.71:0.998:. ./.:4:505,0:.: 3.72:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:132,0:.:-2.09:1.000:. ./.:3:44,0:.:-3.47:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:136,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.24:1.000:. ./.:6:233,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:245,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.10:0.999:. ./.:4:290,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:346,0:.: 1.24:0.897:. ./.:4:274,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:291,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:407,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:346,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:234,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:266,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.04:1.000:. -chr3.1 84283981 chr3.1_084283981 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.13:0.998:. ./.:4:44,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.33:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:47,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:6:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:0.999:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.18:1.000:. ./.:6:20,0:.:-1.30:0.897:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.23:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:17,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:49,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:43,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.11:1.000:. -chr3.1 84424131 chr3.1_084424131 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:308,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:161,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.80:0.998:. ./.:4:139,134:.: 0.23:1.000:. ./.:4:309,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:33,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.82:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:315,2:.: 0.91:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:23,0:.:-3.61:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.92:1.000:. ./.:3:12,0:.:-3.77:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.11:1.000:. ./.:6:214,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:263,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.69:0.999:. ./.:4:294,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:355,0:.: 1.49:0.897:. ./.:4:288,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:246,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.06:0.999:. ./.:4:257,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:318,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:207,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:392,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:272,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:336,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:234,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:230,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:273,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.74:1.000:. -chr3.1 84557406 chr3.1_084557406 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:40,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.90:0.998:. ./.:4:14,32:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.03:1.000:. ./.:6:14,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:24,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.75:1.000:. ./.:6:24,0:.:-0.47:0.897:. ./.:4:42,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.40:0.999:. ./.:4:33,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:47,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:43,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:77,0:.: 3.35:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.26:1.000:. -chr3.1 84606105 chr3.1_084606105 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:29,70:0.68: 2.17:1.000:0.957 0/0/1/1:4:28,30:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,33:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,35:0.45: 0.82:1.000:0.984 0/1/1/1:4:23,55:0.68: 1.08:1.000:0.952 0/0/1/1:4:33,33:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,17:0.42:-1.06:1.000:0.922 0/0/1/1:4:37,32:0.43: 0.61:1.000:0.944 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.18:-2.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,20:0.61:-1.32:1.000:0.727 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.26: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,31:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,22:0.34:-0.17:1.000:0.881 0/0/0/1:4:39,22:0.26: 0.19:0.998:0.999 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,36:0.31: 1.81:1.000:0.970 0/0/1/1:4:12,18:0.58:-1.42:1.000:0.897 0/1/1/1:4:21,58:0.71: 1.13:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,76:0.68: 2.59:1.000:0.963 0/0/0/1:4:43,24:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,11:0.66:-2.15:1.000:0.890 0/0/0/1:4:32,22:0.34:-0.17:1.000:0.881 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,54:0.75: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,40:0.36: 1.96:1.000:0.688 0/1/1/1:4:24,47:0.64: 0.71:1.000:0.692 0/0/1/1:4:26,29:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,49:0.67: 0.71:1.000:0.902 0/0/0/1:4:15,9:0.29:-1.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:11,8:0.36:-2.00:1.000:0.688 0/0/1:3:9,4:0.22:-2.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,56:0.69: 1.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:32,50:0.59: 1.29:1.000:0.846 0/0/0/1:4:36,16:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,22:0.36:-0.28:1.000:0.649 0/0/1/1:4:32,27:0.42: 0.09:1.000:0.910 0/0/0/1:4:26,17:0.32:-0.74:1.000:0.957 0/0/1/1:4:37,35:0.47: 0.77:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,22:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,35:0.36: 1.34:1.000:0.676 0/1/1/1:4:13,28:0.66:-0.85:1.000:0.865 0/0/1/1:4:23,28:0.54:-0.33:1.000:0.989 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-2.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,26:0.34: 0.35:1.000:0.892 0/0/1/1:4:38,30:0.39: 0.56:1.000:0.719 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,57:0.69: 1.18:1.000:0.967 0/0/0/1:4:27,20:0.37:-0.54:1.000:0.599 0/0/0/1:4:27,20:0.37:-0.54:1.000:0.599 0/0/0/1:4:39,27:0.34: 0.45:1.000:0.864 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:23,38:0.60: 0.19:1.000:0.682 0/0/0/1:4:39,22:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,14:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,59:0.69: 1.29:1.000:0.977 0/0/0/1:4:35,24:0.34: 0.09:1.000:0.887 0/0/1/1:4:45,40:0.44: 1.44:1.000:0.967 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,23:0.38:-0.22:1.000:0.581 0/0/0/1:4:27,18:0.33:-0.64:1.000:0.936 0/1/1/1:4:24,52:0.66: 0.97:1.000:0.872 0/1/1/1:4:19,58:0.72: 1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,15:0.33:-1.06:1.000:0.899 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,28:0.46: 0.04:1.000:0.987 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,24:0.44:-0.33:1.000:0.967 0/0/0/1:4:35,25:0.35: 0.14:1.000:0.764 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,50:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,20:0.49:-0.90:0.999:0.996 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,31:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:31,41:0.56: 0.77:0.897:0.705 0/1/1/1:4:25,46:0.63: 0.71:1.000:0.530 0/0/1/1:4:23,35:0.59: 0.04:1.000:0.881 0/0/0/1:4:33,18:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,19:0.31:-0.43:1.000:0.979 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,28:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,17:0.30:-0.69:1.000:0.981 0/1/1/1:4:14,37:0.70:-0.33:1.000:0.983 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,27:0.45:-0.02:1.000:0.974 0/0/1/1:4:26,22:0.42:-0.48:1.000:0.915 0/0/0/1:4:22,12:0.25:-1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,50:0.66: 0.82:1.000:0.876 0/0/1/1:4:40,35:0.43: 0.92:1.000:0.955 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,23:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,29:0.54:-0.22:1.000:0.990 0/1/1/1:4:23,64:0.71: 1.55:1.000:0.990 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,35:0.51: 0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,92:0.69: 3.68:1.000:0.976 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,16:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,39:0.41: 1.49:1.000:0.878 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.38:0.999:1.000 0/0/1/1:4:29,31:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,10:0.30:-1.63:1.000:0.984 0/0/1/1:4:19,31:0.60:-0.38:1.000:0.772 0/1/1/1:4:21,52:0.69: 0.82:1.000:0.967 0/1/1/1:4:20,50:0.69: 0.66:1.000:0.970 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,17:0.28:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,34:0.59:-0.07:1.000:0.861 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,35:0.40: 1.13:1.000:0.750 0/0/1/1:4:27,22:0.41:-0.43:1.000:0.832 0/0/1/1:4:29,28:0.47:-0.02:1.000:0.993 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,15:0.32:-1.01:1.000:0.960 0/0/0/1:4:35,7:0.12:-0.80:1.000:0.718 0/1/1/1:4:17,41:0.68: 0.04:1.000:0.956 0/1/1/1:4:31,63:0.65: 1.91:1.000:0.772 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,33:0.56: 0.04:1.000:0.973 0/0/1/1:4:22,24:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,30:0.47: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.58:-1.32:1.000:0.921 0/0/1/1:4:16,23:0.57:-0.95:1.000:0.933 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,25:0.46:-0.28:1.000:0.985 0/1/1/1:4:29,53:0.63: 1.29:1.000:0.511 0/1/1/1:4:14,28:0.64:-0.80:1.000:0.739 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,32:0.40: 0.77:1.000:0.772 0/1/1/1:4:20,70:0.75: 1.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,66:0.67: 1.96:1.000:0.921 0/0/0/1:4:41,30:0.36: 0.71:1.000:0.660 0/0/1/1:4:32,30:0.46: 0.24:1.000:0.988 0/0/0/1:4:56,28:0.24: 1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,60:0.70: 1.29:1.000:0.988 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,34:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,36:0.41: 1.18:1.000:0.843 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,43:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,26:0.47:-0.22:1.000:0.993 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,75:0.71: 2.28:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,38:0.67:-0.12:1.000:0.906 0/1/1/1:4:22,58:0.70: 1.18:1.000:0.983 0/0/1/1:4:36,35:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,48:0.78: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,28:0.39: 0.35:1.000:0.652 0/0/1/1:4:41,32:0.39: 0.82:1.000:0.669 0/0/1/1:4:35,36:0.50: 0.71:0.999:0.997 0/0/0/1:4:40,18:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,29:0.38: 0.51:1.000:0.557 0/0/0/1:4:32,24:0.37:-0.07:1.000:0.534 0/1/1/1:4:16,40:0.69:-0.07:1.000:0.970 0/0/1/1:4:34,37:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,28:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,24:0.36:-0.02:1.000:0.688 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,30:0.25: 1.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,49:0.66: 0.77:1.000:0.850 0/0/1/1:4:34,31:0.45: 0.40:1.000:0.980 0/0/1/1:4:40,35:0.43: 0.92:1.000:0.955 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,42:0.43: 1.70:1.000:0.955 0/1/1/1:4:17,40:0.68:-0.02:1.000:0.944 0/0/0/1:4:47,29:0.30: 0.97:1.000:0.988 -chr3.1 84961817 chr3.1_084961817 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:90,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:101,58:.: 0.78:1.000:. ./.:4:83,53:.: 0.23:1.000:. ./.:4:90,74:.: 0.90:1.000:. ./.:4:159,43:.: 1.81:1.000:. ./.:4:123,33:.: 0.71:1.000:. ./.:4:129,27:.: 0.71:1.000:. ./.:4:137,33:.: 1.04:1.000:. ./.:4:20,1:.:-2.53:1.000:. ./.:4:7,3:.:-2.79:1.000:. ./.:4:151,31:.: 1.33:1.000:. ./.:4:87,47:.: 0.18:1.000:. ./.:4:153,29:.: 1.33:1.000:. ./.:4:91,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:168,37:.: 1.88:1.000:. ./.:4:96,55:.: 0.59:0.998:. ./.:4:55,86:.: 0.35:1.000:. ./.:4:155,34:.: 1.50:1.000:. ./.:4:147,27:.: 1.14:1.000:. ./.:4:11,2:.:-2.72:1.000:. ./.:4:83,59:.: 0.37:1.000:. ./.:4:147,28:.: 1.16:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.91:1.000:. ./.:4:61,100:.: 0.82:1.000:. ./.:4:163,33:.: 1.66:1.000:. ./.:4:115,26:.: 0.35:1.000:. ./.:4:147,20:.: 0.97:1.000:. ./.:4:88,69:.: 0.73:1.000:. ./.:4:52,94:.: 0.47:1.000:. ./.:4:140,41:.: 1.30:1.000:. ./.:4:9,2:.:-2.77:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.86:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:55,115:.: 1.04:1.000:. ./.:4:138,26:.: 0.90:1.000:. ./.:4:83,63:.: 0.47:1.000:. ./.:4:126,24:.: 0.56:1.000:. ./.:4:87,64:.: 0.59:1.000:. ./.:4:64,41:.:-0.52:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:106,18:.:-0.06:1.000:. ./.:4:93,27:.:-0.16:1.000:. ./.:4:60,33:.:-0.80:1.000:. ./.:4:77,43:.:-0.16:1.000:. ./.:4:72,60:.: 0.13:1.000:. ./.:4:47,36:.:-1.04:1.000:. ./.:4:55,45:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,37:.:-0.95:1.000:. ./.:4:79,18:.:-0.71:1.000:. ./.:4:155,33:.: 1.47:1.000:. ./.:4:80,44:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,63:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,66:.: 0.37:1.000:. ./.:4:80,56:.: 0.23:1.000:. ./.:4:83,36:.:-0.18:1.000:. ./.:4:114,28:.: 0.37:1.000:. ./.:4:111,30:.: 0.35:1.000:. ./.:6:67,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:60,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:72,56:.: 0.03:1.000:. ./.:4:83,16:.:-0.66:1.000:. ./.:4:78,73:.: 0.59:1.000:. ./.:4:49,38:.:-0.95:1.000:. ./.:4:87,15:.:-0.59:1.000:. ./.:4:96,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:37,76:.:-0.32:1.000:. ./.:4:102,20:.:-0.11:1.000:. ./.:4:23,64:.:-0.95:1.000:. ./.:4:105,22:.: 0.01:1.000:. ./.:4:145,33:.: 1.23:1.000:. ./.:4:157,38:.: 1.64:1.000:. ./.:4:97,27:.:-0.06:1.000:. ./.:4:118,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:35,74:.:-0.42:1.000:. ./.:4:30,67:.:-0.71:1.000:. ./.:4:79,45:.:-0.06:1.000:. ./.:4:34,61:.:-0.76:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.85:0.999:. ./.:4:83,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:130,30:.: 0.80:1.000:. ./.:4:91,20:.:-0.37:1.000:. ./.:6:119,45:.: 0.90:0.897:. ./.:4:59,45:.:-0.54:1.000:. ./.:4:56,44:.:-0.64:1.000:. ./.:4:91,17:.:-0.44:1.000:. ./.:4:70,34:.:-0.54:1.000:. ./.:4:82,50:.: 0.13:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:71,45:.:-0.25:1.000:. ./.:4:141,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:31,57:.:-0.92:1.000:. ./.:4:73,44:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,44:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,10:.:-1.33:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.54:1.000:. ./.:4:87,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:153,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:90,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:126,24:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,14:.:-1.76:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:45,31:.:-1.21:1.000:. ./.:4:67,59:.:-0.01:1.000:. ./.:4:65,30:.:-0.76:1.000:. ./.:4:119,28:.: 0.49:1.000:. ./.:4:135,34:.: 1.02:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:60,40:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,122:.: 1.30:1.000:. ./.:4:64,16:.:-1.11:0.999:. ./.:4:114,28:.: 0.37:1.000:. ./.:4:62,32:.:-0.78:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:60,30:.:-0.88:1.000:. ./.:4:64,34:.:-0.68:1.000:. ./.:4:91,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:92,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:95,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:45,27:.:-1.31:1.000:. ./.:4:66,48:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,89:.: 0.25:1.000:. ./.:4:33,59:.:-0.83:1.000:. ./.:4:90,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:74,62:.: 0.23:1.000:. ./.:4:54,33:.:-0.95:1.000:. ./.:4:69,17:.:-0.97:1.000:. ./.:4:24,22:.:-1.93:1.000:. ./.:4:29,59:.:-0.92:1.000:. ./.:4:94,63:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,21:.:-1.57:1.000:. ./.:4:63,33:.:-0.73:1.000:. ./.:4:84,25:.:-0.42:1.000:. ./.:4:160,48:.: 1.95:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:70,7:.:-1.19:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:66,9:.:-1.23:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:47,29:.:-1.21:1.000:. ./.:4:117,22:.: 0.30:1.000:. ./.:4:63,17:.:-1.11:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:88,78:.: 0.94:1.000:. ./.:4:74,66:.: 0.32:1.000:. ./.:4:100,61:.: 0.82:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:26,84:.:-0.40:1.000:. ./.:4:131,39:.: 1.04:1.000:. ./.:4:137,30:.: 0.97:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.60:1.000:. ./.:4:62,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:97,75:.: 1.09:1.000:. ./.:4:133,29:.: 0.85:1.000:. ./.:4:95,58:.: 0.63:1.000:. ./.:4:203,1:.: 1.85:1.000:. ./.:4:92,25:.:-0.23:1.000:. ./.:4:133,37:.: 1.04:1.000:. ./.:4:77,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,21:.: 0.32:1.000:. ./.:4:107,27:.: 0.18:1.000:. ./.:4:41,72:.:-0.32:1.000:. ./.:4:116,73:.: 1.50:1.000:. ./.:4:82,57:.: 0.30:1.000:. ./.:4:132,18:.: 0.56:1.000:. ./.:4:66,50:.:-0.25:0.999:. ./.:4:30,67:.:-0.71:1.000:. ./.:4:95,32:.: 0.01:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:70,51:.:-0.13:1.000:. ./.:4:110,29:.: 0.30:1.000:. ./.:4:82,41:.:-0.09:1.000:. ./.:4:98,19:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,27:.:-0.04:1.000:. ./.:4:165,37:.: 1.81:1.000:. ./.:4:49,87:.: 0.23:1.000:. ./.:4:149,38:.: 1.45:1.000:. ./.:4:80,52:.: 0.13:1.000:. ./.:4:108,35:.: 0.39:1.000:. ./.:4:108,81:.: 1.50:1.000:. ./.:4:47,80:.: 0.01:1.000:. ./.:4:82,60:.: 0.37:1.000:. ./.:4:134,29:.: 0.87:1.000:. -chr3.1 85212900 chr3.1_085212900 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:226,98:.: 0.30:1.000:. ./.:4:261,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:294,93:.: 1.25:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:122,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:91,38:.:-2.65:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:154,65:.:-1.29:1.000:. ./.:4:200,91:.:-0.20:1.000:. ./.:4:220,87:.: 0.04:0.998:. ./.:4:157,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:372,2:.: 1.05:1.000:. ./.:4:435,2:.: 2.01:1.000:. ./.:4:104,35:.:-2.50:1.000:. ./.:4:228,91:.: 0.22:1.000:. ./.:4:255,132:.: 1.25:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:112,30:.:-2.45:1.000:. ./.:4:181,84:.:-0.59:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:202,91:.:-0.17:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:215,87:.:-0.03:1.000:. ./.:4:182,73:.:-0.75:1.000:. ./.:4:146,51:.:-1.62:1.000:. ./.:4:78,26:.:-3.03:1.000:. ./.:4:110,50:.:-2.18:1.000:. ./.:3:63,4:.:-3.59:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:193,88:.:-0.35:1.000:. ./.:4:214,66:.:-0.37:1.000:. ./.:4:231,100:.: 0.40:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:263,100:.: 0.89:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:265,99:.: 0.90:1.000:. ./.:4:375,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:65,22:.:-3.28:1.000:. ./.:4:268,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:264,86:.: 0.69:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:203,97:.:-0.07:1.000:. ./.:4:210,87:.:-0.11:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:335,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.12:1.000:. ./.:6:274,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:283,105:.: 1.27:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:272,90:.: 0.87:1.000:. ./.:4:219,94:.: 0.13:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:268,93:.: 0.86:1.000:. ./.:4:243,70:.: 0.13:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:223,104:.: 0.34:1.000:. ./.:4:230,117:.: 0.65:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:256,122:.: 1.11:1.000:. ./.:4:249,2:.:-0.81:0.999:. ./.:4:360,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:288,112:.: 1.45:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:284,95:.: 1.13:0.897:. ./.:4:265,118:.: 1.19:1.000:. ./.:4:211,77:.:-0.25:1.000:. ./.:4:283,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:209,102:.: 0.10:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:239,95:.: 0.45:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:174,64:.:-1.00:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:251,87:.: 0.51:1.000:. ./.:4:270,90:.: 0.84:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:309,99:.: 1.57:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:166,88:.:-0.76:1.000:. ./.:4:253,110:.: 0.89:1.000:. ./.:4:301,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:333,110:.: 2.10:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:244,92:.: 0.48:1.000:. ./.:4:262,99:.: 0.86:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:343,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:152,79:.:-1.11:1.000:. ./.:4:293,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:270,96:.: 0.93:1.000:. ./.:4:198,80:.:-0.40:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:372,2:.: 1.05:1.000:. ./.:4:225,86:.: 0.10:1.000:. ./.:4:391,2:.: 1.34:1.000:. ./.:4:220,82:.:-0.03:1.000:. ./.:4:250,93:.: 0.58:1.000:. ./.:4:288,83:.: 1.01:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:245,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:211,66:.:-0.41:1.000:. ./.:4:215,105:.: 0.24:1.000:. ./.:4:236,104:.: 0.54:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:237,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:348,138:.: 2.75:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:366,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:248,114:.: 0.87:1.000:. ./.:4:234,81:.: 0.16:1.000:. ./.:4:195,75:.:-0.52:1.000:. ./.:4:407,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:233,79:.: 0.12:1.000:. ./.:4:169,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:224,82:.: 0.03:1.000:. ./.:4:268,109:.: 1.10:1.000:. ./.:4:212,84:.:-0.13:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:142,60:.:-1.55:1.000:. ./.:4:189,78:.:-0.56:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:213,69:.:-0.34:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:237,66:.:-0.02:1.000:. ./.:4:162,63:.:-1.20:1.000:. ./.:4:194,83:.:-0.41:1.000:. ./.:4:216,80:.:-0.13:1.000:. ./.:4:160,61:.:-1.26:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:225,98:.: 0.28:1.000:. ./.:4:225,88:.: 0.13:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:185,56:.:-0.96:1.000:. ./.:4:230,84:.: 0.15:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:272,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:200,75:.:-0.44:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:271,107:.: 1.11:1.000:. ./.:4:259,99:.: 0.81:1.000:. ./.:4:219,65:.:-0.31:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:284,92:.: 1.08:1.000:. ./.:4:214,93:.: 0.04:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.14:1.000:. -chr3.1 85271441 chr3.1_085271441 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:165,107:.:-0.34:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:270,189:.: 1.48:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:126,45:.:-1.33:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:79,14:.:-2.10:1.000:. ./.:4:72,38:.:-1.93:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:234,54:.:-0.19:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:163,99:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,47:.:-1.23:1.000:. ./.:4:227,80:.: 0.00:0.998:. ./.:4:112,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:247,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:93,37:.:-1.73:1.000:. ./.:4:196,128:.: 0.16:1.000:. ./.:4:220,124:.: 0.36:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:42,31:.:-2.29:1.000:. ./.:4:198,181:.: 0.70:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:149,54:.:-1.02:1.000:. ./.:4:328,79:.: 0.98:1.000:. ./.:4:135,85:.:-0.85:1.000:. ./.:4:205,134:.: 0.31:1.000:. ./.:4:122,47:.:-1.35:1.000:. ./.:4:42,19:.:-2.41:1.000:. ./.:4:104,64:.:-1.36:1.000:. ./.:3:15,36:.:-2.51:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:187,71:.:-0.48:1.000:. ./.:4:198,75:.:-0.33:1.000:. ./.:4:222,105:.: 0.19:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:341,78:.: 1.09:1.000:. ./.:4:346,79:.: 1.15:1.000:. ./.:4:274,222:.: 1.85:1.000:. ./.:4:317,105:.: 1.12:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:287,103:.: 0.81:1.000:. ./.:4:342,70:.: 1.02:1.000:. ./.:4:34,20:.:-2.48:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:174,90:.:-0.42:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:143,106:.:-0.57:1.000:. ./.:4:231,87:.: 0.11:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:365,135:.: 1.89:1.000:. ./.:4:305,91:.: 0.87:1.000:. ./.:6:300,153:.: 1.43:1.000:. ./.:4:425,98:.: 2.11:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:305,115:.: 1.10:1.000:. ./.:4:340,122:.: 1.51:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:314,97:.: 1.01:1.000:. ./.:4:290,70:.: 0.52:1.000:. ./.:4:233,177:.: 1.01:1.000:. ./.:4:240,84:.: 0.16:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:299,103:.: 0.93:1.000:. ./.:4:188,60:.:-0.58:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:252,53:.:-0.02:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:261,72:.: 0.25:1.000:. ./.:4:249,107:.: 0.48:1.000:. ./.:4:281,225:.: 1.94:1.000:. ./.:4:361,105:.: 1.55:1.000:. ./.:4:258,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:399,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:299,104:.: 0.94:1.000:. ./.:4:240,67:.: 0.00:1.000:. ./.:6:247,149:.: 0.87:0.897:. ./.:4:295,217:.: 2.00:1.000:. ./.:4:212,78:.:-0.17:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:299,96:.: 0.86:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:240,69:.: 0.02:1.000:. ./.:4:258,99:.: 0.49:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:136,57:.:-1.12:1.000:. ./.:4:340,99:.: 1.29:1.000:. ./.:4:260,77:.: 0.29:1.000:. ./.:4:283,86:.: 0.60:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:288,208:.: 1.85:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:300,77:.: 0.68:1.000:. ./.:4:390,108:.: 1.87:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:393,105:.: 1.87:1.000:. ./.:4:244,181:.: 1.15:1.000:. ./.:4:213,171:.: 0.75:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:193,59:.:-0.54:1.000:. ./.:4:258,85:.: 0.35:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:244,186:.: 1.20:1.000:. ./.:4:200,78:.:-0.29:1.000:. ./.:4:420,109:.: 2.17:0.999:. ./.:4:308,87:.: 0.86:1.000:. ./.:4:169,126:.:-0.12:1.000:. ./.:4:324,113:.: 1.27:1.000:. ./.:4:237,180:.: 1.07:1.000:. ./.:4:240,82:.: 0.14:1.000:. ./.:4:366,80:.: 1.36:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:307,92:.: 0.90:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:131,53:.:-1.21:1.000:. ./.:4:267,97:.: 0.56:1.000:. ./.:4:304,120:.: 1.14:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:263,87:.: 0.42:1.000:. ./.:4:241,161:.: 0.93:1.000:. ./.:4:252,186:.: 1.28:1.000:. ./.:4:130,90:.:-0.85:1.000:. ./.:4:258,69:.: 0.19:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:227,59:.:-0.21:1.000:. ./.:4:176,73:.:-0.57:1.000:. ./.:4:295,74:.: 0.60:1.000:. ./.:4:388,108:.: 1.85:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:343,95:.: 1.28:1.000:. ./.:4:395,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:288,99:.: 0.78:1.000:. ./.:4:178,58:.:-0.70:1.000:. ./.:4:219,82:.:-0.06:1.000:. ./.:4:309,82:.: 0.82:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:130,128:.:-0.48:1.000:. ./.:4:163,58:.:-0.84:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:222,90:.: 0.05:1.000:. ./.:4:175,125:.:-0.07:1.000:. ./.:4:142,96:.:-0.68:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:94,66:.:-1.44:1.000:. ./.:4:220,89:.: 0.02:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:257,46:.:-0.04:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:150,105:.:-0.51:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:131,39:.:-1.34:1.000:. ./.:4:140,61:.:-1.04:1.000:. ./.:4:163,134:.:-0.10:1.000:. ./.:4:196,68:.:-0.42:1.000:. ./.:4:96,76:.:-1.32:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:211,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.18:0.999:. ./.:4:161,61:.:-0.83:1.000:. ./.:4:124,84:.:-0.97:1.000:. ./.:4:153,38:.:-1.14:1.000:. ./.:4:135,53:.:-1.17:1.000:. ./.:4:215,141:.: 0.48:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:310,86:.: 0.87:1.000:. ./.:4:123,96:.:-0.86:1.000:. ./.:4:247,59:.:-0.01:1.000:. ./.:4:236,91:.: 0.19:1.000:. ./.:4:155,46:.:-1.04:1.000:. ./.:4:145,78:.:-0.82:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:179,132:.: 0.04:1.000:. ./.:4:140,49:.:-1.16:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.68:1.000:. -chr3.1 85740129 chr3.1_085740129 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:297,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:282,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.67:0.998:. ./.:4:247,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:63,1:.:-2.12:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.92:1.000:. ./.:3:57,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.04:1.000:. ./.:6:106,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.26:0.999:. ./.:4:170,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.53:1.000:. ./.:6:175,0:.:-0.33:0.897:. ./.:4:236,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:179,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:163,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:121,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:129,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:299,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:325,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:267,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:315,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:266,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:222,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:286,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:324,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.20:1.000:. -chr3.1 86016528 chr3.1_086016528 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,97:.: 1.14:1.000:. ./.:4:13,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,15:.:-2.38:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.76:1.000:. ./.:4:38,38:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.54:1.000:. ./.:4:21,61:.: 0.50:1.000:. ./.:4:16,61:.: 0.28:1.000:. ./.:4:25,78:.: 1.40:1.000:. ./.:4:19,61:.: 0.41:0.998:. ./.:4:59,25:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,144:.: 3.15:1.000:. ./.:4:1,85:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,13:.:-2.46:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.10:1.000:. ./.:4:16,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:3,5:.:-2.68:1.000:. ./.:4:22,68:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,81:.: 1.57:1.000:. ./.:4:18,54:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,111:.: 1.74:1.000:. ./.:4:1,94:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.93:1.000:. ./.:4:0,11:.:-2.55:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.98:1.000:. ./.:4:21,61:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.31:1.000:. ./.:4:25,74:.: 1.22:1.000:. ./.:4:23,69:.: 0.92:1.000:. ./.:4:14,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.50:1.000:. ./.:4:19,48:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,68:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,104:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.76:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.65:1.000:. ./.:4:16,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.27:1.000:. ./.:4:11,46:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,97:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,54:.:-0.10:1.000:. ./.:6:0,48:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.75:1.000:. ./.:4:19,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.88:1.000:. ./.:4:15,42:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,80:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,36:.:-1.00:1.000:. ./.:4:13,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,51:.:-0.23:1.000:. ./.:4:18,56:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,34:.:-1.26:1.000:. ./.:4:11,63:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.54:1.000:. ./.:4:20,30:.:-0.88:1.000:. ./.:4:13,56:.:-0.06:1.000:. ./.:4:16,56:.: 0.07:1.000:. ./.:4:9,59:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,72:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,47:.:-0.45:0.999:. ./.:4:18,50:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,57:.: 0.07:1.000:. ./.:4:11,63:.: 0.15:1.000:. ./.:6:16,55:.: 0.02:0.897:. ./.:4:0,70:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:17,55:.: 0.07:1.000:. ./.:4:13,43:.:-0.62:1.000:. ./.:4:17,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,61:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,33:.:-1.18:1.000:. ./.:4:16,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:11,27:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.15:1.000:. ./.:4:6,27:.:-1.60:1.000:. ./.:4:12,50:.:-0.36:1.000:. ./.:4:11,38:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.27:1.000:. ./.:4:23,66:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.20:1.000:. ./.:4:16,49:.:-0.23:0.999:. ./.:4:0,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:7,34:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,40:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,38:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.24:1.000:. ./.:4:15,40:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,54:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,94:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.88:1.000:. ./.:4:12,59:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,32:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.96:1.000:. ./.:4:8,36:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,99:.: 1.22:1.000:. ./.:4:1,54:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.23:1.000:. ./.:4:22,83:.: 1.48:1.000:. ./.:4:16,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:14,41:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.96:1.000:. ./.:4:14,33:.:-1.00:1.000:. ./.:4:9,39:.:-0.96:1.000:. ./.:4:10,53:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.71:1.000:. ./.:4:8,37:.:-1.09:1.000:. ./.:4:14,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,103:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,81:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,107:.: 1.57:1.000:. ./.:4:21,57:.: 0.32:1.000:. ./.:4:31,67:.: 1.18:1.000:. ./.:4:24,64:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.93:1.000:. ./.:4:4,45:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,108:.: 1.61:1.000:. ./.:4:22,75:.: 1.14:1.000:. ./.:4:18,74:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.11:1.000:. ./.:4:22,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.75:1.000:. ./.:4:21,62:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,97:.: 1.14:1.000:. ./.:4:17,54:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.10:0.999:. ./.:4:17,72:.: 0.80:1.000:. ./.:4:16,54:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.02:1.000:. ./.:4:16,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:15,61:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,50:.:-0.19:1.000:. ./.:4:15,63:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,89:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.80:1.000:. ./.:4:9,69:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,94:.: 1.01:1.000:. ./.:4:22,67:.: 0.80:1.000:. ./.:4:32,69:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.24:1.000:. ./.:4:14,59:.: 0.11:1.000:. -chr3.1 86255748 chr3.1_086255748 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:209,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:99,88:.:-0.08:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:192,61:.: 1.22:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:138,45:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:152,39:.: 0.00:1.000:. ./.:4:174,54:.: 0.73:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:186,52:.: 0.92:1.000:. ./.:4:170,67:.: 0.91:1.000:. ./.:4:189,57:.: 1.08:0.998:. ./.:4:133,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:184,61:.: 1.06:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:19,4:.:-3.30:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:185,51:.: 0.89:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:186,64:.: 1.16:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:157,76:.: 0.83:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:132,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:138,45:.:-0.16:1.000:. ./.:4:8,7:.:-3.46:1.000:. ./.:4:29,11:.:-2.96:1.000:. ./.:3:14,10:.:-3.28:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:151,61:.: 0.41:1.000:. ./.:4:152,47:.: 0.16:1.000:. ./.:4:147,36:.:-0.16:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:156,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:171,60:.: 0.79:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:132,53:.:-0.12:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:358,0:.: 3.28:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:84,49:.:-1.14:1.000:. ./.:4:135,43:.:-0.25:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:124,43:.:-0.47:1.000:. ./.:4:169,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:132,41:.:-0.35:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:172,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:143,43:.:-0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:183,53:.: 0.89:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,23:.:-1.49:1.000:. ./.:4:105,97:.: 0.22:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:149,67:.: 0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:85,55:.:-1.00:0.999:. ./.:4:169,40:.: 0.36:1.000:. ./.:4:176,52:.: 0.73:1.000:. ./.:4:137,51:.:-0.06:1.000:. ./.:6:211,0:.: 0.39:0.897:. ./.:4:189,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:94,31:.:-1.29:1.000:. ./.:4:125,47:.:-0.37:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:125,40:.:-0.51:1.000:. ./.:4:158,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:147,55:.: 0.22:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:147,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:131,36:.:-0.47:1.000:. ./.:4:151,43:.: 0.06:1.000:. ./.:4:139,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:127,49:.:-0.29:1.000:. ./.:4:178,43:.: 0.59:1.000:. ./.:4:133,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:116,35:.:-0.78:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:170,58:.: 0.73:1.000:. ./.:4:173,52:.: 0.67:1.000:. ./.:4:150,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:206,85:.: 1.97:1.000:. ./.:4:145,48:.: 0.04:0.999:. ./.:4:168,54:.: 0.61:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:116,54:.:-0.41:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.49:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:195,58:.: 1.22:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:162,51:.: 0.43:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:131,44:.:-0.31:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:150,64:.: 0.45:1.000:. ./.:4:100,33:.:-1.14:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:133,40:.:-0.35:1.000:. ./.:4:240,72:.: 2.38:1.000:. ./.:4:172,53:.: 0.67:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,45:.:-0.08:1.000:. ./.:4:132,40:.:-0.37:1.000:. ./.:4:174,70:.: 1.04:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:144,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:189,44:.: 0.83:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:180,64:.: 1.04:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:213,64:.: 1.69:1.000:. ./.:4:214,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:178,51:.: 0.75:1.000:. ./.:4:157,60:.: 0.51:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:154,58:.: 0.41:1.000:. ./.:4:161,41:.: 0.22:1.000:. ./.:4:158,45:.: 0.24:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:114,39:.:-0.74:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:144,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:138,60:.: 0.14:0.999:. ./.:4:209,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:144,54:.: 0.14:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:110,39:.:-0.82:1.000:. ./.:4:164,57:.: 0.59:1.000:. ./.:4:152,46:.: 0.14:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:130,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:182,65:.: 1.10:1.000:. ./.:4:185,46:.: 0.79:1.000:. ./.:4:174,46:.: 0.57:1.000:. ./.:4:173,53:.: 0.69:1.000:. ./.:4:159,55:.: 0.45:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:165,47:.: 0.41:1.000:. -chr3.1 86475023 chr3.1_086475023 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:24,72:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,46:0.63:-0.35:1.000:0.606 0/0/1/1:4:45,44:0.53: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:62,47:0.47: 0.93:1.000:0.990 0/1/1/1:4:33,106:0.78: 2.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,81:0.72: 1.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,56:0.74:-0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,65:0.74: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,59:0.72: 0.00:1.000:0.995 1/1/1/1:4:2,18:0.91:-2.52:1.000:0.931 0/1/1/1:4:5,29:0.87:-1.98:1.000:0.944 0/0/0/1:4:81,18:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,57:0.61: 0.54:1.000:0.744 0/0/1/1:4:54,56:0.54: 0.97:1.000:0.987 0/0/1/1:4:51,44:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,55:0.62: 0.31:1.000:0.569 0/0/1/1:4:61,63:0.54: 1.51:0.998:0.987 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 3.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,69:0.79: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,97:0.74: 1.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,31:0.87:-1.90:1.000:0.882 0/1/1/1:4:31,76:0.73: 0.85:1.000:0.998 1/1/1/1:4:2,96:0.98: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,58:0.58: 0.77:1.000:0.902 0/1/1/1:4:3,6:0.69:-2.95:1.000:0.976 0/0/0/1:4:55,15:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,48:0.46: 1.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:34,65:0.68: 0.54:1.000:0.959 0/1/1/1:4:28,87:0.78: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,64:0.69: 0.43:1.000:0.976 0/0/1/1:4:35,41:0.57:-0.35:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-2.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,19:0.78:-2.33:1.000:1.000 1/1/1:3:1,7:0.89:-2.99:1.000:0.988 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 1.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,95:0.99: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,53:0.71:-0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:26,49:0.68:-0.39:1.000:0.952 0/0/0/1:4:68,20:0.26: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,17:0.26:-0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,49:0.73:-0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,43:0.69:-0.78:1.000:0.969 0/0/1/1:4:36,32:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,61:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,47:0.48: 0.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,38:0.86:-1.55:1.000:0.975 0/0/1/1:4:33,38:0.57:-0.54:1.000:0.955 0/1/1/1:4:7,13:0.68:-2.52:1.000:0.943 0/0/1/1:4:52,29:0.39:-0.16:1.000:0.722 0/1/1/1:4:22,58:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,28:0.40:-0.35:1.000:0.817 0/0/1/1:4:55,36:0.43: 0.23:1.000:0.947 0/1/1/1:4:25,62:0.74: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,48:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,44:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,57:0.79:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,35:0.54:-0.62:1.000:0.988 0/0/0/1/1/1:6:37,30:0.48:-0.70:1.000:0.871 0/0/1/1:4:52,43:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,63:0.66: 0.58:1.000:0.849 0/1/1/1:4:19,46:0.73:-0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,29:0.47:-0.70:1.000:0.991 0/0/1/1:4:46,40:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,22:0.46:-1.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:24,28:0.57:-1.28:1.000:0.948 0/1/1/1:4:26,68:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,14:0.20:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,34:0.37: 0.58:1.000:0.502 0/0/1/1:4:37,40:0.55:-0.31:1.000:0.979 0/1/1/1:4:20,37:0.68:-1.09:1.000:0.940 0/0/1/1:4:45,27:0.41:-0.51:1.000:0.862 0/1/1/1:4:21,64:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,16:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,32:0.46:-0.35:1.000:0.985 0/0/0/1:4:77,21:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,17:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,26:0.29: 0.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:37,31:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,70:0.81: 0.12:0.999:1.000 0/0/1/1:4:49,33:0.44:-0.12:1.000:0.962 0/1/1/1:4:29,57:0.69: 0.04:1.000:0.971 0/0/1/1:4:51,48:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:34,42:0.58:-0.35:0.897:0.503 0/1/1/1:4:25,66:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,56:0.83:-0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,69:0.73: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,37:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,24:0.26: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,49:0.66:-0.31:1.000:0.887 0/0/1/1:4:55,37:0.44: 0.27:1.000:0.961 0/0/1/1:4:55,37:0.44: 0.27:1.000:0.961 0/0/1/1:4:25,33:0.60:-1.05:1.000:0.803 0/0/1/1:4:41,31:0.46:-0.51:1.000:0.990 0/0/1/1:4:53,33:0.42: 0.04:1.000:0.907 0/1/1/1:4:26,63:0.73: 0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,24:0.43:-0.97:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,44:0.47: 0.66:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,44:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,23:0.40:-0.85:1.000:0.789 1/1/1/1:4:4,113:0.97: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,58:0.77:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,57:0.77:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,30:0.39:-0.04:1.000:0.713 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,59:0.70: 0.12:1.000:0.981 0/1/1/1:4:14,50:0.80:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,81:0.74: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,31:0.44:-0.31:0.999:0.962 0/1/1/1:4:18,69:0.81: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,9:0.38:-2.29:1.000:0.583 0/1/1/1:4:24,50:0.70:-0.43:1.000:0.986 0/1/1/1:4:16,53:0.79:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,35:0.55:-0.66:1.000:0.983 0/0/1/1:4:47,36:0.47:-0.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:20,43:0.71:-0.85:1.000:0.990 0/1/1/1:4:18,61:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,35:0.55:-0.66:1.000:0.983 0/0/0/1:4:80,32:0.32: 1.05:1.000:0.951 0/0/1/1:4:67,57:0.49: 1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,35:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,56:0.64: 0.23:1.000:0.722 0/0/0/1:4:70,17:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,32:0.71:-1.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:42,27:0.43:-0.62:1.000:0.935 0/0/1/1:4:37,38:0.54:-0.39:1.000:0.988 0/1/1/1:4:30,72:0.73: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,22:0.41:-1.01:1.000:0.849 0/0/1/1:4:27,18:0.43:-1.55:1.000:0.957 0/1/1/1:4:24,58:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,61:0.72: 0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,51:0.68:-0.27:1.000:0.953 0/0/1/1:4:46,33:0.45:-0.23:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,28:0.43:-0.54:1.000:0.944 0/1/1/1:4:36,55:0.63: 0.23:1.000:0.595 0/0/1/1:4:52,42:0.48: 0.35:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,37:0.73:-1.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,70:0.71: 0.66:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,55:0.49: 1.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,70:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,68:0.75: 0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,21:0.27: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,100:0.72: 2.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,78:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,17:0.66:-2.25:1.000:0.846 0/0/1/1:4:59,39:0.43: 0.50:1.000:0.953 0/1/1/1:4:17,68:0.82: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,55:0.54: 0.93:1.000:0.989 0/0/0/1:4:102,21:0.20: 1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,82:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,58:0.68: 0.15:1.000:0.947 0/0/1/1:4:60,46:0.47: 0.81:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,59:0.65: 0.35:1.000:0.832 0/0/1/1:4:73,44:0.41: 1.24:1.000:0.869 0/1/1/1:4:20,55:0.76:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,39:0.54:-0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:67,51:0.47: 1.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,53:0.62: 0.15:0.999:0.517 0/0/0/1:4:101,31:0.27: 1.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,76:0.69: 1.16:1.000:0.968 0/1/1/1:4:35,69:0.69: 0.74:1.000:0.972 0/1/1/1:4:26,42:0.65:-0.66:1.000:0.745 0/1/1/1:4:30,67:0.72: 0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:82,28:0.29: 0.97:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,27:0.48:-0.93:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,56:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,82:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,60:0.54: 1.28:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,41:0.43: 0.74:1.000:0.943 0/1/1/1:4:28,93:0.79: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,31:0.27: 1.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:136,33:0.23: 3.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,61:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,49:0.53: 0.54:1.000:0.993 -chr3.1 86736143 chr3.1_086736143 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,451:.: 0.85:1.000:. ./.:4:102,237:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,344:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,445:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,468:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,202:.:-2.31:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,366:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,174:.:-2.66:1.000:. ./.:4:0,169:.:-2.73:1.000:. ./.:4:190,149:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.28:1.000:. ./.:4:129,266:.: 0.14:1.000:. ./.:4:112,302:.: 0.38:1.000:. ./.:4:112,312:.: 0.51:1.000:. ./.:4:122,292:.: 0.38:0.998:. ./.:4:360,115:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,486:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,411:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,156:.:-2.89:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.16:1.000:. ./.:4:104,266:.:-0.17:1.000:. ./.:4:23,70:.:-3.69:1.000:. ./.:4:107,293:.: 0.21:1.000:. ./.:4:96,292:.: 0.05:1.000:. ./.:4:102,307:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,441:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,364:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,363:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,329:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,104:.:-3.55:1.000:. ./.:4:0,203:.:-2.30:1.000:. ./.:3:1,46:.:-4.28:1.000:. ./.:4:114,314:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,381:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,400:.: 0.21:1.000:. ./.:4:146,247:.: 0.12:1.000:. ./.:4:111,272:.:-0.01:1.000:. ./.:4:118,317:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,398:.: 0.18:1.000:. ./.:4:139,331:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,411:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,454:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,440:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,430:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,566:.: 2.32:1.000:. ./.:4:0,356:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,282:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,494:.: 1.40:1.000:. ./.:4:116,228:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,430:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,370:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,398:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,348:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,364:.:-0.25:1.000:. ./.:4:125,296:.: 0.47:1.000:. ./.:6:0,346:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,384:.: 0.00:1.000:. ./.:4:114,291:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,439:.: 0.70:1.000:. ./.:4:111,238:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,417:.: 0.42:1.000:. ./.:4:58,176:.:-1.90:1.000:. ./.:4:118,324:.: 0.74:1.000:. ./.:4:108,275:.:-0.01:1.000:. ./.:4:122,291:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,424:.: 0.51:1.000:. ./.:4:78,191:.:-1.46:1.000:. ./.:4:137,316:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.10:1.000:. ./.:4:272,219:.: 1.36:1.000:. ./.:4:98,261:.:-0.31:1.000:. ./.:4:124,310:.: 0.64:1.000:. ./.:4:110,297:.: 0.30:1.000:. ./.:4:138,309:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,415:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,226:.:-0.99:0.999:. ./.:4:131,352:.: 1.26:1.000:. ./.:4:139,356:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,260:.:-0.36:1.000:. ./.:6:113,414:.: 1.82:1.000:. ./.:4:0,458:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,255:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,368:.:-0.20:1.000:. ./.:4:125,285:.: 0.33:1.000:. ./.:4:111,279:.: 0.08:1.000:. ./.:4:79,192:.:-1.43:1.000:. ./.:4:115,287:.: 0.23:1.000:. ./.:4:112,361:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,278:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,339:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,281:.:-0.14:1.000:. ./.:4:124,325:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.19:1.000:. ./.:4:84,205:.:-1.20:1.000:. ./.:4:103,286:.: 0.07:1.000:. ./.:4:80,278:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,374:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,354:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.83:1.000:. ./.:4:94,296:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,470:.: 1.10:1.000:. ./.:4:130,344:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,555:.: 2.18:1.000:. ./.:4:120,322:.: 0.74:0.999:. ./.:4:0,328:.:-0.71:1.000:. ./.:4:79,256:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.83:1.000:. ./.:4:101,302:.: 0.25:1.000:. ./.:4:128,297:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,353:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,438:.: 0.69:1.000:. ./.:4:117,278:.: 0.14:1.000:. ./.:4:110,300:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,404:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.25:1.000:. ./.:4:135,345:.: 1.22:1.000:. ./.:4:135,297:.: 0.61:1.000:. ./.:4:179,148:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,272:.:-1.42:1.000:. ./.:4:91,263:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,342:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,254:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,349:.:-0.44:1.000:. ./.:4:188,378:.: 2.32:1.000:. ./.:4:112,310:.: 0.49:1.000:. ./.:4:133,288:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,385:.: 0.02:1.000:. ./.:4:86,320:.: 0.28:1.000:. ./.:4:136,288:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,307:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.34:1.000:. ./.:4:86,232:.:-0.83:1.000:. ./.:4:134,365:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,466:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,449:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,394:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,434:.: 0.64:1.000:. ./.:4:101,262:.:-0.26:1.000:. ./.:4:127,368:.: 1.41:1.000:. ./.:4:94,315:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,129:.:-2.71:1.000:. ./.:4:65,209:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,427:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,270:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,324:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,384:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,240:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,385:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,235:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.31:1.000:. ./.:4:112,248:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,412:.: 0.36:1.000:. ./.:4:103,259:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,408:.: 0.31:0.999:. ./.:4:128,301:.: 0.58:1.000:. ./.:4:92,232:.:-0.76:1.000:. ./.:4:112,242:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.82:1.000:. ./.:4:109,297:.: 0.28:1.000:. ./.:4:126,283:.: 0.32:1.000:. ./.:4:102,245:.:-0.47:1.000:. ./.:4:83,244:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,449:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,448:.: 0.82:1.000:. ./.:4:93,314:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,368:.:-0.20:1.000:. ./.:4:114,349:.: 1.01:1.000:. ./.:4:140,326:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.61:1.000:. ./.:4:116,281:.: 0.17:1.000:. -chr3.1 87037740 chr3.1_087037740 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:255,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:100,87:.:-1.34:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:246,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:208,68:.: 0.81:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:178,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:160,54:.:-0.69:1.000:. ./.:4:177,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:267,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:202,53:.: 0.30:1.000:. ./.:4:166,45:.:-0.76:1.000:. ./.:4:196,68:.: 0.52:0.998:. ./.:4:289,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:225,88:.: 1.70:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:137,52:.:-1.30:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:210,71:.: 0.93:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:141,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:150,55:.:-0.91:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:194,57:.: 0.20:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:210,49:.: 0.40:1.000:. ./.:4:152,54:.:-0.89:1.000:. ./.:4:77,17:.:-3.59:1.000:. ./.:4:166,64:.:-0.31:1.000:. ./.:3:95,27:.:-2.92:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:204,70:.: 0.76:1.000:. ./.:4:175,58:.:-0.23:1.000:. ./.:4:213,66:.: 0.88:1.000:. ./.:4:258,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:192,64:.: 0.32:1.000:. ./.:4:228,66:.: 1.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:211,64:.: 0.78:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:153,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:187,57:.: 0.03:1.000:. ./.:4:181,65:.: 0.08:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:179,65:.: 0.03:1.000:. ./.:4:217,81:.: 1.34:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:207,57:.: 0.52:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.32:1.000:. ./.:6:235,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:191,69:.: 0.42:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:176,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:134,29:.:-1.92:1.000:. ./.:4:138,121:.: 0.40:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:203,57:.: 0.42:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:103,91:.:-1.18:0.999:. ./.:4:209,75:.: 1.00:1.000:. ./.:4:223,89:.: 1.68:1.000:. ./.:4:158,48:.:-0.89:1.000:. ./.:6:350,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:301,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:154,53:.:-0.86:1.000:. ./.:4:140,52:.:-1.22:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:178,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:200,48:.: 0.13:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:158,1:.:-2.02:1.000:. ./.:4:251,71:.: 1.92:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:194,51:.: 0.06:1.000:. ./.:4:194,41:.:-0.18:1.000:. ./.:4:210,57:.: 0.59:1.000:. ./.:4:220,56:.: 0.81:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:169,61:.:-0.31:1.000:. ./.:4:226,66:.: 1.19:1.000:. ./.:4:180,54:.:-0.21:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:191,63:.: 0.27:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:229,69:.: 1.34:1.000:. ./.:4:192,65:.: 0.35:1.000:. ./.:4:180,55:.:-0.18:1.000:. ./.:4:232,68:.: 1.39:1.000:. ./.:4:197,68:.: 0.54:0.999:. ./.:4:169,64:.:-0.23:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:141,43:.:-1.42:1.000:. ./.:4:170,62:.:-0.26:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:195,52:.: 0.11:1.000:. ./.:4:193,73:.: 0.56:1.000:. ./.:4:207,62:.: 0.64:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:139,37:.:-1.61:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:199,53:.: 0.23:1.000:. ./.:4:135,51:.:-1.37:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:155,38:.:-1.20:1.000:. ./.:4:245,73:.: 1.82:1.000:. ./.:4:192,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:170,48:.:-0.60:1.000:. ./.:4:185,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:204,50:.: 0.27:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:163,48:.:-0.76:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:222,72:.: 1.24:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:206,72:.: 0.85:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:229,82:.: 1.65:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,1:.:-2.48:1.000:. ./.:4:147,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:195,49:.: 0.03:1.000:. ./.:4:193,62:.: 0.30:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:204,73:.: 0.83:1.000:. ./.:4:128,49:.:-1.59:1.000:. ./.:4:163,59:.:-0.50:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:161,42:.:-0.96:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:174,68:.:-0.02:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:237,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:184,59:.: 0.01:0.999:. ./.:4:240,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:158,52:.:-0.79:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:147,55:.:-0.98:1.000:. ./.:4:145,54:.:-1.05:1.000:. ./.:4:176,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:123,50:.:-1.68:1.000:. ./.:4:227,58:.: 1.02:1.000:. ./.:4:205,62:.: 0.59:1.000:. ./.:4:184,82:.: 0.56:1.000:. ./.:4:179,43:.:-0.50:1.000:. ./.:4:201,75:.: 0.81:1.000:. ./.:4:300,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:190,67:.: 0.35:1.000:. -chr3.1 87196712 chr3.1_087196712 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:5,16:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,18:0.66:-0.17:1.000:0.863 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-1.39:1.000:0.977 0/1/1/1:4:5,21:0.80:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.33:-1.18:1.000:0.923 0/0/0/1:4:8,3:0.35:-1.25:1.000:0.834 0/0/1/1:4:3,5:0.62:-1.46:1.000:0.578 0/0/0/1:4:13,2:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,9:0.37:-0.03:1.000:0.554 0/0/1/1:4:8,7:0.48:-0.98:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,16:0.72:-0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,11:0.78:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-0.91:1.000:0.951 0/1/1/1:4:4,20:0.83:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,9:0.48:-0.71:1.000:0.995 1/1/1/1:4:2,21:0.91:-0.44:0.998:0.934 0/1/1/1:4:8,16:0.66:-0.37:1.000:0.863 0/0/1/1:4:16,10:0.42:-0.24:1.000:0.919 0/0/1/1:4:12,19:0.61: 0.10:1.000:0.716 0/1/1/1:4:7,16:0.69:-0.44:1.000:0.968 1/1/1/1:4:1,13:0.92:-1.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,8:0.72:-1.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,4:0.37:-1.12:1.000:0.578 0/0/1/1:4:12,18:0.60: 0.03:1.000:0.827 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.66:-1.59:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,13:0.86:-0.98:1.000:0.967 0/1/1/1:4:3,7:0.69:-1.32:1.000:0.975 0/0/1/1:4:5,3:0.41:-1.46:1.000:0.890 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,11:0.42:-0.03:1.000:0.904 0/1/1:3:5,7:0.58:-1.18:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-1.05:1.000:0.951 0/1/1/1:4:3,21:0.87:-0.37:1.000:0.920 0/0/1/1:4:12,15:0.55:-0.17:1.000:0.977 0/1/1/1:4:4,19:0.82:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,44:0.86: 1.46:1.000:0.978 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,35:0.64: 1.66:1.000:0.705 0/0/1/1:4:11,15:0.57:-0.24:1.000:0.937 0/1/1/1:4:9,43:0.82: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,22:0.62: 0.37:1.000:0.534 0/1/1/1:4:3,23:0.88:-0.24:1.000:0.786 0/1/1/1:4:18,39:0.68: 1.86:1.000:0.942 0/1/1/1:4:6,17:0.73:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,25:0.51: 1.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,34:0.66: 1.46:1.000:0.863 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-0.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:3,51:0.94: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,34:0.64: 1.59:1.000:0.629 0/1/1/1:4:6,18:0.74:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,24:0.52: 1.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,17:0.80:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,9:0.36: 0.03:1.000:0.645 0/0/1/1:4:14,20:0.58: 0.31:1.000:0.895 0/0/1/1/1/1:6:11,34:0.74: 1.05:1.000:0.544 0/1/1/1:4:12,28:0.69: 0.71:1.000:0.975 0/0/1/1:4:10,7:0.44:-0.85:1.000:0.967 0/1/1/1:4:8,34:0.80: 0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,34:0.91: 0.51:1.000:0.974 0/1/1/1:4:10,22:0.68: 0.17:1.000:0.951 0/0/1/1:4:11,18:0.62:-0.03:1.000:0.630 0/1/1/1:4:12,25:0.67: 0.51:1.000:0.911 0/0/1/1:4:15,22:0.59: 0.51:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,18:0.62:-0.03:1.000:0.630 0/0/1/1:4:21,31:0.59: 1.52:1.000:0.853 0/0/1/1:4:9,8:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,34:0.80: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,27:0.58: 1.12:1.000:0.901 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 1.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00: 2.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,54:0.88: 2.13:1.000:0.773 1/1/1/1:4:0,39:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.70:-1.05:0.999:0.989 0/0/1/1:4:25,36:0.59: 2.13:1.000:0.886 0/0/1/1:4:27,38:0.58: 2.41:1.000:0.911 0/1/1/1:4:6,14:0.69:-0.64:1.000:0.975 0/1/1/1/1/1:6:9,37:0.79: 1.12:1.000:0.901 0/1/1/1:4:7,34:0.82: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,18:0.71:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,37:0.79: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,35:0.85: 0.78:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,10:0.39:-0.03:1.000:0.736 0/1/1/1:4:4,32:0.88: 0.44:1.000:0.683 0/1/1/1:4:9,32:0.77: 0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,36:0.65: 1.73:1.000:0.769 0/1/1/1:4:6,47:0.88: 1.59:1.000:0.737 0/0/1/1:4:19,24:0.56: 0.92:1.000:0.974 0/1/1/1:4:9,24:0.72: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,18:0.45: 0.85:1.000:0.981 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,35:0.69: 1.39:1.000:0.975 0/1/1/1:4:15,27:0.64: 0.85:1.000:0.645 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,32:0.73: 0.92:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,28:0.81: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,24:0.68: 0.37:1.000:0.946 0/0/1/1:4:9,13:0.59:-0.51:1.000:0.882 0/0/1/1:4:8,11:0.58:-0.71:1.000:0.931 0/0/1/1:4:11,10:0.48:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,23:0.52: 0.98:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,8:0.66:-1.18:1.000:0.863 0/1/1/1:4:19,41:0.68: 2.07:0.999:0.939 0/0/1/1:4:14,10:0.44:-0.37:1.000:0.972 0/1/1/1:4:9,29:0.75: 0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,13:0.64:-0.64:1.000:0.724 0/1/1/1:4:6,20:0.76:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,25:0.45: 1.93:1.000:0.983 0/0/1/1:4:23,16:0.44: 0.64:1.000:0.965 0/0/0/1:4:29,5:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,50:0.87: 1.86:1.000:0.900 1/1/1/1:4:5,44:0.89: 1.32:1.000:0.606 0/1/1/1:4:6,11:0.64:-0.85:1.000:0.693 0/1/1/1:4:8,40:0.83: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,26:0.60: 0.92:1.000:0.792 0/1/1/1:4:12,51:0.80: 2.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,11:0.52:-0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,35:0.73: 1.19:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,31:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,16:0.79:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.66:-0.17:1.000:0.863 0/1/1/1:4:6,21:0.77:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-1.18:1.000:0.972 0/0/1/1:4:16,14:0.48: 0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,7:0.39:-0.57:1.000:0.649 0/1/1/1:4:8,23:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,25:0.59: 0.85:1.000:0.858 0/0/0/1:4:36,16:0.37: 1.52:1.000:0.578 1/1/1/1:4:6,62:0.91: 2.61:1.000:0.921 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-1.18:1.000:0.972 0/1/1/1:4:10,24:0.70: 0.31:1.000:0.982 0/0/1/1:4:15,9:0.41:-0.37:1.000:0.890 0/1/1/1:4:4,14:0.77:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.58:-0.85:1.000:0.895 0/1/1/1:4:3,17:0.84:-0.64:1.000:0.994 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,9:0.41:-0.37:1.000:0.890 0/1/1/1:4:6,14:0.69:-0.64:1.000:0.975 0/0/1/1:4:21,17:0.46: 0.58:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,16:0.72:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,14:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,17:0.73:-0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,22:0.81:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.77:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.48:-0.71:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,9:0.68:-1.12:1.000:0.962 0/1/1/1:4:6,22:0.78:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,9:0.68:-1.12:1.000:0.962 0/1/1/1:4:5,15:0.74:-0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,14:0.81:-0.85:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,19:0.57: 0.24:1.000:0.940 0/0/1/1:4:10,6:0.41:-0.91:1.000:0.890 0/0/1/1:4:4,6:0.60:-1.32:1.000:0.827 0/1/1/1:4:6,17:0.73:-0.44:1.000:0.997 1/1/1/1:4:3,26:0.89:-0.03:1.000:0.560 0/1/1/1:4:5,16:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,9:0.56:-0.91:1.000:0.968 0/0/0/1:4:9,2:0.28:-1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,28:0.87: 0.17:1.000:0.920 0/0/0/1:4:9,2:0.28:-1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,13:0.75:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,27:0.78: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,10:0.62:-0.91:1.000:0.578 0/1/1/1:4:7,19:0.72:-0.24:1.000:0.996 -chr3.1 87356557 chr3.1_087356557 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:266,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:272,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:94,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:94,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:259,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.69:0.998:. ./.:4:266,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:111,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:299,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:295,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:121,0:.:-2.13:1.000:. ./.:3:26,0:.:-3.70:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:345,4:.: 1.63:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:242,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.93:1.000:. ./.:6:228,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:184,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:233,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:211,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.44:0.999:. ./.:4:295,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:391,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:209,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:204,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:301,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:194,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:338,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:214,1:.:-0.58:0.999:. ./.:4:317,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:208,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:247,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:173,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:192,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:273,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:372,1:.: 2.03:1.000:. ./.:4:361,1:.: 1.85:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:301,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:272,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:350,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.23:1.000:. -chr3.1 87400611 chr3.1_087400611 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:319,6:.: 1.36:1.000:. ./.:4:198,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:215,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:279,5:.: 0.67:1.000:. ./.:4:341,8:.: 1.76:1.000:. ./.:4:274,4:.: 0.57:1.000:. ./.:4:168,3:.:-1.21:1.000:. ./.:4:265,8:.: 0.49:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:104,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:227,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:232,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:267,3:.: 0.44:1.000:. ./.:4:268,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:213,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:243,8:.: 0.12:0.998:. ./.:4:278,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:292,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:260,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:221,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,3:.:-2.95:1.000:. ./.:4:252,13:.: 0.36:1.000:. ./.:4:292,6:.: 0.91:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:296,2:.: 0.91:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:213,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:118,0:.:-2.09:1.000:. ./.:3:45,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:255,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:221,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:244,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:251,12:.: 0.32:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:293,3:.: 0.87:1.000:. ./.:4:305,2:.: 1.06:1.000:. ./.:4:240,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:304,5:.: 1.09:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:584,0:.: 5.68:1.000:. ./.:4:239,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:306,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:320,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:341,9:.: 1.77:1.000:. ./.:4:256,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:276,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:249,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:225,2:.:-0.28:1.000:. ./.:6:194,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:264,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:222,6:.:-0.26:1.000:. ./.:4:135,2:.:-1.78:1.000:. ./.:4:236,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:300,2:.: 0.97:1.000:. ./.:4:262,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:162,2:.:-1.33:1.000:. ./.:4:253,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:273,3:.: 0.54:1.000:. ./.:4:273,3:.: 0.54:1.000:. ./.:4:213,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,5:.:-0.16:1.000:. ./.:4:227,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:251,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:259,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:289,6:.: 0.86:1.000:. ./.:4:241,4:.: 0.02:1.000:. ./.:6:298,4:.: 0.97:1.000:. ./.:4:245,4:.: 0.09:1.000:. ./.:4:182,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:217,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:257,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:229,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:263,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:220,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:205,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:280,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:292,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:177,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:172,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:230,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:196,2:.:-0.76:1.000:. ./.:4:252,6:.: 0.24:1.000:. ./.:4:315,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:256,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:242,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:291,11:.: 0.97:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:255,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:194,4:.:-0.76:1.000:. ./.:4:217,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:236,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:247,5:.: 0.14:1.000:. ./.:4:257,7:.: 0.34:1.000:. ./.:4:263,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:312,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:230,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:189,2:.:-0.88:1.000:. ./.:4:180,2:.:-1.03:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:221,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:260,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:246,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:325,2:.: 1.39:1.000:. ./.:4:243,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:237,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:202,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:228,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:207,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:311,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:361,14:.: 2.19:1.000:. ./.:4:253,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:259,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:334,8:.: 1.64:1.000:. ./.:4:238,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:275,7:.: 0.64:1.000:. ./.:4:253,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:280,6:.: 0.71:1.000:. ./.:4:274,5:.: 0.59:1.000:. ./.:4:316,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:243,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:267,7:.: 0.51:1.000:. ./.:4:199,3:.:-0.69:1.000:. ./.:4:227,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:230,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:265,5:.: 0.44:1.000:. ./.:4:187,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:229,4:.:-0.18:0.999:. ./.:4:278,6:.: 0.67:1.000:. ./.:4:205,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:203,6:.:-0.58:1.000:. ./.:4:202,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:217,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:236,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:246,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:266,5:.: 0.46:1.000:. ./.:4:214,4:.:-0.43:1.000:. ./.:4:284,4:.: 0.74:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:307,9:.: 1.21:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:253,7:.: 0.27:1.000:. -chr3.1 87784823 chr3.1_087784823 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:232,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.76:0.998:. ./.:4:94,80:.: 1.00:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.07:1.000:. ./.:3:26,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.74:1.000:. ./.:6:92,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:219,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.36:1.000:. ./.:6:173,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:244,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:129,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:242,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:85,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.56:1.000:. -chr3.1 87894917 chr3.1_087894917 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:156,187:0.53:-0.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:221,154:0.41:-0.03:1.000:0.874 0/1/1/1:4:86,282:0.74:-0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,258:0.73:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:281,97:0.28: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,314:0.71: 0.56:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,257:0.78:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,258:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,318:0.73: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,123:0.76:-2.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,73:0.39:-2.19:1.000:0.699 0/1/1/1:4:87,447:0.81: 1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,258:0.73:-0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,326:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,239:0.57: 0.32:1.000:0.942 0/0/1/1:4:198,292:0.58: 1.31:1.000:0.925 0/0/1/1:4:190,303:0.59: 1.35:0.998:0.833 1/1/1/1:4:0,457:1.00: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,320:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,335:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,45:0.31:-2.60:1.000:0.974 0/0/1/1:4:203,171:0.45:-0.04:1.000:0.982 0/0/0/1:4:255,102:0.30:-0.23:1.000:0.981 0/1/1/1:4:72,368:0.81: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,139:0.76:-2.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,430:0.76: 1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,356:0.78: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,234:0.61:-0.06:1.000:0.712 0/0/1/1:4:187,190:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,212:0.54: 0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:248,258:0.50: 1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:246,74:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,45:0.38:-3.00:1.000:0.617 0/0/1/1:4:102,73:0.42:-2.35:1.000:0.903 0/1/1:3:25,67:0.70:-3.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,480:1.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,103:0.31:-0.21:1.000:0.980 0/0/0/1:4:247,115:0.33:-0.18:1.000:0.914 0/0/1/1:4:211,312:0.58: 1.70:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,556:1.00: 2.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,477:1.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,177:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,271:0.61: 0.64:1.000:0.729 0/1/1/1:4:77,256:0.74:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,303:0.74: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:146,183:0.54:-0.56:1.000:0.987 0/1/1/1:4:72,291:0.77:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,137:0.55:-1.55:1.000:0.984 0/1/1/1:4:83,259:0.73:-0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:137,391:0.71: 1.75:1.000:0.993 0/1/1/1:4:74,299:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,309:0.79: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,224:0.58:-0.04:1.000:0.914 0/1/1/1:4:75,289:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,170:0.53:-0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:188,202:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:84,240:0.71:-0.62:1.000:0.993 0/1/1/1:4:100,349:0.75: 0.83:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,483:1.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:80,180:0.67:-1.36:1.000:0.920 0/1/1/1:4:94,276:0.72:-0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,308:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,196:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,388:0.78: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,292:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,260:0.69:-0.18:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,431:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,239:0.58: 0.25:1.000:0.914 0/1/1/1:4:106,445:0.78: 2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,238:0.62:-0.07:1.000:0.573 0/0/1/1:4:196,207:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,210:0.61:-0.54:1.000:0.655 0/0/1/1:4:202,333:0.60: 1.83:1.000:0.774 0/1/1/1:4:85,270:0.73:-0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:74,449:0.84: 1.70:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,447:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,338:0.79: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,344:0.77: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,461:1.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,209:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:188,151:0.44:-0.44:0.999:0.970 0/1/1/1:4:90,381:0.78: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,277:0.55: 1.32:1.000:0.982 0/1/1/1:4:64,275:0.78:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:199,430:0.66: 2.93:1.000:0.914 0/0/1/1:4:169,173:0.49:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,64:0.29:-1.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:145,141:0.48:-1.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,295:0.80:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,368:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,336:0.79: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:142,267:0.63: 0.37:1.000:0.567 0/1/1/1:4:82,370:0.79: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,104:0.50:-2.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,262:0.72:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,380:0.79: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,189:0.58:-0.69:1.000:0.930 0/0/1/1:4:148,256:0.61: 0.31:1.000:0.664 0/0/0/1:4:244,70:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,160:0.52:-0.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,397:1.00: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,479:1.00: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,281:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,179:0.53:-0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:155,181:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:141,175:0.54:-0.71:1.000:0.989 0/1/1/1:4:76,222:0.72:-0.92:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,380:0.82: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:258,83:0.27:-0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:93,332:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,148:0.47:-0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:315,137:0.32: 0.87:1.000:0.956 0/1/1/1:4:72,313:0.79: 0.09:0.999:1.000 0/0/1/1:4:163,184:0.52:-0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,266:0.80:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,211:0.68:-0.91:1.000:0.953 0/0/1/1:4:134,174:0.55:-0.80:1.000:0.981 0/0/1/1:4:148,251:0.61: 0.25:1.000:0.712 1/1/1/1:4:0,357:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,138:0.48:-1.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:79,230:0.72:-0.79:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,299:0.80:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,429:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,183:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,150:0.48:-0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:153,299:0.64: 0.87:1.000:0.670 1/1/1/1:4:0,414:1.00: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,509:1.00: 1.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,213:0.74:-1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,221:0.58:-0.13:1.000:0.893 0/0/1/1:4:134,154:0.52:-1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:262,99:0.29:-0.19:1.000:0.989 0/1/1/1:4:53,196:0.76:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,239:0.72:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,140:0.48:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:228,328:0.57: 2.08:1.000:0.942 0/1/1/1:4:89,313:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,318:0.79: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,135:0.50:-1.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,327:0.80: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,337:0.78: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,297:0.81:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,87:0.30:-0.72:1.000:0.988 0/0/1/1:4:123,202:0.60:-0.61:1.000:0.781 0/1/1/1:4:84,369:0.79: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,270:0.69: 0.01:1.000:0.970 0/0/1/1:4:167,152:0.47:-0.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:149,170:0.52:-0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,191:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,273:0.74:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,301:0.59: 1.36:1.000:0.866 0/0/1/1:4:183,279:0.58: 0.99:1.000:0.893 1/1/1/1:4:0,161:1.00:-2.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,257:0.79:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,205:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,367:0.78: 0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,478:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,202:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,265:0.62: 0.39:1.000:0.533 0/1/1/1:4:88,255:0.71:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:163,241:0.58: 0.31:1.000:0.922 0/0/0/1:4:215,87:0.31:-0.87:1.000:0.979 0/0/1/1:4:165,241:0.58: 0.33:1.000:0.932 0/0/1/1:4:178,180:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:283,99:0.28: 0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,260:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,321:0.77: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,171:0.52:-0.67:0.999:0.995 0/1/1/1:4:69,352:0.81: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,253:0.61: 0.27:1.000:0.676 0/1/1/1:4:70,318:0.79: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,141:0.49:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,251:0.58: 0.49:1.000:0.913 0/1/1/1:4:56,283:0.81:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,339:0.78: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,222:0.63:-0.46:1.000:0.615 0/1/1/1:4:106,310:0.72: 0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:193,194:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:289,110:0.30: 0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:155,228:0.58: 0.07:1.000:0.927 0/0/1/1:4:208,206:0.49: 0.43:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,571:1.00: 2.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,429:0.82: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,163:0.53:-0.92:1.000:0.992 0/1/1/1:4:128,237:0.63:-0.14:1.000:0.524 -chr3.1 88114859 chr3.1_088114859 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:353,88:.: 0.96:1.000:. ./.:4:80,173:.:-1.38:1.000:. ./.:4:265,74:.:-0.31:1.000:. ./.:4:351,71:.: 0.72:1.000:. ./.:4:261,188:.: 1.06:1.000:. ./.:4:376,71:.: 1.03:1.000:. ./.:4:202,41:.:-1.50:1.000:. ./.:4:295,70:.: 0.02:1.000:. ./.:4:268,91:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,11:.:-3.13:1.000:. ./.:4:170,7:.:-2.32:1.000:. ./.:4:258,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:327,58:.: 0.26:1.000:. ./.:4:355,88:.: 0.98:1.000:. ./.:4:312,66:.: 0.18:1.000:. ./.:4:360,89:.: 1.06:1.000:. ./.:4:326,66:.: 0.35:0.998:. ./.:4:504,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:422,98:.: 1.94:1.000:. ./.:4:333,80:.: 0.61:1.000:. ./.:4:78,36:.:-3.10:1.000:. ./.:4:321,84:.: 0.51:1.000:. ./.:4:195,157:.:-0.15:1.000:. ./.:4:280,63:.:-0.26:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:302,74:.: 0.15:1.000:. ./.:4:306,60:.: 0.03:1.000:. ./.:4:240,177:.: 0.66:1.000:. ./.:4:312,70:.: 0.23:1.000:. ./.:4:297,72:.: 0.06:1.000:. ./.:4:147,116:.:-1.25:1.000:. ./.:4:143,20:.:-2.50:1.000:. ./.:4:158,23:.:-2.27:1.000:. ./.:3:61,13:.:-3.60:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:194,153:.:-0.21:1.000:. ./.:4:216,124:.:-0.30:1.000:. ./.:4:317,67:.: 0.25:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:220,127:.:-0.21:1.000:. ./.:4:395,78:.: 1.36:1.000:. ./.:4:274,60:.:-0.37:1.000:. ./.:4:311,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:354,55:.: 0.56:1.000:. ./.:4:384,69:.: 1.11:1.000:. ./.:4:197,27:.:-1.74:1.000:. ./.:4:274,54:.:-0.44:1.000:. ./.:4:318,50:.: 0.05:1.000:. ./.:4:309,46:.:-0.11:1.000:. ./.:4:384,92:.: 1.39:1.000:. ./.:4:300,52:.:-0.15:1.000:. ./.:4:353,75:.: 0.80:1.000:. ./.:4:294,74:.: 0.05:1.000:. ./.:4:343,64:.: 0.54:1.000:. ./.:4:272,77:.:-0.18:1.000:. ./.:4:353,74:.: 0.79:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.18:1.000:. ./.:6:238,50:.:-0.94:1.000:. ./.:4:321,60:.: 0.21:1.000:. ./.:4:258,64:.:-0.52:1.000:. ./.:4:324,84:.: 0.55:1.000:. ./.:4:311,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:321,71:.: 0.35:1.000:. ./.:4:290,68:.:-0.07:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:287,80:.: 0.04:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:222,131:.:-0.13:1.000:. ./.:4:354,79:.: 0.86:1.000:. ./.:4:282,65:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,158:.: 0.14:1.000:. ./.:4:370,80:.: 1.07:1.000:. ./.:4:320,59:.: 0.19:1.000:. ./.:4:282,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:350,75:.: 0.76:1.000:. ./.:4:61,109:.:-2.41:0.999:. ./.:4:382,71:.: 1.11:1.000:. ./.:4:365,75:.: 0.95:1.000:. ./.:4:291,60:.:-0.16:1.000:. ./.:6:369,53:.: 0.72:1.000:. ./.:4:348,87:.: 0.89:1.000:. ./.:4:160,93:.:-1.38:1.000:. ./.:4:189,100:.:-0.93:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:263,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:290,73:.:-0.01:1.000:. ./.:4:381,75:.: 1.15:1.000:. ./.:4:273,60:.:-0.38:1.000:. ./.:4:259,55:.:-0.62:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:286,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:167,101:.:-1.19:1.000:. ./.:4:206,151:.:-0.08:1.000:. ./.:4:240,147:.: 0.29:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:235,42:.:-1.08:1.000:. ./.:4:217,118:.:-0.36:1.000:. ./.:4:256,26:.:-1.02:1.000:. ./.:4:261,54:.:-0.61:1.000:. ./.:4:253,52:.:-0.73:1.000:. ./.:4:285,66:.:-0.16:1.000:. ./.:4:346,212:.: 2.41:1.000:. ./.:4:281,75:.:-0.10:1.000:. ./.:4:288,71:.:-0.06:1.000:. ./.:4:263,185:.: 1.05:1.000:. ./.:4:360,63:.: 0.74:0.999:. ./.:4:202,143:.:-0.23:1.000:. ./.:4:281,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:250,75:.:-0.48:1.000:. ./.:4:282,50:.:-0.39:1.000:. ./.:4:265,44:.:-0.68:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:210,100:.:-0.67:1.000:. ./.:4:315,72:.: 0.29:1.000:. ./.:4:371,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:313,70:.: 0.24:1.000:. ./.:4:332,74:.: 0.52:1.000:. ./.:4:320,93:.: 0.61:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:207,38:.:-1.48:1.000:. ./.:4:246,56:.:-0.77:1.000:. ./.:4:314,60:.: 0.13:1.000:. ./.:4:183,138:.:-0.53:1.000:. ./.:4:153,46:.:-2.05:1.000:. ./.:4:365,100:.: 1.26:1.000:. ./.:4:203,124:.:-0.46:1.000:. ./.:4:404,84:.: 1.54:1.000:. ./.:4:332,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:290,53:.:-0.26:1.000:. ./.:4:132,94:.:-1.71:1.000:. ./.:4:323,54:.: 0.16:1.000:. ./.:4:352,86:.: 0.92:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:193,129:.:-0.52:1.000:. ./.:4:216,43:.:-1.30:1.000:. ./.:4:410,96:.: 1.77:1.000:. ./.:4:464,110:.: 2.61:1.000:. ./.:4:360,80:.: 0.95:1.000:. ./.:4:354,68:.: 0.72:1.000:. ./.:4:275,188:.: 1.23:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:364,65:.: 0.81:1.000:. ./.:4:306,94:.: 0.45:1.000:. ./.:4:229,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:342,80:.: 0.72:1.000:. ./.:4:342,86:.: 0.80:1.000:. ./.:4:525,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:215,162:.: 0.16:1.000:. ./.:4:219,57:.:-1.09:1.000:. ./.:4:353,79:.: 0.85:1.000:. ./.:4:301,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:185,115:.:-0.79:1.000:. ./.:4:259,51:.:-0.67:1.000:. ./.:4:299,73:.: 0.10:1.000:. ./.:4:191,150:.:-0.28:1.000:. ./.:4:334,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:271,66:.:-0.33:1.000:. ./.:4:204,130:.:-0.37:0.999:. ./.:4:416,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:252,59:.:-0.66:1.000:. ./.:4:234,55:.:-0.93:1.000:. ./.:4:233,74:.:-0.71:1.000:. ./.:4:274,64:.:-0.32:1.000:. ./.:4:267,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:269,62:.:-0.41:1.000:. ./.:4:204,66:.:-1.17:1.000:. ./.:4:337,85:.: 0.72:1.000:. ./.:4:328,71:.: 0.44:1.000:. ./.:4:225,156:.: 0.21:1.000:. ./.:4:266,77:.:-0.26:1.000:. ./.:4:223,157:.: 0.20:1.000:. ./.:4:501,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:553,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:253,73:.:-0.47:1.000:. ./.:4:235,156:.: 0.34:1.000:. -chr3.1 88171126 chr3.1_088171126 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:174,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:131,21:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,20:.:-1.58:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:228,30:.: 0.55:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:176,21:.:-0.31:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:156,17:.:-0.65:1.000:. ./.:4:206,40:.: 0.38:0.998:. ./.:4:148,24:.:-0.66:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:170,38:.:-0.16:1.000:. ./.:4:177,31:.:-0.16:1.000:. ./.:4:222,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:76,1:.:-2.00:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:122,13:.:-1.18:1.000:. ./.:4:123,21:.:-1.06:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:169,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:167,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:61,13:.:-2.04:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.20:1.000:. ./.:3:83,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:170,22:.:-0.38:1.000:. ./.:4:341,43:.: 2.32:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:272,40:.: 1.31:1.000:. ./.:4:244,43:.: 0.95:1.000:. ./.:4:262,47:.: 1.26:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,24:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:133,23:.:-0.89:1.000:. ./.:4:224,45:.: 0.70:1.000:. ./.:4:189,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:313,40:.: 1.88:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:209,36:.: 0.36:1.000:. ./.:4:253,55:.: 1.25:1.000:. ./.:4:289,38:.: 1.52:1.000:. ./.:6:272,35:.: 1.24:1.000:. ./.:4:279,54:.: 1.60:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:248,38:.: 0.94:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:299,62:.: 1.99:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:332,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:275,33:.: 1.25:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.01:0.999:. ./.:4:296,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.13:1.000:. ./.:6:217,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:217,40:.: 0.53:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:206,21:.: 0.11:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:262,43:.: 1.21:1.000:. ./.:4:369,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:99,15:.:-1.48:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:266,44:.: 1.28:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:223,38:.: 0.59:1.000:. ./.:4:159,30:.:-0.42:1.000:. ./.:4:293,54:.: 1.80:1.000:. ./.:4:234,32:.: 0.66:1.000:. ./.:4:354,39:.: 2.44:1.000:. ./.:4:228,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:174,24:.:-0.30:1.000:. ./.:4:209,28:.: 0.25:1.000:. ./.:4:230,39:.: 0.70:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.99:0.999:. ./.:4:280,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:196,35:.: 0.17:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:235,46:.: 0.87:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:278,21:.: 1.12:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:296,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:177,16:.:-0.37:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:213,33:.: 0.38:1.000:. ./.:4:226,20:.: 0.38:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:172,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:306,51:.: 1.94:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:191,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:215,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:174,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:112,27:.:-1.13:1.000:. ./.:4:119,26:.:-1.04:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:255,32:.: 0.95:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:145,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:140,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:125,20:.:-1.04:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:111,31:.:-1.08:1.000:. ./.:4:91,8:.:-1.69:1.000:. ./.:4:165,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:182,21:.:-0.23:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:119,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:158,19:.:-0.59:1.000:. ./.:4:110,18:.:-1.28:1.000:. ./.:4:125,21:.:-1.03:1.000:. ./.:4:144,22:.:-0.75:1.000:. ./.:4:153,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:227,29:.: 0.52:1.000:. ./.:4:152,25:.:-0.59:1.000:. ./.:4:178,30:.:-0.16:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:126,28:.:-0.92:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:199,24:.: 0.05:1.000:. ./.:4:75,25:.:-1.67:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.76:1.000:. -chr3.1 88373303 chr3.1_088373303 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:347,246:0.43:-0.03:1.000:0.938 0/1/1/1:4:104,371:0.73:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:303,101:0.25:-1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:313,334:0.53: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:275,468:0.61: 0.88:1.000:0.665 0/0/0/1:4:381,129:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:239,88:0.27:-1.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:348,232:0.41:-0.11:1.000:0.870 0/0/1/1:4:346,360:0.52: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:219,140:0.40:-1.45:1.000:0.791 0/0/1/1:4:277,249:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:304,305:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:299,201:0.41:-0.60:1.000:0.882 0/0/1/1:4:366,350:0.51: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:340,360:0.52: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:351,231:0.41:-0.10:1.000:0.849 0/0/1/1:4:397,344:0.48: 0.86:0.998:0.995 0/0/1/1:4:221,237:0.53:-0.85:1.000:0.993 0/0/1/1:4:434,304:0.42: 0.85:1.000:0.928 0/0/0/1:4:341,118:0.26:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,143:0.41:-1.46:1.000:0.873 0/0/0/1:4:305,112:0.27:-1.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:235,477:0.64: 0.69:1.000:0.719 0/0/1/1:4:333,217:0.40:-0.29:1.000:0.831 0/0/0/1:4:225,72:0.24:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:612,171:0.22: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:301,337:0.54: 0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:336,345:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,405:0.60: 0.35:1.000:0.766 0/0/1/1:4:339,236:0.42:-0.14:1.000:0.923 0/0/1/1:4:399,366:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:208,399:0.63: 0.05:1.000:0.604 0/0/1/1:4:129,163:0.56:-1.86:1.000:0.970 0/0/1/1:4:258,156:0.39:-1.12:1.000:0.642 0/0/1:3:190,96:0.34:-1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:422,220:0.35: 0.26:1.000:0.804 0/0/1/1:4:248,390:0.60: 0.24:1.000:0.806 0/0/1/1:4:184,325:0.62:-0.54:1.000:0.584 0/0/1/1:4:318,392:0.55: 0.68:1.000:0.976 0/0/0/1:4:489,237:0.33: 0.77:1.000:0.916 0/0/0/0:4:487,1:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:284,528:0.63: 1.29:1.000:0.534 0/0/0/1:4:421,142:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:354,242:0.42:-0.01:1.000:0.903 0/0/1/1:4:376,315:0.47: 0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:387,412:0.53: 1.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:368,413:0.54: 1.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:820,889:0.53: 6.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:366,379:0.52: 0.89:1.000:0.995 0/0/0/1:4:454,152:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:289,125:0.30:-1.12:1.000:0.981 0/0/1/1:4:451,320:0.43: 1.05:1.000:0.939 0/0/0/1:4:337,136:0.29:-0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:397,322:0.46: 0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:300,206:0.42:-0.56:1.000:0.908 0/0/1/1:4:443,455:0.52: 1.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:345,245:0.43:-0.05:1.000:0.940 0/0/1/1:4:439,343:0.45: 1.11:1.000:0.982 0/0/0/1:4:487,128:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:328,311:0.50: 0.25:1.000:0.888 0/0/1/1:4:400,447:0.53: 1.51:1.000:0.990 0/0/1/1:4:328,375:0.54: 0.63:1.000:0.988 0/0/1/1:4:534,466:0.48: 2.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:367,252:0.42: 0.12:1.000:0.908 0/0/1/1:4:348,331:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:399,139:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:327,183:0.37:-0.54:1.000:0.612 0/0/1/1:4:364,237:0.40: 0.02:1.000:0.829 0/0/0/0:4:534,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,400:0.62: 0.14:1.000:0.528 0/0/1/1:4:395,426:0.53: 1.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:278,110:0.28:-1.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:282,528:0.63: 1.28:1.000:0.550 0/0/1/1:4:370,358:0.51: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:386,248:0.40: 0.22:1.000:0.802 0/0/0/1:4:444,254:0.37: 0.60:1.000:0.540 0/0/0/1:4:429,144:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:475,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:554,146:0.21: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:420,149:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,551:0.78: 0.34:0.999:1.000 0/0/1/1:4:430,405:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:463,482:0.52: 2.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:325,291:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:569,417:0.44: 2.35:1.000:0.647 0/0/1/1:4:398,296:0.44: 0.58:1.000:0.967 0/0/1/1:4:210,194:0.50:-1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:229,346:0.59:-0.14:1.000:0.858 0/0/0/0:4:422,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:496,237:0.33: 0.82:1.000:0.930 0/0/0/1:4:313,99:0.24:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,113:0.25:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:442,296:0.41: 0.85:1.000:0.876 0/0/1/1:4:229,259:0.54:-0.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:423,403:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:596,143:0.19: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:396,238:0.38: 0.22:1.000:0.623 0/0/1/1:4:214,229:0.53:-0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:262,467:0.62: 0.79:1.000:0.564 0/1/1/1:4:238,459:0.63: 0.60:1.000:0.616 0/0/0/0:4:346,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:526,145:0.21: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:241,176:0.43:-1.10:1.000:0.958 0/0/1/1:4:243,349:0.58:-0.04:1.000:0.907 0/0/1/1:4:293,310:0.52: 0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:350,257:0.44: 0.05:1.000:0.961 0/0/1/1:4:366,233:0.40: 0.00:1.000:0.782 0/0/1/1:4:325,205:0.40:-0.41:1.000:0.760 0/0/1/1:4:260,432:0.61: 0.57:1.000:0.713 0/0/1/1:4:345,258:0.44: 0.03:1.000:0.969 0/0/1/1:4:340,261:0.45: 0.02:1.000:0.978 0/0/1/1:4:295,518:0.62: 1.30:1.000:0.598 0/0/0/1:4:363,115:0.24:-0.73:0.999:1.000 0/0/1/1:4:276,482:0.62: 0.97:1.000:0.610 0/0/0/0:4:396,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,328:0.56:-0.11:1.000:0.963 0/0/0/1:4:329,178:0.36:-0.55:1.000:0.713 0/0/1/1:4:317,247:0.45:-0.21:1.000:0.982 0/0/0/1:4:471,138:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,338:0.60:-0.31:1.000:0.762 0/0/1/1:4:380,398:0.52: 1.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:457,261:0.37: 0.72:1.000:0.546 0/0/0/0:4:508,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:327,100:0.23:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:376,292:0.45: 0.42:1.000:0.981 0/0/1/1:4:423,440:0.52: 1.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:541,132:0.19: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:419,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,223:0.48:-0.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:289,271:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:341,129:0.27:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:212,276:0.56:-0.67:1.000:0.961 0/0/1/1:4:242,149:0.39:-1.26:1.000:0.696 0/0/0/1:4:354,153:0.30:-0.55:1.000:0.981 0/1/1/1:4:205,436:0.65: 0.26:1.000:0.797 0/0/1/1:4:426,271:0.40: 0.60:1.000:0.780 0/0/1/1:4:353,226:0.40:-0.12:1.000:0.795 0/0/1/1:4:328,353:0.53: 0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:209,186:0.49:-1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:353,383:0.53: 0.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:377,431:0.54: 1.27:1.000:0.988 0/0/0/1:4:485,129:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:198,415:0.65: 0.09:1.000:0.775 0/0/1/1:4:293,218:0.44:-0.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:452,299:0.41: 0.92:1.000:0.857 0/0/1/1:4:465,330:0.43: 1.19:1.000:0.939 0/0/1/1:4:351,337:0.51: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:349,371:0.53: 0.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:243,408:0.61: 0.32:1.000:0.693 0/0/0/0:4:454,1:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:341,260:0.45: 0.02:1.000:0.976 0/0/1/1:4:303,233:0.45:-0.38:1.000:0.978 0/0/0/1:4:274,130:0.33:-1.18:1.000:0.936 0/0/0/1:4:365,86:0.19:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:361,130:0.26:-0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:360,241:0.41: 0.02:1.000:0.876 0/0/0/1:4:518,291:0.37: 1.28:1.000:0.600 0/0/1/1:4:228,353:0.60:-0.11:1.000:0.828 0/0/1/1:4:296,193:0.41:-0.66:1.000:0.832 0/0/0/1:4:372,111:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,311:0.52: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:228,216:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:309,187:0.39:-0.62:1.000:0.645 0/0/1/1:4:338,256:0.44:-0.03:1.000:0.974 0/1/1/1:4:232,428:0.63: 0.37:1.000:0.516 0/0/0/1:4:321,90:0.22:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:308,179:0.38:-0.68:1.000:0.513 0/0/1/1:4:218,211:0.51:-1.03:0.999:0.996 0/0/0/0:4:377,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:284,197:0.42:-0.71:1.000:0.919 0/0/0/1:4:260,83:0.24:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,180:0.41:-0.89:1.000:0.858 0/0/0/1:4:324,93:0.22:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,119:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:310,91:0.23:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,181:0.45:-1.11:1.000:0.980 0/0/0/1:4:368,132:0.26:-0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:356,214:0.38:-0.17:1.000:0.624 0/0/1/1:4:199,359:0.62:-0.25:1.000:0.536 0/0/1/1:4:294,180:0.39:-0.75:1.000:0.679 0/0/1/1:4:225,329:0.58:-0.27:1.000:0.892 0/0/0/1:4:516,290:0.37: 1.26:1.000:0.599 0/0/0/0:4:596,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:289,169:0.38:-0.85:1.000:0.533 0/0/1/1:4:225,362:0.60:-0.07:1.000:0.771 -chr3.1 88572986 chr3.1_088572986 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:34,37:0.52:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:67,27:0.31: 0.37:1.000:0.972 0/0/1/1:4:45,40:0.49: 0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,32:0.26: 1.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,77:0.83:-0.21:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,37:0.51:-0.28:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.50:-2.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,33:0.48:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,48:0.53: 0.23:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,38:0.33: 1.49:1.000:0.930 0/0/0/1:4:76,32:0.32: 0.88:1.000:0.954 0/0/0/1:4:87,32:0.29: 1.27:0.998:0.990 0/0/0/1:4:89,30:0.28: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,64:0.56: 0.88:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,10:0.29:-1.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,58:0.54: 0.73:1.000:0.987 0/0/0/1:4:110,41:0.30: 2.43:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,10:0.38:-2.01:1.000:0.580 0/0/1/1:4:36,49:0.55: 0.05:1.000:0.980 0/0/1/1:4:39,43:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,61:0.57: 0.52:1.000:0.940 0/0/1/1:4:57,51:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,45:0.57:-0.39:1.000:0.948 0/0/0/1:4:89,36:0.31: 1.49:1.000:0.971 0/0/0/1:4:73,28:0.30: 0.62:1.000:0.984 0/0/0/1:4:19,9:0.35:-2.01:1.000:0.833 0/0/0/1:4:28,14:0.36:-1.50:1.000:0.722 0/0/0:3:18,0:0.00:-2.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,25:0.27: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,35:0.28: 1.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,30:0.29: 0.99:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,55:0.57: 0.23:1.000:0.954 0/0/0/1:4:99,32:0.27: 1.71:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.29: 0.91:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,73:0.55: 1.60:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,37:0.45: 0.08:1.000:0.983 0/0/1/1:4:39,35:0.50:-0.35:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,22:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,51:0.52: 0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,51:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,32:0.28: 1.42:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:9,41:0.67:-1.22:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,52:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,38:0.52:-0.31:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,49:0.50: 0.66:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,30:0.31: 0.70:1.000:0.965 0/0/1/1:4:43,54:0.54: 0.48:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,50:0.54: 0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:49,24:0.35:-0.39:1.000:0.769 0/0/0/1:4:77,25:0.27: 0.66:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,43:0.56:-0.42:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,50:0.55: 0.08:1.000:0.978 0/0/1/1:4:42,51:0.54: 0.34:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,54:0.55: 0.30:1.000:0.974 0/0/0/1:4:72,22:0.26: 0.37:0.999:0.999 0/0/1/1:4:38,48:0.54: 0.08:1.000:0.987 0/0/0/1:4:94,28:0.25: 1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,34:0.39: 0.30:1.000:0.727 0/0/0/1/1/1:6:55,76:0.55: 1.71:1.000:0.735 0/0/1/1:4:35,64:0.58: 0.55:1.000:0.895 0/0/0/1:4:60,20:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,37:0.55:-0.71:1.000:0.979 0/0/1/1:4:34,38:0.53:-0.42:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,46:0.57:-0.31:1.000:0.952 0/0/0/1:4:80,23:0.25: 0.70:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,43:0.53:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,47:0.53: 0.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:38,49:0.54: 0.12:1.000:0.986 0/0/0/1:4:54,20:0.29:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:50,45:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,24:0.27: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,53:0.53: 0.52:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,33:0.48:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,54:0.54: 0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:67,21:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,37:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,35:0.50:-0.35:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,49:0.41: 1.56:1.000:0.861 0/0/1/1:4:37,62:0.57: 0.55:1.000:0.934 0/0/0/1:4:69,35:0.36: 0.73:1.000:0.686 0/0/0/1:4:99,52:0.37: 2.43:1.000:0.588 0/0/1/1:4:39,44:0.53:-0.02:0.999:0.993 0/0/1/1:4:36,37:0.52:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,39:0.52:-0.31:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,29:0.53:-1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:32,27:0.48:-0.89:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,20:0.48:-1.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,49:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,45:0.53: 0.01:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,30:0.28: 1.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:81,28:0.28: 0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,49:0.43: 1.38:1.000:0.933 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,24:0.31: 0.01:1.000:0.974 0/0/1/1:4:42,35:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:75,36:0.35: 0.99:1.000:0.810 0/0/1/1:4:26,27:0.52:-1.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,42:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,43:0.32: 2.25:1.000:0.958 0/0/0/1:4:84,29:0.28: 1.06:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,30:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,33:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,41:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,46:0.54:-0.06:1.000:0.986 0/0/0/1:4:102,29:0.24: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,71:0.53: 1.67:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,59:0.53: 0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,38:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,50:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,50:0.58:-0.17:1.000:0.923 0/0/0/1:4:91,36:0.31: 1.56:1.000:0.978 0/0/1/1:4:36,35:0.51:-0.46:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-2.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,44:0.55:-0.28:1.000:0.979 0/0/0/1:4:104,40:0.30: 2.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:45,42:0.50: 0.12:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,67:0.52: 1.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:84,21:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,51:0.54: 0.26:1.000:0.987 0/0/1/1:4:33,45:0.55:-0.21:1.000:0.980 0/0/0/1:4:58,26:0.33: 0.01:1.000:0.907 0/0/1/1:4:47,53:0.53: 0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:73,33:0.33: 0.81:1.000:0.898 0/0/1/1:4:41,57:0.55: 0.52:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,54:0.76:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,44:0.51: 0.19:0.999:0.996 0/0/1/1:4:50,49:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,24:0.26: 0.62:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,24:0.29: 0.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:82,35:0.32: 1.20:1.000:0.946 0/0/1/1:4:33,54:0.57: 0.12:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,21:0.29:-0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:53,57:0.52: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:91,37:0.31: 1.60:1.000:0.969 0/0/0/1:4:84,34:0.31: 1.24:1.000:0.971 0/0/0/1:4:86,30:0.28: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,54:0.52: 0.73:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,66:0.56: 1.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:36,43:0.53:-0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:44,43:0.51: 0.12:1.000:0.996 -chr3.1 88781520 chr3.1_088781520 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:348,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:565,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.62:0.998:. ./.:4:292,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:265,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:421,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:279,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.26:1.000:. ./.:3:84,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:421,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.70:1.000:. ./.:6:359,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:507,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:530,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.11:0.999:. ./.:4:265,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.82:1.000:. ./.:6:361,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:369,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:399,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:416,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:462,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:329,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:256,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:454,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.13:0.999:. ./.:4:299,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:479,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.63:1.000:. -chr3.1 88969889 chr3.1_088969889 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:113,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:0.998:. ./.:4:163,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.70:1.000:. ./.:3:15,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.24:1.000:. ./.:6:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.61:0.999:. ./.:4:46,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.69:1.000:. ./.:6:97,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:44,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:159,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:117,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.50:0.999:. ./.:4:79,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.52:1.000:. -chr3.1 89419279 chr3.1_089419279 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.74:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.08:0.998:. ./.:4:3,24:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.29:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.75:1.000:. ./.:3:0,4:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,42:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,45:.: 2.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,51:.: 2.92:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,43:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,43:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,37:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.87:0.999:. ./.:4:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.98:1.000:. ./.:6:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,55:.: 3.36:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,45:.: 2.27:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.64:0.999:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.22:0.999:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,25:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.09:1.000:. -chr3.1 89686120 chr3.1_089686120 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:259,207:0.46: 0.21:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,277:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:264,167:0.41:-0.13:1.000:0.877 0/0/0/1:4:287,67:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,478:0.79: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:412,49:0.17: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,38:0.25:-2.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:260,59:0.25:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:268,151:0.39:-0.24:1.000:0.692 0/1/1/1:4:105,288:0.71:-0.49:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,378:0.79: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,317:0.78:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:268,168:0.41:-0.08:1.000:0.867 0/0/1/1:4:197,165:0.47:-0.78:1.000:0.992 0/1/1/1:4:80,409:0.81: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,388:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:116,400:0.75: 0.68:0.998:0.999 0/0/1/1:4:318,193:0.40: 0.63:1.000:0.825 0/0/1/1:4:420,246:0.40: 2.11:1.000:0.768 0/0/0/1:4:305,61:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,357:0.86:-0.35:1.000:0.972 0/0/1/1:4:164,198:0.55:-0.78:1.000:0.983 0/1/1/1:4:109,316:0.72:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:180,136:0.45:-1.22:1.000:0.977 0/1/1/1:4:60,273:0.80:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,301:0.56: 0.90:1.000:0.973 0/0/1/1:4:218,205:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,252:0.71:-0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:210,271:0.56: 0.35:1.000:0.966 0/0/1/1:4:161,119:0.44:-1.56:1.000:0.972 0/0/1/1:4:186,249:0.57:-0.09:1.000:0.951 0/1/1/1:4:91,195:0.66:-1.50:1.000:0.895 1/1/1/1:4:31,329:0.90:-0.80:1.000:0.852 0/1/1/1:4:47,245:0.82:-1.45:1.000:0.999 1/1/1:3:33,404:0.91:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,135:0.37:-0.36:1.000:0.599 0/1/1/1:4:90,318:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,292:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:134,373:0.71: 0.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:275,136:0.37:-0.32:1.000:0.616 0/0/1/1:4:265,206:0.45: 0.25:1.000:0.983 0/0/1/1:4:200,256:0.56: 0.11:1.000:0.969 0/1/1/1:4:122,553:0.80: 2.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,119:0.34:-0.44:1.000:0.870 0/0/1/1:4:283,156:0.39:-0.05:1.000:0.644 0/1/1/1:4:206,373:0.63: 1.28:1.000:0.582 0/0/0/1:4:310,75:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,185:0.64:-1.52:1.000:0.662 0/0/0/1:4:229,103:0.35:-1.07:1.000:0.801 0/0/1/1:4:272,229:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:159,366:0.68: 0.77:1.000:0.948 0/0/0/1:4:369,113:0.29: 0.36:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,426:0.85: 0.45:1.000:0.990 0/0/1/1:4:337,297:0.48: 1.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,198:0.59:-1.08:1.000:0.858 0/1/1/1:4:188,363:0.64: 1.01:1.000:0.736 0/0/0/1:4:217,108:0.37:-1.13:1.000:0.601 0/0/0/1:4:330,162:0.36: 0.45:1.000:0.633 0/0/1/1:4:248,219:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:160,194:0.55:-0.86:1.000:0.762 0/0/1/1:4:257,215:0.47: 0.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:184,168:0.49:-0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:229,367:0.61: 1.44:1.000:0.730 0/0/1/1:4:189,271:0.58: 0.15:1.000:0.901 0/0/0/1:4:294,123:0.34:-0.26:1.000:0.890 0/0/1/1:4:302,253:0.47: 1.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:220,137:0.41:-0.83:1.000:0.859 0/1/1/1:4:104,408:0.77: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:159,343:0.67: 0.55:1.000:0.901 0/1/1/1:4:92,187:0.65:-1.57:1.000:0.829 0/1/1/1:4:200,367:0.63: 1.17:1.000:0.616 0/1/1/1:4:80,360:0.79:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,567:0.83: 2.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:341,73:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,515:0.84: 1.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:216,161:0.44:-0.64:1.000:0.974 0/0/1/1:4:189,256:0.57: 0.01:1.000:0.944 0/1/1/1:4:190,441:0.68: 1.77:1.000:0.952 0/0/1/1:4:272,266:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,242:0.56:-0.17:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,359:1.00:-0.81:0.999:1.000 0/1/1/1:4:217,478:0.67: 2.38:1.000:0.920 0/1/1/1:4:88,557:0.85: 1.91:1.000:0.992 0/0/1/1:4:191,261:0.57: 0.07:1.000:0.939 0/0/1/1/1/1:6:184,366:0.65: 1.00:1.000:0.899 0/0/1/1:4:214,295:0.57: 0.61:1.000:0.933 0/1/1/1:4:55,254:0.80:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,285:0.61: 0.13:1.000:0.667 0/1/1/1:4:167,345:0.66: 0.64:1.000:0.852 0/0/1/1:4:218,181:0.47:-0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:126,219:0.62:-0.94:1.000:0.528 0/1/1/1:4:92,495:0.82: 1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,290:0.57: 0.57:1.000:0.944 0/0/1/1:4:147,117:0.46:-1.71:1.000:0.986 0/0/1/1:4:240,245:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:210,355:0.62: 1.15:1.000:0.602 0/1/1/1:4:81,519:0.85: 1.48:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,297:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,452:0.82: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,206:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:221,205:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:343,230:0.42: 1.22:1.000:0.928 0/1/1/1:4:112,276:0.69:-0.54:1.000:0.974 0/1/1/1:4:141,311:0.67: 0.07:1.000:0.921 0/1/1/1:4:135,326:0.69: 0.16:1.000:0.968 0/0/1/1:4:177,243:0.57:-0.23:1.000:0.936 0/0/1/1:4:226,241:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:198,147:0.44:-0.94:1.000:0.973 0/1/1/1:4:131,474:0.75: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,293:0.62: 0.18:1.000:0.551 0/1/1/1:4:177,363:0.66: 0.91:1.000:0.842 0/1/1/1:4:116,387:0.74: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:163,416:0.70: 1.28:0.999:0.982 0/0/1/1:4:201,301:0.59: 0.55:1.000:0.850 0/0/1/1:4:145,251:0.62:-0.46:1.000:0.539 0/0/1/1:4:200,144:0.44:-0.95:1.000:0.963 0/1/1/1:4:140,281:0.65:-0.22:1.000:0.809 0/1/1/1:4:73,427:0.83: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:213,239:0.53: 0.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:148,283:0.64:-0.13:1.000:0.715 0/0/1/1:4:322,279:0.48: 1.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:153,389:0.70: 0.93:1.000:0.981 0/0/1/1:4:277,242:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:160,295:0.64: 0.10:1.000:0.628 0/1/1/1:4:208,453:0.67: 2.06:1.000:0.910 0/1/1/1:4:109,560:0.82: 2.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:245,236:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,233:0.62:-0.74:1.000:0.507 0/0/0/1:4:153,75:0.36:-2.06:1.000:0.636 0/1/1/1:4:67,348:0.82:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:175,319:0.63: 0.47:1.000:0.599 0/1/1/1:4:101,259:0.70:-0.80:1.000:0.983 0/0/1/1:4:163,164:0.51:-1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:274,82:0.28:-0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,201:0.56:-0.84:1.000:0.965 0/1/1/1:4:107,470:0.79: 1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,464:0.81: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,264:0.57: 0.11:1.000:0.935 0/1/1/1:4:128,225:0.63:-0.87:1.000:0.502 0/1/1/1:4:154,360:0.68: 0.66:1.000:0.956 0/1/1/1:4:187,421:0.67: 1.56:1.000:0.935 0/1/1/1:4:178,374:0.66: 1.02:1.000:0.873 0/1/1/1:4:78,227:0.72:-1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,284:0.82:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:272,351:0.56: 1.70:1.000:0.967 0/0/0/1:4:366,113:0.29: 0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:221,202:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,189:0.51:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,208:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,238:0.60:-0.53:1.000:0.764 0/1/1/1:4:103,441:0.79: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,247:0.72:-1.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:110,296:0.71:-0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:110,177:0.61:-1.50:1.000:0.721 0/0/1/1:4:253,307:0.55: 1.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:196,319:0.61: 0.67:1.000:0.696 0/0/0/1:4:436,216:0.37: 1.97:1.000:0.612 0/0/1/1:4:205,157:0.45:-0.78:1.000:0.980 0/1/1/1:4:73,374:0.82: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:315,186:0.40: 0.54:1.000:0.782 0/1/1/1:4:80,248:0.73:-1.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:81,242:0.72:-1.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,254:0.72:-0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:178,299:0.62: 0.31:1.000:0.619 0/0/1/1:4:90,131:0.59:-2.12:1.000:0.886 0/0/0/1:4:254,64:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,140:0.50:-1.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,176:0.50:-0.80:0.999:0.997 0/0/1/1:4:198,295:0.59: 0.46:1.000:0.857 0/1/1/1:4:76,302:0.77:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,127:0.48:-1.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,194:0.60:-1.19:1.000:0.793 0/1/1/1:4:67,415:0.84: 0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:152,273:0.63:-0.18:1.000:0.560 0/0/1/1:4:177,162:0.49:-1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,264:0.82:-1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:334,172:0.37: 0.59:1.000:0.519 0/0/1/1:4:227,370:0.61: 1.45:1.000:0.692 0/1/1/1:4:82,292:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:118,289:0.69:-0.36:1.000:0.972 0/0/1/1:4:183,177:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:352,200:0.39: 1.02:1.000:0.710 0/1/1/1:4:219,397:0.63: 1.63:1.000:0.585 0/0/1/1:4:131,119:0.48:-1.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:103,315:0.73:-0.25:1.000:0.997 -chr3.1 89746248 chr3.1_089746248 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:338,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:254,88:.: 0.74:1.000:. ./.:4:243,76:.: 0.41:1.000:. ./.:4:300,84:.: 1.34:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:47,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:94,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:272,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:234,63:.: 0.09:1.000:. ./.:4:262,86:.: 0.82:1.000:. ./.:4:228,76:.: 0.19:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:244,82:.: 0.51:0.998:. ./.:4:299,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:380,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:69,19:.:-2.90:1.000:. ./.:4:233,79:.: 0.31:1.000:. ./.:4:375,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:283,77:.: 1.00:1.000:. ./.:4:224,68:.: 0.02:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:268,86:.: 0.91:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:242,94:.: 0.65:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.24:1.000:. ./.:3:33,0:.:-3.69:1.000:. ./.:4:123,100:.:-0.97:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:240,57:.: 0.09:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:270,77:.: 0.81:1.000:. ./.:4:251,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:345,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:287,101:.: 1.40:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:264,77:.: 0.72:1.000:. ./.:4:94,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:220,71:.: 0.01:1.000:. ./.:4:220,78:.: 0.11:1.000:. ./.:4:212,68:.:-0.15:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:180,46:.:-0.92:1.000:. ./.:4:251,94:.: 0.78:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:198,59:.:-0.48:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:172,56:.:-0.89:1.000:. ./.:4:265,76:.: 0.72:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:300,78:.: 1.25:1.000:. ./.:4:267,93:.: 1.00:1.000:. ./.:4:223,77:.: 0.14:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:227,71:.: 0.11:1.000:. ./.:4:265,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:291,101:.: 1.45:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:320,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:193,64:.:-0.48:1.000:. ./.:4:266,78:.: 0.77:1.000:. ./.:4:213,66:.:-0.16:1.000:. ./.:4:253,75:.: 0.54:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:261,69:.: 0.57:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:160,59:.:-1.02:1.000:. ./.:6:362,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:182,46:.:-0.89:1.000:. ./.:4:218,71:.:-0.02:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:196,52:.:-0.61:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:187,67:.:-0.52:1.000:. ./.:4:271,87:.: 0.97:1.000:. ./.:4:169,47:.:-1.07:1.000:. ./.:4:222,86:.: 0.25:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:341,2:.: 0.75:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:161,44:.:-1.22:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:187,62:.:-0.59:1.000:. ./.:4:235,83:.: 0.39:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:280,92:.: 1.17:1.000:. ./.:4:220,78:.: 0.11:0.999:. ./.:4:247,81:.: 0.54:1.000:. ./.:4:259,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:162,64:.:-0.92:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:232,49:.:-0.14:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:223,67:.:-0.01:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:249,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:216,77:.: 0.04:1.000:. ./.:4:238,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:226,74:.: 0.14:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:173,55:.:-0.89:1.000:. ./.:4:201,68:.:-0.31:1.000:. ./.:4:209,59:.:-0.32:1.000:. ./.:4:155,43:.:-1.32:1.000:. ./.:4:173,39:.:-1.12:1.000:. ./.:4:174,60:.:-0.81:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:202,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:209,59:.:-0.32:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:284,75:.: 0.98:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:185,73:.:-0.46:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:352,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:246,66:.: 0.31:1.000:. ./.:4:306,85:.: 1.44:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:187,51:.:-0.75:1.000:. ./.:4:276,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:250,80:.: 0.57:1.000:. ./.:4:205,61:.:-0.35:1.000:. ./.:4:228,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:194,57:.:-0.56:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.56:0.999:. ./.:4:248,60:.: 0.25:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:166,54:.:-1.01:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,117:.:-0.75:1.000:. ./.:4:205,76:.:-0.14:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:291,82:.: 1.18:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,42:.:-0.67:1.000:. ./.:4:233,70:.: 0.18:1.000:. ./.:4:262,74:.: 0.65:1.000:. ./.:4:271,94:.: 1.07:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.17:1.000:. -chr3.1 89830276 chr3.1_089830276 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,54:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,40:.:-0.06:1.000:. ./.:4:95,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:53,97:.:-0.09:1.000:. ./.:4:89,105:.: 1.11:1.000:. ./.:4:98,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:67,28:.:-1.58:1.000:. ./.:4:100,43:.:-0.28:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:42,14:.:-2.64:1.000:. ./.:4:49,17:.:-2.37:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:98,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:102,91:.: 1.08:1.000:. ./.:4:136,33:.: 0.43:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:147,59:.: 1.43:0.998:. ./.:4:126,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:142,57:.: 1.24:1.000:. ./.:4:36,37:.:-2.18:1.000:. ./.:4:50,84:.:-0.52:1.000:. ./.:4:167,43:.: 1.54:1.000:. ./.:4:120,37:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:98,51:.:-0.11:1.000:. ./.:4:137,42:.: 0.70:1.000:. ./.:4:111,46:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,112:.: 1.73:1.000:. ./.:4:104,52:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,64:.: 0.81:1.000:. ./.:4:121,26:.:-0.17:1.000:. ./.:4:50,7:.:-2.61:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.37:1.000:. ./.:3:61,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:50,90:.:-0.36:1.000:. ./.:4:130,50:.: 0.73:1.000:. ./.:4:85,93:.: 0.67:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:109,46:.: 0.05:1.000:. ./.:4:94,41:.:-0.49:1.000:. ./.:4:127,31:.: 0.13:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:104,42:.:-0.20:1.000:. ./.:4:72,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,116:.: 0.81:1.000:. ./.:4:32,11:.:-2.99:1.000:. ./.:4:42,68:.:-1.17:1.000:. ./.:4:76,30:.:-1.28:1.000:. ./.:4:117,33:.:-0.09:1.000:. ./.:4:115,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:124,45:.: 0.43:1.000:. ./.:4:118,51:.: 0.43:1.000:. ./.:4:73,37:.:-1.17:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:60,85:.:-0.22:1.000:. ./.:4:100,36:.:-0.47:1.000:. ./.:4:158,1:.: 0.16:1.000:. ./.:6:45,74:.:-0.93:1.000:. ./.:4:56,96:.:-0.03:1.000:. ./.:4:108,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:133,51:.: 0.83:1.000:. ./.:4:97,87:.: 0.83:1.000:. ./.:4:65,99:.: 0.29:1.000:. ./.:4:96,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:126,47:.: 0.54:1.000:. ./.:4:56,108:.: 0.29:1.000:. ./.:4:56,93:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:106,47:.:-0.01:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:63,76:.:-0.39:1.000:. ./.:4:97,52:.:-0.11:1.000:. ./.:4:127,44:.: 0.48:1.000:. ./.:4:58,98:.: 0.07:1.000:. ./.:4:90,41:.:-0.60:0.999:. ./.:4:154,41:.: 1.13:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:102,43:.:-0.22:1.000:. ./.:6:133,38:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,58:.: 0.24:1.000:. ./.:4:68,61:.:-0.66:1.000:. ./.:4:82,80:.: 0.24:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,36:.:-0.58:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,48:.: 0.40:1.000:. ./.:4:102,99:.: 1.30:1.000:. ./.:4:45,51:.:-1.55:1.000:. ./.:4:118,52:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:91,34:.:-0.77:1.000:. ./.:4:126,41:.: 0.37:1.000:. ./.:4:155,56:.: 1.57:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:118,34:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,63:.: 0.81:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:98,42:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,46:.:-0.55:1.000:. ./.:4:92,74:.: 0.35:1.000:. ./.:4:148,46:.: 1.11:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,125:.: 2.38:1.000:. ./.:4:167,38:.: 1.40:0.999:. ./.:4:104,84:.: 0.94:1.000:. ./.:4:76,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:54,94:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,42:.:-0.30:1.000:. ./.:4:79,89:.: 0.40:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:80,77:.: 0.10:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:148,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:101,53:.: 0.02:1.000:. ./.:4:92,39:.:-0.60:1.000:. ./.:4:110,45:.: 0.05:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:102,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:93,32:.:-0.77:1.000:. ./.:4:106,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:49,78:.:-0.71:1.000:. ./.:4:99,85:.: 0.83:1.000:. ./.:4:66,34:.:-1.44:1.000:. ./.:4:41,60:.:-1.42:1.000:. ./.:4:69,93:.: 0.24:1.000:. ./.:4:251,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:89,83:.: 0.51:1.000:. ./.:4:110,39:.:-0.11:1.000:. ./.:4:127,30:.: 0.10:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:122,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:100,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:243,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:58,112:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,59:.: 0.21:1.000:. ./.:4:81,46:.:-0.71:1.000:. ./.:4:137,52:.: 0.97:1.000:. ./.:4:94,36:.:-0.63:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:121,25:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:157,60:.: 1.73:1.000:. ./.:4:143,40:.: 0.81:1.000:. ./.:4:164,42:.: 1.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:66,78:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:146,46:.: 1.05:1.000:. ./.:4:114,49:.: 0.26:1.000:. ./.:4:32,81:.:-1.09:1.000:. ./.:4:53,73:.:-0.74:1.000:. ./.:4:93,105:.: 1.21:1.000:. ./.:4:59,60:.:-0.93:0.999:. ./.:4:109,43:.:-0.03:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:109,47:.: 0.07:1.000:. ./.:4:80,35:.:-1.04:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,81:.: 0.86:1.000:. ./.:4:77,71:.:-0.14:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:122,51:.: 0.54:1.000:. ./.:4:137,31:.: 0.40:1.000:. ./.:4:121,47:.: 0.40:1.000:. ./.:4:113,91:.: 1.38:1.000:. ./.:4:122,51:.: 0.54:1.000:. ./.:4:146,55:.: 1.30:1.000:. ./.:4:87,35:.:-0.85:1.000:. ./.:4:114,45:.: 0.16:1.000:. -chr3.1 89970853 chr3.1_089970853 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:174,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:122,47:.: 0.78:1.000:. ./.:4:110,44:.: 0.43:1.000:. ./.:4:125,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:121,40:.: 0.60:1.000:. ./.:4:134,30:.: 0.67:1.000:. ./.:4:142,31:.: 0.88:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:125,51:.: 0.95:0.998:. ./.:4:78,90:.: 0.76:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:20,5:.:-2.56:1.000:. ./.:4:120,35:.: 0.46:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:123,48:.: 0.83:1.000:. ./.:4:157,50:.: 1.67:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:108,42:.: 0.34:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:125,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.84:1.000:. ./.:3:9,1:.:-2.91:1.000:. ./.:4:68,74:.: 0.16:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:127,30:.: 0.50:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:135,48:.: 1.11:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:99,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:129,56:.: 1.15:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:107,31:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,32:.:-0.24:1.000:. ./.:4:68,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:81,29:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,39:.: 0.34:1.000:. ./.:4:142,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:153,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:96,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.06:1.000:. ./.:6:74,12:.:-1.14:1.000:. ./.:4:88,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:92,34:.:-0.22:1.000:. ./.:4:122,47:.: 0.78:1.000:. ./.:4:113,19:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:97,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:77,20:.:-0.89:1.000:. ./.:4:68,24:.:-1.01:1.000:. ./.:4:115,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.02:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:85,28:.:-0.52:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:80,25:.:-0.70:1.000:. ./.:6:157,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:68,21:.:-1.07:1.000:. ./.:4:67,18:.:-1.17:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:93,44:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:82,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:93,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:81,17:.:-0.87:1.000:. ./.:4:106,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:47,19:.:-1.61:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:86,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:125,46:.: 0.83:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:173,51:.: 2.06:1.000:. ./.:4:79,15:.:-0.96:0.999:. ./.:4:108,37:.: 0.23:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:58,25:.:-1.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:76,32:.:-0.63:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:82,15:.:-0.89:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:97,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:164,59:.: 2.04:1.000:. ./.:4:75,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:90,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:45,19:.:-1.66:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:122,46:.: 0.76:1.000:. ./.:4:55,17:.:-1.47:1.000:. ./.:4:106,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:87,34:.:-0.33:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,19:.:-1.33:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:66,18:.:-1.19:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:149,48:.: 1.43:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:82,37:.:-0.38:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:119,29:.: 0.30:1.000:. ./.:4:141,54:.: 1.39:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:128,31:.: 0.55:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:137,38:.: 0.92:1.000:. ./.:4:138,46:.: 1.13:1.000:. ./.:4:120,35:.: 0.46:1.000:. ./.:4:97,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.57:0.999:. ./.:4:96,44:.: 0.11:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:117,33:.: 0.34:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:69,49:.:-0.40:1.000:. ./.:4:87,26:.:-0.52:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:107,37:.: 0.20:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:121,34:.: 0.46:1.000:. ./.:4:114,41:.: 0.46:1.000:. ./.:4:159,57:.: 1.87:1.000:. ./.:4:167,57:.: 2.06:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.43:1.000:. -chr3.1 90153084 chr3.1_090153084 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:133,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:109,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:137,50:.: 1.25:1.000:. ./.:4:104,52:.: 0.33:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:65,1:.:-2.34:1.000:. ./.:4:49,6:.:-2.67:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:114,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:117,40:.: 0.36:1.000:. ./.:4:73,62:.:-0.30:1.000:. ./.:4:146,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:78,57:.:-0.30:0.998:. ./.:4:136,27:.: 0.54:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:42,34:.:-2.05:1.000:. ./.:4:93,41:.:-0.33:1.000:. ./.:4:147,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:45,7:.:-2.76:1.000:. ./.:4:77,45:.:-0.68:1.000:. ./.:4:164,38:.: 1.69:1.000:. ./.:4:110,26:.:-0.27:1.000:. ./.:4:134,28:.: 0.51:1.000:. ./.:4:144,14:.: 0.39:1.000:. ./.:4:95,56:.: 0.18:1.000:. ./.:4:133,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,10:.:-3.09:1.000:. ./.:4:66,7:.:-2.14:1.000:. ./.:3:30,10:.:-3.12:1.000:. ./.:4:79,77:.: 0.33:1.000:. ./.:4:125,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:94,57:.: 0.18:1.000:. ./.:4:86,13:.:-1.36:1.000:. ./.:4:127,37:.: 0.57:1.000:. ./.:4:133,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:129,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:119,33:.: 0.21:1.000:. ./.:4:142,19:.: 0.48:1.000:. ./.:4:157,40:.: 1.54:1.000:. ./.:4:92,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.24:1.000:. ./.:4:95,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:95,20:.:-0.89:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:92,59:.: 0.18:1.000:. ./.:4:151,49:.: 1.63:1.000:. ./.:4:130,13:.:-0.06:1.000:. ./.:4:147,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:133,38:.: 0.77:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.39:1.000:. ./.:6:89,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:138,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:119,24:.:-0.06:1.000:. ./.:4:105,22:.:-0.53:1.000:. ./.:4:151,40:.: 1.37:1.000:. ./.:4:137,40:.: 0.95:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:128,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:60,49:.:-1.07:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:74,76:.: 0.15:1.000:. ./.:4:57,4:.:-2.49:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:80,51:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,48:.:-0.27:1.000:. ./.:4:136,40:.: 0.92:1.000:. ./.:4:97,78:.: 0.89:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:102,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:137,19:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,26:.:-0.15:1.000:. ./.:6:188,23:.: 1.96:1.000:. ./.:4:135,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:63,43:.:-1.16:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.59:1.000:. ./.:4:101,14:.:-0.89:1.000:. ./.:4:120,34:.: 0.27:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:72,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:147,32:.: 1.01:1.000:. ./.:4:70,54:.:-0.62:1.000:. ./.:4:121,35:.: 0.33:1.000:. ./.:4:122,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:101,21:.:-0.68:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:127,16:.:-0.06:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:97,13:.:-1.04:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:103,17:.:-0.74:1.000:. ./.:4:128,19:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:131,41:.: 0.80:1.000:. ./.:4:156,23:.: 1.01:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:127,17:.:-0.03:1.000:. ./.:4:80,78:.: 0.39:1.000:. ./.:4:120,41:.: 0.48:0.999:. ./.:4:123,31:.: 0.27:1.000:. ./.:4:93,16:.:-1.07:1.000:. ./.:4:85,27:.:-0.98:1.000:. ./.:4:106,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:70,50:.:-0.74:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:111,36:.: 0.06:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:112,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:131,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,61:.: 0.15:1.000:. ./.:4:77,51:.:-0.50:1.000:. ./.:4:127,19:.: 0.03:1.000:. ./.:4:108,36:.:-0.03:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:51,38:.:-1.66:1.000:. ./.:4:79,58:.:-0.24:1.000:. ./.:4:96,44:.:-0.15:1.000:. ./.:4:84,17:.:-1.31:1.000:. ./.:4:133,25:.: 0.39:1.000:. ./.:4:123,34:.: 0.36:1.000:. ./.:4:148,18:.: 0.62:1.000:. ./.:4:126,23:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,38:.:-0.24:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,43:.:-0.59:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:143,8:.: 0.18:1.000:. ./.:4:107,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:91,19:.:-1.04:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:161,49:.: 1.93:1.000:. ./.:4:144,18:.: 0.51:1.000:. ./.:4:158,19:.: 0.95:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:80,46:.:-0.56:1.000:. ./.:4:152,12:.: 0.57:1.000:. ./.:4:126,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:101,13:.:-0.92:1.000:. ./.:4:136,15:.: 0.18:1.000:. ./.:4:123,46:.: 0.71:1.000:. ./.:4:149,42:.: 1.37:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:109,15:.:-0.62:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:94,55:.: 0.12:1.000:. ./.:4:120,7:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,8:.:-0.44:1.000:. ./.:4:92,53:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,54:.:-0.09:1.000:. ./.:4:117,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:110,23:.:-0.36:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:84,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:91,10:.:-1.31:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,39:.:-1.04:1.000:. ./.:4:96,8:.:-1.22:1.000:. ./.:4:80,67:.: 0.06:1.000:. ./.:4:90,25:.:-0.89:1.000:. ./.:4:112,13:.:-0.59:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:74,56:.:-0.44:1.000:. ./.:4:146,18:.: 0.57:1.000:. ./.:4:109,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:136,34:.: 0.74:1.000:. ./.:4:165,47:.: 1.99:1.000:. ./.:4:105,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:97,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.84:1.000:. -chr3.1 90535510 chr3.1_090535510 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:477,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:294,106:.:-0.76:1.000:. ./.:4:349,118:.: 0.02:1.000:. ./.:4:353,104:.:-0.10:1.000:. ./.:4:416,138:.: 1.03:1.000:. ./.:4:552,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:376,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:250,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:254,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:234,226:.:-0.06:1.000:. ./.:4:348,109:.:-0.10:1.000:. ./.:4:259,240:.: 0.39:1.000:. ./.:4:204,238:.:-0.27:1.000:. ./.:4:355,111:.: 0.01:1.000:. ./.:4:262,269:.: 0.76:0.998:. ./.:4:264,283:.: 0.95:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:176,85:.:-2.37:1.000:. ./.:4:350,96:.:-0.23:1.000:. ./.:4:551,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:340,119:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,45:.:-3.38:1.000:. ./.:4:260,288:.: 0.96:1.000:. ./.:4:250,220:.: 0.05:1.000:. ./.:4:317,111:.:-0.44:1.000:. ./.:4:412,143:.: 1.04:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:402,128:.: 0.75:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:138,0:.:-3.80:1.000:. ./.:4:303,2:.:-1.86:1.000:. ./.:3:139,0:.:-3.79:1.000:. ./.:4:133,384:.: 0.60:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:251,244:.: 0.34:1.000:. ./.:4:379,130:.: 0.50:1.000:. ./.:4:241,290:.: 0.76:1.000:. ./.:4:245,229:.: 0.10:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:423,159:.: 1.35:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:425,137:.: 1.12:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:388,138:.: 0.70:1.000:. ./.:4:710,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:353,125:.: 0.14:1.000:. ./.:4:454,144:.: 1.54:1.000:. ./.:4:213,222:.:-0.35:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:223,225:.:-0.20:1.000:. ./.:4:411,130:.: 0.88:1.000:. ./.:4:368,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:349,111:.:-0.06:1.000:. ./.:4:620,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:394,127:.: 0.64:1.000:. ./.:6:309,113:.:-0.51:1.000:. ./.:4:381,135:.: 0.59:1.000:. ./.:4:362,110:.: 0.07:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:284,247:.: 0.76:1.000:. ./.:4:374,119:.: 0.32:1.000:. ./.:4:344,105:.:-0.19:1.000:. ./.:4:284,78:.:-1.20:1.000:. ./.:4:356,128:.: 0.21:1.000:. ./.:4:301,317:.: 1.77:1.000:. ./.:4:316,122:.:-0.32:1.000:. ./.:4:408,162:.: 1.21:1.000:. ./.:4:271,120:.:-0.87:1.000:. ./.:4:450,131:.: 1.34:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:261,252:.: 0.55:1.000:. ./.:4:345,120:.:-0.01:1.000:. ./.:4:360,124:.: 0.21:1.000:. ./.:4:264,251:.: 0.57:1.000:. ./.:4:229,276:.: 0.46:1.000:. ./.:4:388,136:.: 0.68:1.000:. ./.:4:294,92:.:-0.92:0.999:. ./.:4:289,243:.: 0.77:1.000:. ./.:4:376,123:.: 0.39:1.000:. ./.:4:198,161:.:-1.24:1.000:. ./.:6:621,172:.: 3.80:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:297,86:.:-0.96:1.000:. ./.:4:304,114:.:-0.55:1.000:. ./.:4:312,137:.:-0.19:1.000:. ./.:4:239,241:.: 0.17:1.000:. ./.:4:304,127:.:-0.40:1.000:. ./.:4:210,217:.:-0.45:1.000:. ./.:4:289,243:.: 0.77:1.000:. ./.:4:237,92:.:-1.59:1.000:. ./.:4:371,135:.: 0.47:1.000:. ./.:4:374,129:.: 0.43:1.000:. ./.:4:319,121:.:-0.30:1.000:. ./.:4:309,110:.:-0.54:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:438,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:293,97:.:-0.88:1.000:. ./.:4:389,124:.: 0.55:1.000:. ./.:4:185,178:.:-1.19:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:388,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:325,123:.:-0.20:1.000:. ./.:4:212,237:.:-0.19:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:359,139:.: 0.38:1.000:. ./.:4:451,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:479,159:.: 2.00:1.000:. ./.:4:254,258:.: 0.54:0.999:. ./.:4:348,127:.: 0.11:1.000:. ./.:4:272,95:.:-1.14:1.000:. ./.:4:243,113:.:-1.27:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:212,239:.:-0.17:1.000:. ./.:4:325,131:.:-0.11:1.000:. ./.:4:338,125:.:-0.03:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:332,96:.:-0.44:1.000:. ./.:4:233,247:.: 0.17:1.000:. ./.:4:388,108:.: 0.35:1.000:. ./.:4:388,117:.: 0.46:1.000:. ./.:4:371,145:.: 0.59:1.000:. ./.:4:213,211:.:-0.48:1.000:. ./.:4:216,207:.:-0.49:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:206,189:.:-0.82:1.000:. ./.:4:355,116:.: 0.06:1.000:. ./.:4:301,81:.:-0.97:1.000:. ./.:4:279,87:.:-1.16:1.000:. ./.:4:358,123:.: 0.18:1.000:. ./.:4:279,104:.:-0.96:1.000:. ./.:4:477,146:.: 1.83:1.000:. ./.:4:373,110:.: 0.20:1.000:. ./.:4:247,197:.:-0.25:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:248,205:.:-0.15:1.000:. ./.:4:359,138:.: 0.36:1.000:. ./.:4:338,132:.: 0.05:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:301,101:.:-0.74:1.000:. ./.:4:419,128:.: 0.95:1.000:. ./.:4:394,141:.: 0.81:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:510,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:225,195:.:-0.53:1.000:. ./.:4:424,130:.: 1.03:1.000:. ./.:4:311,110:.:-0.52:1.000:. ./.:4:197,66:.:-2.35:1.000:. ./.:4:253,89:.:-1.43:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:258,250:.: 0.49:1.000:. ./.:4:266,279:.: 0.92:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:296,82:.:-1.02:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:214,223:.:-0.33:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:314,137:.:-0.17:1.000:. ./.:4:330,121:.:-0.17:1.000:. ./.:4:364,116:.: 0.17:1.000:. ./.:4:325,124:.:-0.19:1.000:. ./.:4:227,236:.:-0.03:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:220,210:.:-0.41:1.000:. ./.:4:340,109:.:-0.19:1.000:. ./.:4:292,127:.:-0.54:1.000:. ./.:4:299,96:.:-0.82:1.000:. ./.:4:333,118:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,300:.:-0.74:1.000:. ./.:4:198,236:.:-0.37:1.000:. ./.:4:280,86:.:-1.16:1.000:. ./.:4:582,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:393,153:.: 0.93:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:252,161:.:-0.61:1.000:. ./.:4:407,129:.: 0.82:1.000:. ./.:4:265,295:.: 1.10:1.000:. ./.:4:284,264:.: 0.96:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:322,113:.:-0.35:1.000:. -chr3.1 90583093 chr3.1_090583093 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,19:0.29: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,19:0.37:-0.38:1.000:0.588 0/0/0/1:4:35,19:0.28: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:58,26:0.24: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,38:0.72:-0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:25,19:0.37:-0.38:1.000:0.588 0/0/1/1:4:31,34:0.47: 0.72:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,35:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,29:0.28: 1.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,50:0.50: 2.04:0.998:0.997 1/1/1/1:4:0,76:1.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.60:-2.53:1.000:0.766 0/0/1/1:4:28,22:0.38:-0.06:1.000:0.528 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,13:0.21:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.60:-2.53:1.000:0.766 0/1/1/1:4:19,53:0.67: 1.09:1.000:0.908 0/0/1/1:4:41,55:0.52: 2.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,21:0.20: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,25:0.25: 1.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,25:0.31: 0.78:1.000:0.971 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.32:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-2.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.43: 1.57:1.000:0.956 0/0/0/1:4:45,22:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,42:0.62: 0.51:1.000:0.530 0/1/1/1:4:9,43:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,17:0.19: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,26:0.41: 0.20:1.000:0.874 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,27:0.45: 0.09:1.000:0.981 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,24:0.45:-0.22:1.000:0.982 0/0/0/1:4:27,11:0.23:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,36:0.58: 0.25:1.000:0.911 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,44:0.53: 1.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:44,28:0.32: 1.09:1.000:0.947 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,27:0.30: 1.20:1.000:0.988 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,17:0.40:-0.75:1.000:0.769 0/0/0/0/0/1:6:23,5:0.14:-1.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,14:0.26:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:49,20:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,33:0.55: 0.15:1.000:0.978 0/0/0/1:4:36,28:0.37: 0.67:1.000:0.508 0/0/0/1:4:28,20:0.35:-0.17:1.000:0.774 0/0/1/1:4:7,8:0.48:-1.90:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,20:0.20: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,36:0.58: 0.25:1.000:0.911 0/0/0/1:4:30,21:0.35:-0.01:1.000:0.820 0/0/0/1:4:27,21:0.37:-0.17:1.000:0.508 0/0/0/1:4:12,8:0.33:-1.64:1.000:0.902 0/0/1/1:4:26,21:0.38:-0.22:1.000:0.622 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,28:0.60:-0.48:1.000:0.766 0/0/0/1:4:20,14:0.35:-0.90:1.000:0.820 0/0/1/1:4:21,20:0.43:-0.54:1.000:0.941 0/1/1/1:4:13,36:0.67:-0.12:1.000:0.902 0/1/1/1:4:13,49:0.72: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,23:0.34: 0.30:1.000:0.881 0/0/0/1:4:34,16:0.25:-0.06:0.999:0.999 0/0/1/1:4:26,40:0.55: 0.78:1.000:0.983 0/0/0/1:4:43,25:0.30: 0.88:1.000:0.985 0/0/1/1:4:37,40:0.46: 1.36:1.000:0.988 0/0/0/0/1/1:6:38,19:0.26: 0.30:1.000:0.618 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,17:0.29:-0.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:30,14:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,39:0.60: 0.41:1.000:0.811 0/0/0/1:4:39,12:0.18:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,29:0.38: 0.72:1.000:0.613 0/1/1/1:4:23,53:0.63: 1.30:1.000:0.579 0/0/0/1:4:32,23:0.35: 0.20:1.000:0.758 0/0/0/1:4:29,10:0.20:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,12:0.42:-1.38:1.000:0.912 0/0/0/1:4:33,15:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,20:0.53:-0.90:1.000:0.992 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,5:0.35:-2.06:1.000:0.774 0/0/1/1:4:25,23:0.42:-0.17:1.000:0.908 0/0/1/1:4:19,24:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,26:0.39: 0.36:1.000:0.641 0/0/1/1:4:21,43:0.61: 0.67:1.000:0.717 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,24:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,15:0.16: 1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,29:0.51:-0.01:0.999:0.996 0/0/0/1:4:37,24:0.33: 0.51:1.000:0.932 0/0/1/1:4:16,23:0.53:-0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:27,18:0.33:-0.33:1.000:0.902 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,25:0.55:-0.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:19,17:0.41:-0.80:1.000:0.871 0/0/0/1:4:29,13:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,14:0.36:-0.96:1.000:0.688 0/1/1/1:4:11,32:0.67:-0.43:1.000:0.938 0/0/1/1:4:23,24:0.45:-0.22:1.000:0.982 0/0/0/1:4:26,9:0.20:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,25:0.33: 0.62:1.000:0.917 0/0/1/1:4:16,32:0.60:-0.17:1.000:0.766 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,17:0.41:-0.80:1.000:0.871 0/0/0/1:4:30,17:0.29:-0.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:47,14:0.18: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,16:0.58:-1.38:1.000:0.921 0/0/1/1:4:34,30:0.41: 0.67:1.000:0.848 0/0/0/1:4:62,21:0.20: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,32:0.30: 1.83:1.000:0.981 0/0/0/1:4:44,23:0.27: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,27:0.57:-0.43:1.000:0.954 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,31:0.61:-0.27:1.000:0.697 0/0/0/1:4:43,18:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,15:0.33:-0.69:1.000:0.926 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,14:0.31:-0.75:1.000:0.972 0/0/0/1:4:55,26:0.25: 1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,23:0.34: 0.30:1.000:0.881 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,43:0.60: 0.72:1.000:0.807 0/0/0/1:4:52,33:0.32: 1.78:1.000:0.949 0/0/0/1:4:39,28:0.35: 0.83:1.000:0.761 0/0/0/1:4:5,2:0.22:-2.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,11:0.24:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,49:0.59: 1.25:1.000:0.861 0/1/1/1:4:10,47:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,19:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,41:0.54: 0.88:1.000:0.985 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,9:0.12: 0.30:1.000:0.820 0/0/1/1:4:32,25:0.38: 0.30:1.000:0.508 0/0/0/1:4:47,23:0.26: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,22:0.44:-0.38:1.000:0.968 0/1/1/1:4:12,27:0.63:-0.64:1.000:0.517 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.43:0.999:1.000 0/1/1/1:4:16,39:0.64: 0.20:1.000:0.712 0/0/0/1:4:39,17:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,20:0.28: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,19:0.35:-0.27:1.000:0.809 0/0/0/1:4:34,15:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,65:0.79: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,26:0.46:-0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:44,12:0.17: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,24:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,34:0.57: 0.15:1.000:0.950 0/0/0/1:4:49,17:0.20: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,49:0.68: 0.72:1.000:0.962 0/1/1/1:4:10,46:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,18:0.32:-0.22:1.000:0.963 -chr3.1 90757623 chr3.1_090757623 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:97,48:0.33: 0.63:1.000:0.908 0/0/1/1:4:71,51:0.41:-0.03:1.000:0.876 0/0/0/1:4:111,40:0.27: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,49:0.46:-0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,81:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:102,30:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,13:0.19:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,24:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,2:0.12:-3.03:1.000:0.812 0/0/0/0:4:10,1:0.09:-3.21:1.000:0.896 0/0/1/1:4:72,66:0.47: 0.43:1.000:0.991 0/0/0/1:4:90,31:0.26:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,90:0.67: 0.17:1.000:0.938 0/0/1/1:4:68,75:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,45:0.30: 0.77:1.000:0.981 0/0/1/1:4:89,102:0.52: 1.94:0.998:0.995 0/0/1/1:4:57,72:0.54: 0.17:1.000:0.987 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,28:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.57:-2.83:1.000:0.957 0/0/1/1:4:81,66:0.44: 0.68:1.000:0.967 0/0/0/1:4:105,25:0.20: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,62:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,4:0.27:-3.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,85:0.55: 0.74:1.000:0.976 0/0/1/1:4:62,66:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,67:0.55:-0.15:1.000:0.979 0/0/1/1:4:58,58:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,29:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,63:0.33: 2.05:1.000:0.937 0/0/0/1:4:108,30:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-3.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,2:0.08:-2.81:1.000:0.980 0/0/0:3:8,0:0.00:-3.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,112:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,29:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,88:0.47: 1.74:1.000:0.991 0/0/0/1:4:113,34:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,90:0.48: 1.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,81:0.55: 0.54:1.000:0.976 0/0/0/1:4:109,24:0.19: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,29:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,28:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,65:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,72:0.47: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/0:4:26,1:0.04:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,54:0.44:-0.09:1.000:0.969 0/0/0/1:4:80,37:0.32:-0.18:1.000:0.955 0/0/1/1:4:47,50:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:100,38:0.28: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,79:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,39:0.29: 0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:88,30:0.26:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,60:0.46: 0.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:106,22:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,38:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:42,69:0.60:-0.35:1.000:0.662 0/0/1/1:4:72,77:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,61:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,21:0.20:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,107:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,56:0.43: 0.17:1.000:0.937 0/0/0/1:4:92,46:0.33: 0.43:1.000:0.898 0/0/0/1:4:48,12:0.21:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,36:0.27: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,82:0.53: 0.74:1.000:0.991 0/1/1/1:4:29,77:0.70:-0.49:1.000:0.987 0/0/1/1:4:65,66:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,18:0.30:-1.78:1.000:0.985 0/0/0/1:4:103,48:0.32: 0.80:1.000:0.951 0/0/0/1:4:103,30:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,59:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,48:0.35: 0.37:1.000:0.766 0/0/1/1:4:48,52:0.51:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,67:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,92:0.54: 1.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:78,88:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,51:0.51:-0.75:0.999:0.996 0/0/1/1:4:64,88:0.56: 0.83:1.000:0.965 0/0/0/1:4:136,32:0.20: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,64:0.51: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:103,62:0.37: 1.20:1.000:0.817 0/0/0/1:4:90,32:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,42:0.42:-0.72:1.000:0.920 0/0/1/1:4:53,38:0.41:-0.92:1.000:0.874 0/0/0/1:4:83,27:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,82:0.53: 0.74:1.000:0.991 0/0/0/1:4:64,29:0.32:-0.86:1.000:0.964 0/0/1/1:4:55,71:0.55: 0.08:1.000:0.983 0/1/1/1:4:32,124:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,41:0.46:-1.03:1.000:0.988 0/0/0/1:4:122,57:0.32: 1.60:1.000:0.950 0/0/0/1:4:103,33:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,26:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,51:0.44:-0.29:1.000:0.971 0/0/0/1:4:86,21:0.20:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,26:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,23:0.36:-1.69:1.000:0.704 0/0/0/1:4:92,36:0.29: 0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,52:0.47:-0.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:80,14:0.16:-0.83:1.000:0.993 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,33:0.28: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,32:0.29:-0.32:1.000:0.991 0/1/1/1:4:38,109:0.72: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:116,24:0.18: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,40:0.31: 0.17:1.000:0.967 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,79:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,67:0.48: 0.37:0.999:0.995 0/0/1/1:4:70,68:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:66,31:0.32:-0.75:1.000:0.947 0/1/1/1:4:32,62:0.64:-0.83:1.000:0.669 0/0/0/1:4:60,14:0.20:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,89:0.79:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,25:0.25:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,47:0.45:-0.60:1.000:0.981 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,34:0.35:-0.75:1.000:0.787 0/0/1/1:4:69,79:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:124,38:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,37:0.35:-0.52:1.000:0.771 0/0/0/1:4:84,28:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,71:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,55:0.47:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:80,25:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,41:0.43:-0.86:1.000:0.953 0/0/1/1:4:36,58:0.60:-0.83:1.000:0.810 0/0/1/1:4:87,62:0.41: 0.74:1.000:0.866 0/0/0/1:4:69,21:0.24:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,49:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,67:0.45: 0.68:1.000:0.976 0/0/0/1:4:157,45:0.23: 2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,45:0.29: 0.97:1.000:0.990 0/1/1/1:4:23,81:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,24:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,53:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,30:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,28:0.29:-0.72:1.000:0.991 0/0/0/1:4:108,14:0.12:-0.03:1.000:0.752 0/0/1/1:4:41,38:0.47:-1.26:1.000:0.992 0/0/0/1:4:106,40:0.28: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,75:0.48: 0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:108,27:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,24:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,30:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,64:0.45: 0.48:1.000:0.977 0/0/0/1:4:136,41:0.24: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,71:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:20,3:0.14:-2.86:1.000:0.950 0/0/0/1:4:74,19:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,60:0.43: 0.40:1.000:0.947 0/0/1/1:4:52,71:0.56: 0.00:1.000:0.968 0/0/0/1:4:117,20:0.15: 0.40:1.000:0.990 0/0/0/1:4:85,31:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,77:0.70:-0.49:1.000:0.987 0/0/0/1:4:84,31:0.28:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,51:0.41: 0.02:1.000:0.837 0/0/0/1:4:102,40:0.29: 0.54:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,123:0.73: 1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,70:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,99:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:124,14:0.11: 0.43:0.999:0.651 0/0/1/1:4:67,67:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,33:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,43:0.41:-0.58:1.000:0.873 0/0/0/1:4:80,30:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:102,26:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,114:0.71: 0.91:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,113:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,35:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,46:0.30: 0.88:1.000:0.982 0/0/0/1:4:106,33:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,68:0.47: 0.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,66:0.45: 0.63:1.000:0.975 0/0/1/1:4:72,93:0.55: 1.20:1.000:0.983 0/0/1/1:4:64,89:0.56: 0.85:1.000:0.960 0/0/0/1:4:70,19:0.22:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,53:0.45:-0.26:1.000:0.984 -chr3.1 91189551 chr3.1_091189551 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:10,33:0.71: 0.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:32,8:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,17:0.44:-0.16:1.000:0.968 0/0/1/1:4:18,22:0.52:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,39:0.56: 1.77:1.000:0.968 0/1/1/1:4:10,45:0.75: 1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,36:0.81: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,28:0.59: 0.33:1.000:0.885 0/0/1/1:4:8,10:0.53:-1.53:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,6:0.81:-2.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,8:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,23:0.60:-0.29:1.000:0.788 0/0/0/1:4:36,11:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,31:0.56: 0.81:1.000:0.960 0/0/1/1:4:25,15:0.38:-0.02:0.998:0.596 0/0/0/1:4:38,17:0.33: 1.01:1.000:0.926 0/0/1/1:4:27,50:0.61: 2.53:1.000:0.699 0/1/1/1:4:7,58:0.85: 1.70:1.000:0.981 0/0/1/1:4:6,10:0.59:-1.67:1.000:0.872 0/1/1/1:4:11,24:0.64:-0.36:1.000:0.691 0/1/1/1:4:14,54:0.73: 1.91:1.000:0.998 0/1/1/1:4:7,28:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.48:-2.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,10:0.45:-1.26:1.000:0.976 0/0/1/1:4:25,18:0.42: 0.19:1.000:0.903 0/1/1/1:4:9,32:0.72: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,36:0.67: 0.67:1.000:0.918 0/1/1/1:4:4,38:0.87: 0.12:1.000:0.896 0/0/0/1:4:13,6:0.33:-1.47:1.000:0.902 0/1/1/1:4:7,34:0.77: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,10:0.88:-2.02:1.000:0.815 0/0/0:3:3,0:0.00:-2.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,32:0.65: 0.39:1.000:0.780 0/0/1/1:4:30,20:0.40: 0.67:1.000:0.810 0/0/1/1:4:8,7:0.46:-1.74:1.000:0.985 0/0/0/1:4:26,14:0.36:-0.02:1.000:0.666 0/0/1/1:4:22,16:0.42:-0.16:1.000:0.911 0/1/1/1:4:9,37:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,26:0.56: 0.26:1.000:0.968 0/1/1/1:4:7,21:0.69:-0.85:1.000:0.980 0/0/1/1:4:15,27:0.60: 0.12:1.000:0.757 0/0/1/1:4:14,25:0.60:-0.09:1.000:0.771 0/0/1/1:4:32,33:0.49: 1.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,22:0.70:-0.78:1.000:0.987 0/1/1/1:4:7,19:0.68:-0.98:1.000:0.950 0/0/0/1:4:12,6:0.35:-1.53:1.000:0.806 0/0/0/1:4:17,8:0.34:-1.05:1.000:0.883 0/1/1/1:4:10,47:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,18:0.41: 0.26:1.000:0.862 0/0/0/1:4:37,10:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,46:0.73: 1.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,27:0.71:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,32:0.55: 1.01:1.000:0.978 0/1/1/1:4:3,25:0.86:-0.85:1.000:0.979 0/0/1/1:4:14,21:0.57:-0.36:1.000:0.953 0/0/0/1/1/1:6:19,20:0.49:-0.09:1.000:0.887 0/0/1/1:4:23,31:0.55: 0.95:1.000:0.984 0/1/1/1:4:6,31:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,45:0.87: 0.67:1.000:0.945 0/1/1/1:4:5,22:0.75:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,19:0.61:-0.78:1.000:0.642 0/0/1/1:4:20,12:0.38:-0.57:1.000:0.596 0/1/1/1:4:5,13:0.67:-1.53:1.000:0.926 0/1/1/1:4:16,40:0.66: 1.08:1.000:0.895 0/0/0/1:4:15,8:0.36:-1.19:1.000:0.687 0/0/1/1:4:35,34:0.48: 1.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,26:0.56: 0.26:1.000:0.968 0/1/1/1:4:7,19:0.68:-0.98:1.000:0.950 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,44:0.77: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,11:0.41:-0.91:1.000:0.853 0/1/1/1:4:10,23:0.65:-0.50:1.000:0.790 0/0/0/1:4:24,10:0.32:-0.43:1.000:0.961 0/0/1/1:4:31,25:0.44: 1.08:1.000:0.967 0/0/1/1:4:19,20:0.49:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,10:0.37:-0.85:0.999:0.594 0/0/0/1:4:27,14:0.35: 0.05:1.000:0.744 0/0/1/1:4:17,27:0.58: 0.26:1.000:0.918 0/0/1/1:4:24,15:0.39:-0.09:1.000:0.690 0/0/1/1/1/1:6:16,26:0.58: 0.12:1.000:0.508 0/1/1/1:4:5,36:0.84: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,24:0.59:-0.16:1.000:0.837 0/0/1/1:4:10,17:0.59:-0.91:1.000:0.848 0/0/1/1:4:17,19:0.51:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,16:0.35: 0.53:1.000:0.806 0/0/1/1:4:13,22:0.59:-0.36:1.000:0.854 0/0/0/1:4:24,12:0.35:-0.29:1.000:0.806 0/1/1/1:4:13,35:0.68: 0.53:1.000:0.946 0/0/1/1:4:15,16:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,11:0.31:-0.16:1.000:0.969 0/0/1/1:4:16,22:0.55:-0.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:16,28:0.60: 0.26:1.000:0.806 0/0/0/1:4:17,6:0.29:-1.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,44:0.66: 1.50:1.000:0.873 0/1/1/1:4:9,48:0.79: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.67:-1.53:1.000:0.926 0/0/1/1:4:16,15:0.47:-0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:20,11:0.37:-0.64:1.000:0.618 0/1/1/1:4:10,43:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,3:0.24:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,31:0.73:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,7:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,32:0.48: 1.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,56:0.74: 2.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,35:0.62: 0.88:1.000:0.587 0/0/1/1:4:22,28:0.53: 0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,25:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,17:0.38: 0.33:0.999:0.625 0/0/1/1:4:16,28:0.60: 0.26:1.000:0.806 0/0/1/1:4:11,17:0.57:-0.85:1.000:0.937 0/1/1/1:4:9,19:0.63:-0.85:1.000:0.617 0/1/1/1:4:6,36:0.81: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,14:0.46:-0.71:1.000:0.985 0/0/1/1:4:20,19:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,26:0.60: 0.05:1.000:0.821 0/0/1/1:4:16,23:0.56:-0.09:1.000:0.969 0/0/1/1:4:10,19:0.61:-0.78:1.000:0.642 0/0/1/1:4:18,11:0.39:-0.78:1.000:0.640 0/0/0/1:4:42,15:0.29: 1.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:17,7:0.31:-1.12:1.000:0.965 0/0/1/1:4:14,26:0.61:-0.02:1.000:0.693 0/0/0/1:4:25,4:0.16:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,28:0.68:-0.16:1.000:0.962 0/0/0/1:4:16,4:0.24:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,22:0.62:-0.50:1.000:0.517 0/0/1/1:4:24,31:0.54: 1.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:10,5:0.35:-1.74:1.000:0.806 0/0/1/1:4:10,16:0.58:-0.98:1.000:0.912 0/0/1/1:4:23,41:0.60: 1.63:1.000:0.774 0/1/1/1:4:18,45:0.66: 1.57:1.000:0.895 0/0/1/1:4:19,20:0.49:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,21:0.53:-0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,33:0.85:-0.23:1.000:0.982 0/0/1/1:4:20,15:0.43:-0.36:1.000:0.933 0/0/1/1:4:14,26:0.61:-0.02:1.000:0.693 0/0/1/1:4:15,16:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,46:0.78: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,22:0.75:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,48:0.57: 2.67:1.000:0.936 0/0/1/1:4:24,33:0.55: 1.15:1.000:0.980 0/1/1/1:4:11,59:0.79: 2.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,52:0.72: 1.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,56:0.80: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,14:0.37:-0.09:1.000:0.575 0/0/1/1:4:19,34:0.60: 0.88:1.000:0.767 0/1/1/1:4:10,48:0.77: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.45:-1.88:1.000:0.982 0/0/1/1:4:17,23:0.55:-0.02:1.000:0.983 0/1/1/1:4:11,32:0.69: 0.19:1.000:0.973 0/0/0/1:4:31,15:0.34: 0.39:1.000:0.852 0/0/0/1:4:38,17:0.33: 1.01:1.000:0.926 0/1/1/1:4:10,52:0.78: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,27:0.58: 0.26:1.000:0.918 0/0/1/1:4:21,32:0.57: 0.88:1.000:0.945 0/0/1/1:4:21,31:0.56: 0.81:1.000:0.960 0/1/1/1:4:7,30:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,44:0.79: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,15:0.35: 0.33:1.000:0.806 0/1/1/1:4:5,36:0.84: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,31:0.54: 1.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,23:0.62:-0.36:1.000:0.621 0/0/1/1:4:26,16:0.39: 0.12:0.999:0.656 0/0/1/1:4:17,23:0.55:-0.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:15,28:0.61: 0.19:1.000:0.682 0/1/1/1:4:5,45:0.87: 0.67:1.000:0.945 0/0/1/1:4:26,16:0.39: 0.12:1.000:0.656 0/0/1/1:4:22,30:0.55: 0.81:1.000:0.982 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,13:0.61:-1.40:1.000:0.693 0/0/1/1:4:15,22:0.56:-0.23:1.000:0.962 0/0/1/1:4:21,28:0.54: 0.60:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,11:0.36:-0.57:1.000:0.724 0/1/1/1:4:9,45:0.78: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,15:0.33: 0.53:1.000:0.914 0/0/1/1:4:24,26:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,13:0.34: 0.05:1.000:0.896 0/0/1/1:4:32,19:0.38: 0.74:1.000:0.571 0/1/1/1:4:4,40:0.88: 0.26:1.000:0.815 0/0/0/1:4:39,11:0.26: 0.67:1.000:0.999 -chr3.1 91696207 chr3.1_091696207 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,12:.: 0.95:1.000:. ./.:4:2,7:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,7:.: 2.08:1.000:. ./.:4:2,9:.: 0.67:1.000:. ./.:4:8,6:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.95:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.95:1.000:. ./.:4:3,9:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.31:0.998:. ./.:4:3,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,7:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,7:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:2,12:.: 1.51:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:5,8:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,16:.: 2.08:1.000:. ./.:4:5,6:.: 0.67:1.000:. ./.:4:4,7:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,11:.: 2.36:1.000:. ./.:4:3,11:.: 1.51:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:3,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:3,9:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:3,11:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.59:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.59:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.23:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.31:1.000:. ./.:4:7,6:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,11:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:6:1,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,12:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,9:.: 0.67:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:6,7:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,10:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,8:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.31:0.999:. ./.:4:4,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.31:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.74:1.000:. ./.:6:0,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,15:.: 1.80:1.000:. ./.:4:5,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,7:.: 0.67:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:9,9:.: 2.64:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,10:.: 0.95:1.000:. ./.:4:3,6:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:2,9:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,9:.: 0.67:1.000:. ./.:4:10,5:.: 1.80:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.31:0.999:. ./.:4:3,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1,11:.: 0.95:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.95:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:5,8:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:1,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:6,5:.: 0.67:1.000:. ./.:4:2,9:.: 0.67:1.000:. ./.:4:2,7:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,8:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:2,13:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,14:.: 2.64:1.000:. ./.:4:0,16:.: 2.08:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:5,9:.: 1.51:1.000:. ./.:4:5,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:2,8:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,7:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,8:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:5,6:.: 0.67:0.999:. ./.:4:4,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:4,7:.: 0.67:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,8:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.31:1.000:. ./.:4:2,10:.: 0.95:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,5:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:2,8:.: 0.39:1.000:. -chr3.1 91947885 chr3.1_091947885 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:163,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.57:0.998:. ./.:4:168,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.88:1.000:. ./.:3:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:288,0:.: 3.40:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:207,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.09:1.000:. ./.:6:138,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:173,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:0.999:. ./.:4:82,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.24:1.000:. ./.:6:78,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:86,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:61,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:140,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:218,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.05:1.000:. -chr3.1 92074238 chr3.1_092074238 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:70,209:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.50:1.000:. ./.:4:78,241:.: 1.03:1.000:. ./.:4:71,197:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.46:1.000:. ./.:4:76,264:.: 1.41:1.000:. ./.:4:64,136:.:-1.14:1.000:. ./.:4:80,173:.:-0.18:1.000:. ./.:4:75,174:.:-0.25:1.000:. ./.:4:22,79:.:-2.95:1.000:. ./.:4:42,113:.:-1.96:1.000:. ./.:4:61,167:.:-0.63:1.000:. ./.:4:46,191:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,195:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,295:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.41:0.998:. ./.:4:70,209:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,351:.: 1.61:1.000:. ./.:4:111,227:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,117:.:-2.66:1.000:. ./.:4:57,208:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.08:1.000:. ./.:4:7,71:.:-3.37:1.000:. ./.:4:82,250:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1,372:.: 2.01:1.000:. ./.:4:91,225:.: 0.97:1.000:. ./.:4:94,230:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,152:.:-2.02:1.000:. ./.:4:37,123:.:-1.87:1.000:. ./.:3:6,42:.:-3.92:1.000:. ./.:4:70,201:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,293:.: 0.57:1.000:. ./.:4:88,241:.: 1.21:1.000:. ./.:4:61,196:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1,273:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,181:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,217:.: 0.59:1.000:. ./.:4:76,215:.: 0.52:1.000:. ./.:4:71,231:.: 0.72:1.000:. ./.:4:80,310:.: 2.32:1.000:. ./.:4:71,186:.:-0.10:1.000:. ./.:4:84,211:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,259:.:-0.05:1.000:. ./.:4:93,274:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.70:1.000:. ./.:4:76,184:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,165:.:-0.56:1.000:. ./.:4:74,250:.: 1.12:1.000:. ./.:4:77,199:.: 0.24:1.000:. ./.:4:87,220:.: 0.81:1.000:. ./.:4:75,214:.: 0.48:1.000:. ./.:6:58,194:.:-0.19:1.000:. ./.:4:60,187:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.69:1.000:. ./.:4:85,228:.: 0.92:1.000:. ./.:4:2,239:.:-0.39:1.000:. ./.:4:92,254:.: 1.52:1.000:. ./.:4:72,195:.: 0.08:1.000:. ./.:4:123,107:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,258:.:-0.07:1.000:. ./.:4:86,205:.: 0.52:1.000:. ./.:4:54,153:.:-1.01:1.000:. ./.:4:96,193:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.61:1.000:. ./.:4:63,245:.: 0.83:1.000:. ./.:4:80,226:.: 0.79:1.000:. ./.:4:55,210:.: 0.04:1.000:. ./.:4:70,222:.: 0.54:1.000:. ./.:4:66,196:.:-0.01:1.000:. ./.:4:74,196:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,205:.: 0.39:1.000:. ./.:4:70,206:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.72:0.999:. ./.:4:0,304:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,332:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.83:1.000:. ./.:6:90,320:.: 2.69:1.000:. ./.:4:75,227:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,185:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.72:1.000:. ./.:4:66,171:.:-0.47:1.000:. ./.:4:68,179:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,304:.: 0.75:1.000:. ./.:4:37,139:.:-1.58:1.000:. ./.:4:84,259:.: 1.47:1.000:. ./.:4:89,224:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.92:1.000:. ./.:4:77,170:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,296:.: 0.63:1.000:. ./.:4:51,138:.:-1.34:1.000:. ./.:4:68,207:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,178:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.30:1.000:. ./.:4:68,161:.:-0.61:1.000:. ./.:4:67,214:.: 0.34:1.000:. ./.:4:64,200:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.34:1.000:. ./.:4:71,173:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,385:.: 2.23:1.000:. ./.:4:1,292:.: 0.55:0.999:. ./.:4:0,308:.: 0.83:1.000:. ./.:4:46,151:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.72:1.000:. ./.:4:70,160:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.14:1.000:. ./.:4:71,190:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.65:1.000:. ./.:4:81,210:.: 0.52:1.000:. ./.:4:53,186:.:-0.43:1.000:. ./.:4:90,218:.: 0.83:1.000:. ./.:4:62,164:.:-0.67:1.000:. ./.:4:64,184:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.01:1.000:. ./.:4:58,188:.:-0.30:1.000:. ./.:4:121,116:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,149:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,196:.:-1.22:1.000:. ./.:4:55,200:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,129:.:-1.54:1.000:. ./.:4:67,186:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,306:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,255:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,193:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,262:.:-0.01:1.000:. ./.:4:55,205:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.74:1.000:. ./.:4:71,270:.: 1.43:1.000:. ./.:4:69,237:.: 0.79:1.000:. ./.:4:56,208:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.39:1.000:. ./.:4:74,178:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,98:.:-2.42:1.000:. ./.:4:40,139:.:-1.53:1.000:. ./.:4:89,258:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,334:.: 1.30:1.000:. ./.:4:76,232:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,219:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.45:1.000:. ./.:4:71,205:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,322:.: 1.08:1.000:. ./.:4:71,232:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.54:1.000:. ./.:4:134,117:.:-0.21:0.999:. ./.:4:57,191:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,197:.:-1.20:1.000:. ./.:4:65,172:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,207:.:-1.01:1.000:. ./.:4:105,238:.: 1.47:1.000:. ./.:4:82,225:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.05:1.000:. ./.:4:26,206:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,302:.: 0.74:1.000:. ./.:4:99,306:.: 2.60:1.000:. ./.:4:74,224:.: 0.65:1.000:. ./.:4:62,155:.:-0.83:1.000:. ./.:4:60,208:.: 0.10:1.000:. -chr3.1 92179293 chr3.1_092179293 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:13,38:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:11,18:.:-0.87:1.000:. ./.:4:31,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:15,43:.: 1.54:1.000:. ./.:4:3,26:.:-0.87:1.000:. ./.:4:2,17:.:-1.70:1.000:. ./.:4:11,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:12,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:7,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:11,22:.:-0.54:1.000:. ./.:4:7,24:.:-0.70:1.000:. ./.:4:20,27:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,38:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:8,30:.:-0.12:0.998:. ./.:4:14,37:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,62:.: 1.87:1.000:. ./.:4:13,53:.: 2.20:1.000:. ./.:4:5,20:.:-1.20:1.000:. ./.:4:15,27:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,4:.:-2.36:1.000:. ./.:4:14,16:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:15,36:.: 0.95:1.000:. ./.:4:13,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:12,10:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,18:.:-1.28:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.54:1.000:. ./.:4:8,19:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:23,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.04:1.000:. ./.:4:8,27:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:9,29:.:-0.12:1.000:. ./.:4:19,21:.: 0.04:1.000:. ./.:4:5,9:.:-2.11:1.000:. ./.:4:20,23:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,8:.:-2.11:1.000:. ./.:4:8,17:.:-1.20:1.000:. ./.:4:12,42:.: 1.20:1.000:. ./.:4:6,22:.:-0.95:1.000:. ./.:4:27,22:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,33:.: 0.29:1.000:. ./.:4:9,25:.:-0.45:1.000:. ./.:4:25,16:.: 0.13:1.000:. ./.:4:13,33:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,28:.: 0.13:1.000:. ./.:6:24,18:.: 0.21:1.000:. ./.:4:21,29:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,39:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,22:.:-0.70:1.000:. ./.:4:18,25:.: 0.29:1.000:. ./.:4:12,22:.:-0.45:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.37:1.000:. ./.:4:12,17:.:-0.87:1.000:. ./.:4:12,23:.:-0.37:1.000:. ./.:4:16,31:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.20:1.000:. ./.:4:8,36:.: 0.37:1.000:. ./.:4:12,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,35:.: 0.71:1.000:. ./.:4:8,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:18,20:.:-0.12:1.000:. ./.:4:18,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:24,16:.: 0.04:1.000:. ./.:4:15,32:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:0.999:. ./.:4:15,49:.: 2.03:1.000:. ./.:4:0,55:.: 1.29:1.000:. ./.:4:11,34:.: 0.46:1.000:. ./.:6:7,18:.:-1.20:1.000:. ./.:4:11,32:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,23:.:-0.87:1.000:. ./.:4:11,29:.: 0.04:1.000:. ./.:4:11,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:13,25:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.87:1.000:. ./.:4:12,33:.: 0.46:1.000:. ./.:4:12,41:.: 1.12:1.000:. ./.:4:18,14:.:-0.62:1.000:. ./.:4:27,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:11,33:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,28:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,55:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,68:.: 2.36:1.000:. ./.:4:4,23:.:-1.03:1.000:. ./.:4:17,35:.: 1.04:1.000:. ./.:4:9,32:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.95:1.000:. ./.:4:12,14:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,24:.: 0.71:1.000:. ./.:4:14,19:.:-0.54:1.000:. ./.:4:10,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,82:.: 3.52:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.71:1.000:. ./.:4:8,28:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,50:.: 1.87:1.000:. ./.:4:8,36:.: 0.37:0.999:. ./.:4:8,24:.:-0.62:1.000:. ./.:4:2,9:.:-2.36:1.000:. ./.:4:7,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,32:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,23:.:-0.45:1.000:. ./.:4:9,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:6,37:.: 0.29:1.000:. ./.:4:7,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:17,11:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:24,24:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.70:1.000:. ./.:4:22,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:10,8:.:-1.78:1.000:. ./.:4:6,15:.:-1.53:1.000:. ./.:4:2,20:.:-1.45:1.000:. ./.:4:24,23:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,37:.: 0.46:1.000:. ./.:4:11,20:.:-0.70:1.000:. ./.:4:12,14:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,26:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.62:1.000:. ./.:4:12,37:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,53:.: 1.12:1.000:. ./.:4:11,39:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,70:.: 2.53:1.000:. ./.:4:27,30:.: 1.45:1.000:. ./.:4:7,46:.: 1.12:1.000:. ./.:4:11,22:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,15:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,69:.: 2.45:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:3,8:.:-2.36:1.000:. ./.:4:10,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:5,34:.:-0.04:1.000:. ./.:4:5,35:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,36:.: 2.20:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:12,32:.: 0.37:1.000:. ./.:4:11,35:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,27:.: 0.87:1.000:. ./.:4:2,15:.:-1.86:1.000:. ./.:4:26,20:.: 0.54:1.000:. ./.:4:7,35:.: 0.21:1.000:. ./.:4:24,28:.: 1.04:0.999:. ./.:4:14,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.37:1.000:. ./.:4:19,21:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:15,17:.:-0.62:1.000:. ./.:4:4,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,37:.: 0.71:1.000:. ./.:4:24,31:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.04:1.000:. ./.:4:12,28:.: 0.04:1.000:. ./.:4:7,38:.: 0.46:1.000:. ./.:4:27,26:.: 1.12:1.000:. ./.:4:26,36:.: 1.87:1.000:. ./.:4:12,34:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,43:.: 1.37:1.000:. -chr3.1 92391363 chr3.1_092391363 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:3,15:0.71: 0.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:13,5:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,5:0.34:-0.40:1.000:0.843 0/0/1/1:4:6,7:0.48:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,8:0.42: 0.32:1.000:0.911 0/0/1/1:4:8,10:0.49: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,5:0.55:-1.29:1.000:0.981 0/0/1/1:4:3,6:0.58:-1.11:1.000:0.908 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/1/1/1:4:0,2:0.85:-2.36:1.000:0.988 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:11,10:0.42: 1.03:1.000:0.930 0/0/0/1:4:15,8:0.31: 1.39:1.000:0.971 0/0/0/1:4:13,5:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.86:0.998:1.000 0/0/0/1:4:12,8:0.36: 0.86:1.000:0.719 0/0/0/1:4:15,7:0.29: 1.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:8,17:0.59: 1.75:1.000:0.852 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:10,15:0.53: 1.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:13,8:0.34: 1.03:1.000:0.865 0/0/0/1:4:11,4:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.25: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.26:-1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,6:0.25: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,9:0.37: 1.21:1.000:0.624 0/0/0/1:4:10,3:0.21:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,4:0.19: 0.68:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:11,9:0.40: 0.86:1.000:0.801 0/0/0/1:4:10,5:0.30:-0.04:1.000:0.986 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,5:0.34:-0.40:1.000:0.843 0/0/0/1:4:7,5:0.37:-0.57:1.000:0.537 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.45:-0.57:1.000:0.974 0/0/1/1:4:5,7:0.52:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,6:0.36:-0.04:1.000:0.719 0/0/1/1:4:10,15:0.53: 1.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,18:0.45: 3.72:1.000:0.974 0/0/1/1:4:7,10:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/0:4:15,1:0.06: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,16:0.58: 1.57:1.000:0.908 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,13:0.57: 0.86:1.000:0.951 0/0/0/1:4:12,5:0.26: 0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:7,10:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,9:0.53:-0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:5,11:0.60: 0.14:1.000:0.810 0/0/0/1:4:5,2:0.26:-1.47:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:7,8:0.47:-0.04:1.000:0.852 0/0/1/1:4:4,6:0.53:-0.93:1.000:0.992 0/0/0/1:4:7,5:0.37:-0.57:1.000:0.537 0/0/1/1:4:7,9:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,7:0.42:-0.04:1.000:0.896 0/0/0/1:4:9,6:0.36:-0.04:1.000:0.719 0/0/0/1:4:14,3:0.16: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,7:0.48:-0.40:1.000:0.995 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,3:0.16: 0.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,17:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,11:0.63:-0.04:1.000:0.609 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,10:0.55: 0.14:1.000:0.981 0/1/1/1:4:4,11:0.63:-0.04:1.000:0.609 0/0/0/1:4:11,5:0.28: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,2:0.18:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,8:0.58:-0.57:1.000:0.908 0/0/0/1:4:8,5:0.34:-0.40:1.000:0.843 0/0/1/1:4:8,8:0.45: 0.14:1.000:0.974 0/0/1/1:4:9,9:0.45: 0.50:1.000:0.974 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-1.83:0.999:0.719 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:4,10:0.62:-0.22:1.000:0.775 0/0/1/1:4:9,13:0.52: 1.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:6,5:0.41:-0.75:1.000:0.832 0/0/0/1:4:11,6:0.32: 0.32:1.000:0.963 0/0/0/1:4:9,5:0.32:-0.22:1.000:0.954 0/0/0/1:4:8,3:0.25:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.18: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-1.47:1.000:0.600 0/0/1/1:4:10,8:0.40: 0.50:1.000:0.758 0/0/0/1:4:9,6:0.36:-0.04:1.000:0.719 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,8:0.58:-0.57:1.000:0.908 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-1.47:1.000:0.600 0/0/0/1:4:11,5:0.28: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:5,2:0.26:-1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,4:0.15: 1.57:1.000:0.988 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.11:-1.29:1.000:0.563 0/0/0/1:4:7,2:0.20:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.42:-0.04:1.000:0.896 0/0/0/1:4:11,5:0.28: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,3:0.25:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,7:0.35: 0.50:1.000:0.814 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.18:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,9:0.21: 4.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.04:0.999:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.33: 1.21:1.000:0.938 0/0/0/1:4:7,5:0.37:-0.57:1.000:0.537 0/0/1/1:4:6,10:0.55: 0.14:1.000:0.981 0/0/1/1:4:4,4:0.45:-1.29:1.000:0.974 0/0/1/1:4:7,6:0.41:-0.40:1.000:0.872 0/0/1/1:4:5,7:0.52:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,1:0.13:-1.47:1.000:0.896 0/0/0/1:4:6,4:0.36:-0.93:1.000:0.719 0/0/0/0:4:8,1:0.10:-1.11:1.000:0.801 0/0/0/1:4:16,9:0.32: 1.75:1.000:0.948 0/0/0/1:4:8,5:0.34:-0.40:1.000:0.843 0/0/0/0:4:14,1:0.06:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,10:0.55: 0.14:1.000:0.981 0/0/1/1:4:4,7:0.56:-0.75:1.000:0.971 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,8:0.58:-0.57:1.000:0.908 0/0/0/1:4:9,3:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.22:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.65:-1.29:1.000:0.760 0/0/1/1:4:8,6:0.38:-0.22:1.000:0.600 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.28:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.34:-1.29:1.000:0.896 0/0/0/1:4:10,6:0.34: 0.14:1.000:0.896 0/0/0/1:4:11,4:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,5:0.37:-0.57:1.000:0.537 0/0/1/1:4:10,13:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,2:0.14:-0.40:1.000:0.962 0/0/0/1:4:9,6:0.36:-0.04:1.000:0.719 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.40: 0.50:1.000:0.758 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:12,4:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.30: 1.03:1.000:0.986 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.55: 0.68:1.000:0.976 0/0/1/1:4:11,8:0.38: 0.68:1.000:0.514 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.45:-0.57:1.000:0.974 0/0/0/1:4:8,3:0.25:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.21: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.65: 0.14:1.000:0.760 0/0/1/1:4:9,14:0.54: 1.39:1.000:0.990 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,22:0.67: 2.29:0.999:0.937 0/0/0/1:4:9,6:0.36:-0.04:1.000:0.719 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,2:0.09: 1.03:1.000:0.971 0/0/0/1:4:11,3:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-1.47:1.000:0.600 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.38: 0.68:1.000:0.514 0/0/1/1:4:8,18:0.60: 1.93:1.000:0.778 0/0/0/1:4:17,9:0.31: 1.93:1.000:0.973 0/0/0/0:4:20,1:0.04: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.28: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,6:0.22: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.29: 1.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,15:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,6:0.45:-0.57:1.000:0.974 -chr3.1 92506369 chr3.1_092506369 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.45:0.998:. ./.:4:171,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.38:1.000:. ./.:3:67,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.81:1.000:. ./.:6:135,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:50,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:222,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:258,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.32:1.000:. ./.:6:214,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:269,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.77:0.999:. ./.:4:214,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:242,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:253,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.91:0.999:. ./.:4:147,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.18:1.000:. -chr3.1 92577217 chr3.1_092577217 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:342,413:.: 1.63:1.000:. ./.:4:283,146:.:-0.53:1.000:. ./.:4:303,162:.:-0.29:1.000:. ./.:4:282,334:.: 0.71:1.000:. ./.:4:334,178:.: 0.02:1.000:. ./.:4:361,304:.: 1.03:1.000:. ./.:4:224,298:.: 0.09:1.000:. ./.:4:325,174:.:-0.07:1.000:. ./.:4:296,147:.:-0.44:1.000:. ./.:4:101,37:.:-2.45:1.000:. ./.:4:116,19:.:-2.47:1.000:. ./.:4:287,82:.:-0.93:1.000:. ./.:4:308,195:.:-0.04:1.000:. ./.:4:327,194:.: 0.08:1.000:. ./.:4:279,271:.: 0.27:1.000:. ./.:4:342,380:.: 1.41:1.000:. ./.:4:317,254:.: 0.41:0.998:. ./.:4:297,243:.: 0.20:1.000:. ./.:4:422,203:.: 0.77:1.000:. ./.:4:372,408:.: 1.79:1.000:. ./.:4:95,64:.:-2.31:1.000:. ./.:4:306,388:.: 1.22:1.000:. ./.:4:378,81:.:-0.33:1.000:. ./.:4:308,153:.:-0.32:1.000:. ./.:4:49,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:324,366:.: 1.20:1.000:. ./.:4:289,173:.:-0.31:1.000:. ./.:4:298,223:.: 0.08:1.000:. ./.:4:336,387:.: 1.41:1.000:. ./.:4:355,84:.:-0.46:1.000:. ./.:4:318,183:.:-0.05:1.000:. ./.:4:301,221:.: 0.09:1.000:. ./.:4:62,10:.:-2.89:1.000:. ./.:4:118,48:.:-2.27:1.000:. ./.:3:42,10:.:-3.02:1.000:. ./.:4:333,166:.:-0.07:1.000:. ./.:4:362,242:.: 0.63:1.000:. ./.:4:347,170:.: 0.05:1.000:. ./.:4:317,152:.:-0.27:1.000:. ./.:4:372,119:.:-0.12:1.000:. ./.:4:285,412:.: 1.24:1.000:. ./.:4:270,307:.: 0.45:1.000:. ./.:4:380,233:.: 0.69:1.000:. ./.:4:227,72:.:-1.39:1.000:. ./.:4:327,151:.:-0.21:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:358,360:.: 1.38:1.000:. ./.:4:497,362:.: 2.31:1.000:. ./.:4:270,209:.:-0.20:1.000:. ./.:4:326,163:.:-0.13:1.000:. ./.:4:262,265:.: 0.12:1.000:. ./.:4:369,233:.: 0.61:1.000:. ./.:4:218,270:.:-0.14:1.000:. ./.:4:328,177:.:-0.03:1.000:. ./.:4:302,145:.:-0.41:1.000:. ./.:4:274,148:.:-0.58:1.000:. ./.:4:268,196:.:-0.30:1.000:. ./.:4:311,309:.: 0.73:1.000:. ./.:4:293,238:.: 0.14:1.000:. ./.:6:251,224:.:-0.23:1.000:. ./.:4:296,372:.: 1.05:1.000:. ./.:4:291,53:.:-1.09:1.000:. ./.:4:343,87:.:-0.52:1.000:. ./.:4:308,232:.: 0.20:1.000:. ./.:4:303,243:.: 0.24:1.000:. ./.:4:293,201:.:-0.10:1.000:. ./.:4:219,133:.:-1.04:1.000:. ./.:4:344,153:.:-0.08:1.000:. ./.:4:285,270:.: 0.30:1.000:. ./.:4:278,132:.:-0.65:1.000:. ./.:4:319,323:.: 0.88:1.000:. ./.:4:142,176:.:-1.26:1.000:. ./.:4:303,138:.:-0.45:1.000:. ./.:4:285,155:.:-0.46:1.000:. ./.:4:300,203:.:-0.04:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:293,180:.:-0.24:1.000:. ./.:4:277,126:.:-0.70:1.000:. ./.:4:343,177:.: 0.07:1.000:. ./.:4:343,392:.: 1.49:1.000:. ./.:4:222,127:.:-1.06:0.999:. ./.:4:271,248:.: 0.07:1.000:. ./.:4:324,300:.: 0.76:1.000:. ./.:4:278,224:.:-0.05:1.000:. ./.:6:479,181:.: 1.00:1.000:. ./.:4:367,282:.: 0.92:1.000:. ./.:4:245,238:.:-0.17:1.000:. ./.:4:276,298:.: 0.43:1.000:. ./.:4:283,271:.: 0.30:1.000:. ./.:4:263,237:.:-0.06:1.000:. ./.:4:194,278:.:-0.25:1.000:. ./.:4:309,343:.: 0.94:1.000:. ./.:4:323,161:.:-0.17:1.000:. ./.:4:237,208:.:-0.42:1.000:. ./.:4:342,325:.: 1.04:1.000:. ./.:4:315,236:.: 0.28:1.000:. ./.:4:248,196:.:-0.43:1.000:. ./.:4:272,273:.: 0.24:1.000:. ./.:4:285,216:.:-0.05:1.000:. ./.:4:272,239:.: 0.01:1.000:. ./.:4:182,191:.:-0.90:1.000:. ./.:4:343,238:.: 0.48:1.000:. ./.:4:208,271:.:-0.20:1.000:. ./.:4:273,288:.: 0.34:1.000:. ./.:4:246,61:.:-1.34:1.000:. ./.:4:285,258:.: 0.22:1.000:. ./.:4:297,235:.: 0.15:1.000:. ./.:4:334,411:.: 1.56:1.000:. ./.:4:342,387:.: 1.45:1.000:. ./.:4:322,259:.: 0.48:1.000:. ./.:4:274,208:.:-0.18:1.000:. ./.:4:421,454:.: 2.42:1.000:. ./.:4:303,276:.: 0.46:0.999:. ./.:4:293,81:.:-0.89:1.000:. ./.:4:212,144:.:-1.01:1.000:. ./.:4:243,76:.:-1.26:1.000:. ./.:4:228,189:.:-0.61:1.000:. ./.:4:283,264:.: 0.25:1.000:. ./.:4:269,207:.:-0.22:1.000:. ./.:4:223,128:.:-1.04:1.000:. ./.:4:299,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:273,178:.:-0.38:1.000:. ./.:4:320,173:.:-0.11:1.000:. ./.:4:315,412:.: 1.44:1.000:. ./.:4:322,219:.: 0.21:1.000:. ./.:4:324,294:.: 0.72:1.000:. ./.:4:295,138:.:-0.50:1.000:. ./.:4:234,154:.:-0.80:1.000:. ./.:4:237,72:.:-1.32:1.000:. ./.:4:231,117:.:-1.06:1.000:. ./.:4:213,59:.:-1.57:1.000:. ./.:4:291,164:.:-0.36:1.000:. ./.:4:188,47:.:-1.81:1.000:. ./.:4:306,245:.: 0.28:1.000:. ./.:4:243,327:.: 0.40:1.000:. ./.:4:395,481:.: 2.42:1.000:. ./.:4:281,231:.: 0.02:1.000:. ./.:4:259,245:.:-0.03:1.000:. ./.:4:229,161:.:-0.79:1.000:. ./.:4:265,119:.:-0.83:1.000:. ./.:4:262,139:.:-0.71:1.000:. ./.:4:276,291:.: 0.38:1.000:. ./.:4:257,166:.:-0.57:1.000:. ./.:4:237,260:.:-0.08:1.000:. ./.:4:395,385:.: 1.79:1.000:. ./.:4:406,402:.: 1.98:1.000:. ./.:4:327,274:.: 0.61:1.000:. ./.:4:312,140:.:-0.38:1.000:. ./.:4:368,363:.: 1.47:1.000:. ./.:4:250,245:.:-0.09:1.000:. ./.:4:347,97:.:-0.43:1.000:. ./.:4:317,227:.: 0.23:1.000:. ./.:4:75,43:.:-2.58:1.000:. ./.:4:189,112:.:-1.38:1.000:. ./.:4:369,368:.: 1.51:1.000:. ./.:4:311,146:.:-0.34:1.000:. ./.:4:370,287:.: 0.98:1.000:. ./.:4:344,344:.: 1.18:1.000:. ./.:4:258,224:.:-0.18:1.000:. ./.:4:305,418:.: 1.41:1.000:. ./.:4:274,282:.: 0.31:1.000:. ./.:4:252,185:.:-0.48:1.000:. ./.:4:308,240:.: 0.26:1.000:. ./.:4:304,410:.: 1.35:1.000:. ./.:4:332,271:.: 0.62:1.000:. ./.:4:307,328:.: 0.83:1.000:. ./.:4:313,375:.: 1.18:1.000:. ./.:4:301,240:.: 0.21:0.999:. ./.:4:300,335:.: 0.83:1.000:. ./.:4:269,177:.:-0.42:1.000:. ./.:4:241,310:.: 0.28:1.000:. ./.:4:256,56:.:-1.30:1.000:. ./.:4:286,242:.: 0.12:1.000:. ./.:4:298,287:.: 0.50:1.000:. ./.:4:265,296:.: 0.34:1.000:. ./.:4:237,62:.:-1.39:1.000:. ./.:4:398,330:.: 1.45:1.000:. ./.:4:357,194:.: 0.28:1.000:. ./.:4:299,291:.: 0.53:1.000:. ./.:4:304,173:.:-0.21:1.000:. ./.:4:373,261:.: 0.83:1.000:. ./.:4:389,99:.:-0.14:1.000:. ./.:4:360,419:.: 1.78:1.000:. ./.:4:270,279:.: 0.26:1.000:. ./.:4:285,229:.: 0.03:1.000:. -chr3.1 92892315 chr3.1_092892315 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:10,6:0.41: 0.96:1.000:0.879 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,3:0.36:-0.31:1.000:0.688 0/0/1/1:4:3,4:0.55:-0.94:1.000:0.978 0/1/1/1:4:1,12:0.88: 0.33:1.000:0.852 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.21:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.31:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.72:-0.31:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 1.60:0.998:1.000 0/1/1/1:4:1,12:0.88: 0.33:1.000:0.852 0/0/0/1:4:10,4:0.35: 0.54:1.000:0.792 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.55:-0.94:1.000:0.978 0/0/1/1:4:8,4:0.38: 0.12:1.000:0.612 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:3,7:0.64:-0.31:1.000:0.738 0/1/1/1:4:3,10:0.69: 0.33:1.000:0.979 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:6,7:0.53: 0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:13,5:0.34: 1.39:1.000:0.838 0/0/1/1:4:8,12:0.57: 1.81:1.000:0.941 0/0/1/1:4:7,10:0.56: 1.18:1.000:0.961 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-1.79:1.000:0.565 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:10,8:0.46: 1.39:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,11:0.61: 1.18:1.000:0.732 0/0/1/1:4:8,9:0.52: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,7:0.56: 0.12:1.000:0.967 0/0/0/1:4:13,2:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,16:0.72: 1.81:1.000:0.995 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.36:-0.31:1.000:0.688 0/0/1/1:4:8,7:0.48: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,7:0.46: 0.96:1.000:0.985 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:21,1:0.08: 2.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,6:0.57:-0.31:1.000:0.941 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 2.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.41: 1.60:1.000:0.851 0/0/0/1:4:7,3:0.36:-0.31:1.000:0.688 0/0/1/1:4:6,10:0.59: 0.96:1.000:0.862 0/0/0/1:4:3,1:0.32:-1.57:1.000:0.939 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,1:0.09: 1.60:1.000:0.926 0/0/0/0/1/1:6:7,2:0.31:-0.52:1.000:0.889 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,3:0.25: 2.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,10:0.48: 2.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:11,6:0.40: 1.18:1.000:0.764 0/0/1/1:4:10,5:0.38: 0.75:1.000:0.612 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,12:0.62: 1.39:1.000:0.565 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,6:0.43: 0.75:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,22:0.75: 3.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,13:0.73: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,3:0.28: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,5:0.54:-0.52:1.000:0.988 0/0/1/1:4:11,6:0.40: 1.18:1.000:0.764 0/0/1/1:4:6,6:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,9:0.64: 0.33:0.999:0.675 0/1/1/1:4:3,10:0.69: 0.33:1.000:0.979 0/1/1/1:4:3,8:0.66:-0.09:1.000:0.893 0/1/1/1:4:1,7:0.80:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:5,5:0.50:-0.31:1.000:0.889 0/0/0/1:4:9,1:0.18:-0.31:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,8:0.82:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.94:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,7:0.56: 0.12:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.65: 1.18:1.000:0.780 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:6,6:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,8:0.58: 0.33:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,6:0.62:-0.52:1.000:0.565 0/0/0/1:4:11,4:0.34: 0.75:1.000:0.889 0/0/0/1:4:9,3:0.32: 0.12:1.000:0.939 0/0/0/1:4:11,3:0.30: 0.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:6,1:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.62:-1.15:1.000:0.565 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-1.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,11:0.67: 0.75:1.000:0.914 0/0/0/1:4:14,3:0.27: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,7:0.60:-0.09:1.000:0.804 0/0/0/1:4:6,1:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,6:0.62:-0.52:1.000:0.565 0/0/1/1:4:11,7:0.42: 1.39:1.000:0.923 0/0/0/1:4:6,2:0.32:-0.73:1.000:0.939 0/1/1/1:4:4,11:0.67: 0.75:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.15:0.999:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.60:-0.09:1.000:0.804 0/0/0/1:4:3,1:0.32:-1.57:1.000:0.939 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-0.94:1.000:0.792 0/0/0/1:4:4,1:0.29:-1.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,7:0.70:-0.52:1.000:0.986 0/0/0/1:4:11,3:0.30: 0.54:1.000:0.985 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-0.52:1.000:0.988 0/0/0/1:4:18,2:0.18: 1.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.94:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:4,8:0.62: 0.12:1.000:0.565 0/1/1/1:4:5,11:0.64: 0.96:1.000:0.633 0/0/1/1:4:2,3:0.57:-1.36:1.000:0.941 0/0/0/1:4:6,1:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.31:1.000:0.947 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,9:0.68: 0.12:1.000:0.955 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-1.15:1.000:0.612 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.56: 1.60:1.000:0.972 0/0/1/1:4:3,5:0.59:-0.73:1.000:0.862 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,8:0.62: 0.12:1.000:0.565 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.94:1.000:0.980 0/0/1/1:4:2,1:0.38:-1.79:1.000:0.612 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-0.52:1.000:0.988 0/0/1/1:4:3,5:0.59:-0.73:1.000:0.862 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:8,1:0.19:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-1.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,1:0.15: 0.12:1.000:0.982 0/0/1/1:4:7,4:0.40:-0.09:1.000:0.827 0/0/1/1:4:4,8:0.62: 0.12:1.000:0.565 0/1/1/1:4:2,12:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.31:1.000:0.947 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.65:-0.94:1.000:0.832 0/0/1/1:4:13,9:0.44: 2.23:1.000:0.961 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,3:0.36:-0.31:1.000:0.688 0/0/0/1:4:11,1:0.15: 0.12:1.000:0.982 0/1/1/1:4:1,10:0.85:-0.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:13,4:0.31: 1.18:1.000:0.965 0/1/1/1:4:2,5:0.65:-0.94:1.000:0.832 0/0/0/1:4:13,5:0.34: 1.39:1.000:0.838 0/0/1/1:4:6,8:0.55: 0.54:1.000:0.978 0/0/1/1:4:4,8:0.62: 0.12:1.000:0.565 0/0/1/1:4:3,5:0.59:-0.73:1.000:0.862 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,1:0.15: 0.12:0.999:0.982 0/1/1/1:4:2,9:0.73:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:3,5:0.59:-0.73:1.000:0.862 0/0/0/1:4:12,1:0.13: 0.33:1.000:0.943 0/0/1/1:4:5,7:0.56: 0.12:1.000:0.967 0/0/1/1:4:3,4:0.55:-0.94:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.44: 0.12:1.000:0.970 0/1/1/1:4:3,10:0.69: 0.33:1.000:0.979 0/0/0/1:4:14,3:0.27: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,4:0.40:-0.09:1.000:0.827 0/0/1/1:4:3,6:0.62:-0.52:1.000:0.565 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.60: 0.54:1.000:0.762 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.31:1.000:0.947 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.31:1.000:0.947 0/0/1/1:4:4,6:0.57:-0.31:1.000:0.941 -chr4.1 46379 chr4.1_000046379 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:5,3:0.41:-0.85:1.000:0.861 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.85:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.70:-0.97:1.000:0.986 0/1/1/1:4:6,12:0.66: 0.31:1.000:0.848 0/1/1/1:4:1,2:0.66:-1.43:1.000:0.848 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:9,2:0.27:-0.50:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,16:0.83: 0.42:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.69:-0.62:1.000:0.971 0/0/0/1:4:9,4:0.36:-0.27:1.000:0.680 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-0.50:0.999:0.986 0/0/1/1:4:3,2:0.43:-1.20:1.000:0.940 0/0/1/1:4:3,2:0.43:-1.20:1.000:0.940 0/0/0/1:4:8,0:0.11:-0.85:1.000:0.568 0/0/1/1:4:11,7:0.42: 0.31:1.000:0.912 0/0/1/1:4:8,5:0.42:-0.27:1.000:0.899 1/1/1/1:4:1,10:0.90:-0.50:1.000:0.860 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.62:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.24:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.11:-1.66:1.000:0.568 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.50: 0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,0:0.11:-1.55:1.000:0.568 0/1/1/1:4:4,8:0.66:-0.39:1.000:0.848 0/0/0:3:6,0:0.11:-1.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.97:1.000:0.978 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-0.74:1.000:0.977 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-0.74:1.000:0.977 0/0/1/1:4:7,6:0.47:-0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,3:0.29:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:11,10:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,9:0.53: 0.19:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,7:0.39: 0.54:1.000:0.707 0/0/1/1:4:8,10:0.55: 0.31:1.000:0.977 0/0/1/1:4:3,5:0.62:-0.85:1.000:0.600 0/0/1/1:4:5,8:0.61:-0.27:1.000:0.707 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-0.16:1.000:0.953 0/0/1/1:4:9,7:0.45: 0.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:8,11:0.57: 0.42:1.000:0.934 0/0/1/1:4:6,7:0.54:-0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:14,8:0.40: 0.77:1.000:0.802 0/0/1/1:4:14,12:0.47: 1.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:5,2:0.34:-0.97:1.000:0.835 0/0/1/1:4:12,8:0.43: 0.54:1.000:0.940 0/1/1/1:4:6,12:0.66: 0.31:1.000:0.848 0/1/1/1:4:8,27:0.76: 2.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,33:0.74: 3.32:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:6,18:0.74: 1.00:1.000:0.634 0/1/1/1:4:7,18:0.71: 1.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-0.62:1.000:0.837 0/0/1/1:4:11,18:0.61: 1.58:1.000:0.650 0/0/1/1:4:12,20:0.62: 1.93:1.000:0.600 0/1/1/1:4:8,18:0.68: 1.23:1.000:0.956 0/0/1/1:4:14,12:0.47: 1.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,9:0.68:-0.27:1.000:0.956 0/0/0/1:4:22,5:0.27: 1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,9:0.59:-0.04:1.000:0.837 0/0/0/1:4:5,0:0.11:-1.20:1.000:0.568 0/0/1/1:4:12,19:0.61: 1.81:1.000:0.732 0/1/1/1:4:5,24:0.82: 1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,14:0.54: 1.23:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,8:0.66:-0.39:1.000:0.848 0/1/1/1:4:3,9:0.74:-0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,20:0.86: 0.89:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,4:0.27: 0.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,8:0.44: 0.42:1.000:0.971 0/1/1/1:4:4,13:0.75: 0.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.39:0.999:1.000 0/1/1/1:4:6,14:0.69: 0.54:1.000:0.971 0/0/0/1:4:26,9:0.32: 2.28:1.000:0.942 0/1/1/1:4:5,10:0.66:-0.04:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 1.12:0.989:1.000 0/1/1/1:4:5,14:0.72: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,10:0.58: 0.19:1.000:0.901 0/0/1/1:4:11,6:0.39: 0.19:1.000:0.729 0/1/1/1:4:7,28:0.79: 2.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,11:0.60: 0.31:1.000:0.749 0/1/1/1:4:2,11:0.84:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,12:0.69: 0.19:1.000:0.979 0/1/1/1:4:14,29:0.66: 3.20:1.000:0.893 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-0.74:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,27:0.72: 2.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:10,3:0.31:-0.27:1.000:0.980 0/0/1/1:4:14,19:0.57: 2.04:1.000:0.943 0/1/1/1:4:7,23:0.75: 1.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,5:0.35: 0.19:1.000:0.784 0/1/1/1:4:4,15:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.46: 1.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,10:0.55: 0.31:1.000:0.977 0/0/1/1:4:17,20:0.54: 2.51:1.000:0.989 0/0/1/1:4:13,14:0.52: 1.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,17:0.76: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.45: 1.46:1.000:0.978 0/1/1/1:4:2,6:0.74:-0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,3:0.29:-0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:3,8:0.71:-0.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,12:0.66: 0.31:1.000:0.848 0/0/0/1:4:6,0:0.11:-1.08:1.000:0.568 0/0/1/1:4:13,15:0.53: 1.46:0.999:0.991 0/0/1/1:4:9,12:0.57: 0.65:1.000:0.953 1/1/1/1:4:2,19:0.90: 0.65:1.000:0.763 0/0/1/1:4:12,7:0.40: 0.42:1.000:0.829 0/0/1/1:4:9,9:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,13:0.52: 1.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,22:0.72: 1.70:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,12:0.66: 0.31:1.000:0.848 0/1/1/1:4:4,9:0.68:-0.27:1.000:0.956 0/1/1/1:4:8,14:0.63: 0.77:1.000:0.541 0/0/0/1:4:17,8:0.37: 1.12:1.000:0.568 0/0/0/1:4:3,1:0.32:-1.31:1.000:0.956 0/1/1/1:4:5,19:0.78: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.58: 0.19:1.000:0.901 0/1/1/1:4:9,17:0.64: 1.23:1.000:0.741 0/0/1/1:4:9,14:0.60: 0.89:1.000:0.771 0/1/1/1:4:3,15:0.82: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,9:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,2:0.66:-1.43:1.000:0.848 0/1/1/1:4:4,8:0.66:-0.39:1.000:0.848 0/1/1/1:4:5,12:0.69: 0.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.97:1.000:0.978 0/0/0/1:4:10,2:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,10:0.62: 0.08:1.000:0.600 0/1/1/1:4:3,9:0.74:-0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,17:0.73: 0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,16:0.83: 0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,15:0.70: 0.65:1.000:0.986 0/1/1/1:4:4,20:0.82: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,2:0.34:-0.97:1.000:0.835 0/0/1/1:4:14,12:0.47: 1.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:1,6:0.85:-0.97:1.000:0.990 0/0/0/1:4:11,4:0.33:-0.04:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.46: 0.54:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.48:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,2:0.66:-1.43:1.000:0.848 0/1/1/1:4:4,12:0.74: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.97:1.000:0.978 0/0/1/1:4:5,8:0.61:-0.27:1.000:0.707 0/0/1/1:4:9,5:0.40:-0.16:1.000:0.760 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.27: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,5:0.40:-0.16:1.000:0.760 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-0.39:1.000:0.967 0/0/1/1:4:6,3:0.38:-0.74:1.000:0.560 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.97:1.000:0.978 0/0/1/1:4:6,3:0.38:-0.74:1.000:0.560 0/0/1/1:4:3,2:0.43:-1.20:1.000:0.940 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-0.74:1.000:0.848 0/0/1/1:4:5,3:0.41:-0.85:1.000:0.861 0/0/0/1:4:9,4:0.36:-0.27:1.000:0.680 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-0.74:0.999:0.848 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.62:1.000:0.940 0/0/1/1:4:6,3:0.38:-0.74:1.000:0.560 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.34:-0.97:1.000:0.835 0/0/0/1:4:13,1:0.18:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,1:0.18:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,4:0.66:-1.08:1.000:0.848 0/0/1/1:4:9,7:0.45: 0.08:1.000:0.984 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-0.74:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,2:0.26:-0.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.74:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-0.74:1.000:0.977 -chr4.1 216045 chr4.1_000216045 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:139,35:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,71:0.74:-0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,70:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,22:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,128:0.75: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,43:0.43:-0.81:1.000:0.956 0/0/1/1:4:37,34:0.49:-1.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,100:0.74: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,63:0.70:-1.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:22,27:0.57:-2.42:1.000:0.952 0/0/0/1:4:37,17:0.33:-2.28:1.000:0.907 0/0/0/1:4:93,22:0.21:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,68:0.53: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,60:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,33:0.23: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,62:0.54:-0.33:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,109:0.76: 0.53:0.999:1.000 0/0/1/1:4:102,63:0.40: 1.04:1.000:0.783 0/0/1/1:4:97,74:0.45: 1.22:1.000:0.979 0/1/1/1:4:35,115:0.78: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,11:0.27:-2.57:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,99:0.77: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,75:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,52:0.48:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,21:0.50:-2.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,80:0.54: 0.71:1.000:0.990 0/1/1/1:4:29,71:0.73:-0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,88:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,36:0.22: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,25:0.28:-1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,76:0.78:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,64:0.55:-0.30:1.000:0.980 0/0/0/1:4:31,17:0.37:-2.45:1.000:0.538 0/0/0/1:4:31,14:0.33:-2.54:1.000:0.923 0/1/1:3:5,6:0.56:-3.56:1.000:0.985 0/0/1/1:4:67,69:0.52: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,75:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,31:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,75:0.54: 0.35:1.000:0.985 0/0/1/1:4:67,61:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,83:0.57: 0.62:1.000:0.955 0/0/0/1:4:148,28:0.17: 1.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:129,51:0.30: 1.49:1.000:0.983 0/0/0/1:4:117,35:0.25: 0.65:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,44:0.28: 1.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,124:0.74: 1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,12:0.77:-3.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,78:0.62: 0.00:1.000:0.602 0/0/1/1:4:45,37:0.47:-1.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:73,63:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,85:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,67:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,54:0.31: 1.58:1.000:0.967 0/1/1/1:4:24,87:0.80:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,84:0.73:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,37:0.28: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,127:0.81: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,107:0.76: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:82,41:0.35:-0.21:1.000:0.896 0/0/0/1:4:93,37:0.30: 0.00:1.000:0.982 0/0/1/1:4:72,67:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,135:0.75: 1.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,68:0.55:-0.09:1.000:0.978 0/0/0/1:4:125,45:0.28: 1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,93:0.57: 1.10:1.000:0.936 0/0/0/1:4:52,23:0.33:-1.65:1.000:0.939 0/0/1/1:4:76,69:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:83,34:0.31:-0.39:1.000:0.974 0/1/1/1:4:37,98:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,88:0.54: 1.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:26,72:0.75:-0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,117:0.75: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,32:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,30:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,49:0.51:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,65:0.54:-0.21:1.000:0.984 0/0/1/1:4:51,71:0.60:-0.24:1.000:0.798 0/0/1/1:4:87,87:0.52: 1.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,101:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,27:0.21: 0.26:0.999:1.000 0/0/1/1:4:84,73:0.48: 0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,118:0.79: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,64:0.48: 0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,64:0.56:-0.36:0.989:0.969 0/0/1/1:4:91,62:0.42: 0.68:1.000:0.922 0/0/1/1:4:53,48:0.49:-0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,62:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,64:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,67:0.47: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:56,43:0.45:-0.93:1.000:0.981 0/0/0/1:4:124,41:0.27: 1.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:125,36:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,22:0.20:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,66:0.54:-0.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:72,76:0.53: 0.53:1.000:0.992 0/0/0/1:4:94,35:0.29:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,64:0.53:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,112:0.76: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,17:0.21:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,100:0.73: 0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,76:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,108:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,43:0.40:-0.51:1.000:0.772 0/0/0/1:4:102,37:0.29: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,43:0.43:-0.75:1.000:0.936 0/0/0/1:4:93,21:0.20:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,140:0.73: 1.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:84,61:0.44: 0.44:1.000:0.963 0/1/1/1:4:45,99:0.71: 0.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:101,78:0.45: 1.46:1.000:0.982 0/1/1/1:4:43,108:0.73: 0.62:0.999:0.998 0/0/0/1:4:91,40:0.32: 0.03:1.000:0.943 0/0/0/1:4:56,19:0.27:-1.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,61:0.43: 0.56:1.000:0.936 0/0/0/1:4:73,26:0.28:-0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,66:0.47: 0.50:1.000:0.990 0/1/1/1:4:22,83:0.81:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,68:0.45: 0.83:1.000:0.977 0/0/0/1:4:125,43:0.28: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,74:0.48: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,89:0.58: 0.83:1.000:0.913 0/1/1/1:4:40,121:0.77: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,69:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,25:0.19: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,64:0.55:-0.30:1.000:0.980 0/1/1/1:4:27,93:0.79:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,53:0.57:-1.05:1.000:0.933 0/0/1/1:4:72,57:0.46:-0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:97,28:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,32:0.47:-1.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,61:0.47: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,42:0.44:-0.93:1.000:0.968 0/0/1/1:4:78,94:0.56: 1.25:1.000:0.962 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,94:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,77:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,65:0.54:-0.21:1.000:0.984 0/0/0/1:4:121,34:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,59:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,63:0.54:-0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:58,41:0.43:-0.93:1.000:0.949 0/0/1/1:4:93,90:0.51: 1.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,93:0.50: 1.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,71:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,71:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,85:0.54: 0.92:1.000:0.985 0/1/1/1:4:17,88:0.85:-0.75:1.000:0.988 0/0/1/1:4:68,70:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,92:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,30:0.56:-2.25:1.000:0.964 0/0/1/1:4:49,46:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,27:0.19: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,29:0.21: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,89:0.48: 1.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,93:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,72:0.54: 0.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:112,34:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,46:0.46:-0.81:1.000:0.989 0/0/1/1:4:51,53:0.53:-0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:97,28:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,104:0.69: 0.74:1.000:0.973 0/1/1/1:4:28,55:0.68:-1.41:1.000:0.956 0/0/1/1:4:78,61:0.46: 0.26:1.000:0.984 0/0/1/1:4:51,33:0.41:-1.38:1.000:0.864 0/1/1/1:4:39,102:0.74: 0.32:0.999:0.999 0/1/1/1:4:47,95:0.69: 0.35:1.000:0.970 0/0/1/1:4:57,51:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,49:0.53:-1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,45:0.47:-0.93:1.000:0.992 0/1/1/1:4:39,98:0.73: 0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,64:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,64:0.45: 0.47:1.000:0.984 0/1/1/1:4:34,92:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,43:0.29: 0.77:1.000:0.989 0/0/1/1:4:76,72:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,93:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,66:0.57:-0.30:1.000:0.955 0/0/1/1:4:60,61:0.52:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,75:0.52: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,61:0.40: 0.83:1.000:0.818 0/0/1/1:4:46,41:0.49:-1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,65:0.44: 0.65:1.000:0.973 -chr4.1 283218 chr4.1_000283218 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:491,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:365,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:284,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.70:1.000:. ./.:3:87,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:247,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:335,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:467,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:434,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.18:1.000:. ./.:6:214,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:195,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.56:0.999:. ./.:4:209,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.40:0.989:. ./.:4:247,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:261,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:449,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:296,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:182,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:332,2:.: 0.82:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:430,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:414,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:248,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:285,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.53:0.999:. ./.:4:342,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:239,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:387,2:.: 1.50:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:243,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.23:1.000:. -chr4.1 611893 chr4.1_000611893 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.16:0.999:. ./.:4:96,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.29:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.99:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:72,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:68,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.44:0.989:. ./.:4:80,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.38:0.999:. ./.:4:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:121,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.99:1.000:. -chr4.1 655569 chr4.1_000655569 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:188,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:147,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:202,67:.: 1.71:1.000:. ./.:4:127,45:.:-0.18:1.000:. ./.:4:50,19:.:-2.20:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:96,46:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:35,9:.:-2.69:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:129,43:.:-0.18:0.999:. ./.:4:183,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:145,72:.: 0.70:1.000:. ./.:4:148,47:.: 0.27:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:85,34:.:-1.22:1.000:. ./.:4:74,79:.:-0.56:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:87,37:.:-1.12:1.000:. ./.:4:98,42:.:-0.81:1.000:. ./.:4:81,36:.:-1.26:1.000:. ./.:4:18,7:.:-3.06:1.000:. ./.:4:42,21:.:-2.32:1.000:. ./.:3:13,0:.:-3.29:1.000:. ./.:4:106,39:.:-0.71:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:172,56:.: 0.91:1.000:. ./.:4:153,67:.: 0.75:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:167,48:.: 0.66:1.000:. ./.:4:26,7:.:-2.90:1.000:. ./.:4:146,55:.: 0.38:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:162,55:.: 0.70:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:152,56:.: 0.52:1.000:. ./.:4:163,48:.: 0.58:1.000:. ./.:4:89,130:.: 0.73:1.000:. ./.:4:153,60:.: 0.62:1.000:. ./.:6:162,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:154,53:.: 0.50:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:126,54:.:-0.03:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:188,52:.: 1.15:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:239,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:131,55:.: 0.09:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:157,44:.: 0.38:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:141,56:.: 0.30:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:198,54:.: 1.38:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:167,53:.: 0.75:1.000:. ./.:4:96,46:.:-0.77:0.989:. ./.:4:178,71:.: 1.32:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:108,40:.:-0.65:1.000:. ./.:4:163,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:286,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:144,54:.: 0.32:1.000:. ./.:4:164,48:.: 0.60:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:172,60:.: 0.99:1.000:. ./.:4:118,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:178,60:.: 1.11:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:96,32:.:-1.04:1.000:. ./.:4:207,70:.: 1.87:1.000:. ./.:4:187,56:.: 1.20:1.000:. ./.:4:151,58:.: 0.54:1.000:. ./.:4:143,44:.: 0.11:1.000:. ./.:4:198,68:.: 1.65:0.999:. ./.:4:231,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:127,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:143,64:.: 0.50:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:111,40:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,46:.: 0.15:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:160,65:.: 0.85:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:153,57:.: 0.56:1.000:. ./.:4:128,49:.:-0.09:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:166,71:.: 1.09:1.000:. ./.:4:172,57:.: 0.93:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:188,62:.: 1.34:1.000:. ./.:4:144,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:157,44:.: 0.38:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:129,48:.:-0.09:1.000:. ./.:4:119,44:.:-0.36:1.000:. ./.:4:47,7:.:-2.49:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:139,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:107,56:.:-0.36:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:94,45:.:-0.83:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:135,52:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,36:.:-0.87:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.48:0.999:. ./.:4:121,42:.:-0.36:1.000:. ./.:4:98,37:.:-0.91:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:97,34:.:-0.99:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:117,55:.:-0.18:1.000:. ./.:4:132,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:135,52:.: 0.11:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:100,41:.:-0.79:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:132,51:.: 0.03:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.93:1.000:. -chr4.1 768094 chr4.1_000768094 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:87,130:0.56: 0.09:1.000:0.962 0/0/0/1:4:157,60:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,125:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,57:0.27:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,147:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,148:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,110:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,118:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-3.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,76:0.74:-2.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,150:0.69:-0.26:1.000:0.972 0/0/0/1:4:189,61:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,68:0.22: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,63:0.29:-0.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:220,63:0.20: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,129:0.50: 0.67:0.999:0.997 0/0/1/1:4:135,114:0.43: 0.74:1.000:0.956 0/0/0/1:4:165,74:0.28: 0.53:1.000:0.994 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,41:0.57:-2.94:1.000:0.936 0/0/0/1:4:122,62:0.31:-0.58:1.000:0.970 0/1/1/1:4:81,171:0.63: 0.80:1.000:0.554 0/0/0/1:4:138,44:0.22:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,15:0.14:-2.34:1.000:0.969 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,83:0.31: 0.67:1.000:0.969 0/1/1/1:4:60,178:0.69: 0.51:1.000:0.969 0/0/0/1:4:162,63:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,174:0.70: 0.29:1.000:0.987 0/0/1/1:4:146,140:0.47: 1.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:103,128:0.53: 0.37:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,78:0.76:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,71:0.58:-1.97:1.000:0.920 0/0/0:3:40,0:0.00:-3.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,126:0.45: 1.06:1.000:0.982 0/0/0/0:4:211,1:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,58:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,55:0.28:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,107:0.48:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,92:0.55:-1.10:1.000:0.981 0/0/0/1:4:162,57:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,147:0.66:-0.15:1.000:0.877 0/0/0/1:4:220,83:0.25: 1.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:176,52:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,149:0.50: 1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,106:0.70:-1.49:1.000:0.984 0/0/1/1:4:113,92:0.43:-0.15:1.000:0.932 0/0/0/1:4:202,69:0.23: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,109:0.57:-0.70:1.000:0.935 0/0/0/1:4:215,69:0.22: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,47:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,50:0.25:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,1:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,146:0.52: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,164:0.82:-0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,183:0.68: 0.71:1.000:0.950 0/0/1/1:4:98,107:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:114,46:0.26:-1.06:1.000:0.611 0/0/0/1:4:141,56:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,124:0.62:-0.54:1.000:0.577 0/0/0/0:4:256,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,114:0.54:-0.26:1.000:0.988 0/0/0/1:4:131,61:0.29:-0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:165,108:0.37: 1.22:1.000:0.544 0/0/0/1:4:105,46:0.28:-1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,58:0.26:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:125,61:0.30:-0.54:1.000:0.982 0/0/0/1:4:164,57:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,63:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,92:0.46:-0.48:1.000:0.989 0/0/0/1:4:198,74:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,76:0.30: 0.39:1.000:0.982 0/1/1/1:4:59,165:0.68: 0.23:1.000:0.947 0/0/0/1:4:183,47:0.19: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,101:0.41: 0.37:1.000:0.883 0/0/0/1:4:152,77:0.31: 0.33:1.000:0.971 0/0/0/1:4:126,52:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,65:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,137:0.72:-0.78:0.999:0.995 0/0/1/1:4:79,128:0.58:-0.11:1.000:0.917 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,114:0.54:-0.30:1.000:0.985 0/0/1/1:4:119,129:0.50: 0.71:0.989:0.997 0/0/1/1:4:77,109:0.55:-0.54:1.000:0.977 0/0/0/1:4:121,53:0.28:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,58:0.31:-0.82:1.000:0.969 0/0/0/1:4:165,48:0.20: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,160:0.68: 0.05:1.000:0.963 0/1/1/1:4:22,152:0.80:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,68:0.31:-0.24:1.000:0.967 0/0/0/1:4:120,35:0.21:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,104:0.41: 0.57:1.000:0.849 0/0/1/1:4:76,134:0.60:-0.05:1.000:0.826 0/0/0/1:4:70,38:0.33:-2.12:1.000:0.931 0/0/1/1:4:114,124:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,110:0.48: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:198,1:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,59:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,121:0.45: 0.82:1.000:0.984 0/0/0/1:4:97,63:0.37:-1.06:1.000:0.569 0/0/1/1:4:114,115:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,42:0.25:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,42:0.24:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,48:0.32:-1.47:1.000:0.958 0/1/1/1:4:19,173:0.82:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,146:0.47: 1.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,120:0.57:-0.28:1.000:0.955 0/0/1/1:4:130,113:0.44: 0.61:1.000:0.969 0/0/1/1:4:88,169:0.61: 0.90:1.000:0.670 0/0/1/1:4:117,107:0.45: 0.23:0.999:0.984 0/0/1/1:4:130,113:0.44: 0.61:1.000:0.969 0/0/0/1:4:99,40:0.26:-1.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:157,74:0.30: 0.37:1.000:0.989 0/0/0/1:4:129,73:0.34:-0.22:1.000:0.887 0/0/0/1:4:126,52:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:165,56:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,50:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,68:0.33:-0.42:1.000:0.922 0/0/1/1:4:70,78:0.50:-1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:191,77:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,136:0.46: 1.44:1.000:0.984 0/0/1/1:4:63,119:0.61:-0.62:1.000:0.706 0/0/0/1:4:122,64:0.32:-0.54:1.000:0.955 0/0/1/1:4:122,115:0.46: 0.49:1.000:0.989 0/0/0/1:4:147,56:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,96:0.60:-1.27:1.000:0.814 0/0/0/1:4:115,51:0.28:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,41:0.25:-1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,61:0.29:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,61:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,47:0.20:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,75:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,136:0.64:-0.32:1.000:0.678 0/0/1/1:4:101,89:0.44:-0.46:1.000:0.974 0/0/1/1:4:86,77:0.45:-1.00:1.000:0.979 0/0/0/1:4:138,54:0.26:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,211:0.84: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,117:0.57:-0.44:1.000:0.934 0/0/0/1:4:155,47:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,49:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,68:0.22: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,181:0.56: 1.85:1.000:0.967 0/0/1/1:4:126,115:0.45: 0.57:1.000:0.983 0/0/0/1:4:160,51:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,137:0.45: 1.52:1.000:0.982 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,170:0.51: 2.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,110:0.45: 0.35:1.000:0.984 0/0/1/1:4:33,43:0.54:-2.76:1.000:0.990 0/0/0/1:4:154,68:0.28: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,148:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:155,58:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,146:0.45: 1.95:1.000:0.979 0/0/0/0:4:239,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,108:0.53:-0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:146,68:0.29: 0.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:189,58:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,127:0.60:-0.32:1.000:0.781 0/0/1/1:4:75,93:0.53:-0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,112:0.47: 0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:127,151:0.52: 1.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,66:0.28: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:159,43:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,55:0.22: 0.29:0.999:1.000 0/0/1/1:4:120,116:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:73,144:0.62: 0.09:1.000:0.610 0/0/0/1:4:159,66:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,88:0.54:-1.21:1.000:0.985 0/0/0/0:4:208,1:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,58:0.29:-0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:117,54:0.29:-0.84:1.000:0.991 0/0/1/1:4:115,104:0.45: 0.13:1.000:0.981 0/1/1/1:4:18,217:0.84: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/0:4:229,1:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,135:0.45: 1.44:1.000:0.982 0/0/0/1:4:159,58:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,144:0.48: 1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,79:0.26: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:167,174:0.49: 2.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,55:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,148:0.52: 1.14:1.000:0.994 -chr4.1 1022673 chr4.1_001022673 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:56,145:.:-0.38:1.000:. ./.:4:149,36:.:-0.87:1.000:. ./.:4:157,43:.:-0.42:1.000:. ./.:4:112,102:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,57:.: 1.01:1.000:. ./.:4:169,33:.:-0.35:1.000:. ./.:4:109,39:.:-2.00:1.000:. ./.:4:196,48:.: 0.92:1.000:. ./.:4:155,47:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,18:.:-0.81:1.000:. ./.:4:145,126:.: 1.74:1.000:. ./.:4:51,139:.:-0.72:1.000:. ./.:4:140,45:.:-0.87:1.000:. ./.:4:118,91:.:-0.14:1.000:. ./.:4:109,73:.:-0.96:1.000:. ./.:4:166,48:.: 0.01:1.000:. ./.:4:155,53:.:-0.17:0.999:. ./.:4:64,150:.: 0.01:1.000:. ./.:4:153,118:.: 1.74:1.000:. ./.:4:249,64:.: 3.02:1.000:. ./.:4:89,171:.: 1.41:1.000:. ./.:4:153,49:.:-0.35:1.000:. ./.:4:115,97:.:-0.05:1.000:. ./.:4:107,66:.:-1.24:1.000:. ./.:4:163,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:171,50:.: 0.22:1.000:. ./.:4:150,28:.:-1.08:1.000:. ./.:4:174,49:.: 0.28:1.000:. ./.:4:131,93:.: 0.31:1.000:. ./.:4:144,110:.: 1.23:1.000:. ./.:4:180,39:.: 0.16:1.000:. ./.:4:130,42:.:-1.27:1.000:. ./.:4:92,73:.:-1.48:1.000:. ./.:4:132,102:.: 0.62:1.000:. ./.:3:128,8:.:-2.36:1.000:. ./.:4:147,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,36:.:-1.51:1.000:. ./.:4:107,97:.:-0.29:1.000:. ./.:4:205,53:.: 1.35:1.000:. ./.:4:179,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:117,114:.: 0.53:1.000:. ./.:4:67,149:.: 0.07:1.000:. ./.:4:155,92:.: 1.01:1.000:. ./.:4:91,87:.:-1.08:1.000:. ./.:4:287,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:118,99:.: 0.10:1.000:. ./.:4:165,57:.: 0.25:1.000:. ./.:4:176,69:.: 0.95:1.000:. ./.:4:155,43:.:-0.48:1.000:. ./.:4:142,34:.:-1.14:1.000:. ./.:4:121,87:.:-0.17:1.000:. ./.:4:189,62:.: 1.13:1.000:. ./.:4:227,47:.: 1.83:1.000:. ./.:4:144,109:.: 1.20:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,120:.:-1.27:1.000:. ./.:4:167,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:179,48:.: 0.41:1.000:. ./.:6:136,68:.:-0.29:1.000:. ./.:4:119,94:.:-0.02:1.000:. ./.:4:101,64:.:-1.48:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:194,57:.: 1.13:1.000:. ./.:4:118,93:.:-0.08:1.000:. ./.:4:212,45:.: 1.32:1.000:. ./.:4:108,82:.:-0.72:1.000:. ./.:4:112,89:.:-0.38:1.000:. ./.:4:119,98:.: 0.10:1.000:. ./.:4:149,43:.:-0.66:1.000:. ./.:4:168,56:.: 0.31:1.000:. ./.:4:131,38:.:-1.36:1.000:. ./.:4:179,38:.: 0.10:1.000:. ./.:4:100,94:.:-0.60:1.000:. ./.:4:64,154:.: 0.13:1.000:. ./.:4:149,42:.:-0.69:1.000:. ./.:4:169,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:141,78:.: 0.16:1.000:. ./.:4:130,109:.: 0.77:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:59,96:.:-1.78:0.999:. ./.:4:122,88:.:-0.11:1.000:. ./.:4:188,46:.: 0.62:1.000:. ./.:4:123,76:.:-0.45:1.000:. ./.:4:193,43:.: 0.68:0.989:. ./.:4:164,92:.: 1.29:1.000:. ./.:4:90,77:.:-1.42:1.000:. ./.:4:106,82:.:-0.78:1.000:. ./.:4:152,48:.:-0.42:1.000:. ./.:4:158,39:.:-0.51:1.000:. ./.:4:118,97:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,143:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,101:.: 1.23:1.000:. ./.:4:87,88:.:-1.17:1.000:. ./.:4:214,59:.: 1.80:1.000:. ./.:4:145,113:.: 1.35:1.000:. ./.:4:51,125:.:-1.14:1.000:. ./.:4:100,74:.:-1.21:1.000:. ./.:4:76,184:.: 1.41:1.000:. ./.:4:188,55:.: 0.89:1.000:. ./.:4:176,43:.: 0.16:1.000:. ./.:4:202,67:.: 1.68:1.000:. ./.:4:162,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:186,74:.: 1.41:1.000:. ./.:4:135,87:.: 0.25:1.000:. ./.:4:121,104:.: 0.34:1.000:. ./.:4:129,104:.: 0.59:1.000:. ./.:4:68,119:.:-0.81:1.000:. ./.:4:222,64:.: 2.20:1.000:. ./.:4:99,79:.:-1.08:1.000:. ./.:4:174,48:.: 0.25:1.000:. ./.:4:138,111:.: 1.07:1.000:. ./.:4:173,54:.: 0.41:0.999:. ./.:4:109,88:.:-0.51:1.000:. ./.:4:104,65:.:-1.36:1.000:. ./.:4:125,106:.: 0.53:1.000:. ./.:4:132,99:.: 0.53:1.000:. ./.:4:105,86:.:-0.69:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:141,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:116,76:.:-0.66:1.000:. ./.:4:130,95:.: 0.34:1.000:. ./.:4:183,50:.: 0.59:1.000:. ./.:4:195,41:.: 0.68:1.000:. ./.:4:149,111:.: 1.41:1.000:. ./.:4:137,85:.: 0.25:1.000:. ./.:4:174,42:.: 0.07:1.000:. ./.:4:146,46:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,121:.:-1.24:1.000:. ./.:4:149,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:116,100:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,99:.: 0.13:1.000:. ./.:4:123,33:.:-1.75:1.000:. ./.:4:182,52:.: 0.62:1.000:. ./.:4:159,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:143,124:.: 1.62:1.000:. ./.:4:71,144:.: 0.04:1.000:. ./.:4:174,43:.: 0.10:1.000:. ./.:4:136,46:.:-0.96:1.000:. ./.:4:147,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:67,146:.:-0.02:1.000:. ./.:4:145,108:.: 1.20:1.000:. ./.:4:184,42:.: 0.37:1.000:. ./.:4:149,36:.:-0.87:1.000:. ./.:4:210,50:.: 1.41:1.000:. ./.:4:157,123:.: 2.02:1.000:. ./.:4:159,42:.:-0.38:1.000:. ./.:4:91,81:.:-1.27:1.000:. ./.:4:195,52:.: 1.01:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:207,63:.: 1.71:1.000:. ./.:4:180,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:98,90:.:-0.78:1.000:. ./.:4:110,39:.:-1.97:1.000:. ./.:4:127,91:.: 0.13:1.000:. ./.:4:128,83:.:-0.08:1.000:. ./.:4:223,55:.: 1.95:1.000:. ./.:4:185,39:.: 0.31:1.000:. ./.:4:120,89:.:-0.14:1.000:. ./.:4:115,84:.:-0.45:1.000:. ./.:4:151,44:.:-0.57:1.000:. ./.:4:88,63:.:-1.90:1.000:. ./.:4:53,130:.:-0.93:1.000:. ./.:4:176,42:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,43:.:-1.69:1.000:. ./.:4:110,92:.:-0.35:1.000:. ./.:4:126,38:.:-1.51:1.000:. ./.:4:153,36:.:-0.75:0.999:. ./.:4:152,45:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,92:.:-0.42:1.000:. ./.:4:141,39:.:-1.02:1.000:. ./.:4:100,78:.:-1.08:1.000:. ./.:4:153,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:111,99:.:-0.11:1.000:. ./.:4:93,70:.:-1.54:1.000:. ./.:4:125,40:.:-1.48:1.000:. ./.:4:60,154:.: 0.01:1.000:. ./.:4:191,50:.: 0.83:1.000:. ./.:4:169,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:163,33:.:-0.54:1.000:. ./.:4:193,44:.: 0.71:1.000:. ./.:4:128,111:.: 0.77:1.000:. ./.:4:244,60:.: 2.75:1.000:. ./.:4:101,76:.:-1.11:1.000:. ./.:4:113,79:.:-0.66:1.000:. -chr4.1 1101368 chr4.1_001101368 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:102,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:116,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,8:.: 0.68:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:173,3:.: 1.08:1.000:. ./.:4:94,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:167,5:.: 0.99:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:55,6:.:-1.33:1.000:. ./.:4:51,3:.:-1.48:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:168,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:220,6:.: 2.13:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.72:0.999:. ./.:4:87,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:187,2:.: 1.35:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:75,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:91,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:119,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,6:.:-1.52:1.000:. ./.:4:143,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:72,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:87,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:98,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:191,4:.: 1.48:1.000:. ./.:4:113,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:81,11:.:-0.68:1.000:. ./.:3:44,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:96,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:162,6:.: 0.91:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:108,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:184,4:.: 1.33:1.000:. ./.:4:176,5:.: 1.18:1.000:. ./.:4:93,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:111,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:93,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:194,8:.: 1.62:1.000:. ./.:4:103,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:145,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:91,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:159,2:.: 0.76:1.000:. ./.:4:41,7:.:-1.60:1.000:. ./.:4:142,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:99,10:.:-0.33:1.000:. ./.:4:200,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:131,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:39,7:.:-1.65:1.000:. ./.:4:62,10:.:-1.10:1.000:. ./.:4:158,6:.: 0.83:1.000:. ./.:6:146,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:146,3:.: 0.51:1.000:. ./.:4:36,4:.:-1.77:1.000:. ./.:4:266,5:.: 3.07:1.000:. ./.:4:155,5:.: 0.74:1.000:. ./.:4:188,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:129,7:.: 0.24:1.000:. ./.:4:145,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:124,4:.: 0.07:1.000:. ./.:4:178,4:.: 1.20:1.000:. ./.:4:86,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:185,15:.: 1.58:1.000:. ./.:4:111,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:119,6:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,3:.: 0.95:1.000:. ./.:4:54,9:.:-1.29:1.000:. ./.:4:187,6:.: 1.43:1.000:. ./.:4:158,5:.: 0.81:1.000:. ./.:4:118,7:.: 0.01:1.000:. ./.:4:168,6:.: 1.04:1.000:. ./.:4:171,5:.: 1.08:1.000:. ./.:4:117,8:.: 0.01:0.999:. ./.:4:122,4:.: 0.03:1.000:. ./.:4:196,16:.: 1.83:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:160,4:.: 0.83:0.989:. ./.:4:107,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:127,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:138,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:195,3:.: 1.54:1.000:. ./.:4:121,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:90,8:.:-0.56:1.000:. ./.:4:46,1:.:-1.62:1.000:. ./.:4:169,5:.: 1.04:1.000:. ./.:4:69,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:183,7:.: 1.37:1.000:. ./.:4:118,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:95,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:100,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:138,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:138,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:104,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:126,10:.: 0.24:1.000:. ./.:4:174,7:.: 1.18:1.000:. ./.:4:135,4:.: 0.30:1.000:. ./.:4:162,4:.: 0.87:1.000:. ./.:4:28,2:.:-1.98:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:99,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:145,5:.: 0.53:1.000:. ./.:4:44,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:192,4:.: 1.50:0.999:. ./.:4:160,8:.: 0.91:1.000:. ./.:4:103,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:122,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:92,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:179,7:.: 1.29:1.000:. ./.:4:155,8:.: 0.81:1.000:. ./.:4:183,2:.: 1.27:1.000:. ./.:4:142,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,7:.: 0.24:1.000:. ./.:4:192,8:.: 1.58:1.000:. ./.:4:100,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:121,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:111,7:.:-0.14:1.000:. ./.:4:135,4:.: 0.30:1.000:. ./.:4:104,14:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:162,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:104,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:129,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:86,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:248,4:.: 2.67:1.000:. ./.:4:115,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:107,6:.:-0.24:1.000:. ./.:4:82,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:107,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:138,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:190,7:.: 1.52:1.000:. ./.:4:55,4:.:-1.37:1.000:. ./.:4:99,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:134,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:127,6:.: 0.18:1.000:. ./.:4:236,3:.: 2.40:1.000:. ./.:4:54,2:.:-1.44:1.000:. ./.:4:91,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:138,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:128,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:172,4:.: 1.08:1.000:. ./.:4:119,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:76,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:88,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:135,5:.: 0.32:1.000:. ./.:4:98,5:.:-0.45:1.000:. ./.:4:154,6:.: 0.74:1.000:. ./.:4:138,9:.: 0.47:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:99,6:.:-0.41:1.000:. ./.:4:116,4:.:-0.09:1.000:. ./.:4:26,2:.:-2.02:1.000:. ./.:4:85,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:149,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,6:.: 0.37:1.000:. ./.:4:156,4:.: 0.74:1.000:. ./.:4:151,4:.: 0.64:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.30:0.999:. ./.:4:75,6:.:-0.91:1.000:. ./.:4:31,1:.:-1.94:1.000:. ./.:4:132,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:84,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:174,4:.: 1.12:1.000:. ./.:4:87,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:97,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:134,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:170,5:.: 1.06:1.000:. ./.:4:81,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:185,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:80,5:.:-0.83:1.000:. ./.:4:115,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:161,8:.: 0.93:1.000:. ./.:4:114,5:.:-0.12:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.83:1.000:. -chr4.1 1137477 chr4.1_001137477 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.27:0.999:. ./.:4:41,14:.: 0.33:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.54:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.93:1.000:. ./.:6:68,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.17:0.999:. ./.:4:90,0:.: 2.96:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:0.989:. ./.:4:73,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.39:0.999:. ./.:4:71,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:56,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.17:0.999:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:53,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.04:1.000:. -chr4.1 1342769 chr4.1_001342769 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:391,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:84,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:136,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:429,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:563,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:555,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:121,1:.:-2.65:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:495,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:123,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:412,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:70,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:151,0:.:-2.32:1.000:. ./.:3:61,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:295,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.31:1.000:. ./.:6:268,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.77:0.999:. ./.:4:351,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.68:0.989:. ./.:4:393,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:541,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:378,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:239,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:248,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:587,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:273,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:557,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:471,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:130,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:479,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:366,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:405,1:.: 0.60:0.999:. ./.:4:330,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:274,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:487,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:494,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.60:1.000:. -chr4.1 1509767 chr4.1_001509767 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:174,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:135,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:175,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:126,11:.: 0.17:1.000:. ./.:4:167,20:.: 1.39:1.000:. ./.:4:97,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:125,7:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:41,7:.:-2.01:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:141,13:.: 0.58:0.999:. ./.:4:207,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:224,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:123,8:.: 0.02:1.000:. ./.:4:144,14:.: 0.68:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:127,15:.: 0.29:1.000:. ./.:4:81,21:.:-0.69:1.000:. ./.:4:177,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:151,12:.: 0.80:1.000:. ./.:4:146,13:.: 0.71:1.000:. ./.:4:110,10:.:-0.25:1.000:. ./.:4:22,5:.:-2.53:1.000:. ./.:4:35,4:.:-2.23:1.000:. ./.:3:41,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:138,15:.: 0.56:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:126,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:118,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:86,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:119,8:.:-0.08:1.000:. ./.:4:91,20:.:-0.47:1.000:. ./.:4:125,10:.: 0.12:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:66,2:.:-1.52:1.000:. ./.:4:219,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:123,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:102,7:.:-0.52:1.000:. ./.:4:84,11:.:-0.86:1.000:. ./.:4:94,7:.:-0.71:1.000:. ./.:6:117,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:124,7:.: 0.02:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:88,7:.:-0.86:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:142,8:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:95,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:108,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:104,7:.:-0.47:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:109,10:.:-0.27:1.000:. ./.:4:100,12:.:-0.44:0.989:. ./.:4:94,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:69,7:.:-1.33:1.000:. ./.:4:82,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:79,6:.:-1.11:1.000:. ./.:4:89,8:.:-0.81:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:112,16:.:-0.05:1.000:. ./.:4:47,6:.:-1.89:1.000:. ./.:4:71,12:.:-1.15:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,8:.:-0.47:1.000:. ./.:4:148,12:.: 0.73:1.000:. ./.:4:115,6:.:-0.22:1.000:. ./.:4:81,5:.:-1.08:1.000:. ./.:4:183,21:.: 1.81:1.000:. ./.:4:76,6:.:-1.18:0.999:. ./.:4:136,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:83,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:82,3:.:-1.11:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:125,15:.: 0.24:1.000:. ./.:4:82,4:.:-1.08:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:70,6:.:-1.33:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,5:.:-1.69:1.000:. ./.:4:66,5:.:-1.45:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:103,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:87,7:.:-0.89:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:205,1:.: 1.86:1.000:. ./.:4:145,19:.: 0.83:1.000:. ./.:4:123,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:139,17:.: 0.63:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:156,12:.: 0.93:1.000:. ./.:4:130,12:.: 0.29:1.000:. ./.:4:35,3:.:-2.26:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:144,16:.: 0.73:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:103,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:127,12:.: 0.22:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:122,8:.: 0.00:1.000:. ./.:4:116,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:134,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:123,7:.: 0.00:1.000:. ./.:4:126,11:.: 0.17:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:117,14:.: 0.02:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,8:.:-0.86:1.000:. ./.:4:174,10:.: 1.32:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:131,12:.: 0.31:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:120,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:149,16:.: 0.85:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.66:1.000:. -chr4.1 1744051 chr4.1_001744051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:223,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:76,60:.:-1.04:1.000:. ./.:4:153,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:117,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:224,49:.: 2.02:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:72,17:.:-2.08:1.000:. ./.:4:133,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:117,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:34,19:.:-2.89:1.000:. ./.:4:56,19:.:-2.40:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:123,28:.:-0.70:1.000:. ./.:4:152,27:.:-0.08:1.000:. ./.:4:146,42:.: 0.12:1.000:. ./.:4:117,44:.:-0.48:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:89,68:.:-0.57:1.000:. ./.:4:177,44:.: 0.86:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:140,38:.:-0.10:1.000:. ./.:4:142,39:.:-0.03:1.000:. ./.:4:123,33:.:-0.59:1.000:. ./.:4:24,18:.:-3.13:1.000:. ./.:4:139,35:.:-0.19:1.000:. ./.:4:119,36:.:-0.61:1.000:. ./.:4:121,38:.:-0.52:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:131,39:.:-0.28:1.000:. ./.:4:95,35:.:-1.17:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:65,24:.:-2.08:1.000:. ./.:3:17,14:.:-3.38:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:122,38:.:-0.50:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:176,53:.: 1.04:1.000:. ./.:4:144,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:195,61:.: 1.64:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:15,6:.:-3.60:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:131,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:173,46:.: 0.81:1.000:. ./.:6:156,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:166,31:.: 0.32:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:211,45:.: 1.64:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:160,54:.: 0.70:1.000:. ./.:4:287,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:104,24:.:-1.21:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:159,35:.: 0.26:1.000:. ./.:4:118,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:119,17:.:-1.04:1.000:. ./.:4:204,44:.: 1.46:1.000:. ./.:4:148,33:.:-0.03:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:137,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:180,30:.: 0.61:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:160,61:.: 0.86:1.000:. ./.:4:176,41:.: 0.77:1.000:. ./.:4:126,37:.:-0.43:0.999:. ./.:4:188,30:.: 0.79:1.000:. ./.:4:198,49:.: 1.44:1.000:. ./.:4:121,31:.:-0.68:1.000:. ./.:4:164,37:.: 0.41:0.989:. ./.:4:172,58:.: 1.06:1.000:. ./.:4:137,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:145,48:.: 0.23:1.000:. ./.:4:157,42:.: 0.37:1.000:. ./.:4:112,33:.:-0.84:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:157,35:.: 0.21:1.000:. ./.:4:165,52:.: 0.77:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:151,40:.: 0.19:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:125,40:.:-0.39:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:137,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:142,39:.:-0.03:1.000:. ./.:4:165,37:.: 0.44:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:172,38:.: 0.61:1.000:. ./.:4:171,36:.: 0.55:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:160,50:.: 0.61:0.999:. ./.:4:201,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:122,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:132,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:145,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.17:1.000:. ./.:4:171,32:.: 0.46:1.000:. ./.:4:154,40:.: 0.26:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:152,40:.: 0.21:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:140,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:158,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:108,41:.:-0.75:1.000:. ./.:4:176,44:.: 0.84:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:126,32:.:-0.55:1.000:. ./.:4:154,30:.: 0.03:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:162,52:.: 0.70:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:127,33:.:-0.50:1.000:. ./.:4:160,48:.: 0.57:1.000:. ./.:4:152,35:.: 0.10:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,17:.:-2.91:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:153,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:151,35:.: 0.08:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:128,43:.:-0.26:1.000:. ./.:4:139,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:111,35:.:-0.81:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:86,60:.:-0.81:0.999:. ./.:4:171,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:113,27:.:-0.95:1.000:. ./.:4:143,26:.:-0.30:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:129,30:.:-0.52:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:166,48:.: 0.70:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:130,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,28:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,32:.:-1.73:1.000:. ./.:4:137,39:.:-0.14:1.000:. -chr4.1 2022002 chr4.1_002022002 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,7:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:57,4:0.18:-0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,14:0.30: 0.09:1.000:0.982 0/0/0/1:4:116,7:0.16: 1.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:24,3:0.26:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,63:0.56: 0.64:1.000:0.959 0/0/0/1:4:43,4:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,26:0.55:-0.76:1.000:0.983 0/0/1/1:4:8,23:0.62:-1.06:1.000:0.514 0/0/0/1:4:40,14:0.35:-0.49:1.000:0.812 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,6:0.14: 1.14:0.999:0.962 0/0/0/0:4:76,3:0.10: 0.14:1.000:0.688 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,62:0.38: 2.99:1.000:0.618 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,57:0.41: 2.04:1.000:0.869 0/0/1/1:4:43,65:0.55: 0.86:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,51:0.47: 0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,63:0.44: 1.91:1.000:0.969 0/0/0/1:4:80,5:0.16: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,76:0.53: 1.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:47,6:0.26:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,5:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,7:0.28:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,29:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1:3:7,2:0.33:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,2:0.05: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,59:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,46:0.47: 0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,63:0.43: 2.09:1.000:0.947 0/0/1/1:4:51,65:0.52: 1.06:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,50:0.49: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,6:0.28:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:84,1:0.03: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,52:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:108,6:0.14: 1.01:1.000:0.979 0/0/0/1:4:10,1:0.25:-1.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,6:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,9:0.45:-1.31:1.000:0.976 0/0/1/1:4:69,53:0.45: 1.21:1.000:0.979 0/0/0/1:4:45,5:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,7:0.29:-0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,4:0.12: 0.41:1.000:0.806 0/0/0/1:4:40,16:0.36:-0.44:1.000:0.651 0/0/0/1:4:80,5:0.16: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,69:0.60: 0.61:1.000:0.765 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,5:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:9,29:0.64:-0.89:1.000:0.859 1/1/1/1:4:1,65:0.89:-0.19:1.000:0.521 0/0/1/1:4:87,52:0.41: 1.64:1.000:0.889 0/0/0/1:4:44,8:0.29:-0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,5:0.16: 0.34:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,7:0.12: 2.01:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,50:0.51: 0.49:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,4:0.14: 0.16:1.000:0.958 0/0/0/1:4:61,13:0.30: 0.01:1.000:0.986 0/0/0/1:4:22,4:0.29:-1.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:87,8:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,56:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,8:0.32:-0.86:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.32:-0.81:1.000:0.940 0/0/1/1:4:40,54:0.53: 0.51:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,6:0.15: 0.89:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.51:0.999:1.000 0/0/1/1:4:36,54:0.54: 0.41:1.000:0.985 0/0/1/1:4:46,64:0.53: 0.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,45:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,2:0.15:-0.94:0.989:0.991 0/0/1/1:4:50,50:0.49: 0.66:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,46:0.48: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,3:0.20:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,45:0.49: 0.39:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,42:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,8:0.28:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,51:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,79:0.56: 1.31:1.000:0.968 0/0/0/1:4:41,4:0.24:-0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,60:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,10:0.36:-0.94:1.000:0.705 0/0/0/0:4:99,4:0.11: 0.74:1.000:0.617 0/0/0/1:4:78,6:0.20: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,8:0.25: 0.29:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,50:0.48: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,6:0.13: 1.24:1.000:0.941 0/0/1/1:4:58,60:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,6:0.28:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,76:0.41: 3.29:1.000:0.879 0/0/0/1:4:35,10:0.33:-0.71:0.999:0.935 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,63:0.55: 0.76:1.000:0.982 0/0/1/1:4:37,42:0.51: 0.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,9:0.26: 0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,59:0.57: 0.44:1.000:0.943 0/0/0/1:4:43,6:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:115,8:0.18: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,47:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,59:0.51: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,6:0.16: 0.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:65,5:0.20:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,10:0.31:-0.54:1.000:0.975 0/0/1/1:4:54,44:0.46: 0.61:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,36:0.56:-0.41:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,6:0.30:-0.96:1.000:0.988 0/0/1/1:4:61,57:0.48: 1.11:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,4:0.12: 0.36:1.000:0.852 0/0/0/1:4:35,9:0.32:-0.74:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,47:0.53: 0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:46,51:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,8:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,2:0.12:-0.74:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,69:0.43: 2.51:1.000:0.940 0/0/0/1:4:106,5:0.12: 0.94:1.000:0.835 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,8:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,7:0.28:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:136,13:0.24: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,3:0.08: 0.84:1.000:0.993 0/0/1/1:4:10,18:0.57:-1.14:1.000:0.950 0/0/0/1:4:31,5:0.28:-0.94:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,63:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,11:0.29:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,57:0.52: 0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,42:0.37: 1.66:1.000:0.544 0/0/1/1:4:54,70:0.52: 1.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:45,4:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,42:0.40: 1.14:1.000:0.809 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,12:0.33:-0.51:1.000:0.926 0/0/0/1:4:28,6:0.30:-0.99:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,8:0.30:-0.66:1.000:0.988 0/0/0/1:4:44,7:0.28:-0.56:0.999:0.996 0/0/0/0:4:96,4:0.11: 0.66:1.000:0.516 0/0/1/1:4:95,57:0.42: 1.96:1.000:0.892 0/0/0/1:4:34,8:0.31:-0.79:1.000:0.977 0/0/1/1:4:39,39:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,54:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,52:0.55: 0.31:1.000:0.983 0/0/1/1:4:37,56:0.55: 0.49:1.000:0.984 0/0/0/1:4:38,8:0.30:-0.69:1.000:0.987 0/0/1/1:4:62,87:0.54: 1.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,48:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,6:0.16: 0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,8:0.55:-1.51:1.000:0.977 0/0/0/1:4:91,6:0.17: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,78:0.54: 1.49:1.000:0.989 0/0/0/1:4:60,11:0.29:-0.06:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,12:0.33:-0.49:1.000:0.935 -chr4.1 2245481 chr4.1_002245481 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:104,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:83,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.07:0.999:. ./.:4:80,19:.: 0.06:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.68:1.000:. ./.:3:26,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:99,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.33:0.999:. ./.:4:157,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.28:0.989:. ./.:4:110,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.50:0.999:. ./.:4:116,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:81,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.46:1.000:. -chr4.1 2402452 chr4.1_002402452 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:40,117:0.72: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,26:0.20:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,29:0.20:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,96:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,48:0.24: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,48:0.21: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,32:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,46:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,38:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,14:0.33:-2.70:1.000:0.926 0/0/1/1:4:35,31:0.46:-2.03:1.000:0.986 0/1/1/1:4:34,114:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,32:0.20: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,96:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,65:0.39: 0.52:1.000:0.704 0/0/0/1:4:145,44:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,36:0.21: 0.54:0.999:1.000 0/0/1/1:4:113,90:0.43: 1.64:1.000:0.949 0/0/1/1:4:106,92:0.45: 1.51:1.000:0.982 0/0/0/1:4:161,48:0.22: 1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,47:0.73:-2.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,32:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,81:0.46: 0.84:1.000:0.985 0/0/1/1:4:71,65:0.47:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,12:0.39:-3.00:1.000:0.661 0/0/0/1:4:141,51:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,32:0.18: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,38:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,95:0.49: 1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,94:0.55: 0.63:1.000:0.976 0/0/0/1:4:116,31:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,21:0.17:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-3.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,29:0.40:-1.92:1.000:0.805 0/0/0:3:33,0:0.00:-2.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,43:0.21: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,34:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,83:0.42: 1.40:1.000:0.893 0/0/0/1:4:94,37:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,51:0.32: 0.33:1.000:0.958 0/0/1/1:4:67,74:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,136:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,75:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,62:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,69:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:145,42:0.21: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.22:-2.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,41:0.30:-0.26:1.000:0.987 0/0/0/1:4:79,32:0.28:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,65:0.59:-0.96:1.000:0.837 0/0/0/1:4:136,48:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,37:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,42:0.28: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:162,2:0.01: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,39:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,75:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,39:0.27:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,42:0.28: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:70,56:0.43:-0.42:1.000:0.618 0/0/1/1:4:54,66:0.54:-0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:59,79:0.56:-0.10:1.000:0.973 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,25:0.22:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,68:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:152,33:0.17: 1.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,58:0.44:-0.37:1.000:0.968 0/0/1/1:4:77,75:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,76:0.59:-0.47:1.000:0.839 0/0/0/1:4:96,36:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,44:0.27: 0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,44:0.29: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:102,39:0.26:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,94:0.49: 1.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,96:0.72:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:96,28:0.21:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,46:0.28: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,64:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,87:0.55: 0.36:1.000:0.984 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,71:0.70:-1.17:0.999:0.983 0/0/1/1:4:70,85:0.53: 0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:108,38:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,74:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,24:0.22:-0.98:0.989:1.000 0/0/1/1:4:82,98:0.53: 1.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,45:0.46:-1.25:1.000:0.988 0/0/1/1:4:47,54:0.52:-1.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:84,30:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,34:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,73:0.52:-0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,101:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,100:0.52: 1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,63:0.52:-0.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:116,53:0.30: 0.73:1.000:0.985 0/0/1/1:4:73,67:0.47:-0.05:1.000:0.991 0/1/1/1:4:26,94:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,84:0.65:-0.45:1.000:0.782 0/1/1/1:4:35,135:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,34:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,29:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,41:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,25:0.24:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,41:0.28:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,63:0.55:-0.80:1.000:0.983 0/0/1/1:4:71,68:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,55:0.45:-0.58:1.000:0.975 0/1/1/1:4:37,90:0.68:-0.39:1.000:0.961 0/0/0/1:4:149,67:0.30: 1.99:1.000:0.987 0/0/1/1:4:85,66:0.42: 0.25:1.000:0.931 0/0/0/1:4:101,40:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,112:0.47: 2.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:86,43:0.32:-0.34:0.999:0.952 0/0/1/1:4:72,85:0.53: 0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,40:0.47:-1.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:83,72:0.45: 0.36:1.000:0.982 0/0/1/1:4:68,91:0.56: 0.46:1.000:0.973 0/0/1/1:4:63,70:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,35:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,73:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,70:0.47: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:106,46:0.29: 0.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:117,35:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,79:0.54: 0.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:82,74:0.46: 0.38:1.000:0.989 0/0/0/1:4:91,38:0.28:-0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,34:0.37:-1.41:1.000:0.572 0/1/1/1:4:18,64:0.75:-1.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,25:0.32:-1.79:1.000:0.952 0/0/1/1:4:68,65:0.48:-0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,85:0.57: 0.09:1.000:0.949 0/0/0/1:4:62,17:0.20:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,36:0.28:-0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,26:0.20:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,90:0.47: 1.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,94:0.70:-0.31:1.000:0.982 0/0/0/1:4:80,34:0.29:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:84,28:0.24:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,39:0.35:-0.90:1.000:0.807 0/1/1/1:4:33,135:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,79:0.62:-0.47:1.000:0.616 0/0/0/1:4:92,32:0.25:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,23:0.26:-1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,64:0.29: 1.86:1.000:0.992 0/0/1/1:4:104,95:0.47: 1.54:1.000:0.990 0/0/0/1:4:109,40:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,76:0.45: 0.65:1.000:0.975 0/0/0/1:4:146,36:0.19: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,29:0.18: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,56:0.30: 0.97:1.000:0.984 0/1/1/1:4:13,38:0.72:-2.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,43:0.30:-0.10:1.000:0.986 0/0/1/1:4:83,89:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,105:0.50: 1.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,44:0.22: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,51:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,82:0.57:-0.07:1.000:0.940 0/0/1/1:4:90,99:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,48:0.31: 0.17:1.000:0.971 0/0/1/1:4:61,67:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,97:0.71:-0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:120,45:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,36:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,68:0.43: 0.33:1.000:0.944 0/0/0/1:4:74,38:0.33:-0.80:1.000:0.934 0/0/0/1:4:138,37:0.20: 0.89:0.999:1.000 0/0/0/1:4:108,40:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,76:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,37:0.29:-0.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,48:0.36:-0.31:1.000:0.728 0/0/0/1:4:99,31:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,57:0.43:-0.34:1.000:0.945 0/0/1/1:4:52,50:0.48:-1.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:57,22:0.27:-1.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,147:0.73: 1.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:131,41:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,39:0.19: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,36:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,41:0.22: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,91:0.45: 1.46:1.000:0.982 0/0/0/1:4:148,62:0.28: 1.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,68:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,79:0.51: 0.28:1.000:0.996 -chr4.1 2546492 chr4.1_002546492 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:46,199:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,58:0.36:-0.44:1.000:0.723 0/0/1/1:4:89,65:0.45:-0.57:1.000:0.979 0/1/1/1:4:48,119:0.69:-0.38:1.000:0.975 0/0/0/1:4:237,106:0.29: 2.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:225,93:0.27: 1.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,40:0.55:-1.69:1.000:0.979 0/0/1/1:4:109,64:0.38:-0.29:1.000:0.525 0/0/1/1:4:95,61:0.41:-0.54:1.000:0.838 0/0/1/1:4:15,17:0.55:-2.33:1.000:0.974 0/1/1/1:4:34,80:0.68:-1.14:1.000:0.961 0/1/1/1:4:27,150:0.80:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,59:0.43:-0.71:1.000:0.952 0/0/1/1:4:97,151:0.61: 0.79:1.000:0.654 0/1/1/1:4:68,139:0.66: 0.20:1.000:0.872 0/0/0/1:4:206,85:0.27: 1.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:186,105:0.36: 1.41:0.999:0.641 0/1/1/1:4:89,159:0.64: 0.79:1.000:0.659 0/0/1/1:4:138,226:0.62: 2.46:1.000:0.539 0/0/1/1:4:141,90:0.40: 0.54:1.000:0.824 0/1/1/1:4:19,98:0.79:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,63:0.38:-0.37:1.000:0.617 0/1/1/1:4:79,168:0.67: 0.77:1.000:0.907 0/1/1/1:4:48,122:0.70:-0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:14,13:0.52:-2.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,85:0.40: 0.37:1.000:0.808 0/0/1/1:4:87,57:0.41:-0.71:1.000:0.880 0/0/1/1:4:106,64:0.39:-0.34:1.000:0.642 0/1/1/1:4:90,167:0.64: 0.92:1.000:0.734 0/1/1/1:4:52,132:0.69:-0.14:1.000:0.980 0/0/1/1:4:84,63:0.46:-0.67:1.000:0.987 0/0/1/1:4:103,65:0.40:-0.37:1.000:0.794 0/1/1/1:4:13,26:0.66:-2.23:1.000:0.847 0/0/1/1:4:48,73:0.61:-1.04:1.000:0.702 0/0/0:3:46,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,74:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,63:0.29: 0.14:1.000:0.990 0/1/1/1:4:85,145:0.63: 0.53:1.000:0.557 0/0/1/1:4:98,80:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,83:0.37: 0.50:1.000:0.584 0/1/1/1:4:59,99:0.63:-0.51:1.000:0.518 0/1/1/1:4:56,181:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,187:0.61: 1.70:1.000:0.718 0/0/1/1:4:88,140:0.62: 0.50:1.000:0.606 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,149:0.58: 0.97:1.000:0.893 0/0/0/1:4:134,71:0.34: 0.17:1.000:0.844 0/0/0/1:4:250,120:0.31: 2.55:1.000:0.969 0/0/1/1:4:78,58:0.46:-0.83:1.000:0.985 0/0/1/1:4:99,73:0.45:-0.31:1.000:0.982 0/0/1/1:4:78,120:0.61: 0.07:1.000:0.678 0/0/0/1:4:269,108:0.26: 2.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,39:0.32:-1.07:1.000:0.959 0/0/0/1:4:107,60:0.36:-0.38:1.000:0.668 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,77:0.46:-0.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:57,84:0.60:-0.76:1.000:0.760 0/0/0/1:4:120,63:0.34:-0.15:1.000:0.864 0/0/0/1:4:123,60:0.32:-0.15:1.000:0.959 0/0/1/1/1/1:6:53,80:0.61:-0.87:1.000:0.703 0/1/1/1:4:37,125:0.74:-0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,103:0.61:-0.31:1.000:0.737 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,74:0.44:-0.24:1.000:0.973 0/1/1/1:4:84,142:0.63: 0.47:1.000:0.535 0/0/0/1:4:259,75:0.20: 2.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,172:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,138:0.72:-0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,90:0.71:-1.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:112,60:0.35:-0.31:1.000:0.817 0/0/0/1:4:148,85:0.37: 0.57:1.000:0.570 0/0/0/1:4:132,65:0.32: 0.05:1.000:0.952 0/0/1/1:4:131,77:0.38: 0.21:1.000:0.530 0/0/1/1:4:95,132:0.59: 0.48:1.000:0.847 0/1/1/1:4:42,183:0.77: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,67:0.47:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:121,72:0.38:-0.01:1.000:0.582 0/1/1/1:4:58,140:0.69: 0.07:1.000:0.969 0/0/1/1:4:106,154:0.60: 0.96:1.000:0.784 0/0/0/0:4:196,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,97:0.91:-1.33:0.999:0.953 0/0/1/1:4:123,183:0.61: 1.62:1.000:0.743 0/0/1/1:4:73,64:0.51:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,122:0.61: 0.14:1.000:0.720 0/0/1/1:4:93,89:0.52:-0.16:0.989:0.994 0/1/1/1:4:96,184:0.65: 1.25:1.000:0.789 0/1/1/1:4:34,92:0.70:-0.97:1.000:0.989 0/0/1/1:4:84,132:0.61: 0.33:1.000:0.633 0/0/1/1:4:81,61:0.46:-0.74:1.000:0.988 0/0/0/1:4:93,53:0.37:-0.68:1.000:0.603 0/1/1/1:4:41,107:0.70:-0.65:1.000:0.984 0/1/1/1:4:73,237:0.73: 1.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:101,179:0.64: 1.25:1.000:0.642 0/0/1/1:4:77,107:0.59:-0.14:1.000:0.847 0/0/1/1:4:112,90:0.48: 0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,142:0.67: 0.23:1.000:0.904 0/1/1/1:4:49,185:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,120:0.65:-0.14:1.000:0.753 0/1/1/1:4:31,180:0.81: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,89:0.32: 1.10:1.000:0.953 0/0/0/1:4:54,28:0.34:-1.61:1.000:0.888 0/0/1/1:4:113,81:0.44: 0.01:1.000:0.972 0/0/1/1:4:60,46:0.47:-1.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,75:0.55:-0.74:1.000:0.977 0/1/1/1:4:41,94:0.68:-0.84:1.000:0.951 0/0/1/1:4:115,139:0.57: 0.87:1.000:0.954 0/1/1/1:4:56,116:0.66:-0.31:1.000:0.885 0/1/1/1:4:32,169:0.80: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,65:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,148:0.57: 1.06:1.000:0.941 0/0/0/1:4:118,68:0.37:-0.11:1.000:0.556 0/0/1/1:4:155,197:0.58: 2.29:1.000:0.928 0/0/1/1:4:63,51:0.48:-1.14:0.999:0.996 0/0/1/1:4:93,147:0.62: 0.67:1.000:0.620 0/1/1/1:4:21,61:0.71:-1.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,137:0.62: 0.40:1.000:0.549 0/1/1/1:4:51,112:0.67:-0.44:1.000:0.929 0/1/1/1:4:57,108:0.65:-0.41:1.000:0.770 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,64:0.38:-0.29:1.000:0.525 0/0/1/1:4:109,149:0.59: 0.93:1.000:0.866 0/1/1/1:4:79,150:0.65: 0.51:1.000:0.774 0/0/1/1:4:104,74:0.44:-0.22:1.000:0.968 0/0/0/1:4:109,48:0.29:-0.52:1.000:0.993 0/1/1/1:4:81,141:0.63: 0.41:1.000:0.603 0/0/1/1:4:89,137:0.61: 0.47:1.000:0.677 0/0/0/1:4:96,53:0.36:-0.64:1.000:0.725 0/0/1/1:4:48,60:0.57:-1.23:1.000:0.938 0/1/1/1:4:18,145:0.84:-0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,38:0.42:-1.42:1.000:0.908 0/1/1/1:4:63,105:0.63:-0.37:1.000:0.502 0/1/1/1:4:66,130:0.65: 0.04:1.000:0.828 0/0/1/1:4:42,42:0.53:-1.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,43:0.41:-1.22:1.000:0.870 0/0/1/1:4:81,55:0.42:-0.83:1.000:0.931 0/0/1/1:4:169,223:0.58: 2.86:1.000:0.900 0/1/1/1:4:42,192:0.78: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,56:0.35:-0.48:1.000:0.803 0/0/1/1:4:49,31:0.40:-1.64:1.000:0.801 0/0/1/1:4:89,68:0.46:-0.52:1.000:0.990 0/1/1/1:4:52,220:0.77: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,134:0.72:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,53:0.38:-0.73:1.000:0.538 0/0/1/1:4:51,47:0.52:-1.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:203,93:0.30: 1.48:1.000:0.986 0/0/1/1:4:103,159:0.61: 0.99:1.000:0.671 0/0/0/1:4:184,74:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,91:0.65:-0.78:1.000:0.771 0/0/0/1:4:223,84:0.24: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,87:0.37: 0.67:1.000:0.612 0/0/0/1:4:147,67:0.30: 0.30:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,41:0.64:-1.88:1.000:0.742 0/0/1/1:4:45,29:0.41:-1.72:1.000:0.847 0/0/1/1:4:125,150:0.57: 1.18:1.000:0.957 0/0/1/1:4:99,162:0.62: 0.97:1.000:0.541 0/0/0/1:4:152,80:0.34: 0.56:1.000:0.859 0/0/1/1:4:167,101:0.39: 1.08:1.000:0.649 0/1/1/1:4:42,77:0.64:-1.07:1.000:0.711 0/1/1/1:4:65,148:0.68: 0.28:1.000:0.948 0/0/1/1:4:82,64:0.47:-0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,147:0.59: 0.92:1.000:0.889 0/1/1/1:4:35,181:0.79: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,61:0.42:-0.58:1.000:0.900 0/0/1/1:4:85,59:0.43:-0.71:1.000:0.952 0/0/1/1:4:101,156:0.61: 0.92:1.000:0.670 0/0/0/1:4:135,70:0.34: 0.17:1.000:0.888 0/0/0/1:4:144,81:0.36: 0.46:0.999:0.656 0/0/0/1:4:106,51:0.31:-0.52:1.000:0.967 0/1/1/1:4:62,124:0.66:-0.11:1.000:0.847 0/0/0/1:4:59,32:0.35:-1.48:1.000:0.782 0/1/1/1:4:66,121:0.64:-0.09:1.000:0.711 0/0/1/1:4:75,55:0.45:-0.91:1.000:0.981 0/0/1/1:4:102,117:0.56: 0.37:1.000:0.971 0/1/1/1:4:76,132:0.63: 0.21:1.000:0.598 0/0/1/1:4:35,37:0.54:-1.75:1.000:0.986 0/1/1/1:4:57,268:0.78: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,94:0.33: 1.28:1.000:0.937 0/0/0/1:4:186,60:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,61:0.33:-0.15:1.000:0.937 0/0/0/1:4:114,65:0.37:-0.21:1.000:0.601 0/1/1/1:4:107,181:0.63: 1.36:1.000:0.537 0/0/1/1:4:151,97:0.41: 0.79:1.000:0.839 0/1/1/1:4:70,118:0.63:-0.08:1.000:0.529 0/0/1/1:4:69,103:0.61:-0.31:1.000:0.737 -chr4.1 2773590 chr4.1_002773590 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:74,26:0.27: 0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,38:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,44:0.42: 0.91:1.000:0.929 0/0/0/1:4:69,27:0.29: 0.72:1.000:0.994 0/1/1/1:4:28,64:0.64: 0.57:1.000:0.692 0/0/0/1:4:97,42:0.30: 2.35:1.000:0.981 0/0/1/1:4:16,19:0.52:-1.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,53:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,70:0.66: 0.76:1.000:0.876 0/0/0/1:4:10,4:0.29:-2.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:11,6:0.35:-2.27:1.000:0.795 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,42:0.47: 0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,42:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:68,19:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,47:0.42: 1.25:1.000:0.899 0/0/1/1:4:43,53:0.53: 0.72:0.999:0.994 0/0/1/1:4:64,61:0.47: 1.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,53:0.45: 1.40:1.000:0.980 0/0/0/1:4:77,25:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,3:0.37:-2.61:1.000:0.569 0/0/1/1:4:45,51:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,45:0.45: 0.76:1.000:0.979 0/0/1/1:4:35,50:0.55: 0.31:1.000:0.975 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,25:0.25: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,59:0.49: 1.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,60:0.63: 0.42:1.000:0.554 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,18:0.19: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,80:0.68: 1.14:1.000:0.958 0/0/1/1:4:51,42:0.44: 0.61:1.000:0.965 0/0/1/1:4:2,4:0.62:-2.69:1.000:0.606 0/1/1/1:4:4,10:0.66:-2.38:1.000:0.836 0/0/0:3:5,0:0.00:-2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,24:0.24: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,17:0.19: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,47:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,20:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,45:0.56:-0.07:1.000:0.960 0/0/0/1:4:72,27:0.28: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,19:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,45:0.61:-0.34:1.000:0.654 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,51:0.46: 1.14:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,51:0.77:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,48:0.55: 0.19:1.000:0.978 0/0/0/1:4:56,16:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,10:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,26:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,15:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,17:0.22: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,45:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,35:0.43: 0.12:1.000:0.935 0/0/0/1:4:65,20:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,27:0.42:-0.53:1.000:0.904 0/1/1/1:4:19,55:0.68:-0.11:1.000:0.949 0/0/0/0/1/1:6:41,14:0.26:-0.83:1.000:0.598 0/0/0/1:4:35,8:0.19:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.29: 0.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:46,42:0.46: 0.42:1.000:0.988 0/0/0/1:4:36,18:0.33:-0.87:1.000:0.912 0/0/0/1:4:71,13:0.16: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,12:0.13: 0.61:1.000:0.935 0/0/0/1:4:26,4:0.14:-1.78:1.000:0.958 0/0/0/1:4:52,21:0.29:-0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,16:0.20: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,24:0.28: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:57,18:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,31:0.74:-1.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:69,15:0.18: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,24:0.27: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,46:0.53: 0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,33:0.43:-0.07:1.000:0.941 0/0/0/1:4:50,8:0.14:-0.72:1.000:0.974 0/0/1/1:4:41,35:0.45:-0.04:1.000:0.976 0/0/1/1:4:36,40:0.51:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,14:0.25:-0.75:0.999:0.999 0/0/1/1:4:33,29:0.45:-0.57:1.000:0.983 0/0/1/1:4:32,46:0.56: 0.04:1.000:0.973 0/0/1/1:4:41,39:0.47: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,36:0.45: 0.04:0.989:0.977 0/0/1/1:4:31,38:0.52:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,30:0.47:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,32:0.53:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:34,24:0.40:-0.72:1.000:0.826 0/0/0/1:4:67,19:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,22:0.35:-0.53:1.000:0.824 0/0/0/1:4:59,20:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,17:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,22:0.35:-0.53:1.000:0.824 0/0/1/1:4:34,29:0.45:-0.53:1.000:0.976 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,10:0.19:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,39:0.52:-0.22:1.000:0.994 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,39:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,15:0.41:-1.55:1.000:0.845 0/0/1/1:4:37,28:0.42:-0.45:1.000:0.913 0/0/1/1:4:18,25:0.55:-1.28:1.000:0.981 0/0/0/1:4:55,10:0.16:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,34:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/0:4:71,7:0.09: 0.04:1.000:0.921 0/0/1/1:4:44,58:0.54: 0.95:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,46:0.56: 0.04:1.000:0.973 0/0/1/1:4:19,29:0.57:-1.10:1.000:0.953 0/0/0/1:4:100,28:0.23: 1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,40:0.65:-0.75:0.999:0.746 0/0/0/1:4:69,21:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,15:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,18:0.27:-0.30:1.000:0.998 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,13:0.29:-1.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,25:0.54:-1.25:1.000:0.988 0/0/1/1:4:34,35:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,16:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,26:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,10:0.12: 0.27:1.000:0.818 0/0/1/1:4:71,58:0.44: 1.97:1.000:0.961 0/0/1/1:4:22,29:0.54:-0.98:1.000:0.988 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,16:0.29:-0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:56,15:0.22:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,11:0.26:-1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,16:0.26:-0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:94,24:0.21: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,7:0.13:-0.83:1.000:0.921 0/0/1/1:4:31,32:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,17:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,35:0.28: 1.82:1.000:0.994 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.56:-1.70:1.000:0.969 0/1/1/1:4:14,36:0.66:-1.02:1.000:0.868 0/0/1/1:4:21,35:0.58:-0.79:1.000:0.897 0/0/0/1:4:35,19:0.35:-0.87:1.000:0.804 0/0/1/1:4:31,24:0.42:-0.83:1.000:0.931 0/0/0/1:4:63,26:0.29: 0.46:1.000:0.989 0/0/0/1:4:27,11:0.29:-1.47:1.000:0.990 0/0/1/1:4:46,55:0.52: 0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,16:0.15: 1.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:71,21:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,44:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,37:0.41: 0.38:1.000:0.890 0/0/1/1:4:35,38:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,29:0.26: 1.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,60:0.53: 1.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:4,4:0.48:-2.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,19:0.26:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,27:0.29: 0.65:1.000:0.992 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,39:0.44: 0.38:1.000:0.959 0/0/1/1:4:41,48:0.52: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,20:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,36:0.32: 1.33:1.000:0.950 0/0/0/1:4:81,21:0.21: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,32:0.33: 0.72:1.000:0.912 0/1/1/1:4:21,65:0.69: 0.34:1.000:0.971 0/1/1/1:4:33,84:0.66: 1.52:1.000:0.857 0/0/1/1:4:43,62:0.56: 1.06:1.000:0.973 0/0/0/1:4:48,16:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,37:0.45: 0.12:0.999:0.978 0/0/1/1:4:47,35:0.42: 0.19:1.000:0.897 0/0/0/1:4:75,19:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,28:0.31: 0.57:1.000:0.979 0/0/1/1:4:28,44:0.57:-0.19:1.000:0.939 0/0/1/1:4:48,52:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,29:0.30: 0.72:1.000:0.981 0/0/0/1:4:43,16:0.28:-0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,54:0.67:-0.11:1.000:0.910 0/0/0/1:4:109,30:0.22: 2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,20:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,45:0.46: 0.65:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,34:0.40: 0.27:1.000:0.757 0/0/0/1:4:76,23:0.24: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,38:0.26: 2.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,47:0.43: 1.10:1.000:0.949 0/0/1/1:4:25,32:0.53:-0.75:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,20:0.24: 0.38:1.000:1.000 -chr4.1 2838673 chr4.1_002838673 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:47,43:0.43:-0.22:1.000:0.952 0/0/0/1:4:29,17:0.33:-1.22:1.000:0.928 0/0/0/1:4:47,18:0.24:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,20:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,27:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,6:0.19:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.24:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,16:0.27:-1.08:1.000:0.998 0/0/0/0:4:78,2:0.02:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,23:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,49:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,18:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,26:0.34:-0.70:1.000:0.897 0/0/0/1:4:39,19:0.29:-0.95:1.000:0.993 0/0/0/1:4:28,11:0.24:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,31:0.37:-0.56:0.999:0.560 0/0/1/1:4:19,32:0.57:-1.11:1.000:0.944 0/0/0/1:4:63,27:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,82:0.50: 1.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,30:0.31:-0.31:1.000:0.976 0/0/0/1:4:41,11:0.18:-1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,22:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,14:0.27:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,43:0.33: 0.35:1.000:0.911 0/0/1/1:4:19,19:0.45:-1.40:1.000:0.983 0/0/0/1:4:34,8:0.17:-1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,5:0.18:-1.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,64:0.58: 0.03:1.000:0.927 0/0/0/1:4:70,33:0.28: 0.08:1.000:0.995 0/0/0:3:30,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.17:-1.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,29:0.29:-0.29:1.000:0.990 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,68:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,60:0.55:-0.01:1.000:0.978 0/0/0/1:4:70,36:0.30: 0.14:1.000:0.986 0/0/1/1:4:47,51:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,37:0.26: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,30:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,36:0.25: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.26:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,18:0.16:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:90,31:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,25:0.20: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,44:0.26: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,35:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,29:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,64:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,40:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,28:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:137,53:0.24: 2.05:1.000:0.611 0/0/0/1:4:147,55:0.24: 2.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,25:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:151,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,44:0.30: 0.69:1.000:0.987 0/0/0/1:4:78,25:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,42:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,19:0.16: 0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,24:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,26:0.16: 1.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:44,22:0.29:-0.76:1.000:0.990 0/0/0/1:4:118,43:0.23: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,37:0.27: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,33:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,28:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,90:0.65: 0.58:1.000:0.825 0/0/0/1:4:70,31:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,27:0.20: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,47:0.24: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,46:0.29: 0.94:1.000:0.993 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,75:0.75:-0.20:0.999:0.999 0/0/0/1:4:110,44:0.25: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,22:0.33:-0.92:1.000:0.915 0/0/0/1:4:120,49:0.25: 1.58:0.989:0.999 0/0/0/1:4:170,44:0.18: 2.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,32:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,41:0.28: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:140,49:0.22: 2.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,72:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,48:0.44:-0.01:1.000:0.965 0/0/0/1:4:123,42:0.22: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,18:0.22:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,38:0.19: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,48:0.30: 0.92:1.000:0.983 0/0/0/1:4:78,48:0.34: 0.60:1.000:0.875 0/0/1/1:4:73,75:0.46: 1.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:102,133:0.52: 3.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,35:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,44:0.29: 0.78:1.000:0.992 0/0/0/1:4:76,33:0.26: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:169,58:0.22: 2.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,53:0.34: 0.87:1.000:0.855 0/0/0/1:4:83,32:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,38:0.23: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,27:0.44:-1.01:1.000:0.974 0/0/0/1:4:94,27:0.19: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,29:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,50:0.25: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,19:0.29:-0.97:1.000:0.990 0/0/0/1:4:139,69:0.29: 2.46:0.999:0.991 0/0/1/1:4:64,104:0.56: 1.55:1.000:0.961 0/0/0/1:4:68,36:0.31: 0.10:1.000:0.979 0/0/0/1:4:116,46:0.25: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,63:0.28: 2.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:83,22:0.18: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:145,1:0.01: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,39:0.30: 0.37:1.000:0.988 0/0/0/1:4:54,30:0.32:-0.36:1.000:0.962 0/0/0/1:4:103,39:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,44:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,15:0.36:-1.42:1.000:0.657 0/0/0/1:4:92,33:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,46:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,38:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,27:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,72:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,27:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,40:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,15:0.20:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,29:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,32:0.27: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,18:0.20:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,60:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,46:0.31: 0.74:1.000:0.976 0/0/0/1:4:100,36:0.23: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,38:0.26: 0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,70:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,51:0.26: 1.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,19:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,39:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,32:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,34:0.25: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,16:0.20:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,24:0.28:-0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,22:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,19:0.26:-0.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:32,13:0.25:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,28:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,11:0.21:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,35:0.52:-0.88:1.000:0.994 0/0/0/1:4:74,38:0.30: 0.28:1.000:0.986 0/0/0/1:4:53,24:0.27:-0.51:1.000:0.997 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,21:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,27:0.33:-0.63:1.000:0.906 0/0/0/1:4:42,22:0.30:-0.81:1.000:0.982 0/0/0/1:4:25,10:0.25:-1.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,39:0.52:-0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:32,12:0.24:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,9:0.18:-1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,16:0.23:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,15:0.22:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,34:0.36:-0.36:0.999:0.665 0/0/0/1:4:46,19:0.25:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,13:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.25:-1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,16:0.29:-1.17:1.000:0.990 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,20:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,19:0.28:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,14:0.24:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,24:0.52:-1.31:1.000:0.995 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,14:0.27:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,19:0.29:-0.97:1.000:0.990 0/0/0/1:4:52,12:0.16:-0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,20:0.27:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,18:0.20:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,11:0.19:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,32:0.46:-0.83:1.000:0.988 -chr4.1 3138318 chr4.1_003138318 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,187:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,46:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,71:0.54:-1.51:1.000:0.987 0/1/1/1:4:49,133:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,133:0.52: 2.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,92:0.46: 0.46:1.000:0.988 0/0/1/1:4:54,68:0.58:-1.92:1.000:0.916 0/0/1/1:4:91,71:0.46:-0.83:1.000:0.988 0/0/1/1:4:90,73:0.47:-0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:62,68:0.55:-1.70:1.000:0.984 0/0/1/1:4:83,53:0.41:-1.54:1.000:0.882 0/1/1/1:4:44,125:0.76:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,92:0.59:-0.81:1.000:0.883 0/1/1/1:4:56,128:0.72:-0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,128:0.71:-0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:50,138:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,108:0.52: 0.71:0.999:0.996 0/0/1/1:4:108,104:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,146:0.67: 0.90:1.000:0.911 0/0/1/1:4:134,103:0.46: 1.19:1.000:0.986 1/1/1/1:4:3,137:0.98:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,49:0.27: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,98:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,109:0.74:-1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,48:0.72:-3.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,101:0.54: 0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:132,43:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:152,54:0.29: 0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:64,145:0.72: 0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,127:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,100:0.46: 1.03:1.000:0.985 0/0/1/1:4:66,64:0.51:-1.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,39:0.71:-3.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:75,66:0.49:-1.40:1.000:0.996 0/1/1:3:21,27:0.58:-3.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,78:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,71:0.49:-1.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,134:0.73:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:164,44:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,89:0.49:-0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,198:1.00: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,212:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,166:0.81: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,115:0.71:-0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:186,54:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,145:0.69: 0.65:1.000:0.973 0/0/1/1:4:106,119:0.55: 0.87:1.000:0.979 0/0/1/1:4:45,37:0.47:-3.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:99,89:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,164:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,85:0.43: 0.38:1.000:0.956 0/1/1/1:4:62,168:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,145:0.79:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,111:0.48: 1.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,90:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,103:0.45: 1.27:1.000:0.982 0/1/1/1:4:40,114:0.76:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,71:0.29: 1.90:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,95:0.46: 0.60:1.000:0.990 0/1/1/1/1/1:6:51,144:0.76: 0.06:1.000:0.622 0/1/1/1:4:63,148:0.72: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,114:0.56: 0.57:1.000:0.974 0/0/1/1:4:152,139:0.50: 2.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,109:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,155:0.72: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,98:0.39: 1.98:1.000:0.714 0/1/1/1:4:43,100:0.72:-1.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,131:0.72:-0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,151:0.70: 0.84:1.000:0.981 0/0/0/1:4:143,39:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,196:0.80: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,67:0.52:-1.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:186,48:0.23: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,154:0.72: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,145:0.71: 0.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:42,134:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,92:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,169:0.76: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,167:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,57:0.27: 1.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,118:0.71:-0.56:0.999:0.991 0/0/1/1:4:127,101:0.47: 0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:124,117:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,81:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,93:0.47: 0.41:0.989:0.992 0/0/1/1:4:116,122:0.54: 1.22:1.000:0.990 0/1/1/1:4:44,129:0.77:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,134:0.73:-0.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,134:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,81:0.44: 0.00:1.000:0.971 0/1/1/1:4:44,118:0.75:-0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,141:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,173:0.75: 1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,104:0.77:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,124:0.57: 0.92:1.000:0.950 0/0/1/1:4:122,87:0.44: 0.44:1.000:0.966 0/1/1/1:4:62,124:0.69:-0.19:1.000:0.971 0/0/1/1:4:104,77:0.45:-0.32:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,210:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,110:0.53: 0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:52,114:0.71:-0.73:1.000:0.991 0/0/1/1:4:100,128:0.58: 0.95:1.000:0.898 0/0/1/1:4:88,83:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,109:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,125:0.72:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,131:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,147:0.73: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,128:0.80:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,141:0.60: 1.41:1.000:0.810 0/0/1/1:4:86,85:0.52:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,85:0.45: 0.11:1.000:0.984 0/0/1/1:4:131,90:0.43: 0.76:1.000:0.948 0/0/1/1:4:116,116:0.52: 1.06:0.999:0.994 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,122:0.78:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,192:0.77: 1.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,122:0.72:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,128:0.70:-0.13:1.000:0.987 0/0/0/1:4:161,58:0.29: 0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,146:0.82:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,168:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,84:0.48:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,171:0.75: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,86:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,99:0.56:-0.27:1.000:0.961 0/1/1/1:4:68,166:0.73: 1.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,121:0.53: 1.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:137,33:0.22:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,132:0.77:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,150:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,138:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,74:0.51:-1.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,174:0.78: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,154:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,168:0.78: 0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,86:0.47: 0.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:96,86:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,157:0.82: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,141:0.69: 0.49:1.000:0.973 0/0/1/1:4:110,101:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,137:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,119:0.73:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,191:0.79: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,122:0.51: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,91:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,142:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,111:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,100:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,117:0.54: 0.84:1.000:0.984 0/0/1/1:4:99,89:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,86:0.58:-1.08:1.000:0.895 0/1/1/1:4:36,91:0.74:-1.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,226:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,137:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,92:0.44: 0.73:1.000:0.969 0/0/1/1:4:87,93:0.54:-0.35:1.000:0.988 0/0/1/1:4:99,72:0.44:-0.59:1.000:0.973 0/1/1/1:4:65,146:0.71: 0.49:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,124:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,70:0.52:-1.38:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,173:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,94:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,94:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,145:0.77: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,126:0.80:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,59:0.33: 0.03:0.999:0.927 0/0/1/1:4:103,94:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,69:0.43:-0.67:1.000:0.956 0/1/1/1:4:45,129:0.76:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,85:0.49:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,84:0.48:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,127:0.79:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,114:0.78:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,63:0.48:-1.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,140:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,98:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,92:0.46: 0.44:1.000:0.989 0/1/1/1:4:60,105:0.66:-0.75:1.000:0.857 0/0/1/1:4:92,108:0.56: 0.19:1.000:0.963 0/1/1/1:4:63,164:0.74: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,115:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,115:0.73:-0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,80:0.42: 0.19:1.000:0.927 -chr4.1 3186465 chr4.1_003186465 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:220,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:131,1:.:-1.93:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.36:0.999:. ./.:4:280,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:104,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:69,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:357,1:.: 2.39:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:285,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:104,1:.:-2.45:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.49:1.000:. ./.:3:59,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:372,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:202,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:221,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:222,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:264,2:.: 0.63:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.37:0.999:. ./.:4:269,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.78:0.989:. ./.:4:266,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:206,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:177,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:350,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.49:0.999:. ./.:4:260,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:179,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:319,2:.: 1.69:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:226,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.02:0.999:. ./.:4:200,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:363,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:290,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.02:1.000:. -chr4.1 3417640 chr4.1_003417640 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:51,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.85:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.28:1.000:. ./.:4:35,8:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:39,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,4:.: 0.53:1.000:. ./.:4:38,9:.: 1.05:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.31:0.999:. ./.:4:40,5:.: 0.88:1.000:. ./.:4:40,5:.: 0.88:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:33,7:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,15:.:-0.16:1.000:. ./.:4:42,5:.: 1.05:1.000:. ./.:4:45,2:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.71:1.000:. ./.:3:10,7:.:-1.54:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:30,6:.: 0.10:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:34,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.16:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:29,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.76:1.000:. ./.:6:25,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:29,6:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:35,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:43,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:34,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.85:0.999:. ./.:4:23,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:25,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.68:0.989:. ./.:4:25,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:36,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:30,6:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.28:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.85:0.999:. ./.:4:36,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:6,6:.:-1.97:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:20,3:.:-1.02:1.000:. ./.:4:14,2:.:-1.63:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.37:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:20,3:.:-1.02:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,5:.: 0.45:1.000:. ./.:4:19,3:.:-1.11:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.54:1.000:. ./.:4:14,3:.:-1.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.19:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:48,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:34,6:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.24:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.01:0.999:. ./.:4:64,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.85:1.000:. ./.:4:37,5:.: 0.62:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:20,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:75,0:.: 3.47:1.000:. ./.:4:36,7:.: 0.71:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:42,8:.: 1.31:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:38,6:.: 0.79:1.000:. -chr4.1 3509124 chr4.1_003509124 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:37,7:0.19: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.31: 0.12:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,25:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,10:0.30: 0.45:1.000:0.981 0/0/1/1:4:24,16:0.41: 0.65:1.000:0.890 0/1/1/1:4:11,43:0.76: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.55:-0.95:1.000:0.975 0/0/1/1:4:33,26:0.45: 1.92:1.000:0.979 0/0/1/1:4:20,18:0.48: 0.52:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.29:-1.74:1.000:0.993 0/0/0/1:4:34,11:0.28: 0.98:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,18:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,7:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,5:0.13: 0.98:1.000:0.940 0/0/1/1:4:26,34:0.56: 1.98:1.000:0.970 0/1/1/1:4:15,49:0.73: 2.25:0.999:0.998 0/0/1/1:4:30,27:0.48: 1.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:30,10:0.29: 0.65:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,33:0.72: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,17:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,16:0.37: 1.05:1.000:0.562 0/0/0/1:4:31,12:0.31: 0.85:1.000:0.971 0/0/0/1:4:3,1:0.29:-1.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,31:0.56: 1.65:1.000:0.974 0/0/1/1:4:36,24:0.41: 1.98:1.000:0.890 0/0/1/1:4:29,17:0.39: 1.05:1.000:0.676 0/0/1/1:4:23,23:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,21:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,29:0.58: 1.25:1.000:0.916 0/0/1/1:4:16,22:0.57: 0.52:1.000:0.950 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.74:1.000:0.997 1/1/1:3:0,1:1.00:-1.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,31:0.72: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,18:0.37: 1.38:1.000:0.504 0/0/1/1:4:30,19:0.40: 1.25:1.000:0.824 0/0/1/1:4:17,12:0.43:-0.08:1.000:0.936 0/0/1/1:4:20,18:0.48: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,10:0.52:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:22,6:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,9:0.38:-0.35:1.000:0.575 0/1/1/1:4:9,18:0.64:-0.21:1.000:0.738 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.58:-0.55:1.000:0.919 0/1/1/1:4:11,28:0.69: 0.59:1.000:0.972 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-1.61:1.000:0.738 0/1/1/1:4:5,11:0.66:-0.95:1.000:0.884 0/0/1/1:4:6,8:0.56:-1.08:1.000:0.964 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.95:1.000:0.727 0/1/1/1:4:5,20:0.76:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,16:0.81:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,19:0.68:-0.21:1.000:0.944 0/1/1/1:4:8,30:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,21:0.81:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,13:0.60:-0.61:1.000:0.762 0/1/1/1:4:2,14:0.85:-0.95:1.000:0.985 0/0/1/1:4:15,10:0.41:-0.35:1.000:0.890 0/0/0/1/1/1:6:9,7:0.45:-0.95:1.000:0.723 0/0/0/1:4:9,3:0.29:-1.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:20,19:0.49: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,14:0.57:-0.41:1.000:0.940 0/1/1/1:4:6,15:0.69:-0.61:1.000:0.966 0/0/0/0:4:31,3:0.11: 0.25:1.000:0.628 0/0/1/1:4:9,13:0.58:-0.55:1.000:0.919 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,4:0.17:-0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,17:0.38: 1.12:1.000:0.594 0/1/1/1:4:4,18:0.79:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.38:-1.08:1.000:0.543 0/0/1/1:4:18,16:0.47: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:27,8:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:18,6:0.29:-0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,9:0.36:-0.21:1.000:0.715 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,6:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,28:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.88:0.999:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.33:-0.68:1.000:0.924 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,4:0.15: 0.12:1.000:0.989 0/0/1/1:4:13,9:0.42:-0.55:0.989:0.923 0/0/0/1:4:19,7:0.30:-0.28:1.000:0.982 0/0/0/1:4:16,3:0.19:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.27:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,9:0.44:-0.61:1.000:0.966 0/0/1/1:4:12,14:0.53:-0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:16,4:0.24:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,5:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.41:-0.48:1.000:0.846 0/0/0/1:4:17,3:0.18:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,6:0.30:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:9,3:0.29:-1.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:16,3:0.19:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.19:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,13:0.56:-0.48:1.000:0.972 0/1/1/1:4:3,8:0.70:-1.28:1.000:0.982 0/1/1/1:4:4,12:0.72:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,5:0.38:-1.08:1.000:0.543 0/1/1/1:4:3,6:0.64:-1.41:1.000:0.738 0/0/0/1:4:13,6:0.34:-0.75:1.000:0.851 0/0/0/1:4:17,5:0.27:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:19,3:0.16:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,7:0.19: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,31:0.72: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,8:0.26: 0.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:9,1:0.12:-1.35:1.000:0.776 0/0/1/1:4:27,25:0.48: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,6:0.41:-1.01:0.999:0.890 0/0/1/1:4:12,11:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:15,5:0.29:-0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:9,8:0.47:-0.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,11:0.63:-0.88:1.000:0.530 0/0/0/1:4:19,4:0.21:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,13:0.63:-0.68:1.000:0.564 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-1.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:24,7:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,6:0.64:-1.41:1.000:0.738 0/1/1/1:4:5,15:0.72:-0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,37:0.75: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,4:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,11:0.63:-0.88:1.000:0.530 0/1/1/1:4:4,9:0.67:-1.15:1.000:0.906 0/0/1/1:4:10,7:0.42:-0.88:1.000:0.931 0/0/0/1:4:12,3:0.24:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.70:-0.55:1.000:0.982 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.95:1.000:0.727 0/0/0/1:4:42,11:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,10:0.52:-0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-1.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:9,15:0.61:-0.41:1.000:0.709 0/0/1/1:4:22,17:0.45: 0.59:1.000:0.975 0/0/0/1:4:25,10:0.32: 0.32:1.000:0.961 0/1/1/1:4:3,9:0.72:-1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,6:0.47:-1.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-1.41:1.000:0.982 0/0/0/1:4:14,5:0.30:-0.75:1.000:0.987 0/0/0/0:4:10,1:0.11:-1.28:1.000:0.526 0/1/1/1:4:10,26:0.69: 0.39:1.000:0.977 0/1/1/1:4:4,14:0.74:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,16:0.38: 0.92:1.000:0.615 0/0/1/1:4:21,25:0.54: 1.05:1.000:0.989 0/1/1/1:4:17,33:0.64: 1.32:1.000:0.673 0/0/0/1:4:23,6:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,24:0.48: 1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,33:0.77: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,25:0.64: 0.52:1.000:0.651 0/1/1/1:4:10,32:0.73: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,2:0.36:-1.61:1.000:0.715 0/1/1/1:4:8,44:0.82: 1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,22:0.45: 1.32:1.000:0.979 0/0/1/1:4:24,25:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,22:0.46: 1.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:20,18:0.48: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,22:0.44: 1.38:1.000:0.969 0/0/1/1:4:29,17:0.39: 1.05:1.000:0.676 0/1/1/1:4:13,25:0.64: 0.52:1.000:0.651 0/0/1/1:4:23,21:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,10:0.30: 0.45:1.000:0.981 0/0/1/1:4:30,26:0.47: 1.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,18:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,6:0.14: 1.38:1.000:0.973 0/1/1/1:4:13,27:0.65: 0.65:1.000:0.807 0/0/0/1:4:31,10:0.28: 0.72:0.999:0.995 0/1/1/1:4:13,31:0.68: 0.92:1.000:0.946 0/0/1/1:4:27,16:0.39: 0.85:1.000:0.700 0/1/1/1:4:10,40:0.76: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,23:0.62: 0.39:1.000:0.564 0/0/1/1:4:17,19:0.52: 0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,10:0.41:-0.35:1.000:0.890 0/0/1/1:4:16,16:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,9:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,27:0.51: 1.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,31:0.66: 0.98:1.000:0.891 0/0/1/1:4:17,26:0.59: 0.85:1.000:0.860 0/1/1/1:4:9,33:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,23:0.46: 1.38:1.000:0.986 0/0/1/1:4:34,27:0.45: 2.05:1.000:0.981 0/0/0/1:4:32,8:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,8:0.18: 1.52:1.000:0.999 -chr4.1 3843331 chr4.1_003843331 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:33,142:0.80:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,136:0.75:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,201:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,136:0.71: 0.11:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,177:0.76: 1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,99:0.50: 0.21:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,204:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,41:0.46:-2.43:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,67:0.70:-2.33:1.000:0.981 0/1/1/1:4:45,134:0.73:-0.12:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,125:0.70:-0.23:1.000:0.982 0/1/1/1:4:58,132:0.68: 0.16:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,222:1.00: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,185:0.77: 1.30:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,177:0.77: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,60:0.33: 1.28:1.000:0.918 0/1/1/1:4:18,37:0.66:-3.34:1.000:0.847 0/0/1/1:4:101,102:0.49: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,145:0.74: 0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,141:0.84:-0.46:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-3.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,115:0.58: 0.29:1.000:0.928 0/0/1/1:4:106,108:0.50: 0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,181:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,114:0.48: 1.41:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,260:1.00: 1.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,199:0.99: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-3.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,64:0.66:-2.33:1.000:0.896 0/1/1:3:8,28:0.76:-3.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,166:0.75: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,84:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,131:0.60: 0.76:1.000:0.785 0/0/1/1:4:83,120:0.58: 0.50:1.000:0.924 0/0/1/1:4:100,142:0.57: 1.51:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,200:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,129:0.77:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,102:0.56:-0.12:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,180:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,148:0.78: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,95:0.54:-0.33:1.000:0.986 0/1/1/1:4:43,177:0.79: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,138:0.70: 0.24:1.000:0.983 0/1/1/1:4:41,115:0.72:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,93:0.56:-0.56:1.000:0.966 0/1/1/1:4:46,153:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,132:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,164:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,133:0.75:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,161:0.73: 0.78:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,201:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,148:0.75: 0.24:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:47,140:0.73: 0.08:1.000:0.680 0/1/1/1:4:47,170:0.77: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,93:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,165:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,132:0.81:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,145:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,149:0.68: 0.81:1.000:0.944 0/1/1/1:4:34,102:0.73:-1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,111:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,151:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,87:0.53:-0.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:43,166:0.78: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-2.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,93:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,147:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,126:0.70:-0.23:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,162:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,100:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,172:0.80: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,162:0.76: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,161:1.00:-0.59:0.999:1.000 0/1/1/1:4:38,153:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,112:0.53: 0.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:35,130:0.77:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,243:1.00: 1.54:0.989:1.000 0/1/1/1:4:43,131:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,104:0.76:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,108:0.78:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,104:0.49: 0.60:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,133:0.71:-0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,204:0.78: 1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,71:0.53:-1.39:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,206:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,151:0.79: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,18:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,159:0.80: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,153:0.75: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,102:0.53: 0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:37,103:0.72:-1.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,144:0.78:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,124:0.82:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,130:0.72:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,110:0.76:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,129:0.79:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,130:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,166:0.72: 1.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,168:0.74: 0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,136:0.73:-0.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,122:0.51: 1.25:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,187:1.00: 0.08:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,219:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,121:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,120:0.56: 0.65:1.000:0.965 0/0/1/1:4:73,70:0.49:-1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,127:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,153:0.79: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,149:0.73: 0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,114:0.73:-0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,158:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,145:0.73: 0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,117:0.78:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,92:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,150:0.81:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,82:0.59:-1.26:1.000:0.843 0/1/1/1:4:38,128:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,122:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,86:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,184:0.74: 1.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,58:0.47:-1.50:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,131:0.69: 0.06:1.000:0.969 0/0/1/1:4:105,141:0.56: 1.61:1.000:0.967 0/1/1/1:4:53,151:0.72: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,135:0.75:-0.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,134:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,162:0.79: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,126:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,165:0.75: 0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,108:0.75:-1.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,239:1.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,109:0.48: 1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,170:0.78: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,126:0.76:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,210:1.00: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,164:0.72: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,174:0.80: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,178:0.79: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,62:0.67:-2.43:1.000:0.930 0/1/1/1:4:33,119:0.77:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,77:0.46:-0.36:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,129:0.53: 1.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:92,111:0.53: 0.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,93:0.48: 0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,143:0.81:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,75:0.54:-1.26:1.000:0.986 0/1/1/1:4:31,131:0.79:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,177:1.00:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,206:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,170:0.78: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,146:0.77: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,152:0.77: 0.24:0.999:1.000 0/1/1/1:4:38,146:0.78: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,101:0.55:-0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:44,122:0.72:-0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,135:0.74:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,79:0.49:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,108:0.56: 0.11:1.000:0.965 0/0/1/1:4:73,84:0.52:-0.69:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,214:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,187:0.72: 1.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,104:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,144:0.74: 0.19:1.000:0.998 1/1/1/1:4:7,193:0.96: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,150:0.71: 0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:130,136:0.50: 2.13:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,222:1.00: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,127:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,154:0.73: 0.55:1.000:0.998 -chr4.1 4013831 chr4.1_004013831 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:97,28:.: 0.66:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:135,41:.: 2.21:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:92,38:.: 0.81:1.000:. ./.:4:81,21:.:-0.05:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:65,35:.:-0.11:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:82,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:69,13:.:-0.66:0.999:. ./.:4:117,45:.: 1.78:1.000:. ./.:4:103,39:.: 1.17:1.000:. ./.:4:104,41:.: 1.27:1.000:. ./.:4:14,10:.:-2.42:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:77,36:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.88:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:68,25:.:-0.32:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,3:.:-2.94:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.18:1.000:. ./.:3:5,1:.:-2.97:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:44,60:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,28:.: 0.41:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:50,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,38:.: 1.17:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.61:1.000:. ./.:4:55,16:.:-0.99:1.000:. ./.:4:36,14:.:-1.63:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,25:.: 0.41:1.000:. ./.:4:57,24:.:-0.69:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:88,36:.: 0.63:1.000:. ./.:4:45,17:.:-1.27:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,21:.:-0.47:1.000:. ./.:6:86,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.87:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:80,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:93,30:.: 0.60:1.000:. ./.:4:75,14:.:-0.44:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,19:.:-1.17:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:113,41:.: 1.54:1.000:. ./.:4:77,38:.: 0.35:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.38:0.999:. ./.:4:106,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:91,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.11:0.989:. ./.:4:123,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:70,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:85,36:.: 0.53:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.56:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:89,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:88,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:65,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:100,43:.: 1.21:1.000:. ./.:4:46,17:.:-1.23:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.01:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:115,45:.: 1.72:1.000:. ./.:4:95,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,27:.:-0.75:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:84,38:.: 0.56:0.999:. ./.:4:102,44:.: 1.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:103,47:.: 1.42:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,34:.:-0.41:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:77,29:.: 0.08:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,36:.: 0.72:1.000:. ./.:4:113,45:.: 1.66:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:65,23:.:-0.47:1.000:. ./.:4:55,30:.:-0.56:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:90,20:.: 0.20:1.000:. ./.:4:93,26:.: 0.47:1.000:. ./.:4:100,28:.: 0.75:1.000:. ./.:4:138,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:69,31:.:-0.11:1.000:. ./.:4:87,35:.: 0.56:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:85,28:.: 0.29:1.000:. ./.:4:44,18:.:-1.27:1.000:. ./.:4:111,58:.: 2.00:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:91,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:73,31:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:64,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:62,18:.:-0.72:1.000:. ./.:4:69,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:87,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:72,30:.:-0.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:59,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,32:.: 1.21:1.000:. ./.:4:96,25:.: 0.53:1.000:. ./.:4:72,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:74,21:.:-0.26:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:86,36:.: 0.56:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:73,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:87,34:.: 0.53:1.000:. ./.:4:80,33:.: 0.29:1.000:. ./.:4:57,24:.:-0.69:1.000:. ./.:4:90,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:94,24:.: 0.44:1.000:. ./.:4:92,20:.: 0.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:125,43:.: 1.97:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:54,22:.:-0.84:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.11:1.000:. -chr4.1 4116304 chr4.1_004116304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:269,87:.: 0.80:1.000:. ./.:4:230,147:.: 1.06:1.000:. ./.:4:265,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:266,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:322,66:.: 1.19:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:127,34:.:-1.62:1.000:. ./.:4:262,65:.: 0.44:1.000:. ./.:4:216,102:.: 0.33:1.000:. ./.:4:61,5:.:-2.79:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:237,104:.: 0.61:1.000:. ./.:4:300,132:.: 1.74:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:241,109:.: 0.72:1.000:. ./.:4:268,81:.: 0.71:1.000:. ./.:4:276,48:.: 0.40:0.999:. ./.:4:305,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:298,65:.: 0.88:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:48,15:.:-2.83:1.000:. ./.:4:246,64:.: 0.23:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:33,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:267,63:.: 0.48:1.000:. ./.:4:254,57:.: 0.24:1.000:. ./.:4:243,121:.: 0.90:1.000:. ./.:4:280,68:.: 0.70:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:224,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:223,91:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.89:1.000:. ./.:3:29,0:.:-3.25:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:278,46:.: 0.40:1.000:. ./.:4:255,118:.: 1.01:1.000:. ./.:4:237,116:.: 0.76:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:279,68:.: 0.69:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:312,48:.: 0.85:1.000:. ./.:4:262,72:.: 0.53:1.000:. ./.:4:254,21:.:-0.20:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:253,80:.: 0.51:1.000:. ./.:4:207,105:.: 0.25:1.000:. ./.:4:318,58:.: 1.05:1.000:. ./.:4:206,104:.: 0.23:1.000:. ./.:4:271,112:.: 1.13:1.000:. ./.:4:271,79:.: 0.72:1.000:. ./.:4:236,112:.: 0.70:1.000:. ./.:4:242,55:.: 0.07:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.66:1.000:. ./.:6:195,40:.:-0.70:1.000:. ./.:4:229,58:.:-0.06:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:259,50:.: 0.22:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:239,77:.: 0.30:1.000:. ./.:4:317,117:.: 1.76:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:207,113:.: 0.35:1.000:. ./.:4:243,59:.: 0.13:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:254,75:.: 0.46:1.000:. ./.:4:149,67:.:-0.93:1.000:. ./.:4:237,138:.: 1.03:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:257,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:234,68:.: 0.13:1.000:. ./.:4:244,59:.: 0.14:1.000:. ./.:4:268,68:.: 0.55:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:187,131:.: 0.33:0.999:. ./.:4:260,60:.: 0.35:1.000:. ./.:4:301,77:.: 1.07:1.000:. ./.:4:228,111:.: 0.59:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.23:0.989:. ./.:4:259,118:.: 1.06:1.000:. ./.:4:177,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:239,104:.: 0.64:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:220,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:183,81:.:-0.34:1.000:. ./.:4:213,109:.: 0.38:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:220,99:.: 0.34:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:213,63:.:-0.19:1.000:. ./.:4:192,87:.:-0.16:1.000:. ./.:4:210,124:.: 0.53:1.000:. ./.:4:302,58:.: 0.85:1.000:. ./.:4:285,128:.: 1.50:1.000:. ./.:4:172,54:.:-0.81:1.000:. ./.:4:227,65:.: 0.01:1.000:. ./.:4:170,74:.:-0.59:1.000:. ./.:4:217,89:.: 0.18:1.000:. ./.:4:198,38:.:-0.69:1.000:. ./.:4:256,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:242,84:.: 0.43:1.000:. ./.:4:263,107:.: 0.97:1.000:. ./.:4:315,167:.: 2.36:1.000:. ./.:4:233,118:.: 0.74:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:316,69:.: 1.16:1.000:. ./.:4:234,98:.: 0.50:0.999:. ./.:4:249,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:192,43:.:-0.70:1.000:. ./.:4:206,66:.:-0.24:1.000:. ./.:4:209,54:.:-0.35:1.000:. ./.:4:216,38:.:-0.46:1.000:. ./.:4:291,53:.: 0.65:1.000:. ./.:4:220,48:.:-0.29:1.000:. ./.:4:243,55:.: 0.08:1.000:. ./.:4:242,129:.: 0.98:1.000:. ./.:4:241,57:.: 0.08:1.000:. ./.:4:211,93:.: 0.15:1.000:. ./.:4:239,56:.: 0.04:1.000:. ./.:4:212,43:.:-0.45:1.000:. ./.:4:157,36:.:-1.22:1.000:. ./.:4:167,39:.:-1.06:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:240,63:.: 0.14:1.000:. ./.:4:150,32:.:-1.36:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:247,112:.: 0.84:1.000:. ./.:4:345,70:.: 1.53:1.000:. ./.:4:271,64:.: 0.54:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:208,40:.:-0.54:1.000:. ./.:4:245,59:.: 0.15:1.000:. ./.:4:219,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:237,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:158,94:.:-0.49:1.000:. ./.:4:312,146:.: 2.06:1.000:. ./.:4:294,88:.: 1.12:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:261,55:.: 0.30:1.000:. ./.:4:325,129:.: 2.01:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:280,62:.: 0.62:1.000:. ./.:4:37,10:.:-3.03:1.000:. ./.:4:184,37:.:-0.87:1.000:. ./.:4:283,64:.: 0.69:1.000:. ./.:4:254,64:.: 0.33:1.000:. ./.:4:290,67:.: 0.81:1.000:. ./.:4:256,69:.: 0.41:1.000:. ./.:4:249,107:.: 0.80:1.000:. ./.:4:266,128:.: 1.27:1.000:. ./.:4:234,77:.: 0.24:1.000:. ./.:4:221,48:.:-0.28:1.000:. ./.:4:209,63:.:-0.24:1.000:. ./.:4:258,64:.: 0.38:1.000:. ./.:4:235,62:.: 0.07:1.000:. ./.:4:269,116:.: 1.16:1.000:. ./.:4:218,62:.:-0.14:1.000:. ./.:4:251,185:.: 1.79:0.999:. ./.:4:222,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:222,61:.:-0.11:1.000:. ./.:4:201,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:184,40:.:-0.84:1.000:. ./.:4:224,108:.: 0.50:1.000:. ./.:4:214,101:.: 0.29:1.000:. ./.:4:158,51:.:-1.02:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:272,182:.: 2.01:1.000:. ./.:4:221,59:.:-0.14:1.000:. ./.:4:244,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:260,33:.: 0.02:1.000:. ./.:4:230,112:.: 0.62:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:333,79:.: 1.49:1.000:. ./.:4:223,66:.:-0.03:1.000:. ./.:4:301,136:.: 1.80:1.000:. -chr4.1 4279828 chr4.1_004279828 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:39,149:0.73:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,142:0.76:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,122:0.57:-0.04:1.000:0.944 0/0/1/1:4:77,113:0.51: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,215:0.73: 1.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:120,62:0.32:-0.14:1.000:0.961 0/0/1/1:4:39,66:0.54:-1.77:1.000:0.985 0/0/1/1:4:87,119:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,174:0.73: 0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,23:0.39:-2.89:1.000:0.711 0/0/1/1:4:23,35:0.52:-2.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,181:0.84: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,103:0.57:-0.65:1.000:0.945 0/1/1/1:4:46,216:0.77: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,135:0.57: 0.41:1.000:0.953 0/1/1/1:4:52,185:0.72: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,135:0.48: 1.08:0.999:0.995 0/1/1/1:4:35,151:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,237:0.73: 2.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,72:0.28: 1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,43:0.84:-2.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,61:0.34:-0.48:1.000:0.889 0/0/1/1:4:83,129:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,198:0.79: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,42:0.81:-2.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,75:0.34: 0.32:1.000:0.889 0/0/0/1:4:107,64:0.34:-0.38:1.000:0.859 0/0/1/1:4:73,106:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,77:0.33: 0.49:1.000:0.905 0/0/1/1:4:81,119:0.51: 0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,205:0.72: 1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,102:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,25:0.69:-3.30:1.000:0.972 0/0/1/1:4:27,42:0.52:-2.54:1.000:0.994 1/1/1:3:0,7:1.00:-3.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,69:0.34:-0.10:1.000:0.855 0/0/0/1:4:129,62:0.30: 0.05:1.000:0.980 0/0/0/1:4:120,66:0.33:-0.06:1.000:0.931 0/0/0/1:4:155,84:0.32: 1.06:1.000:0.940 0/0/0/1:4:145,71:0.31: 0.57:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,218:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,186:0.77: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,69:0.33: 0.13:1.000:0.934 0/0/1/1:4:100,138:0.49: 1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,132:0.55: 0.38:1.000:0.975 0/0/0/1:4:119,57:0.30:-0.27:1.000:0.981 0/0/1/1:4:85,112:0.48: 0.17:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-3.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,83:0.49:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,92:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,58:0.36:-0.91:1.000:0.705 0/0/1/1:4:79,128:0.53: 0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,97:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,59:0.30:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:57,105:0.57:-0.57:1.000:0.955 0/0/1/1:4:97,142:0.51: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,102:0.47:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:113,84:0.38: 0.17:1.000:0.570 0/1/1/1:4:35,171:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:60,116:0.58:-0.27:1.000:0.531 0/0/1/1:4:85,129:0.52: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,59:0.34:-0.65:1.000:0.863 0/0/1/1:4:84,152:0.56: 1.00:1.000:0.964 0/0/0/1:4:139,86:0.35: 0.76:1.000:0.814 0/0/1/1:4:89,115:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:143,57:0.28: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,92:0.56:-0.95:1.000:0.973 0/0/1/1:4:90,103:0.46: 0.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:75,110:0.51:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,108:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,156:0.55: 1.19:1.000:0.976 0/1/1/1:4:27,124:0.76:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,125:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,134:0.59: 0.21:1.000:0.833 0/1/1/1:4:37,159:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,155:0.70: 0.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:58,102:0.55:-0.61:1.000:0.975 0/0/1/1:4:100,135:0.49: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,184:0.73: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,48:0.25: 0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,198:1.00: 0.19:0.999:1.000 0/0/1/1:4:79,144:0.56: 0.72:1.000:0.961 0/0/1/1:4:90,141:0.52: 0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,108:0.59:-0.59:1.000:0.853 0/0/1/1:4:81,127:0.52: 0.41:0.989:0.994 0/0/1/1:4:86,137:0.53: 0.72:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,128:0.78:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,186:0.80: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,178:0.74: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,58:0.32:-0.44:1.000:0.953 0/1/1/1:4:30,148:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,105:0.53:-0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:96,139:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:100,40:0.28:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,154:0.51: 1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,144:0.54: 0.85:1.000:0.985 0/0/0/1:4:103,61:0.34:-0.53:1.000:0.870 0/1/1/1:4:33,170:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,132:0.52: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,126:0.48: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,40:0.35:-1.82:1.000:0.774 0/0/1/1:4:85,124:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,94:0.51:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,125:0.55: 0.15:1.000:0.975 0/1/1/1:4:43,188:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,190:0.74: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,175:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,127:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,137:0.54: 0.66:1.000:0.989 0/0/1/1:4:71,127:0.56: 0.19:1.000:0.969 0/1/1/1:4:26,181:0.83: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:143,74:0.32: 0.60:1.000:0.961 0/1/1/1:4:38,181:0.77: 0.64:0.999:1.000 0/1/1/1:4:22,225:0.88: 1.23:1.000:0.720 0/0/1/1:4:37,55:0.51:-2.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,141:0.56: 0.62:1.000:0.959 0/0/0/1:4:123,71:0.34: 0.11:1.000:0.895 0/1/1/1:4:38,159:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,72:0.31: 0.53:1.000:0.967 0/1/1/1:4:33,173:0.79: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,116:0.47: 0.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,125:0.53: 0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:90,126:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,100:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,107:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:121,75:0.35: 0.15:1.000:0.812 0/0/0/1:4:128,80:0.35: 0.41:1.000:0.799 0/0/1/1:4:72,112:0.52:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,104:0.49:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,97:0.53:-0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,99:0.54:-0.65:1.000:0.986 0/0/1/1:4:95,123:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,45:0.34:-1.39:1.000:0.896 0/1/1/1:4:43,175:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,85:0.47:-0.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,126:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,141:0.58: 0.53:1.000:0.920 0/0/1/1:4:87,109:0.48: 0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:28,140:0.78:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,118:0.56:-0.10:1.000:0.969 0/0/1/1:4:87,125:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,117:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,106:0.57:-0.57:1.000:0.938 0/0/1/1:4:66,107:0.53:-0.34:1.000:0.991 0/1/1/1:4:47,244:0.79: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,75:0.36:-0.06:1.000:0.653 0/0/0/1:4:128,70:0.33: 0.19:1.000:0.935 0/1/1/1:4:36,161:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,117:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,104:0.54:-0.48:1.000:0.986 0/0/0/1:4:132,61:0.30: 0.09:1.000:0.986 0/0/1/1:4:79,104:0.48:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,51:0.73:-2.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,60:0.53:-1.94:1.000:0.991 0/1/1/1:4:52,190:0.72: 1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,72:0.32: 0.49:1.000:0.963 0/0/1/1:4:93,134:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,136:0.54: 0.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:91,49:0.32:-1.03:1.000:0.943 0/0/0/1:4:120,53:0.29:-0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:70,106:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:82,40:0.31:-1.41:1.000:0.977 0/1/1/1:4:41,184:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,193:0.82: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,143:0.80:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,156:0.72: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,116:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,186:0.72: 1.00:0.999:0.996 0/0/1/1:4:69,101:0.51:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,59:0.32:-0.38:1.000:0.954 0/0/1/1:4:48,81:0.54:-1.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:56,101:0.56:-0.67:1.000:0.966 0/0/1/1:4:61,100:0.54:-0.59:1.000:0.990 0/0/1/1:4:75,84:0.46:-0.63:1.000:0.984 0/0/1/1:4:61,102:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/1/1/1:4:31,129:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,151:0.54: 1.15:1.000:0.990 0/0/0/1:4:148,69:0.30: 0.60:1.000:0.985 0/0/1/1:4:71,125:0.55: 0.15:1.000:0.975 0/1/1/1:4:27,168:0.82: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,69:0.33: 0.07:1.000:0.918 0/0/1/1:4:90,177:0.58: 1.65:1.000:0.902 0/0/1/1:4:82,143:0.55: 0.76:1.000:0.978 0/1/1/1:4:30,148:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,166:0.73: 0.43:1.000:0.998 -chr4.1 4463235 chr4.1_004463235 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:22,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.69:1.000:. ./.:4:49,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:49,2:.: 1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:47,3:.: 1.20:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:25,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:60,2:.: 1.92:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:57,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:59,1:.: 1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.39:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:44,3:.: 1.02:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.91:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.85:1.000:. ./.:6:29,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.63:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.42:0.989:. ./.:4:52,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:37,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:75,3:.: 2.88:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.48:0.999:. ./.:4:30,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:30,7:.: 0.42:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:33,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:54,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,2:.: 2.28:1.000:. ./.:4:30,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:12,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.69:0.999:. ./.:4:21,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:63,2:.: 2.10:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:54,2:.: 1.56:1.000:. ./.:4:33,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:77,1:.: 2.88:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.63:1.000:. -chr4.1 4529814 chr4.1_004529814 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:135,123:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,188:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.87:1.000:. ./.:4:54,158:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,189:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,128:.:-2.16:1.000:. ./.:4:119,101:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,184:.:-0.13:1.000:. ./.:4:43,161:.:-0.83:1.000:. ./.:4:65,210:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1,201:.:-0.87:1.000:. ./.:4:100,103:.:-0.85:1.000:. ./.:4:60,179:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,157:.:-0.87:1.000:. ./.:4:61,169:.:-0.38:0.999:. ./.:4:123,116:.:-0.22:1.000:. ./.:4:141,144:.: 0.59:1.000:. ./.:4:139,110:.:-0.04:1.000:. ./.:4:124,118:.:-0.16:1.000:. ./.:4:57,193:.:-0.02:1.000:. ./.:4:59,135:.:-1.01:1.000:. ./.:4:81,92:.:-1.37:1.000:. ./.:4:57,156:.:-0.67:1.000:. ./.:4:67,218:.: 0.59:1.000:. ./.:4:52,149:.:-0.88:1.000:. ./.:4:2,236:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,163:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,155:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,185:.:-1.16:1.000:. ./.:4:29,158:.:-1.13:1.000:. ./.:4:47,175:.:-0.52:1.000:. ./.:3:55,68:.:-2.25:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,180:.:-0.22:1.000:. ./.:4:59,174:.:-0.32:1.000:. ./.:4:70,212:.: 0.54:1.000:. ./.:4:68,183:.:-0.01:1.000:. ./.:4:149,128:.: 0.45:1.000:. ./.:4:161,167:.: 1.34:1.000:. ./.:4:91,220:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.38:1.000:. ./.:4:100,265:.: 1.99:1.000:. ./.:4:71,202:.: 0.38:1.000:. ./.:4:62,171:.:-0.32:1.000:. ./.:4:137,348:.: 4.10:1.000:. ./.:4:77,187:.: 0.22:1.000:. ./.:4:140,391:.: 4.90:1.000:. ./.:4:69,229:.: 0.82:1.000:. ./.:4:85,208:.: 0.73:1.000:. ./.:4:70,200:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,171:.:-0.59:1.000:. ./.:4:101,262:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,416:.: 2.89:1.000:. ./.:4:91,178:.: 0.31:1.000:. ./.:6:82,181:.: 0.20:1.000:. ./.:4:92,211:.: 0.90:1.000:. ./.:4:58,174:.:-0.34:1.000:. ./.:4:118,260:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.85:1.000:. ./.:4:74,177:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,338:.: 1.52:1.000:. ./.:4:33,105:.:-1.99:1.000:. ./.:4:130,111:.:-0.18:1.000:. ./.:4:96,237:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.03:1.000:. ./.:4:85,236:.: 1.22:1.000:. ./.:4:61,149:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,375:.: 2.17:1.000:. ./.:4:54,186:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,177:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,311:.: 1.04:1.000:. ./.:4:156,140:.: 0.78:1.000:. ./.:4:160,139:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.22:0.999:. ./.:4:70,217:.: 0.62:1.000:. ./.:4:171,125:.: 0.78:1.000:. ./.:4:51,171:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,313:.: 1.08:0.989:. ./.:4:74,190:.: 0.22:1.000:. ./.:4:131,121:.: 0.01:1.000:. ./.:4:161,119:.: 0.50:1.000:. ./.:4:73,213:.: 0.61:1.000:. ./.:4:74,170:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,159:.:-0.73:1.000:. ./.:4:81,180:.: 0.17:1.000:. ./.:4:84,214:.: 0.82:1.000:. ./.:4:47,129:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.17:1.000:. ./.:4:80,212:.: 0.71:1.000:. ./.:4:159,155:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,250:.: 1.66:1.000:. ./.:4:109,109:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,176:.:-1.32:1.000:. ./.:4:84,198:.: 0.54:1.000:. ./.:4:57,153:.:-0.73:1.000:. ./.:4:75,186:.: 0.17:1.000:. ./.:4:161,119:.: 0.50:1.000:. ./.:4:136,136:.: 0.36:1.000:. ./.:4:159,116:.: 0.41:1.000:. ./.:4:69,132:.:-0.88:1.000:. ./.:4:87,192:.: 0.48:1.000:. ./.:4:69,166:.:-0.29:1.000:. ./.:4:57,205:.: 0.19:1.000:. ./.:4:74,198:.: 0.36:1.000:. ./.:4:71,227:.: 0.82:0.999:. ./.:4:77,189:.: 0.26:1.000:. ./.:4:73,191:.: 0.22:1.000:. ./.:4:181,162:.: 1.61:1.000:. ./.:4:60,190:.:-0.02:1.000:. ./.:4:166,166:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.50:1.000:. ./.:4:83,187:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,192:.: 0.29:1.000:. ./.:4:93,226:.: 1.18:1.000:. ./.:4:77,167:.:-0.13:1.000:. ./.:4:61,171:.:-0.34:1.000:. ./.:4:89,206:.: 0.76:1.000:. ./.:4:79,230:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,151:.:-0.80:1.000:. ./.:4:63,196:.: 0.13:1.000:. ./.:4:142,127:.: 0.31:1.000:. ./.:4:50,122:.:-1.39:1.000:. ./.:4:61,131:.:-1.04:1.000:. ./.:4:92,247:.: 1.54:1.000:. ./.:4:56,135:.:-1.06:1.000:. ./.:4:148,119:.: 0.27:1.000:. ./.:4:68,175:.:-0.15:1.000:. ./.:4:116,230:.: 1.66:1.000:. ./.:4:60,177:.:-0.25:1.000:. ./.:4:81,200:.: 0.52:1.000:. ./.:4:101,226:.: 1.33:1.000:. ./.:4:86,217:.: 0.90:1.000:. ./.:4:66,146:.:-0.69:1.000:. ./.:4:67,165:.:-0.34:1.000:. ./.:4:72,212:.: 0.57:1.000:. ./.:4:75,219:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1,201:.:-0.87:1.000:. ./.:4:171,126:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.38:1.000:. ./.:4:58,129:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,130:.:-1.27:1.000:. ./.:4:58,123:.:-1.23:1.000:. ./.:4:29,99:.:-2.16:1.000:. ./.:4:68,204:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,150:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,249:.:-0.04:1.000:. ./.:4:113,111:.:-0.48:1.000:. ./.:4:35,141:.:-1.32:1.000:. ./.:4:73,151:.:-0.48:1.000:. ./.:4:57,136:.:-1.02:1.000:. ./.:4:67,141:.:-0.76:1.000:. ./.:4:119,93:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,149:.:-0.59:1.000:. ./.:4:63,157:.:-0.55:1.000:. ./.:4:132,118:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,136:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,172:.:-1.39:0.999:. ./.:4:60,135:.:-0.99:1.000:. ./.:4:40,117:.:-1.66:1.000:. ./.:4:51,127:.:-1.29:1.000:. ./.:4:45,150:.:-0.99:1.000:. ./.:4:131,125:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,97:.:-0.85:1.000:. ./.:4:92,88:.:-1.25:1.000:. ./.:4:51,132:.:-1.20:1.000:. ./.:4:69,167:.:-0.27:1.000:. ./.:4:71,174:.:-0.11:1.000:. ./.:4:73,208:.: 0.52:1.000:. ./.:4:40,175:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.64:1.000:. ./.:4:144,110:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.33:1.000:. ./.:4:100,99:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.59:1.000:. -chr4.1 4781701 chr4.1_004781701 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:362,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:229,81:.:-0.19:1.000:. ./.:4:383,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:330,120:.: 1.65:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:306,87:.: 0.90:1.000:. ./.:4:361,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:61,26:.:-3.10:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:245,78:.:-0.02:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:326,121:.: 1.61:0.999:. ./.:4:337,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:452,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:199,216:.: 1.19:1.000:. ./.:4:77,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:300,89:.: 0.85:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:349,114:.: 1.82:1.000:. ./.:4:284,67:.: 0.35:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:286,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:97,0:.:-2.97:1.000:. ./.:3:34,19:.:-3.55:1.000:. ./.:4:266,99:.: 0.53:1.000:. ./.:4:304,93:.: 0.95:1.000:. ./.:4:266,83:.: 0.32:1.000:. ./.:4:294,98:.: 0.89:1.000:. ./.:4:352,106:.: 1.75:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:254,94:.: 0.31:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:270,90:.: 0.47:1.000:. ./.:4:269,72:.: 0.22:1.000:. ./.:4:290,109:.: 0.98:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:236,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:283,111:.: 0.91:1.000:. ./.:4:192,60:.:-0.94:1.000:. ./.:4:335,119:.: 1.70:1.000:. ./.:4:193,68:.:-0.83:1.000:. ./.:4:283,97:.: 0.73:1.000:. ./.:4:210,90:.:-0.32:1.000:. ./.:4:320,97:.: 1.21:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:286,109:.: 0.93:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:206,43:.:-0.98:1.000:. ./.:4:200,78:.:-0.60:1.000:. ./.:4:253,79:.: 0.10:1.000:. ./.:4:281,90:.: 0.61:1.000:. ./.:4:294,81:.: 0.66:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:265,154:.: 1.24:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:252,81:.: 0.12:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:139,107:.:-1.02:1.000:. ./.:4:282,95:.: 0.69:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:209,231:.: 1.51:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:250,66:.:-0.11:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:238,66:.:-0.26:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:286,94:.: 0.73:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:334,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:299,84:.: 0.77:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.87:0.989:. ./.:4:331,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:225,76:.:-0.30:1.000:. ./.:4:284,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:196,68:.:-0.79:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:165,66:.:-1.22:1.000:. ./.:4:230,69:.:-0.33:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:252,93:.: 0.27:1.000:. ./.:4:189,59:.:-1.00:1.000:. ./.:4:248,69:.:-0.09:1.000:. ./.:4:189,71:.:-0.84:1.000:. ./.:4:241,80:.:-0.04:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:264,79:.: 0.25:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:372,110:.: 2.06:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:364,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:247,80:.: 0.04:1.000:. ./.:4:219,67:.:-0.50:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:251,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:230,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:269,93:.: 0.49:1.000:. ./.:4:267,61:.: 0.05:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:284,77:.: 0.48:1.000:. ./.:4:222,74:.:-0.37:1.000:. ./.:4:166,147:.:-0.15:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:194,47:.:-1.09:1.000:. ./.:4:204,79:.:-0.54:1.000:. ./.:4:355,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:175,41:.:-1.41:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,57:.:-0.72:1.000:. ./.:4:324,112:.: 1.46:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:186,63:.:-0.98:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:251,84:.: 0.14:1.000:. ./.:4:189,67:.:-0.89:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:274,101:.: 0.66:1.000:. ./.:4:295,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:238,73:.:-0.17:1.000:. ./.:4:310,109:.: 1.24:1.000:. ./.:4:236,87:.:-0.02:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.53:1.000:. ./.:4:215,59:.:-0.66:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:229,78:.:-0.22:1.000:. ./.:4:411,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:276,93:.: 0.59:1.000:. ./.:4:234,69:.:-0.28:1.000:. ./.:4:289,103:.: 0.89:1.000:. ./.:4:240,80:.:-0.05:1.000:. ./.:4:212,68:.:-0.58:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:391,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:240,91:.: 0.09:1.000:. ./.:4:241,64:.:-0.25:0.999:. ./.:4:240,82:.:-0.03:1.000:. ./.:4:259,87:.: 0.29:1.000:. ./.:4:191,71:.:-0.81:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:249,80:.: 0.06:1.000:. ./.:4:246,69:.:-0.12:1.000:. ./.:4:237,77:.:-0.13:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:301,80:.: 0.74:1.000:. ./.:4:276,84:.: 0.47:1.000:. ./.:4:303,13:.:-0.11:1.000:. ./.:4:283,85:.: 0.57:1.000:. ./.:4:299,107:.: 1.07:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:256,78:.: 0.13:1.000:. -chr4.1 5128770 chr4.1_005128770 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:54,53:0.53: 1.06:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,70:0.81: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,44:0.65:-0.38:1.000:0.781 0/1/1/1:4:26,92:0.79: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,43:0.76:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,31:0.78:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,26:0.45:-0.65:1.000:0.976 0/1/1/1:4:21,61:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,24:0.42:-0.69:1.000:0.904 0/1/1/1:4:11,48:0.82:-0.81:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,66:0.74: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,41:0.46: 0.63:1.000:0.989 0/0/1/1:4:30,43:0.61:-0.26:1.000:0.645 0/0/1/1:4:30,38:0.59:-0.46:1.000:0.879 0/1/1/1:4:24,40:0.65:-0.62:0.999:0.751 0/0/1/1:4:33,49:0.62: 0.09:1.000:0.550 0/0/1/1:4:51,55:0.55: 1.02:1.000:0.977 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,37:0.57:-0.42:1.000:0.953 0/1/1/1:4:26,56:0.70: 0.09:1.000:0.982 0/1/1/1:4:34,85:0.72: 1.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,29:0.44:-0.34:1.000:0.970 0/0/1/1:4:22,29:0.60:-1.12:1.000:0.823 0/0/0/1:4:38,12:0.25:-1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,44:0.83:-1.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,28:0.34: 0.28:1.000:0.847 0/1/1/1:4:20,59:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,53:0.77:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,51:0.72:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,21:0.78:-2.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,58:0.82:-0.34:1.000:0.999 0/0/1:3:14,7:0.36:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,48:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,15:0.30:-1.04:1.000:0.986 0/0/1/1:4:42,26:0.41:-0.46:1.000:0.877 0/1/1/1:4:20,39:0.68:-0.81:1.000:0.946 0/0/1/1:4:29,19:0.43:-1.24:1.000:0.940 0/0/1/1:4:45,54:0.58: 0.75:1.000:0.930 0/0/1/1:4:49,40:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,21:0.32:-0.38:1.000:0.958 0/1/1/1:4:23,62:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,66:0.68: 0.75:1.000:0.959 0/0/0/1:4:47,19:0.30:-0.54:1.000:0.981 0/1/1/1:4:25,42:0.65:-0.50:1.000:0.767 0/1/1/1:4:14,30:0.70:-1.40:1.000:0.981 0/1/1/1:4:19,37:0.68:-0.93:1.000:0.946 0/0/1/1:4:26,23:0.51:-1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,40:0.69:-0.81:1.000:0.977 0/0/0/1:4:44,22:0.36:-0.54:1.000:0.730 0/0/1/1:4:48,30:0.41:-0.07:1.000:0.890 0/1/1/1:4:37,75:0.68: 1.26:1.000:0.965 0/0/0/1:4:44,15:0.27:-0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,48:0.71:-0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:21,51:0.72:-0.30:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,90:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,78:0.74: 1.06:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:49,21:0.32:-0.38:1.000:0.914 0/0/1/1:4:53,37:0.44: 0.40:1.000:0.974 0/1/1/1:4:22,45:0.69:-0.50:1.000:0.968 0/0/1/1:4:63,37:0.40: 0.79:1.000:0.774 0/1/1/1:4:25,54:0.70:-0.03:1.000:0.982 0/0/1/1:4:48,62:0.59: 1.18:1.000:0.854 0/1/1/1:4:16,44:0.74:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,55:0.58: 0.79:1.000:0.915 0/0/0/1:4:44,22:0.36:-0.54:1.000:0.730 0/0/1/1:4:40,42:0.55: 0.09:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,35:0.38: 0.71:1.000:0.614 0/1/1/1:4:11,40:0.79:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,53:0.57: 0.75:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,54:0.60: 0.55:1.000:0.780 0/1/1/1:4:28,82:0.75: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,37:0.39: 0.87:1.000:0.690 0/0/1/1:4:69,58:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,50:0.66:-0.07:1.000:0.868 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.51:0.999:1.000 0/1/1/1:4:21,110:0.84: 2.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,26:0.36:-0.11:1.000:0.674 0/1/1/1:4:21,72:0.78: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,100:0.73: 2.31:0.989:0.997 0/1/1/1:4:34,105:0.76: 2.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,40:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,56:0.56: 1.02:1.000:0.966 0/1/1/1:4:41,64:0.63: 0.98:1.000:0.590 0/0/0/1:4:45,22:0.35:-0.50:1.000:0.786 0/1/1/1:4:26,78:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,70:0.79: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,53:0.48: 1.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,11:0.30:-1.59:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,122:0.78: 3.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,96:0.77: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,26:0.41:-0.42:1.000:0.837 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,93:0.64: 2.70:1.000:0.743 0/0/0/1:4:68,24:0.27: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,32:0.54:-0.65:1.000:0.986 0/1/1/1:4:22,63:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,49:0.71:-0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,59:0.64: 0.63:1.000:0.646 0/0/1/1:4:39,53:0.60: 0.48:1.000:0.767 0/0/1/1:4:43,56:0.59: 0.75:1.000:0.842 0/0/1/1:4:43,58:0.60: 0.83:1.000:0.782 0/1/1/1:4:21,58:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,50:0.64: 0.05:1.000:0.675 0/1/1/1:4:22,68:0.76: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,90:0.78: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,42:0.62:-0.38:1.000:0.521 0/1/1/1:4:35,122:0.78: 3.01:0.999:1.000 0/0/1/1:4:51,57:0.56: 1.10:1.000:0.967 0/0/1/1:4:25,23:0.52:-1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,38:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,26:0.39:-0.30:1.000:0.668 0/0/1/1:4:52,49:0.52: 0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,62:0.72: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,42:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,54:0.58: 0.75:1.000:0.930 0/1/1/1:4:24,89:0.79: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,33:0.37: 0.59:1.000:0.532 0/1/1/1:4:19,43:0.71:-0.69:1.000:0.990 0/1/1/1:4:27,85:0.76: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,27:0.34: 0.16:1.000:0.851 0/1/1/1:4:32,75:0.71: 1.06:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,34:0.46: 0.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,24:0.43:-0.77:1.000:0.952 0/0/1/1:4:40,35:0.51:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,60:0.61: 0.90:1.000:0.710 0/0/1/1:4:24,18:0.46:-1.47:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,39:0.58:-0.34:1.000:0.918 0/0/0/1:4:38,18:0.34:-0.93:1.000:0.851 0/0/0/1:4:44,11:0.21:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,40:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,50:0.66:-0.07:1.000:0.868 0/1/1/1:4:22,73:0.77: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,59:0.56: 1.26:1.000:0.968 0/1/1/1:4:27,110:0.81: 2.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,98:0.77: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,26:0.43:-0.58:1.000:0.952 0/0/1/1:4:39,24:0.41:-0.65:1.000:0.867 0/0/1/1:4:73,70:0.53: 2.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:33,67:0.69: 0.79:1.000:0.965 0/1/1/1:4:15,51:0.78:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,44:0.57: 0.05:1.000:0.936 0/1/1/1:4:24,47:0.68:-0.34:1.000:0.949 0/0/0/1:4:57,28:0.35: 0.20:1.000:0.775 0/1/1/1:4:18,48:0.74:-0.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,40:0.69:-0.81:1.000:0.977 0/1/1/1:4:6,36:0.86:-1.47:1.000:0.965 0/0/1/1:4:29,17:0.40:-1.32:1.000:0.769 0/0/1/1:4:33,38:0.57:-0.34:1.000:0.955 0/0/1/1:4:46,25:0.38:-0.34:1.000:0.539 0/1/1/1:4:27,96:0.79: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,18:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,35:0.65:-0.93:1.000:0.751 0/0/0/1:4:42,19:0.33:-0.73:1.000:0.915 0/0/0/1:4:43,22:0.36:-0.58:1.000:0.663 0/1/1/1:4:9,26:0.75:-1.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,48:0.57: 0.36:1.000:0.946 0/1/1/1:4:20,65:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,22:0.68:-1.82:1.000:0.959 0/0/1/1:4:26,38:0.62:-0.62:1.000:0.593 0/0/1/1:4:41,29:0.45:-0.38:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.15:0.999:1.000 0/1/1/1:4:19,37:0.68:-0.93:1.000:0.946 0/1/1/1:4:22,44:0.68:-0.54:1.000:0.959 0/0/1/1:4:36,22:0.41:-0.85:1.000:0.856 0/1/1/1:4:17,50:0.75:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,16:0.29:-0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,25:0.52:-1.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:38,15:0.30:-1.04:1.000:0.986 0/1/1/1:4:19,55:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,81:0.80: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,34:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,38:0.70:-0.97:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,35:0.53:-0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:21,39:0.67:-0.77:1.000:0.911 0/0/1/1:4:50,27:0.38:-0.11:1.000:0.517 0/1/1/1:4:31,107:0.78: 2.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,39:0.63:-0.62:1.000:0.588 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.30:1.000:1.000 -chr4.1 5184973 chr4.1_005184973 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:118,149:0.52: 0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,94:0.48:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,135:0.53: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:119,130:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,86:0.29: 1.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:75,263:0.74: 1.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,82:0.51:-1.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,71:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,44:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,45:0.54:-2.53:1.000:0.986 0/0/0/1:4:49,21:0.29:-2.67:1.000:0.993 1/1/1/1:4:1,228:0.99: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,110:0.45: 0.10:1.000:0.982 0/0/0/1:4:162,69:0.29: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:111,156:0.55: 0.76:1.000:0.980 0/0/1/1:4:123,122:0.47: 0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:125,141:0.50: 0.74:0.999:0.997 0/0/0/1:4:185,71:0.27: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:232,80:0.25: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,146:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,39:0.57:-2.76:1.000:0.957 0/0/0/1:4:155,65:0.28:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:176,69:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,74:0.32:-0.09:1.000:0.942 0/0/1/1:4:18,32:0.60:-3.02:1.000:0.747 0/0/1/1:4:108,95:0.44:-0.36:1.000:0.968 0/0/0/1:4:137,68:0.32:-0.32:1.000:0.961 0/0/0/1:4:180,75:0.28: 0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,238:0.81: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,211:0.77: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,64:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,160:0.70:-0.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:17,34:0.63:-3.00:1.000:0.575 0/0/0/1:4:53,26:0.31:-2.51:1.000:0.965 0/1/1:3:10,20:0.63:-3.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,209:0.78: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,128:0.46: 0.65:1.000:0.988 0/1/1/1:4:68,220:0.73: 1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,58:0.32:-0.91:1.000:0.943 0/0/1/1:4:100,93:0.45:-0.53:1.000:0.983 0/0/1/1:4:106,147:0.55: 0.51:1.000:0.983 0/0/1/1:4:117,137:0.51: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,211:0.74: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,165:0.77:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,61:0.29:-0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,177:0.70: 0.27:1.000:0.988 0/0/1/1:4:139,145:0.48: 1.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:39,23:0.35:-2.81:1.000:0.767 0/0/1/1:4:89,103:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,116:0.78:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,100:0.47:-0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,236:0.75: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,177:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,246:0.75: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,125:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,106:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,191:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,127:0.56:-0.18:1.000:0.964 0/0/0/1:4:138,57:0.28:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1/1/1:6:39,156:0.76:-0.49:1.000:0.673 0/1/1/1:4:60,192:0.72: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,115:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,111:0.48:-0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,170:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,144:0.48: 1.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,260:0.76: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,93:0.59:-1.31:1.000:0.842 0/0/1/1:4:93,132:0.55: 0.03:1.000:0.977 0/0/1/1:4:99,114:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,209:0.74: 0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:61,206:0.73: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,55:0.38:-1.50:1.000:0.575 0/1/1/1:4:40,194:0.80: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,133:0.50: 0.45:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,263:0.99: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,93:0.51:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,119:0.55:-0.36:1.000:0.978 0/0/1/1:4:106,126:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,80:0.32: 0.31:1.000:0.960 0/0/1/1:4:86,125:0.56:-0.22:1.000:0.970 0/1/1/1:4:29,130:0.78:-1.12:0.999:1.000 0/0/0/1:4:168,57:0.25: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,55:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,62:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,105:0.51:-0.51:0.989:0.996 0/0/0/1:4:182,77:0.29: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:108,42:0.27:-1.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:131,61:0.30:-0.55:1.000:0.981 0/0/1/1:4:89,101:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,139:0.54: 0.31:1.000:0.986 0/0/1/1:4:76,80:0.48:-1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,122:0.53:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:128,135:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,171:0.74:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,116:0.55:-0.41:1.000:0.983 0/0/0/1:4:139,59:0.29:-0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,102:0.52:-0.67:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,171:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,212:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,80:0.28: 0.88:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,177:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,146:0.51: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,100:0.53:-0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:104,138:0.54: 0.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:129,52:0.28:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,56:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,58:0.31:-0.79:1.000:0.971 0/0/1/1:4:126,119:0.46: 0.38:1.000:0.986 0/0/1/1:4:140,203:0.56: 2.08:1.000:0.971 0/0/0/1:4:173,70:0.28: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,63:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,160:0.50: 1.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,83:0.32: 0.38:0.999:0.944 0/0/1/1:4:97,125:0.53:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:62,71:0.50:-1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,125:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,148:0.73:-0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,54:0.30:-0.84:1.000:0.988 0/0/1/1:4:100,80:0.42:-0.76:1.000:0.912 0/0/1/1:4:87,107:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,134:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,50:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,190:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,136:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,53:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,208:0.72: 0.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:57,180:0.72: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,111:0.73:-1.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,114:0.71:-1.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:42,121:0.71:-1.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:100,111:0.49:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,136:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,79:0.52:-1.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,113:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,176:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,173:0.52: 1.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,190:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,125:0.54:-0.11:1.000:0.986 0/0/0/1:4:141,49:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,117:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,135:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:165,72:0.29: 0.24:1.000:0.991 0/1/1/1:4:47,181:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,130:0.74:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,186:0.54: 1.78:1.000:0.989 0/0/1/1:4:155,205:0.54: 2.38:1.000:0.990 0/1/1/1:4:49,199:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,88:0.32: 0.67:1.000:0.951 0/0/1/1:4:134,161:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,123:0.53:-0.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,239:0.75: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,132:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,24:0.38:-2.84:1.000:0.557 0/1/1/1:4:42,123:0.71:-1.02:1.000:0.991 0/1/1/1:4:50,205:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,193:0.72: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,186:0.52: 1.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:172,75:0.29: 0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:98,127:0.53: 0.03:1.000:0.992 0/1/1/1:4:66,219:0.73: 1.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,212:0.79: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,129:0.52: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,100:0.45:-0.22:1.000:0.976 0/0/0/1:4:186,66:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,54:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:193,68:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,154:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,118:0.49: 0.01:0.999:0.997 0/0/1/1:4:114,150:0.53: 0.71:1.000:0.990 0/0/1/1:4:99,107:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,172:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,55:0.27:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,70:0.31:-0.09:1.000:0.977 0/0/1/1:4:107,123:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,88:0.46:-0.79:1.000:0.990 0/0/0/1:4:142,44:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,147:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,149:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,157:0.52: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,120:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,260:0.74: 1.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,170:0.49: 1.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,167:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,46:0.23:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,202:0.73: 0.67:1.000:0.998 -chr4.1 5257459 chr4.1_005257459 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,31:.:-0.07:1.000:. ./.:4:82,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:90,52:.: 0.97:1.000:. ./.:4:128,41:.: 1.79:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:60,53:.: 0.09:1.000:. ./.:4:72,33:.:-0.16:1.000:. ./.:4:4,8:.:-3.00:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:82,25:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:92,43:.: 0.76:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:106,37:.: 1.00:1.000:. ./.:4:70,68:.: 0.85:0.999:. ./.:4:90,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:88,41:.: 0.57:1.000:. ./.:4:31,111:.: 0.97:1.000:. ./.:4:7,1:.:-3.12:1.000:. ./.:4:77,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,31:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,1:.:-3.24:1.000:. ./.:4:110,32:.: 0.97:1.000:. ./.:4:123,31:.: 1.34:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:90,41:.: 0.63:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:116,38:.: 1.34:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.87:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:111,37:.: 1.15:1.000:. ./.:4:109,33:.: 0.97:1.000:. ./.:4:81,27:.:-0.07:1.000:. ./.:4:88,24:.: 0.05:1.000:. ./.:4:97,25:.: 0.36:1.000:. ./.:4:58,76:.: 0.73:1.000:. ./.:4:86,40:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,40:.: 1.03:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,62:.: 0.27:1.000:. ./.:4:95,37:.: 0.67:1.000:. ./.:4:61,71:.: 0.67:1.000:. ./.:4:49,17:.:-1.35:1.000:. ./.:4:53,65:.: 0.24:1.000:. ./.:4:50,61:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,26:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,77:.: 1.28:1.000:. ./.:4:60,59:.: 0.27:1.000:. ./.:4:91,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,63:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,77:.: 1.49:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:101,30:.: 0.63:1.000:. ./.:4:86,33:.: 0.27:1.000:. ./.:6:59,33:.:-0.56:1.000:. ./.:4:89,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:91,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,62:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,23:.:-0.49:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:81,61:.: 0.97:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:46,62:.:-0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,57:.:-0.07:1.000:. ./.:4:68,74:.: 0.97:1.000:. ./.:4:89,23:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,76:.: 1.89:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:101,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:108,26:.: 0.73:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:42,46:.:-0.68:1.000:. ./.:4:76,32:.:-0.07:1.000:. ./.:4:102,34:.: 0.79:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.92:0.999:. ./.:4:133,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:49,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.06:0.989:. ./.:4:112,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,24:.:-0.77:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.49:1.000:. ./.:4:76,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:85,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,27:.:-0.31:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:50,25:.:-1.07:1.000:. ./.:4:59,24:.:-0.83:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:56,66:.: 0.36:1.000:. ./.:4:50,25:.:-1.07:1.000:. ./.:4:58,73:.: 0.63:1.000:. ./.:4:25,25:.:-1.84:1.000:. ./.:4:45,67:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,25:.:-0.74:1.000:. ./.:4:82,25:.:-0.10:1.000:. ./.:4:82,31:.: 0.09:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:65,69:.: 0.73:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:54,19:.:-1.13:1.000:. ./.:4:122,28:.: 1.21:1.000:. ./.:4:57,30:.:-0.71:0.999:. ./.:4:73,35:.:-0.07:1.000:. ./.:4:68,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:49,75:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:82,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,29:.:-0.56:1.000:. ./.:4:70,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:58,54:.: 0.05:1.000:. ./.:4:45,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:71,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:58,23:.:-0.89:1.000:. ./.:4:41,39:.:-0.92:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:38,43:.:-0.89:1.000:. ./.:4:46,71:.: 0.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,27:.:-0.80:1.000:. ./.:4:41,62:.:-0.22:1.000:. ./.:4:91,90:.: 2.16:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:31,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:46,17:.:-1.44:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:60,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:33,45:.:-0.98:1.000:. ./.:4:99,43:.: 0.97:1.000:. ./.:4:97,39:.: 0.79:1.000:. ./.:4:111,25:.: 0.79:1.000:. ./.:4:93,27:.: 0.30:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:66,60:.: 0.48:1.000:. ./.:4:95,30:.: 0.45:1.000:. ./.:4:55,79:.: 0.73:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:40,49:.:-0.65:1.000:. ./.:4:157,38:.: 2.59:1.000:. ./.:4:91,42:.: 0.70:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:70,69:.: 0.88:1.000:. ./.:4:73,25:.:-0.37:1.000:. ./.:4:93,40:.: 0.70:1.000:. ./.:4:61,65:.: 0.48:1.000:. ./.:4:65,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:78,32:.:-0.01:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.42:1.000:. ./.:4:112,41:.: 1.31:1.000:. ./.:4:101,51:.: 1.28:1.000:. ./.:4:46,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:79,25:.:-0.19:0.999:. ./.:4:41,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:90,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:50,47:.:-0.40:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:55,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:51,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,56:.: 0.27:1.000:. ./.:4:72,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:94,31:.: 0.45:1.000:. ./.:4:57,80:.: 0.82:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,40:.: 0.18:1.000:. ./.:4:97,88:.: 2.28:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:82,30:.: 0.05:1.000:. ./.:4:89,27:.: 0.18:1.000:. -chr4.1 5436465 chr4.1_005436465 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:50,83:0.57: 0.97:1.000:0.936 0/0/1/1:4:34,50:0.55:-0.55:1.000:0.983 0/0/1/1:4:37,65:0.59: 0.01:1.000:0.885 0/0/1/1:4:47,70:0.55: 0.47:1.000:0.981 0/0/1/1:4:90,60:0.39: 1.50:1.000:0.648 0/1/1/1:4:21,122:0.81: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,43:0.57:-1.02:1.000:0.939 0/0/0/1:4:54,26:0.33:-0.68:1.000:0.927 0/0/0/1:4:70,42:0.37: 0.32:1.000:0.602 0/0/1/1:4:10,16:0.57:-2.36:1.000:0.957 0/0/1/1:4:9,8:0.44:-2.64:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,88:0.59: 1.13:1.000:0.883 0/0/0/1:4:66,37:0.35: 0.04:1.000:0.746 0/0/1/1:4:50,81:0.57: 0.91:1.000:0.951 0/0/1/1:4:52,59:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,61:0.56:-0.05:0.999:0.967 0/0/1/1:4:63,46:0.40: 0.22:1.000:0.818 0/0/1/1:4:63,57:0.44: 0.57:1.000:0.973 0/0/1/1:4:57,78:0.53: 1.03:1.000:0.993 1/1/1/1:4:2,30:0.92:-2.17:1.000:0.986 0/0/0/1:4:74,30:0.30: 0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:64,42:0.38: 0.13:1.000:0.612 0/0/0/1:4:50,31:0.37:-0.65:1.000:0.524 0/1/1/1:4:5,15:0.69:-2.54:1.000:0.980 0/1/1/1:4:28,64:0.64:-0.30:1.000:0.717 0/0/0/1:4:73,30:0.30: 0.04:1.000:0.983 0/0/1/1:4:50,47:0.45:-0.15:1.000:0.981 0/1/1/1:4:21,109:0.79: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,137:0.83: 1.75:1.000:0.998 0/0/0/1:4:48,20:0.30:-1.05:1.000:0.981 0/1/1/1:4:19,92:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,8:0.67:-2.82:1.000:0.932 0/0/1/1:4:11,13:0.50:-2.42:1.000:0.997 1/1/1:3:0,3:1.00:-3.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,114:0.81: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,68:0.60: 0.07:1.000:0.770 0/1/1/1:4:22,120:0.80: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,19:0.31:-1.24:1.000:0.967 0/0/1/1:4:35,38:0.48:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,66:0.58: 0.10:1.000:0.922 0/0/1/1:4:38,60:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/1/1/1:4:22,90:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,72:0.79:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,33:0.36:-0.37:1.000:0.682 0/1/1/1:4:24,107:0.76: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,88:0.58: 1.16:1.000:0.904 0/0/1/1:4:18,14:0.42:-2.17:1.000:0.893 0/0/1/1:4:30,57:0.60:-0.46:1.000:0.758 0/1/1/1:4:5,38:0.85:-1.83:1.000:0.989 0/0/1/1:4:31,41:0.52:-0.93:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,115:0.78: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,70:0.65:-0.05:1.000:0.761 0/1/1/1:4:31,88:0.68: 0.54:1.000:0.964 0/0/1/1:4:42,75:0.59: 0.47:1.000:0.864 0/0/1/1:4:31,46:0.55:-0.77:1.000:0.982 0/1/1/1:4:26,109:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,45:0.55:-0.83:1.000:0.979 0/0/0/1:4:67,23:0.27:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:18,69:0.74:-0.46:1.000:0.624 0/1/1/1:4:22,85:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,54:0.52:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,57:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,79:0.72: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,75:0.64: 0.22:1.000:0.631 0/1/1/1:4:16,108:0.83: 0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,64:0.67:-0.43:1.000:0.932 0/0/1/1:4:55,63:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,60:0.56:-0.09:1.000:0.973 0/1/1/1:4:23,111:0.78: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,107:0.83: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,25:0.49:-1.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,86:0.82:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,89:0.58: 1.22:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,128:1.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,44:0.55:-0.86:1.000:0.984 0/1/1/1:4:31,66:0.63:-0.15:1.000:0.535 0/0/1/1:4:43,53:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,23:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,67:0.60: 0.04:1.000:0.799 0/1/1/1:4:12,86:0.84:-0.12:0.999:0.995 0/0/0/1:4:56,32:0.36:-0.43:1.000:0.709 0/0/0/1:4:53,24:0.32:-0.77:1.000:0.958 0/0/1/1:4:45,36:0.42:-0.65:1.000:0.916 0/1/1/1:4:18,43:0.65:-1.27:0.989:0.805 0/0/0/1:4:72,37:0.34: 0.22:1.000:0.872 0/0/0/1:4:45,22:0.33:-1.08:1.000:0.916 0/0/1/1:4:48,34:0.40:-0.61:1.000:0.769 0/0/1/1:4:34,53:0.56:-0.46:1.000:0.968 0/0/1/1:4:49,52:0.47:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:25,49:0.61:-0.86:1.000:0.688 0/0/1/1:4:48,57:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,56:0.55:-0.27:1.000:0.977 0/1/1/1:4:14,74:0.79:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,72:0.60: 0.29:1.000:0.813 0/0/0/1:4:48,28:0.36:-0.80:1.000:0.666 0/0/1/1:4:32,46:0.54:-0.74:1.000:0.987 0/1/1/1:4:14,73:0.79:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,108:0.81: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,42:0.35: 0.54:1.000:0.793 1/1/1/1:4:0,104:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,58:0.53:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:25,42:0.58:-1.08:1.000:0.928 0/0/1/1:4:49,61:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,35:0.43:-0.77:1.000:0.942 0/0/0/1:4:55,27:0.33:-0.61:1.000:0.913 0/0/0/1:4:54,26:0.33:-0.68:1.000:0.927 0/0/1/1:4:42,77:0.60: 0.54:1.000:0.825 0/0/1/1:4:55,102:0.60: 1.72:1.000:0.805 0/0/1/1:4:61,55:0.44: 0.44:1.000:0.972 0/0/1/1:4:61,39:0.38:-0.05:1.000:0.551 0/0/1/1:4:57,78:0.53: 1.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:67,34:0.34:-0.02:0.999:0.885 0/0/1/1:4:59,81:0.53: 1.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,26:0.44:-1.45:1.000:0.971 0/1/1/1:4:29,67:0.64:-0.18:1.000:0.740 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:52,34:0.38:-0.49:1.000:0.604 0/0/1/1:4:37,48:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,50:0.57:-0.65:1.000:0.953 0/0/1/1:4:38,75:0.61: 0.35:1.000:0.671 0/0/0/1:4:44,24:0.35:-1.05:1.000:0.793 0/1/1/1:4:26,96:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,78:0.55: 0.85:1.000:0.974 0/0/0/1:4:58,27:0.32:-0.52:1.000:0.946 0/1/1/1:4:16,86:0.80: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,67:0.55: 0.32:1.000:0.981 0/1/1/1:4:16,46:0.69:-1.24:1.000:0.969 0/1/1/1:4:13,53:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,70:0.71:-0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:39,58:0.55:-0.15:1.000:0.981 0/0/1/1:4:48,78:0.57: 0.75:1.000:0.949 0/0/1/1:4:26,30:0.49:-1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,47:0.52:-0.61:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,91:0.84: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,70:0.53: 0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,101:0.82: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,53:0.47: 0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,35:0.38:-0.37:1.000:0.539 0/0/1/1:4:32,54:0.58:-0.49:1.000:0.924 0/0/1/1:4:34,60:0.59:-0.24:1.000:0.879 0/0/1/1:4:44,36:0.42:-0.68:1.000:0.932 0/1/1/1:4:26,113:0.76: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,52:0.73:-1.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,103:0.60: 1.78:1.000:0.820 0/1/1/1:4:49,111:0.64: 1.81:1.000:0.696 0/1/1/1:4:27,131:0.78: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,32:0.31: 0.13:1.000:0.973 0/0/1/1:4:45,79:0.59: 0.69:1.000:0.885 0/0/1/1:4:33,43:0.52:-0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,135:0.72: 2.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,61:0.49: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,7:0.44:-2.70:1.000:0.963 0/1/1/1:4:18,116:0.83: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,104:0.73: 0.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,115:0.76: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,120:0.61: 2.46:1.000:0.679 0/0/0/1:4:54,28:0.34:-0.61:1.000:0.862 0/0/1/1:4:58,72:0.51: 0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,106:0.70: 1.22:1.000:0.982 0/1/1/1:4:26,109:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,51:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,66:0.55: 0.29:1.000:0.984 0/0/0/1:4:62,37:0.37:-0.09:1.000:0.615 0/0/0/1:4:40,25:0.37:-1.14:1.000:0.505 0/0/0/1:4:71,44:0.37: 0.41:1.000:0.525 0/1/1/1:4:22,85:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,75:0.51: 1.00:0.999:0.996 0/1/1/1:4:34,83:0.66: 0.47:1.000:0.840 0/0/1/1:4:47,75:0.56: 0.63:1.000:0.959 0/1/1/1:4:21,107:0.79: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,33:0.36:-0.40:1.000:0.643 0/0/1/1:4:53,34:0.38:-0.46:1.000:0.559 0/1/1/1:4:32,72:0.64: 0.07:1.000:0.680 0/0/1/1:4:28,51:0.59:-0.71:1.000:0.835 0/0/0/1:4:61,36:0.36:-0.15:1.000:0.640 0/0/1/1:4:53,79:0.55: 0.94:1.000:0.981 0/0/1/1:4:48,62:0.52: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,55:0.53:-0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:45,71:0.56: 0.44:1.000:0.964 0/1/1/1:4:23,137:0.81: 1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,94:0.60: 1.34:1.000:0.816 0/1/1/1:4:57,135:0.65: 2.81:1.000:0.790 0/0/0/1:4:66,35:0.35:-0.02:1.000:0.834 0/1/1/1:4:23,121:0.79: 1.31:1.000:1.000 -chr4.1 5667932 chr4.1_005667932 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:175,117:.: 0.64:1.000:. ./.:4:154,94:.:-0.06:1.000:. ./.:4:219,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:257,37:.: 0.67:1.000:. ./.:4:223,113:.: 1.35:1.000:. ./.:4:219,75:.: 0.67:1.000:. ./.:4:196,60:.: 0.07:1.000:. ./.:4:114,108:.:-0.48:1.000:. ./.:4:173,96:.: 0.27:1.000:. ./.:4:81,19:.:-2.43:1.000:. ./.:4:64,6:.:-2.91:1.000:. ./.:4:210,136:.: 1.51:1.000:. ./.:4:237,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:202,76:.: 0.42:1.000:. ./.:4:214,42:.: 0.07:1.000:. ./.:4:187,94:.: 0.47:1.000:. ./.:4:135,142:.: 0.40:0.999:. ./.:4:213,126:.: 1.39:1.000:. ./.:4:245,115:.: 1.73:1.000:. ./.:4:71,206:.: 0.40:1.000:. ./.:4:79,41:.:-2.11:1.000:. ./.:4:208,73:.: 0.47:1.000:. ./.:4:264,31:.: 0.69:1.000:. ./.:4:203,106:.: 0.91:1.000:. ./.:4:49,13:.:-3.04:1.000:. ./.:4:173,96:.: 0.27:1.000:. ./.:4:222,73:.: 0.69:1.000:. ./.:4:226,59:.: 0.53:1.000:. ./.:4:259,118:.: 2.00:1.000:. ./.:4:277,20:.: 0.72:1.000:. ./.:4:204,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:196,22:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,14:.:-3.09:1.000:. ./.:4:95,25:.:-2.11:1.000:. ./.:3:22,27:.:-3.25:1.000:. ./.:4:176,88:.: 0.19:1.000:. ./.:4:166,72:.:-0.22:1.000:. ./.:4:207,68:.: 0.37:1.000:. ./.:4:167,65:.:-0.32:1.000:. ./.:4:252,47:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,92:.:-0.48:1.000:. ./.:4:153,80:.:-0.30:1.000:. ./.:4:180,27:.:-0.72:1.000:. ./.:4:189,23:.:-0.64:1.000:. ./.:4:108,76:.:-1.09:1.000:. ./.:4:169,48:.:-0.56:1.000:. ./.:4:132,149:.: 0.47:1.000:. ./.:4:56,18:.:-2.85:1.000:. ./.:4:115,75:.:-0.99:1.000:. ./.:4:84,61:.:-1.71:1.000:. ./.:4:139,103:.:-0.16:1.000:. ./.:4:136,181:.: 1.04:1.000:. ./.:4:128,127:.: 0.05:1.000:. ./.:4:194,134:.: 1.22:1.000:. ./.:4:121,171:.: 0.64:1.000:. ./.:4:115,95:.:-0.67:1.000:. ./.:4:252,56:.: 0.90:1.000:. ./.:4:153,41:.:-0.93:1.000:. ./.:4:150,60:.:-0.67:1.000:. ./.:6:127,67:.:-0.93:1.000:. ./.:4:176,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:194,59:.: 0.02:1.000:. ./.:4:149,75:.:-0.45:1.000:. ./.:4:159,66:.:-0.43:1.000:. ./.:4:269,71:.: 1.41:1.000:. ./.:4:142,99:.:-0.17:1.000:. ./.:4:267,65:.: 1.28:1.000:. ./.:4:109,137:.:-0.09:1.000:. ./.:4:268,39:.: 0.88:1.000:. ./.:4:120,110:.:-0.35:1.000:. ./.:4:139,121:.: 0.13:1.000:. ./.:4:131,85:.:-0.57:1.000:. ./.:4:123,120:.:-0.14:1.000:. ./.:4:220,23:.:-0.14:1.000:. ./.:4:164,96:.: 0.13:1.000:. ./.:4:173,64:.:-0.24:1.000:. ./.:4:227,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:91,114:.:-0.75:1.000:. ./.:4:203,111:.: 0.99:1.000:. ./.:4:199,47:.:-0.09:1.000:. ./.:4:174,66:.:-0.19:0.999:. ./.:4:229,59:.: 0.58:1.000:. ./.:4:119,141:.: 0.13:1.000:. ./.:4:230,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:199,19:.:-0.54:0.989:. ./.:4:240,103:.: 1.46:1.000:. ./.:4:151,84:.:-0.27:1.000:. ./.:4:137,106:.:-0.14:1.000:. ./.:4:174,82:.: 0.07:1.000:. ./.:4:149,118:.: 0.24:1.000:. ./.:4:175,78:.: 0.02:1.000:. ./.:4:197,73:.: 0.29:1.000:. ./.:4:259,26:.: 0.53:1.000:. ./.:4:121,81:.:-0.80:1.000:. ./.:4:277,66:.: 1.46:1.000:. ./.:4:261,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:108,64:.:-1.28:1.000:. ./.:4:131,83:.:-0.61:1.000:. ./.:4:222,49:.: 0.31:1.000:. ./.:4:154,129:.: 0.50:1.000:. ./.:4:173,88:.: 0.15:1.000:. ./.:4:124,97:.:-0.49:1.000:. ./.:4:88,91:.:-1.17:1.000:. ./.:4:129,117:.:-0.09:1.000:. ./.:4:141,79:.:-0.51:1.000:. ./.:4:156,34:.:-0.99:1.000:. ./.:4:159,75:.:-0.29:1.000:. ./.:4:261,44:.: 0.85:1.000:. ./.:4:160,215:.: 1.97:1.000:. ./.:4:256,69:.: 1.17:1.000:. ./.:4:141,50:.:-0.97:1.000:. ./.:4:229,45:.: 0.35:1.000:. ./.:4:143,134:.: 0.40:0.999:. ./.:4:161,55:.:-0.57:1.000:. ./.:4:164,11:.:-1.23:1.000:. ./.:4:139,98:.:-0.24:1.000:. ./.:4:182,106:.: 0.58:1.000:. ./.:4:114,91:.:-0.75:1.000:. ./.:4:158,61:.:-0.53:1.000:. ./.:4:144,31:.:-1.23:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:188,63:.:-0.01:1.000:. ./.:4:119,121:.:-0.19:1.000:. ./.:4:126,184:.: 0.93:1.000:. ./.:4:176,56:.:-0.32:1.000:. ./.:4:167,97:.: 0.19:1.000:. ./.:4:232,44:.: 0.39:1.000:. ./.:4:78,80:.:-1.50:1.000:. ./.:4:169,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:90,68:.:-1.50:1.000:. ./.:4:111,69:.:-1.15:1.000:. ./.:4:253,25:.: 0.42:1.000:. ./.:4:124,28:.:-1.60:1.000:. ./.:4:181,44:.:-0.43:1.000:. ./.:4:100,92:.:-0.96:1.000:. ./.:4:154,163:.: 1.04:1.000:. ./.:4:226,53:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,54:.:-1.81:1.000:. ./.:4:151,73:.:-0.45:1.000:. ./.:4:147,25:.:-1.28:1.000:. ./.:4:227,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:230,82:.: 0.96:1.000:. ./.:4:132,90:.:-0.48:1.000:. ./.:4:76,94:.:-1.31:1.000:. ./.:4:234,148:.: 2.08:1.000:. ./.:4:224,86:.: 0.93:1.000:. ./.:4:212,70:.: 0.48:1.000:. ./.:4:165,100:.: 0.21:1.000:. ./.:4:273,35:.: 0.90:1.000:. ./.:4:131,137:.: 0.26:1.000:. ./.:4:218,91:.: 0.91:1.000:. ./.:4:129,131:.: 0.13:1.000:. ./.:4:90,10:.:-2.43:1.000:. ./.:4:106,101:.:-0.72:1.000:. ./.:4:216,71:.: 0.56:1.000:. ./.:4:252,84:.: 1.35:1.000:. ./.:4:292,40:.: 1.28:1.000:. ./.:4:133,153:.: 0.55:1.000:. ./.:4:170,71:.:-0.17:1.000:. ./.:4:215,124:.: 1.39:1.000:. ./.:4:120,143:.: 0.18:1.000:. ./.:4:134,39:.:-1.26:1.000:. ./.:4:199,62:.: 0.15:1.000:. ./.:4:203,105:.: 0.90:1.000:. ./.:4:177,98:.: 0.37:1.000:. ./.:4:193,101:.: 0.67:1.000:. ./.:4:128,139:.: 0.24:1.000:. ./.:4:226,113:.: 1.39:0.999:. ./.:4:131,94:.:-0.43:1.000:. ./.:4:191,95:.: 0.55:1.000:. ./.:4:120,145:.: 0.21:1.000:. ./.:4:211,37:.:-0.06:1.000:. ./.:4:122,152:.: 0.35:1.000:. ./.:4:132,134:.: 0.23:1.000:. ./.:4:121,139:.: 0.13:1.000:. ./.:4:182,88:.: 0.29:1.000:. ./.:4:304,91:.: 2.29:1.000:. ./.:4:221,62:.: 0.50:1.000:. ./.:4:144,117:.: 0.15:1.000:. ./.:4:171,73:.:-0.13:1.000:. ./.:4:181,147:.: 1.22:1.000:. ./.:4:186,161:.: 1.52:1.000:. ./.:4:312,36:.: 1.54:1.000:. ./.:4:178,82:.: 0.13:1.000:. ./.:4:200,106:.: 0.87:1.000:. -chr4.1 5912989 chr4.1_005912989 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:820,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:630,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:529,88:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1062,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:798,142:.: 1.38:1.000:. ./.:4:456,75:.:-1.20:1.000:. ./.:4:707,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:765,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:314,42:.:-2.30:1.000:. ./.:4:283,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:715,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:635,97:.: 0.07:1.000:. ./.:4:725,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:488,127:.:-0.67:1.000:. ./.:4:598,99:.:-0.15:1.000:. ./.:4:856,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:787,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:915,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:900,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:385,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:727,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:945,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:634,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:233,44:.:-2.80:1.000:. ./.:4:533,123:.:-0.41:1.000:. ./.:4:704,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:784,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:774,115:.: 1.06:1.000:. ./.:4:652,104:.: 0.22:1.000:. ./.:4:740,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:539,83:.:-0.63:1.000:. ./.:4:225,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:454,1:.:-1.68:1.000:. ./.:3:129,23:.:-3.59:1.000:. ./.:4:732,114:.: 0.79:1.000:. ./.:4:549,110:.:-0.39:1.000:. ./.:4:628,108:.: 0.09:1.000:. ./.:4:681,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:516,104:.:-0.64:1.000:. ./.:4:775,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:780,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:696,127:.: 0.64:1.000:. ./.:4:561,102:.:-0.37:1.000:. ./.:4:992,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:621,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1004,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:251,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:704,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:471,136:.:-0.72:1.000:. ./.:4:728,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:792,121:.: 1.21:1.000:. ./.:4:677,79:.: 0.22:1.000:. ./.:4:831,133:.: 1.53:1.000:. ./.:4:576,80:.:-0.41:1.000:. ./.:4:748,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:646,88:.: 0.08:1.000:. ./.:4:974,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:702,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:536,115:.:-0.44:1.000:. ./.:4:611,105:.:-0.03:1.000:. ./.:4:724,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:720,106:.: 0.66:1.000:. ./.:4:693,107:.: 0.50:1.000:. ./.:4:537,124:.:-0.38:1.000:. ./.:4:862,98:.: 1.50:1.000:. ./.:4:418,55:.:-1.57:1.000:. ./.:4:743,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:582,95:.:-0.28:1.000:. ./.:4:667,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:769,134:.: 1.15:1.000:. ./.:4:602,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:730,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:530,122:.:-0.44:1.000:. ./.:4:709,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:552,100:.:-0.44:1.000:. ./.:4:687,121:.: 0.55:1.000:. ./.:4:809,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:717,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:670,102:.: 0.32:1.000:. ./.:4:466,0:.:-1.61:0.999:. ./.:4:799,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:807,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:684,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:685,116:.: 0.50:0.989:. ./.:4:877,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:585,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:665,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:638,109:.: 0.16:1.000:. ./.:4:539,115:.:-0.42:1.000:. ./.:4:611,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:789,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:665,102:.: 0.29:1.000:. ./.:4:500,82:.:-0.88:1.000:. ./.:4:693,101:.: 0.46:1.000:. ./.:4:794,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:674,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:551,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:730,124:.: 0.84:1.000:. ./.:4:787,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:413,170:.:-0.87:1.000:. ./.:4:966,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:688,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:768,104:.: 0.95:1.000:. ./.:4:594,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:687,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:641,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:787,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1193,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:762,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:722,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:971,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:910,0:.: 1.19:0.999:. ./.:4:774,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:324,103:.:-1.86:1.000:. ./.:4:851,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:615,97:.:-0.06:1.000:. ./.:4:681,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:656,90:.: 0.16:1.000:. ./.:4:593,104:.:-0.15:1.000:. ./.:4:601,94:.:-0.17:1.000:. ./.:4:735,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:706,111:.: 0.60:1.000:. ./.:4:871,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:757,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:632,107:.: 0.11:1.000:. ./.:4:665,95:.: 0.24:1.000:. ./.:4:561,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:388,91:.:-1.53:1.000:. ./.:4:487,94:.:-0.88:1.000:. ./.:4:721,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:564,66:.:-0.58:1.000:. ./.:4:395,59:.:-1.69:1.000:. ./.:4:578,113:.:-0.19:1.000:. ./.:4:556,105:.:-0.38:1.000:. ./.:4:888,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:582,117:.:-0.14:1.000:. ./.:4:713,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:599,86:.:-0.23:1.000:. ./.:4:545,88:.:-0.56:1.000:. ./.:4:839,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:731,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:630,97:.: 0.04:1.000:. ./.:4:526,80:.:-0.73:1.000:. ./.:4:816,138:.: 1.47:1.000:. ./.:4:1090,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:764,116:.: 1.00:1.000:. ./.:4:697,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:753,128:.: 1.01:1.000:. ./.:4:511,81:.:-0.82:1.000:. ./.:4:845,101:.: 1.42:1.000:. ./.:4:828,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:284,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:525,75:.:-0.76:1.000:. ./.:4:582,102:.:-0.24:1.000:. ./.:4:685,96:.: 0.38:1.000:. ./.:4:913,118:.: 1.95:1.000:. ./.:4:754,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:697,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:676,131:.: 0.54:1.000:. ./.:4:630,96:.: 0.03:1.000:. ./.:4:627,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:646,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:767,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:626,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:714,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:601,102:.:-0.12:1.000:. ./.:4:654,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:876,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:768,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:634,88:.: 0.00:1.000:. ./.:4:578,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:698,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:678,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:548,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:632,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:828,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:683,93:.: 0.34:1.000:. ./.:4:865,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:547,99:.:-0.47:1.000:. ./.:4:768,116:.: 1.03:1.000:. ./.:4:845,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:933,135:.: 2.19:1.000:. ./.:4:584,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:699,1:.:-0.13:1.000:. -chr4.1 6028559 chr4.1_006028559 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:287,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:167,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:228,75:.: 0.76:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:175,81:.: 0.04:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,17:.:-3.20:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:189,71:.: 0.10:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:206,78:.: 0.47:0.999:. ./.:4:263,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:178,202:.: 1.95:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:229,69:.: 0.68:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:170,67:.:-0.26:1.000:. ./.:4:223,88:.: 0.89:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:237,93:.: 1.18:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.66:1.000:. ./.:3:5,9:.:-3.70:1.000:. ./.:4:208,75:.: 0.45:1.000:. ./.:4:163,65:.:-0.39:1.000:. ./.:4:212,80:.: 0.59:1.000:. ./.:4:173,67:.:-0.21:1.000:. ./.:4:220,85:.: 0.79:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:168,55:.:-0.47:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:185,89:.: 0.31:1.000:. ./.:4:188,72:.: 0.10:1.000:. ./.:4:246,99:.: 1.41:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:133,54:.:-1.03:1.000:. ./.:4:127,54:.:-1.12:1.000:. ./.:4:152,63:.:-0.60:1.000:. ./.:4:245,93:.: 1.30:1.000:. ./.:4:173,66:.:-0.23:1.000:. ./.:4:216,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:204,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:181,60:.:-0.19:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:158,48:.:-0.73:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.66:1.000:. ./.:6:141,56:.:-0.87:1.000:. ./.:4:192,86:.: 0.38:1.000:. ./.:4:184,56:.:-0.21:1.000:. ./.:4:187,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:140,58:.:-0.86:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:168,123:.: 0.58:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:186,72:.: 0.07:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:98,105:.:-0.78:1.000:. ./.:4:201,72:.: 0.30:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:112,107:.:-0.53:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:173,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:187,70:.: 0.05:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:194,82:.: 0.35:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:285,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:233,84:.: 0.98:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.07:0.989:. ./.:4:326,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:152,67:.:-0.53:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:145,50:.:-0.90:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:149,60:.:-0.69:1.000:. ./.:4:160,58:.:-0.55:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:196,71:.: 0.21:1.000:. ./.:4:167,69:.:-0.27:1.000:. ./.:4:196,70:.: 0.19:1.000:. ./.:4:138,50:.:-1.01:1.000:. ./.:4:203,65:.: 0.22:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:258,81:.: 1.32:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:241,102:.: 1.38:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:275,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:245,70:.: 0.95:1.000:. ./.:4:203,75:.: 0.38:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:185,74:.: 0.08:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:229,59:.: 0.53:1.000:. ./.:4:230,84:.: 0.93:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:207,69:.: 0.35:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:111,127:.:-0.24:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:164,51:.:-0.60:1.000:. ./.:4:164,54:.:-0.55:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:139,52:.:-0.97:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:217,87:.: 0.78:1.000:. ./.:4:251,99:.: 1.49:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:170,52:.:-0.49:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:201,62:.: 0.15:1.000:. ./.:4:161,56:.:-0.56:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:283,119:.: 2.29:1.000:. ./.:4:224,74:.: 0.68:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:358,2:.: 1.64:1.000:. ./.:4:194,71:.: 0.18:1.000:. ./.:4:232,95:.: 1.13:1.000:. ./.:4:235,64:.: 0.70:1.000:. ./.:4:48,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:219,70:.: 0.55:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:230,92:.: 1.06:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:220,87:.: 0.82:1.000:. ./.:4:192,91:.: 0.45:1.000:. ./.:4:222,87:.: 0.85:1.000:. ./.:4:227,68:.: 0.64:1.000:. ./.:4:131,48:.:-1.15:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:182,72:.: 0.01:1.000:. ./.:4:226,73:.: 0.70:0.999:. ./.:4:172,61:.:-0.32:1.000:. ./.:4:231,79:.: 0.87:1.000:. ./.:4:157,57:.:-0.61:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:165,82:.:-0.10:1.000:. ./.:4:185,90:.: 0.33:1.000:. ./.:4:162,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:230,90:.: 1.02:1.000:. ./.:4:207,67:.: 0.31:1.000:. ./.:4:182,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:232,83:.: 0.95:1.000:. ./.:4:288,81:.: 1.78:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:190,76:.: 0.19:1.000:. -chr4.1 6175066 chr4.1_006175066 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:137,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:73,27:.:-0.61:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:87,36:.: 0.22:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,18:.:-2.05:1.000:. ./.:4:59,1:.:-2.05:1.000:. ./.:4:61,23:.:-1.19:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,23:.: 0.40:0.999:. ./.:4:88,50:.: 0.76:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:75,84:.: 1.52:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:58,36:.:-0.83:1.000:. ./.:4:123,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:76,38:.:-0.10:1.000:. ./.:4:89,30:.: 0.08:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:106,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:54,1:.:-2.24:1.000:. ./.:3:26,13:.:-2.81:1.000:. ./.:4:87,40:.: 0.37:1.000:. ./.:4:81,29:.:-0.25:1.000:. ./.:4:93,31:.: 0.26:1.000:. ./.:4:88,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:71,34:.:-0.43:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:93,40:.: 0.58:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:101,43:.: 0.98:1.000:. ./.:4:112,36:.: 1.13:1.000:. ./.:4:97,36:.: 0.58:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:97,38:.: 0.66:1.000:. ./.:4:60,25:.:-1.15:1.000:. ./.:4:94,36:.: 0.47:1.000:. ./.:4:105,48:.: 1.31:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.90:1.000:. ./.:4:90,42:.: 0.55:1.000:. ./.:4:80,32:.:-0.18:1.000:. ./.:4:75,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:99,33:.: 0.55:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:88,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:110,46:.: 1.41:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.26:1.000:. ./.:4:109,35:.: 0.98:1.000:. ./.:4:76,31:.:-0.36:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:125,73:.: 2.93:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:92,41:.: 0.58:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:58,58:.:-0.03:1.000:. ./.:4:105,42:.: 1.09:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:76,80:.: 1.41:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:99,46:.: 1.02:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:86,41:.: 0.37:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,34:.: 0.62:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:155,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:106,39:.: 1.02:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.03:0.989:. ./.:4:124,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:80,24:.:-0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:94,29:.: 0.22:1.000:. ./.:4:87,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:96,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,29:.:-1.15:1.000:. ./.:4:100,44:.: 0.98:1.000:. ./.:4:75,18:.:-0.86:1.000:. ./.:4:85,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:122,55:.: 2.17:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:142,55:.: 2.90:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:131,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:106,43:.: 1.16:1.000:. ./.:4:84,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:88,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:84,36:.: 0.11:1.000:. ./.:4:89,39:.: 0.40:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:53,64:.: 0.01:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:66,44:.:-0.25:1.000:. ./.:4:80,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:62,24:.:-1.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:60,24:.:-1.19:1.000:. ./.:4:107,38:.: 1.02:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,36:.: 0.58:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:71,30:.:-0.57:1.000:. ./.:4:57,19:.:-1.48:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:97,43:.: 0.84:1.000:. ./.:4:95,38:.: 0.58:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:90,35:.: 0.29:1.000:. ./.:4:117,42:.: 1.52:1.000:. ./.:4:85,30:.:-0.07:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:58,19:.:-1.44:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:84,25:.:-0.28:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:111,32:.: 0.94:1.000:. ./.:4:96,32:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.18:1.000:. ./.:4:111,37:.: 1.13:1.000:. ./.:4:54,17:.:-1.66:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:70,34:.:-0.46:1.000:. ./.:4:116,43:.: 1.52:0.999:. ./.:4:84,21:.:-0.43:1.000:. ./.:4:89,27:.:-0.03:1.000:. ./.:4:76,29:.:-0.43:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:91,28:.: 0.08:1.000:. ./.:4:73,34:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,24:.:-1.08:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:108,32:.: 0.84:1.000:. ./.:4:88,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:93,5:.:-0.68:1.000:. ./.:4:95,45:.: 0.84:1.000:. ./.:4:97,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:96,39:.: 0.66:1.000:. -chr4.1 6349686 chr4.1_006349686 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:176,215:0.60: 1.46:1.000:0.811 0/0/1/1:4:153,162:0.57: 0.51:1.000:0.942 0/0/1/1:4:94,85:0.54:-1.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:217,113:0.38: 0.70:1.000:0.588 0/0/1/1:4:212,130:0.44: 0.85:1.000:0.971 1/1/1/1:4:7,243:0.97:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,93:0.60:-1.33:1.000:0.789 0/0/0/1:4:261,103:0.29: 1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:178,103:0.42: 0.09:1.000:0.916 0/0/0/1:4:92,23:0.19:-1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,49:0.36:-1.55:1.000:0.734 1/1/1/1:4:0,436:1.00: 2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,96:0.38: 0.10:1.000:0.546 0/0/0/1:4:282,105:0.27: 1.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:192,97:0.37: 0.18:1.000:0.557 0/0/1/1:4:178,99:0.41: 0.04:1.000:0.835 0/1/1/1:4:88,259:0.74: 0.91:0.999:0.999 0/0/1/1:4:195,198:0.56: 1.48:1.000:0.960 0/0/0/1:4:371,144:0.28: 3.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:262,244:0.55: 2.90:1.000:0.981 0/0/1/1:4:111,58:0.38:-1.31:1.000:0.604 0/0/1/1:4:192,108:0.41: 0.32:1.000:0.863 0/0/0/1:4:248,109:0.32: 1.03:1.000:0.950 0/0/0/1:4:294,101:0.24: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,18:0.35:-2.73:1.000:0.814 0/0/1/1:4:216,122:0.41: 0.80:1.000:0.872 0/0/1/1:4:185,107:0.42: 0.22:1.000:0.915 0/0/1/1:4:89,78:0.54:-1.34:1.000:0.989 0/1/1/1:4:95,234:0.71: 0.68:1.000:0.994 1/1/1/1:4:2,225:0.99:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,146:0.50: 0.92:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,156:0.99:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,46:0.70:-2.60:1.000:0.989 0/0/0/1:4:97,47:0.36:-1.63:1.000:0.739 0/1/1:3:28,26:0.55:-2.75:1.000:0.961 1/1/1/1:4:2,213:0.99:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,93:0.31: 0.43:1.000:0.966 0/1/1/1:4:112,198:0.66: 0.45:1.000:0.882 0/0/0/1:4:205,77:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:224,133:0.43: 1.03:1.000:0.947 0/1/1/1:4:146,230:0.64: 1.27:1.000:0.717 0/0/1/1:4:166,213:0.61: 1.31:1.000:0.731 0/1/1/1:4:91,182:0.68:-0.01:1.000:0.959 0/0/1/1:4:98,90:0.55:-1.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:199,111:0.41: 0.45:1.000:0.843 0/1/1/1:4:90,170:0.67:-0.18:1.000:0.933 0/1/1/1:4:81,228:0.73: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,66:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,192:0.78:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,224:0.81:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,159:0.68:-0.45:1.000:0.962 0/1/1/1:4:73,223:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,186:0.75:-0.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:3,192:0.98:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,89:0.42:-0.40:1.000:0.923 0/1/1/1:4:59,194:0.76:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,193:0.97:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,199:0.99:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,96:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:75,119:0.64:-1.00:1.000:0.884 0/1/1/1:4:97,184:0.67: 0.09:1.000:0.935 0/1/1/1:4:88,171:0.68:-0.19:1.000:0.948 0/0/1/1:4:161,89:0.40:-0.30:1.000:0.819 1/1/1/1:4:2,203:0.99:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,111:0.50:-0.09:1.000:0.997 1/1/1/1:4:4,241:0.98:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,84:0.34:-0.13:1.000:0.854 0/0/1/1:4:153,212:0.62: 1.13:1.000:0.569 0/0/0/1:4:225,110:0.36: 0.76:1.000:0.704 0/1/1/1:4:90,248:0.73: 0.80:1.000:0.998 0/1/1/1:4:69,215:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,89:0.57:-1.23:1.000:0.957 0/1/1/1:4:101,311:0.75: 1.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:216,96:0.33: 0.47:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,341:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,108:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,100:0.59:-1.11:1.000:0.860 0/0/1/1:4:122,166:0.62: 0.17:1.000:0.610 0/0/0/1:4:205,88:0.31: 0.23:1.000:0.968 0/0/1/1:4:106,81:0.51:-1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,229:0.80: 0.13:0.999:1.000 0/0/1/1:4:163,104:0.46:-0.09:1.000:0.986 0/0/0/1:4:226,105:0.34: 0.71:1.000:0.865 0/0/0/1:4:172,81:0.35:-0.26:1.000:0.831 0/0/1/1:4:118,115:0.56:-0.51:0.989:0.972 0/0/1/1:4:167,108:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:180,85:0.35:-0.11:1.000:0.823 0/0/0/1:4:190,76:0.29:-0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:143,98:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,68:0.31:-0.58:1.000:0.974 0/1/1/1:4:64,183:0.74:-0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:66,182:0.73:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,116:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:77,134:0.66:-0.79:1.000:0.866 0/0/1/1:4:97,133:0.62:-0.55:1.000:0.593 0/0/0/1:4:196,93:0.35: 0.18:1.000:0.809 0/0/1/1:4:135,129:0.55:-0.13:1.000:0.977 0/1/1/1:4:66,222:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,222:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,81:0.23: 0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,155:0.98:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,174:0.72:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,130:0.73:-1.19:1.000:0.997 1/1/1/1:4:3,168:0.98:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,76:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,91:0.32: 0.30:1.000:0.950 0/0/0/1:4:183,86:0.34:-0.06:1.000:0.837 0/1/1/1:4:128,256:0.68: 1.37:1.000:0.959 0/1/1/1:4:82,218:0.73: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:176,109:0.45: 0.13:1.000:0.976 0/0/0/1:4:218,99:0.33: 0.53:1.000:0.909 0/1/1/1:4:140,248:0.66: 1.42:1.000:0.884 0/0/1/1:4:134,108:0.52:-0.40:0.999:0.994 0/0/1/1:4:155,192:0.60: 0.91:1.000:0.791 0/0/1/1:4:131,76:0.42:-0.84:1.000:0.920 0/0/1/1:4:144,204:0.62: 0.92:1.000:0.518 0/1/1/1:4:88,194:0.70: 0.10:1.000:0.983 0/0/0/1:4:190,86:0.33: 0.02:1.000:0.914 0/0/1/1:4:66,87:0.61:-1.51:1.000:0.679 0/0/0/1:4:152,61:0.29:-0.76:1.000:0.991 0/0/0/1:4:180,91:0.37:-0.04:1.000:0.554 0/0/1/1:4:125,93:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,212:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,172:0.69:-0.24:1.000:0.970 0/0/1/1:4:150,78:0.38:-0.58:1.000:0.581 0/1/1/1:4:101,175:0.66: 0.02:1.000:0.861 0/0/1/1:4:103,92:0.54:-0.99:1.000:0.987 0/1/1/1:4:75,242:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,152:0.72:-0.80:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,128:0.98:-1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,186:0.64: 0.38:1.000:0.701 0/0/0/1:4:191,91:0.35: 0.10:1.000:0.797 0/0/0/1:4:108,53:0.36:-1.41:1.000:0.688 0/0/1/1:4:163,98:0.43:-0.16:1.000:0.958 0/1/1/1:4:58,147:0.72:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:254,292:0.59: 3.40:1.000:0.884 0/1/1/1:4:85,217:0.72: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,140:0.70:-0.90:1.000:0.986 0/0/1/1:4:58,80:0.62:-1.70:1.000:0.580 0/0/1/1:4:155,81:0.38:-0.48:1.000:0.604 0/1/1/1:4:75,157:0.69:-0.53:1.000:0.973 0/0/1/1:4:174,111:0.46: 0.13:1.000:0.986 0/1/1/1:4:87,201:0.71: 0.17:1.000:0.989 0/1/1/1:4:54,146:0.73:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,141:0.48: 0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:126,203:0.65: 0.68:1.000:0.757 1/1/1/1:4:1,193:0.99:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,80:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,112:0.54:-0.43:1.000:0.989 0/0/0/1:4:162,78:0.35:-0.43:1.000:0.762 1/1/1/1:4:1,266:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,194:0.69: 0.18:1.000:0.966 0/0/1/1:4:69,46:0.47:-1.99:1.000:0.994 0/1/1/1:4:94,167:0.66:-0.16:1.000:0.887 0/1/1/1:4:80,236:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,226:0.69: 0.77:1.000:0.968 0/0/1/1:4:113,117:0.57:-0.55:1.000:0.952 0/0/0/1:4:321,132:0.30: 2.23:1.000:0.986 0/1/1/1:4:99,150:0.64:-0.31:1.000:0.637 0/1/1/1:4:106,209:0.68: 0.51:1.000:0.954 0/1/1/1:4:78,188:0.71:-0.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:76,149:0.68:-0.61:1.000:0.952 0/0/1/1:4:184,200:0.58: 1.37:1.000:0.927 0/0/1/1:4:184,97:0.39: 0.09:1.000:0.644 0/0/1/1:4:215,131:0.44: 0.90:1.000:0.967 0/0/0/1:4:256,89:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,175:0.73:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:205,178:0.54: 1.36:0.999:0.990 0/1/1/1:4:75,158:0.69:-0.51:1.000:0.975 0/1/1/1:4:93,221:0.71: 0.50:1.000:0.992 0/1/1/1:4:53,182:0.77:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,73:0.29:-0.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:240,91:0.27: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,181:0.61: 0.52:1.000:0.643 0/0/1/1:4:163,183:0.58: 0.90:1.000:0.904 0/0/1/1:4:140,97:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:131,255:0.68: 1.40:1.000:0.948 0/0/0/1:4:213,103:0.35: 0.52:1.000:0.746 0/1/1/1:4:83,222:0.73: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:183,100:0.40: 0.11:1.000:0.783 1/1/1/1:4:3,252:0.99:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,288:0.60: 3.03:1.000:0.766 0/0/1/1:4:119,100:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:229,88:0.28: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,316:0.75: 1.77:1.000:0.999 -chr4.1 6473437 chr4.1_006473437 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:275,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:181,76:.:-0.44:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:206,94:.: 0.45:1.000:. ./.:4:178,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:190,84:.:-0.09:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:137,21:.:-2.47:1.000:. ./.:4:176,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:170,69:.:-0.81:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:234,74:.: 0.61:0.999:. ./.:4:286,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:164,158:.: 0.90:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:205,55:.:-0.37:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:123,3:.:-3.13:1.000:. ./.:4:192,68:.:-0.37:1.000:. ./.:4:188,73:.:-0.35:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:220,88:.: 0.61:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:126,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.36:1.000:. ./.:3:84,17:.:-3.65:1.000:. ./.:4:233,75:.: 0.61:1.000:. ./.:4:197,84:.: 0.06:1.000:. ./.:4:202,82:.: 0.12:1.000:. ./.:4:223,93:.: 0.78:1.000:. ./.:4:210,76:.: 0.16:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:257,76:.: 1.13:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:248,83:.: 1.09:1.000:. ./.:4:203,78:.: 0.06:1.000:. ./.:4:244,68:.: 0.70:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:241,72:.: 0.72:1.000:. ./.:4:199,78:.:-0.02:1.000:. ./.:4:200,75:.:-0.07:1.000:. ./.:4:239,112:.: 1.50:1.000:. ./.:4:229,71:.: 0.45:1.000:. ./.:4:247,66:.: 0.72:1.000:. ./.:4:207,83:.: 0.24:1.000:. ./.:4:226,90:.: 0.78:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:290,87:.: 2.03:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.44:1.000:. ./.:6:200,72:.:-0.13:1.000:. ./.:4:216,65:.: 0.06:1.000:. ./.:4:186,66:.:-0.54:1.000:. ./.:4:271,64:.: 1.17:1.000:. ./.:4:249,91:.: 1.27:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:216,154:.: 1.89:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:209,56:.:-0.27:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:131,140:.:-0.15:1.000:. ./.:4:261,85:.: 1.40:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:166,154:.: 0.86:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:207,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:220,72:.: 0.28:1.000:. ./.:4:376,1:.: 2.03:1.000:. ./.:4:214,73:.: 0.18:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.18:0.999:. ./.:4:345,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:251,89:.: 1.27:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.17:0.989:. ./.:4:353,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:214,69:.: 0.10:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:273,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:152,50:.:-1.57:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:204,54:.:-0.42:1.000:. ./.:4:187,60:.:-0.64:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:208,71:.: 0.02:1.000:. ./.:4:206,48:.:-0.50:1.000:. ./.:4:238,73:.: 0.68:1.000:. ./.:4:152,45:.:-1.67:1.000:. ./.:4:269,78:.: 1.42:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:281,103:.: 2.18:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:260,108:.: 1.85:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:283,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:269,91:.: 1.68:1.000:. ./.:4:225,80:.: 0.55:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:233,78:.: 0.68:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:229,79:.: 0.61:1.000:. ./.:4:199,83:.: 0.08:1.000:. ./.:4:264,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:227,75:.: 0.49:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:131,134:.:-0.27:1.000:. ./.:4:225,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:192,42:.:-0.91:1.000:. ./.:4:220,66:.: 0.16:1.000:. ./.:4:245,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:153,59:.:-1.36:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:187,54:.:-0.77:1.000:. ./.:4:221,67:.: 0.20:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:190,53:.:-0.72:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:306,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:181,66:.:-0.64:1.000:. ./.:4:186,49:.:-0.89:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:284,95:.: 2.08:1.000:. ./.:4:216,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:174,60:.:-0.91:1.000:. ./.:4:271,97:.: 1.85:1.000:. ./.:4:199,89:.: 0.20:1.000:. ./.:4:212,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:151,48:.:-1.63:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:232,81:.: 0.72:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:235,82:.: 0.80:1.000:. ./.:4:185,67:.:-0.54:1.000:. ./.:4:230,84:.: 0.74:1.000:. ./.:4:219,84:.: 0.51:1.000:. ./.:4:197,63:.:-0.37:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:159,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:193,68:.:-0.35:1.000:. ./.:4:196,83:.: 0.02:0.999:. ./.:4:176,67:.:-0.72:1.000:. ./.:4:203,63:.:-0.25:1.000:. ./.:4:178,64:.:-0.74:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:160,70:.:-0.99:1.000:. ./.:4:174,76:.:-0.58:1.000:. ./.:4:157,66:.:-1.14:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:236,76:.: 0.70:1.000:. ./.:4:199,67:.:-0.25:1.000:. ./.:4:243,8:.:-0.56:1.000:. ./.:4:220,77:.: 0.39:1.000:. ./.:4:179,82:.:-0.35:1.000:. ./.:4:336,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:211,73:.: 0.12:1.000:. -chr4.1 6641999 chr4.1_006641999 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:59,133:0.72: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,60:0.45:-0.70:1.000:0.979 0/0/1/1:4:117,116:0.49: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,133:0.60: 1.04:1.000:0.754 0/0/1/1:4:115,132:0.53: 1.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,129:0.73: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,55:0.52:-1.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,68:0.44:-0.30:1.000:0.968 0/0/1/1:4:84,116:0.58: 0.60:1.000:0.894 0/0/0/1:4:26,12:0.33:-2.55:1.000:0.924 0/0/0/1:4:46,18:0.30:-2.04:1.000:0.986 1/1/1/1:4:1,153:0.99:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,33:0.19: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,95:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,95:0.53: 0.15:1.000:0.991 0/1/1/1:4:55,181:0.79: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,135:0.71: 0.52:0.999:0.993 0/1/1/1:4:56,188:0.80: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,128:0.53: 1.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:69,79:0.53:-0.41:1.000:0.992 0/1/1/1:4:15,50:0.79:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,55:0.29: 0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:93,97:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,27:0.76:-2.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,79:0.40: 0.54:1.000:0.827 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,42:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,119:0.70: 0.13:1.000:0.984 0/1/1/1:4:52,228:0.83: 2.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:130,156:0.54: 2.27:1.000:0.985 0/1/1/1:4:67,209:0.78: 2.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,37:0.77:-2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,21:0.45:-2.39:1.000:0.983 0/0/1:3:7,7:0.49:-3.02:1.000:0.628 0/1/1/1:4:51,117:0.72:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,48:0.33:-0.32:1.000:0.931 0/1/1/1:4:59,147:0.74: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,83:0.37: 1.20:1.000:0.594 1/1/1/1:4:0,246:1.00: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,131:0.80: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,110:0.68:-0.04:1.000:0.948 0/0/1/1:4:92,120:0.57: 0.83:1.000:0.952 0/0/0/1:4:112,44:0.30:-0.26:1.000:0.986 0/1/1/1:4:45,98:0.71:-0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,97:0.75:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,42:0.45:-1.46:1.000:0.974 0/1/1/1:4:55,116:0.70: 0.03:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,31:0.33:-1.38:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,171:1.00: 0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,163:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,123:0.76: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,105:0.66:-0.12:1.000:0.874 0/1/1/1:4:68,155:0.72: 1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,98:0.80:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,68:0.40: 0.03:1.000:0.804 0/0/1/1:4:106,134:0.56: 1.38:1.000:0.969 0/1/1/1/1/1:6:23,111:0.85:-0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:51,130:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,52:0.30: 0.23:1.000:0.981 0/1/1/1:4:60,122:0.69: 0.25:1.000:0.976 0/1/1/1:4:49,117:0.73:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:93,160:0.65: 1.63:1.000:0.762 0/1/1/1:4:60,107:0.66:-0.04:1.000:0.847 0/0/1/1:4:51,60:0.54:-1.13:1.000:0.989 0/1/1/1:4:37,98:0.76:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,102:0.53: 0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,38:0.48:-1.75:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,66:0.61:-1.15:1.000:0.710 0/0/1/1:4:62,67:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,108:0.53: 0.62:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,184:0.83: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,94:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,96:0.77:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,124:0.55: 1.08:1.000:0.980 0/0/0/1:4:112,62:0.37: 0.09:1.000:0.628 0/1/1/1:4:42,148:0.80: 0.40:0.999:1.000 0/0/0/1:4:136,51:0.29: 0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:107,76:0.42: 0.27:1.000:0.902 0/0/0/1:4:117,47:0.30:-0.10:1.000:0.982 0/0/1/1:4:100,138:0.58: 1.34:0.989:0.895 0/0/0/1:4:169,49:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,61:0.46:-0.76:1.000:0.990 0/0/1/1:4:47,58:0.55:-1.25:1.000:0.978 0/1/1/1:4:44,117:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,36:0.33:-1.07:1.000:0.924 0/1/1/1:4:46,163:0.80: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,78:0.44: 0.11:1.000:0.973 0/0/1/1:4:139,125:0.47: 1.84:1.000:0.992 0/1/1/1:4:24,73:0.78:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,136:0.53: 1.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:162,61:0.29: 1.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:76,40:0.35:-1.03:1.000:0.745 0/1/1/1:4:41,105:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,167:0.81: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,61:0.37:-0.04:1.000:0.524 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,99:0.72:-0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,54:0.66:-1.66:1.000:0.864 0/1/1/1:4:40,78:0.68:-1.00:1.000:0.956 0/0/1/1:4:63,77:0.55:-0.57:1.000:0.981 0/0/1/1:4:93,100:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,92:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,118:0.49: 1.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,137:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,53:0.27: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,85:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,83:0.38: 1.06:1.000:0.538 0/0/1/1:4:70,90:0.56:-0.18:0.999:0.961 0/1/1/1:4:43,204:0.85: 1.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:78,85:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,83:0.68:-0.86:1.000:0.964 0/1/1/1:4:20,83:0.83:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,78:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,54:0.41:-0.72:1.000:0.874 0/1/1/1:4:46,118:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,89:0.52: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:109,35:0.26:-0.49:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,190:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,114:0.71:-0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:122,36:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,107:0.73:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,96:0.58:-0.04:1.000:0.920 0/0/1/1:4:40,49:0.55:-1.56:1.000:0.980 0/1/1/1:4:40,129:0.79: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,73:0.70:-1.19:1.000:0.984 0/1/1/1:4:33,89:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,113:0.49: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,36:0.37:-1.34:1.000:0.586 0/1/1/1:4:46,143:0.78: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,158:0.99:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,130:0.72: 0.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,175:0.78: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,83:0.71:-0.94:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,83:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,95:0.57:-0.02:1.000:0.953 0/0/1/1:4:104,97:0.48: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,69:0.41: 0.02:1.000:0.857 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,175:0.77: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,61:0.37:-0.06:1.000:0.502 0/1/1/1:4:44,112:0.75:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,132:0.61: 1.01:1.000:0.744 0/0/1/1:4:109,105:0.48: 0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,111:0.71:-0.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,140:0.73: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,133:0.74: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:28,10:0.28:-2.55:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,266:1.00: 1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,113:0.72:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,125:0.57: 0.99:1.000:0.945 0/0/1/1:4:80,53:0.40:-0.70:1.000:0.810 0/0/1/1:4:94,68:0.42:-0.14:1.000:0.918 0/1/1/1:4:55,95:0.65:-0.37:1.000:0.773 1/1/1/1:4:1,155:0.99:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,58:0.40:-0.43:1.000:0.781 0/1/1/1:4:50,158:0.79: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,121:0.52: 1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,157:0.56: 2.15:1.000:0.964 0/0/1/1:4:86,105:0.55: 0.42:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,146:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,57:0.38:-0.32:0.999:0.561 0/1/1/1:4:45,93:0.70:-0.61:1.000:0.981 0/0/0/1:4:87,49:0.37:-0.65:1.000:0.582 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,50:0.29: 0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:93,50:0.36:-0.51:1.000:0.699 0/1/1/1:4:49,92:0.67:-0.55:1.000:0.924 0/1/1/1:4:37,86:0.73:-0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,129:0.66: 0.62:1.000:0.856 0/0/1/1:4:139,166:0.54: 2.64:1.000:0.986 0/0/0/1:4:115,59:0.35: 0.09:1.000:0.794 0/1/1/1:4:46,114:0.74:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,145:0.74: 0.70:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,112:0.68: 0.00:1.000:0.960 0/1/1/1:4:52,147:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,119:0.53: 1.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:81,90:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:63,108:0.65: 0.03:1.000:0.752 -chr4.1 6959876 chr4.1_006959876 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:384,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:448,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:84,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:435,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:529,1:.: 2.29:1.000:. ./.:4:481,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:131,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:93,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:424,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:399,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:358,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:44,0:.:-3.62:1.000:. ./.:4:115,0:.:-2.75:1.000:. ./.:3:80,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:379,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:338,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:258,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:365,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:280,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:320,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:277,2:.:-0.76:0.999:. ./.:4:402,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:355,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:341,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:186,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:274,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:493,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:354,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:429,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:352,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:299,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:517,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:405,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:86,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:387,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:481,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:338,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:311,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:294,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:339,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:367,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:430,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:487,1:.: 1.78:1.000:. ./.:4:507,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.32:1.000:. -chr4.1 7022040 chr4.1_007022040 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:55,20:.: 0.72:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:69,9:.: 0.86:1.000:. ./.:4:37,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:24,10:.:-1.27:1.000:. ./.:4:57,11:.: 0.38:0.999:. ./.:4:27,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:66,19:.: 1.20:1.000:. ./.:4:73,13:.: 1.25:1.000:. ./.:4:25,2:.:-1.61:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.01:1.000:. ./.:4:16,1:.:-2.10:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.11:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:7,3:.:-2.44:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.25:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:12,23:.:-1.22:1.000:. ./.:4:45,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:93,19:.: 2.52:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:43,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:52,17:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,5:.:-1.86:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:46,15:.: 0.04:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.11:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:72,17:.: 1.40:1.000:. ./.:6:61,7:.: 0.38:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:60,21:.: 1.01:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,22:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:52,19:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,6:.:-0.59:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:56,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:52,19:.: 0.52:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:115,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:90,19:.: 2.37:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:57,14:.: 0.52:1.000:. ./.:4:55,15:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,15:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:31,14:.:-0.74:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:78,22:.: 1.93:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:72,21:.: 1.59:1.000:. ./.:4:55,17:.: 0.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:49,12:.: 0.04:1.000:. ./.:4:48,14:.: 0.09:1.000:. ./.:4:65,17:.: 1.06:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:70,22:.: 1.54:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:80,19:.: 1.88:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:88,24:.: 2.52:0.999:. ./.:4:49,18:.: 0.33:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:81,18:.: 1.88:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:67,16:.: 1.11:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:36,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:52,12:.: 0.18:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,13:.:-1.18:1.000:. ./.:4:16,12:.:-1.56:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,23:.: 1.30:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:25,8:.:-1.32:1.000:. ./.:4:30,12:.:-0.88:1.000:. ./.:4:44,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:44,8:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:28,9:.:-1.13:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:22,12:.:-1.27:1.000:. ./.:4:26,11:.:-1.13:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,10:.: 1.25:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:32,10:.:-0.88:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:27,12:.:-1.03:1.000:. ./.:4:34,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:14,2:.:-2.15:1.000:. ./.:4:38,9:.:-0.64:1.000:. ./.:4:31,18:.:-0.54:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.33:0.999:. ./.:4:42,9:.:-0.45:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,13:.:-0.84:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:72,12:.: 1.16:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,7:.:-0.69:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.50:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:33,11:.:-0.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.59:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:51,16:.: 0.33:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.03:1.000:. -chr4.1 7195140 chr4.1_007195140 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,8:.: 0.59:1.000:. ./.:4:4,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:10,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,10:.: 1.24:1.000:. ./.:4:10,12:.: 1.24:1.000:. ./.:4:5,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:14,15:.: 2.38:1.000:. ./.:4:9,13:.: 1.24:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.69:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:6,11:.: 0.43:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.75:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,14:.: 2.38:1.000:. ./.:4:13,6:.: 0.75:1.000:. ./.:4:6,14:.: 0.92:0.999:. ./.:4:12,7:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,7:.: 0.59:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.86:1.000:. ./.:4:3,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,7:.: 0.75:1.000:. ./.:4:6,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.18:1.000:. ./.:4:9,9:.: 0.59:1.000:. ./.:4:9,6:.: 0.10:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:14,17:.: 2.71:1.000:. ./.:4:12,14:.: 1.89:1.000:. ./.:4:7,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:2,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:10,9:.: 0.75:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.71:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:12,12:.: 1.57:1.000:. ./.:4:9,16:.: 1.73:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,17:.: 2.71:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:8,9:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.69:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:9,11:.: 0.92:1.000:. ./.:4:13,14:.: 2.06:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,9:.:-0.39:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:15,9:.: 1.57:1.000:. ./.:4:13,4:.: 0.43:1.000:. ./.:6:8,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:9,10:.: 0.75:1.000:. ./.:4:10,16:.: 1.89:1.000:. ./.:4:2,11:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:6,8:.:-0.06:1.000:. ./.:4:7,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,9:.: 1.73:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:7,16:.: 1.41:1.000:. ./.:4:4,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,11:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,7:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.26:1.000:. ./.:4:9,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.88:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:8,6:.:-0.06:0.999:. ./.:4:4,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:9,10:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.55:1.000:. ./.:4:10,5:.: 0.10:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,8:.:-0.06:1.000:. ./.:4:15,11:.: 1.89:1.000:. ./.:4:15,18:.: 3.04:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,7:.: 0.10:1.000:. ./.:4:4,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,9:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:10,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:7,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:3,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,11:.: 0.59:1.000:. ./.:4:6,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:4,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,9:.:-0.39:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,6:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.39:0.999:. ./.:4:6,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.69:1.000:. ./.:4:3,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:7,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.88:1.000:. ./.:4:2,6:.:-1.04:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,7:.: 0.10:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.37:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.86:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.53:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.69:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.20:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.69:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:3,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.37:1.000:. ./.:4:17,8:.: 1.73:1.000:. ./.:4:5,15:.: 0.92:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:10,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.20:1.000:. ./.:4:5,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:6,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.02:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.10:1.000:. ./.:4:17,15:.: 2.87:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:15,5:.: 0.92:1.000:. ./.:4:8,14:.: 1.24:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,13:.: 0.75:1.000:. ./.:4:3,10:.:-0.23:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.75:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:8,10:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,5:.:-1.37:0.999:. ./.:4:4,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:6,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:4,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.37:1.000:. ./.:4:10,8:.: 0.59:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:3,11:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,8:.: 0.43:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,15:.: 2.06:1.000:. ./.:4:5,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:10,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:8,6:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.26:1.000:. -chr4.1 7372929 chr4.1_007372929 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:159,47:.: 1.31:1.000:. ./.:4:118,11:.:-0.44:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:176,42:.: 1.58:1.000:. ./.:4:200,40:.: 2.08:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:97,62:.: 0.24:1.000:. ./.:4:135,34:.: 0.47:1.000:. ./.:4:25,7:.:-2.64:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:128,22:.: 0.04:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:148,42:.: 0.95:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:169,52:.: 1.65:1.000:. ./.:4:92,78:.: 0.49:0.999:. ./.:4:149,46:.: 1.06:1.000:. ./.:4:171,54:.: 1.74:1.000:. ./.:4:49,100:.: 0.02:1.000:. ./.:4:22,3:.:-2.80:1.000:. ./.:4:140,19:.: 0.24:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:118,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:19,5:.:-2.82:1.000:. ./.:4:127,35:.: 0.31:1.000:. ./.:4:146,32:.: 0.67:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:153,28:.: 0.74:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:127,44:.: 0.52:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:25,7:.:-2.64:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.27:1.000:. ./.:3:4,8:.:-3.09:1.000:. ./.:4:148,31:.: 0.70:1.000:. ./.:4:124,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:158,35:.: 1.01:1.000:. ./.:4:127,27:.: 0.13:1.000:. ./.:4:174,29:.: 1.24:1.000:. ./.:4:67,57:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,41:.: 0.04:1.000:. ./.:4:111,29:.:-0.19:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:68,46:.:-0.78:1.000:. ./.:4:108,23:.:-0.39:1.000:. ./.:4:95,76:.: 0.52:1.000:. ./.:4:94,36:.:-0.41:1.000:. ./.:4:61,57:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,40:.:-1.25:1.000:. ./.:4:84,15:.:-1.12:1.000:. ./.:4:106,67:.: 0.56:1.000:. ./.:4:74,43:.:-0.71:1.000:. ./.:4:111,26:.:-0.26:1.000:. ./.:4:96,72:.: 0.45:1.000:. ./.:4:82,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:100,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:112,28:.:-0.19:1.000:. ./.:6:73,33:.:-0.96:1.000:. ./.:4:106,26:.:-0.37:1.000:. ./.:4:129,17:.:-0.05:1.000:. ./.:4:81,71:.: 0.08:1.000:. ./.:4:112,28:.:-0.19:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:125,56:.: 0.74:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:70,60:.:-0.41:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:74,47:.:-0.62:1.000:. ./.:4:80,61:.:-0.16:1.000:. ./.:4:68,22:.:-1.32:1.000:. ./.:4:84,45:.:-0.44:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:78,56:.:-0.32:1.000:. ./.:4:137,37:.: 0.58:1.000:. ./.:4:140,35:.: 0.61:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:158,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:90,77:.: 0.42:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:94,37:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:70,23:.:-1.25:1.000:. ./.:4:113,29:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,18:.:-1.05:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:88,24:.:-0.82:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:107,17:.:-0.55:1.000:. ./.:4:100,19:.:-0.66:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:91,60:.: 0.06:1.000:. ./.:4:77,8:.:-1.43:1.000:. ./.:4:74,53:.:-0.48:1.000:. ./.:4:52,34:.:-1.41:1.000:. ./.:4:106,30:.:-0.28:1.000:. ./.:4:90,23:.:-0.80:1.000:. ./.:4:128,29:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,38:.:-0.21:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:105,85:.: 0.95:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:89,24:.:-0.80:1.000:. ./.:4:192,29:.: 1.65:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.53:0.999:. ./.:4:133,39:.: 0.54:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:96,57:.: 0.11:1.000:. ./.:4:102,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:81,30:.:-0.85:1.000:. ./.:4:103,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:106,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:108,102:.: 1.40:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:116,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,30:.:-1.43:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:85,17:.:-1.05:1.000:. ./.:4:74,32:.:-0.96:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:60,11:.:-1.75:1.000:. ./.:4:121,36:.: 0.20:1.000:. ./.:4:85,52:.:-0.26:1.000:. ./.:4:149,92:.: 2.10:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:54,39:.:-1.25:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:81,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:44,32:.:-1.64:1.000:. ./.:4:156,42:.: 1.13:1.000:. ./.:4:179,27:.: 1.31:1.000:. ./.:4:146,23:.: 0.47:1.000:. ./.:4:148,31:.: 0.70:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:71,70:.:-0.16:1.000:. ./.:4:162,32:.: 1.04:1.000:. ./.:4:91,76:.: 0.42:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:66,42:.:-0.91:1.000:. ./.:4:147,49:.: 1.08:1.000:. ./.:4:147,32:.: 0.70:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:109,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:134,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:140,24:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,72:.: 0.13:1.000:. ./.:4:107,14:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,39:.: 0.29:1.000:. ./.:4:135,48:.: 0.79:1.000:. ./.:4:162,49:.: 1.42:1.000:. ./.:4:131,27:.: 0.22:1.000:. ./.:4:90,60:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,31:.: 1.06:0.999:. ./.:4:77,64:.:-0.16:1.000:. ./.:4:123,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:65,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:67,60:.:-0.48:1.000:. ./.:4:75,69:.:-0.10:1.000:. ./.:4:71,54:.:-0.53:1.000:. ./.:4:109,40:.: 0.02:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:148,43:.: 0.97:1.000:. ./.:4:113,85:.: 1.13:1.000:. ./.:4:141,41:.: 0.76:1.000:. ./.:4:124,22:.:-0.05:1.000:. ./.:4:124,80:.: 1.26:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:100,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:140,26:.: 0.40:1.000:. -chr4.1 7593473 chr4.1_007593473 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:200,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:136,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:142,50:.: 0.50:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:183,66:.: 1.91:1.000:. ./.:4:90,27:.:-1.35:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,36:.:-1.82:1.000:. ./.:4:57,25:.:-2.21:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:154,67:.: 1.22:1.000:. ./.:4:158,59:.: 1.12:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:226,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:33,32:.:-2.63:1.000:. ./.:4:163,53:.: 1.09:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:150,42:.: 0.50:1.000:. ./.:4:128,49:.: 0.13:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:123,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.34:1.000:. ./.:3:26,9:.:-3.37:1.000:. ./.:4:137,58:.: 0.57:1.000:. ./.:4:156,55:.: 0.97:1.000:. ./.:4:134,39:.: 0.03:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:166,72:.: 1.64:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:158,61:.: 1.17:1.000:. ./.:4:121,52:.: 0.03:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:147,43:.: 0.45:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:326,0:.: 3.81:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:153,60:.: 1.02:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:141,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:132,37:.:-0.07:1.000:. ./.:4:172,51:.: 1.26:1.000:. ./.:4:152,47:.: 0.67:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:128,39:.:-0.12:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.22:1.000:. ./.:6:102,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:130,30:.:-0.29:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:142,61:.: 0.77:1.000:. ./.:4:123,43:.:-0.14:1.000:. ./.:4:139,57:.: 0.60:1.000:. ./.:4:169,51:.: 1.19:1.000:. ./.:4:69,38:.:-1.60:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:107,48:.:-0.41:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:138,52:.: 0.45:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:145,54:.: 0.67:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:96,42:.:-0.83:1.000:. ./.:4:117,49:.:-0.14:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:130,43:.: 0.03:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.38:0.999:. ./.:4:154,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:134,47:.: 0.23:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:105,40:.:-0.66:1.000:. ./.:4:112,48:.:-0.29:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:142,51:.: 0.52:1.000:. ./.:4:102,36:.:-0.83:1.000:. ./.:4:96,36:.:-0.98:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:117,68:.: 0.33:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,66:.:-1.28:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:117,56:.: 0.03:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:299,0:.: 3.14:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:170,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:93,49:.:-0.73:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:107,43:.:-0.54:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:123,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:121,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:124,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:113,47:.:-0.29:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:123,51:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:83,36:.:-1.30:1.000:. ./.:4:91,37:.:-1.08:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,54:.: 0.15:1.000:. ./.:4:80,29:.:-1.55:1.000:. ./.:4:123,65:.: 0.40:1.000:. ./.:4:137,52:.: 0.43:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:101,30:.:-1.01:1.000:. ./.:4:100,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:120,45:.:-0.17:1.000:. ./.:4:100,28:.:-1.08:1.000:. ./.:4:174,63:.: 1.61:1.000:. ./.:4:215,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:174,58:.: 1.49:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:182,61:.: 1.76:1.000:. ./.:4:125,47:.: 0.01:1.000:. ./.:4:172,54:.: 1.34:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:86,31:.:-1.35:1.000:. ./.:4:122,55:.: 0.13:1.000:. ./.:4:176,60:.: 1.59:1.000:. ./.:4:147,63:.: 0.94:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:132,50:.: 0.25:1.000:. ./.:4:156,57:.: 1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:166,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:102,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.59:0.999:. ./.:4:198,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:117,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:126,39:.:-0.17:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:140,47:.: 0.38:1.000:. ./.:4:140,53:.: 0.52:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:167,75:.: 1.73:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.38:1.000:. -chr4.1 7904743 chr4.1_007904743 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:63,64:0.64: 1.22:1.000:0.709 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,60:0.66: 0.90:1.000:0.858 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,64:0.70: 0.96:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,8:0.63:-2.29:1.000:0.620 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-2.60:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:53,51:0.62: 0.49:1.000:0.614 0/1/1/1:4:57,59:0.65: 0.87:1.000:0.797 0/1/1/1:4:65,72:0.68: 1.53:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.33:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,95:0.74: 2.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,47:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,6:0.44:-2.29:1.000:0.964 0/0/1/1:4:63,45:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,53:0.53: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,60:0.60: 1.15:1.000:0.815 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,91:0.76: 2.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,69:0.75: 1.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,45:0.47: 0.77:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.31:-2.19:1.000:0.977 1/1/1:3:0,5:1.00:-2.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,65:0.56: 1.66:1.000:0.964 0/0/0/1:4:51,23:0.36:-0.46:1.000:0.651 0/0/0/1:4:67,25:0.32: 0.11:1.000:0.960 0/1/1/1:4:65,76:0.71: 1.66:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,38:0.44: 0.39:1.000:0.967 0/0/1/1:4:65,49:0.50: 0.81:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,42:0.47: 0.49:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,108:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,26:0.38:-0.30:1.000:0.627 1/1/1/1:4:0,109:1.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:35,45:0.75:-0.27:1.000:0.525 0/0/1/1:4:41,27:0.46:-0.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:52,28:0.41:-0.27:1.000:0.858 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,54:0.51: 1.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,33:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,35:0.44: 0.17:1.000:0.958 0/0/1/1:4:57,49:0.56: 0.55:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-2.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-2.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,69:0.66: 1.44:1.000:0.883 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,106:1.00: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,47:0.57: 0.39:1.000:0.947 0/1/1/1:4:54,66:0.73: 0.99:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,108:1.00: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-2.32:0.999:1.000 0/0/1/1:4:63,47:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,68:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,52:0.60: 0.62:1.000:0.792 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,61:0.74: 0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,62:0.77: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,48:0.64: 0.21:1.000:0.736 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,57:0.64: 0.77:1.000:0.719 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.34:-0.17:1.000:0.882 0/1/1/1:4:68,70:0.65: 1.56:1.000:0.773 0/1/1/1:4:38,46:0.72:-0.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,38:0.47: 0.21:1.000:0.991 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,35:0.44: 0.11:1.000:0.974 0/1/1/1:4:64,64:0.63: 1.25:1.000:0.620 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,24:0.42:-0.68:1.000:0.908 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,43:0.76:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,63:0.69: 0.96:1.000:0.972 0/1/1/1:4:51,72:0.76: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,33:0.48:-0.27:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,37:0.45: 0.24:1.000:0.980 0/0/1/1:4:60,44:0.49: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,43:0.50: 0.36:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.02:0.999:1.000 0/0/1/1:4:67,46:0.48: 0.77:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,48:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,48:0.64: 0.21:1.000:0.736 0/0/1/1:4:48,33:0.48:-0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:55,74:0.76: 1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,65:0.64: 1.28:1.000:0.707 0/1/1/1:4:47,49:0.65: 0.24:1.000:0.825 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,38:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,51:0.57: 0.68:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-2.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,20:0.43:-1.09:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,31:0.46:-0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:59,50:0.56: 0.65:1.000:0.971 0/1/1/1:4:37,45:0.73:-0.21:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,58:0.50: 1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,23:0.28: 0.24:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,45:0.56: 0.30:1.000:0.970 0/0/1/1:4:50,28:0.42:-0.33:1.000:0.912 0/0/1/1:4:46,45:0.62: 0.08:1.000:0.515 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,150:1.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,52:0.52: 0.93:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,74:0.78: 1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 1.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,114:1.00: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,8:0.39:-2.04:1.000:0.686 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,54:0.51: 1.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,70:0.75: 1.15:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:54,33:0.44:-0.05:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,36:0.43: 0.27:1.000:0.955 0/0/1/1:4:62,49:0.53: 0.71:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,59:0.65: 0.87:1.000:0.797 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.66:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,25:0.33:-0.02:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,39:0.61:-0.27:1.000:0.679 0/0/1/1:4:64,49:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,29:0.38: 0.05:1.000:0.523 0/0/1/1:4:41,37:0.59:-0.33:1.000:0.883 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,33:0.38: 0.39:1.000:0.592 0/0/1/1:4:63,60:0.61: 1.09:1.000:0.673 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,51:0.50: 0.99:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,104:1.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,44:0.50: 0.46:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-2.04:1.000:1.000 -chr4.1 8061677 chr4.1_008061677 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,88:0.41:-0.36:1.000:0.868 0/0/1/1:4:88,109:0.53:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:205,120:0.30: 1.14:1.000:0.983 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,223:0.64: 1.32:1.000:0.727 0/0/1/1:4:96,101:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,103:0.42:-0.04:1.000:0.924 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,33:0.51:-1.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,17:0.31:-2.01:1.000:0.970 0/0/0/1:4:309,96:0.18: 2.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,97:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,99:0.35: 0.20:1.000:0.767 0/0/1/1:4:94,104:0.49:-0.29:0.999:0.996 0/0/0/0:4:103,1:0.01:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:314,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,226:0.65: 1.35:1.000:0.764 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,88:0.43:-0.43:1.000:0.951 0/0/0/0:4:214,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,2:0.01:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.39:-2.21:1.000:0.731 0/0/1/1:4:129,219:0.61: 1.40:1.000:0.638 0/0/1/1:4:110,87:0.39:-0.30:1.000:0.694 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,223:0.47: 2.45:1.000:0.991 0/0/0/1:4:246,111:0.24: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,1:0.01:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,95:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1:3:0,17:1.00:-2.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,203:0.66: 0.92:1.000:0.850 0/1/1/1:4:107,190:0.63: 0.83:1.000:0.520 0/0/1/1:4:182,201:0.49: 1.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,88:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:121,227:0.64: 1.40:1.000:0.706 0/0/0/0:4:169,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:240,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,182:0.47: 1.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:69,78:0.50:-0.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,188:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,110:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,77:0.46:-0.77:1.000:0.986 0/1/1/1:4:77,137:0.63:-0.11:1.000:0.527 0/0/0/1:4:114,47:0.22:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,203:0.65: 0.93:1.000:0.831 0/1/1/1:4:70,146:0.67:-0.09:1.000:0.918 0/1/1/1:4:87,190:0.68: 0.60:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,193:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,107:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:170,92:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,97:0.56:-0.64:1.000:0.971 0/0/0/0:4:82,1:0.01:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:99,123:0.53:-0.02:1.000:0.851 0/0/1/1:4:161,144:0.43: 0.92:1.000:0.939 0/0/0/1:4:178,66:0.21: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,230:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,143:0.67:-0.14:1.000:0.926 0/0/0/1:4:186,114:0.32: 0.86:1.000:0.965 0/1/1/1:4:98,273:0.74: 1.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,83:0.28: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,95:0.32: 0.27:1.000:0.956 0/0/0/1:4:173,93:0.28: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,159:0.62: 0.31:1.000:0.577 0/1/1/1:4:100,198:0.66: 0.84:1.000:0.840 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,200:0.68: 0.77:1.000:0.953 0/0/0/1:4:222,82:0.21: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,92:0.21: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,72:0.46:-0.89:1.000:0.988 0/0/1/1:4:66,70:0.48:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:163,81:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,179:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.32:0.999:1.000 0/0/0/0:4:182,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,107:0.48:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:173,2:0.01:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,106:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,73:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,193:0.69: 0.61:1.000:0.975 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,102:0.25: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,140:0.44: 0.74:1.000:0.971 0/0/1/1:4:124,96:0.38:-0.04:1.000:0.618 0/0/0/0:4:165,1:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,57:0.18: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,80:0.33:-0.20:1.000:0.938 0/0/0/1:4:264,89:0.19: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,86:0.44:-0.52:1.000:0.973 0/1/1/1:4:77,218:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,77:0.43:-0.69:1.000:0.950 0/0/0/1:4:109,58:0.28:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,163:0.71: 0.07:1.000:0.991 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,123:0.45: 0.30:1.000:0.981 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:258,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,156:0.28: 2.52:1.000:0.996 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.73:0.999:1.000 0/0/0/0:4:256,1:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,73:0.31:-0.34:1.000:0.969 0/0/0/1:4:178,87:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,187:0.52: 1.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,191:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,63:0.44:-1.05:1.000:0.971 0/0/0/1:4:145,74:0.26:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,177:0.72: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,108:0.45:-0.04:1.000:0.980 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,182:0.48: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,97:0.48:-0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,167:0.69: 0.20:1.000:0.972 0/0/0/1:4:173,72:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,124:0.65:-0.40:1.000:0.793 0/0/0/1:4:147,97:0.34: 0.23:1.000:0.890 0/0/0/1:4:199,98:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,114:0.72:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,80:0.52:-0.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,153:0.68:-0.02:1.000:0.964 0/0/0/1:4:279,183:0.33: 2.68:1.000:0.899 0/0/0/0:4:235,1:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,81:0.55:-0.94:1.000:0.974 0/0/1/1:4:73,75:0.47:-0.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:143,75:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,195:0.72: 0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,122:0.65:-0.45:1.000:0.827 0/0/1/1:4:128,119:0.44: 0.26:1.000:0.966 0/0/0/1:4:233,147:0.32: 1.76:1.000:0.944 0/1/1/1:4:109,209:0.65: 1.06:1.000:0.767 0/0/0/0:4:206,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,108:0.44: 0.02:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:117,251:0.68: 1.62:1.000:0.944 0/0/1/1:4:102,126:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,197:0.61: 1.03:1.000:0.692 0/0/0/1:4:202,128:0.32: 1.20:1.000:0.940 0/0/1/1:4:203,197:0.45: 1.98:1.000:0.982 0/0/1/1:4:105,109:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:108,106:0.46:-0.11:1.000:0.985 0/0/0/1:4:159,92:0.30: 0.31:1.000:0.986 0/0/1/1:4:222,215:0.45: 2.40:1.000:0.981 0/1/1/1:4:102,186:0.63: 0.72:1.000:0.614 0/0/0/1:4:165,87:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/0:4:265,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,208:0.68: 0.92:1.000:0.943 0/0/1/1:4:78,105:0.55:-0.46:0.999:0.980 0/0/1/1:4:91,82:0.43:-0.57:1.000:0.946 0/0/0/1:4:176,93:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:84,155:0.64: 0.17:1.000:0.654 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,97:0.45:-0.28:1.000:0.976 0/0/0/1:4:197,77:0.22: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,69:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:368,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,190:0.61: 0.88:1.000:0.641 0/0/1/1:4:116,97:0.41:-0.12:1.000:0.845 0/0/1/1:4:79,97:0.52:-0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:96,219:0.69: 1.03:1.000:0.976 0/0/0/1:4:254,136:0.28: 1.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,141:0.54: 0.30:1.000:0.989 0/0/0/0:4:182,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,96:0.25: 0.79:1.000:0.999 -chr4.1 8335980 chr4.1_008335980 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:45,11:.: 0.92:1.000:. ./.:4:54,13:.: 1.69:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:32,25:.: 0.99:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.84:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,10:.:-1.68:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.31:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:56,17:.: 2.11:1.000:. ./.:4:53,19:.: 2.04:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:51,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:6,2:.:-2.45:1.000:. ./.:4:22,16:.:-0.35:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:27,26:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,12:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:46,11:.: 0.99:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.03:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.56:1.000:. ./.:4:38,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:21,22:.: 0.00:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:36,21:.: 0.99:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.91:1.000:. ./.:4:33,13:.: 0.21:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:24,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:12,4:.:-1.89:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:23,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:30,11:.:-0.14:1.000:. ./.:4:27,12:.:-0.28:1.000:. ./.:4:29,19:.: 0.35:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.14:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:12,13:.:-1.26:1.000:. ./.:4:28,10:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:18,17:.:-0.56:1.000:. ./.:4:21,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:41,21:.: 1.34:1.000:. ./.:4:20,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:33,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:42,16:.: 1.06:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:30,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:21,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:31,11:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.56:0.999:. ./.:4:38,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:23,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:38,9:.: 0.28:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:34,21:.: 0.85:1.000:. ./.:4:27,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,12:.: 0.92:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:42,10:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:14,17:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:23,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:35,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.84:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:12,8:.:-1.61:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,13:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:36,16:.: 0.63:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,15:.: 0.77:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:19,8:.:-1.12:1.000:. ./.:4:26,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:45,22:.: 1.69:1.000:. ./.:4:15,9:.:-1.33:1.000:. ./.:4:34,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,14:.:-0.14:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:27,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:29,17:.: 0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:22,12:.:-0.63:1.000:. ./.:4:13,6:.:-1.68:1.000:. ./.:4:54,18:.: 2.04:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,23:.: 1.41:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,15:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,10:.:-0.07:1.000:. ./.:4:38,21:.: 1.13:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:36,17:.: 0.70:1.000:. ./.:4:30,18:.: 0.35:1.000:. ./.:4:51,9:.: 1.20:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,26:.: 1.20:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.49:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:31,16:.: 0.28:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:23,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:21,15:.:-0.49:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:38,17:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,20:.: 0.63:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:52,21:.: 2.11:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. -chr4.1 8430580 chr4.1_008430580 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:22,18:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,17:0.53:-0.50:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,30:0.74: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,20:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,38:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,17:0.41: 0.42:1.000:0.872 0/0/1/1:4:5,7:0.60:-2.36:1.000:0.791 0/0/1/1:4:22,15:0.44:-0.25:1.000:0.968 0/1/1/1:4:8,24:0.74:-0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,14:0.56:-1.18:1.000:0.962 0/0/0/1:4:3,1:0.28:-3.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,10:0.38:-0.92:1.000:0.524 0/0/0/1:4:29,10:0.28:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,14:0.55:-1.09:1.000:0.983 0/1/1/1:4:14,24:0.64:-0.17:1.000:0.684 0/0/1/1:4:20,22:0.55: 0.17:0.999:0.979 0/1/1/1:4:14,33:0.70: 0.59:1.000:0.983 0/0/1/1:4:31,32:0.54: 1.94:1.000:0.989 0/0/0/1:4:36,15:0.32: 0.93:1.000:0.945 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-3.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,17:0.54:-0.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:28,18:0.43: 0.51:1.000:0.934 0/1/1/1:4:11,21:0.66:-0.67:1.000:0.868 1/1/1/1:4:1,13:0.91:-2.19:1.000:0.939 0/0/1/1:4:18,11:0.41:-0.92:1.000:0.881 0/0/1/1:4:16,22:0.60:-0.17:1.000:0.821 0/1/1/1:4:15,28:0.66: 0.26:1.000:0.839 0/0/0/1:4:34,12:0.29: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,21:0.49: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,11:0.51:-1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,13:0.44:-0.67:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,2:0.98:-3.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.58:-2.02:1.000:0.902 0/1/1:3:2,3:0.61:-2.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,13:0.43:-0.59:1.000:0.942 0/0/1/1:4:20,12:0.41:-0.67:1.000:0.854 0/0/0/1:4:43,10:0.21: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,6:0.17: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,12:0.34:-0.08:1.000:0.885 0/0/1/1:4:30,19:0.42: 0.76:1.000:0.921 0/0/0/1:4:37,13:0.29: 0.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:34,12:0.29: 0.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:9,25:0.72:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,34:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,10:0.26: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,21:0.40: 1.44:1.000:0.803 0/1/1/1:4:11,20:0.65:-0.76:1.000:0.799 0/0/1/1:4:29,29:0.53: 1.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:15,8:0.38:-1.43:1.000:0.566 0/0/0/1:4:40,10:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,17:0.42: 0.34:1.000:0.916 0/0/1/1:4:30,18:0.41: 0.68:1.000:0.854 0/0/1/1:4:26,22:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,36:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,16:0.59:-1.01:1.000:0.863 0/1/1/1:4:14,25:0.65:-0.08:1.000:0.767 0/0/1/1:4:15,14:0.52:-0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,40:0.87: 0.42:1.000:0.906 0/0/0/0/1/1:6:33,10:0.26: 0.26:1.000:0.565 0/0/0/1:4:40,7:0.17: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,8:0.19: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,38:0.72: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,25:0.58: 0.42:1.000:0.925 0/0/1/1:4:29,21:0.46: 0.85:1.000:0.985 0/0/1/1:4:39,24:0.41: 1.94:1.000:0.890 0/0/1/1:4:27,23:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,12:0.36:-0.33:1.000:0.635 0/0/1/1:4:18,26:0.61: 0.34:1.000:0.733 0/0/0/1:4:30,11:0.30: 0.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:33,27:0.49: 1.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,12:0.67:-1.85:1.000:0.914 0/0/0/1:4:29,8:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,20:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,23:0.71:-0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:17,20:0.56:-0.25:1.000:0.959 0/0/0/1:4:30,15:0.36: 0.42:1.000:0.635 0/0/1/1:4:20,26:0.59: 0.51:1.000:0.891 0/0/1/1:4:21,29:0.60: 0.85:1.000:0.814 0/0/0/1:4:31,10:0.27: 0.09:0.999:0.998 0/0/1/1:4:29,18:0.42: 0.59:1.000:0.900 0/0/1/1:4:37,23:0.42: 1.69:1.000:0.902 0/0/1/1:4:22,18:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,32:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,26:0.47: 1.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,23:0.61:-0.08:1.000:0.742 0/0/1/1:4:21,16:0.47:-0.25:1.000:0.992 0/1/1/1:4:7,16:0.69:-1.43:1.000:0.977 0/0/1/1:4:20,22:0.55: 0.17:1.000:0.979 0/0/1/1:4:17,12:0.45:-0.92:1.000:0.979 0/0/0/1:4:34,12:0.29: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:30,23:0.47: 1.10:1.000:0.992 0/0/0/1:4:27,11:0.32:-0.17:1.000:0.958 0/1/1/1:4:12,38:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,25:0.52: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,7:0.18: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,6:0.16: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,21:0.48: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,10:0.47:-1.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,20:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,10:0.28: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,23:0.54: 0.42:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,14:0.38: 0.00:1.000:0.595 0/0/1/1:4:27,34:0.58: 1.77:1.000:0.919 0/0/1/1:4:27,15:0.39: 0.17:1.000:0.687 0/0/0/1:4:29,12:0.32: 0.09:1.000:0.950 0/0/1/1:4:36,20:0.39: 1.35:1.000:0.687 0/0/1/1:4:20,18:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,10:0.26: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,8:0.14: 1.86:1.000:0.976 0/1/1/1:4:9,53:0.84: 1.86:0.999:0.996 0/0/1/1:4:24,18:0.47: 0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-1.26:1.000:0.720 0/0/0/1:4:39,13:0.28: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,6:0.23:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,18:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,30:0.69: 0.26:1.000:0.979 0/1/1/1:4:13,26:0.67:-0.08:1.000:0.914 0/0/1/1:4:31,18:0.40: 0.76:1.000:0.794 0/0/1/1:4:29,20:0.44: 0.76:1.000:0.972 0/0/1/1:4:37,20:0.38: 1.44:1.000:0.607 0/0/1/1:4:31,19:0.41: 0.85:1.000:0.885 0/0/1/1:4:26,20:0.47: 0.51:1.000:0.993 0/0/0/1:4:26,6:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,29:0.73:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:25,3:0.12:-1.01:1.000:0.741 0/0/0/1:4:19,7:0.30:-1.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:23,19:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:30,2:0.07:-0.67:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,29:0.63: 0.59:1.000:0.532 0/0/1/1:4:16,14:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,16:0.78:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.36:-1.35:1.000:0.635 0/0/0/0:4:30,3:0.10:-0.59:1.000:0.778 0/0/0/1:4:30,8:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,21:0.47: 0.76:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,28:0.71:-0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,24:0.59: 0.17:1.000:0.863 0/0/0/1:4:31,9:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,23:0.57: 0.17:1.000:0.945 0/0/1/1:4:24,22:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,19:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,29:0.70: 0.09:1.000:0.987 0/0/0/1:4:32,10:0.26: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:27,27:0.53: 1.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:21,24:0.56: 0.42:1.000:0.969 0/1/1/1:4:9,29:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,19:0.62:-0.76:1.000:0.514 0/0/1/1:4:40,34:0.50: 2.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,23:0.38: 2.19:1.000:0.575 0/1/1/1:4:3,5:0.63:-2.69:1.000:0.617 0/0/1/1:4:10,15:0.61:-1.26:1.000:0.649 0/0/1/1:4:19,14:0.46:-0.59:1.000:0.988 0/0/0/1:4:31,4:0.13:-0.42:1.000:0.878 0/1/1/1:4:12,39:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,13:0.34: 0.17:1.000:0.874 0/0/0/1:4:34,5:0.14:-0.08:1.000:0.974 0/0/0/1:4:30,15:0.36: 0.42:1.000:0.635 0/0/1/1:4:19,20:0.54:-0.08:1.000:0.986 0/0/0/1:4:20,10:0.36:-0.84:1.000:0.635 0/0/0/1:4:30,11:0.30: 0.09:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,32:0.80:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,7:0.64:-2.44:1.000:0.728 0/0/1/1:4:31,17:0.39: 0.68:1.000:0.650 0/0/1/1:4:12,18:0.61:-0.84:1.000:0.649 0/0/1/1:4:27,22:0.49: 0.76:0.999:0.996 0/0/0/1:4:21,9:0.33:-0.84:1.000:0.924 0/0/0/1:4:33,8:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,19:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,12:0.48:-1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,11:0.38:-0.67:1.000:0.509 0/0/0/1:4:33,8:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,28:0.67: 0.17:1.000:0.914 0/0/0/1:4:39,7:0.17: 0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,20:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,16:0.42: 0.09:1.000:0.931 0/0/1/1:4:14,16:0.56:-0.84:1.000:0.969 0/0/1/1:4:25,18:0.45: 0.26:1.000:0.984 0/0/0/1:4:41,11:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,28:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,14:0.47:-0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:44,13:0.25: 1.44:1.000:0.999 -chr4.1 8722990 chr4.1_008722990 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,55:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,88:.: 1.43:1.000:. ./.:4:11,38:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,45:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,52:.: 0.75:1.000:. ./.:4:9,28:.:-1.05:1.000:. ./.:4:41,59:.: 2.02:1.000:. ./.:4:15,43:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,17:.:-1.63:1.000:. ./.:4:5,21:.:-1.58:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.95:1.000:. ./.:4:24,42:.: 0.36:1.000:. ./.:4:31,41:.: 0.65:1.000:. ./.:4:16,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,51:.: 0.99:1.000:. ./.:4:15,45:.: 0.07:0.999:. ./.:4:0,69:.: 0.51:1.000:. ./.:4:36,62:.: 1.92:1.000:. ./.:4:37,67:.: 2.21:1.000:. ./.:4:4,5:.:-2.41:1.000:. ./.:4:11,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,53:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,40:.: 0.51:1.000:. ./.:4:7,10:.:-2.02:1.000:. ./.:4:25,42:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,45:.: 0.02:1.000:. ./.:4:16,51:.: 0.41:1.000:. ./.:4:30,58:.: 1.43:1.000:. ./.:4:15,37:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,35:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,32:.:-0.61:1.000:. ./.:4:5,4:.:-2.41:1.000:. ./.:4:3,13:.:-2.07:1.000:. ./.:3:0,10:.:-2.36:1.000:. ./.:4:19,41:.: 0.07:1.000:. ./.:4:16,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:29,52:.: 1.09:1.000:. ./.:4:17,19:.:-1.10:1.000:. ./.:4:27,51:.: 0.95:1.000:. ./.:4:31,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,25:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,44:.: 0.51:1.000:. ./.:4:18,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,61:.: 0.75:1.000:. ./.:4:29,31:.: 0.07:1.000:. ./.:4:18,50:.: 0.46:1.000:. ./.:4:5,9:.:-2.16:1.000:. ./.:4:3,38:.:-0.85:1.000:. ./.:4:13,12:.:-1.63:1.000:. ./.:4:14,27:.:-0.85:1.000:. ./.:4:31,47:.: 0.95:1.000:. ./.:4:24,38:.: 0.17:1.000:. ./.:4:14,57:.: 0.61:1.000:. ./.:4:25,62:.: 1.38:1.000:. ./.:4:2,27:.:-1.44:1.000:. ./.:4:11,25:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.48:1.000:. ./.:4:14,41:.:-0.17:1.000:. ./.:6:22,34:.:-0.12:1.000:. ./.:4:25,33:.:-0.03:1.000:. ./.:4:13,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,69:.: 1.72:1.000:. ./.:4:10,23:.:-1.24:1.000:. ./.:4:21,47:.: 0.46:1.000:. ./.:4:11,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,24:.:-1.14:1.000:. ./.:4:29,41:.: 0.56:1.000:. ./.:4:28,31:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,89:.: 1.48:1.000:. ./.:4:32,39:.: 0.61:1.000:. ./.:4:7,21:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.85:1.000:. ./.:4:25,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,20:.:-1.00:1.000:. ./.:4:8,34:.:-0.80:1.000:. ./.:4:28,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:26,50:.: 0.85:1.000:. ./.:4:11,51:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.76:0.999:. ./.:4:16,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,46:.: 0.65:1.000:. ./.:4:13,45:.:-0.03:1.000:. ./.:4:13,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,42:.:-0.17:1.000:. ./.:4:22,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,36:.:-0.22:1.000:. ./.:4:17,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:20,38:.:-0.03:1.000:. ./.:4:5,10:.:-2.12:1.000:. ./.:4:15,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:30,36:.: 0.36:1.000:. ./.:4:16,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:13,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:26,47:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,19:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,57:.: 1.48:1.000:. ./.:4:13,18:.:-1.34:1.000:. ./.:4:10,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,27:.:-0.56:1.000:. ./.:4:12,42:.:-0.22:1.000:. ./.:4:27,27:.:-0.22:1.000:. ./.:4:19,47:.: 0.36:1.000:. ./.:4:19,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,33:.:-0.41:1.000:. ./.:4:18,57:.: 0.80:1.000:. ./.:4:15,43:.:-0.03:1.000:. ./.:4:17,19:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,61:.: 1.29:1.000:. ./.:4:16,40:.:-0.12:0.999:. ./.:4:20,17:.:-1.05:1.000:. ./.:4:11,20:.:-1.34:1.000:. ./.:4:28,45:.: 0.70:1.000:. ./.:4:25,23:.:-0.51:1.000:. ./.:4:21,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:7,47:.:-0.22:1.000:. ./.:4:23,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:32,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:7,29:.:-1.10:1.000:. ./.:4:22,31:.:-0.27:1.000:. ./.:4:15,49:.: 0.27:1.000:. ./.:4:12,34:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,43:.: 0.70:1.000:. ./.:4:11,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.02:1.000:. ./.:4:26,10:.:-1.10:1.000:. ./.:4:6,29:.:-1.14:1.000:. ./.:4:28,31:.: 0.02:1.000:. ./.:4:34,39:.: 0.70:1.000:. ./.:4:18,36:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,28:.:-0.80:1.000:. ./.:4:21,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,51:.: 1.34:1.000:. ./.:4:8,27:.:-1.14:1.000:. ./.:4:22,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,26:.:-0.85:1.000:. ./.:4:24,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:11,26:.:-1.05:1.000:. ./.:4:12,29:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,41:.: 0.07:1.000:. ./.:4:24,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:30,62:.: 1.63:1.000:. ./.:4:16,49:.: 0.31:1.000:. ./.:4:19,57:.: 0.85:1.000:. ./.:4:34,45:.: 0.99:1.000:. ./.:4:18,50:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,52:.: 1.09:1.000:. ./.:4:25,78:.: 2.16:1.000:. ./.:4:12,57:.: 0.51:1.000:. ./.:4:4,4:.:-2.46:1.000:. ./.:4:21,40:.: 0.12:1.000:. ./.:4:16,28:.:-0.71:1.000:. ./.:4:30,35:.: 0.31:1.000:. ./.:4:13,57:.: 0.56:1.000:. ./.:4:23,64:.: 1.38:1.000:. ./.:4:12,43:.:-0.17:1.000:. ./.:4:35,40:.: 0.80:1.000:. ./.:4:28,45:.: 0.70:1.000:. ./.:4:10,33:.:-0.76:1.000:. ./.:4:24,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:17,54:.: 0.61:1.000:. ./.:4:5,22:.:-1.53:1.000:. ./.:4:43,59:.: 2.11:1.000:. ./.:4:28,44:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,116:.: 2.79:0.999:. ./.:4:14,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:22,46:.: 0.46:1.000:. ./.:4:18,31:.:-0.46:1.000:. ./.:4:31,62:.: 1.68:1.000:. ./.:4:24,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:17,20:.:-1.05:1.000:. ./.:4:11,40:.:-0.37:1.000:. ./.:4:23,39:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,71:.: 2.70:1.000:. ./.:4:12,57:.: 0.51:1.000:. ./.:4:22,63:.: 1.29:1.000:. ./.:4:11,63:.: 0.75:1.000:. ./.:4:43,37:.: 1.04:1.000:. ./.:4:17,57:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,39:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,98:.: 1.92:1.000:. -chr4.1 8867628 chr4.1_008867628 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:67,183:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.00:1.000:. ./.:4:29,160:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,187:.: 1.09:1.000:. ./.:4:73,166:.: 1.03:1.000:. ./.:4:60,199:.: 1.43:1.000:. ./.:4:16,77:.:-1.92:1.000:. ./.:4:53,158:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,141:.:-0.18:1.000:. ./.:4:5,39:.:-2.91:1.000:. ./.:4:12,27:.:-3.01:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.38:1.000:. ./.:4:45,165:.: 0.44:1.000:. ./.:4:43,170:.: 0.50:1.000:. ./.:4:46,169:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,242:.: 1.09:1.000:. ./.:4:50,181:.: 0.87:0.999:. ./.:4:86,93:.:-0.18:1.000:. ./.:4:54,188:.: 1.09:1.000:. ./.:4:41,175:.: 0.56:1.000:. ./.:4:6,14:.:-3.39:1.000:. ./.:4:92,127:.: 0.63:1.000:. ./.:4:105,100:.: 0.34:1.000:. ./.:4:33,128:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,28:.:-3.23:1.000:. ./.:4:50,134:.:-0.08:1.000:. ./.:4:128,106:.: 0.93:1.000:. ./.:4:52,164:.: 0.56:1.000:. ./.:4:53,150:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,183:.: 0.97:1.000:. ./.:4:30,195:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,189:.: 0.75:1.000:. ./.:4:2,14:.:-3.47:1.000:. ./.:4:23,27:.:-2.79:1.000:. ./.:3:0,15:.:-3.49:1.000:. ./.:4:58,186:.: 1.13:1.000:. ./.:4:51,142:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,172:.: 0.73:1.000:. ./.:4:78,109:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,187:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.97:1.000:. ./.:4:37,141:.:-0.20:1.000:. ./.:4:39,131:.:-0.36:1.000:. ./.:4:40,105:.:-0.87:1.000:. ./.:4:41,166:.: 0.38:1.000:. ./.:4:33,160:.: 0.10:1.000:. ./.:4:69,176:.: 1.15:1.000:. ./.:4:79,228:.: 2.40:1.000:. ./.:4:40,109:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.34:1.000:. ./.:4:74,78:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,240:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,200:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,155:.: 0.08:1.000:. ./.:4:48,130:.:-0.20:1.000:. ./.:4:93,101:.: 0.12:1.000:. ./.:4:35,161:.: 0.16:1.000:. ./.:6:30,146:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,165:.: 0.50:1.000:. ./.:4:97,98:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,126:.:-0.61:1.000:. ./.:4:50,166:.: 0.56:1.000:. ./.:4:47,208:.: 1.35:1.000:. ./.:4:20,99:.:-1.39:1.000:. ./.:4:50,165:.: 0.54:1.000:. ./.:4:39,152:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.06:1.000:. ./.:4:15,75:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.36:1.000:. ./.:4:49,183:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.12:1.000:. ./.:4:43,137:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,159:.: 0.12:1.000:. ./.:4:54,179:.: 0.91:1.000:. ./.:4:46,176:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.79:0.999:. ./.:4:78,97:.:-0.26:1.000:. ./.:4:34,155:.: 0.02:1.000:. ./.:4:77,87:.:-0.49:1.000:. ./.:4:29,148:.:-0.22:1.000:. ./.:4:102,115:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,84:.:-1.68:1.000:. ./.:4:38,121:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.38:1.000:. ./.:4:45,152:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,119:.:-0.91:1.000:. ./.:4:95,89:.:-0.08:1.000:. ./.:4:62,152:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,114:.:-0.81:1.000:. ./.:4:31,142:.:-0.30:1.000:. ./.:4:82,110:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,79:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.08:1.000:. ./.:4:37,151:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,168:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,115:.:-1.47:1.000:. ./.:4:55,135:.: 0.04:1.000:. ./.:4:34,106:.:-0.97:1.000:. ./.:4:38,124:.:-0.53:1.000:. ./.:4:37,122:.:-0.59:1.000:. ./.:4:39,150:.: 0.02:1.000:. ./.:4:37,144:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,109:.: 0.24:1.000:. ./.:4:53,182:.: 0.95:1.000:. ./.:4:94,91:.:-0.06:1.000:. ./.:4:33,114:.:-0.83:1.000:. ./.:4:100,139:.: 1.03:1.000:. ./.:4:43,133:.:-0.24:0.999:. ./.:4:59,174:.: 0.91:1.000:. ./.:4:41,114:.:-0.67:1.000:. ./.:4:47,140:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,99:.:-1.49:1.000:. ./.:4:31,103:.:-1.09:1.000:. ./.:4:35,164:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,142:.:-0.89:1.000:. ./.:4:54,163:.: 0.59:1.000:. ./.:4:95,87:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.07:1.000:. ./.:4:70,175:.: 1.15:1.000:. ./.:4:71,97:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,144:.: 0.02:1.000:. ./.:4:40,163:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.75:1.000:. ./.:4:26,111:.:-1.03:1.000:. ./.:4:16,80:.:-1.86:1.000:. ./.:4:28,125:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,161:.: 0.24:1.000:. ./.:4:31,94:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,192:.: 0.10:1.000:. ./.:4:67,195:.: 1.49:1.000:. ./.:4:98,113:.: 0.46:1.000:. ./.:4:51,122:.:-0.30:1.000:. ./.:4:43,130:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,125:.:-0.57:1.000:. ./.:4:85,92:.:-0.22:1.000:. ./.:4:77,86:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,200:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.91:1.000:. ./.:4:111,134:.: 1.15:1.000:. ./.:4:62,142:.: 0.32:1.000:. ./.:4:57,173:.: 0.85:1.000:. ./.:4:65,200:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.67:1.000:. ./.:4:58,184:.: 1.09:1.000:. ./.:4:39,186:.: 0.75:1.000:. ./.:4:18,14:.:-3.15:1.000:. ./.:4:0,118:.:-1.41:1.000:. ./.:4:46,173:.: 0.63:1.000:. ./.:4:48,187:.: 0.95:1.000:. ./.:4:52,198:.: 1.25:1.000:. ./.:4:44,138:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,103:.:-0.20:1.000:. ./.:4:49,175:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.52:1.000:. ./.:4:83,89:.:-0.32:1.000:. ./.:4:29,166:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,170:.: 0.91:1.000:. ./.:4:60,162:.: 0.69:1.000:. ./.:4:43,142:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,183:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.81:0.999:. ./.:4:55,143:.: 0.20:1.000:. ./.:4:71,90:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,188:.: 0.02:1.000:. ./.:4:74,98:.:-0.32:1.000:. ./.:4:49,136:.:-0.06:1.000:. ./.:4:57,181:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,138:.:-0.18:1.000:. ./.:4:42,144:.:-0.04:1.000:. ./.:4:96,124:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,162:.: 0.38:1.000:. ./.:4:54,169:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.75:1.000:. ./.:4:42,169:.: 0.46:1.000:. ./.:4:46,177:.: 0.71:1.000:. ./.:4:46,202:.: 1.21:1.000:. ./.:4:29,132:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.67:1.000:. -chr4.1 9047328 chr4.1_009047328 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-0.73:1.000:0.891 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.57:-0.73:1.000:0.950 0/0/0/1:4:9,4:0.34:-0.31:1.000:0.837 0/1/1/1:4:2,8:0.72:-0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,2:0.33:-1.16:1.000:0.929 0/0/0/1:4:2,1:0.36:-1.73:1.000:0.639 0/1/1/1:4:2,13:0.80:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,6:0.30: 1.26:1.000:0.984 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-1.59:1.000:0.965 0/1/1/1:4:1,9:0.85:-0.73:1.000:0.988 0/0/1/1:4:7,7:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,6:0.44:-0.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:5,8:0.58:-0.31:1.000:0.912 0/1/1/1:4:1,8:0.83:-0.88:0.999:0.997 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-1.02:1.000:0.753 0/0/0/1:4:11,5:0.35: 0.12:1.000:0.807 0/0/1/1:4:8,11:0.55: 0.55:1.000:0.978 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.65: 0.26:1.000:0.800 0/0/1/1:4:12,7:0.39: 0.55:1.000:0.701 0/0/1/1:4:3,5:0.59:-1.02:1.000:0.876 0/1/1/1:4:2,5:0.66:-1.16:1.000:0.852 0/0/1/1:4:7,10:0.56: 0.26:1.000:0.968 0/0/1/1:4:6,11:0.61: 0.26:1.000:0.743 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.02:1.000:0.990 0/0/0/1:4:14,7:0.36: 0.83:1.000:0.639 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.75:-1.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-0.31:1.000:0.817 0/0/1:3:11,4:0.31:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-0.88:1.000:0.991 0/0/1/1:4:9,10:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,7:0.38: 0.69:1.000:0.528 0/0/1/1:4:9,6:0.41:-0.02:1.000:0.891 0/0/1/1:4:10,12:0.53: 0.98:1.000:0.993 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,6:0.29: 1.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,10:0.62:-0.02:1.000:0.565 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,6:0.29: 1.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:1,7:0.81:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,14:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,6:0.69:-1.02:1.000:0.965 0/0/1/1:4:7,7:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,12:0.57: 0.69:1.000:0.950 0/0/1/1:4:9,14:0.58: 1.12:1.000:0.931 0/0/1/1:4:5,10:0.62:-0.02:1.000:0.565 0/0/1/1:4:10,13:0.54: 1.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:6,11:0.61: 0.26:1.000:0.743 0/1/1/1:4:1,4:0.72:-1.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,12:0.88:-0.31:1.000:0.648 0/1/1/1:4:1,11:0.87:-0.45:1.000:0.852 0/0/0/0/1/1:6:18,7:0.32: 1.40:1.000:0.919 0/0/0/1:4:14,7:0.36: 0.83:1.000:0.639 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-0.59:1.000:0.659 0/1/1/1:4:11,24:0.64: 2.83:1.000:0.630 0/0/0/1:4:17,3:0.20: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.36: 1.26:1.000:0.639 0/1/1/1:4:7,17:0.65: 1.26:1.000:0.816 0/0/1/1:4:10,6:0.40: 0.12:1.000:0.753 0/0/1/1:4:6,10:0.59: 0.12:1.000:0.876 0/0/1/1:4:14,10:0.43: 1.26:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,17:0.63: 1.40:1.000:0.573 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,33:0.96: 2.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.66:-0.16:1.000:0.852 0/0/1/1:4:9,15:0.59: 1.26:1.000:0.876 0/0/1/1:4:11,8:0.43: 0.55:1.000:0.949 0/0/1/1:4:10,13:0.54: 1.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,8:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,12:0.62: 0.41:1.000:0.565 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.16:0.999:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,14:0.65: 0.69:1.000:0.757 0/1/1/1:4:2,7:0.71:-0.88:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,7:0.39: 0.55:1.000:0.701 0/0/0/1:4:13,6:0.35: 0.55:1.000:0.785 0/1/1/1:4:5,11:0.64: 0.12:1.000:0.647 0/0/1/1:4:7,12:0.59: 0.55:1.000:0.844 0/0/1/1:4:8,13:0.58: 0.83:1.000:0.900 0/0/1/1:4:17,19:0.51: 2.97:1.000:0.996 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,14:0.41: 2.97:1.000:0.841 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-0.45:1.000:0.639 0/0/1/1:4:18,14:0.44: 2.40:1.000:0.972 0/0/1/1:4:9,9:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,14:0.58: 1.12:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,18:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.56: 0.26:1.000:0.968 0/0/1/1:4:7,7:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,8:0.67:-0.59:1.000:0.910 0/0/0/1:4:12,5:0.33: 0.26:1.000:0.901 0/0/1/1:4:10,11:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,8:0.62:-0.45:1.000:0.565 0/0/1/1:4:5,9:0.60:-0.16:1.000:0.775 0/0/1/1:4:14,13:0.48: 1.69:1.000:0.994 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.57:-1.45:1.000:0.950 0/0/0/1:4:15,5:0.30: 0.69:1.000:0.984 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,11:0.87:-0.45:0.999:0.852 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,6:0.36: 0.41:1.000:0.639 0/0/1/1:4:5,8:0.58:-0.31:1.000:0.912 0/0/1/1:4:22,12:0.38: 2.69:1.000:0.557 0/0/0/1:4:10,4:0.33:-0.16:1.000:0.929 0/0/1/1:4:7,10:0.56: 0.26:1.000:0.968 0/0/1/1:4:12,12:0.49: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,9:0.45: 0.69:1.000:0.983 0/0/1/1:4:7,5:0.43:-0.45:1.000:0.940 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-0.31:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,5:0.23: 2.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,9:0.57:-0.02:1.000:0.950 1/1/1/1:4:1,24:0.94: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.72:-0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,6:0.34: 0.69:1.000:0.877 0/0/1/1:4:11,9:0.45: 0.69:1.000:0.983 0/0/1/1:4:14,17:0.53: 2.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,8:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,6:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,6:0.40: 0.12:1.000:0.753 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,11:0.87:-0.45:1.000:0.852 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:12,7:0.39: 0.55:1.000:0.701 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,14:0.62: 0.83:1.000:0.565 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,10:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,6:0.44:-0.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:7,6:0.46:-0.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:8,10:0.53: 0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:7,6:0.46:-0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:10,3:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,14:0.65: 0.69:1.000:0.757 0/0/1/1:4:6,10:0.59: 0.12:1.000:0.876 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-1.59:1.000:0.965 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.59:1.000:0.984 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.59:1.000:0.984 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.53: 0.98:1.000:0.993 0/0/0/1:4:8,3:0.32:-0.59:1.000:0.958 0/0/1/1:4:6,8:0.55:-0.16:1.000:0.983 0/1/1/1:4:2,8:0.72:-0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,6:0.41:-0.02:1.000:0.891 0/0/0/1:4:8,2:0.26:-0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,8:0.47: 0.26:1.000:0.992 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.74:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-1.59:1.000:0.965 0/0/1/1:4:8,13:0.58: 0.83:1.000:0.900 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,18:0.85: 0.69:0.999:0.988 0/0/1/1:4:2,4:0.62:-1.30:1.000:0.565 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:5,8:0.58:-0.31:1.000:0.912 0/0/1/1:4:7,5:0.43:-0.45:1.000:0.940 0/1/1/1:4:4,12:0.69: 0.12:1.000:0.965 0/0/1/1:4:5,5:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-0.59:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.55: 1.83:1.000:0.983 0/1/1/1:4:2,10:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,11:0.87:-0.45:1.000:0.852 0/0/0/1:4:8,2:0.26:-0.73:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,14:0.65: 0.69:1.000:0.757 0/0/1/1:4:9,10:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,2:0.30:-1.02:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,18:1.00: 0.41:1.000:1.000 -chr4.1 9263866 chr4.1_009263866 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:107,87:0.51: 0.70:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,63:0.45: 0.42:1.000:0.980 0/0/1/1:4:81,62:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,83:0.48: 0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,87:0.51: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,55:0.51:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,137:0.56: 1.76:1.000:0.968 0/0/1/1:4:94,55:0.46:-0.15:1.000:0.988 0/1/1/1:4:15,42:0.66:-1.90:1.000:0.871 0/0/1/1:4:23,24:0.54:-2.09:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,68:0.46: 0.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:98,61:0.47: 0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,66:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,75:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,85:0.49: 0.79:0.999:0.997 0/0/1/1:4:111,87:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,90:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,178:0.59: 2.61:1.000:0.870 0/0/0/1:4:22,1:0.27:-2.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,134:0.56: 1.65:1.000:0.967 0/0/1/1:4:109,74:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,70:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,20:0.48:-2.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,144:0.58: 1.61:1.000:0.894 0/0/1/1:4:114,138:0.56: 1.80:1.000:0.968 0/0/1/1:4:80,69:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,77:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,1:0.17:-0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:114,67:0.46: 0.45:1.000:0.988 0/0/0/1:4:91,1:0.23:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.41:-2.84:1.000:0.870 0/0/1/1:4:20,33:0.60:-1.97:1.000:0.797 0/1/1:3:2,19:0.75:-2.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,82:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,137:0.57: 1.55:1.000:0.939 0/0/1/1:4:102,72:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,81:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,150:0.59: 1.74:1.000:0.873 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,1:0.22:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,89:0.49: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,48:0.47:-0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:107,138:0.57: 1.67:1.000:0.953 0/0/1/1:4:105,75:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,100:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,35:0.58:-1.84:1.000:0.921 0/0/1/1:4:96,53:0.45:-0.15:1.000:0.982 0/0/1/1:4:67,55:0.51:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,54:0.51:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,100:0.52: 1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,80:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,79:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,149:0.62: 1.33:1.000:0.604 0/0/1/1:4:88,61:0.48:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,81:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,73:0.48: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:85,50:0.46:-0.42:1.000:0.801 0/0/1/1:4:95,70:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,58:0.45: 0.21:1.000:0.976 0/0/1/1:4:111,161:0.58: 2.18:1.000:0.902 0/0/1/1:4:95,53:0.45:-0.17:1.000:0.983 0/0/1/1:4:98,66:0.48: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,157:0.59: 1.97:1.000:0.876 0/0/1/1:4:58,46:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,75:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,87:0.52: 0.51:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,210:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,67:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,53:0.51:-0.80:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,263:1.00: 2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,73:0.51: 0.06:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,40:0.44:-0.76:1.000:0.973 0/0/1/1:4:100,74:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,66:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,69:0.47: 0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,131:0.57: 1.44:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.93:0.999:1.000 0/0/1/1:4:102,56:0.45: 0.02:1.000:0.981 0/0/1/1:4:94,155:0.60: 1.74:1.000:0.798 0/0/1/1:4:73,71:0.53:-0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:98,80:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,73:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,44:0.43:-0.36:1.000:0.948 0/0/1/1:4:86,66:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,66:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,130:0.56: 1.57:1.000:0.973 0/0/0/1:4:83,1:0.25:-1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,1:0.20:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,73:0.47: 0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,70:0.55:-0.49:1.000:0.978 0/0/1/1:4:95,57:0.46:-0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,58:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,54:0.50:-0.61:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,142:0.58: 1.55:1.000:0.896 0/0/1/1:4:57,42:0.49:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,82:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,49:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,82:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,58:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,58:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,62:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,100:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,73:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,96:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,60:0.46: 0.09:0.999:0.988 0/0/0/1:4:88,2:0.26:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,44:0.54:-1.37:1.000:0.986 0/0/1/1:4:107,70:0.48: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,53:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,57:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,120:0.58: 0.87:1.000:0.904 0/0/1/1:4:85,65:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,70:0.48: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,57:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,67:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,64:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:87,72:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,80:0.52: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,65:0.48: 0.09:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,170:0.98: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,47:0.48:-0.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,72:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,57:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,87:0.58:-0.15:1.000:0.920 0/0/1/1:4:86,61:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,78:0.54:-0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,102:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,46:0.48:-0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,50:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,60:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,69:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,67:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,51:0.52:-0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,89:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,96:0.49: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,78:0.51: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,73:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,90:0.52: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,127:0.57: 1.25:1.000:0.944 0/0/1/1:4:126,85:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,77:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,24:0.58:-2.20:1.000:0.917 0/0/1/1:4:78,40:0.44:-0.74:1.000:0.971 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,71:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,89:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,155:0.59: 1.95:1.000:0.891 0/0/1/1:4:97,67:0.48: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,79:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,68:0.48: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,53:0.46:-0.25:1.000:0.987 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,64:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,65:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,74:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,54:0.51:-0.68:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.74:0.999:1.000 0/0/1/1:4:98,81:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,62:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,59:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,52:0.47:-0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,120:0.59: 0.83:1.000:0.889 0/0/1/1:4:92,59:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,63:0.53:-0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,65:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,140:0.58: 1.53:1.000:0.910 0/0/1/1:4:129,77:0.46: 0.93:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,84:0.53: 0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,67:0.47: 0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,89:0.53: 0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,103:0.53: 0.93:1.000:0.991 0/0/1/1:4:86,54:0.47:-0.32:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.11:1.000:1.000 -chr4.1 9477985 chr4.1_009477985 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:30,24:0.46: 0.09:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,28:0.43: 0.73:1.000:0.955 0/0/1/1:4:19,32:0.62:-0.04:1.000:0.544 0/0/1/1:4:56,35:0.42: 1.68:1.000:0.921 0/0/1/1:4:47,28:0.42: 0.99:1.000:0.895 0/0/1/1:4:18,18:0.49:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,1:0.15:-1.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:26,31:0.52: 0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,5:0.72:-1.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,12:0.76:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,22:0.60:-0.68:1.000:0.768 0/0/1/1:4:27,30:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,33:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,39:0.46: 1.50:1.000:0.986 0/0/1/1:4:50,38:0.45: 1.55:0.999:0.978 0/0/1/1:4:51,26:0.40: 1.08:1.000:0.751 0/0/1/1:4:28,36:0.55: 0.52:1.000:0.984 0/0/0/1:4:24,2:0.25:-1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,10:0.78:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.26:-1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,42:0.67: 0.48:1.000:0.914 0/0/1/1:4:19,27:0.57:-0.25:1.000:0.935 0/0/1/1:4:7,10:0.58:-1.49:1.000:0.930 0/0/0/1:4:19,1:0.16:-1.36:1.000:0.996 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,28:0.45: 0.56:1.000:0.977 0/1/1/1:4:19,43:0.70: 0.43:1.000:0.985 0/1/1/1:4:41,77:0.65: 2.83:1.000:0.806 0/0/1/1:4:40,33:0.46: 0.90:1.000:0.987 0/0/1/1:4:58,57:0.48: 2.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,5:0.72:-1.92:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,9:0.91:-1.79:1.000:0.897 1/1/1:3:0,6:1.00:-1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,26:0.42: 0.69:1.000:0.917 0/0/0/1:4:22,2:0.25:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,30:0.54: 0.09:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,34:0.59: 0.22:1.000:0.890 0/0/0/1:4:23,1:0.14:-1.19:1.000:0.948 0/0/1/1:4:39,66:0.62: 2.27:1.000:0.527 0/1/1/1:4:8,56:0.88: 0.52:1.000:0.723 0/1/1/1:4:19,36:0.65: 0.13:1.000:0.826 0/0/1/1:4:26,27:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,3:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,34:0.72:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,48:0.48: 1.93:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,20:0.64:-0.89:1.000:0.721 0/0/1/1:4:26,17:0.43:-0.38:1.000:0.941 0/0/1/1:4:24,17:0.44:-0.47:1.000:0.965 0/1/1/1:4:16,32:0.67:-0.17:1.000:0.914 0/0/1/1:4:45,40:0.47: 1.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,34:0.57: 0.26:1.000:0.938 0/0/1/1:4:51,28:0.41: 1.16:1.000:0.831 0/0/0/1:4:46,2:0.14:-0.17:1.000:0.948 0/0/1/1:4:34,18:0.40: 0.01:1.000:0.794 0/0/1/1:4:32,47:0.58: 1.16:1.000:0.899 0/0/1/1:4:23,27:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,31:0.47: 0.65:1.000:0.990 0/0/1/1/1/1:6:13,21:0.61:-0.77:1.000:0.721 0/0/1/1:4:19,25:0.55:-0.34:1.000:0.978 0/0/1/1:4:11,18:0.61:-0.98:1.000:0.646 0/0/0/0:4:40,1:0.08:-0.47:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,23:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,27:0.53:-0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:28,31:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,28:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,23:0.47:-0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,12:0.46:-1.06:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,26:0.40: 1.03:1.000:0.775 0/0/1/1:4:12,8:0.43:-1.36:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,30:0.50: 0.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,74:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,20:0.44:-0.12:1.000:0.958 0/0/1/1:4:33,21:0.42: 0.09:1.000:0.930 0/1/1/1:4:15,29:0.66:-0.34:1.000:0.865 0/0/1/1:4:25,37:0.59: 0.43:1.000:0.888 0/0/0/1:4:32,3:0.25:-0.72:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.48:0.999:1.000 0/1/1/1:4:12,29:0.72:-0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:24,2:0.25:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,32:0.62:-0.04:1.000:0.544 0/0/1/1:4:26,31:0.52: 0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,42:0.72: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,19:0.58:-0.85:1.000:0.905 0/0/1/1:4:30,21:0.44:-0.04:1.000:0.962 0/0/1/1:4:20,25:0.54:-0.29:1.000:0.989 0/0/0/1:4:12,3:0.32:-1.58:1.000:0.957 0/0/1/1:4:24,34:0.57: 0.26:1.000:0.938 0/1/1/1:4:17,40:0.71: 0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,33:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,29:0.55:-0.04:1.000:0.977 0/0/1/1:4:39,46:0.52: 1.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,31:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,18:0.51:-0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,54:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,55:0.77: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,2:0.25:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,18:0.61:-0.98:1.000:0.646 0/0/1/1:4:25,26:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,19:0.58:-0.85:1.000:0.905 0/0/1/1:4:30,25:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-1.11:1.000:0.717 0/0/1/1:4:21,28:0.56:-0.12:1.000:0.973 0/0/1/1:4:17,25:0.58:-0.42:1.000:0.897 0/0/1/1:4:34,52:0.59: 1.46:1.000:0.831 0/0/1/1:4:48,26:0.40: 0.95:1.000:0.818 0/1/1/1:4:17,35:0.68: 0.01:1.000:0.942 0/1/1/1:4:16,41:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,38:0.48: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,16:0.39:-0.17:0.999:0.727 0/1/1/1:4:13,62:0.84: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-1.11:1.000:0.717 0/0/1/1:4:19,21:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-0.94:1.000:0.980 0/1/1/1:4:9,23:0.73:-0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:33,4:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,26:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,31:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,31:0.63:-0.12:1.000:0.537 0/0/1/1:4:34,28:0.46: 0.43:1.000:0.987 0/0/1/1:4:50,29:0.41: 1.16:1.000:0.876 0/1/1/1:4:10,26:0.73:-0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,22:0.53:-0.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,32:0.48: 0.60:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,34:0.70:-0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:23,15:0.43:-0.59:1.000:0.940 0/1/1/1:4:7,23:0.78:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,38:0.57: 0.56:1.000:0.943 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,32:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,26:0.43: 0.52:1.000:0.956 0/0/1/1:4:22,28:0.54:-0.08:1.000:0.986 0/1/1/1:4:17,64:0.80: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,41:0.61: 0.60:1.000:0.639 0/0/1/1:4:19,22:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,22:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,40:0.80:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,22:0.60:-0.68:1.000:0.768 0/0/1/1:4:50,33:0.43: 1.33:1.000:0.944 0/0/1/1:4:22,24:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,39:0.46: 1.46:1.000:0.988 0/0/1/1:4:24,28:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,32:0.43: 1.29:1.000:0.932 0/1/1/1:4:18,31:0.63:-0.12:1.000:0.537 0/0/1/1:4:41,31:0.45: 0.86:1.000:0.977 0/0/0/1:4:39,2:0.16:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,40:0.41: 2.57:1.000:0.842 0/0/1/1:4:58,32:0.41: 1.63:1.000:0.835 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-2.05:1.000:0.821 0/0/1/1:4:32,17:0.40:-0.12:1.000:0.798 0/0/1/1:4:36,54:0.59: 1.63:1.000:0.867 0/0/1/1:4:32,26:0.46: 0.26:1.000:0.986 0/0/1/1:4:33,34:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,2:0.27:-1.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,33:0.62: 0.05:1.000:0.618 0/0/1/1:4:23,25:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,23:0.45: 0.01:1.000:0.984 0/0/1/1:4:18,26:0.58:-0.34:1.000:0.919 0/1/1/1:4:22,53:0.72: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,28:0.41: 1.08:1.000:0.865 0/0/1/1:4:34,39:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,29:0.58:-0.12:1.000:0.915 0/0/1/1:4:34,18:0.40: 0.01:1.000:0.794 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.81:0.999:1.000 0/0/1/1:4:44,25:0.41: 0.73:1.000:0.861 0/0/1/1:4:15,23:0.60:-0.59:1.000:0.826 0/0/1/1:4:39,18:0.38: 0.22:1.000:0.614 0/0/1/1:4:20,14:0.44:-0.77:1.000:0.962 0/0/0/1:4:15,1:0.20:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,22:0.65:-0.77:1.000:0.745 0/0/1/1:4:45,22:0.39: 0.65:1.000:0.697 0/1/1/1:4:34,85:0.72: 2.87:1.000:0.997 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,36:0.46: 1.25:1.000:0.984 0/0/1/1:4:40,35:0.47: 0.99:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,40:0.46: 1.63:1.000:0.984 0/0/1/1:4:33,32:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,40:0.44: 1.89:1.000:0.967 0/0/1/1:4:14,22:0.60:-0.68:1.000:0.768 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.35:1.000:1.000 -chr4.1 9519470 chr4.1_009519470 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:341,247:.: 0.98:1.000:. ./.:4:119,239:.:-0.80:1.000:. ./.:4:426,113:.: 0.60:1.000:. ./.:4:281,226:.: 0.35:1.000:. ./.:4:606,149:.: 2.27:1.000:. ./.:4:460,99:.: 0.76:1.000:. ./.:4:348,73:.:-0.31:1.000:. ./.:4:150,309:.:-0.02:1.000:. ./.:4:376,87:.: 0.01:1.000:. ./.:4:16,34:.:-3.18:1.000:. ./.:4:89,16:.:-2.75:1.000:. ./.:4:394,94:.: 0.21:1.000:. ./.:4:278,218:.: 0.27:1.000:. ./.:4:301,234:.: 0.57:1.000:. ./.:4:290,227:.: 0.43:1.000:. ./.:4:420,87:.: 0.35:1.000:. ./.:4:486,119:.: 1.11:0.999:. ./.:4:447,85:.: 0.55:1.000:. ./.:4:411,274:.: 1.73:1.000:. ./.:4:180,394:.: 0.87:1.000:. ./.:4:51,13:.:-3.07:1.000:. ./.:4:153,337:.: 0.22:1.000:. ./.:4:384,261:.: 1.42:1.000:. ./.:4:265,178:.:-0.14:1.000:. ./.:4:41,13:.:-3.15:1.000:. ./.:4:143,362:.: 0.34:1.000:. ./.:4:167,294:.: 0.00:1.000:. ./.:4:395,96:.: 0.23:1.000:. ./.:4:408,287:.: 1.81:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:409,98:.: 0.35:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:45,35:.:-2.95:1.000:. ./.:3:24,20:.:-3.23:1.000:. ./.:4:416,85:.: 0.31:1.000:. ./.:4:149,326:.: 0.11:1.000:. ./.:4:314,206:.: 0.45:1.000:. ./.:4:246,182:.:-0.26:1.000:. ./.:4:132,343:.: 0.11:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:413,129:.: 0.62:1.000:. ./.:4:283,230:.: 0.40:1.000:. ./.:4:372,87:.:-0.02:1.000:. ./.:4:271,208:.: 0.14:1.000:. ./.:4:254,220:.: 0.10:1.000:. ./.:4:603,176:.: 2.46:1.000:. ./.:4:168,35:.:-2.00:1.000:. ./.:4:366,82:.:-0.10:1.000:. ./.:4:326,70:.:-0.50:1.000:. ./.:4:198,150:.:-0.88:1.000:. ./.:4:521,149:.: 1.61:1.000:. ./.:4:316,76:.:-0.54:1.000:. ./.:4:453,89:.: 0.62:1.000:. ./.:4:272,209:.: 0.15:1.000:. ./.:4:366,101:.: 0.04:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:359,108:.: 0.04:1.000:. ./.:4:348,95:.:-0.14:1.000:. ./.:6:242,145:.:-0.57:1.000:. ./.:4:254,204:.:-0.02:1.000:. ./.:4:231,223:.:-0.06:1.000:. ./.:4:232,235:.: 0.04:1.000:. ./.:4:277,68:.:-0.90:1.000:. ./.:4:319,220:.: 0.60:1.000:. ./.:4:393,187:.: 0.92:1.000:. ./.:4:205,164:.:-0.71:1.000:. ./.:4:234,209:.:-0.14:1.000:. ./.:4:236,214:.:-0.09:1.000:. ./.:4:145,277:.:-0.30:1.000:. ./.:4:465,110:.: 0.88:1.000:. ./.:4:351,105:.:-0.04:1.000:. ./.:4:117,318:.:-0.20:1.000:. ./.:4:333,233:.: 0.81:1.000:. ./.:4:379,93:.: 0.08:1.000:. ./.:4:299,87:.:-0.58:1.000:. ./.:4:356,91:.:-0.11:1.000:. ./.:4:277,198:.: 0.11:1.000:. ./.:4:254,221:.: 0.11:1.000:. ./.:4:272,215:.: 0.20:1.000:. ./.:4:312,76:.:-0.57:0.999:. ./.:4:288,217:.: 0.34:1.000:. ./.:4:122,346:.: 0.05:1.000:. ./.:4:203,180:.:-0.60:1.000:. ./.:4:293,88:.:-0.62:1.000:. ./.:4:284,210:.: 0.25:1.000:. ./.:4:208,152:.:-0.78:1.000:. ./.:4:320,92:.:-0.38:1.000:. ./.:4:324,83:.:-0.42:1.000:. ./.:4:114,305:.:-0.33:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:388,99:.: 0.20:1.000:. ./.:4:289,211:.: 0.30:1.000:. ./.:4:216,181:.:-0.50:1.000:. ./.:4:387,92:.: 0.14:1.000:. ./.:4:250,160:.:-0.40:1.000:. ./.:4:194,158:.:-0.84:1.000:. ./.:4:205,146:.:-0.85:1.000:. ./.:4:410,101:.: 0.38:1.000:. ./.:4:119,335:.:-0.06:1.000:. ./.:4:345,99:.:-0.13:1.000:. ./.:4:413,100:.: 0.40:1.000:. ./.:4:176,146:.:-1.08:1.000:. ./.:4:377,92:.: 0.06:1.000:. ./.:4:183,153:.:-0.97:1.000:. ./.:4:210,166:.:-0.66:1.000:. ./.:4:238,172:.:-0.40:1.000:. ./.:4:408,115:.: 0.48:1.000:. ./.:4:653,180:.: 2.87:1.000:. ./.:4:281,229:.: 0.38:1.000:. ./.:4:336,88:.:-0.29:1.000:. ./.:4:347,251:.: 1.06:1.000:. ./.:4:389,86:.: 0.11:0.999:. ./.:4:405,95:.: 0.30:1.000:. ./.:4:183,158:.:-0.93:1.000:. ./.:4:296,207:.: 0.32:1.000:. ./.:4:207,145:.:-0.84:1.000:. ./.:4:206,202:.:-0.41:1.000:. ./.:4:270,184:.:-0.06:1.000:. ./.:4:345,86:.:-0.23:1.000:. ./.:4:312,213:.: 0.49:1.000:. ./.:4:247,180:.:-0.26:1.000:. ./.:4:415,101:.: 0.42:1.000:. ./.:4:478,103:.: 0.93:1.000:. ./.:4:252,205:.:-0.03:1.000:. ./.:4:241,222:.: 0.01:1.000:. ./.:4:324,82:.:-0.43:1.000:. ./.:4:93,218:.:-1.16:1.000:. ./.:4:314,78:.:-0.54:1.000:. ./.:4:240,69:.:-1.18:1.000:. ./.:4:220,152:.:-0.69:1.000:. ./.:4:241,187:.:-0.26:1.000:. ./.:4:83,177:.:-1.56:1.000:. ./.:4:339,89:.:-0.26:1.000:. ./.:4:390,120:.: 0.38:1.000:. ./.:4:376,294:.: 1.61:1.000:. ./.:4:454,122:.: 0.89:1.000:. ./.:4:334,84:.:-0.33:1.000:. ./.:4:290,64:.:-0.83:1.000:. ./.:4:208,177:.:-0.59:1.000:. ./.:4:379,123:.: 0.32:1.000:. ./.:4:255,196:.:-0.08:1.000:. ./.:4:342,87:.:-0.25:1.000:. ./.:4:241,80:.:-1.08:1.000:. ./.:4:577,154:.: 2.09:1.000:. ./.:4:425,326:.: 2.24:1.000:. ./.:4:478,124:.: 1.09:1.000:. ./.:4:248,196:.:-0.13:1.000:. ./.:4:486,99:.: 0.96:1.000:. ./.:4:249,186:.:-0.20:1.000:. ./.:4:437,104:.: 0.62:1.000:. ./.:4:378,94:.: 0.08:1.000:. ./.:4:26,22:.:-3.19:1.000:. ./.:4:338,76:.:-0.37:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:322,291:.: 1.17:1.000:. ./.:4:534,124:.: 1.52:1.000:. ./.:4:159,363:.: 0.47:1.000:. ./.:4:237,172:.:-0.40:1.000:. ./.:4:289,225:.: 0.41:1.000:. ./.:4:417,82:.: 0.29:1.000:. ./.:4:216,166:.:-0.61:1.000:. ./.:4:361,96:.:-0.03:1.000:. ./.:4:449,100:.: 0.68:1.000:. ./.:4:451,130:.: 0.93:1.000:. ./.:4:271,188:.:-0.02:1.000:. ./.:4:425,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:142,285:.:-0.26:0.999:. ./.:4:406,93:.: 0.29:1.000:. ./.:4:246,194:.:-0.16:1.000:. ./.:4:349,74:.:-0.30:1.000:. ./.:4:185,161:.:-0.89:1.000:. ./.:4:140,281:.:-0.31:1.000:. ./.:4:267,204:.: 0.08:1.000:. ./.:4:221,186:.:-0.42:1.000:. ./.:4:285,59:.:-0.91:1.000:. ./.:4:435,129:.: 0.79:1.000:. ./.:4:154,333:.: 0.20:1.000:. ./.:4:407,122:.: 0.52:1.000:. ./.:4:347,130:.: 0.12:1.000:. ./.:4:483,124:.: 1.13:1.000:. ./.:4:385,294:.: 1.68:1.000:. ./.:4:591,156:.: 2.21:1.000:. ./.:4:250,161:.:-0.39:1.000:. ./.:4:340,251:.: 1.00:1.000:. -chr4.1 9672443 chr4.1_009672443 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:132,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.04:0.999:. ./.:4:95,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.08:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:72,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:110,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:101,1:.:-0.01:0.999:. ./.:4:146,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.48:0.999:. ./.:4:113,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:210,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.23:1.000:. -chr4.1 9919954 chr4.1_009919954 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:101,98:0.52:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:200,36:0.19: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,33:0.26:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,49:0.29:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:156,134:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:249,55:0.23: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,30:0.31:-1.56:1.000:0.970 0/0/0/1:4:212,53:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,90:0.54:-0.67:1.000:0.987 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-2.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,31:0.29:-1.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:67,113:0.60:-0.51:1.000:0.800 0/0/1/1:4:93,83:0.51:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,106:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,36:0.26:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,83:0.44:-0.04:1.000:0.960 0/0/0/1:4:178,63:0.31: 0.44:0.999:0.976 0/0/1/1:4:124,81:0.44:-0.12:1.000:0.960 0/0/1/1:4:142,131:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:343,58:0.18: 2.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,48:0.56:-1.98:1.000:0.971 0/0/0/0:4:243,1:0.01: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,42:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,89:0.48:-0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,24:0.57:-2.69:1.000:0.937 0/0/0/0:4:299,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,39:0.26:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:248,45:0.19: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,70:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,60:0.51:-1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,54:0.40:-0.98:1.000:0.811 0/1/1/1:4:5,37:0.75:-2.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,20:0.27:-1.93:1.000:0.997 0/0/0:3:73,4:0.06:-2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,43:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:277,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,54:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,43:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:253,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,107:0.64:-0.93:1.000:0.707 0/0/0/1:4:234,44:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,26:0.19:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,45:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,39:0.18: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,111:0.43: 1.15:1.000:0.945 0/0/1/1:4:89,98:0.54:-0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:122,73:0.42:-0.28:1.000:0.897 0/0/1/1:4:123,77:0.43:-0.20:1.000:0.936 0/0/0/1:4:193,36:0.20: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,93:0.36: 1.31:1.000:0.704 0/0/1/1:4:147,90:0.42: 0.38:1.000:0.919 0/0/0/1:4:201,48:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,41:0.21: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,80:0.41: 0.04:1.000:0.887 0/0/1/1:4:90,90:0.52:-0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:221,41:0.20: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,74:0.45:-0.49:1.000:0.979 0/0/0/0/1/1:6:149,43:0.27:-0.32:1.000:0.705 0/0/0/1:4:157,37:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,33:0.19: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,71:0.29: 1.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:191,26:0.15: 0.07:1.000:0.987 0/0/0/1:4:157,40:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:288,41:0.16: 1.82:1.000:0.993 0/0/0/1:4:118,26:0.23:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,63:0.37:-0.34:1.000:0.515 0/0/0/1:4:124,46:0.32:-0.67:1.000:0.961 0/0/0/1:4:247,31:0.14: 1.02:1.000:0.964 0/0/1/1:4:158,95:0.42: 0.63:1.000:0.902 0/0/1/1:4:98,108:0.54:-0.10:1.000:0.989 0/0/0/1:4:284,50:0.19: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,36:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,131:0.57: 0.23:1.000:0.950 0/0/1/1:4:81,65:0.48:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,32:0.21:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,79:0.43:-0.18:1.000:0.956 0/0/1/1:4:144,108:0.47: 0.62:1.000:0.991 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,83:0.67:-1.57:0.999:0.905 0/0/0/1:4:172,40:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,44:0.21: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,46:0.29:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:139,36:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,57:0.28: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,66:0.52:-1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,79:0.49:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,66:0.49:-1.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,97:0.64:-1.17:1.000:0.730 0/0/1/1:4:83,61:0.46:-1.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:189,48:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,28:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,48:0.22: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,44:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,29:0.18:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,70:0.38:-0.10:1.000:0.610 0/0/1/1:4:105,101:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:263,65:0.25: 1.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,40:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,87:0.42: 0.23:1.000:0.931 0/0/1/1:4:114,74:0.43:-0.39:1.000:0.957 0/0/0/1:4:215,50:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,52:0.49:-1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,88:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:98,67:0.45:-0.74:1.000:0.976 0/0/1/1:4:102,92:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:248,127:0.38: 2.54:1.000:0.596 0/0/0/1:4:185,49:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,97:0.57:-0.68:1.000:0.954 0/0/0/1:4:314,55:0.19: 2.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,59:0.39:-0.67:0.999:0.693 0/1/1/1:4:51,136:0.66:-0.40:1.000:0.858 0/0/0/1:4:80,20:0.25:-1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,88:0.42: 0.30:1.000:0.918 0/0/0/1:4:203,42:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,71:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,75:0.44:-0.40:1.000:0.970 0/0/0/1:4:167,42:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,48:0.32:-0.56:1.000:0.959 0/0/1/1:4:153,91:0.41: 0.49:1.000:0.891 0/0/1/1:4:125,106:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,48:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,32:0.17: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,41:0.30:-0.74:1.000:0.988 0/0/0/1:4:157,27:0.18:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,58:0.48:-1.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:134,24:0.19:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,70:0.36: 0.10:1.000:0.642 0/0/0/1:4:156,37:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,75:0.52:-0.98:1.000:0.994 0/0/0/1:4:135,60:0.35:-0.28:1.000:0.769 0/0/1/1:4:226,122:0.39: 2.12:1.000:0.729 0/0/1/1:4:86,96:0.54:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:152,68:0.35: 0.12:1.000:0.756 0/0/0/1:4:109,34:0.29:-1.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:143,40:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,72:0.44:-0.48:1.000:0.961 0/0/0/1:4:125,49:0.33:-0.60:1.000:0.930 0/0/1/1:4:120,84:0.45:-0.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:116,61:0.39:-0.56:1.000:0.666 0/0/1/1:4:169,137:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:243,51:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,58:0.22: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,94:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,56:0.25: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:192,33:0.18: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:289,56:0.20: 2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,83:0.40: 0.33:1.000:0.768 0/0/0/0:4:42,4:0.11:-2.61:1.000:0.566 0/0/0/1:4:100,49:0.37:-1.00:1.000:0.527 0/0/1/1:4:95,69:0.46:-0.76:1.000:0.988 0/0/0/1:4:235,42:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,73:0.30: 1.20:1.000:0.985 0/0/0/1:4:262,52:0.21: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,31:0.20:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,54:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,118:0.45: 1.18:1.000:0.980 0/0/0/1:4:150,35:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,95:0.65:-1.23:1.000:0.767 0/0/1/1:4:89,79:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,79:0.52:-0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,91:0.45: 0.12:1.000:0.983 0/0/1/1:4:165,85:0.38: 0.59:1.000:0.612 0/0/0/1:4:258,52:0.21: 1.52:0.999:1.000 0/0/0/1:4:154,73:0.37: 0.23:1.000:0.618 0/0/0/1:4:183,43:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,67:0.44:-0.71:1.000:0.970 0/0/0/1:4:139,30:0.22:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,33:0.22:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,94:0.44: 0.40:1.000:0.960 0/0/1/1:4:120,72:0.42:-0.32:1.000:0.900 0/0/1/1:4:64,64:0.52:-1.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:120,95:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/0:4:371,0:0.00: 2.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,77:0.33: 0.96:1.000:0.932 0/0/1/1:4:132,81:0.42: 0.01:1.000:0.921 0/0/0/1:4:206,50:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,109:0.42: 1.18:1.000:0.914 0/0/0/1:4:211,75:0.31: 1.15:1.000:0.975 0/0/1/1:4:120,83:0.45:-0.15:1.000:0.979 0/0/1/1:4:163,81:0.38: 0.49:1.000:0.512 -chr4.1 10146082 chr4.1_010146082 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:121,36:.: 0.88:1.000:. ./.:4:20,73:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,28:.:-0.02:1.000:. ./.:4:137,51:.: 1.49:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.46:1.000:. ./.:4:139,33:.: 1.17:1.000:. ./.:4:90,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:77,61:.: 0.50:1.000:. ./.:4:126,27:.: 0.80:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:7,6:.:-1.98:1.000:. ./.:4:112,32:.: 0.62:1.000:. ./.:4:121,37:.: 0.90:1.000:. ./.:4:118,36:.: 0.82:1.000:. ./.:4:124,36:.: 0.94:1.000:. ./.:4:150,45:.: 1.63:1.000:. ./.:4:123,39:.: 0.98:0.999:. ./.:4:93,77:.: 1.13:1.000:. ./.:4:138,31:.: 1.11:1.000:. ./.:4:113,96:.: 1.91:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:71,45:.: 0.06:1.000:. ./.:4:118,30:.: 0.70:1.000:. ./.:4:95,33:.: 0.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:91,63:.: 0.82:1.000:. ./.:4:120,90:.: 1.93:1.000:. ./.:4:136,41:.: 1.27:1.000:. ./.:4:123,33:.: 0.86:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:141,21:.: 0.98:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:140,47:.: 1.47:1.000:. ./.:4:88,73:.: 0.96:1.000:. ./.:4:114,40:.: 0.82:1.000:. ./.:4:74,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:104,62:.: 1.05:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:74,13:.:-0.51:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.89:1.000:. ./.:4:42,43:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.71:1.000:. ./.:4:136,48:.: 1.41:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.40:1.000:. ./.:4:68,15:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,7:.:-1.52:1.000:. ./.:4:47,11:.:-1.09:1.000:. ./.:4:112,17:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,22:.:-0.81:1.000:. ./.:4:88,23:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,56:.: 0.22:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,8:.:-1.03:1.000:. ./.:4:66,20:.:-0.53:1.000:. ./.:6:44,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:80,13:.:-0.39:1.000:. ./.:4:69,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,33:.:-0.69:1.000:. ./.:4:57,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:84,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:56,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,9:.:-0.89:1.000:. ./.:4:75,30:.:-0.16:1.000:. ./.:4:74,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,81:.:-0.08:1.000:. ./.:4:85,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:36,12:.:-1.29:1.000:. ./.:4:22,48:.:-0.85:1.000:. ./.:4:128,26:.: 0.82:1.000:. ./.:4:69,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,21:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,23:.:-0.73:1.000:. ./.:4:57,10:.:-0.91:1.000:. ./.:4:61,21:.:-0.61:1.000:. ./.:4:55,47:.:-0.21:1.000:. ./.:4:56,20:.:-0.73:0.999:. ./.:4:77,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,31:.:-0.93:1.000:. ./.:4:99,31:.: 0.34:1.000:. ./.:4:81,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:70,18:.:-0.49:1.000:. ./.:4:47,11:.:-1.09:1.000:. ./.:4:40,13:.:-1.19:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.89:1.000:. ./.:4:34,39:.:-0.79:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:59,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:70,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:80,25:.:-0.16:1.000:. ./.:4:84,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:31,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:80,56:.: 0.46:1.000:. ./.:4:41,9:.:-1.25:1.000:. ./.:4:64,16:.:-0.65:1.000:. ./.:4:51,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,13:.:-1.21:1.000:. ./.:4:69,20:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:125,46:.: 1.15:1.000:. ./.:4:73,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:161,59:.: 2.13:1.000:. ./.:4:50,20:.:-0.85:0.999:. ./.:4:112,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:50,17:.:-0.91:1.000:. ./.:4:84,13:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,16:.:-1.07:1.000:. ./.:4:47,15:.:-1.01:1.000:. ./.:4:42,24:.:-0.93:1.000:. ./.:4:49,11:.:-1.05:1.000:. ./.:4:83,25:.:-0.10:1.000:. ./.:4:60,10:.:-0.85:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:160,34:.: 1.61:1.000:. ./.:4:55,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:77,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.95:1.000:. ./.:4:19,53:.:-0.81:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:44,10:.:-1.17:1.000:. ./.:4:55,14:.:-0.87:1.000:. ./.:4:110,39:.: 0.72:1.000:. ./.:4:27,30:.:-1.11:1.000:. ./.:4:61,20:.:-0.63:1.000:. ./.:4:94,30:.: 0.22:1.000:. ./.:4:177,54:.: 2.34:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.91:1.000:. ./.:4:61,18:.:-0.67:1.000:. ./.:4:44,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:61,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:118,37:.: 0.84:1.000:. ./.:4:45,14:.:-1.07:1.000:. ./.:4:147,37:.: 1.41:1.000:. ./.:4:142,39:.: 1.35:1.000:. ./.:4:138,32:.: 1.13:1.000:. ./.:4:100,30:.: 0.34:1.000:. ./.:4:107,32:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,48:.:-0.29:1.000:. ./.:4:161,48:.: 1.91:1.000:. ./.:4:139,38:.: 1.27:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.10:1.000:. ./.:4:112,26:.: 0.50:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:122,35:.: 0.88:1.000:. ./.:4:147,42:.: 1.51:1.000:. ./.:4:82,85:.: 1.07:1.000:. ./.:4:106,29:.: 0.44:1.000:. ./.:4:113,37:.: 0.74:1.000:. ./.:4:126,29:.: 0.84:1.000:. ./.:4:91,18:.:-0.08:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:151,43:.: 1.61:1.000:. ./.:4:142,59:.: 1.75:1.000:. ./.:4:138,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:114,26:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,127:.: 0.92:0.999:. ./.:4:119,41:.: 0.94:1.000:. ./.:4:115,42:.: 0.88:1.000:. ./.:4:110,30:.: 0.54:1.000:. ./.:4:85,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,62:.: 0.46:1.000:. ./.:4:93,34:.: 0.28:1.000:. ./.:4:76,19:.:-0.35:1.000:. ./.:4:97,24:.: 0.16:1.000:. ./.:4:224,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:71,69:.: 0.54:1.000:. ./.:4:140,37:.: 1.27:1.000:. ./.:4:101,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:138,43:.: 1.35:1.000:. ./.:4:153,29:.: 1.37:1.000:. ./.:4:137,51:.: 1.49:1.000:. ./.:4:82,41:.: 0.20:1.000:. ./.:4:93,77:.: 1.13:1.000:. -chr4.1 10269648 chr4.1_010269648 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.04:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.26:1.000:. ./.:3:1,1:.:-1.82:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.23:1.000:. ./.:6:7,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:24,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 4.44:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.: 3.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr4.1 10356301 chr4.1_010356301 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:577,507:.: 1.37:1.000:. ./.:4:337,168:.:-1.34:1.000:. ./.:4:523,409:.: 0.66:1.000:. ./.:4:578,429:.: 1.01:1.000:. ./.:4:555,497:.: 1.22:1.000:. ./.:4:654,459:.: 1.51:1.000:. ./.:4:347,201:.:-1.14:1.000:. ./.:4:513,304:.: 0.12:1.000:. ./.:4:406,349:.:-0.17:1.000:. ./.:4:259,142:.:-1.82:1.000:. ./.:4:311,263:.:-1.02:1.000:. ./.:4:437,221:.:-0.62:1.000:. ./.:4:548,331:.: 0.41:1.000:. ./.:4:538,278:.: 0.12:1.000:. ./.:4:520,423:.: 0.71:1.000:. ./.:4:537,444:.: 0.89:1.000:. ./.:4:572,368:.: 0.70:0.999:. ./.:4:495,409:.: 0.53:1.000:. ./.:4:726,409:.: 1.61:1.000:. ./.:4:484,432:.: 0.58:1.000:. ./.:4:205,179:.:-1.90:1.000:. ./.:4:515,373:.: 0.45:1.000:. ./.:4:596,365:.: 0.79:1.000:. ./.:4:454,266:.:-0.33:1.000:. ./.:4:227,177:.:-1.81:1.000:. ./.:4:530,377:.: 0.54:1.000:. ./.:4:581,451:.: 1.13:1.000:. ./.:4:534,422:.: 0.77:1.000:. ./.:4:599,507:.: 1.47:1.000:. ./.:4:497,469:.: 0.82:1.000:. ./.:4:539,354:.: 0.48:1.000:. ./.:4:412,340:.:-0.18:1.000:. ./.:4:164,168:.:-2.15:1.000:. ./.:4:236,229:.:-1.53:1.000:. ./.:3:145,81:.:-2.64:1.000:. ./.:4:528,263:.: 0.00:1.000:. ./.:4:488,388:.: 0.40:1.000:. ./.:4:516,308:.: 0.15:1.000:. ./.:4:524,415:.: 0.69:1.000:. ./.:4:543,495:.: 1.15:1.000:. ./.:4:445,376:.: 0.14:1.000:. ./.:4:525,411:.: 0.68:1.000:. ./.:4:485,338:.: 0.15:1.000:. ./.:4:385,406:.: 0.00:1.000:. ./.:4:434,221:.:-0.64:1.000:. ./.:4:497,411:.: 0.55:1.000:. ./.:4:563,365:.: 0.64:1.000:. ./.:4:1236,1087:.: 7.16:1.000:. ./.:4:399,296:.:-0.45:1.000:. ./.:4:576,373:.: 0.74:1.000:. ./.:4:397,273:.:-0.57:1.000:. ./.:4:581,522:.: 1.46:1.000:. ./.:4:432,206:.:-0.72:1.000:. ./.:4:575,353:.: 0.64:1.000:. ./.:4:457,288:.:-0.22:1.000:. ./.:4:493,321:.: 0.11:1.000:. ./.:4:409,417:.: 0.16:1.000:. ./.:4:473,377:.: 0.28:1.000:. ./.:4:394,330:.:-0.31:1.000:. ./.:6:355,368:.:-0.32:1.000:. ./.:4:398,439:.: 0.21:1.000:. ./.:4:422,313:.:-0.26:1.000:. ./.:4:491,351:.: 0.24:1.000:. ./.:4:404,233:.:-0.72:1.000:. ./.:4:551,472:.: 1.08:1.000:. ./.:4:581,400:.: 0.89:1.000:. ./.:4:296,276:.:-1.02:1.000:. ./.:4:443,374:.: 0.12:1.000:. ./.:4:490,365:.: 0.30:1.000:. ./.:4:410,207:.:-0.81:1.000:. ./.:4:501,389:.: 0.46:1.000:. ./.:4:319,203:.:-1.26:1.000:. ./.:4:517,250:.:-0.11:1.000:. ./.:4:577,300:.: 0.40:1.000:. ./.:4:401,217:.:-0.81:1.000:. ./.:4:396,311:.:-0.39:1.000:. ./.:4:425,311:.:-0.26:1.000:. ./.:4:402,393:.: 0.02:1.000:. ./.:4:391,363:.:-0.17:1.000:. ./.:4:469,417:.: 0.44:1.000:. ./.:4:337,193:.:-1.22:0.999:. ./.:4:430,358:.:-0.01:1.000:. ./.:4:445,449:.: 0.48:1.000:. ./.:4:423,227:.:-0.66:1.000:. ./.:4:385,451:.: 0.21:1.000:. ./.:4:396,419:.: 0.11:1.000:. ./.:4:318,243:.:-1.08:1.000:. ./.:4:336,228:.:-1.06:1.000:. ./.:4:351,339:.:-0.47:1.000:. ./.:4:419,304:.:-0.32:1.000:. ./.:4:369,325:.:-0.45:1.000:. ./.:4:427,323:.:-0.19:1.000:. ./.:4:474,382:.: 0.30:1.000:. ./.:4:407,358:.:-0.12:1.000:. ./.:4:446,351:.: 0.03:1.000:. ./.:4:487,417:.: 0.53:1.000:. ./.:4:310,168:.:-1.46:1.000:. ./.:4:321,191:.:-1.31:1.000:. ./.:4:397,299:.:-0.44:1.000:. ./.:4:457,391:.: 0.27:1.000:. ./.:4:313,180:.:-1.39:1.000:. ./.:4:475,306:.:-0.05:1.000:. ./.:4:287,207:.:-1.39:1.000:. ./.:4:386,359:.:-0.22:1.000:. ./.:4:382,250:.:-0.74:1.000:. ./.:4:420,322:.:-0.23:1.000:. ./.:4:355,337:.:-0.46:1.000:. ./.:4:474,340:.: 0.11:1.000:. ./.:4:583,478:.: 1.26:1.000:. ./.:4:495,302:.: 0.03:1.000:. ./.:4:382,319:.:-0.42:1.000:. ./.:4:686,504:.: 1.87:1.000:. ./.:4:330,334:.:-0.59:0.999:. ./.:4:469,387:.: 0.30:1.000:. ./.:4:356,220:.:-1.01:1.000:. ./.:4:459,376:.: 0.21:1.000:. ./.:4:326,230:.:-1.10:1.000:. ./.:4:379,326:.:-0.40:1.000:. ./.:4:376,220:.:-0.91:1.000:. ./.:4:378,237:.:-0.82:1.000:. ./.:4:470,278:.:-0.20:1.000:. ./.:4:357,271:.:-0.76:1.000:. ./.:4:532,461:.: 0.94:1.000:. ./.:4:514,429:.: 0.71:1.000:. ./.:4:403,381:.:-0.03:1.000:. ./.:4:472,339:.: 0.09:1.000:. ./.:4:426,304:.:-0.29:1.000:. ./.:4:416,194:.:-0.85:1.000:. ./.:4:318,164:.:-1.45:1.000:. ./.:4:318,182:.:-1.36:1.000:. ./.:4:368,288:.:-0.63:1.000:. ./.:4:478,402:.: 0.42:1.000:. ./.:4:276,222:.:-1.37:1.000:. ./.:4:493,384:.: 0.40:1.000:. ./.:4:454,333:.:-0.02:1.000:. ./.:4:610,478:.: 1.39:1.000:. ./.:4:510,465:.: 0.86:1.000:. ./.:4:342,284:.:-0.77:1.000:. ./.:4:295,342:.:-0.72:1.000:. ./.:4:398,319:.:-0.35:1.000:. ./.:4:402,348:.:-0.19:1.000:. ./.:4:392,277:.:-0.57:1.000:. ./.:4:429,298:.:-0.30:1.000:. ./.:4:302,296:.:-0.90:1.000:. ./.:4:569,566:.: 1.61:1.000:. ./.:4:682,545:.: 2.04:1.000:. ./.:4:462,235:.:-0.44:1.000:. ./.:4:428,398:.: 0.16:1.000:. ./.:4:513,443:.: 0.77:1.000:. ./.:4:470,280:.:-0.19:1.000:. ./.:4:633,547:.: 1.82:1.000:. ./.:4:458,354:.: 0.10:1.000:. ./.:4:254,117:.:-1.96:1.000:. ./.:4:388,301:.:-0.48:1.000:. ./.:4:560,420:.: 0.88:1.000:. ./.:4:441,332:.:-0.08:1.000:. ./.:4:644,400:.: 1.18:1.000:. ./.:4:508,336:.: 0.25:1.000:. ./.:4:488,316:.: 0.06:1.000:. ./.:4:568,444:.: 1.03:1.000:. ./.:4:449,322:.:-0.09:1.000:. ./.:4:382,260:.:-0.70:1.000:. ./.:4:389,403:.: 0.00:1.000:. ./.:4:561,338:.: 0.50:1.000:. ./.:4:536,511:.: 1.20:1.000:. ./.:4:510,290:.: 0.04:1.000:. ./.:4:339,215:.:-1.11:1.000:. ./.:4:470,206:.:-0.54:0.999:. ./.:4:435,371:.: 0.07:1.000:. ./.:4:453,394:.: 0.26:1.000:. ./.:4:408,264:.:-0.56:1.000:. ./.:4:346,239:.:-0.96:1.000:. ./.:4:498,277:.:-0.08:1.000:. ./.:4:462,300:.:-0.14:1.000:. ./.:4:372,238:.:-0.85:1.000:. ./.:4:364,311:.:-0.54:1.000:. ./.:4:585,524:.: 1.49:1.000:. ./.:4:458,392:.: 0.28:1.000:. ./.:4:532,335:.: 0.35:1.000:. ./.:4:467,358:.: 0.16:1.000:. ./.:4:511,400:.: 0.56:1.000:. ./.:4:634,411:.: 1.19:1.000:. ./.:4:599,493:.: 1.41:1.000:. ./.:4:371,252:.:-0.79:1.000:. ./.:4:458,221:.:-0.52:1.000:. -chr4.1 10582695 chr4.1_010582695 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:175,75:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,161:0.60: 0.43:1.000:0.754 0/0/0/1:4:122,63:0.29:-0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:166,83:0.28: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,73:0.21: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,83:0.28: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,50:0.31:-1.07:1.000:0.966 0/0/1/1:4:81,107:0.53:-0.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:111,60:0.30:-0.52:1.000:0.985 0/0/1/1:4:18,39:0.59:-2.44:1.000:0.859 0/0/0/1:4:40,23:0.32:-2.34:1.000:0.959 0/0/0/1:4:196,58:0.18: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,68:0.25: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,82:0.30: 0.56:1.000:0.987 0/0/0/1:4:135,59:0.25:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,67:0.19: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,63:0.27:-0.13:0.999:0.998 0/0/1/1:4:166,131:0.41: 1.60:1.000:0.872 0/0/0/1:4:196,97:0.28: 1.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,154:0.56: 0.80:1.000:0.973 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,119:0.54:-0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:101,81:0.42:-0.33:1.000:0.897 0/0/0/1:4:129,66:0.28:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,9:0.15:-2.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:71,122:0.56:-0.15:1.000:0.962 0/1/1/1:4:2,126:0.75:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,58:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,69:0.22: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:193,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,62:0.33:-0.62:1.000:0.917 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-2.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,30:0.42:-2.27:1.000:0.912 0/0/1:3:24,7:0.18:-2.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:135,50:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,125:0.54: 0.16:1.000:0.986 0/0/0/1:4:170,88:0.29: 0.95:1.000:0.993 0/0/1/1:4:56,59:0.50:-1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,104:0.56:-0.62:1.000:0.963 0/0/0/0:4:238,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:229,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,58:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,52:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,146:0.59: 0.21:1.000:0.866 0/0/0/1:4:158,71:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,98:0.30: 1.30:1.000:0.985 0/0/1/1:4:24,27:0.51:-2.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,54:0.29:-0.72:1.000:0.993 0/0/0/1:4:100,36:0.21:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,58:0.48:-1.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:236,79:0.20: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,50:0.18: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,80:0.31: 0.36:1.000:0.974 0/0/1/1:4:142,122:0.44: 1.05:1.000:0.962 0/0/0/1:4:128,58:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:177,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,57:0.49:-1.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,61:0.33:-0.65:1.000:0.925 0/0/0/0/0/1:6:138,60:0.24:-0.06:1.000:0.585 0/0/0/1:4:144,75:0.29: 0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,59:0.44:-1.28:1.000:0.974 0/0/1/1:4:146,127:0.44: 1.20:1.000:0.969 0/0/0/1:4:109,54:0.28:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,78:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,119:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,64:0.28:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:153,68:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,56:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,177:0.62: 0.68:1.000:0.623 0/0/0/1:4:222,70:0.19: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,56:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/1/1/1:4:61,197:0.63: 0.95:1.000:0.601 0/0/0/1:4:171,68:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,66:0.21: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,74:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,64:0.29:-0.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:177,78:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,71:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,141:0.58: 0.21:1.000:0.924 0/0/0/1:4:178,58:0.20: 0.58:0.999:1.000 0/0/0/1:4:86,53:0.34:-1.06:1.000:0.883 0/0/1/1:4:80,124:0.55: 0.04:1.000:0.980 0/0/1/1:4:89,69:0.41:-0.74:1.000:0.837 0/0/0/1:4:91,56:0.34:-0.92:1.000:0.886 0/0/1/1:4:82,76:0.46:-0.74:1.000:0.988 0/0/0/1:4:97,47:0.27:-0.97:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,57:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,61:0.19: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,111:0.56:-0.45:1.000:0.959 0/0/0/0:4:177,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,70:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,56:0.32:-0.82:1.000:0.957 0/0/0/1:4:158,74:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,48:0.26:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,71:0.44:-0.84:1.000:0.972 0/0/1/1:4:117,120:0.49: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/0:4:226,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,126:0.55: 0.07:1.000:0.977 0/0/0/1:4:185,102:0.31: 1.44:1.000:0.979 0/0/0/1:4:189,84:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,50:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,73:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,47:0.21:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,97:0.43: 0.17:1.000:0.951 0/0/0/1:4:147,68:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:150,1:0.01:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,89:0.24: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,74:0.48:-0.89:1.000:0.995 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,103:0.52:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:178,88:0.28: 1.08:0.999:0.997 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,33:0.20:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,74:0.23: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,69:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,53:0.28:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,134:0.54: 0.48:1.000:0.989 0/0/0/1:4:211,44:0.14: 0.90:1.000:0.964 0/0/0/1:4:132,63:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,70:0.49:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:236,64:0.17: 1.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,83:0.27: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,65:0.50:-1.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,82:0.29: 0.63:1.000:0.991 0/0/0/1:4:152,55:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,124:0.57:-0.18:1.000:0.941 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,42:0.21:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,66:0.25: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,85:0.27: 1.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,88:0.57:-1.09:1.000:0.950 0/0/0/1:4:161,57:0.21: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,66:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,76:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,62:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,69:0.27: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,63:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,68:0.41:-0.79:1.000:0.854 0/0/0/1:4:205,64:0.19: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,42:0.16: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:276,78:0.18: 2.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,88:0.43:-0.13:1.000:0.938 0/0/0/1:4:142,77:0.30: 0.29:1.000:0.984 0/0/0/1:4:135,72:0.30: 0.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:151,70:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,110:0.45: 0.49:1.000:0.984 0/0/0/1:4:169,94:0.31: 1.03:1.000:0.976 0/0/0/1:4:129,67:0.29:-0.10:1.000:0.992 0/0/0/1:4:32,13:0.23:-2.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,57:0.20: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,69:0.26: 0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:159,70:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,154:0.56: 0.70:1.000:0.960 0/0/1/1:4:63,60:0.47:-1.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:149,67:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:257,81:0.19: 2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,49:0.51:-1.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,63:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,50:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,73:0.27: 0.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:205,66:0.20: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,232:0.62: 1.87:0.999:0.556 0/0/0/1:4:157,54:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,78:0.45:-0.60:1.000:0.976 0/0/0/1:4:186,59:0.19: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,44:0.43:-1.76:1.000:0.938 0/0/1/1:4:70,115:0.56:-0.28:1.000:0.971 0/0/0/1:4:147,55:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,51:0.28:-0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,54:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:179,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,164:0.57: 0.83:1.000:0.934 0/0/0/1:4:211,65:0.19: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,90:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:170,53:0.19: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,77:0.22: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,77:0.21: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,64:0.29:-0.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,132:0.44: 1.37:1.000:0.971 -chr4.1 10776361 chr4.1_010776361 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:6:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:0.999:. ./.:4:26,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:37,0:.: 3.49:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.50:1.000:. -chr4.1 10858348 chr4.1_010858348 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,235:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.41:1.000:. ./.:4:103,129:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,169:.: 0.26:1.000:. ./.:4:66,216:.: 1.18:1.000:. ./.:4:94,151:.: 0.50:1.000:. ./.:4:43,56:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,152:.:-0.47:1.000:. ./.:4:16,73:.:-2.35:1.000:. ./.:4:15,48:.:-2.82:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.32:1.000:. ./.:4:42,152:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,197:.: 0.74:1.000:. ./.:4:71,205:.: 1.07:0.999:. ./.:4:0,297:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,46:.:-3.13:1.000:. ./.:4:48,165:.:-0.08:1.000:. ./.:4:57,160:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.67:1.000:. ./.:4:12,26:.:-3.28:1.000:. ./.:4:58,198:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,165:.:-0.10:1.000:. ./.:4:112,122:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,143:.:-0.47:1.000:. ./.:4:112,152:.: 0.85:1.000:. ./.:4:53,198:.: 0.61:1.000:. ./.:4:98,120:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,33:.:-3.35:1.000:. ./.:4:8,46:.:-2.99:1.000:. ./.:3:5,21:.:-3.50:1.000:. ./.:4:86,133:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,149:.:-0.25:1.000:. ./.:4:55,147:.:-0.28:1.000:. ./.:4:46,208:.: 0.67:1.000:. ./.:4:62,165:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,191:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.43:1.000:. ./.:4:81,223:.: 1.58:1.000:. ./.:4:102,152:.: 0.67:1.000:. ./.:4:59,223:.: 1.18:1.000:. ./.:4:51,218:.: 0.94:1.000:. ./.:4:69,211:.: 1.14:1.000:. ./.:4:62,262:.: 1.95:1.000:. ./.:4:56,188:.: 0.48:1.000:. ./.:4:71,242:.: 1.74:1.000:. ./.:4:45,175:.: 0.05:1.000:. ./.:4:62,223:.: 1.23:1.000:. ./.:4:53,151:.:-0.25:1.000:. ./.:4:55,218:.: 1.01:1.000:. ./.:4:52,150:.:-0.28:1.000:. ./.:4:54,209:.: 0.83:1.000:. ./.:4:89,149:.: 0.37:1.000:. ./.:4:102,193:.: 1.42:1.000:. ./.:4:64,185:.: 0.58:1.000:. ./.:6:46,154:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,196:.: 0.67:1.000:. ./.:4:50,135:.:-0.59:1.000:. ./.:4:54,247:.: 1.52:1.000:. ./.:4:108,135:.: 0.47:1.000:. ./.:4:58,192:.: 0.59:1.000:. ./.:4:122,223:.: 2.33:1.000:. ./.:4:18,118:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.05:1.000:. ./.:4:45,183:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.72:1.000:. ./.:4:64,252:.: 1.80:1.000:. ./.:4:25,127:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,372:.: 2.82:1.000:. ./.:4:44,150:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,309:.: 1.67:1.000:. ./.:4:25,148:.:-0.81:1.000:. ./.:4:98,148:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.65:1.000:. ./.:4:117,140:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,239:.: 0.41:0.999:. ./.:4:48,184:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,144:.:-0.74:1.000:. ./.:4:106,141:.: 0.54:1.000:. ./.:4:54,184:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.90:1.000:. ./.:4:48,163:.:-0.12:1.000:. ./.:4:33,185:.: 0.01:1.000:. ./.:4:47,154:.:-0.30:1.000:. ./.:4:38,154:.:-0.47:1.000:. ./.:4:48,147:.:-0.41:1.000:. ./.:4:57,201:.: 0.74:1.000:. ./.:4:48,116:.:-0.98:1.000:. ./.:4:93,127:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,203:.: 0.70:1.000:. ./.:4:41,156:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.48:1.000:. ./.:4:39,191:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.23:1.000:. ./.:4:34,85:.:-1.80:1.000:. ./.:4:52,195:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.58:1.000:. ./.:4:81,138:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.01:1.000:. ./.:4:47,154:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,239:.: 1.58:1.000:. ./.:4:45,166:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.96:1.000:. ./.:4:58,202:.: 0.78:1.000:. ./.:4:54,210:.: 0.85:0.999:. ./.:4:0,212:.:-0.10:1.000:. ./.:4:44,151:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.76:1.000:. ./.:4:26,133:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.70:1.000:. ./.:4:83,146:.: 0.21:1.000:. ./.:4:46,174:.: 0.05:1.000:. ./.:4:67,150:.:-0.01:1.000:. ./.:4:52,175:.: 0.17:1.000:. ./.:4:54,219:.: 1.01:1.000:. ./.:4:44,196:.: 0.41:1.000:. ./.:4:38,157:.:-0.41:1.000:. ./.:4:53,192:.: 0.50:1.000:. ./.:4:73,132:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.58:1.000:. ./.:4:28,108:.:-1.49:1.000:. ./.:4:66,109:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.17:1.000:. ./.:4:52,153:.:-0.23:1.000:. ./.:4:33,102:.:-1.51:1.000:. ./.:4:54,236:.: 1.32:1.000:. ./.:4:59,173:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,169:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,187:.: 0.41:1.000:. ./.:4:97,116:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,163:.:-0.16:1.000:. ./.:4:55,196:.: 0.61:1.000:. ./.:4:50,183:.: 0.28:1.000:. ./.:4:40,146:.:-0.58:1.000:. ./.:4:39,149:.:-0.54:1.000:. ./.:4:53,216:.: 0.94:1.000:. ./.:4:43,208:.: 0.61:1.000:. ./.:4:106,129:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,140:.: 0.74:1.000:. ./.:4:50,157:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,175:.: 1.38:1.000:. ./.:4:51,159:.:-0.14:1.000:. ./.:4:14,56:.:-2.69:1.000:. ./.:4:20,119:.:-1.43:1.000:. ./.:4:89,134:.: 0.10:1.000:. ./.:4:38,173:.:-0.12:1.000:. ./.:4:118,143:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,144:.:-0.59:1.000:. ./.:4:50,172:.: 0.08:1.000:. ./.:4:39,160:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,143:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.67:1.000:. ./.:4:62,192:.: 0.67:1.000:. ./.:4:53,203:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.16:1.000:. ./.:4:32,135:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.16:0.999:. ./.:4:41,183:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,130:.:-0.69:1.000:. ./.:4:34,140:.:-0.79:1.000:. ./.:4:33,114:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,160:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,161:.:-1.03:1.000:. ./.:4:36,164:.:-0.32:1.000:. ./.:4:71,162:.: 0.28:1.000:. ./.:4:43,153:.:-0.39:1.000:. ./.:4:47,157:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,169:.:-0.01:1.000:. ./.:4:88,108:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,148:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,143:.:-1.36:1.000:. ./.:4:1,268:.: 0.94:1.000:. -chr4.1 10946497 chr4.1_010946497 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:465,105:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:401,96:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:141,308:0.71:-0.33:1.000:0.989 0/0/1/1:4:300,226:0.49: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:300,265:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/1/1/1:4:197,387:0.69: 0.86:1.000:0.967 0/1/1/1:4:162,298:0.67:-0.23:1.000:0.936 0/0/0/0:4:591,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:280,214:0.50: 0.07:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:55,157:0.75:-2.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:152,327:0.70:-0.07:1.000:0.987 0/0/0/1:4:410,100:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:472,124:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:274,217:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:297,239:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:342,267:0.50: 1.08:0.999:0.997 0/0/1/1:4:281,225:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:632,170:0.26: 2.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:730,0:0.00: 2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,66:0.50:-2.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:436,126:0.28: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:362,248:0.47: 1.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:453,117:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,40:0.40:-3.24:1.000:0.771 0/0/0/1:4:568,122:0.22: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:471,105:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:172,329:0.68: 0.13:1.000:0.957 0/0/1/1:4:411,313:0.50: 2.09:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,505:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:397,235:0.43: 1.28:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,368:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,104:0.74:-3.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,95:0.50:-2.34:1.000:0.997 0/0/1:3:83,30:0.32:-3.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:162,331:0.69: 0.06:1.000:0.978 0/0/0/1:4:451,109:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:314,208:0.46: 0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:296,217:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:538,144:0.26: 1.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:160,357:0.71: 0.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:316,223:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:353,239:0.47: 0.93:1.000:0.991 0/1/1/1:4:144,259:0.67:-0.73:1.000:0.921 0/0/0/1:4:512,115:0.23: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:305,172:0.42:-0.08:1.000:0.917 0/0/1/1:4:367,241:0.46: 1.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:233,156:0.46:-0.86:1.000:0.990 0/0/1/1:4:269,193:0.48:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:336,233:0.47: 0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:224,166:0.49:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:355,261:0.49: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,163:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:314,261:0.52: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:413,110:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:304,258:0.52: 0.66:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,406:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:158,363:0.71: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:296,199:0.47: 0.07:1.000:0.990 0/0/0/1/1/1:6:202,168:0.52:-1.02:1.000:0.875 0/0/1/1:4:278,201:0.48:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:258,192:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:542,134:0.25: 1.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:156,295:0.68:-0.31:1.000:0.952 0/0/1/1:4:320,218:0.47: 0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:260,307:0.59: 0.71:1.000:0.880 0/0/1/1:4:298,200:0.46: 0.10:1.000:0.990 0/0/0/1:4:416,113:0.26: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:353,225:0.45: 0.81:1.000:0.981 0/0/0/1:4:379,98:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:284,208:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:280,168:0.44:-0.34:1.000:0.960 0/0/0/1:4:456,136:0.28: 0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:262,205:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:128,307:0.72:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:259,182:0.48:-0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:117,281:0.72:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:412,106:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:454,115:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:315,238:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:111,272:0.73:-0.91:0.999:0.997 0/0/1/1:4:258,180:0.47:-0.43:1.000:0.994 0/0/0/0:4:593,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,187:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:132,358:0.74: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:320,216:0.47: 0.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:325,79:0.24:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,174:0.52:-0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:237,173:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:398,88:0.23: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:128,276:0.70:-0.73:1.000:0.988 0/1/1/1:4:138,297:0.70:-0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:301,226:0.49: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,152:0.51:-1.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:134,287:0.70:-0.58:1.000:0.987 0/0/1/1:4:309,185:0.44: 0.07:1.000:0.959 0/0/1/1:4:188,140:0.49:-1.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:228,145:0.45:-1.00:1.000:0.981 0/1/1/1:4:139,341:0.73:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:615,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:128,286:0.71:-0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:299,248:0.52: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:328,49:0.16:-0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:120,292:0.72:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:340,80:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:371,104:0.27:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:350,79:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:138,285:0.70:-0.56:1.000:0.981 0/0/1/1:4:379,292:0.50: 1.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:282,223:0.51: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:198,140:0.48:-1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:380,291:0.50: 1.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:274,169:0.44:-0.38:0.999:0.972 0/0/1/1:4:290,223:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,134:0.45:-1.26:1.000:0.983 0/0/0/1:4:520,126:0.24: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,173:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:379,80:0.22:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:266,165:0.44:-0.49:1.000:0.974 0/0/1/1:4:242,205:0.52:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:235,230:0.55:-0.19:1.000:0.981 0/0/1/1:4:238,188:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:294,212:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:294,226:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:237,200:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:301,220:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:147,302:0.69:-0.33:1.000:0.979 0/0/0/1:4:387,87:0.23:-0.11:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:99,208:0.70:-1.58:1.000:0.984 0/0/0/1:4:340,87:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:227,193:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:252,50:0.21:-1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:315,226:0.48: 0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:273,221:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:598,141:0.24: 2.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:173,323:0.68: 0.08:1.000:0.945 0/0/1/1:4:243,187:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,226:0.68:-1.22:1.000:0.941 0/0/1/1:4:212,163:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,323:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,185:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:291,206:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,147:0.49:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:390,292:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:353,300:0.52: 1.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:135,295:0.71:-0.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:440,118:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:162,377:0.72: 0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:386,102:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:168,362:0.70: 0.38:1.000:0.987 0/0/1/1:4:280,188:0.46:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:139,101:0.49:-2.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:255,210:0.51:-0.19:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,537:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:308,226:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:175,430:0.73: 1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:695,1:0.00: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,172:0.49:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:313,265:0.52: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:249,185:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,174:0.48:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:291,194:0.46:-0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:284,233:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:286,220:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:468,119:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:253,156:0.44:-0.68:1.000:0.972 0/0/0/1:4:429,97:0.23: 0.35:0.999:1.000 0/0/1/1:4:245,218:0.53:-0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:249,186:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:248,193:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,162:0.48:-0.88:1.000:0.996 0/0/0/0:4:631,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:359,97:0.26:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:390,97:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,234:0.70:-1.24:1.000:0.983 0/1/1/1:4:200,375:0.68: 0.78:1.000:0.948 0/0/0/1:4:479,123:0.25: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:332,221:0.46: 0.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:288,177:0.44:-0.19:1.000:0.971 0/1/1/1:4:179,395:0.71: 0.77:1.000:0.990 0/0/0/1:4:557,148:0.26: 1.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:217,405:0.68: 1.19:1.000:0.945 0/0/0/1:4:364,102:0.27:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:325,250:0.50: 0.78:1.000:0.997 -chr4.1 11492334 chr4.1_011492334 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:104,7:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,6:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,14:0.26: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,7:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:211,3:0.07: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:221,5:0.11: 1.16:1.000:0.594 0/0/0/1:4:117,4:0.16:-0.25:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,4:0.11: 0.61:1.000:0.668 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:218,1:0.02: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,11:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:92,15:0.27:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,10:0.26:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,12:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:197,14:0.25: 0.96:0.999:0.999 0/0/0/1:4:155,10:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,12:0.26:-0.31:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,5:0.11: 1.01:1.000:0.580 0/0/0/1:4:73,10:0.27:-0.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,7:0.26:-1.01:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,4:0.21:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,7:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,5:0.21:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:255,4:0.08: 1.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,16:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:261,4:0.07: 1.68:1.000:0.996 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:147,6:0.19: 0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,6:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,13:0.25: 1.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,2:0.04: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,10:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,13:0.27:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:178,8:0.21: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,6:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:186,13:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,6:0.16: 0.63:1.000:0.993 0/0/0/0:4:286,1:0.02: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,9:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,6:0.19: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,7:0.20: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,18:0.28:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,5:0.26:-1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,6:0.15: 0.67:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,10:0.21: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:279,5:0.09: 1.94:1.000:0.972 0/0/0/0:4:369,4:0.05: 3.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,6:0.14: 0.86:1.000:0.976 0/0/0/0/1/1:6:77,11:0.27:-0.70:1.000:0.678 0/0/0/1:4:89,10:0.26:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:166,9:0.25: 0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,13:0.25: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,6:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:231,18:0.26: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,12:0.28:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,19:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,10:0.26:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,7:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,15:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:221,7:0.15: 1.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:128,16:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:89,7:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:262,3:0.06: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,8:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,9:0.20: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,20:0.29:-0.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,15:0.28:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,13:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/0:4:248,2:0.04: 1.48:0.999:1.000 0/0/0/1:4:180,9:0.23: 0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,5:0.15: 0.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:188,6:0.15: 0.73:1.000:0.988 0/0/0/1:4:198,10:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,9:0.27:-0.91:1.000:0.998 0/0/0/1:4:151,9:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,14:0.27:-0.46:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:221,1:0.02: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,7:0.13: 1.56:1.000:0.933 0/0/0/1:4:91,10:0.26:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,4:0.25:-1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:195,9:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,9:0.18: 1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,8:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,7:0.19: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,7:0.21: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,7:0.26:-0.95:1.000:0.998 0/0/0/1:4:188,5:0.13: 0.71:1.000:0.865 0/0/0/1:4:60,9:0.27:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,9:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,8:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:93,8:0.26:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,7:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:270,2:0.04: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,5:0.13: 0.71:1.000:0.865 0/0/0/0:4:187,4:0.10: 0.69:1.000:0.759 0/0/0/1:4:156,6:0.18: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,6:0.12: 1.48:1.000:0.683 0/0/0/1:4:176,8:0.21: 0.59:0.999:1.000 0/0/0/1:4:183,9:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,3:0.16:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:106,14:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:89,7:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,7:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,10:0.26:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,7:0.26:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,6:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:152,2:0.06: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,13:0.27:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:176,3:0.08: 0.53:1.000:0.985 0/0/0/0:4:171,2:0.06: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,8:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,8:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,11:0.26:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:128,3:0.11:-0.12:1.000:0.526 0/0/0/1:4:139,5:0.17: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:82,14:0.27:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,6:0.25:-0.42:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,5:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,10:0.26:-0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:113,6:0.25:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:272,6:0.10: 1.86:1.000:0.674 0/0/0/1:4:161,6:0.17: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,7:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,9:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:289,1:0.02: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,6:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,9:0.27:-0.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,12:0.28:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,8:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,8:0.16: 1.39:1.000:0.995 0/0/0/0:4:193,1:0.03: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,8:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:168,3:0.09: 0.42:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,5:0.12: 0.91:1.000:0.688 0/0/0/1:4:147,6:0.19: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,5:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,6:0.26:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:338,11:0.15: 2.81:1.000:0.991 0/0/0/1:4:79,12:0.27:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/0:4:194,4:0.10: 0.78:1.000:0.838 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,4:0.14: 0.04:1.000:0.951 0/0/0/1:4:105,8:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,12:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:163,11:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,9:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,4:0.11: 0.54:1.000:0.579 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,6:0.26:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,6:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,4:0.22:-0.68:0.999:1.000 0/0/0/1:4:187,5:0.13: 0.70:1.000:0.873 0/0/0/1:4:130,8:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,5:0.26:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,4:0.14:-0.01:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,3:0.18:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,3:0.17:-0.70:1.000:0.997 0/0/0/0:4:225,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:314,3:0.05: 2.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,10:0.26:-0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,6:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:176,9:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,10:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:235,4:0.08: 1.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:79,11:0.27:-0.67:1.000:0.998 0/0/0/0:4:155,1:0.03: 0.22:1.000:1.000 -chr4.1 11689233 chr4.1_011689233 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:118,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:209,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:247,0:.: 3.28:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.21:0.999:. ./.:4:182,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.88:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.86:1.000:. ./.:6:69,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:235,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:174,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:66,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:137,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.62:0.999:. ./.:4:104,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:205,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:223,0:.: 2.69:1.000:. -chr4.1 11770158 chr4.1_011770158 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:146,143:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,166:0.71:-0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:174,80:0.30: 0.32:1.000:0.983 0/0/1/1:4:102,133:0.55: 0.00:1.000:0.981 0/0/0/1:4:198,81:0.28: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,93:0.29: 1.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:182,68:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,192:0.78: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,87:0.32: 0.46:1.000:0.958 0/1/1/1:4:11,58:0.83:-2.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,44:0.45:-2.31:1.000:0.981 0/0/0/1:4:172,60:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,139:0.52: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,132:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,126:0.54:-0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:183,80:0.29: 0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:205,60:0.22: 0.50:0.999:1.000 0/0/0/1:4:192,73:0.26: 0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:180,179:0.48: 2.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,209:0.74: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,25:0.45:-2.98:1.000:0.984 0/1/1/1:4:50,211:0.79: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,153:0.54: 0.66:1.000:0.988 0/0/1/1:4:131,138:0.49: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,32:0.62:-3.03:1.000:0.513 0/1/1/1:4:79,214:0.72: 0.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,174:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,51:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,158:0.50: 1.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:273,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,84:0.27: 1.10:1.000:0.998 0/0/0/0:4:204,1:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-3.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,61:0.69:-2.42:1.000:0.968 0/1/1:3:9,22:0.70:-3.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,58:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,202:0.74: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,119:0.47: 0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:141,136:0.47: 0.69:1.000:0.993 0/1/1/1:4:76,206:0.72: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,60:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,155:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,54:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:140,126:0.46: 0.51:1.000:0.985 0/0/0/1:4:212,57:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,79:0.25: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:427,174:0.28: 6.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,53:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,71:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,112:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,67:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,38:0.21:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,57:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,109:0.44: 0.05:1.000:0.969 0/0/0/1:4:167,62:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,76:0.30: 0.17:1.000:0.987 0/0/0/1:4:168,63:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:91,67:0.41:-1.26:1.000:0.576 0/0/1/1:4:126,131:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,100:0.45:-0.36:1.000:0.982 0/0/1/1:4:146,140:0.47: 0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:167,49:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,153:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,117:0.39: 0.94:1.000:0.643 0/0/1/1:4:77,103:0.56:-0.90:1.000:0.974 0/0/1/1:4:100,124:0.54:-0.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:109,140:0.54: 0.23:1.000:0.984 0/1/1/1:4:42,152:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,46:0.17: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,64:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,211:0.74: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,119:0.47: 0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:152,42:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,60:0.29:-0.62:1.000:0.990 0/0/0/1:4:171,62:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,107:0.44:-0.03:1.000:0.971 0/0/1/1:4:122,103:0.44:-0.16:1.000:0.969 0/0/1/1:4:127,136:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,46:0.25:-0.96:0.999:0.999 0/0/1/1:4:106,130:0.53: 0.02:1.000:0.991 0/1/1/1:4:76,209:0.72: 0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,133:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,74:0.29: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,125:0.54:-0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:99,100:0.48:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,54:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,61:0.29:-0.52:1.000:0.992 0/1/1/1:4:67,196:0.73: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/0:4:188,1:0.01:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,71:0.33:-0.47:1.000:0.915 0/0/1/1:4:108,154:0.57: 0.45:1.000:0.944 0/0/1/1:4:85,111:0.55:-0.64:1.000:0.981 0/0/0/1:4:144,84:0.35:-0.11:1.000:0.749 0/0/1/1:4:101,142:0.57: 0.14:1.000:0.953 0/0/1/1:4:96,97:0.48:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,93:0.52:-1.01:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:67,178:0.71: 0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:163,38:0.18:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:186,60:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,69:0.45:-1.44:1.000:0.982 0/0/0/1:4:164,48:0.22:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,100:0.52:-0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,105:0.48:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,103:0.46:-0.29:1.000:0.986 0/0/0/1:4:183,64:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,77:0.23: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,119:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:121,54:0.30:-0.98:1.000:0.988 0/0/1/1:4:179,172:0.47: 1.91:1.000:0.993 0/0/0/1:4:162,51:0.23:-0.36:0.999:1.000 0/0/0/1:4:187,60:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,81:0.44:-0.91:1.000:0.960 0/0/1/1:4:126,119:0.47: 0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:126,116:0.46: 0.12:1.000:0.989 0/0/1/1:4:93,122:0.55:-0.32:1.000:0.980 0/0/1/1:4:113,132:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:149,55:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,117:0.47: 0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:104,124:0.53:-0.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:162,52:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,69:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,134:0.53: 0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:120,121:0.48: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,68:0.28:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,135:0.74:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,37:0.27:-1.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,42:0.27:-1.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,124:0.56:-0.32:1.000:0.968 0/0/1/1:4:125,122:0.48: 0.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,108:0.74:-1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,76:0.31: 0.04:1.000:0.976 0/0/0/1:4:136,54:0.27:-0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,172:0.52: 1.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:176,77:0.29: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:130,52:0.27:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,53:0.26:-0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,106:0.56:-0.82:1.000:0.973 0/0/0/1:4:163,52:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,146:0.61: 0.00:1.000:0.743 0/0/0/1:4:184,54:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,35:0.21:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,86:0.28: 0.92:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,181:0.52: 1.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:174,59:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,156:0.55: 0.69:1.000:0.984 0/0/0/1:4:239,79:0.24: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,103:0.47:-0.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:228,83:0.26: 1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,67:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,63:0.81:-2.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,66:0.26: 0.07:1.000:0.998 0/0/0/0:4:275,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,118:0.45: 0.32:1.000:0.978 0/0/0/1:4:234,80:0.24: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,212:0.77: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,110:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,150:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,50:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,114:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:175,53:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,75:0.28: 0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:184,66:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,151:0.55: 0.53:1.000:0.982 0/0/0/1:4:164,56:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,168:0.72:-0.09:0.999:0.995 0/0/0/1:4:189,47:0.19: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,122:0.49: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,42:0.19:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,87:0.49:-1.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,186:0.73: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,118:0.52:-0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,109:0.52:-0.55:1.000:0.994 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,91:0.27: 1.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:65,221:0.76: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,62:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,92:0.39:-0.11:1.000:0.675 0/0/0/1:4:189,67:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,176:0.52: 1.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:232,81:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,123:0.47: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:132,137:0.49: 0.56:1.000:0.996 -chr4.1 11848912 chr4.1_011848912 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,10:0.25: 2.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,23:0.62: 0.36:1.000:0.611 0/0/1/1:4:19,15:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,6:0.14: 2.49:1.000:0.954 0/0/0/1:4:22,6:0.29:-0.09:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,14:0.44: 0.90:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.24:-1.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,14:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,14:0.45: 0.82:1.000:0.980 0/0/1/1:4:22,25:0.56: 1.35:0.999:0.971 0/0/1/1:4:23,19:0.52: 0.97:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,39:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,23:0.51: 1.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,14:0.52: 0.21:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.70:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:18,15:0.53: 0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,33:0.60: 1.65:1.000:0.748 0/0/0/1:4:48,8:0.20: 2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,13:0.45: 0.59:1.000:0.982 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,9:0.38: 0.14:1.000:0.586 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,1:0.43:-1.98:1.000:0.949 0/1/1:3:1,1:0.54:-2.06:1.000:0.950 0/0/0/1:4:43,5:0.15: 1.43:1.000:0.984 0/0/1/1:4:21,15:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,12:0.43: 0.52:1.000:0.949 0/0/1/1:4:19,8:0.39:-0.17:1.000:0.671 0/0/1/1:4:21,14:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,6:0.39:-0.70:1.000:0.718 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,9:0.43:-0.17:1.000:0.949 0/0/0/1:4:41,5:0.15: 1.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:21,23:0.55: 1.12:1.000:0.976 0/0/1/1:4:24,11:0.41: 0.44:1.000:0.858 0/0/1/1:4:18,16:0.53: 0.36:1.000:0.991 0/1/1/1:4:1,3:0.65:-1.91:1.000:0.765 0/0/1/1:4:22,9:0.38: 0.14:1.000:0.586 0/0/0/1:4:13,2:0.19:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,14:0.53: 0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:20,18:0.53: 0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:11,8:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,8:0.33: 0.21:1.000:0.900 0/0/1/1:4:26,21:0.52: 1.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:24,5:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,2:0.06: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,11:0.43: 0.29:1.000:0.949 0/0/0/0/1/1:6:21,9:0.39: 0.06:1.000:0.702 0/0/0/1:4:28,9:0.33: 0.59:1.000:0.933 0/0/1/1:4:20,8:0.38:-0.09:1.000:0.515 0/0/1/1:4:17,13:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,7:0.32:-0.01:1.000:0.941 0/0/1/1:4:17,12:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,7:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,4:0.40:-1.23:1.000:0.802 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.49: 0.36:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,2:0.43:-1.76:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,11:0.42: 0.36:1.000:0.913 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.36:-0.54:1.000:0.678 0/0/0/1:4:30,5:0.20: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,9:0.28: 1.12:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.45:0.999:1.000 0/0/1/1:4:12,13:0.55:-0.32:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.32: 0.67:1.000:0.955 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.36:-0.01:1.000:0.634 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,11:0.51:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,10:0.53:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,13:0.45: 0.59:1.000:0.982 0/0/0/1:4:12,4:0.33:-1.00:1.000:0.900 0/0/1/1:4:15,9:0.48:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,15:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,7:0.40:-0.47:1.000:0.768 0/0/1/1:4:28,13:0.41: 0.90:1.000:0.877 0/0/0/1:4:18,6:0.33:-0.39:1.000:0.900 0/0/1/1:4:12,9:0.51:-0.62:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,7:0.38:-0.39:1.000:0.605 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.35:-1.07:1.000:0.756 0/0/1/1:4:22,13:0.48: 0.44:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,4:0.12: 1.50:1.000:0.646 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.32: 0.06:1.000:0.964 0/0/1/1:4:25,13:0.44: 0.67:1.000:0.969 0/0/1/1:4:21,13:0.49: 0.36:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,25:0.55: 1.50:1.000:0.981 0/0/1/1:4:26,11:0.39: 0.59:0.999:0.684 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,5:0.43:-1.07:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.49:-0.62:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,6:0.21: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,10:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,13:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,8:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,12:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,25:0.53: 1.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,7:0.40:-0.47:1.000:0.768 0/0/0/1:4:22,6:0.29:-0.09:1.000:0.990 0/0/0/1:4:32,3:0.12: 0.44:1.000:0.784 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,1:0.11:-1.23:1.000:0.559 0/0/0/0:4:30,2:0.09: 0.21:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,13:0.48: 0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,9:0.46:-0.32:1.000:0.989 0/0/1/1:4:15,7:0.41:-0.54:1.000:0.884 0/0/1/1:4:19,15:0.52: 0.36:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.12:-0.47:1.000:0.817 0/0/0/1:4:31,7:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,4:0.13: 0.97:1.000:0.943 0/0/0/1:4:21,5:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:15,4:0.29:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:17,11:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,24:0.56: 1.12:1.000:0.962 0/0/1/1:4:12,6:0.43:-0.85:1.000:0.949 0/0/1/1:4:29,13:0.40: 0.97:1.000:0.819 0/0/1/1:4:18,12:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,8:0.27: 0.90:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,8:0.19: 2.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,14:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,11:0.31: 1.43:1.000:0.973 0/0/1/1:4:24,21:0.53: 1.20:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,16:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,6:0.32:-0.32:1.000:0.945 0/0/0/1:4:53,14:0.29: 2.86:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,17:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,19:0.53: 0.90:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,14:0.54:-0.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:22,8:0.35: 0.06:1.000:0.756 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,11:0.44: 0.21:1.000:0.972 0/0/1/1:4:22,23:0.55: 1.20:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.53:-0.39:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:0.999:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.33:-0.09:1.000:0.900 0/0/1/1:4:27,14:0.44: 0.90:1.000:0.968 0/0/1/1:4:18,16:0.53: 0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:17,11:0.50:-0.09:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.36: 0.29:1.000:0.678 0/0/1/1:4:26,14:0.45: 0.82:1.000:0.980 0/0/1/1:4:18,14:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,15:0.43: 1.20:1.000:0.949 0/0/1/1:4:12,23:0.61: 0.44:1.000:0.705 0/0/0/1:4:46,9:0.23: 1.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,10:0.25: 2.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.30:1.000:1.000 -chr4.1 12448863 chr4.1_012448863 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:55,160:.: 1.00:1.000:. ./.:4:27,126:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.13:1.000:. ./.:4:48,167:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,236:.: 1.47:1.000:. ./.:4:52,198:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.76:1.000:. ./.:4:87,92:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.76:1.000:. ./.:4:29,31:.:-2.45:1.000:. ./.:4:26,73:.:-1.58:1.000:. ./.:4:35,153:.: 0.40:1.000:. ./.:4:40,151:.: 0.47:1.000:. ./.:4:48,164:.: 0.93:1.000:. ./.:4:59,116:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,155:.: 0.87:0.999:. ./.:4:46,161:.: 0.82:1.000:. ./.:4:61,210:.: 2.25:1.000:. ./.:4:179,69:.: 1.74:1.000:. ./.:4:27,65:.:-1.74:1.000:. ./.:4:85,98:.: 0.29:1.000:. ./.:4:56,188:.: 1.65:1.000:. ./.:4:40,147:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,60:.:-2.45:1.000:. ./.:4:96,81:.: 0.16:1.000:. ./.:4:86,108:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,128:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,70:.:-2.22:1.000:. ./.:4:22,57:.:-2.02:1.000:. ./.:3:11,32:.:-2.83:1.000:. ./.:4:43,175:.: 1.07:1.000:. ./.:4:96,110:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,108:.: 0.62:1.000:. ./.:4:89,94:.: 0.29:1.000:. ./.:4:116,121:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,111:.:-0.60:1.000:. ./.:4:79,88:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.67:1.000:. ./.:4:37,136:.: 0.07:1.000:. ./.:4:37,101:.:-0.71:1.000:. ./.:4:57,191:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,219:.: 1.09:1.000:. ./.:4:50,110:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,99:.:-0.78:1.000:. ./.:4:73,70:.:-0.60:1.000:. ./.:4:46,154:.: 0.67:1.000:. ./.:4:34,109:.:-0.60:1.000:. ./.:4:44,139:.: 0.29:1.000:. ./.:4:49,163:.: 0.93:1.000:. ./.:4:37,115:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.11:1.000:. ./.:4:39,108:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.27:1.000:. ./.:6:59,58:.:-1.18:1.000:. ./.:4:71,81:.:-0.40:1.000:. ./.:4:71,78:.:-0.47:1.000:. ./.:4:32,133:.:-0.11:1.000:. ./.:4:38,117:.:-0.33:1.000:. ./.:4:45,122:.:-0.07:1.000:. ./.:4:80,117:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,94:.:-0.93:1.000:. ./.:4:75,61:.:-0.76:1.000:. ./.:4:46,105:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,92:.: 0.07:1.000:. ./.:4:54,135:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,102:.:-1.51:1.000:. ./.:4:73,111:.: 0.31:1.000:. ./.:4:44,147:.: 0.47:1.000:. ./.:4:32,124:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.82:1.000:. ./.:4:64,64:.:-0.93:1.000:. ./.:4:52,124:.: 0.13:1.000:. ./.:4:51,115:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,115:.:-1.22:0.999:. ./.:4:46,115:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,65:.:-0.47:1.000:. ./.:4:44,133:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.47:1.000:. ./.:4:43,154:.: 0.60:1.000:. ./.:4:37,83:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.60:1.000:. ./.:4:86,73:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,111:.:-0.49:1.000:. ./.:4:42,139:.: 0.24:1.000:. ./.:4:63,90:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,109:.:-0.24:1.000:. ./.:4:73,56:.:-0.91:1.000:. ./.:4:31,98:.:-0.91:1.000:. ./.:4:33,120:.:-0.38:1.000:. ./.:4:111,104:.: 1.00:1.000:. ./.:4:27,104:.:-0.87:1.000:. ./.:4:37,107:.:-0.58:1.000:. ./.:4:51,51:.:-1.51:1.000:. ./.:4:36,102:.:-0.71:1.000:. ./.:4:37,106:.:-0.60:1.000:. ./.:4:36,129:.:-0.11:1.000:. ./.:4:32,98:.:-0.89:1.000:. ./.:4:43,151:.: 0.53:1.000:. ./.:4:62,185:.: 1.71:1.000:. ./.:4:48,149:.: 0.60:1.000:. ./.:4:46,109:.:-0.33:1.000:. ./.:4:121,129:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.18:0.999:. ./.:4:41,120:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,69:.:-1.58:1.000:. ./.:4:93,92:.: 0.33:1.000:. ./.:4:77,69:.:-0.53:1.000:. ./.:4:26,93:.:-1.13:1.000:. ./.:4:41,120:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.87:1.000:. ./.:4:29,124:.:-0.38:1.000:. ./.:4:41,97:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,121:.:-0.36:1.000:. ./.:4:42,174:.: 1.02:1.000:. ./.:4:39,114:.:-0.38:1.000:. ./.:4:68,79:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,55:.:-1.36:1.000:. ./.:4:18,86:.:-1.47:1.000:. ./.:4:31,94:.:-1.00:1.000:. ./.:4:81,66:.:-0.51:1.000:. ./.:4:76,199:.: 2.34:1.000:. ./.:4:51,44:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.60:1.000:. ./.:4:35,114:.:-0.47:1.000:. ./.:4:54,192:.: 1.69:1.000:. ./.:4:38,113:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,94:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.98:1.000:. ./.:4:44,92:.:-0.76:1.000:. ./.:4:31,95:.:-0.98:1.000:. ./.:4:32,88:.:-1.11:1.000:. ./.:4:53,136:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,83:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,273:.: 2.29:1.000:. ./.:4:115,120:.: 1.45:1.000:. ./.:4:64,173:.: 1.49:1.000:. ./.:4:33,132:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,232:.: 1.40:1.000:. ./.:4:34,122:.:-0.31:1.000:. ./.:4:59,169:.: 1.29:1.000:. ./.:4:57,180:.: 1.49:1.000:. ./.:4:21,53:.:-2.14:1.000:. ./.:4:27,103:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.76:1.000:. ./.:4:102,111:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,260:.: 2.00:1.000:. ./.:4:104,111:.: 1.00:1.000:. ./.:4:84,93:.: 0.16:1.000:. ./.:4:107,98:.: 0.78:1.000:. ./.:4:48,171:.: 1.09:1.000:. ./.:4:64,73:.:-0.73:1.000:. ./.:4:49,137:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.58:1.000:. ./.:4:49,154:.: 0.73:1.000:. ./.:4:46,143:.: 0.42:1.000:. ./.:4:51,144:.: 0.56:0.999:. ./.:4:49,138:.: 0.38:1.000:. ./.:4:100,90:.: 0.45:1.000:. ./.:4:40,146:.: 0.36:1.000:. ./.:4:43,101:.:-0.58:1.000:. ./.:4:79,76:.:-0.33:1.000:. ./.:4:71,98:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,70:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.24:1.000:. ./.:4:45,193:.: 1.51:1.000:. ./.:4:104,106:.: 0.89:1.000:. ./.:4:56,144:.: 0.67:1.000:. ./.:4:10,196:.: 0.80:1.000:. ./.:4:72,164:.: 1.47:1.000:. ./.:4:126,130:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,271:.: 2.25:1.000:. ./.:4:38,138:.: 0.13:1.000:. ./.:4:44,158:.: 0.71:1.000:. -chr4.1 13065649 chr4.1_013065649 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:182,198:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,352:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,292:.: 0.32:1.000:. ./.:4:84,331:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1,423:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,277:.:-1.12:1.000:. ./.:4:171,185:.:-0.13:1.000:. ./.:4:64,252:.:-0.63:1.000:. ./.:4:46,135:.:-2.32:1.000:. ./.:4:0,239:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.78:1.000:. ./.:4:160,173:.:-0.41:1.000:. ./.:4:167,178:.:-0.26:1.000:. ./.:4:75,256:.:-0.44:1.000:. ./.:4:48,304:.:-0.18:1.000:. ./.:4:67,335:.: 0.45:0.999:. ./.:4:0,369:.: 0.04:1.000:. ./.:4:241,299:.: 2.18:1.000:. ./.:4:175,279:.: 1.10:1.000:. ./.:4:72,108:.:-2.33:1.000:. ./.:4:83,310:.: 0.34:1.000:. ./.:4:116,345:.: 1.19:1.000:. ./.:4:143,176:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,96:.:-3.13:1.000:. ./.:4:112,359:.: 1.31:1.000:. ./.:4:93,262:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,351:.:-0.19:1.000:. ./.:4:112,317:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,385:.: 0.24:1.000:. ./.:4:55,291:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,298:.:-0.85:1.000:. ./.:4:5,66:.:-3.70:1.000:. ./.:4:86,180:.:-1.25:1.000:. ./.:3:12,55:.:-3.75:1.000:. ./.:4:0,366:.: 0.00:1.000:. ./.:4:91,293:.: 0.22:1.000:. ./.:4:116,333:.: 1.04:1.000:. ./.:4:123,349:.: 1.33:1.000:. ./.:4:101,340:.: 0.94:1.000:. ./.:4:75,286:.:-0.06:1.000:. ./.:4:199,227:.: 0.75:1.000:. ./.:4:116,330:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.29:1.000:. ./.:4:96,321:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,296:.: 0.22:1.000:. ./.:4:73,315:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,81:.:-3.43:1.000:. ./.:4:83,251:.:-0.40:1.000:. ./.:4:68,318:.: 0.25:1.000:. ./.:4:77,264:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,368:.: 0.88:1.000:. ./.:4:75,262:.:-0.36:1.000:. ./.:4:78,284:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,299:.: 0.19:1.000:. ./.:4:76,294:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,465:.: 1.24:1.000:. ./.:4:91,340:.: 0.81:1.000:. ./.:6:76,251:.:-0.49:1.000:. ./.:4:97,299:.: 0.38:1.000:. ./.:4:91,258:.:-0.21:1.000:. ./.:4:92,385:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,429:.: 0.79:1.000:. ./.:4:109,327:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,568:.: 2.53:1.000:. ./.:4:76,244:.:-0.58:1.000:. ./.:4:179,174:.:-0.16:1.000:. ./.:4:98,315:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,325:.:-0.50:1.000:. ./.:4:84,364:.: 1.03:1.000:. ./.:4:89,268:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,441:.: 0.94:1.000:. ./.:4:107,316:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.30:1.000:. ./.:4:83,242:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,386:.: 0.25:1.000:. ./.:4:185,237:.: 0.70:1.000:. ./.:4:199,242:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,459:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,283:.:-1.04:0.999:. ./.:4:125,360:.: 1.49:1.000:. ./.:4:200,247:.: 1.01:1.000:. ./.:4:89,245:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,416:.: 0.63:1.000:. ./.:4:109,345:.: 1.10:1.000:. ./.:4:151,142:.:-0.92:1.000:. ./.:4:49,259:.:-0.73:1.000:. ./.:4:60,293:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,251:.:-0.49:1.000:. ./.:4:54,234:.:-0.98:1.000:. ./.:4:96,293:.: 0.29:1.000:. ./.:4:119,346:.: 1.24:1.000:. ./.:4:68,201:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,434:.: 0.85:1.000:. ./.:4:123,319:.: 0.95:1.000:. ./.:4:101,260:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,395:.: 0.36:1.000:. ./.:4:107,331:.: 0.90:1.000:. ./.:4:194,237:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,352:.:-0.18:1.000:. ./.:4:89,333:.: 0.70:1.000:. ./.:4:125,141:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,382:.: 0.20:1.000:. ./.:4:137,175:.:-0.68:1.000:. ./.:4:179,216:.: 0.36:1.000:. ./.:4:154,176:.:-0.45:1.000:. ./.:4:95,297:.: 0.32:1.000:. ./.:4:79,348:.: 0.76:1.000:. ./.:4:90,306:.: 0.38:1.000:. ./.:4:161,177:.:-0.35:1.000:. ./.:4:113,356:.: 1.29:1.000:. ./.:4:72,346:.: 0.65:0.999:. ./.:4:200,203:.: 0.46:1.000:. ./.:4:80,250:.:-0.45:1.000:. ./.:4:198,222:.: 0.68:1.000:. ./.:4:97,276:.: 0.09:1.000:. ./.:4:198,187:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,422:.: 0.70:1.000:. ./.:4:74,292:.: 0.00:1.000:. ./.:4:104,331:.: 0.86:1.000:. ./.:4:85,225:.:-0.70:1.000:. ./.:4:89,332:.: 0.69:1.000:. ./.:4:67,260:.:-0.49:1.000:. ./.:4:87,296:.: 0.21:1.000:. ./.:4:145,327:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,336:.:-0.36:1.000:. ./.:4:76,247:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,314:.:-0.65:1.000:. ./.:4:168,187:.:-0.14:1.000:. ./.:4:83,297:.: 0.17:1.000:. ./.:4:63,195:.:-1.35:1.000:. ./.:4:72,302:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,228:.:-0.97:1.000:. ./.:4:226,286:.: 1.83:1.000:. ./.:4:109,321:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,309:.:-0.70:1.000:. ./.:4:90,301:.: 0.31:1.000:. ./.:4:110,308:.: 0.65:1.000:. ./.:4:108,304:.: 0.58:1.000:. ./.:4:59,262:.:-0.56:1.000:. ./.:4:51,212:.:-1.29:1.000:. ./.:4:103,396:.: 1.67:1.000:. ./.:4:124,353:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,394:.: 0.35:1.000:. ./.:4:140,182:.:-0.55:1.000:. ./.:4:2,494:.: 1.63:1.000:. ./.:4:62,280:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1,433:.: 0.85:1.000:. ./.:4:65,271:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,132:.:-2.58:1.000:. ./.:4:56,179:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,408:.: 0.53:1.000:. ./.:4:101,302:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,465:.: 1.24:1.000:. ./.:4:199,238:.: 0.89:1.000:. ./.:4:74,234:.:-0.73:1.000:. ./.:4:90,304:.: 0.35:1.000:. ./.:4:65,234:.:-0.84:1.000:. ./.:4:79,243:.:-0.55:1.000:. ./.:4:165,187:.:-0.18:1.000:. ./.:4:67,262:.:-0.46:1.000:. ./.:4:51,242:.:-0.92:1.000:. ./.:4:155,176:.:-0.44:1.000:. ./.:4:61,248:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,410:.: 0.56:0.999:. ./.:4:68,283:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,276:.:-0.05:1.000:. ./.:4:52,215:.:-1.24:1.000:. ./.:4:47,139:.:-2.26:1.000:. ./.:4:133,165:.:-0.85:1.000:. ./.:4:155,177:.:-0.43:1.000:. ./.:4:140,155:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,205:.:-1.38:1.000:. ./.:4:97,302:.: 0.41:1.000:. ./.:4:118,297:.: 0.61:1.000:. ./.:4:59,261:.:-0.58:1.000:. ./.:4:44,251:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.27:1.000:. ./.:4:190,230:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,471:.: 1.31:1.000:. ./.:4:120,170:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.19:1.000:. -chr4.1 13278753 chr4.1_013278753 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:415,126:.: 0.19:1.000:. ./.:4:254,212:.:-0.65:1.000:. ./.:4:394,113:.:-0.19:1.000:. ./.:4:390,123:.:-0.12:1.000:. ./.:4:490,143:.: 1.23:1.000:. ./.:4:672,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:342,107:.:-0.85:1.000:. ./.:4:393,124:.:-0.08:1.000:. ./.:4:438,125:.: 0.44:1.000:. ./.:4:256,131:.:-1.55:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:514,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:427,128:.: 0.35:1.000:. ./.:4:471,141:.: 1.00:1.000:. ./.:4:404,120:.: 0.00:1.000:. ./.:4:428,118:.: 0.25:1.000:. ./.:4:657,0:.: 1.51:0.999:. ./.:4:276,293:.: 0.51:1.000:. ./.:4:536,194:.: 2.33:1.000:. ./.:4:638,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:388,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:357,112:.:-0.62:1.000:. ./.:4:412,129:.: 0.19:1.000:. ./.:4:400,129:.: 0.06:1.000:. ./.:4:301,89:.:-1.51:1.000:. ./.:4:541,164:.: 2.05:1.000:. ./.:4:392,125:.:-0.08:1.000:. ./.:4:383,120:.:-0.24:1.000:. ./.:4:621,2:.: 1.12:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:537,152:.: 1.87:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:443,3:.:-0.88:1.000:. ./.:4:316,96:.:-1.26:1.000:. ./.:3:268,56:.:-2.26:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:410,133:.: 0.22:1.000:. ./.:4:500,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:708,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:478,152:.: 1.20:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:575,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:605,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:422,103:.: 0.01:1.000:. ./.:4:461,132:.: 0.78:1.000:. ./.:4:575,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:533,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:489,148:.: 1.28:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:690,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:607,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:433,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:330,112:.:-0.93:1.000:. ./.:4:622,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:710,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:379,118:.:-0.30:1.000:. ./.:6:444,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:516,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:513,153:.: 1.61:1.000:. ./.:4:627,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:426,134:.: 0.41:1.000:. ./.:4:682,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:397,123:.:-0.04:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:490,128:.: 1.07:1.000:. ./.:4:365,125:.:-0.38:1.000:. ./.:4:641,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:448,122:.: 0.52:1.000:. ./.:4:593,179:.: 2.81:1.000:. ./.:4:370,105:.:-0.55:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:400,115:.:-0.10:1.000:. ./.:4:420,144:.: 0.45:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:365,120:.:-0.44:1.000:. ./.:4:475,123:.: 0.84:1.000:. ./.:4:292,99:.:-1.50:0.999:. ./.:4:423,129:.: 0.32:1.000:. ./.:4:404,143:.: 0.26:1.000:. ./.:4:319,94:.:-1.25:1.000:. ./.:4:501,183:.: 1.81:1.000:. ./.:4:431,141:.: 0.54:1.000:. ./.:4:265,111:.:-1.67:1.000:. ./.:4:289,103:.:-1.49:1.000:. ./.:4:340,117:.:-0.76:1.000:. ./.:4:411,122:.: 0.10:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:377,125:.:-0.25:1.000:. ./.:4:394,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:380,154:.: 0.12:1.000:. ./.:4:452,140:.: 0.77:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:383,126:.:-0.17:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:406,112:.:-0.07:1.000:. ./.:4:510,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:617,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:384,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:500,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:362,115:.:-0.53:1.000:. ./.:4:369,135:.:-0.22:1.000:. ./.:4:366,114:.:-0.50:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:627,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:338,124:.:-0.70:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:753,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:389,130:.:-0.05:0.999:. ./.:4:514,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:309,90:.:-1.41:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:498,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:341,137:.:-0.52:1.000:. ./.:4:374,108:.:-0.47:1.000:. ./.:4:341,105:.:-0.88:1.000:. ./.:4:388,129:.:-0.08:1.000:. ./.:4:367,103:.:-0.61:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:384,122:.:-0.20:1.000:. ./.:4:571,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:380,132:.:-0.13:1.000:. ./.:4:358,137:.:-0.33:1.000:. ./.:4:372,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:427,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:382,125:.:-0.19:1.000:. ./.:4:272,94:.:-1.79:1.000:. ./.:4:487,121:.: 0.95:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:540,171:.: 2.12:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:274,94:.:-1.76:1.000:. ./.:4:332,120:.:-0.81:1.000:. ./.:4:504,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:348,108:.:-0.77:1.000:. ./.:4:522,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:412,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:440,145:.: 0.69:1.000:. ./.:4:723,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:514,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:400,111:.:-0.15:1.000:. ./.:4:416,121:.: 0.15:1.000:. ./.:4:300,98:.:-1.42:1.000:. ./.:4:643,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:265,42:.:-2.45:1.000:. ./.:4:300,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:482,139:.: 1.10:1.000:. ./.:4:413,142:.: 0.35:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:427,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:360,124:.:-0.45:1.000:. ./.:4:406,106:.:-0.13:1.000:. ./.:4:360,124:.:-0.45:1.000:. ./.:4:518,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:281,262:.: 0.22:0.999:. ./.:4:508,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:393,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:303,107:.:-1.29:1.000:. ./.:4:383,102:.:-0.44:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:510,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:434,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:655,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:500,172:.: 1.68:1.000:. ./.:4:555,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:355,135:.:-0.38:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:653,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:455,161:.: 1.04:1.000:. ./.:4:359,105:.:-0.68:1.000:. ./.:4:342,125:.:-0.64:1.000:. -chr4.1 13361689 chr4.1_013361689 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:82,35:.: 0.49:1.000:. ./.:4:29,84:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,23:.:-0.65:1.000:. ./.:4:83,22:.: 0.09:1.000:. ./.:4:104,42:.: 1.47:1.000:. ./.:4:126,42:.: 2.22:1.000:. ./.:4:30,13:.:-2.00:1.000:. ./.:4:66,73:.: 1.24:1.000:. ./.:4:80,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:15,11:.:-2.58:1.000:. ./.:4:21,8:.:-2.48:1.000:. ./.:4:82,21:.: 0.02:1.000:. ./.:4:72,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:80,29:.: 0.22:1.000:. ./.:4:73,31:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,37:.: 1.20:1.000:. ./.:4:86,29:.: 0.43:0.999:. ./.:4:74,71:.: 1.44:1.000:. ./.:4:93,47:.: 1.27:1.000:. ./.:4:60,71:.: 0.97:1.000:. ./.:4:21,1:.:-2.71:1.000:. ./.:4:39,59:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,32:.: 0.22:1.000:. ./.:4:60,31:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,5:.:-3.22:1.000:. ./.:4:57,69:.: 0.80:1.000:. ./.:4:56,62:.: 0.53:1.000:. ./.:4:100,27:.: 0.83:1.000:. ./.:4:90,30:.: 0.59:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,31:.:-0.28:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:19,9:.:-2.51:1.000:. ./.:3:5,14:.:-2.82:1.000:. ./.:4:81,37:.: 0.53:1.000:. ./.:4:56,60:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.22:1.000:. ./.:4:67,32:.:-0.11:1.000:. ./.:4:56,75:.: 0.97:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:96,30:.: 0.80:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:50,43:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.25:1.000:. ./.:4:132,43:.: 2.45:1.000:. ./.:4:37,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:54,31:.:-0.59:1.000:. ./.:4:98,34:.: 1.00:1.000:. ./.:4:73,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:102,31:.: 1.03:1.000:. ./.:4:54,58:.: 0.32:1.000:. ./.:4:76,33:.: 0.22:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:78,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:82,24:.: 0.12:1.000:. ./.:6:72,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:72,20:.:-0.35:1.000:. ./.:4:102,20:.: 0.66:1.000:. ./.:4:60,53:.: 0.36:1.000:. ./.:4:61,20:.:-0.72:1.000:. ./.:4:68,29:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,57:.: 0.83:1.000:. ./.:4:29,13:.:-2.04:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.25:1.000:. ./.:4:61,25:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,82:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,30:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,15:.:-1.57:1.000:. ./.:4:35,82:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,41:.: 1.03:1.000:. ./.:4:71,35:.: 0.12:1.000:. ./.:4:72,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:74,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:71,30:.:-0.05:1.000:. ./.:4:93,36:.: 0.90:1.000:. ./.:4:58,76:.: 1.07:1.000:. ./.:4:46,24:.:-1.09:0.999:. ./.:4:91,43:.: 1.07:1.000:. ./.:4:62,78:.: 1.27:1.000:. ./.:4:79,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:69,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:71,42:.: 0.36:1.000:. ./.:4:56,22:.:-0.82:1.000:. ./.:4:65,35:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,28:.:-0.49:1.000:. ./.:4:56,68:.: 0.73:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:63,24:.:-0.52:1.000:. ./.:4:101,53:.: 1.74:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.35:1.000:. ./.:4:79,39:.: 0.53:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.73:1.000:. ./.:4:70,18:.:-0.49:1.000:. ./.:4:47,54:.:-0.05:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:57,77:.: 1.07:1.000:. ./.:4:20,9:.:-2.48:1.000:. ./.:4:78,30:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,17:.:-1.40:1.000:. ./.:4:61,34:.:-0.25:1.000:. ./.:4:43,17:.:-1.43:1.000:. ./.:4:88,36:.: 0.73:1.000:. ./.:4:91,32:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:102,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:121,34:.: 1.78:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:109,44:.: 1.71:1.000:. ./.:4:69,24:.:-0.32:0.999:. ./.:4:120,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:42,13:.:-1.60:1.000:. ./.:4:83,31:.: 0.39:1.000:. ./.:4:72,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:67,24:.:-0.38:1.000:. ./.:4:52,65:.: 0.49:1.000:. ./.:4:62,38:.:-0.08:1.000:. ./.:4:82,36:.: 0.53:1.000:. ./.:4:53,27:.:-0.76:1.000:. ./.:4:65,18:.:-0.65:1.000:. ./.:4:68,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.22:1.000:. ./.:4:69,27:.:-0.22:1.000:. ./.:4:65,31:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,50:.:-1.30:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:81,26:.: 0.16:1.000:. ./.:4:57,22:.:-0.79:1.000:. ./.:4:77,30:.: 0.16:1.000:. ./.:4:39,42:.:-0.72:1.000:. ./.:4:72,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,23:.: 0.12:1.000:. ./.:4:97,25:.: 0.66:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,25:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,26:.:-0.52:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:53,20:.:-0.99:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,30:.:-0.42:1.000:. ./.:4:119,46:.: 2.11:1.000:. ./.:4:102,37:.: 1.24:1.000:. ./.:4:69,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,33:.: 0.97:1.000:. ./.:4:110,42:.: 1.67:1.000:. ./.:4:53,67:.: 0.59:1.000:. ./.:4:93,34:.: 0.83:1.000:. ./.:4:92,30:.: 0.66:1.000:. ./.:4:15,5:.:-2.78:1.000:. ./.:4:36,8:.:-1.97:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:97,40:.: 1.17:1.000:. ./.:4:92,32:.: 0.73:1.000:. ./.:4:54,59:.: 0.36:1.000:. ./.:4:62,23:.:-0.59:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,24:.: 0.97:1.000:. ./.:4:93,26:.: 0.56:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:70,36:.: 0.12:1.000:. ./.:4:87,32:.: 0.56:1.000:. ./.:4:115,31:.: 1.47:1.000:. ./.:4:58,25:.:-0.65:1.000:. ./.:4:33,104:.: 1.17:0.999:. ./.:4:82,27:.: 0.22:1.000:. ./.:4:68,23:.:-0.38:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.72:1.000:. ./.:4:79,33:.: 0.32:1.000:. ./.:4:47,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:76,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,17:.:-1.43:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:51,80:.: 0.97:1.000:. ./.:4:87,39:.: 0.80:1.000:. ./.:4:67,44:.: 0.29:1.000:. ./.:4:78,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:84,35:.: 0.56:1.000:. ./.:4:71,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:59,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:59,56:.: 0.43:1.000:. -chr4.1 13581653 chr4.1_013581653 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:88,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:24,49:.:-1.21:1.000:. ./.:4:87,23:.:-0.14:1.000:. ./.:4:81,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:119,22:.: 0.76:1.000:. ./.:4:89,22:.:-0.11:1.000:. ./.:4:56,12:.:-1.36:1.000:. ./.:4:64,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:87,23:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,7:.:-3.07:1.000:. ./.:4:18,3:.:-2.72:1.000:. ./.:4:73,20:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,23:.:-0.37:1.000:. ./.:4:69,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:73,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:77,12:.:-0.75:1.000:. ./.:4:123,32:.: 1.17:0.999:. ./.:4:29,50:.:-1.04:1.000:. ./.:4:105,25:.: 0.44:1.000:. ./.:4:61,54:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:47,46:.:-0.63:1.000:. ./.:4:92,33:.: 0.30:1.000:. ./.:4:74,15:.:-0.75:1.000:. ./.:4:17,3:.:-2.75:1.000:. ./.:4:42,44:.:-0.83:1.000:. ./.:4:42,39:.:-0.98:1.000:. ./.:4:83,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:101,27:.: 0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,20:.:-0.51:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:36,5:.:-2.14:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:89,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,43:.:-0.89:1.000:. ./.:4:78,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:88,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:56,39:.:-0.57:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:100,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,26:.:-0.31:1.000:. ./.:4:89,66:.: 1.17:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:118,23:.: 0.76:1.000:. ./.:4:45,6:.:-1.85:1.000:. ./.:4:56,44:.:-0.43:1.000:. ./.:4:85,18:.:-0.34:1.000:. ./.:4:107,26:.: 0.53:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.62:1.000:. ./.:4:121,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:111,33:.: 0.85:1.000:. ./.:4:47,27:.:-1.18:1.000:. ./.:4:95,24:.: 0.13:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:116,21:.: 0.65:1.000:. ./.:4:112,13:.: 0.30:1.000:. ./.:6:121,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:117,30:.: 0.94:1.000:. ./.:4:100,29:.: 0.42:1.000:. ./.:4:87,57:.: 0.85:1.000:. ./.:4:98,33:.: 0.47:1.000:. ./.:4:101,33:.: 0.56:1.000:. ./.:4:120,40:.: 1.32:1.000:. ./.:4:100,24:.: 0.27:1.000:. ./.:4:96,17:.:-0.05:1.000:. ./.:4:117,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:19,55:.:-1.18:1.000:. ./.:4:127,28:.: 1.17:1.000:. ./.:4:94,21:.: 0.01:1.000:. ./.:4:45,71:.: 0.04:1.000:. ./.:4:82,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:100,37:.: 0.65:1.000:. ./.:4:107,33:.: 0.74:1.000:. ./.:4:121,21:.: 0.79:1.000:. ./.:4:120,36:.: 1.20:1.000:. ./.:4:121,25:.: 0.91:1.000:. ./.:4:89,74:.: 1.40:1.000:. ./.:4:82,26:.:-0.19:0.999:. ./.:4:126,31:.: 1.23:1.000:. ./.:4:85,76:.: 1.35:1.000:. ./.:4:80,23:.:-0.34:1.000:. ./.:4:89,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:122,40:.: 1.37:1.000:. ./.:4:91,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:104,26:.: 0.44:1.000:. ./.:4:96,29:.: 0.30:1.000:. ./.:4:91,59:.: 1.03:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:106,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:151,37:.: 2.13:1.000:. ./.:4:49,11:.:-1.59:1.000:. ./.:4:151,41:.: 2.25:1.000:. ./.:4:88,40:.: 0.39:1.000:. ./.:4:116,36:.: 1.08:1.000:. ./.:4:69,41:.:-0.14:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:64,60:.: 0.27:1.000:. ./.:4:104,29:.: 0.53:1.000:. ./.:4:142,30:.: 1.66:1.000:. ./.:4:112,29:.: 0.76:1.000:. ./.:4:131,34:.: 1.46:0.998:. ./.:4:92,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:105,33:.: 0.68:1.000:. ./.:4:104,27:.: 0.47:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:132,33:.: 1.46:1.000:. ./.:4:96,29:.: 0.30:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:85,17:.:-0.37:1.000:. ./.:4:134,34:.: 1.55:0.999:. ./.:4:170,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:61,13:.:-1.18:1.000:. ./.:4:126,42:.: 1.55:1.000:. ./.:4:115,36:.: 1.05:1.000:. ./.:4:92,25:.: 0.07:1.000:. ./.:4:82,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:95,16:.:-0.11:1.000:. ./.:4:109,28:.: 0.65:1.000:. ./.:4:73,20:.:-0.63:1.000:. ./.:4:118,29:.: 0.94:1.000:. ./.:4:68,13:.:-0.98:1.000:. ./.:4:104,34:.: 0.68:1.000:. ./.:4:118,38:.: 1.20:1.000:. ./.:4:119,31:.: 1.03:1.000:. ./.:4:31,64:.:-0.57:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:81,30:.:-0.11:1.000:. ./.:4:113,28:.: 0.76:1.000:. ./.:4:79,15:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,43:.:-0.89:1.000:. ./.:4:107,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:72,15:.:-0.80:1.000:. ./.:4:119,32:.: 1.05:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,30:.: 1.14:1.000:. ./.:4:94,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:126,25:.: 1.05:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:124,42:.: 1.49:1.000:. ./.:4:73,20:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,25:.:-0.22:1.000:. ./.:4:101,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:102,33:.: 0.59:1.000:. ./.:4:92,22:.:-0.02:1.000:. ./.:4:94,26:.: 0.15:1.000:. ./.:4:88,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:65,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,17:.: 0.18:1.000:. ./.:4:74,10:.:-0.89:1.000:. ./.:4:22,4:.:-2.58:1.000:. ./.:4:56,13:.:-1.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:94,25:.: 0.13:1.000:. ./.:4:92,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:65,55:.: 0.15:1.000:. ./.:4:70,10:.:-1.01:1.000:. ./.:4:93,23:.: 0.04:1.000:. ./.:4:73,16:.:-0.75:1.000:. ./.:4:70,15:.:-0.86:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:81,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:63,17:.:-1.01:1.000:. ./.:4:83,20:.:-0.34:1.000:. ./.:4:69,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:29,50:.:-1.04:0.999:. ./.:4:70,21:.:-0.69:1.000:. ./.:4:89,20:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,15:.:-1.07:1.000:. ./.:4:63,19:.:-0.95:1.000:. ./.:4:62,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,22:.:-0.80:1.000:. ./.:4:93,19:.:-0.08:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:77,61:.: 0.68:1.000:. ./.:4:100,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:54,27:.:-0.98:1.000:. ./.:4:77,25:.:-0.37:1.000:. ./.:4:129,28:.: 1.23:1.000:. ./.:4:92,25:.: 0.07:1.000:. ./.:4:74,14:.:-0.78:1.000:. ./.:4:63,46:.:-0.17:1.000:. -chr4.1 13872451 chr4.1_013872451 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:279,274:0.52: 0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:96,263:0.73:-1.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:356,102:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:310,259:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:513,156:0.24: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:385,126:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:393,119:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:129,366:0.73: 0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:330,112:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:71,216:0.74:-2.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,73:0.30:-2.33:1.000:0.988 0/0/0/1:4:336,110:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:260,231:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:290,222:0.46: 0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:262,201:0.46:-0.28:1.000:0.989 0/0/0/1:4:349,115:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:386,108:0.23: 0.03:0.999:1.000 0/0/1/1:4:311,254:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:315,217:0.43: 0.41:1.000:0.957 0/1/1/1:4:169,436:0.72: 1.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:217,69:0.25:-2.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:141,370:0.72: 0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:334,274:0.48: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:220,223:0.53:-0.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:157,92:0.39:-2.42:1.000:0.712 0/1/1/1:4:113,292:0.72:-0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:124,451:0.77: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:370,93:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:362,295:0.48: 1.66:1.000:0.995 0/0/0/0:4:426,1:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,95:0.24:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:328,1:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-3.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,143:0.48:-1.71:1.000:0.994 0/0/1:3:92,57:0.41:-3.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:366,122:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:153,325:0.68:-0.13:1.000:0.956 0/0/1/1:4:244,215:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:208,163:0.47:-1.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:100,245:0.71:-1.46:1.000:0.990 0/0/0/0:4:461,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:400,112:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:325,252:0.47: 0.86:1.000:0.991 0/0/0/1:4:350,110:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:303,248:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:398,94:0.20: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:488,147:0.24: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,100:0.32:-1.65:1.000:0.947 0/0/1/1:4:190,189:0.53:-1.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:303,91:0.24:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,213:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:449,127:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:392,129:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:450,147:0.26: 1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:269,275:0.53: 0.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:341,115:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:495,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:428,114:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,113:0.29:-0.80:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:313,210:0.43: 0.32:1.000:0.580 0/0/1/1:4:337,272:0.48: 1.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:271,235:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:247,218:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:303,95:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:301,246:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:333,203:0.40: 0.45:1.000:0.808 0/0/1/1:4:162,157:0.52:-1.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:258,250:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:286,270:0.52: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:166,380:0.69: 0.55:1.000:0.980 0/0/0/1:4:439,153:0.27: 1.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:279,91:0.26:-1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,323:0.73:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:270,236:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:373,114:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,75:0.21:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:414,127:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:332,269:0.48: 1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,235:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:272,223:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:345,122:0.27:-0.24:0.999:0.997 0/0/1/1:4:298,257:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:136,366:0.72: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:256,234:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:369,101:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,257:0.49: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:189,210:0.55:-0.92:1.000:0.980 0/0/0/1:4:381,136:0.27: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:399,134:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:156,369:0.70: 0.34:1.000:0.986 0/0/0/0:4:478,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,207:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:266,210:0.47:-0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:223,201:0.51:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:376,105:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,204:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:272,219:0.48: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:206,168:0.48:-1.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:493,139:0.23: 1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,326:0.75:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:529,157:0.24: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:449,152:0.26: 1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:209,186:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:560,186:0.26: 2.55:0.998:0.999 0/0/1/1:4:246,214:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:207,182:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:229,235:0.53:-0.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:398,97:0.20: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:498,187:0.29: 1.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:235,217:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:483,138:0.23: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:265,273:0.53: 0.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:462,142:0.24: 1.13:0.999:1.000 0/0/0/1:4:396,128:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:234,175:0.46:-0.82:1.000:0.985 0/0/1/1:4:313,266:0.49: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:234,206:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:243,216:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:285,218:0.46: 0.12:1.000:0.989 0/0/0/1:4:329,142:0.32:-0.20:1.000:0.961 0/0/1/1:4:296,276:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:281,244:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:476,157:0.26: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:440,149:0.26: 0.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:257,264:0.53: 0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:351,321:0.51: 1.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:404,135:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:133,300:0.69:-0.58:1.000:0.976 0/0/0/1:4:267,77:0.23:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,102:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,203:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:253,199:0.47:-0.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:90,274:0.74:-1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:446,163:0.28: 1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:479,152:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:277,255:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:487,118:0.20: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:394,114:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:425,137:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:284,235:0.48: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:422,125:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:307,246:0.48: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:368,118:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:285,83:0.23:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:463,149:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:438,395:0.51: 3.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:447,147:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:285,258:0.51: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:359,111:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,193:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:457,124:0.22: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:371,115:0.25:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,125:0.49:-2.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:338,112:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:499,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:302,260:0.49: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:471,147:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,345:0.77:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,251:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:360,290:0.48: 1.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:314,101:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:182,183:0.53:-1.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:335,103:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:460,145:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:389,136:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:242,224:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:318,104:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:140,332:0.70:-0.19:0.999:0.986 0/0/0/1:4:417,147:0.27: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:279,231:0.48: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:345,118:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:197,159:0.48:-1.35:1.000:0.994 0/1/1/1:4:131,407:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,201:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:187,163:0.50:-1.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:353,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:399,97:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:287,241:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:379,137:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:317,159:0.35:-0.15:1.000:0.767 0/0/0/1:4:438,147:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:302,265:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:511,154:0.24: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,172:0.51:-1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:313,260:0.48: 0.82:1.000:0.996 -chr4.1 14070845 chr4.1_014070845 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:266,230:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:115,217:0.68:-0.71:1.000:0.959 0/0/1/1:4:205,139:0.44:-0.60:1.000:0.969 0/0/1/1:4:231,209:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:329,194:0.41: 1.18:1.000:0.851 0/0/1/1:4:284,185:0.43: 0.64:1.000:0.950 0/0/1/1:4:196,118:0.41:-0.89:1.000:0.880 0/1/1/1:4:114,266:0.73:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:230,149:0.43:-0.25:1.000:0.947 0/1/1/1:4:61,132:0.71:-2.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,64:0.54:-2.73:1.000:0.990 0/0/0/1:4:304,85:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:240,217:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:335,261:0.48: 1.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:211,201:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:373,76:0.21: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,185:0.42: 0.80:0.999:0.908 0/1/1/1:4:115,244:0.71:-0.45:1.000:0.990 0/0/1/1:4:321,292:0.51: 2.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:307,260:0.50: 1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,69:0.39:-2.06:1.000:0.678 0/1/1/1:4:119,280:0.73:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:132,354:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:247,230:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,63:0.47:-2.57:1.000:0.993 0/1/1/1:4:119,268:0.72:-0.17:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,288:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,150:0.41:-0.07:1.000:0.891 0/0/1/1:4:294,286:0.53: 1.74:1.000:0.992 0/0/0/1:4:399,77:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,119:0.34:-0.13:1.000:0.864 0/0/0/1:4:324,56:0.19:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,74:0.64:-2.79:1.000:0.656 0/1/1/1:4:54,128:0.73:-2.20:1.000:0.998 0/1/1:3:39,61:0.64:-3.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:279,165:0.41: 0.39:1.000:0.855 0/1/1/1:4:120,263:0.71:-0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:265,208:0.48: 0.68:1.000:0.994 0/1/1/1:4:119,282:0.73:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:142,293:0.70: 0.31:1.000:0.986 0/0/0/1:4:396,75:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:380,152:0.32: 1.27:1.000:0.948 0/0/1/1:4:267,250:0.52: 1.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:209,141:0.44:-0.54:1.000:0.967 0/1/1/1:4:100,257:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:399,118:0.26: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:284,238:0.49: 1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,48:0.71:-3.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:108,230:0.71:-0.65:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,36:0.25:-2.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,265:0.79:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:391,102:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,82:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,210:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:204,121:0.41:-0.78:1.000:0.859 0/0/1/1:4:169,119:0.45:-1.15:1.000:0.980 0/0/0/1:4:318,94:0.26: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:122,338:0.76: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,126:0.41:-0.63:1.000:0.848 0/0/0/0/1/1:6:216,125:0.40:-0.62:1.000:0.617 0/0/1/1:4:221,190:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:113,254:0.72:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:279,208:0.46: 0.82:1.000:0.990 0/0/1/1:4:237,187:0.48: 0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:264,236:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:196,250:0.59: 0.41:1.000:0.842 0/0/1/1:4:237,206:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:273,213:0.48: 0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:216,199:0.52: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:120,244:0.70:-0.40:1.000:0.983 0/0/0/1:4:384,88:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,114:0.42:-1.05:1.000:0.912 0/1/1/1:4:131,265:0.70:-0.08:1.000:0.982 0/0/1/1:4:253,222:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:322,95:0.26: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:271,64:0.23:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,148:0.44:-0.38:1.000:0.970 0/0/1/1:4:256,249:0.53: 1.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:232,231:0.53: 0.58:1.000:0.990 0/1/1/1:4:124,230:0.68:-0.50:1.000:0.949 0/0/0/1:4:267,68:0.24:-0.68:0.999:1.000 0/1/1/1:4:122,311:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:125,324:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,261:0.76:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,125:0.44:-0.91:1.000:0.963 0/1/1/1:4:132,368:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,119:0.48:-1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:222,149:0.44:-0.33:1.000:0.965 0/0/0/1:4:286,83:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,246:0.77:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,81:0.29:-0.89:1.000:0.990 0/1/1/1:4:107,264:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:263,245:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:194,165:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:276,165:0.41: 0.37:1.000:0.871 0/1/1/1:4:121,267:0.71:-0.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:101,297:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,103:0.39:-1.14:1.000:0.727 0/0/0/1:4:382,148:0.32: 1.25:1.000:0.964 0/1/1/1:4:132,342:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:301,92:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:226,228:0.54: 0.49:1.000:0.989 0/0/1/1:4:215,185:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:222,178:0.48:-0.04:0.998:0.995 0/0/1/1:4:214,162:0.47:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:232,181:0.48: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:177,192:0.56:-0.35:1.000:0.974 0/0/1/1:4:228,214:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:313,229:0.46: 1.37:1.000:0.987 0/1/1/1:4:121,275:0.72:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:339,133:0.32: 0.67:1.000:0.958 0/1/1/1:4:158,406:0.75: 1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,180:0.46: 0.22:0.999:0.988 0/0/0/1:4:341,122:0.30: 0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:96,63:0.43:-2.43:1.000:0.955 0/0/1/1:4:276,222:0.48: 0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:194,194:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:188,191:0.54:-0.25:1.000:0.988 0/1/1/1:4:107,269:0.74:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:246,58:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,217:0.49: 0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:130,333:0.74: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:320,89:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:207,151:0.46:-0.46:1.000:0.987 0/1/1/1:4:123,288:0.73: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:254,235:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:222,177:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:95,178:0.68:-1.30:1.000:0.955 0/0/0/1:4:265,91:0.29:-0.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:183,145:0.48:-0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:203,186:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:258,184:0.45: 0.38:1.000:0.983 0/1/1/1:4:73,166:0.72:-1.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:318,52:0.18:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:284,70:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:323,235:0.46: 1.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:231,201:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:216,175:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,139:0.47:-0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:193,195:0.54:-0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:223,209:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:115,297:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:332,93:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:246,60:0.23:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:491,97:0.20: 1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:187,457:0.74: 2.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:298,230:0.47: 1.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:234,197:0.49: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:269,170:0.42: 0.35:1.000:0.930 0/0/1/1:4:240,157:0.43:-0.07:1.000:0.953 0/0/1/1:4:309,250:0.48: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,162:0.45:-0.07:1.000:0.975 0/1/1/1:4:56,154:0.76:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,56:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:358,76:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:270,241:0.51: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:317,212:0.44: 1.24:1.000:0.964 0/1/1/1:4:117,342:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,307:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:270,234:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:120,22:0.19:-2.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,264:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:337,141:0.33: 0.73:1.000:0.915 0/0/1/1:4:255,175:0.44: 0.26:1.000:0.973 0/0/1/1:4:129,69:0.39:-2.04:1.000:0.636 0/0/1/1:4:252,190:0.47: 0.38:1.000:0.991 0/0/0/1:4:345,85:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,252:0.70:-0.31:0.999:0.988 0/0/1/1:4:258,176:0.44: 0.30:1.000:0.971 0/1/1/1:4:125,298:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:312,72:0.22:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,220:0.69:-0.71:1.000:0.974 0/1/1/1:4:134,291:0.71: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:241,206:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,199:0.55:-0.21:1.000:0.975 0/0/0/1:4:271,80:0.26:-0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:263,262:0.53: 1.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:295,286:0.53: 1.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:239,187:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:304,94:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:282,207:0.46: 0.84:1.000:0.988 0/0/1/1:4:323,256:0.48: 1.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:342,205:0.41: 1.41:1.000:0.874 0/0/1/1:4:222,176:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:216,184:0.50:-0.04:1.000:0.997 -chr4.1 14269297 chr4.1_014269297 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:49,99:0.69: 0.21:1.000:0.969 0/0/0/1:4:85,21:0.21:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,83:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,121:0.76: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,42:0.34:-0.32:1.000:0.873 0/0/1/1:4:110,76:0.41: 1.13:1.000:0.875 0/0/1/1:4:51,39:0.44:-1.19:1.000:0.960 0/0/0/1:4:82,41:0.34:-0.39:1.000:0.873 0/0/0/1:4:72,41:0.37:-0.64:1.000:0.591 0/0/0/1:4:26,15:0.37:-2.38:1.000:0.553 0/0/1/1:4:22,16:0.42:-2.45:1.000:0.929 0/1/1/1:4:32,127:0.82: 0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,69:0.71:-0.95:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,80:0.67:-0.39:1.000:0.906 0/1/1/1:4:43,128:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,104:0.70: 0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:74,53:0.42:-0.30:1.000:0.915 0/0/0/1:4:146,50:0.26: 1.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,105:0.69: 0.40:1.000:0.976 0/1/1/1:4:39,100:0.74:-0.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,20:0.92:-2.84:1.000:0.982 0/0/1/1:4:97,78:0.45: 0.86:1.000:0.977 0/0/1/1:4:99,80:0.45: 0.96:1.000:0.979 0/1/1/1:4:22,56:0.74:-1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,13:0.75:-2.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,96:0.52: 1.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:132,41:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,103:0.52: 1.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,139:0.79: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,126:0.79: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,24:0.20:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,110:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.59:-2.91:1.000:0.878 0/0/1/1:4:29,35:0.55:-1.82:1.000:0.978 0/0/1:3:8,3:0.28:-3.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,75:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,85:0.45: 1.18:1.000:0.983 0/1/1/1:4:54,113:0.70: 0.67:1.000:0.981 0/0/1/1:4:72,82:0.54: 0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:87,108:0.56: 1.35:1.000:0.968 0/1/1/1:4:48,94:0.68: 0.06:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,139:0.78: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,73:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,38:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,23:0.45:-2.13:1.000:0.982 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,53:0.61:-1.24:1.000:0.652 0/0/1/1:4:70,67:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,121:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,99:0.65: 0.40:1.000:0.785 0/0/0/1:4:102,56:0.36: 0.45:1.000:0.691 0/0/0/1:4:91,39:0.31:-0.23:1.000:0.977 0/0/0/1:4:95,50:0.35: 0.14:1.000:0.788 0/1/1/1:4:50,144:0.77: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,82:0.53: 0.38:1.000:0.991 0/0/0/1:4:90,39:0.31:-0.25:1.000:0.974 0/0/1/1/1/1:6:38,93:0.73:-0.20:1.000:0.658 0/1/1/1:4:60,116:0.68: 0.89:1.000:0.944 0/0/1/1:4:108,94:0.47: 1.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:94,45:0.33:-0.01:1.000:0.920 0/0/1/1:4:83,52:0.39:-0.10:1.000:0.685 0/1/1/1:4:49,120:0.73: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:156,75:0.33: 2.22:1.000:0.916 0/1/1/1:4:31,78:0.74:-0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,69:0.67:-0.81:1.000:0.909 0/1/1/1:4:38,133:0.80: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,36:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,77:0.65:-0.44:1.000:0.803 0/0/0/1:4:58,21:0.27:-1.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:143,32:0.19: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,137:0.81: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,114:0.77: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,64:0.63:-0.85:1.000:0.536 0/0/1/1:4:85,71:0.46: 0.40:1.000:0.986 0/1/1/1:4:34,87:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,100:0.73: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,45:0.23: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,96:0.73:-0.08:0.999:0.997 0/0/1/1:4:74,80:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:89,46:0.35:-0.10:1.000:0.822 0/0/1/1:4:77,87:0.53: 0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:78,53:0.41:-0.20:1.000:0.852 0/0/1/1:4:111,97:0.47: 1.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,65:0.75:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,35:0.35:-0.93:1.000:0.772 0/1/1/1:4:38,68:0.66:-0.81:1.000:0.848 0/0/1/1:4:92,83:0.48: 0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:28,70:0.74:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,85:0.54: 0.45:1.000:0.986 0/1/1/1:4:41,161:0.82: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,99:0.73: 0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,87:0.48: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,84:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,65:0.47:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,76:0.50: 0.28:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,188:1.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,52:0.36: 0.16:1.000:0.672 0/1/1/1:4:32,60:0.67:-1.14:1.000:0.915 0/0/0/1:4:87,34:0.29:-0.44:1.000:0.992 0/1/1/1:4:15,42:0.76:-1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,77:0.47: 0.57:0.998:0.993 0/1/1/1:4:25,64:0.74:-1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,89:0.65: 0.04:1.000:0.749 0/0/1/1:4:46,71:0.62:-0.54:1.000:0.589 0/1/1/1:4:38,113:0.77: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,48:0.27: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,73:0.46: 0.50:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,101:0.49: 1.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,31:0.27:-0.54:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,86:0.75:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,88:0.67:-0.10:1.000:0.914 0/1/1/1:4:42,79:0.67:-0.44:1.000:0.919 0/1/1/1:4:42,73:0.65:-0.59:1.000:0.787 0/0/0/1:4:120,38:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,93:0.76:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,125:0.74: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,83:0.54: 0.40:1.000:0.990 0/1/1/1:4:47,82:0.65:-0.25:1.000:0.796 0/0/0/1:4:64,32:0.34:-1.05:1.000:0.873 0/0/1/1:4:76,81:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,121:0.74: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,73:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:89,33:0.28:-0.42:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,51:0.49:-0.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,90:0.76:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,117:0.84: 0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,52:0.46:-0.64:1.000:0.989 0/1/1/1:4:41,79:0.68:-0.47:1.000:0.941 0/1/1/1:4:47,81:0.65:-0.27:1.000:0.766 0/1/1/1:4:56,126:0.71: 1.03:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,147:0.79: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,81:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,61:0.44:-0.01:1.000:0.969 0/1/1/1:4:37,118:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,107:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,83:0.47: 0.89:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,68:0.66:-0.81:1.000:0.848 0/0/1/1:4:47,51:0.52:-1.00:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,100:0.63: 0.57:1.000:0.508 0/0/1/1:4:101,119:0.55: 1.95:1.000:0.984 0/0/1/1:4:77,74:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,103:0.70: 0.31:1.000:0.982 0/0/1/1:4:126,137:0.52: 2.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:102,49:0.33: 0.28:1.000:0.917 0/0/1/1:4:103,85:0.45: 1.18:1.000:0.983 0/0/0/1:4:82,46:0.36:-0.27:1.000:0.634 0/0/1/1:4:13,17:0.57:-2.64:1.000:0.936 0/0/1/1:4:43,62:0.60:-0.83:1.000:0.788 0/1/1/1:4:58,163:0.76: 1.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,162:0.73: 2.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,74:0.46: 0.52:1.000:0.988 0/0/0/1:4:94,47:0.34: 0.04:1.000:0.873 0/0/1/1:4:75,59:0.44:-0.13:1.000:0.971 0/1/1/1:4:30,133:0.83: 0.57:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,91:0.72:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,87:0.52: 0.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,44:0.37:-0.42:1.000:0.618 0/0/0/1:4:92,42:0.32:-0.13:1.000:0.953 0/1/1/1:4:36,73:0.69:-0.73:1.000:0.971 0/1/1/1:4:28,74:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,33:0.23: 0.16:0.999:1.000 0/0/1/1:4:60,43:0.42:-0.88:1.000:0.916 0/0/1/1:4:68,56:0.45:-0.37:1.000:0.983 0/1/1/1:4:31,59:0.67:-1.19:1.000:0.930 0/0/1/1:4:58,67:0.54:-0.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:84,34:0.30:-0.52:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,74:0.64:-0.49:1.000:0.629 0/1/1/1:4:43,71:0.64:-0.61:1.000:0.642 0/1/1/1:4:27,67:0.74:-1.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:49,107:0.71: 0.40:1.000:0.990 0/1/1/1:4:50,133:0.75: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,35:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,66:0.60:-0.66:1.000:0.799 0/0/1/1:4:68,75:0.53: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:68,104:0.62: 0.79:1.000:0.620 0/0/1/1:4:81,84:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,63:0.70:-1.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:98,99:0.50: 1.39:1.000:0.997 -chr4.1 14571258 chr4.1_014571258 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:97,93:.: 0.13:1.000:. ./.:4:35,125:.:-0.52:1.000:. ./.:4:90,104:.: 0.21:1.000:. ./.:4:103,74:.:-0.15:1.000:. ./.:4:94,122:.: 0.69:1.000:. ./.:4:113,132:.: 1.31:1.000:. ./.:4:60,79:.:-0.97:1.000:. ./.:4:49,131:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,86:.:-0.32:1.000:. ./.:4:7,30:.:-3.16:1.000:. ./.:4:29,17:.:-2.97:1.000:. ./.:4:133,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:90,81:.:-0.28:1.000:. ./.:4:75,101:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,104:.: 0.47:1.000:. ./.:4:173,53:.: 0.90:1.000:. ./.:4:106,116:.: 0.81:1.000:. ./.:4:112,103:.: 0.66:1.000:. ./.:4:145,121:.: 1.76:1.000:. ./.:4:115,109:.: 0.86:1.000:. ./.:4:14,9:.:-3.46:1.000:. ./.:4:38,147:.: 0.02:1.000:. ./.:4:52,120:.:-0.26:1.000:. ./.:4:92,75:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,11:.:-3.29:1.000:. ./.:4:66,189:.: 1.52:1.000:. ./.:4:1,199:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,94:.: 0.21:1.000:. ./.:4:99,109:.: 0.51:1.000:. ./.:4:154,46:.: 0.34:1.000:. ./.:4:123,89:.: 0.60:1.000:. ./.:4:125,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:13,6:.:-3.55:1.000:. ./.:4:14,36:.:-2.88:1.000:. ./.:3:9,5:.:-3.65:1.000:. ./.:4:99,100:.: 0.32:1.000:. ./.:4:56,186:.: 1.24:1.000:. ./.:4:91,109:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,149:.: 0.49:1.000:. ./.:4:55,150:.: 0.45:1.000:. ./.:4:143,35:.:-0.13:1.000:. ./.:4:163,45:.: 0.51:1.000:. ./.:4:119,105:.: 0.86:1.000:. ./.:4:91,97:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,154:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:104,100:.: 0.43:1.000:. ./.:4:20,13:.:-3.25:1.000:. ./.:4:50,159:.: 0.53:1.000:. ./.:4:123,31:.:-0.65:1.000:. ./.:4:26,117:.:-0.88:1.000:. ./.:4:149,58:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,53:.:-0.02:1.000:. ./.:4:80,114:.: 0.21:1.000:. ./.:4:92,100:.: 0.17:1.000:. ./.:4:116,102:.: 0.73:1.000:. ./.:4:151,49:.: 0.34:1.000:. ./.:4:63,182:.: 1.31:1.000:. ./.:4:106,103:.: 0.53:1.000:. ./.:6:83,75:.:-0.56:1.000:. ./.:4:82,99:.:-0.07:1.000:. ./.:4:57,162:.: 0.75:1.000:. ./.:4:108,104:.: 0.60:1.000:. ./.:4:96,120:.: 0.69:1.000:. ./.:4:103,109:.: 0.60:1.000:. ./.:4:106,168:.: 1.93:1.000:. ./.:4:67,76:.:-0.88:1.000:. ./.:4:97,101:.: 0.30:1.000:. ./.:4:78,118:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,125:.:-0.52:1.000:. ./.:4:152,69:.: 0.79:1.000:. ./.:4:75,83:.:-0.56:1.000:. ./.:4:57,219:.: 1.97:1.000:. ./.:4:120,107:.: 0.92:1.000:. ./.:4:154,53:.: 0.49:1.000:. ./.:4:132,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:98,91:.: 0.11:1.000:. ./.:4:94,95:.: 0.11:1.000:. ./.:4:105,140:.: 1.31:1.000:. ./.:4:59,157:.: 0.69:1.000:. ./.:4:123,48:.:-0.28:0.999:. ./.:4:46,176:.: 0.81:1.000:. ./.:4:60,173:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,152:.: 0.06:1.000:. ./.:4:86,95:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,128:.:-0.24:1.000:. ./.:4:81,72:.:-0.67:1.000:. ./.:4:87,91:.:-0.13:1.000:. ./.:4:126,42:.:-0.35:1.000:. ./.:4:41,146:.: 0.06:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.88:1.000:. ./.:4:35,141:.:-0.17:1.000:. ./.:4:129,143:.: 1.89:1.000:. ./.:4:71,57:.:-1.20:1.000:. ./.:4:100,110:.: 0.56:1.000:. ./.:4:43,175:.: 0.73:1.000:. ./.:4:35,124:.:-0.54:1.000:. ./.:4:107,86:.: 0.19:1.000:. ./.:4:135,37:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,157:.: 0.51:1.000:. ./.:4:85,30:.:-1.48:1.000:. ./.:4:100,114:.: 0.64:1.000:. ./.:4:58,67:.:-1.27:1.000:. ./.:4:85,95:.:-0.09:0.998:. ./.:4:71,74:.:-0.84:1.000:. ./.:4:87,102:.: 0.11:1.000:. ./.:4:90,114:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,89:.:-0.22:1.000:. ./.:4:142,139:.: 2.08:1.000:. ./.:4:44,146:.: 0.13:1.000:. ./.:4:138,46:.: 0.00:1.000:. ./.:4:71,202:.: 1.91:1.000:. ./.:4:78,108:.: 0.04:0.999:. ./.:4:149,62:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,79:.:-0.80:1.000:. ./.:4:101,101:.: 0.38:1.000:. ./.:4:72,89:.:-0.50:1.000:. ./.:4:87,80:.:-0.37:1.000:. ./.:4:43,131:.:-0.22:1.000:. ./.:4:126,45:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,91:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,121:.:-0.47:1.000:. ./.:4:155,63:.: 0.73:1.000:. ./.:4:102,98:.: 0.34:1.000:. ./.:4:49,131:.:-0.09:1.000:. ./.:4:98,95:.: 0.19:1.000:. ./.:4:87,103:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,102:.:-1.08:1.000:. ./.:4:135,30:.:-0.41:1.000:. ./.:4:55,76:.:-1.14:1.000:. ./.:4:92,72:.:-0.43:1.000:. ./.:4:98,105:.: 0.41:1.000:. ./.:4:31,85:.:-1.46:1.000:. ./.:4:133,41:.:-0.22:1.000:. ./.:4:150,39:.: 0.11:1.000:. ./.:4:116,116:.: 1.03:1.000:. ./.:4:96,110:.: 0.47:1.000:. ./.:4:90,89:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,88:.:-0.56:1.000:. ./.:4:105,82:.: 0.06:1.000:. ./.:4:91,94:.: 0.02:1.000:. ./.:4:36,140:.:-0.17:1.000:. ./.:4:125,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:91,36:.:-1.23:1.000:. ./.:4:176,51:.: 0.92:1.000:. ./.:4:43,185:.: 0.94:1.000:. ./.:4:95,108:.: 0.41:1.000:. ./.:4:110,102:.: 0.60:1.000:. ./.:4:143,119:.: 1.67:1.000:. ./.:4:110,106:.: 0.69:1.000:. ./.:4:117,116:.: 1.05:1.000:. ./.:4:116,84:.: 0.34:1.000:. ./.:4:6,27:.:-3.25:1.000:. ./.:4:121,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:161,62:.: 0.84:1.000:. ./.:4:108,107:.: 0.66:1.000:. ./.:4:86,128:.: 0.64:1.000:. ./.:4:46,130:.:-0.17:1.000:. ./.:4:35,116:.:-0.71:1.000:. ./.:4:54,144:.: 0.30:1.000:. ./.:4:148,45:.: 0.19:1.000:. ./.:4:59,129:.: 0.08:1.000:. ./.:4:128,45:.:-0.24:1.000:. ./.:4:106,95:.: 0.36:1.000:. ./.:4:94,80:.:-0.22:1.000:. ./.:4:100,103:.: 0.41:1.000:. ./.:4:130,39:.:-0.32:1.000:. ./.:4:36,137:.:-0.24:0.999:. ./.:4:98,94:.: 0.17:1.000:. ./.:4:40,110:.:-0.73:1.000:. ./.:4:131,36:.:-0.37:1.000:. ./.:4:52,140:.: 0.17:1.000:. ./.:4:41,144:.: 0.02:1.000:. ./.:4:77,101:.:-0.13:1.000:. ./.:4:97,87:.: 0.00:1.000:. ./.:4:130,47:.:-0.15:1.000:. ./.:4:103,118:.: 0.79:1.000:. ./.:4:86,92:.:-0.13:1.000:. ./.:4:109,113:.: 0.81:1.000:. ./.:4:114,43:.:-0.58:1.000:. ./.:4:88,96:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,116:.: 0.90:1.000:. ./.:4:114,142:.: 1.54:1.000:. ./.:4:73,72:.:-0.84:1.000:. ./.:4:82,104:.: 0.04:1.000:. -chr4.1 14778212 chr4.1_014778212 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:293,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:141,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:83,0:.:-3.60:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:278,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:126,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,0:.:-3.96:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.36:1.000:. ./.:3:38,0:.:-4.62:0.999:. ./.:4:221,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:326,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:257,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:214,1:.:-0.62:0.999:. ./.:4:251,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.69:0.998:. ./.:4:222,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.28:0.999:. ./.:4:262,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:257,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:237,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:312,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:237,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:338,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:142,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:251,2:.: 0.24:0.999:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.05:1.000:. -chr4.1 14979802 chr4.1_014979802 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,43:.: 2.25:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.34:1.000:. ./.:3:0,12:.:-0.73:0.999:. ./.:4:1,11:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,42:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,20:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,35:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:1,13:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.19:1.000:. ./.:6:0,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,52:.: 3.11:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,41:.: 2.05:0.999:. ./.:4:1,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,14:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,39:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1,37:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:1,63:.: 4.26:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.81:0.998:. ./.:4:1,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.33:0.999:. ./.:4:0,42:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,37:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,37:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,32:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.77:1.000:. ./.:4:1,13:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,46:.: 2.53:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,21:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1,24:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.11:0.999:. ./.:4:0,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,8:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.90:1.000:. -chr4.1 15210316 chr4.1_015210316 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:116,114:0.51: 0.96:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,134:0.79:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,94:0.48: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,95:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,124:0.55: 0.90:1.000:0.974 0/0/1/1:4:99,123:0.56: 0.80:1.000:0.963 0/0/1/1:4:59,55:0.49:-1.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,156:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,93:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,15:0.79:-3.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,17:0.64:-3.27:1.000:0.635 0/0/0/1:4:112,44:0.30:-0.58:1.000:0.987 0/0/1/1:4:109,99:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,93:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,122:0.59: 0.52:1.000:0.857 0/0/0/1:4:185,44:0.21: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,117:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,197:0.76: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,119:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,117:0.48: 1.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:18,9:0.35:-3.27:1.000:0.813 0/1/1/1:4:45,143:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,145:0.73: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,89:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:15,1:0.08:-3.50:1.000:0.982 0/1/1/1:4:37,165:0.82: 0.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,99:0.47: 0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:114,120:0.52: 1.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,98:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,94:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,51:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:2,0:0.02:-3.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.77:-3.21:1.000:1.000 0/1/1:3:4,5:0.56:-3.65:0.999:0.986 0/0/1/1:4:89,110:0.56: 0.32:1.000:0.965 0/1/1/1:4:46,159:0.78: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,116:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,137:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,143:0.70: 0.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:149,49:0.26: 0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:145,45:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,122:0.57: 0.69:1.000:0.946 0/0/1/1:4:83,68:0.46:-0.69:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,143:0.79:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,46:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,111:0.48: 1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,18:0.47:-3.02:1.000:0.993 0/1/1/1:4:54,143:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,39:0.29:-0.83:1.000:0.993 0/1/1/1:4:46,118:0.72:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:194,55:0.24: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,61:0.33: 0.23:1.000:0.930 0/0/1/1:4:97,104:0.53: 0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:81,102:0.57:-0.02:1.000:0.957 0/0/1/1:4:88,111:0.57: 0.32:1.000:0.956 0/0/0/1:4:149,31:0.19:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,144:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,101:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:83,64:0.45:-0.77:1.000:0.727 0/0/1/1:4:92,106:0.54: 0.30:1.000:0.985 0/1/1/1:4:46,145:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,118:0.55: 0.73:1.000:0.982 0/0/1/1:4:81,95:0.55:-0.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:99,95:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,122:0.54: 0.94:1.000:0.986 0/0/1/1:4:61,43:0.43:-1.67:1.000:0.935 0/0/1/1:4:85,99:0.55: 0.00:1.000:0.983 0/0/1/1:4:76,91:0.55:-0.35:1.000:0.976 0/1/1/1:4:52,135:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,42:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,69:0.57:-1.29:1.000:0.937 0/1/1/1:4:48,137:0.74: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,112:0.53: 0.63:1.000:0.991 0/0/0/1:4:142,41:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,34:0.23:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,91:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,98:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,116:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,156:0.72: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,46:0.31:-0.56:0.999:0.976 0/1/1/1:4:44,141:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,141:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,134:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,86:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,136:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,58:0.45:-1.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:69,98:0.59:-0.35:1.000:0.837 0/0/0/1:4:120,50:0.31:-0.29:1.000:0.974 0/1/1/1:4:59,118:0.67:-0.14:1.000:0.926 0/0/0/1:4:92,32:0.27:-1.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,144:0.69: 0.52:1.000:0.978 0/0/1/1:4:103,90:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,76:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,91:0.48: 0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:61,140:0.70: 0.36:1.000:0.985 0/1/1/1:4:39,117:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,82:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,68:0.33: 0.61:1.000:0.903 0/1/1/1:4:58,165:0.74: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,26:0.23:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,98:0.53: 0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,63:0.48:-1.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,103:0.50: 0.55:0.998:0.997 0/0/1/1:4:91,84:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,96:0.55:-0.14:1.000:0.979 0/0/1/1:4:85,106:0.56: 0.15:1.000:0.961 0/0/1/1:4:107,95:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:138,128:0.49: 1.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,135:0.71: 0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:136,62:0.33: 0.30:1.000:0.929 0/1/1/1:4:56,186:0.77: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,81:0.45:-0.02:0.999:0.984 0/0/0/1:4:153,53:0.27: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,66:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,111:0.51: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,77:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,84:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,133:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,41:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,110:0.54: 0.52:1.000:0.990 0/1/1/1:4:47,138:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,45:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,98:0.48: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,137:0.73: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,115:0.57: 0.46:1.000:0.955 0/0/1/1:4:89,81:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,96:0.74:-1.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,32:0.26:-1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,102:0.57:-0.06:1.000:0.942 0/0/1/1:4:83,79:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,104:0.53: 0.32:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,100:0.75:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,67:0.33: 0.61:1.000:0.924 0/0/0/1:4:137,56:0.31: 0.19:1.000:0.980 0/0/1/1:4:123,133:0.53: 1.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:106,84:0.45: 0.13:1.000:0.983 0/0/1/1:4:94,82:0.48:-0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,72:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,90:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:106,99:0.49: 0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,134:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,43:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,39:0.32:-1.17:1.000:0.955 0/0/0/1:4:184,77:0.31: 1.61:1.000:0.973 0/1/1/1:4:63,162:0.72: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,105:0.49: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,115:0.55: 0.61:1.000:0.981 0/0/1/1:4:103,128:0.56: 0.98:1.000:0.963 0/0/1/1:4:97,92:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,96:0.47: 0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,123:0.56: 0.86:1.000:0.974 1/1/1/1:4:2,21:0.91:-3.36:1.000:0.969 0/0/0/1:4:102,30:0.24:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,52:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,111:0.54: 0.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:101,121:0.55: 0.80:1.000:0.976 0/1/1/1:4:48,154:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,125:0.80:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,156:0.72: 0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:138,45:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,134:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,42:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,84:0.43: 0.40:1.000:0.936 0/0/1/1:4:107,84:0.45: 0.15:1.000:0.981 0/0/1/1:4:80,129:0.62: 0.52:1.000:0.523 0/0/0/1:4:130,39:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,132:0.71: 0.07:0.999:0.991 0/0/1/1:4:87,99:0.54: 0.04:1.000:0.987 0/1/1/1:4:54,141:0.73: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:133,42:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,104:0.71:-0.77:1.000:0.992 0/1/1/1:4:59,130:0.69: 0.11:1.000:0.976 0/0/1/1:4:95,89:0.49: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,74:0.46:-0.37:1.000:0.986 0/0/0/1:4:136,30:0.20:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,136:0.54: 1.53:1.000:0.989 0/0/1/1:4:110,98:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,116:0.49: 1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,52:0.28: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,104:0.55: 0.21:1.000:0.984 0/0/1/1:4:127,114:0.48: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,118:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,63:0.42:-0.58:1.000:0.898 0/0/1/1:4:113,132:0.55: 1.28:1.000:0.982 -chr4.1 15298419 chr4.1_015298419 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,99:.:-0.17:1.000:. ./.:4:20,37:.:-1.86:1.000:. ./.:4:65,93:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,71:.:-0.69:1.000:. ./.:4:87,127:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,72:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,38:.:-1.49:1.000:. ./.:4:35,61:.:-1.13:1.000:. ./.:4:49,64:.:-0.82:1.000:. ./.:4:11,59:.:-1.62:1.000:. ./.:4:35,38:.:-1.56:1.000:. ./.:4:51,58:.:-0.89:1.000:. ./.:4:53,69:.:-0.65:1.000:. ./.:4:60,68:.:-0.54:1.000:. ./.:4:50,70:.:-0.69:1.000:. ./.:4:57,64:.:-0.67:1.000:. ./.:4:71,69:.:-0.32:1.000:. ./.:4:28,84:.:-0.84:1.000:. ./.:4:84,106:.: 0.61:1.000:. ./.:4:58,94:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,111:.: 0.11:1.000:. ./.:4:33,58:.:-1.23:1.000:. ./.:4:57,109:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,72:.:-0.78:1.000:. ./.:4:30,9:.:-2.19:1.000:. ./.:4:55,81:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,46:.:-1.77:1.000:. ./.:4:46,91:.:-0.37:1.000:. ./.:4:81,90:.: 0.26:1.000:. ./.:4:64,73:.:-0.37:1.000:. ./.:4:75,69:.:-0.24:1.000:. ./.:4:60,80:.:-0.32:1.000:. ./.:4:17,42:.:-1.82:1.000:. ./.:4:46,88:.:-0.43:1.000:. ./.:3:16,21:.:-2.23:0.999:. ./.:4:59,65:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,49:.:-1.19:1.000:. ./.:4:50,64:.:-0.80:1.000:. ./.:4:65,113:.: 0.39:1.000:. ./.:4:24,54:.:-1.47:1.000:. ./.:4:95,148:.: 1.60:1.000:. ./.:4:108,128:.: 1.47:1.000:. ./.:4:84,114:.: 0.76:1.000:. ./.:4:67,121:.: 0.58:1.000:. ./.:4:53,124:.: 0.37:1.000:. ./.:4:88,133:.: 1.19:1.000:. ./.:4:84,121:.: 0.89:1.000:. ./.:4:9,22:.:-2.34:1.000:. ./.:4:40,92:.:-0.47:1.000:. ./.:4:36,41:.:-1.49:1.000:. ./.:4:53,122:.: 0.33:1.000:. ./.:4:95,96:.: 0.63:1.000:. ./.:4:82,93:.: 0.33:1.000:. ./.:4:74,145:.: 1.15:1.000:. ./.:4:28,65:.:-1.19:1.000:. ./.:4:71,87:.: 0.02:1.000:. ./.:4:93,111:.: 0.87:1.000:. ./.:4:83,108:.: 0.63:1.000:. ./.:4:81,102:.: 0.48:1.000:. ./.:6:84,102:.: 0.54:1.000:. ./.:4:94,145:.: 1.52:1.000:. ./.:4:45,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:83,109:.: 0.65:1.000:. ./.:4:81,117:.: 0.76:1.000:. ./.:4:85,94:.: 0.41:1.000:. ./.:4:85,112:.: 0.74:1.000:. ./.:4:68,67:.:-0.41:1.000:. ./.:4:80,93:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,122:.: 0.82:1.000:. ./.:4:12,47:.:-1.82:1.000:. ./.:4:110,142:.: 1.77:1.000:. ./.:4:52,83:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,74:.:-0.71:1.000:. ./.:4:47,79:.:-0.58:1.000:. ./.:4:97,100:.: 0.74:1.000:. ./.:4:84,102:.: 0.54:1.000:. ./.:4:89,130:.: 1.15:1.000:. ./.:4:94,129:.: 1.23:1.000:. ./.:4:91,117:.: 0.95:1.000:. ./.:4:48,114:.: 0.09:1.000:. ./.:4:98,113:.: 1.00:0.999:. ./.:4:78,125:.: 0.86:1.000:. ./.:4:63,108:.: 0.26:1.000:. ./.:4:39,84:.:-0.63:1.000:. ./.:4:58,86:.:-0.24:1.000:. ./.:4:68,132:.: 0.80:1.000:. ./.:4:54,82:.:-0.39:1.000:. ./.:4:79,122:.: 0.82:1.000:. ./.:4:98,124:.: 1.21:1.000:. ./.:4:40,93:.:-0.45:1.000:. ./.:4:92,89:.: 0.45:1.000:. ./.:4:66,123:.: 0.59:1.000:. ./.:4:91,136:.: 1.30:1.000:. ./.:4:40,52:.:-1.21:1.000:. ./.:4:104,119:.: 1.23:1.000:. ./.:4:58,127:.: 0.52:1.000:. ./.:4:82,143:.: 1.26:1.000:. ./.:4:57,74:.:-0.48:1.000:. ./.:4:135,185:.: 3.03:1.000:. ./.:4:29,78:.:-0.93:1.000:. ./.:4:91,86:.: 0.37:1.000:. ./.:4:92,136:.: 1.32:1.000:. ./.:4:80,124:.: 0.87:1.000:. ./.:4:123,177:.: 2.66:0.998:. ./.:4:72,106:.: 0.39:1.000:. ./.:4:74,75:.:-0.15:1.000:. ./.:4:93,103:.: 0.72:1.000:. ./.:4:50,70:.:-0.69:1.000:. ./.:4:78,129:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,88:.: 0.00:1.000:. ./.:4:116,151:.: 2.05:1.000:. ./.:4:60,127:.: 0.56:1.000:. ./.:4:72,200:.: 2.14:0.999:. ./.:4:101,123:.: 1.25:1.000:. ./.:4:29,54:.:-1.38:1.000:. ./.:4:104,140:.: 1.62:1.000:. ./.:4:61,89:.:-0.13:1.000:. ./.:4:73,102:.: 0.33:1.000:. ./.:4:44,106:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,130:.: 1.00:1.000:. ./.:4:60,102:.: 0.09:1.000:. ./.:4:88,165:.: 1.78:1.000:. ./.:4:111,133:.: 1.62:1.000:. ./.:4:42,82:.:-0.61:1.000:. ./.:4:63,127:.: 0.61:1.000:. ./.:4:94,133:.: 1.30:1.000:. ./.:4:81,114:.: 0.71:1.000:. ./.:4:39,48:.:-1.30:1.000:. ./.:4:91,103:.: 0.69:1.000:. ./.:4:56,108:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,106:.: 0.52:1.000:. ./.:4:48,75:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,48:.:-1.43:1.000:. ./.:4:74,99:.: 0.30:1.000:. ./.:4:55,102:.: 0.00:1.000:. ./.:4:50,83:.:-0.45:1.000:. ./.:4:74,132:.: 0.91:1.000:. ./.:4:89,146:.: 1.45:1.000:. ./.:4:82,152:.: 1.43:1.000:. ./.:4:92,140:.: 1.39:1.000:. ./.:4:89,127:.: 1.10:1.000:. ./.:4:76,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:53,75:.:-0.54:1.000:. ./.:4:84,123:.: 0.93:1.000:. ./.:4:87,108:.: 0.71:1.000:. ./.:4:61,134:.: 0.71:1.000:. ./.:4:53,96:.:-0.15:1.000:. ./.:4:55,90:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,103:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,61:.:-0.89:1.000:. ./.:4:59,113:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,80:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,95:.:-0.78:1.000:. ./.:4:28,48:.:-1.51:1.000:. ./.:4:107,122:.: 1.34:1.000:. ./.:4:46,80:.:-0.58:1.000:. ./.:4:67,106:.: 0.30:1.000:. ./.:4:35,88:.:-0.63:1.000:. ./.:4:37,69:.:-0.95:1.000:. ./.:4:31,60:.:-1.23:1.000:. ./.:4:35,68:.:-1.00:1.000:. ./.:4:32,71:.:-1.00:1.000:. ./.:4:51,78:.:-0.52:1.000:. ./.:4:50,86:.:-0.39:1.000:. ./.:4:20,31:.:-1.97:1.000:. ./.:4:41,84:.:-0.60:1.000:. ./.:4:71,75:.:-0.20:1.000:. ./.:4:14,59:.:-1.56:0.999:. ./.:4:49,123:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,76:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,71:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,59:.:-1.13:1.000:. ./.:4:32,52:.:-1.36:1.000:. ./.:4:38,65:.:-1.00:1.000:. ./.:4:48,55:.:-1.00:1.000:. ./.:4:63,96:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,95:.: 0.26:1.000:. ./.:4:59,91:.:-0.13:1.000:. ./.:4:58,98:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,86:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,111:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,98:.:-0.24:1.000:. ./.:4:57,145:.: 0.84:1.000:. ./.:4:38,62:.:-1.06:1.000:. ./.:4:37,73:.:-0.87:1.000:. -chr4.1 15544441 chr4.1_015544441 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:116,64:0.41: 1.01:1.000:0.857 0/0/0/1:4:100,25:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,24:0.18: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:170,26:0.16: 1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,69:0.44: 1.01:1.000:0.963 0/0/0/1:4:164,37:0.23: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,9:0.18:-1.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,31:0.21: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,40:0.42:-0.73:1.000:0.930 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.83:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:36,54:0.57:-1.16:1.000:0.946 0/0/1/1:4:71,50:0.47:-0.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:98,41:0.35: 0.02:1.000:0.824 0/0/0/1:4:143,28:0.20: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,63:0.45: 0.50:1.000:0.981 0/0/1/1:4:93,71:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:137,25:0.19: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,71:0.44: 1.13:1.000:0.964 0/0/0/1:4:108,45:0.35: 0.36:1.000:0.831 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-3.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,28:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,30:0.39:-1.21:1.000:0.732 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-3.19:1.000:0.644 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,35:0.27: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,34:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,66:0.48: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,72:0.46: 0.94:1.000:0.989 0/0/1/1:4:89,56:0.44: 0.16:1.000:0.968 0/0/1/1:4:5,7:0.56:-3.04:1.000:0.962 0/0/0/1:4:24,3:0.14:-2.68:1.000:0.958 0/0/0:3:1,0:0.00:-3.31:0.999:1.000 0/0/0/1:4:123,29:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,35:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,44:0.32: 0.55:1.000:0.943 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,78:0.60:-0.54:1.000:0.766 0/0/1/1:4:41,94:0.61:-0.08:1.000:0.651 0/0/0/1:4:134,30:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,29:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,20:0.17: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,66:0.48: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,70:0.42: 1.32:1.000:0.898 0/0/1/1:4:58,56:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,19:0.18:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,61:0.51:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,16:0.15:-0.15:1.000:0.988 0/0/1/1:4:110,89:0.50: 1.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,41:0.42:-0.63:1.000:0.913 0/0/1/1:4:103,71:0.46: 0.86:1.000:0.989 0/0/0/1:4:121,26:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,48:0.43:-0.25:1.000:0.944 0/0/0/1:4:85,32:0.32:-0.51:1.000:0.942 0/0/0/1:4:97,23:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,59:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:86,31:0.32:-0.51:1.000:0.910 0/0/0/1:4:142,24:0.18: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,35:0.29: 0.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:115,34:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,26:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,33:0.21: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,29:0.19: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,17:0.25:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,59:0.46: 0.19:1.000:0.987 0/0/0/1:4:100,26:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,25:0.23:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,49:0.37: 0.36:1.000:0.531 0/0/1/1:4:35,20:0.42:-2.01:1.000:0.902 0/0/0/1:4:93,22:0.24:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,32:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,68:0.60:-0.90:1.000:0.762 0/0/1/1:4:63,41:0.45:-0.82:1.000:0.979 0/0/0/1:4:85,11:0.14:-1.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:100,72:0.47: 0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:106,75:0.47: 1.03:1.000:0.992 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,68:0.59:-0.80:0.999:0.854 0/0/0/1:4:99,27:0.26:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:160,35:0.22: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,27:0.22: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,11:0.12:-0.61:1.000:0.774 0/0/0/1:4:133,20:0.16: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,30:0.40:-1.26:1.000:0.808 0/0/1/1:4:61,40:0.45:-0.90:1.000:0.981 0/0/1/1:4:60,42:0.47:-0.87:1.000:0.991 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,53:0.59:-1.38:1.000:0.833 0/0/0/1:4:130,22:0.18: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,44:0.27: 1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,34:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,37:0.28: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,17:0.16:-0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,23:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,49:0.43:-0.17:1.000:0.941 0/0/1/1:4:86,53:0.44: 0.02:1.000:0.959 0/0/0/1:4:156,31:0.21: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,11:0.20:-1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,50:0.46:-0.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:69,33:0.38:-0.87:1.000:0.514 0/0/0/0:4:129,1:0.01:-0.20:0.998:1.000 0/0/1/1:4:59,58:0.52:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,60:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,64:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,56:0.45: 0.12:1.000:0.976 0/0/1/1:4:111,64:0.42: 0.89:1.000:0.912 0/0/0/1:4:123,33:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,69:0.57:-0.51:1.000:0.957 0/0/0/1:4:179,45:0.25: 2.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,47:0.45:-0.46:0.999:0.980 0/0/1/1:4:41,77:0.59:-0.49:1.000:0.839 0/0/0/1:4:78,25:0.29:-0.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:83,47:0.42:-0.20:1.000:0.892 0/0/0/1:4:71,15:0.22:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,41:0.46:-0.90:1.000:0.988 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,52:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,26:0.20: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,35:0.31:-0.03:1.000:0.980 0/0/1/1:4:96,58:0.43: 0.38:1.000:0.948 0/0/1/1:4:106,63:0.43: 0.74:1.000:0.938 0/0/0/1:4:118,18:0.16:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,41:0.29: 0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:93,18:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,23:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,32:0.39:-1.04:1.000:0.687 0/0/0/1:4:100,14:0.15:-0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,50:0.44:-0.22:1.000:0.970 0/0/0/1:4:140,32:0.23: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,68:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,50:0.45:-0.32:1.000:0.984 0/0/1/1:4:103,77:0.48: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,74:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,20:0.18:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,22:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,29:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,51:0.42: 0.02:1.000:0.917 0/0/0/1:4:112,30:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,62:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,50:0.52:-0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,58:0.42: 0.48:1.000:0.917 0/0/0/1:4:152,31:0.21: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,20:0.14: 0.98:1.000:0.961 0/0/1/1:4:85,53:0.44: 0.00:1.000:0.964 0/0/0/1:4:154,46:0.28: 1.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,22:0.19: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,29:0.17: 1.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,59:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,2:0.09:-2.63:1.000:0.973 0/0/1/1:4:52,33:0.44:-1.28:1.000:0.971 0/0/1/1:4:107,60:0.41: 0.69:1.000:0.880 0/0/0/1:4:136,27:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,31:0.22: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,18:0.14: 0.48:1.000:0.971 0/0/0/1:4:127,24:0.20: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,39:0.38:-0.46:1.000:0.572 0/0/0/1:4:119,30:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,81:0.59:-0.25:1.000:0.892 0/0/1/1:4:88,59:0.46: 0.21:1.000:0.985 0/0/1/1:4:116,56:0.38: 0.82:1.000:0.542 0/0/1/1:4:81,53:0.45:-0.10:1.000:0.980 0/0/1/1:4:69,45:0.45:-0.58:1.000:0.979 0/0/0/1:4:135,15:0.12: 0.28:0.999:0.834 0/0/1/1:4:94,58:0.44: 0.33:1.000:0.960 0/0/0/1:4:120,24:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.32:-0.70:1.000:0.962 0/0/0/1:4:82,20:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,27:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,64:0.47: 0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:81,45:0.41:-0.29:1.000:0.868 0/0/1/1:4:43,84:0.60:-0.27:1.000:0.809 0/0/1/1:4:101,58:0.42: 0.50:1.000:0.908 0/0/0/1:4:148,33:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,57:0.47: 0.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,55:0.41: 0.43:1.000:0.837 0/0/0/1:4:135,29:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,63:0.39: 1.13:1.000:0.728 0/0/0/1:4:125,28:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,32:0.43:-1.26:1.000:0.935 0/0/1/1:4:114,68:0.43: 1.06:1.000:0.940 -chr4.1 15813800 chr4.1_015813800 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.28:0.999:. ./.:4:44,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.91:1.000:. ./.:6:44,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:71,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:0.999:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.14:0.998:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:63,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.78:0.999:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.32:1.000:. -chr4.1 15983024 chr4.1_015983024 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:199,201:0.51: 1.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,174:0.77:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,227:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,275:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,180:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,279:0.79: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,154:0.75:-1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,219:0.72: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,123:0.49:-0.47:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,150:0.99:-2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,83:0.81:-2.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,69:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,142:0.46: 0.33:1.000:0.989 0/0/1/1:4:171,154:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:92,249:0.74: 0.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:142,144:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,131:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:77,284:0.79: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,149:0.47: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:198,176:0.48: 1.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,37:0.32:-2.41:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,340:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,255:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,121:0.47:-0.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:20,55:0.74:-3.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,226:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,324:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,218:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:104,345:0.77: 2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,109:0.45:-0.63:1.000:0.982 0/0/1/1:4:114,105:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,119:0.47:-0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,48:0.62:-3.07:1.000:0.561 0/1/1/1:4:33,158:0.83:-1.42:1.000:0.998 1/1/1:3:4,74:0.95:-3.07:0.999:1.000 0/1/1/1:4:83,238:0.75: 0.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,290:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,200:0.74:-0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,167:0.72:-0.78:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,241:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,71:0.27:-0.11:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:83,251:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,181:0.78:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,226:0.74: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,152:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:201,201:0.50: 1.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,45:0.48:-2.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,183:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,85:0.55:-1.93:1.000:0.980 0/1/1/1:4:64,192:0.76:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,196:0.52: 1.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:113,143:0.56:-0.47:1.000:0.961 0/0/1/1:4:170,156:0.48: 0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,215:0.72: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,97:0.49:-1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,142:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,139:0.72:-1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,121:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:89,230:0.73: 0.45:1.000:0.712 0/1/1/1:4:96,275:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,172:0.66:-0.37:1.000:0.865 0/1/1/1:4:71,271:0.80: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,140:0.73:-1.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:77,253:0.77: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,270:0.83: 0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,191:0.78:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,141:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,220:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,181:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,187:0.57: 0.64:1.000:0.951 0/0/1/1:4:95,97:0.51:-1.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,157:0.65:-0.66:1.000:0.805 0/1/1/1:4:103,245:0.71: 0.87:1.000:0.992 0/0/0/1:4:222,66:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,125:0.53:-0.70:1.000:0.994 0/1/1/1:4:69,253:0.79: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,190:0.55: 0.86:1.000:0.977 0/0/1/1:4:163,122:0.44:-0.05:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,307:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,64:0.30:-0.97:0.999:0.981 0/1/1/1:4:78,199:0.72:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,233:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,215:0.80:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,175:0.73:-0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,243:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,96:0.45:-1.04:1.000:0.980 0/1/1/1:4:75,229:0.76: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,172:0.56: 0.35:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,308:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,49:0.23:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,189:0.72:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,227:0.80:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,186:0.78:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,221:0.81:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,196:0.79:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,224:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,97:0.48:-1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,192:0.52: 1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,189:0.73:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,274:0.79: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,172:0.52: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,120:0.51:-0.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,390:1.00: 1.49:0.998:1.000 0/0/1/1:4:117,110:0.49:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,140:0.55:-0.47:1.000:0.978 0/0/1/1:4:129,103:0.45:-0.82:1.000:0.981 0/0/1/1:4:158,151:0.49: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,197:0.52: 1.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:86,253:0.75: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:240,81:0.27: 0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:100,269:0.73: 1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:173,183:0.52: 0.99:0.999:0.995 0/0/0/1:4:229,74:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,160:0.76:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,157:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,240:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,120:0.51:-0.75:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,285:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,138:0.53:-0.34:1.000:0.994 0/1/1/1:4:85,246:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,224:0.75: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,154:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,177:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,197:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,305:0.78: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,219:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,134:0.68:-1.29:1.000:0.941 0/0/1/1:4:90,116:0.57:-1.20:1.000:0.951 0/1/1/1:4:70,202:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,165:0.54: 0.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:72,261:0.79: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,194:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,150:0.54:-0.15:1.000:0.985 0/0/1/1:4:172,159:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,172:0.52: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:159,129:0.46: 0.00:1.000:0.984 0/1/1/1:4:69,232:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,243:0.81: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,238:0.82: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,156:0.49: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:80,212:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:155,173:0.53: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:103,137:0.58:-0.70:1.000:0.929 0/0/1/1:4:179,242:0.58: 1.94:1.000:0.914 0/1/1/1:4:124,311:0.72: 2.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,276:0.77: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,157:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,213:0.79:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,205:0.71: 0.06:1.000:0.991 0/1/1/1:4:102,279:0.74: 1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,132:0.46: 0.03:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,118:0.88:-2.25:1.000:0.683 0/0/1/1:4:111,125:0.53:-0.76:1.000:0.990 0/0/1/1:4:131,164:0.56: 0.10:1.000:0.966 0/1/1/1:4:89,264:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:116,342:0.75: 2.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,241:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,178:0.67:-0.30:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,360:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,177:0.55: 0.54:1.000:0.980 0/1/1/1:4:66,167:0.72:-0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:204,61:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:240,82:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,94:0.44:-1.05:1.000:0.972 0/0/1/1:4:141,145:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,146:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,220:0.74: 0.14:0.999:0.999 0/0/1/1:4:182,163:0.48: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,201:0.74:-0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:159,162:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,146:0.74:-1.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:79,244:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,139:0.49:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,93:0.48:-1.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:179,54:0.25:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,145:0.45: 0.52:1.000:0.984 0/1/1/1:4:105,269:0.72: 1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,150:0.48: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,186:0.57: 0.61:1.000:0.950 0/1/1/1:4:134,263:0.67: 1.59:1.000:0.912 0/0/1/1:4:217,165:0.44: 1.37:1.000:0.967 0/1/1/1:4:113,336:0.75: 2.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,107:0.44:-0.59:1.000:0.967 0/0/1/1:4:162,166:0.51: 0.58:1.000:0.996 -chr4.1 16811129 chr4.1_016811129 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:68,67:0.48: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,38:0.41:-0.83:1.000:0.832 0/0/1/1:4:56,69:0.54: 0.21:1.000:0.988 0/0/1/1:4:64,51:0.43:-0.09:1.000:0.950 0/0/1/1:4:46,74:0.60: 0.06:1.000:0.778 0/0/0/1:4:148,54:0.25: 2.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,53:0.58:-0.89:1.000:0.909 0/0/1/1:4:62,66:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,69:0.47: 0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,16:0.38:-2.35:1.000:0.538 0/0/0/1:4:62,9:0.12:-1.44:1.000:0.763 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,78:0.57: 0.49:1.000:0.951 0/0/1/1:4:66,68:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,60:0.52:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,34:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,48:0.31: 0.88:1.000:0.968 0/1/1/1:4:34,111:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,86:0.49: 1.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:150,39:0.20: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,10:0.18:-1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,61:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,65:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,73:0.46: 1.09:1.000:0.989 0/0/0/1:4:56,13:0.18:-1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,91:0.52: 1.58:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,121:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,75:0.54: 0.52:1.000:0.986 0/0/0/1:4:97,37:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,88:0.46: 2.13:1.000:0.985 0/0/1/1:4:102,106:0.50: 2.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:120,42:0.25: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,24:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,44:0.78:-1.92:1.000:1.000 0/0/1:3:19,14:0.41:-2.59:0.999:0.997 0/0/0/1:4:104,29:0.21: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,80:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,28:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,68:0.45: 0.85:1.000:0.983 0/0/1/1:4:101,89:0.46: 2.19:1.000:0.985 0/0/0/1:4:92,26:0.21: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,33:0.27: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,46:0.30: 0.88:1.000:0.986 0/0/1/1:4:43,45:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,51:0.41: 0.12:1.000:0.836 0/0/0/1:4:77,31:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,36:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,95:0.48: 2.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,59:0.46: 0.24:1.000:0.985 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,43:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/0:4:157,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,38:0.27: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,24:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,35:0.22: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,31:0.32:-0.73:1.000:0.962 0/0/1/1:4:68,72:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,65:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:58,10:0.14:-1.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,32:0.33:-0.73:1.000:0.931 0/0/1/1:4:50,61:0.54:-0.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:106,33:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,33:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,66:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:115,25:0.17: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,48:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,28:0.30:-0.86:1.000:0.987 0/0/1/1:4:66,77:0.53: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,25:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,39:0.47:-1.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:130,49:0.26: 1.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,67:0.53: 0.18:1.000:0.993 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,31:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,52:0.54:-0.73:1.000:0.987 0/0/0/1:4:59,23:0.27:-1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,50:0.43:-0.19:1.000:0.957 0/0/1/1:4:67,73:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,32:0.28:-0.31:0.999:0.995 0/1/1/1:4:36,96:0.71: 0.42:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,58:0.57:-0.55:1.000:0.956 0/1/1/1:4:19,62:0.74:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,76:0.49: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,105:0.75: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,54:0.60:-0.92:1.000:0.803 0/0/1/1:4:34,22:0.38:-1.89:1.000:0.572 0/0/0/1:4:60,28:0.30:-0.92:1.000:0.980 0/0/1/1:4:73,54:0.41: 0.27:1.000:0.881 0/0/0/1:4:72,21:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,46:0.52:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,57:0.53:-0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:57,22:0.26:-1.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,71:0.57: 0.09:1.000:0.939 0/1/1/1:4:28,123:0.79: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,29:0.36:-1.22:1.000:0.701 0/0/0/1:4:58,20:0.24:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,30:0.29:-0.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,65:0.57:-0.19:1.000:0.955 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,31:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:61,27:0.29:-0.92:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,53:0.58:-0.89:0.998:0.909 0/0/1/1:4:42,47:0.52:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,71:0.59:-0.03:1.000:0.851 0/0/1/1:4:46,67:0.58:-0.16:1.000:0.919 0/0/1/1:4:71,73:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,37:0.29: 0.09:1.000:0.991 0/1/1/1:4:28,84:0.73:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,23:0.24:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,91:0.49: 1.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,45:0.48:-0.80:0.999:0.994 0/0/0/1:4:75,30:0.27:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,35:0.46:-1.34:1.000:0.988 0/0/0/1:4:64,30:0.31:-0.73:1.000:0.979 0/0/0/1:4:61,26:0.29:-0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,57:0.56:-0.55:1.000:0.972 0/0/1/1:4:43,53:0.54:-0.67:1.000:0.988 0/0/0/1:4:45,20:0.29:-1.62:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,71:0.59: 0.00:1.000:0.881 0/1/1/1:4:21,68:0.74:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,36:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,77:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,22:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,66:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,36:0.29:-0.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:56,24:0.29:-1.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:64,25:0.27:-0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:84,33:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,68:0.53: 0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:36,42:0.53:-1.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:69,30:0.29:-0.58:1.000:0.992 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,96:0.52: 1.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,63:0.55:-0.22:1.000:0.975 0/0/0/1:4:58,22:0.26:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,42:0.56:-1.37:1.000:0.964 0/0/1/1:4:52,40:0.42:-0.80:1.000:0.924 0/0/1/1:4:42,44:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,67:0.76:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,41:0.23: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,63:0.53:-0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:100,33:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,66:0.53: 0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:77,75:0.48: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,33:0.30:-0.43:1.000:0.981 0/0/0/1:4:140,37:0.20: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,41:0.23: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,27:0.75:-2.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,31:0.21: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,29:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,61:0.47: 0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,78:0.53: 0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,51:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:78,64:0.44: 0.73:1.000:0.965 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,51:0.40: 0.18:1.000:0.781 0/0/0/1:4:109,41:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,29:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,82:0.49: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,62:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,59:0.50:-0.06:0.999:0.997 0/0/0/1:4:71,25:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,65:0.44: 0.79:1.000:0.966 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,80:0.79:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,62:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,19:0.21:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,37:0.31:-0.09:1.000:0.976 0/0/0/1:4:91,32:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,97:0.49: 2.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,40:0.28: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:111,37:0.24: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,46:0.38:-0.06:1.000:0.620 0/0/0/1:4:116,27:0.18: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,40:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,70:0.44: 1.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:54,48:0.46:-0.49:1.000:0.987 0/0/0/1:4:74,37:0.32:-0.22:1.000:0.953 -chr4.1 17113106 chr4.1_017113106 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:96,30:.: 0.76:1.000:. ./.:4:45,38:.:-0.62:1.000:. ./.:4:67,24:.:-0.36:1.000:. ./.:4:88,38:.: 0.76:1.000:. ./.:4:61,84:.: 1.37:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:20,21:.:-1.97:1.000:. ./.:4:67,29:.:-0.20:1.000:. ./.:4:53,52:.: 0.09:1.000:. ./.:4:16,11:.:-2.41:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:87,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:70,31:.:-0.04:1.000:. ./.:4:60,56:.: 0.44:1.000:. ./.:4:61,23:.:-0.59:1.000:. ./.:4:95,33:.: 0.82:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,78:.:-0.14:1.000:. ./.:4:83,39:.: 0.63:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,6:.:-2.13:1.000:. ./.:4:100,26:.: 0.76:1.000:. ./.:4:111,39:.: 1.53:1.000:. ./.:4:65,21:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,5:.:-2.70:1.000:. ./.:4:59,22:.:-0.68:1.000:. ./.:4:77,64:.: 1.24:1.000:. ./.:4:52,71:.: 0.66:1.000:. ./.:4:132,31:.: 1.95:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:51,49:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:20,9:.:-2.35:1.000:. ./.:3:7,4:.:-2.93:0.999:. ./.:4:79,29:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,22:.:-0.07:1.000:. ./.:4:112,31:.: 1.30:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:66,51:.: 0.47:1.000:. ./.:4:95,36:.: 0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,29:.: 1.50:1.000:. ./.:4:45,30:.:-0.88:1.000:. ./.:4:64,59:.: 0.66:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:13,7:.:-2.64:1.000:. ./.:4:50,29:.:-0.75:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,28:.: 1.21:1.000:. ./.:4:85,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:67,44:.: 0.28:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:55,34:.:-0.43:1.000:. ./.:6:98,31:.: 0.86:1.000:. ./.:4:111,24:.: 1.05:1.000:. ./.:4:61,24:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,65:.: 1.46:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:90,55:.: 1.37:1.000:. ./.:4:107,21:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,18:.:-1.52:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,24:.:-0.14:1.000:. ./.:4:74,50:.: 0.70:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:35,11:.:-1.81:1.000:. ./.:4:70,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:106,29:.: 1.05:1.000:. ./.:4:94,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:62,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:63,50:.: 0.34:1.000:. ./.:4:141,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:93,68:.: 1.88:1.000:. ./.:4:53,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:63,41:.: 0.05:0.999:. ./.:4:58,56:.: 0.37:1.000:. ./.:4:108,59:.: 2.07:1.000:. ./.:4:70,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:36,42:.:-0.78:1.000:. ./.:4:60,27:.:-0.49:1.000:. ./.:4:65,17:.:-0.65:1.000:. ./.:4:51,28:.:-0.75:1.000:. ./.:4:82,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,35:.: 0.89:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:51,73:.: 0.70:1.000:. ./.:4:74,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:70,26:.:-0.20:1.000:. ./.:4:113,29:.: 1.27:1.000:. ./.:4:90,37:.: 0.79:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:94,30:.: 0.70:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:100,51:.: 1.56:0.998:. ./.:4:62,23:.:-0.55:1.000:. ./.:4:76,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,41:.: 0.66:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:92,33:.: 0.73:1.000:. ./.:4:51,67:.: 0.50:1.000:. ./.:4:118,24:.: 1.27:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:66,29:.:-0.23:0.999:. ./.:4:105,24:.: 0.86:1.000:. ./.:4:48,53:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,24:.:-0.36:1.000:. ./.:4:47,51:.:-0.14:1.000:. ./.:4:74,50:.: 0.70:1.000:. ./.:4:88,32:.: 0.57:1.000:. ./.:4:46,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:57,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:46,52:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,27:.: 1.14:1.000:. ./.:4:60,59:.: 0.54:1.000:. ./.:4:60,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,24:.: 0.05:1.000:. ./.:4:68,25:.:-0.30:0.999:. ./.:4:113,35:.: 1.46:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:94,36:.: 0.89:1.000:. ./.:4:105,30:.: 1.05:1.000:. ./.:4:82,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,40:.: 0.18:1.000:. ./.:4:94,65:.: 1.82:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:71,38:.: 0.21:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:78,18:.:-0.20:1.000:. ./.:4:98,37:.: 1.05:1.000:. ./.:4:121,44:.: 2.01:1.000:. ./.:4:79,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:87,70:.: 1.75:1.000:. ./.:4:57,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,4:.:-2.90:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:65,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:114,30:.: 1.34:1.000:. ./.:4:59,18:.:-0.81:1.000:. ./.:4:79,59:.: 1.14:1.000:. ./.:4:64,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:81,64:.: 1.37:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:75,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:91,21:.: 0.31:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:63,28:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:91,22:.: 0.34:1.000:. ./.:4:44,88:.: 0.95:0.999:. ./.:4:89,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,42:.:-0.68:1.000:. ./.:4:73,20:.:-0.30:1.000:. ./.:4:107,29:.: 1.08:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:89,26:.: 0.41:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:102,27:.: 0.86:1.000:. ./.:4:75,28:.: 0.02:1.000:. ./.:4:72,59:.: 0.92:1.000:. ./.:4:77,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:79,39:.: 0.50:1.000:. ./.:4:51,33:.:-0.59:1.000:. ./.:4:88,56:.: 1.34:1.000:. -chr4.1 17342544 chr4.1_017342544 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:194,59:.: 1.65:1.000:. ./.:4:92,81:.: 0.18:1.000:. ./.:4:110,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:158,41:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:137,68:.: 0.77:1.000:. ./.:4:66,27:.:-1.29:1.000:. ./.:4:171,44:.: 0.95:1.000:. ./.:4:116,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:37,15:.:-2.04:1.000:. ./.:4:13,1:.:-2.74:1.000:. ./.:4:139,96:.: 1.32:1.000:. ./.:4:151,42:.: 0.55:1.000:. ./.:4:174,50:.: 1.12:1.000:. ./.:4:159,43:.: 0.71:1.000:. ./.:4:171,47:.: 1.01:1.000:. ./.:4:123,54:.: 0.25:1.000:. ./.:4:131,114:.: 1.51:1.000:. ./.:4:225,61:.: 2.26:1.000:. ./.:4:247,60:.: 2.65:1.000:. ./.:4:42,7:.:-2.10:1.000:. ./.:4:181,52:.: 1.28:1.000:. ./.:4:118,43:.:-0.04:1.000:. ./.:4:173,58:.: 1.25:1.000:. ./.:4:27,4:.:-2.43:1.000:. ./.:4:107,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:103,45:.:-0.28:1.000:. ./.:4:112,54:.: 0.05:1.000:. ./.:4:175,49:.: 1.12:1.000:. ./.:4:116,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:90,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,28:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,7:.:-2.82:1.000:. ./.:4:40,23:.:-1.84:1.000:. ./.:3:35,3:.:-2.30:0.999:. ./.:4:104,43:.:-0.30:1.000:. ./.:4:152,26:.: 0.27:1.000:. ./.:4:172,51:.: 1.10:1.000:. ./.:4:89,33:.:-0.76:1.000:. ./.:4:162,49:.: 0.88:1.000:. ./.:4:108,46:.:-0.17:1.000:. ./.:4:143,41:.: 0.38:1.000:. ./.:4:132,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:89,41:.:-0.61:1.000:. ./.:4:110,36:.:-0.32:1.000:. ./.:4:138,60:.: 0.64:1.000:. ./.:4:127,36:.: 0.00:1.000:. ./.:4:13,6:.:-2.65:1.000:. ./.:4:68,34:.:-1.13:1.000:. ./.:4:39,14:.:-2.03:1.000:. ./.:4:90,36:.:-0.68:1.000:. ./.:4:165,53:.: 1.01:1.000:. ./.:4:130,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:109,53:.:-0.02:1.000:. ./.:4:155,38:.: 0.55:1.000:. ./.:4:69,30:.:-1.18:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:47,24:.:-1.70:1.000:. ./.:4:91,37:.:-0.65:1.000:. ./.:6:126,33:.:-0.08:1.000:. ./.:4:145,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:95,35:.:-0.61:1.000:. ./.:4:172,45:.: 0.99:1.000:. ./.:4:82,35:.:-0.85:1.000:. ./.:4:180,52:.: 1.27:1.000:. ./.:4:112,51:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,26:.:-0.90:1.000:. ./.:4:164,50:.: 0.94:1.000:. ./.:4:149,25:.: 0.20:1.000:. ./.:4:110,82:.: 0.53:1.000:. ./.:4:151,34:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,10:.:-1.84:1.000:. ./.:4:87,73:.:-0.06:1.000:. ./.:4:171,45:.: 0.97:1.000:. ./.:4:73,76:.:-0.26:1.000:. ./.:4:129,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:81,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:124,36:.:-0.06:1.000:. ./.:4:133,31:.: 0.02:1.000:. ./.:4:104,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:70,70:.:-0.43:0.999:. ./.:4:88,37:.:-0.70:1.000:. ./.:4:149,40:.: 0.48:1.000:. ./.:4:96,39:.:-0.52:1.000:. ./.:4:76,41:.:-0.85:1.000:. ./.:4:112,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:101,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:74,24:.:-1.20:1.000:. ./.:4:145,29:.: 0.20:1.000:. ./.:4:151,61:.: 0.90:1.000:. ./.:4:75,41:.:-0.87:1.000:. ./.:4:104,30:.:-0.54:1.000:. ./.:4:141,41:.: 0.35:1.000:. ./.:4:107,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:98,36:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,36:.:-1.18:1.000:. ./.:4:88,50:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,63:.:-0.65:1.000:. ./.:4:139,41:.: 0.31:1.000:. ./.:4:202,65:.: 1.91:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.87:1.000:. ./.:4:92,50:.:-0.39:1.000:. ./.:4:123,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:125,37:.:-0.02:0.998:. ./.:4:93,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:147,50:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,33:.:-0.65:1.000:. ./.:4:133,51:.: 0.38:1.000:. ./.:4:138,73:.: 0.88:1.000:. ./.:4:95,51:.:-0.32:1.000:. ./.:4:151,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:167,55:.: 1.08:1.000:. ./.:4:93,43:.:-0.50:0.999:. ./.:4:147,30:.: 0.25:1.000:. ./.:4:60,17:.:-1.59:1.000:. ./.:4:167,55:.: 1.08:1.000:. ./.:4:97,42:.:-0.44:1.000:. ./.:4:123,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:66,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:107,45:.:-0.21:1.000:. ./.:4:136,48:.: 0.38:1.000:. ./.:4:63,33:.:-1.24:1.000:. ./.:4:146,42:.: 0.46:1.000:. ./.:4:167,83:.: 1.60:1.000:. ./.:4:78,40:.:-0.83:1.000:. ./.:4:139,25:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:77,46:.:-0.74:1.000:. ./.:4:96,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:83,37:.:-0.79:1.000:. ./.:4:117,30:.:-0.30:1.000:. ./.:4:198,51:.: 1.58:1.000:. ./.:4:78,28:.:-1.05:0.999:. ./.:4:101,30:.:-0.59:1.000:. ./.:4:139,46:.: 0.40:1.000:. ./.:4:190,54:.: 1.49:1.000:. ./.:4:86,42:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:77,35:.:-0.94:1.000:. ./.:4:106,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:91,28:.:-0.81:1.000:. ./.:4:90,33:.:-0.74:1.000:. ./.:4:197,46:.: 1.47:1.000:. ./.:4:112,32:.:-0.35:1.000:. ./.:4:220,55:.: 2.06:1.000:. ./.:4:134,59:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,52:.: 0.46:1.000:. ./.:4:156,41:.: 0.62:1.000:. ./.:4:121,44:.: 0.03:1.000:. ./.:4:140,34:.: 0.20:1.000:. ./.:4:175,63:.: 1.38:1.000:. ./.:4:132,59:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,5:.:-2.10:1.000:. ./.:4:150,38:.: 0.46:1.000:. ./.:4:100,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:189,54:.: 1.47:1.000:. ./.:4:169,52:.: 1.06:1.000:. ./.:4:202,56:.: 1.74:1.000:. ./.:4:124,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:159,59:.: 1.01:1.000:. ./.:4:175,52:.: 1.17:1.000:. ./.:4:98,41:.:-0.44:1.000:. ./.:4:169,40:.: 0.84:1.000:. ./.:4:118,46:.: 0.02:1.000:. ./.:4:78,29:.:-1.03:1.000:. ./.:4:150,31:.: 0.33:1.000:. ./.:4:159,44:.: 0.73:1.000:. ./.:4:135,125:.: 1.78:0.999:. ./.:4:101,46:.:-0.30:1.000:. ./.:4:119,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:156,45:.: 0.70:1.000:. ./.:4:83,47:.:-0.61:1.000:. ./.:4:150,36:.: 0.42:1.000:. ./.:4:152,40:.: 0.53:1.000:. ./.:4:104,40:.:-0.35:1.000:. ./.:4:100,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:144,53:.: 0.62:1.000:. ./.:4:203,46:.: 1.58:1.000:. ./.:4:101,38:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,58:.: 0.94:1.000:. ./.:4:152,58:.: 0.86:1.000:. ./.:4:193,66:.: 1.76:1.000:. ./.:4:148,74:.: 1.08:1.000:. ./.:4:137,44:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,92:.: 0.79:1.000:. -chr4.1 17413262 chr4.1_017413262 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:26,38:0.59:-0.06:1.000:0.852 0/0/0/1:4:86,13:0.18: 1.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,30:0.60:-0.79:1.000:0.760 0/0/1/1:4:29,37:0.53: 0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:28,28:0.47:-0.48:1.000:0.991 0/1/1/1:4:22,37:0.65:-0.32:1.000:0.822 0/0/1/1:4:28,30:0.48:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,30:0.35: 1.10:1.000:0.752 0/0/1/1:4:29,33:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,9:0.26:-1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,24:0.79:-1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,45:0.72: 0.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,46:0.69: 0.31:1.000:0.976 0/0/1/1:4:32,44:0.56: 0.57:1.000:0.959 0/1/1/1:4:13,36:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,55:0.68: 1.10:1.000:0.943 0/1/1/1:4:21,34:0.64:-0.53:1.000:0.652 0/0/0/1:4:75,11:0.17: 1.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,63:0.65: 1.89:1.000:0.766 0/1/1/1:4:43,72:0.65: 2.63:1.000:0.806 1/1/1/1:4:1,40:0.98:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,45:0.46: 1.36:1.000:0.989 0/1/1/1:4:20,45:0.76: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,63:0.78: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.56:-2.06:1.000:0.966 0/0/0/1:4:69,31:0.33: 1.84:1.000:0.939 0/0/0/1:4:46,14:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,31:0.74:-1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,56:0.74: 0.94:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,30:0.49:-0.43:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,10:0.39:-2.11:1.000:0.718 0/0/1:3:17,16:0.46:-1.69:0.999:0.950 0/0/1/1:4:38,39:0.47: 0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,39:0.39: 1.73:1.000:0.701 0/1/1/1:4:32,54:0.65: 1.10:1.000:0.833 0/1/1/1:4:13,34:0.78:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,34:0.39: 1.05:1.000:0.718 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,45:0.72: 0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,31:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:48,26:0.36: 0.47:1.000:0.733 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,37:0.75:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,29:0.77:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,37:0.63:-0.27:1.000:0.617 0/0/1/1:4:18,14:0.42:-1.74:1.000:0.916 0/0/1/1:4:41,62:0.61: 2.00:1.000:0.724 0/1/1/1:4:28,51:0.69: 0.73:1.000:0.969 0/0/1/1:4:31,33:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,24:0.38:-0.11:1.000:0.545 0/0/1/1:4:26,32:0.51:-0.37:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,28:0.45:-0.37:1.000:0.984 0/0/1/1:4:35,33:0.46: 0.15:1.000:0.985 0/0/1/1/1/1:6:21,39:0.70:-0.27:1.000:0.885 0/1/1/1:4:20,51:0.78: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,32:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,37:0.36: 2.05:1.000:0.696 0/0/1/1:4:17,23:0.56:-1.32:1.000:0.971 0/0/1/1:4:31,41:0.55: 0.36:1.000:0.983 0/0/0/1:4:55,24:0.32: 0.73:1.000:0.952 0/1/1/1:4:26,67:0.78: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,52:0.78: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,55:0.76: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,14:0.23: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,25:0.62:-1.27:1.000:0.551 0/0/0/1:4:83,22:0.25: 2.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,36:0.68:-0.48:1.000:0.959 0/1/1/1:4:18,45:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,57:0.66: 1.31:1.000:0.897 0/0/1/1:4:30,38:0.53: 0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,37:0.75:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,49:0.69: 0.57:1.000:0.967 0/0/0/1:4:58,21:0.29: 0.73:1.000:0.991 0/1/1/1:4:13,47:0.83:-0.27:0.999:0.998 0/0/1/1:4:28,24:0.44:-0.69:1.000:0.964 0/0/1/1:4:58,52:0.45: 2.36:1.000:0.976 0/0/1/1:4:20,24:0.50:-1.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,43:0.60: 0.36:1.000:0.805 0/1/1/1:4:23,37:0.63:-0.27:1.000:0.617 0/0/1/1:4:35,41:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:41,11:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,44:0.58: 0.52:1.000:0.919 0/0/1/1:4:43,31:0.41: 0.47:1.000:0.842 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,36:0.70:-0.53:1.000:0.988 0/0/1/1:4:35,49:0.57: 1.00:1.000:0.939 0/1/1/1:4:13,27:0.74:-1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,40:0.54: 0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:28,42:0.60: 0.26:1.000:0.760 0/0/1/1:4:25,34:0.56:-0.32:1.000:0.968 0/0/0/1:4:51,23:0.33: 0.47:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,45:0.46: 1.42:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,48:0.73: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,32:0.75:-0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,44:0.80:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,39:0.42: 1.26:0.998:0.918 0/0/1/1:4:29,38:0.54: 0.10:1.000:0.986 0/1/1/1:4:25,53:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,43:0.72: 0.00:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,23:0.44:-0.85:1.000:0.973 0/0/1/1:4:25,26:0.47:-0.74:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,50:0.53: 1.26:1.000:0.991 0/1/1/1:4:17,31:0.69:-0.90:0.999:0.970 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,25:0.68:-1.37:1.000:0.951 0/1/1/1:4:25,58:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,42:0.73:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,41:0.58: 0.26:1.000:0.925 0/0/0/1:4:46,17:0.30:-0.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,33:0.74:-0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,39:0.68:-0.22:1.000:0.942 0/0/1/1:4:20,26:0.54:-1.01:1.000:0.988 0/1/1/1:4:25,52:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,29:0.55:-0.74:1.000:0.984 0/0/1/1:4:20,27:0.56:-0.95:1.000:0.973 0/1/1/1:4:21,50:0.77: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,33:0.48:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,11:0.23:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,23:0.48:-1.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,33:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,49:0.66: 0.68:1.000:0.837 0/0/1/1:4:28,29:0.47:-0.43:0.999:0.993 0/0/1/1:4:28,28:0.47:-0.48:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,38:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,70:0.76: 1.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,28:0.67:-1.11:1.000:0.923 0/1/1/1:4:17,30:0.67:-0.95:1.000:0.936 0/0/1/1:4:34,30:0.44:-0.06:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,26:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,45:0.65: 0.36:1.000:0.788 0/1/1/1:4:19,39:0.74:-0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,71:0.73: 2.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,26:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,41:0.58: 0.26:1.000:0.925 0/1/1/1:4:21,39:0.70:-0.27:1.000:0.981 0/0/1/1:4:34,33:0.46: 0.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:42,31:0.41: 0.42:1.000:0.869 0/0/1/1:4:34,44:0.54: 0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:21,31:0.60:-0.69:1.000:0.821 0/1/1/1:4:8,20:0.78:-1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,33:0.69:-0.74:1.000:0.974 0/0/1/1:4:34,29:0.44:-0.11:1.000:0.963 0/1/1/1:4:28,57:0.73: 1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,33:0.46: 0.15:1.000:0.985 0/0/0/1:4:70,40:0.37: 2.36:1.000:0.625 0/0/1/1:4:19,26:0.56:-1.06:1.000:0.963 0/0/0/1:4:58,34:0.37: 1.42:1.000:0.568 0/1/1/1:4:26,49:0.70: 0.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:20,27:0.56:-0.95:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.44:-1.37:1.000:0.964 0/0/1/1:4:34,51:0.60: 1.05:1.000:0.760 0/1/1/1:4:24,46:0.71: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:85,25:0.26: 2.36:0.999:0.998 0/0/1/1:4:25,38:0.61:-0.11:1.000:0.700 0/1/1/1:4:27,47:0.67: 0.47:1.000:0.913 0/1/1/1:4:29,52:0.68: 0.84:1.000:0.956 0/0/1/1:4:16,20:0.52:-1.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,31:0.42: 0.36:1.000:0.893 0/1/1/1:4:10,46:0.86:-0.48:1.000:0.965 0/1/1/1:4:21,54:0.78: 0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,72:0.77: 1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,25:0.45:-0.64:1.000:0.976 0/0/1/1:4:36,41:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,48:0.66: 0.57:1.000:0.879 0/1/1/1:4:32,52:0.64: 1.00:1.000:0.671 0/0/1/1:4:42,43:0.47: 1.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,39:0.55: 0.15:1.000:0.975 0/0/1/1:4:42,27:0.39: 0.21:1.000:0.644 -chr4.1 17482305 chr4.1_017482305 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:312,108:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,286:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,274:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:286,84:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,335:0.49: 1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:238,317:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,196:0.55:-1.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:201,191:0.43:-0.33:1.000:0.933 0/0/1/1:4:163,291:0.57: 0.25:1.000:0.944 0/0/1/1:4:53,74:0.50:-2.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,92:0.48:-2.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:228,80:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:269,66:0.19:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,119:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:275,107:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:288,95:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,300:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:112,336:0.71: 0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:391,140:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,111:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/0:4:130,2:0.01:-2.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,176:0.43:-0.70:1.000:0.956 0/0/1/1:4:190,275:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:301,88:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.28:-3.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:202,234:0.46: 0.08:1.000:0.989 0/1/1/1:4:91,396:0.78: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,285:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:330,115:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:293,244:0.40: 1.02:1.000:0.794 0/0/1/1:4:212,320:0.52: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:242,172:0.37:-0.13:1.000:0.550 0/0/0/1:4:52,37:0.37:-3.17:1.000:0.548 0/0/1/1:4:76,120:0.53:-2.17:1.000:0.991 0/1/1:3:17,32:0.59:-3.54:0.999:0.997 0/0/1/1:4:185,318:0.56: 0.70:1.000:0.968 0/0/1/1:4:199,207:0.44:-0.20:1.000:0.971 0/0/0/1:4:289,84:0.22:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,342:0.52: 1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:226,219:0.43: 0.16:1.000:0.944 0/0/1/1:4:342,258:0.38: 1.61:1.000:0.595 0/0/0/0:4:435,1:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:368,130:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,296:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:114,490:0.78: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:394,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,359:0.53: 1.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:277,450:0.54: 2.80:1.000:0.986 0/1/1/1:4:71,352:0.80:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:338,132:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:207,294:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:338,116:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:299,105:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,352:0.55: 1.29:1.000:0.983 0/0/1/1:4:187,176:0.42:-0.61:1.000:0.927 0/0/1/1:4:216,305:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:268,192:0.37: 0.30:1.000:0.531 0/0/1/1:4:241,337:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,287:0.52: 0.44:1.000:0.994 0/0/0/0/1/1:6:252,88:0.25:-0.82:1.000:0.505 0/0/0/1:4:306,92:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,280:0.53: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:282,253:0.41: 1.00:1.000:0.889 0/0/1/1:4:240,304:0.48: 1.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:352,111:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:244,419:0.56: 2.20:1.000:0.968 0/0/0/1:4:223,81:0.26:-1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,84:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:369,97:0.20: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,314:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:521,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,238:0.53:-0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,365:0.74: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:334,111:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,97:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,106:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:201,330:0.55: 0.97:1.000:0.984 0/0/0/1:4:330,118:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:315,109:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,414:0.76: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,80:0.24:-0.89:0.999:1.000 0/0/1/1:4:230,326:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,221:0.43: 0.16:1.000:0.952 0/0/1/1:4:171,260:0.52: 0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:241,322:0.49: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:225,351:0.53: 1.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:240,80:0.24:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,369:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,96:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,200:0.42:-0.09:1.000:0.908 0/0/0/1:4:257,166:0.35:-0.04:1.000:0.758 0/0/1/1:4:200,300:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:340,109:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,75:0.25:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,293:0.54: 0.46:1.000:0.989 0/0/1/1:4:209,349:0.55: 1.22:1.000:0.979 0/0/1/1:4:176,290:0.55: 0.36:1.000:0.983 0/0/1/1:4:181,166:0.42:-0.76:1.000:0.908 0/0/0/0:4:432,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,218:0.43: 0.17:1.000:0.937 0/0/0/1:4:217,85:0.27:-1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:228,309:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:211,90:0.28:-1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,307:0.54: 0.65:0.998:0.987 0/0/0/1:4:282,100:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:264,97:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,81:0.24:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,192:0.36: 0.49:1.000:0.697 0/0/1/1:4:260,392:0.52: 2.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,302:0.54: 0.60:1.000:0.990 0/0/0/0:4:379,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,399:0.52: 2.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:185,270:0.51: 0.25:0.999:0.996 0/0/0/0:4:404,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,78:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:315,146:0.30: 0.31:1.000:0.988 0/0/0/1:4:269,67:0.20:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,108:0.27:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:113,396:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:301,101:0.25:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,95:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,287:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:296,106:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:182,314:0.56: 0.64:1.000:0.966 0/0/1/1:4:198,294:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:314,110:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,296:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:84,264:0.72:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/0:4:282,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,208:0.51:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:272,71:0.20:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:294,91:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,156:0.45:-1.21:0.999:0.981 0/0/0/1:4:319,89:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,89:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:370,121:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,191:0.34: 0.72:1.000:0.850 0/0/1/1:4:185,266:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,256:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:311,93:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,200:0.39: 0.26:1.000:0.674 0/0/1/1:4:181,235:0.48:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:258,79:0.23:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,74:0.22:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:344,109:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,359:0.49: 1.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:225,320:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:288,88:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,350:0.56: 1.15:1.000:0.961 0/0/1/1:4:169,194:0.46:-0.61:1.000:0.988 0/0/1/1:4:216,331:0.52: 1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:200,273:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,79:0.60:-2.89:1.000:0.785 0/0/0/1:4:202,76:0.26:-1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:215,334:0.53: 1.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:285,99:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:219,344:0.53: 1.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:243,224:0.42: 0.37:1.000:0.912 0/0/1/1:4:156,249:0.54:-0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:202,200:0.43:-0.24:1.000:0.954 0/0/0/1:4:261,114:0.29:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:172,268:0.53: 0.11:1.000:0.992 0/0/0/0:4:380,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,196:0.35: 0.73:1.000:0.795 0/0/1/1:4:194,299:0.53: 0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:270,97:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,96:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,270:0.66:-0.43:0.999:0.844 0/0/1/1:4:189,256:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,238:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:212,88:0.28:-1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,228:0.55:-0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:192,180:0.42:-0.52:1.000:0.924 0/0/0/1:4:262,77:0.22:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:289,99:0.25:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,150:0.37:-0.57:1.000:0.617 0/0/0/1:4:352,223:0.35: 1.38:1.000:0.792 0/0/0/1:4:331,108:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,280:0.52: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:266,148:0.33:-0.13:1.000:0.932 0/0/1/1:4:192,302:0.53: 0.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:338,120:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,342:0.54: 1.21:1.000:0.990 0/0/0/1:4:238,90:0.26:-0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:194,192:0.43:-0.39:1.000:0.954 -chr4.1 17726877 chr4.1_017726877 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:180,52:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,158:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,76:0.44:-1.26:1.000:0.968 0/0/0/1:4:139,46:0.26:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,125:0.49: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,118:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,102:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,110:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,119:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:110,91:0.45:-0.47:1.000:0.983 0/0/1/1:4:103,110:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,53:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,51:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,42:0.20:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,48:0.27:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,37:0.21:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,103:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,152:0.76:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,77:0.29: 1.41:1.000:0.989 0/0/0/1:4:202,63:0.25: 1.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:250,2:0.01: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,114:0.55:-0.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:119,123:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,66:0.33:-0.47:1.000:0.904 0/0/0/1:4:153,40:0.21:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,111:0.54:-0.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:66,120:0.64:-0.89:1.000:0.636 0/0/1/1:4:83,89:0.52:-1.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,87:0.31: 2.00:1.000:0.977 0/0/0/1:4:165,61:0.28: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,94:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:114,49:0.31:-1.54:1.000:0.978 0/0/0/1:4:127,49:0.29:-1.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,103:0.47: 0.09:1.000:0.991 0/1/1:3:60,62:0.51:-2.69:0.999:0.612 0/0/1/1:4:99,115:0.53:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:99,74:0.43:-1.26:1.000:0.945 0/0/0/1:4:181,72:0.29: 0.99:1.000:0.991 0/0/1/1:4:124,113:0.48: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:113,114:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,38:0.20:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,58:0.24: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,100:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,185:0.70: 1.18:1.000:0.983 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,96:0.42: 0.37:1.000:0.905 0/0/1/1:4:129,101:0.44: 0.34:1.000:0.968 0/1/1/1:4:59,125:0.67:-0.95:1.000:0.911 0/0/0/1:4:121,54:0.31:-1.20:1.000:0.965 0/0/1/1:4:120,93:0.44:-0.13:1.000:0.964 0/0/0/1:4:143,46:0.25:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,63:0.28: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,110:0.46: 0.54:1.000:0.990 0/0/1/1:4:110,96:0.47:-0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:88,93:0.51:-1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:142,50:0.27:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,118:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,135:0.55: 0.76:1.000:0.982 0/0/0/0/1/1:6:175,65:0.28: 0.62:1.000:0.752 0/0/0/1:4:174,45:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,91:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,140:0.53: 1.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:111,122:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:182,60:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,159:0.62: 0.96:1.000:0.539 0/0/0/1:4:194,86:0.31: 1.75:1.000:0.968 0/0/0/1:4:155,69:0.31: 0.17:1.000:0.966 0/0/0/1:4:174,47:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,125:0.75:-1.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:283,0:0.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,72:0.42:-1.31:1.000:0.926 0/1/1/1:4:49,161:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,51:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,98:0.48:-0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:148,44:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,94:0.52:-1.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:201,55:0.22: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,60:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,161:0.70: 0.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:144,29:0.17:-1.26:0.999:0.999 0/0/1/1:4:125,131:0.51: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,156:0.49: 2.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,97:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,127:0.53: 0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:133,130:0.49: 1.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,62:0.31:-0.47:1.000:0.966 0/1/1/1:4:48,142:0.73:-0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:177,60:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,83:0.42:-0.47:1.000:0.893 0/0/0/1:4:189,51:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,95:0.54:-1.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:203,73:0.27: 1.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,34:0.24:-2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,146:0.46: 2.90:1.000:0.985 0/0/1/1:4:137,116:0.46: 0.99:1.000:0.987 0/0/1/1:4:111,93:0.46:-0.39:1.000:0.985 0/0/1/1:4:122,110:0.47: 0.40:1.000:0.994 0/0/0/0:4:289,0:0.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,137:0.53: 1.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:180,74:0.30: 1.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:146,112:0.44: 1.13:1.000:0.959 0/0/0/1:4:149,47:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,148:0.50: 2.22:0.998:0.997 0/0/0/1:4:154,38:0.20:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,56:0.29:-0.61:1.000:0.990 0/0/0/1:4:150,40:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,47:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,135:0.53: 1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:105,111:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:220,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,130:0.48: 1.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,131:0.52: 0.96:0.999:0.995 0/0/0/0:4:263,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,38:0.26:-1.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:200,60:0.24: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,63:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,42:0.22:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,159:0.67: 0.45:1.000:0.912 0/0/0/1:4:159,36:0.19:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,61:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,100:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,66:0.29: 0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,88:0.49:-1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,112:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:246,53:0.18: 2.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,103:0.44: 0.48:1.000:0.967 0/1/1/1:4:44,149:0.76:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,89:0.44:-0.44:1.000:0.970 0/0/0/1:4:149,55:0.28:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:167,62:0.28: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,84:0.54:-1.74:0.999:0.990 0/0/0/1:4:133,40:0.24:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,35:0.20:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,56:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,50:0.27:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,114:0.47: 0.71:1.000:0.992 0/0/1/1:4:103,97:0.48:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:174,47:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,50:0.22: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,118:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:152,35:0.19:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,45:0.28:-1.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:212,71:0.26: 1.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,120:0.47: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:122,112:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:156,57:0.28:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,104:0.44: 0.57:1.000:0.964 0/0/1/1:4:102,98:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,134:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,111:0.53:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:115,124:0.52: 0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:129,37:0.23:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,126:0.54: 0.37:1.000:0.986 0/0/0/1:4:171,64:0.28: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,146:0.55: 1.24:1.000:0.977 0/0/1/1:4:119,155:0.56: 1.58:1.000:0.966 0/0/1/1:4:113,83:0.43:-0.61:1.000:0.933 0/0/1/1:4:105,97:0.48:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:182,61:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,86:0.50:-1.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:189,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,45:0.24:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,60:0.50:-2.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:178,44:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,52:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,169:0.74: 0.20:0.999:0.998 0/0/1/1:4:102,86:0.46:-0.84:1.000:0.986 0/0/1/1:4:85,100:0.54:-0.92:1.000:0.989 0/0/0/1:4:140,39:0.23:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,91:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,93:0.49:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,48:0.26:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,38:0.24:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,35:0.21:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,72:0.29: 1.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:178,64:0.27: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,120:0.54: 0.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:127,73:0.37:-0.50:1.000:0.575 0/0/1/1:4:139,112:0.45: 0.93:1.000:0.977 0/0/0/1:4:204,55:0.22: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,138:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,62:0.31:-0.30:1.000:0.979 0/0/1/1:4:90,99:0.52:-0.81:1.000:0.995 -chr4.1 18077880 chr4.1_018077880 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:58,157:0.73: 0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,34:0.25:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,60:0.27: 1.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,105:0.55: 0.61:1.000:0.983 0/0/1/1:4:92,96:0.54: 0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:221,61:0.25: 2.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,31:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,86:0.46: 0.63:1.000:0.985 0/0/1/1:4:107,90:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,10:0.17:-1.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,5:0.11:-2.26:1.000:0.588 0/1/1/1:4:30,114:0.79:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,146:0.71: 0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:52,125:0.71: 0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:120,94:0.47: 0.86:1.000:0.992 0/0/1/1:4:119,101:0.49: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,175:0.72: 1.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:204,61:0.26: 1.84:1.000:0.998 0/1/1/1:4:53,157:0.74: 0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,148:0.75: 0.52:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-2.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,45:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,104:0.45: 1.50:1.000:0.982 0/1/1/1:4:42,136:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,16:0.37:-2.31:1.000:0.621 0/0/0/1:4:209,62:0.26: 1.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,60:0.24: 2.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,28:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,107:0.53: 0.79:1.000:0.990 0/1/1/1:4:65,157:0.71: 1.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:118,97:0.48: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,93:0.52: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,29:0.80:-2.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,21:0.43:-2.22:1.000:0.940 0/0/1:3:16,5:0.27:-2.83:0.999:1.000 0/0/0/1:4:169,38:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,54:0.26: 1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,80:0.46: 0.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:98,96:0.52: 0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:144,36:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,86:0.74:-1.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,147:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,109:0.51: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,43:0.29: 0.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:128,38:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,118:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,144:0.71: 0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,37:0.40:-1.30:1.000:0.774 0/0/0/1:4:141,42:0.26: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:99,63:0.42:-0.13:1.000:0.915 0/0/1/1:4:68,44:0.42:-1.09:1.000:0.930 0/0/1/1:4:102,84:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,75:0.55:-0.50:1.000:0.982 0/0/1/1:4:91,65:0.45:-0.25:1.000:0.977 0/0/0/1:4:142,50:0.29: 0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:108,99:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,60:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,108:0.51: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,97:0.53: 0.42:1.000:0.991 0/0/0/1/1/1:6:62,50:0.48:-1.09:1.000:0.860 0/0/1/1:4:93,74:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:93,66:0.45:-0.19:1.000:0.976 0/0/0/1:4:138,33:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,37:0.30:-0.57:1.000:0.986 0/0/1/1:4:126,84:0.43: 0.79:1.000:0.950 0/0/0/1:4:182,26:0.14: 0.75:1.000:0.979 0/0/1/1:4:55,33:0.41:-1.55:1.000:0.842 0/1/1/1:4:50,113:0.70:-0.11:1.000:0.981 0/0/1/1:4:92,80:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,34:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,145:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,91:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:214,62:0.26: 2.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,117:0.56: 0.94:1.000:0.969 0/0/1/1:4:98,77:0.47: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:100,63:0.42:-0.11:1.000:0.906 0/0/0/1:4:123,42:0.29:-0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:43,102:0.71:-0.46:1.000:0.989 0/1/1/1:4:53,99:0.66:-0.32:1.000:0.865 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,80:0.62:-0.69:0.999:0.625 0/0/1/1:4:108,65:0.41: 0.08:1.000:0.847 0/0/1/1:4:98,78:0.47: 0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:89,74:0.48:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,35:0.30:-0.74:1.000:0.983 0/0/1/1:4:75,62:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,81:0.64:-0.78:1.000:0.723 0/0/0/1:4:112,32:0.26:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,62:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,23:0.16: 0.00:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,92:0.73:-0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,70:0.53:-0.59:1.000:0.991 0/0/1/1:4:98,66:0.43:-0.09:1.000:0.955 0/0/1/1:4:79,64:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,15:0.14:-0.90:1.000:0.973 0/0/1/1:4:79,99:0.58: 0.17:1.000:0.929 0/0/1/1:4:53,49:0.51:-1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,44:0.45:-1.22:1.000:0.980 0/1/1/1:4:29,91:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,68:0.45:-0.09:1.000:0.975 0/0/0/1:4:61,20:0.28:-1.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:80,54:0.43:-0.67:1.000:0.956 0/1/1/1:4:18,44:0.71:-2.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:120,29:0.22:-0.38:0.998:1.000 0/1/1/1:4:38,67:0.65:-1.22:1.000:0.771 0/1/1/1:4:28,86:0.75:-1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,88:0.70:-0.80:1.000:0.981 0/1/1/1:4:50,121:0.71: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:125,105:0.49: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,78:0.50:-0.06:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,104:0.47: 1.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,62:0.46:-0.46:0.999:0.987 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,52:0.56:-1.38:1.000:0.970 0/1/1/1:4:46,105:0.70:-0.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:69,58:0.49:-0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,103:0.65:-0.15:1.000:0.785 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,85:0.55:-0.11:1.000:0.984 0/0/1/1:4:92,70:0.46:-0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:73,56:0.46:-0.76:1.000:0.990 0/0/1/1:4:104,88:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,122:0.54: 1.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:89,63:0.45:-0.32:1.000:0.975 0/0/1/1:4:86,66:0.47:-0.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:91,26:0.26:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,31:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,60:0.81:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,18:0.20:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,104:0.65:-0.15:1.000:0.831 0/0/1/1:4:113,87:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:91,18:0.19:-1.15:0.999:1.000 0/0/1/1:4:79,80:0.53:-0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,68:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,176:0.72: 1.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,112:0.70:-0.17:1.000:0.987 0/0/0/1:4:72,20:0.25:-1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,24:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,54:0.47:-0.90:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,113:0.80:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,53:0.51:-1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,79:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,42:0.42:-1.15:1.000:0.900 0/0/1/1:4:123,102:0.48: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,127:0.52: 1.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:148,49:0.28: 0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,144:0.69: 0.79:1.000:0.973 0/0/0/1:4:156,48:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:125,32:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,45:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,102:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,14:0.51:-2.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,82:0.51: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,50:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,109:0.52: 0.98:1.000:0.994 0/0/0/1:4:173,50:0.26: 1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,75:0.43: 0.37:1.000:0.947 0/0/1/1:4:107,107:0.53: 0.86:1.000:0.993 0/0/0/1:4:181,40:0.21: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,75:0.46: 0.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:101,94:0.51: 0.50:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,163:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,135:0.72: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,149:0.54: 2.36:1.000:0.990 0/1/1/1:4:62,172:0.73: 1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,76:0.53:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:137,36:0.24: 0.08:0.999:1.000 0/0/1/1:4:97,90:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,85:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,93:0.56: 0.06:1.000:0.963 0/0/1/1:4:71,70:0.52:-0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,86:0.47: 0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:56,106:0.66:-0.13:1.000:0.881 0/1/1/1:4:35,87:0.71:-0.90:1.000:0.993 0/1/1/1:4:26,122:0.82:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,158:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,75:0.43: 0.35:1.000:0.952 0/0/1/1:4:108,128:0.56: 1.29:1.000:0.960 0/0/1/1:4:123,87:0.45: 0.79:1.000:0.975 0/0/0/1:4:171,55:0.28: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,210:0.73: 2.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:189,51:0.25: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,128:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,100:0.49: 0.90:1.000:0.997 -chr4.1 18265836 chr4.1_018265836 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:206,64:0.22: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,153:0.66: 0.38:1.000:0.890 0/0/0/1:4:134,52:0.26: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,57:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,56:0.21: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,62:0.20: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,60:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,120:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:179,60:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,32:0.53:-1.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:36,20:0.34:-1.94:1.000:0.872 0/0/0/1:4:140,53:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,35:0.16: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,60:0.25: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,58:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,64:0.23: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,46:0.18: 0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,183:0.66: 1.06:1.000:0.840 0/0/0/1:4:226,76:0.24: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,79:0.26: 1.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,119:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,61:0.22: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,63:0.26: 0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,30:0.35:-1.55:1.000:0.771 0/0/1/1:4:124,129:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,122:0.47: 0.98:1.000:0.993 0/0/0/1:4:200,73:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:218,70:0.23: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:247,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,65:0.28: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/0:4:213,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,33:0.50:-1.83:1.000:0.997 0/0/1:3:28,21:0.41:-2.04:0.999:0.998 0/0/0/1:4:185,60:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,117:0.44: 1.08:1.000:0.971 0/0/0/1:4:158,53:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,47:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,114:0.49: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,1:0.01:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,62:0.31: 0.12:1.000:0.974 0/0/0/1:4:115,31:0.20:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,108:0.52: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:253,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,39:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,95:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,59:0.31:-0.06:1.000:0.965 0/0/0/1:4:97,42:0.29:-0.66:1.000:0.993 0/0/0/1:4:189,62:0.23: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,35:0.27:-0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:114,59:0.32:-0.14:1.000:0.942 0/0/1/1:4:113,113:0.48: 0.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:131,58:0.29: 0.11:1.000:0.991 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,63:0.29: 0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:127,44:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:54,30:0.34:-1.51:1.000:0.916 0/0/0/1:4:74,30:0.27:-1.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,36:0.19:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,90:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,61:0.31: 0.09:1.000:0.976 0/0/0/1:4:133,48:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,88:0.39: 0.51:1.000:0.689 0/0/0/1:4:103,27:0.20:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,47:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,53:0.31:-0.34:0.999:0.966 0/1/1/1:4:62,153:0.64: 0.51:1.000:0.718 0/0/0/0:4:148,1:0.01:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,36:0.22:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,175:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,65:0.28: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,93:0.46: 0.18:1.000:0.986 0/0/0/1:4:88,42:0.31:-0.80:1.000:0.978 0/0/0/1:4:101,37:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,44:0.30:-0.68:1.000:0.983 0/0/0/1:4:112,44:0.27:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,83:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,44:0.28:-0.48:0.999:0.996 0/0/0/1:4:106,38:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,97:0.58:-0.42:1.000:0.924 0/0/0/1:4:139,62:0.29: 0.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:84,43:0.32:-0.85:1.000:0.949 0/0/0/1:4:119,45:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,34:0.27:-0.95:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,62:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,34:0.27:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,71:0.47:-0.57:1.000:0.991 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,31:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,54:0.34:-0.48:1.000:0.869 0/0/0/1:4:137,36:0.20:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,29:0.28:-1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,38:0.28:-0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,21:0.22:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,69:0.56:-1.05:1.000:0.964 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,98:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:109,37:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,53:0.35:-0.57:1.000:0.813 0/0/0/1:4:56,34:0.36:-1.41:1.000:0.696 0/0/1/1:4:80,63:0.42:-0.60:0.998:0.913 0/0/0/1:4:78,34:0.29:-1.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:107,26:0.18:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,23:0.18:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,87:0.23: 2.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,47:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,80:0.24: 2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,31:0.23:-0.85:0.999:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,28:0.28:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,32:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,43:0.30:-0.71:1.000:0.985 0/0/0/1:4:93,46:0.31:-0.66:1.000:0.966 0/0/1/1:4:57,69:0.52:-0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,34:0.27:-0.95:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,42:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,30:0.28:-1.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,33:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,71:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,35:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,47:0.32:-0.63:1.000:0.962 0/0/0/1:4:76,46:0.36:-0.92:1.000:0.704 0/1/1/1:4:22,136:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,25:0.26:-1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,31:0.29:-1.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:151,44:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.51:-1.77:0.999:0.996 0/0/0/1:4:112,44:0.27:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:111,36:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,77:0.24: 1.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,26:0.26:-1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,28:0.30:-1.45:1.000:0.983 0/0/1/1:4:61,41:0.38:-1.23:1.000:0.604 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,45:0.32:-0.74:1.000:0.956 0/0/0/1:4:176,56:0.23: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,25:0.31:-1.61:1.000:0.976 0/0/0/1:4:215,75:0.24: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,85:0.27: 1.81:1.000:0.998 0/0/0/1:4:165,60:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,49:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,74:0.26: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,79:0.55:-0.74:1.000:0.980 0/0/0/1:4:226,76:0.24: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,58:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,8:0.35:-2.46:1.000:0.828 0/0/0/1:4:162,48:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,48:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,51:0.20: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,70:0.22: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,154:0.49: 1.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,56:0.28: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,139:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,53:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,67:0.26: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,48:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,66:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,42:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,159:0.66: 0.51:0.999:0.891 0/0/0/1:4:195,53:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,53:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,47:0.19: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,43:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,92:0.45: 0.23:1.000:0.975 0/0/0/1:4:138,37:0.20:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,26:0.19:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:272,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,40:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,57:0.22: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,72:0.34: 0.32:1.000:0.886 0/0/0/1:4:200,71:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:197,87:0.29: 1.57:1.000:0.991 0/0/0/1:4:227,81:0.25: 1.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,51:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,120:0.47: 0.95:1.000:0.992 -chr4.1 18394489 chr4.1_018394489 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:10,4:0.29:-0.50:1.000:0.992 0/1/1/1:4:3,17:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.49:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-0.62:1.000:0.795 0/0/0/1:4:10,5:0.34:-0.38:1.000:0.848 0/0/1/1:4:7,4:0.38:-0.86:1.000:0.530 0/0/0/1:4:4,2:0.34:-1.45:1.000:0.848 0/1/1/1:4:2,12:0.78:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25:-1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,14:0.71:-0.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:5,2:0.29:-1.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:14,8:0.38: 0.45:1.000:0.530 0/0/0/1:4:9,5:0.37:-0.50:1.000:0.566 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-0.97:1.000:0.904 0/0/1/1:4:3,3:0.52:-1.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:14,3:0.18:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.57:1.000:0.904 1/1/1/1:4:1,24:0.94: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-0.62:1.000:0.795 0/0/0/1:4:10,3:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-0.50:1.000:0.953 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-0.50:1.000:0.953 0/0/1/1:4:5,5:0.52:-0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,3:0.39:-1.21:1.000:0.688 0/1/1/1:4:1,12:0.88:-0.62:1.000:0.699 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:13,7:0.36: 0.21:1.000:0.668 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.52:-0.97:1.000:0.995 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.52:-1.45:1.000:0.995 1/1/1:3:0,1:1.00:-2.04:0.999:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,13:0.65: 0.09:1.000:0.746 0/0/0/1:4:13,6:0.32: 0.09:1.000:0.944 0/1/1/1:4:5,12:0.66:-0.14:1.000:0.870 0/1/1/1:4:4,13:0.70:-0.14:1.000:0.986 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,9:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,16:0.60: 0.92:1.000:0.809 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,10:0.36: 1.28:1.000:0.733 0/1/1/1:4:6,16:0.67: 0.45:1.000:0.939 0/0/0/1:4:18,6:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,10:0.63:-0.38:1.000:0.604 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-0.26:1.000:0.954 0/0/0/1:4:21,8:0.28: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,7:0.23: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.60: 0.92:1.000:0.809 0/0/1/1:4:13,8:0.40: 0.33:1.000:0.758 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.61: 0.09:1.000:0.703 0/0/1/1:4:14,9:0.41: 0.57:1.000:0.851 0/0/0/1/1/1:6:19,14:0.44: 1.75:1.000:0.711 0/0/0/1:4:22,12:0.37: 1.87:1.000:0.627 0/0/1/1:4:7,6:0.49:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,14:0.43: 1.87:1.000:0.949 0/0/0/1:4:24,12:0.34: 2.11:1.000:0.848 0/0/1/1:4:12,9:0.45: 0.33:1.000:0.979 0/0/1/1:4:17,19:0.54: 2.11:1.000:0.989 0/0/0/1:4:14,4:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,10:0.36: 1.28:0.999:0.733 0/1/1/1:4:5,26:0.75: 1.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.36: 0.21:1.000:0.668 0/1/1/1:4:7,26:0.72: 1.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,10:0.36: 1.28:1.000:0.733 0/0/1/1:4:11,15:0.57: 0.92:1.000:0.943 0/0/0/1:4:19,6:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,7:0.41:-0.03:1.000:0.832 0/0/1/1:4:18,15:0.48: 1.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,9:0.30: 1.51:1.000:0.989 0/1/1/1:4:9,24:0.67: 1.75:1.000:0.939 0/0/1/1:4:10,7:0.43:-0.14:0.999:0.949 0/0/0/1:4:17,9:0.36: 0.92:1.000:0.717 0/1/1/1:4:10,27:0.68: 2.23:1.000:0.944 0/0/1/1:4:6,10:0.60:-0.26:1.000:0.750 0/0/1/1:4:9,12:0.57: 0.33:1.000:0.953 0/0/1/1:4:14,11:0.46: 0.80:1.000:0.989 0/0/1/1:4:13,9:0.43: 0.45:1.000:0.941 0/0/1/1:4:11,16:0.58: 1.04:1.000:0.905 0/0/0/1:4:23,7:0.23: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,18:0.71: 0.57:1.000:0.993 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.55:-0.86:1.000:0.980 0/0/1/1:4:16,13:0.47: 1.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:6,6:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,14:0.44: 1.75:1.000:0.974 0/1/1/1:4:6,13:0.65: 0.09:1.000:0.746 0/0/1/1:4:6,9:0.59:-0.38:1.000:0.880 0/0/1/1:4:20,17:0.48: 2.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,17:0.68: 0.57:1.000:0.961 0/0/1/1:4:11,7:0.41:-0.03:1.000:0.832 0/0/1/1:4:8,8:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:11,4:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,16:0.70: 0.33:0.998:0.984 0/0/0/0:4:9,1:0.10:-0.97:1.000:0.801 0/0/0/1:4:9,5:0.37:-0.50:1.000:0.566 0/0/1/1:4:10,11:0.53: 0.33:1.000:0.990 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.55:-0.86:1.000:0.980 0/0/1/1:4:6,7:0.54:-0.62:1.000:0.984 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:21,5:0.19: 0.92:0.999:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.34:-0.74:1.000:0.848 0/0/1/1:4:19,12:0.40: 1.51:1.000:0.817 0/0/0/1:4:11,4:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,11:0.55: 0.21:1.000:0.977 0/1/1/1:4:11,23:0.64: 1.87:1.000:0.688 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 1.04:1.000:0.627 0/0/1/1:4:15,13:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,13:0.65: 0.09:1.000:0.746 0/0/0/1:4:23,10:0.31: 1.75:1.000:0.975 0/0/1/1:4:6,5:0.48:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-0.97:1.000:0.904 0/0/1/1:4:8,9:0.54:-0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:18,10:0.37: 1.16:1.000:0.566 1/1/1/1:4:1,20:0.93: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-0.26:1.000:0.954 0/0/0/1:4:16,7:0.31: 0.57:1.000:0.972 0/1/1/1:4:6,12:0.63:-0.03:1.000:0.604 0/1/1/1:4:3,15:0.75:-0.03:0.999:0.999 0/0/0/1:4:17,9:0.36: 0.92:1.000:0.717 0/0/1/1:4:5,9:0.62:-0.50:1.000:0.611 0/0/1/1:4:11,8:0.44: 0.09:1.000:0.969 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-0.50:1.000:0.979 0/0/1/1:4:16,15:0.51: 1.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-0.50:1.000:0.953 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,10:0.56:-0.03:1.000:0.972 0/0/0/1:4:13,4:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,11:0.46: 0.80:1.000:0.989 0/0/1/1:4:8,13:0.60: 0.33:1.000:0.788 0/1/1/1:4:3,6:0.63:-1.09:1.000:0.604 0/0/1/1:4:8,7:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:13,6:0.32: 0.09:1.000:0.944 0/0/1/1:4:14,20:0.58: 1.87:1.000:0.918 0/0/0/1:4:8,1:0.11:-1.09:1.000:0.520 0/0/1/1:4:7,6:0.49:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,9:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/0/0/0:4:9,1:0.10:-0.97:1.000:0.801 0/0/1/1:4:17,11:0.41: 1.16:1.000:0.862 0/0/1/1:4:7,10:0.58:-0.14:1.000:0.918 0/0/1/1:4:6,7:0.54:-0.62:1.000:0.984 0/1/1/1:4:2,9:0.74:-0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,4:0.63:-1.45:1.000:0.604 0/1/1/1:4:3,15:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,6:0.49:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-0.97:1.000:0.880 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-0.62:1.000:0.795 0/0/1/1:4:4,4:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,3:0.28:-0.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.45:0.999:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-0.74:1.000:0.961 0/0/1/1:4:3,5:0.60:-1.21:1.000:0.750 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.57:1.000:0.904 0/1/1/1:4:4,8:0.63:-0.74:1.000:0.604 0/0/1/1:4:11,11:0.52: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.26:1.000:0.688 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.38:-0.86:1.000:0.530 0/0/0/1:4:6,2:0.25:-1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-0.62:1.000:0.795 0/0/1/1:4:8,10:0.56:-0.03:1.000:0.972 0/0/1/1:4:10,7:0.43:-0.14:1.000:0.949 0/0/1/1:4:8,13:0.60: 0.33:1.000:0.788 0/0/1/1:4:4,5:0.56:-1.09:1.000:0.972 0/0/1/1:4:9,17:0.62: 0.92:1.000:0.513 -chr4.1 18560791 chr4.1_018560791 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:96,100:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,39:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,50:0.31:-0.50:1.000:0.978 0/0/0/1:4:182,51:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,102:0.43: 1.21:1.000:0.939 0/0/1/1:4:125,112:0.47: 1.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:101,28:0.22:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,132:0.73:-0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,87:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,49:0.61:-2.52:1.000:0.717 0/0/1/1:4:51,51:0.50:-2.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,40:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,83:0.45:-0.06:1.000:0.978 0/0/1/1:4:93,95:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:150,42:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,37:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,128:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,135:0.54: 1.44:1.000:0.988 0/1/1/1:4:62,170:0.73: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,41:0.38:-1.84:1.000:0.551 0/0/1/1:4:93,98:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,181:0.75: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,90:0.45: 0.27:1.000:0.982 0/0/0/0:4:30,2:0.06:-3.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,106:0.55: 0.13:1.000:0.984 0/1/1/1:4:51,151:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,41:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,120:0.47: 1.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:87,99:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,80:0.47:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,42:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:9,4:0.31:-4.09:1.000:0.969 0/0/1/1:4:43,47:0.52:-2.28:1.000:0.995 0/0/1:3:29,5:0.15:-3.59:0.999:0.731 0/0/1/1:4:83,103:0.55:-0.03:1.000:0.980 0/0/1/1:4:85,81:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,103:0.48: 0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:41,139:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,88:0.45: 0.20:1.000:0.978 0/0/1/1:4:92,105:0.53: 0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,108:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,123:0.55: 0.83:1.000:0.982 0/0/0/1:4:122,52:0.30:-0.32:1.000:0.981 0/1/1/1:4:38,164:0.80: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,44:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,117:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,124:0.70:-0.27:1.000:0.983 0/1/1/1:4:29,108:0.78:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,65:0.55:-1.63:1.000:0.982 0/1/1/1:4:47,130:0.73:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,129:0.48: 1.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,108:0.47: 0.95:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,153:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,100:0.52: 0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,134:0.69: 0.11:1.000:0.975 0/0/0/1:4:153,43:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,105:0.66:-0.69:1.000:0.860 0/0/1/1:4:92,86:0.48:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:81,103:0.56:-0.08:1.000:0.705 0/0/1/1:4:105,94:0.47: 0.27:1.000:0.993 0/1/1/1:4:43,119:0.73:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,93:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,71:0.47:-0.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:153,38:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,126:0.61: 0.41:1.000:0.694 0/0/0/1:4:107,27:0.21:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,155:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,38:0.24:-0.53:0.999:1.000 0/0/1/1:4:93,92:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:185,55:0.24: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,90:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,76:0.46:-0.50:1.000:0.986 0/0/0/1:4:170,67:0.29: 1.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:98,81:0.45:-0.20:1.000:0.982 0/0/0/1:4:111,38:0.26:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,61:0.31: 0.34:1.000:0.977 0/1/1/1:4:52,160:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,115:0.48: 1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:106,109:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-1.70:0.999:1.000 0/0/1/1:4:106,98:0.48: 0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,174:0.72: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,105:0.56:-0.01:1.000:0.971 0/0/0/1:4:144,42:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,115:0.48: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,78:0.54:-1.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:50,109:0.68:-0.67:1.000:0.951 0/0/0/1:4:154,34:0.19: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,93:0.54:-0.39:1.000:0.987 0/0/1/1:4:77,89:0.53:-0.50:1.000:0.991 0/1/1/1:4:55,132:0.70:-0.01:1.000:0.984 0/0/0/1:4:163,67:0.30: 1.00:1.000:0.988 0/0/1/1:4:69,81:0.54:-0.88:1.000:0.989 0/0/0/1:4:187,62:0.26: 1.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,99:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,141:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,49:0.33:-0.83:1.000:0.933 0/0/0/1:4:168,66:0.29: 1.09:1.000:0.993 0/1/1/1:4:59,161:0.72: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,42:0.28:-0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,174:0.74: 1.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,123:0.78:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,107:0.47: 0.97:0.998:0.991 0/0/1/1:4:74,70:0.48:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,87:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,77:0.47:-0.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,72:0.42:-0.41:1.000:0.929 0/1/1/1:4:62,201:0.76: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,91:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,89:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,173:0.76: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,119:0.50: 1.16:0.999:0.997 0/0/1/1:4:121,88:0.42: 0.50:1.000:0.921 0/0/0/1:4:99,39:0.29:-1.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:52,191:0.78: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,95:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,81:0.52:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,100:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,39:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,61:0.30: 0.50:1.000:0.987 0/0/1/1:4:105,83:0.44: 0.01:1.000:0.969 0/0/1/1:4:114,118:0.51: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,156:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,96:0.53:-0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,116:0.48: 1.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,43:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,73:0.55:-1.28:1.000:0.984 0/0/0/1:4:106,41:0.29:-0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,82:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,142:0.76:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,57:0.29: 0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,68:0.51:-1.30:0.999:0.996 0/0/0/1:4:143,43:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,104:0.56:-0.06:1.000:0.970 0/0/1/1:4:158,124:0.44: 2.21:1.000:0.967 0/0/1/1:4:109,103:0.48: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,99:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:117,39:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,49:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,87:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,105:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,93:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,74:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:215,66:0.24: 2.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,208:0.76: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,116:0.54: 0.62:1.000:0.988 0/0/1/1:4:90,93:0.51:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,63:0.31: 0.39:1.000:0.967 0/0/1/1:4:86,82:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,109:0.48: 0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,146:0.73: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,23:0.40:-3.03:1.000:0.775 0/0/1/1:4:70,71:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,121:0.54: 0.79:1.000:0.985 0/0/1/1:4:114,100:0.47: 0.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:193,68:0.27: 1.72:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,182:0.81: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,126:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,100:0.45: 0.76:1.000:0.983 0/0/1/1:4:95,97:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,133:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,98:0.54:-0.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:83,104:0.55:-0.01:1.000:0.977 0/0/1/1:4:87,107:0.55: 0.15:1.000:0.982 0/0/1/1:4:125,84:0.40: 0.50:1.000:0.818 0/0/1/1:4:89,81:0.48:-0.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:143,56:0.29: 0.27:0.999:0.993 0/1/1/1:4:40,142:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,152:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,83:0.61:-1.23:1.000:0.692 0/0/1/1:4:73,80:0.52:-0.81:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,143:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,129:0.82:-0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,126:0.77:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,82:0.52:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,115:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,108:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,161:0.71: 0.86:1.000:0.993 0/0/0/1:4:128,54:0.30:-0.13:1.000:0.983 0/0/1/1:4:116,78:0.40: 0.15:1.000:0.820 0/1/1/1:4:59,210:0.77: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,72:0.27: 1.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,74:0.52:-1.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:169,39:0.19: 0.48:1.000:1.000 -chr4.1 18795368 chr4.1_018795368 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:6,2:0.41: 0.62:1.000:0.879 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,1:0.15: 1.61:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.29: 1.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:7,2:0.37: 0.87:1.000:0.558 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.37: 0.87:1.000:0.558 0/0/1/1:4:5,5:0.57: 1.11:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.34: 2.35:1.000:0.889 0/0/1/1:4:10,5:0.51: 2.35:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,3:0.38: 1.86:1.000:0.612 0/0/0/1:4:10,1:0.16: 1.36:1.000:0.995 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,1:0.18: 1.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,3:0.61:-0.13:1.000:0.739 0/1/1/1:4:1,5:0.69: 0.12:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.13:1.000:0.889 0/0/0/1:4:12,3:0.34: 2.35:1.000:0.889 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:5,1:0.29: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,6:0.59: 1.36:1.000:0.887 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.52: 2.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,1:0.41:-0.38:1.000:0.879 0/0/0/1:4:8,1:0.19: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.27: 1.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,5:0.53: 1.86:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 2.35:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.22: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,3:0.49: 1.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,3:0.38: 1.86:1.000:0.612 0/0/0/1:4:8,1:0.19: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.57:-0.87:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.13:1.000:0.889 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.13:1.000:0.889 0/0/1/1:4:13,4:0.39: 2.85:1.000:0.694 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:0.999:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.61:-0.13:1.000:0.739 0/0/1/1:4:9,3:0.41: 1.61:1.000:0.879 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,2:0.63:-0.62:1.000:0.558 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,4:0.50: 1.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,2:0.47: 0.37:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,3:0.49: 1.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.47: 0.37:1.000:0.991 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.47: 0.37:1.000:0.991 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.12:0.998:1.000 0/0/1/1:4:3,1:0.41:-0.38:1.000:0.879 0/0/1/1:4:6,4:0.53: 1.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:9,2:0.31: 1.36:1.000:0.975 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:7,3:0.49: 1.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.13:1.000:0.889 0/0/1/1:4:2,3:0.61:-0.13:1.000:0.739 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.38:0.999:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:5,1:0.29: 0.12:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:9,4:0.50: 1.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,1:0.41:-0.38:1.000:0.879 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.66:-0.38:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:9,3:0.41: 1.61:1.000:0.879 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:8,1:0.19: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.38:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.57:-0.87:1.000:0.948 0/0/0/1:4:6,1:0.25: 0.37:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,1:0.18: 1.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.29: 0.12:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,3:0.51: 0.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.25: 0.37:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.19: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.29: 0.12:1.000:0.994 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.37: 0.87:1.000:0.558 0/0/1/1:4:6,2:0.41: 0.62:1.000:0.879 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:0.999:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.27: 1.86:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.51:-0.62:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,3:0.52: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 1.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,2:0.25: 2.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.53:-0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:1,3:0.66:-0.38:1.000:0.867 0/0/1/1:4:6,2:0.41: 0.62:1.000:0.879 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,1:0.15: 1.61:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.62:1.000:1.000 -chr4.1 18963011 chr4.1_018963011 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:159,9:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,5:0.20: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,7:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,9:0.27:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:176,10:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,8:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,8:0.27:-1.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:233,3:0.19: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,4:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,1:0.19:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,17:0.39:-1.31:1.000:0.730 0/0/0/1:4:65,8:0.27:-0.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:152,5:0.21: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,8:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,5:0.24:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,4:0.20: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,12:0.23: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,2:0.19: 2.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,15:0.24: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,12:0.23: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,13:0.31:-1.01:1.000:0.969 0/0/0/1:4:180,10:0.23: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,22:0.32:-0.39:1.000:0.942 0/0/0/1:4:148,4:0.21: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,9:0.27:-0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:158,5:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,4:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,10:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,12:0.26:-0.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,6:0.22: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,26:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,20:0.33:-0.65:1.000:0.914 0/0/1:3:74,3:0.22:-0.86:0.999:1.000 0/0/0/1:4:69,8:0.26:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:147,3:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,8:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,17:0.31:-0.56:1.000:0.978 0/0/0/1:4:149,2:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,11:0.28:-0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:82,7:0.25:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,13:0.30:-0.79:1.000:0.989 0/0/0/1:4:83,12:0.28:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:265,6:0.20: 2.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,8:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,5:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,4:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,18:0.29:-0.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:56,16:0.33:-0.94:1.000:0.920 0/0/0/1:4:171,8:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,13:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:218,10:0.22: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,3:0.19: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,12:0.24: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,17:0.30:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/1:4:160,9:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:112,14:0.27:-0.01:1.000:0.655 0/0/0/1:4:77,11:0.27:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,14:0.31:-0.87:1.000:0.975 0/0/0/1:4:230,6:0.20: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,14:0.32:-0.96:1.000:0.963 0/0/0/1:4:83,14:0.29:-0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:144,15:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,13:0.30:-0.87:1.000:0.984 0/0/0/1:4:139,4:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,13:0.31:-0.92:0.999:0.980 0/0/0/1:4:195,4:0.20: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,27:0.33:-0.08:1.000:0.922 0/0/0/1:4:112,10:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:229,6:0.20: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,13:0.27:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,8:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,14:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,10:0.26:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,7:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,14:0.24: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,8:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,18:0.33:-0.80:0.999:0.913 0/0/0/1:4:84,13:0.28:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,3:0.19: 2.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,11:0.29:-0.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:74,19:0.32:-0.58:1.000:0.953 0/0/0/1:4:83,25:0.34:-0.32:1.000:0.895 0/0/0/1:4:112,4:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,4:0.20: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,13:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,8:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,22:0.34:-0.60:1.000:0.870 0/0/0/1:4:71,11:0.28:-0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:82,13:0.28:-0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,7:0.27:-1.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,25:0.32:-0.15:1.000:0.941 0/0/0/1:4:98,20:0.30:-0.15:1.000:0.985 0/0/0/1:4:78,9:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,9:0.23: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,5:0.20: 2.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,17:0.38:-1.22:1.000:0.525 0/0/0/1:4:153,7:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,10:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,16:0.26: 0.82:0.998:0.999 0/0/0/1:4:123,14:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,12:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,13:0.25: 0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,12:0.22: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,14:0.29:-0.58:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,23:0.34:-0.56:1.000:0.848 0/0/0/1:4:94,12:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:184,21:0.26: 1.36:0.999:0.999 0/0/0/1:4:84,16:0.29:-0.46:1.000:0.989 0/0/0/1:4:71,8:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,6:0.21: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,14:0.30:-0.68:1.000:0.989 0/0/0/1:4:131,16:0.27: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:138,14:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,15:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,12:0.29:-0.77:1.000:0.993 0/0/0/1:4:61,15:0.32:-0.87:1.000:0.963 0/0/0/1:4:192,11:0.23: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,10:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,17:0.31:-0.60:1.000:0.975 0/0/0/1:4:71,14:0.30:-0.72:1.000:0.987 0/0/0/1:4:81,14:0.29:-0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:175,1:0.19: 0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,16:0.32:-0.82:1.000:0.956 0/0/0/1:4:132,11:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,8:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,4:0.21:-0.37:0.999:1.000 0/0/0/1:4:121,8:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,7:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,7:0.21: 1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,8:0.30:-1.37:1.000:0.985 0/0/0/1:4:75,17:0.31:-0.60:1.000:0.975 0/0/0/1:4:64,16:0.32:-0.80:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.30:-0.72:1.000:0.981 0/0/0/1:4:108,5:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,3:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,12:0.23: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,12:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,14:0.29:-0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:152,8:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,9:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:216,5:0.20: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,17:0.28:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:140,3:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,12:0.29:-0.89:1.000:0.989 0/0/0/1:4:149,7:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,11:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,12:0.28:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,10:0.26:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:247,4:0.20: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,10:0.27:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:160,7:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,3:0.20: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,9:0.27:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,14:0.29:-0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:89,14:0.28:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,8:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,10:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,6:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,2:0.19: 1.41:0.999:1.000 0/0/0/1:4:175,8:0.22: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,10:0.27:-0.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:135,6:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,4:0.24:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,4:0.20: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,4:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,6:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,10:0.28:-0.84:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,10:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,6:0.21: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,4:0.20: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,10:0.27:-0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:203,5:0.20: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,7:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,7:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,6:0.21: 0.88:1.000:1.000 -chr4.1 19127280 chr4.1_019127280 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:123,133:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,167:0.82:-0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,165:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,212:0.79: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,167:0.52: 1.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,246:0.76: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,83:0.80:-2.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,208:0.82: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,130:0.51:-0.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,157:0.68:-0.37:1.000:0.956 0/0/0/1:4:143,74:0.35:-0.50:1.000:0.758 0/0/1/1:4:106,146:0.56: 0.15:1.000:0.972 0/0/1/1:4:104,115:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,190:0.74: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,149:0.52: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,175:0.54: 1.27:1.000:0.989 0/0/1/1:4:122,109:0.46:-0.24:1.000:0.987 0/0/1/1:4:136,165:0.52: 1.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,164:0.58: 0.53:1.000:0.911 0/0/0/1:4:64,31:0.34:-2.78:1.000:0.857 1/1/1/1:4:0,260:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,195:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,107:0.54:-1.01:1.000:0.987 0/0/1/1:4:47,74:0.59:-2.30:1.000:0.866 1/1/1/1:4:0,318:1.00: 1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,296:1.00: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,190:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,191:0.78:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,138:0.54: 0.00:1.000:0.986 0/0/1/1:4:143,122:0.45: 0.39:1.000:0.979 0/0/1/1:4:112,106:0.47:-0.48:1.000:0.992 0/0/0/1:4:78,26:0.28:-2.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,105:0.70:-1.83:1.000:0.985 0/1/1:3:28,73:0.70:-2.67:0.999:1.000 0/1/1/1:4:59,201:0.75: 0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,261:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,216:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,267:0.76: 1.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,318:1.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,78:0.33: 0.13:1.000:0.923 0/0/0/1:4:198,77:0.30: 0.58:1.000:0.980 0/1/1/1:4:73,256:0.76: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,209:0.81: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,213:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,124:0.44: 0.62:1.000:0.965 0/0/0/1:4:202,69:0.28: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:224,210:0.47: 3.55:1.000:0.991 0/1/1/1:4:62,189:0.73: 0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:143,194:0.55: 1.74:1.000:0.977 0/1/1/1:4:48,216:0.80: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,192:0.52: 2.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,100:0.48:-0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:145,161:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,157:0.74:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,149:0.55: 0.26:1.000:0.974 0/0/1/1:4:106,105:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,291:0.82: 1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,139:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:64,157:0.69:-0.43:1.000:0.899 0/1/1/1:4:55,192:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,177:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,262:0.77: 1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,208:0.74: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,220:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,302:0.82: 2.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,85:0.68:-2.30:1.000:0.960 0/0/1/1:4:112,140:0.53: 0.15:1.000:0.991 0/1/1/1:4:52,168:0.74:-0.45:0.999:0.999 0/1/1/1:4:54,220:0.79: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,79:0.29: 1.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:65,93:0.57:-1.60:1.000:0.956 0/1/1/1:4:82,269:0.75: 2.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,186:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,145:0.59:-0.15:1.000:0.848 0/0/1/1:4:109,105:0.47:-0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:58,199:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,134:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:127,134:0.49: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,335:1.00: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,37:0.24:-1.17:0.999:1.000 0/1/1/1:4:72,232:0.74: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,198:0.73: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,182:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,222:0.74: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,225:0.73: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,79:0.47:-1.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,204:0.79: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,115:0.49:-0.39:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,49:0.32:-1.47:1.000:0.958 0/1/1/1:4:58,212:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,210:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,140:0.74:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,191:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,182:0.71: 0.13:1.000:0.989 0/1/1/1:4:48,182:0.77:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,131:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,133:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,178:0.71: 0.00:1.000:0.992 0/1/1/1:4:27,112:0.79:-1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,169:0.53: 1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,94:0.49:-1.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,260:1.00: 0.30:0.998:1.000 0/0/1/1:4:85,94:0.50:-1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,121:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,142:0.57:-0.07:1.000:0.948 0/0/1/1:4:123,133:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,160:0.55: 0.66:1.000:0.979 0/1/1/1:4:62,210:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:174,64:0.30:-0.11:1.000:0.988 0/1/1/1:4:75,287:0.78: 2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,137:0.49: 0.47:0.999:0.996 0/0/0/1:4:155,79:0.35:-0.18:1.000:0.785 0/1/1/1:4:33,129:0.78:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,126:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,140:0.73:-1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:113,144:0.54: 0.25:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,247:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,113:0.47:-0.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,200:0.77: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,192:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,153:0.53: 0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:114,134:0.52: 0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,202:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,197:0.75: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,176:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,183:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,81:0.42:-0.97:1.000:0.907 0/1/1/1:4:56,177:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,137:0.49: 0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,155:0.72:-0.61:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-1.59:0.999:1.000 0/0/1/1:4:127,138:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,127:0.49: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,140:0.53: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:108,133:0.53:-0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:56,176:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,137:0.74:-1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,164:0.70:-0.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:111,117:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,167:0.75:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,115:0.54:-0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:91,143:0.59:-0.18:1.000:0.869 0/0/1/1:4:134,146:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,243:0.74: 1.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,206:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,128:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,218:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,186:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,222:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,141:0.55: 0.06:1.000:0.982 0/1/1/1:4:30,84:0.72:-2.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,61:0.47:-2.18:1.000:0.990 0/1/1/1:4:72,225:0.74: 0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,166:0.77:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,227:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,182:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,169:0.81:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,289:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,119:0.55:-0.69:1.000:0.978 0/1/1/1:4:59,182:0.74:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:161,68:0.32:-0.28:1.000:0.958 0/0/0/1:4:170,65:0.30:-0.17:1.000:0.983 0/0/1/1:4:102,126:0.53:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,126:0.53:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:82,98:0.52:-1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,174:0.77:-0.45:0.999:1.000 0/0/1/1:4:97,112:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,130:0.74:-1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,107:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,144:0.73:-0.97:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,196:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,129:0.55:-0.37:1.000:0.976 0/0/1/1:4:98,141:0.57:-0.09:1.000:0.953 0/0/0/1:4:132,37:0.26:-1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,134:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,238:0.76: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,149:0.58: 0.06:1.000:0.909 0/0/1/1:4:125,125:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,202:0.78: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,156:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,198:0.71: 0.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,82:0.49:-1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,146:0.52: 0.51:1.000:0.996 -chr4.1 19403311 chr4.1_019403311 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:257,177:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:281,83:0.29:-0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:190,121:0.47:-1.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:351,94:0.27: 0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:145,294:0.61: 0.57:1.000:0.710 0/0/1/1:4:276,206:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,132:0.47:-0.80:1.000:0.991 0/0/0/1:4:326,81:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,210:0.59:-0.83:1.000:0.870 0/0/0/0:4:525,7:0.02: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,111:0.44:-1.30:1.000:0.972 0/0/1/1:4:100,207:0.61:-1.22:1.000:0.688 0/0/1/1:4:210,144:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:225,164:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:301,83:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:204,142:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:236,164:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,161:0.47: 0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:277,206:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:302,184:0.45: 1.21:1.000:0.984 0/0/1/1:4:113,212:0.60:-0.98:1.000:0.784 0/0/0/0:4:406,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,165:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:216,137:0.46:-0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:234,104:0.38:-0.80:1.000:0.513 0/0/0/0:4:509,2:0.01: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:349,85:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:223,175:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:417,94:0.24: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,211:0.60:-0.98:1.000:0.796 0/0/1/1:4:157,236:0.58:-0.05:1.000:0.921 0/0/1/1:4:89,188:0.61:-1.63:1.000:0.666 1/1/1/1:4:0,176:1.00:-3.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,176:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1:3:215,59:0.27:-1.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:255,164:0.47: 0.30:1.000:0.992 0/0/0/0:4:395,1:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:385,75:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:250,171:0.48: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:519,1:0.00: 1.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,304:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,228:0.61:-0.79:1.000:0.696 0/0/0/1:4:416,102:0.25: 1.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:233,176:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:290,219:0.50: 1.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:231,174:0.50: 0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,395:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,75:0.56:-3.54:1.000:0.974 0/0/1/1:4:226,148:0.47:-0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:285,149:0.42: 0.51:1.000:0.893 0/0/1/1:4:231,158:0.48:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:288,199:0.49: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,164:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,310:0.62: 0.60:1.000:0.533 0/0/0/1:4:282,71:0.26:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,253:0.61:-0.27:1.000:0.703 0/0/1/1:4:104,243:0.62:-0.68:1.000:0.548 0/0/1/1:4:247,242:0.53: 1.25:1.000:0.991 0/1/1/1:4:103,266:0.63:-0.38:1.000:0.570 0/0/0/0/1/1:6:306,101:0.31: 0.14:1.000:0.900 0/0/0/1:4:390,99:0.26: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:223,135:0.45:-0.53:1.000:0.982 0/0/0/1:4:463,117:0.26: 2.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:259,140:0.42: 0.03:1.000:0.927 0/0/0/1:4:395,80:0.22: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:451,70:0.17: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:325,71:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:231,142:0.46:-0.32:1.000:0.985 0/0/0/1:4:447,101:0.24: 2.06:0.999:1.000 0/0/0/1:4:334,89:0.27: 0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:163,260:0.58: 0.36:1.000:0.894 0/1/1/1:4:101,259:0.63:-0.50:1.000:0.562 0/0/0/1:4:434,105:0.25: 1.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:319,88:0.27: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:245,183:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,138:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:255,167:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:275,179:0.47: 0.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:254,166:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:385,96:0.26: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,194:0.61:-1.51:0.999:0.668 0/0/1/1:4:272,205:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:421,117:0.28: 1.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:208,149:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:302,156:0.41: 0.83:1.000:0.877 0/0/1/1:4:265,195:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,106:0.49:-1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:237,157:0.48:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:203,130:0.47:-0.87:1.000:0.991 0/0/0/0:4:438,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,261:0.75:-1.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,151:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:380,107:0.28: 1.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:276,72:0.26:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:284,166:0.44: 0.72:1.000:0.972 0/0/1/1:4:263,181:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:200,152:0.51:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,139:0.46:-0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:318,190:0.45: 1.51:1.000:0.979 0/0/0/1:4:388,78:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:368,91:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,303:0.61: 0.78:1.000:0.720 0/0/1/1:4:184,122:0.48:-1.24:1.000:0.994 0/0/0/0:4:546,0:0.00: 2.03:0.998:1.000 0/0/1/1:4:234,130:0.43:-0.45:1.000:0.948 0/0/1/1:4:256,145:0.44: 0.06:1.000:0.959 0/0/1/1:4:186,152:0.51:-0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,213:0.59:-0.83:1.000:0.846 0/0/1/1:4:138,317:0.62: 0.79:1.000:0.569 0/0/1/1:4:232,142:0.46:-0.31:1.000:0.985 0/0/1/1:4:124,250:0.61:-0.31:1.000:0.716 0/0/1/1:4:295,234:0.51: 1.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,233:0.60:-0.57:0.999:0.768 0/1/1/1:4:86,236:0.64:-1.02:1.000:0.637 0/0/0/1:4:246,49:0.21:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,170:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:359,84:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,146:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:344,81:0.25: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,150:0.46:-0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:369,88:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:253,178:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,177:0.49: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,239:0.62:-0.72:1.000:0.580 0/0/1/1:4:261,186:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:430,100:0.24: 1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,176:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:318,63:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,108:0.45:-1.52:1.000:0.984 0/0/1/1:4:181,141:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:203,128:0.46:-0.90:1.000:0.989 0/0/0/1:4:306,72:0.25:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,0:0.00:-1.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:268,175:0.47: 0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:224,150:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:311,198:0.47: 1.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:119,246:0.61:-0.43:1.000:0.689 0/0/1/1:4:283,167:0.45: 0.72:1.000:0.975 0/0/1/1:4:218,185:0.52: 0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:311,72:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,266:0.61: 0.03:1.000:0.724 0/0/1/1:4:240,196:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,140:0.46:-0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:200,131:0.47:-0.90:1.000:0.993 0/0/1/1:4:255,206:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:259,258:0.53: 1.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:238,148:0.46:-0.15:1.000:0.987 0/0/1/1:4:216,165:0.51:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:253,179:0.49: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:302,58:0.21:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,200:0.49: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,208:0.60:-1.00:1.000:0.814 0/0/1/1:4:230,171:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:177,120:0.48:-1.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:238,170:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:332,80:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:267,188:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:379,69:0.20: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,135:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:486,1:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,152:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:200,130:0.47:-0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,199:0.61:-1.36:1.000:0.708 0/1/1/1:4:1,283:0.76:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,208:0.60:-1.05:1.000:0.793 0/0/1/1:4:210,152:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,115:0.44:-1.15:1.000:0.972 0/0/0/1:4:326,54:0.18:-0.23:0.999:0.999 0/1/1/1:4:108,276:0.63:-0.18:1.000:0.558 0/0/1/1:4:221,140:0.46:-0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:191,146:0.51:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,129:0.51:-1.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:370,80:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,137:0.49:-0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:202,136:0.48:-0.80:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,244:1.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,287:0.61: 0.48:1.000:0.734 0/0/0/1:4:402,87:0.23: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,249:0.63:-0.69:1.000:0.563 0/0/1/1:4:202,118:0.44:-1.05:1.000:0.972 0/0/1/1:4:214,177:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:269,188:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:286,187:0.47: 1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:187,141:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:235,178:0.50: 0.22:1.000:0.997 -chr4.1 19638725 chr4.1_019638725 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:91,123:0.56: 1.82:1.000:0.964 0/0/0/1:4:86,41:0.32:-0.53:1.000:0.960 0/0/1/1:4:89,88:0.48: 0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:101,51:0.33: 0.14:1.000:0.924 0/1/1/1:4:41,168:0.81: 1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,81:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,53:0.52:-1.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:112,45:0.28: 0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,130:0.74: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-3.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.48:-3.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,97:0.69:-0.18:1.000:0.973 0/0/1/1:4:71,77:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,86:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,45:0.33:-0.34:1.000:0.923 0/0/1/1:4:87,77:0.45: 0.47:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,85:0.57: 0.01:1.000:0.957 0/1/1/1:4:47,137:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,107:0.52: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,100:0.51: 1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,18:0.72:-3.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,85:0.45: 0.95:1.000:0.982 0/0/1/1:4:69,78:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,11:0.38:-3.20:1.000:0.606 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,37:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,92:0.54: 0.55:1.000:0.990 0/0/0/1:4:96,52:0.34: 0.04:1.000:0.841 0/1/1/1:4:42,124:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,114:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,101:0.72:-0.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-3.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,10:0.33:-3.15:1.000:0.932 0/0/0:3:13,1:0.07:-3.58:0.999:1.000 0/0/1/1:4:76,87:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,44:0.26: 0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,68:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,149:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,111:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,50:0.28: 0.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,72:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,84:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,82:0.54: 0.04:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,38:0.79:-2.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,71:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,55:0.52:-1.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,66:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:90,94:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,80:0.47: 0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:42,130:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,45:0.27: 0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,142:0.80: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,124:0.72: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,69:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,121:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:93,31:0.25:-0.61:1.000:0.531 0/0/0/1:4:110,37:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,82:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,45:0.28: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,58:0.48:-0.77:1.000:0.994 0/0/0/1:4:124,51:0.29: 0.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,94:0.46: 1.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:69,26:0.27:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,86:0.54: 0.23:1.000:0.988 0/0/0/1:4:124,45:0.26: 0.60:0.999:0.998 0/0/0/1:4:120,40:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,121:0.73: 0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,76:0.73:-1.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,56:0.31: 0.87:1.000:0.976 0/0/0/1:4:127,37:0.22: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,89:0.55: 0.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:64,69:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,70:0.46: 0.04:1.000:0.986 0/0/1/1:4:80,79:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,86:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,44:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,81:0.74:-1.02:0.999:0.999 0/0/1/1:4:65,96:0.59: 0.39:1.000:0.891 0/0/0/1:4:104,41:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,81:0.56:-0.15:1.000:0.965 0/0/1/1:4:54,57:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,111:0.63: 0.77:1.000:0.514 0/0/1/1:4:44,63:0.58:-1.07:1.000:0.926 0/0/1/1:4:78,67:0.45:-0.04:1.000:0.977 0/0/1/1:4:71,75:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,93:0.53: 0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:135,42:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,24:0.22:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,78:0.47: 0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,99:0.52: 0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,72:0.45: 0.25:1.000:0.977 0/0/1/1:4:75,74:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,72:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,42:0.26: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,14:0.17:-1.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,137:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,55:0.51:-1.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.50:0.998:1.000 0/0/1/1:4:53,58:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,60:0.43:-0.29:1.000:0.941 0/0/1/1:4:70,59:0.44:-0.48:1.000:0.972 0/1/1/1:4:38,119:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,153:0.72: 1.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,82:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,110:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,101:0.46: 1.82:1.000:0.986 0/1/1/1:4:40,124:0.76: 0.47:0.999:1.000 0/1/1/1:4:24,117:0.83:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:83,28:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,84:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,31:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,82:0.58:-0.23:1.000:0.902 0/0/0/1:4:103,30:0.22:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,94:0.59: 0.28:1.000:0.877 0/0/0/1:4:117,51:0.30: 0.58:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,73:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,86:0.61:-0.23:1.000:0.642 0/1/1/1:4:42,132:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,87:0.54: 0.28:1.000:0.988 0/0/0/1:4:131,43:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,73:0.53:-0.37:1.000:0.991 0/0/0/1:4:106,24:0.18:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,50:0.56:-1.61:1.000:0.964 0/0/1/1:4:59,57:0.48:-0.83:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,66:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:143,42:0.23: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-1.64:0.999:1.000 0/0/1/1:4:67,57:0.45:-0.61:1.000:0.975 0/0/1/1:4:59,77:0.55:-0.29:1.000:0.977 0/0/1/1:4:90,80:0.46: 0.63:1.000:0.985 0/1/1/1:4:29,127:0.82: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,61:0.45:-0.40:1.000:0.977 0/0/1/1:4:59,74:0.54:-0.37:1.000:0.987 0/0/0/1:4:97,33:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,98:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,85:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,79:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,49:0.46:-1.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:95,108:0.52: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,106:0.48: 1.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,102:0.49: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,106:0.54: 1.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:80,80:0.48: 0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,42:0.29:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,90:0.51: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,126:0.72: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,16:0.33:-2.69:1.000:0.904 0/0/1/1:4:65,60:0.46:-0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:77,57:0.41:-0.34:1.000:0.883 0/0/0/1:4:105,34:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,80:0.44: 0.77:1.000:0.972 0/0/0/1:4:125,39:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,94:0.56: 0.44:1.000:0.961 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,88:0.53: 0.36:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,85:0.63:-0.37:1.000:0.584 0/1/1/1:4:31,130:0.81: 0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,92:0.72:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,94:0.62: 0.06:1.000:0.535 0/0/1/1:4:67,88:0.55: 0.23:1.000:0.975 0/0/0/1:4:118,46:0.28: 0.47:0.999:0.996 0/1/1/1:4:47,114:0.71: 0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,87:0.57: 0.06:1.000:0.942 0/0/1/1:4:90,71:0.43: 0.39:1.000:0.941 0/0/1/1:4:59,55:0.47:-0.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:118,36:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,83:0.53: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:52,66:0.54:-0.77:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,150:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,123:0.82: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,44:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,128:0.80: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,68:0.43: 0.20:1.000:0.942 0/0/1/1:4:85,89:0.49: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,99:0.51: 1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,100:0.51: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,64:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,102:0.53: 1.09:1.000:0.992 -chr4.1 19784419 chr4.1_019784419 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:130,35:.: 0.51:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:160,32:.: 1.16:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:121,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:110,33:.:-0.03:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.15:1.000:. ./.:4:154,32:.: 1.02:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:121,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:121,32:.: 0.21:1.000:. ./.:4:133,35:.: 0.58:1.000:. ./.:4:160,37:.: 1.28:1.000:. ./.:4:182,27:.: 1.57:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:117,21:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:93,11:.:-0.97:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:21,10:.:-2.75:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.65:1.000:. ./.:3:22,8:.:-2.77:0.999:. ./.:4:168,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:120,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:107,25:.:-0.29:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:154,49:.: 1.43:1.000:. ./.:4:30,2:.:-2.72:1.000:. ./.:4:65,20:.:-1.44:1.000:. ./.:4:45,9:.:-2.19:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:128,33:.: 0.41:1.000:. ./.:4:113,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:153,35:.: 1.06:1.000:. ./.:4:125,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:83,30:.:-0.76:1.000:. ./.:6:114,6:.:-0.59:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:97,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:113,34:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:178,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:132,22:.: 0.24:1.000:. ./.:4:69,13:.:-1.51:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:82,14:.:-1.17:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:133,31:.: 0.48:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.90:0.999:. ./.:4:176,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:140,29:.: 0.60:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:69,21:.:-1.31:1.000:. ./.:4:103,23:.:-0.44:1.000:. ./.:4:106,16:.:-0.54:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:89,15:.:-0.97:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:161,36:.: 1.28:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:123,25:.: 0.09:1.000:. ./.:4:80,24:.:-0.97:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.70:0.998:. ./.:4:88,20:.:-0.88:1.000:. ./.:4:103,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:144,38:.: 0.92:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:106,27:.:-0.27:0.999:. ./.:4:132,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:135,35:.: 0.63:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:95,20:.:-0.71:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:102,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:108,30:.:-0.15:1.000:. ./.:4:121,35:.: 0.29:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:99,17:.:-0.68:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.12:0.999:. ./.:4:63,16:.:-1.58:1.000:. ./.:4:99,26:.:-0.46:1.000:. ./.:4:194,35:.: 2.06:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:120,32:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,14:.:-1.17:1.000:. ./.:4:175,53:.: 2.03:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:142,30:.: 0.68:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:110,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:144,27:.: 0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:84,22:.:-0.93:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:161,30:.: 1.14:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:131,32:.: 0.46:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,23:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,27:.:-0.34:1.000:. ./.:4:71,17:.:-1.36:1.000:. ./.:4:130,24:.: 0.24:1.000:. ./.:4:120,39:.: 0.36:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.94:0.999:. ./.:4:138,22:.: 0.38:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:110,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:116,24:.:-0.10:1.000:. ./.:4:83,21:.:-0.97:1.000:. ./.:4:70,30:.:-1.07:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:145,31:.: 0.77:1.000:. ./.:4:138,24:.: 0.43:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:167,48:.: 1.72:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:113,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.68:1.000:. -chr4.1 20023726 chr4.1_020023726 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,53:.: 0.02:1.000:. ./.:4:19,37:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.60:1.000:. ./.:4:21,80:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,98:.: 0.90:1.000:. ./.:4:19,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.81:1.000:. ./.:4:50,63:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.02:1.000:. ./.:4:6,8:.:-2.60:1.000:. ./.:4:8,26:.:-1.77:1.000:. ./.:4:22,39:.:-0.64:1.000:. ./.:4:25,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,80:.: 1.02:1.000:. ./.:4:27,64:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.77:1.000:. ./.:4:54,35:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.73:1.000:. ./.:4:36,80:.: 1.64:1.000:. ./.:4:57,60:.: 1.69:1.000:. ./.:4:10,17:.:-2.06:1.000:. ./.:4:41,45:.: 0.40:1.000:. ./.:4:47,48:.: 0.77:1.000:. ./.:4:25,64:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.93:1.000:. ./.:4:50,48:.: 0.90:1.000:. ./.:4:42,46:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:57,51:.: 1.31:1.000:. ./.:4:29,82:.: 1.44:1.000:. ./.:4:30,33:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,3:.:-3.06:1.000:. ./.:4:8,8:.:-2.52:1.000:. ./.:3:2,1:.:-3.06:0.999:. ./.:4:37,73:.: 1.40:1.000:. ./.:4:39,35:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,50:.: 0.90:1.000:. ./.:4:38,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,47:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.60:1.000:. ./.:4:17,53:.:-0.27:1.000:. ./.:4:41,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:27,51:.: 0.06:1.000:. ./.:4:16,54:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,61:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,81:.: 1.35:1.000:. ./.:4:15,58:.:-0.15:1.000:. ./.:4:18,61:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:19,52:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:58,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.73:1.000:. ./.:6:22,27:.:-1.14:1.000:. ./.:4:54,30:.: 0.31:1.000:. ./.:4:34,27:.:-0.64:1.000:. ./.:4:17,56:.:-0.15:1.000:. ./.:4:16,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:20,52:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,41:.:-0.81:1.000:. ./.:4:37,35:.:-0.19:1.000:. ./.:4:22,42:.:-0.52:0.999:. ./.:4:42,48:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:40,45:.: 0.35:1.000:. ./.:4:20,65:.: 0.35:1.000:. ./.:4:45,27:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.10:1.000:. ./.:4:34,25:.:-0.73:1.000:. ./.:4:20,47:.:-0.40:1.000:. ./.:4:26,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.06:0.999:. ./.:4:23,60:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,30:.:-0.02:1.000:. ./.:4:31,51:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.35:1.000:. ./.:4:27,61:.: 0.48:1.000:. ./.:4:19,47:.:-0.44:1.000:. ./.:4:17,46:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,28:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.98:1.000:. ./.:4:41,47:.: 0.48:1.000:. ./.:4:24,57:.: 0.19:1.000:. ./.:4:41,28:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.19:1.000:. ./.:4:14,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,34:.:-0.44:1.000:. ./.:4:15,37:.:-1.02:1.000:. ./.:4:15,54:.:-0.31:1.000:. ./.:4:62,53:.: 1.60:1.000:. ./.:4:17,51:.:-0.35:1.000:. ./.:4:19,64:.: 0.27:1.000:. ./.:4:34,28:.:-0.60:1.000:. ./.:4:44,44:.: 0.48:0.998:. ./.:4:7,48:.:-0.89:1.000:. ./.:4:14,45:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,33:.:-1.02:1.000:. ./.:4:20,61:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,104:.: 2.60:1.000:. ./.:4:9,55:.:-0.52:1.000:. ./.:4:19,39:.:-0.77:1.000:. ./.:4:70,57:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.15:0.999:. ./.:4:26,59:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,27:.:-1.56:1.000:. ./.:4:32,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,45:.: 0.31:1.000:. ./.:4:18,51:.:-0.31:1.000:. ./.:4:26,46:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.23:1.000:. ./.:4:21,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:21,35:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,39:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,62:.: 0.56:1.000:. ./.:4:26,50:.:-0.02:1.000:. ./.:4:43,33:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.77:1.000:. ./.:4:33,19:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,33:.:-1.27:1.000:. ./.:4:15,31:.:-1.27:1.000:. ./.:4:32,25:.:-0.81:1.000:. ./.:4:30,62:.: 0.65:1.000:. ./.:4:32,20:.:-1.02:0.999:. ./.:4:0,67:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,59:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,79:.: 1.06:1.000:. ./.:4:21,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:14,24:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.73:1.000:. ./.:4:21,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:19,49:.:-0.35:1.000:. ./.:4:25,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:19,34:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,109:.: 1.35:1.000:. ./.:4:62,69:.: 2.27:1.000:. ./.:4:29,84:.: 1.52:1.000:. ./.:4:21,69:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,117:.: 1.69:1.000:. ./.:4:26,48:.:-0.10:1.000:. ./.:4:43,90:.: 2.35:1.000:. ./.:4:25,68:.: 0.69:1.000:. ./.:4:5,18:.:-2.23:1.000:. ./.:4:9,59:.:-0.35:1.000:. ./.:4:29,61:.: 0.56:1.000:. ./.:4:56,44:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,112:.: 1.48:1.000:. ./.:4:61,47:.: 1.31:1.000:. ./.:4:36,35:.:-0.23:1.000:. ./.:4:63,49:.: 1.48:1.000:. ./.:4:26,67:.: 0.69:1.000:. ./.:4:38,36:.:-0.10:1.000:. ./.:4:22,41:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.35:1.000:. ./.:4:26,79:.: 1.19:1.000:. ./.:4:21,65:.: 0.40:1.000:. ./.:4:23,57:.: 0.15:0.999:. ./.:4:24,70:.: 0.73:1.000:. ./.:4:48,59:.: 1.27:1.000:. ./.:4:24,61:.: 0.35:1.000:. ./.:4:14,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:25,30:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:46,33:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.81:1.000:. ./.:4:22,92:.: 1.56:1.000:. ./.:4:53,43:.: 0.81:1.000:. ./.:4:20,70:.: 0.56:1.000:. ./.:4:4,73:.: 0.02:1.000:. ./.:4:29,81:.: 1.40:1.000:. ./.:4:59,50:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,130:.: 2.23:1.000:. ./.:4:23,65:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,88:.: 1.64:1.000:. -chr4.1 20174960 chr4.1_020174960 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:3,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.16:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.26:0.999:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:15,1:.: 3.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:8,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:6:8,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:8,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,2:.: 2.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.73:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:13,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:9,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:17,0:.: 3.28:0.998:. ./.:4:4,1:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:11,1:.: 1.86:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:13,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:7,3:.: 1.29:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:16,0:.: 3.00:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:9,1:.: 1.29:0.999:. ./.:4:1,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:7,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:4,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:4,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.12:1.000:. -chr4.1 20508687 chr4.1_020508687 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:3,6:0.55: 0.23:1.000:0.982 0/0/1/1:4:1,3:0.61:-1.12:1.000:0.723 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.15:-0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:8,2:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.38: 1.57:1.000:0.611 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.58:1.000:0.958 0/0/0/1:4:6,3:0.32: 0.23:1.000:0.958 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.43:-0.04:1.000:0.951 0/0/0/1:4:2,1:0.32:-1.39:1.000:0.958 0/0/0/1:4:3,1:0.26:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.12: 0.23:1.000:0.745 0/0/1/1:4:4,6:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,6:0.55: 0.23:1.000:0.982 0/0/0/1:4:12,4:0.26: 2.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,6:0.43: 1.03:1.000:0.951 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,7:0.63: 0.23:1.000:0.523 0/0/0/1:4:9,3:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,1:0.18:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.53: 0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.58:1.000:0.951 0/0/0/1:4:3,1:0.26:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,2:0.18: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,1:0.11: 0.49:1.000:0.602 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.64:-0.85:1.000:0.721 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.93:0.999:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.43: 0.49:1.000:0.951 0/0/1/1:4:5,6:0.46: 0.76:1.000:0.989 0/0/0/1:4:6,1:0.15:-0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:6,4:0.36: 0.49:1.000:0.643 0/0/0/1:4:2,1:0.32:-1.39:1.000:0.958 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 3.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.64:-0.85:1.000:0.721 0/0/1/1:4:1,1:0.43:-1.66:1.000:0.951 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.58:1.000:0.951 0/0/0/1:4:6,4:0.36: 0.49:1.000:0.643 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,1:0.13:-0.04:1.000:0.940 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,1:0.18:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:4,1:0.21:-0.85:1.000:0.851 0/0/0/1:4:7,1:0.13:-0.04:1.000:0.940 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.58:1.000:0.958 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,4:0.36: 0.49:0.999:0.643 0/1/1/1:4:2,7:0.63: 0.23:1.000:0.523 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.32:-1.39:1.000:0.958 0/0/1/1:4:4,8:0.55: 1.03:1.000:0.982 0/0/0/1:4:9,3:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,6:0.38: 1.57:1.000:0.611 0/0/0/1:4:10,2:0.18: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,3:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.31:1.000:0.611 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.85:0.999:0.643 0/0/0/1:4:7,3:0.30: 0.49:1.000:0.989 0/0/1/1:4:4,7:0.53: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:9,2:0.20: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.25: 2.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,3:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.58:1.000:0.958 0/0/0/1:4:8,4:0.32: 1.03:1.000:0.958 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.43:-1.12:1.000:0.951 0/0/0/1:4:11,3:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.12: 0.23:1.000:0.745 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.15:-0.31:1.000:0.991 0/0/0/0:4:11,1:0.09: 1.03:1.000:0.950 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,6:0.61:-0.04:1.000:0.723 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,3:0.32: 0.23:1.000:0.958 0/0/1/1:4:7,6:0.41: 1.30:0.998:0.836 0/0/1/1:4:4,5:0.47: 0.23:1.000:0.992 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:6,3:0.32: 0.23:1.000:0.958 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.06: 2.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,3:0.19: 2.38:0.999:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,3:0.30: 0.49:1.000:0.989 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,5:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:9,5:0.33: 1.57:1.000:0.900 0/0/0/1:4:6,1:0.15:-0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:7,2:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,3:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,6:0.61:-0.04:1.000:0.723 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.58:1.000:0.951 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-0.58:1.000:0.951 0/0/1/1:4:8,7:0.41: 1.84:1.000:0.859 0/0/1/1:4:5,5:0.43: 0.49:1.000:0.951 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.93:0.999:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.18:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,2:0.18: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,6:0.46: 0.76:1.000:0.989 0/0/0/1:4:7,1:0.13:-0.04:1.000:0.940 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.43:-0.04:1.000:0.951 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,5:0.38: 1.03:1.000:0.505 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.58:1.000:0.958 0/0/0/0:4:11,1:0.09: 1.03:1.000:0.950 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.85:1.000:0.643 0/0/0/0:4:9,1:0.11: 0.49:1.000:0.602 0/0/1/1:4:7,6:0.41: 1.30:1.000:0.836 0/0/0/1:4:9,5:0.33: 1.57:1.000:0.900 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.85:1.000:0.643 0/1/1/1:4:0,3:0.79:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.26:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,2:0.13: 2.38:1.000:0.868 0/0/0/1:4:8,2:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.32: 0.23:1.000:0.958 0/0/0/1:4:6,4:0.36: 0.49:1.000:0.643 0/0/0/1:4:4,1:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,1:0.79:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.20: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,1:0.09: 1.03:1.000:0.950 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,4:0.43:-0.04:1.000:0.951 0/1/1/1:4:1,9:0.71: 0.49:0.999:0.994 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,1:0.79:-1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.38:-0.31:1.000:0.611 0/0/0/1:4:7,2:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,10:0.67: 1.03:1.000:0.906 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.58:1.000:0.958 0/0/0/1:4:5,3:0.35:-0.04:1.000:0.821 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.15:-0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:9,3:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,1:0.26:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-0.85:1.000:0.643 0/0/0/1:4:8,3:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.39: 0.23:1.000:0.735 -chr4.1 20770470 chr4.1_020770470 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,25:0.54: 0.76:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.55: 1.83:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,22:0.56: 0.23:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.35:-1.51:1.000:0.764 0/0/1/1:4:3,2:0.52:-1.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,18:0.44: 0.86:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,26:0.50: 1.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,21:0.46: 1.20:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,17:0.33: 1.63:1.000:0.920 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,26:0.55: 0.71:1.000:0.976 0/0/1/1:4:44,28:0.51: 1.58:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,23:0.45: 1.54:1.000:0.981 0/0/1/1:4:62,38:0.51: 2.94:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,22:0.51: 0.91:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,33:0.90:-0.25:1.000:0.710 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00: 0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/1/1:3:1,2:0.63:-1.75:0.999:1.000 0/0/1/1:4:43,19:0.43: 1.10:1.000:0.941 0/0/1/1:4:49,24:0.46: 1.63:1.000:0.986 0/0/1/1:4:37,31:0.54: 1.39:1.000:0.986 0/0/1/1:4:55,23:0.41: 1.87:1.000:0.879 0/0/0/1:4:79,28:0.37: 3.27:1.000:0.583 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,16:0.44: 0.57:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,8:0.27: 0.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,14:0.43: 0.28:1.000:0.956 0/0/0/1:4:36,11:0.33: 0.38:1.000:0.913 0/0/1/1:4:23,11:0.45:-0.25:1.000:0.981 0/0/1/1:4:39,18:0.44: 0.86:1.000:0.968 0/0/1/1:4:17,10:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,17:0.52: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,12:0.43:-0.01:1.000:0.946 0/0/0/1:4:30,9:0.33:-0.01:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,21:0.42: 1.49:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:25,13:0.48:-0.06:1.000:0.855 0/0/1/1:4:32,19:0.51: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,22:0.56: 0.28:1.000:0.972 0/0/1/1:4:32,14:0.43: 0.33:1.000:0.933 0/0/1/1:4:37,14:0.39: 0.57:1.000:0.640 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,26:0.54: 0.96:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,18:0.44: 0.86:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:0.999:1.000 0/0/0/1:4:47,14:0.33: 1.05:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,21:0.31: 2.74:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,13:0.26: 1.58:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,16:0.44: 0.57:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,32:0.55: 1.44:1.000:0.984 0/1/1/1:4:1,25:0.86:-0.64:0.999:0.948 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,17:0.51: 0.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,15:0.54:-0.25:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,23:0.55: 0.42:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,20:0.54: 0.23:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,16:0.51: 0.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,11:0.44:-0.20:1.000:0.964 0/0/1/1:4:27,15:0.50: 0.13:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,23:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,11:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,17:0.52: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,9:0.35:-0.15:1.000:0.764 0/0/1/1:4:22,14:0.51:-0.15:0.998:0.996 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,17:0.49: 0.42:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,34:0.50: 2.65:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.02:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,10:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,10:0.48:-0.49:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,16:0.50: 0.23:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,16:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,19:0.45: 0.96:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,17:0.52: 0.13:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,10:0.25: 0.96:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,8:0.35:-0.35:1.000:0.764 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.53:-0.54:0.999:0.992 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.34:-0.06:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,11:0.50:-0.44:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,12:0.39: 0.18:1.000:0.709 0/0/1/1:4:18,10:0.50:-0.54:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,20:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,31:0.53: 1.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,17:0.45: 0.67:1.000:0.977 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:36,14:0.39: 0.52:1.000:0.723 0/0/1/1:4:36,35:0.56: 1.54:1.000:0.970 0/0/1/1:4:43,26:0.51: 1.44:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,15:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,24:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,27:0.53: 1.10:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,11:0.30: 0.62:1.000:0.983 0/0/1/1:4:32,27:0.54: 0.96:1.000:0.986 0/0/1/1:4:33,28:0.54: 1.05:1.000:0.985 0/0/1/1:4:50,25:0.46: 1.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:38,17:0.43: 0.76:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,11:0.23: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,26:0.51: 1.44:0.999:0.996 0/0/1/1:4:39,17:0.42: 0.81:1.000:0.929 0/0/1/1:4:39,22:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,17:0.46: 0.62:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,16:0.43: 0.62:1.000:0.946 0/0/0/1:4:47,10:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,12:0.35: 0.47:1.000:0.824 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.54: 1.78:1.000:0.989 0/0/0/1:4:39,14:0.37: 0.67:1.000:0.539 0/1/1/1:4:3,26:0.74:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,30:0.54: 1.25:1.000:0.985 0/0/1/1:4:39,29:0.53: 1.39:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,20:0.50: 0.81:1.000:0.997 -chr4.1 20993005 chr4.1_020993005 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:124,192:.: 0.40:1.000:. ./.:4:180,127:.: 0.28:1.000:. ./.:4:153,151:.: 0.24:1.000:. ./.:4:96,212:.: 0.29:1.000:. ./.:4:167,180:.: 0.80:1.000:. ./.:4:321,79:.: 1.48:1.000:. ./.:4:123,95:.:-0.86:1.000:. ./.:4:112,212:.: 0.50:1.000:. ./.:4:159,140:.: 0.18:1.000:. ./.:4:21,22:.:-3.12:1.000:. ./.:4:59,21:.:-2.64:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:99,177:.:-0.12:1.000:. ./.:4:87,195:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,210:.: 0.32:1.000:. ./.:4:116,229:.: 0.77:1.000:. ./.:4:215,167:.: 1.25:1.000:. ./.:4:114,210:.: 0.50:1.000:. ./.:4:149,273:.: 1.76:1.000:. ./.:4:245,196:.: 2.01:1.000:. ./.:4:36,28:.:-2.85:1.000:. ./.:4:103,190:.: 0.10:1.000:. ./.:4:265,84:.: 0.82:1.000:. ./.:4:98,178:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,39:.:-2.97:1.000:. ./.:4:122,222:.: 0.76:1.000:. ./.:4:162,133:.: 0.13:1.000:. ./.:4:151,143:.: 0.11:1.000:. ./.:4:235,155:.: 1.35:1.000:. ./.:4:293,75:.: 1.07:1.000:. ./.:4:103,207:.: 0.32:1.000:. ./.:4:222,58:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,7:.:-3.39:1.000:. ./.:4:36,27:.:-2.86:1.000:. ./.:3:10,18:.:-3.31:0.999:. ./.:4:261,67:.: 0.55:1.000:. ./.:4:208,130:.: 0.68:1.000:. ./.:4:221,150:.: 1.11:1.000:. ./.:4:265,61:.: 0.53:1.000:. ./.:4:136,229:.: 1.03:1.000:. ./.:4:214,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:172,110:.:-0.04:1.000:. ./.:4:208,156:.: 1.02:1.000:. ./.:4:77,182:.:-0.34:1.000:. ./.:4:165,139:.: 0.24:1.000:. ./.:4:181,109:.: 0.06:1.000:. ./.:4:290,70:.: 0.96:1.000:. ./.:4:97,74:.:-1.47:1.000:. ./.:4:123,117:.:-0.58:1.000:. ./.:4:173,91:.:-0.27:1.000:. ./.:4:187,42:.:-0.72:1.000:. ./.:4:226,171:.: 1.44:1.000:. ./.:4:150,99:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,188:.:-0.05:1.000:. ./.:4:253,65:.: 0.42:1.000:. ./.:4:228,55:.:-0.03:1.000:. ./.:4:209,57:.:-0.25:1.000:. ./.:4:128,124:.:-0.43:1.000:. ./.:6:118,93:.:-0.95:1.000:. ./.:4:173,123:.: 0.14:1.000:. ./.:4:216,64:.:-0.07:1.000:. ./.:4:109,214:.: 0.49:1.000:. ./.:4:239,60:.: 0.18:1.000:. ./.:4:122,209:.: 0.59:1.000:. ./.:4:273,110:.: 1.26:1.000:. ./.:4:92,141:.:-0.67:1.000:. ./.:4:204,130:.: 0.63:1.000:. ./.:4:102,171:.:-0.16:0.999:. ./.:4:244,64:.: 0.29:1.000:. ./.:4:212,128:.: 0.71:1.000:. ./.:4:143,92:.:-0.64:1.000:. ./.:4:311,74:.: 1.29:1.000:. ./.:4:111,196:.: 0.28:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:86,139:.:-0.77:1.000:. ./.:4:124,112:.:-0.63:1.000:. ./.:4:164,122:.: 0.01:1.000:. ./.:4:152,126:.:-0.09:1.000:. ./.:4:154,112:.:-0.25:1.000:. ./.:4:202,40:.:-0.55:0.999:. ./.:4:125,131:.:-0.37:1.000:. ./.:4:102,208:.: 0.32:1.000:. ./.:4:115,125:.:-0.58:1.000:. ./.:4:145,110:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,150:.: 0.41:1.000:. ./.:4:73,127:.:-1.10:1.000:. ./.:4:115,98:.:-0.93:1.000:. ./.:4:72,127:.:-1.11:1.000:. ./.:4:78,155:.:-0.67:1.000:. ./.:4:205,51:.:-0.37:1.000:. ./.:4:198,53:.:-0.44:1.000:. ./.:4:88,180:.:-0.22:1.000:. ./.:4:134,102:.:-0.63:1.000:. ./.:4:143,85:.:-0.73:1.000:. ./.:4:162,121:.:-0.03:1.000:. ./.:4:178,45:.:-0.80:1.000:. ./.:4:247,50:.: 0.15:1.000:. ./.:4:169,126:.: 0.13:1.000:. ./.:4:125,188:.: 0.36:1.000:. ./.:4:138,77:.:-0.90:1.000:. ./.:4:237,57:.: 0.11:1.000:. ./.:4:143,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:70,153:.:-0.80:0.998:. ./.:4:84,144:.:-0.73:1.000:. ./.:4:68,164:.:-0.68:1.000:. ./.:4:119,117:.:-0.63:1.000:. ./.:4:304,74:.: 1.20:1.000:. ./.:4:321,74:.: 1.41:1.000:. ./.:4:144,129:.:-0.16:1.000:. ./.:4:146,101:.:-0.49:1.000:. ./.:4:393,107:.: 2.77:1.000:. ./.:4:116,106:.:-0.81:0.999:. ./.:4:187,115:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,97:.:-1.60:1.000:. ./.:4:187,124:.: 0.33:1.000:. ./.:4:193,78:.:-0.18:1.000:. ./.:4:86,142:.:-0.73:1.000:. ./.:4:196,60:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,149:.:-0.93:1.000:. ./.:4:89,190:.:-0.08:1.000:. ./.:4:101,97:.:-1.12:1.000:. ./.:4:192,127:.: 0.44:1.000:. ./.:4:281,90:.: 1.11:1.000:. ./.:4:109,107:.:-0.89:1.000:. ./.:4:190,121:.: 0.33:1.000:. ./.:4:129,96:.:-0.77:1.000:. ./.:4:222,40:.:-0.30:1.000:. ./.:4:134,96:.:-0.71:1.000:. ./.:4:170,54:.:-0.79:1.000:. ./.:4:145,90:.:-0.64:1.000:. ./.:4:118,241:.: 0.95:1.000:. ./.:4:53,117:.:-1.48:0.999:. ./.:4:92,125:.:-0.88:1.000:. ./.:4:157,96:.:-0.41:1.000:. ./.:4:138,299:.: 1.96:1.000:. ./.:4:232,54:.: 0.01:1.000:. ./.:4:188,37:.:-0.77:1.000:. ./.:4:100,83:.:-1.31:1.000:. ./.:4:81,138:.:-0.85:1.000:. ./.:4:192,52:.:-0.53:1.000:. ./.:4:118,99:.:-0.88:1.000:. ./.:4:226,123:.: 0.82:1.000:. ./.:4:131,80:.:-0.95:1.000:. ./.:4:128,266:.: 1.40:1.000:. ./.:4:325,82:.: 1.57:1.000:. ./.:4:270,95:.: 1.03:1.000:. ./.:4:175,135:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,151:.: 0.62:1.000:. ./.:4:84,181:.:-0.26:1.000:. ./.:4:347,95:.: 2.02:1.000:. ./.:4:235,89:.: 0.50:1.000:. ./.:4:28,48:.:-2.69:1.000:. ./.:4:146,99:.:-0.52:1.000:. ./.:4:229,81:.: 0.32:1.000:. ./.:4:190,144:.: 0.63:1.000:. ./.:4:197,192:.: 1.34:1.000:. ./.:4:125,255:.: 1.22:1.000:. ./.:4:219,44:.:-0.28:1.000:. ./.:4:110,235:.: 0.77:1.000:. ./.:4:217,126:.: 0.75:1.000:. ./.:4:197,52:.:-0.46:1.000:. ./.:4:195,116:.: 0.33:1.000:. ./.:4:263,62:.: 0.51:1.000:. ./.:4:165,132:.: 0.15:1.000:. ./.:4:99,207:.: 0.27:1.000:. ./.:4:197,121:.: 0.42:1.000:. ./.:4:184,148:.: 0.60:0.999:. ./.:4:234,63:.: 0.15:1.000:. ./.:4:236,67:.: 0.23:1.000:. ./.:4:170,106:.:-0.12:1.000:. ./.:4:213,65:.:-0.09:1.000:. ./.:4:80,170:.:-0.45:1.000:. ./.:4:214,137:.: 0.85:1.000:. ./.:4:163,117:.:-0.07:1.000:. ./.:4:231,62:.: 0.10:1.000:. ./.:4:328,77:.: 1.54:1.000:. ./.:4:247,133:.: 1.22:1.000:. ./.:4:266,61:.: 0.54:1.000:. ./.:4:119,188:.: 0.28:1.000:. ./.:4:308,77:.: 1.29:1.000:. ./.:4:250,166:.: 1.69:1.000:. ./.:4:188,168:.: 0.91:1.000:. ./.:4:83,182:.:-0.26:1.000:. ./.:4:274,70:.: 0.76:1.000:. -chr4.1 21055091 chr4.1_021055091 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:145,79:0.44: 0.39:1.000:0.969 0/0/1/1:4:90,66:0.52:-0.43:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,64:0.46:-0.20:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,89:0.50: 0.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:218,7:0.08: 0.40:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,1:0.06:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,50:0.57:-1.14:1.000:0.947 0/1/1/1:4:108,164:0.63: 0.98:1.000:0.519 0/0/1/1:4:103,78:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,71:0.52:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,81:0.54:-0.17:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,61:0.29: 0.76:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,88:0.47: 0.51:1.000:0.993 0/0/0/1:4:275,87:0.29: 2.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,60:0.58:-0.95:1.000:0.915 0/0/0/0:4:223,5:0.07: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:269,76:0.26: 1.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,64:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,36:0.84:-1.83:1.000:0.993 0/0/0/0:4:225,8:0.08: 0.50:1.000:0.988 0/0/0/0:4:261,8:0.08: 0.94:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,86:0.26: 2.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,131:0.57: 0.76:1.000:0.937 0/0/1/1:4:93,72:0.52:-0.33:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,59:0.53:-0.74:1.000:0.991 0/0/1:3:35,5:0.17:-1.85:0.999:0.947 0/0/1/1:4:104,67:0.49:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,82:0.35: 1.18:1.000:0.818 0/0/0/1:4:228,78:0.31: 1.39:1.000:0.977 0/0/0/1:4:218,66:0.28: 1.12:1.000:0.996 0/0/0/0:4:228,3:0.06: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,139:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,133:0.60: 0.59:1.000:0.817 0/0/0/1:4:259,94:0.32: 1.96:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,15:0.14:-0.42:1.000:0.962 0/0/1/1:4:105,157:0.62: 0.86:1.000:0.511 1/1/1/1:4:0,174:1.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,3:0.07:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,96:0.55: 0.11:1.000:0.980 0/0/0/1:4:215,64:0.27: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:130,91:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,67:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,75:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,8:0.11:-0.95:1.000:0.623 0/0/1/1:4:117,68:0.46:-0.08:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,87:0.34: 1.43:1.000:0.841 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:190,66:0.31: 0.78:1.000:0.904 0/0/0/1:4:243,72:0.27: 1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:204,49:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,9:0.11:-0.69:1.000:0.521 0/0/1/1:4:112,69:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,80:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:213,128:0.47: 1.82:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,46:0.36:-0.42:1.000:0.692 0/0/0/1:4:249,54:0.22: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,69:0.52:-0.37:0.999:0.995 0/0/0/1:4:189,61:0.29: 0.71:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,95:0.34: 1.85:1.000:0.888 0/0/1/1:4:128,91:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:240,153:0.49: 2.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,9:0.12:-0.93:1.000:0.806 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,76:0.29: 1.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,80:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:109,3:0.07:-0.97:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-0.20:0.999:1.000 0/0/1/1:4:136,69:0.42: 0.16:1.000:0.910 0/0/0/0:4:248,5:0.07: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,66:0.50:-0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,78:0.44: 0.36:1.000:0.969 0/0/1/1:4:99,76:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:109,10:0.13:-0.89:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,5:0.08:-0.26:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,66:0.28: 1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,79:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:168,62:0.33: 0.47:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,81:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,57:0.25: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,111:0.59: 0.14:1.000:0.850 0/0/1/1:4:130,126:0.56: 0.78:1.000:0.969 0/0/0/0:4:229,3:0.06: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,59:0.44:-0.30:1.000:0.970 0/0/1/1:4:123,74:0.47: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:178,54:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/0:4:228,5:0.07: 0.50:0.998:0.999 0/0/1/1:4:99,51:0.42:-0.51:1.000:0.928 0/0/1/1:4:110,64:0.46:-0.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:103,51:0.41:-0.46:1.000:0.874 0/0/1/1:4:127,139:0.58: 0.90:1.000:0.924 0/0/1/1:4:129,78:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,61:0.46:-0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:102,129:0.60: 0.48:1.000:0.796 0/0/0/1:4:267,94:0.32: 2.06:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.38:0.999:1.000 0/0/1/1:4:118,112:0.56: 0.47:1.000:0.973 0/0/1/1:4:76,56:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:233,98:0.36: 1.69:1.000:0.642 0/0/0/1:4:228,59:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,85:0.53:-0.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:117,75:0.49: 0.00:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,70:0.43: 0.14:1.000:0.947 0/0/1/1:4:110,67:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,79:0.47: 0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:138,76:0.44: 0.27:1.000:0.973 0/0/1/1:4:132,65:0.41: 0.06:1.000:0.864 0/0/0/1:4:233,86:0.33: 1.55:1.000:0.929 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,71:0.34: 0.77:1.000:0.870 0/0/1/1:4:88,87:0.56:-0.20:1.000:0.964 0/0/1/1:4:111,49:0.38:-0.39:1.000:0.540 0/0/0/1:4:215,58:0.25: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,53:0.40:-0.31:1.000:0.749 0/0/0/0:4:148,1:0.05:-0.52:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,58:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,84:0.47: 0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,106:0.57: 0.21:1.000:0.951 0/0/1/1:4:93,74:0.53:-0.30:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,67:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,137:0.57: 0.90:1.000:0.939 0/0/1/1:4:108,78:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,66:0.47:-0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:82,64:0.53:-0.56:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:332,115:0.31: 3.11:1.000:0.972 0/0/1/1:4:109,88:0.53: 0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:215,63:0.27: 1.05:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,3:0.07:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,90:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:126,59:0.39:-0.08:1.000:0.744 0/0/0/1:4:65,18:0.26:-1.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,78:0.34: 1.07:1.000:0.869 0/0/1/1:4:125,79:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:219,67:0.28: 1.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:223,4:0.06: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,60:0.27: 0.87:1.000:0.997 0/0/0/0:4:242,5:0.07: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,60:0.47:-0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:187,68:0.32: 0.77:1.000:0.943 0/0/1/1:4:102,110:0.58: 0.25:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,53:0.41:-0.40:1.000:0.890 0/0/1/1:4:92,61:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,61:0.45:-0.26:0.999:0.979 0/0/1/1:4:100,65:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:248,64:0.24: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,74:0.54:-0.40:1.000:0.986 0/0/1/1:4:82,109:0.61:-0.01:1.000:0.725 0/0/0/0:4:190,7:0.08: 0.06:1.000:0.985 0/0/0/1:4:199,52:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,47:0.24: 0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,129:0.54: 1.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:257,60:0.23: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,69:0.46:-0.05:1.000:0.988 0/1/1/1:4:28,76:0.70:-1.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:103,68:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:275,94:0.31: 2.16:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,64:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,153:0.61: 0.90:1.000:0.695 -chr4.1 21327628 chr4.1_021327628 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:158,62:.: 0.50:1.000:. ./.:4:79,113:.: 0.00:1.000:. ./.:4:158,61:.: 0.48:1.000:. ./.:4:185,65:.: 1.03:1.000:. ./.:4:218,75:.: 1.80:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:146,44:.:-0.03:1.000:. ./.:4:163,63:.: 0.61:1.000:. ./.:4:150,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:37,20:.:-2.39:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:145,67:.: 0.36:1.000:. ./.:4:177,67:.: 0.93:1.000:. ./.:4:170,73:.: 0.91:1.000:. ./.:4:175,62:.: 0.80:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:75,244:.: 2.26:1.000:. ./.:4:238,98:.: 2.56:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:148,47:.: 0.06:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:154,57:.: 0.34:1.000:. ./.:4:9,13:.:-3.02:1.000:. ./.:4:188,73:.: 1.23:1.000:. ./.:4:142,69:.: 0.34:1.000:. ./.:4:146,63:.: 0.31:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:161,65:.: 0.61:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:33,14:.:-2.57:1.000:. ./.:3:20,4:.:-2.98:0.999:. ./.:4:222,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:169,65:.: 0.75:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:106,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:104,57:.:-0.55:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:259,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:55,21:.:-2.06:1.000:. ./.:4:114,44:.:-0.60:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:139,58:.: 0.09:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:121,48:.:-0.40:1.000:. ./.:6:132,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:152,53:.: 0.23:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:155,65:.: 0.50:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:129,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:116,39:.:-0.65:0.999:. ./.:4:118,69:.:-0.08:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:140,55:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,58:.:-0.16:1.000:. ./.:4:199,70:.: 1.37:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:126,73:.: 0.13:1.000:. ./.:4:123,58:.:-0.19:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:143,66:.: 0.31:1.000:. ./.:4:146,55:.: 0.16:1.000:. ./.:4:89,34:.:-1.22:0.999:. ./.:4:161,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:131,53:.:-0.14:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:125,41:.:-0.46:1.000:. ./.:4:166,69:.: 0.77:1.000:. ./.:4:116,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:130,52:.:-0.17:1.000:. ./.:4:126,48:.:-0.32:1.000:. ./.:4:125,51:.:-0.28:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:182,50:.: 0.71:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:164,57:.: 0.52:1.000:. ./.:4:150,51:.: 0.16:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:85,44:.:-1.12:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:152,86:.: 0.82:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:120,50:.:-0.39:0.998:. ./.:4:88,37:.:-1.19:1.000:. ./.:4:135,52:.:-0.08:1.000:. ./.:4:115,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:135,62:.: 0.09:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:138,56:.: 0.04:0.999:. ./.:4:175,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:76,35:.:-1.43:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:117,55:.:-0.35:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:143,64:.: 0.27:1.000:. ./.:4:163,65:.: 0.64:1.000:. ./.:4:125,38:.:-0.51:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,44:.:-0.35:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:131,46:.:-0.26:1.000:. ./.:4:88,40:.:-1.13:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:166,64:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,43:.:-1.54:0.999:. ./.:4:105,50:.:-0.65:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:220,113:.: 2.51:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:93,32:.:-1.19:1.000:. ./.:4:126,27:.:-0.69:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,52:.: 0.04:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:217,81:.: 1.89:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:255,70:.: 2.37:1.000:. ./.:4:137,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:47,26:.:-2.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:200,79:.: 1.55:1.000:. ./.:4:184,83:.: 1.34:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:189,78:.: 1.34:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:91,44:.:-1.01:1.000:. ./.:4:183,82:.: 1.30:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,138:.: 1.16:0.999:. ./.:4:167,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:134,58:.: 0.00:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:282,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:134,77:.: 0.34:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:230,100:.: 2.46:1.000:. ./.:4:147,55:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,67:.: 0.68:1.000:. -chr4.1 21580168 chr4.1_021580168 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:236,87:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:276,7:0.02: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,70:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,94:0.22: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:277,74:0.18: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,97:0.44:-0.20:1.000:0.961 0/0/0/1:4:268,60:0.16: 1.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:170,96:0.34: 0.38:1.000:0.898 0/0/0/1:4:201,101:0.30: 0.82:1.000:0.982 0/0/0/1:4:54,18:0.22:-1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,49:0.73:-2.17:1.000:0.998 0/0/0/0:4:164,5:0.03:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,74:0.27: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:287,78:0.18: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,79:0.28: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,174:0.54: 0.84:1.000:0.985 0/0/1/1:4:121,104:0.46:-0.11:1.000:0.986 0/0/0/0:4:313,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,113:0.26: 1.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:213,127:0.35: 1.28:1.000:0.790 0/0/0/1:4:67,34:0.31:-1.61:1.000:0.979 0/0/0/1:4:166,81:0.30: 0.15:1.000:0.989 0/0/0/0:4:176,9:0.04:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:305,82:0.18: 1.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,37:0.69:-2.29:1.000:0.974 0/0/0/1:4:245,137:0.33: 1.79:1.000:0.911 0/0/0/0:4:316,8:0.02: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,74:0.21: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,88:0.42:-0.34:1.000:0.892 0/0/0/0:4:350,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:355,118:0.21: 2.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,68:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,4:0.10:-2.41:1.000:0.836 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-1.96:1.000:1.000 0/1/1:3:12,14:0.52:-2.52:0.999:0.832 0/0/1/1:4:99,96:0.49:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,110:0.29: 1.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:189,101:0.32: 0.67:1.000:0.954 0/0/0/0:4:235,16:0.05: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,113:0.28: 1.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:164,74:0.27: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,79:0.30: 0.02:1.000:0.982 0/0/1/1:4:104,107:0.51:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,143:0.58:-0.09:1.000:0.923 0/0/0/1:4:166,76:0.28: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,73:0.29:-0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:180,108:0.35: 0.65:1.000:0.773 0/0/0/1:4:290,96:0.21: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,80:0.31: 0.00:1.000:0.970 0/1/1/1:4:18,221:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:169,13:0.06:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,221:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,128:0.78:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,69:0.34:-0.55:1.000:0.869 0/0/1/1:4:85,146:0.58:-0.04:1.000:0.919 0/0/1/1:4:97,117:0.53:-0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:145,61:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:273,18:0.05: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,76:0.21: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:56,87:0.56:-1.10:1.000:0.642 0/0/0/1:4:119,66:0.33:-0.60:1.000:0.921 0/0/0/0:4:115,11:0.08:-1.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,177:0.61: 0.32:1.000:0.736 0/0/1/1:4:104,91:0.46:-0.48:1.000:0.989 0/0/0/1:4:210,86:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:162,85:0.31: 0.15:1.000:0.965 0/0/0/1:4:190,60:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,88:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,68:0.22: 0.38:0.999:1.000 0/0/0/0:4:142,16:0.09:-0.92:1.000:0.964 0/0/1/1:4:148,178:0.53: 1.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:148,60:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,43:0.15: 0.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:227,68:0.20: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,25:0.38:-2.07:1.000:0.549 0/0/1/1:4:66,113:0.58:-0.67:1.000:0.920 0/0/0/1:4:163,81:0.30: 0.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:52,70:0.54:-1.36:1.000:0.984 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,93:0.34: 0.25:1.000:0.872 0/0/0/0:4:152,1:0.01:-0.98:0.999:1.000 0/0/0/0:4:296,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,88:0.38:-0.15:1.000:0.542 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,74:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,63:0.29:-0.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:110,58:0.32:-0.80:1.000:0.963 0/0/1/1:4:78,97:0.53:-0.72:1.000:0.991 0/0/0/1:4:138,58:0.26:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,55:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,7:0.04:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,69:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,79:0.51:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,67:0.29:-0.34:1.000:0.991 0/0/0/0:4:332,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,7:0.04:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,7:0.03:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,62:0.32:-0.66:1.000:0.965 0/0/1/1:4:147,109:0.41: 0.26:1.000:0.883 0/1/1/1:4:16,119:0.72:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,78:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,49:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,70:0.35:-0.55:0.998:0.823 0/0/0/1:4:186,58:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,67:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:180,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:324,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,113:0.36: 0.73:1.000:0.668 0/0/0/0:4:201,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,57:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:394,19:0.04: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,76:0.37:-0.49:0.999:0.533 0/0/0/1:4:159,92:0.34: 0.20:1.000:0.857 0/0/0/1:4:157,59:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,81:0.45:-0.69:1.000:0.982 0/0/0/1:4:119,59:0.30:-0.68:1.000:0.986 0/0/0/1:4:148,71:0.29:-0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:122,74:0.36:-0.46:1.000:0.742 0/0/1/1:4:118,105:0.47:-0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:159,89:0.33: 0.16:1.000:0.910 0/0/0/0:4:227,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,148:0.61:-0.25:1.000:0.649 0/0/1/1:4:110,85:0.43:-0.48:1.000:0.934 0/0/0/0:4:180,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,84:0.53:-1.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:198,55:0.19: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,23:0.13:-1.02:1.000:0.926 0/0/0/1:4:111,49:0.27:-0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,48:0.42:-1.49:1.000:0.920 0/0/1/1:4:68,61:0.47:-1.27:1.000:0.992 0/0/0/1:4:205,79:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,38:0.28:-1.36:0.999:0.997 0/0/1/1:4:126,143:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,135:0.59:-0.35:1.000:0.836 0/0/0/1:4:354,133:0.23: 3.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:243,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,79:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,45:0.28:-1.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:102,50:0.30:-1.00:1.000:0.988 0/0/0/0:4:205,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,140:0.58:-0.16:1.000:0.915 0/1/1/1:4:9,110:0.75:-1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,203:0.57: 1.17:1.000:0.952 0/0/0/0:4:301,16:0.04: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,107:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,84:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:289,98:0.22: 1.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,151:0.63:-0.27:1.000:0.507 0/0/0/1:4:226,128:0.34: 1.45:1.000:0.893 0/0/1/1:4:110,99:0.47:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,77:0.29: 0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:129,97:0.42:-0.10:1.000:0.904 0/0/0/1:4:174,84:0.29: 0.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:297,100:0.22: 1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,118:0.34: 1.10:1.000:0.883 0/0/0/0:4:157,6:0.03:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,108:0.32: 0.93:1.000:0.957 0/1/1/1:4:6,152:0.78:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,11:0.04: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,81:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:196,101:0.31: 0.76:1.000:0.974 0/0/0/1:4:227,86:0.24: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,82:0.29: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,185:0.61: 0.44:1.000:0.709 0/0/0/0:4:269,3:0.01: 0.46:0.999:1.000 0/0/0/1:4:166,89:0.32: 0.25:1.000:0.952 0/0/0/0:4:181,5:0.02:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,160:0.75:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,95:0.32: 0.43:1.000:0.942 0/0/0/1:4:135,76:0.33:-0.28:1.000:0.902 0/0/1/1:4:90,72:0.44:-0.87:1.000:0.960 0/0/0/1:4:167,70:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:392,1:0.00: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,99:0.31: 0.67:1.000:0.971 0/0/1/1:4:114,89:0.43:-0.38:1.000:0.943 0/0/1/1:4:185,130:0.40: 0.98:1.000:0.769 0/0/0/1:4:201,104:0.31: 0.85:1.000:0.972 0/0/1/1:4:147,117:0.43: 0.36:1.000:0.957 0/0/0/1:4:382,100:0.18: 2.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,95:0.34: 0.30:1.000:0.855 0/0/0/0:4:205,3:0.01:-0.32:1.000:1.000 -chr4.1 21808044 chr4.1_021808044 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:101,36:.:-0.28:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:101,33:.:-0.34:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:83,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:37,7:.:-2.22:1.000:. ./.:4:41,22:.:-1.82:1.000:. ./.:4:80,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:99,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:120,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:95,42:.:-0.28:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:114,24:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:196,50:.: 2.00:1.000:. ./.:4:80,31:.:-0.82:1.000:. ./.:4:129,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:116,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:250,1:.: 2.10:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.53:1.000:. ./.:3:17,4:.:-2.70:0.999:. ./.:4:92,33:.:-0.53:1.000:. ./.:4:137,46:.: 0.68:1.000:. ./.:4:102,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:170,67:.: 1.81:1.000:. ./.:4:148,42:.: 0.83:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:169,47:.: 1.37:1.000:. ./.:4:201,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:120,51:.: 0.43:1.000:. ./.:4:242,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:129,60:.: 0.81:1.000:. ./.:4:170,69:.: 1.85:1.000:. ./.:4:121,38:.: 0.18:1.000:. ./.:4:122,42:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,35:.:-0.36:1.000:. ./.:4:120,46:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:179,62:.: 1.89:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:192,43:.: 1.77:1.000:. ./.:4:206,1:.: 1.18:1.000:. ./.:6:122,37:.: 0.18:1.000:. ./.:4:131,47:.: 0.58:1.000:. ./.:4:141,40:.: 0.64:1.000:. ./.:4:145,78:.: 1.52:1.000:. ./.:4:199,54:.: 2.14:1.000:. ./.:4:168,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:212,48:.: 2.29:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,39:.:-0.28:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:59,58:.:-0.70:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:145,125:.: 2.50:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:104,95:.: 1.02:1.000:. ./.:4:134,43:.: 0.56:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:95,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:169,53:.: 1.50:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.16:0.999:. ./.:4:179,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:119,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:297,1:.: 3.08:1.000:. ./.:4:234,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.44:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:141,56:.: 0.98:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:124,48:.: 0.45:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:91,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:252,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:128,37:.: 0.31:1.000:. ./.:4:144,41:.: 0.72:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:82,49:.:-0.40:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:126,44:.: 0.41:1.000:. ./.:4:86,33:.:-0.65:1.000:. ./.:4:141,40:.: 0.64:0.998:. ./.:4:158,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:113,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:124,33:.: 0.14:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.26:0.999:. ./.:4:166,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:105,43:.:-0.05:1.000:. ./.:4:130,51:.: 0.64:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:156,47:.: 1.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:190,2:.: 0.87:1.000:. ./.:4:157,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:127,47:.: 0.50:1.000:. ./.:4:56,25:.:-1.45:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:141,43:.: 0.70:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,98:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:104,53:.: 0.14:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,26:.:-0.61:0.999:. ./.:4:143,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:69,36:.:-0.95:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:105,38:.:-0.15:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.80:1.000:. ./.:4:106,22:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:136,42:.: 0.58:1.000:. ./.:4:92,31:.:-0.57:1.000:. ./.:4:81,35:.:-0.72:1.000:. ./.:4:184,2:.: 0.75:1.000:. ./.:4:84,28:.:-0.80:1.000:. ./.:4:110,33:.:-0.15:1.000:. ./.:4:75,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:43,22:.:-1.78:1.000:. ./.:4:157,44:.: 1.06:1.000:. ./.:4:107,41:.:-0.05:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:83,27:.:-0.84:1.000:. ./.:4:86,19:.:-0.95:1.000:. ./.:4:109,35:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,20:.:-1.53:1.000:. ./.:4:63,33:.:-1.13:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,23:.:-1.57:1.000:. ./.:4:92,28:.:-0.63:0.999:. ./.:4:56,33:.:-1.28:1.000:. ./.:4:86,34:.:-0.63:1.000:. ./.:4:54,20:.:-1.59:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:110,40:.:-0.01:1.000:. ./.:4:87,30:.:-0.70:1.000:. ./.:4:109,51:.: 0.20:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:118,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:85,35:.:-0.63:1.000:. ./.:4:97,6:.:-0.99:1.000:. ./.:4:120,38:.: 0.16:1.000:. ./.:4:113,44:.: 0.14:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:92,26:.:-0.67:1.000:. -chr4.1 22038007 chr4.1_022038007 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:431,141:0.27: 0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:326,101:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:146,395:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:423,133:0.27: 0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:510,137:0.24: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:191,459:0.73: 1.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:343,99:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,218:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:260,220:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,71:0.43:-2.78:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,201:1.00:-2.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:280,228:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:283,249:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:465,114:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:255,221:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:130,366:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:133,350:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:315,278:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:336,310:0.51: 1.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:339,260:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:93,97:0.54:-2.68:1.000:0.987 0/0/1/1:4:286,221:0.47: 0.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:319,248:0.47: 0.81:1.000:0.992 0/0/0/1:4:432,100:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,92:0.71:-3.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:320,239:0.46: 0.74:1.000:0.986 0/0/0/1:4:420,109:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:399,137:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:168,467:0.76: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:429,132:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:399,126:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:201,183:0.51:-0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,46:0.36:-3.16:1.000:0.665 0/0/0/1:4:156,27:0.16:-2.75:1.000:0.997 0/1/1:3:12,37:0.78:-3.99:0.999:1.000 0/1/1/1:4:152,376:0.74: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:275,239:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:239,258:0.55: 0.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:272,261:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:305,244:0.48: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:236,213:0.51:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:275,244:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:167,346:0.70: 0.31:1.000:0.985 0/1/1/1:4:109,279:0.74:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:290,219:0.46: 0.27:1.000:0.988 0/0/1/1:4:252,279:0.56: 0.48:1.000:0.974 0/0/1/1:4:298,319:0.55: 1.28:1.000:0.983 0/0/1/1:4:164,231:0.61:-0.78:1.000:0.661 0/0/1/1:4:270,224:0.48: 0.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,351:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:347,100:0.25:-0.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,560:1.00: 0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,407:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:290,203:0.44: 0.13:1.000:0.970 0/1/1/1:4:130,348:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:144,325:0.72:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:239,188:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:430,108:0.22: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:354,102:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:169,228:0.60:-0.76:1.000:0.665 0/0/1/1:4:278,221:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:214,205:0.52:-0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:163,414:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:122,289:0.73:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:280,293:0.54: 0.87:1.000:0.987 0/0/1/1:4:239,323:0.60: 0.77:1.000:0.765 0/0/1/1:4:247,205:0.48:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,326:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:427,86:0.19: 0.31:0.999:1.000 0/0/1/1:4:252,194:0.47:-0.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:147,377:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:263,208:0.47:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:291,259:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:426,140:0.27: 0.80:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,446:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,313:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,225:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:131,327:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:402,102:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,236:0.47: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:187,192:0.54:-0.93:0.999:0.989 0/0/0/0:4:553,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,217:0.44: 0.45:1.000:0.969 0/0/0/1:4:364,90:0.22:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,181:0.45:-0.42:1.000:0.977 0/0/0/1:4:483,149:0.26: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,178:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:249,195:0.47:-0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:124,293:0.73:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:256,210:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:235,198:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:226,226:0.53:-0.25:1.000:0.992 0/0/0/1:4:445,116:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,272:0.73:-0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:262,239:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:490,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:346,90:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,108:0.31:-0.86:1.000:0.978 0/0/1/1:4:285,237:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:261,233:0.50: 0.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,443:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,359:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,244:0.75:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:242,217:0.50:-0.19:0.998:0.997 0/0/0/1:4:311,72:0.21:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:339,107:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:299,78:0.23:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:383,126:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:390,334:0.49: 2.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:365,115:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:257,215:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:539,164:0.26: 2.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:263,222:0.49: 0.05:0.999:0.996 0/0/1/1:4:263,266:0.53: 0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:217,52:0.22:-1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:151,325:0.71:-0.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:270,198:0.45:-0.11:1.000:0.983 0/0/1/1:4:263,209:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:229,218:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:208,193:0.51:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,217:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:463,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,349:0.78:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:128,428:0.79: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:559,1:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:145,363:0.74: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:346,105:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,191:0.55:-1.04:1.000:0.979 0/0/1/1:4:189,146:0.47:-1.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:204,177:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:121,283:0.72:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:271,255:0.52: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,134:0.46:-1.54:0.999:0.987 0/0/1/1:4:278,211:0.46: 0.09:1.000:0.989 0/1/1/1:4:101,285:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:593,138:0.21: 2.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:357,100:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,290:0.74:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,181:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:221,193:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:416,97:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:373,131:0.29: 0.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:131,348:0.75: 0.00:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,352:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:202,473:0.72: 1.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:569,162:0.25: 2.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,392:0.79: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:144,332:0.72:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:444,151:0.28: 1.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:101,298:0.77:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:342,297:0.50: 1.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:118,321:0.75:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00:-2.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,213:0.52:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:139,400:0.76: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,280:0.55: 0.55:1.000:0.980 0/0/0/1:4:538,168:0.26: 2.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:340,276:0.48: 1.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:268,200:0.46:-0.11:1.000:0.986 0/0/1/1:4:323,243:0.46: 0.80:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,468:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:348,95:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,212:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:272,268:0.53: 0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:235,196:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:297,252:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:128,321:0.74:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:413,107:0.23: 0.38:0.999:1.000 0/0/1/1:4:270,232:0.49: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:261,234:0.50: 0.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,444:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,101:0.27:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:303,230:0.46: 0.50:1.000:0.989 0/0/1/1:4:220,197:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:106,248:0.72:-1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:204,188:0.51:-0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:498,143:0.25: 1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:253,261:0.54: 0.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:131,359:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,241:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:335,285:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:189,490:0.75: 1.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:517,156:0.26: 1.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:251,229:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:262,239:0.51: 0.20:1.000:0.996 -chr4.1 22156437 chr4.1_022156437 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:261,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:62,62:.:-2.03:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:198,78:.:-0.32:1.000:. ./.:4:176,146:.: 0.20:1.000:. ./.:4:106,37:.:-1.82:1.000:. ./.:4:156,61:.:-0.99:1.000:. ./.:4:115,75:.:-1.29:1.000:. ./.:4:90,33:.:-2.05:1.000:. ./.:4:101,77:.:-1.43:1.000:. ./.:4:211,56:.:-0.42:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:278,77:.: 0.57:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:334,102:.: 1.48:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:187,85:.:-0.37:1.000:. ./.:4:205,172:.: 0.81:1.000:. ./.:4:220,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:67,3:.:-2.64:1.000:. ./.:4:164,103:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,112:.:-1.52:1.000:. ./.:4:139,55:.:-1.25:1.000:. ./.:4:339,93:.: 1.43:1.000:. ./.:4:173,64:.:-0.76:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:185,44:.:-0.85:1.000:. ./.:4:44,50:.:-2.37:1.000:. ./.:4:90,49:.:-1.87:1.000:. ./.:3:48,21:.:-2.65:0.999:. ./.:4:160,127:.:-0.20:1.000:. ./.:4:249,62:.: 0.07:1.000:. ./.:4:242,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:251,217:.: 1.84:1.000:. ./.:4:197,102:.:-0.06:1.000:. ./.:4:300,89:.: 0.95:1.000:. ./.:4:304,105:.: 1.17:1.000:. ./.:4:369,127:.: 2.15:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:117,220:.: 0.36:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:312,90:.: 1.10:1.000:. ./.:4:31,22:.:-2.83:1.000:. ./.:4:88,168:.:-0.55:1.000:. ./.:4:273,119:.: 0.98:1.000:. ./.:4:194,182:.: 0.80:1.000:. ./.:4:383,130:.: 2.35:1.000:. ./.:4:248,79:.: 0.25:1.000:. ./.:4:224,216:.: 1.52:1.000:. ./.:4:158,76:.:-0.80:1.000:. ./.:4:204,161:.: 0.68:1.000:. ./.:4:250,78:.: 0.26:1.000:. ./.:4:257,219:.: 1.93:1.000:. ./.:4:181,100:.:-0.27:1.000:. ./.:6:280,92:.: 0.76:1.000:. ./.:4:347,94:.: 1.54:1.000:. ./.:4:184,207:.: 0.97:1.000:. ./.:4:248,119:.: 0.70:1.000:. ./.:4:219,181:.: 1.07:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:431,90:.: 2.44:1.000:. ./.:4:290,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:299,83:.: 0.87:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.25:0.999:. ./.:4:70,141:.:-1.05:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:171,73:.:-0.68:1.000:. ./.:4:121,218:.: 0.39:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:216,209:.: 1.35:1.000:. ./.:4:219,114:.: 0.32:1.000:. ./.:4:232,128:.: 0.62:1.000:. ./.:4:316,90:.: 1.14:1.000:. ./.:4:208,107:.: 0.12:1.000:. ./.:4:112,232:.: 0.44:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:253,91:.: 0.44:1.000:. ./.:4:231,90:.: 0.18:1.000:. ./.:4:223,63:.:-0.21:1.000:. ./.:4:227,99:.: 0.24:1.000:. ./.:4:250,105:.: 0.57:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:95,167:.:-0.48:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:186,85:.:-0.38:1.000:. ./.:4:260,75:.: 0.34:1.000:. ./.:4:214,159:.: 0.77:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:216,71:.:-0.20:1.000:. ./.:4:265,110:.: 0.79:1.000:. ./.:4:241,108:.: 0.50:1.000:. ./.:4:214,170:.: 0.89:1.000:. ./.:4:181,86:.:-0.42:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:198,95:.:-0.13:1.000:. ./.:4:248,78:.: 0.24:1.000:. ./.:4:223,206:.: 1.40:1.000:. ./.:4:257,73:.: 0.29:1.000:. ./.:4:189,93:.:-0.26:0.998:. ./.:4:276,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:188,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:214,61:.:-0.33:1.000:. ./.:4:229,208:.: 1.49:1.000:. ./.:4:177,95:.:-0.37:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:183,161:.: 0.44:1.000:. ./.:4:202,106:.: 0.04:0.999:. ./.:4:451,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:204,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:305,92:.: 1.04:1.000:. ./.:4:330,87:.: 1.26:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:231,217:.: 1.61:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:199,77:.:-0.32:1.000:. ./.:4:311,103:.: 1.23:1.000:. ./.:4:128,114:.:-0.71:1.000:. ./.:4:209,94:.:-0.02:1.000:. ./.:4:328,109:.: 1.49:1.000:. ./.:4:181,88:.:-0.40:1.000:. ./.:4:170,161:.: 0.30:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:246,72:.: 0.15:1.000:. ./.:4:188,182:.: 0.74:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:140,55:.:-1.23:0.999:. ./.:4:253,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:218,86:.:-0.01:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:331,95:.: 1.37:1.000:. ./.:4:226,174:.: 1.07:1.000:. ./.:4:181,55:.:-0.77:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:298,103:.: 1.08:1.000:. ./.:4:192,98:.:-0.17:1.000:. ./.:4:230,79:.: 0.05:1.000:. ./.:4:255,93:.: 0.49:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:250,201:.: 1.65:1.000:. ./.:4:163,148:.: 0.07:1.000:. ./.:4:221,71:.:-0.14:1.000:. ./.:4:211,100:.: 0.07:1.000:. ./.:4:179,75:.:-0.57:1.000:. ./.:4:182,164:.: 0.47:1.000:. ./.:4:135,128:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,32:.:-2.41:1.000:. ./.:4:140,36:.:-1.45:1.000:. ./.:4:211,179:.: 0.96:1.000:. ./.:4:293,78:.: 0.75:1.000:. ./.:4:175,79:.:-0.57:1.000:. ./.:4:191,65:.:-0.55:1.000:. ./.:4:161,114:.:-0.33:1.000:. ./.:4:148,74:.:-0.93:1.000:. ./.:4:205,65:.:-0.39:1.000:. ./.:4:123,115:.:-0.75:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:270,80:.: 0.51:1.000:. ./.:4:161,64:.:-0.90:1.000:. ./.:4:211,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:222,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:78,58:.:-1.90:0.999:. ./.:4:136,132:.:-0.41:1.000:. ./.:4:131,125:.:-0.55:1.000:. ./.:4:168,68:.:-0.77:1.000:. ./.:4:201,59:.:-0.50:1.000:. ./.:4:164,83:.:-0.65:1.000:. ./.:4:224,74:.:-0.07:1.000:. ./.:4:292,91:.: 0.88:1.000:. ./.:4:183,50:.:-0.81:1.000:. ./.:4:258,74:.: 0.31:1.000:. ./.:4:286,108:.: 1.01:1.000:. ./.:4:161,133:.:-0.12:1.000:. ./.:4:203,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:167,150:.: 0.14:1.000:. ./.:4:268,106:.: 0.78:1.000:. ./.:4:205,74:.:-0.29:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:180,82:.:-0.48:1.000:. -chr4.1 22337727 chr4.1_022337727 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,29:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:51,63:.: 0.73:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:61,55:.: 0.80:1.000:. ./.:4:77,67:.: 1.77:1.000:. ./.:4:31,48:.:-0.49:1.000:. ./.:4:78,41:.: 0.90:1.000:. ./.:4:59,61:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,12:.:-2.58:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:70,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:83,30:.: 0.69:1.000:. ./.:4:77,28:.: 0.41:1.000:. ./.:4:64,53:.: 0.83:1.000:. ./.:4:76,36:.: 0.66:1.000:. ./.:4:106,37:.: 1.74:1.000:. ./.:4:127,44:.: 2.71:1.000:. ./.:4:96,42:.: 1.56:1.000:. ./.:4:16,9:.:-2.37:1.000:. ./.:4:94,32:.: 1.15:1.000:. ./.:4:91,28:.: 0.90:1.000:. ./.:4:64,34:.: 0.17:1.000:. ./.:4:3,8:.:-2.86:1.000:. ./.:4:90,32:.: 1.01:1.000:. ./.:4:81,27:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,55:.: 0.03:1.000:. ./.:4:103,36:.: 1.60:1.000:. ./.:4:77,32:.: 0.55:1.000:. ./.:4:59,23:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,47:.: 0.17:1.000:. ./.:4:10,6:.:-2.69:1.000:. ./.:4:20,10:.:-2.20:1.000:. ./.:3:1,3:.:-3.11:0.999:. ./.:4:59,62:.: 0.97:1.000:. ./.:4:69,27:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:81,30:.: 0.62:1.000:. ./.:4:75,41:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,48:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,58:.: 0.69:1.000:. ./.:4:77,29:.: 0.45:1.000:. ./.:4:38,35:.:-0.70:1.000:. ./.:4:39,56:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,57:.: 1.11:1.000:. ./.:4:7,10:.:-2.65:1.000:. ./.:4:38,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,21:.:-1.89:1.000:. ./.:4:42,21:.:-1.05:1.000:. ./.:4:66,60:.: 1.15:1.000:. ./.:4:41,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:42,54:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,63:.: 0.66:1.000:. ./.:4:42,37:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,49:.: 0.24:1.000:. ./.:4:70,32:.: 0.31:1.000:. ./.:4:37,59:.: 0.10:1.000:. ./.:6:44,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:57,30:.:-0.21:1.000:. ./.:4:72,28:.: 0.24:1.000:. ./.:4:48,51:.: 0.21:1.000:. ./.:4:49,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,24:.: 0.27:1.000:. ./.:4:95,22:.: 0.83:1.000:. ./.:4:42,19:.:-1.12:1.000:. ./.:4:59,16:.:-0.63:1.000:. ./.:4:50,12:.:-1.08:0.999:. ./.:4:73,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:59,47:.: 0.45:1.000:. ./.:4:26,44:.:-0.81:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,34:.: 1.36:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,42:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:72,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:83,28:.: 0.62:1.000:. ./.:4:32,55:.:-0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.94:0.999:. ./.:4:65,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.25:1.000:. ./.:4:59,25:.:-0.32:1.000:. ./.:4:41,37:.:-0.53:1.000:. ./.:4:72,23:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,39:.:-0.70:1.000:. ./.:4:32,37:.:-0.84:1.000:. ./.:4:62,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:51,35:.:-0.25:1.000:. ./.:4:67,28:.: 0.07:1.000:. ./.:4:73,28:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,23:.:-0.94:1.000:. ./.:4:45,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.60:1.000:. ./.:4:61,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:69,35:.: 0.38:1.000:. ./.:4:71,27:.: 0.17:1.000:. ./.:4:33,26:.:-1.19:1.000:. ./.:4:62,49:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:77,23:.: 0.24:0.998:. ./.:4:45,18:.:-1.05:1.000:. ./.:4:49,22:.:-0.77:1.000:. ./.:4:63,27:.:-0.11:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.11:1.000:. ./.:4:58,76:.: 1.42:1.000:. ./.:4:79,29:.: 0.52:1.000:. ./.:4:69,31:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,36:.: 1.39:1.000:. ./.:4:47,41:.:-0.18:0.999:. ./.:4:71,30:.: 0.27:1.000:. ./.:4:16,10:.:-2.34:1.000:. ./.:4:56,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,20:.:-0.77:1.000:. ./.:4:52,39:.:-0.07:1.000:. ./.:4:43,49:.:-0.04:1.000:. ./.:4:74,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:46,27:.:-0.70:1.000:. ./.:4:51,54:.: 0.41:1.000:. ./.:4:68,47:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.35:1.000:. ./.:4:57,35:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,42:.:-0.07:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,11:.:-1.85:1.000:. ./.:4:21,18:.:-1.89:1.000:. ./.:4:56,51:.: 0.48:1.000:. ./.:4:90,38:.: 1.22:1.000:. ./.:4:44,11:.:-1.33:0.999:. ./.:4:32,37:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,48:.: 0.38:1.000:. ./.:4:58,31:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:21,35:.:-1.29:1.000:. ./.:4:26,45:.:-0.77:1.000:. ./.:4:58,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:75,22:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,27:.: 0.00:1.000:. ./.:4:39,47:.:-0.25:1.000:. ./.:4:26,48:.:-0.67:1.000:. ./.:4:94,70:.: 2.47:1.000:. ./.:4:91,46:.: 1.53:1.000:. ./.:4:72,68:.: 1.63:1.000:. ./.:4:50,20:.:-0.81:1.000:. ./.:4:67,69:.: 1.49:1.000:. ./.:4:43,37:.:-0.46:1.000:. ./.:4:68,64:.: 1.36:1.000:. ./.:4:63,74:.: 1.53:1.000:. ./.:4:15,9:.:-2.41:1.000:. ./.:4:62,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:58,53:.: 0.62:1.000:. ./.:4:83,29:.: 0.66:1.000:. ./.:4:51,74:.: 1.11:1.000:. ./.:4:74,30:.: 0.38:1.000:. ./.:4:92,26:.: 0.87:1.000:. ./.:4:82,34:.: 0.80:1.000:. ./.:4:77,65:.: 1.70:1.000:. ./.:4:52,33:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,41:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,63:.: 0.80:1.000:. ./.:4:32,37:.:-0.84:1.000:. ./.:4:83,31:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,49:.:-0.14:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:48,50:.: 0.17:1.000:. ./.:4:83,20:.: 0.34:1.000:. ./.:4:46,64:.: 0.59:1.000:. ./.:4:66,27:.: 0.00:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:46,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:47,35:.:-0.39:1.000:. ./.:4:119,37:.: 2.19:1.000:. ./.:4:74,27:.: 0.27:1.000:. ./.:4:72,63:.: 1.46:1.000:. ./.:4:53,33:.:-0.25:1.000:. ./.:4:55,59:.: 0.73:1.000:. ./.:4:88,27:.: 0.76:1.000:. ./.:4:63,65:.: 1.22:1.000:. ./.:4:66,24:.:-0.11:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.59:1.000:. -chr4.1 22392833 chr4.1_022392833 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:172,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:246,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:272,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.47:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.03:0.999:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:248,3:.: 1.85:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.30:1.000:. ./.:6:100,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:66,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.13:0.999:. ./.:4:218,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:174,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.93:0.998:. ./.:4:123,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:52,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:171,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:115,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:266,2:.: 2.12:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:241,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:78,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.98:1.000:. -chr4.1 22663352 chr4.1_022663352 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:171,217:0.53: 0.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:134,174:0.54:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/1:4:214,87:0.29:-0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:172,192:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:313,123:0.28: 1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:203,209:0.48: 0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,61:0.29:-1.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:163,198:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:241,94:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,21:0.47:-3.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,46:0.55:-2.97:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,318:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,174:0.54:-0.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:192,225:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,185:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,105:0.28: 0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,340:0.78: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,108:0.29: 0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:226,284:0.53: 1.96:1.000:0.992 0/1/1/1:4:120,337:0.71: 1.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,40:0.75:-3.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,197:0.55: 0.04:1.000:0.981 0/1/1/1:4:94,321:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,170:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,9:0.20:-3.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,215:0.53: 0.51:1.000:0.990 0/0/1/1:4:164,207:0.53: 0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:230,103:0.31:-0.07:1.000:0.980 0/1/1/1:4:124,365:0.72: 1.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:87,287:0.74: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,200:0.49: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,182:0.52:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,46:0.76:-3.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,42:0.50:-2.97:1.000:0.997 0/0/1:3:15,3:0.17:-3.68:0.999:0.960 0/0/1/1:4:171,191:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:84,299:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,300:0.73: 0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,307:0.77: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,242:0.53: 1.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:175,189:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,220:0.56: 0.38:1.000:0.958 0/1/1/1:4:107,298:0.71: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:255,95:0.27: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:293,113:0.28: 0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,294:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:212,220:0.48: 1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:83,36:0.30:-2.52:1.000:0.986 0/0/0/1:4:231,90:0.28:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,186:0.54:-0.14:1.000:0.986 0/1/1/1:4:91,262:0.72: 0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:232,234:0.48: 1.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,184:0.55:-0.25:1.000:0.976 0/0/1/1:4:189,220:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:250,98:0.28: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:150,196:0.54: 0.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:163,169:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,271:0.78:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,76:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:94,230:0.69:-0.17:1.000:0.909 0/1/1/1:4:79,283:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,261:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,91:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,187:0.54:-0.11:1.000:0.987 0/0/1/1:4:167,199:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,410:0.83: 1.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,149:0.53:-0.81:1.000:0.993 0/1/1/1:4:89,287:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,184:0.56:-0.30:0.999:0.965 0/1/1/1:4:78,249:0.74:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,198:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,76:0.30:-1.04:1.000:0.983 0/1/1/1:4:84,274:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,215:0.51: 0.73:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,331:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,95:0.33:-0.70:1.000:0.902 0/0/0/1:4:223,86:0.28:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,280:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,211:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:296,99:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,209:0.77:-0.87:0.999:1.000 0/0/1/1:4:164,184:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:202,224:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,247:0.73:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:256,107:0.29: 0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:206,244:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,133:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:209,96:0.31:-0.39:1.000:0.973 0/0/0/1:4:197,86:0.30:-0.64:1.000:0.985 0/0/1/1:4:148,143:0.47:-0.55:1.000:0.991 0/0/1/1:4:134,119:0.45:-0.98:1.000:0.979 0/1/1/1:4:92,261:0.72: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:196,207:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,200:0.72:-0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:293,98:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,179:0.47: 0.30:1.000:0.991 0/1/1/1:4:57,263:0.80:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,262:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,314:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,227:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,133:0.56:-1.29:1.000:0.964 0/0/1/1:4:190,182:0.47: 0.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:80,235:0.72:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,158:0.54:-0.70:0.998:0.987 0/0/1/1:4:145,182:0.53:-0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:149,173:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,137:0.48:-0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:85,291:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,249:0.56: 1.01:1.000:0.972 0/0/1/1:4:192,215:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,253:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,399:0.77: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,97:0.29:-0.08:0.999:0.992 0/1/1/1:4:76,260:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,121:0.48:-1.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:86,304:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,238:0.78:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,147:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,183:0.55:-0.26:1.000:0.977 0/0/0/1:4:219,78:0.26:-0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:187,191:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:129,144:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,220:0.55: 0.49:1.000:0.981 0/0/1/1:4:187,198:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,189:0.54:-0.09:1.000:0.985 0/1/1/1:4:78,316:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,79:0.25:-0.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,261:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,203:0.73:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,155:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,151:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,176:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,108:0.49:-1.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:243,95:0.28:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,161:0.48:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:232,271:0.51: 1.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,291:0.73: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,168:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:195,73:0.27:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,156:0.51:-0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,300:0.79: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,202:0.55: 0.12:1.000:0.978 0/0/1/1:4:160,172:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,132:0.48:-0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:320,133:0.29: 1.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:114,376:0.74: 1.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,230:0.53: 0.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:72,275:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,119:0.26: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:237,76:0.25:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,245:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,179:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,33:0.66:-3.33:1.000:0.884 0/1/1/1:4:49,149:0.73:-1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:201,217:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:99,297:0.73: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:281,115:0.29: 0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:159,210:0.54: 0.35:1.000:0.986 0/1/1/1:4:60,246:0.78:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,223:0.52: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:149,183:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,226:0.74:-0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,297:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,211:0.53: 0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:264,128:0.32: 0.61:1.000:0.952 0/0/1/1:4:153,208:0.55: 0.25:1.000:0.980 0/0/1/1:4:175,165:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:134,185:0.55:-0.23:0.999:0.976 0/0/1/1:4:145,207:0.56: 0.15:1.000:0.965 0/1/1/1:4:65,239:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,139:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,163:0.78:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,205:0.54: 0.24:1.000:0.986 0/1/1/1:4:75,296:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,277:0.74: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,151:0.53:-0.79:1.000:0.991 0/1/1/1:4:87,374:0.79: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,345:0.74: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,194:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:241,109:0.31: 0.13:1.000:0.978 0/0/1/1:4:192,208:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,348:0.73: 1.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:264,123:0.31: 0.55:1.000:0.969 0/0/1/1:4:133,164:0.53:-0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:78,298:0.77: 0.43:1.000:1.000 -chr4.1 22840291 chr4.1_022840291 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:178,179:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,175:0.53:-0.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:226,94:0.31:-0.14:1.000:0.973 0/1/1/1:4:90,282:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,193:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:100,381:0.78: 1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,295:0.79: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,164:0.46: 0.17:1.000:0.990 0/0/0/1:4:271,100:0.29: 0.48:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,68:0.80:-2.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,62:0.57:-2.72:1.000:0.951 0/1/1/1:4:83,252:0.74: 0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:220,73:0.27:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:308,94:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,199:0.55: 0.25:1.000:0.981 0/0/0/1:4:255,105:0.31: 0.34:1.000:0.976 0/0/1/1:4:197,210:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:283,100:0.28: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:343,96:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,360:0.76: 1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,58:0.59:-2.84:1.000:0.879 0/1/1/1:4:85,268:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,335:0.75: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,177:0.51: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:61,14:0.21:-3.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,359:0.74: 1.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,299:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:75,276:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,314:0.73: 1.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:86,305:0.76: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,367:0.79: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,253:0.71: 0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,52:0.60:-2.98:1.000:0.771 0/0/1/1:4:41,59:0.57:-2.79:1.000:0.938 0/0/1:3:19,19:0.49:-3.53:0.999:0.721 0/1/1/1:4:98,310:0.74: 0.92:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,381:1.00: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,401:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,272:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,300:0.73: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,176:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,176:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,310:0.77: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,82:0.32:-0.73:1.000:0.959 0/0/1/1:4:187,208:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,233:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:220,197:0.46: 1.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:122,65:0.36:-1.74:1.000:0.732 0/0/1/1:4:134,166:0.54:-0.38:1.000:0.989 0/0/1/1:4:143,163:0.52:-0.31:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,253:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,212:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,136:0.48:-0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,267:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,174:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,202:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,231:0.72:-0.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,374:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,165:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1/1/1:6:82,160:0.64:-1.08:1.000:0.885 0/1/1/1:4:72,224:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,236:0.71:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:176,215:0.53: 0.72:1.000:0.991 0/1/1/1:4:84,197:0.68:-0.61:1.000:0.963 0/0/1/1:4:207,181:0.46: 0.68:1.000:0.986 0/1/1/1:4:76,330:0.80: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,146:0.52:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,163:0.49:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,274:0.76: 0.26:0.999:1.000 0/1/1/1:4:68,216:0.74:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,209:0.53: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:230,82:0.28:-0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:127,329:0.70: 1.50:1.000:0.989 0/1/1/1:4:85,302:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,174:0.51: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,181:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,171:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,171:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,170:0.49: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:81,302:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,66:0.30:-1.21:0.999:0.982 0/1/1/1:4:84,291:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,207:0.53: 0.54:1.000:0.991 0/1/1/1:4:76,236:0.74:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:182,207:0.52: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,212:0.55: 0.50:1.000:0.978 0/0/0/1:4:191,76:0.30:-0.78:1.000:0.983 0/0/1/1:4:140,134:0.48:-0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:206,87:0.31:-0.46:1.000:0.969 0/1/1/1:4:68,280:0.79: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,186:0.54: 0.01:1.000:0.985 0/1/1/1:4:53,215:0.79:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,292:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,191:0.80:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,221:0.56: 0.63:1.000:0.969 0/1/1/1:4:77,259:0.75: 0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,280:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,171:0.69:-1.09:1.000:0.977 0/1/1/1:4:88,242:0.72:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:193,179:0.47: 0.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:159,170:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,197:0.55: 0.17:1.000:0.977 0/0/1/1:4:108,117:0.50:-1.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,236:0.75:-0.30:0.998:0.999 0/0/1/1:4:108,143:0.55:-0.97:1.000:0.977 0/0/1/1:4:161,135:0.45:-0.43:1.000:0.978 0/0/1/1:4:124,134:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,236:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:122,336:0.72: 1.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:158,206:0.55: 0.39:1.000:0.981 0/0/1/1:4:147,146:0.48:-0.46:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,506:1.00: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,73:0.28:-0.62:0.999:0.995 0/0/1/1:4:173,167:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,197:0.76:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,194:0.52: 0.39:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,316:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,74:0.28:-0.57:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,333:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,150:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:185,150:0.44: 0.04:1.000:0.969 0/1/1/1:4:62,183:0.73:-1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:80,264:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,178:0.52:-0.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,234:0.80:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,257:0.78:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,239:0.81:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,291:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,186:0.73:-1.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,170:0.74:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,152:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,153:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,170:0.79:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,144:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,205:0.73:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:217,256:0.52: 1.70:1.000:0.994 0/1/1/1:4:84,234:0.72:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,174:0.78:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,133:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,117:0.45:-0.90:1.000:0.977 0/1/1/1:4:71,261:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,136:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,262:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,103:0.52:-1.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:353,131:0.29: 1.84:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,495:1.00: 1.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,288:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,161:0.47: 0.08:1.000:0.990 0/1/1/1:4:117,266:0.68: 0.62:1.000:0.947 0/0/1/1:4:162,171:0.50: 0.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,449:1.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,176:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,49:0.74:-3.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:81,210:0.70:-0.49:1.000:0.989 0/1/1/1:4:81,287:0.76: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,418:1.00: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,314:0.75: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,226:0.51: 1.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,256:0.76:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,352:0.76: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,171:0.51:-0.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,289:0.99:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,181:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:195,181:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:183,195:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,194:0.52: 0.34:1.000:0.994 0/1/1/1:4:78,255:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,196:0.52: 0.43:0.999:0.995 0/1/1/1:4:89,278:0.74: 0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,377:1.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,176:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,209:0.78:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,182:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,242:0.76:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,143:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,150:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:106,322:0.74: 1.16:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,478:1.00: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,200:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,145:0.47:-0.34:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,420:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,247:0.53: 1.44:1.000:0.992 0/1/1/1:4:107,378:0.76: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,75:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,184:0.49: 0.39:1.000:0.996 -chr4.1 23008505 chr4.1_023008505 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-1.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.74: 0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,11:0.91: 1.24:1.000:0.967 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.54:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.54:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,1:0.38:-0.84:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.60: 0.95:1.000:0.781 0/1/1/1:4:3,6:0.69: 0.35:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,10:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.85:-0.25:1.000:0.986 0/0/1/1:4:2,2:0.57:-1.14:1.000:0.948 0/1/1/1:4:2,7:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,8:0.88: 0.35:1.000:0.653 0/1/1/1:4:1,3:0.74:-1.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,2:0.69:-1.44:1.000:0.966 0/1/1/1:4:1,3:0.74:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,6:0.64: 0.65:1.000:0.677 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.79: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.03:1.000:1.000 1/1/1:3:0,1:1.00:-2.03:0.999:1.000 0/1/1/1:4:4,6:0.64: 0.65:1.000:0.677 0/1/1/1:4:2,4:0.69:-0.54:1.000:0.966 0/1/1/1:4:2,5:0.72:-0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,11:0.84: 1.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,8:0.79: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.05:1.000:0.845 0/1/1/1:4:2,9:0.81: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,12:0.92: 1.54:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,10:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.81: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.76: 1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.54: 0.95:1.000:0.989 0/1/1/1:4:1,8:0.88: 0.35:1.000:0.653 0/0/0/1:4:7,1:0.33: 0.05:1.000:0.928 0/1/1/1:4:3,9:0.74: 1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,12:0.79: 2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.53: 3.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,8:0.79: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.05:1.000:0.845 0/1/1/1:4:6,9:0.64: 2.14:1.000:0.677 0/1/1/1:4:2,11:0.84: 1.54:1.000:0.995 1/1/1/1/1/1:6:0,9:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.43:-0.25:1.000:0.943 0/1/1/1:4:1,2:0.69:-1.44:1.000:0.966 0/1/1/1:4:5,7:0.63: 1.24:1.000:0.529 1/1/1/1:4:1,9:0.90: 0.65:1.000:0.700 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.54: 1.54:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,3:0.64:-0.84:1.000:0.677 0/1/1/1:4:3,8:0.73: 0.95:0.999:0.997 0/0/0/1:4:6,0:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,6:0.69: 0.35:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.57: 1.84:1.000:0.948 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.05:1.000:0.845 0/0/1/1:4:8,7:0.55: 2.14:1.000:0.983 0/1/1/1:4:3,11:0.78: 1.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,7:0.66: 0.95:1.000:0.894 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.87: 0.05:1.000:0.910 0/1/1/1:4:3,10:0.76: 1.54:0.999:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.05:1.000:0.845 1/1/1/1:4:1,11:0.91: 1.24:1.000:0.967 0/1/1/1:4:2,4:0.69:-0.54:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,9:0.70: 1.54:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,8:0.88: 0.35:1.000:0.653 1/1/1/1:4:1,9:0.90: 0.65:1.000:0.700 0/1/1/1:4:3,9:0.74: 1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,9:0.74: 1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.54:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,8:0.69: 1.24:1.000:0.966 0/0/1/1:4:3,4:0.62:-0.25:1.000:0.580 0/0/0/1:4:7,1:0.33: 0.05:1.000:0.928 0/1/1/1:4:2,7:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.54:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,9:0.81: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.50:-0.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.84:0.998:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.79: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.57:-0.54:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,3:0.64:-0.84:1.000:0.677 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.05:1.000:0.845 0/0/1/1:4:5,2:0.43:-0.25:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.54:0.999:1.000 0/1/1/1:4:1,8:0.88: 0.35:1.000:0.653 0/1/1/1:4:4,6:0.64: 0.65:1.000:0.677 0/1/1/1:4:2,5:0.72:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:1,1:0.57:-1.74:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.69:-0.54:1.000:0.966 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.54:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,0:0.25:-1.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,6:0.85:-0.25:1.000:0.986 0/1/1/1:4:2,4:0.69:-0.54:1.000:0.966 0/1/1/1:4:1,6:0.85:-0.25:1.000:0.986 0/1/1/1:4:1,2:0.69:-1.44:1.000:0.966 0/0/0/1:4:6,0:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.74:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,8:0.79: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.52:-0.25:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.69: 0.35:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.85:-0.25:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.48: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.05:1.000:0.845 0/1/1/1:4:2,4:0.69:-0.54:1.000:0.966 0/1/1/1:4:3,7:0.71: 0.65:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,12:0.92: 1.54:1.000:0.989 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,4:0.48: 0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,7:0.57: 1.84:1.000:0.948 0/0/1/1:4:3,4:0.62:-0.25:1.000:0.580 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.53: 0.35:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.57: 0.65:1.000:0.948 0/1/1/1:4:2,4:0.69:-0.54:1.000:0.966 0/1/1/1:4:2,4:0.69:-0.54:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.77: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,3:0.64:-0.84:0.999:0.677 0/1/1/1:4:1,3:0.74:-1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,3:0.48: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,8:0.88: 0.35:1.000:0.653 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.85:-0.25:1.000:0.986 0/0/0/1:4:5,1:0.35:-0.54:1.000:0.752 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.72:-0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,6:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.57: 0.05:1.000:0.948 0/1/1/1:4:3,8:0.73: 0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,10:0.83: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,3:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.05:1.000:0.845 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.74: 0.05:1.000:0.999 -chr4.1 23097699 chr4.1_023097699 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:44,47:0.49: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,18:0.34:-0.94:1.000:0.861 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,36:0.53:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:44,51:0.51: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,19:0.19: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,10:0.63:-2.54:1.000:0.503 0/0/0/1:4:43,24:0.33:-0.09:1.000:0.910 0/0/0/1:4:38,14:0.25:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,7:0.19:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-2.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.53:-1.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:32,10:0.22:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,16:0.21: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,23:0.26: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,27:0.29: 0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:44,17:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,19:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,35:0.40: 0.57:1.000:0.824 0/1/1/1:4:10,21:0.63:-1.79:1.000:0.627 0/0/0/1:4:51,13:0.19:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,41:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,27:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,23:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,33:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,47:0.56: 0.47:1.000:0.969 0/0/0/1:4:64,21:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,47:0.69:-0.23:1.000:0.969 0/0/1/1:4:36,46:0.53: 0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,35:0.56:-0.47:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,6:0.93:-2.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,37:0.75:-1.08:1.000:0.999 0/0/0:3:28,0:0.00:-1.93:0.999:1.000 0/0/0/1:4:56,17:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,33:0.55:-0.61:1.000:0.976 0/0/1/1:4:47,33:0.39: 0.52:1.000:0.634 0/0/1/1:4:56,51:0.45: 1.79:1.000:0.977 0/0/0/1:4:50,32:0.36: 0.61:1.000:0.647 0/0/1/1:4:28,35:0.52:-0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:32,37:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,37:0.36: 1.27:1.000:0.702 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,25:0.38:-0.38:1.000:0.602 0/0/1/1:4:41,43:0.48: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,33:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,18:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,21:0.40:-0.94:1.000:0.797 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,78:0.81: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,38:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,26:0.32: 0.33:1.000:0.961 0/0/1/1:4:28,35:0.52:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,72:0.72: 1.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,40:0.53: 0.10:1.000:0.992 0/0/0/0/0/1:6:39,12:0.22:-0.85:1.000:0.847 0/0/0/1:4:40,22:0.33:-0.33:1.000:0.924 0/0/1/1:4:23,42:0.61:-0.19:1.000:0.733 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,16:0.16: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,17:0.23:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,54:0.42: 2.40:1.000:0.920 0/0/0/1:4:28,11:0.26:-1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,18:0.27:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,40:0.61:-0.33:0.999:0.742 0/0/0/1:4:47,12:0.19:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,27:0.26: 1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,23:0.39:-0.66:1.000:0.698 0/0/0/1:4:76,31:0.27: 1.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,50:0.55: 0.75:1.000:0.977 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,19:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,20:0.27:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,47:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,29:0.32: 0.75:1.000:0.963 0/0/0/1:4:22,7:0.22:-1.88:0.999:1.000 0/1/1/1:4:41,110:0.68: 3.86:1.000:0.958 0/0/0/1:4:55,31:0.33: 0.80:1.000:0.900 0/1/1/1:4:19,73:0.74: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,29:0.26: 1.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,45:0.43: 1.37:1.000:0.948 0/0/0/1:4:25,7:0.20:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,20:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,17:0.26:-0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,23:0.49:-1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,48:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,51:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,16:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,13:0.18:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,76:0.73: 1.32:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,64:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,47:0.56: 0.47:1.000:0.969 0/0/1/1:4:43,40:0.45: 0.66:1.000:0.982 0/0/0/1:4:53,27:0.31: 0.52:1.000:0.970 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,19:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.26:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,22:0.31:-0.19:0.998:0.968 0/0/1/1:4:35,34:0.46: 0.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,45:0.46: 1.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:40,38:0.46: 0.43:1.000:0.986 0/1/1/1:4:18,43:0.66:-0.38:1.000:0.871 0/0/1/1:4:54,52:0.46: 1.74:1.000:0.988 0/0/1/1:4:38,45:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,46:0.52: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,84:0.71: 1.93:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,27:0.32: 0.47:0.999:0.962 0/0/1/1:4:29,46:0.58: 0.28:1.000:0.929 0/0/0/1:4:21,12:0.34:-1.70:1.000:0.883 0/0/0/1:4:60,25:0.27: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,37:0.54:-0.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:56,28:0.31: 0.71:1.000:0.976 0/0/1/1:4:27,48:0.60: 0.28:1.000:0.787 0/0/0/1:4:71,25:0.24: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,30:0.25: 1.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,69:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,22:0.25: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,19:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,63:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:44,23:0.32:-0.09:1.000:0.959 0/0/1/1:4:29,28:0.46:-0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:25,24:0.46:-0.94:1.000:0.988 0/0/1/1:4:37,37:0.47: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,40:0.58:-0.19:1.000:0.922 0/0/0/1:4:58,17:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.15:-1.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:35,7:0.15:-1.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:67,20:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,17:0.31:-0.85:1.000:0.976 0/0/1/1:4:38,43:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,58:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,23:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,22:0.30:-0.05:1.000:0.986 0/0/0/1:4:52,22:0.27: 0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,73:0.72: 1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,34:0.44: 0.14:1.000:0.972 0/0/0/1:4:34,16:0.30:-0.89:1.000:0.989 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,75:0.76: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,25:0.34: 0.00:1.000:0.890 0/0/0/1:4:48,26:0.33: 0.24:1.000:0.937 0/0/1/1:4:38,55:0.56: 1.13:1.000:0.973 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,52:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,14:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,10:0.32:-1.88:1.000:0.955 0/0/1/1:4:13,12:0.45:-2.07:1.000:0.980 0/0/0/1:4:46,26:0.34: 0.14:1.000:0.897 0/0/1/1:4:27,38:0.55:-0.19:1.000:0.980 0/0/1/1:4:36,38:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,19:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,28:0.46:-0.56:1.000:0.988 0/0/0/1:4:40,18:0.29:-0.52:1.000:0.994 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,61:0.69: 0.66:1.000:0.970 0/0/1/1:4:22,40:0.61:-0.33:1.000:0.742 0/0/1/1:4:29,37:0.53:-0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:35,16:0.29:-0.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:65,18:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,20:0.31:-0.47:1.000:0.967 0/0/0/1:4:49,17:0.24:-0.14:0.999:1.000 0/0/1/1:4:26,27:0.48:-0.75:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,44:0.66:-0.33:1.000:0.896 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,33:0.66:-1.04:1.000:0.854 0/0/0/1:4:28,16:0.34:-1.18:1.000:0.883 0/0/1/1:4:26,44:0.59: 0.05:1.000:0.864 0/0/0/1:4:50,16:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,18:0.46:-1.51:1.000:0.986 0/1/1/1:4:16,73:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,60:0.61: 1.08:1.000:0.672 0/0/0/1:4:46,12:0.19:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,21:0.34:-0.56:1.000:0.854 0/0/1/1:4:23,27:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,19:0.21: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,42:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,15:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,24:0.35:-0.23:1.000:0.804 -chr4.1 23206961 chr4.1_023206961 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:48,8:0.13:-0.22:1.000:0.920 0/0/0/1:4:16,10:0.35:-1.06:1.000:0.756 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,8:0.22:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,15:0.17: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,6:0.46:-1.45:1.000:0.988 0/0/0/0:4:15,1:0.06:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,5:0.12:-0.70:1.000:0.709 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,25:0.23: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,50:0.26: 3.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,20:0.75:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,3:0.11:-1.09:1.000:0.510 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,18:0.32:-0.36:1.000:0.941 0/0/0/1:4:74,48:0.36: 1.64:1.000:0.666 0/0/0/1:4:39,10:0.19:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,13:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,4:0.14:-1.06:1.000:0.971 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,1:0.04:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,4:0.10:-0.81:1.000:0.674 0/0/0/1:4:24,6:0.18:-0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,16:0.31:-0.44:1.000:0.978 0/0/0/0:4:24,3:0.10:-1.03:1.000:0.753 0/0/0/1:4:19,8:0.27:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:10,2:0.15:-1.45:1.000:0.991 0/0/0/1:4:49,15:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,1:0.01: 0.57:1.000:1.000 0/0/0:3:76,11:0.12: 0.65:0.999:0.984 0/0/1/1:4:8,6:0.39:-1.40:1.000:0.738 0/0/1/1:4:17,19:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,21:0.53:-0.81:1.000:0.990 0/0/0/1:4:37,20:0.32:-0.19:1.000:0.947 0/0/0/0:4:37,5:0.11:-0.61:1.000:0.538 0/0/1/1:4:40,28:0.38: 0.12:1.000:0.554 0/0/0/1:4:59,17:0.21: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,26:0.39:-0.08:1.000:0.716 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,27:0.21: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,16:0.28:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,6:0.12:-0.50:1.000:0.757 0/0/0/0:4:265,0:0.00: 5.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,22:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,73:0.35: 3.61:1.000:0.795 0/0/1/1:4:53,60:0.49: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,16:0.33:-0.55:1.000:0.901 0/0/0/1:4:41,28:0.37: 0.15:1.000:0.519 0/0/1/1:4:54,59:0.48: 1.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:31,10:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,33:0.32: 0.88:1.000:0.955 0/0/0/1:4:33,20:0.35:-0.30:1.000:0.818 0/0/1/1:4:63,73:0.49: 2.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,31:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:46,56:0.50: 1.08:1.000:0.888 0/0/1/1:4:38,66:0.56: 1.13:1.000:0.973 0/0/0/1:4:34,9:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,36:0.32: 1.13:1.000:0.958 0/0/0/1:4:65,34:0.32: 0.99:1.000:0.963 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,34:0.45: 0.18:1.000:0.977 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,16:0.29:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/1:4:66,22:0.23: 0.68:0.999:1.000 0/1/1/1:4:10,32:0.63:-0.61:1.000:0.611 0/0/1/1:4:58,52:0.44: 1.30:1.000:0.958 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,79:0.62: 1.19:1.000:0.523 0/0/0/1:4:31,5:0.13:-0.78:1.000:0.884 0/1/1/1:4:13,46:0.64:-0.13:1.000:0.739 0/0/0/1:4:33,16:0.30:-0.41:1.000:0.985 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,36:0.32: 1.13:1.000:0.958 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,35:0.35: 0.82:1.000:0.825 0/0/1/1:4:32,23:0.38:-0.25:0.999:0.630 0/0/0/1:4:71,34:0.30: 1.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:78,26:0.23: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.20:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,22:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,13:0.19: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,21:0.29: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,27:0.38: 0.04:1.000:0.598 0/0/0/1:4:64,25:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,12:0.39:-1.00:1.000:0.738 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,19:0.19: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,60:0.54: 0.96:1.000:0.986 0/1/1/1:4:18,66:0.65: 0.57:1.000:0.776 0/0/0/1:4:69,38:0.33: 1.22:1.000:0.934 0/0/0/1:4:62,16:0.19: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,22:0.32:-0.02:1.000:0.951 0/0/0/1:4:64,25:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,20:0.20: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,42:0.29: 1.98:0.998:0.993 0/0/0/1:4:77,25:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,6:0.15:-0.78:1.000:0.991 0/0/1/1:4:48,35:0.39: 0.54:1.000:0.669 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,35:0.32: 1.02:1.000:0.949 0/0/0/1:4:27,10:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 1.47:0.999:1.000 0/0/0/1:4:72,26:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,40:0.35: 1.13:1.000:0.756 0/0/0/1:4:74,33:0.28: 1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,57:0.56: 0.71:1.000:0.968 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,39:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,26:0.28: 0.60:1.000:0.995 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,36:0.28: 1.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,60:0.56: 0.82:1.000:0.963 0/0/0/1:4:24,6:0.18:-0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,24:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,27:0.30: 0.54:1.000:0.986 0/0/0/1:4:67,24:0.24: 0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,19:0.30:-0.13:1.000:0.988 0/0/0/1:4:49,29:0.34: 0.40:1.000:0.856 0/0/1/1:4:58,44:0.40: 1.08:1.000:0.764 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,11:0.22:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,19:0.20: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,31:0.59:-0.53:1.000:0.869 0/0/0/1:4:48,17:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,21:0.38:-0.36:1.000:0.554 0/0/0/1:4:56,28:0.31: 0.57:1.000:0.978 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,32:0.30: 0.94:1.000:0.982 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.43:-0.89:1.000:0.950 0/0/0/1:4:45,26:0.34: 0.20:1.000:0.888 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,23:0.31: 0.15:1.000:0.978 0/0/0/1:4:20,10:0.31:-0.95:1.000:0.978 0/0/0/1:4:42,10:0.18:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,21:0.34:-0.22:1.000:0.835 0/0/0/1:4:28,15:0.32:-0.58:1.000:0.952 0/0/0/1:4:17,9:0.32:-1.06:1.000:0.958 0/0/0/0:4:26,3:0.09:-0.98:1.000:0.892 0/0/0/1:4:66,24:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,6:0.17:-0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,6:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,23:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,11:0.19:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,11:0.17:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,14:0.36:-0.78:1.000:0.714 0/0/0/0:4:26,2:0.07:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,6:0.32:-1.31:1.000:0.941 0/0/0/1:4:26,14:0.32:-0.67:1.000:0.949 0/0/0/1:4:32,11:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,12:0.23:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.46:-0.84:1.000:0.988 0/0/0/1:4:24,14:0.34:-0.72:0.999:0.876 0/0/0/1:4:20,8:0.26:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,13:0.35:-0.84:1.000:0.777 0/0/0/1:4:19,5:0.19:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,7:0.36:-1.29:1.000:0.714 0/0/0/1:4:54,11:0.16: 0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,13:0.30:-0.67:1.000:0.986 0/0/0/1:4:34,13:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,7:0.20:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,3:0.11:-1.09:1.000:0.510 0/0/0/1:4:25,14:0.33:-0.70:1.000:0.920 0/0/0/1:4:17,5:0.21:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.17:-1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,26:0.57:-0.67:1.000:0.957 0/0/0/1:4:33,5:0.12:-0.72:1.000:0.779 0/0/0/1:4:42,12:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,26:0.48:-0.39:1.000:0.995 -chr4.1 23397042 chr4.1_023397042 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:10,1:0.25: 1.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.30:-0.20:1.000:0.983 0/0/1/1:4:6,9:0.56: 2.15:1.000:0.971 0/0/1/1:4:2,4:0.59:-0.20:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.34: 0.58:1.000:0.885 0/0/1/1:4:4,2:0.41:-0.20:1.000:0.847 0/0/0/1:4:4,0:0.18:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-0.98:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,2:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,2:0.35: 0.32:1.000:0.745 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-0.98:1.000:0.847 0/0/0/1:4:11,1:0.25: 1.37:0.999:0.999 0/0/0/1:4:4,0:0.18:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,3:0.32: 2.15:1.000:0.944 0/0/1/1:4:8,10:0.54: 2.93:1.000:0.990 0/0/0/1:4:5,1:0.30:-0.20:1.000:0.983 0/1/1/1:4:1,4:0.65:-0.46:1.000:0.824 0/1/1/1:4:2,6:0.63: 0.32:1.000:0.558 0/0/1/1:4:5,4:0.48: 0.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:1,0:0.18:-1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,7:0.55: 1.37:1.000:0.980 0/0/0/1:4:4,1:0.32:-0.46:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.56: 1.63:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.51:-1.24:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.30:-0.20:1.000:0.983 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.72:1.000:0.558 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.67:-0.20:1.000:0.920 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 0.06:1.000:0.664 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-0.98:1.000:0.847 0/0/1/1:4:4,3:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:3,3:0.51:-0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:2,2:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 0.06:1.000:0.664 0/0/1/1:4:6,8:0.54: 1.89:1.000:0.985 0/1/1/1:4:1,5:0.67:-0.20:1.000:0.920 0/0/0/1:4:1,0:0.18:-1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,6:0.56: 0.84:1.000:0.971 0/0/1/1:4:3,4:0.54: 0.06:1.000:0.985 0/1/1/1:4:2,11:0.68: 1.63:1.000:0.942 0/0/1/1:4:9,7:0.47: 2.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:2,6:0.63: 0.32:1.000:0.558 0/0/1/1:4:7,7:0.51: 1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,2:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,4:0.45: 0.84:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.57: 0.32:1.000:0.948 0/0/1/1:4:3,3:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:3,4:0.54: 0.06:1.000:0.779 0/1/1/1:4:2,6:0.63: 0.32:1.000:0.558 0/0/1/1:4:3,7:0.61: 0.84:1.000:0.739 0/0/0/1:4:6,2:0.35: 0.32:1.000:0.745 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.45:-0.46:1.000:0.979 0/1/1/1:4:2,9:0.66: 1.10:1.000:0.884 0/0/0/1:4:1,0:0.18:-1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,2:0.41:-0.20:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.32:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.18:-1.50:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.57: 0.32:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.72:1.000:0.558 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,8:0.59: 1.37:1.000:0.867 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-0.98:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:0.999:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.41:-0.20:1.000:0.847 0/0/1/1:4:14,7:0.41: 3.71:1.000:0.847 0/0/0/1:4:6,1:0.29: 0.06:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-0.98:1.000:0.847 0/0/0/1:4:5,0:0.18:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,5:0.57: 0.32:1.000:0.948 0/0/0/1:4:4,0:0.18:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,2:0.59:-0.98:1.000:0.867 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.72:1.000:0.745 0/1/1/1:4:1,5:0.67:-0.20:1.000:0.920 0/0/1/1:4:8,4:0.41: 1.37:1.000:0.847 0/0/1/1:4:3,3:0.51:-0.20:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.67:-0.20:1.000:0.920 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.45:-0.46:1.000:0.979 0/0/0/1:4:9,3:0.35: 1.37:1.000:0.745 0/0/1/1:4:5,6:0.53: 1.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:2,4:0.59:-0.20:1.000:0.867 0/0/0/1:4:3,0:0.18:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,5:0.54: 0.58:0.998:0.990 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-0.98:1.000:0.847 0/0/0/1:4:4,0:0.18:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,0:0.18:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,5:0.48: 1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,5:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:3,2:0.45:-0.46:1.000:0.979 0/0/1/1:4:4,3:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:3,5:0.57: 0.32:1.000:0.948 0/0/1/1:4:1,1:0.51:-1.24:0.999:0.996 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 0.06:1.000:0.664 0/1/1/1:4:2,11:0.68: 1.63:1.000:0.942 0/0/0/1:4:8,2:0.32: 0.84:1.000:0.944 0/0/1/1:4:2,2:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,1:0.25: 1.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,2:0.41:-0.20:1.000:0.847 0/0/1/1:4:3,3:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,4:0.48: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,6:0.49: 1.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,9:0.63: 1.37:1.000:0.558 0/0/0/1:4:4,0:0.18:-0.72:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.54: 0.06:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.57: 0.32:1.000:0.948 0/0/1/1:4:3,5:0.57: 0.32:1.000:0.948 0/0/0/1:4:2,0:0.18:-1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,6:0.56: 0.84:1.000:0.971 0/0/1/1:4:7,3:0.39: 0.84:1.000:0.648 0/0/1/1:4:7,3:0.39: 0.84:1.000:0.648 0/0/1/1:4:4,5:0.54: 0.58:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,0:0.18:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,2:0.41:-0.20:1.000:0.847 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-0.98:1.000:0.847 0/0/0/1:4:6,2:0.35: 0.32:1.000:0.745 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,13:0.64: 2.67:1.000:0.649 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.45: 0.84:1.000:0.979 0/0/1/1:4:6,6:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:4,1:0.32:-0.46:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.53: 1.10:1.000:0.992 0/0/0/1:4:3,0:0.18:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,7:0.55: 1.37:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 0.06:1.000:0.664 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,5:0.54: 0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:1,2:0.59:-0.98:1.000:0.867 0/0/1/1:4:2,5:0.61: 0.06:1.000:0.664 0/0/1/1:4:5,4:0.48: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,5:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:3,2:0.45:-0.46:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,4:0.65:-0.46:1.000:0.824 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.24:0.999:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.72:1.000:0.558 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.61: 0.84:1.000:0.739 0/0/1/1:4:1,2:0.59:-0.98:1.000:0.867 0/0/1/1:4:2,2:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,4:0.39: 1.63:1.000:0.704 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.72:1.000:0.745 0/0/1/1:4:1,1:0.51:-1.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,6:0.68: 0.06:1.000:0.957 0/0/1/1:4:8,5:0.44: 1.63:1.000:0.966 0/0/0/1:4:6,1:0.29: 0.06:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.28: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,0:0.18:-1.24:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.58:1.000:1.000 -chr4.1 23747817 chr4.1_023747817 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:26,8:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:130,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:71,26:.: 1.96:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:10,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:37,15:.: 0.44:1.000:. ./.:4:31,8:.: 0.00:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:27,13:.: 0.04:0.999:. ./.:4:58,9:.: 0.95:1.000:. ./.:4:48,11:.: 0.68:1.000:. ./.:4:17,11:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.54:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,7:.:-0.74:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:10,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:25,15:.: 0.04:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,4:.:-0.20:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.11:0.999:. ./.:4:38,10:.: 0.31:1.000:. ./.:4:23,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,7:.:-0.67:1.000:. ./.:4:17,15:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:34,22:.: 0.58:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:60,12:.: 1.12:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:14,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:20,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:86,34:.: 2.74:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:29,5:.:-0.16:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:11,12:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:6:12,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.33:1.000:. ./.:4:13,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.50:1.000:. ./.:4:116,63:.: 4.73:1.000:. ./.:4:14,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.47:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.57:0.999:. ./.:4:20,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:21,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,8:.: 0.85:1.000:. ./.:4:23,12:.:-0.13:1.000:. ./.:4:31,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:14,8:.:-0.57:1.000:. ./.:4:89,29:.: 2.67:1.000:. ./.:4:48,9:.: 0.61:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:71,14:.: 1.56:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.30:1.000:. ./.:4:30,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,15:.: 1.86:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:41,13:.: 0.51:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.67:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:44,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,24:.: 1.93:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,32:.: 1.15:1.000:. ./.:4:23,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,12:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.50:1.000:. ./.:4:11,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:13,9:.:-0.57:0.998:. ./.:4:10,3:.:-0.87:1.000:. ./.:4:122,23:.: 3.58:1.000:. ./.:4:45,13:.: 0.65:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:50,14:.: 0.85:1.000:. ./.:4:105,19:.: 2.87:1.000:. ./.:4:34,10:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,18:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.40:0.999:. ./.:4:25,6:.:-0.27:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:17,19:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:44,11:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:86,23:.: 2.37:1.000:. ./.:4:46,4:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:64,12:.: 1.25:1.000:. ./.:4:17,11:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.08:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:36,4:.: 0.04:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:11,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:66,22:.: 1.66:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.33:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:36,13:.: 0.34:1.000:. ./.:4:38,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.91:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:30,15:.: 0.21:1.000:. ./.:4:41,13:.: 0.51:1.000:. ./.:4:10,15:.:-0.47:1.000:. ./.:4:166,34:.: 5.44:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.43:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:50,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:13,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.11:1.000:. ./.:4:29,17:.: 0.24:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:17,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:9,11:.:-0.64:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.27:1.000:. ./.:4:40,30:.: 1.05:1.000:. ./.:4:17,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:53,14:.: 0.95:1.000:. ./.:4:38,15:.: 0.48:1.000:. ./.:4:60,25:.: 1.56:0.999:. ./.:4:12,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:8,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.16:1.000:. ./.:4:11,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:13,13:.:-0.43:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:39,6:.: 0.21:1.000:. ./.:4:28,19:.: 0.28:1.000:. ./.:4:37,12:.: 0.34:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:17,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:25,18:.: 0.14:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:38,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.50:1.000:. -chr4.1 23988610 chr4.1_023988610 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:110,19:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:88,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:60,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:126,36:.: 2.09:1.000:. ./.:4:56,26:.:-1.34:1.000:. ./.:4:90,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:41,27:.:-1.94:1.000:. ./.:4:43,18:.:-2.24:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:83,19:.:-0.48:1.000:. ./.:4:80,20:.:-0.57:1.000:. ./.:4:71,58:.: 0.68:1.000:. ./.:4:107,31:.: 1.06:1.000:. ./.:4:110,22:.: 0.80:0.999:. ./.:4:95,43:.: 1.06:1.000:. ./.:4:98,21:.: 0.25:1.000:. ./.:4:88,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,11:.:-1.60:1.000:. ./.:4:72,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:83,17:.:-0.57:1.000:. ./.:4:34,12:.:-2.88:1.000:. ./.:4:83,57:.: 1.15:1.000:. ./.:4:113,20:.: 0.85:1.000:. ./.:4:87,32:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,54:.: 0.38:1.000:. ./.:4:93,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,53:.:-0.31:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:83,13:.:-0.74:1.000:. ./.:3:39,11:.:-2.71:0.999:. ./.:4:102,35:.: 1.02:1.000:. ./.:4:63,62:.: 0.50:1.000:. ./.:4:70,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:118,22:.: 1.15:1.000:. ./.:4:52,45:.:-0.70:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:69,62:.: 0.76:1.000:. ./.:4:83,33:.: 0.12:1.000:. ./.:4:123,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:50,45:.:-0.78:1.000:. ./.:4:107,27:.: 0.89:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:52,44:.:-0.74:1.000:. ./.:4:76,22:.:-0.65:1.000:. ./.:4:103,45:.: 1.49:1.000:. ./.:4:85,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:82,32:.: 0.03:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:79,38:.: 0.16:1.000:. ./.:4:90,27:.: 0.16:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.80:1.000:. ./.:6:66,24:.:-1.00:1.000:. ./.:4:97,25:.: 0.38:1.000:. ./.:4:81,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.98:1.000:. ./.:4:95,29:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,54:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,61:.: 2.18:1.000:. ./.:4:36,24:.:-2.28:1.000:. ./.:4:101,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:66,60:.: 0.55:0.999:. ./.:4:104,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:86,51:.: 1.02:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:73,60:.: 0.85:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:103,30:.: 0.85:1.000:. ./.:4:95,30:.: 0.50:1.000:. ./.:4:103,29:.: 0.80:1.000:. ./.:4:107,22:.: 0.68:1.000:. ./.:4:70,24:.:-0.83:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:87,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:103,33:.: 0.98:1.000:. ./.:4:93,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:61,24:.:-1.21:1.000:. ./.:4:97,19:.: 0.12:1.000:. ./.:4:95,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:79,27:.:-0.31:1.000:. ./.:4:56,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:94,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:70,90:.: 2.01:1.000:. ./.:4:50,47:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,30:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,46:.:-0.70:1.000:. ./.:4:76,18:.:-0.83:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,54:.:-0.48:1.000:. ./.:4:90,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,16:.:-1.77:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:57,24:.:-1.38:1.000:. ./.:4:52,45:.:-0.70:0.998:. ./.:4:67,24:.:-0.95:1.000:. ./.:4:88,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:102,27:.: 0.68:1.000:. ./.:4:80,9:.:-1.04:1.000:. ./.:4:165,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:97,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:85,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:90,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,29:.:-2.28:1.000:. ./.:4:82,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:51,42:.:-0.87:1.000:. ./.:4:74,19:.:-0.87:1.000:. ./.:4:95,44:.: 1.10:1.000:. ./.:4:96,31:.: 0.59:1.000:. ./.:4:72,42:.: 0.03:1.000:. ./.:4:77,12:.:-1.04:1.000:. ./.:4:92,40:.: 0.80:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:89,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:81,47:.: 0.63:1.000:. ./.:4:103,29:.: 0.80:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:37,46:.:-1.30:1.000:. ./.:4:76,30:.:-0.31:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:51,48:.:-0.61:1.000:. ./.:4:39,38:.:-1.55:1.000:. ./.:4:85,43:.: 0.63:1.000:. ./.:4:77,41:.: 0.20:1.000:. ./.:4:96,24:.: 0.29:1.000:. ./.:4:83,18:.:-0.53:1.000:. ./.:4:64,28:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,24:.:-0.74:1.000:. ./.:4:54,41:.:-0.78:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:104,20:.: 0.46:1.000:. ./.:4:85,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:79,28:.:-0.27:1.000:. ./.:4:126,40:.: 2.26:1.000:. ./.:4:115,19:.: 0.89:1.000:. ./.:4:90,30:.: 0.29:1.000:. ./.:4:96,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:86,48:.: 0.89:1.000:. ./.:4:84,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,40:.: 0.93:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,12:.:-1.77:1.000:. ./.:4:95,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:106,20:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,65:.: 0.16:1.000:. ./.:4:113,43:.: 1.83:1.000:. ./.:4:91,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:75,22:.:-0.70:1.000:. ./.:4:75,43:.: 0.20:1.000:. ./.:4:91,26:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,12:.: 0.03:1.000:. ./.:4:88,20:.:-0.23:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:53,30:.:-1.30:1.000:. ./.:4:50,47:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,29:.:-0.65:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:114,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:80,11:.:-0.95:1.000:. ./.:4:79,38:.: 0.16:1.000:. ./.:4:88,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:106,30:.: 0.98:1.000:. ./.:4:91,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:70,12:.:-1.34:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:116,43:.: 1.96:1.000:. ./.:4:49,43:.:-0.91:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:99,32:.: 0.76:1.000:. ./.:4:85,28:.:-0.01:1.000:. ./.:4:125,17:.: 1.23:1.000:. ./.:4:109,31:.: 1.15:1.000:. ./.:4:73,12:.:-1.21:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.10:1.000:. -chr4.1 24125352 chr4.1_024125352 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:100,117:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:102,42:0.27:-0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:150,52:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,54:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,69:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,72:0.27: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:117,2:0.02:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,158:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,50:0.26:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,19:0.47:-2.97:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,17:0.45:-3.03:1.000:0.980 0/0/0/1:4:101,54:0.33:-0.62:1.000:0.936 0/1/1/1:4:37,131:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,96:0.49: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,50:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,71:0.27: 1.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,176:0.75: 0.89:0.999:0.999 0/0/0/1:4:161,65:0.26: 0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:122,132:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,167:0.76: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,16:0.44:-3.05:1.000:0.959 0/0/1/1:4:86,97:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,118:0.54: 0.51:1.000:0.989 0/0/1/1:4:103,83:0.42: 0.00:1.000:0.930 0/0/1/1:4:9,8:0.45:-3.41:1.000:0.979 0/0/1/1:4:128,132:0.49: 1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,130:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,94:0.42: 0.53:1.000:0.920 0/0/0/1:4:161,67:0.27: 0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,65:0.28: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:158,48:0.21: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,6:0.17:-3.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,17:0.53:-3.13:1.000:0.993 0/1/1:3:2,7:0.76:-3.57:0.999:1.000 0/0/0/1:4:179,68:0.25: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,126:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,130:0.57: 0.73:1.000:0.958 0/0/1/1:4:97,140:0.57: 1.03:1.000:0.946 0/0/1/1:4:114,151:0.55: 1.60:1.000:0.981 0/0/0/1:4:137,52:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,43:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,50:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,55:0.27: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,94:0.53:-0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:156,41:0.19: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,53:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,70:0.24: 1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,103:0.55:-0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:94,117:0.53: 0.51:1.000:0.991 0/0/1/1:4:58,81:0.56:-0.95:1.000:0.963 0/0/1/1:4:114,128:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,86:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,99:0.46: 0.43:1.000:0.985 0/0/1/1:4:99,101:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,107:0.46: 0.69:1.000:0.990 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,97:0.48: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,60:0.29: 0.18:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:81,83:0.48:-0.44:1.000:0.876 0/0/1/1:4:91,86:0.46:-0.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:84,110:0.55: 0.16:1.000:0.983 0/0/1/1:4:114,117:0.48: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,49:0.21: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,65:0.29: 0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:150,109:0.40: 1.47:1.000:0.781 0/0/0/1:4:71,30:0.27:-1.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,172:0.72: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,65:0.31: 0.20:0.999:0.975 0/0/1/1:4:89,78:0.45:-0.38:1.000:0.975 0/0/0/1:4:172,75:0.28: 1.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:83,45:0.33:-1.17:1.000:0.924 0/0/1/1:4:94,126:0.55: 0.69:1.000:0.978 0/0/0/1:4:147,72:0.31: 0.67:1.000:0.979 0/0/1/1:4:67,91:0.56:-0.56:1.000:0.974 0/0/1/1:4:84,106:0.54: 0.08:1.000:0.989 0/0/0/0:4:169,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,139:0.74:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,76:0.29: 1.17:1.000:0.992 0/0/0/1:4:185,67:0.24: 1.33:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:161,60:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,159:0.70: 0.73:1.000:0.983 0/0/0/1:4:149,50:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,47:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,79:0.51:-0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,70:0.48:-0.93:1.000:0.995 0/0/0/1:4:102,38:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,99:0.56:-0.32:1.000:0.964 0/0/0/1:4:108,41:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,101:0.47: 0.43:1.000:0.991 0/0/0/1:4:170,75:0.28: 1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,86:0.53:-0.58:1.000:0.993 0/0/0/0:4:221,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,67:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,72:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,47:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:145,54:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,145:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,52:0.49:-1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,85:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,87:0.70:-1.31:1.000:0.986 0/0/1/1:4:89,71:0.42:-0.52:0.998:0.921 0/0/1/1:4:57,67:0.52:-1.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,100:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,45:0.21: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,52:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,106:0.42: 1.11:1.000:0.905 0/0/0/1:4:150,43:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,86:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,136:0.49: 1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,41:0.22:-0.32:0.999:1.000 0/0/1/1:4:104,124:0.52: 0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,32:0.23:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,163:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,75:0.46:-0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:51,75:0.58:-1.21:1.000:0.932 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,44:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,45:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,36:0.22:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,106:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,115:0.49: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,50:0.28:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,105:0.46: 0.63:1.000:0.989 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,44:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,39:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,65:0.43:-0.85:1.000:0.945 0/0/0/1:4:130,57:0.28: 0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,69:0.55:-1.33:1.000:0.975 0/0/0/1:4:147,53:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,103:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,134:0.49: 1.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,47:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,38:0.27:-1.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,41:0.21:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,105:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,37:0.24:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,75:0.47:-0.64:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,67:0.53:-1.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:184,56:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,100:0.44: 0.65:1.000:0.962 0/0/0/1:4:140,53:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,138:0.71: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:174,78:0.29: 1.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,111:0.55: 0.18:1.000:0.981 0/0/0/1:4:163,65:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,139:0.54: 1.23:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,8:0.25:-3.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,114:0.75:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,77:0.28: 1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,100:0.44: 0.61:1.000:0.969 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,140:0.72: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,69:0.43:-0.64:1.000:0.936 0/0/1/1:4:86,118:0.56: 0.36:1.000:0.970 0/0/1/1:4:95,110:0.52: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,109:0.56: 0.06:1.000:0.973 0/0/1/1:4:82,79:0.47:-0.50:1.000:0.992 0/0/0/1:4:133,36:0.20:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:227,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,54:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,107:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,49:0.23: 0.24:0.999:1.000 0/0/1/1:4:76,88:0.52:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,85:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,90:0.52:-0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:124,40:0.22:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,124:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,161:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,126:0.70:-0.20:1.000:0.983 0/0/0/1:4:116,52:0.29:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,128:0.59: 0.49:1.000:0.867 0/0/1/1:4:91,115:0.54: 0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:159,50:0.22: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,63:0.27: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,181:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:255,3:0.01: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,88:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:137,44:0.22:-0.10:1.000:1.000 -chr4.1 24320563 chr4.1_024320563 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:147,49:.: 0.77:1.000:. ./.:4:119,99:.: 1.27:1.000:. ./.:4:120,31:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,41:.:-0.14:1.000:. ./.:4:135,42:.: 0.34:1.000:. ./.:4:189,53:.: 1.82:1.000:. ./.:4:85,25:.:-1.19:1.000:. ./.:4:119,82:.: 0.89:1.000:. ./.:4:142,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:57,13:.:-2.10:1.000:. ./.:4:71,16:.:-1.71:1.000:. ./.:4:134,45:.: 0.39:1.000:. ./.:4:122,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:140,46:.: 0.55:1.000:. ./.:4:135,32:.: 0.11:1.000:. ./.:4:151,43:.: 0.73:1.000:. ./.:4:141,36:.: 0.34:0.999:. ./.:4:156,94:.: 2.00:1.000:. ./.:4:177,56:.: 1.62:1.000:. ./.:4:156,40:.: 0.77:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:122,93:.: 1.21:1.000:. ./.:4:153,37:.: 0.64:1.000:. ./.:4:112,44:.:-0.14:1.000:. ./.:4:22,23:.:-2.67:1.000:. ./.:4:142,74:.: 1.23:1.000:. ./.:4:144,96:.: 1.78:1.000:. ./.:4:134,38:.: 0.23:1.000:. ./.:4:147,42:.: 0.61:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:159,34:.: 0.71:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:37,1:.:-2.83:1.000:. ./.:4:83,12:.:-1.53:1.000:. ./.:3:43,6:.:-2.58:0.999:. ./.:4:142,41:.: 0.48:1.000:. ./.:4:143,46:.: 0.61:1.000:. ./.:4:125,30:.:-0.16:1.000:. ./.:4:141,48:.: 0.61:1.000:. ./.:4:169,74:.: 1.84:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,36:.:-0.37:1.000:. ./.:4:120,68:.: 0.59:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,44:.: 0.14:1.000:. ./.:4:124,70:.: 0.73:1.000:. ./.:4:141,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:115,21:.:-0.59:1.000:. ./.:4:163,51:.: 1.18:1.000:. ./.:4:112,36:.:-0.32:1.000:. ./.:4:138,38:.: 0.32:1.000:. ./.:4:123,63:.: 0.55:1.000:. ./.:4:156,37:.: 0.71:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:138,42:.: 0.41:1.000:. ./.:4:130,47:.: 0.34:1.000:. ./.:6:100,31:.:-0.71:1.000:. ./.:4:103,39:.:-0.46:1.000:. ./.:4:141,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:160,103:.: 2.30:1.000:. ./.:4:110,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:104,34:.:-0.55:1.000:. ./.:4:133,42:.: 0.29:1.000:. ./.:4:71,16:.:-1.71:1.000:. ./.:4:113,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:126,45:.: 0.20:0.999:. ./.:4:98,108:.: 1.00:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:74,23:.:-1.48:1.000:. ./.:4:135,111:.: 1.91:1.000:. ./.:4:118,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,81:.: 1.87:1.000:. ./.:4:104,70:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:113,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:142,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:142,87:.: 1.53:1.000:. ./.:4:102,28:.:-0.73:0.999:. ./.:4:116,48:.: 0.04:1.000:. ./.:4:146,82:.: 1.50:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:132,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.02:1.000:. ./.:4:87,27:.:-1.10:1.000:. ./.:4:91,48:.:-0.53:1.000:. ./.:4:127,26:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:136,41:.: 0.34:1.000:. ./.:4:172,50:.: 1.37:1.000:. ./.:4:97,26:.:-0.89:1.000:. ./.:4:115,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:137,48:.: 0.52:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.87:1.000:. ./.:4:96,67:.: 0.02:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:114,76:.: 0.64:1.000:. ./.:4:74,10:.:-1.78:1.000:. ./.:4:114,36:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,33:.:-0.89:1.000:. ./.:4:111,84:.: 0.75:0.998:. ./.:4:87,30:.:-1.03:1.000:. ./.:4:119,41:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,25:.:-0.64:1.000:. ./.:4:113,34:.:-0.34:1.000:. ./.:4:161,47:.: 1.05:1.000:. ./.:4:131,30:.:-0.02:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:178,59:.: 1.71:1.000:. ./.:4:111,36:.:-0.34:0.999:. ./.:4:111,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:108,44:.:-0.23:1.000:. ./.:4:132,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:92,26:.:-1.00:1.000:. ./.:4:130,28:.:-0.09:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:91,33:.:-0.87:1.000:. ./.:4:123,60:.: 0.48:1.000:. ./.:4:89,43:.:-0.69:1.000:. ./.:4:109,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:139,48:.: 0.57:1.000:. ./.:4:118,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:121,39:.:-0.05:1.000:. ./.:4:136,32:.: 0.14:1.000:. ./.:4:94,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:114,38:.:-0.23:1.000:. ./.:4:135,43:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,36:.:-1.51:1.000:. ./.:4:121,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:103,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:188,50:.: 1.73:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:110,35:.:-0.39:1.000:. ./.:4:90,16:.:-1.28:1.000:. ./.:4:100,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:138,44:.: 0.45:1.000:. ./.:4:115,30:.:-0.39:1.000:. ./.:4:124,42:.: 0.09:1.000:. ./.:4:94,23:.:-1.03:1.000:. ./.:4:151,57:.: 1.05:1.000:. ./.:4:174,40:.: 1.18:1.000:. ./.:4:141,39:.: 0.41:1.000:. ./.:4:131,46:.: 0.34:1.000:. ./.:4:174,36:.: 1.09:1.000:. ./.:4:111,84:.: 0.75:1.000:. ./.:4:150,52:.: 0.91:1.000:. ./.:4:133,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:47,16:.:-2.26:1.000:. ./.:4:97,24:.:-0.94:1.000:. ./.:4:141,43:.: 0.50:1.000:. ./.:4:132,43:.: 0.29:1.000:. ./.:4:157,48:.: 0.98:1.000:. ./.:4:138,91:.: 1.53:1.000:. ./.:4:103,44:.:-0.34:1.000:. ./.:4:157,96:.: 2.07:1.000:. ./.:4:131,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:106,36:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:132,42:.: 0.27:1.000:. ./.:4:168,52:.: 1.32:1.000:. ./.:4:102,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:140,104:.: 1.87:0.999:. ./.:4:112,48:.:-0.05:1.000:. ./.:4:116,35:.:-0.25:1.000:. ./.:4:116,38:.:-0.18:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:142,72:.: 1.18:1.000:. ./.:4:111,54:.: 0.07:1.000:. ./.:4:104,31:.:-0.62:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:125,50:.: 0.29:1.000:. ./.:4:184,43:.: 1.48:1.000:. ./.:4:115,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:135,41:.: 0.32:1.000:. ./.:4:177,51:.: 1.50:1.000:. ./.:4:153,48:.: 0.89:1.000:. ./.:4:131,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:133,68:.: 0.89:1.000:. -chr4.1 24625314 chr4.1_024625314 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:73,28:0.29: 1.16:1.000:0.994 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,76:0.76: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,40:0.51: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,30:0.28: 1.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,48:0.47: 1.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:23,4:0.15:-2.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:53,16:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,38:0.43: 0.55:1.000:0.957 0/0/0/1:4:20,5:0.21:-2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.58:-3.11:1.000:0.896 0/0/0/1:4:65,15:0.20: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,38:0.48: 0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,29:0.42:-0.34:1.000:0.927 0/0/1/1:4:35,45:0.55: 0.18:1.000:0.977 0/1/1/1:4:15,55:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,37:0.41: 0.74:0.999:0.837 0/0/0/1:4:68,22:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,55:0.53: 1.21:1.000:0.991 0/0/0/1:4:75,20:0.22: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.61:-3.07:1.000:0.636 0/0/0/1:4:57,18:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,34:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,15:0.21:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.71:-3.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:86,27:0.25: 1.73:1.000:0.999 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,21:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,21:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,17:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,27:0.31: 0.60:1.000:0.972 0/0/1/1:4:25,41:0.60:-0.48:1.000:0.773 0/1/1/1:4:1,2:0.64:-3.44:1.000:0.691 0/0/0/1:4:12,2:0.15:-2.93:1.000:0.986 0/0/1:3:2,1:0.34:-3.44:0.999:1.000 0/0/1/1:4:45,37:0.45: 0.27:1.000:0.983 0/0/0/1:4:73,14:0.17: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,28:0.30: 0.93:1.000:0.985 0/0/0/1:4:71,30:0.30: 1.16:1.000:0.980 0/0/0/1:4:78,17:0.19: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,32:0.40: 0.22:1.000:0.783 0/0/1/1:4:49,48:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,47:0.57: 0.22:1.000:0.953 0/1/1/1:4:22,42:0.63:-0.58:1.000:0.582 0/0/0/1:4:71,15:0.18: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,36:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,23:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,43:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,24:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,53:0.69:-0.15:1.000:0.974 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,62:0.69: 0.41:1.000:0.978 0/1/1/1:4:16,51:0.72:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,22:0.21: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,41:0.54:-0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:58,44:0.43: 1.21:1.000:0.956 0/0/1/1:4:45,33:0.43: 0.08:1.000:0.935 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,28:0.28: 1.21:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:24,33:0.57:-0.91:1.000:0.630 0/0/1/1:4:45,32:0.42: 0.03:1.000:0.909 0/0/0/1:4:63,12:0.17:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,27:0.40:-0.39:1.000:0.800 0/0/1/1:4:37,51:0.57: 0.55:1.000:0.954 0/0/1/1:4:50,38:0.43: 0.55:1.000:0.957 0/0/0/1:4:56,31:0.36: 0.50:1.000:0.667 0/0/0/1:4:27,14:0.35:-1.66:1.000:0.814 0/0/1/1:4:37,25:0.41:-0.67:1.000:0.844 0/0/0/1:4:58,14:0.20:-0.20:0.999:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,62:0.68: 0.50:1.000:0.951 0/0/0/1:4:33,18:0.36:-1.19:1.000:0.705 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,19:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,32:0.45:-0.20:1.000:0.976 0/0/0/1:4:50,28:0.36: 0.08:1.000:0.635 0/0/1/1:4:41,26:0.39:-0.44:1.000:0.717 0/0/1/1:4:28,30:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:68,22:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,18:0.20: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,24:0.38:-0.58:0.999:0.567 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,18:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,21:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,27:0.45:-0.76:1.000:0.982 0/0/0/1:4:90,15:0.15: 1.35:1.000:0.986 0/0/1/1:4:26,27:0.51:-1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,24:0.36:-0.39:1.000:0.705 0/1/1/1:4:22,43:0.64:-0.53:1.000:0.639 0/0/0/1:4:50,12:0.20:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,23:0.41:-0.95:1.000:0.887 0/0/0/1:4:72,17:0.20: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,14:0.18: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,29:0.43:-0.39:1.000:0.945 0/0/1/1:4:41,35:0.46:-0.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:59,22:0.28: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,30:0.51:-0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,17:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,15:0.38:-1.70:1.000:0.567 0/0/1/1:4:48,34:0.42: 0.27:1.000:0.905 0/0/0/1:4:30,13:0.31:-1.56:1.000:0.974 0/0/0/1:4:53,9:0.15:-0.67:0.998:0.989 0/0/0/1:4:48,12:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,46:0.52: 0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,23:0.31: 0.03:1.000:0.978 0/0/0/1:4:64,20:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,26:0.24: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,27:0.33: 0.32:1.000:0.912 0/0/1/1:4:47,30:0.39: 0.03:1.000:0.733 0/0/0/1:4:92,27:0.24: 2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,35:0.51:-0.34:0.999:0.997 0/0/1/1:4:43,41:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,15:0.42:-1.89:1.000:0.914 0/0/1/1:4:42,30:0.42:-0.20:1.000:0.914 0/0/0/1:4:27,15:0.36:-1.61:1.000:0.657 0/0/1/1:4:32,33:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,38:0.41: 0.79:1.000:0.876 0/0/1/1:4:40,36:0.47:-0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,45:0.55: 0.22:1.000:0.983 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,30:0.43:-0.29:1.000:0.950 0/0/1/1:4:45,48:0.51: 0.79:1.000:0.996 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,25:0.37:-0.39:1.000:0.527 0/0/0/1:4:70,13:0.16: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,14:0.16: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,15:0.26:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,19:0.35:-1.00:1.000:0.779 0/0/1/1:4:41,26:0.39:-0.44:1.000:0.717 0/0/1/1:4:41,46:0.52: 0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:46,9:0.17:-1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,26:0.40:-0.53:1.000:0.822 0/0/1/1:4:34,21:0.39:-1.00:1.000:0.649 0/0/1/1:4:49,60:0.54: 1.54:1.000:0.986 0/0/0/1:4:64,19:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,18:0.31:-0.81:1.000:0.969 0/0/1/1:4:37,26:0.42:-0.62:1.000:0.897 0/0/1/1:4:33,34:0.51:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,12:0.16: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,35:0.42: 0.36:1.000:0.914 0/0/1/1:4:19,35:0.62:-1.05:1.000:0.508 0/1/1/1:4:27,65:0.67: 0.74:1.000:0.935 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,45:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,46:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,26:0.26: 1.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,34:0.47:-0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:76,24:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,50:0.57: 0.41:1.000:0.935 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-2.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,15:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,36:0.39: 0.83:1.000:0.663 0/0/0/1:4:71,22:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,21:0.22: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,16:0.18: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,17:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:71,26:0.28: 0.97:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,58:0.65: 0.41:1.000:0.822 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,36:0.42: 0.46:1.000:0.921 0/0/1/1:4:50,54:0.52: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,48:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,19:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,33:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.46:0.999:1.000 0/0/0/1:4:63,26:0.30: 0.60:1.000:0.985 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,52:0.70:-0.25:1.000:0.981 0/0/0/1:4:57,26:0.32: 0.32:1.000:0.952 0/0/0/1:4:52,19:0.28:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,24:0.29: 0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,31:0.53:-0.86:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,22:0.38:-0.81:1.000:0.540 0/0/1/1:4:46,48:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,25:0.22: 2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,44:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,34:0.47:-0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:62,19:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,43:0.39: 1.68:1.000:0.673 0/0/0/1:4:80,18:0.19: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,23:0.36:-0.53:1.000:0.695 0/0/0/1:4:61,21:0.27: 0.27:1.000:0.998 -chr4.1 24770171 chr4.1_024770171 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:171,202:.: 1.19:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:215,94:.: 0.28:1.000:. ./.:4:225,95:.: 0.44:1.000:. ./.:4:311,114:.: 1.92:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:141,159:.: 0.15:1.000:. ./.:4:193,75:.:-0.30:1.000:. ./.:4:49,32:.:-2.94:1.000:. ./.:4:111,49:.:-1.83:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:133,196:.: 0.56:1.000:. ./.:4:161,152:.: 0.34:1.000:. ./.:4:236,95:.: 0.59:1.000:. ./.:4:231,84:.: 0.36:1.000:. ./.:4:146,171:.: 0.39:0.999:. ./.:4:267,92:.: 0.99:1.000:. ./.:4:217,213:.: 1.99:1.000:. ./.:4:200,262:.: 2.44:1.000:. ./.:4:55,58:.:-2.49:1.000:. ./.:4:205,70:.:-0.20:1.000:. ./.:4:272,89:.: 1.02:1.000:. ./.:4:245,76:.: 0.45:1.000:. ./.:4:38,4:.:-3.50:1.000:. ./.:4:224,84:.: 0.27:1.000:. ./.:4:223,78:.: 0.17:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:299,107:.: 1.65:1.000:. ./.:4:268,100:.: 1.11:1.000:. ./.:4:197,81:.:-0.16:1.000:. ./.:4:179,83:.:-0.38:1.000:. ./.:4:68,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:94,36:.:-2.25:1.000:. ./.:3:31,40:.:-3.09:0.999:. ./.:4:300,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:204,83:.:-0.03:1.000:. ./.:4:253,84:.: 0.68:1.000:. ./.:4:198,72:.:-0.27:1.000:. ./.:4:191,81:.:-0.24:1.000:. ./.:4:217,79:.: 0.10:1.000:. ./.:4:202,88:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,98:.: 0.22:1.000:. ./.:4:180,75:.:-0.48:1.000:. ./.:4:278,93:.: 1.16:1.000:. ./.:4:222,67:.: 0.00:1.000:. ./.:4:292,143:.: 2.06:1.000:. ./.:4:38,27:.:-3.17:1.000:. ./.:4:161,62:.:-0.94:1.000:. ./.:4:109,47:.:-1.88:1.000:. ./.:4:200,68:.:-0.30:1.000:. ./.:4:227,75:.: 0.18:1.000:. ./.:4:160,69:.:-0.85:1.000:. ./.:4:241,94:.: 0.65:1.000:. ./.:4:217,90:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,73:.:-0.65:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:212,76:.:-0.02:1.000:. ./.:4:211,76:.:-0.03:1.000:. ./.:6:167,62:.:-0.85:1.000:. ./.:4:241,94:.: 0.65:1.000:. ./.:4:170,69:.:-0.71:1.000:. ./.:4:254,115:.: 1.13:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:234,96:.: 0.58:1.000:. ./.:4:261,83:.: 0.77:1.000:. ./.:4:193,75:.:-0.30:1.000:. ./.:4:134,170:.: 0.21:1.000:. ./.:4:247,89:.: 0.66:0.999:. ./.:4:247,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:198,104:.: 0.18:1.000:. ./.:4:140,62:.:-1.23:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:247,79:.: 0.52:1.000:. ./.:4:281,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:169,71:.:-0.70:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:156,191:.: 0.82:1.000:. ./.:4:216,77:.: 0.05:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:255,2:.:-0.46:0.999:. ./.:4:243,91:.: 0.63:1.000:. ./.:4:164,181:.: 0.79:1.000:. ./.:4:196,56:.:-0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:249,98:.: 0.82:1.000:. ./.:4:124,140:.:-0.36:1.000:. ./.:4:200,72:.:-0.24:1.000:. ./.:4:205,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:184,75:.:-0.43:1.000:. ./.:4:171,63:.:-0.78:1.000:. ./.:4:192,77:.:-0.29:1.000:. ./.:4:236,93:.: 0.56:1.000:. ./.:4:156,50:.:-1.18:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:202,75:.:-0.17:1.000:. ./.:4:214,82:.: 0.10:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:287,102:.: 1.41:1.000:. ./.:4:147,180:.: 0.53:1.000:. ./.:4:223,84:.: 0.25:1.000:. ./.:4:211,95:.: 0.24:1.000:. ./.:4:125,138:.:-0.37:1.000:. ./.:4:250,87:.: 0.68:0.998:. ./.:4:107,153:.:-0.41:1.000:. ./.:4:145,137:.:-0.10:1.000:. ./.:4:191,71:.:-0.38:1.000:. ./.:4:210,78:.:-0.02:1.000:. ./.:4:310,118:.: 1.96:1.000:. ./.:4:209,79:.:-0.02:1.000:. ./.:4:146,178:.: 0.49:1.000:. ./.:4:297,121:.: 1.82:1.000:. ./.:4:265,81:.: 0.80:0.999:. ./.:4:147,156:.: 0.20:1.000:. ./.:4:119,71:.:-1.40:1.000:. ./.:4:155,183:.: 0.69:1.000:. ./.:4:217,78:.: 0.08:1.000:. ./.:4:125,176:.: 0.17:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:207,66:.:-0.23:1.000:. ./.:4:201,79:.:-0.13:1.000:. ./.:4:202,92:.: 0.07:1.000:. ./.:4:210,94:.: 0.21:1.000:. ./.:4:260,115:.: 1.21:1.000:. ./.:4:235,79:.: 0.35:1.000:. ./.:4:249,100:.: 0.85:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:172,56:.:-0.87:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:179,73:.:-0.53:1.000:. ./.:4:217,88:.: 0.22:1.000:. ./.:4:147,50:.:-1.30:1.000:. ./.:4:195,47:.:-0.67:1.000:. ./.:4:172,52:.:-0.92:1.000:. ./.:4:194,224:.: 1.82:1.000:. ./.:4:222,62:.:-0.07:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:179,77:.:-0.47:1.000:. ./.:4:216,93:.: 0.28:1.000:. ./.:4:244,85:.: 0.56:1.000:. ./.:4:202,97:.: 0.14:1.000:. ./.:4:171,73:.:-0.64:1.000:. ./.:4:286,106:.: 1.45:1.000:. ./.:4:297,121:.: 1.82:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:136,171:.: 0.25:1.000:. ./.:4:246,99:.: 0.79:1.000:. ./.:4:179,74:.:-0.51:1.000:. ./.:4:386,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:187,94:.:-0.12:1.000:. ./.:4:52,19:.:-3.09:1.000:. ./.:4:154,168:.: 0.46:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:229,73:.: 0.18:1.000:. ./.:4:356,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:175,179:.: 0.92:1.000:. ./.:4:215,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:267,97:.: 1.06:1.000:. ./.:4:230,73:.: 0.20:1.000:. ./.:4:181,76:.:-0.46:1.000:. ./.:4:140,158:.: 0.12:1.000:. ./.:4:213,94:.: 0.25:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:233,94:.: 0.53:1.000:. ./.:4:176,75:.:-0.54:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:235,77:.: 0.32:1.000:. ./.:4:239,85:.: 0.49:1.000:. ./.:4:194,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:151,64:.:-1.05:1.000:. ./.:4:150,133:.:-0.09:1.000:. ./.:4:133,161:.: 0.07:1.000:. ./.:4:114,123:.:-0.74:1.000:. ./.:4:175,80:.:-0.48:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:249,83:.: 0.61:1.000:. ./.:4:241,91:.: 0.61:1.000:. ./.:4:214,62:.:-0.19:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:204,231:.: 2.06:1.000:. ./.:4:425,2:.: 1.95:1.000:. ./.:4:149,173:.: 0.46:1.000:. ./.:4:344,1:.: 0.79:1.000:. -chr4.1 25009130 chr4.1_025009130 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1476,161:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1126,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1321,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1461,143:.: 0.62:1.000:. ./.:4:2016,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:1957,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:1043,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:1307,157:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1347,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:273,12:.:-3.20:1.000:. ./.:4:438,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:1300,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1266,144:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1452,155:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1336,139:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1585,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1318,151:.: 0.23:0.999:. ./.:4:1420,318:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1596,172:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1480,174:.: 0.76:1.000:. ./.:4:294,18:.:-3.12:1.000:. ./.:4:1305,153:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1922,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:1174,131:.:-0.25:1.000:. ./.:4:209,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:1467,149:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1465,163:.: 0.69:1.000:. ./.:4:1480,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1703,201:.: 1.49:1.000:. ./.:4:1159,127:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1240,133:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1105,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:287,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:412,20:.:-2.77:1.000:. ./.:3:239,0:.:-3.33:0.999:. ./.:4:1482,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1365,132:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1255,162:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1193,120:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1054,112:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1364,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1503,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1388,157:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1338,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1496,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1355,122:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1693,189:.: 1.43:1.000:. ./.:4:2635,0:.: 3.61:1.000:. ./.:4:1292,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1370,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1182,91:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1898,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:1251,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1605,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1375,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:1387,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1269,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1384,114:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1159,0:.:-0.67:1.000:. ./.:6:1299,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1460,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1243,152:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1586,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1159,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1516,138:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1549,136:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1017,97:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1253,137:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1318,126:.: 0.16:0.999:. ./.:4:1439,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1649,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1513,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1556,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1401,143:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1611,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:1325,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1404,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1428,156:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1221,152:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1496,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1101,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:1327,147:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1528,140:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1197,141:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1339,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1484,148:.: 0.70:1.000:. ./.:4:905,91:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1389,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1385,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1277,150:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1213,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1203,121:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1250,101:.:-0.11:1.000:. ./.:4:999,121:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1332,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:1213,135:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1098,94:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1107,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1408,113:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1295,145:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1653,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1799,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:972,95:.:-0.94:1.000:. ./.:4:1405,126:.: 0.41:0.998:. ./.:4:951,89:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1135,110:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1000,94:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1129,141:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2024,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:1094,119:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1166,123:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1897,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:1519,1:.: 0.38:0.999:. ./.:4:1279,128:.: 0.05:1.000:. ./.:4:929,98:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1486,171:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1147,122:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1254,114:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1270,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1207,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1400,161:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1223,137:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1524,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1538,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1315,137:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1405,118:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1418,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1043,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:788,79:.:-1.51:1.000:. ./.:4:1051,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1401,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1174,140:.:-0.22:1.000:. ./.:4:754,81:.:-1.61:1.000:. ./.:4:1483,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1346,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1745,206:.: 1.63:1.000:. ./.:4:1331,146:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1310,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1249,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1126,120:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1390,140:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1276,131:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1335,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1037,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1930,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:2096,230:.: 2.71:1.000:. ./.:4:1485,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1245,152:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1338,161:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1150,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1660,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1367,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:282,3:.:-3.20:1.000:. ./.:4:936,114:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1610,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:1348,155:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1911,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:1408,147:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1167,136:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1606,175:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1292,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1050,124:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1064,125:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1603,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1741,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:1335,161:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1186,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1386,0:.:-0.01:0.999:. ./.:4:1602,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1138,125:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1175,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:900,111:.:-1.10:1.000:. ./.:4:1354,171:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1097,146:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1029,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1634,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1518,175:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1557,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1329,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1613,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1750,188:.: 1.59:1.000:. ./.:4:2001,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:1074,124:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1521,0:.: 0.38:1.000:. -chr4.1 25133835 chr4.1_025133835 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:256,216:.: 0.07:1.000:. ./.:4:337,91:.:-0.33:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:366,82:.:-0.15:1.000:. ./.:4:433,109:.: 0.70:1.000:. ./.:4:611,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:362,84:.:-0.17:1.000:. ./.:4:392,103:.: 0.27:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:59,5:.:-3.63:1.000:. ./.:4:135,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:241,208:.:-0.14:1.000:. ./.:4:395,110:.: 0.37:1.000:. ./.:4:388,119:.: 0.38:1.000:. ./.:4:360,100:.:-0.04:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:385,101:.: 0.19:0.999:. ./.:4:668,3:.: 1.87:1.000:. ./.:4:403,142:.: 0.73:1.000:. ./.:4:322,261:.: 1.07:1.000:. ./.:4:59,46:.:-3.26:1.000:. ./.:4:364,106:.: 0.05:1.000:. ./.:4:641,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:237,206:.:-0.20:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.73:1.000:. ./.:4:373,100:.: 0.07:1.000:. ./.:4:434,102:.: 0.65:1.000:. ./.:4:320,88:.:-0.51:1.000:. ./.:4:532,137:.: 1.85:1.000:. ./.:4:273,234:.: 0.38:1.000:. ./.:4:278,215:.: 0.26:1.000:. ./.:4:333,101:.:-0.28:1.000:. ./.:4:46,10:.:-3.71:1.000:. ./.:4:100,31:.:-3.03:1.000:. ./.:3:37,1:.:-3.87:0.999:. ./.:4:393,99:.: 0.25:1.000:. ./.:4:291,206:.: 0.29:1.000:. ./.:4:240,195:.:-0.27:1.000:. ./.:4:336,79:.:-0.45:1.000:. ./.:4:436,116:.: 0.79:1.000:. ./.:4:334,90:.:-0.37:1.000:. ./.:4:390,92:.: 0.16:1.000:. ./.:4:238,211:.:-0.14:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:269,197:.: 0.01:1.000:. ./.:4:308,238:.: 0.74:1.000:. ./.:4:673,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:203,154:.:-0.98:1.000:. ./.:4:639,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:354,101:.:-0.09:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:595,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:405,91:.: 0.28:1.000:. ./.:4:286,199:.: 0.18:1.000:. ./.:4:331,112:.:-0.20:1.000:. ./.:6:364,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:440,120:.: 0.86:1.000:. ./.:4:384,95:.: 0.13:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:419,110:.: 0.58:1.000:. ./.:4:326,169:.: 0.27:1.000:. ./.:4:321,82:.:-0.56:1.000:. ./.:4:404,109:.: 0.44:1.000:. ./.:4:328,224:.: 0.79:0.999:. ./.:4:304,86:.:-0.68:1.000:. ./.:4:457,118:.: 1.00:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:386,111:.: 0.29:1.000:. ./.:4:279,224:.: 0.35:1.000:. ./.:4:479,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:358,88:.:-0.17:1.000:. ./.:4:401,100:.: 0.33:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:259,202:.:-0.03:1.000:. ./.:4:427,121:.: 0.76:1.000:. ./.:4:203,166:.:-0.87:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:386,108:.: 0.27:1.000:. ./.:4:346,83:.:-0.32:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:426,106:.: 0.61:1.000:. ./.:4:425,92:.: 0.47:1.000:. ./.:4:330,83:.:-0.47:1.000:. ./.:4:290,198:.: 0.21:1.000:. ./.:4:239,69:.:-1.42:1.000:. ./.:4:586,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:260,232:.: 0.25:1.000:. ./.:4:215,149:.:-0.91:1.000:. ./.:4:222,134:.:-0.99:1.000:. ./.:4:276,206:.: 0.16:1.000:. ./.:4:352,106:.:-0.06:1.000:. ./.:4:679,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:233,73:.:-1.44:1.000:. ./.:4:371,114:.: 0.18:0.998:. ./.:4:186,185:.:-0.85:1.000:. ./.:4:307,79:.:-0.71:1.000:. ./.:4:353,93:.:-0.17:1.000:. ./.:4:362,111:.: 0.07:1.000:. ./.:4:469,120:.: 1.13:1.000:. ./.:4:370,99:.: 0.04:1.000:. ./.:4:233,181:.:-0.46:1.000:. ./.:4:449,124:.: 0.98:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:290,204:.: 0.27:1.000:. ./.:4:286,61:.:-1.07:1.000:. ./.:4:428,112:.: 0.68:1.000:. ./.:4:307,207:.: 0.45:1.000:. ./.:4:363,76:.:-0.23:1.000:. ./.:4:379,84:.:-0.02:1.000:. ./.:4:362,78:.:-0.22:1.000:. ./.:4:299,122:.:-0.40:1.000:. ./.:4:220,183:.:-0.56:1.000:. ./.:4:413,110:.: 0.53:1.000:. ./.:4:585,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:205,161:.:-0.90:1.000:. ./.:4:422,117:.: 0.67:1.000:. ./.:4:383,110:.: 0.26:1.000:. ./.:4:224,182:.:-0.53:1.000:. ./.:4:184,154:.:-1.15:1.000:. ./.:4:270,64:.:-1.19:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:369,101:.: 0.05:1.000:. ./.:4:239,62:.:-1.49:1.000:. ./.:4:412,86:.: 0.30:1.000:. ./.:4:382,96:.: 0.12:1.000:. ./.:4:423,119:.: 0.70:1.000:. ./.:4:295,196:.: 0.24:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:190,150:.:-1.13:1.000:. ./.:4:303,204:.: 0.38:1.000:. ./.:4:378,102:.: 0.14:1.000:. ./.:4:430,110:.: 0.68:1.000:. ./.:4:348,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:570,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:396,256:.: 1.70:1.000:. ./.:4:456,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:427,102:.: 0.58:1.000:. ./.:4:250,223:.: 0.07:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:416,148:.: 0.90:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,34:.:-3.52:1.000:. ./.:4:267,176:.:-0.20:1.000:. ./.:4:534,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:288,237:.: 0.55:1.000:. ./.:4:478,114:.: 1.15:1.000:. ./.:4:397,140:.: 0.66:1.000:. ./.:4:390,98:.: 0.21:1.000:. ./.:4:481,137:.: 1.39:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:181,136:.:-1.34:1.000:. ./.:4:231,207:.:-0.24:1.000:. ./.:4:421,134:.: 0.82:1.000:. ./.:4:637,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:276,183:.:-0.05:1.000:. ./.:4:365,100:.: 0.00:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:417,101:.: 0.48:1.000:. ./.:4:242,209:.:-0.12:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:167,175:.:-1.11:1.000:. ./.:4:348,122:.: 0.05:1.000:. ./.:4:284,81:.:-0.90:1.000:. ./.:4:316,80:.:-0.62:1.000:. ./.:4:352,90:.:-0.21:1.000:. ./.:4:446,111:.: 0.84:1.000:. ./.:4:259,197:.:-0.08:1.000:. ./.:4:566,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:363,64:.:-0.34:1.000:. ./.:4:414,115:.: 0.58:1.000:. ./.:4:454,142:.: 1.19:1.000:. ./.:4:419,115:.: 0.63:1.000:. ./.:4:361,100:.:-0.03:1.000:. ./.:4:467,99:.: 0.92:1.000:. -chr4.1 25322741 chr4.1_025322741 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:33,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:21,3:.: 0.93:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:28,1:.: 1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:28,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:23,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.50:0.999:. ./.:4:25,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:19,3:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,3:.: 1.04:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.23:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.44:0.999:. ./.:4:17,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.04:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.26:1.000:. ./.:6:10,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:17,4:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:25,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:14,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.01:0.999:. ./.:4:0,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.33:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.15:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.90:0.999:. ./.:4:2,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:26,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.23:0.998:. ./.:4:6,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:23,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:31,4:.: 2.11:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.60:0.999:. ./.:4:14,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:23,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:19,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:37,2:.: 2.54:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,2:.: 3.19:1.000:. ./.:4:22,3:.: 1.04:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:36,2:.: 2.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,6:.: 1.57:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:13,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.39:0.999:. ./.:4:20,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:25,4:.: 1.47:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:41,1:.: 2.87:1.000:. ./.:4:33,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:32,2:.: 2.01:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.90:1.000:. -chr4.1 25545723 chr4.1_025545723 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:69,85:0.53: 0.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:68,79:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,88:0.57:-0.09:1.000:0.945 0/1/1/1:4:37,122:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,136:0.60: 1.63:1.000:0.767 0/0/1/1:4:97,130:0.55: 1.85:1.000:0.976 0/1/1/1:4:31,93:0.72:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,76:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,87:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,51:0.63:-1.87:1.000:0.583 0/0/0/1:4:31,8:0.21:-2.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,26:0.16: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,80:0.44: 0.65:1.000:0.958 0/1/1/1:4:47,128:0.71: 0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:99,110:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,35:0.21: 0.40:0.999:1.000 0/1/1/1:4:50,170:0.75: 1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,101:0.49: 1.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,38:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,19:0.33:-2.39:1.000:0.919 0/1/1/1:4:34,151:0.79: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,70:0.34: 1.25:1.000:0.862 0/1/1/1:4:38,120:0.73: 0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,13:0.45:-3.11:1.000:0.981 0/1/1/1:4:29,129:0.79: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,128:0.73: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,148:0.77: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,124:0.54: 1.75:1.000:0.989 0/0/1/1:4:89,100:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,117:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,48:0.31: 0.03:1.000:0.973 0/0/1/1:4:21,24:0.52:-2.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,50:0.79:-2.29:1.000:1.000 0/0/1:3:19,11:0.36:-3.06:0.999:1.000 0/0/1/1:4:102,115:0.51: 1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,72:0.44: 0.15:1.000:0.968 0/0/1/1:4:78,84:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,68:0.45:-0.12:1.000:0.976 0/1/1/1:4:42,135:0.74: 0.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,35:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,41:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,87:0.53: 0.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,69:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,81:0.56:-0.29:1.000:0.974 0/0/1/1:4:68,69:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,96:0.53: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,46:0.42:-1.12:1.000:0.896 0/0/1/1:4:59,68:0.52:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:58,23:0.28:-1.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,67:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:135,47:0.26: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,31:0.20: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,56:0.30: 0.88:1.000:0.987 0/0/1/1:4:91,94:0.49: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,22:0.23:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,73:0.45: 0.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:70,75:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,87:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:92,28:0.24:-0.82:1.000:0.661 0/0/0/1:4:92,41:0.31:-0.49:1.000:0.977 0/0/1/1:4:66,61:0.47:-0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:55,94:0.61:-0.09:1.000:0.698 0/0/1/1:4:43,71:0.60:-0.97:1.000:0.777 0/1/1/1:4:41,123:0.72: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,57:0.40:-0.32:1.000:0.778 0/1/1/1:4:18,81:0.79:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,30:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,82:0.75:-1.17:0.999:0.999 0/0/0/1:4:112,46:0.29: 0.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:126,41:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,61:0.55:-1.14:1.000:0.979 0/0/0/1:4:88,38:0.30:-0.67:1.000:0.984 0/1/1/1:4:44,141:0.74: 0.80:1.000:0.998 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,68:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,107:0.80:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,32:0.28:-0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,151:0.78: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,146:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,38:0.35:-1.12:0.999:0.814 0/1/1/1:4:33,106:0.74:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,81:0.45: 0.53:1.000:0.982 0/0/1/1:4:70,76:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,101:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,129:0.72: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,69:0.56:-0.84:1.000:0.967 0/0/0/1:4:101,32:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,65:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,113:0.72:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:90,41:0.31:-0.54:1.000:0.971 0/0/1/1:4:74,62:0.44:-0.42:1.000:0.972 0/1/1/1:4:39,141:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,68:0.48:-0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,190:0.80: 1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,96:0.69:-0.47:1.000:0.976 0/0/1/1:4:63,67:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,36:0.31:-0.89:1.000:0.978 0/0/1/1:4:59,61:0.49:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,70:0.43: 0.13:1.000:0.951 0/0/1/1:4:54,82:0.58:-0.42:1.000:0.903 0/0/0/1:4:121,58:0.32: 0.65:1.000:0.948 0/0/0/1:4:82,28:0.26:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,135:0.74: 0.60:0.998:0.998 0/0/1/1:4:52,56:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,70:0.47:-0.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,115:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,127:0.80: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,56:0.26: 1.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,135:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,30:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:160,64:0.29: 1.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,91:0.52: 0.43:0.999:0.995 0/0/0/1:4:119,36:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,38:0.42:-1.62:1.000:0.919 0/0/0/1:4:120,37:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,80:0.58:-0.47:1.000:0.926 0/0/1/1:4:52,69:0.55:-0.79:1.000:0.979 0/0/1/1:4:70,88:0.54: 0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,78:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,119:0.71: 0.23:1.000:0.991 0/1/1/1:4:22,114:0.81:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,58:0.32: 0.63:1.000:0.944 0/0/0/1:4:133,47:0.26: 0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,115:0.72: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,71:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,128:0.73: 0.40:1.000:0.998 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,70:0.57:-0.84:1.000:0.951 0/0/1/1:4:63,54:0.45:-0.89:1.000:0.978 0/0/0/1:4:99,40:0.29:-0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:44,130:0.72: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,80:0.79:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,82:0.59:-0.47:1.000:0.857 0/0/0/1:4:112,40:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,101:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,66:0.47:-0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,81:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,101:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,82:0.52:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,68:0.43: 0.06:1.000:0.940 0/1/1/1:4:28,114:0.77:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,42:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,31:0.30:-1.27:1.000:0.982 0/0/0/1:4:169,61:0.27: 1.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,99:0.55: 0.55:1.000:0.983 0/0/1/1:4:97,113:0.52: 1.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,29:0.19:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,146:0.73: 1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,85:0.54:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:91,104:0.52: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,56:0.31: 0.60:1.000:0.965 0/1/1/1:4:8,32:0.77:-2.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,30:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,106:0.54: 0.88:1.000:0.984 0/0/1/1:4:83,110:0.55: 1.00:1.000:0.979 0/1/1/1:4:50,193:0.77: 2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,94:0.48: 0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,69:0.42: 0.18:1.000:0.917 0/1/1/1:4:61,167:0.71: 1.88:1.000:0.990 0/0/0/1:4:111,56:0.33: 0.35:1.000:0.911 0/0/1/1:4:64,67:0.49:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,26:0.23:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,65:0.35: 0.78:1.000:0.802 0/1/1/1:4:26,114:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,129:0.69: 0.68:1.000:0.976 0/0/0/1:4:130,43:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,103:0.50: 1.18:0.999:0.997 0/0/0/1:4:124,52:0.30: 0.58:1.000:0.989 0/0/1/1:4:97,86:0.46: 0.75:1.000:0.985 0/0/0/1:4:116,41:0.26: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,70:0.52:-0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,74:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,71:0.47:-0.12:1.000:0.990 0/0/0/1:4:92,25:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,33:0.22:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,129:0.56: 1.78:1.000:0.972 0/0/1/1:4:85,101:0.52: 0.83:1.000:0.994 0/0/0/1:4:100,54:0.35: 0.03:1.000:0.823 0/0/1/1:4:98,116:0.52: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,103:0.52: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,32:0.18: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,226:0.76: 3.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,100:0.59: 0.30:1.000:0.889 0/0/0/1:4:123,50:0.29: 0.50:1.000:0.992 -chr4.1 25753408 chr4.1_025753408 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:80,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:128,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:89,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:97,2:.: 1.36:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:12,2:.:-2.26:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:85,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.34:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.84:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.69:0.999:. ./.:4:70,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:93,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:57,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.02:1.000:. ./.:6:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:67,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.94:0.999:. ./.:4:80,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:101,2:.: 1.53:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:81,3:.: 0.72:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:52,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:67,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.86:0.998:. ./.:4:43,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:126,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:64,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:47,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:101,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:30,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:97,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:74,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:74,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.81:0.999:. ./.:4:92,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:103,2:.: 1.61:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.57:1.000:. -chr4.1 26004018 chr4.1_026004018 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:18,13:0.44: 0.29:1.000:0.970 0/0/0/1:4:9,3:0.28:-1.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:21,11:0.37: 0.37:1.000:0.554 0/0/0/1:4:25,6:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,24:0.72: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:30,9:0.26: 0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,6:0.55:-1.33:1.000:0.978 0/0/1/1:4:12,9:0.45:-0.52:1.000:0.980 0/0/0/1:4:25,10:0.32: 0.61:1.000:0.962 0/0/0/1:4:4,1:0.23:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-1.09:1.000:0.938 0/0/1/1:4:19,14:0.45: 0.45:1.000:0.976 0/0/0/1:4:23,8:0.29: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:31,4:0.13: 0.61:1.000:0.931 0/0/0/1:4:35,6:0.17: 1.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,9:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,12:0.29: 1.50:0.999:0.990 0/0/0/1:4:37,17:0.34: 2.15:1.000:0.845 0/0/0/1:4:44,10:0.22: 2.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.60:-0.36:1.000:0.761 0/0/0/1:4:8,3:0.30:-1.33:1.000:0.981 0/0/1/1:4:13,7:0.38:-0.60:1.000:0.524 0/0/1/1:4:20,13:0.42: 0.45:1.000:0.905 0/0/1/1:4:8,12:0.60:-0.60:1.000:0.822 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-1.57:1.000:0.791 0/0/1/1:4:15,9:0.40:-0.28:1.000:0.791 0/0/1/1:4:8,13:0.61:-0.52:1.000:0.673 0/0/0/1:4:17,3:0.17:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,17:0.36: 1.91:1.000:0.678 0/1/1/1:4:5,12:0.68:-0.84:1.000:0.959 0/0/0/1:4:35,13:0.30: 1.66:1.000:0.983 0/0/0/1:4:2,1:0.36:-1.98:1.000:0.678 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-1.41:1.000:0.923 0/1/1:3:1,3:0.72:-1.90:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.61:-1.17:1.000:0.706 0/1/1/1:4:3,17:0.82:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,5:0.22:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,10:0.35: 0.29:1.000:0.785 0/0/1/1:4:17,20:0.55: 0.77:1.000:0.982 0/0/1/1:4:22,24:0.53: 1.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,17:0.45: 1.02:1.000:0.977 0/0/0/1:4:23,10:0.33: 0.45:1.000:0.910 1/1/1/1:4:1,12:0.91:-1.17:1.000:0.934 0/0/1/1:4:18,13:0.44: 0.29:1.000:0.970 0/0/1/1:4:22,13:0.40: 0.61:1.000:0.761 0/0/1/1:4:35,27:0.46: 2.80:1.000:0.986 0/0/1/1:4:7,11:0.61:-0.76:1.000:0.742 0/0/1/1:4:16,10:0.41:-0.12:1.000:0.858 0/0/1/1:4:8,7:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,9:0.30: 0.53:1.000:0.988 0/0/1/1:4:20,13:0.42: 0.45:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,13:0.66:-0.68:1.000:0.895 0/0/0/1:4:23,11:0.35: 0.53:1.000:0.777 0/0/1/1:4:23,27:0.55: 1.83:1.000:0.982 0/1/1/1:4:6,12:0.65:-0.76:1.000:0.795 0/1/1/1:4:9,26:0.71: 0.61:1.000:0.993 0/1/1/1/1/1:6:4,15:0.75:-0.68:1.000:0.522 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.19: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-0.28:1.000:0.614 0/0/1/1:4:15,14:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,8:0.24: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,6:0.32:-0.52:1.000:0.962 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,3:0.12: 0.13:1.000:0.765 0/0/1/1:4:11,11:0.52:-0.44:0.999:0.996 0/0/1/1:4:3,5:0.62:-1.57:1.000:0.614 0/0/1/1:4:18,14:0.46: 0.37:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,8:0.52:-0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,8:0.61:-1.17:1.000:0.706 0/1/1/1:4:9,16:0.63:-0.20:1.000:0.545 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.55:-1.17:1.000:0.983 0/0/0/1:4:24,10:0.32: 0.53:1.000:0.942 0/0/0/1:4:21,9:0.33: 0.21:1.000:0.923 0/0/0/1:4:29,10:0.29: 0.94:1.000:0.992 0/0/1/1:4:10,7:0.43:-0.84:1.000:0.957 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.20:0.999:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.70:-0.44:1.000:0.985 0/0/0/1:4:14,7:0.36:-0.52:1.000:0.678 0/0/1/1:4:29,20:0.43: 1.74:1.000:0.949 0/0/1/1:4:20,13:0.42: 0.45:1.000:0.905 0/0/0/0:4:24,1:0.05:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,4:0.15: 0.37:1.000:0.980 0/1/1/1:4:5,12:0.68:-0.84:1.000:0.959 0/0/1/1:4:20,12:0.40: 0.37:1.000:0.791 0/0/0/1:4:19,5:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,16:0.48: 0.61:1.000:0.994 0/0/0/0:4:27,2:0.08: 0.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,20:0.51: 1.10:1.000:0.997 0/0/0/0:4:21,1:0.05:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,13:0.44: 0.29:1.000:0.970 0/0/1/1:4:15,16:0.53: 0.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,13:0.64:-0.60:1.000:0.650 0/0/1/1:4:8,5:0.41:-1.17:1.000:0.858 0/0/1/1:4:19,14:0.45: 0.45:1.000:0.976 0/0/1/1:4:9,5:0.38:-1.09:1.000:0.611 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,8:0.34:-0.12:1.000:0.888 0/0/0/0:4:15,1:0.07:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,8:0.32: 0.05:0.998:0.962 0/0/1/1:4:10,11:0.53:-0.52:1.000:0.990 0/0/0/1:4:24,6:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,9:0.34: 0.13:1.000:0.873 0/0/0/1:4:35,12:0.29: 1.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:31,22:0.44: 2.07:1.000:0.963 0/0/0/1:4:37,6:0.16: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,13:0.47: 0.13:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,30:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,14:0.37: 1.10:0.999:0.583 0/0/0/1:4:19,10:0.37: 0.13:1.000:0.541 0/0/0/0:4:23,2:0.09:-0.20:1.000:0.918 0/0/0/1:4:15,2:0.14:-0.84:1.000:0.954 0/1/1/1:4:5,12:0.68:-0.84:1.000:0.959 0/0/0/0:4:30,3:0.11: 0.45:1.000:0.654 0/1/1/1:4:10,20:0.65: 0.21:1.000:0.795 0/1/1/1:4:6,18:0.72:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,3:0.12: 0.13:1.000:0.765 0/1/1/1:4:8,15:0.64:-0.36:1.000:0.671 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,11:0.25: 1.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,10:0.54:-0.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:21,9:0.33: 0.21:1.000:0.923 0/1/1/1:4:5,14:0.71:-0.68:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,11:0.40: 0.13:1.000:0.824 0/0/0/1:4:22,9:0.32: 0.29:1.000:0.952 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-0.12:1.000:0.706 0/0/1/1:4:17,10:0.40:-0.03:1.000:0.751 0/0/0/1:4:35,4:0.12: 0.94:1.000:0.743 0/0/0/1:4:11,4:0.30:-1.01:1.000:0.987 0/1/1/1:4:3,10:0.73:-1.17:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,9:0.19: 2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,13:0.37: 0.85:1.000:0.575 0/0/1/1:4:9,8:0.49:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,13:0.45: 0.21:1.000:0.984 0/0/1/1:4:11,11:0.52:-0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,10:0.65:-1.01:1.000:0.795 0/0/0/1:4:27,7:0.24: 0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.44:-0.28:1.000:0.966 0/0/1/1:4:25,26:0.52: 1.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,17:0.74:-0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,19:0.40: 1.83:1.000:0.828 0/0/0/1:4:45,5:0.12: 1.83:1.000:0.669 0/0/1/1:4:12,15:0.56:-0.03:1.000:0.967 0/1/1/1:4:8,15:0.64:-0.36:1.000:0.671 0/0/0/1:4:44,17:0.31: 2.71:1.000:0.974 0/0/0/1:4:29,13:0.34: 1.18:1.000:0.878 0/1/1/1:4:1,6:0.83:-1.65:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,11:0.67:-0.92:1.000:0.909 0/0/0/1:4:19,9:0.35: 0.05:1.000:0.795 0/0/1/1:4:6,10:0.62:-0.92:1.000:0.614 0/1/1/1:4:7,17:0.68:-0.28:1.000:0.963 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-1.41:1.000:0.923 0/0/0/1:4:31,4:0.13: 0.61:1.000:0.931 0/0/0/1:4:15,4:0.24:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,24:0.56: 1.26:1.000:0.963 0/1/1/1:4:4,8:0.65:-1.25:1.000:0.795 0/0/0/1:4:24,10:0.32: 0.53:1.000:0.942 0/0/1/1:4:28,26:0.50: 2.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,11:0.33: 0.77:1.000:0.932 0/0/0/1:4:12,5:0.32:-0.84:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.33:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,11:0.63:-0.84:1.000:0.620 0/0/1/1:4:23,14:0.40: 0.77:1.000:0.817 0/0/0/1:4:21,7:0.28: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,7:0.38:-0.60:1.000:0.524 0/0/0/1:4:30,4:0.14: 0.53:1.000:0.954 0/0/0/1:4:17,6:0.29:-0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:25,18:0.44: 1.26:1.000:0.969 0/0/1/1:4:23,16:0.43: 0.94:1.000:0.954 0/1/1/1:4:4,11:0.70:-1.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:22,13:0.40: 0.61:1.000:0.761 0/0/1/1:4:16,20:0.56: 0.69:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,6:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,30:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/0:4:24,2:0.09:-0.12:1.000:0.950 0/0/0/1:4:25,8:0.28: 0.45:1.000:0.997 -chr4.1 26036161 chr4.1_026036161 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:173,140:0.44: 1.64:1.000:0.963 0/0/1/1:4:73,101:0.55:-0.80:1.000:0.984 0/0/1/1:4:113,122:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,218:0.65: 1.19:1.000:0.794 0/0/0/1:4:241,75:0.21: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,83:0.26: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,84:0.47:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,131:0.56:-0.08:1.000:0.964 0/0/0/1:4:220,59:0.19: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,63:0.63:-2.33:1.000:0.555 0/0/0/1:4:75,27:0.24:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,58:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,127:0.44: 1.08:1.000:0.971 0/1/1/1:4:72,189:0.63: 0.73:1.000:0.555 0/0/1/1:4:166,173:0.50: 2.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,78:0.29: 0.50:0.999:0.992 0/0/1/1:4:163,145:0.46: 1.56:1.000:0.990 0/0/1/1:4:178,171:0.48: 2.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,62:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,23:0.21:-2.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,179:0.78:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:251,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,150:0.63:-0.26:1.000:0.613 0/0/1/1:4:48,33:0.39:-2.44:1.000:0.725 0/1/1/1:4:8,230:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,146:0.53: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:164,117:0.40: 1.08:1.000:0.816 0/0/0/1:4:200,73:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,85:0.22: 2.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,207:0.64: 0.99:1.000:0.739 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,18:0.23:-2.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,53:0.55:-2.28:1.000:0.980 0/0/1:3:28,27:0.49:-2.90:0.999:0.719 0/0/0/1:4:160,79:0.31: 0.34:1.000:0.977 0/0/1/1:4:85,144:0.57: 0.17:1.000:0.937 0/0/1/1:4:92,111:0.53:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:149,74:0.31: 0.06:1.000:0.975 0/1/1/1:4:9,186:0.77:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:264,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,130:0.45: 1.15:1.000:0.977 0/0/1/1:4:89,90:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,52:0.22:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,124:0.51: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,74:0.21: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,126:0.53: 0.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:104,51:0.31:-1.14:1.000:0.979 0/0/0/1:4:150,47:0.21:-0.40:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:166,93:0.34: 0.69:1.000:0.873 0/0/0/1:4:129,51:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,98:0.55:-0.94:1.000:0.979 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,59:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,79:0.29: 0.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:170,50:0.20: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:116,49:0.27:-0.96:1.000:0.687 0/0/0/1:4:132,43:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,65:0.32:-0.56:1.000:0.940 0/0/1/1:4:110,144:0.54: 0.61:1.000:0.989 0/0/0/1:4:138,52:0.25:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,208:0.65: 0.90:1.000:0.833 0/0/1/1:4:147,115:0.43: 0.75:1.000:0.942 0/1/1/1:4:34,114:0.66:-1.26:1.000:0.845 0/0/0/1:4:130,46:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,138:0.61:-0.38:0.999:0.652 0/0/1/1:4:77,66:0.45:-1.35:1.000:0.983 0/0/1/1:4:118,113:0.48: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,56:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,81:0.45:-0.73:1.000:0.976 0/1/1/1:4:66,199:0.65: 0.80:1.000:0.745 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,62:0.31:-0.61:1.000:0.969 0/0/1/1:4:132,97:0.41: 0.17:1.000:0.870 0/0/0/1:4:170,78:0.29: 0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:166,122:0.41: 1.20:1.000:0.871 0/0/1/1:4:87,127:0.55:-0.10:1.000:0.977 0/0/0/1:4:99,62:0.37:-1.03:0.999:0.585 0/0/1/1:4:129,120:0.48: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,142:0.58: 0.06:1.000:0.921 0/0/0/1:4:200,59:0.20: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,124:0.51: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,112:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,87:0.45:-0.52:1.000:0.979 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,119:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,165:0.76:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,47:0.26:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,195:0.61: 1.06:1.000:0.655 0/0/1/1:4:70,116:0.57:-0.59:1.000:0.945 0/0/1/1:4:115,100:0.46:-0.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:69,174:0.62: 0.41:1.000:0.508 0/0/0/1:4:128,64:0.31:-0.49:1.000:0.972 0/0/0/1:4:121,30:0.18:-1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:193,66:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,144:0.59:-0.05:1.000:0.839 0/0/1/1:4:54,79:0.55:-1.52:1.000:0.977 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,45:0.27:-1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,159:0.73:-0.75:0.998:0.998 0/0/1/1:4:90,80:0.46:-0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:112,114:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,91:0.41:-0.05:1.000:0.841 0/0/1/1:4:123,139:0.52: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/0:4:279,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,119:0.44: 0.83:1.000:0.959 0/0/0/1:4:171,67:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,33:0.16:-0.50:0.999:0.992 0/0/0/1:4:194,65:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:153,60:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,103:0.58:-1.07:1.000:0.894 0/0/1/1:4:100,97:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,51:0.19: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,104:0.45: 0.11:1.000:0.981 0/1/1/1:4:56,221:0.67: 1.01:1.000:0.931 0/0/1/1:4:106,98:0.47:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:140,58:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,109:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:156,59:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,115:0.46: 0.48:1.000:0.986 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,77:0.40:-0.61:1.000:0.815 0/0/0/1:4:128,38:0.21:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,188:0.62: 0.78:1.000:0.539 0/1/1/1:4:9,119:0.75:-1.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,146:0.47: 1.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:161,58:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,148:0.45: 1.84:1.000:0.978 0/0/0/1:4:180,79:0.28: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,29:0.20:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,86:0.45:-0.54:1.000:0.976 0/0/1/1:4:108,120:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,51:0.27:-0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,112:0.47: 0.27:1.000:0.992 0/0/0/1:4:147,61:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,37:0.24:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,73:0.19: 2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,71:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,71:0.30:-0.03:1.000:0.983 0/0/0/1:4:121,73:0.36:-0.45:1.000:0.705 0/0/1/1:4:101,243:0.62: 2.19:1.000:0.583 0/0/1/1:4:71,108:0.56:-0.71:1.000:0.969 0/0/0/1:4:245,74:0.21: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:226,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,55:0.61:-2.47:1.000:0.657 0/0/0/1:4:107,44:0.26:-1.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:167,50:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,153:0.60: 0.17:1.000:0.819 0/0/1/1:4:175,146:0.45: 1.78:1.000:0.975 0/0/1/1:4:82,136:0.57:-0.03:1.000:0.945 0/0/0/1:4:123,36:0.20:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,213:0.77: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,70:0.32:-0.27:1.000:0.949 0/0/0/1:4:136,53:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:198,58:0.20: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:291,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,118:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,201:0.64: 0.94:1.000:0.647 0/0/0/1:4:113,55:0.30:-0.91:1.000:0.981 0/0/1/1:4:95,119:0.53:-0.10:0.999:0.992 0/0/0/0:4:201,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,55:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:162,68:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:175,51:0.20: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,113:0.56:-0.54:1.000:0.974 0/0/1/1:4:144,116:0.44: 0.71:1.000:0.960 0/0/0/1:4:113,68:0.36:-0.68:1.000:0.713 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,74:0.19: 2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,141:0.56: 0.22:1.000:0.965 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,118:0.47: 0.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:152,64:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:179,78:0.28: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,167:0.45: 2.51:1.000:0.983 0/0/1/1:4:96,133:0.55: 0.17:1.000:0.984 0/0/0/1:4:161,81:0.31: 0.39:1.000:0.970 -chr4.1 26323325 chr4.1_026323325 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,9:.: 0.70:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.80:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:39,13:.: 2.31:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:24,19:.: 1.34:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,9:.:-0.92:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.46:1.000:. ./.:4:16,8:.:-0.70:1.000:. ./.:4:11,18:.:-0.17:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:15,17:.: 0.16:0.999:. ./.:4:21,7:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,20:.: 0.26:1.000:. ./.:4:5,2:.:-2.54:1.000:. ./.:4:16,16:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:21,18:.: 0.91:1.000:. ./.:4:21,27:.: 1.88:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:13,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:25,11:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.92:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.10:1.000:. ./.:3:9,1:.:-2.21:0.999:. ./.:4:21,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:17,21:.: 0.80:1.000:. ./.:4:28,23:.: 2.20:1.000:. ./.:4:18,20:.: 0.80:1.000:. ./.:4:20,24:.: 1.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:27,9:.: 0.59:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:22,7:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,10:.: 1.13:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:23,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.17:1.000:. ./.:4:11,6:.:-1.46:1.000:. ./.:4:24,13:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.59:1.000:. ./.:4:24,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:24,4:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:14,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:21,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.37:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.70:1.000:. ./.:4:15,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,8:.: 1.67:1.000:. ./.:4:27,14:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.57:1.000:. ./.:4:19,22:.: 1.13:1.000:. ./.:4:29,6:.: 0.48:0.999:. ./.:4:10,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,9:.: 1.45:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:12,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:10,18:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,8:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,11:.: 0.91:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.27:0.999:. ./.:4:22,8:.:-0.06:1.000:. ./.:4:20,20:.: 1.02:1.000:. ./.:4:28,8:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.21:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.27:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:13,17:.:-0.06:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,21:.: 0.59:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,17:.:-0.17:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:11,17:.:-0.27:1.000:. ./.:4:10,9:.:-1.24:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,23:.: 0.80:1.000:. ./.:4:10,6:.:-1.57:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.24:1.000:. ./.:4:10,11:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,24:.: 1.34:0.998:. ./.:4:19,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,8:.:-1.03:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.06:1.000:. ./.:4:26,13:.: 0.91:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.24:1.000:. ./.:4:33,10:.: 1.34:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.27:0.999:. ./.:4:19,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,4:.:-2.00:1.000:. ./.:4:12,19:.: 0.05:1.000:. ./.:4:10,13:.:-0.81:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.17:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:23,21:.: 1.45:1.000:. ./.:4:25,11:.: 0.59:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.14:1.000:. ./.:4:7,14:.:-1.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.70:1.000:. ./.:4:8,11:.:-1.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.27:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:27,13:.: 1.02:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.03:1.000:. ./.:4:12,7:.:-1.24:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.06:1.000:. ./.:4:11,24:.: 0.48:1.000:. ./.:4:19,9:.:-0.27:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.38:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:28,21:.: 1.99:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.06:1.000:. ./.:4:14,27:.: 1.13:1.000:. ./.:4:26,9:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,12:.: 1.02:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:24,15:.: 0.91:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.10:1.000:. ./.:4:9,10:.:-1.24:1.000:. ./.:4:26,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,18:.: 0.26:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:16,18:.: 0.37:1.000:. ./.:4:15,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,18:.: 1.34:1.000:. ./.:4:25,17:.: 1.23:1.000:. ./.:4:24,17:.: 1.13:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.05:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:32,12:.: 1.45:0.999:. ./.:4:18,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:14,22:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:38,6:.: 1.45:1.000:. ./.:4:11,16:.:-0.38:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:22,15:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,13:.: 1.13:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:29,14:.: 1.34:1.000:. ./.:4:15,23:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.81:1.000:. ./.:4:40,10:.: 2.10:1.000:. -chr4.1 26535957 chr4.1_026535957 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:133,44:0.21: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,32:0.21:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,35:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,80:0.33: 1.38:1.000:0.917 0/0/1/1:4:111,104:0.44: 1.45:1.000:0.963 0/0/1/1:4:88,113:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,104:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,50:0.30: 0.03:1.000:0.988 0/1/1/1:4:4,17:0.76:-2.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.47:-2.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:85,84:0.45: 0.50:1.000:0.981 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,41:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,54:0.30: 0.21:1.000:0.984 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.07:0.999:1.000 0/0/0/1:4:127,63:0.28: 0.93:1.000:0.994 0/0/0/0:4:211,0:0.00: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,57:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,6:0.24:-2.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,46:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,64:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,97:0.52: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,51:0.29: 0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:104,45:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,130:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,68:0.27: 1.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,96:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,85:0.57:-0.12:1.000:0.957 0/0/1/1:4:68,64:0.44:-0.26:1.000:0.965 0/0/1/1:4:1,1:0.45:-2.93:1.000:0.983 0/0/0/1:4:20,10:0.29:-2.36:1.000:0.993 0/0/1:3:9,2:0.15:-2.75:0.999:0.766 0/1/1/1:4:44,129:0.70: 0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:58,92:0.57: 0.11:1.000:0.952 0/0/1/1:4:79,127:0.57: 1.26:1.000:0.945 0/0/0/1:4:110,29:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,39:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,52:0.39:-0.53:1.000:0.700 0/0/1/1:4:74,74:0.45: 0.07:1.000:0.983 0/0/1/1:4:77,78:0.46: 0.21:1.000:0.986 0/0/0/1:4:99,41:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,46:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,66:0.44:-0.18:1.000:0.966 0/0/1/1:4:97,135:0.54: 1.79:1.000:0.990 0/0/0/1:4:28,14:0.29:-2.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:94,28:0.19:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,25:0.28:-1.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,60:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,69:0.30: 1.14:1.000:0.987 0/0/0/1:4:83,49:0.32:-0.26:1.000:0.940 0/0/1/1:4:70,102:0.55: 0.56:1.000:0.982 0/0/0/1:4:111,56:0.29: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:80,21:0.18:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,106:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,76:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,74:0.54:-0.36:1.000:0.989 0/0/1/1/1/1:6:27,49:0.60:-1.41:1.000:0.637 0/0/1/1:4:56,77:0.53:-0.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:88,42:0.28:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,42:0.29:-0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,62:0.53:-0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:121,54:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,65:0.37: 0.23:1.000:0.559 0/0/0/1:4:64,35:0.31:-0.94:1.000:0.978 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,79:0.55:-0.26:0.999:0.977 0/0/0/1:4:130,45:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,65:0.40: 0.01:1.000:0.808 0/0/0/1:4:68,30:0.26:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,34:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,83:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,23:0.26:-1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,65:0.58:-0.84:1.000:0.917 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,60:0.33: 0.27:1.000:0.907 0/0/1/1:4:60,99:0.58: 0.29:1.000:0.926 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.73:0.999:1.000 0/0/1/1:4:71,56:0.39:-0.36:1.000:0.742 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,81:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,47:0.51:-1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,44:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,36:0.28:-0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:82,35:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,42:0.29:-0.44:1.000:0.989 0/0/0/1:4:63,43:0.36:-0.79:1.000:0.697 0/0/0/1:4:83,38:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,74:0.44: 0.15:1.000:0.968 0/0/0/1:4:99,37:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,81:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,64:0.46:-0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:43,50:0.49:-1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,56:0.48:-0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,63:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,46:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,40:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,38:0.27:-0.51:0.998:0.998 0/0/0/1:4:82,29:0.22:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,40:0.37:-0.98:1.000:0.615 0/0/0/1:4:120,50:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,58:0.26: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,39:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,26:0.26:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,127:0.52: 1.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,40:0.22: 0.17:0.999:1.000 0/0/0/1:4:119,38:0.20: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,63:0.45:-0.34:1.000:0.976 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,104:0.71:-0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,63:0.41:-0.12:1.000:0.845 0/0/0/1:4:106,44:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,61:0.44:-0.38:1.000:0.964 0/0/1/1:4:67,91:0.53: 0.27:1.000:0.992 0/0/0/1:4:136,63:0.27: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,58:0.45:-0.55:1.000:0.975 0/0/0/1:4:77,45:0.32:-0.47:1.000:0.948 0/1/1/1:4:34,97:0.69:-0.28:1.000:0.980 0/0/0/1:4:53,37:0.36:-1.12:1.000:0.631 0/0/1/1:4:46,48:0.46:-1.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:29,84:0.70:-0.65:1.000:0.983 0/0/0/1:4:90,29:0.21:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,66:0.29: 1.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:47,26:0.31:-1.47:1.000:0.974 0/0/1/1:4:60,62:0.46:-0.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,81:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,90:0.55: 0.13:1.000:0.980 0/0/1/1:4:61,51:0.41:-0.67:1.000:0.859 0/0/1/1:4:55,80:0.55:-0.20:1.000:0.983 0/0/1/1:4:65,66:0.46:-0.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:35,55:0.57:-1.12:1.000:0.957 0/0/0/1:4:93,23:0.17:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,106:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,17:0.18:-1.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,139:0.52: 2.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,119:0.48: 1.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,135:0.56: 1.61:1.000:0.968 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,84:0.45: 0.50:1.000:0.981 0/0/0/1:4:121,46:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,206:0.74: 2.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,59:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,9:0.48:-2.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,51:0.22: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,104:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,108:0.52: 0.93:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,222:0.75: 2.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:201,1:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,52:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,48:0.21: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,49:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,75:0.54:-0.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:117,39:0.21: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,105:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,85:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,103:0.54: 0.62:1.000:0.986 0/0/1/1:4:83,101:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.81:0.999:1.000 0/0/1/1:4:92,102:0.48: 1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,112:0.58: 0.73:1.000:0.927 0/0/0/1:4:130,64:0.28: 1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,87:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,91:0.56: 0.13:1.000:0.972 0/1/1/1:4:47,159:0.73: 1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,107:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:122,51:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,76:0.36: 0.85:1.000:0.662 0/0/1/1:4:84,145:0.59: 1.73:1.000:0.879 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,213:0.75: 2.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,43:0.22: 0.38:1.000:1.000 -chr4.1 26885628 chr4.1_026885628 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:95,34:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,62:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,88:0.74: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:129,36:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,119:0.74: 1.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,61:0.54:-0.19:1.000:0.985 0/0/0/1:4:103,30:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,58:0.52:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,17:0.41:-2.67:1.000:0.838 0/0/1/1:4:24,29:0.54:-2.27:1.000:0.987 0/0/0/1:4:94,28:0.25: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,54:0.45: 0.06:1.000:0.984 0/0/1/1:4:57,53:0.48:-0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,100:0.74: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,62:0.47: 0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:66,72:0.51: 0.77:0.999:0.996 0/0/1/1:4:86,88:0.50: 2.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,90:0.48: 2.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:106,47:0.32: 1.31:1.000:0.961 0/0/0/1:4:39,16:0.30:-2.20:1.000:0.983 0/0/1/1:4:70,63:0.47: 0.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,77:0.49: 1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,53:0.46:-0.05:1.000:0.986 0/0/1/1:4:28,23:0.45:-2.34:1.000:0.978 0/0/1/1:4:58,62:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,74:0.59: 0.27:1.000:0.839 0/0/1/1:4:60,59:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,121:0.78: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,104:0.74: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,63:0.55:-0.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:40,55:0.58:-0.77:1.000:0.932 0/1/1/1:4:11,23:0.68:-2.95:1.000:0.947 0/1/1/1:4:19,46:0.71:-1.84:1.000:0.992 0/0/1:3:15,9:0.38:-3.31:0.999:1.000 0/0/1/1:4:65,77:0.54: 0.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:62,59:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,70:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,65:0.73:-0.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,65:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,43:0.42:-0.52:1.000:0.920 0/0/1/1:4:52,65:0.55: 0.02:1.000:0.979 0/1/1/1:4:25,83:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,37:0.45:-1.23:1.000:0.978 0/0/0/1:4:97,32:0.26: 0.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,83:0.76:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,98:0.74: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,19:0.46:-2.70:1.000:0.987 0/0/0/1:4:60,20:0.26:-1.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,32:0.45:-1.63:1.000:0.978 0/0/1/1:4:66,51:0.43: 0.02:1.000:0.957 0/0/1/1:4:66,71:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,57:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:101,29:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,27:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,49:0.45:-0.34:1.000:0.984 0/1/1/1:4:32,88:0.74: 0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,70:0.58: 0.09:1.000:0.893 0/0/0/1:4:87,33:0.29: 0.13:1.000:0.993 0/0/0/0/1/1:6:68,47:0.41:-0.05:1.000:0.566 0/0/0/1:4:91,28:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,82:0.70: 0.06:1.000:0.982 0/0/0/1:4:100,25:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,77:0.70:-0.19:1.000:0.981 0/1/1/1:4:25,95:0.80: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,96:0.68: 0.92:1.000:0.946 0/1/1/1:4:13,74:0.86:-1.05:1.000:0.979 0/0/1/1:4:63,53:0.45:-0.01:1.000:0.983 0/0/1/1:4:52,52:0.49:-0.44:0.999:0.996 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,105:0.78: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,47:0.43:-0.30:1.000:0.956 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,53:0.44: 0.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:61,58:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,16:0.24:-1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,68:0.68:-0.59:1.000:0.957 0/0/1/1:4:54,41:0.43:-0.77:1.000:0.948 0/1/1/1:4:24,96:0.80: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,51:0.55:-0.87:1.000:0.981 0/0/1/1:4:56,43:0.43:-0.62:0.999:0.954 0/0/1/1:4:66,69:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,40:0.27: 1.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:34,93:0.74: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,77:0.78:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,103:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,61:0.60:-0.52:1.000:0.830 0/0/1/1:4:63,52:0.45:-0.05:1.000:0.979 0/0/1/1:4:53,55:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,63:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,48:0.44:-0.30:1.000:0.971 0/1/1/1:4:36,96:0.73: 0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,68:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,55:0.67:-1.23:1.000:0.927 0/1/1/1:4:39,86:0.69: 0.31:1.000:0.973 0/0/1/1:4:49,61:0.55:-0.23:1.000:0.980 0/0/1/1:4:52,55:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,103:0.77: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,38:0.28: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,21:0.18: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,52:0.43: 0.13:1.000:0.952 0/0/1/1:4:41,37:0.47:-1.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:87,71:0.45: 1.49:0.998:0.976 0/0/0/1:4:54,13:0.21:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,50:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,95:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,63:0.67:-0.80:1.000:0.924 0/0/1/1:4:91,89:0.49: 2.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,98:0.73: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,71:0.56: 0.31:1.000:0.961 0/0/0/1:4:128,42:0.26: 1.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,81:0.57: 0.88:0.999:0.946 0/0/1/1:4:50,61:0.54:-0.19:1.000:0.985 0/1/1/1:4:22,51:0.70:-1.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:63,63:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,65:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,33:0.43:-1.45:1.000:0.954 0/1/1/1:4:30,85:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,27:0.28:-0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,86:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,59:0.62:-0.77:1.000:0.579 0/0/1/1:4:59,66:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,74:0.54: 0.67:1.000:0.986 0/0/1/1:4:62,43:0.41:-0.41:1.000:0.867 0/1/1/1:4:34,74:0.69:-0.30:1.000:0.968 0/0/1/1:4:63,66:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,27:0.30:-0.84:1.000:0.984 0/1/1/1:4:23,60:0.73:-1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,58:0.80:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,45:0.41:-0.19:1.000:0.842 0/1/1/1:4:30,104:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,47:0.47:-0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:83,16:0.17:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:78,19:0.21:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,76:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,68:0.70:-0.66:1.000:0.981 0/1/1/1:4:25,75:0.75:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,65:0.74:-1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,82:0.79:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,59:0.47: 0.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,96:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,24:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,40:0.53:-1.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:86,81:0.48: 1.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,73:0.48: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,99:0.72: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,68:0.53: 0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,81:0.52: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,28:0.26:-0.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,121:0.77: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,65:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,11:0.20:-2.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,43:0.29: 1.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:35,89:0.72: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,75:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,94:0.56: 1.81:1.000:0.970 0/0/0/1:4:99,29:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,101:0.88:-0.01:1.000:0.838 0/0/1/1:4:75,81:0.51: 1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,60:0.41: 1.06:1.000:0.874 0/0/1/1:4:52,44:0.46:-0.73:1.000:0.984 0/0/1/1:4:43,50:0.53:-0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,69:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,59:0.78:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,70:0.54: 0.41:1.000:0.987 0/0/0/1:4:78,27:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,25:0.22: 0.24:0.999:1.000 0/0/0/1:4:100,38:0.29: 0.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:62,49:0.44:-0.19:1.000:0.967 0/0/1/1:4:51,66:0.56: 0.02:1.000:0.968 0/1/1/1:4:32,81:0.72:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,33:0.35:-0.70:1.000:0.818 0/0/1/1:4:48,47:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,47:0.52:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,48:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,88:0.70: 0.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,72:0.52: 0.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,69:0.45: 1.24:1.000:0.983 0/0/0/1:4:81,23:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,78:0.47: 1.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,66:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,90:0.51: 2.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,57:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:102,35:0.27: 0.74:1.000:0.998 -chr4.1 26927256 chr4.1_026927256 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:239,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:239,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.21:0.999:. ./.:4:389,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:395,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:398,1:.: 2.05:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:320,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.38:0.999:. ./.:4:269,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:125,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.34:1.000:. ./.:6:101,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:235,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:155,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.29:0.998:. ./.:4:161,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:388,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:507,0:.: 3.27:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.04:0.999:. ./.:4:216,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:151,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:373,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.57:0.999:. ./.:4:298,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:426,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.77:1.000:. -chr4.1 27201181 chr4.1_027201181 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:49,174:0.76: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,124:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,171:0.76: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,104:0.55: 0.18:1.000:0.983 0/1/1/1:4:57,166:0.73: 1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,51:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,85:0.73:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,109:0.53: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:90,78:0.44:-0.12:1.000:0.969 0/0/1/1:4:7,12:0.61:-3.27:1.000:0.703 0/0/1/1:4:12,19:0.59:-3.01:1.000:0.866 0/0/1/1:4:83,99:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,47:0.29:-0.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:73,93:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,103:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,147:0.72: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:149,58:0.27: 0.71:0.999:0.998 0/1/1/1:4:63,175:0.72: 1.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,143:0.53: 1.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,129:0.54: 1.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:13,16:0.53:-3.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,94:0.55:-0.18:1.000:0.984 0/0/0/1:4:138,60:0.29: 0.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,142:0.76: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,9:0.89:-3.46:1.000:0.586 0/0/1/1:4:77,93:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:156,56:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,160:0.81: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,1:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,52:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,160:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,93:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-3.48:1.000:0.746 0/0/0/1:4:20,8:0.27:-3.08:1.000:0.997 1/1/1:3:2,15:0.87:-3.31:0.999:0.921 0/0/1/1:4:74,91:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,113:0.53: 0.62:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,96:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:162,1:0.01:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,113:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,92:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,96:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,103:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,156:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,90:0.47: 0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,119:0.57: 0.60:1.000:0.958 0/0/0/1:4:156,71:0.30: 1.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:26,84:0.75:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,95:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,96:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,40:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,129:0.49: 1.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,93:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,96:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,179:0.75: 1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,70:0.32: 0.77:1.000:0.962 0/0/1/1:4:90,108:0.52: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,44:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,142:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:52,96:0.63:-0.54:1.000:0.818 0/1/1/1:4:43,141:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,151:0.80: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,49:0.29:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,120:0.47: 1.51:1.000:0.990 0/0/1/1:4:162,110:0.38: 2.08:1.000:0.621 0/0/1/1:4:43,45:0.49:-1.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,53:0.30:-0.12:1.000:0.986 0/1/1/1:4:42,164:0.78: 0.68:0.999:1.000 0/0/1/1:4:93,88:0.46: 0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,89:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,67:0.51:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,89:0.49:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,182:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,81:0.53:-0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,72:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,49:0.25: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,63:0.31: 0.45:1.000:0.978 0/0/1/1:4:82,99:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:105,42:0.27:-0.56:0.999:0.997 0/0/1/1:4:74,110:0.57: 0.22:1.000:0.935 0/0/1/1:4:65,99:0.58:-0.20:1.000:0.914 0/0/0/1:4:121,49:0.27:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,62:0.46:-0.94:1.000:0.985 0/0/0/1:4:136,37:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,71:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,43:0.29:-0.69:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,93:0.70:-0.92:1.000:0.981 0/0/1/1:4:90,81:0.45:-0.06:1.000:0.980 0/0/1/1:4:82,94:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,158:0.72: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,39:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,106:0.57: 0.11:1.000:0.951 0/0/1/1:4:70,80:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,37:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,116:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,45:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,111:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,80:0.82:-1.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,38:0.27:-0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,19:0.21:-1.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,72:0.49:-0.73:0.998:0.996 0/1/1/1:4:27,91:0.75:-1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,104:0.52: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:136,54:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:122,51:0.28:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,71:0.27: 1.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,110:0.51: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,78:0.47:-0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:101,114:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,96:0.53: 0.01:0.999:0.993 0/0/1/1:4:92,76:0.43:-0.12:1.000:0.946 0/0/1/1:4:76,81:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,43:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,69:0.46:-0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,81:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,75:0.45:-0.31:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,182:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,108:0.56: 0.24:1.000:0.968 0/0/1/1:4:69,80:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,103:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,54:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,59:0.44:-0.96:1.000:0.964 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,118:0.76:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,72:0.41:-0.18:1.000:0.889 0/0/1/1:4:51,47:0.46:-1.60:1.000:0.985 0/0/1/1:4:55,69:0.53:-1.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:114,40:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,86:0.48:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,57:0.50:-1.39:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,139:0.70: 0.39:1.000:0.989 0/0/1/1:4:122,127:0.48: 1.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,62:0.32: 0.26:1.000:0.962 0/0/0/1:4:73,38:0.32:-1.32:1.000:0.939 0/0/1/1:4:86,79:0.45:-0.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:65,82:0.53:-0.56:1.000:0.991 0/0/0/1:4:128,57:0.29: 0.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:101,28:0.21:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,139:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,76:0.51:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,173:0.73: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,65:0.27: 1.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,62:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,50:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,202:0.73: 2.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,148:0.70: 0.68:1.000:0.984 0/0/1/1:4:99,110:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,58:0.30: 0.22:1.000:0.986 0/1/1/1:4:4,13:0.75:-3.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,93:0.45: 0.45:1.000:0.983 0/0/0/1:4:149,56:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,155:0.69: 0.96:1.000:0.970 0/1/1/1:4:48,173:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,103:0.56: 0.05:1.000:0.965 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,112:0.53: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,100:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:122,37:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,89:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,130:0.62: 0.60:1.000:0.552 0/0/1/1:4:116,115:0.47: 1.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,166:0.74: 0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,125:0.74:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,98:0.55:-0.06:0.999:0.981 0/0/1/1:4:89,83:0.46:-0.03:1.000:0.987 0/0/0/1:4:137,46:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,87:0.53:-0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:107,36:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,96:0.44: 0.73:1.000:0.965 0/0/1/1:4:85,106:0.53: 0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:108,50:0.30:-0.33:1.000:0.985 0/0/1/1:4:75,96:0.54:-0.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,106:0.52: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,79:0.45:-0.18:1.000:0.984 0/0/0/1:4:136,57:0.28: 0.41:1.000:0.995 1/1/1/1:4:18,168:0.90: 0.26:1.000:0.691 0/0/1/1:4:91,118:0.54: 0.75:1.000:0.988 0/0/0/1:4:204,58:0.21: 1.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,177:0.78: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,81:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,112:0.52: 0.64:1.000:0.994 -chr4.1 27397835 chr4.1_027397835 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:287,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:204,56:.:-0.01:1.000:. ./.:4:290,77:.: 1.73:1.000:. ./.:4:119,27:.:-1.86:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:210,48:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:296,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:322,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:230,59:.: 0.46:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:264,73:.: 1.24:1.000:. ./.:4:200,43:.:-0.28:1.000:. ./.:4:237,66:.: 0.69:1.000:. ./.:4:210,64:.: 0.22:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:207,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:40,12:.:-3.38:1.000:. ./.:4:85,20:.:-2.52:1.000:. ./.:3:31,0:.:-3.72:0.999:. ./.:4:241,48:.: 0.46:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:245,68:.: 0.85:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:224,54:.: 0.29:1.000:. ./.:4:221,63:.: 0.38:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:258,73:.: 1.15:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:254,79:.: 1.18:1.000:. ./.:4:477,0:.: 3.51:1.000:. ./.:4:200,60:.:-0.01:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:186,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:278,59:.: 1.24:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:183,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,69:.:-0.20:1.000:. ./.:4:219,44:.: 0.04:1.000:. ./.:4:213,56:.: 0.14:1.000:. ./.:6:253,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:186,53:.:-0.35:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:195,58:.:-0.12:1.000:. ./.:4:326,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:245,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:107,41:.:-1.82:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:197,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:232,57:.: 0.46:1.000:. ./.:4:293,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:237,62:.: 0.63:1.000:. ./.:4:242,57:.: 0.63:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:202,55:.:-0.05:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:188,58:.:-0.23:1.000:. ./.:4:239,89:.: 1.10:1.000:. ./.:4:202,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:187,40:.:-0.54:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:181,58:.:-0.35:1.000:. ./.:4:198,54:.:-0.14:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:205,53:.:-0.04:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:192,63:.:-0.09:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:185,54:.:-0.35:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:231,57:.: 0.45:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.07:0.998:. ./.:4:234,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:182,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:214,71:.: 0.40:1.000:. ./.:4:221,66:.: 0.43:1.000:. ./.:4:219,63:.: 0.35:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:327,78:.: 2.35:1.000:. ./.:4:196,62:.:-0.04:0.999:. ./.:4:299,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:188,47:.:-0.41:1.000:. ./.:4:220,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:207,79:.: 0.42:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:228,66:.: 0.55:1.000:. ./.:4:200,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:237,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:207,69:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:161,42:.:-0.93:1.000:. ./.:4:173,60:.:-0.44:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:230,55:.: 0.40:1.000:. ./.:4:178,62:.:-0.33:1.000:. ./.:4:186,56:.:-0.30:1.000:. ./.:4:252,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:217,57:.: 0.22:1.000:. ./.:4:189,51:.:-0.33:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:296,83:.: 1.92:1.000:. ./.:4:247,69:.: 0.90:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:276,56:.: 1.16:1.000:. ./.:4:234,45:.: 0.30:1.000:. ./.:4:72,19:.:-2.75:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:241,84:.: 1.05:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:232,57:.: 0.46:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:188,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:235,49:.: 0.38:1.000:. ./.:4:284,61:.: 1.37:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.16:0.999:. ./.:4:215,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:171,45:.:-0.72:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:175,34:.:-0.83:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:170,48:.:-0.69:1.000:. ./.:4:276,73:.: 1.44:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:234,54:.: 0.45:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:391,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:215,70:.: 0.40:1.000:. ./.:4:149,47:.:-1.04:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.74:1.000:. -chr4.1 27515924 chr4.1_027515924 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:186,17:.: 0.75:1.000:. ./.:4:102,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:110,37:.:-0.29:1.000:. ./.:4:162,17:.: 0.30:1.000:. ./.:4:212,19:.: 1.28:1.000:. ./.:4:202,22:.: 1.15:1.000:. ./.:4:134,19:.:-0.18:1.000:. ./.:4:158,16:.: 0.21:1.000:. ./.:4:106,25:.:-0.59:1.000:. ./.:4:46,1:.:-2.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:189,13:.: 0.73:1.000:. ./.:4:190,14:.: 0.77:1.000:. ./.:4:113,36:.:-0.26:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.82:1.000:. ./.:4:110,63:.: 0.19:1.000:. ./.:4:188,14:.: 0.73:0.999:. ./.:4:75,64:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,41:.: 0.23:1.000:. ./.:4:314,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:37,1:.:-2.33:1.000:. ./.:4:174,16:.: 0.51:1.000:. ./.:4:226,16:.: 1.48:1.000:. ./.:4:146,24:.: 0.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:119,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:180,18:.: 0.66:1.000:. ./.:4:161,10:.: 0.16:1.000:. ./.:4:251,15:.: 1.93:1.000:. ./.:4:168,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:156,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,9:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:30,10:.:-2.29:1.000:. ./.:3:20,0:.:-2.67:0.999:. ./.:4:230,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:134,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:135,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:144,18:.:-0.01:1.000:. ./.:4:152,21:.: 0.19:1.000:. ./.:4:155,8:.: 0.01:1.000:. ./.:4:70,20:.:-1.36:1.000:. ./.:4:128,16:.:-0.35:1.000:. ./.:4:131,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:209,18:.: 1.20:1.000:. ./.:4:53,6:.:-1.94:1.000:. ./.:4:119,8:.:-0.67:1.000:. ./.:4:83,2:.:-1.45:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:199,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:168,13:.: 0.34:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:137,22:.:-0.07:1.000:. ./.:4:147,13:.:-0.05:1.000:. ./.:4:133,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:128,13:.:-0.41:1.000:. ./.:6:157,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:151,8:.:-0.07:1.000:. ./.:4:142,15:.:-0.11:1.000:. ./.:4:112,8:.:-0.80:1.000:. ./.:4:128,31:.:-0.07:1.000:. ./.:4:147,7:.:-0.16:1.000:. ./.:4:94,31:.:-0.71:1.000:. ./.:4:155,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:137,16:.:-0.18:0.999:. ./.:4:174,13:.: 0.45:1.000:. ./.:4:162,13:.: 0.23:1.000:. ./.:4:74,32:.:-1.06:1.000:. ./.:4:127,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:211,21:.: 1.30:1.000:. ./.:4:93,16:.:-1.00:1.000:. ./.:4:138,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:90,20:.:-0.99:1.000:. ./.:4:134,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:110,33:.:-0.37:1.000:. ./.:4:146,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:35,28:.:-1.86:0.999:. ./.:4:144,16:.:-0.05:1.000:. ./.:4:167,19:.: 0.44:1.000:. ./.:4:145,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:82,21:.:-1.12:1.000:. ./.:4:90,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:79,13:.:-1.32:1.000:. ./.:4:126,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:69,24:.:-1.30:1.000:. ./.:4:157,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:162,16:.: 0.29:1.000:. ./.:4:108,13:.:-0.78:1.000:. ./.:4:172,19:.: 0.53:1.000:. ./.:4:125,10:.:-0.52:1.000:. ./.:4:126,30:.:-0.13:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:106,10:.:-0.87:1.000:. ./.:4:174,18:.: 0.55:1.000:. ./.:4:185,19:.: 0.77:1.000:. ./.:4:184,15:.: 0.68:1.000:. ./.:4:165,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:94,11:.:-1.08:1.000:. ./.:4:169,13:.: 0.36:0.998:. ./.:4:106,12:.:-0.84:1.000:. ./.:4:102,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:110,26:.:-0.50:1.000:. ./.:4:112,26:.:-0.46:1.000:. ./.:4:212,21:.: 1.31:1.000:. ./.:4:114,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:137,15:.:-0.20:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:125,25:.:-0.24:0.999:. ./.:4:172,10:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,10:.:-1.73:1.000:. ./.:4:183,23:.: 0.81:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:78,18:.:-1.25:1.000:. ./.:4:154,11:.: 0.04:1.000:. ./.:4:134,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:92,31:.:-0.74:1.000:. ./.:4:126,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:202,16:.: 1.03:1.000:. ./.:4:106,21:.:-0.67:1.000:. ./.:4:153,9:.:-0.01:1.000:. ./.:4:165,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:94,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:103,6:.:-1.00:1.000:. ./.:4:127,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,15:.: 0.10:1.000:. ./.:4:107,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:102,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:114,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:131,44:.: 0.23:1.000:. ./.:4:184,9:.: 0.57:1.000:. ./.:4:127,6:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,31:.:-0.54:1.000:. ./.:4:114,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:112,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:105,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:215,23:.: 1.41:1.000:. ./.:4:310,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:163,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:151,15:.: 0.06:1.000:. ./.:4:199,12:.: 0.90:1.000:. ./.:4:190,22:.: 0.92:1.000:. ./.:4:216,22:.: 1.41:1.000:. ./.:4:172,17:.: 0.49:1.000:. ./.:4:24,10:.:-2.41:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:177,11:.: 0.47:1.000:. ./.:4:211,23:.: 1.33:1.000:. ./.:4:231,29:.: 1.82:1.000:. ./.:4:185,29:.: 0.96:1.000:. ./.:4:182,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:157,19:.: 0.25:1.000:. ./.:4:184,14:.: 0.66:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:135,10:.:-0.33:1.000:. ./.:4:164,11:.: 0.23:1.000:. ./.:4:139,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:172,22:.: 0.59:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:53,60:.:-0.93:0.999:. ./.:4:191,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:136,20:.:-0.13:1.000:. ./.:4:131,9:.:-0.42:1.000:. ./.:4:147,18:.: 0.04:1.000:. ./.:4:101,26:.:-0.67:1.000:. ./.:4:116,10:.:-0.69:1.000:. ./.:4:135,10:.:-0.33:1.000:. ./.:4:205,20:.: 1.16:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:199,17:.: 1.00:1.000:. ./.:4:128,22:.:-0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:236,17:.: 1.69:1.000:. ./.:4:240,27:.: 1.95:1.000:. ./.:4:106,20:.:-0.69:1.000:. ./.:4:117,30:.:-0.29:1.000:. -chr4.1 27869722 chr4.1_027869722 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:291,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.02:0.999:. ./.:4:211,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:136,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.54:1.000:. ./.:3:27,0:.:-3.21:0.999:. ./.:4:180,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:282,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:294,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.35:1.000:. ./.:6:178,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:242,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:272,3:.: 0.98:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:282,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:371,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.25:0.998:. ./.:4:209,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:189,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.13:0.999:. ./.:4:300,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:319,2:.: 1.75:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:299,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:379,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:258,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:185,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:352,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.98:1.000:. -chr4.1 28156130 chr4.1_028156130 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,113:.: 1.10:1.000:. ./.:4:124,40:.:-0.37:1.000:. ./.:4:77,96:.:-0.23:1.000:. ./.:4:85,94:.:-0.14:1.000:. ./.:4:231,82:.: 1.89:1.000:. ./.:4:176,67:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,76:.: 0.51:1.000:. ./.:4:152,36:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,46:.:-0.48:1.000:. ./.:4:73,37:.:-1.19:1.000:. ./.:4:21,21:.:-2.22:1.000:. ./.:4:161,79:.: 0.78:1.000:. ./.:4:120,76:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,71:.:-0.58:1.000:. ./.:4:94,89:.:-0.08:1.000:. ./.:4:71,39:.:-1.19:1.000:. ./.:4:109,40:.:-0.60:0.999:. ./.:4:109,66:.:-0.20:1.000:. ./.:4:124,95:.: 0.46:1.000:. ./.:4:239,133:.: 2.78:1.000:. ./.:4:31,60:.:-1.47:1.000:. ./.:4:127,103:.: 0.63:1.000:. ./.:4:186,127:.: 1.89:1.000:. ./.:4:120,59:.:-0.14:1.000:. ./.:4:15,11:.:-2.46:1.000:. ./.:4:110,32:.:-0.70:1.000:. ./.:4:148,52:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,69:.: 0.66:1.000:. ./.:4:173,123:.: 1.63:1.000:. ./.:4:170,40:.: 0.33:1.000:. ./.:4:127,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:146,82:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,32:.:-1.87:1.000:. ./.:4:49,13:.:-1.91:1.000:. ./.:3:14,5:.:-2.57:0.999:. ./.:4:205,82:.: 1.49:1.000:. ./.:4:172,38:.: 0.33:1.000:. ./.:4:166,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:119,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:123,46:.:-0.29:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.76:1.000:. ./.:4:160,53:.: 0.37:1.000:. ./.:4:126,67:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,63:.:-1.02:1.000:. ./.:4:165,41:.: 0.27:1.000:. ./.:4:126,47:.:-0.23:1.000:. ./.:4:182,100:.: 1.42:1.000:. ./.:4:23,31:.:-2.04:1.000:. ./.:4:159,50:.: 0.31:1.000:. ./.:4:38,25:.:-1.90:1.000:. ./.:4:159,40:.: 0.16:1.000:. ./.:4:132,76:.: 0.30:1.000:. ./.:4:102,54:.:-0.49:1.000:. ./.:4:201,49:.: 0.93:1.000:. ./.:4:137,52:.: 0.01:1.000:. ./.:4:119,29:.:-0.61:1.000:. ./.:4:110,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:159,63:.: 0.51:1.000:. ./.:4:170,42:.: 0.36:1.000:. ./.:6:122,65:.:-0.02:1.000:. ./.:4:194,105:.: 1.68:1.000:. ./.:4:143,70:.: 0.37:1.000:. ./.:4:134,42:.:-0.19:1.000:. ./.:4:107,70:.:-0.17:1.000:. ./.:4:103,106:.: 0.31:1.000:. ./.:4:136,47:.:-0.08:1.000:. ./.:4:58,37:.:-1.41:1.000:. ./.:4:124,70:.: 0.09:1.000:. ./.:4:130,73:.: 0.22:0.999:. ./.:4:164,72:.: 0.72:1.000:. ./.:4:96,72:.:-0.31:1.000:. ./.:4:51,31:.:-1.61:1.000:. ./.:4:183,78:.: 1.10:1.000:. ./.:4:157,84:.: 0.80:1.000:. ./.:4:103,39:.:-0.70:1.000:. ./.:4:141,42:.:-0.08:1.000:. ./.:4:90,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:119,68:.:-0.02:1.000:. ./.:4:109,75:.:-0.07:1.000:. ./.:4:141,26:.:-0.32:1.000:. ./.:4:68,51:.:-1.05:0.999:. ./.:4:135,42:.:-0.17:1.000:. ./.:4:178,87:.: 1.16:1.000:. ./.:4:138,36:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,52:.:-1.22:1.000:. ./.:4:103,69:.:-0.25:1.000:. ./.:4:65,37:.:-1.31:1.000:. ./.:4:129,60:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,44:.:-1.17:1.000:. ./.:4:138,83:.: 0.49:1.000:. ./.:4:122,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:108,59:.:-0.32:1.000:. ./.:4:122,42:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,40:.:-1.13:1.000:. ./.:4:115,59:.:-0.22:1.000:. ./.:4:125,54:.:-0.14:1.000:. ./.:4:153,80:.: 0.68:1.000:. ./.:4:131,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:155,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:155,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:123,56:.:-0.14:1.000:. ./.:4:132,70:.: 0.21:1.000:. ./.:4:83,54:.:-0.78:1.000:. ./.:4:134,73:.: 0.28:0.998:. ./.:4:99,30:.:-0.90:1.000:. ./.:4:61,32:.:-1.44:1.000:. ./.:4:95,42:.:-0.78:1.000:. ./.:4:122,95:.: 0.43:1.000:. ./.:4:183,133:.: 1.93:1.000:. ./.:4:67,58:.:-0.96:1.000:. ./.:4:94,77:.:-0.26:1.000:. ./.:4:297,92:.: 3.04:1.000:. ./.:4:119,45:.:-0.37:0.999:. ./.:4:117,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,25:.:-2.23:1.000:. ./.:4:106,97:.: 0.22:1.000:. ./.:4:139,44:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,42:.:-1.47:1.000:. ./.:4:99,55:.:-0.52:1.000:. ./.:4:95,60:.:-0.51:1.000:. ./.:4:72,57:.:-0.90:1.000:. ./.:4:152,60:.: 0.36:1.000:. ./.:4:179,37:.: 0.42:1.000:. ./.:4:203,124:.: 2.10:1.000:. ./.:4:135,54:.: 0.01:1.000:. ./.:4:153,77:.: 0.63:1.000:. ./.:4:152,88:.: 0.78:1.000:. ./.:4:114,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:48,21:.:-1.81:1.000:. ./.:4:104,52:.:-0.49:1.000:. ./.:4:103,60:.:-0.38:1.000:. ./.:4:100,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:87,61:.:-0.61:1.000:. ./.:4:72,25:.:-1.38:1.000:. ./.:4:154,71:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,77:.:-0.29:1.000:. ./.:4:128,60:.:-0.01:1.000:. ./.:4:140,68:.: 0.30:1.000:. ./.:4:89,56:.:-0.66:1.000:. ./.:4:74,32:.:-1.25:1.000:. ./.:4:193,57:.: 0.93:1.000:. ./.:4:103,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:197,68:.: 1.16:1.000:. ./.:4:77,57:.:-0.82:1.000:. ./.:4:146,128:.: 1.30:1.000:. ./.:4:298,105:.: 3.25:1.000:. ./.:4:165,99:.: 1.15:1.000:. ./.:4:113,82:.: 0.10:1.000:. ./.:4:166,44:.: 0.33:1.000:. ./.:4:118,41:.:-0.44:1.000:. ./.:4:197,113:.: 1.84:1.000:. ./.:4:159,46:.: 0.25:1.000:. ./.:4:60,18:.:-1.67:1.000:. ./.:4:165,67:.: 0.66:1.000:. ./.:4:162,36:.: 0.15:1.000:. ./.:4:155,57:.: 0.36:1.000:. ./.:4:238,58:.: 1.63:1.000:. ./.:4:156,76:.: 0.66:1.000:. ./.:4:164,105:.: 1.22:1.000:. ./.:4:152,45:.: 0.13:1.000:. ./.:4:101,76:.:-0.17:1.000:. ./.:4:166,41:.: 0.28:1.000:. ./.:4:113,63:.:-0.19:1.000:. ./.:4:146,104:.: 0.93:1.000:. ./.:4:67,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:136,59:.: 0.10:1.000:. ./.:4:148,67:.: 0.40:1.000:. ./.:4:121,95:.: 0.42:0.999:. ./.:4:181,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:232,73:.: 1.77:1.000:. ./.:4:116,48:.:-0.37:1.000:. ./.:4:117,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:135,89:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,46:.:-1.04:1.000:. ./.:4:64,41:.:-1.26:1.000:. ./.:4:107,81:.:-0.01:1.000:. ./.:4:172,89:.: 1.10:1.000:. ./.:4:211,78:.: 1.52:1.000:. ./.:4:138,82:.: 0.48:1.000:. ./.:4:123,87:.: 0.33:1.000:. ./.:4:225,71:.: 1.63:1.000:. ./.:4:146,88:.: 0.69:1.000:. ./.:4:243,75:.: 1.96:1.000:. ./.:4:98,65:.:-0.38:1.000:. ./.:4:170,95:.: 1.16:1.000:. -chr4.1 28435465 chr4.1_028435465 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:82,278:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.49:1.000:. ./.:4:187,205:.: 0.88:1.000:. ./.:4:77,268:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,320:.: 1.15:1.000:. ./.:4:104,352:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,285:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,379:.: 0.68:1.000:. ./.:4:178,214:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,200:.:-2.10:1.000:. ./.:4:79,102:.:-2.40:1.000:. ./.:4:99,295:.: 0.92:1.000:. ./.:4:185,198:.: 0.74:1.000:. ./.:4:182,205:.: 0.81:1.000:. ./.:4:73,260:.:-0.03:1.000:. ./.:4:195,214:.: 1.15:1.000:. ./.:4:170,193:.: 0.43:0.999:. ./.:4:266,100:.: 0.48:1.000:. ./.:4:218,238:.: 1.88:1.000:. ./.:4:86,342:.: 1.44:1.000:. ./.:4:92,100:.:-2.23:1.000:. ./.:4:0,370:.: 0.54:1.000:. ./.:4:208,227:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,408:.: 1.13:1.000:. ./.:4:75,69:.:-2.97:1.000:. ./.:4:0,417:.: 1.27:1.000:. ./.:4:1,367:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,356:.: 0.32:1.000:. ./.:4:102,343:.: 1.71:1.000:. ./.:4:102,304:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1,394:.: 0.93:1.000:. ./.:4:160,164:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,101:.:-3.11:1.000:. ./.:4:55,154:.:-1.96:1.000:. ./.:3:38,146:.:-2.35:0.999:. ./.:4:0,381:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,369:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,421:.: 1.34:1.000:. ./.:4:70,238:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,417:.: 1.27:1.000:. ./.:4:182,176:.: 0.36:1.000:. ./.:4:162,184:.: 0.17:1.000:. ./.:4:77,263:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,153:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,283:.: 0.43:1.000:. ./.:4:79,260:.: 0.06:1.000:. ./.:4:95,322:.: 1.27:1.000:. ./.:4:80,84:.:-2.66:1.000:. ./.:4:84,223:.:-0.44:1.000:. ./.:4:113,120:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.69:1.000:. ./.:4:204,200:.: 1.07:1.000:. ./.:4:141,158:.:-0.56:1.000:. ./.:4:76,294:.: 0.54:1.000:. ./.:4:76,235:.:-0.38:1.000:. ./.:4:162,153:.:-0.31:1.000:. ./.:4:84,221:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.50:1.000:. ./.:4:75,255:.:-0.08:1.000:. ./.:6:87,191:.:-0.89:1.000:. ./.:4:73,209:.:-0.83:1.000:. ./.:4:71,265:.: 0.01:1.000:. ./.:4:90,274:.: 0.45:1.000:. ./.:4:82,219:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,292:.: 0.68:1.000:. ./.:4:82,321:.: 1.06:1.000:. ./.:4:73,244:.:-0.28:1.000:. ./.:4:170,186:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,328:.:-0.11:0.999:. ./.:4:1,301:.:-0.52:1.000:. ./.:4:111,310:.: 1.34:1.000:. ./.:4:130,130:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.90:1.000:. ./.:4:1,348:.: 0.22:1.000:. ./.:4:179,174:.: 0.28:1.000:. ./.:4:70,253:.:-0.19:1.000:. ./.:4:73,234:.:-0.44:1.000:. ./.:4:171,159:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,260:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,375:.: 0.62:1.000:. ./.:4:142,143:.:-0.78:0.999:. ./.:4:0,333:.:-0.03:1.000:. ./.:4:82,298:.: 0.70:1.000:. ./.:4:84,221:.:-0.47:1.000:. ./.:4:83,261:.: 0.14:1.000:. ./.:4:99,281:.: 0.70:1.000:. ./.:4:133,131:.:-1.11:1.000:. ./.:4:140,171:.:-0.38:1.000:. ./.:4:167,171:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.31:1.000:. ./.:4:150,156:.:-0.45:1.000:. ./.:4:80,220:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,344:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,209:.:-0.92:1.000:. ./.:4:92,276:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,355:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,293:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,269:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,271:.: 0.25:1.000:. ./.:4:62,269:.:-0.07:1.000:. ./.:4:85,266:.: 0.25:1.000:. ./.:4:184,176:.: 0.39:1.000:. ./.:4:119,117:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,328:.:-0.11:0.998:. ./.:4:58,194:.:-1.29:1.000:. ./.:4:127,146:.:-0.97:1.000:. ./.:4:82,213:.:-0.63:1.000:. ./.:4:85,282:.: 0.50:1.000:. ./.:4:200,208:.: 1.13:1.000:. ./.:4:160,172:.:-0.05:1.000:. ./.:4:175,147:.:-0.21:1.000:. ./.:4:111,359:.: 2.10:1.000:. ./.:4:151,164:.:-0.31:0.999:. ./.:4:164,179:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,85:.:-2.35:1.000:. ./.:4:169,186:.: 0.31:1.000:. ./.:4:3,329:.:-0.05:1.000:. ./.:4:128,123:.:-1.31:1.000:. ./.:4:81,204:.:-0.78:1.000:. ./.:4:63,228:.:-0.69:1.000:. ./.:4:66,247:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,347:.: 0.20:1.000:. ./.:4:210,209:.: 1.30:1.000:. ./.:4:2,313:.:-0.31:1.000:. ./.:4:93,250:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.47:1.000:. ./.:4:68,240:.:-0.42:1.000:. ./.:4:63,181:.:-1.42:1.000:. ./.:4:62,156:.:-1.82:1.000:. ./.:4:141,142:.:-0.81:1.000:. ./.:4:93,304:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,225:.:-1.71:1.000:. ./.:4:82,255:.: 0.03:1.000:. ./.:4:78,224:.:-0.52:1.000:. ./.:4:203,235:.: 1.60:1.000:. ./.:4:88,263:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,219:.:-0.42:1.000:. ./.:4:75,185:.:-1.17:1.000:. ./.:4:62,205:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,292:.:-0.67:1.000:. ./.:4:80,231:.:-0.38:1.000:. ./.:4:77,259:.: 0.01:1.000:. ./.:4:105,115:.:-1.79:1.000:. ./.:4:190,211:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,477:.: 2.21:1.000:. ./.:4:78,298:.: 0.64:1.000:. ./.:4:178,170:.: 0.20:1.000:. ./.:4:97,262:.: 0.37:1.000:. ./.:4:82,271:.: 0.28:1.000:. ./.:4:92,333:.: 1.40:1.000:. ./.:4:157,196:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,203:.:-2.06:1.000:. ./.:4:71,211:.:-0.83:1.000:. ./.:4:64,299:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,361:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,414:.: 1.23:1.000:. ./.:4:84,326:.: 1.16:1.000:. ./.:4:63,238:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,432:.: 1.51:1.000:. ./.:4:163,162:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.69:1.000:. ./.:4:159,196:.: 0.31:1.000:. ./.:4:163,161:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,236:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.28:1.000:. ./.:4:85,295:.: 0.70:1.000:. ./.:4:88,255:.: 0.12:0.999:. ./.:4:77,275:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,360:.: 0.39:1.000:. ./.:4:140,179:.:-0.25:1.000:. ./.:4:81,182:.:-1.12:1.000:. ./.:4:82,224:.:-0.45:1.000:. ./.:4:83,254:.: 0.03:1.000:. ./.:4:142,127:.:-1.03:1.000:. ./.:4:133,163:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,349:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,406:.: 1.10:1.000:. ./.:4:169,211:.: 0.70:1.000:. ./.:4:74,267:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,382:.: 0.74:1.000:. ./.:4:217,203:.: 1.32:1.000:. ./.:4:1,479:.: 2.25:1.000:. ./.:4:158,180:.: 0.04:1.000:. ./.:4:93,265:.: 0.36:1.000:. -chr4.1 28514073 chr4.1_028514073 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:121,38:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,29:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,30:0.21: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,125:0.75: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,75:0.46: 1.02:1.000:0.987 0/1/1/1:4:51,144:0.74: 1.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,18:0.27:-1.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,79:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,93:0.55: 1.05:1.000:0.976 0/0/1/1:4:36,24:0.42:-2.16:1.000:0.930 0/0/0/1:4:38,18:0.34:-2.27:1.000:0.835 0/0/1/1:4:67,48:0.44:-0.61:1.000:0.970 0/1/1/1:4:28,109:0.79: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,61:0.45: 0.21:1.000:0.978 0/0/1/1:4:75,74:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,29:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,144:0.75: 1.53:0.999:0.999 0/0/1/1:4:93,90:0.52: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,87:0.48: 1.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:98,110:0.55: 2.01:1.000:0.981 0/0/1/1:4:33,33:0.52:-1.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,92:0.55: 1.02:1.000:0.978 0/1/1/1:4:46,120:0.72: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,31:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.30:-2.44:1.000:0.982 0/0/1/1:4:87,65:0.45: 0.43:1.000:0.982 0/1/1/1:4:52,124:0.71: 1.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:119,34:0.24: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,175:0.99: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,122:0.72: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:122,41:0.27: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,56:0.42: 0.09:1.000:0.930 0/0/0/1:4:44,9:0.19:-2.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,50:0.76:-1.99:1.000:1.000 0/1/1:3:18,18:0.52:-2.83:0.999:0.820 0/0/1/1:4:91,63:0.43: 0.49:1.000:0.955 0/0/1/1:4:78,87:0.55: 0.80:1.000:0.982 0/0/1/1:4:99,78:0.47: 1.14:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,142:0.99: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,68:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,72:0.57:-0.19:1.000:0.943 0/0/1/1:4:86,64:0.45: 0.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:98,78:0.47: 1.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:91,27:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,50:0.49:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,77:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,146:0.74: 1.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,20:0.14: 0.43:1.000:0.979 0/0/1/1:4:78,69:0.49: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,55:0.48:-0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,95:0.83:-0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,93:0.54: 1.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,52:0.46:-0.50:1.000:0.989 0/0/1/1:4:94,89:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,32:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,94:0.73:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,62:0.52:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,80:0.72:-0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:91,32:0.28:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:69,30:0.33:-1.06:1.000:0.920 0/0/0/1:4:100,24:0.21:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,35:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,111:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,85:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,90:0.56: 0.83:1.000:0.966 0/0/1/1:4:37,24:0.42:-2.13:1.000:0.904 0/1/1/1:4:36,113:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,25:0.21:-0.19:0.999:1.000 0/0/1/1:4:66,67:0.53:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,67:0.51: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,34:0.46:-1.62:1.000:0.984 0/0/1/1:4:73,60:0.48:-0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,43:0.27: 0.97:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,67:0.55:-0.30:1.000:0.978 0/0/1/1:4:58,45:0.46:-0.95:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,95:0.78:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,102:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,69:0.44: 0.83:1.000:0.967 0/0/1/1:4:43,61:0.60:-0.92:0.999:0.785 0/0/1/1:4:76,45:0.40:-0.44:1.000:0.754 0/0/1/1:4:68,70:0.53: 0.04:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,92:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,55:0.46:-0.30:1.000:0.988 0/1/1/1:4:53,100:0.66: 0.46:1.000:0.876 0/0/1/1:4:58,39:0.43:-1.12:1.000:0.937 0/1/1/1:4:33,58:0.65:-1.28:1.000:0.759 0/0/0/1:4:95,28:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,73:0.54: 0.09:1.000:0.986 0/0/1/1:4:66,39:0.40:-0.89:1.000:0.749 1/1/1/1:4:1,127:0.99:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,42:0.29: 0.54:1.000:0.991 0/1/1/1:4:26,81:0.75:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,69:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:62,59:0.51:-0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,60:0.73:-1.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,28:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,87:0.77:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,75:0.49: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,16:0.24:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,92:0.71:-0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,65:0.80:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,64:0.51:-0.13:0.998:0.996 0/0/0/1:4:69,16:0.21:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,74:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,67:0.68:-1.06:1.000:0.958 0/1/1/1:4:26,78:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,132:0.73: 1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,39:0.28: 0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,55:0.45:-0.22:1.000:0.981 0/0/1/1:4:108,95:0.49: 1.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,56:0.45:-0.13:0.999:0.979 0/0/1/1:4:87,60:0.43: 0.29:1.000:0.953 0/0/1/1:4:48,29:0.40:-1.68:1.000:0.797 0/1/1/1:4:42,86:0.68:-0.24:1.000:0.947 0/0/1/1:4:62,56:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,55:0.54:-0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:56,34:0.40:-1.31:1.000:0.807 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,58:0.41: 0.35:1.000:0.884 0/0/1/1:4:61,42:0.43:-0.95:1.000:0.952 0/0/1/1:4:70,83:0.56: 0.46:1.000:0.965 0/1/1/1:4:41,83:0.68:-0.36:1.000:0.940 0/0/1/1:4:57,58:0.53:-0.61:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,38:0.30: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:53,52:0.52:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,39:0.41:-1.03:1.000:0.888 0/0/1/1:4:47,44:0.51:-1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,67:0.76:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,90:0.57: 0.77:1.000:0.955 0/0/1/1:4:41,45:0.54:-1.43:1.000:0.985 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,34:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,94:0.53: 1.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,111:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,85:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,39:0.41:-1.03:1.000:0.888 0/0/1/1:4:64,68:0.54:-0.13:1.000:0.990 0/1/1/1:4:36,112:0.75: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,80:0.80:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,34:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,47:0.50:-1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:143,58:0.31: 1.81:1.000:0.971 0/1/1/1:4:49,121:0.71: 0.94:1.000:0.993 0/1/1/1:4:55,128:0.70: 1.30:1.000:0.987 0/1/1/1:4:46,94:0.68: 0.09:1.000:0.946 0/0/0/1:4:132,62:0.34: 1.61:1.000:0.849 0/0/0/1:4:112,27:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,87:0.47: 1.70:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,113:0.70: 0.71:1.000:0.986 0/0/0/1:4:44,19:0.32:-2.07:1.000:0.940 0/0/1/1:4:43,30:0.44:-1.79:1.000:0.959 0/1/1/1:4:51,129:0.72: 1.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:124,43:0.28: 0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,50:0.28: 1.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,74:0.47: 0.88:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,115:0.99:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,77:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,73:0.55: 0.04:1.000:0.981 0/1/1/1:4:25,99:0.80:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,64:0.56:-0.52:1.000:0.966 0/0/1/1:4:97,53:0.38: 0.38:1.000:0.532 0/0/1/1:4:108,89:0.48: 1.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:114,43:0.30: 0.57:1.000:0.988 0/0/0/1:4:132,35:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,66:0.41: 0.94:0.999:0.878 0/0/1/1:4:78,70:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,93:0.73:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,64:0.53:-0.33:1.000:0.991 0/1/1/1:4:42,109:0.72: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,52:0.43:-0.27:1.000:0.956 0/0/1/1:4:66,61:0.51:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,72:0.69:-0.89:1.000:0.973 0/0/1/1:4:75,58:0.46:-0.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:104,102:0.52: 1.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,87:0.48: 1.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,120:0.74: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/0:4:134,14:0.10: 0.32:1.000:0.703 0/0/1/1:4:80,72:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,155:0.75: 1.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,37:0.24: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,57:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,72:0.45: 0.88:1.000:0.983 -chr4.1 29147572 chr4.1_029147572 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:118,54:0.39: 0.70:1.000:0.672 0/0/1/1:4:105,58:0.41: 0.53:1.000:0.889 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,10:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,11:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,15:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,33:0.36:-0.16:1.000:0.737 0/0/0/1:4:117,8:0.17:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/0:4:229,5:0.06: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,1:0.08:-1.92:1.000:0.979 0/0/0/0:4:32,1:0.08:-1.90:1.000:0.986 0/0/1/1:4:82,138:0.57: 1.59:1.000:0.947 0/0/0/1:4:133,14:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:202,3:0.04: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,2:0.03: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 2.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,5:0.08: 0.66:0.999:0.991 0/0/0/0:4:181,6:0.09: 0.98:1.000:0.970 0/0/0/0:4:266,4:0.04: 2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,91:0.53: 0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:24,6:0.32:-1.95:1.000:0.961 0/0/0/1:4:103,6:0.15:-0.48:1.000:0.984 0/0/0/1:4:116,15:0.26:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:129,49:0.36: 0.81:1.000:0.640 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,16:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,18:0.32:-0.93:1.000:0.942 0/0/1/1:4:110,60:0.41: 0.66:1.000:0.880 0/0/0/1:4:71,14:0.29:-0.93:1.000:0.989 0/0/1/1:4:75,86:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:173,88:0.40: 2.36:1.000:0.814 0/0/0/1:4:140,56:0.37: 1.15:1.000:0.556 0/0/1/1:4:16,11:0.45:-2.01:1.000:0.976 0/0/0/0:4:36,1:0.07:-1.82:1.000:0.997 0/0/0:3:25,1:0.10:-2.03:0.999:0.998 0/0/1/1:4:50,77:0.56:-0.14:1.000:0.969 0/0/1/1:4:62,58:0.49:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,59:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,5:0.16:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:172,10:0.15: 0.88:1.000:0.984 0/0/1/1:4:116,50:0.38: 0.59:1.000:0.573 0/0/0/1:4:115,43:0.36: 0.44:1.000:0.664 0/0/1/1:4:118,63:0.41: 0.87:1.000:0.862 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,7:0.15:-0.12:1.000:0.983 0/0/0/1:4:113,43:0.36: 0.40:1.000:0.637 0/0/1/1:4:77,55:0.45:-0.05:1.000:0.982 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,8:0.18:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:145,6:0.11: 0.31:1.000:0.626 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,4:0.06: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,2:0.05:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,39:0.41:-0.46:1.000:0.885 0/0/0/0:4:162,5:0.08: 0.60:1.000:0.988 0/0/0/0:4:114,4:0.09:-0.31:1.000:0.938 0/0/1/1:4:97,42:0.38: 0.08:1.000:0.581 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,54:0.39: 0.73:1.000:0.645 0/0/0/0/1/1:6:91,16:0.29:-0.52:1.000:0.799 0/0/0/1:4:115,47:0.37: 0.51:1.000:0.519 0/0/0/1:4:38,10:0.32:-1.62:1.000:0.948 0/0/0/0:4:146,2:0.04: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,7:0.15:-0.14:1.000:0.985 0/0/0/0:4:162,4:0.06: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,51:0.45:-0.18:1.000:0.977 0/0/0/1:4:121,6:0.13:-0.14:1.000:0.874 0/0/0/1:4:125,12:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,44:0.36: 0.55:0.999:0.693 0/0/1/1:4:49,44:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:109,40:0.36: 0.27:1.000:0.691 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,56:0.45:-0.01:1.000:0.983 0/0/0/1:4:119,46:0.37: 0.57:1.000:0.612 0/0/0/1:4:105,5:0.12:-0.46:1.000:0.799 0/0/0/1:4:93,6:0.16:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:124,2:0.04:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,8:0.23:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,9:0.19:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,8:0.16:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,35:0.32: 0.72:0.999:0.958 0/0/1/1:4:58,47:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/0/0:4:107,3:0.07:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,54:0.49:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,3:0.08:-0.74:1.000:0.976 0/0/0/0:4:109,1:0.02:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,9:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/0:4:151,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,7:0.19:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,38:0.41:-0.46:1.000:0.851 0/0/0/1:4:44,8:0.29:-1.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:119,48:0.37: 0.60:1.000:0.541 0/0/0/1:4:84,5:0.15:-0.85:1.000:0.988 0/0/0/0:4:149,3:0.05: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,38:0.43:-0.68:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,62:0.54:-0.52:1.000:0.984 0/0/1/1:4:60,55:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,12:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:117,2:0.05:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,5:0.12:-0.50:1.000:0.838 0/0/0/1:4:67,7:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,7:0.18:-0.59:0.998:0.999 0/0/1/1:4:80,38:0.39:-0.31:1.000:0.727 0/0/0/1:4:138,8:0.15: 0.21:1.000:0.983 0/0/0/1:4:81,5:0.16:-0.91:1.000:0.993 0/0/0/1:4:120,8:0.17:-0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:126,13:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,30:0.36:-0.39:1.000:0.728 0/0/1/1:4:69,108:0.56: 0.79:1.000:0.966 0/0/0/0:4:142,4:0.07: 0.21:0.999:0.996 0/0/1/1:4:92,50:0.41: 0.14:1.000:0.877 0/0/0/0:4:138,2:0.04: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,11:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,28:0.43:-1.13:1.000:0.943 0/0/0/0:4:110,2:0.05:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,40:0.37: 0.14:1.000:0.589 0/0/0/1:4:120,34:0.33: 0.36:1.000:0.921 0/0/0/0:4:168,3:0.05: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,26:0.43:-1.24:1.000:0.949 0/0/1/1:4:49,50:0.51:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,12:0.19: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,32:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,3:0.17:-1.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,43:0.39: 0.01:1.000:0.704 0/0/1/1:4:57,90:0.56: 0.23:1.000:0.964 0/0/0/1:4:75,30:0.37:-0.55:1.000:0.556 0/0/0/1:4:83,26:0.34:-0.48:1.000:0.862 0/0/0/1:4:84,9:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,8:0.11: 1.09:1.000:0.519 0/0/0/1:4:61,4:0.16:-1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,29:0.29: 0.98:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,50:0.39: 0.44:1.000:0.690 0/0/0/0:4:247,9:0.09: 2.27:1.000:0.902 0/0/1/1:4:50,55:0.52:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,14:0.28:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/0:4:121,1:0.02:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,30:0.35:-0.33:1.000:0.772 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,6:0.16:-0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,51:0.36: 1.01:1.000:0.681 0/0/0/0:4:103,3:0.08:-0.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:209,64:0.34: 2.58:1.000:0.879 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,14:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,8:0.19:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,62:0.38: 1.26:1.000:0.619 0/0/0/0:4:147,4:0.07: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:183,92:0.40: 2.62:1.000:0.801 0/0/0/1:4:117,12:0.25:-0.11:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:52,36:0.45:-0.87:1.000:0.978 0/0/0/1:4:131,9:0.17: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,56:0.40: 0.59:1.000:0.815 0/0/0/1:4:148,55:0.36: 1.28:1.000:0.673 0/0/0/1:4:123,13:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,10:0.30:-1.43:1.000:0.985 0/0/0/1:4:131,11:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,4:0.06: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,42:0.75:-1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,36:0.36:-0.05:1.000:0.660 0/0/1/1:4:113,59:0.41: 0.70:1.000:0.841 0/0/0/0:4:199,8:0.10: 1.35:1.000:0.712 0/0/1/1:4:121,55:0.39: 0.77:1.000:0.661 0/0/0/1:4:139,45:0.34: 0.92:1.000:0.836 0/0/0/1:4:169,11:0.16: 0.85:0.999:0.997 0/0/1/1:4:54,57:0.51:-0.44:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:172,2:0.03: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,51:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,9:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,5:0.08: 0.77:1.000:0.994 0/0/0/1:4:91,9:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,73:0.42: 1.28:1.000:0.901 0/0/1/1:4:175,91:0.41: 2.45:1.000:0.837 0/0/1/1:4:66,64:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,25:0.29: 0.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:203,55:0.33: 2.30:1.000:0.939 0/0/1/1:4:62,63:0.51:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,21:0.26: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,62:0.37: 1.52:1.000:0.545 0/0/0/1:4:150,7:0.12: 0.42:1.000:0.752 0/0/0/1:4:140,56:0.37: 1.15:1.000:0.556 -chr4.1 29295252 chr4.1_029295252 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:182,171:0.47: 0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:73,168:0.67:-0.89:1.000:0.930 0/0/1/1:4:148,175:0.52: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:225,85:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:263,100:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:278,91:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,151:0.68:-1.28:1.000:0.962 0/0/1/1:4:137,150:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:219,77:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,68:0.50:-2.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,30:0.20:-2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,163:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/0:4:289,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,77:0.20: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,142:0.45:-0.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:152,164:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:352,0:0.00: 0.64:0.999:1.000 0/0/1/1:4:171,175:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,110:0.28: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:249,106:0.29: 0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,38:0.23:-2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,156:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:425,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,237:0.78:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,64:0.55:-2.67:1.000:0.983 0/0/1/1:4:181,161:0.45: 0.51:1.000:0.983 0/0/0/1:4:234,85:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,208:0.73:-0.42:1.000:0.998 0/0/0/0:4:423,1:0.00: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,92:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,276:0.74: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:226,59:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,37:0.52:-3.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:82,43:0.33:-2.50:1.000:0.923 0/0/1:3:36,25:0.39:-3.39:0.999:0.999 0/0/1/1:4:154,145:0.47:-0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:163,172:0.49: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,141:0.47:-0.19:1.000:0.990 0/0/0/0:4:294,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,179:0.47: 0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:189,70:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:219,88:0.27: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,178:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,158:0.51:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:248,97:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:132,172:0.55:-0.02:1.000:0.984 0/0/0/1:4:280,101:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:342,395:0.52: 5.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:209,78:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,81:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,68:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,104:0.25: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,86:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:282,107:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,151:0.46: 0.12:1.000:0.989 0/0/0/0:4:364,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,147:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:287,99:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,167:0.53:-0.02:1.000:0.992 0/0/0/1/1/1:6:142,113:0.43:-0.70:1.000:0.572 0/0/1/1:4:153,156:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:277,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,185:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:217,79:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,181:0.47: 0.88:1.000:0.993 0/0/0/1:4:212,125:0.36: 0.44:1.000:0.736 0/0/1/1:4:135,170:0.54:-0.01:1.000:0.989 0/0/0/0:4:275,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,233:0.68: 0.33:0.999:0.961 0/0/1/1:4:117,126:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,191:0.51: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:276,89:0.23: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,180:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/1/1/1:4:86,234:0.71: 0.20:1.000:0.989 0/0/0/0:4:327,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,84:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,160:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/0:4:283,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,67:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,202:0.52: 0.98:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,128:0.52:-0.96:0.999:0.994 0/0/1/1:4:186,163:0.45: 0.60:1.000:0.979 0/0/0/1:4:241,101:0.28: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:188,81:0.29:-0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:186,212:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,101:0.30: 0.24:1.000:0.986 0/0/0/1:4:189,74:0.27:-0.59:1.000:0.998 0/0/0/0:4:254,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,158:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,159:0.53:-0.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:230,69:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:277,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,296:0.72: 1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,54:0.22:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,195:0.52: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,159:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:161,72:0.30:-1.00:1.000:0.989 0/1/1/1:4:58,198:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:233,90:0.27: 0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:235,84:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:166,122:0.41:-0.24:1.000:0.846 0/0/0/0:4:366,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,168:0.47: 0.55:0.998:0.992 0/0/1/1:4:136,143:0.49:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:191,81:0.28:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:213,81:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,71:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:409,0:0.00: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,142:0.45:-0.05:1.000:0.982 0/0/0/1:4:194,69:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:289,98:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,83:0.29:-0.44:0.999:0.992 0/0/0/1:4:269,93:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,46:0.20:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:345,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,146:0.48:-0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:205,73:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,169:0.53: 0.02:1.000:0.992 0/1/1/1:4:61,221:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,154:0.47: 0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:147,148:0.48:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,160:0.47: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/0:4:324,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,152:0.49:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:376,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,252:0.73: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,118:0.51:-1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:179,60:0.24:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,134:0.53:-0.87:1.000:0.992 0/0/0/0:4:280,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,127:0.44:-0.42:1.000:0.974 0/0/1/1:4:105,87:0.44:-1.57:1.000:0.960 0/1/1/1:4:71,237:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,119:0.44:-0.64:1.000:0.970 0/0/0/1:4:298,91:0.22: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,76:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,65:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,137:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,153:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:270,79:0.22: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,69:0.22:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,148:0.52:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,56:0.24:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,210:0.49: 1.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:330,112:0.24: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,83:0.28:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:281,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,178:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,136:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,188:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/0:4:253,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,67:0.50:-2.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,57:0.24:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,100:0.26: 0.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,279:0.73: 0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:115,276:0.68: 1.19:1.000:0.956 0/0/0/1:4:237,98:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:264,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,169:0.48: 0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:208,65:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,80:0.32:-0.87:1.000:0.965 0/0/0/1:4:180,54:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,98:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,161:0.46: 0.45:1.000:0.987 0/1/1/1:4:72,255:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,145:0.53:-0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:136,147:0.50:-0.31:0.999:0.997 0/0/0/1:4:213,68:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,73:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,68:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,59:0.25:-1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,65:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,142:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:274,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,61:0.27:-1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:223,166:0.41: 1.16:1.000:0.866 0/0/1/1:4:179,193:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/0:4:350,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,200:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,197:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/0:4:452,0:0.00: 2.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,312:0.69: 1.78:1.000:0.978 0/0/0/1:4:172,61:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,141:0.42: 0.20:1.000:0.928 -chr4.1 29482028 chr4.1_029482028 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,1:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.57:0.999:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:6:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.04:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.22:0.999:. ./.:4:3,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:0.998:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.63:0.999:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:11,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:20,0:.: 3.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:11,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:16,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.28:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.75:1.000:. -chr4.1 29720070 chr4.1_029720070 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,4:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:1,16:.: 3.52:1.000:. ./.:4:5,6:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.11:0.999:. ./.:4:2,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,11:.: 2.53:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:6,6:.: 1.87:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.55:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:4,8:.: 1.87:1.000:. ./.:3:0,6:.:-0.11:0.999:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.88:1.000:. ./.:4:7,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,7:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,9:.: 1.54:1.000:. ./.:4:4,13:.: 3.52:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,9:.: 1.21:1.000:. ./.:6:3,6:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,9:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:3,4:.: 0.22:0.999:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,13:.: 2.20:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,7:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:0.999:. ./.:4:1,7:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,9:.: 2.53:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,7:.: 0.88:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,11:.: 2.53:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,9:.: 1.54:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.88:1.000:. ./.:4:6,6:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.11:0.998:. ./.:4:0,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:0.999:. ./.:4:5,4:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:6,6:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:2,6:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,7:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,6:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.55:0.996:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:3,8:.: 1.54:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,8:.: 1.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:2,6:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,6:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:6,6:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:0.999:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.55:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.44:1.000:. -chr4.1 29804419 chr4.1_029804419 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:28,2:0.10: 0.08:1.000:0.715 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,2:0.12:-0.21:1.000:0.839 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,2:0.16:-0.50:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,5:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.34: 0.43:1.000:0.877 0/0/1/1:4:28,12:0.45: 0.66:1.000:0.981 0/0/0/1:4:25,6:0.30: 0.14:1.000:0.987 0/0/0/0:4:21,1:0.07:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/0:4:26,1:0.06:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,3:0.21:-0.38:0.999:1.000 0/0/0/0:4:44,3:0.10: 1.07:1.000:0.822 0/0/1/1:4:38,13:0.39: 1.30:1.000:0.647 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,17:0.53: 0.78:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,12:0.42: 0.83:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.51:-0.67:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,18:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,5:0.31:-0.21:1.000:0.978 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:9,2:0.28:-1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,5:0.36:-0.44:1.000:0.668 0/0/1/1:4:25,10:0.43: 0.37:1.000:0.949 1/1/1:3:0,10:1.00:-1.08:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,7:0.34: 0.14:1.000:0.842 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,23:0.53: 1.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,22:0.51: 1.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,13:0.43: 1.01:1.000:0.936 0/0/0/1:4:30,8:0.32: 0.54:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.31: 0.60:1.000:0.967 0/0/1/1:4:30,12:0.43: 0.78:1.000:0.949 0/0/0/1:4:20,6:0.35:-0.15:1.000:0.782 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,16:0.53: 0.60:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,12:0.47: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,10:0.41: 0.49:1.000:0.854 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,15:0.47: 1.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:35,6:0.23: 0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:5,18:0.67:-0.33:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,11:0.46: 0.43:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,9:0.41: 0.25:1.000:0.876 0/0/0/1:4:35,3:0.12: 0.54:1.000:0.812 0/0/1/1:4:23,9:0.42: 0.20:1.000:0.930 0/0/0/0:4:29,1:0.05: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,23:0.53: 1.53:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.25:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,11:0.34: 1.18:1.000:0.856 0/0/1/1:4:19,9:0.48:-0.04:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,8:0.22: 1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,5:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,26:0.53: 1.88:1.000:0.990 0/0/0/1:4:47,13:0.33: 1.82:1.000:0.918 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,7:0.14: 2.86:0.999:0.965 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,5:0.28:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,5:0.27: 0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,19:0.47: 1.88:1.000:0.992 0/0/0/1:4:33,8:0.30: 0.72:1.000:0.986 0/0/1/1:4:31,17:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,7:0.24: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.68:-1.37:1.000:0.939 0/0/1/1:4:24,16:0.52: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,14:0.52: 0.43:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,1:0.07:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,7:0.24: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,32:0.54: 2.46:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,25:0.55: 1.47:1.000:0.981 0/0/1/1:4:38,23:0.52: 1.88:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.27:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,7:0.38:-0.04:1.000:0.557 0/0/0/1:4:22,6:0.33:-0.04:1.000:0.932 0/0/0/1:4:33,9:0.33: 0.78:1.000:0.932 0/0/1/1:4:37,15:0.43: 1.36:1.000:0.958 0/0/0/1:4:27,4:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,16:0.49: 1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,15:0.35: 2.11:0.999:0.782 0/0/1/1:4:35,18:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,9:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,27:0.53: 2.23:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,15:0.45: 1.24:1.000:0.981 0/0/0/1:4:37,11:0.35: 1.12:1.000:0.803 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,1:0.05: 0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,6:0.26: 0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,17:0.51: 1.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,14:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,17:0.53: 0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:27,12:0.46: 0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:20,22:0.57: 0.78:1.000:0.943 0/0/0/1:4:29,5:0.23: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.20:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,9:0.33: 0.78:1.000:0.932 0/0/1/1:4:26,14:0.51: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,14:0.37: 1.70:1.000:0.608 0/0/0/1:4:38,7:0.24: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,22:0.52: 1.65:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,14:0.50: 0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,17:0.52: 0.89:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,5:0.17: 1.07:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,5:0.19: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,10:0.35: 0.83:1.000:0.757 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,1:0.04: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,5:0.31:-0.21:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,6:0.31: 0.08:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,11:0.42: 0.66:1.000:0.893 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,10:0.40: 0.54:1.000:0.774 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,10:0.41: 0.49:1.000:0.854 0/0/0/1:4:37,10:0.32: 1.07:1.000:0.939 0/0/1/1:4:9,4:0.46:-0.91:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,3:0.15: 0.14:0.999:0.988 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,7:0.42:-0.21:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,2:0.09: 0.37:1.000:0.955 0/0/1/1:4:23,12:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,5:0.33:-0.33:1.000:0.914 0/0/0/0:4:26,1:0.06:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,8:0.37: 0.25:1.000:0.589 0/0/1/1:4:7,5:0.53:-0.96:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,8:0.27: 0.95:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,2:0.10: 0.14:1.000:0.799 0/0/1/1:4:41,14:0.39: 1.53:1.000:0.640 -chr4.1 30010594 chr4.1_030010594 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:13,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:27,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.79:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:3,0:.:-1.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.12:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.79:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.37:0.999:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.61:0.998:. ./.:4:8,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:33,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:25,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.79:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:0,1:.:-1.79:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. -chr4.1 30160090 chr4.1_030160090 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:87,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.78:0.999:. ./.:4:61,28:.: 1.03:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-2.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:151,0:.: 3.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.32:1.000:. ./.:6:16,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:36,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:35,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:0.998:. ./.:4:43,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.75:0.999:. ./.:4:84,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:0.996:. ./.:4:21,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:120,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:58,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:126,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.80:1.000:. -chr4.1 30353399 chr4.1_030353399 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:50,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:66,4:.: 0.79:1.000:. ./.:4:62,6:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,3:.: 0.65:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:49,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,5:.: 1.20:1.000:. ./.:4:49,5:.: 0.07:0.999:. ./.:4:56,4:.: 0.34:1.000:. ./.:4:61,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:90,3:.: 1.83:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:52,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:71,5:.: 1.06:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.24:1.000:. ./.:4:34,5:.:-0.61:1.000:. ./.:4:105,7:.: 2.69:1.000:. ./.:4:87,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:61,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:71,4:.: 1.02:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.06:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.02:0.999:. ./.:4:71,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:75,3:.: 1.15:1.000:. ./.:4:98,2:.: 2.15:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:52,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:36,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:51,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:59,5:.: 0.52:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:75,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.16:1.000:. ./.:6:38,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:64,5:.: 0.74:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.52:1.000:. ./.:4:50,4:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.39:1.000:. ./.:4:54,9:.: 0.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,3:.: 0.07:0.999:. ./.:4:23,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:17,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:21,6:.:-1.16:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.02:1.000:. ./.:4:26,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:50,5:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,7:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.70:0.999:. ./.:4:48,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:52,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:47,4:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:34,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:38,3:.:-0.52:1.000:. ./.:4:58,2:.: 0.34:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:58,3:.: 0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:38,7:.:-0.34:0.998:. ./.:4:58,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:44,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:53,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,6:.: 1.83:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.57:0.999:. ./.:4:66,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:23,6:.:-1.07:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:44,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:47,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:55,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:62,3:.: 0.56:1.000:. ./.:4:60,4:.: 0.52:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:57,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,3:.: 0.47:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.98:0.996:. ./.:4:71,4:.: 1.02:1.000:. ./.:4:82,3:.: 1.47:1.000:. ./.:4:55,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:70,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:44,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:59,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:24,2:.:-1.20:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:90,3:.: 1.83:1.000:. ./.:4:46,8:.: 0.07:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:56,6:.: 0.43:1.000:. ./.:4:51,4:.: 0.11:1.000:. ./.:4:102,1:.: 2.28:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:67,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:75,6:.: 1.29:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:49,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:39,6:.:-0.34:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:59,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:80,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:79,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:75,3:.: 1.15:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:63,2:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.97:0.999:. ./.:4:64,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:53,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:50,4:.: 0.07:1.000:. ./.:4:55,5:.: 0.34:1.000:. ./.:4:28,2:.:-1.02:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:96,3:.: 2.10:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:44,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,6:.: 0.70:1.000:. ./.:4:93,3:.: 1.97:1.000:. ./.:4:76,3:.: 1.20:1.000:. ./.:4:96,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:30,9:.:-0.61:1.000:. -chr4.1 30573945 chr4.1_030573945 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,264:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.54:1.000:. ./.:4:9,188:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,148:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,283:.: 1.84:1.000:. ./.:4:16,212:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,121:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,242:.: 1.09:1.000:. ./.:4:5,135:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,23:.:-2.92:1.000:. ./.:4:2,26:.:-2.83:1.000:. ./.:4:11,162:.:-0.18:1.000:. ./.:4:11,155:.:-0.30:1.000:. ./.:4:9,198:.: 0.45:1.000:. ./.:4:6,176:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,194:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,189:.: 0.26:0.999:. ./.:4:19,205:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1,225:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.25:1.000:. ./.:4:1,14:.:-3.07:1.000:. ./.:4:0,246:.: 1.16:1.000:. ./.:4:6,212:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1,3:.:-3.27:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,239:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.76:1.000:. ./.:4:8,232:.: 1.05:1.000:. ./.:4:6,165:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.76:1.000:. ./.:4:13,177:.: 0.14:1.000:. ./.:4:7,10:.:-3.03:1.000:. ./.:4:3,22:.:-2.88:1.000:. ./.:3:0,13:.:-3.10:0.999:. ./.:4:0,294:.: 2.04:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,281:.: 1.80:1.000:. ./.:4:5,143:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.65:1.000:. ./.:4:6,178:.: 0.03:1.000:. ./.:4:12,166:.:-0.08:1.000:. ./.:4:13,137:.:-0.60:1.000:. ./.:4:6,170:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.17:1.000:. ./.:4:10,149:.:-0.43:1.000:. ./.:4:11,207:.: 0.65:1.000:. ./.:4:4,179:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.38:1.000:. ./.:4:10,129:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,207:.: 0.61:1.000:. ./.:4:4,95:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.21:1.000:. ./.:4:10,141:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,152:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.01:1.000:. ./.:6:0,174:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.76:1.000:. ./.:4:8,170:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,113:.:-1.14:1.000:. ./.:4:9,186:.: 0.23:1.000:. ./.:4:13,189:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,90:.:-1.62:1.000:. ./.:4:12,143:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.61:0.999:. ./.:4:0,202:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,170:.:-0.01:1.000:. ./.:4:2,108:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,256:.: 1.34:1.000:. ./.:4:11,101:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.06:1.000:. ./.:4:6,132:.:-0.82:1.000:. ./.:4:10,166:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,178:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,93:.:-1.38:0.999:. ./.:4:0,187:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.81:1.000:. ./.:4:9,148:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,120:.:-1.07:1.000:. ./.:4:8,179:.: 0.08:1.000:. ./.:4:9,89:.:-1.55:1.000:. ./.:4:4,125:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,139:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,115:.:-1.04:1.000:. ./.:4:9,147:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.83:1.000:. ./.:4:6,129:.:-0.87:1.000:. ./.:4:8,166:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,149:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,148:.:-0.38:1.000:. ./.:4:10,109:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,219:.: 0.67:0.998:. ./.:4:1,157:.:-0.45:1.000:. ./.:4:12,148:.:-0.41:1.000:. ./.:4:10,134:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,159:.:-0.32:1.000:. ./.:4:12,189:.: 0.34:1.000:. ./.:4:12,185:.: 0.26:1.000:. ./.:4:5,153:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,295:.: 2.06:1.000:. ./.:4:13,181:.: 0.21:0.999:. ./.:4:11,197:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,137:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,187:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,135:.:-0.63:1.000:. ./.:4:10,152:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,142:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,207:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,200:.: 0.32:1.000:. ./.:4:11,167:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.14:1.000:. ./.:4:9,115:.:-1.07:1.000:. ./.:4:7,115:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,148:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,156:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,173:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.87:0.996:. ./.:4:0,224:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,211:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,177:.: 0.04:1.000:. ./.:4:4,142:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,164:.:-0.16:1.000:. ./.:4:4,134:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.23:1.000:. ./.:4:8,145:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,105:.:-1.29:1.000:. ./.:4:5,189:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,277:.: 1.73:1.000:. ./.:4:10,174:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,190:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,229:.: 1.20:1.000:. ./.:4:7,189:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,20:.:-2.97:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.56:1.000:. ./.:4:9,181:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,244:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,293:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.76:1.000:. ./.:4:9,195:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,283:.: 1.84:1.000:. ./.:4:8,176:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.07:1.000:. ./.:4:6,154:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,211:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,231:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,259:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.19:1.000:. ./.:4:14,191:.: 0.41:0.999:. ./.:4:0,259:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.63:1.000:. ./.:4:7,165:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,119:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.50:1.000:. ./.:4:11,160:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,135:.:-0.74:1.000:. ./.:4:9,145:.:-0.52:1.000:. ./.:4:11,204:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.89:1.000:. ./.:4:15,193:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.25:1.000:. ./.:4:15,264:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,308:.: 2.29:1.000:. ./.:4:13,147:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,174:.: 0.06:1.000:. -chr4.1 30794163 chr4.1_030794163 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.93:0.999:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.02:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.97:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:105,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.47:1.000:. ./.:6:46,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:72,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.10:0.999:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,4:.: 0.57:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.10:0.998:. ./.:4:37,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.54:0.999:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:81,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.05:0.996:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.20:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:80,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:51,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.18:1.000:. -chr4.1 30978059 chr4.1_030978059 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.16:0.999:. ./.:4:50,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.09:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.73:0.999:. ./.:4:99,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.70:1.000:. ./.:6:86,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.90:0.999:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:32,1:.:-1.91:0.999:. ./.:4:96,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.12:0.998:. ./.:4:75,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:66,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.47:0.996:. ./.:4:80,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:100,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:165,0:.: 3.24:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.55:1.000:. -chr4.1 31081364 chr4.1_031081364 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,28:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.: 0.60:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.01:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,17:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,38:.: 2.16:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.:-2.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,33:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.:-0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.: 1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.07:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,17:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.58:0.998:. ./.:4:0,11:.:-1.36:1.000:. ./.:4:2,22:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,38:.: 2.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,9:.:-1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,18:.:-0.32:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.: 0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr4.1 31199915 chr4.1_031199915 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,123:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,94:0.55:-0.29:1.000:0.978 0/0/0/1:4:101,40:0.29:-0.87:1.000:0.992 0/1/1/1:4:64,162:0.68: 1.61:1.000:0.961 0/0/0/1:4:136,53:0.29: 0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,91:0.70:-1.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:76,103:0.54: 0.24:1.000:0.986 0/1/1/1:4:31,137:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,43:0.47:-2.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,40:0.41:-2.24:1.000:0.861 0/0/1/1:4:79,72:0.45:-0.58:1.000:0.983 0/0/1/1:4:76,82:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,137:0.78:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,92:0.54:-0.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:64,80:0.52:-0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,106:0.53: 0.50:0.999:0.992 0/0/0/1:4:96,44:0.31:-0.90:1.000:0.965 0/1/1/1:4:37,168:0.79: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,194:0.70: 2.68:1.000:0.988 0/1/1/1:4:19,113:0.83:-1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,79:0.43: 0.21:1.000:0.933 0/0/1/1:4:90,101:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,106:0.70:-0.78:1.000:0.987 0/1/1/1:4:11,43:0.76:-3.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,106:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,133:0.72: 0.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,134:0.71: 0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,115:0.53: 0.94:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,134:0.81:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,160:0.75: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,104:0.74:-1.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,35:0.74:-3.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,75:0.86:-2.50:1.000:0.952 0/0/1:3:18,13:0.40:-4.07:0.999:0.998 0/0/1/1:4:81,92:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,91:0.52:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,88:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,96:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,86:0.45: 0.35:1.000:0.977 0/1/1/1:4:34,147:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,153:0.73: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,105:0.54: 0.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,104:0.56: 0.15:1.000:0.969 0/0/1/1:4:115,107:0.46: 1.49:1.000:0.986 0/0/1/1:4:89,92:0.48: 0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,177:0.79: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,24:0.55:-3.78:1.000:0.977 0/1/1/1:4:47,146:0.72: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,44:0.27:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,116:0.71:-0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:146,69:0.32: 1.28:1.000:0.952 0/0/0/1:4:104,47:0.31:-0.58:1.000:0.970 0/1/1/1:4:49,157:0.73: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,92:0.47: 0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,79:0.46:-0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:81,98:0.52: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,166:0.70: 1.58:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:91,66:0.41:-0.40:1.000:0.603 0/0/1/1:4:94,96:0.48: 0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,92:0.55:-0.40:1.000:0.976 0/0/1/1:4:112,93:0.43: 0.99:1.000:0.955 0/0/0/1:4:132,53:0.29: 0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:100,80:0.43: 0.27:1.000:0.934 0/0/1/1:4:111,92:0.43: 0.94:1.000:0.954 0/0/1/1:4:52,62:0.51:-1.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,106:0.54: 0.38:1.000:0.985 0/1/1/1:4:40,159:0.77: 0.82:0.999:1.000 0/0/1/1:4:82,82:0.47:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,103:0.53: 0.32:1.000:0.991 0/1/1/1:4:27,108:0.77:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,116:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,149:0.69: 1.02:1.000:0.973 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,137:0.72: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,77:0.48:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,103:0.53: 0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,161:0.78: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,116:0.49: 1.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,40:0.31:-1.25:0.999:0.968 1/1/1/1:4:0,169:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,169:0.67: 1.98:1.000:0.935 0/1/1/1:4:36,113:0.72:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,90:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,148:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,120:0.77:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,78:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,99:0.56:-0.14:1.000:0.960 0/0/1/1:4:75,81:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,136:0.82:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,103:0.56: 0.06:1.000:0.962 0/1/1/1:4:42,161:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,34:0.29:-1.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,111:0.56: 0.50:1.000:0.970 0/0/1/1:4:102,119:0.51: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,150:0.73: 0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,121:0.70:-0.20:1.000:0.988 0/1/1/1:4:37,166:0.79: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,119:0.69:-0.20:1.000:0.976 0/0/1/1:4:89,88:0.47: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,117:0.55: 0.91:1.000:0.983 0/0/1/1:4:61,97:0.58:-0.38:1.000:0.908 0/0/1/1:4:91,116:0.53: 1.05:0.998:0.993 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,132:0.78:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,140:0.85:-0.29:1.000:0.989 0/1/1/1:4:24,147:0.84: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,132:0.56: 1.49:1.000:0.963 0/0/1/1:4:82,108:0.54: 0.56:1.000:0.990 0/1/1/1:4:23,145:0.84:-0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,165:0.67: 1.90:1.000:0.902 0/1/1/1:4:39,161:0.77: 0.85:0.999:1.000 0/1/1/1:4:33,150:0.79: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,117:0.80:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,106:0.51: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,81:0.45:-0.03:1.000:0.983 0/1/1/1:4:27,122:0.79:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,104:0.60:-0.20:1.000:0.779 0/1/1/1:4:33,144:0.78: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,85:0.52:-0.52:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,199:1.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,123:0.51: 1.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,77:0.51:-0.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,107:0.59: 0.00:1.000:0.844 0/1/1/1:4:54,156:0.71: 1.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,102:0.60:-0.26:1.000:0.816 0/1/1/1:4:26,135:0.81:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,79:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,108:0.57: 0.24:1.000:0.944 0/0/1/1:4:90,89:0.47: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:62,73:0.51:-1.05:0.996:0.996 0/1/1/1:4:49,136:0.70: 0.41:1.000:0.986 0/0/1/1:4:78,76:0.47:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,107:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,152:0.84: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,55:0.33:-0.08:1.000:0.936 0/0/1/1:4:67,93:0.55:-0.32:1.000:0.981 0/0/1/1:4:89,89:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,124:0.67: 0.18:1.000:0.909 0/1/1/1:4:28,115:0.77:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,81:0.47:-0.20:1.000:0.991 0/0/0/1:4:106,41:0.28:-0.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,117:0.60: 0.41:1.000:0.793 0/0/1/1:4:62,117:0.62: 0.24:1.000:0.560 0/0/0/1:4:131,45:0.26: 0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,89:0.50:-0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,74:0.45:-0.46:1.000:0.983 0/0/1/1:4:95,114:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,92:0.50: 0.06:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-2.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,108:0.71:-0.72:1.000:0.990 0/0/0/1:4:128,40:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,144:0.70: 0.76:1.000:0.983 0/1/1/1:4:56,173:0.72: 1.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,124:0.69: 0.03:1.000:0.969 0/0/1/1:4:66,104:0.58:-0.03:1.000:0.917 0/0/1/1:4:82,106:0.53: 0.50:1.000:0.992 0/0/0/1:4:106,42:0.29:-0.67:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,107:0.75:-0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,107:0.78:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,143:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,66:0.47:-1.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:46,140:0.72: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,82:0.46:-0.05:1.000:0.988 0/0/1/1:4:65,111:0.60: 0.15:0.999:0.808 0/1/1/1:4:42,130:0.72: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,113:0.70:-0.52:1.000:0.989 0/0/0/1:4:97,42:0.30:-0.93:1.000:0.981 0/1/1/1:4:24,123:0.81:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,143:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,85:0.57:-0.90:1.000:0.933 0/0/1/1:4:66,87:0.54:-0.52:1.000:0.989 0/1/1/1:4:25,124:0.81:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,99:0.56:-0.08:1.000:0.972 0/0/1/1:4:92,100:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,112:0.59: 0.24:1.000:0.845 0/1/1/1:4:48,140:0.71: 0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:105,94:0.45: 0.82:1.000:0.979 0/0/1/1:4:103,116:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,179:0.72: 1.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,117:0.76:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,92:0.54:-0.26:1.000:0.990 -chr4.1 31266068 chr4.1_031266068 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:165,48:.: 1.18:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:155,57:.: 1.16:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:127,38:.: 0.20:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:148,61:.: 1.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:9,10:.:-2.79:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:139,46:.: 0.61:1.000:. ./.:4:147,58:.: 1.02:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:144,61:.: 1.02:1.000:. ./.:4:161,62:.: 1.39:0.999:. ./.:4:223,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:156,65:.: 1.35:1.000:. ./.:4:175,67:.: 1.78:1.000:. ./.:4:9,2:.:-2.95:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:138,50:.: 0.67:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:10,1:.:-2.95:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:231,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:118,54:.: 0.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.81:1.000:. ./.:3:7,0:.:-3.04:0.999:. ./.:4:184,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:124,42:.: 0.22:1.000:. ./.:4:104,39:.:-0.25:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:108,33:.:-0.29:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:83,21:.:-1.05:1.000:. ./.:4:98,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:74,33:.:-0.99:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:137,53:.: 0.71:1.000:. ./.:4:114,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:111,56:.: 0.24:1.000:. ./.:4:134,39:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,53:.: 0.51:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:116,40:.: 0.02:1.000:. ./.:6:93,39:.:-0.48:1.000:. ./.:4:121,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:103,30:.:-0.46:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:127,45:.: 0.34:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.48:0.998:. ./.:4:154,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:58,17:.:-1.64:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:111,32:.:-0.25:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:109,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:136,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:136,57:.: 0.77:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,34:.:-0.82:1.000:. ./.:4:87,24:.:-0.91:1.000:. ./.:4:88,30:.:-0.76:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:101,32:.:-0.46:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:87,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:132,44:.: 0.43:1.000:. ./.:4:64,25:.:-1.36:1.000:. ./.:4:109,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:101,23:.:-0.64:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.78:0.998:. ./.:4:74,27:.:-1.11:1.000:. ./.:4:108,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:147,49:.: 0.84:1.000:. ./.:4:151,59:.: 1.12:1.000:. ./.:4:108,35:.:-0.25:1.000:. ./.:4:185,56:.: 1.76:1.000:. ./.:4:110,41:.:-0.09:0.999:. ./.:4:106,44:.:-0.11:1.000:. ./.:4:64,25:.:-1.36:1.000:. ./.:4:96,35:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:73,31:.:-1.05:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:106,56:.: 0.14:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:174,64:.: 1.70:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:145,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:111,32:.:-0.25:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.52:0.996:. ./.:4:137,30:.: 0.24:1.000:. ./.:4:140,43:.: 0.57:1.000:. ./.:4:182,57:.: 1.72:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:138,48:.: 0.63:1.000:. ./.:4:82,34:.:-0.80:1.000:. ./.:4:135,42:.: 0.45:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:127,33:.: 0.10:1.000:. ./.:4:153,51:.: 1.00:1.000:. ./.:4:103,54:.: 0.04:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:176,57:.: 1.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:103,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:124,54:.: 0.47:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:131,57:.: 0.67:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:126,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:120,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:123,54:.: 0.45:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.71:0.999:. ./.:4:103,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:116,54:.: 0.30:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:113,60:.: 0.36:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,29:.:-0.84:1.000:. ./.:4:122,45:.: 0.24:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:156,55:.: 1.14:1.000:. ./.:4:158,42:.: 0.92:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:173,68:.: 1.76:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:110,39:.:-0.13:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.45:1.000:. -chr4.1 31608586 chr4.1_031608586 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:29,21:0.46:-0.32:1.000:0.985 0/0/1/1:4:26,31:0.54:-0.03:1.000:0.987 0/0/0/1:4:60,20:0.30: 0.90:1.000:0.986 0/0/0/1:4:42,20:0.37: 0.17:1.000:0.610 0/0/0/1:4:61,7:0.16: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,25:0.25: 2.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,16:0.44:-0.72:1.000:0.964 0/0/0/1:4:68,23:0.30: 1.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:35,36:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:38,13:0.30:-0.28:1.000:0.981 0/0/0/1:4:36,15:0.34:-0.28:1.000:0.869 0/0/1/1:4:24,24:0.52:-0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,17:0.29: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,20:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,24:0.42: 0.21:1.000:0.915 0/0/0/1:4:81,40:0.37: 2.56:1.000:0.513 0/0/0/1:4:62,30:0.37: 1.38:0.999:0.568 0/0/1/1:4:74,42:0.40: 2.36:1.000:0.815 0/0/1/1:4:38,45:0.54: 1.02:1.000:0.987 0/0/0/1:4:58,14:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,22:0.54:-0.72:1.000:0.984 0/0/0/1:4:54,10:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,13:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,32:0.57:-0.16:1.000:0.952 0/0/1/1:4:15,9:0.41:-1.37:1.000:0.891 0/0/1/1:4:71,41:0.41: 2.19:1.000:0.842 0/0/1/1:4:50,42:0.49: 1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,19:0.41:-0.28:1.000:0.879 0/0/1/1:4:27,20:0.46:-0.44:1.000:0.988 1/1/1/1:4:1,49:0.93:-0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,48:0.54: 1.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,45:0.56: 0.86:1.000:0.974 0/0/1/1:4:16,12:0.46:-1.21:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/1:3:23,4:0.20:-1.25:0.999:0.999 0/0/0/1:4:77,19:0.25: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,26:0.32: 1.55:1.000:0.957 0/0/0/1:4:50,21:0.34: 0.53:1.000:0.859 0/0/1/1:4:27,30:0.53:-0.03:1.000:0.991 0/0/0/1:4:81,32:0.33: 2.24:1.000:0.921 0/0/1/1:4:24,15:0.42:-0.76:1.000:0.928 0/0/1/1:4:22,23:0.52:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,50:0.60: 0.78:1.000:0.802 0/0/1/1:4:52,30:0.41: 0.98:1.000:0.840 0/0/0/1:4:41,14:0.30:-0.12:1.000:0.982 0/0/1/1:4:23,35:0.57: 0.01:1.000:0.936 0/1/1/1:4:2,26:0.75:-1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,52:0.51: 1.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,17:0.35:-0.07:1.000:0.803 0/0/0/1:4:67,20:0.28: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,19:0.56:-1.01:1.000:0.969 0/0/0/1:4:94,16:0.20: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,12:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,12:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,13:0.20: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,21:0.38: 0.21:1.000:0.521 0/0/1/1:4:19,22:0.54:-0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:29,38:0.55: 0.37:1.000:0.975 0/0/1/1:4:25,17:0.44:-0.64:1.000:0.971 0/0/0/0/0/1:6:52,10:0.22: 0.17:1.000:0.836 0/0/0/1:4:52,5:0.15:-0.03:1.000:0.985 0/0/1/1:4:30,23:0.47:-0.20:1.000:0.992 0/0/0/1:4:85,15:0.21: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,19:0.38:-0.07:1.000:0.593 0/0/1/1:4:28,39:0.56: 0.37:1.000:0.963 0/0/1/1:4:61,34:0.40: 1.51:1.000:0.782 0/0/1/1:4:9,6:0.44:-1.74:1.000:0.964 0/0/1/1:4:34,21:0.42:-0.12:1.000:0.918 0/0/1/1:4:26,43:0.58: 0.45:0.998:0.894 0/0/0/1:4:51,20:0.33: 0.53:1.000:0.927 0/0/1/1:4:20,27:0.56:-0.44:1.000:0.970 0/0/1/1:4:13,16:0.55:-1.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:79,41:0.38: 2.52:1.000:0.620 0/0/1/1:4:31,27:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,30:0.38: 1.26:1.000:0.566 0/0/0/1:4:46,17:0.32: 0.21:1.000:0.959 0/0/1/1:4:23,12:0.39:-0.93:1.000:0.634 0/0/1/1:4:19,11:0.41:-1.13:1.000:0.846 0/1/1/1:4:1,27:0.88:-1.21:1.000:0.852 0/0/0/1:4:41,9:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,20:0.57:-0.97:0.999:0.957 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,22:0.44:-0.16:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,27:0.52:-0.16:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,20:0.58:-1.01:1.000:0.931 0/0/0/1:4:41,8:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,22:0.44:-0.16:1.000:0.974 0/0/0/1:4:40,15:0.32:-0.12:1.000:0.953 0/0/1/1:4:24,20:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,17:0.46:-0.72:1.000:0.988 0/1/1/1:4:11,32:0.65:-0.60:1.000:0.793 0/0/0/1:4:45,13:0.28: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,17:0.53:-1.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:46,29:0.43: 0.70:1.000:0.934 0/0/1/1:4:14,12:0.49:-1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,27:0.55:-0.36:1.000:0.984 0/0/1/1:4:22,14:0.43:-0.89:1.000:0.940 0/0/0/1:4:38,8:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,1:0.10:-1.13:1.000:0.852 0/0/0/1:4:44,13:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,9:0.38:-1.25:1.000:0.521 0/0/1/1:4:36,18:0.38:-0.16:0.998:0.521 0/0/1/1:4:21,25:0.54:-0.48:1.000:0.987 0/0/1/1:4:29,29:0.52: 0.01:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,21:0.72:-1.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,9:0.21: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,17:0.33: 0.13:1.000:0.937 0/0/1/1:4:13,16:0.55:-1.17:1.000:0.984 0/0/0/1:4:112,23:0.23: 3.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.36:-1.33:0.999:0.641 0/0/1/1:4:19,30:0.58:-0.36:1.000:0.919 0/0/1/1:4:15,32:0.62:-0.44:1.000:0.623 0/0/0/1:4:26,9:0.31:-0.93:1.000:0.979 0/0/1/1:4:28,17:0.42:-0.52:1.000:0.903 0/0/1/1:4:16,37:0.63:-0.20:1.000:0.502 0/0/1/1:4:20,26:0.55:-0.48:1.000:0.977 0/0/1/1:4:27,26:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,20:0.51:-0.68:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,31:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,15:0.23: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,16:0.54:-1.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,14:0.38:-0.68:1.000:0.618 0/0/1/1:4:24,25:0.52:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,24:0.62:-0.93:1.000:0.590 0/0/1/1:4:9,16:0.59:-1.33:1.000:0.840 0/0/1/1:4:28,14:0.38:-0.64:1.000:0.521 0/0/1/1:4:35,24:0.44: 0.05:1.000:0.973 0/0/0/1:4:23,11:0.37:-0.97:0.996:0.599 0/0/1/1:4:21,14:0.44:-0.93:1.000:0.964 0/0/0/1:4:45,6:0.18:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,30:0.32: 2.11:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,3:0.16:-1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-1.13:1.000:0.976 0/0/1/1:4:19,22:0.54:-0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:16,15:0.51:-1.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,7:0.15: 0.98:1.000:0.982 0/0/0/1:4:42,4:0.15:-0.48:1.000:0.984 0/0/0/1:4:68,14:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,26:0.46: 0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:53,10:0.21: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,13:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,41:0.54: 0.74:1.000:0.988 0/0/0/1:4:58,6:0.15: 0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:53,29:0.40: 0.98:1.000:0.745 0/0/0/1:4:61,12:0.22: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,14:0.29: 0.05:1.000:0.993 0/0/0/1:4:79,22:0.27: 1.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,28:0.54:-0.28:1.000:0.985 0/0/0/1:4:47,19:0.33: 0.33:1.000:0.901 0/0/0/1:4:51,18:0.31: 0.45:1.000:0.974 0/0/1/1:4:18,14:0.47:-1.05:1.000:0.993 0/0/0/1:4:59,25:0.34: 1.06:1.000:0.847 0/0/0/1:4:64,9:0.18: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,36:0.57: 0.13:1.000:0.955 0/0/1/1:4:17,35:0.61:-0.24:1.000:0.674 0/0/1/1:4:25,15:0.41:-0.72:1.000:0.891 0/0/1/1:4:34,30:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,34:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,14:0.21: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,23:0.45:-0.12:0.999:0.984 0/0/0/1:4:59,5:0.14: 0.25:1.000:0.965 0/0/1/1:4:23,21:0.51:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,7:0.14: 1.18:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,16:0.26: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,19:0.56:-1.01:1.000:0.969 0/0/0/1:4:44,17:0.33: 0.13:1.000:0.937 0/0/1/1:4:27,25:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,34:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,17:0.32: 0.17:1.000:0.949 0/0/0/1:4:71,9:0.17: 0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,21:0.34: 0.53:1.000:0.859 0/0/0/1:4:56,24:0.35: 0.90:1.000:0.830 0/0/0/1:4:80,28:0.31: 2.03:1.000:0.977 0/0/1/1:4:32,24:0.46:-0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:24,25:0.52:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,30:0.60:-0.48:1.000:0.789 -chr4.1 31725314 chr4.1_031725314 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:69,170:0.75: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,131:0.76:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,103:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,114:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,100:0.44: 0.80:1.000:0.973 0/0/1/1:4:153,120:0.49: 1.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,171:0.71: 0.93:1.000:0.990 0/0/1/1:4:110,93:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,33:0.73:-2.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,16:0.39:-2.87:1.000:0.636 0/0/1/1:4:96,107:0.57:-0.06:1.000:0.938 0/0/0/1:4:162,42:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,101:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,166:0.79: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,113:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:198,67:0.30: 1.05:0.999:0.988 0/1/1/1:4:73,170:0.74: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,121:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,116:0.47: 1.23:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,21:0.72:-3.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,202:0.78: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,48:0.22: 1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,173:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,19:0.59:-3.09:1.000:0.872 0/1/1/1:4:72,202:0.78: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,167:0.75: 0.57:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,212:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,119:0.46: 1.50:1.000:0.985 0/1/1/1:4:62,171:0.77: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,233:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,117:0.58: 0.26:1.000:0.931 1/1/1/1:4:1,25:0.97:-3.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,42:0.80:-2.73:1.000:1.000 0/1/1:3:4,10:0.76:-3.46:0.999:1.000 0/1/1/1:4:87,141:0.66: 0.39:1.000:0.889 0/1/1/1:4:51,161:0.80: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,192:0.78: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,122:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,181:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,88:0.46: 0.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:142,114:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,163:0.77: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,122:0.55: 0.62:1.000:0.977 0/1/1/1:4:72,159:0.73: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:79,167:0.72: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,184:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,29:0.68:-2.89:1.000:0.940 0/0/1/1:4:111,110:0.54: 0.26:1.000:0.985 0/0/0/1:4:125,47:0.32:-0.62:1.000:0.961 0/1/1/1:4:60,133:0.73:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:215,65:0.28: 1.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,38:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,130:0.51: 1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,94:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:189,56:0.27: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,134:0.73:-0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,163:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,147:0.72: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:106,81:0.48:-0.35:1.000:0.866 0/0/1/1:4:120,101:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,100:0.55:-0.13:1.000:0.981 0/0/1/1:4:144,93:0.44: 0.55:1.000:0.964 0/0/1/1:4:99,107:0.57:-0.01:1.000:0.957 0/1/1/1:4:68,188:0.77: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,146:0.56: 1.38:1.000:0.964 0/1/1/1:4:35,75:0.73:-1.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:216,38:0.18: 0.86:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,198:1.00:-0.15:0.998:1.000 0/0/1/1:4:140,96:0.45: 0.53:1.000:0.982 0/1/1/1:4:58,166:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,53:0.51:-1.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,114:0.48: 1.02:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,218:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:257,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,108:0.55: 0.12:1.000:0.976 0/1/1/1:4:49,129:0.77:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,51:0.26: 0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:61,133:0.73:-0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,157:0.74: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,48:0.28:-0.06:0.999:0.996 1/1/1/1:4:0,182:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,112:0.49: 0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,129:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,153:0.78: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,163:0.84:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,67:0.51:-1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:149,35:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,77:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,148:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,73:0.46:-0.55:1.000:0.988 0/0/1/1:4:118,121:0.55: 0.59:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,243:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,76:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,164:0.74: 0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:72,134:0.70:-0.01:1.000:0.980 0/1/1/1:4:49,106:0.73:-0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,115:0.75:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,85:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:106,106:0.55: 0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:80,43:0.39:-1.50:1.000:0.740 0/0/0/1:4:185,63:0.30: 0.75:1.000:0.987 0/0/0/1:4:110,32:0.27:-1.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,124:0.72:-0.42:0.998:0.996 0/1/1/1:4:42,101:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,84:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,131:0.78:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,155:0.78: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,58:0.22: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,99:0.49: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,71:0.46:-0.64:1.000:0.988 0/0/1/1:4:170,152:0.52: 2.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,87:0.47:-0.04:0.999:0.993 0/0/1/1:4:125,105:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,62:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,44:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,89:0.67:-1.16:1.000:0.927 0/0/1/1:4:92,85:0.53:-0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,83:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,105:0.74:-1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,179:0.75: 0.82:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,157:0.74: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,123:0.55: 0.69:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,201:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,112:0.48: 0.95:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,183:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,82:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,67:0.53:-1.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,113:0.78:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,36:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,152:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,82:0.74:-1.61:0.996:0.999 0/1/1/1:4:61,128:0.72:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,100:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:235,61:0.25: 1.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,166:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,80:0.49:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,121:0.80:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,124:0.72:-0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,134:0.71:-0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:51,120:0.75:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,107:0.56: 0.05:1.000:0.970 0/0/0/1:4:123,36:0.27:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,105:0.45: 1.02:1.000:0.974 0/1/1/1:4:77,199:0.76: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,117:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,55:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,181:0.78: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,87:0.46: 0.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:66,219:0.80: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,56:0.29: 0.32:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-3.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,82:0.53:-0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:145,137:0.53: 1.36:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,98:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,89:0.52:-0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:76,159:0.72: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,41:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,155:0.77: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,103:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,99:0.46: 0.64:1.000:0.984 0/1/1/1:4:46,185:0.83: 0.44:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,80:0.47:-0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:127,99:0.48: 0.35:0.999:0.996 0/0/1/1:4:103,100:0.54:-0.06:1.000:0.988 0/1/1/1:4:64,141:0.73:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,53:0.33:-0.39:1.000:0.919 0/1/1/1:4:45,109:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,94:0.55:-0.33:1.000:0.983 0/1/1/1:4:52,149:0.78:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,44:0.29:-0.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,96:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,191:0.77: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,153:0.73: 0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:183,57:0.28: 0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,120:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,134:0.71:-0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:230,59:0.25: 1.49:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,247:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,88:0.55:-0.58:1.000:0.978 0/0/1/1:4:140,97:0.46: 0.55:1.000:0.984 -chr4.1 32099918 chr4.1_032099918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:68,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.74:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.78:0.999:. ./.:4:77,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:79,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.06:1.000:. ./.:6:63,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.38:0.998:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.94:0.998:. ./.:4:25,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:0.999:. ./.:4:50,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.94:0.996:. ./.:4:71,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:141,0:.: 3.70:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:35,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:127,0:.: 3.14:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. -chr4.1 32135182 chr4.1_032135182 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:46,49:0.49: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,30:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:49,19:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,33:0.35: 1.14:1.000:0.769 0/0/1/1:4:38,54:0.55: 1.40:1.000:0.977 0/0/0/1:4:55,31:0.33: 1.14:1.000:0.926 0/0/1/1:4:9,18:0.62:-1.42:1.000:0.527 0/0/1/1:4:33,58:0.60: 1.36:1.000:0.814 0/0/1/1:4:32,41:0.53: 0.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,9:0.76:-2.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,24:0.31: 0.49:1.000:0.979 0/0/1/1:4:31,30:0.46: 0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:37,56:0.57: 1.45:1.000:0.956 0/0/0/1:4:74,25:0.22: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,32:0.30: 1.58:0.999:0.984 0/0/1/1:4:43,48:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,47:0.57: 0.75:1.000:0.937 0/0/0/1:4:51,21:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,28:0.35: 0.58:1.000:0.770 0/0/0/1:4:41,23:0.33: 0.19:1.000:0.930 0/0/1/1:4:29,30:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,3:0.47:-2.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:31,45:0.56: 0.71:1.000:0.972 0/0/1/1:4:49,66:0.54: 2.40:1.000:0.987 0/0/1/1:4:36,56:0.57: 1.40:1.000:0.942 0/0/1/1:4:27,40:0.56: 0.32:1.000:0.965 0/0/1/1:4:42,47:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,62:0.60: 1.62:1.000:0.801 0/0/0/1:4:53,27:0.31: 0.88:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,3:0.93:-2.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,5:0.52:-2.20:1.000:0.994 0/0/0:3:2,0:0.00:-2.50:0.999:1.000 0/0/0/1:4:35,15:0.27:-0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,22:0.32: 0.10:1.000:0.946 0/0/0/1:4:43,26:0.35: 0.41:1.000:0.831 0/0/1/1:4:45,46:0.48: 1.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,44:0.57: 0.58:1.000:0.955 0/0/0/1:4:51,21:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,26:0.33: 0.54:1.000:0.923 0/0/0/1:4:48,31:0.36: 0.84:1.000:0.672 0/0/0/1:4:42,22:0.31: 0.19:1.000:0.971 0/0/1/1:4:27,28:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,18:0.31:-0.33:1.000:0.967 0/0/1/1:4:42,38:0.45: 0.88:1.000:0.975 0/0/1/1:4:5,5:0.47:-2.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,37:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,30:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,20:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,23:0.23: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,21:0.35:-0.20:1.000:0.787 0/0/0/1:4:31,15:0.29:-0.59:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,30:0.39: 0.49:1.000:0.716 0/0/1/1:4:24,32:0.54:-0.16:1.000:0.988 0/0/0/0/0/0:6:39,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,37:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,16:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,21:0.30: 0.19:1.000:0.989 0/0/1/1:4:44,34:0.41: 0.80:1.000:0.837 0/0/0/1:4:59,16:0.19: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.45:-1.59:1.000:0.979 0/0/0/1:4:46,15:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,26:0.49:-0.42:0.998:0.996 0/0/0/1:4:46,25:0.32: 0.49:1.000:0.953 0/0/0/1:4:37,14:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,17:0.53:-1.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:48,19:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,52:0.54: 1.36:1.000:0.988 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,24:0.43:-0.33:1.000:0.952 0/0/1/1:4:19,26:0.54:-0.64:1.000:0.985 0/0/0/1:4:43,10:0.17:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,38:0.68:-0.33:1.000:0.954 0/0/1/1:4:30,45:0.56: 0.67:1.000:0.960 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.03:0.999:1.000 0/1/1/1:4:12,39:0.71:-0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,22:0.45:-0.59:1.000:0.979 0/0/1/1:4:35,37:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,23:0.58:-0.98:1.000:0.900 0/1/1/1:4:10,51:0.77: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,14:0.47:-1.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:36,11:0.21:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,13:0.28:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,28:0.44: 0.01:1.000:0.963 0/0/0/1:4:35,13:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,40:0.56: 0.32:1.000:0.965 0/0/1/1:4:26,31:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,19:0.20: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.47:-1.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:38,11:0.20:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,21:0.45:-0.68:1.000:0.978 0/0/0/1:4:26,12:0.28:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:31,13:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,34:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,3:0.22:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,19:0.30:-0.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:24,11:0.28:-1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,27:0.58:-0.68:0.998:0.928 0/0/1/1:4:23,20:0.44:-0.72:1.000:0.960 0/0/1/1:4:37,40:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,34:0.75:-0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,68:0.67: 1.49:1.000:0.934 0/0/0/1:4:64,24:0.24: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,18:0.29:-0.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,8:0.19:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,23:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,20:0.41:-0.64:0.999:0.890 0/0/0/1:4:38,14:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,24:0.55:-0.81:1.000:0.979 0/0/0/1:4:38,17:0.28:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:17,3:0.13:-1.72:1.000:0.928 0/0/1/1:4:18,22:0.52:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:36,8:0.16:-0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,14:0.38:-1.11:1.000:0.585 0/0/1/1:4:40,48:0.52: 1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,41:0.72:-0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,21:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,64:0.56: 2.06:1.000:0.963 0/1/1/1:4:13,37:0.69:-0.42:1.000:0.971 0/0/1/1:4:28,29:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,27:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,12:0.37:-1.29:1.000:0.574 0/0/0/1:4:20,8:0.25:-1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,14:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,54:0.53: 1.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:13,10:0.40:-1.59:0.996:0.829 0/0/0/1:4:45,17:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,21:0.32: 0.01:1.000:0.958 0/0/1/1:4:41,38:0.45: 0.84:1.000:0.982 0/0/0/1:4:33,15:0.28:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,27:0.55:-0.59:1.000:0.977 0/0/0/1:4:40,11:0.19:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,21:0.45:-0.68:1.000:0.978 0/1/1/1:4:10,37:0.73:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,52:0.54: 1.32:1.000:0.985 0/0/0/1:4:49,28:0.33: 0.75:1.000:0.912 0/0/0/1:4:53,15:0.19: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,37:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,21:0.29: 0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:63,28:0.27: 1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,20:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.67:-2.29:1.000:0.900 0/0/0/1:4:25,14:0.33:-0.90:1.000:0.932 0/0/0/1:4:55,21:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,45:0.59: 0.54:1.000:0.885 0/0/1/1:4:28,43:0.57: 0.49:1.000:0.949 0/0/1/1:4:20,34:0.59:-0.25:1.000:0.862 0/0/1/1:4:32,40:0.52: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:32,52:0.58: 1.06:1.000:0.910 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,39:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,22:0.33: 0.06:1.000:0.925 0/0/0/1:4:58,32:0.32: 1.32:1.000:0.943 0/0/1/1:4:32,34:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,38:0.58: 0.06:1.000:0.894 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,32:0.48: 0.14:0.999:0.995 0/0/0/1:4:68,31:0.28: 1.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,43:0.55: 0.58:1.000:0.975 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,17:0.37:-0.77:1.000:0.509 0/0/1/1:4:32,42:0.54: 0.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,50:0.57: 0.97:1.000:0.939 0/0/0/1:4:52,15:0.20: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,22:0.31: 0.23:1.000:0.979 0/0/0/1:4:56,20:0.23: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,21:0.27: 0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,17:0.29:-0.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,27:0.30: 0.97:1.000:0.988 0/0/0/1:4:36,13:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,31:0.37: 0.75:1.000:0.539 0/0/1/1:4:32,47:0.56: 0.84:1.000:0.968 0/0/1/1:4:18,32:0.60:-0.42:1.000:0.795 0/0/0/1:4:68,32:0.29: 1.75:1.000:0.993 -chr4.1 32186858 chr4.1_032186858 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:55,112:0.71: 0.00:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,74:0.71:-1.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:109,61:0.42: 0.08:1.000:0.926 0/0/1/1:4:93,67:0.48:-0.18:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,195:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,86:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,54:0.39:-0.08:1.000:0.735 0/1/1/1:4:47,94:0.71:-0.68:1.000:0.991 0/1/1/1:4:52,107:0.71:-0.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,33:0.66:-2.94:1.000:0.858 0/0/1/1:4:44,20:0.38:-2.68:1.000:0.537 0/0/0/1:4:153,34:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,114:0.77:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,96:0.66:-0.26:1.000:0.861 0/0/1/1:4:103,71:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:115,79:0.47: 0.70:1.000:0.993 0/1/1/1:4:73,117:0.66: 0.60:0.999:0.885 0/0/1/1:4:125,90:0.48: 1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:78,144:0.69: 1.43:1.000:0.977 0/1/1/1:4:64,111:0.68: 0.21:1.000:0.952 0/0/1/1:4:47,40:0.52:-2.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,72:0.46: 0.39:1.000:0.987 0/1/1/1:4:58,116:0.71: 0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,56:0.44:-0.47:1.000:0.967 0/0/0/1:4:31,11:0.33:-3.25:1.000:0.930 0/1/1/1:4:54,111:0.71:-0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:48,104:0.72:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,64:0.43: 0.26:1.000:0.935 0/1/1/1:4:69,119:0.68: 0.54:1.000:0.949 0/0/1/1:4:117,66:0.42: 0.41:1.000:0.932 0/0/1/1:4:94,48:0.40:-0.65:1.000:0.813 0/0/1/1:4:74,62:0.52:-0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,14:0.33:-2.94:1.000:0.939 0/0/1/1:4:36,37:0.56:-2.44:1.000:0.961 0/1/1:3:10,16:0.66:-3.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:95,71:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,82:0.52: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,78:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,81:0.63:-0.68:1.000:0.502 0/0/1/1:4:67,84:0.61:-0.42:1.000:0.707 0/0/1/1:4:91,83:0.54: 0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:121,85:0.48: 1.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:195,40:0.24: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,79:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:61,155:0.75: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,32:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,85:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,32:0.36:-1.53:1.000:0.670 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,71:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,101:0.69:-0.29:1.000:0.976 0/0/1/1:4:143,87:0.44: 1.64:1.000:0.971 0/0/1/1:4:119,78:0.46: 0.78:1.000:0.987 0/1/1/1:4:63,97:0.65:-0.18:1.000:0.826 0/1/1/1:4:59,116:0.71: 0.21:1.000:0.989 0/1/1/1:4:68,120:0.68: 0.54:1.000:0.961 0/0/0/1:4:168,38:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,101:0.64: 0.10:1.000:0.686 0/1/1/1:4:47,111:0.74:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:103,63:0.44:-0.03:1.000:0.703 0/0/1/1:4:104,71:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/1/1/1:4:44,96:0.73:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,125:0.66: 0.93:1.000:0.885 0/0/1/1:4:103,71:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:109,82:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,76:0.46: 0.70:1.000:0.985 0/0/1/1:4:80,67:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,105:0.68:-0.03:1.000:0.948 0/0/1/1:4:102,66:0.46: 0.02:0.998:0.985 0/1/1/1:4:42,104:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,47:0.24: 2.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,118:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:65,92:0.64:-0.26:1.000:0.635 0/0/1/1:4:104,68:0.46: 0.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:109,56:0.40:-0.05:1.000:0.823 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,73:0.47: 0.28:1.000:0.993 0/1/1/1:4:55,108:0.71:-0.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:58,103:0.68:-0.16:1.000:0.964 0/1/1/1:4:68,119:0.68: 0.52:1.000:0.957 0/0/0/1:4:117,27:0.25:-0.60:0.999:0.999 0/1/1/1:4:70,129:0.69: 0.83:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,172:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,55:0.41:-0.21:1.000:0.867 0/0/1/1:4:88,57:0.46:-0.57:1.000:0.986 0/1/1/1:4:58,116:0.71: 0.18:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,120:0.82:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,113:0.77:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,75:0.49: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,137:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,69:0.45: 0.28:1.000:0.981 0/1/1/1:4:52,104:0.71:-0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:119,89:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,52:0.47:-1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:121,88:0.48: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,67:0.41: 0.70:1.000:0.863 0/1/1/1:4:46,99:0.72:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,61:0.45:-0.18:1.000:0.975 0/0/1/1:4:116,88:0.49: 0.96:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,177:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,103:0.77:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,121:0.76:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,90:0.76:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,159:0.77: 1.27:0.998:1.000 0/1/1/1:4:36,87:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,87:0.66:-0.65:1.000:0.868 0/1/1/1:4:60,115:0.70: 0.21:1.000:0.985 0/1/1/1:4:49,107:0.73:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,160:0.73: 1.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,86:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,85:0.53: 0.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:70,142:0.71: 1.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:65,140:0.72: 0.99:0.999:0.996 0/0/1/1:4:115,102:0.53: 1.30:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,68:0.66:-1.46:1.000:0.867 0/1/1/1:4:63,138:0.73: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,83:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,90:0.73:-0.96:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,74:0.47: 0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:91,70:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,91:0.49: 1.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,108:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,66:0.43: 0.31:1.000:0.954 0/1/1/1:4:48,95:0.71:-0.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:55,125:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,117:0.72: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,66:0.47:-0.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:135,27:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,57:0.46:-0.60:1.000:0.987 0/0/0/1:4:108,29:0.28:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,90:0.70:-0.81:1.000:0.989 0/0/1/1:4:104,75:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,83:0.75:-1.33:0.996:0.999 0/0/1/1:4:122,84:0.47: 1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,68:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:68,155:0.73: 1.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,64:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,68:0.46: 0.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:85,69:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,38:0.29: 0.02:1.000:0.990 0/1/1/1:4:61,112:0.69: 0.15:1.000:0.975 0/1/1/1:4:39,127:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,64:0.45: 0.00:1.000:0.977 0/0/0/1:4:107,48:0.37:-0.31:1.000:0.500 0/0/0/1:4:237,51:0.24: 3.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,171:0.78: 1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,66:0.42: 0.41:1.000:0.932 0/1/1/1:4:55,109:0.71:-0.08:1.000:0.990 0/1/1/1:4:67,144:0.72: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,111:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:179,37:0.24: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,99:0.69:-0.34:1.000:0.969 0/1/1/1:4:18,38:0.72:-2.89:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,93:0.67:-0.50:1.000:0.936 0/0/1/1:4:115,73:0.45: 0.54:1.000:0.982 0/0/1/1:4:137,83:0.44: 1.38:1.000:0.969 0/0/1/1:4:115,94:0.51: 1.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,96:0.69:-0.50:1.000:0.977 0/1/1/1:4:61,120:0.71: 0.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:122,65:0.41: 0.52:1.000:0.876 0/1/1/1:4:47,67:0.64:-1.38:1.000:0.654 0/0/1/1:4:98,69:0.48: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,66:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,54:0.43:-0.47:1.000:0.937 0/0/1/1:4:128,76:0.44: 0.96:1.000:0.961 0/0/1/1:4:90,69:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,107:0.73:-0.29:0.999:0.997 0/1/1/1:4:54,100:0.69:-0.34:1.000:0.978 0/1/1/1:4:61,90:0.64:-0.42:1.000:0.740 0/0/1/1:4:94,66:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,47:0.44:-1.12:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,59:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,78:0.73:-1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:73,46:0.45:-1.25:1.000:0.980 0/0/0/1:4:187,44:0.26: 1.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,76:0.44: 0.93:1.000:0.965 0/1/1/1:4:61,118:0.70: 0.31:1.000:0.987 0/0/1/1:4:82,55:0.47:-0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:94,71:0.49:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,128:0.70: 0.73:1.000:0.985 0/0/1/1:4:143,131:0.54: 2.78:1.000:0.989 0/1/1/1:4:52,118:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,83:0.51: 0.47:1.000:0.996 -chr4.1 32476670 chr4.1_032476670 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.42:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.90:0.999:. ./.:4:16,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 1.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:6:15,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.44:0.998:. ./.:4:22,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.76:0.998:. ./.:4:17,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.77:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.44:0.996:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:50,1:.: 2.06:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.92:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.53:1.000:. -chr4.1 32756643 chr4.1_032756643 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,8:0.57: 0.17:1.000:0.943 0/0/1/1:4:3,4:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,9:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,13:0.59: 1.28:1.000:0.863 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:3,8:0.64: 0.02:1.000:0.645 0/1/1/1:4:2,14:0.79: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.36: 0.02:1.000:0.645 0/1/1/1:4:1,9:0.81:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,6:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/1/1/1:4:2,7:0.69:-0.30:1.000:0.974 0/1/1/1:4:9,23:0.63: 3.32:0.999:0.526 0/1/1/1:4:3,34:0.83: 4.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,11:0.55: 0.96:1.000:0.979 0/1/1/1:4:2,21:0.82: 1.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.33:-0.93:1.000:0.906 0/0/1/1:4:5,6:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,10:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,15:0.70: 1.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-1.24:1.000:0.679 0/1/1/1:4:3,9:0.66: 0.17:1.000:0.873 0/1/1/1:4:1,8:0.80:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,19:0.67: 2.22:1.000:0.927 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.56:0.999:1.000 0/1/1/1:4:4,11:0.64: 0.65:1.000:0.721 0/0/1/1:4:7,6:0.44: 0.33:1.000:0.971 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.55: 0.49:1.000:0.983 0/0/1/1:4:3,4:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,8:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,13:0.84: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,8:0.47: 0.65:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,12:0.71: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,16:0.60: 1.91:1.000:0.769 0/0/1/1:4:4,6:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,2:0.33: 0.02:1.000:0.937 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,3:0.35: 0.33:1.000:0.825 0/0/1/1:4:6,6:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.43: 0.49:1.000:0.943 0/0/1/1:4:5,12:0.61: 0.96:1.000:0.652 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-1.24:1.000:0.679 0/0/1/1:4:7,6:0.44: 0.33:1.000:0.971 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:5,7:0.49: 0.17:1.000:0.886 0/1/1/1:4:6,16:0.64: 1.75:1.000:0.645 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,15:0.66: 1.43:1.000:0.873 0/0/1/1:4:8,5:0.41: 0.33:1.000:0.866 0/1/1/1:4:4,11:0.64: 0.65:1.000:0.721 0/0/1/1:4:9,4:0.38: 0.33:1.000:0.546 0/1/1/1:4:1,7:0.79:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.78: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.47: 0.33:0.998:0.994 0/0/1/1:4:2,4:0.57:-0.77:1.000:0.943 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,9:0.47: 0.96:1.000:0.992 0/0/1/1:4:4,9:0.60: 0.33:1.000:0.800 0/0/1/1:4:11,12:0.47: 1.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,11:0.43: 2.22:1.000:0.955 0/1/1/1:4:5,16:0.67: 1.59:1.000:0.934 0/0/1/1:4:5,9:0.55: 0.49:1.000:0.983 0/0/1/1:4:7,6:0.44: 0.33:1.000:0.971 0/0/1/1:4:7,15:0.59: 1.75:1.000:0.878 0/1/1/1:4:1,9:0.81:-0.14:0.999:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.54: 0.02:1.000:0.988 0/1/1/1:4:2,14:0.79: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,10:0.53: 0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,5:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,12:0.57: 1.12:1.000:0.943 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,15:0.62: 1.59:1.000:0.537 0/1/1/1:4:2,10:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,7:0.42: 0.96:1.000:0.920 0/0/1/1:4:8,6:0.43: 0.49:1.000:0.943 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.62:-0.61:1.000:0.537 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.44: 0.65:1.000:0.974 0/0/1/1:4:3,5:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:0.998:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.61:-0.14:1.000:0.723 0/0/0/1:4:8,3:0.36: 0.02:1.000:0.645 0/0/1/1:4:5,7:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/1/1/1:4:6,20:0.68: 2.38:1.000:0.957 0/1/1/1:4:2,14:0.79: 0.80:0.999:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-0.77:1.000:0.679 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.40: 0.02:1.000:0.804 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.73: 0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,15:0.70: 1.28:1.000:0.988 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,18:0.77: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,10:0.62: 0.49:1.000:0.537 0/0/1/1:4:6,5:0.44: 0.02:1.000:0.966 0/0/1/1:4:3,5:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:2,4:0.57:-0.77:1.000:0.943 0/0/1/1:4:4,6:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,5:0.46:-0.14:1.000:0.987 0/0/1/1:4:7,6:0.44: 0.33:1.000:0.971 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.62:-0.61:0.996:0.537 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-0.14:1.000:0.900 0/1/1/1:4:3,15:0.75: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,4:0.71:-0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,7:0.54: 0.02:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,6:0.90:-0.77:1.000:0.801 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.61:-0.14:1.000:0.723 0/0/1/1:4:5,7:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,6:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,8:0.57: 0.17:1.000:0.943 0/0/1/1:4:3,3:0.46:-0.77:1.000:0.987 0/1/1/1:4:3,18:0.77: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.73: 0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,11:0.64: 0.65:1.000:0.721 0/0/1/1:4:5,6:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,8:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,3:0.39:-0.30:1.000:0.679 0/0/1/1:4:7,8:0.47: 0.65:1.000:0.993 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.57:-0.30:1.000:0.943 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.81:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.68: 0.33:1.000:0.957 0/1/1/1:4:4,12:0.66: 0.80:1.000:0.873 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,14:0.65: 1.28:1.000:0.760 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,9:0.60: 0.33:1.000:0.800 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.56:0.999:1.000 0/1/1/1:4:1,15:0.84: 0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,7:0.61:-0.14:1.000:0.723 0/0/1/1:4:6,8:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,9:0.73: 0.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-0.77:1.000:0.679 0/0/1/1:4:7,6:0.44: 0.33:1.000:0.971 0/0/1/1:4:5,5:0.46:-0.14:1.000:0.987 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,12:0.57: 1.12:1.000:0.943 0/0/1/1:4:5,12:0.61: 0.96:1.000:0.652 0/1/1/1:4:2,13:0.78: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.55: 0.49:1.000:0.983 0/0/1/1:4:7,13:0.55: 1.43:1.000:0.976 0/0/1/1:4:5,8:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,3:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,13:0.63: 1.12:1.000:0.576 -chr4.1 32807526 chr4.1_032807526 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:231,46:.: 0.77:1.000:. ./.:4:87,47:.:-1.65:1.000:. ./.:4:120,45:.:-1.12:1.000:. ./.:4:178,27:.:-0.45:1.000:. ./.:4:266,46:.: 1.36:1.000:. ./.:4:225,33:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,41:.:-1.76:1.000:. ./.:4:141,57:.:-0.56:1.000:. ./.:4:179,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:60,31:.:-2.37:1.000:. ./.:4:53,10:.:-2.85:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:234,37:.: 0.67:1.000:. ./.:4:128,88:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,72:.:-0.63:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.74:0.999:. ./.:4:174,85:.: 0.47:1.000:. ./.:4:248,47:.: 1.08:1.000:. ./.:4:348,1:.: 1.99:1.000:. ./.:4:117,2:.:-1.90:1.000:. ./.:4:216,30:.: 0.25:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:117,65:.:-0.83:1.000:. ./.:4:20,13:.:-3.35:1.000:. ./.:4:106,48:.:-1.31:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:130,65:.:-0.61:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:106,29:.:-1.63:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:34,13:.:-3.12:1.000:. ./.:4:123,16:.:-1.56:1.000:. ./.:3:18,12:.:-3.40:0.999:. ./.:4:197,23:.:-0.19:1.000:. ./.:4:185,31:.:-0.26:1.000:. ./.:4:207,28:.: 0.06:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:135,48:.:-0.82:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:181,38:.:-0.21:1.000:. ./.:4:115,63:.:-0.90:1.000:. ./.:4:141,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:209,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:85,43:.:-1.75:1.000:. ./.:4:129,25:.:-1.31:1.000:. ./.:4:114,22:.:-1.61:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:259,40:.: 1.14:1.000:. ./.:4:208,53:.: 0.50:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:129,68:.:-0.58:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:201,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:185,35:.:-0.19:1.000:. ./.:6:199,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:247,49:.: 1.09:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,107:.:-0.21:1.000:. ./.:4:151,37:.:-0.73:1.000:. ./.:4:140,89:.:-0.04:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:81,71:.:-1.34:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:124,72:.:-0.60:0.998:. ./.:4:166,32:.:-0.56:1.000:. ./.:4:231,34:.: 0.57:1.000:. ./.:4:185,35:.:-0.19:1.000:. ./.:4:155,34:.:-0.72:1.000:. ./.:4:144,80:.:-0.12:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:193,35:.:-0.06:1.000:. ./.:4:139,73:.:-0.33:1.000:. ./.:4:325,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:233,45:.: 0.79:1.000:. ./.:4:174,97:.: 0.67:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:225,46:.: 0.67:1.000:. ./.:4:252,40:.: 1.03:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,57:.:-1.22:1.000:. ./.:4:210,50:.: 0.48:1.000:. ./.:4:178,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:124,68:.:-0.67:1.000:. ./.:4:124,71:.:-0.61:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:141,91:.: 0.01:1.000:. ./.:4:141,19:.:-1.21:1.000:. ./.:4:149,111:.: 0.48:1.000:. ./.:4:178,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:151,27:.:-0.90:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:222,54:.: 0.75:1.000:. ./.:4:115,81:.:-0.60:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:156,108:.: 0.55:0.998:. ./.:4:153,27:.:-0.87:1.000:. ./.:4:210,31:.: 0.16:1.000:. ./.:4:182,33:.:-0.28:1.000:. ./.:4:209,35:.: 0.21:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:122,90:.:-0.33:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:222,52:.: 0.72:0.999:. ./.:4:342,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:114,21:.:-1.63:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:203,31:.: 0.04:1.000:. ./.:4:163,30:.:-0.65:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,77:.:-0.14:1.000:. ./.:4:140,84:.:-0.12:1.000:. ./.:4:200,32:.: 0.01:1.000:. ./.:4:239,55:.: 1.06:1.000:. ./.:4:229,31:.: 0.48:1.000:. ./.:4:195,38:.: 0.03:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:146,91:.: 0.10:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:169,27:.:-0.60:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:141,89:.:-0.02:1.000:. ./.:4:99,65:.:-1.14:0.996:. ./.:4:116,73:.:-0.72:1.000:. ./.:4:174,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:171,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:124,72:.:-0.60:1.000:. ./.:4:187,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,55:.: 0.50:1.000:. ./.:4:168,25:.:-0.65:1.000:. ./.:4:186,28:.:-0.29:1.000:. ./.:4:272,51:.: 1.55:1.000:. ./.:4:357,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:224,34:.: 0.45:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:247,37:.: 0.89:1.000:. ./.:4:155,73:.:-0.06:1.000:. ./.:4:225,51:.: 0.75:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:62,15:.:-2.61:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:230,29:.: 0.47:1.000:. ./.:4:133,87:.:-0.19:1.000:. ./.:4:196,73:.: 0.64:1.000:. ./.:4:243,31:.: 0.72:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:144,80:.:-0.12:1.000:. ./.:4:232,40:.: 0.69:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:123,47:.:-1.04:1.000:. ./.:4:138,78:.:-0.26:1.000:. ./.:4:180,37:.:-0.24:1.000:. ./.:4:145,100:.: 0.23:0.999:. ./.:4:235,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,28:.:-0.36:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,35:.: 0.06:1.000:. ./.:4:131,83:.:-0.29:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:242,36:.: 0.79:1.000:. ./.:4:221,35:.: 0.42:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:121,61:.:-0.83:1.000:. ./.:4:225,28:.: 0.37:1.000:. ./.:4:381,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:192,95:.: 0.94:1.000:. ./.:4:179,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:200,38:.: 0.11:1.000:. -chr4.1 33190792 chr4.1_033190792 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:133,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:193,0:.: 2.14:0.999:. ./.:4:156,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.27:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.57:0.999:. ./.:4:124,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:150,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.81:0.998:. ./.:4:172,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:127,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.26:0.999:. ./.:4:43,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.84:0.998:. ./.:4:88,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:137,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.26:0.996:. ./.:4:110,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:191,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:106,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:205,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.55:0.999:. ./.:4:158,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:158,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.33:1.000:. -chr4.1 33322831 chr4.1_033322831 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:48,50:0.56: 0.67:1.000:0.971 0/0/0/1:4:64,15:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,47:0.45: 1.51:1.000:0.981 0/1/1/1:4:28,54:0.68:-0.01:1.000:0.958 0/0/1/1:4:58,33:0.41: 0.37:1.000:0.872 0/0/1/1:4:72,40:0.41: 1.26:1.000:0.831 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,43:0.48: 0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,42:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,16:0.43:-1.70:1.000:0.951 0/1/1/1:4:4,21:0.85:-2.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,27:0.41:-0.35:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,67:0.81: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,34:0.47:-0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,46:0.43: 1.64:1.000:0.949 1/1/1/1:4:1,117:0.99: 1.51:0.999:1.000 0/0/1/1:4:69,51:0.48: 1.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,73:0.72: 0.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,73:0.67: 1.30:1.000:0.926 0/1/1/1:4:11,27:0.73:-1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,33:0.46:-0.05:1.000:0.989 0/1/1/1:4:30,59:0.69: 0.28:1.000:0.966 0/0/0/1:4:58,17:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,6:0.34:-2.63:1.000:0.865 0/0/1/1:4:48,37:0.49: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,41:0.43: 1.13:1.000:0.937 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,55:0.70:-0.05:1.000:0.984 0/0/1/1:4:61,32:0.39: 0.45:1.000:0.696 0/0/0/1:4:101,28:0.25: 1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,38:0.45: 0.58:1.000:0.979 0/0/0/1:4:14,3:0.20:-2.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.29:-2.34:1.000:0.989 0/1/1:3:10,9:0.53:-2.68:0.999:0.860 0/0/0/1:4:92,29:0.27: 1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,51:0.55: 0.79:1.000:0.976 0/0/1/1:4:64,49:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,71:0.72: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,66:0.56: 1.98:1.000:0.969 0/0/1/1:4:57,34:0.42: 0.37:1.000:0.928 0/0/1/1:4:38,41:0.57:-0.14:1.000:0.958 0/0/1/1:4:57,37:0.45: 0.50:1.000:0.976 0/0/1/1:4:37,41:0.57:-0.18:1.000:0.945 0/0/0/1:4:71,14:0.19: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,37:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:63,38:0.43: 0.79:1.000:0.937 0/0/1/1:4:18,16:0.52:-2.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,35:0.53:-0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,35:0.73:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,36:0.45: 0.37:1.000:0.978 0/1/1/1:4:36,72:0.69: 1.09:1.000:0.971 0/1/1/1:4:19,62:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,51:0.53: 1.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,39:0.44: 0.75:1.000:0.970 0/1/1/1:4:33,61:0.67: 0.50:1.000:0.935 0/0/1/1:4:56,30:0.40: 0.16:1.000:0.752 0/0/1/1:4:48,40:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,24:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:23,34:0.63:-1.07:1.000:0.833 0/0/1/1:4:50,35:0.47: 0.12:1.000:0.991 0/1/1/1:4:32,69:0.70: 0.79:1.000:0.987 0/0/1/1:4:62,55:0.52: 1.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,40:0.53: 0.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,46:0.52: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,88:0.73: 1.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,15:0.51:-2.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,4:0.06:-0.10:0.998:1.000 0/0/1/1:4:44,39:0.52: 0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,37:0.43: 0.62:1.000:0.953 0/0/1/1:4:23,14:0.43:-1.92:1.000:0.944 0/0/1/1:4:56,40:0.47: 0.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:88,16:0.17: 0.92:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,37:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,11:0.16:-0.10:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,83:0.70: 1.68:1.000:0.985 0/0/0/1:4:103,17:0.16: 1.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,38:0.75:-1.32:0.999:1.000 0/0/0/1:4:55,19:0.29:-0.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:20,57:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,33:0.46:-0.05:1.000:0.989 0/0/0/1:4:85,19:0.21: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,39:0.41: 1.05:1.000:0.883 0/0/1/1:4:19,27:0.62:-1.53:1.000:0.545 0/1/1/1:4:20,38:0.68:-1.03:1.000:0.951 0/0/1/1:4:40,24:0.43:-0.77:1.000:0.933 0/0/1/1:4:55,41:0.48: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,35:0.62:-0.94:0.999:0.585 0/1/1/1:4:29,44:0.64:-0.39:1.000:0.628 0/0/0/1:4:99,18:0.17: 1.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,36:0.75:-1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,22:0.28: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,29:0.43:-0.27:1.000:0.953 0/0/1/1:4:49,35:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,30:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,24:0.43:-0.77:1.000:0.933 0/0/1/1:4:65,37:0.41: 0.84:1.000:0.872 0/0/0/1:4:18,8:0.35:-2.38:1.000:0.799 0/1/1/1:4:21,46:0.71:-0.65:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,25:0.41:-0.56:0.998:0.870 0/1/1/1:4:22,37:0.66:-0.98:1.000:0.837 0/1/1/1:4:24,72:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,20:0.37:-0.90:1.000:0.536 0/0/1/1:4:47,53:0.57: 0.75:1.000:0.935 0/1/1/1:4:27,68:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,39:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,51:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,51:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,24:0.43:-0.77:0.999:0.933 0/1/1/1:4:26,44:0.66:-0.52:1.000:0.846 0/1/1/1:4:16,33:0.69:-1.41:1.000:0.979 0/1/1/1:4:26,42:0.65:-0.60:1.000:0.769 0/0/0/1:4:34,10:0.26:-1.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,41:0.70:-0.94:1.000:0.987 0/1/1/1:4:14,70:0.84: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,10:0.16:-0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:59,42:0.47: 0.79:1.000:0.993 0/0/0/1:4:65,21:0.28: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,38:0.42: 0.88:1.000:0.907 0/0/1/1:4:59,42:0.47: 0.79:1.000:0.993 0/0/0/1:4:54,13:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,45:0.69:-0.65:1.000:0.977 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,34:0.55:-0.60:1.000:0.981 0/1/1/1:4:14,51:0.79:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,11:0.18:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,56:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,47:0.48: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,22:0.52:-1.49:0.996:0.994 0/0/0/1:4:72,20:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,36:0.50:-0.01:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,46:0.56: 0.33:1.000:0.970 0/0/1/1:4:49,33:0.46:-0.01:1.000:0.985 0/0/0/1:4:60,18:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,40:0.55:-0.14:1.000:0.975 0/0/1/1:4:45,38:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,38:0.54:-0.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:40,30:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,44:0.72:-0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,41:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,51:0.59: 0.45:1.000:0.866 0/0/1/1:4:70,49:0.47: 1.55:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,40:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,52:0.52: 1.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:75,24:0.28: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,75:0.73: 0.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:16,5:0.27:-2.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:17,36:0.70:-1.24:1.000:0.984 0/0/1/1:4:67,42:0.44: 1.13:1.000:0.962 0/0/0/1:4:80,23:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,53:0.68:-0.05:1.000:0.949 0/1/1/1:4:24,59:0.73: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,39:0.58:-0.39:1.000:0.923 0/1/1/1:4:30,55:0.67: 0.12:1.000:0.929 0/0/1/1:4:54,33:0.43: 0.20:1.000:0.947 0/1/1/1:4:26,58:0.71: 0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:58,39:0.46: 0.62:1.000:0.985 0/0/0/1:4:61,20:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,27:0.31: 0.67:1.000:0.969 0/0/1/1:4:41,43:0.56: 0.07:1.000:0.969 0/0/1/1:4:45,45:0.55: 0.33:0.999:0.981 0/0/1/1:4:47,28:0.42:-0.31:1.000:0.927 0/0/1/1:4:51,30:0.42:-0.05:1.000:0.914 0/1/1/1:4:15,36:0.72:-1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,22:0.38:-0.69:1.000:0.546 0/1/1/1:4:20,49:0.72:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,34:0.44: 0.20:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,34:0.46: 0.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:101,23:0.21: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,36:0.44: 0.45:1.000:0.965 0/1/1/1:4:22,78:0.79: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,25:0.32: 0.24:1.000:0.947 0/0/1/1:4:46,37:0.50: 0.03:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,33:0.56:-0.73:1.000:0.973 0/0/1/1:4:42,42:0.55: 0.07:1.000:0.981 -chr4.1 33456500 chr4.1_033456500 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.26: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,11:0.56: 0.70:1.000:0.966 0/0/1/1:4:14,4:0.43: 0.05:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,9:0.53: 0.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:1,1:0.59:-1.23:1.000:0.877 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:0.999:1.000 0/0/1/1:4:22,6:0.41: 0.86:1.000:0.860 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,3:0.15: 1.34:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.10:-0.03:1.000:0.859 0/0/0/1:4:24,3:0.18: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,5:0.29: 1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,5:0.39: 0.54:1.000:0.737 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,6:0.45: 0.70:1.000:0.981 0/1/1/1:4:1,12:0.74:-0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,4:0.46:-0.03:1.000:0.989 1/1/1:3:0,6:1.00:-0.91:0.999:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.55: 0.46:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,7:0.50: 0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,11:0.50: 2.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,7:0.31: 1.82:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,5:0.23: 1.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.26: 1.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,6:0.31: 1.34:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,7:0.40: 1.26:1.000:0.822 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,7:0.32: 1.74:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,5:0.30: 0.94:1.000:0.982 0/0/1/1:4:24,10:0.52: 1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,10:0.50: 1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,6:0.34: 1.18:1.000:0.860 1/1/1/1/1/1:6:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,7:0.50: 0.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,8:0.46: 1.34:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.11:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.58:-0.03:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,20:1.00: 0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,12:0.51: 2.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,13:0.54: 1.58:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,6:0.33: 1.26:1.000:0.933 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.35:0.999:1.000 0/0/0/1:4:33,7:0.31: 1.82:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,6:0.43: 0.78:1.000:0.945 0/0/1/1:4:29,9:0.47: 1.66:1.000:0.991 0/0/0/1:4:28,4:0.21: 1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.31: 0.46:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:0.999:1.000 0/0/1/1:4:24,11:0.52: 1.42:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.23: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,2:0.11: 0.94:1.000:0.602 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,4:0.15: 2.15:1.000:0.988 0/0/0/1:4:27,5:0.26: 1.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,5:0.23: 1.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,6:0.34: 1.18:1.000:0.860 0/0/0/1:4:24,5:0.30: 0.94:1.000:0.982 0/0/0/1:4:26,6:0.34: 1.18:1.000:0.860 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,8:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,8:0.39: 1.74:0.999:0.646 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,6:0.37: 1.02:1.000:0.522 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,2:0.19:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,5:0.24: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.29: 1.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:32,8:0.37: 1.82:1.000:0.522 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,7:0.44: 1.10:1.000:0.965 0/0/1/1:4:30,10:0.50: 1.82:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.23:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,6:0.39: 0.94:1.000:0.698 0/0/0/1:4:27,6:0.33: 1.26:1.000:0.933 0/0/1/1:4:30,8:0.40: 1.66:1.000:0.789 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,6:0.26: 1.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,7:0.35: 1.58:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,4:0.16: 1.99:1.000:0.994 0/0/0/0:4:24,1:0.07: 0.62:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,4:0.22: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,7:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,9:0.53: 0.78:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,5:0.30: 0.94:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,2:0.12: 0.78:1.000:0.806 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,5:0.25: 1.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,6:0.47: 0.62:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,1:0.08: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:13,2:0.22:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.15:0.999:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,1:0.11:-0.19:1.000:0.516 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,6:0.52: 0.14:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,5:0.21: 1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.72:-0.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,4:0.31: 0.46:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,9:0.51: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,5:0.50: 0.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.07:1.000:1.000 -chr4.1 33557008 chr4.1_033557008 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:73,31:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,84:.: 1.09:1.000:. ./.:4:66,68:.: 0.19:1.000:. ./.:4:89,67:.: 0.73:1.000:. ./.:4:68,110:.: 1.26:1.000:. ./.:4:59,69:.: 0.05:1.000:. ./.:4:37,53:.:-0.87:1.000:. ./.:4:103,90:.: 1.62:1.000:. ./.:4:48,59:.:-0.46:1.000:. ./.:4:15,14:.:-2.34:1.000:. ./.:4:19,5:.:-2.46:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,29:.:-0.43:1.000:. ./.:4:89,59:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,49:.:-0.34:1.000:. ./.:4:69,35:.:-0.53:0.999:. ./.:4:133,64:.: 1.72:1.000:. ./.:4:113,43:.: 0.73:1.000:. ./.:4:94,36:.: 0.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:100,77:.: 1.23:1.000:. ./.:4:70,56:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,61:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:96,86:.: 1.35:1.000:. ./.:4:47,51:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,80:.: 0.58:1.000:. ./.:4:89,55:.: 0.44:1.000:. ./.:4:48,23:.:-1.33:1.000:. ./.:4:81,58:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,21:.:-1.59:1.000:. ./.:4:8,4:.:-2.75:1.000:. ./.:4:18,16:.:-2.22:1.000:. ./.:3:12,1:.:-2.73:0.999:. ./.:4:61,93:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,62:.: 0.94:1.000:. ./.:4:94,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:76,67:.: 0.41:1.000:. ./.:4:114,99:.: 2.10:1.000:. ./.:4:61,35:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,21:.:-1.50:1.000:. ./.:4:132,31:.: 0.89:1.000:. ./.:4:65,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:82,114:.: 1.69:1.000:. ./.:4:98,34:.: 0.15:1.000:. ./.:4:77,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:6,3:.:-2.82:1.000:. ./.:4:61,68:.: 0.07:1.000:. ./.:4:50,39:.:-0.89:1.000:. ./.:4:47,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:90,49:.: 0.31:1.000:. ./.:4:81,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:60,73:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,89:.: 0.68:1.000:. ./.:4:50,49:.:-0.65:1.000:. ./.:4:74,50:.:-0.05:1.000:. ./.:4:86,54:.: 0.34:1.000:. ./.:4:47,53:.:-0.63:1.000:. ./.:6:67,58:.:-0.02:1.000:. ./.:4:91,72:.: 0.89:1.000:. ./.:4:67,49:.:-0.24:1.000:. ./.:4:111,90:.: 1.81:1.000:. ./.:4:54,77:.: 0.12:1.000:. ./.:4:116,63:.: 1.28:1.000:. ./.:4:123,32:.: 0.70:1.000:. ./.:4:68,29:.:-0.70:1.000:. ./.:4:67,22:.:-0.89:1.000:. ./.:4:89,59:.: 0.53:0.998:. ./.:4:94,83:.: 1.23:1.000:. ./.:4:131,30:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,35:.:-1.42:1.000:. ./.:4:105,107:.: 2.08:1.000:. ./.:4:82,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:102,53:.: 0.70:1.000:. ./.:4:50,90:.: 0.34:1.000:. ./.:4:66,96:.: 0.87:1.000:. ./.:4:90,22:.:-0.34:1.000:. ./.:4:83,37:.:-0.14:1.000:. ./.:4:80,124:.: 1.88:1.000:. ./.:4:91,37:.: 0.05:0.999:. ./.:4:82,59:.: 0.36:1.000:. ./.:4:100,95:.: 1.67:1.000:. ./.:4:67,27:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,66:.:-0.29:1.000:. ./.:4:115,69:.: 1.40:1.000:. ./.:4:63,20:.:-1.04:1.000:. ./.:4:53,48:.:-0.60:1.000:. ./.:4:80,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:112,83:.: 1.67:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.40:0.999:. ./.:4:79,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:118,62:.: 1.30:1.000:. ./.:4:65,58:.:-0.07:1.000:. ./.:4:69,96:.: 0.94:1.000:. ./.:4:111,51:.: 0.87:1.000:. ./.:4:81,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:111,43:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,27:.:-0.89:1.000:. ./.:4:70,105:.: 1.18:1.000:. ./.:4:49,70:.:-0.17:1.000:. ./.:4:61,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,25:.:-1.04:1.000:. ./.:4:107,96:.: 1.86:0.999:. ./.:4:65,19:.:-1.01:1.000:. ./.:4:96,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:71,54:.:-0.02:1.000:. ./.:4:72,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,65:.:-0.02:1.000:. ./.:4:79,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:63,63:.: 0.00:1.000:. ./.:4:72,80:.: 0.63:0.999:. ./.:4:75,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:47,22:.:-1.38:1.000:. ./.:4:77,71:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,32:.:-0.14:1.000:. ./.:4:56,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:65,50:.:-0.26:1.000:. ./.:4:95,49:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:115,79:.: 1.64:1.000:. ./.:4:41,42:.:-1.04:1.000:. ./.:4:81,51:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,52:.: 0.24:1.000:. ./.:4:72,94:.: 0.97:1.000:. ./.:4:85,25:.:-0.39:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:55,39:.:-0.77:1.000:. ./.:4:73,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:84,74:.: 0.77:1.000:. ./.:4:58,47:.:-0.51:0.996:. ./.:4:68,62:.: 0.10:1.000:. ./.:4:67,59:.: 0.00:1.000:. ./.:4:98,44:.: 0.39:1.000:. ./.:4:86,28:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,78:.: 0.27:1.000:. ./.:4:68,85:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,52:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,49:.: 0.07:1.000:. ./.:4:66,62:.: 0.05:1.000:. ./.:4:60,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:105,33:.: 0.29:1.000:. ./.:4:89,72:.: 0.85:1.000:. ./.:4:75,85:.: 0.82:1.000:. ./.:4:78,32:.:-0.39:1.000:. ./.:4:85,26:.:-0.36:1.000:. ./.:4:72,80:.: 0.63:1.000:. ./.:4:75,64:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,53:.:-0.89:1.000:. ./.:4:16,6:.:-2.51:1.000:. ./.:4:61,18:.:-1.13:1.000:. ./.:4:75,92:.: 0.99:1.000:. ./.:4:96,71:.: 0.99:1.000:. ./.:4:69,97:.: 0.97:1.000:. ./.:4:60,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,57:.:-0.12:1.000:. ./.:4:87,94:.: 1.33:1.000:. ./.:4:81,56:.: 0.27:1.000:. ./.:4:55,44:.:-0.65:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:63,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:62,82:.: 0.44:1.000:. ./.:4:86,47:.: 0.17:1.000:. ./.:4:68,53:.:-0.12:1.000:. ./.:4:88,102:.: 1.55:0.999:. ./.:4:50,53:.:-0.55:1.000:. ./.:4:61,54:.:-0.26:1.000:. ./.:4:50,53:.:-0.55:1.000:. ./.:4:70,29:.:-0.65:1.000:. ./.:4:59,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:104,62:.: 0.97:1.000:. ./.:4:91,23:.:-0.29:1.000:. ./.:4:43,35:.:-1.16:1.000:. ./.:4:77,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:131,80:.: 2.05:1.000:. ./.:4:49,57:.:-0.48:1.000:. ./.:4:80,63:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,40:.: 0.24:1.000:. ./.:4:89,41:.: 0.10:1.000:. ./.:4:80,102:.: 1.35:1.000:. ./.:4:45,59:.:-0.53:1.000:. ./.:4:89,58:.: 0.51:1.000:. -chr4.1 33855700 chr4.1_033855700 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,472:.: 0.45:1.000:. ./.:4:51,321:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,381:.: 0.07:1.000:. ./.:4:130,317:.: 0.20:1.000:. ./.:4:187,436:.: 1.93:1.000:. ./.:4:234,329:.: 1.34:1.000:. ./.:4:39,205:.:-1.79:1.000:. ./.:4:58,402:.: 0.33:1.000:. ./.:4:136,300:.: 0.10:1.000:. ./.:4:35,111:.:-2.75:1.000:. ./.:4:36,102:.:-2.83:1.000:. ./.:4:100,290:.:-0.36:1.000:. ./.:4:140,288:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,382:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,377:.: 0.16:1.000:. ./.:4:82,433:.: 0.87:1.000:. ./.:4:166,309:.: 0.48:0.999:. ./.:4:271,311:.: 1.53:1.000:. ./.:4:88,518:.: 1.76:1.000:. ./.:4:82,438:.: 0.92:1.000:. ./.:4:22,102:.:-2.97:1.000:. ./.:4:64,383:.: 0.20:1.000:. ./.:4:245,266:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,396:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,49:.:-3.54:1.000:. ./.:4:82,374:.: 0.29:1.000:. ./.:4:145,324:.: 0.42:1.000:. ./.:4:71,411:.: 0.55:1.000:. ./.:4:234,286:.: 0.92:1.000:. ./.:4:125,344:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,418:.:-0.07:1.000:. ./.:4:119,264:.:-0.42:1.000:. ./.:4:25,46:.:-3.49:1.000:. ./.:4:67,83:.:-2.71:1.000:. ./.:3:6,36:.:-3.77:0.999:. ./.:4:158,378:.: 1.08:1.000:. ./.:4:55,357:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,410:.: 0.44:1.000:. ./.:4:185,230:.:-0.11:1.000:. ./.:4:66,399:.: 0.38:1.000:. ./.:4:139,334:.: 0.46:1.000:. ./.:4:155,360:.: 0.87:1.000:. ./.:4:77,394:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,290:.:-0.62:1.000:. ./.:4:124,327:.: 0.24:1.000:. ./.:4:66,366:.: 0.06:1.000:. ./.:4:131,365:.: 0.68:1.000:. ./.:4:36,309:.:-0.80:1.000:. ./.:4:101,262:.:-0.62:1.000:. ./.:4:126,252:.:-0.47:1.000:. ./.:4:116,259:.:-0.50:1.000:. ./.:4:193,426:.: 1.89:1.000:. ./.:4:138,316:.: 0.27:1.000:. ./.:4:155,378:.: 1.05:1.000:. ./.:4:66,405:.: 0.44:1.000:. ./.:4:226,228:.: 0.27:1.000:. ./.:4:119,306:.:-0.01:1.000:. ./.:4:124,304:.: 0.02:1.000:. ./.:4:51,314:.:-0.60:1.000:. ./.:6:81,292:.:-0.52:1.000:. ./.:4:80,369:.: 0.22:1.000:. ./.:4:218,255:.: 0.46:1.000:. ./.:4:68,427:.: 0.67:1.000:. ./.:4:127,213:.:-0.85:1.000:. ./.:4:67,354:.:-0.05:1.000:. ./.:4:133,383:.: 0.88:1.000:. ./.:4:46,218:.:-1.59:1.000:. ./.:4:128,340:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,416:.:-0.10:0.998:. ./.:4:138,312:.: 0.23:1.000:. ./.:4:69,360:.: 0.03:1.000:. ./.:4:100,222:.:-1.02:1.000:. ./.:4:126,314:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,542:.: 1.14:1.000:. ./.:4:243,177:.:-0.06:1.000:. ./.:4:110,250:.:-0.65:1.000:. ./.:4:154,332:.: 0.59:1.000:. ./.:4:113,295:.:-0.18:1.000:. ./.:4:75,413:.: 0.61:1.000:. ./.:4:147,343:.: 0.63:1.000:. ./.:4:157,175:.:-0.92:0.999:. ./.:4:68,422:.: 0.63:1.000:. ./.:4:72,433:.: 0.77:1.000:. ./.:4:121,290:.:-0.15:1.000:. ./.:4:121,268:.:-0.37:1.000:. ./.:4:164,349:.: 0.85:1.000:. ./.:4:62,318:.:-0.45:1.000:. ./.:4:188,220:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,368:.: 0.14:1.000:. ./.:4:65,360:.:-0.01:1.000:. ./.:4:57,258:.:-1.09:0.999:. ./.:4:183,262:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,494:.: 0.66:1.000:. ./.:4:107,265:.:-0.53:1.000:. ./.:4:119,322:.: 0.14:1.000:. ./.:4:53,324:.:-0.48:1.000:. ./.:4:129,312:.: 0.14:1.000:. ./.:4:105,261:.:-0.59:1.000:. ./.:4:227,291:.: 0.90:1.000:. ./.:4:143,316:.: 0.32:1.000:. ./.:4:40,211:.:-1.72:1.000:. ./.:4:181,270:.: 0.24:1.000:. ./.:4:80,189:.:-1.54:1.000:. ./.:4:56,355:.:-0.15:0.999:. ./.:4:54,294:.:-0.77:1.000:. ./.:4:75,385:.: 0.33:1.000:. ./.:4:129,260:.:-0.37:1.000:. ./.:4:123,273:.:-0.30:1.000:. ./.:4:315,345:.: 2.29:1.000:. ./.:4:66,402:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,350:.:-0.13:1.000:. ./.:4:177,383:.: 1.31:1.000:. ./.:4:124,335:.: 0.32:0.999:. ./.:4:61,350:.:-0.15:1.000:. ./.:4:55,219:.:-1.49:1.000:. ./.:4:198,244:.: 0.15:1.000:. ./.:4:61,321:.:-0.43:1.000:. ./.:4:66,277:.:-0.82:1.000:. ./.:4:63,388:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,391:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,449:.: 0.89:1.000:. ./.:4:48,338:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,343:.:-0.16:1.000:. ./.:4:116,313:.: 0.03:1.000:. ./.:4:70,403:.: 0.46:1.000:. ./.:4:215,263:.: 0.51:1.000:. ./.:4:56,425:.: 0.54:1.000:. ./.:4:91,200:.:-1.33:1.000:. ./.:4:40,278:.:-1.06:1.000:. ./.:4:79,232:.:-1.13:1.000:. ./.:4:160,183:.:-0.82:1.000:. ./.:4:78,391:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,268:.:-1.11:0.996:. ./.:4:1,425:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,349:.:-0.16:1.000:. ./.:4:166,461:.: 1.97:1.000:. ./.:4:133,318:.: 0.24:1.000:. ./.:4:148,228:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,247:.:-0.82:1.000:. ./.:4:60,353:.:-0.13:1.000:. ./.:4:144,330:.: 0.47:1.000:. ./.:4:111,246:.:-0.68:1.000:. ./.:4:49,381:.: 0.04:1.000:. ./.:4:104,243:.:-0.78:1.000:. ./.:4:92,520:.: 1.82:1.000:. ./.:4:199,416:.: 1.85:1.000:. ./.:4:197,282:.: 0.52:1.000:. ./.:4:141,367:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,529:.: 1.01:1.000:. ./.:4:68,377:.: 0.18:1.000:. ./.:4:142,382:.: 0.96:1.000:. ./.:4:202,259:.: 0.34:1.000:. ./.:4:22,69:.:-3.29:1.000:. ./.:4:51,295:.:-0.79:1.000:. ./.:4:222,243:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,553:.: 1.24:1.000:. ./.:4:85,510:.: 1.66:1.000:. ./.:4:78,384:.: 0.35:1.000:. ./.:4:154,187:.:-0.84:1.000:. ./.:4:66,446:.: 0.84:1.000:. ./.:4:130,311:.: 0.14:1.000:. ./.:4:133,244:.:-0.48:1.000:. ./.:4:69,351:.:-0.06:1.000:. ./.:4:128,355:.: 0.56:1.000:. ./.:4:140,329:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,530:.: 1.02:1.000:. ./.:4:53,332:.:-0.40:1.000:. ./.:4:128,352:.: 0.53:0.999:. ./.:4:130,361:.: 0.64:1.000:. ./.:4:120,273:.:-0.33:1.000:. ./.:4:105,288:.:-0.33:1.000:. ./.:4:58,285:.:-0.82:1.000:. ./.:4:59,356:.:-0.11:1.000:. ./.:4:69,365:.: 0.08:1.000:. ./.:4:135,272:.:-0.19:1.000:. ./.:4:111,247:.:-0.67:1.000:. ./.:4:159,373:.: 1.04:1.000:. ./.:4:72,382:.: 0.27:1.000:. ./.:4:247,307:.: 1.25:1.000:. ./.:4:24,419:.: 0.16:1.000:. ./.:4:60,436:.: 0.68:1.000:. ./.:4:126,333:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,487:.: 1.38:1.000:. ./.:4:116,271:.:-0.38:1.000:. ./.:4:152,325:.: 0.50:1.000:. -chr4.1 34020777 chr4.1_034020777 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,174:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,291:.: 1.49:1.000:. ./.:4:1,115:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,298:.: 1.60:1.000:. ./.:4:1,229:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.83:0.999:. ./.:4:0,160:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,42:.:-2.27:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,317:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,354:.: 2.45:1.000:. ./.:4:0,360:.: 2.54:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.47:1.000:. ./.:3:0,44:.:-2.24:0.999:. ./.:4:0,237:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,263:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1,314:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,229:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,274:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,79:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,334:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,200:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,300:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,262:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,337:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.88:1.000:. ./.:6:0,130:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,294:.: 1.54:1.000:. ./.:4:1,108:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,270:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.35:0.998:. ./.:4:0,225:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,93:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,266:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,310:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.62:0.999:. ./.:4:0,187:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.20:1.000:. ./.:4:2,258:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,125:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.33:0.999:. ./.:4:0,274:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,270:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,226:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.76:0.999:. ./.:4:0,189:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,140:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,226:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,279:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.62:0.999:. ./.:4:0,224:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,101:.:-1.38:1.000:. ./.:4:1,322:.: 1.98:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,120:.:-1.09:1.000:. ./.:4:2,198:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,211:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,303:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,111:.:-1.23:0.996:. ./.:4:0,71:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,107:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,298:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.72:1.000:. ./.:4:1,188:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,271:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,327:.: 2.04:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,81:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.74:1.000:. ./.:4:5,133:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,262:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.93:0.999:. ./.:4:0,206:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,263:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,118:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,303:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,108:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,275:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.43:1.000:. -chr4.1 34265620 chr4.1_034265620 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:25,0:.: 3.69:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.36:0.998:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,1:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.83:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,1:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.12:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.79:0.996:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 1.79:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.07:1.000:. -chr4.1 34712800 chr4.1_034712800 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:60,47:0.50: 0.57:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,134:0.84: 2.39:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,59:0.55: 1.01:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,91:0.80: 1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,14:0.76:-1.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,60:0.64: 0.65:1.000:0.732 0/1/1/1:4:47,98:0.78: 1.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,138:1.00: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,165:0.84: 3.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,65:0.65: 0.86:0.999:0.803 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,117:0.78: 2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,6:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,11:0.65:-1.65:1.000:0.793 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,50:0.51: 0.70:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.34:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,39:0.57:-0.12:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.29:1.000:1.000 1/1/1:3:1,15:0.96:-1.75:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,101:0.99: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,104:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,30:0.48:-0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,48:0.63: 0.14:1.000:0.528 1/1/1/1:4:1,94:0.99: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,89:0.83: 0.91:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,36:0.82:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,27:0.45:-0.29:1.000:0.982 0/1/1/1:4:10,39:0.86:-0.91:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,89:0.76: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,75:0.81: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,10:0.31:-0.60:1.000:0.973 0/1/1/1:4:46,82:0.76: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,35:0.58:-0.37:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,33:0.63:-0.57:1.000:0.509 0/0/1/1/1/1:6:29,34:0.64:-0.55:1.000:0.858 0/1/1/1:4:30,39:0.67:-0.40:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,99:0.81: 1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,41:0.60:-0.12:1.000:0.799 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,42:0.55: 0.09:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.50:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,100:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,62:0.84:-0.06:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,41:0.59:-0.09:1.000:0.861 1/1/1/1:4:0,88:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,42:0.53: 0.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:39,89:0.80: 1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.35:0.999:1.000 0/1/1/1:4:31,38:0.65:-0.40:1.000:0.801 0/1/1/1:4:34,48:0.70:-0.06:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,64:0.76: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,36:0.56:-0.27:1.000:0.961 0/1/1/1:4:33,114:0.85: 1.60:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,41:0.55: 0.04:0.999:0.979 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 2.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,43:0.58: 0.04:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,55:0.73: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,40:0.61:-0.19:1.000:0.708 0/1/1/1:4:25,31:0.65:-0.73:1.000:0.833 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.01:0.999:1.000 0/0/0/1:4:36,6:0.30:-1.09:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,85:0.77: 1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,66:0.59: 1.16:1.000:0.848 0/1/1/1:4:52,141:0.82: 2.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,41:0.60:-0.12:1.000:0.799 0/0/0/1:4:64,6:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,90:0.80: 1.11:0.999:1.000 0/1/1/1:4:43,49:0.63: 0.19:1.000:0.515 0/1/1/1:4:18,43:0.80:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,44:0.71:-0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:46,44:0.57: 0.14:1.000:0.954 0/1/1/1:4:26,89:0.85: 0.78:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,96:0.68: 2.11:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,27:0.49:-0.55:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.57:-0.09:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 1.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.91:0.996:1.000 0/1/1/1:4:32,69:0.79: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,42:0.60:-0.06:1.000:0.802 0/0/1/1:4:53,51:0.57: 0.50:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,110:0.99: 0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,48:0.64: 0.11:1.000:0.634 0/1/1/1:4:30,46:0.73:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,116:0.80: 2.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,46:0.60: 0.14:1.000:0.814 0/0/1/1:4:68,43:0.46: 0.68:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,82:0.75: 1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,143:1.00: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,70:0.56: 1.52:1.000:0.962 1/1/1/1:4:1,15:0.96:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,1:0.21:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,100:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,50:0.56: 0.50:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,98:0.77: 1.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,33:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,51:0.58: 0.47:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,44:0.70:-0.24:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 1.57:0.999:1.000 0/0/0/1:4:55,4:0.24:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,85:0.79: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,42:0.71:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:52,52:0.58: 0.50:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,151:1.00: 1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,53:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,26:0.49:-0.60:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,128:0.99: 1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,59:0.63: 0.65:1.000:0.583 0/1/1/1:4:38,90:0.80: 1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,69:0.62: 1.16:1.000:0.518 1/1/1/1:4:0,109:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,88:0.84: 0.80:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.37:1.000:1.000 -chr4.1 34857483 chr4.1_034857483 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:46,163:0.79: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,83:0.54:-0.01:1.000:0.987 0/0/1/1:4:83,66:0.46:-0.21:1.000:0.988 0/1/1/1:4:52,113:0.69: 0.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:119,113:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,106:0.55: 0.98:1.000:0.982 0/0/0/1:4:71,32:0.34:-1.32:1.000:0.851 0/0/1/1:4:82,97:0.55: 0.52:1.000:0.976 0/0/1/1:4:82,83:0.52: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,18:0.39:-2.59:1.000:0.652 0/1/1/1:4:8,13:0.63:-3.29:1.000:0.554 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,119:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,73:0.47: 0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,93:0.51: 0.71:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 0.16:0.999:1.000 0/0/0/1:4:146,38:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,152:0.73: 1.27:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,189:1.00: 0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-2.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,117:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,117:0.77:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,65:0.49:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,7:0.39:-3.34:1.000:0.736 0/0/1/1:4:94,98:0.52: 0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,152:0.76: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,44:0.32:-0.11:1.000:0.948 0/1/1/1:4:52,131:0.72: 0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,150:0.76: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,113:0.56: 1.17:1.000:0.967 0/1/1/1:4:52,123:0.71: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-3.56:1.000:0.923 0/0/1/1:4:28,15:0.38:-2.76:1.000:0.526 0/1/1:3:5,8:0.63:-3.49:0.999:1.000 0/0/1/1:4:83,98:0.55: 0.57:1.000:0.977 0/1/1/1:4:44,138:0.77: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,134:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,154:0.77: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,93:0.55: 0.40:1.000:0.983 0/1/1/1:4:43,108:0.72:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,138:0.79: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,160:0.77: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,83:0.53: 0.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:138,39:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,112:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,151:0.68: 1.60:1.000:0.962 0/1/1/1:4:9,24:0.74:-3.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,83:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,87:0.80:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,107:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,123:0.71: 0.45:1.000:0.991 0/1/1/1:4:45,91:0.68:-0.52:1.000:0.950 0/1/1/1:4:48,161:0.78: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,85:0.56:-0.06:1.000:0.967 0/1/1/1:4:37,146:0.80: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,62:0.39: 0.28:1.000:0.721 0/1/1/1:4:44,158:0.79: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,85:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/1/1/1/1/1:6:29,109:0.80:-0.47:1.000:0.909 0/1/1/1:4:40,115:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,138:0.71: 0.98:1.000:0.989 0/0/1/1:4:92,83:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,86:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,90:0.53: 0.40:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,235:1.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,36:0.44:-1.75:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,79:0.53:-0.13:0.998:0.992 0/1/1/1:4:42,126:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,134:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,46:0.49:-1.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,166:0.79: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,104:0.54: 0.95:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,89:0.61:-0.23:1.000:0.669 0/0/0/1:4:127,23:0.20:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,137:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,129:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,46:0.30: 0.45:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,163:0.75: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,128:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,127:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,23:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,82:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:21,83:0.80:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,125:0.79: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,76:0.55:-0.37:1.000:0.983 0/0/1/1:4:90,83:0.49: 0.37:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-1.00:0.999:1.000 0/1/1/1:4:42,123:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,73:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,104:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,41:0.29: 0.08:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,144:0.76: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,76:0.54:-0.33:1.000:0.988 0/1/1/1:4:32,92:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,121:0.70: 0.40:1.000:0.988 0/0/1/1:4:90,115:0.57: 1.15:1.000:0.940 0/0/1/1:4:43,47:0.53:-1.63:1.000:0.991 0/1/1/1:4:37,142:0.80: 0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,74:0.47: 0.11:0.999:0.993 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,111:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,70:0.57:-0.78:1.000:0.943 0/0/1/1:4:97,99:0.52: 0.93:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,192:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,79:0.50: 0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,179:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,176:0.73: 2.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:99,73:0.44: 0.35:0.999:0.973 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,77:0.73:-1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,126:0.71: 0.54:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,105:0.82:-0.69:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,162:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,67:0.55:-0.81:1.000:0.978 0/0/1/1:4:93,92:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,94:0.55: 0.45:1.000:0.984 0/1/1/1:4:40,156:0.80: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,76:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,90:0.53: 0.40:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,137:0.74: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,45:0.30: 0.33:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,50:0.46:-1.05:1.000:0.985 0/1/1/1:4:26,112:0.82:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,79:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,68:0.67:-1.32:0.996:0.920 0/0/1/1:4:94,93:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,129:0.84:-0.06:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,176:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,113:0.74:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,65:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,26:0.26:-0.98:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,92:0.78:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,152:0.79: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,65:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,123:0.77: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,82:0.74:-1.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,157:0.74: 1.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:62,168:0.74: 1.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,70:0.45: 0.08:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,141:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,88:0.59:-0.16:1.000:0.840 0/0/1/1:4:112,87:0.46: 1.00:1.000:0.984 0/1/1/1:4:52,132:0.73: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,26:0.71:-2.91:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,61:0.42:-0.08:1.000:0.909 0/0/1/1:4:79,80:0.52: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,48:0.29: 0.76:1.000:0.991 0/1/1/1:4:55,134:0.72: 0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,100:0.79:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,91:0.53: 0.40:1.000:0.990 0/1/1/1:4:24,101:0.81:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,127:0.74: 0.37:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,121:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,31:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,99:0.57: 0.45:1.000:0.936 0/1/1/1:4:49,113:0.71: 0.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,74:0.56:-0.52:0.999:0.973 0/1/1/1:4:34,139:0.81: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,122:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,105:0.68:-0.01:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,122:0.73: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,54:0.39:-0.18:1.000:0.652 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,123:0.79: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,95:0.47: 1.32:1.000:0.990 0/1/1/1:4:51,142:0.74: 0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,153:0.82: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,74:0.52:-0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,120:0.74: 0.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,49:0.29: 1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:66,56:0.47:-0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,125:0.71: 0.47:1.000:0.994 -chr4.1 34970650 chr4.1_034970650 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:177,44:.:-0.32:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:165,42:.:-0.63:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:239,52:.: 1.20:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:166,46:.:-0.52:1.000:. ./.:4:117,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:129,35:.:-1.56:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:173,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:187,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:156,37:.:-0.93:1.000:. ./.:4:195,34:.:-0.15:0.999:. ./.:4:244,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:236,74:.: 1.61:1.000:. ./.:4:273,72:.: 2.37:1.000:. ./.:4:86,19:.:-2.84:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:175,47:.:-0.30:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,23:.:-2.93:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:134,27:.:-1.63:1.000:. ./.:4:130,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:131,0:.:-2.28:1.000:. ./.:3:84,17:.:-2.93:0.999:. ./.:4:235,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:207,40:.: 0.24:1.000:. ./.:4:167,37:.:-0.69:1.000:. ./.:4:298,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:171,38:.:-0.58:1.000:. ./.:4:373,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:212,36:.: 0.27:1.000:. ./.:4:161,22:.:-1.15:1.000:. ./.:4:158,46:.:-0.69:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,53:.:-0.06:1.000:. ./.:4:162,33:.:-0.89:1.000:. ./.:4:219,47:.: 0.66:1.000:. ./.:4:165,34:.:-0.80:1.000:. ./.:4:152,34:.:-1.08:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:191,38:.:-0.15:1.000:. ./.:6:186,44:.:-0.13:1.000:. ./.:4:200,43:.: 0.16:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:203,57:.: 0.53:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:267,54:.: 1.85:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:211,33:.: 0.18:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.11:0.998:. ./.:4:237,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:144,28:.:-1.39:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:154,30:.:-1.13:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:224,45:.: 0.72:1.000:. ./.:4:213,51:.: 0.61:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:210,49:.: 0.50:1.000:. ./.:4:195,53:.: 0.27:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:162,36:.:-0.82:1.000:. ./.:4:170,31:.:-0.76:1.000:. ./.:4:184,46:.:-0.13:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:144,35:.:-1.23:0.999:. ./.:4:268,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:175,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:252,53:.: 1.50:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:185,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:211,36:.: 0.24:1.000:. ./.:4:190,30:.:-0.34:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.35:0.999:. ./.:4:199,44:.: 0.16:1.000:. ./.:4:162,35:.:-0.84:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:222,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:248,66:.: 1.70:1.000:. ./.:4:187,46:.:-0.06:1.000:. ./.:4:232,45:.: 0.90:1.000:. ./.:4:224,55:.: 0.94:1.000:. ./.:4:213,39:.: 0.35:0.999:. ./.:4:188,43:.:-0.10:1.000:. ./.:4:153,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:192,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:195,42:.: 0.03:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:198,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:171,24:.:-0.89:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:156,37:.:-0.93:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.04:0.996:. ./.:4:188,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:170,41:.:-0.54:1.000:. ./.:4:204,58:.: 0.57:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:164,36:.:-0.78:1.000:. ./.:4:172,42:.:-0.47:1.000:. ./.:4:253,55:.: 1.57:1.000:. ./.:4:326,1:.: 1.98:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:223,42:.: 0.63:1.000:. ./.:4:205,42:.: 0.24:1.000:. ./.:4:177,36:.:-0.50:1.000:. ./.:4:350,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:207,45:.: 0.35:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:147,35:.:-1.17:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:209,54:.: 0.59:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:188,40:.:-0.17:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:169,33:.:-0.73:1.000:. ./.:4:200,48:.: 0.27:1.000:. ./.:4:125,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:180,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:268,1:.: 0.72:0.999:. ./.:4:158,41:.:-0.80:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:185,51:.: 0.00:1.000:. ./.:4:138,33:.:-1.41:1.000:. ./.:4:180,49:.:-0.15:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:140,36:.:-1.30:1.000:. ./.:4:141,38:.:-1.23:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:193,36:.:-0.15:1.000:. ./.:4:184,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:225,45:.: 0.74:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:130,26:.:-1.73:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.90:1.000:. -chr4.1 35087878 chr4.1_035087878 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,20:0.41: 0.21:1.000:0.854 0/1/1/1:4:7,18:0.64:-0.62:1.000:0.708 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.39: 0.50:1.000:0.639 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,26:0.22: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,15:0.67:-0.86:1.000:0.905 0/0/0/1:4:33,18:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,22:0.36: 0.60:1.000:0.666 0/0/0/1:4:30,21:0.33: 0.65:1.000:0.937 0/1/1/1:4:4,23:0.75:-0.52:0.999:0.999 0/0/0/1:4:75,15:0.12: 2.55:1.000:0.718 0/0/0/1:4:44,32:0.34: 1.87:1.000:0.884 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,23:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,5:0.29:-1.20:1.000:0.991 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,22:0.28: 0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:44,27:0.29: 1.62:1.000:0.994 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,25:0.40: 0.74:1.000:0.813 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,3:0.08:-0.62:1.000:0.974 0/0/0:3:6,0:0.00:-1.55:0.999:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,33:0.73: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,26:0.36: 1.04:1.000:0.655 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,21:0.41: 0.31:1.000:0.863 0/0/0/1:4:21,16:0.35:-0.04:1.000:0.772 0/1/1/1:4:7,26:0.70:-0.23:1.000:0.983 0/0/0/1:4:17,10:0.27:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,15:0.67:-0.86:1.000:0.905 0/0/0/1:4:32,24:0.35: 0.89:1.000:0.816 0/0/0/1:4:11,8:0.34:-0.91:1.000:0.884 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,14:0.60:-0.82:1.000:0.808 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,17:0.42:-0.13:1.000:0.917 0/0/0/1:4:25,17:0.32: 0.21:1.000:0.961 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,5:1.00:-1.59:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:33,16:0.23: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.46: 0.06:1.000:0.985 0/0/0/1:4:31,19:0.28: 0.60:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,22:0.70:-0.47:1.000:0.981 0/0/0/1:4:20,14:0.33:-0.18:1.000:0.937 0/1/1/1:4:6,19:0.67:-0.62:1.000:0.938 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.62:0.998:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,6:0.25:-1.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,17:0.28: 0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,27:0.72:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,29:0.28: 1.91:1.000:0.995 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,29:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,12:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,26:0.23: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,15:0.36:-0.18:1.000:0.647 0/0/0/1:4:28,14:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,15:0.32:-0.04:1.000:0.960 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.53:-0.67:0.999:0.992 0/0/0/1:4:28,19:0.32: 0.45:1.000:0.963 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,21:0.65:-0.43:1.000:0.745 0/0/0/1:4:59,23:0.20: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,19:0.38: 0.21:1.000:0.541 0/0/0/1:4:41,25:0.28: 1.38:1.000:0.995 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,12:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:7,16:0.62:-0.72:1.000:0.547 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.01:0.999:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,21:0.36: 0.50:1.000:0.703 0/0/0/1:4:55,19:0.18: 1.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,21:0.17: 2.50:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,22:0.63:-0.33:1.000:0.606 0/0/1/1:4:20,21:0.45: 0.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:8,15:0.59:-0.72:1.000:0.886 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,33:0.28: 2.45:0.999:0.996 0/1/1/1:4:6,20:0.68:-0.57:1.000:0.959 0/0/0/1:4:13,9:0.32:-0.77:1.000:0.948 0/0/0/1:4:48,19:0.20: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.57:-0.91:1.000:0.949 0/0/1/1:4:10,17:0.57:-0.52:1.000:0.953 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,21:0.33: 0.65:1.000:0.937 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,39:0.31: 2.94:1.000:0.976 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,21:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,26:0.72:-0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,14:0.38:-0.33:1.000:0.528 0/0/0/1:4:22,15:0.32:-0.04:1.000:0.960 0/0/0/1:4:43,31:0.33: 1.77:1.000:0.899 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.86:0.996:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:7,22:0.67:-0.43:1.000:0.934 0/0/0/1:4:38,13:0.18: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,16:0.38:-0.13:1.000:0.620 0/0/0/1:4:56,15:0.15: 1.62:1.000:0.987 0/1/1/1:4:3,16:0.74:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,25:0.22: 2.06:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,26:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,15:0.73:-0.96:1.000:0.998 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,32:0.38: 1.57:1.000:0.620 0/0/1/1:4:21,24:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.47: 0.40:1.000:0.991 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,21:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,17:0.57:-0.52:1.000:0.953 0/0/1/1:4:28,26:0.42: 0.79:1.000:0.893 0/0/0/1:4:44,19:0.21: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:67,25:0.19: 2.65:0.999:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,15:0.67:-0.86:1.000:0.905 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,22:0.26: 1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,15:0.64:-0.82:1.000:0.653 0/0/1/1:4:25,28:0.48: 0.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,37:0.41: 1.96:1.000:0.839 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,14:0.40:-0.38:1.000:0.756 0/0/0/1:4:25,5:0.12:-0.38:1.000:0.718 0/1/1/1:4:12,32:0.65: 0.31:1.000:0.771 0/0/1/1:4:12,24:0.60:-0.08:1.000:0.808 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,14:0.17: 0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,19:0.39: 0.16:1.000:0.714 -chr4.1 35429313 chr4.1_035429313 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:273,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.90:0.999:. ./.:4:319,3:.: 1.04:1.000:. ./.:4:397,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:309,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.18:1.000:. ./.:3:71,1:.:-2.37:0.999:. ./.:4:329,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:305,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:343,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:218,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:240,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:202,1:.:-0.58:1.000:. ./.:6:161,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.13:0.998:. ./.:4:249,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:147,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:256,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.95:0.999:. ./.:4:194,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:249,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:140,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:198,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:350,2:.: 1.45:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.37:0.999:. ./.:4:220,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:168,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:185,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.44:0.996:. ./.:4:226,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:201,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:442,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:167,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:315,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:400,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:270,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.80:0.999:. ./.:4:315,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:211,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:364,2:.: 1.64:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:326,2:.: 1.12:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:397,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.48:1.000:. -chr4.1 35666092 chr4.1_035666092 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,266:.: 1.51:1.000:. ./.:4:134,112:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,220:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,271:.: 0.18:1.000:. ./.:4:72,210:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.97:1.000:. ./.:4:36,89:.:-2.07:1.000:. ./.:4:74,231:.: 0.71:1.000:. ./.:4:63,219:.: 0.35:1.000:. ./.:4:29,47:.:-2.83:1.000:. ./.:4:0,76:.:-2.83:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.19:1.000:. ./.:4:75,197:.: 0.20:1.000:. ./.:4:89,203:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.79:0.999:. ./.:4:75,180:.:-0.06:1.000:. ./.:4:83,243:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,53:.:-3.19:1.000:. ./.:4:0,327:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.80:1.000:. ./.:4:65,210:.: 0.25:1.000:. ./.:4:8,23:.:-3.53:1.000:. ./.:4:57,212:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,196:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,342:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.35:1.000:. ./.:4:90,213:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,33:.:-3.50:1.000:. ./.:4:13,56:.:-2.94:1.000:. ./.:3:7,16:.:-3.65:0.999:. ./.:4:0,246:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,305:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.03:1.000:. ./.:4:60,193:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,304:.: 0.69:1.000:. ./.:4:79,217:.: 0.57:1.000:. ./.:4:64,215:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,319:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,316:.: 0.88:1.000:. ./.:4:12,38:.:-3.23:1.000:. ./.:4:68,208:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,315:.: 0.86:1.000:. ./.:4:50,189:.:-0.31:1.000:. ./.:4:63,209:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.38:1.000:. ./.:4:89,194:.: 0.37:1.000:. ./.:6:0,229:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.40:1.000:. ./.:4:70,232:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.56:1.000:. ./.:4:84,249:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.94:1.000:. ./.:4:36,85:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,212:.: 0.54:0.998:. ./.:4:67,220:.: 0.43:1.000:. ./.:4:2,278:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,93:.:-2.12:1.000:. ./.:4:76,214:.: 0.48:1.000:. ./.:4:91,248:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.45:1.000:. ./.:4:58,187:.:-0.22:1.000:. ./.:4:70,147:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.66:1.000:. ./.:4:61,227:.: 0.45:1.000:. ./.:4:85,230:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.01:1.000:. ./.:4:75,224:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,239:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.17:1.000:. ./.:4:51,172:.:-0.56:1.000:. ./.:4:76,194:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,135:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.09:1.000:. ./.:4:64,178:.:-0.26:1.000:. ./.:4:60,193:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,193:.:-1.02:0.999:. ./.:4:0,272:.: 0.20:1.000:. ./.:4:64,240:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.40:1.000:. ./.:4:77,186:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.26:1.000:. ./.:4:56,190:.:-0.20:1.000:. ./.:4:66,183:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.01:1.000:. ./.:4:65,221:.: 0.42:1.000:. ./.:4:46,101:.:-1.73:1.000:. ./.:4:1,241:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.50:1.000:. ./.:4:59,180:.:-0.31:0.999:. ./.:4:0,214:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,191:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,179:.: 0.12:1.000:. ./.:4:85,247:.: 1.13:1.000:. ./.:4:2,280:.: 0.35:1.000:. ./.:4:71,212:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.91:1.000:. ./.:4:70,194:.: 0.08:0.999:. ./.:4:0,311:.: 0.80:1.000:. ./.:4:50,139:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,148:.:-1.72:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1,240:.:-0.28:1.000:. ./.:4:61,157:.:-0.64:1.000:. ./.:4:96,233:.: 1.08:1.000:. ./.:4:54,208:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,325:.: 1.03:1.000:. ./.:4:79,225:.: 0.69:1.000:. ./.:4:58,196:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,264:.: 0.09:1.000:. ./.:4:66,203:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,216:.: 0.29:1.000:. ./.:4:40,162:.:-0.88:0.996:. ./.:4:78,225:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,341:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.35:1.000:. ./.:4:66,183:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,174:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,328:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,349:.: 1.39:1.000:. ./.:4:74,215:.: 0.46:1.000:. ./.:4:69,183:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.02:1.000:. ./.:4:19,36:.:-3.16:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,347:.: 1.36:1.000:. ./.:4:89,210:.: 0.62:1.000:. ./.:4:89,247:.: 1.19:1.000:. ./.:4:64,195:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,319:.: 0.94:1.000:. ./.:4:65,220:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,185:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,271:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.11:1.000:. ./.:4:78,237:.: 0.86:1.000:. ./.:4:73,217:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.96:1.000:. ./.:4:168,140:.: 0.76:0.999:. ./.:4:0,291:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.73:1.000:. ./.:4:72,227:.: 0.62:1.000:. ./.:4:73,195:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,218:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.38:1.000:. ./.:4:89,193:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,394:.: 2.09:1.000:. ./.:4:83,212:.: 0.55:1.000:. ./.:4:56,157:.:-0.71:1.000:. ./.:4:71,200:.: 0.18:1.000:. -chr4.1 35885959 chr4.1_035885959 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:111,38:.: 0.80:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:107,24:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,70:.: 0.45:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:101,27:.: 0.19:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:86,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,25:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,3:.:-3.03:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:89,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:66,70:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,65:.: 0.39:1.000:. ./.:4:63,43:.:-0.45:1.000:. ./.:4:93,29:.: 0.01:1.000:. ./.:4:63,58:.:-0.02:0.999:. ./.:4:98,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:92,83:.: 1.56:1.000:. ./.:4:127,42:.: 1.39:1.000:. ./.:4:5,4:.:-3.29:1.000:. ./.:4:97,41:.: 0.48:1.000:. ./.:4:99,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,7:.:-3.12:1.000:. ./.:4:87,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,35:.:-0.05:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,72:.: 1.53:1.000:. ./.:4:54,59:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,22:.: 0.22:1.000:. ./.:4:72,22:.:-0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:15,13:.:-2.74:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.44:0.999:. ./.:4:112,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,68:.: 0.54:1.000:. ./.:4:54,38:.:-0.86:1.000:. ./.:4:91,19:.:-0.34:1.000:. ./.:4:128,28:.: 1.01:1.000:. ./.:4:99,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:72,57:.: 0.22:1.000:. ./.:4:89,34:.: 0.04:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:61,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:101,74:.: 1.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:61,28:.:-0.95:1.000:. ./.:4:126,22:.: 0.77:1.000:. ./.:4:136,26:.: 1.18:1.000:. ./.:4:89,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:102,31:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,21:.:-0.54:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.16:1.000:. ./.:6:103,4:.:-0.43:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:50,31:.:-1.19:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:78,9:.:-1.01:1.000:. ./.:4:75,65:.: 0.54:1.000:. ./.:4:98,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,33:.:-0.83:1.000:. ./.:4:88,58:.: 0.72:1.000:. ./.:4:103,32:.: 0.39:0.998:. ./.:4:114,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:82,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:61,19:.:-1.22:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:101,30:.: 0.28:1.000:. ./.:4:66,53:.:-0.07:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:105,27:.: 0.31:1.000:. ./.:4:72,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:75,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:49,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:110,27:.: 0.45:1.000:. ./.:4:156,37:.: 2.09:1.000:. ./.:4:60,51:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:97,67:.: 1.24:1.000:. ./.:4:73,39:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:90,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:90,31:.:-0.02:1.000:. ./.:4:54,28:.:-1.16:0.999:. ./.:4:76,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:119,30:.: 0.80:1.000:. ./.:4:46,44:.:-0.92:1.000:. ./.:4:114,35:.: 0.80:1.000:. ./.:4:103,28:.: 0.28:1.000:. ./.:4:118,24:.: 0.60:1.000:. ./.:4:95,18:.:-0.25:1.000:. ./.:4:126,19:.: 0.69:1.000:. ./.:4:110,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:128,28:.: 1.01:1.000:. ./.:4:53,35:.:-0.98:1.000:. ./.:4:122,28:.: 0.83:0.999:. ./.:4:87,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:68,50:.:-0.10:1.000:. ./.:4:57,32:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,61:.:-0.10:1.000:. ./.:4:98,77:.: 1.56:1.000:. ./.:4:116,23:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:122,17:.: 0.51:0.999:. ./.:4:82,64:.: 0.72:1.000:. ./.:4:49,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,73:.: 0.83:1.000:. ./.:4:107,26:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,43:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,36:.:-1.01:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:81,64:.: 0.69:1.000:. ./.:4:129,22:.: 0.86:1.000:. ./.:4:115,32:.: 0.74:1.000:. ./.:4:115,31:.: 0.72:1.000:. ./.:4:106,27:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,63:.: 0.83:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,25:.:-0.66:1.000:. ./.:4:57,34:.:-0.89:1.000:. ./.:4:87,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:101,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:54,50:.:-0.51:1.000:. ./.:4:62,14:.:-1.33:0.996:. ./.:4:103,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:88,91:.: 1.68:1.000:. ./.:4:80,42:.: 0.01:1.000:. ./.:4:93,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,21:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,51:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:83,50:.: 0.34:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:86,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:130,45:.: 1.56:1.000:. ./.:4:140,37:.: 1.62:1.000:. ./.:4:103,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:80,46:.: 0.13:1.000:. ./.:4:82,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:115,42:.: 1.04:1.000:. ./.:4:99,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:9,1:.:-3.26:1.000:. ./.:4:76,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:96,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:103,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:103,33:.: 0.42:1.000:. ./.:4:68,50:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,38:.: 0.72:1.000:. ./.:4:81,23:.:-0.51:1.000:. ./.:4:82,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:62,53:.:-0.19:1.000:. ./.:4:95,38:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,26:.:-0.16:1.000:. ./.:4:84,34:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:105,31:.: 0.42:0.999:. ./.:4:142,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:83,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:84,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:44,44:.:-0.98:1.000:. ./.:4:83,28:.:-0.31:1.000:. ./.:4:55,67:.: 0.01:1.000:. ./.:4:61,55:.:-0.16:1.000:. ./.:4:93,31:.: 0.07:1.000:. ./.:4:86,31:.:-0.13:1.000:. ./.:4:117,28:.: 0.69:1.000:. ./.:4:98,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:115,4:.:-0.07:1.000:. ./.:4:85,71:.: 1.01:1.000:. ./.:4:93,84:.: 1.62:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:74,27:.:-0.60:1.000:. ./.:4:93,25:.:-0.10:1.000:. -chr4.1 35990571 chr4.1_035990571 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:112,297:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,363:.:-0.32:1.000:. ./.:4:97,322:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,389:.:-0.01:1.000:. ./.:4:137,364:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,476:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,395:.: 0.06:1.000:. ./.:4:127,324:.: 0.74:1.000:. ./.:4:4,191:.:-2.34:1.000:. ./.:4:39,126:.:-2.70:1.000:. ./.:4:0,398:.: 0.10:1.000:. ./.:4:87,306:.: 0.04:1.000:. ./.:4:124,333:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,385:.:-0.06:1.000:. ./.:4:114,315:.: 0.47:1.000:. ./.:4:120,319:.: 0.59:0.999:. ./.:4:0,471:.: 0.98:1.000:. ./.:4:156,456:.: 2.67:1.000:. ./.:4:128,384:.: 1.47:1.000:. ./.:4:75,164:.:-1.81:1.000:. ./.:4:0,430:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,349:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,425:.: 0.43:1.000:. ./.:4:38,94:.:-3.10:1.000:. ./.:4:0,424:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,421:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,499:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,480:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,450:.: 0.73:1.000:. ./.:4:100,248:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,92:.:-3.58:1.000:. ./.:4:0,228:.:-1.94:1.000:. ./.:3:20,61:.:-3.71:0.999:. ./.:4:0,431:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,405:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,371:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,435:.: 0.55:1.000:. ./.:4:115,288:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,287:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,456:.: 0.80:1.000:. ./.:4:97,254:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,446:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,462:.: 0.87:1.000:. ./.:4:22,71:.:-3.57:1.000:. ./.:4:115,253:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,123:.:-2.56:1.000:. ./.:4:0,353:.:-0.44:1.000:. ./.:4:131,368:.: 1.32:1.000:. ./.:4:102,274:.:-0.16:1.000:. ./.:4:129,301:.: 0.49:1.000:. ./.:4:113,284:.: 0.09:1.000:. ./.:4:104,280:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,355:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,404:.: 0.17:1.000:. ./.:4:100,262:.:-0.33:1.000:. ./.:6:85,256:.:-0.59:1.000:. ./.:4:103,298:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,348:.:-0.50:1.000:. ./.:4:116,331:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,373:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,478:.: 1.06:1.000:. ./.:4:118,402:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,364:.:-0.31:1.000:. ./.:4:114,297:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,358:.:-0.37:0.998:. ./.:4:0,331:.:-0.71:1.000:. ./.:4:1,416:.: 0.33:1.000:. ./.:4:63,198:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,416:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,394:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,414:.: 0.29:1.000:. ./.:4:95,248:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.11:1.000:. ./.:4:99,285:.:-0.07:1.000:. ./.:4:90,283:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,368:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,322:.: 0.62:1.000:. ./.:4:126,367:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,345:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,361:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,497:.: 1.29:1.000:. ./.:4:68,231:.:-1.09:1.000:. ./.:4:92,246:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,366:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,373:.:-0.20:1.000:. ./.:4:79,258:.:-0.63:0.999:. ./.:4:0,382:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,475:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,300:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,424:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,386:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,361:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,299:.:-1.09:1.000:. ./.:4:107,318:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,421:.: 0.38:1.000:. ./.:4:101,260:.:-0.34:1.000:. ./.:4:101,329:.: 0.49:1.000:. ./.:4:71,252:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,425:.: 0.44:0.999:. ./.:4:89,232:.:-0.83:1.000:. ./.:4:112,269:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,379:.:-0.13:1.000:. ./.:4:146,410:.: 2.00:1.000:. ./.:4:98,323:.: 0.38:1.000:. ./.:4:101,300:.: 0.14:1.000:. ./.:4:140,376:.: 1.52:1.000:. ./.:4:114,337:.: 0.74:0.999:. ./.:4:108,286:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,150:.:-2.20:1.000:. ./.:4:0,441:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.37:1.000:. ./.:4:98,254:.:-0.45:1.000:. ./.:4:119,301:.: 0.37:1.000:. ./.:4:95,258:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,367:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,356:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,460:.: 0.85:1.000:. ./.:4:100,332:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,414:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,440:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,326:.:-0.77:1.000:. ./.:4:63,225:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,306:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,294:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,280:.:-1.32:0.996:. ./.:4:100,283:.:-0.08:1.000:. ./.:4:94,244:.:-0.62:1.000:. ./.:4:137,340:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,358:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,351:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,418:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.08:1.000:. ./.:4:120,285:.: 0.18:1.000:. ./.:4:84,224:.:-0.98:1.000:. ./.:4:142,368:.: 1.45:1.000:. ./.:4:1,548:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,421:.: 0.38:1.000:. ./.:4:94,319:.: 0.28:1.000:. ./.:4:135,342:.: 1.05:1.000:. ./.:4:94,251:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1,476:.: 1.05:1.000:. ./.:4:103,286:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,191:.:-2.39:1.000:. ./.:4:83,296:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,430:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,457:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,500:.: 1.33:1.000:. ./.:4:141,372:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,459:.: 0.83:1.000:. ./.:4:106,268:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,312:.:-0.93:1.000:. ./.:4:91,292:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,316:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,343:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,374:.:-0.19:1.000:. ./.:4:91,290:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.14:0.999:. ./.:4:101,283:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,408:.: 0.22:1.000:. ./.:4:78,260:.:-0.62:1.000:. ./.:4:81,232:.:-0.92:1.000:. ./.:4:98,304:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,322:.:-0.81:1.000:. ./.:4:80,243:.:-0.80:1.000:. ./.:4:83,264:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,509:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,514:.: 1.50:1.000:. ./.:4:117,305:.: 0.39:1.000:. ./.:4:83,306:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,432:.: 0.51:1.000:. ./.:4:140,398:.: 1.78:1.000:. ./.:4:1,558:.: 2.04:1.000:. ./.:4:107,295:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,449:.: 0.71:1.000:. -chr4.1 36139030 chr4.1_036139030 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,84:.: 0.86:1.000:. ./.:4:16,76:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,137:.: 1.26:1.000:. ./.:4:22,98:.: 0.64:1.000:. ./.:4:48,65:.: 0.38:1.000:. ./.:4:61,68:.: 0.97:1.000:. ./.:4:20,52:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,85:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,72:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,29:.:-2.65:1.000:. ./.:4:12,23:.:-2.47:1.000:. ./.:4:27,80:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,84:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,83:.: 0.20:1.000:. ./.:4:38,84:.: 0.71:0.999:. ./.:4:33,74:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,148:.: 1.67:1.000:. ./.:4:34,102:.: 1.23:1.000:. ./.:4:8,17:.:-2.83:1.000:. ./.:4:30,82:.: 0.35:1.000:. ./.:4:57,95:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,22:.:-2.94:1.000:. ./.:4:32,94:.: 0.86:1.000:. ./.:4:51,48:.:-0.13:1.000:. ./.:4:30,77:.: 0.17:1.000:. ./.:4:76,64:.: 1.37:1.000:. ./.:4:33,86:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.12:1.000:. ./.:4:14,63:.:-0.93:1.000:. ./.:4:5,6:.:-3.35:1.000:. ./.:4:4,40:.:-2.14:1.000:. ./.:3:2,10:.:-3.31:0.999:. ./.:4:61,62:.: 0.75:1.000:. ./.:4:29,91:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.60:1.000:. ./.:4:45,63:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,102:.: 0.90:1.000:. ./.:4:27,84:.: 0.31:1.000:. ./.:4:23,97:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.02:1.000:. ./.:4:74,57:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.79:1.000:. ./.:4:30,105:.: 1.19:1.000:. ./.:4:4,11:.:-3.20:1.000:. ./.:4:56,51:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,27:.:-2.21:1.000:. ./.:4:42,59:.:-0.05:1.000:. ./.:4:17,88:.: 0.09:1.000:. ./.:4:24,73:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,57:.: 0.17:1.000:. ./.:4:17,73:.:-0.46:1.000:. ./.:4:35,75:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,70:.: 0.13:1.000:. ./.:4:69,68:.: 1.26:1.000:. ./.:4:26,94:.: 0.64:1.000:. ./.:6:30,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:17,78:.:-0.27:1.000:. ./.:4:58,58:.: 0.49:1.000:. ./.:4:30,112:.: 1.45:1.000:. ./.:4:70,72:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.71:1.000:. ./.:4:27,121:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.09:1.000:. ./.:4:24,75:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.20:0.998:. ./.:4:42,37:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,64:.:-0.57:1.000:. ./.:4:67,65:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,56:.: 0.64:1.000:. ./.:4:48,46:.:-0.31:1.000:. ./.:4:23,70:.:-0.35:1.000:. ./.:4:20,61:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.24:1.000:. ./.:4:45,39:.:-0.68:1.000:. ./.:4:19,69:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.49:1.000:. ./.:4:24,68:.:-0.38:1.000:. ./.:4:23,61:.:-0.68:1.000:. ./.:4:23,68:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,97:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.41:1.000:. ./.:4:43,41:.:-0.68:1.000:. ./.:4:30,78:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,62:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.93:0.999:. ./.:4:56,54:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.53:1.000:. ./.:4:29,56:.:-0.64:1.000:. ./.:4:31,95:.: 0.86:1.000:. ./.:4:25,83:.: 0.20:1.000:. ./.:4:36,39:.:-1.01:1.000:. ./.:4:23,72:.:-0.27:1.000:. ./.:4:59,45:.: 0.06:1.000:. ./.:4:68,60:.: 0.93:1.000:. ./.:4:20,64:.:-0.68:1.000:. ./.:4:53,59:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,45:.:-1.30:1.000:. ./.:4:23,86:.: 0.24:0.999:. ./.:4:11,69:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.20:1.000:. ./.:4:17,59:.:-0.97:1.000:. ./.:4:42,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,86:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.02:1.000:. ./.:4:76,82:.: 2.03:1.000:. ./.:4:24,77:.:-0.05:0.999:. ./.:4:0,116:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,38:.:-2.36:1.000:. ./.:4:53,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:17,64:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.24:1.000:. ./.:4:31,63:.:-0.31:1.000:. ./.:4:26,75:.:-0.05:1.000:. ./.:4:26,82:.: 0.20:1.000:. ./.:4:22,53:.:-1.01:1.000:. ./.:4:54,46:.:-0.09:1.000:. ./.:4:23,74:.:-0.20:1.000:. ./.:4:26,77:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.82:1.000:. ./.:4:20,67:.:-0.57:1.000:. ./.:4:42,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.24:1.000:. ./.:4:15,58:.:-1.08:0.996:. ./.:4:0,81:.:-0.79:1.000:. ./.:4:27,62:.:-0.49:1.000:. ./.:4:39,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:28,75:.: 0.02:1.000:. ./.:4:37,36:.:-1.08:1.000:. ./.:4:46,42:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.82:1.000:. ./.:4:47,54:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,79:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,54:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,137:.: 1.26:1.000:. ./.:4:67,76:.: 1.48:1.000:. ./.:4:43,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,80:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.38:1.000:. ./.:4:20,83:.: 0.02:1.000:. ./.:4:32,112:.: 1.52:1.000:. ./.:4:62,59:.: 0.68:1.000:. ./.:4:4,19:.:-2.91:1.000:. ./.:4:23,67:.:-0.46:1.000:. ./.:4:63,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,92:.: 0.79:1.000:. ./.:4:37,101:.: 1.30:1.000:. ./.:4:21,80:.:-0.05:1.000:. ./.:4:35,85:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,84:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,48:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.09:1.000:. ./.:4:21,85:.: 0.13:1.000:. ./.:4:18,57:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.64:1.000:. ./.:4:21,65:.:-0.60:1.000:. ./.:4:35,79:.: 0.42:0.999:. ./.:4:50,57:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,62:.: 0.17:1.000:. ./.:4:31,62:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.53:1.000:. ./.:4:23,94:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:25,61:.:-0.60:1.000:. ./.:4:24,72:.:-0.24:1.000:. ./.:4:40,127:.: 2.36:1.000:. ./.:4:30,103:.: 1.12:1.000:. ./.:4:64,51:.: 0.46:1.000:. ./.:4:5,105:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.68:1.000:. ./.:4:45,96:.: 1.41:1.000:. ./.:4:36,111:.: 1.63:1.000:. ./.:4:28,72:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,74:.:-0.13:1.000:. -chr4.1 36361500 chr4.1_036361500 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:13,1:0.07:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,13:0.56: 0.45:1.000:0.968 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,9:0.31: 1.36:1.000:0.974 0/0/0/1:4:25,7:0.20: 2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,6:0.22: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.23: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,3:0.13: 0.84:1.000:0.861 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,5:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,1:0.04: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.46:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:11,4:0.25:-0.06:0.999:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.25: 1.74:1.000:0.999 0/0/0/0:4:17,1:0.05: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,7:0.36: 0.20:1.000:0.668 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,10:0.28: 2.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,6:0.29: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.23: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.43: 1.10:1.000:0.951 0/0/0/0:4:29,1:0.03: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.32: 0.84:1.000:0.944 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1:3:3,4:0.49:-1.09:0.999:0.681 0/0/1/1:4:14,11:0.38: 1.23:1.000:0.622 0/0/1/1:4:12,11:0.41: 0.97:1.000:0.889 0/0/0/1:4:7,1:0.12:-0.96:1.000:0.643 0/0/0/1:4:20,5:0.18: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,4:0.18: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.24: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,1:0.05: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,3:0.09: 2.00:1.000:0.951 0/0/0/0:4:10,1:0.08:-0.58:1.000:0.979 0/0/1/1:4:4,4:0.43:-0.96:1.000:0.951 0/0/0/1:4:19,9:0.29: 1.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,11:0.52: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:7,5:0.37:-0.45:1.000:0.620 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,6:0.29: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.38: 0.71:1.000:0.504 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:1,7:0.67:-0.96:1.000:0.920 0/0/0/1:4:9,5:0.32:-0.19:1.000:0.958 0/0/0/1:4:9,5:0.32:-0.19:1.000:0.958 0/0/0/1:4:10,3:0.21:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.18:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.30:-1.22:1.000:0.986 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.12:-0.96:1.000:0.643 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.07:0.998:1.000 0/0/1/1:4:10,22:0.56: 2.13:1.000:0.965 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,9:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,2:0.23:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.22: 2.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.23: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.52:-0.32:1.000:0.995 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.23: 2.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.22:0.999:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.31: 0.20:1.000:0.965 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.41: 0.45:1.000:0.870 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.12:-0.06:1.000:0.818 0/0/0/1:4:15,4:0.19: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,9:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,6:0.47:-0.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:24,8:0.23: 2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.30:-0.84:1.000:0.986 0/0/1/1:4:2,4:0.55:-1.22:1.000:0.981 0/0/0/1:4:7,4:0.32:-0.58:1.000:0.944 0/0/0/1:4:20,6:0.21: 1.36:0.999:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.18:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.47:-0.58:1.000:0.991 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.71:0.999:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.30: 1.10:1.000:0.986 0/0/0/1:4:5,3:0.33:-0.96:1.000:0.910 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.32: 0.84:1.000:0.944 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.05: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,7:0.75:-1.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.38: 0.07:1.000:0.597 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.29: 0.84:0.996:0.993 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.53:-0.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:8,9:0.46: 0.20:1.000:0.984 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,4:0.19: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,8:0.37: 0.45:1.000:0.575 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.43: 0.07:1.000:0.951 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-1.22:1.000:0.951 0/0/0/1:4:4,1:0.18:-1.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.43: 1.10:1.000:0.951 0/0/0/1:4:18,7:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,6:0.47:-0.58:1.000:0.991 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,1:0.04: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,8:0.31: 0.97:1.000:0.972 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,6:0.40:-0.32:1.000:0.802 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,9:0.56:-0.32:1.000:0.959 0/0/0/0:4:12,1:0.07:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:26,9:0.24: 2.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,5:0.34:-0.32:1.000:0.868 0/0/1/1:4:10,11:0.45: 0.71:1.000:0.981 0/0/0/1:4:7,2:0.20:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.17:-0.58:1.000:0.998 0/0/0/0:4:26,1:0.03: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.33:-0.96:1.000:0.910 0/0/0/1:4:13,3:0.17: 0.07:0.999:0.998 0/0/0/1:4:10,5:0.30:-0.06:1.000:0.986 0/0/0/1:4:13,9:0.36: 0.84:1.000:0.693 0/0/1/1:4:9,8:0.41: 0.20:1.000:0.854 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.38: 1.61:1.000:0.504 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.33:-0.96:1.000:0.910 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.27: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,5:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:15,5:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,14:0.53: 0.84:1.000:0.992 0/0/0/0:4:17,1:0.05: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,4:0.35:-0.71:1.000:0.770 -chr4.1 36496430 chr4.1_036496430 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:178,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,49:.: 0.39:1.000:. ./.:4:88,44:.:-0.45:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:86,31:.:-0.72:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:127,29:.:-0.01:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:206,57:.: 1.93:1.000:. ./.:4:55,25:.:-1.39:1.000:. ./.:4:61,33:.:-1.14:1.000:. ./.:4:149,43:.: 0.64:1.000:. ./.:4:106,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,22:.:-1.57:1.000:. ./.:4:54,26:.:-1.39:0.999:. ./.:4:115,23:.:-0.34:1.000:. ./.:4:152,36:.: 0.57:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:220,38:.: 1.84:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:118,36:.:-0.05:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:100,13:.:-0.79:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:136,38:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,28:.:-0.77:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:34,18:.:-1.90:1.000:. ./.:4:132,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:210,39:.: 1.68:1.000:. ./.:3:112,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:93,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:66,33:.:-1.05:1.000:. ./.:4:111,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:109,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:94,33:.:-0.54:1.000:. ./.:4:112,44:.:-0.01:1.000:. ./.:4:110,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:351,0:.: 3.53:1.000:. ./.:4:92,39:.:-0.47:1.000:. ./.:4:121,35:.:-0.01:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:117,31:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:75,34:.:-0.87:1.000:. ./.:4:103,35:.:-0.34:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:141,33:.: 0.31:1.000:. ./.:4:105,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.46:1.000:. ./.:6:140,11:.:-0.10:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:92,29:.:-0.65:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:163,35:.: 0.75:1.000:. ./.:4:165,41:.: 0.90:1.000:. ./.:4:107,27:.:-0.41:1.000:. ./.:4:120,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:82,43:.:-0.58:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.41:0.998:. ./.:4:110,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:146,54:.: 0.79:1.000:. ./.:4:140,27:.: 0.19:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:72,72:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:197,43:.: 1.51:1.000:. ./.:4:109,38:.:-0.18:1.000:. ./.:4:156,54:.: 0.97:1.000:. ./.:4:293,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:54,55:.:-0.87:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:98,19:.:-0.72:1.000:. ./.:4:186,42:.: 1.29:1.000:. ./.:4:199,35:.: 1.40:1.000:. ./.:4:105,36:.:-0.28:1.000:. ./.:4:123,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:180,32:.: 1.00:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:87,26:.:-0.79:0.999:. ./.:4:129,37:.: 0.17:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:44,22:.:-1.65:1.000:. ./.:4:259,58:.: 2.91:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:124,37:.: 0.08:1.000:. ./.:4:153,36:.: 0.59:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:144,38:.: 0.46:1.000:. ./.:4:104,29:.:-0.43:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.60:0.999:. ./.:4:121,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:113,44:.: 0.01:1.000:. ./.:4:159,25:.: 0.50:1.000:. ./.:4:151,37:.: 0.57:1.000:. ./.:4:111,27:.:-0.34:1.000:. ./.:4:153,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:85,47:.:-0.45:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:258,46:.: 2.67:0.999:. ./.:4:92,42:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,27:.:-0.59:1.000:. ./.:4:184,44:.: 1.29:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:97,25:.:-0.63:1.000:. ./.:4:102,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:187,38:.: 1.24:1.000:. ./.:4:268,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:135,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:270,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:107,27:.:-0.41:1.000:. ./.:4:69,28:.:-1.08:1.000:. ./.:4:108,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:103,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:138,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.54:0.996:. ./.:4:143,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:74,31:.:-0.94:1.000:. ./.:4:93,27:.:-0.67:1.000:. ./.:4:181,54:.: 1.42:1.000:. ./.:4:152,32:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:184,66:.: 1.69:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:94,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:94,63:.: 0.01:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,36:.:-0.99:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:124,37:.: 0.08:1.000:. ./.:4:83,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:65,21:.:-1.28:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:293,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:99,28:.:-0.54:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:71,24:.:-1.12:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:78,23:.:-1.01:1.000:. ./.:4:94,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:69,15:.:-1.32:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:187,46:.: 1.39:0.999:. ./.:4:82,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:61,29:.:-1.21:1.000:. ./.:4:44,24:.:-1.61:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:117,36:.:-0.07:1.000:. ./.:4:63,30:.:-1.16:1.000:. ./.:4:62,21:.:-1.34:1.000:. ./.:4:75,43:.:-0.70:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:84,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:174,5:.: 0.41:1.000:. ./.:4:70,22:.:-1.17:1.000:. ./.:4:76,31:.:-0.90:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:91,19:.:-0.85:1.000:. ./.:4:164,56:.: 1.15:1.000:. -chr4.1 36757390 chr4.1_036757390 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:174,154:0.47: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,121:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,138:0.45: 0.70:1.000:0.981 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,250:0.71: 1.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:263,82:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,98:0.51:-1.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,82:0.28: 0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,211:0.71: 0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:64,14:0.19:-3.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,23:0.30:-3.00:1.000:0.985 0/0/0/0:4:287,1:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,79:0.29: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:151,133:0.47: 0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:209,51:0.20:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,74:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,79:0.25: 0.89:0.999:0.999 0/1/1/1:4:71,266:0.76: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,164:0.47: 1.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:250,75:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.30:-2.94:1.000:0.987 0/0/0/0:4:274,2:0.01: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,171:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,61:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,44:0.55:-3.00:1.000:0.975 0/0/0/1:4:228,64:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,82:0.27: 0.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:140,144:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:267,88:0.26: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,93:0.27: 1.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:233,51:0.19: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,140:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:45,8:0.16:-3.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,52:0.57:-2.81:1.000:0.954 0/1/1:3:16,17:0.52:-3.74:0.999:0.760 0/0/0/1:4:210,92:0.31: 0.57:1.000:0.969 0/0/0/0:4:309,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:292,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,67:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:226,83:0.28: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,159:0.52: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,154:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/0:4:325,2:0.01: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,113:0.46:-0.29:1.000:0.988 0/0/1/1:4:165,154:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/0:4:313,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,73:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,39:0.35:-2.42:1.000:0.821 0/1/1/1:4:68,227:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,57:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,59:0.31:-1.17:1.000:0.967 0/0/0/1:4:245,95:0.29: 1.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:172,64:0.28:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,149:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,122:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/1/1/1:4:63,194:0.73:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:202,76:0.28: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:231,77:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,219:0.74: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:176,47:0.22:-0.69:1.000:0.821 0/0/0/1:4:199,71:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:219,67:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,121:0.45: 0.14:1.000:0.975 0/0/0/1:4:171,54:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:234,78:0.26: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:261,71:0.22: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,28:0.19:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,82:0.29: 0.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:215,62:0.23: 0.17:0.998:1.000 0/0/0/1:4:191,69:0.27:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/0:4:325,1:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,143:0.76:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,76:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,68:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:313,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,171:0.74:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,113:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,46:0.18: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,116:0.46:-0.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:140,121:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,126:0.53:-0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:142,141:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:186,69:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,111:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,126:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,95:0.49:-1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,128:0.56:-0.61:1.000:0.970 0/0/1/1:4:131,108:0.46:-0.44:1.000:0.986 0/0/0/1:4:196,64:0.26:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,68:0.30:-0.55:0.999:0.984 0/0/0/1:4:212,62:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,68:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:238,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,113:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/0:4:287,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,109:0.49:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,47:0.21:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,140:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,136:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,65:0.46:-1.96:1.000:0.986 0/0/1/1:4:166,163:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,47:0.23:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,45:0.22:-0.90:0.999:1.000 0/0/0/1:4:182,64:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:121,108:0.48:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,125:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,139:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:290,105:0.27: 2.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,134:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,71:0.28:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:313,82:0.22: 2.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,208:0.72: 0.22:0.999:0.995 0/0/0/1:4:177,90:0.34: 0.01:1.000:0.836 0/0/1/1:4:123,89:0.43:-0.87:1.000:0.935 0/0/0/1:4:190,73:0.29:-0.05:1.000:0.993 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,73:0.29:-0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:176,50:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,102:0.48:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,74:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:138,100:0.43:-0.45:1.000:0.936 0/0/0/0:4:266,1:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,272:0.74: 1.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,122:0.52:-0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:235,70:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,113:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/0:4:238,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,45:0.24:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,59:0.29:-0.92:1.000:0.991 0/0/1/1:4:127,131:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:195,57:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,39:0.24:-1.59:0.996:1.000 0/0/0/1:4:204,68:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,61:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,98:0.30: 1.21:1.000:0.989 0/0/0/1:4:194,82:0.31: 0.15:1.000:0.979 0/0/0/1:4:194,70:0.27:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:166,54:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/0:4:236,3:0.01:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,68:0.30:-0.47:1.000:0.989 0/0/0/1:4:206,53:0.21:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,66:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,59:0.29:-0.95:1.000:0.990 0/0/0/1:4:284,85:0.24: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,90:0.26: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:239,65:0.22: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,70:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,148:0.45: 1.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:137,119:0.47:-0.17:1.000:0.992 0/0/0/1:4:269,83:0.25: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,147:0.52: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,45:0.55:-2.95:1.000:0.983 0/0/0/1:4:217,70:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:208,85:0.30: 0.43:1.000:0.986 0/0/0/1:4:224,74:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,176:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,128:0.47: 0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:191,81:0.31: 0.09:1.000:0.979 0/0/0/1:4:248,69:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,56:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,53:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,63:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,159:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,130:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:234,55:0.20: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,56:0.26:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,124:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,138:0.47: 0.51:1.000:0.992 0/0/0/1:4:213,68:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:197,82:0.30: 0.20:1.000:0.983 0/0/0/1:4:154,59:0.29:-0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:144,138:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,60:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,44:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,156:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,76:0.22: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,84:0.28: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,166:0.53: 0.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:138,142:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:302,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,87:0.24: 1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,166:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,179:0.71:-0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:204,62:0.24:-0.01:1.000:1.000 -chr4.1 36869216 chr4.1_036869216 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:121,66:0.37: 0.55:1.000:0.580 0/0/0/1:4:104,50:0.34:-0.16:1.000:0.860 0/0/1/1:4:101,100:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,100:0.48: 1.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:160,35:0.19: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,57:0.28: 1.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,29:0.34:-1.56:1.000:0.853 0/0/0/1:4:159,38:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,82:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,8:0.31:-2.90:1.000:0.967 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:53,129:0.71: 0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,111:0.67: 0.12:1.000:0.926 0/1/1/1:4:49,108:0.69:-0.10:1.000:0.979 0/0/1/1:4:86,94:0.53: 0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:112,90:0.46: 0.87:1.000:0.987 0/1/1/1:4:52,135:0.73: 0.55:0.999:0.997 0/0/1/1:4:98,83:0.47: 0.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:60,125:0.68: 0.51:1.000:0.959 0/1/1/1:4:46,144:0.76: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,19:0.91:-3.03:1.000:0.910 0/0/1/1:4:127,82:0.41: 1.02:1.000:0.843 0/0/1/1:4:116,84:0.43: 0.83:1.000:0.955 0/0/1/1:4:65,88:0.58:-0.18:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-3.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,30:0.16: 1.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:116,96:0.47: 1.09:1.000:0.990 0/0/0/1:4:129,50:0.30: 0.38:1.000:0.987 0/0/1/1:4:104,80:0.45: 0.49:1.000:0.978 0/1/1/1:4:44,161:0.79: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,70:0.44: 0.05:1.000:0.967 0/1/1/1:4:51,131:0.73: 0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,6:0.86:-3.33:1.000:0.968 0/0/1/1:4:14,11:0.45:-2.94:1.000:0.983 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:149,40:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,86:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,170:0.77: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,93:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,35:0.19: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,139:0.77: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,132:0.73: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,138:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,73:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,129:0.75: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,167:0.81: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,67:0.19: 4.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,31:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,123:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,61:0.53:-0.96:1.000:0.992 0/0/1/1:4:110,98:0.48: 1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,86:0.55:-0.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:107,101:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,41:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,88:0.55: 0.05:1.000:0.983 0/0/1/1:4:81,88:0.53: 0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,90:0.55: 0.10:1.000:0.978 0/0/1/1:4:73,84:0.55:-0.10:1.000:0.984 0/0/0/1/1/1:6:57,65:0.54:-0.85:1.000:0.783 0/0/1/1:4:98,94:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,84:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,17:0.14:-0.57:1.000:0.954 0/0/0/1:4:91,39:0.32:-0.68:1.000:0.960 0/0/1/1:4:106,87:0.46: 0.68:1.000:0.989 0/1/1/1:4:38,162:0.81: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,51:0.58:-1.54:1.000:0.929 0/1/1/1:4:58,115:0.67: 0.25:1.000:0.927 0/0/1/1:4:69,95:0.59: 0.05:0.998:0.874 0/0/0/1:4:160,61:0.29: 1.28:1.000:0.989 0/1/1/1:4:43,130:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,33:0.52:-2.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,49:0.31: 0.12:1.000:0.972 0/0/1/1:4:110,90:0.46: 0.83:1.000:0.989 0/0/1/1:4:90,83:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,33:0.28:-0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:82,39:0.34:-0.87:1.000:0.875 0/1/1/1:4:45,120:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,111:0.79:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,39:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,129:0.73: 0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,135:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,64:0.45:-0.33:1.000:0.981 0/1/1/1:4:47,112:0.71:-0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:117,46:0.30: 0.03:1.000:0.985 0/0/1/1:4:76,74:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,64:0.74:-1.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,65:0.53:-0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:84,29:0.28:-1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,34:0.26:-0.44:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.87:0.999:1.000 0/0/1/1:4:83,73:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,94:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,66:0.44:-0.16:1.000:0.970 0/0/0/1:4:121,40:0.27:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,89:0.54: 0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:86,24:0.24:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,81:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,63:0.46:-0.46:1.000:0.989 0/0/0/1:4:141,31:0.20: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,12:0.20:-2.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,74:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,73:0.71:-1.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:95,26:0.23:-0.87:0.999:1.000 0/1/1/1:4:29,97:0.77:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,103:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,79:0.57:-0.46:1.000:0.936 0/0/1/1:4:111,86:0.45: 0.77:1.000:0.979 0/1/1/1:4:58,143:0.72: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:80,88:0.53: 0.14:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,93:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,84:0.53: 0.03:0.999:0.993 1/1/1/1:4:0,182:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,89:0.73:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:89,73:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:46,59:0.57:-1.22:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,71:0.56:-0.68:1.000:0.973 0/0/1/1:4:97,93:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,67:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,97:0.49: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,94:0.51: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,77:0.57:-0.51:1.000:0.953 0/0/1/1:4:104,79:0.44: 0.46:1.000:0.974 0/0/0/1:4:138,45:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,134:0.85:-0.05:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,71:0.59:-0.85:1.000:0.859 0/0/1/1:4:82,78:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,93:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,17:0.21:-1.58:0.996:1.000 0/0/1/1:4:78,80:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,93:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,132:0.72: 0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,162:0.72: 1.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,33:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,50:0.31: 0.25:1.000:0.978 0/1/1/1:4:43,111:0.73:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,89:0.55: 0.05:1.000:0.977 0/0/1/1:4:67,65:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,82:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,60:0.53:-0.98:1.000:0.993 0/1/1/1:4:59,140:0.71: 0.81:1.000:0.991 0/0/1/1:4:124,110:0.48: 1.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:173,51:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,112:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,99:0.69:-0.36:1.000:0.972 0/0/0/1:4:128,44:0.27: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,136:0.55: 1.91:1.000:0.976 0/0/1/1:4:114,82:0.43: 0.74:1.000:0.951 0/1/1/1:4:9,18:0.67:-2.90:1.000:0.933 0/1/1/1:4:41,83:0.68:-0.81:1.000:0.942 0/0/0/1:4:159,61:0.30: 1.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,87:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,56:0.26: 1.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,49:0.37:-0.53:1.000:0.520 0/1/1/1:4:29,145:0.84: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,29:0.16: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,62:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,81:0.51: 0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,150:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,50:0.27: 0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:89,81:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,58:0.44:-0.53:1.000:0.962 0/0/0/1:4:115,50:0.32: 0.08:1.000:0.953 0/0/1/1:4:104,91:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,70:0.48:-0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,80:0.66:-0.83:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,56:0.43:-0.55:1.000:0.934 0/0/1/1:4:84,88:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,117:0.75:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,135:0.75: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,99:0.56: 0.42:1.000:0.972 0/0/1/1:4:90,95:0.52: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,92:0.52: 0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,80:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:40,137:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,148:0.74: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,46:0.27: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,48:0.42:-0.96:1.000:0.929 0/0/1/1:4:94,96:0.52: 0.61:1.000:0.996 -chr4.1 37000282 chr4.1_037000282 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:34,18:0.39:-0.26:1.000:0.642 0/0/0/1:4:32,9:0.27:-0.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,35:0.65:-0.01:1.000:0.787 0/0/1/1:4:28,22:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,43:0.48: 1.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,42:0.59: 0.96:1.000:0.885 0/0/1/1:4:15,12:0.48:-1.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:44,14:0.29: 0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,35:0.79:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,38:0.79:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,25:0.64:-0.82:1.000:0.744 0/1/1/1:4:18,30:0.66:-0.46:1.000:0.873 0/0/1/1:4:31,33:0.55: 0.35:1.000:0.982 0/0/1/1:4:30,22:0.46:-0.26:1.000:0.986 0/1/1/1:4:19,56:0.78: 0.91:0.999:1.000 0/1/1/1:4:19,38:0.70:-0.01:1.000:0.988 0/1/1/1:4:19,31:0.66:-0.36:1.000:0.838 0/1/1/1:4:16,28:0.67:-0.66:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,33:0.45: 1.11:1.000:0.982 0/1/1/1:4:21,33:0.65:-0.16:1.000:0.758 0/0/1/1:4:17,18:0.55:-1.12:1.000:0.983 0/0/1/1:4:3,2:0.44:-2.64:1.000:0.960 0/0/0/1:4:51,19:0.32: 0.65:1.000:0.963 0/1/1/1:4:11,26:0.74:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,25:0.53:-0.36:1.000:0.991 0/1/1/1:4:10,40:0.83:-0.36:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,36:0.48: 1.21:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.70:-2.59:1.000:0.988 0/1/1/1:4:4,8:0.70:-2.29:1.000:0.988 0/0/1:3:7,1:0.16:-2.49:0.999:0.823 0/0/1/1:4:32,20:0.42:-0.26:1.000:0.920 0/0/1/1:4:36,34:0.52: 0.65:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,44:0.69: 0.50:1.000:0.978 0/1/1/1:4:25,69:0.77: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,21:0.28: 1.62:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,71:0.75: 2.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,33:0.46: 1.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:64,14:0.22: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,56:0.70: 1.36:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,32:0.42: 1.31:1.000:0.923 0/1/1/1:4:20,52:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,50:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,46:0.57: 1.41:1.000:0.934 0/0/1/1:4:48,34:0.45: 1.26:1.000:0.979 0/1/1/1:4:23,63:0.77: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,10:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,53:0.77: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,39:0.64: 0.35:1.000:0.740 0/1/1/1:4:24,71:0.78: 1.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,55:0.72: 1.21:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:37,24:0.43: 0.20:1.000:0.601 0/0/0/1:4:42,20:0.36: 0.25:1.000:0.643 0/1/1/1:4:24,42:0.67: 0.45:1.000:0.930 0/0/0/1:4:66,20:0.28: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,31:0.40: 1.41:1.000:0.816 0/0/1/1:4:45,34:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/1/1/1:4:24,69:0.78: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.51:-1.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,51:0.69: 1.06:1.000:0.974 0/0/1/1:4:51,42:0.48: 1.82:0.998:0.996 0/0/0/1:4:46,12:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,51:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,22:0.70:-1.22:1.000:0.988 0/0/0/1:4:72,21:0.27: 1.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,35:0.54: 0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:43,33:0.47: 0.96:1.000:0.991 0/1/1/1:4:32,48:0.63: 1.16:1.000:0.627 0/0/1/1:4:50,36:0.45: 1.46:1.000:0.983 0/1/1/1:4:26,42:0.65: 0.55:1.000:0.819 0/1/1/1:4:23,45:0.70: 0.55:1.000:0.984 0/0/1/1:4:58,42:0.45: 2.17:1.000:0.984 0/1/1/1:4:20,40:0.70: 0.15:1.000:0.988 0/1/1/1:4:21,47:0.73: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,31:0.40: 1.41:1.000:0.816 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,34:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,52:0.77: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,25:0.63:-0.77:1.000:0.564 0/1/1/1:4:20,39:0.70: 0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:34,28:0.48: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,14:0.27: 0.35:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.56:0.999:1.000 0/1/1/1:4:24,51:0.72: 0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,35:0.53: 0.65:1.000:0.991 0/0/1/1:4:25,23:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,27:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,36:0.51: 0.96:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,31:0.70:-0.51:1.000:0.981 0/0/1/1:4:31,40:0.60: 0.70:1.000:0.813 0/1/1/1:4:15,50:0.80: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,20:0.35: 0.40:1.000:0.793 0/0/0/1:4:18,4:0.23:-1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,49:0.70: 0.86:1.000:0.984 0/1/1/1:4:15,22:0.63:-1.02:1.000:0.555 0/0/0/1:4:53,13:0.25: 0.45:0.999:1.000 0/1/1/1:4:19,37:0.70:-0.06:1.000:0.983 0/1/1/1:4:26,43:0.66: 0.60:1.000:0.861 0/1/1/1:4:20,42:0.71: 0.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,22:0.66:-1.12:1.000:0.894 0/1/1/1:4:17,45:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,23:0.46:-0.16:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,30:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,44:0.66: 0.70:0.999:0.836 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,29:0.64:-0.46:1.000:0.680 0/1/1/1:4:18,39:0.72:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,19:0.59:-1.17:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,23:0.40: 0.35:1.000:0.774 0/0/0/1:4:45,18:0.33: 0.30:1.000:0.923 0/1/1/1:4:16,50:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,30:0.78:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,35:0.72:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,40:0.78:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,32:0.56: 0.20:1.000:0.971 0/1/1/1:4:17,28:0.66:-0.61:1.000:0.855 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,30:0.82:-0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,36:0.63: 0.15:1.000:0.627 0/0/1/1:4:22,16:0.46:-0.97:1.000:0.985 0/0/0/1:4:40,11:0.26:-0.31:0.996:0.998 0/0/1/1:4:37,34:0.51: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,16:0.37:-0.46:1.000:0.513 0/1/1/1:4:10,20:0.70:-1.37:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,65:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,32:0.52: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,28:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,47:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,43:0.71: 0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:35,21:0.41:-0.06:1.000:0.879 0/0/1/1:4:32,27:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,23:0.45:-0.06:1.000:0.975 0/1/1/1:4:22,36:0.66: 0.05:1.000:0.843 0/1/1/1:4:17,42:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,15:0.38:-0.66:1.000:0.580 0/1/1/1:4:18,38:0.72:-0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,49:0.79: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,14:0.20: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,28:0.67:-0.66:1.000:0.930 0/1/1/1:4:19,36:0.69:-0.11:1.000:0.975 1/1/1/1:4:1,7:0.89:-2.49:1.000:0.565 0/1/1/1:4:6,15:0.75:-1.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,34:0.46: 1.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:33,14:0.34:-0.51:1.000:0.864 0/0/1/1:4:28,15:0.39:-0.71:1.000:0.671 0/0/0/1:4:34,13:0.32:-0.51:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,9:0.21:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,18:0.52:-1.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:21,41:0.70: 0.25:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,23:0.47:-0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:20,21:0.54:-0.82:1.000:0.984 0/0/0/1:4:37,7:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,24:0.68:-1.02:1.000:0.965 0/1/1/1:4:10,31:0.79:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,31:0.79:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,30:0.53: 0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,23:0.43: 0.10:1.000:0.937 0/1/1/1:4:19,34:0.68:-0.21:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,40:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,39:0.77:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,42:0.71: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,22:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,31:0.74:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,42:0.85:-0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:22,21:0.52:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,29:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,17:0.35:-0.06:1.000:0.826 -chr4.1 37283985 chr4.1_037283985 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:58,32:0.28: 1.59:1.000:0.997 0/0/0/0:4:55,9:0.11: 0.44:1.000:0.657 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,26:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,28:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,21:0.53:-0.85:1.000:0.993 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.21: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,5:0.12:-1.02:1.000:0.783 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,18:0.20: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.40:-0.98:1.000:0.826 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,30:0.42: 0.35:0.999:0.920 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,20:0.23: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,17:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,24:0.39:-0.05:1.000:0.648 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,26:0.36: 0.30:1.000:0.734 0/0/0/1:4:57,11:0.12: 0.62:1.000:0.790 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,19:0.17: 1.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.09:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0:3:9,0:0.00:-2.00:0.999:1.000 0/0/0/1:4:30,10:0.19:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,24:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,23:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,31:0.31: 1.15:1.000:0.971 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,26:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,4:0.33:-1.95:1.000:0.936 0/0/0/1:4:36,15:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.20:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,17:0.14: 1.59:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,16:0.72:-1.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,31:0.30: 1.24:1.000:0.984 0/0/1/1:4:16,26:0.54:-0.54:1.000:0.989 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,1:0.02:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,22:0.19: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:15,25:0.54:-0.63:1.000:0.795 0/0/1/1:4:25,29:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,18:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,29:0.40: 0.35:1.000:0.817 0/0/1/1:4:23,25:0.46:-0.27:1.000:0.990 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,21:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,23:0.38:-0.14:1.000:0.622 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.39:0.998:1.000 0/0/1/1:4:45,43:0.43: 1.50:1.000:0.939 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,38:0.37: 1.46:1.000:0.590 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,25:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,28:0.45: 0.04:1.000:0.980 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,24:0.18: 2.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,26:0.47:-0.23:1.000:0.994 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,27:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,19:0.43:-0.67:1.000:0.933 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,24:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.58:0.999:1.000 0/0/0/1:4:64,21:0.19: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,15:0.46:-1.11:1.000:0.987 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,33:0.28: 1.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,20:0.16: 1.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,18:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,28:0.44: 0.08:1.000:0.967 0/0/0/1:4:65,31:0.24: 1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.47:-1.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,19:0.44:-0.71:1.000:0.967 0/0/1/1:4:18,17:0.42:-0.85:1.000:0.928 0/0/0/1:4:58,29:0.25: 1.46:0.999:0.999 0/0/0/1:4:50,13:0.15: 0.39:1.000:0.992 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,25:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,20:0.34:-0.23:1.000:0.896 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.35:0.999:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,19:0.22: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,17:0.29:-0.36:1.000:0.991 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 2.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,39:0.29: 2.30:1.000:0.992 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,32:0.31: 1.28:1.000:0.974 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,26:0.31: 0.62:1.000:0.979 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,21:0.36:-0.23:1.000:0.705 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,14:0.24:-0.45:0.996:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,26:0.54:-0.54:1.000:0.989 0/0/0/1:4:20,14:0.34:-0.89:1.000:0.873 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,22:0.38:-0.23:1.000:0.593 0/0/1/1:4:26,22:0.39:-0.27:1.000:0.719 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,23:0.16: 2.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,19:0.41:-0.63:1.000:0.873 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,24:0.15: 2.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:53,22:0.22: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.47:-0.54:1.000:0.991 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,13:0.27:-0.76:1.000:0.998 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,20:0.39:-0.45:1.000:0.671 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,19:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,24:0.35: 0.13:1.000:0.792 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,17:0.21: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,15:0.19: 0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,14:0.13: 1.24:1.000:0.890 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,29:0.53:-0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:49,27:0.28: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,12:0.16: 0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:46,22:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.42:-1.11:1.000:0.915 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.42:-0.18:1.000:0.902 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,23:0.43:-0.32:1.000:0.941 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,12:0.11: 1.37:1.000:0.645 0/0/1/1:4:19,25:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:42,5:0.08:-0.32:1.000:0.989 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,22:0.33:-0.01:1.000:0.900 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,26:0.25: 1.01:1.000:0.999 -chr4.1 37415568 chr4.1_037415568 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:213,95:.: 1.19:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:225,85:.: 1.21:1.000:. ./.:4:180,59:.: 0.27:1.000:. ./.:4:293,119:.: 2.56:1.000:. ./.:4:184,69:.: 0.46:1.000:. ./.:4:193,76:.: 0.67:1.000:. ./.:4:202,79:.: 0.83:1.000:. ./.:4:63,35:.:-1.59:1.000:. ./.:4:54,1:.:-2.16:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:162,72:.: 0.21:1.000:. ./.:4:189,81:.: 0.68:1.000:. ./.:4:209,89:.: 1.05:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:243,94:.: 1.57:0.999:. ./.:4:192,84:.: 0.76:1.000:. ./.:4:226,95:.: 1.36:1.000:. ./.:4:217,99:.: 1.29:1.000:. ./.:4:26,42:.:-1.99:1.000:. ./.:4:184,76:.: 0.55:1.000:. ./.:4:214,84:.: 1.05:1.000:. ./.:4:197,69:.: 0.63:1.000:. ./.:4:31,15:.:-2.28:1.000:. ./.:4:232,78:.: 1.21:1.000:. ./.:4:182,181:.: 1.91:1.000:. ./.:4:179,93:.: 0.71:1.000:. ./.:4:126,159:.: 0.88:1.000:. ./.:4:169,202:.: 2.02:1.000:. ./.:4:267,114:.: 2.15:1.000:. ./.:4:213,79:.: 0.97:1.000:. ./.:4:12,39:.:-2.21:1.000:. ./.:4:26,61:.:-1.74:1.000:. ./.:3:15,0:.:-2.69:0.999:. ./.:4:241,96:.: 1.57:1.000:. ./.:4:200,81:.: 0.83:1.000:. ./.:4:204,82:.: 0.89:1.000:. ./.:4:136,138:.: 0.74:1.000:. ./.:4:223,104:.: 1.44:1.000:. ./.:4:115,57:.:-0.61:1.000:. ./.:4:135,62:.:-0.28:1.000:. ./.:4:168,57:.: 0.09:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:140,43:.:-0.47:1.000:. ./.:4:155,55:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,167:.: 1.34:1.000:. ./.:4:132,98:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,58:.:-0.43:1.000:. ./.:4:108,62:.:-0.64:1.000:. ./.:4:58,80:.:-1.06:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:146,62:.:-0.14:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:153,67:.: 0.02:1.000:. ./.:4:140,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:88,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:141,57:.:-0.27:1.000:. ./.:6:120,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:99,98:.:-0.28:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:112,49:.:-0.76:1.000:. ./.:4:165,63:.: 0.13:1.000:. ./.:4:170,44:.:-0.06:1.000:. ./.:4:129,44:.:-0.60:1.000:. ./.:4:168,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,51:.:-0.24:0.998:. ./.:4:181,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:132,69:.:-0.23:1.000:. ./.:4:95,41:.:-1.09:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:180,63:.: 0.33:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:135,57:.:-0.35:1.000:. ./.:4:136,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:118,40:.:-0.80:1.000:. ./.:4:148,59:.:-0.15:1.000:. ./.:4:103,117:.: 0.02:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,56:.:-0.53:1.000:. ./.:4:140,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:103,115:.: 0.00:1.000:. ./.:4:153,67:.: 0.02:1.000:. ./.:4:106,122:.: 0.13:1.000:. ./.:4:122,36:.:-0.80:1.000:. ./.:4:95,42:.:-1.08:1.000:. ./.:4:109,35:.:-0.98:1.000:. ./.:4:142,70:.:-0.08:1.000:. ./.:4:146,58:.:-0.19:0.999:. ./.:4:93,101:.:-0.32:1.000:. ./.:4:129,51:.:-0.51:1.000:. ./.:4:146,42:.:-0.40:1.000:. ./.:4:134,46:.:-0.51:1.000:. ./.:4:138,69:.:-0.15:1.000:. ./.:4:70,75:.:-0.97:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:120,52:.:-0.61:1.000:. ./.:4:105,119:.: 0.07:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:135,60:.:-0.31:1.000:. ./.:4:87,31:.:-1.33:1.000:. ./.:4:90,44:.:-1.12:0.999:. ./.:4:109,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:109,49:.:-0.80:1.000:. ./.:4:62,100:.:-0.75:1.000:. ./.:4:147,184:.: 1.49:1.000:. ./.:4:210,71:.: 0.83:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:106,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:354,1:.: 1.81:1.000:. ./.:4:108,45:.:-0.86:0.999:. ./.:4:119,48:.:-0.68:1.000:. ./.:4:110,37:.:-0.94:1.000:. ./.:4:93,92:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,43:.:-1.05:1.000:. ./.:4:115,44:.:-0.79:1.000:. ./.:4:81,47:.:-1.20:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:147,51:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,85:.:-0.81:1.000:. ./.:4:140,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:243,99:.: 1.64:1.000:. ./.:4:67,67:.:-1.12:1.000:. ./.:4:98,94:.:-0.35:1.000:. ./.:4:134,52:.:-0.43:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:69,32:.:-1.55:1.000:. ./.:4:102,51:.:-0.86:1.000:. ./.:4:97,53:.:-0.90:1.000:. ./.:4:199,83:.: 0.84:1.000:. ./.:4:75,14:.:-1.71:0.996:. ./.:4:115,52:.:-0.68:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:287,88:.: 2.07:1.000:. ./.:4:91,112:.:-0.20:1.000:. ./.:4:108,33:.:-1.02:1.000:. ./.:4:100,35:.:-1.10:1.000:. ./.:4:109,35:.:-0.98:1.000:. ./.:4:63,85:.:-0.93:1.000:. ./.:4:113,40:.:-0.86:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:128,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:160,172:.: 1.50:1.000:. ./.:4:210,70:.: 0.82:1.000:. ./.:4:155,61:.:-0.03:1.000:. ./.:4:225,77:.: 1.11:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:238,114:.: 1.77:1.000:. ./.:4:227,84:.: 1.23:1.000:. ./.:4:17,41:.:-2.12:1.000:. ./.:4:172,67:.: 0.27:1.000:. ./.:4:200,82:.: 0.84:1.000:. ./.:4:198,80:.: 0.79:1.000:. ./.:4:237,93:.: 1.48:1.000:. ./.:4:214,96:.: 1.21:1.000:. ./.:4:125,137:.: 0.58:1.000:. ./.:4:209,65:.: 0.74:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:105,128:.: 0.19:1.000:. ./.:4:180,68:.: 0.39:1.000:. ./.:4:188,67:.: 0.48:1.000:. ./.:4:266,82:.: 1.71:1.000:. ./.:4:196,78:.: 0.74:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:164,69:.: 0.19:1.000:. ./.:4:171,93:.: 0.60:1.000:. ./.:4:163,52:.:-0.04:1.000:. ./.:4:156,58:.:-0.06:1.000:. ./.:4:169,61:.: 0.15:1.000:. ./.:4:143,63:.:-0.16:1.000:. ./.:4:138,44:.:-0.48:1.000:. ./.:4:166,73:.: 0.27:1.000:. ./.:4:240,98:.: 1.58:1.000:. ./.:4:134,161:.: 1.01:1.000:. ./.:4:211,86:.: 1.04:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:210,112:.: 1.37:1.000:. ./.:4:267,100:.: 1.97:1.000:. ./.:4:257,81:.: 1.58:1.000:. ./.:4:163,57:.: 0.02:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.02:1.000:. -chr4.1 37693962 chr4.1_037693962 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:347,93:0.23: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,136:0.52:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:208,170:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,280:0.74: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,186:0.47: 1.09:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,473:1.00: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,169:0.74:-1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:224,146:0.43: 0.25:1.000:0.949 0/0/1/1:4:175,163:0.52:-0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:97,45:0.34:-2.63:1.000:0.838 0/1/1/1:4:46,109:0.74:-2.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,320:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,176:0.51: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:271,92:0.27: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,192:0.54: 0.46:1.000:0.988 0/1/1/1:4:123,283:0.73: 0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:217,184:0.50: 0.65:0.999:0.997 0/1/1/1:4:126,282:0.73: 0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:405,106:0.23: 2.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:249,202:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,50:0.43:-2.83:1.000:0.955 0/1/1/1:4:111,258:0.74: 0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:122,334:0.77: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,155:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,59:0.56:-2.98:1.000:0.969 0/0/1/1:4:232,208:0.52: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,289:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,245:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,293:0.72: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:108,258:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:235,182:0.48: 0.85:1.000:0.994 0/1/1/1:4:80,224:0.77:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,63:0.99:-3.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,75:0.52:-2.44:1.000:0.995 0/1/1:3:44,37:0.50:-3.40:0.999:0.503 1/1/1/1:4:1,362:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,261:0.73: 0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:86,250:0.78:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,246:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,187:0.53: 0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:93,239:0.75:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,270:0.79: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,297:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,151:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:110,265:0.74: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:124,285:0.73: 0.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:132,328:0.75: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,219:0.53: 1.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:172,153:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:298,84:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,228:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:143,357:0.75: 1.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,244:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,290:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,165:0.54:-0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:208,159:0.47: 0.22:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,309:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,308:0.80: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,153:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1/1/1:6:73,229:0.79:-0.61:1.000:0.869 0/1/1/1:4:106,255:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,291:0.81: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,190:0.50: 0.86:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,266:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:239,208:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,238:0.60: 0.94:1.000:0.778 0/0/1/1:4:145,102:0.45:-1.30:1.000:0.981 0/0/1/1:4:168,159:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:220,209:0.53: 1.00:0.998:0.992 0/1/1/1:4:89,213:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:118,254:0.72: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,117:0.44:-0.78:1.000:0.973 0/1/1/1:4:137,296:0.72: 1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:204,185:0.52: 0.49:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,330:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,157:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:104,227:0.72:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,185:0.54: 0.23:1.000:0.984 0/0/0/1:4:277,82:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,174:0.58:-0.35:1.000:0.909 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:317,94:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:316,104:0.27: 0.89:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,212:0.78:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,225:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:182,189:0.55: 0.27:1.000:0.979 0/0/0/1:4:225,68:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,207:0.73:-0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:100,217:0.72:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,171:0.53: 0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:174,144:0.50:-0.40:0.999:0.997 0/1/1/1:4:94,216:0.73:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:238,198:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,190:0.77:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,235:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,238:0.75:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,146:0.53:-0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:67,191:0.77:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,297:0.80: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,193:0.53: 0.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:192,125:0.43:-0.42:1.000:0.948 0/1/1/1:4:104,258:0.75: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,108:0.50:-1.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,165:0.50: 0.11:0.999:0.997 0/0/1/1:4:145,128:0.51:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,87:0.27:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,138:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:178,149:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:285,222:0.48: 1.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,180:0.53: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:190,169:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:129,349:0.76: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,149:0.47:-0.06:0.999:0.993 0/0/1/1:4:227,168:0.47: 0.57:1.000:0.990 0/0/0/1:4:215,72:0.27:-0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,283:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,228:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,160:0.51:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,125:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:209,161:0.48: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:195,151:0.48:-0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:177,163:0.52:-0.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:109,245:0.73: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:255,202:0.48: 1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,129:0.45:-0.51:1.000:0.984 0/1/1/1:4:92,258:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,229:0.75:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,265:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,99:0.50:-1.67:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,246:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,150:0.48:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,117:0.58:-1.67:0.996:0.923 0/0/1/1:4:220,156:0.45: 0.33:1.000:0.983 0/1/1/1:4:111,230:0.71:-0.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:306,219:0.46: 2.21:1.000:0.985 0/1/1/1:4:112,264:0.74: 0.33:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,280:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,259:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,221:0.78:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,227:0.71:-0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:171,137:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,245:0.74: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:62,188:0.78:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,333:0.77: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:163,359:0.72: 2.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,307:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,179:0.52: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:346,82:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,170:0.50: 0.33:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,371:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,268:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,50:0.38:-2.63:1.000:0.616 0/0/1/1:4:169,142:0.50:-0.49:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,391:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,193:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:136,330:0.74: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:349,109:0.26: 1.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:98,246:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,198:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,245:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,230:0.77:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,161:0.53:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:211,171:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:123,296:0.74: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,189:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,212:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,159:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,252:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,242:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,146:0.52:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,119:0.44:-0.70:1.000:0.968 0/0/0/1:4:312,105:0.27: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,144:0.52:-0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:161,134:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,229:0.78:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,407:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:138,289:0.71: 0.97:1.000:0.993 0/1/1/1:4:130,308:0.74: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,174:0.53: 0.05:1.000:0.991 0/1/1/1:4:112,293:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:314,260:0.50: 2.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:117,294:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,117:0.42:-0.57:1.000:0.909 0/1/1/1:4:109,265:0.74: 0.30:1.000:0.999 -chr4.1 37854730 chr4.1_037854730 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:243,215:0.47: 0.71:1.000:0.992 0/0/1/1:4:183,184:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,160:0.52:-1.11:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,426:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:343,148:0.32: 1.11:1.000:0.949 0/1/1/1:4:124,401:0.77: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,105:0.50:-2.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:116,300:0.72: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:252,93:0.29:-0.65:1.000:0.990 0/1/1/1:4:43,123:0.74:-2.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,161:0.67:-1.94:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,379:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,277:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:219,212:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,311:0.80:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,323:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,322:0.75: 0.39:0.999:0.999 0/0/0/1:4:310,94:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:268,279:0.51: 1.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:131,429:0.77: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,60:0.35:-2.63:1.000:0.820 1/1/1/1:4:0,380:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,272:0.51: 1.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:124,285:0.70: 0.12:1.000:0.984 0/1/1/1:4:31,84:0.73:-3.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:104,303:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,365:0.79: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,242:0.52: 0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:130,363:0.74: 1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,308:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,293:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,154:0.50:-1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,89:0.62:-3.10:1.000:0.543 0/0/1/1:4:122,88:0.43:-2.29:1.000:0.934 0/0/1:3:73,56:0.44:-3.27:0.999:0.984 0/1/1/1:4:111,312:0.74: 0.29:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,445:1.00: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,419:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,293:0.72: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:119,319:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:213,221:0.51: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:200,189:0.48:-0.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,475:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,175:0.49:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,223:0.51: 0.46:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,448:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,400:0.77: 1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,414:0.76: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,100:0.30:-0.53:1.000:0.981 0/0/1/1:4:204,226:0.52: 0.38:1.000:0.994 0/1/1/1:4:87,292:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:159,365:0.70: 1.51:1.000:0.983 0/1/1/1:4:101,235:0.70:-0.76:1.000:0.986 0/0/1/1:4:239,242:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:245,175:0.42: 0.25:1.000:0.927 0/0/0/1:4:295,97:0.27:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,268:0.71:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:115,298:0.72: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:272,97:0.29:-0.36:1.000:0.993 0/1/1/1/1/1:6:77,257:0.77:-0.79:1.000:0.748 0/1/1/1:4:96,344:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,260:0.71:-0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:276,227:0.45: 1.26:1.000:0.984 0/1/1/1:4:98,304:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,239:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:86,356:0.81: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,263:0.79:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,317:0.73: 0.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:101,273:0.73:-0.30:0.998:0.998 0/1/1/1:4:101,313:0.76: 0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,456:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:220,59:0.24:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:131,376:0.74: 1.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,315:0.75: 0.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,428:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,70:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,183:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,344:0.79: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,204:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,229:0.52: 0.50:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,300:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,249:0.52: 0.88:1.000:0.994 0/0/1/1:4:237,211:0.47: 0.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:87,251:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:206,240:0.54: 0.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:210,262:0.55: 0.88:1.000:0.977 0/0/1/1:4:166,140:0.46:-1.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:160,201:0.55:-0.46:1.000:0.974 0/0/1/1:4:192,224:0.54: 0.21:1.000:0.990 0/1/1/1:4:92,267:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:87,205:0.70:-1.30:0.999:0.988 0/1/1/1:4:103,274:0.73:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:99,304:0.76: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,308:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,194:0.45: 0.40:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,394:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,230:0.57: 0.06:1.000:0.952 0/1/1/1:4:77,248:0.77:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,222:0.48: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,254:0.55: 0.77:1.000:0.983 0/0/1/1:4:168,173:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:240,227:0.48: 0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,267:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,324:0.78: 0.23:0.999:1.000 0/1/1/1:4:81,274:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,169:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,172:0.47:-0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:215,225:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:117,372:0.76: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,217:0.54: 0.01:1.000:0.987 0/1/1/1:4:103,295:0.74:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:143,428:0.75: 2.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:329,112:0.28: 0.51:0.999:0.996 0/1/1/1:4:85,344:0.80: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,187:0.55:-0.75:1.000:0.977 0/1/1/1:4:130,350:0.73: 0.98:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,348:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,273:0.74:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,286:0.72:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,177:0.46:-0.13:1.000:0.987 0/1/1/1:4:99,320:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,220:0.49: 0.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,389:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:284,100:0.29:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:210,220:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:110,371:0.77: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,238:0.55: 0.36:1.000:0.977 1/1/1/1:4:1,313:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,241:0.78:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,230:0.72:-0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,177:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:99,321:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,211:0.76:-1.45:0.996:1.000 0/1/1/1:4:132,337:0.72: 0.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:102,293:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:136,463:0.78: 2.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,334:0.79: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,301:0.73: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,246:0.76:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,417:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,323:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,321:0.74: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,303:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,241:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:119,386:0.77: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:151,424:0.74: 2.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:119,352:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,273:0.71:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:246,220:0.47: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:143,140:0.49:-1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:132,366:0.74: 1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:174,195:0.53:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:106,62:0.38:-2.80:1.000:0.589 0/1/1/1:4:76,167:0.69:-1.89:1.000:0.971 0/1/1/1:4:117,343:0.75: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:142,317:0.69: 0.73:1.000:0.976 0/0/1/1:4:242,265:0.52: 1.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:222,225:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,277:0.79:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,372:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,270:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,246:0.74:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,175:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,314:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,207:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:95,290:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,304:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:221,213:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:188,213:0.53: 0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:193,198:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,270:0.80:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,235:0.71:-0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:183,189:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,282:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,283:0.78:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,146:0.53:-1.54:1.000:0.990 0/1/1/1:4:101,354:0.78: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,348:0.77: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,197:0.47: 0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:170,174:0.50:-0.67:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,483:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:131,393:0.75: 1.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:305,257:0.46: 1.97:1.000:0.987 0/0/0/1:4:249,93:0.30:-0.69:1.000:0.988 0/1/1/1:4:123,305:0.71: 0.35:1.000:0.994 -chr4.1 37979616 chr4.1_037979616 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:279,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:204,61:.: 1.20:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:343,0:.: 2.96:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.00:1.000:. ./.:3:158,0:.:-1.23:0.999:. ./.:4:245,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:6:155,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.12:0.998:. ./.:4:189,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.59:0.999:. ./.:4:178,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:166,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:102,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:163,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:312,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:319,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:167,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:212,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.70:0.996:. ./.:4:183,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:315,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:311,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:112,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:320,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.52:1.000:. -chr4.1 38174935 chr4.1_038174935 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,6:.: 0.57:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:30,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,1:.:-2.38:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.66:1.000:. ./.:4:29,6:.: 0.21:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:33,6:.: 0.57:1.000:. ./.:4:29,6:.: 0.21:0.999:. ./.:4:32,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:51,11:.: 2.62:1.000:. ./.:4:41,9:.: 1.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:35,6:.: 0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:27,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.56:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.73:0.999:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,10:.: 0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.12:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:37,6:.: 0.93:1.000:. ./.:4:13,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:29,7:.: 0.30:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,7:.: 1.02:1.000:. ./.:6:21,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:18,3:.:-1.04:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:39,4:.: 0.93:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,3:.: 1.02:1.000:. ./.:4:34,8:.: 0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:0.998:. ./.:4:36,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:16,6:.:-0.95:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.68:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.22:0.999:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.57:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:15,4:.:-1.22:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:39,9:.: 1.37:1.000:. ./.:4:34,7:.: 0.75:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,8:.: 2.09:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.95:0.999:. ./.:4:21,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.22:0.996:. ./.:4:18,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.84:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:32,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:28,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:32,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:34,7:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:36,5:.: 0.75:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:31,9:.: 0.66:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:35,3:.: 0.48:1.000:. ./.:4:32,7:.: 0.57:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.48:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.84:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:29,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:56,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. -chr4.1 38381507 chr4.1_038381507 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:298,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:170,53:.:-0.34:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:218,85:.: 1.07:1.000:. ./.:4:212,71:.: 0.71:1.000:. ./.:4:76,79:.:-1.54:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:181,61:.:-0.01:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:69,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:145,130:.: 0.57:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.11:0.999:. ./.:4:116,129:.: 0.04:1.000:. ./.:4:331,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:240,102:.: 1.75:1.000:. ./.:4:41,39:.:-2.86:1.000:. ./.:4:191,69:.: 0.31:1.000:. ./.:4:218,83:.: 1.03:1.000:. ./.:4:167,77:.: 0.03:1.000:. ./.:4:50,0:.:-3.39:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:114,134:.: 0.10:1.000:. ./.:4:130,118:.: 0.10:1.000:. ./.:4:233,93:.: 1.47:1.000:. ./.:4:105,114:.:-0.41:1.000:. ./.:4:194,53:.: 0.08:1.000:. ./.:4:94,95:.:-0.94:1.000:. ./.:4:30,11:.:-3.55:1.000:. ./.:4:79,28:.:-2.38:1.000:. ./.:3:35,1:.:-3.63:0.999:. ./.:4:107,125:.:-0.18:1.000:. ./.:4:171,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:207,78:.: 0.75:1.000:. ./.:4:132,55:.:-0.98:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:129,137:.: 0.41:1.000:. ./.:4:122,126:.: 0.10:1.000:. ./.:4:182,48:.:-0.22:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:219,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:172,60:.:-0.18:1.000:. ./.:4:160,186:.: 1.82:1.000:. ./.:4:385,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:168,56:.:-0.33:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:108,92:.:-0.75:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:136,158:.: 0.91:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:187,53:.:-0.04:1.000:. ./.:4:130,125:.: 0.22:1.000:. ./.:4:95,90:.:-1.01:1.000:. ./.:4:117,102:.:-0.41:1.000:. ./.:6:182,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:216,79:.: 0.92:1.000:. ./.:4:175,64:.:-0.06:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:140,50:.:-0.92:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:205,47:.: 0.17:1.000:. ./.:4:173,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:183,78:.: 0.33:0.998:. ./.:4:173,48:.:-0.38:1.000:. ./.:4:189,78:.: 0.43:1.000:. ./.:4:102,32:.:-1.91:1.000:. ./.:4:160,62:.:-0.36:1.000:. ./.:4:251,66:.: 1.31:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:160,56:.:-0.47:1.000:. ./.:4:168,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:206,72:.: 0.63:1.000:. ./.:4:137,40:.:-1.15:1.000:. ./.:4:180,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:122,114:.:-0.11:1.000:. ./.:4:198,67:.: 0.40:1.000:. ./.:4:220,77:.: 0.96:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:163,55:.:-0.43:1.000:. ./.:4:167,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:170,68:.:-0.08:0.999:. ./.:4:169,54:.:-0.34:1.000:. ./.:4:233,68:.: 1.03:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:198,77:.: 0.57:1.000:. ./.:4:160,63:.:-0.34:1.000:. ./.:4:160,41:.:-0.73:1.000:. ./.:4:168,43:.:-0.55:1.000:. ./.:4:209,56:.: 0.40:1.000:. ./.:4:200,58:.: 0.27:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:201,88:.: 0.82:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:152,57:.:-0.59:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:117,103:.:-0.40:1.000:. ./.:4:200,78:.: 0.63:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:181,51:.:-0.18:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:181,66:.: 0.08:0.999:. ./.:4:194,71:.: 0.40:1.000:. ./.:4:136,65:.:-0.73:1.000:. ./.:4:216,80:.: 0.94:1.000:. ./.:4:175,64:.:-0.06:1.000:. ./.:4:156,59:.:-0.48:1.000:. ./.:4:173,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:175,42:.:-0.45:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:113,104:.:-0.45:1.000:. ./.:4:191,74:.: 0.40:1.000:. ./.:4:197,71:.: 0.45:1.000:. ./.:4:179,57:.:-0.11:1.000:. ./.:4:187,61:.: 0.10:1.000:. ./.:4:129,144:.: 0.54:1.000:. ./.:4:99,101:.:-0.75:1.000:. ./.:4:134,50:.:-1.03:1.000:. ./.:4:97,89:.:-0.99:1.000:. ./.:4:170,67:.:-0.10:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:180,1:.:-1.08:0.996:. ./.:4:209,80:.: 0.82:1.000:. ./.:4:198,65:.: 0.36:1.000:. ./.:4:378,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:106,156:.: 0.34:1.000:. ./.:4:146,50:.:-0.82:1.000:. ./.:4:153,64:.:-0.45:1.000:. ./.:4:138,68:.:-0.64:1.000:. ./.:4:123,125:.: 0.10:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:183,83:.: 0.41:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:256,91:.: 1.84:1.000:. ./.:4:169,180:.: 1.87:1.000:. ./.:4:127,127:.: 0.20:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:129,156:.: 0.75:1.000:. ./.:4:191,69:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,28:.:-3.05:1.000:. ./.:4:120,53:.:-1.22:1.000:. ./.:4:194,86:.: 0.66:1.000:. ./.:4:219,81:.: 1.01:1.000:. ./.:4:169,172:.: 1.73:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:100,138:.:-0.08:0.998:. ./.:4:278,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:95,74:.:-1.29:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:169,67:.:-0.11:1.000:. ./.:4:205,81:.: 0.77:1.000:. ./.:4:202,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:151,63:.:-0.50:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:132,125:.: 0.26:1.000:. ./.:4:129,132:.: 0.33:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:137,64:.:-0.73:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:89,130:.:-0.41:1.000:. ./.:4:135,146:.: 0.68:1.000:. ./.:4:123,163:.: 0.77:1.000:. ./.:4:163,53:.:-0.47:1.000:. ./.:4:182,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:205,77:.: 0.70:1.000:. ./.:4:358,1:.: 2.05:1.000:. ./.:4:189,163:.: 1.93:1.000:. ./.:4:172,55:.:-0.27:1.000:. ./.:4:220,73:.: 0.89:1.000:. -chr4.1 38649614 chr4.1_038649614 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:231,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.26:0.999:. ./.:4:124,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:266,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.58:1.000:. ./.:3:39,0:.:-1.82:0.999:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.42:1.000:. ./.:6:135,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.71:0.998:. ./.:4:104,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:73,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:263,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,1:.:-1.62:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:134,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.49:0.999:. ./.:4:180,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.31:0.996:. ./.:4:203,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:274,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:224,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.69:0.998:. ./.:4:187,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:80,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:267,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.26:1.000:. -chr4.1 38887458 chr4.1_038887458 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,7:.: 0.45:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.62:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:0.999:. ./.:4:3,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,7:.: 0.69:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:6,5:.: 0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.85:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:7,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:7,6:.: 0.92:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:3,8:.: 0.45:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.92:1.000:. ./.:4:15,2:.: 1.84:1.000:. ./.:4:4,8:.: 0.69:1.000:. ./.:4:3,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,0:.: 3.92:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.69:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.92:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:10,4:.: 1.15:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:9,8:.: 1.84:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.69:1.000:. ./.:4:9,6:.: 1.38:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:1.000:. ./.:6:17,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.93:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:5,15:.: 2.53:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,7:.: 1.84:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:0.998:. ./.:4:8,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:7,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,2:.: 1.15:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,3:.: 1.84:1.000:. ./.:4:13,4:.: 1.84:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.70:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:3,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:10,8:.: 2.07:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:9,5:.: 1.15:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.92:0.999:. ./.:4:1,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:10,4:.: 1.15:1.000:. ./.:4:8,6:.: 1.15:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:10,6:.: 1.61:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.01:0.999:. ./.:4:13,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:13,6:.: 2.30:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.24:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:7,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.24:0.999:. ./.:4:7,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:8,8:.: 1.61:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:5,6:.: 0.45:1.000:. ./.:4:7,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,7:.: 0.45:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.01:0.996:. ./.:4:9,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:5,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:11,5:.: 1.61:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:15,5:.: 2.53:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:5,7:.: 0.69:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:14,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.01:0.998:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:12,4:.: 1.61:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.85:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:4,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.93:1.000:. -chr4.1 39351842 chr4.1_039351842 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:51,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:159,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.44:0.999:. ./.:4:95,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.51:1.000:. ./.:3:10,0:.:-1.30:0.999:. ./.:4:161,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.51:1.000:. ./.:6:75,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.33:0.998:. ./.:4:68,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:45,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.91:0.999:. ./.:4:28,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:206,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:23,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.12:0.996:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.68:0.998:. ./.:4:165,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:144,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.07:1.000:. -chr4.1 39432651 chr4.1_039432651 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:117,83:.: 1.39:1.000:. ./.:4:37,71:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,92:.: 0.39:1.000:. ./.:4:65,122:.: 1.15:1.000:. ./.:4:59,104:.: 0.72:1.000:. ./.:4:168,98:.: 2.59:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.50:1.000:. ./.:4:50,89:.: 0.28:1.000:. ./.:4:37,80:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,3:.:-2.02:1.000:. ./.:4:9,11:.:-1.87:1.000:. ./.:4:53,99:.: 0.52:1.000:. ./.:4:148,76:.: 1.83:1.000:. ./.:4:58,84:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.23:1.000:. ./.:4:132,88:.: 1.75:1.000:. ./.:4:126,71:.: 1.34:0.999:. ./.:4:54,113:.: 0.79:1.000:. ./.:4:54,105:.: 0.65:1.000:. ./.:4:116,102:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.07:1.000:. ./.:4:52,116:.: 0.81:1.000:. ./.:4:124,91:.: 1.66:1.000:. ./.:4:1,145:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.22:1.000:. ./.:4:52,102:.: 0.56:1.000:. ./.:4:84,129:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.16:1.000:. ./.:4:78,155:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,93:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,126:.: 1.35:1.000:. ./.:4:60,125:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,53:.:-0.70:1.000:. ./.:4:43,91:.: 0.19:1.000:. ./.:4:28,60:.:-0.64:1.000:. ./.:4:44,78:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,50:.:-0.46:1.000:. ./.:4:37,47:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,192:.: 1.24:1.000:. ./.:4:50,44:.:-0.53:1.000:. ./.:4:66,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:63,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:28,51:.:-0.80:1.000:. ./.:4:122,57:.: 1.01:1.000:. ./.:4:44,52:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,50:.:-0.13:1.000:. ./.:4:101,68:.: 0.83:1.000:. ./.:4:46,65:.:-0.22:1.000:. ./.:4:47,85:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,53:.:-0.66:1.000:. ./.:4:41,35:.:-0.86:1.000:. ./.:6:53,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:82,43:.: 0.03:1.000:. ./.:4:103,41:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,30:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,37:.:-0.93:1.000:. ./.:4:44,83:.: 0.07:1.000:. ./.:4:67,57:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.42:1.000:. ./.:4:79,59:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,70:.:-0.95:0.998:. ./.:4:97,54:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,57:.:-1.20:1.000:. ./.:4:34,51:.:-0.70:1.000:. ./.:4:85,42:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.68:1.000:. ./.:4:72,36:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,29:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.00:1.000:. ./.:4:71,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,48:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,54:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,60:.:-0.51:1.000:. ./.:4:46,71:.:-0.12:1.000:. ./.:4:36,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,118:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.82:1.000:. ./.:4:33,42:.:-0.88:1.000:. ./.:4:67,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,54:.:-1.26:1.000:. ./.:4:42,53:.:-0.51:1.000:. ./.:4:34,50:.:-0.71:0.999:. ./.:4:28,60:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.90:1.000:. ./.:4:33,66:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.00:1.000:. ./.:4:55,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,40:.:-0.84:1.000:. ./.:4:25,30:.:-1.24:1.000:. ./.:4:79,42:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,99:.: 0.30:1.000:. ./.:4:44,47:.:-0.59:1.000:. ./.:4:110,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:46,25:.:-0.95:1.000:. ./.:4:35,32:.:-1.02:0.999:. ./.:4:50,20:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,52:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,56:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.45:1.000:. ./.:4:155,98:.: 2.35:1.000:. ./.:4:48,70:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,50:.:-0.82:1.000:. ./.:4:140,87:.: 1.88:1.000:. ./.:4:28,40:.:-1.00:0.999:. ./.:4:61,88:.: 0.46:1.000:. ./.:4:35,40:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,78:.:-0.17:1.000:. ./.:4:32,40:.:-0.93:1.000:. ./.:4:36,54:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,59:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,46:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.93:1.000:. ./.:4:43,62:.:-0.33:1.000:. ./.:4:59,119:.: 0.99:1.000:. ./.:4:34,49:.:-0.73:1.000:. ./.:4:52,75:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,61:.:-1.13:1.000:. ./.:4:47,44:.:-0.59:1.000:. ./.:4:18,20:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.31:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.25:1.000:. ./.:4:16,30:.:-1.40:0.996:. ./.:4:0,111:.:-0.22:1.000:. ./.:4:84,58:.: 0.34:1.000:. ./.:4:119,112:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.44:1.000:. ./.:4:20,46:.:-1.04:1.000:. ./.:4:34,47:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.08:1.000:. ./.:4:36,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.08:1.000:. ./.:4:92,72:.: 0.74:1.000:. ./.:4:62,28:.:-0.61:1.000:. ./.:4:68,152:.: 1.75:1.000:. ./.:4:108,176:.: 2.91:1.000:. ./.:4:53,110:.: 0.72:1.000:. ./.:4:104,73:.: 0.97:1.000:. ./.:4:123,76:.: 1.37:1.000:. ./.:4:87,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,182:.: 1.06:1.000:. ./.:4:111,95:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.09:1.000:. ./.:4:117,74:.: 1.23:1.000:. ./.:4:63,93:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.85:1.000:. ./.:4:91,74:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.13:0.998:. ./.:4:77,108:.: 1.12:1.000:. ./.:4:110,69:.: 1.01:1.000:. ./.:4:53,100:.: 0.54:1.000:. ./.:4:54,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,119:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,200:.: 1.39:1.000:. ./.:4:1,154:.: 0.57:1.000:. ./.:4:94,53:.: 0.43:1.000:. ./.:4:53,98:.: 0.50:1.000:. ./.:4:84,65:.: 0.46:1.000:. ./.:4:123,76:.: 1.37:1.000:. ./.:4:103,74:.: 0.97:1.000:. ./.:4:39,90:.: 0.10:1.000:. ./.:4:103,52:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,98:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.41:1.000:. ./.:4:50,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:130,67:.: 1.34:1.000:. ./.:4:49,94:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.81:1.000:. ./.:4:160,107:.: 2.61:1.000:. ./.:4:0,188:.: 1.17:1.000:. ./.:4:28,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:68,114:.: 1.06:1.000:. -chr4.1 39595706 chr4.1_039595706 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:32,80:0.68: 1.56:1.000:0.963 0/0/1/1:4:44,45:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,41:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,46:0.58:-0.08:1.000:0.914 0/0/1/1:4:60,73:0.53: 2.52:1.000:0.993 0/1/1/1:4:18,69:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,32:0.55:-0.99:1.000:0.982 0/0/1/1:4:49,36:0.42: 0.33:1.000:0.911 0/0/1/1:4:32,34:0.49:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,21:0.53:-1.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,15:0.55:-2.36:1.000:0.977 0/1/1/1:4:16,50:0.73:-0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,47:0.74:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,27:0.40:-0.44:1.000:0.769 0/0/0/1:4:61,18:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,33:0.45:-0.26:1.000:0.978 0/1/1/1:4:8,65:0.87:-0.21:0.999:0.870 0/0/0/1:4:70,27:0.30: 0.88:1.000:0.985 0/0/1/1:4:55,61:0.50: 1.75:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,126:1.00: 2.20:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:16,64:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,86:0.85: 0.97:1.000:0.989 0/0/1/1:4:44,38:0.45: 0.20:1.000:0.982 0/0/0/1:4:15,3:0.20:-2.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,34:0.48:-0.40:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,42:0.48: 0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,68:0.68: 0.83:1.000:0.950 0/0/1/1:4:46,48:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,33:0.48:-0.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:8,50:0.84:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,5:0.48:-3.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,27:0.62:-1.63:1.000:0.620 1/1/1:3:1,19:0.94:-2.63:0.999:1.000 0/1/1/1:4:15,64:0.78: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,66:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,56:0.59: 0.61:1.000:0.865 0/1/1/1:4:14,39:0.70:-1.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:31,34:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,66:0.84:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,72:0.77: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,47:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,14:0.27:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,55:0.59: 0.52:1.000:0.850 0/0/1/1:4:36,43:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:21,85:0.77: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,14:0.71:-2.68:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,36:0.66:-1.17:1.000:0.888 0/1/1/1:4:6,22:0.75:-2.27:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,48:0.53: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,34:0.56:-0.90:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,40:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,30:0.46:-0.62:1.000:0.985 0/0/1/1:4:50,30:0.38: 0.11:1.000:0.562 1/1/1/1:4:0,88:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,62:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:25,72:0.71: 0.88:1.000:0.821 0/1/1/1:4:19,76:0.77: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,40:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,42:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,34:0.55:-0.85:1.000:0.977 0/0/1/1:4:49,29:0.38: 0.01:1.000:0.527 0/1/1/1:4:12,66:0.82: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,12:0.36:-1.99:1.000:0.674 0/1/1/1:4:15,69:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,41:0.46: 0.38:0.998:0.989 0/1/1/1:4:20,72:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,44:0.55:-0.03:1.000:0.982 0/0/1/1:4:17,23:0.55:-1.72:1.000:0.979 0/1/1/1:4:18,52:0.71:-0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,60:0.53: 1.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:33,28:0.45:-0.76:1.000:0.978 0/1/1/1:4:23,50:0.66:-0.21:1.000:0.843 0/0/0/1:4:50,22:0.32:-0.26:1.000:0.948 0/1/1/1:4:21,75:0.75: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,60:0.55: 1.20:1.000:0.977 0/1/1/1:4:19,48:0.69:-0.49:1.000:0.967 0/0/1/1:4:32,37:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,76:0.77: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,49:0.47: 1.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,56:0.72:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,21:0.41:-1.22:1.000:0.862 0/0/1/1:4:40,68:0.60: 1.38:1.000:0.760 0/0/1/1:4:32,29:0.46:-0.76:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,49:0.72:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,18:0.27:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,41:0.45: 0.47:1.000:0.984 0/1/1/1:4:8,52:0.85:-0.81:0.999:0.991 0/1/1/1:4:13,76:0.83: 0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,60:0.59: 0.88:1.000:0.846 0/0/1/1:4:26,27:0.49:-1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,31:0.32: 1.06:1.000:0.944 0/1/1/1:4:18,46:0.69:-0.62:1.000:0.971 0/1/1/1:4:18,73:0.77: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,34:0.53:-0.76:1.000:0.990 0/1/1/1:4:18,93:0.81: 1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,62:0.65: 0.65:1.000:0.751 0/0/1/1:4:19,24:0.54:-1.58:1.000:0.990 0/1/1/1:4:9,74:0.88: 0.24:1.000:0.852 0/1/1/1:4:18,65:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,50:0.52: 0.70:0.999:0.996 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,48:0.58: 0.11:1.000:0.932 0/1/1/1:4:16,53:0.74:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,44:0.54: 0.01:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,83:0.77: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,19:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,78:0.78: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,30:0.42:-0.31:1.000:0.908 0/0/1/1:4:39,54:0.56: 0.70:0.999:0.972 0/1/1/1:4:16,78:0.80: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,22:0.66:-2.08:1.000:0.860 0/1/1/1:4:21,60:0.71: 0.15:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,48:0.74:-0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,44:0.84:-1.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,64:0.79: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,54:0.71:-0.21:1.000:0.991 0/0/0/1:4:61,18:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,75:0.67: 1.38:1.000:0.899 1/1/1/1:4:0,79:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,62:0.58: 1.11:1.000:0.903 0/1/1/1:4:22,72:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,73:0.80: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,46:0.46: 0.93:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,48:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,45:0.88:-1.26:1.000:0.645 0/1/1/1:4:12,45:0.76:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,64:0.87:-0.26:1.000:0.891 0/0/0/1:4:57,17:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,33:0.54:-0.85:0.996:0.990 0/0/1/1:4:35,30:0.45:-0.58:1.000:0.981 0/1/1/1:4:15,51:0.74:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,73:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,42:0.55:-0.21:1.000:0.978 0/0/1/1:4:38,44:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,47:0.59:-0.08:1.000:0.847 0/0/1/1:4:36,53:0.57: 0.52:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,17:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,79:0.77: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,31:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,54:0.50: 1.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,111:1.00: 1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,93:0.72: 2.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,77:0.80: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,89:0.76: 1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,55:0.66: 0.11:1.000:0.860 0/0/1/1:4:71,44:0.39: 1.70:1.000:0.641 0/1/1/1:4:27,59:0.66: 0.38:1.000:0.851 0/0/1/1:4:14,18:0.54:-2.08:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,27:0.46:-0.94:1.000:0.988 0/0/1/1:4:45,44:0.48: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,69:0.51: 2.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,82:0.73: 1.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,63:0.72: 0.29:0.998:0.995 0/0/1/1:4:42,48:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,38:0.50:-0.21:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,63:0.68: 0.52:1.000:0.949 0/1/1/1:4:12,55:0.79:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,8:0.24:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,46:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,51:0.70:-0.35:1.000:0.983 0/0/0/1:4:62,21:0.28: 0.24:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,55:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,39:0.72:-1.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,47:0.63:-0.31:1.000:0.619 0/0/0/1:4:62,25:0.31: 0.42:1.000:0.977 0/1/1/1:4:12,40:0.74:-1.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,53:0.65: 0.01:1.000:0.801 0/0/1/1:4:35,52:0.57: 0.42:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,51:0.80:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,32:0.39: 0.24:1.000:0.670 0/0/1/1:4:45,55:0.53: 1.02:1.000:0.993 0/1/1/1:4:18,65:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,72:0.52: 2.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,62:0.72: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,44:0.51: 0.20:1.000:0.996 -chr4.1 39732629 chr4.1_039732629 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:35,57:0.57:-0.56:1.000:0.942 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,72:0.55: 0.34:1.000:0.977 0/0/1/1:4:47,40:0.43:-0.71:1.000:0.950 0/0/0/1:4:90,38:0.26: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:52,30:0.34:-0.87:1.000:0.897 0/0/0/1:4:45,19:0.26:-1.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,59:0.54:-0.28:1.000:0.985 0/0/0/1:4:72,25:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,17:0.53:-2.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,30:0.51:-1.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,55:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,82:0.56: 0.83:1.000:0.974 0/0/1/1:4:41,47:0.51:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,44:0.52:-0.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,81:0.53: 0.99:0.999:0.991 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,87:0.55: 1.14:1.000:0.980 0/0/1/1:4:59,72:0.52: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,14:0.44:-2.47:1.000:0.964 0/0/1/1:4:57,52:0.45:-0.03:1.000:0.979 0/0/0/1:4:69,37:0.32:-0.13:1.000:0.959 0/0/1/1:4:54,56:0.48: 0.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,14:0.77:-2.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,74:0.53: 0.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:57,18:0.21:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,24:0.26:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,39:0.23: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,28:0.29:-0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,72:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,22:0.27:-1.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:7,2:0.20:-3.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,7:0.34:-2.81:1.000:0.883 0/0/1:3:5,3:0.34:-3.15:0.999:1.000 0/0/0/1:4:58,26:0.28:-0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,60:0.44: 0.52:1.000:0.973 0/0/1/1:4:58,45:0.41:-0.22:1.000:0.850 0/0/0/1:4:87,33:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,78:0.52: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,22:0.16: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,41:0.31: 0.34:1.000:0.977 0/0/1/1:4:100,98:0.47: 2.71:1.000:0.991 0/0/1/1:4:73,63:0.43: 0.80:1.000:0.958 0/0/0/1:4:84,39:0.29: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,74:0.46: 1.29:1.000:0.987 0/0/0/1:4:105,34:0.22: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,14:0.73:-2.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,23:0.21:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,43:0.47:-0.71:1.000:0.991 0/0/0/1:4:71,27:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,86:0.54: 1.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:48,67:0.54: 0.15:1.000:0.986 0/0/0/1:4:80,28:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,52:0.52:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,37:0.28: 0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:80,38:0.29: 0.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:91,57:0.35: 1.17:1.000:0.746 0/0/0/1:4:73,32:0.27:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:51,65:0.53: 0.18:1.000:0.852 0/0/1/1:4:67,57:0.43: 0.43:1.000:0.949 0/0/0/1:4:72,43:0.34: 0.15:1.000:0.847 0/1/1/1:4:43,107:0.64: 1.23:1.000:0.739 0/0/0/1:4:91,41:0.28: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,70:0.48: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,71:0.49: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,71:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,70:0.58: 0.06:1.000:0.929 0/0/1/1:4:53,72:0.54: 0.46:0.998:0.989 0/0/0/0:4:75,1:0.01:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,100:0.52: 2.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:91,41:0.28: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,67:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,31:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:89,37:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,76:0.51: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,84:0.56: 0.92:1.000:0.972 0/0/0/1:4:105,55:0.31: 1.54:1.000:0.970 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,84:0.48: 1.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,79:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,24:0.28:-1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,52:0.32: 1.20:1.000:0.959 0/0/1/1:4:88,98:0.50: 2.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,69:0.55: 0.21:1.000:0.981 0/0/0/1:4:70,36:0.31:-0.13:1.000:0.976 0/0/0/1:4:75,31:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,59:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,51:0.47:-0.25:0.999:0.993 0/0/0/1:4:78,34:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,65:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,53:0.63:-1.02:1.000:0.502 0/0/0/1:4:96,56:0.34: 1.29:1.000:0.883 0/0/1/1:4:71,109:0.56: 2.16:1.000:0.966 0/0/0/1:4:85,40:0.29: 0.46:1.000:0.993 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,44:0.27: 1.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,32:0.22: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,59:0.55:-0.34:1.000:0.976 0/0/0/1:4:108,39:0.23: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,51:0.45:-0.09:1.000:0.978 0/0/1/1:4:54,77:0.55: 0.65:0.999:0.982 0/0/1/1:4:62,55:0.44: 0.21:1.000:0.970 0/0/1/1:4:50,69:0.54: 0.28:1.000:0.987 0/0/0/1:4:72,27:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,27:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,80:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,69:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,68:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,53:0.45: 0.00:1.000:0.983 0/0/0/1:4:84,44:0.31: 0.55:0.999:0.970 0/0/1/1:4:57,75:0.53: 0.68:1.000:0.992 0/0/0/1:4:56,30:0.32:-0.74:1.000:0.959 0/0/0/1:4:102,37:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,65:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,55:0.55:-0.56:1.000:0.974 0/0/1/1:4:64,71:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,64:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,76:0.49: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,45:0.34: 0.34:1.000:0.861 0/0/0/1:4:90,29:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,19:0.22:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,70:0.54: 0.34:1.000:0.988 0/0/0/1:4:103,32:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,40:0.28: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,69:0.57: 0.06:1.000:0.949 0/0/0/1:4:63,34:0.32:-0.40:1.000:0.955 0/0/0/1:4:75,27:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,52:0.55:-0.71:1.000:0.974 0/0/1/1:4:30,57:0.60:-0.71:0.996:0.796 0/0/1/1:4:41,70:0.58: 0.03:1.000:0.912 0/0/1/1:4:49,47:0.46:-0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:52,85:0.57: 0.83:1.000:0.940 0/0/1/1:4:62,68:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,38:0.33:-0.16:1.000:0.917 0/0/0/1:4:75,42:0.33: 0.21:1.000:0.929 0/0/1/1:4:48,79:0.57: 0.52:1.000:0.936 0/0/0/1:4:88,29:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,58:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,52:0.55:-0.68:1.000:0.980 0/0/1/1:4:48,60:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,93:0.54: 1.57:1.000:0.988 0/0/0/1:4:122,28:0.17: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,24:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,55:0.45: 0.15:1.000:0.980 0/0/1/1:4:51,69:0.54: 0.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,58:0.43: 0.49:1.000:0.951 0/0/0/1:4:79,23:0.20:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,16:0.22:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.53:-2.90:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,33:0.53:-1.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:110,48:0.27: 1.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,67:0.43: 1.14:1.000:0.939 0/0/0/1:4:91,22:0.17: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,64:0.46: 0.65:1.000:0.988 0/0/0/1:4:48,25:0.31:-1.14:0.998:0.972 0/0/1/1:4:54,57:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,49:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,23:0.26:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,55:0.52:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:42,41:0.47:-0.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:60,22:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,39:0.49:-1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,71:0.57: 0.15:1.000:0.946 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,29:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,30:0.34:-0.93:1.000:0.838 0/0/1/1:4:31,34:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,34:0.47:-1.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,54:0.44: 0.15:1.000:0.969 0/0/0/1:4:79,33:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,82:0.54: 1.02:1.000:0.990 0/0/0/1:4:58,23:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,28:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,35:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,16:0.21:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,33:0.42:-1.11:1.000:0.901 0/0/1/1:4:58,44:0.40:-0.25:1.000:0.809 0/0/1/1:4:61,80:0.53: 0.95:1.000:0.992 0/0/0/1:4:80,32:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,27:0.26:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/0:4:108,1:0.01:-0.03:1.000:1.000 -chr4.1 40704747 chr4.1_040704747 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:51,106:0.69: 0.05:1.000:0.974 0/1/1/1:4:46,95:0.69:-0.35:1.000:0.972 0/1/1/1:4:43,120:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,73:0.46: 0.28:1.000:0.990 0/1/1/1:4:39,140:0.79: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,159:0.76: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,92:0.74:-0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,118:0.72: 0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,112:0.72: 0.10:1.000:0.995 1/1/1/1:4:6,46:0.89:-2.61:1.000:0.520 0/1/1/1:4:9,25:0.75:-3.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,42:0.31:-0.18:1.000:0.965 0/0/1/1:4:76,80:0.53: 0.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:114,110:0.51: 1.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,85:0.49: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,141:0.75: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,88:0.51: 0.61:0.999:0.996 0/0/1/1:4:98,91:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,103:0.49: 1.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,98:0.48: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,30:0.49:-2.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,83:0.53: 0.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:48,139:0.76: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,70:0.47: 0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,4:0.16:-3.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,164:0.73: 1.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,103:0.49: 1.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,115:0.69: 0.38:1.000:0.976 0/0/1/1:4:99,93:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,94:0.54: 0.68:1.000:0.989 0/0/0/1:4:152,43:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,98:0.57: 0.56:1.000:0.936 0/0/1/1:4:17,10:0.40:-3.24:1.000:0.772 0/0/0/1:4:38,20:0.37:-2.46:1.000:0.519 0/0/1:3:11,4:0.30:-3.55:0.999:1.000 0/1/1/1:4:51,132:0.73: 0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,94:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,38:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,81:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,170:0.79: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,66:0.47:-0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,68:0.47:-0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:139,45:0.28: 0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,90:0.74:-0.81:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,75:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,38:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,85:0.76:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,95:0.71:-0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,43:0.43:-1.24:1.000:0.951 0/1/1/1:4:56,145:0.73: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,57:0.48:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,146:0.78: 0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,129:0.76: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,145:0.82: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,88:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,111:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:32,89:0.75:-0.86:1.000:0.502 0/1/1/1:4:37,118:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,124:0.78: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,117:0.72: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,100:0.72:-0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,137:0.81: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,79:0.41: 1.34:1.000:0.844 0/0/1/1:4:50,42:0.48:-1.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,51:0.43:-0.76:1.000:0.956 0/0/1/1:4:62,69:0.55:-0.61:0.998:0.982 0/1/1/1:4:47,113:0.72: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,31:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,86:0.75:-0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,117:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,84:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,66:0.53:-0.61:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,120:0.78: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,66:0.47:-0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,76:0.47: 0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,110:0.68: 0.28:1.000:0.949 0/0/1/1:4:63,58:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,76:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,60:0.42:-0.10:1.000:0.928 0/0/0/1:4:139,39:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,100:0.70:-0.20:1.000:0.980 0/0/1/1:4:84,92:0.54: 0.53:1.000:0.985 0/0/1/1:4:68,76:0.55:-0.28:1.000:0.981 0/1/1/1:4:26,105:0.81:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,91:0.70:-0.58:1.000:0.988 0/1/1/1:4:46,106:0.71:-0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:89,28:0.27:-0.96:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,98:0.52: 1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,52:0.44:-0.78:1.000:0.974 0/1/1/1:4:34,116:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,88:0.53: 0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,96:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,59:0.53:-0.96:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,102:0.69:-0.08:1.000:0.967 0/1/1/1:4:48,144:0.76: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,119:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,52:0.46:-0.91:1.000:0.989 0/1/1/1:4:50,97:0.68:-0.20:0.999:0.941 0/0/1/1:4:49,51:0.53:-1.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,75:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,86:0.54: 0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:95,85:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,116:0.53: 1.90:1.000:0.993 0/1/1/1:4:46,100:0.70:-0.23:1.000:0.985 0/0/0/1:4:105,30:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,183:0.76: 2.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,98:0.72:-0.40:0.999:0.995 0/0/0/1:4:113,30:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,87:0.81:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,70:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,60:0.47:-0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:105,22:0.21:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,32:0.27:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,55:0.46:-0.71:1.000:0.986 0/0/1/1:4:103,94:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,73:0.52:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,72:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,130:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,72:0.54:-0.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:80,77:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,113:0.73: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,22:0.22:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,18:0.21:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,25:0.28:-1.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,99:0.76:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,87:0.54: 0.33:1.000:0.988 0/1/1/1:4:34,61:0.66:-1.52:0.996:0.860 0/0/1/1:4:95,62:0.42: 0.05:1.000:0.920 0/1/1/1:4:40,119:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,106:0.51: 1.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:128,31:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,90:0.71:-0.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:28,74:0.74:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:118,32:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,70:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,59:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,107:0.74:-0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,81:0.76:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,111:0.52: 1.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,96:0.46: 1.67:1.000:0.987 0/1/1/1:4:52,130:0.73: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,100:0.53: 1.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:52,145:0.75: 1.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,106:0.74:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,90:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,135:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,17:0.43:-2.86:1.000:0.949 0/0/1/1:4:61,53:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,119:0.71: 0.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:108,95:0.49: 1.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,142:0.71: 1.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,145:0.80: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,39:0.30:-0.30:0.998:0.981 0/1/1/1:4:42,139:0.78: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,121:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,77:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,105:0.76:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,40:0.26: 0.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,115:0.69: 0.41:1.000:0.970 0/0/1/1:4:113,95:0.48: 1.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:37,97:0.74:-0.53:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,111:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,122:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,126:0.77: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,75:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,30:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,106:0.71:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,131:0.83: 0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,63:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,57:0.51:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,112:0.51: 1.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,100:0.57: 0.68:1.000:0.947 0/1/1/1:4:44,147:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,115:0.78:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,43:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,90:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,167:0.76: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,76:0.53:-0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:80,90:0.55: 0.38:1.000:0.979 -chr4.1 40870396 chr4.1_040870396 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,52:0.46: 1.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,69:0.50: 1.83:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,61:0.48: 1.65:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:55,48:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,48:0.50: 0.50:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.33:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:77,1:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,67:0.50: 1.65:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.33:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.29:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:80,83:0.52: 2.28:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,59:0.48: 1.45:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,1:0.20:-0.15:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:45,17:0.39:-0.72:1.000:0.701 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1:3:0,59:1.00:-0.81:0.999:1.000 0/0/1/1:4:67,67:0.51: 1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,51:0.48: 0.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:93,2:0.25: 0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,78:0.50: 2.31:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,86:0.52: 2.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:72,1:0.22:-0.39:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:40,34:0.49:-0.36:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,67:0.49: 1.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,49:0.46: 1.00:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,61:0.48: 1.62:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:60,58:0.51: 0.94:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.81:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1/1/1:6:58,61:0.52: 0.97:1.000:0.869 0/0/1/1:4:79,50:0.45: 1.27:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,61:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,1:0.25:-0.89:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,90:1.00: 0.11:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,121:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,59:0.75:-0.78:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.28:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,64:0.53: 1.00:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:59,58:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,48:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,62:0.51: 1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,58:0.54: 0.53:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,75:0.54: 1.39:0.999:0.985 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.75:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:105,92:0.50: 3.28:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,60:0.50: 1.15:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.52:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:50,69:0.55: 0.97:1.000:0.978 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.15:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.07:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,41:0.52:-0.18:0.996:0.995 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,57:0.52: 0.68:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,66:0.53: 1.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,43:0.46: 0.56:1.000:0.990 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,73:0.50: 1.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,47:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,61:0.48: 1.65:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.60:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,74:0.49: 2.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:107,68:0.45: 2.63:1.000:0.983 0/0/1/1:4:60,54:0.50: 0.82:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.57:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,65:0.50: 1.51:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.57:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.01:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,14:0.35:-0.45:1.000:0.802 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.33:1.000:1.000 -chr4.1 41012489 chr4.1_041012489 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:378,5:.: 0.99:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:360,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:158,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:109,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:155,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.69:0.999:. ./.:4:327,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:412,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:327,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:109,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:104,2:.:-3.23:1.000:. ./.:3:53,0:.:-4.03:0.999:. ./.:4:305,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:424,2:.: 1.65:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:321,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:302,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.06:1.000:. ./.:6:277,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:440,2:.: 1.89:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.17:0.998:. ./.:4:293,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:299,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:260,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:423,3:.: 1.65:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.96:0.999:. ./.:4:324,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:297,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:248,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:288,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:304,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:340,5:.: 0.41:1.000:. ./.:4:336,3:.: 0.32:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.57:0.999:. ./.:4:354,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:246,2:.:-1.06:0.996:. ./.:4:332,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:442,2:.: 1.92:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:120,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:338,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.42:0.998:. ./.:4:333,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:289,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:293,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:278,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:231,2:.:-1.29:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.66:1.000:. -chr4.1 41325734 chr4.1_041325734 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:119,47:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,120:0.72: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,128:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,47:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,104:0.51: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,89:0.33: 2.06:1.000:0.936 0/1/1/1:4:18,127:0.86: 0.12:1.000:0.973 0/0/1/1:4:83,86:0.47: 0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:85,101:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,14:0.67:-2.16:1.000:0.902 0/0/0/1:4:16,5:0.22:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,112:0.61: 0.63:1.000:0.674 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,43:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,87:0.53: 0.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:186,68:0.24: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.51:0.999:1.000 0/0/0/1:4:96,55:0.33: 0.23:1.000:0.898 0/0/0/1:4:136,75:0.33: 1.33:1.000:0.934 0/0/0/1:4:150,65:0.28: 1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,24:0.72:-1.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,88:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,55:0.27: 0.87:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,164:0.75: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,13:0.53:-2.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,112:0.49: 1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,122:0.49: 1.73:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,222:1.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,47:0.26: 0.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,151:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,103:0.48: 1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,114:0.48: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,16:0.60:-2.07:1.000:0.755 0/0/1/1:4:13,21:0.58:-1.90:1.000:0.911 0/0/1:3:14,10:0.38:-2.09:0.999:1.000 0/1/1/1:4:63,159:0.68: 1.53:1.000:0.960 0/0/1/1:4:102,96:0.45: 1.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:111,116:0.47: 1.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:99,41:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,105:0.53: 0.83:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,69:0.61:-0.57:1.000:0.704 0/0/1/1:4:62,61:0.46:-0.28:1.000:0.987 0/0/1/1:4:53,82:0.57:-0.06:1.000:0.946 0/0/1/1:4:53,58:0.48:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,78:0.68:-0.52:1.000:0.940 0/1/1/1:4:34,97:0.71:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:88,98:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,60:0.52:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,66:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,21:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,34:0.58:-1.52:1.000:0.908 0/0/0/1:4:113,36:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,34:0.32:-0.75:1.000:0.948 0/0/0/1:4:77,27:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,87:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,83:0.58:-0.06:1.000:0.922 0/0/1/1:4:68,71:0.47: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:52,71:0.54:-0.28:1.000:0.988 0/1/1/1:4:31,103:0.74:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/1/1/1:6:38,44:0.50:-1.03:1.000:0.889 0/0/1/1:4:41,57:0.54:-0.74:1.000:0.985 0/0/0/1:4:82,41:0.31:-0.28:1.000:0.979 0/0/0/1:4:62,34:0.33:-0.77:1.000:0.938 0/0/1/1:4:48,51:0.48:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,94:0.59: 0.21:1.000:0.863 0/0/0/1:4:119,32:0.19: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,49:0.59:-1.10:1.000:0.853 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,98:0.75:-0.24:0.998:0.999 0/0/1/1:4:78,80:0.47: 0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,70:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,44:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,89:0.57: 0.16:1.000:0.951 0/1/1/1:4:35,145:0.78: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,50:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,86:0.74:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,29:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,94:0.57: 0.32:1.000:0.957 0/0/1/1:4:39,45:0.50:-0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,58:0.45:-0.33:1.000:0.977 0/0/0/1:4:55,36:0.36:-0.86:1.000:0.634 0/0/1/1:4:59,62:0.47:-0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,106:0.85:-0.30:1.000:0.988 0/0/0/1:4:85,53:0.35:-0.01:1.000:0.758 0/0/0/1:4:53,19:0.24:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,22:0.23:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,73:0.79:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,87:0.61:-0.06:1.000:0.708 0/0/0/1:4:58,32:0.33:-0.88:0.999:0.933 0/1/1/1:4:24,96:0.77:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,96:0.74:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,31:0.31:-0.86:1.000:0.969 0/1/1/1:4:25,109:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,58:0.42:-0.21:1.000:0.922 0/0/1/1:4:24,41:0.59:-1.34:1.000:0.835 0/0/1/1:4:39,49:0.52:-0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,30:0.30:-0.83:1.000:0.988 0/0/1/1:4:53,92:0.60: 0.12:1.000:0.806 0/1/1/1:4:26,53:0.64:-1.08:1.000:0.637 0/0/0/1:4:93,40:0.28:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,64:0.57:-0.59:0.999:0.955 0/0/0/1:4:45,17:0.25:-1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,33:0.30:-0.70:1.000:0.983 0/1/1/1:4:21,76:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,106:0.53: 0.91:1.000:0.994 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,87:0.53: 0.25:1.000:0.991 0/0/0/1:4:52,21:0.26:-1.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,66:0.24: 2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,58:0.59:-0.84:0.999:0.838 0/0/0/1:4:85,43:0.31:-0.19:1.000:0.976 0/0/1/1:4:42,43:0.47:-0.97:1.000:0.992 0/0/0/1:4:61,30:0.30:-0.86:1.000:0.983 0/0/1/1:4:40,45:0.49:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,25:0.31:-1.16:1.000:0.979 0/0/0/1:4:56,38:0.37:-0.81:1.000:0.528 0/0/1/1:4:38,44:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,38:0.31:-0.50:1.000:0.966 0/1/1/1:4:15,76:0.81:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,63:0.55:-0.57:1.000:0.979 0/0/1/1:4:91,121:0.53: 1.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:45,52:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,29:0.27:-0.72:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,49:0.51:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,22:0.26:-1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,48:0.52:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,18:0.20:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,98:0.48: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,30:0.46:-1.43:0.996:0.989 0/1/1/1:4:28,88:0.73:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,70:0.45: 0.09:1.000:0.983 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,69:0.47:-0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,44:0.57:-1.19:1.000:0.957 0/0/1/1:4:35,42:0.51:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,33:0.47:-1.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,53:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,41:0.53:-1.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:72,98:0.54: 0.58:1.000:0.989 0/0/0/1:4:46,22:0.30:-1.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:73,92:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,111:0.52: 1.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,158:0.75: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,65:0.31: 1.00:1.000:0.975 0/0/0/1:4:92,45:0.30:-0.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:116,130:0.49: 1.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,63:0.28: 1.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,23:0.73:-1.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,103:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,112:0.52: 1.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,163:0.79: 1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,56:0.27: 0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,90:0.54: 0.34:0.998:0.990 0/0/1/1:4:97,135:0.54: 1.71:1.000:0.985 0/0/0/1:4:127,45:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,78:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,45:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,47:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,158:0.70: 1.42:1.000:0.984 0/1/1/1:4:35,171:0.81: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,83:0.53: 0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,89:0.46: 0.74:1.000:0.988 0/0/1/1:4:98,85:0.43: 0.82:1.000:0.945 0/0/1/1:4:87,105:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,57:0.35: 0.25:1.000:0.833 0/0/0/1:4:77,35:0.29:-0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,137:0.80: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,83:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,184:0.72: 1.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,106:0.54: 0.83:1.000:0.989 0/0/0/1:4:140,58:0.27: 1.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:49,154:0.73: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,97:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,270:1.00: 2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,111:0.58: 0.74:1.000:0.899 0/0/1/1:4:70,101:0.55: 0.60:1.000:0.977 -chr4.1 41375538 chr4.1_041375538 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:150,40:0.26: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,47:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,87:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,61:0.43: 0.47:1.000:0.955 0/0/1/1:4:54,80:0.62:-0.27:1.000:0.528 0/0/1/1:4:89,47:0.40:-0.21:1.000:0.823 0/0/1/1:4:44,38:0.52:-1.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,89:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,66:0.64:-0.97:1.000:0.723 0/0/1/1:4:61,31:0.40:-1.33:1.000:0.746 0/0/1/1:4:47,27:0.42:-1.78:1.000:0.929 0/0/0/0:4:160,9:0.07: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:131,12:0.11:-0.04:1.000:0.619 0/0/1/1:4:90,45:0.39:-0.24:1.000:0.707 0/1/1/1:4:37,81:0.69:-0.67:1.000:0.977 0/0/1/1:4:97,58:0.43: 0.27:1.000:0.955 0/0/0/0:4:178,6:0.04: 1.00:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,70:0.41: 1.43:1.000:0.843 0/0/0/0:4:293,0:0.00: 3.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,16:0.36:-2.31:1.000:0.702 0/0/0/1:4:166,39:0.24: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,45:0.36: 0.11:1.000:0.700 0/0/1/1:4:99,54:0.41: 0.22:1.000:0.874 0/0/1/1:4:22,31:0.61:-2.31:1.000:0.648 0/0/1/1:4:103,66:0.45: 0.62:1.000:0.980 0/0/0/1:4:146,33:0.23: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,101:0.68: 0.17:1.000:0.951 0/0/0/1:4:112,37:0.30: 0.11:1.000:0.982 0/1/1/1:4:65,113:0.65: 0.85:1.000:0.815 0/0/1/1:4:91,52:0.42:-0.04:1.000:0.924 0/0/1/1:4:102,48:0.38: 0.14:1.000:0.538 0/0/1/1:4:33,19:0.42:-2.34:1.000:0.930 0/0/1/1:4:24,27:0.57:-2.37:1.000:0.945 0/0/1:3:33,5:0.17:-2.69:0.999:0.951 0/0/1/1:4:91,72:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:160,48:0.29: 1.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,58:0.42: 0.37:1.000:0.928 0/0/0/1:4:102,43:0.35: 0.01:1.000:0.761 0/0/1/1:4:132,84:0.45: 1.81:1.000:0.979 0/0/1/1:4:88,48:0.41:-0.21:1.000:0.874 0/0/1/1:4:86,46:0.41:-0.32:1.000:0.845 0/0/0/1:4:96,41:0.36:-0.19:1.000:0.732 0/1/1/1:4:42,75:0.66:-0.70:1.000:0.851 0/1/1/1:4:43,128:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,65:0.44: 0.65:1.000:0.970 0/0/1/1:4:105,53:0.39: 0.34:1.000:0.730 0/0/1/1:4:90,58:0.45: 0.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:77,50:0.45:-0.44:1.000:0.983 0/0/0/1:4:88,27:0.29:-0.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:112,22:0.21:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,65:0.44: 0.70:1.000:0.963 0/0/1/1:4:86,46:0.41:-0.32:1.000:0.845 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,91:0.54: 1.10:1.000:0.990 0/1/1/1:4:46,77:0.65:-0.54:1.000:0.751 0/1/1/1:4:39,68:0.65:-0.95:1.000:0.819 0/0/0/1:4:114,43:0.33: 0.32:1.000:0.921 0/0/1/1:4:97,60:0.44: 0.32:1.000:0.970 0/0/0/0/0/1:6:142,30:0.22: 0.70:1.000:0.801 0/0/0/1:4:146,38:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,42:0.38:-0.32:1.000:0.513 0/0/0/1:4:183,26:0.16: 1.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,76:0.72:-1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,81:0.63:-0.29:1.000:0.596 0/0/0/0:4:183,15:0.10: 1.35:1.000:0.871 0/0/1/1:4:45,44:0.54:-1.40:1.000:0.985 0/0/0/1:4:147,16:0.12: 0.47:1.000:0.850 0/0/1/1:4:92,68:0.49: 0.39:0.998:0.996 0/0/0/1:4:132,22:0.18: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,68:0.46: 0.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:25,22:0.52:-2.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:148,36:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,70:0.47: 0.72:1.000:0.990 0/0/0/1:4:85,28:0.30:-0.80:1.000:0.982 0/0/1/1:4:92,54:0.43: 0.04:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,15:0.14:-0.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:93,51:0.41:-0.01:1.000:0.881 0/0/1/1:4:115,72:0.44: 1.08:1.000:0.974 0/0/1/1:4:67,45:0.46:-0.82:1.000:0.989 0/0/0/1:4:126,31:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,51:0.37: 0.49:1.000:0.586 0/0/0/1:4:95,40:0.35:-0.24:1.000:0.763 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,42:0.41:-0.62:1.000:0.855 0/0/1/1:4:48,33:0.47:-1.61:1.000:0.991 0/0/0/1:4:58,22:0.33:-1.63:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,57:0.46:-0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:130,14:0.12:-0.01:0.999:0.831 0/1/1/1:4:35,93:0.72:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,81:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,45:0.52:-1.20:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,38:0.26: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,49:0.43:-0.32:1.000:0.948 0/0/1/1:4:82,46:0.42:-0.42:1.000:0.907 0/0/1/1:4:77,51:0.46:-0.42:1.000:0.987 0/0/1/1:4:102,73:0.48: 0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,22:0.41:-2.09:1.000:0.884 0/0/0/1:4:83,35:0.35:-0.67:1.000:0.760 0/0/0/1:4:102,15:0.16:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,58:0.47:-0.04:0.999:0.991 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,41:0.39:-0.52:1.000:0.675 0/0/1/1:4:70,63:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:44,60:0.61:-1.02:1.000:0.718 0/0/0/0:4:178,15:0.10: 1.23:1.000:0.825 0/0/1/1:4:48,70:0.62:-0.67:1.000:0.566 0/0/0/1:4:112,11:0.11:-0.54:1.000:0.601 0/0/1/1:4:120,71:0.43: 1.18:1.000:0.949 0/0/1/1:4:48,68:0.61:-0.72:0.999:0.635 0/0/0/0:4:160,15:0.11: 0.77:1.000:0.547 0/1/1/1:4:25,42:0.65:-1.96:1.000:0.758 0/0/0/1:4:90,40:0.36:-0.37:1.000:0.630 0/0/0/1:4:91,31:0.31:-0.57:1.000:0.974 0/0/0/1:4:106,14:0.15:-0.62:1.000:0.986 0/0/0/0:4:146,13:0.10: 0.37:1.000:0.700 0/0/0/1:4:103,18:0.19:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,53:0.40: 0.22:1.000:0.830 0/0/1/1:4:74,46:0.44:-0.62:1.000:0.972 0/0/0/1:4:136,33:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,103:0.67: 0.29:1.000:0.930 0/0/0/1:4:107,22:0.22:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,42:0.37:-0.29:1.000:0.520 0/1/1/1:4:50,92:0.66:-0.06:1.000:0.885 0/0/0/1:4:121,14:0.13:-0.24:1.000:0.925 0/0/0/1:4:88,12:0.15:-1.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,44:0.40:-0.44:1.000:0.830 0/0/1/1:4:73,57:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,101:0.63: 0.57:1.000:0.553 0/0/1/1:4:60,36:0.43:-1.23:0.996:0.957 0/0/1/1:4:80,47:0.43:-0.44:1.000:0.945 0/0/0/1:4:142,30:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,10:0.08: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,55:0.42: 0.17:1.000:0.926 0/0/1/1:4:55,62:0.57:-0.70:1.000:0.944 0/1/1/1:4:43,73:0.65:-0.72:1.000:0.776 0/0/1/1:4:69,49:0.48:-0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:119,31:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,62:0.61:-0.95:1.000:0.697 0/0/0/1:4:123,43:0.31: 0.54:1.000:0.966 0/0/1/1:4:79,38:0.38:-0.70:1.000:0.602 0/0/1/1:4:130,61:0.38: 1.18:1.000:0.529 0/0/0/1:4:180,26:0.16: 1.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,87:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:130,12:0.11:-0.06:1.000:0.596 0/0/0/1:4:163,35:0.22: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,31:0.20: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,68:0.39: 1.56:1.000:0.669 0/0/0/1:4:123,49:0.34: 0.70:1.000:0.861 0/0/1/1:4:35,27:0.50:-2.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,24:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,95:0.63: 0.29:1.000:0.595 0/0/1/1:4:97,79:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,132:0.69: 1.20:1.000:0.978 0/0/0/1:4:178,31:0.19: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,43:0.37:-0.16:0.998:0.578 0/0/1/1:4:96,52:0.41: 0.09:1.000:0.864 0/0/1/1:4:92,49:0.41:-0.09:1.000:0.838 0/0/0/1:4:109,31:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:154,28:0.20: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,15:0.12: 0.52:1.000:0.655 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,61:0.38: 1.08:1.000:0.620 0/0/0/1:4:144,32:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,62:0.65:-1.15:1.000:0.753 0/0/0/1:4:152,23:0.17: 0.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,30:0.20: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,13:0.11: 0.32:1.000:0.662 0/0/0/1:4:114,15:0.15:-0.39:1.000:0.985 0/0/0/1:4:126,29:0.24: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,11:0.10:-0.01:1.000:0.857 0/0/1/1:4:96,54:0.42: 0.14:1.000:0.910 0/1/1/1:4:72,133:0.66: 1.53:1.000:0.889 0/0/0/1:4:183,42:0.24: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,36:0.34:-0.39:1.000:0.896 0/0/1/1:4:70,93:0.60: 0.47:1.000:0.767 0/0/1/1:4:97,56:0.43: 0.22:1.000:0.933 0/0/0/0:4:180,14:0.09: 1.25:1.000:0.929 0/1/1/1:4:59,113:0.67: 0.70:1.000:0.920 0/0/0/1:4:84,27:0.30:-0.85:1.000:0.987 0/0/1/1:4:92,50:0.41:-0.06:1.000:0.869 -chr4.1 41427141 chr4.1_041427141 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,338:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,230:0.80:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,163:0.54: 0.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:175,160:0.49: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:299,128:0.31: 1.63:1.000:0.974 0/0/1/1:4:147,154:0.53:-0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,67:0.50:-2.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,220:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,156:0.54:-0.13:1.000:0.985 0/1/1/1:4:51,97:0.67:-2.12:1.000:0.924 0/0/1/1:4:109,98:0.49:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,55:0.24:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,226:0.79:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,254:0.73: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:164,140:0.48:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:169,180:0.53: 0.58:1.000:0.991 0/1/1/1:4:85,293:0.79: 0.97:0.999:1.000 0/0/1/1:4:192,159:0.47: 0.61:1.000:0.992 0/1/1/1:4:116,307:0.74: 1.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,234:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,45:0.40:-2.56:1.000:0.828 0/0/1/1:4:149,153:0.52:-0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:174,168:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,133:0.52:-0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,44:0.33:-2.25:1.000:0.923 0/1/1/1:4:111,312:0.75: 1.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,161:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:239,70:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,170:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/0:4:291,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,78:0.28:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:223,69:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,13:0.13:-2.73:1.000:0.922 0/0/1/1:4:105,79:0.44:-1.63:1.000:0.973 1/1/1:3:0,56:1.00:-3.35:0.999:1.000 0/0/0/1:4:278,73:0.21: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,167:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:287,89:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,212:0.51: 1.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:106,294:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:229,84:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,83:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:329,105:0.25: 1.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,148:0.49: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,138:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,175:0.48: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:274,96:0.27: 0.86:1.000:0.998 0/1/1/1:4:140,440:0.77: 3.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,221:0.79:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,352:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,134:0.47:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:205,215:0.53: 1.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,117:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:98,220:0.71: 0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:65,215:0.78:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,160:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:195,58:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,186:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,149:0.47: 0.32:1.000:0.991 0/0/0/1/1/1:6:129,134:0.53:-0.57:1.000:0.851 0/0/1/1:4:147,142:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,134:0.49:-0.33:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,361:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,83:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,168:0.53: 0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:187,282:0.62: 2.19:1.000:0.607 0/0/1/1:4:117,91:0.45:-1.31:1.000:0.982 0/1/1/1:4:68,228:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,120:0.53:-0.95:0.998:0.993 0/1/1/1:4:88,223:0.73: 0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:292,80:0.22: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,119:0.49:-0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:101,279:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,157:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,163:0.57:-0.16:1.000:0.945 0/1/1/1:4:50,176:0.79:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,75:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,228:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,246:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,304:0.79: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,112:0.50:-0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:102,284:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,206:0.76:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,71:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,85:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:107,296:0.75: 1.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,149:0.73:-1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:146,125:0.48:-0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:217,76:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:74,203:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,97:0.50:-1.42:0.999:0.997 0/0/1/1:4:163,177:0.54: 0.46:1.000:0.989 0/0/1/1:4:206,213:0.53: 1.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:134,126:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:278,95:0.26: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:182,164:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,202:0.77:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,140:0.53:-0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:137,148:0.54:-0.28:1.000:0.990 0/1/1/1:4:97,244:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,113:0.70:-1.89:1.000:0.985 0/0/1/1:4:161,145:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,156:0.73:-1.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,210:0.76:-0.31:0.999:1.000 0/1/1/1:4:63,184:0.76:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,245:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,141:0.53:-0.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:168,135:0.46:-0.04:1.000:0.988 0/1/1/1:4:102,318:0.77: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,165:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,114:0.47:-0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:238,244:0.52: 2.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:178,118:0.41:-0.13:0.999:0.877 0/0/1/1:4:176,144:0.47: 0.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,76:0.49:-1.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,163:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,113:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:146,132:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,151:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,206:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,162:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,159:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:184,159:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,145:0.52:-0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:84,212:0.73:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:201,170:0.47: 0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:201,57:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,59:0.30:-1.41:1.000:0.982 0/0/1/1:4:155,98:0.40:-0.71:1.000:0.796 0/0/0/1:4:210,67:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,126:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,162:0.53: 0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,135:0.72:-1.53:0.996:0.995 0/0/1/1:4:160,160:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,165:0.57:-0.13:1.000:0.936 0/1/1/1:4:115,292:0.73: 1.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:251,89:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:275,79:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,50:0.23:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,92:0.29: 0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:160,155:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,137:0.48:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,129:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,90:0.46:-1.39:1.000:0.988 0/0/0/1:4:330,110:0.26: 1.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,190:0.54: 0.81:1.000:0.990 0/0/0/1:4:300,104:0.27: 1.32:1.000:0.998 0/1/1/1:4:79,205:0.74:-0.29:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,388:1.00: 1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,281:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:276,97:0.27: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:160,157:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,58:0.53:-2.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,54:0.43:-2.37:1.000:0.954 0/0/0/1:4:288,76:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,143:0.47: 0.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:320,105:0.25: 1.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,358:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,58:0.28:-1.20:0.998:0.996 0/1/1/1:4:83,259:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,133:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,138:0.48:-0.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,320:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,147:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,58:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,160:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,144:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,262:0.79: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,170:0.56: 0.11:1.000:0.971 0/0/1/1:4:108,117:0.54:-1.08:1.000:0.989 0/1/1/1:4:65,157:0.72:-1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,138:0.52:-0.44:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,256:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,85:0.28: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,228:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,55:0.27:-1.27:1.000:0.998 0/0/0/0:4:398,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,187:0.47: 1.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:167,143:0.48: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,162:0.56:-0.10:1.000:0.967 0/0/0/1:4:244,77:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:114,259:0.71: 0.90:1.000:0.991 0/0/0/1:4:298,100:0.26: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,60:0.24:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,153:0.53:-0.10:1.000:0.992 -chr4.1 41595604 chr4.1_041595604 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:301,104:.: 1.02:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:197,169:.: 0.49:1.000:. ./.:4:352,116:.: 1.88:1.000:. ./.:4:319,95:.: 1.14:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:279,92:.: 0.56:1.000:. ./.:4:253,78:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,40:.:-3.07:1.000:. ./.:4:73,55:.:-2.73:1.000:. ./.:4:236,74:.:-0.27:1.000:. ./.:4:185,159:.: 0.19:1.000:. ./.:4:186,152:.: 0.11:1.000:. ./.:4:172,167:.: 0.13:1.000:. ./.:4:286,88:.: 0.60:1.000:. ./.:4:168,188:.: 0.36:0.999:. ./.:4:202,91:.:-0.50:1.000:. ./.:4:229,209:.: 1.47:1.000:. ./.:4:311,125:.: 1.44:1.000:. ./.:4:68,44:.:-2.95:1.000:. ./.:4:246,88:.: 0.06:1.000:. ./.:4:263,99:.: 0.44:1.000:. ./.:4:240,46:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,43:.:-3.38:1.000:. ./.:4:324,90:.: 1.14:1.000:. ./.:4:283,74:.: 0.37:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:198,188:.: 0.76:1.000:. ./.:4:304,78:.: 0.71:1.000:. ./.:4:199,161:.: 0.41:1.000:. ./.:4:217,72:.:-0.55:1.000:. ./.:4:27,0:.:-4.10:1.000:. ./.:4:55,62:.:-2.88:1.000:. ./.:3:13,2:.:-4.27:0.999:. ./.:4:311,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:288,86:.: 0.60:1.000:. ./.:4:170,177:.: 0.23:1.000:. ./.:4:176,173:.: 0.26:1.000:. ./.:4:264,88:.: 0.30:1.000:. ./.:4:270,86:.: 0.36:1.000:. ./.:4:275,86:.: 0.42:1.000:. ./.:4:223,177:.: 0.95:1.000:. ./.:4:277,83:.: 0.41:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:262,95:.: 0.37:1.000:. ./.:4:202,198:.: 0.95:1.000:. ./.:4:91,28:.:-2.86:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:204,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:210,84:.:-0.48:1.000:. ./.:4:307,77:.: 0.74:1.000:. ./.:4:162,146:.:-0.29:1.000:. ./.:4:289,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:289,75:.: 0.47:1.000:. ./.:4:262,67:.:-0.01:1.000:. ./.:4:305,103:.: 1.06:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.01:1.000:. ./.:6:265,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:256,76:.: 0.03:1.000:. ./.:4:309,98:.: 1.05:1.000:. ./.:4:241,79:.:-0.13:1.000:. ./.:4:268,86:.: 0.33:1.000:. ./.:4:277,174:.: 1.64:1.000:. ./.:4:163,146:.:-0.28:1.000:. ./.:4:149,148:.:-0.44:1.000:. ./.:4:269,70:.: 0.13:0.998:. ./.:4:346,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:200,184:.: 0.74:1.000:. ./.:4:227,74:.:-0.39:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:278,94:.: 0.57:1.000:. ./.:4:153,167:.:-0.13:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:258,81:.: 0.13:1.000:. ./.:4:157,162:.:-0.14:1.000:. ./.:4:183,191:.: 0.60:1.000:. ./.:4:244,92:.: 0.09:1.000:. ./.:4:214,73:.:-0.58:1.000:. ./.:4:280,99:.: 0.67:1.000:. ./.:4:198,177:.: 0.61:1.000:. ./.:4:156,157:.:-0.23:1.000:. ./.:4:236,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:184,201:.: 0.75:1.000:. ./.:4:153,128:.:-0.66:1.000:. ./.:4:237,86:.:-0.09:1.000:. ./.:4:237,73:.:-0.27:1.000:. ./.:4:213,73:.:-0.59:1.000:. ./.:4:157,140:.:-0.44:0.999:. ./.:4:312,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:290,97:.: 0.78:1.000:. ./.:4:146,132:.:-0.70:1.000:. ./.:4:248,86:.: 0.06:1.000:. ./.:4:268,82:.: 0.28:1.000:. ./.:4:224,84:.:-0.29:1.000:. ./.:4:206,74:.:-0.67:1.000:. ./.:4:270,102:.: 0.57:1.000:. ./.:4:306,90:.: 0.90:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:275,94:.: 0.53:1.000:. ./.:4:123,161:.:-0.62:1.000:. ./.:4:277,84:.: 0.42:0.999:. ./.:4:219,69:.:-0.56:1.000:. ./.:4:198,143:.: 0.15:1.000:. ./.:4:229,66:.:-0.47:1.000:. ./.:4:174,171:.: 0.21:1.000:. ./.:4:240,231:.: 1.92:1.000:. ./.:4:244,79:.:-0.09:1.000:. ./.:4:184,175:.: 0.40:1.000:. ./.:4:366,98:.: 1.82:1.000:. ./.:4:264,111:.: 0.61:0.999:. ./.:4:150,163:.:-0.23:1.000:. ./.:4:207,46:.:-1.04:1.000:. ./.:4:173,196:.: 0.53:1.000:. ./.:4:225,61:.:-0.59:1.000:. ./.:4:138,163:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,153:.:-0.13:1.000:. ./.:4:248,59:.:-0.31:1.000:. ./.:4:198,131:.:-0.01:1.000:. ./.:4:256,71:.:-0.04:1.000:. ./.:4:275,86:.: 0.42:1.000:. ./.:4:237,77:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,80:.: 0.25:1.000:. ./.:4:189,175:.: 0.47:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:225,52:.:-0.71:1.000:. ./.:4:148,118:.:-0.86:1.000:. ./.:4:120,139:.:-0.96:1.000:. ./.:4:209,52:.:-0.93:1.000:. ./.:4:158,156:.:-0.21:1.000:. ./.:4:179,64:.:-1.17:0.996:. ./.:4:295,63:.: 0.38:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:244,217:.: 1.78:1.000:. ./.:4:152,164:.:-0.19:1.000:. ./.:4:228,70:.:-0.43:1.000:. ./.:4:193,65:.:-0.97:1.000:. ./.:4:167,157:.:-0.08:1.000:. ./.:4:283,72:.: 0.34:1.000:. ./.:4:162,165:.:-0.04:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:195,75:.:-0.81:1.000:. ./.:4:318,106:.: 1.28:1.000:. ./.:4:328,113:.: 1.51:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:182,176:.: 0.38:1.000:. ./.:4:317,110:.: 1.32:1.000:. ./.:4:213,78:.:-0.52:1.000:. ./.:4:214,232:.: 1.58:1.000:. ./.:4:235,86:.:-0.12:1.000:. ./.:4:45,27:.:-3.49:1.000:. ./.:4:185,70:.:-1.01:1.000:. ./.:4:238,60:.:-0.43:1.000:. ./.:4:271,89:.: 0.41:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:315,107:.: 1.25:1.000:. ./.:4:160,152:.:-0.24:0.998:. ./.:4:281,73:.: 0.33:1.000:. ./.:4:261,88:.: 0.26:1.000:. ./.:4:218,53:.:-0.80:1.000:. ./.:4:234,75:.:-0.28:1.000:. ./.:4:171,187:.: 0.38:1.000:. ./.:4:233,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:309,78:.: 0.78:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:277,85:.: 0.44:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:149,130:.:-0.69:1.000:. ./.:4:147,137:.:-0.62:1.000:. ./.:4:270,88:.: 0.38:1.000:. ./.:4:251,80:.: 0.02:1.000:. ./.:4:153,169:.:-0.10:1.000:. ./.:4:229,51:.:-0.67:1.000:. ./.:4:333,95:.: 1.33:1.000:. ./.:4:320,84:.: 1.01:1.000:. ./.:4:265,67:.: 0.03:1.000:. ./.:4:321,16:.: 0.10:1.000:. ./.:4:208,192:.: 0.95:1.000:. ./.:4:190,192:.: 0.71:1.000:. ./.:4:418,3:.: 1.24:1.000:. ./.:4:201,56:.:-0.99:1.000:. ./.:4:301,81:.: 0.71:1.000:. -chr4.1 41768022 chr4.1_041768022 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:176,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:161,79:.: 0.81:1.000:. ./.:4:126,55:.:-0.13:1.000:. ./.:4:73,46:.:-1.12:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:80,47:.:-0.99:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.01:0.999:. ./.:4:85,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:55,17:.:-1.87:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:165,69:.: 0.71:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:74,46:.:-1.10:1.000:. ./.:4:59,43:.:-1.39:1.000:. ./.:4:187,77:.: 1.19:1.000:. ./.:4:82,48:.:-0.94:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,45:.:-1.25:1.000:. ./.:4:24,14:.:-2.41:1.000:. ./.:4:69,26:.:-1.50:1.000:. ./.:3:43,0:.:-2.33:0.999:. ./.:4:125,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:194,89:.: 1.49:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:118,68:.:-0.05:1.000:. ./.:4:144,86:.: 0.65:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:216,101:.: 2.03:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:94,70:.:-0.40:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:185,81:.: 1.22:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:174,87:.: 1.14:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:139,75:.: 0.39:1.000:. ./.:4:135,69:.: 0.23:1.000:. ./.:4:232,95:.: 2.19:1.000:. ./.:4:107,71:.:-0.18:1.000:. ./.:6:228,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:148,68:.: 0.42:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:189,98:.: 1.55:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:155,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:133,86:.: 0.47:0.998:. ./.:4:93,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:109,78:.:-0.04:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:171,77:.: 0.93:1.000:. ./.:4:101,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:190,91:.: 1.46:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:78,48:.:-1.01:1.000:. ./.:4:136,89:.: 0.57:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:171,76:.: 0.92:1.000:. ./.:4:110,66:.:-0.21:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:181,74:.: 1.05:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:129,82:.: 0.34:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:138,56:.: 0.07:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:144,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:214,89:.: 1.81:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:236,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:84,65:.:-0.64:1.000:. ./.:4:65,46:.:-1.25:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:102,75:.:-0.20:0.999:. ./.:4:206,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:122,54:.:-0.21:1.000:. ./.:4:239,82:.: 2.10:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:108,71:.:-0.16:1.000:. ./.:4:165,88:.: 1.01:1.000:. ./.:4:69,45:.:-1.20:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:181,86:.: 1.24:1.000:. ./.:4:100,86:.:-0.05:1.000:. ./.:4:145,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,69:.:-0.56:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.39:0.996:. ./.:4:113,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:271,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:165,80:.: 0.89:1.000:. ./.:4:189,61:.: 0.97:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:179,87:.: 1.22:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:185,84:.: 1.27:1.000:. ./.:4:96,51:.:-0.67:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:109,49:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,15:.:-2.25:1.000:. ./.:4:93,32:.:-1.02:1.000:. ./.:4:212,79:.: 1.62:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:65,54:.:-1.12:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:56,49:.:-1.34:0.998:. ./.:4:140,60:.: 0.17:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:133,45:.:-0.18:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:97,68:.:-0.39:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:106,47:.:-0.58:1.000:. ./.:4:96,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:94,61:.:-0.55:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,39:.:-1.37:1.000:. ./.:4:110,54:.:-0.40:1.000:. ./.:4:141,71:.: 0.36:1.000:. ./.:4:160,52:.: 0.36:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:74,54:.:-0.98:1.000:. ./.:4:69,67:.:-0.85:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.47:1.000:. -chr4.1 41879085 chr4.1_041879085 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:146,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:124,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.70:0.999:. ./.:4:164,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.29:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.21:1.000:. ./.:3:12,0:.:-3.29:0.999:. ./.:4:118,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.35:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.16:1.000:. ./.:6:160,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.06:0.998:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:145,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:213,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:133,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:144,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.51:0.999:. ./.:4:124,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:179,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:174,1:.: 1.13:0.999:. ./.:4:168,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:173,2:.: 1.13:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:90,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.63:0.996:. ./.:4:100,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:114,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.07:0.998:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:121,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.64:1.000:. -chr4.1 42080638 chr4.1_042080638 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,39:.:-0.02:1.000:. ./.:4:116,29:.: 0.53:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:44,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:73,41:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:183,54:.: 2.22:1.000:. ./.:4:179,42:.: 1.93:0.999:. ./.:4:159,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:47,11:.:-1.06:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.83:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,38:.: 0.94:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:278,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.26:1.000:. ./.:3:25,8:.:-1.52:0.999:. ./.:4:79,35:.:-0.04:1.000:. ./.:4:180,51:.: 2.11:1.000:. ./.:4:101,37:.: 0.41:1.000:. ./.:4:194,33:.: 2.04:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:97,26:.: 0.13:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:84,40:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:87,42:.: 0.24:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:32,19:.:-1.19:1.000:. ./.:4:56,24:.:-0.66:1.000:. ./.:4:112,43:.: 0.72:1.000:. ./.:4:98,28:.: 0.18:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,30:.: 0.18:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:124,1:.: 0.17:1.000:. ./.:6:27,7:.:-1.50:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:88,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:113,32:.: 0.53:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:69,34:.:-0.24:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.17:0.998:. ./.:4:120,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:88,37:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,19:.:-0.73:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:75,37:.:-0.07:1.000:. ./.:4:137,28:.: 0.90:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:115,26:.: 0.46:1.000:. ./.:4:145,33:.: 1.14:1.000:. ./.:4:97,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:148,25:.: 1.05:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:32,38:.:-0.84:1.000:. ./.:4:32,29:.:-1.01:0.999:. ./.:4:158,33:.: 1.38:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.24:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:62,28:.:-0.48:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:210,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,27:.:-1.10:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:161,36:.: 1.49:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:153,58:.: 1.74:1.000:. ./.:4:78,36:.:-0.04:0.999:. ./.:4:103,42:.: 0.53:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:102,39:.: 0.46:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.15:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:90,35:.: 0.17:1.000:. ./.:4:104,26:.: 0.26:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:40,31:.:-0.82:1.000:. ./.:4:177,46:.: 1.96:1.000:. ./.:4:100,23:.: 0.13:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:99,30:.: 0.24:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:98,30:.: 0.22:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:204,56:.: 2.64:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.70:0.996:. ./.:4:61,27:.:-0.51:1.000:. ./.:4:98,35:.: 0.31:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,20:.:-0.09:1.000:. ./.:4:117,29:.: 0.55:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:199,28:.: 2.04:1.000:. ./.:4:129,39:.: 0.96:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:181,39:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.30:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:162,40:.: 1.58:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.04:0.998:. ./.:4:37,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:158,32:.: 1.36:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:154,32:.: 1.29:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:152,34:.: 1.29:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,40:.:-0.60:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.52:1.000:. ./.:4:100,42:.: 0.48:1.000:. ./.:4:149,35:.: 1.25:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:113,43:.: 0.74:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:133,39:.: 1.03:1.000:. ./.:4:140,57:.: 1.49:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.27:1.000:. -chr4.1 42270584 chr4.1_042270584 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:86,34:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,45:.: 0.57:1.000:. ./.:4:70,43:.: 0.12:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:61,29:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:35,10:.:-1.68:1.000:. ./.:4:30,32:.:-1.23:1.000:. ./.:4:84,44:.: 0.52:1.000:. ./.:4:92,35:.: 0.49:1.000:. ./.:4:81,36:.: 0.22:1.000:. ./.:4:73,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.15:0.999:. ./.:4:48,36:.:-0.65:1.000:. ./.:4:115,57:.: 1.68:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:74,28:.:-0.17:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:12,2:.:-2.50:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:78,48:.: 0.46:1.000:. ./.:4:44,42:.:-0.60:1.000:. ./.:4:54,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:35,18:.:-1.47:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:33,21:.:-1.44:1.000:. ./.:3:24,0:.:-2.24:0.999:. ./.:4:76,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:63,41:.:-0.12:1.000:. ./.:4:70,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:71,42:.: 0.12:1.000:. ./.:4:77,46:.: 0.38:1.000:. ./.:4:123,49:.: 1.68:1.000:. ./.:4:76,26:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:66,53:.: 0.28:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:129,47:.: 1.79:1.000:. ./.:4:92,46:.: 0.78:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,34:.:-0.44:1.000:. ./.:4:68,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.57:1.000:. ./.:6:99,19:.: 0.25:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:57,21:.:-0.81:1.000:. ./.:4:162,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:63,37:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,41:.: 0.30:1.000:. ./.:4:124,38:.: 1.41:1.000:. ./.:4:67,32:.:-0.25:1.000:. ./.:4:116,37:.: 1.18:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.46:0.998:. ./.:4:71,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:102,37:.: 0.81:1.000:. ./.:4:56,26:.:-0.70:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:50,82:.: 0.62:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:72,35:.:-0.04:1.000:. ./.:4:127,42:.: 1.60:1.000:. ./.:4:153,42:.: 2.29:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:54,27:.:-0.73:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:155,59:.: 2.79:1.000:. ./.:4:75,37:.: 0.09:1.000:. ./.:4:55,27:.:-0.70:1.000:. ./.:4:139,47:.: 2.05:1.000:. ./.:4:117,31:.: 1.04:1.000:. ./.:4:70,58:.: 0.52:1.000:. ./.:4:82,48:.: 0.57:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:66,22:.:-0.54:0.999:. ./.:4:109,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:52,26:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,38:.: 0.44:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:62,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:122,60:.: 1.94:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:106,52:.: 1.31:1.000:. ./.:4:107,39:.: 0.99:1.000:. ./.:4:186,0:.: 2.05:0.999:. ./.:4:112,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:106,44:.: 1.10:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,37:.:-0.52:1.000:. ./.:4:139,49:.: 2.10:1.000:. ./.:4:89,42:.: 0.59:1.000:. ./.:4:146,45:.: 2.18:1.000:. ./.:4:100,36:.: 0.73:1.000:. ./.:4:129,49:.: 1.84:0.999:. ./.:4:110,34:.: 0.94:1.000:. ./.:4:36,21:.:-1.36:1.000:. ./.:4:101,56:.: 1.28:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:115,38:.: 1.18:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,50:.: 1.36:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:62,37:.:-0.25:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:86,59:.: 0.97:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:50,26:.:-0.86:1.000:. ./.:4:74,27:.:-0.20:1.000:. ./.:4:72,46:.: 0.25:1.000:. ./.:4:96,48:.: 0.94:1.000:. ./.:4:66,34:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.54:0.996:. ./.:4:54,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:97,36:.: 0.65:1.000:. ./.:4:58,30:.:-0.54:1.000:. ./.:4:67,44:.: 0.07:1.000:. ./.:4:69,32:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,40:.: 1.41:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:112,65:.: 1.81:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:95,38:.: 0.65:1.000:. ./.:4:126,44:.: 1.63:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:99,39:.: 0.78:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:92,63:.: 1.23:1.000:. ./.:4:68,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:45,30:.:-0.89:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:67,37:.:-0.12:0.998:. ./.:4:90,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:61,28:.:-0.52:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:101,46:.: 1.02:1.000:. ./.:4:29,15:.:-1.71:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:59,44:.:-0.15:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,27:.: 0.15:1.000:. ./.:4:72,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:44,23:.:-1.10:1.000:. ./.:4:80,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:43,26:.:-1.05:1.000:. ./.:4:58,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:75,51:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,7:.:-0.52:1.000:. ./.:4:85,43:.: 0.52:1.000:. ./.:4:97,39:.: 0.73:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:64,35:.:-0.25:1.000:. ./.:4:64,38:.:-0.17:1.000:. -chr4.1 42574608 chr4.1_042574608 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:246,260:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:183,186:0.49:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,182:0.45:-0.24:1.000:0.980 0/0/0/1:4:306,111:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:430,129:0.22: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:265,261:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,151:0.46:-0.96:1.000:0.988 0/0/0/1:4:335,116:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:294,113:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:62,21:0.25:-3.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,71:0.48:-2.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:90,296:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,214:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:311,111:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:452,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,233:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:339,106:0.23: 0.23:0.999:1.000 0/0/0/1:4:383,137:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:447,141:0.23: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,369:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,27:0.22:-2.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,217:0.54:-0.27:1.000:0.987 0/0/1/1:4:226,256:0.52: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:208,194:0.47:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-3.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:370,120:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,191:0.46:-0.11:1.000:0.986 0/0/0/1:4:333,125:0.27: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:363,144:0.28: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:317,97:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,103:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,171:0.45:-0.50:1.000:0.984 0/0/0/1:4:39,22:0.35:-3.49:1.000:0.768 0/0/0/0:4:95,1:0.01:-3.15:1.000:1.000 0/0/1:3:35,7:0.16:-3.68:0.999:0.910 0/0/1/1:4:207,215:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:230,218:0.48: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:298,124:0.29: 0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:280,101:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:325,109:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,220:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:237,254:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:370,142:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:303,101:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:341,124:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:332,140:0.29: 0.50:1.000:0.992 0/0/0/1:4:415,102:0.19: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:591,188:0.23: 3.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,223:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:252,272:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,209:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:287,298:0.50: 1.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:311,130:0.29: 0.20:1.000:0.993 0/1/1/1:4:131,372:0.72: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:239,234:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:373,103:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:302,118:0.27:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:265,251:0.48: 0.92:1.000:0.994 0/0/1/1:4:202,229:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:103,229:0.67:-0.86:1.000:0.921 0/1/1/1:4:96,400:0.79: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,204:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,238:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,90:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:296,131:0.30: 0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:242,376:0.59: 1.91:1.000:0.832 0/0/0/0:4:299,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,219:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:319,112:0.25: 0.10:0.998:0.999 0/1/1/1:4:95,304:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:362,123:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:362,110:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,396:0.76: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:378,124:0.24: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,251:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:183,204:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/0:4:390,1:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,225:0.53:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:368,121:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:351,98:0.21: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,197:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:225,247:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:352,130:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:308,103:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:399,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:345,123:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,104:0.29:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:149,192:0.55:-0.77:1.000:0.978 0/0/0/0:4:384,1:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:319,118:0.26: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:168,181:0.51:-0.70:0.999:0.996 0/0/0/1:4:301,110:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:392,118:0.22: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,76:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:367,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,225:0.52: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:238,108:0.30:-0.73:1.000:0.981 0/1/1/1:4:81,283:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,272:0.53: 0.78:1.000:0.991 0/0/0/1:4:361,103:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,199:0.53:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:227,260:0.52: 0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,154:0.53:-1.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:298,98:0.24:-0.24:0.999:1.000 0/1/1/1:4:79,262:0.75:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:300,103:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:307,89:0.22:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:371,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:351,349:0.49: 2.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:333,115:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:200,225:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:293,280:0.48: 1.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:342,93:0.21: 0.14:0.999:1.000 0/0/1/1:4:207,222:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:276,84:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:351,142:0.28: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,212:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,177:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:176,195:0.52:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,206:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:343,137:0.28: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:276,119:0.29:-0.25:1.000:0.990 0/0/1/1:4:190,208:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:316,110:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:231,251:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:360,116:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:345,107:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,258:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,154:0.51:-1.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:242,86:0.26:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,198:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/0/0:4:380,2:0.01:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,77:0.28:-1.44:0.996:0.997 0/0/0/1:4:316,106:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,352:0.73: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:268,307:0.52: 1.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:282,114:0.28:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:292,94:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,76:0.23:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,103:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,232:0.47: 0.59:1.000:0.993 0/0/0/0:4:426,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,308:0.72:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,187:0.59:-1.08:1.000:0.853 0/0/1/1:4:291,269:0.47: 1.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:311,307:0.49: 1.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:208,229:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:257,237:0.47: 0.71:1.000:0.992 0/0/1/1:4:314,296:0.48: 1.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:178,201:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:391,131:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,206:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,32:0.35:-3.22:1.000:0.778 0/0/1/1:4:162,187:0.53:-0.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:346,124:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:397,152:0.27: 1.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:404,169:0.29: 1.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:253,231:0.47: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:275,100:0.26:-0.44:0.998:0.999 0/0/0/1:4:376,116:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,201:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:224,208:0.47: 0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:178,158:0.46:-0.82:1.000:0.988 0/0/1/1:4:199,223:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:431,1:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:347,129:0.26: 0.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:81,261:0.74:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:318,110:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,350:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,292:0.76:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,203:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:163,162:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,202:0.48:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/0:4:369,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,164:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,151:0.44:-0.79:1.000:0.961 0/0/0/1:4:354,134:0.27: 0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:235,220:0.47: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:237,233:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:228,181:0.43:-0.11:1.000:0.955 0/0/0/1:4:333,118:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:243,265:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:414,146:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,188:0.48:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:200,210:0.50:-0.10:1.000:0.997 -chr4.1 42828677 chr4.1_042828677 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:462,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:226,109:.:-0.86:1.000:. ./.:4:365,129:.: 0.41:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:337,96:.:-0.08:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:609,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:126,242:.:-0.60:1.000:. ./.:4:400,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:328,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:749,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:351,176:.: 0.67:1.000:. ./.:4:54,27:.:-2.88:1.000:. ./.:4:271,127:.:-0.36:1.000:. ./.:4:465,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:299,126:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:299,140:.:-0.03:1.000:. ./.:4:371,131:.: 0.47:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:501,175:.: 1.85:1.000:. ./.:4:480,173:.: 1.67:1.000:. ./.:4:359,109:.: 0.20:1.000:. ./.:4:48,23:.:-2.96:1.000:. ./.:4:118,0:.:-2.58:1.000:. ./.:3:20,2:.:-3.35:0.999:. ./.:4:307,131:.:-0.04:1.000:. ./.:4:294,140:.:-0.07:1.000:. ./.:4:383,134:.: 0.59:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:422,145:.: 0.99:1.000:. ./.:4:393,109:.: 0.47:1.000:. ./.:4:474,141:.: 1.37:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:451,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:426,146:.: 1.03:1.000:. ./.:4:510,181:.: 1.97:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:232,133:.:-0.62:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:318,130:.: 0.04:1.000:. ./.:4:394,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:649,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:285,148:.:-0.08:1.000:. ./.:4:362,125:.: 0.35:1.000:. ./.:6:239,89:.:-0.91:1.000:. ./.:4:297,154:.: 0.06:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:616,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:415,134:.: 0.84:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:423,141:.: 0.96:0.998:. ./.:4:117,120:.:-1.64:1.000:. ./.:4:418,153:.: 1.02:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:149,152:.:-1.13:1.000:. ./.:4:412,126:.: 0.76:1.000:. ./.:4:278,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:575,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:393,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:223,121:.:-0.79:1.000:. ./.:4:396,140:.: 0.74:1.000:. ./.:4:578,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:331,129:.: 0.14:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:336,91:.:-0.13:0.999:. ./.:4:342,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:429,153:.: 1.11:1.000:. ./.:4:311,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:547,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:296,139:.:-0.06:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:106,136:.:-1.60:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:287,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:197,91:.:-1.23:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:348,120:.: 0.20:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:534,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:356,104:.: 0.14:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:425,160:.: 1.13:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:378,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:246,120:.:-0.61:1.000:. ./.:4:393,115:.: 0.52:1.000:. ./.:4:402,115:.: 0.59:1.000:. ./.:4:346,115:.: 0.14:1.000:. ./.:4:370,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:368,147:.: 0.57:1.000:. ./.:4:295,131:.:-0.13:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:376,129:.: 0.49:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:408,113:.: 0.62:1.000:. ./.:4:120,235:.:-0.70:1.000:. ./.:4:315,100:.:-0.22:1.000:. ./.:4:247,100:.:-0.76:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.61:0.996:. ./.:4:395,151:.: 0.82:1.000:. ./.:4:263,131:.:-0.39:1.000:. ./.:4:566,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:391,151:.: 0.79:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:303,120:.:-0.16:1.000:. ./.:4:276,136:.:-0.25:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:252,114:.:-0.61:1.000:. ./.:4:273,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:509,152:.: 1.73:1.000:. ./.:4:378,200:.: 1.07:1.000:. ./.:4:238,134:.:-0.56:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:497,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:534,169:.: 2.07:1.000:. ./.:4:395,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,19:.:-2.85:1.000:. ./.:4:236,124:.:-0.66:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:433,142:.: 1.05:1.000:. ./.:4:453,149:.: 1.26:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:352,135:.: 0.35:0.998:. ./.:4:451,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:424,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:215,119:.:-0.87:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:417,121:.: 0.76:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:403,117:.: 0.61:1.000:. ./.:4:268,134:.:-0.33:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:223,102:.:-0.94:1.000:. ./.:4:287,126:.:-0.24:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:357,98:.: 0.10:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:349,109:.: 0.12:1.000:. ./.:4:516,156:.: 1.82:1.000:. ./.:4:312,151:.: 0.16:1.000:. ./.:4:471,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:356,95:.: 0.06:1.000:. ./.:4:441,158:.: 1.24:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:484,180:.: 1.76:1.000:. ./.:4:350,97:.: 0.03:1.000:. ./.:4:276,141:.:-0.21:1.000:. -chr4.1 42890943 chr4.1_042890943 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:46,19:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:53,14:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,38:.: 0.43:1.000:. ./.:4:18,6:.:-1.51:1.000:. ./.:4:90,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:25,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,8:.:-1.71:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:53,28:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,20:.:-0.36:1.000:. ./.:4:40,42:.: 0.78:1.000:. ./.:4:48,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,46:.: 0.63:0.999:. ./.:4:37,55:.: 1.18:1.000:. ./.:4:52,27:.: 0.66:1.000:. ./.:4:75,23:.: 1.42:1.000:. ./.:4:28,2:.:-1.27:1.000:. ./.:4:30,22:.:-0.40:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:35,30:.: 0.11:1.000:. ./.:4:3,11:.:-1.90:1.000:. ./.:4:37,46:.: 0.82:1.000:. ./.:4:31,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:32,8:.:-0.88:1.000:. ./.:4:53,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:34,42:.: 0.55:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.02:1.000:. ./.:4:32,6:.:-0.95:1.000:. ./.:3:11,5:.:-1.82:0.999:. ./.:4:62,20:.: 0.78:1.000:. ./.:4:38,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:28,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:36,16:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,59:.: 1.53:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,35:.: 0.39:1.000:. ./.:4:38,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:86,12:.: 1.42:1.000:. ./.:4:38,44:.: 0.78:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.74:1.000:. ./.:4:5,7:.:-1.98:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,21:.: 0.19:1.000:. ./.:4:46,19:.: 0.11:1.000:. ./.:4:67,28:.: 1.30:1.000:. ./.:4:28,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,4:.:-2.22:1.000:. ./.:4:47,19:.: 0.15:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:40,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:71,14:.: 0.90:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.24:1.000:. ./.:6:43,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,18:.: 0.74:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,7:.:-1.71:1.000:. ./.:4:64,23:.: 0.98:1.000:. ./.:4:77,40:.: 2.17:1.000:. ./.:4:67,21:.: 1.02:1.000:. ./.:4:39,43:.: 0.78:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.56:1.000:. ./.:4:56,23:.: 0.66:0.998:. ./.:4:66,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:41,44:.: 0.90:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:44,46:.: 1.10:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:56,22:.: 0.63:1.000:. ./.:4:59,21:.: 0.70:1.000:. ./.:4:39,18:.:-0.20:1.000:. ./.:4:16,8:.:-1.51:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:44,15:.:-0.13:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.02:1.000:. ./.:4:49,18:.: 0.19:1.000:. ./.:4:41,24:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,14:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,21:.: 0.63:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:44,24:.: 0.23:1.000:. ./.:4:45,35:.: 0.70:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.40:0.999:. ./.:4:45,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,7:.:-1.63:1.000:. ./.:4:25,34:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.74:1.000:. ./.:4:33,30:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.43:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:65,23:.: 1.02:1.000:. ./.:4:56,23:.: 0.66:1.000:. ./.:4:68,22:.: 1.10:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:46,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,37:.: 0.39:0.999:. ./.:4:48,13:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,15:.: 0.98:1.000:. ./.:4:55,18:.: 0.43:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.11:1.000:. ./.:4:83,37:.: 2.28:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.98:1.000:. ./.:4:51,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:64,20:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:51,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:48,19:.: 0.19:1.000:. ./.:4:43,47:.: 1.10:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.20:1.000:. ./.:4:58,19:.: 0.59:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,16:.: 0.35:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.82:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:45,8:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,24:.: 1.14:1.000:. ./.:4:52,18:.: 0.31:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:41,21:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:31,40:.: 0.35:1.000:. ./.:4:29,27:.:-0.24:0.996:. ./.:4:11,6:.:-1.78:1.000:. ./.:4:48,17:.: 0.11:1.000:. ./.:4:68,38:.: 1.73:1.000:. ./.:4:32,50:.: 0.78:1.000:. ./.:4:53,23:.: 0.55:1.000:. ./.:4:36,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:36,45:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,17:.: 0.74:1.000:. ./.:4:39,33:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,19:.: 0.55:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:73,30:.: 1.61:1.000:. ./.:4:63,17:.: 0.70:1.000:. ./.:4:41,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:77,23:.: 1.49:1.000:. ./.:4:76,22:.: 1.42:1.000:. ./.:4:7,6:.:-1.94:1.000:. ./.:4:33,38:.: 0.35:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,20:.: 0.86:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.98:1.000:. ./.:4:35,38:.: 0.43:1.000:. ./.:4:57,19:.: 0.55:1.000:. ./.:4:22,5:.:-1.39:1.000:. ./.:4:36,18:.:-0.32:0.998:. ./.:4:62,15:.: 0.59:1.000:. ./.:4:44,25:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,18:.: 0.27:1.000:. ./.:4:55,12:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,17:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,16:.: 0.63:1.000:. ./.:4:30,36:.: 0.15:1.000:. ./.:4:48,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:10,3:.:-1.94:1.000:. ./.:4:41,18:.:-0.13:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.10:1.000:. ./.:4:42,10:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:40,26:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:43,20:.: 0.03:1.000:. ./.:4:42,32:.: 0.47:1.000:. ./.:4:16,8:.:-1.51:1.000:. ./.:4:51,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.39:1.000:. -chr4.1 43009684 chr4.1_043009684 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:74,64:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,53:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,68:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,83:0.68:-0.59:1.000:0.960 0/0/1/1:4:119,63:0.41: 1.12:1.000:0.840 0/0/0/1:4:193,47:0.25: 2.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,22:0.26:-1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,106:0.74: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,42:0.64:-2.28:1.000:0.664 0/0/1/1:4:68,43:0.45:-1.02:1.000:0.978 0/1/1/1:4:41,91:0.70:-0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:84,57:0.47:-0.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:137,26:0.21: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,74:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,76:0.43: 1.90:1.000:0.935 0/1/1/1:4:75,116:0.64: 1.39:0.999:0.651 0/0/0/1:4:121,28:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,50:0.29: 2.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:53,104:0.68: 0.37:1.000:0.957 0/0/1/1:4:37,36:0.54:-2.16:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,38:0.26: 1.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,26:0.50:-2.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,117:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,96:0.65: 0.31:1.000:0.760 0/0/1/1:4:78,60:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,62:0.43: 0.67:1.000:0.951 0/0/1/1:4:95,72:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,113:0.66: 1.03:1.000:0.843 0/0/0/1:4:133,30:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,38:0.63:-2.43:1.000:0.508 0/0/0/1:4:71,17:0.25:-1.71:1.000:0.999 0/0/1:3:15,8:0.41:-3.66:0.999:0.998 0/1/1/1:4:63,112:0.66: 0.91:1.000:0.888 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,81:0.66:-0.53:1.000:0.878 0/0/1/1:4:117,64:0.41: 1.09:1.000:0.886 0/1/1/1:4:43,81:0.67:-0.62:1.000:0.936 0/0/0/1:4:127,33:0.26: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:147,22:0.17: 0.73:1.000:0.998 0/1/1/1:4:49,102:0.69: 0.19:1.000:0.976 0/0/0/1:4:123,20:0.18:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,40:0.39:-0.74:1.000:0.726 0/1/1/1:4:41,111:0.74: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,73:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,103:0.67: 0.40:1.000:0.932 0/0/0/1:4:138,23:0.18: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,74:0.46: 1.18:1.000:0.990 0/1/1/1:4:37,91:0.72:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,86:0.49: 1.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,79:0.68:-0.77:1.000:0.960 0/1/1/1:4:47,91:0.68:-0.20:1.000:0.951 0/0/1/1:4:76,56:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:230,0:0.00: 2.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,51:0.38: 0.37:1.000:0.627 0/1/1/1:4:62,99:0.64: 0.49:1.000:0.722 0/0/0/1:4:116,22:0.21:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:55,65:0.58:-0.74:1.000:0.510 0/1/1/1:4:56,87:0.64:-0.05:1.000:0.661 0/0/0/1:4:157,32:0.22: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,97:0.58: 1.06:1.000:0.907 0/0/1/1:4:91,48:0.41:-0.17:1.000:0.834 0/0/0/1:4:121,35:0.28: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,90:0.53: 1.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:52,42:0.51:-1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,60:0.47: 0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:68,46:0.46:-0.92:0.998:0.990 0/1/1/1:4:28,86:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,109:0.69: 0.49:1.000:0.978 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,107:0.71: 0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,126:0.83: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,65:0.48: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,28:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,38:0.27: 1.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,49:0.41:-0.11:1.000:0.849 0/0/0/1:4:108,41:0.33: 0.13:1.000:0.904 0/0/1/1:4:96,75:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,47:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,69:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,22:0.17: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,45:0.40:-0.38:1.000:0.799 0/0/0/1:4:166,38:0.24: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,39:0.27: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,28:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,23:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,37:0.28: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,76:0.71:-1.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,46:0.42:-0.50:0.999:0.913 0/0/1/1:4:83,59:0.48:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,43:0.39:-0.47:1.000:0.726 0/1/1/1:4:34,74:0.70:-1.11:1.000:0.985 0/0/0/1:4:125,29:0.24: 0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,50:0.47:-0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:34,77:0.71:-1.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:78,56:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,65:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,54:0.52:-0.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:171,36:0.23: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,39:0.49:-1.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,73:0.69:-1.11:0.999:0.977 0/1/1/1:4:46,73:0.64:-0.77:1.000:0.709 0/0/0/1:4:133,36:0.27: 0.73:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,42:0.36:-0.20:1.000:0.646 0/0/0/1:4:133,30:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,83:0.45: 2.02:1.000:0.982 0/0/0/1:4:134,26:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,54:0.43: 0.01:1.000:0.954 0/0/1/1:4:123,78:0.45: 1.69:1.000:0.979 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.32:0.999:1.000 0/0/1/1:4:100,53:0.41: 0.25:1.000:0.842 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,50:0.41:-0.11:1.000:0.891 1/1/1/1:4:2,108:0.98:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,89:0.73:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,49:0.41:-0.11:1.000:0.849 0/0/1/1:4:75,60:0.51:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,90:0.80:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,58:0.52:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,81:0.65:-0.47:1.000:0.822 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,43:0.36:-0.08:1.000:0.665 0/0/1/1:4:93,62:0.46: 0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:84,48:0.42:-0.38:1.000:0.929 0/1/1/1:4:38,89:0.71:-0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,34:0.45:-1.71:1.000:0.977 0/0/1/1:4:56,28:0.39:-1.83:1.000:0.726 0/0/1/1:4:89,50:0.42:-0.17:1.000:0.915 0/0/1/1:4:82,58:0.48:-0.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,61:0.73:-1.83:0.996:0.998 0/1/1/1:4:34,90:0.73:-0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,69:0.64:-0.92:1.000:0.630 0/0/1/1:4:127,67:0.41: 1.48:1.000:0.834 0/1/1/1:4:37,108:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,46:0.44:-0.74:1.000:0.973 0/0/1/1:4:60,53:0.53:-0.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,82:0.70:-0.77:1.000:0.987 0/1/1/1:4:50,80:0.64:-0.44:1.000:0.726 0/0/1/1:4:68,48:0.48:-0.86:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,76:0.69:-0.99:1.000:0.979 0/0/1/1:4:61,43:0.48:-1.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,86:0.47: 1.93:1.000:0.993 0/1/1/1:4:49,123:0.72: 0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,85:0.69:-0.56:1.000:0.975 0/0/1/1:4:107,60:0.42: 0.67:1.000:0.913 0/0/1/1:4:103,76:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,51:0.46:-0.53:1.000:0.989 0/1/1/1:4:60,91:0.63: 0.19:1.000:0.603 0/0/0/1:4:143,39:0.27: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,36:0.39:-1.08:1.000:0.692 0/1/1/1:4:36,67:0.67:-1.26:1.000:0.928 0/0/1/1:4:106,70:0.46: 0.94:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,102:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,80:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:147,31:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,41:0.41:-0.80:0.998:0.849 0/0/1/1:4:94,79:0.52: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,53:0.40: 0.37:1.000:0.769 0/1/1/1:4:48,86:0.66:-0.32:1.000:0.896 0/0/1/1:4:92,61:0.46: 0.25:1.000:0.988 0/0/1/1:4:99,71:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:127,25:0.21: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,93:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,78:0.75:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,31:0.27:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,68:0.46: 0.76:1.000:0.988 0/0/1/1:4:95,62:0.46: 0.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:62,52:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,62:0.48: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,51:0.43:-0.17:1.000:0.940 0/0/0/1:4:120,25:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,50:0.42:-0.20:1.000:0.925 0/0/0/1:4:97,30:0.29:-0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:120,76:0.45: 1.54:1.000:0.979 0/1/1/1:4:55,91:0.65: 0.04:1.000:0.790 0/0/0/1:4:185,30:0.18: 2.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,36:0.37:-0.83:1.000:0.602 0/1/1/1:4:51,92:0.67:-0.05:1.000:0.903 0/0/1/1:4:104,87:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,77:0.47: 1.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:107,25:0.25:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,66:0.44: 0.94:1.000:0.960 -chr4.1 43659507 chr4.1_043659507 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:165,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:90,30:.:-0.38:1.000:. ./.:4:126,39:.: 0.77:1.000:. ./.:4:86,15:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:70,18:.:-1.19:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:188,27:.: 2.05:1.000:. ./.:4:75,21:.:-0.99:1.000:. ./.:4:98,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:83,31:.:-0.53:1.000:. ./.:4:83,10:.:-1.07:1.000:. ./.:4:72,24:.:-0.99:1.000:. ./.:4:84,24:.:-0.68:0.999:. ./.:4:91,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:99,30:.:-0.15:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:208,9:.: 2.10:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:90,17:.:-0.71:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:131,44:.: 1.03:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:126,47:.: 0.98:1.000:. ./.:4:83,18:.:-0.86:1.000:. ./.:4:54,13:.:-1.73:1.000:. ./.:4:45,13:.:-1.96:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:167,49:.: 2.07:1.000:. ./.:3:136,0:.: 0.03:0.999:. ./.:4:87,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:82,15:.:-0.96:1.000:. ./.:4:98,20:.:-0.43:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:151,23:.: 1.00:1.000:. ./.:4:89,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:105,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:135,30:.: 0.77:1.000:. ./.:4:336,0:.: 5.14:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:131,38:.: 0.87:1.000:. ./.:4:109,29:.: 0.08:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:106,30:.: 0.03:1.000:. ./.:4:97,27:.:-0.28:1.000:. ./.:4:191,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.40:1.000:. ./.:6:163,9:.: 0.95:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:87,19:.:-0.73:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:130,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:91,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:155,31:.: 1.31:1.000:. ./.:4:88,37:.:-0.25:1.000:. ./.:4:105,30:.: 0.01:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.03:0.998:. ./.:4:107,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:151,37:.: 1.36:1.000:. ./.:4:72,24:.:-0.99:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:74,58:.:-0.07:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:121,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:129,31:.: 0.64:1.000:. ./.:4:140,20:.: 0.64:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:79,22:.:-0.86:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:137,40:.: 1.08:1.000:. ./.:4:85,19:.:-0.79:1.000:. ./.:4:139,47:.: 1.31:1.000:. ./.:4:148,40:.: 1.36:1.000:. ./.:4:87,23:.:-0.63:1.000:. ./.:4:106,32:.: 0.08:1.000:. ./.:4:122,24:.: 0.29:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:71,27:.:-0.94:0.999:. ./.:4:131,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:173,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:86,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:126,39:.: 0.77:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:72,33:.:-0.76:1.000:. ./.:4:190,32:.: 2.23:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:114,37:.: 0.41:1.000:. ./.:4:76,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.95:0.999:. ./.:4:158,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:99,30:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,20:.:-1.12:1.000:. ./.:4:140,39:.: 1.13:1.000:. ./.:4:85,22:.:-0.71:1.000:. ./.:4:138,41:.: 1.13:1.000:. ./.:4:102,29:.:-0.10:1.000:. ./.:4:157,34:.: 1.44:0.999:. ./.:4:118,30:.: 0.34:1.000:. ./.:4:103,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:126,29:.: 0.52:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:115,22:.: 0.06:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:108,24:.:-0.07:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:76,20:.:-0.99:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:128,40:.: 0.85:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:77,22:.:-0.91:1.000:. ./.:4:98,23:.:-0.35:1.000:. ./.:4:88,14:.:-0.84:1.000:. ./.:4:123,26:.: 0.36:1.000:. ./.:4:65,23:.:-1.19:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.27:0.996:. ./.:4:182,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:103,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,24:.: 0.24:1.000:. ./.:4:106,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,23:.:-0.10:1.000:. ./.:4:117,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:102,26:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:94,31:.:-0.25:1.000:. ./.:4:145,30:.: 1.03:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:97,23:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:82,20:.:-0.84:1.000:. ./.:4:65,13:.:-1.45:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:86,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:93,21:.:-0.53:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:123,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,17:.:-0.68:1.000:. ./.:4:99,18:.:-0.45:0.998:. ./.:4:110,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:76,25:.:-0.86:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:91,21:.:-0.58:1.000:. ./.:4:60,17:.:-1.47:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,10:.:-0.96:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:66,27:.:-1.07:1.000:. ./.:4:60,17:.:-1.47:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:96,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:78,20:.:-0.94:1.000:. ./.:4:65,19:.:-1.30:1.000:. ./.:4:78,17:.:-1.02:1.000:. ./.:4:190,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:87,27:.:-0.53:1.000:. ./.:4:88,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.79:1.000:. ./.:4:96,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:64,13:.:-1.47:1.000:. ./.:4:106,27:.:-0.05:1.000:. -chr4.1 44553513 chr4.1_044553513 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:165,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:145,44:.: 0.43:1.000:. ./.:4:214,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:224,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.54:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.88:0.999:. ./.:4:154,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:315,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:140,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.76:0.998:. ./.:4:127,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:230,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.14:0.999:. ./.:4:136,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:278,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.57:0.999:. ./.:4:164,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.56:0.999:. ./.:4:223,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.25:0.996:. ./.:4:175,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:279,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:307,1:.: 2.74:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.93:0.998:. ./.:4:118,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:297,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.47:1.000:. -chr4.1 44694078 chr4.1_044694078 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,14:.: 1.46:1.000:. ./.:4:10,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:19,9:.: 0.01:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:11,4:.:-1.34:1.000:. ./.:4:23,7:.: 0.21:1.000:. ./.:4:23,10:.: 0.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,4:.: 0.94:1.000:. ./.:4:10,5:.:-1.34:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:18,15:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,8:.: 1.98:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:5,1:.:-2.27:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:15,8:.:-0.51:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:8,4:.:-1.65:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.79:0.999:. ./.:4:22,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.63:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,10:.: 0.11:1.000:. ./.:4:18,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:5,1:.:-2.27:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:25,6:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:23,7:.: 0.21:1.000:. ./.:6:15,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.63:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:16,12:.: 0.01:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.86:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:24,6:.: 0.21:0.998:. ./.:4:30,9:.: 1.15:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.41:1.000:. ./.:4:37,14:.: 2.39:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.13:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:19,9:.: 0.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,9:.: 1.04:1.000:. ./.:4:23,12:.: 0.73:1.000:. ./.:4:15,9:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,10:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.63:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:12,4:.:-1.24:1.000:. ./.:4:27,5:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.52:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,8:.:-0.82:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:19,9:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,7:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:18,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.52:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.41:1.000:. ./.:4:10,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:23,6:.: 0.11:0.999:. ./.:4:34,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.84:1.000:. ./.:4:27,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:15,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:19,14:.: 0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:33,11:.: 1.66:0.999:. ./.:4:28,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:9,6:.:-1.34:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,5:.:-0.93:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:27,8:.: 0.73:1.000:. ./.:4:23,10:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:23,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:7,11:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.24:0.996:. ./.:4:12,4:.:-1.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.32:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,10:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,17:.: 0.94:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.10:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.72:0.998:. ./.:4:30,10:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:26,6:.: 0.42:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:4,9:.:-1.55:1.000:. ./.:4:14,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:21,19:.: 1.25:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:22,6:.: 0.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:19,11:.: 0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:29,11:.: 1.25:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,7:.: 1.15:1.000:. -chr4.1 44864682 chr4.1_044864682 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:205,260:0.59: 0.88:1.000:0.856 0/0/1/1:4:156,121:0.47:-1.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:201,206:0.55: 0.28:1.000:0.984 0/0/0/1:4:347,145:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:330,188:0.36: 1.43:1.000:0.696 0/0/1/1:4:180,164:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,147:0.76:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,201:0.47: 0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:66,182:0.74:-1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,113:0.48:-1.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:85,58:0.43:-2.47:1.000:0.934 0/0/0/0:4:296,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,154:0.31: 0.86:1.000:0.970 0/1/1/1:4:168,258:0.63: 0.47:1.000:0.583 0/0/1/1:4:240,214:0.52: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:281,141:0.31: 0.43:1.000:0.966 0/0/0/1:4:326,120:0.23: 0.68:0.999:1.000 0/0/1/1:4:164,243:0.62: 0.28:1.000:0.516 0/0/1/1:4:207,267:0.59: 0.97:1.000:0.831 0/0/1/1:4:279,170:0.38: 0.71:1.000:0.617 0/0/1/1:4:72,93:0.60:-2.24:1.000:0.829 0/0/0/1:4:353,141:0.24: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,185:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:299,162:0.34: 0.84:1.000:0.859 0/0/1/1:4:66,50:0.47:-2.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:264,232:0.51: 1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:246,151:0.39: 0.17:1.000:0.650 0/0/1/1:4:174,198:0.57:-0.09:1.000:0.951 0/0/1/1:4:269,182:0.42: 0.73:1.000:0.923 0/0/0/1:4:257,141:0.35: 0.18:1.000:0.827 0/0/0/1:4:259,135:0.33: 0.14:1.000:0.929 0/0/1/1:4:140,107:0.47:-1.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:42,23:0.35:-3.28:1.000:0.832 0/0/1/1:4:63,79:0.59:-2.48:1.000:0.871 0/1/1:3:42,65:0.63:-2.85:0.999:1.000 0/0/0/1:4:233,131:0.35:-0.17:1.000:0.747 0/0/0/1:4:349,161:0.29: 1.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:336,143:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:240,146:0.38: 0.06:1.000:0.610 0/0/1/1:4:251,207:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,137:0.54:-1.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:267,141:0.33: 0.29:1.000:0.910 0/0/1/1:4:279,211:0.46: 1.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:166,205:0.59:-0.10:1.000:0.888 0/1/1/1:4:180,269:0.63: 0.71:1.000:0.508 0/0/1/1:4:254,248:0.54: 1.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:313,163:0.33: 0.99:1.000:0.930 0/0/0/1:4:44,23:0.33:-3.26:1.000:0.925 0/1/1/1:4:100,227:0.71:-0.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:128,155:0.58:-1.02:1.000:0.908 0/0/0/1:4:239,136:0.36:-0.06:1.000:0.700 0/0/1/1:4:304,187:0.39: 1.15:1.000:0.659 0/0/0/1:4:315,132:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:299,163:0.34: 0.85:1.000:0.844 0/0/1/1:4:148,197:0.60:-0.37:1.000:0.777 0/1/1/1:4:77,214:0.74:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:263,164:0.39: 0.48:1.000:0.716 0/0/1/1:4:258,157:0.38: 0.36:1.000:0.611 0/0/1/1:4:166,200:0.58:-0.15:1.000:0.913 0/0/0/0/1/1:6:219,122:0.35:-0.41:1.000:0.896 0/0/0/1:4:294,165:0.35: 0.82:1.000:0.754 0/0/1/1:4:164,124:0.46:-0.96:1.000:0.990 0/0/1/1:4:202,220:0.56: 0.43:1.000:0.969 0/0/0/1:4:251,132:0.33: 0.03:1.000:0.917 0/0/1/1:4:191,231:0.58: 0.43:1.000:0.909 0/0/0/1:4:352,137:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,140:0.58:-1.31:1.000:0.903 0/0/0/1:4:241,119:0.31:-0.21:1.000:0.975 0/0/1/1:4:147,200:0.61:-0.35:0.998:0.732 0/0/0/1:4:241,71:0.19:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:316,170:0.34: 1.10:1.000:0.875 0/1/1/1:4:69,178:0.73:-1.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:228,80:0.22:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,259:0.53: 1.57:1.000:0.992 0/0/0/0:4:351,2:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,191:0.73:-1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,206:0.60:-0.21:1.000:0.767 0/0/0/1:4:293,157:0.34: 0.72:1.000:0.884 0/0/1/1:4:175,226:0.60: 0.21:1.000:0.829 0/0/1/1:4:182,200:0.56: 0.02:1.000:0.966 0/0/0/1:4:193,54:0.19:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,249:0.61: 0.47:1.000:0.654 0/0/1/1:4:213,301:0.61: 1.39:1.000:0.643 0/0/0/1:4:234,130:0.35:-0.17:1.000:0.789 0/0/1/1:4:162,167:0.55:-0.54:1.000:0.983 0/0/1/1:4:180,241:0.60: 0.42:1.000:0.766 0/0/1/1:4:153,178:0.57:-0.52:1.000:0.939 0/0/1/1:4:156,137:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,192:0.61:-0.51:1.000:0.715 0/0/1/1:4:247,169:0.43: 0.37:1.000:0.937 0/0/1/1:4:200,137:0.43:-0.45:0.999:0.938 0/0/1/1:4:169,178:0.55:-0.35:1.000:0.978 0/0/1/1:4:195,218:0.56: 0.34:1.000:0.960 0/0/0/1:4:272,120:0.27: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,221:0.60: 0.06:1.000:0.765 0/0/0/1:4:327,155:0.30: 1.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:157,194:0.59:-0.31:1.000:0.888 0/0/0/0:4:256,1:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:307,190:0.39: 1.21:1.000:0.685 0/0/1/1:4:188,247:0.60: 0.57:1.000:0.801 0/0/1/1:4:155,162:0.55:-0.66:1.000:0.980 0/0/1/1:4:160,166:0.55:-0.57:1.000:0.982 0/0/0/1:4:197,117:0.37:-0.69:1.000:0.505 0/0/1/1:4:296,253:0.51: 1.75:0.999:0.997 0/0/1/1:4:190,133:0.44:-0.60:1.000:0.958 0/1/1/1:4:136,222:0.64:-0.23:1.000:0.733 0/0/1/1:4:153,196:0.59:-0.33:1.000:0.842 0/0/1/1:4:176,201:0.57:-0.04:1.000:0.949 0/0/0/1:4:326,187:0.36: 1.38:1.000:0.667 0/0/1/1:4:178,217:0.58: 0.15:1.000:0.902 0/0/0/1:4:292,149:0.32: 0.63:1.000:0.952 0/0/1/1:4:263,192:0.45: 0.77:1.000:0.981 0/1/1/1:4:80,261:0.77:-0.41:0.999:1.000 0/0/0/1:4:296,139:0.29: 0.57:1.000:0.991 0/1/1/1:4:67,150:0.71:-1.70:1.000:0.989 0/0/0/1:4:316,171:0.34: 1.11:1.000:0.862 0/0/0/1:4:331,139:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,120:0.32:-0.25:1.000:0.959 0/0/1/1:4:240,150:0.39: 0.10:1.000:0.724 0/0/1/1:4:149,206:0.61:-0.27:1.000:0.696 0/0/0/1:4:357,146:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,195:0.47: 0.73:1.000:0.991 0/0/1/1:4:289,180:0.39: 0.92:1.000:0.711 0/1/1/1:4:87,192:0.70:-1.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:200,211:0.55: 0.32:1.000:0.978 0/0/1/1:4:186,243:0.60: 0.50:1.000:0.811 0/0/1/1:4:161,237:0.62: 0.18:1.000:0.534 0/0/0/0:4:286,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,123:0.38:-0.56:1.000:0.568 0/0/0/1:4:197,94:0.30:-0.93:1.000:0.987 0/0/0/1:4:241,140:0.37: 0.00:1.000:0.610 0/0/1/1:4:242,218:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,136:0.51:-0.93:0.996:0.996 0/0/1/1:4:274,259:0.53: 1.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:236,118:0.31:-0.28:1.000:0.968 0/0/1/1:4:348,212:0.38: 1.87:1.000:0.616 0/0/0/1:4:372,152:0.25: 1.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:266,102:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,119:0.32:-0.31:1.000:0.948 0/0/0/1:4:309,147:0.30: 0.79:1.000:0.988 0/0/1/1:4:233,146:0.39:-0.02:1.000:0.734 0/0/1/1:4:258,221:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,154:0.42: 0.00:1.000:0.927 0/0/1/1:4:213,131:0.39:-0.38:1.000:0.659 0/0/0/1:4:341,196:0.36: 1.63:1.000:0.658 0/0/0/1:4:351,194:0.35: 1.71:1.000:0.805 0/0/0/1:4:237,134:0.36:-0.10:1.000:0.726 0/0/1/1:4:261,166:0.40: 0.48:1.000:0.786 0/1/1/1:4:181,274:0.63: 0.77:1.000:0.544 0/0/1/1:4:154,192:0.59:-0.36:1.000:0.878 0/0/0/1:4:353,167:0.29: 1.45:1.000:0.989 0/0/1/1:4:185,152:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,82:0.55:-2.27:1.000:0.984 0/0/0/1:4:202,108:0.34:-0.73:1.000:0.888 0/0/1/1:4:258,174:0.42: 0.54:1.000:0.919 0/0/1/1:4:288,239:0.50: 1.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:234,274:0.57: 1.33:1.000:0.935 0/0/1/1:4:165,215:0.60:-0.01:1.000:0.815 0/0/1/1:4:230,140:0.38:-0.11:0.998:0.612 0/0/1/1:4:191,232:0.58: 0.44:1.000:0.905 0/0/0/1:4:228,116:0.32:-0.38:1.000:0.955 0/0/0/1:4:221,95:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,180:0.56:-0.40:1.000:0.962 0/0/1/1:4:286,171:0.38: 0.80:1.000:0.528 0/0/1/1:4:138,179:0.60:-0.66:1.000:0.823 0/0/1/1:4:173,198:0.57:-0.10:1.000:0.948 0/0/0/1:4:218,126:0.36:-0.38:1.000:0.633 0/0/1/1:4:155,147:0.53:-0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:159,161:0.54:-0.63:1.000:0.986 0/0/1/1:4:169,132:0.48:-0.83:1.000:0.994 0/0/0/1:4:222,111:0.31:-0.49:1.000:0.968 0/0/0/1:4:181,102:0.36:-1.02:1.000:0.739 0/0/1/1:4:195,196:0.54: 0.11:1.000:0.987 0/0/1/1:4:148,204:0.61:-0.30:1.000:0.703 0/0/0/1:4:178,103:0.36:-1.04:1.000:0.628 0/0/1/1:4:147,104:0.44:-1.35:1.000:0.966 0/0/0/1:4:272,161:0.37: 0.55:1.000:0.521 0/0/1/1:4:269,169:0.39: 0.60:1.000:0.744 0/0/1/1:4:168,159:0.53:-0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:164,200:0.58:-0.17:1.000:0.901 0/0/0/1:4:341,181:0.33: 1.47:1.000:0.902 0/0/1/1:4:304,211:0.43: 1.40:1.000:0.951 0/0/1/1:4:201,272:0.61: 0.96:1.000:0.744 0/0/1/1:4:155,137:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:293,81:0.19:-0.07:1.000:0.999 -chr4.1 45044416 chr4.1_045044416 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:796,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:648,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:517,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:775,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:664,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:526,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:630,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:771,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:489,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:544,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:358,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:647,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:534,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:598,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:653,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:602,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:605,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:839,3:.: 1.20:1.000:. ./.:4:607,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:773,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:610,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:810,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:858,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:1073,3:.: 2.28:1.000:. ./.:4:844,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:812,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:951,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:716,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:346,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:516,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.24:1.000:. ./.:3:287,0:.:-1.36:0.999:. ./.:4:787,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:796,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:665,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:607,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:930,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:838,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:369,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:835,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:711,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:786,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:2310,1:.: 7.97:1.000:. ./.:4:513,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:454,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:605,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:595,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:582,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:428,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:502,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:731,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:547,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:381,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:530,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:357,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:545,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:509,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:745,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:404,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:779,0:.: 0.91:0.998:. ./.:4:697,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:625,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:394,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:751,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:750,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:594,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:535,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:342,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:707,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:559,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:528,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:588,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:300,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:339,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:491,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:575,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.00:0.999:. ./.:4:647,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:672,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:555,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:529,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:712,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:485,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:408,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:765,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:547,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:715,0:.: 0.61:0.999:. ./.:4:421,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:325,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:716,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:625,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:370,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:285,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:536,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:405,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:579,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:610,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:604,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:567,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:737,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:487,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:491,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:542,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:629,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:414,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:305,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.84:0.996:. ./.:4:701,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:507,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:507,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:650,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:499,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:395,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:673,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:535,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:665,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:294,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:603,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1190,1:.: 2.81:1.000:. ./.:4:870,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:712,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:481,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:764,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:467,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:696,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:685,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:782,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:996,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:573,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:553,1:.:-0.13:0.998:. ./.:4:990,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:398,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:576,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:609,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:688,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:757,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:537,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:594,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:649,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:586,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:300,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:678,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:558,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:342,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:442,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:847,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:908,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:692,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:568,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1116,1:.: 2.46:1.000:. ./.:4:352,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:704,0:.: 0.56:1.000:. -chr4.1 45355032 chr4.1_045355032 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,28:.: 0.89:1.000:. ./.:4:88,50:.: 0.05:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:134,29:.: 0.51:1.000:. ./.:4:174,33:.: 1.31:1.000:. ./.:4:160,23:.: 0.87:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:129,23:.: 0.31:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:10,4:.:-2.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:129,28:.: 0.40:1.000:. ./.:4:116,29:.: 0.18:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:136,30:.: 0.56:1.000:. ./.:4:152,28:.: 0.82:0.999:. ./.:4:184,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:162,26:.: 0.96:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:135,24:.: 0.43:1.000:. ./.:4:141,31:.: 0.67:1.000:. ./.:4:118,22:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,4:.:-2.31:1.000:. ./.:4:141,26:.: 0.58:1.000:. ./.:4:132,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:176,31:.: 1.31:1.000:. ./.:4:169,35:.: 1.26:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:8,6:.:-2.22:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.18:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.42:0.999:. ./.:4:148,31:.: 0.80:1.000:. ./.:4:160,17:.: 0.76:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:87,13:.:-0.65:1.000:. ./.:4:138,32:.: 0.63:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:85,15:.:-0.65:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.31:1.000:. ./.:4:110,15:.:-0.19:1.000:. ./.:4:47,8:.:-1.47:1.000:. ./.:4:71,9:.:-1.01:1.000:. ./.:4:131,24:.: 0.36:1.000:. ./.:4:83,18:.:-0.63:1.000:. ./.:4:104,23:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,32:.: 0.65:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:103,22:.:-0.19:1.000:. ./.:4:73,12:.:-0.92:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.19:1.000:. ./.:6:76,7:.:-0.96:1.000:. ./.:4:96,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:102,18:.:-0.28:1.000:. ./.:4:85,17:.:-0.61:1.000:. ./.:4:77,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:112,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:120,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.61:0.998:. ./.:4:89,43:.:-0.06:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,27:.:-0.79:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:53,23:.:-1.08:1.000:. ./.:4:70,7:.:-1.07:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:79,16:.:-0.74:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,13:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,13:.:-0.94:1.000:. ./.:4:128,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:84,12:.:-0.72:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:86,8:.:-0.75:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:92,17:.:-0.48:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:87,16:.:-0.59:1.000:. ./.:4:73,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:55,25:.:-1.01:1.000:. ./.:4:82,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:126,20:.: 0.20:1.000:. ./.:4:76,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:106,15:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,12:.:-1.32:1.000:. ./.:4:62,10:.:-1.16:0.999:. ./.:4:58,12:.:-1.19:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:190,31:.: 1.57:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:235,45:.: 2.65:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:141,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:104,17:.:-0.26:1.000:. ./.:4:65,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:74,11:.:-0.92:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:121,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:101,22:.:-0.22:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:55,12:.:-1.25:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:61,6:.:-1.25:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:52,8:.:-1.38:0.996:. ./.:4:101,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:174,37:.: 1.38:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,13:.:-1.27:1.000:. ./.:4:46,7:.:-1.50:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:73,17:.:-0.83:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:126,31:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,7:.:-1.38:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:207,21:.: 1.69:1.000:. ./.:4:152,26:.: 0.78:1.000:. ./.:4:137,20:.: 0.40:1.000:. ./.:4:150,38:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,20:.:-0.22:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:126,29:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:137,21:.: 0.42:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.63:0.998:. ./.:4:161,36:.: 1.13:1.000:. ./.:4:136,26:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:129,26:.: 0.36:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:131,32:.: 0.51:1.000:. ./.:4:146,30:.: 0.74:1.000:. ./.:4:130,29:.: 0.43:1.000:. ./.:4:125,24:.: 0.25:1.000:. ./.:4:126,19:.: 0.18:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:130,28:.: 0.42:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:109,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:254,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:134,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:174,30:.: 1.26:1.000:. ./.:4:163,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:168,39:.: 1.31:1.000:. ./.:4:254,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:136,26:.: 0.49:1.000:. -chr4.1 45890713 chr4.1_045890713 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:76,81:0.53: 0.93:1.000:0.994 0/0/0/1:4:113,56:0.35: 1.16:1.000:0.826 0/0/0/1:4:93,35:0.29: 0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:96,60:0.40: 0.92:1.000:0.774 0/0/1/1:4:91,97:0.53: 1.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,47:0.42: 0.14:1.000:0.920 0/0/1/1:4:49,66:0.58: 0.14:1.000:0.912 0/0/0/1:4:147,71:0.34: 2.09:1.000:0.865 0/1/1/1:4:62,137:0.69: 1.73:1.000:0.972 0/0/1/1:4:22,15:0.42:-1.35:1.000:0.908 0/0/1/1:4:42,24:0.38:-0.80:1.000:0.538 0/1/1/1:4:39,82:0.68: 0.25:1.000:0.951 0/0/1/1:4:53,65:0.56: 0.19:1.000:0.969 0/0/1/1:4:45,68:0.61: 0.10:1.000:0.724 0/0/1/1:4:88,63:0.43: 0.82:1.000:0.947 0/0/1/1:4:128,103:0.46: 2.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:107,121:0.54: 2.28:0.999:0.988 0/1/1/1:4:57,97:0.63: 0.88:1.000:0.611 0/1/1/1:4:58,112:0.66: 1.18:1.000:0.876 0/0/1/1:4:57,64:0.54: 0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:15,9:0.39:-1.60:1.000:0.677 0/0/1/1:4:87,98:0.54: 1.47:1.000:0.988 0/0/1/1:4:52,40:0.45:-0.30:1.000:0.977 0/0/1/1:4:76,58:0.45: 0.50:1.000:0.975 0/0/0/1:4:35,11:0.26:-1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:190,86:0.33: 3.20:1.000:0.933 0/0/1/1:4:54,78:0.60: 0.46:1.000:0.818 0/0/1/1:4:85,54:0.40: 0.59:1.000:0.807 0/0/1/1:4:92,57:0.40: 0.78:1.000:0.755 0/0/1/1:4:123,98:0.46: 2.15:1.000:0.985 0/0/1/1:4:59,94:0.62: 0.86:1.000:0.583 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.59:-1.73:1.000:0.837 0/1/1/1:4:14,30:0.68:-1.22:1.000:0.960 0/0/1:3:20,14:0.42:-1.41:0.999:0.994 0/0/0/1:4:135,37:0.23: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,27:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,93:0.62: 0.82:1.000:0.564 0/0/1/1:4:59,83:0.59: 0.65:1.000:0.860 0/0/1/1:4:129,163:0.57: 3.50:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,53:0.58:-0.30:1.000:0.903 0/0/0/1:4:65,26:0.30:-0.32:1.000:0.984 0/0/0/1:4:66,33:0.35:-0.17:1.000:0.810 0/0/1/1:4:75,43:0.38: 0.19:1.000:0.548 0/0/1/1:4:83,55:0.41: 0.57:1.000:0.874 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,11:0.34:-1.41:1.000:0.879 0/0/1/1:4:78,48:0.39: 0.34:1.000:0.740 0/0/0/1:4:47,24:0.35:-0.70:1.000:0.768 0/0/1/1:4:26,30:0.54:-0.99:1.000:0.985 0/0/1/1:4:80,80:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,76:0.54: 0.69:1.000:0.989 0/0/1/1:4:25,28:0.54:-1.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:97,18:0.17: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,45:0.56:-0.49:1.000:0.972 0/0/1/1:4:57,67:0.55: 0.31:1.000:0.981 0/1/1/1:4:33,90:0.73: 0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,80:0.65: 0.31:1.000:0.775 0/0/0/0/1/1:6:58,26:0.32:-0.45:1.000:0.920 0/0/1/1:4:58,35:0.39:-0.28:1.000:0.692 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,101:0.55: 1.50:1.000:0.981 0/0/1/1:4:70,49:0.42: 0.21:1.000:0.931 0/0/1/1:4:80,53:0.41: 0.48:1.000:0.874 0/1/1/1:4:39,87:0.69: 0.34:1.000:0.975 0/0/1/1:4:53,48:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,38:0.56:-0.74:1.000:0.969 0/1/1/1:4:25,89:0.78: 0.12:0.998:1.000 0/0/0/1:4:86,45:0.36: 0.44:1.000:0.712 0/0/0/0:4:39,3:0.08:-1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,63:0.62:-0.11:1.000:0.542 0/0/0/1:4:137,34:0.21: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,26:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,44:0.40: 0.14:1.000:0.756 0/0/1/1:4:78,107:0.58: 1.47:1.000:0.892 0/0/0/1:4:58,31:0.36:-0.36:1.000:0.657 0/1/1/1:4:17,58:0.77:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,57:0.61:-0.25:1.000:0.741 0/0/1/1:4:68,95:0.59: 1.05:1.000:0.870 0/0/1/1:4:61,44:0.43:-0.06:1.000:0.951 0/1/1/1:4:28,52:0.65:-0.53:1.000:0.816 0/1/1/1:4:29,56:0.66:-0.44:1.000:0.876 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.49:-0.89:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,56:0.69:-0.51:1.000:0.976 0/0/1/1:4:27,38:0.59:-0.82:1.000:0.859 0/0/1/1:4:65,53:0.46: 0.19:1.000:0.988 0/0/0/1:4:101,46:0.33: 0.74:1.000:0.928 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.76:0.999:1.000 0/0/1/1:4:73,63:0.47: 0.53:1.000:0.994 0/0/0/0:4:47,2:0.04:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,36:0.41:-0.32:1.000:0.857 0/0/1/1:4:63,53:0.47: 0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:94,49:0.36: 0.67:1.000:0.721 0/0/1/1:4:41,34:0.47:-0.63:1.000:0.990 0/0/0/1:4:50,18:0.28:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,12:0.19:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,48:0.44: 0.10:1.000:0.963 0/0/1/1:4:71,55:0.45: 0.34:1.000:0.979 0/0/0/1:4:41,13:0.26:-1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,20:0.59:-1.41:1.000:0.837 0/0/0/1:4:57,21:0.29:-0.57:0.999:0.994 0/1/1/1:4:27,50:0.65:-0.59:1.000:0.811 0/1/1/1:4:39,81:0.68: 0.23:1.000:0.944 0/0/1/1:4:36,37:0.52:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,57:0.60:-0.23:1.000:0.796 0/0/1/1:4:47,28:0.39:-0.63:1.000:0.658 0/0/1/1:4:96,77:0.46: 1.24:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,134:0.51: 3.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,42:0.64:-0.80:0.999:0.686 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,20:0.51:-1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,45:0.61:-0.63:1.000:0.741 0/0/0/1:4:70,38:0.37: 0.00:1.000:0.614 0/0/1/1:4:24,22:0.49:-1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,40:0.68:-0.93:1.000:0.952 0/0/1/1:4:55,67:0.56: 0.27:1.000:0.971 0/0/1/1:4:46,44:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,59:0.61:-0.21:1.000:0.655 0/1/1/1:4:50,111:0.69: 1.01:1.000:0.974 0/0/1/1:4:25,37:0.60:-0.87:1.000:0.771 0/0/0/0:4:24,2:0.08:-1.56:1.000:0.983 0/0/1/1:4:48,30:0.40:-0.57:1.000:0.774 0/0/1/1:4:36,57:0.62:-0.28:1.000:0.601 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,87:0.61: 0.67:1.000:0.653 0/0/1/1:4:92,72:0.45: 1.07:1.000:0.981 0/0/1/1:4:47,31:0.41:-0.57:0.996:0.868 0/0/1/1:4:49,33:0.42:-0.49:1.000:0.894 0/0/1/1:4:46,39:0.47:-0.44:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,59:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,46:0.60:-0.59:1.000:0.765 0/0/1/1:4:40,49:0.56:-0.36:1.000:0.970 0/0/1/1:4:40,27:0.42:-0.78:1.000:0.897 0/1/1/1:4:25,54:0.68:-0.55:1.000:0.964 0/0/1/1:4:31,49:0.62:-0.53:1.000:0.605 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,78:0.54: 0.74:1.000:0.988 0/0/1/1:4:41,35:0.47:-0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,62:0.59:-0.02:1.000:0.887 0/0/1/1:4:45,56:0.56:-0.13:1.000:0.963 0/0/1/1:4:96,70:0.43: 1.11:1.000:0.957 0/0/1/1:4:27,24:0.48:-1.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:103,38:0.29: 0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,52:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,67:0.59: 0.14:1.000:0.871 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,11:0.41:-1.52:1.000:0.839 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,60:0.38: 1.09:1.000:0.538 0/0/1/1:4:84,54:0.40: 0.57:1.000:0.828 0/0/1/1:4:105,103:0.51: 1.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,74:0.61: 0.27:1.000:0.674 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.25:0.998:1.000 0/0/0/1:4:116,31:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,76:0.45: 1.28:1.000:0.976 0/0/1/1:4:44,29:0.41:-0.66:1.000:0.867 0/0/1/1:4:88,55:0.40: 0.67:1.000:0.774 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,58:0.39: 0.86:1.000:0.721 0/0/1/1:4:96,57:0.39: 0.86:1.000:0.649 0/0/0/1:4:86,31:0.28: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,53:0.31: 1.39:1.000:0.976 0/0/1/1:4:38,55:0.60:-0.28:1.000:0.814 0/1/1/1:4:38,99:0.72: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,20:0.36:-0.95:1.000:0.697 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,77:0.56: 0.61:1.000:0.970 0/0/1/1:4:60,42:0.42:-0.11:1.000:0.931 0/1/1/1:4:24,73:0.75:-0.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,100:0.58: 1.26:1.000:0.908 0/0/1/1:4:45,65:0.60: 0.04:1.000:0.818 0/0/1/1:4:48,34:0.43:-0.49:1.000:0.940 0/0/0/1:4:85,41:0.34: 0.34:1.000:0.867 0/0/1/1:4:48,75:0.61: 0.29:1.000:0.638 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,121:0.55: 2.19:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,56:0.41: 0.63:1.000:0.866 -chr4.1 46484973 chr4.1_046484973 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:102,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:45,56:.:-0.34:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:76,25:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,94:.: 2.17:1.000:. ./.:4:67,65:.: 0.70:1.000:. ./.:4:63,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:100,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:41,55:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,13:.:-2.44:1.000:. ./.:4:11,17:.:-2.78:1.000:. ./.:4:76,33:.:-0.07:1.000:. ./.:4:87,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:73,26:.:-0.41:1.000:. ./.:4:82,43:.: 0.46:0.999:. ./.:4:87,41:.: 0.56:1.000:. ./.:4:171,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:86,38:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,5:.:-2.98:1.000:. ./.:4:96,38:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,67:.: 0.66:1.000:. ./.:4:94,36:.: 0.63:1.000:. ./.:4:13,6:.:-3.08:1.000:. ./.:4:83,33:.: 0.16:1.000:. ./.:4:57,75:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,33:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,44:.: 1.13:1.000:. ./.:4:70,59:.: 0.60:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:57,21:.:-1.11:1.000:. ./.:4:4,10:.:-3.25:1.000:. ./.:4:25,14:.:-2.41:1.000:. ./.:3:4,10:.:-3.25:0.999:. ./.:4:62,68:.: 0.63:1.000:. ./.:4:91,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:48,66:.: 0.10:1.000:. ./.:4:99,39:.: 0.90:1.000:. ./.:4:80,26:.:-0.17:1.000:. ./.:4:85,44:.: 0.60:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:58,79:.: 0.86:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:125,41:.: 1.83:1.000:. ./.:4:5,5:.:-3.38:1.000:. ./.:4:47,60:.:-0.14:1.000:. ./.:4:73,26:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,50:.:-0.64:1.000:. ./.:4:97,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:84,17:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,33:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:85,24:.:-0.07:1.000:. ./.:4:57,59:.: 0.16:1.000:. ./.:4:64,72:.: 0.83:1.000:. ./.:4:84,26:.:-0.04:1.000:. ./.:6:54,28:.:-0.97:1.000:. ./.:4:69,37:.:-0.17:1.000:. ./.:4:43,44:.:-0.81:1.000:. ./.:4:98,39:.: 0.86:1.000:. ./.:4:42,59:.:-0.34:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:113,26:.: 0.93:1.000:. ./.:4:63,17:.:-1.04:1.000:. ./.:4:86,22:.:-0.10:1.000:. ./.:4:87,29:.: 0.16:0.998:. ./.:4:50,48:.:-0.44:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:56,15:.:-1.34:1.000:. ./.:4:65,65:.: 0.63:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,45:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,44:.:-0.87:1.000:. ./.:4:94,32:.: 0.50:1.000:. ./.:4:93,32:.: 0.46:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:67,61:.: 0.56:1.000:. ./.:4:71,18:.:-0.74:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:82,23:.:-0.21:1.000:. ./.:4:61,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:38,55:.:-0.61:1.000:. ./.:4:72,25:.:-0.47:1.000:. ./.:4:83,22:.:-0.21:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.31:0.999:. ./.:4:76,51:.: 0.53:1.000:. ./.:4:87,35:.: 0.36:1.000:. ./.:4:77,39:.: 0.16:1.000:. ./.:4:79,33:.: 0.03:1.000:. ./.:4:96,34:.: 0.63:1.000:. ./.:4:72,72:.: 1.10:1.000:. ./.:4:53,59:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:60,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:63,32:.:-0.54:1.000:. ./.:4:57,73:.: 0.63:1.000:. ./.:4:67,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,36:.: 1.10:0.999:. ./.:4:79,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:76,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,22:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,48:.: 2.44:1.000:. ./.:4:66,28:.:-0.57:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:73,44:.: 0.20:1.000:. ./.:4:100,34:.: 0.76:0.999:. ./.:4:110,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:51,31:.:-0.97:1.000:. ./.:4:77,78:.: 1.47:1.000:. ./.:4:75,27:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:82,37:.: 0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:60,61:.: 0.33:1.000:. ./.:4:81,38:.: 0.26:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:92,34:.: 0.50:1.000:. ./.:4:93,20:.: 0.06:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.91:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:63,25:.:-0.77:1.000:. ./.:4:61,17:.:-1.11:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:53,28:.:-1.01:0.996:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:139,50:.: 2.60:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:41,58:.:-0.41:1.000:. ./.:4:57,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:56,72:.: 0.56:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,40:.: 0.36:1.000:. ./.:4:43,27:.:-1.37:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:91,93:.: 2.44:1.000:. ./.:4:74,73:.: 1.20:1.000:. ./.:4:54,28:.:-0.97:1.000:. ./.:4:104,56:.: 1.63:1.000:. ./.:4:86,34:.: 0.30:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:51,49:.:-0.37:1.000:. ./.:4:24,4:.:-2.78:1.000:. ./.:4:73,15:.:-0.77:1.000:. ./.:4:49,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:84,44:.: 0.56:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:78,36:.: 0.10:0.998:. ./.:4:75,81:.: 1.50:1.000:. ./.:4:57,26:.:-0.94:1.000:. ./.:4:50,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:87,39:.: 0.50:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:98,26:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:74,23:.:-0.47:1.000:. ./.:4:107,27:.: 0.76:1.000:. ./.:4:50,55:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,50:.:-0.10:1.000:. ./.:4:69,31:.:-0.37:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:83,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:61,21:.:-0.97:1.000:. ./.:4:62,30:.:-0.64:1.000:. ./.:4:86,23:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,74:.: 1.40:1.000:. ./.:4:55,56:.: 0.00:1.000:. ./.:4:105,6:.: 0.00:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:125,44:.: 1.93:1.000:. ./.:4:65,30:.:-0.54:1.000:. ./.:4:110,27:.: 0.86:1.000:. -chr4.1 46799418 chr4.1_046799418 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:181,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:257,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.15:0.999:. ./.:4:317,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:283,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:281,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.48:1.000:. ./.:3:53,0:.:-1.79:0.999:. ./.:4:357,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:364,1:.: 2.13:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:360,2:.: 2.09:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:401,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.50:1.000:. ./.:6:231,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:296,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.06:0.998:. ./.:4:313,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:406,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:221,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:81,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:259,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.50:0.999:. ./.:4:305,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.05:0.999:. ./.:4:164,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:111,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.70:0.999:. ./.:4:87,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:163,1:.:-0.40:0.996:. ./.:4:275,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:292,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:213,2:.: 0.25:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:332,2:.: 1.74:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:144,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:374,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.04:0.998:. ./.:4:240,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:209,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:286,2:.: 1.16:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:371,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.86:1.000:. -chr4.1 46941170 chr4.1_046941170 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:287,1:.: 2.07:1.000:. ./.:4:155,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:162,11:.: 0.00:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:172,23:.: 0.40:1.000:. ./.:4:214,11:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,11:.:-1.24:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:176,12:.: 0.27:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:116,20:.:-0.67:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:243,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.50:0.999:. ./.:4:163,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:327,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:214,10:.: 0.92:1.000:. ./.:4:28,1:.:-2.60:1.000:. ./.:4:146,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:197,9:.: 0.59:1.000:. ./.:4:151,6:.:-0.29:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:120,11:.:-0.76:1.000:. ./.:4:87,21:.:-1.17:1.000:. ./.:4:233,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:119,17:.:-0.67:1.000:. ./.:4:179,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:119,12:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,7:.:-1.95:1.000:. ./.:3:25,0:.:-2.67:0.999:. ./.:4:90,16:.:-1.21:1.000:. ./.:4:150,8:.:-0.27:1.000:. ./.:4:155,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:193,7:.: 0.49:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:140,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,20:.:-0.81:1.000:. ./.:4:175,10:.: 0.22:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:159,12:.:-0.04:1.000:. ./.:4:166,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:134,28:.:-0.20:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:175,4:.: 0.11:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:88,14:.:-1.28:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:205,12:.: 0.79:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:187,5:.: 0.34:1.000:. ./.:4:136,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:128,16:.:-0.52:1.000:. ./.:4:106,19:.:-0.87:1.000:. ./.:6:141,5:.:-0.49:1.000:. ./.:4:133,14:.:-0.47:1.000:. ./.:4:176,10:.: 0.23:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:141,10:.:-0.40:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:232,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:111,12:.:-0.90:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:138,21:.:-0.25:0.998:. ./.:4:179,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:180,7:.: 0.25:1.000:. ./.:4:122,5:.:-0.83:1.000:. ./.:4:185,8:.: 0.36:1.000:. ./.:4:172,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:133,6:.:-0.61:1.000:. ./.:4:125,14:.:-0.61:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:212,12:.: 0.92:1.000:. ./.:4:135,14:.:-0.43:1.000:. ./.:4:184,7:.: 0.32:1.000:. ./.:4:295,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:118,15:.:-0.72:1.000:. ./.:4:150,8:.:-0.27:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:138,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:146,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:132,10:.:-0.56:0.999:. ./.:4:141,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,21:.:-0.51:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:199,14:.: 0.72:1.000:. ./.:4:155,9:.:-0.16:1.000:. ./.:4:147,12:.:-0.25:1.000:. ./.:4:148,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:193,8:.: 0.50:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:181,11:.: 0.34:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:173,9:.: 0.16:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:103,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:186,6:.: 0.34:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:148,8:.:-0.31:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:184,13:.: 0.43:0.999:. ./.:4:159,11:.:-0.05:1.000:. ./.:4:139,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:182,9:.: 0.32:1.000:. ./.:4:130,10:.:-0.60:1.000:. ./.:4:138,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:178,11:.: 0.29:1.000:. ./.:4:154,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:136,9:.:-0.51:1.000:. ./.:4:132,20:.:-0.38:1.000:. ./.:4:178,6:.: 0.20:1.000:. ./.:4:166,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:162,7:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,29:.:-1.23:1.000:. ./.:4:109,19:.:-0.81:1.000:. ./.:4:138,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,18:.:-0.94:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.78:0.996:. ./.:4:136,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:122,10:.:-0.74:1.000:. ./.:4:304,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:168,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:141,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,10:.:-0.96:1.000:. ./.:4:133,9:.:-0.56:1.000:. ./.:4:112,14:.:-0.85:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:151,6:.:-0.29:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:192,9:.: 0.50:1.000:. ./.:4:132,26:.:-0.27:1.000:. ./.:4:95,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:315,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:215,13:.: 0.99:1.000:. ./.:4:174,9:.: 0.18:1.000:. ./.:4:16,6:.:-2.72:1.000:. ./.:4:90,13:.:-1.26:1.000:. ./.:4:150,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:143,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:110,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:285,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:94,16:.:-1.14:0.998:. ./.:4:185,10:.: 0.40:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:89,11:.:-1.32:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:171,10:.: 0.14:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:89,15:.:-1.24:1.000:. ./.:4:122,4:.:-0.85:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:112,18:.:-0.78:1.000:. ./.:4:88,14:.:-1.28:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:147,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:123,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:91,9:.:-1.32:1.000:. ./.:4:120,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:142,26:.:-0.09:1.000:. ./.:4:177,7:.: 0.20:1.000:. ./.:4:151,10:.:-0.22:1.000:. ./.:4:166,10:.: 0.05:1.000:. ./.:4:289,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:102,28:.:-0.78:1.000:. ./.:4:71,14:.:-1.59:1.000:. ./.:4:172,4:.: 0.05:1.000:. -chr4.1 46974577 chr4.1_046974577 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:21,71:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,61:0.71:-0.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:61,26:0.29:-0.41:1.000:0.989 0/0/1/1:4:38,31:0.45:-1.06:1.000:0.978 0/0/0/1:4:81,33:0.28: 0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:69,26:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,21:0.31:-1.17:1.000:0.966 0/1/1/1:4:28,60:0.67:-0.37:1.000:0.909 0/0/1/1:4:41,49:0.54:-0.30:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,70:0.75:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,48:0.25: 3.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,14:0.22:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,44:0.59:-0.88:1.000:0.881 0/0/1/1:4:43,57:0.56: 0.06:1.000:0.959 0/0/1/1:4:41,46:0.53:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:58,22:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,50:0.49: 0.17:0.999:0.996 0/0/0/1:4:60,15:0.20:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,55:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,50:0.48: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,54:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,41:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,20:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,49:0.46: 0.32:1.000:0.986 0/1/1/1:4:35,90:0.70: 0.97:1.000:0.987 0/1/1/1:4:28,85:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,30:0.43:-1.03:1.000:0.938 0/0/0/1:4:55,23:0.29:-0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,54:0.46: 0.72:1.000:0.985 0/0/0/1:4:66,20:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,28:0.30:-0.19:1.000:0.988 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,27:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,95:0.60: 2.06:1.000:0.756 0/1/1:3:36,67:0.64: 0.17:0.999:1.000 0/0/0/1:4:63,18:0.22:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,49:0.47: 0.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,20:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,91:0.66: 1.30:1.000:0.897 0/1/1/1:4:34,74:0.67: 0.35:1.000:0.922 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,73:0.52: 1.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,37:0.30: 0.86:1.000:0.986 0/0/1/1:4:61,64:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,50:0.45: 0.50:1.000:0.975 0/0/0/1:4:73,22:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,196:0.76: 5.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,47:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,113:0.77: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,49:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:90,35:0.28: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,42:0.48:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,60:0.59: 0.10:1.000:0.884 0/0/1/1:4:44,29:0.40:-0.92:1.000:0.745 0/0/0/1:4:96,28:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,22:0.22:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,93:0.55: 2.57:1.000:0.983 0/0/1/1:4:74,70:0.49: 1.66:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:73,21:0.22:-0.16:1.000:0.823 0/0/0/1:4:61,23:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,18:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,138:0.78: 2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,34:0.21: 2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,20:0.26:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,53:0.35: 1.92:1.000:0.811 0/0/0/1:4:57,26:0.31:-0.56:1.000:0.975 0/0/1/1:4:40,46:0.53:-0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,74:0.57: 1.08:0.998:0.942 0/1/1/1:4:19,53:0.72:-0.96:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,33:0.23: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,19:0.20:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,141:0.74: 3.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,34:0.37:-0.23:1.000:0.605 0/0/1/1:4:62,62:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,96:0.78: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,25:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,43:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,68:0.52: 1.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,92:0.71: 1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,29:0.50:-1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,59:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,36:0.43:-0.56:1.000:0.952 0/0/0/1:4:59,15:0.20:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,57:0.31: 3.05:1.000:0.975 0/0/1/1:4:78,76:0.49: 2.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,32:0.44:-0.96:1.000:0.972 0/0/0/1:4:61,26:0.29:-0.41:1.000:0.989 0/0/0/1:4:78,27:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,80:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,20:0.28:-0.99:0.999:0.996 0/0/1/1:4:49,36:0.42:-0.48:1.000:0.921 0/0/1/1:4:68,53:0.44: 0.83:1.000:0.961 0/0/1/1:4:25,41:0.61:-1.17:1.000:0.674 0/0/0/1:4:100,31:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,67:0.46: 1.66:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,53:0.61:-0.48:1.000:0.649 0/0/1/1:4:61,57:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,32:0.28: 0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,70:0.69: 0.03:1.000:0.974 0/1/1/1:4:23,43:0.64:-1.17:1.000:0.681 0/0/0/1:4:71,24:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,32:0.51:-1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,87:0.74: 0.61:0.999:0.998 0/0/1/1:4:50,45:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,49:0.48: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,51:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,43:0.49:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,57:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:69,22:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,30:0.27: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,30:0.26: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,29:0.33:-0.41:0.999:0.922 0/0/0/1:4:69,25:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,16:0.26:-1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,51:0.46: 0.46:1.000:0.987 0/0/1/1:4:53,58:0.52: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,41:0.47:-0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:70,17:0.19:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,41:0.47:-0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:49,36:0.42:-0.48:1.000:0.921 0/0/1/1:4:55,45:0.45: 0.06:1.000:0.979 0/0/1/1:4:45,49:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,16:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,42:0.47:-0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:52,36:0.41:-0.37:1.000:0.846 0/0/0/1:4:64,28:0.30:-0.23:1.000:0.985 0/0/0/1:4:80,26:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,18:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,15:0.22:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,29:0.29: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,47:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,53:0.72:-0.96:0.996:0.995 0/0/1/1:4:33,34:0.51:-1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,8:0.14:-1.46:1.000:0.946 0/0/1/1:4:46,54:0.54: 0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:63,20:0.24:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,23:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,29:0.38:-0.81:1.000:0.557 0/0/0/1:4:70,18:0.20:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,50:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,34:0.43:-0.74:1.000:0.957 0/0/0/1:4:57,24:0.29:-0.63:1.000:0.991 0/0/0/1:4:59,19:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,62:0.45: 1.41:1.000:0.981 0/0/0/1:4:79,24:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,16:0.21:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,88:0.73: 0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,63:0.71:-0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:93,26:0.21: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,17:0.20:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,44:0.53:-0.59:1.000:0.991 0/0/0/1:4:47,11:0.19:-1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,24:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,55:0.55: 0.03:1.000:0.979 0/0/0/1:4:65,29:0.30:-0.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:50,51:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,18:0.22:-0.63:0.998:1.000 0/1/1/1:4:18,80:0.79:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,25:0.30:-0.63:1.000:0.981 0/0/1/1:4:33,38:0.53:-0.99:1.000:0.991 0/1/1/1:4:21,66:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,25:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:35,12:0.25:-1.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,27:0.32:-0.52:1.000:0.959 0/0/0/1:4:73,24:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,81:0.80:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,20:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,19:0.25:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,40:0.52:-0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:45,18:0.28:-1.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,64:0.80:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,26:0.33:-0.70:1.000:0.938 0/0/1/1:4:49,49:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,54:0.47: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,17:0.19:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,32:0.34:-0.19:1.000:0.864 0/0/0/1:4:69,30:0.30: 0.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:49,40:0.45:-0.34:1.000:0.978 0/0/0/1:4:80,35:0.30: 0.61:1.000:0.985 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,38:0.45:-0.52:1.000:0.981 -chr4.1 47266859 chr4.1_047266859 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:292,102:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:210,70:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,160:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:244,84:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:225,213:0.47: 1.65:1.000:0.992 0/0/0/1:4:346,104:0.22: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,95:0.49:-2.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,162:0.47: 0.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:145,147:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,111:0.53:-2.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:158,51:0.24:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:333,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:328,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,83:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,194:0.53: 0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:155,175:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,82:0.27:-0.64:0.999:0.998 0/0/0/1:4:286,92:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:329,113:0.25: 1.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:371,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,92:0.36:-1.38:1.000:0.710 0/0/0/1:4:232,102:0.30:-0.02:1.000:0.988 0/0/0/1:4:299,102:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,89:0.27:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,78:0.50:-2.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,152:0.45:-0.16:1.000:0.982 0/0/0/1:4:243,100:0.28: 0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:93,220:0.67:-0.35:1.000:0.936 0/0/0/1:4:289,113:0.27: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,158:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:194,63:0.24:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,62:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,71:0.53:-3.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:109,189:0.61:-0.60:1.000:0.696 0/0/0:3:98,16:0.14:-3.54:0.999:0.737 0/0/1/1:4:184,176:0.47: 0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:250,68:0.21:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,93:0.27: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:223,83:0.26:-0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:157,139:0.45:-0.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:275,88:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,194:0.55: 0.13:1.000:0.984 0/0/1/1:4:198,182:0.46: 0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:127,170:0.55:-0.61:1.000:0.978 0/1/1/1:4:98,316:0.73: 1.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,198:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:338,104:0.23: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,232:0.52: 1.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:154,151:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:218,79:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:255,83:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,112:0.28: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:259,94:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:457,0:0.00: 1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,170:0.52:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:168,183:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:167,175:0.49: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:295,104:0.25: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,145:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:213,104:0.32:-0.29:1.000:0.914 0/0/0/1:4:277,78:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,85:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:319,100:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,165:0.44: 0.46:1.000:0.965 0/0/1/1:4:190,178:0.47: 0.53:1.000:0.991 0/0/0/0:4:434,2:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,187:0.71:-1.35:1.000:0.993 0/0/0/0:4:327,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,183:0.53:-0.08:0.998:0.990 0/0/0/1:4:238,78:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,112:0.27: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,134:0.47:-0.95:1.000:0.992 0/0/0/1:4:231,92:0.28:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,193:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:361,1:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,163:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,306:0.74: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/0:4:374,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,94:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,172:0.48: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:185,69:0.26:-1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:298,95:0.24: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,106:0.27: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:238,85:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,234:0.72:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:301,110:0.26: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,65:0.25:-1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:232,71:0.23:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,223:0.73:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:169,174:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:275,0:0.00:-0.96:0.999:1.000 0/1/1/1:4:89,232:0.69:-0.23:1.000:0.977 0/0/1/1:4:190,211:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:190,75:0.28:-1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,262:0.71: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:245,103:0.29: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:157,148:0.47:-0.48:1.000:0.992 0/0/0/0:4:310,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,110:0.26: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,196:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,140:0.47:-0.77:1.000:0.993 0/0/0/1:4:277,93:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:263,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,185:0.46: 0.89:0.999:0.986 0/0/0/0:4:289,1:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,84:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:172,150:0.45:-0.21:1.000:0.980 0/0/1/1:4:161,179:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:498,1:0.00: 2.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:257,85:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:328,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:352,97:0.21: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,197:0.50: 0.70:0.999:0.997 0/0/0/0:4:322,1:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,110:0.47:-1.73:1.000:0.992 0/0/0/1:4:328,96:0.22: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,72:0.21:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:340,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:369,1:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,89:0.27:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:274,86:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,197:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:257,96:0.26: 0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:180,193:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:299,82:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,218:0.49: 1.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,265:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:247,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:254,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,66:0.24:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,101:0.27: 0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:161,147:0.46:-0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:129,126:0.48:-1.28:0.996:0.994 0/0/1/1:4:164,146:0.46:-0.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:138,169:0.53:-0.45:1.000:0.992 0/0/0/0:4:459,0:0.00: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,90:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,161:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,132:0.45:-0.79:1.000:0.976 0/0/0/1:4:274,97:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:281,92:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,177:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,92:0.27:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:213,76:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,101:0.23: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:355,97:0.21: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,164:0.46: 0.19:1.000:0.986 0/0/0/1:4:268,97:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:294,107:0.26: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:215,69:0.24:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:330,88:0.20: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,106:0.31:-0.05:1.000:0.974 0/0/1/1:4:94,116:0.53:-2.00:1.000:0.991 0/0/0/1:4:178,74:0.29:-1.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,141:0.46:-0.63:1.000:0.988 0/0/1/1:4:208,168:0.43: 0.65:1.000:0.952 0/1/1/1:4:110,314:0.71: 1.42:1.000:0.991 0/0/0/1:4:292,93:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,78:0.26:-0.74:0.998:0.999 0/0/1/1:4:187,158:0.44: 0.16:1.000:0.972 0/0/0/1:4:248,100:0.28: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,57:0.23:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,75:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:316,1:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,200:0.70:-1.00:1.000:0.987 0/1/1/1:4:95,288:0.72: 0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,74:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,150:0.46:-0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:237,82:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,69:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:294,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,76:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,243:0.73:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/0:4:248,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,62:0.25:-1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,185:0.51: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:302,98:0.24: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,97:0.26: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,164:0.46: 0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:284,104:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:285,113:0.28: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:131,335:0.69: 2.09:1.000:0.972 0/0/0/1:4:235,72:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,84:0.23: 0.45:1.000:1.000 -chr4.1 47510150 chr4.1_047510150 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:117,130:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,164:0.72:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,182:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,195:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,200:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,232:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,93:0.52:-1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,125:0.52: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,124:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,23:0.40:-3.08:1.000:0.774 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-3.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,255:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,188:0.79:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,133:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,95:0.49:-0.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,186:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,226:0.72: 1.19:0.999:0.994 0/0/0/1:4:156,68:0.35:-0.28:1.000:0.764 0/0/1/1:4:142,171:0.54: 1.27:1.000:0.988 0/1/1/1:4:78,207:0.71: 0.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:28,8:0.29:-3.55:1.000:0.990 0/1/1/1:4:51,183:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,202:0.73: 0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,175:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,19:0.64:-3.68:1.000:0.714 0/0/1/1:4:116,137:0.54: 0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:95,121:0.55:-0.42:1.000:0.977 0/0/1/1:4:123,130:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,207:0.71: 0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,215:0.79: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,226:0.76: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,182:0.77:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,16:0.68:-3.78:1.000:0.954 0/0/0/1:4:53,24:0.36:-2.84:1.000:0.701 0/1/1:3:9,13:0.58:-3.80:0.999:0.996 0/1/1/1:4:58,179:0.74:-0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,176:0.70: 0.07:1.000:0.989 0/1/1/1:4:75,208:0.72: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,129:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,156:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,208:0.72: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,191:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,144:0.53: 0.47:1.000:0.991 0/1/1/1:4:67,167:0.70:-0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:149,136:0.48: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:132,154:0.53: 0.80:1.000:0.991 0/0/1/1:4:118,130:0.52: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,13:0.47:-3.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,100:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,129:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,99:0.50:-0.73:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,247:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,173:0.72:-0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:55,209:0.77: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,170:0.71:-0.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:127,159:0.55: 0.80:1.000:0.981 0/1/1/1:4:69,209:0.73: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:137,123:0.48: 0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:225,75:0.31: 1.05:1.000:0.967 1/1/1/1/1/1:6:16,264:0.94: 0.70:1.000:0.881 1/1/1/1:4:0,271:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,185:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,139:0.47: 1.12:1.000:0.991 0/1/1/1:4:77,171:0.67: 0.14:1.000:0.938 0/1/1/1:4:75,219:0.73: 0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,290:0.76: 2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,126:0.56:-0.31:1.000:0.967 0/1/1/1:4:55,229:0.79: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,66:0.31: 0.44:0.998:0.969 0/1/1/1:4:48,126:0.71:-1.15:1.000:0.990 0/1/1/1:4:75,254:0.75: 1.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,98:0.58:-1.27:1.000:0.922 0/1/1/1:4:80,192:0.69: 0.56:1.000:0.973 0/0/1/1:4:131,131:0.50: 0.39:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,80:0.33: 1.07:1.000:0.938 0/0/1/1:4:111,99:0.48:-0.52:1.000:0.994 0/1/1/1:4:67,148:0.67:-0.43:1.000:0.934 0/0/1/1:4:121,156:0.56: 0.65:1.000:0.973 0/0/0/1:4:210,70:0.31: 0.70:1.000:0.967 0/1/1/1:4:46,168:0.77:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,127:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,151:0.48: 1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,104:0.53:-0.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:138,154:0.52: 0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:99,134:0.57:-0.12:1.000:0.954 0/0/1/1:4:93,113:0.54:-0.59:1.000:0.986 0/1/1/1:4:44,155:0.76:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,130:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,127:0.53:-0.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:51,179:0.76:-0.17:0.999:1.000 0/0/1/1:4:114,136:0.54: 0.18:1.000:0.989 0/0/0/1:4:254,82:0.31: 1.68:1.000:0.975 0/1/1/1:4:36,96:0.71:-1.88:1.000:0.992 0/0/1/1:4:188,162:0.47: 1.92:1.000:0.992 0/1/1/1:4:86,212:0.70: 1.01:1.000:0.980 0/0/0/1:4:165,51:0.30:-0.42:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,220:1.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,276:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,123:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,156:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,173:0.70: 0.05:1.000:0.981 0/1/1/1:4:51,149:0.73:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,122:0.50: 0.00:0.999:0.997 0/1/1/1:4:54,168:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,121:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:167,74:0.36: 0.02:1.000:0.738 0/0/0/1:4:174,68:0.34: 0.04:1.000:0.890 0/1/1/1:4:54,194:0.76: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,252:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,153:0.73:-0.61:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,324:1.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,140:0.53: 0.33:0.999:0.990 0/1/1/1:4:69,236:0.75: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,102:0.46:-0.21:1.000:0.987 0/0/1/1:4:151,137:0.48: 0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,196:0.82:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,163:0.73:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,236:0.78: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,83:0.43:-0.59:1.000:0.935 0/1/1/1:4:60,169:0.72:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,124:0.53:-0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:148,139:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,110:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,117:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,70:0.32: 0.56:1.000:0.956 0/0/1/1:4:128,130:0.50: 0.32:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,237:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,155:0.76:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,105:0.51:-0.61:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,251:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,164:0.55: 1.00:1.000:0.984 0/0/1/1:4:69,103:0.59:-1.18:0.996:0.868 0/0/1/1:4:97,121:0.55:-0.38:1.000:0.982 0/1/1/1:4:49,186:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,240:0.76: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,219:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,179:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,189:0.78:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,177:0.74:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,132:0.53: 0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:110,118:0.51:-0.21:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,177:0.99:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,294:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,113:0.48:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,179:0.74:-0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,232:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,138:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,139:0.57: 0.02:1.000:0.950 0/1/1/1:4:68,225:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,194:0.79: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,8:0.25:-3.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,122:0.54:-0.26:1.000:0.990 0/1/1/1:4:86,221:0.70: 1.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:126,122:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,154:0.55: 0.66:1.000:0.983 0/0/1/1:4:120,126:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,123:0.57:-0.47:0.998:0.949 0/0/0/1:4:156,59:0.33:-0.43:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,236:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,109:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,119:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,184:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,151:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,117:0.50:-0.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:4,239:0.98: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,108:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,181:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,177:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,181:0.80:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,146:0.77:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,121:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,141:0.53: 0.39:1.000:0.991 0/1/1/1:4:47,207:0.80: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,193:0.76: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,234:0.80: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,151:0.52: 0.82:1.000:0.995 0/1/1/1:4:68,187:0.72: 0.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,171:0.69: 0.04:1.000:0.974 0/1/1/1:4:54,198:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,161:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,165:0.61: 0.44:1.000:0.672 0/1/1/1:4:36,167:0.81:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,178:0.76:-0.21:1.000:1.000 -chr4.1 47758416 chr4.1_047758416 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:9,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.35:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.35:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:9,6:.: 0.35:1.000:. ./.:4:20,3:.: 1.86:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.78:0.999:. ./.:4:19,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:16,4:.: 1.29:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.40:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,3:.:-1.72:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.16:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.29:0.999:. ./.:4:5,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:12,5:.: 0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:7,6:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,3:.: 0.91:1.000:. ./.:4:16,4:.: 1.29:1.000:. ./.:4:13,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:6,10:.: 0.54:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:6:3,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:19,3:.: 1.67:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.35:0.998:. ./.:4:8,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,6:.: 0.91:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,4:.: 2.23:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.16:0.999:. ./.:4:7,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:18,5:.: 1.86:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,9:.: 0.91:1.000:. ./.:4:18,6:.: 2.04:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.72:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.59:0.999:. ./.:4:13,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:11,9:.: 1.29:1.000:. ./.:4:18,2:.: 1.29:0.999:. ./.:4:25,1:.: 2.42:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,4:.: 2.23:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:6,5:.:-0.40:1.000:. ./.:4:16,9:.: 2.23:1.000:. ./.:4:6,5:.:-0.40:0.996:. ./.:4:10,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,6:.: 0.35:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.78:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:16,6:.: 1.67:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,6:.: 1.86:1.000:. ./.:4:20,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,3:.: 1.10:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:18,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:23,8:.: 3.36:1.000:. ./.:4:20,9:.: 2.99:1.000:. ./.:4:19,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.59:0.998:. ./.:4:12,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:17,5:.: 1.67:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:13,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:11,9:.: 1.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:19,7:.: 2.42:1.000:. ./.:4:14,4:.: 0.91:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.40:1.000:. -chr4.1 47838711 chr4.1_047838711 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:0.999:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.49:1.000:. ./.:3:9,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:17,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:6:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.20:0.998:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:20,1:.: 2.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.75:0.999:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.: 2.30:0.999:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.39:0.996:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:0.998:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.00:1.000:. -chr4.1 48336539 chr4.1_048336539 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:588,73:.: 0.77:1.000:. ./.:4:404,138:.:-0.21:1.000:. ./.:4:503,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:409,123:.:-0.29:1.000:. ./.:4:493,164:.: 0.74:1.000:. ./.:4:492,155:.: 0.65:1.000:. ./.:4:489,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:547,80:.: 0.49:1.000:. ./.:4:578,63:.: 0.60:1.000:. ./.:4:223,40:.:-2.50:1.000:. ./.:4:169,54:.:-2.83:1.000:. ./.:4:447,148:.: 0.23:1.000:. ./.:4:475,149:.: 0.46:1.000:. ./.:4:587,66:.: 0.70:1.000:. ./.:4:433,68:.:-0.55:1.000:. ./.:4:580,87:.: 0.82:1.000:. ./.:4:501,155:.: 0.73:0.999:. ./.:4:327,211:.:-0.24:1.000:. ./.:4:743,121:.: 2.44:1.000:. ./.:4:619,91:.: 1.17:1.000:. ./.:4:211,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:537,71:.: 0.33:1.000:. ./.:4:496,134:.: 0.51:1.000:. ./.:4:516,82:.: 0.25:1.000:. ./.:4:114,18:.:-3.58:1.000:. ./.:4:582,87:.: 0.83:1.000:. ./.:4:531,75:.: 0.32:1.000:. ./.:4:566,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:453,137:.: 0.19:1.000:. ./.:4:566,85:.: 0.69:1.000:. ./.:4:559,78:.: 0.57:1.000:. ./.:4:527,73:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,16:.:-4.20:1.000:. ./.:4:278,49:.:-1.98:1.000:. ./.:3:69,4:.:-4.07:0.999:. ./.:4:489,83:.: 0.04:1.000:. ./.:4:516,60:.: 0.07:1.000:. ./.:4:593,74:.: 0.82:1.000:. ./.:4:479,163:.: 0.61:1.000:. ./.:4:677,98:.: 1.71:1.000:. ./.:4:568,54:.: 0.45:1.000:. ./.:4:427,73:.:-0.56:1.000:. ./.:4:638,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:448,53:.:-0.55:1.000:. ./.:4:578,85:.: 0.79:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:585,72:.: 0.74:1.000:. ./.:4:129,43:.:-3.25:1.000:. ./.:4:453,75:.:-0.32:1.000:. ./.:4:539,65:.: 0.30:1.000:. ./.:4:448,52:.:-0.56:1.000:. ./.:4:431,141:.: 0.04:1.000:. ./.:4:407,135:.:-0.21:1.000:. ./.:4:567,65:.: 0.53:1.000:. ./.:4:487,62:.:-0.15:1.000:. ./.:4:545,67:.: 0.37:1.000:. ./.:4:428,146:.: 0.05:1.000:. ./.:4:611,63:.: 0.88:1.000:. ./.:4:632,0:.: 0.53:1.000:. ./.:6:490,65:.:-0.10:1.000:. ./.:4:548,88:.: 0.56:1.000:. ./.:4:410,123:.:-0.28:1.000:. ./.:4:629,83:.: 1.19:1.000:. ./.:4:425,143:.: 0.00:1.000:. ./.:4:574,75:.: 0.67:1.000:. ./.:4:478,141:.: 0.42:1.000:. ./.:4:466,66:.:-0.29:1.000:. ./.:4:487,166:.: 0.70:1.000:. ./.:4:606,0:.: 0.32:0.998:. ./.:4:373,133:.:-0.51:1.000:. ./.:4:593,79:.: 0.86:1.000:. ./.:4:345,55:.:-1.38:1.000:. ./.:4:488,146:.: 0.55:1.000:. ./.:4:571,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:243,228:.:-0.79:1.000:. ./.:4:428,68:.:-0.59:1.000:. ./.:4:423,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:428,127:.:-0.10:1.000:. ./.:4:510,70:.: 0.10:1.000:. ./.:4:512,115:.: 0.49:1.000:. ./.:4:342,95:.:-1.07:1.000:. ./.:4:631,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:638,95:.: 1.36:1.000:. ./.:4:396,60:.:-0.92:1.000:. ./.:4:552,84:.: 0.56:1.000:. ./.:4:655,77:.: 1.35:1.000:. ./.:4:410,52:.:-0.87:1.000:. ./.:4:367,129:.:-0.59:1.000:. ./.:4:448,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:412,58:.:-0.80:1.000:. ./.:4:460,44:.:-0.52:0.999:. ./.:4:398,60:.:-0.90:1.000:. ./.:4:714,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:299,98:.:-1.40:1.000:. ./.:4:617,78:.: 1.05:1.000:. ./.:4:610,79:.: 1.00:1.000:. ./.:4:447,61:.:-0.49:1.000:. ./.:4:376,212:.: 0.17:1.000:. ./.:4:524,147:.: 0.85:1.000:. ./.:4:449,80:.:-0.32:1.000:. ./.:4:443,43:.:-0.67:1.000:. ./.:4:456,148:.: 0.30:1.000:. ./.:4:399,113:.:-0.46:1.000:. ./.:4:552,70:.: 0.45:0.999:. ./.:4:476,74:.:-0.14:1.000:. ./.:4:448,73:.:-0.38:1.000:. ./.:4:533,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:565,81:.: 0.65:1.000:. ./.:4:527,157:.: 0.96:1.000:. ./.:4:490,141:.: 0.52:1.000:. ./.:4:452,64:.:-0.42:1.000:. ./.:4:579,193:.: 1.68:1.000:. ./.:4:481,82:.:-0.04:0.999:. ./.:4:638,71:.: 1.16:1.000:. ./.:4:404,58:.:-0.87:1.000:. ./.:4:563,175:.: 1.40:1.000:. ./.:4:478,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:426,52:.:-0.74:1.000:. ./.:4:553,67:.: 0.43:1.000:. ./.:4:504,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:420,143:.:-0.04:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:523,74:.: 0.24:1.000:. ./.:4:565,76:.: 0.60:1.000:. ./.:4:577,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:546,77:.: 0.46:1.000:. ./.:4:697,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:424,125:.:-0.15:1.000:. ./.:4:475,79:.:-0.11:1.000:. ./.:4:419,60:.:-0.73:1.000:. ./.:4:351,116:.:-0.83:1.000:. ./.:4:526,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:398,46:.:-1.02:0.996:. ./.:4:573,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:520,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:616,177:.: 1.85:1.000:. ./.:4:555,70:.: 0.47:1.000:. ./.:4:391,124:.:-0.43:1.000:. ./.:4:322,126:.:-0.98:1.000:. ./.:4:492,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:530,76:.: 0.32:1.000:. ./.:4:567,69:.: 0.56:1.000:. ./.:4:524,71:.: 0.23:1.000:. ./.:4:353,115:.:-0.82:1.000:. ./.:4:676,71:.: 1.48:1.000:. ./.:4:523,65:.: 0.17:1.000:. ./.:4:516,78:.: 0.22:1.000:. ./.:4:359,138:.:-0.58:1.000:. ./.:4:549,76:.: 0.47:1.000:. ./.:4:521,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:610,85:.: 1.05:1.000:. ./.:4:447,127:.: 0.05:1.000:. ./.:4:185,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:401,56:.:-0.91:1.000:. ./.:4:518,151:.: 0.83:1.000:. ./.:4:592,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:618,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:619,83:.: 1.11:1.000:. ./.:4:445,45:.:-0.64:0.998:. ./.:4:517,68:.: 0.14:1.000:. ./.:4:458,137:.: 0.23:1.000:. ./.:4:387,56:.:-1.02:1.000:. ./.:4:556,63:.: 0.42:1.000:. ./.:4:504,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:593,69:.: 0.78:1.000:. ./.:4:572,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:520,74:.: 0.22:1.000:. ./.:4:411,142:.:-0.12:1.000:. ./.:4:481,72:.:-0.12:1.000:. ./.:4:508,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:416,101:.:-0.42:1.000:. ./.:4:413,56:.:-0.81:1.000:. ./.:4:461,133:.: 0.22:1.000:. ./.:4:455,76:.:-0.30:1.000:. ./.:4:376,136:.:-0.46:1.000:. ./.:4:477,62:.:-0.23:1.000:. ./.:4:643,88:.: 1.34:1.000:. ./.:4:569,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:477,168:.: 0.64:1.000:. ./.:4:602,21:.: 0.46:1.000:. ./.:4:590,90:.: 0.93:1.000:. ./.:4:759,92:.: 2.33:1.000:. ./.:4:626,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:467,53:.:-0.39:1.000:. ./.:4:386,117:.:-0.53:1.000:. -chr4.1 48609422 chr4.1_048609422 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,135:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,199:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,23:.:-2.33:1.000:. ./.:4:0,13:.:-2.55:1.000:. ./.:4:0,253:.: 2.70:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.08:0.999:. ./.:4:0,136:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,238:.: 2.37:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,187:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,221:.: 2.00:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.75:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,216:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,11:.:-2.59:1.000:. ./.:4:0,27:.:-2.24:1.000:. ./.:3:0,17:.:-2.46:0.999:. ./.:4:0,191:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1,152:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,180:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,75:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,69:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.45:1.000:. ./.:6:0,78:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,136:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,74:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.43:0.998:. ./.:4:0,176:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,79:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,83:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.23:0.999:. ./.:4:0,70:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,54:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.80:0.999:. ./.:4:0,109:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,200:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,176:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.93:0.999:. ./.:4:0,162:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,194:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.46:0.996:. ./.:4:0,96:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,227:.: 2.13:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,54:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,230:.: 2.20:1.000:. ./.:4:0,276:.: 3.20:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,185:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,30:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.82:0.998:. ./.:4:0,190:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,186:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,179:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,189:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1,147:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,194:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,188:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,217:.: 1.91:1.000:. -chr4.1 48763974 chr4.1_048763974 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:454,157:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,372:0.73:-1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:239,280:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:297,343:0.52: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:174,586:0.76: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:340,355:0.49: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:204,234:0.51:-1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:294,295:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:249,289:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,200:0.52:-2.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:233,201:0.44:-1.74:1.000:0.972 0/1/1/1:4:133,399:0.74:-0.81:1.000:0.998 0/0/0/1:4:419,149:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:677,3:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:433,170:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:449,169:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:312,358:0.51: 0.49:0.999:0.996 0/0/0/0:4:626,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:778,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:356,306:0.44: 0.41:1.000:0.970 0/0/1/1:4:332,323:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/1/1/1:4:145,464:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:345,361:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:147,459:0.74:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,193:0.58:-2.76:1.000:0.930 0/0/1/1:4:310,348:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:145,501:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:160,423:0.71:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:355,365:0.49: 0.96:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,650:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,358:0.53: 0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:230,261:0.51:-1.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,447:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:359,141:0.26:-1.12:1.000:0.999 0/0/1:3:183,36:0.15:-3.76:0.999:0.744 1/1/1/1:4:3,630:0.99: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:139,455:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:285,307:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:304,373:0.53: 0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:294,324:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:362,320:0.45: 0.60:1.000:0.979 0/1/1/1:4:148,493:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:350,441:0.54: 1.63:1.000:0.988 0/0/0/1:4:407,166:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:178,677:0.78: 2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:302,300:0.48:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:351,376:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,283:0.57:-1.32:1.000:0.936 0/0/1/1:4:272,283:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:557,269:0.31: 1.96:1.000:0.979 0/1/1/1:4:144,504:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:383,396:0.49: 1.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:254,290:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:316,365:0.52: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:269,299:0.51:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:422,159:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:147,429:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:139,592:0.80: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:284,295:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:226,385:0.61:-0.07:1.000:0.739 0/1/1/1:4:148,554:0.78: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:264,282:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:623,230:0.25: 2.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:145,604:0.80: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:455,173:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:442,325:0.40: 1.40:1.000:0.821 0/0/1/1:4:309,310:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:392,149:0.26:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:282,336:0.52: 0.00:0.998:0.994 0/1/1/1:4:133,414:0.74:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:352,450:0.54: 1.73:1.000:0.986 0/0/0/1:4:411,184:0.29:-0.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:150,610:0.79: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:312,323:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:287,355:0.53: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:254,319:0.54:-0.43:1.000:0.989 0/0/0/1:4:443,185:0.27: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:515,196:0.26: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/0:4:628,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:337,419:0.54: 1.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:251,269:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:535,198:0.25: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:652,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,250:0.48:-1.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:329,390:0.52: 0.95:1.000:0.994 0/0/0/0:4:730,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:445,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,305:0.51:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:301,309:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:270,295:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:410,150:0.25:-0.55:0.999:0.999 0/1/1/1:4:164,453:0.72:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:366,349:0.47: 0.91:1.000:0.992 0/0/1/1:4:235,236:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:333,368:0.51: 0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:147,521:0.77: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,308:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:128,433:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:375,395:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:169,546:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:325,324:0.48: 0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:339,393:0.52: 1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:395,131:0.23:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:314,361:0.52: 0.53:0.999:0.996 0/0/1/1:4:278,324:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/0:4:574,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:280,325:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:317,317:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:556,225:0.27: 1.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:258,261:0.48:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:475,171:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:442,424:0.47: 2.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:496,193:0.26: 0.67:0.999:0.999 0/0/0/1:4:455,167:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:334,118:0.24:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:344,380:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:169,460:0.72: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:309,311:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:464,189:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:430,150:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:337,322:0.47: 0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:309,395:0.54: 0.81:1.000:0.986 0/1/1/1:4:143,523:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:443,171:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:473,150:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:535,199:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:178,503:0.72: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:143,415:0.73:-0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:373,117:0.22:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,238:0.49:-1.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:274,272:0.48:-0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:396,120:0.22:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,239:0.52:-1.66:0.996:0.995 0/0/1/1:4:359,369:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:277,279:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:617,222:0.24: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:306,322:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:160,512:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:138,399:0.73:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:304,278:0.46:-0.34:1.000:0.986 0/1/1/1:4:178,590:0.75: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:549,202:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:134,438:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,314:0.53:-0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:355,418:0.52: 1.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:182,607:0.76: 1.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,653:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,292:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:471,179:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:387,173:0.29:-0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:344,382:0.51: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:252,273:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,182:0.53:-2.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:175,186:0.50:-2.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:185,532:0.73: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:290,299:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:185,563:0.74: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:709,1:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:270,243:0.45:-0.99:0.998:0.983 0/0/1/1:4:342,339:0.48: 0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:266,309:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:146,342:0.69:-1.23:1.000:0.966 0/0/0/1:4:409,139:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:468,154:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,309:0.53:-0.49:1.000:0.993 0/1/1/1:4:131,458:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:131,378:0.73:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:425,155:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:137,442:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:151,402:0.71:-0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:353,141:0.27:-1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:213,254:0.52:-1.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:456,181:0.26: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:277,249:0.45:-0.87:1.000:0.983 0/0/0/1:4:395,161:0.27:-0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:227,245:0.50:-1.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:162,541:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:173,535:0.74: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:287,322:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:283,232:0.43:-0.97:1.000:0.948 0/0/1/1:4:332,349:0.49: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/0:4:708,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:196,636:0.75: 2.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,305:0.52:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:297,323:0.50: 0.02:1.000:0.997 -chr4.1 48949656 chr4.1_048949656 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:366,110:.: 0.23:1.000:. ./.:4:203,197:.:-0.48:1.000:. ./.:4:339,129:.: 0.16:1.000:. ./.:4:264,247:.: 0.56:1.000:. ./.:4:314,274:.: 1.29:1.000:. ./.:4:409,145:.: 0.97:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:221,243:.: 0.12:1.000:. ./.:4:356,130:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,61:.:-3.35:1.000:. ./.:4:68,63:.:-3.02:1.000:. ./.:4:394,133:.: 0.71:1.000:. ./.:4:347,112:.: 0.07:1.000:. ./.:4:544,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:403,114:.: 0.62:1.000:. ./.:4:382,134:.: 0.61:1.000:. ./.:4:238,250:.: 0.34:0.999:. ./.:4:488,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:456,144:.: 1.40:1.000:. ./.:4:87,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:247,259:.: 0.51:1.000:. ./.:4:467,132:.: 1.39:1.000:. ./.:4:220,225:.:-0.06:1.000:. ./.:4:24,30:.:-3.74:1.000:. ./.:4:257,240:.: 0.43:1.000:. ./.:4:352,133:.: 0.32:1.000:. ./.:4:307,96:.:-0.46:1.000:. ./.:4:302,306:.: 1.47:1.000:. ./.:4:261,259:.: 0.65:1.000:. ./.:4:337,113:.:-0.01:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:19,13:.:-3.95:1.000:. ./.:4:113,0:.:-3.19:1.000:. ./.:3:17,3:.:-4.06:0.999:. ./.:4:248,253:.: 0.47:1.000:. ./.:4:257,230:.: 0.33:1.000:. ./.:4:396,129:.: 0.69:1.000:. ./.:4:307,133:.:-0.11:1.000:. ./.:4:226,278:.: 0.49:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:339,131:.: 0.17:1.000:. ./.:4:337,129:.: 0.14:1.000:. ./.:4:253,97:.:-0.96:1.000:. ./.:4:262,279:.: 0.84:1.000:. ./.:4:338,108:.:-0.05:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:134,171:.:-1.38:1.000:. ./.:4:258,73:.:-1.13:1.000:. ./.:4:314,108:.:-0.28:1.000:. ./.:4:274,103:.:-0.70:1.000:. ./.:4:245,263:.: 0.53:1.000:. ./.:4:261,224:.: 0.32:1.000:. ./.:4:368,135:.: 0.49:1.000:. ./.:4:224,210:.:-0.16:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:240,209:.:-0.02:1.000:. ./.:4:312,93:.:-0.44:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:228,191:.:-0.31:1.000:. ./.:4:231,278:.: 0.54:1.000:. ./.:4:328,122:.:-0.01:1.000:. ./.:4:377,123:.: 0.46:1.000:. ./.:4:187,207:.:-0.54:1.000:. ./.:4:368,115:.: 0.30:1.000:. ./.:4:412,85:.: 0.43:1.000:. ./.:4:305,123:.:-0.22:1.000:. ./.:4:352,124:.: 0.23:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.35:0.998:. ./.:4:194,210:.:-0.45:1.000:. ./.:4:351,123:.: 0.21:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:197,209:.:-0.43:1.000:. ./.:4:383,115:.: 0.44:1.000:. ./.:4:220,259:.: 0.26:1.000:. ./.:4:325,98:.:-0.27:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:378,154:.: 0.76:1.000:. ./.:4:445,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:347,145:.: 0.38:1.000:. ./.:4:292,75:.:-0.80:1.000:. ./.:4:481,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:511,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:313,99:.:-0.37:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:299,114:.:-0.36:1.000:. ./.:4:333,120:.: 0.01:1.000:. ./.:4:248,233:.: 0.28:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.33:0.999:. ./.:4:217,217:.:-0.16:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:167,186:.:-0.93:1.000:. ./.:4:405,135:.: 0.83:1.000:. ./.:4:213,292:.: 0.50:1.000:. ./.:4:301,91:.:-0.56:1.000:. ./.:4:170,217:.:-0.61:1.000:. ./.:4:253,266:.: 0.64:1.000:. ./.:4:251,256:.: 0.52:1.000:. ./.:4:228,208:.:-0.15:1.000:. ./.:4:388,149:.: 0.81:1.000:. ./.:4:271,69:.:-1.05:1.000:. ./.:4:273,290:.: 1.05:0.999:. ./.:4:263,103:.:-0.80:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:334,120:.: 0.02:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:224,252:.: 0.23:1.000:. ./.:4:421,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:293,332:.: 1.63:1.000:. ./.:4:402,124:.: 0.70:0.999:. ./.:4:472,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:389,153:.: 0.85:1.000:. ./.:4:194,273:.: 0.15:1.000:. ./.:4:317,108:.:-0.25:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:256,221:.: 0.24:1.000:. ./.:4:296,108:.:-0.45:1.000:. ./.:4:350,157:.: 0.52:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:335,145:.: 0.27:1.000:. ./.:4:271,103:.:-0.73:1.000:. ./.:4:328,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:214,259:.: 0.20:1.000:. ./.:4:365,97:.: 0.10:1.000:. ./.:4:168,174:.:-1.03:0.996:. ./.:4:409,109:.: 0.63:1.000:. ./.:4:319,92:.:-0.38:1.000:. ./.:4:465,163:.: 1.66:1.000:. ./.:4:369,125:.: 0.40:1.000:. ./.:4:208,213:.:-0.29:1.000:. ./.:4:202,238:.:-0.11:1.000:. ./.:4:271,96:.:-0.80:1.000:. ./.:4:386,106:.: 0.38:1.000:. ./.:4:373,131:.: 0.49:1.000:. ./.:4:202,218:.:-0.30:1.000:. ./.:4:180,199:.:-0.68:1.000:. ./.:4:466,132:.: 1.38:1.000:. ./.:4:494,151:.: 1.82:1.000:. ./.:4:240,219:.: 0.07:1.000:. ./.:4:215,223:.:-0.13:1.000:. ./.:4:392,136:.: 0.72:1.000:. ./.:4:339,118:.: 0.05:1.000:. ./.:4:447,135:.: 1.23:1.000:. ./.:4:289,133:.:-0.28:1.000:. ./.:4:101,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:386,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:231,285:.: 0.61:1.000:. ./.:4:418,138:.: 0.98:1.000:. ./.:4:450,146:.: 1.36:1.000:. ./.:4:566,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.70:0.998:. ./.:4:434,138:.: 1.14:1.000:. ./.:4:236,248:.: 0.31:1.000:. ./.:4:302,85:.:-0.61:1.000:. ./.:4:283,92:.:-0.72:1.000:. ./.:4:419,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:389,119:.: 0.53:1.000:. ./.:4:364,128:.: 0.38:1.000:. ./.:4:213,232:.:-0.06:1.000:. ./.:4:319,118:.:-0.14:1.000:. ./.:4:347,100:.:-0.04:1.000:. ./.:4:319,123:.:-0.09:1.000:. ./.:4:311,104:.:-0.34:1.000:. ./.:4:299,92:.:-0.57:1.000:. ./.:4:382,110:.: 0.38:1.000:. ./.:4:297,106:.:-0.46:1.000:. ./.:4:272,90:.:-0.84:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:437,131:.: 1.10:1.000:. ./.:4:383,136:.: 0.64:1.000:. ./.:4:341,133:.: 0.21:1.000:. ./.:4:312,115:.:-0.23:1.000:. ./.:4:414,136:.: 0.93:1.000:. ./.:4:656,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:472,165:.: 1.75:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:369,113:.: 0.29:1.000:. -chr4.1 49103282 chr4.1_049103282 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:178,66:.: 0.71:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:157,73:.: 0.45:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:201,92:.: 1.65:1.000:. ./.:4:57,35:.:-2.18:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:170,70:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:49,27:.:-2.48:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:132,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:146,68:.: 0.14:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:189,82:.: 1.23:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:202,68:.: 1.21:1.000:. ./.:4:215,90:.: 1.87:1.000:. ./.:4:192,78:.: 1.21:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:179,68:.: 0.77:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:181,68:.: 0.81:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.54:1.000:. ./.:3:12,9:.:-3.53:0.999:. ./.:4:251,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:289,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:145,62:.: 0.01:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:139,60:.:-0.14:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:141,60:.:-0.10:1.000:. ./.:4:136,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:169,93:.: 1.06:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:193,71:.: 1.09:1.000:. ./.:4:134,57:.:-0.29:1.000:. ./.:4:153,66:.: 0.24:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.58:1.000:. ./.:6:114,52:.:-0.77:1.000:. ./.:4:117,72:.:-0.33:1.000:. ./.:4:135,49:.:-0.43:1.000:. ./.:4:178,80:.: 0.98:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:164,75:.: 0.62:1.000:. ./.:4:264,76:.: 2.54:1.000:. ./.:4:157,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:190,78:.: 1.17:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.54:0.998:. ./.:4:186,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:237,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:100,54:.:-1.00:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:137,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:144,70:.: 0.14:1.000:. ./.:4:181,73:.: 0.90:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:179,69:.: 0.79:1.000:. ./.:4:171,61:.: 0.49:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:178,84:.: 1.06:1.000:. ./.:4:100,39:.:-1.28:1.000:. ./.:4:128,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:96,49:.:-1.17:0.999:. ./.:4:217,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:143,75:.: 0.22:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:73,46:.:-1.66:1.000:. ./.:4:150,75:.: 0.35:1.000:. ./.:4:136,55:.:-0.29:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.60:0.999:. ./.:4:146,62:.: 0.03:1.000:. ./.:4:200,68:.: 1.17:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:177,77:.: 0.90:1.000:. ./.:4:150,84:.: 0.52:1.000:. ./.:4:148,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:247,90:.: 2.48:1.000:. ./.:4:143,66:.: 0.05:0.999:. ./.:4:146,61:.: 0.01:1.000:. ./.:4:74,36:.:-1.83:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:142,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:160,80:.: 0.64:1.000:. ./.:4:143,63:.:-0.01:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:145,63:.: 0.03:1.000:. ./.:4:157,73:.: 0.45:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:104,41:.:-1.17:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:129,64:.:-0.26:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.32:0.996:. ./.:4:181,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:137,60:.:-0.18:1.000:. ./.:4:218,95:.: 2.03:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:123,71:.:-0.24:1.000:. ./.:4:105,51:.:-0.96:1.000:. ./.:4:150,58:.: 0.03:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:142,56:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,83:.: 1.09:1.000:. ./.:4:150,46:.:-0.20:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:169,70:.: 0.62:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:186,77:.: 1.08:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.60:0.998:. ./.:4:213,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:148,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:148,68:.: 0.18:1.000:. ./.:4:146,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:151,76:.: 0.39:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,72:.: 0.03:1.000:. ./.:4:138,51:.:-0.33:1.000:. ./.:4:95,64:.:-0.90:1.000:. ./.:4:120,43:.:-0.83:1.000:. ./.:4:147,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:177,76:.: 0.89:1.000:. ./.:4:114,46:.:-0.88:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:258,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:164,67:.: 0.47:1.000:. ./.:4:159,64:.: 0.32:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:191,77:.: 1.17:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:120,71:.:-0.29:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.26:1.000:. -chr4.1 49344042 chr4.1_049344042 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,0:.: 3.42:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:0.998:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:26,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.32:0.999:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:26,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:18,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:0.996:. ./.:4:2,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:18,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:0.998:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.26:1.000:. -chr4.1 49535688 chr4.1_049535688 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:94,99:0.52:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,58:0.39:-1.12:1.000:0.720 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,140:0.73:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,131:0.50: 1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,99:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:185,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,99:0.60:-0.81:1.000:0.790 0/0/0/1:4:147,39:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,33:0.57:-2.99:1.000:0.932 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:111,105:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,129:0.63: 0.00:1.000:0.535 0/0/1/1:4:117,124:0.52: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,128:0.60: 0.14:1.000:0.748 0/0/0/1:4:130,55:0.29:-0.35:1.000:0.990 0/1/1/1:4:38,176:0.80: 0.24:0.999:1.000 0/0/0/1:4:193,68:0.26: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,149:0.56: 1.29:1.000:0.967 0/0/1/1:4:177,127:0.42: 2.10:1.000:0.913 0/0/0/1:4:61,10:0.14:-2.70:1.000:0.959 0/0/1/1:4:95,109:0.54: 0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,125:0.46: 1.52:1.000:0.985 0/0/1/1:4:89,91:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-3.65:1.000:0.800 0/1/1/1:4:64,117:0.63:-0.44:1.000:0.625 0/0/1/1:4:92,90:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,180:0.76: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,29:0.16:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,106:0.54:-0.15:1.000:0.985 0/0/0/1:4:156,32:0.17:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,6:0.13:-3.22:1.000:0.885 0/0/1/1:4:36,38:0.52:-2.64:1.000:0.995 0/0/0:3:21,2:0.09:-3.69:0.999:1.000 0/0/0/1:4:164,48:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,105:0.48: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,105:0.54:-0.17:1.000:0.987 0/1/1/1:4:60,148:0.69: 0.12:1.000:0.977 0/0/1/1:4:76,85:0.53:-0.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:172,59:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,60:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,68:0.30: 0.41:1.000:0.982 0/0/0/1:4:141,57:0.28:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:167,48:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,56:0.28:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,136:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,54:0.65:-2.48:1.000:0.750 0/0/0/1:4:157,42:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,107:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,83:0.44:-0.23:1.000:0.962 0/0/1/1:4:147,138:0.49: 1.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,163:0.78: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,139:0.51: 1.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,37:0.20:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,70:0.26: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,100:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,107:0.45: 0.76:1.000:0.981 0/0/0/1:4:161,56:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:148,38:0.20:-0.33:1.000:0.924 0/0/0/1:4:181,37:0.17: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,96:0.40: 0.76:1.000:0.814 0/0/1/1:4:123,109:0.47: 0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,91:0.47:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:138,55:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:125,159:0.56: 1.69:1.000:0.970 0/0/0/1:4:123,43:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,148:0.71: 0.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:173,62:0.26: 0.68:0.998:0.999 0/0/1/1:4:80,65:0.45:-1.18:1.000:0.981 0/0/1/1:4:125,135:0.52: 1.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:143,39:0.21:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,93:0.40: 0.61:1.000:0.807 0/0/0/1:4:153,63:0.29: 0.28:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,195:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,81:0.45:-0.40:1.000:0.975 0/0/0/1:4:184,62:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,141:0.73:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,123:0.55: 0.43:1.000:0.979 0/0/1/1:4:121,104:0.47: 0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,69:0.47:-1.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:215,74:0.25: 1.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,123:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,91:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,65:0.29: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:119,126:0.52: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,76:0.47:-0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:129,90:0.41: 0.35:1.000:0.879 0/0/0/1:4:139,57:0.29:-0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,98:0.54:-0.46:1.000:0.985 0/0/1/1:4:137,108:0.44: 0.88:0.999:0.973 0/0/0/1:4:150,33:0.18:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,59:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,125:0.78:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,62:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,79:0.40:-0.11:1.000:0.809 0/0/1/1:4:99,88:0.47:-0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:48,132:0.71:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,120:0.52: 0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:160,34:0.17:-0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:126,41:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,120:0.44: 1.48:1.000:0.968 0/1/1/1:4:32,106:0.74:-1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,108:0.51: 0.24:0.999:0.996 0/0/1/1:4:115,70:0.38:-0.35:1.000:0.549 0/0/1/1:4:104,108:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:169,44:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,99:0.55:-0.44:1.000:0.983 0/0/1/1:4:148,161:0.52: 2.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,99:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,97:0.45: 0.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:119,122:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,66:0.34:-0.15:0.999:0.889 0/0/1/1:4:123,115:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,62:0.34:-0.40:1.000:0.887 0/1/1/1:4:76,170:0.67: 0.90:1.000:0.937 0/0/1/1:4:87,106:0.55:-0.19:1.000:0.981 0/0/1/1:4:136,111:0.45: 0.92:1.000:0.982 0/0/1/1:4:129,114:0.47: 0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:152,40:0.20:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,177:0.82: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,61:0.32:-0.29:1.000:0.948 0/0/1/1:4:153,124:0.45: 1.54:1.000:0.981 0/0/0/1:4:147,51:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,40:0.19:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,124:0.53: 0.72:1.000:0.994 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,91:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,72:0.44:-0.79:1.000:0.970 0/0/0/1:4:104,31:0.22:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,95:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,99:0.58:-0.70:1.000:0.896 0/0/1/1:4:46,54:0.54:-2.11:0.996:0.987 0/0/0/1:4:140,55:0.28:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,188:0.69: 1.29:1.000:0.975 0/0/1/1:4:113,101:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,88:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,93:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,114:0.55: 0.08:1.000:0.978 0/0/1/1:4:144,102:0.42: 0.90:1.000:0.898 0/0/1/1:4:75,103:0.57:-0.50:1.000:0.933 0/0/0/1:4:122,41:0.25:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,62:0.41:-1.05:1.000:0.877 0/0/0/1:4:243,73:0.23: 2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,121:0.44: 1.56:1.000:0.964 0/0/0/1:4:145,59:0.29: 0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,92:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,144:0.57: 0.99:1.000:0.940 0/0/1/1:4:89,87:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,128:0.58: 0.37:1.000:0.924 0/0/1/1:4:120,103:0.47: 0.43:1.000:0.991 0/0/0/1:4:63,22:0.25:-2.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,107:0.48: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,108:0.47: 0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:166,57:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:258,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,119:0.51: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,120:0.58: 0.06:0.998:0.912 0/0/1/1:4:117,111:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,92:0.52:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:106,98:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,87:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,109:0.47: 0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:117,56:0.32:-0.60:1.000:0.950 0/0/0/0:4:187,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,27:0.15:-0.64:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,97:0.56:-0.60:1.000:0.969 0/0/0/1:4:181,45:0.19: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,31:0.15: 0.02:1.000:0.987 0/1/1/1:4:47,132:0.72:-0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,46:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,176:0.73: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,50:0.28:-0.58:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,127:0.74:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,49:0.27:-0.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:153,57:0.27: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:143,95:0.40: 0.74:1.000:0.793 0/0/1/1:4:125,118:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/0:4:170,15:0.08:-0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:89,108:0.55:-0.11:1.000:0.982 0/0/1/1:4:139,156:0.53: 1.91:1.000:0.992 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,58:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,123:0.48: 1.17:1.000:0.995 -chr4.1 49906387 chr4.1_049906387 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:262,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:190,90:.: 0.57:1.000:. ./.:4:224,98:.: 1.30:1.000:. ./.:4:208,87:.: 0.83:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:40,12:.:-3.39:1.000:. ./.:4:183,78:.: 0.24:1.000:. ./.:4:194,84:.: 0.54:1.000:. ./.:4:205,66:.: 0.41:1.000:. ./.:4:199,72:.: 0.41:1.000:. ./.:4:150,77:.:-0.35:1.000:. ./.:4:205,83:.: 0.71:0.999:. ./.:4:188,80:.: 0.36:1.000:. ./.:4:242,107:.: 1.77:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:49,6:.:-3.33:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:235,80:.: 1.18:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.:-3.63:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:204,78:.: 0.61:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:161,81:.:-0.09:1.000:. ./.:4:149,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:15,0:.:-4.03:1.000:. ./.:4:46,39:.:-2.81:1.000:. ./.:3:59,0:.:-3.26:0.999:. ./.:4:265,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:196,81:.: 0.52:1.000:. ./.:4:201,92:.: 0.80:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:167,89:.: 0.15:1.000:. ./.:4:198,70:.: 0.36:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:184,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:214,90:.: 0.99:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:226,83:.: 1.07:1.000:. ./.:4:163,86:.: 0.03:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:164,73:.:-0.18:1.000:. ./.:4:181,55:.:-0.19:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.26:1.000:. ./.:6:184,20:.:-0.75:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:179,55:.:-0.23:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:170,71:.:-0.11:1.000:. ./.:4:222,80:.: 0.95:1.000:. ./.:4:267,68:.: 1.53:1.000:. ./.:4:132,70:.:-0.78:1.000:. ./.:4:183,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.26:0.998:. ./.:4:286,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:222,84:.: 1.02:1.000:. ./.:4:130,62:.:-0.96:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,147:.: 0.94:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:167,67:.:-0.23:1.000:. ./.:4:178,84:.: 0.26:1.000:. ./.:4:200,89:.: 0.73:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:178,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:236,90:.: 1.37:1.000:. ./.:4:170,72:.:-0.09:1.000:. ./.:4:172,71:.:-0.07:1.000:. ./.:4:226,85:.: 1.11:1.000:. ./.:4:157,49:.:-0.71:1.000:. ./.:4:187,64:.: 0.07:1.000:. ./.:4:198,75:.: 0.45:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:140,85:.:-0.38:0.999:. ./.:4:230,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:167,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:205,94:.: 0.90:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:188,66:.: 0.12:1.000:. ./.:4:222,56:.: 0.54:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:191,78:.: 0.38:1.000:. ./.:4:154,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:237,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:181,80:.: 0.24:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:238,78:.: 1.20:1.000:. ./.:4:188,83:.: 0.41:1.000:. ./.:4:194,73:.: 0.35:1.000:. ./.:4:239,89:.: 1.40:1.000:. ./.:4:172,78:.: 0.05:0.999:. ./.:4:186,71:.: 0.17:1.000:. ./.:4:135,54:.:-1.01:1.000:. ./.:4:229,90:.: 1.25:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:194,69:.: 0.28:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:213,78:.: 0.76:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:171,87:.: 0.19:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:203,89:.: 0.78:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:142,58:.:-0.82:1.000:. ./.:4:139,40:.:-1.18:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:164,63:.:-0.35:1.000:. ./.:4:176,77:.: 0.10:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.39:0.996:. ./.:4:280,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:258,94:.: 1.82:1.000:. ./.:4:209,105:.: 1.16:1.000:. ./.:4:175,70:.:-0.04:1.000:. ./.:4:153,49:.:-0.78:1.000:. ./.:4:183,57:.:-0.12:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:190,82:.: 0.43:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:118,65:.:-1.11:1.000:. ./.:4:245,83:.: 1.40:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:188,69:.: 0.17:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:227,105:.: 1.47:1.000:. ./.:4:180,72:.: 0.09:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:128,45:.:-1.29:1.000:. ./.:4:182,81:.: 0.28:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:195,99:.: 0.81:1.000:. ./.:4:187,71:.: 0.19:0.998:. ./.:4:274,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:161,82:.:-0.07:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,79:.: 0.66:1.000:. ./.:4:149,60:.:-0.66:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:181,90:.: 0.41:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:154,70:.:-0.40:1.000:. ./.:4:130,57:.:-1.04:1.000:. ./.:4:197,66:.: 0.28:1.000:. ./.:4:189,72:.: 0.24:1.000:. ./.:4:146,72:.:-0.50:1.000:. ./.:4:147,79:.:-0.37:1.000:. ./.:4:185,85:.: 0.40:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:187,73:.: 0.22:1.000:. ./.:4:225,9:.:-0.23:1.000:. ./.:4:186,82:.: 0.36:1.000:. ./.:4:226,81:.: 1.04:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:143,65:.:-0.68:1.000:. ./.:4:200,79:.: 0.55:1.000:. -chr4.1 50257785 chr4.1_050257785 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:189,54:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,113:0.53:-0.37:1.000:0.991 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,139:0.53: 0.76:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,221:0.76: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,216:0.72: 1.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,46:0.27:-1.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,55:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,105:0.46:-0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:65,29:0.29:-2.85:1.000:0.989 0/0/1/1:4:60,67:0.50:-2.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,121:0.53:-0.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:96,123:0.54:-0.01:1.000:0.988 0/0/0/1:4:163,53:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,50:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,66:0.23: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,129:0.49: 0.72:0.999:0.996 0/0/0/1:4:169,60:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:239,60:0.19: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,82:0.26: 1.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:90,30:0.24:-2.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,54:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,189:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,53:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,39:0.38:-2.76:1.000:0.566 0/0/0/1:4:152,62:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,161:0.50: 1.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,57:0.22: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,115:0.44: 0.72:1.000:0.962 0/0/1/1:4:142,193:0.55: 2.63:1.000:0.976 0/0/0/1:4:206,72:0.25: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,114:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,44:0.55:-3.24:1.000:0.981 0/0/1/1:4:43,71:0.60:-2.40:1.000:0.777 0/0/1:3:47,33:0.39:-3.17:0.999:0.999 0/0/1/1:4:106,107:0.48:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:131,53:0.27:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:177,64:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:81,186:0.68: 1.08:1.000:0.947 0/0/0/1:4:195,72:0.26: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,121:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,107:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:197,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,38:0.19:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,150:0.55: 1.01:1.000:0.984 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,120:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:163,57:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,111:0.56:-0.62:1.000:0.973 0/0/0/1:4:148,64:0.29:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,112:0.56:-0.62:1.000:0.965 0/0/1/1:4:111,150:0.55: 0.95:1.000:0.977 0/0/1/1:4:97,111:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,63:0.27:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,59:0.26:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,118:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,185:0.76: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,133:0.55: 0.31:1.000:0.981 0/0/0/1:4:185,45:0.19: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:139,66:0.31:-0.33:1.000:0.893 0/0/0/1:4:169,58:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,164:0.79:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,58:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,191:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,59:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,124:0.38: 2.04:1.000:0.607 0/0/1/1:4:75,77:0.48:-1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,92:0.41:-0.12:1.000:0.866 0/0/0/1:4:187,71:0.26: 0.88:0.998:0.999 0/0/1/1:4:86,93:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,62:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,78:0.54:-1.85:1.000:0.986 0/0/1/1:4:100,134:0.55: 0.33:1.000:0.980 0/0/0/0:4:214,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,215:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,118:0.46: 0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:104,109:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,136:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,63:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,133:0.53: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,86:0.49:-1.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,67:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,100:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,140:0.48: 1.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:175,71:0.28: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,44:0.23:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,151:0.77:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,121:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,73:0.32: 0.01:1.000:0.962 0/0/0/1:4:165,46:0.21:-0.19:0.999:1.000 0/0/1/1:4:95,114:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:181,54:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,78:0.49:-1.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,129:0.51: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:174,61:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,110:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,162:0.75:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,135:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,139:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,37:0.24:-1.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,183:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,97:0.56:-1.22:1.000:0.964 0/0/0/1:4:132,55:0.28:-0.74:0.999:0.995 0/0/0/1:4:130,48:0.26:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,41:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,46:0.23:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,132:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,62:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,86:0.43:-0.67:1.000:0.952 0/0/0/1:4:144,61:0.28:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:156,161:0.48: 2.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,62:0.27: 0.08:0.999:0.998 0/0/0/1:4:159,48:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,161:0.75:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,192:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,59:0.36:-1.42:1.000:0.705 0/0/0/1:4:125,54:0.29:-0.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:146,66:0.30:-0.17:1.000:0.988 0/0/0/0:4:172,1:0.01:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,125:0.54: 0.10:1.000:0.990 0/0/0/0:4:193,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,91:0.45:-0.56:1.000:0.975 0/0/1/1:4:130,150:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:201,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,122:0.49: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,66:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,97:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:132,40:0.22:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,61:0.29:-0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:99,108:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,66:0.26: 0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:138,39:0.21:-0.97:0.996:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-2.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,173:0.53: 2.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:166,67:0.27: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,155:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,158:0.73:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:151,59:0.27:-0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,100:0.48:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,51:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,60:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,99:0.52:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:186,82:0.29: 1.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:112,140:0.53: 0.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:111,115:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,111:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:228,70:0.22: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,70:0.30: 0.10:1.000:0.987 0/0/0/1:4:209,66:0.23: 1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,173:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,31:0.33:-2.97:1.000:0.911 0/0/1/1:4:81,95:0.52:-0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,181:0.72: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:236,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,63:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,70:0.30: 0.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:109,128:0.52: 0.40:0.998:0.995 0/0/1/1:4:127,117:0.46: 0.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:113,117:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,74:0.45:-1.42:1.000:0.980 0/0/0/1:4:155,48:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,59:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,118:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:149,67:0.30:-0.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:153,62:0.28:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,128:0.52: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:119,105:0.45: 0.10:1.000:0.977 0/0/1/1:4:122,128:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,116:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,48:0.27:-1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,122:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,112:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,123:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,112:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,160:0.48: 2.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,108:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,172:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:205,17:0.07: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:197,66:0.24: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,79:0.26: 1.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:213,95:0.29: 2.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:86,96:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,122:0.55:-0.17:1.000:0.977 -chr4.1 50765134 chr4.1_050765134 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:559,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:526,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:541,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:455,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:477,1:.: 0.32:0.999:. ./.:4:492,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:371,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:450,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:239,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:534,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:223,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.00:1.000:. ./.:3:223,1:.:-2.84:0.999:. ./.:4:469,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:502,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:399,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:528,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:607,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:107,0:.:-4.29:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:495,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:461,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:574,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:434,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:539,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:617,1:.: 2.06:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.09:1.000:. ./.:6:436,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:543,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:595,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:276,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.71:0.998:. ./.:4:516,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:555,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:333,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:577,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:544,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:366,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:474,3:.: 0.31:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:397,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:458,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:514,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:347,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:480,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.95:0.999:. ./.:4:470,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:342,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:435,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:394,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:356,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:356,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:482,1:.: 0.38:0.999:. ./.:4:397,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:454,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:571,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:459,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:600,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:527,1:.: 0.94:0.999:. ./.:4:435,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:371,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:474,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:429,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:485,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:600,2:.: 1.86:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:372,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:348,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:301,0:.:-1.88:0.996:. ./.:4:451,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:545,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:380,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:525,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:604,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:666,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:394,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:344,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:544,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:383,1:.:-0.85:0.998:. ./.:4:521,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:364,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:408,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:363,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:362,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:347,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:371,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:363,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:340,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:460,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:459,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:453,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:538,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:566,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:366,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.21:1.000:. -chr4.1 50978420 chr4.1_050978420 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:103,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.23:0.999:. ./.:4:115,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.57:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.25:0.999:. ./.:4:110,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.01:1.000:. ./.:6:84,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.98:0.998:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:68,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:77,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:176,0:.: 2.85:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.14:0.999:. ./.:4:109,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:0.996:. ./.:4:77,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:179,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:156,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.79:0.998:. ./.:4:74,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.06:1.000:. -chr4.1 51046614 chr4.1_051046614 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:150,188:.: 1.93:1.000:. ./.:4:109,102:.: 0.26:1.000:. ./.:4:89,54:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.87:1.000:. ./.:4:72,59:.:-0.79:1.000:. ./.:4:109,106:.: 0.32:1.000:. ./.:4:111,153:.: 0.96:1.000:. ./.:4:9,19:.:-2.13:1.000:. ./.:4:0,34:.:-2.06:1.000:. ./.:4:0,108:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.50:1.000:. ./.:4:154,175:.: 1.81:1.000:. ./.:4:112,135:.: 0.73:1.000:. ./.:4:132,139:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.55:0.999:. ./.:4:163,110:.: 1.07:1.000:. ./.:4:189,184:.: 2.38:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.16:1.000:. ./.:4:23,22:.:-1.91:1.000:. ./.:4:0,110:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,278:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,110:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,16:.:-2.09:1.000:. ./.:4:93,81:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.79:1.000:. ./.:4:136,60:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,99:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,108:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.41:1.000:. ./.:4:17,35:.:-1.82:1.000:. ./.:3:1,15:.:-2.29:0.999:. ./.:4:0,135:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.55:1.000:. ./.:4:96,87:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.82:1.000:. ./.:4:92,52:.:-0.61:1.000:. ./.:4:102,89:.: 0.00:1.000:. ./.:4:127,144:.: 1.05:1.000:. ./.:4:120,57:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.13:1.000:. ./.:4:177,155:.: 1.85:1.000:. ./.:4:118,140:.: 0.88:1.000:. ./.:4:108,147:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.12:1.000:. ./.:4:160,149:.: 1.55:1.000:. ./.:4:83,141:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.71:1.000:. ./.:4:107,95:.: 0.14:1.000:. ./.:6:32,97:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.22:1.000:. ./.:4:118,126:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,96:.:-1.24:1.000:. ./.:4:70,132:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.16:1.000:. ./.:4:65,87:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.08:1.000:. ./.:4:95,91:.:-0.06:0.998:. ./.:4:113,94:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.26:1.000:. ./.:4:100,116:.: 0.33:1.000:. ./.:4:99,92:.: 0.00:1.000:. ./.:4:123,82:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.29:1.000:. ./.:4:94,124:.: 0.35:1.000:. ./.:4:109,136:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.51:1.000:. ./.:4:120,154:.: 1.09:1.000:. ./.:4:124,158:.: 1.19:1.000:. ./.:4:75,84:.:-0.42:1.000:. ./.:4:118,107:.: 0.45:1.000:. ./.:4:126,157:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.60:1.000:. ./.:4:115,86:.: 0.13:1.000:. ./.:4:135,186:.: 1.70:1.000:. ./.:4:102,153:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.28:1.000:. ./.:4:112,124:.: 0.59:1.000:. ./.:4:134,128:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.84:0.999:. ./.:4:119,111:.: 0.51:1.000:. ./.:4:126,123:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.69:1.000:. ./.:4:136,124:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.23:1.000:. ./.:4:111,132:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.28:1.000:. ./.:4:139,133:.: 1.06:1.000:. ./.:4:74,72:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.56:1.000:. ./.:4:105,115:.: 0.38:0.999:. ./.:4:0,124:.:-0.88:1.000:. ./.:4:108,123:.: 0.52:1.000:. ./.:4:94,90:.:-0.09:1.000:. ./.:4:131,146:.: 1.13:1.000:. ./.:4:214,250:.: 3.58:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,125:.: 0.69:0.999:. ./.:4:0,176:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.92:1.000:. ./.:4:100,86:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.09:1.000:. ./.:4:128,69:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,159:.: 1.14:1.000:. ./.:4:102,103:.: 0.18:1.000:. ./.:4:135,171:.: 1.51:1.000:. ./.:4:111,61:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.84:1.000:. ./.:4:96,68:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,74:.:-0.29:0.996:. ./.:4:118,63:.:-0.13:1.000:. ./.:4:142,74:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,336:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,105:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.29:1.000:. ./.:4:113,121:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,200:.: 0.12:1.000:. ./.:4:188,207:.: 2.67:1.000:. ./.:4:132,141:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,26:.:-2.07:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.05:1.000:. ./.:4:159,76:.: 0.58:1.000:. ./.:4:168,84:.: 0.80:1.000:. ./.:4:152,173:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.65:0.998:. ./.:4:163,181:.: 2.00:1.000:. ./.:4:1,186:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.43:1.000:. ./.:4:107,118:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.37:1.000:. ./.:4:151,142:.: 1.34:1.000:. ./.:4:177,91:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.26:1.000:. ./.:4:254,133:.: 2.57:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.12:1.000:. ./.:4:127,124:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.50:1.000:. ./.:4:143,64:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.69:1.000:. ./.:4:177,202:.: 2.46:1.000:. ./.:4:181,99:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.73:1.000:. ./.:4:134,141:.: 1.10:1.000:. -chr4.1 51421231 chr4.1_051421231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:419,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:136,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:398,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.74:0.999:. ./.:4:297,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:418,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:101,0:.:-0.63:1.000:. ./.:3:67,0:.:-0.94:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:335,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:404,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.76:1.000:. ./.:6:102,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.79:0.998:. ./.:4:187,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:396,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:202,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:226,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.97:0.999:. ./.:4:123,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:402,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.72:0.999:. ./.:4:146,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:307,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.17:0.996:. ./.:4:271,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:283,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.02:0.998:. ./.:4:338,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:423,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.29:1.000:. -chr4.1 51466346 chr4.1_051466346 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:132,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:108,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:59,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:192,1:.: 2.38:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:161,2:.: 1.69:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.42:1.000:. ./.:3:28,0:.:-1.37:0.999:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.24:1.000:. ./.:6:43,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.42:0.998:. ./.:4:47,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:109,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.57:0.999:. ./.:4:118,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:30,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:181,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:43,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.46:0.996:. ./.:4:130,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:177,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:94,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:208,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.11:0.998:. ./.:4:229,0:.: 3.19:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:186,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:241,0:.: 3.46:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.91:1.000:. -chr4.1 51781234 chr4.1_051781234 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:177,40:.: 0.30:1.000:. ./.:4:157,31:.:-0.29:1.000:. ./.:4:164,30:.:-0.17:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:111,17:.:-1.52:1.000:. ./.:4:170,34:.: 0.03:1.000:. ./.:4:155,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:49,7:.:-2.99:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:189,41:.: 0.56:1.000:. ./.:4:148,24:.:-0.62:1.000:. ./.:4:181,36:.: 0.30:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.57:0.999:. ./.:4:158,43:.:-0.03:1.000:. ./.:4:233,48:.: 1.61:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:105,3:.:-1.93:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,11:.:-3.15:1.000:. ./.:4:193,43:.: 0.69:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:174,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:52,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:75,24:.:-2.11:1.000:. ./.:3:21,3:.:-3.64:0.999:. ./.:4:236,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:205,29:.: 0.65:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:155,34:.:-0.27:1.000:. ./.:4:164,42:.: 0.07:1.000:. ./.:4:173,37:.: 0.16:1.000:. ./.:4:187,53:.: 0.77:1.000:. ./.:4:241,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:26,14:.:-3.32:1.000:. ./.:4:136,25:.:-0.84:1.000:. ./.:4:107,13:.:-1.68:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:146,36:.:-0.42:1.000:. ./.:4:169,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:179,38:.: 0.30:1.000:. ./.:6:139,19:.:-0.91:1.000:. ./.:4:225,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:172,34:.: 0.07:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:192,31:.: 0.42:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:141,26:.:-0.72:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:156,29:.:-0.35:0.998:. ./.:4:121,33:.:-0.99:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:156,18:.:-0.58:1.000:. ./.:4:193,29:.: 0.40:1.000:. ./.:4:166,37:.: 0.01:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:148,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:136,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:198,33:.: 0.59:1.000:. ./.:4:175,41:.: 0.28:1.000:. ./.:4:134,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:179,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:197,47:.: 0.85:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:204,32:.: 0.69:1.000:. ./.:4:166,29:.:-0.15:1.000:. ./.:4:120,21:.:-1.25:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:144,38:.:-0.42:1.000:. ./.:4:138,39:.:-0.52:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.03:0.999:. ./.:4:145,24:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,44:.: 0.97:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:188,36:.: 0.44:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:129,28:.:-0.93:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:160,38:.:-0.09:1.000:. ./.:4:144,25:.:-0.68:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:154,45:.:-0.07:0.999:. ./.:4:174,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:128,31:.:-0.89:1.000:. ./.:4:173,35:.: 0.12:1.000:. ./.:4:140,36:.:-0.54:1.000:. ./.:4:194,40:.: 0.65:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:323,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:182,42:.: 0.44:0.999:. ./.:4:215,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:133,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:169,40:.: 0.14:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:165,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:136,38:.:-0.58:1.000:. ./.:4:182,45:.: 0.50:1.000:. ./.:4:161,31:.:-0.21:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:144,21:.:-0.76:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:97,30:.:-1.54:0.996:. ./.:4:122,25:.:-1.13:1.000:. ./.:4:144,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:121,41:.:-0.82:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:185,32:.: 0.30:1.000:. ./.:4:146,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:54,19:.:-2.64:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:175,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:199,37:.: 0.69:1.000:. ./.:4:156,36:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.05:0.998:. ./.:4:180,33:.: 0.22:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:163,33:.:-0.13:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:153,26:.:-0.48:1.000:. ./.:4:169,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:110,84:.:-0.17:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:170,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:176,41:.: 0.30:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:260,52:.: 2.24:1.000:. ./.:4:212,56:.: 1.34:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:148,41:.:-0.27:1.000:. -chr4.1 51969812 chr4.1_051969812 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:136,270:0.64: 0.98:1.000:0.696 0/0/0/1:4:247,80:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:238,178:0.42: 1.08:1.000:0.920 0/0/0/1:4:303,106:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:349,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,106:0.36:-0.26:1.000:0.637 0/1/1/1:4:67,142:0.65:-1.09:1.000:0.824 0/0/1/1:4:260,188:0.41: 1.42:1.000:0.884 0/0/1/1:4:114,169:0.58:-0.32:1.000:0.918 0/0/1/1:4:44,36:0.44:-2.45:1.000:0.971 0/0/0/1:4:85,28:0.25:-2.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:292,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,199:0.48: 1.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:96,272:0.71: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:243,156:0.39: 0.90:1.000:0.647 0/0/1/1:4:257,190:0.42: 1.41:1.000:0.909 0/0/0/1:4:353,109:0.24: 1.56:0.999:1.000 0/0/1/1:4:217,179:0.44: 0.87:1.000:0.974 0/1/1/1:4:139,354:0.69: 1.89:1.000:0.972 0/0/1/1:4:217,238:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,52:0.63:-2.45:1.000:0.523 0/0/0/1:4:275,74:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,102:0.36:-0.33:1.000:0.709 0/0/0/1:4:335,86:0.21: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,32:0.43:-2.52:1.000:0.950 0/0/1/1:4:247,209:0.45: 1.50:1.000:0.980 0/0/0/1:4:169,78:0.31:-0.69:1.000:0.966 0/0/0/1:4:223,95:0.30: 0.05:1.000:0.987 0/0/0/1:4:361,101:0.22: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:354,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:365,112:0.24: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,93:0.30:-0.10:1.000:0.980 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-2.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,62:0.61:-2.26:1.000:0.678 0/1/1:3:16,34:0.65:-2.76:0.999:1.000 0/0/0/0:4:320,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:356,101:0.22: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,90:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,110:0.25: 1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:276,211:0.43: 1.83:1.000:0.937 0/0/0/1:4:155,67:0.30:-0.96:1.000:0.984 0/0/0/0:4:287,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,190:0.42: 1.43:1.000:0.901 0/0/1/1:4:232,156:0.40: 0.79:1.000:0.762 0/0/0/1:4:242,79:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,158:0.39: 0.96:1.000:0.648 0/0/0/1:4:200,107:0.35:-0.06:1.000:0.829 0/0/1/1:4:54,61:0.52:-2.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,157:0.60:-0.61:1.000:0.824 0/1/1/1:4:79,311:0.76: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,68:0.33:-1.16:1.000:0.909 0/0/0/1:4:355,92:0.21: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,59:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,168:0.46: 0.48:1.000:0.987 0/0/1/1:4:216,168:0.43: 0.75:1.000:0.948 0/0/1/1:4:114,198:0.61:-0.01:1.000:0.657 0/0/0/0:4:239,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,85:0.32:-0.47:1.000:0.964 0/1/1/1:4:89,165:0.63:-0.62:1.000:0.518 0/0/0/0/1/1:6:170,84:0.33:-0.62:1.000:0.921 0/0/0/1:4:277,60:0.18: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,80:0.35:-0.90:1.000:0.798 0/1/1/1:4:77,282:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:289,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:239,192:0.44: 1.24:1.000:0.964 0/0/0/1:4:272,153:0.36: 1.18:1.000:0.727 0/0/0/1:4:163,40:0.20:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,154:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,157:0.63:-0.75:0.998:0.508 0/0/0/1:4:233,66:0.22:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,94:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,133:0.62:-1.11:1.000:0.567 0/0/0/1:4:289,116:0.29: 0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:243,164:0.40: 0.99:1.000:0.770 0/0/0/0:4:321,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,175:0.62:-0.41:1.000:0.611 0/0/1/1:4:89,162:0.62:-0.65:1.000:0.532 0/0/1/1:4:125,134:0.51:-0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,229:0.71:-0.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:110,154:0.57:-0.52:1.000:0.955 0/0/0/1:4:197,66:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,201:0.67:-0.24:1.000:0.903 0/1/1/1:4:95,267:0.71: 0.51:1.000:0.990 0/0/0/1:4:151,65:0.30:-1.02:1.000:0.985 0/0/0/1:4:218,89:0.29:-0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:87,239:0.70: 0.14:1.000:0.987 0/1/1/1:4:78,169:0.66:-0.69:1.000:0.856 0/0/0/1:4:138,72:0.34:-1.08:1.000:0.868 0/0/0/1:4:158,68:0.30:-0.91:1.000:0.985 0/0/1/1:4:242,159:0.39: 0.92:1.000:0.708 0/0/1/1:4:134,131:0.48:-0.50:0.999:0.996 0/0/0/1:4:203,67:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,141:0.55:-0.66:1.000:0.981 0/0/0/1:4:201,54:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,80:0.28:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:292,97:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,111:0.62:-1.48:1.000:0.533 0/0/0/0:4:280,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,82:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,76:0.26:-0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:141,122:0.46:-0.53:1.000:0.985 0/0/0/1:4:201,81:0.29:-0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,97:0.48:-1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:168,125:0.42:-0.21:0.999:0.915 0/0/1/1:4:124,118:0.48:-0.75:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,217:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,142:0.61:-0.95:1.000:0.633 0/0/1/1:4:132,180:0.56:-0.01:1.000:0.966 0/1/1/1:4:110,305:0.70: 1.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:300,77:0.21: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,146:0.54:-0.49:1.000:0.990 0/0/0/1:4:432,149:0.26: 2.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:183,117:0.39:-0.14:0.999:0.636 0/0/1/1:4:137,148:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,61:0.35:-1.47:1.000:0.797 0/0/0/1:4:162,94:0.36:-0.60:1.000:0.647 0/0/0/1:4:236,73:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,157:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,117:0.46:-0.66:1.000:0.987 0/1/1/1:4:58,201:0.74:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:249,80:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,133:0.41: 0.08:1.000:0.855 0/0/1/1:4:157,97:0.38:-0.62:1.000:0.537 0/1/1/1:4:103,200:0.64:-0.11:1.000:0.642 0/1/1/1:4:78,214:0.70:-0.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:102,171:0.61:-0.42:1.000:0.739 0/0/0/1:4:192,58:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:268,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,102:0.45:-0.97:1.000:0.983 0/1/1/1:4:68,129:0.63:-1.22:1.000:0.581 0/0/0/1:4:239,79:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:363,92:0.20: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,80:0.36:-0.97:0.996:0.706 0/0/1/1:4:186,138:0.42: 0.11:1.000:0.912 0/0/1/1:4:178,136:0.43: 0.01:1.000:0.937 0/0/1/1:4:192,237:0.54: 1.22:1.000:0.988 0/0/0/1:4:284,81:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,71:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,75:0.36:-1.13:1.000:0.663 0/0/1/1:4:158,104:0.39:-0.54:1.000:0.712 0/0/0/1:4:302,91:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,49:0.21:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:379,108:0.22: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,109:0.32: 0.31:1.000:0.962 0/0/0/0:4:371,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:325,66:0.17: 0.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:103,274:0.70: 0.67:1.000:0.982 0/1/1/1:4:99,229:0.67: 0.16:1.000:0.924 0/0/0/1:4:388,111:0.22: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,98:0.33:-0.15:1.000:0.937 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:114,78:0.40:-1.27:1.000:0.797 0/0/0/0:4:370,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,183:0.44: 1.04:1.000:0.962 0/0/0/1:4:287,92:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,281:0.71: 0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:142,85:0.37:-0.90:0.998:0.558 0/1/1/1:4:106,213:0.64: 0.06:1.000:0.723 0/0/0/1:4:300,81:0.21: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,80:0.34:-0.80:1.000:0.897 0/1/1/1:4:94,257:0.70: 0.40:1.000:0.986 0/0/1/1:4:166,183:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:285,97:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,94:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:282,93:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,187:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:175,73:0.29:-0.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:184,93:0.33:-0.38:1.000:0.906 0/0/1/1:4:175,177:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:285,92:0.25: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,205:0.53: 0.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:212,71:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,153:0.46: 0.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:151,62:0.29:-1.05:1.000:0.991 0/0/0/0:4:405,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,89:0.31:-0.32:1.000:0.968 0/0/0/1:4:184,95:0.34:-0.36:1.000:0.882 0/0/1/1:4:232,168:0.41: 0.91:1.000:0.886 0/0/0/1:4:377,101:0.21: 1.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,374:0.72: 1.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:275,92:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,71:0.29:-0.73:1.000:0.991 0/0/0/1:4:215,75:0.26:-0.24:1.000:0.999 -chr4.1 52226061 chr4.1_052226061 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:115,92:0.43:-0.43:1.000:0.936 0/1/1/1:4:78,240:0.67: 0.77:1.000:0.903 0/0/0/1:4:184,97:0.29: 0.37:1.000:0.989 0/0/0/1:4:214,93:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:344,97:0.18: 2.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:252,110:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,64:0.32:-0.76:1.000:0.962 0/0/0/1:4:205,78:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,88:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,27:0.39:-1.96:1.000:0.666 0/1/1/1:4:93,276:0.66: 1.32:1.000:0.879 0/0/1/1:4:116,94:0.43:-0.40:1.000:0.948 0/0/0/0:4:200,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:325,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:316,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,102:0.25: 0.91:0.999:0.999 0/0/0/0:4:413,0:0.00: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,214:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,29:0.53:-2.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:114,191:0.58: 0.63:1.000:0.904 0/0/0/1:4:270,124:0.25: 1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,152:0.57: 0.02:1.000:0.941 0/0/0/1:4:28,15:0.30:-2.20:1.000:0.986 0/0/0/1:4:192,94:0.27: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,211:0.61: 0.72:1.000:0.667 0/0/0/1:4:296,99:0.20: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,105:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,190:0.46: 1.69:1.000:0.989 0/0/0/1:4:176,71:0.23: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,93:0.25: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,32:0.41:-1.87:1.000:0.866 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/1:3:36,10:0.17:-2.17:0.999:0.978 0/0/1/1:4:219,216:0.50: 2.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,199:0.60: 0.62:1.000:0.784 0/0/0/1:4:212,94:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:192,83:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,104:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,74:0.28:-0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:276,81:0.18: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,83:0.28:-0.01:1.000:0.994 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,90:0.20: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,77:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,74:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,145:0.28: 2.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:127,62:0.27:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,74:0.48:-1.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,122:0.63:-0.78:1.000:0.544 0/0/0/1:4:197,96:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,62:0.27:-0.63:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,185:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,91:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:204,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,57:0.15: 0.66:1.000:0.986 0/0/1/1:4:74,128:0.59:-0.49:1.000:0.880 0/0/0/1:4:118,77:0.36:-0.56:1.000:0.682 0/0/0/1/1/1:6:114,92:0.43:-0.44:1.000:0.596 0/0/1/1:4:86,149:0.59:-0.13:1.000:0.879 0/0/0/1:4:141,81:0.32:-0.27:1.000:0.952 0/0/1/1:4:60,47:0.42:-1.51:1.000:0.912 0/0/0/1:4:189,73:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,145:0.57:-0.10:1.000:0.943 0/0/0/0:4:218,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,88:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,72:0.29:-0.39:0.998:0.992 0/1/1/1:4:81,278:0.68: 1.21:1.000:0.951 0/0/0/1:4:212,79:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,193:0.65: 0.17:1.000:0.814 0/0/0/1:4:239,120:0.28: 1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:156,150:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,72:0.32:-0.55:1.000:0.942 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,86:0.52:-0.91:1.000:0.995 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,77:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,102:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,63:0.52:-1.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,63:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:314,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,51:0.21:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:285,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,76:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,64:0.50:-1.28:0.999:0.997 0/0/0/1:4:221,76:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,78:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,56:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:337,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,145:0.62:-0.36:1.000:0.623 0/0/0/1:4:99,52:0.29:-1.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,184:0.67:-0.04:1.000:0.911 0/0/0/1:4:144,80:0.31:-0.25:1.000:0.973 0/0/0/1:4:258,90:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,48:0.26:-1.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:142,82:0.32:-0.25:1.000:0.947 0/0/1/1:4:64,45:0.38:-1.49:1.000:0.626 0/0/0/1:4:132,57:0.24:-0.63:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,55:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,108:0.27: 0.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,75:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,53:0.40:-1.32:1.000:0.784 0/0/0/1:4:259,131:0.28: 1.54:1.000:0.995 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.39:0.999:1.000 0/0/0/1:4:104,68:0.36:-0.81:1.000:0.674 0/0/0/1:4:129,64:0.28:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,77:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,103:0.57:-0.82:1.000:0.954 1/1/1/1:4:1,133:0.98:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,57:0.45:-1.34:1.000:0.981 0/0/1/1:4:70,58:0.44:-1.28:1.000:0.963 0/0/0/1:4:140,69:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,62:0.28:-0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,162:0.58: 0.13:1.000:0.906 0/0/0/0:4:331,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,54:0.43:-1.37:1.000:0.955 0/0/0/0:4:247,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,63:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,158:0.65:-0.33:1.000:0.801 0/0/1/1:4:50,56:0.52:-1.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:106,64:0.34:-0.83:1.000:0.891 0/0/0/1:4:114,60:0.29:-0.79:1.000:0.989 0/0/0/1:4:218,112:0.29: 0.90:1.000:0.993 0/0/0/1:4:91,58:0.35:-1.06:0.996:0.762 0/0/0/1:4:154,79:0.29:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:197,70:0.21: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,105:0.44:-0.16:1.000:0.962 0/0/0/1:4:186,88:0.26: 0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:192,41:0.14:-0.15:1.000:0.971 0/0/0/1:4:151,50:0.20:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,69:0.28:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,138:0.58:-0.28:1.000:0.909 0/0/0/0:4:218,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,169:0.63:-0.03:1.000:0.504 0/0/0/1:4:101,59:0.33:-0.94:1.000:0.936 0/0/0/1:4:220,113:0.29: 0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:141,222:0.57: 1.25:1.000:0.939 0/0/1/1:4:222,194:0.46: 1.83:1.000:0.984 0/0/0/1:4:190,99:0.29: 0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:100,112:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,61:0.42:-1.18:1.000:0.926 0/0/0/1:4:240,105:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,98:0.28: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,29:0.36:-1.87:1.000:0.726 0/0/0/1:4:177,66:0.22:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:348,103:0.18: 2.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,97:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:422,120:0.18: 3.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,81:0.24: 0.27:0.998:1.000 0/0/0/1:4:191,104:0.30: 0.52:1.000:0.981 0/0/0/1:4:197,98:0.28: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,146:0.59:-0.18:1.000:0.876 0/0/1/1:4:74,71:0.49:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,99:0.45:-0.34:1.000:0.977 0/0/0/0:4:433,0:0.00: 2.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:305,84:0.17: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,142:0.59:-0.25:1.000:0.880 0/0/0/1:4:301,82:0.17: 1.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,172:0.58: 0.32:1.000:0.919 0/0/1/1:4:82,168:0.61: 0.03:1.000:0.667 0/0/1/1:4:79,78:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:177,75:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,88:0.44:-0.59:1.000:0.974 0/0/0/0:4:380,0:0.00: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,84:0.52:-0.96:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,77:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:355,111:0.19: 2.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,185:0.56: 0.70:1.000:0.966 0/0/0/1:4:200,95:0.26: 0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:207,86:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,119:0.35: 0.64:1.000:0.767 0/0/0/0:4:273,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:330,131:0.23: 2.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,86:0.33:-0.18:1.000:0.909 0/0/1/1:4:194,182:0.48: 1.39:1.000:0.995 -chr4.1 52385824 chr4.1_052385824 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:313,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:228,62:.:-0.07:1.000:. ./.:4:302,96:.: 1.51:1.000:. ./.:4:306,100:.: 1.63:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:91,38:.:-2.43:1.000:. ./.:4:65,27:.:-2.97:1.000:. ./.:4:257,79:.: 0.60:1.000:. ./.:4:237,93:.: 0.51:1.000:. ./.:4:251,106:.: 0.91:1.000:. ./.:4:227,80:.: 0.18:1.000:. ./.:4:269,94:.: 1.00:1.000:. ./.:4:258,79:.: 0.61:0.999:. ./.:4:184,199:.: 1.29:1.000:. ./.:4:312,123:.: 2.05:1.000:. ./.:4:394,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:109,2:.:-2.70:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:232,88:.: 0.37:1.000:. ./.:4:345,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:60,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:282,98:.: 1.24:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:217,92:.: 0.20:1.000:. ./.:4:210,86:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,1:.:-3.90:1.000:. ./.:4:77,18:.:-2.93:1.000:. ./.:3:48,0:.:-3.62:0.999:. ./.:4:331,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:231,90:.: 0.38:1.000:. ./.:4:267,81:.: 0.78:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:230,74:.: 0.13:1.000:. ./.:4:230,80:.: 0.22:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:208,92:.: 0.07:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:290,92:.: 1.27:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:259,95:.: 0.86:1.000:. ./.:4:200,73:.:-0.32:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:228,100:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,66:.:-0.34:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:325,1:.: 0.45:1.000:. ./.:6:223,28:.:-0.65:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:181,62:.:-0.76:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:197,69:.:-0.43:1.000:. ./.:4:254,81:.: 0.59:1.000:. ./.:4:314,113:.: 1.93:1.000:. ./.:4:156,61:.:-1.14:1.000:. ./.:4:186,90:.:-0.28:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.13:0.998:. ./.:4:307,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:233,90:.: 0.41:1.000:. ./.:4:150,66:.:-1.16:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:167,145:.: 0.25:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:226,71:.: 0.03:1.000:. ./.:4:216,76:.:-0.04:1.000:. ./.:4:246,94:.: 0.66:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,64:.:-1.01:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:233,93:.: 0.45:1.000:. ./.:4:200,71:.:-0.35:1.000:. ./.:4:213,91:.: 0.13:1.000:. ./.:4:225,79:.: 0.13:1.000:. ./.:4:154,40:.:-1.48:1.000:. ./.:4:216,69:.:-0.15:1.000:. ./.:4:215,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:182,78:.:-0.51:0.999:. ./.:4:277,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,58:.:-1.11:1.000:. ./.:4:268,91:.: 0.94:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:164,63:.:-1.00:1.000:. ./.:4:265,88:.: 0.85:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:261,85:.: 0.75:1.000:. ./.:4:166,56:.:-1.07:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:251,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:236,76:.: 0.25:1.000:. ./.:4:233,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:264,96:.: 0.95:1.000:. ./.:4:255,75:.: 0.51:1.000:. ./.:4:192,101:.:-0.03:1.000:. ./.:4:313,132:.: 2.20:1.000:. ./.:4:211,89:.: 0.07:0.999:. ./.:4:228,90:.: 0.34:1.000:. ./.:4:153,58:.:-1.23:1.000:. ./.:4:227,73:.: 0.07:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:226,67:.:-0.03:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:228,67:.: 0.00:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:261,88:.: 0.79:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:195,81:.:-0.28:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:200,66:.:-0.43:1.000:. ./.:4:146,69:.:-1.17:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:208,72:.:-0.22:1.000:. ./.:4:237,87:.: 0.42:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.73:0.996:. ./.:4:323,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:311,120:.: 1.99:1.000:. ./.:4:248,79:.: 0.47:1.000:. ./.:4:208,78:.:-0.13:1.000:. ./.:4:197,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:208,74:.:-0.19:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:174,77:.:-0.65:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:147,69:.:-1.16:1.000:. ./.:4:257,115:.: 1.13:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:366,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:241,96:.: 0.61:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:267,99:.: 1.04:1.000:. ./.:4:231,72:.: 0.12:1.000:. ./.:4:82,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:148,51:.:-1.41:1.000:. ./.:4:253,86:.: 0.64:1.000:. ./.:4:321,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:391,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:287,85:.: 1.13:1.000:. ./.:4:185,66:.:-0.65:0.998:. ./.:4:320,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:221,85:.: 0.16:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:240,89:.: 0.50:1.000:. ./.:4:243,95:.: 0.63:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:204,87:.:-0.06:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:213,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:193,72:.:-0.44:1.000:. ./.:4:201,73:.:-0.31:1.000:. ./.:4:209,81:.:-0.07:1.000:. ./.:4:230,70:.: 0.07:1.000:. ./.:4:191,63:.:-0.60:1.000:. ./.:4:312,123:.: 2.05:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:246,98:.: 0.72:1.000:. ./.:4:287,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:245,90:.: 0.59:1.000:. ./.:4:282,137:.: 1.82:1.000:. ./.:4:395,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:186,79:.:-0.44:1.000:. ./.:4:242,93:.: 0.59:1.000:. -chr4.1 52974490 chr4.1_052974490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:0.999:0.997 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.44:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.44:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:10,1:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,4:0.29: 1.45:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.58:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,2:0.28: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.44:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:12,1:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,1:0.28:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,1:0.25: 0.37:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,1:0.28:-0.31:0.998:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.58:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:3,2:0.34:-0.31:1.000:0.898 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:7,1:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,1:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,2:0.28: 0.37:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.44:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:3,2:0.34:-0.31:1.000:0.898 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,1:0.28:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 2.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:0.996:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.28:-0.31:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:9,3:0.29: 0.64:1.000:0.990 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:22,2:0.23: 2.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,2:0.25: 1.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 1.32:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/0:4:31,1:0.09: 3.35:1.000:0.970 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 1.59:0.998:1.000 0/0/0/1:4:20,2:0.25: 1.99:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:15,2:0.26: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,1:0.13: 1.86:1.000:0.918 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,1:0.16: 1.32:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 2.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,1:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.25: 1.86:1.000:0.999 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-0.71:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:35,2:0.15: 4.02:1.000:0.986 0/0/0/1:4:22,2:0.23: 2.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-0.17:1.000:0.997 -chr4.1 53356900 chr4.1_053356900 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:337,68:.: 0.76:1.000:. ./.:4:306,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:371,39:.: 0.82:1.000:. ./.:4:274,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:278,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:306,26:.:-0.09:1.000:. ./.:4:296,90:.: 0.54:1.000:. ./.:4:380,37:.: 0.90:1.000:. ./.:4:100,33:.:-2.42:1.000:. ./.:4:106,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:357,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:289,41:.:-0.12:1.000:. ./.:4:284,86:.: 0.35:1.000:. ./.:4:190,77:.:-0.85:1.000:. ./.:4:293,45:.:-0.02:1.000:. ./.:4:294,60:.: 0.16:0.999:. ./.:4:153,51:.:-1.59:1.000:. ./.:4:400,113:.: 2.02:1.000:. ./.:4:435,50:.: 1.70:1.000:. ./.:4:139,43:.:-1.85:1.000:. ./.:4:370,38:.: 0.79:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:340,44:.: 0.51:1.000:. ./.:4:106,17:.:-2.54:1.000:. ./.:4:306,81:.: 0.55:1.000:. ./.:4:362,53:.: 0.88:1.000:. ./.:4:302,49:.: 0.13:1.000:. ./.:4:292,41:.:-0.08:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:361,53:.: 0.87:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:110,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:143,27:.:-1.99:1.000:. ./.:3:51,9:.:-3.28:0.999:. ./.:4:388,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:241,28:.:-0.83:1.000:. ./.:4:406,41:.: 1.25:1.000:. ./.:4:372,34:.: 0.77:1.000:. ./.:4:310,104:.: 0.87:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:248,89:.:-0.04:1.000:. ./.:4:223,30:.:-1.02:1.000:. ./.:4:394,47:.: 1.18:1.000:. ./.:4:257,75:.:-0.09:1.000:. ./.:4:397,45:.: 1.19:1.000:. ./.:4:213,47:.:-0.94:1.000:. ./.:4:275,27:.:-0.45:1.000:. ./.:4:304,74:.: 0.44:1.000:. ./.:4:204,24:.:-1.31:1.000:. ./.:4:465,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:269,40:.:-0.36:1.000:. ./.:4:376,41:.: 0.90:1.000:. ./.:4:375,42:.: 0.90:1.000:. ./.:4:313,36:.: 0.10:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:364,57:.: 0.95:1.000:. ./.:4:295,96:.: 0.60:1.000:. ./.:6:280,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:397,96:.: 1.79:1.000:. ./.:4:386,4:.: 0.58:1.000:. ./.:4:304,53:.: 0.20:1.000:. ./.:4:357,46:.: 0.74:1.000:. ./.:4:233,26:.:-0.95:1.000:. ./.:4:206,44:.:-1.05:1.000:. ./.:4:302,66:.: 0.33:0.998:. ./.:4:317,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:407,38:.: 1.23:1.000:. ./.:4:269,26:.:-0.53:1.000:. ./.:4:454,58:.: 2.01:1.000:. ./.:4:333,84:.: 0.90:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:291,79:.: 0.35:1.000:. ./.:4:251,30:.:-0.69:1.000:. ./.:4:294,39:.:-0.08:1.000:. ./.:4:331,100:.: 1.06:1.000:. ./.:4:406,125:.: 2.23:1.000:. ./.:4:276,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:275,93:.: 0.33:1.000:. ./.:4:229,95:.:-0.19:1.000:. ./.:4:265,29:.:-0.54:1.000:. ./.:4:328,46:.: 0.40:1.000:. ./.:4:325,77:.: 0.72:1.000:. ./.:4:205,75:.:-0.70:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:183,28:.:-1.51:1.000:. ./.:4:275,62:.:-0.04:1.000:. ./.:4:204,27:.:-1.28:0.999:. ./.:4:286,33:.:-0.25:1.000:. ./.:4:402,91:.: 1.79:1.000:. ./.:4:212,38:.:-1.05:1.000:. ./.:4:377,66:.: 1.20:1.000:. ./.:4:333,46:.: 0.46:1.000:. ./.:4:256,63:.:-0.25:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:367,52:.: 0.92:1.000:. ./.:4:236,25:.:-0.92:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:201,18:.:-1.42:1.000:. ./.:4:292,77:.: 0.34:0.999:. ./.:4:239,36:.:-0.76:1.000:. ./.:4:220,103:.:-0.20:1.000:. ./.:4:295,72:.: 0.32:1.000:. ./.:4:297,87:.: 0.51:1.000:. ./.:4:284,87:.: 0.36:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:223,30:.:-1.02:1.000:. ./.:4:524,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:235,40:.:-0.76:0.999:. ./.:4:295,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:283,47:.:-0.12:1.000:. ./.:4:258,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:298,26:.:-0.19:1.000:. ./.:4:219,32:.:-1.04:1.000:. ./.:4:256,73:.:-0.13:1.000:. ./.:4:320,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:189,66:.:-0.99:1.000:. ./.:4:399,45:.: 1.22:1.000:. ./.:4:298,36:.:-0.07:1.000:. ./.:4:263,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:201,70:.:-0.81:1.000:. ./.:4:251,49:.:-0.47:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:265,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:190,58:.:-1.08:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:336,48:.: 0.51:1.000:. ./.:4:204,46:.:-1.05:0.996:. ./.:4:284,71:.: 0.17:1.000:. ./.:4:303,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:300,51:.: 0.13:1.000:. ./.:4:275,55:.:-0.12:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:272,32:.:-0.42:1.000:. ./.:4:324,40:.: 0.28:1.000:. ./.:4:266,73:.:-0.01:1.000:. ./.:4:312,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:234,5:.:-1.18:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:442,45:.: 1.72:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:424,83:.: 1.95:1.000:. ./.:4:302,89:.: 0.60:1.000:. ./.:4:357,44:.: 0.71:1.000:. ./.:4:310,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:122,15:.:-2.38:1.000:. ./.:4:178,31:.:-1.53:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:317,88:.: 0.76:1.000:. ./.:4:377,58:.: 1.11:1.000:. ./.:4:242,84:.:-0.16:1.000:. ./.:4:195,39:.:-1.24:0.998:. ./.:4:328,97:.: 0.99:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:274,26:.:-0.47:1.000:. ./.:4:225,73:.:-0.49:1.000:. ./.:4:288,56:.: 0.05:1.000:. ./.:4:293,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:397,47:.: 1.22:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:301,88:.: 0.57:1.000:. ./.:4:345,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:248,37:.:-0.64:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:280,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:308,39:.: 0.08:1.000:. ./.:4:302,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:533,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:463,39:.: 1.89:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:225,41:.:-0.87:1.000:. ./.:4:385,47:.: 1.08:1.000:. ./.:4:285,96:.: 0.48:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:294,37:.:-0.11:1.000:. -chr4.1 53439911 chr4.1_053439911 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:39,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:0.999:. ./.:4:1,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:6:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 1.43:0.998:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.95:0.998:. ./.:4:30,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.73:1.000:. -chr4.1 53798057 chr4.1_053798057 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.73:1.000:. ./.:4:44,4:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:79,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:61,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:71,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:100,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:27,6:.:-1.20:0.999:. ./.:4:110,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:99,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:54,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:64,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.98:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:111,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:37,3:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,2:.:-1.64:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.07:1.000:. ./.:3:10,1:.:-1.94:0.999:. ./.:4:58,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:10,3:.:-1.88:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:93,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:21,4:.:-1.47:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,3:.:-1.20:1.000:. ./.:4:32,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:112,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:78,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.96:1.000:. ./.:6:66,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:52,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,5:.:-1.44:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:85,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:56,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.62:0.998:. ./.:4:64,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:50,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.18:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:75,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:41,5:.:-0.76:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.69:0.999:. ./.:4:60,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:31,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:32,2:.:-1.17:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:92,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:30,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:35,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:38,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:64,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:62,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:123,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:32,3:.:-1.13:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:27,4:.:-1.27:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:99,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:28,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:28,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:104,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:36,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:39,4:.:-0.86:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.76:0.996:. ./.:4:80,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:29,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:26,3:.:-1.34:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:77,4:.: 0.42:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:145,3:.: 2.69:1.000:. ./.:4:82,3:.: 0.56:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:97,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:61,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.50:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.93:0.998:. ./.:4:99,3:.: 1.13:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.03:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:97,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:54,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:117,2:.: 1.71:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:87,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:83,2:.: 0.56:1.000:. -chr4.1 53833596 chr4.1_053833596 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:94,79:.: 0.00:1.000:. ./.:4:60,43:.:-1.22:1.000:. ./.:4:95,30:.:-0.84:1.000:. ./.:4:77,86:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,78:.: 0.36:1.000:. ./.:4:95,16:.:-1.08:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:74,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:80,34:.:-1.03:1.000:. ./.:4:163,85:.: 1.30:1.000:. ./.:4:122,71:.: 0.35:1.000:. ./.:4:78,27:.:-1.18:1.000:. ./.:4:87,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:109,63:.:-0.02:1.000:. ./.:4:93,46:.:-0.59:1.000:. ./.:4:63,20:.:-1.57:1.000:. ./.:4:121,103:.: 0.89:0.999:. ./.:4:78,36:.:-1.03:1.000:. ./.:4:136,30:.:-0.12:1.000:. ./.:4:103,69:.:-0.02:1.000:. ./.:4:156,62:.: 0.78:1.000:. ./.:4:104,97:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,87:.: 0.03:1.000:. ./.:4:103,64:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,45:.:-0.91:1.000:. ./.:4:55,20:.:-1.70:1.000:. ./.:4:141,109:.: 1.34:1.000:. ./.:4:60,46:.:-1.17:1.000:. ./.:4:54,40:.:-1.37:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:68,47:.:-1.01:1.000:. ./.:4:126,44:.:-0.05:1.000:. ./.:3:59,40:.:-1.29:0.999:. ./.:4:81,52:.:-0.70:1.000:. ./.:4:94,79:.: 0.00:1.000:. ./.:4:118,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:103,111:.: 0.71:1.000:. ./.:4:76,86:.:-0.19:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:97,38:.:-0.66:1.000:. ./.:4:130,70:.: 0.47:1.000:. ./.:4:135,43:.: 0.09:1.000:. ./.:4:170,121:.: 2.05:1.000:. ./.:4:148,99:.: 1.29:1.000:. ./.:4:91,37:.:-0.78:1.000:. ./.:4:194,194:.: 3.74:1.000:. ./.:4:97,37:.:-0.68:1.000:. ./.:4:125,98:.: 0.87:1.000:. ./.:4:128,100:.: 0.96:1.000:. ./.:4:110,64:.: 0.02:1.000:. ./.:4:141,134:.: 1.77:1.000:. ./.:4:136,92:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,50:.:-0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:111,77:.: 0.26:1.000:. ./.:4:199,136:.: 2.82:1.000:. ./.:4:141,54:.: 0.38:1.000:. ./.:6:165,51:.: 0.75:1.000:. ./.:4:123,48:.:-0.04:1.000:. ./.:4:96,43:.:-0.59:1.000:. ./.:4:163,103:.: 1.62:1.000:. ./.:4:175,107:.: 1.89:1.000:. ./.:4:142,32:.: 0.02:1.000:. ./.:4:182,61:.: 1.22:1.000:. ./.:4:111,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:127,95:.: 0.85:1.000:. ./.:4:139,44:.: 0.17:0.998:. ./.:4:73,57:.:-0.75:1.000:. ./.:4:199,110:.: 2.36:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:162,91:.: 1.39:1.000:. ./.:4:103,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:130,74:.: 0.54:1.000:. ./.:4:119,65:.: 0.19:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:140,81:.: 0.83:1.000:. ./.:4:169,53:.: 0.85:1.000:. ./.:4:151,101:.: 1.37:1.000:. ./.:4:120,27:.:-0.45:1.000:. ./.:4:178,59:.: 1.11:1.000:. ./.:4:182,56:.: 1.13:1.000:. ./.:4:81,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:184,46:.: 0.99:1.000:. ./.:4:158,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:140,45:.: 0.21:1.000:. ./.:4:104,42:.:-0.47:1.000:. ./.:4:152,47:.: 0.45:1.000:. ./.:4:96,116:.: 0.68:1.000:. ./.:4:129,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,57:.:-0.44:1.000:. ./.:4:148,68:.: 0.75:1.000:. ./.:4:68,51:.:-0.94:1.000:. ./.:4:183,94:.: 1.81:1.000:. ./.:4:166,149:.: 2.47:1.000:. ./.:4:105,80:.: 0.21:1.000:. ./.:4:122,73:.: 0.38:1.000:. ./.:4:169,126:.: 2.12:1.000:. ./.:4:103,69:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,96:.: 1.23:1.000:. ./.:4:128,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:87,71:.:-0.26:1.000:. ./.:4:218,182:.: 3.95:0.999:. ./.:4:114,83:.: 0.42:1.000:. ./.:4:116,40:.:-0.30:1.000:. ./.:4:116,44:.:-0.23:1.000:. ./.:4:91,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:161,42:.: 0.52:1.000:. ./.:4:117,72:.: 0.28:1.000:. ./.:4:132,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:111,68:.: 0.10:1.000:. ./.:4:136,48:.: 0.19:0.999:. ./.:4:133,50:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,30:.:-0.84:1.000:. ./.:4:142,98:.: 1.16:1.000:. ./.:4:132,149:.: 1.88:1.000:. ./.:4:128,81:.: 0.63:1.000:. ./.:4:143,47:.: 0.29:1.000:. ./.:4:123,44:.:-0.11:1.000:. ./.:4:108,98:.: 0.57:1.000:. ./.:4:137,73:.: 0.64:1.000:. ./.:4:143,96:.: 1.15:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:132,38:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:132,33:.:-0.14:1.000:. ./.:4:133,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,47:.:-0.45:1.000:. ./.:4:98,40:.:-0.61:1.000:. ./.:4:142,92:.: 1.06:1.000:. ./.:4:97,82:.: 0.10:1.000:. ./.:4:91,99:.: 0.29:0.996:. ./.:4:104,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,23:.:-0.82:1.000:. ./.:4:94,63:.:-0.28:1.000:. ./.:4:109,79:.: 0.26:1.000:. ./.:4:114,98:.: 0.68:1.000:. ./.:4:129,83:.: 0.68:1.000:. ./.:4:136,90:.: 0.92:1.000:. ./.:4:112,82:.: 0.36:1.000:. ./.:4:125,75:.: 0.47:1.000:. ./.:4:100,25:.:-0.84:1.000:. ./.:4:145,73:.: 0.78:1.000:. ./.:4:157,32:.: 0.28:1.000:. ./.:4:141,91:.: 1.03:1.000:. ./.:4:87,54:.:-0.56:1.000:. ./.:4:93,35:.:-0.78:1.000:. ./.:4:113,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:100,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:85,70:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,20:.:-1.10:1.000:. ./.:4:117,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:74,25:.:-1.29:1.000:. ./.:4:94,70:.:-0.16:1.000:. ./.:4:102,93:.: 0.38:1.000:. ./.:4:118,42:.:-0.23:1.000:. ./.:4:121,38:.:-0.24:1.000:. ./.:4:93,39:.:-0.71:0.998:. ./.:4:108,74:.: 0.16:1.000:. ./.:4:99,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:65,41:.:-1.17:1.000:. ./.:4:94,53:.:-0.45:1.000:. ./.:4:113,17:.:-0.75:1.000:. ./.:4:67,18:.:-1.53:1.000:. ./.:4:77,19:.:-1.34:1.000:. ./.:4:79,57:.:-0.64:1.000:. ./.:4:100,27:.:-0.80:1.000:. ./.:4:96,33:.:-0.77:1.000:. ./.:4:67,24:.:-1.43:1.000:. ./.:4:78,46:.:-0.85:1.000:. ./.:4:68,17:.:-1.53:1.000:. ./.:4:96,62:.:-0.26:1.000:. ./.:4:100,23:.:-0.87:1.000:. ./.:4:99,64:.:-0.17:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:59,24:.:-1.57:1.000:. ./.:4:125,67:.: 0.33:1.000:. ./.:4:91,22:.:-1.04:1.000:. ./.:4:73,28:.:-1.25:1.000:. ./.:4:84,59:.:-0.52:1.000:. ./.:4:100,46:.:-0.47:1.000:. ./.:4:125,37:.:-0.19:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.85:1.000:. -chr4.1 54076524 chr4.1_054076524 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:209,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:204,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:263,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.96:0.999:. ./.:4:151,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:241,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.19:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.63:0.999:. ./.:4:198,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:297,0:.: 3.25:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.77:0.998:. ./.:4:110,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:125,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:134,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.30:0.996:. ./.:4:136,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.61:0.998:. ./.:4:159,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:169,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.31:1.000:. -chr4.1 54247341 chr4.1_054247341 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:28,12:0.32: 1.40:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,25:0.64: 1.29:1.000:0.727 0/0/1/1:4:8,8:0.53:-1.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,20:0.66: 0.24:1.000:0.891 0/0/0/1:4:18,6:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,9:0.42:-0.57:1.000:0.926 0/1/1/1:4:15,25:0.63: 1.40:1.000:0.572 0/0/1/1:4:18,18:0.53: 0.94:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,14:0.86:-1.39:1.000:0.964 0/1/1/1:4:6,23:0.77: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.40:-1.04:1.000:0.771 0/0/1/1:4:16,13:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,18:0.64: 0.01:1.000:0.742 0/1/1/1:4:6,14:0.69:-0.92:1.000:0.974 0/1/1/1:4:12,20:0.63: 0.47:0.999:0.572 1/1/1/1:4:0,30:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.39: 0.59:1.000:0.719 0/0/1/1:4:24,14:0.40: 1.17:1.000:0.771 0/0/1/1:4:9,8:0.51:-1.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,21:0.66: 0.47:1.000:0.838 0/0/1/1:4:20,14:0.45: 0.71:1.000:0.975 0/0/1/1:4:10,13:0.58:-0.57:1.000:0.900 0/1/1/1:4:5,10:0.66:-1.50:1.000:0.891 0/1/1/1:4:8,31:0.77: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.42:-0.57:1.000:0.926 0/0/1/1:4:10,16:0.62:-0.22:1.000:0.530 0/1/1/1:4:10,21:0.67: 0.36:1.000:0.930 0/0/1/1:4:10,16:0.62:-0.22:1.000:0.530 0/1/1/1:4:5,21:0.79:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.25:-1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,10:0.81:-1.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-1.50:1.000:0.997 1/1/1:3:0,17:1.00:-1.27:0.999:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.69: 0.24:1.000:0.974 0/1/1/1:4:8,25:0.74: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,15:0.61:-0.34:1.000:0.682 0/0/1/1:4:10,16:0.62:-0.22:1.000:0.530 0/1/1/1:4:9,36:0.78: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,7:0.38:-0.92:1.000:0.534 0/0/1/1:4:15,16:0.54: 0.36:1.000:0.985 0/1/1/1:4:7,32:0.80: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,35:0.77: 1.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,26:0.71: 0.94:1.000:0.991 0/1/1/1:4:10,26:0.71: 0.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:26,8:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,15:0.77:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,12:0.42: 0.36:1.000:0.908 0/0/0/1:4:6,2:0.27:-2.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,15:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,24:0.68: 0.82:1.000:0.951 0/1/1/1:4:6,14:0.69:-0.92:1.000:0.974 0/0/1/1:4:22,13:0.40: 0.82:1.000:0.800 0/0/1/1:4:14,17:0.57: 0.36:1.000:0.947 0/0/1/1:4:20,12:0.41: 0.47:1.000:0.831 0/1/1/1:4:8,24:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,24:0.56: 1.98:1.000:0.970 0/0/1/1:4:17,19:0.55: 0.94:1.000:0.976 0/0/0/1/1/1:6:24,22:0.51: 2.10:1.000:0.878 0/0/0/1:4:19,6:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,15:0.53: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:28,19:0.44: 2.22:1.000:0.963 0/1/1/1:4:9,33:0.76: 1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,23:0.84:-0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,28:0.65: 1.75:1.000:0.805 0/1/1/1:4:7,17:0.70:-0.46:1.000:0.982 0/0/0/1:4:15,7:0.34:-0.69:1.000:0.856 0/0/1/1:4:16,14:0.50: 0.24:0.998:0.997 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,23:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,14:0.64:-0.69:1.000:0.685 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 2.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.62:-0.22:1.000:0.530 1/1/1/1:4:2,37:0.94: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,15:0.43: 1.17:1.000:0.938 0/0/1/1:4:25,14:0.39: 1.29:1.000:0.660 0/0/1/1:4:18,11:0.41: 0.13:1.000:0.863 0/0/1/1:4:25,19:0.47: 1.87:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-0.34:1.000:0.674 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,11:0.36: 0.59:1.000:0.702 0/0/1/1:4:13,12:0.52:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,8:0.39:-0.69:1.000:0.719 0/1/1/1:4:8,19:0.69:-0.11:1.000:0.978 0/0/1/1:4:18,20:0.55: 1.17:1.000:0.977 0/0/0/1:4:26,11:0.32: 1.05:1.000:0.956 0/0/1/1:4:25,18:0.45: 1.75:1.000:0.983 0/1/1/1:4:7,20:0.72:-0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,23:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,21:0.69: 0.24:1.000:0.974 0/0/1/1:4:19,18:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,8:0.71:-1.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,13:0.55:-0.34:1.000:0.982 0/1/1/1:4:8,17:0.67:-0.34:1.000:0.937 0/0/1/1:4:11,10:0.51:-0.80:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,28:0.80: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.59:-0.22:1.000:0.848 0/1/1/1:4:6,23:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,15:0.45: 0.94:1.000:0.981 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-0.22:1.000:0.987 0/1/1/1:4:6,26:0.79: 0.47:0.999:1.000 0/0/1/1:4:16,14:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,11:0.41: 0.13:1.000:0.863 0/0/1/1:4:12,11:0.51:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,7:0.33:-0.57:1.000:0.934 0/0/0/1:4:31,6:0.18: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,13:0.60:-0.69:1.000:0.758 0/0/0/1:4:25,10:0.31: 0.82:1.000:0.979 0/0/1/1:4:24,19:0.48: 1.75:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,20:0.95:-0.80:0.999:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,7:0.40:-1.04:1.000:0.771 0/0/1/1:4:15,12:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,14:0.56:-0.22:1.000:0.964 0/0/0/1:4:23,12:0.37: 0.82:1.000:0.571 0/0/1/1:4:19,11:0.40: 0.24:1.000:0.753 0/0/1/1:4:10,13:0.58:-0.57:1.000:0.900 0/1/1/1:4:7,15:0.68:-0.69:1.000:0.942 0/1/1/1:4:5,19:0.77:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.41: 0.71:1.000:0.883 0/0/1/1:4:22,16:0.46: 1.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,21:0.59: 1.05:1.000:0.891 0/0/0/1:4:19,7:0.29:-0.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,17:0.83:-0.92:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.27:-0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,9:0.44:-0.69:1.000:0.972 0/1/1/1:4:4,25:0.85: 0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:4,18:0.80:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-1.50:0.996:0.995 1/1/1/1:4:1,12:0.91:-1.73:1.000:0.972 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-1.39:1.000:0.954 0/0/1/1:4:7,5:0.45:-1.85:1.000:0.981 0/1/1/1:4:6,11:0.65:-1.27:1.000:0.776 0/1/1/1:4:5,9:0.64:-1.62:1.000:0.742 0/0/1/1:4:8,12:0.61:-0.92:1.000:0.682 0/1/1/1:4:9,16:0.64:-0.34:1.000:0.718 0/0/0/1:4:21,11:0.37: 0.47:1.000:0.558 0/1/1/1:4:4,23:0.84:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,18:0.45: 1.75:1.000:0.983 0/1/1/1:4:4,17:0.79:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,19:0.65: 0.13:1.000:0.831 0/0/1/1:4:14,15:0.55: 0.13:1.000:0.984 0/1/1/1:4:9,16:0.64:-0.34:1.000:0.718 0/1/1/1:4:10,17:0.63:-0.11:1.000:0.620 0/0/0/1:4:21,10:0.35: 0.36:1.000:0.819 0/0/1/1:4:20,17:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,16:0.57: 0.13:1.000:0.940 0/0/1/1:4:14,10:0.45:-0.46:1.000:0.981 0/0/1/1:4:8,8:0.53:-1.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,8:0.46:-1.04:1.000:0.985 0/1/1/1:4:10,30:0.73: 1.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,11:0.65:-1.27:1.000:0.776 0/1/1/1:4:10,23:0.69: 0.59:1.000:0.970 0/0/0/1:4:21,11:0.37: 0.47:1.000:0.558 0/0/1/1:4:12,11:0.51:-0.57:0.998:0.996 0/0/1/1:4:18,12:0.43: 0.24:1.000:0.953 0/0/1/1:4:11,11:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,11:0.44:-0.11:1.000:0.969 0/0/1/1:4:15,16:0.54: 0.36:1.000:0.985 0/0/1/1:4:23,15:0.43: 1.17:1.000:0.938 0/0/1/1:4:3,2:0.43:-2.66:1.000:0.953 0/0/1/1:4:9,12:0.59:-0.80:1.000:0.875 0/1/1/1:4:7,20:0.72:-0.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-2.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.33:-0.57:1.000:0.934 0/0/0/1:4:17,6:0.28:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,11:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,15:0.70:-0.80:1.000:0.986 0/0/1/1:4:20,12:0.41: 0.47:1.000:0.831 0/1/1/1:4:4,13:0.74:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,11:0.48:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,13:0.55:-0.34:1.000:0.982 0/1/1/1:4:12,35:0.73: 2.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,9:0.31: 0.36:1.000:0.972 0/0/1/1:4:21,19:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,12:0.61:-0.92:1.000:0.682 0/0/1/1:4:9,14:0.62:-0.57:1.000:0.599 0/0/1/1:4:18,14:0.47: 0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:9,19:0.67: 0.01:1.000:0.933 0/0/0/1:4:19,9:0.35: 0.01:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.04:1.000:1.000 -chr4.1 54376712 chr4.1_054376712 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.01:1.000:. ./.:3:15,0:.:-1.53:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:147,0:.: 5.60:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.79:1.000:. ./.:6:70,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.02:0.998:. ./.:4:31,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.22:0.999:. ./.:4:59,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.33:0.999:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.40:0.996:. ./.:4:46,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.34:0.998:. ./.:4:39,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.50:1.000:. -chr4.1 54821103 chr4.1_054821103 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:0.999:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:3:24,0:.:-1.33:0.999:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:241,0:.:10.31:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.97:1.000:. ./.:6:40,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.19:0.998:. ./.:4:41,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.01:0.999:. ./.:4:49,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:0.999:. ./.:4:54,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:0.996:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.26:0.998:. ./.:4:50,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:53,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.64:1.000:. -chr4.1 54937372 chr4.1_054937372 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:266,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:126,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:94,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:274,2:.: 0.76:0.999:. ./.:4:197,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:266,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:69,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:346,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:62,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:103,0:.:-2.63:1.000:. ./.:3:46,0:.:-3.75:0.999:. ./.:4:232,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:253,1:.: 0.33:1.000:. ./.:6:245,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.25:0.998:. ./.:4:213,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:345,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:312,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.25:0.999:. ./.:4:266,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:315,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:227,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:303,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.53:0.998:. ./.:4:233,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.40:1.000:. -chr4.1 55030482 chr4.1_055030482 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:17,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.50:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,6:.:-1.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:10,8:.:-0.77:1.000:. ./.:4:17,8:.:-0.15:1.000:. ./.:4:28,12:.: 1.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:17,8:.:-0.15:0.999:. ./.:4:51,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:30,11:.: 1.26:1.000:. ./.:4:17,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:23,9:.: 0.46:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.30:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:34,9:.: 1.43:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.82:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.09:0.999:. ./.:4:33,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.73:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.38:1.000:. ./.:4:14,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:13,6:.:-0.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:32,9:.: 1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:31,13:.: 1.52:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.47:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:12,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.38:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:22,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.24:1.000:. ./.:6:18,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:27,8:.: 0.73:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:36,6:.: 1.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:14,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.38:0.998:. ./.:4:38,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:27,10:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.64:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:31,9:.: 1.17:1.000:. ./.:4:34,10:.: 1.52:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:35,11:.: 1.69:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.24:1.000:. ./.:4:23,9:.: 0.46:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:31,12:.: 1.43:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:11,5:.:-0.94:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:36,16:.: 2.22:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:30,13:.: 1.43:1.000:. ./.:4:26,13:.: 1.08:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:38,9:.: 1.78:1.000:. ./.:4:27,7:.: 0.64:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:34,12:.: 1.69:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.90:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:22,9:.: 0.38:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:20,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.99:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.94:1.000:. ./.:4:27,9:.: 0.82:1.000:. ./.:4:20,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,9:.: 1.87:1.000:. ./.:4:17,11:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:31,11:.: 1.34:1.000:. ./.:4:23,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.86:1.000:. ./.:4:16,5:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:15,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,19:.: 1.78:1.000:. ./.:4:17,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.06:1.000:. ./.:4:34,8:.: 1.34:1.000:. ./.:4:22,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:23,13:.: 0.82:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:37,16:.: 2.31:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.74:1.000:. ./.:4:10,2:.:-1.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:22,9:.: 0.38:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:22,8:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,3:.:-1.12:0.998:. ./.:4:21,10:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.33:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.86:1.000:. ./.:4:15,6:.:-0.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:14,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:35,6:.: 1.26:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:20,9:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.11:1.000:. -chr4.1 55794152 chr4.1_055794152 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:268,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:215,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:99,1:.:-2.55:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.00:0.999:. ./.:4:231,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:200,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.94:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:48,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.72:1.000:. ./.:3:31,0:.:-4.01:0.999:. ./.:4:213,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:218,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:123,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:291,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:191,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:125,1:.:-2.00:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.45:0.998:. ./.:4:221,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:264,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:221,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:238,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:215,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:296,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.69:0.999:. ./.:4:234,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:246,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:235,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:287,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:224,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.41:0.998:. ./.:4:264,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:272,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:241,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.94:1.000:. -chr4.1 55993002 chr4.1_055993002 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:148,72:0.28: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,102:0.52:-0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:114,58:0.29:-0.23:1.000:0.990 0/1/1/1:4:35,187:0.79: 0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,294:1.00: 2.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,241:0.76: 2.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,27:0.36:-2.23:1.000:0.670 0/0/1/1:4:84,130:0.54: 0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:76,132:0.56: 0.44:1.000:0.959 0/1/1/1:4:15,43:0.68:-2.36:1.000:0.950 0/1/1/1:4:9,68:0.85:-2.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:89,120:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,113:0.54:-0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:74,143:0.59: 0.61:1.000:0.861 0/0/1/1:4:70,118:0.56: 0.07:1.000:0.972 0/0/1/1:4:98,137:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,195:0.75: 1.07:0.999:0.999 0/0/1/1:4:86,75:0.41:-0.44:1.000:0.834 0/0/0/1:4:142,75:0.30: 0.61:1.000:0.984 0/0/0/1:4:130,77:0.32: 0.42:1.000:0.943 0/0/1/1:4:16,24:0.53:-2.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,117:0.54: 0.10:1.000:0.985 0/1/1/1:4:35,207:0.81: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,120:0.62:-0.20:1.000:0.526 1/1/1/1:4:4,47:0.90:-2.49:1.000:0.749 0/0/1/1:4:73,146:0.60: 0.64:1.000:0.802 0/0/1/1:4:78,151:0.59: 0.83:1.000:0.859 0/0/1/1:4:79,117:0.52: 0.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:42,194:0.77: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,246:0.78: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,134:0.62: 0.20:1.000:0.561 0/0/1/1:4:96,134:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,32:0.89:-2.79:1.000:0.537 0/0/1/1:4:18,33:0.58:-2.49:1.000:0.923 0/1/1:3:4,14:0.72:-3.11:0.999:1.000 0/1/1/1:4:47,200:0.75: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,147:0.61: 0.59:1.000:0.651 0/0/1/1:4:93,143:0.53: 0.96:1.000:0.991 0/1/1/1:4:32,200:0.82: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,133:0.48: 1.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,112:0.56:-0.14:1.000:0.963 0/1/1/1:4:24,168:0.84: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,60:0.33:-0.49:1.000:0.919 0/0/1/1:4:66,102:0.53:-0.31:1.000:0.990 0/1/1/1:4:29,141:0.78:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,61:0.32:-0.35:1.000:0.954 0/0/1/1:4:72,137:0.59: 0.46:1.000:0.883 0/0/1/1:4:42,78:0.58:-1.20:1.000:0.911 0/0/1/1:4:66,100:0.53:-0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,45:0.38:-1.54:1.000:0.620 0/0/1/1:4:70,104:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,197:0.74: 1.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,171:0.71: 0.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:137,49:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,110:0.48: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:66,125:0.59: 0.12:1.000:0.889 1/1/1/1:4:0,219:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,117:0.58:-0.08:1.000:0.911 0/0/0/1:4:108,54:0.29:-0.42:1.000:0.992 0/0/1/1/1/1:6:44,95:0.62:-0.85:1.000:0.762 0/0/1/1:4:62,106:0.56:-0.31:1.000:0.966 0/1/1/1:4:38,172:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,52:0.29:-0.55:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,184:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,154:0.56: 1.09:1.000:0.961 0/0/1/1:4:106,126:0.47: 0.89:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,111:0.79:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,116:0.55: 0.03:1.000:0.977 0/0/1/1:4:85,66:0.38:-0.62:0.998:0.575 0/0/1/1:4:69,105:0.53:-0.20:1.000:0.992 0/0/1/1:4:65,144:0.62: 0.46:1.000:0.536 0/1/1/1:4:32,81:0.65:-1.33:1.000:0.813 0/0/1/1:4:62,127:0.60: 0.08:1.000:0.751 0/0/0/1:4:139,65:0.28: 0.36:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,198:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,122:0.56: 0.18:1.000:0.970 0/0/1/1:4:57,85:0.53:-0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,108:0.57:-0.31:1.000:0.938 0/0/0/1:4:130,83:0.34: 0.53:1.000:0.874 0/0/1/1:4:100,135:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,84:0.56:-0.94:1.000:0.973 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,55:0.30:-0.49:1.000:0.982 0/0/1/1:4:79,98:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,145:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,56:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,51:0.36:-1.13:1.000:0.712 0/1/1/1:4:28,124:0.76:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,117:0.73:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,99:0.47:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:80,52:0.34:-0.98:1.000:0.850 0/1/1/1:4:31,154:0.78: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,72:0.31: 0.31:1.000:0.971 0/1/1/1:4:29,137:0.77:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,291:1.00: 1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,135:0.59: 0.40:1.000:0.884 0/0/1/1:4:50,89:0.57:-0.85:1.000:0.945 0/1/1/1:4:36,150:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,174:0.77: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,211:0.76: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,63:0.65:-1.80:1.000:0.804 0/1/1/1:4:31,157:0.79: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,72:0.59:-1.41:1.000:0.851 0/0/1/1:4:61,105:0.56:-0.35:1.000:0.964 0/0/0/1:4:77,36:0.28:-1.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,48:0.28:-0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,61:0.34:-0.55:1.000:0.852 0/0/1/1:4:72,133:0.58: 0.38:1.000:0.916 0/0/0/1:4:135,74:0.31: 0.46:1.000:0.976 0/1/1/1:4:57,186:0.70: 1.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:90,43:0.28:-0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,246:0.77: 2.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,80:0.49:-0.77:0.999:0.996 0/0/0/1:4:94,68:0.37:-0.42:1.000:0.623 0/1/1/1:4:25,114:0.77:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,199:0.78: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,69:0.57:-1.43:1.000:0.949 0/0/0/1:4:79,41:0.30:-1.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:89,43:0.28:-0.98:1.000:0.994 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,191:0.77: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,53:0.35:-1.02:1.000:0.745 0/0/1/1:4:103,113:0.46: 0.59:1.000:0.984 0/0/1/1:4:75,107:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,121:0.54: 0.23:1.000:0.986 0/0/1/1:4:56,108:0.59:-0.38:1.000:0.864 0/0/1/1:4:48,93:0.59:-0.81:1.000:0.857 0/0/0/1:4:84,36:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,39:0.31:-1.43:1.000:0.966 0/1/1/1:4:41,153:0.73: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,194:0.79: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,75:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:101,57:0.31:-0.49:1.000:0.967 0/0/0/1:4:122,52:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,157:0.51: 1.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,107:0.47: 0.23:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,182:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,106:0.56:-0.33:1.000:0.959 0/0/1/1:4:64,119:0.58:-0.03:1.000:0.909 0/0/1/1:4:60,103:0.56:-0.40:1.000:0.965 0/0/1/1:4:77,109:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,130:0.73:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,135:0.55: 0.62:1.000:0.982 0/0/1/1:4:88,114:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,232:0.82: 1.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,201:0.78: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,72:0.29: 0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:104,75:0.36:-0.10:1.000:0.632 0/0/1/1:4:88,186:0.61: 1.67:1.000:0.672 0/1/1/1:4:45,232:0.79: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,15:0.38:-2.81:1.000:0.620 0/0/1/1:4:62,102:0.55:-0.38:1.000:0.979 1/1/1/1:4:1,272:1.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,69:0.27: 0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,137:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,67:0.32:-0.07:1.000:0.948 0/0/1/1:4:79,101:0.49:-0.08:0.998:0.996 0/0/1/1:4:85,149:0.57: 0.92:1.000:0.955 0/1/1/1:4:47,175:0.73: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,107:0.52:-0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:111,55:0.29:-0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,66:0.32:-0.14:1.000:0.941 0/1/1/1:4:40,212:0.79: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,131:0.57: 0.40:1.000:0.956 0/0/1/1:4:79,139:0.57: 0.62:1.000:0.952 0/0/1/1:4:72,131:0.58: 0.34:1.000:0.929 0/0/1/1:4:65,97:0.53:-0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,138:0.58: 0.53:1.000:0.920 0/0/1/1:4:50,83:0.55:-0.96:1.000:0.977 0/0/1/1:4:71,97:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,120:0.57: 0.05:1.000:0.941 0/1/1/1:4:36,173:0.78: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,91:0.55:-0.70:1.000:0.982 0/0/1/1:4:82,95:0.47:-0.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:59,243:0.75: 2.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,161:0.60: 1.07:1.000:0.814 0/1/1/1:4:55,213:0.74: 1.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,77:0.39:-0.20:1.000:0.635 0/0/1/1:4:80,119:0.53: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:190,79:0.26: 1.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,205:0.77: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,117:0.53: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:78,116:0.53: 0.18:1.000:0.994 -chr4.1 56251860 chr4.1_056251860 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,328:.:-0.15:1.000:. ./.:4:100,275:.: 0.41:1.000:. ./.:4:187,100:.:-0.73:1.000:. ./.:4:102,296:.: 0.70:1.000:. ./.:4:132,365:.: 1.97:1.000:. ./.:4:5,334:.:-0.06:1.000:. ./.:4:67,131:.:-1.87:1.000:. ./.:4:97,280:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,295:.:-0.47:1.000:. ./.:4:105,195:.:-0.56:1.000:. ./.:4:99,113:.:-1.69:1.000:. ./.:4:216,187:.: 0.77:1.000:. ./.:4:5,295:.:-0.56:1.000:. ./.:4:3,310:.:-0.39:1.000:. ./.:4:88,277:.: 0.28:1.000:. ./.:4:103,231:.:-0.12:1.000:. ./.:4:119,312:.: 1.13:0.999:. ./.:4:104,282:.: 0.55:1.000:. ./.:4:12,348:.: 0.21:1.000:. ./.:4:132,189:.:-0.29:1.000:. ./.:4:57,161:.:-1.61:1.000:. ./.:4:223,192:.: 0.92:1.000:. ./.:4:9,330:.:-0.06:1.000:. ./.:4:199,236:.: 1.18:1.000:. ./.:4:63,137:.:-1.84:1.000:. ./.:4:102,295:.: 0.69:1.000:. ./.:4:109,291:.: 0.73:1.000:. ./.:4:226,199:.: 1.05:1.000:. ./.:4:111,293:.: 0.78:1.000:. ./.:4:249,234:.: 1.79:1.000:. ./.:4:233,243:.: 1.70:1.000:. ./.:4:100,165:.:-1.01:1.000:. ./.:4:177,139:.:-0.35:1.000:. ./.:4:3,241:.:-1.28:1.000:. ./.:3:0,118:.:-2.90:0.999:. ./.:4:238,229:.: 1.59:1.000:. ./.:4:215,210:.: 1.05:1.000:. ./.:4:255,217:.: 1.65:1.000:. ./.:4:120,313:.: 1.15:1.000:. ./.:4:132,290:.: 1.01:1.000:. ./.:4:103,213:.:-0.35:1.000:. ./.:4:190,200:.: 0.60:1.000:. ./.:4:235,222:.: 1.46:1.000:. ./.:4:96,161:.:-1.11:1.000:. ./.:4:145,357:.: 2.04:1.000:. ./.:4:200,209:.: 0.84:1.000:. ./.:4:121,328:.: 1.36:1.000:. ./.:4:26,87:.:-2.96:1.000:. ./.:4:3,239:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,220:.:-1.59:1.000:. ./.:4:98,317:.: 0.92:1.000:. ./.:4:119,231:.: 0.08:1.000:. ./.:4:95,261:.: 0.16:1.000:. ./.:4:123,216:.:-0.06:1.000:. ./.:4:110,191:.:-0.55:1.000:. ./.:4:5,279:.:-0.76:1.000:. ./.:4:90,280:.: 0.34:1.000:. ./.:4:104,303:.: 0.82:1.000:. ./.:4:106,264:.: 0.34:1.000:. ./.:6:106,177:.:-0.78:1.000:. ./.:4:120,198:.:-0.33:1.000:. ./.:4:5,259:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,331:.:-0.08:1.000:. ./.:4:115,295:.: 0.86:1.000:. ./.:4:125,225:.: 0.08:1.000:. ./.:4:99,271:.: 0.34:1.000:. ./.:4:94,236:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,188:.:-0.46:1.000:. ./.:4:124,310:.: 1.16:0.998:. ./.:4:101,236:.:-0.08:1.000:. ./.:4:250,221:.: 1.64:1.000:. ./.:4:3,191:.:-1.92:1.000:. ./.:4:109,320:.: 1.10:1.000:. ./.:4:211,215:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,342:.:-0.02:1.000:. ./.:4:2,224:.:-1.51:1.000:. ./.:4:6,275:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,316:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,391:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.48:1.000:. ./.:4:135,203:.:-0.07:1.000:. ./.:4:8,360:.: 0.32:1.000:. ./.:4:92,280:.: 0.37:1.000:. ./.:4:106,260:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,315:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,215:.:-1.57:1.000:. ./.:4:3,258:.:-1.06:1.000:. ./.:4:79,288:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,252:.: 0.07:1.000:. ./.:4:98,177:.:-0.88:1.000:. ./.:4:106,288:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,334:.: 1.43:1.000:. ./.:4:59,195:.:-1.15:1.000:. ./.:4:120,316:.: 1.19:1.000:. ./.:4:208,226:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,314:.:-0.38:1.000:. ./.:4:92,248:.:-0.04:1.000:. ./.:4:120,190:.:-0.43:1.000:. ./.:4:109,320:.: 1.10:1.000:. ./.:4:90,143:.:-1.42:1.000:. ./.:4:7,314:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,217:.:-1.55:1.000:. ./.:4:86,280:.: 0.29:1.000:. ./.:4:115,143:.:-1.10:1.000:. ./.:4:6,244:.:-1.20:1.000:. ./.:4:109,238:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,432:.: 1.14:1.000:. ./.:4:8,408:.: 0.93:1.000:. ./.:4:99,178:.:-0.85:1.000:. ./.:4:124,205:.:-0.19:1.000:. ./.:4:162,235:.: 0.69:1.000:. ./.:4:107,191:.:-0.58:0.999:. ./.:4:129,196:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,164:.:-2.29:1.000:. ./.:4:0,443:.: 1.28:1.000:. ./.:4:152,181:.:-0.13:1.000:. ./.:4:95,170:.:-1.01:1.000:. ./.:4:109,184:.:-0.65:1.000:. ./.:4:111,160:.:-0.93:1.000:. ./.:4:124,283:.: 0.82:1.000:. ./.:4:195,170:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,312:.: 1.01:1.000:. ./.:4:4,326:.:-0.17:1.000:. ./.:4:103,171:.:-0.89:1.000:. ./.:4:132,324:.: 1.45:1.000:. ./.:4:241,182:.: 1.02:1.000:. ./.:4:192,166:.: 0.19:1.000:. ./.:4:103,154:.:-1.11:1.000:. ./.:4:85,216:.:-0.55:1.000:. ./.:4:202,100:.:-0.53:1.000:. ./.:4:95,265:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,192:.:-1.23:1.000:. ./.:4:229,233:.: 1.52:1.000:. ./.:4:179,88:.:-0.98:1.000:. ./.:4:6,359:.: 0.28:1.000:. ./.:4:214,195:.: 0.84:1.000:. ./.:4:78,246:.:-0.25:1.000:. ./.:4:92,279:.: 0.35:1.000:. ./.:4:189,189:.: 0.44:1.000:. ./.:4:122,290:.: 0.88:1.000:. ./.:4:104,286:.: 0.60:1.000:. ./.:4:98,161:.:-1.09:1.000:. ./.:4:104,133:.:-1.37:1.000:. ./.:4:241,108:.: 0.07:1.000:. ./.:4:110,324:.: 1.16:1.000:. ./.:4:217,217:.: 1.16:1.000:. ./.:4:121,165:.:-0.74:1.000:. ./.:4:4,318:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,265:.:-0.89:1.000:. ./.:4:211,236:.: 1.33:1.000:. ./.:4:2,274:.:-0.87:1.000:. ./.:4:110,122:.:-1.43:1.000:. ./.:4:73,180:.:-1.16:1.000:. ./.:4:119,304:.: 1.02:1.000:. ./.:4:214,204:.: 0.96:1.000:. ./.:4:206,215:.: 1.00:1.000:. ./.:4:9,322:.:-0.16:1.000:. ./.:4:103,271:.: 0.39:0.998:. ./.:4:0,368:.: 0.32:1.000:. ./.:4:105,166:.:-0.93:1.000:. ./.:4:89,212:.:-0.55:1.000:. ./.:4:5,250:.:-1.14:1.000:. ./.:4:107,207:.:-0.38:1.000:. ./.:4:120,293:.: 0.89:1.000:. ./.:4:229,201:.: 1.11:1.000:. ./.:4:197,92:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.59:1.000:. ./.:4:91,168:.:-1.09:1.000:. ./.:4:81,185:.:-1.00:1.000:. ./.:4:97,176:.:-0.91:1.000:. ./.:4:195,86:.:-0.80:1.000:. ./.:4:6,285:.:-0.67:1.000:. ./.:4:94,256:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,248:.:-1.18:1.000:. ./.:4:97,186:.:-0.78:1.000:. ./.:4:256,211:.: 1.59:1.000:. ./.:4:104,388:.: 1.91:1.000:. ./.:4:5,267:.:-0.92:1.000:. ./.:4:188,143:.:-0.16:1.000:. ./.:4:232,214:.: 1.32:1.000:. ./.:4:7,376:.: 0.51:1.000:. ./.:4:237,235:.: 1.65:1.000:. ./.:4:92,174:.:-1.00:1.000:. ./.:4:92,268:.: 0.21:1.000:. -chr4.1 56329749 chr4.1_056329749 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:21,129:0.81: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,21:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,99:0.56: 1.28:1.000:0.968 0/0/0/1:4:67,12:0.17:-0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:63,14:0.20:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,105:0.52: 1.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,69:0.59: 0.03:1.000:0.890 0/0/1/1:4:62,71:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,136:0.73: 1.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,15:0.48:-1.83:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,23:0.36:-1.04:1.000:0.716 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,60:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,43:0.46:-0.48:1.000:0.987 0/0/1/1:4:64,72:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,95:0.60: 0.89:1.000:0.763 0/0/0/1:4:87,22:0.22: 0.03:0.999:1.000 0/0/0/1:4:84,49:0.36: 0.58:1.000:0.687 0/1/1/1:4:41,128:0.71: 1.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,89:0.54: 1.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:10,51:0.79:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,21:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,67:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,26:0.29:-0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:13,24:0.60:-1.64:1.000:0.782 0/0/1/1:4:70,85:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,82:0.46: 1.35:1.000:0.986 0/0/0/1:4:77,24:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,16:0.20:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,44:0.31: 0.82:1.000:0.969 0/0/0/1:4:142,58:0.30: 2.14:1.000:0.986 0/0/1/1:4:84,92:0.48: 1.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,27:0.55:-1.46:1.000:0.977 0/1/1/1:4:10,31:0.71:-1.55:1.000:0.991 0/1/1:3:11,24:0.64:-1.69:0.999:1.000 0/0/0/1:4:124,39:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,18:0.19:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,16:0.20:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,35:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,97:0.57: 1.14:1.000:0.946 0/0/1/1:4:44,48:0.48:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:58,20:0.27:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,62:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,89:0.53: 1.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,63:0.55:-0.07:1.000:0.977 0/0/1/1:4:44,56:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,45:0.45:-0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:222,235:0.47: 8.09:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,128:0.79: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,160:0.78: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,29:0.44:-1.06:1.000:0.963 0/0/0/1:4:90,39:0.31: 0.49:1.000:0.976 0/0/0/1:4:56,20:0.28:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,51:0.47:-0.16:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,73:0.65:-0.09:1.000:0.829 0/0/1/1:4:63,88:0.54: 1.00:1.000:0.990 0/0/0/1:4:50,21:0.30:-0.85:1.000:0.982 0/0/1/1:4:64,71:0.48: 0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,102:0.74: 0.51:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:27,57:0.63:-0.55:1.000:0.838 0/0/1/1:4:26,51:0.61:-0.71:1.000:0.636 0/0/1/1:4:58,78:0.53: 0.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,117:0.68: 1.23:1.000:0.951 0/0/0/1:4:73,35:0.33: 0.00:1.000:0.937 0/1/1/1:4:41,89:0.64: 0.51:1.000:0.652 0/0/1/1:4:79,57:0.40: 0.65:1.000:0.788 0/0/1/1:4:27,44:0.57:-0.85:1.000:0.941 0/0/1/1:4:35,48:0.53:-0.57:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,101:0.72: 0.54:0.998:0.996 0/0/1/1:4:51,44:0.43:-0.30:1.000:0.956 0/0/0/1:4:70,24:0.27:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,74:0.78:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,51:0.32: 1.16:1.000:0.941 0/0/1/1:4:42,76:0.60: 0.24:1.000:0.820 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,99:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,107:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,54:0.58:-0.51:1.000:0.913 0/1/1/1:4:18,85:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,102:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,31:0.34:-0.39:1.000:0.878 0/1/1/1:4:20,81:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,88:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,29:0.48:-1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,72:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,104:0.82: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,64:0.71:-0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,39:0.47:-0.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,53:0.55:-0.44:1.000:0.982 0/0/1/1:4:44,59:0.53:-0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,56:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,58:0.54:-0.23:1.000:0.985 0/1/1/1:4:30,88:0.70: 0.24:1.000:0.983 0/0/0/1:4:38,12:0.26:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,16:0.24:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,25:0.27:-0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,48:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,28:0.40:-0.97:1.000:0.821 0/1/1/1:4:27,60:0.64:-0.48:1.000:0.712 0/1/1/1:4:23,56:0.66:-0.67:1.000:0.877 0/0/1/1:4:50,59:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,34:0.61:-1.29:1.000:0.732 0/0/1/1:4:28,46:0.57:-0.78:1.000:0.935 0/0/1/1:4:31,56:0.60:-0.48:1.000:0.823 0/0/1/1:4:40,45:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,83:0.72: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,83:0.71: 0.05:1.000:0.990 0/1/1/1:4:21,136:0.81: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,43:0.36: 0.24:1.000:0.722 0/0/1/1:4:22,36:0.57:-1.15:1.000:0.938 0/0/0/1:4:107,55:0.34: 1.26:1.000:0.884 0/1/1/1:4:19,63:0.72:-0.60:0.999:0.996 0/0/1/1:4:44,58:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,50:0.54:-0.53:1.000:0.987 0/0/1/1:4:47,46:0.46:-0.34:1.000:0.987 0/0/0/1:4:52,17:0.26:-0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,59:0.53:-0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,43:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,70:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,13:0.19:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,35:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,25:0.40:-1.13:1.000:0.818 0/1/1/1:4:38,145:0.74: 1.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,69:0.76:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,85:0.79:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,48:0.55:-0.64:1.000:0.977 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,45:0.55:-0.76:1.000:0.977 0/1/1/1:4:19,59:0.71:-0.69:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,32:0.35:-0.44:1.000:0.762 0/0/0/1:4:64,34:0.34:-0.23:1.000:0.846 0/0/1/1:4:25,36:0.54:-1.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:35,52:0.55:-0.48:1.000:0.980 0/1/1/1:4:28,70:0.67:-0.23:1.000:0.906 0/0/1/1:4:53,80:0.55: 0.58:1.000:0.976 0/0/0/1:4:63,17:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,11:0.22:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,11:0.21:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,7:0.18:-1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,35:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,38:0.58:-1.08:1.000:0.931 0/0/1/1:4:51,57:0.48: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,20:0.31:-0.97:1.000:0.975 0/0/1/1:4:82,56:0.39: 0.70:1.000:0.684 0/0/1/1:4:59,52:0.44: 0.07:1.000:0.964 0/0/0/1:4:68,24:0.28:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,40:0.40:-0.30:1.000:0.801 0/1/1/1:4:26,127:0.78: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,104:0.80: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,24:0.22: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,73:0.55: 0.33:1.000:0.979 0/1/1/1:4:4,40:0.85:-1.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:48,35:0.40:-0.57:1.000:0.805 0/0/0/1:4:89,37:0.30: 0.42:1.000:0.983 0/0/1/1:4:33,64:0.61:-0.25:1.000:0.667 0/0/1/1:4:49,76:0.56: 0.40:1.000:0.967 0/1/1/1:4:22,124:0.80: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,41:0.44:-0.48:0.998:0.968 0/1/1/1:4:21,80:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,37:0.39:-0.37:1.000:0.651 0/0/1/1:4:50,55:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,103:0.74: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,58:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,98:0.51: 1.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,79:0.53: 0.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:80,31:0.29: 0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,76:0.60: 0.24:1.000:0.820 0/0/1/1:4:37,67:0.60:-0.09:1.000:0.819 0/0/1/1:4:45,61:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,50:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,37:0.37:-0.25:1.000:0.559 0/1/1/1:4:33,75:0.65: 0.00:1.000:0.762 0/0/1/1:4:43,47:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,54:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,88:0.53: 1.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:122,46:0.29: 1.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,58:0.47: 0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,74:0.48: 0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,74:0.55: 0.38:1.000:0.981 0/0/0/1:4:96,27:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,156:0.83: 1.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,25:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,57:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,26:0.30:-0.46:1.000:0.982 -chr4.1 56540472 chr4.1_056540472 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:383,110:0.22: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,78:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,189:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:357,114:0.24: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,233:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:295,110:0.27: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:152,60:0.28:-1.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:184,214:0.53: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:161,181:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,34:0.32:-3.13:1.000:0.948 0/0/0/1:4:116,35:0.23:-2.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:367,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:388,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:409,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,184:0.47: 0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:202,206:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:335,108:0.24: 0.97:0.999:1.000 0/0/0/1:4:195,78:0.28:-1.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:365,136:0.27: 1.67:1.000:0.998 0/0/0/0:4:442,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,40:0.36:-3.06:1.000:0.703 0/0/0/1:4:284,96:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,124:0.27: 1.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:281,99:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,55:0.46:-2.95:1.000:0.986 0/0/1/1:4:220,227:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:314,103:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,175:0.44: 0.35:1.000:0.970 0/0/0/1:4:349,119:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,155:0.45:-0.28:1.000:0.981 0/0/0/1:4:339,94:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,86:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,33:0.53:-3.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,106:0.59:-2.31:1.000:0.834 0/0/1:3:56,20:0.26:-3.47:0.999:1.000 0/0/1/1:4:203,184:0.47: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:318,101:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:324,103:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:315,102:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,232:0.49: 1.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:303,93:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,174:0.46: 0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:239,193:0.44: 0.83:1.000:0.970 0/0/1/1:4:218,185:0.45: 0.48:1.000:0.984 0/1/1/1:4:114,367:0.72: 1.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,225:0.53: 0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:398,110:0.21: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,145:0.42:-0.26:1.000:0.911 0/0/1/1:4:173,180:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:276,102:0.26: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:269,94:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:352,123:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,62:0.23:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:467,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,184:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,176:0.44: 0.36:1.000:0.972 0/0/1/1:4:161,162:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:280,122:0.30: 0.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:191,176:0.47: 0.05:1.000:0.994 0/0/0/0/1/1:6:175,116:0.39:-0.87:1.000:0.692 0/0/0/1:4:236,93:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:255,96:0.27:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:305,93:0.23: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,157:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:247,246:0.49: 1.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:497,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,230:0.77:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:395,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,160:0.49:-0.49:0.998:0.996 0/0/0/1:4:277,78:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,109:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,120:0.52:-1.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:315,107:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:190,223:0.53: 0.60:1.000:0.992 0/0/0/0:4:388,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,173:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,164:0.47:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/0:4:379,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,89:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,172:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:196,68:0.25:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:276,113:0.29: 0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:302,100:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,77:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,250:0.73:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:284,117:0.29: 0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:176,75:0.29:-1.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:271,73:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,261:0.73:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,152:0.47:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/0:4:252,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,263:0.70:-0.09:1.000:0.984 0/0/1/1:4:190,195:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:196,86:0.30:-0.98:1.000:0.985 0/0/1/1:4:167,189:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:259,84:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,170:0.53:-0.58:1.000:0.992 0/0/0/0:4:322,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,78:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,306:0.69: 0.69:1.000:0.973 0/0/1/1:4:133,138:0.50:-1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:322,83:0.20: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:305,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,180:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:323,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:352,1:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,136:0.52:-1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:255,208:0.44: 1.21:1.000:0.974 0/0/0/1:4:361,122:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,97:0.27:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/0:4:347,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:397,124:0.23: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,179:0.48: 0.06:0.999:0.995 0/0/0/0:4:352,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,65:0.29:-1.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:298,99:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,84:0.29:-0.90:1.000:0.994 0/0/0/0:4:342,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:319,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,79:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:292,91:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,180:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:291,87:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,224:0.53: 0.59:1.000:0.991 0/0/0/1:4:295,100:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,196:0.47: 0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:93,264:0.70:-0.07:1.000:0.984 0/0/0/0:4:297,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,140:0.49:-0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:213,79:0.27:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:241,90:0.27:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,115:0.50:-1.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:203,214:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,183:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/0:4:470,0:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,116:0.28: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:193,164:0.45:-0.07:1.000:0.984 0/0/1/1:4:185,156:0.45:-0.27:1.000:0.982 0/0/0/1:4:239,77:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,106:0.26: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,185:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:260,67:0.20:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,85:0.29:-0.91:1.000:0.992 0/0/0/1:4:363,111:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:388,153:0.28: 2.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,196:0.48: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:301,108:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:304,126:0.29: 0.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:227,81:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:356,122:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,79:0.22:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,63:0.49:-2.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:254,77:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,212:0.53: 0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:224,176:0.44: 0.45:1.000:0.959 0/1/1/1:4:122,355:0.70: 1.38:1.000:0.987 0/0/0/1:4:305,92:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,83:0.22: 0.10:0.998:1.000 0/0/1/1:4:203,208:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,103:0.30:-0.24:1.000:0.989 0/0/0/1:4:280,80:0.22:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,93:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:433,1:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,287:0.70: 0.29:1.000:0.986 0/1/1/1:4:99,244:0.68:-0.24:1.000:0.939 0/0/0/1:4:218,91:0.29:-0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:199,186:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:277,89:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,96:0.26:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/0:4:344,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,83:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:406,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,244:0.70:-0.39:1.000:0.982 0/0/0/0:4:294,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,75:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,206:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:320,117:0.26: 0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:280,96:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,213:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:363,111:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:346,134:0.27: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:250,263:0.51: 1.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,87:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:294,97:0.24: 0.34:1.000:1.000 -chr4.1 56692423 chr4.1_056692423 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:78,70:0.47:-0.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:69,34:0.33:-1.10:1.000:0.901 0/0/0/1:4:204,42:0.18: 1.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,32:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,58:0.34: 0.25:1.000:0.873 0/0/0/1:4:171,60:0.27: 1.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,27:0.21:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,80:0.62:-0.71:1.000:0.625 0/0/1/1:4:72,89:0.54: 0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:13,22:0.60:-2.40:1.000:0.801 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-2.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,45:0.27: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,36:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,89:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,45:0.20: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,36:0.27:-0.50:0.999:0.997 0/1/1/1:4:46,165:0.72: 0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:163,107:0.40: 2.11:1.000:0.781 0/0/0/1:4:188,53:0.23: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,39:0.76:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,40:0.26:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:137,50:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,40:0.30:-0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:6,11:0.61:-2.75:1.000:0.656 0/1/1/1:4:50,99:0.63:-0.22:1.000:0.516 0/0/1/1:4:71,68:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,51:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,51:0.36:-0.35:1.000:0.657 0/0/0/1:4:129,50:0.28: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:155,36:0.19: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,33:0.17: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:18,3:0.15:-2.67:1.000:0.983 0/1/1/1:4:7,32:0.75:-2.32:1.000:0.999 0/1/1:3:12,15:0.54:-2.56:0.999:0.946 0/0/0/1:4:124,37:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,41:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,39:0.19: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,44:0.38:-0.83:1.000:0.558 0/0/1/1:4:38,68:0.61:-1.04:1.000:0.705 0/0/0/1:4:177,45:0.21: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,40:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,107:0.47: 1.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:148,40:0.22: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,86:0.64:-0.64:1.000:0.643 0/0/1/1:4:95,82:0.46: 0.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:134,74:0.36: 0.92:1.000:0.696 0/1/1/1:4:46,128:0.68: 0.26:1.000:0.957 0/0/1/1:4:70,78:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,54:0.42:-0.58:1.000:0.903 0/0/1/1:4:65,54:0.45:-0.79:1.000:0.984 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,38:0.33:-0.83:1.000:0.924 0/0/0/1:4:141,45:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,32:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,29:0.14: 0.90:1.000:0.977 0/0/0/1:4:68,40:0.37:-1.00:1.000:0.515 0/0/1/1:4:80,79:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,117:0.59: 0.55:1.000:0.854 0/0/0/0/0/1:6:141,33:0.19: 0.26:1.000:0.941 0/0/0/1:4:132,29:0.18: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,39:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,72:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,31:0.34:-1.29:1.000:0.884 0/0/0/1:4:157,37:0.20: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,58:0.24: 1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,48:0.52:-1.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:137,37:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,95:0.53: 0.32:0.998:0.993 0/0/1/1:4:63,43:0.41:-1.04:1.000:0.852 0/0/0/1:4:174,36:0.18: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,80:0.43: 0.53:1.000:0.939 0/0/0/1:4:79,30:0.28:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:132,68:0.34: 0.76:1.000:0.842 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,59:0.33: 0.36:1.000:0.903 0/0/0/1:4:100,39:0.29:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:122,96:0.44: 1.11:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,50:0.58:-1.50:1.000:0.895 0/0/1/1:4:166,105:0.39: 2.13:1.000:0.694 0/0/1/1:4:119,72:0.38: 0.59:1.000:0.570 0/0/1/1:4:96,81:0.46: 0.32:1.000:0.987 0/0/1/1:4:56,56:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,91:0.45: 0.80:1.000:0.981 0/0/1/1:4:68,63:0.48:-0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:83,36:0.31:-0.79:1.000:0.977 0/0/1/1:4:59,64:0.52:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,77:0.63:-0.87:1.000:0.568 0/0/0/1:4:149,41:0.22: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,59:0.59:-1.25:1.000:0.844 0/0/1/1:4:99,143:0.57: 1.57:1.000:0.947 0/0/1/1:4:49,30:0.38:-1.56:1.000:0.605 0/0/0/1:4:103,36:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,45:0.27: 0.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,94:0.63:-0.37:1.000:0.539 0/0/0/1:4:66,23:0.26:-1.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,43:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,34:0.33:-1.10:1.000:0.901 0/1/1/1:4:31,90:0.69:-0.75:1.000:0.969 0/0/0/1:4:93,33:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:144,29:0.17: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,111:0.57: 0.51:1.000:0.941 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,109:0.39: 2.26:1.000:0.742 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,43:0.19: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,50:0.26: 0.71:0.999:0.999 0/0/0/1:4:196,33:0.15: 1.32:1.000:0.985 0/0/0/1:4:73,25:0.26:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,77:0.61:-0.77:1.000:0.704 0/0/0/1:4:97,43:0.31:-0.39:1.000:0.970 0/0/0/1:4:126,39:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,39:0.20: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,71:0.35: 0.88:1.000:0.805 0/0/0/1:4:86,41:0.33:-0.64:1.000:0.931 0/0/1/1:4:97,76:0.44: 0.25:1.000:0.968 0/0/1/1:4:72,89:0.54: 0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:118,89:0.43: 0.90:1.000:0.951 0/0/1/1:4:125,85:0.41: 0.95:1.000:0.846 0/0/1/1:4:72,116:0.59: 0.53:1.000:0.864 0/0/1/1:4:106,69:0.40: 0.28:1.000:0.763 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,30:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,105:0.61: 0.05:1.000:0.682 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,43:0.39:-0.92:1.000:0.655 0/1/1/1:4:27,55:0.63:-1.50:1.000:0.580 0/0/1/1:4:93,60:0.39:-0.14:1.000:0.743 0/0/0/1:4:197,30:0.14: 1.28:1.000:0.949 0/0/0/1:4:148,56:0.28: 0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:142,43:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,42:0.41:-1.08:1.000:0.840 0/0/1/1:4:62,40:0.39:-1.12:1.000:0.743 0/0/0/1:4:121,34:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,88:0.55:-0.06:1.000:0.983 0/0/1/1:4:57,77:0.56:-0.50:1.000:0.971 0/0/0/1:4:119,43:0.27: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 2.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,112:0.56: 0.67:1.000:0.971 0/0/0/1:4:106,39:0.27:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,97:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,68:0.52:-0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:154,56:0.27: 0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,37:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,14:0.60:-2.65:1.000:0.746 0/0/1/1:4:86,72:0.46:-0.04:1.000:0.986 0/0/0/1:4:91,43:0.33:-0.50:1.000:0.938 0/0/1/1:4:157,106:0.41: 1.97:1.000:0.834 0/0/1/1:4:145,97:0.40: 1.57:1.000:0.818 0/0/1/1:4:131,88:0.40: 1.13:1.000:0.825 0/0/1/1:4:90,76:0.46: 0.11:0.998:0.987 1/1/1/1:4:1,141:0.99:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,67:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,76:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:177,42:0.20: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,81:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:136,90:0.40: 1.26:1.000:0.797 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,88:0.64:-0.60:1.000:0.689 0/0/0/1:4:156,40:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,42:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:149,30:0.17: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,51:0.30: 0.25:1.000:0.985 0/0/1/1:4:91,65:0.42:-0.08:1.000:0.909 0/0/0/1:4:87,26:0.24:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,38:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,36:0.17: 1.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,97:0.54: 0.32:1.000:0.989 0/0/0/1:4:138,50:0.27: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,51:0.26: 0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:172,48:0.22: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,85:0.34: 1.74:1.000:0.851 0/0/0/1:4:211,49:0.19: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,40:0.21: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,39:0.25:-0.02:1.000:0.999 -chr4.1 57079358 chr4.1_057079358 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:100,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.42:1.000:. ./.:3:14,0:.:-1.53:0.999:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:170,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:89,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:71,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:142,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.82:0.998:. ./.:4:45,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:130,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:123,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:90,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:150,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:165,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:101,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.38:0.998:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:111,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.50:1.000:. -chr4.1 57390827 chr4.1_057390827 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:296,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.44:0.999:. ./.:4:269,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:448,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.37:1.000:. ./.:3:34,0:.:-2.49:0.999:. ./.:4:216,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.16:1.000:. ./.:6:172,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.16:0.998:. ./.:4:230,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:325,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:396,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:392,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.53:0.998:. ./.:4:209,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.94:1.000:. -chr4.1 57510696 chr4.1_057510696 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:228,2:.: 0.92:1.000:. ./.:4:168,58:.: 0.86:1.000:. ./.:4:161,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:177,42:.: 0.74:1.000:. ./.:4:203,83:.: 1.84:1.000:. ./.:4:83,91:.: 0.01:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:187,69:.: 1.35:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:104,88:.: 0.30:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:213,5:.: 0.73:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:220,3:.: 0.81:0.999:. ./.:4:175,79:.: 1.32:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:202,100:.: 2.10:1.000:. ./.:4:29,35:.:-1.79:1.000:. ./.:4:159,53:.: 0.63:1.000:. ./.:4:164,57:.: 0.78:1.000:. ./.:4:166,70:.: 1.02:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:156,170:.: 2.50:1.000:. ./.:4:106,129:.: 1.01:1.000:. ./.:4:206,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:122,122:.: 1.15:1.000:. ./.:4:195,80:.: 1.66:1.000:. ./.:4:110,111:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,26:.:-2.19:1.000:. ./.:4:48,8:.:-1.92:1.000:. ./.:3:8,3:.:-2.66:0.999:. ./.:4:103,140:.: 1.14:1.000:. ./.:4:159,51:.: 0.60:1.000:. ./.:4:141,46:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:201,10:.: 0.61:1.000:. ./.:4:68,70:.:-0.58:1.000:. ./.:4:89,84:.:-0.01:1.000:. ./.:4:126,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,108:.: 0.48:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:111,41:.:-0.35:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:62,62:.:-0.81:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:107,39:.:-0.45:1.000:. ./.:4:190,3:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:119,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:61,81:.:-0.52:1.000:. ./.:4:70,70:.:-0.55:1.000:. ./.:6:83,28:.:-1.02:1.000:. ./.:4:77,60:.:-0.60:1.000:. ./.:4:123,46:.:-0.07:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:95,35:.:-0.71:1.000:. ./.:4:220,7:.: 0.88:1.000:. ./.:4:131,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:96,29:.:-0.79:1.000:. ./.:4:115,39:.:-0.32:1.000:. ./.:4:80,96:.: 0.04:0.998:. ./.:4:113,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,52:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,30:.:-1.11:1.000:. ./.:4:141,39:.: 0.11:1.000:. ./.:4:172,60:.: 0.96:1.000:. ./.:4:130,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:119,50:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,35:.:-0.40:1.000:. ./.:4:120,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:128,49:.: 0.06:1.000:. ./.:4:124,6:.:-0.71:1.000:. ./.:4:108,34:.:-0.52:1.000:. ./.:4:162,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,100:.: 0.09:1.000:. ./.:4:156,45:.: 0.45:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:81,26:.:-1.09:1.000:. ./.:4:111,33:.:-0.48:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:91,45:.:-0.61:1.000:. ./.:4:116,42:.:-0.25:1.000:. ./.:4:87,92:.: 0.09:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:104,39:.:-0.50:1.000:. ./.:4:124,45:.:-0.07:1.000:. ./.:4:78,22:.:-1.20:1.000:. ./.:4:79,25:.:-1.14:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:141,65:.: 0.53:1.000:. ./.:4:94,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:113,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:78,24:.:-1.17:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:64,66:.:-0.71:1.000:. ./.:4:177,47:.: 0.83:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:70,30:.:-1.20:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:110,49:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,30:.:-1.17:1.000:. ./.:4:100,45:.:-0.47:1.000:. ./.:4:79,27:.:-1.11:1.000:. ./.:4:91,29:.:-0.88:1.000:. ./.:4:85,34:.:-0.89:1.000:. ./.:4:105,35:.:-0.55:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:70,24:.:-1.30:1.000:. ./.:4:68,75:.:-0.50:1.000:. ./.:4:213,63:.: 1.68:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:66,63:.:-0.73:1.000:. ./.:4:66,55:.:-0.86:1.000:. ./.:4:70,71:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,32:.:-1.01:1.000:. ./.:4:60,55:.:-0.96:1.000:. ./.:4:95,34:.:-0.73:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:108,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:126,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:122,58:.: 0.11:1.000:. ./.:4:59,26:.:-1.45:1.000:. ./.:4:72,35:.:-1.09:1.000:. ./.:4:75,30:.:-1.12:1.000:. ./.:4:62,56:.:-0.91:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:109,108:.: 0.71:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:162,75:.: 1.04:1.000:. ./.:4:133,143:.: 1.68:1.000:. ./.:4:111,107:.: 0.73:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:160,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:218,78:.: 2.01:1.000:. ./.:4:168,81:.: 1.24:1.000:. ./.:4:15,25:.:-2.19:1.000:. ./.:4:80,85:.:-0.14:1.000:. ./.:4:175,77:.: 1.29:1.000:. ./.:4:136,84:.: 0.76:1.000:. ./.:4:132,126:.: 1.38:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:89,106:.: 0.35:0.998:. ./.:4:170,65:.: 1.01:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:91,95:.: 0.20:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:165,58:.: 0.81:1.000:. ./.:4:166,79:.: 1.17:1.000:. ./.:4:100,134:.: 0.99:1.000:. ./.:4:126,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:94,114:.: 0.56:1.000:. ./.:4:108,148:.: 1.35:1.000:. ./.:4:152,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:142,57:.: 0.42:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:116,55:.:-0.04:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:98,96:.: 0.34:1.000:. ./.:4:128,160:.: 1.87:1.000:. ./.:4:89,125:.: 0.66:1.000:. ./.:4:148,72:.: 0.76:1.000:. ./.:4:173,48:.: 0.78:1.000:. ./.:4:171,86:.: 1.37:1.000:. ./.:4:284,13:.: 2.02:1.000:. ./.:4:134,150:.: 1.81:1.000:. ./.:4:99,112:.: 0.61:1.000:. ./.:4:161,62:.: 0.81:1.000:. -chr4.1 57661939 chr4.1_057661939 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:362,52:.: 0.63:1.000:. ./.:4:213,49:.:-0.98:1.000:. ./.:4:235,59:.:-0.64:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:316,65:.: 0.28:1.000:. ./.:4:466,70:.: 1.92:1.000:. ./.:4:186,31:.:-1.45:1.000:. ./.:4:362,44:.: 0.54:1.000:. ./.:4:225,98:.:-0.33:1.000:. ./.:4:98,26:.:-2.43:1.000:. ./.:4:149,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:485,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:300,44:.:-0.11:1.000:. ./.:4:379,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:536,0:.: 1.92:0.999:. ./.:4:399,62:.: 1.12:1.000:. ./.:4:468,61:.: 1.84:1.000:. ./.:4:505,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:47,40:.:-2.82:1.000:. ./.:4:351,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:415,68:.: 1.36:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,18:.:-3.18:1.000:. ./.:4:346,80:.: 0.75:1.000:. ./.:4:432,80:.: 1.66:1.000:. ./.:4:304,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:341,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:520,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:319,50:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,2:.:-3.00:1.000:. ./.:4:97,29:.:-2.41:1.000:. ./.:3:49,16:.:-3.06:0.999:. ./.:4:308,52:.: 0.06:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:386,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:504,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:382,89:.: 1.23:1.000:. ./.:4:320,67:.: 0.34:1.000:. ./.:4:318,51:.: 0.15:1.000:. ./.:4:309,69:.: 0.25:1.000:. ./.:4:272,42:.:-0.43:1.000:. ./.:4:250,118:.: 0.14:1.000:. ./.:4:269,56:.:-0.31:1.000:. ./.:4:322,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:306,38:.:-0.11:1.000:. ./.:4:253,113:.: 0.12:1.000:. ./.:4:320,60:.: 0.27:1.000:. ./.:4:260,29:.:-0.69:1.000:. ./.:4:515,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:315,52:.: 0.13:1.000:. ./.:4:341,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:222,41:.:-0.97:1.000:. ./.:4:356,82:.: 0.88:1.000:. ./.:4:203,87:.:-0.68:1.000:. ./.:6:268,54:.:-0.34:1.000:. ./.:4:323,50:.: 0.20:1.000:. ./.:4:289,58:.:-0.08:1.000:. ./.:4:334,75:.: 0.58:1.000:. ./.:4:344,64:.: 0.56:1.000:. ./.:4:310,57:.: 0.13:1.000:. ./.:4:437,61:.: 1.52:1.000:. ./.:4:141,98:.:-1.22:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:197,99:.:-0.62:0.998:. ./.:4:277,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:181,81:.:-0.98:1.000:. ./.:4:328,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:259,52:.:-0.46:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:188,89:.:-0.82:1.000:. ./.:4:265,97:.: 0.08:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:311,58:.: 0.15:1.000:. ./.:4:233,121:.:-0.01:1.000:. ./.:4:214,39:.:-1.07:1.000:. ./.:4:321,42:.: 0.09:1.000:. ./.:4:337,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:271,42:.:-0.44:1.000:. ./.:4:223,123:.:-0.09:1.000:. ./.:4:284,69:.:-0.02:1.000:. ./.:4:214,39:.:-1.07:1.000:. ./.:4:243,36:.:-0.80:1.000:. ./.:4:244,101:.:-0.10:1.000:. ./.:4:283,70:.:-0.02:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:278,91:.: 0.15:1.000:. ./.:4:304,111:.: 0.64:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:344,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:172,91:.:-0.97:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:230,114:.:-0.11:1.000:. ./.:4:119,27:.:-2.20:1.000:. ./.:4:288,52:.:-0.15:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:242,44:.:-0.72:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:250,100:.:-0.05:1.000:. ./.:4:338,130:.: 1.20:1.000:. ./.:4:396,64:.: 1.11:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:635,0:.: 2.96:1.000:. ./.:4:316,51:.: 0.13:0.999:. ./.:4:325,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:183,48:.:-1.30:1.000:. ./.:4:358,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:368,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:208,28:.:-1.25:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:277,55:.:-0.24:1.000:. ./.:4:380,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:209,122:.:-0.25:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:266,98:.: 0.10:1.000:. ./.:4:218,106:.:-0.32:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:206,90:.:-0.62:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:501,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:187,27:.:-1.48:1.000:. ./.:4:296,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:234,54:.:-0.70:1.000:. ./.:4:500,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:240,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:249,35:.:-0.74:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:247,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:276,53:.:-0.27:1.000:. ./.:4:299,53:.:-0.03:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:472,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:329,62:.: 0.39:1.000:. ./.:4:295,70:.: 0.11:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:369,62:.: 0.81:1.000:. ./.:4:300,40:.:-0.15:1.000:. ./.:4:588,1:.: 2.48:1.000:. ./.:4:329,62:.: 0.39:1.000:. ./.:4:92,38:.:-2.37:1.000:. ./.:4:205,41:.:-1.15:1.000:. ./.:4:302,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:270,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:302,130:.: 0.82:1.000:. ./.:4:425,69:.: 1.47:1.000:. ./.:4:300,56:.: 0.02:0.998:. ./.:4:222,114:.:-0.20:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:253,42:.:-0.63:1.000:. ./.:4:310,55:.: 0.11:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:172,117:.:-0.69:1.000:. ./.:4:289,117:.: 0.54:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:161,114:.:-0.84:1.000:. ./.:4:337,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:274,50:.:-0.32:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:460,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:231,116:.:-0.08:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:285,56:.:-0.14:1.000:. ./.:4:451,79:.: 1.85:1.000:. ./.:4:388,79:.: 1.19:1.000:. ./.:4:327,56:.: 0.30:1.000:. ./.:4:250,55:.:-0.52:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:341,72:.: 0.62:1.000:. ./.:4:425,62:.: 1.40:1.000:. ./.:4:275,48:.:-0.33:1.000:. ./.:4:268,54:.:-0.34:1.000:. -chr4.1 57717115 chr4.1_057717115 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:34,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:101,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.54:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.84:0.999:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:6:39,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.99:0.998:. ./.:4:76,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.27:0.999:. ./.:4:36,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.04:0.998:. ./.:4:55,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:99,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.68:1.000:. -chr4.1 57882705 chr4.1_057882705 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:286,122:.:-0.55:1.000:. ./.:4:128,209:.:-1.33:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:421,127:.: 0.99:1.000:. ./.:4:442,138:.: 1.34:1.000:. ./.:4:467,155:.: 1.80:1.000:. ./.:4:480,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:307,129:.:-0.24:1.000:. ./.:4:277,117:.:-0.70:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:271,94:.:-1.02:1.000:. ./.:4:396,151:.: 0.98:1.000:. ./.:4:369,131:.: 0.46:1.000:. ./.:4:405,150:.: 1.07:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:412,154:.: 1.19:0.999:. ./.:4:463,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:497,189:.: 2.51:1.000:. ./.:4:310,1:.:-1.61:1.000:. ./.:4:392,132:.: 0.73:1.000:. ./.:4:423,152:.: 1.29:1.000:. ./.:4:362,98:.: 0.03:1.000:. ./.:4:183,73:.:-2.22:1.000:. ./.:4:285,130:.:-0.47:1.000:. ./.:4:374,110:.: 0.29:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:442,183:.: 1.84:1.000:. ./.:4:308,140:.:-0.11:1.000:. ./.:4:641,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:256,112:.:-0.99:1.000:. ./.:4:363,1:.:-1.03:1.000:. ./.:3:112,42:.:-3.34:0.999:. ./.:4:400,119:.: 0.67:1.000:. ./.:4:379,131:.: 0.57:1.000:. ./.:4:506,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:456,149:.: 1.62:1.000:. ./.:4:323,150:.: 0.17:1.000:. ./.:4:494,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:384,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:366,159:.: 0.74:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:601,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:220,93:.:-1.59:1.000:. ./.:4:231,99:.:-1.40:1.000:. ./.:4:319,140:.: 0.01:1.000:. ./.:4:342,114:.:-0.02:1.000:. ./.:4:469,128:.: 1.53:1.000:. ./.:4:399,126:.: 0.74:1.000:. ./.:4:439,137:.: 1.30:1.000:. ./.:4:268,142:.:-0.52:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:369,117:.: 0.31:1.000:. ./.:4:380,146:.: 0.75:1.000:. ./.:4:349,0:.:-1.19:1.000:. ./.:6:348,55:.:-0.60:1.000:. ./.:4:385,126:.: 0.59:1.000:. ./.:4:370,102:.: 0.16:1.000:. ./.:4:335,140:.: 0.19:1.000:. ./.:4:338,97:.:-0.25:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:401,114:.: 0.63:1.000:. ./.:4:366,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:411,136:.: 0.98:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.25:0.998:. ./.:4:116,184:.:-1.73:1.000:. ./.:4:633,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:182,256:.:-0.22:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:280,235:.: 0.63:1.000:. ./.:4:279,132:.:-0.51:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:407,122:.: 0.78:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:309,168:.: 0.21:1.000:. ./.:4:137,199:.:-1.34:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:489,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:304,96:.:-0.63:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:268,130:.:-0.66:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:246,105:.:-1.17:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:265,74:.:-1.30:1.000:. ./.:4:448,143:.: 1.46:1.000:. ./.:4:412,149:.: 1.13:1.000:. ./.:4:225,83:.:-1.64:1.000:. ./.:4:203,231:.:-0.26:1.000:. ./.:4:420,126:.: 0.97:1.000:. ./.:4:286,123:.:-0.53:1.000:. ./.:4:257,120:.:-0.89:1.000:. ./.:4:401,152:.: 1.05:1.000:. ./.:4:305,94:.:-0.64:1.000:. ./.:4:284,126:.:-0.52:1.000:. ./.:4:328,97:.:-0.36:1.000:. ./.:4:432,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:363,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:281,134:.:-0.47:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:388,124:.: 0.60:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:484,161:.: 2.06:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:489,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:290,98:.:-0.77:1.000:. ./.:4:439,145:.: 1.39:1.000:. ./.:4:374,127:.: 0.48:1.000:. ./.:4:339,113:.:-0.06:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:339,114:.:-0.05:1.000:. ./.:4:351,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:417,141:.: 1.10:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:466,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:411,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:338,108:.:-0.13:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:336,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:349,128:.: 0.21:1.000:. ./.:4:365,124:.: 0.34:1.000:. ./.:4:203,77:.:-1.95:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:355,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:488,156:.: 2.05:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:359,119:.: 0.22:1.000:. ./.:4:306,98:.:-0.59:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:423,105:.: 0.77:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:370,111:.: 0.26:1.000:. ./.:4:301,92:.:-0.71:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:440,165:.: 1.62:1.000:. ./.:4:318,120:.:-0.22:1.000:. ./.:4:369,99:.: 0.11:1.000:. ./.:4:301,134:.:-0.25:1.000:. ./.:4:260,116:.:-0.90:1.000:. ./.:4:600,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:384,131:.: 0.63:1.000:. ./.:4:243,1:.:-2.35:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:482,158:.: 2.00:1.000:. ./.:4:464,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:502,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.16:0.998:. ./.:4:238,125:.:-1.04:1.000:. ./.:4:360,116:.: 0.20:1.000:. ./.:4:288,91:.:-0.86:1.000:. ./.:4:289,118:.:-0.56:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:434,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:337,107:.:-0.15:1.000:. ./.:4:136,100:.:-2.44:1.000:. ./.:4:345,106:.:-0.07:1.000:. ./.:4:387,123:.: 0.57:1.000:. ./.:4:457,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:377,127:.: 0.51:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:348,126:.: 0.18:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:660,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:459,156:.: 1.73:1.000:. ./.:4:417,134:.: 1.02:1.000:. ./.:4:307,19:.:-1.45:1.000:. ./.:4:611,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:554,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:592,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:286,125:.:-0.51:1.000:. -chr4.1 58210567 chr4.1_058210567 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,71:.: 1.65:1.000:. ./.:4:19,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:17,65:.: 0.76:1.000:. ./.:4:27,60:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,89:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,98:.: 1.44:1.000:. ./.:4:8,30:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,44:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,4:.:-2.57:1.000:. ./.:4:49,33:.: 0.76:1.000:. ./.:4:19,59:.: 0.59:1.000:. ./.:4:28,67:.: 1.31:1.000:. ./.:4:15,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.37:1.000:. ./.:4:23,48:.: 0.29:0.999:. ./.:4:8,43:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,83:.: 1.87:1.000:. ./.:4:62,43:.: 1.74:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:51,31:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,92:.: 1.18:1.000:. ./.:4:46,43:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.66:1.000:. ./.:4:17,37:.:-0.44:1.000:. ./.:4:38,38:.: 0.50:1.000:. ./.:4:32,57:.: 1.06:1.000:. ./.:4:29,70:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.22:1.000:. ./.:4:47,33:.: 0.67:1.000:. ./.:4:17,70:.: 0.97:1.000:. ./.:4:1,2:.:-2.61:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,66:.: 0.89:1.000:. ./.:4:46,27:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,52:.: 0.93:1.000:. ./.:4:15,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:28,55:.: 0.80:1.000:. ./.:4:11,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:20,31:.:-0.57:1.000:. ./.:4:30,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.44:1.000:. ./.:4:30,30:.:-0.18:1.000:. ./.:4:44,28:.: 0.33:1.000:. ./.:4:5,11:.:-2.06:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.08:1.000:. ./.:4:6,16:.:-1.80:1.000:. ./.:4:19,17:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.03:1.000:. ./.:4:16,48:.:-0.01:1.000:. ./.:4:36,41:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,16:.:-1.46:1.000:. ./.:4:30,29:.:-0.22:1.000:. ./.:6:8,25:.:-1.33:1.000:. ./.:4:17,51:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.29:1.000:. ./.:4:10,28:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:12,48:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.12:1.000:. ./.:4:27,40:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,22:.:-0.57:0.998:. ./.:4:20,52:.: 0.33:1.000:. ./.:4:42,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.29:1.000:. ./.:4:7,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:53,37:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.57:1.000:. ./.:4:21,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.69:1.000:. ./.:4:11,42:.:-0.48:1.000:. ./.:4:16,51:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.82:1.000:. ./.:4:27,25:.:-0.52:1.000:. ./.:4:18,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:35,44:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:17,63:.: 0.67:1.000:. ./.:4:8,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.16:1.000:. ./.:4:18,52:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.03:1.000:. ./.:4:31,24:.:-0.39:1.000:. ./.:4:13,29:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:27,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:13,26:.:-1.08:1.000:. ./.:4:10,22:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.18:1.000:. ./.:4:8,32:.:-1.04:1.000:. ./.:4:15,37:.:-0.52:1.000:. ./.:4:21,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:23,52:.: 0.46:1.000:. ./.:4:19,26:.:-0.82:1.000:. ./.:4:32,76:.: 1.87:1.000:. ./.:4:22,71:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.80:1.000:. ./.:4:30,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,89:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.78:0.999:. ./.:4:24,33:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.59:1.000:. ./.:4:19,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:28,20:.:-0.69:1.000:. ./.:4:28,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:30,21:.:-0.57:1.000:. ./.:4:23,26:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:17,16:.:-1.33:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,24:.:-1.04:1.000:. ./.:4:20,19:.:-1.08:1.000:. ./.:4:15,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:23,19:.:-0.95:1.000:. ./.:4:30,22:.:-0.52:1.000:. ./.:4:24,20:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,39:.:-0.57:1.000:. ./.:4:21,59:.: 0.67:1.000:. ./.:4:12,29:.:-0.99:1.000:. ./.:4:27,25:.:-0.52:1.000:. ./.:4:17,65:.: 0.76:1.000:. ./.:4:29,68:.: 1.40:1.000:. ./.:4:36,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.57:1.000:. ./.:4:22,25:.:-0.74:1.000:. ./.:4:27,41:.: 0.16:1.000:. ./.:4:13,44:.:-0.31:1.000:. ./.:4:22,65:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.29:1.000:. ./.:4:32,66:.: 1.44:1.000:. ./.:4:36,46:.: 0.76:1.000:. ./.:4:24,78:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1,66:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,67:.: 1.40:1.000:. ./.:4:19,71:.: 1.10:1.000:. ./.:4:56,61:.: 2.25:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.70:1.000:. ./.:4:27,24:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.89:1.000:. ./.:4:48,51:.: 1.48:1.000:. ./.:4:26,48:.: 0.42:1.000:. ./.:4:26,68:.: 1.27:1.000:. ./.:4:49,44:.: 1.23:0.998:. ./.:4:27,69:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,91:.: 1.14:1.000:. ./.:4:35,33:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,49:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,29:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,75:.: 1.44:1.000:. ./.:4:17,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.37:1.000:. ./.:4:14,44:.:-0.27:1.000:. ./.:4:21,69:.: 1.10:1.000:. ./.:4:42,33:.: 0.46:1.000:. ./.:4:15,59:.: 0.42:1.000:. ./.:4:18,46:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,88:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,45:.:-0.22:1.000:. ./.:4:17,61:.: 0.59:1.000:. ./.:4:26,56:.: 0.76:1.000:. ./.:4:54,47:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,88:.: 1.01:1.000:. ./.:4:27,70:.: 1.40:1.000:. ./.:4:52,46:.: 1.44:1.000:. ./.:4:25,70:.: 1.31:1.000:. ./.:4:22,75:.: 1.40:1.000:. ./.:4:26,56:.: 0.76:1.000:. ./.:4:26,50:.: 0.50:1.000:. -chr4.1 58394014 chr4.1_058394014 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:74,74:.: 0.25:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:127,40:.: 0.77:1.000:. ./.:4:116,40:.: 0.47:1.000:. ./.:4:161,35:.: 1.57:1.000:. ./.:4:99,76:.: 0.99:1.000:. ./.:4:70,36:.:-0.90:1.000:. ./.:4:119,38:.: 0.50:1.000:. ./.:4:88,60:.: 0.25:1.000:. ./.:4:73,3:.:-1.73:1.000:. ./.:4:41,14:.:-2.31:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,58:.: 0.06:1.000:. ./.:4:104,75:.: 1.10:1.000:. ./.:4:126,28:.: 0.42:1.000:. ./.:4:151,40:.: 1.43:1.000:. ./.:4:167,39:.: 1.85:0.999:. ./.:4:150,42:.: 1.46:1.000:. ./.:4:93,85:.: 1.08:1.000:. ./.:4:93,95:.: 1.35:1.000:. ./.:4:38,17:.:-2.31:1.000:. ./.:4:138,35:.: 0.94:1.000:. ./.:4:85,62:.: 0.22:1.000:. ./.:4:121,37:.: 0.53:1.000:. ./.:4:36,3:.:-2.75:1.000:. ./.:4:132,37:.: 0.83:1.000:. ./.:4:56,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:106,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:134,42:.: 1.02:1.000:. ./.:4:117,30:.: 0.22:1.000:. ./.:4:103,33:.:-0.08:1.000:. ./.:4:72,54:.:-0.35:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:51,21:.:-1.84:1.000:. ./.:3:25,2:.:-3.08:0.999:. ./.:4:131,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:116,36:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,32:.: 0.83:1.000:. ./.:4:113,38:.: 0.33:1.000:. ./.:4:126,60:.: 1.30:1.000:. ./.:4:65,50:.:-0.66:1.000:. ./.:4:117,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:122,35:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,48:.:-0.85:1.000:. ./.:4:106,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:130,37:.: 0.77:1.000:. ./.:4:99,70:.: 0.83:1.000:. ./.:4:29,8:.:-2.80:1.000:. ./.:4:57,36:.:-1.26:1.000:. ./.:4:32,42:.:-1.78:1.000:. ./.:4:61,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:150,34:.: 1.24:1.000:. ./.:4:108,41:.: 0.28:1.000:. ./.:4:82,63:.: 0.17:1.000:. ./.:4:134,39:.: 0.94:1.000:. ./.:4:128,35:.: 0.66:1.000:. ./.:4:93,24:.:-0.60:1.000:. ./.:4:72,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:75,40:.:-0.66:1.000:. ./.:6:60,36:.:-1.18:1.000:. ./.:4:56,61:.:-0.60:1.000:. ./.:4:56,61:.:-0.60:1.000:. ./.:4:87,67:.: 0.42:1.000:. ./.:4:105,21:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,40:.: 0.61:1.000:. ./.:4:128,73:.: 1.71:1.000:. ./.:4:84,12:.:-1.18:1.000:. ./.:4:66,63:.:-0.27:1.000:. ./.:4:81,41:.:-0.46:0.998:. ./.:4:133,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:118,48:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,53:.:-0.55:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:144,39:.: 1.21:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,46:.:-0.27:1.000:. ./.:4:79,57:.:-0.08:1.000:. ./.:4:90,55:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,70:.: 0.72:1.000:. ./.:4:80,75:.: 0.44:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:89,75:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,76:.: 0.55:1.000:. ./.:4:59,50:.:-0.82:1.000:. ./.:4:110,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:82,93:.: 0.99:1.000:. ./.:4:52,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:65,56:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,21:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,24:.:-0.52:1.000:. ./.:4:60,60:.:-0.52:1.000:. ./.:4:89,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:107,88:.: 1.54:1.000:. ./.:4:96,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:148,22:.: 0.86:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:62,38:.:-1.07:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:140,36:.: 1.02:1.000:. ./.:4:118,27:.: 0.17:1.000:. ./.:4:67,21:.:-1.40:1.000:. ./.:4:78,63:.: 0.06:1.000:. ./.:4:58,36:.:-1.23:1.000:. ./.:4:114,34:.: 0.25:1.000:. ./.:4:64,48:.:-0.74:1.000:. ./.:4:74,85:.: 0.55:1.000:. ./.:4:67,54:.:-0.49:1.000:. ./.:4:69,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:109,102:.: 1.98:1.000:. ./.:4:122,40:.: 0.64:1.000:. ./.:4:71,57:.:-0.30:1.000:. ./.:4:176,43:.: 2.20:1.000:. ./.:4:105,25:.:-0.24:0.999:. ./.:4:85,79:.: 0.69:1.000:. ./.:4:43,30:.:-1.81:1.000:. ./.:4:91,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:125,30:.: 0.44:1.000:. ./.:4:71,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:93,74:.: 0.77:1.000:. ./.:4:78,55:.:-0.16:1.000:. ./.:4:122,45:.: 0.77:1.000:. ./.:4:99,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,54:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,61:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,57:.:-0.60:1.000:. ./.:4:78,48:.:-0.35:1.000:. ./.:4:129,27:.: 0.47:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:54,32:.:-1.45:1.000:. ./.:4:49,39:.:-1.40:1.000:. ./.:4:123,32:.: 0.44:1.000:. ./.:4:125,31:.: 0.47:1.000:. ./.:4:72,17:.:-1.37:1.000:. ./.:4:108,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,32:.: 0.09:1.000:. ./.:4:102,94:.: 1.57:1.000:. ./.:4:106,38:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,21:.:-1.04:1.000:. ./.:4:88,13:.:-1.04:1.000:. ./.:4:122,31:.: 0.39:1.000:. ./.:4:77,52:.:-0.27:1.000:. ./.:4:100,35:.:-0.11:1.000:. ./.:4:58,64:.:-0.46:1.000:. ./.:4:74,20:.:-1.23:1.000:. ./.:4:173,40:.: 2.04:1.000:. ./.:4:114,60:.: 0.97:1.000:. ./.:4:116,30:.: 0.20:1.000:. ./.:4:113,30:.: 0.11:1.000:. ./.:4:99,101:.: 1.68:1.000:. ./.:4:71,82:.: 0.39:1.000:. ./.:4:139,34:.: 0.94:1.000:. ./.:4:98,71:.: 0.83:1.000:. ./.:4:33,16:.:-2.47:1.000:. ./.:4:51,34:.:-1.48:1.000:. ./.:4:123,28:.: 0.33:1.000:. ./.:4:149,38:.: 1.32:1.000:. ./.:4:135,32:.: 0.77:1.000:. ./.:4:96,60:.: 0.47:1.000:. ./.:4:68,51:.:-0.55:0.998:. ./.:4:108,60:.: 0.80:1.000:. ./.:4:143,43:.: 1.30:1.000:. ./.:4:67,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:101,34:.:-0.11:1.000:. ./.:4:80,74:.: 0.42:1.000:. ./.:4:98,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:141,26:.: 0.77:1.000:. ./.:4:126,46:.: 0.91:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:64,44:.:-0.85:1.000:. ./.:4:70,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:48,68:.:-0.63:1.000:. ./.:4:114,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:72,49:.:-0.49:1.000:. ./.:4:81,17:.:-1.12:1.000:. ./.:4:60,47:.:-0.88:1.000:. ./.:4:55,44:.:-1.10:1.000:. ./.:4:168,32:.: 1.68:1.000:. ./.:4:93,75:.: 0.80:1.000:. ./.:4:89,69:.: 0.53:1.000:. ./.:4:111,23:.:-0.13:1.000:. ./.:4:130,36:.: 0.75:1.000:. ./.:4:93,103:.: 1.57:1.000:. ./.:4:157,31:.: 1.35:1.000:. ./.:4:74,46:.:-0.52:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.75:1.000:. -chr4.1 58547273 chr4.1_058547273 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:675,183:.: 0.88:1.000:. ./.:4:465,124:.:-0.62:1.000:. ./.:4:518,342:.: 0.89:1.000:. ./.:4:589,138:.: 0.15:1.000:. ./.:4:573,154:.: 0.15:1.000:. ./.:4:621,161:.: 0.46:1.000:. ./.:4:396,184:.:-0.67:1.000:. ./.:4:535,141:.:-0.13:1.000:. ./.:4:496,125:.:-0.44:1.000:. ./.:4:287,78:.:-1.87:1.000:. ./.:4:366,209:.:-0.70:1.000:. ./.:4:508,131:.:-0.34:1.000:. ./.:4:502,118:.:-0.45:1.000:. ./.:4:603,139:.: 0.23:1.000:. ./.:4:519,125:.:-0.31:1.000:. ./.:4:571,265:.: 0.76:1.000:. ./.:4:538,157:.:-0.03:0.999:. ./.:4:533,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:703,164:.: 0.93:1.000:. ./.:4:719,292:.: 1.73:1.000:. ./.:4:334,106:.:-1.45:1.000:. ./.:4:552,263:.: 0.64:1.000:. ./.:4:573,124:.:-0.02:1.000:. ./.:4:554,246:.: 0.56:1.000:. ./.:4:291,60:.:-1.95:1.000:. ./.:4:500,122:.:-0.44:1.000:. ./.:4:597,131:.: 0.16:1.000:. ./.:4:588,276:.: 0.91:1.000:. ./.:4:639,155:.: 0.52:1.000:. ./.:4:613,156:.: 0.38:1.000:. ./.:4:685,260:.: 1.37:1.000:. ./.:4:452,243:.:-0.03:1.000:. ./.:4:233,92:.:-2.09:1.000:. ./.:4:334,0:.:-2.04:1.000:. ./.:3:126,26:.:-3.06:0.999:. ./.:4:525,246:.: 0.40:1.000:. ./.:4:522,228:.: 0.28:1.000:. ./.:4:578,265:.: 0.80:1.000:. ./.:4:522,133:.:-0.25:1.000:. ./.:4:606,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:551,286:.: 0.76:1.000:. ./.:4:549,237:.: 0.48:1.000:. ./.:4:621,273:.: 1.08:1.000:. ./.:4:479,109:.:-0.63:1.000:. ./.:4:646,175:.: 0.67:1.000:. ./.:4:497,269:.: 0.37:1.000:. ./.:4:683,160:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1526,431:.: 7.01:1.000:. ./.:4:464,108:.:-0.72:1.000:. ./.:4:633,162:.: 0.53:1.000:. ./.:4:491,144:.:-0.36:1.000:. ./.:4:596,290:.: 1.04:1.000:. ./.:4:429,111:.:-0.89:1.000:. ./.:4:596,276:.: 0.96:1.000:. ./.:4:489,263:.: 0.29:1.000:. ./.:4:576,299:.: 0.98:1.000:. ./.:4:438,100:.:-0.90:1.000:. ./.:4:566,125:.:-0.05:1.000:. ./.:4:472,119:.:-0.61:1.000:. ./.:6:439,223:.:-0.21:1.000:. ./.:4:567,286:.: 0.85:1.000:. ./.:4:441,108:.:-0.84:1.000:. ./.:4:591,130:.: 0.12:1.000:. ./.:4:548,126:.:-0.15:1.000:. ./.:4:597,445:.: 1.91:1.000:. ./.:4:599,118:.: 0.09:1.000:. ./.:4:413,103:.:-1.03:1.000:. ./.:4:472,284:.: 0.31:1.000:. ./.:4:561,141:.: 0.01:0.998:. ./.:4:548,128:.:-0.13:1.000:. ./.:4:579,284:.: 0.91:1.000:. ./.:4:363,77:.:-1.45:1.000:. ./.:4:617,138:.: 0.31:1.000:. ./.:4:570,244:.: 0.64:1.000:. ./.:4:527,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:520,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:497,119:.:-0.47:1.000:. ./.:4:578,110:.:-0.07:1.000:. ./.:4:471,213:.:-0.09:1.000:. ./.:4:516,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:424,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:526,255:.: 0.45:1.000:. ./.:4:526,134:.:-0.22:1.000:. ./.:4:474,134:.:-0.51:1.000:. ./.:4:555,143:.:-0.01:1.000:. ./.:4:565,150:.: 0.08:1.000:. ./.:4:328,89:.:-1.58:1.000:. ./.:4:459,114:.:-0.71:1.000:. ./.:4:510,127:.:-0.35:1.000:. ./.:4:461,116:.:-0.69:1.000:. ./.:4:416,221:.:-0.35:1.000:. ./.:4:517,123:.:-0.34:1.000:. ./.:4:561,123:.:-0.09:1.000:. ./.:4:425,86:.:-1.06:1.000:. ./.:4:416,252:.:-0.18:1.000:. ./.:4:471,246:.: 0.09:1.000:. ./.:4:465,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:422,108:.:-0.95:1.000:. ./.:4:564,277:.: 0.79:1.000:. ./.:4:541,141:.:-0.10:1.000:. ./.:4:393,213:.:-0.53:1.000:. ./.:4:646,143:.: 0.50:1.000:. ./.:4:364,84:.:-1.41:1.000:. ./.:4:472,115:.:-0.63:1.000:. ./.:4:437,236:.:-0.15:1.000:. ./.:4:394,104:.:-1.13:1.000:. ./.:4:415,121:.:-0.92:1.000:. ./.:4:545,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:742,201:.: 1.36:1.000:. ./.:4:461,227:.:-0.07:1.000:. ./.:4:451,220:.:-0.16:1.000:. ./.:4:740,358:.: 2.22:1.000:. ./.:4:523,284:.: 0.60:0.999:. ./.:4:525,273:.: 0.55:1.000:. ./.:4:394,108:.:-1.11:1.000:. ./.:4:598,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:394,195:.:-0.62:1.000:. ./.:4:457,252:.: 0.05:1.000:. ./.:4:501,278:.: 0.44:1.000:. ./.:4:463,241:.: 0.02:1.000:. ./.:4:513,154:.:-0.18:1.000:. ./.:4:525,266:.: 0.51:1.000:. ./.:4:581,148:.: 0.16:1.000:. ./.:4:569,155:.: 0.13:1.000:. ./.:4:508,262:.: 0.39:1.000:. ./.:4:571,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:663,128:.: 0.51:1.000:. ./.:4:382,215:.:-0.58:1.000:. ./.:4:374,166:.:-0.89:1.000:. ./.:4:421,110:.:-0.94:1.000:. ./.:4:442,344:.: 0.48:1.000:. ./.:4:517,129:.:-0.30:1.000:. ./.:4:301,101:.:-1.66:1.000:. ./.:4:610,279:.: 1.05:1.000:. ./.:4:541,389:.: 1.28:1.000:. ./.:4:719,169:.: 1.05:1.000:. ./.:4:548,287:.: 0.75:1.000:. ./.:4:523,123:.:-0.30:1.000:. ./.:4:432,115:.:-0.85:1.000:. ./.:4:474,247:.: 0.12:1.000:. ./.:4:491,162:.:-0.26:1.000:. ./.:4:565,145:.: 0.06:1.000:. ./.:4:490,263:.: 0.30:1.000:. ./.:4:438,229:.:-0.18:1.000:. ./.:4:648,516:.: 2.59:1.000:. ./.:4:692,166:.: 0.88:1.000:. ./.:4:594,313:.: 1.15:1.000:. ./.:4:598,287:.: 1.03:1.000:. ./.:4:590,162:.: 0.29:1.000:. ./.:4:446,96:.:-0.88:1.000:. ./.:4:647,322:.: 1.50:1.000:. ./.:4:543,132:.:-0.14:1.000:. ./.:4:352,77:.:-1.51:1.000:. ./.:4:346,116:.:-1.33:1.000:. ./.:4:575,154:.: 0.16:1.000:. ./.:4:503,248:.: 0.28:1.000:. ./.:4:645,304:.: 1.39:1.000:. ./.:4:613,150:.: 0.35:1.000:. ./.:4:477,125:.:-0.55:0.998:. ./.:4:556,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:399,217:.:-0.47:1.000:. ./.:4:462,107:.:-0.73:1.000:. ./.:4:509,254:.: 0.35:1.000:. ./.:4:514,277:.: 0.51:1.000:. ./.:4:577,128:.: 0.03:1.000:. ./.:4:518,244:.: 0.35:1.000:. ./.:4:447,335:.: 0.46:1.000:. ./.:4:459,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:504,270:.: 0.41:1.000:. ./.:4:505,239:.: 0.24:1.000:. ./.:4:439,272:.: 0.06:1.000:. ./.:4:412,302:.: 0.08:1.000:. ./.:4:518,151:.:-0.17:1.000:. ./.:4:479,130:.:-0.51:1.000:. ./.:4:476,116:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:631,319:.: 1.39:1.000:. ./.:4:556,150:.: 0.03:1.000:. ./.:4:529,134:.:-0.21:1.000:. ./.:4:497,313:.: 0.61:1.000:. ./.:4:600,326:.: 1.26:1.000:. ./.:4:663,182:.: 0.81:1.000:. ./.:4:704,332:.: 1.87:1.000:. ./.:4:445,226:.:-0.16:1.000:. ./.:4:516,130:.:-0.30:1.000:. -chr4.1 58607488 chr4.1_058607488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:273,90:.: 0.23:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:232,101:.:-0.11:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:253,76:.:-0.16:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:82,15:.:-2.83:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:240,106:.: 0.04:1.000:. ./.:4:277,85:.: 0.22:1.000:. ./.:4:221,70:.:-0.60:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:234,87:.:-0.25:0.999:. ./.:4:299,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:291,120:.: 0.79:1.000:. ./.:4:392,115:.: 1.89:1.000:. ./.:4:120,11:.:-2.44:1.000:. ./.:4:222,80:.:-0.47:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:252,90:.:-0.01:1.000:. ./.:4:60,15:.:-3.09:1.000:. ./.:4:182,84:.:-0.88:1.000:. ./.:4:380,97:.: 1.55:1.000:. ./.:4:384,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:265,104:.: 0.30:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:300,101:.: 0.67:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,2:.:-3.07:1.000:. ./.:4:166,22:.:-1.78:1.000:. ./.:3:39,5:.:-3.44:0.999:. ./.:4:339,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:236,90:.:-0.19:1.000:. ./.:4:279,92:.: 0.33:1.000:. ./.:4:251,101:.: 0.11:1.000:. ./.:4:309,88:.: 0.63:1.000:. ./.:4:369,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:264,85:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,77:.:-0.57:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:295,66:.: 0.21:1.000:. ./.:4:418,93:.: 1.94:1.000:. ./.:4:81,32:.:-2.65:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:256,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:318,74:.: 0.57:1.000:. ./.:4:252,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:238,74:.:-0.35:1.000:. ./.:4:317,85:.: 0.68:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:323,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:371,93:.: 1.40:1.000:. ./.:4:308,82:.: 0.54:1.000:. ./.:6:308,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:262,90:.: 0.11:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:314,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:337,74:.: 0.79:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:278,104:.: 0.45:1.000:. ./.:4:391,92:.: 1.62:0.998:. ./.:4:380,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:313,89:.: 0.68:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:299,113:.: 0.80:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:270,64:.:-0.10:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:245,80:.:-0.20:1.000:. ./.:4:265,80:.: 0.03:1.000:. ./.:4:327,97:.: 0.94:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:253,77:.:-0.15:1.000:. ./.:4:310,94:.: 0.71:1.000:. ./.:4:276,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:340,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:276,84:.: 0.20:1.000:. ./.:4:208,65:.:-0.80:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:202,98:.:-0.49:1.000:. ./.:4:256,79:.:-0.09:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:339,80:.: 0.88:1.000:. ./.:4:178,68:.:-1.12:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:276,81:.: 0.16:1.000:. ./.:4:265,78:.: 0.00:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:182,63:.:-1.13:1.000:. ./.:4:271,81:.: 0.11:1.000:. ./.:4:216,76:.:-0.59:1.000:. ./.:4:198,70:.:-0.86:1.000:. ./.:4:301,65:.: 0.27:1.000:. ./.:4:361,97:.: 1.33:1.000:. ./.:4:300,93:.: 0.58:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:239,64:.:-0.46:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:291,96:.: 0.51:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:357,109:.: 1.42:1.000:. ./.:4:252,69:.:-0.25:1.000:. ./.:4:269,79:.: 0.06:1.000:. ./.:4:246,77:.:-0.23:1.000:. ./.:4:228,77:.:-0.44:1.000:. ./.:4:228,84:.:-0.35:1.000:. ./.:4:243,62:.:-0.44:1.000:. ./.:4:367,103:.: 1.47:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:251,76:.:-0.18:1.000:. ./.:4:410,109:.: 2.03:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:210,66:.:-0.77:1.000:. ./.:4:269,65:.:-0.10:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:282,111:.: 0.58:1.000:. ./.:4:170,65:.:-1.24:1.000:. ./.:4:252,85:.:-0.07:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:310,100:.: 0.77:1.000:. ./.:4:293,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:228,74:.:-0.47:1.000:. ./.:4:374,78:.: 1.26:1.000:. ./.:4:246,99:.: 0.03:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:522,110:.: 3.33:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:294,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:226,86:.:-0.35:1.000:. ./.:4:209,77:.:-0.65:1.000:. ./.:4:323,111:.: 1.05:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:131,4:.:-2.39:1.000:. ./.:4:308,78:.: 0.50:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:258,99:.: 0.16:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:249,105:.: 0.13:1.000:. ./.:4:386,107:.: 1.73:0.998:. ./.:4:395,93:.: 1.67:1.000:. ./.:4:262,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:280,61:.:-0.02:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:283,98:.: 0.44:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:382,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:273,86:.: 0.19:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:266,109:.: 0.37:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:215,80:.:-0.55:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:395,93:.: 1.67:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:336,105:.: 1.13:1.000:. ./.:4:309,93:.: 0.68:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.62:1.000:. -chr4.1 58921221 chr4.1_058921221 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:143,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:244,2:.: 1.35:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:124,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.63:0.999:. ./.:4:237,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:287,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.01:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.89:0.999:. ./.:4:173,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:234,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:163,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.12:1.000:. ./.:6:134,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.94:0.998:. ./.:4:104,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:188,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:236,2:.: 1.20:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:105,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:365,0:.: 3.47:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:287,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.14:0.998:. ./.:4:116,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:142,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:273,2:.: 1.86:1.000:. ./.:4:215,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:254,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:311,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.26:1.000:. -chr4.1 59386119 chr4.1_059386119 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:12,20:0.65:-0.27:1.000:0.780 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,17:0.59:-0.46:1.000:0.852 0/0/1/1:4:15,11:0.45:-0.86:1.000:0.982 0/0/1/1:4:20,23:0.56: 0.82:1.000:0.966 0/0/1/1:4:8,11:0.60:-1.55:1.000:0.756 0/1/1/1:4:5,21:0.82:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,16:0.43: 0.52:1.000:0.947 0/1/1/1:4:12,19:0.64:-0.36:1.000:0.651 0/0/1/1:4:9,6:0.43:-1.94:1.000:0.947 0/1/1/1:4:1,5:0.85:-2.83:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,21:0.77:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,16:0.56:-0.46:1.000:0.968 0/0/1/1:4:18,18:0.53: 0.13:0.999:0.993 0/1/1/1:4:14,35:0.74: 1.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:16,33:0.70: 1.41:1.000:0.981 0/1/1/1:4:14,32:0.72: 1.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,6:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,17:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,34:0.74: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,17:0.45: 0.52:1.000:0.984 0/0/1/1:4:13,9:0.44:-1.25:1.000:0.965 0/0/1/1:4:22,12:0.38:-0.07:1.000:0.625 0/0/1/1:4:15,10:0.43:-0.95:1.000:0.947 0/0/1/1:4:15,9:0.41:-1.05:1.000:0.836 0/0/1/1:4:28,17:0.41: 1.01:1.000:0.854 0/0/1/1:4:21,17:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,16:0.60:-0.66:1.000:0.819 0/0/1/1:4:11,13:0.57:-1.05:1.000:0.953 0/0/0/1:4:22,3:0.16:-0.95:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,6:0.69:-2.53:1.000:0.972 1/1/1:3:0,18:1.00:-1.64:0.999:1.000 0/0/0/1:4:22,9:0.32:-0.36:1.000:0.943 0/0/1/1:4:25,14:0.39: 0.42:1.000:0.694 0/0/1/1:4:23,19:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,12:0.41:-0.27:1.000:0.836 0/0/1/1:4:20,16:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,24:0.58: 0.82:1.000:0.898 0/0/1/1:4:29,16:0.39: 1.01:1.000:0.656 0/0/1/1:4:31,19:0.41: 1.51:1.000:0.868 0/1/1/1:4:9,15:0.65:-1.05:1.000:0.780 0/0/0/1:4:30,15:0.37: 1.01:1.000:0.623 0/0/1/1:4:16,17:0.54:-0.17:1.000:0.986 0/0/1/1:4:22,15:0.44: 0.23:1.000:0.959 0/0/0/1:4:8,3:0.31:-2.33:1.000:0.978 0/0/1/1:4:13,18:0.61:-0.36:1.000:0.740 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,19:0.54: 0.23:1.000:0.987 0/0/1/1:4:17,21:0.58: 0.33:1.000:0.921 0/0/0/1:4:30,15:0.37: 1.01:1.000:0.623 0/0/1/1:4:23,28:0.57: 1.60:1.000:0.933 0/1/1/1:4:9,31:0.79: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.43:-1.45:1.000:0.947 0/0/1/1:4:25,22:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,19:0.47: 0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:17,9:0.38:-0.86:1.000:0.541 0/0/1/1/1/1:6:13,25:0.68: 0.33:1.000:0.915 0/1/1/1:4:12,20:0.65:-0.27:1.000:0.780 0/1/1/1:4:14,22:0.64: 0.13:1.000:0.629 0/1/1/1:4:11,22:0.69:-0.17:1.000:0.972 0/0/1/1:4:27,18:0.43: 1.01:1.000:0.947 0/1/1/1:4:8,32:0.82: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,36:0.68: 2.00:1.000:0.947 0/0/1/1:4:23,15:0.42: 0.33:1.000:0.932 0/0/1/1:4:14,17:0.57:-0.36:1.000:0.935 0/0/1/1:4:23,15:0.42: 0.33:0.998:0.932 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,20:0.42: 1.60:1.000:0.923 0/1/1/1:4:7,16:0.72:-1.15:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,18:0.40: 1.41:1.000:0.776 1/1/1/1:4:0,44:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,18:0.43: 1.01:1.000:0.947 0/1/1/1:4:12,23:0.68: 0.03:1.000:0.953 0/1/1/1:4:11,29:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,21:0.64:-0.07:1.000:0.706 0/0/1/1:4:19,19:0.53: 0.33:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,25:0.65: 0.52:1.000:0.780 0/0/1/1:4:28,24:0.49: 1.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,12:0.37: 0.13:1.000:0.623 0/0/0/1:4:25,9:0.30:-0.07:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,28:0.74: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,10:0.50:-1.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,14:0.63:-1.15:1.000:0.599 0/0/1/1:4:15,17:0.56:-0.27:1.000:0.971 0/0/0/1:4:23,12:0.37: 0.03:1.000:0.502 0/0/1/1:4:14,15:0.54:-0.56:1.000:0.985 0/0/1/1:4:19,17:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,15:0.39: 0.72:1.000:0.674 0/0/1/1:4:19,13:0.44:-0.27:1.000:0.960 0/1/1/1:4:13,34:0.74: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,8:0.32:-0.66:1.000:0.956 0/0/1/1:4:18,10:0.39:-0.66:1.000:0.674 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,20:0.74:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:27,15:0.39: 0.72:1.000:0.674 0/0/1/1:4:20,25:0.58: 1.01:1.000:0.910 0/0/1/1:4:15,14:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,18:0.56:-0.07:1.000:0.973 0/0/1/1:4:20,21:0.54: 0.62:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,20:0.71:-0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,33:0.79: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,10:0.40:-0.76:1.000:0.802 0/0/1/1:4:27,21:0.47: 1.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:24,31:0.59: 2.00:1.000:0.870 0/1/1/1:4:10,19:0.68:-0.56:1.000:0.948 0/1/1/1:4:13,32:0.73: 1.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,31:0.64: 1.51:1.000:0.731 0/1/1/1:4:13,35:0.75: 1.31:0.999:0.999 0/0/1/1:4:14,16:0.56:-0.46:1.000:0.968 0/1/1/1:4:6,11:0.67:-1.74:1.000:0.921 0/0/0/1:4:28,10:0.30: 0.33:1.000:0.987 0/0/0/1:4:30,14:0.35: 0.92:1.000:0.786 0/1/1/1:4:10,26:0.74: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,28:0.69: 0.72:1.000:0.972 0/0/1/1:4:16,11:0.44:-0.76:1.000:0.962 0/0/0/1:4:34,16:0.35: 1.51:1.000:0.769 0/0/1/1:4:24,18:0.46: 0.72:1.000:0.986 0/0/0/1:4:33,17:0.37: 1.51:1.000:0.539 0/1/1/1:4:9,29:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,27:0.71: 0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,6:0.27:-0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,22:0.50: 1.21:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,15:0.68:-1.15:1.000:0.939 0/0/0/1:4:14,7:0.37:-1.35:1.000:0.623 0/0/1/1:4:10,12:0.57:-1.25:1.000:0.943 0/0/1/1:4:21,18:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,11:0.41:-0.56:1.000:0.864 0/0/0/1:4:11,5:0.35:-1.84:1.000:0.833 0/0/1/1:4:14,13:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,19:0.84:-1.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,11:0.51:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,12:0.39:-0.17:1.000:0.742 0/0/0/1:4:29,15:0.37: 0.92:1.000:0.527 0/0/1/1:4:21,13:0.41:-0.07:1.000:0.881 0/0/0/1:4:29,11:0.31: 0.52:1.000:0.975 0/0/1/1:4:20,17:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,38:0.79: 1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,17:0.76:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,33:0.71: 1.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,29:0.52: 2.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,19:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,18:0.61:-0.36:1.000:0.740 0/0/1/1:4:14,15:0.54:-0.56:1.000:0.985 0/1/1/1:4:6,29:0.84: 0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,21:0.44: 1.60:1.000:0.969 0/1/1/1:4:8,24:0.77:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,9:0.38:-0.86:1.000:0.541 0/1/1/1:4:6,12:0.69:-1.64:1.000:0.972 0/0/0/1:4:18,9:0.37:-0.76:1.000:0.623 0/0/1/1:4:21,20:0.52: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,22:0.53: 0.92:1.000:0.993 0/1/1/1:4:9,28:0.78: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.49: 0.82:0.998:0.996 0/0/1/1:4:18,20:0.55: 0.33:1.000:0.977 0/1/1/1:4:8,32:0.82: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,14:0.45:-0.17:1.000:0.983 0/0/1/1:4:15,18:0.57:-0.17:1.000:0.943 0/1/1/1:4:13,27:0.70: 0.52:1.000:0.983 0/0/1/1:4:2,3:0.62:-2.92:1.000:0.512 0/0/1/1:4:18,17:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,14:0.61:-1.05:1.000:0.712 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.62:-1.25:1.000:0.627 0/1/1/1:4:9,22:0.73:-0.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:7,23:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,14:0.66:-1.25:1.000:0.867 0/0/1/1:4:16,24:0.62: 0.52:1.000:0.512 0/0/1/1:4:20,21:0.54: 0.62:1.000:0.988 0/1/1/1:4:5,18:0.80:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,36:0.80: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,26:0.51: 1.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,16:0.35: 1.60:1.000:0.823 0/1/1/1:4:7,23:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,26:0.74: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,13:0.42:-0.17:1.000:0.929 0/1/1/1:4:13,26:0.69: 0.42:1.000:0.972 0/0/1/1:4:18,20:0.55: 0.33:1.000:0.977 0/1/1/1:4:9,22:0.73:-0.36:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 0.03:1.000:1.000 -chr4.1 59556051 chr4.1_059556051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:77,9:0.14: 0.41:1.000:0.948 0/0/1/1:4:21,18:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,12:0.19: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,12:0.35:-0.78:1.000:0.788 0/0/0/1:4:43,13:0.29:-0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:59,10:0.19:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,6:0.17:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,12:0.30:-0.57:1.000:0.982 0/0/0/1:4:56,8:0.16:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,9:0.29:-0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:151,20:0.15: 2.61:1.000:0.989 0/0/0/1:4:47,19:0.34:-0.11:1.000:0.875 0/0/0/1:4:51,9:0.19:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,14:0.20: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,13:0.31:-0.52:1.000:0.969 0/0/0/1:4:89,13:0.16: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,13:0.44:-0.96:0.999:0.965 0/0/0/1:4:68,22:0.30: 0.51:1.000:0.987 0/0/0/1:4:157,26:0.18: 2.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,22:0.35: 0.10:1.000:0.810 0/0/0/1:4:83,20:0.25: 0.85:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,11:0.15: 0.57:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,15:0.32:-0.34:1.000:0.963 0/0/0/1:4:32,13:0.34:-0.65:1.000:0.869 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.22:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,19:0.41:-0.44:1.000:0.834 0/0/0/1:4:26,11:0.35:-0.86:1.000:0.810 0/0/1/1:4:12,6:0.38:-1.35:1.000:0.593 0/0/0/0:4:43,3:0.08:-0.63:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,13:0.19: 0.51:1.000:1.000 0/0/1:3:52,8:0.17:-0.26:0.999:0.972 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,20:0.46:-0.57:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,20:0.43:-0.47:1.000:0.947 0/0/0/1:4:28,6:0.23:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,17:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,15:0.44:-0.83:1.000:0.967 0/0/0/1:4:31,11:0.31:-0.73:1.000:0.966 0/0/0/1:4:120,12:0.12: 1.60:1.000:0.707 0/0/0/1:4:85,15:0.19: 0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,10:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,22:0.33: 0.20:1.000:0.905 0/0/0/1:4:80,17:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,22:0.19: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,14:0.36:-0.65:1.000:0.678 0/0/0/0:4:85,7:0.10: 0.57:1.000:0.834 0/0/0/1:4:29,10:0.31:-0.81:1.000:0.974 0/0/0/1:4:94,19:0.22: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,13:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,18:0.17: 1.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,26:0.56:-0.68:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,23:0.41:-0.19:1.000:0.874 0/0/0/0/0/1:6:119,16:0.15: 1.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:90,12:0.15: 0.83:1.000:0.990 0/0/0/1:4:73,9:0.14: 0.31:1.000:0.973 0/0/0/1:4:193,28:0.16: 3.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:41,14:0.31:-0.39:1.000:0.977 0/0/0/1:4:79,13:0.18: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:147,11:0.09: 2.28:1.000:0.945 0/0/0/0:4:45,4:0.11:-0.55:1.000:0.653 0/0/0/1:4:51,12:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,7:0.22:-0.73:0.998:1.000 0/0/1/1:4:23,23:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,18:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,11:0.11: 1.50:1.000:0.522 0/0/0/1:4:90,20:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,20:0.42:-0.42:1.000:0.900 0/0/0/1:4:61,25:0.34: 0.41:1.000:0.858 0/0/0/1:4:23,9:0.33:-0.99:1.000:0.908 0/0/0/1:4:132,16:0.14: 2.02:1.000:0.967 0/0/0/1:4:77,16:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,14:0.19: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,7:0.19:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,23:0.41:-0.16:1.000:0.840 0/0/0/1:4:121,21:0.19: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,14:0.12: 1.97:1.000:0.837 0/0/1/1:4:30,16:0.40:-0.63:1.000:0.749 0/0/0/1:4:70,16:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,21:0.18: 2.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,17:0.18: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,25:0.26: 1.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,16:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,16:0.39:-0.60:1.000:0.675 0/0/0/1:4:64,17:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,17:0.39:-0.55:1.000:0.741 0/0/0/1:4:39,17:0.35:-0.37:1.000:0.756 0/0/0/1:4:21,10:0.37:-1.02:1.000:0.540 0/0/0/1:4:95,17:0.20: 1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,15:0.32:-0.34:1.000:0.963 0/0/1/1:4:27,16:0.42:-0.70:1.000:0.907 0/0/0/1:4:113,39:0.31: 2.12:1.000:0.974 0/0/1/1:4:38,28:0.47:-0.11:1.000:0.991 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:89,21:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,13:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,22:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,18:0.30: 0.10:1.000:0.987 0/0/0/1:4:100,13:0.15: 1.11:1.000:0.986 0/0/0/1:4:41,19:0.37:-0.26:1.000:0.613 0/0/1/1:4:20,17:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:146,7:0.06: 2.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,21:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,11:0.14: 0.75:1.000:0.977 0/0/0/0:4:99,8:0.10: 0.96:1.000:0.865 0/0/0/0:4:150,11:0.09: 2.36:0.999:0.957 0/0/0/1:4:94,17:0.20: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,6:0.18:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,21:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,11:0.30:-0.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:63,15:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,22:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,22:0.28: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,12:0.31:-0.63:1.000:0.967 0/0/0/1:4:39,13:0.30:-0.47:1.000:0.982 0/0/1/1:4:33,17:0.39:-0.52:1.000:0.670 0/0/0/1:4:99,13:0.15: 1.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:78,19:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,16:0.38:-0.57:1.000:0.593 0/0/1/1:4:26,22:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,14:0.48:-0.99:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,15:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.32:-1.04:1.000:0.956 0/0/0/1:4:56,14:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,20:0.52:-0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,14:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,4:0.09:-0.26:1.000:0.969 0/0/0/1:4:75,17:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.52:-1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,18:0.38:-0.39:1.000:0.519 0/0/1/1:4:17,10:0.42:-1.12:1.000:0.900 0/0/0/1:4:29,14:0.37:-0.70:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,14:0.20: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,18:0.42:-0.57:1.000:0.918 0/0/0/1:4:66,20:0.29: 0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:100,20:0.22: 1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,26:0.32: 0.75:1.000:0.964 0/0/0/1:4:77,21:0.27: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,9:0.16: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,29:0.46: 0.00:1.000:0.986 0/0/0/1:4:78,19:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,21:0.40:-0.26:1.000:0.769 0/0/1/1:4:22,14:0.43:-0.89:1.000:0.956 0/0/1/1:4:17,15:0.50:-0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:41,19:0.37:-0.26:1.000:0.613 0/0/0/1:4:35,13:0.32:-0.57:1.000:0.945 0/0/0/0:4:106,9:0.10: 1.16:1.000:0.772 0/0/1/1:4:19,10:0.39:-1.07:0.998:0.720 0/0/0/1:4:38,15:0.33:-0.44:1.000:0.900 0/0/0/1:4:81,18:0.24: 0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,9:0.13: 0.44:1.000:0.939 0/0/0/1:4:86,12:0.16: 0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:18,5:0.27:-1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,16:0.33:-0.32:1.000:0.930 0/0/0/1:4:41,13:0.29:-0.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:83,29:0.31: 1.08:1.000:0.971 0/0/0/1:4:33,12:0.32:-0.65:1.000:0.956 0/0/0/1:4:49,15:0.29:-0.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:62,6:0.11:-0.06:1.000:0.613 0/0/0/1:4:24,8:0.30:-0.99:1.000:0.982 0/0/0/1:4:51,14:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,12:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,10:0.18: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,8:0.16:-0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,14:0.37:-0.70:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,11:0.18: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,11:0.18: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,16:0.42:-0.70:1.000:0.907 0/0/0/1:4:86,11:0.15: 0.70:1.000:0.983 0/0/0/1:4:42,19:0.36:-0.24:1.000:0.674 0/0/0/1:4:64,11:0.19: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,24:0.33: 0.44:1.000:0.930 -chr4.1 60009849 chr4.1_060009849 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:79,133:.:-0.54:1.000:. ./.:4:53,194:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,104:.: 0.05:1.000:. ./.:4:110,151:.: 0.17:1.000:. ./.:4:171,220:.: 2.04:1.000:. ./.:4:100,202:.: 0.76:1.000:. ./.:4:105,72:.:-1.05:1.000:. ./.:4:105,143:.:-0.02:1.000:. ./.:4:91,159:.: 0.01:1.000:. ./.:4:27,22:.:-2.89:1.000:. ./.:4:21,44:.:-2.66:1.000:. ./.:4:57,228:.: 0.51:1.000:. ./.:4:70,123:.:-0.81:1.000:. ./.:4:85,142:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,166:.: 0.12:1.000:. ./.:4:94,177:.: 0.31:1.000:. ./.:4:115,183:.: 0.70:0.999:. ./.:4:72,172:.:-0.08:1.000:. ./.:4:95,181:.: 0.38:1.000:. ./.:4:176,104:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,26:.:-2.57:1.000:. ./.:4:128,116:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,159:.: 0.41:1.000:. ./.:4:148,122:.: 0.30:1.000:. ./.:4:9,16:.:-3.24:1.000:. ./.:4:99,171:.: 0.30:1.000:. ./.:4:173,110:.: 0.48:1.000:. ./.:4:181,153:.: 1.22:1.000:. ./.:4:128,182:.: 0.87:1.000:. ./.:4:130,221:.: 1.46:1.000:. ./.:4:157,124:.: 0.45:1.000:. ./.:4:132,89:.:-0.41:1.000:. ./.:4:34,13:.:-2.92:1.000:. ./.:4:28,39:.:-2.63:1.000:. ./.:3:6,4:.:-3.45:0.999:. ./.:4:220,171:.: 2.04:1.000:. ./.:4:179,159:.: 1.28:1.000:. ./.:4:160,136:.: 0.67:1.000:. ./.:4:110,163:.: 0.34:1.000:. ./.:4:131,195:.: 1.10:1.000:. ./.:4:167,123:.: 0.58:1.000:. ./.:4:215,150:.: 1.67:1.000:. ./.:4:187,162:.: 1.43:1.000:. ./.:4:74,116:.:-0.86:1.000:. ./.:4:139,195:.: 1.22:1.000:. ./.:4:147,142:.: 0.57:1.000:. ./.:4:179,159:.: 1.28:1.000:. ./.:4:156,209:.: 1.67:1.000:. ./.:4:98,126:.:-0.37:1.000:. ./.:4:70,96:.:-1.20:1.000:. ./.:4:180,98:.: 0.41:1.000:. ./.:4:119,223:.: 1.33:1.000:. ./.:4:79,118:.:-0.76:1.000:. ./.:4:158,83:.:-0.12:1.000:. ./.:4:94,141:.:-0.21:1.000:. ./.:4:110,142:.: 0.04:1.000:. ./.:4:137,178:.: 0.94:1.000:. ./.:4:166,101:.: 0.25:1.000:. ./.:4:143,82:.:-0.35:1.000:. ./.:6:101,107:.:-0.60:1.000:. ./.:4:133,116:.:-0.01:1.000:. ./.:4:88,126:.:-0.51:1.000:. ./.:4:67,119:.:-0.92:1.000:. ./.:4:116,199:.: 0.94:1.000:. ./.:4:188,134:.: 1.05:1.000:. ./.:4:66,195:.: 0.17:1.000:. ./.:4:83,142:.:-0.35:1.000:. ./.:4:115,88:.:-0.67:1.000:. ./.:4:166,110:.: 0.38:0.998:. ./.:4:61,171:.:-0.25:1.000:. ./.:4:189,143:.: 1.19:1.000:. ./.:4:71,115:.:-0.92:1.000:. ./.:4:68,244:.: 0.90:1.000:. ./.:4:163,112:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,103:.:-0.81:1.000:. ./.:4:86,129:.:-0.50:1.000:. ./.:4:63,112:.:-1.07:1.000:. ./.:4:176,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:89,162:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.73:1.000:. ./.:4:176,99:.: 0.37:1.000:. ./.:4:82,136:.:-0.45:1.000:. ./.:4:162,120:.: 0.47:1.000:. ./.:4:116,186:.: 0.76:1.000:. ./.:4:92,145:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,94:.:-1.48:1.000:. ./.:4:80,134:.:-0.51:1.000:. ./.:4:113,162:.: 0.37:1.000:. ./.:4:86,133:.:-0.44:1.000:. ./.:4:114,85:.:-0.73:1.000:. ./.:4:122,175:.: 0.68:1.000:. ./.:4:194,107:.: 0.74:1.000:. ./.:4:82,120:.:-0.68:1.000:. ./.:4:121,167:.: 0.56:1.000:. ./.:4:145,97:.:-0.11:1.000:. ./.:4:71,121:.:-0.83:1.000:. ./.:4:46,149:.:-0.79:1.000:. ./.:4:118,160:.: 0.41:1.000:. ./.:4:141,194:.: 1.23:1.000:. ./.:4:85,128:.:-0.53:1.000:. ./.:4:107,149:.: 0.09:1.000:. ./.:4:50,95:.:-1.51:1.000:. ./.:4:114,127:.:-0.12:1.000:. ./.:4:117,74:.:-0.84:1.000:. ./.:4:57,131:.:-0.89:1.000:. ./.:4:135,90:.:-0.35:1.000:. ./.:4:95,179:.: 0.35:1.000:. ./.:4:90,138:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,137:.:-0.32:1.000:. ./.:4:141,82:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,201:.: 1.06:1.000:. ./.:4:102,126:.:-0.31:0.999:. ./.:4:124,89:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,94:.:-1.09:1.000:. ./.:4:101,145:.:-0.05:1.000:. ./.:4:146,100:.:-0.05:1.000:. ./.:4:118,68:.:-0.92:1.000:. ./.:4:156,95:.: 0.02:1.000:. ./.:4:137,84:.:-0.41:1.000:. ./.:4:113,153:.: 0.24:1.000:. ./.:4:128,121:.:-0.01:1.000:. ./.:4:172,131:.: 0.77:1.000:. ./.:4:100,138:.:-0.17:1.000:. ./.:4:133,74:.:-0.61:1.000:. ./.:4:149,118:.: 0.25:1.000:. ./.:4:118,175:.: 0.63:1.000:. ./.:4:109,136:.:-0.06:1.000:. ./.:4:89,65:.:-1.38:1.000:. ./.:4:110,73:.:-0.96:1.000:. ./.:4:143,97:.:-0.14:1.000:. ./.:4:89,135:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,95:.:-1.35:1.000:. ./.:4:175,112:.: 0.54:1.000:. ./.:4:144,92:.:-0.19:1.000:. ./.:4:95,157:.: 0.04:1.000:. ./.:4:159,115:.: 0.35:1.000:. ./.:4:93,157:.: 0.01:1.000:. ./.:4:84,138:.:-0.40:1.000:. ./.:4:134,115:.:-0.01:1.000:. ./.:4:161,121:.: 0.47:1.000:. ./.:4:104,143:.:-0.04:1.000:. ./.:4:135,109:.:-0.08:1.000:. ./.:4:68,96:.:-1.23:1.000:. ./.:4:190,185:.: 1.81:1.000:. ./.:4:215,151:.: 1.68:1.000:. ./.:4:218,153:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,153:.:-0.05:1.000:. ./.:4:75,121:.:-0.77:1.000:. ./.:4:160,163:.: 1.06:1.000:. ./.:4:100,169:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,30:.:-2.43:1.000:. ./.:4:145,102:.:-0.04:1.000:. ./.:4:125,216:.: 1.32:1.000:. ./.:4:178,115:.: 0.63:1.000:. ./.:4:206,199:.: 2.24:1.000:. ./.:4:74,164:.:-0.17:1.000:. ./.:4:151,104:.: 0.08:0.998:. ./.:4:112,162:.: 0.35:1.000:. ./.:4:101,146:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,96:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,162:.:-0.05:1.000:. ./.:4:106,83:.:-0.87:1.000:. ./.:4:137,167:.: 0.79:1.000:. ./.:4:199,155:.: 1.51:1.000:. ./.:4:148,106:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.58:1.000:. ./.:4:156,101:.: 0.11:1.000:. ./.:4:140,98:.:-0.17:1.000:. ./.:4:130,74:.:-0.66:1.000:. ./.:4:142,101:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,141:.:-0.77:1.000:. ./.:4:108,163:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,119:.:-1.29:1.000:. ./.:4:142,97:.:-0.15:1.000:. ./.:4:214,216:.: 2.60:1.000:. ./.:4:161,163:.: 1.07:1.000:. ./.:4:124,176:.: 0.73:1.000:. ./.:4:140,104:.:-0.08:1.000:. ./.:4:163,151:.: 0.93:1.000:. ./.:4:83,145:.:-0.31:1.000:. ./.:4:229,214:.: 2.79:1.000:. ./.:4:108,116:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,236:.: 0.77:1.000:. -chr4.1 60088886 chr4.1_060088886 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:80,256:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,135:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,150:0.49: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,159:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,182:0.48: 1.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:87,294:0.76: 1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,169:0.78:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,147:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,211:0.69: 0.12:1.000:0.975 0/1/1/1:4:18,61:0.76:-3.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,54:0.59:-3.06:1.000:0.849 0/0/1/1:4:143,173:0.53: 0.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,217:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,231:0.69: 0.54:1.000:0.977 0/0/1/1:4:158,155:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:88,295:0.76: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,192:0.53: 0.91:0.999:0.993 0/1/1/1:4:84,252:0.74: 0.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:3,384:0.99: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,197:0.49: 1.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,92:0.81:-2.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,74:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,284:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:196,56:0.24:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,32:0.72:-3.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:171,188:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,176:0.53: 0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:155,139:0.46: 0.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:166,187:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,152:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:170,188:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,226:0.79:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,31:0.44:-3.36:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-2.48:1.000:1.000 0/1/1:3:13,26:0.65:-3.81:0.999:1.000 0/0/0/1:4:256,99:0.29: 0.94:1.000:0.992 0/0/0/1:4:222,86:0.29: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:152,165:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,172:0.51: 0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,270:0.70: 1.27:1.000:0.989 0/1/1/1:4:66,201:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,167:0.48: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,168:0.52: 0.33:1.000:0.995 1/1/1/1:4:3,305:0.99: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,241:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,79:0.29:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:81,257:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,112:0.51:-1.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,193:0.72:-0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,215:0.73:-0.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:71,217:0.74:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,205:0.50: 1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,164:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,274:0.71: 1.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:146,160:0.51: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,264:0.73: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,158:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,167:0.54: 0.10:1.000:0.986 0/1/1/1:4:76,212:0.72:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:72,185:0.71:-0.53:1.000:0.836 0/1/1/1:4:74,232:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,220:0.76:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,333:1.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,124:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,170:0.47: 0.94:1.000:0.991 0/1/1/1:4:80,324:0.79: 1.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,169:0.79:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,166:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:68,223:0.76:-0.02:0.998:1.000 0/0/0/1:4:222,68:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,172:0.54: 0.25:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,216:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,189:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,182:0.52: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,141:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,228:0.74: 0.16:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,271:0.99:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,230:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,250:0.72: 0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,262:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:112,105:0.47:-1.13:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,245:0.80: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,359:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,217:0.78:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,236:0.73: 0.37:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,337:1.00: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,243:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,206:0.80:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,213:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,123:0.46:-0.44:1.000:0.986 0/1/1/1:4:72,234:0.75: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,153:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,266:0.71: 1.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:91,113:0.54:-1.33:1.000:0.989 0/0/1/1:4:178,154:0.45: 0.60:1.000:0.983 0/0/0/1:4:239,75:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,137:0.52:-0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:190,59:0.25:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,171:0.54: 0.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:127,157:0.54:-0.12:1.000:0.989 0/0/1/1:4:87,103:0.53:-1.54:1.000:0.993 0/1/1/1:4:75,227:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,143:0.67:-1.24:1.000:0.914 0/0/1/1:4:96,154:0.60:-0.63:1.000:0.774 0/0/1/1:4:110,115:0.50:-1.01:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,304:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,232:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,226:0.75: 0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,361:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,171:0.53: 0.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:56,182:0.75:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,230:0.53: 1.97:1.000:0.993 0/1/1/1:4:70,230:0.76: 0.12:0.999:1.000 0/1/1/1:4:76,220:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:66,159:0.69:-1.01:1.000:0.980 0/1/1/1:4:71,247:0.77: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,137:0.55:-0.77:1.000:0.976 0/0/1/1:4:110,149:0.56:-0.50:1.000:0.967 0/1/1/1:4:69,205:0.74:-0.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,199:0.76:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,154:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,122:0.47:-0.57:1.000:0.991 0/1/1/1:4:86,270:0.75: 0.96:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,338:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,210:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,286:0.82: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,120:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,58:0.27:-0.94:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,180:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,178:0.80:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,58:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,128:0.45:-0.26:1.000:0.984 0/0/1/1:4:81,78:0.48:-2.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:144,148:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,151:0.51:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:189,169:0.46: 0.99:1.000:0.988 0/0/1/1:4:178,197:0.51: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,116:0.46:-0.66:1.000:0.986 0/0/1/1:4:125,133:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,134:0.47:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:131,145:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,203:0.72:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,166:0.55: 0.04:1.000:0.982 0/0/1/1:4:105,113:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,207:0.53: 1.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:200,194:0.48: 1.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:255,67:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,155:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,273:0.78: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,236:0.72: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,199:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,263:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,74:0.82:-3.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,189:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,195:0.50: 1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,168:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,153:0.45: 0.60:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,316:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,197:0.71:-0.30:0.998:0.993 0/1/1/1:4:95,254:0.72: 0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:128,137:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,140:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,141:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,244:0.78: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,296:0.78: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,161:0.47: 0.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:202,62:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,232:0.75: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,144:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,146:0.49:-0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,214:0.79:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,64:0.27:-0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,198:0.78:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,220:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,202:0.79:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,182:0.75:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,187:0.47: 1.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:166,162:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:76,270:0.77: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,139:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,154:0.49: 0.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,413:1.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,187:0.49: 1.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,183:0.72:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,145:0.49:-0.11:1.000:0.996 -chr4.1 61300456 chr4.1_061300456 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:831,205:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:136,392:0.74:-1.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:476,157:0.29:-0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:379,553:0.61: 0.55:1.000:0.702 0/1/1/1:4:342,766:0.69: 1.26:1.000:0.977 0/0/1/1:4:408,396:0.52: 0.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:232,81:0.30:-1.95:1.000:0.986 0/0/1/1:4:567,307:0.39: 0.31:1.000:0.675 0/0/0/1:4:482,118:0.23:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:265,136:0.38:-1.59:1.000:0.527 0/1/1/1:4:119,233:0.67:-1.79:1.000:0.910 0/1/1/1:4:138,396:0.74:-1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:526,354:0.44: 0.34:1.000:0.964 0/0/1/1:4:534,366:0.44: 0.42:1.000:0.971 0/0/1/1:4:565,390:0.44: 0.64:1.000:0.973 0/0/1/1:4:386,328:0.49:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:379,551:0.61: 0.54:0.999:0.710 0/0/1/1:4:446,267:0.41:-0.33:1.000:0.871 0/0/0/1:4:1052,281:0.25: 2.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:772,209:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:575,6:0.01:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:544,377:0.45: 0.50:1.000:0.975 0/0/1/1:4:472,386:0.48: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:413,275:0.44:-0.43:1.000:0.960 0/0/0/1:4:211,78:0.31:-2.04:1.000:0.975 0/0/1/1:4:632,395:0.42: 0.93:1.000:0.918 0/0/0/1:4:594,133:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:318,275:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:462,699:0.62: 1.47:1.000:0.614 0/0/1/1:4:232,222:0.52:-1.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:218,359:0.63:-0.88:1.000:0.611 0/0/0/1:4:364,128:0.30:-1.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:190,131:0.44:-1.91:1.000:0.973 0/0/0/1:4:433,108:0.24:-1.03:1.000:1.000 0/0/0:3:177,18:0.11:-2.42:0.999:0.995 0/0/1/1:4:348,290:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:537,348:0.43: 0.36:1.000:0.945 0/0/1/1:4:496,310:0.42: 0.04:1.000:0.918 0/0/1/1:4:351,552:0.62: 0.43:1.000:0.512 0/0/0/1:4:673,188:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:500,165:0.29:-0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:365,321:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:506,512:0.53: 0.90:1.000:0.992 0/0/0/1:4:685,164:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:356,304:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:585,375:0.43: 0.66:1.000:0.938 0/0/0/1:4:731,169:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:510,369:0.46: 0.34:1.000:0.985 0/0/0/1:4:502,158:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:532,165:0.28:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:700,165:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:298,813:0.73: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:338,494:0.61: 0.15:1.000:0.698 0/0/0/1:4:735,195:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:329,294:0.51:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:440,344:0.47:-0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:167,442:0.72:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:864,205:0.23: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:860,1:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:406,150:0.31:-0.97:1.000:0.898 0/0/0/1:4:529,169:0.28:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:330,341:0.54:-0.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:909,202:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:229,505:0.69:-0.25:1.000:0.973 0/0/1/1:4:463,361:0.47: 0.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:846,401:0.36: 1.82:1.000:0.693 0/0/1/1:4:305,262:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:596,166:0.26:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:825,0:0.00: 0.12:0.998:1.000 0/0/1/1:4:348,340:0.52:-0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:625,400:0.43: 0.92:1.000:0.937 0/0/0/1:4:679,200:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:804,226:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:850,195:0.22: 1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,842:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:550,145:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:629,198:0.28: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:509,328:0.43: 0.17:1.000:0.942 0/0/0/0:4:1012,1:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:883,196:0.22: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,304:0.72:-1.52:1.000:0.996 0/0/0/0:4:1624,5:0.00: 3.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:835,188:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:709,198:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:439,350:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:1030,255:0.24: 1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:505,129:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:415,414:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:400,316:0.48:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:456,300:0.43:-0.16:1.000:0.954 0/0/0/1:4:435,108:0.24:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:483,358:0.46: 0.18:1.000:0.988 0/0/0/0:4:1173,2:0.00: 1.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:295,524:0.65: 0.09:1.000:0.780 0/1/1/1:4:242,510:0.68:-0.18:1.000:0.957 0/0/1/1:4:580,351:0.41: 0.54:1.000:0.885 0/0/1/1:4:423,344:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:157,472:0.74:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:230,613:0.72: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:537,455:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:308,252:0.48:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:458,434:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:344,279:0.48:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:555,364:0.43: 0.50:1.000:0.952 0/0/0/1:4:520,124:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:521,394:0.47: 0.48:1.000:0.991 0/0/0/0:4:921,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:527,112:0.21:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1304,288:0.22: 3.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:197,567:0.74:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:892,196:0.22: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:180,519:0.74:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:409,391:0.52: 0.02:0.999:0.995 0/0/1/1:4:609,368:0.41: 0.73:1.000:0.883 0/0/1/1:4:171,189:0.55:-1.76:1.000:0.979 0/0/1/1:4:756,467:0.42: 1.72:1.000:0.907 0/0/1/1:4:582,391:0.44: 0.71:1.000:0.964 0/0/0/1:4:765,197:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:778,186:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1043,2:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:498,753:0.62: 1.83:1.000:0.616 0/0/0/1:4:845,160:0.19: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:833,192:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:408,136:0.29:-1.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:835,230:0.26: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1075,2:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:186,458:0.71:-0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:207,187:0.51:-1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:442,107:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:645,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:323,290:0.51:-0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:225,372:0.63:-0.80:1.000:0.621 0/0/0/1:4:353,174:0.37:-1.08:1.000:0.589 0/0/1/1:4:459,293:0.43:-0.18:1.000:0.935 0/0/0/1:4:504,135:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:874,234:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:666,406:0.42: 1.11:1.000:0.893 0/1/1/1:4:253,495:0.67:-0.19:1.000:0.910 0/1/1/1:4:151,377:0.71:-1.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:420,304:0.46:-0.29:1.000:0.985 0/0/0/1:4:1086,241:0.22: 2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:594,350:0.41: 0.60:1.000:0.849 0/0/0/1:4:435,157:0.30:-0.82:1.000:0.980 0/1/1/1:4:115,360:0.75:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:562,482:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:1118,271:0.23: 2.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:423,427:0.53: 0.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:165,520:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:1107,275:0.24: 2.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:624,164:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:564,354:0.42: 0.49:1.000:0.922 0/0/1/1:4:363,327:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/0:4:353,9:0.03:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:306,90:0.27:-1.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:219,617:0.73: 0.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:902,213:0.23: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:658,216:0.29: 0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:804,170:0.21: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:468,120:0.24:-0.84:0.998:1.000 0/0/0/1:4:751,203:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:262,286:0.55:-1.00:1.000:0.982 0/0/0/1:4:655,154:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:153,371:0.71:-1.10:1.000:0.990 0/0/0/1:4:650,155:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,232:0.49:-1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:636,184:0.26: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:288,267:0.51:-0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:408,349:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:379,137:0.30:-1.13:1.000:0.980 0/0/0/1:4:368,127:0.30:-1.21:1.000:0.988 0/0/0/1:4:356,108:0.27:-1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:264,255:0.52:-1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:488,302:0.42:-0.02:1.000:0.909 0/0/1/1:4:387,327:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:301,192:0.43:-1.22:1.000:0.935 0/0/0/1:4:303,101:0.29:-1.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:362,317:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:922,237:0.24: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:427,387:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:435,150:0.30:-0.85:1.000:0.988 0/0/1/1:4:438,278:0.42:-0.32:1.000:0.931 0/0/0/1:4:860,216:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:496,432:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:396,120:0.27:-1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:440,417:0.52: 0.25:1.000:0.995 -chr4.1 61541635 chr4.1_061541635 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:63,19:.:-1.20:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:70,24:.:-0.88:1.000:. ./.:4:85,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:86,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:55,24:.:-1.28:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:42,24:.:-1.63:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.94:1.000:. ./.:4:40,46:.:-1.09:1.000:. ./.:4:79,30:.:-0.48:1.000:. ./.:4:99,40:.: 0.31:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:83,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:92,25:.:-0.27:0.999:. ./.:4:64,30:.:-0.88:1.000:. ./.:4:96,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:79,35:.:-0.35:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:77,24:.:-0.70:1.000:. ./.:4:79,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:74,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:91,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:60,29:.:-1.02:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:60,17:.:-1.33:1.000:. ./.:3:43,0:.:-2.24:0.999:. ./.:4:98,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:71,25:.:-0.83:1.000:. ./.:4:139,36:.: 1.27:1.000:. ./.:4:127,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,38:.: 0.47:1.000:. ./.:4:112,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:170,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:144,37:.: 1.43:1.000:. ./.:4:157,45:.: 1.99:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:72,27:.:-0.75:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:288,1:.: 4.30:1.000:. ./.:4:97,35:.: 0.13:1.000:. ./.:4:128,40:.: 1.08:1.000:. ./.:4:123,36:.: 0.84:1.000:. ./.:4:107,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:175,46:.: 2.49:1.000:. ./.:4:113,31:.: 0.45:1.000:. ./.:4:219,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.53:1.000:. ./.:6:88,25:.:-0.38:1.000:. ./.:4:96,34:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,31:.:-0.09:1.000:. ./.:4:165,45:.: 2.20:1.000:. ./.:4:160,46:.: 2.09:1.000:. ./.:4:108,33:.: 0.37:1.000:. ./.:4:169,50:.: 2.44:1.000:. ./.:4:96,28:.:-0.09:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.38:0.998:. ./.:4:108,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:120,52:.: 1.19:1.000:. ./.:4:124,43:.: 1.06:1.000:. ./.:4:231,1:.: 2.78:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:72,80:.: 0.66:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:112,27:.: 0.31:1.000:. ./.:4:105,40:.: 0.47:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:86,29:.:-0.32:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:103,51:.: 0.71:1.000:. ./.:4:72,29:.:-0.70:1.000:. ./.:4:147,45:.: 1.72:1.000:. ./.:4:123,31:.: 0.71:1.000:. ./.:4:96,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:117,34:.: 0.63:1.000:. ./.:4:107,32:.: 0.31:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:92,35:.:-0.01:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:65,33:.:-0.78:1.000:. ./.:4:117,37:.: 0.71:1.000:. ./.:4:208,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:113,37:.: 0.61:1.000:. ./.:4:140,51:.: 1.69:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:112,38:.: 0.61:1.000:. ./.:4:78,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:47,68:.:-0.32:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:113,33:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,30:.:-0.30:1.000:. ./.:4:104,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,33:.: 0.79:1.000:. ./.:4:116,47:.: 0.95:0.999:. ./.:4:104,31:.: 0.21:1.000:. ./.:4:114,41:.: 0.74:1.000:. ./.:4:130,43:.: 1.22:1.000:. ./.:4:110,41:.: 0.63:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:120,33:.: 0.69:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:84,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:111,35:.: 0.50:1.000:. ./.:4:68,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:98,33:.: 0.10:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:102,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:118,25:.: 0.42:1.000:. ./.:4:97,40:.: 0.26:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:59,22:.:-1.23:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:107,36:.: 0.42:1.000:. ./.:4:77,41:.:-0.24:1.000:. ./.:4:103,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:135,33:.: 1.08:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:85,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:112,35:.: 0.53:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:72,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:79,31:.:-0.46:1.000:. ./.:4:67,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:54,13:.:-1.60:1.000:. ./.:4:135,52:.: 1.59:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:86,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,14:.:-1.47:0.998:. ./.:4:126,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:109,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.99:1.000:. ./.:4:70,32:.:-0.67:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.94:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:58,24:.:-1.20:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:87,33:.:-0.19:1.000:. ./.:4:67,27:.:-0.88:1.000:. ./.:4:102,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:59,23:.:-1.20:1.000:. ./.:4:79,28:.:-0.54:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:85,28:.:-0.38:1.000:. ./.:4:101,3:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.86:1.000:. ./.:4:105,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,27:.:-0.48:1.000:. ./.:4:72,25:.:-0.80:1.000:. ./.:4:64,15:.:-1.28:1.000:. -chr4.1 61835774 chr4.1_061835774 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:281,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:111,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:219,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.24:1.000:. ./.:3:29,0:.:-2.23:0.999:. ./.:4:125,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:472,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:436,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:261,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.09:1.000:. ./.:6:212,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.04:0.998:. ./.:4:83,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:212,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.79:0.999:. ./.:4:164,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:270,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:291,2:.: 0.89:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:152,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:319,2:.: 1.23:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:246,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.87:0.998:. ./.:4:237,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:251,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:360,2:.: 1.71:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:448,1:.: 2.74:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:279,3:.: 0.76:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.39:1.000:. -chr4.1 62706221 chr4.1_062706221 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:298,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:319,3:.: 1.05:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:148,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:259,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:337,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:313,2:.: 0.93:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:251,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:118,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:381,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:338,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:142,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.44:1.000:. ./.:3:66,0:.:-3.51:0.999:. ./.:4:253,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:234,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:319,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:77,2:.:-3.28:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:383,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:376,2:.: 2.05:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:246,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:436,1:.: 3.10:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:213,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:345,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.43:0.998:. ./.:4:252,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:299,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:203,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:251,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:261,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:144,1:.:-2.10:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:383,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.05:0.999:. ./.:4:290,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:309,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:302,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:256,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:233,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:352,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:217,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:222,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:329,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:381,1:.: 2.12:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:289,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:129,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:149,1:.:-2.01:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:283,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.68:0.998:. ./.:4:283,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:248,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:200,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:329,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:281,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:346,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.27:1.000:. -chr4.1 62941909 chr4.1_062941909 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:306,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:566,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:338,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:522,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.64:1.000:. ./.:3:54,0:.:-2.45:0.999:. ./.:4:461,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:264,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:642,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:639,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:428,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.81:1.000:. ./.:6:420,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:569,0:.: 1.58:0.998:. ./.:4:161,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:495,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:506,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:517,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:557,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:516,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:343,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:590,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:656,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:596,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:636,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:514,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:697,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:555,0:.: 1.47:0.998:. ./.:4:492,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:637,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:596,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:641,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:692,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.70:1.000:. -chr4.1 63381286 chr4.1_063381286 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:806,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:593,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:570,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:686,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:462,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:718,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:278,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:306,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:531,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:883,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:797,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:387,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:1008,0:.: 1.70:0.999:. ./.:4:876,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:894,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:830,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:265,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:859,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:419,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:707,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:248,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:941,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:835,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:740,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1149,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:541,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1050,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:399,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:175,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:267,0:.:-1.71:1.000:. ./.:3:109,0:.:-2.43:0.999:. ./.:4:790,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:623,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:944,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:1028,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:971,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:535,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:663,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:715,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:422,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:567,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:896,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:1068,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:388,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:584,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:666,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:710,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:658,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1011,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:650,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:581,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:396,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1145,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:927,0:.: 1.32:1.000:. ./.:6:394,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:535,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:371,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:555,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:526,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:613,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:698,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:961,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:719,0:.: 0.37:0.998:. ./.:4:588,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:946,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:410,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:612,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:794,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:485,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:700,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:516,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:673,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:740,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:867,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:806,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:765,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:527,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:686,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:834,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:391,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:709,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:544,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:761,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:324,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1056,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:353,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:616,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:734,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:660,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:687,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:789,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:567,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:546,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:751,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:891,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:876,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:409,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:606,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:942,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:806,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:665,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:560,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:508,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.80:0.999:. ./.:4:715,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:519,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:833,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:699,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:690,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:695,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:645,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:837,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:372,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:574,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:850,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:433,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:620,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:517,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:800,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:535,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:410,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:703,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:377,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:1394,0:.: 3.47:1.000:. ./.:4:843,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:230,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:613,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:805,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:706,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:541,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:593,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:399,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:535,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1031,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:667,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:532,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:722,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:868,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:826,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:508,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:296,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:339,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:563,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:514,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:863,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.88:0.998:. ./.:4:1052,2:.: 1.91:1.000:. ./.:4:502,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:624,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:552,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:888,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:610,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:489,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:523,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:749,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:598,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:813,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:484,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:918,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:499,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:765,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:558,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1055,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:909,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:583,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:507,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:756,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:674,0:.: 0.16:0.997:. ./.:4:596,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.81:1.000:. -chr4.1 63736338 chr4.1_063736338 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:203,111:0.38:-0.16:1.000:0.629 0/0/0/1:4:217,81:0.30:-0.31:1.000:0.987 0/0/1/1:4:94,125:0.59:-1.07:1.000:0.887 0/0/1/1:4:193,103:0.38:-0.33:1.000:0.554 0/0/0/1:4:421,124:0.25: 2.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:402,118:0.25: 1.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:215,76:0.29:-0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:195,90:0.34:-0.44:1.000:0.839 0/0/0/1:4:316,92:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,75:0.65:-2.07:1.000:0.791 0/1/1/1:4:75,137:0.65:-1.14:1.000:0.745 0/0/1/1:4:142,84:0.40:-1.01:1.000:0.825 0/0/0/1:4:167,87:0.37:-0.74:1.000:0.524 0/0/0/1:4:201,101:0.36:-0.28:1.000:0.637 0/0/0/1:4:192,99:0.37:-0.38:1.000:0.557 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,124:0.42:-0.12:0.999:0.928 0/0/1/1:4:176,94:0.38:-0.58:1.000:0.556 0/1/1/1:4:99,206:0.67:-0.25:1.000:0.912 0/0/0/1:4:225,116:0.37: 0.10:1.000:0.557 0/0/0/1:4:259,48:0.17:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:265,39:0.14:-0.26:1.000:0.970 0/0/0/1:4:394,89:0.20: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,56:0.19:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,49:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,110:0.36: 0.06:1.000:0.736 0/0/0/0:4:488,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,93:0.28: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:240,102:0.33: 0.11:1.000:0.937 0/0/0/1:4:363,98:0.23: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,100:0.33:-0.03:1.000:0.909 0/0/0/1:4:249,99:0.31: 0.17:1.000:0.972 0/0/0/1:4:266,67:0.22: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,49:0.22:-0.79:1.000:1.000 0/1/1:3:67,71:0.54:-1.85:0.999:0.942 0/0/0/0:4:478,50:0.10: 1.90:1.000:0.700 0/0/0/1:4:305,47:0.15: 0.21:1.000:0.983 0/0/1/1:4:137,109:0.48:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:213,119:0.39: 0.01:1.000:0.691 0/0/0/1:4:422,53:0.12: 1.39:1.000:0.812 0/0/0/1:4:276,100:0.29: 0.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:301,103:0.28: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,145:0.54:-0.43:1.000:0.990 0/1/1/1:4:63,154:0.69:-1.09:1.000:0.980 0/0/1/1:4:246,148:0.41: 0.61:1.000:0.854 0/0/0/1:4:245,57:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:456,61:0.13: 1.79:1.000:0.906 0/0/1/1:4:392,285:0.46: 3.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:313,94:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:235,158:0.44: 0.60:1.000:0.961 0/0/0/1:4:330,43:0.13: 0.41:1.000:0.873 0/0/1/1:4:147,173:0.56:-0.10:1.000:0.963 0/0/0/1:4:188,71:0.30:-0.69:1.000:0.985 0/0/1/1:4:130,111:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,127:0.58:-1.00:1.000:0.925 1/1/1/1:4:0,211:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,90:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:600,0:0.00: 2.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:336,40:0.12: 0.44:1.000:0.687 0/0/0/1/1/1:6:176,110:0.42:-0.43:1.000:0.502 0/0/0/1:4:291,102:0.28: 0.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:327,86:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,154:0.63:-0.83:1.000:0.606 0/0/0/1:4:363,106:0.25: 1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,177:0.67:-0.66:1.000:0.913 0/0/1/1:4:190,133:0.45:-0.07:1.000:0.977 0/0/1/1:4:158,118:0.46:-0.53:1.000:0.990 0/0/0/1:4:264,37:0.13:-0.29:1.000:0.945 0/0/0/1:4:340,128:0.30: 1.32:0.998:0.986 0/0/0/1:4:256,43:0.16:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:169,104:0.41:-0.55:1.000:0.887 0/0/1/1:4:232,156:0.44: 0.55:1.000:0.961 0/0/0/1:4:261,116:0.34: 0.45:1.000:0.894 0/0/0/1:4:289,42:0.14: 0.00:1.000:0.965 0/0/0/1:4:218,80:0.29:-0.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:406,52:0.12: 1.22:1.000:0.847 0/0/1/1:4:232,143:0.41: 0.43:1.000:0.889 0/0/0/1:4:219,106:0.36:-0.05:1.000:0.739 0/0/1/1:4:167,96:0.40:-0.65:1.000:0.764 0/0/0/0:4:467,49:0.10: 1.78:1.000:0.692 0/0/0/1:4:187,72:0.30:-0.69:1.000:0.981 0/0/1/1:4:167,88:0.38:-0.73:1.000:0.513 0/1/1/1:4:63,167:0.71:-0.97:1.000:0.991 0/0/0/1:4:289,46:0.15: 0.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:271,180:0.43: 1.16:1.000:0.955 0/1/1/1:4:81,165:0.66:-0.81:1.000:0.894 0/1/1/1:4:55,105:0.65:-1.64:1.000:0.818 0/0/0/1:4:302,85:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,130:0.39: 0.33:1.000:0.664 0/0/0/1:4:209,83:0.31:-0.37:1.000:0.973 0/1/1/1:4:75,164:0.68:-0.88:1.000:0.944 0/0/0/1:4:292,90:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:428,62:0.14: 1.53:1.000:0.963 0/0/0/1:4:118,52:0.33:-1.54:1.000:0.904 0/0/1/1:4:106,138:0.58:-0.83:1.000:0.906 0/0/0/1:4:288,37:0.13:-0.05:1.000:0.852 0/0/0/1:4:275,75:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:278,34:0.12:-0.18:1.000:0.755 0/0/1/1:4:129,164:0.58:-0.36:1.000:0.924 0/0/0/1:4:344,82:0.21: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,137:0.58:-0.83:1.000:0.919 0/0/1/1:4:153,151:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:147,90:0.41:-0.90:1.000:0.880 0/0/0/1:4:196,81:0.32:-0.52:1.000:0.955 0/0/0/1:4:241,43:0.17:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,135:0.66:-1.23:1.000:0.868 0/0/0/1:4:338,56:0.16: 0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:370,50:0.13: 0.86:1.000:0.916 0/1/1/1:4:94,192:0.66:-0.43:1.000:0.897 0/0/1/1:4:109,141:0.58:-0.78:1.000:0.911 0/0/1/1:4:139,96:0.44:-0.92:1.000:0.972 0/0/1/1:4:166,221:0.59: 0.54:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,177:1.00:-1.48:0.999:1.000 0/0/1/1:4:142,91:0.42:-0.94:1.000:0.930 0/0/0/1:4:292,81:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:475,59:0.12: 1.95:1.000:0.790 0/0/1/1:4:143,84:0.40:-1.00:1.000:0.811 0/0/0/1:4:266,72:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,100:0.44:-0.80:1.000:0.967 0/0/1/1:4:128,94:0.46:-1.04:1.000:0.987 0/0/0/1:4:229,100:0.33:-0.02:1.000:0.914 0/0/1/1:4:125,107:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:404,46:0.11: 1.15:1.000:0.555 0/0/1/1:4:213,157:0.46: 0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:145,93:0.42:-0.89:1.000:0.931 0/0/0/1:4:416,49:0.12: 1.29:1.000:0.657 0/0/0/1:4:371,103:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,34:0.15:-0.78:1.000:0.988 0/0/1/1:4:116,62:0.38:-1.47:1.000:0.558 0/0/0/1:4:260,40:0.15:-0.29:1.000:0.983 0/0/0/1:4:215,105:0.36:-0.10:1.000:0.716 0/0/1/1:4:164,105:0.42:-0.59:1.000:0.929 0/0/0/1:4:118,57:0.35:-1.50:1.000:0.744 0/0/0/1:4:253,51:0.18:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,163:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,65:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,93:0.42:-0.88:1.000:0.925 0/0/0/1:4:303,112:0.30: 0.81:1.000:0.989 0/0/0/1:4:271,86:0.26: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,83:0.43:-1.17:1.000:0.950 0/0/0/0:4:493,1:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,151:0.65:-0.96:1.000:0.801 0/0/0/1:4:401,50:0.12: 1.16:1.000:0.798 0/0/1/1:4:105,114:0.55:-1.07:1.000:0.983 0/1/1/1:4:74,166:0.68:-0.87:1.000:0.956 0/0/0/0:4:680,0:0.00: 3.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:400,50:0.12: 1.15:1.000:0.803 0/0/1/1:4:123,142:0.56:-0.63:1.000:0.969 0/0/1/1:4:207,122:0.40:-0.02:1.000:0.818 0/0/0/1:4:168,79:0.35:-0.80:1.000:0.804 0/0/1/1:4:178,119:0.44:-0.32:1.000:0.958 0/0/0/1:4:339,100:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:253,29:0.11:-0.47:1.000:0.576 0/0/0/0:4:266,28:0.10:-0.35:1.000:0.683 0/0/0/1:4:424,96:0.20: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,87:0.40:-0.88:1.000:0.754 0/0/0/1:4:375,111:0.25: 1.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,159:0.66:-0.86:1.000:0.840 0/0/0/1:4:310,40:0.13: 0.19:0.998:0.859 0/0/0/0:4:470,49:0.10: 1.81:1.000:0.709 0/0/1/1:4:162,91:0.39:-0.75:1.000:0.706 0/0/0/0:4:441,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,136:0.58:-0.85:1.000:0.918 0/0/1/1:4:135,113:0.49:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:241,172:0.45: 0.79:1.000:0.982 0/0/0/1:4:298,98:0.27: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,100:0.37:-0.35:1.000:0.558 0/0/1/1:4:115,122:0.54:-0.90:1.000:0.986 0/0/0/1:4:383,75:0.18: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:445,45:0.10: 1.53:1.000:0.782 0/0/1/1:4:132,81:0.41:-1.13:1.000:0.883 0/0/0/1:4:172,72:0.32:-0.83:1.000:0.948 0/0/1/1:4:168,95:0.39:-0.65:1.000:0.724 0/0/1/1:4:200,120:0.41:-0.10:1.000:0.850 0/0/0/1:4:171,86:0.36:-0.71:1.000:0.634 0/0/0/1:4:222,81:0.29:-0.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:378,133:0.28: 1.73:1.000:0.994 0/0/0/0:4:568,0:0.00: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:359,92:0.22: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,126:0.63:-1.24:1.000:0.530 0/0/1/1:4:146,100:0.44:-0.81:1.000:0.969 0/1/1/1:4:95,182:0.65:-0.52:0.997:0.823 0/0/0/1:4:349,127:0.29: 1.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:253,81:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,98:0.39:-0.55:1.000:0.698 -chr4.1 64012860 chr4.1_064012860 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:10,3:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.35:-0.72:1.000:0.792 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.08:1.000:0.960 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.08:1.000:0.960 0/1/1/1:4:1,5:0.70:-1.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:2,3:0.56:-1.45:1.000:0.967 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.19: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.33: 0.02:1.000:0.933 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-0.72:1.000:0.852 0/0/0/1:4:9,4:0.33: 0.02:1.000:0.933 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-0.72:1.000:0.980 0/0/1/1:4:7,5:0.43:-0.16:1.000:0.932 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.90:0.999:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.28: 1.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-0.72:1.000:0.852 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-0.53:1.000:0.967 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.35:-1.27:1.000:0.792 0/0/1/1:4:6,8:0.54: 0.20:1.000:0.986 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-0.35:1.000:0.747 0/0/0/1:4:5,1:0.19:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-0.53:1.000:0.954 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,2:0.41:-1.45:1.000:0.864 0/0/0/1:4:5,2:0.31:-1.08:1.000:0.977 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.44: 0.20:1.000:0.960 0/1/1:3:2,22:0.75: 2.04:0.999:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,5:0.40: 0.02:1.000:0.756 0/0/0/1:4:8,2:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-0.53:1.000:0.954 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.38:-0.35:1.000:0.534 0/0/1/1:4:6,9:0.56: 0.39:1.000:0.967 0/0/1/1:4:6,7:0.52: 0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:15,4:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.34: 1.68:1.000:0.890 0/0/0/1:4:11,4:0.29: 0.39:1.000:0.992 0/0/0/0:4:13,1:0.08: 0.20:1.000:0.988 0/0/0/1:4:27,13:0.34: 4.99:1.000:0.852 0/0/1/1:4:2,4:0.60:-1.27:1.000:0.791 0/0/0/1:4:15,4:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,6:0.41: 0.39:1.000:0.864 0/0/0/1:4:11,3:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.19: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,4:0.82:-1.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,9:0.54: 0.57:1.000:0.989 0/1/1/1:4:1,8:0.73:-0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:12,6:0.35: 0.94:1.000:0.792 0/0/0/1:4:8,3:0.30:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/1/1/1:6:8,6:0.44: 0.20:1.000:0.647 0/0/1/1:4:8,5:0.40: 0.02:1.000:0.756 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,6:0.23: 2.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,13:0.61: 1.12:1.000:0.686 0/0/1/1:4:10,9:0.48: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:16,3:0.18: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-0.53:1.000:0.967 0/0/0/1:4:8,2:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.19: 0.94:0.998:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.38: 1.12:1.000:0.590 0/0/1/1:4:5,7:0.55:-0.16:1.000:0.980 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.14:-0.90:1.000:0.969 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.39: 0.57:1.000:0.663 0/0/1/1:4:8,7:0.47: 0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:5,3:0.39:-0.90:1.000:0.663 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-0.53:1.000:0.864 0/0/0/1:4:10,4:0.31: 0.20:1.000:0.977 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.39: 0.57:1.000:0.663 0/0/0/0:4:24,2:0.09: 2.41:1.000:0.967 0/0/0/1:4:8,3:0.30:-0.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:10,9:0.48: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:14,3:0.20: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,3:0.17: 1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-0.35:1.000:0.747 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.30:-0.35:1.000:0.989 0/1/1/1:4:3,11:0.67: 0.20:1.000:0.927 0/0/0/0:4:21,1:0.05: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.30:-0.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,6:0.44: 0.20:1.000:0.960 0/0/1/1:4:9,6:0.41: 0.39:1.000:0.864 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.67: 0.20:1.000:0.927 0/0/1/1:4:3,5:0.58:-0.90:1.000:0.932 0/0/1/1:4:5,9:0.59: 0.20:1.000:0.888 0/0/1/1:4:2,4:0.60:-1.27:1.000:0.791 0/0/1/1:4:7,6:0.47: 0.02:1.000:0.990 0/0/0/1:4:11,2:0.17: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,3:0.21: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.31: 0.76:1.000:0.965 0/0/0/1:4:10,2:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,1:0.05: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.39:-0.90:1.000:0.663 0/0/1/1:4:13,8:0.39: 1.49:1.000:0.723 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-1.08:1.000:0.986 0/0/0/1:4:14,7:0.35: 1.49:0.999:0.792 0/0/0/1:4:14,4:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,7:0.62:-0.53:1.000:0.569 0/0/0/1:4:14,2:0.14: 0.57:1.000:0.969 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,4:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,4:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.28: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,7:0.38: 1.12:1.000:0.590 0/0/0/0:4:17,1:0.06: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.35: 0.39:1.000:0.792 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-0.72:1.000:0.991 0/0/0/0:4:11,1:0.09:-0.16:1.000:0.908 0/0/0/1:4:10,3:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-0.53:1.000:0.864 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,2:0.16: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,2:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,1:0.28:-1.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-0.53:1.000:0.954 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-0.53:1.000:0.954 0/0/0/1:4:11,4:0.29: 0.39:1.000:0.992 0/0/0/0:4:16,1:0.07: 0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,9:0.65:-0.16:1.000:0.792 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.16:1.000:0.792 0/0/0/1:4:16,2:0.12: 0.94:1.000:0.852 0/0/0/1:4:15,5:0.28: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.08:1.000:0.960 0/0/1/1:4:13,8:0.39: 1.49:1.000:0.723 0/0/0/1:4:11,3:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.58:-0.35:1.000:0.906 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-0.53:1.000:0.967 0/0/0/1:4:11,5:0.33: 0.57:1.000:0.916 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.16:1.000:0.792 0/0/1/1:4:10,9:0.48: 1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:3,2:0.41:-1.45:1.000:0.864 0/0/1/1:4:16,15:0.49: 3.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,2:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.57: 0.02:1.000:0.949 0/0/0/1:4:9,1:0.11:-0.53:1.000:0.563 0/0/1/1:4:12,8:0.41: 1.31:1.000:0.864 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,1:0.07: 0.57:0.998:0.998 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-0.53:1.000:0.864 0/0/0/1:4:6,3:0.35:-0.72:1.000:0.792 0/0/0/1:4:4,1:0.23:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.65:-0.90:1.000:0.792 0/0/0/1:4:11,5:0.33: 0.57:1.000:0.916 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,7:0.47: 0.39:1.000:0.992 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.58:-0.90:1.000:0.932 0/1/1/1:4:2,5:0.63:-1.08:1.000:0.544 0/0/0/1:4:10,3:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,5:0.63:-1.08:1.000:0.544 0/0/1/1:4:5,3:0.39:-0.90:1.000:0.663 0/0/1/1:4:11,7:0.40: 0.94:1.000:0.791 0/0/0/1:4:9,4:0.33: 0.02:1.000:0.933 0/0/1/1:4:5,7:0.55:-0.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-0.35:1.000:0.987 0/0/0/1:4:11,6:0.37: 0.76:1.000:0.594 0/1/1/1:4:2,7:0.67:-0.72:1.000:0.906 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-0.35:1.000:0.747 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-0.53:0.997:0.954 0/0/0/1:4:12,5:0.31: 0.76:1.000:0.965 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-0.16:1.000:0.792 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 2.41:1.000:1.000 -chr4.1 64292388 chr4.1_064292388 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,324:1.00: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,176:0.74:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,180:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,183:0.73: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:165,181:0.51: 1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,213:0.54: 2.59:1.000:0.986 0/0/0/1:4:145,66:0.35:-0.59:1.000:0.806 1/1/1/1:4:0,218:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,203:0.80: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,102:0.81:-2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,109:0.87:-2.17:1.000:0.943 0/0/0/1:4:178,67:0.32: 0.03:1.000:0.958 0/1/1/1:4:69,202:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:69,215:0.74: 0.75:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,216:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,175:0.72:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,147:0.67:-0.48:0.999:0.900 0/0/1/1:4:137,147:0.51: 0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,218:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,284:0.79: 2.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,100:0.69:-1.84:1.000:0.969 0/1/1/1:4:70,171:0.70:-0.04:1.000:0.983 0/0/1/1:4:149,200:0.56: 1.95:1.000:0.965 0/1/1/1:4:65,139:0.67:-0.72:1.000:0.918 1/1/1/1:4:1,88:0.99:-2.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,210:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,127:0.45: 0.71:1.000:0.983 0/0/0/1:4:176,38:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,232:0.73: 1.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:69,169:0.70:-0.10:1.000:0.983 0/1/1/1:4:68,146:0.67:-0.54:1.000:0.922 0/0/0/1:4:179,70:0.32: 0.11:1.000:0.942 0/1/1/1:4:18,40:0.68:-3.41:1.000:0.947 0/0/1/1:4:35,49:0.57:-2.93:1.000:0.942 1/1/1:3:4,68:0.94:-3.15:0.999:1.000 0/0/1/1:4:117,129:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,173:0.70: 0.00:1.000:0.985 0/0/1/1:4:119,103:0.46:-0.39:1.000:0.990 0/1/1/1:4:62,144:0.69:-0.68:1.000:0.968 0/1/1/1:4:67,128:0.64:-0.89:1.000:0.738 0/0/0/1:4:188,71:0.32: 0.29:1.000:0.956 0/0/0/1:4:182,48:0.27:-0.24:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,263:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,159:0.72:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,122:0.53:-0.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:51,179:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,50:0.25: 0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,197:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,193:0.77: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,194:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,53:0.31:-0.80:1.000:0.970 0/1/1/1:4:78,286:0.77: 2.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,194:0.74: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,150:0.53: 0.62:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,274:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,188:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,149:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,134:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,87:0.46:-0.94:1.000:0.985 0/0/0/1/1/1:6:114,126:0.51:-0.06:1.000:0.879 0/0/0/1:4:212,99:0.35: 1.25:1.000:0.768 0/0/1/1:4:126,168:0.56: 0.93:1.000:0.968 0/1/1/1:4:70,185:0.71: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,121:0.53:-0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:134,173:0.55: 1.17:1.000:0.978 0/1/1/1:4:48,233:0.82: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,66:0.46:-1.86:1.000:0.990 0/1/1/1:4:56,208:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,114:0.48:-0.19:0.998:0.995 0/1/1/1:4:44,201:0.81: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,143:0.52: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,124:0.55:-0.45:1.000:0.975 0/1/1/1:4:59,178:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,192:0.77: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,77:0.34: 0.27:1.000:0.884 0/1/1/1:4:50,157:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,142:0.53: 0.36:1.000:0.993 0/1/1/1:4:62,210:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,172:0.72:-0.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,163:0.68:-0.17:1.000:0.964 0/1/1/1:4:54,188:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,206:0.74: 0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,230:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,52:0.29:-0.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:94,70:0.44:-1.46:1.000:0.959 0/1/1/1:4:65,222:0.76: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,155:0.77:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,156:0.56: 0.58:1.000:0.973 0/0/1/1:4:104,78:0.44:-1.13:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,164:0.79:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,179:0.80:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,124:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,107:0.66:-1.53:1.000:0.847 0/1/1/1:4:60,220:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,173:0.73:-0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:53,139:0.71:-0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:92,106:0.52:-0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:74,249:0.76: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,190:0.74: 0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,255:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,233:0.81: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,145:0.76:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,269:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,139:0.74:-1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,148:0.56: 0.27:1.000:0.964 0/0/1/1:4:92,94:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,172:0.73:-0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,241:0.76: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,203:0.79: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,128:0.54:-0.19:1.000:0.989 0/1/1/1:4:63,242:0.78: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,209:0.81: 0.22:0.999:1.000 0/0/1/1:4:141,133:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,147:0.60:-0.06:1.000:0.785 0/0/1/1:4:142,145:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,99:0.46:-0.52:1.000:0.988 0/1/1/1:4:40,200:0.82:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,134:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,185:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,200:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,142:0.73:-0.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:194,58:0.29: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:112,148:0.56: 0.31:1.000:0.971 0/0/1/1:4:106,142:0.56: 0.09:1.000:0.966 0/0/1/1:4:164,116:0.43: 0.68:1.000:0.935 0/0/1/1:4:113,140:0.54: 0.18:1.000:0.986 0/0/0/1:4:140,60:0.34:-0.80:1.000:0.877 0/0/1/1:4:79,99:0.54:-1.20:1.000:0.985 0/0/1/1:4:67,75:0.52:-1.86:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,217:0.72: 0.99:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,172:0.72:-0.17:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,165:0.71:-0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,156:0.70:-0.46:1.000:0.988 0/1/1/1:4:72,282:0.79: 2.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,105:0.44: 0.01:1.000:0.964 0/0/1/1:4:105,86:0.45:-0.96:1.000:0.983 0/0/1/1:4:120,130:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,106:0.52:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,145:0.54: 0.40:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,146:0.74:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,132:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,183:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,202:0.51: 2.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,197:0.50: 2.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,154:0.57: 0.42:1.000:0.953 0/1/1/1:4:65,225:0.76: 0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,282:1.00: 0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,234:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,110:0.46:-0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:149,179:0.53: 1.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:37,61:0.61:-2.67:1.000:0.685 0/0/0/1:4:163,53:0.30:-0.50:1.000:0.988 0/0/1/1:4:145,138:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,184:0.71: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:145,138:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,204:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,38:0.23:-0.17:0.998:1.000 0/1/1/1:4:68,217:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,226:0.80: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,116:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,179:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,149:0.48: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,73:0.40:-0.98:1.000:0.815 0/0/1/1:4:119,101:0.46:-0.43:1.000:0.988 0/1/1/1:4:47,163:0.76:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,171:0.74:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,160:0.55: 0.73:1.000:0.976 0/0/1/1:4:135,173:0.55: 1.19:1.000:0.980 0/0/1/1:4:124,119:0.48: 0.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,170:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,231:0.77: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,78:0.44:-1.20:1.000:0.973 0/1/1/1:4:48,161:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,73:0.36:-0.45:1.000:0.639 0/0/0/1:4:211,38:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,149:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,172:0.54: 1.30:1.000:0.990 0/1/1/1:4:56,186:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,112:0.47:-0.13:1.000:0.993 0/1/1/1:4:80,278:0.76: 2.11:0.997:1.000 0/0/0/1:4:245,66:0.27: 1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,89:0.40:-0.21:1.000:0.811 0/0/1/1:4:127,124:0.49: 0.14:1.000:0.996 -chr4.1 64479785 chr4.1_064479785 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:26,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.34:0.999:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-2.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:6:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:0.998:. ./.:4:26,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:35,0:.: 3.41:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:0.998:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.47:0.997:. ./.:4:18,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.72:1.000:. -chr4.1 64648730 chr4.1_064648730 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:318,122:0.29: 0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:238,87:0.28:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,197:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:343,91:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:255,226:0.48: 1.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:400,134:0.26: 1.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:189,202:0.52: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:212,209:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,205:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,56:0.58:-3.18:1.000:0.895 0/0/0/1:4:114,34:0.24:-2.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,101:0.27: 0.22:1.000:0.998 0/0/0/0:4:411,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:518,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,174:0.46: 0.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:237,221:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:369,115:0.25: 1.18:0.999:0.999 0/0/0/1:4:333,119:0.28: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:392,137:0.27: 1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:281,278:0.50: 2.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,119:0.74:-2.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:203,192:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:372,111:0.24: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,230:0.52: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,32:0.36:-3.22:1.000:0.714 0/0/1/1:4:249,254:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:123,335:0.72: 0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,294:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:346,111:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:134,343:0.71: 1.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:404,144:0.28: 1.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,169:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,66:0.80:-3.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,59:0.47:-2.82:1.000:0.991 0/0/1:3:52,38:0.43:-3.25:0.999:0.991 0/1/1/1:4:113,314:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,224:0.52: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,209:0.55: 0.06:1.000:0.982 0/0/0/1:4:365,100:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:279,216:0.44: 1.31:1.000:0.973 0/0/1/1:4:214,174:0.46: 0.10:1.000:0.985 0/1/1/1:4:103,250:0.70:-0.29:1.000:0.987 0/0/1/1:4:212,206:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:277,100:0.28:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,323:0.78: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,206:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:247,211:0.47: 0.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:221,203:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,181:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:365,141:0.29: 1.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:175,160:0.48:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:394,117:0.24: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:311,90:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:352,93:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,177:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:197,200:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,152:0.52:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:216,208:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,252:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:158,143:0.48:-0.87:1.000:0.870 0/0/1/1:4:171,167:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:281,85:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:315,109:0.27: 0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:142,126:0.48:-1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:258,210:0.46: 1.00:1.000:0.985 0/0/0/1:4:345,84:0.21: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,263:0.71:-0.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:256,75:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,207:0.52: 0.30:0.998:0.996 0/0/1/1:4:157,172:0.53:-0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:207,194:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,167:0.53:-0.71:1.000:0.991 0/1/1/1:4:111,336:0.74: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,177:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:285,93:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:219,162:0.43: 0.03:1.000:0.954 0/0/1/1:4:181,161:0.48:-0.41:1.000:0.994 0/0/0/0:4:371,1:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,173:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,181:0.47: 0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:253,77:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,201:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:326,82:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,173:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:98,276:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:311,102:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:221,72:0.26:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:239,84:0.27:-0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,214:0.70:-0.85:1.000:0.985 0/0/1/1:4:200,197:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:266,75:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,231:0.74:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:125,289:0.69: 0.40:1.000:0.977 0/0/0/1:4:255,72:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,114:0.28: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:191,182:0.49:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,212:0.79:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,66:0.23:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,93:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,329:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,184:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:293,87:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:265,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,152:0.46:-0.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:220,68:0.25:-1.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:354,3:0.01:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,211:0.73:-1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,215:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:382,123:0.26: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:288,81:0.23:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,68:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:380,114:0.24: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,188:0.52:-0.13:0.999:0.995 0/0/1/1:4:207,192:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,73:0.28:-1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:285,97:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:207,167:0.45:-0.05:1.000:0.983 0/0/0/1:4:228,85:0.28:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:270,78:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,207:0.54: 0.07:1.000:0.987 0/0/0/1:4:278,86:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,232:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,169:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:194,176:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:249,74:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,284:0.73: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:164,173:0.52:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,177:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:213,83:0.29:-0.93:1.000:0.991 0/1/1/1:4:69,194:0.73:-1.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:145,151:0.52:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:247,77:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,93:0.44:-1.83:1.000:0.964 0/0/0/1:4:304,98:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,277:0.75:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:403,132:0.26: 1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,192:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,140:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,138:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,147:0.54:-1.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:174,190:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:145,139:0.50:-1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,170:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:217,65:0.24:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,248:0.48: 1.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:274,275:0.51: 1.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:114,298:0.72: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:313,91:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:378,136:0.28: 1.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:282,85:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,220:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:292,75:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,98:0.76:-2.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,155:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:232,238:0.51: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:114,280:0.70: 0.17:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,483:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:417,110:0.22: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,158:0.46:-0.30:0.998:0.985 0/0/1/1:4:246,257:0.52: 1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,164:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,148:0.47:-0.63:1.000:0.990 0/0/0/1:4:309,93:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:316,104:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:98,322:0.76: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,371:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:400,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,183:0.51:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:203,176:0.47: 0.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:206,202:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:248,83:0.26:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:163,142:0.47:-0.83:1.000:0.993 0/0/0/0:4:424,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,252:0.76:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:367,2:0.01:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,172:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:133,346:0.72: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:248,233:0.49: 1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:323,100:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,230:0.67:-0.42:1.000:0.922 0/0/1/1:4:233,250:0.52: 1.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:398,143:0.28: 1.83:0.997:0.996 0/1/1/1:4:130,347:0.72: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,189:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:236,218:0.49: 0.85:1.000:0.996 -chr4.1 64850060 chr4.1_064850060 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:375,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:197,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.86:0.999:. ./.:4:216,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:390,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.81:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.54:0.999:. ./.:4:236,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.34:1.000:. ./.:6:207,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.22:0.998:. ./.:4:116,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:414,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:410,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:184,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:460,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:348,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:393,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.37:0.998:. ./.:4:347,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:241,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.08:0.997:. ./.:4:216,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.22:1.000:. -chr4.1 64925789 chr4.1_064925789 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:147,52:.: 1.75:1.000:. ./.:4:98,42:.: 0.18:1.000:. ./.:4:135,51:.: 1.40:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:112,42:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,5:.:-3.22:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:111,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:76,39:.:-0.48:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:137,44:.: 1.27:1.000:. ./.:4:148,45:.: 1.59:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,5:.:-3.11:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:122,50:.: 1.03:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:102,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:17,13:.:-2.74:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.48:0.999:. ./.:4:117,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:106,44:.: 0.45:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:102,34:.: 0.08:1.000:. ./.:4:72,35:.:-0.69:1.000:. ./.:4:117,43:.: 0.71:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:15,2:.:-3.08:1.000:. ./.:4:120,38:.: 0.66:1.000:. ./.:4:71,27:.:-0.93:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:102,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:91,39:.:-0.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:94,33:.:-0.16:1.000:. ./.:6:92,7:.:-0.91:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:110,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:124,45:.: 0.95:1.000:. ./.:4:57,19:.:-1.52:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:91,38:.:-0.11:0.998:. ./.:4:95,47:.: 0.23:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:52,24:.:-1.52:1.000:. ./.:4:76,94:.: 0.98:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,30:.:-0.48:1.000:. ./.:4:97,42:.: 0.16:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,51:.: 0.85:1.000:. ./.:4:109,41:.: 0.45:1.000:. ./.:4:66,38:.:-0.77:1.000:. ./.:4:78,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:125,45:.: 0.98:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:62,35:.:-0.96:1.000:. ./.:4:116,41:.: 0.63:1.000:. ./.:4:60,28:.:-1.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:84,26:.:-0.61:1.000:. ./.:4:97,37:.: 0.02:1.000:. ./.:4:84,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:110,36:.: 0.34:1.000:. ./.:4:122,54:.: 1.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:76,43:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:109,39:.: 0.39:1.000:. ./.:4:75,21:.:-0.99:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,42:.:-0.69:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,35:.:-0.14:1.000:. ./.:4:132,57:.: 1.48:1.000:. ./.:4:157,55:.: 2.09:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:105,47:.: 0.50:0.999:. ./.:4:166,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:85,22:.:-0.69:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,32:.:-0.46:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,51:.: 1.06:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:109,42:.: 0.47:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:93,39:.:-0.03:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:62,33:.:-1.01:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.11:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,55:.: 1.54:1.000:. ./.:4:107,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:17,2:.:-3.03:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:116,59:.: 1.11:1.000:. ./.:4:117,52:.: 0.95:1.000:. ./.:4:132,48:.: 1.24:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.50:0.998:. ./.:4:119,44:.: 0.79:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:91,33:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,32:.:-0.59:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:63,82:.: 0.31:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:101,45:.: 0.34:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:147,46:.: 1.59:0.997:. ./.:4:157,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:129,53:.: 1.30:1.000:. -chr4.1 65048149 chr4.1_065048149 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,36:.: 2.81:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,18:.: 0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:47,12:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,11:.:-1.85:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:56,30:.: 0.99:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:2,2:.:-2.65:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.12:1.000:. ./.:4:40,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:25,17:.:-0.96:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.33:0.999:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:72,32:.: 1.79:1.000:. ./.:4:77,25:.: 1.70:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,28:.: 0.59:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.25:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.69:0.999:. ./.:4:51,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:63,27:.: 1.17:1.000:. ./.:4:37,30:.: 0.15:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:34,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:32,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:56,31:.: 1.04:1.000:. ./.:4:60,24:.: 0.90:1.000:. ./.:4:29,15:.:-0.87:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.95:1.000:. ./.:6:37,27:.: 0.02:1.000:. ./.:4:52,30:.: 0.82:1.000:. ./.:4:31,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:57,31:.: 1.08:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,27:.: 0.19:1.000:. ./.:4:73,17:.: 1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:66,20:.: 0.99:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.21:0.998:. ./.:4:85,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,14:.:-1.14:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:29,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:51,29:.: 0.73:1.000:. ./.:4:82,29:.: 2.10:1.000:. ./.:4:98,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,26:.: 1.48:1.000:. ./.:4:53,29:.: 0.82:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:54,26:.: 0.73:1.000:. ./.:4:38,26:.: 0.02:1.000:. ./.:4:33,15:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.25:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:56,34:.: 1.17:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,23:.:-0.78:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:29,21:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,19:.:-0.60:1.000:. ./.:4:35,19:.:-0.43:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:49,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:33,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:63,32:.: 1.39:1.000:. ./.:4:34,24:.:-0.25:1.000:. ./.:4:50,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:50,29:.: 0.68:1.000:. ./.:4:46,31:.: 0.59:0.999:. ./.:4:61,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:16,16:.:-1.40:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:60,19:.: 0.68:1.000:. ./.:4:67,27:.: 1.35:1.000:. ./.:4:53,16:.: 0.24:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:35,25:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,27:.: 0.86:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.25:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:55,31:.: 0.99:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:45,21:.: 0.11:1.000:. ./.:4:94,30:.: 2.68:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:52,31:.: 0.86:1.000:. ./.:4:21,23:.:-0.87:1.000:. ./.:4:43,32:.: 0.51:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:32,30:.:-0.07:1.000:. ./.:4:68,24:.: 1.26:1.000:. ./.:4:66,24:.: 1.17:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:42,35:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:63,27:.: 1.17:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.07:0.998:. ./.:4:67,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:56,24:.: 0.73:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:42,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:53,20:.: 0.42:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:47,22:.: 0.24:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:58,25:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,25:.: 1.30:1.000:. ./.:4:48,25:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:44,27:.: 0.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:33,17:.:-0.60:1.000:. ./.:4:51,20:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:64,17:.: 0.77:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:54,35:.: 1.13:0.997:. ./.:4:53,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:28,17:.:-0.83:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.35:1.000:. -chr4.1 65262228 chr4.1_065262228 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:0.999:. ./.:4:18,26:.: 2.58:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:6:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:0.998:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:48,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:0.998:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.48:0.997:. ./.:4:45,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:42,0:.: 2.33:1.000:. -chr4.1 65427807 chr4.1_065427807 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:111,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:128,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:186,0:.: 3.41:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.73:1.000:. ./.:3:11,0:.:-3.22:0.999:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.76:1.000:. ./.:6:71,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.50:0.998:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:178,0:.: 3.10:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:110,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:145,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:154,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.49:0.998:. ./.:4:113,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.22:0.997:. ./.:4:142,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.60:1.000:. -chr4.1 66214695 chr4.1_066214695 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:60,29:0.38: 1.18:1.000:0.571 0/0/1/1:4:24,39:0.61: 0.12:1.000:0.643 0/0/1/1:4:70,33:0.38: 1.75:1.000:0.525 0/0/1/1:4:27,41:0.60: 0.32:1.000:0.816 0/0/1/1:4:34,42:0.54: 0.65:1.000:0.986 0/0/1/1:4:30,48:0.61: 0.73:1.000:0.689 0/0/1/1:4:8,11:0.57:-1.68:1.000:0.943 0/0/1/1:4:43,34:0.45: 0.69:1.000:0.984 0/0/1/1:4:49,27:0.40: 0.65:1.000:0.783 0/0/0/1:4:11,1:0.22:-1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,14:0.42:-0.98:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,34:0.55: 0.04:1.000:0.982 0/0/1/1:4:24,21:0.47:-0.62:1.000:0.992 0/0/1/1:4:62,31:0.38: 1.34:1.000:0.632 0/0/0/1:4:112,7:0.19: 2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,27:0.46:-0.04:0.999:0.990 0/0/0/1:4:118,8:0.20: 2.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,5:0.20: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,56:0.56: 1.59:1.000:0.972 0/1/1/1:4:2,9:0.82:-2.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,56:0.66: 1.02:1.000:0.846 0/0/1/1:4:35,29:0.46: 0.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:19,36:0.65:-0.21:1.000:0.811 0/0/1/1:4:14,7:0.38:-1.60:1.000:0.632 0/0/1/1:4:63,32:0.39: 1.43:1.000:0.659 0/1/1/1:4:39,68:0.63: 1.92:1.000:0.586 0/0/1/1:4:26,34:0.56: 0.00:1.000:0.970 0/0/1/1:4:27,44:0.61: 0.45:1.000:0.635 0/0/1/1:4:50,29:0.41: 0.77:1.000:0.842 0/0/1/1:4:33,25:0.45:-0.09:1.000:0.978 0/0/1/1:4:27,37:0.57: 0.16:1.000:0.946 0/1/1/1:4:4,15:0.79:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-2.01:1.000:0.989 1/1/1:3:1,7:0.88:-2.13:0.999:0.954 0/1/1/1:4:28,58:0.67: 1.06:1.000:0.934 0/1/1/1:4:34,62:0.64: 1.47:1.000:0.720 0/0/1/1:4:26,37:0.58: 0.12:1.000:0.913 0/0/1/1:4:25,32:0.55:-0.13:1.000:0.977 0/0/1/1:4:28,31:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,23:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,50:0.68: 0.53:1.000:0.964 0/0/0/1:4:78,27:0.34: 1.83:1.000:0.893 0/0/0/1:4:47,8:0.26:-0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:37,5:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,72:0.75: 1.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,8:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,19:0.35: 0.28:1.000:0.764 0/0/0/1:4:38,13:0.33:-0.37:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,47:0.43: 2.37:1.000:0.937 0/1/1/1:4:14,25:0.64:-0.86:1.000:0.660 0/0/1/1:4:27,38:0.58: 0.20:1.000:0.924 0/0/1/1:4:70,40:0.40: 2.04:1.000:0.826 0/0/0/1:4:56,4:0.20: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,29:0.53:-0.25:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,23:0.43:-0.13:1.000:0.947 0/0/0/1/1/1:6:31,25:0.46:-0.17:1.000:0.786 0/0/1/1:4:27,32:0.53:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,28:0.48:-0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:36,3:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,45:0.44: 1.96:1.000:0.965 0/0/1/1:4:52,51:0.49: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,3:0.26:-1.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,50:0.66: 0.65:1.000:0.839 0/0/0/1:4:21,9:0.36:-1.23:0.998:0.646 0/0/1/1:4:36,59:0.62: 1.43:1.000:0.617 0/0/1/1:4:26,43:0.62: 0.36:1.000:0.588 0/0/0/1:4:24,3:0.24:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,47:0.51: 1.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,74:0.67: 2.08:1.000:0.898 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.52:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:30,6:0.28:-0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,17:0.47:-0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,42:0.45: 1.43:1.000:0.984 0/1/1/1:4:20,34:0.63:-0.25:1.000:0.503 0/1/1/1:4:14,36:0.72:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,34:0.42: 1.14:1.000:0.910 0/0/0/1:4:49,8:0.26:-0.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,4:0.23:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,9:0.29:-0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,2:0.20:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,24:0.43:-0.04:1.000:0.952 0/0/0/1:4:32,7:0.29:-0.86:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,35:0.47: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:35,3:0.21:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,19:0.37: 0.00:1.000:0.507 0/0/1/1:4:38,41:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,22:0.47:-0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,25:0.38: 0.65:1.000:0.597 0/1/1/1:4:26,52:0.67: 0.73:1.000:0.898 0/0/1/1:4:38,31:0.46: 0.36:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,20:0.42:-0.37:1.000:0.925 0/0/1/1:4:59,36:0.41: 1.43:1.000:0.888 0/0/0/1:4:31,4:0.24:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,20:0.39:-0.04:1.000:0.675 0/0/1/1:4:11,15:0.57:-1.39:1.000:0.949 0/0/0/1:4:40,14:0.34:-0.25:1.000:0.885 0/1/1/1:4:13,39:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,9:0.34:-1.07:1.000:0.864 0/0/1/1:4:23,25:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,29:0.51:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,10:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,29:0.41: 0.77:1.000:0.842 0/1/1/1:4:15,26:0.63:-0.78:1.000:0.567 0/0/0/1:4:60,26:0.37: 1.06:1.000:0.628 0/0/0/1:4:54,6:0.23: 0.00:0.999:1.000 0/0/1/1:4:22,31:0.58:-0.29:1.000:0.923 0/0/1/1:4:12,18:0.59:-1.23:1.000:0.839 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,17:0.50:-1.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,35:0.63:-0.21:1.000:0.598 0/0/1/1:4:21,32:0.60:-0.29:1.000:0.809 0/0/0/1:4:51,12:0.29: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,33:0.54: 0.00:1.000:0.987 0/0/1/1:4:35,25:0.44: 0.00:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,7:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,29:0.60:-0.49:1.000:0.806 0/0/1/1:4:22,28:0.55:-0.41:1.000:0.979 0/0/1/1:4:23,22:0.48:-0.62:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,17:0.54:-1.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:16,18:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,50:0.52: 1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,27:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,5:0.27:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,23:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:57,25:0.37: 0.90:1.000:0.607 0/1/1/1:4:30,51:0.63: 0.85:1.000:0.503 0/0/1/1:4:33,30:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,25:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,30:0.67:-0.62:1.000:0.898 0/0/1/1:4:24,31:0.55:-0.21:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,4:0.24:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,47:0.66: 0.45:1.000:0.869 0/0/1/1:4:28,22:0.45:-0.41:1.000:0.983 0/0/1/1:4:59,42:0.44: 1.67:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,61:0.71: 1.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:46,21:0.37: 0.28:1.000:0.535 0/0/1/1:4:58,27:0.37: 1.02:1.000:0.501 0/0/1/1:4:49,25:0.39: 0.57:1.000:0.667 0/0/1/1:4:36,47:0.56: 0.94:1.000:0.971 0/0/1/1:4:36,31:0.47: 0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:8,9:0.52:-1.76:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,35:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,32:0.37: 1.71:1.000:0.532 0/0/1/1:4:51,41:0.46: 1.30:1.000:0.986 0/0/0/1:4:58,3:0.19: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.19:0.998:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,38:0.48: 0.73:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,27:0.42: 0.45:1.000:0.892 0/0/1/1:4:28,40:0.58: 0.32:1.000:0.909 0/0/0/1:4:48,6:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,36:0.44: 1.10:1.000:0.961 0/0/1/1:4:13,20:0.60:-1.11:1.000:0.789 0/0/1/1:4:45,29:0.42: 0.57:1.000:0.924 0/1/1/1:4:14,40:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,38:0.61: 0.08:1.000:0.718 0/1/1/1:4:14,26:0.65:-0.82:1.000:0.766 0/0/1/1:4:46,38:0.46: 0.98:1.000:0.988 0/0/1/1:4:19,30:0.61:-0.45:1.000:0.726 0/0/0/1:4:39,6:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,17:0.44:-0.82:1.000:0.973 0/0/1/1:4:22,18:0.46:-0.82:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,36:0.49: 0.49:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,34:0.61:-0.21:1.000:0.654 0/0/0/1:4:79,29:0.34: 1.96:1.000:0.847 0/0/1/1:4:19,26:0.57:-0.62:1.000:0.947 0/0/0/1:4:55,10:0.27: 0.20:0.997:0.998 0/0/1/1:4:27,44:0.61: 0.45:1.000:0.635 0/0/1/1:4:17,17:0.49:-1.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,64:0.64: 1.59:1.000:0.727 -chr4.1 66288769 chr4.1_066288769 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:101,45:0.25: 1.16:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,41:0.24: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,40:0.38:-0.12:1.000:0.529 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,33:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,29:0.40:-0.85:1.000:0.771 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,14:0.35:-1.63:1.000:0.765 0/0/1/1:4:38,34:0.44:-0.70:1.000:0.958 0/0/0/1:4:75,41:0.30: 0.40:1.000:0.985 0/0/0/1:4:85,51:0.32: 0.90:1.000:0.941 0/0/0/1:4:81,24:0.18: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,37:0.22: 0.88:0.999:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,60:0.21: 3.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,26:0.13: 1.41:1.000:0.943 0/0/1/1:4:36,40:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,39:0.19: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.20:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,40:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,40:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,50:0.29: 1.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,51:0.52:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,45:0.32: 0.53:1.000:0.951 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,6:0.23:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-2.06:1.000:1.000 0/0/0:3:23,0:0.00:-1.93:0.999:1.000 0/0/0/1:4:91,40:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,48:0.20: 2.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,45:0.30: 0.65:1.000:0.981 0/0/1/1:4:69,64:0.45: 0.83:1.000:0.975 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,52:0.31: 1.08:1.000:0.971 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,38:0.19: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,34:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,33:0.40:-0.63:1.000:0.777 0/0/0/1:4:82,33:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,42:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,27:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,42:0.45:-0.32:1.000:0.977 0/0/0/1:4:110,33:0.19: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:86,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,44:0.52:-0.58:1.000:0.994 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,33:0.41:-0.65:1.000:0.832 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,37:0.22: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,30:0.16: 1.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.53:0.998:1.000 0/0/0/1:4:42,28:0.35:-0.75:1.000:0.765 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,54:0.49: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,45:0.17: 2.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,37:0.47:-0.65:1.000:0.991 0/0/0/1:4:38,23:0.33:-0.98:1.000:0.933 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,46:0.31: 0.65:1.000:0.968 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,44:0.49:-0.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,21:0.19:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,33:0.28:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,41:0.45:-0.40:1.000:0.983 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,37:0.28: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:103,41:0.23: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,35:0.19: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,23:0.34:-1.03:1.000:0.860 0/0/1/1:4:36,68:0.57: 0.10:1.000:0.956 0/0/0/1:4:70,41:0.32: 0.28:1.000:0.958 0/0/1/1:4:51,58:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,23:0.34:-1.03:1.000:0.860 0/0/0/1:4:75,30:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,28:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,46:0.35: 0.40:1.000:0.801 0/0/0/1:4:89,35:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,34:0.41:-0.63:1.000:0.885 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,41:0.25: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,45:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.53:0.999:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,25:0.48:-1.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,45:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:127,1:0.01: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,40:0.20: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,48:0.28: 1.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,26:0.39:-1.00:1.000:0.701 0/0/0/1:4:60,34:0.31:-0.15:1.000:0.974 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,22:0.13: 0.80:1.000:0.943 0/0/0/1:4:95,39:0.24: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,22:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,41:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,52:0.20: 2.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,34:0.47:-0.80:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,30:0.38:-0.73:1.000:0.551 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,27:0.17: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,30:0.29:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,25:0.27:-0.58:1.000:0.998 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,51:0.34: 0.75:1.000:0.840 0/0/0/1:4:89,34:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,37:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,55:0.29: 1.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:79,34:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,40:0.43:-0.38:1.000:0.954 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,40:0.40:-0.22:1.000:0.773 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.90:0.998:1.000 0/0/0/1:4:59,42:0.37: 0.03:1.000:0.550 0/0/0/1:4:122,39:0.20: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,22:0.16: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,34:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,32:0.22: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,29:0.34:-0.63:1.000:0.883 0/0/0/1:4:70,29:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,24:0.14: 0.93:1.000:0.972 0/0/0/1:4:70,36:0.28: 0.15:1.000:0.994 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,26:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,66:0.33: 1.83:1.000:0.913 0/0/1/1:4:26,42:0.55:-0.80:1.000:0.983 0/0/0/0:4:85,3:0.03:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.03:0.997:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,23:0.31:-0.93:1.000:0.968 -chr4.1 66468724 chr4.1_066468724 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:17,2:0.19: 2.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,1:0.09: 2.26:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,3:0.24: 2.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,1:0.14: 1.05:1.000:0.959 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.57:-0.85:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.29: 1.91:1.000:0.991 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.20: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,1:0.14: 1.05:1.000:0.959 0/0/0/1:4:9,2:0.32: 0.71:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.37: 1.22:1.000:0.607 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.34: 0.53:1.000:0.839 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.27: 1.05:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.29:-0.16:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.33:1.000:0.839 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:7,2:0.38: 0.36:1.000:0.557 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:13,3:0.32: 1.57:1.000:0.940 0/0/1/1:4:9,4:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:5,1:0.29:-0.16:1.000:0.838 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.34: 1.39:1.000:0.839 0/0/0/1:4:5,1:0.29:-0.16:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.29: 0.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:8,2:0.34: 0.53:1.000:0.839 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:7,2:0.38: 0.36:1.000:0.557 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.50:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.33:1.000:0.839 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.32: 0.71:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,2:0.38: 0.36:1.000:0.557 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,1:0.18: 0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.33:1.000:0.839 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.33:1.000:0.839 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,1:0.18: 0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.50:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,2:0.54:-0.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.33:1.000:0.839 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.20: 0.36:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,2:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,3:0.29: 1.91:1.000:0.991 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.36: 2.95:1.000:0.719 0/0/1/1:4:4,2:0.51:-0.16:0.999:0.996 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,3:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,2:0.42: 0.19:1.000:0.923 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,8:0.51: 2.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,2:0.48: 0.02:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.51:-0.16:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.52: 1.74:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,6:0.46: 2.60:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,7:0.49: 2.95:1.000:0.996 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.32: 0.71:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.57: 1.22:1.000:0.943 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,5:0.50: 1.57:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,1:0.15: 0.88:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,1:0.16: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,1:0.18: 0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.53: 0.19:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,4:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,2:0.24: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,4:0.40: 1.74:1.000:0.786 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,6:0.38: 3.46:1.000:0.557 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.29: 0.88:1.000:0.991 0/0/1/1:4:6,7:0.59: 1.05:1.000:0.890 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,5:0.47: 1.91:0.997:0.991 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.02:1.000:1.000 -chr4.1 66717280 chr4.1_066717280 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:55,149:0.64: 0.34:1.000:0.718 0/1/1/1:4:46,142:0.66: 0.01:1.000:0.854 0/0/1/1:4:77,112:0.56: 0.03:1.000:0.969 0/0/0/1:4:147,54:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:203,58:0.22: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,64:0.26: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,23:0.21:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,114:0.52: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,168:0.66: 0.69:1.000:0.874 0/0/0/1:4:49,17:0.25:-2.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,53:0.55:-1.98:1.000:0.981 0/0/0/1:4:112,41:0.26:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,111:0.47: 1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:133,103:0.44: 1.00:1.000:0.964 0/0/1/1:4:109,106:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,128:0.46: 1.91:1.000:0.987 0/0/0/1:4:189,53:0.22: 1.13:0.999:1.000 0/0/1/1:4:103,117:0.52: 0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:138,129:0.49: 1.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,120:0.52: 0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,9:0.19:-2.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,52:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,114:0.40: 1.97:1.000:0.820 0/0/0/1:4:116,58:0.33:-0.28:1.000:0.912 0/0/1/1:4:18,13:0.42:-3.24:1.000:0.916 0/0/1/1:4:150,101:0.40: 1.31:1.000:0.816 0/0/0/1:4:150,62:0.29: 0.51:1.000:0.992 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,67:0.24: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,116:0.48: 1.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:148,51:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,48:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.30:-3.41:1.000:0.983 0/0/0/1:4:56,22:0.28:-2.27:1.000:0.996 0/0/1:3:11,10:0.48:-3.45:0.999:0.803 0/0/0/1:4:150,59:0.28: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,49:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:217,1:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,42:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,102:0.47: 0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:95,47:0.33:-0.94:1.000:0.922 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,144:0.63: 0.32:1.000:0.560 0/0/1/1:4:91,92:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,37:0.18: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,61:0.32: 0.09:1.000:0.963 0/0/0/0:4:228,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,89:0.57:-0.86:1.000:0.949 0/0/1/1:4:62,111:0.59:-0.30:1.000:0.873 0/1/1/1:4:35,86:0.63:-1.38:1.000:0.571 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,122:0.44: 1.83:1.000:0.973 0/0/0/1:4:142,46:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,62:0.32: 0.13:1.000:0.958 0/0/1/1:4:79,98:0.53:-0.22:1.000:0.990 0/0/1/1:4:125,86:0.41: 0.48:1.000:0.854 0/0/0/1:4:178,47:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,39:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,35:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:112,49:0.30:-0.55:1.000:0.879 0/0/0/1:4:127,49:0.28:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,90:0.47: 0.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:131,113:0.47: 1.17:1.000:0.990 0/0/0/1:4:143,42:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,52:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,152:0.53: 1.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:125,33:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,111:0.56:-0.05:1.000:0.962 0/0/0/1:4:122,43:0.26:-0.47:0.998:0.999 0/1/1/1:4:18,146:0.74:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:221,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,79:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,155:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,54:0.28: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,49:0.29:-0.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:97,85:0.47:-0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:105,76:0.42:-0.14:1.000:0.918 0/0/1/1:4:94,81:0.47:-0.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,125:0.57: 0.34:1.000:0.944 0/0/1/1:4:118,116:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,129:0.65:-0.32:1.000:0.831 0/0/1/1:4:78,109:0.55:-0.01:1.000:0.977 0/0/1/1:4:105,104:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,28:0.18:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,86:0.39: 0.67:1.000:0.706 0/0/1/1:4:82,73:0.47:-0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:93,84:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:135,42:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,84:0.44: 0.09:1.000:0.966 0/0/1/1:4:87,54:0.38:-0.96:1.000:0.610 0/0/1/1:4:94,99:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:181,61:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,37:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,96:0.40: 1.04:1.000:0.824 0/0/0/1:4:151,37:0.19: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,58:0.40:-0.88:1.000:0.796 0/1/1/1:4:26,82:0.66:-1.65:1.000:0.870 0/0/1/1:4:119,113:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,96:0.48: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,77:0.60:-1.44:1.000:0.830 0/0/1/1:4:119,101:0.46: 0.67:1.000:0.988 0/0/1/1:4:70,70:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,102:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,77:0.56:-1.17:1.000:0.974 0/0/0/1:4:149,45:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,34:0.21:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,109:0.49: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,131:0.52: 1.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,91:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,56:0.37:-0.74:1.000:0.587 0/0/1/1:4:152,137:0.48: 2.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,105:0.51: 0.40:0.999:0.997 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,62:0.48:-1.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,55:0.30:-0.09:1.000:0.986 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,86:0.55:-0.82:1.000:0.978 0/0/0/1:4:122,49:0.28:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,72:0.55:-1.29:1.000:0.981 0/0/0/1:4:181,50:0.21: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,43:0.32:-1.11:1.000:0.955 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,125:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:110,42:0.27:-0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,44:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,49:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,38:0.38:-1.79:1.000:0.520 0/0/0/1:4:65,17:0.20:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,28:0.22:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,77:0.49:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:188,57:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,53:0.44:-1.36:1.000:0.960 0/0/0/1:4:174,39:0.18: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,85:0.53:-0.67:1.000:0.992 0/0/0/1:4:159,54:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,46:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,38:0.21:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,40:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,50:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,104:0.53: 0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,53:0.42:-1.23:1.000:0.892 0/0/0/1:4:166,58:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,74:0.31: 1.08:1.000:0.978 0/0/0/1:4:159,44:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,110:0.52: 0.38:1.000:0.994 0/1/1/1:4:59,166:0.65: 0.77:1.000:0.765 0/0/1/1:4:54,122:0.62:-0.24:1.000:0.571 0/0/0/0:4:220,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,129:0.50: 1.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,12:0.21:-2.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,56:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,70:0.33: 0.44:1.000:0.904 0/0/0/1:4:157,67:0.30: 0.75:1.000:0.988 0/0/1/1:4:104,105:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/0:4:180,0:0.00:-0.16:0.998:1.000 0/0/1/1:4:120,112:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,92:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,49:0.28:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:119,91:0.43: 0.46:1.000:0.958 0/0/0/1:4:143,57:0.28: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:136,28:0.17:-0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:140,48:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,94:0.45: 0.42:1.000:0.983 0/1/1/1:4:64,166:0.64: 0.88:1.000:0.657 0/1/1/1:4:54,142:0.64: 0.17:1.000:0.677 0/0/1/1:4:75,104:0.55:-0.18:1.000:0.978 0/0/0/1:4:104,44:0.30:-0.82:1.000:0.989 0/0/1/1:4:80,81:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,47:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,49:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,76:0.44:-0.30:1.000:0.969 0/0/0/1:4:104,40:0.28:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,68:0.31: 0.69:1.000:0.979 0/0/1/1:4:140,102:0.42: 1.13:1.000:0.924 0/0/1/1:4:67,93:0.55:-0.57:1.000:0.978 0/0/0/0:4:195,4:0.02: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,120:0.47: 1.48:0.997:0.991 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,56:0.31:-0.16:1.000:0.975 0/0/1/1:4:63,120:0.60:-0.09:1.000:0.815 -chr4.1 67052118 chr4.1_067052118 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:157,95:.: 0.45:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.05:1.000:. ./.:3:57,0:.:-2.57:0.999:. ./.:4:243,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.47:1.000:. ./.:6:219,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.12:0.998:. ./.:4:204,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:368,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:359,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:357,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:324,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:367,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:398,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.34:0.998:. ./.:4:272,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:365,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:400,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.13:0.997:. ./.:4:343,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.38:1.000:. -chr4.1 67582496 chr4.1_067582496 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:271,80:.: 0.70:1.000:. ./.:4:356,31:.: 1.07:1.000:. ./.:4:214,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:212,16:.:-0.58:1.000:. ./.:4:269,64:.: 0.51:1.000:. ./.:4:215,46:.:-0.24:1.000:. ./.:4:151,20:.:-1.18:1.000:. ./.:4:242,59:.: 0.18:1.000:. ./.:4:323,43:.: 0.86:1.000:. ./.:4:59,15:.:-2.19:1.000:. ./.:4:29,5:.:-2.60:1.000:. ./.:4:424,72:.: 2.21:1.000:. ./.:4:295,56:.: 0.70:1.000:. ./.:4:391,26:.: 1.39:1.000:. ./.:4:178,33:.:-0.76:1.000:. ./.:4:350,74:.: 1.46:1.000:. ./.:4:387,66:.: 1.76:0.999:. ./.:4:513,92:.: 3.35:1.000:. ./.:4:273,111:.: 1.04:1.000:. ./.:4:315,31:.: 0.65:1.000:. ./.:4:54,7:.:-2.32:1.000:. ./.:4:165,78:.:-0.43:1.000:. ./.:4:225,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:256,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,5:.:-2.52:1.000:. ./.:4:222,37:.:-0.26:1.000:. ./.:4:263,42:.: 0.22:1.000:. ./.:4:374,43:.: 1.39:1.000:. ./.:4:296,60:.: 0.75:1.000:. ./.:4:160,70:.:-0.56:1.000:. ./.:4:434,82:.: 2.42:1.000:. ./.:4:297,66:.: 0.82:1.000:. ./.:4:33,9:.:-2.52:1.000:. ./.:4:32,13:.:-2.49:1.000:. ./.:3:27,7:.:-2.60:0.999:. ./.:4:251,75:.: 0.44:1.000:. ./.:4:305,51:.: 0.75:1.000:. ./.:4:266,67:.: 0.51:1.000:. ./.:4:238,58:.: 0.13:1.000:. ./.:4:241,56:.: 0.14:1.000:. ./.:4:129,62:.:-0.97:1.000:. ./.:4:329,54:.: 1.03:1.000:. ./.:4:252,41:.: 0.09:1.000:. ./.:4:165,34:.:-0.88:1.000:. ./.:4:306,50:.: 0.75:1.000:. ./.:4:314,38:.: 0.71:1.000:. ./.:4:304,76:.: 1.00:1.000:. ./.:4:26,5:.:-2.64:1.000:. ./.:4:208,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:246,39:.: 0.01:1.000:. ./.:4:241,18:.:-0.26:1.000:. ./.:4:304,64:.: 0.88:1.000:. ./.:4:247,57:.: 0.21:1.000:. ./.:4:222,71:.: 0.09:1.000:. ./.:4:105,37:.:-1.48:1.000:. ./.:4:406,37:.: 1.66:1.000:. ./.:4:310,73:.: 1.03:1.000:. ./.:4:289,51:.: 0.58:1.000:. ./.:4:270,70:.: 0.58:1.000:. ./.:6:120,43:.:-1.26:1.000:. ./.:4:102,56:.:-1.31:1.000:. ./.:4:258,46:.: 0.21:1.000:. ./.:4:351,59:.: 1.31:1.000:. ./.:4:98,55:.:-1.36:1.000:. ./.:4:346,20:.: 0.86:1.000:. ./.:4:311,50:.: 0.80:1.000:. ./.:4:95,21:.:-1.75:1.000:. ./.:4:349,61:.: 1.31:1.000:. ./.:4:215,62:.:-0.07:0.998:. ./.:4:277,51:.: 0.46:1.000:. ./.:4:210,59:.:-0.16:1.000:. ./.:4:91,18:.:-1.82:1.000:. ./.:4:301,69:.: 0.90:1.000:. ./.:4:182,89:.:-0.13:1.000:. ./.:4:241,64:.: 0.22:1.000:. ./.:4:122,31:.:-1.36:1.000:. ./.:4:282,54:.: 0.54:1.000:. ./.:4:308,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:218,43:.:-0.24:1.000:. ./.:4:166,63:.:-0.57:1.000:. ./.:4:315,43:.: 0.77:1.000:. ./.:4:233,31:.:-0.21:1.000:. ./.:4:212,72:.: 0.00:1.000:. ./.:4:199,25:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,48:.:-0.07:1.000:. ./.:4:191,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:196,43:.:-0.47:1.000:. ./.:4:207,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:164,52:.:-0.71:1.000:. ./.:4:225,69:.: 0.11:1.000:. ./.:4:123,53:.:-1.12:1.000:. ./.:4:188,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:181,71:.:-0.33:1.000:. ./.:4:262,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:216,49:.:-0.20:1.000:. ./.:4:240,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:196,41:.:-0.49:1.000:. ./.:4:258,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:236,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:352,67:.: 1.41:1.000:. ./.:4:123,21:.:-1.46:1.000:. ./.:4:228,76:.: 0.21:1.000:. ./.:4:144,20:.:-1.25:1.000:. ./.:4:126,54:.:-1.08:1.000:. ./.:4:284,46:.: 0.48:1.000:. ./.:4:243,54:.: 0.14:1.000:. ./.:4:162,35:.:-0.91:1.000:. ./.:4:229,54:.:-0.01:1.000:. ./.:4:281,36:.: 0.35:1.000:. ./.:4:213,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:263,28:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,113:.: 0.47:1.000:. ./.:4:259,65:.: 0.42:0.999:. ./.:4:259,51:.: 0.27:1.000:. ./.:4:171,33:.:-0.83:1.000:. ./.:4:202,36:.:-0.48:1.000:. ./.:4:144,19:.:-1.26:1.000:. ./.:4:136,60:.:-0.92:1.000:. ./.:4:278,31:.: 0.26:1.000:. ./.:4:255,35:.: 0.06:1.000:. ./.:4:122,82:.:-0.83:1.000:. ./.:4:284,50:.: 0.52:1.000:. ./.:4:219,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:231,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:261,33:.: 0.11:1.000:. ./.:4:230,58:.: 0.04:1.000:. ./.:4:284,59:.: 0.62:1.000:. ./.:4:354,61:.: 1.37:1.000:. ./.:4:111,43:.:-1.35:1.000:. ./.:4:125,49:.:-1.15:1.000:. ./.:4:327,36:.: 0.82:1.000:. ./.:4:205,45:.:-0.35:1.000:. ./.:4:134,34:.:-1.21:1.000:. ./.:4:226,52:.:-0.06:1.000:. ./.:4:207,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:342,77:.: 1.41:1.000:. ./.:4:314,78:.: 1.13:1.000:. ./.:4:153,23:.:-1.12:1.000:. ./.:4:183,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:230,64:.: 0.11:1.000:. ./.:4:231,38:.:-0.16:1.000:. ./.:4:274,48:.: 0.40:1.000:. ./.:4:261,50:.: 0.28:1.000:. ./.:4:124,33:.:-1.32:1.000:. ./.:4:306,66:.: 0.92:1.000:. ./.:4:145,67:.:-0.75:1.000:. ./.:4:324,72:.: 1.17:1.000:. ./.:4:323,47:.: 0.90:1.000:. ./.:4:303,55:.: 0.77:1.000:. ./.:4:348,49:.: 1.18:1.000:. ./.:4:197,71:.:-0.17:1.000:. ./.:4:365,54:.: 1.41:1.000:. ./.:4:44,13:.:-2.36:1.000:. ./.:4:205,27:.:-0.54:1.000:. ./.:4:201,65:.:-0.19:1.000:. ./.:4:311,50:.: 0.80:1.000:. ./.:4:309,57:.: 0.86:1.000:. ./.:4:153,62:.:-0.72:1.000:. ./.:4:298,50:.: 0.67:0.998:. ./.:4:214,55:.:-0.16:1.000:. ./.:4:327,38:.: 0.85:1.000:. ./.:4:240,67:.: 0.24:1.000:. ./.:4:232,58:.: 0.06:1.000:. ./.:4:308,37:.: 0.64:1.000:. ./.:4:139,59:.:-0.90:1.000:. ./.:4:243,44:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,70:.:-0.81:1.000:. ./.:4:448,52:.: 2.25:1.000:. ./.:4:262,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:281,39:.: 0.38:1.000:. ./.:4:225,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:275,49:.: 0.42:1.000:. ./.:4:262,46:.: 0.25:1.000:. ./.:4:201,73:.:-0.10:1.000:. ./.:4:218,63:.:-0.03:1.000:. ./.:4:274,40:.: 0.31:1.000:. ./.:4:283,47:.: 0.48:1.000:. ./.:4:236,28:.:-0.21:1.000:. ./.:4:248,75:.: 0.41:1.000:. ./.:4:297,47:.: 0.63:1.000:. ./.:4:235,72:.: 0.24:1.000:. ./.:4:217,55:.:-0.12:0.997:. ./.:4:280,56:.: 0.54:1.000:. ./.:4:176,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:386,45:.: 1.53:1.000:. -chr4.1 67900614 chr4.1_067900614 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,535:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,410:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,485:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,440:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,604:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,568:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,275:.:-2.02:1.000:. ./.:4:0,450:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,455:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,196:.:-2.70:1.000:. ./.:4:0,352:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,395:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,500:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,502:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,493:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,545:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,503:.:-0.06:0.999:. ./.:4:0,561:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,648:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,514:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,271:.:-2.06:1.000:. ./.:4:1,493:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,577:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,452:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,173:.:-2.90:1.000:. ./.:4:0,635:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,432:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,429:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,582:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,405:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,492:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,381:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,173:.:-2.90:1.000:. ./.:4:0,238:.:-2.34:1.000:. ./.:3:0,85:.:-3.65:0.999:. ./.:4:0,506:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,520:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,468:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,624:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,460:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,545:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,596:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,711:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,560:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,576:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,614:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,614:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,1034:.: 4.50:1.000:. ./.:4:0,519:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,666:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,566:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,611:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,480:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,605:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,458:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,718:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,768:.: 2.21:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.15:1.000:. ./.:6:0,467:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,551:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,488:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,766:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,584:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,475:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1,709:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,348:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,557:.: 0.40:0.998:. ./.:4:0,444:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,651:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,552:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,774:.: 2.26:1.000:. ./.:4:0,555:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,688:.: 1.52:1.000:. ./.:4:1,478:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,577:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,558:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,533:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,568:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,425:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,627:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,671:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,445:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,616:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1,601:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,392:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,479:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,567:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,481:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,414:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,520:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,628:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,409:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,550:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,607:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,539:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,501:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,602:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,488:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,462:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,663:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,431:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,555:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,509:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,448:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,551:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,405:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,688:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,484:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,501:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,636:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,559:.: 0.42:0.999:. ./.:4:0,528:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,601:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,517:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,589:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,531:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,514:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,540:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,559:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,551:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,443:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,597:.: 0.74:1.000:. ./.:4:2,660:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,530:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,461:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,422:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,408:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,564:.: 0.46:1.000:. ./.:4:2,458:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,368:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,558:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,425:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,643:.: 1.14:1.000:. ./.:4:2,549:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,537:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,455:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,543:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,636:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,452:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,484:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,644:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,703:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,515:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,481:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,574:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,415:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,529:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,471:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,265:.:-2.11:1.000:. ./.:4:0,319:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,590:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,571:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,651:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,553:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,400:.:-0.95:0.998:. ./.:4:0,544:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,420:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,430:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,401:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,490:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,489:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,540:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,368:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,436:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,448:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,369:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,353:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,480:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,406:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,449:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,351:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,511:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,535:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,516:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,438:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,463:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,586:.: 0.65:0.997:. ./.:4:0,589:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,387:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,456:.:-0.47:1.000:. -chr4.1 68000947 chr4.1_068000947 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:137,135:.: 0.96:1.000:. ./.:4:50,152:.:-0.66:1.000:. ./.:4:86,100:.:-1.03:1.000:. ./.:4:48,183:.: 0.01:1.000:. ./.:4:61,216:.: 1.08:1.000:. ./.:4:31,145:.:-1.26:1.000:. ./.:4:38,130:.:-1.44:1.000:. ./.:4:109,114:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,91:.:-1.63:1.000:. ./.:4:58,64:.:-2.51:1.000:. ./.:4:76,73:.:-1.88:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.24:1.000:. ./.:4:33,201:.: 0.08:1.000:. ./.:4:61,210:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,116:.:-0.80:1.000:. ./.:4:135,61:.:-0.80:1.000:. ./.:4:57,217:.: 1.01:0.999:. ./.:4:48,193:.: 0.25:1.000:. ./.:4:140,147:.: 1.31:1.000:. ./.:4:94,144:.: 0.18:1.000:. ./.:4:26,133:.:-1.65:1.000:. ./.:4:45,174:.:-0.26:1.000:. ./.:4:53,210:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,173:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,85:.:-1.79:1.000:. ./.:4:92,110:.:-0.66:1.000:. ./.:4:33,165:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,175:.:-0.17:1.000:. ./.:4:62,251:.: 1.91:1.000:. ./.:4:80,133:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,152:.:-0.80:1.000:. ./.:4:43,152:.:-0.82:1.000:. ./.:4:22,97:.:-2.58:1.000:. ./.:4:44,135:.:-1.19:1.000:. ./.:3:30,44:.:-3.62:0.999:. ./.:4:44,188:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,176:.:-0.56:1.000:. ./.:4:60,176:.: 0.13:1.000:. ./.:4:44,183:.:-0.08:1.000:. ./.:4:45,174:.:-0.26:1.000:. ./.:4:61,213:.: 1.01:1.000:. ./.:4:48,167:.:-0.36:1.000:. ./.:4:179,71:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,111:.:-0.96:1.000:. ./.:4:115,155:.: 0.92:1.000:. ./.:4:46,192:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.52:1.000:. ./.:4:96,114:.:-0.47:1.000:. ./.:4:82,111:.:-0.87:1.000:. ./.:4:64,99:.:-1.56:1.000:. ./.:4:59,189:.: 0.41:1.000:. ./.:4:97,123:.:-0.24:1.000:. ./.:4:73,184:.: 0.62:1.000:. ./.:4:54,230:.: 1.24:1.000:. ./.:4:149,66:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,60:.:-1.07:1.000:. ./.:4:51,201:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,274:.: 1.01:1.000:. ./.:4:40,171:.:-0.45:1.000:. ./.:6:82,147:.:-0.03:1.000:. ./.:4:71,232:.: 1.68:1.000:. ./.:4:33,141:.:-1.31:1.000:. ./.:4:143,150:.: 1.45:1.000:. ./.:4:69,212:.: 1.17:1.000:. ./.:4:110,117:.:-0.08:1.000:. ./.:4:95,163:.: 0.64:1.000:. ./.:4:79,125:.:-0.61:1.000:. ./.:4:53,188:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,218:.: 0.82:0.998:. ./.:4:109,120:.:-0.03:1.000:. ./.:4:63,234:.: 1.54:1.000:. ./.:4:72,73:.:-1.98:1.000:. ./.:4:100,100:.:-0.70:1.000:. ./.:4:45,205:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.73:1.000:. ./.:4:54,158:.:-0.43:1.000:. ./.:4:90,91:.:-1.14:1.000:. ./.:4:76,241:.: 2.01:1.000:. ./.:4:85,121:.:-0.56:1.000:. ./.:4:41,225:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,159:.:-0.29:1.000:. ./.:4:131,141:.: 0.96:1.000:. ./.:4:105,174:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.24:1.000:. ./.:4:84,102:.:-1.03:1.000:. ./.:4:137,155:.: 1.43:1.000:. ./.:4:78,115:.:-0.87:1.000:. ./.:4:119,146:.: 0.80:1.000:. ./.:4:96,156:.: 0.50:1.000:. ./.:4:101,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,120:.:-0.36:1.000:. ./.:4:103,117:.:-0.24:1.000:. ./.:4:65,200:.: 0.80:1.000:. ./.:4:40,132:.:-1.35:1.000:. ./.:4:115,128:.: 0.29:1.000:. ./.:4:49,174:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,146:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.20:1.000:. ./.:4:118,141:.: 0.66:1.000:. ./.:4:56,190:.: 0.36:1.000:. ./.:4:150,53:.:-0.63:1.000:. ./.:4:114,147:.: 0.71:1.000:. ./.:4:46,174:.:-0.24:1.000:. ./.:4:116,167:.: 1.22:1.000:. ./.:4:62,193:.: 0.57:1.000:. ./.:4:44,163:.:-0.54:1.000:. ./.:4:55,155:.:-0.47:1.000:. ./.:4:63,217:.: 1.15:1.000:. ./.:4:130,136:.: 0.82:1.000:. ./.:4:82,132:.:-0.38:1.000:. ./.:4:65,170:.: 0.11:1.000:. ./.:4:108,165:.: 0.99:1.000:. ./.:4:196,84:.: 1.15:0.999:. ./.:4:62,192:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,130:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,289:.: 1.36:1.000:. ./.:4:53,176:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,181:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,249:.: 1.68:1.000:. ./.:4:104,124:.:-0.06:1.000:. ./.:4:65,228:.: 1.45:1.000:. ./.:4:109,150:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.64:1.000:. ./.:4:100,112:.:-0.43:1.000:. ./.:4:69,199:.: 0.87:1.000:. ./.:4:55,212:.: 0.85:1.000:. ./.:4:73,202:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.17:1.000:. ./.:4:55,173:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,174:.:-0.08:1.000:. ./.:4:96,146:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,185:.:-0.22:1.000:. ./.:4:78,92:.:-1.40:1.000:. ./.:4:60,187:.: 0.38:1.000:. ./.:4:111,70:.:-1.14:1.000:. ./.:4:54,217:.: 0.94:1.000:. ./.:4:46,161:.:-0.54:1.000:. ./.:4:70,226:.: 1.52:1.000:. ./.:4:47,178:.:-0.12:1.000:. ./.:4:59,208:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,316:.: 1.98:1.000:. ./.:4:131,159:.: 1.38:1.000:. ./.:4:56,185:.: 0.25:1.000:. ./.:4:94,113:.:-0.54:1.000:. ./.:4:127,182:.: 1.82:1.000:. ./.:4:0,289:.: 1.36:1.000:. ./.:4:64,186:.: 0.45:1.000:. ./.:4:115,124:.: 0.20:1.000:. ./.:4:108,152:.: 0.69:1.000:. ./.:4:112,109:.:-0.22:1.000:. ./.:4:50,236:.: 1.29:1.000:. ./.:4:39,190:.:-0.03:1.000:. ./.:4:41,100:.:-2.07:1.000:. ./.:4:1,188:.:-0.96:1.000:. ./.:4:58,185:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,120:.:-0.29:1.000:. ./.:4:134,163:.: 1.54:1.000:. ./.:4:104,166:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.20:0.998:. ./.:4:62,218:.: 1.15:1.000:. ./.:4:95,116:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.61:1.000:. ./.:4:77,102:.:-1.19:1.000:. ./.:4:51,194:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,87:.:-2.16:1.000:. ./.:4:92,111:.:-0.63:1.000:. ./.:4:39,169:.:-0.52:1.000:. ./.:4:96,132:.:-0.06:1.000:. ./.:4:89,124:.:-0.40:1.000:. ./.:4:46,186:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,178:.:-0.12:1.000:. ./.:4:80,79:.:-1.65:1.000:. ./.:4:48,148:.:-0.80:1.000:. ./.:4:95,111:.:-0.56:1.000:. ./.:4:69,87:.:-1.72:1.000:. ./.:4:31,146:.:-1.24:1.000:. ./.:4:48,183:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,292:.: 1.43:1.000:. ./.:4:43,141:.:-1.07:1.000:. ./.:4:104,120:.:-0.15:1.000:. ./.:4:48,225:.: 0.99:1.000:. ./.:4:125,151:.: 1.06:0.997:. ./.:4:72,241:.: 1.91:1.000:. ./.:4:36,150:.:-1.03:1.000:. ./.:4:47,195:.: 0.27:1.000:. -chr4.1 68363490 chr4.1_068363490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:73,150:.: 0.49:1.000:. ./.:4:99,54:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,207:.: 0.29:1.000:. ./.:4:42,192:.: 0.66:1.000:. ./.:4:112,127:.: 0.74:1.000:. ./.:4:53,202:.: 0.99:1.000:. ./.:4:35,114:.:-0.66:1.000:. ./.:4:5,211:.: 0.38:1.000:. ./.:4:100,68:.:-0.37:1.000:. ./.:4:3,33:.:-2.42:1.000:. ./.:4:5,27:.:-2.49:1.000:. ./.:4:62,170:.: 0.63:1.000:. ./.:4:42,208:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,199:.: 0.86:1.000:. ./.:4:44,123:.:-0.38:1.000:. ./.:4:3,216:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,165:.: 0.15:0.999:. ./.:4:70,71:.:-0.79:1.000:. ./.:4:10,225:.: 0.68:1.000:. ./.:4:57,251:.: 1.81:1.000:. ./.:4:22,9:.:-2.50:1.000:. ./.:4:46,196:.: 0.78:1.000:. ./.:4:148,172:.: 2.00:1.000:. ./.:4:50,190:.: 0.75:1.000:. ./.:4:3,3:.:-2.89:1.000:. ./.:4:37,117:.:-0.59:1.000:. ./.:4:98,157:.: 0.99:1.000:. ./.:4:55,164:.: 0.43:1.000:. ./.:4:68,242:.: 1.84:1.000:. ./.:4:111,76:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,169:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,186:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.94:1.000:. ./.:4:10,30:.:-2.36:1.000:. ./.:3:1,1:.:-2.95:0.999:. ./.:4:113,116:.: 0.58:1.000:. ./.:4:50,187:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,259:.: 1.05:1.000:. ./.:4:40,150:.:-0.03:1.000:. ./.:4:99,56:.:-0.57:1.000:. ./.:4:49,165:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,154:.: 0.08:1.000:. ./.:4:47,100:.:-0.70:1.000:. ./.:4:7,159:.:-0.40:1.000:. ./.:4:52,101:.:-0.60:1.000:. ./.:4:38,163:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,222:.: 1.45:1.000:. ./.:4:21,49:.:-1.89:1.000:. ./.:4:84,34:.:-1.15:1.000:. ./.:4:12,112:.:-1.05:1.000:. ./.:4:37,126:.:-0.45:1.000:. ./.:4:54,190:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,115:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,235:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,164:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,132:.:-0.88:1.000:. ./.:4:88,106:.: 0.04:1.000:. ./.:4:61,103:.:-0.43:1.000:. ./.:4:52,98:.:-0.65:1.000:. ./.:6:31,139:.:-0.34:1.000:. ./.:4:55,168:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,103:.: 0.05:1.000:. ./.:4:4,165:.:-0.35:1.000:. ./.:4:71,84:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,277:.: 1.33:1.000:. ./.:4:35,136:.:-0.32:1.000:. ./.:4:46,58:.:-1.37:1.000:. ./.:4:61,201:.: 1.10:1.000:. ./.:4:60,97:.:-0.54:0.998:. ./.:4:48,52:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,73:.:-1.24:1.000:. ./.:4:36,43:.:-1.75:1.000:. ./.:4:53,198:.: 0.93:1.000:. ./.:4:49,131:.:-0.18:1.000:. ./.:4:81,48:.:-0.98:1.000:. ./.:4:49,73:.:-1.08:1.000:. ./.:4:37,151:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,147:.:-0.57:1.000:. ./.:4:120,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:88,30:.:-1.15:1.000:. ./.:4:6,148:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,178:.:-0.10:1.000:. ./.:4:50,167:.: 0.40:1.000:. ./.:4:38,79:.:-1.16:1.000:. ./.:4:5,158:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,130:.:-0.91:1.000:. ./.:4:33,143:.:-0.24:1.000:. ./.:4:65,90:.:-0.57:1.000:. ./.:4:48,120:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,147:.:-0.63:1.000:. ./.:4:87,43:.:-0.96:1.000:. ./.:4:119,68:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,120:.:-0.54:1.000:. ./.:4:40,173:.: 0.33:1.000:. ./.:4:41,164:.: 0.21:1.000:. ./.:4:73,42:.:-1.19:1.000:. ./.:4:82,104:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,161:.: 0.11:1.000:. ./.:4:90,117:.: 0.24:1.000:. ./.:4:53,95:.:-0.68:1.000:. ./.:4:40,142:.:-0.15:1.000:. ./.:4:36,133:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,93:.:-0.82:1.000:. ./.:4:23,129:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.45:1.000:. ./.:4:52,102:.:-0.59:1.000:. ./.:4:121,73:.: 0.04:1.000:. ./.:4:6,216:.: 0.47:1.000:. ./.:4:49,176:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.21:1.000:. ./.:4:64,234:.: 1.66:1.000:. ./.:4:9,165:.:-0.27:0.999:. ./.:4:56,167:.: 0.49:1.000:. ./.:4:78,81:.:-0.51:1.000:. ./.:4:98,128:.: 0.54:1.000:. ./.:4:4,182:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,146:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.22:1.000:. ./.:4:8,127:.:-0.88:1.000:. ./.:4:39,157:.: 0.07:1.000:. ./.:4:2,157:.:-0.51:1.000:. ./.:4:49,180:.: 0.58:1.000:. ./.:4:98,176:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,128:.:-0.17:1.000:. ./.:4:84,117:.: 0.15:1.000:. ./.:4:35,111:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.21:1.000:. ./.:4:61,46:.:-1.32:1.000:. ./.:4:33,133:.:-0.40:1.000:. ./.:4:60,232:.: 1.56:1.000:. ./.:4:35,77:.:-1.24:1.000:. ./.:4:37,156:.: 0.02:1.000:. ./.:4:9,170:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,271:.: 2.55:1.000:. ./.:4:0,259:.: 1.05:1.000:. ./.:4:86,89:.:-0.26:1.000:. ./.:4:60,91:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.38:1.000:. ./.:4:100,110:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,101:.:-0.66:1.000:. ./.:4:117,146:.: 1.11:1.000:. ./.:4:23,99:.:-1.08:1.000:. ./.:4:2,300:.: 1.72:1.000:. ./.:4:154,174:.: 2.12:1.000:. ./.:4:124,128:.: 0.94:1.000:. ./.:4:45,152:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,144:.: 0.24:1.000:. ./.:4:49,90:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,317:.: 1.95:1.000:. ./.:4:129,151:.: 1.38:1.000:. ./.:4:6,13:.:-2.69:1.000:. ./.:4:57,186:.: 0.80:1.000:. ./.:4:132,121:.: 0.96:1.000:. ./.:4:6,211:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,156:.: 0.61:1.000:. ./.:4:6,232:.: 0.72:1.000:. ./.:4:64,199:.: 1.11:0.998:. ./.:4:129,72:.: 0.15:1.000:. ./.:4:50,197:.: 0.86:1.000:. ./.:4:94,94:.:-0.06:1.000:. ./.:4:45,150:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.89:1.000:. ./.:4:75,139:.: 0.35:1.000:. ./.:4:77,107:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,199:.: 0.88:1.000:. ./.:4:59,71:.:-0.96:1.000:. ./.:4:127,67:.: 0.04:1.000:. ./.:4:115,127:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,245:.: 0.85:1.000:. ./.:4:33,143:.:-0.24:1.000:. ./.:4:59,189:.: 0.88:1.000:. ./.:4:76,112:.:-0.06:1.000:. ./.:4:43,133:.:-0.24:1.000:. ./.:4:47,187:.: 0.66:1.000:. ./.:4:87,235:.: 2.03:1.000:. ./.:4:145,116:.: 1.08:1.000:. ./.:4:104,128:.: 0.63:1.000:. ./.:4:13,251:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,280:.: 1.38:1.000:. ./.:4:5,294:.: 1.67:0.997:. ./.:4:76,241:.: 1.95:1.000:. ./.:4:72,153:.: 0.52:1.000:. ./.:4:58,127:.:-0.10:1.000:. -chr4.1 68607220 chr4.1_068607220 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:301,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:210,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.49:1.000:. ./.:6:166,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.68:0.998:. ./.:4:252,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:252,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:350,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:313,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:352,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.29:0.999:. ./.:4:124,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:341,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.24:0.997:. ./.:4:160,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.59:0.998:. ./.:4:192,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:328,0:.: 2.34:0.997:. ./.:4:135,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.83:1.000:. -chr4.1 68807407 chr4.1_068807407 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:89,0:.: 0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.53:0.999:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:128,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.65:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.19:0.999:. ./.:4:59,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:80,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:132,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:0.998:. ./.:4:26,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:80,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.40:0.999:. ./.:4:62,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.84:0.997:. ./.:4:69,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:167,0:.: 3.39:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.57:0.998:. ./.:4:30,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.67:0.997:. ./.:4:68,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.08:1.000:. -chr4.1 68886385 chr4.1_068886385 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:872,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:574,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:630,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:549,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:274,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:646,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:648,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:552,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:758,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:664,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:625,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:842,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:736,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:685,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:710,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:906,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:778,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:520,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:607,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:663,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:980,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:509,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:823,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:724,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:648,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:158,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:243,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:334,0:.:-1.12:1.000:. ./.:3:319,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:446,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:668,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:672,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:700,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1066,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:661,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:639,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:1095,1:.: 2.72:1.000:. ./.:4:631,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:878,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:745,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:580,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:601,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:786,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:567,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.70:1.000:. ./.:6:371,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:804,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:456,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:851,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:399,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.68:0.998:. ./.:4:520,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:523,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:934,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:672,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:635,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:683,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:620,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:731,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:542,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:768,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:816,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:608,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:651,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:602,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:802,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:661,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:536,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:807,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:699,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:725,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:826,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:489,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1079,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:736,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:515,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1108,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:531,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:660,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:761,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:727,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:340,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:849,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:711,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:302,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:555,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:602,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:627,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:518,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:495,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:482,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:527,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:638,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.23:0.997:. ./.:4:612,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:795,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:490,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:912,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:599,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:555,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:504,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:619,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1053,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:763,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:753,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:562,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:735,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:159,0:.:-2.00:0.998:. ./.:4:718,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:659,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:314,2:.:-1.21:1.000:. ./.:4:593,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:519,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:659,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:632,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:357,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:539,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:312,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:544,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:456,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:604,0:.: 0.24:0.997:. ./.:4:312,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.53:1.000:. -chr4.1 69188425 chr4.1_069188425 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,10:0.26:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,21:0.33:-0.40:1.000:0.932 0/0/0/1:4:169,20:0.23: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,1:0.14: 1.10:1.000:0.980 0/0/0/1:4:143,1:0.15: 0.38:1.000:0.982 0/0/0/1:4:79,16:0.28:-0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:79,8:0.22:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,45:0.56:-0.64:1.000:0.967 0/0/1/1:4:45,36:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,14:0.27:-0.50:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,8:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,5:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,11:0.24:-0.38:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,6:0.16: 1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,57:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,19:0.23: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,22:0.32:-0.22:1.000:0.963 0/0/0/1:4:157,5:0.17: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,41:0.57:-0.82:1.000:0.936 0/0/0/1:4:88,9:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,1:0.14: 2.59:1.000:0.976 0/0/0/1:4:201,4:0.16: 1.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,27:0.36:-0.25:1.000:0.693 0/0/0/1:4:156,5:0.17: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,8:0.20:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,4:0.17: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,4:0.17: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,40:0.57:-0.84:1.000:0.944 0/1/1:3:12,35:0.65:-1.19:0.999:1.000 0/0/0/1:4:219,1:0.14: 1.60:1.000:0.978 0/0/0/1:4:161,10:0.19: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,7:0.17: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,15:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,17:0.30:-0.51:1.000:0.982 0/0/0/1:4:144,18:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,10:0.18: 1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,28:0.34:-0.06:1.000:0.838 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,38:0.29: 1.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:150,19:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,14:0.20: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,37:0.56:-0.87:1.000:0.969 0/0/0/1:4:73,23:0.34:-0.40:1.000:0.836 0/0/1/1:4:48,27:0.45:-0.74:1.000:0.976 0/0/0/1:4:191,13:0.20: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,21:0.31:-0.27:1.000:0.969 0/0/1/1:4:51,38:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,31:0.38:-0.17:1.000:0.576 0/0/0/1:4:143,5:0.17: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,31:0.38:-0.17:1.000:0.576 0/0/0/1:4:128,20:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,29:0.27: 1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,10:0.20: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:117,27:0.30: 0.38:1.000:0.873 0/0/0/1:4:126,22:0.27: 0.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,13:0.27:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,39:0.75:-1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,27:0.29: 0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:151,16:0.22: 0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,24:0.30: 0.17:1.000:0.988 0/0/0/1:4:61,23:0.37:-0.59:1.000:0.514 0/0/1/1:4:65,30:0.41:-0.42:0.998:0.859 0/0/0/1:4:74,25:0.36:-0.35:1.000:0.737 0/0/0/1:4:164,28:0.27: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,33:0.46:-0.53:1.000:0.987 0/0/1/1:4:82,42:0.43: 0.05:1.000:0.943 0/0/0/1:4:117,14:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,36:0.40:-0.06:1.000:0.811 0/0/1/1:4:51,28:0.44:-0.67:1.000:0.970 0/0/1/1:4:62,35:0.45:-0.38:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,33:0.35: 0.21:1.000:0.789 0/0/1/1:4:76,39:0.43:-0.09:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,23:0.31:-0.13:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,7:0.19: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,37:0.31: 1.05:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,35:0.45:-0.42:1.000:0.983 0/0/0/1:4:131,30:0.30: 0.65:1.000:0.985 0/0/1/1:4:62,25:0.39:-0.55:1.000:0.635 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,27:0.29: 0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,38:0.41: 0.02:1.000:0.835 0/0/0/1:4:52,5:0.22:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,42:0.46:-0.13:1.000:0.985 0/0/0/1:4:106,12:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,44:0.34: 1.02:1.000:0.839 0/0/0/1:4:127,26:0.29: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,54:0.54:-0.27:1.000:0.985 0/0/0/1:4:220,4:0.16: 1.67:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,38:0.43:-0.16:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,48:0.45: 0.17:1.000:0.982 0/0/1/1:4:72,28:0.38:-0.34:1.000:0.556 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,21:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,14:0.26:-0.32:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,23:0.37:-0.55:1.000:0.619 0/0/1/1:4:66,27:0.39:-0.45:1.000:0.665 0/0/0/1:4:122,11:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,44:0.48:-0.19:0.999:0.996 0/0/0/1:4:244,13:0.18: 2.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,23:0.41:-0.75:1.000:0.831 0/0/1/1:4:60,43:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,18:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,19:0.31:-0.45:1.000:0.965 0/0/1/1:4:72,30:0.39:-0.30:1.000:0.701 0/0/1/1:4:58,30:0.43:-0.53:1.000:0.948 0/0/1/1:4:78,31:0.38:-0.19:1.000:0.604 0/0/0/1:4:127,15:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,26:0.26: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,7:0.22:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,32:0.39:-0.17:1.000:0.671 0/0/0/1:4:169,24:0.25: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,26:0.28: 0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:114,22:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,22:0.36:-0.59:1.000:0.645 0/0/1/1:4:49,23:0.41:-0.79:1.000:0.878 0/0/0/1:4:123,18:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,9:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,15:0.36:-1.00:0.997:0.721 0/0/1/1:4:57,26:0.41:-0.61:1.000:0.845 0/0/0/1:4:130,9:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,9:0.18: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,11:0.20: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,33:0.30: 0.88:1.000:0.984 0/0/0/1:4:123,28:0.30: 0.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:128,21:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,15:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,46:0.45: 0.08:1.000:0.981 0/0/0/1:4:136,7:0.18: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,20:0.37:-0.74:1.000:0.594 0/0/0/1:4:188,8:0.18: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,10:0.19: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,8:0.17: 2.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,14:0.26:-0.38:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,9:0.17: 1.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,6:0.21:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,22:0.33:-0.37:1.000:0.912 0/0/0/1:4:109,3:0.16:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,12:0.20: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,12:0.20: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,8:0.16: 2.99:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,15:0.23: 0.31:0.998:1.000 0/0/0/1:4:85,19:0.30:-0.27:1.000:0.988 0/0/0/1:4:159,11:0.20: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,6:0.18: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,14:0.27:-0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:78,10:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,7:0.18: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,3:0.15: 2.38:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,12:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,3:0.16: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,16:0.29:-0.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:133,6:0.18: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,22:0.35:-0.51:1.000:0.782 0/0/0/1:4:139,13:0.21: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,10:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,7:0.21:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:348,6:0.15: 3.77:1.000:0.992 0/0/0/1:4:186,12:0.19: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,5:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,9:0.20: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,9:0.18: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,20:0.29:-0.13:0.997:0.991 0/0/0/1:4:340,6:0.16: 3.64:1.000:0.993 0/0/0/1:4:150,1:0.15: 0.49:1.000:0.982 0/0/0/1:4:71,15:0.29:-0.56:1.000:0.992 -chr4.1 69262711 chr4.1_069262711 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,72:.:-0.02:1.000:. ./.:4:4,46:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.16:1.000:. ./.:4:50,31:.: 0.39:1.000:. ./.:4:54,57:.: 1.75:1.000:. ./.:4:11,58:.:-0.16:1.000:. ./.:4:9,34:.:-1.34:1.000:. ./.:4:42,43:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:5,17:.:-2.29:1.000:. ./.:4:8,11:.:-2.43:1.000:. ./.:4:14,44:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,51:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,57:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,63:.: 1.66:1.000:. ./.:4:54,41:.: 1.02:1.000:. ./.:4:34,44:.: 0.25:0.999:. ./.:4:99,35:.: 2.79:1.000:. ./.:4:9,81:.: 0.80:1.000:. ./.:4:45,73:.: 2.07:1.000:. ./.:4:0,18:.:-2.48:1.000:. ./.:4:34,49:.: 0.48:1.000:. ./.:4:17,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:33,62:.: 1.02:1.000:. ./.:4:6,22:.:-2.02:1.000:. ./.:4:38,57:.: 1.02:1.000:. ./.:4:34,50:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,44:.: 0.57:1.000:. ./.:4:55,52:.: 1.57:1.000:. ./.:4:42,46:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:10,54:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,26:.:-2.11:1.000:. ./.:4:1,28:.:-1.98:1.000:. ./.:3:0,9:.:-2.88:0.999:. ./.:4:25,43:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,69:.: 1.66:1.000:. ./.:4:51,38:.: 0.75:1.000:. ./.:4:45,19:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.70:1.000:. ./.:4:9,66:.: 0.11:1.000:. ./.:4:50,39:.: 0.75:1.000:. ./.:4:38,67:.: 1.48:1.000:. ./.:4:10,38:.:-1.11:1.000:. ./.:4:42,42:.: 0.52:1.000:. ./.:4:26,56:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,84:.: 1.07:1.000:. ./.:4:3,12:.:-2.61:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,25:.:-2.16:1.000:. ./.:4:28,25:.:-0.89:1.000:. ./.:4:54,39:.: 0.93:1.000:. ./.:4:40,33:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,67:.: 0.39:1.000:. ./.:4:36,48:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,30:.:-0.02:1.000:. ./.:4:37,49:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.20:1.000:. ./.:6:16,43:.:-0.61:1.000:. ./.:4:9,54:.:-0.43:1.000:. ./.:4:14,64:.: 0.25:1.000:. ./.:4:15,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:23,30:.:-0.89:1.000:. ./.:4:58,42:.: 1.25:1.000:. ./.:4:5,78:.: 0.48:1.000:. ./.:4:47,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.07:1.000:. ./.:4:7,48:.:-0.79:0.998:. ./.:4:0,72:.:-0.02:1.000:. ./.:4:35,38:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,35:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.48:1.000:. ./.:4:40,57:.: 1.11:1.000:. ./.:4:15,43:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.57:1.000:. ./.:4:9,58:.:-0.25:1.000:. ./.:4:17,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.25:1.000:. ./.:4:7,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.20:1.000:. ./.:4:13,58:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,55:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,24:.:-0.52:1.000:. ./.:4:8,52:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,41:.:-0.93:1.000:. ./.:4:32,29:.:-0.52:1.000:. ./.:4:36,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:32,61:.: 0.93:1.000:. ./.:4:6,40:.:-1.20:1.000:. ./.:4:39,56:.: 1.02:1.000:. ./.:4:6,67:.: 0.02:1.000:. ./.:4:39,30:.:-0.16:1.000:. ./.:4:46,42:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,47:.: 0.34:1.000:. ./.:4:34,40:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:41,52:.: 0.93:1.000:. ./.:4:35,61:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.43:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.02:1.000:. ./.:4:6,46:.:-0.93:1.000:. ./.:4:37,55:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,49:.:-1.07:1.000:. ./.:4:14,33:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.25:1.000:. ./.:4:6,72:.: 0.25:1.000:. ./.:4:44,37:.: 0.39:1.000:. ./.:4:11,59:.:-0.11:1.000:. ./.:4:73,48:.: 2.20:1.000:. ./.:4:51,40:.: 0.84:0.999:. ./.:4:43,43:.: 0.61:1.000:. ./.:4:3,14:.:-2.52:1.000:. ./.:4:22,60:.: 0.43:1.000:. ./.:4:30,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.21:1.000:. ./.:4:6,50:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.57:1.000:. ./.:4:47,39:.: 0.61:1.000:. ./.:4:31,46:.: 0.21:1.000:. ./.:4:11,61:.:-0.02:1.000:. ./.:4:11,58:.:-0.16:1.000:. ./.:4:13,68:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,37:.: 0.43:1.000:. ./.:4:7,50:.:-0.70:1.000:. ./.:4:3,38:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:58,49:.: 1.57:1.000:. ./.:4:26,29:.:-0.79:0.997:. ./.:4:34,16:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,45:.: 0.11:1.000:. ./.:4:41,62:.: 1.39:1.000:. ./.:4:37,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,32:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,30:.:-0.34:1.000:. ./.:4:32,30:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.25:1.000:. ./.:4:33,45:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,34:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,68:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.25:1.000:. ./.:4:44,76:.: 2.16:1.000:. ./.:4:53,46:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,57:.: 1.80:1.000:. ./.:4:10,52:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.98:1.000:. ./.:4:10,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:59,34:.: 0.93:1.000:. ./.:4:43,56:.: 1.20:1.000:. ./.:4:45,79:.: 2.34:1.000:. ./.:4:8,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:10,55:.:-0.34:0.998:. ./.:4:0,82:.: 0.43:1.000:. ./.:4:37,56:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,28:.:-0.43:1.000:. ./.:4:4,65:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,17:.:-1.29:1.000:. ./.:4:37,52:.: 0.75:1.000:. ./.:4:8,64:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,58:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.75:1.000:. ./.:4:7,58:.:-0.34:1.000:. ./.:4:31,49:.: 0.34:1.000:. ./.:4:38,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,29:.:-0.16:1.000:. ./.:4:37,27:.:-0.39:1.000:. ./.:4:7,28:.:-1.70:1.000:. ./.:4:50,54:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.48:1.000:. ./.:4:5,54:.:-0.61:1.000:. ./.:4:46,36:.: 0.43:1.000:. ./.:4:64,51:.: 1.93:1.000:. ./.:4:8,51:.:-0.61:0.997:. ./.:4:54,57:.: 1.75:1.000:. ./.:4:6,51:.:-0.70:1.000:. ./.:4:9,52:.:-0.52:1.000:. -chr4.1 69623578 chr4.1_069623578 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:228,111:.: 1.03:1.000:. ./.:4:173,63:.:-0.49:1.000:. ./.:4:211,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:197,76:.: 0.06:1.000:. ./.:4:288,118:.: 2.02:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:148,172:.: 0.75:1.000:. ./.:4:195,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:33,61:.:-2.58:1.000:. ./.:4:49,24:.:-2.89:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:145,155:.: 0.46:1.000:. ./.:4:154,167:.: 0.77:1.000:. ./.:4:236,77:.: 0.65:0.999:. ./.:4:228,106:.: 0.96:1.000:. ./.:4:258,107:.: 1.42:1.000:. ./.:4:259,94:.: 1.24:1.000:. ./.:4:70,37:.:-2.39:1.000:. ./.:4:225,71:.: 0.40:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:178,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:27,49:.:-2.85:1.000:. ./.:4:167,214:.: 1.65:1.000:. ./.:4:199,97:.: 0.40:1.000:. ./.:4:198,67:.:-0.06:1.000:. ./.:4:245,70:.: 0.68:1.000:. ./.:4:130,135:.:-0.06:1.000:. ./.:4:234,70:.: 0.52:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:33,36:.:-2.95:1.000:. ./.:4:53,53:.:-2.40:1.000:. ./.:3:40,0:.:-3.38:0.999:. ./.:4:214,82:.: 0.40:1.000:. ./.:4:231,98:.: 0.89:1.000:. ./.:4:196,63:.:-0.15:1.000:. ./.:4:190,70:.:-0.13:1.000:. ./.:4:189,94:.: 0.21:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:207,107:.: 0.67:1.000:. ./.:4:170,206:.: 1.58:1.000:. ./.:4:210,75:.: 0.24:1.000:. ./.:4:122,190:.: 0.64:1.000:. ./.:4:242,82:.: 0.81:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:33,28:.:-3.07:1.000:. ./.:4:209,98:.: 0.56:1.000:. ./.:4:128,58:.:-1.22:1.000:. ./.:4:169,84:.:-0.23:1.000:. ./.:4:277,105:.: 1.67:1.000:. ./.:4:182,78:.:-0.13:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:124,170:.: 0.37:1.000:. ./.:4:136,170:.: 0.55:1.000:. ./.:4:194,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:210,86:.: 0.40:1.000:. ./.:6:175,42:.:-0.77:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:210,96:.: 0.55:1.000:. ./.:4:188,84:.: 0.05:1.000:. ./.:4:217,101:.: 0.72:1.000:. ./.:4:301,102:.: 1.98:1.000:. ./.:4:77,87:.:-1.55:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:182,98:.: 0.16:0.998:. ./.:4:151,137:.: 0.28:1.000:. ./.:4:229,78:.: 0.56:1.000:. ./.:4:156,59:.:-0.80:1.000:. ./.:4:175,204:.: 1.62:1.000:. ./.:4:202,68:.: 0.02:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:144,58:.:-0.99:1.000:. ./.:4:178,84:.:-0.10:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:203,72:.: 0.09:1.000:. ./.:4:198,95:.: 0.36:1.000:. ./.:4:147,74:.:-0.71:1.000:. ./.:4:231,98:.: 0.89:1.000:. ./.:4:218,77:.: 0.39:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:145,169:.: 0.67:1.000:. ./.:4:204,114:.: 0.72:1.000:. ./.:4:128,48:.:-1.37:1.000:. ./.:4:151,97:.:-0.31:1.000:. ./.:4:137,160:.: 0.41:1.000:. ./.:4:133,170:.: 0.50:1.000:. ./.:4:145,47:.:-1.13:1.000:. ./.:4:142,201:.: 1.09:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,70:.:-0.54:1.000:. ./.:4:191,98:.: 0.30:1.000:. ./.:4:217,103:.: 0.75:1.000:. ./.:4:118,163:.: 0.18:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:187,112:.: 0.44:1.000:. ./.:4:204,85:.: 0.30:1.000:. ./.:4:116,54:.:-1.46:1.000:. ./.:4:190,89:.: 0.15:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:120,171:.: 0.33:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:169,90:.:-0.15:1.000:. ./.:4:185,84:.: 0.00:1.000:. ./.:4:262,97:.: 1.33:1.000:. ./.:4:219,70:.: 0.30:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:272,102:.: 1.55:1.000:. ./.:4:118,168:.: 0.25:0.999:. ./.:4:191,87:.: 0.13:1.000:. ./.:4:133,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:192,72:.:-0.07:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:161,59:.:-0.72:1.000:. ./.:4:238,101:.: 1.03:1.000:. ./.:4:121,183:.: 0.52:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:191,77:.:-0.01:1.000:. ./.:4:298,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:205,73:.: 0.13:1.000:. ./.:4:198,66:.:-0.07:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:146,71:.:-0.77:1.000:. ./.:4:215,72:.: 0.27:1.000:. ./.:4:194,78:.: 0.05:1.000:. ./.:4:83,104:.:-1.21:0.997:. ./.:4:169,74:.:-0.38:1.000:. ./.:4:99,138:.:-0.47:1.000:. ./.:4:242,93:.: 0.98:1.000:. ./.:4:218,76:.: 0.37:1.000:. ./.:4:162,76:.:-0.46:1.000:. ./.:4:119,50:.:-1.47:1.000:. ./.:4:183,75:.:-0.16:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:119,159:.: 0.13:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:149,54:.:-0.97:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:373,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:222,100:.: 0.78:1.000:. ./.:4:208,69:.: 0.12:1.000:. ./.:4:265,84:.: 1.18:1.000:. ./.:4:184,71:.:-0.21:1.000:. ./.:4:233,93:.: 0.84:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:72,26:.:-2.52:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:236,81:.: 0.71:1.000:. ./.:4:160,191:.: 1.21:1.000:. ./.:4:171,180:.: 1.21:1.000:. ./.:4:238,103:.: 1.06:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.66:0.998:. ./.:4:199,87:.: 0.25:1.000:. ./.:4:163,78:.:-0.41:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:170,65:.:-0.50:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:125,150:.: 0.09:1.000:. ./.:4:176,159:.: 0.98:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:126,141:.:-0.03:1.000:. ./.:4:206,77:.: 0.21:1.000:. ./.:4:258,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:162,66:.:-0.60:1.000:. ./.:4:151,70:.:-0.71:1.000:. ./.:4:128,144:.: 0.05:1.000:. ./.:4:181,68:.:-0.29:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:282,111:.: 1.83:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:188,89:.: 0.12:1.000:. ./.:4:225,106:.: 0.92:1.000:. ./.:4:231,116:.: 1.15:0.997:. ./.:4:265,93:.: 1.31:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:175,70:.:-0.35:1.000:. -chr4.1 69838755 chr4.1_069838755 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 2.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:0.997:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr4.1 69922502 chr4.1_069922502 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:198,71:.: 0.59:1.000:. ./.:4:140,41:.:-0.99:1.000:. ./.:4:128,109:.: 0.02:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:260,81:.: 1.89:1.000:. ./.:4:160,52:.:-0.43:1.000:. ./.:4:187,55:.: 0.11:1.000:. ./.:4:206,57:.: 0.49:1.000:. ./.:4:97,15:.:-2.23:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:219,44:.: 0.49:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:168,71:.: 0.05:1.000:. ./.:4:234,53:.: 0.92:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:251,71:.: 1.54:1.000:. ./.:4:282,83:.: 2.32:1.000:. ./.:4:229,70:.: 1.13:1.000:. ./.:4:57,54:.:-2.24:1.000:. ./.:4:197,67:.: 0.50:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:185,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:60,59:.:-2.10:1.000:. ./.:4:252,62:.: 1.40:1.000:. ./.:4:205,83:.: 0.93:1.000:. ./.:4:176,65:.: 0.09:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:239,63:.: 1.19:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:192,52:.: 0.14:1.000:. ./.:4:83,42:.:-1.99:1.000:. ./.:4:121,29:.:-1.54:1.000:. ./.:3:34,20:.:-3.27:0.999:. ./.:4:200,57:.: 0.38:1.000:. ./.:4:210,59:.: 0.59:1.000:. ./.:4:207,59:.: 0.54:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:233,53:.: 0.90:1.000:. ./.:4:180,51:.:-0.09:1.000:. ./.:4:209,60:.: 0.59:1.000:. ./.:4:203,69:.: 0.65:1.000:. ./.:4:182,41:.:-0.23:1.000:. ./.:4:201,62:.: 0.49:1.000:. ./.:4:148,56:.:-0.57:1.000:. ./.:4:234,67:.: 1.17:1.000:. ./.:4:169,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:117,118:.:-0.02:1.000:. ./.:4:171,151:.: 1.54:1.000:. ./.:4:171,46:.:-0.34:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:210,64:.: 0.68:1.000:. ./.:4:120,91:.:-0.45:1.000:. ./.:4:238,75:.: 1.38:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:209,66:.: 0.70:1.000:. ./.:4:111,90:.:-0.63:1.000:. ./.:6:143,63:.:-0.54:1.000:. ./.:4:170,48:.:-0.32:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:228,69:.: 1.10:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:203,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:242,62:.: 1.22:1.000:. ./.:4:134,44:.:-1.04:1.000:. ./.:4:171,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:241,71:.: 1.37:0.998:. ./.:4:46,146:.:-0.79:1.000:. ./.:4:214,80:.: 1.04:1.000:. ./.:4:201,66:.: 0.56:1.000:. ./.:4:71,217:.: 0.93:1.000:. ./.:4:165,55:.:-0.29:1.000:. ./.:4:172,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:156,55:.:-0.45:1.000:. ./.:4:191,58:.: 0.23:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:96,96:.:-0.79:1.000:. ./.:4:165,65:.:-0.11:1.000:. ./.:4:114,35:.:-1.56:1.000:. ./.:4:194,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:199,55:.: 0.32:1.000:. ./.:4:155,40:.:-0.74:1.000:. ./.:4:240,77:.: 1.46:1.000:. ./.:4:176,67:.: 0.13:1.000:. ./.:4:113,47:.:-1.36:1.000:. ./.:4:198,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:175,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:152,39:.:-0.81:1.000:. ./.:4:139,29:.:-1.22:1.000:. ./.:4:143,53:.:-0.72:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:197,67:.: 0.50:1.000:. ./.:4:131,47:.:-1.04:1.000:. ./.:4:71,87:.:-1.40:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:161,60:.:-0.27:1.000:. ./.:4:152,52:.:-0.57:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:166,47:.:-0.41:1.000:. ./.:4:118,33:.:-1.53:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:104,96:.:-0.65:1.000:. ./.:4:187,57:.: 0.14:1.000:. ./.:4:219,69:.: 0.93:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:162,58:.:-0.29:1.000:. ./.:4:354,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:151,55:.:-0.54:0.999:. ./.:4:214,51:.: 0.52:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:148,46:.:-0.75:1.000:. ./.:4:164,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:141,58:.:-0.66:1.000:. ./.:4:109,88:.:-0.70:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:110,102:.:-0.43:1.000:. ./.:4:176,50:.:-0.18:1.000:. ./.:4:208,75:.: 0.84:1.000:. ./.:4:196,43:.: 0.05:1.000:. ./.:4:122,101:.:-0.23:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:84,96:.:-1.01:1.000:. ./.:4:125,32:.:-1.42:1.000:. ./.:4:105,48:.:-1.49:1.000:. ./.:4:130,40:.:-1.19:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:90,38:.:-1.94:0.997:. ./.:4:224,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:88,92:.:-1.01:1.000:. ./.:4:222,91:.: 1.38:1.000:. ./.:4:174,51:.:-0.20:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:161,57:.:-0.32:1.000:. ./.:4:166,61:.:-0.16:1.000:. ./.:4:124,63:.:-0.88:1.000:. ./.:4:158,37:.:-0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:233,74:.: 1.28:1.000:. ./.:4:261,84:.: 1.96:1.000:. ./.:4:169,65:.:-0.04:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:218,70:.: 0.93:1.000:. ./.:4:127,41:.:-1.22:1.000:. ./.:4:256,88:.: 1.94:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:66,75:.:-1.71:1.000:. ./.:4:144,40:.:-0.93:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:126,106:.:-0.07:1.000:. ./.:4:161,148:.: 1.31:1.000:. ./.:4:258,83:.: 1.89:1.000:. ./.:4:161,47:.:-0.50:0.998:. ./.:4:208,74:.: 0.83:1.000:. ./.:4:177,44:.:-0.27:1.000:. ./.:4:158,38:.:-0.72:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:207,59:.: 0.54:1.000:. ./.:4:242,51:.: 1.02:1.000:. ./.:4:169,118:.: 0.92:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:110,109:.:-0.31:1.000:. ./.:4:199,54:.: 0.31:1.000:. ./.:4:165,52:.:-0.34:1.000:. ./.:4:175,44:.:-0.31:1.000:. ./.:4:117,46:.:-1.31:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:175,45:.:-0.29:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:140,42:.:-0.97:1.000:. ./.:4:232,78:.: 1.33:1.000:. ./.:4:210,57:.: 0.56:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:171,60:.:-0.09:1.000:. ./.:4:219,69:.: 0.93:1.000:. ./.:4:278,73:.: 2.07:0.997:. ./.:4:297,70:.: 2.35:1.000:. ./.:4:180,56:.: 0.00:1.000:. ./.:4:128,115:.: 0.13:1.000:. -chr4.1 70165870 chr4.1_070165870 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:75,78:0.52: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,34:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,102:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,42:0.23: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,131:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,69:0.69:-0.98:1.000:0.974 0/0/0/1:4:123,37:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,118:0.79: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,2:0.10:-2.92:1.000:0.730 0/0/0/1:4:14,4:0.23:-2.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,28:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,35:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,28:0.21: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,47:0.29: 0.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:80,73:0.48: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 1.92:0.999:1.000 0/0/0/1:4:162,40:0.20: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,106:0.49: 2.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,68:0.44: 0.50:1.000:0.963 0/1/1/1:4:3,9:0.73:-3.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:145,38:0.21: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,85:0.51: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,38:0.28:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:8,3:0.28:-3.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,43:0.22: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,71:0.45: 0.55:1.000:0.981 0/0/1/1:4:80,71:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/0:4:156,1:0.01: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,72:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/0:4:186,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,111:0.67: 0.60:1.000:0.933 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-3.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,16:0.48:-2.57:1.000:0.994 0/1/1:3:3,3:0.51:-3.27:0.999:0.606 0/0/1/1:4:93,108:0.54: 1.57:1.000:0.988 0/0/0/1:4:125,40:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,42:0.22: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,73:0.39: 1.30:1.000:0.706 0/1/1/1:4:36,108:0.73: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,86:0.53: 0.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,92:0.48: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,59:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,61:0.46:-0.04:1.000:0.985 0/0/0/1:4:91,33:0.27:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,88:0.53: 0.73:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,22:0.25:-1.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,139:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,53:0.68:-1.53:1.000:0.963 0/0/1/1:4:59,51:0.47:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:111,40:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,69:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,112:0.70: 0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:61,64:0.52:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:109,44:0.29: 0.38:1.000:0.989 0/0/1/1:4:57,55:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,92:0.68:-0.14:1.000:0.962 0/0/1/1/1/1:6:36,85:0.69:-0.41:1.000:0.903 0/1/1/1:4:27,101:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,63:0.45: 0.11:1.000:0.981 0/0/1/1:4:59,68:0.54:-0.27:1.000:0.989 0/0/0/1:4:82,20:0.20:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,70:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,58:0.42: 0.11:1.000:0.894 0/0/1/1:4:34,23:0.41:-2.00:1.000:0.868 0/0/1/1:4:80,67:0.46: 0.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,61:0.48:-0.24:0.998:0.996 0/1/1/1:4:34,105:0.74: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,36:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,65:0.75:-1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,83:0.67:-0.41:1.000:0.935 0/0/0/1:4:142,46:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,34:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,62:0.54:-0.56:1.000:0.987 0/1/1/1:4:41,100:0.69: 0.08:1.000:0.980 0/0/0/1:4:91,37:0.30:-0.24:1.000:0.988 0/1/1/1:4:42,102:0.69: 0.16:1.000:0.979 0/0/1/1:4:66,81:0.55: 0.23:1.000:0.977 0/0/0/1:4:88,33:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,69:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,71:0.53:-0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,71:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,44:0.44:-0.89:1.000:0.965 0/0/1/1:4:75,84:0.53: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,46:0.45:-0.81:1.000:0.975 0/0/0/1:4:90,39:0.31:-0.22:1.000:0.974 0/0/1/1:4:49,55:0.53:-0.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,38:0.28:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,51:0.53:-1.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,66:0.52:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,39:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,31:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,33:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,55:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,52:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,35:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,72:0.44: 0.73:1.000:0.964 0/0/1/1:4:33,39:0.54:-1.63:1.000:0.985 0/0/0/1:4:113,27:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,17:0.19:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,31:0.28:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,39:0.40:-0.96:1.000:0.800 0/0/0/1:4:85,28:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,82:0.64:-0.29:1.000:0.713 0/0/1/1:4:71,78:0.53: 0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:89,73:0.46: 0.60:1.000:0.986 0/0/0/1:4:128,29:0.19: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,54:0.46:-0.49:1.000:0.990 0/0/0/1:4:175,53:0.24: 2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,70:0.52:-0.04:0.999:0.995 0/0/1/1:4:80,70:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,29:0.43:-1.73:1.000:0.955 0/0/0/1:4:127,33:0.21: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,29:0.28:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,54:0.46:-0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,53:0.43:-0.31:1.000:0.949 0/1/1/1:4:23,72:0.74:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,59:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,75:0.55:-0.02:1.000:0.981 0/1/1/1:4:42,128:0.73: 0.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,50:0.43:-0.46:1.000:0.939 0/1/1/1:4:33,121:0.77: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,31:0.27:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,64:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,42:0.45:-1.08:1.000:0.983 0/0/1/1:4:61,36:0.38:-1.01:1.000:0.546 0/0/1/1:4:55,54:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,23:0.28:-1.33:0.997:0.995 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,97:0.73:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:168,37:0.19: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,41:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,31:0.27:-0.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:93,20:0.18:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,28:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,54:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,30:0.22: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,106:0.71: 0.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:65,25:0.28:-1.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:42,154:0.77: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,88:0.44: 1.59:1.000:0.971 0/0/1/1:4:90,73:0.45: 0.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:139,45:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,95:0.56: 0.83:1.000:0.972 0/0/1/1:4:71,73:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,57:0.31: 1.30:1.000:0.978 0/0/1/1:4:78,87:0.53: 0.68:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,12:0.69:-2.99:1.000:0.976 0/0/1/1:4:51,58:0.54:-0.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:142,30:0.18: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,78:0.46: 0.83:1.000:0.989 0/1/1/1:4:49,127:0.71: 0.95:1.000:0.989 0/0/1/1:4:64,60:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,59:0.48:-0.31:0.998:0.995 0/0/1/1:4:84,83:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,43:0.29: 0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,80:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,34:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,75:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,70:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,121:0.72: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,40:0.31:-0.19:1.000:0.965 0/0/1/1:4:68,71:0.52: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,103:0.69: 0.21:1.000:0.975 0/1/1/1:4:42,129:0.74: 0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:85,60:0.42: 0.18:1.000:0.918 0/0/1/1:4:68,67:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,64:0.45: 0.13:1.000:0.984 0/0/0/1:4:92,32:0.27:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,58:0.38: 0.43:1.000:0.586 0/0/1/1:4:94,92:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,80:0.53: 0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:112,108:0.50: 2.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,83:0.55: 0.33:1.000:0.979 0/0/0/1:4:120,35:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,84:0.44: 1.45:0.997:0.959 0/0/1/1:4:104,96:0.49: 1.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,98:0.80:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,62:0.43: 0.21:1.000:0.951 -chr4.1 70571159 chr4.1_070571159 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:235,73:.: 1.29:1.000:. ./.:4:209,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:190,82:.: 0.72:1.000:. ./.:4:227,82:.: 1.31:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:207,68:.: 0.77:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:10,8:.:-3.32:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:184,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:196,60:.: 0.46:1.000:. ./.:4:183,62:.: 0.29:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:211,59:.: 0.69:0.999:. ./.:4:317,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:241,78:.: 1.46:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:26,4:.:-3.13:1.000:. ./.:4:210,55:.: 0.61:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:172,55:.: 0.00:1.000:. ./.:4:23,2:.:-3.21:1.000:. ./.:4:216,63:.: 0.83:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:214,65:.: 0.83:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:237,67:.: 1.23:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:37,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:22,7:.:-3.15:1.000:. ./.:3:28,5:.:-3.08:0.999:. ./.:4:245,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:193,69:.: 0.56:1.000:. ./.:4:175,73:.: 0.34:1.000:. ./.:4:190,64:.: 0.43:1.000:. ./.:4:208,68:.: 0.78:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:170,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:173,54:.: 0.00:1.000:. ./.:4:229,58:.: 0.96:1.000:. ./.:4:166,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:167,40:.:-0.32:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:136,44:.:-0.75:1.000:. ./.:4:207,67:.: 0.75:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:147,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:153,57:.:-0.27:1.000:. ./.:6:163,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:163,44:.:-0.32:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:210,63:.: 0.73:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:175,68:.: 0.26:1.000:. ./.:4:161,51:.:-0.24:0.998:. ./.:4:243,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:177,52:.: 0.03:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:210,57:.: 0.64:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:145,50:.:-0.51:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:149,42:.:-0.57:1.000:. ./.:4:168,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:190,65:.: 0.45:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:160,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:175,61:.: 0.15:1.000:. ./.:4:152,44:.:-0.49:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:197,49:.: 0.30:1.000:. ./.:4:118,39:.:-1.11:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:187,51:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,30:.:-1.06:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:194,49:.: 0.26:1.000:. ./.:4:149,41:.:-0.59:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:173,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:117,32:.:-1.24:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:119,30:.:-1.24:1.000:. ./.:4:135,50:.:-0.67:1.000:. ./.:4:127,43:.:-0.90:1.000:. ./.:4:137,41:.:-0.78:1.000:. ./.:4:158,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:243,69:.: 1.35:1.000:. ./.:4:249,79:.: 1.61:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:143,42:.:-0.67:1.000:. ./.:4:371,1:.: 2.31:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.32:0.999:. ./.:4:224,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:162,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:91,34:.:-1.62:1.000:. ./.:4:161,47:.:-0.30:1.000:. ./.:4:161,37:.:-0.46:1.000:. ./.:4:130,48:.:-0.78:1.000:. ./.:4:168,66:.: 0.11:1.000:. ./.:4:146,51:.:-0.47:1.000:. ./.:4:161,59:.:-0.11:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:158,40:.:-0.46:1.000:. ./.:4:166,55:.:-0.09:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:106,46:.:-1.19:1.000:. ./.:4:135,41:.:-0.81:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:224,61:.: 0.92:1.000:. ./.:4:99,30:.:-1.56:0.997:. ./.:4:165,62:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:211,75:.: 0.94:1.000:. ./.:4:178,76:.: 0.43:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:124,41:.:-0.98:1.000:. ./.:4:158,59:.:-0.16:1.000:. ./.:4:156,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:294,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:253,75:.: 1.61:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:218,57:.: 0.77:1.000:. ./.:4:138,48:.:-0.65:1.000:. ./.:4:218,79:.: 1.12:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,10:.:-2.94:1.000:. ./.:4:160,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:188,50:.: 0.18:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:193,65:.: 0.50:1.000:. ./.:4:194,68:.: 0.56:0.998:. ./.:4:204,61:.: 0.61:1.000:. ./.:4:187,55:.: 0.24:1.000:. ./.:4:179,64:.: 0.26:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:213,69:.: 0.88:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:160,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,66:.: 0.29:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:187,69:.: 0.46:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:183,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:200,49:.: 0.35:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:213,55:.: 0.65:1.000:. ./.:4:256,74:.: 1.64:0.997:. ./.:4:347,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.84:1.000:. -chr4.1 70888858 chr4.1_070888858 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.01:0.999:. ./.:4:164,25:.: 3.98:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.11:1.000:. ./.:3:35,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:1.000:. ./.:6:11,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:0.998:. ./.:4:74,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.01:0.997:. ./.:4:64,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:106,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.36:0.998:. ./.:4:73,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.05:0.997:. ./.:4:24,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.46:1.000:. -chr4.1 71131561 chr4.1_071131561 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:408,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:279,97:.: 0.18:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:320,120:.: 1.08:1.000:. ./.:4:189,212:.: 0.53:1.000:. ./.:4:122,115:.:-1.77:1.000:. ./.:4:412,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:246,85:.:-0.45:1.000:. ./.:4:177,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:203,1:.:-2.24:1.000:. ./.:4:225,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:274,115:.: 0.36:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:386,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:345,98:.: 1.12:1.000:. ./.:4:87,73:.:-2.85:1.000:. ./.:4:184,181:.: 0.03:1.000:. ./.:4:361,118:.: 1.63:1.000:. ./.:4:245,69:.:-0.69:1.000:. ./.:4:158,1:.:-2.87:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:238,197:.: 1.01:1.000:. ./.:4:173,167:.:-0.32:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:262,91:.:-0.14:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:161,151:.:-0.72:1.000:. ./.:4:53,52:.:-3.63:1.000:. ./.:4:161,54:.:-2.08:1.000:. ./.:3:55,19:.:-4.06:0.999:. ./.:4:188,183:.: 0.11:1.000:. ./.:4:300,87:.: 0.34:1.000:. ./.:4:270,88:.:-0.07:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:268,91:.:-0.06:1.000:. ./.:4:168,192:.:-0.04:1.000:. ./.:4:234,199:.: 0.98:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:296,107:.: 0.56:1.000:. ./.:4:294,128:.: 0.83:1.000:. ./.:4:239,217:.: 1.31:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:152,189:.:-0.31:1.000:. ./.:4:278,94:.: 0.13:1.000:. ./.:4:159,164:.:-0.56:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:333,95:.: 0.91:1.000:. ./.:4:276,94:.: 0.10:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:269,85:.:-0.13:1.000:. ./.:4:194,185:.: 0.22:1.000:. ./.:4:153,178:.:-0.45:1.000:. ./.:6:208,138:.:-0.24:1.000:. ./.:4:193,231:.: 0.86:1.000:. ./.:4:266,97:.: 0.00:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:235,100:.:-0.39:1.000:. ./.:4:318,112:.: 0.94:1.000:. ./.:4:472,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:195,61:.:-1.51:1.000:. ./.:4:286,73:.:-0.06:1.000:. ./.:4:264,115:.: 0.22:0.998:. ./.:4:220,96:.:-0.66:1.000:. ./.:4:318,125:.: 1.12:1.000:. ./.:4:250,90:.:-0.32:1.000:. ./.:4:292,97:.: 0.36:1.000:. ./.:4:340,103:.: 1.12:1.000:. ./.:4:260,104:.: 0.01:1.000:. ./.:4:242,104:.:-0.24:1.000:. ./.:4:280,88:.: 0.07:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:290,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:283,124:.: 0.62:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:161,165:.:-0.52:1.000:. ./.:4:290,104:.: 0.43:1.000:. ./.:4:399,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:273,114:.: 0.34:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:276,88:.: 0.01:1.000:. ./.:4:318,104:.: 0.83:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:294,108:.: 0.55:1.000:. ./.:4:264,77:.:-0.31:1.000:. ./.:4:152,165:.:-0.65:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:175,187:.:-0.01:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:275,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:232,65:.:-0.93:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:180,198:.: 0.21:1.000:. ./.:4:263,79:.:-0.30:1.000:. ./.:4:508,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:282,85:.: 0.06:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:208,183:.: 0.39:1.000:. ./.:4:205,72:.:-1.21:1.000:. ./.:4:332,125:.: 1.32:1.000:. ./.:4:257,80:.:-0.37:1.000:. ./.:4:248,98:.:-0.24:1.000:. ./.:4:248,94:.:-0.30:1.000:. ./.:4:240,79:.:-0.62:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:284,106:.: 0.38:1.000:. ./.:4:208,214:.: 0.83:1.000:. ./.:4:310,107:.: 0.76:1.000:. ./.:4:263,102:.: 0.03:1.000:. ./.:4:212,218:.: 0.94:1.000:. ./.:4:277,85:.:-0.01:1.000:. ./.:4:160,165:.:-0.54:1.000:. ./.:4:195,64:.:-1.46:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:255,94:.:-0.20:1.000:. ./.:4:359,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:183,0:.:-2.53:0.997:. ./.:4:398,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:251,67:.:-0.63:1.000:. ./.:4:346,125:.: 1.52:1.000:. ./.:4:304,122:.: 0.88:1.000:. ./.:4:221,89:.:-0.75:1.000:. ./.:4:288,84:.: 0.13:1.000:. ./.:4:249,99:.:-0.21:1.000:. ./.:4:201,215:.: 0.74:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:162,177:.:-0.34:1.000:. ./.:4:288,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:275,236:.: 2.08:1.000:. ./.:4:283,260:.: 2.53:1.000:. ./.:4:191,194:.: 0.31:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:303,110:.: 0.70:1.000:. ./.:4:284,89:.: 0.14:1.000:. ./.:4:134,33:.:-2.76:1.000:. ./.:4:157,149:.:-0.80:1.000:. ./.:4:309,129:.: 1.05:1.000:. ./.:4:332,106:.: 1.05:1.000:. ./.:4:259,234:.: 1.83:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:174,140:.:-0.69:0.998:. ./.:4:338,98:.: 1.03:1.000:. ./.:4:251,84:.:-0.39:1.000:. ./.:4:157,156:.:-0.70:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:301,87:.: 0.35:1.000:. ./.:4:300,101:.: 0.53:1.000:. ./.:4:191,181:.: 0.13:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:346,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:272,95:.: 0.06:1.000:. ./.:4:186,152:.:-0.35:1.000:. ./.:4:211,67:.:-1.20:1.000:. ./.:4:202,60:.:-1.42:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:252,79:.:-0.45:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:206,90:.:-0.94:1.000:. ./.:4:194,211:.: 0.59:1.000:. ./.:4:275,83:.:-0.07:1.000:. ./.:4:290,91:.: 0.25:1.000:. ./.:4:271,61:.:-0.44:1.000:. ./.:4:327,112:.: 1.07:1.000:. ./.:4:368,128:.: 1.87:0.997:. ./.:4:245,195:.: 1.08:1.000:. ./.:4:152,145:.:-0.93:1.000:. ./.:4:296,97:.: 0.42:1.000:. -chr4.1 71291016 chr4.1_071291016 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:132,38:0.22: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,63:0.41: 0.88:1.000:0.869 0/0/1/1:4:49,34:0.39:-0.57:1.000:0.644 0/0/0/0:4:129,1:0.01: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,34:0.20: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,33:0.29: 0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,35:0.44:-0.76:1.000:0.962 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.49:-2.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,3:0.11:-1.93:1.000:0.547 0/0/1/1:4:31,23:0.40:-1.26:1.000:0.795 0/0/0/1:4:79,26:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,39:0.28: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,26:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,36:0.41:-0.60:0.999:0.877 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,54:0.27: 2.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,34:0.19: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,14:0.35:-1.65:1.000:0.801 0/0/0/1:4:91,51:0.34: 0.83:1.000:0.864 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,51:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,5:0.30:-2.17:1.000:0.986 0/0/0/1:4:87,35:0.28: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,20:0.21:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,26:0.32:-0.69:1.000:0.959 0/0/0/1:4:65,31:0.31:-0.26:1.000:0.976 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,30:0.39:-0.84:1.000:0.715 0/0/0/1:4:82,23:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.24:-2.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.16:-1.55:1.000:0.996 0/0/0:3:13,1:0.07:-2.22:0.999:1.000 0/0/0/1:4:92,36:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,57:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,57:0.80:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,36:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,20:0.19:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,24:0.36:-1.05:1.000:0.686 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,22:0.21:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,52:0.55:-0.60:1.000:0.974 0/0/1/1:4:116,80:0.38: 2.12:1.000:0.627 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-2.41:1.000:0.959 0/0/0/0:4:108,13:0.10: 0.33:1.000:0.693 0/0/0/1:4:33,15:0.30:-1.41:1.000:0.986 0/0/0/1:4:41,20:0.31:-1.10:1.000:0.969 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,33:0.44:-0.88:1.000:0.969 0/0/1/1:4:43,54:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,55:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,42:0.33: 0.36:1.000:0.931 0/0/1/1:4:83,61:0.40: 0.88:1.000:0.777 0/0/0/0/0/1:6:86,23:0.20: 0.05:1.000:0.904 0/0/0/1:4:90,19:0.17: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,25:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,33:0.35:-0.43:1.000:0.782 0/0/0/1:4:168,41:0.19: 2.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,57:0.41: 0.59:1.000:0.836 0/0/0/1:4:83,28:0.24: 0.09:0.998:1.000 0/0/0/1:4:105,19:0.15: 0.40:1.000:0.986 0/1/1/1:4:2,53:0.74:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,26:0.17: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,58:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,13:0.25:-1.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,37:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,40:0.28: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,77:0.42: 1.52:1.000:0.923 0/0/0/1:4:162,38:0.18: 2.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,26:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,29:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,48:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,41:0.24: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,20:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,22:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,34:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,31:0.21: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,21:0.38:-1.31:1.000:0.579 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,54:0.53:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,35:0.33:-0.17:1.000:0.910 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,45:0.26: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,30:0.18: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,16:0.20:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,32:0.38:-0.67:1.000:0.593 0/0/0/1:4:74,31:0.28:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:61,22:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,42:0.36: 0.09:1.000:0.712 0/0/0/1:4:116,31:0.20: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,40:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,42:0.39:-0.12:1.000:0.666 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.22:0.999:1.000 0/0/1/1:4:31,29:0.45:-1.12:1.000:0.981 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,23:0.16: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,56:0.80:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,44:0.36: 0.19:1.000:0.668 0/0/1/1:4:46,66:0.53: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,57:0.39: 0.74:1.000:0.679 0/0/0/1:4:53,28:0.33:-0.62:1.000:0.926 0/0/1/1:4:35,53:0.54:-0.45:1.000:0.989 0/0/1/1:4:65,70:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,38:0.43:-0.60:1.000:0.956 0/0/1/1:4:80,61:0.41: 0.81:1.000:0.841 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,41:0.52:-0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,17:0.19:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,20:0.22:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,34:0.37:-0.50:1.000:0.522 0/0/0/1:4:48,21:0.29:-0.91:0.997:0.991 0/0/0/1:4:40,21:0.33:-1.10:1.000:0.931 0/0/0/1:4:78,20:0.20:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,77:0.54: 0.50:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,71:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,45:0.75:-1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,50:0.32: 1.05:1.000:0.963 0/0/0/1:4:82,26:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,27:0.16: 1.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,34:0.19: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,59:0.30: 1.88:1.000:0.982 0/0/0/1:4:89,25:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,44:0.22: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,28:0.17: 1.21:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,10:0.25:-1.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,67:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,70:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:139,41:0.22: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,42:0.26: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,46:0.45:-0.26:0.998:0.978 0/0/0/1:4:171,38:0.18: 2.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,45:0.44:-0.29:1.000:0.972 0/0/0/1:4:68,44:0.37: 0.12:1.000:0.551 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,64:0.53: 0.02:1.000:0.992 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,31:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,32:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,35:0.20: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,37:0.47:-0.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:70,28:0.28:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,32:0.42:-0.86:1.000:0.924 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,38:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,37:0.34:-0.12:1.000:0.842 0/0/0/1:4:154,32:0.17: 1.88:1.000:0.997 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,13:0.19:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,45:0.27: 1.28:0.997:0.998 0/0/0/1:4:65,34:0.33:-0.19:1.000:0.933 0/0/0/1:4:95,22:0.18: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,39:0.29: 0.57:1.000:0.994 -chr4.1 71572433 chr4.1_071572433 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:191,63:.: 1.38:1.000:. ./.:4:114,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:173,60:.: 1.02:1.000:. ./.:4:117,32:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,35:.:-0.55:1.000:. ./.:4:165,111:.: 1.75:1.000:. ./.:4:83,51:.:-0.65:1.000:. ./.:4:117,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:182,49:.: 0.99:1.000:. ./.:4:35,2:.:-2.30:1.000:. ./.:4:5,18:.:-2.53:1.000:. ./.:4:92,64:.:-0.28:1.000:. ./.:4:150,26:.: 0.06:1.000:. ./.:4:130,98:.: 0.94:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:80,111:.: 0.31:1.000:. ./.:4:127,23:.:-0.38:0.999:. ./.:4:203,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:189,132:.: 2.51:1.000:. ./.:4:133,71:.: 0.53:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:101,101:.: 0.50:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:146,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:105,33:.:-0.59:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,26:.:-0.55:1.000:. ./.:4:141,75:.: 0.73:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:75,10:.:-1.48:1.000:. ./.:3:21,8:.:-2.43:0.999:. ./.:4:158,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:153,39:.: 0.33:1.000:. ./.:4:120,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:227,51:.: 1.78:1.000:. ./.:4:146,79:.: 0.89:1.000:. ./.:4:131,29:.:-0.21:1.000:. ./.:4:112,56:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,51:.:-0.06:1.000:. ./.:4:169,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:316,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:402,0:.: 3.88:1.000:. ./.:4:169,48:.: 0.75:1.000:. ./.:4:216,29:.: 1.22:1.000:. ./.:4:111,15:.:-0.79:1.000:. ./.:4:36,84:.:-0.89:1.000:. ./.:4:67,20:.:-1.45:1.000:. ./.:4:163,85:.: 1.28:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:57,69:.:-0.79:1.000:. ./.:4:90,16:.:-1.13:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.85:1.000:. ./.:6:81,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:99,63:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:169,75:.: 1.21:1.000:. ./.:4:95,27:.:-0.86:1.000:. ./.:4:74,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:174,35:.: 0.62:1.000:. ./.:4:86,25:.:-1.04:1.000:. ./.:4:159,57:.: 0.73:1.000:. ./.:4:186,20:.: 0.56:0.998:. ./.:4:224,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:133,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:56,34:.:-1.40:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,44:.:-0.89:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:121,63:.: 0.19:1.000:. ./.:4:86,79:.:-0.13:1.000:. ./.:4:189,46:.: 1.06:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,56:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,84:.: 0.67:1.000:. ./.:4:184,19:.: 0.51:1.000:. ./.:4:133,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:131,84:.: 0.72:1.000:. ./.:4:93,42:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,67:.:-1.53:1.000:. ./.:4:143,22:.:-0.13:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:98,67:.:-0.13:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:150,26:.: 0.06:1.000:. ./.:4:62,22:.:-1.50:1.000:. ./.:4:28,66:.:-1.33:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,50:.:-1.60:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:93,34:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,87:.:-0.82:1.000:. ./.:4:80,39:.:-0.91:1.000:. ./.:4:117,26:.:-0.50:1.000:. ./.:4:169,30:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,76:.:-0.72:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:296,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:125,89:.: 0.70:1.000:. ./.:4:23,73:.:-1.30:1.000:. ./.:4:125,64:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,117:.:-0.08:1.000:. ./.:4:50,68:.:-0.93:0.999:. ./.:4:113,15:.:-0.76:1.000:. ./.:4:64,47:.:-1.04:1.000:. ./.:4:172,23:.: 0.38:1.000:. ./.:4:96,16:.:-1.03:1.000:. ./.:4:132,35:.:-0.10:1.000:. ./.:4:130,64:.: 0.36:1.000:. ./.:4:147,28:.: 0.04:1.000:. ./.:4:106,29:.:-0.64:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:189,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:141,99:.: 1.14:1.000:. ./.:4:115,59:.: 0.02:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:89,18:.:-1.11:1.000:. ./.:4:140,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,37:.:-0.94:1.000:. ./.:4:122,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:71,40:.:-1.04:1.000:. ./.:4:101,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.37:0.997:. ./.:4:97,19:.:-0.96:1.000:. ./.:4:108,53:.:-0.20:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:141,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,15:.:-1.30:1.000:. ./.:4:76,22:.:-1.26:1.000:. ./.:4:83,23:.:-1.13:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:184,55:.: 1.12:1.000:. ./.:4:38,54:.:-1.37:1.000:. ./.:4:121,86:.: 0.58:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:30,79:.:-1.08:1.000:. ./.:4:180,55:.: 1.06:1.000:. ./.:4:135,49:.: 0.19:1.000:. ./.:4:175,45:.: 0.80:1.000:. ./.:4:109,93:.: 0.50:1.000:. ./.:4:65,6:.:-1.72:1.000:. ./.:4:131,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,30:.:-0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:150,98:.: 1.28:1.000:. ./.:4:195,27:.: 0.84:0.998:. ./.:4:269,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:40,94:.:-0.65:1.000:. ./.:4:151,92:.: 1.19:1.000:. ./.:4:128,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:86,101:.: 0.24:1.000:. ./.:4:182,36:.: 0.77:1.000:. ./.:4:171,62:.: 1.02:1.000:. ./.:4:150,62:.: 0.67:1.000:. ./.:4:122,78:.: 0.46:1.000:. ./.:4:83,60:.:-0.50:1.000:. ./.:4:131,39:.:-0.05:1.000:. ./.:4:122,23:.:-0.47:1.000:. ./.:4:33,70:.:-1.18:1.000:. ./.:4:133,86:.: 0.78:1.000:. ./.:4:215,49:.: 1.55:1.000:. ./.:4:275,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:96,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:85,71:.:-0.28:1.000:. ./.:4:135,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:258,29:.: 1.94:0.997:. ./.:4:155,40:.: 0.38:1.000:. ./.:4:126,74:.: 0.46:1.000:. ./.:4:161,26:.: 0.24:1.000:. -chr4.1 71603376 chr4.1_071603376 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,197:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,135:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,271:.: 2.37:1.000:. ./.:4:0,240:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,79:.:-2.40:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,104:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,219:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.58:0.999:. ./.:4:0,203:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,264:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1,102:.:-1.81:1.000:. ./.:4:1,150:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,66:.:-2.72:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,111:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.53:1.000:. ./.:3:0,32:.:-3.57:0.999:. ./.:4:0,168:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,280:.: 2.59:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,218:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,226:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,223:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,229:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,268:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,224:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.07:1.000:. ./.:6:0,157:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,250:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,271:.: 2.37:1.000:. ./.:4:1,107:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.44:0.998:. ./.:4:1,177:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,233:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,237:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,120:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,220:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,254:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1,136:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,129:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,225:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,131:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,228:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,223:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,235:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,258:.: 2.05:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,254:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,219:.: 1.08:0.999:. ./.:4:0,169:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,94:.:-2.03:1.000:. ./.:4:0,217:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,217:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.53:0.997:. ./.:4:0,196:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,234:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,218:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,106:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,94:.:-2.03:1.000:. ./.:4:1,182:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,100:.:-1.88:0.998:. ./.:4:0,168:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,121:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,112:.:-1.58:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,159:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,99:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,200:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.34:0.997:. ./.:4:1,211:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.03:1.000:. -chr4.1 72049662 chr4.1_072049662 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:135,286:0.70: 0.25:1.000:0.987 0/1/1/1:4:99,225:0.72:-0.89:1.000:0.994 0/1/1/1:4:103,313:0.77: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,206:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:396,117:0.27: 1.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:421,105:0.24: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,61:0.27:-1.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:228,190:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:225,191:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,92:0.58:-2.71:1.000:0.916 0/0/0/1:4:151,53:0.30:-2.29:1.000:0.984 0/0/1/1:4:187,138:0.46:-0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:199,178:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:224,211:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:121,260:0.71:-0.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:342,87:0.25: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:248,189:0.47: 0.44:0.999:0.992 0/1/1/1:4:123,299:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:296,217:0.46: 1.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:253,231:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,147:0.77:-2.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,291:0.79:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:373,119:0.28: 1.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:100,248:0.73:-0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,53:0.72:-3.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:116,307:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:239,168:0.45: 0.09:1.000:0.981 0/0/0/1:4:317,81:0.25:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,206:0.47: 0.94:1.000:0.991 0/0/1/1:4:255,176:0.45: 0.37:1.000:0.977 0/0/1/1:4:260,208:0.48: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:214,149:0.45:-0.43:1.000:0.979 0/0/1/1:4:49,37:0.47:-3.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,127:0.51:-1.55:1.000:0.996 1/1/1:3:2,67:0.97:-3.87:0.999:1.000 0/0/1/1:4:254,178:0.45: 0.38:1.000:0.980 0/1/1/1:4:126,292:0.72: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:240,194:0.48: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:216,197:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:266,192:0.46: 0.68:1.000:0.986 0/0/0/1:4:324,80:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:371,97:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:258,244:0.52: 1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:206,168:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:352,101:0.26: 0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:100,308:0.77: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:147,326:0.71: 0.86:1.000:0.992 0/1/1/1:4:91,291:0.78:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:324,68:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,272:0.73:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:312,72:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:375,120:0.28: 1.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:183,144:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:254,217:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,242:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:329,77:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,73:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:151,321:0.70: 0.85:1.000:0.987 0/1/1/1:4:150,276:0.67: 0.31:1.000:0.932 0/0/0/0/1/1:6:287,117:0.33: 0.05:1.000:0.921 0/0/0/1:4:389,112:0.27: 1.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:348,96:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:252,232:0.52: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:294,95:0.29:-0.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:369,97:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:114,351:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,80:0.30:-1.09:1.000:0.984 0/1/1/1:4:113,318:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,206:0.50: 0.50:0.998:0.997 1/1/1/1:4:0,295:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,227:0.51: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:260,73:0.26:-0.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,419:1.00: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,316:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,183:0.47: 0.33:1.000:0.991 0/1/1/1:4:96,269:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:347,106:0.28: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:223,181:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:133,293:0.71: 0.31:1.000:0.992 0/1/1/1:4:133,303:0.72: 0.43:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,285:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,195:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:254,217:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:170,168:0.53:-0.72:1.000:0.991 0/0/0/1:4:376,96:0.25: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,207:0.48: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:170,118:0.45:-1.31:1.000:0.978 0/0/0/1:4:301,84:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:339,67:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,264:0.71:-0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:199,172:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:196,188:0.53:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:254,198:0.48: 0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:147,122:0.49:-1.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:368,101:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,272:0.73:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,161:0.49:-0.51:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,331:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:379,114:0.27: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,177:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,133:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:327,111:0.29: 0.45:1.000:0.989 0/0/1/1:4:157,124:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:205,193:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:99,251:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:280,63:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,252:0.72:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:107,287:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:324,249:0.47: 2.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:323,101:0.28: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:216,182:0.49:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:506,154:0.27: 3.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:361,92:0.25: 0.62:0.999:1.000 0/0/0/1:4:380,100:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:223,66:0.27:-1.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:256,195:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:185,127:0.45:-1.03:1.000:0.975 0/1/1/1:4:102,276:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:229,177:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:94,238:0.74:-0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:209,177:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:136,307:0.71: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:229,227:0.53: 0.66:1.000:0.991 0/0/0/1:4:403,97:0.24: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,191:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:122,320:0.74: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:353,84:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,235:0.73:-0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:165,157:0.52:-0.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:97,229:0.72:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:240,188:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:202,173:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,188:0.73:-1.55:0.997:0.997 0/0/1/1:4:251,193:0.47: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:200,163:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:144,348:0.73: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:235,201:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:347,91:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:304,75:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,183:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:135,271:0.69: 0.07:1.000:0.975 0/1/1/1:4:95,224:0.72:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:247,184:0.47: 0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:251,78:0.28:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:433,108:0.24: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,362:0.73: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:236,173:0.46: 0.11:1.000:0.988 0/0/0/1:4:355,84:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,271:0.71:-0.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:90,211:0.72:-1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:309,206:0.44: 1.35:1.000:0.965 0/0/0/1:4:344,74:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,79:0.59:-3.02:1.000:0.878 0/0/1/1:4:146,143:0.53:-1.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:402,103:0.25: 1.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:120,296:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:285,230:0.48: 1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,203:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:198,139:0.45:-0.73:0.998:0.981 0/1/1/1:4:146,271:0.67: 0.20:1.000:0.938 0/1/1/1:4:105,265:0.74:-0.35:1.000:0.998 0/1/1/1:4:97,237:0.73:-0.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:276,71:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,191:0.54:-0.21:1.000:0.990 0/0/0/1:4:377,91:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:248,205:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,171:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:122,273:0.71:-0.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:219,155:0.45:-0.30:1.000:0.982 0/0/1/1:4:242,173:0.46: 0.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:178,164:0.52:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,127:0.46:-1.14:1.000:0.987 0/0/1/1:4:216,187:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:334,92:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:308,82:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,157:0.52:-0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:420,109:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,307:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:387,95:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:269,136:0.38: 0.06:1.000:0.512 0/0/1/1:4:270,157:0.41: 0.32:1.000:0.844 0/0/1/1:4:338,255:0.47: 2.27:0.997:0.992 0/0/0/1:4:461,103:0.23: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,84:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,310:0.76: 0.21:1.000:1.000 -chr4.1 72538178 chr4.1_072538178 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:533,200:.: 0.82:1.000:. ./.:4:456,161:.:-0.20:1.000:. ./.:4:434,181:.:-0.22:1.000:. ./.:4:524,196:.: 0.71:1.000:. ./.:4:400,326:.: 0.76:1.000:. ./.:4:628,228:.: 1.90:1.000:. ./.:4:304,110:.:-1.98:1.000:. ./.:4:351,260:.:-0.25:1.000:. ./.:4:456,173:.:-0.09:1.000:. ./.:4:204,123:.:-2.75:1.000:. ./.:4:221,98:.:-2.82:1.000:. ./.:4:442,170:.:-0.24:1.000:. ./.:4:486,175:.: 0.19:1.000:. ./.:4:428,181:.:-0.27:1.000:. ./.:4:334,301:.:-0.04:1.000:. ./.:4:400,333:.: 0.82:1.000:. ./.:4:371,296:.: 0.24:0.999:. ./.:4:367,281:.: 0.07:1.000:. ./.:4:614,214:.: 1.66:1.000:. ./.:4:447,321:.: 1.13:1.000:. ./.:4:283,71:.:-2.51:1.000:. ./.:4:427,174:.:-0.34:1.000:. ./.:4:479,192:.: 0.28:1.000:. ./.:4:369,271:.: 0.00:1.000:. ./.:4:134,92:.:-3.64:1.000:. ./.:4:364,269:.:-0.06:1.000:. ./.:4:382,312:.: 0.48:1.000:. ./.:4:390,261:.: 0.10:1.000:. ./.:4:457,356:.: 1.53:1.000:. ./.:4:352,273:.:-0.13:1.000:. ./.:4:363,286:.: 0.08:1.000:. ./.:4:405,171:.:-0.56:1.000:. ./.:4:155,96:.:-3.42:1.000:. ./.:4:262,92:.:-2.51:1.000:. ./.:3:174,23:.:-3.89:0.999:. ./.:4:426,321:.: 0.94:1.000:. ./.:4:366,274:.: 0.00:1.000:. ./.:4:392,245:.:-0.02:1.000:. ./.:4:344,324:.: 0.25:1.000:. ./.:4:528,211:.: 0.87:1.000:. ./.:4:473,164:.:-0.02:1.000:. ./.:4:330,276:.:-0.29:1.000:. ./.:4:403,297:.: 0.53:1.000:. ./.:4:435,162:.:-0.37:1.000:. ./.:4:497,362:.: 1.93:1.000:. ./.:4:519,196:.: 0.66:1.000:. ./.:4:492,224:.: 0.67:1.000:. ./.:4:530,184:.: 0.65:1.000:. ./.:4:408,160:.:-0.63:1.000:. ./.:4:571,180:.: 0.98:1.000:. ./.:4:380,287:.: 0.24:1.000:. ./.:4:445,361:.: 1.46:1.000:. ./.:4:309,274:.:-0.50:1.000:. ./.:4:504,183:.: 0.42:1.000:. ./.:4:311,278:.:-0.44:1.000:. ./.:4:370,266:.:-0.03:1.000:. ./.:4:350,278:.:-0.10:1.000:. ./.:4:535,183:.: 0.69:1.000:. ./.:4:458,160:.:-0.19:1.000:. ./.:6:399,192:.:-0.43:1.000:. ./.:4:535,214:.: 0.96:1.000:. ./.:4:403,172:.:-0.57:1.000:. ./.:4:577,229:.: 1.46:1.000:. ./.:4:366,295:.: 0.19:1.000:. ./.:4:397,303:.: 0.53:1.000:. ./.:4:597,179:.: 1.20:1.000:. ./.:4:307,221:.:-0.98:1.000:. ./.:4:472,190:.: 0.20:1.000:. ./.:4:476,216:.: 0.46:0.998:. ./.:4:403,174:.:-0.55:1.000:. ./.:4:440,346:.: 1.29:1.000:. ./.:4:357,116:.:-1.46:1.000:. ./.:4:479,203:.: 0.37:1.000:. ./.:4:372,290:.: 0.20:1.000:. ./.:4:517,182:.: 0.52:1.000:. ./.:4:399,180:.:-0.53:1.000:. ./.:4:476,192:.: 0.25:1.000:. ./.:4:508,230:.: 0.87:1.000:. ./.:4:473,220:.: 0.47:1.000:. ./.:4:511,195:.: 0.58:1.000:. ./.:4:455,168:.:-0.15:1.000:. ./.:4:507,208:.: 0.66:1.000:. ./.:4:562,236:.: 1.39:1.000:. ./.:4:451,170:.:-0.16:1.000:. ./.:4:398,286:.: 0.39:1.000:. ./.:4:576,206:.: 1.25:1.000:. ./.:4:370,151:.:-1.04:1.000:. ./.:4:307,251:.:-0.72:1.000:. ./.:4:374,242:.:-0.21:1.000:. ./.:4:306,254:.:-0.70:1.000:. ./.:4:406,144:.:-0.79:1.000:. ./.:4:300,279:.:-0.53:1.000:. ./.:4:505,225:.: 0.80:1.000:. ./.:4:286,240:.:-1.00:1.000:. ./.:4:367,298:.: 0.22:1.000:. ./.:4:348,289:.:-0.02:1.000:. ./.:4:333,260:.:-0.41:1.000:. ./.:4:426,182:.:-0.28:1.000:. ./.:4:470,300:.: 1.15:1.000:. ./.:4:384,317:.: 0.54:1.000:. ./.:4:467,170:.:-0.02:1.000:. ./.:4:385,348:.: 0.82:1.000:. ./.:4:401,135:.:-0.91:1.000:. ./.:4:365,389:.: 1.01:1.000:. ./.:4:416,203:.:-0.18:1.000:. ./.:4:452,180:.:-0.07:1.000:. ./.:4:412,159:.:-0.60:1.000:. ./.:4:513,190:.: 0.56:1.000:. ./.:4:608,220:.: 1.66:1.000:. ./.:4:297,262:.:-0.71:1.000:. ./.:4:462,179:.: 0.01:1.000:. ./.:4:487,400:.: 2.18:1.000:. ./.:4:391,291:.: 0.37:0.999:. ./.:4:366,325:.: 0.45:1.000:. ./.:4:444,133:.:-0.55:1.000:. ./.:4:552,209:.: 1.07:1.000:. ./.:4:296,245:.:-0.87:1.000:. ./.:4:382,161:.:-0.85:1.000:. ./.:4:449,182:.:-0.07:1.000:. ./.:4:397,155:.:-0.77:1.000:. ./.:4:389,263:.: 0.11:1.000:. ./.:4:325,303:.:-0.10:1.000:. ./.:4:543,221:.: 1.09:1.000:. ./.:4:490,166:.: 0.14:1.000:. ./.:4:497,174:.: 0.28:1.000:. ./.:4:563,219:.: 1.25:1.000:. ./.:4:368,280:.: 0.07:1.000:. ./.:4:443,169:.:-0.24:1.000:. ./.:4:385,175:.:-0.70:1.000:. ./.:4:353,179:.:-0.95:1.000:. ./.:4:324,237:.:-0.69:1.000:. ./.:4:352,285:.:-0.02:1.000:. ./.:4:250,171:.:-1.92:0.997:. ./.:4:414,313:.: 0.77:1.000:. ./.:4:328,261:.:-0.44:1.000:. ./.:4:454,337:.: 1.33:1.000:. ./.:4:409,272:.: 0.36:1.000:. ./.:4:341,266:.:-0.29:1.000:. ./.:4:311,278:.:-0.44:1.000:. ./.:4:326,269:.:-0.39:1.000:. ./.:4:470,183:.: 0.12:1.000:. ./.:4:339,269:.:-0.28:1.000:. ./.:4:502,167:.: 0.26:1.000:. ./.:4:301,229:.:-0.96:1.000:. ./.:4:548,206:.: 1.01:1.000:. ./.:4:651,233:.: 2.15:1.000:. ./.:4:355,280:.:-0.04:1.000:. ./.:4:308,274:.:-0.51:1.000:. ./.:4:552,198:.: 0.97:1.000:. ./.:4:439,182:.:-0.16:1.000:. ./.:4:448,349:.: 1.38:1.000:. ./.:4:439,180:.:-0.18:1.000:. ./.:4:293,40:.:-2.70:1.000:. ./.:4:319,135:.:-1.63:1.000:. ./.:4:405,279:.: 0.39:1.000:. ./.:4:343,275:.:-0.19:1.000:. ./.:4:474,336:.: 1.50:1.000:. ./.:4:519,180:.: 0.52:1.000:. ./.:4:446,143:.:-0.44:0.998:. ./.:4:478,212:.: 0.44:1.000:. ./.:4:341,229:.:-0.61:1.000:. ./.:4:384,149:.:-0.94:1.000:. ./.:4:353,269:.:-0.15:1.000:. ./.:4:443,182:.:-0.13:1.000:. ./.:4:347,271:.:-0.19:1.000:. ./.:4:325,281:.:-0.29:1.000:. ./.:4:434,186:.:-0.17:1.000:. ./.:4:475,173:.: 0.07:1.000:. ./.:4:441,154:.:-0.39:1.000:. ./.:4:393,160:.:-0.76:1.000:. ./.:4:385,159:.:-0.84:1.000:. ./.:4:293,224:.:-1.08:1.000:. ./.:4:341,267:.:-0.28:1.000:. ./.:4:355,285:.: 0.00:1.000:. ./.:4:345,265:.:-0.26:1.000:. ./.:4:408,150:.:-0.72:1.000:. ./.:4:430,370:.: 1.41:1.000:. ./.:4:513,187:.: 0.53:1.000:. ./.:4:514,177:.: 0.45:1.000:. ./.:4:368,244:.:-0.24:1.000:. ./.:4:392,311:.: 0.56:1.000:. ./.:4:633,221:.: 1.89:0.997:. ./.:4:457,330:.: 1.30:1.000:. ./.:4:405,154:.:-0.71:1.000:. ./.:4:449,202:.: 0.10:1.000:. -chr4.1 72647051 chr4.1_072647051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:22,46:0.66: 1.31:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,22:0.62:-0.51:1.000:0.560 0/0/1/1:4:14,24:0.62:-0.34:1.000:0.525 0/0/0/1:4:50,13:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,3:0.07: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,16:0.37: 0.10:1.000:0.619 0/0/0/1:4:43,23:0.37: 1.20:1.000:0.611 0/1/1/1:4:2,5:0.70:-2.05:1.000:0.981 0/0/0/1:4:11,6:0.37:-1.50:1.000:0.557 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,17:0.57:-0.78:1.000:0.956 0/0/1/1:4:15,14:0.49:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,35:0.59: 0.81:1.000:0.867 0/0/0/1:4:50,22:0.33: 1.53:1.000:0.935 0/0/1/1:4:35,22:0.40: 0.70:0.999:0.802 0/1/1/1:4:13,45:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,17:0.43:-0.18:1.000:0.941 0/0/0/1:4:50,25:0.35: 1.69:1.000:0.772 0/0/1/1:4:4,6:0.60:-1.88:1.000:0.827 0/0/1/1:4:24,22:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,12:0.29: 0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,20:0.45: 0.10:1.000:0.977 0/0/0/1:4:7,2:0.25:-1.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,39:0.60: 1.14:1.000:0.827 0/0/0/1:4:56,23:0.31: 1.91:1.000:0.969 0/0/0/0:4:51,3:0.06: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,21:0.45: 0.21:1.000:0.979 0/0/1/1:4:50,39:0.45: 2.46:1.000:0.980 0/0/0/1:4:38,21:0.37: 0.81:1.000:0.520 0/0/0/1:4:20,10:0.35:-0.78:1.000:0.772 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-1.94:1.000:0.838 0/0/1/1:4:8,7:0.48:-1.61:1.000:0.994 0/0/0:3:5,0:0.00:-2.16:0.999:1.000 0/0/0/1:4:43,14:0.27: 0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,17:0.31: 0.87:1.000:0.979 0/0/0/1:4:26,11:0.32:-0.40:1.000:0.957 0/0/1/1:4:41,23:0.38: 1.09:1.000:0.523 0/0/1/1:4:36,29:0.46: 1.14:1.000:0.986 0/0/0/0:4:40,1:0.03:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,1:0.03:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,28:0.39: 1.64:1.000:0.737 0/0/1/1:4:21,23:0.53:-0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:59,12:0.19: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,24:0.46: 0.54:1.000:0.985 0/0/1/1:4:21,28:0.57: 0.26:1.000:0.946 0/1/1/1:4:20,40:0.65: 0.87:1.000:0.828 0/0/0/0:4:31,3:0.10:-0.56:1.000:0.832 0/0/1/1:4:11,14:0.56:-1.06:1.000:0.967 0/0/0/0:4:34,1:0.03:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,16:0.25: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,16:0.37: 0.10:1.000:0.619 0/0/1/1:4:14,8:0.38:-1.22:1.000:0.576 0/0/1/1:4:17,20:0.54:-0.40:1.000:0.986 0/0/0/1:4:45,11:0.22: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,18:0.28: 1.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,19:0.57:-0.62:1.000:0.935 0/0/1/1:4:14,14:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:26,5:0.18:-0.73:1.000:0.972 0/0/0/0:4:42,4:0.10: 0.10:1.000:0.858 0/0/0/1:4:32,17:0.36: 0.26:1.000:0.629 0/0/1/1:4:17,18:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:44,14:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/0:4:51,3:0.06: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,55:0.75: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:35,2:0.06:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,29:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,13:0.47:-0.89:0.998:0.994 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,12:0.33:-0.29:1.000:0.928 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,28:0.60: 0.10:1.000:0.762 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,27:0.69:-0.34:1.000:0.978 0/0/0/1:4:40,11:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,22:0.61:-0.45:1.000:0.742 0/0/1/1:4:24,25:0.52: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,39:0.60: 1.09:1.000:0.757 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,25:0.58:-0.07:1.000:0.918 0/0/1/1:4:20,18:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:18,6:0.27:-1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,13:0.22: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.44:-0.51:1.000:0.969 0/1/1/1:4:5,12:0.69:-1.50:1.000:0.972 0/0/0/1:4:32,11:0.28:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,9:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,31:0.52: 0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,11:0.55:-1.33:1.000:0.978 0/0/1/1:4:41,27:0.41: 1.31:1.000:0.874 0/0/1/1:4:26,19:0.44: 0.04:1.000:0.958 0/0/1/1:4:27,17:0.40:-0.01:1.000:0.805 0/0/0/1:4:34,13:0.30: 0.15:1.000:0.986 0/0/1/1:4:20,23:0.54:-0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:30,30:0.51: 0.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,12:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,15:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.41:-2.16:1.000:0.889 0/0/0/1:4:33,9:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,15:0.54:-0.89:1.000:0.988 0/0/1/1:4:29,18:0.40: 0.15:1.000:0.778 0/0/1/1:4:17,13:0.45:-0.78:1.000:0.975 0/0/0/1:4:20,3:0.15:-1.17:1.000:0.981 0/0/1/1:4:14,21:0.60:-0.51:1.000:0.827 0/0/1/1:4:23,38:0.62: 0.92:1.000:0.624 0/1/1/1:4:16,34:0.67: 0.32:1.000:0.903 0/0/0/1:4:33,17:0.36: 0.32:1.000:0.707 0/0/0/1:4:20,6:0.26:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,21:0.25: 2.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,13:0.25: 0.81:0.999:0.999 0/0/0/0:4:35,3:0.09:-0.34:1.000:0.958 0/0/0/1:4:43,19:0.33: 0.98:1.000:0.932 0/0/1/1:4:18,20:0.53:-0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:21,6:0.25:-0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,18:0.65:-0.95:1.000:0.828 0/0/0/1:4:15,8:0.37:-1.17:1.000:0.619 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-1.00:1.000:0.702 0/0/1/1:4:36,21:0.38: 0.70:1.000:0.632 0/0/1/1:4:12,18:0.60:-0.78:1.000:0.827 0/0/0/1:4:14,5:0.29:-1.39:1.000:0.993 0/0/0/1:4:44,15:0.28: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,9:0.35:-0.95:1.000:0.772 0/0/1/1:4:17,22:0.56:-0.29:1.000:0.960 0/0/0/1:4:49,18:0.29: 1.25:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.21:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,22:0.62:-0.51:1.000:0.560 0/0/0/1:4:44,14:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,24:0.40: 0.98:1.000:0.811 0/0/1/1:4:23,25:0.53: 0.21:0.997:0.994 0/0/1/1:4:23,19:0.46:-0.12:1.000:0.989 0/0/0/1:4:46,24:0.36: 1.42:1.000:0.676 0/0/1/1:4:35,23:0.41: 0.76:1.000:0.871 0/0/0/1:4:34,6:0.17:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,11:0.30:-0.23:1.000:0.987 0/0/0/1:4:39,14:0.29: 0.48:1.000:0.993 0/0/0/0:4:22,2:0.09:-1.11:1.000:0.916 0/0/1/1:4:20,17:0.47:-0.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:21,33:0.61: 0.54:1.000:0.742 0/0/1/1:4:26,17:0.41:-0.07:1.000:0.865 0/0/0/1:4:32,11:0.28:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:32,2:0.07:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,29:0.55: 0.48:1.000:0.981 0/0/0/1:4:50,20:0.31: 1.42:1.000:0.977 0/0/0/1:4:37,13:0.28: 0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,35:0.74: 0.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,45:0.66: 1.25:1.000:0.860 0/0/0/1:4:41,16:0.30: 0.70:1.000:0.982 0/0/0/1:4:34,18:0.36: 0.43:1.000:0.638 0/0/1/1:4:4,4:0.51:-1.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,3:0.24:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,15:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,21:0.45: 0.21:1.000:0.979 0/0/0/1:4:65,18:0.24: 2.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,13:0.39:-0.51:1.000:0.666 0/0/0/1:4:11,2:0.17:-1.72:0.998:0.998 0/1/1/1:4:14,41:0.72: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,21:0.52:-0.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,28:0.64:-0.07:1.000:0.695 0/0/0/1:4:69,20:0.25: 2.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,12:0.34:-0.40:1.000:0.843 0/0/0/1:4:51,16:0.26: 1.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,19:0.31: 1.14:1.000:0.967 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-1.06:1.000:0.994 1/1/1/1:4:2,24:0.91:-1.00:1.000:0.972 0/0/1/1:4:28,23:0.46: 0.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,24:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:11,4:0.29:-1.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:29,12:0.31:-0.18:1.000:0.966 0/0/0/1:4:24,10:0.32:-0.56:1.000:0.964 0/0/0/1:4:46,17:0.29: 1.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:50,13:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,11:0.38:-0.78:1.000:0.612 0/0/0/1:4:56,8:0.14: 1.09:1.000:0.966 0/0/1/1:4:15,21:0.58:-0.45:1.000:0.911 0/0/0/1:4:31,10:0.27:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:37,16:0.32: 0.48:1.000:0.946 0/0/0/1:4:31,7:0.21:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,25:0.52: 0.26:0.997:0.996 0/0/0/0:4:52,5:0.10: 0.70:1.000:0.843 0/0/0/0:4:31,1:0.03:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,38:0.97:-0.29:1.000:1.000 -chr4.1 73066904 chr4.1_073066904 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.47:0.999:. ./.:4:23,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:6:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.05:0.998:. ./.:4:8,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.65:0.999:. ./.:4:65,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.24:0.997:. ./.:4:33,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.03:0.998:. ./.:4:16,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:69,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.65:0.997:. ./.:4:64,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.04:1.000:. -chr4.1 73227247 chr4.1_073227247 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:142,1:.: 3.60:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:53,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:27,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.42:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.77:0.999:. ./.:4:75,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:6:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.48:0.998:. ./.:4:18,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:82,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.44:0.999:. ./.:4:61,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:125,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.91:0.997:. ./.:4:23,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:103,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:50,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.83:0.998:. ./.:4:57,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:113,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:129,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.40:0.997:. ./.:4:113,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.19:1.000:. -chr4.1 73343400 chr4.1_073343400 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:70,0:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:120,0:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.66:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:105,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:173,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.94:1.000:. ./.:3:25,0:.:-1.48:0.999:. ./.:4:86,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:129,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.21:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:147,0:.: 2.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:147,0:.: 2.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.13:0.999:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.56:0.997:. ./.:4:101,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:162,1:.: 2.73:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.93:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:117,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.02:0.997:. ./.:4:87,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr4.1 73883582 chr4.1_073883582 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:127,272:0.70: 0.52:1.000:0.985 0/1/1/1:4:78,226:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,239:0.73:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:235,191:0.47: 0.83:1.000:0.992 0/0/1/1:4:244,229:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:393,131:0.27: 1.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,60:0.29:-1.52:1.000:0.991 0/1/1/1:4:110,310:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,174:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,120:0.76:-2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,73:0.62:-2.73:1.000:0.540 0/0/1/1:4:193,173:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:212,201:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:222,213:0.51: 0.94:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,344:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:239,205:0.48: 1.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:146,356:0.73: 1.72:0.999:0.997 0/0/1/1:4:221,178:0.47: 0.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:224,225:0.52: 1.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:126,391:0.77: 1.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,128:0.82:-2.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,300:0.78: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:356,93:0.23: 1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,340:1.00:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-2.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,430:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:126,315:0.73: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:195,181:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:142,345:0.73: 1.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,305:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,308:0.74: 0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:173,176:0.52:-0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,89:0.83:-2.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,113:0.60:-1.86:1.000:0.802 0/1/1:3:24,67:0.75:-3.08:0.999:1.000 0/1/1/1:4:99,268:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:123,315:0.74: 0.97:1.000:0.998 0/1/1/1:4:114,326:0.76: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,267:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:250,222:0.49: 1.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,80:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,180:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:116,243:0.70: 0.05:1.000:0.980 0/0/1/1:4:164,138:0.48:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:171,173:0.52:-0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:97,253:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:135,366:0.75: 1.71:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-2.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,69:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,253:0.79:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,164:0.51:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:254,230:0.50: 1.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,227:0.78:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,172:0.47: 0.33:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,324:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,182:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,151:0.53:-0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:80,260:0.78:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,206:0.72:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:199,131:0.42:-0.29:1.000:0.507 0/0/0/1:4:308,86:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,59:0.21:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:222,203:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,184:0.55:-0.09:1.000:0.980 0/0/1/1:4:226,238:0.53: 1.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,322:0.80: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,150:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:101,266:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,171:0.49: 0.09:0.998:0.996 1/1/1/1:4:0,328:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:129,332:0.74: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,75:0.29:-0.80:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,435:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,174:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,214:0.71:-0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:255,88:0.28:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:187,193:0.53: 0.30:1.000:0.993 0/1/1/1:4:84,217:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,271:0.78:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,192:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,176:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:177,194:0.54: 0.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:171,169:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:208,230:0.54: 0.97:1.000:0.984 0/0/1/1:4:205,200:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,127:0.53:-1.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,145:0.57:-1.05:1.000:0.954 0/0/1/1:4:180,154:0.48:-0.24:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,293:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,166:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,234:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:183,209:0.55: 0.44:1.000:0.977 0/1/1/1:4:84,242:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,176:0.51: 0.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,391:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,175:0.77:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,244:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,183:0.55:-0.11:1.000:0.980 0/1/1/1:4:89,290:0.78: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,138:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,154:0.47:-0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:115,101:0.49:-1.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,215:0.77:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,202:0.73:-0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:249,85:0.28:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,212:0.71:-0.56:1.000:0.991 0/1/1/1:4:112,313:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:257,221:0.48: 1.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,157:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,176:0.55:-0.29:1.000:0.977 0/0/1/1:4:241,239:0.52: 1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:174,183:0.53: 0.03:0.999:0.991 0/0/1/1:4:164,183:0.55:-0.09:1.000:0.982 0/0/0/1:4:179,55:0.26:-1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,180:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,219:0.78:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,230:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,174:0.53:-0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:67,202:0.77:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,194:0.52: 0.41:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,321:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,180:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:325,87:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,182:0.56:-0.18:1.000:0.972 0/1/1/1:4:96,234:0.73:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,174:0.54:-0.22:1.000:0.989 0/1/1/1:4:57,161:0.76:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,122:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,171:0.73:-1.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,197:0.78:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,237:0.72:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,170:0.80:-1.61:0.997:1.000 0/1/1/1:4:107,293:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,241:0.76:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,461:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,300:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,244:0.77:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,144:0.52:-0.75:1.000:0.995 0/1/1/1:4:72,245:0.79:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,243:0.74:-0.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,291:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,95:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:143,126:0.49:-1.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:403,121:0.26: 1.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:149,356:0.72: 1.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:103,289:0.75: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,179:0.55:-0.19:1.000:0.980 0/1/1/1:4:128,297:0.72: 0.82:1.000:0.995 0/1/1/1:4:96,228:0.72:-0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:137,360:0.74: 1.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:353,100:0.25: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,100:0.61:-2.18:1.000:0.641 0/0/1/1:4:160,115:0.44:-0.93:1.000:0.966 0/0/1/1:4:242,202:0.48: 1.04:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,417:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:145,355:0.73: 1.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:232,209:0.49: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,149:0.49:-0.46:0.998:0.997 0/0/1/1:4:223,176:0.46: 0.52:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,324:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,228:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,163:0.44: 0.38:1.000:0.971 0/0/1/1:4:223,201:0.49: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:272,222:0.47: 1.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:210,167:0.46: 0.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:182,164:0.49:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,218:0.73:-0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:207,171:0.47: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:195,177:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,128:0.47:-0.78:1.000:0.990 0/1/1/1:4:83,203:0.73:-0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,238:0.73:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:183,186:0.52: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:193,177:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,155:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:272,252:0.50: 1.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:110,334:0.77: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,95:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,188:0.57:-0.16:1.000:0.944 0/1/1/1:4:128,324:0.73: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:275,234:0.48: 1.80:0.997:0.995 0/0/1/1:4:234,247:0.53: 1.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:236,64:0.24:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,306:0.76: 0.68:1.000:1.000 -chr4.1 74137411 chr4.1_074137411 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:17,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:3:5,0:.:-1.61:0.999:. ./.:4:5,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:49,1:.: 2.71:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.79:1.000:. ./.:6:18,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.50:0.998:. ./.:4:6,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.75:0.999:. ./.:4:22,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:0.997:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:0.998:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.27:0.997:. ./.:4:29,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. -chr4.1 74237012 chr4.1_074237012 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:78,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:88,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:83,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.25:1.000:. ./.:3:20,0:.:-1.43:0.999:. ./.:4:43,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:74,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:159,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.75:1.000:. ./.:6:59,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.72:0.998:. ./.:4:2,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:93,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:109,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:132,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:116,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.27:0.999:. ./.:4:80,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:0.997:. ./.:4:92,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.05:0.998:. ./.:4:55,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.22:0.997:. ./.:4:110,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:64,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.66:1.000:. -chr4.1 74601490 chr4.1_074601490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:366,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:270,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:534,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:517,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:164,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:417,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.72:0.999:. ./.:4:361,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:494,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:544,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:376,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:141,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:402,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:569,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:154,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:165,0:.:-2.27:1.000:. ./.:3:131,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:277,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:446,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:338,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:542,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:347,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:464,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:471,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.58:0.998:. ./.:4:224,1:.:-1.62:1.000:. ./.:4:479,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:280,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:473,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:177,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:484,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:335,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:441,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:570,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.49:0.999:. ./.:4:442,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:488,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.24:0.997:. ./.:4:411,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:567,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:444,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:558,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:626,1:.: 2.73:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:446,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:172,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:458,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.09:0.998:. ./.:4:377,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:277,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:503,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.73:0.997:. ./.:4:620,1:.: 2.67:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.23:1.000:. -chr4.1 74653903 chr4.1_074653903 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:154,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:264,1:.: 2.95:0.999:. ./.:4:71,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:247,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:239,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:23,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.40:1.000:. ./.:6:37,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.08:0.998:. ./.:4:52,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:222,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:217,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:107,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:223,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.34:0.997:. ./.:4:200,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:46,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:192,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:193,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.06:0.998:. ./.:4:64,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:166,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:217,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.52:0.997:. ./.:4:127,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.06:1.000:. -chr4.1 74846334 chr4.1_074846334 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:247,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.61:0.999:. ./.:4:209,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.46:1.000:. ./.:3:27,0:.:-3.55:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:312,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:225,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.31:1.000:. ./.:6:195,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.23:0.998:. ./.:4:172,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.58:0.999:. ./.:4:229,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.07:0.997:. ./.:4:218,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.70:0.998:. ./.:4:186,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.97:0.997:. ./.:4:215,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.75:1.000:. -chr4.1 75471586 chr4.1_075471586 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:250,61:.: 0.51:1.000:. ./.:4:191,44:.:-0.87:1.000:. ./.:4:284,52:.: 0.96:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:191,54:.:-0.69:1.000:. ./.:4:227,50:.:-0.11:1.000:. ./.:4:149,37:.:-1.76:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:206,64:.:-0.24:1.000:. ./.:4:228,55:.: 0.00:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:248,76:.: 0.75:1.000:. ./.:4:333,71:.: 2.20:1.000:. ./.:4:430,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:145,40:.:-1.78:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:101,10:.:-3.13:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:228,61:.: 0.11:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:135,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:169,23:.:-1.66:1.000:. ./.:3:116,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:236,48:.: 0.02:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:215,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:231,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:196,34:.:-0.96:1.000:. ./.:4:239,59:.: 0.27:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:246,63:.: 0.47:1.000:. ./.:4:112,22:.:-2.71:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:192,29:.:-1.13:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:218,49:.:-0.29:1.000:. ./.:4:197,41:.:-0.82:1.000:. ./.:4:278,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.53:1.000:. ./.:6:254,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:287,52:.: 1.02:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:304,42:.: 1.15:1.000:. ./.:4:190,30:.:-1.15:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:207,47:.:-0.53:0.998:. ./.:4:130,104:.:-0.89:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:143,81:.:-1.07:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:198,44:.:-0.75:1.000:. ./.:4:246,55:.: 0.33:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:237,76:.: 0.55:1.000:. ./.:4:211,39:.:-0.60:1.000:. ./.:4:119,64:.:-1.82:1.000:. ./.:4:252,38:.: 0.13:1.000:. ./.:4:304,65:.: 1.56:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:204,42:.:-0.67:1.000:. ./.:4:284,66:.: 1.22:1.000:. ./.:4:215,38:.:-0.55:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:191,47:.:-0.82:1.000:. ./.:4:213,54:.:-0.29:1.000:. ./.:4:243,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:165,42:.:-1.38:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:214,42:.:-0.49:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:256,49:.: 0.40:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:229,60:.: 0.11:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:195,49:.:-0.71:1.000:. ./.:4:246,62:.: 0.45:1.000:. ./.:4:299,70:.: 1.56:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:409,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:253,51:.: 0.38:0.999:. ./.:4:324,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:219,44:.:-0.36:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:196,53:.:-0.62:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:264,74:.: 1.00:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:215,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:172,34:.:-1.40:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.87:0.997:. ./.:4:245,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:200,43:.:-0.73:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:204,43:.:-0.66:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:193,55:.:-0.64:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:267,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:360,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:271,60:.: 0.87:1.000:. ./.:4:238,42:.:-0.05:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:162,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:266,59:.: 0.76:1.000:. ./.:4:258,72:.: 0.85:1.000:. ./.:4:311,77:.: 1.91:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.60:0.998:. ./.:4:290,72:.: 1.44:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:173,49:.:-1.11:1.000:. ./.:4:227,53:.:-0.05:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:279,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:233,58:.: 0.15:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:184,54:.:-0.82:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:275,61:.: 0.96:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:254,63:.: 0.62:0.997:. ./.:4:439,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:219,56:.:-0.15:1.000:. -chr4.1 75752712 chr4.1_075752712 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,4:.:-1.67:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.44:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.23:0.999:. ./.:4:37,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:37,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:90,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:97,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:123,2:.: 1.83:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.50:1.000:. ./.:4:13,1:.:-1.39:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:94,3:.: 1.02:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:133,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.73:1.000:. ./.:4:44,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:103,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.70:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:47,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:94,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:114,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:75,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:122,1:.: 1.77:1.000:. ./.:6:88,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:152,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:80,3:.: 0.61:1.000:. ./.:4:84,3:.: 0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:90,5:.: 0.96:0.998:. ./.:4:44,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:88,2:.: 0.82:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:120,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.60:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.73:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.73:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:44,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:41,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:39,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:40,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:66,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.31:0.999:. ./.:4:168,4:.: 3.19:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:80,3:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:40,3:.:-0.55:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,5:.: 0.87:1.000:. ./.:4:28,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:136,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.21:0.991:. ./.:4:51,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:78,3:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:138,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:92,4:.: 0.99:1.000:. ./.:4:39,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.67:1.000:. ./.:4:102,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:74,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:64,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:90,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:114,2:.: 1.57:0.998:. ./.:4:48,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:90,2:.: 0.87:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:94,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:84,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:72,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,4:.:-1.07:1.000:. ./.:4:71,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:76,3:.: 0.50:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.47:0.997:. ./.:4:122,2:.: 1.80:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:91,2:.: 0.90:1.000:. -chr4.1 76089724 chr4.1_076089724 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:140,43:.: 1.15:1.000:. ./.:4:28,72:.:-0.83:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:93,51:.: 0.22:1.000:. ./.:4:89,68:.: 0.53:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,58:.: 0.84:1.000:. ./.:4:29,1:.:-2.49:1.000:. ./.:4:43,18:.:-1.75:1.000:. ./.:4:45,31:.:-1.40:1.000:. ./.:4:92,34:.:-0.21:1.000:. ./.:4:79,69:.: 0.31:1.000:. ./.:4:123,41:.: 0.70:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:113,62:.: 0.96:0.999:. ./.:4:96,57:.: 0.43:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:160,80:.: 2.50:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:128,44:.: 0.89:1.000:. ./.:4:102,45:.: 0.29:1.000:. ./.:4:139,56:.: 1.43:1.000:. ./.:4:29,17:.:-2.11:1.000:. ./.:4:178,58:.: 2.41:1.000:. ./.:4:135,61:.: 1.46:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:106,53:.: 0.58:1.000:. ./.:4:144,77:.: 2.05:1.000:. ./.:4:102,68:.: 0.84:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,3:.:-2.28:1.000:. ./.:4:72,2:.:-1.45:1.000:. ./.:3:29,8:.:-2.33:1.000:. ./.:4:139,59:.: 1.50:1.000:. ./.:4:149,53:.: 1.60:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:98,49:.: 0.29:1.000:. ./.:4:154,57:.: 1.81:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:128,50:.: 1.03:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:120,44:.: 0.70:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:151,90:.: 2.53:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:194,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:107,52:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,48:.:-0.11:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:145,56:.: 1.58:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.73:1.000:. ./.:6:100,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:106,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:70,37:.:-0.66:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:108,81:.: 1.29:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:94,53:.: 0.29:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.14:0.998:. ./.:4:113,33:.: 0.27:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,51:.: 0.24:1.000:. ./.:4:150,57:.: 1.72:1.000:. ./.:4:29,61:.:-1.06:1.000:. ./.:4:135,47:.: 1.12:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,36:.:-0.68:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:105,60:.: 0.72:1.000:. ./.:4:59,54:.:-0.52:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:59,36:.:-0.95:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:122,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:101,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:75,51:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,25:.:-1.18:1.000:. ./.:4:62,54:.:-0.45:1.000:. ./.:4:121,47:.: 0.79:1.000:. ./.:4:80,32:.:-0.54:1.000:. ./.:4:36,78:.:-0.49:1.000:. ./.:4:83,57:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,43:.: 1.05:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:78,36:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,16:.:-1.78:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:83,34:.:-0.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:116,53:.: 0.81:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:99,44:.: 0.20:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:122,64:.: 1.22:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.09:0.999:. ./.:4:113,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:46,30:.:-1.40:1.000:. ./.:4:79,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:98,36:.:-0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:82,36:.:-0.40:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:72,45:.:-0.42:1.000:. ./.:4:63,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:60,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:75,31:.:-0.68:1.000:. ./.:4:85,48:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:54,22:.:-1.40:0.991:. ./.:4:65,45:.:-0.59:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:150,78:.: 2.22:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:55,27:.:-1.25:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:109,48:.: 0.53:1.000:. ./.:4:102,42:.: 0.22:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:62,28:.:-1.06:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:179,63:.: 2.55:1.000:. ./.:4:118,46:.: 0.70:1.000:. ./.:4:78,37:.:-0.47:1.000:. ./.:4:178,63:.: 2.53:1.000:. ./.:4:122,33:.: 0.48:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:87,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:39,20:.:-1.80:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:109,54:.: 0.67:1.000:. ./.:4:200,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:0.998:. ./.:4:125,65:.: 1.31:1.000:. ./.:4:124,47:.: 0.86:1.000:. ./.:4:115,47:.: 0.65:1.000:. ./.:4:73,46:.:-0.37:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,89:.:-0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:118,56:.: 0.93:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:110,43:.: 0.43:1.000:. ./.:4:81,47:.:-0.16:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:72,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:102,58:.: 0.60:1.000:. ./.:4:131,54:.: 1.19:1.000:. ./.:4:125,63:.: 1.27:1.000:. ./.:4:87,12:.:-0.85:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:82,53:.: 0.01:1.000:. -chr4.1 76256138 chr4.1_076256138 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:17,7:.: 0.84:1.000:. ./.:4:12,7:.: 0.16:1.000:. ./.:4:12,5:.:-0.12:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:20,6:.: 1.11:1.000:. ./.:4:20,7:.: 1.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:14,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:28,7:.: 2.34:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.70:0.999:. ./.:4:9,6:.:-0.39:1.000:. ./.:4:22,8:.: 1.66:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:20,4:.: 0.84:1.000:. ./.:4:35,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-2.17:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:22,3:.: 0.98:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:16,5:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:14,9:.: 0.70:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.21:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:5,3:.:-1.35:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.29:1.000:. ./.:6:7,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:6,3:.:-1.21:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,5:.: 0.29:0.998:. ./.:4:3,3:.:-1.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:8,9:.:-0.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,5:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.62:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.94:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:17,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.66:1.000:. ./.:4:23,6:.: 1.52:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:16,4:.: 0.29:0.999:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:9,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:24,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:40,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.62:0.991:. ./.:4:12,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.80:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:16,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:20,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:40,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:13,14:.: 1.25:1.000:. ./.:4:25,3:.: 1.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:0.998:. ./.:4:15,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:13,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,5:.: 0.02:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:23,6:.: 1.52:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:27,6:.: 2.07:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:10,8:.: 0.02:1.000:. -chr4.1 76415218 chr4.1_076415218 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:63,83:0.56:-0.26:1.000:0.973 0/0/0/1:4:97,40:0.29:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:89,80:0.47: 0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:95,32:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,40:0.22: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-2.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,97:0.71:-0.67:1.000:0.991 0/0/0/1:4:91,18:0.17:-1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,48:0.61:-2.05:1.000:0.689 0/0/0/1:4:73,26:0.26:-1.46:1.000:0.998 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,25:0.21:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,35:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,80:0.69:-1.16:1.000:0.968 0/0/1/1:4:45,61:0.56:-1.28:1.000:0.963 0/0/1/1:4:70,89:0.55: 0.08:0.999:0.981 0/0/0/1:4:95,44:0.32:-0.44:1.000:0.962 0/0/1/1:4:90,78:0.46: 0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:120,31:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,39:0.41:-1.59:1.000:0.884 0/0/0/1:4:130,38:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,51:0.44:-1.05:1.000:0.970 0/0/1/1:4:42,49:0.53:-1.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:73,66:0.47:-0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:53,17:0.24:-2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,30:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,85:0.45: 0.77:1.000:0.984 0/0/1/1:4:50,57:0.53:-1.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,77:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,37:0.32:-1.00:1.000:0.962 0/0/0/1:4:31,13:0.30:-2.88:1.000:0.988 0/0/1/1:4:44,64:0.58:-1.23:1.000:0.926 0/0/1:3:26,12:0.32:-3.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,29:0.27:-1.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,35:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,88:0.53: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,96:0.44: 1.54:1.000:0.971 0/0/0/1:4:107,40:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,42:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,86:0.52: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,91:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,91:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,47:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,86:0.49: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,75:0.80:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,40:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,101:0.54: 0.69:1.000:0.986 0/0/0/1:4:132,50:0.28: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,48:0.23: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,40:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,58:0.28: 1.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,104:0.75:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,99:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,48:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:152,57:0.27: 1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:136,36:0.21: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:152,23:0.13: 0.49:1.000:0.992 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,98:0.48: 1.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:129,48:0.27: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,46:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,78:0.34: 1.82:1.000:0.847 0/0/1/1:4:66,49:0.42:-1.05:1.000:0.930 0/0/0/1:4:128,48:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,105:0.52: 1.08:0.998:0.994 0/0/1/1:4:64,62:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:180,45:0.20: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,97:0.48: 1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:85,98:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,94:0.53: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:67,84:0.55:-0.13:1.000:0.984 0/0/0/1:4:140,59:0.30: 1.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:95,81:0.46: 0.51:1.000:0.986 0/0/1/1:4:104,102:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,69:0.48:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:119,135:0.52: 2.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,122:0.50: 2.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,50:0.32: 0.02:1.000:0.957 0/0/1/1:4:89,106:0.53: 1.00:1.000:0.990 0/0/1/1:4:115,96:0.45: 1.41:1.000:0.983 0/0/1/1:4:55,71:0.55:-0.77:1.000:0.978 0/0/0/1:4:111,60:0.35: 0.38:1.000:0.788 0/0/1/1:4:78,94:0.54: 0.41:1.000:0.989 0/1/1/1:4:35,129:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,90:0.53: 0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,91:0.53: 0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:172,57:0.25: 1.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,61:0.49:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,52:0.27: 1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:85,94:0.52: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,101:0.54: 0.74:1.000:0.989 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,48:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,39:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,89:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,36:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,28:0.19:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,110:0.51: 1.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,40:0.29:-0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,57:0.29: 1.00:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,91:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,67:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,81:0.46: 0.49:1.000:0.988 0/0/0/1:4:139,43:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,45:0.27: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:121,37:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,94:0.47: 1.10:0.999:0.992 0/0/0/1:4:171,48:0.22: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,60:0.24: 2.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,75:0.43: 0.43:1.000:0.951 0/0/0/1:4:130,51:0.28: 0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:121,38:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,71:0.47:-0.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:132,52:0.28: 0.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,102:0.72:-0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:158,42:0.21: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,28:0.30:-1.57:1.000:0.989 0/0/0/1:4:119,31:0.21:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,85:0.47: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:130,57:0.31: 0.79:1.000:0.980 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,24:0.17:-0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,75:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,51:0.28: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,57:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,50:0.49:-1.41:0.991:0.996 0/0/1/1:4:113,96:0.46: 1.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:74,71:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,83:0.45: 0.67:1.000:0.983 0/0/1/1:4:104,105:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,127:0.68: 0.56:1.000:0.954 0/0/0/1:4:133,52:0.28: 0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,76:0.47: 0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:165,58:0.26: 1.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,131:0.71: 0.51:1.000:0.990 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,42:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,30:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,42:0.28:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,94:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,101:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,63:0.54:-1.08:1.000:0.986 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,12:0.18:-2.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,21:0.24:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,48:0.23: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,139:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,85:0.53: 0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:71,54:0.43:-0.80:1.000:0.947 0/0/0/1:4:103,26:0.20:-0.69:0.998:1.000 0/0/0/1:4:101,36:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,63:0.54:-1.08:1.000:0.986 0/0/0/1:4:88,39:0.31:-0.75:1.000:0.977 0/0/0/1:4:92,35:0.28:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,33:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,72:0.49:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,31:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,51:0.45:-1.13:1.000:0.983 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,29:0.31:-1.62:1.000:0.970 0/0/0/1:4:86,32:0.27:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,25:0.28:-1.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:109,30:0.22:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,70:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,70:0.53:-0.67:1.000:0.992 0/0/0/1:4:113,37:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,30:0.27:-1.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:111,31:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,72:0.46:-0.03:1.000:0.989 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,28:0.25:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,57:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,83:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:106,34:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,45:0.30:-0.10:1.000:0.988 -chr4.1 76670480 chr4.1_076670480 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:144,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:88,22:.: 1.01:1.000:. ./.:4:99,25:.: 1.49:1.000:. ./.:4:81,22:.: 0.77:1.000:. ./.:4:31,7:.:-1.47:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:71,11:.: 0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:96,18:.: 1.14:1.000:. ./.:4:111,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:76,26:.: 0.73:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:116,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.46:1.000:. ./.:4:75,19:.: 0.46:1.000:. ./.:4:113,27:.: 2.04:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.74:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:98,24:.: 1.42:1.000:. ./.:4:63,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:76,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.63:1.000:. ./.:4:2,3:.:-2.60:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:57,15:.:-0.30:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:72,9:.: 0.01:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:87,23:.: 1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:44,13:.:-0.81:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:57,7:.:-0.57:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,15:.:-0.13:1.000:. ./.:4:34,13:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,11:.:-0.64:1.000:. ./.:6:39,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:56,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,24:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:40,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:41,6:.:-1.16:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,10:.:-0.02:0.998:. ./.:4:97,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:44,18:.:-0.64:1.000:. ./.:4:21,5:.:-1.88:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.11:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:76,20:.: 0.53:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:64,24:.: 0.25:1.000:. ./.:4:41,9:.:-1.05:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:85,22:.: 0.90:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:47,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.47:1.000:. ./.:4:43,10:.:-0.95:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,7:.:-1.19:1.000:. ./.:4:81,19:.: 0.66:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:46,14:.:-0.71:1.000:. ./.:4:55,13:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:69,13:.: 0.05:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:96,26:.: 1.42:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:54,15:.:-0.40:1.000:. ./.:4:53,11:.:-0.57:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.68:0.991:. ./.:4:112,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.88:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:53,18:.:-0.33:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:60,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:52,9:.:-0.68:1.000:. ./.:4:64,15:.:-0.06:1.000:. ./.:4:93,31:.: 1.49:1.000:. ./.:4:79,17:.: 0.53:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:90,17:.: 0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:64,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:81,27:.: 0.94:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:61,13:.:-0.23:0.998:. ./.:4:115,19:.: 1.83:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:112,29:.: 2.07:1.000:. ./.:4:55,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,18:.: 0.97:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:79,18:.: 0.56:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,14:.: 0.42:1.000:. ./.:4:87,22:.: 0.97:1.000:. ./.:4:76,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:105,28:.: 1.80:1.000:. ./.:4:80,25:.: 0.84:1.000:. ./.:4:55,11:.:-0.50:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.94:1.000:. -chr4.1 76704580 chr4.1_076704580 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.24:-1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,6:0.27: 1.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:16,4:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,5:0.26: 1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-0.50:1.000:0.959 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,3:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-1.57:1.000:0.503 0/0/0/1:4:13,3:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:14,1:0.09:-0.10:0.999:0.899 0/0/1/1:4:8,6:0.44:-0.24:1.000:0.974 0/0/1/1:4:8,10:0.53: 0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,5:0.56:-1.04:1.000:0.963 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.24:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.16:-0.90:1.000:0.994 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.27:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,1:0.12:-0.50:1.000:0.718 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,2:0.10: 1.77:1.000:0.848 0/0/0/1:4:14,3:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,3:0.27:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:13,3:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,1:0.20:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.66:-0.64:1.000:0.863 1/1/1:3:0,3:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.27: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-0.90:1.000:0.993 0/0/0/1:4:16,7:0.35: 0.97:1.000:0.803 0/0/0/0:4:15,1:0.09: 0.03:1.000:0.956 0/0/0/1:4:8,2:0.27:-0.77:1.000:0.998 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,3:0.16: 1.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-0.50:1.000:0.959 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-0.64:1.000:0.741 0/0/0/0:4:25,2:0.10: 1.50:1.000:0.673 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,6:0.37: 0.30:1.000:0.547 0/0/0/1:4:3,1:0.31:-1.57:1.000:0.978 0/0/0/1:4:11,4:0.32:-0.10:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,3:0.14: 1.90:1.000:0.972 0/0/0/1:4:29,3:0.13: 2.17:1.000:0.932 0/0/0/1:4:18,2:0.14: 0.56:1.000:0.972 0/0/0/1:4:13,6:0.36: 0.43:1.000:0.715 0/0/1/1:4:7,6:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/0:4:17,1:0.08: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 2.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:12,6:0.37: 0.30:1.000:0.547 0/0/0/0/1/1:6:13,4:0.30: 0.16:1.000:0.853 0/0/1/1:4:16,9:0.39: 1.23:1.000:0.712 0/0/0/1:4:11,2:0.22:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.54: 0.16:1.000:0.985 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,4:0.28: 0.43:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,2:0.18: 0.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.50:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.32: 0.43:1.000:0.961 0/0/0/1:4:20,2:0.13: 0.83:1.000:0.898 0/0/1/1:4:12,8:0.42: 0.56:1.000:0.924 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-0.64:1.000:0.741 0/0/0/0:4:16,1:0.08: 0.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,6:0.52:-0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,7:0.45: 0.03:1.000:0.981 0/0/0/1:4:27,4:0.18: 2.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,5:0.41:-0.37:1.000:0.869 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,2:0.17: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,4:0.23: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,2:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,1:0.10:-0.24:1.000:0.774 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.31: 0.03:1.000:0.978 0/0/0/1:4:6,3:0.37:-0.90:1.000:0.547 0/0/0/1:4:13,5:0.33: 0.30:1.000:0.928 0/0/0/1:4:23,5:0.25: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,1:0.09: 0.03:1.000:0.956 0/0/0/1:4:7,1:0.18:-1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,3:0.16: 1.37:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,1:0.05: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,1:0.09:-0.10:1.000:0.899 0/0/0/1:4:16,5:0.30: 0.70:1.000:0.987 0/0/0/1:4:16,5:0.30: 0.70:1.000:0.987 0/0/0/0:4:17,1:0.08: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:20,4:0.24: 1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.19:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.30: 0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:5,3:0.40:-1.04:1.000:0.819 0/0/1/1:4:8,9:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:17,3:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,10:0.42: 1.23:1.000:0.924 0/0/0/1:4:21,3:0.18: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,8:0.36: 1.23:0.999:0.678 0/0/0/1:4:19,3:0.19: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.20:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,3:0.16: 1.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,3:0.18: 0.97:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.45: 0.03:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,4:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:13,3:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,5:0.37:-0.10:1.000:0.547 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 2.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.37:-0.50:1.000:0.547 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-0.90:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:12,2:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.22:-0.37:0.991:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.33:-1.17:1.000:0.901 0/0/0/1:4:4,2:0.37:-1.30:1.000:0.547 0/0/0/1:4:8,4:0.37:-0.50:1.000:0.547 0/0/1/1:4:12,7:0.40: 0.43:1.000:0.776 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.54: 0.43:1.000:0.988 0/0/0/1:4:16,3:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.46: 0.30:1.000:0.986 0/0/0/1:4:20,3:0.18: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-0.64:1.000:0.741 0/0/0/1:4:22,5:0.26: 1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,8:0.42: 0.56:1.000:0.924 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,2:0.19:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.31:-1.04:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,2:0.10: 1.77:1.000:0.848 0/0/0/0:4:25,2:0.10: 1.50:1.000:0.673 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,4:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,5:0.67:-1.30:1.000:0.906 0/0/0/1:4:14,2:0.18: 0.03:0.998:0.999 0/0/0/0:4:16,1:0.08: 0.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:17,1:0.08: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/0:4:12,1:0.11:-0.37:1.000:0.548 0/0/0/1:4:11,4:0.32:-0.10:1.000:0.954 0/0/0/1:4:8,1:0.16:-0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,5:0.39:-0.24:1.000:0.687 0/0/0/1:4:3,1:0.31:-1.57:1.000:0.978 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,1:0.08: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:8,2:0.27:-0.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-0.90:1.000:0.986 0/0/0/1:4:6,2:0.31:-1.04:1.000:0.978 0/0/0/1:4:14,3:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:19,1:0.07: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.35:-0.77:1.000:0.831 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 2.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.22:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.33:-0.24:1.000:0.901 0/0/0/1:4:18,5:0.28: 0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,8:0.38: 0.97:1.000:0.600 0/0/0/0:4:24,1:0.06: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.32: 0.97:1.000:0.964 0/0/0/1:4:9,3:0.31:-0.50:1.000:0.978 -chr4.1 76880326 chr4.1_076880326 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:267,77:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,56:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:249,70:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,152:0.47: 0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:233,188:0.45: 1.70:1.000:0.981 0/0/0/1:4:325,78:0.20: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,64:0.29:-0.95:1.000:0.993 0/1/1/1:4:78,234:0.74: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:314,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,104:0.71:-2.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:45,40:0.47:-2.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,113:0.49:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,148:0.46: 0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:173,163:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,179:0.53: 0.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:173,168:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,252:0.76: 0.41:0.999:1.000 0/0/0/0:4:355,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,182:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:221,80:0.28: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,30:0.25:-2.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,69:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:326,88:0.22: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,131:0.48:-0.28:1.000:0.994 0/0/0/0:4:55,6:0.10:-3.29:1.000:0.741 0/0/1/1:4:213,188:0.47: 1.42:1.000:0.993 0/0/0/1:4:267,68:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,156:0.49: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,315:0.76: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,77:0.28:-0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:68,213:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,131:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/0:4:50,3:0.06:-3.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,69:0.53:-2.33:1.000:0.991 0/0/0:3:24,1:0.04:-3.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,84:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:263,83:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,214:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,226:0.72: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/0:4:225,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,74:0.28:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:185,163:0.47: 0.69:1.000:0.993 0/0/0/1:4:291,82:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,136:0.44: 0.23:1.000:0.962 0/0/1/1:4:157,143:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:283,81:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,101:0.27: 1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,36:0.48:-3.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,155:0.55:-0.26:1.000:0.976 0/0/0/1:4:178,67:0.28:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,150:0.54:-0.28:1.000:0.987 0/0/1/1:4:181,201:0.53: 1.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:147,151:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,163:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,125:0.48:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:151,196:0.56: 0.67:1.000:0.960 0/0/1/1:4:152,133:0.47:-0.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:261,86:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,137:0.54:-0.62:1.000:0.988 0/0/0/0/0/1:6:200,51:0.21:-0.66:1.000:0.868 0/0/0/1:4:228,83:0.28: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:217,77:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,189:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,120:0.48:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,181:0.52: 0.74:1.000:0.995 0/0/0/1:4:305,84:0.23: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,75:0.43:-1.68:1.000:0.944 0/0/0/1:4:233,62:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,160:0.56:-0.17:0.998:0.969 0/0/0/0:4:296,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,180:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:235,76:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,87:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,220:0.54: 1.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:163,166:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:192,54:0.23:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,165:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,158:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:252,89:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:233,62:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:229,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,196:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,186:0.47: 1.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:126,144:0.53:-0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,146:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,199:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,128:0.52:-0.74:1.000:0.994 0/0/1/1:4:142,162:0.53: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:176,163:0.48: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,162:0.52: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,128:0.52:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:205,72:0.27:-0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:193,147:0.44: 0.57:1.000:0.963 0/1/1/1:4:58,168:0.73:-1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,143:0.48: 0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:162,152:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:209,79:0.28:-0.15:1.000:0.994 0/0/0/0:4:265,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,163:0.52: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:252,80:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,147:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,190:0.53: 0.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,91:0.48:-1.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:87,217:0.70: 0.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:181,68:0.28:-0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:83,198:0.70:-0.24:1.000:0.980 0/0/0/1:4:230,63:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,82:0.28: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,211:0.52: 1.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,158:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,173:0.54: 0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:194,161:0.46: 0.78:1.000:0.986 0/0/1/1:4:172,136:0.45: 0.13:0.999:0.976 0/0/1/1:4:162,166:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,58:0.30:-1.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:181,202:0.53: 1.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:82,193:0.69:-0.33:1.000:0.977 0/0/0/1:4:208,82:0.29:-0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:140,167:0.54: 0.12:1.000:0.985 0/0/0/1:4:226,79:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:177,157:0.47: 0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:162,152:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,158:0.47: 0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:208,75:0.27:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,142:0.47: 0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:301,92:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,150:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,56:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,111:0.53:-1.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:181,54:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,79:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,174:0.72:-0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,139:0.75:-1.63:0.991:1.000 0/1/1/1:4:99,250:0.71: 0.70:1.000:0.990 0/0/0/1:4:215,73:0.26:-0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,167:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:93,231:0.70: 0.35:1.000:0.988 0/1/1/1:4:77,201:0.71:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:146,110:0.43:-0.59:1.000:0.958 0/1/1/1:4:61,208:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,64:0.20: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,144:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,62:0.26:-0.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,50:0.24:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:330,96:0.23: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:364,112:0.25: 2.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,69:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,162:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:285,82:0.23: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,75:0.29:-0.38:1.000:0.994 0/1/1/1:4:77,224:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:238,55:0.20:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,64:0.74:-2.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,114:0.43:-0.38:1.000:0.935 0/0/1/1:4:191,175:0.48: 0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,173:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:306,92:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,128:0.42: 0.19:1.000:0.896 0/0/1/1:4:140,102:0.43:-0.78:0.998:0.938 0/0/0/0:4:349,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,134:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,126:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,114:0.42:-0.28:1.000:0.895 0/0/1/1:4:179,164:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,162:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:334,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,110:0.44:-0.63:1.000:0.967 0/0/0/1:4:184,65:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:218,88:0.30: 0.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:204,77:0.28:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:136,106:0.44:-0.78:1.000:0.971 0/0/0/1:4:204,60:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,236:0.72: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,145:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,120:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,87:0.52:-1.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:188,163:0.47: 0.73:1.000:0.992 0/0/0/1:4:234,70:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,79:0.22: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,124:0.44:-0.20:1.000:0.970 0/1/1/1:4:106,244:0.69: 0.71:1.000:0.971 0/0/1/1:4:191,198:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,198:0.47: 1.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:170,46:0.22:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,81:0.23: 1.03:1.000:1.000 -chr4.1 76940440 chr4.1_076940440 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:386,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:422,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:265,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:428,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:10,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.66:1.000:. ./.:6:209,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.85:0.998:. ./.:4:248,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:424,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.41:0.999:. ./.:4:252,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.91:0.991:. ./.:4:339,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.64:0.998:. ./.:4:354,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:242,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:427,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.34:1.000:. -chr4.1 77807591 chr4.1_077807591 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,83:.:-0.51:1.000:. ./.:4:129,59:.:-1.20:1.000:. ./.:4:247,109:.: 0.28:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:255,49:.:-0.18:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:326,77:.: 0.70:1.000:. ./.:4:159,74:.:-0.80:1.000:. ./.:4:137,53:.:-1.18:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:269,43:.:-0.11:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:247,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:250,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:167,157:.: 0.00:1.000:. ./.:4:406,133:.: 1.90:1.000:. ./.:4:216,79:.:-0.26:1.000:. ./.:4:211,81:.:-0.28:1.000:. ./.:4:246,70:.:-0.07:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:207,48:.:-0.61:1.000:. ./.:4:108,20:.:-1.73:1.000:. ./.:4:233,76:.:-0.13:1.000:. ./.:4:254,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:316,56:.: 0.42:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:229,67:.:-0.25:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:179,49:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,22:.:-2.00:1.000:. ./.:4:191,50:.:-0.73:1.000:. ./.:3:91,14:.:-1.93:1.000:. ./.:4:275,59:.: 0.09:1.000:. ./.:4:183,66:.:-0.66:1.000:. ./.:4:365,65:.: 0.93:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:191,73:.:-0.53:1.000:. ./.:4:258,61:.:-0.05:1.000:. ./.:4:388,65:.: 1.14:1.000:. ./.:4:222,112:.: 0.09:1.000:. ./.:4:274,79:.: 0.25:1.000:. ./.:4:448,94:.: 1.92:1.000:. ./.:4:221,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:444,179:.: 2.64:1.000:. ./.:4:273,95:.: 0.39:1.000:. ./.:4:229,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:170,96:.:-0.51:1.000:. ./.:4:333,87:.: 0.85:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:331,98:.: 0.93:1.000:. ./.:4:376,152:.: 1.80:1.000:. ./.:4:233,81:.:-0.09:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:322,100:.: 0.86:1.000:. ./.:4:321,74:.: 0.63:1.000:. ./.:6:245,102:.: 0.20:1.000:. ./.:4:273,80:.: 0.25:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:401,104:.: 1.60:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:277,71:.: 0.21:1.000:. ./.:4:171,79:.:-0.65:1.000:. ./.:4:272,67:.: 0.13:1.000:. ./.:4:198,52:.:-0.65:1.000:. ./.:4:375,81:.: 1.16:0.998:. ./.:4:235,204:.: 1.01:1.000:. ./.:4:392,94:.: 1.43:1.000:. ./.:4:206,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:287,212:.: 1.54:1.000:. ./.:4:320,74:.: 0.62:1.000:. ./.:4:259,80:.: 0.13:1.000:. ./.:4:227,43:.:-0.48:1.000:. ./.:4:284,93:.: 0.47:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:278,174:.: 1.13:1.000:. ./.:4:311,93:.: 0.70:1.000:. ./.:4:149,143:.:-0.28:1.000:. ./.:4:354,103:.: 1.17:1.000:. ./.:4:284,76:.: 0.32:1.000:. ./.:4:346,68:.: 0.79:1.000:. ./.:4:303,77:.: 0.49:1.000:. ./.:4:302,87:.: 0.57:1.000:. ./.:4:219,68:.:-0.33:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:332,85:.: 0.82:1.000:. ./.:4:239,76:.:-0.08:1.000:. ./.:4:214,52:.:-0.51:1.000:. ./.:4:276,100:.: 0.46:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:274,71:.: 0.18:1.000:. ./.:4:220,90:.:-0.12:1.000:. ./.:4:134,109:.:-0.72:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:332,74:.: 0.72:1.000:. ./.:4:268,74:.: 0.16:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:420,80:.: 1.55:1.000:. ./.:4:169,78:.:-0.68:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:327,143:.: 1.29:1.000:. ./.:4:274,82:.: 0.28:1.000:. ./.:4:403,121:.: 1.76:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:306,82:.: 0.56:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:317,88:.: 0.71:0.999:. ./.:4:345,72:.: 0.82:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:316,64:.: 0.49:1.000:. ./.:4:159,68:.:-0.86:1.000:. ./.:4:287,80:.: 0.38:1.000:. ./.:4:248,158:.: 0.72:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:399,182:.: 2.27:1.000:. ./.:4:376,73:.: 1.10:1.000:. ./.:4:295,73:.: 0.39:1.000:. ./.:4:299,71:.: 0.40:1.000:. ./.:4:403,156:.: 2.07:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:203,122:.: 0.01:1.000:. ./.:4:187,41:.:-0.85:1.000:. ./.:4:149,61:.:-1.01:1.000:. ./.:4:125,56:.:-1.26:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.23:0.991:. ./.:4:205,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:213,116:.: 0.04:1.000:. ./.:4:283,70:.: 0.25:1.000:. ./.:4:331,70:.: 0.68:1.000:. ./.:4:391,90:.: 1.38:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:329,55:.: 0.53:1.000:. ./.:4:294,86:.: 0.49:1.000:. ./.:4:292,92:.: 0.53:1.000:. ./.:4:220,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:392,115:.: 1.61:1.000:. ./.:4:384,87:.: 1.30:1.000:. ./.:4:327,72:.: 0.66:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:220,80:.:-0.21:1.000:. ./.:4:183,76:.:-0.57:1.000:. ./.:4:510,86:.: 2.40:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:266,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:380,135:.: 1.68:1.000:. ./.:4:482,169:.: 2.88:1.000:. ./.:4:379,77:.: 1.16:1.000:. ./.:4:331,58:.: 0.57:0.998:. ./.:4:213,81:.:-0.27:1.000:. ./.:4:271,67:.: 0.12:1.000:. ./.:4:277,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:279,60:.: 0.13:1.000:. ./.:4:192,34:.:-0.87:1.000:. ./.:4:226,175:.: 0.68:1.000:. ./.:4:227,64:.:-0.29:1.000:. ./.:4:194,50:.:-0.71:1.000:. ./.:4:261,64:.: 0.01:1.000:. ./.:4:261,59:.:-0.04:1.000:. ./.:4:232,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:120,40:.:-1.45:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:332,66:.: 0.65:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:212,51:.:-0.54:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:361,102:.: 1.22:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:207,53:.:-0.57:1.000:. ./.:4:387,60:.: 1.08:1.000:. ./.:4:400,73:.: 1.31:1.000:. ./.:4:525,84:.: 2.51:1.000:. ./.:4:229,57:.:-0.34:1.000:. ./.:4:331,156:.: 1.44:1.000:. -chr4.1 77932265 chr4.1_077932265 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,46:0.67: 0.98:1.000:0.913 0/0/0/1:4:63,30:0.33: 1.90:1.000:0.899 0/1/1/1:4:26,49:0.69: 1.11:1.000:0.966 0/0/1/1:4:22,18:0.45:-0.43:1.000:0.983 0/1/1/1:4:26,57:0.73: 1.46:1.000:0.997 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.88:-1.88:1.000:0.797 0/0/1/1:4:12,8:0.41:-1.31:1.000:0.844 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,46:0.81: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,28:0.48: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,32:0.43: 1.11:1.000:0.951 0/1/1/1:4:40,66:0.65: 2.47:0.999:0.778 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,20:0.52:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,32:0.59: 0.27:1.000:0.884 0/0/1/1:4:36,24:0.41: 0.45:1.000:0.844 0/0/0/1:4:2,1:0.34:-2.06:1.000:0.835 0/0/1/1:4:32,30:0.48: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,43:0.46: 1.94:1.000:0.988 0/0/0/1:4:31,15:0.34:-0.17:1.000:0.881 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,64:0.67: 2.21:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,68:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-1.53:1.000:0.992 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,41:0.56: 1.11:1.000:0.972 0/0/1/1:4:39,48:0.56: 1.63:1.000:0.963 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,30:0.54: 0.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:53,36:0.41: 1.72:1.000:0.870 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,19:0.25: 1.46:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,23:0.59:-0.43:1.000:0.859 0/1/1/1:4:12,23:0.69:-0.65:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,17:0.33: 0.18:1.000:0.930 0/0/1/1:4:30,31:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,40:0.79: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,22:0.39: 0.32:1.000:0.733 0/0/1/1:4:29,32:0.53: 0.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:55,26:0.33: 1.37:1.000:0.906 0/1/1/1:4:15,24:0.64:-0.48:1.000:0.685 0/1/1/1:4:23,41:0.67: 0.62:1.000:0.922 0/0/0/1/1/1:6:18,19:0.52:-0.56:1.000:0.874 0/0/1/1:4:20,16:0.45:-0.61:1.000:0.978 0/0/1/1:4:25,26:0.51: 0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,25:0.38: 0.76:1.000:0.594 0/0/1/1:4:20,26:0.58:-0.17:1.000:0.918 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,11:0.30:-0.52:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,50:0.70: 1.11:0.998:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:24,40:0.65: 0.62:1.000:0.804 0/0/1/1:4:14,11:0.44:-1.09:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,28:0.48: 0.40:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.52:-0.48:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,48:0.69: 1.02:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,32:0.54: 0.45:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,47:0.67: 1.02:1.000:0.936 0/0/0/1:4:55,21:0.29: 1.15:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.44:-0.78:1.000:0.970 0/0/0/1:4:45,20:0.32: 0.67:1.000:0.951 0/0/1/1:4:18,20:0.53:-0.52:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,44:0.78: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,43:0.72: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-1.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,20:0.48:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:16,16:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,27:0.67:-0.34:1.000:0.932 0/0/1/1:4:24,21:0.47:-0.21:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,31:0.62: 0.10:1.000:0.615 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,18:0.54:-0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:28,24:0.46: 0.10:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,29:0.51: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,48:0.58: 1.55:1.000:0.921 0/0/1/1:4:21,27:0.58:-0.08:0.999:0.930 0/0/0/1:4:46,15:0.26: 0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,22:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,27:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,48:0.84: 0.40:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,19:0.27: 1.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,17:0.44:-0.48:1.000:0.968 0/1/1/1:4:24,42:0.67: 0.71:1.000:0.898 0/0/1/1:4:28,37:0.58: 0.67:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.46:-0.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:33,18:0.36: 0.05:1.000:0.652 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,54:0.65: 1.63:1.000:0.755 0/0/1/1:4:20,20:0.50:-0.43:0.991:0.997 0/1/1/1:4:25,39:0.63: 0.62:1.000:0.595 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,34:0.46: 1.06:1.000:0.989 0/1/1/1:4:24,55:0.74: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,34:0.69: 0.10:1.000:0.967 0/0/1/1:4:22,17:0.44:-0.48:1.000:0.968 0/1/1/1:4:12,25:0.71:-0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,23:0.69:-0.65:1.000:0.974 0/0/1/1:4:18,22:0.56:-0.43:1.000:0.966 0/0/1/1:4:21,28:0.59:-0.04:1.000:0.884 0/0/1/1:4:10,15:0.62:-1.09:1.000:0.556 0/0/1/1:4:32,25:0.44: 0.32:1.000:0.971 0/0/1/1:4:38,38:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,28:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,65:0.75: 1.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,33:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,9:0.79:-1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,42:0.75: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,27:0.29: 2.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:21,18:0.46:-0.48:1.000:0.990 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,48:0.66: 1.15:1.000:0.864 0/1/1/1:4:24,43:0.67: 0.76:0.998:0.927 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,25:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,64:0.75: 1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,25:0.46: 0.23:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,21:0.32: 0.80:1.000:0.948 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,23:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,15:0.38:-0.43:1.000:0.616 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,48:0.62: 1.33:1.000:0.556 0/0/1/1:4:53,31:0.38: 1.50:1.000:0.544 0/0/1/1:4:28,21:0.43:-0.04:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,22:0.25: 1.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,27:0.64:-0.26:1.000:0.659 0/0/1/1:4:33,24:0.43: 0.32:1.000:0.937 0/0/1/1:4:23,23:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,62:0.74: 1.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,72:0.81: 1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,36:0.40: 1.81:1.000:0.814 0/0/1/1:4:28,23:0.45: 0.05:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.05:1.000:1.000 -chr4.1 78068790 chr4.1_078068790 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:141,25:.: 0.80:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:162,26:.: 1.24:1.000:. ./.:4:169,19:.: 1.24:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:153,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:137,27:.: 0.76:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:138,17:.: 0.58:1.000:. ./.:4:108,27:.: 0.19:1.000:. ./.:4:123,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:150,26:.: 1.00:0.999:. ./.:4:153,19:.: 0.92:1.000:. ./.:4:165,29:.: 1.36:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:18,1:.:-2.11:1.000:. ./.:4:212,23:.: 2.17:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:116,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,1:.:-2.09:1.000:. ./.:4:146,28:.: 0.96:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:128,21:.: 0.46:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:142,20:.: 0.72:1.000:. ./.:4:155,20:.: 0.98:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:19,3:.:-2.06:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,35:.: 2.07:1.000:. ./.:4:150,22:.: 0.92:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:116,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:166,25:.: 1.30:1.000:. ./.:4:190,25:.: 1.77:1.000:. ./.:4:54,7:.:-1.28:1.000:. ./.:4:147,23:.: 0.88:1.000:. ./.:4:137,15:.: 0.52:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:130,18:.: 0.44:1.000:. ./.:4:198,24:.: 1.91:1.000:. ./.:4:138,23:.: 0.70:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:156,22:.: 1.04:1.000:. ./.:4:163,14:.: 1.02:1.000:. ./.:6:120,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:120,19:.: 0.27:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:135,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:136,21:.: 0.62:1.000:. ./.:4:136,17:.: 0.54:0.998:. ./.:4:106,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:175,18:.: 1.34:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:181,18:.: 1.46:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:103,14:.:-0.17:1.000:. ./.:4:93,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:151,17:.: 0.84:1.000:. ./.:4:169,25:.: 1.36:1.000:. ./.:4:182,16:.: 1.44:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:117,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:138,25:.: 0.74:1.000:. ./.:4:166,26:.: 1.32:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:135,26:.: 0.70:1.000:. ./.:4:83,16:.:-0.53:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:100,24:.:-0.03:1.000:. ./.:4:65,8:.:-1.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:152,34:.: 1.20:1.000:. ./.:4:106,16:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:153,29:.: 1.12:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:59,6:.:-1.20:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:121,14:.: 0.19:1.000:. ./.:4:145,13:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:134,10:.: 0.36:1.000:. ./.:4:138,22:.: 0.68:1.000:. ./.:4:188,24:.: 1.71:1.000:. ./.:4:136,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:130,14:.: 0.36:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.94:0.999:. ./.:4:120,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:145,21:.: 0.80:1.000:. ./.:4:54,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:106,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:118,14:.: 0.13:1.000:. ./.:4:110,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:147,13:.: 0.68:1.000:. ./.:4:176,26:.: 1.51:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:133,9:.: 0.32:1.000:. ./.:4:175,16:.: 1.30:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:101,17:.:-0.15:1.000:. ./.:4:104,11:.:-0.21:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:137,18:.: 0.58:1.000:. ./.:4:71,8:.:-0.92:0.991:. ./.:4:138,16:.: 0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:198,37:.: 2.17:1.000:. ./.:4:151,16:.: 0.82:1.000:. ./.:4:105,14:.:-0.13:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:147,12:.: 0.66:1.000:. ./.:4:186,20:.: 1.59:1.000:. ./.:4:101,20:.:-0.09:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:193,22:.: 1.77:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:134,23:.: 0.62:1.000:. ./.:4:233,35:.: 2.82:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:93,13:.:-0.39:1.000:. ./.:4:131,13:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,16:.: 0.34:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:117,16:.: 0.15:1.000:. ./.:4:164,19:.: 1.14:0.998:. ./.:4:88,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:137,19:.: 0.60:1.000:. ./.:4:164,18:.: 1.12:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:169,26:.: 1.38:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:107,27:.: 0.17:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:159,16:.: 0.98:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:128,17:.: 0.38:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:159,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:149,23:.: 0.92:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,22:.: 0.84:1.000:. ./.:4:173,19:.: 1.32:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.27:1.000:. -chr4.1 78384695 chr4.1_078384695 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:45,72:0.56:-0.19:1.000:0.968 0/1/1/1:4:27,92:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,57:0.30: 1.65:1.000:0.989 0/0/0/1:4:101,36:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,34:0.19: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,19:0.34:-2.26:1.000:0.859 0/0/0/1:4:103,28:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,67:0.41: 0.67:1.000:0.847 0/0/0/1:4:31,11:0.25:-2.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,20:0.27:-1.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,23:0.18:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,32:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,41:0.30:-0.01:1.000:0.981 0/0/1/1:4:52,65:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:101,42:0.27: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,44:0.27: 0.79:0.999:0.997 0/0/1/1:4:73,70:0.43: 0.61:1.000:0.945 0/0/0/1:4:104,41:0.26: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,25:0.17: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,17:0.55:-2.93:1.000:0.983 0/0/0/1:4:84,30:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,32:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,25:0.24:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.64:-2.96:1.000:0.684 0/0/0/1:4:95,41:0.28: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,29:0.16: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,70:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,85:0.42: 1.62:1.000:0.929 0/0/0/1:4:103,32:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.18:-2.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,11:0.24:-2.44:1.000:1.000 0/0/1:3:19,5:0.20:-3.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,40:0.26: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,37:0.26: 0.24:1.000:0.998 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,45:0.28: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,76:0.44: 0.91:1.000:0.958 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,81:0.42: 1.38:1.000:0.927 0/0/0/1:4:103,45:0.28: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,39:0.29:-0.01:1.000:0.991 0/0/0/1:4:84,35:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,140:0.51: 3.62:1.000:0.997 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,53:0.32: 0.79:1.000:0.948 0/0/0/0:4:125,1:0.01: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,39:0.19: 2.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,33:0.29:-0.53:1.000:0.993 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,36:0.27:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,36:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,28:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,29:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:92,35:0.26: 0.11:1.000:0.563 0/0/0/1:4:89,39:0.28: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:116,31:0.20: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,43:0.28: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,47:0.27: 1.28:1.000:0.998 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,116:0.63: 1.59:1.000:0.611 0/0/0/1:4:38,20:0.31:-2.01:1.000:0.968 0/0/0/1:4:69,27:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,37:0.26: 0.36:0.998:0.999 0/1/1/1:4:47,94:0.64: 0.55:1.000:0.684 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,129:0.74: 1.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,40:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,43:0.26: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,58:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,18:0.19:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,31:0.27:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,44:0.30: 0.27:1.000:0.981 0/0/1/1:4:47,81:0.59: 0.15:1.000:0.884 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,37:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,32:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,33:0.21: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,36:0.26: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:61,28:0.29:-1.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:102,25:0.19: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,31:0.25:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,71:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,22:0.24:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,61:0.39: 0.42:1.000:0.733 0/0/0/1:4:90,46:0.31: 0.39:1.000:0.976 0/0/0/1:4:65,30:0.29:-0.87:1.000:0.992 0/0/0/1:4:89,30:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,38:0.29:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,75:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,76:0.56: 0.02:1.000:0.974 0/0/0/1:4:99,29:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,37:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,14:0.24:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,37:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,25:0.32:-1.61:1.000:0.956 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,32:0.30:-0.75:1.000:0.988 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,27:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,67:0.52:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:101,36:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,41:0.25: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,42:0.21: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,52:0.30: 1.10:0.999:0.986 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,28:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,45:0.29: 0.55:1.000:0.990 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,27:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,25:0.24:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,45:0.28: 0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,29:0.29:-0.93:1.000:0.993 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,33:0.20: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,46:0.30: 0.55:1.000:0.986 0/0/0/1:4:94,38:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,32:0.32:-1.02:1.000:0.948 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,47:0.54:-1.39:1.000:0.988 0/0/0/1:4:88,32:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,40:0.28: 0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,20:0.25:-1.46:0.991:0.999 0/0/0/1:4:83,36:0.28:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,24:0.17: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:100,44:0.28: 0.64:1.000:0.995 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,25:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,32:0.32:-0.96:1.000:0.963 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,36:0.32:-0.66:1.000:0.954 0/0/1/1:4:40,66:0.57:-0.53:1.000:0.945 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,24:0.23:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,33:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,35:0.21: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,30:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,75:0.43: 0.95:1.000:0.939 0/0/1/1:4:61,65:0.45: 0.08:1.000:0.980 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,49:0.29: 1.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:25,12:0.30:-2.66:1.000:0.988 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,35:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,37:0.31:-0.41:1.000:0.978 0/0/0/1:4:102,32:0.22: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,24:0.21:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.06:0.998:1.000 0/0/1/1:4:75,73:0.43: 0.76:1.000:0.952 0/0/0/1:4:59,22:0.25:-1.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,35:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,56:0.30: 1.53:1.000:0.988 0/0/0/1:4:101,26:0.19: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,22:0.20:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,67:0.43: 0.39:1.000:0.951 0/0/0/1:4:103,28:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,29:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,28:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,32:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,33:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,38:0.21: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,70:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:103,24:0.18: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:111,7:0.06:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,41:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,74:0.42: 0.98:1.000:0.913 -chr4.1 78500211 chr4.1_078500211 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,384:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,357:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,388:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,362:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,386:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,153:.:-2.21:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,70:.:-3.24:1.000:. ./.:4:1,79:.:-3.12:1.000:. ./.:4:0,329:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,355:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,391:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,325:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,340:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,367:.: 0.45:0.999:. ./.:4:0,338:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,489:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,357:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,88:.:-3.02:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,405:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,57:.:-3.40:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,310:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,438:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,307:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,347:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,313:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,22:.:-3.83:1.000:. ./.:4:0,111:.:-2.73:1.000:. ./.:3:0,35:.:-3.67:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,386:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,376:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,435:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,359:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,408:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,347:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,51:.:-3.48:1.000:. ./.:4:0,342:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,288:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,293:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,360:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,398:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,310:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,316:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,336:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,342:.: 0.13:1.000:. ./.:6:1,346:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,414:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,324:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1,428:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,531:.: 2.47:1.000:. ./.:4:2,258:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,376:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.22:0.998:. ./.:4:0,320:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,454:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,213:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,395:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,321:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,421:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,443:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,368:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,379:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,215:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,249:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,269:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1,356:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,347:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,380:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,348:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,216:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,344:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,312:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,352:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,293:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,383:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,421:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,356:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,454:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.61:0.999:. ./.:4:0,371:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,425:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,211:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,329:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,312:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,325:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,353:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,369:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,370:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,269:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,308:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,347:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.90:0.991:. ./.:4:0,319:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,431:.: 1.23:1.000:. ./.:4:1,314:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,325:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,344:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,358:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,407:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1,477:.: 1.82:1.000:. ./.:4:0,386:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,355:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,378:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,419:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,369:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,83:.:-3.07:1.000:. ./.:4:0,238:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,363:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,340:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,375:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,286:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,354:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,362:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,305:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,278:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,328:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,351:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,361:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,357:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,485:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.10:1.000:. -chr4.1 78673986 chr4.1_078673986 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:130,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:105,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:127,47:.: 1.18:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:24,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:102,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:105,40:.: 0.29:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:122,64:.: 1.55:1.000:. ./.:4:18,6:.:-3.42:1.000:. ./.:4:93,46:.: 0.11:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,36:.:-0.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.88:1.000:. ./.:4:93,39:.:-0.11:1.000:. ./.:4:81,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,41:.: 0.54:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:98,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,2:.:-3.66:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.93:1.000:. ./.:3:6,14:.:-3.54:1.000:. ./.:4:115,41:.: 0.63:1.000:. ./.:4:88,50:.: 0.08:1.000:. ./.:4:107,38:.: 0.29:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:101,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:84,27:.:-0.75:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:127,44:.: 1.09:1.000:. ./.:4:103,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:127,38:.: 0.90:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:94,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:95,23:.:-0.54:1.000:. ./.:4:90,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:134,39:.: 1.15:1.000:. ./.:4:82,38:.:-0.47:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:101,44:.: 0.29:1.000:. ./.:4:93,48:.: 0.17:1.000:. ./.:6:102,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:125,38:.: 0.84:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:92,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.14:0.998:. ./.:4:86,26:.:-0.72:1.000:. ./.:4:125,45:.: 1.06:1.000:. ./.:4:63,33:.:-1.21:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:105,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:114,38:.: 0.51:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:151,44:.: 1.82:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,41:.: 0.08:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:123,38:.: 0.78:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,72:.: 0.20:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,34:.:-0.11:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:124,42:.: 0.93:1.000:. ./.:4:99,40:.: 0.11:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:101,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:81,38:.:-0.51:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.52:0.999:. ./.:4:114,49:.: 0.84:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:100,32:.:-0.11:1.000:. ./.:4:117,25:.: 0.20:1.000:. ./.:4:123,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:86,37:.:-0.38:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,26:.:-0.60:1.000:. ./.:4:95,42:.: 0.05:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:123,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:110,39:.: 0.41:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:62,70:.:-0.11:1.000:. ./.:4:100,32:.:-0.11:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:108,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.03:0.991:. ./.:4:76,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:94,31:.:-0.32:1.000:. ./.:4:124,62:.: 1.55:1.000:. ./.:4:77,35:.:-0.72:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:114,43:.: 0.66:1.000:. ./.:4:124,40:.: 0.87:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:134,30:.: 0.87:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:121,38:.: 0.72:1.000:. ./.:4:125,40:.: 0.90:1.000:. ./.:4:112,39:.: 0.48:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:140,49:.: 1.64:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:96,38:.:-0.05:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:133,41:.: 1.18:1.000:. ./.:4:117,50:.: 0.97:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:93,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:96,30:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,23:.:-1.09:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:101,42:.: 0.23:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:80,42:.:-0.41:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:122,43:.: 0.90:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:88,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,37:.:-1.21:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:96,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,54:.: 0.90:1.000:. ./.:4:117,42:.: 0.72:1.000:. ./.:4:181,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:134,47:.: 1.39:1.000:. ./.:4:104,47:.: 0.48:1.000:. ./.:4:111,38:.: 0.41:1.000:. -chr4.1 78860331 chr4.1_078860331 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,237:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,122:0.69:-1.30:1.000:0.971 0/1/1/1:4:70,153:0.71:-0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:129,122:0.52: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,138:0.45: 1.82:1.000:0.978 0/0/0/1:4:179,56:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,76:0.56:-2.17:1.000:0.972 0/1/1/1:4:59,156:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,161:0.73:-0.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,109:0.84:-2.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,108:0.76:-2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,43:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,105:0.55:-0.93:1.000:0.978 0/1/1/1:4:79,162:0.70:-0.06:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,144:0.76:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,166:0.74:-0.27:0.999:0.999 0/1/1/1:4:77,177:0.72: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,233:0.79: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,181:0.73: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,99:0.55:-1.17:1.000:0.980 0/0/1/1:4:123,119:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,109:0.45: 0.27:1.000:0.982 0/1/1/1:4:71,156:0.71:-0.36:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,95:0.74:-2.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,162:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,98:0.55:-1.19:1.000:0.982 0/0/0/1:4:185,68:0.28: 0.21:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,273:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,140:0.73:-1.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,144:0.75:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,78:0.49:-1.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,36:0.27:-2.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,68:0.44:-1.74:1.000:0.968 0/0/1:3:65,44:0.43:-2.94:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,105:0.60:-1.28:1.000:0.827 0/1/1/1:4:67,176:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,111:0.49:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,181:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,146:0.76:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,68:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:204,64:0.25: 0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,293:1.00: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,141:0.70:-0.73:1.000:0.982 0/0/0/1:4:201,100:0.35: 1.25:1.000:0.778 0/1/1/1:4:77,209:0.75: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,222:0.73: 1.52:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,284:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,119:0.53:-0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,181:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,52:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,219:0.73: 1.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,116:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,153:0.52: 1.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,175:0.72: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,188:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,123:0.49: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,130:0.47: 1.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:191,65:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/0/1/1/1:6:121,121:0.53:-0.03:1.000:0.840 0/0/1/1:4:147,128:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,126:0.55:-0.06:1.000:0.978 0/1/1/1:4:92,220:0.73: 1.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:137,141:0.54: 0.75:1.000:0.989 0/0/1/1:4:172,150:0.50: 1.71:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,314:1.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,85:0.44:-0.82:1.000:0.964 0/1/1/1:4:64,198:0.78: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,139:0.52: 0.82:0.998:0.994 0/1/1/1:4:59,128:0.71:-1.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:224,90:0.30: 1.54:1.000:0.983 0/0/0/1:4:145,51:0.27:-1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,206:0.78: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,211:0.79: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,55:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,136:0.69:-0.86:1.000:0.977 0/1/1/1:4:82,201:0.73: 0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:136,151:0.56: 0.95:1.000:0.974 0/1/1/1:4:89,208:0.72: 1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,216:0.77: 0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,221:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,203:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,221:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,55:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,113:0.46: 0.40:1.000:0.987 0/1/1/1:4:71,200:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,145:0.80:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,173:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,114:0.52:-0.21:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,215:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,152:0.75:-0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,189:0.80:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,159:0.51: 1.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,138:0.73:-1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,191:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,189:0.69: 0.88:1.000:0.975 0/1/1/1:4:57,188:0.79: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,103:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,234:0.79: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,123:0.47: 0.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,74:0.45:-1.48:1.000:0.977 0/1/1/1:4:90,204:0.72: 1.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,141:0.74:-1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:182,136:0.45: 1.63:1.000:0.984 0/1/1/1:4:74,149:0.69:-0.45:1.000:0.978 0/0/1/1:4:148,123:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,125:0.55:-0.08:1.000:0.980 0/1/1/1:4:60,176:0.77:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,275:0.80: 2.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,159:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,111:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,211:0.78: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,191:0.70: 0.88:0.999:0.983 0/0/0/1:4:190,93:0.35: 0.86:1.000:0.813 0/0/1/1:4:117,106:0.51:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,159:0.52: 1.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,116:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,161:0.78:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,115:0.47: 0.42:1.000:0.990 0/1/1/1:4:54,174:0.78:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,135:0.48: 1.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,222:0.78: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,67:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,129:0.55: 0.14:1.000:0.984 0/0/1/1:4:139,140:0.53: 0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:176,153:0.50: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,137:0.52: 0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:179,35:0.18:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,87:0.48:-1.13:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,208:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,197:0.80: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,148:0.72:-0.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,124:0.79:-1.80:0.991:1.000 0/1/1/1:4:67,203:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,175:0.74: 0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:78,237:0.77: 1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,121:0.47: 0.71:1.000:0.991 0/1/1/1:4:94,176:0.68: 0.58:1.000:0.947 0/0/1/1:4:114,113:0.53:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:146,135:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,130:0.50: 0.75:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,283:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,52:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,85:0.50:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:237,90:0.29: 1.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:166,151:0.51: 1.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,120:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,193:0.75: 0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,270:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,246:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,109:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,98:0.48:-0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,91:0.77:-2.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,47:0.29:-1.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:101,102:0.53:-0.89:1.000:0.991 0/1/1/1:4:75,196:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,133:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,121:0.53:-0.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:154,54:0.27:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,150:0.70:-0.49:1.000:0.988 0/1/1/1:4:73,171:0.73: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:153,50:0.26:-0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,149:0.73:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,126:0.54: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:108,105:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,119:0.58:-0.62:1.000:0.907 0/1/1/1:4:67,143:0.71:-0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:107,94:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,102:0.53:-0.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:114,104:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,110:0.56:-0.75:1.000:0.974 0/1/1/1:4:39,159:0.82:-1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,177:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,121:0.53: 0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,136:0.77:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,87:0.49:-1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,111:0.46: 0.32:1.000:0.986 0/1/1/1:4:72,221:0.78: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,103:0.46:-0.10:1.000:0.986 0/0/1/1:4:121,93:0.46:-0.65:1.000:0.989 0/0/1/1:4:121,108:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,137:0.51: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:219,67:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:138,46:0.26:-1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,134:0.53: 0.49:1.000:0.991 -chr4.1 78900010 chr4.1_078900010 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,32:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:73,34:.:-0.22:1.000:. ./.:4:74,27:.:-0.44:1.000:. ./.:4:147,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,27:.: 1.11:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:41,12:.:-2.21:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:80,30:.:-0.11:1.000:. ./.:4:69,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,34:.:-0.96:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:85,21:.:-0.26:0.999:. ./.:4:153,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:110,45:.: 1.55:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:45,6:.:-2.29:1.000:. ./.:4:72,39:.:-0.07:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:82,28:.:-0.11:1.000:. ./.:4:25,8:.:-2.95:1.000:. ./.:4:95,41:.: 0.85:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,43:.: 0.33:1.000:. ./.:4:184,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:90,42:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:29,12:.:-2.66:1.000:. ./.:3:16,4:.:-3.43:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:93,30:.: 0.37:1.000:. ./.:4:92,39:.: 0.66:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:62,35:.:-0.59:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,28:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,42:.: 0.48:1.000:. ./.:4:82,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,41:.: 0.59:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:81,34:.: 0.07:1.000:. ./.:4:100,28:.: 0.55:1.000:. ./.:4:79,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:102,33:.: 0.81:1.000:. ./.:4:93,27:.: 0.26:1.000:. ./.:6:92,8:.:-0.48:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:106,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:120,46:.: 1.96:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:103,29:.: 0.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:86,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:81,33:.: 0.04:0.998:. ./.:4:89,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:96,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:85,37:.: 0.33:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:61,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:104,31:.: 0.81:1.000:. ./.:4:68,33:.:-0.44:1.000:. ./.:4:93,34:.: 0.52:1.000:. ./.:4:92,44:.: 0.85:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:83,45:.: 0.55:1.000:. ./.:4:89,38:.: 0.52:1.000:. ./.:4:91,28:.: 0.22:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:111,38:.: 1.33:1.000:. ./.:4:51,37:.:-0.92:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:72,39:.:-0.07:1.000:. ./.:4:70,27:.:-0.59:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:117,39:.: 1.59:1.000:. ./.:4:74,23:.:-0.59:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:76,33:.:-0.15:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,24:.:-0.52:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:43,16:.:-1.99:1.000:. ./.:4:107,37:.: 1.14:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.89:1.000:. ./.:4:85,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:80,30:.:-0.11:1.000:. ./.:4:85,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:106,38:.: 1.14:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,36:.: 0.15:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:114,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:88,37:.: 0.44:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:74,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:105,30:.: 0.81:1.000:. ./.:4:85,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:68,27:.:-0.66:1.000:. ./.:4:75,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:78,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:107,30:.: 0.89:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:73,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:40,32:.:-1.51:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:86,30:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,21:.:-1.40:0.991:. ./.:4:84,37:.: 0.30:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:118,44:.: 1.81:1.000:. ./.:4:79,30:.:-0.15:1.000:. ./.:4:76,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:88,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:100,33:.: 0.74:1.000:. ./.:4:68,28:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:77,36:.: 0.00:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:97,34:.: 0.66:1.000:. ./.:4:104,52:.: 1.59:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:28,17:.:-2.51:1.000:. ./.:4:49,19:.:-1.66:1.000:. ./.:4:98,38:.: 0.85:1.000:. ./.:4:96,41:.: 0.89:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:111,33:.: 1.14:1.000:. ./.:4:69,26:.:-0.66:1.000:. ./.:4:140,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:96,41:.: 0.89:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:70,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:76,32:.:-0.18:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:58,25:.:-1.11:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:74,40:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,23:.:-1.48:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:92,36:.: 0.55:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:93,36:.: 0.59:1.000:. ./.:4:95,42:.: 0.89:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.52:1.000:. -chr4.1 79121231 chr4.1_079121231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,55:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,58:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,53:.:-0.02:1.000:. ./.:4:68,45:.: 0.58:1.000:. ./.:4:67,53:.: 0.78:1.000:. ./.:4:79,57:.: 1.26:1.000:. ./.:4:39,49:.:-0.17:1.000:. ./.:4:81,51:.: 1.14:1.000:. ./.:4:37,55:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,30:.:-1.44:1.000:. ./.:4:68,50:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,48:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,64:.: 0.64:1.000:. ./.:4:65,47:.: 0.55:1.000:. ./.:4:59,78:.: 1.29:0.999:. ./.:4:11,67:.:-0.46:1.000:. ./.:4:52,68:.: 0.78:1.000:. ./.:4:12,37:.:-1.32:1.000:. ./.:4:32,39:.:-0.67:1.000:. ./.:4:55,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:48,54:.: 0.25:1.000:. ./.:4:29,35:.:-0.88:1.000:. ./.:4:29,29:.:-1.06:1.000:. ./.:4:45,95:.: 1.38:1.000:. ./.:4:58,43:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,54:.: 0.04:1.000:. ./.:4:79,60:.: 1.35:1.000:. ./.:4:52,125:.: 2.48:1.000:. ./.:4:36,41:.:-0.49:1.000:. ./.:4:31,13:.:-1.47:1.000:. ./.:4:33,32:.:-0.85:1.000:. ./.:3:2,11:.:-2.39:1.000:. ./.:4:51,40:.:-0.08:1.000:. ./.:4:23,54:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:75,115:.: 2.86:1.000:. ./.:4:64,82:.: 1.56:1.000:. ./.:4:53,45:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,59:.: 1.29:1.000:. ./.:4:32,97:.: 1.05:1.000:. ./.:4:61,82:.: 1.47:1.000:. ./.:4:72,44:.: 0.66:1.000:. ./.:4:11,56:.:-0.79:1.000:. ./.:4:48,41:.:-0.14:1.000:. ./.:4:41,24:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,69:.: 0.04:1.000:. ./.:4:63,43:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,79:.: 0.78:1.000:. ./.:4:61,34:.: 0.04:1.000:. ./.:4:36,51:.:-0.20:1.000:. ./.:4:28,39:.:-0.79:1.000:. ./.:4:62,85:.: 1.58:1.000:. ./.:4:55,29:.:-0.29:1.000:. ./.:4:91,59:.: 1.67:1.000:. ./.:4:62,52:.: 0.61:1.000:. ./.:6:39,46:.:-0.26:1.000:. ./.:4:41,49:.:-0.11:1.000:. ./.:4:64,67:.: 1.11:1.000:. ./.:4:59,89:.: 1.61:1.000:. ./.:4:89,77:.: 2.15:1.000:. ./.:4:34,41:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,91:.: 0.69:1.000:. ./.:4:50,42:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,40:.:-1.29:1.000:. ./.:4:101,81:.: 2.62:0.998:. ./.:4:26,38:.:-0.88:1.000:. ./.:4:76,61:.: 1.29:1.000:. ./.:4:37,39:.:-0.52:1.000:. ./.:4:110,115:.: 3.90:1.000:. ./.:4:33,29:.:-0.94:1.000:. ./.:4:38,51:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,57:.: 1.41:1.000:. ./.:4:55,68:.: 0.87:1.000:. ./.:4:65,56:.: 0.81:1.000:. ./.:4:33,48:.:-0.37:1.000:. ./.:4:81,66:.: 1.58:1.000:. ./.:4:18,62:.:-0.40:1.000:. ./.:4:50,77:.: 0.99:1.000:. ./.:4:50,62:.: 0.55:1.000:. ./.:4:60,37:.: 0.10:1.000:. ./.:4:82,65:.: 1.58:1.000:. ./.:4:43,70:.: 0.58:1.000:. ./.:4:41,36:.:-0.49:1.000:. ./.:4:18,46:.:-0.88:1.000:. ./.:4:72,54:.: 0.96:1.000:. ./.:4:48,60:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,49:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,54:.: 0.34:1.000:. ./.:4:52,63:.: 0.64:1.000:. ./.:4:39,42:.:-0.37:1.000:. ./.:4:15,34:.:-1.32:1.000:. ./.:4:31,69:.: 0.19:1.000:. ./.:4:43,32:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.65:1.000:. ./.:4:21,48:.:-0.73:1.000:. ./.:4:56,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,33:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,63:.: 0.22:1.000:. ./.:4:15,37:.:-1.24:1.000:. ./.:4:35,30:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,39:.:-1.26:1.000:. ./.:4:52,69:.: 0.81:1.000:. ./.:4:70,47:.: 0.69:1.000:. ./.:4:43,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:57,46:.: 0.28:1.000:. ./.:4:23,54:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,30:.:-1.09:1.000:. ./.:4:47,83:.: 1.08:1.000:. ./.:4:23,46:.:-0.73:0.999:. ./.:4:49,45:.: 0.01:1.000:. ./.:4:35,33:.:-0.76:1.000:. ./.:4:55,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:22,28:.:-1.29:1.000:. ./.:4:15,60:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,37:.:-0.76:1.000:. ./.:4:31,32:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,59:.: 1.11:1.000:. ./.:4:29,42:.:-0.67:1.000:. ./.:4:60,52:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,43:.:-0.55:1.000:. ./.:4:55,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:38,50:.:-0.17:1.000:. ./.:4:19,36:.:-1.15:1.000:. ./.:4:22,30:.:-1.24:1.000:. ./.:4:18,35:.:-1.21:1.000:. ./.:4:13,52:.:-0.85:1.000:. ./.:4:48,35:.:-0.31:1.000:. ./.:4:26,31:.:-1.09:0.991:. ./.:4:50,41:.:-0.08:1.000:. ./.:4:19,21:.:-1.59:1.000:. ./.:4:42,42:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,52:.: 0.25:1.000:. ./.:4:45,35:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,28:.:-1.00:1.000:. ./.:4:31,29:.:-1.00:1.000:. ./.:4:38,17:.:-1.15:1.000:. ./.:4:27,23:.:-1.29:1.000:. ./.:4:38,27:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,30:.:-1.32:1.000:. ./.:4:57,32:.:-0.14:1.000:. ./.:4:67,38:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,40:.: 0.19:1.000:. ./.:4:22,46:.:-0.76:1.000:. ./.:4:30,48:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:64,45:.: 0.46:1.000:. ./.:4:56,47:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,27:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,31:.:-1.03:1.000:. ./.:4:94,91:.: 2.71:1.000:. ./.:4:43,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:70,33:.: 0.28:1.000:. ./.:4:85,55:.: 1.38:1.000:. ./.:4:51,28:.:-0.43:1.000:. ./.:4:50,45:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,27:.:-1.12:1.000:. ./.:4:65,44:.: 0.46:1.000:. ./.:4:19,55:.:-0.58:1.000:. ./.:4:22,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:79,37:.: 0.66:1.000:. ./.:4:62,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:40,56:.: 0.07:1.000:. ./.:4:16,23:.:-1.62:1.000:. ./.:4:68,49:.: 0.69:1.000:. ./.:4:24,26:.:-1.29:1.000:. ./.:4:18,35:.:-1.21:1.000:. ./.:4:10,38:.:-1.35:1.000:. ./.:4:42,60:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:33,60:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,35:.:-1.06:1.000:. ./.:4:88,83:.: 2.30:1.000:. ./.:4:68,51:.: 0.75:1.000:. ./.:4:70,47:.: 0.69:1.000:. ./.:4:28,33:.:-0.97:1.000:. ./.:4:54,36:.:-0.11:1.000:. ./.:4:103,54:.: 1.88:1.000:. ./.:4:67,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,33:.:-0.94:1.000:. ./.:4:25,42:.:-0.79:1.000:. -chr4.1 79361715 chr4.1_079361715 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:345,115:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/0:4:378,1:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,215:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:329,93:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:383,138:0.27: 1.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:119,399:0.75: 1.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,132:0.49:-1.96:1.000:0.996 0/0/0/0:4:378,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,189:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:297,1:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,90:0.27:-0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:239,83:0.26:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:356,113:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:322,118:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/0:4:426,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,112:0.28:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/0:4:453,0:0.00: 0.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:224,236:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:381,122:0.24: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,254:0.51: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,161:0.49:-1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:204,208:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:222,249:0.52: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:301,90:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,97:0.32:-1.49:1.000:0.941 0/0/0/1:4:308,101:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,216:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:296,101:0.26:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:477,2:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,97:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:265,88:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,182:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,141:0.67:-2.76:1.000:0.911 0/0/0/1:4:262,84:0.24:-0.81:1.000:1.000 0/1/1:3:107,122:0.52:-2.43:1.000:0.811 0/0/1/1:4:209,237:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:210,214:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:303,111:0.27: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:382,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,193:0.47: 0.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:103,329:0.74: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:182,203:0.52:-0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:296,92:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,92:0.26:-0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:216,230:0.51: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,227:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:394,120:0.23: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-4.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,140:0.44:-1.22:1.000:0.960 0/0/1/1:4:116,145:0.54:-1.98:1.000:0.985 0/0/1/1:4:176,192:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:346,128:0.27: 0.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:290,96:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:215,225:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:288,87:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:311,87:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,73:0.20:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,193:0.47:-0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:174,195:0.52:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:210,202:0.48: 0.10:1.000:0.870 0/0/1/1:4:193,217:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:177,166:0.48:-0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:352,101:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,97:0.27:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:230,239:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:378,113:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,90:0.26:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,177:0.46:-0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:327,102:0.24: 0.34:0.998:1.000 0/0/0/1:4:286,84:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,224:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,255:0.73:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/0:4:409,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,133:0.27: 1.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:342,129:0.27: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:295,104:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:292,109:0.27:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:325,90:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,212:0.48: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:292,111:0.28:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:303,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:327,97:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,118:0.27: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,191:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:275,86:0.24:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:362,126:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:234,69:0.23:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,106:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,70:0.23:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:384,1:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,74:0.21:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,105:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:371,101:0.21: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:315,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,263:0.53: 1.06:1.000:0.990 0/0/0/1:4:314,103:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:278,108:0.28:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,209:0.56:-0.57:1.000:0.963 0/0/0/1:4:324,114:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,239:0.54: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:360,88:0.20: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:331,103:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,96:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:310,106:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,173:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:272,91:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:187,179:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,183:0.47:-0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:374,107:0.22: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:357,116:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:231,216:0.47: 0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:419,143:0.26: 2.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:354,86:0.20: 0.49:0.999:1.000 0/0/1/1:4:235,187:0.44: 0.24:1.000:0.961 0/0/1/1:4:141,119:0.45:-2.00:1.000:0.980 0/0/0/1:4:367,122:0.25: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:229,222:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:210,201:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:186,224:0.53: 0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:207,197:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:309,102:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:337,92:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,258:0.52: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:206,205:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:199,183:0.47:-0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:226,238:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:317,92:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,175:0.51:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,189:0.56:-1.02:1.000:0.971 0/0/0/1:4:223,72:0.25:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,246:0.56: 0.31:1.000:0.963 0/0/0/0:4:411,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:270,0:0.00:-1.86:0.991:1.000 0/0/0/0:4:415,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,172:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:409,167:0.29: 2.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:315,120:0.28: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:419,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,78:0.24:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,114:0.30:-0.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:197,257:0.55: 0.68:1.000:0.976 0/0/0/0:4:339,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,272:0.72:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,154:0.49:-1.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:134,397:0.72: 1.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:279,294:0.50: 2.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:226,205:0.47: 0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:288,97:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:344,124:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:262,85:0.25:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:369,143:0.28: 1.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,240:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/0:4:287,4:0.01:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,149:0.50:-1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:380,120:0.24: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:380,116:0.23: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,269:0.49: 1.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:370,126:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:237,182:0.43: 0.20:1.000:0.941 0/0/1/1:4:212,194:0.47: 0.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:260,85:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,209:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:280,71:0.20:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,213:0.55:-0.31:1.000:0.984 0/0/0/1:4:281,82:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,349:0.70: 1.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:294,93:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,116:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:215,188:0.46:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:183,211:0.52:-0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:146,195:0.56:-0.88:1.000:0.969 0/0/1/1:4:183,158:0.46:-0.88:1.000:0.985 0/0/0/0:4:435,1:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,108:0.28:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:263,80:0.23:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,152:0.50:-1.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:389,140:0.27: 1.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:380,126:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:330,107:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:209,189:0.47:-0.09:1.000:0.991 0/0/0/1:4:346,116:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:429,135:0.24: 2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,299:0.53: 2.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:89,316:0.75: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,102:0.27:-0.41:1.000:0.997 -chr4.1 79690999 chr4.1_079690999 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:206,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.18:0.999:. ./.:4:159,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.83:1.000:. ./.:3:15,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.11:1.000:. ./.:6:93,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.11:0.998:. ./.:4:121,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:129,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.17:0.991:. ./.:4:149,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.77:1.000:. -chr4.1 79801737 chr4.1_079801737 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:130,0:.: 3.56:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.01:0.999:. ./.:4:49,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:101,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.53:1.000:. ./.:3:13,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:35,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:101,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:0.998:. ./.:4:39,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.01:0.999:. ./.:4:60,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.06:0.991:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.04:1.000:. -chr4.1 80064612 chr4.1_080064612 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.18:0.999:. ./.:4:81,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.18:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.80:1.000:. ./.:6:83,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.03:0.998:. ./.:4:68,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:181,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:76,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:137,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:208,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:165,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:0.991:. ./.:4:11,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:199,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.17:1.000:. -chr4.1 80111485 chr4.1_080111485 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,34:0.29: 0.93:1.000:0.990 0/0/1/1:4:66,81:0.53: 0.93:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,131:0.57: 2.34:1.000:0.933 0/0/1/1:4:29,28:0.51:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,68:0.52: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,44:0.43: 0.05:1.000:0.956 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-2.31:1.000:0.956 0/0/0/1:4:17,5:0.29:-2.02:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,86:0.56: 0.81:1.000:0.965 0/0/0/1:4:120,38:0.30: 1.19:1.000:0.985 0/0/0/1:4:72,31:0.35:-0.11:1.000:0.782 0/0/1/1:4:75,74:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,59:0.49: 0.41:0.999:0.997 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,48:0.29: 2.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,66:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:10,3:0.29:-2.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:70,53:0.46: 0.36:1.000:0.987 0/0/1/1:4:74,59:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,59:0.51: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,84:0.58: 0.57:1.000:0.928 1/1/1/1:4:0,143:1.00: 0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,33:0.40:-0.37:1.000:0.786 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,66:0.52: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,71:0.42: 1.82:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.50:1.000:1.000 0/0/1:3:7,3:0.35:-2.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,57:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,102:0.55: 1.66:1.000:0.984 0/0/1/1:4:61,40:0.43:-0.16:1.000:0.948 0/0/1/1:4:62,55:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,88:0.55: 0.97:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,34:0.39:-0.23:1.000:0.687 0/0/0/1:4:113,23:0.23: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,37:0.29: 1.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,59:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,21:0.34:-0.82:1.000:0.869 0/0/1/1:4:91,50:0.40: 0.78:1.000:0.754 0/0/0/1:4:90,22:0.26: 0.10:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,63:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,51:0.53:-0.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:101,47:0.37: 0.95:1.000:0.627 0/0/1/1:4:60,61:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,52:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,46:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,35:0.52:-0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,98:0.61: 0.71:1.000:0.667 0/0/0/1/1/1:6:29,25:0.49:-1.27:1.000:0.879 0/0/1/1:4:58,43:0.46:-0.16:1.000:0.985 0/0/1/1:4:58,54:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,17:0.20: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,93:0.56: 1.09:1.000:0.966 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,29:0.29: 0.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:53,51:0.51:-0.09:0.998:0.997 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,73:0.58: 0.12:1.000:0.910 0/0/1/1:4:31,31:0.51:-1.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,53:0.52:-0.11:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,23:0.43:-1.15:1.000:0.934 0/0/0/1:4:89,19:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,46:0.44: 0.10:1.000:0.971 0/0/0/1:4:123,27:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,36:0.43:-0.37:1.000:0.937 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:112,26:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,21:0.19: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,98:0.59: 0.93:1.000:0.858 0/0/1/1:4:44,25:0.40:-0.92:1.000:0.811 0/0/0/1:4:131,23:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,20:0.27:-0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,25:0.43:-1.03:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,23:0.35:-0.73:1.000:0.799 0/0/0/1:4:85,17:0.23:-0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,60:0.53: 0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,47:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,42:0.44:-0.11:1.000:0.968 0/0/1/1:4:51,53:0.51:-0.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,35:0.43:-0.44:1.000:0.942 0/1/1/1:4:1,89:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,20:0.48:-1.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,33:0.41:-0.42:1.000:0.838 0/0/0/1:4:81,13:0.19:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,53:0.53:-0.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:90,12:0.16:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,47:0.35: 1.16:1.000:0.794 0/0/1/1:4:36,41:0.53:-0.73:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,30:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,59:0.45: 0.74:1.000:0.984 0/0/0/1:4:108,44:0.34: 1.04:1.000:0.859 0/0/1/1:4:71,94:0.54: 1.35:1.000:0.985 0/0/1/1:4:63,36:0.40:-0.21:0.999:0.820 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,43:0.47:-0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,47:0.44: 0.17:1.000:0.969 0/0/1/1:4:51,48:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,19:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,31:0.33: 0.12:1.000:0.925 0/0/0/1:4:98,20:0.24: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,25:0.40:-0.92:1.000:0.811 0/0/1/1:4:47,88:0.58: 0.64:1.000:0.897 0/0/1/1:4:62,81:0.54: 0.83:1.000:0.986 0/0/0/1:4:105,40:0.33: 0.88:1.000:0.920 0/0/1/1:4:66,51:0.46: 0.22:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,41:0.41: 0.08:1.000:0.854 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,29:0.40:-0.63:1.000:0.781 0/0/1/1:4:60,73:0.53: 0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,33:0.47:-0.80:0.991:0.993 0/0/1/1:4:51,40:0.47:-0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,44:0.44: 0.01:1.000:0.967 0/0/1/1:4:100,88:0.49: 1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,90:0.56: 0.95:1.000:0.963 0/0/1/1:4:43,26:0.41:-0.92:1.000:0.889 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,45:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,45:0.51:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,16:0.31:-1.01:1.000:0.980 0/0/1/1:4:59,93:0.56: 1.04:1.000:0.959 0/0/0/1:4:50,24:0.37:-0.80:1.000:0.554 0/0/1/1:4:78,108:0.55: 1.85:1.000:0.981 0/0/1/1:4:88,85:0.51: 1.54:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,129:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,59:0.52: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,35:0.43:-0.47:1.000:0.952 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,127:0.57: 2.22:1.000:0.939 0/0/1/1:4:70,89:0.54: 1.21:1.000:0.988 0/0/1/1:4:5,4:0.47:-2.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,66:0.56: 0.08:1.000:0.973 0/0/1/1:4:52,62:0.53: 0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:70,57:0.47: 0.45:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,65:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,90:0.58: 0.81:1.000:0.932 0/0/1/1:4:55,45:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,66:0.54: 0.26:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,125:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,56:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,41:0.32: 1.19:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,78:0.56: 0.52:1.000:0.969 0/0/0/1:4:106,23:0.25: 0.50:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,81:0.57: 0.48:1.000:0.933 0/0/1/1:4:65,75:0.53: 0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:108,57:0.39: 1.35:1.000:0.673 0/0/1/1:4:39,68:0.58:-0.02:1.000:0.929 0/0/1/1:4:62,47:0.46: 0.03:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,129:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,46:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:99,67:0.44: 1.37:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,41:0.46:-0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:70,84:0.53: 1.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:58,96:0.57: 1.09:1.000:0.947 0/0/1/1:4:66,96:0.56: 1.28:1.000:0.974 0/0/1/1:4:68,97:0.55: 1.35:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,161:1.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,94:0.57: 0.97:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.84:1.000:1.000 -chr4.1 80360679 chr4.1_080360679 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,42:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,34:0.58: 0.96:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,34:0.51: 1.65:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.38:-1.35:1.000:0.546 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,22:0.26: 1.40:1.000:0.998 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.46:0.999:1.000 0/0/1/1:4:22,26:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,36:0.49: 2.03:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.73:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,44:0.53: 2.40:1.000:0.991 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,21:0.24: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:18,28:0.54: 0.71:1.000:0.813 0/0/1/1:4:19,32:0.55: 1.03:1.000:0.983 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,36:0.46: 2.22:1.000:0.987 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.41:-0.48:1.000:0.855 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:33,26:0.35: 1.53:0.998:0.822 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,83:0.61: 4.85:1.000:0.705 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,35:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,35:0.53: 1.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:20,43:0.58: 1.78:1.000:0.926 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,24:0.27: 1.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,32:0.46: 1.71:1.000:0.988 0/0/1/1:4:18,21:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,29:0.51: 1.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,28:0.53: 0.77:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.54:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:12,18:0.53:-0.29:1.000:0.992 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 1.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.98:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:33,32:0.42: 1.90:1.000:0.932 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,39:0.55: 1.71:0.999:0.982 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.92:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.04:0.991:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,21:0.32: 0.96:1.000:0.965 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.41:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:31,31:0.44: 1.71:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.41: 0.96:1.000:0.840 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,32:0.55: 1.03:1.000:0.983 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,26:0.42: 1.15:1.000:0.923 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,50:0.53: 3.09:1.000:0.992 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,25:0.41: 1.09:1.000:0.848 -chr4.1 80478320 chr4.1_080478320 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:248,74:.: 1.23:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:149,54:.:-0.70:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:220,71:.: 0.73:1.000:. ./.:4:117,48:.:-1.32:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:202,70:.: 0.42:1.000:. ./.:4:83,3:.:-2.61:1.000:. ./.:4:57,14:.:-2.86:1.000:. ./.:4:206,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:189,58:.: 0.01:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:186,51:.:-0.15:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:276,83:.: 1.84:1.000:. ./.:4:249,86:.: 1.45:1.000:. ./.:4:226,70:.: 0.81:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:239,63:.: 0.91:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:322,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:217,56:.: 0.44:1.000:. ./.:4:184,66:.: 0.06:1.000:. ./.:4:39,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:68,3:.:-2.86:1.000:. ./.:3:43,4:.:-3.25:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:210,64:.: 0.45:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:196,72:.: 0.35:1.000:. ./.:4:193,62:.: 0.14:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:230,105:.: 1.45:1.000:. ./.:4:169,51:.:-0.43:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:215,67:.: 0.58:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:433,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:190,57:.: 0.01:1.000:. ./.:4:195,70:.: 0.31:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:224,80:.: 0.94:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:215,70:.: 0.63:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:249,80:.: 1.35:1.000:. ./.:4:214,58:.: 0.42:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:162,20:.:-1.05:1.000:. ./.:4:185,53:.:-0.13:1.000:. ./.:4:188,66:.: 0.13:1.000:. ./.:4:221,75:.: 0.81:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:207,69:.: 0.49:1.000:. ./.:4:311,70:.: 2.20:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:198,67:.: 0.31:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.32:0.998:. ./.:4:254,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:174,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:185,67:.: 0.09:1.000:. ./.:4:246,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:213,56:.: 0.37:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:215,88:.: 0.92:1.000:. ./.:4:223,72:.: 0.79:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:232,77:.: 1.02:1.000:. ./.:4:147,43:.:-0.92:1.000:. ./.:4:185,56:.:-0.09:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:154,37:.:-0.90:1.000:. ./.:4:269,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:164,51:.:-0.51:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:197,80:.: 0.50:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:120,46:.:-1.31:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:124,49:.:-1.19:1.000:. ./.:4:191,62:.: 0.11:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:284,86:.: 2.02:1.000:. ./.:4:224,66:.: 0.71:1.000:. ./.:4:195,66:.: 0.24:1.000:. ./.:4:281,76:.: 1.80:1.000:. ./.:4:221,51:.: 0.42:0.999:. ./.:4:263,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:129,41:.:-1.24:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:161,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:201,61:.: 0.26:1.000:. ./.:4:175,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:203,55:.: 0.19:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:179,56:.:-0.18:1.000:. ./.:4:198,47:.:-0.02:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:121,44:.:-1.32:1.000:. ./.:4:143,45:.:-0.95:1.000:. ./.:4:148,48:.:-0.82:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.34:0.991:. ./.:4:262,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:154,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:337,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:188,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:122,40:.:-1.37:1.000:. ./.:4:265,88:.: 1.74:1.000:. ./.:4:334,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:184,71:.: 0.14:1.000:. ./.:4:269,85:.: 1.76:1.000:. ./.:4:146,51:.:-0.80:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:174,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:75,1:.:-2.77:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:153,55:.:-0.62:1.000:. ./.:4:223,66:.: 0.70:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:152,51:.:-0.70:1.000:. ./.:4:178,58:.:-0.17:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:204,90:.: 0.78:1.000:. ./.:4:165,57:.:-0.39:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:164,76:.:-0.10:1.000:. ./.:4:154,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:149,44:.:-0.87:1.000:. ./.:4:177,55:.:-0.23:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,62:.:-0.28:1.000:. ./.:4:126,52:.:-1.11:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:269,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:191,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:296,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:188,60:.: 0.03:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.26:1.000:. -chr4.1 80630832 chr4.1_080630832 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:49,34:0.41: 0.21:1.000:0.872 0/0/1/1:4:34,26:0.43:-0.57:1.000:0.955 0/0/0/1:4:39,14:0.27:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,17:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,25:0.20: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,15:0.32:-0.98:1.000:0.955 0/0/1/1:4:23,31:0.57:-0.77:1.000:0.942 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,29:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,16:0.42:-1.32:1.000:0.922 0/0/0/1:4:42,18:0.31:-0.57:1.000:0.977 0/0/0/1:4:52,15:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,38:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,19:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,11:0.23:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,16:0.23:-0.09:0.999:1.000 0/1/1/1:4:16,48:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,14:0.15: 0.72:1.000:0.987 0/0/1/1:4:28,44:0.61:-0.16:1.000:0.697 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,20:0.38:-0.81:1.000:0.579 0/0/1/1:4:56,48:0.46: 0.93:1.000:0.988 0/0/0/1:4:46,19:0.30:-0.40:1.000:0.985 0/0/0/0:4:18,1:0.05:-1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,14:0.26:-0.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,11:0.32:-1.42:1.000:0.951 0/0/0/1:4:59,10:0.15:-0.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:97,25:0.21: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,11:0.21:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,20:0.32:-0.43:1.000:0.955 0/0/1/1:4:17,14:0.45:-1.55:1.000:0.981 0/1/1/1:4:1,2:0.67:-2.51:1.000:0.902 0/0/0/1:4:41,10:0.20:-0.87:1.000:1.000 0/1/1:3:2,4:0.67:-2.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,16:0.31:-0.84:1.000:0.965 0/0/1/1:4:23,33:0.59:-0.70:1.000:0.880 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,20:0.29:-0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,30:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,19:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,31:0.41:-0.06:1.000:0.891 0/0/0/1:4:51,18:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,41:0.61:-0.33:1.000:0.688 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.34:-2.30:1.000:0.875 0/0/0/1:4:50,14:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,6:0.20:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,49:0.44: 1.17:1.000:0.969 0/0/0/1:4:95,25:0.22: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,28:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,10:0.13: 0.15:1.000:0.900 0/0/1/1:4:45,42:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,20:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:91,12:0.12: 0.89:1.000:0.984 0/0/0/1:4:99,22:0.19: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,43:0.46: 0.55:1.000:0.988 0/0/0/1:4:103,32:0.25: 1.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,15:0.20: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,16:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,39:0.40: 0.76:1.000:0.758 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,43:0.62:-0.26:1.000:0.547 0/0/0/1:4:74,18:0.20: 0.52:0.998:1.000 0/0/0/1:4:51,12:0.20:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,16:0.38:-1.15:1.000:0.513 0/0/0/1:4:65,18:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,34:0.55:-0.50:1.000:0.984 0/0/0/1:4:52,21:0.30:-0.13:1.000:0.988 0/0/0/1:4:75,18:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,30:0.27: 1.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:117,22:0.17: 2.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,27:0.33: 0.25:1.000:0.930 0/0/0/1:4:79,15:0.17: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,40:0.45: 0.38:1.000:0.983 0/0/0/1:4:83,28:0.26: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,28:0.19: 2.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,19:0.32:-0.53:1.000:0.958 0/0/0/1:4:94,26:0.23: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,25:0.29: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:49,40:0.45: 0.42:1.000:0.979 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 2.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,21:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,18:0.17: 1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,26:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,30:0.24: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,6:0.15:-1.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:34,42:0.55:-0.02:1.000:0.980 0/0/0/1:4:55,23:0.30: 0.04:1.000:0.983 0/0/0/1:4:93,23:0.21: 1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,74:0.46: 2.80:1.000:0.990 0/0/0/1:4:76,16:0.18: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,31:0.22: 2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,38:0.43: 0.38:1.000:0.952 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,29:0.52:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:77,33:0.31: 1.13:1.000:0.977 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,12:0.31:-1.25:1.000:0.977 0/0/0/1:4:92,28:0.24: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,40:0.47: 0.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:63,35:0.36: 0.72:1.000:0.670 0/0/1/1:4:56,40:0.42: 0.66:1.000:0.905 0/0/0/1:4:104,46:0.31: 2.49:0.999:0.967 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,23:0.46:-0.91:1.000:0.987 0/0/0/1:4:98,24:0.21: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,19:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,34:0.56:-0.57:1.000:0.959 0/0/0/1:4:66,22:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,24:0.31: 0.11:1.000:0.977 0/0/0/1:4:81,24:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,16:0.31:-0.84:1.000:0.965 0/0/0/1:4:58,28:0.33: 0.32:1.000:0.914 0/0/0/1:4:67,24:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,17:0.15: 1.44:1.000:0.987 0/0/1/1:4:20,15:0.43:-1.42:1.000:0.945 0/0/0/1:4:51,13:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,39:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,34:0.55:-0.53:1.000:0.974 0/0/0/1:4:50,13:0.22:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,16:0.23:-0.13:0.991:1.000 0/0/0/1:4:68,22:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,15:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,16:0.32:-0.87:1.000:0.952 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,29:0.22: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,35:0.37: 0.66:1.000:0.581 0/0/0/1:4:97,28:0.23: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,15:0.33:-1.04:1.000:0.911 0/0/1/1:4:54,47:0.46: 0.83:1.000:0.990 0/0/0/1:4:67,13:0.17: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,25:0.28: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,15:0.30:-0.84:1.000:0.988 0/0/1/1:4:45,44:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,31:0.47:-0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,33:0.41: 0.15:1.000:0.859 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,32:0.44:-0.16:1.000:0.973 0/0/0/1:4:22,8:0.28:-1.59:1.000:0.997 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,25:0.22: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,20:0.42:-0.98:1.000:0.905 0/0/1/1:4:34,36:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,18:0.32:-0.64:1.000:0.960 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,28:0.45:-0.50:1.000:0.981 0/1/1/1:4:24,42:0.64:-0.36:1.000:0.629 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,12:0.27:-1.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:52,8:0.14:-0.57:1.000:0.965 0/0/1/1:4:20,28:0.58:-0.98:1.000:0.909 0/0/0/1:4:56,15:0.22:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,10:0.24:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,7:0.21:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,18:0.64:-1.66:1.000:0.708 0/0/0/1:4:62,18:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,21:0.38:-0.74:1.000:0.632 0/0/0/1:4:26,13:0.34:-1.28:1.000:0.875 0/0/0/1:4:68,24:0.27: 0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,17:0.16: 1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,17:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,11:0.29:-1.28:1.000:0.992 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.20:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,17:0.26:-0.30:1.000:0.999 -chr4.1 80785939 chr4.1_080785939 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:62,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,18:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,36:.: 0.09:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,19:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,12:.:-1.86:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:38,13:.:-1.04:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:32,24:.:-0.78:1.000:. ./.:4:41,19:.:-0.58:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:40,15:.:-0.84:1.000:. ./.:4:65,16:.: 0.49:1.000:. ./.:4:40,25:.:-0.32:1.000:. ./.:4:26,20:.:-1.30:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.89:1.000:. ./.:4:17,6:.:-2.47:1.000:. ./.:4:39,20:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,17:.:-1.14:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,24:.: 0.03:1.000:. ./.:4:32,16:.:-1.19:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:36,13:.:-1.14:1.000:. ./.:4:23,3:.:-2.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.27:1.000:. ./.:3:18,4:.:-2.52:1.000:. ./.:4:31,15:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,17:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,22:.:-0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:55,19:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,22:.: 0.70:1.000:. ./.:4:53,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:53,15:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,24:.: 1.21:1.000:. ./.:4:72,29:.: 1.52:1.000:. ./.:4:39,51:.: 0.96:1.000:. ./.:4:105,42:.: 3.87:1.000:. ./.:4:54,14:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,48:.: 0.55:1.000:. ./.:4:66,24:.: 0.96:1.000:. ./.:4:80,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:70,19:.: 0.90:1.000:. ./.:4:44,43:.: 0.80:1.000:. ./.:4:61,25:.: 0.75:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:63,33:.: 1.26:1.000:. ./.:4:40,24:.:-0.38:1.000:. ./.:6:67,25:.: 1.06:1.000:. ./.:4:71,27:.: 1.36:1.000:. ./.:4:83,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:72,30:.: 1.57:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:60,21:.: 0.49:1.000:. ./.:4:77,19:.: 1.26:1.000:. ./.:4:47,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:61,13:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.44:0.998:. ./.:4:12,47:.:-0.63:1.000:. ./.:4:47,36:.: 0.60:1.000:. ./.:4:56,25:.: 0.49:1.000:. ./.:4:46,42:.: 0.85:1.000:. ./.:4:49,23:.: 0.03:1.000:. ./.:4:61,17:.: 0.34:1.000:. ./.:4:57,30:.: 0.80:1.000:. ./.:4:59,20:.: 0.39:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:44,57:.: 1.52:1.000:. ./.:4:77,29:.: 1.77:1.000:. ./.:4:18,37:.:-0.84:1.000:. ./.:4:63,26:.: 0.90:1.000:. ./.:4:85,26:.: 2.03:1.000:. ./.:4:42,14:.:-0.78:1.000:. ./.:4:68,27:.: 1.21:1.000:. ./.:4:69,25:.: 1.16:1.000:. ./.:4:61,16:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,27:.: 0.85:1.000:. ./.:4:72,27:.: 1.42:1.000:. ./.:4:61,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:55,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:73,30:.: 1.62:1.000:. ./.:4:46,27:.: 0.09:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.07:1.000:. ./.:4:24,44:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:71,28:.: 1.42:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:71,31:.: 1.57:1.000:. ./.:4:40,16:.:-0.78:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:37,51:.: 0.85:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,31:.: 1.83:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:65,19:.: 0.65:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:56,25:.: 0.49:0.999:. ./.:4:45,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:76,25:.: 1.52:1.000:. ./.:4:56,22:.: 0.34:1.000:. ./.:4:63,38:.: 1.52:1.000:. ./.:4:48,49:.: 1.31:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:34,49:.: 0.60:1.000:. ./.:4:64,26:.: 0.96:1.000:. ./.:4:29,31:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,26:.:-0.38:1.000:. ./.:4:46,37:.: 0.60:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:27,46:.: 0.09:1.000:. ./.:4:35,10:.:-1.35:1.000:. ./.:4:40,11:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,28:.: 1.31:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.89:0.991:. ./.:4:64,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:44,38:.: 0.55:1.000:. ./.:4:46,19:.:-0.32:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:56,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:48,20:.:-0.17:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:56,26:.: 0.55:1.000:. ./.:4:40,13:.:-0.94:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:74,20:.: 1.16:1.000:. ./.:4:60,26:.: 0.75:1.000:. ./.:4:50,14:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:61,26:.: 0.80:1.000:. ./.:4:51,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,29:.: 1.16:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:48,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:34,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:30,38:.:-0.17:1.000:. ./.:4:65,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:35,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:43,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:52,25:.: 0.29:1.000:. ./.:4:44,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:45,23:.:-0.17:1.000:. ./.:4:27,10:.:-1.76:1.000:. ./.:4:45,43:.: 0.85:1.000:. ./.:4:35,16:.:-1.04:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:47,16:.:-0.43:1.000:. ./.:4:39,19:.:-0.68:1.000:. ./.:4:35,15:.:-1.09:1.000:. ./.:4:38,13:.:-1.04:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,10:.:-0.68:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:35,20:.:-0.84:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:51,23:.: 0.14:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:36,16:.:-0.99:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.73:1.000:. ./.:4:47,20:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,27:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,9:.:-1.04:1.000:. ./.:4:35,40:.: 0.19:1.000:. -chr4.1 80968465 chr4.1_080968465 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,2:.: 1.19:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:62,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:90,1:.: 1.99:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.49:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.71:1.000:. ./.:6:40,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.50:0.998:. ./.:4:1,1:.:-2.75:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.75:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:59,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.81:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.94:0.991:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:67,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:90,1:.: 1.99:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr4.1 81157594 chr4.1_081157594 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,50:.:-0.05:1.000:. ./.:4:60,33:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.35:1.000:. ./.:4:37,45:.:-0.82:1.000:. ./.:4:59,66:.: 1.12:1.000:. ./.:4:23,95:.: 0.80:1.000:. ./.:4:56,48:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,88:.: 0.53:1.000:. ./.:4:26,69:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,36:.:-2.26:1.000:. ./.:4:33,25:.:-1.90:1.000:. ./.:4:50,35:.:-0.68:1.000:. ./.:4:52,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:20,57:.:-1.05:1.000:. ./.:4:31,83:.: 0.62:1.000:. ./.:4:49,67:.: 0.71:0.999:. ./.:4:48,72:.: 0.89:1.000:. ./.:4:32,124:.: 2.52:1.000:. ./.:4:30,98:.: 1.25:1.000:. ./.:4:1,44:.:-2.49:1.000:. ./.:4:28,80:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:20,90:.: 0.44:1.000:. ./.:4:6,20:.:-3.34:1.000:. ./.:4:27,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:25,71:.:-0.19:1.000:. ./.:4:35,58:.:-0.32:1.000:. ./.:4:23,86:.: 0.40:1.000:. ./.:4:39,101:.: 1.79:1.000:. ./.:4:48,63:.: 0.49:1.000:. ./.:4:20,75:.:-0.23:1.000:. ./.:4:8,37:.:-2.49:1.000:. ./.:4:22,28:.:-2.26:1.000:. ./.:3:8,15:.:-3.48:1.000:. ./.:4:21,115:.: 1.61:1.000:. ./.:4:20,75:.:-0.23:1.000:. ./.:4:19,67:.:-0.64:1.000:. ./.:4:44,55:.:-0.05:1.000:. ./.:4:24,80:.: 0.17:1.000:. ./.:4:22,83:.: 0.22:1.000:. ./.:4:16,76:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,89:.: 0.80:1.000:. ./.:4:16,63:.:-0.96:1.000:. ./.:4:30,93:.: 1.03:1.000:. ./.:4:25,77:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.62:1.000:. ./.:4:14,58:.:-1.27:1.000:. ./.:4:18,68:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,73:.:-1.23:1.000:. ./.:4:13,69:.:-0.82:1.000:. ./.:4:51,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:32,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,84:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,85:.: 0.26:1.000:. ./.:4:43,46:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,87:.: 0.08:1.000:. ./.:4:13,85:.:-0.10:1.000:. ./.:6:8,90:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,89:.: 0.58:1.000:. ./.:4:47,41:.:-0.55:1.000:. ./.:4:27,111:.: 1.70:1.000:. ./.:4:34,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:28,103:.: 1.39:1.000:. ./.:4:30,77:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,68:.:-0.55:1.000:. ./.:4:15,67:.:-0.82:1.000:. ./.:4:50,50:.:-0.01:0.998:. ./.:4:12,85:.:-0.14:1.000:. ./.:4:23,100:.: 1.03:1.000:. ./.:4:25,71:.:-0.19:1.000:. ./.:4:50,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,61:.:-0.73:1.000:. ./.:4:65,24:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,78:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,86:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,125:.: 1.12:1.000:. ./.:4:25,97:.: 0.98:1.000:. ./.:4:33,60:.:-0.32:1.000:. ./.:4:25,87:.: 0.53:1.000:. ./.:4:34,101:.: 1.57:1.000:. ./.:4:21,79:.:-0.01:1.000:. ./.:4:16,63:.:-0.96:1.000:. ./.:4:20,105:.: 1.12:1.000:. ./.:4:20,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:35,60:.:-0.23:1.000:. ./.:4:23,83:.: 0.26:1.000:. ./.:4:19,83:.: 0.08:1.000:. ./.:4:24,67:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,84:.: 0.04:1.000:. ./.:4:49,62:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,30:.:-1.95:1.000:. ./.:4:29,94:.: 1.03:1.000:. ./.:4:31,76:.: 0.31:1.000:. ./.:4:22,77:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,42:.:-1.41:1.000:. ./.:4:51,61:.: 0.53:1.000:. ./.:4:17,108:.: 1.12:1.000:. ./.:4:18,74:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,58:.: 0.13:1.000:. ./.:4:34,42:.:-1.09:1.000:. ./.:4:40,111:.: 2.29:1.000:. ./.:4:14,71:.:-0.68:1.000:. ./.:4:43,50:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,78:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,91:.: 1.43:1.000:. ./.:4:43,63:.: 0.26:1.000:. ./.:4:26,92:.: 0.80:1.000:. ./.:4:76,75:.: 2.29:1.000:. ./.:4:24,90:.: 0.62:0.999:. ./.:4:19,71:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,37:.:-1.54:1.000:. ./.:4:44,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:19,97:.: 0.71:1.000:. ./.:4:16,75:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,73:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,52:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.62:1.000:. ./.:4:25,84:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,124:.: 1.07:1.000:. ./.:4:28,94:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.67:1.000:. ./.:4:46,64:.: 0.44:1.000:. ./.:4:28,53:.:-0.87:1.000:. ./.:4:18,78:.:-0.19:1.000:. ./.:4:16,62:.:-1.00:1.000:. ./.:4:24,78:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,66:.: 1.30:1.000:. ./.:4:35,37:.:-1.27:0.991:. ./.:4:36,53:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.68:1.000:. ./.:4:19,99:.: 0.80:1.000:. ./.:4:23,77:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,64:.:-0.77:1.000:. ./.:4:34,42:.:-1.09:1.000:. ./.:4:18,80:.:-0.10:1.000:. ./.:4:27,80:.: 0.31:1.000:. ./.:4:23,88:.: 0.49:1.000:. ./.:4:19,56:.:-1.14:1.000:. ./.:4:42,50:.:-0.37:1.000:. ./.:4:37,109:.: 2.07:1.000:. ./.:4:37,84:.: 0.94:1.000:. ./.:4:40,83:.: 1.03:1.000:. ./.:4:47,54:.: 0.04:1.000:. ./.:4:28,88:.: 0.71:1.000:. ./.:4:20,67:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,115:.: 1.97:1.000:. ./.:4:43,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:9,19:.:-3.25:1.000:. ./.:4:27,57:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,123:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.98:1.000:. ./.:4:25,87:.: 0.53:1.000:. ./.:4:22,69:.:-0.41:1.000:. ./.:4:36,86:.: 0.98:1.000:. ./.:4:32,78:.: 0.44:1.000:. ./.:4:19,55:.:-1.18:1.000:. ./.:4:40,51:.:-0.41:1.000:. ./.:4:27,80:.: 0.31:1.000:. ./.:4:15,38:.:-2.13:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.49:1.000:. ./.:4:16,71:.:-0.59:1.000:. ./.:4:72,28:.:-0.01:1.000:. ./.:4:21,95:.: 0.71:1.000:. ./.:4:20,65:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,63:.:-0.96:1.000:. ./.:4:24,62:.:-0.64:1.000:. ./.:4:56,37:.:-0.32:1.000:. ./.:4:16,85:.: 0.04:1.000:. ./.:4:37,43:.:-0.91:1.000:. ./.:4:22,77:.:-0.05:1.000:. ./.:4:44,67:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,115:.: 1.70:1.000:. ./.:4:46,44:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,75:.:-0.01:1.000:. ./.:4:24,94:.: 0.80:1.000:. ./.:4:27,103:.: 1.34:1.000:. ./.:4:22,120:.: 1.88:1.000:. ./.:4:11,76:.:-0.59:1.000:. ./.:4:46,46:.:-0.37:1.000:. -chr4.1 81302983 chr4.1_081302983 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:20,39:0.67: 0.79:1.000:0.910 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,25:0.57:-0.15:1.000:0.937 0/0/1/1:4:28,39:0.57: 1.26:1.000:0.934 0/1/1/1:4:20,45:0.70: 1.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:43,24:0.37: 1.26:1.000:0.529 0/0/1/1:4:19,15:0.44:-0.67:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,50:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,30:0.46: 1.09:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.87:-2.26:1.000:0.931 1/1/1/1:4:6,52:0.90: 0.73:1.000:0.876 0/1/1/1:4:11,42:0.81: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,36:0.63: 0.68:1.000:0.599 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,47:0.72: 1.26:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 1.26:0.999:1.000 0/1/1/1:4:26,58:0.70: 2.26:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,67:0.76: 2.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,39:0.49: 1.85:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,10:0.92:-2.02:1.000:0.976 0/1/1/1:4:13,33:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,30:0.48: 0.91:1.000:0.995 1/1/1/1:4:6,49:0.90: 0.56:1.000:0.771 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,30:0.89:-0.67:1.000:0.540 0/0/1/1:4:32,30:0.47: 0.97:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,39:0.71: 0.62:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,48:0.70: 1.44:1.000:0.982 0/0/1/1:4:20,24:0.53:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:23,21:0.47:-0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:3,2:0.41:-2.38:1.000:0.835 0/0/1/1:4:5,5:0.48:-2.08:1.000:0.996 0/0/0:3:1,0:0.06:-2.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,30:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,21:0.51:-0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:5,39:0.89:-0.09:1.000:0.656 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,28:0.46: 0.85:1.000:0.987 0/0/0/1:4:37,16:0.33: 0.44:1.000:0.929 0/1/1/1:4:19,34:0.64: 0.44:1.000:0.739 0/0/1/1:4:23,37:0.62: 0.85:1.000:0.631 0/1/1/1:4:8,28:0.79:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,25:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,29:0.62: 0.09:1.000:0.626 1/1/1/1:4:4,48:0.93: 0.38:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,23:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-1.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,14:0.52:-1.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,45:0.77: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,33:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,31:0.55: 0.56:1.000:0.977 1/1/1/1:4:2,45:0.96: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,31:0.83:-0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,52:0.81: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,12:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,27:0.65:-0.21:1.000:0.755 0/0/0/1/1/1:6:14,19:0.57:-0.73:1.000:0.627 0/0/1/1:4:27,19:0.42: 0.03:1.000:0.896 0/0/0/1:4:29,14:0.35:-0.15:1.000:0.820 0/1/1/1:4:13,31:0.72:-0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,24:0.63:-0.44:1.000:0.599 0/0/1/1:4:24,39:0.62: 1.03:1.000:0.596 0/1/1/1:4:21,44:0.69: 1.14:1.000:0.967 0/1/1/1:4:6,14:0.71:-1.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,31:0.62: 0.26:1.000:0.581 0/0/1/1:4:17,20:0.53:-0.50:0.998:0.994 0/1/1/1:4:8,49:0.87: 0.68:1.000:0.913 0/0/1/1:4:15,19:0.55:-0.67:1.000:0.983 0/0/0/1:4:12,6:0.35:-1.61:1.000:0.765 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,24:0.48: 0.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:3,24:0.90:-1.09:1.000:0.723 0/1/1/1:4:17,29:0.63: 0.03:1.000:0.582 0/1/1/1:4:12,25:0.68:-0.50:1.000:0.965 0/1/1/1:4:16,33:0.68: 0.21:1.000:0.959 0/1/1/1:4:19,32:0.63: 0.32:1.000:0.535 0/1/1/1:4:12,23:0.66:-0.62:1.000:0.887 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,40:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,31:0.62: 0.26:1.000:0.581 0/0/1/1:4:21,27:0.55: 0.15:1.000:0.979 0/1/1/1:4:7,17:0.72:-1.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,39:0.77: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,24:0.72:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,35:0.85:-0.21:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,22:0.70:-0.79:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,21:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,37:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,29:0.67:-0.09:1.000:0.899 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,16:0.44:-0.56:1.000:0.968 1/1/1/1:4:3,31:0.92:-0.67:1.000:0.984 0/1/1/1:4:9,37:0.82: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,13:0.88:-1.79:1.000:0.834 0/1/1/1:4:18,35:0.67: 0.44:1.000:0.907 0/0/1/1:4:25,27:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,18:0.74:-1.20:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,28:0.71:-0.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,34:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.48:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,38:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,12:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,28:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,58:0.69: 2.32:1.000:0.977 0/1/1/1:4:7,30:0.82:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,18:0.55:-0.79:1.000:0.979 0/1/1/1:4:17,61:0.80: 1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,26:0.64:-0.26:0.999:0.638 0/0/1/1:4:13,17:0.56:-0.91:1.000:0.973 0/0/1/1:4:12,8:0.41:-1.50:1.000:0.835 0/1/1/1:4:13,37:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,16:0.64:-1.20:1.000:0.719 0/1/1/1:4:11,31:0.76:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,25:0.61:-0.26:1.000:0.724 0/0/1/1:4:12,14:0.52:-1.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,28:0.61: 0.03:1.000:0.737 0/1/1/1:4:6,31:0.85:-0.50:1.000:0.988 0/0/1/1:4:17,21:0.54:-0.44:1.000:0.988 0/0/0/1:4:47,12:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,20:0.49:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,17:0.36: 0.26:1.000:0.710 0/1/1/1:4:13,22:0.63:-0.62:1.000:0.553 0/1/1/1:4:4,10:0.73:-1.85:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,9:0.70:-1.91:1.000:0.989 0/1/1/1:4:5,19:0.81:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.71:-0.91:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.79:-1.14:0.991:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,24:0.53:-0.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:9,38:0.82: 0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:4,38:0.91:-0.21:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,29:0.82:-0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,34:0.86:-0.32:1.000:0.965 0/0/1/1:4:17,19:0.51:-0.56:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,38:0.98:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,9:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.43:-1.03:1.000:0.942 0/0/0/1:4:60,25:0.32: 2.32:1.000:0.949 0/0/1/1:4:29,24:0.45: 0.44:1.000:0.977 0/1/1/1:4:17,36:0.69: 0.44:1.000:0.972 0/1/1/1:4:19,33:0.64: 0.38:1.000:0.645 0/1/1/1:4:12,48:0.81: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,33:0.61: 0.50:1.000:0.707 1/1/1/1:4:6,49:0.90: 0.56:1.000:0.771 0/0/1/1:4:38,29:0.43: 1.26:1.000:0.951 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:25,39:0.61: 1.09:1.000:0.729 0/1/1/1:4:10,23:0.71:-0.73:1.000:0.992 1/1/1/1:4:4,38:0.91:-0.21:1.000:0.956 0/0/1/1:4:35,46:0.56: 2.08:1.000:0.971 0/1/1/1:4:23,40:0.64: 1.03:1.000:0.649 0/0/0/1:4:46,12:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,31:0.54: 0.62:1.000:0.987 1/1/1/1:4:6,46:0.89: 0.38:1.000:0.606 0/0/1/1:4:26,17:0.40:-0.15:1.000:0.807 0/1/1/1:4:11,44:0.81: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,38:0.53: 1.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,13:0.65:-1.50:1.000:0.831 0/0/0/1:4:36,15:0.32: 0.32:1.000:0.949 0/1/1/1:4:16,28:0.64:-0.09:1.000:0.670 1/1/1/1:4:5,42:0.90: 0.09:1.000:0.827 0/0/1/1:4:27,24:0.46: 0.32:1.000:0.988 0/1/1/1:4:15,30:0.67:-0.03:1.000:0.937 0/0/1/1:4:19,16:0.45:-0.62:1.000:0.981 0/0/1/1:4:21,22:0.49:-0.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,73:1.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,32:0.54: 0.73:1.000:0.989 0/1/1/1:4:6,25:0.82:-0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,28:0.67:-0.21:1.000:0.937 0/1/1/1:4:22,45:0.68: 1.26:1.000:0.954 0/1/1/1:4:15,44:0.76: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,48:0.65: 1.67:1.000:0.818 0/1/1/1:4:15,36:0.72: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:4,44:0.92: 0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,44:0.75: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,43:0.51: 2.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,18:0.32: 0.97:1.000:0.957 0/1/1/1:4:7,45:0.88: 0.38:1.000:0.852 -chr4.1 82263220 chr4.1_082263220 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:367,129:0.22: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,179:0.56:-1.25:1.000:0.962 0/0/0/1:4:295,154:0.33: 0.24:1.000:0.918 0/0/0/1:4:295,132:0.28: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:331,145:0.27: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:361,144:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,101:0.32:-1.27:1.000:0.960 0/0/0/0:4:459,66:0.07: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/0:4:399,60:0.08: 0.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:207,88:0.26:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,93:0.50:-2.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,266:0.75:-1.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,118:0.26:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:307,109:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:449,53:0.05: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:448,52:0.05: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:299,135:0.28: 0.09:0.999:0.995 0/0/1/1:4:149,181:0.54:-0.98:1.000:0.985 0/0/0/0:4:577,93:0.09: 2.52:1.000:0.955 0/0/0/1:4:360,126:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,28:0.09:-2.36:1.000:0.917 0/0/0/1:4:279,100:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:363,157:0.27: 0.98:1.000:0.998 0/0/0/1:4:288,108:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,32:0.14:-2.64:1.000:0.974 0/0/0/1:4:328,157:0.30: 0.62:1.000:0.985 0/0/0/1:4:341,122:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,107:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:460,82:0.10: 1.20:1.000:0.756 0/0/0/0:4:459,54:0.05: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:319,147:0.29: 0.42:1.000:0.993 0/0/0/1:4:250,112:0.28:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,72:0.46:-2.63:1.000:0.985 0/0/0/1:4:135,79:0.37:-2.17:1.000:0.542 0/0/1:3:69,45:0.41:-3.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:290,118:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:280,132:0.30:-0.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:287,145:0.32: 0.07:1.000:0.955 0/0/0/1:4:324,144:0.28: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:451,87:0.11: 1.16:1.000:0.577 0/0/0/1:4:306,145:0.30: 0.27:1.000:0.987 0/0/0/1:4:292,119:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:497,72:0.08: 1.48:1.000:0.995 0/0/0/0:4:404,68:0.09: 0.48:1.000:0.901 0/0/0/1:4:327,153:0.29: 0.56:1.000:0.990 0/0/1/1:4:280,175:0.40: 0.31:1.000:0.752 0/0/0/0:4:560,86:0.08: 2.27:1.000:0.982 0/0/0/1:4:188,41:0.13:-2.02:1.000:0.921 0/0/0/1:4:285,127:0.28:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:374,67:0.10: 0.16:1.000:0.738 0/0/0/1:4:270,108:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,130:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,132:0.40:-0.87:1.000:0.787 0/0/0/1:4:343,139:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:427,66:0.08: 0.70:1.000:0.980 0/0/0/1:4:432,82:0.11: 0.91:1.000:0.505 0/0/0/1:4:265,126:0.30:-0.35:1.000:0.986 0/0/0/1:4:300,133:0.27: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:281,131:0.29:-0.14:1.000:0.991 0/0/0/0/0/1:6:338,71:0.13:-0.17:1.000:0.988 0/0/0/0:4:435,66:0.08: 0.78:1.000:0.986 0/0/0/1:4:260,140:0.34:-0.26:1.000:0.858 0/0/0/0:4:363,68:0.11: 0.06:1.000:0.555 0/0/0/1:4:254,138:0.34:-0.34:1.000:0.835 0/0/0/1:4:322,161:0.32: 0.59:1.000:0.963 0/0/0/1:4:458,142:0.19: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:319,61:0.11:-0.47:1.000:0.538 0/0/0/1:4:307,138:0.28: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:342,147:0.26: 0.66:0.998:0.998 0/0/0/1:4:281,98:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,150:0.27: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,99:0.32:-1.32:1.000:0.963 0/0/0/1:4:313,184:0.37: 0.74:1.000:0.520 0/0/0/1:4:303,135:0.28: 0.13:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,284:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:330,59:0.10:-0.37:1.000:0.745 0/0/0/0:4:368,65:0.10: 0.08:1.000:0.786 0/0/0/1:4:287,136:0.30:-0.02:1.000:0.987 0/0/0/0:4:419,58:0.07: 0.53:1.000:0.998 0/0/0/0:4:457,57:0.06: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,110:0.27:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/0:4:395,68:0.10: 0.39:1.000:0.856 0/0/0/1:4:500,97:0.11: 1.77:1.000:0.601 0/0/0/1:4:248,104:0.26:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:461,84:0.10: 1.23:1.000:0.674 0/0/0/1:4:426,85:0.12: 0.88:1.000:0.713 0/0/0/0:4:322,54:0.09:-0.51:1.000:0.907 0/0/0/1:4:257,141:0.35:-0.28:1.000:0.807 0/0/0/1:4:401,77:0.11: 0.54:1.000:0.557 0/0/0/0:4:363,59:0.09:-0.03:1.000:0.947 0/0/0/0:4:341,60:0.10:-0.25:1.000:0.798 0/0/0/0:4:429,62:0.08: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:310,187:0.38: 0.74:1.000:0.604 0/0/0/1:4:205,100:0.31:-1.24:1.000:0.977 0/0/0/1:4:302,132:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:327,169:0.33: 0.73:1.000:0.932 0/0/0/0:4:335,59:0.10:-0.32:1.000:0.795 1/1/1/1:4:0,220:1.00:-2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,141:0.33:-0.12:1.000:0.932 0/0/0/1:4:289,113:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,68:0.14:-0.63:1.000:0.965 0/0/0/1:4:295,167:0.36: 0.38:1.000:0.693 0/0/0/1:4:219,108:0.31:-1.01:1.000:0.972 0/0/0/1:4:279,146:0.33: 0.00:1.000:0.914 0/0/0/1:4:197,94:0.30:-1.38:1.000:0.985 0/0/0/1:4:234,128:0.35:-0.65:1.000:0.816 0/0/0/1:4:308,73:0.14:-0.45:1.000:0.979 0/0/0/1:4:298,113:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:459,78:0.10: 1.15:1.000:0.884 0/0/0/1:4:251,129:0.33:-0.47:1.000:0.938 0/0/0/1:4:258,149:0.37:-0.19:1.000:0.605 0/0/0/1:4:399,163:0.25: 1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:292,141:0.30: 0.08:0.999:0.982 0/0/0/1:4:290,147:0.32: 0.12:1.000:0.952 0/0/0/1:4:227,96:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:318,151:0.30: 0.45:1.000:0.987 0/0/0/1:4:230,125:0.34:-0.72:1.000:0.834 0/0/0/1:4:280,110:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,143:0.36:-0.30:1.000:0.700 0/0/0/0:4:370,59:0.09: 0.04:1.000:0.963 0/0/0/1:4:263,149:0.36:-0.14:1.000:0.690 0/0/0/0:4:397,59:0.08: 0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:313,175:0.36: 0.65:1.000:0.742 0/0/0/0:4:483,72:0.08: 1.34:1.000:0.990 0/0/0/1:4:265,142:0.34:-0.19:1.000:0.869 0/0/0/0:4:524,63:0.06: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,142:0.35:-0.23:1.000:0.831 1/1/1/1:4:0,249:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,106:0.33:-1.22:1.000:0.901 0/0/0/0:4:331,37:0.05:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,116:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:294,144:0.31: 0.13:1.000:0.976 0/0/0/1:4:166,86:0.33:-1.78:0.991:0.928 0/0/0/1:4:266,98:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:401,49:0.06: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:396,169:0.26: 1.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:295,122:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:392,79:0.12: 0.47:1.000:0.747 0/0/0/1:4:268,130:0.31:-0.28:1.000:0.980 0/0/0/1:4:287,118:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:305,135:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:449,66:0.08: 0.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:271,124:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:209,96:0.29:-1.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:329,169:0.33: 0.75:1.000:0.939 0/0/0/1:4:417,204:0.31: 2.02:1.000:0.976 0/0/0/1:4:303,112:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,134:0.28: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/0:4:515,68:0.07: 1.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:401,60:0.08: 0.37:1.000:0.989 0/0/0/1:4:340,162:0.30: 0.79:1.000:0.986 0/0/0/1:4:279,111:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,96:0.52:-2.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:221,93:0.26:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:316,167:0.34: 0.59:1.000:0.897 0/0/0/0:4:475,61:0.06: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:504,74:0.08: 1.57:1.000:0.993 0/0/0/0:4:500,81:0.09: 1.60:1.000:0.950 0/0/1/1:4:238,143:0.38:-0.45:1.000:0.585 0/0/0/0:4:484,74:0.08: 1.37:1.000:0.984 0/0/0/1:4:240,111:0.29:-0.76:1.000:0.992 0/0/0/1:4:285,107:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,122:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:482,70:0.08: 1.31:1.000:0.994 0/0/0/0:4:459,50:0.05: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:411,64:0.08: 0.51:1.000:0.977 0/0/0/0:4:356,57:0.09:-0.13:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,246:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:413,64:0.08: 0.53:1.000:0.979 0/0/0/1:4:281,123:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:249,112:0.28:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:224,96:0.26:-1.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:293,129:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:412,60:0.08: 0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:263,104:0.24:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,117:0.35:-0.99:1.000:0.788 0/0/0/1:4:404,166:0.25: 1.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:467,77:0.09: 1.22:1.000:0.931 0/0/0/1:4:281,106:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,121:0.37:-1.00:1.000:0.547 0/0/0/1:4:318,138:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/0:4:561,103:0.11: 2.46:1.000:0.642 0/0/0/1:4:381,169:0.28: 1.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:244,110:0.28:-0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,203:0.56:-0.82:1.000:0.964 -chr4.1 82295500 chr4.1_082295500 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:135,84:0.34: 1.09:1.000:0.865 0/1/1/1:4:45,96:0.68:-0.23:1.000:0.954 0/0/1/1:4:102,76:0.40: 0.40:1.000:0.775 0/0/0/1:4:156,74:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,80:0.27: 1.47:1.000:0.997 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,37:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,67:0.21: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,3:0.07:-2.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,29:0.26:-1.11:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,69:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,78:0.32: 1.01:1.000:0.964 0/0/0/1:4:194,66:0.20: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,1:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,79:0.39: 0.57:0.999:0.683 0/0/0/1:4:227,70:0.19: 2.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,63:0.30: 0.38:1.000:0.981 0/0/0/1:4:173,90:0.29: 1.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:108,57:0.29: 0.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:27,11:0.23:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,66:0.33: 0.35:1.000:0.912 0/0/0/1:4:140,63:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,67:0.32: 0.45:1.000:0.946 0/0/0/1:4:245,87:0.21: 3.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,66:0.21: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,61:0.28: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,70:0.40: 0.14:1.000:0.804 0/0/1/1:4:34,32:0.48:-1.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:36,13:0.21:-1.79:1.000:1.000 0/0/1:3:39,17:0.24:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,61:0.26: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,66:0.27: 0.80:1.000:0.998 0/0/0/0:4:113,1:0.01:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,63:0.39:-0.06:1.000:0.636 0/0/0/1:4:136,63:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:86,1:0.01:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,67:0.22: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,2:0.01:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,68:0.39: 0.11:1.000:0.715 0/0/0/0:4:262,3:0.01: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,90:0.22: 2.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,1:0.01:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,1:0.01:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,73:0.31: 0.79:1.000:0.968 0/0/1/1:4:70,60:0.44:-0.42:1.000:0.973 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,1:0.01:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,53:0.33:-0.25:1.000:0.903 0/0/0/1:4:93,64:0.37: 0.04:1.000:0.529 0/0/0/0:4:77,1:0.01:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:102,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,58:0.29: 0.25:1.000:0.993 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,54:0.41:-0.53:1.000:0.888 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,55:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,57:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,53:0.34:-0.30:0.998:0.835 0/0/0/1:4:118,79:0.36: 0.72:1.000:0.643 0/0/0/0:4:91,1:0.01:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,63:0.32: 0.30:1.000:0.959 0/0/0/1:4:118,64:0.30: 0.47:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,37:0.17: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:148,1:0.01:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,59:0.40:-0.28:1.000:0.782 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,41:0.19: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,83:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,1:0.01: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,1:0.01:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,55:0.35:-0.21:1.000:0.830 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,71:0.29: 0.87:1.000:0.992 0/0/0/0:4:110,1:0.01:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,55:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,62:0.37:-0.03:1.000:0.572 0/0/0/1:4:98,51:0.29:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:80,50:0.34:-0.42:1.000:0.856 0/0/0/1:4:83,51:0.34:-0.35:1.000:0.889 0/0/0/1:4:115,42:0.21: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,65:0.40:-0.04:1.000:0.783 0/0/0/1:4:121,64:0.29: 0.52:1.000:0.992 0/0/0/0:4:194,2:0.01: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,60:0.32: 0.16:1.000:0.961 0/0/0/1:4:58,28:0.26:-1.16:1.000:0.998 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,41:0.34:-0.79:1.000:0.896 0/0/0/0:4:68,3:0.03:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,65:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,64:0.37: 0.04:1.000:0.529 0/0/0/0:4:88,1:0.01:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,81:0.31: 1.19:1.000:0.975 0/0/0/0:4:111,1:0.01:-0.72:0.999:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,30:0.19:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,68:0.35: 0.35:1.000:0.816 0/0/0/0:4:80,1:0.01:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,46:0.31:-0.47:1.000:0.970 0/0/0/0:4:84,3:0.03:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,63:0.33: 0.23:1.000:0.924 0/0/0/0:4:136,1:0.01:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,1:0.01:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,51:0.35:-0.42:1.000:0.772 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-2.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,2:0.03:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,44:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,51:0.35:-0.42:1.000:0.772 0/0/0/1:4:126,80:0.35: 0.87:1.000:0.819 0/0/0/1:4:69,29:0.23:-0.96:0.991:1.000 0/0/0/1:4:107,53:0.27: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,84:0.35: 1.04:1.000:0.813 0/0/0/0:4:110,1:0.01:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,47:0.30:-0.35:1.000:0.988 0/0/0/0:4:66,3:0.03:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,47:0.34:-0.53:1.000:0.877 0/0/0/1:4:127,50:0.22: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,1:0.01:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,29:0.26:-1.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:138,2:0.01:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,91:0.28: 1.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,79:0.33: 0.97:1.000:0.936 0/0/0/1:4:119,77:0.35: 0.70:1.000:0.765 0/0/0/1:4:171,83:0.27: 1.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:144,61:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,1:0.01:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,73:0.35: 0.55:1.000:0.796 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-2.28:1.000:0.997 0/0/0/0:4:124,1:0.01:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,70:0.36: 0.38:1.000:0.729 0/0/0/0:4:196,1:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,3:0.02:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,69:0.17: 2.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,58:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,49:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,72:0.19: 2.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,123:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,50:0.33:-0.36:1.000:0.919 0/0/0/1:4:143,56:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,54:0.40:-0.47:1.000:0.753 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,73:0.31: 0.79:1.000:0.968 0/0/0/1:4:174,69:0.23: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,72:0.34: 0.55:1.000:0.852 0/0/0/1:4:93,27:0.18:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:150,1:0.01:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:277,1:0.00: 2.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:193,1:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,72:0.50:-0.21:1.000:0.997 -chr4.1 82393467 chr4.1_082393467 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:254,68:.: 0.73:1.000:. ./.:4:188,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:229,71:.: 0.42:1.000:. ./.:4:233,65:.: 0.39:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:169,106:.: 0.06:1.000:. ./.:4:236,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:76,18:.:-2.49:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:244,69:.: 0.60:1.000:. ./.:4:246,67:.: 0.60:1.000:. ./.:4:148,90:.:-0.46:1.000:. ./.:4:220,11:.:-0.56:1.000:. ./.:4:241,81:.: 0.73:0.999:. ./.:4:158,97:.:-0.22:1.000:. ./.:4:244,131:.: 1.48:1.000:. ./.:4:431,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:53,17:.:-2.83:1.000:. ./.:4:221,70:.: 0.29:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:223,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,8:.:-3.45:1.000:. ./.:4:268,71:.: 0.97:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:211,96:.: 0.52:1.000:. ./.:4:269,30:.: 0.40:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:205,57:.:-0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:119,0:.:-2.14:1.000:. ./.:3:10,7:.:-3.58:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:258,71:.: 0.83:1.000:. ./.:4:264,58:.: 0.73:1.000:. ./.:4:239,15:.:-0.23:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:235,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:149,80:.:-0.59:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:251,63:.: 0.61:1.000:. ./.:4:194,96:.: 0.28:1.000:. ./.:4:27,34:.:-2.96:1.000:. ./.:4:207,56:.:-0.11:1.000:. ./.:4:119,67:.:-1.19:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:227,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:247,59:.: 0.50:1.000:. ./.:4:123,89:.:-0.83:1.000:. ./.:4:234,12:.:-0.35:1.000:. ./.:4:287,2:.: 0.26:1.000:. ./.:4:238,54:.: 0.30:1.000:. ./.:4:196,51:.:-0.33:1.000:. ./.:6:185,29:.:-0.80:1.000:. ./.:4:237,15:.:-0.26:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:213,77:.: 0.28:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:328,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:228,87:.: 0.63:1.000:. ./.:4:209,11:.:-0.71:1.000:. ./.:4:232,59:.: 0.29:1.000:. ./.:4:220,53:.: 0.04:0.998:. ./.:4:121,40:.:-1.55:1.000:. ./.:4:243,78:.: 0.71:1.000:. ./.:4:195,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:172,23:.:-1.07:1.000:. ./.:4:270,63:.: 0.88:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:125,68:.:-1.09:1.000:. ./.:4:135,70:.:-0.92:1.000:. ./.:4:265,62:.: 0.80:1.000:. ./.:4:179,88:.:-0.05:1.000:. ./.:4:183,79:.:-0.12:1.000:. ./.:4:130,31:.:-1.55:1.000:. ./.:4:150,73:.:-0.67:1.000:. ./.:4:183,91:.: 0.05:1.000:. ./.:4:198,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:140,71:.:-0.84:1.000:. ./.:4:181,90:.: 0.01:1.000:. ./.:4:144,58:.:-0.97:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:206,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:138,73:.:-0.84:1.000:. ./.:4:125,72:.:-1.04:1.000:. ./.:4:218,12:.:-0.57:1.000:. ./.:4:261,75:.: 0.93:1.000:. ./.:4:172,51:.:-0.67:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:263,64:.: 0.80:1.000:. ./.:4:201,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:132,55:.:-1.18:1.000:. ./.:4:260,71:.: 0.86:1.000:. ./.:4:226,67:.: 0.32:1.000:. ./.:4:244,47:.: 0.29:1.000:. ./.:4:189,62:.:-0.28:1.000:. ./.:4:213,72:.: 0.21:1.000:. ./.:4:133,65:.:-1.02:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:205,111:.: 0.64:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:225,54:.: 0.12:1.000:. ./.:4:426,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.86:0.999:. ./.:4:309,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:224,65:.: 0.26:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:208,45:.:-0.25:1.000:. ./.:4:228,60:.: 0.25:1.000:. ./.:4:128,69:.:-1.04:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:184,82:.:-0.06:1.000:. ./.:4:255,72:.: 0.80:1.000:. ./.:4:279,25:.: 0.47:1.000:. ./.:4:185,58:.:-0.39:1.000:. ./.:4:230,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:308,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:203,47:.:-0.29:1.000:. ./.:4:107,55:.:-1.53:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:238,73:.: 0.57:1.000:. ./.:4:157,34:.:-1.12:0.991:. ./.:4:223,58:.: 0.15:1.000:. ./.:4:195,8:.:-0.95:1.000:. ./.:4:309,91:.: 1.83:1.000:. ./.:4:225,65:.: 0.28:1.000:. ./.:4:172,66:.:-0.46:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:223,66:.: 0.26:1.000:. ./.:4:223,55:.: 0.11:1.000:. ./.:4:164,76:.:-0.43:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:258,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:282,88:.: 1.41:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:292,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,70:.:-1.08:1.000:. ./.:4:315,70:.: 1.62:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,13:.:-3.14:1.000:. ./.:4:164,39:.:-0.95:1.000:. ./.:4:228,57:.: 0.21:1.000:. ./.:4:153,93:.:-0.35:1.000:. ./.:4:278,25:.: 0.46:1.000:. ./.:4:178,99:.: 0.09:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:274,18:.: 0.30:1.000:. ./.:4:233,64:.: 0.37:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,104:.: 0.12:1.000:. ./.:4:204,21:.:-0.64:1.000:. ./.:4:235,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:150,64:.:-0.80:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:260,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:216,69:.: 0.21:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:226,78:.: 0.47:1.000:. ./.:4:235,15:.:-0.29:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:191,49:.:-0.43:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:192,103:.: 0.35:1.000:. ./.:4:244,56:.: 0.42:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:273,79:.: 1.15:1.000:. ./.:4:206,105:.: 0.57:1.000:. ./.:4:393,1:.: 1.74:1.000:. ./.:4:284,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:208,17:.:-0.64:1.000:. -chr4.1 82713157 chr4.1_082713157 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:41,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:0.999:. ./.:4:45,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.36:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.44:1.000:. ./.:6:60,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.99:0.998:. ./.:4:52,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,0:.: 3.46:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:67,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.21:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.02:0.991:. ./.:4:26,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.80:1.000:. -chr4.1 82942714 chr4.1_082942714 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:33,66:0.65:-0.58:1.000:0.771 0/1/1/1:4:10,65:0.86:-1.31:1.000:0.976 0/0/0/1:4:80,24:0.30:-0.43:1.000:0.984 0/0/1/1:4:33,57:0.61:-0.85:1.000:0.647 1/1/1/1:4:11,119:0.91: 0.37:1.000:0.937 0/1/1/1:4:25,82:0.75:-0.33:1.000:0.999 1/1/1/1:4:9,89:0.90:-0.61:1.000:0.828 0/1/1/1:4:29,102:0.76: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,92:0.96:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,40:0.77:-2.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-2.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,87:0.73:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,78:0.65:-0.06:1.000:0.822 0/1/1/1:4:25,65:0.70:-0.85:1.000:0.988 0/0/1/1:4:34,49:0.57:-1.07:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,81:0.67:-0.03:0.999:0.935 0/0/0/1:4:70,35:0.37:-0.39:1.000:0.541 0/1/1/1:4:42,127:0.73: 1.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,122:0.73: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,35:0.62:-1.92:1.000:0.609 0/0/1/1:4:81,43:0.38: 0.19:1.000:0.580 1/1/1/1:4:4,108:0.96:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,32:0.38:-0.76:1.000:0.556 0/0/1/1:4:11,7:0.41:-3.06:1.000:0.862 0/0/1/1:4:72,38:0.38:-0.24:1.000:0.569 0/1/1/1:4:28,61:0.67:-0.88:1.000:0.906 1/1/1/1:4:6,91:0.93:-0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,99:0.63: 1.04:1.000:0.591 1/1/1/1:4:9,113:0.92: 0.13:1.000:0.990 1/1/1/1:4:7,104:0.93:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,25:0.41:-1.65:1.000:0.869 0/0/0/1:4:15,6:0.34:-2.97:1.000:0.875 1/1/1/1:4:2,50:0.96:-2.02:1.000:1.000 0/0/1:3:12,4:0.31:-3.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,78:0.64: 0.00:1.000:0.711 0/0/1/1:4:31,56:0.62:-0.95:1.000:0.512 0/0/1/1:4:58,61:0.49: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,57:0.53:-0.46:1.000:0.991 1/1/1/1:4:9,88:0.90:-0.64:1.000:0.806 0/1/1/1:4:31,121:0.78: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,106:0.73: 0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,124:0.88: 0.65:1.000:0.666 0/1/1/1:4:20,65:0.75:-1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,150:0.83: 1.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:71,25:0.32:-0.67:1.000:0.949 0/0/1/1:4:83,92:0.50: 1.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,23:0.62:-2.51:1.000:0.576 0/0/1/1:4:57,61:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,39:0.58:-1.62:1.000:0.914 0/1/1/1:4:29,96:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,100:0.88:-0.15:1.000:0.832 0/0/1/1:4:47,80:0.61: 0.28:1.000:0.687 0/0/1/1:4:66,85:0.54: 1.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:60,76:0.54: 0.55:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,72:0.61:-0.09:1.000:0.729 0/0/1/1:4:86,44:0.38: 0.37:1.000:0.505 0/0/1/1:4:74,62:0.46: 0.55:1.000:0.985 0/1/1/1/1/1:6:10,123:0.92: 0.46:1.000:0.592 1/1/1/1:4:0,149:1.00: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:7,130:0.95: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,137:0.81: 1.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:13,126:0.90: 0.65:1.000:0.788 0/1/1/1:4:36,123:0.76: 1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,91:0.71: 0.22:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,38:0.37:-0.15:1.000:0.514 0/1/1/1:4:31,80:0.70:-0.21:0.998:0.987 0/1/1/1:4:27,59:0.67:-0.98:1.000:0.909 0/0/1/1:4:71,106:0.58: 1.81:1.000:0.918 0/1/1/1:4:23,92:0.78:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,110:0.89: 0.16:1.000:0.598 0/0/0/1:4:87,16:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,86:0.69: 0.13:1.000:0.968 0/0/1/1:4:35,57:0.60:-0.79:1.000:0.792 0/1/1/1:4:28,104:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,76:0.64:-0.06:1.000:0.641 0/0/1/1:4:84,57:0.42: 0.71:1.000:0.915 0/0/1/1:4:53,69:0.55: 0.13:1.000:0.984 0/1/1/1:4:18,70:0.78:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,111:0.78: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,134:0.75: 1.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,54:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,51:0.81:-1.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,95:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,108:0.81: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,140:1.00: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,85:0.67: 0.19:1.000:0.907 0/1/1/1:4:30,109:0.77: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,131:0.88: 0.89:1.000:0.692 0/1/1/1:4:44,95:0.66: 0.65:1.000:0.896 0/1/1/1:4:22,51:0.68:-1.37:1.000:0.954 0/0/1/1:4:56,82:0.57: 0.62:1.000:0.935 0/0/0/1:4:71,28:0.34:-0.58:1.000:0.886 0/1/1/1:4:30,111:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:8,135:0.94: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,92:0.68: 0.43:1.000:0.949 0/1/1/1:4:31,105:0.75: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,75:0.59: 0.16:1.000:0.864 0/0/1/1:4:42,74:0.62:-0.06:1.000:0.588 0/0/1/1:4:73,84:0.51: 1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,58:0.62:-0.82:1.000:0.596 0/0/1/1:4:52,72:0.56: 0.19:1.000:0.966 0/1/1/1:4:48,88:0.63: 0.55:1.000:0.534 0/1/1/1:4:32,74:0.68:-0.36:1.000:0.953 0/1/1/1:4:46,156:0.76: 2.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,89:0.95:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,63:0.54:-0.15:1.000:0.989 1/1/1/1:4:3,128:0.98: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,127:0.74: 1.50:0.999:0.999 0/1/1/1:4:40,122:0.74: 1.35:1.000:0.998 1/1/1/1:4:3,63:0.95:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,80:0.65: 0.06:1.000:0.771 0/1/1/1:4:31,94:0.73: 0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:63,32:0.37:-0.70:1.000:0.509 0/0/1/1:4:48,71:0.58: 0.03:1.000:0.927 0/0/1/1:4:46,68:0.58:-0.12:1.000:0.927 1/1/1/1:4:11,97:0.89:-0.30:1.000:0.531 0/0/1/1:4:50,77:0.59: 0.28:1.000:0.884 0/0/1/1:4:69,89:0.54: 1.23:1.000:0.986 0/1/1/1:4:28,110:0.78: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,72:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,140:0.78: 1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,125:0.88: 0.68:1.000:0.643 0/0/1/1:4:64,35:0.39:-0.58:1.000:0.638 0/1/1/1:4:24,79:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,46:0.59:-1.31:1.000:0.841 0/1/1/1:4:36,73:0.65:-0.27:1.000:0.799 0/0/1/1:4:48,76:0.59: 0.19:1.000:0.844 0/0/1/1:4:30,54:0.62:-1.04:0.991:0.523 0/1/1/1:4:26,65:0.70:-0.82:1.000:0.981 0/1/1/1:4:35,97:0.72: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,35:0.38:-0.55:1.000:0.608 0/0/1/1:4:58,69:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,117:0.85: 0.55:1.000:0.988 0/1/1/1:4:12,101:0.89:-0.15:1.000:0.614 0/0/1/1:4:52,86:0.60: 0.62:1.000:0.759 0/0/1/1:4:82,50:0.40: 0.43:1.000:0.813 0/1/1/1:4:38,75:0.64:-0.15:1.000:0.740 0/1/1/1:4:31,104:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,93:0.88:-0.39:1.000:0.818 0/1/1/1:4:51,133:0.70: 2.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:79,44:0.39: 0.16:1.000:0.672 0/1/1/1:4:38,73:0.64:-0.21:1.000:0.671 1/1/1/1:4:13,118:0.89: 0.40:1.000:0.620 1/1/1/1:4:10,97:0.90:-0.33:1.000:0.790 0/0/1/1:4:36,63:0.62:-0.58:1.000:0.609 0/0/1/1:4:68,99:0.57: 1.50:1.000:0.939 1/1/1/1:4:5,96:0.95:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,27:0.59:-2.26:1.000:0.839 0/0/1/1:4:76,81:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,84:0.68: 0.10:1.000:0.941 0/0/1/1:4:68,74:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,151:0.83: 1.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,129:0.81: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,96:0.74: 0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:7,111:0.94: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,35:0.37:-0.30:1.000:0.624 0/1/1/1:4:19,80:0.79:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,76:0.85:-0.91:1.000:0.983 0/0/1/1:4:43,66:0.59:-0.27:1.000:0.888 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,122:0.80: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,92:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,35:0.42:-0.91:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,96:0.68: 0.58:1.000:0.959 0/0/1/1:4:68,78:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,55:0.59:-0.85:1.000:0.856 0/1/1/1:4:35,89:0.70: 0.19:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,70:0.94:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,63:0.50: 0.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:11,121:0.91: 0.43:1.000:0.948 0/0/1/1:4:54,84:0.59: 0.62:1.000:0.871 0/1/1/1:4:33,61:0.63:-0.73:1.000:0.559 0/1/1/1:4:23,85:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,81:0.54: 0.80:1.000:0.986 0/1/1/1:4:48,135:0.72: 1.99:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,129:0.70: 1.87:1.000:0.987 0/1/1/1:4:31,96:0.74: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,79:0.66:-0.03:1.000:0.844 -chr4.1 83533301 chr4.1_083533301 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:84,137:0.56: 0.55:1.000:0.966 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,144:0.85:-0.87:1.000:0.985 0/0/1/1:4:80,114:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,132:0.47: 1.28:1.000:0.992 0/1/1/1:4:64,213:0.75: 1.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,95:0.53:-1.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:120,122:0.45: 1.08:1.000:0.982 0/0/1/1:4:85,97:0.47:-0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,70:0.39:-0.72:1.000:0.636 0/0/1/1:4:71,68:0.44:-1.50:1.000:0.969 0/0/0/1:4:128,49:0.29:-0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:63,118:0.60:-0.45:1.000:0.787 0/0/1/1:4:96,132:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,95:0.48:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,126:0.46: 1.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:70,106:0.54:-0.57:0.999:0.988 0/0/1/1:4:88,121:0.51: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,140:0.44: 2.20:1.000:0.967 0/1/1/1:4:67,193:0.71: 1.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:55,155:0.71: 0.28:1.000:0.990 0/1/1/1:4:30,182:0.83: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,127:0.55: 0.23:1.000:0.981 0/1/1/1:4:27,144:0.82:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,51:0.58:-2.98:1.000:0.903 1/1/1/1:4:15,183:0.90:-0.02:1.000:0.725 0/1/1/1:4:17,181:0.89:-0.02:1.000:0.575 0/0/1/1:4:88,92:0.46:-0.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:118,136:0.47: 1.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,137:0.55: 0.65:1.000:0.982 0/0/1/1:4:87,112:0.49: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,135:0.86:-1.17:1.000:0.960 0/1/1/1:4:15,84:0.82:-2.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,119:0.65:-0.70:1.000:0.833 1/1/1:3:3,56:0.92:-3.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,167:0.88:-0.37:1.000:0.746 0/1/1/1:4:20,129:0.84:-1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,178:0.68: 1.25:1.000:0.949 0/1/1/1:4:56,117:0.63:-0.65:1.000:0.571 0/0/1/1:4:80,149:0.60: 0.75:1.000:0.801 0/1/1/1:4:61,156:0.68: 0.45:1.000:0.961 0/1/1/1:4:48,177:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,123:0.54: 0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:76,90:0.48:-0.82:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,197:0.75: 1.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,157:0.83:-0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:62,174:0.71: 0.93:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,64:0.45:-1.80:1.000:0.982 0/1/1/1:4:37,175:0.80: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,126:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,171:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,154:0.60: 0.93:1.000:0.780 0/0/1/1:4:71,120:0.57:-0.20:1.000:0.943 0/1/1/1:4:67,165:0.67: 0.83:1.000:0.935 0/1/1/1:4:43,151:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,121:0.47: 0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,90:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,176:0.87:-0.07:1.000:0.896 0/1/1/1:4:36,150:0.78:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:71,146:0.63: 0.45:1.000:0.816 0/0/1/1:4:112,124:0.47: 0.93:1.000:0.991 0/1/1/1:4:50,118:0.66:-0.77:1.000:0.886 0/0/1/1:4:111,157:0.52: 1.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,109:0.55:-0.50:1.000:0.982 0/1/1/1:4:55,157:0.71: 0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,91:0.42:-0.05:1.000:0.920 0/0/1/1:4:83,83:0.45:-0.82:1.000:0.979 1/1/1/1:4:14,162:0.89:-0.57:1.000:0.618 0/0/1/1:4:62,120:0.61:-0.42:0.998:0.696 0/0/0/1:4:121,35:0.25:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,197:0.77: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,145:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,179:0.83: 0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,51:0.34:-1.25:1.000:0.897 0/0/1/1:4:73,110:0.54:-0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:116,112:0.44: 0.73:1.000:0.971 0/0/1/1:4:82,131:0.55: 0.35:1.000:0.975 0/1/1/1:4:56,190:0.75: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,112:0.57:-0.52:1.000:0.940 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,131:0.48: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,124:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,147:0.72:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,102:0.45: 0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:119,108:0.43: 0.70:1.000:0.950 0/0/1/1:4:78,85:0.46:-0.90:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,91:0.57:-1.35:1.000:0.946 0/0/1/1:4:91,84:0.43:-0.60:1.000:0.957 0/0/1/1:4:77,113:0.53:-0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,116:0.47: 0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:52,120:0.66:-0.67:1.000:0.849 0/0/1/1:4:85,119:0.52: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,103:0.53:-0.67:1.000:0.990 0/1/1/1:4:24,161:0.84:-0.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,160:0.86:-0.45:1.000:0.974 0/1/1/1:4:46,156:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,83:0.74:-2.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,140:0.52: 1.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,190:0.85: 0.45:1.000:0.988 0/0/1/1:4:92,95:0.45:-0.30:1.000:0.984 0/0/1/1:4:86,100:0.48:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,74:0.48:-1.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,180:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,92:0.60:-1.45:1.000:0.781 0/1/1/1:4:54,161:0.72: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,136:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,195:0.87: 0.45:1.000:0.889 0/0/1/1:4:124,168:0.51: 2.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,112:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,168:0.72: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,150:0.55: 1.20:1.000:0.984 0/1/1/1:4:48,193:0.78: 1.05:0.999:1.000 0/1/1/1:4:42,172:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,84:0.57:-1.63:1.000:0.948 0/0/1/1:4:87,130:0.54: 0.45:1.000:0.990 0/1/1/1:4:50,176:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,167:0.84:-0.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,168:0.80: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,166:0.68: 0.83:1.000:0.951 0/0/1/1:4:79,118:0.53:-0.05:1.000:0.990 0/1/1/1:4:46,136:0.72:-0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,189:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,207:0.70: 2.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:35,148:0.78:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,176:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,121:0.64:-0.55:1.000:0.684 0/0/1/1:4:58,91:0.55:-1.25:1.000:0.980 0/1/1/1:4:42,136:0.74:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,84:0.55:-1.53:1.000:0.983 0/1/1/1:4:16,160:0.88:-0.57:1.000:0.712 0/0/1/1:4:91,100:0.47:-0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:46,81:0.58:-1.80:0.991:0.901 0/0/1/1:4:64,109:0.57:-0.65:1.000:0.937 0/1/1/1:4:42,148:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,236:0.87: 1.60:1.000:0.902 0/1/1/1:4:58,155:0.69: 0.35:1.000:0.979 0/0/1/1:4:73,109:0.53:-0.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:52,91:0.58:-1.40:1.000:0.909 0/1/1/1:4:42,162:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,200:0.87: 0.60:1.000:0.907 0/0/1/1:4:76,115:0.54:-0.20:1.000:0.988 0/1/1/1:4:49,153:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,82:0.49:-1.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,227:0.71: 2.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,225:0.84: 1.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,178:0.79: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,122:0.56:-0.05:1.000:0.967 0/0/1/1:4:85,113:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,112:0.59:-0.65:1.000:0.832 0/1/1/1:4:66,189:0.71: 1.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,121:0.54: 0.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:61,91:0.53:-1.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:41,146:0.76:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,133:0.53: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,143:0.62: 0.35:1.000:0.510 0/1/1/1:4:68,202:0.72: 1.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:125,119:0.44: 1.13:1.000:0.967 0/1/1/1:4:47,194:0.78: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,123:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,164:0.82:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,159:0.74: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,120:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,141:0.61: 0.35:1.000:0.659 0/0/1/1:4:76,103:0.51:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,191:0.76: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,88:0.46:-0.67:1.000:0.986 0/0/0/1:4:117,49:0.30:-0.82:1.000:0.984 0/0/1/1:4:96,109:0.47: 0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,179:0.79: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,178:0.76: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,127:0.81:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,102:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,102:0.47:-0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:48,91:0.60:-1.50:1.000:0.756 0/1/1/1:4:42,125:0.72:-0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,162:0.61: 1.18:1.000:0.707 0/0/1/1:4:86,126:0.53: 0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:96,105:0.47: 0.05:1.000:0.990 0/1/1/1:4:57,138:0.67:-0.10:1.000:0.918 0/1/1/1:4:64,174:0.70: 0.98:1.000:0.984 0/0/1/1:4:136,143:0.46: 2.00:1.000:0.986 0/1/1/1:4:71,218:0.73: 2.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,155:0.72: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:142,62:0.31: 0.13:1.000:0.977 -chr4.1 83786784 chr4.1_083786784 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,112:0.53: 1.02:1.000:0.993 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,75:0.34: 1.05:1.000:0.896 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,17:0.53:-1.58:1.000:0.993 0/1/1/1:4:1,9:0.70:-1.87:1.000:0.984 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,1:0.01:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,100:0.45: 1.19:1.000:0.976 0/0/1/1:4:61,100:0.52: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,80:0.50: 0.30:0.999:0.997 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,1:0.01:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,120:0.58: 0.86:1.000:0.926 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,1:0.01:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,101:0.44: 1.26:1.000:0.969 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,91:0.41: 1.10:1.000:0.883 0/0/1/1:4:98,105:0.44: 1.43:1.000:0.959 0/0/1/1:4:39,97:0.58: 0.28:1.000:0.908 0/0/1/1:4:123,112:0.40: 1.97:1.000:0.752 0/0/1/1:4:101,90:0.39: 1.22:1.000:0.698 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0:3:11,2:0.12:-1.81:1.000:0.979 0/0/1/1:4:92,79:0.38: 0.88:1.000:0.590 0/0/1/1:4:32,93:0.60: 0.10:1.000:0.784 0/0/1/1:4:97,96:0.42: 1.26:1.000:0.896 0/0/1/1:4:28,61:0.56:-0.52:1.000:0.960 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,81:0.39: 0.92:1.000:0.665 0/0/1/1:4:44,93:0.56: 0.30:1.000:0.968 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,89:0.43: 0.92:1.000:0.953 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,115:0.29: 3.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:41,17:0.22:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,74:0.44: 0.39:1.000:0.966 0/1/1/1:4:5,124:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,87:0.29: 2.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,74:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:97,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,1:0.01:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,80:0.55: 0.05:1.000:0.984 0/0/1/1:4:41,84:0.56: 0.10:1.000:0.974 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,70:0.35: 0.73:1.000:0.768 0/0/0/0:4:81,1:0.01:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.60:0.998:1.000 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,1:0.02:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,2:0.01:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,1:0.01: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,92:0.55: 0.34:1.000:0.981 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,72:0.74:-0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,81:0.39: 0.93:1.000:0.633 0/0/1/1:4:94,83:0.39: 0.98:1.000:0.673 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,84:0.46: 0.59:1.000:0.989 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,72:0.56:-0.21:1.000:0.973 0/0/1/1:4:50,84:0.53: 0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:98,66:0.32: 0.76:1.000:0.943 0/0/0/1:4:116,71:0.30: 1.15:1.000:0.984 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,113:0.77:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,94:0.36: 1.65:1.000:0.737 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,100:0.58: 0.39:1.000:0.930 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,112:0.48: 1.38:1.000:0.994 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,101:0.38: 1.70:1.000:0.580 0/0/0/0:4:117,1:0.01:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,113:0.88:-0.09:1.000:0.666 0/0/1/1:4:49,91:0.54: 0.35:0.999:0.987 0/0/1/1:4:105,96:0.40: 1.39:1.000:0.762 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,97:0.55: 0.44:1.000:0.976 0/0/0/1:4:108,82:0.35: 1.21:1.000:0.773 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,1:0.01:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,85:0.54: 0.18:1.000:0.985 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,59:0.56:-0.55:1.000:0.968 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,71:0.55:-0.23:1.000:0.975 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.91:0.991:1.000 0/0/1/1:4:43,99:0.57: 0.39:1.000:0.943 0/0/1/1:4:77,95:0.47: 0.90:1.000:0.992 0/0/1/1:4:109,123:0.45: 1.92:1.000:0.978 0/0/1/1:4:88,99:0.45: 1.15:1.000:0.977 0/0/1/1:4:76,76:0.42: 0.56:1.000:0.908 0/0/1/1:4:44,72:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,85:0.39: 1.05:1.000:0.681 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,77:0.34: 1.14:1.000:0.898 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,109:0.36: 2.16:1.000:0.649 0/1/1/1:4:2,96:0.75:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,115:0.55: 0.93:1.000:0.981 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,98:0.33: 2.01:1.000:0.900 0/1/1/1:4:1,93:0.86:-0.43:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,91:0.28: 2.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:195,117:0.30: 3.29:1.000:0.987 0/0/0/0:4:206,1:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,99:0.43: 1.24:1.000:0.955 0/0/1/1:4:70,80:0.45: 0.52:1.000:0.981 0/1/1/1:4:3,83:0.74:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.43: 0.61:1.000:0.956 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,95:0.53: 0.54:1.000:0.993 0/0/0/0:4:84,1:0.01:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,71:0.55:-0.21:1.000:0.980 0/0/1/1:4:49,98:0.55: 0.47:1.000:0.978 0/0/1/1:4:94,82:0.39: 0.97:1.000:0.638 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,88:0.55: 0.23:1.000:0.981 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,63:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,112:0.40: 1.96:1.000:0.771 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,113:0.34: 2.57:1.000:0.873 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 -chr4.1 83845317 chr4.1_083845317 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:55,190:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-1.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,319:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,95:0.34:-0.14:1.000:0.849 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,230:0.55: 1.85:1.000:0.984 0/0/1/1:4:130,83:0.38:-0.81:1.000:0.607 0/0/0/1:4:258,109:0.27: 1.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:193,94:0.31: 0.13:1.000:0.978 0/0/0/1:4:80,48:0.36:-1.88:1.000:0.629 0/0/1/1:4:64,49:0.44:-2.06:1.000:0.962 0/0/1/1:4:120,75:0.38:-1.03:1.000:0.527 0/0/0/1:4:165,80:0.31:-0.40:1.000:0.980 0/1/1/1:4:69,228:0.72: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,86:0.32:-0.31:1.000:0.944 0/0/0/1:4:264,98:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,114:0.43:-0.14:0.999:0.948 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,261:0.54: 2.62:1.000:0.986 0/0/1/1:4:255,232:0.49: 2.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,66:0.48:-1.70:1.000:0.994 0/1/1/1:4:79,170:0.66:-0.35:1.000:0.844 0/0/0/1:4:201,113:0.35: 0.47:1.000:0.823 0/1/1/1:4:95,196:0.65: 0.18:1.000:0.784 0/0/1/1:4:60,51:0.47:-2.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:97,177:0.63:-0.04:1.000:0.527 0/0/0/1:4:178,86:0.30:-0.16:1.000:0.981 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,117:0.31: 0.94:1.000:0.969 0/0/0/0:4:331,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,111:0.35: 0.37:1.000:0.793 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,39:0.63:-2.73:1.000:0.569 0/0/1/1:4:73,46:0.38:-1.99:1.000:0.558 1/1/1:3:3,67:0.95:-2.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,87:0.26: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,150:0.57:-0.20:1.000:0.944 0/0/1/1:4:171,182:0.52: 0.96:1.000:0.994 0/0/0/1:4:143,84:0.36:-0.63:1.000:0.702 0/0/0/1:4:202,123:0.37: 0.60:1.000:0.574 0/0/1/1:4:154,162:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:205,98:0.30: 0.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:159,100:0.38:-0.23:1.000:0.551 0/0/1/1:4:125,167:0.57: 0.19:1.000:0.950 0/0/0/1:4:268,103:0.25: 1.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,259:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:227,204:0.49: 1.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:80,34:0.27:-2.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,242:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,211:0.69: 0.20:1.000:0.967 0/0/0/1:4:191,80:0.27:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,103:0.37:-0.05:1.000:0.593 0/0/0/1:4:149,65:0.28:-0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,278:0.78: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,166:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:226,71:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,141:0.70:-1.07:1.000:0.982 0/1/1/1:4:88,190:0.66: 0.01:1.000:0.848 0/0/1/1:4:132,166:0.56: 0.26:1.000:0.972 0/0/0/0/1/1:6:205,108:0.33: 0.45:1.000:0.921 0/0/0/1:4:254,106:0.27: 1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,74:0.44:-1.35:1.000:0.965 0/0/1/1:4:139,172:0.55: 0.43:1.000:0.976 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,183:0.55: 0.72:1.000:0.980 0/0/1/1:4:146,178:0.55: 0.59:1.000:0.979 0/0/0/0:4:347,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,294:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,85:0.33:-0.40:0.998:0.919 0/0/0/1:4:158,92:0.36:-0.34:1.000:0.729 0/0/1/1:4:152,194:0.56: 0.87:1.000:0.967 0/0/1/1:4:117,162:0.58: 0.03:1.000:0.930 0/0/0/0:4:253,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,310:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,80:0.46:-1.27:1.000:0.989 0/0/0/1:4:131,67:0.32:-0.99:1.000:0.954 0/0/1/1:4:118,161:0.57: 0.03:1.000:0.939 0/0/1/1:4:142,101:0.41:-0.43:1.000:0.891 0/1/1/1:4:87,237:0.69: 0.59:1.000:0.980 0/0/0/1:4:189,74:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,188:0.55: 0.82:1.000:0.979 0/0/1/1:4:150,204:0.57: 0.97:1.000:0.941 0/0/1/1:4:112,159:0.58:-0.08:1.000:0.912 0/0/1/1:4:159,168:0.52: 0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:260,98:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,131:0.56:-0.53:1.000:0.971 0/0/1/1:4:109,82:0.43:-1.08:1.000:0.951 0/0/0/0:4:329,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,80:0.34:-0.65:1.000:0.862 0/0/1/1:4:150,151:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:225,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,87:0.36:-0.50:1.000:0.741 0/0/0/1:4:104,62:0.36:-1.40:1.000:0.652 0/1/1/1:4:95,185:0.64: 0.04:1.000:0.676 0/1/1/1:4:80,203:0.68: 0.08:1.000:0.962 0/0/0/1:4:206,64:0.21:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,77:0.37:-0.96:1.000:0.502 0/0/0/1:4:196,93:0.30: 0.15:1.000:0.985 0/0/0/1:4:195,92:0.30: 0.13:1.000:0.987 0/0/0/1:4:147,89:0.37:-0.52:1.000:0.595 0/0/1/1:4:69,121:0.62:-1.09:1.000:0.569 0/0/1/1:4:128,161:0.56: 0.15:1.000:0.972 0/1/1/1:4:35,149:0.76:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,184:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,153:0.55: 0.04:1.000:0.981 0/0/0/1:4:220,83:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,272:0.61: 2.04:1.000:0.730 0/0/0/1:4:144,85:0.36:-0.60:1.000:0.686 0/1/1/1:4:75,243:0.72: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:200,133:0.39: 0.71:1.000:0.743 0/0/1/1:4:113,167:0.59: 0.04:0.999:0.875 0/0/0/1:4:226,84:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,59:0.31:-1.25:1.000:0.971 0/0/1/1:4:152,126:0.46: 0.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:120,177:0.59: 0.25:1.000:0.877 1/1/1/1:4:0,224:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,271:0.81: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,218:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,157:0.52: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,176:0.57: 0.42:1.000:0.957 0/0/1/1:4:189,242:0.56: 1.94:1.000:0.966 0/1/1/1:4:40,230:0.81:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,179:0.52: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/0:4:223,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,159:0.74:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,110:0.56:-1.02:1.000:0.967 0/1/1/1:4:82,158:0.64:-0.47:1.000:0.653 0/1/1/1:4:74,142:0.64:-0.77:1.000:0.644 0/1/1/1:4:57,163:0.70:-0.72:1.000:0.987 0/0/0/1:4:108,65:0.37:-1.31:0.991:0.617 0/0/1/1:4:125,95:0.43:-0.72:1.000:0.957 0/0/1/1:4:168,164:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,236:0.62: 1.17:1.000:0.559 0/0/1/1:4:164,171:0.52: 0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:196,79:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,140:0.57:-0.42:1.000:0.946 0/1/1/1:4:71,175:0.68:-0.39:1.000:0.951 0/0/0/1:4:157,84:0.33:-0.45:1.000:0.910 0/0/1/1:4:147,184:0.56: 0.68:1.000:0.973 0/0/0/1:4:109,61:0.35:-1.35:1.000:0.833 0/0/1/1:4:192,236:0.55: 1.90:1.000:0.977 0/1/1/1:4:128,241:0.63: 1.16:1.000:0.601 0/0/0/1:4:179,94:0.33:-0.05:1.000:0.931 0/0/0/1:4:140,81:0.35:-0.70:1.000:0.749 0/0/1/1:4:183,117:0.38: 0.29:1.000:0.612 0/0/1/1:4:94,157:0.61:-0.33:1.000:0.680 0/0/1/1:4:221,236:0.52: 2.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:154,77:0.31:-0.58:1.000:0.967 0/0/1/1:4:48,30:0.38:-2.50:1.000:0.527 0/0/1/1:4:138,190:0.57: 0.64:1.000:0.934 0/0/0/1:4:152,89:0.36:-0.45:1.000:0.712 0/0/1/1:4:188,171:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:357,145:0.26: 2.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:296,115:0.25: 1.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,177:0.57: 0.43:1.000:0.955 0/0/0/1:4:215,106:0.31: 0.55:1.000:0.974 0/0/1/1:4:91,157:0.62:-0.36:1.000:0.607 0/0/0/1:4:170,74:0.28:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,81:0.34:-0.59:1.000:0.887 0/1/1/1:4:104,195:0.63: 0.28:1.000:0.591 0/0/0/0:4:389,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,195:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,164:0.52: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:72,85:0.54:-1.51:0.999:0.985 0/0/0/1:4:256,94:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,158:0.55: 0.10:1.000:0.974 0/1/1/1:4:46,226:0.79:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,136:0.70:-1.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:152,105:0.41:-0.25:1.000:0.839 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,86:0.40:-0.79:1.000:0.772 0/1/1/1:4:58,225:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:334,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,107:0.31: 0.59:1.000:0.973 0/0/0/1:4:161,98:0.37:-0.23:1.000:0.575 0/0/1/1:4:136,175:0.56: 0.43:1.000:0.965 0/0/1/1:4:197,227:0.54: 1.85:1.000:0.988 0/0/0/1:4:302,133:0.28: 1.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:308,112:0.24: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,175:0.56: 0.42:1.000:0.962 0/0/0/1:4:154,87:0.35:-0.45:1.000:0.812 -chr4.1 83932823 chr4.1_083932823 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:59,30:0.24: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,61:0.64: 1.52:1.000:0.632 0/0/1/1:4:34,32:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,33:0.36: 0.96:1.000:0.717 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,28:0.32: 0.59:1.000:0.961 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,2:0.08:-1.91:1.000:0.994 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,36:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,40:0.48: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,32:0.42: 0.55:1.000:0.915 0/0/0/1:4:34,24:0.37:-0.10:1.000:0.585 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,36:0.38: 1.20:0.999:0.523 0/0/0/1:4:48,33:0.36: 0.96:1.000:0.717 0/0/1/1:4:55,40:0.38: 1.61:1.000:0.577 0/0/0/1:4:50,26:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,7:0.54:-2.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:31,54:0.62: 1.15:1.000:0.590 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,57:0.71: 0.73:1.000:0.993 0/0/0/0:4:17,2:0.08:-1.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:21,76:0.74: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,24:0.38:-0.15:1.000:0.577 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,41:0.42: 1.47:1.000:0.923 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,50:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.15:-2.56:1.000:0.981 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-2.24:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:41,26:0.32: 0.31:1.000:0.940 0/0/1/1:4:38,29:0.40: 0.31:1.000:0.796 0/0/1/1:4:34,33:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,28:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.44:-0.15:1.000:0.967 0/0/0/1:4:34,18:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,19:0.52:-1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,25:0.53:-0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:25,49:0.64: 0.64:1.000:0.694 0/1/1/1:4:28,68:0.68: 1.66:1.000:0.949 0/0/0/1:4:11,3:0.16:-2.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,34:0.72:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,20:0.75:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,29:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,19:0.26:-0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,64:0.69: 1.34:1.000:0.969 0/1/1/1:4:17,54:0.72: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,27:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,47:0.64: 0.50:1.000:0.692 0/1/1/1:4:18,47:0.69: 0.22:1.000:0.974 0/0/0/0/0/1:6:24,12:0.24:-1.12:1.000:0.608 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,30:0.45: 0.22:1.000:0.979 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,35:0.36: 1.20:1.000:0.725 0/0/1/1:4:41,37:0.47: 0.82:1.000:0.993 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,66:0.69: 1.43:1.000:0.977 0/0/0/1:4:28,20:0.37:-0.57:0.998:0.521 0/0/0/1:4:52,30:0.29: 1.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:22,61:0.70: 1.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:14,12:0.45:-1.59:1.000:0.979 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,52:0.64: 0.87:1.000:0.655 0/0/1/1:4:30,22:0.38:-0.38:1.000:0.621 0/0/0/1:4:20,10:0.24:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,16:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,36:0.46: 0.78:1.000:0.987 0/1/1/1:4:20,64:0.72: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,32:0.55:-0.10:1.000:0.980 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,30:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,34:0.30: 1.43:1.000:0.985 0/1/1/1:4:29,68:0.67: 1.71:1.000:0.930 0/0/1/1:4:16,21:0.56:-1.08:1.000:0.963 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,12:0.21:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,20:0.33:-0.43:1.000:0.914 0/0/1/1:4:16,16:0.51:-1.31:1.000:0.996 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,20:0.32:-0.38:1.000:0.957 0/0/1/1:4:28,22:0.41:-0.47:1.000:0.880 0/0/1/1:4:31,32:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,43:0.65: 0.18:1.000:0.778 0/0/1/1:4:33,25:0.40:-0.10:1.000:0.769 0/1/1/1:4:17,37:0.66:-0.29:1.000:0.865 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,24:0.36:-0.06:1.000:0.729 0/0/0/1:4:30,17:0.28:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,25:0.36: 0.04:1.000:0.670 0/0/0/1:4:36,15:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,59:0.67: 1.15:1.000:0.906 0/0/1/1:4:16,24:0.59:-0.94:1.000:0.868 0/1/1/1:4:13,48:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,34:0.75:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,24:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,39:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,54:0.71: 0.55:1.000:0.993 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,23:0.27: 0.22:0.999:0.998 0/0/1/1:4:27,28:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,27:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,27:0.46:-0.10:1.000:0.985 0/1/1/1:4:13,49:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,38:0.67:-0.29:1.000:0.938 0/1/1/1:4:9,48:0.79:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,45:0.62: 0.45:1.000:0.509 0/1/1/1:4:11,59:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,30:0.34: 0.73:1.000:0.893 0/1/1/1:4:12,55:0.77: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,30:0.41: 0.36:1.000:0.891 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,52:0.75: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,18:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,24:0.63:-1.08:1.000:0.555 0/0/1/1:4:29,22:0.40:-0.43:1.000:0.774 0/0/1/1:4:31,30:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,20:0.47:-0.84:0.991:0.994 0/0/1/1:4:18,25:0.57:-0.80:1.000:0.935 0/0/1/1:4:34,28:0.43: 0.08:1.000:0.953 0/1/1/1:4:23,67:0.71: 1.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:20,41:0.65: 0.04:1.000:0.780 0/0/1/1:4:20,22:0.53:-0.84:1.000:0.993 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,43:0.66: 0.13:1.000:0.850 0/1/1/1:4:24,55:0.67: 0.87:1.000:0.914 0/0/0/1:4:29,15:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,25:0.26: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,30:0.24: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,83:0.64: 3.05:1.000:0.661 0/0/0/1:4:48,28:0.29: 0.73:1.000:0.991 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,34:0.41: 0.82:1.000:0.837 0/1/1/1:4:26,60:0.67: 1.20:1.000:0.919 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,56:0.61: 1.34:1.000:0.653 0/0/0/1:4:39,25:0.33: 0.18:1.000:0.925 0/1/1/1:4:21,46:0.66: 0.31:1.000:0.872 0/0/0/1:4:60,36:0.30: 1.66:1.000:0.983 0/0/1/1:4:39,30:0.40: 0.41:1.000:0.823 0/0/0/1:4:42,30:0.37: 0.55:1.000:0.521 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,54:0.62: 1.15:1.000:0.590 0/0/1/1:4:29,31:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,30:0.28: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,42:0.46: 1.38:1.000:0.986 0/0/0/1:4:34,21:0.31:-0.24:1.000:0.967 0/0/0/1:4:55,24:0.22: 0.87:0.999:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,37:0.39: 1.24:1.000:0.667 0/1/1/1:4:26,53:0.65: 0.87:1.000:0.770 0/0/0/1:4:41,28:0.35: 0.41:1.000:0.747 0/0/1/1:4:33,27:0.43:-0.01:1.000:0.946 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,44:0.65: 0.22:1.000:0.815 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,31:0.34: 0.82:1.000:0.866 0/0/0/1:4:45,32:0.37: 0.78:1.000:0.545 0/0/1/1:4:42,33:0.41: 0.69:1.000:0.880 0/0/1/1:4:31,55:0.62: 1.20:1.000:0.545 0/0/0/1:4:65,38:0.29: 1.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:67,38:0.28: 2.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,28:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,39:0.40: 1.38:1.000:0.803 -chr4.1 84371300 chr4.1_084371300 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:100,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.11:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.48:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:24,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.18:0.998:. ./.:4:59,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.69:0.999:. ./.:4:26,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.10:0.991:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:99,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:50,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:132,0:.: 3.70:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:69,1:.: 1.11:1.000:. -chr4.1 84570797 chr4.1_084570797 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:271,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:223,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:270,87:.: 1.29:1.000:. ./.:4:369,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:210,93:.: 0.51:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:166,58:.:-0.63:1.000:. ./.:4:166,49:.:-0.76:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:188,59:.:-0.30:1.000:. ./.:4:295,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:214,89:.: 0.51:1.000:. ./.:4:244,86:.: 0.90:1.000:. ./.:4:226,86:.: 0.64:0.999:. ./.:4:342,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:388,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:229,67:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:156,50:.:-0.89:1.000:. ./.:4:102,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:271,88:.: 1.31:1.000:. ./.:4:181,87:.: 0.00:1.000:. ./.:4:203,83:.: 0.26:1.000:. ./.:4:211,82:.: 0.36:1.000:. ./.:4:170,73:.:-0.36:1.000:. ./.:4:194,58:.:-0.23:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:120,1:.:-2.12:1.000:. ./.:4:135,63:.:-1.01:1.000:. ./.:3:119,1:.:-2.13:1.000:. ./.:4:225,70:.: 0.39:1.000:. ./.:4:266,74:.: 1.04:1.000:. ./.:4:219,79:.: 0.43:1.000:. ./.:4:212,82:.: 0.38:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:231,82:.: 0.65:1.000:. ./.:4:257,99:.: 1.27:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:186,69:.:-0.19:1.000:. ./.:4:305,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:229,78:.: 0.56:1.000:. ./.:4:425,190:.: 5.01:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:191,50:.:-0.39:1.000:. ./.:4:289,89:.: 1.59:1.000:. ./.:4:212,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:194,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:233,92:.: 0.82:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:328,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.33:1.000:. ./.:6:195,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:209,79:.: 0.29:1.000:. ./.:4:203,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:435,4:.: 2.47:1.000:. ./.:4:121,49:.:-1.41:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.15:0.998:. ./.:4:264,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:265,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:294,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:189,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:352,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:250,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:248,84:.: 0.93:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:204,60:.:-0.06:1.000:. ./.:4:158,67:.:-0.62:1.000:. ./.:4:154,59:.:-0.79:1.000:. ./.:4:164,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:212,62:.: 0.09:1.000:. ./.:4:337,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:195,64:.:-0.13:1.000:. ./.:4:184,78:.:-0.08:1.000:. ./.:4:215,78:.: 0.36:1.000:. ./.:4:185,65:.:-0.26:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:207,74:.: 0.19:1.000:. ./.:4:240,91:.: 0.91:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:192,76:.: 0.00:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:165,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:285,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:194,65:.:-0.13:1.000:. ./.:4:416,1:.: 2.15:1.000:. ./.:4:212,78:.: 0.32:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:284,102:.: 1.70:1.000:. ./.:4:187,81:.: 0.00:0.999:. ./.:4:187,64:.:-0.24:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:287,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:198,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:241,4:.:-0.33:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:259,88:.: 1.14:1.000:. ./.:4:194,57:.:-0.24:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:134,69:.:-0.94:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:137,57:.:-1.07:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:194,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.92:0.991:. ./.:4:213,67:.: 0.17:1.000:. ./.:4:182,61:.:-0.36:1.000:. ./.:4:307,102:.: 2.04:1.000:. ./.:4:214,75:.: 0.30:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:106,39:.:-1.77:1.000:. ./.:4:196,67:.:-0.07:1.000:. ./.:4:313,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:184,60:.:-0.34:1.000:. ./.:4:244,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:168,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:213,71:.: 0.23:1.000:. ./.:4:182,67:.:-0.27:1.000:. ./.:4:315,115:.: 2.34:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:228,90:.: 0.72:1.000:. ./.:4:205,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:126,34:.:-1.56:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:359,2:.: 1.34:1.000:. ./.:4:263,98:.: 1.34:1.000:. ./.:4:249,79:.: 0.87:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:204,67:.: 0.04:1.000:. ./.:4:235,72:.: 0.56:1.000:. ./.:4:156,51:.:-0.88:1.000:. ./.:4:243,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:199,51:.:-0.26:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.04:0.999:. ./.:4:255,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:168,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:164,83:.:-0.30:1.000:. ./.:4:170,56:.:-0.60:1.000:. ./.:4:187,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,60:.:-0.59:1.000:. ./.:4:169,2:.:-1.40:1.000:. ./.:4:221,80:.: 0.48:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:223,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:194,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:291,78:.: 1.46:1.000:. ./.:4:258,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.29:1.000:. -chr4.1 84814748 chr4.1_084814748 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:75,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:141,1:.: 1.04:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:185,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:66,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:39,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:176,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:136,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:150,2:.: 1.32:1.000:. ./.:4:56,9:.:-1.06:1.000:. ./.:4:97,6:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,5:.:-1.15:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:26,7:.:-1.94:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:7,5:.:-2.51:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.80:1.000:. ./.:3:11,2:.:-2.48:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:117,3:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,3:.: 1.67:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:74,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:143,5:.: 1.21:1.000:. ./.:4:64,3:.:-1.01:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:54,4:.:-1.25:1.000:. ./.:4:78,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:64,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:98,7:.: 0.03:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:108,5:.: 0.25:1.000:. ./.:4:114,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:165,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:108,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:62,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:91,8:.:-0.13:1.000:. ./.:4:133,7:.: 0.99:1.000:. ./.:6:89,8:.:-0.19:1.000:. ./.:4:99,5:.: 0.00:1.000:. ./.:4:60,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:97,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:91,4:.:-0.24:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:100,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:92,6:.:-0.16:0.998:. ./.:4:103,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:132,17:.: 1.23:1.000:. ./.:4:58,5:.:-1.12:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:107,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:105,4:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:83,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:93,7:.:-0.11:1.000:. ./.:4:98,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:112,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:77,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:138,5:.: 1.07:1.000:. ./.:4:85,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:87,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:155,5:.: 1.53:1.000:. ./.:4:151,2:.: 1.34:1.000:. ./.:4:70,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:120,8:.: 0.66:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:143,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:130,6:.: 0.88:1.000:. ./.:4:48,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:105,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:42,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:166,6:.: 1.86:1.000:. ./.:4:45,2:.:-1.56:1.000:. ./.:4:79,9:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:100,7:.: 0.08:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:113,9:.: 0.50:0.999:. ./.:4:161,9:.: 1.81:1.000:. ./.:4:40,4:.:-1.64:1.000:. ./.:4:110,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:58,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:72,6:.:-0.71:1.000:. ./.:4:78,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:105,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:136,2:.: 0.93:1.000:. ./.:4:132,5:.: 0.91:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:89,5:.:-0.27:1.000:. ./.:4:89,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,5:.: 0.47:1.000:. ./.:4:77,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:76,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:52,2:.:-1.36:1.000:. ./.:4:96,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:64,1:.:-1.06:0.991:. ./.:4:118,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,2:.: 1.62:1.000:. ./.:4:83,6:.:-0.41:1.000:. ./.:4:123,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:130,8:.: 0.93:1.000:. ./.:4:97,7:.: 0.00:1.000:. ./.:4:99,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:92,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:36,1:.:-1.83:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:149,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:196,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:199,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:206,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:143,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:75,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:123,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:108,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:187,1:.: 2.30:1.000:. ./.:4:164,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:200,2:.: 2.68:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:101,1:.:-0.05:1.000:. -chr4.1 84910037 chr4.1_084910037 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,27:.: 0.41:1.000:. ./.:4:38,11:.:-0.30:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,19:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,34:.: 3.26:1.000:. ./.:4:20,27:.:-0.43:1.000:. ./.:4:7,8:.:-2.51:1.000:. ./.:4:33,18:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,9:.:-0.24:1.000:. ./.:4:15,7:.:-2.05:1.000:. ./.:4:14,14:.:-1.66:1.000:. ./.:4:30,19:.:-0.30:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:29,30:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,22:.: 0.09:1.000:. ./.:4:46,10:.: 0.15:0.999:. ./.:4:44,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:27,33:.: 0.41:1.000:. ./.:4:37,33:.: 1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,40:.: 2.03:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,8:.:-1.02:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:28,7:.:-1.21:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:13,17:.:-1.53:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:52,17:.: 0.99:1.000:. ./.:4:37,32:.: 0.99:1.000:. ./.:4:36,4:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.43:1.000:. ./.:4:37,21:.: 0.28:1.000:. ./.:4:48,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,25:.:-0.11:1.000:. ./.:4:42,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,6:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,21:.:-0.95:1.000:. ./.:4:23,12:.:-1.21:1.000:. ./.:4:35,18:.:-0.04:1.000:. ./.:4:28,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.17:1.000:. ./.:4:29,24:.:-0.04:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:27,16:.:-0.69:1.000:. ./.:4:26,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.69:1.000:. ./.:6:29,24:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,45:.: 1.06:1.000:. ./.:4:35,25:.: 0.41:1.000:. ./.:4:22,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:46,22:.: 0.93:1.000:. ./.:4:39,26:.: 0.73:1.000:. ./.:4:65,41:.: 3.39:1.000:. ./.:4:29,12:.:-0.82:1.000:. ./.:4:53,15:.: 0.93:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.54:0.998:. ./.:4:45,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,27:.: 1.64:1.000:. ./.:4:10,16:.:-1.79:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:41,25:.: 0.80:1.000:. ./.:4:26,29:.: 0.09:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:19,25:.:-0.63:1.000:. ./.:4:35,20:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,15:.: 1.45:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:48,26:.: 1.32:1.000:. ./.:4:46,42:.: 2.22:1.000:. ./.:4:44,17:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,29:.:-0.24:1.000:. ./.:4:36,33:.: 0.99:1.000:. ./.:4:15,30:.:-0.56:1.000:. ./.:4:26,33:.: 0.34:1.000:. ./.:4:40,16:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:29,24:.:-0.04:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:57,15:.: 1.19:1.000:. ./.:4:26,12:.:-1.02:1.000:. ./.:4:59,26:.: 2.03:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:30,25:.: 0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:32,12:.:-0.63:1.000:. ./.:4:50,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:29,12:.:-0.82:1.000:. ./.:4:49,16:.: 0.73:1.000:. ./.:4:23,16:.:-0.95:1.000:. ./.:4:21,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:40,41:.: 1.77:1.000:. ./.:4:34,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:35,47:.: 1.83:1.000:. ./.:4:34,24:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,35:.: 0.22:0.999:. ./.:4:48,19:.: 0.86:1.000:. ./.:4:12,12:.:-1.92:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,27:.:-0.56:1.000:. ./.:4:35,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:28,27:.: 0.09:1.000:. ./.:4:32,12:.:-0.63:1.000:. ./.:4:45,15:.: 0.41:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:55,21:.: 1.45:1.000:. ./.:4:41,13:.: 0.02:1.000:. ./.:4:25,21:.:-0.50:1.000:. ./.:4:48,16:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,12:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,16:.:-0.89:1.000:. ./.:4:23,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:42,14:.: 0.15:1.000:. ./.:4:41,15:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,22:.: 0.34:1.000:. ./.:4:26,10:.:-1.15:0.991:. ./.:4:28,6:.:-1.28:1.000:. ./.:4:44,12:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:49,19:.: 0.93:1.000:. ./.:4:36,26:.: 0.54:1.000:. ./.:4:38,15:.:-0.04:1.000:. ./.:4:42,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:43,14:.: 0.22:1.000:. ./.:4:16,23:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,36:.: 1.77:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:27,32:.: 0.34:1.000:. ./.:4:51,13:.: 0.67:1.000:. ./.:4:45,18:.: 0.60:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,32:.: 0.67:1.000:. ./.:4:10,7:.:-2.38:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:37,25:.: 0.54:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:47,10:.: 0.22:1.000:. ./.:4:33,33:.: 0.80:1.000:. ./.:4:49,14:.: 0.60:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:19,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:22,32:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,17:.: 0.09:1.000:. ./.:4:24,10:.:-1.28:1.000:. ./.:4:38,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:15,27:.:-0.76:1.000:. ./.:4:48,14:.: 0.54:0.999:. ./.:4:23,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:28,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,26:.:-0.37:1.000:. ./.:4:26,7:.:-1.34:1.000:. ./.:4:28,9:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:27,17:.:-0.63:1.000:. ./.:4:28,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:43,10:.:-0.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:42,11:.:-0.04:1.000:. ./.:4:20,20:.:-0.89:1.000:. ./.:4:46,13:.: 0.34:1.000:. ./.:4:41,17:.: 0.28:1.000:. ./.:4:46,15:.: 0.47:1.000:. ./.:4:23,20:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.73:1.000:. -chr4.1 85194819 chr4.1_085194819 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-2.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:22,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,0:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 2.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-1.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.: 1.38:1.000:. -chr4.1 85442831 chr4.1_085442831 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.56:0.999:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.06:1.000:. ./.:6:5,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:0.998:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.15:0.999:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:0.991:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:12,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:34,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.73:1.000:. -chr4.1 85591844 chr4.1_085591844 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:346,465:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,503:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:342,180:0.33:-0.91:1.000:0.918 0/1/1/1:4:160,768:0.77: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1145:1.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:369,474:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:147,628:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,405:0.55:-0.32:1.000:0.979 0/0/1/1:4:275,498:0.57: 0.24:1.000:0.935 0/0/1/1:4:102,179:0.57:-2.01:1.000:0.955 0/1/1/1:4:63,385:0.81:-1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:137,539:0.74:-0.20:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,920:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:333,454:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:286,601:0.61: 0.76:1.000:0.699 0/0/1/1:4:333,406:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:137,653:0.77: 0.32:0.999:1.000 0/1/1/1:4:180,611:0.71: 0.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:527,179:0.26:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:300,466:0.54: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:143,118:0.41:-2.11:1.000:0.863 0/0/1/1:4:274,552:0.60: 0.48:1.000:0.796 0/1/1/1:4:248,902:0.72: 1.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,522:0.61: 0.23:1.000:0.715 0/1/1/1:4:37,215:0.81:-2.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,477:0.57: 0.11:1.000:0.945 0/1/1/1:4:153,936:0.81: 1.69:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,968:1.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:421,690:0.55: 1.79:1.000:0.980 0/1/1/1:4:133,742:0.80: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:141,620:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,215:0.36:-0.76:1.000:0.665 0/1/1/1:4:38,145:0.73:-2.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:82,361:0.76:-1.27:1.000:1.000 0/0/1:3:60,38:0.36:-2.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,551:0.59: 0.51:1.000:0.844 0/0/1/1:4:322,511:0.54: 0.51:1.000:0.987 0/0/1/1:4:293,439:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:122,548:0.76:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,497:0.60: 0.12:1.000:0.828 0/0/1/1:4:283,382:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:147,597:0.74: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:324,548:0.56: 0.69:1.000:0.971 0/0/0/1:4:388,91:0.20:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:134,753:0.80: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:431,289:0.37: 0.00:1.000:0.532 0/0/1/1:4:486,350:0.39: 0.53:1.000:0.634 0/1/1/1:4:614,1503:0.64: 6.40:1.000:0.729 0/0/0/1:4:318,98:0.25:-1.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:423,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,591:0.77:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:198,793:0.74: 1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,577:0.80:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:506,145:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:397,286:0.39:-0.17:1.000:0.634 0/0/1/1:4:265,368:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:257,361:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:279,477:0.56: 0.16:1.000:0.967 0/0/1/1:4:225,303:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:255,299:0.47:-0.76:1.000:0.852 0/0/1/1:4:357,429:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:150,642:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:456,132:0.24:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,688:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:349,473:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:401,332:0.41: 0.06:1.000:0.866 0/1/1/1:4:121,653:0.79: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:412,254:0.36:-0.25:1.000:0.716 0/1/1/1:4:136,715:0.79: 0.60:0.998:1.000 0/0/0/1:4:390,253:0.37:-0.36:1.000:0.609 0/0/1/1:4:290,416:0.52:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:254,309:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:235,396:0.56:-0.41:1.000:0.973 0/0/0/1:4:511,292:0.34: 0.38:1.000:0.838 0/1/1/1:4:129,525:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:209,426:0.60:-0.39:1.000:0.771 0/0/0/1:4:374,140:0.28:-0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:153,757:0.78: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:456,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,513:0.62: 0.11:1.000:0.557 0/0/1/1:4:207,407:0.59:-0.49:1.000:0.840 0/0/0/1:4:465,121:0.22:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:438,166:0.28:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:247,372:0.53:-0.47:1.000:0.993 0/0/0/1:4:397,133:0.26:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:286,398:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:305,99:0.26:-1.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:140,575:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:137,616:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:250,515:0.60: 0.20:1.000:0.748 0/0/0/1:4:340,112:0.26:-1.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:122,748:0.82: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:125,620:0.78: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,524:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,419:0.54:-0.18:1.000:0.985 0/0/1/1:4:222,494:0.62:-0.02:1.000:0.538 0/0/1/1:4:205,396:0.59:-0.55:1.000:0.867 0/0/1/1:4:170,351:0.61:-0.91:1.000:0.742 0/1/1/1:4:229,712:0.69: 1.01:1.000:0.978 0/1/1/1:4:130,827:0.82: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:299,509:0.56: 0.40:1.000:0.969 0/1/1/1:4:148,802:0.79: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:304,208:0.38:-0.96:1.000:0.516 0/0/1/1:4:273,407:0.53:-0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:123,558:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,111:0.27:-1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:319,223:0.38:-0.82:1.000:0.566 0/1/1/1:4:140,870:0.82: 1.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:650,209:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:153,539:0.72:-0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:421,134:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:183,848:0.77: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:336,397:0.48: 0.06:0.999:0.994 0/1/1/1:4:169,603:0.72: 0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:116,478:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:157,782:0.78: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,342:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:370,243:0.37:-0.49:1.000:0.581 0/0/0/1:4:357,104:0.24:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:526,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:151,850:0.80: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:374,241:0.37:-0.48:1.000:0.624 0/0/1/1:4:278,411:0.52:-0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:479,350:0.39: 0.50:1.000:0.665 0/0/0/1:4:420,121:0.24:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:490,297:0.35: 0.30:1.000:0.748 1/1/1/1:4:0,832:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,266:0.52:-1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,245:0.53:-1.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:305,201:0.37:-0.98:1.000:0.573 0/0/1/1:4:243,435:0.57:-0.20:1.000:0.943 0/0/1/1:4:259,358:0.51:-0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,446:0.81:-0.91:0.991:1.000 0/1/1/1:4:153,779:0.78: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:439,256:0.35:-0.12:1.000:0.810 0/0/1/1:4:343,712:0.61: 1.53:1.000:0.730 0/0/1/1:4:313,448:0.52: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:369,117:0.25:-1.08:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,812:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,379:0.56:-0.54:1.000:0.971 0/0/1/1:4:272,496:0.58: 0.22:1.000:0.930 0/0/1/1:4:257,550:0.61: 0.40:1.000:0.651 0/0/1/1:4:243,363:0.53:-0.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:124,484:0.73:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:389,503:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:444,901:0.60: 2.86:1.000:0.781 0/1/1/1:4:131,903:0.83: 1.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:199,693:0.71: 0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:335,536:0.54: 0.69:1.000:0.985 0/0/0/1:4:334,201:0.35:-0.85:1.000:0.760 0/0/1/1:4:336,448:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:221,603:0.67: 0.47:1.000:0.906 0/1/1/1:4:80,329:0.74:-1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:206,315:0.53:-0.91:1.000:0.991 0/1/1/1:4:171,740:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:472,339:0.38: 0.41:1.000:0.628 0/0/1/1:4:379,714:0.58: 1.71:1.000:0.899 0/0/1/1:4:295,457:0.54: 0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:298,391:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:382,640:0.55: 1.38:1.000:0.974 0/0/1/1:4:253,439:0.56:-0.13:1.000:0.961 0/0/1/1:4:246,330:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:152,595:0.74: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:422,281:0.37:-0.08:1.000:0.549 0/1/1/1:4:148,717:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:481,256:0.33: 0.07:1.000:0.910 0/0/0/1:4:329,133:0.29:-1.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:120,606:0.78: 0.02:0.999:1.000 0/0/1/1:4:315,488:0.54: 0.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:321,396:0.48:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:362,147:0.29:-0.97:1.000:0.992 0/0/1/1:4:210,333:0.54:-0.81:1.000:0.987 0/1/1/1:4:155,711:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:144,557:0.73:-0.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:128,555:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,288:0.56:-1.20:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,1099:1.00: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,565:0.60: 0.56:1.000:0.770 0/1/1/1:4:129,658:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,398:0.54:-0.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:347,477:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:374,557:0.53: 0.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:188,929:0.78: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,90:0.24:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:333,475:0.51: 0.40:1.000:0.996 -chr4.1 85794609 chr4.1_085794609 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:89,36:0.27: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,30:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,47:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,32:0.21: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,34:0.31:-0.17:1.000:0.973 0/0/0/1:4:25,12:0.31:-2.20:1.000:0.977 0/0/0/1:4:82,17:0.16:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,18:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,11:0.36:-2.44:1.000:0.673 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-2.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,1:0.01:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,29:0.31:-0.65:1.000:0.969 0/0/0/1:4:72,28:0.26:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,22:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,24:0.16: 0.89:0.999:0.996 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,30:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,13:0.58:-2.75:1.000:0.892 0/0/1/1:4:61,54:0.45: 0.16:1.000:0.979 0/0/0/1:4:80,37:0.30: 0.22:1.000:0.985 0/0/0/1:4:42,22:0.33:-1.38:1.000:0.934 0/1/1/1:4:0,11:0.75:-2.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,35:0.31:-0.05:1.000:0.977 0/0/0/1:4:56,25:0.29:-0.87:1.000:0.990 0/0/0/1:4:69,20:0.21:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,32:0.20: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,17:0.14: 0.04:1.000:0.979 0/0/0/0:4:130,1:0.01: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,27:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,10:0.38:-2.56:1.000:0.588 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-2.26:1.000:1.000 0/0/0:3:14,0:0.00:-2.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,29:0.20: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,29:0.23: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,38:0.24: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,36:0.26: 0.59:1.000:0.998 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,39:0.27: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,31:0.28:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,30:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,34:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,1:0.12:-3.08:1.000:0.714 0/0/0/1:4:78,23:0.21:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,21:0.17: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,39:0.30: 0.38:1.000:0.982 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,80:0.51: 1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,37:0.23: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,40:0.30: 0.50:1.000:0.984 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,38:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,56:0.42: 0.50:1.000:0.931 0/0/1/1:4:68,67:0.48: 0.77:1.000:0.994 0/0/0/0/1/1:6:78,38:0.31: 0.19:1.000:0.902 0/0/0/1:4:106,36:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,32:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,39:0.23: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,24:0.21:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,28:0.15: 2.07:1.000:0.986 0/0/0/1:4:57,21:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,44:0.31: 0.80:1.000:0.978 0/0/1/1:4:65,91:0.53: 1.41:0.998:0.991 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,86:0.55: 0.92:1.000:0.981 0/0/0/1:4:42,19:0.30:-1.47:1.000:0.989 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,38:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,75:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,28:0.19: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,92:0.55: 1.19:1.000:0.980 0/0/0/1:4:110,28:0.19: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,81:0.48: 1.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,37:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,44:0.25: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,59:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,43:0.31: 0.62:1.000:0.967 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,22:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,36:0.29: 0.19:1.000:0.989 0/0/0/1:4:94,35:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,21:0.20:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,35:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,91:0.50: 1.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,14:0.20:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,37:0.29: 0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:88,29:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,35:0.23: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,41:0.53:-1.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,43:0.38:-0.08:1.000:0.611 0/0/0/1:4:56,28:0.32:-0.78:1.000:0.962 0/0/0/1:4:78,34:0.29: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:61,31:0.32:-0.53:1.000:0.954 0/0/0/1:4:103,29:0.21: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,77:0.46: 1.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:72,23:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,36:0.21: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,30:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.22:0.999:1.000 0/0/0/1:4:122,47:0.26: 1.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:53,32:0.36:-0.75:1.000:0.706 0/0/1/1:4:49,83:0.56: 0.68:1.000:0.973 0/0/0/1:4:55,27:0.31:-0.84:1.000:0.969 0/0/0/1:4:77,27:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,32:0.27: 0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,35:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,46:0.29: 1.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:90,26:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,89:0.52: 1.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,27:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,42:0.29: 0.77:1.000:0.989 0/0/0/1:4:91,30:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,38:0.27: 0.71:1.000:0.998 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,32:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,23:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,44:0.49:-0.72:0.991:0.996 0/0/0/1:4:76,41:0.33: 0.22:1.000:0.907 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,29:0.28:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:109,37:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,29:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,38:0.28: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:76,33:0.29:-0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,63:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,28:0.21: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,23:0.29:-1.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:83,36:0.29: 0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:88,33:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,73:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,24:0.20: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,25:0.17: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,24:0.20: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-2.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,36:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,71:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,23:0.16: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,30:0.28:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,41:0.44:-0.59:1.000:0.959 0/0/0/1:4:82,31:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,29:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,14:0.19:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,34:0.28: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,27:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,23:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,19:0.24:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.08:0.999:1.000 0/0/0/1:4:70,14:0.16:-0.78:1.000:0.994 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,21:0.30:-1.29:1.000:0.987 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,30:0.35:-0.87:1.000:0.768 0/0/0/1:4:88,25:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,24:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,30:0.30:-0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:62,62:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,60:0.46: 0.47:1.000:0.987 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,74:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,24:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,22:0.27:-0.96:1.000:0.998 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 -chr4.1 85960696 chr4.1_085960696 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:188,61:.: 0.35:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:190,55:.: 0.28:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:209,85:.: 1.17:1.000:. ./.:4:230,67:.: 1.23:1.000:. ./.:4:135,40:.:-1.00:1.000:. ./.:4:202,81:.: 0.97:1.000:. ./.:4:191,53:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,63:.:-2.32:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:181,70:.: 0.39:1.000:. ./.:4:202,50:.: 0.41:1.000:. ./.:4:170,74:.: 0.26:1.000:. ./.:4:146,126:.: 0.77:1.000:. ./.:4:185,90:.: 0.83:0.999:. ./.:4:246,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:229,92:.: 1.67:1.000:. ./.:4:151,160:.: 1.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:204,58:.: 0.59:1.000:. ./.:4:174,64:.: 0.15:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:217,72:.: 1.08:1.000:. ./.:4:225,80:.: 1.37:1.000:. ./.:4:203,87:.: 1.10:1.000:. ./.:4:210,71:.: 0.94:1.000:. ./.:4:191,92:.: 0.97:1.000:. ./.:4:158,151:.: 1.45:1.000:. ./.:4:189,50:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,13:.:-3.60:1.000:. ./.:4:43,64:.:-2.24:1.000:. ./.:3:10,6:.:-3.91:1.000:. ./.:4:121,134:.: 0.46:1.000:. ./.:4:128,141:.: 0.72:1.000:. ./.:4:132,125:.: 0.50:1.000:. ./.:4:189,75:.: 0.62:1.000:. ./.:4:205,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:173,51:.:-0.11:1.000:. ./.:4:166,71:.: 0.13:1.000:. ./.:4:121,127:.: 0.33:1.000:. ./.:4:160,58:.:-0.22:1.000:. ./.:4:192,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:175,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:196,86:.: 0.95:1.000:. ./.:4:254,30:.: 0.99:1.000:. ./.:4:162,52:.:-0.29:1.000:. ./.:4:198,57:.: 0.46:1.000:. ./.:4:137,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:152,144:.: 1.21:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:200,55:.: 0.46:1.000:. ./.:4:148,63:.:-0.34:1.000:. ./.:4:113,163:.: 0.84:1.000:. ./.:4:169,39:.:-0.40:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:153,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:147,49:.:-0.62:1.000:. ./.:4:137,43:.:-0.91:1.000:. ./.:4:153,54:.:-0.42:1.000:. ./.:4:165,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:114,157:.: 0.75:1.000:. ./.:4:207,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:165,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:187,50:.: 0.13:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.17:0.998:. ./.:4:213,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:268,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:88,30:.:-2.04:1.000:. ./.:4:265,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:188,56:.: 0.26:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:161,60:.:-0.16:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:167,41:.:-0.40:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:177,52:.:-0.01:1.000:. ./.:4:196,74:.: 0.73:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:181,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:116,116:.: 0.04:1.000:. ./.:4:120,42:.:-1.24:1.000:. ./.:4:109,106:.:-0.27:1.000:. ./.:4:175,56:.: 0.02:1.000:. ./.:4:143,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:156,45:.:-0.53:1.000:. ./.:4:145,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:154,55:.:-0.38:1.000:. ./.:4:132,120:.: 0.41:1.000:. ./.:4:194,85:.: 0.90:1.000:. ./.:4:125,36:.:-1.26:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:110,118:.:-0.03:1.000:. ./.:4:172,59:.: 0.02:1.000:. ./.:4:201,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:183,69:.: 0.41:1.000:. ./.:4:125,39:.:-1.20:1.000:. ./.:4:127,71:.:-0.58:1.000:. ./.:4:145,43:.:-0.76:1.000:. ./.:4:154,43:.:-0.60:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:193,62:.: 0.46:1.000:. ./.:4:200,69:.: 0.72:1.000:. ./.:4:109,104:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,55:.:-0.12:1.000:. ./.:4:170,189:.: 2.36:1.000:. ./.:4:99,117:.:-0.25:0.999:. ./.:4:165,50:.:-0.27:1.000:. ./.:4:126,55:.:-0.89:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:146,42:.:-0.76:1.000:. ./.:4:121,42:.:-1.22:1.000:. ./.:4:162,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:145,35:.:-0.91:1.000:. ./.:4:162,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:162,64:.:-0.07:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:215,59:.: 0.81:1.000:. ./.:4:192,37:.:-0.01:1.000:. ./.:4:164,53:.:-0.23:1.000:. ./.:4:136,75:.:-0.34:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:120,69:.:-0.75:1.000:. ./.:4:140,42:.:-0.87:1.000:. ./.:4:109,104:.:-0.31:1.000:. ./.:4:171,55:.:-0.07:1.000:. ./.:4:151,1:.:-1.42:0.991:. ./.:4:157,71:.:-0.03:1.000:. ./.:4:106,126:.: 0.04:1.000:. ./.:4:254,92:.: 2.12:1.000:. ./.:4:172,73:.: 0.28:1.000:. ./.:4:147,46:.:-0.67:1.000:. ./.:4:146,56:.:-0.51:1.000:. ./.:4:133,67:.:-0.54:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:171,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:185,60:.: 0.28:1.000:. ./.:4:157,37:.:-0.65:1.000:. ./.:4:185,61:.: 0.30:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:174,88:.: 0.59:1.000:. ./.:4:99,104:.:-0.49:1.000:. ./.:4:130,144:.: 0.81:1.000:. ./.:4:176,61:.: 0.13:1.000:. ./.:4:234,107:.: 2.03:1.000:. ./.:4:120,129:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,30:.:-3.23:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:173,75:.: 0.33:1.000:. ./.:4:229,75:.: 1.36:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:154,43:.:-0.60:1.000:. ./.:4:190,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:174,43:.:-0.23:1.000:. ./.:4:102,101:.:-0.49:1.000:. ./.:4:102,129:.: 0.02:1.000:. ./.:4:193,62:.: 0.46:1.000:. ./.:4:224,102:.: 1.76:1.000:. ./.:4:191,54:.: 0.28:1.000:. ./.:4:169,53:.:-0.14:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.28:0.999:. ./.:4:198,60:.: 0.52:1.000:. ./.:4:120,133:.: 0.42:1.000:. ./.:4:189,61:.: 0.37:1.000:. ./.:4:96,84:.:-0.91:1.000:. ./.:4:178,83:.: 0.57:1.000:. ./.:4:177,56:.: 0.06:1.000:. ./.:4:90,106:.:-0.62:1.000:. ./.:4:132,53:.:-0.82:1.000:. ./.:4:210,90:.: 1.28:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:126,124:.: 0.37:1.000:. ./.:4:197,83:.: 0.92:1.000:. ./.:4:358,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:214,80:.: 1.17:1.000:. ./.:4:187,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.09:1.000:. -chr4.1 86079315 chr4.1_086079315 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:282,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:221,40:.: 0.27:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:305,61:.: 1.81:1.000:. ./.:4:283,66:.: 1.56:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:235,46:.: 0.57:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:31,10:.:-2.95:1.000:. ./.:4:23,8:.:-3.09:1.000:. ./.:4:219,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:226,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:222,54:.: 0.49:1.000:. ./.:4:286,43:.: 1.27:1.000:. ./.:4:230,45:.: 0.48:0.999:. ./.:4:301,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:302,64:.: 1.81:1.000:. ./.:4:221,115:.: 1.37:1.000:. ./.:4:53,17:.:-2.52:1.000:. ./.:4:217,35:.: 0.14:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:189,95:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:200,102:.: 0.87:1.000:. ./.:4:222,109:.: 1.30:1.000:. ./.:4:238,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:265,45:.: 0.99:1.000:. ./.:4:274,58:.: 1.31:1.000:. ./.:4:201,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:229,54:.: 0.60:1.000:. ./.:4:23,3:.:-3.17:1.000:. ./.:4:58,12:.:-2.52:1.000:. ./.:3:12,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:211,97:.: 0.96:1.000:. ./.:4:175,103:.: 0.52:1.000:. ./.:4:206,85:.: 0.71:1.000:. ./.:4:189,44:.:-0.14:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:206,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:179,72:.: 0.13:1.000:. ./.:4:209,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,80:.: 0.05:1.000:. ./.:4:188,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:240,81:.: 1.15:1.000:. ./.:4:143,28:.:-1.04:1.000:. ./.:4:199,36:.:-0.11:1.000:. ./.:4:143,45:.:-0.80:1.000:. ./.:4:121,53:.:-1.00:1.000:. ./.:4:272,50:.: 1.17:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:224,44:.: 0.38:1.000:. ./.:4:211,112:.: 1.18:1.000:. ./.:4:177,40:.:-0.37:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:182,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:212,35:.: 0.07:1.000:. ./.:6:169,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:173,34:.:-0.52:1.000:. ./.:4:174,82:.: 0.20:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:107,28:.:-1.57:1.000:. ./.:4:212,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.43:0.998:. ./.:4:195,45:.:-0.03:1.000:. ./.:4:192,58:.: 0.11:1.000:. ./.:4:136,29:.:-1.13:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:224,46:.: 0.40:1.000:. ./.:4:195,27:.:-0.30:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:213,42:.: 0.19:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:220,44:.: 0.32:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:234,47:.: 0.57:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:173,35:.:-0.50:1.000:. ./.:4:169,26:.:-0.69:1.000:. ./.:4:224,39:.: 0.30:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:177,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:172,39:.:-0.46:1.000:. ./.:4:184,83:.: 0.36:1.000:. ./.:4:143,77:.:-0.33:1.000:. ./.:4:112,52:.:-1.15:1.000:. ./.:4:121,58:.:-0.93:1.000:. ./.:4:222,40:.: 0.29:1.000:. ./.:4:194,101:.: 0.77:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:207,40:.: 0.07:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:147,63:.:-0.47:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:203,50:.: 0.16:1.000:. ./.:4:167,45:.:-0.44:1.000:. ./.:4:157,74:.:-0.17:1.000:. ./.:4:389,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:231,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:219,38:.: 0.21:1.000:. ./.:4:285,74:.: 1.71:1.000:. ./.:4:151,74:.:-0.25:0.999:. ./.:4:148,91:.:-0.05:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:185,47:.:-0.15:1.000:. ./.:4:143,36:.:-0.93:1.000:. ./.:4:199,34:.:-0.14:1.000:. ./.:4:185,40:.:-0.25:1.000:. ./.:4:183,80:.: 0.30:1.000:. ./.:4:129,67:.:-0.68:1.000:. ./.:4:201,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:220,47:.: 0.36:1.000:. ./.:4:147,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:195,43:.:-0.06:1.000:. ./.:4:176,38:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,58:.:-1.28:1.000:. ./.:4:105,64:.:-1.07:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:156,80:.:-0.09:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.35:0.991:. ./.:4:193,44:.:-0.08:1.000:. ./.:4:162,81:.: 0.01:1.000:. ./.:4:208,132:.: 1.43:1.000:. ./.:4:156,79:.:-0.11:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:128,65:.:-0.72:1.000:. ./.:4:195,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:173,20:.:-0.72:1.000:. ./.:4:203,41:.: 0.02:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:356,53:.: 2.44:1.000:. ./.:4:282,49:.: 1.30:1.000:. ./.:4:204,100:.: 0.90:1.000:. ./.:4:272,50:.: 1.17:1.000:. ./.:4:274,61:.: 1.36:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:233,123:.: 1.66:1.000:. ./.:4:236,50:.: 0.64:1.000:. ./.:4:54,9:.:-2.63:1.000:. ./.:4:157,34:.:-0.75:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:187,95:.: 0.58:1.000:. ./.:4:248,116:.: 1.78:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:173,41:.:-0.42:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:195,101:.: 0.79:1.000:. ./.:4:160,79:.:-0.05:1.000:. ./.:4:222,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:195,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:265,45:.: 0.99:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:236,40:.: 0.49:0.999:. ./.:4:252,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:175,79:.: 0.17:1.000:. ./.:4:231,46:.: 0.51:1.000:. ./.:4:161,70:.:-0.17:1.000:. ./.:4:194,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:209,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:176,27:.:-0.58:1.000:. ./.:4:162,71:.:-0.14:1.000:. ./.:4:267,72:.: 1.41:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:208,83:.: 0.71:1.000:. ./.:4:199,95:.: 0.76:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:242,110:.: 1.61:1.000:. ./.:4:209,44:.: 0.16:1.000:. ./.:4:267,46:.: 1.03:1.000:. -chr4.1 86201512 chr4.1_086201512 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:352,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:186,108:.:-0.77:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:471,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:235,103:.:-0.26:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:281,86:.: 0.08:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:347,97:.: 0.98:1.000:. ./.:4:517,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:254,112:.: 0.07:1.000:. ./.:4:185,37:.:-1.61:1.000:. ./.:4:309,76:.: 0.29:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:277,96:.: 0.15:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:357,117:.: 1.33:1.000:. ./.:4:278,96:.: 0.16:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:196,95:.:-0.81:1.000:. ./.:4:107,56:.:-2.30:1.000:. ./.:4:270,0:.:-1.05:1.000:. ./.:3:61,12:.:-3.35:1.000:. ./.:4:215,111:.:-0.40:1.000:. ./.:4:204,101:.:-0.64:1.000:. ./.:4:232,101:.:-0.32:1.000:. ./.:4:454,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:212,80:.:-0.80:1.000:. ./.:4:370,84:.: 1.10:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:376,107:.: 1.43:1.000:. ./.:4:233,119:.:-0.10:1.000:. ./.:4:384,99:.: 1.43:1.000:. ./.:4:87,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:235,76:.:-0.57:1.000:. ./.:4:227,93:.:-0.47:1.000:. ./.:4:302,94:.: 0.42:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:237,103:.:-0.24:1.000:. ./.:4:244,72:.:-0.52:1.000:. ./.:4:340,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:274,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:382,106:.: 1.49:1.000:. ./.:4:340,88:.: 0.79:1.000:. ./.:6:234,29:.:-1.13:1.000:. ./.:4:351,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:242,107:.:-0.13:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:206,100:.:-0.63:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.73:0.998:. ./.:4:287,68:.:-0.06:1.000:. ./.:4:412,105:.: 1.83:1.000:. ./.:4:171,99:.:-1.05:1.000:. ./.:4:515,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:232,107:.:-0.25:1.000:. ./.:4:309,106:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:359,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:238,105:.:-0.20:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:260,77:.:-0.27:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:242,2:.:-1.36:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:497,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:234,98:.:-0.33:1.000:. ./.:4:378,92:.: 1.28:1.000:. ./.:4:317,76:.: 0.38:1.000:. ./.:4:214,170:.: 0.28:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:334,83:.: 0.66:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:548,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:327,97:.: 0.74:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:213,83:.:-0.75:1.000:. ./.:4:300,101:.: 0.48:1.000:. ./.:4:317,94:.: 0.59:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:199,76:.:-0.99:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:235,102:.:-0.27:0.999:. ./.:4:340,101:.: 0.94:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:470,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:175,85:.:-1.17:1.000:. ./.:4:204,113:.:-0.50:1.000:. ./.:4:227,97:.:-0.42:1.000:. ./.:4:208,104:.:-0.56:1.000:. ./.:4:313,107:.: 0.70:1.000:. ./.:4:313,84:.: 0.43:1.000:. ./.:4:343,104:.: 1.01:1.000:. ./.:4:221,97:.:-0.49:1.000:. ./.:4:239,90:.:-0.36:1.000:. ./.:4:255,122:.: 0.20:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:188,192:.: 0.23:1.000:. ./.:4:177,67:.:-1.36:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:211,68:.:-0.95:1.000:. ./.:4:313,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.33:0.991:. ./.:4:471,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:198,111:.:-0.60:1.000:. ./.:4:411,125:.: 2.05:1.000:. ./.:4:323,102:.: 0.76:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:319,91:.: 0.58:1.000:. ./.:4:310,100:.: 0.58:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:242,105:.:-0.15:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:256,134:.: 0.35:1.000:. ./.:4:368,117:.: 1.46:1.000:. ./.:4:295,93:.: 0.32:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:362,131:.: 1.55:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:161,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:198,58:.:-1.22:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:324,91:.: 0.64:1.000:. ./.:4:344,129:.: 1.32:1.000:. ./.:4:466,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:189,70:.:-1.18:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:288,92:.: 0.23:1.000:. ./.:4:179,84:.:-1.13:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:211,98:.:-0.60:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:288,96:.: 0.28:0.999:. ./.:4:311,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:212,71:.:-0.90:1.000:. ./.:4:150,84:.:-1.47:1.000:. ./.:4:176,70:.:-1.33:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:246,85:.:-0.34:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:229,110:.:-0.25:1.000:. ./.:4:297,119:.: 0.65:1.000:. ./.:4:504,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:365,121:.: 1.47:1.000:. ./.:4:175,80:.:-1.23:1.000:. ./.:4:307,97:.: 0.51:1.000:. -chr4.1 86532358 chr4.1_086532358 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,99:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,96:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.19:1.000:. ./.:4:29,153:.: 0.79:1.000:. ./.:4:46,164:.: 1.36:1.000:. ./.:4:31,104:.:-0.18:1.000:. ./.:4:13,54:.:-1.59:1.000:. ./.:4:38,153:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,33:.:-2.29:1.000:. ./.:4:4,5:.:-2.78:1.000:. ./.:4:53,104:.: 0.27:1.000:. ./.:4:34,120:.: 0.21:1.000:. ./.:4:33,93:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.95:1.000:. ./.:4:29,94:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,179:.: 1.36:0.999:. ./.:4:0,238:.: 1.94:1.000:. ./.:4:39,168:.: 1.30:1.000:. ./.:4:36,106:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,28:.:-2.35:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.58:1.000:. ./.:4:42,128:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,18:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,194:.: 1.03:1.000:. ./.:4:35,155:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,229:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,198:.: 1.12:1.000:. ./.:4:35,84:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,12:.:-2.72:1.000:. ./.:4:9,26:.:-2.25:1.000:. ./.:3:0,9:.:-2.78:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.16:1.000:. ./.:4:40,111:.: 0.15:1.000:. ./.:4:32,134:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.15:1.000:. ./.:4:36,88:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,138:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.27:1.000:. ./.:4:31,73:.:-0.82:1.000:. ./.:4:22,107:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,247:.: 2.13:1.000:. ./.:4:0,44:.:-2.06:1.000:. ./.:4:25,85:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.59:1.000:. ./.:4:27,107:.:-0.20:1.000:. ./.:4:36,129:.: 0.44:1.000:. ./.:4:29,144:.: 0.60:1.000:. ./.:4:40,93:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,218:.: 1.53:1.000:. ./.:4:41,84:.:-0.39:1.000:. ./.:4:31,84:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.20:1.000:. ./.:4:36,129:.: 0.44:1.000:. ./.:6:13,120:.:-0.22:1.000:. ./.:4:52,104:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,80:.:-0.66:1.000:. ./.:4:38,95:.:-0.22:1.000:. ./.:4:23,74:.:-0.97:1.000:. ./.:4:39,116:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,140:.: 0.60:1.000:. ./.:4:24,71:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,125:.: 0.27:0.998:. ./.:4:0,161:.: 0.35:1.000:. ./.:4:34,117:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,49:.:-1.69:1.000:. ./.:4:27,107:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.09:1.000:. ./.:4:69,75:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.39:1.000:. ./.:4:37,84:.:-0.47:1.000:. ./.:4:51,162:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.51:1.000:. ./.:4:30,89:.:-0.51:1.000:. ./.:4:38,105:.:-0.02:1.000:. ./.:4:25,136:.: 0.35:1.000:. ./.:4:20,61:.:-1.30:1.000:. ./.:4:38,79:.:-0.55:1.000:. ./.:4:24,79:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,60:.:-1.09:1.000:. ./.:4:22,113:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.77:1.000:. ./.:4:37,74:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.15:1.000:. ./.:4:41,138:.: 0.72:1.000:. ./.:4:32,121:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.02:1.000:. ./.:4:33,72:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,201:.: 1.18:1.000:. ./.:4:23,88:.:-0.68:1.000:. ./.:4:24,114:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,127:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,66:.:-0.99:1.000:. ./.:4:36,80:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,194:.: 1.03:1.000:. ./.:4:37,110:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,101:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,69:.:-0.76:1.000:. ./.:4:36,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:33,95:.:-0.33:0.999:. ./.:4:50,145:.: 1.05:1.000:. ./.:4:27,58:.:-1.21:1.000:. ./.:4:31,129:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,48:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.03:1.000:. ./.:4:32,79:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,199:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.33:1.000:. ./.:4:49,153:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,74:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.04:1.000:. ./.:4:30,105:.:-0.18:1.000:. ./.:4:20,104:.:-0.41:1.000:. ./.:4:29,70:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.93:1.000:. ./.:4:40,115:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,88:.:-0.62:0.991:. ./.:4:37,133:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,242:.: 2.02:1.000:. ./.:4:43,192:.: 1.88:1.000:. ./.:4:39,69:.:-0.74:1.000:. ./.:4:40,70:.:-0.70:1.000:. ./.:4:24,123:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,78:.:-0.74:1.000:. ./.:4:20,57:.:-1.38:1.000:. ./.:4:44,104:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,265:.: 2.50:1.000:. ./.:4:0,202:.: 1.20:1.000:. ./.:4:24,83:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.29:1.000:. ./.:4:40,181:.: 1.59:1.000:. ./.:4:30,107:.:-0.14:1.000:. ./.:4:3,13:.:-2.64:1.000:. ./.:4:25,107:.:-0.24:1.000:. ./.:4:38,176:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,214:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,234:.: 1.86:1.000:. ./.:4:19,141:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,89:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.58:1.000:. ./.:4:29,77:.:-0.78:1.000:. ./.:4:42,101:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.37:1.000:. ./.:4:60,184:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.15:1.000:. ./.:4:28,79:.:-0.76:1.000:. ./.:4:34,139:.: 0.60:0.999:. ./.:4:31,89:.:-0.49:1.000:. ./.:4:19,112:.:-0.27:1.000:. ./.:4:22,87:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.93:1.000:. ./.:4:32,116:.: 0.09:1.000:. ./.:4:34,137:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,87:.:-0.72:1.000:. ./.:4:33,129:.: 0.37:1.000:. ./.:4:35,193:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,199:.: 1.14:1.000:. ./.:4:39,142:.: 0.77:1.000:. ./.:4:37,103:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,160:.: 0.91:1.000:. ./.:4:49,191:.: 1.98:1.000:. ./.:4:34,163:.: 1.10:1.000:. ./.:4:27,68:.:-1.01:1.000:. ./.:4:33,152:.: 0.85:1.000:. -chr4.1 86675872 chr4.1_086675872 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:568,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:279,94:.:-1.34:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:499,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:308,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:364,110:.:-0.43:1.000:. ./.:4:380,118:.:-0.22:1.000:. ./.:4:302,61:.:-1.43:1.000:. ./.:4:513,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:381,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:328,105:.:-0.80:1.000:. ./.:4:363,93:.:-0.59:1.000:. ./.:4:536,1:.: 0.13:0.999:. ./.:4:253,217:.:-0.47:1.000:. ./.:4:494,161:.: 1.19:1.000:. ./.:4:608,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:328,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:396,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:192,49:.:-2.53:1.000:. ./.:4:582,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:457,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:368,126:.:-0.25:1.000:. ./.:4:392,128:.:-0.02:1.000:. ./.:4:627,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:425,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:223,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.38:1.000:. ./.:3:212,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:521,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:521,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:634,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:408,135:.: 0.19:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:609,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:527,131:.: 1.22:1.000:. ./.:4:438,118:.: 0.30:1.000:. ./.:4:731,2:.: 1.89:1.000:. ./.:4:592,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:393,149:.: 0.18:1.000:. ./.:4:942,128:.: 4.92:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:662,146:.: 2.57:1.000:. ./.:4:546,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:671,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:627,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:335,101:.:-0.77:1.000:. ./.:4:532,122:.: 1.18:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:765,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:398,116:.:-0.07:1.000:. ./.:4:507,134:.: 1.07:1.000:. ./.:4:499,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:620,169:.: 2.40:1.000:. ./.:4:695,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:596,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:586,127:.: 1.71:1.000:. ./.:4:306,93:.:-1.11:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:598,0:.: 0.68:0.998:. ./.:4:248,209:.:-0.59:1.000:. ./.:4:727,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:411,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:353,311:.: 1.27:1.000:. ./.:4:487,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:598,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:352,91:.:-0.71:1.000:. ./.:4:457,129:.: 0.57:1.000:. ./.:4:606,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:394,122:.:-0.06:1.000:. ./.:4:469,156:.: 0.92:1.000:. ./.:4:239,190:.:-0.84:1.000:. ./.:4:537,142:.: 1.41:1.000:. ./.:4:499,125:.: 0.91:1.000:. ./.:4:368,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:575,143:.: 1.76:1.000:. ./.:4:498,144:.: 1.08:1.000:. ./.:4:350,81:.:-0.82:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:409,125:.: 0.11:1.000:. ./.:4:325,97:.:-0.90:1.000:. ./.:4:319,78:.:-1.13:1.000:. ./.:4:397,125:.: 0.00:1.000:. ./.:4:644,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:364,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:630,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:593,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:402,132:.: 0.11:1.000:. ./.:4:497,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:662,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:497,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:334,72:.:-1.04:1.000:. ./.:4:630,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:353,86:.:-0.75:1.000:. ./.:4:594,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:609,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:430,128:.: 0.32:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:473,117:.: 0.61:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:510,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:589,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:644,0:.: 1.09:0.999:. ./.:4:635,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:507,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:676,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:483,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:587,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:597,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:391,96:.:-0.32:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:454,129:.: 0.55:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:354,102:.:-0.59:1.000:. ./.:4:631,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:528,146:.: 1.36:1.000:. ./.:4:578,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:466,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:344,106:.:-0.65:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.66:0.991:. ./.:4:684,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:340,108:.:-0.67:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:576,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:477,113:.: 0.61:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:565,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:470,136:.: 0.75:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:584,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:595,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:515,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:419,125:.: 0.20:1.000:. ./.:4:361,112:.:-0.44:1.000:. ./.:4:511,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:370,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:297,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:268,74:.:-1.62:1.000:. ./.:4:441,134:.: 0.47:1.000:. ./.:4:402,120:.: 0.00:1.000:. ./.:4:403,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:373,121:.:-0.25:1.000:. ./.:4:369,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:497,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:402,122:.: 0.02:1.000:. ./.:4:356,129:.:-0.33:1.000:. ./.:4:361,90:.:-0.64:1.000:. ./.:4:325,82:.:-1.04:1.000:. ./.:4:397,0:.:-1.13:0.999:. ./.:4:348,85:.:-0.80:1.000:. ./.:4:444,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:348,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:495,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:335,113:.:-0.67:1.000:. ./.:4:491,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:356,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:499,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:364,106:.:-0.47:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:524,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:420,147:.: 0.40:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:395,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:362,124:.:-0.33:1.000:. -chr4.1 86852720 chr4.1_086852720 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,144:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.76:1.000:. ./.:4:85,84:.: 0.31:1.000:. ./.:4:33,120:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,151:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,89:.:-2.14:1.000:. ./.:4:46,113:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.18:1.000:. ./.:4:23,57:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,71:.:-2.69:1.000:. ./.:4:38,115:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.06:1.000:. ./.:4:52,130:.: 0.70:1.000:. ./.:4:48,110:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.13:1.000:. ./.:4:61,116:.: 0.55:0.999:. ./.:4:0,185:.: 0.80:1.000:. ./.:4:58,144:.: 1.31:1.000:. ./.:4:46,135:.: 0.67:1.000:. ./.:4:56,29:.:-2.26:1.000:. ./.:4:80,86:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.18:1.000:. ./.:4:63,75:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,43:.:-3.08:1.000:. ./.:4:97,78:.: 0.49:1.000:. ./.:4:44,125:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.18:1.000:. ./.:4:53,121:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1,179:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,66:.:-0.15:1.000:. ./.:4:21,39:.:-3.02:1.000:. ./.:4:0,80:.:-2.41:1.000:. ./.:3:24,23:.:-3.42:1.000:. ./.:4:35,114:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,121:.: 0.31:1.000:. ./.:4:33,124:.:-0.06:1.000:. ./.:4:52,128:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,146:.: 0.86:1.000:. ./.:4:39,129:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,221:.: 1.90:1.000:. ./.:4:37,129:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,126:.: 0.58:1.000:. ./.:4:107,86:.: 1.04:1.000:. ./.:4:89,82:.: 0.37:1.000:. ./.:4:16,99:.:-1.34:1.000:. ./.:4:92,98:.: 0.95:1.000:. ./.:4:78,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:48,107:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,204:.: 1.38:1.000:. ./.:4:45,108:.:-0.18:1.000:. ./.:4:94,93:.: 0.86:1.000:. ./.:4:81,75:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,117:.: 0.34:1.000:. ./.:4:103,101:.: 1.38:1.000:. ./.:4:86,88:.: 0.46:1.000:. ./.:6:20,123:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,139:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.06:1.000:. ./.:4:37,119:.:-0.09:1.000:. ./.:4:35,191:.: 2.05:1.000:. ./.:4:0,77:.:-2.50:1.000:. ./.:4:70,79:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,131:.: 0.83:0.998:. ./.:4:39,117:.:-0.09:1.000:. ./.:4:101,84:.: 0.80:1.000:. ./.:4:39,80:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.18:1.000:. ./.:4:96,87:.: 0.73:1.000:. ./.:4:47,132:.: 0.61:1.000:. ./.:4:47,136:.: 0.73:1.000:. ./.:4:54,117:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,138:.: 0.52:1.000:. ./.:4:95,76:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,122:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.70:1.000:. ./.:4:56,131:.: 0.86:1.000:. ./.:4:43,124:.: 0.25:1.000:. ./.:4:86,75:.: 0.06:1.000:. ./.:4:51,112:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,100:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,106:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,103:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.18:1.000:. ./.:4:51,161:.: 1.62:1.000:. ./.:4:21,97:.:-1.25:1.000:. ./.:4:39,116:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,95:.: 1.35:1.000:. ./.:4:35,109:.:-0.46:1.000:. ./.:4:74,70:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,122:.:-0.18:1.000:. ./.:4:26,79:.:-1.65:1.000:. ./.:4:43,129:.: 0.40:1.000:. ./.:4:19,94:.:-1.40:1.000:. ./.:4:65,84:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.64:1.000:. ./.:4:79,80:.: 0.00:1.000:. ./.:4:92,93:.: 0.80:1.000:. ./.:4:27,120:.:-0.37:1.000:. ./.:4:63,124:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.43:1.000:. ./.:4:69,66:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,239:.: 2.45:1.000:. ./.:4:35,132:.: 0.25:0.999:. ./.:4:43,116:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.01:1.000:. ./.:4:51,152:.: 1.35:1.000:. ./.:4:44,82:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,88:.: 0.43:1.000:. ./.:4:81,69:.:-0.27:1.000:. ./.:4:83,76:.: 0.00:1.000:. ./.:4:43,126:.: 0.31:1.000:. ./.:4:88,82:.: 0.34:1.000:. ./.:4:95,109:.: 1.38:1.000:. ./.:4:38,136:.: 0.46:1.000:. ./.:4:65,83:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,142:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.03:1.000:. ./.:4:97,108:.: 1.41:1.000:. ./.:4:30,83:.:-1.40:1.000:. ./.:4:32,98:.:-0.88:1.000:. ./.:4:41,120:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,107:.:-0.46:1.000:. ./.:4:19,76:.:-1.95:0.991:. ./.:4:45,128:.: 0.43:1.000:. ./.:4:39,116:.:-0.12:1.000:. ./.:4:97,107:.: 1.38:1.000:. ./.:4:97,88:.: 0.80:1.000:. ./.:4:32,121:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.91:1.000:. ./.:4:57,60:.:-1.28:1.000:. ./.:4:86,76:.: 0.09:1.000:. ./.:4:53,110:.: 0.12:1.000:. ./.:4:33,122:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.01:1.000:. ./.:4:61,145:.: 1.44:1.000:. ./.:4:108,119:.: 2.08:1.000:. ./.:4:41,117:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,192:.: 1.01:1.000:. ./.:4:56,118:.: 0.46:1.000:. ./.:4:87,100:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,74:.:-2.56:1.000:. ./.:4:70,61:.:-0.85:1.000:. ./.:4:48,139:.: 0.86:1.000:. ./.:4:87,89:.: 0.52:1.000:. ./.:4:45,154:.: 1.22:1.000:. ./.:4:48,137:.: 0.80:1.000:. ./.:4:34,99:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.21:1.000:. ./.:4:86,70:.:-0.09:1.000:. ./.:4:45,116:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.40:1.000:. ./.:4:46,114:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.27:1.000:. ./.:4:41,130:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,103:.:-0.70:1.000:. ./.:4:31,74:.:-1.65:0.999:. ./.:4:0,153:.:-0.18:1.000:. ./.:4:37,99:.:-0.70:1.000:. ./.:4:73,74:.:-0.37:1.000:. ./.:4:37,87:.:-1.07:1.000:. ./.:4:39,110:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,111:.:-1.46:1.000:. ./.:4:66,62:.:-0.95:1.000:. ./.:4:1,184:.: 0.80:1.000:. ./.:4:40,137:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,124:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,119:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,91:.: 0.49:1.000:. ./.:4:60,152:.: 1.62:1.000:. ./.:4:46,152:.: 1.19:1.000:. ./.:4:68,77:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,134:.: 0.70:1.000:. -chr4.1 87039943 chr4.1_087039943 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:124,91:.: 1.06:1.000:. ./.:4:60,64:.:-0.39:1.000:. ./.:4:85,63:.:-0.01:1.000:. ./.:4:62,124:.: 0.60:1.000:. ./.:4:5,135:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,167:.: 1.03:1.000:. ./.:4:23,48:.:-1.23:1.000:. ./.:4:110,163:.: 1.98:1.000:. ./.:4:85,83:.: 0.31:1.000:. ./.:4:17,20:.:-1.77:1.000:. ./.:4:3,9:.:-2.17:1.000:. ./.:4:16,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,108:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,66:.:-0.02:1.000:. ./.:4:122,131:.: 1.66:1.000:. ./.:4:118,117:.: 1.38:1.000:. ./.:4:62,119:.: 0.52:0.999:. ./.:4:90,78:.: 0.31:1.000:. ./.:4:149,201:.: 3.20:1.000:. ./.:4:51,164:.: 1.06:1.000:. ./.:4:14,25:.:-1.74:1.000:. ./.:4:55,91:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,83:.:-0.49:1.000:. ./.:4:53,121:.: 0.40:1.000:. ./.:4:10,26:.:-1.79:1.000:. ./.:4:55,109:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,120:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,106:.:-0.58:1.000:. ./.:4:142,145:.: 2.20:1.000:. ./.:4:71,145:.: 1.07:1.000:. ./.:4:49,74:.:-0.41:1.000:. ./.:4:90,63:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.33:1.000:. ./.:4:5,14:.:-2.06:1.000:. ./.:3:2,6:.:-2.24:1.000:. ./.:4:59,84:.:-0.09:1.000:. ./.:4:45,74:.:-0.47:1.000:. ./.:4:40,116:.: 0.12:1.000:. ./.:4:45,92:.:-0.18:1.000:. ./.:4:95,73:.: 0.31:1.000:. ./.:4:22,96:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.29:1.000:. ./.:4:78,66:.:-0.07:1.000:. ./.:4:99,74:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,139:.:-0.14:1.000:. ./.:4:55,56:.:-0.60:1.000:. ./.:4:113,179:.: 2.28:1.000:. ./.:4:32,16:.:-1.60:1.000:. ./.:4:66,77:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,28:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.99:1.000:. ./.:4:53,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,78:.:-0.68:1.000:. ./.:4:75,103:.: 0.47:1.000:. ./.:4:94,150:.: 1.52:1.000:. ./.:4:51,66:.:-0.50:1.000:. ./.:4:78,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:66,45:.:-0.60:1.000:. ./.:4:46,122:.: 0.31:1.000:. ./.:6:50,74:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,93:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,66:.:-0.76:1.000:. ./.:4:99,90:.: 0.64:1.000:. ./.:4:9,69:.:-1.12:1.000:. ./.:4:39,124:.: 0.23:1.000:. ./.:4:116,93:.: 0.96:1.000:. ./.:4:37,98:.:-0.22:1.000:. ./.:4:85,74:.: 0.17:1.000:. ./.:4:51,100:.: 0.04:0.998:. ./.:4:114,95:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,139:.: 0.53:1.000:. ./.:4:9,43:.:-1.54:1.000:. ./.:4:83,96:.: 0.48:1.000:. ./.:4:118,74:.: 0.69:1.000:. ./.:4:8,79:.:-0.98:1.000:. ./.:4:67,67:.:-0.23:1.000:. ./.:4:97,87:.: 0.56:1.000:. ./.:4:54,87:.:-0.12:1.000:. ./.:4:109,80:.: 0.64:1.000:. ./.:4:92,90:.: 0.53:1.000:. ./.:4:92,53:.:-0.06:1.000:. ./.:4:102,92:.: 0.72:1.000:. ./.:4:111,106:.: 1.09:1.000:. ./.:4:46,112:.: 0.15:1.000:. ./.:4:66,59:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,106:.: 0.26:1.000:. ./.:4:78,67:.:-0.06:1.000:. ./.:4:23,52:.:-1.17:1.000:. ./.:4:28,97:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:83,70:.: 0.07:1.000:. ./.:4:47,89:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,103:.: 0.07:1.000:. ./.:4:54,53:.:-0.66:1.000:. ./.:4:25,62:.:-0.98:1.000:. ./.:4:41,87:.:-0.33:1.000:. ./.:4:35,80:.:-0.53:1.000:. ./.:4:7,44:.:-1.55:1.000:. ./.:4:21,61:.:-1.06:1.000:. ./.:4:7,101:.:-0.64:1.000:. ./.:4:51,71:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,80:.:-0.47:1.000:. ./.:4:74,33:.:-0.66:1.000:. ./.:4:40,96:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,45:.:-1.33:1.000:. ./.:4:64,73:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,90:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,144:.: 0.25:1.000:. ./.:4:200,145:.: 3.12:1.000:. ./.:4:38,63:.:-0.76:1.000:. ./.:4:53,65:.:-0.49:1.000:. ./.:4:62,84:.:-0.04:1.000:. ./.:4:14,69:.:-1.04:0.999:. ./.:4:0,127:.:-0.34:1.000:. ./.:4:11,19:.:-1.89:1.000:. ./.:4:52,96:.:-0.01:1.000:. ./.:4:14,61:.:-1.17:1.000:. ./.:4:56,49:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,68:.:-0.49:1.000:. ./.:4:80,73:.: 0.07:1.000:. ./.:4:8,104:.:-0.58:1.000:. ./.:4:66,109:.: 0.42:1.000:. ./.:4:39,110:.: 0.01:1.000:. ./.:4:151,173:.: 2.79:1.000:. ./.:4:65,96:.: 0.20:1.000:. ./.:4:50,85:.:-0.22:1.000:. ./.:4:3,99:.:-0.74:1.000:. ./.:4:4,69:.:-1.20:1.000:. ./.:4:16,57:.:-1.20:1.000:. ./.:4:104,51:.: 0.10:1.000:. ./.:4:28,65:.:-0.88:1.000:. ./.:4:96,90:.: 0.60:1.000:. ./.:4:32,55:.:-0.98:0.991:. ./.:4:43,64:.:-0.66:1.000:. ./.:4:58,63:.:-0.44:1.000:. ./.:4:70,121:.: 0.68:1.000:. ./.:4:40,111:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,74:.: 0.13:1.000:. ./.:4:31,51:.:-1.06:1.000:. ./.:4:31,104:.:-0.22:1.000:. ./.:4:43,54:.:-0.82:1.000:. ./.:4:67,73:.:-0.14:1.000:. ./.:4:41,129:.: 0.34:1.000:. ./.:4:19,45:.:-1.34:1.000:. ./.:4:39,145:.: 0.56:1.000:. ./.:4:60,141:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.58:1.000:. ./.:4:51,77:.:-0.33:1.000:. ./.:4:100,66:.: 0.28:1.000:. ./.:4:114,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:68,207:.: 2.01:1.000:. ./.:4:62,94:.: 0.12:1.000:. ./.:4:5,8:.:-2.16:1.000:. ./.:4:46,151:.: 0.77:1.000:. ./.:4:50,100:.: 0.02:1.000:. ./.:4:105,147:.: 1.65:1.000:. ./.:4:56,229:.: 2.17:1.000:. ./.:4:99,159:.: 1.74:1.000:. ./.:4:41,108:.: 0.01:1.000:. ./.:4:111,84:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,102:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,78:.:-0.63:1.000:. ./.:4:53,75:.:-0.33:1.000:. ./.:4:178,83:.: 1.79:1.000:. ./.:4:49,83:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,97:.: 0.40:1.000:. ./.:4:110,100:.: 0.98:1.000:. ./.:4:24,99:.:-0.41:0.999:. ./.:4:102,114:.: 1.07:1.000:. ./.:4:45,150:.: 0.74:1.000:. ./.:4:79,105:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,60:.:-1.01:1.000:. ./.:4:59,105:.: 0.25:1.000:. ./.:4:46,142:.: 0.63:1.000:. ./.:4:28,30:.:-1.44:1.000:. ./.:4:55,138:.: 0.71:1.000:. ./.:4:5,133:.:-0.17:1.000:. ./.:4:124,118:.: 1.49:1.000:. ./.:4:59,118:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,111:.: 0.09:1.000:. ./.:4:66,216:.: 2.12:1.000:. ./.:4:139,190:.: 2.87:1.000:. ./.:4:0,229:.: 1.28:1.000:. ./.:4:59,95:.: 0.09:1.000:. ./.:4:69,107:.: 0.44:1.000:. -chr4.1 87236652 chr4.1_087236652 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:33,11:.:-0.53:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:54,17:.: 1.05:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:45,21:.: 0.75:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:73,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:71,27:.: 2.62:1.000:. ./.:4:5,6:.:-2.45:1.000:. ./.:4:33,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,17:.:-0.53:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.68:1.000:. ./.:4:26,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,16:.: 0.05:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:31,22:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,4:.:-2.68:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.40:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:47,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:54,9:.: 0.58:1.000:. ./.:4:55,23:.: 1.45:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:56,17:.: 1.16:1.000:. ./.:4:47,15:.: 0.52:1.000:. ./.:4:75,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:38,15:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:38,16:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:26,12:.:-0.88:1.000:. ./.:4:11,4:.:-2.22:1.000:. ./.:4:41,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:45,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:34,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:25,10:.:-1.05:1.000:. ./.:6:44,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:53,21:.: 1.22:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:43,16:.: 0.35:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.94:0.998:. ./.:4:31,14:.:-0.47:1.000:. ./.:4:24,14:.:-0.88:1.000:. ./.:4:21,11:.:-1.23:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:28,16:.:-0.53:1.000:. ./.:4:41,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:29,22:.:-0.12:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:24,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:78,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:79,2:.: 1.63:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:60,25:.: 1.86:1.000:. ./.:4:46,17:.: 0.58:1.000:. ./.:4:53,23:.: 1.34:1.000:. ./.:4:32,34:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,18:.: 1.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,17:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:40,16:.: 0.17:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:46,26:.: 1.10:0.999:. ./.:4:51,17:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:44,13:.: 0.23:1.000:. ./.:4:28,16:.:-0.53:1.000:. ./.:4:36,23:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,23:.:-0.53:1.000:. ./.:4:51,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.47:1.000:. ./.:4:34,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:55,13:.: 0.87:1.000:. ./.:4:31,19:.:-0.18:1.000:. ./.:4:49,18:.: 0.81:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:18,29:.:-0.35:1.000:. ./.:4:29,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,10:.: 0.05:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.29:0.991:. ./.:4:27,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:45,8:.: 0.00:1.000:. ./.:4:27,18:.:-0.47:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.29:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:28,14:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,16:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:44,15:.: 0.35:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,15:.: 0.81:1.000:. ./.:4:37,12:.:-0.24:1.000:. ./.:4:56,20:.: 1.34:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,25:.: 1.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.58:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:29,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:70,17:.: 1.98:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,18:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,15:.: 0.00:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:51,29:.: 1.57:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:56,23:.: 1.51:0.999:. ./.:4:54,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:60,20:.: 1.57:1.000:. ./.:4:21,13:.:-1.11:1.000:. ./.:4:33,9:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:26,18:.:-0.53:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:46,18:.: 0.64:1.000:. ./.:4:43,21:.: 0.64:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:70,18:.: 2.04:1.000:. ./.:4:28,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:42,11:.: 0.00:1.000:. -chr4.1 87371304 chr4.1_087371304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:114,131:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,96:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,100:0.54:-0.48:1.000:0.987 0/0/1/1:4:88,100:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,133:0.51: 0.98:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,253:1.00: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,139:0.72:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,131:0.54: 0.66:1.000:0.987 0/1/1/1:4:59,169:0.72: 0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,43:0.67:-2.83:1.000:0.905 0/0/1/1:4:38,51:0.54:-2.26:1.000:0.988 0/1/1/1:4:51,167:0.74: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,124:0.52: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,109:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,68:0.31: 0.64:1.000:0.974 0/1/1/1:4:66,180:0.71: 1.04:1.000:0.990 0/0/0/1:4:154,53:0.28: 0.22:0.999:0.997 0/0/0/1:4:179,60:0.27: 0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,152:0.49: 1.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,192:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,70:0.85:-2.43:1.000:0.987 0/0/1/1:4:101,111:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,182:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,44:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,25:0.61:-3.31:1.000:0.682 0/0/0/1:4:182,59:0.27: 0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,143:0.55: 1.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:101,106:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,68:0.33: 0.32:1.000:0.932 0/0/1/1:4:106,122:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,119:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,123:0.54: 0.41:1.000:0.990 1/1/1/1:4:2,22:0.91:-3.63:1.000:0.932 0/0/1/1:4:43,60:0.55:-1.97:1.000:0.981 0/1/1:3:8,17:0.65:-3.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,120:0.52: 0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,123:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,194:0.79: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,52:0.32:-0.66:1.000:0.947 0/1/1/1:4:61,154:0.69: 0.39:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,179:0.78: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,141:0.58: 0.70:1.000:0.909 0/1/1/1:4:38,149:0.78:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,200:0.78: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,115:0.51: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,131:0.57: 0.43:1.000:0.943 0/0/1/1:4:132,90:0.39: 0.53:1.000:0.744 0/1/1/1:4:55,177:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,160:0.74: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,138:0.77:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,126:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,80:0.52:-1.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,163:0.73: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,129:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,206:0.80: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,95:0.47:-0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,106:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,135:0.79:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:11,135:0.92:-1.06:1.000:0.642 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,180:0.77: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,189:0.76: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,104:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,130:0.73:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,189:0.67: 1.56:1.000:0.923 0/1/1/1:4:18,88:0.81:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,106:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,127:0.51: 0.79:0.998:0.996 0/1/1/1:4:46,151:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,186:0.75: 0.93:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,177:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,207:0.75: 1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,125:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,138:0.79:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,93:0.55:-0.79:1.000:0.978 0/1/1/1:4:32,154:0.81:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,90:0.56:-0.94:1.000:0.969 0/1/1/1:4:43,126:0.72:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,92:0.48:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,78:0.52:-1.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,140:0.73:-0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,178:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,143:0.72:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,164:0.67: 0.83:1.000:0.912 0/1/1/1:4:59,155:0.70: 0.37:1.000:0.984 0/1/1/1:4:40,134:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,95:0.59:-0.92:1.000:0.866 0/1/1/1:4:29,125:0.79:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,117:0.61:-0.27:1.000:0.740 0/1/1/1:4:47,129:0.71:-0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:84,86:0.48:-0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,120:0.53: 0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:69,100:0.56:-0.58:1.000:0.969 0/0/1/1:4:93,96:0.48:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:126,64:0.34:-0.14:1.000:0.870 0/1/1/1:4:32,111:0.75:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,82:0.52:-1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,114:0.56:-0.08:1.000:0.971 0/0/1/1:4:91,99:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,111:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,47:0.29:-0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:60,62:0.48:-1.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,114:0.57:-0.16:1.000:0.944 0/1/1/1:4:37,115:0.73:-0.94:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,133:0.72:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,153:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,85:0.47:-0.52:1.000:0.991 0/1/1/1:4:65,213:0.74: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,111:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,156:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,119:0.47: 0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,153:0.75: 0.01:0.999:1.000 0/1/1/1:4:49,139:0.72:-0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,125:0.75:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,113:0.52: 0.16:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,194:0.99:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,102:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,173:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,122:0.73:-0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,98:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,84:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,155:0.71: 0.28:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,148:0.78:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,218:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,113:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:37,149:0.78:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,103:0.75:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,77:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,93:0.54:-0.71:1.000:0.990 0/0/1/1:4:103,115:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,56:0.47:-1.80:0.991:0.994 0/0/0/1:4:120,51:0.31:-0.54:1.000:0.975 0/1/1/1:4:49,143:0.72:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,65:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,100:0.53:-0.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,109:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,109:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,95:0.52:-0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,117:0.53: 0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:127,64:0.34:-0.12:1.000:0.878 1/1/1/1:4:0,203:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,95:0.76:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,312:1.00: 2.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,170:0.53: 2.15:1.000:0.991 0/1/1/1:4:54,167:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:109,117:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,157:0.54: 1.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:78,83:0.48:-0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,131:0.54: 0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:91,99:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,31:0.66:-3.19:1.000:0.879 0/1/1/1:4:34,123:0.76:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,115:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,115:0.46: 0.89:1.000:0.985 0/1/1/1:4:66,234:0.76: 2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,194:0.80: 0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,201:0.76: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,127:0.51: 0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,165:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,86:0.45:-0.29:1.000:0.976 0/0/1/1:4:84,106:0.52:-0.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,178:0.73: 0.83:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,249:1.00: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,136:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,132:0.53: 0.74:0.999:0.990 1/1/1/1:4:0,205:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,152:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,146:0.74:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,107:0.58:-0.48:1.000:0.900 0/0/0/1:4:131,38:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,138:0.77:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,69:0.46:-1.15:1.000:0.987 0/0/1/1:4:77,101:0.53:-0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:114,137:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,128:0.53: 0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,126:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,149:0.70: 0.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:118,106:0.45: 0.58:1.000:0.979 0/1/1/1:4:35,197:0.83: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,212:0.74: 1.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,154:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,162:0.73: 0.41:1.000:0.997 -chr4.1 87536266 chr4.1_087536266 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,119:.: 0.30:1.000:. ./.:4:156,44:.:-0.17:1.000:. ./.:4:140,51:.:-0.32:1.000:. ./.:4:102,95:.:-0.22:1.000:. ./.:4:219,47:.: 0.98:1.000:. ./.:4:136,45:.:-0.50:1.000:. ./.:4:116,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:112,91:.:-0.12:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:21,15:.:-3.01:1.000:. ./.:4:27,13:.:-2.94:1.000:. ./.:4:114,102:.: 0.11:1.000:. ./.:4:152,56:.:-0.03:1.000:. ./.:4:134,122:.: 0.80:1.000:. ./.:4:161,47:.:-0.03:1.000:. ./.:4:168,62:.: 0.35:1.000:. ./.:4:132,106:.: 0.49:0.999:. ./.:4:150,46:.:-0.24:1.000:. ./.:4:184,136:.: 1.91:1.000:. ./.:4:200,59:.: 0.85:1.000:. ./.:4:17,11:.:-3.15:1.000:. ./.:4:147,47:.:-0.27:1.000:. ./.:4:222,76:.: 1.53:1.000:. ./.:4:176,58:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,13:.:-2.98:1.000:. ./.:4:175,63:.: 0.49:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:155,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:273,60:.: 2.14:1.000:. ./.:4:237,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:192,42:.: 0.42:1.000:. ./.:4:108,35:.:-1.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:29,9:.:-2.98:1.000:. ./.:3:9,1:.:-3.46:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:198,54:.: 0.73:1.000:. ./.:4:136,90:.: 0.28:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:138,33:.:-0.67:1.000:. ./.:4:153,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:100,111:.: 0.02:1.000:. ./.:4:215,52:.: 0.99:1.000:. ./.:4:180,42:.: 0.21:1.000:. ./.:4:238,58:.: 1.50:1.000:. ./.:4:35,10:.:-2.86:1.000:. ./.:4:58,72:.:-1.38:1.000:. ./.:4:142,46:.:-0.38:1.000:. ./.:4:137,51:.:-0.38:1.000:. ./.:4:206,59:.: 0.96:1.000:. ./.:4:98,92:.:-0.34:1.000:. ./.:4:106,110:.: 0.11:1.000:. ./.:4:198,58:.: 0.80:1.000:. ./.:4:158,52:.: 0.00:1.000:. ./.:4:118,90:.:-0.03:1.000:. ./.:4:132,56:.:-0.38:1.000:. ./.:4:73,102:.:-0.60:1.000:. ./.:6:136,44:.:-0.52:1.000:. ./.:4:157,58:.: 0.09:1.000:. ./.:4:126,54:.:-0.52:1.000:. ./.:4:140,105:.: 0.61:1.000:. ./.:4:169,59:.: 0.32:1.000:. ./.:4:164,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:161,118:.: 1.20:1.000:. ./.:4:212,39:.: 0.72:1.000:. ./.:4:166,38:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,68:.:-0.65:0.998:. ./.:4:223,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:104,96:.:-0.17:1.000:. ./.:4:97,59:.:-0.93:1.000:. ./.:4:182,48:.: 0.35:1.000:. ./.:4:171,60:.: 0.37:1.000:. ./.:4:116,92:.:-0.03:1.000:. ./.:4:166,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:90,97:.:-0.39:1.000:. ./.:4:112,110:.: 0.21:1.000:. ./.:4:171,52:.: 0.23:1.000:. ./.:4:201,56:.: 0.82:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:113,89:.:-0.13:1.000:. ./.:4:142,121:.: 0.92:1.000:. ./.:4:104,104:.:-0.03:1.000:. ./.:4:124,95:.: 0.16:1.000:. ./.:4:238,74:.: 1.77:1.000:. ./.:4:94,109:.:-0.12:1.000:. ./.:4:166,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:133,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:96,76:.:-0.65:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:117,117:.: 0.42:1.000:. ./.:4:94,85:.:-0.53:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:209,51:.: 0.87:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:189,62:.: 0.72:1.000:. ./.:4:296,2:.: 1.53:1.000:. ./.:4:124,99:.: 0.23:1.000:. ./.:4:117,90:.:-0.05:1.000:. ./.:4:157,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:123,113:.: 0.46:1.000:. ./.:4:119,46:.:-0.78:1.000:. ./.:4:95,99:.:-0.27:1.000:. ./.:4:126,38:.:-0.79:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:159,152:.: 1.76:1.000:. ./.:4:173,61:.: 0.42:1.000:. ./.:4:86,112:.:-0.20:1.000:. ./.:4:228,68:.: 1.50:1.000:. ./.:4:150,48:.:-0.20:0.999:. ./.:4:188,53:.: 0.54:1.000:. ./.:4:127,36:.:-0.81:1.000:. ./.:4:139,116:.: 0.79:1.000:. ./.:4:158,47:.:-0.08:1.000:. ./.:4:121,49:.:-0.69:1.000:. ./.:4:103,115:.: 0.14:1.000:. ./.:4:151,51:.:-0.13:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:140,37:.:-0.57:1.000:. ./.:4:124,123:.: 0.65:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,92:.:-0.46:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:189,45:.: 0.42:1.000:. ./.:4:114,42:.:-0.93:1.000:. ./.:4:114,29:.:-1.16:1.000:. ./.:4:131,41:.:-0.65:1.000:. ./.:4:163,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:114,111:.: 0.26:1.000:. ./.:4:102,75:.:-0.57:0.991:. ./.:4:110,91:.:-0.15:1.000:. ./.:4:211,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:271,73:.: 2.33:1.000:. ./.:4:111,106:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,75:.:-0.76:1.000:. ./.:4:150,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,92:.:-0.27:1.000:. ./.:4:164,46:.: 0.00:1.000:. ./.:4:217,48:.: 0.96:1.000:. ./.:4:144,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:103,36:.:-1.23:1.000:. ./.:4:218,90:.: 1.70:1.000:. ./.:4:205,92:.: 1.51:1.000:. ./.:4:167,56:.: 0.23:1.000:. ./.:4:152,45:.:-0.22:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:168,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:121,108:.: 0.33:1.000:. ./.:4:177,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,11:.:-3.20:1.000:. ./.:4:70,60:.:-1.38:1.000:. ./.:4:87,87:.:-0.62:1.000:. ./.:4:206,62:.: 1.01:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:152,137:.: 1.37:1.000:. ./.:4:153,38:.:-0.32:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:153,53:.:-0.06:1.000:. ./.:4:127,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:172,52:.: 0.25:1.000:. ./.:4:177,51:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,58:.: 0.52:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:145,95:.: 0.52:1.000:. ./.:4:197,58:.: 0.79:0.999:. ./.:4:164,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:179,47:.: 0.28:1.000:. ./.:4:87,80:.:-0.74:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,100:.: 0.06:1.000:. ./.:4:167,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:142,51:.:-0.29:1.000:. ./.:4:79,75:.:-0.97:1.000:. ./.:4:193,60:.: 0.75:1.000:. ./.:4:235,63:.: 1.53:1.000:. ./.:4:125,104:.: 0.33:1.000:. ./.:4:156,39:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,100:.: 0.21:1.000:. ./.:4:165,123:.: 1.36:1.000:. ./.:4:227,60:.: 1.34:1.000:. ./.:4:102,95:.:-0.22:1.000:. ./.:4:206,63:.: 1.03:1.000:. -chr4.1 87845084 chr4.1_087845084 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:167,199:0.53: 0.81:1.000:0.991 0/1/1/1:4:55,227:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:234,96:0.28: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:182,141:0.43: 0.23:1.000:0.950 0/0/1/1:4:205,212:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:260,93:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,127:0.52:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:235,74:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,72:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,5:0.12:-3.54:1.000:0.717 0/0/1/1:4:20,24:0.53:-3.50:1.000:0.990 0/1/1/1:4:69,217:0.71:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:179,178:0.49: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,190:0.53: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:248,69:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,95:0.27: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,188:0.50: 0.90:0.999:0.997 0/0/0/1:4:274,81:0.22: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,114:0.25: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,91:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.48:-3.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:253,87:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,209:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:218,71:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.26:-3.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:248,79:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,81:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,140:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:290,101:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,73:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,181:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:211,67:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,4:0.22:-3.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.47:-3.27:1.000:0.993 0/0/1:3:1,1:0.50:-4.06:1.000:0.568 0/0/0/1:4:227,73:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,98:0.30: 0.11:1.000:0.980 0/0/0/1:4:244,93:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:194,173:0.47: 0.82:1.000:0.991 0/0/0/1:4:253,89:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:238,66:0.21:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,75:0.28:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:228,103:0.30: 0.34:1.000:0.981 0/0/0/1:4:232,73:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,100:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,64:0.19: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:363,1:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:399,141:0.25: 3.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,81:0.26:-0.10:1.000:0.998 0/0/0/0:4:345,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,66:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,172:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,144:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:242,85:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:354,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,99:0.30: 0.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:158,162:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,70:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,74:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:220,49:0.18:-0.49:1.000:0.977 0/0/0/1:4:280,83:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,168:0.54:-0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:248,90:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,146:0.51:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:227,97:0.29: 0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:229,171:0.42: 1.26:1.000:0.922 0/0/0/0:4:260,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,70:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,169:0.52: 0.18:0.998:0.995 0/0/0/1:4:200,65:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,94:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:186,52:0.21:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,157:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:270,79:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,274:0.76: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,65:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,51:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,159:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:312,1:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,99:0.27: 0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:136,133:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:268,92:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:271,107:0.28: 0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:216,62:0.22:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,83:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:230,93:0.28: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:202,69:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,153:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:229,83:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:213,73:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,75:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:220,59:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,155:0.45: 0.49:1.000:0.978 0/0/1/1:4:132,117:0.47:-0.76:1.000:0.990 0/0/0/1:4:243,90:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:245,74:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:283,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,129:0.52:-0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,175:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:257,82:0.23: 0.45:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:163,170:0.51: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,67:0.26:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,89:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,111:0.45:-0.85:1.000:0.983 0/0/0/1:4:178,79:0.30:-0.65:1.000:0.985 0/0/0/0:4:275,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,83:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,99:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,169:0.52: 0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:208,71:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,184:0.47: 1.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:252,96:0.27: 0.57:0.999:0.998 0/0/0/1:4:251,94:0.26: 0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,124:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,203:0.55: 0.77:1.000:0.984 0/0/0/1:4:211,85:0.28:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:215,75:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,69:0.26:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,92:0.28: 0.14:1.000:0.994 0/0/0/0:4:270,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,85:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,69:0.22:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:335,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,174:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,142:0.51:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:186,69:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,68:0.28:-0.93:1.000:0.995 0/0/0/1:4:194,90:0.31:-0.29:1.000:0.974 0/0/1/1:4:168,164:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,128:0.52:-0.81:0.991:0.996 0/0/1/1:4:165,149:0.47: 0.11:1.000:0.992 0/0/0/0:4:271,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,110:0.26: 1.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:227,89:0.27: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:197,85:0.29:-0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:131,138:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,71:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:223,62:0.21:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,70:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,71:0.21: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,138:0.53:-0.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:302,116:0.27: 1.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:292,94:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,83:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,169:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:245,93:0.27: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:220,90:0.28: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:294,105:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,156:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,11:0.43:-3.75:1.000:0.958 0/0/0/1:4:195,76:0.27:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,161:0.46: 0.54:1.000:0.988 0/0/0/0:4:358,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:334,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,101:0.28: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:220,76:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:282,99:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,75:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,61:0.21:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,159:0.55:-0.29:1.000:0.983 0/0/0/1:4:260,75:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,100:0.30: 0.23:1.000:0.983 0/0/0/0:4:298,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,84:0.28:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,245:0.74: 0.02:0.999:0.999 0/0/0/1:4:232,73:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,73:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,77:0.28:-0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:187,69:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:172,158:0.47: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:228,74:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,120:0.44:-0.50:1.000:0.971 0/0/0/1:4:206,75:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,186:0.48: 1.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:281,87:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,163:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,95:0.32:-0.22:1.000:0.949 0/0/0/1:4:258,90:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:325,120:0.26: 1.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:310,94:0.23: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,64:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,167:0.50: 0.31:1.000:0.997 -chr4.1 88184530 chr4.1_088184530 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:224,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:193,57:.: 0.01:1.000:. ./.:4:180,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:262,69:.: 1.15:1.000:. ./.:4:324,76:.: 2.12:1.000:. ./.:4:294,103:.: 2.08:1.000:. ./.:4:87,32:.:-1.83:1.000:. ./.:4:235,43:.: 0.40:1.000:. ./.:4:204,55:.: 0.14:1.000:. ./.:4:97,10:.:-2.00:1.000:. ./.:4:58,17:.:-2.45:1.000:. ./.:4:167,79:.:-0.04:1.000:. ./.:4:194,47:.:-0.11:1.000:. ./.:4:196,60:.: 0.10:1.000:. ./.:4:224,73:.: 0.67:1.000:. ./.:4:294,87:.: 1.85:1.000:. ./.:4:284,101:.: 1.91:0.999:. ./.:4:216,108:.: 1.05:1.000:. ./.:4:184,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:176,112:.: 0.55:1.000:. ./.:4:38,5:.:-2.90:1.000:. ./.:4:202,51:.: 0.05:1.000:. ./.:4:284,35:.: 0.98:1.000:. ./.:4:153,44:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,14:.:-2.71:1.000:. ./.:4:270,51:.: 1.01:1.000:. ./.:4:266,139:.: 2.19:1.000:. ./.:4:211,30:.:-0.11:1.000:. ./.:4:246,85:.: 1.15:1.000:. ./.:4:261,76:.: 1.23:1.000:. ./.:4:273,25:.: 0.69:1.000:. ./.:4:210,29:.:-0.14:1.000:. ./.:4:54,11:.:-2.59:1.000:. ./.:4:75,19:.:-2.18:1.000:. ./.:3:27,13:.:-2.94:1.000:. ./.:4:231,61:.: 0.60:1.000:. ./.:4:235,91:.: 1.08:1.000:. ./.:4:192,55:.:-0.03:1.000:. ./.:4:241,66:.: 0.81:1.000:. ./.:4:228,39:.: 0.25:1.000:. ./.:4:167,79:.:-0.04:1.000:. ./.:4:216,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:228,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:187,57:.:-0.07:1.000:. ./.:4:196,51:.:-0.03:1.000:. ./.:4:198,125:.: 1.04:1.000:. ./.:4:221,85:.: 0.80:1.000:. ./.:4:180,100:.: 0.43:1.000:. ./.:4:162,27:.:-0.85:1.000:. ./.:4:178,82:.: 0.15:1.000:. ./.:4:174,25:.:-0.70:1.000:. ./.:4:332,106:.: 2.65:1.000:. ./.:4:230,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:166,66:.:-0.24:1.000:. ./.:4:156,104:.: 0.15:1.000:. ./.:4:209,57:.: 0.24:1.000:. ./.:4:207,48:.: 0.08:1.000:. ./.:4:196,67:.: 0.19:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.18:1.000:. ./.:6:136,54:.:-0.83:1.000:. ./.:4:174,106:.: 0.43:1.000:. ./.:4:239,62:.: 0.73:1.000:. ./.:4:214,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:231,102:.: 1.18:1.000:. ./.:4:215,71:.: 0.52:1.000:. ./.:4:257,57:.: 0.91:1.000:. ./.:4:111,42:.:-1.35:1.000:. ./.:4:141,33:.:-1.06:1.000:. ./.:4:176,64:.:-0.13:0.998:. ./.:4:178,84:.: 0.18:1.000:. ./.:4:201,53:.: 0.07:1.000:. ./.:4:133,32:.:-1.18:1.000:. ./.:4:217,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:247,127:.: 1.75:1.000:. ./.:4:228,54:.: 0.46:1.000:. ./.:4:213,103:.: 0.94:1.000:. ./.:4:199,94:.: 0.62:1.000:. ./.:4:183,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:185,58:.:-0.09:1.000:. ./.:4:229,61:.: 0.57:1.000:. ./.:4:185,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:179,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:196,115:.: 0.87:1.000:. ./.:4:167,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:235,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:159,78:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,39:.:-1.29:1.000:. ./.:4:177,24:.:-0.68:1.000:. ./.:4:178,36:.:-0.49:1.000:. ./.:4:221,31:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,24:.:-0.86:1.000:. ./.:4:252,57:.: 0.84:1.000:. ./.:4:253,122:.: 1.77:1.000:. ./.:4:168,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:211,76:.: 0.53:1.000:. ./.:4:194,56:.: 0.01:1.000:. ./.:4:212,16:.:-0.30:1.000:. ./.:4:119,19:.:-1.56:1.000:. ./.:4:178,46:.:-0.35:1.000:. ./.:4:212,31:.:-0.09:1.000:. ./.:4:103,37:.:-1.53:1.000:. ./.:4:204,55:.: 0.14:1.000:. ./.:4:115,36:.:-1.38:1.000:. ./.:4:196,58:.: 0.07:1.000:. ./.:4:98,40:.:-1.56:1.000:. ./.:4:193,76:.: 0.28:1.000:. ./.:4:194,71:.: 0.22:1.000:. ./.:4:200,49:.: 0.00:1.000:. ./.:4:198,26:.:-0.35:1.000:. ./.:4:236,34:.: 0.29:1.000:. ./.:4:122,62:.:-0.92:1.000:. ./.:4:288,120:.: 2.23:1.000:. ./.:4:220,82:.: 0.74:0.999:. ./.:4:223,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:165,38:.:-0.65:1.000:. ./.:4:222,63:.: 0.50:1.000:. ./.:4:123,17:.:-1.53:1.000:. ./.:4:131,67:.:-0.72:1.000:. ./.:4:131,48:.:-0.99:1.000:. ./.:4:152,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:207,98:.: 0.78:1.000:. ./.:4:174,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:207,113:.: 0.99:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:129,72:.:-0.68:1.000:. ./.:4:190,93:.: 0.48:1.000:. ./.:4:185,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:150,23:.:-1.07:1.000:. ./.:4:79,35:.:-1.90:1.000:. ./.:4:124,35:.:-1.27:1.000:. ./.:4:183,68:.: 0.03:1.000:. ./.:4:232,63:.: 0.64:1.000:. ./.:4:156,33:.:-0.85:0.991:. ./.:4:232,60:.: 0.60:1.000:. ./.:4:186,89:.: 0.36:1.000:. ./.:4:199,72:.: 0.31:1.000:. ./.:4:219,94:.: 0.90:1.000:. ./.:4:161,74:.:-0.20:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:155,49:.:-0.63:1.000:. ./.:4:175,58:.:-0.23:1.000:. ./.:4:166,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:171,64:.:-0.20:1.000:. ./.:4:142,45:.:-0.87:1.000:. ./.:4:210,58:.: 0.26:1.000:. ./.:4:243,100:.: 1.32:1.000:. ./.:4:216,100:.: 0.94:1.000:. ./.:4:224,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:227,64:.: 0.59:1.000:. ./.:4:155,54:.:-0.56:1.000:. ./.:4:202,104:.: 0.80:1.000:. ./.:4:237,64:.: 0.73:1.000:. ./.:4:52,15:.:-2.56:1.000:. ./.:4:142,31:.:-1.07:1.000:. ./.:4:295,37:.: 1.16:1.000:. ./.:4:205,75:.: 0.43:1.000:. ./.:4:235,67:.: 0.74:1.000:. ./.:4:160,68:.:-0.30:1.000:. ./.:4:171,57:.:-0.30:1.000:. ./.:4:204,34:.:-0.16:1.000:. ./.:4:149,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:167,58:.:-0.34:1.000:. ./.:4:220,63:.: 0.48:1.000:. ./.:4:160,68:.:-0.30:1.000:. ./.:4:302,74:.: 1.78:1.000:. ./.:4:218,56:.: 0.35:1.000:. ./.:4:150,48:.:-0.72:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.40:0.999:. ./.:4:205,60:.: 0.22:1.000:. ./.:4:169,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:123,80:.:-0.65:1.000:. ./.:4:179,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:231,66:.: 0.67:1.000:. ./.:4:191,50:.:-0.11:1.000:. ./.:4:150,47:.:-0.73:1.000:. ./.:4:222,82:.: 0.77:1.000:. ./.:4:186,91:.: 0.39:1.000:. ./.:4:251,69:.: 0.99:1.000:. ./.:4:188,77:.: 0.22:1.000:. ./.:4:165,85:.: 0.01:1.000:. ./.:4:299,111:.: 2.26:1.000:. ./.:4:242,39:.: 0.45:1.000:. ./.:4:140,39:.:-0.99:1.000:. ./.:4:262,75:.: 1.23:1.000:. -chr4.1 88263594 chr4.1_088263594 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:1,161:0.99: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,90:0.70:-0.61:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,132:0.77: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,97:0.51: 1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,137:0.81: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,88:0.75:-0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,113:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,74:0.54:-0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,11:0.56:-3.39:1.000:0.969 0/1/1/1:4:13,36:0.76:-2.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,76:0.49: 0.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.54: 0.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:86,85:0.53: 0.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:43,129:0.78: 0.33:0.999:1.000 0/1/1/1:4:46,134:0.77: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,107:0.52: 1.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,165:0.81: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,27:0.76:-3.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,88:0.68:-0.56:1.000:0.952 0/1/1/1:4:62,133:0.71: 0.90:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,109:0.77:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.31:-3.37:1.000:0.968 0/1/1/1:4:67,115:0.66: 0.58:1.000:0.896 0/0/1/1:4:89,57:0.43:-0.31:1.000:0.941 0/0/1/1:4:90,78:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,98:0.49: 1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,41:0.26: 0.65:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,142:0.72: 1.17:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,139:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.47:-3.56:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,30:0.76:-2.90:1.000:1.000 0/1/1:3:1,5:0.85:-3.76:1.000:0.633 0/1/1/1:4:40,109:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,112:0.71: 0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:41,136:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,154:0.77: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,91:0.46: 1.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:44,91:0.71:-0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:105,73:0.45: 0.48:1.000:0.977 0/0/1/1:4:118,90:0.47: 1.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:45,121:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,97:0.58: 0.48:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,100:0.52: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,58:0.47:-0.63:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,120:0.64: 0.95:1.000:0.715 0/0/1/1:4:69,59:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,158:0.72: 1.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,112:0.77:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,93:0.58: 0.31:1.000:0.921 0/0/1/1:4:108,83:0.47: 0.80:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,125:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:77,57:0.46:-0.61:1.000:0.807 0/0/1/1:4:81,70:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,116:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,134:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,80:0.47: 0.68:1.000:0.991 0/1/1/1:4:34,125:0.81: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,159:0.80: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,44:0.31: 0.06:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,117:0.75: 0.11:0.998:0.999 0/1/1/1:4:31,106:0.80:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,121:0.74: 0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,96:0.71:-0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,90:0.46: 1.39:1.000:0.985 0/1/1/1:4:48,113:0.73: 0.06:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,46:0.38:-0.61:1.000:0.597 0/1/1/1:4:45,115:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,100:0.76:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,128:0.79: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,99:0.55: 0.82:1.000:0.979 0/0/1/1:4:66,53:0.48:-0.98:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,119:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,126:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,108:0.74:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,139:0.69: 1.27:1.000:0.979 0/0/1/1:4:91,106:0.57: 0.95:1.000:0.940 0/1/1/1:4:28,95:0.80:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,93:0.75:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,29:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,70:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,80:0.70:-0.98:1.000:0.988 0/0/0/1:4:117,35:0.27:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,126:0.76: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,114:0.71: 0.26:1.000:0.990 0/1/1/1:4:50,118:0.73: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,27:0.25:-0.70:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,141:0.99:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,116:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,96:0.48: 1.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:58,66:0.57:-0.85:1.000:0.954 0/1/1/1:4:43,131:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,77:0.74:-1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,113:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,75:0.55:-0.28:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,179:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,64:0.48:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,55:0.38: 0.04:1.000:0.602 0/1/1/1:4:65,150:0.73: 1.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,112:0.73: 0.04:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,179:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,162:0.76: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,102:0.74:-0.38:0.999:0.999 0/0/1/1:4:87,84:0.53: 0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:49,96:0.69:-0.33:1.000:0.979 0/1/1/1:4:50,116:0.73: 0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,91:0.72:-0.63:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,108:0.70: 0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:87,66:0.47:-0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,63:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,144:0.74: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,69:0.50:-0.21:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,80:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,76:0.56:-0.36:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,79:0.74:-1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,103:0.77:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,116:0.78:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,57:0.70:-1.79:0.991:0.980 0/1/1/1:4:45,105:0.73:-0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,63:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,168:0.71: 2.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,131:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,96:0.78:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,94:0.71:-0.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,106:0.77:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,124:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,80:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,108:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,77:0.73:-1.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,163:0.77: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,153:0.72: 1.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,81:0.55:-0.04:1.000:0.979 0/1/1/1:4:47,111:0.73:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,98:0.48: 1.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,115:0.78:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,131:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,96:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,18:0.72:-3.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,72:0.56:-0.56:1.000:0.960 0/1/1/1:4:51,157:0.78: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,93:0.54: 0.60:1.000:0.986 0/0/0/1:4:164,39:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,98:0.52: 1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,108:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,84:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,111:0.69: 0.26:1.000:0.972 0/1/1/1:4:38,116:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,107:0.76:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,86:0.54: 0.26:1.000:0.985 0/0/0/1:4:148,46:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,76:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,100:0.77:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 0.41:0.999:1.000 0/0/1/1:4:78,75:0.53:-0.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,119:0.83:-0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,85:0.75:-0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,101:0.67:-0.01:1.000:0.928 0/0/0/1:4:112,32:0.26:-0.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,126:0.74: 0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,66:0.69:-1.44:1.000:0.977 0/1/1/1:4:60,135:0.72: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,96:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,160:0.79: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,110:0.78:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,130:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,103:0.51: 1.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,113:0.54: 1.66:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,137:0.73: 0.92:1.000:0.998 -chr4.1 88675558 chr4.1_088675558 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:89,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:54,23:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,36:.: 0.59:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:67,23:.: 0.64:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:76,28:.: 1.27:1.000:. ./.:4:45,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:49,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,26:.: 0.32:1.000:. ./.:4:55,18:.:-0.13:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:0.999:. ./.:4:51,46:.: 0.95:1.000:. ./.:4:88,33:.: 2.04:1.000:. ./.:4:78,39:.: 1.86:1.000:. ./.:4:21,8:.:-2.12:1.000:. ./.:4:46,22:.:-0.36:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,28:.:-0.27:1.000:. ./.:4:20,10:.:-2.08:1.000:. ./.:4:64,34:.: 1.00:1.000:. ./.:4:56,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,24:.: 1.59:1.000:. ./.:4:82,23:.: 1.31:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:45,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,8:.:-2.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.12:1.000:. ./.:3:4,1:.:-3.21:1.000:. ./.:4:71,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:41,28:.:-0.31:1.000:. ./.:4:63,20:.: 0.32:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:43,18:.:-0.68:1.000:. ./.:4:52,36:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,29:.: 0.36:1.000:. ./.:4:59,35:.: 0.82:1.000:. ./.:4:41,18:.:-0.77:1.000:. ./.:4:55,42:.: 0.95:1.000:. ./.:4:49,17:.:-0.45:1.000:. ./.:4:54,75:.: 2.40:1.000:. ./.:4:29,3:.:-1.99:1.000:. ./.:4:31,24:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,30:.:-1.58:1.000:. ./.:4:36,19:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:63,34:.: 0.95:1.000:. ./.:4:40,53:.: 0.77:1.000:. ./.:4:37,28:.:-0.49:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:43,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,38:.: 0.45:1.000:. ./.:6:43,38:.: 0.23:1.000:. ./.:4:45,29:.:-0.09:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:42,45:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,24:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,33:.:-1.17:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.81:0.998:. ./.:4:17,49:.:-0.45:1.000:. ./.:4:59,41:.: 1.09:1.000:. ./.:4:26,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:39,61:.: 1.09:1.000:. ./.:4:45,22:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,30:.:-0.31:1.000:. ./.:4:42,25:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,62:.: 1.13:1.000:. ./.:4:47,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:30,62:.: 0.73:1.000:. ./.:4:63,37:.: 1.09:1.000:. ./.:4:56,42:.: 1.00:1.000:. ./.:4:62,27:.: 0.59:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.68:1.000:. ./.:4:75,43:.: 1.90:1.000:. ./.:4:25,23:.:-1.26:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,24:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,17:.:-0.59:1.000:. ./.:4:56,29:.: 0.41:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:67,25:.: 0.73:1.000:. ./.:4:60,31:.: 0.68:1.000:. ./.:4:38,52:.: 0.64:1.000:. ./.:4:28,64:.: 0.73:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,20:.:-1.22:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:37,27:.:-0.54:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.91:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:43,37:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,64:.: 0.50:1.000:. ./.:4:53,31:.: 0.36:1.000:. ./.:4:62,35:.: 0.95:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:63,30:.: 0.77:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:71,36:.: 1.40:0.999:. ./.:4:58,32:.: 0.64:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:52,20:.:-0.18:1.000:. ./.:4:50,24:.:-0.09:1.000:. ./.:4:28,46:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,33:.: 0.32:1.000:. ./.:4:31,45:.: 0.00:1.000:. ./.:4:63,32:.: 0.86:1.000:. ./.:4:60,51:.: 1.59:1.000:. ./.:4:37,25:.:-0.63:1.000:. ./.:4:33,54:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:23,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:27,16:.:-1.49:1.000:. ./.:4:49,20:.:-0.31:1.000:. ./.:4:42,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:101,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.04:0.991:. ./.:4:43,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:25,37:.:-0.63:1.000:. ./.:4:57,40:.: 0.95:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.18:1.000:. ./.:4:38,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:45,38:.: 0.32:1.000:. ./.:4:47,26:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,35:.: 0.45:1.000:. ./.:4:45,23:.:-0.36:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:63,30:.: 0.77:1.000:. ./.:4:82,24:.: 1.36:1.000:. ./.:4:65,32:.: 0.95:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:57,23:.: 0.18:1.000:. ./.:4:41,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:80,25:.: 1.31:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:38,21:.:-0.77:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:42,50:.: 0.73:1.000:. ./.:4:51,70:.: 2.04:1.000:. ./.:4:66,34:.: 1.09:1.000:. ./.:4:50,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:54,23:.: 0.05:1.000:. ./.:4:49,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:71,27:.: 1.00:1.000:. ./.:4:25,6:.:-2.03:1.000:. ./.:4:36,44:.: 0.18:1.000:. ./.:4:51,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:67,28:.: 0.86:0.999:. ./.:4:60,29:.: 0.59:1.000:. ./.:4:56,24:.: 0.18:1.000:. ./.:4:50,17:.:-0.40:1.000:. ./.:4:51,13:.:-0.54:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:46,17:.:-0.59:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:47,26:.:-0.13:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:61,33:.: 0.82:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:62,36:.: 1.00:1.000:. ./.:4:85,21:.: 1.36:1.000:. ./.:4:71,22:.: 0.77:1.000:. ./.:4:74,29:.: 1.22:1.000:. ./.:4:64,19:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,47:.: 0.55:1.000:. -chr4.1 89092890 chr4.1_089092890 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:354,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:251,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:358,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:362,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:233,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:308,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:307,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:372,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.13:0.999:. ./.:4:323,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:483,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:310,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:418,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:340,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:138,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:342,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:162,0:.:-2.29:1.000:. ./.:3:153,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:348,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:369,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:470,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:161,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:299,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:306,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.77:1.000:. ./.:6:264,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:314,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.33:0.998:. ./.:4:280,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:263,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:309,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:256,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:426,2:.: 1.56:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:283,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:465,1:.: 2.11:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.58:0.999:. ./.:4:360,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:177,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:308,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:247,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:359,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.62:0.991:. ./.:4:360,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:475,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:359,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:328,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:452,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:127,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:225,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:412,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:322,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:306,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:463,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:337,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:303,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.84:1.000:. -chr4.1 89131935 chr4.1_089131935 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:189,49:.: 0.36:1.000:. ./.:4:199,34:.: 0.28:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:201,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:236,42:.: 0.95:1.000:. ./.:4:288,59:.: 1.98:1.000:. ./.:4:245,48:.: 1.18:1.000:. ./.:4:221,45:.: 0.77:1.000:. ./.:4:294,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:53,1:.:-2.39:1.000:. ./.:4:83,23:.:-1.61:1.000:. ./.:4:142,94:.: 0.33:1.000:. ./.:4:196,49:.: 0.46:1.000:. ./.:4:211,40:.: 0.55:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:235,56:.: 1.15:1.000:. ./.:4:221,50:.: 0.85:0.999:. ./.:4:330,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:269,58:.: 1.68:1.000:. ./.:4:238,44:.: 1.01:1.000:. ./.:4:102,19:.:-1.39:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:224,52:.: 0.92:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:199,51:.: 0.53:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:269,49:.: 1.55:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:42,3:.:-2.52:1.000:. ./.:3:48,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:197,34:.: 0.25:1.000:. ./.:4:181,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:304,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:121,43:.:-0.75:1.000:. ./.:4:151,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:157,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:161,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:156,49:.:-0.14:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:99,23:.:-1.37:1.000:. ./.:4:216,53:.: 0.82:1.000:. ./.:4:119,32:.:-0.94:1.000:. ./.:4:179,51:.: 0.24:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:209,40:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:143,45:.:-0.39:1.000:. ./.:6:94,17:.:-1.54:1.000:. ./.:4:113,32:.:-1.03:1.000:. ./.:4:171,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:154,47:.:-0.20:1.000:. ./.:4:149,40:.:-0.37:1.000:. ./.:4:174,30:.:-0.15:1.000:. ./.:4:230,41:.: 0.85:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:183,43:.: 0.18:0.998:. ./.:4:195,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:148,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:166,39:.:-0.14:1.000:. ./.:4:230,46:.: 0.92:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:113,69:.:-0.48:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:168,40:.:-0.09:1.000:. ./.:4:132,30:.:-0.78:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:180,36:.: 0.03:1.000:. ./.:4:178,53:.: 0.25:1.000:. ./.:4:146,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:142,33:.:-0.58:1.000:. ./.:4:164,39:.:-0.17:1.000:. ./.:4:138,33:.:-0.64:1.000:. ./.:4:117,27:.:-1.05:1.000:. ./.:4:126,26:.:-0.93:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:154,43:.:-0.26:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:163,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:140,34:.:-0.60:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:144,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:168,34:.:-0.18:1.000:. ./.:4:142,34:.:-0.57:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:96,38:.:-1.19:1.000:. ./.:4:104,25:.:-1.27:1.000:. ./.:4:135,53:.:-0.39:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:254,47:.: 1.30:1.000:. ./.:4:178,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:115,40:.:-0.88:1.000:. ./.:4:265,57:.: 1.61:1.000:. ./.:4:109,20:.:-1.27:0.999:. ./.:4:126,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:112,30:.:-1.08:1.000:. ./.:4:163,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:146,27:.:-0.61:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:155,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:179,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:235,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:139,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:301,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:112,24:.:-1.16:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.79:1.000:. ./.:4:126,29:.:-0.88:1.000:. ./.:4:99,12:.:-1.54:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:177,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:84,16:.:-1.70:0.991:. ./.:4:149,28:.:-0.55:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:430,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:181,47:.: 0.21:1.000:. ./.:4:93,24:.:-1.45:1.000:. ./.:4:76,21:.:-1.75:1.000:. ./.:4:110,39:.:-0.97:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:175,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:98,26:.:-1.34:1.000:. ./.:4:214,52:.: 0.77:1.000:. ./.:4:350,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:191,58:.: 0.52:1.000:. ./.:4:197,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:217,65:.: 1.01:1.000:. ./.:4:236,47:.: 1.03:1.000:. ./.:4:41,17:.:-2.33:1.000:. ./.:4:190,43:.: 0.28:1.000:. ./.:4:190,55:.: 0.46:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:358,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:221,51:.: 0.86:1.000:. ./.:4:146,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:186,42:.: 0.21:1.000:. ./.:4:187,33:.: 0.09:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:186,49:.: 0.31:1.000:. ./.:4:266,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:173,36:.:-0.08:1.000:. ./.:4:169,45:.: 0.00:0.999:. ./.:4:176,46:.: 0.12:1.000:. ./.:4:212,44:.: 0.62:1.000:. ./.:4:183,33:.: 0.03:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:188,43:.: 0.25:1.000:. ./.:4:142,45:.:-0.40:1.000:. ./.:4:143,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:144,37:.:-0.49:1.000:. ./.:4:277,66:.: 1.92:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:224,49:.: 0.88:1.000:. ./.:4:190,44:.: 0.30:1.000:. ./.:4:228,68:.: 1.22:1.000:. ./.:4:254,62:.: 1.52:1.000:. ./.:4:253,54:.: 1.38:1.000:. ./.:4:172,47:.: 0.07:1.000:. ./.:4:217,33:.: 0.53:1.000:. -chr4.1 89175341 chr4.1_089175341 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:17,70:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,93:0.83: 1.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,59:0.70: 0.15:1.000:0.985 0/0/1/1:4:40,34:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,41:0.38: 1.44:1.000:0.591 0/0/1/1:4:81,40:0.38: 1.41:1.000:0.522 0/1/1/1:4:29,50:0.63: 0.09:1.000:0.550 0/1/1/1:4:20,70:0.74: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,95:0.79: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.25:-2.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,22:0.34:-0.07:1.000:0.840 0/0/1/1:4:55,43:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,69:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,72:0.81: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,78:0.60: 1.72:1.000:0.779 0/0/1/1:4:51,42:0.49: 0.53:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,151:1.00: 2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,47:0.47: 1.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:83,45:0.40: 1.63:1.000:0.761 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,32:0.42: 0.31:1.000:0.899 0/0/1/1:4:50,77:0.61: 1.60:1.000:0.699 0/0/1/1:4:38,28:0.47:-0.32:1.000:0.991 0/1/1/1:4:1,8:0.86:-2.11:1.000:0.954 0/0/1/1:4:35,22:0.43:-0.60:1.000:0.947 0/0/0/1:4:68,24:0.31: 0.50:1.000:0.975 0/0/0/1:4:59,26:0.35: 0.28:1.000:0.769 0/1/1/1:4:24,94:0.75: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,71:0.61: 1.31:1.000:0.735 0/0/1/1:4:38,52:0.59: 0.44:1.000:0.874 0/1/1/1:4:12,52:0.77:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.46:-2.01:1.000:0.987 1/1/1:3:0,8:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,72:0.60: 1.44:1.000:0.812 0/0/1/1:4:48,64:0.58: 1.13:1.000:0.898 0/0/0/1:4:73,26:0.31: 0.72:1.000:0.973 0/0/0/1:4:48,23:0.37:-0.16:1.000:0.564 0/1/1/1:4:21,89:0.77: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,28:0.44:-0.16:1.000:0.964 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,83:0.78: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,47:0.74:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,67:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,49:0.52: 0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:1,3:0.72:-2.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,19:0.38:-0.63:1.000:0.630 0/0/1/1:4:9,12:0.58:-1.73:1.000:0.898 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,82:0.63: 1.66:1.000:0.577 0/0/1/1:4:50,25:0.38:-0.04:1.000:0.557 0/0/1/1:4:33,28:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,21:0.41:-0.60:1.000:0.881 0/0/1/1:4:29,31:0.54:-0.51:1.000:0.986 0/1/1/1:4:19,53:0.71:-0.13:1.000:0.989 0/1/1/1:4:12,58:0.79:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:21,30:0.60:-0.79:1.000:0.613 0/1/1/1:4:23,70:0.72: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,40:0.59:-0.22:1.000:0.866 0/1/1/1:4:7,51:0.85:-0.57:1.000:0.986 0/0/1/1:4:49,28:0.41: 0.03:1.000:0.854 0/0/1/1:4:51,39:0.48: 0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,83:0.80: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,22:0.39:-0.41:1.000:0.738 0/1/1/1:4:12,65:0.81: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.50:-0.88:0.998:0.997 0/1/1/1:4:33,65:0.65: 0.69:1.000:0.805 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,22:0.46:-0.73:1.000:0.986 0/1/1/1:4:18,96:0.81: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,61:0.63: 0.62:1.000:0.575 0/0/1/1:4:39,33:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,48:0.75:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,62:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,23:0.53:-0.95:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,56:0.74:-0.13:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,61:0.76: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,39:0.66:-0.57:1.000:0.857 0/1/1/1:4:16,51:0.72:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,28:0.74:-1.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,62:0.63: 0.66:1.000:0.611 0/1/1/1:4:10,33:0.73:-1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,54:0.67: 0.06:1.000:0.932 0/0/1/1:4:29,17:0.41:-0.95:1.000:0.887 0/1/1/1:4:18,78:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,41:0.72:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,49:0.58: 0.31:1.000:0.904 0/0/1/1:4:39,30:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:10,37:0.74:-0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,92:0.72: 1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,25:0.47:-0.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:33,20:0.42:-0.73:1.000:0.920 0/0/1/1:4:25,33:0.58:-0.57:1.000:0.907 0/1/1/1:4:20,56:0.71: 0.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,36:0.41: 0.72:1.000:0.854 0/0/1/1:4:27,20:0.47:-0.91:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,20:0.44:-0.82:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,21:0.41:-0.57:1.000:0.844 0/0/0/1:4:35,17:0.37:-0.76:1.000:0.526 0/0/1/1:4:20,14:0.45:-1.32:1.000:0.984 0/0/1/1:4:57,38:0.44: 0.59:1.000:0.972 0/1/1/1:4:18,84:0.78: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,61:0.63: 0.66:1.000:0.510 0/0/1/1:4:22,28:0.58:-0.82:1.000:0.932 0/0/1/1:4:86,112:0.58: 3.83:1.000:0.917 0/0/1/1:4:45,31:0.45: 0.00:0.999:0.981 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,30:0.67:-1.01:1.000:0.899 0/0/1/1:4:27,33:0.57:-0.51:1.000:0.952 0/0/1/1:4:24,26:0.55:-0.82:1.000:0.984 0/1/1/1:4:13,40:0.72:-0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,33:0.59:-0.60:1.000:0.869 0/1/1/1:4:12,46:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,29:0.43: 0.00:1.000:0.934 0/0/1/1:4:31,21:0.45:-0.76:1.000:0.977 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,67:0.62: 1.03:1.000:0.626 0/0/1/1:4:24,30:0.57:-0.69:1.000:0.942 0/1/1/1:4:28,72:0.69: 0.75:1.000:0.978 0/0/1/1:4:45,29:0.44:-0.07:1.000:0.959 0/0/1/1:4:40,30:0.47:-0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,23:0.46:-0.66:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,34:0.56:-0.41:1.000:0.967 0/1/1/1:4:31,86:0.70: 1.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:16,16:0.53:-1.39:0.991:0.992 0/0/1/1:4:23,16:0.45:-1.17:1.000:0.983 0/1/1/1:4:26,54:0.66: 0.12:1.000:0.870 0/0/0/1:4:65,28:0.35: 0.53:1.000:0.811 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,57:0.73:-0.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,33:0.63:-0.76:1.000:0.567 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,23:0.55:-1.01:1.000:0.982 0/1/1/1:4:10,60:0.82:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,34:0.38: 0.78:1.000:0.598 0/0/1/1:4:19,24:0.57:-1.04:1.000:0.936 0/0/1/1:4:91,52:0.41: 2.10:1.000:0.854 0/0/1/1:4:46,40:0.51: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,56:0.59: 0.62:1.000:0.849 0/1/1/1:4:21,113:0.81: 1.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,93:0.62: 2.35:1.000:0.615 0/1/1/1:4:1,6:0.82:-2.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,31:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,22:0.42:-0.57:1.000:0.927 0/0/1/1:4:50,32:0.43: 0.18:1.000:0.956 0/0/1/1:4:84,51:0.42: 1.85:1.000:0.922 0/0/1/1:4:46,45:0.53: 0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:58,31:0.39: 0.40:1.000:0.730 0/1/1/1:4:21,127:0.83: 2.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,25:0.44:-0.41:1.000:0.968 0/0/0/1:4:56,25:0.36: 0.15:1.000:0.742 0/0/1/1:4:41,59:0.60: 0.75:1.000:0.813 0/1/1/1:4:21,111:0.80: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,24:0.45:-0.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:34,57:0.62: 0.47:1.000:0.514 0/1/1/1:4:14,44:0.72:-0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,87:0.66: 1.63:0.999:0.890 0/1/1/1:4:29,66:0.67: 0.59:1.000:0.938 0/0/1/1:4:55,32:0.41: 0.34:1.000:0.878 0/0/1/1:4:37,27:0.46:-0.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:38,45:0.56: 0.22:1.000:0.964 0/0/1/1:4:42,32:0.47:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,29:0.39: 0.28:1.000:0.652 0/0/1/1:4:28,39:0.59:-0.29:1.000:0.855 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,48:0.46: 1.19:1.000:0.990 0/1/1/1:4:27,87:0.73: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,38:0.54:-0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:52,30:0.41: 0.18:1.000:0.867 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,45:0.54: 0.34:1.000:0.985 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,33:0.53:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,63:0.55: 1.38:1.000:0.981 -chr4.1 89508587 chr4.1_089508587 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:237,68:.: 0.71:1.000:. ./.:4:187,56:.:-0.34:1.000:. ./.:4:201,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:206,56:.:-0.02:1.000:. ./.:4:257,77:.: 1.20:1.000:. ./.:4:155,125:.: 0.28:1.000:. ./.:4:151,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:222,63:.: 0.37:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,52:.:-2.53:1.000:. ./.:4:119,13:.:-2.23:1.000:. ./.:4:57,144:.:-1.06:1.000:. ./.:4:172,70:.:-0.36:1.000:. ./.:4:215,58:.: 0.17:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:219,56:.: 0.20:1.000:. ./.:4:222,60:.: 0.32:0.999:. ./.:4:252,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:308,85:.: 2.20:1.000:. ./.:4:204,137:.: 1.32:1.000:. ./.:4:51,24:.:-3.19:1.000:. ./.:4:250,65:.: 0.88:1.000:. ./.:4:235,65:.: 0.62:1.000:. ./.:4:169,51:.:-0.73:1.000:. ./.:4:96,2:.:-2.80:1.000:. ./.:4:267,57:.: 1.03:1.000:. ./.:4:223,74:.: 0.57:1.000:. ./.:4:232,53:.: 0.37:1.000:. ./.:4:301,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:261,71:.: 1.17:1.000:. ./.:4:206,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:58,2:.:-3.45:1.000:. ./.:4:109,14:.:-2.38:1.000:. ./.:3:42,11:.:-3.57:1.000:. ./.:4:206,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:231,59:.: 0.45:1.000:. ./.:4:143,137:.: 0.28:1.000:. ./.:4:255,66:.: 0.98:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:135,117:.:-0.19:1.000:. ./.:4:185,106:.: 0.47:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:210,66:.: 0.22:1.000:. ./.:4:153,125:.: 0.25:1.000:. ./.:4:240,55:.: 0.54:1.000:. ./.:4:218,59:.: 0.23:1.000:. ./.:4:484,0:.: 3.74:1.000:. ./.:4:137,98:.:-0.48:1.000:. ./.:4:200,59:.:-0.07:1.000:. ./.:4:116,91:.:-0.95:1.000:. ./.:4:239,71:.: 0.79:1.000:. ./.:4:254,53:.: 0.74:1.000:. ./.:4:143,132:.: 0.20:1.000:. ./.:4:182,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:221,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:195,65:.:-0.06:1.000:. ./.:4:252,69:.: 0.98:1.000:. ./.:4:187,135:.: 1.00:1.000:. ./.:6:201,69:.: 0.11:1.000:. ./.:4:240,61:.: 0.64:1.000:. ./.:4:187,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:252,61:.: 0.84:1.000:. ./.:4:205,53:.:-0.09:1.000:. ./.:4:144,129:.: 0.17:1.000:. ./.:4:279,64:.: 1.35:1.000:. ./.:4:185,47:.:-0.53:1.000:. ./.:4:248,48:.: 0.56:1.000:. ./.:4:246,55:.: 0.64:0.998:. ./.:4:133,95:.:-0.60:1.000:. ./.:4:171,132:.: 0.67:1.000:. ./.:4:82,52:.:-2.19:1.000:. ./.:4:241,65:.: 0.72:1.000:. ./.:4:204,65:.: 0.10:1.000:. ./.:4:84,153:.:-0.45:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:213,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:231,60:.: 0.47:1.000:. ./.:4:227,69:.: 0.56:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:222,63:.: 0.37:1.000:. ./.:4:262,62:.: 1.03:1.000:. ./.:4:163,99:.:-0.02:1.000:. ./.:4:250,83:.: 1.18:1.000:. ./.:4:254,64:.: 0.93:1.000:. ./.:4:153,40:.:-1.19:1.000:. ./.:4:171,37:.:-0.94:1.000:. ./.:4:178,62:.:-0.39:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:171,38:.:-0.92:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:261,68:.: 1.12:1.000:. ./.:4:173,52:.:-0.65:1.000:. ./.:4:258,73:.: 1.15:1.000:. ./.:4:215,51:.: 0.05:1.000:. ./.:4:205,68:.: 0.17:1.000:. ./.:4:167,118:.: 0.37:1.000:. ./.:4:256,69:.: 1.05:1.000:. ./.:4:189,66:.:-0.14:1.000:. ./.:4:101,26:.:-2.31:1.000:. ./.:4:239,57:.: 0.56:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:135,100:.:-0.48:1.000:. ./.:4:189,43:.:-0.53:1.000:. ./.:4:153,95:.:-0.26:1.000:. ./.:4:192,43:.:-0.48:1.000:. ./.:4:264,63:.: 1.08:1.000:. ./.:4:244,51:.: 0.54:1.000:. ./.:4:219,54:.: 0.17:1.000:. ./.:4:114,107:.:-0.72:1.000:. ./.:4:282,75:.: 1.59:1.000:. ./.:4:156,116:.: 0.15:0.999:. ./.:4:140,116:.:-0.12:1.000:. ./.:4:171,41:.:-0.87:1.000:. ./.:4:227,56:.: 0.33:1.000:. ./.:4:92,66:.:-1.79:1.000:. ./.:4:181,36:.:-0.78:1.000:. ./.:4:129,91:.:-0.73:1.000:. ./.:4:184,39:.:-0.68:1.000:. ./.:4:203,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:226,52:.: 0.25:1.000:. ./.:4:165,132:.: 0.57:1.000:. ./.:4:236,63:.: 0.61:1.000:. ./.:4:154,105:.:-0.07:1.000:. ./.:4:259,49:.: 0.76:1.000:. ./.:4:222,52:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,159:.:-0.45:1.000:. ./.:4:103,72:.:-1.50:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:168,47:.:-0.82:1.000:. ./.:4:212,58:.: 0.11:1.000:. ./.:4:143,34:.:-1.46:0.991:. ./.:4:204,50:.:-0.16:1.000:. ./.:4:192,44:.:-0.46:1.000:. ./.:4:311,75:.: 2.08:1.000:. ./.:4:161,105:.: 0.05:1.000:. ./.:4:201,61:.:-0.02:1.000:. ./.:4:206,60:.: 0.05:1.000:. ./.:4:140,124:.: 0.01:1.000:. ./.:4:212,59:.: 0.13:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:159,99:.:-0.09:1.000:. ./.:4:153,32:.:-1.33:1.000:. ./.:4:189,127:.: 0.89:1.000:. ./.:4:267,61:.: 1.10:1.000:. ./.:4:159,117:.: 0.22:1.000:. ./.:4:195,53:.:-0.26:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:196,169:.: 1.73:1.000:. ./.:4:216,67:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,15:.:-2.77:1.000:. ./.:4:136,50:.:-1.31:1.000:. ./.:4:236,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:217,48:.: 0.03:1.000:. ./.:4:256,67:.: 1.01:1.000:. ./.:4:236,49:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,90:.:-0.90:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:228,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:99,80:.:-1.43:1.000:. ./.:4:249,55:.: 0.69:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:189,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:206,58:.: 0.01:1.000:. ./.:4:213,52:.: 0.03:1.000:. ./.:4:163,126:.: 0.44:0.999:. ./.:4:219,60:.: 0.27:1.000:. ./.:4:111,113:.:-0.67:1.000:. ./.:4:112,111:.:-0.68:1.000:. ./.:4:127,56:.:-1.36:1.000:. ./.:4:225,59:.: 0.35:1.000:. ./.:4:206,59:.: 0.03:1.000:. ./.:4:217,58:.: 0.20:1.000:. ./.:4:145,105:.:-0.22:1.000:. ./.:4:263,83:.: 1.40:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:230,57:.: 0.40:1.000:. ./.:4:144,105:.:-0.24:1.000:. ./.:4:166,109:.: 0.20:1.000:. ./.:4:243,61:.: 0.69:1.000:. ./.:4:143,124:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,95:.:-0.73:1.000:. ./.:4:143,111:.:-0.16:1.000:. -chr5.1 33929 chr5.1_000033929 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:302,96:.: 0.91:1.000:. ./.:4:146,135:.:-0.74:1.000:. ./.:4:227,86:.:-0.29:1.000:. ./.:4:283,85:.: 0.48:1.000:. ./.:4:292,103:.: 0.86:1.000:. ./.:4:306,111:.: 1.17:1.000:. ./.:4:176,182:.: 0.34:1.000:. ./.:4:255,102:.: 0.33:1.000:. ./.:4:143,151:.:-0.56:1.000:. ./.:4:179,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:116,28:.:-2.67:1.000:. ./.:4:242,74:.:-0.25:1.000:. ./.:4:225,74:.:-0.49:1.000:. ./.:4:225,195:.: 1.22:1.000:. ./.:4:232,76:.:-0.36:1.000:. ./.:4:278,90:.: 0.48:1.000:. ./.:4:314,102:.: 1.16:0.996:. ./.:4:179,195:.: 0.57:1.000:. ./.:4:347,135:.: 2.09:1.000:. ./.:4:367,127:.: 2.26:1.000:. ./.:4:73,85:.:-2.47:1.000:. ./.:4:138,166:.:-0.42:1.000:. ./.:4:335,115:.: 1.64:1.000:. ./.:4:238,96:.: 0.00:1.000:. ./.:4:120,42:.:-2.42:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:267,92:.: 0.36:1.000:. ./.:4:142,151:.:-0.57:1.000:. ./.:4:322,113:.: 1.43:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:330,92:.: 1.24:1.000:. ./.:4:226,74:.:-0.47:1.000:. ./.:4:90,31:.:-3.00:1.000:. ./.:4:211,1:.:-1.71:1.000:. ./.:3:52,37:.:-3.45:1.000:. ./.:4:164,165:.:-0.07:1.000:. ./.:4:267,92:.: 0.36:1.000:. ./.:4:257,80:.: 0.05:1.000:. ./.:4:181,162:.: 0.13:1.000:. ./.:4:270,83:.: 0.27:1.000:. ./.:4:241,97:.: 0.06:1.000:. ./.:4:238,76:.:-0.28:1.000:. ./.:4:278,75:.: 0.27:1.000:. ./.:4:135,137:.:-0.87:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:259,85:.: 0.15:1.000:. ./.:4:280,110:.: 0.79:1.000:. ./.:4:428,177:.: 3.82:1.000:. ./.:4:221,68:.:-0.63:1.000:. ./.:4:157,200:.: 0.33:1.000:. ./.:4:194,83:.:-0.80:1.000:. ./.:4:214,214:.: 1.33:1.000:. ./.:4:241,73:.:-0.28:1.000:. ./.:4:261,91:.: 0.26:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:317,113:.: 1.36:1.000:. ./.:4:261,67:.:-0.08:1.000:. ./.:4:268,84:.: 0.26:1.000:. ./.:4:237,75:.:-0.31:1.000:. ./.:6:177,88:.:-0.97:1.000:. ./.:4:231,86:.:-0.23:1.000:. ./.:4:251,89:.: 0.09:1.000:. ./.:4:259,91:.: 0.23:1.000:. ./.:4:225,72:.:-0.52:1.000:. ./.:4:259,90:.: 0.22:1.000:. ./.:4:259,80:.: 0.07:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:255,88:.: 0.13:1.000:. ./.:4:265,84:.: 0.22:0.997:. ./.:4:150,124:.:-0.84:1.000:. ./.:4:272,118:.: 0.79:1.000:. ./.:4:172,188:.: 0.37:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:270,82:.: 0.26:1.000:. ./.:4:99,267:.: 0.46:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:222,85:.:-0.38:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:245,89:.: 0.00:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:120,130:.:-1.18:1.000:. ./.:4:273,110:.: 0.69:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:132,152:.:-0.70:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:202,190:.: 0.82:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:194,70:.:-0.98:1.000:. ./.:4:220,69:.:-0.63:1.000:. ./.:4:246,72:.:-0.22:1.000:. ./.:4:158,158:.:-0.25:1.000:. ./.:4:211,74:.:-0.69:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:196,73:.:-0.91:1.000:. ./.:4:174,186:.: 0.37:1.000:. ./.:4:165,157:.:-0.16:1.000:. ./.:4:183,82:.:-0.97:1.000:. ./.:4:71,197:.:-0.92:1.000:. ./.:4:286,116:.: 0.96:1.000:. ./.:4:255,98:.: 0.27:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:257,92:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,50:.:-1.63:1.000:. ./.:4:264,77:.: 0.10:1.000:. ./.:4:102,151:.:-1.14:1.000:. ./.:4:228,69:.:-0.52:1.000:. ./.:4:144,162:.:-0.39:1.000:. ./.:4:255,86:.: 0.10:1.000:. ./.:4:490,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:240,95:.: 0.02:1.000:. ./.:4:147,164:.:-0.32:1.000:. ./.:4:369,111:.: 2.06:1.000:. ./.:4:245,79:.:-0.14:0.999:. ./.:4:314,84:.: 0.91:1.000:. ./.:4:183,54:.:-1.36:1.000:. ./.:4:292,104:.: 0.88:1.000:. ./.:4:314,82:.: 0.88:1.000:. ./.:4:222,85:.:-0.38:1.000:. ./.:4:242,90:.:-0.02:1.000:. ./.:4:243,77:.:-0.19:1.000:. ./.:4:249,61:.:-0.33:1.000:. ./.:4:244,83:.:-0.09:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:232,99:.:-0.04:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:213,82:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,206:.:-0.88:1.000:. ./.:4:130,127:.:-1.08:1.000:. ./.:4:172,52:.:-1.54:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:244,83:.:-0.09:1.000:. ./.:5:155,121:.:-0.81:0.982:. ./.:4:327,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:137,137:.:-0.84:1.000:. ./.:4:365,137:.: 2.37:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:175,77:.:-1.15:1.000:. ./.:4:253,95:.: 0.20:1.000:. ./.:4:239,85:.:-0.14:1.000:. ./.:4:256,81:.: 0.05:1.000:. ./.:4:124,134:.:-1.07:1.000:. ./.:4:340,136:.: 2.00:1.000:. ./.:4:363,111:.: 1.98:1.000:. ./.:3:170,91:.:-1.02:1.000:. ./.:4:260,78:.: 0.06:1.000:. ./.:4:196,217:.: 1.12:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:290,105:.: 0.86:1.000:. ./.:4:253,107:.: 0.37:1.000:. ./.:4:70,65:.:-2.80:1.000:. ./.:4:163,191:.: 0.29:1.000:. ./.:4:298,96:.: 0.85:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:204,204:.: 1.05:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:207,81:.:-0.64:1.000:. ./.:4:309,91:.: 0.93:1.000:. ./.:4:261,76:.: 0.05:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:215,75:.:-0.62:1.000:. ./.:4:239,93:.:-0.02:1.000:. ./.:4:270,101:.: 0.53:1.000:. ./.:4:269,78:.: 0.19:1.000:. ./.:4:162,150:.:-0.31:1.000:. ./.:4:164,132:.:-0.53:0.999:. ./.:4:242,81:.:-0.15:1.000:. ./.:4:265,92:.: 0.33:1.000:. ./.:4:122,134:.:-1.09:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:165,171:.: 0.03:1.000:. ./.:4:217,87:.:-0.42:1.000:. ./.:4:225,84:.:-0.35:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:319,119:.: 1.47:1.000:. ./.:4:300,97:.: 0.89:1.000:. ./.:4:187,191:.: 0.62:1.000:. ./.:4:184,85:.:-0.91:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:331,117:.: 1.61:1.000:. ./.:4:330,111:.: 1.51:1.000:. ./.:4:254,93:.: 0.19:1.000:. ./.:4:179,172:.: 0.24:1.000:. -chr5.1 322505 chr5.1_000322505 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:18,21:.: 0.98:1.000:. ./.:4:11,18:.: 0.04:1.000:. ./.:4:5,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,23:.: 0.23:1.000:. ./.:4:6,20:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.39:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.20:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.51:1.000:. ./.:4:8,26:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,29:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.32:0.996:. ./.:4:17,19:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.48:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.15:1.000:. ./.:4:10,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.30:1.000:. ./.:4:5,12:.:-1.08:1.000:. ./.:4:6,28:.: 0.51:1.000:. ./.:4:11,19:.: 0.14:1.000:. ./.:4:12,36:.: 1.82:1.000:. ./.:4:13,39:.: 2.19:1.000:. ./.:4:8,27:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.58:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.11:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.58:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.48:1.000:. ./.:4:5,29:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1,4:.:-2.20:1.000:. ./.:4:1,18:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:8,25:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:2,10:.:-1.55:1.000:. ./.:4:5,24:.: 0.04:1.000:. ./.:4:9,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.33:1.000:. ./.:6:4,24:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,36:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:8,21:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:9,29:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.08:1.000:. ./.:4:6,20:.:-0.24:0.997:. ./.:4:0,29:.: 0.04:1.000:. ./.:4:12,26:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.02:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.23:1.000:. ./.:4:9,29:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:9,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,49:.: 1.91:1.000:. ./.:4:8,27:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,50:.: 2.01:1.000:. ./.:4:8,9:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,44:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.15:1.000:. ./.:4:11,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.15:1.000:. ./.:4:9,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:7,18:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,37:.: 2.47:1.000:. ./.:4:6,7:.:-1.45:1.000:. ./.:4:16,35:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:7,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:5,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:6,19:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.98:1.000:. ./.:4:7,23:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.71:1.000:. ./.:4:9,31:.: 1.07:1.000:. ./.:4:13,26:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:13,23:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.52:0.999:. ./.:4:8,36:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:9,34:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.98:1.000:. ./.:4:6,22:.:-0.05:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:9,36:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,51:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:5,14:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.43:1.000:. ./.:5:0,20:.:-0.80:0.982:. ./.:4:11,13:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,24:.: 0.14:1.000:. ./.:4:9,29:.: 0.88:1.000:. ./.:4:11,26:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,31:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.45:1.000:. ./.:4:7,24:.: 0.23:1.000:. ./.:4:9,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.79:1.000:. ./.:3:4,10:.:-1.36:1.000:. ./.:4:6,33:.: 0.98:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:6,28:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,31:.: 1.35:1.000:. ./.:4:2,6:.:-1.92:1.000:. ./.:4:11,25:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:10,36:.: 1.63:1.000:. ./.:4:12,17:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,31:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,42:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.36:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,21:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.88:0.999:. ./.:4:10,18:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,42:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.05:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,44:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:17,19:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,45:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.04:1.000:. ./.:4:9,25:.: 0.51:1.000:. ./.:4:5,24:.: 0.04:1.000:. ./.:4:7,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.16:1.000:. -chr5.1 616294 chr5.1_000616294 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:161,169:.: 0.98:1.000:. ./.:4:169,54:.:-0.65:1.000:. ./.:4:128,133:.:-0.07:1.000:. ./.:4:130,146:.: 0.16:1.000:. ./.:4:278,85:.: 1.49:1.000:. ./.:4:134,150:.: 0.28:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:138,137:.: 0.14:1.000:. ./.:4:190,63:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,1:.:-3.36:1.000:. ./.:4:51,9:.:-3.15:1.000:. ./.:4:183,74:.:-0.13:1.000:. ./.:4:215,70:.: 0.30:1.000:. ./.:4:160,150:.: 0.68:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:146,156:.: 0.56:1.000:. ./.:4:203,67:.: 0.07:0.996:. ./.:4:305,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:269,93:.: 1.47:1.000:. ./.:4:153,180:.: 1.03:1.000:. ./.:4:61,26:.:-2.73:1.000:. ./.:4:198,75:.: 0.11:1.000:. ./.:4:252,67:.: 0.82:1.000:. ./.:4:203,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:37,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:203,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:184,65:.:-0.26:1.000:. ./.:4:227,87:.: 0.74:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:164,82:.:-0.30:1.000:. ./.:4:100,110:.:-0.85:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.64:1.000:. ./.:4:69,3:.:-2.96:1.000:. ./.:3:13,15:.:-3.64:1.000:. ./.:4:133,139:.: 0.10:1.000:. ./.:4:156,140:.: 0.46:1.000:. ./.:4:138,149:.: 0.33:1.000:. ./.:4:190,69:.:-0.10:1.000:. ./.:4:203,55:.:-0.12:1.000:. ./.:4:206,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:151,137:.: 0.34:1.000:. ./.:4:216,75:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,108:.:-0.52:1.000:. ./.:4:309,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:131,138:.: 0.05:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:197,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:133,116:.:-0.26:1.000:. ./.:4:201,72:.: 0.11:1.000:. ./.:4:311,81:.: 1.93:1.000:. ./.:4:112,124:.:-0.45:1.000:. ./.:4:263,99:.: 1.47:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:223,79:.: 0.56:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:150,60:.:-0.85:1.000:. ./.:6:235,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:159,141:.: 0.53:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:134,139:.: 0.11:1.000:. ./.:4:195,75:.: 0.07:1.000:. ./.:4:129,48:.:-1.36:1.000:. ./.:4:141,145:.: 0.31:1.000:. ./.:4:183,50:.:-0.50:0.997:. ./.:4:187,79:.: 0.01:1.000:. ./.:4:213,84:.: 0.48:1.000:. ./.:4:144,139:.: 0.27:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:240,88:.: 0.95:1.000:. ./.:4:208,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:147,51:.:-1.04:1.000:. ./.:4:213,71:.: 0.28:1.000:. ./.:4:207,73:.: 0.22:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:141,50:.:-1.14:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:147,131:.: 0.19:1.000:. ./.:4:145,52:.:-1.05:1.000:. ./.:4:256,86:.: 1.17:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:179,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:139,126:.:-0.01:1.000:. ./.:4:151,54:.:-0.93:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:114,127:.:-0.38:1.000:. ./.:4:223,87:.: 0.68:1.000:. ./.:4:130,125:.:-0.16:1.000:. ./.:4:129,106:.:-0.47:1.000:. ./.:4:106,123:.:-0.56:1.000:. ./.:4:73,203:.: 0.16:1.000:. ./.:4:237,103:.: 1.14:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:143,134:.: 0.17:1.000:. ./.:4:148,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:210,53:.:-0.04:1.000:. ./.:4:104,100:.:-0.94:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:188,73:.:-0.07:1.000:. ./.:4:128,149:.: 0.17:1.000:. ./.:4:276,94:.: 1.60:1.000:. ./.:4:134,155:.: 0.36:1.000:. ./.:4:276,61:.: 1.09:1.000:. ./.:4:250,84:.: 1.05:1.000:. ./.:4:242,87:.: 0.97:0.999:. ./.:4:205,57:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,79:.:-1.56:1.000:. ./.:4:150,140:.: 0.37:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:182,72:.:-0.18:1.000:. ./.:4:201,61:.:-0.06:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:188,161:.: 1.27:1.000:. ./.:4:192,58:.:-0.24:1.000:. ./.:4:196,60:.:-0.15:1.000:. ./.:4:195,74:.: 0.05:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:230,57:.: 0.33:1.000:. ./.:4:143,135:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,115:.:-1.05:1.000:. ./.:4:162,56:.:-0.73:1.000:. ./.:4:167,49:.:-0.76:1.000:. ./.:4:183,47:.:-0.55:1.000:. ./.:4:148,133:.: 0.23:1.000:. ./.:5:101,116:.:-0.74:0.982:. ./.:4:223,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:133,91:.:-0.64:1.000:. ./.:4:286,75:.: 1.46:1.000:. ./.:4:212,74:.: 0.31:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:228,82:.: 0.68:1.000:. ./.:4:132,132:.:-0.03:1.000:. ./.:4:106,107:.:-0.81:1.000:. ./.:4:212,191:.: 2.10:1.000:. ./.:4:330,105:.: 2.59:1.000:. ./.:3:173,73:.:-0.30:1.000:. ./.:4:245,71:.: 0.77:1.000:. ./.:4:196,198:.: 1.96:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:218,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:284,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,26:.:-2.92:1.000:. ./.:4:130,48:.:-1.34:1.000:. ./.:4:245,67:.: 0.71:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:208,167:.: 1.67:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:228,82:.: 0.68:1.000:. ./.:4:194,67:.:-0.07:1.000:. ./.:4:198,70:.: 0.04:1.000:. ./.:4:199,61:.:-0.09:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:234,82:.: 0.77:1.000:. ./.:4:201,72:.: 0.11:1.000:. ./.:4:152,138:.: 0.37:0.999:. ./.:4:120,123:.:-0.35:1.000:. ./.:4:189,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:135,124:.:-0.10:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:132,135:.: 0.02:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:139,50:.:-1.17:1.000:. ./.:4:227,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:203,64:.: 0.02:1.000:. ./.:4:170,149:.: 0.82:1.000:. ./.:4:170,89:.:-0.10:1.000:. ./.:4:212,67:.: 0.20:1.000:. ./.:4:238,77:.: 0.75:1.000:. ./.:4:184,190:.: 1.66:1.000:. ./.:4:142,154:.: 0.46:1.000:. ./.:4:222,76:.: 0.49:1.000:. -chr5.1 870207 chr5.1_000870207 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:134,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:128,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:128,2:.: 0.06:1.000:. ./.:4:173,3:.: 1.33:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.17:0.996:. ./.:4:192,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:175,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:211,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.38:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:98,2:.:-0.76:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:122,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:89,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:106,1:.:-0.57:1.000:. ./.:6:118,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:137,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:48,1:.:-2.16:1.000:. ./.:4:115,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,1:.:-0.10:0.997:. ./.:4:168,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:105,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:108,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:83,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:120,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:81,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:113,3:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:145,2:.: 0.53:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:136,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:102,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:127,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.65:1.000:. ./.:5:71,2:.:-1.50:0.982:. ./.:4:126,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:169,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:151,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.20:1.000:. ./.:3:89,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:116,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:112,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:112,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:125,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:95,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.16:1.000:. -chr5.1 1026329 chr5.1_001026329 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:61,31:0.38: 0.22:1.000:0.576 0/1/1/1:4:22,50:0.70:-0.55:1.000:0.985 0/0/1/1:4:55,47:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,14:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,66:0.64: 0.76:1.000:0.668 0/0/1/1:4:76,46:0.42: 1.37:1.000:0.911 0/1/1/1:4:14,27:0.67:-1.75:1.000:0.916 0/0/1/1:4:65,38:0.41: 0.64:1.000:0.873 0/0/1/1:4:31,46:0.62:-0.36:1.000:0.611 0/1/1/1:4:6,18:0.75:-2.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,4:0.35:-2.82:1.000:0.772 0/0/1/1:4:52,31:0.42:-0.13:1.000:0.896 0/0/1/1:4:51,33:0.43:-0.09:1.000:0.957 0/0/1/1:4:59,34:0.41: 0.26:1.000:0.853 0/0/1/1:4:49,33:0.44:-0.17:1.000:0.973 0/0/1/1:4:51,41:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,47:0.47: 0.87:0.996:0.993 0/0/1/1:4:74,46:0.43: 1.29:1.000:0.933 0/0/1/1:4:81,41:0.38: 1.37:1.000:0.565 0/0/0/1:4:124,20:0.17: 2.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,10:0.44:-2.36:1.000:0.970 0/0/1/1:4:59,37:0.43: 0.37:1.000:0.940 0/0/0/1:4:93,26:0.27: 1.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,55:0.69:-0.21:1.000:0.967 0/1/1/1:4:4,8:0.68:-2.86:1.000:0.942 0/0/1/1:4:92,46:0.38: 1.99:1.000:0.530 0/0/1/1:4:65,38:0.41: 0.64:1.000:0.873 0/1/1/1:4:23,39:0.64:-0.94:1.000:0.730 0/0/1/1:4:55,46:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,35:0.37: 0.79:1.000:0.551 0/1/1/1:4:33,74:0.70: 0.79:1.000:0.982 0/0/1/1:4:62,48:0.48: 0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,7:0.60:-2.86:1.000:0.747 0/0/1/1:4:17,9:0.39:-2.32:1.000:0.685 0/0/0:3:6,0:0.00:-3.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,31:0.35: 0.60:1.000:0.806 0/0/1/1:4:63,33:0.39: 0.37:1.000:0.658 0/0/0/1:4:84,11:0.14: 0.33:1.000:0.976 0/1/1/1:4:31,75:0.71: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:60,46:0.47: 0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,46:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:93,24:0.25: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,23:0.25: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,37:0.40: 0.64:1.000:0.808 0/0/0/1:4:58,19:0.29:-0.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:86,21:0.24: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,25:0.26: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,6:0.47:-2.79:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,57:0.71:-0.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,48:0.72:-0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,33:0.59:-1.09:1.000:0.848 0/0/1/1:4:73,57:0.48: 1.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:33,25:0.47:-1.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:78,17:0.22: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,17:0.19: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,69:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,35:0.51:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,39:0.43: 0.56:1.000:0.942 0/0/1/1:4:57,45:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:25,39:0.63:-0.86:1.000:0.819 0/1/1/1:4:33,63:0.67: 0.37:1.000:0.907 0/0/0/1:4:71,26:0.31: 0.41:1.000:0.967 0/0/1/1:4:50,53:0.55: 0.64:1.000:0.983 0/1/1/1:4:24,66:0.73: 0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:100,21:0.21: 1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,63:0.68: 0.26:1.000:0.965 0/0/0/1:4:44,8:0.19:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,16:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,48:0.63:-0.32:0.997:0.590 0/1/1/1:4:25,46:0.66:-0.59:1.000:0.867 0/0/1/1:4:52,43:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,27:0.43:-0.67:1.000:0.954 0/0/1/1:4:73,59:0.49: 1.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,39:0.40: 0.83:1.000:0.822 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,12:0.18:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,60:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,17:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,28:0.32: 0.64:1.000:0.960 0/0/1/1:4:59,50:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,36:0.68:-1.25:1.000:0.942 0/0/0/1:4:88,19:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,24:0.29: 0.49:1.000:0.992 0/1/1/1:4:26,51:0.67:-0.36:1.000:0.929 0/0/0/1:4:75,15:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,38:0.46: 0.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:39,12:0.28:-1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,16:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,37:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,23:0.30: 0.22:1.000:0.988 0/1/1/1:4:23,43:0.66:-0.78:1.000:0.886 0/0/1/1:4:37,25:0.44:-0.94:1.000:0.974 0/0/1/1:4:66,43:0.44: 0.87:1.000:0.961 0/1/1/1:4:16,49:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,65:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,30:0.40:-0.05:1.000:0.754 0/0/1/1:4:42,23:0.40:-0.82:1.000:0.763 0/0/1/1:4:25,36:0.61:-0.98:1.000:0.685 0/0/1/1:4:46,33:0.46:-0.28:1.000:0.987 0/1/1/1:4:34,64:0.66: 0.45:1.000:0.893 0/0/1/1:4:26,15:0.41:-1.75:1.000:0.855 0/0/1/1:4:67,38:0.40: 0.72:1.000:0.828 0/0/1/1:4:31,31:0.53:-0.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:70,27:0.32: 0.41:1.000:0.943 0/0/1/1:4:22,32:0.61:-1.25:1.000:0.661 0/1/1/1:4:26,59:0.70:-0.05:1.000:0.984 0/1/1/1:4:29,52:0.65:-0.21:1.000:0.832 0/0/0/1:4:98,21:0.22: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,25:0.21: 2.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,18:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,53:0.72:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,46:0.39: 1.76:1.000:0.710 0/0/0/1:4:68,16:0.24:-0.09:0.999:1.000 0/0/1/1:4:42,46:0.55: 0.06:1.000:0.976 0/0/0/1:4:47,11:0.23:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,22:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,57:0.72:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,26:0.44:-0.82:1.000:0.970 0/0/0/1:4:77,15:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,26:0.40:-0.55:1.000:0.822 0/1/1/1:4:25,72:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,16:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,20:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,24:0.36:-0.44:1.000:0.639 0/0/0/1:4:65,19:0.27:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,29:0.32: 0.72:1.000:0.949 0/0/0/1:4:65,19:0.27:-0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,42:0.64:-0.75:1.000:0.710 0/0/1/1:4:29,31:0.55:-1.02:1.000:0.982 0/0/0/1:4:47,11:0.23:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,39:0.55:-0.44:1.000:0.979 0/0/0/1:4:81,16:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:52,41:0.48: 0.26:0.982:0.680 0/0/1/1:4:45,56:0.58: 0.56:1.000:0.913 0/0/1/1:4:40,27:0.44:-0.75:1.000:0.974 0/0/0/1:4:114,17:0.16: 1.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,16:0.19: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,30:0.55:-1.09:1.000:0.981 0/0/1/1:4:34,29:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,57:0.77:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,54:0.62: 0.14:1.000:0.583 0/0/0/1:4:52,17:0.29:-0.67:1.000:0.990 0/0/0/1:4:76,17:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,41:0.69:-1.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:74,55:0.47: 1.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,47:0.47: 0.91:1.000:0.991 0/1/1:3:34,38:0.56:-0.55:1.000:0.979 0/0/0/1:4:62,27:0.35: 0.10:1.000:0.810 0/1/1/1:4:38,60:0.63: 0.45:1.000:0.555 0/0/1/1:4:43,32:0.47:-0.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:83,36:0.35: 1.26:1.000:0.817 0/1/1/1:4:33,57:0.65: 0.14:1.000:0.767 0/0/1/1:4:4,5:0.58:-2.98:1.000:0.909 0/0/1/1:4:25,28:0.56:-1.28:1.000:0.970 0/0/1/1:4:67,42:0.43: 0.87:1.000:0.939 0/0/1/1:4:56,32:0.41: 0.06:1.000:0.840 0/1/1/1:4:31,71:0.70: 0.60:1.000:0.986 0/0/1/1:4:68,40:0.41: 0.83:1.000:0.881 0/0/0/1:4:74,12:0.17:-0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:105,13:0.14: 1.22:1.000:0.952 0/0/0/1:4:90,24:0.26: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,24:0.28: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,41:0.42: 0.87:1.000:0.908 0/0/0/1:4:88,16:0.19: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,33:0.53:-0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,33:0.36: 0.72:1.000:0.705 0/1/1/1:4:21,46:0.69:-0.75:1.000:0.977 0/1/1/1:4:21,47:0.70:-0.71:0.999:0.982 0/1/1/1:4:23,46:0.68:-0.67:1.000:0.942 0/0/0/1:4:77,12:0.17: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,41:0.55:-0.28:1.000:0.980 0/1/1/1:4:24,58:0.71:-0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,36:0.47:-0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:67,20:0.28: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,31:0.46:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:57,13:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,45:0.45: 0.91:1.000:0.980 0/0/0/1:4:84,21:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,60:0.70: 0.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:39,49:0.58: 0.06:1.000:0.905 0/0/0/1:4:92,24:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,47:0.46: 0.95:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,43:0.41: 1.18:1.000:0.865 0/0/0/1:4:40,16:0.33:-1.17:1.000:0.917 0/1/1/1:4:24,49:0.68:-0.51:1.000:0.953 -chr5.1 1201609 chr5.1_001201609 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:82,91:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,75:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,59:0.51:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,66:0.47: 0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:108,118:0.52: 1.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,116:0.52: 1.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,49:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,80:0.43: 0.96:1.000:0.955 0/0/1/1:4:93,89:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-2.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,8:0.17:-2.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,41:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,47:0.27: 0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,118:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,55:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,108:0.51: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,71:0.41: 0.67:0.996:0.885 0/0/0/1:4:155,80:0.34: 2.10:1.000:0.883 0/0/1/1:4:123,102:0.45: 1.88:1.000:0.982 0/0/1/1:4:98,109:0.52: 1.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,27:0.76:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,80:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,71:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,70:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-3.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,24:0.14: 0.54:1.000:0.976 0/0/0/1:4:112,42:0.27: 0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,98:0.53: 0.87:1.000:0.991 0/0/0/1:4:124,53:0.30: 0.81:1.000:0.988 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,42:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,85:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,2:0.22:-2.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-2.31:1.000:1.000 0/0/1:3:6,5:0.45:-2.89:1.000:0.956 0/1/1/1:4:50,141:0.68: 1.12:1.000:0.957 0/0/1/1:4:94,97:0.51: 1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,80:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,84:0.44: 1.07:1.000:0.972 0/0/1/1:4:108,73:0.40: 0.90:1.000:0.805 0/0/1/1:4:62,50:0.45:-0.64:1.000:0.975 0/0/1/1:4:64,60:0.48:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,52:0.28: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,85:0.66:-0.48:1.000:0.888 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,66:0.51:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,39:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,35:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,42:0.30:-0.06:1.000:0.984 0/0/1/1:4:44,80:0.61:-0.37:1.000:0.685 0/0/0/1:4:95,24:0.20:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,125:0.52: 2.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:72,72:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:95,41:0.30:-0.11:1.000:0.987 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,43:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,37:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,37:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,62:0.45:-0.08:1.000:0.982 0/0/0/0/1/1:6:61,43:0.41:-0.82:1.000:0.546 0/0/0/1:4:68,36:0.34:-0.82:1.000:0.845 0/0/0/1:4:104,42:0.28: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,57:0.42:-0.11:1.000:0.905 0/0/0/1:4:91,26:0.22:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,52:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,42:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,10:0.12:-1.35:1.000:0.820 0/0/0/1:4:75,39:0.34:-0.60:1.000:0.872 0/0/1/1:4:70,46:0.39:-0.55:0.997:0.743 0/0/1/1:4:56,75:0.56:-0.22:1.000:0.974 0/0/0/1:4:115,32:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,78:0.61:-0.42:1.000:0.733 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,43:0.21: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,91:0.68:-0.39:1.000:0.960 0/0/0/1:4:90,28:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,37:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,18:0.15:-0.57:1.000:0.992 0/0/0/1:4:100,43:0.30: 0.05:1.000:0.987 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,53:0.48:-0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,53:0.35: 0.25:1.000:0.825 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,103:0.65: 0.14:1.000:0.817 0/0/0/0:4:109,12:0.10:-0.44:1.000:0.850 0/0/1/1:4:63,94:0.58: 0.36:1.000:0.932 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,33:0.31:-0.82:1.000:0.966 0/0/1/1:4:52,41:0.44:-1.06:1.000:0.967 0/0/1/1:4:77,64:0.45: 0.01:1.000:0.983 0/0/1/1:4:44,49:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,40:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,54:0.42:-0.31:1.000:0.929 0/0/1/1:4:69,85:0.54: 0.29:1.000:0.988 0/1/1/1:4:35,97:0.68:-0.19:1.000:0.951 0/0/1/1:4:54,36:0.40:-1.13:1.000:0.776 0/1/1/1:4:14,75:0.76:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,63:0.59:-0.88:1.000:0.836 0/0/0/1:4:120,40:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,56:0.39: 0.03:1.000:0.720 0/0/0/1:4:47,21:0.31:-1.62:1.000:0.979 0/0/1/1:4:51,49:0.49:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,40:0.59:-1.69:1.000:0.876 0/0/0/1:4:110,38:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,58:0.48:-0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,68:0.43: 0.34:1.000:0.958 0/0/0/1:4:160,42:0.20: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,68:0.53:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,63:0.48:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,121:0.48: 2.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,35:0.29:-0.44:0.999:0.994 0/0/0/1:4:93,32:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,41:0.44:-1.06:1.000:0.967 0/0/1/1:4:66,69:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,40:0.31:-0.28:1.000:0.974 0/0/0/1:4:100,38:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,51:0.48:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:108,24:0.18:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,75:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,33:0.36:-1.13:1.000:0.635 0/0/0/1:4:80,22:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,66:0.33: 1.23:1.000:0.903 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,29:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,43:0.40:-0.75:1.000:0.793 0/1/1/1:4:23,73:0.70:-1.00:1.000:0.984 0/0/1/1:4:35,52:0.57:-1.20:1.000:0.934 0/0/0/1:4:62,27:0.30:-1.15:1.000:0.985 0/0/0/1:4:99,27:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,60:0.45:-0.15:1.000:0.977 0/0/1/1/1:5:25,63:0.66:-1.17:0.982:0.831 0/0/0/1:4:110,35:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,109:0.71: 0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:99,119:0.53: 1.72:1.000:0.990 0/0/0/1:4:97,25:0.20:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,29:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,38:0.28:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,49:0.49:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,75:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,46:0.54:-1.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:105,100:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,112:0.50: 1.85:1.000:0.997 0/1/1:3:42,87:0.63:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,40:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,173:0.70: 1.94:1.000:0.982 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,72:0.43: 0.56:1.000:0.953 0/0/0/1:4:135,48:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,3:0.23:-2.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,43:0.40:-0.75:1.000:0.793 0/0/1/1:4:94,72:0.43: 0.56:1.000:0.953 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,150:0.68: 1.36:1.000:0.964 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,42:0.36:-0.57:1.000:0.653 0/0/0/1:4:132,46:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,48:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,37:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,36:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,36:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,49:0.30: 0.45:1.000:0.984 0/0/0/1:4:152,50:0.24: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,77:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,111:0.56: 1.10:0.999:0.960 0/0/1/1:4:75,62:0.45:-0.08:1.000:0.982 0/0/0/1:4:110,42:0.27: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,103:0.70:-0.11:1.000:0.981 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,93:0.66:-0.19:1.000:0.840 0/0/0/1:4:88,39:0.30:-0.31:1.000:0.981 0/0/0/1:4:101,33:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,26:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,44:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,94:0.54: 0.70:1.000:0.990 0/1/1/1:4:55,161:0.69: 1.67:1.000:0.968 0/0/0/1:4:110,65:0.37: 0.76:1.000:0.572 0/0/0/1:4:115,37:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,103:0.49: 1.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,113:0.51: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,77:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,100:0.54: 0.85:1.000:0.984 -chr5.1 1534333 chr5.1_001534333 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:0.996:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.72:1.000:. ./.:3:13,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.: 3.54:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.49:1.000:. ./.:6:13,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:18,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.27:0.997:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:22,0:.: 3.31:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:0.999:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.46:1.000:. ./.:5:9,0:.: 0.36:0.982:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:3:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.24:0.999:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 1755977 chr5.1_001755977 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:163,105:.: 0.62:1.000:. ./.:4:54,171:.:-0.04:1.000:. ./.:4:60,167:.:-0.01:1.000:. ./.:4:117,141:.: 0.47:1.000:. ./.:4:133,191:.: 1.49:1.000:. ./.:4:257,128:.: 2.42:1.000:. ./.:4:40,140:.:-0.73:1.000:. ./.:4:175,107:.: 0.84:1.000:. ./.:4:62,184:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,54:.:-1.89:1.000:. ./.:4:22,84:.:-1.87:1.000:. ./.:4:105,128:.: 0.08:1.000:. ./.:4:108,148:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,185:.: 0.21:1.000:. ./.:4:108,127:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,250:.: 1.36:1.000:. ./.:4:51,185:.: 0.13:0.996:. ./.:4:226,131:.: 1.99:1.000:. ./.:4:63,261:.: 1.49:1.000:. ./.:4:140,171:.: 1.29:1.000:. ./.:4:27,81:.:-1.84:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.02:1.000:. ./.:4:123,160:.: 0.85:1.000:. ./.:4:103,130:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,85:.:-2.19:1.000:. ./.:4:206,114:.: 1.42:1.000:. ./.:4:121,184:.: 1.19:1.000:. ./.:4:42,193:.: 0.12:1.000:. ./.:4:110,156:.: 0.59:1.000:. ./.:4:110,140:.: 0.35:1.000:. ./.:4:52,198:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,186:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,33:.:-2.64:1.000:. ./.:4:28,89:.:-1.70:1.000:. ./.:3:27,20:.:-2.78:1.000:. ./.:4:55,210:.: 0.58:1.000:. ./.:4:40,192:.: 0.07:1.000:. ./.:4:110,131:.: 0.21:1.000:. ./.:4:48,134:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,187:.: 0.15:1.000:. ./.:4:46,171:.:-0.16:1.000:. ./.:4:102,123:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,167:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,136:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,155:.:-0.39:1.000:. ./.:4:91,143:.: 0.10:1.000:. ./.:4:51,189:.: 0.19:1.000:. ./.:4:281,408:.: 7.10:1.000:. ./.:4:56,145:.:-0.41:1.000:. ./.:4:116,132:.: 0.32:1.000:. ./.:4:81,90:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.21:1.000:. ./.:4:118,94:.:-0.24:1.000:. ./.:4:56,185:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.13:1.000:. ./.:4:58,196:.: 0.41:1.000:. ./.:4:121,149:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,138:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,160:.:-0.24:1.000:. ./.:6:21,146:.:-0.93:1.000:. ./.:4:40,142:.:-0.70:1.000:. ./.:4:62,228:.: 0.96:1.000:. ./.:4:49,189:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,133:.:-0.72:1.000:. ./.:4:104,151:.: 0.42:1.000:. ./.:4:67,186:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,68:.:-1.65:1.000:. ./.:4:86,107:.:-0.53:1.000:. ./.:4:93,131:.:-0.05:0.997:. ./.:4:41,161:.:-0.39:1.000:. ./.:4:103,135:.: 0.16:1.000:. ./.:4:31,134:.:-0.96:1.000:. ./.:4:124,155:.: 0.79:1.000:. ./.:4:115,153:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.48:1.000:. ./.:4:100,115:.:-0.19:1.000:. ./.:4:47,162:.:-0.28:1.000:. ./.:4:90,125:.:-0.19:1.000:. ./.:4:49,217:.: 0.59:1.000:. ./.:4:92,166:.: 0.47:1.000:. ./.:4:33,127:.:-1.04:1.000:. ./.:4:53,168:.:-0.10:1.000:. ./.:4:55,182:.: 0.15:1.000:. ./.:4:95,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:101,128:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.02:1.000:. ./.:4:34,148:.:-0.70:1.000:. ./.:4:48,127:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,71:.:-0.50:1.000:. ./.:4:114,142:.: 0.44:1.000:. ./.:4:36,147:.:-0.68:1.000:. ./.:4:83,104:.:-0.62:1.000:. ./.:4:99,122:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,104:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,181:.: 0.01:1.000:. ./.:4:46,155:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,147:.:-0.78:1.000:. ./.:4:110,128:.: 0.16:1.000:. ./.:4:44,164:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,79:.:-1.29:1.000:. ./.:4:49,180:.: 0.02:1.000:. ./.:4:70,108:.:-0.76:1.000:. ./.:4:100,122:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,78:.:-1.33:1.000:. ./.:4:46,182:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,157:.:-0.58:1.000:. ./.:4:97,149:.: 0.28:1.000:. ./.:4:148,211:.: 2.02:1.000:. ./.:4:74,139:.:-0.22:1.000:. ./.:4:40,170:.:-0.27:1.000:. ./.:4:61,235:.: 1.05:1.000:. ./.:4:42,161:.:-0.38:0.999:. ./.:4:86,125:.:-0.25:1.000:. ./.:4:63,89:.:-1.16:1.000:. ./.:4:107,127:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,188:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.68:1.000:. ./.:4:77,118:.:-0.50:1.000:. ./.:4:88,117:.:-0.35:1.000:. ./.:4:105,123:.: 0.01:1.000:. ./.:4:66,113:.:-0.75:1.000:. ./.:4:94,120:.:-0.21:1.000:. ./.:4:112,144:.: 0.44:1.000:. ./.:4:37,150:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,132:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,102:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,135:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1,144:.:-1.27:1.000:. ./.:4:26,128:.:-1.13:1.000:. ./.:4:109,94:.:-0.38:1.000:. ./.:4:96,138:.: 0.10:1.000:. ./.:5:67,102:.:-0.90:0.982:. ./.:4:150,104:.: 0.41:1.000:. ./.:4:52,158:.:-0.27:1.000:. ./.:4:143,180:.: 1.47:1.000:. ./.:4:102,144:.: 0.28:1.000:. ./.:4:77,89:.:-0.95:1.000:. ./.:4:59,88:.:-1.24:1.000:. ./.:4:39,148:.:-0.62:1.000:. ./.:4:87,158:.: 0.27:1.000:. ./.:4:75,122:.:-0.47:1.000:. ./.:4:93,117:.:-0.27:1.000:. ./.:4:45,114:.:-1.05:1.000:. ./.:4:225,125:.: 1.89:1.000:. ./.:4:63,230:.: 1.01:1.000:. ./.:3:120,93:.:-0.22:1.000:. ./.:4:114,169:.: 0.85:1.000:. ./.:4:156,181:.: 1.69:1.000:. ./.:4:113,126:.: 0.18:1.000:. ./.:4:65,227:.: 0.99:1.000:. ./.:4:57,207:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,78:.:-2.02:1.000:. ./.:4:53,151:.:-0.36:1.000:. ./.:4:65,239:.: 1.18:1.000:. ./.:4:114,154:.: 0.62:1.000:. ./.:4:133,171:.: 1.18:1.000:. ./.:4:121,136:.: 0.45:1.000:. ./.:4:42,123:.:-0.96:1.000:. ./.:4:69,215:.: 0.87:1.000:. ./.:4:50,208:.: 0.47:1.000:. ./.:4:101,129:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.39:1.000:. ./.:4:49,173:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.64:1.000:. ./.:4:115,167:.: 0.84:1.000:. ./.:4:50,159:.:-0.28:1.000:. ./.:4:55,160:.:-0.19:0.999:. ./.:4:98,130:.: 0.01:1.000:. ./.:4:51,171:.:-0.08:1.000:. ./.:4:43,144:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,138:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,156:.:-0.39:1.000:. ./.:4:42,168:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.95:1.000:. ./.:4:65,109:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.32:1.000:. ./.:4:114,173:.: 0.92:1.000:. ./.:4:110,166:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,205:.:-0.24:1.000:. ./.:4:121,175:.: 1.05:1.000:. ./.:4:209,115:.: 1.49:1.000:. ./.:4:200,131:.: 1.59:1.000:. ./.:4:168,93:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,217:.: 0.70:1.000:. -chr5.1 1816247 chr5.1_001816247 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:103,22:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,89:0.69: 0.68:1.000:0.966 0/0/0/1:4:82,41:0.37: 0.58:1.000:0.501 0/0/0/1:4:161,18:0.13: 1.93:1.000:0.911 0/0/1/1:4:44,47:0.53:-0.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:125,31:0.26: 1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,42:0.60:-0.67:1.000:0.824 0/0/0/1:4:123,29:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,55:0.70:-0.53:1.000:0.982 0/0/1/1:4:4,3:0.46:-2.21:1.000:0.987 0/0/0/0:4:23,1:0.05:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,53:0.42: 0.90:1.000:0.931 0/0/0/1:4:68,24:0.31:-0.16:1.000:0.973 0/0/1/1:4:57,45:0.47: 0.08:1.000:0.992 0/0/0/1:4:90,30:0.30: 0.51:1.000:0.985 0/0/0/1:4:87,43:0.37: 0.75:1.000:0.532 0/0/1/1:4:86,58:0.44: 1.09:0.996:0.961 0/0/0/1:4:97,28:0.28: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,65:0.39: 2.03:1.000:0.735 0/0/0/1:4:141,41:0.28: 2.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:8,2:0.26:-2.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,43:0.42: 0.32:1.000:0.913 0/0/0/1:4:115,35:0.29: 1.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,50:0.53: 0.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:11,3:0.27:-2.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,30:0.28: 0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:109,26:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,46:0.75:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,27:0.28: 0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:93,26:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,50:0.68:-0.65:1.000:0.954 0/0/1/1:4:76,57:0.46: 0.82:1.000:0.987 0/0/1/1:4:6,5:0.48:-2.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,2:0.14:-1.95:1.000:0.978 0/0/0:3:14,0:0.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,61:0.45: 1.14:1.000:0.980 0/0/1/1:4:58,38:0.43:-0.07:1.000:0.947 0/0/0/1:4:165,21:0.15: 2.10:1.000:0.982 0/0/1/1:4:48,43:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,42:0.31: 1.57:1.000:0.979 0/0/1/1:4:51,31:0.41:-0.41:1.000:0.889 0/0/0/1:4:92,22:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,18:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,38:0.39: 0.27:1.000:0.638 0/0/0/1:4:82,15:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,23:0.20: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,22:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.30:-2.00:1.000:0.985 0/0/1/1:4:36,42:0.55:-0.50:1.000:0.977 0/0/1/1:4:18,26:0.60:-1.32:1.000:0.827 0/0/0/1:4:60,11:0.20:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,40:0.42: 0.10:1.000:0.927 0/0/0/1:4:71,17:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,22:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,58:0.42: 1.31:1.000:0.893 0/0/1/1:4:33,32:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:80,24:0.28: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,16:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,45:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:42,28:0.43:-0.69:1.000:0.633 0/0/0/1:4:36,17:0.36:-1.10:1.000:0.647 0/0/0/1:4:100,17:0.19: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,30:0.40:-0.41:1.000:0.820 0/0/1/1:4:29,31:0.53:-0.94:1.000:0.990 0/0/0/1:4:86,19:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,37:0.54:-0.67:1.000:0.989 0/0/0/1:4:64,17:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:90,9:0.12: 0.00:1.000:0.709 0/0/1/1:4:35,38:0.54:-0.62:0.997:0.989 0/0/1/1:4:44,70:0.61: 0.37:1.000:0.640 0/0/0/1:4:44,15:0.30:-0.96:1.000:0.981 0/0/0/1:4:27,12:0.35:-1.44:1.000:0.775 0/0/0/1:4:99,45:0.36: 1.09:1.000:0.732 0/0/0/1:4:70,17:0.25:-0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,20:0.16: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,18:0.39:-1.13:1.000:0.646 0/0/0/1:4:71,9:0.15:-0.45:1.000:0.981 0/0/0/1:4:99,20:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,28:0.37:-0.33:1.000:0.548 0/0/1/1:4:38,46:0.56:-0.36:1.000:0.967 0/0/0/1:4:40,19:0.36:-0.96:1.000:0.633 0/0/0/1:4:109,18:0.18: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,42:0.55:-0.48:1.000:0.983 0/0/0/1:4:75,14:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,40:0.59:-0.74:1.000:0.843 0/0/0/1:4:76,16:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,12:0.20:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,8:0.15:-0.74:1.000:0.990 0/0/0/1:4:108,18:0.18: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,17:0.58:-1.66:1.000:0.930 0/0/0/1:4:46,16:0.31:-0.89:1.000:0.977 0/0/0/1:4:55,25:0.36:-0.45:1.000:0.732 0/0/1/1:4:33,19:0.40:-1.13:1.000:0.817 0/0/1/1:4:44,35:0.47:-0.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:76,35:0.36: 0.29:1.000:0.704 0/0/0/1:4:72,11:0.17:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,44:0.61:-0.65:1.000:0.669 0/0/0/1:4:67,27:0.33:-0.12:1.000:0.904 0/0/1/1:4:41,37:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,9:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,36:0.43:-0.21:1.000:0.956 0/0/0/1:4:35,10:0.28:-1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,15:0.21:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,23:0.49:-1.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,36:0.69:-1.15:1.000:0.973 0/1/1/1:4:9,24:0.71:-1.59:1.000:0.990 0/0/0/1:4:133,21:0.18: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,29:0.19: 2.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,22:0.18: 1.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,23:0.74:-1.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,65:0.45: 1.38:1.000:0.979 0/0/0/1:4:81,14:0.19:-0.09:0.999:1.000 0/0/0/1:4:69,22:0.29:-0.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:35,9:0.26:-1.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,12:0.14: 0.37:1.000:0.952 0/0/1/1:4:21,23:0.54:-1.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:31,17:0.39:-1.23:1.000:0.726 0/0/0/1:4:85,8:0.11:-0.14:1.000:0.528 0/0/0/1:4:38,16:0.34:-1.08:1.000:0.858 0/0/1/1:4:50,34:0.44:-0.36:1.000:0.964 0/0/0/1:4:59,17:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,15:0.18: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,33:0.26: 1.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:73,17:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,17:0.18: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,13:0.13: 0.63:1.000:0.944 0/1/1/1:4:28,49:0.63:-0.53:1.000:0.598 0/0/0/1:4:36,14:0.33:-1.18:1.000:0.931 0/0/0/1:4:59,15:0.26:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,12:0.22:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,25:0.29: 0.13:1.000:0.991 0/0/0/0/1:5:61,20:0.30:-0.43:0.982:0.536 0/0/0/1:4:75,13:0.19:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,35:0.44:-0.31:1.000:0.967 0/0/0/1:4:177,18:0.12: 2.32:1.000:0.752 0/0/0/1:4:118,22:0.20: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,11:0.23:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,12:0.22:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,36:0.59:-0.89:1.000:0.881 0/0/0/1:4:36,14:0.33:-1.18:1.000:0.931 0/0/0/1:4:102,15:0.17: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,16:0.15: 0.99:1.000:0.985 0/0/1/1:4:24,21:0.49:-1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,36:0.30: 1.07:1.000:0.983 0/0/1/1:4:69,46:0.43: 0.39:1.000:0.956 0/0/1:3:57,29:0.38:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,19:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,51:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,16:0.16: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,60:0.46: 1.02:1.000:0.985 0/1/1/1:4:22,60:0.71:-0.41:1.000:0.992 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,33:0.71:-1.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,59:0.46: 0.95:1.000:0.987 0/0/0/1:4:68,23:0.30:-0.19:1.000:0.982 0/0/1/1:4:55,69:0.57: 0.61:1.000:0.953 0/0/0/1:4:93,21:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,29:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,33:0.31: 0.70:1.000:0.977 0/0/0/1:4:116,31:0.27: 1.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:111,18:0.18: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,48:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,24:0.21: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,28:0.38:-0.41:1.000:0.594 0/0/0/1:4:75,34:0.36: 0.25:1.000:0.737 0/0/1/1:4:51,46:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,86:0.65: 0.78:0.999:0.784 0/0/1/1:4:51,40:0.47:-0.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:136,26:0.21: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,65:0.45: 1.38:1.000:0.979 0/0/1/1:4:41,44:0.54:-0.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:64,32:0.37:-0.07:1.000:0.501 0/0/0/1:4:106,25:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,38:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,23:0.17: 1.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,57:0.44: 0.97:1.000:0.971 0/0/0/1:4:140,35:0.26: 1.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,42:0.46: 0.00:1.000:0.985 0/0/1/1:4:75,55:0.45: 0.75:1.000:0.984 0/0/0/1:4:150,34:0.24: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,30:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,38:0.31: 1.11:1.000:0.971 0/0/0/1:4:94,17:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,67:0.63: 0.17:1.000:0.552 -chr5.1 2193671 chr5.1_002193671 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:38,49:0.57:-0.40:1.000:0.935 0/1/1/1:4:14,49:0.77:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,63:0.79:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,69:0.72:-0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,34:0.42:-0.46:1.000:0.931 0/0/1/1:4:36,27:0.45:-1.08:1.000:0.981 0/0/0/1:4:25,8:0.28:-1.94:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,40:0.63:-1.05:1.000:0.571 0/0/1/1:4:32,27:0.48:-1.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,43:0.69:-1.11:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,45:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,32:0.45:-0.74:1.000:0.979 0/0/1/1:4:38,28:0.45:-1.00:1.000:0.977 0/1/1/1:4:17,48:0.73:-1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,54:0.62:-0.37:0.996:0.566 0/0/0/1:4:43,9:0.21:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,46:0.43: 0.31:1.000:0.957 0/1/1/1:4:36,61:0.63:-0.11:1.000:0.617 0/0/1/1:4:54,41:0.45:-0.17:1.000:0.983 0/1/1/1:4:17,64:0.79:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,49:0.58:-0.43:1.000:0.914 0/0/0/1:4:49,13:0.25:-1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,61:0.65:-0.17:1.000:0.757 0/0/1/1:4:27,29:0.53:-1.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:19,39:0.67:-1.22:1.000:0.936 0/1/1/1:4:25,45:0.65:-0.88:1.000:0.764 0/0/1/1:4:56,68:0.56: 0.66:1.000:0.966 0/1/1/1:4:11,40:0.78:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,50:0.80:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,49:0.94:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,40:0.42: 0.00:1.000:0.919 1/1/1/1:4:1,106:0.99: 0.17:1.000:1.000 0/1/1:3:9,13:0.60:-2.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,31:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,53:0.73:-0.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,65:0.85:-0.71:1.000:0.985 0/0/1/1:4:68,53:0.46: 0.57:1.000:0.987 0/0/1/1:4:35,30:0.48:-1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,70:0.61: 0.46:1.000:0.733 0/1/1/1:4:28,76:0.73: 0.09:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,118:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,48:0.53:-0.20:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,198:1.00: 2.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,106:0.75: 1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,92:0.80: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,114:0.47: 4.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,64:0.77:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,43:0.25: 2.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,135:0.76: 2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,59:0.69:-0.46:1.000:0.979 0/0/1/1:4:65,58:0.49: 0.63:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,122:1.00: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,54:0.53: 0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:22,67:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,81:0.48: 2.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,62:0.47: 1.05:1.000:0.992 0/0/0/1/1/1:6:74,64:0.48: 1.05:1.000:0.873 0/0/1/1:4:68,71:0.53: 1.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:20,72:0.78:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,158:0.78: 2.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,96:0.54: 2.31:1.000:0.987 0/1/1/1:4:34,82:0.71: 0.43:1.000:0.989 0/1/1/1:4:28,78:0.73: 0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,87:0.73: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,72:0.78:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,35:0.31: 0.83:0.997:0.980 0/1/1/1:4:11,64:0.85:-0.74:1.000:0.988 0/1/1/1:4:39,111:0.74: 1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,50:0.55:-0.20:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,124:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,72:0.82:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,56:0.46: 0.77:1.000:0.987 0/1/1/1:4:25,79:0.75: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,90:0.79: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,86:0.69: 0.68:1.000:0.971 0/1/1/1:4:33,86:0.72: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,87:0.67: 0.83:1.000:0.925 0/1/1/1:4:20,52:0.72:-0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,101:0.74: 0.97:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,138:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,29:0.35:-0.31:1.000:0.757 0/1/1/1:4:56,135:0.71: 2.56:1.000:0.989 0/1/1/1:4:32,107:0.76: 1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,87:0.79: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,34:0.29: 1.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,79:0.83:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,40:0.44:-0.14:1.000:0.967 0/0/1/1:4:44,41:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,117:0.79: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,27:0.51:-1.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,67:0.46: 1.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:70,67:0.51: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,68:0.50: 1.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,98:0.72: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,86:0.58: 1.40:1.000:0.900 0/1/1/1:4:20,76:0.79:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,82:0.71: 0.40:1.000:0.992 0/1/1/1:4:45,102:0.69: 1.31:1.000:0.979 0/1/1/1:4:25,93:0.78: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,87:0.49: 2.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,32:0.24: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,58:0.57: 0.09:1.000:0.949 0/0/1/1:4:63,63:0.52: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,59:0.72:-0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,97:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,50:0.66:-0.71:1.000:0.874 0/0/1/1:4:62,64:0.52: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,38:0.53:-0.77:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 1.48:0.999:1.000 0/1/1/1:4:26,100:0.79: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,102:0.81: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,105:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,55:0.46: 0.66:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,80:0.55: 1.40:1.000:0.983 0/0/1/1:4:57,63:0.54: 0.54:1.000:0.988 0/0/1/1:4:42,52:0.56:-0.20:1.000:0.958 0/0/1/1:4:62,64:0.52: 0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,86:0.74: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,58:0.77:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,76:0.67: 0.34:1.000:0.936 0/1/1/1:4:36,87:0.71: 0.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,92:0.82: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,57:0.70:-0.57:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,58:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,70:0.83:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:69,38:0.38: 0.17:0.982:0.967 0/0/1/1:4:55,46:0.48: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,35:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,44:0.48:-0.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:25,61:0.71:-0.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,82:0.72: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,85:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,65:0.52: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,62:0.57: 0.26:1.000:0.934 0/0/1/1:4:59,58:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,59:0.70:-0.48:1.000:0.986 0/1/1/1:4:30,103:0.77: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,62:0.59: 0.17:1.000:0.870 0/0/1/1:4:57,46:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/0/0:3:64,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,60:0.72:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,20:0.28:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,77:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,42:0.64:-1.00:1.000:0.700 0/0/1/1:4:27,30:0.54:-1.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:61,65:0.53: 0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,33:0.65:-1.42:1.000:0.800 0/0/1/1:4:44,48:0.54:-0.26:1.000:0.990 0/1/1/1:4:18,68:0.79:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,27:0.29: 0.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:26,62:0.70:-0.37:1.000:0.988 0/1/1/1:4:17,55:0.76:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,60:0.87:-0.91:1.000:0.935 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,67:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,48:0.82:-1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,41:0.77:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,39:0.58:-0.94:1.000:0.899 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.68:0.999:1.000 0/0/0/1:4:49,17:0.29:-1.00:1.000:0.989 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:34,34:0.52:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,29:0.62:-1.54:1.000:0.526 0/0/1/1:4:43,48:0.54:-0.28:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,52:0.75:-0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,66:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,58:0.84:-0.91:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,36:0.42:-0.31:1.000:0.931 0/0/0/1:4:40,13:0.28:-1.37:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,78:0.82:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,24:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,53:0.52: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,30:0.48:-1.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,70:0.77:-0.31:1.000:1.000 -chr5.1 2453649 chr5.1_002453649 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:1,155:0.99:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,73:0.44: 0.29:1.000:0.961 0/0/1/1:4:79,109:0.59: 0.57:1.000:0.855 0/1/1/1:4:71,142:0.67: 1.08:1.000:0.933 0/0/1/1:4:93,93:0.52: 0.53:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,261:1.00: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,39:0.25: 0.08:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,178:0.99: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,98:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,20:0.55:-2.51:1.000:0.975 0/0/1/1:4:28,38:0.59:-1.92:1.000:0.877 0/1/1/1:4:54,133:0.71: 0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,135:0.72: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,92:0.53: 0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:116,89:0.45: 0.92:1.000:0.981 0/0/1/1:4:111,95:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:172,50:0.24: 1.27:0.996:1.000 0/1/1/1:4:63,102:0.63: 0.10:1.000:0.531 0/0/0/1:4:208,52:0.21: 2.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,185:0.73: 1.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:16,8:0.35:-2.77:1.000:0.796 0/0/0/1:4:154,38:0.21: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,102:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,95:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-2.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,141:0.73: 0.70:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,170:0.79: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,87:0.46: 0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:106,95:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,122:0.52: 1.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:119,117:0.51: 1.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,82:0.51: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,2:0.16:-3.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,7:0.21:-2.53:1.000:1.000 0/1/1:3:5,7:0.59:-3.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:106,100:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,120:0.55: 1.29:1.000:0.977 0/1/1/1:4:48,136:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,87:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:193,71:0.28: 2.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:107,44:0.31:-0.18:1.000:0.977 0/1/1/1:4:48,117:0.71: 0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,76:0.46: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,78:0.46: 0.33:1.000:0.988 0/0/0/1:4:92,37:0.30:-0.63:1.000:0.983 0/1/1/1:4:36,123:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,48:0.24: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,40:0.38:-1.04:1.000:0.615 0/0/1/1:4:85,66:0.45:-0.18:1.000:0.984 0/1/1/1:4:39,126:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,83:0.70:-0.83:1.000:0.987 0/0/0/1:4:159,47:0.24: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,79:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,41:0.29:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:135,47:0.27: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,107:0.77:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,72:0.45: 0.12:1.000:0.981 0/0/0/1:4:108,29:0.23:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:81,21:0.22:-1.18:1.000:0.820 0/0/0/1:4:123,31:0.21:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,28:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,64:0.44:-0.20:1.000:0.973 0/0/0/1:4:114,42:0.28:-0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,130:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,76:0.54:-0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:52,49:0.50:-1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,91:0.72:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,74:0.47: 0.08:0.997:0.992 0/0/1/1:4:82,60:0.44:-0.37:1.000:0.967 0/1/1/1:4:30,102:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,58:0.46:-0.59:1.000:0.988 0/0/1/1:4:84,78:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,134:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,31:0.21:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,75:0.53:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,64:0.47:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,53:0.46:-0.79:1.000:0.984 0/0/0/1:4:103,39:0.29:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,80:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,52:0.48:-0.96:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,32:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,33:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,87:0.65:-0.49:1.000:0.771 0/0/1/1:4:80,86:0.53: 0.12:1.000:0.991 0/0/0/1:4:117,48:0.31: 0.10:1.000:0.978 0/0/0/1:4:75,23:0.25:-1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,15:0.15:-1.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:37,82:0.69:-0.83:1.000:0.979 0/1/1/1:4:38,92:0.71:-0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,83:0.54:-0.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:70,72:0.52:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,81:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,94:0.77:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,63:0.43:-0.14:1.000:0.943 0/0/1/1:4:96,67:0.43: 0.06:1.000:0.941 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,87:0.72:-0.77:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,109:0.77:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,68:0.43: 0.08:1.000:0.951 0/0/1/1:4:50,37:0.44:-1.49:1.000:0.971 0/0/1/1:4:64,55:0.48:-0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,53:0.71:-1.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,55:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,75:0.69:-1.02:1.000:0.969 0/0/0/1:4:119,41:0.27: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,58:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,139:0.71: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:120,88:0.44: 0.98:1.000:0.967 0/1/1/1:4:36,114:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,48:0.43:-0.88:1.000:0.939 0/0/0/1:4:205,67:0.26: 2.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,53:0.48:-0.94:0.999:0.995 0/1/1/1:4:40,135:0.77: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,82:0.78:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,103:0.72:-0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,32:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,21:0.20:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,56:0.48:-0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,56:0.46:-0.69:1.000:0.989 0/1/1/1:4:40,105:0.73:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,44:0.45:-1.18:1.000:0.978 0/0/1/1:4:69,59:0.48:-0.65:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,152:0.75: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,40:0.29:-0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:78,68:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,73:0.70:-1.12:1.000:0.985 0/1/1/1:4:28,92:0.77:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,26:0.25:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,48:0.48:-1.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,73:0.65:-0.96:1.000:0.824 0/1/1/1:4:58,131:0.70: 0.59:1.000:0.983 0/0/1/1/1:5:49,51:0.53:-1.22:0.982:0.739 0/1/1/1:4:43,118:0.74: 0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,74:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,124:0.50: 1.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,92:0.53: 0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,60:0.57:-1.08:1.000:0.936 0/0/1/1:4:60,73:0.56:-0.55:1.000:0.963 0/0/0/1:4:94,26:0.23:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,54:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,57:0.41:-0.32:1.000:0.880 0/1/1/1:4:43,140:0.77: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,80:0.73:-1.02:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,212:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,59:0.27: 1.55:1.000:0.998 0/1/1:3:51,83:0.63:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,119:0.74: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,164:0.69: 1.59:1.000:0.979 0/0/1/1:4:83,63:0.45:-0.28:1.000:0.979 0/0/0/1:4:200,54:0.23: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,63:0.31: 1.17:1.000:0.979 0/0/0/1:4:38,20:0.36:-2.08:1.000:0.674 0/0/1/1:4:96,73:0.45: 0.19:1.000:0.979 0/0/0/1:4:165,51:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,104:0.51: 1.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,147:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,101:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,42:0.29:-0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:105,88:0.47: 0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,89:0.54: 0.17:1.000:0.985 0/0/0/1:4:106,58:0.37: 0.08:1.000:0.562 0/0/0/1:4:120,54:0.33: 0.29:1.000:0.935 0/0/0/1:4:153,42:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:248,0:0.00: 1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,151:0.80: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,83:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,141:0.76: 0.51:0.999:1.000 0/1/1/1:4:47,129:0.74: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,100:0.53: 0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,80:0.48: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:136,39:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,76:0.45: 0.29:1.000:0.983 0/0/0/1:4:111,43:0.29:-0.12:1.000:0.989 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,82:0.54:-0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:192,64:0.27: 1.96:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,96:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,154:0.76: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,57:0.35: 0.27:1.000:0.829 0/0/1/1:4:94,121:0.58: 1.12:1.000:0.930 0/1/1/1:4:55,207:0.79: 2.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,230:1.00: 1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,108:0.52: 1.12:1.000:0.995 -chr5.1 2594461 chr5.1_002594461 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:195,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.92:0.996:. ./.:4:115,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:248,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.93:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:38,0:.:-3.55:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.28:1.000:. ./.:3:30,0:.:-3.78:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:242,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.00:1.000:. ./.:6:149,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.11:0.997:. ./.:4:148,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.26:0.999:. ./.:4:186,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:96,1:.:-1.85:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.15:1.000:. ./.:5:131,0:.:-0.87:0.982:. ./.:4:148,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.03:1.000:. ./.:3:155,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:157,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.03:1.000:. -chr5.1 2800396 chr5.1_002800396 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:164,154:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,124:0.47:-0.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:213,66:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,133:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,171:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,156:0.46: 0.95:1.000:0.986 0/0/1/1:4:137,134:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,142:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:241,64:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,21:0.20:-2.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,20:0.22:-2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,131:0.45: 0.22:1.000:0.976 0/0/0/1:4:236,69:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:190,169:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,143:0.52:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:307,74:0.21: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,125:0.45: 0.01:0.996:0.977 0/0/1/1:4:165,164:0.52: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:237,203:0.49: 2.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,161:0.46: 1.13:1.000:0.986 0/0/1/1:4:72,92:0.57:-1.95:1.000:0.938 0/0/0/1:4:214,68:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:76,230:0.73: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:177,140:0.47: 0.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:45,14:0.26:-3.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,153:0.45: 1.00:1.000:0.975 0/0/0/1:4:266,99:0.30: 0.98:1.000:0.989 0/0/0/1:4:210,64:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,166:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:291,72:0.22: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:395,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,54:0.19: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,9:0.32:-3.90:1.000:0.940 0/0/0/1:4:96,20:0.19:-2.65:1.000:1.000 0/1/1:3:28,31:0.54:-3.48:1.000:0.950 0/0/1/1:4:176,152:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:266,68:0.22: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,134:0.47: 0.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:283,58:0.19: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,157:0.48: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:159,126:0.47:-0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,137:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:241,82:0.28: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,106:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:242,75:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,128:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:216,148:0.43: 0.97:1.000:0.956 0/0/1/1:4:58,60:0.53:-2.62:1.000:0.992 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,139:0.57:-0.72:1.000:0.939 0/0/0/1:4:179,60:0.27:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:289,99:0.28: 1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,155:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:218,55:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:240,74:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,77:0.26: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:155,136:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,136:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:175,71:0.31:-0.75:1.000:0.906 0/0/0/1:4:209,89:0.32: 0.01:1.000:0.944 0/0/1/1:4:144,134:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:292,70:0.21: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:240,55:0.21:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,114:0.42:-0.11:1.000:0.914 0/0/0/0:4:342,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,116:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,122:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,120:0.45:-0.15:0.997:0.975 0/0/1/1:4:122,91:0.46:-1.23:1.000:0.984 0/0/0/1:4:266,75:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,161:0.55: 0.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:185,139:0.46: 0.39:1.000:0.986 0/0/0/1:4:223,78:0.28: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,121:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,117:0.49:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/0:4:313,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,128:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:196,139:0.44: 0.55:1.000:0.971 0/0/0/1:4:287,81:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,107:0.52:-1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,164:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:263,70:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,135:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,146:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:275,78:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,57:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,117:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,174:0.70:-0.80:1.000:0.984 0/0/1/1:4:129,136:0.53:-0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:213,74:0.28:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:136,146:0.54:-0.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:318,94:0.25: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:188,49:0.23:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:396,85:0.19: 2.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,138:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,141:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,109:0.42:-0.29:1.000:0.910 0/0/1/1:4:194,184:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:387,1:0.00: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,80:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,82:0.27: 0.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:172,57:0.27:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,220:0.70: 0.15:1.000:0.983 0/0/1/1:4:146,90:0.41:-0.90:1.000:0.852 0/0/0/1:4:244,81:0.27: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:208,74:0.29:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:194,128:0.42: 0.36:1.000:0.931 0/0/1/1:4:199,209:0.53: 1.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:175,144:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:219,84:0.30: 0.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:229,181:0.47: 1.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:220,66:0.25:-0.17:0.999:0.999 0/0/0/1:4:263,81:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,102:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:170,185:0.54: 0.84:1.000:0.987 0/0/0/1:4:250,71:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:243,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,215:0.66: 0.34:1.000:0.878 0/0/1/1:4:140,130:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:237,79:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,195:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,140:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:229,80:0.28: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:209,63:0.25:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,178:0.55: 0.49:1.000:0.975 0/0/1/1:4:175,136:0.47: 0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:134,105:0.47:-0.85:1.000:0.991 0/0/0/1:4:179,60:0.27:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:193,38:0.18:-0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,91:0.42:-0.94:1.000:0.903 0/0/0/1:4:270,65:0.21: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:88,152:0.63:-0.84:0.982:0.950 0/0/1/1:4:151,142:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,149:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:103,290:0.72: 1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:153,131:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,47:0.21:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,60:0.28:-0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:219,61:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,162:0.52: 0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:64,232:0.75:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,128:0.47:-0.10:1.000:0.991 0/0/0/0:4:239,1:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,198:0.49: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,194:0.54: 1.10:1.000:0.988 0/1/1:3:82,155:0.65:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,69:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:225,194:0.49: 1.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:248,66:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,161:0.45: 1.16:1.000:0.984 0/0/0/1:4:227,68:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,16:0.23:-3.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,45:0.24:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,155:0.46: 0.91:1.000:0.987 0/0/0/1:4:298,88:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,160:0.48: 0.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:275,80:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,139:0.53:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:283,75:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,56:0.19: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,125:0.55:-0.90:1.000:0.982 0/0/0/0:4:319,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,136:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:260,62:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,94:0.29: 0.72:1.000:0.989 0/0/0/1:4:268,61:0.20: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,69:0.23: 0.43:0.999:1.000 0/0/1/1:4:154,138:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:242,76:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,120:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/0:4:258,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,118:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,118:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,42:0.20:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,115:0.46:-0.43:1.000:0.986 0/0/0/0:4:466,0:0.00: 2.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,232:0.67: 0.66:1.000:0.907 0/0/1/1:4:170,181:0.54: 0.78:1.000:0.990 0/0/0/0:4:288,9:0.03:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,160:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,226:0.69: 0.34:1.000:0.972 0/0/1/1:4:208,176:0.49: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,138:0.46: 0.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:162,139:0.49: 0.05:1.000:0.996 -chr5.1 2982104 chr5.1_002982104 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:184,182:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,140:0.45:-0.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:253,69:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,87:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,238:0.51: 1.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:244,210:0.46: 1.41:1.000:0.986 0/1/1/1:4:54,159:0.73:-1.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:192,181:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,256:0.73:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,37:0.22:-2.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,62:0.30:-1.99:1.000:0.984 0/0/0/1:4:201,74:0.27:-1.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:193,155:0.44:-0.04:1.000:0.969 0/0/1/1:4:217,195:0.47: 0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:184,212:0.53: 0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:322,107:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:284,107:0.27: 0.55:0.996:0.997 0/0/1/1:4:188,201:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:369,122:0.25: 1.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:335,105:0.24: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,84:0.49:-2.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,181:0.48: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:301,110:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:148,174:0.53:-0.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,19:0.13:-2.78:1.000:0.900 0/0/0/1:4:323,104:0.24: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,193:0.48: 0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,264:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:227,211:0.48: 1.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:223,101:0.31:-0.37:1.000:0.972 0/0/1/1:4:188,207:0.52: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:246,73:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,36:0.27:-3.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:228,3:0.01:-1.64:1.000:1.000 0/0/1:3:67,13:0.16:-3.71:1.000:0.921 0/0/1/1:4:199,207:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:274,100:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:291,89:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,354:0.75: 1.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:274,117:0.30: 0.55:1.000:0.986 0/0/0/1:4:267,103:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:282,104:0.27: 0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:321,120:0.27: 1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:177,189:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/0:4:345,1:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,110:0.27: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:304,92:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,99:0.49:-2.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,195:0.54: 0.07:1.000:0.987 0/1/1/1:4:114,355:0.74: 1.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,180:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:290,263:0.47: 2.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:162,158:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:301,99:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:224,83:0.27:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,202:0.51: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,147:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:236,246:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:248,99:0.29:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:155,153:0.49:-0.59:1.000:0.885 0/0/1/1:4:162,176:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:247,88:0.26:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:323,103:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,184:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:288,117:0.29: 0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:179,204:0.53: 0.44:1.000:0.993 0/0/0/0:4:246,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,93:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,192:0.55:-0.09:0.997:0.979 0/0/1/1:4:176,149:0.45:-0.35:1.000:0.984 0/0/1/1:4:209,231:0.52: 1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,146:0.46:-0.49:1.000:0.987 0/0/0/0:4:509,0:0.00: 2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,203:0.48: 0.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,275:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:331,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,177:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/0:4:361,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:294,97:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:326,94:0.22: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,141:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:299,107:0.26: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/0:4:358,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,257:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/0:4:471,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,198:0.48: 0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:191,69:0.27:-1.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:260,81:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,84:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:242,65:0.21:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,190:0.78:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,171:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:351,109:0.24: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,156:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,263:0.74:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:210,236:0.52: 1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:160,153:0.48:-0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,205:0.68:-0.77:1.000:0.959 0/0/0/1:4:279,82:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,223:0.52: 1.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:200,74:0.27:-1.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:247,93:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,148:0.54:-1.14:1.000:0.984 0/0/0/1:4:260,84:0.25:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,210:0.72:-0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:175,187:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,263:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:234,80:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:462,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:299,103:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,275:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:365,105:0.22: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,83:0.24: 0.03:0.999:1.000 0/0/1/1:4:180,171:0.48: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:184,41:0.18:-1.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:288,87:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,148:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:275,83:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,87:0.28:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,140:0.45:-0.59:1.000:0.980 0/0/1/1:4:214,215:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:269,76:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:334,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,183:0.49: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:344,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:369,1:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,80:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,202:0.75:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,123:0.50:-1.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,85:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:291,78:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,169:0.47: 0.07:1.000:0.992 0/0/0/1/1:5:162,110:0.40:-1.08:0.982:0.971 0/0/0/1:4:300,94:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,183:0.53:-0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:354,109:0.24: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:393,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,82:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:206,82:0.28:-0.86:1.000:0.994 0/0/1/1:4:189,174:0.47: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:171,194:0.53: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:244,76:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,82:0.26:-0.53:1.000:0.998 0/1/1/1:4:71,207:0.73:-1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:223,228:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:379,126:0.25: 2.11:1.000:0.999 0/1/1:3:102,165:0.61:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,168:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,291:0.73: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:206,86:0.29:-0.81:1.000:0.989 0/0/0/1:4:306,105:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,185:0.53:-0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:60,156:0.71:-1.85:1.000:0.991 0/1/1/1:4:51,165:0.75:-1.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:297,92:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:302,72:0.19: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,307:0.73: 0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:312,84:0.21: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,85:0.29:-0.85:1.000:0.990 0/0/0/1:4:283,108:0.28: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:235,68:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:278,1:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,83:0.27:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:267,108:0.29: 0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:256,102:0.29: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:197,192:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,256:0.74:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:168,160:0.48:-0.31:0.999:0.995 0/1/1/1:4:95,260:0.72: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:220,70:0.24:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,140:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:226,77:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,173:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:266,88:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:255,68:0.21:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:254,1:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:319,126:0.28: 1.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:288,98:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,258:0.72: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,87:0.29:-0.77:1.000:0.989 0/0/0/0:4:365,1:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:233,224:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:230,219:0.48: 1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,136:0.46:-0.79:1.000:0.987 0/0/1/1:4:197,196:0.49: 0.58:1.000:0.997 -chr5.1 3330526 chr5.1_003330526 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:2,498:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,262:0.78:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,192:0.48:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,322:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:170,424:0.72: 2.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,519:1.00: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,254:0.73:-0.96:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,438:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:126,353:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,101:0.49:-2.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,86:0.43:-2.79:1.000:0.954 0/1/1/1:4:111,322:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:124,334:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:114,311:0.74:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,341:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:249,216:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:221,209:0.50: 0.03:0.996:0.997 0/1/1/1:4:117,370:0.77: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:275,271:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:126,370:0.76: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,194:0.77:-2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,226:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:127,389:0.76: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,324:0.78:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,39:0.24:-3.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,374:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,319:0.77:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,322:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:128,337:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:248,244:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:218,255:0.55: 0.57:1.000:0.979 0/0/1/1:4:205,191:0.49:-0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,123:0.64:-2.94:1.000:0.707 0/0/0/1:4:197,51:0.24:-2.27:1.000:1.000 1/1/1:3:17,118:0.88:-3.70:1.000:0.966 0/1/1/1:4:121,335:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,177:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:116,318:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,317:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,207:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,213:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:117,318:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,244:0.51: 0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,294:0.74:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:369,116:0.27: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:113,381:0.78: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,279:0.52: 1.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,155:0.78:-2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,185:0.48:-0.40:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,359:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,284:0.73:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:259,256:0.51: 1.10:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,338:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,262:0.55: 0.80:1.000:0.984 0/0/1/1:4:248,229:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,216:0.51: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:121,305:0.73:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,380:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,232:0.55: 0.05:1.000:0.981 0/0/0/1/1/1:6:191,195:0.52:-0.53:1.000:0.873 0/0/1/1:4:237,196:0.47: 0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:193,184:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:247,259:0.52: 0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:207,174:0.47:-0.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:126,364:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:207,235:0.54: 0.18:1.000:0.986 0/0/1/1:4:182,171:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,331:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,331:0.73: 0.42:0.997:0.997 0/1/1/1:4:102,336:0.78: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:129,367:0.75: 0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:115,303:0.74:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:248,226:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,381:0.79: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:126,287:0.71:-0.19:1.000:0.989 0/0/1/1:4:214,228:0.53: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:254,214:0.47: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:261,226:0.48: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:221,216:0.51: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:223,222:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,277:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,246:0.52: 0.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:392,149:0.30: 1.43:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,329:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,254:0.55: 0.55:1.000:0.979 0/0/1/1:4:252,252:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,166:0.49:-1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:203,195:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:127,298:0.71:-0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:95,292:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,272:0.77:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,295:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:243,202:0.47: 0.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:85,236:0.75:-1.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,331:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,295:0.74:-0.29:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,416:1.00:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,397:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:132,364:0.74: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:237,236:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,188:0.53:-0.86:1.000:0.991 0/0/1/1:4:258,232:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:91,241:0.74:-1.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:118,311:0.74: 0.02:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,356:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:233,214:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:93,287:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,321:0.80:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,272:0.49: 1.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:131,328:0.72: 0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:121,305:0.73:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:302,287:0.50: 2.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:262,250:0.50: 1.06:0.999:0.997 0/1/1/1:4:128,320:0.72: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,275:0.76:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:134,381:0.75: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:200,206:0.52:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:317,85:0.25:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:134,301:0.70: 0.09:1.000:0.987 0/1/1/1:4:100,283:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,323:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:118,323:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,212:0.52:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:137,361:0.74: 0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:344,137:0.31: 0.67:1.000:0.969 0/0/1/1:4:295,298:0.51: 2.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:103,347:0.78: 0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,379:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,140:0.47:-1.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:175,146:0.47:-1.35:1.000:0.992 0/1/1/1:4:98,301:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,305:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1/1:5:83,284:0.78:-0.77:0.982:0.988 0/1/1/1:4:111,315:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:94,287:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:141,433:0.76: 1.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,231:0.55:-0.04:1.000:0.974 0/0/1/1:4:196,178:0.49:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,187:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:212,199:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:117,347:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,304:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,338:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,231:0.72:-1.31:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,529:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:295,293:0.51: 2.02:1.000:0.996 1/1/1:3:0,363:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:129,310:0.72: 0.14:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,511:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,191:0.47:-0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:272,253:0.49: 1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,198:0.52:-0.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,179:0.72:-2.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:93,242:0.73:-1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:223,197:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:238,215:0.49: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,576:1.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,254:0.49: 1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,202:0.53:-0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:290,262:0.49: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,193:0.49:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,189:0.54:-0.84:1.000:0.990 0/0/0/1:4:276,114:0.32:-0.48:1.000:0.954 0/0/1/1:4:231,221:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:279,111:0.31:-0.48:1.000:0.969 0/1/1/1:4:120,317:0.74: 0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:108,290:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:106,324:0.76: 0.03:0.999:1.000 1/1/1/1:4:1,484:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,216:0.55:-0.34:1.000:0.980 0/1/1/1:4:81,276:0.78:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:257,77:0.26:-1.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:103,322:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,201:0.52:-0.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:289,82:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,181:0.54:-1.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:350,107:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:125,358:0.75: 0.70:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,520:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:312,134:0.33: 0.23:1.000:0.931 0/0/1/1:4:243,232:0.50: 0.60:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,574:1.00: 1.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,599:1.00: 2.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,377:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,350:0.77: 0.39:1.000:1.000 -chr5.1 3448195 chr5.1_003448195 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:41,98:0.69: 0.88:1.000:0.965 0/0/1/1:4:49,53:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,60:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,75:0.53: 0.86:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,121:0.74: 1.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,106:0.74: 0.90:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,62:0.75:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,116:0.79: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,88:0.67: 0.59:1.000:0.933 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-2.27:1.000:0.973 0/0/0/1:4:18,9:0.33:-1.79:1.000:0.932 0/0/0/1:4:102,33:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,67:0.48: 0.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,108:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,63:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,68:0.45: 1.09:1.000:0.976 0/0/1/1:4:65,61:0.47: 0.57:0.996:0.992 0/0/1/1:4:55,68:0.54: 0.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,87:0.52: 1.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,90:0.49: 1.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-2.22:1.000:0.769 0/0/1/1:4:65,63:0.48: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,73:0.48: 1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,82:0.66: 0.45:1.000:0.858 0/0/0/1:4:12,5:0.29:-2.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,58:0.45: 0.57:1.000:0.977 0/0/1/1:4:62,86:0.56: 1.09:1.000:0.961 0/1/1/1:4:28,102:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,80:0.54: 0.97:1.000:0.986 0/0/0/1:4:110,37:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,47:0.42: 0.14:1.000:0.927 0/0/1/1:4:64,66:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/0:3:6,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,112:0.69: 1.33:1.000:0.972 0/0/1/1:4:58,60:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,79:0.55: 0.88:1.000:0.979 0/1/1/1:4:28,72:0.70:-0.05:1.000:0.985 0/0/1/1:4:60,71:0.53: 0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,46:0.60:-0.65:1.000:0.829 0/0/1/1:4:48,49:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,25:0.29:-0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,50:0.73:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,48:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,46:0.27: 1.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,52:0.60:-0.43:1.000:0.784 0/0/1/1:4:54,36:0.39:-0.29:1.000:0.693 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,30:0.52:-1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,57:0.57:-0.12:1.000:0.947 0/1/1/1:4:18,46:0.70:-0.91:1.000:0.984 0/0/0/1:4:54,20:0.27:-0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,71:0.49: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,41:0.56:-0.74:1.000:0.967 0/0/1/1:4:52,44:0.45:-0.15:1.000:0.975 0/0/1/1:4:32,47:0.58:-0.55:1.000:0.925 0/0/1/1:4:38,45:0.53:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:21,31:0.58:-1.19:1.000:0.533 0/0/1/1:4:42,35:0.44:-0.60:1.000:0.970 0/0/0/1:4:68,22:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,54:0.58:-0.29:1.000:0.905 0/0/1/1:4:33,37:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,69:0.53: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,51:0.58:-0.41:1.000:0.905 0/0/0/1:4:54,23:0.29:-0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:60,47:0.43: 0.12:1.000:0.939 0/1/1/1:4:19,43:0.67:-0.96:0.997:0.936 0/0/1/1:4:56,36:0.38:-0.24:1.000:0.594 0/0/1/1:4:44,57:0.55:-0.03:1.000:0.982 0/1/1/1:4:6,43:0.87:-1.27:1.000:0.938 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,61:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,57:0.80:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,15:0.27:-1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,34:0.46:-0.74:1.000:0.990 0/0/0/1:4:54,19:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,27:0.26:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:73,24:0.25:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,27:0.40:-0.86:1.000:0.780 0/0/0/1:4:51,24:0.31:-0.65:1.000:0.966 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,22:0.34:-0.93:1.000:0.855 0/0/1/1:4:49,46:0.47:-0.17:1.000:0.992 0/0/0/1:4:50,27:0.34:-0.60:1.000:0.845 0/0/0/1:4:47,23:0.32:-0.77:1.000:0.946 0/0/1/1:4:32,33:0.49:-0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,50:0.55:-0.34:1.000:0.979 0/1/1/1:4:15,51:0.75:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,43:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,32:0.33:-0.15:1.000:0.932 0/1/1/1:4:10,63:0.85:-0.69:1.000:0.987 0/1/1/1:4:23,70:0.73:-0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,70:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,34:0.62:-1.17:1.000:0.532 0/1/1/1:4:18,51:0.72:-0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,69:0.83:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,46:0.40: 0.21:1.000:0.821 0/0/0/1:4:54,14:0.20:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,33:0.46:-0.77:1.000:0.986 0/0/1/1:4:23,37:0.60:-1.00:1.000:0.804 0/0/1/1:4:33,40:0.53:-0.69:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,50:0.53:-0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,62:0.85:-0.72:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,91:0.51: 1.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,46:0.30: 1.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:42,64:0.59: 0.09:1.000:0.887 0/1/1/1:4:18,60:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,92:0.46: 2.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:66,24:0.26:-0.29:0.999:0.998 0/0/1/1:4:60,48:0.43: 0.14:1.000:0.952 0/0/1/1:4:27,28:0.49:-1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,57:0.55:-0.03:1.000:0.982 0/0/1/1:4:34,42:0.54:-0.62:1.000:0.990 0/0/0/1:4:44,15:0.25:-1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,56:0.57:-0.17:1.000:0.942 0/0/1/1:4:31,34:0.51:-0.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,74:0.79:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,40:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,21:0.25:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,86:0.50: 1.50:1.000:0.997 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,13:0.16:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,45:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,48:0.73:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,32:0.51:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,18:0.32:-1.10:1.000:0.963 0/0/1/1:4:26,33:0.54:-1.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:89,101:0.52: 2.09:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:10,53:0.83:-0.93:0.982:0.999 0/0/1/1:4:29,30:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,77:0.83:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,84:0.51: 1.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,27:0.27:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,24:0.38:-0.96:1.000:0.543 0/0/0/1:4:45,12:0.21:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,31:0.56:-1.15:1.000:0.972 0/0/1/1:4:30,39:0.55:-0.79:1.000:0.982 0/0/1/1:4:25,34:0.56:-1.03:1.000:0.969 0/0/1/1:4:66,59:0.46: 0.55:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,38:0.75:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,148:0.77: 2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,84:0.57: 0.95:1.000:0.936 1/1/1:3:0,145:1.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,67:0.53: 0.50:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,132:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,29:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,105:0.53: 2.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,90:0.51: 1.64:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,111:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,66:0.54: 0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:92,43:0.31: 0.78:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,200:1.00: 2.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,36:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,39:0.33: 0.33:1.000:0.921 0/0/0/1:4:94,41:0.30: 0.78:1.000:0.986 0/0/0/1:4:101,38:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,25:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,39:0.33: 0.33:1.000:0.921 0/0/0/1:4:98,45:0.31: 0.97:1.000:0.974 0/0/0/1:4:52,13:0.20:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,65:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,93:0.70: 0.66:1.000:0.980 0/0/1/1:4:88,80:0.46: 1.57:0.999:0.989 1/1/1/1:4:1,118:0.99: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,35:0.23: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,99:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,33:0.31: 0.02:1.000:0.965 0/1/1/1:4:26,86:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,37:0.32: 0.28:1.000:0.956 0/0/0/1:4:59,17:0.22:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,27:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,52:0.25: 2.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,78:0.52: 1.05:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,149:1.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,47:0.30: 1.21:1.000:0.983 0/0/0/1:4:109,34:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,134:0.74: 1.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,161:0.73: 2.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,110:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,68:0.53: 0.55:1.000:0.993 -chr5.1 3769336 chr5.1_003769336 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:84,203:.: 1.38:1.000:. ./.:4:47,149:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.16:1.000:. ./.:4:121,118:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,292:.: 1.47:1.000:. ./.:4:88,226:.: 1.85:1.000:. ./.:4:37,114:.:-0.96:1.000:. ./.:4:70,158:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,226:.: 0.33:1.000:. ./.:4:44,20:.:-2.46:1.000:. ./.:4:66,46:.:-1.63:1.000:. ./.:4:111,104:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,146:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.51:1.000:. ./.:4:131,108:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,271:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,226:.: 0.33:0.996:. ./.:4:96,233:.: 2.11:1.000:. ./.:4:60,214:.: 1.16:1.000:. ./.:4:73,215:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,50:.:-2.70:1.000:. ./.:4:46,153:.:-0.13:1.000:. ./.:4:71,163:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.20:1.000:. ./.:4:15,35:.:-2.70:1.000:. ./.:4:63,187:.: 0.75:1.000:. ./.:4:163,141:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.04:1.000:. ./.:4:167,145:.: 1.82:1.000:. ./.:4:85,223:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.06:1.000:. ./.:4:22,26:.:-2.73:1.000:. ./.:4:38,23:.:-2.51:1.000:. ./.:3:24,6:.:-3.05:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,246:.: 0.69:1.000:. ./.:4:130,94:.: 0.30:1.000:. ./.:4:70,178:.: 0.71:1.000:. ./.:4:69,157:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,146:.:-0.12:1.000:. ./.:4:141,126:.: 1.04:1.000:. ./.:4:44,131:.:-0.55:1.000:. ./.:4:98,108:.:-0.01:1.000:. ./.:4:134,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:164,144:.: 1.75:1.000:. ./.:4:158,103:.: 0.94:1.000:. ./.:4:70,134:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,145:.:-1.06:1.000:. ./.:4:83,76:.:-0.82:1.000:. ./.:4:80,208:.: 1.40:1.000:. ./.:4:56,159:.: 0.14:1.000:. ./.:4:142,109:.: 0.76:1.000:. ./.:4:63,157:.: 0.23:1.000:. ./.:4:69,150:.: 0.21:1.000:. ./.:4:116,76:.:-0.25:1.000:. ./.:4:108,86:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.30:1.000:. ./.:6:44,120:.:-0.74:1.000:. ./.:4:53,143:.:-0.18:1.000:. ./.:4:118,91:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,211:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,108:.:-0.82:1.000:. ./.:4:68,156:.: 0.30:1.000:. ./.:4:69,159:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,91:.:-1.34:1.000:. ./.:4:54,141:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.56:0.997:. ./.:4:69,162:.: 0.42:1.000:. ./.:4:74,167:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,139:.:-1.17:1.000:. ./.:4:119,110:.: 0.38:1.000:. ./.:4:63,182:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.09:1.000:. ./.:4:97,86:.:-0.41:1.000:. ./.:4:53,145:.:-0.15:1.000:. ./.:4:70,115:.:-0.37:1.000:. ./.:4:124,88:.: 0.09:1.000:. ./.:4:63,154:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,128:.:-0.37:1.000:. ./.:4:112,113:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.13:1.000:. ./.:4:56,130:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.13:1.000:. ./.:4:83,74:.:-0.86:1.000:. ./.:4:86,86:.:-0.60:1.000:. ./.:4:104,90:.:-0.22:1.000:. ./.:4:102,111:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.80:1.000:. ./.:4:54,122:.:-0.53:1.000:. ./.:4:61,150:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,126:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,126:.:-0.56:1.000:. ./.:4:40,103:.:-1.10:1.000:. ./.:4:42,109:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.60:1.000:. ./.:4:60,178:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,79:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.10:1.000:. ./.:4:32,89:.:-1.48:1.000:. ./.:4:51,122:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,125:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.77:1.000:. ./.:4:77,161:.: 0.54:1.000:. ./.:4:166,187:.: 2.52:1.000:. ./.:4:132,84:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,339:.: 2.28:1.000:. ./.:4:88,78:.:-0.70:0.999:. ./.:4:57,125:.:-0.43:1.000:. ./.:4:27,90:.:-1.55:1.000:. ./.:4:87,88:.:-0.55:1.000:. ./.:4:43,106:.:-0.99:1.000:. ./.:4:49,110:.:-0.82:1.000:. ./.:4:53,130:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,140:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.36:1.000:. ./.:4:48,135:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,157:.:-0.06:1.000:. ./.:4:144,151:.: 1.52:1.000:. ./.:4:85,92:.:-0.51:1.000:. ./.:4:123,90:.: 0.11:1.000:. ./.:4:95,72:.:-0.68:1.000:. ./.:4:44,108:.:-0.94:1.000:. ./.:4:34,76:.:-1.67:1.000:. ./.:4:80,69:.:-0.99:1.000:. ./.:4:50,114:.:-0.74:1.000:. ./.:4:65,168:.: 0.45:1.000:. ./.:5:0,132:.:-1.29:0.982:. ./.:4:54,148:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,219:.: 0.21:1.000:. ./.:4:163,156:.: 1.94:1.000:. ./.:4:111,111:.: 0.26:1.000:. ./.:4:90,56:.:-1.05:1.000:. ./.:4:65,70:.:-1.24:1.000:. ./.:4:60,113:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,118:.:-0.79:1.000:. ./.:4:97,85:.:-0.43:1.000:. ./.:4:126,105:.: 0.42:1.000:. ./.:4:32,87:.:-1.51:1.000:. ./.:4:90,194:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,311:.: 1.80:1.000:. ./.:3:0,194:.:-0.22:1.000:. ./.:4:147,124:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,331:.: 2.14:1.000:. ./.:4:107,94:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,289:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,41:.:-2.86:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.56:1.000:. ./.:4:79,187:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,290:.: 1.44:1.000:. ./.:4:142,120:.: 0.95:1.000:. ./.:4:99,80:.:-0.48:1.000:. ./.:4:139,115:.: 0.82:1.000:. ./.:4:130,111:.: 0.59:1.000:. ./.:4:50,165:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,144:.: 0.07:1.000:. ./.:4:134,115:.: 0.73:1.000:. ./.:4:62,148:.: 0.06:1.000:. ./.:4:77,182:.: 0.90:1.000:. ./.:4:51,124:.:-0.55:1.000:. ./.:4:64,190:.: 0.82:0.999:. ./.:4:1,200:.:-0.10:1.000:. ./.:4:123,120:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.01:1.000:. ./.:4:38,146:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.49:1.000:. ./.:4:109,109:.: 0.20:1.000:. ./.:4:59,117:.:-0.53:1.000:. ./.:4:118,85:.:-0.06:1.000:. ./.:4:79,213:.: 1.47:1.000:. ./.:4:58,190:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,150:.: 0.06:1.000:. ./.:4:62,175:.: 0.52:1.000:. ./.:4:83,205:.: 1.40:1.000:. ./.:4:84,230:.: 1.85:1.000:. ./.:4:56,142:.:-0.15:1.000:. ./.:4:76,171:.: 0.69:1.000:. -chr5.1 3894532 chr5.1_003894532 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:33,72:0.68: 1.84:1.000:0.965 0/0/1/1:4:37,33:0.47: 0.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:23,51:0.69: 0.32:1.000:0.971 0/0/1/1:4:44,35:0.44: 0.56:1.000:0.974 0/1/1/1:4:31,64:0.67: 1.35:1.000:0.932 0/1/1/1:4:21,57:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:26,15:0.37:-1.31:1.000:0.568 0/1/1/1:4:25,58:0.70: 0.76:1.000:0.983 0/0/1/1:4:37,36:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,10:0.67:-2.58:1.000:0.902 0/0/0/1:4:10,3:0.24:-2.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,27:0.38: 0.17:1.000:0.616 0/0/1/1:4:40,40:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,30:0.45:-0.03:1.000:0.979 0/0/0/1:4:72,17:0.20: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,44:0.62: 0.17:1.000:0.580 0/0/1/1:4:45,42:0.48: 0.95:0.996:0.995 0/0/1/1:4:49,40:0.45: 1.05:1.000:0.981 0/0/1/1:4:58,55:0.49: 2.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,48:0.54: 1.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:15,6:0.29:-2.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:61,17:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.30: 0.02:1.000:0.985 0/1/1/1:4:15,37:0.71:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,5:0.42:-2.73:1.000:0.910 0/1/1/1:4:19,52:0.73: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,36:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,33:0.56:-0.42:1.000:0.969 0/0/0/1:4:61,21:0.26: 0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,29:0.45:-0.18:1.000:0.984 0/1/1/1:4:25,60:0.70: 0.86:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,53:0.77: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-3.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.27:-2.58:1.000:0.997 0/1/1:3:3,5:0.62:-2.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,28:0.47:-0.37:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,45:0.74:-0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,28:0.47:-0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,41:0.53: 0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:44,36:0.45: 0.61:1.000:0.981 0/0/1/1:4:39,27:0.41:-0.08:1.000:0.874 0/0/1/1:4:46,29:0.39: 0.36:1.000:0.690 0/0/0/1:4:52,22:0.30: 0.32:1.000:0.982 0/0/1/1:4:43,37:0.46: 0.61:1.000:0.990 0/0/0/1:4:52,16:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,34:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.17:-2.73:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,49:0.80:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,22:0.67:-1.70:1.000:0.902 0/0/1/1:4:24,23:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,29:0.29: 1.74:1.000:0.993 0/1/1/1:4:13,54:0.81:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,22:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,66:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,36:0.57:-0.23:1.000:0.944 0/0/1/1:4:41,52:0.56: 1.25:1.000:0.969 0/0/0/1:4:47,9:0.17:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,22:0.39:-0.52:1.000:0.682 0/0/0/0/1/1:6:29,19:0.40:-0.96:1.000:0.655 0/0/1/1:4:30,35:0.54:-0.13:1.000:0.989 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,59:0.78: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,28:0.47:-0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,46:0.52: 1.00:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,51:0.74: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,16:0.49:-1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,31:0.44: 0.12:1.000:0.974 0/1/1/1:4:18,43:0.70:-0.32:0.997:0.988 0/0/1/1:4:43,35:0.45: 0.51:1.000:0.980 0/0/1/1:4:29,43:0.60: 0.22:1.000:0.817 0/0/1/1:4:13,16:0.55:-1.90:1.000:0.978 0/0/1/1:4:30,31:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,52:0.59: 1.00:1.000:0.861 0/0/1/1:4:26,38:0.59:-0.18:1.000:0.842 0/0/1/1:4:30,22:0.43:-0.77:1.000:0.933 0/1/1/1:4:15,41:0.73:-0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,29:0.48:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,39:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:34,26:0.44:-0.37:1.000:0.958 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,19:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,60:0.79: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,20:0.37:-0.67:1.000:0.510 0/0/0/1:4:49,21:0.31: 0.12:1.000:0.979 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,32:0.45: 0.17:1.000:0.982 0/0/1/1:4:27,40:0.60:-0.03:1.000:0.819 0/0/0/1:4:64,24:0.28: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,44:0.47: 1.25:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,74:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,40:0.62:-0.18:1.000:0.511 0/0/1/1:4:29,29:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,45:0.74:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,18:0.37:-0.91:1.000:0.549 1/1/1/1:4:0,74:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,74:0.84: 1.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,11:0.37:-1.85:1.000:0.558 0/1/1/1:4:26,46:0.64: 0.22:1.000:0.668 0/0/1/1:4:27,31:0.53:-0.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:55,11:0.17:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,27:0.56:-0.96:1.000:0.963 0/0/1/1:4:40,41:0.51: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,33:0.53:-0.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,39:0.51: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,51:0.44: 2.38:1.000:0.969 0/0/1/1:4:43,40:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,34:0.55:-0.27:1.000:0.982 0/0/1/1:4:46,49:0.52: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,17:0.26: 0.02:0.999:0.999 0/0/1/1:4:40,31:0.44: 0.17:1.000:0.964 0/0/1/1:4:25,18:0.42:-1.21:1.000:0.917 0/0/1/1:4:25,30:0.55:-0.62:1.000:0.984 0/0/1/1:4:25,20:0.45:-1.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:27,27:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,18:0.31:-0.37:1.000:0.979 0/0/0/1:4:42,13:0.24:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,76:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,17:0.28:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,37:0.55:-0.03:1.000:0.978 0/0/1/1:4:39,41:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,19:0.29:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,26:0.47:-0.57:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,25:0.43:-0.42:1.000:0.935 0/0/1/1:4:28,30:0.52:-0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:35,10:0.23:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,10:0.24:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,47:0.71:-0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,50:0.50: 1.59:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:38,42:0.52: 0.61:0.982:0.730 0/1/1/1:4:18,37:0.67:-0.62:1.000:0.929 0/0/1/1:4:48,38:0.44: 0.91:1.000:0.972 0/0/0/1:4:69,22:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,39:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,24:0.48:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,33:0.60:-0.62:1.000:0.795 0/0/0/1:4:27,13:0.33:-1.36:1.000:0.921 0/0/0/1:4:50,12:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,14:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,35:0.45: 0.51:1.000:0.980 0/1/1/1:4:5,29:0.85:-1.65:1.000:0.985 0/1/1/1:4:30,59:0.66: 1.05:1.000:0.882 0/0/1/1:4:38,40:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/1/1:3:20,34:0.63:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,42:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,82:0.73: 2.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,32:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,35:0.42: 0.76:1.000:0.928 0/0/1/1:4:40,49:0.55: 1.05:1.000:0.980 0/0/0/1:4:7,4:0.37:-2.78:1.000:0.597 0/0/1/1:4:29,24:0.45:-0.72:1.000:0.984 0/0/1/1:4:44,46:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,39:0.49: 0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,54:0.63: 0.91:1.000:0.528 0/0/1/1:4:30,32:0.52:-0.27:1.000:0.996 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,14:0.18: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,13:0.19: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,33:0.46: 0.22:1.000:0.987 0/0/0/1:4:38,22:0.37:-0.37:1.000:0.558 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,10:0.25:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,33:0.45: 0.32:1.000:0.977 0/0/1/1:4:31,39:0.56: 0.12:1.000:0.972 0/1/1/1:4:22,51:0.70: 0.27:0.999:0.983 0/1/1/1:4:15,53:0.78: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,18:0.31:-0.37:1.000:0.979 0/0/1/1:4:43,40:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,32:0.65:-0.91:1.000:0.813 0/0/1/1:4:33,28:0.46:-0.32:1.000:0.988 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,8:0.18:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,47:0.48: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,36:0.47: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:59,21:0.27: 0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,58:0.74: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,34:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,44:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,49:0.50: 1.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,71:0.73: 1.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,47:0.71:-0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,47:0.48: 1.50:1.000:0.995 -chr5.1 4061189 chr5.1_004061189 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:7,106:0.94: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,44:0.62:-1.42:1.000:0.556 0/1/1/1:4:35,94:0.73: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,61:0.65:-0.64:1.000:0.790 0/1/1/1:4:42,109:0.72: 1.34:1.000:0.995 1/1/1/1:4:2,126:0.98: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,73:0.86:-0.91:1.000:0.973 1/1/1/1:4:6,89:0.94:-0.57:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.42:-3.03:1.000:0.927 0/0/1/1:4:29,32:0.51:-1.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,46:0.56:-1.08:1.000:0.959 1/1/1/1:4:3,95:0.97:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,141:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,76:0.74:-0.30:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,85:0.73: 0.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,93:0.80: 0.15:0.996:1.000 1/1/1/1:4:8,92:0.92:-0.40:1.000:0.988 0/0/1/1:4:72,90:0.54: 1.72:1.000:0.985 1/1/1/1:4:12,133:0.92: 1.14:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,84:0.73: 0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:14,128:0.90: 1.04:1.000:0.819 0/1/1/1:4:23,103:0.82: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,10:0.44:-3.07:1.000:0.971 0/1/1/1:4:30,56:0.64:-0.88:1.000:0.741 0/1/1/1:4:27,62:0.69:-0.77:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,89:0.67: 0.69:1.000:0.917 0/1/1/1:4:34,89:0.72: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,93:0.84:-0.06:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,76:0.82:-0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,17:0.77:-3.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,12:0.25:-2.24:1.000:0.999 0/0/1:3:6,3:0.32:-3.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,92:0.70: 0.63:1.000:0.988 0/0/1/1:4:41,68:0.62:-0.09:1.000:0.620 0/1/1/1:4:24,78:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,60:0.52: 0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,126:0.77: 1.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:12,109:0.90: 0.32:1.000:0.807 0/0/1/1:4:42,70:0.62: 0.01:1.000:0.604 0/1/1/1:4:32,84:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,56:0.41: 0.73:1.000:0.865 0/0/1/1:4:41,64:0.60:-0.23:1.000:0.782 0/1/1/1:4:52,92:0.63: 1.11:1.000:0.587 0/0/1/1:4:20,26:0.55:-2.24:1.000:0.975 0/0/1/1:4:54,55:0.49:-0.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,62:0.66:-0.64:1.000:0.875 0/1/1/1:4:30,107:0.78: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:6,98:0.94:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,75:0.62: 0.28:1.000:0.604 0/0/1/1:4:53,74:0.57: 0.52:1.000:0.939 0/0/1/1:4:39,48:0.54:-0.84:1.000:0.987 0/0/1/1:4:37,61:0.61:-0.47:1.000:0.638 0/1/1/1:4:32,65:0.66:-0.50:1.000:0.896 0/1/1/1:4:28,98:0.78: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:49,68:0.57: 0.18:1.000:0.592 0/0/1/1:4:60,67:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,62:0.63:-0.50:1.000:0.591 0/1/1/1:4:39,129:0.77: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,53:0.43: 0.25:1.000:0.956 1/1/1/1:4:13,121:0.90: 0.76:1.000:0.850 0/0/1/1:4:66,70:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,60:0.69:-0.88:1.000:0.978 1/1/1/1:4:13,112:0.90: 0.46:1.000:0.683 0/1/1/1:4:34,93:0.73: 0.52:0.997:0.998 0/0/1/1:4:42,65:0.60:-0.16:1.000:0.800 1/1/1/1:4:13,134:0.91: 1.21:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:7,103:0.94:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,101:0.81: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,31:0.34:-0.74:1.000:0.895 0/0/1/1:4:46,75:0.61: 0.32:1.000:0.670 0/0/1/1:4:38,60:0.60:-0.47:1.000:0.755 0/0/1/1:4:52,83:0.61: 0.80:1.000:0.728 0/1/1/1:4:36,71:0.66:-0.16:1.000:0.854 0/1/1/1:4:36,63:0.63:-0.43:1.000:0.553 1/1/1/1:4:9,115:0.93: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,33:0.28: 0.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,121:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,57:0.58:-0.50:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,158:1.00: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,57:0.60:-0.60:1.000:0.810 0/0/1/1:4:36,59:0.61:-0.57:1.000:0.655 0/1/1/1:4:26,62:0.70:-0.81:1.000:0.986 0/0/1/1:4:41,65:0.60:-0.19:1.000:0.746 1/1/1/1:4:0,135:1.00: 0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:8,110:0.93: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,87:0.65: 0.69:1.000:0.819 0/1/1/1:4:25,81:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,134:0.75: 2.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,96:0.79: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:10,107:0.91: 0.18:1.000:0.970 0/1/1/1:4:12,85:0.88:-0.50:1.000:0.843 0/1/1/1:4:45,126:0.73: 2.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,78:0.53: 1.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,30:0.38:-1.19:1.000:0.563 0/1/1/1:4:37,124:0.77: 1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,76:0.85:-0.77:1.000:0.983 1/1/1/1:4:11,114:0.91: 0.46:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,105:0.77: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:9,114:0.93: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,47:0.34: 0.80:1.000:0.874 0/0/1/1:4:40,62:0.60:-0.33:1.000:0.797 1/1/1/1:4:0,137:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,151:0.82: 2.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,88:0.62: 1.00:0.999:0.616 1/1/1/1:4:12,104:0.90: 0.15:1.000:0.699 1/1/1/1:4:4,66:0.94:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,56:0.54:-0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:57,64:0.52: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,61:0.61:-0.47:1.000:0.638 1/1/1/1:4:13,130:0.91: 1.07:1.000:0.933 1/1/1/1:4:8,72:0.90:-1.08:1.000:0.788 0/1/1/1:4:24,84:0.78:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:6,81:0.93:-0.84:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,77:0.65: 0.22:1.000:0.756 0/0/1/1:4:46,67:0.58: 0.05:1.000:0.898 0/0/0/1:4:61,30:0.32:-0.71:1.000:0.951 0/0/0/1:4:62,38:0.37:-0.40:1.000:0.561 0/1/1/1:4:37,74:0.66:-0.02:1.000:0.875 1/1/1/1:4:8,105:0.93: 0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,106:0.79: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,47:0.57:-1.05:1.000:0.946 0/0/1/1:4:52,62:0.53: 0.08:1.000:0.991 1/1/1/1:4:9,115:0.93: 0.42:1.000:0.997 1/1/1/1/1:5:0,131:1.00: 0.66:0.982:1.000 0/1/1/1:4:31,56:0.64:-0.84:1.000:0.651 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,83:0.66: 0.42:1.000:0.892 0/0/0/1:4:46,21:0.31:-1.53:1.000:0.980 0/0/0/1:4:69,28:0.28:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,35:0.31:-0.09:1.000:0.969 0/0/1/1:4:55,66:0.53: 0.32:1.000:0.991 1/1/1/1:4:9,91:0.91:-0.40:1.000:0.941 0/0/1/1:4:45,66:0.59:-0.02:1.000:0.890 0/1/1/1:4:31,70:0.69:-0.36:1.000:0.972 0/1/1/1:4:25,75:0.75:-0.40:1.000:0.999 1/1/1/1:4:7,143:0.95: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,139:0.77: 2.34:1.000:1.000 1/1/1:3:0,105:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,50:0.63:-1.12:1.000:0.504 1/1/1/1:4:0,154:1.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,34:0.31:-0.19:1.000:0.970 0/1/1/1:4:35,126:0.78: 1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,91:0.78: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-2.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,101:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,85:0.68: 0.46:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,186:1.00: 2.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,35:0.32:-0.16:1.000:0.957 0/1/1/1:4:26,60:0.69:-0.88:1.000:0.978 0/1/1/1:4:45,87:0.65: 0.69:1.000:0.819 0/0/1/1:4:35,57:0.61:-0.67:1.000:0.674 0/1/1/1:4:30,54:0.64:-0.95:1.000:0.641 0/0/1/1:4:59,67:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,71:0.66:-0.16:1.000:0.854 0/0/1/1:4:38,43:0.52:-1.05:1.000:0.995 1/1/1/1:4:7,96:0.93:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,93:0.74: 0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,79:0.64: 0.39:0.999:0.633 1/1/1/1:4:0,145:1.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,60:0.50: 0.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,29:0.32:-0.77:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,132:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,59:0.62:-0.60:1.000:0.569 0/0/1/1:4:51,45:0.46:-0.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:42,22:0.33:-1.63:1.000:0.899 0/0/1/1:4:82,86:0.50: 1.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,89:0.87:-0.33:1.000:0.892 1/1/1/1:4:0,140:1.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,70:0.56: 0.35:1.000:0.961 0/1/1/1:4:32,84:0.72: 0.15:1.000:0.996 1/1/1/1:4:4,137:0.97: 1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:8,133:0.94: 1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,97:0.95:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,56:0.60:-0.67:1.000:0.790 -chr5.1 4247500 chr5.1_004247500 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:288,27:.: 0.86:1.000:. ./.:4:186,66:.: 0.00:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:213,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:235,102:.: 1.15:1.000:. ./.:4:373,19:.: 1.90:1.000:. ./.:4:67,151:.:-0.46:1.000:. ./.:4:306,25:.: 1.07:1.000:. ./.:4:241,80:.: 0.94:1.000:. ./.:4:79,26:.:-1.99:1.000:. ./.:4:53,20:.:-2.42:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:276,30:.: 0.73:1.000:. ./.:4:219,82:.: 0.67:1.000:. ./.:4:158,187:.: 1.26:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:225,72:.: 0.61:0.996:. ./.:4:270,117:.: 1.83:1.000:. ./.:4:198,170:.: 1.57:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:83,23:.:-1.98:1.000:. ./.:4:130,103:.:-0.26:1.000:. ./.:4:215,67:.: 0.41:1.000:. ./.:4:183,80:.: 0.15:1.000:. ./.:4:19,32:.:-2.72:1.000:. ./.:4:399,27:.: 2.36:1.000:. ./.:4:230,100:.: 1.06:1.000:. ./.:4:234,94:.: 1.03:1.000:. ./.:4:177,152:.: 1.04:1.000:. ./.:4:349,27:.: 1.68:1.000:. ./.:4:315,11:.: 1.00:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,24:.:-2.73:1.000:. ./.:4:72,8:.:-2.33:1.000:. ./.:3:29,9:.:-2.90:1.000:. ./.:4:234,77:.: 0.80:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:227,71:.: 0.63:1.000:. ./.:4:112,120:.:-0.27:1.000:. ./.:4:167,146:.: 0.83:1.000:. ./.:4:159,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:176,48:.:-0.38:1.000:. ./.:4:87,85:.:-1.08:1.000:. ./.:4:164,42:.:-0.62:1.000:. ./.:4:181,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,135:.: 0.57:1.000:. ./.:4:100,60:.:-1.24:1.000:. ./.:4:201,81:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,58:.:-0.34:1.000:. ./.:4:116,48:.:-1.19:1.000:. ./.:4:168,119:.: 0.48:1.000:. ./.:4:246,26:.: 0.27:1.000:. ./.:4:185,40:.:-0.36:1.000:. ./.:4:223,93:.: 0.87:1.000:. ./.:4:138,140:.: 0.35:1.000:. ./.:4:208,83:.: 0.53:1.000:. ./.:4:162,159:.: 0.94:1.000:. ./.:4:197,51:.:-0.05:1.000:. ./.:6:70,84:.:-1.33:1.000:. ./.:4:88,122:.:-0.57:1.000:. ./.:4:149,130:.: 0.37:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:120,132:.: 0.00:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:188,89:.: 0.34:1.000:. ./.:4:133,1:.:-1.60:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:172,54:.:-0.35:0.997:. ./.:4:181,45:.:-0.35:1.000:. ./.:4:235,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:164,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:309,18:.: 1.02:1.000:. ./.:4:103,92:.:-0.77:1.000:. ./.:4:221,65:.: 0.46:1.000:. ./.:4:169,74:.:-0.12:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:111,74:.:-0.91:1.000:. ./.:4:262,21:.: 0.42:1.000:. ./.:4:114,45:.:-1.26:1.000:. ./.:4:173,48:.:-0.42:1.000:. ./.:4:207,59:.: 0.19:1.000:. ./.:4:169,65:.:-0.24:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:189,57:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,92:.:-0.76:1.000:. ./.:4:91,79:.:-1.11:1.000:. ./.:4:95,78:.:-1.07:1.000:. ./.:4:185,52:.:-0.20:1.000:. ./.:4:190,67:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,67:.:-0.58:1.000:. ./.:4:311,27:.: 1.17:1.000:. ./.:4:175,13:.:-0.86:1.000:. ./.:4:127,135:.: 0.14:1.000:. ./.:4:98,103:.:-0.69:1.000:. ./.:4:168,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:130,39:.:-1.12:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:207,95:.: 0.68:1.000:. ./.:4:84,40:.:-1.73:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:137,19:.:-1.30:1.000:. ./.:4:147,32:.:-0.99:1.000:. ./.:4:124,59:.:-0.93:1.000:. ./.:4:168,64:.:-0.27:1.000:. ./.:4:172,62:.:-0.24:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:256,78:.: 1.11:1.000:. ./.:4:220,80:.: 0.65:1.000:. ./.:4:166,84:.:-0.02:1.000:. ./.:4:289,81:.: 1.60:1.000:. ./.:4:135,42:.:-1.01:0.999:. ./.:4:249,19:.: 0.22:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:190,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,104:.:-0.50:1.000:. ./.:4:170,52:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:180,61:.:-0.15:1.000:. ./.:4:241,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:113,37:.:-1.38:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,118:.: 1.29:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.81:1.000:. ./.:4:177,53:.:-0.30:1.000:. ./.:4:143,47:.:-0.84:1.000:. ./.:4:119,37:.:-1.30:1.000:. ./.:4:73,72:.:-1.45:1.000:. ./.:4:95,32:.:-1.69:1.000:. ./.:4:235,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:270,14:.: 0.44:1.000:. ./.:5:142,27:.:-1.12:0.982:. ./.:4:213,21:.:-0.24:1.000:. ./.:4:180,57:.:-0.20:1.000:. ./.:4:178,159:.: 1.15:1.000:. ./.:4:220,64:.: 0.44:1.000:. ./.:4:137,49:.:-0.89:1.000:. ./.:4:126,41:.:-1.15:1.000:. ./.:4:76,114:.:-0.84:1.000:. ./.:4:167,52:.:-0.44:1.000:. ./.:4:109,78:.:-0.88:1.000:. ./.:4:178,62:.:-0.16:1.000:. ./.:4:112,41:.:-1.34:1.000:. ./.:4:352,33:.: 1.80:1.000:. ./.:4:279,66:.: 1.26:1.000:. ./.:3:139,81:.:-0.43:1.000:. ./.:4:236,107:.: 1.23:1.000:. ./.:4:322,109:.: 2.43:1.000:. ./.:4:186,80:.: 0.19:1.000:. ./.:4:282,77:.: 1.45:1.000:. ./.:4:219,97:.: 0.87:1.000:. ./.:4:53,19:.:-2.44:1.000:. ./.:4:171,70:.:-0.15:1.000:. ./.:4:218,59:.: 0.34:1.000:. ./.:4:319,26:.: 1.26:1.000:. ./.:4:235,103:.: 1.17:1.000:. ./.:4:233,105:.: 1.17:1.000:. ./.:4:110,110:.:-0.43:1.000:. ./.:4:238,75:.: 0.83:1.000:. ./.:4:227,78:.: 0.72:1.000:. ./.:4:277,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:192,52:.:-0.11:1.000:. ./.:4:138,145:.: 0.42:1.000:. ./.:4:134,129:.: 0.15:1.000:. ./.:4:304,20:.: 0.98:1.000:. ./.:4:124,131:.: 0.04:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:187,79:.: 0.19:1.000:. ./.:4:209,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:195,61:.: 0.06:1.000:. ./.:4:189,74:.: 0.15:1.000:. ./.:4:181,69:.:-0.02:1.000:. ./.:4:119,108:.:-0.34:1.000:. ./.:4:110,100:.:-0.57:1.000:. ./.:4:186,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:280,78:.: 1.44:1.000:. ./.:4:211,63:.: 0.30:1.000:. ./.:4:285,92:.: 1.69:1.000:. ./.:4:208,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:281,105:.: 1.82:1.000:. ./.:4:348,34:.: 1.76:1.000:. ./.:4:255,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:232,72:.: 0.71:1.000:. -chr5.1 4383318 chr5.1_004383318 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:199,80:.: 1.62:1.000:. ./.:4:103,70:.:-0.19:1.000:. ./.:4:137,84:.: 0.63:1.000:. ./.:4:206,38:.: 1.02:1.000:. ./.:4:155,69:.: 0.68:1.000:. ./.:4:191,83:.: 1.54:1.000:. ./.:4:77,53:.:-0.92:1.000:. ./.:4:148,76:.: 0.68:1.000:. ./.:4:131,121:.: 1.16:1.000:. ./.:4:22,8:.:-2.63:1.000:. ./.:4:24,5:.:-2.65:1.000:. ./.:4:122,36:.:-0.45:1.000:. ./.:4:139,101:.: 0.96:1.000:. ./.:4:160,91:.: 1.14:1.000:. ./.:4:159,59:.: 0.58:1.000:. ./.:4:142,79:.: 0.63:1.000:. ./.:4:154,59:.: 0.49:0.996:. ./.:4:158,102:.: 1.30:1.000:. ./.:4:146,48:.: 0.17:1.000:. ./.:4:173,78:.: 1.14:1.000:. ./.:4:22,15:.:-2.51:1.000:. ./.:4:159,82:.: 0.97:1.000:. ./.:4:183,65:.: 1.09:1.000:. ./.:4:105,53:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,6:.:-2.94:1.000:. ./.:4:137,37:.:-0.17:1.000:. ./.:4:179,64:.: 1.01:1.000:. ./.:4:157,150:.: 2.10:1.000:. ./.:4:170,82:.: 1.16:1.000:. ./.:4:126,79:.: 0.36:1.000:. ./.:4:118,118:.: 0.89:1.000:. ./.:4:136,68:.: 0.34:1.000:. ./.:4:11,3:.:-2.91:1.000:. ./.:4:34,6:.:-2.46:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:164,104:.: 1.43:1.000:. ./.:4:131,67:.: 0.24:1.000:. ./.:4:172,41:.: 0.49:1.000:. ./.:4:120,92:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:141,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:149,75:.: 0.68:1.000:. ./.:4:149,55:.: 0.34:1.000:. ./.:4:125,58:.:-0.02:1.000:. ./.:4:121,30:.:-0.57:1.000:. ./.:4:149,28:.:-0.12:1.000:. ./.:4:206,87:.: 1.86:1.000:. ./.:4:49,23:.:-1.92:1.000:. ./.:4:104,50:.:-0.51:1.000:. ./.:4:89,48:.:-0.80:1.000:. ./.:4:113,43:.:-0.48:1.000:. ./.:4:149,106:.: 1.21:1.000:. ./.:4:107,42:.:-0.60:1.000:. ./.:4:190,62:.: 1.16:1.000:. ./.:4:132,45:.:-0.12:1.000:. ./.:4:115,61:.:-0.14:1.000:. ./.:4:137,63:.: 0.27:1.000:. ./.:4:130,68:.: 0.24:1.000:. ./.:4:94,43:.:-0.80:1.000:. ./.:6:89,42:.:-0.91:1.000:. ./.:4:125,71:.: 0.20:1.000:. ./.:4:132,67:.: 0.25:1.000:. ./.:4:108,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:86,48:.:-0.86:1.000:. ./.:4:160,61:.: 0.63:1.000:. ./.:4:110,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:86,22:.:-1.30:1.000:. ./.:4:139,57:.: 0.20:1.000:. ./.:4:115,56:.:-0.22:0.997:. ./.:4:134,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:152,96:.: 1.09:1.000:. ./.:4:75,44:.:-1.11:1.000:. ./.:4:117,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:160,106:.: 1.40:1.000:. ./.:4:136,87:.: 0.66:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:133,54:.: 0.05:1.000:. ./.:4:116,15:.:-0.91:1.000:. ./.:4:149,70:.: 0.60:1.000:. ./.:4:97,38:.:-0.84:1.000:. ./.:4:87,38:.:-1.01:1.000:. ./.:4:124,72:.: 0.20:1.000:. ./.:4:128,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:155,91:.: 1.06:1.000:. ./.:4:99,23:.:-1.06:1.000:. ./.:4:141,109:.: 1.13:1.000:. ./.:4:103,43:.:-0.65:1.000:. ./.:4:112,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:127,30:.:-0.46:1.000:. ./.:4:147,27:.:-0.17:1.000:. ./.:4:81,73:.:-0.51:1.000:. ./.:4:116,87:.: 0.32:1.000:. ./.:4:114,66:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,52:.:-0.58:1.000:. ./.:4:122,49:.:-0.22:1.000:. ./.:4:145,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:105,48:.:-0.53:1.000:. ./.:4:97,62:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:167,60:.: 0.73:1.000:. ./.:4:83,17:.:-1.44:1.000:. ./.:4:152,59:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,52:.:-0.75:1.000:. ./.:4:122,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:105,43:.:-0.62:1.000:. ./.:4:98,65:.:-0.36:1.000:. ./.:4:90,69:.:-0.43:1.000:. ./.:4:165,70:.: 0.87:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:157,35:.: 0.14:1.000:. ./.:4:103,105:.: 0.41:1.000:. ./.:4:155,84:.: 0.94:1.000:. ./.:4:124,59:.:-0.02:0.999:. ./.:4:144,66:.: 0.44:1.000:. ./.:4:74,31:.:-1.35:1.000:. ./.:4:167,36:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,23:.:-1.39:1.000:. ./.:4:106,42:.:-0.62:1.000:. ./.:4:88,53:.:-0.74:1.000:. ./.:4:92,64:.:-0.48:1.000:. ./.:4:113,76:.: 0.08:1.000:. ./.:4:124,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:136,42:.:-0.10:1.000:. ./.:4:201,85:.: 1.74:1.000:. ./.:4:107,21:.:-0.96:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:132,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:86,74:.:-0.41:1.000:. ./.:4:89,49:.:-0.79:1.000:. ./.:4:88,33:.:-1.08:1.000:. ./.:4:121,23:.:-0.69:1.000:. ./.:4:147,83:.: 0.78:1.000:. ./.:5:101,64:.:-0.33:0.982:. ./.:4:119,26:.:-0.67:1.000:. ./.:4:128,79:.: 0.39:1.000:. ./.:4:196,60:.: 1.23:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:104,24:.:-0.96:1.000:. ./.:4:122,30:.:-0.55:1.000:. ./.:4:86,51:.:-0.80:1.000:. ./.:4:111,41:.:-0.55:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.80:1.000:. ./.:4:156,31:.: 0.05:1.000:. ./.:4:95,57:.:-0.55:1.000:. ./.:4:209,76:.: 1.72:1.000:. ./.:4:165,87:.: 1.16:1.000:. ./.:3:118,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,59:.: 0.22:1.000:. ./.:4:159,109:.: 1.43:1.000:. ./.:4:107,18:.:-1.01:1.000:. ./.:4:152,79:.: 0.80:1.000:. ./.:4:149,129:.: 1.60:1.000:. ./.:4:26,17:.:-2.41:1.000:. ./.:4:119,88:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,78:.: 0.31:1.000:. ./.:4:111,65:.:-0.14:1.000:. ./.:4:176,121:.: 1.93:1.000:. ./.:4:148,34:.:-0.04:1.000:. ./.:4:131,63:.: 0.17:1.000:. ./.:4:167,76:.: 1.01:1.000:. ./.:4:149,42:.: 0.12:1.000:. ./.:4:109,26:.:-0.84:1.000:. ./.:4:102,64:.:-0.31:1.000:. ./.:4:165,82:.: 1.08:1.000:. ./.:4:112,67:.:-0.09:1.000:. ./.:4:146,88:.: 0.85:1.000:. ./.:4:113,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:162,54:.: 0.55:0.999:. ./.:4:163,106:.: 1.45:1.000:. ./.:4:169,49:.: 0.58:1.000:. ./.:4:127,89:.: 0.55:1.000:. ./.:4:87,21:.:-1.30:1.000:. ./.:4:134,109:.: 1.01:1.000:. ./.:4:134,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,45:.:-0.45:1.000:. ./.:4:110,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:154,99:.: 1.18:1.000:. ./.:4:180,76:.: 1.23:1.000:. ./.:4:145,108:.: 1.18:1.000:. ./.:4:151,69:.: 0.61:1.000:. ./.:4:131,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:198,95:.: 1.86:1.000:. ./.:4:208,76:.: 1.71:1.000:. ./.:4:119,58:.:-0.12:1.000:. ./.:4:122,73:.: 0.19:1.000:. -chr5.1 4668482 chr5.1_004668482 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:13,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:25,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:34,13:.: 1.19:1.000:. ./.:4:18,7:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,7:.: 0.49:1.000:. ./.:4:18,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:17,8:.:-1.00:1.000:. ./.:4:11,10:.:-1.39:1.000:. ./.:4:16,17:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.29:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,15:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.69:1.000:. ./.:4:16,7:.:-1.19:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.39:0.996:. ./.:4:27,8:.: 0.00:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:26,11:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:34,11:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:32,11:.: 0.79:1.000:. ./.:4:11,10:.:-1.39:1.000:. ./.:4:10,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:30,15:.: 0.99:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.60:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:3:13,10:.:-1.19:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:23,17:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:40,4:.: 0.89:1.000:. ./.:4:28,11:.: 0.39:1.000:. ./.:4:32,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:24,11:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.59:1.000:. ./.:4:16,13:.:-0.60:1.000:. ./.:4:7,7:.:-2.09:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.60:1.000:. ./.:4:36,7:.: 0.79:1.000:. ./.:4:24,23:.: 1.19:1.000:. ./.:4:34,15:.: 1.38:1.000:. ./.:4:15,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:40,12:.: 1.68:1.000:. ./.:4:21,23:.: 0.89:1.000:. ./.:4:47,11:.: 2.28:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.89:1.000:. ./.:6:23,8:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:39,11:.: 1.48:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,14:.: 0.39:1.000:. ./.:4:26,24:.: 1.48:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.80:1.000:. ./.:4:30,6:.: 0.09:0.997:. ./.:4:23,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:31,19:.: 1.48:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:56,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:12,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:37,12:.: 1.38:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:17,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:32,11:.: 0.79:1.000:. ./.:4:27,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:56,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:10,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:35,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:45,6:.: 1.58:1.000:. ./.:4:18,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:35,17:.: 1.68:1.000:. ./.:4:16,16:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,25:.: 0.79:1.000:. ./.:4:35,17:.: 1.68:1.000:. ./.:4:17,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.69:1.000:. ./.:4:27,20:.: 1.19:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.70:1.000:. ./.:4:33,11:.: 0.89:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.09:1.000:. ./.:4:28,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,20:.: 0.79:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,18:.: 0.59:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.29:0.999:. ./.:4:15,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.58:1.000:. ./.:4:30,8:.: 0.29:1.000:. ./.:4:26,13:.: 0.39:1.000:. ./.:4:33,12:.: 0.99:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:11,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:30,11:.: 0.59:1.000:. ./.:4:10,11:.:-1.39:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,5:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,13:.:-1.10:1.000:. ./.:5:18,7:.:-1.00:0.982:. ./.:4:12,5:.:-1.79:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.80:1.000:. ./.:4:33,9:.: 0.69:1.000:. ./.:4:17,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,19:.:-1.00:1.000:. ./.:4:24,23:.: 1.19:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.79:1.000:. ./.:3:10,10:.:-1.49:1.000:. ./.:4:18,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,16:.:-0.80:1.000:. ./.:4:27,8:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:25,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,17:.:-1.00:1.000:. ./.:4:10,11:.:-1.39:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:20,12:.:-0.30:1.000:. ./.:4:22,25:.: 1.19:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:35,9:.: 0.89:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,5:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:15,18:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,17:.: 0.19:1.000:. ./.:4:13,13:.:-0.90:0.999:. ./.:4:9,11:.:-1.49:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.60:1.000:. ./.:4:15,2:.:-1.79:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.00:1.000:. ./.:4:30,7:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:31,9:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:17,20:.: 0.19:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,6:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:12,13:.:-1.00:1.000:. ./.:4:14,7:.:-1.39:1.000:. -chr5.1 5193449 chr5.1_005193449 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:150,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.96:0.996:. ./.:4:176,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.29:1.000:. ./.:3:21,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:256,0:.: 3.14:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.39:1.000:. ./.:6:95,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.44:0.997:. ./.:4:139,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:144,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.09:1.000:. ./.:5:120,0:.:-0.39:0.982:. ./.:4:135,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.89:1.000:. ./.:3:119,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:221,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:193,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:137,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:225,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.54:1.000:. -chr5.1 5244824 chr5.1_005244824 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,54:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:126,70:.: 0.66:1.000:. ./.:4:156,71:.: 1.42:1.000:. ./.:4:135,79:.: 1.10:1.000:. ./.:4:110,56:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:56,50:.:-1.56:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:114,66:.: 0.26:1.000:. ./.:4:122,80:.: 0.81:1.000:. ./.:4:127,67:.: 0.61:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.31:0.996:. ./.:4:172,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:135,53:.: 0.46:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:160,83:.: 1.82:1.000:. ./.:4:149,72:.: 1.28:1.000:. ./.:4:110,52:.:-0.18:1.000:. ./.:4:137,69:.: 0.91:1.000:. ./.:4:154,73:.: 1.42:1.000:. ./.:4:125,84:.: 0.98:1.000:. ./.:4:124,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.86:1.000:. ./.:3:20,0:.:-3.68:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:136,74:.: 1.01:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,28:.:-1.98:1.000:. ./.:4:95,52:.:-0.55:1.000:. ./.:4:92,83:.: 0.14:1.000:. ./.:4:99,59:.:-0.28:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:115,55:.: 0.02:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:107,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:128,76:.: 0.86:1.000:. ./.:4:122,53:.: 0.14:1.000:. ./.:4:168,84:.: 2.04:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.45:1.000:. ./.:6:116,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:123,64:.: 0.44:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:126,68:.: 0.61:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:77,65:.:-0.67:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:140,58:.: 0.71:0.997:. ./.:4:129,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:152,76:.: 1.45:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:135,45:.: 0.26:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:114,81:.: 0.63:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:154,73:.: 1.42:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:76,47:.:-1.14:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:183,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,75:.: 0.91:1.000:. ./.:4:107,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,75:.: 1.47:1.000:. ./.:4:84,31:.:-1.34:1.000:. ./.:4:137,74:.: 1.03:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:127,66:.: 0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:107,75:.: 0.31:1.000:. ./.:4:183,88:.: 2.51:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:104,40:.:-0.62:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:91,61:.:-0.43:1.000:. ./.:4:116,61:.: 0.19:1.000:. ./.:4:112,59:.: 0.04:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,66:.:-0.08:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:154,66:.: 1.25:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:156,65:.: 1.28:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:129,75:.: 0.86:1.000:. ./.:4:139,63:.: 0.81:1.000:. ./.:4:141,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,62:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:127,54:.: 0.29:1.000:. ./.:4:115,57:.: 0.07:1.000:. ./.:5:128,0:.:-1.02:0.982:. ./.:4:161,85:.: 1.89:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:96,54:.:-0.48:1.000:. ./.:4:80,62:.:-0.67:1.000:. ./.:4:116,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:79,63:.:-0.67:1.000:. ./.:4:155,64:.: 1.23:1.000:. ./.:4:272,1:.: 2.56:1.000:. ./.:3:79,68:.:-0.55:1.000:. ./.:4:117,65:.: 0.31:1.000:. ./.:4:105,79:.: 0.36:1.000:. ./.:4:121,52:.: 0.09:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:138,61:.: 0.73:1.000:. ./.:4:31,35:.:-2.55:1.000:. ./.:4:112,63:.: 0.14:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:133,78:.: 1.03:1.000:. ./.:4:139,79:.: 1.20:1.000:. ./.:4:143,65:.: 0.96:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:107,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:103,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:116,63:.: 0.24:1.000:. ./.:4:166,1:.:-0.06:0.999:. ./.:4:92,66:.:-0.28:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:102,49:.:-0.45:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:127,62:.: 0.49:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:180,88:.: 2.44:1.000:. ./.:4:131,80:.: 1.03:1.000:. ./.:4:128,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.60:1.000:. -chr5.1 5416282 chr5.1_005416282 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:1,7:0.88:-1.03:1.000:0.852 0/0/1/1:4:4,5:0.56:-0.90:1.000:0.974 0/1/1/1:4:2,12:0.86:-0.24:1.000:0.975 0/0/1/1:4:5,6:0.55:-0.64:1.000:0.984 0/1/1/1:4:3,15:0.83: 0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,8:0.73:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,2:0.67:-1.69:1.000:0.906 0/1/1/1:4:2,7:0.78:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.80:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,27:0.82: 2.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,16:0.59: 1.46:1.000:0.848 0/1/1/1:4:2,5:0.71:-1.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:2,3:0.60:-1.42:1.000:0.791 0/1/1/1:4:4,14:0.78: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.44:-0.77:1.000:0.960 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.77:0.996:0.997 0/0/1/1:4:8,10:0.56: 0.28:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,12:0.67: 0.28:1.000:0.906 0/1/1/1:4:9,20:0.69: 1.72:1.000:0.973 0/1/1/1:4:3,6:0.67:-0.90:1.000:0.906 0/0/0/1:4:7,3:0.37:-0.77:1.000:0.539 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,9:0.64:-0.24:1.000:0.721 0/1/1/1:4:1,8:0.89:-0.90:1.000:0.520 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,14:0.78: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.03:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,1:0.18:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,20:0.77: 1.33:1.000:1.000 1/1/1:3:0,16:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.03:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,10:0.91:-0.64:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.71:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:2,3:0.60:-1.42:1.000:0.791 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,10:0.59: 0.15:1.000:0.874 0/0/1/1:4:10,10:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,17:0.85: 0.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:8,17:0.68: 1.20:1.000:0.954 0/1/1/1:4:4,25:0.86: 1.72:1.000:0.959 0/0/1/1:4:7,5:0.45:-0.51:1.000:0.976 0/1/1/1:4:15,26:0.63: 3.30:1.000:0.617 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.77: 1.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,15:0.71: 0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,11:0.69: 0.02:1.000:0.969 0/1/1/1:4:6,22:0.79: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.59: 0.15:1.000:0.874 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,22:0.81: 1.46:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,17:0.94: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.77: 1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,15:0.68: 0.80:1.000:0.958 0/1/1/1/1/1:6:5,25:0.83: 1.85:1.000:0.986 1/1/1/1:4:1,28:0.97: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.34:-0.51:1.000:0.870 0/1/1/1:4:4,23:0.85: 1.46:1.000:0.985 0/1/1/1:4:4,19:0.83: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.58: 0.41:1.000:0.918 0/1/1/1:4:3,18:0.86: 0.67:0.997:0.975 0/1/1/1:4:3,10:0.77:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.70: 1.85:1.000:0.985 0/1/1/1:4:7,16:0.70: 0.94:1.000:0.981 0/0/1/1:4:9,9:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,3:0.37:-0.77:1.000:0.539 0/1/1/1:4:5,10:0.67:-0.11:1.000:0.906 0/1/1/1:4:3,8:0.73:-0.64:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,24:0.62: 3.03:1.000:0.628 0/0/1/1:4:10,16:0.62: 1.33:1.000:0.628 0/0/1/1:4:7,4:0.41:-0.64:1.000:0.879 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.55: 0.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,8:0.62:-0.37:1.000:0.628 0/0/1/1:4:11,14:0.56: 1.20:1.000:0.967 0/0/1/1:4:20,10:0.39: 1.85:1.000:0.726 0/0/1/1:4:9,4:0.38:-0.37:1.000:0.527 0/0/1/1:4:8,5:0.43:-0.37:1.000:0.935 0/1/1/1:4:5,10:0.67:-0.11:1.000:0.906 0/1/1/1:4:2,13:0.87:-0.11:1.000:0.935 0/1/1/1:4:6,12:0.67: 0.28:1.000:0.906 0/0/0/1:4:18,3:0.27: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,12:0.52: 0.94:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,23:0.88: 1.33:1.000:0.648 0/1/1/1:4:3,16:0.84: 0.41:1.000:0.994 1/1/1/1:4:2,20:0.91: 0.80:1.000:0.938 0/0/1/1:4:9,15:0.62: 1.07:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,37:1.00: 2.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,10:0.83:-0.51:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.79:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,12:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,14:0.82: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,16:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,2:0.36:-1.16:1.000:0.657 0/1/1/1:4:7,18:0.72: 1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,12:0.86:-0.24:1.000:0.975 0/1/1/1:4:11,20:0.65: 1.98:1.000:0.745 0/1/1/1:4:3,8:0.73:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,15:0.68: 0.80:0.999:0.958 0/1/1/1:4:10,17:0.63: 1.46:1.000:0.558 0/0/1/1:4:5,7:0.58:-0.51:1.000:0.900 0/1/1/1:4:4,12:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,15:0.68: 0.80:1.000:0.958 0/1/1/1:4:5,9:0.64:-0.24:1.000:0.721 0/0/0/1:4:12,3:0.31:-0.11:1.000:0.977 0/0/1/1:4:9,7:0.46: 0.02:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.42: 0.41:1.000:0.895 0/0/1/1:4:8,7:0.48:-0.11:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.58: 0.41:1.000:0.918 0/1/1/1:4:3,18:0.86: 0.67:1.000:0.975 0/1/1/1:4:4,18:0.82: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,16:0.80: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.71:-1.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,9:0.64:-0.24:1.000:0.721 1/1/1/1:4:2,23:0.92: 1.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1/1:5:5,11:0.69: 0.02:0.982:0.633 0/1/1/1:4:2,15:0.88: 0.15:1.000:0.708 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-0.90:1.000:0.990 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,20:0.87: 0.94:1.000:0.914 0/1/1/1:4:2,15:0.88: 0.15:1.000:0.708 0/1/1/1:4:2,9:0.82:-0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,29:0.88: 2.25:1.000:0.787 0/0/1/1:4:8,5:0.43:-0.37:1.000:0.935 0/0/1/1:4:8,13:0.62: 0.67:1.000:0.582 0/1/1/1:4:2,9:0.82:-0.64:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.69: 0.02:1.000:0.969 0/1/1/1:4:7,14:0.67: 0.67:1.000:0.906 0/1/1:3:2,5:0.71:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,15:0.88: 0.15:1.000:0.708 0/1/1/1:4:2,14:0.88: 0.02:1.000:0.852 0/1/1/1:4:4,21:0.84: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,4:0.67:-1.29:1.000:0.906 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-1.29:1.000:0.726 0/0/1/1:4:8,11:0.58: 0.41:1.000:0.918 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-1.69:1.000:0.726 0/1/1/1:4:2,4:0.67:-1.29:1.000:0.906 0/1/1/1:4:6,12:0.67: 0.28:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.60:-1.42:1.000:0.791 0/0/1/1:4:9,10:0.53: 0.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.29:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,13:0.93:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,3:0.60:-1.42:1.000:0.791 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,9:0.90:-0.77:1.000:0.801 0/0/1/1:4:6,8:0.57:-0.24:1.000:0.943 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.77:0.999:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,7:0.64:-0.64:1.000:0.645 0/1/1/1:4:1,7:0.88:-1.03:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,4:0.67:-1.29:1.000:0.906 0/1/1/1:4:3,7:0.70:-0.77:1.000:0.985 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-0.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,6:0.38: 0.41:1.000:0.595 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,10:0.67:-0.11:1.000:0.906 0/0/1/1:4:3,4:0.57:-1.16:1.000:0.943 0/0/1/1:4:8,5:0.43:-0.37:1.000:0.935 0/1/1/1:4:1,6:0.86:-1.16:1.000:0.975 0/0/1/1:4:5,8:0.62:-0.37:1.000:0.628 0/0/1/1:4:4,6:0.60:-0.77:1.000:0.791 -chr5.1 5641429 chr5.1_005641429 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:98,50:0.36: 0.33:1.000:0.691 0/0/1/1:4:74,69:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:133,36:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.54: 0.51:1.000:0.990 0/0/0/1:4:92,49:0.37: 0.14:1.000:0.575 0/0/0/1:4:116,48:0.32: 0.75:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,30:0.31:-0.82:1.000:0.970 0/1/1/1:4:42,67:0.64:-0.69:1.000:0.725 0/0/1/1:4:16,19:0.57:-2.62:1.000:0.958 0/1/1/1:4:5,31:0.88:-2.60:1.000:0.781 0/0/1/1:4:66,62:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,84:0.70:-0.25:1.000:0.985 0/0/0/1:4:84,36:0.32:-0.40:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,39:0.30: 0.17:1.000:0.986 0/0/1/1:4:97,99:0.52: 1.58:0.996:0.994 1/1/1/1:4:0,176:1.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,84:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,84:0.47: 1.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,22:0.60:-2.54:1.000:0.751 0/1/1/1:4:45,119:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,130:0.78: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,67:0.75:-1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,23:0.73:-2.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,37:0.28: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,76:0.71:-0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:81,28:0.28:-0.69:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,68:0.65:-0.69:1.000:0.820 0/0/1/1:4:74,45:0.40:-0.43:1.000:0.779 0/0/0/1:4:115,43:0.30: 0.59:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-2.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,46:0.73:-1.81:1.000:0.998 0/1/1:3:8,18:0.73:-2.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,70:0.56:-0.17:1.000:0.958 0/0/0/1:4:123,45:0.29: 0.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,63:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,108:0.71: 0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:81,70:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,79:0.56: 0.30:1.000:0.968 0/0/1/1:4:85,81:0.51: 0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,137:0.77: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,114:0.58: 1.84:1.000:0.927 0/1/1/1:4:53,111:0.71: 0.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:103,91:0.49: 1.53:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 1.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,47:0.41:-0.35:1.000:0.835 0/0/0/1:4:121,44:0.29: 0.77:1.000:0.991 0/1/1/1:4:38,64:0.66:-0.87:1.000:0.850 0/1/1/1:4:59,161:0.77: 2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,33:0.35:-0.87:1.000:0.827 0/1/1/1:4:42,110:0.76: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,37:0.37:-0.77:1.000:0.555 0/1/1/1:4:48,96:0.70: 0.22:1.000:0.985 0/1/1/1:4:39,75:0.69:-0.56:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,96:0.55: 1.16:1.000:0.975 0/0/1/1/1/1:6:53,90:0.66: 0.20:1.000:0.914 0/1/1/1:4:39,85:0.72:-0.30:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,139:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,57:0.34: 1.22:1.000:0.893 0/1/1/1:4:43,95:0.72: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,97:0.57: 1.11:1.000:0.953 0/0/1/1:4:82,55:0.42: 0.04:1.000:0.919 0/0/1/1:4:60,36:0.40:-1.03:1.000:0.751 0/0/1/1:4:93,91:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,48:0.42:-0.40:0.997:0.913 0/0/1/1:4:69,69:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,75:0.63:-0.27:1.000:0.527 0/0/1/1:4:57,51:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,114:0.53: 2.26:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,141:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,78:0.48: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,82:0.56: 0.43:1.000:0.965 0/0/0/1:4:68,29:0.32:-1.00:1.000:0.948 0/0/1/1:4:84,79:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,140:0.81: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,102:0.70: 0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,63:0.58:-0.59:1.000:0.910 1/1/1/1:4:1,167:0.99: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,127:0.77: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,36:0.33:-0.51:1.000:0.907 0/0/1/1:4:62,72:0.56:-0.04:1.000:0.969 0/1/1/1:4:43,126:0.78: 0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,121:0.77: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,64:0.53:-0.27:1.000:0.992 0/1/1/1:4:27,54:0.70:-1.42:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,78:0.60:-0.01:1.000:0.763 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,83:0.71:-0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,93:0.49: 1.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,38:0.36:-0.61:1.000:0.675 0/0/1/1:4:68,83:0.57: 0.41:1.000:0.940 0/0/0/1:4:118,35:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,39:0.31:-0.04:1.000:0.966 0/1/1/1:4:21,67:0.79:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,46:0.27: 1.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,54:0.66:-1.29:1.000:0.853 0/1/1/1:4:40,108:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,27:0.38:-1.55:1.000:0.524 0/1/1/1:4:36,73:0.70:-0.69:1.000:0.988 0/1/1/1:4:31,76:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,69:0.54:-0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:112,69:0.40: 1.19:1.000:0.805 0/0/1/1:4:85,78:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,62:0.60:-0.74:1.000:0.746 0/0/1/1:4:126,95:0.45: 2.23:1.000:0.978 0/1/1/1:4:46,101:0.72: 0.30:0.999:0.996 0/1/1/1:4:41,82:0.70:-0.33:1.000:0.985 0/0/1/1:4:53,63:0.57:-0.51:1.000:0.957 0/0/1/1:4:104,93:0.49: 1.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,75:0.79:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,76:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,123:0.77: 0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,89:0.48: 1.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,77:0.69:-0.48:1.000:0.974 0/1/1/1:4:45,116:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,84:0.45: 1.61:1.000:0.975 0/0/1/1:4:70,82:0.56: 0.43:1.000:0.965 0/0/1/1:4:65,71:0.54: 0.01:1.000:0.986 0/1/1/1:4:30,74:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,101:0.82:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,41:0.36:-0.38:1.000:0.680 0/1/1/1:4:36,95:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:71,43:0.40:-0.56:0.982:0.971 0/0/1/1:4:69,43:0.40:-0.61:1.000:0.825 0/0/1/1:4:65,74:0.55: 0.09:1.000:0.976 0/1/1/1:4:48,108:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,85:0.47: 1.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:42,69:0.65:-0.64:1.000:0.799 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,77:0.68:-0.43:1.000:0.950 0/1/1/1:4:35,121:0.80: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,109:0.78: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,68:0.53:-0.09:1.000:0.990 0/0/0/1:4:66,34:0.36:-0.93:1.000:0.667 0/0/0/1:4:90,49:0.37: 0.09:1.000:0.511 0/0/1/1:4:112,106:0.50: 2.16:1.000:0.997 0/0/1:3:40,34:0.48:-1.60:1.000:0.821 0/1/1/1:4:40,90:0.73:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,40:0.34:-0.22:1.000:0.883 0/1/1/1:4:23,65:0.77:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,96:0.52: 1.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,54:0.59:-1.06:1.000:0.845 1/1/1/1:4:4,40:0.92:-2.39:1.000:0.990 0/1/1/1:4:35,67:0.69:-0.87:1.000:0.972 0/0/1/1:4:93,106:0.55: 1.66:1.000:0.976 0/1/1/1:4:41,75:0.68:-0.51:1.000:0.948 0/0/0/1:4:83,43:0.36:-0.25:1.000:0.652 0/1/1/1:4:42,69:0.65:-0.64:1.000:0.799 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,113:0.83: 0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,91:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,67:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,61:0.45: 0.12:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,155:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,121:0.74: 0.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,57:0.59:-0.90:1.000:0.873 0/1/1/1:4:40,70:0.67:-0.66:1.000:0.907 0/0/0/1:4:135,38:0.24: 0.98:0.999:1.000 0/0/0/1:4:70,35:0.36:-0.80:1.000:0.740 0/1/1/1:4:34,101:0.78:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,68:0.55:-0.19:1.000:0.977 0/0/0/1:4:59,21:0.29:-1.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,94:0.52: 1.40:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,100:0.80:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,64:0.55:-0.40:1.000:0.975 0/0/1/1:4:91,96:0.53: 1.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,125:0.79: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,41:0.36:-0.40:1.000:0.647 0/0/1/1:4:84,77:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,79:0.53: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,85:0.60: 0.33:1.000:0.797 0/0/0/1:4:97,46:0.34: 0.20:1.000:0.841 0/0/0/1:4:72,35:0.35:-0.74:1.000:0.798 0/0/1/1:4:63,59:0.50:-0.35:1.000:0.997 -chr5.1 5712041 chr5.1_005712041 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:83,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:35,5:.:-2.06:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:78,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:85,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.14:0.996:. ./.:4:115,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:65,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.51:1.000:. ./.:3:39,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:110,4:.: 0.87:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:166,4:.: 3.08:1.000:. ./.:4:70,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:80,6:.:-0.24:1.000:. ./.:4:51,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:85,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:109,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:93,5:.: 0.23:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.90:1.000:. ./.:6:82,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:63,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:95,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:89,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,3:.:-0.28:0.997:. ./.:4:67,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:82,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:61,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:87,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:60,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:88,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:102,3:.: 0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:97,6:.: 0.43:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:48,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,4:.:-1.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:47,3:.:-1.66:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:65,5:.:-0.87:1.000:. ./.:4:91,3:.: 0.08:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.32:0.999:. ./.:4:86,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:67,2:.:-0.91:1.000:. ./.:4:87,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.51:1.000:. ./.:5:70,0:.:-0.87:0.982:. ./.:4:60,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:65,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:64,6:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,4:.:-1.63:1.000:. ./.:4:87,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.18:1.000:. ./.:3:57,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:65,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:88,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:35,5:.:-2.06:1.000:. ./.:4:72,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:76,3:.:-0.52:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:73,5:.:-0.56:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:63,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:85,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:72,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.71:1.000:. -chr5.1 5988357 chr5.1_005988357 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,274:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,190:.:-0.03:1.000:. ./.:4:3,332:.: 1.79:1.000:. ./.:4:3,213:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,299:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,120:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,327:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1,171:.:-0.27:1.000:. ./.:4:2,264:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.24:0.996:. ./.:4:0,209:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,22:.:-2.15:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,127:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,65:.:-1.62:1.000:. ./.:4:2,282:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,357:.: 2.07:1.000:. ./.:4:0,285:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,295:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1,231:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1,170:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.77:1.000:. ./.:4:0,83:.:-1.40:1.000:. ./.:3:7,32:.:-1.95:1.000:. ./.:4:1,120:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,289:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1,168:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,275:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,235:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,271:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,309:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,226:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,153:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,286:.: 1.17:1.000:. ./.:4:1,297:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,287:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.66:1.000:. ./.:6:0,99:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,131:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.13:1.000:. ./.:4:2,171:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,305:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.71:1.000:. ./.:4:3,112:.:-0.99:0.997:. ./.:4:3,280:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1,62:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,368:.: 2.21:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1,196:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1,249:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,173:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1,185:.:-0.09:1.000:. ./.:4:2,86:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,112:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1,149:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,91:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,203:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.79:1.000:. ./.:4:2,135:.:-0.71:1.000:. ./.:4:1,164:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1,343:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,187:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,73:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,119:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1,185:.:-0.09:1.000:. ./.:4:2,377:.: 2.35:1.000:. ./.:4:1,302:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,111:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.29:0.999:. ./.:4:0,220:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,124:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1,243:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,69:.:-1.57:1.000:. ./.:4:2,103:.:-1.12:1.000:. ./.:4:2,223:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,388:.: 2.46:1.000:. ./.:4:2,224:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,239:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,171:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.75:1.000:. ./.:5:0,39:.:-1.95:0.982:. ./.:4:0,190:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,77:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,245:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,156:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.43:1.000:. ./.:4:1,143:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1,187:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,324:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.78:1.000:. ./.:3:0,68:.:-1.58:1.000:. ./.:4:0,335:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,21:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.24:1.000:. ./.:4:2,118:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,402:.: 2.64:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,303:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,276:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1,265:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.18:1.000:. ./.:4:2,204:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,270:.: 0.98:1.000:. ./.:4:2,225:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,322:.: 1.63:0.999:. ./.:4:0,162:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,104:.:-1.13:1.000:. ./.:4:3,181:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,146:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,330:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,100:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,289:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,332:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,323:.: 1.64:1.000:. -chr5.1 6234907 chr5.1_006234907 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:283,71:.: 0.17:1.000:. ./.:4:179,66:.:-0.88:1.000:. ./.:4:244,71:.:-0.21:1.000:. ./.:4:221,70:.:-0.44:1.000:. ./.:4:292,145:.: 0.97:1.000:. ./.:4:402,103:.: 1.62:1.000:. ./.:4:276,163:.: 0.99:1.000:. ./.:4:382,71:.: 1.12:1.000:. ./.:4:441,80:.: 1.78:1.000:. ./.:4:71,1:.:-2.55:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:292,179:.: 1.29:1.000:. ./.:4:314,80:.: 0.55:1.000:. ./.:4:333,83:.: 0.77:1.000:. ./.:4:242,176:.: 0.78:0.996:. ./.:4:218,74:.:-0.43:1.000:. ./.:4:291,189:.: 1.38:1.000:. ./.:4:322,95:.: 0.77:1.000:. ./.:4:30,36:.:-2.61:1.000:. ./.:4:308,75:.: 0.45:1.000:. ./.:4:138,168:.:-0.29:1.000:. ./.:4:225,164:.: 0.50:1.000:. ./.:4:44,12:.:-2.70:1.000:. ./.:4:501,102:.: 2.57:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:343,72:.: 0.76:1.000:. ./.:4:537,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:609,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:246,66:.:-0.24:1.000:. ./.:4:35,1:.:-2.90:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.60:1.000:. ./.:3:25,12:.:-2.89:1.000:. ./.:4:195,138:.:-0.03:1.000:. ./.:4:278,85:.: 0.25:1.000:. ./.:4:251,78:.:-0.07:1.000:. ./.:4:453,71:.: 1.81:1.000:. ./.:4:289,201:.: 1.48:1.000:. ./.:4:241,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:143,38:.:-1.50:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:178,123:.:-0.34:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:243,80:.:-0.13:1.000:. ./.:4:249,76:.:-0.11:1.000:. ./.:4:258,70:.:-0.08:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:284,150:.: 0.94:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:334,78:.: 0.73:1.000:. ./.:4:266,80:.: 0.09:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:465,95:.: 2.15:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:364,82:.: 1.05:1.000:. ./.:4:184,142:.:-0.10:1.000:. ./.:6:241,58:.:-0.36:1.000:. ./.:4:316,65:.: 0.43:1.000:. ./.:4:192,73:.:-0.69:1.000:. ./.:4:276,83:.: 0.22:1.000:. ./.:4:388,82:.: 1.29:1.000:. ./.:4:249,89:.: 0.01:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:211,65:.:-0.58:1.000:. ./.:4:224,58:.:-0.53:1.000:. ./.:4:251,130:.: 0.43:0.997:. ./.:4:161,52:.:-1.19:1.000:. ./.:4:503,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:158,122:.:-0.55:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:312,71:.: 0.45:1.000:. ./.:4:161,121:.:-0.53:1.000:. ./.:4:212,64:.:-0.58:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:196,64:.:-0.74:1.000:. ./.:4:266,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:169,64:.:-1.00:1.000:. ./.:4:222,81:.:-0.32:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:196,130:.:-0.10:1.000:. ./.:4:277,111:.: 0.50:1.000:. ./.:4:298,80:.: 0.40:1.000:. ./.:4:180,55:.:-0.98:1.000:. ./.:4:138,56:.:-1.37:1.000:. ./.:4:104,126:.:-1.03:1.000:. ./.:4:183,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:304,73:.: 0.39:1.000:. ./.:4:240,46:.:-0.49:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:233,46:.:-0.55:1.000:. ./.:4:449,70:.: 1.76:1.000:. ./.:4:186,145:.:-0.05:1.000:. ./.:4:210,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:188,45:.:-1.00:1.000:. ./.:4:247,60:.:-0.29:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:227,65:.:-0.43:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:117,110:.:-1.06:1.000:. ./.:4:245,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:327,68:.: 0.56:1.000:. ./.:4:279,67:.: 0.09:1.000:. ./.:4:238,92:.:-0.06:1.000:. ./.:4:266,83:.: 0.12:1.000:. ./.:4:233,67:.:-0.35:1.000:. ./.:4:272,56:.:-0.08:1.000:. ./.:4:266,192:.: 1.17:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:364,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:182,51:.:-1.00:1.000:. ./.:4:248,66:.:-0.22:1.000:. ./.:4:344,73:.: 0.77:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:127,157:.:-0.51:1.000:. ./.:4:273,39:.:-0.24:1.000:. ./.:4:296,52:.: 0.11:1.000:. ./.:4:156,53:.:-1.23:1.000:. ./.:4:193,73:.:-0.68:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:179,65:.:-0.89:1.000:. ./.:4:204,77:.:-0.54:1.000:. ./.:4:220,59:.:-0.55:1.000:. ./.:4:189,44:.:-1.00:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:248,49:.:-0.38:1.000:. ./.:4:443,0:.: 1.03:1.000:. ./.:5:109,132:.:-0.92:0.982:. ./.:4:282,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:153,96:.:-0.84:1.000:. ./.:4:156,189:.: 0.08:1.000:. ./.:4:245,74:.:-0.17:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:219,41:.:-0.74:1.000:. ./.:4:251,62:.:-0.23:1.000:. ./.:4:118,102:.:-1.12:1.000:. ./.:4:110,120:.:-1.03:1.000:. ./.:4:225,65:.:-0.45:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:348,77:.: 0.85:1.000:. ./.:4:188,168:.: 0.19:1.000:. ./.:3:182,131:.:-0.23:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:364,178:.: 1.98:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:247,171:.: 0.78:1.000:. ./.:4:360,84:.: 1.03:1.000:. ./.:4:63,13:.:-2.51:1.000:. ./.:4:283,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:213,173:.: 0.48:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:301,179:.: 1.38:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:182,40:.:-1.10:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:187,52:.:-0.94:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:235,76:.:-0.25:1.000:. ./.:4:323,97:.: 0.80:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:341,49:.: 0.51:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.27:0.999:. ./.:4:225,125:.: 0.13:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:134,107:.:-0.92:1.000:. ./.:4:387,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:149,115:.:-0.70:1.000:. ./.:4:177,53:.:-1.03:1.000:. ./.:4:255,66:.:-0.15:1.000:. ./.:4:171,57:.:-1.05:1.000:. ./.:4:531,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:164,181:.: 0.08:1.000:. ./.:4:309,175:.: 1.42:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:249,81:.:-0.06:1.000:. ./.:4:339,182:.: 1.78:1.000:. ./.:4:383,86:.: 1.28:1.000:. ./.:4:283,70:.: 0.16:1.000:. ./.:4:219,64:.:-0.52:1.000:. -chr5.1 6312642 chr5.1_006312642 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:57,126:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.75:1.000:. ./.:4:59,143:.: 0.85:1.000:. ./.:4:60,159:.: 1.28:1.000:. ./.:4:27,54:.:-2.22:1.000:. ./.:4:49,115:.:-0.12:1.000:. ./.:4:44,117:.:-0.19:1.000:. ./.:4:15,59:.:-2.40:1.000:. ./.:4:15,57:.:-2.45:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.04:1.000:. ./.:4:49,126:.: 0.16:1.000:. ./.:4:58,121:.: 0.26:1.000:. ./.:4:42,131:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,210:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,235:.: 1.68:0.996:. ./.:4:54,131:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,236:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,41:.:-3.23:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,215:.: 1.18:1.000:. ./.:4:41,104:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,41:.:-3.23:1.000:. ./.:4:50,141:.: 0.57:1.000:. ./.:4:57,155:.: 1.10:1.000:. ./.:4:57,140:.: 0.72:1.000:. ./.:4:49,138:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,159:.: 1.13:1.000:. ./.:4:56,139:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,24:.:-3.66:1.000:. ./.:4:0,103:.:-1.66:1.000:. ./.:3:4,43:.:-3.08:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,152:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,214:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,211:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,223:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.70:1.000:. ./.:4:20,33:.:-2.93:1.000:. ./.:4:40,116:.:-0.32:1.000:. ./.:4:39,108:.:-0.55:1.000:. ./.:4:44,112:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,223:.: 1.38:1.000:. ./.:4:37,87:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.92:1.000:. ./.:4:48,132:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,121:.: 0.11:1.000:. ./.:4:48,124:.: 0.09:1.000:. ./.:4:49,126:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.47:1.000:. ./.:6:26,114:.:-0.72:1.000:. ./.:4:53,140:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.54:1.000:. ./.:4:49,131:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.85:1.000:. ./.:4:50,103:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,103:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.47:1.000:. ./.:4:47,120:.:-0.04:0.997:. ./.:4:0,163:.:-0.14:1.000:. ./.:4:63,133:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,88:.:-2.04:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.24:1.000:. ./.:4:64,155:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.55:1.000:. ./.:4:45,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,133:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.34:1.000:. ./.:4:54,132:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,99:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,129:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.60:1.000:. ./.:4:28,90:.:-1.28:1.000:. ./.:4:35,146:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,164:.: 1.35:1.000:. ./.:4:40,100:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,145:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.24:1.000:. ./.:4:49,122:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.42:1.000:. ./.:4:63,155:.: 1.25:1.000:. ./.:4:31,59:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,88:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,120:.: 0.04:1.000:. ./.:4:52,129:.: 0.32:1.000:. ./.:4:37,109:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,208:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.39:1.000:. ./.:4:39,121:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,253:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.24:0.999:. ./.:4:51,142:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.39:1.000:. ./.:4:33,84:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.01:1.000:. ./.:4:24,121:.:-0.60:1.000:. ./.:4:50,154:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.57:1.000:. ./.:4:55,146:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.80:1.000:. ./.:4:42,118:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,149:.: 0.87:1.000:. ./.:5:0,145:.:-0.60:0.982:. ./.:4:47,112:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.42:1.000:. ./.:4:47,110:.:-0.29:1.000:. ./.:4:42,112:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,117:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,175:.: 0.19:1.000:. ./.:4:36,93:.:-1.00:1.000:. ./.:4:46,153:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,234:.: 1.66:1.000:. ./.:3:52,87:.:-0.75:1.000:. ./.:4:52,141:.: 0.62:1.000:. ./.:4:53,129:.: 0.34:1.000:. ./.:4:57,136:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,215:.: 1.18:1.000:. ./.:4:52,134:.: 0.44:1.000:. ./.:4:27,53:.:-2.24:1.000:. ./.:4:30,87:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,222:.: 1.35:1.000:. ./.:4:44,138:.: 0.34:1.000:. ./.:4:53,160:.: 1.13:1.000:. ./.:4:54,133:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,183:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,209:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.32:1.000:. ./.:4:47,137:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,105:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.21:0.999:. ./.:4:43,122:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,113:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,215:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,213:.: 1.13:1.000:. ./.:4:57,112:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.67:1.000:. ./.:4:57,175:.: 1.61:1.000:. ./.:4:68,164:.: 1.61:1.000:. ./.:4:45,90:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.26:1.000:. -chr5.1 6390330 chr5.1_006390330 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:3,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:5,7:.: 1.07:1.000:. ./.:4:4,14:.: 2.61:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,6:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:0.996:. ./.:4:3,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,18:.: 2.61:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:5,10:.: 1.84:1.000:. ./.:4:2,5:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:4,9:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,12:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:3:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,14:.: 1.58:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,5:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:6:0,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,4:.: 0.05:0.997:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,8:.: 0.30:1.000:. ./.:4:2,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,12:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,8:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,22:.: 3.63:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.98:0.999:. ./.:4:2,5:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,15:.: 1.84:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,10:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,8:.: 0.30:1.000:. ./.:5:0,1:.:-1.75:0.982:. ./.:4:0,2:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:2,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:3:2,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,8:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,12:.: 1.07:1.000:. ./.:4:2,10:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,17:.: 2.86:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,12:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,10:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,14:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.49:1.000:. ./.:4:2,10:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.33:0.999:. ./.:4:3,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,20:.: 3.12:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,8:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,16:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,12:.: 1.07:1.000:. ./.:4:2,11:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,15:.: 2.10:1.000:. ./.:4:3,5:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.72:1.000:. -chr5.1 6512241 chr5.1_006512241 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:198,72:.: 0.25:1.000:. ./.:4:175,73:.:-0.15:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:146,170:.: 1.08:1.000:. ./.:4:266,88:.: 1.76:1.000:. ./.:4:33,136:.:-1.57:1.000:. ./.:4:206,83:.: 0.59:1.000:. ./.:4:129,168:.: 0.73:1.000:. ./.:4:61,31:.:-2.96:1.000:. ./.:4:86,46:.:-2.24:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:203,71:.: 0.32:1.000:. ./.:4:125,156:.: 0.45:1.000:. ./.:4:128,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:239,100:.: 1.49:0.996:. ./.:4:186,70:.: 0.00:1.000:. ./.:4:250,92:.: 1.54:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:61,44:.:-2.72:1.000:. ./.:4:197,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:189,88:.: 0.37:1.000:. ./.:4:106,182:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,28:.:-3.34:1.000:. ./.:4:233,87:.: 1.15:1.000:. ./.:4:218,74:.: 0.64:1.000:. ./.:4:199,78:.: 0.37:1.000:. ./.:4:140,161:.: 0.81:1.000:. ./.:4:214,78:.: 0.64:1.000:. ./.:4:217,80:.: 0.73:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,21:.:-3.32:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.85:1.000:. ./.:3:45,0:.:-3.80:1.000:. ./.:4:229,78:.: 0.91:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:147,176:.: 1.20:1.000:. ./.:4:221,95:.: 1.08:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:204,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:225,88:.: 1.02:1.000:. ./.:4:168,216:.: 2.30:1.000:. ./.:4:185,83:.: 0.21:1.000:. ./.:4:156,160:.: 1.08:1.000:. ./.:4:179,82:.: 0.09:1.000:. ./.:4:235,110:.: 1.60:1.000:. ./.:4:167,65:.:-0.44:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:167,64:.:-0.45:1.000:. ./.:4:135,168:.: 0.84:1.000:. ./.:4:181,79:.: 0.07:1.000:. ./.:4:159,162:.: 1.17:1.000:. ./.:4:187,75:.: 0.10:1.000:. ./.:6:106,93:.:-1.03:1.000:. ./.:4:129,157:.: 0.54:1.000:. ./.:4:177,75:.:-0.08:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:125,155:.: 0.43:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:193,77:.: 0.25:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:120,181:.: 0.81:0.997:. ./.:4:159,81:.:-0.29:1.000:. ./.:4:204,86:.: 0.61:1.000:. ./.:4:117,53:.:-1.55:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:173,165:.: 1.47:1.000:. ./.:4:114,179:.: 0.66:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:169,75:.:-0.22:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:197,71:.: 0.21:1.000:. ./.:4:208,87:.: 0.70:1.000:. ./.:4:131,64:.:-1.10:1.000:. ./.:4:196,72:.: 0.21:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:104,123:.:-0.53:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:188,93:.: 0.45:1.000:. ./.:4:131,59:.:-1.19:1.000:. ./.:4:147,72:.:-0.67:1.000:. ./.:4:155,55:.:-0.83:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:85,143:.:-0.51:1.000:. ./.:4:122,142:.: 0.14:1.000:. ./.:4:224,94:.: 1.11:1.000:. ./.:4:142,60:.:-0.98:1.000:. ./.:4:138,157:.: 0.70:1.000:. ./.:4:206,102:.: 0.93:1.000:. ./.:4:128,77:.:-0.92:1.000:. ./.:4:181,75:.: 0.00:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:168,82:.:-0.11:1.000:. ./.:4:110,56:.:-1.63:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:127,57:.:-1.30:1.000:. ./.:4:142,75:.:-0.71:1.000:. ./.:4:145,63:.:-0.87:1.000:. ./.:4:125,132:.: 0.01:1.000:. ./.:4:108,149:.: 0.01:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:111,134:.:-0.20:1.000:. ./.:4:256,132:.: 2.37:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.05:0.999:. ./.:4:193,79:.: 0.28:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:89,139:.:-0.51:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:147,62:.:-0.85:1.000:. ./.:4:112,151:.: 0.12:1.000:. ./.:4:182,79:.: 0.09:1.000:. ./.:4:166,66:.:-0.44:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:197,67:.: 0.14:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:156,75:.:-0.45:1.000:. ./.:4:145,61:.:-0.90:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:181,87:.: 0.21:1.000:. ./.:4:188,93:.: 0.45:1.000:. ./.:5:162,48:.:-0.83:0.982:. ./.:4:212,88:.: 0.79:1.000:. ./.:4:168,70:.:-0.33:1.000:. ./.:4:207,90:.: 0.73:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,51:.:-1.32:1.000:. ./.:4:107,122:.:-0.49:1.000:. ./.:4:94,135:.:-0.49:1.000:. ./.:4:184,72:.: 0.00:1.000:. ./.:4:132,81:.:-0.78:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:141,62:.:-0.96:1.000:. ./.:4:222,93:.: 1.06:1.000:. ./.:4:219,90:.: 0.95:1.000:. ./.:3:79,153:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,96:.:-0.08:1.000:. ./.:4:132,180:.: 1.00:1.000:. ./.:4:192,81:.: 0.30:1.000:. ./.:4:211,89:.: 0.79:1.000:. ./.:4:162,150:.: 1.00:1.000:. ./.:4:24,57:.:-3.16:1.000:. ./.:4:106,128:.:-0.40:1.000:. ./.:4:220,84:.: 0.86:1.000:. ./.:4:199,72:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,182:.: 0.68:1.000:. ./.:4:170,74:.:-0.22:1.000:. ./.:4:182,62:.:-0.22:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:193,72:.: 0.16:1.000:. ./.:4:225,84:.: 0.95:1.000:. ./.:4:192,79:.: 0.27:1.000:. ./.:4:168,73:.:-0.27:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:121,146:.: 0.19:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:174,75:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,66:.:-0.62:1.000:. ./.:4:183,57:.:-0.29:1.000:. ./.:4:178,75:.:-0.06:1.000:. ./.:4:185,81:.: 0.18:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:217,85:.: 0.82:1.000:. ./.:4:155,170:.: 1.24:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:161,223:.: 2.30:1.000:. ./.:4:224,97:.: 1.17:1.000:. ./.:4:148,72:.:-0.65:1.000:. ./.:4:195,68:.: 0.12:1.000:. -chr5.1 6720739 chr5.1_006720739 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:73,36:0.30:-0.07:1.000:0.982 0/0/1/1:4:48,56:0.49:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,71:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,25:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,146:0.84: 1.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,35:0.26: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,30:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,30:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,25:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.31:-2.91:1.000:0.979 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-3.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,33:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,62:0.65:-0.65:1.000:0.761 0/0/0/1:4:87,29:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,93:0.56: 1.41:1.000:0.969 0/1/1/1:4:28,93:0.74: 0.31:0.996:0.999 0/0/1/1:4:61,77:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,127:0.69: 2.12:1.000:0.966 0/0/0/1:4:116,46:0.26: 1.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,15:0.68:-2.91:1.000:0.959 0/0/0/1:4:99,35:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,59:0.43: 0.51:1.000:0.935 0/0/1/1:4:35,45:0.52:-1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,7:0.67:-3.27:1.000:0.907 0/0/1/1:4:49,68:0.54: 0.18:1.000:0.988 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,40:0.29: 0.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:82,39:0.30: 0.31:1.000:0.988 0/0/0/1:4:78,35:0.28: 0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:61,26:0.27:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,61:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-3.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.24:-2.85:1.000:1.000 0/0/1:3:5,5:0.46:-3.27:1.000:0.941 0/0/1/1:4:50,57:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,66:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,37:0.30: 0.09:1.000:0.987 0/0/0/1:4:70,26:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,107:0.74: 0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,57:0.46: 0.09:1.000:0.987 0/0/0/1:4:103,30:0.21: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,39:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,55:0.45: 0.02:1.000:0.980 0/0/0/1:4:99,22:0.17: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,34:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,36:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,32:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,35:0.32:-0.30:1.000:0.965 0/1/1/1:4:45,90:0.63: 0.76:1.000:0.575 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,40:0.24: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,26:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,39:0.29: 0.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:44,93:0.64: 0.83:1.000:0.734 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,30:0.29:-0.53:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,97:0.70: 0.70:1.000:0.984 0/0/0/1/1/1:6:52,47:0.44:-0.40:1.000:0.644 0/0/1/1:4:52,60:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,32:0.21: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,72:0.47: 0.96:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,61:0.60:-0.53:1.000:0.751 0/0/0/1:4:90,26:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,25:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,31:0.47:-1.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:76,22:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,105:0.84: 0.28:0.997:0.993 0/0/1/1:4:58,67:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,50:0.58:-0.98:1.000:0.923 0/0/1/1:4:54,74:0.54: 0.54:1.000:0.990 0/0/0/1:4:82,28:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,81:0.71:-0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,41:0.44:-0.82:1.000:0.962 0/0/0/1:4:80,44:0.33: 0.41:1.000:0.937 0/0/1/1:4:68,65:0.45: 0.70:1.000:0.978 0/0/0/1:4:99,42:0.27: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,47:0.33: 0.57:1.000:0.901 0/0/1/1:4:49,56:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,31:0.22: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,43:0.25: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,49:0.55:-0.91:1.000:0.981 0/0/1/1:4:51,52:0.46:-0.27:1.000:0.989 0/0/0/1:4:103,35:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,25:0.27:-0.82:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,30:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,53:0.43: 0.02:1.000:0.956 0/0/0/1:4:93,27:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,24:0.33:-1.46:1.000:0.904 0/0/0/1:4:68,42:0.35:-0.04:1.000:0.789 0/0/0/1:4:96,33:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,46:0.52:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,27:0.27:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,50:0.43:-0.14:1.000:0.943 0/0/0/1:4:68,30:0.28:-0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,33:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,77:0.45: 1.51:1.000:0.977 0/0/0/1:4:77,52:0.37: 0.57:1.000:0.565 0/0/0/1:4:31,19:0.35:-1.98:1.000:0.804 0/0/1/1:4:72,57:0.41: 0.57:1.000:0.833 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,64:0.48: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,39:0.53:-1.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,48:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,47:0.42:-0.30:1.000:0.924 0/0/0/1:4:93,51:0.33: 1.05:1.000:0.939 0/0/1/1:4:74,97:0.52: 1.93:1.000:0.994 0/0/0/1:4:111,36:0.23: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,32:0.26:-0.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,103:0.71: 0.89:1.000:0.992 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.22:0.999:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,33:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,30:0.20: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,59:0.63:-0.72:1.000:0.521 0/0/0/1:4:75,25:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,60:0.43: 0.57:1.000:0.937 0/0/0/1:4:78,30:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,69:0.54: 0.22:1.000:0.986 0/0/0/1:4:93,35:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,79:0.56: 0.64:1.000:0.963 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,27:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,68:0.46: 0.76:1.000:0.989 0/0/0/1:4:93,27:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,20:0.23:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,27:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,71:0.58: 0.09:1.000:0.899 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:60,54:0.43: 0.09:0.982:0.931 0/0/1/1:4:31,56:0.61:-0.78:1.000:0.734 0/0/1/1:4:70,64:0.44: 0.73:1.000:0.964 0/0/1/1:4:89,95:0.47: 2.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,64:0.53: 0.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,36:0.31:-0.14:1.000:0.975 0/0/0/1:4:56,36:0.36:-0.62:1.000:0.699 0/0/1/1:4:36,65:0.61:-0.33:1.000:0.735 0/0/1/1:4:51,83:0.58: 0.73:1.000:0.915 0/0/1/1:4:47,69:0.55: 0.15:1.000:0.976 0/0/0/1:4:81,30:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,41:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,128:0.76: 1.67:1.000:1.000 0/1/1:3:12,57:0.80:-1.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,84:0.61: 0.57:1.000:0.643 0/0/0/1:4:67,39:0.34:-0.17:1.000:0.883 0/1/1/1:4:37,117:0.73: 1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,72:0.57: 0.22:1.000:0.947 0/0/0/0:4:13,1:0.07:-3.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,22:0.29:-1.36:1.000:0.990 0/1/1/1:4:30,96:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,29:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,70:0.53: 0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:71,32:0.29:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,29:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:132,1:0.01: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,46:0.44:-0.49:1.000:0.966 0/0/0/1:4:78,27:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,31:0.21: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,57:0.38: 0.86:1.000:0.556 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,20:0.21:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,35:0.28: 0.12:0.999:0.996 0/0/1/1:4:39,66:0.59:-0.20:1.000:0.865 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,49:0.47:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:31,44:0.54:-1.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:61,56:0.44: 0.18:1.000:0.965 0/0/0/1:4:82,29:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,60:0.55:-0.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:53,53:0.46:-0.17:1.000:0.987 0/0/0/1:4:97,35:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,80:0.52: 1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,84:0.64: 0.41:1.000:0.717 0/0/0/1:4:86,29:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,81:0.51: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,76:0.59: 0.31:1.000:0.868 0/0/0/1:4:92,47:0.31: 0.89:1.000:0.973 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:81,95:0.49: 2.09:1.000:0.997 -chr5.1 6842304 chr5.1_006842304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,20:.: 0.10:1.000:. ./.:4:66,24:.:-0.91:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:73,50:.: 0.28:1.000:. ./.:4:142,31:.: 2.08:1.000:. ./.:4:13,35:.:-2.43:1.000:. ./.:4:103,18:.: 0.21:1.000:. ./.:4:67,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,8:.:-1.13:1.000:. ./.:4:57,24:.:-1.24:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:85,16:.:-0.52:1.000:. ./.:4:70,54:.: 0.31:1.000:. ./.:4:50,52:.:-0.48:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:135,19:.: 1.39:0.996:. ./.:4:55,50:.:-0.37:1.000:. ./.:4:128,33:.: 1.65:1.000:. ./.:4:188,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:65,15:.:-1.27:1.000:. ./.:4:88,21:.:-0.23:1.000:. ./.:4:106,22:.: 0.46:1.000:. ./.:4:67,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:55,12:.:-1.74:1.000:. ./.:4:101,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:115,21:.: 0.75:1.000:. ./.:4:67,16:.:-1.16:1.000:. ./.:4:81,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:94,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,20:.: 0.28:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:84,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.70:1.000:. ./.:3:37,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:89,22:.:-0.16:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:85,70:.: 1.43:1.000:. ./.:4:128,33:.: 1.65:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:71,26:.:-0.66:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:100,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:103,36:.: 0.85:1.000:. ./.:4:62,17:.:-1.31:1.000:. ./.:4:90,65:.: 1.43:1.000:. ./.:4:90,13:.:-0.44:1.000:. ./.:4:125,18:.: 1.00:1.000:. ./.:4:70,15:.:-1.09:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:78,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:61,49:.:-0.19:1.000:. ./.:4:90,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:75,47:.: 0.24:1.000:. ./.:4:101,18:.: 0.13:1.000:. ./.:6:59,26:.:-1.09:1.000:. ./.:4:62,24:.:-1.06:1.000:. ./.:4:82,27:.:-0.23:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:67,49:.: 0.02:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:90,22:.:-0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:60,40:.:-0.55:0.997:. ./.:4:56,23:.:-1.31:1.000:. ./.:4:122,27:.: 1.21:1.000:. ./.:4:66,14:.:-1.27:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:70,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,37:.:-0.80:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:80,14:.:-0.77:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:127,35:.: 1.68:1.000:. ./.:4:118,25:.: 1.00:1.000:. ./.:4:62,14:.:-1.42:1.000:. ./.:4:103,34:.: 0.78:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:55,38:.:-0.80:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:114,33:.: 1.14:1.000:. ./.:4:65,14:.:-1.31:1.000:. ./.:4:86,23:.:-0.23:1.000:. ./.:4:99,29:.: 0.46:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:40,30:.:-1.63:1.000:. ./.:4:50,32:.:-1.20:1.000:. ./.:4:97,25:.: 0.24:1.000:. ./.:4:88,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:82,64:.: 1.11:1.000:. ./.:4:91,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:82,19:.:-0.52:1.000:. ./.:4:79,24:.:-0.44:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:132,30:.: 1.68:1.000:. ./.:4:41,10:.:-2.32:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,18:.:-1.09:1.000:. ./.:4:72,19:.:-0.88:1.000:. ./.:4:91,21:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,59:.: 0.67:1.000:. ./.:4:75,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:56,26:.:-1.20:1.000:. ./.:4:144,34:.: 2.26:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:100,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:157,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:61,38:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:129,31:.: 1.61:1.000:. ./.:4:54,37:.:-0.88:1.000:. ./.:4:111,15:.: 0.39:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:89,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:63,25:.:-0.98:1.000:. ./.:4:69,19:.:-0.98:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:84,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:101,22:.: 0.28:1.000:. ./.:5:57,27:.:-1.13:0.982:. ./.:4:82,12:.:-0.77:1.000:. ./.:4:84,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:96,39:.: 0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:84,16:.:-0.55:1.000:. ./.:4:43,43:.:-1.06:1.000:. ./.:4:69,33:.:-0.48:1.000:. ./.:4:99,29:.: 0.46:1.000:. ./.:4:73,27:.:-0.55:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:89,13:.:-0.48:1.000:. ./.:4:138,28:.: 1.83:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.75:1.000:. ./.:3:44,47:.:-0.88:1.000:. ./.:4:95,20:.:-0.01:1.000:. ./.:4:91,59:.: 1.25:1.000:. ./.:4:82,13:.:-0.73:1.000:. ./.:4:133,29:.: 1.68:1.000:. ./.:4:57,34:.:-0.88:1.000:. ./.:4:27,24:.:-2.32:1.000:. ./.:4:28,16:.:-2.57:1.000:. ./.:4:89,17:.:-0.34:1.000:. ./.:4:94,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:78,57:.: 0.71:1.000:. ./.:4:119,25:.: 1.03:1.000:. ./.:4:61,21:.:-1.20:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,26:.: 0.31:1.000:. ./.:4:104,17:.: 0.21:1.000:. ./.:4:109,29:.: 0.82:1.000:. ./.:4:84,23:.:-0.30:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:57,28:.:-1.09:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,19:.:-0.95:1.000:. ./.:4:83,17:.:-0.55:1.000:. ./.:4:66,20:.:-1.06:1.000:. ./.:4:87,14:.:-0.52:1.000:. ./.:4:117,24:.: 0.93:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:186,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:144,28:.: 2.04:1.000:. ./.:4:57,41:.:-0.62:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:81,50:.: 0.57:1.000:. ./.:4:111,21:.: 0.60:1.000:. ./.:4:86,20:.:-0.34:1.000:. ./.:4:95,25:.: 0.17:1.000:. -chr5.1 6926839 chr5.1_006926839 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:190,188:0.49: 1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,132:0.55:-0.65:1.000:0.978 0/0/0/1:4:195,91:0.32: 0.12:1.000:0.961 0/0/1/1:4:140,131:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,204:0.53: 1.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:165,148:0.47: 0.55:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,75:0.50:-2.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,148:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,76:0.29:-0.22:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-2.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,77:0.69:-2.70:1.000:0.978 0/1/1/1:4:61,217:0.78:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,167:0.53: 0.54:1.000:0.992 0/0/0/1:4:235,88:0.27: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,205:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:262,90:0.26: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:221,79:0.26: 0.34:0.996:0.998 0/0/0/1:4:236,77:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,193:0.50: 1.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:250,84:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:115,1:0.01:-2.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,73:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,91:0.28: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:143,141:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,31:0.48:-3.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,233:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,234:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,135:0.47: 0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:73,248:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,199:0.78:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,141:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:174,70:0.29:-0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:61,22:0.26:-3.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,92:0.68:-2.31:1.000:0.956 0/0/1:3:33,30:0.47:-3.47:1.000:0.863 0/0/0/0:4:256,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,75:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,173:0.53: 0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:171,169:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,164:0.55: 0.29:1.000:0.981 0/0/1/1:4:130,150:0.53: 0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:230,74:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,173:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:226,78:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,213:0.72: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:153,152:0.49: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,165:0.46: 1.23:1.000:0.988 0/1/1/1:4:40,123:0.76:-1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,222:0.72: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:220,82:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,205:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:278,90:0.24: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,130:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,178:0.52: 0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:77,227:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,210:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,195:0.71:-0.06:1.000:0.991 0/1/1/1:4:75,220:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,68:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:151,95:0.38:-0.53:1.000:0.759 0/0/1/1:4:114,134:0.54:-0.49:1.000:0.989 0/0/1/1:4:121,135:0.52:-0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:219,89:0.29: 0.47:1.000:0.993 0/1/1/1:4:64,225:0.78: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,96:0.28: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,235:0.74: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,108:0.52:-1.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:213,77:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:151,138:0.47: 0.17:0.997:0.993 0/0/1/1:4:159,142:0.47: 0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:178,183:0.50: 1.32:1.000:0.997 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,327:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,151:0.47: 0.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:200,78:0.28:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:68,139:0.67:-1.15:1.000:0.924 0/1/1/1:4:62,182:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,142:0.52:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:224,76:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,252:0.77: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,118:0.53:-0.93:1.000:0.992 0/0/0/1:4:246,76:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,232:0.74: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,72:0.28:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,144:0.54:-0.20:1.000:0.989 0/0/0/0:4:309,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,86:0.48:-1.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,122:0.46:-0.22:1.000:0.986 0/0/1/1:4:138,133:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,113:0.48:-0.69:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,41:0.24:-1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,133:0.47: 0.05:1.000:0.991 0/1/1/1:4:74,221:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,132:0.54:-0.57:1.000:0.988 0/0/1/1:4:154,149:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:228,74:0.25: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,127:0.52:-0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,59:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,139:0.48: 0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:63,214:0.77:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,67:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,88:0.48:-1.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:176,52:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,108:0.53:-1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:140,143:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,68:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:240,85:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,291:0.73: 1.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,152:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,65:0.23: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,93:0.24: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,130:0.46: 0.00:0.999:0.989 0/0/1/1:4:136,192:0.58: 0.79:1.000:0.902 0/0/0/1:4:149,46:0.24:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,152:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,152:0.77:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,129:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,71:0.28:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,132:0.52:-0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:172,127:0.42: 0.33:1.000:0.921 0/0/1/1:4:183,151:0.45: 0.89:1.000:0.979 0/0/1/1:4:172,151:0.46: 0.71:1.000:0.990 0/1/1/1:4:63,229:0.78: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,219:0.70: 0.57:1.000:0.983 0/1/1/1:4:71,236:0.77: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,148:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:178,55:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,46:0.24:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,125:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,192:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,180:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/0/1:5:218,45:0.17:-0.25:0.982:0.999 0/1/1/1:4:77,210:0.73: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:262,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,220:0.52: 2.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:92,241:0.72: 0.87:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,253:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,148:0.76:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,208:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,77:0.27: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,159:0.53: 0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:159,129:0.44: 0.15:1.000:0.974 0/0/1/1:4:99,113:0.53:-1.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:178,187:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:311,100:0.24: 2.13:1.000:1.000 0/0/1:3:154,89:0.36:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,235:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,83:0.24: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,257:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,97:0.26: 1.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,132:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,49:0.43:-2.67:1.000:0.948 0/1/1/1:4:56,144:0.72:-1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:239,92:0.28: 0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,249:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:276,101:0.27: 1.58:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,322:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,117:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,169:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,148:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,146:0.57:-0.41:1.000:0.934 0/0/1/1:4:138,136:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,147:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,145:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,163:0.56: 0.17:1.000:0.965 0/0/0/1:4:191,61:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,240:0.77: 0.57:0.999:1.000 0/0/0/1:4:202,62:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,134:0.51:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:232,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,239:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,156:0.53: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:119,121:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,180:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,174:0.53: 0.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:273,91:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,74:0.25: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,151:0.54: 0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:136,147:0.52: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,194:0.56: 1.02:1.000:0.959 0/0/1/1:4:188,189:0.50: 1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,136:0.52:-0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,166:0.47: 1.15:1.000:0.992 -chr5.1 7094820 chr5.1_007094820 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:219,161:.: 0.17:1.000:. ./.:4:270,72:.:-0.14:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:305,168:.: 0.92:1.000:. ./.:4:249,262:.: 1.23:1.000:. ./.:4:293,395:.: 2.66:1.000:. ./.:4:181,124:.:-0.44:1.000:. ./.:4:221,161:.: 0.19:1.000:. ./.:4:235,73:.:-0.41:1.000:. ./.:4:61,66:.:-1.88:1.000:. ./.:4:52,49:.:-2.09:1.000:. ./.:4:302,76:.: 0.15:1.000:. ./.:4:211,188:.: 0.32:1.000:. ./.:4:255,279:.: 1.42:1.000:. ./.:4:233,228:.: 0.82:1.000:. ./.:4:306,209:.: 1.26:1.000:. ./.:4:284,87:.: 0.10:0.996:. ./.:4:307,93:.: 0.33:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:451,218:.: 2.51:1.000:. ./.:4:79,24:.:-2.07:1.000:. ./.:4:324,103:.: 0.55:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:239,152:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:232,369:.: 1.96:1.000:. ./.:4:281,276:.: 1.60:1.000:. ./.:4:191,74:.:-0.76:1.000:. ./.:4:254,178:.: 0.59:1.000:. ./.:4:242,162:.: 0.36:1.000:. ./.:4:215,152:.: 0.06:1.000:. ./.:4:269,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:47,34:.:-2.25:1.000:. ./.:4:77,92:.:-1.54:1.000:. ./.:3:46,12:.:-2.44:1.000:. ./.:4:300,99:.: 0.32:1.000:. ./.:4:305,82:.: 0.23:1.000:. ./.:4:301,84:.: 0.21:1.000:. ./.:4:194,58:.:-0.87:1.000:. ./.:4:282,76:.:-0.01:1.000:. ./.:4:209,58:.:-0.74:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:231,213:.: 0.69:1.000:. ./.:4:210,77:.:-0.58:1.000:. ./.:4:163,122:.:-0.60:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:320,219:.: 1.46:1.000:. ./.:4:83,52:.:-1.81:1.000:. ./.:4:153,262:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,147:.:-0.49:1.000:. ./.:4:127,126:.:-0.86:1.000:. ./.:4:305,193:.: 1.12:1.000:. ./.:4:168,127:.:-0.52:1.000:. ./.:4:249,259:.: 1.21:1.000:. ./.:4:206,148:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,46:.:-1.40:1.000:. ./.:4:169,207:.: 0.14:1.000:. ./.:4:133,173:.:-0.43:1.000:. ./.:4:212,140:.:-0.06:1.000:. ./.:6:143,118:.:-0.79:1.000:. ./.:4:163,200:.: 0.03:1.000:. ./.:4:232,144:.: 0.14:1.000:. ./.:4:203,133:.:-0.19:1.000:. ./.:4:99,144:.:-0.94:1.000:. ./.:4:257,160:.: 0.47:1.000:. ./.:4:155,110:.:-0.76:1.000:. ./.:4:222,122:.:-0.12:1.000:. ./.:4:225,61:.:-0.59:1.000:. ./.:4:165,275:.: 0.65:0.996:. ./.:4:282,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:133,185:.:-0.33:1.000:. ./.:4:205,90:.:-0.52:1.000:. ./.:4:208,73:.:-0.63:1.000:. ./.:4:226,291:.: 1.28:1.000:. ./.:4:200,65:.:-0.76:1.000:. ./.:4:240,64:.:-0.45:1.000:. ./.:4:133,128:.:-0.79:1.000:. ./.:4:218,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:228,68:.:-0.51:1.000:. ./.:4:189,194:.: 0.19:1.000:. ./.:4:163,72:.:-1.00:1.000:. ./.:4:217,199:.: 0.46:1.000:. ./.:4:240,163:.: 0.36:1.000:. ./.:4:178,71:.:-0.89:1.000:. ./.:4:226,182:.: 0.40:1.000:. ./.:4:251,149:.: 0.33:1.000:. ./.:4:202,95:.:-0.50:1.000:. ./.:4:191,110:.:-0.47:1.000:. ./.:4:211,146:.:-0.02:1.000:. ./.:4:245,207:.: 0.75:1.000:. ./.:4:181,226:.: 0.39:1.000:. ./.:4:117,161:.:-0.66:1.000:. ./.:4:171,168:.:-0.16:1.000:. ./.:4:172,183:.:-0.03:1.000:. ./.:4:199,163:.: 0.02:1.000:. ./.:4:224,131:.:-0.03:1.000:. ./.:4:126,142:.:-0.74:1.000:. ./.:4:161,51:.:-1.19:1.000:. ./.:4:214,61:.:-0.68:1.000:. ./.:4:204,272:.: 0.95:1.000:. ./.:4:144,192:.:-0.19:1.000:. ./.:4:219,66:.:-0.60:1.000:. ./.:4:116,98:.:-1.17:1.000:. ./.:4:214,186:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,160:.:-0.69:1.000:. ./.:4:153,213:.: 0.06:1.000:. ./.:4:154,49:.:-1.26:1.000:. ./.:4:315,175:.: 1.06:1.000:. ./.:4:346,304:.: 2.35:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:149,127:.:-0.67:1.000:. ./.:4:369,197:.: 1.67:1.000:. ./.:4:159,76:.:-1.00:0.999:. ./.:4:178,234:.: 0.43:1.000:. ./.:4:154,142:.:-0.51:1.000:. ./.:4:231,64:.:-0.52:1.000:. ./.:4:168,74:.:-0.95:1.000:. ./.:4:177,185:.: 0.02:1.000:. ./.:4:190,123:.:-0.37:1.000:. ./.:4:125,194:.:-0.32:1.000:. ./.:4:179,137:.:-0.35:1.000:. ./.:4:174,137:.:-0.39:1.000:. ./.:4:233,120:.:-0.05:1.000:. ./.:4:263,202:.: 0.86:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:216,139:.:-0.03:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:126,49:.:-1.49:1.000:. ./.:4:157,105:.:-0.79:1.000:. ./.:4:149,126:.:-0.68:1.000:. ./.:4:249,182:.: 0.58:1.000:. ./.:5:147,45:.:-1.35:0.982:. ./.:4:169,258:.: 0.55:1.000:. ./.:4:223,129:.:-0.06:1.000:. ./.:4:397,231:.: 2.18:1.000:. ./.:4:233,234:.: 0.87:1.000:. ./.:4:115,119:.:-1.01:1.000:. ./.:4:121,121:.:-0.95:1.000:. ./.:4:116,48:.:-1.58:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:192,119:.:-0.39:1.000:. ./.:4:260,97:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,120:.:-0.96:1.000:. ./.:4:256,289:.: 1.50:1.000:. ./.:4:381,184:.: 1.67:1.000:. ./.:3:168,274:.: 0.67:1.000:. ./.:4:203,245:.: 0.72:1.000:. ./.:4:266,268:.: 1.42:1.000:. ./.:4:185,136:.:-0.31:1.000:. ./.:4:379,117:.: 1.11:1.000:. ./.:4:253,240:.: 1.08:1.000:. ./.:4:32,52:.:-2.23:1.000:. ./.:4:206,284:.: 1.06:1.000:. ./.:4:317,195:.: 1.24:1.000:. ./.:4:226,169:.: 0.29:1.000:. ./.:4:252,223:.: 0.94:1.000:. ./.:4:285,325:.: 2.03:1.000:. ./.:4:298,96:.: 0.28:1.000:. ./.:4:315,268:.: 1.81:1.000:. ./.:4:320,72:.: 0.27:1.000:. ./.:4:237,129:.: 0.06:1.000:. ./.:4:246,64:.:-0.40:1.000:. ./.:4:287,242:.: 1.37:1.000:. ./.:4:333,179:.: 1.24:1.000:. ./.:4:229,159:.: 0.23:1.000:. ./.:4:270,158:.: 0.56:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:212,148:.: 0.01:1.000:. ./.:4:285,164:.: 0.73:1.000:. ./.:4:265,65:.:-0.23:1.000:. ./.:4:191,164:.:-0.03:1.000:. ./.:4:254,156:.: 0.41:1.000:. ./.:4:296,211:.: 1.20:1.000:. ./.:4:214,134:.:-0.09:1.000:. ./.:4:204,74:.:-0.66:1.000:. ./.:4:342,152:.: 1.09:1.000:. ./.:4:321,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:241,240:.: 0.99:1.000:. ./.:4:305,123:.: 0.56:1.000:. ./.:4:342,82:.: 0.53:1.000:. ./.:4:331,349:.: 2.60:1.000:. ./.:4:292,332:.: 2.14:1.000:. ./.:4:209,226:.: 0.61:1.000:. ./.:4:298,97:.: 0.29:1.000:. -chr5.1 7207661 chr5.1_007207661 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:0.996:. ./.:4:92,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.26:1.000:. ./.:3:62,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.24:1.000:. ./.:6:52,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:0.996:. ./.:4:67,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:124,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:117,2:.: 1.93:0.999:. ./.:4:101,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:122,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.40:1.000:. ./.:5:30,0:.:-1.75:0.982:. ./.:4:50,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.44:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:36,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.32:1.000:. -chr5.1 7401326 chr5.1_007401326 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:955,69:.: 1.74:1.000:. ./.:4:628,54:.: 0.10:1.000:. ./.:4:632,117:.: 0.42:1.000:. ./.:4:509,139:.:-0.06:1.000:. ./.:4:629,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:663,82:.: 0.41:1.000:. ./.:4:297,35:.:-1.57:1.000:. ./.:4:803,74:.: 1.04:1.000:. ./.:4:406,140:.:-0.55:1.000:. ./.:4:206,8:.:-2.14:1.000:. ./.:4:207,23:.:-2.06:1.000:. ./.:4:713,60:.: 0.54:1.000:. ./.:4:783,164:.: 1.37:1.000:. ./.:4:541,89:.:-0.15:1.000:. ./.:4:476,66:.:-0.57:1.000:. ./.:4:990,173:.: 2.41:1.000:. ./.:4:891,81:.: 1.49:0.996:. ./.:4:819,72:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1040,78:.: 2.19:1.000:. ./.:4:704,172:.: 1.03:1.000:. ./.:4:207,18:.:-2.08:1.000:. ./.:4:336,188:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1064,76:.: 2.30:1.000:. ./.:4:550,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:146,5:.:-2.44:1.000:. ./.:4:698,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:524,157:.: 0.10:1.000:. ./.:4:474,135:.:-0.25:1.000:. ./.:4:895,64:.: 1.43:1.000:. ./.:4:897,95:.: 1.59:1.000:. ./.:4:745,119:.: 0.97:1.000:. ./.:4:554,114:.: 0.04:1.000:. ./.:4:161,15:.:-2.32:1.000:. ./.:4:168,12:.:-2.30:1.000:. ./.:3:88,6:.:-2.71:1.000:. ./.:4:642,146:.: 0.61:1.000:. ./.:4:939,112:.: 1.87:1.000:. ./.:4:674,143:.: 0.75:1.000:. ./.:4:662,101:.: 0.49:1.000:. ./.:4:686,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:690,59:.: 0.42:1.000:. ./.:4:615,115:.: 0.33:1.000:. ./.:4:548,169:.: 0.27:1.000:. ./.:4:492,97:.:-0.34:1.000:. ./.:4:719,108:.: 0.80:1.000:. ./.:4:662,116:.: 0.56:1.000:. ./.:4:656,171:.: 0.80:1.000:. ./.:4:139,25:.:-2.37:1.000:. ./.:4:405,96:.:-0.76:1.000:. ./.:4:264,38:.:-1.71:1.000:. ./.:4:363,74:.:-1.07:1.000:. ./.:4:462,189:.:-0.04:1.000:. ./.:4:470,49:.:-0.68:1.000:. ./.:4:718,189:.: 1.18:1.000:. ./.:4:503,108:.:-0.24:1.000:. ./.:4:489,33:.:-0.66:1.000:. ./.:4:459,87:.:-0.55:1.000:. ./.:4:520,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:792,56:.: 0.90:1.000:. ./.:6:271,57:.:-1.59:1.000:. ./.:4:402,65:.:-0.93:1.000:. ./.:4:383,92:.:-0.89:1.000:. ./.:4:556,95:.:-0.04:1.000:. ./.:4:386,39:.:-1.13:1.000:. ./.:4:468,101:.:-0.44:1.000:. ./.:4:501,111:.:-0.23:1.000:. ./.:4:704,29:.: 0.35:1.000:. ./.:4:773,125:.: 1.14:1.000:. ./.:4:406,0:.:-1.22:0.996:. ./.:4:674,72:.: 0.41:1.000:. ./.:4:679,105:.: 0.59:1.000:. ./.:4:293,68:.:-1.43:1.000:. ./.:4:899,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:672,67:.: 0.38:1.000:. ./.:4:506,56:.:-0.47:1.000:. ./.:4:553,39:.:-0.33:1.000:. ./.:4:344,96:.:-1.05:1.000:. ./.:4:736,49:.: 0.60:1.000:. ./.:4:375,168:.:-0.56:1.000:. ./.:4:584,63:.:-0.06:1.000:. ./.:4:435,39:.:-0.89:1.000:. ./.:4:458,96:.:-0.51:1.000:. ./.:4:691,116:.: 0.70:1.000:. ./.:4:437,61:.:-0.78:1.000:. ./.:4:785,41:.: 0.79:1.000:. ./.:4:534,198:.: 0.34:1.000:. ./.:4:499,84:.:-0.37:1.000:. ./.:4:403,83:.:-0.83:1.000:. ./.:4:614,40:.:-0.03:1.000:. ./.:4:472,103:.:-0.41:1.000:. ./.:4:382,70:.:-1.00:1.000:. ./.:4:682,50:.: 0.34:1.000:. ./.:4:741,52:.: 0.63:1.000:. ./.:4:401,49:.:-1.01:1.000:. ./.:4:406,101:.:-0.73:1.000:. ./.:4:431,94:.:-0.65:1.000:. ./.:4:599,46:.:-0.07:1.000:. ./.:4:435,71:.:-0.74:1.000:. ./.:4:486,104:.:-0.34:1.000:. ./.:4:619,137:.: 0.46:1.000:. ./.:4:358,35:.:-1.28:1.000:. ./.:4:834,111:.: 1.36:1.000:. ./.:4:380,98:.:-0.87:1.000:. ./.:4:833,49:.: 1.06:1.000:. ./.:4:522,40:.:-0.47:1.000:. ./.:4:609,49:.:-0.01:1.000:. ./.:4:387,80:.:-0.93:1.000:. ./.:4:617,177:.: 0.64:1.000:. ./.:4:761,81:.: 0.87:1.000:. ./.:4:666,110:.: 0.55:1.000:. ./.:4:410,97:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1039,88:.: 2.23:1.000:. ./.:4:727,166:.: 1.11:0.999:. ./.:4:696,104:.: 0.67:1.000:. ./.:4:383,65:.:-1.02:1.000:. ./.:4:653,121:.: 0.54:1.000:. ./.:4:418,39:.:-0.97:1.000:. ./.:4:502,112:.:-0.22:1.000:. ./.:4:500,37:.:-0.59:1.000:. ./.:4:409,47:.:-0.98:1.000:. ./.:4:830,67:.: 1.13:1.000:. ./.:4:508,74:.:-0.37:1.000:. ./.:4:729,56:.: 0.60:1.000:. ./.:4:559,152:.: 0.24:1.000:. ./.:4:544,112:.:-0.02:1.000:. ./.:4:972,47:.: 1.72:1.000:. ./.:4:520,88:.:-0.25:1.000:. ./.:4:363,60:.:-1.14:1.000:. ./.:4:351,82:.:-1.09:1.000:. ./.:4:425,117:.:-0.57:1.000:. ./.:4:579,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:746,134:.: 1.05:1.000:. ./.:5:314,56:.:-1.39:0.982:. ./.:4:725,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:634,121:.: 0.45:1.000:. ./.:4:791,80:.: 1.01:1.000:. ./.:4:834,45:.: 1.05:1.000:. ./.:4:522,54:.:-0.40:1.000:. ./.:4:404,43:.:-1.02:1.000:. ./.:4:562,48:.:-0.24:1.000:. ./.:4:600,44:.:-0.08:1.000:. ./.:4:629,48:.: 0.08:1.000:. ./.:4:534,116:.:-0.05:1.000:. ./.:4:199,107:.:-1.70:1.000:. ./.:4:780,101:.: 1.06:1.000:. ./.:4:878,93:.: 1.49:1.000:. ./.:3:722,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:508,114:.:-0.18:1.000:. ./.:4:574,75:.:-0.05:1.000:. ./.:4:711,54:.: 0.50:1.000:. ./.:4:655,78:.: 0.35:1.000:. ./.:4:626,73:.: 0.19:1.000:. ./.:4:130,19:.:-2.45:1.000:. ./.:4:286,38:.:-1.61:1.000:. ./.:4:848,82:.: 1.29:1.000:. ./.:4:677,79:.: 0.46:1.000:. ./.:4:647,91:.: 0.37:1.000:. ./.:4:793,77:.: 1.00:1.000:. ./.:4:530,139:.: 0.04:1.000:. ./.:4:716,223:.: 1.33:1.000:. ./.:4:501,189:.: 0.14:1.000:. ./.:4:758,52:.: 0.72:1.000:. ./.:4:656,206:.: 0.97:1.000:. ./.:4:454,152:.:-0.26:1.000:. ./.:4:754,116:.: 1.00:1.000:. ./.:4:576,151:.: 0.32:1.000:. ./.:4:555,190:.: 0.41:1.000:. ./.:4:784,74:.: 0.95:0.999:. ./.:4:661,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:378,201:.:-0.39:1.000:. ./.:4:329,113:.:-1.04:1.000:. ./.:4:588,46:.:-0.13:1.000:. ./.:4:367,111:.:-0.87:1.000:. ./.:4:549,124:.: 0.06:1.000:. ./.:4:502,106:.:-0.25:1.000:. ./.:4:545,80:.:-0.17:1.000:. ./.:4:621,239:.: 0.96:1.000:. ./.:4:727,73:.: 0.67:1.000:. ./.:4:444,58:.:-0.76:1.000:. ./.:4:644,199:.: 0.87:1.000:. ./.:4:846,76:.: 1.25:1.000:. ./.:4:927,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:763,111:.: 1.02:1.000:. ./.:4:485,45:.:-0.62:1.000:. ./.:4:647,56:.: 0.20:1.000:. -chr5.1 7474818 chr5.1_007474818 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:143,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:118,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:131,1:.:-0.50:0.996:. ./.:4:129,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.04:1.000:. ./.:3:62,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:233,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:292,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:285,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:154,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:201,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.45:0.996:. ./.:4:125,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:284,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:194,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:234,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:220,2:.: 1.16:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:226,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:233,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:231,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.28:1.000:. ./.:5:172,0:.: 0.23:0.982:. ./.:4:187,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.53:1.000:. ./.:3:87,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.37:0.999:. ./.:4:106,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:158,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.17:1.000:. -chr5.1 7687763 chr5.1_007687763 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:167,155:0.50: 1.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,157:0.71: 0.47:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,174:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,133:0.69:-0.07:1.000:0.970 0/1/1/1:4:109,158:0.64: 0.81:1.000:0.728 0/0/1/1:4:175,148:0.48: 1.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,86:0.75:-1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,117:0.44: 1.24:1.000:0.973 0/1/1/1:4:71,151:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,34:0.31:-0.70:1.000:0.971 0/0/1/1:4:135,68:0.40:-0.24:1.000:0.810 0/0/1/1:4:147,144:0.51: 1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,137:0.48: 1.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:83,195:0.77: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,78:0.41: 0.17:1.000:0.844 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-0.94:0.996:1.000 0/0/1/1:4:98,110:0.56:-0.16:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,182:0.79: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,48:0.97:-2.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,233:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,143:0.69: 0.19:1.000:0.970 0/0/1/1:4:136,73:0.41:-0.14:1.000:0.873 0/1/1/1:4:3,10:0.83:-3.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,69:0.41:-0.25:1.000:0.842 0/0/1/1:4:157,119:0.46: 0.96:1.000:0.990 0/1/1/1:4:92,161:0.70: 0.58:1.000:0.988 0/0/1/1:4:187,90:0.40: 0.97:1.000:0.753 0/0/1/1:4:129,72:0.42:-0.27:1.000:0.902 0/1/1/1:4:59,142:0.78:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.46:-3.33:1.000:0.989 0/0/0/1:4:52,17:0.35:-2.43:1.000:0.832 0/1/1:3:12,20:0.69:-3.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,172:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,199:0.76: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,138:0.76:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,107:0.65:-0.61:1.000:0.765 0/1/1/1:4:82,192:0.77: 0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,218:1.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,121:0.62:-0.11:1.000:0.589 0/1/1/1:4:100,165:0.69: 0.78:1.000:0.966 0/0/1/1:4:94,126:0.62: 0.04:1.000:0.602 0/0/0/1:4:366,1:0.17: 2.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,125:0.72:-0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,102:0.60:-0.56:1.000:0.819 0/0/1/1:4:161,128:0.47: 1.17:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,257:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,116:0.46: 0.88:1.000:0.989 0/1/1/1:4:98,203:0.75: 1.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,175:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,76:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,118:0.45: 1.25:1.000:0.974 0/0/0/1:4:156,61:0.37:-0.01:1.000:0.594 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:57,118:0.75:-0.70:1.000:0.559 0/1/1/1:4:85,122:0.64:-0.17:1.000:0.691 0/0/1/1:4:86,95:0.55:-0.60:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,216:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,73:0.56:-1.32:1.000:0.962 0/1/1/1:4:89,161:0.71: 0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:78,137:0.71:-0.04:1.000:0.989 0/1/1/1:4:52,75:0.64:-1.48:1.000:0.709 0/1/1/1:4:74,172:0.77: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,94:0.58:-0.73:0.996:0.924 0/1/1/1:4:81,163:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:182,134:0.46: 1.61:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,70:0.36: 0.65:1.000:0.665 0/0/0/1:4:184,69:0.36: 0.58:1.000:0.662 1/1/1/1:4:0,222:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,80:0.61:-1.25:1.000:0.689 0/1/1/1:4:82,153:0.72: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,107:0.57:-0.30:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,205:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,69:0.38: 0.14:1.000:0.610 0/1/1/1:4:69,126:0.72:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,98:0.58:-0.61:1.000:0.918 0/0/1/1:4:94,120:0.60:-0.06:1.000:0.781 0/1/1/1:4:81,160:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,59:0.45:-1.17:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,271:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,83:0.61:-1.15:1.000:0.730 0/0/1/1:4:100,104:0.53:-0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:89,92:0.53:-0.60:1.000:0.992 0/1/1/1:4:86,168:0.74: 0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,138:0.82:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,61:0.37:-0.14:1.000:0.503 0/0/1/1:4:179,101:0.42: 1.02:1.000:0.909 0/1/1/1:4:76,142:0.72: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,171:0.78: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,195:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,119:0.45: 1.14:1.000:0.983 0/1/1/1:4:65,200:0.81: 0.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,201:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,190:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,54:0.40:-0.84:1.000:0.755 1/1/1/1:4:0,231:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,123:0.52: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,115:0.59:-0.16:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,152:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,91:0.59:-0.88:1.000:0.844 0/1/1/1:4:60,130:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,178:0.76: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,138:0.59: 0.55:1.000:0.885 0/1/1/1:4:101,189:0.73: 1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,158:0.69: 0.58:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,161:0.70: 0.61:0.999:0.983 0/0/1/1:4:202,133:0.44: 1.92:1.000:0.971 0/0/1/1:4:79,103:0.61:-0.58:1.000:0.711 0/1/1/1:4:104,182:0.70: 1.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:75,88:0.57:-0.89:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,178:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,101:0.66:-0.81:1.000:0.844 0/0/0/1:4:167,63:0.36: 0.20:1.000:0.653 0/1/1/1:4:103,181:0.71: 1.09:1.000:0.989 0/1/1/1:4:77,106:0.63:-0.56:1.000:0.515 0/1/1/1:4:81,112:0.63:-0.40:1.000:0.535 0/0/1/1:4:175,118:0.45: 1.24:1.000:0.975 0/0/1/1:4:86,108:0.60:-0.38:1.000:0.826 0/0/1/1:4:90,108:0.58:-0.32:1.000:0.913 0/1/1/1:4:81,193:0.78: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,165:0.80: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,156:0.78: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,82:0.43: 0.06:1.000:0.934 0/0/1/1:4:155,140:0.49: 1.27:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:59,119:0.75:-0.65:0.982:0.922 0/0/0/1:4:175,58:0.35: 0.25:1.000:0.819 1/1/1/1:4:0,236:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,134:0.57: 0.52:1.000:0.946 0/0/1/1:4:84,107:0.60:-0.43:1.000:0.787 0/0/0/1:4:180,74:0.37: 0.60:1.000:0.507 0/0/1/1:4:159,75:0.39: 0.27:1.000:0.724 0/1/1/1:4:82,129:0.67:-0.11:1.000:0.922 0/0/1/1:4:92,96:0.53:-0.48:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,121:0.63:-0.14:1.000:0.510 0/1/1/1:4:75,153:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,192:0.76: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,163:0.46: 2.66:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1:3:106,87:0.48:-0.40:1.000:0.824 0/0/1/1:4:165,156:0.50: 1.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,207:0.77: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,59:0.36: 0.01:1.000:0.678 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,102:0.56:-0.43:1.000:0.959 0/0/1/1:4:52,33:0.44:-2.17:1.000:0.961 0/0/1/1:4:116,55:0.39:-0.76:1.000:0.732 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,91:0.42: 0.55:1.000:0.914 0/1/1/1:4:106,205:0.74: 1.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,87:0.40: 0.73:1.000:0.795 0/0/1/1:4:89,117:0.61:-0.19:1.000:0.680 0/1/1/1:4:86,151:0.71: 0.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:59,138:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,100:0.61:-0.68:1.000:0.677 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,106:0.64:-0.61:1.000:0.683 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,126:0.45: 1.48:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,204:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,145:0.49: 1.43:0.999:0.996 0/0/1/1:4:191,93:0.40: 1.09:1.000:0.768 0/1/1/1:4:82,135:0.68:-0.01:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,184:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,83:0.64:-1.27:1.000:0.743 1/1/1/1:4:0,222:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,128:0.62: 0.07:1.000:0.533 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,92:0.63:-0.96:1.000:0.504 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,138:0.69: 0.04:1.000:0.976 0/1/1/1:4:81,158:0.74: 0.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:34,228:0.90: 0.73:1.000:0.837 0/0/1/1:4:102,121:0.58: 0.09:1.000:0.928 0/0/1/1:4:189,88:0.39: 0.97:1.000:0.705 0/0/1/1:4:182,173:0.50: 2.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,117:0.53: 0.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:89,199:0.77: 1.15:1.000:1.000 -chr5.1 7889756 chr5.1_007889756 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:125,106:0.46: 0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,175:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,161:0.68: 0.09:1.000:0.959 0/0/1/1:4:108,78:0.43:-0.65:1.000:0.945 0/1/1/1:4:65,283:0.78: 2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,79:0.41:-0.45:1.000:0.884 0/0/1/1:4:51,81:0.60:-1.64:1.000:0.799 0/0/1/1:4:103,86:0.46:-0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:72,108:0.59:-0.76:1.000:0.881 0/0/1/1:4:25,25:0.50:-3.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:81,4:0.05:-2.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,156:0.73:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,120:0.52: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:131,158:0.54: 1.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:86,123:0.58:-0.23:1.000:0.925 0/1/1/1:4:60,157:0.69:-0.09:1.000:0.980 1/1/1/1:4:1,248:1.00: 0.49:0.996:1.000 0/1/1/1:4:44,178:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,269:0.81: 1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,133:0.68:-0.64:1.000:0.963 0/1/1/1:4:31,65:0.65:-2.29:1.000:0.829 0/0/1/1:4:113,131:0.53: 0.40:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,282:1.00: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,186:0.80: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,25:0.53:-3.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,151:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,42:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,117:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,155:0.57: 0.80:1.000:0.941 0/1/1/1:4:28,133:0.80:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,95:0.47:-0.29:1.000:0.991 0/1/1/1:4:51,134:0.70:-0.67:1.000:0.981 0/0/1/1:4:11,8:0.43:-3.70:1.000:0.949 0/1/1/1:4:19,57:0.72:-2.66:1.000:0.995 0/1/1:3:8,8:0.50:-3.75:1.000:0.500 0/1/1/1:4:57,172:0.72: 0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,164:0.69: 0.15:1.000:0.966 0/0/1/1:4:116,108:0.48: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,84:0.41:-0.16:1.000:0.849 0/1/1/1:4:31,205:0.85: 0.26:1.000:0.992 1/1/1/1:4:1,241:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,122:0.63:-0.62:1.000:0.560 0/0/1/1:4:131,133:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,118:0.59:-0.47:1.000:0.871 0/1/1/1:4:61,214:0.74: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,77:0.42:-0.65:1.000:0.931 0/1/1/1:4:61,261:0.78: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,148:0.58: 0.48:1.000:0.895 0/0/1/1:4:126,88:0.42:-0.14:1.000:0.923 0/0/1/1:4:120,139:0.53: 0.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:148,51:0.29:-0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,140:0.53: 0.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,71:0.43:-0.93:1.000:0.935 0/0/1/1:4:143,121:0.46: 0.77:1.000:0.990 0/0/0/1:4:139,69:0.35:-0.25:1.000:0.765 0/1/1/1:4:66,147:0.67:-0.16:1.000:0.901 0/0/0/1:4:136,48:0.29:-0.69:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,109:0.57:-0.62:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,223:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:72,184:0.69: 0.62:1.000:0.899 0/1/1/1:4:54,232:0.78: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,171:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,198:0.73: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,172:0.65: 0.66:1.000:0.746 0/1/1/1:4:69,147:0.66:-0.11:1.000:0.851 0/0/1/1:4:136,76:0.38:-0.18:1.000:0.521 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,143:0.63:-0.03:1.000:0.572 0/1/1/1:4:57,204:0.75: 0.71:0.996:0.999 0/1/1/1:4:56,251:0.79: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,121:0.47: 0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,116:0.66:-0.93:1.000:0.837 1/1/1/1:4:1,195:0.99:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,200:0.75: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,305:0.79: 2.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,148:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,79:0.38:-0.05:1.000:0.546 1/1/1/1:4:1,263:1.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,157:0.57: 0.88:1.000:0.944 0/1/1/1:4:51,239:0.79: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,202:0.79: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,247:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,252:0.79: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,129:0.52: 0.40:1.000:0.994 1/1/1/1:4:1,213:0.99:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,248:0.75: 1.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,124:0.73:-1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,176:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,197:0.77: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,82:0.48:-0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,91:0.49:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,182:0.80:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,188:0.78: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,119:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,118:0.44: 1.00:1.000:0.959 0/0/1/1:4:113,125:0.52: 0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,92:0.44:-0.11:1.000:0.959 0/0/1/1:4:135,109:0.45: 0.40:1.000:0.983 0/0/1/1:4:129,143:0.52: 0.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:191,98:0.36: 1.22:1.000:0.696 0/0/1/1:4:100,109:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,235:0.75: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,77:0.47:-1.05:1.000:0.993 1/1/1/1:4:1,240:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,121:0.60:-0.44:1.000:0.817 0/1/1/1:4:56,212:0.75: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,110:0.58:-0.64:1.000:0.926 0/0/1/1:4:74,132:0.62:-0.29:1.000:0.535 0/1/1/1:4:50,216:0.78: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,110:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,151:0.53: 1.09:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,252:1.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,93:0.44:-0.14:0.999:0.971 0/0/1/1:4:116,90:0.44:-0.29:1.000:0.974 0/0/1/1:4:64,114:0.62:-0.80:1.000:0.538 0/0/1/1:4:144,92:0.40: 0.26:1.000:0.821 0/1/1/1:4:72,144:0.65:-0.11:1.000:0.746 0/0/1/1:4:105,122:0.53: 0.09:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,211:0.99:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,147:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,125:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,186:0.77: 0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,35:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,171:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,176:0.71: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,100:0.52:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,107:0.55:-0.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:100,101:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,106:0.54:-0.47:1.000:0.990 0/1/1/1:4:44,191:0.78: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,78:0.44:-0.74:1.000:0.967 0/0/1/1/1:5:63,122:0.64:-0.67:0.982:0.936 0/1/1/1:4:52,151:0.71:-0.34:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,170:0.69: 0.26:1.000:0.976 0/1/1/1:4:71,245:0.74: 1.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,162:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:104,144:0.57: 0.48:1.000:0.946 0/0/1/1:4:106,116:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,193:0.66: 1.13:1.000:0.845 1/1/1/1:4:0,246:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,201:0.73: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,100:0.48:-0.20:1.000:0.994 0/0/0/0:4:187,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,138:0.48: 1.24:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,370:1.00: 2.72:1.000:1.000 0/1/1:3:50,145:0.71:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,49:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,136:0.55: 0.40:1.000:0.980 0/0/1/1:4:103,126:0.54: 0.13:1.000:0.985 1/1/1/1:4:1,317:1.00: 1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,216:0.79: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,25:0.43:-2.97:1.000:0.955 0/0/1/1:4:62,84:0.57:-1.38:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,244:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,181:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,154:0.57: 0.84:1.000:0.958 0/0/1/1:4:89,155:0.62: 0.40:1.000:0.597 0/1/1/1:4:55,164:0.72:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,102:0.45: 0.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:84,74:0.47:-1.16:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,179:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,113:0.53:-0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,185:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,252:0.81: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,85:0.42:-0.22:1.000:0.900 0/0/1/1:4:85,132:0.59:-0.09:1.000:0.835 0/1/1/1:4:54,182:0.74: 0.26:0.999:0.998 0/1/1/1:4:36,199:0.82: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,69:0.49:-1.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,157:0.71:-0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:49,97:0.64:-1.38:1.000:0.725 0/1/1/1:4:70,167:0.68: 0.28:1.000:0.949 0/1/1/1:4:56,164:0.71:-0.03:1.000:0.993 0/1/1/1:4:33,172:0.81:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,152:0.74:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,132:0.53: 0.44:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,250:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,132:0.55: 0.31:1.000:0.984 0/0/1/1:4:89,136:0.59: 0.06:1.000:0.858 1/1/1/1:4:1,229:0.99: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,229:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,98:0.43: 0.22:1.000:0.944 0/0/1/1:4:93,65:0.42:-1.16:1.000:0.924 0/1/1/1:4:49,248:0.81: 1.37:1.000:1.000 -chr5.1 8027469 chr5.1_008027469 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:4,13:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.98:1.000:. ./.:4:4,14:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:4,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:5,7:.: 0.10:0.996:. ./.:4:6,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,13:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.98:1.000:. ./.:4:5,13:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.24:1.000:. ./.:4:4,10:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,14:.: 0.86:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.10:1.000:. ./.:4:5,9:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,1:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:3,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,12:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:3,16:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.79:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,16:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:4,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.41:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.85:1.000:. ./.:6:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,17:.: 1.05:1.000:. ./.:4:5,9:.: 0.48:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.22:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.67:0.996:. ./.:4:8,4:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.41:1.000:. ./.:4:9,10:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:2,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,11:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,15:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,9:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.66:1.000:. ./.:4:2,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:7,10:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:4,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,12:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:7,13:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:7,21:.: 3.13:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.29:0.999:. ./.:4:0,17:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.43:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,7:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,7:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.43:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.29:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,14:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:5:0,4:.:-1.41:0.982:. ./.:4:2,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1,8:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.81:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.10:1.000:. ./.:3:0,19:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,13:.: 0.67:1.000:. ./.:4:6,8:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:6,8:.: 0.48:1.000:. ./.:4:4,16:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,16:.: 1.81:1.000:. ./.:4:1,14:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:4,9:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.43:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:3,13:.: 0.86:0.999:. ./.:4:0,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.29:1.000:. ./.:4:5,16:.: 1.81:1.000:. ./.:4:4,12:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.85:1.000:. ./.:4:6,20:.: 2.75:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,24:.: 2.37:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:11,4:.: 0.67:1.000:. -chr5.1 8221735 chr5.1_008221735 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:364,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:170,40:.:-0.76:1.000:. ./.:4:139,133:.: 0.22:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:275,71:.: 1.40:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:198,64:.: 0.06:1.000:. ./.:4:58,18:.:-2.88:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:174,54:.:-0.47:1.000:. ./.:4:191,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:190,148:.: 1.27:1.000:. ./.:4:173,121:.: 0.57:0.996:. ./.:4:355,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:273,75:.: 1.43:1.000:. ./.:4:229,75:.: 0.73:1.000:. ./.:4:31,12:.:-3.41:1.000:. ./.:4:214,63:.: 0.30:1.000:. ./.:4:224,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:32,21:.:-3.25:1.000:. ./.:4:213,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:139,122:.: 0.05:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:165,129:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,136:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,118:.:-0.32:1.000:. ./.:4:38,12:.:-3.29:1.000:. ./.:4:59,41:.:-2.50:1.000:. ./.:3:42,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:217,77:.: 0.57:1.000:. ./.:4:132,120:.:-0.09:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:221,70:.: 0.52:1.000:. ./.:4:165,129:.: 0.57:1.000:. ./.:4:226,66:.: 0.54:1.000:. ./.:4:146,132:.: 0.32:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:127,137:.: 0.10:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:244,65:.: 0.81:1.000:. ./.:4:417,45:.: 3.23:1.000:. ./.:4:180,60:.:-0.28:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:310,70:.: 1.93:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:263,85:.: 1.43:1.000:. ./.:4:204,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:198,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:140,120:.: 0.03:1.000:. ./.:6:127,107:.:-0.38:1.000:. ./.:4:127,122:.:-0.14:1.000:. ./.:4:198,70:.: 0.16:1.000:. ./.:4:143,118:.: 0.05:1.000:. ./.:4:195,60:.:-0.05:1.000:. ./.:4:241,61:.: 0.70:1.000:. ./.:4:223,53:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,36:.:-2.38:1.000:. ./.:4:194,60:.:-0.06:1.000:. ./.:4:192,70:.: 0.06:0.996:. ./.:4:220,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:216,54:.: 0.19:1.000:. ./.:4:92,20:.:-2.31:1.000:. ./.:4:151,121:.: 0.22:1.000:. ./.:4:244,65:.: 0.81:1.000:. ./.:4:234,69:.: 0.71:1.000:. ./.:4:187,55:.:-0.25:1.000:. ./.:4:225,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:158,127:.: 0.43:1.000:. ./.:4:209,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:173,123:.: 0.60:1.000:. ./.:4:137,47:.:-1.17:1.000:. ./.:4:130,126:.:-0.03:1.000:. ./.:4:159,149:.: 0.79:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:136,109:.:-0.20:1.000:. ./.:4:141,134:.: 0.27:1.000:. ./.:4:144,53:.:-0.97:1.000:. ./.:4:178,54:.:-0.41:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:175,54:.:-0.46:1.000:. ./.:4:229,54:.: 0.40:1.000:. ./.:4:174,161:.: 1.22:1.000:. ./.:4:155,28:.:-1.19:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:208,63:.: 0.21:1.000:. ./.:4:208,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:92,26:.:-2.22:1.000:. ./.:4:135,129:.: 0.10:1.000:. ./.:4:145,37:.:-1.20:1.000:. ./.:4:183,47:.:-0.44:1.000:. ./.:4:185,43:.:-0.47:1.000:. ./.:4:142,118:.: 0.03:1.000:. ./.:4:221,59:.: 0.35:1.000:. ./.:4:196,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:281,78:.: 1.60:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:195,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:166,129:.: 0.59:1.000:. ./.:4:196,43:.:-0.30:0.999:. ./.:4:198,46:.:-0.22:1.000:. ./.:4:179,44:.:-0.55:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:115,28:.:-1.82:1.000:. ./.:4:141,118:.: 0.02:1.000:. ./.:4:179,44:.:-0.55:1.000:. ./.:4:182,56:.:-0.32:1.000:. ./.:4:251,59:.: 0.83:1.000:. ./.:4:225,51:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,132:.: 0.37:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:134,124:.: 0.00:1.000:. ./.:4:226,67:.: 0.56:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:145,51:.:-0.98:1.000:. ./.:4:149,48:.:-0.97:1.000:. ./.:4:200,57:.:-0.01:1.000:. ./.:4:219,58:.: 0.30:1.000:. ./.:5:172,33:.:-0.84:0.982:. ./.:4:243,82:.: 1.06:1.000:. ./.:4:208,71:.: 0.33:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:206,74:.: 0.35:1.000:. ./.:4:186,43:.:-0.46:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:194,70:.: 0.10:1.000:. ./.:4:205,52:.:-0.01:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:163,156:.: 0.97:1.000:. ./.:3:199,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:213,59:.: 0.22:1.000:. ./.:4:147,145:.: 0.54:1.000:. ./.:4:146,153:.: 0.65:1.000:. ./.:4:67,22:.:-2.68:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:161,125:.: 0.45:1.000:. ./.:4:144,119:.: 0.08:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:191,50:.:-0.27:1.000:. ./.:4:190,51:.:-0.27:1.000:. ./.:4:204,69:.: 0.24:1.000:. ./.:4:174,56:.:-0.44:1.000:. ./.:4:140,99:.:-0.30:1.000:. ./.:4:144,133:.: 0.30:1.000:. ./.:4:230,65:.: 0.59:1.000:. ./.:4:149,142:.: 0.52:1.000:. ./.:4:212,50:.: 0.06:1.000:. ./.:4:180,37:.:-0.65:1.000:. ./.:4:183,55:.:-0.32:0.999:. ./.:4:254,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:172,56:.:-0.47:1.000:. ./.:4:183,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,104:.:-0.74:1.000:. ./.:4:208,47:.:-0.05:1.000:. ./.:4:221,70:.: 0.52:1.000:. ./.:4:138,109:.:-0.17:1.000:. ./.:4:174,44:.:-0.63:1.000:. ./.:4:170,139:.: 0.81:1.000:. ./.:4:160,47:.:-0.81:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:128,87:.:-0.68:1.000:. ./.:4:124,111:.:-0.36:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:255,80:.: 1.22:1.000:. -chr5.1 8352949 chr5.1_008352949 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:208,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:0.996:. ./.:4:157,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:309,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:321,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.13:1.000:. ./.:3:42,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:1.000:. ./.:6:140,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.02:0.996:. ./.:4:215,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:295,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:149,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:199,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.17:1.000:. ./.:5:159,0:.:-0.34:0.982:. ./.:4:175,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:231,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:322,0:.: 2.56:1.000:. ./.:3:132,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:183,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.33:1.000:. -chr5.1 8387670 chr5.1_008387670 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,80:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,114:.: 1.83:1.000:. ./.:4:18,66:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,32:.:-1.38:1.000:. ./.:4:17,54:.:-0.57:1.000:. ./.:4:19,59:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,21:.:-1.74:1.000:. ./.:4:72,62:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.39:1.000:. ./.:4:26,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,62:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,39:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.30:0.996:. ./.:4:0,86:.:-0.03:1.000:. ./.:4:17,82:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.45:1.000:. ./.:4:15,63:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,65:.:-0.39:1.000:. ./.:4:5,31:.:-1.85:1.000:. ./.:4:13,37:.:-1.34:1.000:. ./.:4:29,39:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,58:.:-0.43:1.000:. ./.:4:42,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,55:.:-0.76:1.000:. ./.:4:9,62:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,55:.:-1.16:1.000:. ./.:4:16,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:20,26:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,83:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.54:1.000:. ./.:4:18,62:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,50:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,58:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,92:.: 1.06:1.000:. ./.:4:11,69:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,137:.: 1.83:1.000:. ./.:4:29,71:.: 0.48:1.000:. ./.:4:19,83:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,191:.: 8.75:1.000:. ./.:4:23,39:.:-0.90:1.000:. ./.:4:21,111:.: 1.65:1.000:. ./.:4:35,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:29,81:.: 0.85:1.000:. ./.:4:12,79:.: 0.15:1.000:. ./.:4:24,92:.: 1.06:1.000:. ./.:4:54,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:28,51:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,68:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.34:1.000:. ./.:6:10,66:.:-0.39:1.000:. ./.:4:18,78:.: 0.34:1.000:. ./.:4:17,66:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,145:.: 2.12:1.000:. ./.:4:33,57:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,116:.: 1.06:1.000:. ./.:4:29,41:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,98:.: 0.41:1.000:. ./.:4:16,83:.: 0.45:0.996:. ./.:4:0,58:.:-1.05:1.000:. ./.:4:18,89:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.85:1.000:. ./.:4:20,81:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.12:1.000:. ./.:4:24,64:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,59:.: 0.70:1.000:. ./.:4:2,86:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,103:.: 1.46:1.000:. ./.:4:26,83:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.85:1.000:. ./.:4:19,80:.: 0.45:1.000:. ./.:4:17,44:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,120:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.25:1.000:. ./.:4:11,49:.:-0.97:1.000:. ./.:4:21,62:.:-0.14:1.000:. ./.:4:16,79:.: 0.30:1.000:. ./.:4:29,56:.:-0.06:1.000:. ./.:4:15,80:.: 0.30:1.000:. ./.:4:14,64:.:-0.32:1.000:. ./.:4:32,87:.: 1.17:1.000:. ./.:4:13,48:.:-0.94:1.000:. ./.:4:53,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:14,80:.: 0.26:1.000:. ./.:4:16,52:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.36:1.000:. ./.:4:22,67:.: 0.08:1.000:. ./.:4:42,72:.: 0.99:1.000:. ./.:4:36,33:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.06:1.000:. ./.:4:13,46:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.37:1.000:. ./.:4:24,76:.: 0.48:1.000:. ./.:4:23,71:.: 0.26:1.000:. ./.:4:20,72:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.10:1.000:. ./.:4:26,107:.: 1.68:1.000:. ./.:4:19,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:17,79:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.19:1.000:. ./.:4:24,69:.: 0.23:0.999:. ./.:4:24,63:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.03:1.000:. ./.:4:19,82:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,75:.: 1.10:1.000:. ./.:4:15,64:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.74:1.000:. ./.:4:21,57:.:-0.32:1.000:. ./.:4:21,78:.: 0.45:1.000:. ./.:4:18,81:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.77:1.000:. ./.:4:31,47:.:-0.32:1.000:. ./.:4:29,64:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,58:.:-0.10:1.000:. ./.:4:27,63:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,56:.:-0.68:1.000:. ./.:4:13,71:.:-0.10:1.000:. ./.:4:21,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,49:.:-0.79:1.000:. ./.:5:12,58:.:-0.61:0.982:. ./.:4:9,48:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,58:.:-1.05:1.000:. ./.:4:31,99:.: 1.57:1.000:. ./.:4:17,59:.:-0.39:1.000:. ./.:4:36,37:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,57:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,39:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.15:1.000:. ./.:4:22,60:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,52:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,26:.:-1.19:1.000:. ./.:4:24,97:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.81:1.000:. ./.:3:21,40:.:-0.94:1.000:. ./.:4:44,51:.: 0.30:1.000:. ./.:4:30,79:.: 0.81:1.000:. ./.:4:33,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.34:1.000:. ./.:4:18,67:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,16:.:-2.50:1.000:. ./.:4:29,21:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.54:1.000:. ./.:4:26,64:.: 0.12:1.000:. ./.:4:27,70:.: 0.37:1.000:. ./.:4:52,53:.: 0.66:1.000:. ./.:4:11,54:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,61:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,60:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,63:.:-0.54:1.000:. ./.:4:15,82:.: 0.37:1.000:. ./.:4:18,81:.: 0.45:1.000:. ./.:4:17,54:.:-0.57:1.000:. ./.:4:15,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.72:0.999:. ./.:4:18,53:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,53:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.90:1.000:. ./.:4:25,25:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,68:.:-0.06:1.000:. ./.:4:21,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,35:.:-1.38:1.000:. ./.:4:24,60:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.25:1.000:. ./.:4:19,60:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,57:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.17:1.000:. ./.:4:24,73:.: 0.37:1.000:. ./.:4:18,62:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,52:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.28:1.000:. -chr5.1 8546121 chr5.1_008546121 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,144:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,90:.:-0.06:1.000:. ./.:4:36,162:.: 1.00:1.000:. ./.:4:1,188:.: 0.78:1.000:. ./.:4:124,47:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,165:.: 1.21:1.000:. ./.:4:47,18:.:-2.20:1.000:. ./.:4:42,134:.: 0.47:1.000:. ./.:4:73,89:.: 0.13:1.000:. ./.:4:25,36:.:-2.30:1.000:. ./.:4:9,28:.:-2.88:1.000:. ./.:4:46,143:.: 0.78:1.000:. ./.:4:29,140:.: 0.30:1.000:. ./.:4:74,95:.: 0.30:1.000:. ./.:4:71,89:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,165:.: 1.02:1.000:. ./.:4:67,120:.: 0.73:0.996:. ./.:4:76,91:.: 0.25:1.000:. ./.:4:100,125:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,224:.: 1.62:1.000:. ./.:4:4,26:.:-3.05:1.000:. ./.:4:27,144:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,158:.: 1.07:1.000:. ./.:4:59,84:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,18:.:-2.90:1.000:. ./.:4:57,93:.:-0.16:1.000:. ./.:4:49,172:.: 1.55:1.000:. ./.:4:86,114:.: 1.05:1.000:. ./.:4:75,118:.: 0.88:1.000:. ./.:4:75,105:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,117:.: 0.47:1.000:. ./.:4:34,139:.: 0.40:1.000:. ./.:4:8,28:.:-2.90:1.000:. ./.:4:9,23:.:-3.00:1.000:. ./.:3:0,18:.:-3.34:1.000:. ./.:4:33,159:.: 0.85:1.000:. ./.:4:31,147:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,200:.: 1.05:1.000:. ./.:4:64,88:.:-0.11:1.000:. ./.:4:68,112:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,133:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.25:1.000:. ./.:4:42,132:.: 0.42:1.000:. ./.:4:22,137:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,127:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,199:.: 1.02:1.000:. ./.:4:28,177:.: 1.17:1.000:. ./.:4:202,68:.: 2.73:1.000:. ./.:4:58,89:.:-0.23:1.000:. ./.:4:57,97:.:-0.06:1.000:. ./.:4:24,100:.:-0.78:1.000:. ./.:4:47,171:.: 1.48:1.000:. ./.:4:32,107:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,201:.: 1.07:1.000:. ./.:4:76,89:.: 0.20:1.000:. ./.:4:89,44:.:-0.57:1.000:. ./.:4:40,125:.: 0.20:1.000:. ./.:4:45,81:.:-0.74:1.000:. ./.:4:71,85:.:-0.01:1.000:. ./.:6:72,80:.:-0.11:1.000:. ./.:4:108,58:.: 0.23:1.000:. ./.:4:30,140:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,135:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,30:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,234:.: 1.86:1.000:. ./.:4:76,93:.: 0.30:1.000:. ./.:4:20,80:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.47:1.000:. ./.:4:110,42:.:-0.11:0.996:. ./.:4:65,76:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,150:.: 0.95:1.000:. ./.:4:12,65:.:-1.92:1.000:. ./.:4:56,84:.:-0.40:1.000:. ./.:4:87,93:.: 0.56:1.000:. ./.:4:101,33:.:-0.54:1.000:. ./.:4:31,139:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,71:.:-0.64:1.000:. ./.:4:28,139:.: 0.25:1.000:. ./.:4:26,133:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,97:.: 0.16:1.000:. ./.:4:53,61:.:-1.02:1.000:. ./.:4:35,133:.: 0.28:1.000:. ./.:4:35,136:.: 0.35:1.000:. ./.:4:64,93:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,125:.:-0.18:1.000:. ./.:4:31,133:.: 0.18:1.000:. ./.:4:26,94:.:-0.88:1.000:. ./.:4:21,110:.:-0.62:1.000:. ./.:4:34,105:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,69:.:-0.76:1.000:. ./.:4:68,86:.:-0.06:1.000:. ./.:4:81,115:.: 0.95:1.000:. ./.:4:63,78:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,83:.:-0.40:1.000:. ./.:4:35,131:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,103:.:-0.49:1.000:. ./.:4:33,102:.:-0.52:1.000:. ./.:4:45,136:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,99:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,36:.:-2.18:1.000:. ./.:4:39,130:.: 0.30:1.000:. ./.:4:19,92:.:-1.10:1.000:. ./.:4:21,106:.:-0.71:1.000:. ./.:4:19,95:.:-1.02:1.000:. ./.:4:84,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:77,78:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,217:.: 1.46:1.000:. ./.:4:59,142:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.52:1.000:. ./.:4:55,81:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,107:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.47:0.999:. ./.:4:31,150:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.90:1.000:. ./.:4:70,28:.:-1.41:1.000:. ./.:4:25,103:.:-0.69:1.000:. ./.:4:37,103:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,66:.:-1.10:1.000:. ./.:4:63,96:.: 0.06:1.000:. ./.:4:30,81:.:-1.10:1.000:. ./.:4:41,129:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,167:.: 1.46:1.000:. ./.:4:28,95:.:-0.81:1.000:. ./.:4:36,105:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.06:1.000:. ./.:4:21,108:.:-0.66:1.000:. ./.:4:22,95:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,85:.:-1.41:1.000:. ./.:4:66,85:.:-0.13:1.000:. ./.:4:27,163:.: 0.81:1.000:. ./.:5:45,80:.:-0.76:0.982:. ./.:4:69,109:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,130:.: 0.35:1.000:. ./.:4:46,163:.: 1.26:1.000:. ./.:4:51,156:.: 1.21:1.000:. ./.:4:64,63:.:-0.71:1.000:. ./.:4:57,66:.:-0.81:1.000:. ./.:4:69,36:.:-1.24:1.000:. ./.:4:34,120:.:-0.06:1.000:. ./.:4:30,117:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.01:1.000:. ./.:4:13,88:.:-1.34:1.000:. ./.:4:47,155:.: 1.09:1.000:. ./.:4:88,104:.: 0.85:1.000:. ./.:3:70,45:.:-1.00:1.000:. ./.:4:45,133:.: 0.52:1.000:. ./.:4:81,114:.: 0.93:1.000:. ./.:4:58,119:.: 0.49:1.000:. ./.:4:70,106:.: 0.47:1.000:. ./.:4:97,41:.:-0.45:1.000:. ./.:4:30,15:.:-2.69:1.000:. ./.:4:60,61:.:-0.86:1.000:. ./.:4:87,124:.: 1.31:1.000:. ./.:4:62,96:.: 0.03:1.000:. ./.:4:69,88:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,77:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,146:.: 0.44:1.000:. ./.:4:48,158:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.40:1.000:. ./.:4:36,113:.:-0.18:1.000:. ./.:4:33,164:.: 0.97:1.000:. ./.:4:38,149:.: 0.73:1.000:. ./.:4:91,113:.: 1.14:1.000:. ./.:4:33,118:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,132:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,134:.: 0.11:0.999:. ./.:4:77,68:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.93:1.000:. ./.:4:32,113:.:-0.28:1.000:. ./.:4:82,33:.:-1.00:1.000:. ./.:4:29,143:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,133:.: 0.25:1.000:. ./.:4:57,79:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,129:.: 0.20:1.000:. ./.:4:33,161:.: 0.90:1.000:. ./.:4:21,136:.: 0.01:1.000:. ./.:4:58,103:.: 0.11:1.000:. ./.:4:28,137:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,153:.: 0.76:1.000:. ./.:4:92,130:.: 1.58:1.000:. ./.:4:60,169:.: 1.74:1.000:. ./.:4:21,103:.:-0.78:1.000:. ./.:4:111,90:.: 1.07:1.000:. -chr5.1 8617412 chr5.1_008617412 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:8,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:12,7:.:-0.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.99:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:7,8:.:-0.99:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:10,6:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,6:.:-1.44:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,7:.: 0.02:0.996:. ./.:4:9,8:.:-0.80:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:5,3:.:-1.62:1.000:. ./.:4:18,15:.: 0.65:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:31,13:.: 1.65:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.38:1.000:. ./.:3:34,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:11,4:.:-0.99:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:18,8:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,6:.:-0.53:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,16:.: 2.57:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:30,20:.: 2.20:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,8:.: 0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:23,17:.: 1.29:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,17:.: 1.65:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.47:1.000:. ./.:6:19,16:.: 0.84:1.000:. ./.:4:13,13:.: 0.02:1.000:. ./.:4:25,13:.: 1.11:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:19,15:.: 0.74:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:23,14:.: 1.02:0.996:. ./.:4:15,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:21,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:10,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:20,19:.: 1.20:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:33,12:.: 1.75:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:20,8:.: 0.20:1.000:. ./.:4:31,8:.: 1.20:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:11,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,7:.: 0.20:1.000:. ./.:4:21,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:27,11:.: 1.11:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:13,13:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,9:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:16,16:.: 0.56:1.000:. ./.:4:33,12:.: 1.75:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:26,12:.: 1.11:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,14:.: 1.93:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:24,16:.: 1.29:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:26,16:.: 1.47:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.56:0.999:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:21,15:.: 0.93:1.000:. ./.:4:20,12:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:22,16:.: 1.11:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:34,10:.: 1.65:1.000:. ./.:4:20,7:.: 0.11:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:5:23,7:.: 0.38:0.982:. ./.:4:27,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,6:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:15,12:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,12:.: 0.29:1.000:. ./.:4:36,7:.: 1.56:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.84:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.84:1.000:. ./.:3:4,6:.:-1.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:7,5:.:-1.26:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.84:1.000:. ./.:4:5,4:.:-1.53:1.000:. ./.:4:18,15:.: 0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:10,8:.:-0.71:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:9,5:.:-1.08:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.44:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:15,4:.:-0.62:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:5,2:.:-1.72:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:13,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:18,10:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,8:.: 0.11:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,6:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:12,5:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:16,8:.:-0.17:1.000:. -chr5.1 8732112 chr5.1_008732112 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:54,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:25,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:42,10:.: 0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:12,11:.:-1.32:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:25,11:.:-0.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.25:1.000:. ./.:4:27,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:44,9:.: 0.92:0.996:. ./.:4:37,12:.: 0.62:1.000:. ./.:4:43,14:.: 1.21:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:8,9:.:-1.76:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.42:1.000:. ./.:4:40,4:.: 0.25:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.58:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:61,15:.: 2.63:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.58:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.91:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:48,11:.: 1.36:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:29,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.94:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:49,7:.: 1.14:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,4:.:-1.32:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:40,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:21,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.72:1.000:. ./.:6:23,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:30,9:.:-0.13:1.000:. ./.:4:29,10:.:-0.13:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.79:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.65:0.996:. ./.:4:32,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,3:.:-1.69:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,7:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,10:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.42:1.000:. ./.:4:16,8:.:-1.24:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:32,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.54:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.94:1.000:. ./.:4:34,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:29,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:38,14:.: 0.84:1.000:. ./.:4:24,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:55,5:.: 1.44:1.000:. ./.:4:34,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:31,8:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:87,0:.: 3.44:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:54,8:.: 1.58:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:44,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:16,7:.:-1.32:1.000:. ./.:4:16,6:.:-1.39:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:18,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:14,9:.:-1.32:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.47:1.000:. ./.:5:24,3:.:-1.02:0.982:. ./.:4:19,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:26,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:64,9:.: 2.40:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.32:1.000:. ./.:4:18,4:.:-1.39:1.000:. ./.:4:27,13:.:-0.05:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:29,12:.: 0.02:1.000:. ./.:3:37,11:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:32,12:.: 0.25:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:53,14:.: 1.96:1.000:. ./.:4:33,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.46:1.000:. ./.:4:34,10:.: 0.25:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:37,16:.: 0.92:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:43,13:.: 1.14:1.000:. ./.:4:43,16:.: 1.36:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,15:.: 0.77:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.87:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.58:0.999:. ./.:4:30,7:.:-0.27:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:45,9:.: 0.99:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:34,10:.: 0.25:1.000:. ./.:4:42,6:.: 0.54:1.000:. ./.:4:38,7:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:42,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:46,11:.: 1.21:1.000:. ./.:4:81,0:.: 3.00:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:28,10:.:-0.20:1.000:. -chr5.1 9264016 chr5.1_009264016 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:108,356:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,163:0.47:-0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:152,206:0.55:-0.59:1.000:0.980 0/0/1/1:4:206,222:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:119,421:0.76: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,398:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,57:0.20:-1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,291:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,83:0.23:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,212:0.75:-1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,169:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,235:0.69:-0.90:1.000:0.976 0/0/1/1:4:160,182:0.51:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:207,220:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:184,201:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,220:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,218:0.53:-0.23:0.996:0.992 0/0/1/1:4:239,243:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:269,318:0.52: 1.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,230:0.53:-0.01:1.000:0.991 0/0/0/1:4:157,65:0.27:-2.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:354,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,235:0.55:-0.02:1.000:0.983 0/1/1/1:4:95,313:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,70:0.31:-2.18:1.000:0.971 1/1/1/1:4:2,496:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,178:0.44:-0.30:1.000:0.963 0/0/1/1:4:171,197:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,234:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,288:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,206:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,176:0.53:-1.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:137,45:0.23:-2.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,137:0.47:-1.46:1.000:0.992 0/0/1:3:77,71:0.45:-2.84:1.000:0.954 0/0/0/1:4:273,101:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,227:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:219,186:0.43:-0.09:1.000:0.957 0/0/0/1:4:357,117:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,243:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,355:0.81: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,246:0.59:-0.16:1.000:0.841 0/0/0/1:4:370,159:0.28: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:230,248:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:99,425:0.79: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,276:0.53: 0.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:297,121:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:262,324:0.53: 1.85:1.000:0.993 0/0/1/1:4:209,236:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:336,437:0.54: 3.86:1.000:0.988 0/0/1/1:4:227,279:0.53: 0.99:1.000:0.994 0/0/0/0:4:498,2:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,327:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,126:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,183:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:263,301:0.51: 1.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:193,184:0.46:-0.39:1.000:0.989 0/0/1/1:4:362,381:0.49: 3.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:204,225:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:238,132:0.33:-0.46:1.000:0.919 0/0/1/1:4:168,215:0.54:-0.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:279,110:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,354:0.56: 2.05:1.000:0.966 0/0/1/1:4:309,334:0.49: 2.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,230:0.59:-0.43:1.000:0.851 0/0/1/1:4:232,234:0.48: 0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,251:0.83:-1.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:145,206:0.56:-0.67:1.000:0.964 0/1/1/1:4:94,374:0.78: 0.59:0.996:1.000 0/0/1/1:4:169,216:0.54:-0.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:231,281:0.52: 1.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:300,135:0.29: 0.23:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,618:1.00: 2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,201:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:333,114:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,319:0.72: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:213,225:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,384:0.81: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:426,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,390:0.82: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,156:0.43:-0.73:1.000:0.940 0/0/0/1:4:352,156:0.29: 1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:222,231:0.48: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,201:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:117,441:0.77: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:402,1:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,58:0.19:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:317,118:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,267:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,208:0.53:-0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:198,104:0.32:-1.19:1.000:0.947 0/0/1/1:4:152,210:0.55:-0.55:1.000:0.975 0/1/1/1:4:99,415:0.79: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,260:0.71:-0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:358,117:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:361,154:0.28: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:102,338:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:293,101:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:282,278:0.47: 1.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:214,233:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,308:0.69: 0.18:1.000:0.978 0/0/1/1:4:170,240:0.56:-0.03:1.000:0.967 0/1/1/1:4:101,187:0.63:-1.34:1.000:0.501 0/0/1/1:4:200,270:0.55: 0.61:1.000:0.981 0/0/1/1:4:195,220:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,228:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:292,122:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,182:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:128,399:0.74: 1.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:195,231:0.52: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:262,114:0.28:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:201,275:0.55: 0.67:1.000:0.977 0/0/0/1:4:320,144:0.29: 0.54:0.999:0.992 0/0/1/1:4:158,235:0.57:-0.22:1.000:0.938 0/0/1/1:4:138,163:0.52:-1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:256,287:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:203,226:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:307,133:0.28: 0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:175,238:0.55: 0.00:1.000:0.979 0/0/1/1:4:195,214:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:130,365:0.72: 0.88:1.000:0.994 0/0/0/1:4:325,128:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,365:0.84: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,190:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,258:0.53: 0.58:1.000:0.993 0/1/1/1:4:142,399:0.72: 1.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:223,239:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:268,84:0.22:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:357,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:298,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,412:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,150:0.52:-1.50:1.000:0.994 0/0/0/1/1:5:194,137:0.39:-0.88:0.982:0.970 1/1/1/1:4:0,550:1.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,96:0.26:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,307:0.52: 1.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:105,311:0.73: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:142,369:0.70: 1.05:1.000:0.985 0/0/1/1:4:192,177:0.45:-0.47:1.000:0.984 0/0/1/1:4:237,225:0.46: 0.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:227,283:0.53: 1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:241,276:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,167:0.42:-0.44:1.000:0.931 0/0/0/1:4:246,91:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:122,410:0.75: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:238,261:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/1/1:3:93,224:0.68:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,185:0.45:-0.27:1.000:0.981 0/0/1/1:4:262,275:0.49: 1.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:104,264:0.69:-0.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:173,230:0.55:-0.11:1.000:0.984 0/0/1/1:4:166,156:0.46:-0.98:1.000:0.987 0/0/0/1:4:143,69:0.30:-2.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:111,127:0.51:-1.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:203,288:0.56: 0.83:1.000:0.965 0/1/1/1:4:77,291:0.77:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,219:0.46: 0.36:1.000:0.990 0/1/1/1:4:109,300:0.71:-0.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:209,85:0.27:-1.28:1.000:0.998 0/0/0/0:4:377,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,81:0.20:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,298:0.78:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,80:0.24:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,83:0.24:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,96:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,212:0.54:-0.41:1.000:0.988 0/0/0/0:4:265,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,320:0.77:-0.07:0.999:1.000 0/1/1/1:4:84,312:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,74:0.24:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,78:0.26:-1.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,230:0.71:-1.06:1.000:0.992 0/0/0/1:4:235,105:0.29:-0.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:222,92:0.27:-1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:268,107:0.26:-0.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,222:0.70:-1.15:1.000:0.987 0/0/0/1:4:297,108:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,256:0.53: 0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:198,220:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:224,138:0.36:-0.55:1.000:0.706 0/1/1/1:4:78,283:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,393:0.77: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,382:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,273:0.76:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,224:0.51: 0.06:1.000:0.996 -chr5.1 9355966 chr5.1_009355966 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:218,55:.: 0.56:1.000:. ./.:4:130,111:.: 0.01:1.000:. ./.:4:201,63:.: 0.40:1.000:. ./.:4:215,65:.: 0.68:1.000:. ./.:4:222,61:.: 0.73:1.000:. ./.:4:251,88:.: 1.71:1.000:. ./.:4:95,84:.:-1.07:1.000:. ./.:4:194,61:.: 0.25:1.000:. ./.:4:126,117:.: 0.04:1.000:. ./.:4:66,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:74,34:.:-2.30:1.000:. ./.:4:194,67:.: 0.35:1.000:. ./.:4:170,60:.:-0.18:1.000:. ./.:4:167,155:.: 1.41:1.000:. ./.:4:198,64:.: 0.37:1.000:. ./.:4:219,69:.: 0.82:1.000:. ./.:4:230,69:.: 1.01:0.996:. ./.:4:195,56:.: 0.18:1.000:. ./.:4:288,89:.: 2.37:1.000:. ./.:4:254,69:.: 1.43:1.000:. ./.:4:59,66:.:-2.01:1.000:. ./.:4:129,139:.: 0.47:1.000:. ./.:4:235,72:.: 1.15:1.000:. ./.:4:189,48:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,19:.:-2.93:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:220,67:.: 0.80:1.000:. ./.:4:197,68:.: 0.42:1.000:. ./.:4:270,70:.: 1.72:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:227,53:.: 0.68:1.000:. ./.:4:169,56:.:-0.27:1.000:. ./.:4:45,8:.:-3.26:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:36,11:.:-3.36:1.000:. ./.:4:131,115:.: 0.09:1.000:. ./.:4:206,51:.: 0.28:1.000:. ./.:4:233,71:.: 1.10:1.000:. ./.:4:173,159:.: 1.58:1.000:. ./.:4:261,67:.: 1.52:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:205,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:198,69:.: 0.46:1.000:. ./.:4:164,42:.:-0.60:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:207,60:.: 0.46:1.000:. ./.:4:248,56:.: 1.10:1.000:. ./.:4:33,17:.:-3.31:1.000:. ./.:4:175,60:.:-0.10:1.000:. ./.:4:112,110:.:-0.32:1.000:. ./.:4:161,60:.:-0.34:1.000:. ./.:4:149,138:.: 0.80:1.000:. ./.:4:142,49:.:-0.86:1.000:. ./.:4:209,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:177,67:.: 0.06:1.000:. ./.:4:154,74:.:-0.22:1.000:. ./.:4:170,58:.:-0.22:1.000:. ./.:4:181,67:.: 0.13:1.000:. ./.:4:180,45:.:-0.27:1.000:. ./.:6:129,41:.:-1.23:1.000:. ./.:4:177,47:.:-0.29:1.000:. ./.:4:159,53:.:-0.50:1.000:. ./.:4:222,68:.: 0.86:1.000:. ./.:4:169,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:193,81:.: 0.58:1.000:. ./.:4:183,80:.: 0.39:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:208,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:194,38:.:-0.15:0.996:. ./.:4:112,113:.:-0.27:1.000:. ./.:4:184,89:.: 0.56:1.000:. ./.:4:120,87:.:-0.58:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:199,65:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,163:.:-0.51:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:170,47:.:-0.41:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:103,134:.:-0.06:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:80,87:.:-1.28:1.000:. ./.:4:164,52:.:-0.43:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:112,98:.:-0.53:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:134,128:.: 0.37:1.000:. ./.:4:136,33:.:-1.24:1.000:. ./.:4:118,39:.:-1.45:1.000:. ./.:4:141,39:.:-1.05:1.000:. ./.:4:148,55:.:-0.65:1.000:. ./.:4:99,80:.:-1.07:1.000:. ./.:4:167,53:.:-0.36:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:151,44:.:-0.79:1.000:. ./.:4:117,106:.:-0.31:1.000:. ./.:4:140,120:.: 0.34:1.000:. ./.:4:122,47:.:-1.24:1.000:. ./.:4:59,159:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,53:.:-0.36:1.000:. ./.:4:216,64:.: 0.68:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:167,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:143,41:.:-0.98:1.000:. ./.:4:172,50:.:-0.32:1.000:. ./.:4:145,51:.:-0.77:1.000:. ./.:4:178,58:.:-0.08:1.000:. ./.:4:114,114:.:-0.22:1.000:. ./.:4:244,72:.: 1.31:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:175,65:.:-0.01:1.000:. ./.:4:93,98:.:-0.86:1.000:. ./.:4:240,69:.: 1.19:1.000:. ./.:4:146,44:.:-0.88:0.999:. ./.:4:180,54:.:-0.12:1.000:. ./.:4:133,61:.:-0.81:1.000:. ./.:4:206,66:.: 0.54:1.000:. ./.:4:143,46:.:-0.90:1.000:. ./.:4:173,63:.:-0.08:1.000:. ./.:4:155,42:.:-0.76:1.000:. ./.:4:158,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:172,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:155,44:.:-0.72:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:188,68:.: 0.27:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:159,47:.:-0.60:1.000:. ./.:4:47,123:.:-1.23:1.000:. ./.:4:88,82:.:-1.23:1.000:. ./.:4:115,97:.:-0.50:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:213,65:.: 0.65:1.000:. ./.:5:100,78:.:-1.09:0.982:. ./.:4:240,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:89,86:.:-1.14:1.000:. ./.:4:277,92:.: 2.23:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:132,46:.:-1.09:1.000:. ./.:4:156,46:.:-0.67:1.000:. ./.:4:182,52:.:-0.12:1.000:. ./.:4:164,47:.:-0.51:1.000:. ./.:4:207,59:.: 0.44:1.000:. ./.:4:89,76:.:-1.31:1.000:. ./.:4:259,73:.: 1.58:1.000:. ./.:4:223,71:.: 0.93:1.000:. ./.:3:123,71:.:-0.81:1.000:. ./.:4:170,59:.:-0.20:1.000:. ./.:4:145,136:.: 0.70:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:236,83:.: 1.36:1.000:. ./.:4:210,59:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,50:.:-1.71:1.000:. ./.:4:166,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:239,77:.: 1.31:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:161,156:.: 1.32:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:153,55:.:-0.57:1.000:. ./.:4:131,127:.: 0.30:1.000:. ./.:4:198,65:.: 0.39:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:209,53:.: 0.37:1.000:. ./.:4:203,65:.: 0.47:1.000:. ./.:4:240,73:.: 1.26:1.000:. ./.:4:190,51:.: 0.01:1.000:. ./.:4:138,134:.: 0.54:1.000:. ./.:4:214,68:.: 0.72:0.999:. ./.:4:206,73:.: 0.67:1.000:. ./.:4:180,50:.:-0.18:1.000:. ./.:4:119,103:.:-0.32:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:134,106:.:-0.01:1.000:. ./.:4:200,60:.: 0.34:1.000:. ./.:4:179,57:.:-0.08:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:266,79:.: 1.81:1.000:. ./.:4:238,83:.: 1.39:1.000:. ./.:4:157,153:.: 1.20:1.000:. ./.:4:199,48:.: 0.11:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:265,89:.: 1.97:1.000:. ./.:4:287,90:.: 2.37:1.000:. ./.:4:155,57:.:-0.50:1.000:. ./.:4:123,119:.: 0.02:1.000:. -chr5.1 9455011 chr5.1_009455011 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:261,252:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,193:0.53:-1.15:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,290:0.73:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:266,232:0.47: 0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:310,181:0.35: 0.07:1.000:0.805 0/0/1/1:4:228,281:0.55: 0.24:1.000:0.980 0/0/0/0:4:336,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,207:0.56:-1.09:1.000:0.969 0/0/0/1:4:281,156:0.33:-0.44:1.000:0.901 0/0/0/1:4:173,73:0.26:-2.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:257,65:0.17:-1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,258:0.56:-0.21:1.000:0.973 0/0/1/1:4:258,226:0.47: 0.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:355,160:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:466,64:0.10: 0.44:1.000:0.681 0/1/1/1:4:86,330:0.75:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:219,274:0.55: 0.09:0.996:0.977 0/0/0/1:4:302,173:0.34:-0.08:1.000:0.848 0/0/0/1:4:505,185:0.23: 1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,347:0.74:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:185,159:0.46:-1.32:1.000:0.990 0/0/0/1:4:269,136:0.31:-0.74:1.000:0.976 0/0/1/1:4:235,241:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:318,145:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,69:0.43:-3.06:1.000:0.934 0/0/1/1:4:232,273:0.54: 0.21:1.000:0.987 0/0/0/1:4:269,167:0.37:-0.45:1.000:0.611 0/0/1/1:4:167,207:0.55:-1.03:1.000:0.979 0/0/0/1:4:525,105:0.14: 1.39:1.000:0.979 0/0/1/1:4:255,221:0.47:-0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:205,247:0.55:-0.29:1.000:0.984 0/1/1/1:4:110,219:0.64:-1.46:1.000:0.735 0/0/0/1:4:152,67:0.27:-2.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,129:0.38:-1.51:1.000:0.632 0/1/1:3:17,93:0.80:-3.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,217:0.53:-0.71:1.000:0.991 0/1/1/1:4:94,297:0.72:-0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:233,241:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:568,98:0.13: 1.73:1.000:0.884 0/0/0/1:4:358,196:0.33: 0.67:1.000:0.919 0/1/1/1:4:153,345:0.67: 0.14:1.000:0.906 0/0/1/1:4:246,384:0.60: 1.39:1.000:0.810 0/0/1/1:4:336,284:0.46: 1.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:312,165:0.32:-0.06:1.000:0.952 1/1/1/1:4:15,493:0.92: 0.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:257,250:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:312,170:0.33:-0.01:1.000:0.925 0/0/0/1:4:256,95:0.23:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,182:0.34: 0.19:1.000:0.867 0/0/0/1:4:521,297:0.34: 3.17:1.000:0.857 0/0/0/1:4:360,199:0.33: 0.72:1.000:0.907 0/0/0/1:4:392,193:0.30: 0.96:1.000:0.984 0/0/1/1:4:186,227:0.55:-0.66:1.000:0.982 0/0/1/1:4:209,289:0.57: 0.14:1.000:0.937 0/0/1/1:4:195,142:0.41:-1.38:1.000:0.884 0/0/0/1:4:489,104:0.15: 1.04:1.000:0.990 0/0/0/1:4:367,164:0.28: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:626,131:0.15: 2.59:1.000:0.988 0/0/1/1:4:186,247:0.57:-0.47:1.000:0.958 0/0/0/0/1/1:6:312,149:0.29:-0.21:1.000:0.840 0/0/0/1:4:402,172:0.26: 0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:370,155:0.26: 0.40:1.000:0.999 1/1/1/1:4:21,509:0.91: 0.44:1.000:0.927 0/0/0/1:4:525,102:0.14: 1.36:1.000:0.970 0/1/1/1:4:131,338:0.69:-0.13:1.000:0.973 0/0/0/1:4:337,194:0.34: 0.45:1.000:0.837 0/1/1/1:4:119,241:0.65:-1.17:1.000:0.767 0/1/1/1:4:153,314:0.65:-0.15:1.000:0.790 0/0/0/1:4:380,182:0.29: 0.75:0.996:0.990 0/0/1/1:4:177,209:0.54:-0.92:1.000:0.987 0/0/1/1:4:242,309:0.56: 0.64:1.000:0.971 0/0/1/1:4:192,258:0.57:-0.31:1.000:0.952 0/1/1/1:4:108,444:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:405,156:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:517,214:0.26: 2.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,252:0.58:-0.53:1.000:0.907 0/0/0/1:4:341,180:0.32: 0.36:1.000:0.953 0/1/1/1:4:147,364:0.68: 0.26:1.000:0.960 0/0/0/1:4:359,147:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:146,287:0.64:-0.47:1.000:0.710 0/0/1/1:4:287,227:0.44: 0.29:1.000:0.964 0/0/1/1:4:296,313:0.52: 1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:225,253:0.53:-0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:342,151:0.27: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,433:0.78: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,255:0.51: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:319,124:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:373,166:0.27: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:331,162:0.30: 0.09:1.000:0.986 0/0/1/1:4:157,243:0.60:-0.79:1.000:0.823 0/0/0/1:4:305,152:0.30:-0.25:1.000:0.981 0/0/0/1:4:448,159:0.23: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,294:0.52: 0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,193:0.52:-1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:445,95:0.15: 0.54:1.000:0.990 0/0/0/1:4:421,198:0.29: 1.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:299,252:0.46: 0.64:1.000:0.986 0/0/1/1:4:259,232:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:361,357:0.50: 2.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:321,166:0.31: 0.04:1.000:0.966 0/0/1/1:4:274,178:0.38:-0.29:1.000:0.564 0/1/1/1:4:84,393:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,203:0.54:-1.00:1.000:0.989 0/1/1/1:4:160,292:0.63:-0.29:1.000:0.535 0/0/1/1:4:248,260:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:371,174:0.29: 0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:382,158:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:211,285:0.57: 0.12:1.000:0.950 0/0/1/1:4:226,363:0.60: 1.00:1.000:0.761 0/0/1/1:4:222,239:0.52:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:362,146:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:397,308:0.43: 2.10:1.000:0.953 0/0/1/1:4:193,313:0.61: 0.22:0.999:0.743 0/0/1/1:4:355,249:0.40: 1.14:1.000:0.810 0/1/1/1:4:119,324:0.70:-0.38:1.000:0.984 0/0/1/1:4:279,312:0.53: 1.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:457,87:0.14: 0.58:1.000:0.962 0/0/1/1:4:304,282:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/1/1/1:4:138,304:0.66:-0.39:1.000:0.884 0/0/0/1:4:277,177:0.37:-0.28:1.000:0.500 0/0/1/1:4:283,296:0.52: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:362,191:0.32: 0.66:1.000:0.954 0/1/1/1:4:59,373:0.82:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,155:0.36:-0.70:1.000:0.673 0/0/1/1:4:297,286:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:270,326:0.55: 1.07:1.000:0.984 0/0/1/1:4:181,292:0.60:-0.10:1.000:0.753 0/0/1/1:4:180,259:0.58:-0.42:1.000:0.908 0/0/0/1:4:392,153:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,123:0.29:-0.95:1.000:0.992 0/0/1/1:4:231,284:0.55: 0.30:1.000:0.980 0/0/1/1:4:233,192:0.45:-0.55:1.000:0.981 0/0/0/1/1:5:222,174:0.44:-0.82:0.982:0.928 0/0/1/1:4:223,357:0.60: 0.92:1.000:0.767 0/0/1/1:4:172,237:0.57:-0.70:1.000:0.939 0/0/0/1:4:523,212:0.25: 2.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:307,244:0.44: 0.64:1.000:0.967 0/0/0/1:4:335,193:0.34: 0.42:1.000:0.836 0/0/0/1:4:316,68:0.15:-0.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:468,77:0.12: 0.59:1.000:0.811 0/0/1/1:4:360,349:0.50: 2.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:376,221:0.35: 1.08:1.000:0.788 0/0/1/1:4:177,206:0.54:-0.95:1.000:0.989 0/0/0/1:4:290,151:0.32:-0.40:1.000:0.962 0/0/1/1:4:251,267:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:300,300:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/1:3:306,82:0.18:-0.90:1.000:0.992 0/0/0/1:4:373,159:0.26: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:382,212:0.33: 1.05:1.000:0.902 0/0/0/1:4:218,124:0.34:-1.34:1.000:0.861 0/0/1/1:4:222,265:0.54: 0.04:1.000:0.985 0/0/0/1:4:282,162:0.34:-0.37:1.000:0.842 0/0/0/1:4:143,64:0.28:-2.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:210,77:0.23:-1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:292,252:0.46: 0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:272,259:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:329,228:0.40: 0.70:1.000:0.779 0/0/0/1:4:333,135:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:278,120:0.27:-0.81:1.000:0.998 0/0/0/1:4:365,152:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,240:0.55:-0.47:1.000:0.978 0/1/1/1:4:142,275:0.64:-0.63:1.000:0.678 0/0/0/1:4:305,192:0.37: 0.13:1.000:0.558 0/0/0/1:4:318,153:0.29:-0.12:1.000:0.989 0/0/0/1:4:267,148:0.33:-0.65:1.000:0.903 0/0/1/1:4:309,254:0.45: 0.76:1.000:0.980 0/0/0/1:4:249,130:0.32:-0.99:1.000:0.960 0/1/1/1:4:82,267:0.73:-1.27:0.999:0.997 0/0/0/1:4:288,125:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:196,170:0.47:-1.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:156,154:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:300,117:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,246:0.58:-0.63:1.000:0.908 0/0/0/1:4:317,123:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,156:0.29: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:157,150:0.50:-1.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:368,263:0.41: 1.40:1.000:0.850 0/0/1/1:4:199,257:0.56:-0.26:1.000:0.968 0/0/0/1:4:285,157:0.33:-0.39:1.000:0.912 0/0/1/1:4:168,209:0.55:-1.00:1.000:0.978 0/1/1/1:4:85,285:0.73:-1.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:413,173:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,282:0.54: 0.41:1.000:0.989 0/0/1/1:4:241,247:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:274,242:0.47: 0.31:1.000:0.993 -chr5.1 9512874 chr5.1_009512874 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.67:0.996:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.51:1.000:. ./.:6:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.52:0.996:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:6,0:.:-0.79:0.982:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.52:1.000:. ./.:3:25,0:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,1:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:26,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,1:.: 0.85:1.000:. -chr5.1 10167650 chr5.1_010167650 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:35,14:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:31,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:32,10:.:-1.12:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:31,19:.:-0.52:1.000:. ./.:4:34,15:.:-0.59:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:36,7:.:-1.04:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.34:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.67:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.08:0.996:. ./.:4:62,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:64,18:.: 1.87:1.000:. ./.:4:17,9:.:-2.31:1.000:. ./.:4:41,14:.:-0.15:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:40,10:.:-0.52:1.000:. ./.:4:27,7:.:-1.71:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.89:1.000:. ./.:4:36,8:.:-0.97:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:3:17,8:.:-2.38:1.000:. ./.:4:51,14:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,14:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,16:.: 0.60:1.000:. ./.:4:50,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:38,21:.: 0.15:1.000:. ./.:4:55,14:.: 0.90:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:48,15:.: 0.45:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:24,15:.:-1.34:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.67:1.000:. ./.:4:43,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,14:.:-0.15:1.000:. ./.:4:40,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:49,11:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,20:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,4:.:-1.27:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:35,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.75:1.000:. ./.:6:47,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:56,21:.: 1.50:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:55,17:.: 1.12:1.000:. ./.:4:52,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:43,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.53:0.996:. ./.:4:37,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:52,17:.: 0.90:1.000:. ./.:4:30,6:.:-1.56:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:49,16:.: 0.60:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:56,18:.: 1.27:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:65,18:.: 1.94:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:40,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:47,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:52,10:.: 0.38:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.74:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:30,14:.:-0.97:1.000:. ./.:4:49,15:.: 0.53:1.000:. ./.:4:54,20:.: 1.27:1.000:. ./.:4:41,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,27:.: 0.45:1.000:. ./.:4:56,27:.: 1.94:1.000:. ./.:4:48,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:62,18:.: 1.72:1.000:. ./.:4:45,11:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:37,14:.:-0.44:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:44,10:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,13:.:-1.19:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:49,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:51,9:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:49,14:.: 0.45:0.999:. ./.:4:57,19:.: 1.42:1.000:. ./.:4:19,7:.:-2.31:1.000:. ./.:4:55,19:.: 1.27:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:32,15:.:-0.74:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:45,24:.: 0.90:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:48,16:.: 0.53:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:48,13:.: 0.30:1.000:. ./.:4:21,33:.:-0.22:1.000:. ./.:4:42,21:.: 0.45:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:60,23:.: 1.94:1.000:. ./.:5:38,12:.:-0.52:0.982:. ./.:4:48,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:25,7:.:-1.86:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:32,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:31,7:.:-1.41:1.000:. ./.:4:49,7:.:-0.07:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.30:1.000:. ./.:3:37,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:48,16:.: 0.53:1.000:. ./.:4:48,15:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:18,6:.:-2.46:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:50,19:.: 0.90:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:42,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:62,8:.: 0.97:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:35,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.44:1.000:. ./.:4:40,16:.:-0.07:1.000:. ./.:4:49,14:.: 0.45:0.999:. ./.:4:56,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,15:.: 0.23:1.000:. ./.:4:44,19:.: 0.45:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:58,15:.: 1.20:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.12:1.000:. ./.:4:46,15:.: 0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:44,17:.: 0.30:1.000:. ./.:4:51,13:.: 0.53:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.89:1.000:. -chr5.1 10293972 chr5.1_010293972 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:166,44:.:-0.06:1.000:. ./.:4:74,54:.:-1.16:1.000:. ./.:4:172,45:.: 0.03:1.000:. ./.:4:186,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:256,66:.: 1.44:1.000:. ./.:4:127,82:.:-0.08:1.000:. ./.:4:146,15:.:-0.72:1.000:. ./.:4:92,74:.:-0.65:1.000:. ./.:4:152,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:61,17:.:-1.83:1.000:. ./.:4:56,21:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.93:1.000:. ./.:4:101,64:.:-0.67:1.000:. ./.:4:205,72:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,40:.:-0.38:1.000:. ./.:4:215,46:.: 0.62:1.000:. ./.:4:320,30:.: 1.81:0.996:. ./.:4:248,26:.: 0.79:1.000:. ./.:4:360,36:.: 2.43:1.000:. ./.:4:243,60:.: 1.18:1.000:. ./.:4:199,25:.: 0.12:1.000:. ./.:4:241,22:.: 0.65:1.000:. ./.:4:310,30:.: 1.68:1.000:. ./.:4:180,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:101,17:.:-1.30:1.000:. ./.:4:101,84:.:-0.40:1.000:. ./.:4:82,56:.:-1.03:1.000:. ./.:4:100,43:.:-0.96:1.000:. ./.:4:208,64:.: 0.77:1.000:. ./.:4:80,50:.:-1.14:1.000:. ./.:4:72,41:.:-1.36:1.000:. ./.:4:180,33:.:-0.02:1.000:. ./.:4:106,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:154,41:.:-0.26:1.000:. ./.:3:44,16:.:-2.07:1.000:. ./.:4:306,22:.: 1.52:1.000:. ./.:4:194,47:.: 0.35:1.000:. ./.:4:202,49:.: 0.49:1.000:. ./.:4:223,54:.: 0.83:1.000:. ./.:4:321,10:.: 1.56:1.000:. ./.:4:158,43:.:-0.18:1.000:. ./.:4:162,36:.:-0.22:1.000:. ./.:4:201,67:.: 0.71:1.000:. ./.:4:272,21:.: 1.05:1.000:. ./.:4:179,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:221,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:313,25:.: 1.65:1.000:. ./.:4:22,48:.:-1.94:1.000:. ./.:4:85,49:.:-1.08:1.000:. ./.:4:126,18:.:-0.95:1.000:. ./.:4:72,58:.:-1.14:1.000:. ./.:4:365,20:.: 2.28:1.000:. ./.:4:61,67:.:-1.16:1.000:. ./.:4:163,53:.: 0.02:1.000:. ./.:4:51,49:.:-1.54:1.000:. ./.:4:152,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:69,54:.:-1.23:1.000:. ./.:4:180,71:.: 0.49:1.000:. ./.:4:260,14:.: 0.79:1.000:. ./.:6:159,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:163,37:.:-0.20:1.000:. ./.:4:219,19:.: 0.31:1.000:. ./.:4:237,66:.: 1.18:1.000:. ./.:4:243,65:.: 1.25:1.000:. ./.:4:177,47:.: 0.12:1.000:. ./.:4:114,92:.:-0.12:1.000:. ./.:4:125,42:.:-0.64:1.000:. ./.:4:142,42:.:-0.41:1.000:. ./.:4:148,37:.:-0.40:0.996:. ./.:4:74,70:.:-0.95:1.000:. ./.:4:132,86:.: 0.04:1.000:. ./.:4:243,17:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,106:.:-1.46:1.000:. ./.:4:194,48:.: 0.37:1.000:. ./.:4:197,48:.: 0.41:1.000:. ./.:4:135,30:.:-0.67:1.000:. ./.:4:83,87:.:-0.60:1.000:. ./.:4:151,49:.:-0.20:1.000:. ./.:4:335,31:.: 2.03:1.000:. ./.:4:126,65:.:-0.32:1.000:. ./.:4:55,46:.:-1.52:1.000:. ./.:4:394,32:.: 2.83:1.000:. ./.:4:193,47:.: 0.34:1.000:. ./.:4:178,50:.: 0.18:1.000:. ./.:4:188,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:203,65:.: 0.71:1.000:. ./.:4:160,11:.:-0.59:1.000:. ./.:4:288,28:.: 1.36:1.000:. ./.:4:246,13:.: 0.59:1.000:. ./.:4:146,25:.:-0.59:1.000:. ./.:4:104,23:.:-1.18:1.000:. ./.:4:178,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:123,91:.:-0.01:1.000:. ./.:4:79,61:.:-1.00:1.000:. ./.:4:251,68:.: 1.40:1.000:. ./.:4:330,27:.: 1.91:1.000:. ./.:4:86,78:.:-0.68:1.000:. ./.:4:95,75:.:-0.60:1.000:. ./.:4:170,57:.: 0.16:1.000:. ./.:4:93,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:59,72:.:-1.12:1.000:. ./.:4:178,50:.: 0.18:1.000:. ./.:4:63,65:.:-1.16:1.000:. ./.:4:240,21:.: 0.62:1.000:. ./.:4:137,40:.:-0.51:1.000:. ./.:4:202,56:.: 0.58:1.000:. ./.:4:186,47:.: 0.24:1.000:. ./.:4:167,35:.:-0.17:1.000:. ./.:4:212,52:.: 0.66:1.000:. ./.:4:207,52:.: 0.59:1.000:. ./.:4:192,44:.: 0.28:1.000:. ./.:4:391,45:.: 2.96:1.000:. ./.:4:170,46:.: 0.02:0.999:. ./.:4:100,83:.:-0.43:1.000:. ./.:4:69,11:.:-1.80:1.000:. ./.:4:210,44:.: 0.53:1.000:. ./.:4:125,38:.:-0.69:1.000:. ./.:4:154,40:.:-0.28:1.000:. ./.:4:293,31:.: 1.46:1.000:. ./.:4:161,45:.:-0.12:1.000:. ./.:4:94,92:.:-0.38:1.000:. ./.:4:270,24:.: 1.06:1.000:. ./.:4:197,54:.: 0.49:1.000:. ./.:4:84,57:.:-0.99:1.000:. ./.:4:172,40:.:-0.04:1.000:. ./.:4:219,62:.: 0.89:1.000:. ./.:4:170,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,63:.:-1.05:1.000:. ./.:4:159,18:.:-0.51:1.000:. ./.:4:196,18:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,54:.:-1.18:1.000:. ./.:4:65,58:.:-1.23:1.000:. ./.:5:141,29:.:-0.60:0.982:. ./.:4:67,41:.:-1.43:1.000:. ./.:4:214,23:.: 0.30:1.000:. ./.:4:370,19:.: 2.33:1.000:. ./.:4:176,46:.: 0.10:1.000:. ./.:4:71,61:.:-1.11:1.000:. ./.:4:119,35:.:-0.81:1.000:. ./.:4:158,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:291,35:.: 1.49:1.000:. ./.:4:231,24:.: 0.54:1.000:. ./.:4:144,32:.:-0.52:1.000:. ./.:4:65,56:.:-1.26:1.000:. ./.:4:128,100:.: 0.18:1.000:. ./.:4:331,24:.: 1.88:1.000:. ./.:3:203,39:.: 0.37:1.000:. ./.:4:74,53:.:-1.18:1.000:. ./.:4:220,49:.: 0.73:1.000:. ./.:4:85,70:.:-0.80:1.000:. ./.:4:331,27:.: 1.92:1.000:. ./.:4:190,64:.: 0.53:1.000:. ./.:4:91,16:.:-1.44:1.000:. ./.:4:120,10:.:-1.14:1.000:. ./.:4:252,23:.: 0.81:1.000:. ./.:4:96,77:.:-0.56:1.000:. ./.:4:209,69:.: 0.85:1.000:. ./.:4:128,87:.: 0.00:1.000:. ./.:4:208,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:288,31:.: 1.40:1.000:. ./.:4:158,48:.:-0.12:1.000:. ./.:4:167,46:.:-0.02:1.000:. ./.:4:158,48:.:-0.12:1.000:. ./.:4:281,24:.: 1.21:1.000:. ./.:4:195,17:.:-0.04:1.000:. ./.:4:91,87:.:-0.49:1.000:. ./.:4:248,27:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,119:.:-1.28:0.999:. ./.:4:171,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:117,37:.:-0.81:1.000:. ./.:4:119,33:.:-0.84:1.000:. ./.:4:86,51:.:-1.04:1.000:. ./.:4:229,9:.: 0.31:1.000:. ./.:4:242,29:.: 0.75:1.000:. ./.:4:276,17:.: 1.05:1.000:. ./.:4:125,32:.:-0.77:1.000:. ./.:4:222,54:.: 0.82:1.000:. ./.:4:311,41:.: 1.84:1.000:. ./.:4:185,28:.:-0.02:1.000:. ./.:4:124,54:.:-0.49:1.000:. ./.:4:129,51:.:-0.47:1.000:. ./.:4:188,56:.: 0.39:1.000:. ./.:4:118,109:.: 0.16:1.000:. ./.:4:86,69:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,73:.:-0.80:1.000:. -chr5.1 10507226 chr5.1_010507226 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:24,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:0.996:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:3:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:6:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:0.996:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:22,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:26,0:.: 3.39:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:5:6,0:.:-0.42:0.982:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:26,0:.: 3.39:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:3:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:19,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.44:0.999:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 1.68:1.000:. -chr5.1 10802995 chr5.1_010802995 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,86:.: 0.14:1.000:. ./.:4:122,86:.:-0.23:1.000:. ./.:4:60,133:.:-0.45:1.000:. ./.:4:148,82:.: 0.08:1.000:. ./.:4:188,107:.: 1.02:1.000:. ./.:4:186,112:.: 1.06:1.000:. ./.:4:204,33:.: 0.18:1.000:. ./.:4:177,102:.: 0.79:1.000:. ./.:4:215,67:.: 0.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:15,15:.:-2.80:1.000:. ./.:4:145,78:.:-0.02:1.000:. ./.:4:207,70:.: 0.76:1.000:. ./.:4:185,119:.: 1.15:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:84,176:.: 0.52:1.000:. ./.:4:168,89:.: 0.47:0.996:. ./.:4:316,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:227,115:.: 1.70:1.000:. ./.:4:160,124:.: 0.86:1.000:. ./.:4:8,6:.:-3.03:1.000:. ./.:4:207,65:.: 0.69:1.000:. ./.:4:274,53:.: 1.48:1.000:. ./.:4:231,51:.: 0.83:1.000:. ./.:4:11,1:.:-3.06:1.000:. ./.:4:160,88:.: 0.34:1.000:. ./.:4:230,80:.: 1.24:1.000:. ./.:4:132,88:.:-0.06:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:245,48:.: 0.99:1.000:. ./.:4:149,99:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,110:.:-0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:25,4:.:-2.81:1.000:. ./.:3:3,4:.:-3.13:1.000:. ./.:4:132,114:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,151:.: 0.18:1.000:. ./.:4:166,104:.: 0.66:1.000:. ./.:4:190,52:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,62:.: 0.04:1.000:. ./.:4:111,68:.:-0.65:1.000:. ./.:4:144,97:.: 0.24:1.000:. ./.:4:148,74:.:-0.03:1.000:. ./.:4:118,50:.:-0.81:1.000:. ./.:4:114,71:.:-0.56:1.000:. ./.:4:127,84:.:-0.19:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:87,67:.:-1.01:1.000:. ./.:4:125,73:.:-0.38:1.000:. ./.:4:110,66:.:-0.69:1.000:. ./.:4:131,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:274,54:.: 1.50:1.000:. ./.:4:127,87:.:-0.15:1.000:. ./.:4:198,64:.: 0.55:1.000:. ./.:4:151,103:.: 0.43:1.000:. ./.:4:195,26:.:-0.05:1.000:. ./.:4:216,61:.: 0.76:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:122,52:.:-0.72:1.000:. ./.:6:135,35:.:-0.78:1.000:. ./.:4:176,36:.:-0.18:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:66,110:.:-0.69:1.000:. ./.:4:138,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:152,92:.: 0.29:1.000:. ./.:4:117,84:.:-0.33:1.000:. ./.:4:129,46:.:-0.71:1.000:. ./.:4:138,90:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,53:.:-0.75:0.996:. ./.:4:113,92:.:-0.28:1.000:. ./.:4:230,62:.: 0.98:1.000:. ./.:4:147,91:.: 0.20:1.000:. ./.:4:132,51:.:-0.59:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:121,73:.:-0.44:1.000:. ./.:4:118,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:95,68:.:-0.88:1.000:. ./.:4:93,58:.:-1.06:1.000:. ./.:4:214,60:.: 0.72:1.000:. ./.:4:204,33:.: 0.18:1.000:. ./.:4:91,58:.:-1.08:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:201,43:.: 0.29:1.000:. ./.:4:116,93:.:-0.22:1.000:. ./.:4:85,58:.:-1.17:1.000:. ./.:4:243,71:.: 1.29:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:124,36:.:-0.93:1.000:. ./.:4:136,100:.: 0.17:1.000:. ./.:4:170,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:215,34:.: 0.36:1.000:. ./.:4:42,101:.:-1.17:1.000:. ./.:4:216,62:.: 0.78:1.000:. ./.:4:118,89:.:-0.25:1.000:. ./.:4:84,65:.:-1.08:1.000:. ./.:4:82,79:.:-0.91:1.000:. ./.:4:52,137:.:-0.51:1.000:. ./.:4:138,114:.: 0.40:1.000:. ./.:4:119,86:.:-0.28:1.000:. ./.:4:60,126:.:-0.55:1.000:. ./.:4:117,28:.:-1.14:1.000:. ./.:4:188,36:.: 0.00:1.000:. ./.:4:47,72:.:-1.52:1.000:. ./.:4:191,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,54:.:-0.74:1.000:. ./.:4:134,85:.:-0.07:1.000:. ./.:4:199,117:.: 1.32:1.000:. ./.:4:152,115:.: 0.62:1.000:. ./.:4:165,55:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,106:.: 0.82:1.000:. ./.:4:152,43:.:-0.42:0.999:. ./.:4:209,58:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,70:.:-0.85:1.000:. ./.:4:153,94:.: 0.33:1.000:. ./.:4:185,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:104,79:.:-0.59:1.000:. ./.:4:171,30:.:-0.33:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:69,125:.:-0.44:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:151,67:.:-0.09:1.000:. ./.:4:208,62:.: 0.66:1.000:. ./.:4:166,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:143,54:.:-0.39:1.000:. ./.:4:112,71:.:-0.59:1.000:. ./.:4:76,51:.:-1.40:1.000:. ./.:4:148,32:.:-0.64:1.000:. ./.:4:117,23:.:-1.21:1.000:. ./.:4:104,50:.:-1.01:1.000:. ./.:4:198,70:.: 0.63:1.000:. ./.:5:124,61:.:-0.56:0.982:. ./.:4:109,53:.:-0.90:1.000:. ./.:4:140,105:.: 0.30:1.000:. ./.:4:326,42:.: 2.07:1.000:. ./.:4:131,67:.:-0.38:1.000:. ./.:4:152,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:155,28:.:-0.59:1.000:. ./.:4:182,42:.: 0.00:1.000:. ./.:4:176,35:.:-0.19:1.000:. ./.:4:124,96:.:-0.06:1.000:. ./.:4:87,56:.:-1.17:1.000:. ./.:4:201,141:.: 1.70:1.000:. ./.:4:180,122:.: 1.12:1.000:. ./.:3:143,41:.:-0.58:1.000:. ./.:4:238,43:.: 0.82:1.000:. ./.:4:198,147:.: 1.74:1.000:. ./.:4:192,36:.: 0.06:1.000:. ./.:4:177,100:.: 0.76:1.000:. ./.:4:198,43:.: 0.24:1.000:. ./.:4:14,8:.:-2.91:1.000:. ./.:4:181,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:190,74:.: 0.57:1.000:. ./.:4:262,62:.: 1.44:1.000:. ./.:4:207,153:.: 1.96:1.000:. ./.:4:282,54:.: 1.61:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:262,61:.: 1.42:1.000:. ./.:4:229,69:.: 1.06:1.000:. ./.:4:138,69:.:-0.25:1.000:. ./.:4:135,90:.: 0.01:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:230,38:.: 0.63:1.000:. ./.:4:226,62:.: 0.92:1.000:. ./.:4:212,47:.: 0.50:1.000:. ./.:4:157,95:.: 0.40:0.999:. ./.:4:220,48:.: 0.63:1.000:. ./.:4:201,60:.: 0.53:1.000:. ./.:4:137,97:.: 0.14:1.000:. ./.:4:141,27:.:-0.81:1.000:. ./.:4:140,84:.: 0.00:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:178,16:.:-0.44:1.000:. ./.:4:126,74:.:-0.35:1.000:. ./.:4:199,114:.: 1.28:1.000:. ./.:4:269,40:.: 1.22:1.000:. ./.:4:168,126:.: 1.01:1.000:. ./.:4:139,102:.: 0.24:1.000:. ./.:4:157,79:.: 0.17:1.000:. ./.:4:313,41:.: 1.87:1.000:. ./.:4:187,142:.: 1.51:1.000:. ./.:4:132,95:.: 0.04:1.000:. ./.:4:153,101:.: 0.43:1.000:. -chr5.1 11019618 chr5.1_011019618 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,687:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,665:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,807:.: 0.58:1.000:. ./.:4:109,667:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,839:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,828:.: 0.72:1.000:. ./.:4:76,413:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,832:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,759:.: 0.28:1.000:. ./.:4:35,203:.:-3.02:1.000:. ./.:4:38,298:.:-2.40:1.000:. ./.:4:0,719:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,790:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,751:.: 0.23:1.000:. ./.:4:106,544:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,754:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,783:.: 0.43:0.996:. ./.:4:92,572:.:-0.32:1.000:. ./.:4:124,726:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,1075:.: 2.28:1.000:. ./.:4:0,243:.:-2.99:1.000:. ./.:4:92,587:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,792:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,753:.: 0.24:1.000:. ./.:4:8,178:.:-3.35:1.000:. ./.:4:0,904:.: 1.20:1.000:. ./.:4:97,631:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,738:.: 0.15:1.000:. ./.:4:132,677:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,815:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,998:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,707:.:-0.05:1.000:. ./.:4:12,124:.:-3.67:1.000:. ./.:4:35,383:.:-1.88:1.000:. ./.:3:29,97:.:-3.73:1.000:. ./.:4:0,745:.: 0.19:1.000:. ./.:4:4,806:.: 0.60:1.000:. ./.:4:102,801:.: 1.19:1.000:. ./.:4:111,755:.: 0.96:1.000:. ./.:4:123,759:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,826:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,786:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,758:.: 0.92:1.000:. ./.:4:79,541:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,982:.: 1.69:1.000:. ./.:4:96,703:.: 0.53:1.000:. ./.:4:119,649:.: 0.34:1.000:. ./.:4:22,185:.:-3.22:1.000:. ./.:4:75,619:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,733:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,617:.:-0.14:1.000:. ./.:4:110,646:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,725:.: 0.06:1.000:. ./.:4:98,729:.: 0.71:1.000:. ./.:4:92,622:.:-0.01:1.000:. ./.:4:86,572:.:-0.36:1.000:. ./.:4:80,558:.:-0.49:1.000:. ./.:4:112,653:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,699:.:-0.10:1.000:. ./.:6:29,580:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,703:.:-0.08:1.000:. ./.:4:79,479:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,950:.: 1.49:1.000:. ./.:4:98,621:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,797:.: 0.52:1.000:. ./.:4:87,636:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,750:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,784:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,711:.:-0.03:0.996:. ./.:4:0,601:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,867:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,575:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,901:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,621:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,568:.:-0.93:1.000:. ./.:4:94,632:.: 0.07:1.000:. ./.:4:82,716:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,782:.: 0.42:1.000:. ./.:4:99,663:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,951:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,564:.:-0.96:1.000:. ./.:4:102,605:.:-0.05:1.000:. ./.:4:111,759:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,623:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,928:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,829:.: 0.72:1.000:. ./.:4:76,408:.:-1.47:1.000:. ./.:4:92,547:.:-0.48:1.000:. ./.:4:106,567:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,609:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,643:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,625:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,859:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,536:.:-1.14:1.000:. ./.:4:114,683:.: 0.52:1.000:. ./.:4:95,691:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,645:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,652:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,678:.: 0.43:1.000:. ./.:4:120,719:.: 0.79:1.000:. ./.:4:87,548:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,878:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,664:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,657:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,570:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,684:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,605:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,822:.: 0.68:1.000:. ./.:4:137,772:.: 1.23:1.000:. ./.:4:116,739:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,646:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,892:.: 1.13:1.000:. ./.:4:76,645:.: 0.04:0.999:. ./.:4:0,730:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,587:.:-0.81:1.000:. ./.:4:98,807:.: 1.20:1.000:. ./.:4:83,520:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,547:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,661:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,572:.:-0.91:1.000:. ./.:4:1,763:.: 0.31:1.000:. ./.:4:74,546:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,860:.: 0.92:1.000:. ./.:4:121,672:.: 0.49:1.000:. ./.:4:87,632:.: 0.02:1.000:. ./.:4:103,710:.: 0.62:1.000:. ./.:4:88,663:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1,596:.:-0.75:1.000:. ./.:4:96,467:.:-0.96:1.000:. ./.:4:82,516:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,679:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,749:.: 0.22:1.000:. ./.:5:0,576:.:-0.88:0.982:. ./.:4:0,731:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,567:.:-0.94:1.000:. ./.:4:156,811:.: 1.60:1.000:. ./.:4:96,681:.: 0.39:1.000:. ./.:4:86,674:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,479:.:-1.07:1.000:. ./.:4:93,527:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,675:.:-0.25:1.000:. ./.:4:96,561:.:-0.37:1.000:. ./.:4:87,648:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,549:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,936:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,826:.: 0.70:1.000:. ./.:3:0,582:.:-0.84:1.000:. ./.:4:112,602:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,721:.: 0.04:1.000:. ./.:4:101,684:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,935:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,672:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,213:.:-3.18:1.000:. ./.:4:51,331:.:-2.11:1.000:. ./.:4:0,666:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,779:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,797:.: 0.53:1.000:. ./.:4:131,835:.: 1.59:1.000:. ./.:4:96,517:.:-0.65:1.000:. ./.:4:112,628:.: 0.16:1.000:. ./.:4:106,706:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,621:.:-0.60:1.000:. ./.:4:88,741:.: 0.72:1.000:. ./.:4:104,648:.: 0.23:1.000:. ./.:4:97,534:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,792:.: 0.49:1.000:. ./.:4:90,609:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,765:.: 0.32:0.999:. ./.:4:0,705:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,746:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,677:.:-0.24:1.000:. ./.:4:86,608:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,672:.:-0.27:1.000:. ./.:4:96,577:.:-0.27:1.000:. ./.:4:112,560:.:-0.27:1.000:. ./.:4:82,572:.:-0.39:1.000:. ./.:4:133,887:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,839:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,757:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,761:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,882:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,867:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1,982:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,761:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,656:.:-0.37:1.000:. -chr5.1 11171252 chr5.1_011171252 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,13:0.64:-0.88:1.000:0.723 0/0/1/1:4:12,11:0.52:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,17:0.63:-0.20:1.000:0.592 0/1/1/1:4:18,34:0.67: 2.14:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-2.15:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,18:0.71:-0.40:1.000:0.992 0/0/0/0:4:12,1:0.09:-1.66:1.000:0.924 0/0/0/1:4:15,4:0.25:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,13:0.62:-0.79:1.000:0.602 0/1/1/1:4:13,24:0.67: 0.68:1.000:0.920 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,18:0.66:-0.20:1.000:0.896 0/0/0/1:4:37,18:0.37: 2.43:1.000:0.597 0/0/0/1:4:24,11:0.35: 0.48:0.996:0.748 0/0/1/1:4:14,19:0.60: 0.29:1.000:0.757 0/0/1/1:4:33,21:0.43: 2.33:1.000:0.942 0/0/1/1:4:20,23:0.57: 1.26:1.000:0.955 0/0/0/1:4:11,5:0.35:-1.37:1.000:0.765 0/0/0/1:4:22,9:0.33: 0.09:1.000:0.917 0/0/1/1:4:16,10:0.42:-0.40:1.000:0.929 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,15:0.65:-0.59:1.000:0.778 0/1/1/1:4:8,20:0.73:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,9:0.40:-0.49:1.000:0.789 0/1/1/1:4:19,29:0.63: 1.75:1.000:0.557 0/0/1/1:4:14,12:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,12:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-1.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:10,5:0.37:-1.47:1.000:0.518 0/0/0/0:4:39,2:0.06: 1.07:1.000:1.000 0/0/0:3:5,0:0.00:-2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,13:0.55:-0.49:1.000:0.977 0/0/0/1:4:30,8:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,18:0.63:-0.01:1.000:0.506 0/0/1/1:4:14,11:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,9:0.33: 0.09:1.000:0.917 0/0/0/1:4:19,8:0.34:-0.30:1.000:0.888 0/0/1/1:4:13,17:0.60:-0.01:1.000:0.827 0/0/0/1:4:40,11:0.26: 2.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,12:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,12:0.53:-0.59:1.000:0.990 0/1/1/1:4:12,30:0.73: 1.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,11:0.30: 1.16:1.000:0.982 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.56:-1.08:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,18:0.63:-0.01:1.000:0.506 0/0/0/1:4:28,14:0.37: 1.16:1.000:0.518 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,12:0.34: 0.97:1.000:0.866 0/0/0/1:4:21,5:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.32:-0.10:1.000:0.961 0/1/1/1:4:6,19:0.77:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.60:-0.20:1.000:0.793 0/0/0/1:4:34,10:0.27: 1.36:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:24,7:0.27: 0.09:1.000:0.658 0/0/1/1:4:16,9:0.40:-0.49:1.000:0.789 0/0/1/1:4:19,14:0.46: 0.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:33,17:0.38: 1.94:1.000:0.569 0/0/0/1:4:30,7:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.44:-0.98:1.000:0.966 0/0/0/1:4:26,12:0.36: 0.77:1.000:0.732 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:14,15:0.55:-0.10:1.000:0.979 0/1/1/1:4:7,11:0.64:-1.18:0.996:0.638 0/0/1/1:4:13,13:0.53:-0.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:17,19:0.56: 0.58:1.000:0.967 0/0/1/1:4:18,13:0.46: 0.09:1.000:0.987 0/0/0/1:4:28,12:0.34: 0.97:1.000:0.866 0/1/1/1:4:11,23:0.70: 0.38:1.000:0.980 0/1/1/1:4:5,14:0.75:-1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,3:0.22:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,5:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,18:0.37: 2.43:1.000:0.597 0/0/0/1:4:32,9:0.26: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,9:0.47:-0.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:36,12:0.29: 1.75:1.000:0.991 0/0/0/1:4:37,8:0.21: 1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.30:-0.30:1.000:0.985 0/1/1/1:4:14,24:0.65: 0.77:1.000:0.830 0/0/0/1:4:17,8:0.36:-0.49:1.000:0.686 0/0/0/1:4:20,7:0.30:-0.30:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,15:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,11:0.58:-0.98:1.000:0.913 0/0/1/1:4:11,9:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,17:0.61:-0.10:1.000:0.654 0/0/0/1:4:34,14:0.33: 1.75:1.000:0.911 0/1/1/1:4:5,14:0.75:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,25:0.57: 1.55:1.000:0.934 0/1/1/1:4:9,21:0.72:-0.01:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,20:0.37: 2.92:1.000:0.518 0/0/1/1:4:28,18:0.43: 1.55:1.000:0.948 0/0/1/1:4:10,6:0.41:-1.37:1.000:0.889 0/0/0/1:4:29,11:0.32: 0.97:1.000:0.963 0/0/1/1:4:11,8:0.46:-1.08:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,24:0.79: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,11:0.36: 0.38:1.000:0.644 0/0/1/1:4:27,18:0.44: 1.45:1.000:0.966 0/0/1/1:4:17,16:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,9:0.56:-1.27:1.000:0.964 0/0/0/1:4:35,14:0.33: 1.84:1.000:0.934 0/0/1/1:4:19,12:0.43: 0.09:1.000:0.937 0/0/1/1:4:15,13:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,16:0.58:-0.10:1.000:0.906 0/0/0/1:4:20,9:0.35:-0.10:0.999:0.786 0/0/1/1:4:12,9:0.47:-0.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:4,2:0.37:-2.35:1.000:0.518 0/1/1/1:4:11,20:0.67: 0.09:1.000:0.906 0/0/1/1:4:16,18:0.56: 0.38:1.000:0.964 0/0/0/1:4:16,3:0.19:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,30:0.80: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,24:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,15:0.59:-0.30:1.000:0.890 0/0/0/1:4:26,4:0.16:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,15:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,19:0.66:-0.01:1.000:0.842 0/0/0/1:4:32,8:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,13:0.43: 0.29:1.000:0.954 0/0/1/1:4:16,19:0.57: 0.48:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.29: 0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:24,8:0.29: 0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:13,19:0.62: 0.19:1.000:0.569 0/0/1/1:4:13,16:0.58:-0.10:1.000:0.906 0/1/1/1/1:5:4,15:0.80:-1.08:0.982:0.996 0/1/1/1:4:5,10:0.69:-1.47:1.000:0.967 0/1/1/1:4:10,19:0.68:-0.10:1.000:0.942 0/1/1/1:4:13,20:0.63: 0.29:1.000:0.579 0/0/0/1:4:16,5:0.28:-0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,13:0.37: 0.97:1.000:0.625 0/1/1/1:4:6,15:0.73:-0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,13:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,23:0.65: 0.68:1.000:0.748 0/1/1/1:4:9,23:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,20:0.73:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,4:0.23:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,21:0.50: 1.45:1.000:0.997 1/1/1:3:0,23:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.74:-0.79:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,31:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,14:0.39: 0.97:1.000:0.690 0/0/0/1:4:34,14:0.33: 1.75:1.000:0.911 0/0/0/1:4:24,12:0.37: 0.58:1.000:0.518 0/0/1/1:4:7,4:0.40:-1.86:1.000:0.818 0/1/1/1:4:3,15:0.84:-1.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,8:0.33:-0.20:1.000:0.934 0/0/1/1:4:33,18:0.39: 2.04:1.000:0.722 1/1/1/1:4:0,33:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,13:0.36: 1.07:1.000:0.718 0/0/1/1:4:14,15:0.55:-0.10:1.000:0.979 0/0/0/1:4:20,6:0.27:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,13:0.39: 0.68:1.000:0.705 0/0/1/1:4:23,16:0.45: 0.87:1.000:0.979 0/0/0/1:4:30,6:0.20: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,8:0.33:-0.20:1.000:0.934 0/0/0/0:4:20,2:0.11:-0.79:1.000:0.545 0/0/1/1:4:15,21:0.61: 0.58:1.000:0.685 0/0/1/1:4:24,15:0.42: 0.87:1.000:0.929 0/0/1/1:4:19,17:0.51: 0.58:0.999:0.996 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.53:-1.37:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,17:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,5:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.80:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.34:-0.30:1.000:0.888 0/0/0/1:4:29,3:0.11: 0.19:1.000:0.563 0/0/1/1:4:11,6:0.39:-1.27:1.000:0.722 0/0/0/1:4:41,13:0.28: 2.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,15:0.52: 0.09:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,5:0.19: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.42: 0.38:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,28:0.72: 0.97:1.000:0.994 -chr5.1 11443142 chr5.1_011443142 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:50,183:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,177:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,136:0.53: 0.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:178,59:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,220:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,198:0.55: 1.87:1.000:0.976 0/1/1/1:4:27,138:0.82:-1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,161:0.52: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,233:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,33:0.45:-2.84:1.000:0.982 0/0/1/1:4:38,67:0.61:-2.22:1.000:0.660 0/0/1/1:4:101,125:0.53:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,120:0.55:-0.42:1.000:0.983 0/1/1/1:4:68,210:0.73: 0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,131:0.48: 0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:139,151:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,156:0.51: 1.00:0.996:0.996 0/0/0/1:4:182,76:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,183:0.53: 1.63:1.000:0.991 0/0/0/1:4:192,85:0.29: 0.76:1.000:0.991 0/0/1/1:4:29,35:0.52:-2.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,134:0.46: 0.71:1.000:0.989 0/0/0/1:4:187,71:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,147:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,30:0.54:-3.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:145,164:0.50: 1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,143:0.48: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,209:0.74: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,147:0.52: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,156:0.54: 0.71:1.000:0.986 0/1/1/1:4:73,239:0.74: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,138:0.54: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:21,21:0.47:-3.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:60,26:0.29:-2.55:1.000:0.993 0/0/1:3:28,13:0.30:-3.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,144:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,150:0.54: 0.55:1.000:0.988 0/0/0/1:4:180,76:0.28: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,240:0.73: 1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,141:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,73:0.28: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:181,74:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,131:0.47: 0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,128:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:167,65:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,83:0.31: 0.40:1.000:0.978 0/0/0/1:4:216,75:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,49:0.83:-3.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:53,157:0.73:-0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,162:0.77:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,115:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,164:0.49: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,115:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:174,55:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,152:0.71:-0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:70,191:0.71: 0.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:106,132:0.53: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:149,132:0.44: 0.83:1.000:0.974 0/0/1/1:4:114,137:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:65,128:0.64:-0.69:1.000:0.867 0/1/1/1:4:51,178:0.76:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,46:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,108:0.42: 0.17:1.000:0.916 0/1/1/1:4:49,190:0.78: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,71:0.28: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,183:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,31:0.19:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,63:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,201:0.75: 0.47:0.996:0.999 0/1/1/1:4:56,181:0.74: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,151:0.53: 0.62:1.000:0.991 0/0/1/1:4:102,89:0.44:-0.73:1.000:0.969 0/0/1/1:4:173,151:0.44: 1.57:1.000:0.969 0/0/1/1:4:131,141:0.49: 0.67:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,51:0.22:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,178:0.70: 0.21:1.000:0.988 0/0/0/1:4:152,53:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,130:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,144:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,112:0.69:-1.30:1.000:0.966 0/0/0/1:4:206,90:0.29: 1.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:222,68:0.22: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,160:0.72:-0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:176,69:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:70,194:0.71: 0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:125,45:0.25:-1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:160,56:0.25:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,51:0.27:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:159,65:0.27:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,144:0.77:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,122:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,121:0.47: 0.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,152:0.73:-0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,177:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,128:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,83:0.43:-0.87:1.000:0.944 0/1/1/1:4:66,182:0.71: 0.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,107:0.48:-0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,210:0.76: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,126:0.76:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,137:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,89:0.54:-1.33:1.000:0.986 0/0/0/1:4:161,60:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,97:0.52:-0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,172:0.73:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,139:0.80:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,63:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,68:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:177,69:0.27: 0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,165:0.80:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,166:0.45: 2.01:1.000:0.980 0/0/0/1:4:159,68:0.28:-0.10:0.999:0.994 0/0/1/1:4:106,120:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,34:0.21:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,68:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,154:0.77:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,111:0.45:-0.03:1.000:0.984 0/0/0/1:4:124,59:0.31:-0.87:1.000:0.980 0/0/1/1:4:98,112:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,208:0.74: 0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,49:0.27:-1.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:200,70:0.25: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,151:0.55: 0.50:1.000:0.981 0/0/0/1:4:158,55:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,58:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,72:0.31:-0.23:1.000:0.974 0/1/1/1:4:41,145:0.76:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,115:0.58:-0.74:1.000:0.918 0/0/1/1:4:82,77:0.46:-1.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:103,110:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,148:0.55: 0.42:1.000:0.981 0/0/1/1/1:5:71,81:0.50:-1.40:0.982:0.545 0/0/1/1:4:123,125:0.48: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:85,77:0.45:-1.23:1.000:0.980 0/0/0/1:4:240,79:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,77:0.31: 0.07:1.000:0.977 0/0/1/1:4:81,99:0.52:-0.92:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,89:0.49:-1.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,149:0.73:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:150,52:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,60:0.28:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,59:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,116:0.75:-1.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,177:0.53: 1.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:149,191:0.53: 1.85:1.000:0.991 0/1/1:3:61,132:0.66:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,136:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,239:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,112:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,193:0.52: 2.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,201:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,61:0.74:-2.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,46:0.28:-1.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:153,156:0.48: 1.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:115,126:0.49: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,226:0.76: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,148:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:173,62:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,116:0.45: 0.17:1.000:0.981 0/0/0/1:4:148,59:0.27:-0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:154,63:0.28:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,132:0.48: 0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:174,68:0.27: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,151:0.52: 0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,148:0.53: 0.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:116,126:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,136:0.50: 0.43:0.999:0.997 0/0/1/1:4:117,132:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,129:0.47: 0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:154,46:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,111:0.51:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,136:0.52: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,59:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,121:0.49:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,62:0.29:-0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:147,166:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,73:0.27: 0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,219:0.73: 0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,147:0.52: 0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:207,75:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,189:0.52: 1.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,195:0.56: 1.73:1.000:0.969 0/0/1/1:4:102,115:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,190:0.75: 0.21:1.000:1.000 -chr5.1 11548939 chr5.1_011548939 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:217,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:129,60:.:-0.78:1.000:. ./.:4:157,75:.:-0.09:1.000:. ./.:4:133,66:.:-0.62:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:105,67:.:-1.05:1.000:. ./.:4:94,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:140,64:.:-0.54:1.000:. ./.:4:116,66:.:-0.89:1.000:. ./.:4:64,47:.:-2.03:1.000:. ./.:4:54,20:.:-2.62:1.000:. ./.:4:85,138:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,137:.:-0.04:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:132,78:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,62:.:-0.66:1.000:. ./.:4:168,68:.:-0.02:0.996:. ./.:4:159,72:.:-0.10:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:95,145:.: 0.04:1.000:. ./.:4:51,22:.:-2.64:1.000:. ./.:4:169,59:.:-0.15:1.000:. ./.:4:137,140:.: 0.63:1.000:. ./.:4:132,71:.:-0.55:1.000:. ./.:4:46,16:.:-2.81:1.000:. ./.:4:144,79:.:-0.23:1.000:. ./.:4:105,57:.:-1.21:1.000:. ./.:4:126,61:.:-0.81:1.000:. ./.:4:143,80:.:-0.23:1.000:. ./.:4:69,119:.:-0.79:1.000:. ./.:4:127,56:.:-0.87:1.000:. ./.:4:97,48:.:-1.48:1.000:. ./.:4:20,12:.:-3.29:1.000:. ./.:4:62,83:.:-1.48:1.000:. ./.:3:27,11:.:-3.20:1.000:. ./.:4:106,59:.:-1.16:1.000:. ./.:4:165,68:.:-0.07:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:122,153:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,166:.: 1.44:1.000:. ./.:4:275,78:.: 1.85:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:171,171:.: 1.68:1.000:. ./.:4:205,96:.: 1.02:1.000:. ./.:4:110,160:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:219,71:.: 0.84:1.000:. ./.:4:256,78:.: 1.55:1.000:. ./.:4:192,70:.: 0.39:1.000:. ./.:4:148,173:.: 1.34:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:196,51:.: 0.15:1.000:. ./.:4:241,97:.: 1.61:1.000:. ./.:4:212,76:.: 0.81:1.000:. ./.:6:182,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:230,88:.: 1.29:1.000:. ./.:4:125,139:.: 0.43:1.000:. ./.:4:254,78:.: 1.52:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:136,157:.: 0.89:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:64,80:.:-1.50:1.000:. ./.:4:134,138:.: 0.55:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.95:0.996:. ./.:4:154,68:.:-0.25:1.000:. ./.:4:198,175:.: 2.17:1.000:. ./.:4:126,60:.:-0.82:1.000:. ./.:4:169,148:.: 1.28:1.000:. ./.:4:141,153:.: 0.91:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:158,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:140,149:.: 0.83:1.000:. ./.:4:215,68:.: 0.73:1.000:. ./.:4:150,163:.: 1.21:1.000:. ./.:4:172,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:166,173:.: 1.63:1.000:. ./.:4:151,148:.: 0.99:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:119,119:.: 0.01:1.000:. ./.:4:240,91:.: 1.50:1.000:. ./.:4:122,96:.:-0.31:1.000:. ./.:4:143,147:.: 0.84:1.000:. ./.:4:213,55:.: 0.49:1.000:. ./.:4:187,56:.: 0.09:1.000:. ./.:4:140,49:.:-0.78:1.000:. ./.:4:116,131:.: 0.15:1.000:. ./.:4:164,169:.: 1.53:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:209,72:.: 0.70:1.000:. ./.:4:203,67:.: 0.52:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:222,79:.: 1.02:1.000:. ./.:4:121,103:.:-0.22:1.000:. ./.:4:150,131:.: 0.70:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:144,61:.:-0.52:1.000:. ./.:4:187,65:.: 0.23:1.000:. ./.:4:96,172:.: 0.49:1.000:. ./.:4:197,82:.: 0.67:1.000:. ./.:4:167,83:.: 0.20:1.000:. ./.:4:189,87:.: 0.62:1.000:. ./.:4:135,74:.:-0.46:1.000:. ./.:4:186,124:.: 1.16:0.999:. ./.:4:129,133:.: 0.39:1.000:. ./.:4:103,127:.:-0.12:1.000:. ./.:4:263,84:.: 1.76:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:244,74:.: 1.29:1.000:. ./.:4:124,138:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,128:.: 0.31:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:151,144:.: 0.92:1.000:. ./.:4:143,147:.: 0.84:1.000:. ./.:4:124,57:.:-0.91:1.000:. ./.:4:135,163:.: 0.97:1.000:. ./.:4:234,85:.: 1.31:1.000:. ./.:4:195,67:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:167,56:.:-0.23:1.000:. ./.:4:168,73:.: 0.06:1.000:. ./.:4:206,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:97,107:.:-0.54:1.000:. ./.:5:224,49:.: 0.57:0.982:. ./.:4:245,97:.: 1.68:1.000:. ./.:4:183,69:.: 0.23:1.000:. ./.:4:141,82:.:-0.23:1.000:. ./.:4:205,75:.: 0.68:1.000:. ./.:4:211,67:.: 0.65:1.000:. ./.:4:185,61:.: 0.14:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:133,162:.: 0.92:1.000:. ./.:4:219,67:.: 0.78:1.000:. ./.:4:145,53:.:-0.63:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:204,79:.: 0.73:1.000:. ./.:4:210,86:.: 0.94:1.000:. ./.:3:148,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:175,65:.: 0.04:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:159,63:.:-0.25:1.000:. ./.:4:117,59:.:-0.99:1.000:. ./.:4:124,72:.:-0.66:1.000:. ./.:4:66,39:.:-2.12:1.000:. ./.:4:84,45:.:-1.74:1.000:. ./.:4:189,73:.: 0.39:1.000:. ./.:4:102,137:.: 0.02:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:137,62:.:-0.62:1.000:. ./.:4:110,128:.: 0.01:1.000:. ./.:4:147,66:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,99:.:-0.87:1.000:. ./.:4:94,111:.:-0.52:1.000:. ./.:4:130,68:.:-0.63:1.000:. ./.:4:91,127:.:-0.31:1.000:. ./.:4:111,72:.:-0.87:1.000:. ./.:4:86,127:.:-0.39:1.000:. ./.:4:113,62:.:-1.00:1.000:. ./.:4:101,132:.:-0.07:0.999:. ./.:4:142,74:.:-0.34:1.000:. ./.:4:78,103:.:-0.91:1.000:. ./.:4:92,116:.:-0.47:1.000:. ./.:4:110,55:.:-1.16:1.000:. ./.:4:171,77:.: 0.17:1.000:. ./.:4:97,120:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,63:.:-0.41:1.000:. ./.:4:137,58:.:-0.68:1.000:. ./.:4:142,81:.:-0.23:1.000:. ./.:4:111,130:.: 0.06:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:115,71:.:-0.82:1.000:. ./.:4:93,126:.:-0.30:1.000:. ./.:4:165,64:.:-0.14:1.000:. ./.:4:166,72:.: 0.01:1.000:. ./.:4:86,58:.:-1.50:1.000:. ./.:4:181,80:.: 0.38:1.000:. -chr5.1 11677087 chr5.1_011677087 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,49:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.12:1.000:. ./.:4:26,75:.: 0.76:1.000:. ./.:4:22,75:.: 0.61:1.000:. ./.:4:5,25:.:-1.85:1.000:. ./.:4:14,70:.: 0.14:1.000:. ./.:4:12,37:.:-1.15:1.000:. ./.:4:4,12:.:-2.36:1.000:. ./.:4:7,15:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,46:.:-0.60:1.000:. ./.:4:16,42:.:-0.82:1.000:. ./.:4:25,66:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.47:0.996:. ./.:4:0,92:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,19:.:-2.25:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.43:1.000:. ./.:4:11,40:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,17:.:-2.32:1.000:. ./.:4:22,75:.: 0.61:1.000:. ./.:4:11,39:.:-1.11:1.000:. ./.:4:13,55:.:-0.45:1.000:. ./.:4:17,70:.: 0.25:1.000:. ./.:4:10,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:18,53:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.58:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.52:1.000:. ./.:3:0,6:.:-2.73:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.85:1.000:. ./.:4:37,91:.: 1.75:1.000:. ./.:4:1,77:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,98:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,129:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,113:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.05:1.000:. ./.:4:4,27:.:-1.81:1.000:. ./.:4:21,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:25,74:.: 0.69:1.000:. ./.:4:23,74:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,141:.: 2.23:1.000:. ./.:4:14,95:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,111:.: 1.13:1.000:. ./.:4:15,62:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,93:.: 1.46:1.000:. ./.:4:20,88:.: 1.02:1.000:. ./.:4:49,88:.: 2.08:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.36:1.000:. ./.:6:15,87:.: 0.80:1.000:. ./.:4:17,64:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.86:1.000:. ./.:4:29,69:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.76:1.000:. ./.:4:36,77:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.63:1.000:. ./.:4:26,68:.: 0.50:0.996:. ./.:4:0,71:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,86:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,141:.: 2.23:1.000:. ./.:4:17,99:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.50:1.000:. ./.:4:26,65:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,123:.: 1.57:1.000:. ./.:4:29,78:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,116:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,139:.: 2.16:1.000:. ./.:4:8,50:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,88:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.25:1.000:. ./.:4:19,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:26,75:.: 0.76:1.000:. ./.:4:28,123:.: 2.60:1.000:. ./.:4:14,46:.:-0.74:1.000:. ./.:4:26,74:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,128:.: 1.75:1.000:. ./.:4:24,69:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.91:1.000:. ./.:4:16,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:6,35:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.80:1.000:. ./.:4:21,49:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.30:1.000:. ./.:4:21,75:.: 0.58:1.000:. ./.:4:22,74:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.28:1.000:. ./.:4:20,39:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.72:0.999:. ./.:4:18,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,86:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.91:1.000:. ./.:4:15,63:.:-0.08:1.000:. ./.:4:17,74:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.84:1.000:. ./.:4:16,40:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,93:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.34:1.000:. ./.:4:25,84:.: 1.06:1.000:. ./.:4:13,49:.:-0.67:1.000:. ./.:5:24,55:.:-0.05:0.982:. ./.:4:21,64:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.84:1.000:. ./.:4:15,54:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,39:.:-1.08:1.000:. ./.:4:16,75:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,110:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.63:1.000:. ./.:4:22,52:.:-0.23:1.000:. ./.:4:21,75:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.10:1.000:. ./.:3:13,33:.:-1.26:1.000:. ./.:4:11,48:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,66:.: 0.28:1.000:. ./.:4:17,57:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,46:.:-0.74:1.000:. ./.:4:4,7:.:-2.54:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,136:.: 2.05:1.000:. ./.:4:13,70:.: 0.10:1.000:. ./.:4:13,59:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,45:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.10:1.000:. ./.:4:8,54:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.00:0.999:. ./.:4:4,52:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,51:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.19:1.000:. ./.:4:13,49:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.01:1.000:. ./.:4:15,77:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,74:.: 0.39:1.000:. ./.:4:11,53:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,40:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.06:1.000:. -chr5.1 11962462 chr5.1_011962462 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:73,0:.: 3.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:0.996:. ./.:4:27,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:61,0:.: 2.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.18:1.000:. ./.:6:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:0.996:. ./.:4:26,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:49,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.51:1.000:. ./.:5:24,0:.:-0.10:0.982:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:3:38,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.49:0.999:. ./.:4:42,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:92,0:.: 4.23:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.09:1.000:. -chr5.1 12030234 chr5.1_012030234 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:39,3:.: 1.10:1.000:. ./.:4:26,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,2:.: 1.43:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:20,2:.:-0.21:0.996:. ./.:4:31,3:.: 0.57:1.000:. ./.:4:30,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:44,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:31,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:85,0:.: 3.92:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,1:.: 2.54:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.00:1.000:. ./.:6:14,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.35:0.996:. ./.:4:31,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:49,2:.: 1.69:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.08:0.999:. ./.:4:15,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:58,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:57,1:.: 2.15:1.000:. ./.:5:10,1:.:-0.94:0.982:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:67,2:.: 2.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:37,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.54:1.000:. ./.:3:45,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:23,4:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:63,2:.: 2.61:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,3:.: 1.36:1.000:. ./.:4:49,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:49,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:38,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:51,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:42,2:.: 1.23:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,2:.: 1.10:0.999:. ./.:4:43,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:39,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.00:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:32,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:23,3:.: 0.05:1.000:. ./.:4:60,1:.: 2.35:1.000:. ./.:4:34,3:.: 0.77:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.08:1.000:. -chr5.1 12111819 chr5.1_012111819 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:391,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:230,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:76,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:125,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:462,0:.: 1.72:0.996:. ./.:4:275,90:.: 0.50:1.000:. ./.:4:491,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:120,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:122,0:.:-2.56:1.000:. ./.:3:38,0:.:-3.62:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:664,0:.: 4.25:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:413,2:.: 1.12:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.35:1.000:. ./.:6:261,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:306,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:352,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.28:0.996:. ./.:4:293,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:459,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:371,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:229,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:307,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:236,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.07:1.000:. ./.:5:265,0:.:-0.76:0.982:. ./.:4:342,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.29:1.000:. ./.:3:277,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:326,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:412,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:327,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:454,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.26:1.000:. -chr5.1 12233457 chr5.1_012233457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,85:.: 1.23:1.000:. ./.:4:89,17:.:-0.86:1.000:. ./.:4:112,36:.: 0.28:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.13:1.000:. ./.:4:149,36:.: 1.28:1.000:. ./.:4:72,59:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,9:.:-1.96:1.000:. ./.:4:75,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:75,65:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,4:.:-2.94:1.000:. ./.:4:22,17:.:-2.67:1.000:. ./.:4:94,23:.:-0.56:1.000:. ./.:4:57,55:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:102,33:.:-0.07:1.000:. ./.:4:94,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.87:0.996:. ./.:4:143,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:130,48:.: 1.09:1.000:. ./.:4:17,7:.:-3.07:1.000:. ./.:4:101,27:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,29:.:-0.15:1.000:. ./.:4:101,28:.:-0.23:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:144,39:.: 1.23:1.000:. ./.:4:74,55:.:-0.23:1.000:. ./.:4:94,30:.:-0.37:1.000:. ./.:4:130,37:.: 0.79:1.000:. ./.:4:111,28:.: 0.04:1.000:. ./.:4:81,68:.: 0.31:1.000:. ./.:4:102,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.61:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.72:1.000:. ./.:3:5,2:.:-3.53:1.000:. ./.:4:83,20:.:-0.94:1.000:. ./.:4:98,41:.: 0.04:1.000:. ./.:4:94,26:.:-0.48:1.000:. ./.:4:108,79:.: 1.33:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:115,35:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,46:.: 0.60:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:126,46:.: 0.93:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:16,9:.:-3.04:1.000:. ./.:4:100,29:.:-0.23:1.000:. ./.:4:57,74:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,28:.:-0.26:1.000:. ./.:4:163,59:.: 2.28:1.000:. ./.:4:81,53:.:-0.10:1.000:. ./.:4:130,48:.: 1.09:1.000:. ./.:4:72,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,28:.: 0.23:1.000:. ./.:4:85,66:.: 0.36:1.000:. ./.:4:100,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.25:1.000:. ./.:6:109,24:.:-0.13:1.000:. ./.:4:132,28:.: 0.60:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:124,40:.: 0.71:1.000:. ./.:4:108,34:.: 0.12:1.000:. ./.:4:150,33:.: 1.23:1.000:. ./.:4:100,77:.: 1.06:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:137,43:.: 1.14:1.000:. ./.:4:140,35:.: 1.01:0.996:. ./.:4:120,26:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,74:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,15:.:-1.69:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:155,47:.: 1.74:1.000:. ./.:4:132,29:.: 0.63:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:69,74:.: 0.14:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:117,43:.: 0.60:1.000:. ./.:4:127,44:.: 0.90:1.000:. ./.:4:81,33:.:-0.64:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:83,61:.: 0.17:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,79:.: 0.52:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:105,22:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,60:.:-0.50:1.000:. ./.:4:118,39:.: 0.52:1.000:. ./.:4:138,50:.: 1.36:1.000:. ./.:4:60,42:.:-0.96:1.000:. ./.:4:84,64:.: 0.28:1.000:. ./.:4:124,35:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,40:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,67:.: 0.31:1.000:. ./.:4:122,33:.: 0.47:1.000:. ./.:4:75,93:.: 0.82:1.000:. ./.:4:45,31:.:-1.67:1.000:. ./.:4:113,29:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,55:.:-0.64:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:121,18:.: 0.04:1.000:. ./.:4:115,39:.: 0.44:1.000:. ./.:4:74,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:115,31:.: 0.23:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:106,47:.: 0.41:1.000:. ./.:4:68,62:.:-0.21:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:161,40:.: 1.71:0.999:. ./.:4:94,82:.: 1.04:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.80:1.000:. ./.:4:131,36:.: 0.79:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:106,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,26:.:-0.29:1.000:. ./.:4:91,79:.: 0.87:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:76,59:.:-0.07:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:140,38:.: 1.09:1.000:. ./.:4:55,49:.:-0.91:1.000:. ./.:4:80,18:.:-1.07:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:110,29:.: 0.04:1.000:. ./.:4:104,29:.:-0.13:1.000:. ./.:5:74,49:.:-0.40:0.982:. ./.:4:133,40:.: 0.96:1.000:. ./.:4:123,33:.: 0.50:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:103,38:.: 0.09:1.000:. ./.:4:107,25:.:-0.15:1.000:. ./.:4:116,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,26:.:-0.29:1.000:. ./.:4:62,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:93,96:.: 1.39:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.47:1.000:. ./.:3:66,22:.:-1.34:1.000:. ./.:4:61,55:.:-0.59:1.000:. ./.:4:90,77:.: 0.79:1.000:. ./.:4:103,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,13:.:-2.94:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:130,35:.: 0.74:1.000:. ./.:4:89,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:120,26:.: 0.23:1.000:. ./.:4:90,35:.:-0.34:1.000:. ./.:4:118,37:.: 0.47:1.000:. ./.:4:82,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,32:.: 0.20:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:59,67:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,36:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,27:.:-0.42:0.999:. ./.:4:116,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:62,42:.:-0.91:1.000:. ./.:4:88,26:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,22:.:-1.26:1.000:. ./.:4:106,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:118,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:79,61:.: 0.06:1.000:. ./.:4:103,28:.:-0.18:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:119,37:.: 0.50:1.000:. ./.:4:85,64:.: 0.31:1.000:. ./.:4:64,60:.:-0.37:1.000:. ./.:4:99,33:.:-0.15:1.000:. -chr5.1 12407410 chr5.1_012407410 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,462:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,322:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1,345:.:-0.41:1.000:. ./.:4:118,293:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,477:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,452:.: 0.83:1.000:. ./.:4:50,148:.:-2.13:1.000:. ./.:4:0,394:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,371:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,88:.:-2.86:1.000:. ./.:4:44,93:.:-2.84:1.000:. ./.:4:1,408:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,383:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,462:.: 0.94:1.000:. ./.:4:92,282:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,394:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,416:.: 0.41:0.996:. ./.:4:0,396:.: 0.18:1.000:. ./.:4:136,424:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,453:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,95:.:-3.33:1.000:. ./.:4:102,290:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,527:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,375:.:-0.07:1.000:. ./.:4:12,51:.:-3.70:1.000:. ./.:4:0,437:.: 0.65:1.000:. ./.:4:93,307:.: 0.22:1.000:. ./.:4:113,327:.: 0.69:1.000:. ./.:4:93,332:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,360:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,387:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.63:1.000:. ./.:4:4,34:.:-3.99:1.000:. ./.:4:20,97:.:-3.07:1.000:. ./.:3:14,20:.:-4.04:1.000:. ./.:4:2,358:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,300:.: 0.12:1.000:. ./.:4:101,282:.: 0.03:1.000:. ./.:4:107,303:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,419:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.21:1.000:. ./.:4:125,322:.: 0.77:1.000:. ./.:4:100,311:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,482:.: 1.18:1.000:. ./.:4:80,333:.: 0.37:1.000:. ./.:4:108,384:.: 1.29:1.000:. ./.:4:185,423:.: 2.64:1.000:. ./.:4:83,310:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,380:.:-0.01:1.000:. ./.:4:74,262:.:-0.52:1.000:. ./.:4:122,339:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,369:.:-0.14:1.000:. ./.:4:122,373:.: 1.33:1.000:. ./.:4:93,277:.:-0.13:1.000:. ./.:4:95,286:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,287:.: 0.19:1.000:. ./.:4:108,267:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,433:.: 0.61:1.000:. ./.:6:29,293:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,397:.: 0.19:1.000:. ./.:4:89,289:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,414:.: 0.39:1.000:. ./.:4:87,272:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,415:.: 0.40:1.000:. ./.:4:106,320:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,286:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,424:.: 0.50:0.996:. ./.:4:1,394:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,452:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,242:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,407:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,409:.: 0.33:1.000:. ./.:4:74,234:.:-0.85:1.000:. ./.:4:99,281:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,423:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,258:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,378:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,368:.:-0.15:1.000:. ./.:4:100,335:.: 0.63:1.000:. ./.:4:113,358:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,384:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,433:.: 0.61:1.000:. ./.:4:78,216:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,258:.:-0.32:1.000:. ./.:4:107,265:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,295:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,448:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,295:.:-0.03:1.000:. ./.:4:108,337:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.28:1.000:. ./.:4:100,342:.: 0.71:1.000:. ./.:4:124,294:.: 0.43:1.000:. ./.:4:70,241:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,473:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,246:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,363:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,308:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,428:.: 0.55:1.000:. ./.:4:106,357:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,308:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,369:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,498:.: 1.36:1.000:. ./.:4:82,315:.: 0.19:0.999:. ./.:4:0,369:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,385:.: 0.06:1.000:. ./.:4:117,340:.: 0.89:1.000:. ./.:4:87,237:.:-0.66:1.000:. ./.:4:103,279:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,335:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,451:.: 0.82:1.000:. ./.:4:101,312:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1,393:.: 0.15:1.000:. ./.:4:125,308:.: 0.61:1.000:. ./.:4:107,343:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,309:.: 0.21:1.000:. ./.:4:80,277:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,317:.:-0.74:1.000:. ./.:4:71,193:.:-1.36:1.000:. ./.:4:73,259:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,332:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.29:1.000:. ./.:5:0,309:.:-0.84:0.982:. ./.:4:0,392:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,409:.: 0.33:1.000:. ./.:4:128,390:.: 1.60:1.000:. ./.:4:94,328:.: 0.48:1.000:. ./.:4:99,243:.:-0.45:1.000:. ./.:4:78,243:.:-0.70:1.000:. ./.:4:82,267:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.21:1.000:. ./.:4:99,264:.:-0.21:1.000:. ./.:4:88,295:.: 0.03:1.000:. ./.:4:67,201:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,477:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,543:.: 1.89:1.000:. ./.:3:1,320:.:-0.70:1.000:. ./.:4:105,327:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,471:.: 1.05:1.000:. ./.:4:110,274:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,471:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,414:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,117:.:-3.07:1.000:. ./.:4:84,220:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,488:.: 1.25:1.000:. ./.:4:125,313:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,374:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,329:.: 0.54:1.000:. ./.:4:67,256:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,347:.:-0.39:1.000:. ./.:4:86,291:.:-0.04:1.000:. ./.:4:109,279:.: 0.08:1.000:. ./.:4:100,309:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,389:.: 0.09:1.000:. ./.:4:63,261:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,374:.:-0.08:0.999:. ./.:4:0,434:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,366:.:-0.17:1.000:. ./.:4:72,205:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,441:.: 0.70:1.000:. ./.:4:93,299:.: 0.13:1.000:. ./.:4:84,239:.:-0.67:1.000:. ./.:4:104,268:.:-0.10:1.000:. ./.:4:91,344:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,422:.: 0.48:1.000:. ./.:4:71,276:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,422:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,506:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,516:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,324:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,453:.: 0.84:1.000:. -chr5.1 12536172 chr5.1_012536172 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:281,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:155,65:.:-0.11:1.000:. ./.:4:183,60:.: 0.26:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:228,81:.: 1.33:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:118,46:.:-1.02:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:39,10:.:-2.89:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:194,69:.: 0.59:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:197,83:.: 0.86:1.000:. ./.:4:184,75:.: 0.52:0.996:. ./.:4:180,67:.: 0.33:1.000:. ./.:4:246,84:.: 1.67:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:12,5:.:-3.40:1.000:. ./.:4:191,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:184,68:.: 0.41:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:230,62:.: 1.06:1.000:. ./.:4:214,88:.: 1.22:1.000:. ./.:4:164,58:.:-0.08:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:26,11:.:-3.08:1.000:. ./.:3:15,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:190,63:.: 0.42:1.000:. ./.:4:200,88:.: 0.99:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:232,65:.: 1.14:1.000:. ./.:4:195,44:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:189,42:.: 0.07:1.000:. ./.:4:172,51:.:-0.06:1.000:. ./.:4:179,56:.: 0.13:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:24,10:.:-3.13:1.000:. ./.:4:165,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:200,58:.: 0.50:1.000:. ./.:4:185,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:220,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:179,59:.: 0.18:1.000:. ./.:6:157,19:.:-0.83:1.000:. ./.:4:195,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:188,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:159,47:.:-0.34:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:185,64:.: 0.36:1.000:. ./.:4:134,37:.:-0.91:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:170,43:.:-0.23:0.996:. ./.:4:155,52:.:-0.32:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:128,115:.: 0.26:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:160,56:.:-0.18:1.000:. ./.:4:155,36:.:-0.58:1.000:. ./.:4:132,42:.:-0.86:1.000:. ./.:4:164,34:.:-0.47:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:215,49:.: 0.60:1.000:. ./.:4:148,42:.:-0.60:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:235,50:.: 0.94:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:153,32:.:-0.68:1.000:. ./.:4:259,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:233,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:173,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:116,38:.:-1.18:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:164,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:179,66:.: 0.29:1.000:. ./.:4:104,42:.:-1.31:1.000:. ./.:4:180,52:.: 0.08:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:131,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:143,53:.:-0.50:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:223,76:.: 1.17:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:227,88:.: 1.43:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.20:0.999:. ./.:4:278,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.97:1.000:. ./.:4:148,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:204,55:.: 0.52:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:179,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:147,34:.:-0.74:1.000:. ./.:4:193,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:122,30:.:-1.21:1.000:. ./.:4:169,58:.: 0.00:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.67:1.000:. ./.:5:190,0:.:-0.60:0.982:. ./.:4:165,37:.:-0.40:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:190,65:.: 0.46:1.000:. ./.:4:156,31:.:-0.65:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:145,48:.:-0.55:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:136,35:.:-0.91:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:217,78:.: 1.11:1.000:. ./.:3:197,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:185,55:.: 0.21:1.000:. ./.:4:239,93:.: 1.71:1.000:. ./.:4:203,82:.: 0.94:1.000:. ./.:4:26,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:226,73:.: 1.17:1.000:. ./.:4:207,91:.: 1.15:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:231,85:.: 1.45:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:162,54:.:-0.18:1.000:. ./.:4:196,53:.: 0.36:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:169,47:.:-0.18:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:210,45:.: 0.46:0.999:. ./.:4:242,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:144,58:.:-0.40:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:131,44:.:-0.84:1.000:. ./.:4:193,73:.: 0.63:1.000:. ./.:4:220,87:.: 1.30:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:195,63:.: 0.50:1.000:. ./.:4:223,74:.: 1.14:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:164,65:.: 0.03:1.000:. -chr5.1 12706300 chr5.1_012706300 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:207,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:135,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:140,54:.: 0.03:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:173,77:.: 1.22:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:98,39:.:-1.18:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:33,24:.:-2.88:1.000:. ./.:4:50,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:133,63:.: 0.07:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:185,61:.: 1.13:1.000:. ./.:4:193,77:.: 1.64:0.996:. ./.:4:163,72:.: 0.90:1.000:. ./.:4:177,78:.: 1.33:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,15:.:-3.18:1.000:. ./.:4:188,62:.: 1.22:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:162,62:.: 0.67:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:154,66:.: 0.58:1.000:. ./.:4:155,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:144,58:.: 0.20:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.82:1.000:. ./.:4:36,14:.:-3.03:1.000:. ./.:3:19,1:.:-3.67:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:149,63:.: 0.41:1.000:. ./.:4:186,62:.: 1.18:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:159,67:.: 0.71:1.000:. ./.:4:160,58:.: 0.54:1.000:. ./.:4:123,1:.:-1.46:1.000:. ./.:4:159,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,49:.:-0.03:1.000:. ./.:4:164,52:.: 0.50:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:34,9:.:-3.18:1.000:. ./.:4:125,54:.:-0.29:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:152,61:.: 0.43:1.000:. ./.:4:155,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:144,66:.: 0.37:1.000:. ./.:6:132,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:143,62:.: 0.26:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:173,49:.: 0.62:1.000:. ./.:4:123,50:.:-0.42:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:127,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:89,40:.:-1.35:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:153,43:.: 0.07:0.996:. ./.:4:147,58:.: 0.26:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:105,114:.: 0.56:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:129,49:.:-0.31:1.000:. ./.:4:107,59:.:-0.57:1.000:. ./.:4:136,63:.: 0.14:1.000:. ./.:4:161,64:.: 0.69:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:177,61:.: 0.96:1.000:. ./.:4:134,53:.:-0.12:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:161,69:.: 0.79:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:127,49:.:-0.35:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:143,76:.: 0.56:1.000:. ./.:4:106,58:.:-0.61:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:162,76:.: 0.96:1.000:. ./.:4:154,61:.: 0.48:1.000:. ./.:4:97,26:.:-1.48:1.000:. ./.:4:158,60:.: 0.54:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:129,40:.:-0.50:1.000:. ./.:4:138,48:.:-0.14:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:201,66:.: 1.58:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:174,78:.: 1.26:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:205,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:136,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:119,49:.:-0.52:1.000:. ./.:4:114,57:.:-0.46:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:153,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:131,57:.:-0.10:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:133,42:.:-0.37:1.000:. ./.:4:153,81:.: 0.88:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:103,48:.:-0.88:1.000:. ./.:4:148,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.08:1.000:. ./.:5:176,0:.:-0.35:0.982:. ./.:4:144,62:.: 0.28:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:163,67:.: 0.79:1.000:. ./.:4:121,43:.:-0.61:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:161,57:.: 0.54:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:125,41:.:-0.57:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:191,71:.: 1.47:1.000:. ./.:3:153,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:121,50:.:-0.46:1.000:. ./.:4:196,83:.: 1.84:1.000:. ./.:4:129,60:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:170,66:.: 0.92:1.000:. ./.:4:183,76:.: 1.41:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:136,63:.: 0.14:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:141,68:.: 0.35:1.000:. ./.:4:144,59:.: 0.22:1.000:. ./.:4:209,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:150,64:.: 0.45:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:140,59:.: 0.14:0.999:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:112,44:.:-0.78:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:111,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:111,50:.:-0.67:1.000:. ./.:4:188,81:.: 1.62:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:148,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:162,77:.: 0.99:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:141,66:.: 0.31:1.000:. -chr5.1 12769948 chr5.1_012769948 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:141,55:.: 0.94:1.000:. ./.:4:85,73:.: 0.12:1.000:. ./.:4:116,56:.: 0.42:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:110,126:.: 1.82:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:53,84:.:-0.34:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:144,41:.: 0.70:1.000:. ./.:4:15,10:.:-2.78:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:136,45:.: 0.62:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:129,48:.: 0.53:1.000:. ./.:4:122,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:127,51:.: 0.55:1.000:. ./.:4:86,111:.: 0.97:0.996:. ./.:4:132,60:.: 0.86:1.000:. ./.:4:94,134:.: 1.64:1.000:. ./.:4:253,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:13,4:.:-2.96:1.000:. ./.:4:117,54:.: 0.40:1.000:. ./.:4:168,54:.: 1.51:1.000:. ./.:4:117,46:.: 0.22:1.000:. ./.:4:8,3:.:-3.09:1.000:. ./.:4:110,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:124,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:172,66:.: 1.86:1.000:. ./.:4:141,53:.: 0.90:1.000:. ./.:4:100,30:.:-0.49:1.000:. ./.:4:106,45:.:-0.04:1.000:. ./.:4:4,2:.:-3.20:1.000:. ./.:4:19,6:.:-2.78:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:144,58:.: 1.07:1.000:. ./.:4:103,46:.:-0.08:1.000:. ./.:4:128,49:.: 0.53:1.000:. ./.:4:114,38:.:-0.02:1.000:. ./.:4:101,101:.: 1.07:1.000:. ./.:4:102,36:.:-0.32:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:100,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:56,62:.:-0.76:1.000:. ./.:4:131,63:.: 0.90:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:148,68:.: 1.38:1.000:. ./.:4:19,11:.:-2.68:1.000:. ./.:4:55,56:.:-0.91:1.000:. ./.:4:49,18:.:-1.87:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:124,61:.: 0.70:1.000:. ./.:4:126,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:60,61:.:-0.69:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:83,39:.:-0.67:1.000:. ./.:4:47,82:.:-0.52:1.000:. ./.:6:75,68:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,90:.: 0.77:1.000:. ./.:4:67,43:.:-0.93:1.000:. ./.:4:98,43:.:-0.26:1.000:. ./.:4:75,82:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:85,39:.:-0.63:1.000:. ./.:4:113,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:64,83:.:-0.12:0.996:. ./.:4:77,83:.: 0.16:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:89,20:.:-0.95:1.000:. ./.:4:61,84:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:29,107:.:-0.36:1.000:. ./.:4:75,31:.:-1.02:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.73:1.000:. ./.:4:113,44:.: 0.09:1.000:. ./.:4:118,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:91,44:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,78:.:-0.52:1.000:. ./.:4:109,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:137,50:.: 0.75:1.000:. ./.:4:103,42:.:-0.17:1.000:. ./.:4:78,25:.:-1.08:1.000:. ./.:4:132,55:.: 0.75:1.000:. ./.:4:99,20:.:-0.73:1.000:. ./.:4:77,40:.:-0.78:1.000:. ./.:4:106,40:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:90,39:.:-0.52:1.000:. ./.:4:90,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:120,38:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,31:.:-0.89:1.000:. ./.:4:145,41:.: 0.73:1.000:. ./.:4:100,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:86,37:.:-0.65:1.000:. ./.:4:118,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:162,46:.: 1.21:1.000:. ./.:4:106,36:.:-0.23:1.000:. ./.:4:117,54:.: 0.40:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:112,48:.: 0.16:1.000:. ./.:4:82,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,63:.:-0.73:1.000:. ./.:4:82,30:.:-0.89:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:160,63:.: 1.53:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:105,38:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,104:.: 1.07:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.40:0.999:. ./.:4:176,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:62,78:.:-0.28:1.000:. ./.:4:85,38:.:-0.65:1.000:. ./.:4:115,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.89:1.000:. ./.:4:130,35:.: 0.27:1.000:. ./.:4:81,41:.:-0.67:1.000:. ./.:4:105,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:91,51:.:-0.23:1.000:. ./.:4:108,40:.:-0.10:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,31:.:-0.56:1.000:. ./.:4:85,36:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,67:.:-0.47:1.000:. ./.:4:85,21:.:-1.02:1.000:. ./.:4:147,48:.: 0.92:1.000:. ./.:5:85,25:.:-0.93:0.982:. ./.:4:103,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:129,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:136,42:.: 0.55:1.000:. ./.:4:109,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.34:1.000:. ./.:4:106,33:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,69:.:-0.41:1.000:. ./.:4:107,33:.:-0.28:1.000:. ./.:4:117,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:75,34:.:-0.95:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:100,139:.: 1.88:1.000:. ./.:3:84,66:.:-0.06:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:133,54:.: 0.75:1.000:. ./.:4:105,45:.:-0.06:1.000:. ./.:4:131,120:.: 2.14:1.000:. ./.:4:88,96:.: 0.68:1.000:. ./.:4:7,7:.:-3.02:1.000:. ./.:4:116,47:.: 0.22:1.000:. ./.:4:77,72:.:-0.08:1.000:. ./.:4:113,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:188,53:.: 1.93:1.000:. ./.:4:143,57:.: 1.03:1.000:. ./.:4:128,52:.: 0.60:1.000:. ./.:4:145,54:.: 1.01:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:91,29:.:-0.71:1.000:. ./.:4:133,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:128,55:.: 0.66:1.000:. ./.:4:50,66:.:-0.80:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:138,61:.: 1.01:1.000:. ./.:4:116,55:.: 0.40:0.999:. ./.:4:131,45:.: 0.51:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:95,32:.:-0.56:1.000:. ./.:4:123,50:.: 0.44:1.000:. ./.:4:122,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,62:.:-0.52:1.000:. ./.:4:120,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:137,51:.: 0.77:1.000:. ./.:4:125,62:.: 0.75:1.000:. ./.:4:140,49:.: 0.79:1.000:. ./.:4:142,44:.: 0.73:1.000:. ./.:4:151,58:.: 1.23:1.000:. ./.:4:170,63:.: 1.75:1.000:. ./.:4:259,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:91,101:.: 0.86:1.000:. -chr5.1 12970127 chr5.1_012970127 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:191,208:0.53: 1.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,146:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,76:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:260,79:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:128,301:0.70: 1.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:309,98:0.25: 1.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,94:0.28: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,141:0.47:-0.16:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,139:0.82:-2.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,68:0.56:-2.74:1.000:0.968 0/0/0/1:4:247,59:0.20:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,86:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,183:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,239:0.74: 0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:249,80:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,185:0.54: 0.35:0.996:0.985 0/0/1/1:4:152,180:0.55: 0.17:1.000:0.981 0/1/1/1:4:121,335:0.73: 1.90:1.000:0.998 0/0/0/0:4:460,0:0.00: 1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,53:0.38:-2.46:1.000:0.548 0/0/1/1:4:155,186:0.55: 0.30:1.000:0.978 0/0/1/1:4:215,213:0.51: 1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:149,172:0.54: 0.02:1.000:0.986 0/1/1/1:4:12,83:0.87:-3.13:1.000:0.872 0/0/1/1:4:153,132:0.47:-0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:152,145:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,153:0.47: 0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:115,329:0.74: 1.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,144:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,143:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:179,70:0.29:-0.98:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,68:0.64:-2.96:1.000:0.678 0/0/1/1:4:76,87:0.54:-2.18:1.000:0.987 0/0/1:3:38,21:0.36:-3.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,87:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:253,90:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:177,172:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,203:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,243:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,69:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:362,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,176:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,205:0.72:-0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:262,68:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,72:0.25:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,176:0.45: 1.03:1.000:0.984 0/1/1/1:4:13,81:0.86:-3.14:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,268:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,105:0.54:-1.69:1.000:0.989 0/0/0/1:4:199,54:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,191:0.54: 0.57:1.000:0.990 0/0/0/1:4:211,74:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:305,96:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,245:0.78:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,235:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,126:0.45:-0.46:1.000:0.977 0/1/1/1:4:77,231:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,156:0.52:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:69,185:0.73:-0.91:1.000:0.695 0/1/1/1:4:85,227:0.73:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,146:0.48:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:254,91:0.27: 0.35:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,241:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:379,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,219:0.73:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:200,83:0.30:-0.51:1.000:0.985 0/0/0/0:4:351,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,224:0.73:-0.16:0.996:0.997 0/0/1/1:4:155,158:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:301,96:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,57:0.26:-1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,166:0.53:-0.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:181,169:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,241:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,100:0.47:-1.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:79,226:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:278,75:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,198:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,179:0.51: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,141:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,189:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,183:0.45: 1.26:1.000:0.984 0/0/1/1:4:170,177:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:194,77:0.29:-0.68:1.000:0.991 0/0/1/1:4:212,198:0.49: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,118:0.51:-1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,163:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,152:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,84:0.28:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,121:0.49:-0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,145:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,205:0.55: 0.75:1.000:0.975 0/0/1/1:4:148,105:0.42:-0.93:1.000:0.926 0/1/1/1:4:91,307:0.77: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,190:0.51: 0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:254,68:0.22: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,65:0.22:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,176:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/1/1/1:4:90,274:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,192:0.74:-0.82:1.000:0.998 0/0/0/1:4:273,84:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,66:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,89:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,155:0.56:-0.55:1.000:0.967 0/1/1/1:4:77,235:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,127:0.48:-0.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:256,78:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:344,94:0.22: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,91:0.29:-0.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:169,162:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:213,221:0.52: 1.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:316,79:0.21: 1.05:0.999:1.000 0/0/0/1:4:260,100:0.28: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/0:4:219,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,93:0.24: 1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,330:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,129:0.48:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:277,92:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,127:0.46:-0.54:1.000:0.988 0/0/1/1:4:162,132:0.46:-0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:158,158:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:254,86:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,155:0.46: 0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:182,144:0.45: 0.09:1.000:0.980 0/0/1/1:4:180,178:0.51: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:297,92:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,81:0.26:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,138:0.58:-1.10:1.000:0.920 0/1/1/1:4:68,179:0.73:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,135:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:200,169:0.47: 0.69:1.000:0.991 0/0/0/1/1:5:133,96:0.43:-1.26:0.982:0.946 0/0/1/1:4:121,148:0.56:-0.71:1.000:0.972 0/0/0/1:4:230,83:0.27:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,198:0.48: 1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,152:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,210:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,204:0.79:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,345:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,89:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:172,164:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:269,76:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,169:0.71:-1.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:345,119:0.26: 2.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:264,217:0.46: 2.24:1.000:0.987 0/1/1:3:80,200:0.72:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,142:0.47:-0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:195,217:0.53: 1.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:67,223:0.77:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,233:0.53: 1.76:1.000:0.992 0/1/1/1:4:80,240:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,81:0.55:-2.38:1.000:0.979 0/0/1/1:4:158,136:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:165,167:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:218,179:0.46: 1.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:242,215:0.48: 1.91:1.000:0.995 0/1/1/1:4:72,252:0.78: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,155:0.45: 0.38:1.000:0.984 0/0/1/1:4:170,214:0.56: 0.89:1.000:0.961 0/0/0/1:4:249,70:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,72:0.27:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,145:0.51:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,169:0.48: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,243:0.81:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,76:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:172,158:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:238,73:0.24:-0.12:0.999:1.000 0/0/1/1:4:193,176:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:274,88:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:321,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,206:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,80:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,162:0.53:-0.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:53,187:0.78:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,142:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:212,197:0.49: 1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,88:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,156:0.47: 0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:172,146:0.47:-0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:303,106:0.27: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:198,235:0.55: 1.58:1.000:0.980 0/0/0/1:4:371,122:0.25: 2.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:252,68:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,160:0.47: 0.42:1.000:0.990 -chr5.1 13232590 chr5.1_013232590 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:56,45:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,38:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,18:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,29:0.45:-0.91:1.000:0.977 0/0/1/1:4:67,48:0.44: 1.02:1.000:0.974 0/0/1/1:4:40,41:0.53:-0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,49:0.56: 0.01:1.000:0.970 0/0/1/1:4:52,48:0.51: 0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,71:0.68: 0.60:1.000:0.963 0/0/1/1:4:16,18:0.55:-2.38:1.000:0.980 0/0/1/1:4:19,11:0.40:-2.55:1.000:0.747 0/0/1/1:4:47,34:0.45:-0.41:1.000:0.977 0/1/1/1:4:28,54:0.67:-0.37:1.000:0.911 0/0/1/1:4:56,33:0.40:-0.07:1.000:0.784 0/1/1/1:4:29,55:0.66:-0.28:1.000:0.895 0/0/0/1:4:73,19:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,37:0.41: 0.26:0.996:0.862 0/1/1/1:4:25,75:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,35:0.25: 2.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,62:0.56: 1.02:1.000:0.969 0/0/0/1:4:19,6:0.27:-2.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,37:0.44:-0.07:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,62:0.80:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.48:-3.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,44:0.43: 0.81:1.000:0.940 0/0/1/1:4:35,36:0.53:-0.83:1.000:0.992 0/0/0/1:4:64,17:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,75:0.69: 0.81:1.000:0.972 0/1/1/1:4:26,60:0.70:-0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:50,48:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,17:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,10:0.83:-3.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,21:0.53:-2.09:1.000:0.990 0/0/0:3:15,2:0.14:-3.10:1.000:0.772 0/0/1/1:4:48,47:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:69,14:0.19:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,37:0.42: 0.18:1.000:0.903 0/0/0/1:4:73,23:0.27: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,44:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,44:0.44: 0.68:1.000:0.965 0/0/0/1:4:74,23:0.27: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,16:0.17: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,57:0.49: 1.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,34:0.34: 0.77:1.000:0.856 0/1/1/1:4:34,60:0.65: 0.14:1.000:0.787 0/0/0/1:4:34,10:0.26:-1.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,48:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,16:0.38:-1.88:1.000:0.529 0/0/0/1:4:54,23:0.33:-0.58:1.000:0.924 0/0/1/1:4:53,39:0.45: 0.05:1.000:0.981 0/0/1/1:4:45,44:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:60,42:0.44: 0.47:1.000:0.966 0/0/0/1:4:81,19:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,48:0.46: 0.81:1.000:0.989 0/0/1/1:4:46,36:0.47:-0.37:1.000:0.990 0/1/1/1:4:36,90:0.72: 1.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,52:0.49: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:32,49:0.62:-0.41:1.000:0.777 0/1/1/1:4:29,80:0.74: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,45:0.69:-1.04:1.000:0.972 0/0/0/1:4:100,33:0.28: 1.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,51:0.48: 0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,53:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,34:0.32: 1.15:1.000:0.957 0/0/1/1:4:40,29:0.45:-0.91:1.000:0.977 0/0/1/1:4:60,39:0.42: 0.35:1.000:0.921 0/0/1/1:4:67,54:0.47: 1.27:0.996:0.993 0/0/1/1:4:40,34:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,75:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,37:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,49:0.45: 1.06:1.000:0.979 1/1/1/1:4:1,75:0.99:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,49:0.42: 1.40:1.000:0.925 0/0/1/1:4:50,27:0.38:-0.58:1.000:0.565 0/0/0/1:4:81,16:0.19: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,42:0.46: 0.26:1.000:0.987 0/0/1/1:4:53,50:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,71:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,56:0.58: 0.39:1.000:0.922 0/1/1/1:4:30,81:0.73: 0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,58:0.46: 1.78:1.000:0.989 0/0/1/1:4:36,27:0.46:-1.16:1.000:0.985 0/0/1/1:4:35,40:0.55:-0.66:1.000:0.976 0/1/1/1:4:22,69:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,50:0.64:-0.49:1.000:0.738 0/1/1/1:4:21,56:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,33:0.46:-0.58:1.000:0.985 0/0/0/1:4:70,24:0.29: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,52:0.66:-0.45:1.000:0.869 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,79:0.72: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,11:0.20:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,54:0.41: 2.07:1.000:0.885 0/0/0/1:4:107,27:0.23: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,41:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,44:0.49: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:133,0:0.00: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,24:0.27: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,26:0.29: 0.35:1.000:0.990 0/0/0/1:4:71,27:0.31: 0.31:1.000:0.978 0/1/1/1:4:14,64:0.82:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,87:0.81: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,52:0.67:-0.49:1.000:0.910 0/0/1/1:4:42,61:0.61: 0.52:1.000:0.720 0/0/1/1:4:46,44:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,22:0.22: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,26:0.30: 0.31:1.000:0.988 0/1/1/1:4:31,72:0.70: 0.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:77,54:0.44: 1.69:1.000:0.966 0/0/1/1:4:54,50:0.51: 0.56:0.999:0.997 0/1/1/1:4:26,69:0.73: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,21:0.60:-2.30:1.000:0.797 0/0/0/1:4:101,22:0.21: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,27:0.39:-0.70:1.000:0.729 0/0/0/1:4:69,11:0.16:-0.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,69:0.70: 0.39:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,25:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,64:0.69: 0.14:1.000:0.971 0/0/1/1:4:49,52:0.54: 0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:62,54:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,49:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,24:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,29:0.29: 0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,56:0.58: 0.39:1.000:0.922 0/0/1/1:4:34,38:0.55:-0.79:1.000:0.981 0/0/1/1:4:41,30:0.45:-0.83:1.000:0.979 0/0/1/1:4:51,38:0.45:-0.07:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:36,53:0.61:-0.07:0.982:0.970 0/0/1/1:4:40,32:0.47:-0.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,29:0.41:-0.66:1.000:0.890 0/0/1/1:4:55,35:0.42:-0.03:1.000:0.900 0/0/0/1:4:71,28:0.31: 0.35:1.000:0.967 0/0/1/1:4:50,44:0.49: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,82:0.66: 1.48:1.000:0.874 0/0/1/1:4:46,50:0.54: 0.22:1.000:0.986 0/1/1/1:4:23,62:0.73:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,42:0.52:-0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,17:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,23:0.27: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,56:0.52: 0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,52:0.52: 0.56:1.000:0.994 0/1/1:3:22,49:0.70:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,38:0.44: 0.05:1.000:0.968 0/0/1/1:4:42,39:0.51:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,37:0.44:-0.07:1.000:0.972 0/0/1/1:4:61,56:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,62:0.68: 0.10:1.000:0.940 0/1/1/1:4:6,14:0.71:-2.97:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,42:0.48: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,41:0.52:-0.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,74:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,55:0.43: 1.90:1.000:0.951 0/0/1/1:4:55,41:0.45: 0.22:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,41:0.41: 0.73:1.000:0.850 0/0/1/1:4:37,47:0.58:-0.28:1.000:0.923 0/0/1/1:4:30,30:0.52:-1.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,18:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,39:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,13:0.45:-2.51:1.000:0.976 0/1/1/1:4:33,59:0.65: 0.05:1.000:0.811 0/0/1/1:4:36,42:0.56:-0.53:1.000:0.970 0/0/1/1:4:52,33:0.42:-0.24:0.999:0.897 0/1/1/1:4:18,50:0.74:-0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,43:0.64:-0.91:1.000:0.636 0/0/1/1:4:41,43:0.53:-0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,37:0.49:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,40:0.56:-0.70:1.000:0.967 0/1/1/1:4:24,54:0.70:-0.53:1.000:0.984 0/0/1/1:4:48,36:0.46:-0.28:1.000:0.985 0/0/0/1:4:74,16:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,23:0.20: 1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,66:0.71: 0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:58,47:0.47: 0.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,20:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,40:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,60:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,62:0.48: 1.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,39:0.47:-0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,41:0.46: 0.14:1.000:0.989 -chr5.1 13499287 chr5.1_013499287 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:57,30:.: 0.23:1.000:. ./.:4:54,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,29:.: 0.16:1.000:. ./.:4:71,7:.:-0.07:1.000:. ./.:4:61,69:.: 1.67:1.000:. ./.:4:134,68:.: 4.08:1.000:. ./.:4:25,30:.:-0.84:1.000:. ./.:4:79,34:.: 1.10:1.000:. ./.:4:44,21:.:-0.50:1.000:. ./.:4:19,6:.:-1.84:1.000:. ./.:4:24,6:.:-1.67:1.000:. ./.:4:94,12:.: 0.87:1.000:. ./.:4:62,22:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,28:.:-0.20:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.04:1.000:. ./.:4:67,34:.: 0.70:1.000:. ./.:4:32,36:.:-0.40:0.996:. ./.:4:90,5:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,34:.: 0.83:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:46,32:.:-0.07:1.000:. ./.:4:40,27:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,6:.:-2.34:1.000:. ./.:4:75,48:.: 1.43:1.000:. ./.:4:109,32:.: 2.04:1.000:. ./.:4:68,32:.: 0.67:1.000:. ./.:4:72,32:.: 0.80:1.000:. ./.:4:63,54:.: 1.23:1.000:. ./.:4:55,47:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,42:.: 0.06:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:21,4:.:-1.84:1.000:. ./.:3:11,2:.:-2.24:1.000:. ./.:4:34,18:.:-0.94:1.000:. ./.:4:66,20:.: 0.20:1.000:. ./.:4:74,36:.: 1.00:1.000:. ./.:4:69,25:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,33:.: 0.36:1.000:. ./.:4:54,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:73,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:76,20:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,24:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,5:.: 0.83:1.000:. ./.:4:74,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:27,15:.:-1.27:1.000:. ./.:4:41,31:.:-0.27:1.000:. ./.:4:37,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:87,5:.: 0.40:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,25:.: 0.93:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:77,41:.: 1.27:1.000:. ./.:4:49,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:69,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:63,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:31,26:.:-0.77:1.000:. ./.:6:22,23:.:-1.17:1.000:. ./.:4:29,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:54,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,38:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:76,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:74,46:.: 1.33:1.000:. ./.:4:21,18:.:-1.37:1.000:. ./.:4:57,12:.:-0.37:1.000:. ./.:4:34,43:.:-0.10:0.996:. ./.:4:82,15:.: 0.57:1.000:. ./.:4:76,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:21,5:.:-1.81:1.000:. ./.:4:92,43:.: 1.84:1.000:. ./.:4:58,26:.: 0.13:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.54:1.000:. ./.:4:78,25:.: 0.77:1.000:. ./.:4:73,28:.: 0.70:1.000:. ./.:4:62,28:.: 0.33:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:49,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,15:.:-0.34:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:39,20:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:43,2:.:-1.17:1.000:. ./.:4:49,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:84,5:.: 0.30:1.000:. ./.:4:30,13:.:-1.24:1.000:. ./.:4:23,17:.:-1.34:1.000:. ./.:4:63,42:.: 0.83:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.23:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.06:1.000:. ./.:4:63,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,23:.: 0.06:1.000:. ./.:4:72,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:82,22:.: 0.80:1.000:. ./.:4:83,26:.: 0.97:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.74:1.000:. ./.:4:48,28:.:-0.14:1.000:. ./.:4:50,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.94:1.000:. ./.:4:76,26:.: 0.73:1.000:. ./.:4:28,32:.:-0.67:1.000:. ./.:4:36,16:.:-0.94:1.000:. ./.:4:91,44:.: 1.84:1.000:. ./.:4:151,16:.: 2.91:1.000:. ./.:4:96,6:.: 0.73:1.000:. ./.:4:36,15:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,51:.: 0.03:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:69,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:41,6:.:-1.11:1.000:. ./.:4:78,12:.: 0.33:1.000:. ./.:4:40,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:74,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:33,15:.:-1.07:1.000:. ./.:4:35,22:.:-0.77:1.000:. ./.:4:73,57:.: 1.67:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:65,30:.: 0.50:1.000:. ./.:4:140,36:.: 3.21:1.000:. ./.:4:63,12:.:-0.17:1.000:. ./.:4:82,30:.: 1.07:1.000:. ./.:4:78,9:.: 0.23:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:27,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:29,17:.:-1.14:1.000:. ./.:4:72,44:.: 1.20:1.000:. ./.:4:32,24:.:-0.81:1.000:. ./.:5:33,19:.:-0.94:0.982:. ./.:4:39,38:.:-0.10:1.000:. ./.:4:42,18:.:-0.67:1.000:. ./.:4:87,15:.: 0.73:1.000:. ./.:4:95,33:.: 1.60:1.000:. ./.:4:71,34:.: 0.83:1.000:. ./.:4:55,25:.: 0.00:1.000:. ./.:4:34,24:.:-0.74:1.000:. ./.:4:34,8:.:-1.27:1.000:. ./.:4:50,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:94,17:.: 1.03:1.000:. ./.:4:57,32:.: 0.30:1.000:. ./.:4:108,30:.: 1.94:1.000:. ./.:4:40,45:.: 0.16:1.000:. ./.:3:31,43:.:-0.20:1.000:. ./.:4:101,18:.: 1.30:1.000:. ./.:4:58,36:.: 0.46:1.000:. ./.:4:81,33:.: 1.13:1.000:. ./.:4:37,43:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,62:.: 0.57:1.000:. ./.:4:13,8:.:-1.98:1.000:. ./.:4:62,12:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,28:.:-1.07:1.000:. ./.:4:46,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:59,47:.: 0.87:1.000:. ./.:4:59,37:.: 0.53:1.000:. ./.:4:36,28:.:-0.54:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:48,22:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,25:.: 0.40:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:32,16:.:-1.07:1.000:. ./.:4:78,15:.: 0.43:1.000:. ./.:4:42,2:.:-1.21:1.000:. ./.:4:91,19:.: 1.00:0.999:. ./.:4:55,34:.: 0.30:1.000:. ./.:4:55,18:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,16:.: 0.20:1.000:. ./.:4:73,33:.: 0.87:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:36,15:.:-0.97:1.000:. ./.:4:65,30:.: 0.50:1.000:. ./.:4:67,30:.: 0.57:1.000:. ./.:4:46,20:.:-0.47:1.000:. ./.:4:48,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:59,46:.: 0.83:1.000:. ./.:4:57,31:.: 0.26:1.000:. ./.:4:96,35:.: 1.70:1.000:. ./.:4:65,33:.: 0.60:1.000:. ./.:4:69,24:.: 0.43:1.000:. -chr5.1 13619078 chr5.1_013619078 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:214,56:.: 0.15:1.000:. ./.:4:165,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:279,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:278,60:.: 1.32:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:117,40:.:-1.80:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:187,45:.:-0.51:1.000:. ./.:4:71,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:207,72:.: 0.30:1.000:. ./.:4:199,71:.: 0.15:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:254,71:.: 1.10:0.996:. ./.:4:122,116:.:-0.40:1.000:. ./.:4:267,73:.: 1.35:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:47,16:.:-3.42:1.000:. ./.:4:188,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:240,71:.: 0.85:1.000:. ./.:4:190,54:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,5:.:-3.86:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:228,90:.: 0.98:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:40,5:.:-3.73:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.95:1.000:. ./.:3:33,0:.:-3.93:1.000:. ./.:4:196,47:.:-0.32:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:228,67:.: 0.58:1.000:. ./.:4:202,60:.: 0.01:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:178,52:.:-0.54:1.000:. ./.:4:344,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:268,66:.: 1.25:1.000:. ./.:4:78,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:190,51:.:-0.35:1.000:. ./.:4:185,60:.:-0.28:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:235,76:.: 0.85:1.000:. ./.:4:237,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:209,66:.: 0.23:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:227,60:.: 0.44:1.000:. ./.:4:199,76:.: 0.23:1.000:. ./.:6:174,56:.:-0.54:1.000:. ./.:4:238,51:.: 0.48:1.000:. ./.:4:192,49:.:-0.35:1.000:. ./.:4:304,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:210,49:.:-0.04:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:215,58:.: 0.20:0.996:. ./.:4:199,55:.:-0.13:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,36:.:-1.52:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:221,76:.: 0.61:1.000:. ./.:4:161,140:.: 0.68:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:249,79:.: 1.15:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:169,45:.:-0.82:1.000:. ./.:4:224,62:.: 0.42:1.000:. ./.:4:315,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:182,50:.:-0.51:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:231,74:.: 0.75:1.000:. ./.:4:172,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:196,44:.:-0.37:1.000:. ./.:4:223,58:.: 0.34:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:222,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:206,62:.: 0.11:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:239,90:.: 1.16:1.000:. ./.:4:223,63:.: 0.42:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:190,43:.:-0.49:1.000:. ./.:4:327,3:.: 1.18:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:345,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:215,76:.: 0.51:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:184,56:.:-0.37:1.000:. ./.:4:219,55:.: 0.22:1.000:. ./.:4:276,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:220,65:.: 0.41:1.000:. ./.:4:224,88:.: 0.87:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.75:0.999:. ./.:4:315,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:174,51:.:-0.63:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:214,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:172,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:211,57:.: 0.11:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:268,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:178,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:175,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:186,45:.:-0.52:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:185,66:.:-0.18:1.000:. ./.:5:185,41:.:-0.61:0.982:. ./.:4:232,57:.: 0.48:1.000:. ./.:4:194,71:.: 0.06:1.000:. ./.:4:253,66:.: 0.99:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:200,43:.:-0.32:1.000:. ./.:4:159,59:.:-0.75:1.000:. ./.:4:219,61:.: 0.32:1.000:. ./.:4:217,53:.: 0.15:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:257,74:.: 1.20:1.000:. ./.:3:126,84:.:-0.88:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:215,75:.: 0.49:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:199,90:.: 0.48:1.000:. ./.:4:187,57:.:-0.30:1.000:. ./.:4:45,8:.:-3.59:1.000:. ./.:4:190,49:.:-0.39:1.000:. ./.:4:201,71:.: 0.18:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:249,65:.: 0.91:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:167,53:.:-0.71:1.000:. ./.:4:203,64:.: 0.10:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:223,75:.: 0.63:1.000:. ./.:4:247,63:.: 0.84:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:190,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.63:0.999:. ./.:4:194,60:.:-0.13:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:194,57:.:-0.18:1.000:. ./.:4:220,64:.: 0.39:1.000:. ./.:4:164,56:.:-0.71:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:224,68:.: 0.53:1.000:. ./.:4:210,67:.: 0.27:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:277,98:.: 1.96:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:193,64:.:-0.08:1.000:. -chr5.1 13902147 chr5.1_013902147 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,23:.:-0.91:1.000:. ./.:4:51,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:34,45:.:-0.15:1.000:. ./.:4:31,10:.:-1.26:1.000:. ./.:4:35,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,18:.:-0.58:1.000:. ./.:4:34,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:59,15:.:-0.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:36,16:.:-0.94:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:64,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:24,15:.:-1.32:1.000:. ./.:4:49,65:.: 0.88:0.996:. ./.:4:72,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:44,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:36,6:.:-1.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:49,11:.:-0.70:1.000:. ./.:4:16,9:.:-1.73:1.000:. ./.:4:62,59:.: 1.08:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:33,11:.:-1.17:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,18:.:-0.44:1.000:. ./.:4:105,32:.: 1.55:1.000:. ./.:4:38,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:39,21:.:-0.70:1.000:. ./.:3:16,3:.:-1.90:1.000:. ./.:4:30,24:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,34:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,30:.:-0.79:1.000:. ./.:4:175,1:.: 2.69:1.000:. ./.:4:75,91:.: 2.40:1.000:. ./.:4:52,61:.: 0.85:1.000:. ./.:4:84,31:.: 0.91:1.000:. ./.:4:109,33:.: 1.70:1.000:. ./.:4:74,64:.: 1.58:1.000:. ./.:4:75,44:.: 1.02:1.000:. ./.:4:91,34:.: 1.20:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:30,8:.:-1.34:1.000:. ./.:4:67,21:.: 0.12:1.000:. ./.:4:82,35:.: 0.97:1.000:. ./.:4:59,23:.:-0.06:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:72,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:36,12:.:-1.05:1.000:. ./.:4:116,31:.: 1.84:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:72,59:.: 1.38:1.000:. ./.:6:88,20:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,25:.: 0.50:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:91,80:.: 2.55:1.000:. ./.:4:109,31:.: 1.64:1.000:. ./.:4:88,29:.: 0.97:1.000:. ./.:4:87,24:.: 0.79:1.000:. ./.:4:43,40:.:-0.03:1.000:. ./.:4:70,18:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,74:.: 1.52:0.996:. ./.:4:28,11:.:-1.32:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:55,27:.:-0.06:1.000:. ./.:4:77,88:.: 2.37:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:82,33:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,64:.: 0.79:1.000:. ./.:4:71,32:.: 0.56:1.000:. ./.:4:63,51:.: 0.88:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:98,27:.: 1.20:1.000:. ./.:4:71,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:99,27:.: 1.23:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.23:1.000:. ./.:4:77,82:.: 2.20:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,22:.: 0.64:1.000:. ./.:4:59,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:105,34:.: 1.61:1.000:. ./.:4:25,11:.:-1.40:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:97,32:.: 1.32:1.000:. ./.:4:64,12:.:-0.23:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:40,42:.:-0.06:1.000:. ./.:4:62,21:.:-0.03:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:59,65:.: 1.17:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:54,60:.: 0.88:1.000:. ./.:4:79,32:.: 0.79:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:34,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:48,10:.:-0.76:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.12:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:40,50:.: 0.18:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:63,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:95,29:.: 1.17:1.000:. ./.:4:67,22:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,29:.: 1.00:1.000:. ./.:4:72,33:.: 0.62:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:44,51:.: 0.32:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:51,56:.: 0.67:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:76,31:.: 0.67:1.000:. ./.:4:69,48:.: 0.97:1.000:. ./.:4:108,32:.: 1.64:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.41:1.000:. ./.:4:53,53:.: 0.64:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.05:1.000:. ./.:5:67,19:.: 0.06:0.982:. ./.:4:38,51:.: 0.15:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:41,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:49,53:.: 0.53:1.000:. ./.:4:67,21:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:68,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,27:.: 0.70:1.000:. ./.:4:73,18:.: 0.21:1.000:. ./.:4:46,8:.:-0.88:1.000:. ./.:4:69,6:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:36,31:.:-0.50:1.000:. ./.:3:22,11:.:-1.49:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:53,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:52,23:.:-0.26:1.000:. ./.:4:29,25:.:-0.88:1.000:. ./.:4:33,7:.:-1.29:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:19,6:.:-1.73:1.000:. ./.:4:62,61:.: 1.14:1.000:. ./.:4:58,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:39,11:.:-0.99:1.000:. ./.:4:40,13:.:-0.91:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:35,30:.:-0.55:1.000:. ./.:4:49,25:.:-0.29:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,7:.:-0.99:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:42,5:.:-1.08:0.999:. ./.:4:33,10:.:-1.20:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:37,7:.:-1.17:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,20:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:68,39:.: 0.67:1.000:. ./.:4:30,43:.:-0.32:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:64,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:56,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.91:1.000:. ./.:4:24,31:.:-0.85:1.000:. ./.:4:34,20:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,10:.:-1.11:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,12:.:-0.99:1.000:. -chr5.1 14095733 chr5.1_014095733 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,14:.: 0.49:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,11:.:-0.56:1.000:. ./.:4:74,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:194,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:46,14:.:-1.32:1.000:. ./.:4:55,7:.:-1.26:1.000:. ./.:4:58,18:.:-0.85:1.000:. ./.:4:87,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,33:.:-1.17:1.000:. ./.:4:14,48:.:-1.26:1.000:. ./.:4:33,30:.:-1.23:1.000:. ./.:4:79,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:100,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,24:.:-0.53:1.000:. ./.:4:72,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.44:0.996:. ./.:4:75,25:.:-0.15:1.000:. ./.:4:130,16:.: 1.20:1.000:. ./.:4:83,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:48,32:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,23:.:-1.00:1.000:. ./.:4:110,14:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,12:.:-0.03:1.000:. ./.:4:41,9:.:-1.61:1.000:. ./.:4:72,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:15,18:.:-2.11:1.000:. ./.:4:44,17:.:-1.29:1.000:. ./.:4:80,41:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,7:.:-0.68:1.000:. ./.:4:54,5:.:-1.35:1.000:. ./.:4:54,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,14:.:-2.11:1.000:. ./.:4:37,30:.:-1.12:1.000:. ./.:3:7,5:.:-2.72:1.000:. ./.:4:72,9:.:-0.71:1.000:. ./.:4:92,15:.: 0.06:1.000:. ./.:4:63,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:56,27:.:-0.65:1.000:. ./.:4:83,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:121,15:.: 0.90:1.000:. ./.:4:66,42:.: 0.08:1.000:. ./.:4:94,36:.: 0.73:1.000:. ./.:4:109,10:.: 0.41:1.000:. ./.:4:152,35:.: 2.40:1.000:. ./.:4:35,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:82,39:.: 0.46:1.000:. ./.:4:18,7:.:-2.34:1.000:. ./.:4:82,16:.:-0.21:1.000:. ./.:4:65,10:.:-0.88:1.000:. ./.:4:28,49:.:-0.82:1.000:. ./.:4:74,40:.: 0.26:1.000:. ./.:4:85,40:.: 0.58:1.000:. ./.:4:34,49:.:-0.65:1.000:. ./.:4:73,20:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,14:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,45:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,39:.: 0.55:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.20:1.000:. ./.:6:126,6:.: 0.79:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:57,24:.:-0.71:1.000:. ./.:4:169,27:.: 2.66:1.000:. ./.:4:126,27:.: 1.40:1.000:. ./.:4:81,43:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:96,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.61:0.996:. ./.:4:68,21:.:-0.47:1.000:. ./.:4:104,38:.: 1.08:1.000:. ./.:4:106,15:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,33:.: 0.08:1.000:. ./.:4:90,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:90,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:61,29:.:-0.44:1.000:. ./.:4:72,54:.: 0.61:1.000:. ./.:4:115,22:.: 0.93:1.000:. ./.:4:87,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:124,19:.: 1.11:1.000:. ./.:4:57,27:.:-0.62:1.000:. ./.:4:98,42:.: 1.02:1.000:. ./.:4:75,42:.: 0.35:1.000:. ./.:4:92,12:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,17:.: 0.17:1.000:. ./.:4:164,23:.: 2.40:1.000:. ./.:4:71,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:75,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:86,47:.: 0.82:1.000:. ./.:4:22,53:.:-0.88:1.000:. ./.:4:93,13:.: 0.03:1.000:. ./.:4:127,16:.: 1.11:1.000:. ./.:4:137,24:.: 1.63:1.000:. ./.:4:40,21:.:-1.29:1.000:. ./.:4:128,58:.: 2.37:1.000:. ./.:4:82,38:.: 0.44:1.000:. ./.:4:91,45:.: 0.90:1.000:. ./.:4:43,47:.:-0.44:1.000:. ./.:4:93,49:.: 1.08:1.000:. ./.:4:84,39:.: 0.52:1.000:. ./.:4:72,31:.:-0.06:1.000:. ./.:4:145,25:.: 1.90:1.000:. ./.:4:70,24:.:-0.33:1.000:. ./.:4:144,28:.: 1.96:1.000:. ./.:4:67,42:.: 0.11:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:103,22:.: 0.58:1.000:. ./.:4:55,30:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,53:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,58:.: 0.06:1.000:. ./.:4:134,21:.: 1.46:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:45,70:.: 0.29:0.999:. ./.:4:85,49:.: 0.85:1.000:. ./.:4:26,15:.:-1.88:1.000:. ./.:4:36,62:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,24:.: 1.75:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.11:1.000:. ./.:4:115,21:.: 0.90:1.000:. ./.:4:112,20:.: 0.79:1.000:. ./.:4:138,14:.: 1.37:1.000:. ./.:4:72,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:132,18:.: 1.31:1.000:. ./.:4:28,37:.:-1.17:1.000:. ./.:4:76,37:.: 0.23:1.000:. ./.:4:83,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,56:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,40:.:-0.97:1.000:. ./.:4:65,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:103,18:.: 0.46:1.000:. ./.:4:113,16:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,3:.:-0.38:1.000:. ./.:5:128,4:.: 0.79:0.982:. ./.:4:87,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:90,6:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,28:.:-0.15:1.000:. ./.:4:60,29:.:-0.47:1.000:. ./.:4:81,23:.:-0.03:1.000:. ./.:4:74,23:.:-0.24:1.000:. ./.:4:115,20:.: 0.87:1.000:. ./.:4:138,20:.: 1.55:1.000:. ./.:4:87,33:.: 0.44:1.000:. ./.:4:46,35:.:-0.71:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:97,31:.: 0.67:1.000:. ./.:4:213,0:.: 3.16:1.000:. ./.:3:106,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:38,40:.:-0.79:1.000:. ./.:4:108,18:.: 0.61:1.000:. ./.:4:88,26:.: 0.26:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,3:.:-1.82:1.000:. ./.:4:52,19:.:-1.00:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:118,13:.: 0.76:1.000:. ./.:4:127,11:.: 0.96:1.000:. ./.:4:73,33:.: 0.03:1.000:. ./.:4:95,12:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,35:.:-0.41:1.000:. ./.:4:30,33:.:-1.23:1.000:. ./.:4:67,8:.:-0.88:1.000:. ./.:4:42,14:.:-1.44:1.000:. ./.:4:72,35:.: 0.06:1.000:. ./.:4:35,1:.:-2.02:1.000:. ./.:4:59,20:.:-0.76:1.000:. ./.:4:59,27:.:-0.56:1.000:. ./.:4:42,36:.:-0.79:0.999:. ./.:4:88,8:.:-0.27:1.000:. ./.:4:68,20:.:-0.50:1.000:. ./.:4:41,23:.:-1.20:1.000:. ./.:4:52,10:.:-1.26:1.000:. ./.:4:112,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:52,22:.:-0.91:1.000:. ./.:4:68,15:.:-0.65:1.000:. ./.:4:46,12:.:-1.38:1.000:. ./.:4:58,34:.:-0.38:1.000:. ./.:4:123,19:.: 1.08:1.000:. ./.:4:87,10:.:-0.24:1.000:. ./.:4:43,14:.:-1.41:1.000:. ./.:4:115,10:.: 0.58:1.000:. ./.:4:91,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:72,38:.: 0.14:1.000:. ./.:4:51,20:.:-1.00:1.000:. ./.:4:74,29:.:-0.06:1.000:. -chr5.1 14443235 chr5.1_014443235 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:72,13:.: 0.05:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:85,11:.: 0.54:1.000:. ./.:4:66,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:105,13:.: 1.53:1.000:. ./.:4:64,7:.:-0.57:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:72,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:81,7:.: 0.19:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:67,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:84,13:.: 0.59:0.996:. ./.:4:109,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:116,15:.: 2.11:1.000:. ./.:4:110,12:.: 1.71:1.000:. ./.:4:22,3:.:-2.63:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:63,8:.:-0.57:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:63,9:.:-0.53:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:45,6:.:-1.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.09:1.000:. ./.:3:9,0:.:-3.35:1.000:. ./.:4:61,11:.:-0.53:1.000:. ./.:4:62,8:.:-0.62:1.000:. ./.:4:87,15:.: 0.81:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:83,12:.: 0.50:1.000:. ./.:4:65,7:.:-0.53:1.000:. ./.:4:69,11:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:64,7:.:-0.57:1.000:. ./.:4:87,12:.: 0.68:1.000:. ./.:4:71,9:.:-0.17:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:37,5:.:-1.87:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.62:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:71,16:.: 0.14:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:80,15:.: 0.50:1.000:. ./.:6:77,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:102,13:.: 1.39:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:84,11:.: 0.50:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:75,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:74,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:75,14:.: 0.23:0.996:. ./.:4:61,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:56,7:.:-0.93:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:58,10:.:-0.71:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:61,12:.:-0.48:1.000:. ./.:4:83,15:.: 0.63:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:82,11:.: 0.41:1.000:. ./.:4:59,12:.:-0.57:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:51,5:.:-1.24:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:78,15:.: 0.41:1.000:. ./.:4:62,7:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:92,9:.: 0.77:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:63,10:.:-0.48:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:69,8:.:-0.31:1.000:. ./.:4:53,9:.:-0.98:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:64,10:.:-0.44:1.000:. ./.:4:81,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:79,17:.: 0.54:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:97,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.37:0.999:. ./.:4:103,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:25,8:.:-2.27:1.000:. ./.:4:90,20:.: 1.17:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:81,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:84,17:.: 0.77:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:48,11:.:-1.11:1.000:. ./.:4:65,9:.:-0.44:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:50,12:.:-0.98:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.90:1.000:. ./.:5:57,9:.:-0.80:0.982:. ./.:4:51,5:.:-1.24:1.000:. ./.:4:51,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:78,10:.: 0.19:1.000:. ./.:4:66,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:48,10:.:-1.15:1.000:. ./.:4:41,4:.:-1.74:1.000:. ./.:4:87,7:.: 0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:107,13:.: 1.62:1.000:. ./.:4:67,7:.:-0.44:1.000:. ./.:3:43,11:.:-1.33:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,12:.:-0.48:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:96,10:.: 0.99:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:60,4:.:-0.89:1.000:. ./.:4:74,8:.:-0.08:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:68,16:.: 0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:49,9:.:-1.15:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.95:0.999:. ./.:4:55,7:.:-0.98:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:62,10:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:67,7:.:-0.44:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,6:.:-0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:71,12:.:-0.04:1.000:. ./.:4:80,7:.: 0.14:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:49,6:.:-1.29:1.000:. ./.:4:92,14:.: 0.99:1.000:. ./.:4:106,12:.: 1.53:1.000:. ./.:4:68,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.71:1.000:. -chr5.1 14488720 chr5.1_014488720 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:132,146:.: 0.53:1.000:. ./.:4:166,53:.:-0.53:1.000:. ./.:4:143,143:.: 0.68:1.000:. ./.:4:120,138:.: 0.17:1.000:. ./.:4:299,90:.: 2.54:1.000:. ./.:4:158,168:.: 1.40:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:133,120:.: 0.08:1.000:. ./.:4:197,61:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:76,29:.:-2.59:1.000:. ./.:4:179,66:.:-0.06:1.000:. ./.:4:174,62:.:-0.22:1.000:. ./.:4:136,125:.: 0.23:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:130,114:.:-0.08:1.000:. ./.:4:215,68:.: 0.62:0.996:. ./.:4:241,79:.: 1.29:1.000:. ./.:4:275,115:.: 2.55:1.000:. ./.:4:143,145:.: 0.71:1.000:. ./.:4:48,65:.:-2.44:1.000:. ./.:4:208,69:.: 0.52:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:175,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:69,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:211,77:.: 0.71:1.000:. ./.:4:209,71:.: 0.57:1.000:. ./.:4:199,68:.: 0.33:1.000:. ./.:4:308,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:197,64:.: 0.23:1.000:. ./.:4:105,108:.:-0.64:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:129,0:.:-2.15:1.000:. ./.:3:14,19:.:-3.89:1.000:. ./.:4:148,145:.: 0.80:1.000:. ./.:4:140,141:.: 0.59:1.000:. ./.:4:111,121:.:-0.30:1.000:. ./.:4:176,64:.:-0.15:1.000:. ./.:4:186,52:.:-0.19:1.000:. ./.:4:160,77:.:-0.21:1.000:. ./.:4:159,154:.: 1.16:1.000:. ./.:4:224,76:.: 0.93:1.000:. ./.:4:179,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:217,84:.: 0.95:1.000:. ./.:4:134,132:.: 0.32:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:279,95:.: 2.26:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:132,128:.: 0.21:1.000:. ./.:4:94,104:.:-0.91:1.000:. ./.:4:242,84:.: 1.40:1.000:. ./.:4:135,126:.: 0.23:1.000:. ./.:4:191,83:.: 0.46:1.000:. ./.:4:191,60:.: 0.05:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:177,66:.:-0.10:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:173,63:.:-0.22:1.000:. ./.:6:196,24:.:-0.51:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:148,162:.: 1.11:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:126,150:.: 0.50:1.000:. ./.:4:205,56:.: 0.23:1.000:. ./.:4:112,27:.:-1.97:1.000:. ./.:4:131,112:.:-0.10:1.000:. ./.:4:178,69:.:-0.03:0.996:. ./.:4:168,70:.:-0.19:1.000:. ./.:4:212,88:.: 0.93:1.000:. ./.:4:113,124:.:-0.21:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:215,62:.: 0.52:1.000:. ./.:4:117,70:.:-1.11:1.000:. ./.:4:204,53:.: 0.15:1.000:. ./.:4:190,72:.: 0.24:1.000:. ./.:4:201,76:.: 0.52:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:156,53:.:-0.71:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:126,141:.: 0.33:1.000:. ./.:4:157,60:.:-0.57:1.000:. ./.:4:198,81:.: 0.55:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:175,62:.:-0.21:1.000:. ./.:4:115,120:.:-0.24:1.000:. ./.:4:157,56:.:-0.64:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:89,102:.:-1.04:1.000:. ./.:4:176,76:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,120:.:-0.04:1.000:. ./.:4:132,129:.: 0.23:1.000:. ./.:4:101,110:.:-0.68:1.000:. ./.:4:134,125:.: 0.19:1.000:. ./.:4:181,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:145,42:.:-1.11:1.000:. ./.:4:137,154:.: 0.77:1.000:. ./.:4:130,44:.:-1.34:1.000:. ./.:4:182,68:.: 0.03:1.000:. ./.:4:103,85:.:-1.09:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:173,66:.:-0.17:1.000:. ./.:4:108,120:.:-0.37:1.000:. ./.:4:164,168:.: 1.51:1.000:. ./.:4:141,116:.: 0.15:1.000:. ./.:4:177,55:.:-0.30:1.000:. ./.:4:270,91:.: 2.03:1.000:. ./.:4:171,75:.:-0.04:0.999:. ./.:4:189,61:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,93:.:-1.29:1.000:. ./.:4:132,131:.: 0.26:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:166,73:.:-0.17:1.000:. ./.:4:215,77:.: 0.79:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:114,143:.: 0.15:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:197,58:.: 0.12:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:205,81:.: 0.68:1.000:. ./.:4:117,111:.:-0.37:1.000:. ./.:4:95,101:.:-0.95:1.000:. ./.:4:142,53:.:-0.96:1.000:. ./.:4:214,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:177,60:.:-0.21:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.21:1.000:. ./.:5:154,100:.: 0.10:0.982:. ./.:4:219,54:.: 0.44:1.000:. ./.:4:130,110:.:-0.15:1.000:. ./.:4:281,88:.: 2.17:1.000:. ./.:4:192,76:.: 0.35:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:170,71:.:-0.13:1.000:. ./.:4:191,69:.: 0.21:1.000:. ./.:4:121,125:.:-0.04:1.000:. ./.:4:139,44:.:-1.18:1.000:. ./.:4:148,165:.: 1.16:1.000:. ./.:4:316,85:.: 2.75:1.000:. ./.:3:107,63:.:-1.41:1.000:. ./.:4:185,72:.: 0.15:1.000:. ./.:4:160,166:.: 1.40:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:235,83:.: 1.25:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,27:.:-3.25:1.000:. ./.:4:122,60:.:-1.20:1.000:. ./.:4:216,79:.: 0.84:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:139,172:.: 1.13:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:234,68:.: 0.97:1.000:. ./.:4:195,81:.: 0.50:1.000:. ./.:4:172,50:.:-0.48:1.000:. ./.:4:146,56:.:-0.84:1.000:. ./.:4:207,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:198,83:.: 0.59:1.000:. ./.:4:156,63:.:-0.53:1.000:. ./.:4:182,75:.: 0.15:0.999:. ./.:4:185,59:.:-0.08:1.000:. ./.:4:167,58:.:-0.42:1.000:. ./.:4:103,110:.:-0.64:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:147,115:.: 0.24:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:148,59:.:-0.75:1.000:. ./.:4:199,67:.: 0.32:1.000:. ./.:4:214,84:.: 0.89:1.000:. ./.:4:149,148:.: 0.88:1.000:. ./.:4:170,59:.:-0.35:1.000:. ./.:4:211,77:.: 0.71:1.000:. ./.:4:238,87:.: 1.38:1.000:. ./.:4:155,147:.: 0.97:1.000:. ./.:4:104,99:.:-0.82:1.000:. ./.:4:206,79:.: 0.66:1.000:. -chr5.1 14671305 chr5.1_014671305 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:350,584:.: 1.33:1.000:. ./.:4:322,304:.:-0.53:1.000:. ./.:4:367,288:.:-0.35:1.000:. ./.:4:397,320:.: 0.02:1.000:. ./.:4:328,553:.: 1.01:1.000:. ./.:4:435,387:.: 0.65:1.000:. ./.:4:193,245:.:-1.66:1.000:. ./.:4:366,270:.:-0.47:1.000:. ./.:4:262,330:.:-0.73:1.000:. ./.:4:145,112:.:-2.75:1.000:. ./.:4:264,211:.:-1.44:1.000:. ./.:4:374,352:.: 0.08:1.000:. ./.:4:373,296:.:-0.27:1.000:. ./.:4:317,372:.:-0.15:1.000:. ./.:4:279,444:.: 0.06:1.000:. ./.:4:405,308:.: 0.00:1.000:. ./.:4:296,403:.:-0.09:0.996:. ./.:4:345,518:.: 0.90:1.000:. ./.:4:374,446:.: 0.64:1.000:. ./.:4:426,337:.: 0.30:1.000:. ./.:4:118,128:.:-2.82:1.000:. ./.:4:290,456:.: 0.20:1.000:. ./.:4:330,406:.: 0.14:1.000:. ./.:4:244,428:.:-0.25:1.000:. ./.:4:88,141:.:-2.92:1.000:. ./.:4:411,341:.: 0.23:1.000:. ./.:4:428,343:.: 0.35:1.000:. ./.:4:359,388:.: 0.20:1.000:. ./.:4:323,409:.: 0.11:1.000:. ./.:4:427,332:.: 0.27:1.000:. ./.:4:446,313:.: 0.27:1.000:. ./.:4:342,295:.:-0.46:1.000:. ./.:4:54,77:.:-3.51:1.000:. ./.:4:212,158:.:-2.07:1.000:. ./.:3:109,80:.:-3.16:1.000:. ./.:4:250,347:.:-0.70:1.000:. ./.:4:398,311:.:-0.03:1.000:. ./.:4:377,289:.:-0.29:1.000:. ./.:4:340,510:.: 0.82:1.000:. ./.:4:345,564:.: 1.18:1.000:. ./.:4:418,372:.: 0.46:1.000:. ./.:4:431,415:.: 0.80:1.000:. ./.:4:441,443:.: 1.03:1.000:. ./.:4:315,459:.: 0.36:1.000:. ./.:4:513,378:.: 1.07:1.000:. ./.:4:423,418:.: 0.77:1.000:. ./.:4:351,477:.: 0.69:1.000:. ./.:4:922,680:.: 5.35:1.000:. ./.:4:360,344:.:-0.06:1.000:. ./.:4:410,539:.: 1.42:1.000:. ./.:4:423,381:.: 0.55:1.000:. ./.:4:351,554:.: 1.15:1.000:. ./.:4:341,239:.:-0.80:1.000:. ./.:4:449,458:.: 1.17:1.000:. ./.:4:394,286:.:-0.20:1.000:. ./.:4:376,460:.: 0.74:1.000:. ./.:4:348,279:.:-0.52:1.000:. ./.:4:342,498:.: 0.76:1.000:. ./.:4:271,347:.:-0.57:1.000:. ./.:6:275,449:.: 0.06:1.000:. ./.:4:314,466:.: 0.40:1.000:. ./.:4:286,367:.:-0.36:1.000:. ./.:4:441,341:.: 0.41:1.000:. ./.:4:296,374:.:-0.26:1.000:. ./.:4:456,373:.: 0.70:1.000:. ./.:4:431,411:.: 0.77:1.000:. ./.:4:271,215:.:-1.37:1.000:. ./.:4:442,390:.: 0.71:1.000:. ./.:4:383,394:.: 0.38:0.996:. ./.:4:307,420:.: 0.08:1.000:. ./.:4:494,444:.: 1.35:1.000:. ./.:4:222,323:.:-1.01:1.000:. ./.:4:509,461:.: 1.55:1.000:. ./.:4:307,418:.: 0.07:1.000:. ./.:4:217,546:.: 0.30:1.000:. ./.:4:444,408:.: 0.83:1.000:. ./.:4:365,303:.:-0.27:1.000:. ./.:4:404,434:.: 0.75:1.000:. ./.:4:291,370:.:-0.32:1.000:. ./.:4:380,273:.:-0.36:1.000:. ./.:4:258,389:.:-0.40:1.000:. ./.:4:327,390:.: 0.02:1.000:. ./.:4:440,458:.: 1.11:1.000:. ./.:4:249,325:.:-0.84:1.000:. ./.:4:397,357:.: 0.24:1.000:. ./.:4:334,481:.: 0.61:1.000:. ./.:4:216,279:.:-1.32:1.000:. ./.:4:246,298:.:-1.02:1.000:. ./.:4:273,361:.:-0.48:1.000:. ./.:4:402,373:.: 0.37:1.000:. ./.:4:218,231:.:-1.59:1.000:. ./.:4:261,333:.:-0.72:1.000:. ./.:4:446,316:.: 0.29:1.000:. ./.:4:308,301:.:-0.63:1.000:. ./.:4:321,458:.: 0.40:1.000:. ./.:4:336,483:.: 0.64:1.000:. ./.:4:426,320:.: 0.20:1.000:. ./.:4:283,400:.:-0.18:1.000:. ./.:4:519,414:.: 1.32:1.000:. ./.:4:430,330:.: 0.28:1.000:. ./.:4:273,302:.:-0.83:1.000:. ./.:4:421,320:.: 0.17:1.000:. ./.:4:252,281:.:-1.09:1.000:. ./.:4:300,485:.: 0.43:1.000:. ./.:4:339,244:.:-0.79:1.000:. ./.:4:236,318:.:-0.96:1.000:. ./.:4:280,401:.:-0.20:1.000:. ./.:4:378,291:.:-0.27:1.000:. ./.:4:477,475:.: 1.44:1.000:. ./.:4:397,296:.:-0.12:1.000:. ./.:4:287,458:.: 0.19:1.000:. ./.:4:363,581:.: 1.39:1.000:. ./.:4:424,415:.: 0.76:0.999:. ./.:4:443,429:.: 0.96:1.000:. ./.:4:322,335:.:-0.34:1.000:. ./.:4:461,418:.: 1.00:1.000:. ./.:4:314,329:.:-0.42:1.000:. ./.:4:412,375:.: 0.44:1.000:. ./.:4:265,330:.:-0.71:1.000:. ./.:4:278,337:.:-0.59:1.000:. ./.:4:413,331:.: 0.18:1.000:. ./.:4:266,334:.:-0.68:1.000:. ./.:4:454,455:.: 1.18:1.000:. ./.:4:460,439:.: 1.12:1.000:. ./.:4:383,382:.: 0.31:1.000:. ./.:4:443,327:.: 0.34:1.000:. ./.:4:406,291:.:-0.10:1.000:. ./.:4:278,426:.:-0.06:1.000:. ./.:4:203,268:.:-1.46:1.000:. ./.:4:208,264:.:-1.45:1.000:. ./.:4:391,282:.:-0.24:1.000:. ./.:4:262,450:.:-0.01:1.000:. ./.:5:280,292:.:-0.85:0.982:. ./.:4:345,569:.: 1.21:1.000:. ./.:4:296,434:.: 0.10:1.000:. ./.:4:338,563:.: 1.13:1.000:. ./.:4:510,384:.: 1.09:1.000:. ./.:4:355,347:.:-0.07:1.000:. ./.:4:271,321:.:-0.73:1.000:. ./.:4:259,311:.:-0.86:1.000:. ./.:4:292,478:.: 0.34:1.000:. ./.:4:306,403:.:-0.03:1.000:. ./.:4:375,345:.: 0.04:1.000:. ./.:4:317,302:.:-0.57:1.000:. ./.:4:469,473:.: 1.38:1.000:. ./.:4:362,648:.: 1.79:1.000:. ./.:3:194,402:.:-0.71:1.000:. ./.:4:443,416:.: 0.88:1.000:. ./.:4:350,548:.: 1.11:1.000:. ./.:4:399,286:.:-0.17:1.000:. ./.:4:321,520:.: 0.77:1.000:. ./.:4:266,388:.:-0.36:1.000:. ./.:4:116,124:.:-2.85:1.000:. ./.:4:220,291:.:-1.22:1.000:. ./.:4:335,510:.: 0.79:1.000:. ./.:4:370,355:.: 0.07:1.000:. ./.:4:322,521:.: 0.78:1.000:. ./.:4:387,317:.:-0.06:1.000:. ./.:4:263,412:.:-0.23:1.000:. ./.:4:330,490:.: 0.64:1.000:. ./.:4:328,226:.:-0.96:1.000:. ./.:4:303,235:.:-1.06:1.000:. ./.:4:337,392:.: 0.09:1.000:. ./.:4:252,363:.:-0.59:1.000:. ./.:4:417,338:.: 0.25:1.000:. ./.:4:407,315:.: 0.05:1.000:. ./.:4:217,269:.:-1.37:1.000:. ./.:4:332,320:.:-0.37:0.999:. ./.:4:290,440:.: 0.10:1.000:. ./.:4:352,340:.:-0.13:1.000:. ./.:4:338,352:.:-0.14:1.000:. ./.:4:310,313:.:-0.54:1.000:. ./.:4:243,471:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,425:.:-0.27:1.000:. ./.:4:280,322:.:-0.67:1.000:. ./.:4:342,220:.:-0.91:1.000:. ./.:4:432,393:.: 0.67:1.000:. ./.:4:275,452:.: 0.08:1.000:. ./.:4:302,350:.:-0.37:1.000:. ./.:4:351,320:.:-0.26:1.000:. ./.:4:413,312:.: 0.07:1.000:. ./.:4:427,514:.: 1.37:1.000:. ./.:4:468,453:.: 1.25:1.000:. ./.:4:334,252:.:-0.77:1.000:. ./.:4:288,503:.: 0.47:1.000:. -chr5.1 14817786 chr5.1_014817786 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:323,92:.: 0.89:1.000:. ./.:4:71,250:.:-0.22:1.000:. ./.:4:275,81:.: 0.19:1.000:. ./.:4:191,190:.: 0.49:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:261,251:.: 2.04:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:182,183:.: 0.30:1.000:. ./.:4:280,107:.: 0.56:1.000:. ./.:4:62,26:.:-2.98:1.000:. ./.:4:156,129:.:-0.65:1.000:. ./.:4:97,271:.: 0.34:1.000:. ./.:4:200,184:.: 0.53:1.000:. ./.:4:296,114:.: 0.83:1.000:. ./.:4:295,85:.: 0.48:1.000:. ./.:4:325,107:.: 1.09:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.13:0.996:. ./.:4:206,202:.: 0.81:1.000:. ./.:4:502,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:250,221:.: 1.56:1.000:. ./.:4:131,25:.:-2.18:1.000:. ./.:4:263,89:.: 0.15:1.000:. ./.:4:322,101:.: 0.99:1.000:. ./.:4:287,91:.: 0.45:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:311,110:.: 0.96:1.000:. ./.:4:211,210:.: 0.96:1.000:. ./.:4:287,112:.: 0.70:1.000:. ./.:4:329,94:.: 0.99:1.000:. ./.:4:376,114:.: 1.78:1.000:. ./.:4:297,108:.: 0.77:1.000:. ./.:4:273,87:.: 0.24:1.000:. ./.:4:141,43:.:-1.85:1.000:. ./.:4:106,20:.:-2.53:1.000:. ./.:3:40,31:.:-3.18:1.000:. ./.:4:337,120:.: 1.39:1.000:. ./.:4:300,103:.: 0.75:1.000:. ./.:4:305,93:.: 0.69:1.000:. ./.:4:269,88:.: 0.21:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:245,87:.:-0.09:1.000:. ./.:4:159,183:.: 0.03:1.000:. ./.:4:293,85:.: 0.45:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:282,103:.: 0.54:1.000:. ./.:4:182,137:.:-0.24:1.000:. ./.:4:342,105:.: 1.27:1.000:. ./.:4:353,114:.: 1.51:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:345,121:.: 1.50:1.000:. ./.:4:127,130:.:-0.98:1.000:. ./.:4:308,99:.: 0.80:1.000:. ./.:4:113,120:.:-1.26:1.000:. ./.:4:160,164:.:-0.19:1.000:. ./.:4:260,84:.: 0.05:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:148,151:.:-0.48:1.000:. ./.:4:256,97:.: 0.16:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.72:1.000:. ./.:6:223,20:.:-1.15:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:250,61:.:-0.34:1.000:. ./.:4:308,86:.: 0.64:1.000:. ./.:4:329,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,177:.: 0.09:1.000:. ./.:4:238,82:.:-0.23:1.000:. ./.:4:177,63:.:-1.18:1.000:. ./.:4:146,134:.:-0.71:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.45:0.996:. ./.:4:189,197:.: 0.55:1.000:. ./.:4:170,152:.:-0.21:1.000:. ./.:4:227,63:.:-0.59:1.000:. ./.:4:202,174:.: 0.43:1.000:. ./.:4:280,86:.: 0.31:1.000:. ./.:4:228,78:.:-0.40:1.000:. ./.:4:243,63:.:-0.40:1.000:. ./.:4:197,59:.:-0.99:1.000:. ./.:4:223,81:.:-0.42:1.000:. ./.:4:216,77:.:-0.55:1.000:. ./.:4:270,89:.: 0.23:1.000:. ./.:4:143,145:.:-0.61:1.000:. ./.:4:225,78:.:-0.43:1.000:. ./.:4:230,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:240,66:.:-0.40:1.000:. ./.:4:237,75:.:-0.33:1.000:. ./.:4:275,87:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,65:.:-1.30:1.000:. ./.:4:198,53:.:-1.05:1.000:. ./.:4:217,70:.:-0.62:1.000:. ./.:4:156,146:.:-0.45:1.000:. ./.:4:210,79:.:-0.60:1.000:. ./.:4:221,64:.:-0.65:1.000:. ./.:4:218,70:.:-0.61:1.000:. ./.:4:131,163:.:-0.54:1.000:. ./.:4:215,72:.:-0.62:1.000:. ./.:4:223,83:.:-0.40:1.000:. ./.:4:124,121:.:-1.12:1.000:. ./.:4:78,168:.:-1.11:1.000:. ./.:4:246,66:.:-0.33:1.000:. ./.:4:261,81:.: 0.03:1.000:. ./.:4:232,70:.:-0.45:1.000:. ./.:4:243,107:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,140:.:-0.75:1.000:. ./.:4:223,68:.:-0.58:1.000:. ./.:4:204,74:.:-0.73:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:190,62:.:-1.04:1.000:. ./.:4:226,186:.: 0.86:1.000:. ./.:4:240,235:.: 1.60:1.000:. ./.:4:181,161:.: 0.03:1.000:. ./.:4:198,78:.:-0.75:1.000:. ./.:4:535,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:144,142:.:-0.64:0.999:. ./.:4:158,145:.:-0.43:1.000:. ./.:4:146,153:.:-0.48:1.000:. ./.:4:130,150:.:-0.71:1.000:. ./.:4:224,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:191,64:.:-1.00:1.000:. ./.:4:239,82:.:-0.22:1.000:. ./.:4:206,70:.:-0.75:1.000:. ./.:4:229,72:.:-0.46:1.000:. ./.:4:175,48:.:-1.38:1.000:. ./.:4:218,69:.:-0.62:1.000:. ./.:4:198,205:.: 0.75:1.000:. ./.:4:250,90:.: 0.00:1.000:. ./.:4:277,81:.: 0.22:1.000:. ./.:4:149,152:.:-0.46:1.000:. ./.:4:79,180:.:-0.96:1.000:. ./.:4:167,59:.:-1.35:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:197,55:.:-1.04:1.000:. ./.:4:262,99:.: 0.25:1.000:. ./.:5:186,55:.:-1.17:0.982:. ./.:4:324,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:247,60:.:-0.39:1.000:. ./.:4:478,151:.: 3.43:1.000:. ./.:4:250,75:.:-0.17:1.000:. ./.:4:217,74:.:-0.58:1.000:. ./.:4:187,61:.:-1.09:1.000:. ./.:4:236,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:242,74:.:-0.28:1.000:. ./.:4:233,54:.:-0.62:1.000:. ./.:4:173,199:.: 0.38:1.000:. ./.:4:146,52:.:-1.68:1.000:. ./.:4:252,226:.: 1.64:1.000:. ./.:4:509,0:.: 2.01:1.000:. ./.:3:298,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:171,175:.: 0.08:1.000:. ./.:4:302,92:.: 0.64:1.000:. ./.:4:231,74:.:-0.41:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:150,26:.:-1.94:1.000:. ./.:4:277,107:.: 0.53:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:270,103:.: 0.40:1.000:. ./.:4:344,119:.: 1.46:1.000:. ./.:4:324,115:.: 1.18:1.000:. ./.:4:250,71:.:-0.22:1.000:. ./.:4:281,101:.: 0.50:1.000:. ./.:4:209,176:.: 0.54:1.000:. ./.:4:242,89:.:-0.10:1.000:. ./.:4:278,79:.: 0.21:1.000:. ./.:4:267,80:.: 0.09:1.000:. ./.:4:298,96:.: 0.64:1.000:. ./.:4:219,200:.: 0.94:1.000:. ./.:4:233,77:.:-0.35:1.000:. ./.:4:114,316:.: 1.07:0.999:. ./.:4:269,90:.: 0.23:1.000:. ./.:4:202,166:.: 0.34:1.000:. ./.:4:195,166:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,76:.:-0.61:1.000:. ./.:4:285,89:.: 0.41:1.000:. ./.:4:259,81:.: 0.00:1.000:. ./.:4:300,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:256,85:.: 0.02:1.000:. ./.:4:396,140:.: 2.33:1.000:. ./.:4:279,113:.: 0.62:1.000:. ./.:4:294,99:.: 0.63:1.000:. ./.:4:262,127:.: 0.58:1.000:. ./.:4:322,96:.: 0.93:1.000:. ./.:4:401,134:.: 2.32:1.000:. ./.:4:248,248:.: 1.85:1.000:. ./.:4:202,179:.: 0.49:1.000:. ./.:4:199,191:.: 0.60:1.000:. -chr5.1 14937818 chr5.1_014937818 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,356:.: 0.78:1.000:. ./.:4:2,359:.:-0.34:1.000:. ./.:4:68,297:.:-0.30:1.000:. ./.:4:75,316:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,391:.: 1.32:1.000:. ./.:4:81,384:.: 0.92:1.000:. ./.:4:50,202:.:-1.67:1.000:. ./.:4:73,309:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,433:.: 0.53:1.000:. ./.:4:9,169:.:-2.56:1.000:. ./.:4:27,127:.:-2.86:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,421:.: 0.38:1.000:. ./.:4:86,353:.: 0.60:1.000:. ./.:4:87,275:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,323:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,366:.: 0.76:0.996:. ./.:4:94,327:.: 0.38:1.000:. ./.:4:192,295:.: 1.18:1.000:. ./.:4:71,383:.: 0.78:1.000:. ./.:4:39,178:.:-2.09:1.000:. ./.:4:67,314:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,517:.: 1.55:1.000:. ./.:4:67,342:.: 0.24:1.000:. ./.:4:53,100:.:-2.87:1.000:. ./.:4:70,396:.: 0.93:1.000:. ./.:4:71,293:.:-0.31:1.000:. ./.:4:83,300:.:-0.08:1.000:. ./.:4:89,399:.: 1.20:1.000:. ./.:4:1,432:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,472:.: 1.00:1.000:. ./.:4:50,277:.:-0.76:1.000:. ./.:4:18,90:.:-3.41:1.000:. ./.:4:18,155:.:-2.62:1.000:. ./.:3:5,31:.:-4.29:1.000:. ./.:4:82,327:.: 0.24:1.000:. ./.:4:70,315:.:-0.05:1.000:. ./.:4:153,185:.:-0.62:1.000:. ./.:4:97,343:.: 0.61:1.000:. ./.:4:142,241:.:-0.08:1.000:. ./.:4:76,331:.: 0.21:1.000:. ./.:4:92,351:.: 0.65:1.000:. ./.:4:88,385:.: 1.02:1.000:. ./.:4:143,220:.:-0.32:1.000:. ./.:4:107,385:.: 1.25:1.000:. ./.:4:182,240:.: 0.40:1.000:. ./.:4:99,418:.: 1.55:1.000:. ./.:4:26,116:.:-3.00:1.000:. ./.:4:73,326:.: 0.12:1.000:. ./.:4:82,325:.: 0.21:1.000:. ./.:4:165,215:.:-0.11:1.000:. ./.:4:108,436:.: 1.88:1.000:. ./.:4:78,296:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,341:.: 0.48:1.000:. ./.:4:100,314:.: 0.30:1.000:. ./.:4:71,271:.:-0.57:1.000:. ./.:4:85,315:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,373:.: 0.76:1.000:. ./.:4:71,309:.:-0.11:1.000:. ./.:6:26,316:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1,423:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,280:.:-0.42:1.000:. ./.:4:119,412:.: 1.72:1.000:. ./.:4:75,295:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,318:.: 0.06:1.000:. ./.:4:68,321:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,287:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,327:.:-0.10:1.000:. ./.:4:78,305:.:-0.08:0.996:. ./.:4:0,364:.:-0.31:1.000:. ./.:4:2,521:.: 1.62:1.000:. ./.:4:71,290:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1,531:.: 1.73:1.000:. ./.:4:1,398:.: 0.12:1.000:. ./.:4:2,463:.: 0.92:1.000:. ./.:4:129,213:.:-0.57:1.000:. ./.:4:86,304:.: 0.01:1.000:. ./.:4:83,340:.: 0.41:1.000:. ./.:4:100,349:.: 0.72:1.000:. ./.:4:4,493:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,334:.:-0.67:1.000:. ./.:4:109,363:.: 1.00:1.000:. ./.:4:89,362:.: 0.75:1.000:. ./.:4:77,306:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,368:.: 0.53:1.000:. ./.:4:4,488:.: 1.25:1.000:. ./.:4:78,269:.:-0.51:1.000:. ./.:4:79,287:.:-0.28:1.000:. ./.:4:140,203:.:-0.56:1.000:. ./.:4:146,189:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,312:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1,447:.: 0.71:1.000:. ./.:4:61,250:.:-0.95:1.000:. ./.:4:72,299:.:-0.22:1.000:. ./.:4:149,201:.:-0.48:1.000:. ./.:4:91,255:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,395:.: 0.09:1.000:. ./.:4:204,249:.: 0.77:1.000:. ./.:4:95,363:.: 0.83:1.000:. ./.:4:78,246:.:-0.79:1.000:. ./.:4:97,396:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,296:.:-1.13:1.000:. ./.:4:72,330:.: 0.15:1.000:. ./.:4:125,163:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,412:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,361:.:-0.33:1.000:. ./.:4:66,302:.:-0.26:1.000:. ./.:4:207,299:.: 1.42:1.000:. ./.:4:168,206:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,449:.: 0.74:1.000:. ./.:4:100,427:.: 1.67:1.000:. ./.:4:78,333:.: 0.26:0.999:. ./.:4:2,427:.: 0.48:1.000:. ./.:4:52,189:.:-1.80:1.000:. ./.:4:207,241:.: 0.71:1.000:. ./.:4:87,308:.: 0.07:1.000:. ./.:4:66,279:.:-0.54:1.000:. ./.:4:77,302:.:-0.13:1.000:. ./.:4:2,375:.:-0.15:1.000:. ./.:4:95,359:.: 0.78:1.000:. ./.:4:83,326:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,431:.: 0.51:1.000:. ./.:4:56,324:.:-0.11:1.000:. ./.:4:77,358:.: 0.55:1.000:. ./.:4:199,222:.: 0.38:1.000:. ./.:4:144,216:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,356:.:-0.40:1.000:. ./.:4:55,270:.:-0.78:1.000:. ./.:4:61,273:.:-0.67:1.000:. ./.:4:66,275:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,335:.:-0.65:1.000:. ./.:5:70,276:.:-0.53:0.982:. ./.:4:78,321:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,287:.:-0.42:1.000:. ./.:4:221,287:.: 1.44:1.000:. ./.:4:145,250:.: 0.07:1.000:. ./.:4:71,268:.:-0.61:1.000:. ./.:4:55,268:.:-0.80:1.000:. ./.:4:72,299:.:-0.22:1.000:. ./.:4:117,400:.: 1.55:1.000:. ./.:4:190,198:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,208:.:-0.40:1.000:. ./.:4:64,249:.:-0.93:1.000:. ./.:4:107,392:.: 1.33:1.000:. ./.:4:119,435:.: 2.00:1.000:. ./.:3:80,228:.:-0.99:1.000:. ./.:4:77,342:.: 0.36:1.000:. ./.:4:100,364:.: 0.91:1.000:. ./.:4:64,268:.:-0.70:1.000:. ./.:4:89,384:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,170:.:-2.66:1.000:. ./.:4:99,130:.:-1.95:1.000:. ./.:4:90,336:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,465:.: 0.92:1.000:. ./.:4:102,376:.: 1.08:1.000:. ./.:4:86,365:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1,331:.:-0.70:1.000:. ./.:4:87,378:.: 0.92:1.000:. ./.:4:83,261:.:-0.55:1.000:. ./.:4:73,268:.:-0.59:1.000:. ./.:4:74,296:.:-0.23:1.000:. ./.:4:72,330:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,281:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.37:1.000:. ./.:4:81,271:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,397:.: 0.12:0.999:. ./.:4:80,329:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,345:.:-0.54:1.000:. ./.:4:59,263:.:-0.82:1.000:. ./.:4:56,262:.:-0.87:1.000:. ./.:4:61,321:.:-0.09:1.000:. ./.:4:78,273:.:-0.47:1.000:. ./.:4:65,309:.:-0.19:1.000:. ./.:4:131,153:.:-1.28:1.000:. ./.:4:86,358:.: 0.66:1.000:. ./.:4:99,359:.: 0.83:1.000:. ./.:4:79,338:.: 0.34:1.000:. ./.:4:49,306:.:-0.42:1.000:. ./.:4:85,337:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,379:.: 0.69:1.000:. ./.:4:95,430:.: 1.65:1.000:. ./.:4:66,315:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,442:.: 0.64:1.000:. -chr5.1 15163131 chr5.1_015163131 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:49,81:0.60: 1.81:1.000:0.825 0/0/0/1:4:48,14:0.17:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,30:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,29:0.28: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,35:0.21: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,47:0.34: 1.56:1.000:0.857 0/0/1/1:4:40,35:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,40:0.30: 1.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:38,61:0.59: 0.70:1.000:0.853 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.58:-2.50:1.000:0.904 0/0/0/1:4:59,37:0.35: 0.59:1.000:0.804 0/0/0/1:4:66,41:0.34: 0.98:1.000:0.841 0/0/1/1:4:40,59:0.58: 0.70:1.000:0.914 0/0/1/1:4:40,37:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,42:0.36: 0.98:1.000:0.647 0/0/0/1:4:62,26:0.22: 0.30:0.996:1.000 0/0/0/1:4:54,33:0.34: 0.26:1.000:0.892 0/0/0/1:4:82,43:0.26: 1.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,53:0.42: 1.70:1.000:0.892 0/0/1/1:4:1,1:0.52:-2.78:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,85:0.70: 0.98:1.000:0.980 0/0/1/1:4:67,45:0.38: 1.16:1.000:0.605 0/0/1/1:4:51,34:0.38: 0.19:1.000:0.557 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,41:0.30: 1.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:57,32:0.29: 0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:66,53:0.47: 1.41:1.000:0.993 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,34:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,31:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.15:-2.67:1.000:0.985 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.35:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-2.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,71:0.62: 0.98:1.000:0.580 0/0/0/1:4:65,31:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,34:0.28: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,58:0.60: 0.44:1.000:0.791 0/0/1/1:4:58,51:0.51: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,27:0.53:-0.95:1.000:0.992 0/0/0/1:4:54,30:0.29: 0.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,24:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,48:0.53: 0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:24,14:0.31:-1.49:1.000:0.968 0/0/0/1:4:34,16:0.24:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.57:-1.56:1.000:0.939 0/0/0/1:4:34,19:0.29:-0.95:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,59:0.59: 0.55:1.000:0.834 0/0/0/1:4:54,33:0.34: 0.26:1.000:0.892 0/0/0/1:4:52,17:0.18:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,33:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:55,15:0.16:-0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,32:0.33: 0.19:1.000:0.920 0/0/1/1:4:36,25:0.40:-0.67:1.000:0.786 0/0/0/1:4:48,28:0.31:-0.13:1.000:0.968 0/0/0/0/1/1:6:43,29:0.38:-0.27:1.000:0.754 0/0/0/1:4:63,26:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.51:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,25:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,24:0.28:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,30:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,24:0.28:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,17:0.24:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,23:0.28:-0.52:0.996:0.995 0/0/1/1:4:34,59:0.60: 0.48:1.000:0.770 0/0/1/1:4:50,34:0.39: 0.16:1.000:0.679 0/0/1/1:4:17,22:0.56:-1.46:1.000:0.965 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,39:0.38: 0.62:1.000:0.612 0/1/1/1:4:22,80:0.69: 0.80:1.000:0.972 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,42:0.53: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,51:0.60: 0.01:1.000:0.754 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,28:0.55:-0.99:1.000:0.983 0/0/1/1:4:38,32:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,63:0.65: 0.26:1.000:0.829 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,50:0.56: 0.34:1.000:0.967 0/0/1/1:4:31,28:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,15:0.22:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,22:0.31:-0.70:1.000:0.974 0/0/0/1:4:46,19:0.22:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,58:0.59: 0.52:1.000:0.850 0/0/0/1:4:41,17:0.22:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,27:0.36:-0.38:1.000:0.677 0/0/1/1:4:53,69:0.56: 1.52:1.000:0.963 0/0/1/1:4:29,50:0.60:-0.02:1.000:0.778 0/0/1/1:4:36,27:0.44:-0.60:1.000:0.965 0/1/1/1:4:7,56:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,35:0.40: 0.19:1.000:0.819 0/0/0/1:4:63,39:0.34: 0.80:1.000:0.854 0/0/0/1:4:36,18:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,27:0.35:-0.34:1.000:0.798 0/0/0/1:4:29,19:0.37:-1.13:1.000:0.558 0/0/0/1:4:49,32:0.37: 0.05:1.000:0.579 0/0/0/1:4:32,14:0.23:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,28:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,45:0.55: 0.12:1.000:0.981 0/0/0/1:4:68,36:0.27: 0.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,35:0.37: 0.34:1.000:0.628 0/0/0/1:4:35,23:0.37:-0.77:1.000:0.539 0/0/1/1:4:30,46:0.59:-0.13:1.000:0.890 0/0/0/1:4:80,43:0.27: 1.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,30:0.49:-0.49:0.999:0.996 0/0/0/1:4:50,21:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,16:0.47:-1.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:44,26:0.32:-0.34:1.000:0.955 0/0/1/1:4:38,28:0.43:-0.49:1.000:0.945 0/0/0/1:4:44,26:0.32:-0.34:1.000:0.955 0/0/1/1:4:38,26:0.39:-0.56:1.000:0.714 0/0/0/1:4:39,17:0.22:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,28:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,27:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,50:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,25:0.37:-0.60:1.000:0.531 0/1/1/1:4:5,55:0.77:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,33:0.58:-0.88:1.000:0.904 0/0/0/1:4:45,12:0.16:-0.81:1.000:0.993 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,36:0.30: 0.73:1.000:0.988 0/0/1/1/1:5:27,25:0.51:-0.99:0.982:0.628 0/0/0/1:4:44,15:0.19:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,60:0.67:-0.02:1.000:0.939 0/0/1/1:4:59,50:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,21:0.19: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,16:0.17:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,25:0.39:-0.63:1.000:0.642 0/0/0/1:4:36,21:0.31:-0.81:1.000:0.968 0/0/1/1:4:35,36:0.53:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:37,24:0.37:-0.67:1.000:0.623 0/0/0/1:4:76,37:0.24: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,30:0.32: 0.05:1.000:0.960 0/1/1:3:49,42:0.50: 0.41:1.000:0.533 0/0/1/1:4:46,35:0.45: 0.05:1.000:0.975 0/0/1/1:4:55,81:0.58: 2.02:1.000:0.915 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,35:0.20: 1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,44:0.36: 1.20:1.000:0.723 0/1/1/1:4:0,4:0.84:-2.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,36:0.35: 0.48:1.000:0.772 0/0/0/1:4:74,38:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,91:0.58: 2.60:1.000:0.908 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,32:0.27: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,69:0.63: 0.73:1.000:0.622 0/0/1/1:4:42,44:0.53: 0.23:1.000:0.992 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,36:0.38: 0.37:1.000:0.557 0/0/1/1:4:40,68:0.60: 1.02:1.000:0.795 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,33:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,66:0.65: 0.44:1.000:0.796 0/0/1/1:4:54,37:0.39: 0.41:0.999:0.721 0/0/0/1:4:57,34:0.32: 0.41:1.000:0.942 0/0/0/1:4:60,39:0.37: 0.70:1.000:0.610 0/0/1/1:4:43,30:0.40:-0.24:1.000:0.806 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,65:0.67: 0.23:1.000:0.931 0/0/0/1:4:50,31:0.34: 0.05:1.000:0.848 0/0/1/1:4:40,29:0.42:-0.38:1.000:0.919 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,44:0.25: 1.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,59:0.57: 0.80:1.000:0.947 0/0/1/1:4:55,91:0.60: 2.38:1.000:0.824 0/0/1/1:4:47,38:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,55:0.34: 2.31:1.000:0.859 0/0/0/1:4:79,46:0.31: 1.63:1.000:0.969 0/0/0/1:4:56,31:0.29: 0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,68:0.55: 1.63:1.000:0.980 -chr5.1 15353461 chr5.1_015353461 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:1,23:0.97:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,7:0.29: 1.07:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,28:0.97: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,16:0.60: 0.36:1.000:0.810 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.56: 1.17:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.50: 0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.43:-1.59:1.000:0.954 0/0/1/1:4:12,5:0.38:-0.97:1.000:0.541 0/0/0/1:4:26,9:0.35: 0.87:1.000:0.806 0/1/1/1:4:13,18:0.65: 0.46:1.000:0.808 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,16:0.54: 0.66:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,25:0.94: 0.05:0.996:1.000 0/0/0/1:4:32,8:0.30: 1.38:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,12:0.45: 0.46:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,28:0.68: 1.99:1.000:0.962 0/0/0/1:4:23,8:0.35: 0.46:1.000:0.800 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,19:0.69: 0.46:1.000:0.971 0/0/1/1:4:24,23:0.55: 2.09:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,24:0.69: 1.28:1.000:0.976 0/0/1/1:4:25,31:0.62: 3.01:1.000:0.559 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.41:-2.10:1.000:0.858 0/0/1/1:4:8,8:0.56:-1.07:1.000:0.968 0/1/1:3:1,2:0.75:-2.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,17:0.96:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,21:0.97:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,13:0.42: 1.17:1.000:0.896 0/0/1/1:4:18,12:0.46: 0.36:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,20:0.59: 1.17:1.000:0.866 0/0/1/1:4:23,18:0.49: 1.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,22:0.62: 1.38:1.000:0.611 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,13:0.95:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.58: 0.05:1.000:0.911 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.46:-0.67:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,32:0.75: 2.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,21:0.78: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,18:0.63: 0.56:1.000:0.576 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,17:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,16:0.49: 1.07:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,7:0.36:-0.05:1.000:0.711 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.48:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,12:0.45: 0.46:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.28:0.996:1.000 0/0/1/1:4:26,23:0.52: 2.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,24:0.56: 2.20:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.34: 2.71:1.000:0.875 0/0/1/1:4:16,20:0.62: 0.97:1.000:0.529 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.46:-0.67:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.48:-0.05:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.57: 1.28:1.000:0.935 0/0/1/1:4:20,21:0.57: 1.48:1.000:0.937 0/0/1/1:4:16,14:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,20:0.61: 1.07:1.000:0.735 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.50: 0.25:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,14:0.68:-0.36:1.000:0.962 0/1/1/1:4:14,22:0.69: 0.97:1.000:0.968 0/0/1/1:4:16,12:0.48: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,4:0.25: 0.36:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,22:0.55: 1.89:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,26:0.75: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,6:0.41:-0.87:1.000:0.858 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,20:0.93:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,8:0.40:-0.15:1.000:0.777 0/0/1/1:4:25,12:0.40: 1.07:1.000:0.806 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.58: 0.05:1.000:0.911 0/0/1/1:4:11,13:0.61:-0.26:1.000:0.722 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.59:-0.77:1.000:0.866 0/0/1/1:4:22,14:0.45: 0.97:1.000:0.983 0/0/1/1:4:16,11:0.47: 0.05:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,18:0.96:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,16:0.48: 1.17:0.999:0.995 0/0/1/1:4:15,12:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,9:0.53:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,20:0.59: 1.17:1.000:0.866 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,12:0.52:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,17:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,13:0.86:-1.07:1.000:0.969 0/0/1/1:4:16,18:0.59: 0.77:1.000:0.843 0/0/0/1:4:30,11:0.36: 1.48:1.000:0.719 0/0/1/1:4:17,19:0.59: 0.97:1.000:0.856 0/0/1/1:4:16,19:0.61: 0.87:1.000:0.707 0/0/1/1:4:18,18:0.56: 0.97:1.000:0.968 0/0/1/1:4:15,11:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,12:0.61:-0.46:1.000:0.674 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,10:0.38: 0.66:1.000:0.632 0/1/1/1:4:11,16:0.67: 0.05:1.000:0.900 1/1/1/1/1:5:0,12:1.00:-1.48:0.982:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,20:0.57: 1.28:1.000:0.935 0/0/1/1:4:13,16:0.62: 0.25:1.000:0.586 0/1/1/1:4:15,21:0.65: 0.97:1.000:0.833 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,10:0.70:-1.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:12,12:0.56:-0.26:1.000:0.968 0/0/1/1:4:15,14:0.54: 0.25:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,17:0.50: 1.17:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,28:0.95: 0.36:1.000:1.000 1/1/1:3:1,16:0.96:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.56: 0.77:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,23:0.60: 1.69:1.000:0.796 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,5:0.41:-1.18:1.000:0.858 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,16:0.46: 1.38:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,20:0.96:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.56: 0.56:1.000:0.968 0/0/1/1:4:13,15:0.60: 0.15:1.000:0.787 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,10:0.56:-0.67:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,16:0.53: 0.77:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,22:0.69: 0.97:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,8:0.30: 1.58:0.999:0.989 0/0/1/1:4:18,10:0.43: 0.15:1.000:0.941 0/1/1/1:4:8,11:0.65:-0.77:1.000:0.790 0/0/1/1:4:11,7:0.45:-0.87:1.000:0.983 0/0/1/1:4:14,12:0.52:-0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,27:0.74: 1.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.56:-1.28:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,7:0.38:-0.26:1.000:0.515 1/1/1/1:4:2,18:0.92:-0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,13:0.58:-0.15:1.000:0.904 0/0/1/1:4:23,16:0.47: 1.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:22,8:0.36: 0.36:1.000:0.733 0/0/1/1:4:21,10:0.40: 0.46:1.000:0.795 0/0/1/1:4:10,8:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,25:0.70: 1.38:1.000:0.987 -chr5.1 15424123 chr5.1_015424123 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:79,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:252,0:.: 3.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.60:0.996:. ./.:4:151,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.92:1.000:. ./.:3:31,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:151,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.62:1.000:. ./.:6:49,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.77:0.996:. ./.:4:215,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:282,1:.: 3.77:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:117,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:156,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.19:1.000:. ./.:5:48,0:.:-1.17:0.982:. ./.:4:63,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:53,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:148,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:259,0:.: 3.26:0.999:. ./.:4:75,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:224,0:.: 2.53:1.000:. -chr5.1 15626233 chr5.1_015626233 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:13,0:.: 3.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:12,0:.: 3.29:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:1,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:0.996:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:3:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:10,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.08:1.000:. -chr5.1 15934970 chr5.1_015934970 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,252:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1,301:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,311:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,170:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,58:.:-3.36:1.000:. ./.:4:0,101:.:-2.60:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.01:0.996:. ./.:4:0,262:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1,340:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,379:.: 2.43:1.000:. ./.:4:0,64:.:-3.27:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,43:.:-3.65:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,230:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,295:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,25:.:-3.98:1.000:. ./.:4:0,112:.:-2.40:1.000:. ./.:3:0,22:.:-4.03:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,274:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,313:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,142:.:-1.86:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.15:1.000:. ./.:6:0,227:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,225:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1,289:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.25:0.996:. ./.:4:0,254:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,307:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,250:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,224:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,310:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,316:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,271:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,325:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,307:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,327:.: 1.49:1.000:. ./.:4:1,267:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.28:1.000:. ./.:4:2,305:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,360:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.51:0.999:. ./.:4:1,245:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,186:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,320:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,326:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.92:1.000:. ./.:4:1,186:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.03:1.000:. ./.:5:0,252:.: 0.13:0.982:. ./.:4:0,217:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,351:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,194:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,310:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,311:.: 1.20:1.000:. ./.:3:0,186:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,233:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,305:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,50:.:-3.52:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,302:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,320:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,292:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.31:0.999:. ./.:4:0,244:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,186:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,328:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,325:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1,242:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.11:1.000:. ./.:4:1,325:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.05:1.000:. -chr5.1 16153131 chr5.1_016153131 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.50:0.996:. ./.:4:0,12:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,37:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,33:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,33:.: 1.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,33:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./.:6:0,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,31:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.02:0.996:. ./.:4:0,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,54:.: 3.10:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,45:.: 2.32:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-1.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,36:.: 1.54:1.000:. ./.:5:0,22:.: 0.33:0.982:. ./.:4:0,26:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,33:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.33:1.000:. ./.:3:0,41:.: 1.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,50:.: 2.76:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,43:.: 2.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,53:.: 3.02:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:0.999:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,47:.: 2.50:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,19:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 0.24:1.000:. -chr5.1 16300866 chr5.1_016300866 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:226,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.39:0.996:. ./.:4:249,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:337,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:200,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:167,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:50,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.04:1.000:. ./.:3:59,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:179,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:194,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.54:1.000:. ./.:6:201,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.32:0.996:. ./.:4:214,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:203,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:277,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:206,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:337,2:.: 2.16:1.000:. ./.:4:303,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.20:0.999:. ./.:4:307,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:326,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:357,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.13:1.000:. ./.:5:174,0:.:-0.89:0.982:. ./.:4:187,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.18:1.000:. ./.:3:172,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:357,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:259,2:.: 0.72:1.000:. ./.:4:255,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.12:0.999:. ./.:4:208,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:258,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:296,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.07:1.000:. -chr5.1 16709639 chr5.1_016709639 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:143,440:0.72: 1.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,106:0.27:-0.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,348:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,442:0.78: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:250,314:0.51: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:253,292:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:203,90:0.29:-1.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:213,242:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,381:0.78: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-2.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,89:0.34:-2.14:1.000:0.865 0/0/0/1:4:294,136:0.30:-0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:211,231:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:112,358:0.73: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:286,138:0.31:-0.26:1.000:0.979 0/1/1/1:4:117,391:0.74: 0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:87,385:0.79: 0.24:0.996:1.000 0/0/1/1:4:220,250:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:218,330:0.56: 1.04:1.000:0.965 0/1/1/1:4:104,484:0.80: 1.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,335:1.00:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,503:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:265,281:0.47: 1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:190,245:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,151:0.74:-2.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:331,153:0.30: 0.37:1.000:0.987 0/0/0/1:4:334,139:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:219,257:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:374,156:0.28: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:284,119:0.28:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,264:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:93,324:0.74:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,117:0.72:-3.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:150,73:0.31:-2.36:1.000:0.977 0/1/1:3:29,72:0.68:-3.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,400:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,394:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,245:0.48: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,226:0.53:-0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:176,257:0.55:-0.16:1.000:0.978 0/0/1/1:4:220,266:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:107,390:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,266:0.55: 0.01:1.000:0.980 0/0/1/1:4:158,222:0.54:-0.72:1.000:0.986 0/0/1/1:4:204,309:0.56: 0.67:1.000:0.965 0/0/1/1:4:213,291:0.54: 0.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:287,302:0.47: 1.47:1.000:0.993 0/0/0/1:4:650,232:0.25: 4.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:226,107:0.30:-1.21:1.000:0.983 0/1/1/1:4:88,314:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,230:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:126,440:0.74: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,250:0.55:-0.24:1.000:0.984 0/0/1/1:4:232,304:0.52: 0.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:315,143:0.29: 0.10:1.000:0.990 0/0/0/1:4:274,119:0.29:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:181,230:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:304,120:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:87,325:0.76:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:165,275:0.58:-0.09:1.000:0.520 0/0/1/1:4:210,279:0.53: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:192,252:0.52:-0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:109,424:0.76: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,99:0.28:-1.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,393:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:270,127:0.30:-0.54:1.000:0.985 0/0/1/1:4:124,193:0.57:-1.38:1.000:0.951 0/1/1/1:4:116,411:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,287:0.56: 0.29:0.996:0.964 0/0/1/1:4:201,271:0.53: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:218,273:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,204:0.64:-1.54:1.000:0.661 0/0/0/1:4:296,162:0.33: 0.10:1.000:0.918 0/0/1/1:4:214,241:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:120,429:0.75: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,107:0.28:-0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:202,252:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:206,275:0.53: 0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:91,389:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,154:0.30: 0.40:1.000:0.987 0/0/1/1:4:173,201:0.49:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:230,275:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:348,141:0.27: 0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,329:0.79:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,275:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:130,477:0.75: 1.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,173:0.50:-1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,236:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,246:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,235:0.51:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:97,304:0.72:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,229:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:311,152:0.31: 0.15:1.000:0.976 0/0/1/1:4:173,185:0.48:-0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:217,295:0.53: 0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:93,396:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,267:0.53: 0.16:1.000:0.991 0/1/1/1:4:93,344:0.75:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:248,324:0.52: 1.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:314,124:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:204,100:0.31:-1.51:1.000:0.975 0/1/1/1:4:147,476:0.73: 1.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:170,184:0.48:-0.99:1.000:0.995 0/1/1/1:4:108,350:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:150,207:0.54:-0.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:165,234:0.54:-0.52:1.000:0.984 0/1/1/1:4:100,320:0.73:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,261:0.51: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:286,351:0.51: 1.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,229:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:106,374:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:126,487:0.76: 1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:222,268:0.50: 0.43:0.999:0.997 0/0/1/1:4:216,261:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:68,287:0.78:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,303:0.52: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:224,109:0.31:-1.21:1.000:0.977 0/0/0/1:4:252,114:0.29:-0.87:1.000:0.990 0/1/1/1:4:107,342:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,212:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,267:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,279:0.55: 0.26:1.000:0.983 0/0/0/1:4:328,151:0.30: 0.32:1.000:0.988 0/0/0/1:4:363,141:0.26: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:300,117:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:366,144:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:234,274:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,300:0.73:-0.60:1.000:0.998 0/1/1/1:4:72,286:0.77:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,205:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:263,108:0.27:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,239:0.53:-0.32:1.000:0.992 0/1/1/1/1:5:73,315:0.78:-0.64:0.982:0.988 0/0/1/1:4:215,260:0.50: 0.28:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,482:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,326:0.49: 1.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:348,141:0.27: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:253,119:0.30:-0.80:1.000:0.985 0/0/0/1:4:278,128:0.30:-0.45:1.000:0.988 0/0/0/1:4:286,125:0.29:-0.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:103,418:0.77: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,267:0.53: 0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:207,255:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,85:0.26:-1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:257,309:0.50: 1.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:137,522:0.76: 2.20:1.000:1.000 1/1/1:3:0,398:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,124:0.28:-0.38:1.000:0.994 0/1/1/1:4:145,422:0.71: 1.24:1.000:0.992 0/0/0/0:4:342,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,457:0.77: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,244:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,239:0.81:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,189:0.52:-1.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:104,443:0.78: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,121:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:137,489:0.75: 1.86:1.000:0.999 0/0/0/0:4:435,1:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,247:0.54:-0.26:1.000:0.987 0/1/1/1:4:116,453:0.77: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,228:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:167,217:0.52:-0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:159,230:0.55:-0.62:1.000:0.980 0/1/1/1:4:113,387:0.74: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:311,147:0.30: 0.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:199,224:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:93,313:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:296,116:0.27:-0.38:0.999:0.998 0/0/1/1:4:199,245:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,226:0.53:-0.55:1.000:0.993 0/1/1/1:4:108,315:0.71:-0.27:1.000:0.992 0/0/0/0:4:302,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,483:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,240:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:155,193:0.51:-1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:211,107:0.32:-1.37:1.000:0.964 0/0/1/1:4:195,301:0.57: 0.50:1.000:0.956 0/1/1/1:4:97,411:0.78: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:138,398:0.71: 0.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:234,224:0.45: 0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:207,286:0.54: 0.46:1.000:0.989 0/0/1/1:4:285,344:0.50: 1.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:279,306:0.48: 1.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,202:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:238,233:0.46: 0.23:1.000:0.985 -chr5.1 16876960 chr5.1_016876960 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:250,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.94:0.996:. ./.:4:138,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:452,1:.: 3.26:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.43:1.000:. ./.:3:40,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:301,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:281,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:175,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.73:1.000:. ./.:6:209,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:188,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:326,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:288,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:170,3:.:-0.30:0.996:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:314,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:207,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:368,2:.: 2.20:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:297,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.70:0.999:. ./.:4:232,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:131,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:224,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.15:1.000:. ./.:5:256,0:.: 0.75:0.982:. ./.:4:173,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:113,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.49:1.000:. ./.:3:262,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:342,1:.: 1.86:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.38:0.999:. ./.:4:220,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.22:1.000:. -chr5.1 17527107 chr5.1_017527107 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,345:.: 0.89:1.000:. ./.:4:137,136:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,253:.: 0.51:1.000:. ./.:4:138,173:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.81:1.000:. ./.:4:80,304:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.56:1.000:. ./.:4:81,253:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,232:.: 0.19:1.000:. ./.:4:17,65:.:-2.87:1.000:. ./.:4:13,165:.:-1.49:1.000:. ./.:4:115,150:.:-0.25:1.000:. ./.:4:152,172:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,367:.: 1.21:1.000:. ./.:4:67,251:.: 0.51:1.000:. ./.:4:79,291:.: 1.25:1.000:. ./.:4:63,297:.: 1.11:0.944:. ./.:4:170,180:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,397:.: 1.64:1.000:. ./.:4:146,200:.: 0.91:1.000:. ./.:4:21,112:.:-2.14:1.000:. ./.:4:59,240:.: 0.24:1.000:. ./.:4:136,190:.: 0.62:1.000:. ./.:4:90,266:.: 1.05:1.000:. ./.:4:29,85:.:-2.41:1.000:. ./.:4:104,318:.: 1.99:1.000:. ./.:4:93,282:.: 1.32:1.000:. ./.:4:83,246:.: 0.66:1.000:. ./.:4:76,269:.: 0.89:1.000:. ./.:4:143,167:.: 0.39:1.000:. ./.:4:79,273:.: 0.99:1.000:. ./.:4:69,218:.: 0.06:1.000:. ./.:4:48,105:.:-1.85:1.000:. ./.:4:38,78:.:-2.38:1.000:. ./.:3:14,87:.:-2.59:1.000:. ./.:4:163,192:.: 1.04:1.000:. ./.:4:73,250:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,296:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,356:.: 1.05:1.000:. ./.:4:104,148:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,168:.: 0.59:1.000:. ./.:4:70,275:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,312:.: 0.42:1.000:. ./.:4:122,142:.:-0.26:1.000:. ./.:4:65,266:.: 0.69:1.000:. ./.:4:153,184:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,531:.: 3.55:1.000:. ./.:4:0,295:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.81:1.000:. ./.:4:33,155:.:-1.35:1.000:. ./.:4:69,297:.: 1.19:1.000:. ./.:4:48,180:.:-0.78:1.000:. ./.:4:108,161:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,266:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.38:1.000:. ./.:4:118,128:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,377:.: 1.35:1.000:. ./.:4:46,200:.:-0.52:1.000:. ./.:6:30,165:.:-1.25:1.000:. ./.:4:34,211:.:-0.54:1.000:. ./.:4:141,160:.: 0.26:1.000:. ./.:4:44,278:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,291:.: 0.12:1.000:. ./.:4:135,199:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1,376:.: 1.35:1.000:. ./.:4:83,105:.:-1.35:1.000:. ./.:4:115,151:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.36:0.996:. ./.:4:56,198:.:-0.41:1.000:. ./.:4:146,174:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.52:1.000:. ./.:4:76,308:.: 1.45:1.000:. ./.:4:123,163:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.78:1.000:. ./.:4:54,230:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.29:1.000:. ./.:4:97,141:.:-0.64:1.000:. ./.:4:47,244:.: 0.12:1.000:. ./.:4:122,178:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,159:.:-1.08:1.000:. ./.:4:103,163:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,154:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.72:1.000:. ./.:4:135,177:.: 0.42:1.000:. ./.:4:59,257:.: 0.48:1.000:. ./.:4:82,120:.:-1.15:1.000:. ./.:4:74,142:.:-0.95:1.000:. ./.:4:40,187:.:-0.79:1.000:. ./.:4:56,211:.:-0.22:1.000:. ./.:4:43,196:.:-0.62:1.000:. ./.:4:106,133:.:-0.62:1.000:. ./.:4:104,155:.:-0.34:1.000:. ./.:4:44,164:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,178:.:-0.88:1.000:. ./.:4:27,192:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.91:1.000:. ./.:4:40,231:.:-0.16:1.000:. ./.:4:60,78:.:-2.07:1.000:. ./.:4:88,123:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.99:1.000:. ./.:4:47,227:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.34:1.000:. ./.:4:87,252:.: 0.81:1.000:. ./.:4:85,291:.: 1.34:1.000:. ./.:4:60,210:.:-0.18:1.000:. ./.:4:41,194:.:-0.68:1.000:. ./.:4:106,365:.: 2.69:1.000:. ./.:4:88,119:.:-1.08:0.999:. ./.:4:90,150:.:-0.61:1.000:. ./.:4:85,113:.:-1.21:1.000:. ./.:4:51,219:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,293:.: 0.16:1.000:. ./.:4:91,144:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,317:.: 0.49:1.000:. ./.:4:60,88:.:-1.92:1.000:. ./.:4:91,154:.:-0.54:1.000:. ./.:4:102,236:.: 0.79:1.000:. ./.:4:88,128:.:-0.95:1.000:. ./.:4:59,242:.: 0.26:1.000:. ./.:4:46,193:.:-0.62:1.000:. ./.:4:52,198:.:-0.46:1.000:. ./.:4:34,151:.:-1.39:1.000:. ./.:4:36,159:.:-1.25:1.000:. ./.:4:47,189:.:-0.66:1.000:. ./.:4:118,156:.:-0.12:1.000:. ./.:5:22,154:.:-1.52:0.982:. ./.:4:0,292:.: 0.14:1.000:. ./.:4:41,182:.:-0.85:1.000:. ./.:4:88,308:.: 1.62:1.000:. ./.:4:73,250:.: 0.58:1.000:. ./.:4:62,89:.:-1.88:1.000:. ./.:4:46,138:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.58:1.000:. ./.:4:94,141:.:-0.68:1.000:. ./.:4:44,185:.:-0.76:1.000:. ./.:4:58,233:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.92:1.000:. ./.:4:66,288:.: 1.02:1.000:. ./.:4:99,300:.: 1.67:1.000:. ./.:3:66,181:.:-0.51:1.000:. ./.:4:67,270:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,371:.: 1.27:1.000:. ./.:4:59,167:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,270:.: 0.92:1.000:. ./.:4:69,233:.: 0.28:1.000:. ./.:4:23,120:.:-1.99:1.000:. ./.:4:50,220:.:-0.18:1.000:. ./.:4:89,288:.: 1.35:1.000:. ./.:4:156,156:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,406:.: 1.77:1.000:. ./.:4:87,229:.: 0.48:1.000:. ./.:4:134,141:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,276:.: 0.86:1.000:. ./.:4:107,145:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,227:.: 0.19:1.000:. ./.:4:56,220:.:-0.09:1.000:. ./.:4:58,229:.: 0.06:1.000:. ./.:4:160,183:.: 0.86:1.000:. ./.:4:137,184:.: 0.55:1.000:. ./.:4:50,193:.:-0.56:1.000:. ./.:4:130,158:.: 0.08:0.999:. ./.:4:74,229:.: 0.29:1.000:. ./.:4:110,135:.:-0.54:1.000:. ./.:4:132,136:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,191:.:-0.64:1.000:. ./.:4:66,213:.:-0.05:1.000:. ./.:4:101,141:.:-0.58:1.000:. ./.:4:41,210:.:-0.45:1.000:. ./.:4:52,171:.:-0.85:1.000:. ./.:4:70,292:.: 1.14:1.000:. ./.:4:122,169:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,351:.: 0.98:1.000:. ./.:4:80,225:.: 0.32:1.000:. ./.:4:165,171:.: 0.76:1.000:. ./.:4:91,344:.: 2.18:1.000:. ./.:4:89,282:.: 1.27:1.000:. ./.:4:63,216:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,232:.: 0.04:1.000:. -chr5.1 17687955 chr5.1_017687955 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:137,32:.: 0.51:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:76,30:.:-1.29:1.000:. ./.:4:87,58:.:-0.17:1.000:. ./.:4:169,31:.: 1.40:1.000:. ./.:4:156,41:.: 1.31:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:129,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:149,18:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,2:.:-2.60:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:128,25:.: 0.06:1.000:. ./.:4:141,28:.: 0.51:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:110,76:.: 1.00:1.000:. ./.:4:80,55:.:-0.46:0.944:. ./.:4:112,67:.: 0.80:1.000:. ./.:4:177,40:.: 1.88:1.000:. ./.:4:106,66:.: 0.60:1.000:. ./.:4:35,14:.:-2.91:1.000:. ./.:4:85,54:.:-0.34:1.000:. ./.:4:147,29:.: 0.71:1.000:. ./.:4:116,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:49,4:.:-2.80:1.000:. ./.:4:162,34:.: 1.28:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:128,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:206,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:128,23:.: 0.00:1.000:. ./.:4:119,32:.: 0.00:1.000:. ./.:4:80,53:.:-0.52:1.000:. ./.:4:30,8:.:-3.23:1.000:. ./.:4:68,11:.:-2.06:1.000:. ./.:3:20,7:.:-3.54:1.000:. ./.:4:87,50:.:-0.40:1.000:. ./.:4:73,39:.:-1.11:1.000:. ./.:4:138,25:.: 0.34:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:163,35:.: 1.34:1.000:. ./.:4:76,48:.:-0.77:1.000:. ./.:4:105,48:.: 0.06:1.000:. ./.:4:157,20:.: 0.74:1.000:. ./.:4:119,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:107,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:144,33:.: 0.74:1.000:. ./.:4:136,38:.: 0.66:1.000:. ./.:4:130,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:125,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:95,12:.:-1.26:1.000:. ./.:4:123,18:.:-0.29:1.000:. ./.:4:174,29:.: 1.48:1.000:. ./.:4:137,24:.: 0.28:1.000:. ./.:4:143,29:.: 0.60:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:129,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,50:.:-1.11:1.000:. ./.:6:126,15:.:-0.29:1.000:. ./.:4:148,30:.: 0.77:1.000:. ./.:4:126,32:.: 0.20:1.000:. ./.:4:93,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:81,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:51,31:.:-1.97:1.000:. ./.:4:75,51:.:-0.71:1.000:. ./.:4:126,21:.:-0.12:0.996:. ./.:4:193,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:141,26:.: 0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:161,28:.: 1.08:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,19:.:-1.26:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:112,59:.: 0.57:1.000:. ./.:4:158,38:.: 1.28:1.000:. ./.:4:147,22:.: 0.51:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:128,29:.: 0.17:1.000:. ./.:4:134,32:.: 0.43:1.000:. ./.:4:106,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:73,41:.:-1.06:1.000:. ./.:4:146,38:.: 0.94:1.000:. ./.:4:103,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:105,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:137,30:.: 0.46:1.000:. ./.:4:123,23:.:-0.14:1.000:. ./.:4:119,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:112,25:.:-0.40:1.000:. ./.:4:149,40:.: 1.08:1.000:. ./.:4:93,30:.:-0.80:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:129,24:.: 0.06:1.000:. ./.:4:115,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:139,21:.: 0.26:1.000:. ./.:4:172,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:102,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:95,16:.:-1.14:1.000:. ./.:4:85,47:.:-0.54:1.000:. ./.:4:98,25:.:-0.80:1.000:. ./.:4:124,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:133,27:.: 0.26:1.000:. ./.:4:121,23:.:-0.20:1.000:. ./.:4:167,45:.: 1.74:1.000:. ./.:4:144,27:.: 0.57:1.000:. ./.:4:127,21:.:-0.09:1.000:. ./.:4:116,55:.: 0.57:1.000:. ./.:4:116,20:.:-0.43:0.999:. ./.:4:113,22:.:-0.46:1.000:. ./.:4:72,31:.:-1.37:1.000:. ./.:4:149,31:.: 0.83:1.000:. ./.:4:174,3:.: 0.74:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,45:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,18:.:-0.71:1.000:. ./.:4:141,21:.: 0.31:1.000:. ./.:4:127,22:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,24:.:-0.32:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:136,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:157,29:.: 1.00:1.000:. ./.:4:110,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:88,19:.:-1.26:1.000:. ./.:4:94,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:106,24:.:-0.60:1.000:. ./.:4:130,27:.: 0.17:1.000:. ./.:5:93,27:.:-0.89:0.982:. ./.:4:157,20:.: 0.74:1.000:. ./.:4:93,53:.:-0.14:1.000:. ./.:4:150,40:.: 1.11:1.000:. ./.:4:120,30:.:-0.03:1.000:. ./.:4:129,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:88,51:.:-0.34:1.000:. ./.:4:129,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:113,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:176,39:.: 1.83:1.000:. ./.:4:121,82:.: 1.48:1.000:. ./.:3:49,61:.:-1.17:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:190,44:.: 2.37:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:104,60:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,32:.: 0.03:1.000:. ./.:4:43,6:.:-2.91:1.000:. ./.:4:106,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:91,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:132,39:.: 0.57:1.000:. ./.:4:182,48:.: 2.26:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:125,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:148,30:.: 0.77:1.000:. ./.:4:122,20:.:-0.26:1.000:. ./.:4:115,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:98,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:131,23:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,41:.: 1.03:1.000:. ./.:4:106,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:132,22:.: 0.08:1.000:. ./.:4:122,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:83,48:.:-0.57:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,43:.:-0.83:1.000:. ./.:4:114,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,17:.:-0.89:1.000:. ./.:4:95,14:.:-1.20:1.000:. ./.:4:200,32:.: 2.31:1.000:. ./.:4:92,68:.: 0.26:1.000:. ./.:4:127,33:.: 0.26:1.000:. ./.:4:137,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:109,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:154,27:.: 0.86:1.000:. ./.:4:155,37:.: 1.17:1.000:. ./.:4:113,27:.:-0.32:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.48:1.000:. -chr5.1 18002870 chr5.1_018002870 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:45,31:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:63,19:0.28: 0.86:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,29:0.41: 0.82:1.000:0.890 0/0/1/1:4:53,33:0.44: 1.03:1.000:0.969 0/0/0/1:4:88,22:0.25: 2.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,23:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:82,20:0.25: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,19:0.40:-0.29:1.000:0.805 0/0/0/1:4:16,6:0.33:-1.69:1.000:0.935 0/0/1/1:4:15,17:0.56:-1.26:1.000:0.967 0/0/0/1:4:87,12:0.18: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,15:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,23:0.42: 0.05:1.000:0.922 0/0/0/1:4:82,15:0.21: 1.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.22:0.944:1.000 0/0/1/1:4:39,30:0.49: 0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,36:0.53: 0.48:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,16:0.22: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,16:0.23: 1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-2.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,20:0.22: 2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,7:0.13: 1.37:1.000:0.935 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,23:0.25: 2.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,21:0.25: 1.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,28:0.45: 0.43:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,11:0.79:-2.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,25:0.70:-1.18:1.000:0.980 0/1/1:3:6,9:0.61:-1.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,26:0.42: 0.43:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,30:0.48: 0.43:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,26:0.57:-0.58:1.000:0.954 0/0/1/1:4:28,28:0.54:-0.25:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,37:0.55: 0.39:1.000:0.976 0/0/1/1:4:31,26:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,33:0.43: 1.11:1.000:0.952 0/0/1/1:4:17,20:0.57:-1.05:1.000:0.955 0/0/1/1:4:36,22:0.44:-0.16:1.000:0.962 0/0/1/1:4:45,22:0.38: 0.22:1.000:0.620 0/0/1/1:4:23,19:0.51:-0.84:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,13:0.21: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,35:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,33:0.57:-0.03:1.000:0.955 0/0/1/1:4:33,18:0.41:-0.46:1.000:0.861 0/0/0/1:4:62,16:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,27:0.46: 0.26:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:20,12:0.43:-1.26:1.000:0.621 0/0/1/1:4:43,28:0.45: 0.39:1.000:0.982 0/0/1/1:4:44,28:0.45: 0.43:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,32:0.56:-0.08:1.000:0.965 0/0/1/1:4:47,31:0.46: 0.69:1.000:0.985 0/0/1/1:4:35,23:0.45:-0.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:19,28:0.60:-0.63:1.000:0.765 0/0/1/1:4:36,17:0.38:-0.37:1.000:0.518 0/0/1/1:4:37,23:0.44:-0.08:0.996:0.969 0/0/1/1:4:31,26:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,24:0.29: 1.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,16:0.39:-0.58:1.000:0.682 0/0/1/1:4:43,25:0.42: 0.26:1.000:0.931 0/0/0/1:4:90,25:0.27: 2.26:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,25:0.59:-0.80:1.000:0.842 0/0/1/1:4:21,28:0.59:-0.54:1.000:0.883 0/0/1/1:4:37,29:0.50: 0.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,19:0.26: 1.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,27:0.51:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,35:0.53: 0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,29:0.47: 0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,30:0.48: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,27:0.53:-0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:29,39:0.59: 0.26:1.000:0.875 0/0/1/1:4:28,20:0.48:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,18:0.45:-0.67:1.000:0.979 0/0/1/1:4:24,18:0.49:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,22:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:13,24:0.64:-1.05:1.000:0.663 0/0/0/1:4:64,21:0.30: 0.99:1.000:0.985 0/0/0/1:4:79,20:0.25: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,13:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,41:0.52: 1.03:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,16:0.29: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:34,19:0.42:-0.37:1.000:0.893 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,27:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,21:0.57:-1.01:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,19:0.37:-0.08:1.000:0.538 0/0/1/1:4:27,24:0.52:-0.46:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,32:0.63:-0.50:1.000:0.591 0/0/1/1:4:38,30:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,21:0.27: 1.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,31:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,24:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,29:0.54:-0.16:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,29:0.53:-0.12:0.999:0.991 0/0/0/1:4:82,21:0.26: 1.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,15:0.42:-0.88:1.000:0.925 0/0/1/1:4:23,29:0.58:-0.42:1.000:0.923 0/0/1/1:4:25,15:0.43:-0.92:1.000:0.952 0/0/1/1:4:24,15:0.44:-0.97:1.000:0.971 0/0/1/1:4:23,19:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,12:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,31:0.54: 0.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:26,24:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:83,25:0.28: 1.96:1.000:0.994 0/0/0/1:4:99,10:0.15: 2.00:1.000:0.987 0/0/1/1:4:31,29:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,27:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,21:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,20:0.52:-0.80:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,16:0.26: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:69,19:0.27: 1.11:1.000:0.998 0/0/1/1/1:5:20,22:0.56:-0.84:0.982:0.900 0/0/1/1:4:34,21:0.44:-0.29:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,27:0.43: 0.43:1.000:0.952 0/0/1/1:4:43,26:0.43: 0.31:1.000:0.956 0/0/1/1:4:21,25:0.57:-0.67:1.000:0.951 0/0/0/1:4:66,12:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,29:0.53:-0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:34,32:0.53: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,21:0.43:-0.25:1.000:0.952 0/0/1/1:4:38,25:0.45: 0.05:1.000:0.984 0/0/1/1:4:17,22:0.58:-0.97:1.000:0.906 0/0/1/1:4:55,33:0.43: 1.11:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1:3:0,34:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,20:0.27: 1.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,26:0.37: 0.86:1.000:0.532 0/0/0/1:4:56,16:0.27: 0.43:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,33:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,18:0.75:-1.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,30:0.51: 0.14:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,14:0.23: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,37:0.59: 0.09:1.000:0.857 0/0/0/1:4:85,18:0.23: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,20:0.28: 1.07:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,42:0.59: 0.43:1.000:0.833 0/0/0/1:4:76,13:0.20: 1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,12:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,21:0.23: 2.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,14:0.20: 1.54:0.999:1.000 0/0/0/1:4:60,14:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,19:0.29: 0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:40,30:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,16:0.26: 0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,30:0.50: 0.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,32:0.53: 0.18:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,27:0.46: 0.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:49,23:0.37: 0.43:1.000:0.500 0/1/1/1:4:13,27:0.66:-0.92:1.000:0.836 0/0/1/1:4:36,33:0.53: 0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,17:0.22: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,24:0.27: 1.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,24:0.29: 1.58:1.000:0.989 0/0/1/1:4:44,28:0.45: 0.43:1.000:0.976 -chr5.1 18083565 chr5.1_018083565 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,29:.: 1.66:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:74,19:.: 1.56:1.000:. ./.:4:52,35:.: 1.27:1.000:. ./.:4:40,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,29:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,25:.: 1.66:1.000:. ./.:4:8,6:.:-2.24:1.000:. ./.:4:8,9:.:-2.09:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,17:.: 0.26:1.000:. ./.:4:45,21:.: 0.26:1.000:. ./.:4:105,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.23:0.944:. ./.:4:82,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:31,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,17:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:53,32:.: 1.18:1.000:. ./.:4:52,29:.: 0.98:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:46,21:.: 0.31:1.000:. ./.:4:47,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:68,25:.: 1.56:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.14:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:40,17:.:-0.17:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,6:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,21:.: 0.94:1.000:. ./.:4:35,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:39,28:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:72,24:.: 1.71:1.000:. ./.:4:60,25:.: 1.18:1.000:. ./.:4:34,22:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,16:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.31:1.000:. ./.:6:44,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:51,18:.: 0.41:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:41,20:.: 0.02:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:52,17:.: 0.41:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:52,14:.: 0.26:0.996:. ./.:4:60,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:26,13:.:-1.03:1.000:. ./.:4:27,12:.:-1.03:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:38,29:.: 0.31:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:46,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:33,25:.:-0.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:68,19:.: 1.27:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:46,19:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:47,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:25,22:.:-0.65:1.000:. ./.:4:35,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:33,20:.:-0.36:1.000:. ./.:4:51,20:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.60:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:70,22:.: 1.51:1.000:. ./.:4:32,5:.:-1.13:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:14,2:.:-2.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:56,21:.: 0.79:1.000:. ./.:4:48,21:.: 0.41:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:48,22:.: 0.46:1.000:. ./.:4:115,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:37,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,19:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,12:.: 0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.75:1.000:. ./.:4:51,22:.: 0.60:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:33,13:.:-0.70:1.000:. ./.:4:38,21:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.99:1.000:. ./.:4:41,24:.: 0.22:1.000:. ./.:5:45,13:.:-0.12:0.982:. ./.:4:46,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:24,14:.:-1.08:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.70:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,17:.:-0.51:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.47:1.000:. ./.:3:60,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:49,24:.: 0.60:1.000:. ./.:4:72,33:.: 2.14:1.000:. ./.:4:44,19:.: 0.12:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:79,28:.: 2.24:1.000:. ./.:4:15,4:.:-2.00:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:37,22:.:-0.07:1.000:. ./.:4:72,23:.: 1.66:1.000:. ./.:4:37,37:.: 0.65:1.000:. ./.:4:43,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:33,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:49,24:.: 0.60:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.32:0.999:. ./.:4:33,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:30,20:.:-0.51:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,29:.: 0.22:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:68,20:.: 1.32:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:48,22:.: 0.46:1.000:. ./.:4:49,27:.: 0.74:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. -chr5.1 18555117 chr5.1_018555117 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:446,238:0.39: 0.13:1.000:0.703 0/0/1/1:4:354,279:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:404,314:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:577,494:0.50: 1.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:492,386:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:689,365:0.39: 1.68:1.000:0.685 0/0/1/1:4:341,358:0.55: 0.19:1.000:0.984 0/0/1/1:4:389,336:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:125,291:0.72:-0.99:1.000:0.995 0/0/0/1:4:169,36:0.23:-1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,72:0.23:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,372:0.60: 0.00:1.000:0.801 0/0/1/1:4:234,241:0.54:-0.74:1.000:0.987 0/0/1/1:4:284,216:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:361,335:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:248,336:0.60:-0.29:1.000:0.754 0/1/1/1:4:136,442:0.78:-0.31:0.944:1.000 0/1/1/1:4:279,611:0.71: 0.99:1.000:0.990 0/1/1/1:4:180,721:0.81: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:507,538:0.55: 1.64:1.000:0.981 0/0/1/1:4:139,94:0.44:-1.76:1.000:0.973 0/0/1/1:4:316,343:0.55: 0.03:1.000:0.976 0/0/1/1:4:527,669:0.59: 2.28:1.000:0.868 0/0/1/1:4:576,502:0.50: 1.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,152:0.66:-1.74:1.000:0.884 0/0/1/1:4:739,467:0.43: 2.32:1.000:0.942 0/0/1/1:4:432,287:0.44: 0.28:1.000:0.967 0/0/1/1:4:380,211:0.40:-0.26:1.000:0.788 0/0/1/1:4:512,582:0.56: 1.85:1.000:0.960 0/0/1/1:4:579,398:0.45: 1.36:1.000:0.977 0/0/1/1:4:302,231:0.47:-0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:292,282:0.53:-0.33:1.000:0.993 0/1/1/1:4:59,142:0.72:-1.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,116:0.48:-1.65:1.000:0.996 0/1/1:3:62,74:0.58:-2.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:392,467:0.57: 0.86:1.000:0.932 0/0/1/1:4:420,398:0.52: 0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:433,491:0.56: 1.14:1.000:0.961 0/0/1/1:4:164,182:0.56:-1.29:1.000:0.969 0/0/1/1:4:468,623:0.60: 1.84:1.000:0.790 0/0/1/1:4:315,352:0.56: 0.06:1.000:0.967 0/0/1/1:4:431,259:0.42: 0.16:1.000:0.902 0/0/1/1:4:338,399:0.57: 0.35:1.000:0.939 0/0/1/1:4:376,274:0.46:-0.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:347,421:0.58: 0.48:1.000:0.918 0/0/1/1:4:435,363:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:140,561:0.81: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,153:0.42:-1.03:1.000:0.904 0/0/1/1:4:297,211:0.46:-0.61:1.000:0.984 0/0/0/1:4:471,108:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:252,130:0.38:-1.13:1.000:0.617 0/0/1/1:4:334,444:0.60: 0.52:1.000:0.793 0/0/0/1:4:518,121:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:158,369:0.72:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:391,296:0.47: 0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:138,276:0.69:-1.00:1.000:0.971 0/0/0/1:4:539,236:0.35: 0.51:1.000:0.796 0/0/1/1:4:310,224:0.46:-0.50:1.000:0.987 0/1/1/1:4:131,317:0.73:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:323,175:0.39:-0.65:1.000:0.689 0/0/1/1:4:447,223:0.38: 0.07:1.000:0.524 0/0/1/1:4:230,313:0.61:-0.46:1.000:0.744 0/0/1/1:4:350,240:0.45:-0.26:1.000:0.977 0/0/1/1:4:296,267:0.51:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:618,476:0.47: 1.85:1.000:0.993 0/0/1/1:4:304,248:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:373,357:0.52: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:278,400:0.62: 0.11:1.000:0.601 0/0/1/1:4:474,295:0.42: 0.49:0.996:0.932 0/1/1/1:4:192,304:0.64:-0.66:1.000:0.673 0/0/0/1:4:724,181:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,221:0.69:-1.35:1.000:0.972 0/1/1/1:4:169,346:0.69:-0.58:1.000:0.978 0/0/1/1:4:548,452:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:138,216:0.64:-1.25:1.000:0.642 0/0/1/1:4:499,318:0.43: 0.69:1.000:0.947 0/0/1/1:4:265,197:0.47:-0.80:1.000:0.991 0/0/1/1:4:321,362:0.56: 0.13:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,332:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:620,362:0.41: 1.38:1.000:0.868 0/0/1/1:4:250,214:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:164,436:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:165,304:0.67:-0.77:1.000:0.926 0/0/1/1:4:241,193:0.48:-0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:431,248:0.41: 0.11:1.000:0.848 0/1/1/1:4:152,336:0.71:-0.69:1.000:0.991 0/0/1/1:4:192,215:0.56:-1.03:1.000:0.966 0/0/1/1:4:234,246:0.55:-0.72:1.000:0.983 0/0/1/1:4:505,260:0.38: 0.47:1.000:0.612 0/0/1/1:4:363,189:0.39:-0.42:1.000:0.641 0/0/1/1:4:140,208:0.62:-1.28:1.000:0.508 0/0/1/1:4:220,226:0.54:-0.87:1.000:0.987 0/0/0/1:4:642,244:0.32: 0.98:1.000:0.949 0/0/1/1:4:404,233:0.41:-0.07:1.000:0.851 0/0/0/1:4:330,144:0.35:-0.75:1.000:0.802 0/1/1/1:4:148,227:0.63:-1.16:1.000:0.586 0/0/1/1:4:380,188:0.37:-0.36:1.000:0.501 0/0/1/1:4:118,105:0.51:-1.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:598,208:0.31: 0.64:1.000:0.980 0/0/1/1:4:276,221:0.48:-0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:366,228:0.43:-0.25:1.000:0.933 0/1/1/1:4:131,261:0.69:-1.09:1.000:0.969 0/0/1/1:4:218,127:0.41:-1.29:1.000:0.865 0/0/0/1:4:600,289:0.37: 0.99:1.000:0.574 0/0/1/1:4:262,171:0.44:-0.92:1.000:0.960 0/0/1/1:4:239,188:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,123:0.57:-1.78:1.000:0.949 0/0/1/1:4:422,399:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:468,492:0.55: 1.29:1.000:0.983 0/0/1/1:4:247,263:0.55:-0.60:1.000:0.981 0/1/1/1:4:132,204:0.63:-1.33:1.000:0.607 0/1/1/1:4:171,595:0.79: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:131,240:0.67:-1.18:0.999:0.921 0/0/0/1:4:423,166:0.33:-0.27:1.000:0.929 0/0/1/1:4:343,173:0.38:-0.57:1.000:0.555 0/0/1/1:4:451,322:0.46: 0.50:1.000:0.985 0/0/1/1:4:361,232:0.43:-0.25:1.000:0.952 0/1/1/1:4:134,256:0.68:-1.10:1.000:0.950 0/0/1/1:4:386,309:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:478,199:0.34: 0.10:1.000:0.872 0/0/1/1:4:456,276:0.42: 0.33:1.000:0.909 0/0/1/1:4:251,247:0.53:-0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:475,469:0.53: 1.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:381,314:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:276,338:0.58:-0.16:1.000:0.909 0/0/1/1:4:489,334:0.45: 0.71:1.000:0.976 0/0/1/1:4:440,285:0.43: 0.30:1.000:0.956 0/0/1/1:4:124,134:0.55:-1.65:1.000:0.977 0/1/1/1:4:88,221:0.73:-1.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:101,156:0.63:-1.66:1.000:0.605 0/0/0/1:4:498,230:0.36: 0.32:1.000:0.683 0/0/1/1:4:447,246:0.40: 0.17:1.000:0.770 0/0/0/1/1:5:379,193:0.38:-0.34:0.982:0.965 0/0/0/1:4:658,292:0.35: 1.25:1.000:0.771 0/0/1/1:4:364,255:0.45:-0.14:1.000:0.982 0/1/1/1:4:336,629:0.67: 1.31:1.000:0.938 0/0/1/1:4:327,462:0.61: 0.57:1.000:0.651 0/0/1/1:4:359,186:0.38:-0.45:1.000:0.628 0/0/1/1:4:364,231:0.43:-0.24:1.000:0.945 0/0/1/1:4:279,173:0.42:-0.84:1.000:0.929 0/1/1/1:4:127,350:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:407,262:0.43: 0.07:1.000:0.953 0/0/1/1:4:455,341:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:253,55:0.23:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:662,411:0.42: 1.76:1.000:0.930 0/0/1/1:4:370,517:0.61: 0.98:1.000:0.680 0/0/1:3:564,391:0.45: 1.27:1.000:0.967 0/0/1/1:4:393,312:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:588,363:0.42: 1.25:1.000:0.926 0/0/1/1:4:356,346:0.53: 0.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:486,754:0.63: 2.46:1.000:0.618 0/0/1/1:4:223,295:0.60:-0.56:1.000:0.802 0/0/1/1:4:94,82:0.50:-2.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:483,357:0.46: 0.78:1.000:0.990 0/1/1/1:4:345,576:0.65: 1.12:1.000:0.794 0/0/1/1:4:427,339:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:668,306:0.36: 1.35:1.000:0.702 0/1/1/1:4:296,548:0.67: 0.80:1.000:0.929 0/1/1/1:4:116,418:0.80:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:153,384:0.73:-0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:373,420:0.56: 0.59:1.000:0.964 0/0/1/1:4:320,429:0.60: 0.40:1.000:0.776 0/1/1/1:4:119,327:0.75:-0.87:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,584:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:266,392:0.62: 0.02:1.000:0.532 0/0/1/1:4:427,337:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:252,316:0.59:-0.36:1.000:0.883 0/0/1/1:4:259,362:0.61:-0.13:0.999:0.679 0/0/1/1:4:402,487:0.58: 0.99:1.000:0.919 0/1/1/1:4:249,395:0.64:-0.04:1.000:0.678 0/0/1/1:4:482,357:0.46: 0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:271,317:0.57:-0.27:1.000:0.945 0/1/1/1:4:156,317:0.69:-0.75:1.000:0.976 0/1/1/1:4:129,502:0.81:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,419:0.80:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:245,518:0.70: 0.46:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,525:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:465,431:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:434,336:0.48: 0.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:133,396:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:634,662:0.54: 2.70:1.000:0.984 0/0/1/1:4:746,616:0.49: 2.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:782,325:0.34: 1.90:1.000:0.874 0/0/1/1:4:470,306:0.44: 0.52:1.000:0.958 0/0/1/1:4:278,347:0.59:-0.12:1.000:0.889 -chr5.1 18758609 chr5.1_018758609 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:38,28:.:-0.28:1.000:. ./.:4:64,27:.: 0.73:1.000:. ./.:4:78,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,21:.:-0.64:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:77,34:.: 1.53:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:28,26:.:-0.76:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.60:0.944:. ./.:4:60,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:83,42:.: 2.10:1.000:. ./.:4:7,5:.:-2.46:1.000:. ./.:4:31,29:.:-0.52:1.000:. ./.:4:81,34:.: 1.69:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:9,12:.:-2.09:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,25:.:-0.80:1.000:. ./.:4:106,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:67,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:38,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:17,21:.:-1.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:11,20:.:-1.69:1.000:. ./.:3:17,3:.:-2.13:1.000:. ./.:4:39,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:28,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:55,33:.: 0.61:1.000:. ./.:4:56,32:.: 0.61:1.000:. ./.:4:37,35:.:-0.04:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:74,34:.: 1.41:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:73,42:.: 1.69:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:47,39:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:54,31:.: 0.49:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.57:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:37,30:.:-0.24:1.000:. ./.:6:42,38:.: 0.28:1.000:. ./.:4:58,27:.: 0.49:1.000:. ./.:4:44,28:.:-0.04:1.000:. ./.:4:45,38:.: 0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:70,27:.: 0.97:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,29:.:-0.08:1.000:. ./.:4:64,26:.: 0.69:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.93:0.996:. ./.:4:69,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,45:.: 1.94:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,37:.: 1.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:65,45:.: 1.49:1.000:. ./.:4:42,34:.: 0.12:1.000:. ./.:4:92,43:.: 2.50:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:60,43:.: 1.21:1.000:. ./.:4:78,32:.: 1.49:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:47,31:.: 0.20:1.000:. ./.:4:55,53:.: 1.41:1.000:. ./.:4:44,23:.:-0.24:1.000:. ./.:4:52,28:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:32,29:.:-0.48:1.000:. ./.:4:75,29:.: 1.25:1.000:. ./.:4:83,44:.: 2.18:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:46,47:.: 0.81:1.000:. ./.:4:65,28:.: 0.81:1.000:. ./.:4:56,42:.: 1.01:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:37,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:51,41:.: 0.77:1.000:. ./.:4:32,32:.:-0.36:1.000:. ./.:4:85,38:.: 2.02:0.999:. ./.:4:75,37:.: 1.57:1.000:. ./.:4:30,13:.:-1.21:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:62,38:.: 1.09:1.000:. ./.:4:73,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,45:.: 1.37:1.000:. ./.:4:91,36:.: 2.18:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,31:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,26:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,30:.:-0.60:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:76,22:.: 1.01:1.000:. ./.:5:42,24:.:-0.28:0.982:. ./.:4:57,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:34,31:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:56,52:.: 1.41:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:60,36:.: 0.93:1.000:. ./.:4:65,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:43,49:.: 0.77:1.000:. ./.:3:24,30:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:38,42:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,35:.: 0.24:1.000:. ./.:4:7,20:.:-1.85:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:23,29:.:-0.84:1.000:. ./.:4:102,32:.: 2.46:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:55,27:.: 0.36:1.000:. ./.:4:33,34:.:-0.24:1.000:. ./.:4:60,28:.: 0.61:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:25,32:.:-0.64:1.000:. ./.:4:27,27:.:-0.76:1.000:. ./.:4:27,13:.:-1.33:1.000:. ./.:4:85,31:.: 1.73:1.000:. ./.:4:37,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:82,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:63,26:.: 0.65:1.000:. ./.:4:47,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:34,32:.:-0.28:1.000:. ./.:4:55,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:37,24:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:29,24:.:-0.80:1.000:. ./.:4:73,31:.: 1.25:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,32:.:-0.24:1.000:. ./.:4:77,29:.: 1.33:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.88:1.000:. -chr5.1 18905726 chr5.1_018905726 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:55,135:0.68: 1.29:1.000:0.965 0/0/1/1:4:58,80:0.56:-0.07:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,106:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,97:0.53: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:98,98:0.48: 1.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,51:0.49:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,88:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,84:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,7:0.39:-3.22:1.000:0.732 0/0/1/1:4:9,10:0.50:-3.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,79:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,73:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,74:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:105,45:0.32: 0.24:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,118:0.68: 0.68:0.944:0.956 0/0/1/1:4:96,57:0.38: 0.32:1.000:0.578 0/1/1/1:4:49,162:0.74: 1.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,152:0.79: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,21:0.63:-2.85:1.000:0.586 0/1/1/1:4:38,134:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,45:0.32: 0.32:1.000:0.959 0/0/0/1:4:87,37:0.32:-0.44:1.000:0.950 0/1/1/1:4:2,12:0.84:-3.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,82:0.45: 0.97:1.000:0.981 0/0/1/1:4:58,82:0.56:-0.02:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,52:0.29: 1.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,75:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,132:0.79: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,135:0.99:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.22:-3.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.70:-3.11:1.000:0.986 1/1/1:3:1,11:0.91:-3.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,76:0.46: 0.58:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,171:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,72:0.54:-0.36:1.000:0.985 0/1/1/1:4:38,108:0.71: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,113:0.80:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,115:0.75: 0.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,94:0.68:-0.21:1.000:0.957 0/1/1/1:4:42,113:0.70: 0.37:1.000:0.988 0/1/1/1:4:31,125:0.78: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,98:0.54: 0.87:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,68:0.74:-1.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,75:0.55:-0.23:1.000:0.984 0/0/1/1:4:46,49:0.50:-1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,90:0.80:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,140:0.76: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,81:0.54: 0.06:1.000:0.985 0/1/1/1:4:39,124:0.73: 0.58:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,120:0.77: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,84:0.55: 0.14:1.000:0.977 0/0/1/1:4:73,67:0.47:-0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,79:0.58:-0.28:1.000:0.896 0/1/1/1:4:38,100:0.70:-0.07:1.000:0.984 0/0/0/1/1/1:6:51,59:0.51:-0.81:1.000:0.878 0/0/1/1:4:52,73:0.56:-0.41:1.000:0.966 0/0/1/1:4:64,70:0.50:-0.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,179:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,63:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,101:0.73:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,99:0.71:-0.15:1.000:0.990 0/1/1/1:4:13,88:0.86:-1.04:1.000:0.979 0/1/1/1:4:32,109:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,70:0.47: 0.08:0.996:0.993 0/0/1/1:4:65,76:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,80:0.53: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,54:0.48:-0.86:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,119:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,40:0.27: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,70:0.54:-0.41:1.000:0.989 0/1/1/1:4:26,107:0.78:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,63:0.44:-0.02:1.000:0.971 0/1/1/1:4:38,115:0.73: 0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,131:0.72: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,76:0.55:-0.23:1.000:0.977 0/0/1/1:4:53,54:0.49:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,77:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,133:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,81:0.56:-0.05:1.000:0.968 0/1/1/1:4:36,99:0.71:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,76:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,52:0.44:-0.62:1.000:0.964 0/0/1/1:4:64,90:0.56: 0.34:1.000:0.965 0/0/1/1:4:67,69:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,92:0.69:-0.34:1.000:0.978 0/0/1/1:4:57,50:0.46:-0.89:1.000:0.985 0/0/0/1:4:90,33:0.30:-0.47:1.000:0.987 0/0/1/1:4:75,84:0.51: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,61:0.58:-1.04:1.000:0.912 0/0/1/1:4:70,71:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,129:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,58:0.42:-0.10:1.000:0.919 0/0/1/1:4:49,40:0.44:-1.36:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,122:0.79: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,88:0.86:-1.04:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,158:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,51:0.53:-1.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:70,59:0.45:-0.31:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,72:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,52:0.48:-0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,96:0.54: 0.79:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,171:0.77: 1.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,123:0.73: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,66:0.46:-0.02:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,196:0.83: 2.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,101:0.69: 0.03:0.999:0.966 0/0/1/1:4:63,80:0.54: 0.06:1.000:0.989 0/1/1/1:4:21,84:0.78:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,108:0.72: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,67:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,95:0.71:-0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:70,94:0.55: 0.61:1.000:0.979 0/0/0/1:4:81,34:0.32:-0.68:1.000:0.956 0/1/1/1:4:26,99:0.77:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,55:0.43:-0.39:1.000:0.951 0/0/1/1:4:77,73:0.47: 0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,89:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,117:0.80: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,103:0.80:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,102:0.71:-0.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:48,54:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,88:0.79:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,87:0.74:-0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,67:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,34:0.29:-0.21:1.000:0.993 0/0/1/1/1:5:56,72:0.54:-0.34:0.982:0.831 0/0/1/1:4:53,58:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,111:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,120:0.50: 2.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,118:0.77: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,104:0.78:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,34:0.33:-0.86:1.000:0.900 0/0/1/1:4:58,61:0.49:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,65:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,83:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,120:0.77: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,73:0.73:-1.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,171:0.75: 2.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,143:0.70: 1.50:1.000:0.982 0/1/1:3:41,110:0.70: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,86:0.55: 0.27:1.000:0.983 0/0/1/1:4:85,86:0.48: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,73:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,172:0.77: 1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,10:0.43:-3.08:1.000:0.948 0/0/1/1:4:52,67:0.54:-0.57:1.000:0.987 0/1/1/1:4:44,110:0.69: 0.34:1.000:0.971 0/0/1/1:4:70,91:0.54: 0.53:1.000:0.986 0/0/1/1:4:91,103:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,85:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:105,36:0.29: 0.00:1.000:0.993 0/1/1/1:4:43,134:0.73: 0.95:1.000:0.998 0/1/1/1:4:34,102:0.72:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,71:0.56:-0.49:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,141:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,139:0.78: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,117:0.70: 0.55:1.000:0.982 0/0/1/1:4:69,76:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,105:0.73:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,87:0.53: 0.45:0.999:0.993 0/0/0/1:4:100,44:0.33: 0.08:1.000:0.932 0/0/1/1:4:84,73:0.45: 0.42:1.000:0.984 0/1/1/1:4:28,106:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,51:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,120:0.83: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,71:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,85:0.74:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,91:0.73:-0.52:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,208:0.99: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,95:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,96:0.54: 0.79:1.000:0.988 1/1/1/1:4:7,118:0.94:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,142:0.82: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,57:0.28: 2.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,110:0.51: 1.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,68:0.55:-0.60:1.000:0.976 0/0/1/1:4:75,88:0.52: 0.58:1.000:0.995 -chr5.1 18969331 chr5.1_018969331 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.94:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.51:0.944:. ./.:4:22,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:100,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.51:1.000:. ./.:6:65,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:0.996:. ./.:4:34,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.09:1.000:. ./.:5:50,0:.:-0.44:0.982:. ./.:4:78,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.81:1.000:. ./.:3:46,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.76:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:45,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.89:1.000:. -chr5.1 19039918 chr5.1_019039918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 1.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 1.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 1.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.: 3.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 1.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 1.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 19569517 chr5.1_019569517 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.71:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,20:0.27: 1.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:150,11:0.14: 2.00:1.000:0.954 0/0/0/0:4:110,6:0.10: 1.09:1.000:0.715 0/0/0/1:4:134,11:0.15: 1.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:126,11:0.16: 1.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,7:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,22:0.31: 1.56:1.000:0.975 0/0/0/1:4:106,9:0.16: 1.07:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.63:0.944:1.000 0/0/0/0:4:89,5:0.11: 0.65:1.000:0.630 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,12:0.17: 1.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,19:0.27: 1.62:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,10:0.12: 2.00:1.000:0.840 0/0/0/0:4:105,1:0.02: 0.89:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:98,16:0.28: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:138,1:0.01: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,1:0.02: 1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1:3:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,12:0.16: 1.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,19:0.38: 0.67:1.000:0.612 0/0/0/1:4:91,14:0.26: 0.87:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,21:0.48: 0.43:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,8:0.16: 0.81:1.000:0.994 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,17:0.31: 0.91:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:47,17:0.50: 0.05:1.000:0.889 0/0/0/1:4:97,20:0.33: 1.11:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,11:0.21: 0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,29:0.46: 1.18:0.996:0.986 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,10:0.25: 0.37:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:104,7:0.13: 0.99:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,5:0.13: 0.29:1.000:0.923 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:76,18:0.37: 0.65:1.000:0.587 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,12:0.21: 1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,11:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,10:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,2:0.06: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,24:0.33: 1.58:1.000:0.910 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,11:0.26: 0.43:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,11:0.19: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,21:0.37: 0.97:1.000:0.600 0/0/0/1:4:109,13:0.21: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,12:0.25: 0.69:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.71:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,20:0.36: 0.89:1.000:0.650 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,12:0.28: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,12:0.25: 0.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,9:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,12:0.17: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:46,18:0.51: 0.05:0.982:0.553 0/0/0/1:4:87,8:0.17: 0.67:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.91:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:73,15:0.33: 0.53:1.000:0.917 0/0/0/1:4:68,15:0.35: 0.43:1.000:0.801 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.61:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1:3:0,27:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,20:0.29: 1.54:1.000:0.994 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,9:0.15: 1.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:24,4:0.28:-0.67:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,31:0.39: 1.86:1.000:0.641 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,12:0.22: 0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:90,8:0.16: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.93:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:111,19:0.29: 1.38:1.000:0.993 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.98:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,16:0.26: 1.26:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,24:0.31: 1.80:1.000:0.973 0/0/0/0:4:163,8:0.09: 2.20:1.000:0.910 0/0/0/1:4:112,10:0.16: 1.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.04:1.000:1.000 -chr5.1 19815077 chr5.1_019815077 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,0:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,1:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.45:0.944:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:5,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:44,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.09:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:7,0:.:-1.50:0.982:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./.:3:34,0:.: 1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 19879457 chr5.1_019879457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:72,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:37,16:.:-1.20:1.000:. ./.:4:65,15:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,10:.:-1.29:1.000:. ./.:4:79,49:.: 2.25:1.000:. ./.:4:29,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,21:.:-0.88:1.000:. ./.:4:34,53:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,47:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:9,29:.:-1.89:1.000:. ./.:4:38,18:.:-1.06:1.000:. ./.:4:33,50:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,42:.: 0.23:1.000:. ./.:4:47,12:.:-0.92:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.15:0.944:. ./.:4:43,24:.:-0.56:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,13:.:-2.21:1.000:. ./.:4:58,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,32:.: 0.92:1.000:. ./.:4:57,25:.: 0.13:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:76,49:.: 2.11:1.000:. ./.:4:31,37:.:-0.51:1.000:. ./.:4:41,8:.:-1.38:1.000:. ./.:4:66,26:.: 0.59:1.000:. ./.:4:58,28:.: 0.32:1.000:. ./.:4:51,89:.: 2.80:1.000:. ./.:4:42,17:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.12:1.000:. ./.:3:5,1:.:-3.36:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:62,14:.:-0.14:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.97:1.000:. ./.:4:48,66:.: 1.60:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.60:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:74,16:.: 0.50:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:4,12:.:-2.90:1.000:. ./.:4:57,26:.: 0.18:1.000:. ./.:4:20,24:.:-1.61:1.000:. ./.:4:54,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:79,16:.: 0.73:1.000:. ./.:4:33,61:.: 0.69:1.000:. ./.:4:81,22:.: 1.10:1.000:. ./.:4:39,55:.: 0.69:1.000:. ./.:4:68,42:.: 1.42:1.000:. ./.:4:46,38:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,36:.: 1.51:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:62,37:.: 0.92:1.000:. ./.:4:67,37:.: 1.15:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.87:1.000:. ./.:4:71,36:.: 1.28:1.000:. ./.:4:66,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:38,50:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:54,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:63,41:.: 1.15:0.996:. ./.:4:38,13:.:-1.29:1.000:. ./.:4:43,73:.: 1.70:1.000:. ./.:4:26,36:.:-0.79:1.000:. ./.:4:73,26:.: 0.92:1.000:. ./.:4:46,32:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,53:.: 0.46:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:72,15:.: 0.36:1.000:. ./.:4:64,38:.: 1.05:1.000:. ./.:4:57,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:33,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:44,62:.: 1.24:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,19:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,51:.: 1.38:1.000:. ./.:4:60,40:.: 0.96:1.000:. ./.:4:76,48:.: 2.06:1.000:. ./.:4:37,30:.:-0.56:1.000:. ./.:4:58,75:.: 2.48:1.000:. ./.:4:74,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:28,57:.: 0.27:1.000:. ./.:4:38,38:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,22:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,55:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,40:.:-0.51:1.000:. ./.:4:69,14:.: 0.18:1.000:. ./.:4:36,49:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:64,26:.: 0.50:1.000:. ./.:4:56,40:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,43:.:-0.10:1.000:. ./.:4:27,60:.: 0.36:1.000:. ./.:4:67,17:.: 0.23:1.000:. ./.:4:61,13:.:-0.23:1.000:. ./.:4:36,55:.: 0.55:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:67,25:.: 0.59:0.999:. ./.:4:37,71:.: 1.33:1.000:. ./.:4:25,12:.:-1.94:1.000:. ./.:4:68,14:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,35:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,40:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:44,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,51:.: 0.50:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:92,39:.: 2.39:1.000:. ./.:4:31,50:.: 0.09:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:61,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:70,31:.: 1.01:1.000:. ./.:5:45,31:.:-0.14:0.982:. ./.:4:56,30:.: 0.32:1.000:. ./.:4:43,10:.:-1.20:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,33:.: 0.23:1.000:. ./.:4:52,39:.: 0.55:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:30,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.87:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.09:1.000:. ./.:3:53,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:24,40:.:-0.69:1.000:. ./.:4:39,35:.:-0.23:1.000:. ./.:4:42,30:.:-0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:55,26:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,13:.:-2.35:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:46,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:53,43:.: 0.78:1.000:. ./.:4:45,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:58,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:47,12:.:-0.92:1.000:. ./.:4:43,22:.:-0.65:1.000:. ./.:4:33,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,32:.:-0.88:1.000:. ./.:4:52,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:48,10:.:-0.97:0.999:. ./.:4:31,19:.:-1.34:1.000:. ./.:4:33,39:.:-0.33:1.000:. ./.:4:37,16:.:-1.20:1.000:. ./.:4:41,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:57,9:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:64,14:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:36,42:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,16:.:-0.74:1.000:. ./.:4:58,33:.: 0.55:1.000:. ./.:4:43,50:.: 0.64:1.000:. ./.:4:25,40:.:-0.65:1.000:. ./.:4:59,16:.:-0.19:1.000:. -chr5.1 19918897 chr5.1_019918897 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:155,92:.: 0.32:1.000:. ./.:4:167,44:.:-0.32:1.000:. ./.:4:183,38:.:-0.15:1.000:. ./.:4:204,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:248,80:.: 1.78:1.000:. ./.:4:241,51:.: 1.13:1.000:. ./.:4:156,29:.:-0.79:1.000:. ./.:4:172,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:132,96:.:-0.02:1.000:. ./.:4:117,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:58,17:.:-2.77:1.000:. ./.:4:201,54:.: 0.47:1.000:. ./.:4:228,62:.: 1.09:1.000:. ./.:4:158,105:.: 0.61:1.000:. ./.:4:183,42:.:-0.07:1.000:. ./.:4:217,42:.: 0.54:1.000:. ./.:4:218,51:.: 0.72:0.944:. ./.:4:78,164:.: 0.23:1.000:. ./.:4:277,54:.: 1.83:1.000:. ./.:4:251,58:.: 1.43:1.000:. ./.:4:51,37:.:-2.53:1.000:. ./.:4:127,103:.: 0.02:1.000:. ./.:4:193,57:.: 0.38:1.000:. ./.:4:167,49:.:-0.24:1.000:. ./.:4:49,12:.:-3.02:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:192,49:.: 0.21:1.000:. ./.:4:174,38:.:-0.31:1.000:. ./.:4:223,59:.: 0.95:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:184,31:.:-0.25:1.000:. ./.:4:162,35:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,8:.:-3.29:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:28,11:.:-3.41:1.000:. ./.:4:209,37:.: 0.30:1.000:. ./.:4:185,49:.: 0.09:1.000:. ./.:4:188,65:.: 0.43:1.000:. ./.:4:130,65:.:-0.61:1.000:. ./.:4:187,43:.: 0.02:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:155,47:.:-0.49:1.000:. ./.:4:216,46:.: 0.59:1.000:. ./.:4:144,38:.:-0.85:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:182,53:.: 0.11:1.000:. ./.:4:232,58:.: 1.09:1.000:. ./.:4:47,21:.:-2.89:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.67:1.000:. ./.:4:68,44:.:-2.10:1.000:. ./.:4:152,39:.:-0.68:1.000:. ./.:4:149,119:.: 0.70:1.000:. ./.:4:197,51:.: 0.34:1.000:. ./.:4:199,48:.: 0.32:1.000:. ./.:4:185,64:.: 0.36:1.000:. ./.:4:168,38:.:-0.41:1.000:. ./.:4:175,37:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,50:.:-0.20:1.000:. ./.:4:190,32:.:-0.13:1.000:. ./.:6:130,66:.:-0.59:1.000:. ./.:4:188,63:.: 0.39:1.000:. ./.:4:167,51:.:-0.20:1.000:. ./.:4:232,51:.: 0.97:1.000:. ./.:4:157,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:218,46:.: 0.63:1.000:. ./.:4:186,39:.:-0.07:1.000:. ./.:4:197,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,55:.: 0.14:1.000:. ./.:4:147,44:.:-0.68:0.996:. ./.:4:110,81:.:-0.68:1.000:. ./.:4:198,51:.: 0.36:1.000:. ./.:4:100,97:.:-0.58:1.000:. ./.:4:175,41:.:-0.24:1.000:. ./.:4:213,62:.: 0.82:1.000:. ./.:4:69,149:.:-0.20:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:116,111:.:-0.04:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:118,107:.:-0.07:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:102,85:.:-0.76:1.000:. ./.:4:218,66:.: 0.99:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:107,104:.:-0.32:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:140,132:.: 0.77:1.000:. ./.:4:162,43:.:-0.43:1.000:. ./.:4:163,54:.:-0.22:1.000:. ./.:4:185,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:174,48:.:-0.13:1.000:. ./.:4:86,66:.:-1.38:1.000:. ./.:4:163,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:132,32:.:-1.17:1.000:. ./.:4:152,113:.: 0.64:1.000:. ./.:4:102,79:.:-0.86:1.000:. ./.:4:168,45:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,127:.:-0.77:1.000:. ./.:4:217,67:.: 0.99:1.000:. ./.:4:249,61:.: 1.45:1.000:. ./.:4:131,35:.:-1.13:1.000:. ./.:4:217,65:.: 0.95:1.000:. ./.:4:152,31:.:-0.83:1.000:. ./.:4:222,65:.: 1.04:1.000:. ./.:4:158,37:.:-0.61:1.000:. ./.:4:203,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,109:.:-0.40:1.000:. ./.:4:193,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:241,78:.: 1.61:1.000:. ./.:4:204,56:.: 0.55:1.000:. ./.:4:127,111:.: 0.16:1.000:. ./.:4:232,53:.: 1.00:1.000:. ./.:4:215,69:.: 0.99:0.999:. ./.:4:203,51:.: 0.45:1.000:. ./.:4:107,23:.:-1.78:1.000:. ./.:4:225,78:.: 1.33:1.000:. ./.:4:173,50:.:-0.11:1.000:. ./.:4:147,46:.:-0.65:1.000:. ./.:4:184,65:.: 0.36:1.000:. ./.:4:156,38:.:-0.63:1.000:. ./.:4:193,49:.: 0.23:1.000:. ./.:4:158,44:.:-0.49:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:218,54:.: 0.77:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:247,43:.: 1.09:1.000:. ./.:4:49,84:.:-1.73:1.000:. ./.:4:90,64:.:-1.35:1.000:. ./.:4:115,33:.:-1.46:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:199,47:.: 0.30:1.000:. ./.:5:121,79:.:-0.52:0.982:. ./.:4:176,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:113,106:.:-0.18:1.000:. ./.:4:245,49:.: 1.17:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:177,48:.:-0.07:1.000:. ./.:4:184,38:.:-0.13:1.000:. ./.:4:176,55:.: 0.03:1.000:. ./.:4:174,63:.: 0.14:1.000:. ./.:4:191,37:.:-0.02:1.000:. ./.:4:123,25:.:-1.46:1.000:. ./.:4:266,86:.: 2.21:1.000:. ./.:4:232,60:.: 1.13:1.000:. ./.:3:141,55:.:-0.59:1.000:. ./.:4:182,49:.: 0.03:1.000:. ./.:4:135,121:.: 0.48:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:211,48:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,44:.:-2.75:1.000:. ./.:4:129,37:.:-1.13:1.000:. ./.:4:179,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:188,148:.: 1.92:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:160,44:.:-0.45:1.000:. ./.:4:152,121:.: 0.79:1.000:. ./.:4:210,59:.: 0.72:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:194,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,86:.:-0.27:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:187,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:136,81:.:-0.22:1.000:. ./.:4:197,65:.: 0.59:0.999:. ./.:4:179,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:209,44:.: 0.43:1.000:. ./.:4:174,49:.:-0.11:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:125,100:.:-0.07:1.000:. ./.:4:171,48:.:-0.18:1.000:. ./.:4:143,30:.:-1.01:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:266,49:.: 1.54:1.000:. ./.:4:276,38:.: 1.52:1.000:. ./.:4:137,94:.: 0.03:1.000:. ./.:4:172,47:.:-0.18:1.000:. ./.:4:209,55:.: 0.63:1.000:. ./.:4:247,66:.: 1.51:1.000:. ./.:4:286,74:.: 2.35:1.000:. ./.:4:193,41:.: 0.09:1.000:. ./.:4:133,112:.: 0.29:1.000:. -chr5.1 20147516 chr5.1_020147516 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,42:0.48: 0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,41:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,63:0.21: 2.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,42:0.33: 0.76:1.000:0.923 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.16:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,32:0.44: 0.03:1.000:0.968 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,60:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,73:0.48: 1.56:0.944:0.996 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,65:0.46: 1.34:1.000:0.986 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,13:0.64:-0.92:1.000:0.743 0/0/1/1:4:56,71:0.48: 1.52:1.000:0.994 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,45:0.37: 0.79:1.000:0.611 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,46:0.40: 0.74:1.000:0.745 0/0/0/1:4:72,57:0.32: 1.56:1.000:0.962 0/1/1/1:4:11,46:0.68:-0.03:1.000:0.947 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.43:-0.92:1.000:0.958 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,60:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,41:0.42: 0.45:1.000:0.917 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,49:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,58:0.56: 0.67:1.000:0.971 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,50:0.44: 0.79:1.000:0.964 0/0/1/1:4:29,47:0.53: 0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,41:0.46: 0.36:1.000:0.987 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,100:0.56: 2.07:1.000:0.963 0/0/0/1:4:76,42:0.23: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,63:0.26: 2.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:84,50:0.24: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,57:0.24: 2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,42:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:30,29:0.38: 0.01:1.000:0.761 0/0/1/1:4:47,50:0.42: 0.85:1.000:0.897 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,60:0.53: 0.85:1.000:0.992 0/0/0/1:4:69,54:0.31: 1.43:1.000:0.969 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,60:0.32: 1.72:1.000:0.964 0/0/1/1:4:18,32:0.55:-0.19:1.000:0.981 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,48:0.27: 1.30:0.996:0.997 0/1/1/1:4:2,35:0.79:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,1:0.01: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,90:0.55: 1.78:1.000:0.975 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,42:0.45: 0.43:1.000:0.977 0/0/1/1:4:30,31:0.41: 0.05:1.000:0.839 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,53:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,62:0.24: 2.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,36:0.53:-0.01:1.000:0.991 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,48:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,40:0.40: 0.45:1.000:0.821 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,47:0.20: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,49:0.52: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,52:0.23: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,40:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,53:0.55: 0.54:1.000:0.982 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,42:0.46: 0.41:1.000:0.985 0/0/0/1:4:90,60:0.26: 2.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,59:0.52: 0.85:1.000:0.994 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.16:0.999:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,32:0.28: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:68,44:0.25: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,47:0.21: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,52:0.24: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,42:0.44: 0.45:1.000:0.964 0/1/1/1:4:7,54:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,32:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,43:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:28,0:0.00:-0.68:0.982:1.000 0/0/0/1:4:98,61:0.24: 2.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,63:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,37:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,33:0.21: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,30:0.28: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,65:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/0:3:34,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,48:0.23: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,71:0.57: 1.07:1.000:0.955 0/0/0/1:4:77,50:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,60:0.47: 1.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:53,54:0.40: 1.07:1.000:0.803 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,48:0.26: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,42:0.22: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,61:0.48: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,71:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,59:0.60: 0.54:0.999:0.761 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,44:0.33: 0.85:1.000:0.911 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,39:0.72:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,40:0.52: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,70:0.56: 1.07:1.000:0.968 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,54:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,70:0.54: 1.16:1.000:0.987 -chr5.1 20484096 chr5.1_020484096 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:310,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:223,53:.:-0.28:1.000:. ./.:4:266,42:.: 0.26:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:194,113:.: 0.25:1.000:. ./.:4:301,59:.: 1.14:1.000:. ./.:4:135,87:.:-1.19:1.000:. ./.:4:248,62:.: 0.30:1.000:. ./.:4:251,57:.: 0.26:1.000:. ./.:4:87,65:.:-2.37:1.000:. ./.:4:153,32:.:-1.81:1.000:. ./.:4:274,67:.: 0.82:1.000:. ./.:4:236,53:.:-0.06:1.000:. ./.:4:268,49:.: 0.42:1.000:. ./.:4:224,42:.:-0.45:1.000:. ./.:4:245,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:306,63:.: 1.29:0.944:. ./.:4:180,134:.: 0.37:1.000:. ./.:4:363,68:.: 2.34:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:309,52:.: 1.16:1.000:. ./.:4:281,59:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,17:.:-3.13:1.000:. ./.:4:186,132:.: 0.43:1.000:. ./.:4:253,53:.: 0.23:1.000:. ./.:4:240,66:.: 0.23:1.000:. ./.:4:286,55:.: 0.82:1.000:. ./.:4:215,115:.: 0.64:1.000:. ./.:4:193,155:.: 0.94:1.000:. ./.:4:225,71:.: 0.06:1.000:. ./.:4:123,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:139,41:.:-1.90:1.000:. ./.:3:91,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:256,56:.: 0.33:1.000:. ./.:4:261,72:.: 0.69:1.000:. ./.:4:241,53:.: 0.03:1.000:. ./.:4:235,62:.: 0.08:1.000:. ./.:4:245,53:.: 0.09:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:250,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:212,54:.:-0.45:1.000:. ./.:4:240,44:.:-0.14:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:268,177:.: 2.58:1.000:. ./.:4:130,108:.:-0.92:1.000:. ./.:4:261,58:.: 0.45:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:244,52:.: 0.06:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:147,101:.:-0.75:1.000:. ./.:4:168,128:.: 0.06:1.000:. ./.:4:199,65:.:-0.48:1.000:. ./.:4:141,142:.:-0.16:1.000:. ./.:4:233,45:.:-0.24:1.000:. ./.:6:183,74:.:-0.60:1.000:. ./.:4:185,102:.:-0.09:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:245,56:.: 0.15:1.000:. ./.:4:127,92:.:-1.24:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:171,103:.:-0.31:1.000:. ./.:4:178,34:.:-1.36:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:157,127:.:-0.14:0.996:. ./.:4:215,48:.:-0.50:1.000:. ./.:4:302,47:.: 0.96:1.000:. ./.:4:204,58:.:-0.51:1.000:. ./.:4:179,134:.: 0.35:1.000:. ./.:4:258,66:.: 0.53:1.000:. ./.:4:245,43:.:-0.07:1.000:. ./.:4:242,56:.: 0.09:1.000:. ./.:4:234,52:.:-0.11:1.000:. ./.:4:214,57:.:-0.36:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:196,123:.: 0.45:1.000:. ./.:4:174,42:.:-1.29:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:247,51:.: 0.09:1.000:. ./.:4:207,44:.:-0.70:1.000:. ./.:4:296,63:.: 1.13:1.000:. ./.:4:296,60:.: 1.07:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:186,33:.:-1.24:1.000:. ./.:4:232,47:.:-0.23:1.000:. ./.:4:147,106:.:-0.67:1.000:. ./.:4:177,39:.:-1.29:1.000:. ./.:4:286,65:.: 0.99:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:189,50:.:-0.90:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:257,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:164,91:.:-0.63:1.000:. ./.:4:109,82:.:-1.71:1.000:. ./.:4:268,64:.: 0.67:1.000:. ./.:4:140,28:.:-2.10:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:172,37:.:-1.41:1.000:. ./.:4:167,95:.:-0.51:1.000:. ./.:4:207,57:.:-0.48:1.000:. ./.:4:249,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:216,41:.:-0.60:1.000:. ./.:4:344,67:.: 2.00:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:262,45:.: 0.25:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:158,110:.:-0.41:1.000:. ./.:4:160,103:.:-0.50:1.000:. ./.:4:282,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:219,48:.:-0.43:1.000:. ./.:4:179,82:.:-0.53:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:157,114:.:-0.36:1.000:. ./.:4:248,55:.: 0.18:1.000:. ./.:4:211,57:.:-0.41:1.000:. ./.:4:255,41:.: 0.06:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:165,48:.:-1.34:1.000:. ./.:4:159,109:.:-0.41:1.000:. ./.:4:250,48:.: 0.09:1.000:. ./.:5:211,34:.:-0.80:0.982:. ./.:4:153,96:.:-0.73:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:451,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:262,76:.: 0.77:1.000:. ./.:4:185,46:.:-1.04:1.000:. ./.:4:171,41:.:-1.36:1.000:. ./.:4:141,90:.:-1.04:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:250,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:96,73:.:-2.08:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:279,65:.: 0.87:1.000:. ./.:3:245,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:245,44:.:-0.06:1.000:. ./.:4:281,63:.: 0.87:1.000:. ./.:4:144,110:.:-0.65:1.000:. ./.:4:297,56:.: 1.02:1.000:. ./.:4:161,103:.:-0.48:1.000:. ./.:4:121,17:.:-2.61:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:287,63:.: 0.97:1.000:. ./.:4:170,117:.:-0.09:1.000:. ./.:4:274,63:.: 0.75:1.000:. ./.:4:191,121:.: 0.33:1.000:. ./.:4:229,44:.:-0.33:1.000:. ./.:4:377,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:132,103:.:-0.97:1.000:. ./.:4:148,102:.:-0.72:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:281,56:.: 0.75:1.000:. ./.:4:268,65:.: 0.69:1.000:. ./.:4:296,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:271,63:.: 0.70:0.999:. ./.:4:253,57:.: 0.30:1.000:. ./.:4:243,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:118,113:.:-1.04:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:190,60:.:-0.72:1.000:. ./.:4:190,40:.:-1.05:1.000:. ./.:4:326,51:.: 1.43:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:286,69:.: 1.06:1.000:. ./.:4:248,52:.: 0.13:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:303,64:.: 1.26:1.000:. ./.:4:330,77:.: 1.94:1.000:. ./.:4:261,53:.: 0.37:1.000:. ./.:4:250,55:.: 0.21:1.000:. -chr5.1 20562815 chr5.1_020562815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:116,22:.: 1.03:1.000:. ./.:4:23,60:.:-0.90:1.000:. ./.:4:65,39:.:-0.16:1.000:. ./.:4:68,49:.: 0.29:1.000:. ./.:4:135,25:.: 1.80:1.000:. ./.:4:74,50:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,19:.:-0.41:1.000:. ./.:4:77,46:.: 0.50:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:26,23:.:-2.08:1.000:. ./.:4:47,12:.:-1.73:1.000:. ./.:4:29,64:.:-0.55:1.000:. ./.:4:87,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:108,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,48:.:-0.06:1.000:. ./.:4:54,51:.:-0.13:0.944:. ./.:4:106,24:.: 0.75:1.000:. ./.:4:104,63:.: 2.04:1.000:. ./.:4:101,45:.: 1.31:1.000:. ./.:4:70,16:.:-0.79:1.000:. ./.:4:116,27:.: 1.20:1.000:. ./.:4:146,26:.: 2.22:1.000:. ./.:4:60,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:44,12:.:-1.84:1.000:. ./.:4:35,62:.:-0.41:1.000:. ./.:4:95,25:.: 0.40:1.000:. ./.:4:71,11:.:-0.93:1.000:. ./.:4:123,22:.: 1.27:1.000:. ./.:4:57,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:52,13:.:-1.52:1.000:. ./.:4:45,25:.:-1.35:1.000:. ./.:4:39,10:.:-2.08:1.000:. ./.:4:28,40:.:-1.42:1.000:. ./.:3:12,18:.:-2.75:1.000:. ./.:4:83,42:.: 0.57:1.000:. ./.:4:69,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:63,43:.:-0.09:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:61,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,68:.:-0.48:1.000:. ./.:4:83,49:.: 0.82:1.000:. ./.:4:78,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:40,39:.:-1.04:1.000:. ./.:4:22,59:.:-0.97:1.000:. ./.:4:57,44:.:-0.27:1.000:. ./.:4:121,33:.: 1.59:1.000:. ./.:4:73,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,23:.:-1.10:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:57,42:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:68,39:.:-0.06:1.000:. ./.:4:104,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:98,28:.: 0.61:1.000:. ./.:4:81,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,23:.:-0.34:1.000:. ./.:4:108,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:54,31:.:-0.83:1.000:. ./.:6:93,6:.:-0.34:1.000:. ./.:4:119,18:.: 0.99:1.000:. ./.:4:83,19:.:-0.23:1.000:. ./.:4:66,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,43:.:-0.09:1.000:. ./.:4:96,25:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,45:.:-1.63:1.000:. ./.:4:69,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:61,26:.:-0.76:0.996:. ./.:4:80,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:116,17:.: 0.85:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:40,55:.:-0.48:1.000:. ./.:4:116,34:.: 1.45:1.000:. ./.:4:101,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:22,57:.:-1.04:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:29,58:.:-0.76:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:45,36:.:-0.97:1.000:. ./.:4:49,24:.:-1.24:1.000:. ./.:4:96,18:.: 0.19:1.000:. ./.:4:49,55:.:-0.16:1.000:. ./.:4:123,17:.: 1.10:1.000:. ./.:4:25,52:.:-1.10:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:62,17:.:-1.04:1.000:. ./.:4:81,18:.:-0.34:1.000:. ./.:4:50,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:52,41:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:77,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:73,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,31:.:-0.90:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:98,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:49,50:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,14:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,50:.: 0.19:1.000:. ./.:4:114,31:.: 1.27:1.000:. ./.:4:119,15:.: 0.89:1.000:. ./.:4:57,39:.:-0.44:1.000:. ./.:4:57,16:.:-1.24:1.000:. ./.:4:79,48:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,33:.:-1.07:1.000:. ./.:4:84,21:.:-0.13:1.000:. ./.:4:72,18:.:-0.65:1.000:. ./.:4:98,44:.: 1.17:1.000:. ./.:4:107,64:.: 2.18:1.000:. ./.:4:60,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:82,73:.: 1.62:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.16:0.999:. ./.:4:110,24:.: 0.89:1.000:. ./.:4:28,26:.:-1.91:1.000:. ./.:4:66,40:.:-0.09:1.000:. ./.:4:91,27:.: 0.33:1.000:. ./.:4:95,17:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,41:.:-0.44:1.000:. ./.:4:91,19:.: 0.05:1.000:. ./.:4:72,43:.: 0.22:1.000:. ./.:4:93,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:60,48:.:-0.02:1.000:. ./.:4:107,28:.: 0.92:1.000:. ./.:4:47,39:.:-0.79:1.000:. ./.:4:19,40:.:-1.73:1.000:. ./.:4:59,44:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,15:.:-0.69:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:48,16:.:-1.56:1.000:. ./.:4:25,61:.:-0.79:1.000:. ./.:4:107,25:.: 0.82:1.000:. ./.:5:65,21:.:-0.79:0.982:. ./.:4:37,26:.:-1.59:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.90:1.000:. ./.:4:66,62:.: 0.68:1.000:. ./.:4:20,46:.:-1.49:1.000:. ./.:4:43,29:.:-1.28:1.000:. ./.:4:96,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:72,36:.:-0.02:1.000:. ./.:4:99,22:.: 0.43:1.000:. ./.:4:92,21:.: 0.15:1.000:. ./.:4:57,13:.:-1.35:1.000:. ./.:4:90,68:.: 1.73:1.000:. ./.:4:92,81:.: 2.25:1.000:. ./.:3:87,24:.: 0.08:1.000:. ./.:4:97,15:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,37:.: 2.25:1.000:. ./.:4:62,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,91:.: 0.85:1.000:. ./.:4:115,27:.: 1.17:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:53,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:75,47:.: 0.47:1.000:. ./.:4:73,46:.: 0.36:1.000:. ./.:4:154,31:.: 2.67:1.000:. ./.:4:90,48:.: 1.03:1.000:. ./.:4:105,20:.: 0.57:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:124,26:.: 1.45:1.000:. ./.:4:33,45:.:-1.07:1.000:. ./.:4:97,23:.: 0.40:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,37:.:-1.49:1.000:. ./.:4:114,19:.: 0.85:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:43,71:.: 0.19:0.999:. ./.:4:73,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:97,18:.: 0.22:1.000:. ./.:4:45,49:.:-0.51:1.000:. ./.:4:42,37:.:-1.04:1.000:. ./.:4:93,17:.: 0.05:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:77,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:22,45:.:-1.45:1.000:. ./.:4:121,26:.: 1.34:1.000:. ./.:4:83,48:.: 0.78:1.000:. ./.:4:112,23:.: 0.92:1.000:. ./.:4:109,34:.: 1.20:1.000:. ./.:4:88,39:.: 0.64:1.000:. ./.:4:106,67:.: 2.25:1.000:. ./.:4:91,62:.: 1.55:1.000:. ./.:4:73,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:88,52:.: 1.10:1.000:. -chr5.1 20774900 chr5.1_020774900 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:62,256:.: 0.97:1.000:. ./.:4:52,170:.:-0.32:1.000:. ./.:4:95,138:.:-0.17:1.000:. ./.:4:123,155:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,387:.: 1.92:1.000:. ./.:4:76,244:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,274:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,142:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,56:.:-2.57:1.000:. ./.:4:13,44:.:-2.55:1.000:. ./.:4:49,219:.: 0.30:1.000:. ./.:4:129,134:.: 0.23:1.000:. ./.:4:63,230:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.32:1.000:. ./.:4:121,138:.: 0.18:1.000:. ./.:4:64,219:.: 0.50:0.944:. ./.:4:1,327:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,404:.: 2.13:1.000:. ./.:4:161,188:.: 1.39:1.000:. ./.:4:19,37:.:-2.57:1.000:. ./.:4:112,161:.: 0.37:1.000:. ./.:4:64,301:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.64:1.000:. ./.:4:8,15:.:-3.01:1.000:. ./.:4:0,341:.: 1.28:1.000:. ./.:4:68,250:.: 0.97:1.000:. ./.:4:116,121:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,398:.: 2.05:1.000:. ./.:4:67,217:.: 0.51:1.000:. ./.:4:118,126:.:-0.03:1.000:. ./.:4:81,106:.:-0.80:1.000:. ./.:4:10,18:.:-2.94:1.000:. ./.:4:5,60:.:-2.44:1.000:. ./.:3:4,14:.:-3.08:1.000:. ./.:4:46,205:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,143:.: 0.00:1.000:. ./.:4:66,221:.: 0.55:1.000:. ./.:4:57,174:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.28:1.000:. ./.:4:50,184:.:-0.16:1.000:. ./.:4:82,116:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,157:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.46:1.000:. ./.:4:48,211:.: 0.18:1.000:. ./.:4:46,222:.: 0.30:1.000:. ./.:4:73,312:.: 1.88:1.000:. ./.:4:11,36:.:-2.69:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.59:1.000:. ./.:4:51,55:.:-1.89:1.000:. ./.:4:43,143:.:-0.81:1.000:. ./.:4:147,165:.: 0.89:1.000:. ./.:4:50,244:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,135:.:-0.09:1.000:. ./.:4:53,228:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.42:1.000:. ./.:4:104,112:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.26:1.000:. ./.:4:52,162:.:-0.43:1.000:. ./.:6:49,147:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,223:.: 0.46:1.000:. ./.:4:66,171:.:-0.12:1.000:. ./.:4:110,141:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.82:1.000:. ./.:4:127,143:.: 0.32:1.000:. ./.:4:43,179:.:-0.32:1.000:. ./.:4:60,147:.:-0.53:1.000:. ./.:4:85,128:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,253:.: 0.10:0.996:. ./.:4:50,194:.:-0.03:1.000:. ./.:4:91,139:.:-0.22:1.000:. ./.:4:50,190:.:-0.08:1.000:. ./.:4:73,181:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,246:.: 0.73:1.000:. ./.:4:35,202:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.09:1.000:. ./.:4:46,197:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,206:.: 0.08:1.000:. ./.:4:110,121:.:-0.20:1.000:. ./.:4:53,168:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,149:.:-0.90:1.000:. ./.:4:67,223:.: 0.59:1.000:. ./.:4:77,243:.: 1.00:1.000:. ./.:4:52,205:.: 0.15:1.000:. ./.:4:41,117:.:-1.19:1.000:. ./.:4:114,134:.: 0.03:1.000:. ./.:4:32,140:.:-1.00:1.000:. ./.:4:42,152:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,243:.:-0.03:1.000:. ./.:4:55,180:.:-0.15:1.000:. ./.:4:97,168:.: 0.26:1.000:. ./.:4:46,168:.:-0.43:1.000:. ./.:4:51,202:.: 0.10:1.000:. ./.:4:51,150:.:-0.61:1.000:. ./.:4:50,157:.:-0.53:1.000:. ./.:4:41,166:.:-0.53:1.000:. ./.:4:35,166:.:-0.61:1.000:. ./.:4:75,107:.:-0.86:1.000:. ./.:4:55,228:.: 0.50:1.000:. ./.:4:57,273:.: 1.13:1.000:. ./.:4:47,195:.:-0.05:1.000:. ./.:4:91,135:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,81:.:-1.20:1.000:. ./.:4:55,218:.: 0.37:1.000:. ./.:4:31,128:.:-1.17:1.000:. ./.:4:62,172:.:-0.16:1.000:. ./.:4:45,152:.:-0.66:1.000:. ./.:4:58,208:.: 0.27:1.000:. ./.:4:75,321:.: 2.03:1.000:. ./.:4:50,201:.: 0.07:1.000:. ./.:4:97,116:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,259:.: 1.03:1.000:. ./.:4:116,141:.: 0.15:0.999:. ./.:4:90,123:.:-0.45:1.000:. ./.:4:49,68:.:-1.74:1.000:. ./.:4:49,197:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,153:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,169:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,173:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,205:.: 0.22:1.000:. ./.:4:43,176:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,229:.: 0.62:1.000:. ./.:4:65,255:.: 1.00:1.000:. ./.:4:38,168:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.47:1.000:. ./.:4:60,211:.: 0.34:1.000:. ./.:4:76,90:.:-1.08:1.000:. ./.:4:49,81:.:-1.57:1.000:. ./.:4:32,151:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.35:1.000:. ./.:4:54,233:.: 0.55:1.000:. ./.:5:69,120:.:-0.77:0.982:. ./.:4:0,263:.: 0.23:1.000:. ./.:4:92,140:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,363:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.41:1.000:. ./.:4:37,162:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.88:1.000:. ./.:4:44,191:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,253:.: 0.11:1.000:. ./.:4:99,140:.:-0.09:1.000:. ./.:4:30,118:.:-1.32:1.000:. ./.:4:73,303:.: 1.76:1.000:. ./.:4:101,378:.: 3.15:1.000:. ./.:3:53,163:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,212:.: 0.11:1.000:. ./.:4:59,241:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.08:1.000:. ./.:4:71,289:.: 1.54:1.000:. ./.:4:43,225:.: 0.30:1.000:. ./.:4:17,41:.:-2.54:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.91:1.000:. ./.:4:52,232:.: 0.51:1.000:. ./.:4:66,274:.: 1.27:1.000:. ./.:4:70,298:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,327:.: 1.09:1.000:. ./.:4:54,218:.: 0.35:1.000:. ./.:4:121,196:.: 0.96:1.000:. ./.:4:116,151:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.81:1.000:. ./.:4:89,136:.:-0.28:1.000:. ./.:4:118,170:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,156:.:-0.78:1.000:. ./.:4:113,137:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,125:.:-0.34:1.000:. ./.:4:52,248:.: 0.73:0.999:. ./.:4:0,286:.: 0.54:1.000:. ./.:4:109,171:.: 0.46:1.000:. ./.:4:90,132:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,122:.:-0.20:1.000:. ./.:4:35,186:.:-0.34:1.000:. ./.:4:52,144:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.05:1.000:. ./.:4:154,150:.: 0.78:1.000:. ./.:4:79,275:.: 1.46:1.000:. ./.:4:64,303:.: 1.63:1.000:. ./.:4:87,127:.:-0.43:1.000:. ./.:4:115,199:.: 0.92:1.000:. ./.:4:1,364:.: 1.61:1.000:. ./.:4:69,310:.: 1.80:1.000:. ./.:4:39,184:.:-0.31:1.000:. ./.:4:63,269:.: 1.16:1.000:. -chr5.1 20864749 chr5.1_020864749 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:129,313:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:225,232:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:238,263:0.53: 0.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:358,121:0.22: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,323:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,151:0.29: 0.58:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,215:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,107:0.46:-1.27:1.000:0.986 0/0/1/1:4:61,59:0.50:-2.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,93:0.77:-2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,262:0.54: 0.75:1.000:0.989 0/0/1/1:4:256,163:0.38: 0.16:1.000:0.513 0/0/1/1:4:159,164:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,118:0.54:-1.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:217,268:0.57: 0.67:1.000:0.958 0/0/0/1:4:295,166:0.34: 0.48:0.944:0.857 0/0/0/1:4:234,143:0.36:-0.16:1.000:0.636 0/1/1/1:4:159,363:0.73: 0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:498,198:0.25: 2.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,72:0.57:-2.06:1.000:0.955 0/0/0/1:4:243,135:0.34:-0.16:1.000:0.879 0/0/0/0:4:332,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,123:0.31:-0.25:1.000:0.968 0/1/1/1:4:28,79:0.77:-2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,139:0.33:-0.03:1.000:0.907 0/1/1/1:4:119,260:0.72:-0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:131,424:0.79: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,152:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:315,156:0.31: 0.56:1.000:0.977 0/1/1/1:4:122,327:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,254:0.56: 0.52:1.000:0.972 0/0/1/1:4:20,14:0.40:-2.79:1.000:0.811 0/1/1/1:4:76,120:0.63:-1.55:1.000:0.596 0/1/1:3:15,59:0.82:-2.49:1.000:0.986 0/0/0/0:4:324,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:309,303:0.50: 1.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:172,486:0.77: 1.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,327:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:156,345:0.72: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:328,134:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:332,171:0.32: 0.80:1.000:0.958 0/0/1/1:4:256,341:0.59: 1.52:1.000:0.886 0/1/1/1:4:108,249:0.73:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:387,179:0.29: 1.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:223,257:0.55: 0.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:284,158:0.34: 0.34:1.000:0.877 1/1/1/1:4:0,180:1.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,124:0.58:-1.38:1.000:0.899 0/0/1/1:4:140,137:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,251:0.57: 0.38:1.000:0.936 0/1/1/1:4:151,336:0.72: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:237,127:0.33:-0.26:1.000:0.926 0/0/1/1:4:252,296:0.55: 1.15:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,398:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,351:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:241,124:0.32:-0.25:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,305:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,135:0.32: 0.01:1.000:0.962 0/0/1/1/1/1:6:111,164:0.61:-0.95:1.000:0.750 0/0/1/1:4:139,166:0.56:-0.72:1.000:0.973 0/0/0/1:4:224,117:0.32:-0.44:1.000:0.949 0/0/1/1:4:291,341:0.55: 1.79:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,318:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:410,162:0.25: 1.33:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,438:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:371,178:0.30: 1.16:1.000:0.985 0/0/0/1:4:352,138:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,160:0.57:-0.84:0.996:0.955 0/1/1/1:4:97,259:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:325,180:0.34: 0.82:1.000:0.884 1/1/1/1:4:0,288:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,456:0.82: 1.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:266,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,294:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,268:0.54: 0.81:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:371,150:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,266:0.74:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:279,176:0.37: 0.44:1.000:0.521 0/1/1/1:4:92,227:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:292,129:0.28: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:268,323:0.56: 1.48:1.000:0.970 0/0/1/1:4:116,105:0.48:-1.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:433,170:0.25: 1.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,160:0.55:-0.78:1.000:0.978 0/0/0/1:4:223,119:0.33:-0.43:1.000:0.930 0/0/0/1:4:187,108:0.35:-0.79:1.000:0.803 0/0/0/1:4:225,136:0.36:-0.29:1.000:0.673 0/0/1/1:4:223,237:0.52: 0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,119:0.50:-1.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:246,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:312,186:0.36: 0.77:1.000:0.717 0/0/0/1:4:151,79:0.32:-1.29:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,394:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,303:0.72: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,119:0.34:-0.51:1.000:0.870 0/1/1/1:4:105,297:0.77: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,464:0.82: 1.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,485:1.00: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,433:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,292:0.55: 1.13:1.000:0.983 0/0/0/1:4:201,111:0.34:-0.66:1.000:0.889 0/0/0/0:4:366,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,411:0.84: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,117:0.52:-1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,169:0.57:-0.74:1.000:0.938 0/0/0/1:4:284,148:0.32: 0.26:1.000:0.950 0/0/1/1:4:320,367:0.54: 2.21:1.000:0.985 0/0/1/1:4:216,273:0.57: 0.70:1.000:0.942 0/0/1/1:4:118,147:0.57:-1.02:1.000:0.953 0/0/0/1:4:373,211:0.34: 1.42:1.000:0.847 0/0/1/1:4:217,286:0.58: 0.80:0.999:0.900 0/0/1/1:4:260,172:0.39: 0.26:1.000:0.651 0/0/0/1:4:279,124:0.28: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:264,339:0.58: 1.57:1.000:0.929 1/1/1/1:4:2,350:0.99:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,411:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:445,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:247,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,279:0.70: 0.12:1.000:0.987 0/0/0/1:4:233,137:0.35:-0.22:1.000:0.757 0/0/0/1:4:278,142:0.32: 0.17:1.000:0.963 0/1/1/1:4:113,269:0.74:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:227,268:0.55: 0.74:1.000:0.977 0/0/1/1:4:254,292:0.55: 1.13:1.000:0.984 0/0/1/1:4:230,304:0.58: 1.04:1.000:0.896 0/1/1/1:4:99,256:0.75:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,247:0.71:-0.25:1.000:0.989 0/1/1/1:4:105,256:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:234,150:0.38:-0.11:1.000:0.538 0/0/0/0:4:246,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:178,121:0.39:-0.76:0.982:0.971 0/0/1/1:4:122,159:0.58:-0.90:1.000:0.914 0/0/0/1:4:243,125:0.32:-0.23:1.000:0.959 0/0/0/1:4:316,193:0.36: 0.85:1.000:0.638 0/0/1/1:4:242,306:0.57: 1.15:1.000:0.942 0/0/1/1:4:241,287:0.55: 1.00:1.000:0.974 0/0/1/1:4:85,108:0.57:-1.57:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,252:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:336,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,147:0.59:-1.08:1.000:0.881 0/0/1/1:4:220,260:0.55: 0.63:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,374:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:363,350:0.50: 2.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:318,211:0.39: 1.00:1.000:0.661 0/0/0:3:266,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,255:0.71:-0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:163,141:0.46:-0.72:1.000:0.990 0/1/1/1:4:111,272:0.74:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:431,166:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,138:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,66:0.77:-2.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,109:0.32:-0.60:1.000:0.956 0/0/0/1:4:291,174:0.36: 0.51:1.000:0.707 0/0/0/1:4:297,164:0.34: 0.48:1.000:0.889 0/0/1/1:4:154,176:0.54:-0.52:1.000:0.985 0/1/1/1:4:168,366:0.72: 1.04:1.000:0.994 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:117,272:0.73:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:267,274:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:246,127:0.32:-0.19:1.000:0.957 0/1/1/1:4:118,285:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,257:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:285,306:0.53: 1.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:243,142:0.35:-0.10:1.000:0.773 0/1/1/1:4:136,334:0.74: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,303:0.57: 1.14:0.999:0.955 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,114:0.28:-0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:326,119:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,246:0.74:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,136:0.34:-0.15:1.000:0.867 0/0/1/1:4:218,233:0.52: 0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:129,265:0.70:-0.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:191,228:0.56: 0.16:1.000:0.973 0/1/1/1:4:182,584:0.79: 2.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:460,1:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,158:0.60:-0.97:1.000:0.815 0/1/1/1:4:149,337:0.72: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:391,174:0.28: 1.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:357,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,187:0.37: 0.65:1.000:0.516 0/0/0/1:4:251,112:0.28:-0.27:1.000:0.995 0/1/1/1:4:97,276:0.77:-0.19:1.000:1.000 -chr5.1 21174908 chr5.1_021174908 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:186,49:.: 1.23:1.000:. ./.:4:77,55:.:-0.84:1.000:. ./.:4:168,49:.: 0.87:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:65,164:.: 1.11:1.000:. ./.:4:207,67:.: 2.02:1.000:. ./.:4:37,96:.:-0.82:1.000:. ./.:4:83,79:.:-0.23:1.000:. ./.:4:103,92:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,10:.:-3.05:1.000:. ./.:4:25,8:.:-2.83:1.000:. ./.:4:106,37:.:-0.62:1.000:. ./.:4:142,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:81,99:.: 0.13:1.000:. ./.:4:67,84:.:-0.46:1.000:. ./.:4:212,45:.: 1.67:1.000:. ./.:4:121,84:.: 0.63:0.944:. ./.:4:106,105:.: 0.75:1.000:. ./.:4:142,111:.: 1.59:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:25,6:.:-2.87:1.000:. ./.:4:167,46:.: 0.79:1.000:. ./.:4:95,90:.: 0.23:1.000:. ./.:4:110,50:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,6:.:-3.15:1.000:. ./.:4:66,84:.:-0.48:1.000:. ./.:4:170,63:.: 1.19:1.000:. ./.:4:190,67:.: 1.67:1.000:. ./.:4:101,99:.: 0.53:1.000:. ./.:4:86,92:.: 0.09:1.000:. ./.:4:119,112:.: 1.15:1.000:. ./.:4:175,48:.: 0.99:1.000:. ./.:4:17,2:.:-3.11:1.000:. ./.:4:26,4:.:-2.89:1.000:. ./.:3:18,2:.:-3.09:1.000:. ./.:4:143,43:.: 0.25:1.000:. ./.:4:181,46:.: 1.07:1.000:. ./.:4:207,43:.: 1.53:1.000:. ./.:4:107,81:.: 0.29:1.000:. ./.:4:127,83:.: 0.73:1.000:. ./.:4:153,42:.: 0.43:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:170,41:.: 0.75:1.000:. ./.:4:98,86:.: 0.21:1.000:. ./.:4:105,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:131,50:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,66:.:-0.68:1.000:. ./.:4:37,128:.:-0.17:1.000:. ./.:4:96,83:.: 0.11:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:185,56:.: 1.35:1.000:. ./.:4:107,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:115,93:.: 0.69:1.000:. ./.:4:63,120:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,49:.:-0.19:1.000:. ./.:4:55,121:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,73:.: 0.01:1.000:. ./.:6:82,60:.:-0.64:1.000:. ./.:4:47,128:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,38:.:-0.31:1.000:. ./.:4:163,56:.: 0.91:1.000:. ./.:4:40,103:.:-0.62:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:114,75:.: 0.31:1.000:. ./.:4:90,25:.:-1.18:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,105:.:-0.23:0.996:. ./.:4:63,88:.:-0.46:1.000:. ./.:4:139,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,63:.:-0.76:1.000:. ./.:4:60,93:.:-0.42:1.000:. ./.:4:91,101:.: 0.37:1.000:. ./.:4:46,105:.:-0.46:1.000:. ./.:4:107,39:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,82:.: 0.23:1.000:. ./.:4:108,42:.:-0.48:1.000:. ./.:4:165,39:.: 0.61:1.000:. ./.:4:89,88:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,65:.:-0.92:1.000:. ./.:4:99,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:156,55:.: 0.75:1.000:. ./.:4:95,71:.:-0.15:1.000:. ./.:4:123,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:124,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:106,27:.:-0.82:1.000:. ./.:4:116,26:.:-0.64:1.000:. ./.:4:102,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:88,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,88:.:-0.35:1.000:. ./.:4:85,86:.:-0.05:1.000:. ./.:4:101,42:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,79:.: 0.13:1.000:. ./.:4:135,35:.:-0.07:1.000:. ./.:4:90,29:.:-1.10:1.000:. ./.:4:118,31:.:-0.50:1.000:. ./.:4:158,29:.: 0.27:1.000:. ./.:4:107,101:.: 0.69:1.000:. ./.:4:73,61:.:-0.80:1.000:. ./.:4:160,47:.: 0.67:1.000:. ./.:4:88,30:.:-1.12:1.000:. ./.:4:103,35:.:-0.72:1.000:. ./.:4:143,23:.:-0.15:1.000:. ./.:4:40,104:.:-0.60:1.000:. ./.:4:76,70:.:-0.56:1.000:. ./.:4:149,47:.: 0.45:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:86,63:.:-0.50:1.000:. ./.:4:172,132:.: 2.62:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:136,42:.: 0.09:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:48,76:.:-1.00:1.000:. ./.:4:111,62:.:-0.01:1.000:. ./.:4:127,36:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,54:.:-1.46:1.000:. ./.:4:100,96:.: 0.45:1.000:. ./.:4:121,37:.:-0.31:1.000:. ./.:4:73,91:.:-0.19:1.000:. ./.:4:171,57:.: 1.09:1.000:. ./.:4:122,32:.:-0.39:1.000:. ./.:4:121,40:.:-0.25:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:109,34:.:-0.62:1.000:. ./.:4:133,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:86,69:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,61:.:-0.96:1.000:. ./.:4:87,99:.: 0.25:1.000:. ./.:5:95,52:.:-0.54:0.982:. ./.:4:53,99:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,39:.: 0.43:1.000:. ./.:4:165,61:.: 1.05:1.000:. ./.:4:110,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:96,26:.:-1.04:1.000:. ./.:4:55,60:.:-1.18:1.000:. ./.:4:46,76:.:-1.04:1.000:. ./.:4:104,38:.:-0.64:1.000:. ./.:4:55,60:.:-1.18:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:76,42:.:-1.12:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:148,138:.: 2.26:1.000:. ./.:3:137,48:.: 0.23:1.000:. ./.:4:124,53:.: 0.07:1.000:. ./.:4:131,94:.: 1.03:1.000:. ./.:4:67,70:.:-0.74:1.000:. ./.:4:183,55:.: 1.29:1.000:. ./.:4:66,154:.: 0.93:1.000:. ./.:4:9,16:.:-2.99:1.000:. ./.:4:119,33:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,92:.: 1.05:1.000:. ./.:4:59,53:.:-1.24:1.000:. ./.:4:131,127:.: 1.70:1.000:. ./.:4:87,101:.: 0.29:1.000:. ./.:4:84,84:.:-0.11:1.000:. ./.:4:191,47:.: 1.29:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:66,75:.:-0.66:1.000:. ./.:4:105,92:.: 0.47:1.000:. ./.:4:176,54:.: 1.13:1.000:. ./.:4:130,44:.: 0.01:1.000:. ./.:4:154,40:.: 0.41:1.000:. ./.:4:152,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:104,51:.:-0.37:0.999:. ./.:4:64,84:.:-0.52:1.000:. ./.:4:141,44:.: 0.23:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,78:.:-0.78:1.000:. ./.:4:164,47:.: 0.75:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:93,70:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,39:.:-0.25:1.000:. ./.:4:215,57:.: 1.98:1.000:. ./.:4:166,47:.: 0.79:1.000:. ./.:4:124,119:.: 1.39:1.000:. ./.:4:183,50:.: 1.19:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:103,113:.: 0.85:1.000:. ./.:4:183,54:.: 1.27:1.000:. ./.:4:110,46:.:-0.35:1.000:. ./.:4:91,109:.: 0.53:1.000:. -chr5.1 21232571 chr5.1_021232571 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:119,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:76,64:.: 1.12:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:69,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:86,53:.: 1.09:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:86,37:.: 0.59:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:19,9:.:-2.42:1.000:. ./.:4:17,6:.:-2.57:1.000:. ./.:4:67,47:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,30:.: 1.47:1.000:. ./.:4:59,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:78,36:.: 0.30:1.000:. ./.:4:115,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.14:0.944:. ./.:4:64,58:.: 0.56:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:105,39:.: 1.25:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:110,43:.: 1.54:1.000:. ./.:4:49,37:.:-0.58:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:53,26:.:-0.80:1.000:. ./.:4:134,31:.: 1.91:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:101,37:.: 1.06:1.000:. ./.:4:117,45:.: 1.82:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:19,4:.:-2.57:1.000:. ./.:4:26,7:.:-2.26:1.000:. ./.:3:3,2:.:-3.14:1.000:. ./.:4:71,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:124,3:.: 0.71:1.000:. ./.:4:65,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,28:.:-0.08:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:53,37:.:-0.46:1.000:. ./.:4:64,33:.:-0.23:1.000:. ./.:4:139,36:.: 2.23:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.93:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.74:1.000:. ./.:4:100,21:.: 0.52:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:94,25:.: 0.46:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.12:1.000:. ./.:6:98,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:85,20:.: 0.02:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:68,31:.:-0.17:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,15:.:-1.34:1.000:. ./.:4:61,30:.:-0.42:1.000:. ./.:4:98,2:.:-0.14:0.996:. ./.:4:100,25:.: 0.65:1.000:. ./.:4:89,28:.: 0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:78,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:103,33:.: 1.00:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:51,23:.:-0.96:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,36:.:-0.55:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:119,43:.: 1.82:1.000:. ./.:4:70,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:75,27:.:-0.08:1.000:. ./.:4:113,25:.: 1.06:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:54,18:.:-1.02:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:67,14:.:-0.74:1.000:. ./.:4:78,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,23:.:-0.83:1.000:. ./.:4:60,29:.:-0.49:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:83,37:.: 0.49:1.000:. ./.:4:109,34:.: 1.22:1.000:. ./.:4:58,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:34,22:.:-1.53:1.000:. ./.:4:79,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:83,18:.:-0.11:1.000:. ./.:4:64,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:71,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:66,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:60,27:.:-0.55:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:91,25:.: 0.37:0.999:. ./.:4:101,34:.: 0.97:1.000:. ./.:4:50,20:.:-1.09:1.000:. ./.:4:58,21:.:-0.80:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:52,22:.:-0.96:1.000:. ./.:4:62,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:73,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:82,31:.: 0.27:1.000:. ./.:4:123,35:.: 1.69:1.000:. ./.:4:66,18:.:-0.65:1.000:. ./.:4:56,32:.:-0.52:1.000:. ./.:4:51,31:.:-0.71:1.000:. ./.:4:79,23:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:35,30:.:-1.25:1.000:. ./.:4:128,38:.: 1.95:1.000:. ./.:5:85,1:.:-0.58:0.982:. ./.:4:78,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:70,44:.: 0.30:1.000:. ./.:4:62,42:.:-0.01:1.000:. ./.:4:75,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:66,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:42,30:.:-1.02:1.000:. ./.:4:74,21:.:-0.30:1.000:. ./.:4:100,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:72,42:.: 0.30:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.17:1.000:. ./.:3:90,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:94,38:.: 0.87:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:79,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,34:.: 0.65:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:45,29:.:-0.96:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:116,27:.: 1.22:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:105,26:.: 0.84:1.000:. ./.:4:107,36:.: 1.22:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:85,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,23:.:-0.96:1.000:. ./.:4:155,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:95,25:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,26:.: 1.12:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:60,69:.: 0.78:0.999:. ./.:4:71,37:.: 0.11:1.000:. ./.:4:116,32:.: 1.38:1.000:. ./.:4:65,27:.:-0.39:1.000:. ./.:4:66,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,23:.: 0.93:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:78,26:.:-0.01:1.000:. ./.:4:189,1:.: 2.70:1.000:. ./.:4:82,37:.: 0.46:1.000:. ./.:4:102,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:146,9:.: 1.60:1.000:. ./.:4:91,28:.: 0.46:1.000:. ./.:4:86,44:.: 0.81:1.000:. ./.:4:101,40:.: 1.16:1.000:. ./.:4:49,23:.:-1.02:1.000:. ./.:4:95,27:.: 0.56:1.000:. -chr5.1 21454848 chr5.1_021454848 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:123,56:.: 1.41:1.000:. ./.:4:56,45:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,43:.: 0.48:1.000:. ./.:4:111,60:.: 1.25:1.000:. ./.:4:102,79:.: 1.45:1.000:. ./.:4:158,73:.: 2.46:1.000:. ./.:4:37,18:.:-1.10:1.000:. ./.:4:105,75:.: 1.43:1.000:. ./.:4:87,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:4,4:.:-2.05:1.000:. ./.:4:5,5:.:-2.01:1.000:. ./.:4:58,61:.: 0.20:1.000:. ./.:4:85,33:.: 0.18:1.000:. ./.:4:84,43:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,34:.: 0.13:1.000:. ./.:4:158,95:.: 2.91:1.000:. ./.:4:128,59:.: 1.57:0.944:. ./.:4:69,103:.: 1.27:1.000:. ./.:4:127,56:.: 1.49:1.000:. ./.:4:107,59:.: 1.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:105,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:88,40:.: 0.38:1.000:. ./.:4:59,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:97,44:.: 0.64:1.000:. ./.:4:134,66:.: 1.83:1.000:. ./.:4:89,74:.: 1.09:1.000:. ./.:4:84,38:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,51:.: 1.67:1.000:. ./.:4:97,34:.: 0.44:1.000:. ./.:4:125,53:.: 1.39:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.11:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.19:1.000:. ./.:4:114,38:.: 0.86:1.000:. ./.:4:108,44:.: 0.86:1.000:. ./.:4:99,42:.: 0.64:1.000:. ./.:4:74,21:.:-0.29:1.000:. ./.:4:87,70:.: 0.96:1.000:. ./.:4:61,42:.:-0.13:1.000:. ./.:4:80,39:.: 0.20:1.000:. ./.:4:68,42:.: 0.01:1.000:. ./.:4:44,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:51,24:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:91,61:.: 0.86:1.000:. ./.:4:25,21:.:-1.28:1.000:. ./.:4:75,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:62,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:21,10:.:-1.58:1.000:. ./.:4:81,44:.: 0.32:1.000:. ./.:4:49,47:.:-0.27:1.000:. ./.:4:66,33:.:-0.21:1.000:. ./.:4:82,63:.: 0.72:1.000:. ./.:4:56,32:.:-0.43:1.000:. ./.:4:77,51:.: 0.38:1.000:. ./.:4:46,27:.:-0.73:1.000:. ./.:4:64,30:.:-0.31:1.000:. ./.:6:45,31:.:-0.67:1.000:. ./.:4:68,20:.:-0.43:1.000:. ./.:4:60,51:.: 0.03:1.000:. ./.:4:44,21:.:-0.90:1.000:. ./.:4:42,23:.:-0.90:1.000:. ./.:4:87,46:.: 0.48:1.000:. ./.:4:62,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:22,12:.:-1.52:1.000:. ./.:4:81,66:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,29:.:-0.33:0.996:. ./.:4:73,66:.: 0.60:1.000:. ./.:4:53,31:.:-0.51:1.000:. ./.:4:21,10:.:-1.58:1.000:. ./.:4:37,37:.:-0.71:1.000:. ./.:4:111,71:.: 1.47:1.000:. ./.:4:46,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:56,14:.:-0.80:1.000:. ./.:4:52,25:.:-0.65:1.000:. ./.:4:63,63:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,22:.:-1.12:1.000:. ./.:4:62,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:47,41:.:-0.43:1.000:. ./.:4:83,43:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,13:.:-1.30:1.000:. ./.:4:70,51:.: 0.24:1.000:. ./.:4:36,16:.:-1.16:1.000:. ./.:4:43,37:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,15:.:-1.24:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:54,25:.:-0.61:1.000:. ./.:4:68,55:.: 0.28:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.51:1.000:. ./.:4:86,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:46,28:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,40:.:-0.71:1.000:. ./.:4:48,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:20,34:.:-1.12:1.000:. ./.:4:41,19:.:-1.00:1.000:. ./.:4:89,52:.: 0.64:1.000:. ./.:4:21,3:.:-1.73:1.000:. ./.:4:52,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,16:.:-1.22:1.000:. ./.:4:49,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:45,24:.:-0.82:1.000:. ./.:4:71,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:58,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:108,54:.: 1.06:1.000:. ./.:4:88,73:.: 1.04:1.000:. ./.:4:73,62:.: 0.52:1.000:. ./.:4:51,26:.:-0.65:1.000:. ./.:4:151,74:.: 2.34:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.76:0.999:. ./.:4:65,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:50,29:.:-0.61:1.000:. ./.:4:38,34:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,25:.:-1.38:1.000:. ./.:4:31,33:.:-0.92:1.000:. ./.:4:43,24:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,20:.:-0.73:1.000:. ./.:4:88,47:.: 0.52:1.000:. ./.:4:35,23:.:-1.04:1.000:. ./.:4:56,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:105,60:.: 1.13:1.000:. ./.:4:42,26:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,27:.:-0.53:1.000:. ./.:4:48,31:.:-0.61:1.000:. ./.:4:34,34:.:-0.84:1.000:. ./.:4:25,13:.:-1.44:1.000:. ./.:4:34,14:.:-1.24:1.000:. ./.:4:45,26:.:-0.78:1.000:. ./.:4:80,65:.: 0.72:1.000:. ./.:5:41,16:.:-1.06:0.982:. ./.:4:74,44:.: 0.18:1.000:. ./.:4:88,52:.: 0.62:1.000:. ./.:4:118,54:.: 1.27:1.000:. ./.:4:73,56:.: 0.40:1.000:. ./.:4:39,26:.:-0.90:1.000:. ./.:4:30,38:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,18:.:-1.28:1.000:. ./.:4:45,28:.:-0.73:1.000:. ./.:4:40,26:.:-0.88:1.000:. ./.:4:93,46:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,22:.:-1.10:1.000:. ./.:4:99,45:.: 0.70:1.000:. ./.:4:88,58:.: 0.74:1.000:. ./.:3:86,33:.: 0.20:1.000:. ./.:4:87,62:.: 0.80:1.000:. ./.:4:111,41:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,58:.: 0.34:1.000:. ./.:4:117,73:.: 1.63:1.000:. ./.:4:126,72:.: 1.79:1.000:. ./.:4:3,2:.:-2.11:1.000:. ./.:4:60,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:104,62:.: 1.15:1.000:. ./.:4:74,55:.: 0.40:1.000:. ./.:4:109,56:.: 1.13:1.000:. ./.:4:84,48:.: 0.46:1.000:. ./.:4:99,28:.: 0.36:1.000:. ./.:4:76,40:.: 0.13:1.000:. ./.:4:73,52:.: 0.32:1.000:. ./.:4:83,58:.: 0.64:1.000:. ./.:4:106,51:.: 0.96:1.000:. ./.:4:94,63:.: 0.96:1.000:. ./.:4:129,45:.: 1.31:1.000:. ./.:4:107,75:.: 1.47:1.000:. ./.:4:52,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:65,58:.: 0.28:0.999:. ./.:4:88,44:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,35:.:-0.01:1.000:. ./.:4:83,44:.: 0.36:1.000:. ./.:4:54,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:67,33:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,36:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:72,54:.: 0.34:1.000:. ./.:4:105,63:.: 1.19:1.000:. ./.:4:109,52:.: 1.04:1.000:. ./.:4:122,57:.: 1.41:1.000:. ./.:4:98,66:.: 1.11:1.000:. ./.:4:96,66:.: 1.06:1.000:. ./.:4:123,54:.: 1.37:1.000:. ./.:4:110,61:.: 1.25:1.000:. ./.:4:68,45:.: 0.07:1.000:. ./.:4:77,80:.: 0.96:1.000:. -chr5.1 21637488 chr5.1_021637488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:159,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:36,65:.:-0.84:1.000:. ./.:4:96,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:93,33:.: 0.00:1.000:. ./.:4:109,42:.: 0.85:1.000:. ./.:4:125,32:.: 1.05:1.000:. ./.:4:45,19:.:-2.10:1.000:. ./.:4:104,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:33,15:.:-2.64:1.000:. ./.:4:39,6:.:-2.74:1.000:. ./.:4:38,86:.:-0.07:1.000:. ./.:4:98,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:110,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:102,27:.: 0.10:1.000:. ./.:4:111,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:109,21:.: 0.14:0.944:. ./.:4:31,52:.:-1.45:1.000:. ./.:4:158,43:.: 2.54:1.000:. ./.:4:158,36:.: 2.31:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:119,35:.: 0.95:1.000:. ./.:4:105,27:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,8:.:-2.84:1.000:. ./.:4:68,39:.:-0.64:1.000:. ./.:4:93,24:.:-0.30:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.20:1.000:. ./.:4:137,30:.: 1.39:1.000:. ./.:4:76,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:91,30:.:-0.17:1.000:. ./.:4:92,11:.:-0.78:1.000:. ./.:4:16,2:.:-3.66:1.000:. ./.:4:32,18:.:-2.57:1.000:. ./.:3:13,9:.:-3.52:1.000:. ./.:4:102,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:88,23:.:-0.51:1.000:. ./.:4:119,31:.: 0.82:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:116,21:.: 0.38:1.000:. ./.:4:75,59:.: 0.27:1.000:. ./.:4:109,34:.: 0.58:1.000:. ./.:4:127,34:.: 1.19:1.000:. ./.:4:95,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:67,65:.: 0.21:1.000:. ./.:4:105,34:.: 0.44:1.000:. ./.:4:133,28:.: 1.19:1.000:. ./.:4:110,15:.:-0.03:1.000:. ./.:4:96,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:102,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:98,30:.: 0.07:1.000:. ./.:4:130,20:.: 0.82:1.000:. ./.:4:91,22:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:90,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:107,25:.: 0.21:1.000:. ./.:4:118,17:.: 0.31:1.000:. ./.:6:127,16:.: 0.58:1.000:. ./.:4:119,30:.: 0.78:1.000:. ./.:4:87,23:.:-0.54:1.000:. ./.:4:132,25:.: 1.05:1.000:. ./.:4:85,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:119,38:.: 1.05:1.000:. ./.:4:91,19:.:-0.54:1.000:. ./.:4:61,44:.:-0.71:1.000:. ./.:4:98,24:.:-0.13:1.000:. ./.:4:92,28:.:-0.20:0.996:. ./.:4:62,53:.:-0.37:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:34,69:.:-0.78:1.000:. ./.:4:91,35:.: 0.00:1.000:. ./.:4:91,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:60,35:.:-1.05:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:80,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:79,59:.: 0.41:1.000:. ./.:4:55,39:.:-1.08:1.000:. ./.:4:93,30:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,59:.: 0.41:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:70,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:85,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:94,32:.: 0.00:1.000:. ./.:4:87,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,29:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:83,25:.:-0.61:1.000:. ./.:4:87,76:.: 1.26:1.000:. ./.:4:69,23:.:-1.15:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:96,26:.:-0.13:1.000:. ./.:4:65,21:.:-1.35:1.000:. ./.:4:92,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:112,27:.: 0.44:1.000:. ./.:4:89,26:.:-0.37:1.000:. ./.:4:85,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,14:.:-1.15:1.000:. ./.:4:123,30:.: 0.92:1.000:. ./.:4:84,21:.:-0.71:1.000:. ./.:4:85,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:112,27:.: 0.44:1.000:. ./.:4:156,39:.: 2.34:1.000:. ./.:4:124,31:.: 0.99:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:141,39:.: 1.83:1.000:. ./.:4:94,30:.:-0.07:0.999:. ./.:4:93,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:71,17:.:-1.28:1.000:. ./.:4:109,27:.: 0.34:1.000:. ./.:4:121,19:.: 0.48:1.000:. ./.:4:80,18:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,23:.:-0.34:1.000:. ./.:4:105,19:.:-0.07:1.000:. ./.:4:100,31:.: 0.17:1.000:. ./.:4:108,23:.: 0.17:1.000:. ./.:4:85,53:.: 0.41:1.000:. ./.:4:132,32:.: 1.29:1.000:. ./.:4:62,56:.:-0.27:1.000:. ./.:4:65,57:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,31:.: 0.04:1.000:. ./.:4:93,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:78,21:.:-0.91:1.000:. ./.:4:57,49:.:-0.67:1.000:. ./.:4:134,25:.: 1.12:1.000:. ./.:5:120,0:.:-0.20:0.982:. ./.:4:90,21:.:-0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:133,48:.: 1.87:1.000:. ./.:4:63,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:84,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.78:1.000:. ./.:4:105,35:.: 0.48:1.000:. ./.:4:115,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:104,42:.: 0.68:1.000:. ./.:4:81,33:.:-0.40:1.000:. ./.:4:69,16:.:-1.39:1.000:. ./.:4:134,42:.: 1.70:1.000:. ./.:4:134,32:.: 1.36:1.000:. ./.:3:131,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:85,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:68,53:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,58:.: 0.41:1.000:. ./.:4:114,24:.: 0.41:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:86,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:121,23:.: 0.61:1.000:. ./.:4:87,62:.: 0.78:1.000:. ./.:4:170,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:72,67:.: 0.44:1.000:. ./.:4:114,30:.: 0.61:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:120,25:.: 0.65:1.000:. ./.:4:65,31:.:-1.01:1.000:. ./.:4:100,24:.:-0.07:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:51,28:.:-1.59:1.000:. ./.:4:118,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,90:.: 0.38:0.999:. ./.:4:67,18:.:-1.39:1.000:. ./.:4:107,30:.: 0.38:1.000:. ./.:4:119,20:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,42:.:-0.95:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:106,27:.: 0.24:1.000:. ./.:4:65,21:.:-1.35:1.000:. ./.:4:70,53:.:-0.10:1.000:. ./.:4:127,29:.: 1.02:1.000:. ./.:4:120,31:.: 0.85:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:86,34:.:-0.20:1.000:. ./.:4:108,41:.: 0.78:1.000:. ./.:4:151,37:.: 2.10:1.000:. ./.:4:137,41:.: 1.76:1.000:. ./.:4:98,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,50:.: 0.00:1.000:. -chr5.1 21753078 chr5.1_021753078 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:21,55:0.71: 1.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:22,32:0.58:-0.16:1.000:0.899 0/0/1/1:4:21,25:0.54:-0.60:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,42:0.67: 0.28:1.000:0.905 0/0/1/1:4:50,33:0.42: 1.44:1.000:0.897 0/0/1/1:4:31,31:0.49: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,11:0.41:-1.59:1.000:0.879 0/0/1/1:4:22,36:0.61: 0.06:1.000:0.680 0/0/1/1:4:28,38:0.57: 0.50:1.000:0.954 0/0/0/1:4:8,3:0.32:-2.52:1.000:0.951 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-2.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:25,32:0.55: 0.01:1.000:0.977 0/0/1/1:4:24,23:0.49:-0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,46:0.80: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,58:0.82: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,31:0.45: 0.78:1.000:0.975 0/1/1/1:4:12,45:0.78: 0.01:0.944:1.000 0/1/1/1:4:24,62:0.71: 1.60:1.000:0.991 0/1/1/1:4:13,54:0.80: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,61:0.75: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-2.85:1.000:0.859 0/1/1/1:4:14,39:0.72:-0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,48:0.87:-0.10:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-3.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,21:0.56:-1.09:1.000:0.969 0/0/1/1:4:53,39:0.44: 1.93:1.000:0.961 0/0/1/1:4:24,24:0.49:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,57:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,32:0.46: 0.72:1.000:0.989 0/0/0/1:4:27,14:0.37:-0.87:1.000:0.519 0/0/1/1:4:30,28:0.48: 0.06:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-3.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,16:0.83:-2.08:1.000:0.997 1/1/1:3:0,2:1.00:-3.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.47:-0.76:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,42:0.53: 1.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:20,18:0.47:-1.04:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,40:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,64:0.75: 1.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,52:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,32:0.55: 0.01:1.000:0.977 0/1/1/1:4:10,27:0.72:-1.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,35:0.63:-0.10:1.000:0.515 0/1/1/1:4:9,47:0.83:-0.05:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-2.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:22,17:0.45:-0.98:1.000:0.975 0/1/1/1:4:11,25:0.68:-1.15:1.000:0.961 0/1/1/1:4:17,39:0.69:-0.05:1.000:0.965 0/1/1/1:4:17,68:0.79: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,38:0.55: 0.61:1.000:0.979 0/1/1/1:4:18,43:0.69: 0.23:1.000:0.978 0/0/0/1:4:50,17:0.31: 0.56:1.000:0.979 0/0/1/1:4:12,17:0.58:-1.53:1.000:0.925 0/0/1/1:4:30,27:0.47: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,30:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,32:0.72:-0.71:1.000:0.994 0/0/1/1/1/1:6:13,28:0.67:-0.87:1.000:0.921 0/0/1/1:4:42,25:0.40: 0.56:1.000:0.769 1/1/1/1:4:0,65:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,27:0.49:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,25:0.52:-0.54:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,66:0.80: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,20:0.34: 0.56:1.000:0.866 0/1/1/1:4:6,23:0.78:-1.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,35:0.69:-0.38:1.000:0.971 0/1/1/1:4:13,30:0.69:-0.76:0.996:0.967 0/0/1/1:4:27,33:0.54: 0.17:1.000:0.986 0/0/1/1:4:33,34:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,10:0.46:-1.92:1.000:0.987 0/0/0/1:4:33,6:0.23:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,59:0.70: 1.44:1.000:0.984 0/0/1/1:4:28,23:0.46:-0.32:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,32:0.73:-0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,17:0.43:-0.87:1.000:0.944 0/1/1/1:4:14,45:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,56:0.74: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,31:0.54: 0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:26,30:0.53:-0.05:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,62:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,33:0.47: 0.78:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,42:0.72: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,29:0.44: 0.56:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,55:0.77: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,23:0.58:-0.98:1.000:0.911 0/1/1/1:4:11,53:0.82: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,31:0.43: 1.00:1.000:0.942 0/0/1/1:4:25,24:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,44:0.56: 1.16:1.000:0.974 0/1/1/1:4:14,44:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,33:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:25,26:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,32:0.46: 0.78:1.000:0.985 0/0/0/1:4:53,18:0.31: 0.78:1.000:0.979 0/0/0/1:4:14,5:0.31:-2.08:1.000:0.968 0/0/1/1:4:23,39:0.62: 0.28:1.000:0.580 0/0/1/1:4:25,20:0.45:-0.65:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,21:0.49:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,38:0.60: 0.28:1.000:0.760 0/0/1/1:4:29,33:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,34:0.55: 0.23:1.000:0.981 0/1/1/1:4:18,80:0.81: 2.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,58:0.85: 0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,26:0.49:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,48:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,77:0.79: 2.15:0.999:1.000 0/0/1/1:4:44,30:0.42: 0.94:1.000:0.922 0/1/1/1:4:17,35:0.66:-0.27:1.000:0.883 0/1/1/1:4:14,51:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,26:0.71:-1.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:27,7:0.27:-1.26:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,43:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,20:0.36: 0.23:1.000:0.654 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,24:0.43: 0.01:1.000:0.956 0/1/1/1:4:25,45:0.63: 0.72:1.000:0.599 0/1/1/1:4:15,36:0.69:-0.32:1.000:0.979 0/1/1/1:4:16,51:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,47:0.71: 0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:31,21:0.42:-0.27:1.000:0.918 0/1/1/1:4:8,26:0.75:-1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,34:0.84:-0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,19:0.52:-1.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,56:0.72: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:16,24:0.59:-0.93:0.982:0.967 0/0/1/1:4:21,28:0.56:-0.43:1.000:0.962 0/1/1/1:4:11,56:0.83: 0.56:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,74:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,57:0.79: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,30:0.64:-0.60:1.000:0.710 0/1/1/1:4:23,49:0.67: 0.83:1.000:0.919 0/0/1/1:4:30,36:0.54: 0.50:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,48:0.82: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,28:0.47: 0.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:41,9:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,45:0.64: 0.67:1.000:0.710 0/1/1/1:4:18,65:0.77: 1.44:1.000:1.000 1/1/1:3:0,56:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,54:0.74: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,35:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,39:0.55: 0.72:1.000:0.981 0/1/1/1:4:18,72:0.79: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,34:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,6:0.44:-2.36:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,58:0.81: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,35:0.56: 0.28:1.000:0.973 0/0/1/1:4:36,47:0.56: 1.44:1.000:0.971 0/0/1/1:4:30,32:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,51:0.79: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,50:0.77: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,48:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,21:0.53:-0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:36,12:0.30:-0.49:1.000:0.982 0/1/1/1:4:11,56:0.83: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,39:0.70:-0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:42,44:0.50: 1.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,27:0.70:-1.04:1.000:0.984 0/0/1/1:4:26,37:0.58: 0.34:0.999:0.921 0/1/1/1:4:9,49:0.84: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,38:0.61: 0.23:1.000:0.654 0/1/1/1:4:13,44:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,26:0.54:-0.54:1.000:0.984 0/1/1/1:4:13,45:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,62:0.82: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,26:0.71:-1.15:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,38:0.72:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,36:0.53: 0.56:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,38:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,26:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,51:0.74: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,62:0.75: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,45:0.53: 1.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,25:0.56:-0.71:1.000:0.968 0/0/1/1:4:28,41:0.59: 0.67:1.000:0.891 -chr5.1 22021281 chr5.1_022021281 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:33,59:0.71:-0.21:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,191:0.84: 2.80:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,80:0.86:-0.21:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,98:0.75: 0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,11:0.67:-1.81:1.000:0.923 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,112:0.85: 0.65:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,165:1.00: 1.44:0.944:1.000 1/1/1/1:4:0,129:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,129:0.75: 1.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,173:1.00: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,36:0.69:-0.89:1.000:0.972 1/1/1/1:4:2,30:0.93:-1.57:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,60:0.71:-0.14:1.000:0.989 0/1/1/1:4:26,100:0.78: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,120:0.77: 1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,168:1.00: 1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,26:0.74:-1.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,34:0.75:-1.27:1.000:0.999 0/0/0:3:6,0:0.00:-2.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,58:0.73:-0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,97:0.78: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,106:0.79: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,84:0.76: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,114:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,76:0.74: 0.04:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,107:0.75: 0.90:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,76:0.72: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,97:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,142:0.82: 1.55:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:15,153:0.90: 1.51:1.000:0.871 1/1/1/1:4:0,151:1.00: 1.12:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:4,117:0.96: 0.45:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,190:1.00: 2.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,105:0.84: 0.49:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,135:0.82: 1.37:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,98:0.78: 0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,144:1.00: 0.97:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,111:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,65:0.78:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 1.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,145:1.00: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,36:0.67:-0.73:1.000:0.920 0/1/1/1:4:15,106:0.87: 0.45:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,102:0.75: 0.76:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,100:0.84: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,108:0.79: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,151:1.00: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,73:0.85:-0.37:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,93:0.81: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,44:0.72:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,154:1.00: 1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,116:0.87: 0.69:1.000:0.916 0/1/1/1:4:26,56:0.72:-0.44:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,33:0.70:-1.09:1.000:0.987 0/1/1/1:4:35,116:0.75: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,56:0.75:-0.64:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,116:1.00: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,51:0.71:-0.50:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 1.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,209:1.00: 2.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,57:0.72:-0.39:0.999:0.996 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,86:0.80: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,80:0.82:-0.12:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00: 0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,99:0.76: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,47:0.71:-0.62:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,90:0.80: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,48:0.71:-0.62:1.000:0.992 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,63:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,108:0.85: 0.54:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,155:1.00: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1/1:5:0,73:1.00:-0.64:0.982:1.000 1/1/1/1:4:0,125:1.00: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,52:0.73:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,47:0.72:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,73:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,78:0.76:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,164:0.86: 1.96:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,84:0.83:-0.03:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,104:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,64:0.74:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 1.64:1.000:1.000 1/1/1:3:0,109:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,1:0.51:-1.66:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,124:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,113:0.75: 1.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 1.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,36:0.71:-1.00:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 1.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,113:0.78: 0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,114:0.74: 1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,67:0.73:-0.14:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,158:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,104:0.74: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,64:0.73:-0.28:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,100:0.78: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.11:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,68:0.75:-0.25:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,49:0.72:-0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,111:0.84: 0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,40:0.72:-0.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,126:0.81: 1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,131:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,98:0.77: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,120:1.00: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.02:1.000:1.000 -chr5.1 22101524 chr5.1_022101524 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:140,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:239,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.64:0.944:. ./.:4:69,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:474,0:.: 3.31:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.20:1.000:. ./.:3:31,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:400,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:208,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:285,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.55:1.000:. ./.:6:229,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:190,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:296,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.31:0.996:. ./.:4:178,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:226,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:218,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:260,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:131,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:180,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:246,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:433,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.16:0.999:. ./.:4:196,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:173,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.28:1.000:. ./.:5:202,0:.:-0.38:0.982:. ./.:4:247,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:308,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:151,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:313,1:.: 1.14:1.000:. ./.:3:208,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:354,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:384,1:.: 2.10:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:314,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:197,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:427,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:285,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:315,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:277,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.38:1.000:. -chr5.1 22367498 chr5.1_022367498 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:150,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.81:0.944:. ./.:4:135,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:210,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.59:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:167,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.55:1.000:. ./.:6:81,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.12:0.996:. ./.:4:112,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:144,2:.: 0.56:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:207,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:133,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.10:1.000:. ./.:5:111,0:.:-0.35:0.982:. ./.:4:124,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.29:1.000:. ./.:3:96,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:107,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:184,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.36:1.000:. -chr5.1 22941215 chr5.1_022941215 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:95,100:0.47: 0.86:1.000:0.991 0/0/0/1:4:90,31:0.29:-1.11:1.000:0.991 0/1/1/1:4:40,121:0.69:-0.05:1.000:0.980 0/0/1/1:4:63,90:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,155:0.69: 1.21:1.000:0.971 0/0/1/1:4:88,88:0.46: 0.35:1.000:0.986 0/1/1/1:4:19,66:0.72:-2.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,83:0.53:-0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,84:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,63:0.74:-2.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,112:0.81:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,40:0.30:-0.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,86:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,91:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,85:0.47: 0.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,127:0.71: 0.09:1.000:0.991 0/1/1/1:4:36,154:0.76: 0.73:0.944:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,169:0.75: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,98:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,79:0.81:-1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,94:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,121:0.58: 0.73:1.000:0.928 0/0/1/1:4:76,82:0.47:-0.13:1.000:0.992 1/1/1/1:4:4,60:0.92:-2.64:1.000:0.988 0/1/1/1:4:44,156:0.72: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,66:0.46:-0.90:1.000:0.990 0/1/1/1:4:41,119:0.69:-0.07:1.000:0.968 0/0/1/1:4:87,102:0.48: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,126:0.73:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,147:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,109:0.78:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,47:0.63:-2.53:1.000:0.595 0/1/1/1:4:27,90:0.71:-1.22:1.000:0.993 1/1/1:3:2,41:0.94:-3.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,86:0.56:-0.66:1.000:0.964 0/1/1/1:4:35,150:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,142:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,83:0.56:-0.77:1.000:0.970 0/1/1/1:4:28,137:0.78: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,157:0.77: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,114:0.56: 0.54:1.000:0.964 0/1/1/1:4:42,206:0.78: 2.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,150:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,192:0.77: 1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,102:0.58:-0.07:1.000:0.926 0/0/1/1:4:82,82:0.46: 0.03:1.000:0.986 0/1/1/1:4:12,46:0.74:-2.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,164:0.81: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,88:0.61:-0.82:1.000:0.724 0/0/1/1:4:55,99:0.58:-0.23:1.000:0.904 0/0/1/1:4:66,131:0.61: 0.91:1.000:0.741 0/0/1/1:4:51,101:0.60:-0.29:1.000:0.747 0/0/1/1:4:73,122:0.56: 0.86:1.000:0.959 0/1/1/1:4:32,145:0.77: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,184:0.82: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,100:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:35,239:0.84: 2.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,167:0.82: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:20,136:0.84:-0.18:1.000:0.988 0/1/1/1:4:33,155:0.78: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,105:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,205:0.84: 1.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,176:0.79: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,83:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,156:0.82: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,84:0.74:-1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,108:0.56: 0.30:1.000:0.968 0/1/1/1:4:40,143:0.73: 0.54:0.996:0.997 0/0/0/1:4:102,36:0.29:-0.66:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,118:0.56: 0.73:1.000:0.967 0/0/1/1:4:59,103:0.58:-0.02:1.000:0.932 0/0/1/1:4:88,156:0.58: 2.17:1.000:0.919 0/0/1/1:4:76,116:0.54: 0.78:1.000:0.986 0/0/1/1:4:99,70:0.40: 0.17:1.000:0.778 0/1/1/1:4:26,137:0.80: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,117:0.53: 0.94:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,162:0.75: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,75:0.48:-0.58:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,138:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,45:0.37:-1.17:1.000:0.511 0/1/1/1:4:55,124:0.63: 0.43:1.000:0.615 0/1/1/1:4:41,172:0.75: 1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,107:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,124:0.82:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,121:0.55: 0.91:1.000:0.977 0/0/1/1:4:49,72:0.53:-1.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,94:0.54:-0.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:73,120:0.56: 0.81:1.000:0.966 0/0/1/1:4:63,73:0.48:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,97:0.68:-0.82:1.000:0.947 0/0/1/1:4:52,95:0.59:-0.42:1.000:0.887 0/1/1/1:4:38,190:0.79: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,92:0.60:-0.61:1.000:0.814 0/0/1/1:4:62,100:0.56:-0.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:53,78:0.53:-0.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:59,100:0.57:-0.10:1.000:0.951 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,153:0.80: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,131:0.68: 0.41:1.000:0.950 0/1/1/1:4:21,108:0.79:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,192:0.83: 1.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,72:0.55:-1.22:1.000:0.975 0/0/1/1:4:69,109:0.55: 0.41:1.000:0.979 0/1/1/1:4:29,122:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,143:0.85:-0.02:1.000:0.988 0/0/1/1:4:59,97:0.56:-0.18:1.000:0.966 0/0/1/1:4:50,67:0.51:-1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,123:0.47: 1.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,97:0.59:-0.37:1.000:0.859 0/0/1/1:4:71,70:0.45:-0.58:1.000:0.984 0/1/1/1:4:51,161:0.70: 1.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:88,102:0.48: 0.73:0.999:0.995 0/0/1/1:4:65,94:0.53:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,70:0.55:-1.27:1.000:0.983 0/0/1/1:4:78,90:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,141:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,158:0.83: 0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,87:0.53:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,86:0.51:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,161:0.76: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,76:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,148:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,75:0.48:-0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,165:0.78: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,185:0.78: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,118:0.61: 0.35:1.000:0.681 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,72:0.56:-1.25:1.000:0.968 0/1/1/1:4:18,126:0.84:-0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,142:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,67:0.49:-1.06:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:41,119:0.69:-0.07:0.982:0.641 0/1/1/1:4:27,144:0.80: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,88:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,94:0.47: 0.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,139:0.81: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,85:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,90:0.60:-0.69:1.000:0.816 0/1/1/1:4:17,83:0.78:-1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,130:0.64: 0.65:1.000:0.647 0/0/1/1:4:72,129:0.58: 1.02:1.000:0.909 0/0/1/1:4:73,87:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,132:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,116:0.46: 1.77:1.000:0.988 0/1/1/1:4:50,195:0.74: 2.19:1.000:0.999 1/1/1:3:0,135:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,109:0.57: 0.27:1.000:0.949 0/0/1/1:4:85,125:0.53: 1.26:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,125:0.74:-0.13:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,156:0.75: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,115:0.69:-0.26:1.000:0.980 0/0/1/1:4:34,61:0.58:-1.81:1.000:0.907 0/0/1/1:4:61,41:0.39:-1.62:1.000:0.693 0/1/1/1:4:24,193:0.86: 1.45:1.000:0.972 0/1/1/1:4:40,151:0.74: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,121:0.50: 1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,133:0.72: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,72:0.49:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,87:0.46: 0.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:78,65:0.43:-0.53:1.000:0.935 0/1/1/1:4:35,140:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,103:0.56: 0.06:1.000:0.962 0/0/1/1:4:74,85:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,105:0.77:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,88:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:60,76:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,32:0.25: 0.01:0.999:0.999 0/0/1/1:4:88,77:0.43: 0.06:1.000:0.957 0/0/1/1:4:59,68:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,62:0.47:-1.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:32,93:0.69:-1.01:1.000:0.969 0/0/1/1:4:91,89:0.45: 0.46:1.000:0.983 0/0/1/1:4:60,70:0.48:-0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,74:0.56:-1.14:1.000:0.974 0/1/1/1:4:24,96:0.74:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,123:0.70:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:75,98:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,79:0.46:-0.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,87:0.55:-0.53:1.000:0.983 0/0/1/1:4:76,105:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,123:0.52: 1.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,98:0.46: 0.83:1.000:0.988 0/0/1/1:4:58,73:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,40:0.30:-0.29:1.000:0.989 -chr5.1 23092944 chr5.1_023092944 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.09:0.944:. ./.:4:29,0:.: 3.53:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:17,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:0.996:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.: 3.34:1.000:. ./.:5:12,0:.: 0.28:0.982:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:3:7,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:16,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.09:1.000:. -chr5.1 23336598 chr5.1_023336598 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:18,29:0.61: 1.11:1.000:0.686 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,13:0.34:-0.23:1.000:0.846 0/0/0/1:4:20,11:0.29:-0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,17:0.38: 0.44:1.000:0.622 0/0/0/1:4:27,7:0.16:-0.14:1.000:0.995 0/0/0/0:4:22,2:0.06:-1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,17:0.41: 0.25:1.000:0.883 0/0/0/1:4:27,10:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.23:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,18:0.61:-0.62:1.000:0.640 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,15:0.30: 0.63:1.000:0.989 0/0/0/1:4:23,5:0.14:-0.71:1.000:0.961 0/0/0/1:4:16,6:0.21:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.54:-0.81:0.944:0.984 0/0/1/1:4:14,17:0.54:-0.43:1.000:0.989 0/1/1/1:4:20,42:0.67: 2.55:1.000:0.939 0/0/0/1:4:45,17:0.21: 2.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,12:0.23: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.48: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,19:0.68:-0.71:1.000:0.943 0/0/0/1:4:21,10:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,12:0.46:-1.00:1.000:0.985 0/0/0/1:4:17,11:0.34:-0.71:1.000:0.856 0/0/1/1:4:23,19:0.42: 0.63:1.000:0.914 0/0/0/1:4:33,18:0.29: 1.49:1.000:0.992 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.40:-1.00:1.000:0.821 0/0/0/0:4:8,1:0.09:-2.54:1.000:0.969 0/0/0/1:4:24,12:0.26: 0.05:1.000:0.998 1/1/1:3:0,16:1.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.57:-1.10:1.000:0.934 0/0/0/1:4:27,13:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,27:0.65: 0.53:1.000:0.832 0/0/0/1:4:19,5:0.16:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,20:0.53: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,17:0.41: 0.25:1.000:0.883 0/0/0/1:4:30,8:0.16: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,11:0.31:-0.52:1.000:0.977 0/1/1/1:4:8,19:0.70:-0.81:1.000:0.988 0/0/0/1:4:41,11:0.16: 1.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,31:0.66: 1.11:1.000:0.841 0/0/0/1:4:31,19:0.33: 1.40:1.000:0.939 0/0/0/1:4:13,3:0.15:-1.87:1.000:0.981 0/0/0/1:4:20,12:0.32:-0.33:1.000:0.957 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,29:0.62: 1.01:1.000:0.506 0/0/0/1:4:33,18:0.29: 1.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:22,16:0.38: 0.25:1.000:0.556 0/0/0/1:4:34,13:0.21: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,9:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,17:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/0:4:27,1:0.03:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,10:0.37:-1.10:1.000:0.521 0/0/0/1:4:30,14:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:25,4:0.11:-0.62:1.000:0.950 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.41:-0.81:1.000:0.861 0/0/0/1:4:32,16:0.26: 1.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,10:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,18:0.24: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,11:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,14:0.37:-0.14:1.000:0.605 0/0/0/1:4:31,13:0.23: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,17:0.26: 1.59:0.996:0.999 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,6:0.26:-1.67:1.000:0.998 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,26:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,10:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/0:4:27,4:0.10:-0.43:1.000:0.801 0/0/1/1:4:20,18:0.45: 0.25:1.000:0.978 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,13:0.31:-0.04:1.000:0.967 0/0/0/1:4:30,11:0.21: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,11:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.18:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.41:-0.81:1.000:0.861 0/0/0/1:4:17,6:0.20:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,20:0.58:-0.14:1.000:0.915 0/1/1/1:4:18,34:0.65: 1.59:1.000:0.790 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,7:0.21:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,18:0.30: 1.40:1.000:0.986 0/0/0/1:4:16,9:0.30:-1.00:1.000:0.986 0/0/0/1:4:19,8:0.23:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,33:0.72: 1.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,18:0.34: 1.01:1.000:0.869 0/0/0/1:4:27,13:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,15:0.28: 0.73:1.000:0.994 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,22:0.47: 0.92:1.000:0.991 0/1/1/1:4:11,33:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,13:0.31:-0.04:1.000:0.967 0/0/0/1:4:24,16:0.35: 0.44:1.000:0.780 0/1/1/1:4:24,42:0.63: 2.93:1.000:0.578 0/1/1/1:4:17,31:0.64: 1.21:1.000:0.703 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,17:0.29: 1.21:1.000:0.991 0/0/0/1:4:20,13:0.34:-0.23:0.999:0.846 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.44:-1.77:1.000:0.973 0/0/1/1:4:25,26:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,15:0.52:-0.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:23,16:0.36: 0.34:1.000:0.630 0/0/0/1:4:28,15:0.28: 0.73:1.000:0.994 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,14:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,15:0.39:-0.04:1.000:0.678 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,10:0.20: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,20:0.40: 1.01:1.000:0.763 0/0/1/1:4:20,30:0.59: 1.40:1.000:0.849 0/1/1/1:4:18,41:0.69: 2.26:1.000:0.978 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,15:0.36: 0.15:1.000:0.706 0/0/0/1:4:13,6:0.24:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,10:0.20: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:19,5:0.16:-1.10:0.982:0.998 0/0/1/1:4:10,8:0.41:-1.67:1.000:0.861 0/0/0/1:4:22,8:0.21:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,26:0.70: 0.15:1.000:0.987 0/1/1/1:4:13,25:0.65: 0.25:1.000:0.827 0/0/1/1:4:18,19:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,14:0.55:-1.00:1.000:0.980 0/0/0/1:4:22,13:0.31:-0.04:1.000:0.967 0/0/0/1:4:23,14:0.32: 0.15:1.000:0.945 0/0/0/1:4:25,13:0.28: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.45: 0.25:1.000:0.978 0/0/1/1:4:26,36:0.57: 2.55:1.000:0.942 0/0/0/1:4:28,15:0.28: 0.73:1.000:0.994 0/0/1:3:21,15:0.37: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,30:0.61: 1.30:1.000:0.741 0/0/1/1:4:23,19:0.42: 0.63:1.000:0.914 0/0/0/1:4:25,10:0.22:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,15:0.23: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,27:0.55: 1.21:1.000:0.977 0/0/0/1:4:29,7:0.15: 0.05:1.000:0.989 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,15:0.21: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,10:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,14:0.42:-0.43:1.000:0.910 0/0/0/1:4:28,12:0.23: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,9:0.36:-1.29:1.000:0.649 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.19:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.20:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,19:0.45: 0.44:1.000:0.979 0/0/0/1:4:27,12:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.43:0.999:1.000 0/0/0/1:4:22,15:0.36: 0.15:1.000:0.706 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,13:0.28: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,11:0.38:-0.91:1.000:0.590 0/0/1/1:4:19,15:0.41:-0.14:1.000:0.833 0/0/1/1:4:21,19:0.45: 0.44:1.000:0.979 0/0/0/1:4:18,6:0.19:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,17:0.58:-0.62:1.000:0.923 0/0/0/1:4:22,11:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,14:0.32: 0.15:1.000:0.945 0/0/0/1:4:18,8:0.24:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,11:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,14:0.27: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,19:0.26: 2.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,11:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,15:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 -chr5.1 23760819 chr5.1_023760819 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:202,2:.: 1.39:1.000:. ./.:4:121,4:.:-0.82:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:229,2:.: 2.14:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:225,5:.: 2.11:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.86:0.944:. ./.:4:149,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:241,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:161,7:.: 0.38:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.63:1.000:. ./.:3:74,1:.:-2.22:1.000:. ./.:4:161,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:160,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:192,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:110,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.79:1.000:. ./.:6:131,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:116,2:.:-1.02:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.79:0.996:. ./.:4:137,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:96,1:.:-1.60:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:171,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.97:1.000:. ./.:5:110,0:.:-1.24:0.982:. ./.:4:149,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:265,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:167,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.28:1.000:. ./.:3:148,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:235,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:115,3:.:-1.02:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:124,3:.:-0.76:0.999:. ./.:4:149,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:272,0:.: 3.29:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.04:1.000:. -chr5.1 24539807 chr5.1_024539807 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:428,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:277,78:.: 0.14:1.000:. ./.:4:327,99:.: 0.91:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:249,75:.:-0.20:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:167,60:.:-1.26:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:61,16:.:-2.91:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:383,85:.: 1.37:1.000:. ./.:4:436,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:319,89:.: 0.72:1.000:. ./.:4:263,93:.: 0.15:0.944:. ./.:4:418,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:251,108:.: 0.18:1.000:. ./.:4:485,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:431,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:27,18:.:-3.26:1.000:. ./.:4:233,79:.:-0.33:1.000:. ./.:4:459,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:315,71:.: 0.48:1.000:. ./.:4:359,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:298,88:.: 0.48:1.000:. ./.:4:330,100:.: 0.96:1.000:. ./.:4:315,89:.: 0.67:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:59,12:.:-2.97:1.000:. ./.:3:36,0:.:-3.35:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:341,86:.: 0.92:1.000:. ./.:4:323,96:.: 0.84:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:276,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:232,83:.:-0.30:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:294,57:.: 0.09:1.000:. ./.:4:180,63:.:-1.09:1.000:. ./.:4:231,86:.:-0.28:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:49,15:.:-3.05:1.000:. ./.:4:165,66:.:-1.22:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:317,80:.: 0.60:1.000:. ./.:4:216,84:.:-0.47:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:190,76:.:-0.84:1.000:. ./.:4:237,76:.:-0.32:1.000:. ./.:6:344,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:329,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:276,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:333,64:.: 0.60:1.000:. ./.:4:185,56:.:-1.11:1.000:. ./.:4:463,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:285,83:.: 0.28:1.000:. ./.:4:199,64:.:-0.87:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:241,94:.:-0.08:0.996:. ./.:4:225,77:.:-0.44:1.000:. ./.:4:414,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:205,139:.: 0.02:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:290,77:.: 0.27:1.000:. ./.:4:218,65:.:-0.65:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:253,81:.:-0.09:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:301,95:.: 0.59:1.000:. ./.:4:291,76:.: 0.27:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:255,80:.:-0.08:1.000:. ./.:4:339,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:200,76:.:-0.73:1.000:. ./.:4:392,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:406,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:275,83:.: 0.17:1.000:. ./.:4:278,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:428,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:298,95:.: 0.55:1.000:. ./.:4:343,78:.: 0.86:1.000:. ./.:4:253,46:.:-0.48:1.000:. ./.:4:379,80:.: 1.27:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:228,62:.:-0.57:1.000:. ./.:4:226,70:.:-0.51:1.000:. ./.:4:281,68:.: 0.07:1.000:. ./.:4:453,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:416,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:357,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:312,88:.: 0.63:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.20:0.999:. ./.:4:396,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:404,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:180,57:.:-1.15:1.000:. ./.:4:249,61:.:-0.36:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:309,75:.: 0.45:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:274,78:.: 0.10:1.000:. ./.:4:473,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:179,63:.:-1.10:1.000:. ./.:4:241,88:.:-0.15:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:388,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:165,60:.:-1.29:1.000:. ./.:4:220,67:.:-0.61:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.02:1.000:. ./.:5:328,0:.:-0.16:0.982:. ./.:4:254,85:.:-0.04:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:226,85:.:-0.34:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:178,54:.:-1.21:1.000:. ./.:4:290,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:423,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:254,62:.:-0.29:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:322,81:.: 0.66:1.000:. ./.:3:200,88:.:-0.60:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:482,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:197,58:.:-0.96:1.000:. ./.:4:302,107:.: 0.73:1.000:. ./.:4:248,80:.:-0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:252,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:237,84:.:-0.24:1.000:. ./.:4:290,81:.: 0.31:1.000:. ./.:4:476,2:.: 1.48:1.000:. ./.:4:235,92:.:-0.17:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:458,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:376,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:185,64:.:-1.02:1.000:. ./.:4:361,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:219,92:.:-0.34:1.000:. ./.:4:418,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:308,84:.: 0.54:0.999:. ./.:4:338,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:393,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:200,62:.:-0.88:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:216,71:.:-0.61:1.000:. ./.:4:371,110:.: 1.52:1.000:. ./.:4:343,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:327,95:.: 0.87:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:390,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:467,2:.: 1.38:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:318,80:.: 0.61:1.000:. -chr5.1 24617374 chr5.1_024617374 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,255:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,242:.: 1.13:1.000:. ./.:4:61,146:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,211:.: 2.05:1.000:. ./.:4:32,85:.:-1.31:1.000:. ./.:4:69,180:.: 1.27:1.000:. ./.:4:37,168:.: 0.41:1.000:. ./.:4:29,29:.:-2.46:1.000:. ./.:4:25,74:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.74:1.000:. ./.:4:50,159:.: 0.49:1.000:. ./.:4:57,182:.: 1.07:1.000:. ./.:4:48,161:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.41:0.944:. ./.:4:0,205:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,275:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,71:.:-2.21:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,188:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,51:.:-2.60:1.000:. ./.:4:58,141:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,206:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.14:1.000:. ./.:4:51,175:.: 0.82:1.000:. ./.:4:79,176:.: 1.38:1.000:. ./.:4:71,159:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.91:1.000:. ./.:4:1,84:.:-1.93:1.000:. ./.:3:0,46:.:-2.70:1.000:. ./.:4:0,265:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.54:1.000:. ./.:4:71,191:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,284:.: 1.97:1.000:. ./.:4:115,296:.: 4.43:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.31:1.000:. ./.:4:58,163:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,278:.: 1.83:1.000:. ./.:4:36,122:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.21:1.000:. ./.:4:62,136:.: 0.27:1.000:. ./.:4:56,136:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,118:.:-0.51:1.000:. ./.:4:39,100:.:-0.88:1.000:. ./.:4:52,113:.:-0.37:1.000:. ./.:6:23,132:.:-0.57:1.000:. ./.:4:53,113:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.19:1.000:. ./.:4:52,111:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,235:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,129:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,106:.:-0.86:0.996:. ./.:4:0,137:.:-0.92:1.000:. ./.:4:53,168:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,97:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,175:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.51:1.000:. ./.:4:28,125:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.47:1.000:. ./.:4:41,149:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.12:1.000:. ./.:4:46,145:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,149:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,130:.:-0.10:1.000:. ./.:4:61,117:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,119:.: 0.00:1.000:. ./.:4:24,100:.:-1.17:1.000:. ./.:4:53,177:.: 0.90:1.000:. ./.:4:57,181:.: 1.05:1.000:. ./.:4:26,98:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,130:.:-1.06:1.000:. ./.:4:50,116:.:-0.35:1.000:. ./.:4:31,71:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.13:1.000:. ./.:4:27,100:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,121:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,131:.:-1.04:1.000:. ./.:4:48,105:.:-0.61:1.000:. ./.:4:42,94:.:-0.94:1.000:. ./.:4:58,171:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,244:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,110:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,248:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.69:0.999:. ./.:4:50,149:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.27:1.000:. ./.:4:30,75:.:-1.54:1.000:. ./.:4:35,83:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.45:1.000:. ./.:4:37,115:.:-0.63:1.000:. ./.:4:40,110:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.09:1.000:. ./.:4:52,118:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,185:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,119:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.39:1.000:. ./.:4:40,95:.:-0.96:1.000:. ./.:4:57,182:.: 1.07:1.000:. ./.:5:24,124:.:-0.70:0.982:. ./.:4:54,127:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,260:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,106:.:-0.88:1.000:. ./.:4:38,100:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,113:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,143:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,76:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.21:1.000:. ./.:3:0,117:.:-1.31:1.000:. ./.:4:1,190:.: 0.13:1.000:. ./.:4:64,187:.: 1.31:1.000:. ./.:4:46,125:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,246:.: 1.21:1.000:. ./.:4:37,150:.: 0.06:1.000:. ./.:4:13,68:.:-2.01:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,239:.: 1.07:1.000:. ./.:4:54,115:.:-0.29:1.000:. ./.:4:58,146:.: 0.39:1.000:. ./.:4:49,126:.:-0.18:1.000:. ./.:4:54,150:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,238:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1,216:.: 0.64:1.000:. ./.:4:54,122:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,175:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,239:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,236:.: 1.01:1.000:. ./.:4:66,150:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,177:.:-0.12:0.999:. ./.:4:46,144:.: 0.12:1.000:. ./.:4:53,143:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.17:1.000:. ./.:4:54,120:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,275:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.74:1.000:. ./.:4:50,182:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.92:1.000:. ./.:4:69,236:.: 2.36:1.000:. ./.:4:55,188:.: 1.15:1.000:. ./.:4:41,138:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.02:1.000:. -chr5.1 24848910 chr5.1_024848910 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:207,159:.: 1.86:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:251,60:.: 1.11:1.000:. ./.:4:178,54:.: 0.02:1.000:. ./.:4:235,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:188,63:.: 0.28:1.000:. ./.:4:164,29:.:-0.52:1.000:. ./.:4:156,71:.:-0.05:1.000:. ./.:4:230,65:.: 0.89:1.000:. ./.:4:86,15:.:-1.78:1.000:. ./.:4:85,19:.:-1.74:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:145,61:.:-0.34:1.000:. ./.:4:163,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:259,57:.: 1.17:1.000:. ./.:4:253,57:.: 1.09:0.944:. ./.:4:148,60:.:-0.31:1.000:. ./.:4:189,142:.: 1.38:1.000:. ./.:4:174,56:.:-0.01:1.000:. ./.:4:91,11:.:-1.77:1.000:. ./.:4:215,62:.: 0.64:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:78,99:.:-0.74:1.000:. ./.:4:72,4:.:-2.13:1.000:. ./.:4:190,79:.: 0.53:1.000:. ./.:4:174,54:.:-0.04:1.000:. ./.:4:252,54:.: 1.04:1.000:. ./.:4:151,58:.:-0.30:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:414,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:249,47:.: 0.90:1.000:. ./.:4:42,5:.:-2.53:1.000:. ./.:4:88,13:.:-1.78:1.000:. ./.:3:15,1:.:-2.95:1.000:. ./.:4:89,110:.:-0.43:1.000:. ./.:4:220,71:.: 0.83:1.000:. ./.:4:169,123:.: 0.84:1.000:. ./.:4:272,60:.: 1.39:1.000:. ./.:4:179,139:.: 1.20:1.000:. ./.:4:139,72:.:-0.27:1.000:. ./.:4:157,65:.:-0.12:1.000:. ./.:4:253,61:.: 1.15:1.000:. ./.:4:130,112:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,68:.: 0.14:1.000:. ./.:4:98,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:167,50:.:-0.19:1.000:. ./.:4:492,97:.: 4.93:1.000:. ./.:4:230,63:.: 0.86:1.000:. ./.:4:401,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:70,106:.:-0.75:1.000:. ./.:4:298,67:.: 1.85:1.000:. ./.:4:110,47:.:-1.01:1.000:. ./.:4:155,67:.:-0.12:1.000:. ./.:4:224,52:.: 0.62:1.000:. ./.:4:272,88:.: 1.78:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:259,75:.: 1.42:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.19:1.000:. ./.:6:158,14:.:-0.81:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:152,59:.:-0.27:1.000:. ./.:4:253,73:.: 1.31:1.000:. ./.:4:234,60:.: 0.87:1.000:. ./.:4:153,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:251,48:.: 0.94:1.000:. ./.:4:78,31:.:-1.67:1.000:. ./.:4:173,63:.: 0.07:1.000:. ./.:4:249,70:.: 1.22:0.996:. ./.:4:180,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:246,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:174,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:78,113:.:-0.54:1.000:. ./.:4:222,57:.: 0.67:1.000:. ./.:4:124,48:.:-0.81:1.000:. ./.:4:170,52:.:-0.12:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,81:.: 0.06:1.000:. ./.:4:142,61:.:-0.38:1.000:. ./.:4:198,59:.: 0.36:1.000:. ./.:4:154,56:.:-0.28:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:88,45:.:-1.34:1.000:. ./.:4:129,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,75:.:-1.30:1.000:. ./.:4:57,125:.:-0.67:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:104,46:.:-1.11:1.000:. ./.:4:192,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:267,67:.: 1.42:1.000:. ./.:4:106,49:.:-1.04:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:137,99:.: 0.07:1.000:. ./.:4:251,52:.: 1.00:1.000:. ./.:4:130,22:.:-1.08:1.000:. ./.:4:202,63:.: 0.47:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:122,58:.:-0.70:1.000:. ./.:4:104,89:.:-0.52:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:162,48:.:-0.28:1.000:. ./.:4:149,66:.:-0.21:1.000:. ./.:4:84,128:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,116:.:-0.87:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:260,70:.: 1.37:1.000:. ./.:4:118,53:.:-0.82:0.999:. ./.:4:212,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:116,52:.:-0.86:1.000:. ./.:4:73,96:.:-0.85:1.000:. ./.:4:143,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:214,76:.: 0.82:1.000:. ./.:4:118,52:.:-0.83:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:234,59:.: 0.86:1.000:. ./.:4:123,37:.:-0.97:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:188,55:.: 0.17:1.000:. ./.:4:142,66:.:-0.31:1.000:. ./.:4:80,126:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,97:.:-1.01:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:130,40:.:-0.83:1.000:. ./.:4:173,38:.:-0.27:1.000:. ./.:4:121,50:.:-0.82:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.09:1.000:. ./.:5:171,41:.:-0.26:0.982:. ./.:4:191,62:.: 0.31:1.000:. ./.:4:197,51:.: 0.24:1.000:. ./.:4:86,149:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,137:.:-0.15:1.000:. ./.:4:107,40:.:-1.15:1.000:. ./.:4:104,47:.:-1.09:1.000:. ./.:4:206,37:.: 0.17:1.000:. ./.:4:148,67:.:-0.21:1.000:. ./.:4:111,43:.:-1.05:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:149,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:84,169:.: 0.31:1.000:. ./.:4:285,77:.: 1.81:1.000:. ./.:3:165,61:.:-0.06:1.000:. ./.:4:90,114:.:-0.37:1.000:. ./.:4:248,76:.: 1.28:1.000:. ./.:4:124,36:.:-0.97:1.000:. ./.:4:162,63:.:-0.08:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:65,75:.:-1.25:1.000:. ./.:4:296,72:.: 1.89:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:274,63:.: 1.46:1.000:. ./.:4:163,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:258,70:.: 1.34:1.000:. ./.:4:125,47:.:-0.81:1.000:. ./.:4:158,62:.:-0.15:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:253,69:.: 1.26:1.000:. ./.:4:180,81:.: 0.42:1.000:. ./.:4:158,62:.:-0.15:1.000:. ./.:4:192,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.31:0.999:. ./.:4:143,60:.:-0.38:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:124,57:.:-0.68:1.000:. ./.:4:233,52:.: 0.75:1.000:. ./.:4:127,60:.:-0.60:1.000:. ./.:4:185,49:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,111:.:-0.64:1.000:. ./.:4:280,65:.: 1.57:1.000:. ./.:4:157,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:237,67:.: 1.01:1.000:. ./.:4:231,33:.: 0.46:1.000:. ./.:4:155,64:.:-0.16:1.000:. ./.:4:178,70:.: 0.24:1.000:. ./.:4:270,56:.: 1.31:1.000:. ./.:4:115,40:.:-1.04:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.10:1.000:. -chr5.1 24977736 chr5.1_024977736 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:260,76:0.21: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,25:0.16:-0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,97:0.47: 0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:220,52:0.18: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,170:0.65: 0.68:1.000:0.806 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,37:0.53:-1.89:1.000:0.991 0/0/0/1:4:119,51:0.29:-0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,48:0.29:-0.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:52,16:0.22:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-2.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,42:0.19:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,53:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:111,46:0.28:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,39:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,72:0.43:-0.53:1.000:0.945 0/1/1/1:4:62,150:0.70: 0.01:0.944:0.985 0/0/0/1:4:149,79:0.34: 0.23:1.000:0.854 0/0/1/1:4:136,116:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:199,46:0.17: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,26:0.47:-2.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:113,125:0.54: 0.37:1.000:0.986 0/1/1/1:4:91,155:0.63: 0.48:1.000:0.603 0/0/0/1:4:145,42:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.52:-2.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:115,46:0.27:-0.68:1.000:0.998 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,71:0.45:-0.64:1.000:0.976 0/0/0/1:4:177,82:0.31: 0.65:1.000:0.979 0/0/1/1:4:49,60:0.56:-1.39:1.000:0.960 0/0/1/1:4:51,77:0.61:-1.13:1.000:0.711 0/0/1/1:4:83,55:0.41:-1.00:1.000:0.832 0/0/1/1:4:28,17:0.38:-2.26:1.000:0.570 0/0/0/1:4:43,24:0.36:-1.96:1.000:0.728 0/0/0:3:30,5:0.13:-2.40:1.000:0.839 0/0/0/1:4:146,41:0.20:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,110:0.48: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:173,47:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,45:0.27:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,64:0.41:-0.71:1.000:0.864 0/0/1/1:4:122,96:0.46: 0.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:233,68:0.21: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,135:0.47: 1.22:1.000:0.990 0/0/1/1:4:143,132:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,132:0.46: 1.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:225,64:0.21: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,174:0.51: 1.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,5:0.19:-2.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,166:0.71: 0.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:48,55:0.55:-1.47:1.000:0.980 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,160:0.51: 1.59:1.000:0.996 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,99:0.25: 2.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,51:0.29:-0.61:1.000:0.989 0/0/1/1:4:82,118:0.60:-0.15:1.000:0.806 0/0/0/1:4:118,56:0.31:-0.51:1.000:0.969 0/1/1/1:4:75,134:0.64:-0.03:1.000:0.719 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:94,102:0.54:-0.21:1.000:0.808 0/0/1/1:4:93,149:0.62: 0.42:1.000:0.562 0/0/1/1:4:152,144:0.51: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,121:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,91:0.62:-0.85:1.000:0.618 0/0/0/1:4:277,81:0.21: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,44:0.28:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,76:0.48:-0.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:227,58:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,132:0.67:-0.22:0.996:0.935 0/1/1/1:4:71,156:0.68: 0.22:1.000:0.960 0/0/0/1:4:180,75:0.28: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:80,36:0.30:-1.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:112,100:0.49: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,121:0.59:-0.04:1.000:0.858 0/1/1/1:4:68,224:0.75: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,50:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,69:0.32: 0.01:1.000:0.961 0/0/1/1:4:186,164:0.49: 1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,117:0.48: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,122:0.63:-0.25:1.000:0.626 0/0/1/1:4:132,121:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,132:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:176,167:0.51: 1.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,59:0.32:-0.45:1.000:0.942 0/0/1/1:4:106,73:0.42:-0.44:1.000:0.898 0/0/1/1:4:75,113:0.61:-0.31:1.000:0.716 0/0/1/1:4:125,96:0.45: 0.13:1.000:0.978 0/0/1/1:4:152,137:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:205,53:0.19: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,90:0.58:-0.71:1.000:0.924 0/0/1/1:4:77,104:0.58:-0.41:1.000:0.893 0/0/1/1:4:89,119:0.58:-0.04:1.000:0.903 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,46:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,65:0.31:-0.11:1.000:0.973 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,71:0.32: 0.09:1.000:0.960 0/0/0/1:4:265,71:0.20: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,58:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,59:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,138:0.46: 1.37:1.000:0.986 0/0/0/1:4:108,40:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,131:0.40: 1.66:1.000:0.782 0/0/0/1:4:184,51:0.20: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,56:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:396,0:0.00: 2.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:226,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,129:0.60: 0.08:1.000:0.772 0/1/1/1:4:50,141:0.73:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:255,73:0.21: 1.59:0.999:1.000 0/0/0/1:4:186,81:0.29: 0.76:1.000:0.992 0/0/0/1:4:175,47:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:340,0:0.00: 1.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,98:0.66:-0.86:1.000:0.875 0/0/0/1:4:142,70:0.32: 0.01:1.000:0.946 0/0/1/1:4:175,112:0.40: 1.03:1.000:0.746 0/0/1/1:4:75,108:0.60:-0.38:1.000:0.805 0/0/0/1:4:158,69:0.29: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:175,143:0.47: 1.46:1.000:0.991 0/1/1/1:4:85,164:0.66: 0.52:1.000:0.855 0/0/0/0:4:188,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,114:0.42: 0.94:1.000:0.894 0/0/0/1:4:270,74:0.20: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:344,0:0.00: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,35:0.17:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,62:0.47:-1.00:1.000:0.991 0/1/1/1:4:64,143:0.69:-0.06:1.000:0.967 0/0/0/1:4:123,53:0.29:-0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,95:0.67:-0.94:1.000:0.907 0/0/0/1/1:5:115,86:0.44:-0.14:0.982:0.914 0/1/1/1:4:62,128:0.67:-0.29:1.000:0.925 0/0/1/1:4:131,119:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,47:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,70:0.21: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,100:0.39: 0.67:1.000:0.673 0/0/0/1:4:150,74:0.32: 0.18:1.000:0.946 0/0/1/1:4:84,128:0.61: 0.01:1.000:0.690 0/0/1/1:4:187,163:0.49: 1.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,62:0.27: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,41:0.23:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,54:0.33:-0.68:1.000:0.925 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,280:0.73: 2.29:1.000:0.997 0/1/1:3:65,120:0.65:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:314,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,45:0.20:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,48:0.26:-0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:127,85:0.41: 0.01:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,147:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,11:0.35:-2.45:1.000:0.770 0/0/0/1:4:185,39:0.16: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,176:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,118:0.65:-0.41:1.000:0.810 0/0/0/1:4:146,69:0.31: 0.05:1.000:0.971 0/0/0/1:4:125,48:0.26:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,107:0.66:-0.67:1.000:0.866 0/0/1/1:4:134,118:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:153,36:0.18:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,45:0.34:-1.10:1.000:0.856 0/0/0/1:4:107,45:0.28:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:150,121:0.46: 0.82:1.000:0.989 0/0/1/1:4:107,80:0.44:-0.33:1.000:0.968 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,68:0.44:-0.72:1.000:0.972 0/0/0/1:4:194,32:0.13: 0.20:0.999:0.919 0/0/0/1:4:132,54:0.27:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,43:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,27:0.13:-0.31:1.000:0.933 0/0/0/1:4:68,37:0.35:-1.45:1.000:0.798 0/0/1/1:4:148,126:0.48: 0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:190,58:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,75:0.44:-0.51:1.000:0.973 0/0/0/1:4:158,45:0.21:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,84:0.41:-0.04:1.000:0.873 0/0/1/1:4:134,109:0.47: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:129,41:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,64:0.43:-0.81:1.000:0.952 0/0/0/1:4:172,56:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,66:0.29: 0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:143,59:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,136:0.46: 1.32:1.000:0.986 -chr5.1 25207062 chr5.1_025207062 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:270,95:0.21: 2.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,163:0.66: 0.78:1.000:0.895 0/0/1/1:4:74,80:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:192,99:0.29: 1.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:81,71:0.47:-0.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:79,46:0.33:-0.89:1.000:0.912 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,52:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,32:0.46:-1.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:30,38:0.57:-1.66:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,139:0.68: 0.23:1.000:0.941 0/0/0/1:4:156,91:0.33: 0.76:0.944:0.909 0/1/1/1:4:88,167:0.66: 0.87:1.000:0.882 0/0/0/1:4:304,108:0.21: 3.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,92:0.52:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:72,39:0.31:-1.08:1.000:0.974 0/0/0/1:4:152,63:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:217,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,14:0.21:-1.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,89:0.53:-0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,65:0.44:-0.63:1.000:0.974 0/1/1/1:4:65,142:0.69: 0.22:1.000:0.978 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,146:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,50:0.53:-1.30:1.000:0.991 0/0/1:3:41,9:0.15:-1.91:1.000:0.579 0/0/0/0:4:212,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,188:0.75: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,165:0.48: 2.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:173,78:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:260,105:0.23: 2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,78:0.45:-0.27:1.000:0.981 0/0/1/1:4:86,92:0.52:-0.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:103,219:0.69: 1.78:1.000:0.969 0/0/0/1:4:239,81:0.21: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,97:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/0:4:266,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,97:0.65:-0.53:1.000:0.748 0/0/0/1:4:156,76:0.28: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,100:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:154,73:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:188,93:0.28: 1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:80,93:0.55:-0.24:1.000:0.984 0/0/1/1:4:108,97:0.47: 0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,167:0.65: 0.91:1.000:0.830 0/0/0/1:4:191,87:0.26: 1.18:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,85:0.27: 1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,85:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:92,20:0.15:-1.07:1.000:0.994 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,208:0.68: 1.62:1.000:0.949 0/0/0/1:4:155,85:0.31: 0.67:1.000:0.968 0/0/1/1:4:92,104:0.54: 0.07:1.000:0.989 0/1/1/1:4:90,155:0.64: 0.73:1.000:0.687 0/0/1/1:4:63,57:0.48:-0.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,96:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,91:0.36: 0.61:0.996:0.735 0/0/0/1:4:158,75:0.27: 0.57:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,50:0.25:-0.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,278:1.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,137:0.47: 1.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:112,73:0.37:-0.08:1.000:0.590 0/0/0/1:4:151,83:0.31: 0.59:1.000:0.967 0/0/1/1:4:68,80:0.55:-0.58:1.000:0.982 0/0/0/1:4:195,82:0.24: 1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,159:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,108:0.58:-0.02:1.000:0.918 0/0/0/1:4:149,77:0.30: 0.48:1.000:0.989 0/0/1/1:4:91,80:0.47:-0.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,107:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,75:0.28: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,63:0.55:-1.01:1.000:0.979 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,63:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:205,99:0.27: 1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,103:0.35: 1.10:1.000:0.823 0/0/1/1:4:79,64:0.44:-0.65:1.000:0.966 0/1/1/1:4:72,152:0.69: 0.45:1.000:0.966 0/0/1/1:4:161,191:0.55: 2.18:1.000:0.980 0/1/1/1:4:94,185:0.67: 1.20:1.000:0.922 0/1/1/1:4:51,102:0.67:-0.51:1.000:0.935 0/1/1/1:4:96,169:0.64: 1.01:1.000:0.743 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,141:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,76:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,162:0.70: 0.60:1.000:0.982 0/0/1/1:4:104,71:0.38:-0.21:1.000:0.608 0/0/0/1:4:200,117:0.33: 1.71:1.000:0.905 0/0/0/1:4:193,82:0.24: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,83:0.46:-0.15:1.000:0.986 0/0/0/1:4:213,110:0.29: 1.79:1.000:0.989 0/0/1/1:4:75,89:0.55:-0.36:0.999:0.980 1/1/1/1:4:1,92:0.99:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,71:0.61:-1.00:1.000:0.643 0/0/0/1:4:176,96:0.31: 1.10:1.000:0.971 0/0/0/1:4:147,71:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,154:0.74: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,178:0.69: 0.96:1.000:0.968 0/0/0/0:4:189,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,84:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,68:0.42:-0.46:1.000:0.914 0/0/0/1:4:168,84:0.29: 0.83:1.000:0.994 0/0/0/1:4:167,85:0.29: 0.83:1.000:0.991 0/1/1/1:4:67,126:0.66: 0.03:1.000:0.869 0/0/0/1:4:127,54:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,60:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,65:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/0/0:4:75,1:0.01:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:118,69:0.33:-0.05:0.982:0.817 0/0/0/1:4:166,94:0.32: 0.94:1.000:0.944 0/0/0/1:4:164,92:0.32: 0.88:1.000:0.953 0/0/0/0:4:299,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,98:0.31: 1.17:1.000:0.969 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,78:0.29: 0.56:1.000:0.992 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,123:0.65: 0.02:1.000:0.772 0/0/0/1:4:220,96:0.25: 1.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,97:0.26: 1.59:1.000:0.999 0/1/1:3:85,84:0.50:-0.30:1.000:0.578 0/0/0/1:4:147,87:0.34: 0.59:1.000:0.886 0/0/0/1:4:177,105:0.34: 1.24:1.000:0.882 0/0/1/1:4:68,79:0.54:-0.59:1.000:0.984 0/0/1/1:4:108,100:0.48: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,75:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,28:0.27:-1.41:1.000:0.998 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,85:0.27: 1.01:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,103:0.32: 1.32:1.000:0.958 0/0/1/1:4:68,106:0.62:-0.23:1.000:0.614 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,49:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,68:0.47:-0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:69,58:0.45:-0.87:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,70:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,83:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,82:0.47:-0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,73:0.39:-0.17:1.000:0.680 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.76:0.999:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,63:0.56:-1.03:1.000:0.974 0/0/1/1:4:59,53:0.47:-1.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:163,79:0.28: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,81:0.52:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:145,76:0.30: 0.41:1.000:0.986 0/0/0/1:4:124,54:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,168:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,89:0.36: 0.50:1.000:0.662 0/1/1/1:4:51,144:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,93:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,93:0.26: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,63:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,146:0.62: 0.64:1.000:0.559 -chr5.1 25333490 chr5.1_025333490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.20:0.944:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.39:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:152,0:.: 3.78:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:128,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:54,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.74:0.996:. ./.:4:44,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:0.999:. ./.:4:70,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.33:1.000:. ./.:5:58,0:.:-0.55:0.982:. ./.:4:62,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.13:1.000:. ./.:3:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:134,1:.: 3.00:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.05:1.000:. -chr5.1 25557035 chr5.1_025557035 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,33:0.35:-0.72:1.000:0.762 0/0/1/1:4:57,58:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,117:0.57: 1.18:1.000:0.939 0/0/1/1:4:69,73:0.53:-0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:45,43:0.51:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,51:0.47:-0.54:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,20:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,32:0.47:-1.30:1.000:0.991 0/0/0/0:4:204,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,102:0.54: 0.88:1.000:0.985 0/0/1/1:4:56,58:0.53:-0.54:1.000:0.994 0/1/1/1:4:57,112:0.68: 0.45:1.000:0.944 0/0/1/1:4:73,59:0.47:-0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:69,63:0.49:-0.22:0.944:0.997 0/0/1/1:4:74,62:0.48:-0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,69:0.52:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,58:0.46:-0.22:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-2.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,123:0.61: 1.15:1.000:0.731 0/0/1/1:4:54,57:0.53:-0.60:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,37:0.63:-1.51:1.000:0.580 0/0/0/1:4:118,35:0.27: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,122:0.64: 0.90:1.000:0.726 0/1/1/1:4:72,128:0.65: 1.00:1.000:0.828 0/1/1/1:4:70,134:0.67: 1.08:1.000:0.924 0/0/1/1:4:137,98:0.44: 1.63:1.000:0.969 0/0/1/1:4:63,94:0.61: 0.23:1.000:0.649 0/0/1/1:4:58,47:0.47:-0.70:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,25:0.66:-1.89:1.000:0.836 0/0/1/1:4:57,47:0.47:-0.72:1.000:0.993 0/0/1:3:21,10:0.36:-2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,49:0.42:-0.36:1.000:0.922 0/0/0/1:4:128,52:0.33: 0.64:1.000:0.928 0/0/1/1:4:59,58:0.51:-0.49:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,62:0.46:-0.04:1.000:0.987 0/0/0/1:4:140,60:0.34: 1.00:1.000:0.882 0/0/1/1:4:67,63:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,69:0.55:-0.25:1.000:0.983 0/0/1/1:4:48,44:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:170,65:0.32: 1.63:1.000:0.960 0/0/1/1:4:71,60:0.48:-0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:77,130:0.64: 1.13:1.000:0.716 0/1/1/1:4:19,36:0.67:-1.60:1.000:0.915 0/0/1/1:4:46,63:0.59:-0.63:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,72:0.57:-0.25:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,47:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,133:0.65: 1.15:1.000:0.824 0/1/1/1:4:69,125:0.66: 0.90:1.000:0.859 0/0/1/1:4:64,98:0.62: 0.32:1.000:0.573 0/0/1/1:4:66,97:0.61: 0.34:1.000:0.691 0/1/1/1:4:63,99:0.63: 0.32:1.000:0.507 0/0/1/1:4:86,118:0.59: 1.08:1.000:0.840 0/1/1/1/1/1:6:37,116:0.77: 0.16:1.000:0.730 0/1/1/1:4:71,121:0.64: 0.86:1.000:0.740 0/0/1/1:4:70,54:0.46:-0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:77,49:0.42:-0.33:1.000:0.899 0/1/1/1:4:53,91:0.65: 0.00:1.000:0.757 0/0/1/1:4:84,49:0.40:-0.20:1.000:0.777 0/1/1/1:4:67,134:0.68: 1.02:1.000:0.955 0/0/0/1:4:84,31:0.31:-0.52:1.000:0.972 0/0/1/1:4:72,46:0.42:-0.47:1.000:0.903 0/0/1/1:4:79,47:0.40:-0.33:0.996:0.812 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,138:0.66: 1.26:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:224,1:0.01: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,140:0.64: 1.42:1.000:0.714 0/0/0/0:4:68,1:0.02:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,34:0.24: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,71:0.36: 1.31:1.000:0.665 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,115:0.47: 1.99:1.000:0.993 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,136:0.69: 1.02:1.000:0.974 0/0/1/1:4:178,138:0.46: 3.09:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,36:0.25: 0.55:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,87:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,108:0.59: 0.79:1.000:0.866 0/0/1/1:4:68,55:0.47:-0.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:74,37:0.37:-0.60:1.000:0.597 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,119:0.65: 0.77:1.000:0.798 0/0/1/1:4:158,132:0.48: 2.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,47:0.45:-0.61:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,60:0.46:-0.15:1.000:0.989 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,64:0.40: 0.48:1.000:0.820 0/1/1/1:4:76,127:0.64: 1.06:1.000:0.690 0/1/1/1:4:50,80:0.63:-0.25:1.000:0.563 0/0/1/1:4:70,59:0.48:-0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,108:0.71: 0.20:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,68:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,47:0.29: 0.88:1.000:0.993 0/1/1/1:4:69,109:0.63: 0.61:1.000:0.524 0/0/1/1:4:53,40:0.45:-0.92:1.000:0.983 0/0/1/1:4:75,49:0.42:-0.36:1.000:0.922 0/0/1/1:4:80,54:0.43:-0.18:1.000:0.944 0/0/1/1:4:69,55:0.46:-0.36:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,74:0.49: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,143:0.65: 1.45:0.999:0.791 0/0/1/1:4:93,127:0.59: 1.36:1.000:0.848 0/0/1/1:4:54,38:0.44:-0.94:1.000:0.964 0/0/1/1:4:74,68:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,106:0.67: 0.32:1.000:0.914 0/0/1/1:4:82,106:0.58: 0.79:1.000:0.917 0/0/1/1:4:73,47:0.42:-0.43:1.000:0.910 0/1/1/1:4:56,98:0.65: 0.18:1.000:0.798 0/0/1/1:4:65,52:0.47:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:80,107:0.59: 0.77:1.000:0.878 0/0/1/1:4:168,115:0.43: 2.50:1.000:0.951 0/0/1/1:4:66,103:0.62: 0.45:1.000:0.514 0/0/1/1:4:129,120:0.50: 1.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,65:0.34: 1.31:1.000:0.884 0/0/1/1:4:71,50:0.44:-0.42:1.000:0.964 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,82:0.99:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,97:0.65: 0.14:1.000:0.814 0/0/0/1:4:152,51:0.29: 1.06:1.000:0.989 0/1/1/1:4:71,117:0.64: 0.79:1.000:0.651 1/1/1/1/1:5:1,71:0.99:-1.30:0.982:1.000 0/0/1/1:4:77,70:0.49: 0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,75:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,68:0.37: 1.02:1.000:0.539 0/1/1/1:4:58,109:0.67: 0.41:1.000:0.906 0/1/1/1:4:56,111:0.68: 0.41:1.000:0.950 0/0/1/1:4:61,95:0.62: 0.21:1.000:0.521 0/0/1/1:4:90,48:0.38:-0.11:1.000:0.572 0/1/1/1:4:68,133:0.68: 1.02:1.000:0.941 0/1/1/1:4:50,107:0.70: 0.23:1.000:0.980 0/0/1/1:4:48,62:0.58:-0.61:1.000:0.918 0/1/1/1:4:87,146:0.64: 1.60:1.000:0.701 0/0/1/1:4:93,74:0.46: 0.41:1.000:0.990 0/0/1:3:69,54:0.46:-0.38:1.000:0.932 0/0/1/1:4:74,47:0.42:-0.42:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,82:0.38: 1.61:1.000:0.602 0/0/0/1:4:149,77:0.37: 1.47:1.000:0.511 0/1/1/1:4:77,130:0.64: 1.13:1.000:0.716 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,41:0.46:-0.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:71,64:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,104:0.63: 0.46:1.000:0.516 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,136:0.48: 2.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,98:0.64: 0.21:1.000:0.718 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,78:0.59:-0.16:1.000:0.845 0/0/0/1:4:105,39:0.31: 0.00:1.000:0.970 0/0/1/1:4:58,88:0.62: 0.03:1.000:0.601 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,104:0.43: 2.01:1.000:0.951 0/0/1/1:4:67,63:0.50:-0.25:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:204,0:0.00: 1.08:0.999:1.000 0/0/1/1:4:55,58:0.53:-0.56:1.000:0.992 0/1/1/1:4:64,108:0.64: 0.50:1.000:0.715 0/0/1/1:4:68,56:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,84:0.45: 0.93:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,127:0.68: 0.86:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,35:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,108:0.68: 0.34:1.000:0.944 0/0/1/1:4:78,54:0.43:-0.22:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,98:0.54: 0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:71,46:0.42:-0.49:1.000:0.915 0/0/1/1:4:74,72:0.51: 0.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,49:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/0/0:4:131,1:0.01:-0.22:1.000:1.000 -chr5.1 25718153 chr5.1_025718153 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,15:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,11:.:-1.14:1.000:. ./.:4:45,31:.: 0.24:1.000:. ./.:4:38,48:.: 0.65:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:29,2:.:-1.59:1.000:. ./.:4:30,12:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,40:.:-0.61:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:37,34:.: 0.04:1.000:. ./.:4:49,34:.: 0.53:0.944:. ./.:4:43,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,53:.: 1.06:1.000:. ./.:4:43,34:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,39:.: 0.45:1.000:. ./.:4:39,43:.: 0.49:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:7,18:.:-1.83:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,13:.:-1.59:1.000:. ./.:4:12,34:.:-0.98:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,29:.:-0.69:1.000:. ./.:4:25,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:31,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:5,3:.:-2.53:1.000:. ./.:4:27,7:.:-1.47:1.000:. ./.:3:4,6:.:-2.44:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,28:.: 0.24:1.000:. ./.:4:55,6:.:-0.37:1.000:. ./.:4:29,6:.:-1.43:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:64,41:.: 1.42:1.000:. ./.:4:52,47:.: 1.18:1.000:. ./.:4:59,56:.: 1.83:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:85,45:.: 2.44:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,40:.: 0.45:1.000:. ./.:4:39,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:54,24:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,41:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,12:.: 0.36:1.000:. ./.:4:26,34:.:-0.41:1.000:. ./.:4:56,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:37,48:.: 0.61:1.000:. ./.:4:38,6:.:-1.06:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:21,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:27,36:.:-0.29:1.000:. ./.:6:26,57:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,44:.: 1.50:1.000:. ./.:4:53,36:.: 0.77:1.000:. ./.:4:68,80:.: 3.17:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:47,57:.: 1.38:1.000:. ./.:4:34,6:.:-1.22:1.000:. ./.:4:41,33:.: 0.16:1.000:. ./.:4:51,39:.: 0.81:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:0.996:. ./.:4:51,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:31,71:.: 1.30:1.000:. ./.:4:31,12:.:-1.10:1.000:. ./.:4:35,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:31,36:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,17:.:-0.57:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,14:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,37:.: 1.26:1.000:. ./.:4:38,52:.: 0.81:1.000:. ./.:4:41,37:.: 0.32:1.000:. ./.:4:23,17:.:-1.22:1.000:. ./.:4:61,42:.: 1.34:1.000:. ./.:4:53,35:.: 0.73:1.000:. ./.:4:59,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:32,66:.: 1.14:1.000:. ./.:4:39,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,48:.: 0.45:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:54,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:21,43:.:-0.25:1.000:. ./.:4:47,38:.: 0.61:1.000:. ./.:4:48,55:.: 1.34:1.000:. ./.:4:35,6:.:-1.18:1.000:. ./.:4:49,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,17:.: 0.53:1.000:. ./.:4:69,17:.: 0.65:1.000:. ./.:4:28,33:.:-0.37:1.000:. ./.:4:69,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.90:1.000:. ./.:4:58,64:.: 2.11:1.000:. ./.:4:36,54:.: 0.81:1.000:. ./.:4:83,52:.: 2.64:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:69,12:.: 0.45:1.000:. ./.:4:40,9:.:-0.86:1.000:. ./.:4:62,18:.: 0.41:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,54:.: 0.28:1.000:. ./.:4:73,44:.: 1.91:1.000:. ./.:4:51,69:.: 2.03:0.999:. ./.:4:34,51:.: 0.61:1.000:. ./.:4:35,26:.:-0.37:1.000:. ./.:4:96,18:.: 1.79:1.000:. ./.:4:47,15:.:-0.33:1.000:. ./.:4:31,7:.:-1.30:1.000:. ./.:4:66,40:.: 1.46:1.000:. ./.:4:34,41:.: 0.20:1.000:. ./.:4:63,19:.: 0.49:1.000:. ./.:4:32,38:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,50:.: 1.18:1.000:. ./.:4:39,21:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,40:.: 0.73:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:69,13:.: 0.49:1.000:. ./.:4:15,20:.:-1.43:1.000:. ./.:4:18,43:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,38:.:-0.08:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,29:.:-0.25:1.000:. ./.:5:31,26:.:-0.53:0.982:. ./.:4:75,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:27,22:.:-0.86:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:66,45:.: 1.67:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:90,37:.: 2.32:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,45:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,11:.:-1.14:1.000:. ./.:4:30,47:.: 0.28:1.000:. ./.:4:75,52:.: 2.32:1.000:. ./.:3:43,38:.: 0.45:1.000:. ./.:4:57,6:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,35:.: 1.18:1.000:. ./.:4:19,34:.:-0.69:1.000:. ./.:4:28,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:64,38:.: 1.30:1.000:. ./.:4:36,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:67,61:.: 2.36:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:23,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:26,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:20,32:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:9,12:.:-2.00:1.000:. ./.:4:57,11:.:-0.08:1.000:. ./.:4:17,32:.:-0.86:1.000:. ./.:4:48,8:.:-0.57:0.999:. ./.:4:63,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:23,44:.:-0.12:1.000:. ./.:4:31,33:.:-0.25:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:40,41:.: 0.45:1.000:. ./.:4:20,35:.:-0.61:1.000:. ./.:4:27,29:.:-0.57:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:27,48:.: 0.20:1.000:. ./.:4:63,39:.: 1.30:1.000:. ./.:4:52,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:25,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:51,44:.: 1.02:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,12:.: 0.85:1.000:. ./.:4:49,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.90:1.000:. -chr5.1 25792166 chr5.1_025792166 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,64:.: 1.09:1.000:. ./.:4:118,43:.: 0.23:1.000:. ./.:4:93,56:.: 0.06:1.000:. ./.:4:145,76:.: 1.11:1.000:. ./.:4:147,58:.: 0.87:1.000:. ./.:4:123,178:.: 2.27:1.000:. ./.:4:158,53:.: 0.96:1.000:. ./.:4:133,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:113,109:.: 1.12:1.000:. ./.:4:21,17:.:-1.55:1.000:. ./.:4:45,40:.:-0.87:1.000:. ./.:4:127,64:.: 0.67:1.000:. ./.:4:98,106:.: 0.86:1.000:. ./.:4:121,61:.: 0.54:1.000:. ./.:4:154,47:.: 0.82:1.000:. ./.:4:193,70:.: 1.71:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.53:0.944:. ./.:4:175,49:.: 1.15:1.000:. ./.:4:229,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:173,98:.: 1.83:1.000:. ./.:4:49,25:.:-1.03:1.000:. ./.:4:114,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:141,58:.: 0.79:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:116,52:.: 0.34:1.000:. ./.:4:155,187:.: 2.86:1.000:. ./.:4:161,44:.: 0.87:1.000:. ./.:4:150,54:.: 0.86:1.000:. ./.:4:161,44:.: 0.87:1.000:. ./.:4:91,116:.: 0.90:1.000:. ./.:4:142,68:.: 0.95:1.000:. ./.:4:62,1:.:-1.19:1.000:. ./.:4:62,1:.:-1.19:1.000:. ./.:3:29,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:162,61:.: 1.13:1.000:. ./.:4:58,78:.:-0.13:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:67,36:.:-0.61:1.000:. ./.:4:70,32:.:-0.62:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:130,178:.: 2.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:40,43:.:-0.90:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.97:1.000:. ./.:4:144,48:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,39:.:-0.85:1.000:. ./.:4:94,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:104,84:.: 0.63:1.000:. ./.:4:106,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,63:.:-0.52:1.000:. ./.:4:65,20:.:-0.87:1.000:. ./.:4:48,12:.:-1.23:1.000:. ./.:6:50,22:.:-1.06:1.000:. ./.:4:66,24:.:-0.79:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:50,33:.:-0.90:1.000:. ./.:4:70,20:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,48:.:-0.17:1.000:. ./.:4:73,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:70,26:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,32:.:-0.58:0.996:. ./.:4:116,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,62:.:-0.61:1.000:. ./.:4:57,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:71,29:.:-0.65:1.000:. ./.:4:121,59:.: 0.51:1.000:. ./.:4:76,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:73,64:.:-0.11:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:84,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,31:.:-0.71:1.000:. ./.:4:24,40:.:-1.17:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:63,66:.:-0.23:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:46,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:120,33:.: 0.12:1.000:. ./.:4:52,80:.:-0.19:1.000:. ./.:4:54,17:.:-1.07:1.000:. ./.:4:51,24:.:-1.01:1.000:. ./.:4:52,70:.:-0.33:1.000:. ./.:4:71,38:.:-0.52:1.000:. ./.:4:47,51:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,42:.:-1.07:1.000:. ./.:4:34,38:.:-1.06:1.000:. ./.:4:69,22:.:-0.78:1.000:. ./.:4:90,66:.: 0.16:1.000:. ./.:4:61,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:66,33:.:-0.66:1.000:. ./.:4:18,39:.:-1.27:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:71,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:39,53:.:-0.77:1.000:. ./.:4:102,146:.: 1.50:1.000:. ./.:4:183,65:.: 1.50:1.000:. ./.:4:92,38:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,49:.:-0.87:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:65,20:.:-0.87:0.999:. ./.:4:41,54:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,18:.:-1.22:1.000:. ./.:4:84,34:.:-0.39:1.000:. ./.:4:73,42:.:-0.43:1.000:. ./.:4:42,56:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:53,20:.:-1.04:1.000:. ./.:4:53,71:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:70,27:.:-0.69:1.000:. ./.:4:115,159:.: 1.87:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:69,28:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,36:.:-1.23:1.000:. ./.:4:35,12:.:-1.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:63,17:.:-0.94:1.000:. ./.:4:171,67:.: 1.35:1.000:. ./.:5:50,38:.:-0.82:0.982:. ./.:4:67,36:.:-0.61:1.000:. ./.:4:76,34:.:-0.50:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:65,30:.:-0.72:1.000:. ./.:4:67,19:.:-0.85:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,26:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,92:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,21:.:-1.10:1.000:. ./.:4:197,76:.: 1.86:1.000:. ./.:4:239,1:.: 1.38:1.000:. ./.:3:151,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:145,58:.: 0.84:1.000:. ./.:4:93,124:.: 1.05:1.000:. ./.:4:90,28:.:-0.39:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:164,84:.: 1.50:1.000:. ./.:4:19,16:.:-1.59:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:129,53:.: 0.54:1.000:. ./.:4:219,84:.: 2.29:1.000:. ./.:4:156,63:.: 1.08:1.000:. ./.:4:118,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:201,71:.: 1.84:1.000:. ./.:4:159,53:.: 0.97:1.000:. ./.:4:94,42:.:-0.13:1.000:. ./.:4:86,88:.: 0.42:1.000:. ./.:4:163,53:.: 1.03:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:113,124:.: 1.34:1.000:. ./.:4:134,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:127,51:.: 0.48:0.999:. ./.:4:157,57:.: 1.00:1.000:. ./.:4:101,139:.: 1.38:1.000:. ./.:4:143,54:.: 0.76:1.000:. ./.:4:99,46:.: 0.00:1.000:. ./.:4:85,49:.:-0.16:1.000:. ./.:4:107,38:.: 0.00:1.000:. ./.:4:70,39:.:-0.52:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:189,79:.: 1.79:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:81,109:.: 0.66:1.000:. ./.:4:164,54:.: 1.06:1.000:. ./.:4:163,76:.: 1.37:1.000:. ./.:4:188,94:.: 1.99:1.000:. ./.:4:137,176:.: 2.44:1.000:. ./.:4:82,87:.: 0.35:1.000:. ./.:4:118,61:.: 0.50:1.000:. -chr5.1 26004115 chr5.1_026004115 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:564,144:.: 0.47:1.000:. ./.:4:343,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:611,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:606,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:464,390:.: 1.29:1.000:. ./.:4:600,210:.: 1.04:1.000:. ./.:4:265,241:.:-0.65:1.000:. ./.:4:571,303:.: 1.40:1.000:. ./.:4:259,295:.:-0.39:1.000:. ./.:4:300,102:.:-1.23:1.000:. ./.:4:154,175:.:-1.64:1.000:. ./.:4:380,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:362,169:.:-0.51:1.000:. ./.:4:550,386:.: 1.74:1.000:. ./.:4:315,285:.:-0.13:1.000:. ./.:4:651,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:802,188:.: 2.05:0.944:. ./.:4:521,178:.: 0.42:1.000:. ./.:4:815,216:.: 2.27:1.000:. ./.:4:815,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:302,165:.:-0.87:1.000:. ./.:4:584,145:.: 0.59:1.000:. ./.:4:500,346:.: 1.24:1.000:. ./.:4:575,164:.: 0.65:1.000:. ./.:4:210,88:.:-1.81:1.000:. ./.:4:570,178:.: 0.70:1.000:. ./.:4:280,152:.:-1.07:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:243,182:.:-1.10:1.000:. ./.:4:530,166:.: 0.41:1.000:. ./.:4:419,192:.:-0.07:1.000:. ./.:4:539,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:130,107:.:-2.15:1.000:. ./.:4:387,8:.:-1.27:1.000:. ./.:3:175,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:651,188:.: 1.20:1.000:. ./.:4:723,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:592,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:241,338:.:-0.25:1.000:. ./.:4:732,178:.: 1.60:1.000:. ./.:4:660,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:585,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:700,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:548,146:.: 0.40:1.000:. ./.:4:833,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:649,165:.: 1.06:1.000:. ./.:4:553,186:.: 0.65:1.000:. ./.:4:329,175:.:-0.66:1.000:. ./.:4:552,143:.: 0.40:1.000:. ./.:4:369,394:.: 0.78:1.000:. ./.:4:430,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:513,165:.: 0.31:1.000:. ./.:4:333,135:.:-0.86:1.000:. ./.:4:487,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:259,138:.:-1.26:1.000:. ./.:4:343,313:.: 0.18:1.000:. ./.:4:345,140:.:-0.77:1.000:. ./.:4:387,378:.: 0.79:1.000:. ./.:4:416,302:.: 0.53:1.000:. ./.:6:350,210:.:-0.35:1.000:. ./.:4:443,311:.: 0.73:1.000:. ./.:4:638,122:.: 0.76:1.000:. ./.:4:690,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:354,349:.: 0.45:1.000:. ./.:4:694,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:291,175:.:-0.88:1.000:. ./.:4:661,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:612,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:489,348:.: 1.19:0.996:. ./.:4:360,299:.: 0.20:1.000:. ./.:4:409,204:.:-0.06:1.000:. ./.:4:196,329:.:-0.55:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:424,325:.: 0.70:1.000:. ./.:4:310,344:.: 0.17:1.000:. ./.:4:537,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:223,334:.:-0.37:1.000:. ./.:4:720,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:432,159:.:-0.18:1.000:. ./.:4:550,185:.: 0.62:1.000:. ./.:4:214,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:576,153:.: 0.59:1.000:. ./.:4:675,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:361,241:.:-0.12:1.000:. ./.:4:763,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:373,376:.: 0.70:1.000:. ./.:4:364,105:.:-0.86:1.000:. ./.:4:471,153:.: 0.00:1.000:. ./.:4:585,145:.: 0.60:1.000:. ./.:4:423,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:248,266:.:-0.61:1.000:. ./.:4:356,316:.: 0.27:1.000:. ./.:4:524,168:.: 0.38:1.000:. ./.:4:284,114:.:-1.26:1.000:. ./.:4:282,342:.: 0.00:1.000:. ./.:4:413,305:.: 0.53:1.000:. ./.:4:408,142:.:-0.41:1.000:. ./.:4:218,127:.:-1.55:1.000:. ./.:4:618,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:326,168:.:-0.72:1.000:. ./.:4:206,116:.:-1.68:1.000:. ./.:4:718,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:324,134:.:-0.92:1.000:. ./.:4:751,147:.: 1.53:1.000:. ./.:4:545,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:418,293:.: 0.49:1.000:. ./.:4:418,135:.:-0.39:1.000:. ./.:4:441,187:.: 0.03:1.000:. ./.:4:690,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:328,341:.: 0.26:1.000:. ./.:4:965,222:.: 3.14:1.000:. ./.:4:426,1:.:-1.09:0.999:. ./.:4:394,153:.:-0.42:1.000:. ./.:4:424,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:624,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:262,141:.:-1.23:1.000:. ./.:4:273,161:.:-1.05:1.000:. ./.:4:736,175:.: 1.61:1.000:. ./.:4:353,282:.: 0.07:1.000:. ./.:4:418,165:.:-0.22:1.000:. ./.:4:498,168:.: 0.24:1.000:. ./.:4:519,157:.: 0.29:1.000:. ./.:4:266,150:.:-1.15:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:760,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:508,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:195,138:.:-1.62:1.000:. ./.:4:276,127:.:-1.23:1.000:. ./.:4:468,140:.:-0.08:1.000:. ./.:4:527,151:.: 0.31:1.000:. ./.:4:401,282:.: 0.33:1.000:. ./.:5:402,202:.:-0.11:0.982:. ./.:4:489,297:.: 0.91:1.000:. ./.:4:499,120:.:-0.02:1.000:. ./.:4:805,220:.: 2.24:1.000:. ./.:4:623,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:476,151:.: 0.02:1.000:. ./.:4:297,258:.:-0.38:1.000:. ./.:4:354,308:.: 0.22:1.000:. ./.:4:728,172:.: 1.54:1.000:. ./.:4:315,328:.: 0.11:1.000:. ./.:4:364,163:.:-0.54:1.000:. ./.:4:230,146:.:-1.38:1.000:. ./.:4:569,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:971,222:.: 3.18:1.000:. ./.:3:700,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:469,345:.: 1.06:1.000:. ./.:4:352,146:.:-0.70:1.000:. ./.:4:947,1:.: 1.81:1.000:. ./.:4:464,288:.: 0.72:1.000:. ./.:4:114,131:.:-2.11:1.000:. ./.:4:450,102:.:-0.40:1.000:. ./.:4:709,172:.: 1.44:1.000:. ./.:4:432,338:.: 0.82:1.000:. ./.:4:766,187:.: 1.84:1.000:. ./.:4:464,178:.: 0.11:1.000:. ./.:4:388,280:.: 0.25:1.000:. ./.:4:476,164:.: 0.09:1.000:. ./.:4:399,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:478,124:.:-0.12:1.000:. ./.:4:356,145:.:-0.68:1.000:. ./.:4:462,142:.:-0.11:1.000:. ./.:4:582,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:348,132:.:-0.80:1.000:. ./.:4:381,166:.:-0.42:1.000:. ./.:4:401,1:.:-1.23:0.999:. ./.:4:534,291:.: 1.13:1.000:. ./.:4:277,108:.:-1.33:1.000:. ./.:4:515,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:316,111:.:-1.09:1.000:. ./.:4:567,159:.: 0.57:1.000:. ./.:4:430,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:377,161:.:-0.47:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:855,195:.: 2.38:1.000:. ./.:4:447,336:.: 0.89:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:693,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:654,330:.: 2.01:1.000:. ./.:4:598,355:.: 1.84:1.000:. ./.:4:374,126:.:-0.69:1.000:. ./.:4:320,165:.:-0.77:1.000:. -chr5.1 26237597 chr5.1_026237597 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:20,20:0.52: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,22:0.64:-0.07:1.000:0.639 0/0/1/1:4:16,19:0.56:-0.07:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,11:0.21: 2.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,25:0.59: 0.58:1.000:0.854 0/0/0/1:4:23,7:0.28:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:27,10:0.31: 0.09:1.000:0.973 0/0/0/1:4:35,14:0.32: 1.08:1.000:0.942 0/0/1/1:4:11,6:0.38:-1.55:1.000:0.617 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-1.96:1.000:0.968 0/0/1/1:4:14,20:0.60:-0.15:1.000:0.807 0/0/1/1:4:13,18:0.59:-0.40:1.000:0.858 0/0/0/1:4:41,11:0.26: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,21:0.43: 1.32:1.000:0.944 0/0/1/1:4:16,15:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,13:0.32: 0.91:0.944:0.963 0/0/1/1:4:36,23:0.42: 1.90:1.000:0.899 0/0/1/1:4:28,15:0.38: 0.58:1.000:0.571 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.75:-2.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,18:0.70:-0.81:1.000:0.981 0/0/1/1:4:30,20:0.43: 1.16:1.000:0.934 0/1/1/1:4:8,20:0.72:-0.65:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,16:0.42: 0.42:1.000:0.901 0/0/1/1:4:17,18:0.53:-0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,20:0.61:-0.24:1.000:0.635 0/0/1/1:4:32,17:0.38: 1.08:1.000:0.549 0/0/1/1:4:22,16:0.44: 0.17:1.000:0.973 0/0/0/1:4:28,7:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,17:0.60:-0.56:1.000:0.822 0/0/0/1:4:10,4:0.32:-1.80:1.000:0.942 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-2.29:1.000:0.999 0/1/1:3:1,2:0.67:-2.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,23:0.63: 0.09:1.000:0.555 0/1/1/1:4:15,30:0.67: 0.75:1.000:0.928 0/1/1/1:4:7,13:0.66:-1.30:1.000:0.842 0/0/1/1:4:23,16:0.43: 0.26:1.000:0.957 0/0/1/1:4:28,18:0.42: 0.83:1.000:0.905 0/1/1/1:4:15,28:0.66: 0.58:1.000:0.850 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,27:0.79:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.44: 0.58:1.000:0.970 0/0/1/1:4:15,19:0.57:-0.15:1.000:0.946 0/1/1/1:4:14,33:0.71: 0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:25,28:0.54: 1.40:1.000:0.987 0/0/0/1:4:58,29:0.37: 4.20:1.000:0.611 0/0/1/1:4:12,16:0.58:-0.65:1.000:0.905 0/1/1/1:4:9,18:0.67:-0.73:1.000:0.928 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,44:0.76: 1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,25:0.65: 0.26:1.000:0.770 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,8:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,12:0.26: 1.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,14:0.47:-0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:33,8:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,8:0.21: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:25,12:0.36: 0.09:1.000:0.877 0/0/0/1:4:23,8:0.30:-0.40:1.000:0.986 0/0/1/1:4:15,23:0.61: 0.17:1.000:0.645 0/0/1/1:4:14,21:0.61:-0.07:1.000:0.702 0/0/0/1:4:29,9:0.28: 0.17:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,14:0.39: 0.26:1.000:0.682 0/0/1/1:4:5,8:0.62:-1.88:1.000:0.523 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,1:0.08: 0.26:0.996:0.978 0/0/0/1:4:41,8:0.21: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.57:-0.15:1.000:0.946 0/0/1/1:4:21,12:0.39:-0.24:1.000:0.727 0/0/1/1:4:15,17:0.54:-0.32:1.000:0.985 0/0/0/1:4:35,9:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,4:0.13: 1.40:1.000:0.917 0/0/1/1:4:14,16:0.55:-0.48:1.000:0.983 0/0/0/1:4:32,11:0.30: 0.58:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,26:0.64: 0.42:1.000:0.702 0/0/1/1:4:20,13:0.42:-0.24:1.000:0.915 0/1/1/1:4:8,18:0.70:-0.81:1.000:0.981 0/1/1/1:4:14,29:0.68: 0.58:1.000:0.951 0/0/1/1:4:19,23:0.56: 0.50:1.000:0.967 0/0/0/1:4:27,9:0.29: 0.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:11,21:0.66:-0.32:1.000:0.881 0/0/0/1:4:30,10:0.29: 0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,17:0.56:-0.40:1.000:0.966 0/0/1/1:4:12,15:0.57:-0.73:1.000:0.953 0/1/1/1:4:8,18:0.70:-0.81:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,10:0.35:-0.32:1.000:0.811 0/0/1/1:4:29,18:0.41: 0.91:1.000:0.867 0/0/1/1:4:40,24:0.40: 2.31:1.000:0.818 0/0/1/1:4:11,7:0.42:-1.47:1.000:0.895 0/0/0/1:4:33,7:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.21:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.62:-0.81:1.000:0.523 0/1/1/1:4:9,16:0.65:-0.89:1.000:0.761 0/0/1/1:4:21,29:0.59: 1.16:1.000:0.862 0/0/1/1:4:38,20:0.38: 1.82:1.000:0.524 0/0/0/1:4:15,6:0.32:-1.22:1.000:0.942 0/1/1/1:4:6,24:0.80:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.50:-1.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,26:0.66: 0.34:1.000:0.842 0/0/1/1:4:6,9:0.61:-1.71:1.000:0.702 0/0/0/1:4:39,6:0.19: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,5:0.26:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,15:0.53:-0.56:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,12:0.41:-0.40:1.000:0.887 0/0/1/1:4:23,15:0.42: 0.17:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,38:1.00: 0.17:0.999:1.000 0/0/1/1:4:20,11:0.39:-0.40:1.000:0.638 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,11:0.35:-0.07:1.000:0.797 0/0/1/1:4:15,11:0.45:-0.81:1.000:0.976 0/1/1/1:4:14,24:0.64: 0.17:1.000:0.674 0/0/1/1:4:29,20:0.43: 1.08:1.000:0.953 0/0/0/1:4:38,4:0.15: 0.50:1.000:0.987 0/1/1/1:4:7,24:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,13:0.35: 0.50:1.000:0.832 0/0/1/1:4:14,20:0.60:-0.15:1.000:0.807 0/0/1/1:4:15,20:0.58:-0.07:1.000:0.905 0/0/1/1:4:16,21:0.58: 0.09:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.43:-1.30:1.000:0.934 0/1/1/1:4:12,21:0.64:-0.24:1.000:0.725 0/0/0/1:4:22,8:0.31:-0.48:1.000:0.977 0/0/1/1:4:15,12:0.46:-0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:39,24:0.41: 2.23:1.000:0.856 0/0/0/1/1:5:25,18:0.44: 0.58:0.982:0.909 0/0/0/1:4:40,5:0.16: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,18:0.43: 0.75:1.000:0.934 0/1/1/1:4:14,24:0.64: 0.17:1.000:0.674 0/0/1/1:4:15,22:0.60: 0.09:1.000:0.754 0/0/1/1:4:15,15:0.52:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,10:0.32:-0.07:1.000:0.942 0/0/0/1:4:33,13:0.32: 0.83:1.000:0.950 0/0/1/1:4:17,24:0.60: 0.42:1.000:0.828 0/0/1/1:4:26,17:0.42: 0.58:1.000:0.920 0/1/1/1:4:14,23:0.63: 0.09:1.000:0.555 0/0/1/1:4:19,14:0.45:-0.24:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,40:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,13:0.25: 2.39:1.000:0.999 0/1/1:3:17,17:0.52:-0.15:1.000:0.733 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,9:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,13:0.40:-0.07:1.000:0.792 0/1/1/1:4:16,35:0.69: 1.24:1.000:0.974 0/0/0/1:4:34,11:0.29: 0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:5,2:0.32:-2.37:1.000:0.942 0/0/1/1:4:13,12:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,13:0.31: 0.99:1.000:0.972 0/0/0/1:4:40,17:0.34: 1.73:1.000:0.897 0/0/1/1:4:22,14:0.42: 0.01:1.000:0.895 0/0/0/1:4:36,16:0.34: 1.32:1.000:0.845 0/0/0/1:4:30,12:0.32: 0.50:1.000:0.942 0/0/1/1:4:20,23:0.55: 0.58:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,15:0.35: 0.99:1.000:0.811 0/0/1/1:4:16,15:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,18:0.57:-0.32:1.000:0.936 0/1/1/1:4:15,34:0.70: 1.08:1.000:0.983 0/0/1/1:4:23,18:0.46: 0.42:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,17:0.66:-0.81:1.000:0.867 0/1/1/1:4:16,30:0.66: 0.83:0.999:0.857 0/0/0/1:4:20,8:0.32:-0.65:1.000:0.942 0/1/1/1:4:5,18:0.78:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.52:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,18:0.65:-0.65:1.000:0.786 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,24:0.80:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.62:-1.06:1.000:0.605 0/0/1/1:4:16,24:0.61: 0.34:1.000:0.702 0/0/1/1:4:17,19:0.54: 0.01:1.000:0.987 0/0/0/1:4:28,5:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,15:0.55:-0.65:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,37:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:34,13:0.32: 0.91:1.000:0.963 0/0/1/1:4:12,9:0.45:-1.22:1.000:0.981 0/0/1/1:4:33,21:0.42: 1.49:1.000:0.895 -chr5.1 26400570 chr5.1_026400570 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:320,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:131,113:.:-0.68:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:242,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:272,96:.: 1.41:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:253,67:.: 0.60:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:100,26:.:-2.66:1.000:. ./.:4:86,47:.:-2.54:1.000:. ./.:4:136,120:.:-0.47:1.000:. ./.:4:236,51:.: 0.05:1.000:. ./.:4:192,63:.:-0.49:1.000:. ./.:4:221,73:.: 0.17:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.79:0.944:. ./.:4:150,118:.:-0.27:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:287,77:.: 1.34:1.000:. ./.:4:143,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:206,66:.:-0.20:1.000:. ./.:4:225,67:.: 0.13:1.000:. ./.:4:110,1:.:-2.92:1.000:. ./.:4:267,89:.: 1.21:1.000:. ./.:4:266,82:.: 1.08:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:223,69:.: 0.13:1.000:. ./.:4:260,74:.: 0.84:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:83,40:.:-2.71:1.000:. ./.:4:130,32:.:-2.06:1.000:. ./.:3:59,17:.:-3.50:1.000:. ./.:4:255,80:.: 0.86:1.000:. ./.:4:235,79:.: 0.50:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:205,76:.:-0.05:1.000:. ./.:4:209,71:.:-0.07:1.000:. ./.:4:316,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:256,79:.: 0.86:1.000:. ./.:4:251,79:.: 0.77:1.000:. ./.:4:252,79:.: 0.79:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:190,70:.:-0.41:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:193,54:.:-0.63:1.000:. ./.:4:242,77:.: 0.59:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:190,57:.:-0.63:1.000:. ./.:4:346,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.52:1.000:. ./.:6:193,37:.:-0.91:1.000:. ./.:4:184,63:.:-0.63:1.000:. ./.:4:185,55:.:-0.74:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:244,61:.: 0.35:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:213,37:.:-0.57:1.000:. ./.:4:209,72:.:-0.05:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.79:0.996:. ./.:4:200,56:.:-0.47:1.000:. ./.:4:275,75:.: 1.11:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:298,75:.: 1.50:1.000:. ./.:4:249,75:.: 0.67:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:213,50:.:-0.36:1.000:. ./.:4:262,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:251,71:.: 0.64:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:237,74:.: 0.45:1.000:. ./.:4:194,64:.:-0.44:1.000:. ./.:4:204,67:.:-0.22:1.000:. ./.:4:280,71:.: 1.13:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:245,93:.: 0.91:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:144,44:.:-1.62:1.000:. ./.:4:174,41:.:-1.16:1.000:. ./.:4:189,47:.:-0.81:1.000:. ./.:4:187,47:.:-0.84:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:210,67:.:-0.12:1.000:. ./.:4:235,68:.: 0.32:1.000:. ./.:4:172,59:.:-0.89:1.000:. ./.:4:231,66:.: 0.22:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:175,68:.:-0.69:1.000:. ./.:4:186,70:.:-0.47:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:162,51:.:-1.20:1.000:. ./.:4:188,49:.:-0.79:1.000:. ./.:4:223,78:.: 0.28:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:233,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:264,74:.: 0.91:1.000:. ./.:4:211,52:.:-0.36:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:211,56:.:-0.29:0.999:. ./.:4:209,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:164,40:.:-1.35:1.000:. ./.:4:262,65:.: 0.72:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:191,77:.:-0.27:1.000:. ./.:4:176,48:.:-1.01:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:194,66:.:-0.41:1.000:. ./.:4:216,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:261,76:.: 0.89:1.000:. ./.:4:209,62:.:-0.22:1.000:. ./.:4:227,67:.: 0.17:1.000:. ./.:4:236,66:.: 0.30:1.000:. ./.:4:209,53:.:-0.37:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:207,60:.:-0.29:1.000:. ./.:4:254,76:.: 0.77:1.000:. ./.:5:216,0:.:-1.15:0.982:. ./.:4:298,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:335,74:.: 2.10:1.000:. ./.:4:224,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:211,62:.:-0.19:1.000:. ./.:4:174,75:.:-0.59:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:205,54:.:-0.42:1.000:. ./.:4:175,69:.:-0.68:1.000:. ./.:4:228,71:.: 0.25:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:288,82:.: 1.45:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.29:1.000:. ./.:3:203,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:193,66:.:-0.42:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:225,68:.: 0.15:1.000:. ./.:4:264,81:.: 1.02:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:116,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:164,43:.:-1.30:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:221,67:.: 0.07:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:272,80:.: 1.14:1.000:. ./.:4:185,60:.:-0.66:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:218,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:191,70:.:-0.39:1.000:. ./.:4:235,63:.: 0.23:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:268,64:.: 0.81:1.000:. ./.:4:189,68:.:-0.46:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:123,121:.:-0.68:0.999:. ./.:4:205,61:.:-0.31:1.000:. ./.:4:224,64:.: 0.07:1.000:. ./.:4:179,71:.:-0.57:1.000:. ./.:4:194,39:.:-0.86:1.000:. ./.:4:289,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:226,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:194,66:.:-0.41:1.000:. ./.:4:393,1:.: 1.85:1.000:. ./.:4:259,83:.: 0.97:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:282,16:.: 0.23:1.000:. ./.:4:237,69:.: 0.37:1.000:. ./.:4:318,94:.: 2.15:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:190,56:.:-0.64:1.000:. ./.:4:187,60:.:-0.63:1.000:. -chr5.1 26640198 chr5.1_026640198 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:159,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:53,25:.:-0.91:1.000:. ./.:4:91,21:.:-0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:164,53:.: 2.56:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:63,11:.:-1.01:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:20,6:.:-2.20:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:47,33:.:-0.86:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:148,30:.: 1.59:1.000:. ./.:4:91,26:.: 0.07:0.944:. ./.:4:147,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:187,42:.: 2.86:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,4:.:-2.23:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.28:1.000:. ./.:4:70,19:.:-0.63:1.000:. ./.:4:110,28:.: 0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:22,4:.:-2.20:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:97,28:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,37:.: 0.86:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:123,20:.: 0.71:1.000:. ./.:4:83,21:.:-0.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,32:.: 0.89:1.000:. ./.:4:92,20:.:-0.06:1.000:. ./.:4:65,22:.:-0.68:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,5:.:-2.48:1.000:. ./.:4:94,18:.:-0.06:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:107,24:.: 0.41:1.000:. ./.:4:84,20:.:-0.26:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:64,12:.:-0.96:1.000:. ./.:4:83,21:.:-0.26:1.000:. ./.:6:78,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:98,25:.: 0.22:1.000:. ./.:4:67,18:.:-0.73:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:103,25:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,9:.:-1.38:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:59,19:.:-0.91:0.996:. ./.:4:88,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:27,43:.:-1.11:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:82,20:.:-0.31:1.000:. ./.:4:76,28:.:-0.26:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:60,31:.:-0.58:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:49,14:.:-1.28:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:82,38:.: 0.14:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:118,26:.: 0.74:1.000:. ./.:4:120,31:.: 0.91:1.000:. ./.:4:57,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:96,24:.: 0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:75,17:.:-0.56:1.000:. ./.:4:77,28:.:-0.23:1.000:. ./.:4:85,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,43:.: 2.44:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:87,30:.: 0.07:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:92,23:.: 0.02:1.000:. ./.:4:80,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:121,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,29:.:-0.98:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,24:.:-0.66:1.000:. ./.:4:109,39:.: 0.84:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.91:1.000:. ./.:4:93,20:.:-0.03:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.66:1.000:. ./.:5:105,0:.:-0.23:0.982:. ./.:4:96,22:.: 0.09:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:206,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:110,37:.: 0.81:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:79,20:.:-0.38:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,24:.:-0.46:1.000:. ./.:4:49,18:.:-1.18:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:162,41:.: 2.21:1.000:. ./.:3:114,31:.: 0.76:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:195,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:80,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:109,36:.: 0.76:1.000:. ./.:4:136,42:.: 1.59:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:130,45:.: 1.51:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:107,37:.: 0.74:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.61:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,40:.:-0.18:0.999:. ./.:4:116,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:73,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:45,14:.:-1.38:1.000:. ./.:4:123,37:.: 1.14:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:91,39:.: 0.39:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,29:.: 0.27:1.000:. -chr5.1 26818895 chr5.1_026818895 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:103,31:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:94,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:132,30:.: 0.81:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:139,23:.: 0.81:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:102,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:51,7:.:-2.17:1.000:. ./.:4:106,37:.: 0.27:1.000:. ./.:4:120,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:118,24:.: 0.24:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.10:0.944:. ./.:4:143,18:.: 0.79:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:129,23:.: 0.53:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:149,31:.: 1.33:1.000:. ./.:4:138,27:.: 0.90:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:166,28:.: 1.73:1.000:. ./.:4:89,18:.:-0.77:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:184,24:.: 2.13:1.000:. ./.:4:113,27:.: 0.18:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:60,4:.:-2.00:1.000:. ./.:4:87,18:.:-0.82:1.000:. ./.:3:40,6:.:-2.52:1.000:. ./.:4:130,27:.: 0.67:1.000:. ./.:4:126,32:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:131,17:.: 0.41:1.000:. ./.:4:101,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:160,31:.: 1.65:1.000:. ./.:4:137,31:.: 0.99:1.000:. ./.:4:143,28:.: 1.07:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:121,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:150,15:.: 0.90:1.000:. ./.:4:121,22:.: 0.27:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:119,19:.: 0.12:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.01:1.000:. ./.:6:106,12:.:-0.45:1.000:. ./.:4:116,28:.: 0.30:1.000:. ./.:4:148,24:.: 1.10:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:120,29:.: 0.44:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,21:.:-0.45:1.000:. ./.:4:100,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.16:0.996:. ./.:4:61,19:.:-1.54:1.000:. ./.:4:153,29:.: 1.39:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:189,37:.: 2.65:1.000:. ./.:4:120,26:.: 0.35:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:138,22:.: 0.76:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:112,15:.:-0.19:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:134,31:.: 0.90:1.000:. ./.:4:85,13:.:-1.02:1.000:. ./.:4:145,24:.: 1.01:1.000:. ./.:4:157,31:.: 1.56:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:132,28:.: 0.76:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:106,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,23:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:106,30:.: 0.07:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:167,36:.: 1.99:1.000:. ./.:4:144,40:.: 1.45:1.000:. ./.:4:96,18:.:-0.56:1.000:. ./.:4:167,45:.: 2.25:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:112,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:75,17:.:-1.20:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:108,24:.:-0.05:1.000:. ./.:4:159,25:.: 1.45:1.000:. ./.:4:100,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:109,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:143,23:.: 0.93:1.000:. ./.:4:146,30:.: 1.22:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:144,29:.: 1.13:0.999:. ./.:4:137,38:.: 1.19:1.000:. ./.:4:52,3:.:-2.26:1.000:. ./.:4:94,21:.:-0.54:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:129,27:.: 0.64:1.000:. ./.:4:150,24:.: 1.16:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:142,22:.: 0.87:1.000:. ./.:4:146,30:.: 1.22:1.000:. ./.:4:116,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:124,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:126,25:.: 0.50:1.000:. ./.:4:117,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,31:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:142,23:.: 0.90:1.000:. ./.:4:159,15:.: 1.16:1.000:. ./.:5:81,0:.:-1.51:0.982:. ./.:4:104,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:118,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:112,26:.: 0.12:1.000:. ./.:4:139,19:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,18:.:-0.56:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:104,25:.:-0.13:1.000:. ./.:4:116,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:185,29:.: 2.31:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.64:1.000:. ./.:3:111,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,24:.:-0.42:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:118,21:.: 0.15:1.000:. ./.:4:145,28:.: 1.13:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:95,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:156,38:.: 1.73:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:147,26:.: 1.13:1.000:. ./.:4:126,22:.: 0.41:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:99,13:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:59,17:.:-1.66:1.000:. ./.:4:154,22:.: 1.22:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:117,34:.: 0.50:0.999:. ./.:4:143,22:.: 0.90:1.000:. ./.:4:89,20:.:-0.71:1.000:. ./.:4:106,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:115,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:100,29:.:-0.13:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:95,15:.:-0.68:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:167,34:.: 1.93:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:100,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:140,30:.: 1.04:1.000:. ./.:4:157,24:.: 1.36:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:113,18:.:-0.08:1.000:. ./.:4:100,29:.:-0.13:1.000:. -chr5.1 26988440 chr5.1_026988440 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:159,159:.: 0.89:1.000:. ./.:4:36,129:.:-1.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:83,111:.:-0.81:1.000:. ./.:4:121,158:.: 0.36:1.000:. ./.:4:58,113:.:-1.12:1.000:. ./.:4:50,75:.:-1.75:1.000:. ./.:4:70,147:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,138:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,62:.:-2.36:1.000:. ./.:4:59,97:.:-1.32:1.000:. ./.:4:37,111:.:-1.43:1.000:. ./.:4:56,115:.:-1.12:1.000:. ./.:4:77,152:.:-0.33:1.000:. ./.:4:100,135:.:-0.25:1.000:. ./.:4:95,123:.:-0.48:1.000:. ./.:4:101,186:.: 0.46:0.944:. ./.:4:85,133:.:-0.48:1.000:. ./.:4:140,182:.: 0.94:1.000:. ./.:4:101,143:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,81:.:-1.27:1.000:. ./.:4:140,133:.: 0.27:1.000:. ./.:4:55,148:.:-0.68:1.000:. ./.:4:88,111:.:-0.74:1.000:. ./.:4:92,78:.:-1.13:1.000:. ./.:4:81,163:.:-0.12:1.000:. ./.:4:63,94:.:-1.31:1.000:. ./.:4:79,133:.:-0.56:1.000:. ./.:4:83,142:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,107:.:-1.82:1.000:. ./.:4:68,153:.:-0.44:1.000:. ./.:4:56,108:.:-1.22:1.000:. ./.:4:43,84:.:-1.72:1.000:. ./.:4:53,102:.:-1.34:1.000:. ./.:3:17,37:.:-2.72:1.000:. ./.:4:100,125:.:-0.38:1.000:. ./.:4:38,127:.:-1.20:1.000:. ./.:4:131,125:.: 0.04:1.000:. ./.:4:212,194:.: 2.09:1.000:. ./.:4:167,141:.: 0.75:1.000:. ./.:4:81,186:.: 0.19:1.000:. ./.:4:123,177:.: 0.64:1.000:. ./.:4:176,237:.: 2.19:1.000:. ./.:4:174,170:.: 1.24:1.000:. ./.:4:86,216:.: 0.67:1.000:. ./.:4:182,203:.: 1.80:1.000:. ./.:4:101,139:.:-0.18:1.000:. ./.:4:123,157:.: 0.37:1.000:. ./.:4:102,173:.: 0.30:1.000:. ./.:4:156,284:.: 2.55:1.000:. ./.:4:151,178:.: 1.04:1.000:. ./.:4:197,195:.: 1.90:1.000:. ./.:4:93,165:.: 0.07:1.000:. ./.:4:131,202:.: 1.09:1.000:. ./.:4:70,124:.:-0.81:1.000:. ./.:4:110,203:.: 0.82:1.000:. ./.:4:62,181:.:-0.14:1.000:. ./.:4:146,223:.: 1.58:1.000:. ./.:4:70,177:.:-0.08:1.000:. ./.:6:84,172:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,186:.: 0.12:1.000:. ./.:4:106,156:.: 0.12:1.000:. ./.:4:156,221:.: 1.69:1.000:. ./.:4:134,216:.: 1.33:1.000:. ./.:4:141,171:.: 0.81:1.000:. ./.:4:107,166:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,107:.:-1.35:1.000:. ./.:4:111,159:.: 0.23:1.000:. ./.:4:110,195:.: 0.71:0.996:. ./.:4:77,148:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,205:.: 0.49:1.000:. ./.:4:117,105:.:-0.42:1.000:. ./.:4:79,260:.: 1.17:1.000:. ./.:4:54,133:.:-0.90:1.000:. ./.:4:168,181:.: 1.31:1.000:. ./.:4:102,142:.:-0.12:1.000:. ./.:4:223,198:.: 2.29:1.000:. ./.:4:158,196:.: 1.38:1.000:. ./.:4:208,181:.: 1.86:1.000:. ./.:4:11,193:.:-0.67:1.000:. ./.:4:78,146:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,174:.: 0.92:1.000:. ./.:4:62,204:.: 0.18:1.000:. ./.:4:129,129:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,207:.: 0.64:1.000:. ./.:4:139,224:.: 1.50:1.000:. ./.:4:113,130:.:-0.14:1.000:. ./.:4:96,156:.:-0.01:1.000:. ./.:4:160,168:.: 1.02:1.000:. ./.:4:134,182:.: 0.86:1.000:. ./.:4:84,133:.:-0.49:1.000:. ./.:4:82,172:.: 0.01:1.000:. ./.:4:9,203:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,118:.:-0.86:1.000:. ./.:4:134,207:.: 1.20:1.000:. ./.:4:188,180:.: 1.57:1.000:. ./.:4:97,184:.: 0.38:1.000:. ./.:4:194,177:.: 1.61:1.000:. ./.:4:181,209:.: 1.87:1.000:. ./.:4:103,185:.: 0.48:1.000:. ./.:4:80,127:.:-0.63:1.000:. ./.:4:130,199:.: 1.04:1.000:. ./.:4:80,126:.:-0.64:1.000:. ./.:4:134,241:.: 1.67:1.000:. ./.:4:105,163:.: 0.21:1.000:. ./.:4:84,181:.: 0.16:1.000:. ./.:4:85,133:.:-0.48:1.000:. ./.:4:70,132:.:-0.70:1.000:. ./.:4:172,193:.: 1.53:1.000:. ./.:4:141,175:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,160:.: 0.15:1.000:. ./.:4:107,158:.: 0.16:1.000:. ./.:4:151,182:.: 1.09:0.999:. ./.:4:17,224:.:-0.16:1.000:. ./.:4:112,154:.: 0.18:1.000:. ./.:4:193,219:.: 2.17:1.000:. ./.:4:91,149:.:-0.18:1.000:. ./.:4:111,184:.: 0.57:1.000:. ./.:4:113,162:.: 0.30:1.000:. ./.:4:65,147:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,183:.: 0.46:1.000:. ./.:4:112,163:.: 0.30:1.000:. ./.:4:20,164:.:-0.94:1.000:. ./.:4:57,87:.:-1.49:1.000:. ./.:4:67,161:.:-0.34:1.000:. ./.:4:116,189:.: 0.71:1.000:. ./.:4:139,172:.: 0.79:1.000:. ./.:4:168,167:.: 1.12:1.000:. ./.:4:139,139:.: 0.34:1.000:. ./.:4:111,139:.:-0.04:1.000:. ./.:4:58,163:.:-0.44:1.000:. ./.:4:41,126:.:-1.17:1.000:. ./.:5:138,140:.: 0.34:0.982:. ./.:4:112,163:.: 0.30:1.000:. ./.:4:163,154:.: 0.87:1.000:. ./.:4:144,204:.: 1.30:1.000:. ./.:4:92,202:.: 0.56:1.000:. ./.:4:128,138:.: 0.18:1.000:. ./.:4:102,142:.:-0.12:1.000:. ./.:4:123,188:.: 0.79:1.000:. ./.:4:123,194:.: 0.87:1.000:. ./.:4:99,195:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,124:.:-1.56:1.000:. ./.:4:84,116:.:-0.72:1.000:. ./.:4:128,181:.: 0.77:1.000:. ./.:4:121,188:.: 0.77:1.000:. ./.:3:57,143:.:-0.72:1.000:. ./.:4:146,155:.: 0.66:1.000:. ./.:4:154,171:.: 0.98:1.000:. ./.:4:49,173:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,156:.:-0.53:1.000:. ./.:4:39,99:.:-1.57:1.000:. ./.:4:77,70:.:-1.45:1.000:. ./.:4:66,63:.:-1.69:1.000:. ./.:4:117,189:.: 0.72:1.000:. ./.:4:66,142:.:-0.61:1.000:. ./.:4:126,163:.: 0.49:1.000:. ./.:4:45,126:.:-1.12:1.000:. ./.:4:41,116:.:-1.31:1.000:. ./.:4:129,155:.: 0.42:1.000:. ./.:4:60,97:.:-1.31:1.000:. ./.:4:31,131:.:-1.24:1.000:. ./.:4:55,140:.:-0.79:1.000:. ./.:4:167,123:.: 0.51:1.000:. ./.:4:49,145:.:-0.81:1.000:. ./.:4:55,128:.:-0.96:1.000:. ./.:4:108,98:.:-0.64:1.000:. ./.:4:56,128:.:-0.94:0.999:. ./.:4:45,115:.:-1.27:1.000:. ./.:4:42,109:.:-1.39:1.000:. ./.:4:73,93:.:-1.19:1.000:. ./.:4:29,108:.:-1.58:1.000:. ./.:4:127,153:.: 0.37:1.000:. ./.:4:98,163:.: 0.11:1.000:. ./.:4:151,155:.: 0.72:1.000:. ./.:4:49,100:.:-1.42:1.000:. ./.:4:98,111:.:-0.60:1.000:. ./.:4:132,174:.: 0.72:1.000:. ./.:4:97,137:.:-0.26:1.000:. ./.:4:66,123:.:-0.87:1.000:. ./.:4:92,144:.:-0.23:1.000:. ./.:4:85,151:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,143:.:-0.16:1.000:. ./.:4:46,112:.:-1.30:1.000:. ./.:4:87,149:.:-0.23:1.000:. -chr5.1 27192263 chr5.1_027192263 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:259,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.43:0.944:. ./.:4:165,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.12:1.000:. ./.:3:22,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.99:1.000:. ./.:6:117,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:0.996:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:256,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.27:0.999:. ./.:4:95,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.98:1.000:. ./.:5:139,0:.: 0.18:0.982:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.20:1.000:. ./.:3:68,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:167,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:263,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:260,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.42:1.000:. -chr5.1 27258702 chr5.1_027258702 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:251,64:.: 1.07:1.000:. ./.:4:171,49:.:-0.28:1.000:. ./.:4:192,99:.: 0.73:1.000:. ./.:4:140,143:.: 0.62:1.000:. ./.:4:381,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:258,62:.: 1.14:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:142,57:.:-0.57:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:55,15:.:-2.40:1.000:. ./.:4:199,61:.: 0.29:1.000:. ./.:4:171,109:.: 0.58:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:178,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:226,108:.: 1.34:1.000:. ./.:4:191,66:.: 0.25:0.944:. ./.:4:239,65:.: 0.92:1.000:. ./.:4:268,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:140,148:.: 0.69:1.000:. ./.:4:31,68:.:-1.99:1.000:. ./.:4:227,110:.: 1.38:1.000:. ./.:4:284,69:.: 1.61:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:73,27:.:-1.98:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:206,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:243,119:.: 1.74:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:181,48:.:-0.15:1.000:. ./.:4:195,85:.: 0.58:1.000:. ./.:4:152,75:.:-0.18:1.000:. ./.:4:51,20:.:-2.39:1.000:. ./.:4:139,79:.:-0.30:1.000:. ./.:3:16,12:.:-3.00:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,41:.:-0.82:1.000:. ./.:4:314,51:.: 1.78:1.000:. ./.:4:136,87:.:-0.23:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:236,37:.: 0.48:1.000:. ./.:4:162,74:.:-0.05:1.000:. ./.:4:152,104:.: 0.23:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:204,52:.: 0.23:1.000:. ./.:4:240,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:349,83:.: 2.73:1.000:. ./.:4:43,20:.:-2.50:1.000:. ./.:4:114,34:.:-1.30:1.000:. ./.:4:75,49:.:-1.64:1.000:. ./.:4:149,55:.:-0.50:1.000:. ./.:4:157,119:.: 0.52:1.000:. ./.:4:202,56:.: 0.26:1.000:. ./.:4:195,116:.: 1.01:1.000:. ./.:4:219,48:.: 0.39:1.000:. ./.:4:170,2:.:-0.96:1.000:. ./.:4:120,114:.:-0.08:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:170,36:.:-0.47:1.000:. ./.:6:165,67:.:-0.11:1.000:. ./.:4:260,38:.: 0.83:1.000:. ./.:4:165,47:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,84:.:-0.21:1.000:. ./.:4:138,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:100,104:.:-0.50:1.000:. ./.:4:120,53:.:-0.94:1.000:. ./.:4:117,45:.:-1.10:1.000:. ./.:4:137,112:.: 0.14:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.67:0.996:. ./.:4:238,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:161,108:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,40:.:-0.94:1.000:. ./.:4:117,33:.:-1.27:1.000:. ./.:4:200,62:.: 0.32:1.000:. ./.:4:127,44:.:-0.97:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:128,40:.:-1.01:1.000:. ./.:4:156,115:.: 0.45:1.000:. ./.:4:145,113:.: 0.26:1.000:. ./.:4:189,62:.: 0.16:1.000:. ./.:4:59,87:.:-1.33:1.000:. ./.:4:155,45:.:-0.56:1.000:. ./.:4:169,55:.:-0.22:1.000:. ./.:4:148,95:.: 0.05:1.000:. ./.:4:153,33:.:-0.76:1.000:. ./.:4:177,120:.: 0.82:1.000:. ./.:4:115,32:.:-1.31:1.000:. ./.:4:159,43:.:-0.53:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:162,50:.:-0.39:1.000:. ./.:4:121,97:.:-0.30:1.000:. ./.:4:200,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:198,65:.: 0.33:1.000:. ./.:4:187,49:.:-0.05:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:153,32:.:-0.77:1.000:. ./.:4:103,41:.:-1.35:1.000:. ./.:4:142,72:.:-0.36:1.000:. ./.:4:227,60:.: 0.67:1.000:. ./.:4:222,67:.: 0.70:1.000:. ./.:4:148,40:.:-0.73:1.000:. ./.:4:134,117:.: 0.16:1.000:. ./.:4:154,72:.:-0.19:1.000:. ./.:4:232,64:.: 0.80:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:175,27:.:-0.53:1.000:. ./.:4:126,37:.:-1.08:1.000:. ./.:4:243,73:.: 1.09:1.000:. ./.:4:372,73:.: 2.92:1.000:. ./.:4:283,56:.: 1.41:1.000:. ./.:4:153,89:.: 0.04:1.000:. ./.:4:345,81:.: 2.65:1.000:. ./.:4:183,110:.: 0.76:0.999:. ./.:4:201,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:70,72:.:-1.38:1.000:. ./.:4:151,68:.:-0.29:1.000:. ./.:4:229,38:.: 0.39:1.000:. ./.:4:126,36:.:-1.10:1.000:. ./.:4:172,29:.:-0.55:1.000:. ./.:4:167,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:169,57:.:-0.19:1.000:. ./.:4:150,53:.:-0.52:1.000:. ./.:4:162,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:220,51:.: 0.45:1.000:. ./.:4:167,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:158,49:.:-0.46:1.000:. ./.:4:120,64:.:-0.79:1.000:. ./.:4:127,63:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,36:.:-1.28:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:272,63:.: 1.36:1.000:. ./.:5:145,36:.:-0.83:0.982:. ./.:4:214,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:169,103:.: 0.46:1.000:. ./.:4:328,2:.: 1.28:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:223,63:.: 0.66:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:110,46:.:-1.18:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:189,47:.:-0.05:1.000:. ./.:4:140,48:.:-0.73:1.000:. ./.:4:138,133:.: 0.45:1.000:. ./.:4:291,69:.: 1.71:1.000:. ./.:3:146,69:.:-0.35:1.000:. ./.:4:222,64:.: 0.66:1.000:. ./.:4:178,60:.:-0.02:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:293,74:.: 1.81:1.000:. ./.:4:238,67:.: 0.93:1.000:. ./.:4:68,78:.:-1.33:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:238,64:.: 0.89:1.000:. ./.:4:251,61:.: 1.03:1.000:. ./.:4:245,155:.: 2.28:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:181,80:.: 0.31:1.000:. ./.:4:198,118:.: 1.09:1.000:. ./.:4:115,111:.:-0.19:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:136,109:.: 0.08:1.000:. ./.:4:195,99:.: 0.77:1.000:. ./.:4:240,51:.: 0.73:1.000:. ./.:4:270,50:.: 1.14:1.000:. ./.:4:179,84:.: 0.33:1.000:. ./.:4:246,54:.: 0.86:0.999:. ./.:4:172,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:208,112:.: 1.14:1.000:. ./.:4:167,89:.: 0.23:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:171,112:.: 0.62:1.000:. ./.:4:146,113:.: 0.28:1.000:. ./.:4:108,76:.:-0.79:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:178,105:.: 0.62:1.000:. ./.:4:235,61:.: 0.80:1.000:. ./.:4:202,44:.: 0.09:1.000:. ./.:4:137,87:.:-0.22:1.000:. ./.:4:147,134:.: 0.59:1.000:. ./.:4:329,3:.: 1.31:1.000:. ./.:4:335,82:.: 2.52:1.000:. ./.:4:204,54:.: 0.26:1.000:. ./.:4:221,74:.: 0.79:1.000:. -chr5.1 27409582 chr5.1_027409582 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:200,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:202,58:.: 0.32:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:150,39:.:-1.10:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:184,44:.:-0.32:1.000:. ./.:4:122,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:82,17:.:-2.89:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:178,61:.:-0.10:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.00:0.944:. ./.:4:198,46:.: 0.00:1.000:. ./.:4:293,77:.: 2.52:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:139,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:177,55:.:-0.24:1.000:. ./.:4:60,7:.:-3.53:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:181,53:.:-0.20:1.000:. ./.:4:205,56:.: 0.34:1.000:. ./.:4:225,74:.: 1.10:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:314,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:55,3:.:-3.71:1.000:. ./.:4:110,18:.:-2.31:1.000:. ./.:3:39,9:.:-3.91:0.999:. ./.:4:200,74:.: 0.60:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:175,69:.: 0.00:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:229,80:.: 1.30:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:175,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:195,50:.: 0.02:1.000:. ./.:4:223,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:204,55:.: 0.30:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:165,44:.:-0.70:1.000:. ./.:4:217,71:.: 0.88:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:200,64:.: 0.40:1.000:. ./.:4:197,56:.: 0.18:1.000:. ./.:4:222,54:.: 0.64:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:200,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.40:1.000:. ./.:6:226,15:.:-0.06:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:277,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:196,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:198,52:.: 0.12:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.52:0.996:. ./.:4:182,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:175,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:185,56:.:-0.06:1.000:. ./.:4:162,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:185,74:.: 0.30:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:194,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:236,73:.: 1.30:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:153,41:.:-1.00:1.000:. ./.:4:150,35:.:-1.18:1.000:. ./.:4:190,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:176,45:.:-0.46:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:228,60:.: 0.88:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:192,51:.:-0.02:1.000:. ./.:4:220,58:.: 0.68:1.000:. ./.:4:138,45:.:-1.22:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:172,34:.:-0.76:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:229,98:.: 1.66:1.000:. ./.:4:196,54:.: 0.12:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:352,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:187,51:.:-0.12:0.999:. ./.:4:297,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:198,58:.: 0.24:1.000:. ./.:4:174,40:.:-0.60:1.000:. ./.:4:183,50:.:-0.22:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:156,38:.:-1.00:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:204,62:.: 0.44:1.000:. ./.:4:189,44:.:-0.22:1.000:. ./.:4:179,53:.:-0.24:1.000:. ./.:4:206,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:146,47:.:-1.02:1.000:. ./.:4:118,40:.:-1.71:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.06:1.000:. ./.:5:168,34:.:-0.84:0.982:. ./.:4:268,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:235,85:.: 1.52:1.000:. ./.:4:208,52:.: 0.32:1.000:. ./.:4:174,39:.:-0.62:1.000:. ./.:4:167,42:.:-0.70:1.000:. ./.:4:162,45:.:-0.74:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:187,51:.:-0.12:1.000:. ./.:4:228,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:137,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:231,74:.: 1.22:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.24:1.000:. ./.:3:155,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:204,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:188,54:.:-0.04:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:127,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:186,52:.:-0.12:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:204,74:.: 0.68:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:210,48:.: 0.28:1.000:. ./.:4:190,62:.: 0.16:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:185,61:.: 0.04:1.000:. ./.:4:211,84:.: 1.02:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:148,50:.:-0.92:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:196,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:167,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:159,45:.:-0.80:1.000:. ./.:4:129,32:.:-1.66:1.000:. ./.:4:152,43:.:-0.98:1.000:. ./.:4:252,64:.: 1.44:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:181,39:.:-0.48:1.000:. ./.:4:314,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:323,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.18:1.000:. -chr5.1 27581922 chr5.1_027581922 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:50,51:0.46: 0.82:1.000:0.984 0/0/0/1:4:55,15:0.19:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,27:0.28:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,27:0.27: 0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,24:0.22: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,21:0.20: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,16:0.23:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,27:0.26: 0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,44:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/0:4:50,1:0.02:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,16:0.20:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,27:0.31:-0.40:1.000:0.975 0/0/0/1:4:56,19:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,29:0.33:-0.40:1.000:0.909 0/0/1/1:4:35,42:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,31:0.34:-0.19:1.000:0.878 0/0/0/1:4:56,23:0.26:-0.34:0.944:0.999 0/0/0/1:4:42,19:0.28:-1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,20:0.22:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,36:0.28: 1.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,59:0.54: 0.77:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,37:0.52:-1.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,28:0.31:-0.29:1.000:0.969 0/0/0/1:4:66,19:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,17:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,19:0.30:-1.57:1.000:0.982 0/0/0/1:4:77,31:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,19:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,25:0.21: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,28:0.36:-0.88:1.000:0.641 0/0/1/1:4:21,32:0.55:-1.73:1.000:0.979 0/0/0/1:4:54,19:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/1:3:24,8:0.22:-2.84:0.999:1.000 0/0/0/1:4:64,18:0.19:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,16:0.17:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,38:0.55:-1.19:1.000:0.980 0/0/0/1:4:44,19:0.27:-1.19:1.000:0.998 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,27:0.38:-1.14:1.000:0.553 0/0/0/1:4:44,24:0.32:-0.93:1.000:0.964 0/0/0/1:4:59,17:0.20:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,27:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,34:0.27: 1.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:153,57:0.24: 6.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,12:0.19:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,60:0.62: 0.19:1.000:0.541 0/0/0/1:4:70,18:0.18: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,57:0.52: 0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,30:0.28: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,28:0.27: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,29:0.30: 0.03:1.000:0.984 0/0/0/1:4:62,19:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,19:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,20:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,26:0.33:-0.82:1.000:0.910 0/0/0/0/1/1:6:58,38:0.35: 0.56:1.000:0.888 0/0/0/1:4:85,24:0.20: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,23:0.27:-0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,19:0.17: 0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,21:0.31:-1.30:1.000:0.977 0/0/0/1:4:75,26:0.23: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,24:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,34:0.25: 1.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,23:0.26:-0.34:0.996:0.999 0/0/1/1:4:38,35:0.43:-0.66:1.000:0.951 0/0/0/1:4:71,32:0.28: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,51:0.55:-0.08:1.000:0.975 0/0/0/1:4:62,19:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,17:0.18:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,66:0.74:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,40:0.46:-0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:65,30:0.28: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:58,77:0.52: 2.63:1.000:0.995 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,53:0.52: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,22:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,45:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,48:0.46: 0.51:1.000:0.984 0/0/0/1:4:50,19:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,23:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,28:0.22: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,30:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,51:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,15:0.19:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,14:0.20:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,29:0.28: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,42:0.42: 0.24:1.000:0.914 0/0/0/1:4:70,16:0.17: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,62:0.67: 0.03:1.000:0.920 0/0/0/1:4:75,28:0.24: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,34:0.25: 1.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,16:0.17: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,31:0.27: 0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,28:0.29:-0.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:77,31:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,15:0.22:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,27:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,20:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,39:0.29: 1.83:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,24:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,29:0.25: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,27:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,27:0.24: 0.72:0.999:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,25:0.36:-1.19:1.000:0.736 0/0/0/1:4:73,24:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,17:0.25:-1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,19:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,36:0.34: 0.45:1.000:0.849 0/0/0/1:4:68,27:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,18:0.19:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,26:0.29:-0.24:1.000:0.994 0/0/0/0:4:90,1:0.01: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,29:0.23: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,24:0.19: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,64:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,32:0.44:-1.09:1.000:0.972 0/0/0/1:4:65,22:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,18:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:47,39:0.41: 0.03:0.982:0.968 0/0/0/1:4:62,22:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,53:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,32:0.29: 0.77:1.000:0.994 0/0/0/0:4:88,1:0.01: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,29:0.29: 0.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,26:0.25: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,28:0.28: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,27:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,26:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,24:0.31:-0.82:1.000:0.979 0/0/0/1:4:69,22:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,32:0.24: 1.67:1.000:1.000 0/0/0:3:52,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,24:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,46:0.42: 0.72:1.000:0.906 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,20:0.28:-1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,46:0.46: 0.29:1.000:0.985 0/0/0/1:4:67,19:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,21:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,27:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,61:0.52: 1.14:1.000:0.995 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,28:0.32:-0.40:1.000:0.951 0/0/1/1:4:38,54:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:46,20:0.27:-1.04:1.000:0.998 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,22:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,42:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,25:0.31:-0.66:1.000:0.979 0/0/1/1:4:28,34:0.50:-1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,25:0.26:-0.08:0.999:0.998 0/0/0/1:4:69,27:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,28:0.37:-0.93:1.000:0.570 0/0/0/1:4:44,28:0.35:-0.72:1.000:0.806 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,65:0.55: 1.14:1.000:0.975 0/0/0/1:4:56,19:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,47:0.57:-0.56:1.000:0.935 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,27:0.32:-0.50:1.000:0.960 0/0/0/1:4:80,24:0.20: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,45:0.43: 0.51:1.000:0.936 0/0/0/1:4:49,20:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,26:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,30:0.23: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,65:0.47: 2.05:1.000:0.993 0/0/0/1:4:55,22:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,46:0.45: 0.35:1.000:0.980 -chr5.1 27869020 chr5.1_027869020 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.32:-0.90:1.000:0.951 0/1/1/1:4:10,25:0.70: 0.86:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,28:0.74: 1.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,23:0.65: 0.86:1.000:0.785 0/0/1/1:4:16,10:0.42:-0.19:1.000:0.903 0/0/1/1:4:10,5:0.38:-1.48:1.000:0.579 0/0/1/1:4:12,15:0.55:-0.08:1.000:0.977 0/1/1/1:4:11,20:0.64: 0.39:1.000:0.663 0/0/0/1:4:11,3:0.30:-1.60:1.000:0.989 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-2.42:1.000:0.821 0/0/0/1:4:22,3:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.48:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,9:0.41:-0.43:1.000:0.867 0/1/1/1:4:8,26:0.75: 0.74:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,26:0.92: 0.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,34:0.82: 1.57:0.944:0.999 0/0/1/1:4:17,14:0.47: 0.39:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,22:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,32:0.75: 1.68:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-0.19:1.000:0.697 1/1/1/1:4:1,19:0.95:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-2.42:1.000:0.821 0/0/1/1:4:13,18:0.58: 0.39:1.000:0.927 0/0/1/1:4:10,14:0.58:-0.43:1.000:0.918 0/1/1/1:4:8,17:0.67:-0.31:1.000:0.924 0/0/1/1:4:19,20:0.51: 1.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,6:0.28: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:19,24:0.56: 1.80:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,30:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.87:-2.31:1.000:0.926 0/0/1/1:4:10,5:0.38:-1.48:1.000:0.579 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:9,13:0.59:-0.66:1.000:0.885 0/1/1/1:4:9,19:0.67: 0.04:1.000:0.919 0/0/1/1:4:12,14:0.54:-0.19:1.000:0.989 0/1/1/1:4:8,29:0.77: 1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,30:0.74: 1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,6:0.38:-1.13:1.000:0.579 0/1/1/1:4:4,27:0.86: 0.39:1.000:0.952 0/1/1/1:4:7,26:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-0.19:1.000:0.697 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,26:0.86: 0.27:1.000:0.970 0/1/1/1:4:4,25:0.85: 0.16:1.000:0.981 0/0/0/1:4:10,4:0.35:-1.60:1.000:0.821 0/1/1/1:4:8,20:0.70: 0.04:1.000:0.988 0/0/1/1:4:7,11:0.61:-1.13:1.000:0.740 0/1/1/1:4:8,18:0.68:-0.19:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,9:0.40:-0.31:1.000:0.789 0/1/1/1:4:9,24:0.72: 0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:3,14:0.81:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,22:0.49: 2.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,16:0.55: 0.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:17,13:0.45: 0.27:1.000:0.982 0/0/1/1:4:20,24:0.54: 1.92:1.000:0.986 0/0/1/1/1/1:6:16,28:0.63: 1.92:1.000:0.831 0/0/1/1:4:16,19:0.54: 0.86:1.000:0.987 0/1/1/1:4:3,16:0.83:-1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,41:0.87: 2.27:1.000:0.945 0/0/1/1:4:19,21:0.52: 1.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:9,22:0.70: 0.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:21,16:0.45: 1.10:1.000:0.981 0/1/1/1:4:6,19:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,20:0.79:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.48:-0.78:0.996:0.995 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,19:0.48: 1.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,20:0.73:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,16:0.40: 2.03:1.000:0.760 0/0/0/1:4:17,5:0.30:-0.66:1.000:0.980 0/1/1/1:4:8,20:0.70: 0.04:1.000:0.988 0/0/1/1:4:14,15:0.52: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,18:0.71:-0.31:1.000:0.991 1/1/1/1:4:3,27:0.89: 0.27:1.000:0.653 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,6:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,10:0.55:-1.13:1.000:0.977 0/0/1/1:4:14,23:0.62: 1.10:1.000:0.627 0/0/1/1:4:19,12:0.42: 0.39:1.000:0.911 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,19:0.46: 1.80:1.000:0.987 0/1/1/1:4:4,24:0.85: 0.04:1.000:0.989 0/1/1/1:4:6,18:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,16:0.79:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,27:0.89: 0.27:1.000:0.653 0/1/1/1:4:4,18:0.81:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,22:0.87:-0.31:1.000:0.875 0/0/1/1:4:10,12:0.54:-0.66:1.000:0.986 0/0/0/1:4:34,4:0.21: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-1.37:1.000:0.948 0/1/1/1:4:7,24:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,25:0.65: 1.21:1.000:0.792 0/0/1/1:4:15,15:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,22:0.87:-0.31:1.000:0.875 0/1/1/1:4:5,22:0.80:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,18:0.56: 0.51:1.000:0.968 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-2.19:1.000:0.977 0/1/1/1:4:8,21:0.71: 0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,15:0.70:-0.78:1.000:0.988 0/1/1/1:4:6,22:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.42: 0.74:1.000:0.895 0/0/1/1:4:13,12:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,18:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,19:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,29:0.87: 0.63:1.000:0.890 0/1/1/1:4:7,14:0.66:-0.78:1.000:0.857 0/0/1/1:4:13,12:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,34:0.78: 1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.76:-1.72:0.999:1.000 0/0/0/1:4:25,6:0.28: 0.39:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,20:0.86:-0.55:1.000:0.959 0/0/1/1:4:11,15:0.57:-0.19:1.000:0.938 0/1/1/1:4:9,16:0.63:-0.31:1.000:0.601 0/0/1/1:4:14,17:0.55: 0.39:1.000:0.983 0/0/1/1:4:9,7:0.46:-1.37:1.000:0.984 0/0/1/1:4:12,10:0.47:-0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,25:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,5:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,21:0.69: 0.27:1.000:0.973 0/0/1/1:4:14,11:0.46:-0.31:1.000:0.986 0/0/0/1:4:9,4:0.36:-1.72:1.000:0.661 0/1/1/1:4:9,21:0.69: 0.27:1.000:0.973 0/1/1/1:4:8,31:0.78: 1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-0.19:1.000:0.697 0/0/1/1:4:21,13:0.42: 0.74:1.000:0.895 0/0/1/1:4:21,21:0.50: 1.68:1.000:0.997 0/1/1/1/1:5:4,24:0.85: 0.04:0.982:0.997 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,26:0.83: 0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,15:0.52: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,15:0.64:-0.55:1.000:0.738 0/0/1/1:4:10,15:0.59:-0.31:1.000:0.831 0/1/1/1:4:9,20:0.68: 0.16:1.000:0.954 0/1/1/1:4:5,13:0.71:-1.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,12:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,1:0.16:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-0.43:1.000:0.586 0/1/1/1:4:10,27:0.72: 1.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,24:0.70: 0.74:1.000:0.981 0/1/1:3:9,14:0.60:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,24:0.64: 1.10:1.000:0.702 0/1/1/1:4:5,19:0.78:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.32: 0.51:1.000:0.951 0/0/1/1:4:21,23:0.52: 1.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,12:0.45: 0.04:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,16:0.79:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,42:0.81: 2.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,21:0.54: 1.33:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,3:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,15:0.52: 0.16:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,19:0.72:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:13,5:0.34:-1.13:1.000:0.863 0/0/1/1:4:20,12:0.41: 0.51:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.57:-1.02:1.000:0.932 0/1/1/1:4:12,21:0.63: 0.63:1.000:0.556 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,9:0.36: 0.16:0.999:0.637 0/1/1/1:4:7,16:0.69:-0.55:1.000:0.966 0/0/1/1:4:16,15:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,29:0.77: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,12:0.52:-0.55:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,27:0.76: 0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.46:-1.37:1.000:0.984 0/1/1/1:4:9,31:0.76: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,16:0.66:-0.43:1.000:0.857 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,15:0.64:-0.55:1.000:0.738 0/1/1/1:4:6,24:0.79: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,21:0.59: 0.86:1.000:0.831 0/1/1/1:4:11,30:0.72: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,11:0.46:-0.31:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,8:0.48:-1.25:1.000:0.995 -chr5.1 27932046 chr5.1_027932046 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,73:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:23,64:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.14:1.000:. ./.:4:12,30:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,104:.: 1.60:1.000:. ./.:4:28,66:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.47:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.34:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,112:.: 1.94:1.000:. ./.:4:17,68:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.55:0.944:. ./.:4:0,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:27,77:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.59:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,46:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,2:.:-2.63:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.14:1.000:. ./.:4:22,71:.: 1.14:1.000:. ./.:4:21,52:.: 0.30:1.000:. ./.:4:14,72:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.59:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.68:1.000:. ./.:3:0,2:.:-2.68:0.999:. ./.:4:20,58:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.05:1.000:. ./.:4:33,77:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:40,75:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,53:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.41:1.000:. ./.:4:14,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:17,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,13:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:21,46:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,33:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,59:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.41:1.000:. ./.:4:21,44:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.04:1.000:. ./.:6:4,43:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:19,53:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,76:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,46:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.64:0.996:. ./.:4:0,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,28:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,92:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,59:.: 0.72:1.000:. ./.:4:24,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,46:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,39:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,55:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,35:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,34:.:-0.79:1.000:. ./.:4:22,38:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,64:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,78:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.45:1.000:. ./.:4:27,51:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,88:.: 2.31:1.000:. ./.:4:12,30:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.42:1.000:. ./.:4:1,42:.:-0.96:1.000:. ./.:4:22,29:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.22:1.000:. ./.:4:22,72:.: 1.18:1.000:. ./.:4:26,49:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.85:1.000:. ./.:4:17,33:.:-0.66:0.999:. ./.:4:0,59:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.33:1.000:. ./.:4:25,63:.: 0.93:1.000:. ./.:4:14,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:18,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.85:1.000:. ./.:4:22,14:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,58:.: 0.51:1.000:. ./.:4:10,26:.:-1.25:1.000:. ./.:4:14,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:20,59:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,23:.:-0.83:1.000:. ./.:4:8,24:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.33:1.000:. ./.:5:11,32:.:-0.96:0.982:. ./.:4:0,57:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,126:.: 4.03:1.000:. ./.:4:30,71:.: 1.48:1.000:. ./.:4:13,29:.:-1.00:1.000:. ./.:4:14,45:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,39:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.87:1.000:. ./.:4:12,39:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:16,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:19,49:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.37:1.000:. ./.:3:0,41:.:-1.04:1.000:. ./.:4:21,61:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,117:.: 2.15:1.000:. ./.:4:20,81:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.47:1.000:. ./.:4:21,45:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,108:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.85:1.000:. ./.:4:26,83:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:27,38:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,41:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,71:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:33,57:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1,94:.: 1.22:1.000:. ./.:4:32,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.09:0.999:. ./.:4:0,72:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:20,47:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:20,38:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,47:.:-0.03:1.000:. ./.:4:31,48:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.51:1.000:. ./.:4:26,46:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,106:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,115:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.05:1.000:. -chr5.1 28222932 chr5.1_028222932 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:426,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:309,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:355,69:.: 1.00:1.000:. ./.:4:307,51:.: 0.19:1.000:. ./.:4:165,25:.:-1.85:1.000:. ./.:4:274,40:.:-0.34:1.000:. ./.:4:266,37:.:-0.47:1.000:. ./.:4:76,37:.:-2.78:1.000:. ./.:4:75,25:.:-2.94:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:252,61:.:-0.35:1.000:. ./.:4:261,46:.:-0.42:1.000:. ./.:4:267,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.62:0.944:. ./.:4:272,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:564,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:492,2:.: 1.85:1.000:. ./.:4:127,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:296,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:62,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:293,55:.: 0.07:1.000:. ./.:4:291,55:.: 0.05:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:314,54:.: 0.32:1.000:. ./.:4:301,52:.: 0.13:1.000:. ./.:4:341,54:.: 0.64:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.78:1.000:. ./.:4:157,0:.:-2.25:1.000:. ./.:3:33,0:.:-3.75:0.999:. ./.:4:332,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:308,66:.: 0.39:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:101,31:.:-2.55:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:281,84:.: 0.28:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:245,56:.:-0.50:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:248,40:.:-0.66:1.000:. ./.:4:274,78:.: 0.12:1.000:. ./.:4:301,50:.: 0.11:1.000:. ./.:4:298,76:.: 0.39:1.000:. ./.:4:266,63:.:-0.16:1.000:. ./.:6:285,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:271,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:271,67:.:-0.05:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:303,66:.: 0.33:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:281,61:.: 0.00:0.996:. ./.:4:334,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:334,77:.: 0.84:1.000:. ./.:4:168,34:.:-1.70:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:310,47:.: 0.18:1.000:. ./.:4:355,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:268,41:.:-0.40:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:312,74:.: 0.53:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:313,61:.: 0.39:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:211,36:.:-1.15:1.000:. ./.:4:263,59:.:-0.24:1.000:. ./.:4:315,65:.: 0.46:1.000:. ./.:4:223,39:.:-0.97:1.000:. ./.:4:308,69:.: 0.42:1.000:. ./.:4:279,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:265,52:.:-0.30:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:450,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:321,57:.: 0.44:1.000:. ./.:4:185,38:.:-1.44:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:227,51:.:-0.78:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:292,61:.: 0.13:1.000:. ./.:4:237,69:.:-0.44:1.000:. ./.:4:275,62:.:-0.06:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:265,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.93:0.999:. ./.:4:286,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:310,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:241,48:.:-0.64:1.000:. ./.:4:212,59:.:-0.86:1.000:. ./.:4:230,46:.:-0.80:1.000:. ./.:4:224,57:.:-0.74:1.000:. ./.:4:270,77:.: 0.06:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:315,73:.: 0.56:1.000:. ./.:4:296,52:.: 0.07:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:197,47:.:-1.19:1.000:. ./.:4:252,61:.:-0.35:1.000:. ./.:4:287,53:.:-0.02:1.000:. ./.:5:270,44:.:-0.34:0.982:. ./.:4:268,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:536,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:231,56:.:-0.67:1.000:. ./.:4:250,51:.:-0.50:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:280,47:.:-0.18:1.000:. ./.:4:278,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:217,53:.:-0.87:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.65:1.000:. ./.:3:301,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:332,78:.: 0.83:1.000:. ./.:4:304,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:521,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:275,55:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,22:.:-3.07:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:282,61:.: 0.01:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:307,57:.: 0.27:1.000:. ./.:4:259,38:.:-0.55:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:234,45:.:-0.76:1.000:. ./.:4:269,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:270,38:.:-0.41:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:280,44:.:-0.22:1.000:. ./.:4:244,42:.:-0.68:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:200,31:.:-1.35:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:312,49:.: 0.23:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:343,52:.: 0.64:1.000:. ./.:4:326,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:218,48:.:-0.92:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.53:1.000:. -chr5.1 28304227 chr5.1_028304227 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:543,17:.: 0.37:1.000:. ./.:4:242,266:.: 0.01:1.000:. ./.:4:623,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:510,164:.: 1.16:1.000:. ./.:4:543,40:.: 0.53:1.000:. ./.:4:596,192:.: 1.95:1.000:. ./.:4:448,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:342,166:.: 0.01:1.000:. ./.:4:469,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:105,39:.:-2.51:1.000:. ./.:4:90,32:.:-2.66:1.000:. ./.:4:268,342:.: 0.72:1.000:. ./.:4:514,163:.: 1.18:1.000:. ./.:4:326,171:.:-0.06:1.000:. ./.:4:524,14:.: 0.22:1.000:. ./.:4:627,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:545,29:.: 0.47:0.944:. ./.:4:380,184:.: 0.40:1.000:. ./.:4:642,32:.: 1.16:1.000:. ./.:4:621,222:.: 2.33:1.000:. ./.:4:101,7:.:-2.76:1.000:. ./.:4:405,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:356,208:.: 0.40:1.000:. ./.:4:345,190:.: 0.20:1.000:. ./.:4:63,5:.:-3.03:1.000:. ./.:4:370,215:.: 0.55:1.000:. ./.:4:475,153:.: 0.84:1.000:. ./.:4:593,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:369,202:.: 0.45:1.000:. ./.:4:554,174:.: 1.54:1.000:. ./.:4:761,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:410,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:25,6:.:-3.29:1.000:. ./.:4:149,32:.:-2.25:1.000:. ./.:3:55,5:.:-3.09:0.999:. ./.:4:306,184:.:-0.11:1.000:. ./.:4:542,161:.: 1.36:1.000:. ./.:4:612,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:485,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:506,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:361,129:.:-0.11:1.000:. ./.:4:479,21:.:-0.04:1.000:. ./.:4:597,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:415,11:.:-0.56:1.000:. ./.:4:482,194:.: 1.18:1.000:. ./.:4:309,151:.:-0.32:1.000:. ./.:4:347,175:.: 0.11:1.000:. ./.:4:186,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:408,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:356,101:.:-0.34:1.000:. ./.:4:518,16:.: 0.19:1.000:. ./.:4:388,132:.: 0.10:1.000:. ./.:4:419,139:.: 0.36:1.000:. ./.:4:559,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:469,19:.:-0.13:1.000:. ./.:4:397,153:.: 0.30:1.000:. ./.:4:459,25:.:-0.15:1.000:. ./.:4:381,21:.:-0.72:1.000:. ./.:6:262,84:.:-1.11:1.000:. ./.:4:307,147:.:-0.36:1.000:. ./.:4:275,135:.:-0.67:1.000:. ./.:4:464,25:.:-0.12:1.000:. ./.:4:396,22:.:-0.61:1.000:. ./.:4:503,157:.: 1.07:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:397,162:.: 0.37:1.000:. ./.:4:401,130:.: 0.17:1.000:. ./.:4:475,23:.:-0.06:0.996:. ./.:4:109,174:.:-1.55:1.000:. ./.:4:537,171:.: 1.40:1.000:. ./.:4:473,17:.:-0.11:1.000:. ./.:4:514,170:.: 1.23:1.000:. ./.:4:347,187:.: 0.19:1.000:. ./.:4:141,159:.:-1.43:1.000:. ./.:4:437,110:.: 0.28:1.000:. ./.:4:380,19:.:-0.74:1.000:. ./.:4:407,120:.: 0.14:1.000:. ./.:4:397,29:.:-0.56:1.000:. ./.:4:445,150:.: 0.62:1.000:. ./.:4:346,103:.:-0.40:1.000:. ./.:4:318,172:.:-0.11:1.000:. ./.:4:450,193:.: 0.95:1.000:. ./.:4:344,24:.:-0.96:1.000:. ./.:4:450,125:.: 0.48:1.000:. ./.:4:469,12:.:-0.17:1.000:. ./.:4:251,115:.:-0.97:1.000:. ./.:4:234,119:.:-1.06:1.000:. ./.:4:253,122:.:-0.91:1.000:. ./.:4:426,126:.: 0.32:1.000:. ./.:4:404,19:.:-0.58:1.000:. ./.:4:220,128:.:-1.10:1.000:. ./.:4:415,149:.: 0.40:1.000:. ./.:4:305,110:.:-0.63:1.000:. ./.:4:297,190:.:-0.13:1.000:. ./.:4:468,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:316,108:.:-0.57:1.000:. ./.:4:243,119:.:-1.00:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:632,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:566,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:275,99:.:-0.92:1.000:. ./.:4:215,147:.:-1.00:1.000:. ./.:4:318,101:.:-0.60:1.000:. ./.:4:362,21:.:-0.85:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:503,157:.: 1.07:1.000:. ./.:4:696,191:.: 2.64:1.000:. ./.:4:410,143:.: 0.32:1.000:. ./.:4:271,143:.:-0.64:1.000:. ./.:4:591,38:.: 0.85:1.000:. ./.:4:340,136:.:-0.21:0.999:. ./.:4:482,151:.: 0.88:1.000:. ./.:4:281,80:.:-1.01:1.000:. ./.:4:454,163:.: 0.77:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:290,170:.:-0.32:1.000:. ./.:4:279,131:.:-0.67:1.000:. ./.:4:595,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:237,116:.:-1.06:1.000:. ./.:4:442,132:.: 0.47:1.000:. ./.:4:505,154:.: 1.06:1.000:. ./.:4:395,124:.: 0.09:1.000:. ./.:4:438,147:.: 0.55:1.000:. ./.:4:411,129:.: 0.23:1.000:. ./.:4:248,146:.:-0.78:1.000:. ./.:4:297,19:.:-1.32:1.000:. ./.:4:299,11:.:-1.36:1.000:. ./.:4:360,106:.:-0.28:1.000:. ./.:4:332,152:.:-0.15:1.000:. ./.:5:334,8:.:-1.14:0.982:. ./.:4:430,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:406,13:.:-0.60:1.000:. ./.:4:410,225:.: 0.89:1.000:. ./.:4:492,129:.: 0.80:1.000:. ./.:4:213,114:.:-1.24:1.000:. ./.:4:242,105:.:-1.10:1.000:. ./.:4:287,15:.:-1.41:1.000:. ./.:4:284,147:.:-0.52:1.000:. ./.:4:234,170:.:-0.71:1.000:. ./.:4:412,128:.: 0.23:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:556,195:.: 1.70:1.000:. ./.:4:696,27:.: 1.50:1.000:. ./.:3:475,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:444,115:.: 0.37:1.000:. ./.:4:590,16:.: 0.69:1.000:. ./.:4:354,115:.:-0.26:1.000:. ./.:4:544,185:.: 1.54:1.000:. ./.:4:514,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:95,3:.:-2.83:1.000:. ./.:4:268,142:.:-0.67:1.000:. ./.:4:565,13:.: 0.50:1.000:. ./.:4:388,186:.: 0.47:1.000:. ./.:4:612,43:.: 1.03:1.000:. ./.:4:570,182:.: 1.70:1.000:. ./.:4:288,136:.:-0.57:1.000:. ./.:4:558,27:.: 0.55:1.000:. ./.:4:457,141:.: 0.64:1.000:. ./.:4:370,100:.:-0.25:1.000:. ./.:4:391,153:.: 0.26:1.000:. ./.:4:526,26:.: 0.32:1.000:. ./.:4:504,153:.: 1.04:1.000:. ./.:4:478,132:.: 0.72:1.000:. ./.:4:427,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:287,297:.: 0.54:0.999:. ./.:4:292,162:.:-0.36:1.000:. ./.:4:469,160:.: 0.85:1.000:. ./.:4:428,118:.: 0.28:1.000:. ./.:4:371,100:.:-0.24:1.000:. ./.:4:446,23:.:-0.26:1.000:. ./.:4:369,131:.:-0.04:1.000:. ./.:4:428,14:.:-0.44:1.000:. ./.:4:373,135:.: 0.01:1.000:. ./.:4:833,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:354,192:.: 0.28:1.000:. ./.:4:519,25:.: 0.26:1.000:. ./.:4:540,36:.: 0.48:1.000:. ./.:4:570,175:.: 1.65:1.000:. ./.:4:482,271:.: 1.71:1.000:. ./.:4:565,28:.: 0.60:1.000:. ./.:4:424,125:.: 0.30:1.000:. ./.:4:310,190:.:-0.04:1.000:. -chr5.1 28522729 chr5.1_028522729 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:232,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:157,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:163,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:144,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.57:0.944:. ./.:4:274,0:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:336,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:300,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:186,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.01:1.000:. ./.:3:75,0:.:-1.57:0.999:. ./.:4:143,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:180,1:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:294,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:419,1:.: 2.80:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:174,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:137,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:269,0:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:173,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:221,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:359,0:.: 2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:306,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:125,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:185,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:327,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:297,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:344,1:.: 1.85:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:143,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:169,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:158,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.78:0.999:. ./.:4:273,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:162,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:304,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:131,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:126,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:289,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:317,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.38:1.000:. ./.:3:126,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:110,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:124,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:270,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:163,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:139,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:184,2:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:129,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.63:1.000:. -chr5.1 28582101 chr5.1_028582101 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:369,109:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,290:0.76:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,122:0.29: 0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:306,111:0.26: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:251,266:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:370,108:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,149:0.47:-1.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:275,114:0.29:-0.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:287,108:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,62:0.61:-3.26:1.000:0.737 0/0/1/1:4:49,68:0.57:-3.08:1.000:0.951 0/1/1/1:4:113,278:0.69:-0.22:1.000:0.979 0/0/0/1:4:257,80:0.24:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:318,111:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:282,104:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:336,117:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:315,118:0.27: 0.22:0.944:0.998 0/0/0/1:4:343,124:0.26: 0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:280,284:0.49: 1.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:407,145:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-3.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:405,1:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:331,96:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,171:0.47:-0.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,33:0.46:-3.56:1.000:0.984 0/0/0/1:4:366,103:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,254:0.52: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:194,228:0.53: 0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:244,238:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:200,216:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:333,118:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:373,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,37:0.69:-3.76:1.000:0.980 0/1/1/1:4:41,100:0.69:-2.83:1.000:0.977 0/1/1:3:6,20:0.75:-4.03:0.999:1.000 0/0/1/1:4:218,197:0.46: 0.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:222,235:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:216,220:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:491,1:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,239:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,230:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:451,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,117:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,209:0.47: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:253,260:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:227,205:0.46: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:267,240:0.46: 0.99:1.000:0.990 0/0/1/1:4:65,72:0.51:-2.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:318,104:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,116:0.27: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,185:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:388,131:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:313,81:0.20:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,261:0.46: 1.46:1.000:0.989 0/0/1/1:4:180,236:0.55: 0.04:1.000:0.975 0/0/0/1:4:354,114:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,83:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,285:0.51: 1.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:326,101:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:313,95:0.23:-0.04:1.000:0.722 0/0/0/1:4:335,96:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,99:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:351,130:0.27: 0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:230,242:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:387,118:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:227,216:0.48: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:159,150:0.48:-1.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:332,86:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,115:0.27: 0.14:0.996:0.998 0/0/1/1:4:207,194:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:390,132:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:252,106:0.29:-0.56:1.000:0.990 0/1/1/1:4:120,376:0.74: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,82:0.20:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:338,98:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,236:0.71:-0.92:1.000:0.992 0/0/0/1:4:306,111:0.26: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:383,102:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:387,123:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:265,226:0.45: 0.82:1.000:0.981 0/0/1/1:4:183,184:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:268,255:0.48: 1.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:120,363:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/0:4:358,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,197:0.46: 0.10:1.000:0.986 0/0/0/0:4:462,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,170:0.48:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:180,191:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,195:0.48:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,186:0.54:-0.78:1.000:0.988 0/0/0/0:4:329,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,215:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:215,255:0.53: 0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:220,67:0.23:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,222:0.46: 0.59:1.000:0.990 0/0/0/0:4:473,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:324,83:0.20:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,93:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:252,239:0.48: 0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:210,252:0.53: 0.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:151,165:0.51:-1.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:329,112:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,81:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:361,114:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,270:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:290,94:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,102:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:326,102:0.24: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:295,288:0.48: 1.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,184:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:344,106:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:390,164:0.29: 1.48:1.000:0.990 0/0/1/1:4:230,243:0.50: 0.64:0.999:0.997 0/0/1/1:4:231,226:0.48: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:243,96:0.28:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:262,281:0.51: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,200:0.52:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:191,196:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:338,94:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:351,109:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:327,118:0.26: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:195,188:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:235,244:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,214:0.53:-0.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:99,366:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:134,370:0.72: 0.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:238,216:0.47: 0.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:299,105:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:264,84:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,163:0.46:-0.69:1.000:0.988 0/0/1/1:4:160,171:0.51:-0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:274,129:0.32:-0.09:1.000:0.963 0/0/0/0/1:5:283,87:0.23:-0.44:0.982:0.970 0/0/0/1:4:358,138:0.28: 0.88:1.000:0.997 0/0/0/0:4:381,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,303:0.49: 1.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:116,348:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:190,205:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,166:0.49:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:210,207:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:343,131:0.27: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:200,232:0.53: 0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:185,203:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,194:0.54:-0.64:1.000:0.987 0/0/1/1:4:267,309:0.52: 1.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:399,138:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/1:3:206,87:0.29:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,223:0.48: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:524,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,277:0.70:-0.24:1.000:0.980 0/0/1/1:4:233,230:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:314,93:0.23:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-3.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,126:0.43:-1.32:1.000:0.951 0/0/0/1:4:341,131:0.27: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:359,117:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:520,3:0.01: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,362:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:302,89:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:353,128:0.26: 0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:206,198:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,184:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:291,101:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:313,106:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,309:0.74:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:308,112:0.26: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:239,95:0.28:-0.81:1.000:0.995 0/1/1/1:4:105,305:0.73:-0.02:0.999:0.997 0/0/0/1:4:297,98:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:296,85:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,68:0.23:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,245:0.76:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:381,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,185:0.48:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:266,102:0.27:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,272:0.74:-0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:237,265:0.52: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:372,125:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:404,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,224:0.58:-0.36:1.000:0.917 0/0/0/1:4:335,128:0.27: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:391,127:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:501,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,86:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:216,246:0.52: 0.52:1.000:0.995 -chr5.1 28824668 chr5.1_028824668 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:564,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:125,290:.:-0.59:1.000:. ./.:4:400,101:.: 0.40:1.000:. ./.:4:347,104:.:-0.17:1.000:. ./.:4:372,117:.: 0.26:1.000:. ./.:4:471,141:.: 1.66:1.000:. ./.:4:389,103:.: 0.29:1.000:. ./.:4:350,100:.:-0.19:1.000:. ./.:4:574,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:133,116:.:-2.48:1.000:. ./.:4:269,76:.:-1.38:1.000:. ./.:4:137,335:.: 0.07:1.000:. ./.:4:393,78:.: 0.05:1.000:. ./.:4:395,96:.: 0.28:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:441,127:.: 1.16:1.000:. ./.:4:440,148:.: 1.39:0.944:. ./.:4:381,97:.: 0.13:1.000:. ./.:4:488,156:.: 2.03:1.000:. ./.:4:486,151:.: 1.95:1.000:. ./.:4:304,2:.:-1.83:1.000:. ./.:4:455,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:397,103:.: 0.38:1.000:. ./.:4:382,123:.: 0.44:1.000:. ./.:4:169,70:.:-2.59:1.000:. ./.:4:483,113:.: 1.48:1.000:. ./.:4:383,115:.: 0.36:1.000:. ./.:4:377,113:.: 0.27:1.000:. ./.:4:413,100:.: 0.53:1.000:. ./.:4:297,230:.: 0.69:1.000:. ./.:4:521,159:.: 2.44:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:155,35:.:-3.15:1.000:. ./.:4:151,138:.:-2.02:1.000:. ./.:3:145,15:.:-3.49:0.999:. ./.:4:411,108:.: 0.60:1.000:. ./.:4:429,104:.: 0.76:1.000:. ./.:4:409,132:.: 0.85:1.000:. ./.:4:587,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:496,159:.: 2.15:1.000:. ./.:4:215,182:.:-0.79:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:372,123:.: 0.33:1.000:. ./.:4:354,108:.:-0.05:1.000:. ./.:4:217,161:.:-1.01:1.000:. ./.:4:370,95:.:-0.01:1.000:. ./.:4:382,96:.: 0.13:1.000:. ./.:4:214,72:.:-2.06:1.000:. ./.:4:355,85:.:-0.30:1.000:. ./.:4:377,106:.: 0.19:1.000:. ./.:4:309,59:.:-1.12:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:321,94:.:-0.59:1.000:. ./.:4:387,106:.: 0.30:1.000:. ./.:4:360,106:.: 0.00:1.000:. ./.:4:457,148:.: 1.58:1.000:. ./.:4:394,92:.: 0.22:1.000:. ./.:4:418,141:.: 1.06:1.000:. ./.:4:364,126:.: 0.27:1.000:. ./.:6:384,64:.:-0.21:1.000:. ./.:4:361,108:.: 0.03:1.000:. ./.:4:344,91:.:-0.36:1.000:. ./.:4:478,132:.: 1.64:1.000:. ./.:4:407,128:.: 0.78:1.000:. ./.:4:399,107:.: 0.45:1.000:. ./.:4:364,118:.: 0.18:1.000:. ./.:4:266,228:.: 0.32:1.000:. ./.:4:377,124:.: 0.40:1.000:. ./.:4:400,127:.: 0.69:0.996:. ./.:4:186,184:.:-1.10:1.000:. ./.:4:456,123:.: 1.29:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:157,428:.: 1.35:1.000:. ./.:4:395,105:.: 0.38:1.000:. ./.:4:336,99:.:-0.36:1.000:. ./.:4:236,213:.:-0.20:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:328,92:.:-0.53:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:266,241:.: 0.46:1.000:. ./.:4:237,161:.:-0.78:1.000:. ./.:4:377,115:.: 0.29:1.000:. ./.:4:265,259:.: 0.66:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:256,233:.: 0.26:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:291,74:.:-1.16:1.000:. ./.:4:298,88:.:-0.92:1.000:. ./.:4:326,105:.:-0.40:1.000:. ./.:4:322,96:.:-0.55:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:317,68:.:-0.93:1.000:. ./.:4:282,247:.: 0.72:1.000:. ./.:4:210,59:.:-2.25:1.000:. ./.:4:440,125:.: 1.13:1.000:. ./.:4:572,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:277,79:.:-1.26:1.000:. ./.:4:346,93:.:-0.31:1.000:. ./.:4:368,110:.: 0.13:1.000:. ./.:4:340,108:.:-0.21:1.000:. ./.:4:333,113:.:-0.23:1.000:. ./.:4:375,110:.: 0.21:1.000:. ./.:4:226,71:.:-1.93:1.000:. ./.:4:312,100:.:-0.62:1.000:. ./.:4:167,177:.:-1.40:1.000:. ./.:4:319,108:.:-0.45:1.000:. ./.:4:338,99:.:-0.33:1.000:. ./.:4:393,96:.: 0.26:1.000:. ./.:4:440,116:.: 1.02:1.000:. ./.:4:382,92:.: 0.09:1.000:. ./.:4:326,88:.:-0.60:1.000:. ./.:4:497,172:.: 2.31:1.000:. ./.:4:330,100:.:-0.41:0.999:. ./.:4:243,227:.: 0.04:1.000:. ./.:4:290,69:.:-1.22:1.000:. ./.:4:397,135:.: 0.75:1.000:. ./.:4:370,130:.: 0.38:1.000:. ./.:4:319,118:.:-0.33:1.000:. ./.:4:355,101:.:-0.12:1.000:. ./.:4:300,74:.:-1.05:1.000:. ./.:4:332,114:.:-0.23:1.000:. ./.:4:284,62:.:-1.37:1.000:. ./.:4:246,221:.: 0.01:1.000:. ./.:4:427,89:.: 0.57:1.000:. ./.:4:237,212:.:-0.20:1.000:. ./.:4:244,186:.:-0.41:1.000:. ./.:4:377,110:.: 0.24:1.000:. ./.:4:349,79:.:-0.44:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:304,102:.:-0.69:1.000:. ./.:4:193,178:.:-1.09:1.000:. ./.:4:399,102:.: 0.40:1.000:. ./.:5:395,0:.:-0.81:0.982:. ./.:4:316,125:.:-0.29:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:476,127:.: 1.56:1.000:. ./.:4:224,201:.:-0.47:1.000:. ./.:4:306,91:.:-0.79:1.000:. ./.:4:302,80:.:-0.96:1.000:. ./.:4:313,99:.:-0.62:1.000:. ./.:4:365,114:.: 0.15:1.000:. ./.:4:300,80:.:-0.98:1.000:. ./.:4:207,178:.:-0.93:1.000:. ./.:4:279,124:.:-0.72:1.000:. ./.:4:412,98:.: 0.50:1.000:. ./.:4:404,124:.: 0.70:1.000:. ./.:3:250,112:.:-1.19:1.000:. ./.:4:351,71:.:-0.51:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:213,194:.:-0.68:1.000:. ./.:4:286,246:.: 0.75:1.000:. ./.:4:368,123:.: 0.28:1.000:. ./.:4:293,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:299,76:.:-1.04:1.000:. ./.:4:386,135:.: 0.62:1.000:. ./.:4:371,104:.: 0.10:1.000:. ./.:4:595,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:315,288:.: 1.56:1.000:. ./.:4:305,95:.:-0.76:1.000:. ./.:4:550,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:386,102:.: 0.25:1.000:. ./.:4:210,179:.:-0.88:1.000:. ./.:4:388,80:.: 0.02:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:261,196:.:-0.11:1.000:. ./.:4:396,93:.: 0.26:1.000:. ./.:4:482,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:118,302:.:-0.53:0.999:. ./.:4:322,98:.:-0.53:1.000:. ./.:4:389,106:.: 0.33:1.000:. ./.:4:301,86:.:-0.90:1.000:. ./.:4:216,224:.:-0.30:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:301,104:.:-0.70:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:232,189:.:-0.52:1.000:. ./.:4:548,161:.: 2.77:1.000:. ./.:4:378,124:.: 0.41:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:311,144:.:-0.13:1.000:. ./.:4:403,99:.: 0.41:1.000:. ./.:4:483,113:.: 1.48:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:372,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:229,197:.:-0.46:1.000:. -chr5.1 29000806 chr5.1_029000806 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,11:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,14:0.51: 2.20:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,15:0.51: 2.48:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,11:0.52: 1.16:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.17:-1.41:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,10:0.52: 0.95:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,8:0.44: 1.09:1.000:0.972 0/0/1/1:4:39,15:0.51: 2.27:0.944:0.996 0/0/1/1:4:25,15:0.56: 1.30:1.000:0.971 0/0/1/1:4:37,18:0.54: 2.34:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,1:0.42:-1.14:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,6:0.39: 0.74:1.000:0.741 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,10:0.46: 1.57:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,7:0.43: 0.88:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.24:-0.02:1.000:1.000 1/1/1:3:0,2:1.00:-1.34:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,8:0.46: 0.95:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,8:0.41: 1.36:1.000:0.848 0/0/1/1:4:20,6:0.47: 0.32:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,8:0.48: 0.88:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,7:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,6:0.50: 0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,19:0.66: 0.74:1.000:0.850 0/0/1/1:4:26,9:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,4:0.36: 0.18:1.000:0.694 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,10:0.54: 0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,8:0.50: 0.67:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,9:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,10:0.56: 0.32:1.000:0.965 1/1/1/1/1/1:6:0,4:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,7:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:20,4:0.36: 0.18:1.000:0.694 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,5:0.38: 0.46:1.000:0.564 0/0/0/1:4:32,2:0.21: 0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,3:0.22: 1.64:0.996:1.000 0/0/1/1:4:29,13:0.53: 1.43:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,2:0.19: 3.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,11:0.54: 0.81:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,6:0.39: 0.81:1.000:0.633 0/0/1/1:4:16,6:0.51: 0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.34: 0.74:1.000:0.856 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,6:0.52:-0.09:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,3:0.26: 0.46:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,6:0.48: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:41,5:0.26: 1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,4:0.36: 0.18:1.000:0.694 0/0/1/1:4:19,5:0.43: 0.18:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,8:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,5:0.51:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,5:0.40: 0.32:1.000:0.813 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,22:0.54: 2.96:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:0.999:1.000 0/0/1/1:4:28,6:0.38: 0.88:1.000:0.517 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,5:0.42: 0.25:1.000:0.895 0/0/0/1:4:27,3:0.25: 0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,7:0.49: 0.53:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,3:0.24: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,4:0.31: 0.53:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,3:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,3:0.24: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1/1:5:0,4:1.00:-1.20:0.982:1.000 0/0/1/1:4:15,5:0.50:-0.09:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,6:0.39: 0.74:1.000:0.741 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,1:0.22:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,9:0.41: 1.71:1.000:0.854 0/0/0/1:4:20,4:0.36: 0.18:1.000:0.694 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,13:0.47: 2.41:1.000:0.992 0/0/1:3:31,5:0.31: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,10:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,16:0.50: 2.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,9:0.39: 1.85:1.000:0.741 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,8:0.46: 0.95:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,9:0.50: 1.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,11:0.53: 1.02:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,13:0.53: 1.30:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,7:0.38: 1.23:0.999:0.584 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,6:0.36: 1.02:1.000:0.694 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,14:0.53: 1.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,15:0.50: 2.55:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,13:0.51: 1.78:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,7:0.42: 0.95:1.000:0.895 -chr5.1 29182607 chr5.1_029182607 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,258:.: 0.37:1.000:. ./.:4:79,250:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,189:.:-0.90:1.000:. ./.:4:98,226:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,435:.: 1.29:1.000:. ./.:4:96,333:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,201:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,340:.: 0.14:1.000:. ./.:4:90,222:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,96:.:-2.79:1.000:. ./.:4:44,57:.:-2.73:1.000:. ./.:4:84,228:.:-0.20:1.000:. ./.:4:87,200:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,417:.: 1.06:1.000:. ./.:4:73,223:.:-0.39:1.000:. ./.:4:111,241:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,361:.: 0.39:0.944:. ./.:4:0,380:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,442:.: 1.36:1.000:. ./.:4:111,290:.: 0.87:1.000:. ./.:4:38,88:.:-2.43:1.000:. ./.:4:83,213:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,336:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,76:.:-3.03:1.000:. ./.:4:0,428:.: 1.19:1.000:. ./.:4:108,277:.: 0.68:1.000:. ./.:4:70,222:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,407:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,316:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,229:.:-0.10:1.000:. ./.:4:64,216:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,46:.:-3.39:1.000:. ./.:4:0,117:.:-2.54:1.000:. ./.:3:21,34:.:-3.28:0.999:. ./.:4:0,369:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,357:.: 0.34:1.000:. ./.:4:93,304:.: 0.82:1.000:. ./.:4:106,294:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,409:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,323:.:-0.06:1.000:. ./.:4:83,268:.: 0.27:1.000:. ./.:4:100,333:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,344:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,370:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,364:.: 0.43:1.000:. ./.:4:203,554:.: 5.14:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.63:1.000:. ./.:4:135,340:.: 1.76:1.000:. ./.:4:88,255:.: 0.18:1.000:. ./.:4:119,322:.: 1.35:1.000:. ./.:4:68,196:.:-0.77:1.000:. ./.:4:104,269:.: 0.53:1.000:. ./.:4:80,217:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,230:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,320:.:-0.10:1.000:. ./.:6:31,235:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,437:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,367:.: 0.46:1.000:. ./.:4:90,275:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,255:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,227:.:-1.19:1.000:. ./.:4:82,223:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.34:0.996:. ./.:4:0,318:.:-0.12:1.000:. ./.:4:110,323:.: 1.25:1.000:. ./.:4:108,262:.: 0.50:1.000:. ./.:4:101,317:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1,373:.: 0.55:1.000:. ./.:4:100,256:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,264:.:-0.77:1.000:. ./.:4:70,248:.:-0.12:1.000:. ./.:4:68,272:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,262:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,394:.: 0.79:1.000:. ./.:4:106,129:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,412:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,326:.:-0.03:1.000:. ./.:4:84,230:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,325:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,205:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,315:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.46:1.000:. ./.:4:70,224:.:-0.41:1.000:. ./.:4:61,216:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,368:.: 0.47:1.000:. ./.:4:76,231:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.12:1.000:. ./.:4:88,277:.: 0.44:1.000:. ./.:4:67,234:.:-0.33:1.000:. ./.:4:155,157:.:-0.20:1.000:. ./.:4:102,238:.: 0.14:1.000:. ./.:4:89,271:.: 0.38:1.000:. ./.:4:72,223:.:-0.40:1.000:. ./.:4:80,234:.:-0.17:1.000:. ./.:4:60,194:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,321:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,196:.:-0.59:1.000:. ./.:4:87,254:.: 0.15:1.000:. ./.:4:107,358:.: 1.64:1.000:. ./.:4:84,207:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,480:.: 1.83:1.000:. ./.:4:83,220:.:-0.30:0.999:. ./.:4:0,316:.:-0.15:1.000:. ./.:4:57,170:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,253:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,254:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,330:.: 0.02:1.000:. ./.:4:100,294:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,361:.: 0.40:1.000:. ./.:4:77,242:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,340:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.03:1.000:. ./.:4:83,249:.: 0.04:1.000:. ./.:4:129,135:.:-0.77:1.000:. ./.:4:71,207:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.07:1.000:. ./.:5:66,205:.:-0.69:0.982:. ./.:4:0,313:.:-0.18:1.000:. ./.:4:75,213:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,454:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,306:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,245:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,358:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,319:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,293:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,145:.:-1.38:1.000:. ./.:4:105,320:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,434:.: 1.28:1.000:. ./.:3:0,278:.:-0.60:1.000:. ./.:4:80,255:.: 0.08:1.000:. ./.:4:109,341:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1,278:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,376:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.04:1.000:. ./.:4:32,65:.:-2.78:1.000:. ./.:4:0,183:.:-1.74:1.000:. ./.:4:0,375:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,342:.: 0.16:1.000:. ./.:4:105,370:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,391:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.89:1.000:. ./.:4:88,259:.: 0.22:1.000:. ./.:4:105,262:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.28:1.000:. ./.:4:88,226:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,285:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.10:1.000:. ./.:4:102,278:.: 0.62:1.000:. ./.:4:72,221:.:-0.42:1.000:. ./.:4:85,252:.: 0.10:0.999:. ./.:4:0,320:.:-0.10:1.000:. ./.:4:65,262:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,198:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,223:.:-1.25:1.000:. ./.:4:105,247:.: 0.28:1.000:. ./.:4:82,194:.:-0.63:1.000:. ./.:4:78,234:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,233:.:-1.14:1.000:. ./.:4:125,291:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1,386:.: 0.70:1.000:. ./.:4:90,289:.: 0.61:1.000:. ./.:4:81,212:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,256:.: 0.34:1.000:. ./.:4:2,421:.: 1.13:1.000:. ./.:4:127,346:.: 1.73:1.000:. ./.:4:70,240:.:-0.22:1.000:. ./.:4:107,310:.: 1.06:1.000:. -chr5.1 29267797 chr5.1_029267797 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:157,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:127,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:125,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:158,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:99,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:109,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:58,1:.:-0.78:0.944:. ./.:4:58,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:188,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:85,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:128,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:99,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:102,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.43:1.000:. ./.:3:31,0:.:-1.43:0.999:. ./.:4:158,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:84,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:32,2:.:-1.36:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:168,2:.: 1.80:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.12:1.000:. ./.:6:54,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:61,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.85:0.996:. ./.:4:69,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:98,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:44,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:129,2:.: 0.89:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:45,2:.:-1.05:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:38,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:97,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:110,4:.: 0.50:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.05:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:166,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:223,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:49,3:.:-0.94:1.000:. ./.:4:58,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:141,1:.: 1.15:0.999:. ./.:4:50,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:89,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:162,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:193,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:83,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,1:.:-1.15:1.000:. ./.:5:123,1:.: 0.73:0.982:. ./.:4:50,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:38,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.82:1.000:. ./.:3:55,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:193,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:125,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.10:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:99,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:91,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:87,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.03:0.999:. ./.:4:38,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.27:1.000:. -chr5.1 29478588 chr5.1_029478588 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:192,12:.: 0.84:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:105,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:115,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:257,17:.: 2.06:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:204,16:.: 1.12:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:31,7:.:-2.07:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:180,19:.: 0.75:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:127,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:129,24:.:-0.06:0.944:. ./.:4:214,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:242,17:.: 1.80:1.000:. ./.:4:187,17:.: 0.84:1.000:. ./.:4:21,12:.:-2.15:1.000:. ./.:4:117,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:196,17:.: 0.99:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:131,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:291,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:301,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:120,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.31:1.000:. ./.:3:24,3:.:-2.26:0.999:. ./.:4:178,9:.: 0.54:1.000:. ./.:4:117,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:181,15:.: 0.70:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:106,18:.:-0.56:1.000:. ./.:4:96,14:.:-0.81:1.000:. ./.:4:81,16:.:-1.04:1.000:. ./.:4:103,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:103,9:.:-0.77:1.000:. ./.:4:85,19:.:-0.91:1.000:. ./.:4:133,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:62,9:.:-1.49:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:89,15:.:-0.91:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:126,37:.: 0.12:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:228,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:102,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.91:1.000:. ./.:6:102,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:94,16:.:-0.81:1.000:. ./.:4:95,18:.:-0.76:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,18:.:-0.53:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:71,16:.:-1.21:1.000:. ./.:4:114,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:132,12:.:-0.21:0.996:. ./.:4:195,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:143,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:78,19:.:-1.04:1.000:. ./.:4:164,22:.: 0.52:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:109,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:68,8:.:-1.40:1.000:. ./.:4:148,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:112,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:157,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:130,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:115,11:.:-0.53:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:119,12:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,16:.:-0.98:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:118,25:.:-0.23:1.000:. ./.:4:226,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:104,23:.:-0.51:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:86,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:85,16:.:-0.97:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:107,14:.:-0.62:1.000:. ./.:4:180,13:.: 0.64:1.000:. ./.:4:224,31:.: 1.73:1.000:. ./.:4:164,17:.: 0.43:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:157,17:.: 0.31:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:138,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:54,8:.:-1.65:1.000:. ./.:4:81,20:.:-0.97:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:133,15:.:-0.14:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:153,15:.: 0.21:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:301,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:119,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:99,19:.:-0.67:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:93,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.63:1.000:. ./.:5:122,11:.:-0.41:0.982:. ./.:4:123,10:.:-0.41:1.000:. ./.:4:110,15:.:-0.55:1.000:. ./.:4:228,16:.: 1.53:1.000:. ./.:4:141,16:.: 0.01:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:97,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:145,18:.: 0.12:1.000:. ./.:3:60,17:.:-1.39:1.000:. ./.:4:195,19:.: 1.01:1.000:. ./.:4:214,13:.: 1.24:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:164,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,7:.:-2.12:1.000:. ./.:4:208,14:.: 1.15:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:148,22:.: 0.24:1.000:. ./.:4:270,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:243,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:175,12:.: 0.54:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:203,21:.: 1.19:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.62:0.999:. ./.:4:195,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:103,13:.:-0.70:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:102,17:.:-0.65:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:123,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:147,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:196,15:.: 0.96:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:135,22:.: 0.01:1.000:. ./.:4:279,17:.: 2.44:1.000:. ./.:4:280,29:.: 2.67:1.000:. ./.:4:177,22:.: 0.75:1.000:. ./.:4:256,1:.: 1.76:1.000:. -chr5.1 29758128 chr5.1_029758128 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:84,58:0.38: 0.15:1.000:0.570 0/1/1/1:4:21,102:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,36:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,117:0.55: 1.30:1.000:0.975 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,125:0.59: 1.32:1.000:0.876 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,65:0.35: 0.75:1.000:0.772 0/0/1/1:4:76,58:0.40:-0.01:1.000:0.823 0/0/0/0:4:8,1:0.10:-2.58:1.000:0.788 0/0/0/1:4:11,7:0.36:-2.39:1.000:0.679 0/1/1/1:4:36,145:0.74: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,101:0.52: 1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,60:0.40: 0.09:1.000:0.815 0/0/0/1:4:89,47:0.32: 0.03:1.000:0.958 0/0/0/1:4:141,67:0.30: 1.51:1.000:0.989 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.58:0.944:1.000 0/0/1/1:4:98,116:0.51: 1.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:173,1:0.01: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,118:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,4:0.28:-2.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,44:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,56:0.27: 1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,53:0.33: 0.32:1.000:0.936 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,44:0.28: 0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,154:0.63: 1.90:1.000:0.605 0/0/0/1:4:121,44:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,77:0.38: 1.12:1.000:0.557 0/0/0/1:4:118,47:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,34:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,31:0.18: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.50:1.000:1.000 1/1/1:3:0,2:0.93:-2.72:0.999:1.000 0/0/0/1:4:88,57:0.36: 0.21:1.000:0.628 0/0/0/1:4:106,46:0.28: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,47:0.31: 0.11:1.000:0.976 0/0/0/1:4:89,30:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,31:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,28:0.20:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,33:0.18: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,31:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,25:0.19:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,59:0.27: 1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,49:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,21:0.17:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,51:0.51:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,55:0.27: 1.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,44:0.37:-0.51:1.000:0.540 0/0/0/1:4:93,54:0.34: 0.25:1.000:0.871 0/0/0/1:4:94,38:0.26:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,56:0.35: 0.25:1.000:0.764 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:70,18:0.19:-0.96:1.000:0.964 0/0/0/1:4:109,37:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,24:0.18:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,111:0.47: 1.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:98,27:0.20:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,13:0.13:-0.96:1.000:0.938 0/0/1/1:4:85,59:0.38: 0.19:1.000:0.586 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.42:0.996:1.000 0/0/1/1:4:60,75:0.52: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,73:0.45: 0.34:1.000:0.983 0/0/0/1:4:70,24:0.23:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,45:0.43:-0.77:1.000:0.957 0/0/0/1:4:120,52:0.28: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,61:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:61,31:0.31:-0.87:1.000:0.974 0/0/0/1:4:100,14:0.11:-0.42:1.000:0.521 0/0/1/1:4:61,54:0.44:-0.40:1.000:0.967 0/0/0/1:4:70,35:0.31:-0.61:1.000:0.979 0/0/0/1:4:126,34:0.19: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,72:0.65:-0.63:1.000:0.751 0/0/0/1:4:109,22:0.15:-0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:121,34:0.20: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,41:0.31:-0.24:1.000:0.979 0/0/0/1:4:89,20:0.17:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,31:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,18:0.14:-0.40:1.000:0.972 0/0/0/1:4:90,22:0.18:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,30:0.29:-0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,52:0.47:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:84,22:0.19:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,35:0.33:-0.75:1.000:0.922 0/0/0/1:4:109,41:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,64:0.57:-0.61:1.000:0.943 0/0/0/1:4:72,21:0.20:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,33:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,29:0.46:-1.55:1.000:0.989 0/1/1/1:4:18,61:0.72:-1.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,27:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,46:0.33:-0.09:1.000:0.935 0/0/0/1:4:73,23:0.22:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,35:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,27:0.36:-1.35:1.000:0.650 0/0/0/1:4:97,30:0.21:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,14:0.17:-1.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,24:0.19:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,108:0.59: 0.75:1.000:0.858 0/0/1/1:4:96,123:0.53: 1.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,73:0.54:-0.16:1.000:0.988 0/0/0/1:4:78,28:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,43:0.35:-0.40:0.999:0.826 0/0/0/1:4:115,36:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,22:0.21:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,36:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,18:0.16:-0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,23:0.20:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,28:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,17:0.15:-0.61:1.000:0.983 0/0/0/1:4:86,50:0.34: 0.03:1.000:0.869 0/0/0/1:4:86,19:0.16:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,26:0.19:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,130:0.61: 1.32:1.000:0.685 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,29:0.27:-0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:47,53:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,52:0.65:-1.22:1.000:0.760 0/0/0/1:4:68,13:0.15:-1.10:1.000:0.981 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,32:0.27:-0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:105,61:0.34: 0.64:1.000:0.871 0/0/0/0/1:5:48,13:0.19:-1.51:0.982:0.997 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,35:0.30:-0.57:1.000:0.985 0/0/0/1:4:117,76:0.37: 1.20:1.000:0.620 0/0/0/1:4:70,26:0.25:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,24:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,25:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,35:0.27:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,31:0.40:-1.29:1.000:0.806 0/0/0/1:4:97,41:0.27: 0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:48,14:0.20:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,125:0.46: 2.49:1.000:0.987 0/0/0/1:4:163,65:0.26: 1.92:1.000:0.999 0/0/0:3:129,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,74:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,54:0.32: 0.42:1.000:0.951 0/0/0/1:4:84,35:0.27:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,56:0.27: 1.10:1.000:0.997 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,58:0.35: 0.42:1.000:0.823 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,47:0.24: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,77:0.30: 2.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:133,52:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,57:0.27: 1.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:152,66:0.28: 1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,119:0.48: 2.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:98,41:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,87:0.48: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:144,52:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,64:0.29: 1.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:70,100:0.55: 0.73:1.000:0.978 0/0/0/1:4:124,36:0.20: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,177:0.75: 1.73:0.999:0.999 0/0/1/1:4:86,64:0.40: 0.32:1.000:0.773 0/0/1/1:4:85,113:0.54: 1.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,115:0.55: 1.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:60,47:0.41:-0.57:1.000:0.866 0/0/0/1:4:129,45:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,92:0.57: 0.36:1.000:0.953 0/0/0/1:4:90,36:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,30:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,54:0.28: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,61:0.30: 1.06:1.000:0.984 0/0/0/1:4:97,63:0.37: 0.52:1.000:0.620 0/0/1/1:4:111,75:0.37: 1.06:1.000:0.502 0/0/1/1:4:104,91:0.44: 1.24:1.000:0.963 0/0/0/1:4:135,81:0.35: 1.67:1.000:0.817 0/0/0/1:4:144,67:0.29: 1.57:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,77:0.56:-0.14:1.000:0.960 0/0/1/1:4:63,111:0.60: 0.81:1.000:0.818 -chr5.1 29902322 chr5.1_029902322 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:166,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:102,17:.:-0.40:1.000:. ./.:4:111,20:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:149,27:.: 1.52:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:67,9:.:-1.84:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:41,25:.:-2.18:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:94,20:.:-0.57:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,28:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,12:.:-0.03:0.944:. ./.:4:125,29:.: 0.78:1.000:. ./.:4:148,29:.: 1.55:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:27,14:.:-3.02:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:98,19:.:-0.47:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:100,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:67,16:.:-1.61:1.000:. ./.:3:21,0:.:-3.69:0.999:. ./.:4:148,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:113,22:.: 0.14:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:105,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:116,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:105,30:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,15:.:-1.04:1.000:. ./.:4:112,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:127,61:.: 1.92:1.000:. ./.:4:85,16:.:-1.00:1.000:. ./.:4:117,24:.: 0.34:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:107,21:.:-0.10:1.000:. ./.:4:95,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:124,27:.: 0.68:1.000:. ./.:4:97,19:.:-0.50:1.000:. ./.:6:96,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:110,20:.:-0.03:1.000:. ./.:4:96,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:127,27:.: 0.78:1.000:. ./.:4:47,11:.:-2.45:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:90,24:.:-0.57:0.996:. ./.:4:144,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:76,63:.: 0.27:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:71,16:.:-1.47:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:119,26:.: 0.47:1.000:. ./.:4:111,23:.: 0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:115,30:.: 0.47:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:95,18:.:-0.60:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:105,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:120,35:.: 0.81:1.000:. ./.:4:117,20:.: 0.21:1.000:. ./.:4:82,14:.:-1.17:1.000:. ./.:4:139,24:.: 1.08:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.37:1.000:. ./.:4:94,19:.:-0.60:1.000:. ./.:4:106,34:.: 0.31:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:165,27:.: 2.05:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:91,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:87,19:.:-0.84:1.000:. ./.:4:84,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:101,28:.:-0.06:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,25:.: 0.07:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:97,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:103,32:.: 0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:85,18:.:-0.94:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:76,9:.:-1.54:1.000:. ./.:4:83,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:5:108,0:.:-0.77:0.982:. ./.:4:78,17:.:-1.20:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:113,23:.: 0.17:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:87,30:.:-0.47:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:92,16:.:-0.77:1.000:. ./.:4:92,21:.:-0.60:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:194,0:.: 2.12:1.000:. ./.:3:78,26:.:-0.90:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:101,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:151,27:.: 1.58:1.000:. ./.:4:122,16:.: 0.24:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:98,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:122,18:.: 0.31:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:104,19:.:-0.26:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:55,22:.:-1.81:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:122,23:.: 0.47:0.999:. ./.:4:151,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:90,14:.:-0.90:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:96,11:.:-0.80:1.000:. ./.:4:104,20:.:-0.23:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:102,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:218,0:.: 2.93:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:129,22:.: 0.68:1.000:. -chr5.1 30147444 chr5.1_030147444 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:30,37:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,25:0.21: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,25:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,23:0.19: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,34:0.45: 0.22:1.000:0.979 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,21:0.34:-0.35:1.000:0.870 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.43:-1.90:1.000:0.952 0/0/0/1:4:68,35:0.25: 1.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,28:0.22: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,19:0.28:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,37:0.35: 0.96:1.000:0.827 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.56:0.944:1.000 0/0/0/1:4:56,25:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,47:0.31: 2.06:1.000:0.965 0/0/1/1:4:7,7:0.43:-1.62:1.000:0.952 0/0/1/1:4:28,28:0.43:-0.13:1.000:0.952 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,36:0.28: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,38:0.24: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,25:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,26:0.39:-0.13:1.000:0.702 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1:3:3,1:0.18:-1.97:0.999:0.991 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,38:0.29: 1.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:23,24:0.44:-0.45:1.000:0.974 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,16:0.28:-0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,19:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,33:0.24: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,22:0.31:-0.13:1.000:0.976 0/0/0/1:4:42,19:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,36:0.34: 0.93:1.000:0.880 0/0/1/1:4:19,20:0.45:-0.74:1.000:0.977 0/0/0/1:4:100,26:0.15: 2.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:48,18:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,33:0.29: 1.00:1.000:0.993 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:38,4:0.07:-0.63:1.000:0.727 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,39:0.29: 1.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:36,25:0.33: 0.04:1.000:0.928 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,25:0.20: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.51:0.996:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,29:0.34: 0.33:1.000:0.868 0/0/0/1:4:11,3:0.16:-1.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:47,27:0.28: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,15:0.29:-0.70:1.000:0.993 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,24:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,25:0.18: 1.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,33:0.47: 0.08:1.000:0.992 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,38:0.42: 0.64:1.000:0.903 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,23:0.15: 1.88:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,16:0.35:-0.81:1.000:0.752 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,33:0.38: 0.43:1.000:0.621 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,1:0.01: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,27:0.29: 0.40:1.000:0.990 0/0/0/1:4:21,16:0.35:-0.81:1.000:0.752 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,15:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,27:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,42:0.58: 0.01:1.000:0.914 0/0/0/1:4:34,17:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,36:0.34: 0.93:1.000:0.880 0/0/1/1:4:19,16:0.38:-0.88:1.000:0.604 0/0/0/1:4:43,24:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,23:0.21: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,18:0.61:-1.27:1.000:0.710 0/0/1/1:4:38,33:0.39: 0.40:1.000:0.708 0/0/0/1:4:61,20:0.18: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,28:0.20: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,23:0.16: 1.67:0.999:0.994 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,18:0.30:-0.45:1.000:0.987 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,24:0.16: 1.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,26:0.31: 0.22:1.000:0.974 0/0/0/1:4:33,23:0.33:-0.13:1.000:0.924 0/0/0/1:4:39,20:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:25,13:0.25:-0.77:0.982:0.928 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.41:-0.35:1.000:0.858 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,19:0.31:-0.42:1.000:0.970 0/0/0/1:4:102,42:0.21: 2.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,20:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0:3:45,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.21: 0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,26:0.44:-0.31:1.000:0.972 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,19:0.15: 1.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:90,25:0.16: 1.95:1.000:0.995 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,31:0.30: 0.71:1.000:0.983 0/0/0/1:4:62,21:0.18: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 2.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,24:0.43:-0.42:1.000:0.952 0/0/0/1:4:58,20:0.19: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,34:0.24: 1.53:0.999:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,31:0.25: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,24:0.20: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,22:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,30:0.17: 2.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,28:0.29: 0.50:1.000:0.991 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,36:0.26: 1.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,8:0.07: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,27:0.20: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.39:-0.74:1.000:0.666 0/0/0/1:4:42,27:0.31: 0.33:1.000:0.978 -chr5.1 30517371 chr5.1_030517371 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:462,171:0.25: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,204:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:491,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:375,115:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:340,340:0.48: 1.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:239,299:0.54: 0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,135:0.51:-1.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:121,345:0.73:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:217,252:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:32,10:0.22:-3.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,41:0.52:-3.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:198,240:0.53:-0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:251,263:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:136,447:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:265,251:0.47: 0.22:1.000:0.991 0/0/0/0:4:481,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,139:0.26: 0.13:0.944:0.999 0/1/1/1:4:144,410:0.73: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:463,180:0.26: 1.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:413,147:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,8:0.14:-3.57:1.000:0.964 0/0/0/1:4:391,123:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:144,495:0.76: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,257:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,15:0.36:-3.68:1.000:0.720 0/0/1/1:4:270,259:0.47: 0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:219,242:0.51:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:448,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:153,461:0.74: 1.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,291:0.72:-0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:364,95:0.19:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,104:0.24:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,13:0.63:-3.85:1.000:0.605 0/0/0/1:4:81,27:0.23:-3.12:1.000:1.000 0/0/0:3:26,4:0.13:-3.76:0.999:0.938 0/0/1/1:4:215,259:0.53:-0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:246,276:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/0:4:600,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,265:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:367,114:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:393,129:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:387,141:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:546,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:357,137:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:414,146:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:287,341:0.52: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:300,322:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:212,74:0.24:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:322,115:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:307,115:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:353,135:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:458,166:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:207,195:0.47:-0.72:1.000:0.991 0/0/0/1:4:432,157:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,134:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:238,188:0.42:-0.52:1.000:0.924 0/0/1/1:4:235,231:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:235,263:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:245,245:0.48: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:200,260:0.55:-0.24:1.000:0.764 0/1/1/1:4:139,497:0.77: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,231:0.47:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:426,144:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,238:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:401,150:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:355,123:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:305,117:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:394,160:0.27: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:262,265:0.48: 0.31:0.996:0.995 1/1/1/1:4:0,548:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:317,292:0.46: 0.98:1.000:0.988 0/0/1/1:4:194,235:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:358,130:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:144,469:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:133,429:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,106:0.25:-0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:240,231:0.47:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:427,154:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:407,143:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,289:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:302,115:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:253,269:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:423,167:0.27: 0.82:1.000:0.998 0/0/0/1:4:324,134:0.28:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:289,116:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:292,351:0.53: 1.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:177,171:0.47:-1.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:238,250:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:230,263:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:348,132:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,190:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:126,393:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:276,268:0.47: 0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:195,211:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:138,475:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:258,275:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:231,279:0.53: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:225,261:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/0:4:566,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:373,135:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:294,121:0.27:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:558,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,239:0.53:-0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:272,268:0.48: 0.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:322,97:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,222:0.48:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:322,123:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:253,310:0.53: 0.60:1.000:0.992 0/0/0/1:4:477,165:0.24: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:356,139:0.26: 0.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:118,411:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:498,190:0.26: 1.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:443,148:0.24: 0.83:0.999:1.000 0/0/1/1:4:267,322:0.53: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:166,176:0.49:-1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:297,343:0.52: 1.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:325,117:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:351,131:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:118,411:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,379:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,296:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:243,289:0.52: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:270,318:0.52: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:270,285:0.49: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:381,138:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:411,160:0.26: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:241,255:0.49: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,195:0.49:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:274,84:0.22:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,217:0.49:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:247,247:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:142,371:0.71: 0.19:1.000:0.991 0/0/0/1/1:5:250,184:0.41:-0.46:0.982:0.969 0/0/1/1:4:250,228:0.46:-0.10:1.000:0.986 0/0/0/1:4:334,124:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:305,330:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:387,156:0.27: 0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:249,293:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:113,372:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:274,306:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:259,291:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:108,413:0.78: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,286:0.53: 0.23:1.000:0.991 0/0/0/1:4:286,106:0.25:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:414,182:0.29: 0.87:1.000:0.993 0/0/0/1:4:492,185:0.26: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:408,291:0.40: 1.71:1.000:0.773 0/0/0/1:4:381,132:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:302,302:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:239,250:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:458,151:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,285:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,41:0.54:-3.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:168,187:0.51:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:270,306:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:154,465:0.74: 1.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:506,154:0.22: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,279:0.52: 0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:128,361:0.72:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:394,137:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:347,109:0.22:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:222,226:0.48:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:200,257:0.54:-0.27:1.000:0.985 0/0/0/1:4:368,138:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:340,136:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:225,252:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:319,125:0.26:-0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:240,284:0.52: 0.28:0.999:0.994 0/1/1/1:4:127,392:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:260,231:0.45: 0.01:1.000:0.981 0/0/0/1:4:317,110:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,193:0.52:-1.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:314,112:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:369,111:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,110:0.28:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:290,101:0.24:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:558,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,309:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:237,318:0.55: 0.53:1.000:0.975 0/0/0/1:4:306,141:0.30:-0.35:1.000:0.986 0/0/0/1:4:362,122:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:167,506:0.74: 1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:302,356:0.52: 1.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:222,187:0.44:-0.66:1.000:0.964 0/0/1/1:4:254,273:0.50: 0.31:1.000:0.997 -chr5.1 30765344 chr5.1_030765344 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.: 3.20:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:17,0:.: 3.20:0.944:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:6:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.: 3.20:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:5:1,0:.:-1.18:0.982:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:12,1:.: 2.11:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.: 3.20:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.90:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.19:1.000:. -chr5.1 30862231 chr5.1_030862231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:45,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.27:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:81,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:104,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:116,1:.: 1.98:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.42:0.944:. ./.:4:47,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:57,2:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.53:1.000:. ./.:4:104,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:59,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:55,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:134,2:.: 2.53:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:52,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,2:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:59,4:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.24:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:51,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:52,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:63,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.11:1.000:. ./.:6:68,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:87,2:.: 1.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:53,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:92,1:.: 1.28:0.996:. ./.:4:66,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:99,4:.: 1.57:1.000:. ./.:4:85,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:74,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:50,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:89,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:39,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:92,2:.: 1.31:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:33,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,6:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.32:0.999:. ./.:4:44,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:48,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:83,2:.: 1.05:1.000:. ./.:4:50,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,5:.:-0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:115,2:.: 1.98:1.000:. ./.:5:32,0:.:-0.48:0.982:. ./.:4:68,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:48,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:56,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:61,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,6:.: 0.07:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:48,3:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:41,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:88,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:129,1:.: 2.36:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.08:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:0.999:. ./.:4:95,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:69,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:111,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:40,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:125,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:131,2:.: 2.44:1.000:. ./.:4:38,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:47,2:.: 0.01:1.000:. -chr5.1 31022093 chr5.1_031022093 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:180,43:.: 0.97:1.000:. ./.:4:42,150:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:82,102:.: 0.17:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:97,115:.: 0.74:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:163,54:.: 0.84:1.000:. ./.:4:143,62:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,3:.:-3.09:1.000:. ./.:4:12,4:.:-3.28:1.000:. ./.:4:44,120:.:-0.24:1.000:. ./.:4:95,99:.: 0.37:1.000:. ./.:4:142,45:.: 0.23:1.000:. ./.:4:144,48:.: 0.33:1.000:. ./.:4:134,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.22:0.944:. ./.:4:107,111:.: 0.86:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:107,116:.: 0.97:1.000:. ./.:4:20,4:.:-3.11:1.000:. ./.:4:122,51:.:-0.06:1.000:. ./.:4:131,46:.: 0.02:1.000:. ./.:4:142,51:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:163,62:.: 1.01:1.000:. ./.:4:91,106:.: 0.43:1.000:. ./.:4:142,57:.: 0.47:1.000:. ./.:4:202,75:.: 2.07:1.000:. ./.:4:137,53:.: 0.29:1.000:. ./.:4:111,54:.:-0.22:1.000:. ./.:4:113,47:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:19,16:.:-2.89:1.000:. ./.:3:1,2:.:-3.55:0.999:. ./.:4:150,45:.: 0.39:1.000:. ./.:4:138,64:.: 0.53:1.000:. ./.:4:164,45:.: 0.68:1.000:. ./.:4:113,54:.:-0.18:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:155,41:.: 0.41:1.000:. ./.:4:142,50:.: 0.33:1.000:. ./.:4:156,54:.: 0.70:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:163,50:.: 0.76:1.000:. ./.:4:139,40:.: 0.06:1.000:. ./.:4:154,48:.: 0.53:1.000:. ./.:4:33,11:.:-2.70:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,47:.:-0.74:1.000:. ./.:4:86,68:.:-0.45:1.000:. ./.:4:149,59:.: 0.66:1.000:. ./.:4:93,83:.: 0.00:1.000:. ./.:4:97,110:.: 0.64:1.000:. ./.:4:187,51:.: 1.27:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,93:.:-0.08:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.31:1.000:. ./.:6:75,38:.:-1.29:1.000:. ./.:4:111,42:.:-0.47:1.000:. ./.:4:110,40:.:-0.53:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:84,98:.: 0.12:1.000:. ./.:4:164,41:.: 0.60:1.000:. ./.:4:73,36:.:-1.37:1.000:. ./.:4:91,91:.: 0.12:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.43:0.996:. ./.:4:78,110:.: 0.25:1.000:. ./.:4:95,91:.: 0.21:1.000:. ./.:4:86,39:.:-1.04:1.000:. ./.:4:103,79:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,66:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,89:.:-0.22:1.000:. ./.:4:122,45:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:74,110:.: 0.17:1.000:. ./.:4:150,48:.: 0.45:1.000:. ./.:4:121,55:.: 0.00:1.000:. ./.:4:42,82:.:-1.06:1.000:. ./.:4:148,52:.: 0.49:1.000:. ./.:4:89,96:.: 0.19:1.000:. ./.:4:130,55:.: 0.19:1.000:. ./.:4:77,28:.:-1.45:1.000:. ./.:4:141,38:.: 0.06:1.000:. ./.:4:95,35:.:-0.94:1.000:. ./.:4:132,40:.:-0.08:1.000:. ./.:4:151,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:95,120:.: 0.80:1.000:. ./.:4:62,39:.:-1.54:1.000:. ./.:4:116,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:150,60:.: 0.70:1.000:. ./.:4:82,88:.:-0.12:1.000:. ./.:4:121,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:88,78:.:-0.20:1.000:. ./.:4:26,91:.:-1.21:1.000:. ./.:4:173,33:.: 0.62:1.000:. ./.:4:162,68:.: 1.11:1.000:. ./.:4:130,31:.:-0.31:1.000:. ./.:4:163,35:.: 0.45:1.000:. ./.:4:52,58:.:-1.35:1.000:. ./.:4:123,38:.:-0.31:1.000:. ./.:4:105,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,38:.:-0.47:1.000:. ./.:4:101,106:.: 0.64:1.000:. ./.:4:145,153:.: 2.50:1.000:. ./.:4:110,97:.: 0.64:1.000:. ./.:4:131,38:.:-0.14:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:113,75:.: 0.25:0.999:. ./.:4:132,43:.:-0.02:1.000:. ./.:4:89,31:.:-1.15:1.000:. ./.:4:122,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:140,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:142,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:99,44:.:-0.67:1.000:. ./.:4:125,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:112,38:.:-0.53:1.000:. ./.:4:116,50:.:-0.20:1.000:. ./.:4:111,117:.: 1.07:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:159,38:.: 0.43:1.000:. ./.:4:92,77:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,80:.:-0.72:1.000:. ./.:4:96,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:128,44:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,56:.: 0.29:1.000:. ./.:5:125,19:.:-0.65:0.982:. ./.:4:189,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:139,65:.: 0.58:1.000:. ./.:4:203,62:.: 1.83:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.82:1.000:. ./.:4:98,40:.:-0.78:1.000:. ./.:4:118,42:.:-0.33:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:129,45:.:-0.04:1.000:. ./.:4:150,44:.: 0.37:1.000:. ./.:4:131,56:.: 0.23:1.000:. ./.:4:113,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:126,137:.: 1.79:1.000:. ./.:4:170,59:.: 1.09:1.000:. ./.:4:154,162:.: 2.87:1.000:. ./.:4:127,111:.: 1.27:1.000:. ./.:4:195,56:.: 1.54:1.000:. ./.:4:139,42:.: 0.10:1.000:. ./.:4:158,67:.: 1.01:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:21,6:.:-3.05:1.000:. ./.:4:136,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:137,56:.: 0.35:1.000:. ./.:4:151,58:.: 0.68:1.000:. ./.:4:170,58:.: 1.07:1.000:. ./.:4:121,51:.:-0.08:1.000:. ./.:4:152,47:.: 0.47:1.000:. ./.:4:97,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:148,45:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,101:.: 0.17:1.000:. ./.:4:143,46:.: 0.27:1.000:. ./.:4:110,61:.:-0.10:1.000:. ./.:4:114,107:.: 0.92:1.000:. ./.:4:113,50:.:-0.26:1.000:. ./.:4:48,140:.: 0.25:0.999:. ./.:4:131,41:.:-0.08:1.000:. ./.:4:88,104:.: 0.33:1.000:. ./.:4:73,103:.: 0.00:1.000:. ./.:4:143,42:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,57:.: 0.12:1.000:. ./.:4:93,84:.: 0.02:1.000:. ./.:4:98,41:.:-0.76:1.000:. ./.:4:117,48:.:-0.22:1.000:. ./.:4:142,60:.: 0.53:1.000:. ./.:4:120,55:.:-0.02:1.000:. ./.:4:154,67:.: 0.92:1.000:. ./.:4:143,31:.:-0.04:1.000:. ./.:4:98,111:.: 0.68:1.000:. ./.:4:168,80:.: 1.48:1.000:. ./.:4:196,57:.: 1.58:1.000:. ./.:4:93,79:.:-0.08:1.000:. ./.:4:87,112:.: 0.47:1.000:. -chr5.1 31414744 chr5.1_031414744 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:235,0:.: 2.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.40:0.944:. ./.:4:158,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.43:1.000:. ./.:3:23,0:.:-1.58:0.999:. ./.:4:166,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:112,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:224,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.77:1.000:. ./.:6:62,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.90:0.996:. ./.:4:98,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:98,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:156,2:.: 1.21:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:137,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:59,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:109,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.32:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:159,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.:-0.51:1.000:. ./.:5:106,0:.: 0.13:0.982:. ./.:4:66,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:241,0:.: 2.92:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.63:0.999:. ./.:4:61,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:198,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.16:1.000:. -chr5.1 31801926 chr5.1_031801926 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:138,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:61,39:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:89,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:177,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:75,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:83,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:43,9:.:-2.00:1.000:. ./.:4:20,11:.:-2.73:1.000:. ./.:4:66,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,21:.:-0.49:1.000:. ./.:4:83,28:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.86:0.944:. ./.:4:31,48:.:-1.07:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:123,27:.: 1.37:1.000:. ./.:4:21,1:.:-3.04:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:97,31:.: 0.61:1.000:. ./.:4:96,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:59,17:.:-1.18:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,28:.: 1.20:1.000:. ./.:4:68,16:.:-0.90:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:22,9:.:-2.73:1.000:. ./.:4:33,6:.:-2.45:1.000:. ./.:3:11,4:.:-3.28:0.999:. ./.:4:65,11:.:-1.18:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:97,24:.: 0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,19:.: 0.96:1.000:. ./.:4:95,30:.: 0.51:1.000:. ./.:4:133,20:.: 1.48:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:64,23:.:-0.80:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:73,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,26:.: 1.30:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,22:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.24:1.000:. ./.:6:76,15:.:-0.66:1.000:. ./.:4:102,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:88,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:108,30:.: 0.96:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:74,19:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,25:.: 0.89:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.37:0.996:. ./.:4:37,35:.:-1.31:1.000:. ./.:4:107,32:.: 0.99:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:109,30:.: 0.99:1.000:. ./.:4:112,17:.: 0.65:1.000:. ./.:4:85,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:79,13:.:-0.63:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,27:.: 0.51:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:105,24:.: 0.65:1.000:. ./.:4:87,25:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,26:.: 0.27:1.000:. ./.:4:119,28:.: 1.27:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:79,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:91,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:83,24:.:-0.11:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,17:.:-0.42:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:128,31:.: 1.68:1.000:. ./.:4:44,14:.:-1.80:1.000:. ./.:4:111,30:.: 1.06:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:76,33:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.07:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:63,19:.:-0.97:1.000:. ./.:4:83,25:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:72,17:.:-0.73:1.000:. ./.:4:124,42:.: 1.92:1.000:. ./.:4:104,25:.: 0.65:1.000:. ./.:4:81,23:.:-0.21:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:83,28:.: 0.03:0.999:. ./.:4:111,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:51,8:.:-1.76:1.000:. ./.:4:106,24:.: 0.68:1.000:. ./.:4:117,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:100,29:.: 0.65:1.000:. ./.:4:90,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:69,17:.:-0.83:1.000:. ./.:4:121,39:.: 1.72:1.000:. ./.:4:105,19:.: 0.48:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:100,16:.: 0.20:1.000:. ./.:4:104,24:.: 0.61:1.000:. ./.:4:96,27:.: 0.44:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:110,20:.: 0.68:1.000:. ./.:4:79,26:.:-0.18:1.000:. ./.:5:94,0:.:-0.56:0.982:. ./.:4:93,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:118,20:.: 0.96:1.000:. ./.:4:116,17:.: 0.79:1.000:. ./.:4:73,19:.:-0.63:1.000:. ./.:4:78,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:89,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:88,21:.:-0.04:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:115,28:.: 1.13:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:157,25:.: 2.47:1.000:. ./.:4:85,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:89,28:.: 0.24:1.000:. ./.:4:112,28:.: 1.03:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:38,1:.:-2.45:1.000:. ./.:4:80,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:107,29:.: 0.89:1.000:. ./.:4:86,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:92,23:.: 0.17:1.000:. ./.:4:73,15:.:-0.76:1.000:. ./.:4:79,21:.:-0.35:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,7:.:-1.76:1.000:. ./.:4:82,16:.:-0.42:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:77,34:.: 0.03:0.999:. ./.:4:67,19:.:-0.83:1.000:. ./.:4:84,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,19:.:-0.80:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:75,22:.:-0.45:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:101,16:.: 0.24:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:85,22:.:-0.11:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:108,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:81,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:109,19:.: 0.61:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:63,11:.:-1.25:1.000:. ./.:4:107,21:.: 0.61:1.000:. -chr5.1 31984232 chr5.1_031984232 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:191,68:0.19: 1.49:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:169,1:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,70:0.42:-0.16:1.000:0.925 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,46:0.27:-0.44:1.000:0.998 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,70:0.35: 0.12:1.000:0.782 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-2.07:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,70:0.39:-0.03:1.000:0.654 0/0/0/0:4:172,1:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:281,0:0.00: 1.82:0.944:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,99:0.22: 2.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,61:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,14:0.13:-1.19:1.000:0.900 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,65:0.36:-0.09:1.000:0.704 0/0/0/1:4:114,75:0.32: 0.45:1.000:0.950 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,1:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,26:0.35:-1.44:1.000:0.780 0/0/0/1:4:80,46:0.28:-0.49:1.000:0.996 0/0/1:3:12,4:0.18:-2.13:0.999:0.990 0/0/0/1:4:168,71:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,71:0.42:-0.13:1.000:0.927 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:314,0:0.00: 2.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:186,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:220,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,65:0.22: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:211,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,72:0.21: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,86:0.23: 1.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:211,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,47:0.31:-0.58:1.000:0.966 0/0/0/1:4:180,83:0.23: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,61:0.38:-0.31:1.000:0.591 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,78:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:200,18:0.06: 0.88:1.000:0.908 0/0/0/0:4:250,0:0.00: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:269,0:0.00: 1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,68:0.44:-0.27:1.000:0.959 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,55:0.35:-0.40:1.000:0.812 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.52:0.996:1.000 0/0/0/0:4:145,1:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,1:0.01:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,69:0.44:-0.25:1.000:0.968 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,57:0.39:-0.46:1.000:0.645 0/0/1/1:4:64,51:0.38:-0.65:1.000:0.615 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,75:0.19: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:147,88:0.29: 1.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:99,89:0.42: 0.43:1.000:0.927 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,60:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,60:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,62:0.19: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,59:0.38:-0.37:1.000:0.561 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,57:0.34:-0.30:1.000:0.875 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,67:0.42:-0.24:1.000:0.901 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,64:0.30: 0.15:1.000:0.987 0/1/1/1:4:1,78:0.75:-1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,81:0.75:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,1:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,64:0.45:-0.44:1.000:0.983 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,71:0.30: 0.39:1.000:0.981 0/0/1/1:4:75,62:0.40:-0.33:1.000:0.752 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:324,0:0.00: 2.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,77:0.50:-0.21:0.999:0.997 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:214,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,55:0.70:-1.46:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,80:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,60:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,81:0.44: 0.11:1.000:0.972 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,53:0.21: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,50:0.36:-0.61:1.000:0.720 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:111,29:0.15:-0.28:0.982:0.997 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,1:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,84:0.21: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,62:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,55:0.28:-0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,58:0.39:-0.44:1.000:0.711 0/0/0/0:4:256,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,54:0.36:-0.49:1.000:0.644 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,89:0.38: 0.63:1.000:0.604 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 2.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,68:0.43:-0.25:1.000:0.949 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:169,2:0.01: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,1:0.01:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,78:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:335,0:0.00: 2.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,80:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,62:0.40:-0.36:1.000:0.828 0/0/0/0:4:68,1:0.01:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,50:0.17: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,68:0.43:-0.24:1.000:0.937 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,55:0.19: 0.76:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,69:0.22: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,44:0.33:-0.73:1.000:0.938 0/0/0/1:4:157,49:0.17: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,56:0.35:-0.37:1.000:0.797 0/0/1/1:4:82,70:0.41:-0.10:1.000:0.840 0/0/0/0:4:276,0:0.00: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,55:0.21: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:249,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 -chr5.1 32296697 chr5.1_032296697 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:0.944:. ./.:4:38,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.08:1.000:. ./.:3:22,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.82:1.000:. ./.:6:43,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.76:0.996:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,0:.: 3.98:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:49,1:.: 2.11:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:5:26,0:.:-0.02:0.982:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:55,1:.: 2.64:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.16:1.000:. -chr5.1 32560792 chr5.1_032560792 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,70:.: 0.97:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:177,70:.: 1.41:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:79,47:.:-1.11:1.000:. ./.:4:144,68:.: 0.68:1.000:. ./.:4:128,71:.: 0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:141,60:.: 0.45:1.000:. ./.:4:135,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:159,77:.: 1.18:0.944:. ./.:4:154,71:.: 0.95:1.000:. ./.:4:174,91:.: 1.79:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:22,9:.:-3.10:1.000:. ./.:4:161,68:.: 1.04:1.000:. ./.:4:180,65:.: 1.37:1.000:. ./.:4:127,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:6,9:.:-3.43:1.000:. ./.:4:172,82:.: 1.56:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:161,69:.: 1.06:1.000:. ./.:4:146,55:.: 0.45:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:121,56:.:-0.05:1.000:. ./.:4:4,6:.:-3.53:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.16:1.000:. ./.:3:7,0:.:-3.60:0.999:. ./.:4:128,71:.: 0.41:1.000:. ./.:4:156,91:.: 1.41:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:133,57:.: 0.22:1.000:. ./.:4:118,61:.:-0.01:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:126,73:.: 0.41:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:144,60:.: 0.52:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:148,70:.: 0.81:1.000:. ./.:4:153,83:.: 1.18:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:130,58:.: 0.18:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:166,77:.: 1.33:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:146,77:.: 0.91:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:141,67:.: 0.60:1.000:. ./.:4:130,75:.: 0.54:1.000:. ./.:6:125,49:.:-0.11:1.000:. ./.:4:116,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:127,52:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,66:.: 0.52:1.000:. ./.:4:119,70:.: 0.20:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:124,57:.: 0.04:0.996:. ./.:4:62,108:.:-0.19:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,32:.:-1.45:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:137,65:.: 0.47:1.000:. ./.:4:97,118:.: 0.75:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:130,68:.: 0.39:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:132,54:.: 0.14:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:134,56:.: 0.22:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:133,67:.: 0.43:1.000:. ./.:4:104,51:.:-0.51:1.000:. ./.:4:105,49:.:-0.53:1.000:. ./.:4:126,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:107,46:.:-0.55:1.000:. ./.:4:132,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:119,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:125,70:.: 0.33:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:108,41:.:-0.63:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:176,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:112,70:.: 0.06:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:121,40:.:-0.38:1.000:. ./.:4:151,87:.: 1.23:1.000:. ./.:4:156,2:.:-0.44:0.999:. ./.:4:203,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:87,49:.:-0.90:1.000:. ./.:4:144,77:.: 0.87:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:123,64:.: 0.16:1.000:. ./.:4:120,48:.:-0.24:1.000:. ./.:4:147,65:.: 0.68:1.000:. ./.:4:99,33:.:-0.99:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:119,43:.:-0.36:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:116,57:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,43:.:-1.15:1.000:. ./.:4:97,42:.:-0.84:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:160,87:.: 1.41:1.000:. ./.:5:105,24:.:-1.05:0.982:. ./.:4:106,53:.:-0.42:1.000:. ./.:4:115,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:165,69:.: 1.14:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:99,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:97,49:.:-0.69:1.000:. ./.:4:95,49:.:-0.74:1.000:. ./.:4:110,68:.:-0.03:1.000:. ./.:4:114,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:192,76:.: 1.85:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:176,56:.: 1.10:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:139,65:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,13:.:-3.37:1.000:. ./.:4:107,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:158,67:.: 0.95:1.000:. ./.:4:154,66:.: 0.85:1.000:. ./.:4:179,73:.: 1.52:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:133,65:.: 0.39:1.000:. ./.:4:158,64:.: 0.89:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:145,87:.: 1.10:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:118,55:.:-0.13:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:142,74:.: 0.77:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:110,60:.:-0.19:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:119,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:158,69:.: 1.00:1.000:. ./.:4:155,89:.: 1.35:1.000:. ./.:4:106,54:.:-0.40:1.000:. ./.:4:209,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:154,89:.: 1.33:1.000:. ./.:4:177,75:.: 1.52:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:165,64:.: 1.04:1.000:. -chr5.1 33006888 chr5.1_033006888 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:0.944:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:39,0:.: 3.18:1.000:. ./.:4:30,1:.: 2.04:1.000:. ./.:6:22,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,1:.: 2.76:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:0.996:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:40,0:.: 3.32:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:34,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:28,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.76:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.47:0.999:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:5:13,0:.:-0.52:0.982:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:0.999:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.19:1.000:. -chr5.1 33094922 chr5.1_033094922 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:203,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:417,0:.: 2.60:0.944:. ./.:4:204,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:398,1:.: 2.40:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.09:1.000:. ./.:3:20,0:.:-1.69:0.999:. ./.:4:187,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:414,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:364,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:374,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.77:1.000:. ./.:6:161,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:427,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.78:0.996:. ./.:4:136,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:564,0:.: 4.19:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.09:0.999:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:249,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.23:1.000:. ./.:5:77,0:.:-1.08:0.982:. ./.:4:248,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:326,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:68,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:387,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.70:0.999:. ./.:4:183,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.23:1.000:. -chr5.1 33450457 chr5.1_033450457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:26,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:61,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.59:0.944:. ./.:4:46,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.58:0.999:. ./.:4:31,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.32:1.000:. ./.:6:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.67:0.996:. ./.:4:41,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.34:0.999:. ./.:4:22,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:49,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.03:1.000:. ./.:5:23,0:.: 0.00:0.982:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:29,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.47:1.000:. -chr5.1 33546114 chr5.1_033546114 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:351,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:272,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:112,4:.:-1.56:1.000:. ./.:4:177,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:450,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.97:0.944:. ./.:4:0,3:.:-2.80:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:285,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:219,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:186,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:368,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:222,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:48,11:.:-2.19:1.000:. ./.:4:136,1:.:-1.33:1.000:. ./.:3:68,0:.:-2.09:0.999:. ./.:4:334,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:209,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:733,0:.: 5.24:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:538,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:221,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:258,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:255,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.67:1.000:. ./.:6:173,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:134,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:185,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:273,5:.: 0.23:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.65:0.996:. ./.:4:0,1:.:-2.83:1.000:. ./.:4:326,2:.: 0.78:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:404,3:.: 1.65:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:105,5:.:-1.63:1.000:. ./.:4:242,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:232,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:264,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:207,2:.:-0.53:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:256,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:314,3:.: 0.65:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:131,3:.:-1.36:1.000:. ./.:4:144,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:143,3:.:-1.23:1.000:. ./.:4:309,5:.: 0.62:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:155,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:309,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:155,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:152,5:.:-1.11:1.000:. ./.:4:243,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:196,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:369,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:251,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:233,3:.:-0.24:0.999:. ./.:4:239,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:150,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:159,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:125,2:.:-1.44:1.000:. ./.:4:199,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:248,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:157,2:.:-1.09:1.000:. ./.:5:223,0:.:-0.38:0.982:. ./.:4:232,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:240,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:247,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:147,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:119,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:175,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:240,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:376,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:278,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:336,2:.: 0.89:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:318,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:151,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:272,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:192,2:.:-0.70:0.999:. ./.:4:175,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:479,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:243,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:317,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:226,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.57:1.000:. -chr5.1 33716180 chr5.1_033716180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,174:0.72:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,116:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,145:0.54: 0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:129,159:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,171:0.57: 0.79:1.000:0.942 0/1/1/1:4:41,92:0.65:-2.04:1.000:0.775 0/0/1/1:4:116,146:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,52:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,103:0.80:-2.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,67:0.52:-2.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,214:0.80: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,226:0.76: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,130:0.49: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,59:0.29:-0.86:1.000:0.991 0/0/1/1:4:108,119:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,141:0.52: 0.24:0.944:0.995 0/1/1/1:4:70,158:0.65:-0.18:1.000:0.787 0/0/0/1:4:205,73:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,156:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,28:0.35:-3.20:1.000:0.751 0/0/0/1:4:166,80:0.31: 0.18:1.000:0.976 0/1/1/1:4:63,237:0.75: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,73:0.32:-0.45:1.000:0.948 0/0/1/1:4:50,48:0.45:-2.73:1.000:0.980 0/0/0/1:4:140,63:0.30:-0.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:114,164:0.54: 0.80:1.000:0.985 0/0/1/1:4:112,116:0.47:-0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:111,161:0.55: 0.69:1.000:0.984 0/1/1/1:4:49,227:0.79: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,178:0.73:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:165,63:0.27:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,12:0.20:-3.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,63:0.47:-2.26:1.000:0.993 0/0/1:3:35,15:0.29:-3.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:114,126:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,113:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,67:0.31:-0.59:1.000:0.978 0/0/1/1:4:118,139:0.49: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,157:0.53: 0.69:1.000:0.992 0/1/1/1:4:66,209:0.72: 0.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:168,72:0.29: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:137,161:0.49: 1.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,37:0.22:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,270:0.75: 2.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,86:0.30: 0.67:1.000:0.984 0/0/1/1:4:131,163:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,64:0.64:-2.83:1.000:0.738 0/0/1/1:4:108,122:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,186:0.74: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,58:0.27:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,84:0.32: 0.22:1.000:0.953 0/0/1/1:4:101,120:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,175:0.56: 1.00:1.000:0.964 0/0/1/1:4:94,116:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,129:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,202:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,157:0.48: 1.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,230:0.80: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:127,124:0.45: 0.27:1.000:0.766 0/0/1/1:4:97,160:0.58: 0.39:1.000:0.925 0/0/1/1:4:103,138:0.53: 0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:122,145:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,143:0.53: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,129:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:161,88:0.33: 0.24:1.000:0.909 0/1/1/1:4:26,118:0.78:-1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,123:0.54:-0.55:1.000:0.986 0/0/1/1:4:109,159:0.55: 0.61:0.996:0.983 0/0/1/1:4:100,146:0.55: 0.18:1.000:0.982 0/1/1/1:4:56,234:0.77: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,46:0.30:-1.83:1.000:0.982 0/1/1/1:4:59,231:0.76: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,215:0.76: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,146:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,133:0.55:-0.30:1.000:0.977 0/0/0/1:4:125,69:0.33:-0.85:1.000:0.899 0/0/1/1:4:108,134:0.51: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,299:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,133:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:125,146:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,165:0.56: 0.69:1.000:0.966 0/0/1/1:4:91,117:0.52:-0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,183:0.70: 0.20:1.000:0.984 0/0/1/1:4:131,164:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,93:0.52:-1.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,125:0.54:-0.47:1.000:0.987 0/0/1/1:4:108,159:0.55: 0.59:1.000:0.981 0/0/0/1:4:150,75:0.32:-0.24:1.000:0.964 0/0/1/1:4:77,89:0.49:-1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,126:0.45: 0.45:1.000:0.975 0/1/1/1:4:69,251:0.74: 1.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,92:0.47:-1.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:121,156:0.52: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,136:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,144:0.54: 0.14:1.000:0.985 0/0/0/1:4:143,62:0.29:-0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:174,72:0.28: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,149:0.59:-0.06:1.000:0.854 0/0/1/1:4:74,97:0.52:-1.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,153:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,176:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,140:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,139:0.55:-0.10:1.000:0.977 0/0/1/1:4:109,137:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,127:0.55:-0.45:1.000:0.982 0/0/1/1:4:92,117:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:212,100:0.30: 1.47:1.000:0.981 0/0/0/1:4:162,67:0.28:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,200:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,194:0.53: 1.90:1.000:0.991 0/0/1/1:4:103,164:0.57: 0.59:0.999:0.950 1/1/1/1:4:0,303:1.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,82:0.48:-1.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,170:0.53: 1.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:99,128:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,130:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,168:0.60: 0.47:1.000:0.801 0/0/1/1:4:90,131:0.55:-0.31:1.000:0.983 0/0/1/1:4:106,137:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,118:0.50:-0.41:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,285:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,162:0.54: 0.80:1.000:0.990 0/0/1/1:4:107,149:0.54: 0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:190,74:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:112,157:0.54: 0.63:1.000:0.989 0/0/1/1:4:116,132:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,41:0.26:-1.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,139:0.57:-0.22:1.000:0.948 0/1/1/1:4:51,213:0.77: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,188:0.66: 0.61:1.000:0.857 0/0/0/0/1:5:119,51:0.29:-1.32:0.982:0.665 0/0/1/1:4:120,151:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:162,77:0.31: 0.04:1.000:0.979 0/0/1/1:4:124,162:0.52: 0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,250:0.79: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,154:0.54: 0.53:1.000:0.989 0/0/1/1:4:96,113:0.49:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,67:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,157:0.54: 0.63:1.000:0.989 0/0/1/1:4:121,160:0.52: 0.86:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,255:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,126:0.59:-0.79:1.000:0.834 0/0/1/1:4:149,161:0.48: 1.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:199,82:0.28: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,280:0.83: 1.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:171,63:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:196,62:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,175:0.71:-0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:62,271:0.78: 1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,219:0.78: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,35:0.32:-2.59:1.000:0.964 0/0/0/1:4:92,46:0.32:-1.95:1.000:0.964 0/1/1/1:4:56,228:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,204:0.73: 0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:189,72:0.27: 0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,202:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,153:0.71:-0.67:1.000:0.993 0/0/0/1:4:152,76:0.32:-0.18:1.000:0.964 0/0/1/1:4:81,112:0.53:-0.86:1.000:0.991 0/1/1/1:4:53,178:0.73:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,197:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,71:0.30:-0.22:1.000:0.986 0/1/1/1:4:44,165:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,136:0.53: 0.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:129,52:0.28:-1.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,215:0.74: 0.77:0.999:0.999 0/1/1/1:4:60,192:0.72: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,191:0.79:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,126:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,168:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,60:0.28:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:137,68:0.31:-0.63:1.000:0.967 0/0/0/1:4:117,53:0.30:-1.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:109,107:0.46:-0.41:1.000:0.984 0/0/1/1:4:108,157:0.55: 0.55:1.000:0.983 0/0/1/1:4:103,180:0.59: 0.90:1.000:0.858 0/0/1/1:4:89,113:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,153:0.57: 0.22:1.000:0.943 0/0/1/1:4:114,153:0.53: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,158:0.47: 1.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:174,108:0.36: 0.88:1.000:0.709 0/1/1/1:4:61,158:0.68:-0.35:1.000:0.950 0/0/1/1:4:123,136:0.48: 0.43:1.000:0.995 -chr5.1 34527508 chr5.1_034527508 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:44,159:0.79: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,129:0.77: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,41:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,93:0.55: 0.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:116,103:0.47: 1.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,113:0.55: 1.03:1.000:0.983 0/0/1/1:4:47,55:0.54:-1.66:1.000:0.989 0/0/1/1:4:94,75:0.44: 0.07:1.000:0.970 0/1/1/1:4:45,131:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,21:0.37:-2.83:1.000:0.602 0/1/1/1:4:8,40:0.83:-3.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,129:0.73: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:89,80:0.47: 0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,100:0.61:-0.08:1.000:0.659 0/1/1/1:4:57,160:0.74: 1.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,50:0.27: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:129,49:0.27: 0.30:0.944:0.997 0/1/1/1:4:57,141:0.71: 0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:109,125:0.53: 1.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,101:0.49: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,32:0.44:-2.41:1.000:0.960 0/0/1/1:4:81,108:0.57: 0.59:1.000:0.947 0/0/1/1:4:79,81:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,124:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,21:0.54:-3.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:93,101:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,134:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,98:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,146:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,106:0.48: 1.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:121,55:0.31: 0.25:1.000:0.971 0/0/1/1:4:81,97:0.54: 0.30:1.000:0.986 0/1/1/1:4:8,36:0.82:-3.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,31:0.47:-2.62:1.000:0.994 1/1/1:3:1,18:0.95:-3.81:0.999:1.000 0/0/1/1:4:86,93:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,84:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,95:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,90:0.47: 0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:138,43:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,55:0.32: 0.12:1.000:0.952 0/0/1/1:4:84,98:0.54: 0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:145,50:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,102:0.55: 0.51:1.000:0.983 0/0/0/1:4:145,50:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,163:0.76: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,133:0.72: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,28:0.48:-2.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,63:0.32: 0.77:1.000:0.952 0/0/0/1:4:97,42:0.30:-0.71:1.000:0.984 0/1/1/1:4:37,115:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,155:0.75: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,77:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,158:0.75: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,91:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,47:0.27: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,86:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,107:0.53: 0.87:1.000:0.991 0/0/0/1:4:131,34:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:49,80:0.62:-0.96:1.000:0.781 0/0/1/1:4:82,69:0.45:-0.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:85,102:0.54: 0.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:167,46:0.22: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,92:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,97:0.53: 0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:98,106:0.52: 0.98:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,39:0.38:-1.69:1.000:0.627 0/0/1/1:4:91,82:0.47: 0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:121,41:0.25:-0.11:0.996:0.999 1/1/1/1:4:0,162:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,82:0.46: 0.25:1.000:0.989 0/1/1/1:4:17,62:0.79:-2.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,106:0.54: 0.80:1.000:0.990 0/0/1/1:4:91,100:0.52: 0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,129:0.70: 0.46:1.000:0.987 0/0/1/1:4:88,80:0.47: 0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,119:0.77:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,73:0.47:-0.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:54,150:0.74: 0.98:1.000:0.998 0/0/0/1:4:130,42:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,117:0.72:-0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,151:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,150:0.74: 0.98:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,38:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,35:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,98:0.53: 0.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:35,94:0.73:-0.96:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,116:0.71:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,130:0.76: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,134:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,61:0.51:-1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,125:0.76:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,52:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:73,73:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,124:0.74: 0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,42:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,78:0.49:-0.24:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,101:0.52: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,108:0.56: 0.64:1.000:0.960 0/0/1/1:4:43,57:0.57:-1.71:1.000:0.950 0/0/0/1:4:137,55:0.29: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:59,67:0.53:-1.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:90,73:0.45:-0.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:69,70:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,47:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,35:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,77:0.47:-0.06:1.000:0.991 0/1/1/1:4:50,178:0.78: 1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,126:0.72: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,82:0.57:-0.58:1.000:0.952 0/0/0/1:4:160,62:0.28: 1.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,123:0.73: 0.10:0.999:0.997 0/0/0/1:4:134,43:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,51:0.44:-1.30:1.000:0.963 0/0/1/1:4:88,84:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,51:0.47:-1.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,72:0.48:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,69:0.49:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,65:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,52:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,110:0.69:-0.16:1.000:0.971 0/0/0/1:4:135,45:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,128:0.72: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,84:0.54:-0.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:41,134:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,75:0.49:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,86:0.75:-1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,98:0.74:-0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,76:0.49:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,62:0.34: 0.36:1.000:0.846 0/0/1/1:4:88,112:0.56: 0.87:1.000:0.970 0/0/1/1/1:5:56,86:0.60:-0.63:0.982:0.971 0/0/0/1:4:135,44:0.25: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,84:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,160:0.80: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,53:0.30: 0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:68,77:0.53:-0.55:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,115:0.76:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,69:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,87:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,112:0.78:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,51:0.34:-0.42:1.000:0.875 0/0/1/1:4:67,45:0.40:-1.40:1.000:0.791 0/1/1/1:4:65,185:0.74: 2.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,117:0.52: 1.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,94:0.40: 1.70:1.000:0.818 0/1/1/1:4:40,148:0.79: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,102:0.46: 1.44:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,87:0.55:-0.24:1.000:0.977 0/0/0/1:4:151,54:0.26: 1.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:138,48:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,39:0.69:-2.83:1.000:0.965 0/1/1/1:4:18,88:0.83:-1.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,52:0.28: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,96:0.55: 0.17:1.000:0.977 0/0/1/1:4:91,77:0.46: 0.05:1.000:0.985 0/0/1/1:4:91,78:0.46: 0.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,80:0.52:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,118:0.73:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,89:0.67:-0.89:1.000:0.939 0/0/0/1:4:114,40:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,87:0.52: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,132:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,78:0.49:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,105:0.47: 1.44:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,106:0.71:-0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,124:0.76:-0.06:0.999:1.000 0/0/1/1:4:84,101:0.54: 0.49:1.000:0.985 0/0/1/1:4:82,84:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,66:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,73:0.52:-0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,124:0.76:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,145:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,96:0.69:-0.71:1.000:0.976 0/0/1/1:4:77,78:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,100:0.55: 0.38:1.000:0.979 0/0/1/1:4:79,86:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,87:0.44: 0.82:1.000:0.962 0/1/1/1:4:57,97:0.63:-0.32:1.000:0.558 0/0/1/1:4:104,89:0.46: 0.69:1.000:0.987 0/0/1/1:4:116,127:0.52: 1.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,102:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,72:0.49:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,119:0.74:-0.11:1.000:0.998 -chr5.1 34731162 chr5.1_034731162 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:125,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.66:0.944:. ./.:4:79,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.20:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.55:0.999:. ./.:4:110,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.13:1.000:. ./.:6:166,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:197,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:151,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.23:0.996:. ./.:4:109,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:199,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:181,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:203,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.97:0.999:. ./.:4:129,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:5:132,0:.: 0.36:0.982:. ./.:4:80,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:81,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.08:1.000:. -chr5.1 34911821 chr5.1_034911821 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:534,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:523,1:.: 1.04:1.000:. ./.:4:542,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:444,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:466,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:531,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.27:0.944:. ./.:4:529,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:537,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:595,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:417,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:521,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:646,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.39:1.000:. ./.:3:25,0:.:-2.89:0.999:. ./.:4:440,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:452,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:373,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:415,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:612,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:509,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:406,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:496,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.14:1.000:. ./.:6:276,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.28:0.996:. ./.:4:419,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:376,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:274,3:.:-0.91:1.000:. ./.:4:550,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:315,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:339,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:418,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:417,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:630,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:368,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.40:0.999:. ./.:4:450,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:344,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:390,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.34:1.000:. ./.:5:307,0:.:-0.67:0.982:. ./.:4:333,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:456,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:604,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:343,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:386,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:290,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:682,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:771,1:.: 3.00:1.000:. ./.:4:629,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:503,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:396,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:571,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:540,2:.: 1.19:1.000:. ./.:4:649,1:.: 2.04:1.000:. ./.:4:495,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:546,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:490,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:509,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.13:0.999:. ./.:4:494,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:398,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:410,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:472,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:373,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:554,2:.: 1.30:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:703,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:531,0:.: 1.10:1.000:. -chr5.1 35055837 chr5.1_035055837 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:96,267:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:183,124:0.44:-0.01:1.000:0.959 0/0/1/1:4:203,166:0.48: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:281,110:0.31: 0.91:1.000:0.974 1/1/1/1:4:1,366:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:231,231:0.53: 1.68:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,196:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,178:0.49: 0.89:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,319:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,11:0.32:-2.95:1.000:0.959 0/1/1/1:4:17,29:0.65:-2.86:1.000:0.803 0/0/1/1:4:191,125:0.43: 0.09:1.000:0.938 0/0/1/1:4:214,223:0.54: 1.41:1.000:0.987 0/0/1/1:4:192,210:0.55: 1.03:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,366:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,145:0.43: 0.63:1.000:0.940 0/0/1/1:4:231,174:0.46: 1.06:0.944:0.989 0/0/1/1:4:200,153:0.47: 0.49:1.000:0.991 0/1/1/1:4:131,277:0.70: 1.09:1.000:0.981 0/0/0/1:4:380,104:0.24: 1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,17:0.46:-2.93:1.000:0.986 0/0/1/1:4:201,166:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:226,186:0.48: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,166:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,31:0.80:-2.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,308:0.75: 1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,293:0.75: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,219:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,329:0.76: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:222,212:0.52: 1.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:99,229:0.71: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:201,183:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,10:0.49:-3.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,35:0.58:-2.68:1.000:0.906 0/1/1:3:6,11:0.67:-3.18:0.999:1.000 0/0/1/1:4:201,151:0.46: 0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:315,95:0.26: 1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:107,234:0.70: 0.36:1.000:0.987 0/1/1/1:4:76,236:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,169:0.47: 0.83:1.000:0.993 0/0/0/1:4:228,31:0.15:-0.54:1.000:0.987 0/0/1/1:4:121,173:0.61:-0.15:1.000:0.664 0/0/1/1:4:137,117:0.49:-0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,171:0.74:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:197,36:0.18:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,170:0.57: 0.06:1.000:0.949 0/0/1/1:4:209,215:0.54: 1.27:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,243:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,89:0.44:-1.01:1.000:0.973 0/1/1/1:4:69,144:0.69:-1.04:1.000:0.978 0/0/1/1:4:109,134:0.58:-0.71:1.000:0.921 0/1/1/1:4:83,286:0.79: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,166:0.57:-0.03:1.000:0.942 0/0/1/1:4:153,178:0.57: 0.25:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,306:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,199:0.72:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:196,171:0.50: 0.64:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,218:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,238:0.79:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:129,116:0.51:-0.69:1.000:0.887 0/0/0/1:4:227,86:0.30: 0.05:1.000:0.983 0/0/0/1:4:234,93:0.31: 0.21:1.000:0.969 0/0/1/1:4:146,97:0.43:-0.71:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,272:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,108:0.28: 1.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,194:0.72:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,123:0.46:-0.23:1.000:0.988 0/0/0/1:4:254,76:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,184:0.75:-0.66:0.996:1.000 0/0/1/1:4:136,141:0.54:-0.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:157,192:0.58: 0.45:1.000:0.925 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,142:0.65:-0.92:1.000:0.830 0/0/1/1:4:180,189:0.54: 0.66:1.000:0.986 0/1/1/1:4:65,183:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,100:0.45:-0.78:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,298:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,77:0.32:-0.45:1.000:0.961 0/1/1/1:4:81,270:0.78: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,145:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,143:0.73:-1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,169:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:190,161:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,120:0.46:-0.31:1.000:0.988 0/0/0/1:4:194,28:0.16:-0.94:1.000:0.993 0/1/1/1:4:80,248:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,132:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,121:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,141:0.55:-0.44:1.000:0.975 0/0/1/1:4:159,156:0.53: 0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:73,210:0.75:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,195:0.76:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,46:0.18:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,125:0.55:-0.73:1.000:0.982 0/1/1/1:4:83,303:0.80: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,209:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,142:0.56:-0.46:1.000:0.964 0/1/1/1:4:74,203:0.75:-0.34:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,241:1.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,305:1.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,100:0.44:-0.68:1.000:0.964 0/0/1/1:4:107,91:0.49:-1.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,79:0.32:-0.36:1.000:0.964 0/0/1/1:4:109,83:0.46:-1.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:143,111:0.47:-0.59:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,177:0.78:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,207:0.54: 1.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:201,209:0.54: 1.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:224,191:0.49: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,121:0.51:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:249,177:0.45: 1.29:1.000:0.977 0/0/1/1:4:142,143:0.53:-0.25:0.999:0.991 0/0/1/1:4:186,139:0.46: 0.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:187,62:0.28:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:247,79:0.27: 0.19:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,207:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,202:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,165:0.58:-0.11:1.000:0.913 0/0/0/1:4:207,59:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,202:0.75:-0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,181:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,127:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:99,289:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,166:0.72:-0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,173:0.57: 0.12:1.000:0.947 0/0/1/1:4:143,133:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,147:0.66:-0.88:1.000:0.895 0/1/1/1:4:70,191:0.74:-0.52:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,198:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,115:0.52:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:173,191:0.55: 0.61:1.000:0.976 0/1/1/1/1:5:74,238:0.77: 0.04:0.982:0.980 0/1/1/1:4:47,194:0.81:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,160:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:263,206:0.47: 1.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:158,147:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:192,69:0.29:-0.52:1.000:0.991 0/1/1/1:4:55,183:0.78:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,156:0.71:-0.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:205,59:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,203:0.77:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,141:0.45: 0.28:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,204:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:244,204:0.49: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:210,194:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:412,57:0.15: 1.76:1.000:0.989 0/0/1/1:4:175,177:0.53: 0.48:1.000:0.991 0/1/1/1:4:107,300:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,209:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,69:0.20: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,254:0.71: 0.63:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,25:0.73:-2.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,130:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:92,225:0.72: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,177:0.51: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:253,205:0.48: 1.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:110,255:0.71: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:187,175:0.52: 0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,325:0.80: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,195:0.53: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:167,102:0.41:-0.43:1.000:0.864 0/0/1/1:4:173,152:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,254:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,129:0.43: 0.21:1.000:0.934 0/0/1/1:4:224,182:0.48: 1.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:91,269:0.76: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,159:0.46: 0.71:0.999:0.987 0/0/1/1:4:167,155:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,165:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:244,81:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,169:0.70:-0.67:1.000:0.986 0/1/1/1:4:95,218:0.71: 0.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:184,168:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,233:0.75: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,117:0.42:-0.09:1.000:0.918 0/1/1/1:4:134,312:0.72: 1.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:351,117:0.28: 1.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:102,291:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:125,218:0.66: 0.38:1.000:0.841 0/0/0/1:4:304,101:0.28: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:257,263:0.54: 2.31:1.000:0.990 0/1/1/1:4:123,313:0.73: 1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:193,187:0.52: 0.79:1.000:0.994 0/1/1/1:4:91,194:0.70:-0.25:1.000:0.983 -chr5.1 35263239 chr5.1_035263239 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:94,334:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:284,95:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:276,103:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:264,81:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,274:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:408,154:0.26: 2.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,176:0.45:-0.42:1.000:0.974 0/0/0/1:4:322,109:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,337:0.74: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/0:4:248,2:0.01:-2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,147:0.59:-2.15:1.000:0.883 0/0/0/1:4:304,96:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,103:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:385,128:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,315:0.72: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:314,101:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,118:0.23: 1.02:0.944:1.000 0/0/0/1:4:333,140:0.28: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:297,302:0.48: 2.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:390,185:0.30: 2.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:127,158:0.53:-1.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:185,215:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:373,127:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,246:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,101:0.48:-2.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:254,261:0.48: 1.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,224:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:215,238:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:227,276:0.52: 1.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:375,115:0.22: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,116:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,191:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,101:0.57:-3.05:1.000:0.949 0/0/0/1:4:184,57:0.22:-2.12:1.000:1.000 0/0/1:3:74,81:0.49:-3.23:0.999:0.603 0/0/0/1:4:336,115:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:319,115:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:237,223:0.46: 0.70:1.000:0.986 0/0/1/1:4:222,241:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:352,115:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:380,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,231:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:318,117:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,204:0.53:-0.55:1.000:0.991 0/0/0/0:4:424,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,241:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,245:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:172,207:0.52:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:286,75:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,113:0.29:-0.59:1.000:0.990 0/0/1/1:4:176,180:0.48:-0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:93,393:0.78: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,104:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:198,230:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,192:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:325,121:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:320,109:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,242:0.55: 0.17:1.000:0.981 0/0/0/1:4:312,122:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:209,164:0.41:-0.42:1.000:0.527 0/0/0/1:4:318,98:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,110:0.27:-0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:328,147:0.29: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:180,177:0.47:-0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:314,131:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,228:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:239,111:0.30:-0.72:1.000:0.988 0/0/0/1:4:306,104:0.24: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:306,120:0.26: 0.26:0.996:0.998 0/0/1/1:4:172,193:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:324,110:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,296:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:364,107:0.21: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,114:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,242:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:315,119:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,244:0.76:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,89:0.24:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,302:0.71: 0.08:1.000:0.989 0/0/0/0:4:369,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,175:0.49:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,265:0.52: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:240,253:0.48: 1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:236,106:0.29:-0.82:1.000:0.992 0/0/0/0:4:490,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,265:0.52: 0.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:141,144:0.48:-1.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:192,169:0.44:-0.58:1.000:0.970 0/0/1/1:4:205,228:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:198,235:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,167:0.48:-0.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:173,163:0.46:-0.90:1.000:0.986 0/0/0/0:4:436,1:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,72:0.25:-1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:230,258:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:332,120:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:249,83:0.23:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,266:0.72:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:223,230:0.48: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:213,220:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,168:0.52:-1.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:275,133:0.31: 0.03:1.000:0.980 0/0/0/1:4:214,102:0.30:-1.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:261,105:0.27:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:225,90:0.27:-1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:250,121:0.31:-0.45:1.000:0.980 0/0/0/1:4:242,104:0.28:-0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:291,105:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:242,318:0.54: 1.98:1.000:0.988 0/0/1/1:4:202,205:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:268,108:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:393,168:0.28: 1.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,215:0.51:-0.11:0.999:0.996 0/0/0/0:4:344,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,80:0.25:-1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,132:0.27: 0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:182,197:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,222:0.56:-0.37:1.000:0.967 0/0/0/1:4:306,116:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:228,77:0.24:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,107:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,194:0.47:-0.26:1.000:0.994 0/0/0/0:4:401,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,221:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,218:0.51: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,224:0.48: 0.48:1.000:0.994 0/0/0/1:4:311,98:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,161:0.51:-1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,253:0.76:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,166:0.52:-1.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:351,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,129:0.28: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1/1:5:118,201:0.60:-1.12:0.982:0.971 0/0/0/1:4:255,95:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,200:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:280,298:0.49: 2.21:1.000:0.996 0/0/0/0:4:351,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,95:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,188:0.53:-0.86:1.000:0.994 0/0/1/1:4:189,200:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:309,95:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,217:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:393,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,192:0.54:-0.91:1.000:0.985 0/0/1/1:4:245,293:0.52: 1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:237,298:0.53: 1.66:1.000:0.993 0/0/0/0:4:476,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,223:0.46: 0.63:1.000:0.989 0/0/1/1:4:222,259:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:270,108:0.27:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/0:4:521,0:0.00: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,115:0.25: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,130:0.57:-2.43:1.000:0.945 0/0/1/1:4:151,159:0.48:-1.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:313,130:0.27: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:325,103:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:265,270:0.48: 1.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:426,148:0.24: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,95:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,374:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,212:0.49:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:342,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,71:0.19:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,316:0.76:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,110:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:348,132:0.26: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,303:0.73:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:308,121:0.26: 0.30:0.999:0.998 0/0/0/1:4:274,93:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:305,111:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:245,91:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,91:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,294:0.70:-0.02:1.000:0.985 0/0/1/1:4:171,198:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,267:0.72:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,80:0.25:-1.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:281,303:0.49: 2.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:372,131:0.24: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,187:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:208,181:0.44:-0.22:1.000:0.965 0/0/0/1:4:334,133:0.27: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:365,151:0.27: 1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:256,298:0.51: 1.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,104:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:228,230:0.47: 0.67:1.000:0.994 -chr5.1 35363410 chr5.1_035363410 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:118,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:147,22:.: 0.55:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:104,11:.:-0.68:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:164,13:.: 0.73:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:156,13:.: 0.55:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:34,2:.:-2.47:1.000:. ./.:4:39,5:.:-2.29:1.000:. ./.:4:124,16:.:-0.11:1.000:. ./.:4:106,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:128,7:.:-0.22:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.66:0.944:. ./.:4:188,49:.: 2.09:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,10:.: 1.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:112,11:.:-0.50:1.000:. ./.:4:142,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:93,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:124,7:.:-0.32:1.000:. ./.:4:150,15:.: 0.46:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:46,1:.:-2.22:1.000:. ./.:3:12,0:.:-3.02:0.999:. ./.:4:138,12:.: 0.12:1.000:. ./.:4:170,9:.: 0.77:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:179,10:.: 1.00:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:176,18:.: 1.12:1.000:. ./.:4:186,11:.: 1.18:1.000:. ./.:4:139,12:.: 0.14:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:142,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:157,11:.: 0.52:1.000:. ./.:4:168,12:.: 0.80:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:128,10:.:-0.16:1.000:. ./.:4:245,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.75:1.000:. ./.:6:131,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:142,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:157,10:.: 0.50:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,14:.: 0.93:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:153,7:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,14:.: 0.14:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.80:0.996:. ./.:4:128,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:211,11:.: 1.75:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:234,18:.: 2.43:1.000:. ./.:4:120,10:.:-0.34:1.000:. ./.:4:186,13:.: 1.23:1.000:. ./.:4:163,7:.: 0.57:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:146,6:.: 0.16:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:219,13:.: 1.98:1.000:. ./.:4:163,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:194,10:.: 1.34:1.000:. ./.:4:189,12:.: 1.27:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:213,6:.: 1.68:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:116,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:168,8:.: 0.71:1.000:. ./.:4:159,13:.: 0.62:1.000:. ./.:4:136,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:172,10:.: 0.84:1.000:. ./.:4:209,16:.: 1.82:1.000:. ./.:4:79,7:.:-1.34:1.000:. ./.:4:199,13:.: 1.52:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:111,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:151,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:110,5:.:-0.68:1.000:. ./.:4:165,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:164,12:.: 0.71:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:93,5:.:-1.07:1.000:. ./.:4:125,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:153,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:151,15:.: 0.48:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:151,6:.: 0.27:0.999:. ./.:4:144,8:.: 0.16:1.000:. ./.:4:93,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:171,11:.: 0.84:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:184,12:.: 1.16:1.000:. ./.:4:135,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:140,14:.: 0.21:1.000:. ./.:4:183,10:.: 1.09:1.000:. ./.:4:86,9:.:-1.13:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:180,13:.: 1.09:1.000:. ./.:4:159,23:.: 0.84:1.000:. ./.:4:171,8:.: 0.77:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:148,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:91,5:.:-1.11:1.000:. ./.:5:98,0:.:-1.07:0.982:. ./.:4:118,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:139,6:.: 0.00:1.000:. ./.:4:141,11:.: 0.16:1.000:. ./.:4:123,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:119,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:155,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:152,8:.: 0.34:1.000:. ./.:4:106,8:.:-0.70:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:145,14:.: 0.32:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:159,7:.: 0.48:1.000:. ./.:4:120,6:.:-0.43:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:143,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:152,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:69,6:.:-1.59:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:129,12:.:-0.09:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:158,14:.: 0.62:1.000:. ./.:4:112,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:118,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:155,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:138,15:.: 0.18:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:106,9:.:-0.68:1.000:. ./.:4:140,9:.: 0.09:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:117,20:.:-0.18:0.999:. ./.:4:120,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:105,11:.:-0.66:1.000:. ./.:4:89,7:.:-1.11:1.000:. ./.:4:130,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:110,7:.:-0.63:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:116,17:.:-0.27:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:169,12:.: 0.82:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:101,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:132,5:.:-0.18:1.000:. ./.:4:146,17:.: 0.41:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:105,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:101,6:.:-0.86:1.000:. -chr5.1 35543832 chr5.1_035543832 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:74,9:0.28:-1.05:1.000:0.995 0/0/0/0:4:214,1:0.02: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,76:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,93:0.40: 1.75:1.000:0.817 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,97:0.48: 0.65:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,89:0.51: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,81:0.54:-0.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:15,19:0.53:-1.77:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,33:0.61:-1.52:1.000:0.664 0/0/0/1:4:213,5:0.12: 0.92:1.000:0.809 0/0/1/1:4:140,141:0.49: 1.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,95:0.48: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,99:0.56: 0.20:1.000:0.971 0/0/1/1:4:80,99:0.53: 0.35:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.91:0.944:1.000 0/0/0/1:4:156,6:0.20: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,112:0.42: 2.21:1.000:0.902 0/0/1/1:4:23,24:0.49:-1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,112:0.61: 0.29:1.000:0.734 0/1/1/1:4:86,189:0.65: 1.75:1.000:0.779 0/0/0/1:4:77,9:0.28:-1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,15:0.85:-2.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:74,96:0.54: 0.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:168,84:0.40: 1.41:1.000:0.797 0/0/1/1:4:56,90:0.58:-0.13:1.000:0.892 0/0/1/1:4:95,80:0.47: 0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:101,165:0.59: 1.62:1.000:0.874 0/1/1/1:4:52,153:0.70: 0.73:1.000:0.987 0/0/1/1:4:64,78:0.52:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:12,2:0.30:-2.06:1.000:0.985 0/0/0/1:4:32,1:0.16:-1.78:1.000:0.996 0/0/0:3:27,0:0.00:-1.87:0.999:1.000 0/0/0/1:4:86,14:0.30:-0.81:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,75:0.52:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,11:0.30:-1.14:1.000:0.985 0/1/1/1:4:60,152:0.68: 0.83:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,80:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,61:0.46:-0.27:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,80:0.49: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,10:0.28:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,102:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,82:0.53:-0.11:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,112:0.63: 0.20:1.000:0.516 0/0/0/0:4:149,3:0.11:-0.05:1.000:0.663 0/0/1/1:4:71,91:0.54: 0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:154,64:0.38: 0.92:1.000:0.566 0/0/1/1:4:147,82:0.41: 1.08:1.000:0.885 0/0/1/1:4:66,70:0.50:-0.28:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,121:0.50: 1.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:67,69:0.49:-0.28:1.000:0.886 0/0/1/1:4:80,64:0.46:-0.16:1.000:0.987 0/0/1/1:4:68,79:0.51:-0.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,101:0.98:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,84:0.40: 1.41:1.000:0.797 0/0/0/1:4:58,3:0.25:-1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,54:0.48:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,73:0.42: 0.64:1.000:0.907 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.21:0.996:1.000 0/0/0/1:4:164,9:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,154:0.49: 2.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,60:0.52:-0.66:1.000:0.995 0/0/0/0:4:129,1:0.04:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,158:0.58: 1.51:1.000:0.918 0/0/0/1:4:82,5:0.26:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,4:0.26:-1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,68:0.52:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,72:0.40: 0.86:1.000:0.810 0/0/0/1:4:84,11:0.29:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:87,161:0.61: 1.35:1.000:0.641 0/0/0/0:4:131,2:0.08:-0.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:66,77:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,83:0.41: 1.15:1.000:0.875 0/0/1/1:4:58,66:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,57:0.45:-0.31:1.000:0.979 0/1/1/1:4:81,162:0.63: 1.28:1.000:0.564 0/0/1/1:4:63,66:0.49:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,48:0.40:-0.11:1.000:0.754 0/0/1/1:4:51,71:0.55:-0.48:1.000:0.976 0/0/0/1:4:129,6:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,120:0.65: 0.26:1.000:0.829 0/0/1/1:4:69,61:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,82:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,58:0.41: 0.16:1.000:0.859 0/0/1/1:4:77,85:0.50: 0.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,60:0.40: 0.30:1.000:0.828 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,79:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,54:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,69:0.56:-0.54:1.000:0.973 0/0/1/1:4:86,76:0.47: 0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:133,77:0.42: 0.80:1.000:0.907 0/0/0/1:4:51,7:0.29:-1.42:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,63:0.55:-0.67:1.000:0.980 0/0/1/1:4:153,84:0.41: 1.19:1.000:0.874 0/0/0/1:4:193,9:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,6:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,118:0.60: 0.46:1.000:0.808 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,60:0.38: 0.71:0.999:0.570 0/0/1/1:4:86,125:0.56: 0.81:1.000:0.962 0/0/1/1:4:48,61:0.53:-0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:82,93:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,75:0.55:-0.38:1.000:0.976 0/0/1/1:4:54,66:0.53:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,84:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,68:0.52:-0.44:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,78:0.56:-0.34:1.000:0.964 0/0/1/1:4:91,153:0.59: 1.30:1.000:0.835 0/0/1/1:4:182,97:0.41: 1.81:1.000:0.853 0/0/1/1:4:65,81:0.53:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/0:4:144,1:0.04:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,65:0.40: 0.54:1.000:0.819 0/0/0/1:4:99,3:0.16:-0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,61:0.50:-0.57:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,51:0.43:-0.38:1.000:0.954 0/0/1/1:4:95,173:0.61: 1.65:1.000:0.680 0/0/1/1/1:5:41,59:0.56:-0.81:0.982:0.919 1/1/1/1:4:1,90:0.99:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,84:0.58:-0.25:1.000:0.922 0/0/1/1:4:106,92:0.47: 0.62:1.000:0.992 0/0/1/1:4:87,106:0.52: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,61:0.47:-0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,61:0.46:-0.27:1.000:0.987 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-2.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,79:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,78:0.49:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,142:0.61: 0.97:1.000:0.737 0/0/1/1:4:59,52:0.47:-0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:201,124:0.43: 2.48:1.000:0.935 0/0/1/1:4:109,80:0.45: 0.49:1.000:0.978 0/0/1/1:4:168,92:0.41: 1.53:1.000:0.873 0/0/0/0:4:137,2:0.08:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,102:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,70:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,116:0.52: 0.84:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,30:0.52:-1.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,8:0.27:-1.01:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,156:0.63: 1.16:1.000:0.530 0/0/1/1:4:82,109:0.54: 0.52:1.000:0.985 0/0/1/1:4:85,90:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,139:0.63: 0.80:1.000:0.507 0/0/1/1:4:70,80:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,108:0.44: 1.57:1.000:0.969 0/0/1/1:4:74,67:0.48:-0.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:80,157:0.63: 1.19:1.000:0.513 0/0/1/1:4:69,89:0.54: 0.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:104,104:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,87:0.40: 1.47:1.000:0.824 0/0/1/1:4:66,71:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:246,3:0.06: 1.37:0.999:0.999 0/1/1/1:4:74,151:0.63: 1.02:1.000:0.615 0/0/1/1:4:169,172:0.49: 2.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,69:0.39: 0.86:1.000:0.744 0/0/1/1:4:79,69:0.47:-0.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,77:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:136,9:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,52:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,8:0.29:-1.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:83,101:0.52: 0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,98:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,168:0.69: 1.08:1.000:0.974 0/0/1/1:4:39,66:0.60:-0.73:1.000:0.825 0/0/1/1:4:162,88:0.41: 1.38:1.000:0.867 0/0/1/1:4:109,120:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,124:0.53: 0.97:1.000:0.991 0/0/1/1:4:133,172:0.54: 2.19:1.000:0.989 0/0/0/1:4:192,6:0.16: 0.62:1.000:0.996 -chr5.1 37156112 chr5.1_037156112 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,13:.:-0.02:1.000:. ./.:4:16,18:.:-0.97:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:28,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:34,24:.: 0.54:1.000:. ./.:4:19,14:.:-1.03:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.42:1.000:. ./.:4:17,25:.:-0.47:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,11:.:-1.22:1.000:. ./.:4:13,18:.:-1.16:1.000:. ./.:4:16,21:.:-0.78:1.000:. ./.:4:34,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.84:1.000:. ./.:4:35,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:38,21:.: 0.61:0.944:. ./.:4:21,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:26,19:.:-0.28:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,2:.:-2.17:1.000:. ./.:4:38,12:.: 0.04:1.000:. ./.:4:15,16:.:-1.16:1.000:. ./.:4:19,8:.:-1.41:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.67:1.000:. ./.:4:52,12:.: 0.92:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:35,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,18:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:44,11:.: 0.36:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.84:1.000:. ./.:4:9,2:.:-2.42:1.000:. ./.:4:14,14:.:-1.35:1.000:. ./.:3:11,2:.:-2.30:0.999:. ./.:4:24,18:.:-0.47:1.000:. ./.:4:25,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:54,14:.: 1.18:1.000:. ./.:4:69,15:.: 2.19:1.000:. ./.:4:33,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:48,26:.: 1.55:1.000:. ./.:4:38,12:.: 0.04:1.000:. ./.:4:34,31:.: 0.99:1.000:. ./.:4:40,20:.: 0.67:1.000:. ./.:4:49,26:.: 1.62:1.000:. ./.:4:41,17:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:28,27:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,9:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,12:.: 0.92:1.000:. ./.:4:53,9:.: 0.80:1.000:. ./.:4:49,10:.: 0.61:1.000:. ./.:4:56,8:.: 0.92:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:31,23:.: 0.29:1.000:. ./.:4:50,13:.: 0.86:1.000:. ./.:4:35,27:.: 0.80:1.000:. ./.:4:51,30:.: 2.00:1.000:. ./.:6:40,11:.: 0.10:1.000:. ./.:4:47,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:27,18:.:-0.28:1.000:. ./.:4:33,19:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,30:.: 1.87:1.000:. ./.:4:53,14:.: 1.11:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.99:1.000:. ./.:4:20,10:.:-1.22:1.000:. ./.:4:42,10:.: 0.17:1.000:. ./.:4:32,18:.: 0.04:0.996:. ./.:4:10,35:.:-0.28:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.79:1.000:. ./.:4:34,42:.: 1.68:1.000:. ./.:4:29,23:.: 0.17:1.000:. ./.:4:12,48:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,12:.: 0.29:1.000:. ./.:4:40,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:62,2:.: 0.92:1.000:. ./.:4:80,20:.: 3.20:1.000:. ./.:4:35,26:.: 0.73:1.000:. ./.:4:37,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:42,27:.: 1.24:1.000:. ./.:4:58,19:.: 1.74:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,14:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,7:.: 0.67:1.000:. ./.:4:20,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,13:.: 0.42:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.28:1.000:. ./.:4:46,13:.: 0.61:1.000:. ./.:4:21,9:.:-1.22:1.000:. ./.:4:29,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:51,31:.: 2.06:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:40,34:.: 1.55:1.000:. ./.:4:39,28:.: 1.11:1.000:. ./.:4:48,10:.: 0.54:1.000:. ./.:4:39,19:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,30:.: 0.80:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.60:1.000:. ./.:4:57,13:.: 1.30:1.000:. ./.:4:62,13:.: 1.62:1.000:. ./.:4:54,17:.: 1.37:1.000:. ./.:4:30,24:.: 0.29:1.000:. ./.:4:44,25:.: 1.24:1.000:. ./.:4:61,11:.: 1.43:1.000:. ./.:4:35,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,12:.: 0.36:1.000:. ./.:4:46,10:.: 0.42:1.000:. ./.:4:33,24:.: 0.48:1.000:. ./.:4:24,24:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,18:.: 0.99:0.999:. ./.:4:40,21:.: 0.73:1.000:. ./.:4:27,13:.:-0.59:1.000:. ./.:4:45,25:.: 1.30:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.09:1.000:. ./.:4:29,13:.:-0.47:1.000:. ./.:4:29,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,22:.:-0.21:1.000:. ./.:4:41,26:.: 1.11:1.000:. ./.:4:28,30:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,32:.: 1.68:1.000:. ./.:4:25,7:.:-1.10:1.000:. ./.:4:37,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:51,12:.: 0.86:1.000:. ./.:4:39,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:25,23:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,8:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,21:.: 0.29:1.000:. ./.:4:40,19:.: 0.61:1.000:. ./.:4:30,18:.:-0.09:1.000:. ./.:5:48,6:.: 0.29:0.982:. ./.:4:22,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:50,10:.: 0.67:1.000:. ./.:4:39,14:.: 0.23:1.000:. ./.:4:42,25:.: 1.11:1.000:. ./.:4:36,28:.: 0.92:1.000:. ./.:4:38,30:.: 1.18:1.000:. ./.:4:49,23:.: 1.43:1.000:. ./.:4:30,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:16,13:.:-1.29:1.000:. ./.:4:40,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:43,11:.: 0.29:1.000:. ./.:4:24,7:.:-1.16:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.09:1.000:. ./.:4:40,9:.:-0.02:1.000:. ./.:4:35,13:.:-0.09:1.000:. ./.:4:41,19:.: 0.67:1.000:. ./.:4:28,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:19,17:.:-0.84:1.000:. ./.:4:22,3:.:-1.54:1.000:. ./.:4:14,11:.:-1.54:1.000:. ./.:4:33,25:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,20:.: 0.10:1.000:. ./.:4:19,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:15,12:.:-1.41:1.000:. ./.:4:23,15:.:-0.72:1.000:. ./.:4:29,9:.:-0.72:1.000:. ./.:4:26,6:.:-1.10:1.000:. ./.:4:22,11:.:-1.03:1.000:. ./.:4:30,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:24,6:.:-1.22:1.000:. ./.:4:21,8:.:-1.29:1.000:. ./.:4:32,5:.:-0.78:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,25:.:-0.40:0.999:. ./.:4:16,17:.:-1.03:1.000:. ./.:4:25,7:.:-1.10:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.53:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.10:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:49,12:.: 0.73:1.000:. ./.:4:48,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:28,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:51,6:.: 0.48:1.000:. ./.:4:37,25:.: 0.80:1.000:. ./.:4:29,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:23,16:.:-0.65:1.000:. ./.:4:22,7:.:-1.29:1.000:. ./.:4:31,13:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,10:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:34,35:.: 1.24:1.000:. -chr5.1 37261214 chr5.1_037261214 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:176,32:0.18: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,77:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,35:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,26:0.13: 0.93:1.000:0.930 0/0/1/1:4:133,114:0.49: 1.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,46:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,77:0.45: 0.16:1.000:0.975 0/0/0/1:4:213,43:0.19: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,16:0.32:-2.29:1.000:0.960 0/0/1/1:4:53,30:0.39:-1.78:1.000:0.710 0/0/1/1:4:89,86:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,53:0.30: 0.42:1.000:0.986 0/0/1/1:4:91,78:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:195,46:0.22: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,45:0.20: 1.58:0.944:1.000 0/1/1/1:4:105,182:0.64: 2.09:1.000:0.727 0/0/0/1:4:269,56:0.20: 2.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,46:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,12:0.32:-2.57:1.000:0.942 0/0/0/1:4:141,43:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,92:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,78:0.37: 1.01:1.000:0.566 0/0/0/1:4:43,7:0.16:-2.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,57:0.28: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:218,66:0.27: 2.03:1.000:0.998 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,93:0.42: 1.14:1.000:0.922 0/0/1/1:4:135,106:0.47: 1.22:1.000:0.992 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,52:0.29: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:35,10:0.26:-2.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,7:0.17:-2.44:1.000:0.998 0/0/1:3:31,7:0.21:-2.63:0.999:1.000 0/0/0/1:4:220,48:0.21: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,107:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:247,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,29:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,41:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,38:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:110,47:0.33:-0.37:1.000:0.918 0/0/0/1:4:146,46:0.27: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:151,24:0.16:-0.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:113,44:0.31:-0.37:1.000:0.970 0/0/1/1:4:126,68:0.38: 0.33:1.000:0.582 0/0/1/1:4:142,81:0.39: 0.88:1.000:0.729 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,34:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,35:0.31:-0.94:1.000:0.977 0/0/0/1:4:225,45:0.19: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,43:0.29:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:181,41:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:251,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,53:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,42:0.26: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:189,47:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,34:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:94,26:0.25:-1.08:1.000:0.527 0/0/0/1:4:95,38:0.32:-0.83:1.000:0.960 0/0/1/1:4:103,79:0.46: 0.10:1.000:0.989 0/0/0/1:4:147,35:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,35:0.20: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,51:0.29: 0.38:1.000:0.991 0/0/0/0:4:249,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,23:0.22:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,28:0.25:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:159,46:0.26: 0.54:0.996:0.999 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,38:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,30:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,52:0.27: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,85:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,113:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,47:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,41:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,19:0.22:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,47:0.29: 0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:130,58:0.34: 0.21:1.000:0.871 0/0/0/1:4:76,30:0.31:-1.34:1.000:0.965 0/0/1/1:4:130,73:0.39: 0.50:1.000:0.690 0/0/0/1:4:184,41:0.21: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,38:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,34:0.26:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,65:0.47:-0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:142,32:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,50:0.43:-0.98:1.000:0.945 0/0/0/1:4:160,47:0.26: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,35:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,81:0.43: 0.44:1.000:0.957 0/0/0/1:4:133,41:0.27:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:82,22:0.24:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,69:0.42: 0.02:1.000:0.903 0/0/0/1:4:126,37:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,28:0.31:-1.42:1.000:0.978 0/0/1/1:4:58,50:0.49:-1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,40:0.23: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,19:0.29:-1.97:1.000:0.991 0/0/0/1:4:90,29:0.28:-1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,16:0.12:-0.39:1.000:0.720 0/0/0/1:4:114,37:0.28:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,48:0.32:-0.20:1.000:0.952 0/0/0/1:4:197,52:0.24: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,35:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,63:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:191,41:0.20: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,16:0.14:-0.89:0.999:0.972 0/0/0/1:4:102,33:0.28:-0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,50:0.46:-1.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,76:0.57:-0.72:1.000:0.955 0/0/0/0:4:162,3:0.02:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,58:0.48:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,68:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,34:0.27:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,50:0.43:-0.96:1.000:0.937 0/0/0/1:4:119,30:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,54:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,24:0.19:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,31:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,16:0.18:-1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,59:0.44:-0.62:1.000:0.966 0/0/0/1:4:94,22:0.22:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,18:0.15:-0.77:1.000:0.990 0/0/0/1:4:119,33:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,98:0.60:-0.18:1.000:0.776 0/0/0/0/1:5:115,14:0.12:-0.90:0.982:0.973 0/0/0/1:4:111,25:0.21:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,26:0.25:-1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,113:0.41: 2.22:1.000:0.887 0/0/0/1:4:118,30:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,39:0.50:-1.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,52:0.45:-0.98:1.000:0.975 0/0/0/1:4:119,18:0.15:-0.75:1.000:0.989 0/0/1/1:4:95,62:0.42:-0.37:1.000:0.931 0/0/1/1:4:96,65:0.43:-0.30:1.000:0.954 0/0/0/1:4:115,40:0.29:-0.41:1.000:0.992 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,46:0.20: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,44:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,32:0.22:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,59:0.30: 0.90:1.000:0.989 0/0/0/1:4:182,40:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,38:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,44:0.26: 0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:140,40:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,15:0.34:-2.42:1.000:0.885 0/0/0/1:4:138,67:0.36: 0.54:1.000:0.714 0/0/0/1:4:183,46:0.23: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,88:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,35:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,36:0.18: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,58:0.49:-0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,39:0.18: 1.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,44:0.20: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,47:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,65:0.48:-0.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:184,37:0.19: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,48:0.22: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,39:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,44:0.27: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,66:0.52:-0.83:0.999:0.995 0/0/1/1:4:77,80:0.53:-0.37:1.000:0.991 0/0/0/1:4:121,32:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,37:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,44:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,28:0.17: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,33:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,21:0.13: 0.19:1.000:0.904 0/0/0/1:4:163,37:0.21: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:298,0:0.00: 2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,82:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,44:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,55:0.28: 0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:138,31:0.21:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,92:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,42:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,45:0.29:-0.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,76:0.52:-0.41:1.000:0.996 -chr5.1 37451885 chr5.1_037451885 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:76,24:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,50:0.46: 0.30:1.000:0.988 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,27:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:61,34:0.32: 0.18:1.000:0.961 0/0/1/1:4:47,46:0.45: 0.10:1.000:0.976 0/0/0/1:4:38,17:0.27:-1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,41:0.43:-0.18:1.000:0.945 0/0/0/1:4:69,20:0.20:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-3.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.29:-3.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:45,44:0.45:-0.06:1.000:0.976 0/0/0/1:4:61,28:0.28:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,61:0.48: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,29:0.31:-0.26:1.000:0.980 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,34:0.26: 0.99:0.944:0.999 0/1/1/1:4:20,54:0.67:-0.66:1.000:0.921 0/0/0/1:4:89,28:0.21: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,32:0.21: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.45:-3.14:1.000:0.981 0/0/0/1:4:69,27:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,43:0.42: 0.10:1.000:0.895 0/0/1/1:4:37,46:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,2:0.25:-3.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,24:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.26:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,58:0.44: 1.19:1.000:0.959 0/0/1/1:4:42,46:0.47:-0.10:1.000:0.993 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,19:0.21:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,5:0.37:-3.14:1.000:0.529 0/0/0/1:4:19,3:0.12:-2.74:1.000:0.735 0/0/0:3:5,0:0.00:-3.42:0.999:1.000 0/0/0/1:4:58,21:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,40:0.41:-0.10:1.000:0.854 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,26:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,34:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:82,17:0.15: 0.34:1.000:0.987 0/0/0/1:4:52,26:0.29:-0.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:78,37:0.28: 0.99:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,27:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,37:0.24: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,64:0.52: 0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,71:0.55: 1.11:1.000:0.982 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-3.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,21:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,23:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,28:0.21: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,23:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,30:0.21: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,26:0.29:-0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:73,18:0.17: 0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:48,25:0.30:-0.70:1.000:0.983 0/0/0/1:4:72,28:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:63,35:0.32: 0.30:1.000:0.911 0/0/0/1:4:75,36:0.29: 0.83:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,64:0.54: 0.71:1.000:0.988 0/0/0/1:4:65,25:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,22:0.28:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,41:0.27: 1.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.22:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,20:0.18: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,28:0.29:-0.18:0.996:0.993 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,24:0.19: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,14:0.22:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,23:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,55:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,83:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,27:0.33:-0.74:1.000:0.907 0/0/0/1:4:55,27:0.29:-0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:66,34:0.30: 0.38:1.000:0.985 0/0/0/1:4:79,32:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,44:0.29: 1.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:66,28:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,56:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,24:0.19: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,19:0.21:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,35:0.55:-1.30:1.000:0.980 0/0/0/1:4:66,26:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,49:0.59:-0.58:1.000:0.870 0/0/0/1:4:82,22:0.18: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,21:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,57:0.56: 0.10:1.000:0.969 0/0/0/1:4:77,31:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,11:0.18:-1.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,56:0.44: 1.03:1.000:0.958 0/0/0/1:4:77,27:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,31:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,50:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,30:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,32:0.31: 0.06:1.000:0.977 0/0/0/1:4:54,26:0.29:-0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,23:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,27:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,24:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,35:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,25:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,50:0.47: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:89,21:0.17: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,26:0.20: 0.87:0.999:1.000 0/0/0/1:4:97,30:0.21: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,43:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,73:0.52: 1.47:1.000:0.994 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,42:0.40: 0.18:1.000:0.760 0/0/1/1:4:41,44:0.47:-0.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,25:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,48:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,35:0.27: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,32:0.31: 0.06:1.000:0.977 0/0/0/1:4:63,30:0.28: 0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:73,28:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,23:0.21: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,43:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,21:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,24:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,24:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,62:0.58: 0.26:1.000:0.898 0/0/0/0/1:5:70,25:0.23: 0.18:0.982:0.976 0/0/0/1:4:81,32:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,22:0.17: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,74:0.49: 1.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,32:0.29: 0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,79:0.54: 1.71:1.000:0.987 0/0/1/1:4:46,57:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,34:0.27: 0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,46:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,55:0.47: 0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:63,28:0.27: 0.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,36:0.29: 0.79:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,27:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,33:0.30: 0.26:1.000:0.985 0/0/0/1:4:74,23:0.21: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,24:0.20: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,25:0.30:-0.70:1.000:0.983 0/0/0/1:4:84,35:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,18:0.19:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.55:-3.42:1.000:0.983 0/0/1/1:4:22,29:0.52:-1.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,30:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,65:0.52: 0.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,25:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,27:0.27:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,42:0.41: 0.06:1.000:0.866 0/0/0/1:4:60,27:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,26:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,25:0.33:-0.94:1.000:0.915 0/0/1/1:4:50,51:0.46: 0.42:1.000:0.985 0/0/0/1:4:59,30:0.30:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:70,27:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,24:0.21: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,25:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,52:0.46: 0.50:0.999:0.985 0/0/1/1:4:37,50:0.52:-0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,27:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,25:0.27:-0.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,19:0.22:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,23:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,33:0.27: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,22:0.28:-0.90:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,30:0.31:-0.18:1.000:0.976 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,60:0.52: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,37:0.27: 1.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,27:0.28:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:75,30:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,64:0.44: 1.67:1.000:0.962 0/0/0/1:4:55,30:0.31:-0.22:1.000:0.970 0/0/0/1:4:60,29:0.29:-0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,52:0.44: 0.62:1.000:0.971 -chr5.1 37675133 chr5.1_037675133 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:196,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:141,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:169,22:.:-0.40:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:161,76:.: 0.36:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:69,26:.:-1.98:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:122,17:.:-1.25:1.000:. ./.:4:69,19:.:-2.09:1.000:. ./.:4:58,4:.:-2.52:1.000:. ./.:4:160,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:152,23:.:-0.66:1.000:. ./.:4:128,20:.:-1.11:1.000:. ./.:4:118,56:.:-0.68:0.944:. ./.:4:171,29:.:-0.25:1.000:. ./.:4:154,83:.: 0.36:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:224,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:162,17:.:-0.60:1.000:. ./.:4:30,14:.:-2.82:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:135,17:.:-1.04:1.000:. ./.:4:88,31:.:-1.58:1.000:. ./.:4:219,30:.: 0.55:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:159,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:21,4:.:-3.13:1.000:. ./.:4:52,24:.:-2.29:1.000:. ./.:3:27,0:.:-3.10:0.999:. ./.:4:89,31:.:-1.57:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:112,46:.:-0.94:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:194,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:206,35:.: 0.42:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:250,41:.: 1.24:1.000:. ./.:4:133,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:244,48:.: 1.26:1.000:. ./.:4:215,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:243,42:.: 1.14:1.000:. ./.:4:36,22:.:-2.59:1.000:. ./.:4:152,30:.:-0.55:1.000:. ./.:4:224,25:.: 0.55:1.000:. ./.:4:188,24:.:-0.06:1.000:. ./.:4:222,33:.: 0.65:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:229,43:.: 0.93:1.000:. ./.:4:125,62:.:-0.47:1.000:. ./.:4:173,30:.:-0.20:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:153,77:.: 0.24:1.000:. ./.:4:182,31:.:-0.04:1.000:. ./.:6:211,7:.: 0.04:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:249,47:.: 1.33:1.000:. ./.:4:132,52:.:-0.52:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:135,74:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,51:.:-0.99:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:182,33:.:-0.01:0.996:. ./.:4:207,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:340,1:.: 2.06:1.000:. ./.:4:142,22:.:-0.84:1.000:. ./.:4:137,81:.: 0.04:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:191,37:.: 0.21:1.000:. ./.:4:113,40:.:-1.02:1.000:. ./.:4:189,37:.: 0.17:1.000:. ./.:4:338,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:190,32:.: 0.11:1.000:. ./.:4:231,37:.: 0.87:1.000:. ./.:4:165,29:.:-0.35:1.000:. ./.:4:238,45:.: 1.11:1.000:. ./.:4:268,42:.: 1.56:1.000:. ./.:4:155,27:.:-0.55:1.000:. ./.:4:219,21:.: 0.40:1.000:. ./.:4:343,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:169,31:.:-0.25:1.000:. ./.:4:213,40:.: 0.62:1.000:. ./.:4:206,30:.: 0.34:1.000:. ./.:4:189,27:.: 0.01:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:182,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:233,46:.: 1.05:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:268,36:.: 1.46:1.000:. ./.:4:224,46:.: 0.90:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:168,86:.: 0.63:1.000:. ./.:4:145,54:.:-0.27:1.000:. ./.:4:148,56:.:-0.19:1.000:. ./.:4:228,39:.: 0.85:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:119,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:192,24:.: 0.01:1.000:. ./.:4:195,38:.: 0.29:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:266,44:.: 1.56:1.000:. ./.:4:215,32:.: 0.52:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:214,22:.: 0.34:1.000:. ./.:4:242,45:.: 1.18:0.999:. ./.:4:219,46:.: 0.82:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:353,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:149,70:.: 0.06:1.000:. ./.:4:138,51:.:-0.43:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:221,31:.: 0.60:1.000:. ./.:4:230,33:.: 0.78:1.000:. ./.:4:228,30:.: 0.70:1.000:. ./.:4:142,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:197,32:.: 0.22:1.000:. ./.:4:252,51:.: 1.44:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:200,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:173,23:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,48:.:-1.17:1.000:. ./.:4:177,27:.:-0.19:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.53:1.000:. ./.:5:161,19:.:-0.58:0.982:. ./.:4:195,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:226,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:177,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:172,37:.:-0.10:1.000:. ./.:4:134,70:.:-0.19:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:209,44:.: 0.62:1.000:. ./.:4:170,31:.:-0.24:1.000:. ./.:4:109,58:.:-0.79:1.000:. ./.:4:218,40:.: 0.70:1.000:. ./.:4:321,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:177,20:.:-0.30:1.000:. ./.:4:183,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:126,69:.:-0.33:1.000:. ./.:4:169,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:161,18:.:-0.60:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:154,16:.:-0.75:1.000:. ./.:4:204,33:.: 0.36:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:130,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:198,37:.: 0.32:1.000:. ./.:4:143,30:.:-0.70:1.000:. ./.:4:144,14:.:-0.94:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:157,20:.:-0.63:1.000:. ./.:4:92,25:.:-1.62:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:160,26:.:-0.48:1.000:. ./.:4:144,30:.:-0.68:0.999:. ./.:4:237,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:84,29:.:-1.68:1.000:. ./.:4:193,17:.:-0.09:1.000:. ./.:4:148,19:.:-0.79:1.000:. ./.:4:182,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,39:.:-1.25:1.000:. ./.:4:110,36:.:-1.14:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,50:.:-1.50:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:319,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:183,20:.:-0.20:1.000:. -chr5.1 37844680 chr5.1_037844680 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:58,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:34,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:52,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:49,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:49,6:.:-0.43:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:38,2:.:-1.17:1.000:. ./.:4:45,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.41:0.944:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:7,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:72,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,8:.: 2.00:1.000:. ./.:4:50,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.92:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.86:0.999:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:62,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,6:.: 0.91:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:49,4:.:-0.53:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:104,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:11,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:38,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:40,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:72,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:79,2:.: 0.86:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:60,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.46:1.000:. ./.:6:58,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:61,4:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.81:0.996:. ./.:4:59,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:73,4:.: 0.66:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:51,4:.:-0.43:1.000:. ./.:4:51,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:64,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,4:.:-1.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:62,7:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.56:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:62,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:112,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:35,3:.:-1.27:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,3:.: 0.47:1.000:. ./.:4:38,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:69,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:48,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:58,4:.:-0.08:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:67,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:59,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:59,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:55,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.58:0.999:. ./.:4:86,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:43,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:31,2:.:-1.52:1.000:. ./.:4:52,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:62,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:56,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.06:1.000:. ./.:5:47,3:.:-0.68:0.982:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:39,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:71,5:.: 0.61:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:57,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:72,3:.: 0.56:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:118,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,8:.:-0.08:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:61,3:.: 0.02:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.87:1.000:. ./.:4:55,6:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,4:.:-1.02:0.999:. ./.:4:68,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:59,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:52,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:64,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:53,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.28:1.000:. -chr5.1 37976833 chr5.1_037976833 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:354,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:218,96:.: 0.45:1.000:. ./.:4:224,89:.: 0.44:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:28,12:.:-2.96:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:262,84:.: 0.85:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:219,95:.: 0.45:1.000:. ./.:4:216,85:.: 0.29:0.944:. ./.:4:315,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:293,136:.: 1.89:1.000:. ./.:4:27,23:.:-2.84:1.000:. ./.:4:264,91:.: 0.96:1.000:. ./.:4:272,125:.: 1.49:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:33,16:.:-2.85:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:238,98:.: 0.73:1.000:. ./.:4:382,2:.: 1.33:1.000:. ./.:4:309,116:.: 1.84:1.000:. ./.:4:233,105:.: 0.75:1.000:. ./.:4:204,74:.: 0.00:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.68:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.25:0.999:. ./.:4:300,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:207,77:.: 0.08:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:214,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:236,116:.: 0.93:1.000:. ./.:4:179,66:.:-0.41:1.000:. ./.:4:179,74:.:-0.31:1.000:. ./.:4:163,86:.:-0.36:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:204,81:.: 0.09:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:266,97:.: 1.06:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:161,53:.:-0.79:1.000:. ./.:4:166,76:.:-0.44:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:239,99:.: 0.75:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:210,82:.: 0.18:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:210,88:.: 0.25:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:194,60:.:-0.29:1.000:. ./.:6:156,48:.:-0.92:1.000:. ./.:4:193,55:.:-0.37:1.000:. ./.:4:166,69:.:-0.53:1.000:. ./.:4:197,83:.: 0.03:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:233,80:.: 0.44:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:180,77:.:-0.26:1.000:. ./.:4:193,90:.: 0.07:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.52:0.996:. ./.:4:270,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:214,78:.: 0.18:1.000:. ./.:4:160,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:222,95:.: 0.49:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:203,67:.:-0.10:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:226,74:.: 0.28:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:193,55:.:-0.37:1.000:. ./.:4:225,105:.: 0.65:1.000:. ./.:4:202,79:.: 0.04:1.000:. ./.:4:153,54:.:-0.88:1.000:. ./.:4:220,93:.: 0.44:1.000:. ./.:4:134,58:.:-1.07:1.000:. ./.:4:172,40:.:-0.82:1.000:. ./.:4:196,58:.:-0.29:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:193,78:.:-0.08:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:198,68:.:-0.14:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:200,79:.: 0.02:1.000:. ./.:4:155,51:.:-0.89:1.000:. ./.:4:208,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:169,68:.:-0.51:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:345,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:172,70:.:-0.44:1.000:. ./.:4:293,110:.: 1.56:1.000:. ./.:4:170,54:.:-0.67:0.999:. ./.:4:195,79:.:-0.05:1.000:. ./.:4:142,57:.:-0.98:1.000:. ./.:4:198,76:.:-0.05:1.000:. ./.:4:234,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:133,53:.:-1.14:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:216,74:.: 0.15:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:174,49:.:-0.68:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:172,50:.:-0.69:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:269,104:.: 1.19:1.000:. ./.:5:192,0:.:-1.07:0.982:. ./.:4:247,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:207,80:.: 0.12:1.000:. ./.:4:350,145:.: 2.71:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,64:.:-0.59:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:155,67:.:-0.69:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:258,97:.: 0.96:1.000:. ./.:4:150,54:.:-0.92:1.000:. ./.:4:277,106:.: 1.31:1.000:. ./.:4:279,103:.: 1.30:1.000:. ./.:4:231,130:.: 1.04:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:274,113:.: 1.36:1.000:. ./.:4:261,106:.: 1.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:250,81:.: 0.67:1.000:. ./.:4:264,87:.: 0.91:1.000:. ./.:4:280,111:.: 1.41:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:201,76:.:-0.01:1.000:. ./.:4:269,96:.: 1.09:1.000:. ./.:4:210,108:.: 0.50:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:243,86:.: 0.64:1.000:. ./.:4:255,88:.: 0.81:1.000:. ./.:4:252,102:.: 0.95:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:221,90:.: 0.42:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:264,110:.: 1.20:1.000:. ./.:4:266,100:.: 1.10:1.000:. ./.:4:221,93:.: 0.45:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:253,102:.: 0.96:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:180,72:.:-0.32:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:282,138:.: 1.77:1.000:. ./.:4:261,110:.: 1.16:1.000:. ./.:4:220,118:.: 0.75:1.000:. ./.:4:262,85:.: 0.86:1.000:. ./.:4:260,123:.: 1.31:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:412,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:222,87:.: 0.39:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.34:1.000:. -chr5.1 38029905 chr5.1_038029905 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:34,77:0.66: 1.35:1.000:0.886 0/0/1/1:4:45,29:0.38:-0.20:1.000:0.615 0/0/0/1:4:60,19:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,23:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,66:0.49: 2.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,35:0.32: 1.14:1.000:0.942 0/0/1/1:4:24,33:0.56:-0.91:1.000:0.968 0/0/0/1:4:72,30:0.29: 0.97:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,80:0.77: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.46:-2.66:1.000:0.985 0/0/0/1:4:52,22:0.29:-0.20:1.000:0.991 0/0/0/1:4:70,22:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,20:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,62:0.74: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,32:0.28: 1.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:67,28:0.29: 0.68:0.944:0.992 0/0/0/1:4:62,30:0.32: 0.55:1.000:0.954 0/0/1/1:4:52,69:0.55: 1.76:1.000:0.978 0/0/0/1:4:100,35:0.26: 2.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,7:0.56:-2.79:1.000:0.961 0/0/1/1:4:54,49:0.46: 1.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:59,30:0.33: 0.43:1.000:0.918 0/0/1/1:4:38,54:0.57: 0.55:1.000:0.954 0/0/1/1:4:6,4:0.39:-2.87:1.000:0.707 0/0/1/1:4:41,63:0.58: 1.05:1.000:0.898 0/0/1/1:4:45,45:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,54:0.53: 0.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,47:0.54: 0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:82,18:0.18: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,25:0.23: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,36:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,6:0.39:-2.66:1.000:0.707 0/0/0/1:4:20,5:0.20:-2.24:1.000:1.000 0/1/1:3:4,17:0.77:-2.41:0.999:1.000 0/0/0/1:4:75,32:0.29: 1.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:65,19:0.22: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,60:0.53: 1.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,41:0.44: 0.51:1.000:0.967 0/0/0/1:4:50,15:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,41:0.43: 0.60:1.000:0.949 0/0/0/1:4:69,22:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,36:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,43:0.55:-0.11:1.000:0.982 0/0/1/1:4:41,45:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,30:0.56:-1.12:1.000:0.970 0/0/0/1:4:61,19:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,11:0.18:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,36:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,81:0.74: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,17:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,54:0.60: 0.34:1.000:0.814 0/0/1/1:4:45,48:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,19:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,16:0.22:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,32:0.38: 0.18:1.000:0.535 0/0/0/1:4:65,21:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:35,19:0.34:-1.03:1.000:0.909 0/0/0/1:4:47,17:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,16:0.18: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,21:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,30:0.41:-0.28:1.000:0.848 0/0/0/1:4:54,24:0.30:-0.03:1.000:0.983 0/0/1/1:4:43,50:0.52: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,16:0.40:-1.66:1.000:0.801 0/0/0/1:4:54,20:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,13:0.19:-0.41:0.996:0.999 0/0/1/1:4:29,38:0.55:-0.49:1.000:0.981 0/0/0/1:4:53,23:0.30:-0.11:1.000:0.987 0/1/1/1:4:7,29:0.76:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,13:0.16: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:69,28:0.28: 0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,40:0.46: 0.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:43,16:0.27:-0.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,65:0.71: 0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:55,16:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,81:0.73: 1.10:1.000:0.998 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,28:0.50:-0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,42:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,30:0.44:-0.49:1.000:0.963 0/0/0/1:4:63,24:0.27: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,46:0.48: 0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,29:0.44:-0.62:1.000:0.971 0/0/1/1:4:30,31:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,38:0.53:-0.41:1.000:0.991 0/1/1/1:4:23,54:0.67:-0.07:1.000:0.919 0/0/1/1:4:32,29:0.46:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,40:0.53:-0.24:1.000:0.992 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.28:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,25:0.39:-0.70:1.000:0.739 0/0/0/1:4:81,15:0.15: 0.72:1.000:0.992 0/0/0/1:4:46,12:0.20:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,34:0.73:-1.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,22:0.30:-0.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:52,47:0.46: 0.85:1.000:0.989 0/0/1/1:4:25,31:0.54:-0.95:1.000:0.989 0/0/0/1:4:67,20:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.24:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,13:0.20:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,19:0.29:-0.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:70,25:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,19:0.28:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,18:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,66:0.56: 1.51:1.000:0.974 0/0/1/1:4:41,43:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,8:0.12:-0.62:1.000:0.825 0/0/0/1:4:89,34:0.27: 1.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,32:0.50:-0.70:0.999:0.997 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.22:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,21:0.29:-0.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,33:0.47:-0.41:1.000:0.991 0/0/0/1:4:44,21:0.32:-0.57:1.000:0.960 0/0/0/0:4:32,3:0.08:-1.83:1.000:0.976 0/0/0/1:4:47,14:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,22:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,33:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,34:0.42: 0.05:1.000:0.894 0/0/1/1:4:36,37:0.49:-0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,36:0.54:-0.57:1.000:0.989 0/0/0/1:4:49,14:0.22:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,42:0.65:-0.70:1.000:0.775 0/1/1/1:4:13,39:0.71:-1.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:41,24:0.36:-0.57:1.000:0.669 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,34:0.29: 1.47:1.000:0.990 0/0/0/1/1:5:33,34:0.50:-0.49:0.982:0.549 0/0/0/1:4:55,20:0.26:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,47:0.43: 1.18:1.000:0.945 0/0/1/1:4:52,61:0.52: 1.43:1.000:0.994 0/0/0/0:4:83,1:0.01: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,14:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,23:0.48:-1.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,24:0.46:-1.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:57,15:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,29:0.49:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,18:0.38:-1.37:1.000:0.607 0/0/1/1:4:55,58:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,70:0.54: 1.93:1.000:0.986 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,39:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,48:0.41: 1.51:1.000:0.852 0/0/0/1:4:65,27:0.29: 0.55:1.000:0.992 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,29:0.24: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,5:0.35:-2.70:1.000:0.792 0/0/1/1:4:35,46:0.55: 0.09:1.000:0.980 0/0/0/1:4:61,18:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,22:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,63:0.57: 1.18:1.000:0.950 0/0/1/1:4:60,38:0.38: 0.80:1.000:0.563 0/0/0/1:4:47,16:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,77:0.69: 1.14:1.000:0.977 0/0/1/1:4:35,52:0.58: 0.34:1.000:0.927 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,14:0.18:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,86:0.72: 1.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,17:0.28:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,30:0.32: 0.60:1.000:0.961 0/1/1/1:4:15,61:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,29:0.34: 0.18:0.999:0.852 0/0/0/1:4:53,25:0.31:-0.03:1.000:0.966 0/0/0/1:4:46,22:0.32:-0.45:1.000:0.959 0/0/0/1:4:72,23:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,76:0.78: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,52:0.55: 0.51:1.000:0.977 0/1/1/1:4:20,61:0.72: 0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:50,17:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,61:0.56: 1.10:1.000:0.965 0/0/0/1:4:76,20:0.21: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,38:0.44: 0.26:1.000:0.962 0/0/1/1:4:48,50:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,32:0.33: 0.64:1.000:0.903 0/0/0/1:4:77,29:0.27: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,62:0.48: 1.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,18:0.26:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,46:0.48: 0.64:1.000:0.994 -chr5.1 40083095 chr5.1_040083095 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:342,100:.: 0.45:1.000:. ./.:4:298,124:.: 0.31:1.000:. ./.:4:188,130:.:-0.45:1.000:. ./.:4:351,119:.: 0.65:1.000:. ./.:4:369,118:.: 0.78:1.000:. ./.:4:613,144:.: 2.73:1.000:. ./.:4:221,113:.:-0.33:1.000:. ./.:4:431,88:.: 1.01:1.000:. ./.:4:316,146:.: 0.59:1.000:. ./.:4:36,31:.:-2.26:1.000:. ./.:4:156,40:.:-1.33:1.000:. ./.:4:323,224:.: 1.21:1.000:. ./.:4:362,206:.: 1.36:1.000:. ./.:4:345,104:.: 0.50:1.000:. ./.:4:357,153:.: 0.94:1.000:. ./.:4:386,114:.: 0.87:1.000:. ./.:4:304,120:.: 0.32:0.944:. ./.:4:479,118:.: 1.57:1.000:. ./.:4:355,71:.: 0.33:1.000:. ./.:4:344,140:.: 0.75:1.000:. ./.:4:50,25:.:-2.21:1.000:. ./.:4:285,110:.: 0.11:1.000:. ./.:4:494,196:.: 2.24:1.000:. ./.:4:308,100:.: 0.20:1.000:. ./.:4:75,22:.:-2.05:1.000:. ./.:4:437,209:.: 1.93:1.000:. ./.:4:514,174:.: 2.23:1.000:. ./.:4:260,141:.: 0.15:1.000:. ./.:4:377,192:.: 1.37:1.000:. ./.:4:486,154:.: 1.88:1.000:. ./.:4:289,155:.: 0.46:1.000:. ./.:4:316,99:.: 0.25:1.000:. ./.:4:74,6:.:-2.17:1.000:. ./.:4:101,24:.:-1.84:1.000:. ./.:3:39,30:.:-2.25:0.999:. ./.:4:325,123:.: 0.49:1.000:. ./.:4:335,99:.: 0.39:1.000:. ./.:4:248,102:.:-0.22:1.000:. ./.:4:289,156:.: 0.47:1.000:. ./.:4:325,49:.:-0.04:1.000:. ./.:4:192,72:.:-0.84:1.000:. ./.:4:218,97:.:-0.47:1.000:. ./.:4:226,50:.:-0.75:1.000:. ./.:4:189,44:.:-1.06:1.000:. ./.:4:165,37:.:-1.29:1.000:. ./.:4:239,97:.:-0.32:1.000:. ./.:4:394,116:.: 0.94:1.000:. ./.:4:608,138:.: 2.65:1.000:. ./.:4:201,46:.:-0.96:1.000:. ./.:4:222,118:.:-0.29:1.000:. ./.:4:131,93:.:-1.13:1.000:. ./.:4:294,182:.: 0.70:1.000:. ./.:4:262,119:.: 0.01:1.000:. ./.:4:239,179:.: 0.28:1.000:. ./.:4:263,162:.: 0.33:1.000:. ./.:4:227,93:.:-0.43:1.000:. ./.:4:233,168:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:230,97:.:-0.38:1.000:. ./.:6:119,104:.:-1.13:1.000:. ./.:4:178,114:.:-0.64:1.000:. ./.:4:286,96:.: 0.02:1.000:. ./.:4:139,30:.:-1.53:1.000:. ./.:4:163,100:.:-0.85:1.000:. ./.:4:224,167:.: 0.08:1.000:. ./.:4:150,87:.:-1.03:1.000:. ./.:4:128,97:.:-1.12:1.000:. ./.:4:199,145:.:-0.26:1.000:. ./.:4:209,33:.:-1.00:0.996:. ./.:4:396,73:.: 0.65:1.000:. ./.:4:222,238:.: 0.58:1.000:. ./.:4:163,107:.:-0.79:1.000:. ./.:4:267,129:.: 0.12:1.000:. ./.:4:437,136:.: 1.40:1.000:. ./.:4:271,70:.:-0.28:1.000:. ./.:4:207,69:.:-0.75:1.000:. ./.:4:239,109:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,128:.:-0.71:1.000:. ./.:4:202,100:.:-0.56:1.000:. ./.:4:242,152:.: 0.10:1.000:. ./.:4:147,142:.:-0.66:1.000:. ./.:4:214,121:.:-0.32:1.000:. ./.:4:186,184:.:-0.07:1.000:. ./.:4:170,89:.:-0.87:1.000:. ./.:4:170,61:.:-1.08:1.000:. ./.:4:178,132:.:-0.51:1.000:. ./.:4:153,112:.:-0.83:1.000:. ./.:4:158,131:.:-0.66:1.000:. ./.:4:165,118:.:-0.70:1.000:. ./.:4:211,131:.:-0.27:1.000:. ./.:4:188,140:.:-0.37:1.000:. ./.:4:238,114:.:-0.20:1.000:. ./.:4:218,92:.:-0.51:1.000:. ./.:4:251,117:.:-0.09:1.000:. ./.:4:234,94:.:-0.37:1.000:. ./.:4:208,47:.:-0.90:1.000:. ./.:4:143,97:.:-1.01:1.000:. ./.:4:162,99:.:-0.86:1.000:. ./.:4:209,78:.:-0.67:1.000:. ./.:4:265,141:.: 0.19:1.000:. ./.:4:150,87:.:-1.03:1.000:. ./.:4:146,76:.:-1.14:1.000:. ./.:4:112,114:.:-1.11:1.000:. ./.:4:164,156:.:-0.43:1.000:. ./.:4:128,84:.:-1.21:1.000:. ./.:4:176,37:.:-1.21:1.000:. ./.:4:148,89:.:-1.03:1.000:. ./.:4:341,166:.: 0.92:1.000:. ./.:4:380,215:.: 1.56:1.000:. ./.:4:223,136:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,127:.:-0.37:1.000:. ./.:4:388,69:.: 0.56:1.000:. ./.:4:131,158:.:-0.66:0.999:. ./.:4:259,131:.: 0.07:1.000:. ./.:4:197,63:.:-0.87:1.000:. ./.:4:208,127:.:-0.32:1.000:. ./.:4:142,100:.:-1.00:1.000:. ./.:4:184,130:.:-0.48:1.000:. ./.:4:221,105:.:-0.39:1.000:. ./.:4:227,87:.:-0.48:1.000:. ./.:4:275,63:.:-0.30:1.000:. ./.:4:232,145:.:-0.02:1.000:. ./.:4:219,137:.:-0.17:1.000:. ./.:4:470,241:.: 2.40:1.000:. ./.:4:154,108:.:-0.85:1.000:. ./.:4:207,128:.:-0.32:1.000:. ./.:4:185,116:.:-0.57:1.000:. ./.:4:161,79:.:-1.01:1.000:. ./.:4:98,82:.:-1.45:1.000:. ./.:4:132,80:.:-1.21:1.000:. ./.:4:197,85:.:-0.71:1.000:. ./.:4:445,181:.: 1.78:1.000:. ./.:5:158,59:.:-1.18:0.982:. ./.:4:251,38:.:-0.66:1.000:. ./.:4:222,98:.:-0.43:1.000:. ./.:4:455,179:.: 1.84:1.000:. ./.:4:288,101:.: 0.07:1.000:. ./.:4:163,67:.:-1.08:1.000:. ./.:4:216,118:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,42:.:-1.24:1.000:. ./.:4:235,93:.:-0.37:1.000:. ./.:4:209,175:.: 0.03:1.000:. ./.:4:327,99:.: 0.33:1.000:. ./.:4:86,106:.:-1.36:1.000:. ./.:4:407,226:.: 1.83:1.000:. ./.:4:413,136:.: 1.22:1.000:. ./.:4:321,102:.: 0.31:1.000:. ./.:4:279,105:.: 0.03:1.000:. ./.:4:415,114:.: 1.08:1.000:. ./.:4:263,128:.: 0.08:1.000:. ./.:4:363,124:.: 0.78:1.000:. ./.:4:423,154:.: 1.43:1.000:. ./.:4:95,38:.:-1.79:1.000:. ./.:4:354,85:.: 0.43:1.000:. ./.:4:360,122:.: 0.74:1.000:. ./.:4:378,166:.: 1.19:1.000:. ./.:4:390,117:.: 0.92:1.000:. ./.:4:328,172:.: 0.87:1.000:. ./.:4:354,143:.: 0.85:1.000:. ./.:4:368,174:.: 1.17:1.000:. ./.:4:249,227:.: 0.70:1.000:. ./.:4:295,90:.: 0.04:1.000:. ./.:4:319,130:.: 0.50:1.000:. ./.:4:282,185:.: 0.63:1.000:. ./.:4:378,185:.: 1.33:1.000:. ./.:4:376,156:.: 1.10:1.000:. ./.:4:195,142:.:-0.31:1.000:. ./.:4:308,153:.: 0.59:0.999:. ./.:4:387,172:.: 1.30:1.000:. ./.:4:329,160:.: 0.79:1.000:. ./.:4:231,193:.: 0.32:1.000:. ./.:4:233,115:.:-0.23:1.000:. ./.:4:254,129:.: 0.02:1.000:. ./.:4:247,130:.:-0.02:1.000:. ./.:4:187,92:.:-0.73:1.000:. ./.:4:211,101:.:-0.49:1.000:. ./.:4:295,217:.: 0.96:1.000:. ./.:4:290,118:.: 0.20:1.000:. ./.:4:376,176:.: 1.25:1.000:. ./.:4:276,104:.: 0.00:1.000:. ./.:4:298,230:.: 1.07:1.000:. ./.:4:532,168:.: 2.32:1.000:. ./.:4:481,152:.: 1.83:1.000:. ./.:4:283,200:.: 0.75:1.000:. ./.:4:373,113:.: 0.77:1.000:. -chr5.1 40615770 chr5.1_040615770 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:21,10:0.39:-0.55:1.000:0.687 0/0/0/1:4:41,5:0.15: 0.19:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,13:0.44:-0.35:1.000:0.964 0/0/0/1:4:42,10:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:96,3:0.04: 2.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.24:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,4:0.05: 3.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,11:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,3:0.44:-1.70:1.000:0.970 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,3:0.10: 0.00:1.000:0.850 0/0/0/1:4:56,7:0.15: 1.04:1.000:0.990 0/0/0/0:4:60,4:0.09: 1.09:1.000:0.973 0/0/0/1:4:36,9:0.27: 0.14:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,11:0.39:-0.40:0.944:0.697 0/0/0/0:4:71,3:0.06: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,16:0.41: 0.19:1.000:0.891 0/0/1/1:4:33,20:0.44: 0.54:1.000:0.973 0/0/1/1:4:3,2:0.47:-1.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,11:0.47:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/0:4:82,3:0.05: 2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,7:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,15:0.33: 0.74:1.000:0.920 0/0/0/0:4:54,4:0.09: 0.79:1.000:0.902 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,6:0.11: 1.64:1.000:0.539 0/0/0/0:4:97,8:0.10: 3.14:1.000:0.698 0/0/0/1:4:30,10:0.32:-0.10:1.000:0.961 0/0/1/1:4:20,12:0.44:-0.50:1.000:0.970 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-1.75:1.000:0.767 0/0/1/1:4:4,3:0.50:-1.75:1.000:0.997 0/1/1:3:4,5:0.55:-1.65:0.999:0.974 0/0/1/1:4:26,16:0.45: 0.00:1.000:0.978 0/0/0/1:4:46,10:0.24: 0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,11:0.21: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,10:0.31: 0.00:1.000:0.980 0/0/0/1:4:28,5:0.21:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,13:0.42:-0.25:1.000:0.907 0/0/0/1:4:19,5:0.28:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,4:0.28:-1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,8:0.40:-0.90:1.000:0.794 0/0/0/0:4:57,3:0.07: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,6:0.14: 0.74:1.000:0.977 0/0/1/1:4:22,14:0.46:-0.30:1.000:0.985 0/0/0/1:4:20,4:0.23:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.35:-0.50:1.000:0.808 0/0/1/1:4:18,9:0.40:-0.75:1.000:0.794 0/0/0/1:4:24,6:0.27:-0.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,4:0.12: 0.24:1.000:0.672 0/0/1/1:4:20,12:0.44:-0.50:1.000:0.970 0/0/1/1:4:23,14:0.45:-0.25:1.000:0.975 0/0/0/0:4:61,3:0.06: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,5:0.18:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,7:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,5:0.15: 0.14:1.000:0.990 0/0/0/0/0/1:6:27,6:0.25:-0.45:1.000:0.540 0/0/1/1:4:24,11:0.38:-0.35:1.000:0.586 0/0/0/1:4:48,6:0.15: 0.59:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,9:0.39:-0.70:1.000:0.673 0/0/0/1:4:40,4:0.12: 0.10:1.000:0.839 0/0/1/1:4:24,20:0.51: 0.10:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,4:0.29:-1.20:1.000:0.992 0/0/0/1:4:18,6:0.32:-0.90:1.000:0.961 0/0/0/1:4:47,6:0.15: 0.54:0.996:0.992 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,6:0.13: 1.04:1.000:0.911 0/0/0/1:4:20,7:0.33:-0.75:1.000:0.935 0/0/1/1:4:18,12:0.47:-0.60:1.000:0.991 0/0/0/0:4:84,6:0.09: 2.39:1.000:0.936 0/0/0/0:4:56,2:0.05: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,9:0.39:-0.70:1.000:0.673 0/0/0/1:4:38,9:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,6:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,12:0.40:-0.30:1.000:0.794 0/0/0/0:4:48,4:0.11: 0.49:1.000:0.669 0/0/1/1:4:22,15:0.47:-0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,7:0.16: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,8:0.31:-0.45:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,6:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,10:0.27: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,5:0.28:-0.95:1.000:0.994 0/0/0/1:4:25,8:0.31:-0.45:1.000:0.974 0/0/0/1:4:30,8:0.28:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,12:0.42:-0.40:1.000:0.914 0/0/0/1:4:25,6:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,6:0.11: 1.64:1.000:0.539 0/0/0/1:4:24,9:0.34:-0.45:1.000:0.871 0/0/0/1:4:31,7:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:67,2:0.04: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,4:0.10: 0.59:1.000:0.774 0/0/0/0:4:41,2:0.06: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,5:0.15: 0.24:1.000:0.981 0/0/0/1:4:31,5:0.19:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,11:0.38:-0.35:1.000:0.586 0/0/0/1:4:7,3:0.37:-1.60:1.000:0.603 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,6:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.23:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,9:0.44:-0.90:1.000:0.970 0/0/0/1:4:18,6:0.32:-0.90:1.000:0.961 0/0/1/1:4:19,10:0.41:-0.65:1.000:0.875 0/0/0/0:4:49,4:0.10: 0.54:1.000:0.725 0/0/0/1:4:25,7:0.29:-0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:37,13:0.33: 0.39:1.000:0.932 0/0/0/0:4:49,2:0.05: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,13:0.38: 0.00:1.000:0.523 0/0/1/1:4:22,13:0.44:-0.35:0.999:0.964 0/0/0/1:4:48,8:0.20: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,2:0.08:-0.45:1.000:0.982 0/0/0/0:4:52,4:0.10: 0.69:1.000:0.850 0/0/0/1:4:16,5:0.31:-1.05:1.000:0.980 0/0/1/1:4:14,9:0.46:-0.95:1.000:0.987 0/0/0/0:4:62,4:0.08: 1.19:1.000:0.982 0/0/0/1:4:37,7:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,4:0.11: 0.44:1.000:0.606 0/0/0/0:4:43,3:0.09: 0.19:1.000:0.952 0/0/0/1:4:65,8:0.15: 1.54:1.000:0.987 0/0/0/1:4:51,10:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,11:0.46:-0.70:1.000:0.987 0/0/0/1:4:24,7:0.29:-0.55:1.000:0.990 0/0/0/1:4:43,7:0.19: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,4:0.14:-0.20:1.000:0.977 0/0/0/1:4:12,5:0.36:-1.25:1.000:0.676 0/0/0/1:4:20,6:0.30:-0.80:1.000:0.987 0/0/0/1:4:33,3:0.11:-0.30:1.000:0.603 0/0/0/0:4:82,5:0.08: 2.24:1.000:0.991 0/0/0/0/1:5:32,6:0.22:-0.20:0.982:0.989 0/0/0/0:4:38,3:0.10:-0.05:1.000:0.802 0/0/0/1:4:25,11:0.37:-0.30:1.000:0.530 0/0/0/1:4:43,11:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,10:0.18: 1.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,6:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,4:0.09: 0.84:1.000:0.921 0/0/1/1:4:15,8:0.41:-0.95:1.000:0.891 0/0/0/1:4:29,4:0.17:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:51,3:0.08: 0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:48,6:0.15: 0.59:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,14:0.46:-0.30:1.000:0.985 0/0/1/1:4:22,13:0.44:-0.35:1.000:0.964 0/0/0/1:4:26,8:0.30:-0.40:1.000:0.983 0/0/1/1:4:20,12:0.44:-0.50:1.000:0.970 0/0/0/1:4:50,8:0.19: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,6:0.13: 0.94:1.000:0.942 0/0/0/1:4:31,10:0.31:-0.05:1.000:0.972 0/0/0/0:4:54,2:0.05: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.27:-1.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:21,3:0.17:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,7:0.16: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/0:4:64,5:0.10: 1.34:1.000:0.823 0/0/1/1:4:25,22:0.52: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/0:4:56,4:0.09: 0.89:1.000:0.936 0/0/0/0:4:68,4:0.08: 1.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,19:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,14:0.43:-0.15:1.000:0.935 0/0/0/1:4:40,6:0.18: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:88,4:0.06: 2.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,14:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,8:0.31:-0.45:1.000:0.974 0/0/0/1:4:46,5:0.13: 0.44:1.000:0.939 0/0/1/1:4:18,14:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,8:0.20: 0.64:0.999:1.000 0/0/0/0:4:75,3:0.05: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,7:0.19: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,9:0.44:-0.90:1.000:0.970 0/0/0/0:4:45,3:0.09: 0.29:1.000:0.973 0/0/1/1:4:20,9:0.38:-0.65:1.000:0.534 0/0/1/1:4:27,14:0.41:-0.05:1.000:0.854 0/0/0/1:4:16,7:0.37:-0.95:1.000:0.546 0/0/0/1:4:26,10:0.34:-0.30:1.000:0.836 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,15:0.31: 0.99:1.000:0.975 0/0/0/1:4:59,6:0.13: 1.14:1.000:0.867 0/0/0/1:4:32,11:0.32: 0.05:1.000:0.946 0/0/0/1:4:30,12:0.35: 0.00:1.000:0.767 0/0/0/0:4:60,2:0.04: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,16:0.31: 1.24:1.000:0.979 0/0/0/1:4:37,12:0.31: 0.34:1.000:0.970 0/0/0/1:4:43,13:0.30: 0.69:1.000:0.986 -chr5.1 40908635 chr5.1_040908635 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.87:0.944:. ./.:4:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.88:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.88:0.999:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.40:1.000:. ./.:6:49,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.72:0.999:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.18:1.000:. ./.:5:39,0:.: 0.79:0.982:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:22,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.43:1.000:. -chr5.1 41016430 chr5.1_041016430 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:138,60:0.28: 1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,58:0.41:-0.55:1.000:0.851 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,54:0.28: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,102:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,151:0.67: 1.70:1.000:0.907 0/0/1/1:4:62,62:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,134:0.66: 1.11:1.000:0.856 0/0/1/1:4:78,103:0.55: 0.70:1.000:0.983 0/0/0/1:4:55,20:0.24:-2.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,67:0.83:-2.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,81:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,85:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,165:0.75: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,104:0.56: 0.64:1.000:0.970 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,43:0.20: 1.16:0.944:1.000 0/1/1/1:4:55,144:0.70: 1.19:1.000:0.982 0/0/0/1:4:164,72:0.28: 2.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:182,57:0.22: 2.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,13:0.25:-2.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,42:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,167:0.73: 1.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,73:0.42: 0.32:1.000:0.894 0/1/1/1:4:18,55:0.73:-2.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,70:0.45:-0.17:1.000:0.978 0/0/1/1:4:95,108:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:157,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,157:0.72: 1.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,136:0.72: 0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,37:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,26:0.17:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,22:0.33:-2.53:1.000:0.909 0/0/1/1:4:30,27:0.45:-2.66:1.000:0.982 0/0/1:3:23,16:0.39:-3.15:0.999:0.999 0/0/0/1:4:106,42:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,79:0.45: 0.37:1.000:0.976 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,89:0.53: 0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:119,38:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,44:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,41:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,45:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,37:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,60:0.28: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,92:0.52: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,90:0.42: 1.38:1.000:0.893 0/0/0/1:4:104,49:0.30:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:102,29:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,45:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,41:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:133,30:0.17: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,73:0.52:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,48:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,27:0.18:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,67:0.48:-0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,75:0.42: 0.37:1.000:0.923 0/0/1/1:4:87,78:0.45: 0.27:1.000:0.981 0/0/1/1:4:74,78:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:98,29:0.21:-0.77:1.000:0.881 0/0/0/1:4:100,37:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,69:0.45:-0.22:1.000:0.978 0/0/0/1:4:109,44:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,68:0.43:-0.11:1.000:0.944 0/0/0/1:4:151,59:0.26: 1.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,31:0.22:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,43:0.28:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,70:0.47:-0.33:0.996:0.992 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,97:0.54: 0.51:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,59:0.57:-1.50:1.000:0.954 0/0/0/1:4:112,51:0.29: 0.21:1.000:0.992 0/1/1/1:4:42,127:0.72: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,123:0.77:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,40:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,98:0.54: 0.48:1.000:0.985 0/0/0/1:4:97,39:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:115,41:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,67:0.42:-0.06:1.000:0.898 0/0/0/1:4:89,32:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,81:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,49:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,48:0.30:-0.22:1.000:0.981 0/0/1/1:4:83,72:0.44:-0.01:1.000:0.972 0/0/1/1:4:56,46:0.43:-1.44:1.000:0.945 0/0/0/1:4:91,26:0.20:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,47:0.38:-1.06:1.000:0.613 0/0/0/1:4:118,50:0.28: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,68:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,129:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,44:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,59:0.44:-0.71:1.000:0.960 0/1/1/1:4:40,105:0.70:-0.28:1.000:0.983 0/0/1/1:4:73,83:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,66:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,61:0.45:-0.68:1.000:0.978 0/0/1/1:4:75,81:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,49:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,29:0.21:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,61:0.51:-1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,25:0.16:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,25:0.22:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,42:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,27:0.21:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,81:0.45: 0.43:1.000:0.982 0/0/0/1:4:137,48:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,31:0.18: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,95:0.71:-0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:181,48:0.19: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,40:0.27:-0.49:0.999:0.998 0/0/1/1:4:74,81:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,52:0.51:-1.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,82:0.54:-0.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:90,34:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,29:0.19:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,105:0.68:-0.20:1.000:0.961 0/0/1/1:4:51,73:0.57:-0.85:1.000:0.956 0/0/1/1:4:74,73:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,108:0.77:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,91:0.53: 0.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:96,108:0.51: 1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,37:0.26:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,47:0.30:-0.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:62,93:0.58:-0.01:1.000:0.926 0/0/1/1:4:59,64:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,38:0.28:-0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,65:0.46:-0.55:1.000:0.988 0/0/1/1:4:63,83:0.55:-0.25:1.000:0.983 0/1/1/1:4:40,147:0.76: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:74,32:0.28:-1.33:0.982:0.739 0/0/1/1:4:68,52:0.41:-0.96:1.000:0.874 0/0/0/1:4:87,40:0.29:-0.77:1.000:0.990 0/0/1/1:4:106,125:0.52: 2.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,75:0.54:-0.58:1.000:0.989 0/0/1/1:4:48,56:0.52:-1.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,105:0.77:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,23:0.18:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,76:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,113:0.70:-0.01:1.000:0.987 0/0/1/1:4:77,84:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,47:0.21: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,75:0.29: 2.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:142,54:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,43:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,91:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,70:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,66:0.25: 2.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,91:0.46: 0.89:1.000:0.989 0/0/1/1:4:26,39:0.58:-2.45:1.000:0.926 0/0/1/1:4:78,86:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,89:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,135:0.70: 0.86:1.000:0.980 0/0/0/1:4:174,70:0.26: 2.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,109:0.49: 1.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,120:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,54:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,38:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,71:0.51:-0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,104:0.73:-0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,35:0.21:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,44:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,103:0.56: 0.56:1.000:0.963 0/0/0/1:4:114,45:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,83:0.48: 0.27:0.999:0.995 0/1/1/1:4:40,99:0.69:-0.44:1.000:0.966 0/0/1/1:4:87,78:0.45: 0.27:1.000:0.981 0/0/0/1:4:120,43:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,79:0.55:-0.49:1.000:0.975 0/0/0/1:4:113,46:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:100,38:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,24:0.18:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,43:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,95:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,71:0.48:-0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:121,54:0.29: 0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:144,37:0.19: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,159:0.67: 1.97:1.000:0.926 0/0/1/1:4:112,115:0.49: 1.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,94:0.59:-0.03:1.000:0.882 0/0/1/1:4:83,88:0.49: 0.43:1.000:0.997 -chr5.1 41568166 chr5.1_041568166 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:17,46:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:33,15:0.34:-1.08:1.000:0.878 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,47:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,38:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,23:0.37:-0.04:1.000:0.610 0/0/1/1:4:24,22:0.49:-1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,34:0.46: 0.46:1.000:0.988 0/0/1/1:4:27,18:0.42:-1.24:1.000:0.905 0/1/1/1:4:7,25:0.78:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,20:0.26: 1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,23:0.39:-0.31:1.000:0.708 0/0/1/1:4:27,27:0.51:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,24:0.33: 0.57:1.000:0.902 0/0/0/1:4:36,13:0.30:-1.02:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,60:0.75: 0.68:0.944:0.999 0/0/0/1:4:50,22:0.33: 0.24:1.000:0.911 0/1/1/1:4:19,63:0.77: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,47:0.66: 0.24:1.000:0.856 0/0/1/1:4:32,50:0.62: 0.79:1.000:0.619 0/1/1/1:4:15,51:0.78:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,21:0.30: 0.57:1.000:0.986 0/1/1/1:4:28,46:0.63: 0.35:1.000:0.532 0/1/1/1:4:14,70:0.84: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,23:0.45:-0.80:1.000:0.978 0/0/0/1:4:28,13:0.34:-1.46:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,21:0.24: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,11:0.25:-0.91:1.000:0.999 1/1/1/1:4:4,32:0.89:-1.73:1.000:0.519 0/1/1/1:4:16,30:0.66:-1.19:1.000:0.852 0/0/1/1:4:30,40:0.58: 0.13:1.000:0.919 0/1/1/1:4:32,53:0.63: 0.95:1.000:0.556 0/1/1:3:16,35:0.69:-0.91:0.999:1.000 0/0/1/1:4:23,30:0.57:-0.80:1.000:0.937 0/0/1/1:4:28,42:0.61: 0.13:1.000:0.728 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,18:0.42:-1.24:1.000:0.905 0/1/1/1:4:27,58:0.69: 0.95:1.000:0.968 0/1/1/1:4:18,71:0.80: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,53:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,88:0.85: 1.99:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,74:0.74: 1.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,107:0.81: 3.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,40:0.55: 0.35:1.000:0.981 0/0/1/1:4:44,53:0.55: 1.61:1.000:0.975 0/1/1/1:4:17,47:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,54:0.76: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,37:0.84:-1.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,49:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,37:0.62:-0.42:1.000:0.532 0/0/0/1:4:43,18:0.32:-0.36:1.000:0.946 0/1/1/1:4:16,46:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,34:0.81:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,40:0.61:-0.09:1.000:0.663 0/0/1/1:4:28,17:0.40:-1.24:1.000:0.770 0/0/1/1:4:54,78:0.60: 3.52:1.000:0.810 0/0/1/1:4:34,46:0.58: 0.68:1.000:0.905 0/0/1/1/1/1:6:15,38:0.72:-0.80:1.000:0.761 0/1/1/1:4:11,52:0.83:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,32:0.56:-0.53:1.000:0.968 0/1/1/1:4:30,101:0.77: 3.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,59:0.55: 2.26:1.000:0.980 0/1/1/1:4:17,42:0.72:-0.47:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,60:0.85: 0.18:1.000:0.991 0/1/1/1:4:12,56:0.83: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,44:0.52: 1.01:0.996:0.995 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,30:0.42: 0.40:1.000:0.905 0/0/1/1:4:30,17:0.38:-1.13:1.000:0.609 0/1/1/1:4:19,52:0.74: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,20:0.27: 0.95:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,16:0.30:-0.47:1.000:0.984 0/1/1/1:4:20,69:0.78: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,14:0.33:-1.13:1.000:0.939 0/1/1/1:4:13,49:0.79:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,39:0.68:-0.53:1.000:0.946 0/1/1/1:4:30,57:0.66: 1.06:1.000:0.871 0/0/1/1:4:11,16:0.60:-2.23:1.000:0.796 0/0/1/1:4:33,45:0.58: 0.57:1.000:0.896 0/1/1/1:4:24,40:0.63:-0.20:1.000:0.575 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,102:0.84: 2.92:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,22:0.39:-0.47:1.000:0.727 0/0/1/1:4:30,24:0.46:-0.75:1.000:0.986 0/1/1/1:4:15,46:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,48:0.61: 0.62:1.000:0.645 0/1/1/1:4:17,53:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,21:0.46:-1.13:1.000:0.988 0/0/0/1:4:47,24:0.36: 0.18:1.000:0.669 0/1/1/1:4:23,68:0.75: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,18:0.48:-1.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,27:0.38: 0.40:1.000:0.590 0/0/1/1:4:47,53:0.54: 1.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:27,25:0.49:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,47:0.57: 0.84:1.000:0.936 0/1/1/1:4:17,50:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,39:0.70:-0.64:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,82:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,21:0.45:-1.08:1.000:0.982 0/1/1/1:4:11,49:0.82:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,58:0.73: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,60:0.81: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,58:0.88:-0.09:1.000:0.760 0/0/1/1:4:34,33:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,63:0.74: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,46:0.72:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,27:0.40: 0.18:1.000:0.791 0/1/1/1:4:28,64:0.70: 1.33:1.000:0.985 0/1/1/1:4:19,37:0.67:-0.64:0.999:0.901 0/0/1/1:4:48,41:0.47: 1.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,26:0.64:-1.46:1.000:0.687 0/0/1/1:4:35,46:0.58: 0.73:1.000:0.931 0/1/1/1:4:18,42:0.70:-0.42:1.000:0.988 0/1/1/1:4:17,44:0.72:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,27:0.39: 0.29:1.000:0.697 0/0/1/1:4:33,38:0.54: 0.18:1.000:0.985 0/0/1/1:4:41,47:0.54: 1.11:1.000:0.986 0/0/0/1:4:55,23:0.32: 0.57:1.000:0.947 0/0/1/1:4:31,46:0.60: 0.51:1.000:0.754 0/0/0/1:4:33,9:0.25:-1.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,45:0.77:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,46:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,17:0.33:-0.58:1.000:0.937 0/0/1/1:4:30,18:0.40:-1.08:1.000:0.746 0/1/1/1:4:13,35:0.73:-1.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,33:0.54:-0.31:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,58:0.73: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:61,12:0.19: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:19,39:0.68:-0.53:0.982:0.736 0/0/1/1:4:20,23:0.54:-1.35:1.000:0.986 0/1/1/1:4:15,42:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,40:0.57: 0.18:1.000:0.944 0/0/1/1:4:30,32:0.52:-0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:32,45:0.59: 0.51:1.000:0.855 0/0/0/1:4:35,18:0.36:-0.80:1.000:0.652 0/1/1/1:4:14,66:0.83: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,39:0.62:-0.20:1.000:0.624 0/0/1/1:4:41,28:0.42: 0.07:1.000:0.926 0/0/1/1:4:37,46:0.56: 0.84:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,63:0.81: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,59:0.81: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,73:0.79: 1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,46:0.74:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,28:0.44:-0.09:1.000:0.967 0/0/1/1:4:28,43:0.61: 0.18:1.000:0.668 0/1/1/1:4:23,73:0.76: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,41:0.52: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,22:0.44:-0.86:1.000:0.965 0/1/1/1:4:22,36:0.63:-0.53:1.000:0.520 0/0/1/1:4:27,41:0.61: 0.02:1.000:0.698 0/0/0/1:4:53,25:0.35: 0.57:1.000:0.828 0/1/1/1:4:28,69:0.72: 1.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,46:0.57: 0.79:1.000:0.950 0/0/0/1:4:56,21:0.30: 0.51:1.000:0.983 0/1/1/1:4:22,38:0.64:-0.42:1.000:0.677 0/1/1/1:4:22,52:0.71: 0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,42:0.62: 0.07:1.000:0.632 0/0/0/1:4:42,20:0.35:-0.31:1.000:0.813 0/1/1/1:4:16,41:0.72:-0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,41:0.86:-1.08:1.000:0.978 0/0/1/1:4:27,26:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,50:0.71: 0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:30,15:0.36:-1.24:0.999:0.718 0/0/0/1:4:41,17:0.32:-0.53:1.000:0.951 0/0/1/1:4:36,26:0.44:-0.31:1.000:0.959 0/1/1/1:4:7,38:0.85:-1.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,29:0.54:-0.69:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,40:0.67:-0.42:1.000:0.927 0/1/1/1:4:17,33:0.67:-0.97:1.000:0.898 0/1/1/1:4:12,43:0.78:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,56:0.80: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,61:0.60: 1.88:1.000:0.748 0/0/1/1:4:28,19:0.42:-1.13:1.000:0.921 0/1/1/1:4:19,42:0.69:-0.36:1.000:0.977 0/1/1/1:4:23,53:0.70: 0.46:1.000:0.986 0/0/0/1:4:56,28:0.36: 0.90:1.000:0.718 0/0/1/1:4:53,39:0.44: 1.33:1.000:0.966 0/0/0/1:4:32,15:0.34:-1.13:1.000:0.838 0/0/1/1:4:33,19:0.39:-0.86:1.000:0.650 -chr5.1 41728460 chr5.1_041728460 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:0.944:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.50:0.999:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:6:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:0.996:. ./.:4:8,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:13,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:0.999:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:5:8,0:.: 0.62:0.982:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:13,0:.: 2.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:0.999:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.62:1.000:. -chr5.1 41914479 chr5.1_041914479 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:127,50:.: 1.09:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:122,42:.: 0.82:1.000:. ./.:4:191,69:.: 2.82:1.000:. ./.:4:100,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:114,51:.: 0.84:1.000:. ./.:4:136,33:.: 0.92:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:43,23:.:-1.22:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:131,49:.: 1.15:1.000:. ./.:4:116,40:.: 0.65:1.000:. ./.:4:221,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:115,54:.: 0.92:0.944:. ./.:4:92,85:.: 1.09:1.000:. ./.:4:125,47:.: 0.99:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:52,20:.:-1.10:1.000:. ./.:4:132,43:.: 1.05:1.000:. ./.:4:110,49:.: 0.72:1.000:. ./.:4:122,47:.: 0.92:1.000:. ./.:4:64,4:.:-1.18:1.000:. ./.:4:145,51:.: 1.49:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:95,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:174,42:.: 1.90:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:132,45:.: 1.09:1.000:. ./.:4:51,13:.:-1.26:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.41:1.000:. ./.:3:49,0:.:-1.58:0.999:. ./.:4:200,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:121,33:.: 0.61:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:111,38:.: 0.51:1.000:. ./.:4:114,35:.: 0.51:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:71,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:95,46:.: 0.34:1.000:. ./.:4:70,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:90,24:.:-0.22:1.000:. ./.:4:124,55:.: 1.13:1.000:. ./.:4:284,0:.: 3.32:1.000:. ./.:4:69,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:119,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.12:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:79,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,27:.:-0.64:1.000:. ./.:6:68,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:107,45:.: 0.57:1.000:. ./.:4:88,35:.:-0.03:1.000:. ./.:4:66,20:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:83,40:.:-0.03:0.996:. ./.:4:44,70:.:-0.22:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:55,25:.:-0.93:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:91,49:.: 0.32:1.000:. ./.:4:33,67:.:-0.51:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:85,42:.: 0.05:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,26:.:-0.39:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:81,29:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:82,36:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,28:.:-0.68:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:34,21:.:-1.45:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:80,35:.:-0.20:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:47,25:.:-1.10:1.000:. ./.:4:73,35:.:-0.35:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:20,22:.:-1.72:1.000:. ./.:4:69,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:84,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.93:1.000:. ./.:4:169,64:.: 2.26:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:86,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.68:1.000:. ./.:4:107,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:73,21:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,28:.:-0.70:1.000:. ./.:4:104,20:.:-0.01:1.000:. ./.:4:73,25:.:-0.56:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:67,31:.:-0.56:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:35,38:.:-1.08:1.000:. ./.:4:43,18:.:-1.33:1.000:. ./.:4:46,16:.:-1.31:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:124,52:.: 1.07:1.000:. ./.:5:81,17:.:-0.56:0.982:. ./.:4:87,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:151,49:.: 1.57:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:70,20:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,24:.:-1.01:1.000:. ./.:4:41,14:.:-1.45:1.000:. ./.:4:88,35:.:-0.03:1.000:. ./.:4:51,23:.:-1.06:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:133,48:.: 1.17:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:180,36:.: 1.90:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:139,47:.: 1.28:1.000:. ./.:4:53,15:.:-1.18:1.000:. ./.:4:93,36:.: 0.09:1.000:. ./.:4:131,52:.: 1.22:1.000:. ./.:4:96,48:.: 0.40:1.000:. ./.:4:156,45:.: 1.59:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:104,39:.: 0.38:1.000:. ./.:4:134,60:.: 1.45:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:117,39:.: 0.65:1.000:. ./.:4:117,40:.: 0.67:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:98,26:.:-0.01:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:104,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:97,37:.: 0.19:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:116,45:.: 0.76:1.000:. ./.:4:135,39:.: 1.03:1.000:. ./.:4:143,44:.: 1.30:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:167,47:.: 1.86:1.000:. ./.:4:150,59:.: 1.76:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:90,33:.:-0.03:1.000:. -chr5.1 42078298 chr5.1_042078298 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:57,58:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,92:0.82:-0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,115:0.75:-0.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,50:0.33: 0.36:1.000:0.929 0/1/1/1:4:23,88:0.79:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,28:0.30:-1.08:1.000:0.982 0/1/1/1:4:27,93:0.77:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,60:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,55:0.71:-1.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,50:0.45:-0.92:1.000:0.979 0/1/1/1:4:30,71:0.70:-1.20:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,114:0.67: 0.32:1.000:0.937 0/0/1/1:4:70,73:0.51:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,74:0.76:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,26:0.24:-0.36:0.944:1.000 0/0/1/1:4:70,72:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,36:0.26: 0.46:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,65:0.72:-1.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,80:0.69:-0.86:1.000:0.966 0/1/1/1:4:36,112:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,64:0.55:-0.86:1.000:0.982 0/0/0/1:4:44,14:0.28:-2.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:57,154:0.73: 1.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,65:0.78:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,54:0.50:-1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,87:0.48: 0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,95:0.79:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,153:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,65:0.69:-1.35:1.000:0.969 0/0/1/1:4:29,25:0.47:-2.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:66,54:0.46:-0.77:1.000:0.984 0/1/1:3:14,41:0.74:-2.24:0.999:1.000 0/0/1/1:4:67,58:0.47:-0.65:1.000:0.991 0/1/1/1:4:46,111:0.70: 0.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:52,57:0.52:-1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,221:0.82: 2.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,85:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,156:0.77: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,128:0.74: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:121,99:0.46: 1.50:1.000:0.984 0/0/0/1:4:144,41:0.27: 0.70:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,154:0.73: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,84:0.45: 0.77:1.000:0.982 0/0/1/1:4:75,67:0.47:-0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,10:0.43:-2.94:1.000:0.941 0/0/1/1:4:95,92:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,215:0.82: 2.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,129:0.78: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,158:0.77: 1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,158:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,168:0.77: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,84:0.57:-0.16:1.000:0.954 0/0/1/1:4:105,128:0.54: 1.79:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,82:0.33: 2.65:1.000:0.899 0/0/1/1:4:89,113:0.55: 1.09:1.000:0.974 0/1/1/1/1/1:6:35,140:0.80: 0.48:1.000:0.910 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,138:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,131:0.51: 2.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:163,49:0.28: 1.31:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,100:0.52: 0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,76:0.52:-0.20:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,100:0.51: 0.91:0.996:0.996 0/0/1/1:4:65,69:0.51:-0.45:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,273:1.00: 2.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,106:0.55: 0.84:1.000:0.979 0/0/1/1:4:125,126:0.50: 2.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,103:0.71:-0.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:158,63:0.32: 1.52:1.000:0.953 0/0/1/1:4:80,72:0.47:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,108:0.53: 1.07:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,192:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,99:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,162:0.79: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,112:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,110:0.50: 1.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,182:0.78: 1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,79:0.73:-1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,138:0.79: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,157:0.74: 1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,66:0.46:-0.20:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,141:0.79: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,99:0.56: 0.48:1.000:0.965 0/1/1/1:4:28,133:0.82: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,121:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,100:0.53: 0.77:1.000:0.993 0/1/1/1:4:39,118:0.75: 0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,107:0.54: 1.00:1.000:0.990 0/0/1/1:4:93,109:0.54: 1.09:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,148:0.80: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,51:0.31: 0.79:1.000:0.976 0/0/1/1:4:87,84:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,82:0.54:-0.07:1.000:0.988 0/1/1/1:4:48,138:0.74: 0.73:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,145:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,75:0.46: 0.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:96,70:0.43: 0.27:1.000:0.952 0/1/1/1:4:36,108:0.75:-0.22:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,127:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,94:0.68:-0.36:1.000:0.945 0/1/1/1:4:43,161:0.79: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,82:0.48: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,163:0.78: 1.20:0.999:1.000 0/1/1/1:4:51,144:0.73: 0.93:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,104:0.76:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,136:0.70: 0.91:1.000:0.982 0/0/1/1:4:85,91:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,123:0.57: 1.36:1.000:0.946 0/1/1/1:4:38,121:0.76: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,134:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,87:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,87:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,147:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,65:0.71:-1.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,109:0.54: 1.07:1.000:0.989 0/1/1/1:4:49,138:0.73: 0.75:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,116:0.63: 0.66:1.000:0.557 0/0/1/1:4:65,76:0.53:-0.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:93,42:0.34:-0.43:1.000:0.858 0/1/1/1:4:51,143:0.73: 0.91:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,92:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:60,85:0.58:-0.20:0.982:0.959 0/0/1/1:4:71,75:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,107:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,48:0.41:-0.74:1.000:0.874 0/1/1/1:4:46,133:0.74: 0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,127:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,70:0.48:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:127,30:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,144:0.81: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,106:0.55: 0.84:1.000:0.979 0/1/1/1:4:26,89:0.77:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,77:0.52:-0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,105:0.74:-0.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,129:0.71: 0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:29,76:0.72:-1.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,100:0.71:-0.29:1.000:0.989 0/1/1/1:4:40,105:0.72:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,92:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,86:0.72:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,43:0.41:-1.01:1.000:0.863 0/1/1/1:4:21,66:0.75:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.45:-1.76:1.000:0.983 0/0/1/1:4:106,115:0.52: 1.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,87:0.70:-0.70:1.000:0.988 0/1/1/1:4:34,111:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,66:0.55:-0.77:1.000:0.984 0/1/1/1:4:22,59:0.72:-1.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,67:0.48:-0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,82:0.70:-0.86:1.000:0.987 0/1/1/1:4:45,103:0.69:-0.13:1.000:0.976 0/1/1/1:4:32,106:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,70:0.54:-0.59:1.000:0.986 0/0/1/1:4:50,41:0.46:-1.42:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,43:0.47:-1.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,80:0.79:-1.20:0.999:1.000 0/1/1/1:4:40,94:0.70:-0.45:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,65:0.65:-1.24:1.000:0.812 0/0/1/1:4:67,74:0.52:-0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,79:0.77:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,93:0.58: 0.14:1.000:0.926 0/0/1/1:4:61,49:0.45:-0.99:1.000:0.981 0/0/1/1:4:64,68:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,117:0.74: 0.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,123:0.84:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,28:0.29:-0.92:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,126:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,88:0.85:-1.15:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,63:0.51:-0.70:1.000:0.996 -chr5.1 42366255 chr5.1_042366255 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:339,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:370,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:404,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:562,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.59:0.944:. ./.:4:381,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:495,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:580,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:264,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:610,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:443,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:54,0:.:-2.65:0.999:. ./.:4:250,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:513,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:594,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:541,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:528,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:575,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.88:1.000:. ./.:6:323,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:600,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:273,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:556,1:.: 1.87:0.996:. ./.:4:214,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:408,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:373,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:502,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:384,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:570,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:324,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:509,2:.: 1.46:1.000:. ./.:4:276,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:665,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.94:0.999:. ./.:4:468,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:376,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.14:1.000:. ./.:5:348,0:.:-0.01:0.982:. ./.:4:458,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:543,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:585,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:517,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:294,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:230,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:322,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:220,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:579,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:288,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:599,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:330,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.11:1.000:. -chr5.1 42425321 chr5.1_042425321 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:441,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:606,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:125,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:354,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:501,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.10:0.944:. ./.:4:486,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:569,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:592,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:452,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:87,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:495,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:561,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:500,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:518,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:69,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:146,0:.:-2.43:1.000:. ./.:3:37,0:.:-3.50:0.999:. ./.:4:429,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:125,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:345,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:312,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:450,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.20:0.996:. ./.:4:329,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:442,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:356,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:346,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:358,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:482,2:.: 0.87:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:384,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:533,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:467,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:392,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:375,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:378,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:284,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.81:1.000:. ./.:5:268,0:.:-1.24:0.982:. ./.:4:337,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:671,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:566,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:551,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:573,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:81,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:536,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:561,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:511,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.90:0.999:. ./.:4:376,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:326,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:312,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:542,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.22:1.000:. -chr5.1 42706921 chr5.1_042706921 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:310,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:479,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:104,1:.:-2.03:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:518,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:532,0:.: 1.63:0.944:. ./.:4:458,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:539,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:434,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:621,1:.: 2.40:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:501,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:537,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:104,0:.:-2.04:1.000:. ./.:3:41,0:.:-2.58:0.999:. ./.:4:260,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:421,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:495,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:207,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:473,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:534,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.57:1.000:. ./.:6:235,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.10:0.996:. ./.:4:214,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:232,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:368,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:504,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:539,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:407,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:324,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:304,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:168,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.02:1.000:. ./.:5:289,0:.:-0.45:0.982:. ./.:4:249,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:554,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:460,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:468,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:522,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:577,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:551,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.20:0.999:. ./.:4:402,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:437,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:544,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:357,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.43:1.000:. -chr5.1 43043658 chr5.1_043043658 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:290,155:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,369:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,144:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,159:.:-1.21:1.000:. ./.:4:299,307:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,308:.:-0.23:1.000:. ./.:4:247,316:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.31:1.000:. ./.:4:253,132:.: 0.28:1.000:. ./.:4:2,200:.:-0.93:1.000:. ./.:4:212,282:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,459:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,147:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,329:.:-0.09:1.000:. ./.:4:244,153:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,130:.:-1.40:1.000:. ./.:4:299,326:.: 1.86:0.944:. ./.:4:0,296:.:-0.31:1.000:. ./.:4:315,388:.: 2.37:1.000:. ./.:4:1,220:.:-0.80:1.000:. ./.:4:2,89:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,143:.:-1.31:1.000:. ./.:4:1,339:.:-0.02:1.000:. ./.:4:306,281:.: 1.61:1.000:. ./.:4:160,168:.:-0.10:1.000:. ./.:4:318,187:.: 1.07:1.000:. ./.:4:290,161:.: 0.71:1.000:. ./.:4:267,118:.: 0.28:1.000:. ./.:4:269,364:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,183:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,146:.:-1.29:1.000:. ./.:4:105,127:.:-0.73:1.000:. ./.:4:207,224:.: 0.58:1.000:. ./.:3:121,74:.:-0.97:0.999:. ./.:4:275,295:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,324:.:-0.12:1.000:. ./.:4:276,166:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,183:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,263:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,144:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.21:1.000:. ./.:4:260,296:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,392:.: 0.33:1.000:. ./.:4:2,290:.:-0.33:1.000:. ./.:4:262,355:.: 1.81:1.000:. ./.:4:323,218:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,286:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,195:.:-0.96:1.000:. ./.:4:271,154:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,159:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,126:.:-1.42:1.000:. ./.:4:278,154:.: 0.59:1.000:. ./.:4:231,124:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,187:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.41:1.000:. ./.:4:364,346:.: 2.42:1.000:. ./.:4:0,312:.:-0.20:1.000:. ./.:6:75,143:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,147:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.11:1.000:. ./.:4:329,299:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.44:1.000:. ./.:4:249,157:.: 0.42:1.000:. ./.:4:272,327:.: 1.69:1.000:. ./.:4:1,151:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.31:0.996:. ./.:4:0,487:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,173:.:-1.11:1.000:. ./.:4:245,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,536:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,551:.: 1.37:1.000:. ./.:4:208,252:.: 0.77:1.000:. ./.:4:269,136:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,137:.:-1.35:1.000:. ./.:4:234,142:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,321:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.79:1.000:. ./.:4:279,294:.: 1.52:1.000:. ./.:4:284,178:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,322:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,163:.:-1.18:1.000:. ./.:4:184,227:.: 0.45:1.000:. ./.:4:246,115:.: 0.12:1.000:. ./.:4:258,288:.: 1.34:1.000:. ./.:4:222,128:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.42:1.000:. ./.:4:229,238:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1,129:.:-1.40:1.000:. ./.:4:301,323:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,304:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,123:.:-1.44:1.000:. ./.:4:1,242:.:-0.66:1.000:. ./.:4:310,320:.: 1.89:1.000:. ./.:4:229,147:.: 0.22:1.000:. ./.:4:237,124:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,141:.:-1.33:1.000:. ./.:4:4,131:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,141:.:-1.33:1.000:. ./.:4:244,200:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,119:.:-1.45:1.000:. ./.:4:1,178:.:-1.08:1.000:. ./.:4:310,167:.: 0.89:1.000:. ./.:4:210,146:.: 0.09:1.000:. ./.:4:2,255:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,412:.: 0.46:1.000:. ./.:4:194,134:.:-0.10:0.999:. ./.:4:0,427:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,333:.:-0.06:1.000:. ./.:4:264,149:.: 0.46:1.000:. ./.:4:276,129:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.59:1.000:. ./.:4:248,277:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,262:.:-0.53:1.000:. ./.:4:264,146:.: 0.44:1.000:. ./.:4:253,152:.: 0.41:1.000:. ./.:4:2,167:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1,138:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,436:.: 0.62:1.000:. ./.:4:215,265:.: 0.91:1.000:. ./.:4:216,230:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,239:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,307:.:-0.23:1.000:. ./.:5:175,214:.: 0.31:0.982:. ./.:4:0,327:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.37:1.000:. ./.:4:341,414:.: 2.72:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.56:1.000:. ./.:4:217,257:.: 0.87:1.000:. ./.:4:233,243:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,280:.:-0.41:1.000:. ./.:4:288,290:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.35:1.000:. ./.:4:226,105:.:-0.08:1.000:. ./.:4:316,154:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,183:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.35:1.000:. ./.:4:245,139:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,196:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,362:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,102:.:-1.58:1.000:. ./.:4:220,199:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1,324:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,320:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,169:.:-1.14:1.000:. ./.:4:314,347:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.59:1.000:. ./.:4:304,155:.: 0.77:1.000:. ./.:4:260,154:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,308:.:-0.23:1.000:. ./.:4:251,136:.: 0.29:1.000:. ./.:4:317,312:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.27:1.000:. ./.:4:253,154:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.55:0.999:. ./.:4:0,284:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,138:.:-1.34:1.000:. ./.:4:1,108:.:-1.54:1.000:. ./.:4:206,227:.: 0.60:1.000:. ./.:4:250,157:.: 0.42:1.000:. ./.:4:247,134:.: 0.25:1.000:. ./.:4:234,154:.: 0.30:1.000:. ./.:4:235,250:.: 0.94:1.000:. ./.:4:314,200:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1,360:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.27:1.000:. ./.:4:197,295:.: 0.98:1.000:. ./.:4:315,186:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,363:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,178:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,121:.:-1.46:1.000:. ./.:4:1,451:.: 0.72:1.000:. -chr5.1 43331659 chr5.1_043331659 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:85,79:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.62:1.000:. ./.:4:50,110:.: 0.33:1.000:. ./.:4:47,133:.: 0.75:1.000:. ./.:4:57,176:.: 1.86:1.000:. ./.:4:43,184:.: 1.74:1.000:. ./.:4:23,88:.:-0.70:1.000:. ./.:4:48,141:.: 0.94:1.000:. ./.:4:51,144:.: 1.06:1.000:. ./.:4:7,19:.:-2.49:1.000:. ./.:4:11,37:.:-2.03:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.89:1.000:. ./.:4:45,131:.: 0.66:1.000:. ./.:4:56,126:.: 0.79:1.000:. ./.:4:79,143:.: 1.63:1.000:. ./.:4:44,145:.: 0.94:0.944:. ./.:4:45,168:.: 1.44:1.000:. ./.:4:114,131:.: 2.12:1.000:. ./.:4:50,145:.: 1.06:1.000:. ./.:4:5,31:.:-2.28:1.000:. ./.:4:41,123:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.66:1.000:. ./.:4:86,100:.: 0.87:1.000:. ./.:4:7,21:.:-2.45:1.000:. ./.:4:51,149:.: 1.17:1.000:. ./.:4:67,139:.: 1.29:1.000:. ./.:4:51,145:.: 1.08:1.000:. ./.:4:40,126:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,239:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,192:.: 1.00:1.000:. ./.:4:51,123:.: 0.62:1.000:. ./.:4:11,23:.:-2.33:1.000:. ./.:4:15,22:.:-2.26:1.000:. ./.:3:19,11:.:-2.41:0.999:. ./.:4:87,115:.: 1.21:1.000:. ./.:4:33,139:.: 0.58:1.000:. ./.:4:73,77:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.26:1.000:. ./.:4:37,161:.: 1.13:1.000:. ./.:4:43,119:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,90:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,135:.: 0.77:1.000:. ./.:4:53,68:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,99:.:-0.03:1.000:. ./.:4:36,121:.: 0.26:1.000:. ./.:4:47,140:.: 0.89:1.000:. ./.:4:35,114:.: 0.10:1.000:. ./.:4:43,111:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.66:1.000:. ./.:4:44,39:.:-1.29:1.000:. ./.:4:50,130:.: 0.75:1.000:. ./.:4:32,91:.:-0.45:1.000:. ./.:4:33,103:.:-0.18:1.000:. ./.:4:28,99:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,88:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,114:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.39:1.000:. ./.:6:23,63:.:-1.23:1.000:. ./.:4:34,61:.:-1.04:1.000:. ./.:4:27,127:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,108:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,103:.:-0.24:1.000:. ./.:4:33,99:.:-0.26:1.000:. ./.:4:65,62:.:-0.37:1.000:. ./.:4:12,64:.:-1.44:1.000:. ./.:4:30,78:.:-0.77:1.000:. ./.:4:28,106:.:-0.22:0.996:. ./.:4:0,143:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,135:.:-0.18:1.000:. ./.:4:11,67:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.35:1.000:. ./.:4:47,73:.:-0.52:1.000:. ./.:4:29,89:.:-0.56:1.000:. ./.:4:24,77:.:-0.92:1.000:. ./.:4:78,72:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.62:1.000:. ./.:4:32,106:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,83:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,108:.:-0.14:1.000:. ./.:4:29,101:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1,133:.:-0.22:1.000:. ./.:4:25,60:.:-1.25:1.000:. ./.:4:29,67:.:-1.02:1.000:. ./.:4:24,82:.:-0.81:1.000:. ./.:4:70,61:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.52:1.000:. ./.:4:37,116:.: 0.18:1.000:. ./.:4:39,116:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,80:.:-0.81:1.000:. ./.:4:27,106:.:-0.24:1.000:. ./.:4:31,95:.:-0.39:1.000:. ./.:4:11,61:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.73:1.000:. ./.:4:25,105:.:-0.30:1.000:. ./.:4:42,121:.: 0.39:1.000:. ./.:4:18,46:.:-1.69:1.000:. ./.:4:35,84:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,74:.:-1.48:1.000:. ./.:4:27,65:.:-1.10:1.000:. ./.:4:48,45:.:-1.08:1.000:. ./.:4:30,117:.: 0.05:1.000:. ./.:4:28,85:.:-0.66:1.000:. ./.:4:43,143:.: 0.87:1.000:. ./.:4:107,100:.: 1.32:1.000:. ./.:4:72,56:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,211:.: 2.85:1.000:. ./.:4:34,70:.:-0.85:0.999:. ./.:4:0,149:.: 0.10:1.000:. ./.:4:16,92:.:-0.77:1.000:. ./.:4:29,98:.:-0.37:1.000:. ./.:4:18,72:.:-1.15:1.000:. ./.:4:23,93:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,83:.:-0.81:1.000:. ./.:4:24,78:.:-0.89:1.000:. ./.:4:30,122:.: 0.16:1.000:. ./.:4:19,88:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,157:.: 1.29:1.000:. ./.:4:40,76:.:-0.60:1.000:. ./.:4:28,90:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,82:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1,95:.:-1.02:1.000:. ./.:4:24,69:.:-1.08:1.000:. ./.:4:22,90:.:-0.68:1.000:. ./.:4:31,98:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,218:.: 1.55:1.000:. ./.:5:43,47:.:-1.15:0.982:. ./.:4:34,120:.: 0.20:1.000:. ./.:4:29,98:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,176:.: 2.01:1.000:. ./.:4:32,100:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,72:.:-1.08:1.000:. ./.:4:24,57:.:-1.34:1.000:. ./.:4:45,44:.:-1.17:1.000:. ./.:4:35,82:.:-0.58:1.000:. ./.:4:30,67:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,59:.:-1.27:1.000:. ./.:4:47,122:.: 0.52:1.000:. ./.:4:54,142:.: 1.08:1.000:. ./.:4:53,166:.: 1.57:1.000:. ./.:4:110,71:.: 0.77:1.000:. ./.:4:63,133:.: 1.08:1.000:. ./.:4:26,122:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,186:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,198:.: 1.13:1.000:. ./.:4:9,16:.:-2.51:1.000:. ./.:4:60,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,212:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.66:1.000:. ./.:4:51,149:.: 1.17:1.000:. ./.:4:54,140:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.18:1.000:. ./.:4:42,132:.: 0.62:1.000:. ./.:4:41,115:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,122:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.07:1.000:. ./.:4:34,102:.:-0.18:1.000:. ./.:4:49,186:.: 1.91:1.000:. ./.:4:47,130:.: 0.68:1.000:. ./.:4:26,108:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.37:0.999:. ./.:4:0,174:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1,167:.: 0.50:1.000:. ./.:4:41,117:.: 0.28:1.000:. ./.:4:40,130:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,115:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,72:.: 0.28:1.000:. ./.:4:25,74:.:-0.96:1.000:. ./.:4:80,84:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,162:.: 1.21:1.000:. ./.:4:47,114:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,164:.: 1.25:1.000:. ./.:4:32,122:.: 0.20:1.000:. ./.:4:52,183:.: 1.91:1.000:. ./.:4:50,165:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.85:1.000:. -chr5.1 43546718 chr5.1_043546718 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:13,2:.: 1.00:0.944:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:15,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.98:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.55:0.999:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:6:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:0.996:. ./.:4:15,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.63:1.000:. ./.:5:13,0:.: 0.57:0.982:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:14,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:16,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.84:0.999:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.21:1.000:. -chr5.1 43975177 chr5.1_043975177 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:74,36:0.35: 1.54:1.000:0.804 0/1/1/1:4:25,51:0.67:-0.05:1.000:0.912 0/0/1/1:4:41,41:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,49:0.66:-0.15:1.000:0.865 0/0/0/1:4:80,25:0.27: 1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,53:0.55: 0.93:1.000:0.981 0/0/0/1:4:39,14:0.29:-1.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:40,43:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,37:0.44: 0.42:1.000:0.970 0/1/1/1:4:6,16:0.72:-2.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:19,1:0.06:-2.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,54:0.75:-0.29:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,44:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,34:0.41: 0.46:1.000:0.838 0/0/1/1:4:48,53:0.53: 1.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:78,28:0.29: 1.35:0.944:0.991 0/0/0/1:4:93,18:0.19: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,38:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,10:0.45:-2.53:1.000:0.975 0/0/1/1:4:45,45:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,77:0.79: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,18:0.27:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/0:4:19,2:0.11:-2.63:1.000:0.538 0/0/1/1:4:51,50:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,95:0.84: 1.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,31:0.40: 0.18:1.000:0.780 0/0/1/1:4:46,34:0.44: 0.14:1.000:0.962 0/1/1/1:4:30,61:0.67: 0.65:1.000:0.908 0/1/1/1:4:25,73:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,52:0.56: 0.75:1.000:0.965 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-3.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,2:0.12:-2.72:1.000:0.779 0/1/1:3:3,4:0.57:-3.28:0.999:0.993 0/0/0/1:4:61,19:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,47:0.52: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,23:0.31: 0.14:1.000:0.969 0/1/1/1:4:25,57:0.69: 0.23:1.000:0.975 0/0/0/1:4:75,14:0.18: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,44:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,48:0.59: 0.23:1.000:0.886 0/0/0/1:4:79,22:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,41:0.46: 0.70:1.000:0.985 0/0/1/1:4:51,34:0.41: 0.37:1.000:0.888 0/0/0/1:4:53,22:0.32:-0.10:1.000:0.958 0/0/0/1:4:43,22:0.36:-0.57:1.000:0.702 0/0/0/1:4:62,18:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,39:0.65:-0.80:1.000:0.772 0/0/1/1:4:30,35:0.54:-0.57:1.000:0.987 0/0/1/1:4:49,58:0.54: 1.40:1.000:0.984 0/1/1/1:4:23,57:0.71: 0.14:1.000:0.990 0/1/1/1:4:18,67:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,38:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,35:0.40: 0.60:1.000:0.825 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,21:0.30: 0.00:1.000:0.986 0/0/1/1:4:45,43:0.49: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:19,43:0.69:-0.71:1.000:0.901 0/1/1/1:4:16,49:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,53:0.50: 1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,19:0.25: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,30:0.47:-0.57:1.000:0.992 0/1/1/1:4:15,52:0.77:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,20:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,16:0.44:-1.88:1.000:0.972 0/1/1/1:4:27,54:0.66: 0.18:1.000:0.891 0/0/0/1:4:66,19:0.26: 0.37:0.996:0.999 0/0/1/1:4:38,44:0.54: 0.23:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,25:0.56:-1.50:1.000:0.971 0/0/1/1:4:53,36:0.42: 0.56:1.000:0.907 0/1/1/1:4:25,62:0.71: 0.46:1.000:0.990 0/0/0/1:4:56,13:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,18:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,34:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,50:0.75:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,13:0.19: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,63:0.72: 0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,46:0.79:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,43:0.54: 0.14:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,66:0.74: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,42:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,46:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,66:0.68: 0.93:1.000:0.945 0/0/1/1:4:30,24:0.45:-1.08:1.000:0.984 0/1/1/1:4:8,38:0.82:-1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,21:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,45:0.53: 0.37:1.000:0.991 0/1/1/1:4:18,39:0.68:-0.94:1.000:0.955 0/0/1/1:4:37,30:0.46:-0.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:49,42:0.47: 0.65:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,51:0.75:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,22:0.37:-0.71:1.000:0.516 0/0/0/1:4:59,14:0.22:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,47:0.79:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.53:-1.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:52,16:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,56:0.55: 1.17:1.000:0.978 0/0/1/1:4:19,11:0.38:-2.21:1.000:0.623 0/0/1/1:4:44,47:0.52: 0.65:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,44:0.72:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:49,18:0.30:-0.47:1.000:0.988 0/0/0/1:4:79,22:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,42:0.47: 0.65:1.000:0.992 0/1/1/1:4:21,67:0.75: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,61:0.61: 1.07:1.000:0.696 0/0/1/1:4:45,40:0.48: 0.37:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,63:0.81: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,20:0.21: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,56:0.76:-0.19:0.999:1.000 0/0/1/1:4:48,57:0.55: 1.31:1.000:0.984 0/0/1/1:4:31,27:0.47:-0.89:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,48:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,18:0.40:-1.41:1.000:0.782 0/0/1/1:4:24,29:0.55:-1.13:1.000:0.980 0/0/1/1:4:40,25:0.40:-0.57:1.000:0.794 0/0/1/1:4:58,42:0.43: 1.07:1.000:0.952 0/0/0/1:4:59,15:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,23:0.42:-0.99:1.000:0.929 0/1/1/1:4:17,53:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,81:0.76: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,42:0.53: 0.09:1.000:0.990 0/1/1/1:4:21,54:0.71:-0.10:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,43:0.72:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,34:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,19:0.42:-1.41:1.000:0.906 0/0/1/1:4:29,17:0.39:-1.46:1.000:0.655 0/0/1/1:4:35,33:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,56:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/0/1:5:49,8:0.16:-0.94:0.982:0.998 0/0/0/1:4:57,21:0.30: 0.04:1.000:0.988 0/0/1/1:4:42,44:0.52: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,50:0.45: 1.73:1.000:0.979 0/0/1/1:4:51,44:0.47: 0.84:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,25:0.52:-1.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,33:0.48:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,42:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,56:0.84:-0.52:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,58:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,28:0.55:-1.22:1.000:0.978 0/1/1/1:4:20,82:0.80: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,43:0.45: 0.98:1.000:0.979 0/0/1/1:4:43,49:0.54: 0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,43:0.45: 0.93:1.000:0.983 0/0/1/1:4:47,64:0.58: 1.59:1.000:0.923 0/0/1/1:4:35,29:0.46:-0.61:1.000:0.989 0/0/1/1:4:54,53:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,39:0.47: 0.37:1.000:0.991 0/0/0/1:4:10,5:0.35:-2.91:1.000:0.752 0/0/0/1:4:50,13:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,43:0.52: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,82:0.75: 1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,41:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,41:0.48: 0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,45:0.71:-0.66:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,51:0.56: 0.70:1.000:0.972 0/1/1/1:4:18,66:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,48:0.55: 0.51:1.000:0.982 0/1/1/1:4:14,42:0.74:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,46:0.47: 1.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,38:0.44: 0.56:1.000:0.965 0/1/1/1:4:21,65:0.75: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,34:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,55:0.73:-0.10:0.999:0.997 0/1/1/1:4:19,57:0.74:-0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,49:0.66:-0.15:1.000:0.865 0/0/1/1:4:41,48:0.54: 0.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:36,39:0.52:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,33:0.47:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,43:0.53: 0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:61,14:0.21:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,64:0.58: 1.59:1.000:0.923 0/0/1/1:4:43,32:0.44:-0.10:1.000:0.964 0/1/1/1:4:29,88:0.75: 1.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,25:0.33: 0.23:1.000:0.927 0/1/1/1:4:24,62:0.72: 0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,45:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,45:0.49: 0.70:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,56:0.54: 1.31:1.000:0.989 -chr5.1 44186903 chr5.1_044186903 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:133,49:.: 0.99:1.000:. ./.:4:113,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:137,56:.: 1.29:1.000:. ./.:4:200,5:.: 1.63:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.32:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:103,42:.:-0.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:37,19:.:-2.52:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:109,45:.: 0.21:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,53:.: 1.55:0.944:. ./.:4:185,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:133,56:.: 1.18:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,1:.:-2.46:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:96,32:.:-0.51:1.000:. ./.:4:20,5:.:-3.38:1.000:. ./.:4:149,44:.: 1.29:1.000:. ./.:4:134,64:.: 1.43:1.000:. ./.:4:123,55:.: 0.88:1.000:. ./.:4:134,67:.: 1.52:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:13,1:.:-3.68:1.000:. ./.:4:27,10:.:-3.04:1.000:. ./.:3:13,2:.:-3.66:0.999:. ./.:4:83,59:.:-0.12:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:101,44:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:121,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,47:.: 0.96:1.000:. ./.:4:66,48:.:-0.90:1.000:. ./.:4:105,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:137,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,32:.:-0.46:1.000:. ./.:4:201,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:138,56:.: 1.32:1.000:. ./.:4:104,54:.: 0.32:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:103,43:.:-0.01:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:95,13:.:-1.07:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:164,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:105,36:.:-0.15:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:116,40:.: 0.27:1.000:. ./.:4:69,31:.:-1.29:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.43:0.996:. ./.:4:137,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:93,40:.:-0.37:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:122,43:.: 0.52:1.000:. ./.:4:115,32:.: 0.02:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:133,52:.: 1.07:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:125,54:.: 0.91:1.000:. ./.:4:121,51:.: 0.71:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:74,29:.:-1.21:1.000:. ./.:4:103,33:.:-0.29:1.000:. ./.:4:102,53:.: 0.24:1.000:. ./.:4:115,52:.: 0.57:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:86,48:.:-0.35:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:126,53:.: 0.91:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:111,51:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:91,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:70,27:.:-1.37:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:152,71:.: 2.13:1.000:. ./.:4:123,40:.: 0.46:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:94,43:.:-0.26:0.999:. ./.:4:200,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:107,44:.: 0.13:1.000:. ./.:4:99,39:.:-0.23:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:154,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:65,31:.:-1.40:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:146,57:.: 1.57:1.000:. ./.:4:107,44:.: 0.13:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:130,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:86,34:.:-0.74:1.000:. ./.:4:68,29:.:-1.37:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.01:1.000:. ./.:5:99,30:.:-0.48:0.982:. ./.:4:140,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,64:.: 1.80:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:77,43:.:-0.74:1.000:. ./.:4:93,39:.:-0.40:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:83,35:.:-0.79:1.000:. ./.:4:135,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:72,33:.:-1.15:1.000:. ./.:4:117,54:.: 0.68:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:125,48:.: 0.74:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:107,45:.: 0.15:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:87,48:.:-0.32:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:123,49:.: 0.71:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:120,53:.: 0.74:1.000:. ./.:4:132,57:.: 1.18:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:108,41:.: 0.07:1.000:. ./.:4:131,69:.: 1.49:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:99,48:.: 0.02:1.000:. ./.:4:147,2:.: 0.07:0.999:. ./.:4:148,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:100,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:111,46:.: 0.29:1.000:. ./.:4:94,38:.:-0.40:1.000:. ./.:4:100,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:88,34:.:-0.68:1.000:. ./.:4:134,59:.: 1.29:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:97,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:128,51:.: 0.91:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.65:1.000:. -chr5.1 44410864 chr5.1_044410864 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:99,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.44:0.944:. ./.:4:160,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:137,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:105,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.70:1.000:. ./.:6:32,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.46:0.996:. ./.:4:71,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:144,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:95,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:118,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:79,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.04:1.000:. ./.:5:54,0:.:-0.27:0.982:. ./.:4:77,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:135,1:.: 2.26:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:98,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.33:1.000:. -chr5.1 45033046 chr5.1_045033046 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.60:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1,13:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.43:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.71:0.944:. ./.:4:0,27:.: 2.67:1.000:. ./.:4:3,18:.: 1.60:1.000:. ./.:4:8,16:.: 2.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,14:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.89:1.000:. ./.:4:5,8:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:3,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.90:1.000:. ./.:3:0,2:.:-1.79:0.999:. ./.:4:1,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:1,5:.:-1.08:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1,13:.: 0.35:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.08:1.000:. ./.:4:8,14:.: 1.78:1.000:. ./.:4:3,12:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,15:.: 1.42:1.000:. ./.:4:3,7:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:4,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:6:2,14:.: 0.71:1.000:. ./.:4:2,14:.: 0.71:1.000:. ./.:4:2,7:.:-0.54:1.000:. ./.:4:5,18:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:3,13:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:5,15:.: 1.42:1.000:. ./.:4:5,11:.: 0.71:0.996:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,19:.: 1.25:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:5,7:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,15:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:2,22:.: 2.14:1.000:. ./.:4:3,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2,11:.: 0.17:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,16:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,20:.: 1.42:1.000:. ./.:4:8,17:.: 2.32:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,14:.: 0.89:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.53:1.000:. ./.:4:7,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:3,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.53:0.999:. ./.:4:0,18:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.79:1.000:. ./.:4:0,22:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:5,16:.: 1.60:1.000:. ./.:4:3,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,11:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:6,12:.: 1.07:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:6,8:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.35:1.000:. ./.:5:0,7:.:-0.90:0.982:. ./.:4:4,7:.:-0.18:1.000:. ./.:4:3,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.61:1.000:. ./.:4:2,16:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:7,13:.: 1.42:1.000:. ./.:4:5,16:.: 1.60:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,23:.: 2.67:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,26:.: 2.50:1.000:. ./.:4:9,22:.: 3.39:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:7,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,18:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.00:0.999:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:6,7:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:1,11:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:5,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:6,10:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,13:.: 0.17:1.000:. -chr5.1 45250257 chr5.1_045250257 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,14:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,5:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,13:.: 0.94:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.61:1.000:. ./.:4:8,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,7:.:-0.97:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.55:0.944:. ./.:4:0,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:2,12:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.40:1.000:. ./.:4:5,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:6,10:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:4,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.83:1.000:. ./.:4:4,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.25:1.000:. ./.:4:1,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.83:1.000:. ./.:4:16,6:.: 1.58:1.000:. ./.:3:2,11:.:-0.33:0.999:. ./.:4:5,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:6,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:6,9:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.40:1.000:. ./.:4:6,15:.: 1.37:1.000:. ./.:4:3,10:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,8:.:-0.76:1.000:. ./.:4:7,14:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,12:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:3,10:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,9:.: 0.73:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,18:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,8:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,8:.:-0.55:1.000:. ./.:6:6,12:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:7,13:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,25:.: 2.22:1.000:. ./.:4:6,17:.: 1.80:1.000:. ./.:4:4,16:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.83:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:11,11:.: 1.58:0.996:. ./.:4:0,11:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,16:.: 1.16:1.000:. ./.:4:4,15:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.76:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.76:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.94:1.000:. ./.:4:5,15:.: 1.16:1.000:. ./.:4:8,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:6,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,17:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,20:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:5,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,6:.:-1.40:1.000:. ./.:4:7,10:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,19:.: 2.01:1.000:. ./.:4:3,4:.:-1.61:1.000:. ./.:4:5,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:10,6:.: 0.30:1.000:. ./.:4:13,11:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,22:.: 1.58:1.000:. ./.:4:4,22:.: 2.44:1.000:. ./.:4:7,13:.: 1.16:1.000:. ./.:4:6,12:.: 0.73:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:2,8:.:-0.97:1.000:. ./.:4:3,19:.: 1.58:1.000:. ./.:4:6,15:.: 1.37:1.000:. ./.:4:6,12:.: 0.73:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.83:1.000:. ./.:4:5,12:.: 0.52:1.000:. ./.:4:8,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.40:0.999:. ./.:4:5,12:.: 0.52:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.25:1.000:. ./.:4:7,13:.: 1.16:1.000:. ./.:4:3,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:2,13:.: 0.09:1.000:. ./.:4:2,9:.:-0.76:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,7:.:-0.76:1.000:. ./.:4:6,16:.: 1.58:1.000:. ./.:4:4,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:2,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,14:.: 1.58:1.000:. ./.:4:13,6:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.33:1.000:. ./.:4:4,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.97:1.000:. ./.:5:6,5:.:-0.76:0.982:. ./.:4:8,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:7,12:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.61:1.000:. ./.:4:8,6:.:-0.12:1.000:. ./.:4:5,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,11:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,11:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:1,6:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,24:.: 2.01:1.000:. ./.:4:6,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,17:.: 1.16:1.000:. ./.:4:8,15:.: 1.80:1.000:. ./.:4:10,11:.: 1.37:1.000:. ./.:4:6,13:.: 0.94:1.000:. ./.:4:8,11:.: 0.94:1.000:. ./.:4:4,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.83:1.000:. ./.:4:2,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:3,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,15:.: 0.30:1.000:. ./.:4:4,15:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,17:.: 0.52:1.000:. ./.:4:6,3:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1,5:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.97:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.55:0.999:. ./.:4:3,5:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.40:1.000:. ./.:4:2,15:.: 0.52:1.000:. ./.:4:3,14:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:4,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.33:1.000:. ./.:4:8,8:.: 0.30:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,21:.: 1.37:1.000:. ./.:4:9,9:.: 0.73:1.000:. ./.:4:5,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,15:.: 0.09:1.000:. -chr5.1 45404583 chr5.1_045404583 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,81:0.61:-0.07:1.000:0.709 0/0/1/1:4:77,81:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,48:0.32: 0.17:1.000:0.947 0/0/1/1:4:76,76:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,53:0.31: 0.70:1.000:0.975 0/0/1/1:4:50,33:0.38:-1.29:1.000:0.521 0/0/0/1:4:96,44:0.29: 0.22:1.000:0.993 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,66:0.80:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,24:0.46:-2.14:1.000:0.984 0/1/1/1:4:50,102:0.65: 0.54:1.000:0.781 0/0/1/1:4:100,88:0.45: 1.50:1.000:0.982 0/0/0/1:4:81,42:0.32:-0.23:1.000:0.963 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,105:0.48: 2.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,92:0.73:-0.28:0.944:0.998 0/1/1/1:4:44,120:0.71: 0.86:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,54:0.32: 0.70:1.000:0.963 0/1/1/1:4:59,131:0.67: 1.55:1.000:0.903 0/0/0/1:4:43,17:0.25:-1.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,43:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,119:0.70: 0.83:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,42:0.41:-0.89:1.000:0.863 0/1/1/1:4:9,23:0.69:-2.65:1.000:0.978 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,63:0.33: 1.23:1.000:0.924 0/0/1/1:4:67,93:0.56: 0.75:1.000:0.958 0/0/0/1:4:95,54:0.34: 0.46:1.000:0.879 0/0/1/1:4:53,89:0.61: 0.27:1.000:0.720 0/0/1/1:4:94,79:0.44: 1.10:1.000:0.967 0/0/0/1:4:80,38:0.29:-0.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:21,18:0.45:-2.46:1.000:0.975 0/0/1/1:4:24,32:0.56:-2.01:1.000:0.973 0/0/1:3:25,10:0.26:-2.57:0.999:1.000 0/0/1/1:4:70,85:0.53: 0.62:1.000:0.991 0/1/1/1:4:39,95:0.68: 0.06:1.000:0.963 0/0/0/1:4:114,37:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,53:0.36: 0.17:1.000:0.668 0/1/1/1:4:41,89:0.66:-0.04:1.000:0.878 0/1/1/1:4:34,120:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,54:0.39: 0.01:1.000:0.678 0/1/1/1:4:43,90:0.65: 0.04:1.000:0.827 0/0/1/1:4:41,36:0.45:-1.45:1.000:0.982 0/1/1/1:4:43,141:0.74: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,32:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,103:0.66: 0.51:1.000:0.864 0/0/0/1:4:75,31:0.26:-0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,61:0.63:-1.03:1.000:0.623 0/0/1/1:4:47,65:0.56:-0.52:1.000:0.960 0/0/0/1:4:70,41:0.35:-0.55:1.000:0.827 0/0/0/1:4:101,52:0.31: 0.57:1.000:0.967 0/0/0/1:4:95,46:0.30: 0.25:1.000:0.986 0/0/1/1:4:81,107:0.55: 1.50:1.000:0.976 0/0/0/1:4:126,36:0.20: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,100:0.54: 1.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:63,38:0.35:-0.81:1.000:0.761 0/0/1/1:4:43,75:0.62:-0.36:1.000:0.625 0/0/0/1/1/1:6:63,56:0.46:-0.34:1.000:0.774 0/0/1/1:4:92,85:0.47: 1.20:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,77:0.63:-0.36:1.000:0.583 0/1/1/1:4:41,80:0.64:-0.28:1.000:0.683 0/0/1/1:4:32,57:0.62:-1.13:1.000:0.567 0/0/1/1:4:76,104:0.56: 1.28:1.000:0.965 0/0/0/1:4:113,36:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,79:0.80:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,78:0.46: 0.89:1.000:0.986 0/0/0/1:4:81,35:0.27:-0.42:0.996:0.997 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,83:0.46: 1.18:1.000:0.985 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-2.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,103:0.67: 0.43:1.000:0.929 0/1/1/1:4:51,108:0.66: 0.73:1.000:0.845 0/1/1/1:4:34,85:0.69:-0.34:1.000:0.972 0/0/1/1:4:50,75:0.58:-0.18:1.000:0.904 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,55:0.27: 1.42:1.000:0.998 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,80:0.67:-0.42:1.000:0.904 0/0/1/1:4:78,73:0.47: 0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:26,103:0.77:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,98:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,67:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,103:0.70: 0.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:72,56:0.42:-0.10:1.000:0.912 0/1/1/1:4:18,51:0.71:-1.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,76:0.59:-0.15:1.000:0.890 0/1/1/1:4:14,68:0.81:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,34:0.26:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,35:0.29:-0.60:1.000:0.990 0/0/0/1:4:67,34:0.31:-0.81:1.000:0.973 0/1/1/1:4:46,146:0.73: 1.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,23:0.17:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,44:0.30: 0.12:1.000:0.988 0/0/0/1:4:71,42:0.35:-0.50:1.000:0.807 0/0/0/1:4:115,42:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,25:0.22:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,43:0.34:-0.36:1.000:0.866 0/0/0/1:4:97,40:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,35:0.29:-0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:66,72:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,68:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,106:0.62: 0.89:1.000:0.543 0/1/1/1:4:38,73:0.64:-0.55:1.000:0.644 0/1/1/1:4:33,81:0.69:-0.47:1.000:0.966 0/0/0/1:4:91,28:0.21:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,42:0.20: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,64:0.27: 2.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,43:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,74:0.67:-0.66:1.000:0.912 0/0/0/1:4:122,45:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,75:0.46: 0.67:0.999:0.989 0/1/1/1:4:46,165:0.75: 2.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,33:0.40:-1.43:1.000:0.823 0/1/1/1:4:39,86:0.66:-0.18:1.000:0.896 0/0/0/1:4:73,27:0.24:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,31:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,82:0.69:-0.44:1.000:0.970 0/1/1/1:4:28,77:0.71:-0.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:82,32:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,90:0.67:-0.07:1.000:0.935 0/0/0/1:4:138,39:0.20: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,40:0.40:-0.95:1.000:0.764 0/0/0/1:4:116,44:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,50:0.29: 0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:29,44:0.58:-1.56:1.000:0.892 0/1/1/1:4:16,48:0.72:-1.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,27:0.42:-1.85:1.000:0.903 0/0/1/1:4:75,56:0.41:-0.02:1.000:0.856 0/1/1/1:4:36,89:0.69:-0.18:1.000:0.969 0/0/0/0/1:5:43,17:0.25:-1.90:0.982:0.917 0/0/0/1:4:89,52:0.35: 0.25:1.000:0.832 0/0/0/1:4:88,36:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,87:0.78:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,89:0.53: 0.83:1.000:0.992 0/1/1/1:4:31,79:0.69:-0.58:1.000:0.978 0/0/1/1:4:56,41:0.40:-0.92:1.000:0.819 0/0/0/1:4:53,27:0.31:-1.37:1.000:0.971 0/1/1/1:4:36,106:0.72: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:90,48:0.32: 0.17:1.000:0.947 0/1/1/1:4:37,79:0.66:-0.42:1.000:0.857 0/0/1/1:4:44,47:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,106:0.53: 1.68:1.000:0.992 0/0/0/1:4:115,54:0.29: 0.99:1.000:0.991 0/1/1/1:4:42,163:0.77: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,59:0.34: 0.86:1.000:0.895 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,77:0.55: 0.09:1.000:0.975 0/1/1/1:4:48,173:0.75: 2.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,85:0.59: 0.19:1.000:0.844 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,37:0.29:-0.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:42,74:0.62:-0.42:1.000:0.597 0/0/1/1:4:45,81:0.62:-0.15:1.000:0.537 0/0/0/1:4:127,62:0.30: 1.52:1.000:0.984 0/0/1/1:4:71,105:0.58: 1.18:1.000:0.917 0/0/0/1:4:86,33:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,64:0.43: 0.30:1.000:0.948 0/0/1/1:4:66,92:0.57: 0.70:1.000:0.956 0/0/1/1:4:84,63:0.41: 0.41:1.000:0.863 0/1/1/1:4:39,79:0.65:-0.36:1.000:0.767 0/0/0/1:4:81,50:0.36:-0.02:1.000:0.698 0/1/1/1:4:23,118:0.82: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,55:0.26: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,40:0.37:-0.76:1.000:0.610 0/1/1/1:4:46,111:0.68: 0.67:0.999:0.959 0/1/1/1:4:23,86:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,86:0.47: 1.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:85,80:0.47: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:55,72:0.55:-0.12:1.000:0.978 0/0/1/1:4:64,50:0.42:-0.47:1.000:0.917 0/0/0/1:4:86,39:0.28:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,31:0.38:-1.43:1.000:0.519 0/0/1/1:4:53,74:0.57:-0.12:1.000:0.956 0/0/1/1:4:87,120:0.56: 2.00:1.000:0.961 0/1/1/1:4:44,87:0.64:-0.02:1.000:0.715 0/0/0/1:4:97,54:0.33: 0.51:1.000:0.907 0/1/1/1:4:33,82:0.69:-0.44:1.000:0.970 0/0/1/1:4:67,88:0.55: 0.62:1.000:0.978 0/0/0/1:4:121,57:0.29: 1.23:1.000:0.990 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,85:0.54: 0.59:1.000:0.989 0/1/1/1:4:41,90:0.66:-0.02:1.000:0.891 -chr5.1 45823721 chr5.1_045823721 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:3,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:8,7:.: 1.22:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,8:.: 1.43:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.86:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:0.944:. ./.:4:12,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:7,7:.: 1.00:1.000:. ./.:4:14,4:.: 1.86:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.34:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:19,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,10:.: 2.07:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.34:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,5:.: 1.64:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:10,4:.: 1.00:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.49:1.000:. ./.:6:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:11,4:.: 1.22:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.06:0.996:. ./.:4:3,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:19,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:10,4:.: 1.00:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,2:.: 1.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:18,2:.: 2.28:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:2,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:0.999:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.86:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:11,4:.: 1.22:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.00:1.000:. ./.:5:3,1:.:-1.13:0.982:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,5:.: 1.22:1.000:. ./.:4:14,3:.: 1.64:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,5:.: 1.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,4:.: 2.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.34:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:8,6:.: 1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:0.999:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:4,8:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:5,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:17,5:.: 2.71:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.49:1.000:. -chr5.1 45987966 chr5.1_045987966 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:107,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:0.944:. ./.:4:109,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:140,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:159,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:120,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.16:1.000:. ./.:3:21,0:.:-1.95:0.999:. ./.:4:102,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.06:1.000:. ./.:6:65,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.77:0.996:. ./.:4:138,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:41,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:78,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:44,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.51:1.000:. ./.:5:48,0:.:-1.15:0.982:. ./.:4:83,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:150,1:.: 1.90:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:0.999:. ./.:4:113,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:141,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:164,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:127,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.25:1.000:. -chr5.1 46182508 chr5.1_046182508 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:80,94:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,32:0.19: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,89:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,60:0.30: 1.26:1.000:0.982 0/0/0/1:4:59,14:0.17:-1.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,44:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,81:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-2.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.48:-2.41:1.000:0.994 0/0/0/0:4:133,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,45:0.28: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,61:0.42: 0.11:1.000:0.896 0/0/0/0:4:162,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,70:0.44: 0.42:0.944:0.966 0/0/1/1:4:67,95:0.54: 0.82:1.000:0.989 0/0/1/1:4:84,103:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,66:0.30: 1.79:1.000:0.986 0/0/0/1:4:24,11:0.28:-2.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:139,48:0.23: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,62:0.26: 2.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,79:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,23:0.50:-2.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,54:0.42:-0.31:1.000:0.905 0/0/1/1:4:92,64:0.38: 0.66:1.000:0.512 0/0/0/1:4:124,27:0.16: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,91:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,42:0.27: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,30:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,18:0.75:-2.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,5:0.16:-2.73:1.000:0.997 0/1/1:3:4,5:0.51:-3.20:0.999:0.710 0/0/0/1:4:101,39:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,39:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,25:0.14: 0.74:1.000:0.967 0/0/0/1:4:85,34:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,54:0.35: 0.27:1.000:0.800 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,36:0.22: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,44:0.32:-0.13:1.000:0.962 0/0/1/1:4:46,58:0.52:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,40:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,117:0.49: 2.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,11:0.15:-1.76:1.000:0.991 0/0/0/1:4:68,38:0.33:-0.65:1.000:0.938 0/0/0/0:4:60,1:0.01:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,36:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,48:0.30: 0.37:1.000:0.986 0/0/0/1:4:124,35:0.20: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,30:0.27:-0.79:1.000:0.998 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,59:0.54:-0.79:1.000:0.990 0/0/0/1:4:70,33:0.29:-0.73:1.000:0.993 0/0/0/0/0/1:6:79,20:0.18:-0.84:1.000:0.972 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,44:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,37:0.28:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,57:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,29:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,16:0.16:-1.10:1.000:0.995 0/0/0/0:4:122,1:0.01:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,46:0.38:-0.52:0.996:0.565 0/0/1/1:4:68,80:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,40:0.53:-1.63:1.000:0.991 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,48:0.23: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,38:0.31:-0.52:1.000:0.974 0/0/0/1:4:53,19:0.23:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,48:0.42:-0.68:1.000:0.918 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,75:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,40:0.27: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,80:0.52: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,46:0.30: 0.24:1.000:0.988 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,40:0.27: 0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,55:0.56:-1.10:1.000:0.963 0/0/0/1:4:84,35:0.26:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,86:0.56: 0.24:1.000:0.968 0/0/0/1:4:96,34:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,33:0.26:-0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,66:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,1:0.01:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,65:0.46:-0.02:1.000:0.989 0/0/0/1:4:79,36:0.28:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,31:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,89:0.58: 0.24:1.000:0.928 0/0/0/1:4:96,45:0.29: 0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:78,24:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,23:0.19:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,29:0.22:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,44:0.21: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,37:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,49:0.33: 0.08:1.000:0.910 0/0/0/1:4:156,58:0.24: 2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,54:0.33: 0.42:0.999:0.903 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,30:0.28:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,37:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,25:0.22:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,26:0.26:-1.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,32:0.29:-0.86:1.000:0.989 0/0/0/1:4:72,35:0.29:-0.63:1.000:0.989 0/0/0/1:4:96,39:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,80:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,35:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,36:0.21: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,69:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,34:0.37:-1.23:1.000:0.559 0/0/1/1:4:46,43:0.45:-1.10:1.000:0.976 0/0/1/1:4:50,48:0.45:-0.86:1.000:0.982 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,46:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:66,47:0.38:-0.47:0.982:0.966 0/0/0/1:4:110,43:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,41:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,96:0.39: 2.45:1.000:0.728 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,33:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,59:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,59:0.45:-0.29:1.000:0.984 0/0/0/0:4:102,1:0.01:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,43:0.30:-0.08:1.000:0.982 0/0/0/1:4:96,46:0.29: 0.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:60,26:0.27:-1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:133,40:0.21: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,47:0.23: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,42:0.23: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,44:0.26: 0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:93,43:0.28: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,52:0.29: 0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,20:0.46:-2.39:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,64:0.47:-0.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:102,43:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:121,48:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,42:0.20: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,47:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,46:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,93:0.49: 1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,34:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,42:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,82:0.53: 0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:91,21:0.17:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,62:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 1.11:0.999:1.000 0/0/0/1:4:114,42:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,22:0.14: 0.19:1.000:0.973 0/0/0/1:4:77,19:0.18:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,75:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,40:0.23: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,60:0.47:-0.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:85,25:0.20:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,38:0.19: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,43:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,53:0.27: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,41:0.27: 0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:144,34:0.17: 1.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,60:0.26: 1.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,54:0.25: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,43:0.21: 1.34:1.000:1.000 -chr5.1 46378029 chr5.1_046378029 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:109,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:152,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.42:0.944:. ./.:4:104,42:.: 1.92:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:125,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:11,0:.:-2.68:0.999:. ./.:4:67,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:122,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.28:1.000:. ./.:6:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:0.996:. ./.:4:95,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.88:0.999:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.03:1.000:. ./.:5:64,0:.:-0.88:0.982:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.66:0.999:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:145,2:.: 1.95:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.79:1.000:. -chr5.1 46630011 chr5.1_046630011 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:54,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:0.944:. ./.:4:56,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.77:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.89:0.999:. ./.:4:14,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:6:37,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.23:0.996:. ./.:4:33,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.61:1.000:. ./.:5:28,0:.:-0.58:0.982:. ./.:4:29,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.36:0.999:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.13:1.000:. -chr5.1 46887908 chr5.1_046887908 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:70,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:34,55:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.79:1.000:. ./.:4:72,27:.: 0.13:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:39,63:.: 0.25:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.09:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:66,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:33,38:.:-0.99:1.000:. ./.:4:38,27:.:-1.23:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:67,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:35,41:.:-0.79:1.000:. ./.:4:80,35:.: 0.76:0.944:. ./.:4:87,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:118,41:.: 2.52:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:74,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:45,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,32:.: 0.05:1.000:. ./.:4:102,45:.: 2.04:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:18,45:.:-1.31:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:58,59:.: 0.84:1.000:. ./.:4:30,19:.:-1.87:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:73,16:.:-0.27:1.000:. ./.:3:21,33:.:-1.67:0.999:. ./.:4:69,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:39,43:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,30:.: 0.41:1.000:. ./.:4:55,33:.:-0.31:1.000:. ./.:4:74,40:.: 0.72:1.000:. ./.:4:92,51:.: 1.88:1.000:. ./.:4:78,40:.: 0.88:1.000:. ./.:4:88,39:.: 1.24:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:49,32:.:-0.59:1.000:. ./.:4:54,50:.: 0.33:1.000:. ./.:4:70,42:.: 0.64:1.000:. ./.:4:47,72:.: 0.92:1.000:. ./.:4:57,31:.:-0.31:1.000:. ./.:4:70,45:.: 0.76:1.000:. ./.:4:73,28:.: 0.21:1.000:. ./.:4:73,34:.: 0.45:1.000:. ./.:4:42,43:.:-0.43:1.000:. ./.:4:94,43:.: 1.64:1.000:. ./.:4:57,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:145,57:.: 4.23:1.000:. ./.:4:93,34:.: 1.24:1.000:. ./.:6:54,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:58,28:.:-0.39:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:112,50:.: 2.64:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:88,33:.: 1.00:1.000:. ./.:4:63,62:.: 1.16:1.000:. ./.:4:47,30:.:-0.75:1.000:. ./.:4:64,33:.: 0.05:1.000:. ./.:4:71,34:.: 0.37:0.996:. ./.:4:69,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:89,60:.: 2.12:1.000:. ./.:4:85,31:.: 0.80:1.000:. ./.:4:36,141:.: 3.24:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:56,58:.: 0.72:1.000:. ./.:4:101,42:.: 1.88:1.000:. ./.:4:82,25:.: 0.45:1.000:. ./.:4:75,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:77,30:.: 0.45:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:38,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:78,43:.: 1.00:1.000:. ./.:4:31,35:.:-1.19:1.000:. ./.:4:81,37:.: 0.88:1.000:. ./.:4:60,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:61,27:.:-0.31:1.000:. ./.:4:88,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:66,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:57,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:73,40:.: 0.68:1.000:. ./.:4:42,28:.:-1.03:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:105,44:.: 2.12:1.000:. ./.:4:62,37:.: 0.13:1.000:. ./.:4:47,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:65,41:.: 0.41:1.000:. ./.:4:42,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:38,66:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:30,22:.:-1.75:1.000:. ./.:4:71,37:.: 0.49:1.000:. ./.:4:90,29:.: 0.92:1.000:. ./.:4:78,32:.: 0.56:1.000:. ./.:4:49,65:.: 0.72:1.000:. ./.:4:66,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,44:.: 1.12:1.000:. ./.:4:63,32:.:-0.03:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:91,43:.: 1.52:1.000:. ./.:4:49,22:.:-0.99:0.999:. ./.:4:73,83:.: 2.40:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:65,75:.: 1.76:1.000:. ./.:4:55,85:.: 1.76:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,30:.: 0.88:1.000:. ./.:4:65,25:.:-0.23:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:60,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:56,30:.:-0.39:1.000:. ./.:4:81,29:.: 0.56:1.000:. ./.:4:65,30:.:-0.03:1.000:. ./.:4:47,59:.: 0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:64,34:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,38:.: 0.68:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.59:1.000:. ./.:5:44,14:.:-1.51:0.982:. ./.:4:56,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,18:.:-2.27:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:64,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:48,26:.:-0.87:1.000:. ./.:4:72,21:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:38,20:.:-1.51:1.000:. ./.:4:24,44:.:-1.11:1.000:. ./.:4:66,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:62,28:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.67:1.000:. ./.:4:49,22:.:-0.99:1.000:. ./.:4:85,31:.: 0.80:1.000:. ./.:4:69,28:.: 0.05:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.83:1.000:. ./.:4:49,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:65,38:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:83,29:.: 0.64:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:52,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:76,29:.: 0.37:1.000:. ./.:4:47,25:.:-0.95:1.000:. ./.:4:86,35:.: 1.00:1.000:. ./.:4:52,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:85,30:.: 0.76:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:60,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:40,23:.:-1.31:1.000:. ./.:4:63,27:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,47:.:-0.43:0.999:. ./.:4:54,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:44,30:.:-0.87:1.000:. ./.:4:53,24:.:-0.75:1.000:. ./.:4:57,20:.:-0.75:1.000:. ./.:4:46,35:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.95:1.000:. ./.:4:56,18:.:-0.87:1.000:. ./.:4:41,70:.: 0.60:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:74,25:.: 0.13:1.000:. ./.:4:40,20:.:-1.43:1.000:. ./.:4:54,26:.:-0.63:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:70,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:48,14:.:-1.35:1.000:. ./.:4:51,56:.: 0.45:1.000:. -chr5.1 47512348 chr5.1_047512348 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:594,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:342,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:544,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:181,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:223,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:705,0:.: 2.03:0.944:. ./.:4:495,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:754,1:.: 2.48:1.000:. ./.:4:663,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:205,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:214,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:574,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:640,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:599,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:180,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:234,0:.:-2.16:1.000:. ./.:3:139,0:.:-3.01:0.999:. ./.:4:498,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:512,4:.: 0.35:1.000:. ./.:4:647,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:706,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:531,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.57:1.000:. ./.:6:438,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.30:0.996:. ./.:4:388,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:355,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:447,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:471,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:346,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:476,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:280,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:277,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:455,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:338,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:448,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:352,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:644,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:664,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:585,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:328,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:327,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.26:1.000:. ./.:5:345,0:.:-1.17:0.982:. ./.:4:382,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:710,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:358,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:701,1:.: 2.00:1.000:. ./.:4:689,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:619,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:133,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:721,1:.: 2.18:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:699,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:582,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:636,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:432,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:347,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:603,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:775,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:622,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:562,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:591,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:664,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:596,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.01:1.000:. -chr5.1 47728440 chr5.1_047728440 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:5,10:0.65: 0.60:1.000:0.752 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.72:-0.02:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,5:0.42: 0.19:1.000:0.911 0/1/1/1:4:6,12:0.65: 1.22:1.000:0.752 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-1.05:1.000:0.792 0/0/1/1:4:7,10:0.58: 1.01:1.000:0.925 0/0/1/1:4:6,8:0.56: 0.39:1.000:0.963 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.62:-0.23:1.000:0.578 0/0/1/1:4:8,7:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,8:0.56: 0.39:1.000:0.963 0/0/1/1:4:7,8:0.53: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,6:0.45: 0.39:0.944:0.980 0/1/1/1:4:5,14:0.71: 1.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,7:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,15:0.86: 1.01:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,3:0.38:-0.64:1.000:0.612 0/0/0/1:4:9,3:0.32:-0.02:1.000:0.939 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:6,13:0.66: 1.42:1.000:0.876 0/0/0/1:4:12,5:0.36: 1.01:1.000:0.734 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-1.05:1.000:0.963 0/0/1/1:4:6,3:0.38:-0.64:1.000:0.612 0/0/1/1:4:10,17:0.61: 3.07:1.000:0.652 0/0/1/1:4:8,7:0.48: 0.60:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-2.08:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:15,1:0.11: 0.80:1.000:0.536 0/1/1/1:4:3,15:0.81: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,14:0.85: 0.80:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,7:0.57:-0.02:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,17:0.88: 1.42:1.000:0.817 0/0/1/1:4:7,4:0.40:-0.23:1.000:0.827 0/0/1/1:4:5,8:0.60: 0.19:1.000:0.783 0/0/1/1:4:9,6:0.43: 0.60:1.000:0.947 0/0/1/1:4:7,10:0.58: 1.01:1.000:0.925 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-2.08:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,14:0.92: 0.60:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,3:0.72:-1.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,3:0.41:-0.84:1.000:0.879 0/1/1/1:4:8,15:0.63: 2.25:1.000:0.604 0/1/1/1:4:4,11:0.70: 0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,3:0.34:-0.23:1.000:0.863 1/1/1/1:4:1,13:0.92: 0.39:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-1.05:1.000:0.980 0/1/1/1:4:6,13:0.66: 1.42:1.000:0.876 0/0/0/1/1/1:6:3,3:0.50:-1.26:1.000:0.889 1/1/1/1:4:1,11:0.90:-0.02:1.000:0.856 0/1/1/1:4:2,9:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,14:0.85: 0.80:1.000:0.982 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,9:0.59: 0.60:1.000:0.879 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:10,3:0.31: 0.19:1.000:0.971 1/1/1/1:4:1,13:0.92: 0.39:1.000:0.980 0/0/1/1:4:6,7:0.53: 0.19:0.996:0.991 0/0/1/1:4:7,9:0.55: 0.80:1.000:0.975 0/1/1/1:4:3,9:0.72:-0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,6:0.72:-0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:14,3:0.27: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,10:0.69: 0.39:1.000:0.969 0/1/1/1:4:4,10:0.69: 0.39:1.000:0.969 0/1/1/1:4:2,5:0.69:-1.05:1.000:0.969 0/1/1/1:4:3,11:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,8:0.46: 1.22:1.000:0.988 1/1/1/1:4:1,10:0.89:-0.23:1.000:0.640 0/0/1/1:4:9,7:0.46: 0.80:1.000:0.985 0/1/1/1:4:2,7:0.74:-0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.72:-1.67:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,11:0.63: 1.01:1.000:0.546 1/1/1/1:4:1,10:0.89:-0.23:1.000:0.640 0/1/1/1:4:2,6:0.72:-0.84:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,16:0.93: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.43:-1.46:1.000:0.947 0/1/1/1:4:2,6:0.72:-0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,7:0.53: 0.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-0.64:1.000:0.752 1/1/1/1:4:1,12:0.91: 0.19:1.000:0.947 0/0/1/1:4:12,7:0.41: 1.42:1.000:0.851 0/1/1/1:4:4,10:0.69: 0.39:1.000:0.969 0/0/1/1:4:6,3:0.38:-0.64:1.000:0.612 0/0/1/1:4:6,5:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,9:0.67: 0.19:1.000:0.913 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-0.23:1.000:0.988 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-1.46:1.000:0.879 0/0/0/1:4:10,1:0.16:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,5:0.38: 0.60:1.000:0.612 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-1.26:1.000:0.612 1/1/1/1:4:1,10:0.89:-0.23:1.000:0.640 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-1.26:1.000:0.612 0/1/1/1:4:3,8:0.70:-0.23:1.000:0.984 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,14:0.74: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,7:0.62:-0.23:1.000:0.578 0/0/1/1:4:4,7:0.62:-0.23:1.000:0.578 0/1/1/1:4:5,10:0.65: 0.60:1.000:0.752 0/0/1/1:4:5,3:0.41:-0.84:1.000:0.879 0/1/1/1:4:2,8:0.77:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,8:0.40: 2.04:1.000:0.827 0/0/1/1:4:10,6:0.41: 0.80:0.999:0.879 0/0/0/1:4:18,3:0.25: 1.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,7:0.74:-0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,11:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.43:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.72:-1.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.43:1.000:0.947 0/0/1/1:4:7,9:0.55: 0.80:1.000:0.975 0/0/1/1:4:6,3:0.38:-0.64:1.000:0.612 0/0/0/1:4:11,5:0.37: 0.80:1.000:0.580 0/1/1/1:4:1,7:0.85:-0.84:1.000:0.982 0/1/1/1:4:3,10:0.74: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:3,5:0.61:-0.84:1.000:0.699 0/1/1/1:4:4,8:0.65:-0.02:1.000:0.752 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-1.46:1.000:0.879 0/0/0/1:4:7,3:0.36:-0.43:1.000:0.688 0/0/0/1:4:6,1:0.25:-1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,9:0.72:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1/1:5:4,3:0.45:-1.05:0.982:0.880 0/1/1/1:4:1,5:0.81:-1.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,8:0.65:-0.02:1.000:0.752 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-0.43:1.000:0.879 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,6:0.83:-1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,13:0.60: 1.83:1.000:0.753 0/0/0/1:4:5,1:0.27:-1.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,9:0.59: 0.60:1.000:0.879 0/1/1/1:4:2,4:0.65:-1.26:1.000:0.752 0/0/1/1:4:7,9:0.55: 0.80:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,6:0.43: 0.60:1.000:0.947 0/0/0/1:4:13,3:0.28: 0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,9:0.72:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.57: 2.86:1.000:0.953 0/1/1/1:4:6,11:0.63: 1.01:1.000:0.546 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,5:0.61:-0.84:1.000:0.699 0/1/1/1:4:5,12:0.68: 1.01:1.000:0.954 0/0/1/1:4:7,8:0.53: 0.60:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,18:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.62:-0.23:1.000:0.578 0/1/1/1:4:3,19:0.84: 2.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-0.43:1.000:0.879 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.62:-0.23:1.000:0.578 1/1/1/1:4:1,15:0.93: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-2.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,9:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.62: 0.39:1.000:0.503 0/0/0/1:4:10,3:0.31: 0.19:0.999:0.971 0/1/1/1:4:4,8:0.65:-0.02:1.000:0.752 0/1/1/1:4:1,9:0.88:-0.43:1.000:0.683 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-0.43:1.000:0.947 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-0.02:1.000:0.970 0/0/1/1:4:4,7:0.62:-0.23:1.000:0.578 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-0.02:1.000:0.970 0/0/1/1:4:10,10:0.50: 1.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,14:0.85: 0.80:1.000:0.982 0/1/1/1:4:5,12:0.68: 1.01:1.000:0.954 0/0/1/1:4:6,7:0.53: 0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-0.23:1.000:0.988 0/0/1/1:4:11,12:0.52: 2.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,13:0.84: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,8:0.53: 0.60:1.000:0.993 -chr5.1 47833403 chr5.1_047833403 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.41:0.944:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.78:1.000:. ./.:6:3,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.03:0.996:. ./.:4:15,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.66:1.000:. ./.:5:9,0:.:-0.09:0.982:. ./.:4:13,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.91:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.66:0.999:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.: 2.16:1.000:. -chr5.1 48060620 chr5.1_048060620 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:461,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:270,104:.:-0.40:1.000:. ./.:4:296,118:.: 0.07:1.000:. ./.:4:517,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:294,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:377,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:383,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,43:.:-2.38:1.000:. ./.:4:237,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:291,100:.:-0.20:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:298,138:.: 0.33:1.000:. ./.:4:357,133:.: 0.97:0.944:. ./.:4:431,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:568,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:341,129:.: 0.73:1.000:. ./.:4:201,76:.:-1.55:1.000:. ./.:4:278,99:.:-0.37:1.000:. ./.:4:311,140:.: 0.51:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:148,57:.:-2.40:1.000:. ./.:4:482,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:311,117:.: 0.23:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:348,127:.: 0.79:1.000:. ./.:4:372,124:.: 1.04:1.000:. ./.:4:264,72:.:-0.85:1.000:. ./.:4:133,0:.:-3.25:1.000:. ./.:4:180,3:.:-2.66:1.000:. ./.:3:105,2:.:-3.56:0.999:. ./.:4:421,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:310,109:.: 0.13:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:310,127:.: 0.34:1.000:. ./.:4:363,123:.: 0.92:1.000:. ./.:4:308,96:.:-0.05:1.000:. ./.:4:344,132:.: 0.80:1.000:. ./.:4:369,124:.: 1.00:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:366,138:.: 1.13:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:378,119:.: 1.05:1.000:. ./.:4:887,0:.: 5.66:1.000:. ./.:4:294,89:.:-0.30:1.000:. ./.:4:360,143:.: 1.12:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:376,128:.: 1.13:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:362,117:.: 0.84:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:306,116:.: 0.16:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:351,90:.: 0.39:1.000:. ./.:6:257,73:.:-0.92:1.000:. ./.:4:337,118:.: 0.55:1.000:. ./.:4:286,85:.:-0.44:1.000:. ./.:4:409,126:.: 1.50:1.000:. ./.:4:294,111:.:-0.04:1.000:. ./.:4:302,103:.:-0.04:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:250,94:.:-0.76:1.000:. ./.:4:310,97:.:-0.01:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.28:0.996:. ./.:4:336,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:351,145:.: 1.04:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:512,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:294,114:.: 0.00:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:368,148:.: 1.27:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:300,119:.: 0.13:1.000:. ./.:4:370,134:.: 1.13:1.000:. ./.:4:272,108:.:-0.33:1.000:. ./.:4:345,141:.: 0.92:1.000:. ./.:4:369,148:.: 1.29:1.000:. ./.:4:206,79:.:-1.45:1.000:. ./.:4:269,89:.:-0.59:1.000:. ./.:4:327,104:.: 0.27:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:245,78:.:-1.01:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:320,127:.: 0.46:1.000:. ./.:4:279,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:432,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:379,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:460,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:347,110:.: 0.58:1.000:. ./.:4:216,74:.:-1.40:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:263,99:.:-0.54:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:297,97:.:-0.17:1.000:. ./.:4:580,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:327,98:.: 0.20:0.999:. ./.:4:395,111:.: 1.16:1.000:. ./.:4:305,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:319,105:.: 0.19:1.000:. ./.:4:338,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:294,103:.:-0.13:1.000:. ./.:4:237,92:.:-0.93:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:319,92:.: 0.03:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:233,91:.:-0.99:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:298,119:.: 0.10:1.000:. ./.:5:342,0:.:-0.78:0.982:. ./.:4:411,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:288,84:.:-0.43:1.000:. ./.:4:361,129:.: 0.97:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:279,124:.:-0.06:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:348,110:.: 0.59:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:320,95:.: 0.08:1.000:. ./.:4:264,95:.:-0.58:1.000:. ./.:4:403,122:.: 1.38:1.000:. ./.:4:340,129:.: 0.72:1.000:. ./.:4:348,107:.: 0.55:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:370,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:365,130:.: 1.03:1.000:. ./.:4:346,101:.: 0.46:1.000:. ./.:4:150,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:239,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:307,97:.:-0.05:1.000:. ./.:4:328,120:.: 0.47:1.000:. ./.:4:382,143:.: 1.38:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:260,93:.:-0.65:1.000:. ./.:4:354,109:.: 0.65:1.000:. ./.:4:266,94:.:-0.57:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:272,116:.:-0.24:1.000:. ./.:4:307,92:.:-0.11:1.000:. ./.:4:322,102:.: 0.19:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:300,91:.:-0.20:1.000:. ./.:4:379,1:.:-0.33:0.999:. ./.:4:286,101:.:-0.25:1.000:. ./.:4:341,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:257,89:.:-0.73:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:321,110:.: 0.27:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:300,97:.:-0.13:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:361,129:.: 0.97:1.000:. ./.:4:341,127:.: 0.71:1.000:. ./.:4:282,126:.: 0.00:1.000:. ./.:4:322,81:.:-0.06:1.000:. ./.:4:363,138:.: 1.10:1.000:. ./.:4:531,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:511,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:250,99:.:-0.70:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.44:1.000:. -chr5.1 48242530 chr5.1_048242530 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:159,47:.: 1.02:1.000:. ./.:4:81,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:97,44:.:-0.26:1.000:. ./.:4:144,68:.: 1.14:1.000:. ./.:4:105,60:.: 0.21:1.000:. ./.:4:95,93:.: 0.66:1.000:. ./.:4:83,57:.:-0.28:1.000:. ./.:4:72,92:.: 0.19:1.000:. ./.:4:148,57:.: 1.00:1.000:. ./.:4:8,22:.:-2.45:1.000:. ./.:4:21,2:.:-2.59:1.000:. ./.:4:177,47:.: 1.37:1.000:. ./.:4:87,81:.: 0.27:1.000:. ./.:4:99,72:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,52:.: 1.10:1.000:. ./.:4:90,60:.:-0.08:1.000:. ./.:4:125,54:.: 0.49:0.944:. ./.:4:250,29:.: 2.46:1.000:. ./.:4:147,75:.: 1.34:1.000:. ./.:4:120,92:.: 1.14:1.000:. ./.:4:33,14:.:-2.11:1.000:. ./.:4:167,43:.: 1.10:1.000:. ./.:4:91,86:.: 0.45:1.000:. ./.:4:93,75:.: 0.27:1.000:. ./.:4:12,4:.:-2.73:1.000:. ./.:4:156,59:.: 1.20:1.000:. ./.:4:70,75:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,42:.:-0.58:1.000:. ./.:4:106,84:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,94:.: 0.66:1.000:. ./.:4:117,63:.: 0.51:1.000:. ./.:4:129,42:.: 0.33:1.000:. ./.:4:16,2:.:-2.69:1.000:. ./.:4:4,20:.:-2.57:1.000:. ./.:3:0,8:.:-2.88:0.999:. ./.:4:17,73:.:-1.27:1.000:. ./.:4:74,85:.: 0.09:1.000:. ./.:4:98,48:.:-0.16:1.000:. ./.:4:188,60:.: 1.85:1.000:. ./.:4:111,59:.: 0.31:1.000:. ./.:4:22,86:.:-0.91:1.000:. ./.:4:168,49:.: 1.24:1.000:. ./.:4:112,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:74,33:.:-0.93:1.000:. ./.:4:148,58:.: 1.02:1.000:. ./.:4:88,81:.: 0.29:1.000:. ./.:4:112,43:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,13:.:-2.15:1.000:. ./.:4:84,39:.:-0.62:1.000:. ./.:4:42,49:.:-1.25:1.000:. ./.:4:61,56:.:-0.73:1.000:. ./.:4:82,78:.: 0.11:1.000:. ./.:4:83,76:.: 0.09:1.000:. ./.:4:97,84:.: 0.53:1.000:. ./.:4:109,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:175,61:.: 1.61:1.000:. ./.:4:78,81:.: 0.09:1.000:. ./.:4:97,34:.:-0.46:1.000:. ./.:4:93,49:.:-0.24:1.000:. ./.:6:82,61:.:-0.22:1.000:. ./.:4:74,70:.:-0.20:1.000:. ./.:4:90,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:110,64:.: 0.39:1.000:. ./.:4:75,74:.:-0.10:1.000:. ./.:4:74,90:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,43:.:-0.14:1.000:. ./.:4:16,65:.:-1.44:1.000:. ./.:4:75,58:.:-0.42:1.000:. ./.:4:99,51:.:-0.08:0.996:. ./.:4:129,32:.: 0.13:1.000:. ./.:4:128,76:.: 0.98:1.000:. ./.:4:153,51:.: 0.98:1.000:. ./.:4:116,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:87,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:187,16:.: 0.96:1.000:. ./.:4:19,49:.:-1.70:1.000:. ./.:4:170,39:.: 1.08:1.000:. ./.:4:86,73:.: 0.09:1.000:. ./.:4:167,42:.: 1.08:1.000:. ./.:4:100,89:.: 0.68:1.000:. ./.:4:144,38:.: 0.55:1.000:. ./.:4:90,61:.:-0.06:1.000:. ./.:4:92,74:.: 0.23:1.000:. ./.:4:107,49:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,74:.:-1.33:1.000:. ./.:4:209,63:.: 2.32:1.000:. ./.:4:71,58:.:-0.50:1.000:. ./.:4:76,58:.:-0.40:1.000:. ./.:4:77,73:.:-0.08:1.000:. ./.:4:89,70:.: 0.09:1.000:. ./.:4:167,48:.: 1.20:1.000:. ./.:4:82,75:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,79:.:-1.05:1.000:. ./.:4:65,47:.:-0.83:1.000:. ./.:4:98,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:96,40:.:-0.36:1.000:. ./.:4:84,73:.: 0.05:1.000:. ./.:4:123,45:.: 0.27:1.000:. ./.:4:130,43:.: 0.37:1.000:. ./.:4:110,42:.:-0.04:1.000:. ./.:4:107,38:.:-0.18:1.000:. ./.:4:104,61:.: 0.21:1.000:. ./.:4:64,70:.:-0.40:1.000:. ./.:4:89,89:.: 0.47:1.000:. ./.:4:23,73:.:-1.15:1.000:. ./.:4:87,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:99,51:.:-0.08:1.000:. ./.:4:82,63:.:-0.18:1.000:. ./.:4:110,96:.: 1.02:1.000:. ./.:4:80,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,77:.:-0.04:1.000:. ./.:4:120,71:.: 0.72:1.000:. ./.:4:65,54:.:-0.70:0.999:. ./.:4:36,70:.:-0.95:1.000:. ./.:4:48,65:.:-0.81:1.000:. ./.:4:105,73:.: 0.47:1.000:. ./.:4:104,39:.:-0.22:1.000:. ./.:4:78,48:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,89:.: 0.13:1.000:. ./.:4:83,58:.:-0.26:1.000:. ./.:4:95,30:.:-0.58:1.000:. ./.:4:172,39:.: 1.12:1.000:. ./.:4:87,80:.: 0.25:1.000:. ./.:4:75,82:.: 0.05:1.000:. ./.:4:135,44:.: 0.49:1.000:. ./.:4:105,73:.: 0.47:1.000:. ./.:4:87,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:169,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:66,54:.:-0.68:1.000:. ./.:4:82,32:.:-0.79:1.000:. ./.:4:13,68:.:-1.44:1.000:. ./.:4:81,85:.: 0.23:1.000:. ./.:5:76,44:.:-0.68:0.982:. ./.:4:87,44:.:-0.46:1.000:. ./.:4:126,48:.: 0.39:1.000:. ./.:4:89,117:.: 1.02:1.000:. ./.:4:13,83:.:-1.15:1.000:. ./.:4:80,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,53:.:-0.79:1.000:. ./.:4:90,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:10,56:.:-1.74:1.000:. ./.:4:74,58:.:-0.44:1.000:. ./.:4:93,46:.:-0.30:1.000:. ./.:4:91,35:.:-0.56:1.000:. ./.:4:109,90:.: 0.88:1.000:. ./.:4:178,57:.: 1.59:1.000:. ./.:4:22,83:.:-0.97:1.000:. ./.:4:15,76:.:-1.25:1.000:. ./.:4:184,70:.: 1.97:1.000:. ./.:4:12,79:.:-1.25:1.000:. ./.:4:19,95:.:-0.79:1.000:. ./.:4:135,43:.: 0.47:1.000:. ./.:4:37,10:.:-2.11:1.000:. ./.:4:86,73:.: 0.09:1.000:. ./.:4:85,53:.:-0.32:1.000:. ./.:4:104,90:.: 0.78:1.000:. ./.:4:188,65:.: 1.95:1.000:. ./.:4:18,76:.:-1.19:1.000:. ./.:4:145,44:.: 0.68:1.000:. ./.:4:178,63:.: 1.71:1.000:. ./.:4:87,70:.: 0.05:1.000:. ./.:4:10,71:.:-1.44:1.000:. ./.:4:85,47:.:-0.44:1.000:. ./.:4:177,45:.: 1.34:1.000:. ./.:4:5,83:.:-1.31:1.000:. ./.:4:97,69:.: 0.23:1.000:. ./.:4:138,45:.: 0.57:1.000:. ./.:4:108,54:.: 0.15:0.999:. ./.:4:83,78:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,75:.: 0.31:1.000:. ./.:4:84,57:.:-0.26:1.000:. ./.:4:14,68:.:-1.42:1.000:. ./.:4:175,50:.: 1.39:1.000:. ./.:4:80,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:144,33:.: 0.45:1.000:. ./.:4:12,65:.:-1.52:1.000:. ./.:4:139,60:.: 0.88:1.000:. ./.:4:84,96:.: 0.51:1.000:. ./.:4:172,51:.: 1.35:1.000:. ./.:4:109,52:.: 0.13:1.000:. ./.:4:110,79:.: 0.68:1.000:. ./.:4:107,95:.: 0.94:1.000:. ./.:4:229,73:.: 2.91:1.000:. ./.:4:80,90:.: 0.31:1.000:. ./.:4:186,23:.: 1.08:1.000:. -chr5.1 48502404 chr5.1_048502404 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:146,100:.:-0.28:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:157,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:223,52:.: 0.12:1.000:. ./.:4:194,134:.: 0.85:1.000:. ./.:4:203,89:.: 0.35:1.000:. ./.:4:69,62:.:-1.87:1.000:. ./.:4:143,94:.:-0.41:1.000:. ./.:4:154,106:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,10:.:-2.66:1.000:. ./.:4:31,28:.:-2.86:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:183,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,101:.: 0.35:1.000:. ./.:4:125,86:.:-0.76:1.000:. ./.:4:139,47:.:-1.11:1.000:. ./.:4:215,48:.:-0.05:0.944:. ./.:4:308,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:189,140:.: 0.86:1.000:. ./.:4:346,71:.: 2.07:1.000:. ./.:4:54,24:.:-2.59:1.000:. ./.:4:213,41:.:-0.17:1.000:. ./.:4:296,57:.: 1.19:1.000:. ./.:4:147,101:.:-0.25:1.000:. ./.:4:42,8:.:-2.98:1.000:. ./.:4:121,87:.:-0.81:1.000:. ./.:4:153,99:.:-0.20:1.000:. ./.:4:163,44:.:-0.82:1.000:. ./.:4:209,124:.: 0.92:1.000:. ./.:4:236,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:133,41:.:-1.27:1.000:. ./.:4:151,31:.:-1.16:1.000:. ./.:4:6,14:.:-3.39:1.000:. ./.:4:40,23:.:-2.80:1.000:. ./.:3:8,12:.:-3.39:0.999:. ./.:4:110,101:.:-0.76:1.000:. ./.:4:216,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:132,105:.:-0.41:1.000:. ./.:4:209,56:.:-0.02:1.000:. ./.:4:221,50:.: 0.06:1.000:. ./.:4:247,49:.: 0.41:1.000:. ./.:4:208,49:.:-0.13:1.000:. ./.:4:225,47:.: 0.08:1.000:. ./.:4:133,97:.:-0.50:1.000:. ./.:4:344,83:.: 2.21:1.000:. ./.:4:181,101:.: 0.21:1.000:. ./.:4:285,57:.: 1.04:1.000:. ./.:4:69,50:.:-2.03:1.000:. ./.:4:191,47:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,28:.:-0.98:1.000:. ./.:4:165,104:.: 0.03:1.000:. ./.:4:228,55:.: 0.23:1.000:. ./.:4:177,129:.: 0.54:1.000:. ./.:4:256,53:.: 0.59:1.000:. ./.:4:150,94:.:-0.31:1.000:. ./.:4:173,92:.:-0.02:1.000:. ./.:4:230,59:.: 0.31:1.000:. ./.:4:173,103:.: 0.13:1.000:. ./.:4:184,37:.:-0.63:1.000:. ./.:6:250,46:.: 0.41:1.000:. ./.:4:324,58:.: 1.59:1.000:. ./.:4:170,40:.:-0.78:1.000:. ./.:4:280,78:.: 1.26:1.000:. ./.:4:237,57:.: 0.38:1.000:. ./.:4:270,39:.: 0.59:1.000:. ./.:4:102,93:.:-0.98:1.000:. ./.:4:292,45:.: 0.97:1.000:. ./.:4:212,64:.: 0.13:1.000:. ./.:4:145,90:.:-0.43:0.996:. ./.:4:339,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:317,56:.: 1.47:1.000:. ./.:4:128,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:230,47:.: 0.14:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:138,93:.:-0.49:1.000:. ./.:4:153,98:.:-0.21:1.000:. ./.:4:237,108:.: 1.08:1.000:. ./.:4:193,118:.: 0.61:1.000:. ./.:4:273,45:.: 0.71:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:282,59:.: 1.03:1.000:. ./.:4:317,59:.: 1.51:1.000:. ./.:4:152,36:.:-1.08:1.000:. ./.:4:186,35:.:-0.63:1.000:. ./.:4:273,58:.: 0.89:1.000:. ./.:4:245,55:.: 0.46:1.000:. ./.:4:229,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:256,70:.: 0.82:1.000:. ./.:4:164,89:.:-0.19:1.000:. ./.:4:216,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:198,112:.: 0.60:1.000:. ./.:4:281,48:.: 0.86:1.000:. ./.:4:105,62:.:-1.37:1.000:. ./.:4:273,134:.: 1.93:1.000:. ./.:4:159,95:.:-0.17:1.000:. ./.:4:172,98:.: 0.05:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:231,143:.: 1.48:1.000:. ./.:4:137,128:.:-0.02:1.000:. ./.:4:158,129:.: 0.28:1.000:. ./.:4:254,53:.: 0.56:1.000:. ./.:4:231,48:.: 0.17:1.000:. ./.:4:220,152:.: 1.45:1.000:. ./.:4:140,92:.:-0.47:1.000:. ./.:4:165,41:.:-0.83:1.000:. ./.:4:148,95:.:-0.32:1.000:. ./.:4:158,121:.: 0.17:1.000:. ./.:4:210,112:.: 0.76:1.000:. ./.:4:152,106:.:-0.12:1.000:. ./.:4:288,58:.: 1.09:1.000:. ./.:4:170,108:.: 0.16:1.000:. ./.:4:327,76:.: 1.88:0.999:. ./.:4:345,55:.: 1.84:1.000:. ./.:4:167,94:.:-0.08:1.000:. ./.:4:315,61:.: 1.51:1.000:. ./.:4:146,104:.:-0.23:1.000:. ./.:4:124,83:.:-0.82:1.000:. ./.:4:290,58:.: 1.12:1.000:. ./.:4:225,34:.:-0.10:1.000:. ./.:4:165,94:.:-0.10:1.000:. ./.:4:187,113:.: 0.46:1.000:. ./.:4:196,132:.: 0.85:1.000:. ./.:4:148,120:.: 0.02:1.000:. ./.:4:253,50:.: 0.50:1.000:. ./.:4:185,134:.: 0.72:1.000:. ./.:4:183,111:.: 0.38:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:210,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:152,75:.:-0.54:1.000:. ./.:4:163,106:.: 0.03:1.000:. ./.:4:239,54:.: 0.37:1.000:. ./.:5:124,104:.:-0.53:0.982:. ./.:4:175,90:.:-0.02:1.000:. ./.:4:197,45:.:-0.34:1.000:. ./.:4:342,59:.: 1.85:1.000:. ./.:4:142,101:.:-0.32:1.000:. ./.:4:306,67:.: 1.47:1.000:. ./.:4:201,110:.: 0.61:1.000:. ./.:4:179,97:.: 0.13:1.000:. ./.:4:266,52:.: 0.71:1.000:. ./.:4:233,180:.: 2.02:1.000:. ./.:4:212,48:.:-0.09:1.000:. ./.:4:203,46:.:-0.24:1.000:. ./.:4:280,67:.: 1.11:1.000:. ./.:4:261,62:.: 0.78:1.000:. ./.:4:224,46:.: 0.05:1.000:. ./.:4:138,87:.:-0.57:1.000:. ./.:4:183,116:.: 0.45:1.000:. ./.:4:171,93:.:-0.03:1.000:. ./.:4:269,54:.: 0.78:1.000:. ./.:4:209,37:.:-0.28:1.000:. ./.:4:29,19:.:-3.01:1.000:. ./.:4:151,78:.:-0.52:1.000:. ./.:4:172,39:.:-0.76:1.000:. ./.:4:278,49:.: 0.83:1.000:. ./.:4:303,82:.: 1.63:1.000:. ./.:4:181,114:.: 0.39:1.000:. ./.:4:174,47:.:-0.63:1.000:. ./.:4:219,32:.:-0.21:1.000:. ./.:4:231,52:.: 0.23:1.000:. ./.:4:96,72:.:-1.36:1.000:. ./.:4:220,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:192,42:.:-0.45:1.000:. ./.:4:153,41:.:-1.00:1.000:. ./.:4:135,96:.:-0.49:1.000:. ./.:4:190,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.68:0.999:. ./.:4:240,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:155,96:.:-0.21:1.000:. ./.:4:184,35:.:-0.65:1.000:. ./.:4:117,83:.:-0.92:1.000:. ./.:4:187,45:.:-0.47:1.000:. ./.:4:152,95:.:-0.27:1.000:. ./.:4:168,38:.:-0.83:1.000:. ./.:4:124,81:.:-0.85:1.000:. ./.:4:212,49:.:-0.08:1.000:. ./.:4:275,53:.: 0.85:1.000:. ./.:4:186,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:183,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:220,58:.: 0.16:1.000:. ./.:4:218,123:.: 1.03:1.000:. ./.:4:201,145:.: 1.09:1.000:. ./.:4:176,51:.:-0.54:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.70:1.000:. -chr5.1 48741466 chr5.1_048741466 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:193,52:.: 0.83:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:144,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:127,48:.:-0.69:1.000:. ./.:4:211,71:.: 1.63:1.000:. ./.:4:198,137:.: 2.78:1.000:. ./.:4:120,43:.:-0.95:1.000:. ./.:4:126,82:.: 0.02:1.000:. ./.:4:173,52:.: 0.39:1.000:. ./.:4:109,2:.:-2.08:1.000:. ./.:4:150,24:.:-0.71:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:156,53:.: 0.05:1.000:. ./.:4:140,108:.: 0.89:1.000:. ./.:4:212,63:.: 1.48:1.000:. ./.:4:201,55:.: 1.06:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.85:0.944:. ./.:4:229,58:.: 1.74:1.000:. ./.:4:221,38:.: 1.13:1.000:. ./.:4:197,50:.: 0.87:1.000:. ./.:4:76,17:.:-2.47:1.000:. ./.:4:163,45:.: 0.02:1.000:. ./.:4:183,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:195,45:.: 0.72:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:216,62:.: 1.54:1.000:. ./.:4:197,54:.: 0.96:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:201,47:.: 0.89:1.000:. ./.:4:193,50:.: 0.78:1.000:. ./.:4:154,34:.:-0.41:1.000:. ./.:4:155,60:.: 0.18:1.000:. ./.:4:138,18:.:-1.10:1.000:. ./.:4:142,8:.:-1.23:1.000:. ./.:3:34,4:.:-3.66:0.999:. ./.:4:194,48:.: 0.76:1.000:. ./.:4:201,58:.: 1.13:1.000:. ./.:4:172,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:171,44:.: 0.18:1.000:. ./.:4:181,54:.: 0.61:1.000:. ./.:4:147,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:187,63:.: 0.93:1.000:. ./.:4:187,61:.: 0.89:1.000:. ./.:4:156,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:165,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:115,103:.: 0.24:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:226,61:.: 1.74:1.000:. ./.:4:144,47:.:-0.34:1.000:. ./.:4:197,58:.: 1.04:1.000:. ./.:4:140,38:.:-0.63:1.000:. ./.:4:96,47:.:-1.39:1.000:. ./.:4:90,101:.:-0.34:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:155,53:.: 0.02:1.000:. ./.:4:120,124:.: 0.80:1.000:. ./.:4:158,32:.:-0.37:1.000:. ./.:4:198,46:.: 0.80:1.000:. ./.:4:154,48:.:-0.11:1.000:. ./.:6:135,21:.:-1.10:1.000:. ./.:4:136,46:.:-0.54:1.000:. ./.:4:183,55:.: 0.67:1.000:. ./.:4:190,44:.: 0.59:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:145,41:.:-0.45:1.000:. ./.:4:158,57:.: 0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:123,40:.:-0.95:1.000:. ./.:4:125,90:.: 0.18:0.996:. ./.:4:209,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:159,42:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,41:.:-0.26:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:188,57:.: 0.83:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:170,52:.: 0.33:1.000:. ./.:4:153,46:.:-0.17:1.000:. ./.:4:84,74:.:-1.06:1.000:. ./.:4:180,57:.: 0.65:1.000:. ./.:4:198,64:.: 1.19:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:123,55:.:-0.63:1.000:. ./.:4:174,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:149,54:.:-0.08:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:181,52:.: 0.57:1.000:. ./.:4:129,39:.:-0.84:1.000:. ./.:4:173,49:.: 0.33:1.000:. ./.:4:178,52:.: 0.50:1.000:. ./.:4:76,53:.:-1.69:1.000:. ./.:4:218,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:129,91:.: 0.28:1.000:. ./.:4:86,62:.:-1.28:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:163,47:.: 0.07:1.000:. ./.:4:167,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:145,34:.:-0.61:1.000:. ./.:4:142,49:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,27:.:-2.12:1.000:. ./.:4:68,72:.:-1.45:1.000:. ./.:4:128,33:.:-1.00:1.000:. ./.:4:121,43:.:-0.93:1.000:. ./.:4:82,84:.:-0.89:1.000:. ./.:4:95,97:.:-0.32:1.000:. ./.:4:224,76:.: 2.02:1.000:. ./.:4:180,56:.: 0.63:1.000:. ./.:4:141,41:.:-0.54:1.000:. ./.:4:151,115:.: 1.28:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.10:0.999:. ./.:4:181,34:.: 0.18:1.000:. ./.:4:101,62:.:-0.95:1.000:. ./.:4:161,38:.:-0.17:1.000:. ./.:4:171,48:.: 0.26:1.000:. ./.:4:153,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:138,37:.:-0.69:1.000:. ./.:4:116,29:.:-1.34:1.000:. ./.:4:107,90:.:-0.21:1.000:. ./.:4:152,25:.:-0.65:1.000:. ./.:4:188,54:.: 0.76:1.000:. ./.:4:185,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:102,109:.: 0.09:1.000:. ./.:4:90,56:.:-1.32:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:112,30:.:-1.41:1.000:. ./.:4:108,70:.:-0.63:1.000:. ./.:4:171,39:.: 0.07:1.000:. ./.:5:101,43:.:-1.36:0.982:. ./.:4:122,100:.: 0.33:1.000:. ./.:4:147,59:.:-0.02:1.000:. ./.:4:343,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:119,85:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,45:.:-1.00:1.000:. ./.:4:111,25:.:-1.54:1.000:. ./.:4:147,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:160,47:.: 0.00:1.000:. ./.:4:121,42:.:-0.95:1.000:. ./.:4:165,44:.: 0.05:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:174,79:.: 1.00:1.000:. ./.:4:171,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:178,39:.: 0.22:1.000:. ./.:4:137,143:.: 1.58:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.32:1.000:. ./.:4:175,51:.: 0.41:1.000:. ./.:4:172,49:.: 0.31:1.000:. ./.:4:48,30:.:-2.79:1.000:. ./.:4:144,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:209,59:.: 1.32:1.000:. ./.:4:220,55:.: 1.48:1.000:. ./.:4:186,59:.: 0.83:1.000:. ./.:4:205,41:.: 0.85:1.000:. ./.:4:158,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:114,88:.:-0.11:1.000:. ./.:4:146,30:.:-0.67:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,110:.: 0.50:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:168,50:.: 0.24:1.000:. ./.:4:107,76:.:-0.52:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:161,31:.:-0.32:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:167,53:.: 0.28:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:135,32:.:-0.87:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:171,50:.: 0.31:1.000:. ./.:4:202,69:.: 1.39:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:188,127:.: 2.34:1.000:. ./.:4:148,135:.: 1.65:1.000:. ./.:4:156,48:.:-0.06:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.96:1.000:. -chr5.1 48872859 chr5.1_048872859 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:76,56:0.44: 0.38:1.000:0.959 0/0/1/1:4:44,45:0.50:-1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,73:0.62:-0.14:1.000:0.631 0/1/1/1:4:35,90:0.73: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,37:0.35:-0.06:1.000:0.789 0/0/1/1:4:45,65:0.59:-0.43:1.000:0.891 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,80:0.76:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,20:0.24:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,49:0.91:-2.49:1.000:0.945 0/0/1/1:4:39,33:0.46:-1.83:1.000:0.988 0/1/1/1:4:38,80:0.68:-0.14:1.000:0.952 0/0/1/1:4:60,59:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,93:0.64: 0.82:1.000:0.740 0/0/0/1:4:88,31:0.32:-0.10:1.000:0.964 0/0/1/1:4:58,62:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,87:0.63: 0.60:0.944:0.536 1/1/1/1:4:7,72:0.91:-1.57:1.000:0.969 0/0/1/1:4:59,76:0.55: 0.49:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,162:1.00: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,72:0.85:-1.35:1.000:0.986 0/1/1/1:4:37,76:0.67:-0.32:1.000:0.935 0/1/1/1:4:39,114:0.75: 1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,90:0.70: 0.27:1.000:0.986 0/1/1/1:4:12,31:0.73:-2.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,24:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,39:0.38:-0.36:1.000:0.564 0/0/1/1:4:63,33:0.38:-0.95:1.000:0.521 0/0/1/1:4:89,60:0.42: 1.00:1.000:0.912 0/1/1/1:4:39,97:0.72: 0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:76,33:0.35:-0.47:1.000:0.824 0/1/1/1:4:27,62:0.70:-1.21:1.000:0.985 0/1/1/1:4:15,38:0.72:-2.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,43:0.53:-1.57:1.000:0.990 0/0/1:3:37,30:0.45:-2.02:0.999:0.960 0/0/1/1:4:55,58:0.50:-0.32:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,21:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,92:0.56: 1.48:1.000:0.967 1/1/1/1:4:2,90:0.98:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:10,131:0.93: 0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,105:0.81: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,123:0.96: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,70:0.61:-0.29:1.000:0.690 1/1/1/1:4:7,146:0.96: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,96:0.81:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,80:0.61: 0.34:1.000:0.729 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:10,93:0.91:-0.69:1.000:0.899 0/0/1/1:4:59,41:0.42:-0.80:1.000:0.932 0/0/1/1:4:55,78:0.58: 0.41:1.000:0.913 0/1/1/1:4:47,112:0.71: 1.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,69:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,89:0.63: 0.71:1.000:0.547 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,82:0.56: 0.82:1.000:0.964 0/0/1/1:4:62,71:0.52: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,53:0.43: 0.16:1.000:0.953 0/1/1/1:4:34,80:0.71:-0.29:1.000:0.989 0/0/1/1/1/1:6:36,99:0.74: 0.49:1.000:0.591 0/1/1/1:4:36,109:0.76: 0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,126:0.99: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:8,168:0.96: 2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,143:0.81: 2.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,133:0.79: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,28:0.35:-1.13:1.000:0.794 0/0/1/1:4:52,58:0.52:-0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,109:0.74: 0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,81:0.63: 0.23:0.996:0.570 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,84:0.56: 0.93:1.000:0.960 0/0/0/1:4:65,28:0.35:-1.06:1.000:0.834 0/0/1/1:4:62,36:0.39:-0.87:1.000:0.731 0/1/1/1:4:33,110:0.78: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,71:0.70:-0.73:1.000:0.984 0/1/1/1:4:31,71:0.70:-0.73:1.000:0.984 0/0/0/1:4:100,42:0.34: 0.74:1.000:0.862 0/0/1/1:4:59,59:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,78:0.52: 0.93:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,106:0.74: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,62:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,113:0.73: 1.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,91:0.58: 1.26:1.000:0.926 0/0/1/1:4:43,66:0.60:-0.47:1.000:0.783 1/1/1/1:4:2,131:0.99: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,77:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,88:0.80:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,72:0.56: 0.16:1.000:0.960 0/1/1/1:4:34,122:0.79: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,52:0.47:-0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,57:0.59:-0.95:1.000:0.875 0/0/1/1:4:51,68:0.56:-0.10:1.000:0.960 1/1/1/1:4:9,103:0.92:-0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:58,41:0.43:-0.84:1.000:0.941 0/1/1/1:4:43,123:0.75: 1.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,84:0.68: 0.05:1.000:0.965 0/0/1/1:4:41,54:0.56:-0.99:1.000:0.966 0/0/1/1:4:55,64:0.53:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:68,79:0.53: 0.93:1.000:0.993 0/0/0/0:4:115,1:0.01:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,74:0.65:-0.32:1.000:0.830 0/0/1/1:4:42,58:0.57:-0.80:1.000:0.937 0/0/1/1:4:61,96:0.61: 1.30:1.000:0.720 0/1/1/1:4:42,85:0.67: 0.19:1.000:0.921 0/1/1/1:4:12,73:0.86:-1.35:1.000:0.957 0/0/1/1:4:53,49:0.48:-0.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,67:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,74:0.46: 1.55:1.000:0.984 0/0/1/1:4:65,47:0.43:-0.36:1.000:0.951 0/1/1/1:4:34,89:0.73: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,73:0.57: 0.16:1.000:0.940 0/0/1/1:4:60,74:0.54: 0.45:0.999:0.986 0/1/1/1:4:46,84:0.64: 0.30:1.000:0.744 0/1/1/1:4:16,68:0.81:-1.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,102:0.80: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,1:0.02:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,165:1.00: 1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,59:0.58:-0.76:1.000:0.923 0/0/0/1:4:86,36:0.34: 0.01:1.000:0.865 0/0/1/1:4:58,85:0.59: 0.78:1.000:0.871 0/0/0/1:4:111,24:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,70:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,78:0.60: 0.27:1.000:0.791 0/1/1/1:4:53,95:0.64: 0.97:1.000:0.693 0/1/1/1:4:27,77:0.75:-0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,102:0.80: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,11:0.20:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,71:0.68:-0.62:1.000:0.947 0/1/1/1:4:36,99:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:54,52:0.48:-0.58:0.982:0.655 0/1/1/1:4:27,49:0.64:-1.68:1.000:0.727 0/1/1/1:4:30,90:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,98:0.70: 0.67:1.000:0.988 0/1/1/1:4:30,58:0.66:-1.24:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,56:0.55:-0.80:1.000:0.978 0/1/1/1:4:37,78:0.68:-0.25:1.000:0.953 1/1/1/1:4:11,116:0.92: 0.19:1.000:0.977 0/0/0/1:4:69,33:0.36:-0.73:1.000:0.671 0/0/1/1:4:63,62:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,25:0.34:-1.35:1.000:0.870 0/0/1/1:4:104,95:0.47: 2.84:1.000:0.994 0/1/1/1:4:49,127:0.73: 2.00:1.000:0.997 1/1/1/1:4:12,121:0.91: 0.41:1.000:0.961 0/0/1/1:4:53,53:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,59:0.44: 0.49:1.000:0.974 0/0/0/1:4:64,27:0.34:-1.13:1.000:0.857 1/1/1/1:4:7,127:0.95: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,63:0.47: 0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:26,36:0.57:-2.20:1.000:0.935 0/1/1/1:4:20,54:0.74:-1.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,74:0.58: 0.19:1.000:0.928 0/1/1/1:4:41,98:0.71: 0.63:1.000:0.991 0/1/1/1:4:51,118:0.70: 1.74:1.000:0.986 0/0/0/1:4:97,24:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,64:0.46: 0.71:1.000:0.986 0/0/1/1:4:76,69:0.47: 0.86:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,83:0.47: 2.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,42:0.58:-1.83:1.000:0.926 0/1/1/1:4:19,114:0.86: 0.41:1.000:0.964 0/0/1/1:4:65,66:0.49: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,46:0.62:-1.76:1.000:0.590 0/0/1/1:4:74,45:0.40:-0.10:1.000:0.804 0/0/1/1:4:57,59:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,88:0.62: 0.71:0.999:0.555 0/1/1/1:4:36,88:0.71: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,57:0.45: 0.27:1.000:0.978 0/0/1/1:4:79,69:0.47: 0.97:1.000:0.991 0/0/0/1:4:73,14:0.23:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,61:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:72,53:0.44: 0.12:1.000:0.958 0/0/1/1:4:54,47:0.47:-0.76:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,45:0.56:-1.57:1.000:0.964 0/0/0/1:4:100,49:0.37: 1.00:1.000:0.623 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,54:0.43: 0.34:1.000:0.937 0/0/1/1:4:44,69:0.61:-0.32:1.000:0.730 0/0/1/1:4:84,64:0.44: 0.97:1.000:0.969 0/1/1/1:4:43,99:0.70: 0.74:1.000:0.985 0/0/1/1:4:118,93:0.45: 3.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:75,66:0.47: 0.71:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,42:0.41:-0.58:1.000:0.891 -chr5.1 49185463 chr5.1_049185463 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:118,60:0.43: 0.51:1.000:0.951 0/0/0/1:4:92,36:0.37:-0.28:1.000:0.619 0/0/0/0:4:184,15:0.10: 0.84:1.000:0.736 0/0/0/1:4:183,23:0.15: 0.95:1.000:0.990 1/1/1/1:4:3,129:0.93:-0.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,27:0.40:-0.92:1.000:0.754 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,46:0.40: 0.03:1.000:0.797 0/1/1/1:4:8,28:0.68:-1.75:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,42:0.43:-0.33:1.000:0.948 0/0/0/1:4:147,46:0.31: 0.75:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,52:0.45: 0.03:1.000:0.978 0/0/0/1:4:190,32:0.20: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,45:0.42:-0.11:0.944:0.896 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,44:0.42:-0.17:1.000:0.908 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,24:0.19: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,91:0.54: 0.72:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,17:0.60:-1.87:1.000:0.785 0/0/1/1:4:80,49:0.48:-0.27:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,32:0.21: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,100:0.97:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,48:0.47:-0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:163,27:0.19: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,18:0.16: 0.19:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-2.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,26:0.72:-1.84:1.000:0.996 0/0/1:3:13,5:0.36:-2.03:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,38:0.31: 0.24:1.000:0.970 0/0/1/1:4:98,56:0.46: 0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:167,26:0.18: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,28:0.30:-0.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:82,45:0.45:-0.30:1.000:0.982 0/0/0/1:4:176,24:0.16: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,50:0.39: 0.33:1.000:0.659 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,80:0.53: 0.43:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,84:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:250,46:0.21: 2.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,52:0.41: 0.26:1.000:0.880 0/0/0/1:4:163,32:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,42:0.42:-0.27:1.000:0.906 0/0/0/1:4:216,26:0.15: 1.53:1.000:0.983 0/0/1/1:4:84,67:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:197,47:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,66:0.47: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:96,35:0.35:-0.24:1.000:0.801 0/0/0/1:4:172,51:0.30: 1.22:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,62:0.52:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:150,24:0.19: 0.45:1.000:0.958 0/0/0/1:4:199,22:0.14: 1.19:1.000:0.949 0/0/0/1:4:75,26:0.34:-0.71:1.000:0.884 0/0/1/1:4:105,53:0.43: 0.19:1.000:0.946 0/0/1/1:4:97,68:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,30:0.17: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,58:0.47: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:65,60:0.54:-0.33:1.000:0.987 0/0/0/1:4:168,29:0.20: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-1.13:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,65:0.32: 1.97:1.000:0.959 0/0/1/1:4:74,52:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,67:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,67:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,81:0.53: 0.53:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,80:0.56: 0.13:1.000:0.968 0/0/1/1:4:73,65:0.54:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:91,56:0.48: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,63:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,61:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,87:0.53: 0.68:1.000:0.992 0/0/0/1:4:186,45:0.26: 1.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:158,24:0.18: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,38:0.42:-0.49:1.000:0.929 0/0/0/1:4:213,44:0.23: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,55:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,64:0.36: 1.41:1.000:0.742 0/0/1/1:4:83,61:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,40:0.43:-0.44:1.000:0.956 0/0/0/1:4:148,50:0.33: 0.83:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,47:0.40: 0.10:1.000:0.780 0/0/1/1:4:74,32:0.39:-0.63:1.000:0.693 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,41:0.37:-0.06:1.000:0.503 0/0/0/1:4:158,49:0.31: 0.97:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,87:0.53: 0.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:56,60:0.56:-0.48:1.000:0.970 0/0/0/1:4:205,29:0.17: 1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,52:0.39: 0.38:1.000:0.743 0/0/1/1:4:80,70:0.53: 0.06:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,59:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,52:0.47:-0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,39:0.40:-0.33:1.000:0.808 0/0/1/1:4:116,68:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:89,45:0.43:-0.19:1.000:0.947 0/0/1/1:4:97,72:0.51: 0.37:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,55:0.27: 1.99:0.999:0.997 0/0/1/1:4:114,104:0.54: 1.14:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,79:0.52: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,81:0.53: 0.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:96,69:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,49:0.46:-0.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:91,41:0.40:-0.22:1.000:0.795 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,87:0.54: 0.62:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,64:0.51: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:191,65:0.33: 1.75:1.000:0.906 0/0/0/1:4:104,39:0.36:-0.05:1.000:0.737 0/0/1/1:4:82,62:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,61:0.55:-0.38:1.000:0.980 0/0/1/1:4:62,57:0.54:-0.43:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,55:0.51:-0.19:1.000:0.996 1/1/1/1/1:5:0,70:1.00:-1.21:0.982:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,30:0.18: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,93:0.51: 1.29:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,59:0.53:-0.27:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,59:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,99:0.56: 0.68:1.000:0.965 0/0/1/1:4:77,60:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:134,34:0.27: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:250,59:0.26: 2.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:238,29:0.15: 1.92:1.000:0.985 0/0/1/1:4:93,52:0.46:-0.01:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,41:0.34: 0.18:1.000:0.856 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,51:0.43: 0.11:1.000:0.939 0/0/0/1:4:193,48:0.27: 1.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,14:0.59:-1.94:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,43:0.40:-0.11:1.000:0.782 0/0/1/1:4:114,66:0.47: 0.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:244,22:0.11: 1.91:1.000:0.569 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,26:0.19: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,44:0.24: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,40:0.25: 1.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,52:0.53:-0.55:1.000:0.990 0/0/0/1:4:194,46:0.26: 1.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,40:0.39:-0.21:1.000:0.678 0/0/0/1:4:103,27:0.28:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,34:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,85:0.54: 0.53:0.999:0.989 0/0/1/1:4:87,54:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,45:0.38: 0.14:1.000:0.522 0/0/0/1:4:150,36:0.26: 0.64:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,51:0.31: 1.18:1.000:0.977 0/0/1/1:4:76,43:0.46:-0.43:1.000:0.988 0/0/0/1:4:137,32:0.26: 0.37:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,27:0.15: 1.64:1.000:0.985 0/0/1/1:4:99,45:0.40:-0.03:1.000:0.813 0/0/0/1:4:192,37:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,60:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,59:0.28: 2.15:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,51:0.38: 0.46:1.000:0.540 0/0/0/1:4:177,37:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,76:0.52: 0.38:1.000:0.994 -chr5.1 49316953 chr5.1_049316953 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:0.944:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:3:6,0:.:-0.96:0.999:. ./.:4:18,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:6:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.78:0.996:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:26,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:0.999:. ./.:4:17,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:29,0:.: 3.25:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:5:11,0:.:-0.05:0.982:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:23,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.96:1.000:. -chr5.1 49631081 chr5.1_049631081 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:10,3:0.29:-0.84:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,6:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,4:0.21: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,9:0.46: 0.25:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,9:0.44: 0.34:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.06:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.47:-0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,13:0.52: 0.61:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,3:0.16: 0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,9:0.48: 0.15:0.944:0.995 0/0/1/1:4:21,13:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,6:0.36:-0.12:1.000:0.656 0/0/0/1:4:36,7:0.22: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,1:0.12:-0.48:1.000:0.708 0/0/0/1:4:31,6:0.21: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,7:0.39: 0.06:1.000:0.660 0/0/1/1:4:14,9:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,11:0.61:-0.48:1.000:0.741 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.35: 0.97:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.34: 0.70:1.000:0.883 0/0/1/1:4:15,17:0.56: 0.88:1.000:0.970 0/0/0/1:4:14,5:0.33:-0.30:1.000:0.907 0/1/1/1:4:2,7:0.66:-1.21:1.000:0.862 0/0/1/1:4:6,4:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/0:3:3,0:0.06:-1.75:0.999:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.48:-0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,6:0.30: 0.25:1.000:0.983 0/0/1/1:4:5,5:0.55:-1.12:1.000:0.984 0/0/1/1:4:16,16:0.55: 0.88:1.000:0.984 0/0/0/1:4:28,3:0.15: 0.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:36,10:0.27: 2.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,3:0.16: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,9:0.27: 1.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,12:0.57:-0.12:1.000:0.934 0/0/0/1:4:44,5:0.16: 2.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,13:0.51: 0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,6:0.35:-0.03:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,10:0.29: 1.88:1.000:0.990 0/0/1/1:4:9,4:0.39:-0.84:1.000:0.710 0/0/1/1:4:17,10:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:39,9:0.24: 2.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,9:0.37: 0.79:1.000:0.579 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.35: 0.61:1.000:0.794 0/0/1/1:4:13,9:0.51:-0.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.55: 1.06:1.000:0.984 0/0/0/0/1/1:6:26,8:0.30: 1.06:1.000:0.857 0/0/0/1:4:32,4:0.17: 1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,11:0.29: 2.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:34,10:0.29: 1.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,14:0.54: 0.61:1.000:0.989 0/0/0/1:4:20,5:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,14:0.54: 0.61:1.000:0.989 0/0/0/1:4:8,3:0.35:-1.02:1.000:0.829 0/0/0/1:4:24,5:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,12:0.51: 0.61:0.996:0.996 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.51: 1.70:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,10:0.49: 0.34:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,8:0.41: 0.25:1.000:0.850 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,6:0.40:-0.30:1.000:0.810 0/0/1/1:4:21,9:0.38: 0.70:1.000:0.589 0/0/1/1:4:10,15:0.59: 0.25:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,13:0.51: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,13:0.55: 0.34:1.000:0.984 0/0/0/1:4:31,2:0.12: 0.97:1.000:0.747 0/0/1/1:4:27,13:0.41: 1.61:1.000:0.889 0/0/0/1:4:22,7:0.30: 0.61:1.000:0.981 0/0/1/1:4:20,10:0.43: 0.70:1.000:0.933 0/0/1/1:4:11,7:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,10:0.53:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,10:0.53:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,6:0.61:-1.21:1.000:0.653 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,13:0.33: 2.51:1.000:0.925 0/0/1/1:4:5,6:0.56:-1.02:1.000:0.961 0/0/0/1:4:23,9:0.36: 0.88:1.000:0.724 0/0/1/1:4:15,12:0.52: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,8:0.47:-0.03:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,8:0.22: 2.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.21:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,13:0.46: 1.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:13,8:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,3:0.18: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,11:0.44: 0.88:1.000:0.966 0/0/1/1:4:9,7:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,8:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,7:0.36: 0.25:1.000:0.741 0/0/1/1:4:23,12:0.44: 1.15:1.000:0.964 0/0/0/1:4:21,6:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,8:0.35: 0.61:0.999:0.794 0/0/1/1:4:9,20:0.62: 0.61:1.000:0.533 0/0/1/1:4:12,6:0.43:-0.39:1.000:0.933 0/0/0/1:4:21,8:0.35: 0.61:1.000:0.794 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,7:0.24: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,8:0.26: 1.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:21,7:0.32: 0.52:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,4:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.53:-0.03:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,12:0.57:-0.12:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,12:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,7:0.60:-1.02:1.000:0.783 0/0/0/1/1:5:9,4:0.39:-0.84:0.982:0.971 0/0/0/1:4:11,4:0.34:-0.66:1.000:0.883 0/0/0/1:4:19,2:0.15:-0.12:1.000:0.990 0/0/0/1:4:16,4:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,13:0.55: 0.25:1.000:0.976 0/0/0/1:4:30,3:0.15: 0.97:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,10:0.44: 0.61:1.000:0.968 0/0/0/1:4:40,8:0.22: 2.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.55:-0.75:1.000:0.984 0/0/0/1:4:10,4:0.36:-0.75:1.000:0.656 0/0/0/1:4:18,7:0.36: 0.25:1.000:0.741 0/0/0/1:4:45,7:0.19: 2.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.35: 0.61:1.000:0.794 0/0/1/1:4:11,10:0.54:-0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:13,13:0.55: 0.34:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,3:0.16: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,10:0.53:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:9,2:0.23:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,6:0.38:-0.21:1.000:0.589 0/0/1/1:4:10,8:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,7:0.43:-0.12:1.000:0.933 0/0/0/1:4:17,6:0.33: 0.06:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,5:0.40:-0.57:1.000:0.773 0/0/0/1:4:21,6:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,5:0.30:-0.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:10,9:0.53:-0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:13,11:0.53: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,7:0.45:-0.21:1.000:0.977 0/1/1/1:4:2,6:0.65:-1.30:1.000:0.769 0/0/0/1:4:14,2:0.18:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,9:0.51:-0.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.66:0.999:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,6:0.43:-0.39:1.000:0.933 0/0/0/1:4:17,5:0.29:-0.03:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,15:0.62:-0.03:1.000:0.575 0/0/1/1:4:14,6:0.38:-0.21:1.000:0.589 0/0/1/1:4:17,10:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:10,3:0.29:-0.84:1.000:0.992 0/0/0/1:4:14,5:0.33:-0.30:1.000:0.907 0/0/0/1:4:40,6:0.18: 2.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,4:0.39:-0.84:1.000:0.710 0/0/1/1:4:11,5:0.40:-0.57:1.000:0.773 0/0/0/1:4:17,3:0.20:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,4:0.43:-0.93:1.000:0.933 0/0/1/1:4:13,7:0.45:-0.21:1.000:0.977 0/0/1/1:4:11,8:0.51:-0.30:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.39:1.000:1.000 -chr5.1 49753766 chr5.1_049753766 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:86,40:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,38:.:-1.43:1.000:. ./.:4:49,40:.:-0.48:1.000:. ./.:4:42,41:.:-0.70:1.000:. ./.:4:114,28:.: 1.46:1.000:. ./.:4:95,17:.: 0.36:1.000:. ./.:4:19,22:.:-2.24:1.000:. ./.:4:89,23:.: 0.36:1.000:. ./.:4:77,32:.: 0.25:1.000:. ./.:4:9,20:.:-2.67:1.000:. ./.:4:32,9:.:-2.24:1.000:. ./.:4:51,19:.:-1.17:1.000:. ./.:4:65,22:.:-0.55:1.000:. ./.:4:94,19:.: 0.40:1.000:. ./.:4:68,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:25,77:.: 0.00:1.000:. ./.:4:95,26:.: 0.69:0.944:. ./.:4:115,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:70,56:.: 0.87:1.000:. ./.:4:88,20:.: 0.22:1.000:. ./.:4:17,8:.:-2.82:1.000:. ./.:4:58,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:91,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,3:.:-3.59:1.000:. ./.:4:101,32:.: 1.13:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:51,40:.:-0.41:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:65,37:.: 0.00:1.000:. ./.:4:7,5:.:-3.30:1.000:. ./.:4:15,19:.:-2.49:1.000:. ./.:3:2,4:.:-3.52:0.999:. ./.:4:62,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:83,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,78:.: 0.54:1.000:. ./.:4:99,25:.: 0.80:1.000:. ./.:4:62,57:.: 0.62:1.000:. ./.:4:59,43:.: 0.00:1.000:. ./.:4:84,50:.: 1.17:1.000:. ./.:4:85,47:.: 1.09:1.000:. ./.:4:65,40:.: 0.11:1.000:. ./.:4:61,45:.: 0.14:1.000:. ./.:4:86,27:.: 0.40:1.000:. ./.:4:90,28:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,13:.:-2.05:1.000:. ./.:4:61,42:.: 0.03:1.000:. ./.:4:38,42:.:-0.81:1.000:. ./.:4:60,37:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,55:.: 1.42:1.000:. ./.:4:58,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:111,39:.: 1.75:1.000:. ./.:4:78,54:.: 1.09:1.000:. ./.:4:68,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:116,28:.: 1.53:1.000:. ./.:4:74,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:81,21:.: 0.00:1.000:. ./.:6:58,29:.:-0.55:1.000:. ./.:4:58,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,18:.: 0.14:1.000:. ./.:4:83,54:.: 1.28:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:79,35:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,76:.: 0.51:1.000:. ./.:4:49,17:.:-1.32:1.000:. ./.:4:55,31:.:-0.59:1.000:. ./.:4:49,52:.:-0.04:0.996:. ./.:4:85,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:110,27:.: 1.28:1.000:. ./.:4:54,12:.:-1.32:1.000:. ./.:4:47,63:.: 0.29:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:38,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:55,43:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,20:.: 0.03:1.000:. ./.:4:74,42:.: 0.51:1.000:. ./.:4:69,59:.: 0.95:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:34,29:.:-1.43:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:120,17:.: 1.28:1.000:. ./.:4:33,56:.:-0.48:1.000:. ./.:4:63,48:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,25:.: 1.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:85,22:.: 0.18:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:58,46:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,19:.:-0.15:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:92,45:.: 1.28:1.000:. ./.:4:59,33:.:-0.37:1.000:. ./.:4:90,31:.: 0.69:1.000:. ./.:4:64,49:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,33:.:-0.59:1.000:. ./.:4:43,52:.:-0.26:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:76,45:.: 0.69:1.000:. ./.:4:46,25:.:-1.14:1.000:. ./.:4:50,61:.: 0.33:1.000:. ./.:4:77,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:74,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:41,36:.:-0.92:1.000:. ./.:4:91,47:.: 1.31:1.000:. ./.:4:34,64:.:-0.15:1.000:. ./.:4:65,47:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,54:.: 1.13:1.000:. ./.:4:63,53:.: 0.51:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:97,36:.: 1.13:1.000:. ./.:4:96,20:.: 0.51:0.999:. ./.:4:101,41:.: 1.46:1.000:. ./.:4:59,11:.:-1.17:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:50,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:68,29:.:-0.19:1.000:. ./.:4:76,49:.: 0.84:1.000:. ./.:4:57,42:.:-0.11:1.000:. ./.:4:83,44:.: 0.91:1.000:. ./.:4:66,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:84,15:.:-0.11:1.000:. ./.:4:89,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,48:.: 0.11:1.000:. ./.:4:56,47:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,37:.:-1.10:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:52,22:.:-1.03:1.000:. ./.:4:53,36:.:-0.48:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.11:1.000:. ./.:5:42,31:.:-1.06:0.982:. ./.:4:48,36:.:-0.66:1.000:. ./.:4:63,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:71,39:.: 0.29:1.000:. ./.:4:88,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,40:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,50:.: 1.02:1.000:. ./.:4:101,29:.: 1.02:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.77:1.000:. ./.:4:38,32:.:-1.17:1.000:. ./.:4:86,33:.: 0.62:1.000:. ./.:4:54,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:63,60:.: 0.76:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:97,43:.: 1.39:1.000:. ./.:4:95,20:.: 0.47:1.000:. ./.:4:79,34:.: 0.40:1.000:. ./.:4:82,36:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,19:.:-2.71:1.000:. ./.:4:49,11:.:-1.54:1.000:. ./.:4:82,27:.: 0.25:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:83,44:.: 0.91:1.000:. ./.:4:88,23:.: 0.33:1.000:. ./.:4:85,15:.:-0.08:1.000:. ./.:4:88,26:.: 0.44:1.000:. ./.:4:66,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,24:.:-1.43:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:80,23:.: 0.03:1.000:. ./.:4:132,33:.: 2.30:1.000:. ./.:4:75,44:.: 0.62:1.000:. ./.:4:72,23:.:-0.26:1.000:. ./.:4:64,53:.: 0.54:0.999:. ./.:4:100,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:57,37:.:-0.30:1.000:. ./.:4:59,14:.:-1.06:1.000:. ./.:4:71,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:86,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:30,53:.:-0.70:1.000:. ./.:4:79,21:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,22:.:-1.14:1.000:. ./.:4:59,46:.: 0.11:1.000:. ./.:4:89,20:.: 0.25:1.000:. ./.:4:76,29:.: 0.11:1.000:. ./.:4:47,30:.:-0.92:1.000:. ./.:4:104,24:.: 0.95:1.000:. ./.:4:94,53:.: 1.64:1.000:. ./.:4:71,43:.: 0.44:1.000:. ./.:4:61,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:47,37:.:-0.66:1.000:. -chr5.1 49888057 chr5.1_049888057 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:86,103:0.57: 0.50:1.000:0.942 0/0/1/1:4:88,65:0.46:-0.39:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,111:0.73:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:140,112:0.48: 2.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,87:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:21,61:0.76:-2.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,71:0.45: 0.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:92,79:0.49: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,36:0.79:-3.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,40:0.55:-2.30:1.000:0.975 0/0/0/1:4:128,30:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,112:0.70:-0.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:134,98:0.46: 1.56:1.000:0.984 0/0/1/1:4:76,72:0.52:-0.52:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,70:0.54:-0.79:0.944:0.988 0/0/0/1:4:147,40:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,84:0.45: 0.85:1.000:0.976 0/0/1/1:4:112,95:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,48:0.75:-2.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,124:0.80:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,125:0.53: 2.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:131,36:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,22:0.44:-2.85:1.000:0.968 0/0/1/1:4:97,81:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,25:0.18:-0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,113:0.69:-0.02:1.000:0.975 0/0/0/1:4:192,47:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,62:0.46:-0.59:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,86:0.72:-1.14:1.000:0.994 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-3.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,33:0.68:-2.95:1.000:0.952 0/1/1:3:15,19:0.58:-3.34:0.999:0.997 0/0/1/1:4:105,75:0.45: 0.28:1.000:0.979 0/0/1/1:4:99,72:0.45: 0.05:1.000:0.983 0/1/1/1:4:40,121:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,112:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,124:0.79:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,158:0.76: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,118:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,131:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,85:0.61:-0.57:1.000:0.728 0/1/1/1:4:53,144:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,84:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:108,102:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,39:0.76:-2.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,93:0.72:-0.89:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,80:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,171:0.74: 1.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,107:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,88:0.47: 0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:48,108:0.71:-0.32:1.000:0.991 0/1/1/1:4:46,133:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,121:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,88:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,129:0.74: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:60,78:0.59:-0.77:1.000:0.569 0/1/1/1:4:53,152:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,79:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,156:0.74: 1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,43:0.28: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,113:0.70:-0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:45,117:0.74:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,62:0.54:-1.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:56,107:0.68:-0.15:1.000:0.942 0/1/1/1:4:38,122:0.78:-0.22:0.996:1.000 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,144:0.73: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,63:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,131:0.72: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,96:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,95:0.57: 0.18:1.000:0.954 0/0/1/1:4:89,87:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,81:0.47: 0.42:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,165:0.78: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,99:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,92:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:82,73:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,53:0.28: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,144:0.60: 2.06:1.000:0.819 1/1/1/1:4:0,152:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,100:0.72:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,149:0.77: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,28:0.21:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,85:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:126,41:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,89:0.54: 0.10:1.000:0.985 0/1/1/1:4:41,83:0.69:-1.11:1.000:0.970 0/0/0/1:4:122,41:0.29:-0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,191:0.81: 1.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,88:0.74:-1.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:205,47:0.22: 2.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,136:0.70: 0.72:1.000:0.988 0/1/1/1:4:41,152:0.80: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,109:0.75:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,56:0.30: 1.09:1.000:0.987 0/1/1/1:4:57,128:0.71: 0.40:1.000:0.991 0/1/1/1:4:43,130:0.76: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,185:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,121:0.79:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,161:0.73: 1.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,72:0.53:-0.64:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,117:0.72:-0.07:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,131:0.72: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,110:0.51: 1.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,86:0.51: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,73:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,144:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,112:0.53: 1.34:0.999:0.991 0/1/1/1:4:60,184:0.77: 1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,58:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,115:0.57: 1.02:1.000:0.934 0/1/1/1:4:44,110:0.73:-0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,144:0.81: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,137:0.78: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,117:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,131:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,87:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:160,52:0.28: 1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,84:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,98:0.56: 0.40:1.000:0.971 0/1/1/1:4:52,157:0.76: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,154:0.74: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,84:0.65:-0.89:1.000:0.816 0/0/0/1:4:124,31:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,69:0.55:-0.94:1.000:0.974 0/1/1/1:4:39,111:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,72:0.48:-0.17:1.000:0.994 0/0/1/1/1:5:63,88:0.61:-0.44:0.982:0.971 0/1/1/1:4:33,90:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,111:0.77:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,42:0.21: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,110:0.72:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,71:0.46:-0.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:114,38:0.29:-0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,89:0.52: 0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,110:0.70:-0.20:1.000:0.986 0/0/1/1:4:78,90:0.56:-0.02:1.000:0.962 0/1/1/1:4:48,98:0.69:-0.57:1.000:0.973 0/1/1/1:4:36,114:0.77:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,111:0.53: 1.27:1.000:0.991 0/1/1/1:4:60,175:0.76: 1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,117:0.75:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,74:0.49:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,121:0.74:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,83:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,147:0.73: 0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,123:0.78:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:6,50:0.90:-2.80:1.000:0.769 0/0/0/1:4:115,29:0.24:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,136:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,86:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,175:0.72: 1.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,94:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,125:0.81:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,84:0.46: 0.70:1.000:0.987 0/0/1/1:4:97,80:0.48: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,88:0.77:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,66:0.42: 0.00:1.000:0.928 0/0/1/1:4:100,73:0.45: 0.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:73,80:0.55:-0.39:1.000:0.979 0/1/1/1:4:43,114:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,79:0.47: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:109,64:0.40: 0.10:0.999:0.820 0/0/1/1:4:90,82:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,133:0.79: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,70:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,62:0.52:-1.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,68:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,128:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,58:0.42:-0.42:1.000:0.892 0/0/1/1:4:80,65:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,128:0.72: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,77:0.46: 0.33:1.000:0.985 0/1/1/1:4:52,110:0.70:-0.17:1.000:0.982 0/0/1/1:4:99,53:0.38:-0.42:1.000:0.603 0/0/1/1:4:115,88:0.47: 0.85:1.000:0.991 0/1/1/1:4:70,153:0.70: 1.34:1.000:0.988 0/1/1/1:4:61,144:0.72: 0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,104:0.67:-0.22:1.000:0.920 0/0/1/1:4:108,83:0.47: 0.55:1.000:0.991 -chr5.1 50206035 chr5.1_050206035 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:58,32:0.42: 0.72:1.000:0.917 0/0/0/1:4:48,6:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,22:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/0:4:60,2:0.07:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,66:0.46: 2.95:1.000:0.987 0/0/0/1:4:62,5:0.17: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,20:0.61:-1.13:1.000:0.648 0/0/0/0:4:79,4:0.11: 0.50:1.000:0.566 0/0/1/1:4:49,27:0.42: 0.28:1.000:0.917 0/1/1/1:4:2,11:0.74:-1.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,20:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,3:0.16:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,4:0.36:-1.64:1.000:0.703 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,29:0.39: 0.78:1.000:0.721 0/0/1/1:4:31,17:0.42:-0.60:1.000:0.914 0/0/1/1:4:73,40:0.42: 1.44:0.944:0.913 0/0/1/1:4:43,21:0.40:-0.10:1.000:0.805 0/0/1/1:4:76,50:0.45: 1.85:1.000:0.980 0/0/0/1:4:55,4:0.15:-0.25:1.000:0.990 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,3:0.13:-0.47:1.000:0.908 0/0/0/0:4:56,2:0.08:-0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,23:0.42:-0.03:1.000:0.896 0/1/1/1:4:8,17:0.64:-1.32:1.000:0.643 0/0/1/1:4:43,24:0.42: 0.00:1.000:0.924 0/0/1/1:4:41,25:0.44:-0.03:1.000:0.962 0/1/1/1:4:18,41:0.65:-0.25:1.000:0.752 0/0/1/1:4:62,57:0.51: 1.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:48,2:0.09:-0.54:1.000:0.945 0/0/1/1:4:24,15:0.44:-0.88:1.000:0.969 0/0/0/1:4:37,2:0.12:-0.88:1.000:0.648 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,12:0.43:-1.10:1.000:0.957 1/1/1:3:0,1:1.00:-2.08:0.999:1.000 0/0/1/1:4:33,43:0.56: 0.28:1.000:0.963 0/0/0/1:4:50,3:0.13:-0.44:1.000:0.882 0/0/1/1:4:28,54:0.62: 0.47:1.000:0.538 0/0/0/1:4:65,4:0.13: 0.06:1.000:0.914 0/0/1/1:4:60,26:0.38: 0.59:1.000:0.616 0/0/1/1:4:37,21:0.43:-0.29:1.000:0.934 0/0/0/1:4:67,5:0.16: 0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:87,22:0.31: 1.32:1.000:0.968 0/0/1/1:4:97,55:0.43: 2.67:1.000:0.933 0/0/0/1:4:87,28:0.34: 1.51:1.000:0.852 0/0/0/0:4:77,3:0.08: 0.41:1.000:0.977 0/0/1/1:4:62,50:0.48: 1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,6:0.49:-1.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,19:0.33: 0.50:1.000:0.911 0/0/1/1:4:34,17:0.41:-0.51:1.000:0.833 0/0/1/1:4:21,39:0.62:-0.22:1.000:0.609 0/0/0/1:4:29,11:0.36:-0.85:1.000:0.633 0/0/0/0:4:91,3:0.07: 0.85:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,39:0.57: 0.00:1.000:0.938 0/0/0/0:4:69,2:0.06: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,2:0.21:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,50:0.44: 2.01:1.000:0.966 0/0/0/1:4:95,19:0.29: 1.47:1.000:0.992 0/0/0/1/1/1:6:25,23:0.51:-0.60:1.000:0.886 0/0/0/1:4:14,2:0.26:-1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,5:0.17:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:89,22:0.31: 1.38:1.000:0.972 0/0/1/1:4:45,34:0.47: 0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:15,4:0.32:-1.51:1.000:0.955 0/1/1/1:4:23,69:0.68: 0.78:1.000:0.957 0/1/1/1:4:6,39:0.77:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,3:0.28:-1.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,17:0.28: 1.32:0.996:0.995 0/0/0/0:4:94,3:0.07: 0.94:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,4:0.36:-1.64:1.000:0.703 0/0/1/1:4:63,29:0.39: 0.78:1.000:0.721 0/0/1/1:4:35,41:0.55: 0.28:1.000:0.984 0/0/0/1:4:54,4:0.16:-0.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:84,16:0.28: 1.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,51:0.49: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,47:0.43: 1.95:1.000:0.938 0/0/0/1:4:48,4:0.17:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,54:0.44: 2.39:1.000:0.961 0/0/0/1:4:64,5:0.16: 0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,20:0.63:-1.17:1.000:0.532 0/0/1/1:4:51,45:0.50: 0.91:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,18:0.45:-0.66:1.000:0.975 0/0/1/1:4:34,20:0.43:-0.41:1.000:0.950 0/0/0/1:4:18,2:0.23:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.49:-0.88:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,38:0.96:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,47:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,45:0.66:-0.13:1.000:0.858 0/0/0/1:4:42,3:0.15:-0.69:1.000:0.988 0/0/1/1:4:23,42:0.61:-0.07:1.000:0.640 0/0/1/1:4:39,39:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/0:4:34,1:0.06:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,38:0.41: 1.41:1.000:0.861 0/0/0/1:4:99,28:0.33: 1.88:1.000:0.934 0/0/0/0:4:23,1:0.09:-1.35:1.000:0.908 0/0/1/1:4:15,13:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,33:0.42: 0.85:1.000:0.904 0/0/1/1:4:35,54:0.59: 0.69:1.000:0.870 0/0/1/1:4:28,48:0.61: 0.28:1.000:0.744 0/0/1/1:4:33,19:0.43:-0.47:1.000:0.940 0/0/0/0:4:21,1:0.10:-1.42:1.000:0.747 0/0/0/1:4:46,5:0.22:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,39:0.54: 0.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,18:0.28: 1.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,33:0.44: 0.63:1.000:0.963 0/0/0/1:4:33,3:0.19:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,34:0.60:-0.41:1.000:0.757 0/1/1/1:4:19,56:0.68: 0.25:1.000:0.952 0/0/0/1:4:77,4:0.11: 0.44:1.000:0.520 0/0/0/1:4:82,19:0.30: 1.07:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.95:0.999:1.000 0/0/1/1:4:46,39:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/0:4:75,1:0.03: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,6:0.15: 0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:39,47:0.55: 0.59:1.000:0.980 0/1/1/1:4:33,67:0.63: 1.03:1.000:0.560 0/0/1/1:4:49,33:0.45: 0.47:1.000:0.983 0/0/0/1:4:83,23:0.32: 1.22:1.000:0.942 0/0/0/1:4:94,14:0.26: 1.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,32:0.40: 0.94:1.000:0.815 0/0/1/1:4:57,40:0.46: 0.94:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,28:0.69:-0.95:1.000:0.966 0/0/1/1:4:48,29:0.44: 0.31:1.000:0.959 0/0/0/1:4:31,3:0.20:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,4:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,20:0.42:-0.32:1.000:0.904 0/0/1/1:4:31,21:0.45:-0.47:1.000:0.984 0/0/1/1:4:81,44:0.42: 1.82:1.000:0.907 0/0/1/1:4:38,27:0.46:-0.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:51,5:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:67,32:0.40: 1.00:0.982:0.971 0/0/0/1:4:96,21:0.30: 1.57:1.000:0.987 0/0/0/1:4:35,2:0.12:-0.95:1.000:0.795 0/0/1/1:4:78,34:0.38: 1.41:1.000:0.627 0/0/1/1:4:57,33:0.43: 0.72:1.000:0.943 0/0/0/1:4:62,6:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,31:0.40: 0.88:1.000:0.795 0/0/1/1:4:95,54:0.43: 2.57:1.000:0.934 0/0/1/1:4:34,34:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,41:0.69:-0.41:1.000:0.969 0/0/0/1:4:57,10:0.28: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,39:0.69:-0.51:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,3:0.08: 0.53:1.000:0.988 0/0/0/1:4:43,15:0.35:-0.29:1.000:0.763 0/1/1/1:4:20,48:0.65: 0.03:1.000:0.818 0/0/0/0:4:95,1:0.02: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,36:0.57:-0.16:1.000:0.941 0/0/1/1:4:26,13:0.41:-0.88:1.000:0.833 0/0/0/1:4:25,3:0.24:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,24:0.47:-0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:80,22:0.32: 1.10:1.000:0.945 0/0/0/0:4:63,1:0.04:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,1:0.03: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,36:0.58:-0.22:1.000:0.893 0/0/0/1:4:56,4:0.15:-0.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:31,33:0.53:-0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,24:0.64:-1.01:1.000:0.688 0/0/0/1:4:80,14:0.28: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,6:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,25:0.39: 0.37:1.000:0.730 0/1/1/1:4:27,60:0.64: 0.63:1.000:0.716 0/0/0/1:4:23,6:0.32:-1.20:1.000:0.961 0/0/1/1:4:34,30:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,18:0.58:-1.17:0.999:0.893 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,3:0.22:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,43:0.58: 0.19:1.000:0.923 0/0/1/1:4:32,28:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,44:0.59: 0.19:1.000:0.884 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,26:0.55:-0.63:1.000:0.975 0/1/1/1:4:17,41:0.65:-0.29:1.000:0.823 0/0/0/1:4:45,8:0.28:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/0:4:63,2:0.07:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,31:0.46: 0.28:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,22:0.38: 0.22:1.000:0.571 0/0/0/1:4:85,6:0.15: 0.75:1.000:0.986 0/0/0/1:4:13,2:0.27:-1.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,20:0.33: 0.72:1.000:0.930 -chr5.1 50399769 chr5.1_050399769 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:85,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:47,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:62,23:.: 1.03:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:16,12:.:-1.88:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:14,5:.:-2.34:1.000:. ./.:4:9,4:.:-2.65:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,24:.: 1.14:1.000:. ./.:4:69,18:.: 1.14:0.944:. ./.:4:65,30:.: 1.54:1.000:. ./.:4:59,25:.: 0.98:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.80:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,25:.: 0.32:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:48,24:.: 0.37:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.39:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.01:0.999:. ./.:4:54,24:.: 0.67:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,30:.: 0.83:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:66,25:.: 1.34:1.000:. ./.:4:55,23:.: 0.67:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,33:.: 1.39:1.000:. ./.:4:49,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:42,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:69,27:.: 1.60:1.000:. ./.:4:50,44:.: 1.49:1.000:. ./.:4:50,15:.: 0.01:1.000:. ./.:4:57,25:.: 0.88:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:43,30:.: 0.42:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.04:1.000:. ./.:4:62,21:.: 0.93:1.000:. ./.:6:62,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,32:.: 1.39:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:47,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:11,10:.:-2.24:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:59,20:.: 0.73:0.996:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:39,48:.: 1.14:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,14:.: 0.06:1.000:. ./.:4:47,16:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.96:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:42,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,21:.: 0.21:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:43,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:61,20:.: 0.83:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:14,7:.:-2.24:1.000:. ./.:4:52,22:.: 0.47:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:33,16:.:-0.81:1.000:. ./.:4:46,30:.: 0.57:1.000:. ./.:4:45,31:.: 0.57:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:72,44:.: 2.62:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:35,37:.: 0.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:18,15:.:-1.63:1.000:. ./.:4:46,26:.: 0.37:1.000:. ./.:4:39,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:40,27:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:44,16:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:39,9:.:-0.86:1.000:. ./.:4:48,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.57:1.000:. ./.:5:46,9:.:-0.50:0.982:. ./.:4:54,20:.: 0.47:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:70,28:.: 1.70:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:55,19:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,21:.:-0.09:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:45,26:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,28:.: 0.83:1.000:. ./.:4:60,32:.: 1.39:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:65,26:.: 1.34:1.000:. ./.:4:72,18:.: 1.29:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:60,18:.: 0.67:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:47,28:.: 0.52:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:41,35:.: 0.57:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:65,22:.: 1.14:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,27:.: 0.52:0.999:. ./.:4:76,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:48,18:.: 0.06:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:56,13:.: 0.21:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:47,24:.: 0.32:1.000:. ./.:4:62,31:.: 1.44:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:52,33:.: 1.03:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:54,23:.: 0.62:1.000:. -chr5.1 50462325 chr5.1_050462325 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,35:0.43: 0.85:1.000:0.933 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,38:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,13:0.59:-1.37:1.000:0.863 0/0/0/0:4:35,1:0.02:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,26:0.37: 0.30:1.000:0.518 0/0/1/1:4:42,28:0.44: 0.23:1.000:0.960 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.62:0.944:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.03:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:56,40:0.46: 1.08:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,36:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,40:0.48: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,43:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 1.70:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.72:-1.80:1.000:0.995 1/1/1:3:0,3:1.00:-1.96:0.999:1.000 0/0/1/1:4:58,38:0.43: 1.08:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,44:0.54: 0.72:1.000:0.988 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,33:0.47: 0.49:1.000:0.993 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,33:0.42: 0.69:1.000:0.931 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,23:1.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.50:-1.01:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 1.28:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,53:0.55: 1.21:1.000:0.984 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,34:0.24: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,45:0.55: 0.69:1.000:0.982 0/0/1/1:4:48,28:0.39: 0.43:1.000:0.635 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.51: 0.46:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:48,42:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,65:0.58: 1.51:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,31:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,42:0.52: 0.76:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,44:0.55: 0.62:1.000:0.981 0/0/1/1:4:45,33:0.47: 0.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,22:0.32: 0.13:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,22:0.45:-0.29:1.000:0.978 0/0/1/1:4:46,42:0.52: 0.82:1.000:0.995 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,25:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,29:0.46: 0.23:1.000:0.987 0/0/1/1:4:39,34:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,41:0.50: 0.95:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,23:0.36: 0.07:1.000:0.668 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.82:0.999:1.000 0/0/0/1:4:123,45:0.24: 3.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,26:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,37:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,27:0.51:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,44:0.54: 0.69:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,47:0.47: 1.57:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:43,30:0.45: 0.33:1.000:0.983 0/0/1/1:4:38,26:0.45: 0.04:1.000:0.976 0/0/1/1:4:27,28:0.53:-0.26:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,28:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,27:0.47: 0.04:1.000:0.993 0/0/0/0/0:5:56,0:0.00:-0.23:0.982:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,43:0.29: 2.49:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,29:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,28:0.42: 0.30:1.000:0.906 0/0/1/1:4:44,32:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.68:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:78,42:0.36: 1.87:1.000:0.738 0/0/1/1:4:62,41:0.43: 1.31:1.000:0.954 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,39:0.23: 2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,42:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,24:0.38: 0.10:1.000:0.536 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:88,35:0.25: 1.97:1.000:0.999 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,38:0.53: 0.46:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:42,32:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,40:0.47: 1.05:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:34,62:0.60: 1.08:0.999:0.759 0/0/1/1:4:49,43:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,25:0.33: 0.40:1.000:0.926 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,33:0.27: 1.54:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,37:0.53: 0.33:1.000:0.991 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,12:0.17: 0.00:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,39:0.25: 2.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,23:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,37:0.47: 0.82:1.000:0.992 -chr5.1 50692468 chr5.1_050692468 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:23,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.90:0.944:. ./.:4:13,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:6:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.17:1.000:. ./.:5:9,0:.:-0.31:0.982:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.29:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:34,0:.: 3.70:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.93:1.000:. -chr5.1 51075912 chr5.1_051075912 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:85,137:0.70: 0.43:1.000:0.982 0/1/1/1:4:60,154:0.79: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,145:0.76: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,156:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,116:0.47: 1.90:1.000:0.993 0/1/1/1:4:96,191:0.75: 1.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,90:0.77:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,158:0.78: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,142:0.77: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,33:0.58:-2.69:1.000:0.914 0/0/1/1:4:54,33:0.46:-2.27:1.000:0.986 0/1/1/1:4:73,157:0.76: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,191:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,142:0.72: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,151:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,174:0.78: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,103:0.49: 1.05:0.944:0.996 0/0/0/1:4:240,53:0.25: 1.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:187,145:0.52: 2.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:102,201:0.74: 2.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,41:0.70:-2.69:1.000:0.986 0/1/1/1:4:55,139:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,165:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,131:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,29:0.44:-2.39:1.000:0.959 0/1/1/1:4:65,174:0.79: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,172:0.79: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,154:0.73: 0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:78,166:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,168:0.78: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,172:0.74: 1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,142:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,24:0.54:-2.97:1.000:0.986 0/1/1/1:4:23,45:0.74:-2.65:1.000:0.999 1/1/1:3:0,59:1.00:-2.83:0.999:1.000 0/1/1/1:4:59,135:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,140:0.72: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,137:0.71: 0.37:1.000:0.989 0/1/1/1:4:60,129:0.76:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,118:0.55: 1.03:1.000:0.981 0/1/1/1:4:76,107:0.66:-0.35:1.000:0.895 0/1/1/1:4:93,117:0.64: 0.19:1.000:0.654 0/0/1/1:4:167,103:0.46: 1.40:1.000:0.988 0/0/1/1:4:116,65:0.44:-0.39:1.000:0.961 0/0/1/1:4:130,94:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,138:0.70: 0.45:1.000:0.984 0/0/1/1:4:148,106:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,83:0.73:-1.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,92:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,134:0.72: 0.17:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,236:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,122:0.68: 0.07:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,199:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,117:0.79:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,122:0.72:-0.17:1.000:0.994 1/1/1/1:4:1,166:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,89:0.42: 1.13:1.000:0.926 0/0/1/1:4:123,82:0.48: 0.09:1.000:0.995 1/1/1/1/1/1:6:10,127:0.94:-1.27:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,143:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,100:0.43: 1.66:1.000:0.948 0/1/1/1:4:61,136:0.77:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,180:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,124:0.72:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,90:0.75:-1.33:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,161:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,104:0.52: 0.73:0.996:0.995 0/0/1/1:4:133,98:0.50: 0.61:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,195:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,103:0.72:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,108:0.49: 1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,150:0.77: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,79:0.48:-0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,85:0.52:-0.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,113:0.74:-0.59:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,169:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,153:0.77: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,144:0.72: 0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,97:0.67:-0.73:1.000:0.926 0/1/1/1:4:76,165:0.76: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,207:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,124:0.71:-0.07:1.000:0.991 0/1/1/1:4:61,137:0.77:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,180:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,90:0.68:-1.03:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,163:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,97:0.71:-0.91:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,155:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,118:0.78:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,156:0.77: 0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,167:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,116:0.69:-0.21:1.000:0.974 0/0/1/1:4:154,99:0.47: 1.05:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,123:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,114:0.65: 0.01:1.000:0.765 0/1/1/1:4:80,137:0.71: 0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:80,185:0.77: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,89:0.72:-1.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,141:0.73: 0.33:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,93:0.68:-0.93:1.000:0.962 0/0/1/1:4:139,84:0.46: 0.45:1.000:0.984 0/1/1/1:4:55,91:0.70:-1.09:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,202:1.00: 0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,226:1.00: 0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,184:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,101:0.65:-0.45:1.000:0.767 0/0/1/1:4:191,125:0.47: 2.32:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,171:1.00:-0.59:0.999:1.000 0/0/1/1:4:120,117:0.57: 0.73:1.000:0.936 0/1/1/1:4:48,114:0.78:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,131:0.72: 0.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,113:0.76:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,132:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,129:0.73:-0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,66:0.42:-0.21:1.000:0.930 0/0/1/1:4:137,104:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,123:0.71:-0.09:1.000:0.990 0/1/1/1:4:60,119:0.74:-0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,234:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,127:0.68: 0.23:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,199:1.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,159:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,83:0.54:-0.39:1.000:0.988 0/1/1/1:4:40,81:0.75:-1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,66:0.45:-0.47:1.000:0.981 0/1/1/1:4:53,124:0.77:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,150:0.79: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:74,65:0.55:-1.23:0.996:0.871 0/0/1/1:4:152,82:0.43: 0.67:1.000:0.940 0/1/1/1:4:71,142:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,217:0.77: 2.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,159:0.74: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,121:0.71:-0.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:56,93:0.70:-1.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:134,60:0.38:-0.13:1.000:0.626 0/1/1/1:4:67,119:0.72:-0.29:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,97:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,99:0.75:-1.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,242:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,187:0.75: 1.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,143:0.73: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,144:0.75: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,175:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,119:0.78:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,165:0.74: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,169:0.79: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,26:0.56:-2.93:1.000:0.964 0/1/1/1:4:59,128:0.76:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,111:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,134:0.73: 0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,182:0.75: 1.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,192:0.79: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,131:0.80:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,167:0.73: 1.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,235:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,83:0.47: 0.27:1.000:0.991 0/1/1/1:4:47,124:0.79:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,131:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,149:0.73: 0.55:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,209:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,112:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,163:0.80: 0.45:0.999:1.000 0/1/1/1:4:64,147:0.77: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,161:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,109:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,128:0.79:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,126:0.73:-0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,112:0.72:-0.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:84,182:0.76: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,160:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,162:0.77: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,100:0.55: 0.23:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,200:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,204:0.79: 1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,194:0.75: 1.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,88:0.45: 0.77:1.000:0.976 -chr5.1 51301511 chr5.1_051301511 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:229,668:0.76: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:557,160:0.24:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:486,416:0.48: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:446,425:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:252,722:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:551,457:0.47: 0.85:1.000:0.993 0/0/1/1:4:365,323:0.49:-1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:432,404:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:422,391:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:326,194:0.39:-2.16:1.000:0.710 0/1/1/1:4:165,290:0.65:-2.56:1.000:0.811 0/0/0/1:4:642,221:0.27:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:919,2:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:469,451:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:418,369:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:469,409:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:263,721:0.74: 0.70:0.944:0.999 0/0/1/1:4:395,398:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:290,848:0.76: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:495,502:0.52: 0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:312,245:0.46:-1.93:1.000:0.987 0/0/1/1:4:442,372:0.48:-0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:800,241:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:224,635:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:121,263:0.70:-2.99:1.000:0.983 0/0/1/1:4:539,559:0.53: 1.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:458,417:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:395,371:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:565,527:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:727,214:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1091,0:0.00: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:408,364:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,174:0.70:-3.80:1.000:0.986 0/1/1/1:4:167,362:0.70:-2.10:1.000:0.983 0/1/1:3:133,148:0.55:-3.63:0.999:0.953 0/1/1/1:4:236,612:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:459,446:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:236,631:0.74:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:812,237:0.24: 1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:259,690:0.74: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:475,432:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:464,442:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:291,751:0.73: 1.06:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,880:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:296,737:0.73: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:485,447:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:239,690:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:268,214:0.46:-2.39:1.000:0.989 0/1/1/1:4:202,602:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:704,224:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:456,429:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:806,260:0.26: 1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:414,328:0.46:-0.79:1.000:0.988 0/0/0/1:4:716,230:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:400,362:0.49:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:587,529:0.49: 1.51:1.000:0.997 0/0/0/0:4:791,1:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:295,833:0.75: 1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:417,455:0.54: 0.01:1.000:0.987 0/0/0/0/1/1:6:549,297:0.37:-0.15:1.000:0.836 0/0/0/1:4:787,222:0.24: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:435,394:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:320,938:0.76: 2.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:543,517:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:772,225:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:219,675:0.77: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:457,363:0.46:-0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:656,223:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:278,719:0.73: 0.78:0.996:0.998 0/0/1/1:4:384,364:0.51:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1236,2:0.00: 2.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:491,390:0.46: 0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:700,531:0.45: 2.22:1.000:0.981 0/0/0/1:4:702,192:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:538,483:0.49: 0.93:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,817:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:397,370:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:755,217:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:234,629:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:740,247:0.27: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:617,171:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:541,558:0.53: 1.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:853,243:0.24: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:331,336:0.52:-1.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:572,510:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:757,225:0.25: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:348,313:0.49:-1.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:661,231:0.28: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:454,380:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:357,341:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:626,199:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:627,191:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:544,507:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:463,136:0.24:-1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:236,676:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:270,746:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:669,176:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:700,219:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:515,512:0.52: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:433,420:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:409,367:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:542,481:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/0:4:789,1:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:748,248:0.27: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:220,590:0.74:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:165,559:0.78:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:461,352:0.45:-0.35:1.000:0.982 0/0/0/1:4:655,224:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:559,477:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:412,364:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:679,194:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:282,825:0.76: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:698,213:0.25: 0.25:0.999:0.999 0/0/0/1:4:772,419:0.37: 1.97:1.000:0.561 0/0/1/1:4:382,360:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:886,252:0.24: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:488,408:0.47: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:517,411:0.46: 0.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:488,485:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:219,582:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:242,591:0.72:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:493,413:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:510,462:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:710,212:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:417,458:0.54: 0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:760,235:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:731,229:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:438,454:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:361,295:0.47:-1.32:1.000:0.992 0/1/1/1:4:204,523:0.73:-0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:423,402:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:622,180:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:169,556:0.78:-0.89:0.996:0.983 0/1/1/1:4:285,694:0.72: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:393,362:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:519,481:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:489,416:0.48: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:411,407:0.52:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:431,395:0.50:-0.27:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,815:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:514,457:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:714,206:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:372,379:0.52:-0.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:397,318:0.46:-0.96:1.000:0.990 0/0/0/1:4:812,236:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:565,547:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:465,353:0.45:-0.32:1.000:0.981 0/1/1/1:4:225,534:0.72:-0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:430,397:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:426,307:0.44:-0.85:1.000:0.964 0/0/1/1:4:479,442:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:661,222:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:233,168:0.44:-2.89:1.000:0.964 0/1/1/1:4:188,507:0.74:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:526,448:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:632,187:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:500,446:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:501,443:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:626,190:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:493,471:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:362,340:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:181,517:0.75:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:687,187:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:456,406:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:466,420:0.49: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:605,177:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:405,388:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:669,205:0.25: 0.02:0.999:0.999 0/0/0/1:4:627,198:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:623,200:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:543,166:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:318,275:0.48:-1.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:458,461:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:211,515:0.72:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:627,191:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:170,473:0.75:-1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:516,515:0.52: 0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:489,479:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:614,229:0.29:-0.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:244,479:0.68:-0.91:1.000:0.944 0/0/0/1:4:744,241:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:558,582:0.53: 1.66:1.000:0.992 0/0/1/1:4:493,507:0.53: 0.80:1.000:0.993 0/0/0/0:4:788,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:444,422:0.51:-0.03:1.000:0.996 -chr5.1 51344986 chr5.1_051344986 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:273,242:0.45: 0.03:1.000:0.980 0/0/0/0:4:458,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,252:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:396,117:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,288:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:430,148:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,247:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:361,125:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:331,112:0.24:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,217:0.48:-0.93:1.000:0.995 0/1/1/1:4:148,346:0.67:-0.22:1.000:0.920 0/0/0/0:4:454,1:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:461,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:419,119:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:346,112:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:246,255:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:303,308:0.48: 1.17:0.944:0.995 0/0/0/1:4:345,104:0.22:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:326,361:0.50: 2.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:464,154:0.24: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:324,124:0.27:-0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:376,145:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/0:4:529,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:287,247:0.44: 0.25:1.000:0.972 0/0/1/1:4:174,152:0.45:-2.21:1.000:0.976 0/0/0/1:4:450,140:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,119:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:265,276:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:437,144:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:570,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:639,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,129:0.27:-0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,191:0.57:-2.29:1.000:0.939 0/0/1/1:4:195,287:0.57:-0.36:1.000:0.947 0/1/1:3:36,97:0.70:-4.50:0.999:1.000 0/1/1/1:4:117,383:0.73:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:365,118:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:139,389:0.70: 0.18:1.000:0.988 0/0/0/0:4:609,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,306:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:269,314:0.52: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:424,152:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:290,348:0.52: 1.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:139,379:0.70: 0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:314,352:0.51: 1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:405,154:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:281,324:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:342,434:0.54: 3.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:244,292:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:577,195:0.24: 3.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,264:0.53:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:402,149:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:332,134:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:413,164:0.27: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:279,219:0.42:-0.17:1.000:0.920 0/0/0/1:4:439,154:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:455,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,331:0.49: 1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:389,147:0.26: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:303,136:0.30:-0.87:1.000:0.863 0/0/0/1:4:387,138:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:305,127:0.28:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:352,332:0.46: 2.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:445,165:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:396,158:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:117,409:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:283,273:0.47: 0.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:381,119:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,288:0.47: 0.85:0.996:0.993 0/0/0/0:4:403,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:622,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:346,131:0.26:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:336,377:0.51: 2.38:1.000:0.997 0/0/0/0:4:524,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:379,115:0.22:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,358:0.73:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:375,102:0.21:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:371,138:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:255,285:0.51: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/0:4:583,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,96:0.25:-1.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:395,130:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:447,162:0.26: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:207,212:0.48:-1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:305,366:0.52: 1.88:1.000:0.994 0/0/0/1:4:417,168:0.28: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:303,95:0.23:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,113:0.25:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:342,147:0.29:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:229,244:0.49:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/0:4:471,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:365,151:0.28: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:257,291:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:259,116:0.30:-1.63:1.000:0.987 0/0/1/1:4:290,274:0.47: 0.61:1.000:0.990 0/0/1/1:4:297,318:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:335,121:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:349,121:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:430,121:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,283:0.48: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:236,230:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:270,292:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/0:4:411,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:410,135:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,357:0.71:-0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:226,244:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,212:0.47:-0.97:1.000:0.993 0/0/0/1:4:378,148:0.27: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:299,337:0.51: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:226,235:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:397,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:323,358:0.50: 2.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:417,144:0.25: 0.57:0.999:0.999 0/0/1/1:4:369,246:0.38: 1.21:1.000:0.617 0/0/0/1:4:291,125:0.29:-1.14:1.000:0.992 0/0/0/0:4:529,2:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,267:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:247,270:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:254,241:0.47:-0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:235,235:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:245,251:0.48:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:329,115:0.25:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:417,160:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:378,126:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:359,126:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:393,148:0.26: 0.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:404,110:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:378,133:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:344,104:0.22:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,215:0.49:-1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,230:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:496,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:194,280:0.57:-0.46:0.996:0.930 0/0/1/1:4:243,299:0.53: 0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:337,106:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:494,180:0.26: 1.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:226,305:0.55: 0.22:1.000:0.980 0/0/0/1:4:362,121:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,103:0.23:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,354:0.77:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,298:0.53: 0.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:411,123:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:349,134:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:202,193:0.47:-1.39:1.000:0.991 0/0/0/1:4:459,155:0.24: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:428,152:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:225,255:0.51:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:110,370:0.74:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:407,135:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,231:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:287,352:0.53: 1.50:1.000:0.993 0/0/0/0:4:458,1:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,69:0.21:-2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,179:0.53:-2.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:412,128:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:524,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:426,140:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,315:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/0:4:386,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:394,147:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:235,208:0.45:-0.82:1.000:0.980 0/0/1/1:4:230,209:0.46:-0.87:1.000:0.985 0/0/0/0:4:471,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:372,134:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:240,254:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:339,116:0.25:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:389,132:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:375,101:0.20:-0.43:0.999:1.000 0/0/0/0:4:488,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:338,115:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,116:0.26:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,198:0.51:-1.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:369,140:0.26:-0.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:101,384:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:388,119:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,323:0.73:-1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:337,314:0.46: 1.64:1.000:0.989 0/0/0/1:4:413,147:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/0:4:453,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,228:0.48:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:410,144:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:281,324:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:416,179:0.29: 0.98:1.000:0.992 0/0/0/0:4:505,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:354,132:0.26:-0.31:1.000:0.999 -chr5.1 51657630 chr5.1_051657630 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,33:0.63:-1.18:1.000:0.513 0/0/1/1:4:29,30:0.49:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,21:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,55:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,24:0.44:-1.09:1.000:0.964 0/0/1/1:4:15,26:0.61:-1.63:1.000:0.657 0/0/1/1:4:21,27:0.54:-1.32:1.000:0.988 0/0/0/1:4:55,14:0.21:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,24:0.81:-2.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,10:0.39:-2.36:1.000:0.710 0/0/1/1:4:26,40:0.58:-0.50:1.000:0.895 0/1/1/1:4:20,68:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,38:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,14:0.26:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,32:0.50:-0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,32:0.47:-0.50:0.944:0.991 0/0/1/1:4:28,49:0.62: 0.00:1.000:0.629 0/0/1/1:4:45,48:0.49: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,52:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,9:0.24:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,13:0.24:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,99:0.81: 1.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,18:0.33:-1.05:1.000:0.906 0/0/1/1:4:12,14:0.52:-2.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,16:0.31:-1.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:37,35:0.47:-0.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:35,31:0.45:-0.50:1.000:0.982 0/0/1/1:4:65,50:0.42: 1.72:1.000:0.922 0/0/1/1:4:24,35:0.57:-0.82:1.000:0.944 0/1/1/1:4:15,33:0.67:-1.32:1.000:0.911 0/0/0/1:4:35,11:0.25:-1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,2:0.13:-2.77:1.000:0.920 0/0/0/1:4:37,16:0.31:-1.09:1.000:0.979 0/0/0:3:3,0:0.00:-3.36:0.999:1.000 0/0/1/1:4:36,35:0.47:-0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:31,35:0.51:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,15:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,31:0.39: 0.04:1.000:0.685 0/0/1/1:4:36,29:0.43:-0.55:1.000:0.952 0/1/1/1:4:19,70:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,22:0.29: 0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,46:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,16:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,68:0.59: 1.54:1.000:0.858 0/0/1/1:4:41,35:0.44:-0.05:1.000:0.974 0/0/1/1:4:41,45:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,8:0.55:-2.86:1.000:0.981 0/1/1/1:4:24,45:0.63:-0.36:1.000:0.583 0/1/1/1:4:14,35:0.70:-1.27:1.000:0.980 0/0/0/1:4:57,26:0.32: 0.27:1.000:0.963 0/0/1/1:4:47,38:0.43: 0.36:1.000:0.953 0/0/0/1:4:60,22:0.28: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,56:0.52: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,36:0.43: 0.18:1.000:0.948 0/0/0/1:4:44,20:0.32:-0.59:1.000:0.965 0/1/1/1:4:22,57:0.70: 0.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:37,45:0.53: 0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,55:0.68: 0.09:1.000:0.944 0/0/0/0/1/1:6:50,36:0.41: 0.41:1.000:0.580 0/0/1/1:4:49,69:0.56: 1.86:1.000:0.963 0/0/1/1:4:33,39:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,37:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,43:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,68:0.61: 1.36:1.000:0.640 0/0/0/1:4:57,20:0.27: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,56:0.71: 0.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,44:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,37:0.50:-0.27:0.996:0.997 0/0/1/1:4:22,30:0.55:-1.14:1.000:0.975 0/1/1/1:4:32,96:0.73: 2.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,14:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,77:0.80: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,60:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,45:0.55: 0.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:45,26:0.36:-0.27:1.000:0.664 0/0/0/1:4:49,12:0.21:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,47:0.43: 1.36:1.000:0.935 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,67:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,66:0.82: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,55:0.48: 1.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,56:0.48: 1.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,32:0.53:-0.86:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,35:0.82:-1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,42:0.43: 0.77:1.000:0.953 0/0/1/1:4:40,34:0.44:-0.14:1.000:0.973 0/0/1/1:4:55,54:0.48: 1.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,44:0.46: 0.72:1.000:0.985 0/0/0/1:4:44,26:0.37:-0.32:1.000:0.607 0/0/1/1:4:41,41:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,47:0.52: 0.41:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,102:0.78: 2.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,23:0.38:-0.77:1.000:0.531 0/0/0/1:4:85,20:0.20: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,41:0.45: 0.45:1.000:0.983 0/0/1/1:4:52,60:0.51: 1.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,34:0.46:-0.27:1.000:0.988 0/0/1/1:4:58,68:0.52: 2.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,38:0.42: 0.54:1.000:0.893 0/0/1/1:4:45,40:0.45: 0.36:1.000:0.983 0/0/1/1:4:35,58:0.60: 0.72:1.000:0.771 0/1/1/1:4:19,60:0.74: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,49:0.45: 1.31:1.000:0.976 0/0/1/1:4:40,48:0.52: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,34:0.43: 0.00:1.000:0.941 0/0/1/1:4:34,43:0.54: 0.00:1.000:0.990 0/0/1/1:4:23,36:0.59:-0.82:1.000:0.873 0/0/0/1:4:62,22:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,20:0.28:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,79:0.82: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,52:0.54: 0.68:1.000:0.986 0/0/1/1:4:43,60:0.56: 1.18:0.999:0.967 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,29:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,74:0.72: 1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,44:0.46: 0.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:35,31:0.45:-0.50:1.000:0.982 0/1/1/1:4:25,68:0.71: 0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,49:0.53: 0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,42:0.54:-0.14:1.000:0.984 0/0/0/1:4:74,21:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,52:0.54: 0.68:1.000:0.986 0/0/1/1:4:40,41:0.48: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,38:0.34: 1.59:1.000:0.878 0/0/1/1:4:34,49:0.57: 0.27:1.000:0.951 0/0/1/1:4:51,58:0.51: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,44:0.56:-0.09:1.000:0.959 0/0/1/1:4:33,46:0.56: 0.09:1.000:0.967 0/0/1/1:4:31,31:0.48:-0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,71:0.80: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,58:0.74: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:35,26:0.41:-0.73:0.996:0.963 0/0/1/1:4:27,24:0.45:-1.18:1.000:0.983 0/0/0/1:4:37,13:0.27:-1.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,42:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,51:0.73:-0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,55:0.57: 0.72:1.000:0.949 0/0/1/1:4:56,40:0.41: 0.86:1.000:0.840 0/0/0/1:4:86,16:0.16: 1.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,73:0.73: 0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,60:0.51: 1.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,46:0.70:-0.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:36,42:0.52: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,59:0.53: 1.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:80,25:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,77:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,41:0.53:-0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:53,23:0.31:-0.05:1.000:0.978 0/1/1/1:4:20,61:0.73: 0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,62:0.68: 0.54:1.000:0.945 0/0/1/1:4:30,43:0.57:-0.18:1.000:0.954 0/0/0/1:4:16,8:0.33:-2.41:1.000:0.906 0/0/0/1:4:57,20:0.27: 0.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,43:0.75:-0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,65:0.72: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,27:0.29: 0.86:1.000:0.993 0/1/1/1:4:22,58:0.71: 0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,38:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,19:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,21:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,31:0.45:-0.46:1.000:0.976 0/1/1/1:4:16,50:0.74:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,17:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,34:0.77:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,39:0.56:-0.46:1.000:0.968 0/0/0/1:4:46,19:0.30:-0.55:1.000:0.987 0/1/1/1:4:29,66:0.68: 0.81:0.999:0.939 0/1/1/1:4:20,51:0.70:-0.27:1.000:0.984 0/0/1/1:4:25,42:0.61:-0.46:1.000:0.739 0/1/1/1:4:25,46:0.63:-0.27:1.000:0.525 0/1/1/1:4:12,27:0.67:-1.73:1.000:0.931 0/0/0/1:4:44,19:0.31:-0.64:1.000:0.979 0/0/0/1:4:63,25:0.29: 0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,25:0.55:-1.50:1.000:0.984 0/0/1/1:4:29,29:0.48:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,32:0.45:-0.41:1.000:0.983 0/0/1/1:4:38,42:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,25:0.41:-0.77:1.000:0.840 0/0/1/1:4:29,28:0.47:-0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,44:0.56:-0.05:1.000:0.972 0/1/1/1:4:20,72:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,35:0.32: 1.49:1.000:0.953 0/1/1/1:4:13,50:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,49:0.51: 0.68:1.000:0.996 -chr5.1 51786294 chr5.1_051786294 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.58:1.000:. ./.:4:12,45:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.98:1.000:. ./.:4:34,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:7,5:.:-2.37:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.51:1.000:. ./.:4:13,22:.:-0.58:1.000:. ./.:4:3,11:.:-2.21:1.000:. ./.:4:10,2:.:-2.37:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:18,22:.:-0.19:1.000:. ./.:4:12,31:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.50:0.944:. ./.:4:31,43:.: 2.46:1.000:. ./.:4:30,20:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.84:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:11,36:.: 0.35:1.000:. ./.:4:2,4:.:-2.84:1.000:. ./.:4:11,25:.:-0.50:1.000:. ./.:4:14,36:.: 0.59:1.000:. ./.:4:35,17:.: 0.74:1.000:. ./.:4:19,23:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,13:.:-2.29:1.000:. ./.:3:0,3:.:-3.07:0.999:. ./.:4:37,31:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:32,23:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:14,38:.: 0.74:1.000:. ./.:4:30,19:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.59:1.000:. ./.:4:17,28:.: 0.20:1.000:. ./.:4:21,22:.: 0.04:1.000:. ./.:4:12,30:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,29:.: 1.91:1.000:. ./.:4:35,11:.: 0.28:1.000:. ./.:4:15,32:.: 0.35:1.000:. ./.:4:17,12:.:-1.05:1.000:. ./.:4:16,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,77:.: 2.69:1.000:. ./.:4:14,27:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,33:.: 0.20:1.000:. ./.:4:18,9:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:16,18:.:-0.66:1.000:. ./.:6:6,32:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.90:1.000:. ./.:4:10,32:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,25:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,61:.: 1.44:1.000:. ./.:4:29,14:.: 0.04:1.000:. ./.:4:26,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:10,19:.:-1.05:0.996:. ./.:4:0,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,21:.:-1.20:1.000:. ./.:4:39,30:.: 2.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,42:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,20:.: 0.67:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,40:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.81:1.000:. ./.:4:18,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:9,34:.: 0.04:1.000:. ./.:4:16,39:.: 0.98:1.000:. ./.:4:17,32:.: 0.51:1.000:. ./.:4:19,33:.: 0.74:1.000:. ./.:4:18,35:.: 0.82:1.000:. ./.:4:10,17:.:-1.20:1.000:. ./.:4:16,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,30:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,14:.:-1.20:1.000:. ./.:4:12,39:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.28:1.000:. ./.:4:14,21:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,27:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.28:1.000:. ./.:4:18,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:7,19:.:-1.28:1.000:. ./.:4:30,9:.:-0.27:1.000:. ./.:4:15,10:.:-1.36:1.000:. ./.:4:17,35:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.59:1.000:. ./.:4:30,11:.:-0.11:1.000:. ./.:4:17,30:.: 0.35:1.000:. ./.:4:11,25:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:26,37:.: 1.60:1.000:. ./.:4:14,35:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:21,27:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,16:.:-0.58:0.999:. ./.:4:31,16:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:32,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:20,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:18,31:.: 0.51:1.000:. ./.:4:19,28:.: 0.35:1.000:. ./.:4:28,26:.: 0.90:1.000:. ./.:4:20,21:.:-0.11:1.000:. ./.:4:18,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:13,34:.: 0.35:1.000:. ./.:4:14,40:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:10,18:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,21:.:-1.05:1.000:. ./.:4:16,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:16,28:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.19:1.000:. ./.:5:11,16:.:-1.20:0.996:. ./.:4:17,36:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,43:.: 1.68:1.000:. ./.:4:21,29:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.73:1.000:. ./.:4:17,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:25,11:.:-0.50:1.000:. ./.:4:17,37:.: 0.90:1.000:. ./.:4:11,23:.:-0.66:1.000:. ./.:4:16,15:.:-0.89:1.000:. ./.:4:19,13:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,35:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,64:.: 1.68:1.000:. ./.:4:15,25:.:-0.19:1.000:. ./.:4:38,24:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:26,12:.:-0.35:1.000:. ./.:4:11,43:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.91:1.000:. ./.:4:12,33:.: 0.20:1.000:. ./.:4:12,30:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,38:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,58:.: 1.21:1.000:. ./.:4:30,14:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,37:.: 0.90:1.000:. ./.:4:15,37:.: 0.74:1.000:. ./.:4:17,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:18,27:.: 0.20:1.000:. ./.:4:36,28:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,29:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,33:.:-0.11:0.999:. ./.:4:0,33:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.97:1.000:. ./.:4:9,36:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,10:.: 0.20:1.000:. ./.:4:14,43:.: 1.13:1.000:. ./.:4:26,19:.: 0.20:1.000:. ./.:4:11,23:.:-0.66:1.000:. ./.:4:28,23:.: 0.67:1.000:. ./.:4:35,26:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.98:1.000:. ./.:4:28,34:.: 1.52:1.000:. ./.:4:16,42:.: 1.21:1.000:. ./.:4:22,26:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,58:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.73:1.000:. ./.:4:19,44:.: 1.60:1.000:. -chr5.1 51860266 chr5.1_051860266 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:525,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:658,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:569,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:614,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:647,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:895,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:735,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:488,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:235,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:696,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:625,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:734,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:625,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:624,0:.: 0.31:0.944:. ./.:4:683,51:.: 1.04:1.000:. ./.:4:714,2:.: 0.92:1.000:. ./.:4:967,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:271,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:511,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:745,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:654,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:677,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:803,2:.: 1.52:1.000:. ./.:4:740,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:538,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:126,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:232,0:.:-2.31:1.000:. ./.:3:123,0:.:-3.04:0.999:. ./.:4:635,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:678,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:540,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:636,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:675,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:632,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:602,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:727,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:744,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:663,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:629,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:245,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:454,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:745,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:575,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:396,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:541,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:531,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:500,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.69:1.000:. ./.:6:515,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:663,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:569,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:716,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:587,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:697,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:624,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:531,0:.:-0.31:0.996:. ./.:4:701,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:698,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:375,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:671,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:701,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:628,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:411,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:606,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:646,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:525,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:629,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:642,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:524,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:662,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:642,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:529,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:490,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:762,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:424,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:711,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:637,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:546,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:522,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:649,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:503,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:390,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:625,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:625,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:605,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:698,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:746,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:619,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:898,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:568,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:726,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:406,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:763,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:385,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:687,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:644,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:669,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:543,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:487,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:648,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:552,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:514,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:713,0:.: 0.90:1.000:. ./.:5:397,0:.:-1.21:0.996:. ./.:4:511,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:884,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:640,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:650,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:409,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:684,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:554,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:748,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:745,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:765,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:609,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:682,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:927,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:540,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:157,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:637,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:733,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:811,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:762,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:527,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:509,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:676,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:530,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:534,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:684,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:754,0:.: 1.18:0.999:. ./.:4:686,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:705,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:507,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:422,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:548,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:716,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:941,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:565,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:709,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:872,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:801,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:594,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:657,0:.: 0.53:1.000:. -chr5.1 52150963 chr5.1_052150963 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.10:0.944:. ./.:4:19,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:20,3:.: 1.06:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.42:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.56:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:6,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:16,3:.: 0.48:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:34,1:.: 2.81:1.000:. ./.:6:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:11,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:20,4:.: 1.21:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.69:0.996:. ./.:4:14,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:25,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,3:.: 1.06:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:21,2:.: 1.06:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,2:.: 1.06:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.: 3.25:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:23,2:.: 1.35:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.35:0.999:. ./.:4:21,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:17,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,3:.: 0.77:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.48:1.000:. ./.:5:12,1:.:-0.40:0.996:. ./.:4:10,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,2:.: 0.63:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:21,3:.: 1.21:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.42:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:27,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:17,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.40:1.000:. -chr5.1 52214016 chr5.1_052214016 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,126:.: 1.52:1.000:. ./.:4:133,46:.:-0.62:1.000:. ./.:4:241,89:.: 1.37:1.000:. ./.:4:203,129:.: 1.40:1.000:. ./.:4:169,119:.: 0.82:1.000:. ./.:4:160,68:.: 0.03:1.000:. ./.:4:117,37:.:-0.95:1.000:. ./.:4:130,46:.:-0.66:1.000:. ./.:4:177,83:.: 0.45:1.000:. ./.:4:60,25:.:-1.86:1.000:. ./.:4:29,18:.:-2.36:1.000:. ./.:4:149,74:.:-0.04:1.000:. ./.:4:152,43:.:-0.41:1.000:. ./.:4:138,49:.:-0.51:1.000:. ./.:4:147,75:.:-0.05:1.000:. ./.:4:231,116:.: 1.60:1.000:. ./.:4:175,87:.: 0.48:0.944:. ./.:4:150,60:.:-0.21:1.000:. ./.:4:184,118:.: 1.00:1.000:. ./.:4:190,115:.: 1.04:1.000:. ./.:4:26,34:.:-2.19:1.000:. ./.:4:135,114:.: 0.30:1.000:. ./.:4:106,68:.:-0.69:1.000:. ./.:4:151,78:.: 0.04:1.000:. ./.:4:20,8:.:-2.61:1.000:. ./.:4:164,72:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,96:.: 0.33:1.000:. ./.:4:208,98:.: 1.06:1.000:. ./.:4:112,67:.:-0.62:1.000:. ./.:4:153,61:.:-0.16:1.000:. ./.:4:206,68:.: 0.64:1.000:. ./.:4:150,86:.: 0.13:1.000:. ./.:4:16,4:.:-2.72:1.000:. ./.:4:28,37:.:-2.13:1.000:. ./.:3:25,5:.:-2.59:0.999:. ./.:4:167,88:.: 0.38:1.000:. ./.:4:125,101:.: 0.00:1.000:. ./.:4:238,89:.: 1.34:1.000:. ./.:4:149,67:.:-0.13:1.000:. ./.:4:213,108:.: 1.26:1.000:. ./.:4:216,81:.: 0.94:1.000:. ./.:4:164,98:.: 0.48:1.000:. ./.:4:188,111:.: 0.97:1.000:. ./.:4:149,83:.: 0.08:1.000:. ./.:4:175,113:.: 0.82:1.000:. ./.:4:131,55:.:-0.53:1.000:. ./.:4:181,163:.: 1.56:1.000:. ./.:4:30,23:.:-2.28:1.000:. ./.:4:173,80:.: 0.36:1.000:. ./.:4:180,19:.:-0.36:1.000:. ./.:4:158,46:.:-0.29:1.000:. ./.:4:271,87:.: 1.74:1.000:. ./.:4:112,71:.:-0.57:1.000:. ./.:4:172,96:.: 0.56:1.000:. ./.:4:191,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:192,51:.: 0.23:1.000:. ./.:4:150,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:147,72:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,44:.:-1.58:1.000:. ./.:6:137,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:163,80:.: 0.23:1.000:. ./.:4:136,66:.:-0.32:1.000:. ./.:4:214,101:.: 1.18:1.000:. ./.:4:90,67:.:-0.91:1.000:. ./.:4:186,79:.: 0.52:1.000:. ./.:4:227,87:.: 1.16:1.000:. ./.:4:127,46:.:-0.70:1.000:. ./.:4:164,83:.: 0.28:1.000:. ./.:4:166,80:.: 0.27:0.996:. ./.:4:69,47:.:-1.45:1.000:. ./.:4:147,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:86,38:.:-1.35:1.000:. ./.:4:288,74:.: 1.80:1.000:. ./.:4:84,43:.:-1.31:1.000:. ./.:4:161,66:.: 0.01:1.000:. ./.:4:196,79:.: 0.65:1.000:. ./.:4:136,64:.:-0.34:1.000:. ./.:4:187,52:.: 0.17:1.000:. ./.:4:171,85:.: 0.40:1.000:. ./.:4:136,53:.:-0.49:1.000:. ./.:4:155,49:.:-0.29:1.000:. ./.:4:91,69:.:-0.87:1.000:. ./.:4:162,72:.: 0.11:1.000:. ./.:4:217,102:.: 1.23:1.000:. ./.:4:158,48:.:-0.26:1.000:. ./.:4:153,86:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,68:.:-1.31:1.000:. ./.:4:121,50:.:-0.73:1.000:. ./.:4:77,55:.:-1.24:1.000:. ./.:4:195,76:.: 0.60:1.000:. ./.:4:102,66:.:-0.77:1.000:. ./.:4:144,44:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,82:.: 0.60:1.000:. ./.:4:164,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:145,86:.: 0.07:1.000:. ./.:4:190,51:.: 0.20:1.000:. ./.:4:153,37:.:-0.47:1.000:. ./.:4:162,63:.:-0.01:1.000:. ./.:4:87,48:.:-1.20:1.000:. ./.:4:218,90:.: 1.08:1.000:. ./.:4:134,42:.:-0.66:1.000:. ./.:4:234,102:.: 1.45:1.000:. ./.:4:81,38:.:-1.41:1.000:. ./.:4:156,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:128,60:.:-0.50:1.000:. ./.:4:151,90:.: 0.20:1.000:. ./.:4:169,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:254,62:.: 1.19:1.000:. ./.:4:251,113:.: 1.82:1.000:. ./.:4:175,65:.: 0.19:1.000:. ./.:4:71,49:.:-1.40:1.000:. ./.:4:257,109:.: 1.85:1.000:. ./.:4:140,68:.:-0.24:0.999:. ./.:4:204,73:.: 0.67:1.000:. ./.:4:92,14:.:-1.58:1.000:. ./.:4:93,63:.:-0.92:1.000:. ./.:4:160,69:.: 0.04:1.000:. ./.:4:155,73:.: 0.03:1.000:. ./.:4:177,81:.: 0.42:1.000:. ./.:4:138,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:160,82:.: 0.21:1.000:. ./.:4:118,65:.:-0.57:1.000:. ./.:4:109,60:.:-0.75:1.000:. ./.:4:152,62:.:-0.16:1.000:. ./.:4:101,75:.:-0.66:1.000:. ./.:4:178,39:.:-0.12:1.000:. ./.:4:179,51:.: 0.05:1.000:. ./.:4:121,47:.:-0.77:1.000:. ./.:4:57,50:.:-1.57:1.000:. ./.:4:104,61:.:-0.80:1.000:. ./.:4:152,45:.:-0.38:1.000:. ./.:4:95,62:.:-0.91:1.000:. ./.:5:135,61:.:-0.40:0.996:. ./.:4:124,52:.:-0.66:1.000:. ./.:4:159,92:.: 0.33:1.000:. ./.:4:139,119:.: 0.42:1.000:. ./.:4:187,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:78,63:.:-1.12:1.000:. ./.:4:73,39:.:-1.50:1.000:. ./.:4:128,87:.:-0.14:1.000:. ./.:4:159,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:146,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:130,82:.:-0.18:1.000:. ./.:4:126,76:.:-0.32:1.000:. ./.:4:218,123:.: 1.52:1.000:. ./.:4:242,157:.: 2.29:1.000:. ./.:4:204,55:.: 0.44:1.000:. ./.:4:203,89:.: 0.87:1.000:. ./.:4:216,117:.: 1.41:1.000:. ./.:4:137,47:.:-0.55:1.000:. ./.:4:246,134:.: 2.04:1.000:. ./.:4:136,106:.: 0.21:1.000:. ./.:4:39,15:.:-2.27:1.000:. ./.:4:83,75:.:-0.90:1.000:. ./.:4:256,46:.: 1.00:1.000:. ./.:4:99,53:.:-0.98:1.000:. ./.:4:200,172:.: 1.93:1.000:. ./.:4:198,60:.: 0.42:1.000:. ./.:4:115,74:.:-0.49:1.000:. ./.:4:132,122:.: 0.37:1.000:. ./.:4:183,96:.: 0.70:1.000:. ./.:4:169,83:.: 0.34:1.000:. ./.:4:99,65:.:-0.82:1.000:. ./.:4:127,99:.: 0.00:1.000:. ./.:4:209,62:.: 0.60:1.000:. ./.:4:197,50:.: 0.28:1.000:. ./.:4:124,107:.: 0.07:1.000:. ./.:4:210,62:.: 0.61:0.999:. ./.:4:81,64:.:-1.07:1.000:. ./.:4:182,77:.: 0.44:1.000:. ./.:4:148,72:.:-0.08:1.000:. ./.:4:156,71:.: 0.01:1.000:. ./.:4:152,92:.: 0.24:1.000:. ./.:4:238,121:.: 1.76:1.000:. ./.:4:135,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:184,82:.: 0.53:1.000:. ./.:4:271,147:.: 2.54:1.000:. ./.:4:160,80:.: 0.19:1.000:. ./.:4:124,72:.:-0.40:1.000:. ./.:4:128,105:.: 0.09:1.000:. ./.:4:206,140:.: 1.59:1.000:. ./.:4:296,82:.: 2.01:1.000:. ./.:4:221,140:.: 1.78:1.000:. ./.:4:146,58:.:-0.29:1.000:. ./.:4:196,85:.: 0.73:1.000:. -chr5.1 52448736 chr5.1_052448736 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:189,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.30:0.944:. ./.:4:134,52:.: 1.19:1.000:. ./.:4:229,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.57:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.65:0.999:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:108,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:0.996:. ./.:4:127,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.70:0.999:. ./.:4:169,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.07:1.000:. ./.:5:123,0:.:-0.47:0.996:. ./.:4:149,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:217,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:128,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.98:1.000:. -chr5.1 52485063 chr5.1_052485063 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:440,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:232,112:.:-0.34:1.000:. ./.:4:485,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:405,79:.: 1.31:1.000:. ./.:4:200,47:.:-1.49:1.000:. ./.:4:314,64:.: 0.06:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:156,36:.:-2.14:1.000:. ./.:4:174,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:275,117:.: 0.22:1.000:. ./.:4:317,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:341,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:316,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:495,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.11:0.944:. ./.:4:245,59:.:-0.82:1.000:. ./.:4:554,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:460,75:.: 1.92:1.000:. ./.:4:183,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:342,60:.: 0.34:1.000:. ./.:4:263,45:.:-0.77:1.000:. ./.:4:120,1:.:-2.98:1.000:. ./.:4:472,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:334,70:.: 0.37:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:333,63:.: 0.27:1.000:. ./.:4:360,70:.: 0.67:1.000:. ./.:4:396,77:.: 1.18:1.000:. ./.:4:409,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:106,21:.:-2.91:1.000:. ./.:4:147,57:.:-2.00:1.000:. ./.:3:91,19:.:-3.11:0.999:. ./.:4:349,67:.: 0.51:1.000:. ./.:4:391,77:.: 1.12:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:319,56:.: 0.02:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:370,67:.: 0.76:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:262,45:.:-0.78:1.000:. ./.:4:386,65:.: 0.92:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:368,76:.: 0.84:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:314,76:.: 0.20:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:356,70:.: 0.63:1.000:. ./.:6:239,41:.:-1.10:1.000:. ./.:4:301,70:.:-0.02:1.000:. ./.:4:277,72:.:-0.28:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:258,64:.:-0.60:1.000:. ./.:4:433,76:.: 1.61:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:269,56:.:-0.57:1.000:. ./.:4:386,58:.: 0.84:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.11:0.996:. ./.:4:184,114:.:-0.89:1.000:. ./.:4:330,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:306,56:.:-0.13:1.000:. ./.:4:300,62:.:-0.13:1.000:. ./.:4:269,67:.:-0.44:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:348,52:.: 0.32:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:349,71:.: 0.56:1.000:. ./.:4:185,112:.:-0.90:1.000:. ./.:4:316,55:.:-0.02:1.000:. ./.:4:372,65:.: 0.76:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:331,60:.: 0.21:1.000:. ./.:4:318,82:.: 0.32:1.000:. ./.:4:257,39:.:-0.91:1.000:. ./.:4:230,56:.:-1.03:1.000:. ./.:4:220,60:.:-1.10:1.000:. ./.:4:341,77:.: 0.53:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:213,56:.:-1.23:1.000:. ./.:4:346,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:240,42:.:-1.08:1.000:. ./.:4:305,92:.: 0.28:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:252,76:.:-0.53:1.000:. ./.:4:287,44:.:-0.50:1.000:. ./.:4:399,57:.: 0.98:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:269,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:419,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:225,42:.:-1.25:1.000:. ./.:4:342,65:.: 0.40:1.000:. ./.:4:234,56:.:-0.98:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:406,60:.: 1.10:1.000:. ./.:4:483,78:.: 2.22:1.000:. ./.:4:387,63:.: 0.91:1.000:. ./.:4:223,64:.:-1.02:1.000:. ./.:4:570,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:330,72:.: 0.34:0.999:. ./.:4:415,78:.: 1.42:1.000:. ./.:4:240,56:.:-0.91:1.000:. ./.:4:429,53:.: 1.29:1.000:. ./.:4:274,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:322,61:.: 0.12:1.000:. ./.:4:265,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:445,72:.: 1.70:1.000:. ./.:4:339,77:.: 0.51:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:359,62:.: 0.57:1.000:. ./.:4:356,52:.: 0.41:1.000:. ./.:4:270,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:268,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:314,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:266,64:.:-0.51:1.000:. ./.:4:352,59:.: 0.45:1.000:. ./.:5:310,0:.:-0.75:0.996:. ./.:4:349,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:428,73:.: 1.51:1.000:. ./.:4:391,83:.: 1.19:1.000:. ./.:4:252,55:.:-0.78:1.000:. ./.:4:246,55:.:-0.85:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:269,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:267,61:.:-0.53:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:243,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:395,79:.: 1.19:1.000:. ./.:4:485,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:260,60:.:-0.63:1.000:. ./.:4:282,67:.:-0.28:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:280,75:.:-0.21:1.000:. ./.:4:419,66:.: 1.32:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:130,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:252,57:.:-0.76:1.000:. ./.:4:396,60:.: 0.98:1.000:. ./.:4:350,63:.: 0.47:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:297,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:309,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:345,64:.: 0.43:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:333,70:.: 0.35:1.000:. ./.:4:294,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:320,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:269,114:.: 0.12:0.999:. ./.:4:320,57:.: 0.05:1.000:. ./.:4:333,57:.: 0.20:1.000:. ./.:4:299,59:.:-0.18:1.000:. ./.:4:235,54:.:-0.99:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:273,50:.:-0.59:1.000:. ./.:4:322,70:.: 0.22:1.000:. ./.:4:502,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:381,64:.: 0.85:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:360,12:.:-0.01:1.000:. ./.:4:414,69:.: 1.30:1.000:. ./.:4:431,77:.: 1.60:1.000:. ./.:4:481,2:.: 1.30:1.000:. ./.:4:275,55:.:-0.51:1.000:. ./.:4:321,67:.: 0.18:1.000:. -chr5.1 52871908 chr5.1_052871908 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:65,104:0.67: 1.09:1.000:0.911 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,57:0.59:-0.06:1.000:0.845 0/0/0/1:4:124,47:0.35: 1.13:1.000:0.769 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,139:0.68: 2.03:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,45:0.52:-0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,52:0.54:-0.07:1.000:0.987 0/1/1/1:4:10,16:0.67:-1.39:1.000:0.911 0/1/1/1:4:20,28:0.63:-1.01:1.000:0.550 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,54:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,125:0.75: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,41:0.45:-0.11:1.000:0.981 0/1/1/1:4:77,128:0.68: 1.72:1.000:0.950 0/1/1/1:4:58,115:0.73: 1.16:0.944:0.997 0/0/1/1:4:70,63:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,186:0.79: 2.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,190:0.65: 3.63:1.000:0.818 0/0/1/1:4:22,18:0.48:-1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:109,39:0.34: 0.73:1.000:0.840 0/0/1/1:4:104,125:0.58: 2.13:1.000:0.897 0/0/1/1:4:54,42:0.47:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:17,9:0.40:-1.39:1.000:0.829 0/0/1/1:4:74,56:0.47: 0.41:1.000:0.991 0/0/0/1:4:139,58:0.37: 1.58:1.000:0.605 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,65:0.60: 0.19:1.000:0.826 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,32:0.44:-0.44:1.000:0.968 0/0/1/1:4:93,85:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,8:0.57:-1.58:1.000:0.950 0/1/1/1:4:10,19:0.72:-1.34:1.000:0.994 1/1/1:3:0,11:1.00:-1.65:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,87:0.47: 1.68:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,43:0.39: 0.47:1.000:0.668 0/0/1/1:4:109,89:0.48: 1.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,78:0.81:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,41:0.41: 0.19:1.000:0.850 0/0/1/1:4:100,119:0.58: 1.96:1.000:0.910 0/1/1/1:4:41,67:0.67: 0.03:1.000:0.935 0/0/1/1:4:73,51:0.45: 0.31:1.000:0.982 0/1/1/1:4:50,71:0.63: 0.26:1.000:0.605 0/0/0/1:4:147,55:0.35: 1.66:1.000:0.787 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,110:0.66: 1.28:1.000:0.884 0/1/1/1:4:18,80:0.85:-0.14:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,48:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,28:0.40:-0.44:1.000:0.826 0/1/1/1:4:58,110:0.72: 1.07:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,84:0.67: 0.52:1.000:0.922 0/0/1/1:4:41,38:0.51:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,31:0.34: 0.20:1.000:0.845 0/0/1/1:4:60,74:0.59: 0.48:1.000:0.854 0/0/0/1/1/1:6:34,36:0.55:-0.63:1.000:0.767 0/1/1/1:4:33,67:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,76:0.52: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,84:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,26:0.37:-0.32:1.000:0.595 0/1/1/1:4:42,111:0.78: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,72:0.69: 0.14:1.000:0.969 0/0/1/1:4:39,33:0.49:-0.59:0.996:0.996 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,39:0.54:-0.51:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,73:0.79:-0.11:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:130,66:0.40: 1.56:1.000:0.771 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,70:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,71:0.66: 0.17:1.000:0.891 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:48,81:0.68: 0.40:1.000:0.960 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:73,107:0.64: 1.28:1.000:0.716 0/1/1/1:4:43,80:0.71: 0.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:40,80:0.73: 0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:27,41:0.65:-0.66:1.000:0.815 0/0/1/1:4:44,40:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,95:0.62: 1.04:1.000:0.624 0/1/1/1:4:28,56:0.73:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,25:0.34:-0.14:1.000:0.881 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,37:0.45:-0.28:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,39:0.53:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:52,27:0.40:-0.47:1.000:0.804 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.34:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:37,80:0.75: 0.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,73:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,18:0.44:-1.05:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,120:0.69: 1.46:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,27:0.35:-0.09:1.000:0.819 0/0/1/1:4:60,79:0.61: 0.57:1.000:0.680 0/1/1/1:4:29,59:0.73:-0.32:0.999:0.998 0/0/1/1:4:42,38:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,40:0.66:-0.70:1.000:0.845 0/0/0/1:4:75,29:0.36:-0.04:1.000:0.740 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,69:0.72:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,69:0.53: 0.55:1.000:0.993 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,35:0.53:-0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:46,41:0.50:-0.33:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,34:0.40:-0.11:1.000:0.793 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,48:0.54:-0.19:1.000:0.990 0/1/1/1:4:32,77:0.77: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,49:0.36: 1.16:1.000:0.704 0/1/1/1/1:5:18,38:0.74:-0.87:0.996:0.902 0/0/1/1:4:38,39:0.54:-0.51:1.000:0.989 0/0/1/1:4:85,75:0.49: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,63:0.38: 1.59:1.000:0.623 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,37:0.42:-0.07:1.000:0.901 0/0/1/1:4:28,30:0.55:-0.84:1.000:0.980 0/0/1/1:4:42,33:0.47:-0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,31:0.50:-0.72:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,81:0.48: 1.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,40:0.58:-0.56:1.000:0.924 0/0/1/1:4:76,58:0.47: 0.48:1.000:0.992 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,60:0.47: 0.53:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,73:0.58: 0.48:1.000:0.903 0/1/1/1:4:95,145:0.65: 2.32:1.000:0.827 0/0/1/1:4:15,15:0.53:-1.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,36:0.42:-0.16:1.000:0.925 0/0/1/1:4:74,50:0.45: 0.31:1.000:0.976 0/0/1/1:4:103,88:0.49: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,65:0.43: 1.09:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,57:0.41: 0.99:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,40:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,98:0.49: 1.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,110:0.51: 2.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,81:0.49: 1.21:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:97,111:0.57: 1.77:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,139:0.80: 1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,53:0.43: 0.60:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,76:0.71: 0.19:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,1:0.03:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,105:0.47: 2.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:94,39:0.37: 0.47:1.000:0.616 0/0/1/1:4:64,50:0.47: 0.14:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,64:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,85:0.72: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 -chr5.1 53005732 chr5.1_053005732 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:18,70:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,56:.:-1.18:1.000:. ./.:4:12,123:.: 0.21:1.000:. ./.:4:36,115:.: 0.49:1.000:. ./.:4:29,94:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.23:1.000:. ./.:4:24,132:.: 0.57:1.000:. ./.:4:22,78:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1,55:.:-1.18:1.000:. ./.:4:18,136:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.03:1.000:. ./.:4:28,173:.: 1.36:1.000:. ./.:4:16,77:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.60:1.000:. ./.:4:31,139:.: 0.82:0.944:. ./.:4:25,142:.: 0.77:1.000:. ./.:4:20,40:.:-1.11:1.000:. ./.:4:23,32:.:-1.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:37,90:.: 0.07:1.000:. ./.:4:35,84:.:-0.07:1.000:. ./.:4:21,119:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,59:.:-0.99:1.000:. ./.:4:30,174:.: 1.41:1.000:. ./.:4:17,52:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.00:1.000:. ./.:4:22,57:.:-0.78:1.000:. ./.:4:21,49:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.72:1.000:. ./.:4:14,94:.:-0.27:1.000:. ./.:4:12,33:.:-1.37:1.000:. ./.:4:24,43:.:-0.99:1.000:. ./.:3:0,8:.:-2.02:0.999:. ./.:4:0,59:.:-1.13:1.000:. ./.:4:14,38:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.76:1.000:. ./.:4:42,129:.: 0.84:1.000:. ./.:4:28,142:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,256:.: 2.32:1.000:. ./.:4:37,150:.: 1.12:1.000:. ./.:4:48,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,129:.: 0.70:1.000:. ./.:4:46,41:.:-0.64:1.000:. ./.:4:47,119:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,76:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,56:.:-1.18:1.000:. ./.:4:29,120:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,191:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.94:1.000:. ./.:4:29,173:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.64:1.000:. ./.:4:46,109:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,119:.: 0.43:1.000:. ./.:4:28,100:.: 0.08:1.000:. ./.:6:10,123:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.20:1.000:. ./.:4:28,186:.: 1.59:1.000:. ./.:4:23,202:.: 1.78:1.000:. ./.:4:31,169:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,60:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.73:1.000:. ./.:4:31,226:.: 2.34:0.996:. ./.:4:50,73:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.23:1.000:. ./.:4:24,162:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,31:.:-1.16:1.000:. ./.:4:34,184:.: 1.66:1.000:. ./.:4:27,174:.: 1.36:1.000:. ./.:4:35,224:.: 2.38:1.000:. ./.:4:0,210:.: 1.52:1.000:. ./.:4:37,226:.: 2.45:1.000:. ./.:4:36,159:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.29:1.000:. ./.:4:30,227:.: 2.34:1.000:. ./.:4:0,250:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.40:1.000:. ./.:4:16,20:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.72:1.000:. ./.:4:30,74:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.06:1.000:. ./.:4:23,120:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.35:1.000:. ./.:4:31,172:.: 1.40:1.000:. ./.:4:28,248:.: 2.67:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.02:1.000:. ./.:4:34,87:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,98:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,192:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.06:1.000:. ./.:4:37,83:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,183:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,153:.: 1.13:1.000:. ./.:4:20,89:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.19:0.999:. ./.:4:0,37:.:-1.51:1.000:. ./.:4:33,56:.:-0.60:1.000:. ./.:4:28,105:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,58:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.86:1.000:. ./.:4:32,109:.: 0.31:1.000:. ./.:4:42,92:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,142:.: 0.78:1.000:. ./.:4:31,177:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.04:1.000:. ./.:4:29,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,213:.: 1.57:1.000:. ./.:4:26,173:.: 1.33:1.000:. ./.:4:11,47:.:-1.14:1.000:. ./.:4:25,84:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.35:1.000:. ./.:4:19,109:.: 0.08:1.000:. ./.:5:22,84:.:-0.30:0.996:. ./.:4:28,37:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,50:.:-0.76:1.000:. ./.:4:40,188:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.84:1.000:. ./.:4:25,138:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,150:.: 0.84:1.000:. ./.:4:22,134:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,124:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,209:.: 1.50:1.000:. ./.:4:22,167:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.72:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.53:1.000:. ./.:4:31,89:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.79:1.000:. ./.:4:17,68:.:-0.67:1.000:. ./.:4:15,24:.:-1.48:1.000:. ./.:4:11,49:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.53:1.000:. ./.:4:17,162:.: 0.98:1.000:. ./.:4:27,117:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,60:.:-1.11:1.000:. ./.:4:12,98:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,36:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:22,83:.:-0.32:1.000:. ./.:4:28,81:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.16:1.000:. ./.:4:13,117:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.93:0.999:. ./.:4:24,80:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,71:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,120:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,154:.: 0.98:1.000:. ./.:4:22,78:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,105:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1,114:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,137:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.23:1.000:. ./.:4:31,87:.:-0.09:1.000:. -chr5.1 53272458 chr5.1_053272458 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,189:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.65:1.000:. ./.:4:125,88:.: 0.80:1.000:. ./.:4:36,114:.:-0.63:1.000:. ./.:4:52,158:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,231:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,133:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.42:1.000:. ./.:4:40,28:.:-2.49:1.000:. ./.:4:21,37:.:-2.72:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.29:1.000:. ./.:4:49,162:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,123:.: 1.73:1.000:. ./.:4:62,132:.: 0.37:0.944:. ./.:4:0,194:.: 0.37:1.000:. ./.:4:58,183:.: 1.44:1.000:. ./.:4:67,154:.: 0.98:1.000:. ./.:4:11,48:.:-2.70:1.000:. ./.:4:41,109:.:-0.63:1.000:. ./.:4:51,132:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.56:1.000:. ./.:4:27,26:.:-2.83:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.96:1.000:. ./.:4:62,129:.: 0.30:1.000:. ./.:4:83,102:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.21:1.000:. ./.:4:64,192:.: 1.78:1.000:. ./.:4:52,114:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,36:.:-3.22:1.000:. ./.:4:0,72:.:-2.40:1.000:. ./.:3:0,29:.:-3.38:0.999:. ./.:4:46,188:.: 1.28:1.000:. ./.:4:68,122:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,155:.: 0.67:1.000:. ./.:4:49,165:.: 0.83:1.000:. ./.:4:121,93:.: 0.83:1.000:. ./.:4:84,119:.: 0.58:1.000:. ./.:4:61,115:.:-0.04:1.000:. ./.:4:98,87:.: 0.17:1.000:. ./.:4:39,109:.:-0.67:1.000:. ./.:4:89,81:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.27:1.000:. ./.:4:88,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:18,82:.:-1.76:1.000:. ./.:4:83,61:.:-0.77:1.000:. ./.:4:75,97:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,182:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.90:1.000:. ./.:4:49,154:.: 0.58:1.000:. ./.:4:37,153:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.10:1.000:. ./.:4:48,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:119,97:.: 0.87:1.000:. ./.:4:42,136:.: 0.01:1.000:. ./.:6:49,122:.:-0.15:1.000:. ./.:4:44,149:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,95:.:-0.79:1.000:. ./.:4:98,98:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,133:.: 0.21:1.000:. ./.:4:50,159:.: 0.71:1.000:. ./.:4:55,175:.: 1.19:1.000:. ./.:4:50,126:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,163:.: 0.55:1.000:. ./.:4:48,150:.: 0.46:0.996:. ./.:4:0,131:.:-1.06:1.000:. ./.:4:53,165:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.17:1.000:. ./.:4:103,122:.: 1.08:1.000:. ./.:4:45,140:.: 0.17:1.000:. ./.:4:35,116:.:-0.61:1.000:. ./.:4:41,119:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,135:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,105:.:-0.36:1.000:. ./.:4:62,177:.: 1.39:1.000:. ./.:4:87,88:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,120:.: 1.33:1.000:. ./.:4:49,186:.: 1.30:1.000:. ./.:4:38,73:.:-1.52:1.000:. ./.:4:45,120:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,90:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.08:1.000:. ./.:4:46,105:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.42:1.000:. ./.:4:117,120:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,182:.: 0.10:1.000:. ./.:4:63,150:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.99:1.000:. ./.:4:37,175:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.39:1.000:. ./.:4:47,63:.:-1.54:1.000:. ./.:4:110,83:.: 0.35:1.000:. ./.:4:19,100:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.24:1.000:. ./.:4:38,117:.:-0.52:1.000:. ./.:4:87,61:.:-0.67:1.000:. ./.:4:45,133:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,222:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,234:.: 1.28:1.000:. ./.:4:39,86:.:-1.20:1.000:. ./.:4:82,163:.: 1.53:1.000:. ./.:4:43,134:.:-0.02:0.999:. ./.:4:118,103:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,108:.:-1.58:1.000:. ./.:4:55,117:.:-0.13:1.000:. ./.:4:33,132:.:-0.29:1.000:. ./.:4:31,146:.:-0.02:1.000:. ./.:4:92,88:.: 0.05:1.000:. ./.:4:71,46:.:-1.38:1.000:. ./.:4:34,111:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.76:1.000:. ./.:4:40,120:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,225:.: 1.08:1.000:. ./.:4:41,107:.:-0.67:1.000:. ./.:4:23,79:.:-1.72:1.000:. ./.:4:49,73:.:-1.27:1.000:. ./.:4:48,168:.: 0.87:1.000:. ./.:4:48,113:.:-0.38:1.000:. ./.:5:38,110:.:-0.67:0.996:. ./.:4:50,97:.:-0.70:1.000:. ./.:4:44,105:.:-0.65:1.000:. ./.:4:76,151:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,227:.: 1.12:1.000:. ./.:4:32,108:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,108:.:-0.56:1.000:. ./.:4:82,108:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:59,74:.:-1.02:1.000:. ./.:4:53,179:.: 1.23:1.000:. ./.:4:41,142:.: 0.12:1.000:. ./.:4:53,182:.: 1.30:1.000:. ./.:4:33,158:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.80:1.000:. ./.:4:34,133:.:-0.24:1.000:. ./.:4:137,163:.: 2.78:1.000:. ./.:4:44,142:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,71:.:-2.42:1.000:. ./.:4:0,116:.:-1.40:1.000:. ./.:4:89,116:.: 0.62:1.000:. ./.:4:53,147:.: 0.51:1.000:. ./.:4:62,124:.: 0.19:1.000:. ./.:4:55,144:.: 0.48:1.000:. ./.:4:34,112:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,136:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,122:.: 0.03:1.000:. ./.:4:47,104:.:-0.61:1.000:. ./.:4:42,128:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,102:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.80:1.000:. ./.:4:45,124:.:-0.20:1.000:. ./.:4:62,180:.: 1.46:0.999:. ./.:4:48,113:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.35:1.000:. ./.:4:38,120:.:-0.45:1.000:. ./.:4:43,145:.: 0.23:1.000:. ./.:4:54,91:.:-0.74:1.000:. ./.:4:38,169:.: 0.67:1.000:. ./.:4:59,142:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,128:.: 0.01:1.000:. ./.:4:131,149:.: 2.33:1.000:. ./.:4:43,148:.: 0.30:1.000:. ./.:4:57,122:.: 0.03:1.000:. ./.:4:83,95:.: 0.01:1.000:. ./.:4:37,165:.: 0.55:1.000:. ./.:4:79,213:.: 2.60:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.69:1.000:. ./.:4:48,113:.:-0.38:1.000:. ./.:4:56,110:.:-0.27:1.000:. -chr5.1 53435133 chr5.1_053435133 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:32,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:38,17:.: 0.86:1.000:. ./.:4:22,10:.:-1.12:1.000:. ./.:4:21,4:.:-1.72:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.43:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:27,3:.:-1.29:1.000:. ./.:4:27,25:.: 0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.69:1.000:. ./.:4:36,7:.:-0.17:1.000:. ./.:4:25,6:.:-1.20:1.000:. ./.:4:44,10:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,15:.: 0.00:0.944:. ./.:4:34,27:.: 1.38:1.000:. ./.:4:20,20:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,2:.: 0.95:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:38,7:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:41,11:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:40,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,8:.:-0.60:1.000:. ./.:4:50,12:.: 1.46:1.000:. ./.:4:33,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.63:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:60,3:.: 1.55:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.43:1.000:. ./.:3:39,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:27,5:.:-1.12:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:18,10:.:-1.46:1.000:. ./.:4:21,8:.:-1.37:1.000:. ./.:4:27,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:34,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:42,9:.: 0.52:1.000:. ./.:4:37,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:28,12:.:-0.43:1.000:. ./.:4:46,14:.: 1.29:1.000:. ./.:4:40,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:46,28:.: 2.50:1.000:. ./.:4:45,7:.: 0.60:1.000:. ./.:4:35,33:.: 1.98:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:64,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:31,10:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:19,16:.:-0.86:1.000:. ./.:4:38,13:.: 0.52:1.000:. ./.:4:37,6:.:-0.17:1.000:. ./.:4:46,12:.: 1.12:1.000:. ./.:4:43,12:.: 0.86:1.000:. ./.:6:55,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:65,18:.: 3.27:1.000:. ./.:4:72,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:50,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,12:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,21:.:-0.60:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:23,17:.:-0.43:0.996:. ./.:4:59,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:46,13:.: 1.21:1.000:. ./.:4:46,10:.: 0.95:1.000:. ./.:4:37,36:.: 2.41:1.000:. ./.:4:34,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:44,9:.: 0.69:1.000:. ./.:4:45,18:.: 1.55:1.000:. ./.:4:35,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:29,10:.:-0.51:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:31,10:.:-0.34:1.000:. ./.:4:20,9:.:-1.37:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:50,10:.: 1.29:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:35,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:22,7:.:-1.37:1.000:. ./.:4:36,11:.: 0.17:1.000:. ./.:4:41,22:.: 1.55:1.000:. ./.:4:24,3:.:-1.55:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:30,25:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,9:.: 0.43:1.000:. ./.:4:31,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,13:.: 1.03:1.000:. ./.:4:32,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:29,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:48,12:.: 1.29:1.000:. ./.:4:31,8:.:-0.51:1.000:. ./.:4:39,14:.: 0.69:1.000:. ./.:4:31,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:36,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:22,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:69,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:22,31:.: 0.69:1.000:. ./.:4:21,5:.:-1.63:1.000:. ./.:4:45,10:.: 0.86:1.000:. ./.:4:28,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,22:.: 0.69:1.000:. ./.:4:38,14:.: 0.60:1.000:. ./.:4:39,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:26,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:35,9:.:-0.08:1.000:. ./.:4:32,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:52,10:.: 1.46:1.000:. ./.:4:34,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:24,7:.:-1.20:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:20,10:.:-1.29:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.69:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.17:1.000:. ./.:5:20,11:.:-1.20:0.996:. ./.:4:14,12:.:-1.63:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:26,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:30,11:.:-0.34:1.000:. ./.:4:44,12:.: 0.95:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:22,25:.: 0.17:1.000:. ./.:4:25,4:.:-1.37:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,8:.:-0.60:1.000:. ./.:4:54,9:.: 1.55:1.000:. ./.:4:38,12:.: 0.43:1.000:. ./.:4:16,21:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,12:.: 0.60:1.000:. ./.:4:26,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:27,21:.: 0.26:1.000:. ./.:4:30,9:.:-0.51:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,24:.:-0.60:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.12:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:22,15:.:-0.69:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:38,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:32,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,10:.: 0.09:0.999:. ./.:4:30,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:27,2:.:-1.37:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:25,7:.:-1.12:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.72:1.000:. ./.:4:25,13:.:-0.60:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:19,4:.:-1.89:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:30,15:.: 0.00:1.000:. ./.:4:41,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:29,8:.:-0.69:1.000:. ./.:4:38,16:.: 0.78:1.000:. -chr5.1 53688677 chr5.1_053688677 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:150,166:0.49: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,188:0.70:-0.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:175,128:0.43: 0.19:1.000:0.950 0/0/1/1:4:180,117:0.41: 0.10:1.000:0.885 0/0/1/1:4:147,179:0.52: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,203:0.57: 0.69:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,200:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,191:0.60: 0.19:1.000:0.824 0/1/1/1:4:70,265:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,40:0.46:-3.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:70,85:0.51:-2.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,201:0.72:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,202:0.71:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:136,208:0.57: 0.81:1.000:0.946 0/1/1/1:4:57,230:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,108:0.37: 0.66:1.000:0.561 0/0/1/1:4:139,153:0.49: 0.02:0.944:0.997 0/0/1/1:4:128,182:0.55: 0.29:1.000:0.977 0/0/1/1:4:181,214:0.51: 1.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,165:0.44: 1.34:1.000:0.966 0/0/1/1:4:42,28:0.42:-3.33:1.000:0.903 0/0/1/1:4:186,109:0.40: 0.07:1.000:0.779 0/0/1/1:4:147,146:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,175:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,9:0.25:-3.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,298:0.73: 1.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:218,150:0.42: 1.17:1.000:0.922 0/0/1/1:4:138,185:0.54: 0.49:1.000:0.988 0/1/1/1:4:83,238:0.71: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:168,183:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,237:0.71: 0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:206,91:0.36: 0.10:1.000:0.692 0/0/1/1:4:31,20:0.41:-3.62:1.000:0.879 0/0/1/1:4:48,56:0.50:-2.82:1.000:0.997 1/1/1:3:4,39:0.89:-3.74:0.999:0.996 0/0/1/1:4:112,190:0.59: 0.17:1.000:0.833 0/0/1/1:4:226,112:0.38: 0.72:1.000:0.505 0/0/1/1:4:135,158:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,175:0.46: 1.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:315,45:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,77:0.34:-0.21:1.000:0.855 0/0/1/1:4:180,117:0.41: 0.10:1.000:0.885 0/0/0/1:4:315,39:0.23: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,123:0.40: 0.63:1.000:0.785 0/0/0/1:4:309,59:0.27: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:141,177:0.52: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:235,144:0.41: 1.34:1.000:0.832 0/1/1/1:4:92,388:0.78: 2.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,55:0.26: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:192,257:0.54: 2.39:1.000:0.988 0/1/1/1:4:63,231:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,255:0.59: 1.82:1.000:0.886 0/1/1/1:4:50,196:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,288:0.77: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,209:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,207:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,197:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:370,37:0.22: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,174:0.52: 0.32:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:105,138:0.53:-0.72:1.000:0.824 0/0/1/1:4:102,155:0.57:-0.51:1.000:0.949 0/0/1/1:4:178,129:0.43: 0.25:1.000:0.946 0/0/0/1:4:316,39:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,174:0.47: 1.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:153,190:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,183:0.52: 0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,177:0.71:-0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:100,159:0.58:-0.48:1.000:0.916 0/0/1/1:4:157,160:0.48: 0.40:0.996:0.995 0/0/1/1:4:117,138:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:77,233:0.72: 0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,181:0.72:-0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:187,184:0.48: 1.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,167:0.57:-0.24:1.000:0.938 0/0/1/1:4:127,120:0.47:-0.66:1.000:0.992 0/0/1/1:4:194,101:0.38: 0.07:1.000:0.594 0/1/1/1:4:67,212:0.72:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,200:0.74:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,195:0.57: 0.52:1.000:0.956 0/0/1/1:4:134,167:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:37,183:0.80:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,214:0.60: 0.70:1.000:0.786 0/1/1/1:4:65,227:0.74: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,125:0.44:-0.04:1.000:0.965 0/0/0/1:4:237,80:0.33: 0.40:1.000:0.935 0/1/1/1:4:58,218:0.75:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,130:0.53:-0.93:1.000:0.991 0/1/1/1:4:56,231:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,165:0.53: 0.02:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,214:0.80:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,151:0.54:-0.45:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,246:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:227,119:0.38: 0.84:1.000:0.606 0/1/1/1:4:47,190:0.77:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,165:0.55:-0.10:1.000:0.983 0/0/0/1:4:221,91:0.35: 0.32:1.000:0.787 0/1/1/1:4:42,213:0.81:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,186:0.71:-0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,235:0.78:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,206:0.61: 0.47:1.000:0.742 0/0/1/1:4:110,142:0.53:-0.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:225,116:0.38: 0.76:1.000:0.577 0/1/1/1:4:50,179:0.75:-0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,223:0.79:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,144:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:253,30:0.23:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,171:0.57:-0.13:1.000:0.941 0/1/1/1:4:69,244:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,283:0.78: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,237:0.79:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,145:0.49:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:279,111:0.35: 1.50:1.000:0.824 0/1/1/1:4:52,218:0.78:-0.31:0.999:1.000 0/0/1/1:4:176,168:0.47: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:114,121:0.49:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,194:0.57: 0.47:1.000:0.951 0/1/1/1:4:66,193:0.71:-0.48:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,190:0.74:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:231,114:0.37: 0.82:1.000:0.503 0/0/0/1:4:236,38:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:166,117:0.43:-0.11:1.000:0.935 0/1/1/1:4:67,203:0.72:-0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,208:0.75:-0.37:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,283:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,138:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,231:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,217:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,116:0.46:-0.66:1.000:0.988 0/0/1/1:4:110,132:0.51:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,116:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,144:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,167:0.51: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:142,119:0.45:-0.45:0.996:0.872 0/0/1/1:4:232,127:0.39: 1.03:1.000:0.680 0/0/1/1:4:154,101:0.42:-0.54:1.000:0.892 0/0/1/1:4:192,220:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,236:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,114:0.41: 0.05:1.000:0.864 0/1/1/1:4:45,176:0.76:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,100:0.41:-0.48:1.000:0.857 0/0/1/1:4:190,120:0.41: 0.29:1.000:0.861 1/1/1/1:4:0,254:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,88:0.37:-0.25:1.000:0.579 0/0/1/1:4:84,121:0.56:-1.29:1.000:0.973 0/1/1/1:4:83,282:0.74: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:148,240:0.58: 1.47:1.000:0.895 0/0/1/1:4:112,140:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,174:0.53: 0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:149,228:0.57: 1.31:1.000:0.945 0/1/1/1:4:64,191:0.71:-0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:208,130:0.41: 0.72:1.000:0.851 0/0/1/1:4:141,155:0.49: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,36:0.44:-3.12:1.000:0.958 0/0/1/1:4:91,116:0.53:-1.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:144,156:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,167:0.56:-0.17:1.000:0.959 0/0/1/1:4:210,127:0.40: 0.70:1.000:0.817 0/1/1/1:4:80,237:0.71: 0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,131:0.56:-1.08:1.000:0.960 0/0/1/1:4:148,176:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,218:0.74:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,106:0.42:-0.40:1.000:0.907 0/0/1/1:4:102,155:0.57:-0.51:1.000:0.949 0/0/1/1:4:105,160:0.57:-0.39:1.000:0.948 0/0/1/1:4:128,159:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,249:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,149:0.52:-0.34:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,212:0.76:-0.34:0.999:1.000 0/0/1/1:4:145,186:0.53: 0.61:1.000:0.993 0/1/1/1:4:72,207:0.71:-0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,233:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,102:0.49:-1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,183:0.52: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,157:0.57:-0.45:1.000:0.953 0/1/1/1:4:74,198:0.69:-0.28:1.000:0.977 0/0/1/1:4:113,124:0.49:-0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,268:0.74: 0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:182,113:0.41: 0.07:1.000:0.845 0/0/1/1:4:153,189:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,104:0.40:-0.11:1.000:0.768 0/1/1/1:4:72,291:0.77: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,200:0.49: 1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,190:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,183:0.76:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,143:0.47: 0.11:1.000:0.991 -chr5.1 53849545 chr5.1_053849545 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,517:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,331:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,465:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,473:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,586:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,416:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,314:.:-1.92:1.000:. ./.:4:0,481:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,398:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,435:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,565:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,412:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,453:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,528:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,461:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,399:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,520:.: 0.16:0.944:. ./.:4:92,347:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,543:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,464:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,438:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,552:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,425:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,317:.:-1.89:1.000:. ./.:4:0,549:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,381:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,405:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,579:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,383:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,457:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,310:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,208:.:-2.99:1.000:. ./.:4:0,453:.:-0.52:1.000:. ./.:3:0,141:.:-3.67:0.999:. ./.:4:0,391:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,437:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,492:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,577:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,518:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,563:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,561:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,692:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,558:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,723:.: 2.20:1.000:. ./.:4:0,620:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,560:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,491:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,571:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,692:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,536:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,667:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,487:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,619:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,450:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,656:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,510:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,610:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,536:.: 0.32:1.000:. ./.:6:0,466:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,576:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,482:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,740:.: 2.38:1.000:. ./.:4:0,566:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,574:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,587:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,520:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,502:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,593:.: 0.89:0.996:. ./.:4:0,413:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,672:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,557:.: 0.53:1.000:. ./.:4:1,704:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,455:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,617:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,537:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,554:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,620:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,617:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,630:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,417:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,653:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,668:.: 1.65:1.000:. ./.:4:1,412:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,594:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,669:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,427:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,510:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,582:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,491:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,465:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,521:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,644:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,370:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,657:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,627:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,519:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,499:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,654:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,499:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,514:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,639:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,419:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,610:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,503:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,461:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,509:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,434:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,622:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,490:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,530:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,499:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,653:.: 1.50:0.999:. ./.:4:0,600:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,438:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,637:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,579:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,564:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,526:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,496:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,584:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,553:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,645:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,396:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,556:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,577:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,520:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,514:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,410:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,450:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,555:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,370:.:-1.36:1.000:. ./.:5:0,455:.:-0.50:0.996:. ./.:4:0,457:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,460:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,619:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,563:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,537:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,446:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,560:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,606:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,551:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,438:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,491:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,598:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,659:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,470:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,459:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,565:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,430:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,464:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,357:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,426:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,291:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,552:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,485:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,551:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,496:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,387:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,494:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,396:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,380:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,397:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,447:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,439:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,434:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,398:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,413:.:-0.92:0.999:. ./.:4:0,453:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,324:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,347:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,328:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,483:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,437:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,517:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,382:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,481:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,543:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,461:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,355:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,535:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,548:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,494:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,377:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,502:.:-0.03:1.000:. -chr5.1 54011414 chr5.1_054011414 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:81,106:0.53: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,80:0.55:-0.29:1.000:0.981 0/0/0/1:4:119,33:0.21: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,41:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,50:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,88:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,62:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,71:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,32:0.21:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,14:0.60:-3.01:1.000:0.759 0/0/1/1:4:17,15:0.44:-2.77:1.000:0.963 0/0/1/1:4:81,79:0.46: 0.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:105,39:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,90:0.44: 0.94:1.000:0.974 0/0/0/1:4:114,38:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,50:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,39:0.23: 0.37:0.944:1.000 0/1/1/1:4:30,84:0.71:-0.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:159,65:0.28: 1.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,112:0.51: 1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,12:0.32:-2.68:1.000:0.964 0/0/0/1:4:121,35:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,56:0.26: 1.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,114:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,8:0.54:-3.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:141,48:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,93:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,32:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,88:0.46: 0.72:1.000:0.985 0/0/1/1:4:71,84:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,52:0.33: 0.01:1.000:0.931 0/0/0/1:4:103,40:0.27:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:10,5:0.32:-3.17:1.000:0.964 0/0/1/1:4:20,25:0.52:-2.46:1.000:0.995 0/1/1:3:3,10:0.74:-3.22:0.999:1.000 0/1/1/1:4:42,102:0.68:-0.13:1.000:0.951 0/0/1/1:4:69,82:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,60:0.29: 1.15:1.000:0.993 0/0/0/0:4:137,1:0.01:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,57:0.29: 0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,93:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,37:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,45:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,46:0.35:-0.65:1.000:0.745 0/0/0/1:4:121,50:0.28: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,83:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,59:0.30: 0.94:1.000:0.988 0/0/0/1:4:32,9:0.21:-2.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,34:0.28:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,82:0.79:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,102:0.45: 1.46:1.000:0.981 0/0/0/1:4:80,44:0.33:-0.60:1.000:0.899 0/0/1/1:4:86,99:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,40:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,29:0.20:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,45:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,31:0.24:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,42:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:51,66:0.53:-0.76:1.000:0.846 0/0/1/1:4:73,71:0.46:-0.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:81,71:0.44: 0.06:1.000:0.961 0/0/0/1:4:104,48:0.30: 0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:54,72:0.54:-0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:68,109:0.58: 0.65:1.000:0.906 0/0/1/1:4:72,76:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:60,81:0.54:-0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:61,75:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,38:0.28:-0.46:0.996:0.996 0/0/1/1:4:73,75:0.47:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:139,52:0.26: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,42:0.31:-0.46:1.000:0.979 0/0/0/1:4:100,37:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,39:0.20: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,22:0.17:-0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,55:0.48:-1.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,25:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,56:0.40:-0.41:1.000:0.769 0/0/1/1:4:97,105:0.48: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,85:0.42: 0.89:1.000:0.932 0/0/1/1:4:40,60:0.57:-1.17:1.000:0.957 0/0/1/1:4:84,84:0.47: 0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,92:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,40:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,53:0.47:-1.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:83,93:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,57:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,71:0.51:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,73:0.54:-0.55:1.000:0.985 0/1/1/1:4:36,112:0.73:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,84:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,82:0.44: 0.61:1.000:0.963 0/0/1/1:4:47,53:0.49:-1.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,149:0.77: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,37:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,69:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,34:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,78:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,51:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,28:0.23:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,36:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,35:0.28:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,69:0.44:-0.10:1.000:0.973 0/1/1/1:4:31,82:0.70:-0.86:1.000:0.982 0/0/0/1:4:106,31:0.22:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,27:0.23:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,105:0.54: 0.79:1.000:0.989 0/1/1/1:4:73,166:0.66: 2.12:1.000:0.895 0/1/1/1:4:35,126:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,48:0.30: 0.06:1.000:0.986 0/0/0/1:4:162,54:0.24: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,92:0.50: 0.49:0.999:0.997 0/0/0/1:4:163,44:0.20: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,64:0.59:-1.09:1.000:0.877 0/0/0/1:4:116,41:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,26:0.23:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,32:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,70:0.41: 0.25:1.000:0.861 0/0/0/1:4:83,33:0.27:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:108,39:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,31:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,88:0.46: 0.70:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,92:0.52: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,27:0.19:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,87:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,105:0.53: 0.82:1.000:0.990 0/0/0/1:4:76,23:0.22:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,69:0.60:-0.95:1.000:0.791 0/0/0/1:4:86,22:0.20:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,70:0.46:-0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:133,55:0.28: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:81,64:0.41:-0.10:0.996:0.964 0/0/0/1:4:78,21:0.20:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,32:0.22:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,111:0.45: 1.88:1.000:0.982 0/0/1/1:4:72,84:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,63:0.53:-0.91:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,51:0.48:-1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,81:0.53:-0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,82:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,89:0.58:-0.13:1.000:0.895 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,27:0.29:-1.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:123,108:0.44: 1.93:1.000:0.961 0/0/0/1:4:182,62:0.24: 2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,100:0.56: 0.42:1.000:0.960 0/1/1/1:4:34,118:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,50:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,65:0.38: 0.30:1.000:0.526 0/0/1/1:4:109,113:0.47: 1.72:1.000:0.994 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.25:-2.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,94:0.66:-0.32:1.000:0.874 0/0/0/1:4:133,37:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,65:0.31: 1.20:1.000:0.977 0/0/0/1:4:128,54:0.28: 0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,95:0.48: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,51:0.23: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,135:0.73: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,41:0.32:-0.62:1.000:0.964 0/0/0/1:4:94,37:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:115,49:0.28: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,84:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,104:0.49: 1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,48:0.29: 0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,103:0.50: 1.03:0.999:0.997 0/0/0/1:4:109,46:0.28: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,84:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:72,74:0.47:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,87:0.71:-0.74:1.000:0.991 0/0/0/1:4:110,49:0.29: 0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:89,93:0.48: 0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,87:0.61:-0.32:1.000:0.724 0/1/1/1:4:42,115:0.70: 0.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:107,87:0.42: 1.05:1.000:0.912 0/0/1/1:4:103,100:0.46: 1.27:1.000:0.987 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,44:0.29:-0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:82,101:0.52: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,120:0.48: 1.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:174,59:0.24: 1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,35:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,37:0.22: 0.25:1.000:1.000 -chr5.1 54260157 chr5.1_054260157 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:291,102:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:176,164:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,178:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:268,99:0.28: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:351,123:0.27: 1.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:262,232:0.48: 1.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:236,69:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,169:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:395,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,71:0.76:-3.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,30:0.19:-2.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,199:0.47: 0.81:1.000:0.992 0/0/0/1:4:272,79:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,220:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/0:4:338,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,186:0.45: 0.73:1.000:0.976 0/0/0/1:4:345,120:0.26: 1.19:0.944:0.998 0/0/0/1:4:284,92:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:450,164:0.27: 2.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:249,227:0.48: 1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,28:0.19:-2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:276,85:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:374,113:0.24: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,206:0.48: 0.82:1.000:0.996 0/0/0/0:4:89,8:0.08:-2.98:1.000:0.975 0/0/0/0:4:361,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,186:0.48: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:284,68:0.20:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:421,126:0.24: 2.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:261,238:0.48: 1.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:316,113:0.27: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:241,63:0.21:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,20:0.70:-3.77:1.000:0.985 0/0/1/1:4:67,88:0.57:-2.33:1.000:0.952 0/1/1:3:16,48:0.73:-3.36:0.999:1.000 0/1/1/1:4:111,243:0.67:-0.07:1.000:0.938 0/0/1/1:4:213,193:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:219,206:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:424,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,241:0.50: 1.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:106,244:0.68:-0.11:1.000:0.963 0/0/0/1:4:233,80:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:227,184:0.46: 0.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:166,124:0.44:-0.79:1.000:0.959 0/0/1/1:4:203,202:0.51: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,189:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:358,111:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,39:0.28:-2.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:146,121:0.46:-1.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:216,74:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,149:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,184:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:334,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:306,77:0.21: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:257,93:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:225,91:0.29:-0.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:261,86:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,148:0.47:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:253,91:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:215,109:0.34:-0.41:1.000:0.911 0/0/1/1:4:193,184:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,144:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:212,168:0.45: 0.23:1.000:0.980 0/0/0/1:4:248,74:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,196:0.53: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:168,174:0.52:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,142:0.53:-0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:191,174:0.48: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,167:0.51:-0.35:0.996:0.996 0/0/1/1:4:156,159:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:350,113:0.25: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:253,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,216:0.70:-0.65:1.000:0.983 0/0/0/1:4:308,91:0.23: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,131:0.43:-0.54:1.000:0.940 0/0/1/1:4:171,137:0.45:-0.59:1.000:0.982 0/0/0/0:4:292,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,171:0.49:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:249,77:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,208:0.53: 0.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:75,174:0.69:-1.26:1.000:0.966 0/0/0/1:4:253,85:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:303,106:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,153:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,264:0.72:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:334,76:0.19: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,77:0.29:-1.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:209,73:0.27:-0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:266,89:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,161:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/0:4:326,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,79:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,269:0.74:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,138:0.49:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,237:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,193:0.54: 0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:142,135:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,187:0.55:-0.18:1.000:0.983 0/0/0/1:4:327,99:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,99:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,73:0.28:-1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,169:0.48:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,79:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,185:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,250:0.73:-0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,159:0.48:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,141:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:216,237:0.53: 1.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:246,222:0.48: 1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:194,151:0.45:-0.17:1.000:0.975 0/0/0/1:4:234,79:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:271,224:0.46: 1.53:1.000:0.988 0/0/0/1:4:312,82:0.21: 0.39:0.999:1.000 0/0/1/1:4:180,281:0.61: 1.15:1.000:0.739 0/0/1/1:4:160,134:0.46:-0.75:1.000:0.990 0/0/0/1:4:346,108:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,82:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,67:0.29:-1.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:87,271:0.74:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,159:0.54:-0.71:1.000:0.988 0/0/1/1:4:190,172:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/0:4:295,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,80:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,82:0.21: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:339,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,171:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,168:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,151:0.54:-0.87:1.000:0.989 0/0/0/1:4:207,53:0.21:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,72:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,192:0.70:-1.02:1.000:0.982 0/0/0/1:4:308,99:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:180,131:0.43:-0.55:0.996:0.943 0/0/1/1:4:191,173:0.48: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:259,84:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:439,127:0.23: 2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,186:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,190:0.53:-0.01:1.000:0.991 0/0/0/1:4:236,92:0.29:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:194,178:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,263:0.70: 0.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:278,81:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,112:0.29: 0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:220,73:0.26:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:375,130:0.26: 1.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:306,116:0.28: 0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:97,300:0.74: 0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:93,246:0.71:-0.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:358,115:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,172:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:120,403:0.75: 1.85:1.000:0.999 0/0/0/0:4:391,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,47:0.41:-2.76:1.000:0.860 0/0/1/1:4:154,161:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:210,216:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:296,95:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:388,130:0.26: 1.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:281,241:0.47: 1.84:1.000:0.992 0/0/0/0:4:357,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:437,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,185:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,159:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:304,92:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:376,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,189:0.49: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,189:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/0:4:395,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,270:0.71: 0.13:0.999:0.993 0/0/0/1:4:287,92:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,189:0.48: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:261,64:0.20:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,229:0.70:-0.46:1.000:0.987 0/0/0/0:4:357,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,168:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:255,79:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,222:0.70:-0.54:1.000:0.982 0/0/0/1:4:423,120:0.23: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:255,207:0.46: 1.16:1.000:0.985 0/0/0/0:4:392,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,117:0.33: 0.01:1.000:0.915 0/0/0/1:4:331,110:0.26: 0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:114,352:0.74: 1.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:382,135:0.27: 1.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:252,81:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,173:0.47: 0.16:1.000:0.992 -chr5.1 54419722 chr5.1_054419722 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.93:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:45,1:.: 2.07:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:44,1:.: 1.97:0.944:. ./.:4:27,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:50,1:.: 2.54:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.53:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.78:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.10:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.63:1.000:. ./.:3:5,1:.:-1.72:0.999:. ./.:4:22,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,4:.:-1.35:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,3:.: 1.31:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:45,2:.: 2.16:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:9,4:.:-1.06:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:23,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,3:.: 0.64:1.000:. ./.:4:25,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.40:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:13,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,4:.:-0.87:0.996:. ./.:4:16,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,3:.:-1.06:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:22,4:.: 0.17:1.000:. ./.:4:11,6:.:-0.68:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:34,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:24,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,2:.: 1.31:1.000:. ./.:4:44,1:.: 1.97:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,4:.:-1.35:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:27,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.11:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:32,4:.: 1.12:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:25,2:.: 0.27:0.999:. ./.:4:42,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:26,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:34,3:.: 1.21:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:27,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.74:1.000:. ./.:5:19,1:.:-0.40:0.996:. ./.:4:23,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:24,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,1:.: 2.44:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:50,1:.: 2.54:1.000:. ./.:4:14,4:.:-0.59:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:33,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.93:0.999:. ./.:4:25,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:48,1:.: 2.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.93:1.000:. -chr5.1 54780310 chr5.1_054780310 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:234,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:140,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:150,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:0.944:. ./.:4:130,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:50,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:39,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.65:1.000:. ./.:3:32,0:.:-3.43:0.999:. ./.:4:156,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:179,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.77:1.000:. ./.:6:169,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:132,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.75:0.996:. ./.:4:169,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:270,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:248,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:194,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:271,0:.: 2.24:0.999:. ./.:4:260,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:237,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.11:1.000:. ./.:5:171,0:.:-0.13:0.996:. ./.:4:210,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:212,2:.: 0.89:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:224,2:.: 1.17:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:130,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:188,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.09:1.000:. -chr5.1 54917351 chr5.1_054917351 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:194,82:.: 0.15:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:234,110:.: 1.17:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:84,66:.:-1.75:1.000:. ./.:4:111,59:.:-1.45:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:148,66:.:-0.78:1.000:. ./.:4:213,98:.: 0.68:0.944:. ./.:4:222,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:271,96:.: 1.52:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:64,32:.:-2.56:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:138,88:.:-0.60:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:54,0:.:-3.19:0.999:. ./.:4:180,62:.:-0.36:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:202,89:.: 0.38:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:214,113:.: 0.92:1.000:. ./.:4:251,116:.: 1.52:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:269,95:.: 1.47:1.000:. ./.:4:196,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:286,128:.: 2.23:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:230,136:.: 1.50:1.000:. ./.:4:207,166:.: 1.61:1.000:. ./.:4:214,93:.: 0.62:1.000:. ./.:4:277,125:.: 2.05:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:163,85:.:-0.27:1.000:. ./.:4:331,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:252,113:.: 1.49:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.07:1.000:. ./.:6:242,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:276,113:.: 1.85:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:277,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:223,112:.: 1.04:1.000:. ./.:4:132,75:.:-0.89:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:292,110:.: 2.05:0.996:. ./.:4:222,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:167,284:.: 2.78:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:217,100:.: 0.77:1.000:. ./.:4:191,106:.: 0.47:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:167,98:.:-0.02:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:138,82:.:-0.69:1.000:. ./.:4:282,148:.: 2.47:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:232,101:.: 1.01:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:227,121:.: 1.23:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:168,104:.: 0.09:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:272,134:.: 2.11:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:173,97:.: 0.06:1.000:. ./.:4:196,106:.: 0.54:1.000:. ./.:4:184,95:.: 0.19:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:221,100:.: 0.83:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:202,181:.: 1.76:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:174,93:.: 0.01:1.000:. ./.:4:156,98:.:-0.18:1.000:. ./.:4:207,92:.: 0.50:1.000:. ./.:4:181,85:.: 0.00:1.000:. ./.:4:203,94:.: 0.47:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:188,107:.: 0.44:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:159,104:.:-0.05:1.000:. ./.:4:194,100:.: 0.42:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.05:1.000:. ./.:5:176,57:.:-0.50:0.996:. ./.:4:188,86:.: 0.12:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:176,96:.: 0.09:1.000:. ./.:4:236,92:.: 0.93:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:180,85:.:-0.02:1.000:. ./.:4:138,85:.:-0.65:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:159,93:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,94:.: 0.42:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:181,87:.: 0.03:1.000:. ./.:4:203,99:.: 0.54:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:97,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:222,120:.: 1.14:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:198,107:.: 0.59:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:154,77:.:-0.53:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:183,93:.: 0.15:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:144,82:.:-0.60:0.999:. ./.:4:220,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:129,56:.:-1.22:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:185,87:.: 0.09:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:179,68:.:-0.29:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:144,75:.:-0.71:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:248,113:.: 1.43:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:181,93:.: 0.12:1.000:. -chr5.1 55163756 chr5.1_055163756 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:213,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.16:0.944:. ./.:4:191,49:.: 0.32:1.000:. ./.:4:326,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:77,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:90,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:99,0:.:-2.86:1.000:. ./.:3:56,0:.:-3.84:0.999:. ./.:4:267,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:59,0:.:-3.77:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:269,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.70:1.000:. ./.:6:199,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.14:0.996:. ./.:4:225,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:235,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:269,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:274,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:270,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.64:1.000:. ./.:5:177,0:.:-1.10:0.996:. ./.:4:220,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:341,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.23:0.999:. ./.:4:205,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:221,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.50:1.000:. -chr5.1 55241457 chr5.1_055241457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:223,180:.: 1.49:1.000:. ./.:4:241,57:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,188:.:-0.61:1.000:. ./.:4:117,156:.:-0.26:1.000:. ./.:4:249,184:.: 1.89:1.000:. ./.:4:317,182:.: 2.78:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:226,147:.: 1.09:1.000:. ./.:4:246,86:.: 0.53:1.000:. ./.:4:81,44:.:-2.25:1.000:. ./.:4:106,102:.:-1.14:1.000:. ./.:4:257,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:340,90:.: 1.85:1.000:. ./.:4:221,75:.: 0.05:1.000:. ./.:4:89,162:.:-0.56:1.000:. ./.:4:209,155:.: 0.96:0.944:. ./.:4:187,158:.: 0.71:1.000:. ./.:4:231,191:.: 1.75:1.000:. ./.:4:205,175:.: 1.18:1.000:. ./.:4:58,94:.:-1.89:1.000:. ./.:4:103,141:.:-0.65:1.000:. ./.:4:244,95:.: 0.63:1.000:. ./.:4:247,142:.: 1.30:1.000:. ./.:4:86,65:.:-1.90:1.000:. ./.:4:247,82:.: 0.49:1.000:. ./.:4:201,166:.: 1.01:1.000:. ./.:4:148,82:.:-0.84:1.000:. ./.:4:311,78:.: 1.30:1.000:. ./.:4:265,153:.: 1.69:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:93,135:.:-0.87:1.000:. ./.:4:118,32:.:-1.92:1.000:. ./.:4:115,67:.:-1.49:1.000:. ./.:3:54,10:.:-3.07:0.999:. ./.:4:278,155:.: 1.89:1.000:. ./.:4:170,143:.: 0.28:1.000:. ./.:4:130,141:.:-0.29:1.000:. ./.:4:155,67:.:-0.95:1.000:. ./.:4:80,211:.:-0.02:1.000:. ./.:4:154,145:.: 0.09:1.000:. ./.:4:115,134:.:-0.58:1.000:. ./.:4:66,203:.:-0.31:1.000:. ./.:4:211,128:.: 0.63:1.000:. ./.:4:96,217:.: 0.28:1.000:. ./.:4:234,160:.: 1.37:1.000:. ./.:4:179,168:.: 0.74:1.000:. ./.:4:423,75:.: 2.77:1.000:. ./.:4:63,184:.:-0.61:1.000:. ./.:4:140,70:.:-1.11:1.000:. ./.:4:204,60:.:-0.38:1.000:. ./.:4:196,78:.:-0.25:1.000:. ./.:4:154,56:.:-1.11:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:204,70:.:-0.25:1.000:. ./.:4:201,143:.: 0.70:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:100,206:.: 0.18:1.000:. ./.:4:182,77:.:-0.45:1.000:. ./.:6:159,54:.:-1.07:1.000:. ./.:4:168,60:.:-0.87:1.000:. ./.:4:180,110:.:-0.03:1.000:. ./.:4:111,225:.: 0.59:1.000:. ./.:4:233,68:.: 0.12:1.000:. ./.:4:183,62:.:-0.64:1.000:. ./.:4:179,140:.: 0.36:1.000:. ./.:4:211,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:180,70:.:-0.57:1.000:. ./.:4:156,133:.:-0.04:0.996:. ./.:4:257,144:.: 1.46:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:162,48:.:-1.11:1.000:. ./.:4:158,114:.:-0.27:1.000:. ./.:4:212,79:.:-0.02:1.000:. ./.:4:181,138:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,185:.: 0.26:1.000:. ./.:4:219,69:.:-0.06:1.000:. ./.:4:256,80:.: 0.59:1.000:. ./.:4:227,144:.: 1.06:1.000:. ./.:4:251,151:.: 1.48:1.000:. ./.:4:169,45:.:-1.05:1.000:. ./.:4:227,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:73,113:.:-1.43:1.000:. ./.:4:151,135:.:-0.09:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:166,64:.:-0.84:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:239,49:.:-0.06:1.000:. ./.:4:257,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:114,52:.:-1.70:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:128,153:.:-0.15:1.000:. ./.:4:166,52:.:-1.00:1.000:. ./.:4:275,150:.: 1.79:1.000:. ./.:4:114,197:.: 0.25:1.000:. ./.:4:148,120:.:-0.33:1.000:. ./.:4:148,56:.:-1.19:1.000:. ./.:4:303,75:.: 1.15:1.000:. ./.:4:180,167:.: 0.74:1.000:. ./.:4:134,69:.:-1.20:1.000:. ./.:4:108,135:.:-0.66:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:225,48:.:-0.26:1.000:. ./.:4:177,108:.:-0.10:1.000:. ./.:4:63,204:.:-0.34:1.000:. ./.:4:127,124:.:-0.56:1.000:. ./.:4:234,80:.: 0.29:1.000:. ./.:4:300,98:.: 1.42:1.000:. ./.:4:286,68:.: 0.83:1.000:. ./.:4:184,76:.:-0.44:1.000:. ./.:4:146,283:.: 1.84:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:152,124:.:-0.22:1.000:. ./.:4:197,98:.: 0.04:1.000:. ./.:4:201,90:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,51:.:-0.79:1.000:. ./.:4:151,69:.:-0.97:1.000:. ./.:4:158,127:.:-0.10:1.000:. ./.:4:78,163:.:-0.69:1.000:. ./.:4:80,218:.: 0.08:1.000:. ./.:4:213,63:.:-0.22:1.000:. ./.:4:285,87:.: 1.07:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:174,76:.:-0.57:1.000:. ./.:4:260,70:.: 0.51:1.000:. ./.:4:233,72:.: 0.17:1.000:. ./.:4:147,121:.:-0.33:1.000:. ./.:4:163,47:.:-1.11:1.000:. ./.:4:148,111:.:-0.45:1.000:. ./.:4:167,142:.: 0.22:1.000:. ./.:4:240,75:.: 0.31:1.000:. ./.:5:171,129:.: 0.10:0.996:. ./.:4:132,210:.: 0.67:1.000:. ./.:4:92,150:.:-0.68:1.000:. ./.:4:361,115:.: 2.47:1.000:. ./.:4:243,70:.: 0.28:1.000:. ./.:4:188,119:.: 0.20:1.000:. ./.:4:243,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:143,185:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,115:.:-0.48:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:98,152:.:-0.57:1.000:. ./.:4:105,63:.:-1.67:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:230,194:.: 1.77:1.000:. ./.:4:215,151:.: 0.99:1.000:. ./.:4:229,188:.: 1.68:1.000:. ./.:4:180,167:.: 0.74:1.000:. ./.:4:242,69:.: 0.25:1.000:. ./.:4:199,183:.: 1.21:1.000:. ./.:4:172,87:.:-0.45:1.000:. ./.:4:85,52:.:-2.09:1.000:. ./.:4:187,97:.:-0.11:1.000:. ./.:4:190,86:.:-0.22:1.000:. ./.:4:271,88:.: 0.90:1.000:. ./.:4:145,197:.: 0.67:1.000:. ./.:4:299,92:.: 1.33:1.000:. ./.:4:138,55:.:-1.34:1.000:. ./.:4:177,72:.:-0.58:1.000:. ./.:4:263,72:.: 0.57:1.000:. ./.:4:97,174:.:-0.29:1.000:. ./.:4:219,77:.: 0.05:1.000:. ./.:4:152,72:.:-0.92:1.000:. ./.:4:241,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:244,76:.: 0.37:1.000:. ./.:4:168,72:.:-0.70:1.000:. ./.:4:287,72:.: 0.90:0.999:. ./.:4:229,82:.: 0.25:1.000:. ./.:4:254,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:176,105:.:-0.15:1.000:. ./.:4:173,65:.:-0.73:1.000:. ./.:4:136,155:.:-0.02:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:210,101:.: 0.25:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:212,173:.: 1.25:1.000:. ./.:4:143,82:.:-0.91:1.000:. ./.:4:168,136:.: 0.16:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:262,160:.: 1.75:1.000:. ./.:4:242,214:.: 2.20:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:199,163:.: 0.94:1.000:. -chr5.1 55381520 chr5.1_055381520 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:109,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:191,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.48:0.944:. ./.:4:156,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.43:1.000:. ./.:3:7,0:.:-3.13:0.999:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.01:1.000:. ./.:6:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.06:0.996:. ./.:4:136,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.52:0.999:. ./.:4:139,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.56:1.000:. ./.:5:93,0:.:-0.62:0.996:. ./.:4:103,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:161,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:100,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:124,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.25:1.000:. -chr5.1 55629802 chr5.1_055629802 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:52,84:0.63: 0.14:1.000:0.586 0/0/0/1:4:123,34:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,65:0.54:-0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:78,60:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:53,112:0.68: 0.89:1.000:0.962 0/1/1/1:4:23,113:0.83: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,45:0.46:-0.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:43,103:0.71: 0.40:1.000:0.990 0/1/1/1:4:35,88:0.71:-0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,3:0.47:-3.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:6,6:0.53:-3.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:118,28:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,30:0.31:-0.40:1.000:0.980 0/1/1/1:4:27,106:0.79: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,79:0.65:-0.19:1.000:0.815 0/0/0/1:4:103,31:0.28: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,119:0.71: 0.94:0.944:0.993 0/0/1/1:4:80,106:0.59: 1.44:1.000:0.856 0/1/1/1:4:51,140:0.73: 1.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,79:0.48: 1.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,4:0.20:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,63:0.52: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,64:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:41,86:0.68:-0.09:1.000:0.959 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-3.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,115:0.68: 1.02:1.000:0.957 0/0/1/1:4:63,46:0.46:-0.56:1.000:0.988 0/0/0/1:4:114,25:0.22: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,101:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,119:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,36:0.20: 2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,66:0.48: 0.50:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-3.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,14:0.67:-2.83:1.000:0.933 0/0/1:3:2,1:0.38:-3.30:0.999:1.000 0/0/1/1:4:86,56:0.43: 0.30:1.000:0.957 0/0/1/1:4:77,73:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,49:0.44:-0.17:1.000:0.958 0/0/1/1:4:88,88:0.53: 1.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,106:0.58: 1.56:1.000:0.919 0/0/0/1:4:137,27:0.20: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,67:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,75:0.46: 1.23:1.000:0.988 0/0/1/1:4:72,56:0.48:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,62:0.44: 0.66:1.000:0.963 0/1/1/1:4:36,113:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,60:0.46: 0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,63:0.54:-0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,54:0.44: 0.14:1.000:0.962 0/0/0/1:4:136,32:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,56:0.53:-0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:134,43:0.29: 1.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,46:0.43:-0.30:1.000:0.938 0/0/0/1:4:143,37:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,68:0.58:-0.19:1.000:0.926 0/1/1/1:4:46,97:0.68: 0.32:1.000:0.961 0/0/0/1:4:102,29:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,67:0.48: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,67:0.44: 1.00:1.000:0.961 0/0/0/0/1/1:6:61,31:0.38:-1.00:1.000:0.789 0/0/0/1:4:109,21:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,75:0.53: 0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:76,58:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:85,66:0.48: 0.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:134,37:0.26: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,90:0.70:-0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:75,56:0.47: 0.01:1.000:0.991 0/0/0/1:4:105,27:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,75:0.48: 1.05:0.996:0.994 0/0/1/1:4:58,54:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,34:0.23: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,57:0.69:-1.23:1.000:0.974 0/0/0/0:4:214,1:0.01: 2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,63:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,40:0.30: 0.61:1.000:0.981 0/1/1/1:4:43,99:0.70: 0.30:1.000:0.984 0/1/1/1:4:24,88:0.78:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,55:0.56:-0.71:1.000:0.966 0/1/1/1:4:53,111:0.68: 0.87:1.000:0.958 0/1/1/1:4:59,111:0.66: 1.02:1.000:0.879 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,77:0.60: 0.06:1.000:0.800 0/0/0/1:4:124,36:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,21:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,36:0.22: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,34:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,42:0.48:-0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:91,17:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,61:0.54:-0.25:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,68:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,60:0.53:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,50:0.42: 0.04:1.000:0.911 0/0/0/1:4:125,34:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,49:0.54:-0.87:1.000:0.990 0/1/1/1:4:38,107:0.73: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:33,85:0.72:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,36:0.58:-1.69:1.000:0.923 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,70:0.60:-0.25:1.000:0.803 0/1/1/1:4:30,85:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,46:0.46:-0.58:1.000:0.990 0/0/0/1:4:94,29:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:58,30:0.38:-1.10:1.000:0.603 0/0/1/1:4:53,34:0.43:-1.12:1.000:0.949 0/0/1/1:4:57,43:0.47:-0.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,55:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,49:0.43:-0.14:1.000:0.952 0/0/1/1:4:81,73:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,65:0.48: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,63:0.49: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,46:0.44:-0.43:1.000:0.972 0/1/1/1:4:50,116:0.70: 0.92:1.000:0.986 0/0/0/1:4:62,21:0.30:-1.23:0.999:0.987 0/0/0/1:4:141,36:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,73:0.73:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,44:0.44:-0.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:52,51:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:66,46:0.45:-0.48:1.000:0.980 0/0/0/1:4:97,31:0.29:-0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,49:0.48:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,55:0.52:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,66:0.68:-0.84:1.000:0.951 0/1/1/1:4:36,67:0.66:-0.71:1.000:0.866 0/0/1/1:4:57,62:0.55:-0.30:1.000:0.980 0/0/1/1:4:55,49:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,62:0.55:-0.30:1.000:0.980 0/0/1/1:4:74,51:0.45:-0.14:1.000:0.977 0/0/0/1:4:103,37:0.31: 0.25:1.000:0.976 0/0/1/1:4:52,55:0.54:-0.61:1.000:0.985 0/1/1/1:4:20,62:0.75:-1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,55:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,54:0.48:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:19,82:0.81:-0.76:0.996:0.997 0/1/1/1:4:33,76:0.70:-0.56:1.000:0.984 0/0/1/1:4:81,58:0.46: 0.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:128,100:0.48: 2.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,57:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,43:0.48:-0.87:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,60:0.76:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,76:0.72:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,17:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,45:0.43:-0.37:1.000:0.942 0/0/1/1:4:70,59:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,17:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,32:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,94:0.69: 0.14:1.000:0.979 0/0/1/1:4:58,61:0.54:-0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:57,56:0.53:-0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,103:0.73: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,44:0.41:-0.32:1.000:0.884 0/0/0/1:4:116,36:0.28: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,46:0.52:-0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,7:0.87:-3.17:1.000:0.897 0/1/1/1:4:19,68:0.78:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,46:0.27: 1.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,61:0.47: 0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:82,68:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,58:0.43: 0.45:1.000:0.951 0/0/1/1:4:71,68:0.52: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,55:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,61:0.51:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,90:0.74:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,68:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,64:0.47: 0.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:151,49:0.29: 1.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,64:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,68:0.52: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.27:0.999:1.000 0/0/1/1:4:72,55:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,52:0.46:-0.19:1.000:0.989 0/0/0/1:4:90,21:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,47:0.48:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,65:0.46: 0.66:1.000:0.985 0/0/1/1:4:66,65:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:108,27:0.25: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,65:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,38:0.23: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,80:0.53: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:92,77:0.49: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,59:0.44: 0.43:1.000:0.969 0/0/0/1:4:139,32:0.23: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,74:0.44: 1.38:1.000:0.970 0/1/1/1:4:42,119:0.73: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,24:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,27:0.25: 0.09:1.000:0.999 -chr5.1 55812454 chr5.1_055812454 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:113,57:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,19:.:-1.12:1.000:. ./.:4:85,54:.:-0.18:1.000:. ./.:4:99,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:163,42:.: 1.89:1.000:. ./.:4:99,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:97,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:107,28:.:-0.30:1.000:. ./.:4:41,5:.:-3.09:1.000:. ./.:4:106,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:120,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:128,38:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.77:1.000:. ./.:4:87,25:.:-1.02:1.000:. ./.:4:107,25:.:-0.40:0.944:. ./.:4:119,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:128,36:.: 0.61:1.000:. ./.:4:118,59:.: 1.02:1.000:. ./.:4:76,40:.:-0.90:1.000:. ./.:4:127,49:.: 0.98:1.000:. ./.:4:123,28:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,52:.: 0.26:1.000:. ./.:4:90,13:.:-1.30:1.000:. ./.:4:115,28:.:-0.05:1.000:. ./.:4:74,35:.:-1.12:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:129,21:.: 0.17:1.000:. ./.:4:114,44:.: 0.42:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:84,32:.:-0.90:1.000:. ./.:4:65,31:.:-1.52:1.000:. ./.:4:86,17:.:-1.30:1.000:. ./.:3:107,3:.:-1.09:0.999:. ./.:4:112,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:121,55:.: 0.98:1.000:. ./.:4:100,15:.:-0.93:1.000:. ./.:4:122,31:.: 0.26:1.000:. ./.:4:99,45:.:-0.02:1.000:. ./.:4:134,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:137,57:.: 1.55:1.000:. ./.:4:154,60:.: 2.18:1.000:. ./.:4:121,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:161,68:.: 2.65:1.000:. ./.:4:103,44:.: 0.08:1.000:. ./.:4:142,27:.: 0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:136,54:.: 1.42:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:120,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:116,24:.:-0.14:1.000:. ./.:4:128,30:.: 0.42:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:116,57:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:169,65:.: 2.80:1.000:. ./.:4:117,37:.: 0.29:1.000:. ./.:6:125,26:.: 0.20:1.000:. ./.:4:126,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,55:.: 0.20:1.000:. ./.:4:158,80:.: 2.93:1.000:. ./.:4:152,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:114,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:130,59:.: 1.39:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:107,16:.:-0.68:1.000:. ./.:4:139,27:.: 0.67:0.996:. ./.:4:101,72:.: 0.89:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:119,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:123,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:146,27:.: 0.89:1.000:. ./.:4:117,38:.: 0.33:1.000:. ./.:4:149,33:.: 1.17:1.000:. ./.:4:129,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:113,58:.: 0.83:1.000:. ./.:4:126,62:.: 1.36:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:140,36:.: 0.98:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:93,13:.:-1.21:1.000:. ./.:4:106,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:111,28:.:-0.18:1.000:. ./.:4:122,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:123,19:.:-0.08:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:152,35:.: 1.33:1.000:. ./.:4:79,13:.:-1.65:1.000:. ./.:4:121,57:.: 1.05:1.000:. ./.:4:143,62:.: 1.89:1.000:. ./.:4:133,30:.: 0.58:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:157,40:.: 1.64:1.000:. ./.:4:127,59:.: 1.30:1.000:. ./.:4:119,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:133,24:.: 0.39:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:159,35:.: 1.55:1.000:. ./.:4:102,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:104,39:.:-0.05:1.000:. ./.:4:112,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:106,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:164,31:.: 1.58:1.000:. ./.:4:110,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:125,34:.: 0.45:1.000:. ./.:4:146,52:.: 1.67:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:149,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:96,33:.:-0.49:1.000:. ./.:4:160,40:.: 1.74:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:140,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:139,33:.: 0.86:1.000:. ./.:4:119,46:.: 0.64:1.000:. ./.:4:134,52:.: 1.30:1.000:. ./.:4:137,30:.: 0.70:1.000:. ./.:4:137,33:.: 0.80:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.36:1.000:. ./.:4:136,23:.: 0.45:1.000:. ./.:4:120,27:.: 0.08:1.000:. ./.:4:111,30:.:-0.11:1.000:. ./.:4:105,21:.:-0.58:1.000:. ./.:4:96,30:.:-0.58:1.000:. ./.:4:129,26:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,33:.:-0.11:1.000:. ./.:5:101,36:.:-0.24:0.996:. ./.:4:98,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:107,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:109,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:104,22:.:-0.58:1.000:. ./.:4:134,46:.: 1.11:1.000:. ./.:4:105,18:.:-0.68:1.000:. ./.:4:123,52:.: 0.95:1.000:. ./.:4:115,24:.:-0.18:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:102,26:.:-0.52:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:146,81:.: 2.58:1.000:. ./.:4:100,16:.:-0.90:1.000:. ./.:4:111,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:130,60:.: 1.42:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:104,27:.:-0.43:1.000:. ./.:4:122,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,52:.: 0.42:1.000:. ./.:4:113,37:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:89,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:141,71:.: 2.11:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:120,15:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,27:.:-0.71:1.000:. ./.:4:81,43:.:-0.65:1.000:. ./.:4:102,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:160,31:.: 1.46:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:122,20:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,43:.:-0.58:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:106,31:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,18:.:-0.83:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:83,20:.:-1.30:1.000:. ./.:4:94,24:.:-0.83:1.000:. ./.:4:90,18:.:-1.15:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:102,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:96,58:.: 0.29:1.000:. ./.:4:111,18:.:-0.49:1.000:. ./.:4:106,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:121,21:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,70:.: 1.36:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:124,29:.: 0.26:1.000:. -chr5.1 56037953 chr5.1_056037953 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:0.944:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.01:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.27:0.999:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:10,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,0:.: 4.26:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,4:.: 3.25:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:14,1:.: 2.00:1.000:. ./.:4:11,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:11,4:.: 2.00:1.000:. ./.:4:10,3:.: 1.49:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.99:1.000:. ./.:6:8,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,4:.: 1.75:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:9,3:.: 1.24:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:5,5:.: 0.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:0.996:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:5,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:17,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:14,1:.: 2.00:0.999:. ./.:4:5,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.99:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:5:6,0:.:-0.26:0.996:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.77:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:7,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.77:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.49:1.000:. -chr5.1 56260762 chr5.1_056260762 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:269,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:226,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.27:0.944:. ./.:4:339,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:412,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:291,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:268,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.44:1.000:. ./.:3:28,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:184,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.44:0.996:. ./.:4:261,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:389,1:.: 2.08:1.000:. ./.:4:242,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:207,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:359,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:418,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.93:1.000:. ./.:5:156,0:.:-1.10:0.996:. ./.:4:217,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:283,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:364,1:.: 1.74:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:344,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.72:0.989:. ./.:4:323,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:345,2:.: 1.50:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.00:1.000:. -chr5.1 56413219 chr5.1_056413219 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:181,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.40:0.944:. ./.:4:82,55:.:-0.47:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.89:1.000:. ./.:3:52,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:169,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:102,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.21:0.996:. ./.:4:136,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:155,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.99:0.999:. ./.:4:204,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.67:1.000:. ./.:5:132,0:.:-0.60:0.996:. ./.:4:111,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:182,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:247,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:286,0:.: 3.17:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:214,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:134,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.31:0.989:. ./.:4:130,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:144,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.58:1.000:. -chr5.1 56449256 chr5.1_056449256 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:224,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:79,77:.:-0.65:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:158,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:293,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:220,42:.: 1.41:1.000:. ./.:4:129,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:194,51:.: 1.08:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,23:.:-2.26:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:103,93:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,45:.: 0.21:1.000:. ./.:4:185,51:.: 0.91:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:151,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.06:0.944:. ./.:4:259,53:.: 2.38:1.000:. ./.:4:354,1:.: 3.22:1.000:. ./.:4:144,66:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:190,73:.: 1.43:1.000:. ./.:4:139,60:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:92,50:.:-0.92:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:226,68:.: 2.03:1.000:. ./.:4:186,41:.: 0.73:1.000:. ./.:4:151,43:.: 0.09:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:61,19:.:-2.12:1.000:. ./.:4:51,29:.:-2.12:1.000:. ./.:3:41,8:.:-2.72:1.000:. ./.:4:138,59:.: 0.15:1.000:. ./.:4:113,51:.:-0.49:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.90:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:120,42:.:-0.53:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:178,58:.: 0.91:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:132,33:.:-0.47:1.000:. ./.:4:131,68:.: 0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:108,57:.:-0.47:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:160,43:.: 0.27:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:152,44:.: 0.13:1.000:. ./.:6:140,27:.:-0.43:1.000:. ./.:4:120,64:.:-0.10:1.000:. ./.:4:110,49:.:-0.59:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:99,43:.:-0.92:1.000:. ./.:4:120,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:152,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,58:.:-0.06:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.02:0.996:. ./.:4:109,104:.: 0.46:1.000:. ./.:4:183,52:.: 0.89:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:134,54:.:-0.02:1.000:. ./.:4:153,56:.: 0.38:1.000:. ./.:4:153,41:.: 0.09:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,51:.: 0.81:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:189,30:.: 0.58:1.000:. ./.:4:67,82:.:-0.78:1.000:. ./.:4:115,49:.:-0.49:1.000:. ./.:4:143,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:88,34:.:-1.31:1.000:. ./.:4:116,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:92,38:.:-1.15:1.000:. ./.:4:112,42:.:-0.68:1.000:. ./.:4:110,47:.:-0.63:1.000:. ./.:4:138,45:.:-0.12:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:159,50:.: 0.38:1.000:. ./.:4:111,44:.:-0.67:1.000:. ./.:4:142,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:157,50:.: 0.34:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:144,47:.: 0.03:1.000:. ./.:4:125,40:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,44:.: 0.97:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:120,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:180,50:.: 0.79:1.000:. ./.:4:121,25:.:-0.84:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:193,53:.: 1.10:1.000:. ./.:4:178,78:.: 1.30:1.000:. ./.:4:140,56:.: 0.13:1.000:. ./.:4:142,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:300,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:135,64:.: 0.19:0.999:. ./.:4:219,62:.: 1.78:1.000:. ./.:4:102,27:.:-1.17:1.000:. ./.:4:182,53:.: 0.89:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:126,53:.:-0.20:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:214,59:.: 1.63:1.000:. ./.:4:214,62:.: 1.68:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:188,41:.: 0.77:1.000:. ./.:4:189,55:.: 1.06:1.000:. ./.:4:98,54:.:-0.72:1.000:. ./.:4:75,27:.:-1.69:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:155,50:.: 0.31:1.000:. ./.:4:144,54:.: 0.17:1.000:. ./.:5:151,1:.:-0.72:0.996:. ./.:4:192,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:128,59:.:-0.04:1.000:. ./.:4:179,37:.: 0.52:1.000:. ./.:4:105,49:.:-0.68:1.000:. ./.:4:188,36:.: 0.67:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:118,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:187,46:.: 0.85:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:155,65:.: 0.60:1.000:. ./.:4:359,0:.: 3.30:1.000:. ./.:4:196,77:.: 1.63:1.000:. ./.:4:138,36:.:-0.30:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:177,63:.: 0.99:1.000:. ./.:4:118,56:.:-0.30:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:127,56:.:-0.12:1.000:. ./.:4:162,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:149,53:.: 0.25:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:196,53:.: 1.16:1.000:. ./.:4:186,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:115,50:.:-0.47:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:128,45:.:-0.32:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:56,30:.:-2.00:1.000:. ./.:4:179,43:.: 0.64:1.000:. ./.:4:98,46:.:-0.88:1.000:. ./.:4:107,115:.: 0.64:0.989:. ./.:4:195,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:186,59:.: 1.08:1.000:. ./.:4:115,50:.:-0.47:1.000:. ./.:4:128,32:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:82,42:.:-1.27:1.000:. ./.:4:136,42:.:-0.22:1.000:. ./.:4:127,57:.:-0.10:1.000:. ./.:4:132,74:.: 0.32:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:166,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:142,74:.: 0.52:1.000:. ./.:4:260,62:.: 2.58:1.000:. ./.:4:351,0:.: 3.14:1.000:. ./.:4:118,37:.:-0.67:1.000:. ./.:4:164,67:.: 0.81:1.000:. -chr5.1 56728900 chr5.1_056728900 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,11:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.43: 1.46:1.000:0.934 0/0/1/1:4:5,11:0.58: 1.92:1.000:0.896 0/0/1/1:4:1,2:0.57:-1.06:1.000:0.949 0/1/1/1:4:2,7:0.65: 0.32:1.000:0.787 0/0/1/1:4:4,6:0.52: 0.54:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.48: 1.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,5:0.60:-0.14:1.000:0.760 0/1/1/1:4:1,4:0.67:-0.60:1.000:0.900 0/0/1/1:4:5,6:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,1:0.25: 0.77:0.944:0.999 0/0/1/1:4:9,8:0.45: 2.15:1.000:0.977 0/0/1/1:4:8,5:0.40: 1.23:1.000:0.814 0/0/1/1:4:8,7:0.45: 1.69:1.000:0.975 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,13:0.56: 2.84:1.000:0.972 0/0/0/1:4:6,1:0.28:-0.14:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-0.14:1.000:0.780 0/0/1/1:4:9,7:0.43: 1.92:1.000:0.947 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.46: 1.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:7,12:0.54: 2.61:1.000:0.985 0/0/1/1:4:3,5:0.54: 0.09:1.000:0.988 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-1.29:1.000:0.989 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-0.14:1.000:0.934 0/0/1/1:4:7,5:0.42: 1.00:1.000:0.912 0/0/1/1:4:3,3:0.46:-0.37:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.83:1.000:0.989 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.54: 0.09:1.000:0.988 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.67:-0.60:1.000:0.900 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,5:0.38: 1.69:1.000:0.518 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.40: 0.09:1.000:0.771 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.69:-0.37:1.000:0.973 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.67:-0.60:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,2:0.57:-1.06:1.000:0.949 0/0/1/1:4:3,7:0.59: 0.54:1.000:0.844 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.54: 0.09:1.000:0.988 0/0/0/0/1/1:6:3,1:0.33:-0.83:1.000:0.920 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.38:-1.06:1.000:0.518 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.83:1.000:0.554 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.83:1.000:0.989 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,4:0.57:-0.37:1.000:0.949 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.83:0.996:0.554 0/0/1/1:4:4,5:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,5:0.69:-0.37:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.40: 0.09:1.000:0.771 0/0/1/1:4:4,6:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:11,2:0.28: 1.23:1.000:0.995 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.83:1.000:0.554 0/1/1/1:4:1,6:0.71:-0.14:1.000:0.990 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,3:0.38: 0.32:1.000:0.518 0/0/1/1:4:1,2:0.57:-1.06:1.000:0.949 0/0/1/1:4:3,3:0.46:-0.37:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,8:0.61: 0.77:1.000:0.659 0/0/1/1:4:2,4:0.57:-0.37:1.000:0.949 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.83:1.000:0.554 0/0/0/1:4:4,1:0.31:-0.60:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,3:0.38: 0.32:1.000:0.518 0/1/1/1:4:1,7:0.72: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.71:-0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.83:1.000:0.989 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-0.14:1.000:0.934 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.83:1.000:0.554 0/0/1/1:4:2,1:0.38:-1.06:1.000:0.518 0/0/0/1:4:4,1:0.31:-0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:2,1:0.38:-1.06:1.000:0.518 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.57:-1.06:1.000:0.949 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.83:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.55: 0.77:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.57:-0.37:1.000:0.949 0/0/1/1:4:11,7:0.41: 2.38:1.000:0.831 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.60:0.999:1.000 0/0/0/1:4:10,3:0.32: 1.23:1.000:0.946 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.52:-0.60:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.40: 0.09:1.000:0.771 0/0/1/1:4:1,2:0.57:-1.06:1.000:0.949 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.31:-0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:11,6:0.39: 2.15:1.000:0.649 0/1/1/1:4:1,16:0.82: 2.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.57:-0.37:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.33: 0.09:1.000:0.909 0/0/0/1:4:6,2:0.33: 0.09:1.000:0.909 0/0/0/1:4:6,2:0.33: 0.09:1.000:0.909 0/1/1/1:4:1,5:0.69:-0.37:1.000:0.973 0/0/1/1:4:5,10:0.57: 1.69:1.000:0.949 0/0/0/1/1:5:2,1:0.38:-1.06:0.996:0.961 0/0/0/1:4:5,1:0.29:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.28:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,6:0.63: 0.09:1.000:0.554 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-0.14:1.000:0.934 0/0/0/1:4:5,2:0.35:-0.14:1.000:0.780 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-0.37:1.000:0.518 0/0/1/1:4:1,2:0.57:-1.06:1.000:0.949 0/0/0/1:4:8,1:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.39: 0.77:1.000:0.712 0/1/1/1:4:2,8:0.67: 0.54:1.000:0.900 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-0.37:1.000:0.518 0/0/0/1:4:4,1:0.31:-0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:4,6:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,7:0.42: 2.15:1.000:0.901 0/0/1/1:4:8,5:0.40: 1.23:1.000:0.814 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:5,5:0.46: 0.54:1.000:0.989 0/0/1/1:4:6,10:0.54: 1.92:1.000:0.988 0/0/1/1:4:5,7:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.54: 0.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:7,6:0.44: 1.23:1.000:0.971 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.71:-0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:7,5:0.42: 1.00:1.000:0.912 0/1/1/1:4:3,9:0.63: 1.00:1.000:0.554 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-0.14:1.000:0.934 0/1/1/1:4:1,6:0.71:-0.14:1.000:0.990 0/1/1/1:4:1,4:0.67:-0.60:1.000:0.900 0/0/1/1:4:9,8:0.45: 2.15:0.989:0.977 0/0/1/1:4:12,7:0.39: 2.61:1.000:0.738 1/1/1/1:4:0,10:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.41:-0.60:1.000:0.869 0/0/1/1:4:5,5:0.46: 0.54:1.000:0.989 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.63:-0.83:1.000:0.554 0/0/1/1:4:7,5:0.42: 1.00:1.000:0.912 0/0/0/1:4:8,1:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,3:0.33: 1.00:1.000:0.909 0/0/0/1:4:7,2:0.32: 0.32:1.000:0.958 0/0/0/1:4:6,1:0.28:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,3:0.52:-0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,16:0.64: 3.07:1.000:0.664 0/0/1/1:4:2,4:0.57:-0.37:1.000:0.949 0/1/1/1:4:2,6:0.63: 0.09:1.000:0.554 0/0/0/1:4:8,2:0.31: 0.54:1.000:0.978 -chr5.1 57292416 chr5.1_057292416 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,84:0.24: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,54:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,52:0.21: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,31:0.38:-1.76:1.000:0.607 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-2.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,53:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,78:0.27: 1.29:1.000:0.998 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.01:0.944:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,75:0.21: 2.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,2:0.02:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,73:0.27: 0.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:140,77:0.28: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-2.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,55:0.21: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,92:0.32: 1.49:1.000:0.953 0/0/0/1:4:99,58:0.29:-0.05:1.000:0.990 0/0/0/1:4:141,63:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,17:0.24:-2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,51:0.35:-0.72:1.000:0.806 0/1/1:3:18,21:0.50:-2.37:1.000:0.500 0/0/0/1:4:131,78:0.30: 0.97:1.000:0.987 0/0/0/1:4:152,70:0.24: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,48:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,70:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,68:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,3:0.02:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,61:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,95:0.29: 1.98:1.000:0.993 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,75:0.28: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,55:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,57:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:128,35:0.16: 0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:138,57:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,75:0.27: 1.09:1.000:0.998 0/0/0/0:4:162,1:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,65:0.21: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,69:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,60:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:126,57:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-1.09:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,94:0.35: 1.31:1.000:0.792 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,68:0.25: 0.84:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,55:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,63:0.25: 0.58:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,75:0.24: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,64:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,2:0.01:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,87:0.25: 1.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:171,77:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,44:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,66:0.28: 0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,58:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,55:0.28:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,72:0.30: 0.66:1.000:0.987 0/0/0/1:4:166,75:0.23: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,58:0.28: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:173,79:0.23: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,62:0.23: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,43:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,78:0.34: 0.66:1.000:0.895 0/0/0/1:4:111,59:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,1:0.01:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,62:0.32: 0.01:1.000:0.964 0/0/0/1:4:185,94:0.25: 2.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,63:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,71:0.31: 0.50:1.000:0.972 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,61:0.23: 0.72:0.999:1.000 0/0/0/1:4:137,56:0.22: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,46:0.30:-0.73:1.000:0.983 0/0/0/1:4:128,70:0.27: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/0:4:128,1:0.01:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,54:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,71:0.34: 0.31:1.000:0.884 0/0/0/1:4:112,58:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,68:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,51:0.21: 0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,48:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,56:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,59:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:110,0:0.00:-0.97:0.996:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,110:0.34: 2.21:1.000:0.893 0/0/0/1:4:122,71:0.29: 0.66:1.000:0.991 0/0/0/1:4:126,67:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,55:0.27:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,70:0.23: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,86:0.34: 0.97:1.000:0.837 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,71:0.23: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,57:0.26: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:130,58:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,40:0.22:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,86:0.28: 1.56:1.000:0.995 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-2.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,56:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,69:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,77:0.31: 0.84:1.000:0.977 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,71:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,62:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,50:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,68:0.23: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,73:0.29: 0.82:1.000:0.994 0/0/0/1:4:121,61:0.25: 0.44:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.60:0.989:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,63:0.28: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:109,64:0.29: 0.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:113,63:0.28: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,56:0.23: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,35:0.18:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,81:0.24: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,81:0.24: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,17:0.10:-0.73:1.000:0.694 0/0/0/1:4:130,87:0.33: 1.13:1.000:0.914 0/0/0/1:4:126,85:0.33: 1.01:1.000:0.903 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,75:0.32: 0.64:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-1.70:1.000:1.000 -chr5.1 57386346 chr5.1_057386346 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:148,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:62,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:185,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:62,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.89:0.944:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:204,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:145,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:21,1:.:-2.32:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:205,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:37,9:.:-1.75:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.29:1.000:. ./.:3:37,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:124,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:70,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:214,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:39,1:.:-1.89:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.30:1.000:. ./.:6:150,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:225,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:205,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:45,2:.:-1.72:1.000:. ./.:4:200,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.80:0.996:. ./.:4:174,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:142,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:172,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:114,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:101,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:134,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:106,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:98,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:30,2:.:-2.08:1.000:. ./.:4:49,1:.:-1.65:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:131,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:29,1:.:-2.13:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.63:1.000:. ./.:5:57,0:.:-1.48:0.996:. ./.:4:105,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:163,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:79,3:.:-0.89:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:154,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:136,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:220,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.89:0.989:. ./.:4:86,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:180,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.27:1.000:. -chr5.1 57672064 chr5.1_057672064 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,1:.: 0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,1:.: 2.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:98,0:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-1.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:122,0:.: 1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:152,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:149,0:.: 2.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.91:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:101,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:66,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:89,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:66,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:53,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:90,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:78,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.26:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:78,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:101,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:65,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:129,0:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:78,0:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:51,0:.:-1.15:0.996:. ./.:4:86,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:101,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:137,0:.: 1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:118,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:116,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:120,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:90,0:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:147,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 57759645 chr5.1_057759645 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,7:.: 1.06:1.000:. ./.:4:11,10:.: 1.86:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.32:1.000:. ./.:4:8,11:.: 1.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,8:.: 1.46:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:9,6:.: 0.67:0.944:. ./.:4:10,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:6,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,10:.: 2.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,8:.: 1.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,5:.: 1.06:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.07:1.000:. ./.:4:10,5:.: 0.67:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:8,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,10:.: 2.25:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.51:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:3,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,10:.: 1.06:1.000:. ./.:4:6,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.07:1.000:. ./.:6:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.71:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:0.996:. ./.:4:15,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:13,9:.: 2.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:18,12:.: 3.64:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.32:1.000:. ./.:4:7,10:.: 1.06:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:6,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:8,4:.: 0.07:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.31:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:3,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,7:.: 1.86:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.86:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:0.999:. ./.:4:10,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.07:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.51:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.86:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,12:.: 2.05:1.000:. ./.:4:13,6:.: 1.46:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:10,8:.: 1.26:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.32:1.000:. ./.:5:8,5:.: 0.27:0.996:. ./.:4:13,8:.: 1.86:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.67:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:13,7:.: 1.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:20,6:.: 2.85:1.000:. ./.:4:7,5:.: 0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.67:1.000:. ./.:4:5,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:11,4:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.67:1.000:. ./.:4:11,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:14,4:.: 1.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.32:1.000:. ./.:4:7,8:.: 0.67:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:10,9:.: 1.46:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:0.989:. ./.:4:10,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,6:.: 0.47:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,8:.: 2.25:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:12,8:.: 1.66:1.000:. ./.:4:7,9:.: 0.86:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.32:1.000:. -chr5.1 57860456 chr5.1_057860456 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:304,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:261,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:274,64:.: 1.29:1.000:. ./.:4:245,62:.: 0.76:1.000:. ./.:4:148,36:.:-1.33:1.000:. ./.:4:200,45:.:-0.29:1.000:. ./.:4:191,50:.:-0.36:1.000:. ./.:4:142,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:92,7:.:-2.78:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:220,60:.: 0.30:1.000:. ./.:4:241,58:.: 0.63:1.000:. ./.:4:218,56:.: 0.20:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:237,62:.: 0.63:0.944:. ./.:4:263,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:286,64:.: 1.49:1.000:. ./.:4:380,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:119,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:285,66:.: 1.51:1.000:. ./.:4:311,2:.: 0.86:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:205,35:.:-0.38:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:272,56:.: 1.12:1.000:. ./.:4:249,49:.: 0.61:1.000:. ./.:4:146,45:.:-1.21:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:76,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.92:1.000:. ./.:3:73,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:238,60:.: 0.61:1.000:. ./.:4:185,34:.:-0.73:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:220,52:.: 0.17:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:69,9:.:-3.13:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:141,36:.:-1.45:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:209,47:.:-0.11:1.000:. ./.:4:198,47:.:-0.29:1.000:. ./.:4:201,61:.: 0.00:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:216,42:.:-0.07:1.000:. ./.:6:257,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:170,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:197,41:.:-0.41:0.996:. ./.:4:263,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:211,65:.: 0.24:1.000:. ./.:4:159,40:.:-1.07:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:223,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:194,46:.:-0.38:1.000:. ./.:4:209,56:.: 0.05:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:210,47:.:-0.09:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:201,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:202,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:158,51:.:-0.90:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:161,53:.:-0.82:1.000:. ./.:4:201,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:212,63:.: 0.22:1.000:. ./.:4:222,68:.: 0.47:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:147,50:.:-1.11:1.000:. ./.:4:201,55:.:-0.11:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:166,39:.:-0.97:1.000:. ./.:4:201,51:.:-0.17:1.000:. ./.:4:377,1:.: 1.97:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:230,48:.: 0.27:1.000:. ./.:4:267,69:.: 1.26:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:279,61:.: 1.32:1.000:. ./.:4:130,39:.:-1.58:1.000:. ./.:4:260,37:.: 0.59:1.000:. ./.:4:187,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:218,50:.: 0.10:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:235,46:.: 0.32:1.000:. ./.:4:225,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:213,57:.: 0.13:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:212,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:207,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:153,41:.:-1.16:1.000:. ./.:4:225,53:.: 0.27:1.000:. ./.:4:218,50:.: 0.10:1.000:. ./.:5:151,35:.:-1.30:0.996:. ./.:4:182,37:.:-0.73:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:413,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:205,33:.:-0.41:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:178,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:223,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:229,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:291,76:.: 1.78:1.000:. ./.:4:230,61:.: 0.49:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:238,69:.: 0.76:1.000:. ./.:4:200,52:.:-0.17:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:196,39:.:-0.46:1.000:. ./.:4:72,17:.:-2.95:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:212,62:.: 0.20:1.000:. ./.:4:286,81:.: 1.78:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:219,66:.: 0.39:1.000:. ./.:4:185,56:.:-0.36:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:161,45:.:-0.96:1.000:. ./.:4:191,59:.:-0.21:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:234,42:.: 0.24:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.31:0.989:. ./.:4:202,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:214,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:272,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:244,63:.: 0.76:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:331,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:283,66:.: 1.48:1.000:. ./.:4:301,70:.: 1.85:1.000:. ./.:4:192,39:.:-0.53:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.73:1.000:. -chr5.1 57928786 chr5.1_057928786 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:22,5:.: 2.49:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.70:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,4:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.57:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.00:0.944:. ./.:4:17,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.83:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:19,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.52:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:16,8:.: 1.97:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:15,4:.: 1.09:1.000:. ./.:4:12,6:.: 0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,6:.: 0.40:1.000:. ./.:4:13,6:.: 1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:6:8,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:6,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.30:0.996:. ./.:4:11,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:20,3:.: 1.79:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.35:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:15,4:.: 1.09:1.000:. ./.:4:12,6:.: 0.92:1.000:. ./.:4:26,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:23,7:.: 3.01:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:18,2:.: 1.27:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:8,9:.: 0.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:14,3:.: 0.75:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:0.999:. ./.:4:24,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:10,5:.: 0.40:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:26,3:.: 2.84:1.000:. ./.:4:18,3:.: 1.44:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.83:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:25,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:5:6,2:.:-0.83:0.996:. ./.:4:8,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:13,6:.: 1.09:1.000:. ./.:4:5,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:14,4:.: 0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.35:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.57:0.989:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:8,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:12,4:.: 0.57:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:3,4:.:-1.00:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.92:1.000:. -chr5.1 58229780 chr5.1_058229780 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:189,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,83:.:-0.20:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:136,59:.: 0.49:1.000:. ./.:4:128,125:.: 1.69:1.000:. ./.:4:105,102:.: 0.73:1.000:. ./.:4:97,92:.: 0.36:1.000:. ./.:4:155,54:.: 0.78:1.000:. ./.:4:52,8:.:-2.32:1.000:. ./.:4:48,8:.:-2.40:1.000:. ./.:4:83,76:.:-0.26:1.000:. ./.:4:100,108:.: 0.76:1.000:. ./.:4:108,95:.: 0.65:1.000:. ./.:4:135,56:.: 0.40:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:182,61:.: 1.48:0.944:. ./.:4:90,105:.: 0.49:1.000:. ./.:4:197,52:.: 1.61:1.000:. ./.:4:184,50:.: 1.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:100,106:.: 0.71:1.000:. ./.:4:145,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:175,58:.: 1.27:1.000:. ./.:4:168,48:.: 0.92:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:141,115:.: 1.75:1.000:. ./.:4:154,137:.: 2.48:1.000:. ./.:4:134,130:.: 1.92:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:41,10:.:-2.50:1.000:. ./.:4:51,13:.:-2.23:1.000:. ./.:3:54,4:.:-2.36:1.000:. ./.:4:160,61:.: 1.03:1.000:. ./.:4:187,50:.: 1.36:1.000:. ./.:4:139,63:.: 0.63:1.000:. ./.:4:155,39:.: 0.46:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:131,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:131,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:120,31:.:-0.43:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:80,62:.:-0.61:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:228,27:.: 1.73:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:128,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,24:.:-0.82:1.000:. ./.:4:159,49:.: 0.76:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,28:.: 0.49:1.000:. ./.:4:139,45:.: 0.26:1.000:. ./.:4:138,28:.:-0.12:1.000:. ./.:4:88,74:.:-0.20:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:80,73:.:-0.39:1.000:. ./.:6:112,15:.:-0.93:1.000:. ./.:4:106,20:.:-0.95:1.000:. ./.:4:131,34:.:-0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:143,35:.: 0.13:1.000:. ./.:4:147,37:.: 0.26:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,62:.:-0.82:1.000:. ./.:4:117,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:137,52:.: 0.36:0.996:. ./.:4:74,66:.:-0.66:1.000:. ./.:4:96,74:.:-0.03:1.000:. ./.:4:108,42:.:-0.45:1.000:. ./.:4:145,38:.: 0.24:1.000:. ./.:4:92,74:.:-0.12:1.000:. ./.:4:102,28:.:-0.86:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.59:1.000:. ./.:4:69,57:.:-0.95:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:100,63:.:-0.18:1.000:. ./.:4:76,38:.:-1.20:1.000:. ./.:4:128,37:.:-0.14:1.000:. ./.:4:145,27:.: 0.01:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:166,25:.: 0.40:1.000:. ./.:4:139,34:.: 0.03:1.000:. ./.:4:61,20:.:-1.88:1.000:. ./.:4:92,18:.:-1.28:1.000:. ./.:4:112,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:121,29:.:-0.45:1.000:. ./.:4:131,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:79,72:.:-0.43:1.000:. ./.:4:153,30:.: 0.24:1.000:. ./.:4:61,68:.:-0.88:1.000:. ./.:4:151,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:144,32:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,26:.:-1.47:1.000:. ./.:4:118,31:.:-0.47:1.000:. ./.:4:87,54:.:-0.64:1.000:. ./.:4:150,43:.: 0.44:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:78,23:.:-1.47:1.000:. ./.:4:58,50:.:-1.32:1.000:. ./.:4:90,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:100,36:.:-0.74:1.000:. ./.:4:105,108:.: 0.86:1.000:. ./.:4:162,51:.: 0.86:1.000:. ./.:4:131,37:.:-0.07:1.000:. ./.:4:70,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:244,65:.: 2.85:1.000:. ./.:4:106,21:.:-0.93:0.999:. ./.:4:151,85:.: 1.34:1.000:. ./.:4:67,30:.:-1.55:1.000:. ./.:4:68,61:.:-0.88:1.000:. ./.:4:120,43:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,37:.:-0.72:1.000:. ./.:4:114,30:.:-0.57:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:93,31:.:-0.99:1.000:. ./.:4:99,61:.:-0.24:1.000:. ./.:4:104,113:.: 0.94:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:65,56:.:-1.05:1.000:. ./.:4:102,27:.:-0.88:1.000:. ./.:4:105,21:.:-0.95:1.000:. ./.:4:90,27:.:-1.13:1.000:. ./.:4:63,62:.:-0.97:1.000:. ./.:4:118,122:.: 1.42:1.000:. ./.:5:115,32:.:-0.51:0.996:. ./.:4:118,45:.:-0.18:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:192,48:.: 1.42:1.000:. ./.:4:86,81:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,18:.:-1.51:1.000:. ./.:4:45,61:.:-1.36:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:82,23:.:-1.38:1.000:. ./.:4:65,49:.:-1.20:1.000:. ./.:4:146,45:.: 0.40:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:184,58:.: 1.46:1.000:. ./.:4:169,53:.: 1.05:1.000:. ./.:4:100,94:.: 0.46:1.000:. ./.:4:124,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:174,59:.: 1.27:1.000:. ./.:4:76,70:.:-0.53:1.000:. ./.:4:205,50:.: 1.73:1.000:. ./.:4:173,58:.: 1.23:1.000:. ./.:4:58,13:.:-2.09:1.000:. ./.:4:126,37:.:-0.18:1.000:. ./.:4:122,95:.: 0.94:1.000:. ./.:4:115,91:.: 0.71:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:100,113:.: 0.86:1.000:. ./.:4:140,41:.: 0.20:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:136,51:.: 0.32:1.000:. ./.:4:120,51:.:-0.01:1.000:. ./.:4:96,74:.:-0.03:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:162,45:.: 0.73:1.000:. ./.:4:132,94:.: 1.13:1.000:. ./.:4:142,46:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,73:.:-0.34:0.989:. ./.:4:142,37:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,92:.: 0.67:1.000:. ./.:4:128,36:.:-0.16:1.000:. ./.:4:126,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:126,47:.: 0.03:1.000:. ./.:4:233,67:.: 2.67:1.000:. ./.:4:156,52:.: 0.76:1.000:. ./.:4:161,63:.: 1.09:1.000:. ./.:4:194,12:.: 0.71:1.000:. ./.:4:183,44:.: 1.15:1.000:. ./.:4:123,111:.: 1.30:1.000:. ./.:4:174,59:.: 1.27:1.000:. ./.:4:90,99:.: 0.36:1.000:. ./.:4:144,41:.: 0.28:1.000:. -chr5.1 58560998 chr5.1_058560998 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:510,181:.: 1.76:1.000:. ./.:4:307,113:.:-0.71:1.000:. ./.:4:429,35:.:-0.31:1.000:. ./.:4:397,146:.: 0.41:1.000:. ./.:4:455,52:.: 0.09:1.000:. ./.:4:417,23:.:-0.53:1.000:. ./.:4:157,97:.:-2.22:1.000:. ./.:4:371,15:.:-1.02:1.000:. ./.:4:225,133:.:-1.27:1.000:. ./.:4:302,47:.:-1.35:1.000:. ./.:4:225,91:.:-1.66:1.000:. ./.:4:310,129:.:-0.53:1.000:. ./.:4:242,126:.:-1.18:1.000:. ./.:4:385,39:.:-0.67:1.000:. ./.:4:226,141:.:-1.19:1.000:. ./.:4:391,134:.: 0.25:1.000:. ./.:4:393,30:.:-0.68:0.944:. ./.:4:516,22:.: 0.37:1.000:. ./.:4:486,31:.: 0.18:1.000:. ./.:4:607,24:.: 1.22:1.000:. ./.:4:187,231:.:-0.73:1.000:. ./.:4:360,152:.: 0.13:1.000:. ./.:4:447,48:.:-0.02:1.000:. ./.:4:512,26:.: 0.37:1.000:. ./.:4:222,67:.:-1.90:1.000:. ./.:4:255,153:.:-0.82:1.000:. ./.:4:504,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:361,152:.: 0.14:1.000:. ./.:4:461,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:386,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:266,147:.:-0.77:1.000:. ./.:4:339,104:.:-0.50:1.000:. ./.:4:277,78:.:-1.30:1.000:. ./.:4:336,144:.:-0.16:1.000:. ./.:3:194,53:.:-2.29:1.000:. ./.:4:445,19:.:-0.31:1.000:. ./.:4:494,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:260,156:.:-0.74:1.000:. ./.:4:319,184:.: 0.05:1.000:. ./.:4:561,31:.: 0.86:1.000:. ./.:4:574,62:.: 1.26:1.000:. ./.:4:474,50:.: 0.24:1.000:. ./.:4:682,64:.: 2.27:1.000:. ./.:4:516,63:.: 0.74:1.000:. ./.:4:670,99:.: 2.47:1.000:. ./.:4:421,74:.:-0.02:1.000:. ./.:4:578,38:.: 1.08:1.000:. ./.:4:235,165:.:-0.89:1.000:. ./.:4:504,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:319,216:.: 0.34:1.000:. ./.:4:403,243:.: 1.35:1.000:. ./.:4:472,184:.: 1.44:1.000:. ./.:4:342,149:.:-0.06:1.000:. ./.:4:462,180:.: 1.32:1.000:. ./.:4:210,125:.:-1.48:1.000:. ./.:4:298,177:.:-0.21:1.000:. ./.:4:205,142:.:-1.37:1.000:. ./.:4:648,91:.: 2.20:1.000:. ./.:4:352,74:.:-0.65:1.000:. ./.:6:402,213:.: 1.07:1.000:. ./.:4:454,201:.: 1.44:1.000:. ./.:4:455,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:554,117:.: 1.58:1.000:. ./.:4:684,101:.: 2.62:1.000:. ./.:4:432,193:.: 1.16:1.000:. ./.:4:436,166:.: 0.95:1.000:. ./.:4:325,54:.:-1.08:1.000:. ./.:4:383,173:.: 0.53:1.000:. ./.:4:320,198:.: 0.19:0.996:. ./.:4:463,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:316,198:.: 0.15:1.000:. ./.:4:230,149:.:-1.08:1.000:. ./.:4:488,205:.: 1.78:1.000:. ./.:4:390,40:.:-0.62:1.000:. ./.:4:404,194:.: 0.92:1.000:. ./.:4:464,39:.: 0.05:1.000:. ./.:4:291,166:.:-0.37:1.000:. ./.:4:331,220:.: 0.49:1.000:. ./.:4:415,174:.: 0.83:1.000:. ./.:4:379,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:343,170:.: 0.14:1.000:. ./.:4:452,216:.: 1.55:1.000:. ./.:4:467,213:.: 1.66:1.000:. ./.:4:289,123:.:-0.78:1.000:. ./.:4:571,72:.: 1.33:1.000:. ./.:4:463,211:.: 1.61:1.000:. ./.:4:403,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:354,194:.: 0.46:1.000:. ./.:4:557,77:.: 1.24:1.000:. ./.:4:354,150:.: 0.06:1.000:. ./.:4:205,124:.:-1.54:1.000:. ./.:4:271,180:.:-0.42:1.000:. ./.:4:572,86:.: 1.46:1.000:. ./.:4:208,134:.:-1.42:1.000:. ./.:4:529,74:.: 0.96:1.000:. ./.:4:416,74:.:-0.07:1.000:. ./.:4:393,79:.:-0.23:1.000:. ./.:4:253,302:.: 0.52:1.000:. ./.:4:499,83:.: 0.77:1.000:. ./.:4:254,172:.:-0.65:1.000:. ./.:4:367,142:.: 0.10:1.000:. ./.:4:604,81:.: 1.71:1.000:. ./.:4:341,166:.: 0.09:1.000:. ./.:4:304,217:.: 0.21:1.000:. ./.:4:578,94:.: 1.59:1.000:. ./.:4:482,60:.: 0.40:1.000:. ./.:4:236,175:.:-0.79:1.000:. ./.:4:226,116:.:-1.42:1.000:. ./.:4:644,52:.: 1.81:1.000:. ./.:4:385,127:.: 0.13:1.000:. ./.:4:395,86:.:-0.15:1.000:. ./.:4:470,15:.:-0.11:1.000:. ./.:4:445,198:.: 1.33:0.999:. ./.:4:535,71:.: 0.99:1.000:. ./.:4:293,51:.:-1.40:1.000:. ./.:4:466,86:.: 0.50:1.000:. ./.:4:261,173:.:-0.58:1.000:. ./.:4:264,186:.:-0.43:1.000:. ./.:4:512,87:.: 0.92:1.000:. ./.:4:482,65:.: 0.45:1.000:. ./.:4:576,65:.: 1.31:1.000:. ./.:4:293,207:.: 0.02:1.000:. ./.:4:426,79:.: 0.07:1.000:. ./.:4:267,123:.:-0.98:1.000:. ./.:4:404,220:.: 1.15:1.000:. ./.:4:317,186:.: 0.05:1.000:. ./.:4:283,226:.: 0.10:1.000:. ./.:4:365,178:.: 0.41:1.000:. ./.:4:437,41:.:-0.18:1.000:. ./.:4:318,59:.:-1.10:1.000:. ./.:4:406,74:.:-0.16:1.000:. ./.:4:320,25:.:-1.39:1.000:. ./.:5:373,53:.:-0.65:0.996:. ./.:4:518,54:.: 0.68:1.000:. ./.:4:363,144:.: 0.09:1.000:. ./.:4:606,31:.: 1.27:1.000:. ./.:4:269,168:.:-0.55:1.000:. ./.:4:583,73:.: 1.44:1.000:. ./.:4:372,84:.:-0.38:1.000:. ./.:4:524,74:.: 0.92:1.000:. ./.:4:591,78:.: 1.56:1.000:. ./.:4:268,211:.:-0.17:1.000:. ./.:4:357,29:.:-1.02:1.000:. ./.:4:401,169:.: 0.66:1.000:. ./.:4:441,203:.: 1.34:1.000:. ./.:4:314,195:.: 0.10:1.000:. ./.:4:374,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:494,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:291,176:.:-0.28:1.000:. ./.:4:255,163:.:-0.73:1.000:. ./.:4:550,26:.: 0.72:1.000:. ./.:4:250,145:.:-0.94:1.000:. ./.:4:123,173:.:-1.84:1.000:. ./.:4:307,16:.:-1.59:1.000:. ./.:4:379,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:374,33:.:-0.83:1.000:. ./.:4:452,159:.: 1.03:1.000:. ./.:4:394,41:.:-0.57:1.000:. ./.:4:218,122:.:-1.44:1.000:. ./.:4:362,137:.: 0.01:1.000:. ./.:4:296,126:.:-0.69:1.000:. ./.:4:286,21:.:-1.74:1.000:. ./.:4:357,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:406,138:.: 0.42:1.000:. ./.:4:481,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:212,135:.:-1.37:1.000:. ./.:4:279,116:.:-0.94:1.000:. ./.:4:346,128:.:-0.22:0.989:. ./.:4:355,25:.:-1.07:1.000:. ./.:4:181,121:.:-1.78:1.000:. ./.:4:312,115:.:-0.64:1.000:. ./.:4:349,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:378,160:.: 0.37:1.000:. ./.:4:331,143:.:-0.22:1.000:. ./.:4:334,169:.: 0.05:1.000:. ./.:4:415,21:.:-0.56:1.000:. ./.:4:420,134:.: 0.51:1.000:. ./.:4:558,41:.: 0.92:1.000:. ./.:4:233,154:.:-1.01:1.000:. ./.:4:393,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:421,165:.: 0.81:1.000:. ./.:4:440,33:.:-0.22:1.000:. ./.:4:299,181:.:-0.16:1.000:. ./.:4:192,103:.:-1.85:1.000:. ./.:4:400,160:.: 0.57:1.000:. -chr5.1 58642180 chr5.1_058642180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.16:0.944:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:48,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:6:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:0.996:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:35,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:5:14,0:.:-1.23:0.996:. ./.:4:22,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:0.989:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.06:1.000:. -chr5.1 58898149 chr5.1_058898149 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,0:.: 0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-2.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 2.26:0.944:. ./.:4:69,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.13:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:18,0:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,1:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-1.00:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:24,0:.:-1.00:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.: 2.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 1.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 58943715 chr5.1_058943715 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:172,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:200,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.76:0.944:. ./.:4:236,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.72:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:134,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.28:1.000:. ./.:6:96,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.26:0.996:. ./.:4:216,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:172,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:131,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:258,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.59:0.999:. ./.:4:210,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:134,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.24:1.000:. ./.:5:133,0:.:-0.40:0.996:. ./.:4:123,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:84,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:206,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:251,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.47:0.989:. ./.:4:199,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:207,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:253,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.97:1.000:. -chr5.1 59229488 chr5.1_059229488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:428,47:.: 0.23:1.000:. ./.:4:555,43:.: 1.16:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:383,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:431,42:.: 0.21:1.000:. ./.:4:645,45:.: 1.86:1.000:. ./.:4:332,47:.:-0.50:1.000:. ./.:4:441,45:.: 0.31:1.000:. ./.:4:391,93:.: 0.29:1.000:. ./.:4:105,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:97,17:.:-2.51:1.000:. ./.:4:674,44:.: 2.07:1.000:. ./.:4:433,84:.: 0.54:1.000:. ./.:4:538,44:.: 1.04:1.000:. ./.:4:345,79:.:-0.16:1.000:. ./.:4:522,55:.: 1.00:1.000:. ./.:4:520,40:.: 0.87:0.944:. ./.:4:503,56:.: 0.86:1.000:. ./.:4:584,47:.: 1.41:1.000:. ./.:4:475,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,7:.:-2.81:1.000:. ./.:4:373,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:531,51:.: 1.04:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:395,94:.: 0.33:1.000:. ./.:4:465,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:443,44:.: 0.32:1.000:. ./.:4:469,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:496,55:.: 0.80:1.000:. ./.:4:526,97:.: 1.35:1.000:. ./.:4:396,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:123,0:.:-2.44:1.000:. ./.:3:68,3:.:-2.84:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:437,98:.: 0.68:1.000:. ./.:4:345,79:.:-0.16:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:383,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:407,47:.: 0.07:1.000:. ./.:4:484,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:669,113:.: 2.55:1.000:. ./.:4:299,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:350,73:.:-0.17:1.000:. ./.:4:371,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:493,53:.: 0.76:1.000:. ./.:4:335,45:.:-0.49:1.000:. ./.:4:539,57:.: 1.14:1.000:. ./.:4:391,101:.: 0.35:1.000:. ./.:4:336,91:.:-0.14:1.000:. ./.:4:452,95:.: 0.77:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:354,36:.:-0.42:1.000:. ./.:6:314,33:.:-0.74:1.000:. ./.:4:388,38:.:-0.15:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:505,49:.: 0.83:1.000:. ./.:4:327,27:.:-0.69:1.000:. ./.:4:308,22:.:-0.87:1.000:. ./.:4:415,44:.: 0.10:1.000:. ./.:4:366,74:.:-0.04:0.996:. ./.:4:557,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:505,73:.: 1.01:1.000:. ./.:4:214,49:.:-1.38:1.000:. ./.:4:646,36:.: 1.80:1.000:. ./.:4:477,56:.: 0.67:1.000:. ./.:4:603,33:.: 1.45:1.000:. ./.:4:349,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:342,69:.:-0.26:1.000:. ./.:4:404,93:.: 0.39:1.000:. ./.:4:413,47:.: 0.11:1.000:. ./.:4:414,37:.: 0.04:1.000:. ./.:4:493,23:.: 0.54:1.000:. ./.:4:393,42:.:-0.08:1.000:. ./.:4:483,41:.: 0.60:1.000:. ./.:4:360,34:.:-0.39:1.000:. ./.:4:514,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:460,52:.: 0.51:1.000:. ./.:4:267,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:308,34:.:-0.78:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:396,49:.: 0.00:1.000:. ./.:4:299,85:.:-0.46:1.000:. ./.:4:458,62:.: 0.57:1.000:. ./.:4:537,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:337,72:.:-0.27:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:331,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:252,29:.:-1.25:1.000:. ./.:4:461,63:.: 0.60:1.000:. ./.:4:373,38:.:-0.26:1.000:. ./.:4:355,104:.: 0.10:1.000:. ./.:4:193,14:.:-1.81:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:295,22:.:-0.97:1.000:. ./.:4:413,67:.: 0.26:1.000:. ./.:4:343,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:347,74:.:-0.18:1.000:. ./.:4:512,96:.: 1.23:1.000:. ./.:4:592,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:468,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:295,45:.:-0.80:1.000:. ./.:4:551,67:.: 1.31:1.000:. ./.:4:405,37:.:-0.02:0.999:. ./.:4:585,39:.: 1.36:1.000:. ./.:4:322,33:.:-0.68:1.000:. ./.:4:442,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:320,54:.:-0.54:1.000:. ./.:4:326,54:.:-0.49:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:289,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:289,69:.:-0.66:1.000:. ./.:4:387,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:521,92:.: 1.27:1.000:. ./.:4:313,36:.:-0.73:1.000:. ./.:4:404,76:.: 0.26:1.000:. ./.:4:391,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:396,35:.:-0.11:1.000:. ./.:4:262,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:246,22:.:-1.34:1.000:. ./.:4:396,36:.:-0.10:1.000:. ./.:4:446,51:.: 0.39:1.000:. ./.:5:246,11:.:-1.43:0.996:. ./.:4:324,38:.:-0.63:1.000:. ./.:4:301,25:.:-0.90:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:440,70:.: 0.49:1.000:. ./.:4:303,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:282,27:.:-1.03:1.000:. ./.:4:265,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:380,61:.:-0.03:1.000:. ./.:4:365,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:276,25:.:-1.09:1.000:. ./.:4:553,48:.: 1.18:1.000:. ./.:4:423,103:.: 0.61:1.000:. ./.:4:522,50:.: 0.96:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:477,106:.: 1.05:1.000:. ./.:4:437,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:593,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:409,115:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,16:.:-2.78:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:537,36:.: 0.97:1.000:. ./.:4:463,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:440,62:.: 0.43:1.000:. ./.:4:553,39:.: 1.11:1.000:. ./.:4:328,76:.:-0.31:1.000:. ./.:4:411,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:433,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:369,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:400,37:.:-0.06:1.000:. ./.:4:375,47:.:-0.18:1.000:. ./.:4:607,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:504,96:.: 1.17:1.000:. ./.:4:401,40:.:-0.03:1.000:. ./.:4:793,39:.: 2.93:0.989:. ./.:4:341,30:.:-0.56:1.000:. ./.:4:450,74:.: 0.60:1.000:. ./.:4:442,44:.: 0.31:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:375,46:.:-0.18:1.000:. ./.:4:402,42:.:-0.01:1.000:. ./.:4:397,30:.:-0.14:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:616,74:.: 1.86:1.000:. ./.:4:482,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:372,87:.: 0.10:1.000:. ./.:4:481,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:557,47:.: 1.20:1.000:. ./.:4:658,51:.: 2.00:1.000:. ./.:4:451,105:.: 0.84:1.000:. ./.:4:400,73:.: 0.21:1.000:. ./.:4:638,51:.: 1.85:1.000:. -chr5.1 59303635 chr5.1_059303635 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:81,80:0.52: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:187,89:0.38: 2.01:1.000:0.587 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,58:0.46: 0.02:1.000:0.990 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,51:0.30: 1.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:53,58:0.53:-0.42:1.000:0.991 0/0/0/1:4:186,32:0.20: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,38:0.45:-0.65:1.000:0.983 0/0/1/1:4:15,10:0.45:-1.68:1.000:0.983 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,113:0.41: 2.70:1.000:0.844 0/0/1/1:4:94,74:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,34:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,46:0.44:-0.29:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.96:0.944:1.000 0/0/0/1:4:200,88:0.37: 2.18:1.000:0.620 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,47:0.28: 1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,3:0.17:-1.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,66:0.54:-0.27:1.000:0.984 0/0/0/1:4:206,42:0.23: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,24:0.19: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,59:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,53:0.29: 1.38:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,42:0.23: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,29:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,78:0.52: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,45:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/0:4:18,1:0.07:-1.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,6:0.13:-1.12:1.000:0.921 0/1/1:3:1,6:0.69:-1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,47:0.43:-0.23:1.000:0.956 0/0/0/1:4:173,37:0.24: 1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,43:0.46:-0.51:1.000:0.989 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,24:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,14:0.19:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,32:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,77:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,95:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,48:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,87:0.50: 0.80:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,58:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,88:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,15:0.12: 0.48:1.000:0.768 0/0/0/1/1/1:6:73,44:0.43:-0.33:1.000:0.612 0/0/1/1:4:111,83:0.48: 0.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,24:0.18: 0.61:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:139,18:0.16: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,77:0.42: 1.10:1.000:0.897 0/0/1/1:4:69,47:0.46:-0.34:1.000:0.987 0/0/0/1:4:66,7:0.13:-0.98:1.000:0.928 0/0/1/1:4:115,90:0.49: 0.96:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.49:0.996:1.000 0/0/0/1:4:322,68:0.24: 3.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,86:0.48: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,40:0.51:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,62:0.41: 0.51:1.000:0.880 0/0/0/1:4:175,30:0.20: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,71:0.38: 1.15:1.000:0.625 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,60:0.53:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,86:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,59:0.52:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,27:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,89:0.41: 1.61:1.000:0.886 0/0/1/1:4:116,95:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,85:0.50: 0.76:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,18:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,87:0.52: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:132,25:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,68:0.45: 0.48:1.000:0.979 0/0/0/1:4:155,23:0.18: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,68:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,55:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,76:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,39:0.35:-0.08:1.000:0.772 0/0/1/1:4:75,78:0.53: 0.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:140,33:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,104:0.56: 0.60:1.000:0.967 0/0/0/1:4:194,29:0.18: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,52:0.52:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,42:0.52:-0.80:1.000:0.995 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,62:0.51:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,122:0.54: 1.32:1.000:0.988 0/0/0/1:4:91,23:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,51:0.75:-1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,94:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,50:0.33: 0.71:1.000:0.926 0/0/1/1:4:104,70:0.46: 0.51:1.000:0.985 0/0/0/1:4:159,36:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,83:0.51: 0.52:0.999:0.996 0/0/0/1:4:116,22:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,31:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:177,33:0.22: 1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,27:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,51:0.46:-0.21:1.000:0.988 0/0/0/1:4:152,24:0.19: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,107:0.52: 1.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,58:0.53:-0.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:97,72:0.48: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,87:0.52: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,51:0.36: 0.46:1.000:0.702 0/0/0/1:4:108,26:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,31:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,45:0.30: 0.73:1.000:0.982 0/0/0/0/0:5:45,0:0.00:-1.39:0.996:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,57:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:217,46:0.24: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,90:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:176,16:0.11: 0.77:1.000:0.635 0/0/0/1:4:169,33:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,30:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,83:0.47: 0.90:1.000:0.990 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,119:0.53: 1.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:93,76:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,33:0.31:-0.08:1.000:0.973 0/0/1/1:4:81,46:0.42:-0.18:1.000:0.907 0/0/1/1:4:69,71:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,75:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,45:0.34: 0.33:1.000:0.870 0/0/1/1:4:65,42:0.45:-0.48:1.000:0.976 0/0/1/1:4:17,12:0.47:-1.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:120,22:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,26:0.28:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:177,39:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,51:0.42:-0.01:1.000:0.924 0/0/0/1:4:112,30:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,37:0.45:-0.67:1.000:0.977 0/0/1/1:4:68,56:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,79:0.48: 0.68:1.000:0.994 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,24:0.18: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,58:0.54:-0.48:1.000:0.985 0/0/0/1:4:116,41:0.32: 0.26:1.000:0.941 0/0/1/1:4:107,104:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,61:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:191,113:0.43: 2.42:0.989:0.939 0/0/0/0:4:77,1:0.02:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,77:0.47: 0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,61:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,31:0.35:-0.46:1.000:0.806 0/0/1/1:4:56,49:0.51:-0.51:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,58:0.47:-0.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:81,33:0.35:-0.37:1.000:0.786 0/0/1/1:4:101,84:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:175,36:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,61:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,22:0.27:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,96:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,40:0.32: 0.23:1.000:0.950 0/0/1/1:4:75,79:0.53: 0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:69,57:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,113:0.47: 1.95:1.000:0.991 -chr5.1 59469802 chr5.1_059469802 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:216,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.01:0.944:. ./.:4:218,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:375,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.81:1.000:. ./.:3:31,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:347,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.54:1.000:. ./.:6:186,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.38:0.996:. ./.:4:179,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:164,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:417,0:.: 3.11:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:314,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.38:1.000:. ./.:5:152,0:.:-0.72:0.996:. ./.:4:186,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:366,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:443,0:.: 3.49:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.29:0.989:. ./.:4:189,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.13:1.000:. -chr5.1 59627449 chr5.1_059627449 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:256,44:.: 1.14:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:197,37:.: 0.08:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:343,26:.: 2.25:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:94,12:.:-1.98:1.000:. ./.:4:125,3:.:-1.62:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:276,33:.: 1.28:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:188,38:.:-0.05:1.000:. ./.:4:328,32:.: 2.10:0.944:. ./.:4:261,69:.: 1.62:1.000:. ./.:4:380,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:73,13:.:-2.30:1.000:. ./.:4:175,30:.:-0.39:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:84,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:207,33:.: 0.18:1.000:. ./.:4:235,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:288,98:.: 2.52:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:220,29:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,31:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,6:.:-2.34:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.24:1.000:. ./.:3:69,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:308,35:.: 1.83:1.000:. ./.:4:224,45:.: 0.64:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:187,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:187,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:239,51:.: 0.98:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:310,36:.: 1.88:1.000:. ./.:4:108,2:.:-1.91:1.000:. ./.:4:176,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:182,25:.:-0.35:1.000:. ./.:4:208,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:240,32:.: 0.69:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:191,39:.: 0.02:1.000:. ./.:4:222,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:172,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:288,37:.: 1.54:1.000:. ./.:4:180,28:.:-0.34:1.000:. ./.:6:140,19:.:-1.12:1.000:. ./.:4:150,33:.:-0.74:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:165,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:197,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:215,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:199,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:160,31:.:-0.61:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.63:0.996:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:214,28:.: 0.21:1.000:. ./.:4:220,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:340,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:241,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:271,24:.: 1.06:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:197,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:173,35:.:-0.34:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:207,25:.: 0.05:1.000:. ./.:4:215,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:247,28:.: 0.74:1.000:. ./.:4:202,47:.: 0.32:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:211,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:228,24:.: 0.37:1.000:. ./.:4:242,35:.: 0.77:1.000:. ./.:4:151,33:.:-0.72:1.000:. ./.:4:171,34:.:-0.39:1.000:. ./.:4:113,30:.:-1.38:1.000:. ./.:4:233,32:.: 0.58:1.000:. ./.:4:219,27:.: 0.27:1.000:. ./.:4:200,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:294,24:.: 1.43:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:222,26:.: 0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:422,1:.: 3.11:1.000:. ./.:4:131,1:.:-1.56:0.999:. ./.:4:253,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:171,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:206,38:.: 0.24:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:182,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:199,44:.: 0.22:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:269,37:.: 1.24:1.000:. ./.:4:302,41:.: 1.83:1.000:. ./.:4:156,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:164,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:116,23:.:-1.45:1.000:. ./.:4:192,25:.:-0.19:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:163,1:.:-1.04:1.000:. ./.:5:199,0:.:-0.48:0.996:. ./.:4:233,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:136,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:106,27:.:-1.54:1.000:. ./.:4:177,23:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:142,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:145,12:.:-1.16:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:366,54:.: 3.07:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:249,22:.: 0.67:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:252,40:.: 1.01:1.000:. ./.:4:201,41:.: 0.21:1.000:. ./.:4:106,12:.:-1.78:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:208,29:.: 0.13:1.000:. ./.:4:208,41:.: 0.32:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:229,24:.: 0.38:1.000:. ./.:4:265,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:223,35:.: 0.46:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:193,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:192,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:287,30:.: 1.41:1.000:. ./.:4:196,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.80:0.989:. ./.:4:182,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:208,26:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,37:.:-0.74:1.000:. ./.:4:226,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:185,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:212,18:.: 0.02:1.000:. ./.:4:173,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:134,26:.:-1.11:1.000:. ./.:4:249,30:.: 0.80:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:230,27:.: 0.45:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:306,39:.: 1.86:1.000:. ./.:4:161,26:.:-0.68:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.28:1.000:. -chr5.1 59828989 chr5.1_059828989 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:105,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:96,58:.: 1.05:1.000:. ./.:4:115,40:.: 1.08:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:48,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:180,48:.: 2.82:1.000:. ./.:4:44,15:.:-1.21:1.000:. ./.:4:108,24:.: 0.53:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:31,24:.:-1.30:1.000:. ./.:4:27,12:.:-1.69:1.000:. ./.:4:125,60:.: 1.79:1.000:. ./.:4:45,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:104,40:.: 0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:135,23:.: 1.15:1.000:. ./.:4:76,34:.: 0.01:0.944:. ./.:4:126,57:.: 1.74:1.000:. ./.:4:72,30:.:-0.19:1.000:. ./.:4:123,40:.: 1.27:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:76,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:17,8:.:-2.02:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:116,41:.: 1.12:1.000:. ./.:4:106,39:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,36:.: 0.72:1.000:. ./.:4:105,34:.: 0.70:1.000:. ./.:4:97,30:.: 0.41:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:22,5:.:-1.97:1.000:. ./.:4:36,6:.:-1.61:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:87,64:.: 0.98:1.000:. ./.:4:80,30:.: 0.01:1.000:. ./.:4:127,37:.: 1.29:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:102,29:.: 0.51:1.000:. ./.:4:110,45:.: 1.08:1.000:. ./.:4:123,33:.: 1.10:1.000:. ./.:4:120,28:.: 0.91:1.000:. ./.:4:61,57:.: 0.20:1.000:. ./.:4:88,19:.:-0.07:1.000:. ./.:4:61,30:.:-0.45:1.000:. ./.:4:130,30:.: 1.20:1.000:. ./.:4:32,15:.:-1.50:1.000:. ./.:4:72,21:.:-0.40:1.000:. ./.:4:54,13:.:-1.02:1.000:. ./.:4:73,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:127,35:.: 1.24:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:126,27:.: 1.03:1.000:. ./.:4:64,27:.:-0.45:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:76,23:.:-0.26:1.000:. ./.:4:98,29:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,25:.: 0.31:1.000:. ./.:6:73,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:91,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:77,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:85,23:.:-0.04:1.000:. ./.:4:34,27:.:-1.16:1.000:. ./.:4:67,32:.:-0.26:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:27,27:.:-1.33:1.000:. ./.:4:113,23:.: 0.62:1.000:. ./.:4:85,20:.:-0.11:0.996:. ./.:4:82,67:.: 0.93:1.000:. ./.:4:97,26:.: 0.31:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:93,68:.: 1.22:1.000:. ./.:4:42,19:.:-1.16:1.000:. ./.:4:97,61:.: 1.15:1.000:. ./.:4:68,23:.:-0.45:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:82,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:111,34:.: 0.84:1.000:. ./.:4:69,60:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,27:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:71,26:.:-0.30:1.000:. ./.:4:61,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,29:.:-0.54:1.000:. ./.:4:52,20:.:-0.90:1.000:. ./.:4:66,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,20:.:-1.04:1.000:. ./.:4:118,35:.: 1.03:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:93,33:.: 0.39:1.000:. ./.:4:120,62:.: 1.72:1.000:. ./.:4:58,15:.:-0.88:1.000:. ./.:4:99,31:.: 0.48:1.000:. ./.:4:84,21:.:-0.11:1.000:. ./.:4:71,29:.:-0.23:1.000:. ./.:4:111,45:.: 1.10:1.000:. ./.:4:82,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:116,19:.: 0.60:1.000:. ./.:4:78,18:.:-0.33:1.000:. ./.:4:107,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:58,42:.:-0.23:1.000:. ./.:4:107,28:.: 0.60:1.000:. ./.:4:69,19:.:-0.52:1.000:. ./.:4:122,21:.: 0.79:1.000:. ./.:4:122,90:.: 2.43:1.000:. ./.:4:134,33:.: 1.36:1.000:. ./.:4:54,31:.:-0.59:1.000:. ./.:4:112,33:.: 0.84:1.000:. ./.:4:48,26:.:-0.85:0.999:. ./.:4:39,66:.:-0.11:1.000:. ./.:4:64,23:.:-0.54:1.000:. ./.:4:46,26:.:-0.90:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:37,20:.:-1.26:1.000:. ./.:4:136,58:.: 2.01:1.000:. ./.:4:79,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:80,27:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:98,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:94,37:.: 0.51:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:72,29:.:-0.21:1.000:. ./.:4:61,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:86,53:.: 0.70:1.000:. ./.:4:46,18:.:-1.09:1.000:. ./.:4:66,22:.:-0.52:1.000:. ./.:4:61,45:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,42:.:-0.38:1.000:. ./.:5:63,20:.:-0.64:0.996:. ./.:4:84,29:.: 0.08:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:59,36:.:-0.35:1.000:. ./.:4:83,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:107,15:.: 0.29:1.000:. ./.:4:65,27:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,24:.:-0.61:1.000:. ./.:4:80,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,23:.:-1.02:1.000:. ./.:4:45,37:.:-0.66:1.000:. ./.:4:66,17:.:-0.64:1.000:. ./.:4:58,29:.:-0.54:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:82,74:.: 1.10:1.000:. ./.:4:107,57:.: 1.29:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:40,29:.:-0.97:1.000:. ./.:4:166,92:.: 3.53:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:74,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:92,54:.: 0.86:1.000:. ./.:4:72,28:.:-0.23:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:57,67:.: 0.34:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:76,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:100,27:.: 0.41:1.000:. ./.:4:51,29:.:-0.71:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:113,56:.: 1.41:1.000:. ./.:4:140,28:.: 1.39:1.000:. ./.:4:138,35:.: 1.51:1.000:. ./.:4:120,102:.: 2.67:0.989:. ./.:4:46,30:.:-0.80:1.000:. ./.:4:78,20:.:-0.28:1.000:. ./.:4:94,28:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,53:.: 0.98:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:97,34:.: 0.51:1.000:. ./.:4:63,17:.:-0.71:1.000:. ./.:4:94,58:.: 1.01:1.000:. ./.:4:98,46:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,46:.: 0.08:1.000:. ./.:4:54,41:.:-0.35:1.000:. ./.:4:102,81:.: 1.74:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:90,26:.: 0.15:1.000:. ./.:4:104,72:.: 1.58:1.000:. -chr5.1 60024499 chr5.1_060024499 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:48,169:0.79: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,115:0.78:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,145:0.81:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,86:0.46: 0.30:1.000:0.988 0/1/1/1:4:77,189:0.72: 2.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,151:0.77: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,64:0.43:-0.82:1.000:0.948 0/1/1/1:4:45,161:0.79: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,83:0.54:-0.70:1.000:0.990 0/1/1/1:4:40,76:0.67:-1.94:1.000:0.899 0/1/1/1:4:24,70:0.75:-2.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,120:0.73:-0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:129,50:0.30:-0.08:1.000:0.983 0/1/1/1:4:52,154:0.76: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,77:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,105:0.55: 0.36:1.000:0.978 0/1/1/1:4:50,147:0.76: 0.45:0.944:1.000 0/1/1/1:4:59,138:0.71: 0.45:1.000:0.992 0/1/1/1:4:79,158:0.68: 1.63:1.000:0.944 0/1/1/1:4:56,144:0.73: 0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,37:0.42:-2.68:1.000:0.923 0/0/1/1:4:94,90:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,50:0.26: 0.81:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,182:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,58:0.77:-3.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,96:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,154:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,143:0.81:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,155:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,151:0.74: 0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:158,44:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,69:0.46:-0.79:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-3.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,133:0.98:-1.35:1.000:1.000 1/1/1:3:5,61:0.93:-3.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,201:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,116:0.73:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,84:0.53:-0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:179,46:0.23: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,140:0.72: 0.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,154:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,125:0.73:-0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,174:0.77: 1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,147:0.81: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,154:0.70: 1.19:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,225:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,53:0.47:-1.91:1.000:0.991 0/1/1/1:4:55,122:0.70:-0.14:1.000:0.984 0/0/0/1:4:166,43:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,112:0.73:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,88:0.43: 0.86:1.000:0.952 0/0/1/1:4:87,85:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,109:0.56: 0.54:1.000:0.974 0/0/1/1:4:103,84:0.46: 0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:108,87:0.46: 0.39:1.000:0.987 0/0/0/1:4:127,42:0.27:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,149:0.69: 1.07:1.000:0.978 0/0/1/1:4:75,88:0.55:-0.55:1.000:0.979 0/0/0/1/1/1:6:76,83:0.53:-0.67:1.000:0.829 0/0/1/1:4:81,89:0.53:-0.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:35,136:0.80:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,95:0.64:-0.88:1.000:0.630 0/1/1/1:4:64,143:0.70: 0.75:1.000:0.986 0/0/1/1:4:114,119:0.52: 1.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,138:0.69: 0.60:1.000:0.978 0/1/1/1:4:39,99:0.73:-1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,74:0.44:-0.29:1.000:0.974 0/0/1/1:4:109,95:0.48: 0.66:0.996:0.994 1/1/1/1:4:0,172:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,58:0.28: 1.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,60:0.39:-0.61:1.000:0.696 0/1/1/1:4:64,185:0.75: 1.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,91:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,151:0.82: 0.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,105:0.49: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,106:0.55: 0.48:1.000:0.983 0/1/1/1:4:58,154:0.74: 0.89:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,171:0.74: 1.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,119:0.78:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,98:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,107:0.48: 1.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,66:0.48:-1.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,167:0.77: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,157:0.80: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,99:0.82:-1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,77:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,144:0.79: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,139:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,92:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,74:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,145:0.72: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,76:0.53:-1.09:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,235:1.00: 1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,154:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,135:0.79:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,96:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,129:0.78:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,111:0.57: 0.54:1.000:0.957 0/0/1/1:4:61,71:0.55:-1.47:1.000:0.981 0/1/1/1:4:58,180:0.77: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,79:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,91:0.46: 0.63:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,122:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,95:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,91:0.51: 0.01:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,114:0.77:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,90:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,161:0.71: 1.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,99:0.55: 0.07:0.999:0.981 0/0/1/1:4:88,117:0.58: 0.69:1.000:0.909 0/1/1/1:4:39,104:0.74:-1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,96:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,69:0.45:-0.67:1.000:0.978 0/0/1/1:4:95,90:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,145:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,109:0.75:-1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,146:0.77: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,84:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,150:0.72: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,81:0.47:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:96,100:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,120:0.54: 1.34:1.000:0.988 0/0/0/1:4:153,44:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,105:0.71:-0.97:1.000:0.994 0/1/1/1:4:49,127:0.73:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:54,110:0.68:-0.52:1.000:0.955 0/1/1/1:4:50,92:0.66:-1.17:1.000:0.855 0/0/1/1:4:89,88:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:30,124:0.81:-0.82:0.996:0.998 0/1/1/1:4:27,143:0.85:-0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:88,67:0.45:-0.79:1.000:0.976 0/1/1/1:4:61,176:0.75: 1.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,94:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,105:0.77:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,123:0.78:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,126:0.69: 0.13:1.000:0.969 0/0/1/1:4:96,105:0.53: 0.57:1.000:0.991 0/0/1/1:4:81,84:0.52:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:80,78:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,132:0.57: 1.66:1.000:0.958 0/0/1/1:4:102,100:0.51: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,146:0.70: 0.92:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,93:0.47: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,92:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,159:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,41:0.26:-0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,75:0.51:-0.91:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,106:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,89:0.44: 0.78:1.000:0.971 0/0/1/1:4:112,103:0.49: 0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,170:0.78: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,40:0.30:-1.12:1.000:0.984 0/0/1/1:4:92,86:0.49:-0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,99:0.65:-0.79:1.000:0.781 0/1/1/1:4:42,97:0.71:-1.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,96:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,79:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,164:0.78: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,103:0.57: 0.04:1.000:0.938 0/0/1/1:4:97,94:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,129:0.74:-0.17:0.989:0.999 0/0/1/1:4:83,71:0.47:-0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,95:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,77:0.54:-1.06:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,79:0.45:-0.05:1.000:0.982 0/1/1/1:4:30,119:0.81:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,102:0.54: 0.30:1.000:0.986 0/1/1/1:4:49,110:0.70:-0.67:1.000:0.986 0/0/1/1:4:125,116:0.49: 1.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,159:0.71: 1.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:105,45:0.32:-0.94:1.000:0.948 0/1/1/1:4:29,119:0.81:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,92:0.47: 0.57:1.000:0.992 0/1/1/1:4:59,153:0.73: 0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:113,112:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:142,45:0.27: 0.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,136:0.76:-0.05:1.000:1.000 -chr5.1 60095990 chr5.1_060095990 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:74,60:0.43: 0.99:1.000:0.958 0/1/1/1:4:29,82:0.72: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:91,33:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,29:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,69:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,80:0.53: 1.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:37,28:0.42:-1.29:1.000:0.906 0/0/1/1:4:64,60:0.47: 0.66:1.000:0.992 0/0/1/1:4:58,50:0.45: 0.13:1.000:0.980 0/0/0/0:4:11,1:0.08:-3.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:12,9:0.42:-2.74:1.000:0.896 0/1/1/1:4:41,101:0.69: 1.25:1.000:0.976 0/0/0/1:4:83,21:0.19: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,97:0.83: 0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,50:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,74:0.53: 1.09:0.944:0.994 0/1/1/1:4:34,109:0.74: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,95:0.56: 2.05:1.000:0.972 0/0/1/1:4:70,67:0.48: 1.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:8,2:0.19:-3.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,33:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:110,49:0.30: 1.81:1.000:0.988 0/1/1/1:4:39,79:0.65: 0.46:1.000:0.805 0/0/1/1:4:7,12:0.61:-2.81:1.000:0.637 0/0/1/1:4:67,52:0.42: 0.49:1.000:0.930 0/0/1/1:4:61,53:0.45: 0.33:1.000:0.982 0/0/0/1:4:73,36:0.32: 0.16:1.000:0.957 0/1/1/1:4:28,115:0.79: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,72:0.56: 0.69:1.000:0.966 0/0/0/1:4:96,34:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,19:0.17: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,10:0.69:-2.97:1.000:0.980 0/1/1/1:4:3,14:0.81:-2.87:1.000:1.000 0/1/1:3:3,5:0.61:-3.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,68:0.54: 0.59:1.000:0.986 0/0/1/1:4:52,41:0.43:-0.36:1.000:0.942 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,28:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,36:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,30:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,32:0.33:-0.33:1.000:0.926 0/0/0/1:4:84,24:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,42:0.48:-0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:84,13:0.13:-0.23:1.000:0.894 0/0/1/1:4:45,59:0.55: 0.00:1.000:0.978 0/0/1/1:4:67,85:0.54: 1.58:1.000:0.985 0/0/0/1:4:43,8:0.15:-1.75:1.000:0.988 0/0/0/1:4:56,14:0.19:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,41:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:105,43:0.28: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,45:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,42:0.37: 0.16:1.000:0.521 0/0/0/1:4:87,20:0.18: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,25:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,31:0.28: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,21:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,41:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:51,24:0.31:-0.96:1.000:0.897 0/0/0/1:4:74,24:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,40:0.37: 0.00:1.000:0.531 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,74:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,31:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,55:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,53:0.57:-0.46:1.000:0.938 0/0/0/1:4:78,29:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.40:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,28:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,35:0.53:-1.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:64,20:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,51:0.47: 0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:54,42:0.42:-0.27:1.000:0.931 0/0/1/1:4:56,42:0.42:-0.20:1.000:0.896 0/0/1/1:4:33,43:0.55:-0.93:1.000:0.979 0/0/0/1:4:81,33:0.28: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,54:0.43: 0.56:1.000:0.955 0/0/1/1:4:61,68:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,30:0.40:-1.02:1.000:0.778 0/0/0/1:4:74,26:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,28:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,25:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,64:0.53: 0.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:19,55:0.72:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,46:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,81:0.77:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,60:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,50:0.61:-0.79:1.000:0.711 0/0/1/1:4:54,57:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,37:0.30: 0.53:1.000:0.988 0/0/0/1:4:68,13:0.15:-0.76:1.000:0.991 0/1/1/1:4:34,101:0.73: 1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,27:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,22:0.26:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,25:0.30:-0.79:1.000:0.984 0/1/1/1:4:23,77:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,26:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,32:0.53:-1.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:80,34:0.29: 0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,29:0.35:-0.79:1.000:0.787 0/0/0/1:4:64,27:0.29:-0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,35:0.52:-1.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:61,25:0.28:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,33:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,68:0.46: 1.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:57,62:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,49:0.46:-0.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,35:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,55:0.56:-0.27:0.999:0.971 0/0/0/1:4:98,32:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,46:0.47:-0.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:40,40:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,20:0.32:-1.45:1.000:0.949 0/0/0/1:4:52,18:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,28:0.28:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,15:0.19:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,25:0.28:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,51:0.54:-0.40:1.000:0.988 0/1/1/1:4:34,67:0.65:-0.10:1.000:0.749 0/0/1/1:4:72,63:0.45: 1.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:58,50:0.45: 0.13:1.000:0.980 0/0/0/1:4:57,32:0.35:-0.50:1.000:0.813 0/0/0/1:4:87,38:0.29: 0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,37:0.51:-1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,69:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,43:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,22:0.26:-0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,65:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:44,47:0.50:-0.43:0.996:0.529 0/0/0/1:4:54,15:0.21:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,128:0.75: 2.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,35:0.26: 0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,45:0.47:-0.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:21,59:0.72:-0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,34:0.40:-0.73:1.000:0.809 0/0/0/1:4:62,23:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,40:0.40:-0.23:1.000:0.790 0/0/0/1:4:92,24:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,18:0.21:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,65:0.48: 0.96:1.000:0.994 0/0/0/1:4:114,29:0.19: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,27:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,56:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,29:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,55:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,45:0.29: 1.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:100,30:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.21:-2.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,72:0.69:-0.10:1.000:0.978 0/0/0/1:4:77,30:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,67:0.49: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,39:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,69:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,29:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,69:0.47: 1.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,59:0.47: 0.59:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,24:0.25:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,58:0.47: 0.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,61:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,67:0.47: 1.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:88,24:0.21: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,34:0.29: 0.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,81:0.54: 1.35:0.989:0.985 0/0/0/1:4:84,23:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,27:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,56:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,55:0.63:-0.63:1.000:0.559 0/0/1/1:4:47,71:0.59: 0.46:1.000:0.888 0/0/0/1:4:74,25:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,40:0.41:-0.33:1.000:0.881 0/0/0/1:4:78,33:0.29: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,73:0.51: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,72:0.52: 0.99:1.000:0.994 0/0/0/1:4:81,31:0.27: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,60:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,74:0.52: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,45:0.25: 2.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,39:0.24: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,18:0.20:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,54:0.53:-0.17:1.000:0.992 -chr5.1 60344770 chr5.1_060344770 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:45,45:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,52:0.78:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,45:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,67:0.67: 0.93:1.000:0.939 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,54:0.53: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,43:0.54: 0.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:41,45:0.52: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,20:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,15:0.88:-2.30:1.000:0.846 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-2.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,47:0.72:-0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,64:0.73: 0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,26:0.26: 1.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:63,22:0.26: 0.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,62:0.73: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.97:0.944:1.000 0/0/1/1:4:58,54:0.49: 1.48:1.000:0.996 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 2.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,82:0.78: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.58:-1.54:1.000:0.909 0/1/1/1:4:17,61:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,46:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,51:0.54: 0.77:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,6:0.40:-2.38:1.000:0.827 0/0/0/1:4:77,33:0.31: 1.40:1.000:0.979 0/1/1/1:4:26,63:0.70: 0.57:1.000:0.983 0/0/1/1:4:47,43:0.48: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,23:0.23: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,49:0.47: 1.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:32,71:0.68: 1.13:1.000:0.954 0/1/1/1:4:29,60:0.67: 0.57:1.000:0.903 1/1/1/1:4:2,20:0.90:-2.10:1.000:0.872 0/1/1/1:4:6,25:0.79:-1.74:1.000:1.000 0/1/1:3:3,15:0.82:-2.26:1.000:0.983 0/0/1/1:4:44,40:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,73:0.67: 1.28:1.000:0.934 0/0/1/1:4:46,47:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,55:0.63: 0.45:1.000:0.610 0/0/1/1:4:47,54:0.54: 1.05:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,41:0.66:-0.55:1.000:0.893 0/0/1/1:4:39,37:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,41:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,34:0.61:-0.79:1.000:0.649 0/0/1/1:4:38,30:0.45:-0.27:1.000:0.974 0/0/1/1:4:34,32:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:68,22:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,10:0.59:-2.30:1.000:0.888 0/0/1/1:4:40,40:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,19:0.52:-1.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,46:0.78:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,32:0.60:-0.86:1.000:0.789 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,20:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,44:0.53: 0.37:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,41:0.73:-0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,36:0.47: 0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:37,36:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1/1/1:6:6,41:0.86:-1.10:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,54:0.74:-0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,41:0.69:-0.63:1.000:0.966 0/1/1/1:4:25,44:0.63:-0.23:1.000:0.588 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,34:0.52:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,11:0.21:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,64:0.84: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,34:0.45: 0.05:0.996:0.981 0/0/1/1:4:42,39:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,67:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,17:0.29:-0.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,43:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,35:0.39: 0.69:1.000:0.634 0/0/1/1:4:23,26:0.53:-1.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:34,18:0.35:-0.90:1.000:0.782 0/0/1/1:4:43,30:0.42:-0.07:1.000:0.893 0/1/1/1:4:17,34:0.66:-0.94:1.000:0.863 0/0/1/1:4:39,28:0.42:-0.31:1.000:0.922 0/0/1/1:4:37,39:0.52: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,32:0.72:-1.22:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,60:0.98:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,51:0.86:-0.63:1.000:0.977 0/1/1/1:4:16,30:0.65:-1.14:1.000:0.748 0/1/1/1:4:10,50:0.82:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,24:0.56:-1.26:1.000:0.971 0/1/1/1:4:14,52:0.78:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,27:0.53:-0.94:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,64:0.86:-0.03:1.000:0.976 0/0/0/1:4:47,14:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,30:0.55:-0.79:1.000:0.984 0/1/1/1:4:19,50:0.71:-0.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,48:0.69:-0.23:1.000:0.967 0/0/1/1:4:25,24:0.49:-1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,22:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:41,15:0.27:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,53:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,22:0.32:-0.19:1.000:0.955 0/0/1/1:4:43,34:0.45: 0.09:1.000:0.975 0/0/1/1:4:31,30:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,29:0.43:-0.27:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,41:0.65:-0.51:1.000:0.826 0/0/1/1:4:29,40:0.58:-0.23:1.000:0.923 0/0/1/1:4:23,34:0.59:-0.71:1.000:0.842 0/0/1/1:4:24,18:0.43:-1.30:1.000:0.953 0/1/1/1:4:26,74:0.73: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,59:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,46:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,22:0.42:-0.86:1.000:0.912 0/0/0/1:4:111,44:0.29: 3.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,46:0.78:-0.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:45,41:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,8:0.30:-1.90:1.000:0.983 0/0/1/1:4:36,25:0.41:-0.55:1.000:0.887 0/0/0/1:4:31,11:0.27:-1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,25:0.34: 0.01:1.000:0.878 0/1/1/1:4:8,50:0.85:-0.67:1.000:0.982 0/0/1/1:4:36,28:0.44:-0.43:1.000:0.970 0/0/1/1:4:40,49:0.55: 0.57:1.000:0.979 0/0/0/0:4:44,5:0.10:-1.02:1.000:0.683 0/0/0/1:4:59,22:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,56:0.53: 1.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:32,28:0.47:-0.59:1.000:0.992 0/1/1/1:4:25,53:0.67: 0.13:1.000:0.925 0/1/1/1:4:15,57:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,34:0.58:-0.67:1.000:0.897 0/0/1/1:4:24,21:0.47:-1.18:1.000:0.992 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,27:0.45:-0.59:1.000:0.983 0/0/1/1:4:44,56:0.56: 1.01:1.000:0.968 0/0/0/0/1:5:36,11:0.24:-1.10:0.996:0.957 0/0/0/1:4:44,17:0.28:-0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,36:0.74:-1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,59:0.58: 1.05:1.000:0.906 0/1/1/1:4:18,53:0.73:-0.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,47:0.70:-0.35:1.000:0.986 0/0/0/1:4:31,6:0.17:-1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,10:0.25:-1.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,63:0.77: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.52:-1.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,21:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,25:0.56:-1.18:1.000:0.974 0/1/1/1:4:27,97:0.77: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,57:0.46: 1.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:39,52:0.57: 0.65:1.000:0.947 0/0/1/1:4:30,41:0.58:-0.15:1.000:0.930 0/0/1/1:4:45,49:0.52: 0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,36:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/1/1/1:4:20,91:0.81: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,49:0.52: 0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,3:0.26:-2.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,35:0.43: 0.29:1.000:0.949 0/0/1/1:4:39,36:0.48: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,37:0.39: 0.85:1.000:0.692 0/1/1/1:4:37,74:0.66: 1.44:1.000:0.863 0/0/0/1:4:74,23:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,37:0.46: 0.29:1.000:0.984 0/0/1/1:4:38,53:0.58: 0.65:1.000:0.913 0/1/1/1:4:24,63:0.71: 0.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:60,24:0.29: 0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:47,37:0.44: 0.37:1.000:0.974 0/0/1/1:4:34,52:0.60: 0.45:1.000:0.782 0/0/1/1:4:25,17:0.41:-1.30:1.000:0.859 0/1/1/1:4:25,70:0.72: 0.81:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,74:0.73: 0.97:0.989:0.998 0/0/0/1:4:66,28:0.30: 0.77:1.000:0.982 0/1/1/1:4:27,67:0.70: 0.77:1.000:0.987 0/1/1/1:4:16,54:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,41:0.57:-0.11:1.000:0.951 0/0/1/1:4:31,40:0.56:-0.15:1.000:0.963 0/0/1/1:4:28,41:0.59:-0.23:1.000:0.856 0/1/1/1:4:12,53:0.80:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,47:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,86:0.75: 1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,74:0.69: 1.20:1.000:0.980 0/0/1/1:4:62,39:0.39: 1.05:1.000:0.700 0/0/1/1:4:72,43:0.38: 1.60:1.000:0.552 0/1/1/1:4:22,69:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,52:0.46: 1.52:1.000:0.990 0/0/1/1:4:76,83:0.52: 3.35:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,68:0.67: 1.05:1.000:0.899 0/0/1/1:4:45,40:0.47: 0.41:1.000:0.994 -chr5.1 60502787 chr5.1_060502787 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:262,243:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,405:.:-0.74:1.000:. ./.:4:123,335:.:-0.13:1.000:. ./.:4:124,325:.:-0.23:1.000:. ./.:4:279,265:.: 0.85:1.000:. ./.:4:314,270:.: 1.31:1.000:. ./.:4:191,166:.:-1.29:1.000:. ./.:4:220,229:.:-0.23:1.000:. ./.:4:219,226:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,266:.:-2.05:1.000:. ./.:4:105,139:.:-2.58:1.000:. ./.:4:0,406:.:-0.73:1.000:. ./.:4:120,348:.:-0.02:1.000:. ./.:4:261,269:.: 0.69:1.000:. ./.:4:237,202:.:-0.35:1.000:. ./.:4:122,348:.: 0.01:1.000:. ./.:4:269,248:.: 0.54:0.944:. ./.:4:119,356:.: 0.06:1.000:. ./.:4:314,274:.: 1.35:1.000:. ./.:4:146,378:.: 0.62:1.000:. ./.:4:47,216:.:-2.36:1.000:. ./.:4:156,338:.: 0.28:1.000:. ./.:4:151,448:.: 1.48:1.000:. ./.:4:246,243:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,135:.:-3.49:1.000:. ./.:4:283,280:.: 1.07:1.000:. ./.:4:109,329:.:-0.36:1.000:. ./.:4:227,228:.:-0.17:1.000:. ./.:4:302,245:.: 0.89:1.000:. ./.:4:251,280:.: 0.70:1.000:. ./.:4:143,367:.: 0.46:1.000:. ./.:4:97,295:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,143:.:-3.33:1.000:. ./.:4:88,220:.:-1.85:1.000:. ./.:3:63,103:.:-3.47:1.000:. ./.:4:240,223:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,387:.: 0.59:1.000:. ./.:4:235,227:.:-0.09:1.000:. ./.:4:136,376:.: 0.49:1.000:. ./.:4:143,326:.:-0.01:1.000:. ./.:4:126,393:.: 0.57:1.000:. ./.:4:130,404:.: 0.74:1.000:. ./.:4:170,438:.: 1.58:1.000:. ./.:4:236,233:.:-0.01:1.000:. ./.:4:121,457:.: 1.24:1.000:. ./.:4:257,270:.: 0.66:1.000:. ./.:4:296,298:.: 1.42:1.000:. ./.:4:389,480:.: 4.57:1.000:. ./.:4:109,355:.:-0.06:1.000:. ./.:4:113,413:.: 0.65:1.000:. ./.:4:227,218:.:-0.28:1.000:. ./.:4:137,404:.: 0.82:1.000:. ./.:4:92,303:.:-0.85:1.000:. ./.:4:133,425:.: 1.01:1.000:. ./.:4:227,188:.:-0.62:1.000:. ./.:4:264,231:.: 0.29:1.000:. ./.:4:115,343:.:-0.13:1.000:. ./.:4:113,398:.: 0.47:1.000:. ./.:4:105,379:.: 0.17:1.000:. ./.:6:98,322:.:-0.57:1.000:. ./.:4:142,349:.: 0.25:1.000:. ./.:4:104,329:.:-0.42:1.000:. ./.:4:150,284:.:-0.41:1.000:. ./.:4:101,341:.:-0.32:1.000:. ./.:4:134,400:.: 0.74:1.000:. ./.:4:234,235:.:-0.01:1.000:. ./.:4:192,204:.:-0.84:1.000:. ./.:4:120,365:.: 0.18:1.000:. ./.:4:230,268:.: 0.33:0.996:. ./.:4:1,435:.:-0.38:1.000:. ./.:4:154,436:.: 1.38:1.000:. ./.:4:195,208:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,580:.: 1.26:1.000:. ./.:4:135,340:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,544:.: 0.85:1.000:. ./.:4:250,270:.: 0.58:1.000:. ./.:4:222,266:.: 0.21:1.000:. ./.:4:265,281:.: 0.87:1.000:. ./.:4:208,218:.:-0.50:1.000:. ./.:4:258,264:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,402:.:-0.77:1.000:. ./.:4:111,401:.: 0.49:1.000:. ./.:4:157,463:.: 1.72:1.000:. ./.:4:85,271:.:-1.30:1.000:. ./.:4:126,439:.: 1.09:1.000:. ./.:4:258,270:.: 0.67:1.000:. ./.:4:95,302:.:-0.83:1.000:. ./.:4:105,292:.:-0.83:1.000:. ./.:4:113,309:.:-0.54:1.000:. ./.:4:220,236:.:-0.15:1.000:. ./.:4:199,196:.:-0.85:1.000:. ./.:4:225,228:.:-0.19:1.000:. ./.:4:132,422:.: 0.97:1.000:. ./.:4:193,182:.:-1.08:1.000:. ./.:4:275,220:.: 0.29:1.000:. ./.:4:274,273:.: 0.89:1.000:. ./.:4:196,242:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,420:.:-0.57:1.000:. ./.:4:259,257:.: 0.53:1.000:. ./.:4:245,251:.: 0.30:1.000:. ./.:4:110,326:.:-0.38:1.000:. ./.:4:148,388:.: 0.76:1.000:. ./.:4:94,278:.:-1.12:1.000:. ./.:4:220,226:.:-0.27:1.000:. ./.:4:182,201:.:-0.99:1.000:. ./.:4:119,305:.:-0.52:1.000:. ./.:4:208,189:.:-0.83:1.000:. ./.:4:244,204:.:-0.25:1.000:. ./.:4:283,299:.: 1.29:1.000:. ./.:4:258,228:.: 0.19:1.000:. ./.:4:111,345:.:-0.15:1.000:. ./.:4:276,307:.: 1.30:1.000:. ./.:4:126,345:.: 0.02:0.999:. ./.:4:130,467:.: 1.46:1.000:. ./.:4:172,223:.:-0.85:1.000:. ./.:4:140,418:.: 1.01:1.000:. ./.:4:241,218:.:-0.12:1.000:. ./.:4:223,228:.:-0.21:1.000:. ./.:4:115,343:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,344:.:-0.20:1.000:. ./.:4:127,381:.: 0.44:1.000:. ./.:4:209,216:.:-0.51:1.000:. ./.:4:228,276:.: 0.39:1.000:. ./.:4:268,273:.: 0.82:1.000:. ./.:4:129,350:.: 0.11:1.000:. ./.:4:165,431:.: 1.45:1.000:. ./.:4:137,351:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,415:.:-0.62:1.000:. ./.:4:93,292:.:-0.97:1.000:. ./.:4:197,183:.:-1.02:1.000:. ./.:4:238,227:.:-0.05:1.000:. ./.:4:113,311:.:-0.52:1.000:. ./.:5:227,147:.:-1.09:0.996:. ./.:4:206,252:.:-0.13:1.000:. ./.:4:103,296:.:-0.81:1.000:. ./.:4:156,474:.: 1.83:1.000:. ./.:4:269,280:.: 0.91:1.000:. ./.:4:117,319:.:-0.38:1.000:. ./.:4:210,213:.:-0.53:1.000:. ./.:4:223,260:.: 0.15:1.000:. ./.:4:130,387:.: 0.54:1.000:. ./.:4:245,220:.:-0.05:1.000:. ./.:4:131,336:.:-0.03:1.000:. ./.:4:84,301:.:-0.97:1.000:. ./.:4:151,407:.: 1.01:1.000:. ./.:4:328,332:.: 2.18:1.000:. ./.:4:256,201:.:-0.14:1.000:. ./.:4:206,216:.:-0.54:1.000:. ./.:4:297,248:.: 0.86:1.000:. ./.:4:223,169:.:-0.89:1.000:. ./.:4:145,411:.: 0.99:1.000:. ./.:4:87,351:.:-0.36:1.000:. ./.:4:101,165:.:-2.33:1.000:. ./.:4:155,162:.:-1.74:1.000:. ./.:4:137,394:.: 0.70:1.000:. ./.:4:128,363:.: 0.25:1.000:. ./.:4:163,443:.: 1.56:1.000:. ./.:4:236,287:.: 0.61:1.000:. ./.:4:100,311:.:-0.67:1.000:. ./.:4:130,380:.: 0.46:1.000:. ./.:4:208,223:.:-0.44:1.000:. ./.:4:202,211:.:-0.65:1.000:. ./.:4:116,312:.:-0.48:1.000:. ./.:4:127,348:.: 0.06:1.000:. ./.:4:124,338:.:-0.09:1.000:. ./.:4:242,228:.: 0.01:1.000:. ./.:4:110,325:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,431:.:-0.43:0.989:. ./.:4:133,331:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:112,311:.:-0.53:1.000:. ./.:4:201,172:.:-1.10:1.000:. ./.:4:117,339:.:-0.15:1.000:. ./.:4:230,224:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,311:.:-0.67:1.000:. ./.:4:111,249:.:-1.25:1.000:. ./.:4:157,398:.: 0.98:1.000:. ./.:4:122,366:.: 0.21:1.000:. ./.:4:125,349:.: 0.05:1.000:. ./.:4:97,338:.:-0.40:1.000:. ./.:4:121,352:.: 0.04:1.000:. ./.:4:292,341:.: 1.87:1.000:. ./.:4:308,291:.: 1.48:1.000:. ./.:4:93,296:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,515:.: 0.52:1.000:. -chr5.1 60690277 chr5.1_060690277 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:458,101:.:-0.32:1.000:. ./.:4:474,107:.:-0.23:1.000:. ./.:4:613,115:.: 0.42:1.000:. ./.:4:556,131:.: 0.24:1.000:. ./.:4:517,113:.:-0.01:1.000:. ./.:4:574,97:.: 0.17:1.000:. ./.:4:218,32:.:-1.69:1.000:. ./.:4:733,154:.: 1.12:1.000:. ./.:4:345,61:.:-1.00:1.000:. ./.:4:306,35:.:-1.29:1.000:. ./.:4:289,34:.:-1.37:1.000:. ./.:4:561,130:.: 0.26:1.000:. ./.:4:515,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:640,127:.: 0.59:1.000:. ./.:4:370,70:.:-0.85:1.000:. ./.:4:477,114:.:-0.18:1.000:. ./.:4:457,97:.:-0.35:0.944:. ./.:4:737,186:.: 1.28:1.000:. ./.:4:617,105:.: 0.39:1.000:. ./.:4:974,186:.: 2.33:1.000:. ./.:4:326,55:.:-1.11:1.000:. ./.:4:597,131:.: 0.42:1.000:. ./.:4:716,146:.: 1.01:1.000:. ./.:4:560,117:.: 0.20:1.000:. ./.:4:218,40:.:-1.65:1.000:. ./.:4:387,63:.:-0.81:1.000:. ./.:4:630,126:.: 0.54:1.000:. ./.:4:329,79:.:-0.99:1.000:. ./.:4:699,166:.: 1.03:1.000:. ./.:4:713,128:.: 0.92:1.000:. ./.:4:303,61:.:-1.18:1.000:. ./.:4:424,118:.:-0.40:1.000:. ./.:4:257,38:.:-1.49:1.000:. ./.:4:321,69:.:-1.07:1.000:. ./.:3:105,23:.:-2.23:1.000:. ./.:4:359,92:.:-0.80:1.000:. ./.:4:718,168:.: 1.12:1.000:. ./.:4:405,89:.:-0.61:1.000:. ./.:4:724,127:.: 0.96:1.000:. ./.:4:623,145:.: 0.60:1.000:. ./.:4:605,132:.: 0.46:1.000:. ./.:4:615,121:.: 0.46:1.000:. ./.:4:705,141:.: 0.94:1.000:. ./.:4:369,90:.:-0.77:1.000:. ./.:4:819,152:.: 1.49:1.000:. ./.:4:922,215:.: 2.23:1.000:. ./.:4:530,97:.:-0.02:1.000:. ./.:4:263,50:.:-1.41:1.000:. ./.:4:554,139:.: 0.27:1.000:. ./.:4:346,71:.:-0.95:1.000:. ./.:4:345,86:.:-0.89:1.000:. ./.:4:659,162:.: 0.83:1.000:. ./.:4:421,76:.:-0.60:1.000:. ./.:4:638,147:.: 0.67:1.000:. ./.:4:168,32:.:-1.91:1.000:. ./.:4:594,116:.: 0.34:1.000:. ./.:4:511,112:.:-0.04:1.000:. ./.:4:793,194:.: 1.56:1.000:. ./.:4:951,180:.: 2.20:1.000:. ./.:6:607,87:.: 0.27:1.000:. ./.:4:656,135:.: 0.70:1.000:. ./.:4:651,123:.: 0.62:1.000:. ./.:4:476,104:.:-0.23:1.000:. ./.:4:777,167:.: 1.37:1.000:. ./.:4:752,140:.: 1.14:1.000:. ./.:4:492,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:337,76:.:-0.97:1.000:. ./.:4:582,129:.: 0.35:1.000:. ./.:4:353,84:.:-0.86:0.996:. ./.:4:706,150:.: 0.99:1.000:. ./.:4:828,199:.: 1.74:1.000:. ./.:4:323,52:.:-1.14:1.000:. ./.:4:203,42:.:-1.71:1.000:. ./.:4:600,120:.: 0.39:1.000:. ./.:4:374,79:.:-0.79:1.000:. ./.:4:380,78:.:-0.77:1.000:. ./.:4:432,86:.:-0.51:1.000:. ./.:4:607,121:.: 0.42:1.000:. ./.:4:564,99:.: 0.13:1.000:. ./.:4:957,186:.: 2.25:1.000:. ./.:4:348,80:.:-0.90:1.000:. ./.:4:700,179:.: 1.09:1.000:. ./.:4:638,138:.: 0.63:1.000:. ./.:4:189,36:.:-1.80:1.000:. ./.:4:555,134:.: 0.25:1.000:. ./.:4:462,111:.:-0.26:1.000:. ./.:4:526,113:.: 0.03:1.000:. ./.:4:383,81:.:-0.74:1.000:. ./.:4:691,121:.: 0.79:1.000:. ./.:4:477,103:.:-0.23:1.000:. ./.:4:387,83:.:-0.72:1.000:. ./.:4:413,99:.:-0.53:1.000:. ./.:4:731,133:.: 1.02:1.000:. ./.:4:375,99:.:-0.70:1.000:. ./.:4:802,157:.: 1.44:1.000:. ./.:4:683,152:.: 0.89:1.000:. ./.:4:628,112:.: 0.47:1.000:. ./.:4:194,35:.:-1.78:1.000:. ./.:4:769,153:.: 1.28:1.000:. ./.:4:726,155:.: 1.10:1.000:. ./.:4:363,59:.:-0.93:1.000:. ./.:4:595,131:.: 0.41:1.000:. ./.:4:493,105:.:-0.15:1.000:. ./.:4:738,150:.: 1.13:1.000:. ./.:4:416,72:.:-0.64:1.000:. ./.:4:579,126:.: 0.32:1.000:. ./.:4:392,63:.:-0.78:1.000:. ./.:4:552,118:.: 0.17:1.000:. ./.:4:483,107:.:-0.19:1.000:. ./.:4:378,81:.:-0.77:1.000:. ./.:4:921,199:.: 2.15:1.000:. ./.:4:689,122:.: 0.79:1.000:. ./.:4:432,74:.:-0.56:0.999:. ./.:4:612,119:.: 0.43:1.000:. ./.:4:510,95:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1022,227:.: 2.72:1.000:. ./.:4:196,31:.:-1.79:1.000:. ./.:4:203,43:.:-1.71:1.000:. ./.:4:434,91:.:-0.47:1.000:. ./.:4:545,109:.: 0.09:1.000:. ./.:4:720,128:.: 0.95:1.000:. ./.:4:543,90:.: 0.00:1.000:. ./.:4:794,137:.: 1.32:1.000:. ./.:4:318,71:.:-1.07:1.000:. ./.:4:480,94:.:-0.26:1.000:. ./.:4:615,124:.: 0.47:1.000:. ./.:4:656,135:.: 0.70:1.000:. ./.:4:527,109:.: 0.02:1.000:. ./.:4:551,99:.: 0.08:1.000:. ./.:4:387,67:.:-0.79:1.000:. ./.:4:540,133:.: 0.18:1.000:. ./.:4:863,176:.: 1.79:1.000:. ./.:5:472,94:.:-0.29:0.993:. ./.:4:531,118:.: 0.07:1.000:. ./.:4:530,105:.: 0.01:1.000:. ./.:4:584,137:.: 0.39:1.000:. ./.:4:622,127:.: 0.51:1.000:. ./.:4:873,166:.: 1.79:1.000:. ./.:4:526,117:.: 0.05:1.000:. ./.:4:522,80:.:-0.13:1.000:. ./.:4:633,132:.: 0.58:1.000:. ./.:4:432,110:.:-0.40:1.000:. ./.:4:573,114:.: 0.24:1.000:. ./.:4:193,30:.:-1.81:1.000:. ./.:4:484,109:.:-0.17:1.000:. ./.:4:715,154:.: 1.04:1.000:. ./.:4:625,129:.: 0.54:1.000:. ./.:4:336,77:.:-0.97:1.000:. ./.:4:567,138:.: 0.32:1.000:. ./.:4:359,73:.:-0.88:1.000:. ./.:4:488,96:.:-0.21:1.000:. ./.:4:565,118:.: 0.22:1.000:. ./.:4:325,42:.:-1.17:1.000:. ./.:4:412,102:.:-0.52:1.000:. ./.:4:483,134:.:-0.07:1.000:. ./.:4:864,186:.: 1.84:1.000:. ./.:4:787,173:.: 1.44:1.000:. ./.:4:416,112:.:-0.46:1.000:. ./.:4:547,119:.: 0.15:1.000:. ./.:4:435,76:.:-0.54:1.000:. ./.:4:356,100:.:-0.78:1.000:. ./.:4:430,82:.:-0.53:1.000:. ./.:4:758,168:.: 1.29:1.000:. ./.:4:442,94:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,46:.:-1.58:1.000:. ./.:4:483,124:.:-0.11:1.000:. ./.:4:492,113:.:-0.12:1.000:. ./.:4:390,99:.:-0.63:0.989:. ./.:4:616,121:.: 0.46:1.000:. ./.:4:345,74:.:-0.94:1.000:. ./.:4:335,80:.:-0.96:1.000:. ./.:4:261,69:.:-1.33:1.000:. ./.:4:201,32:.:-1.76:1.000:. ./.:4:175,32:.:-1.88:1.000:. ./.:4:354,64:.:-0.95:1.000:. ./.:4:523,101:.:-0.04:1.000:. ./.:4:408,106:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1068,216:.: 2.87:1.000:. ./.:4:548,107:.: 0.10:1.000:. ./.:4:382,74:.:-0.78:1.000:. ./.:4:408,113:.:-0.49:1.000:. ./.:4:575,145:.: 0.39:1.000:. ./.:4:735,166:.: 1.18:1.000:. ./.:4:456,105:.:-0.32:1.000:. ./.:4:390,99:.:-0.63:1.000:. -chr5.1 61166879 chr5.1_061166879 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:188,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:232,2:.: 1.73:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:245,2:.: 1.98:1.000:. ./.:4:251,2:.: 2.10:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:207,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:120,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:208,3:.: 1.28:1.000:. ./.:4:268,0:.: 2.39:0.944:. ./.:4:199,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:296,2:.: 2.97:1.000:. ./.:4:214,2:.: 1.38:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:151,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:176,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:177,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:208,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:182,3:.: 0.77:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:226,3:.: 1.63:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.38:1.000:. ./.:3:29,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:169,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:292,1:.: 2.87:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:198,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:85,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.53:1.000:. ./.:6:89,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:120,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:146,3:.: 0.07:1.000:. ./.:4:116,2:.:-0.53:1.000:. ./.:4:120,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:135,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:178,2:.: 0.68:0.996:. ./.:4:91,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:122,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:146,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:143,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:87,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:128,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:120,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:198,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,1:.:-1.79:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:126,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:330,0:.: 3.59:1.000:. ./.:4:91,1:.:-1.03:0.999:. ./.:4:169,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:137,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:80,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:70,1:.:-1.44:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:166,2:.: 0.44:1.000:. ./.:5:145,1:.: 0.02:0.993:. ./.:4:166,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:222,2:.: 1.53:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:81,3:.:-1.19:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:87,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:231,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:119,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:192,2:.: 0.95:1.000:. ./.:4:175,5:.: 0.68:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:195,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:147,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:132,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:99,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.38:0.989:. ./.:4:206,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:115,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:152,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:148,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:187,3:.: 0.87:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:255,2:.: 2.17:1.000:. ./.:4:240,2:.: 1.88:1.000:. ./.:4:114,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.66:1.000:. -chr5.1 61426054 chr5.1_061426054 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,43:.: 0.81:1.000:. ./.:4:108,12:.: 0.81:1.000:. ./.:4:22,52:.:-0.66:1.000:. ./.:4:25,53:.:-0.53:1.000:. ./.:4:86,25:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,74:.: 1.10:1.000:. ./.:4:57,12:.:-0.81:1.000:. ./.:4:48,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:82,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:24,13:.:-1.84:1.000:. ./.:4:17,21:.:-1.80:1.000:. ./.:4:114,12:.: 1.00:1.000:. ./.:4:75,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:88,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:80,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:88,44:.: 1.20:1.000:. ./.:4:77,26:.: 0.27:0.944:. ./.:4:84,54:.: 1.39:1.000:. ./.:4:79,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,40:.:-0.40:1.000:. ./.:4:10,27:.:-1.84:1.000:. ./.:4:46,62:.: 0.43:1.000:. ./.:4:41,26:.:-0.88:1.000:. ./.:4:61,39:.: 0.17:1.000:. ./.:4:27,5:.:-2.00:1.000:. ./.:4:87,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:47,74:.: 0.84:1.000:. ./.:4:98,35:.: 1.23:1.000:. ./.:4:82,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:46,50:.: 0.05:1.000:. ./.:4:146,11:.: 1.99:1.000:. ./.:4:30,49:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,8:.:-1.90:1.000:. ./.:4:39,10:.:-1.45:1.000:. ./.:3:10,5:.:-2.54:1.000:. ./.:4:148,52:.: 3.37:1.000:. ./.:4:37,55:.:-0.08:1.000:. ./.:4:71,48:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,27:.:-1.07:1.000:. ./.:4:37,62:.: 0.14:1.000:. ./.:4:63,34:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,44:.:-0.56:1.000:. ./.:4:37,67:.: 0.30:1.000:. ./.:4:94,15:.: 0.46:1.000:. ./.:4:34,39:.:-0.69:1.000:. ./.:4:43,57:.: 0.17:1.000:. ./.:4:76,41:.: 0.72:1.000:. ./.:4:82,14:.: 0.05:1.000:. ./.:4:37,48:.:-0.30:1.000:. ./.:4:73,33:.: 0.37:1.000:. ./.:4:71,19:.:-0.14:1.000:. ./.:4:105,47:.: 1.83:1.000:. ./.:4:51,12:.:-1.01:1.000:. ./.:4:62,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:99,12:.: 0.53:1.000:. ./.:4:46,69:.: 0.65:1.000:. ./.:4:57,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:44,44:.:-0.21:1.000:. ./.:4:34,29:.:-1.01:1.000:. ./.:6:54,23:.:-0.56:1.000:. ./.:4:56,34:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,44:.:-0.62:1.000:. ./.:4:33,40:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:73,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:72,38:.: 0.49:1.000:. ./.:4:74,9:.:-0.37:1.000:. ./.:4:68,34:.: 0.24:1.000:. ./.:4:76,39:.: 0.65:0.996:. ./.:4:64,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:51,12:.:-1.01:1.000:. ./.:4:210,0:.: 3.68:1.000:. ./.:4:27,22:.:-1.45:1.000:. ./.:4:110,12:.: 0.88:1.000:. ./.:4:57,39:.: 0.05:1.000:. ./.:4:76,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:59,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:73,32:.: 0.33:1.000:. ./.:4:34,44:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:77,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:71,33:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:87,46:.: 1.23:1.000:. ./.:4:110,29:.: 1.42:1.000:. ./.:4:56,12:.:-0.85:1.000:. ./.:4:92,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:55,14:.:-0.81:1.000:. ./.:4:96,27:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,13:.:-1.07:1.000:. ./.:4:106,6:.: 0.56:1.000:. ./.:4:67,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,41:.: 0.21:1.000:. ./.:4:28,51:.:-0.50:1.000:. ./.:4:17,29:.:-1.55:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:42,15:.:-1.20:1.000:. ./.:4:43,56:.: 0.14:1.000:. ./.:4:34,11:.:-1.58:1.000:. ./.:4:27,46:.:-0.69:1.000:. ./.:4:46,27:.:-0.69:1.000:. ./.:4:59,40:.: 0.14:1.000:. ./.:4:60,21:.:-0.43:1.000:. ./.:4:28,43:.:-0.75:1.000:. ./.:4:61,32:.:-0.05:1.000:. ./.:4:79,49:.: 1.07:1.000:. ./.:4:128,31:.: 2.06:1.000:. ./.:4:100,24:.: 0.94:1.000:. ./.:4:34,21:.:-1.26:1.000:. ./.:4:61,83:.: 1.58:1.000:. ./.:4:85,6:.:-0.11:0.999:. ./.:4:92,16:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,36:.:-1.33:1.000:. ./.:4:26,28:.:-1.29:1.000:. ./.:4:92,11:.: 0.27:1.000:. ./.:4:92,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:92,7:.: 0.14:1.000:. ./.:4:27,36:.:-1.01:1.000:. ./.:4:28,47:.:-0.62:1.000:. ./.:4:50,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:64,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:127,9:.: 1.32:1.000:. ./.:4:51,12:.:-1.01:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.81:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,12:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:44,14:.:-1.17:1.000:. ./.:4:53,24:.:-0.56:1.000:. ./.:4:27,24:.:-1.39:1.000:. ./.:5:43,31:.:-0.66:0.993:. ./.:4:28,37:.:-0.94:1.000:. ./.:4:27,36:.:-1.01:1.000:. ./.:4:101,29:.: 1.13:1.000:. ./.:4:75,36:.: 0.53:1.000:. ./.:4:35,28:.:-1.01:1.000:. ./.:4:43,14:.:-1.20:1.000:. ./.:4:51,27:.:-0.53:1.000:. ./.:4:64,36:.: 0.17:1.000:. ./.:4:76,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:38,36:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:145,9:.: 1.90:1.000:. ./.:4:53,57:.: 0.49:1.000:. ./.:4:57,43:.: 0.17:1.000:. ./.:4:101,36:.: 1.35:1.000:. ./.:4:52,63:.: 0.65:1.000:. ./.:4:88,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:92,45:.: 1.35:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,16:.:-2.25:1.000:. ./.:4:51,23:.:-0.66:1.000:. ./.:4:74,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,50:.:-0.05:1.000:. ./.:4:135,9:.: 1.58:1.000:. ./.:4:28,20:.:-1.48:1.000:. ./.:4:115,30:.: 1.61:1.000:. ./.:4:109,23:.: 1.20:1.000:. ./.:4:32,48:.:-0.46:1.000:. ./.:4:36,25:.:-1.07:1.000:. ./.:4:88,26:.: 0.62:1.000:. ./.:4:138,18:.: 1.96:1.000:. ./.:4:66,47:.: 0.59:1.000:. ./.:4:57,31:.:-0.21:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.61:0.989:. ./.:4:37,31:.:-0.85:1.000:. ./.:4:71,44:.: 0.65:1.000:. ./.:4:95,18:.: 0.59:1.000:. ./.:4:97,23:.: 0.81:1.000:. ./.:4:67,17:.:-0.34:1.000:. ./.:4:98,25:.: 0.91:1.000:. ./.:4:100,7:.: 0.40:1.000:. ./.:4:41,37:.:-0.53:1.000:. ./.:4:136,20:.: 1.96:1.000:. ./.:4:36,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,41:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,14:.: 0.40:1.000:. ./.:4:131,10:.: 1.48:1.000:. ./.:4:106,62:.: 2.34:1.000:. ./.:4:48,65:.: 0.59:1.000:. ./.:4:66,19:.:-0.30:1.000:. ./.:4:104,12:.: 0.68:1.000:. -chr5.1 61716630 chr5.1_061716630 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:249,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:20,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.07:0.944:. ./.:4:155,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:320,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.95:1.000:. ./.:3:35,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:308,1:.: 2.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:252,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.21:1.000:. ./.:6:177,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:221,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.75:0.996:. ./.:4:121,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:180,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:308,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:185,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:244,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:175,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.55:1.000:. ./.:5:188,0:.:-0.07:0.993:. ./.:4:237,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:187,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:237,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:166,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.65:0.989:. ./.:4:223,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:263,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:229,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.34:1.000:. -chr5.1 61837772 chr5.1_061837772 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:107,0:.: 3.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.17:0.944:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.87:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:6:29,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.05:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,1:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:101,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:121,0:.: 3.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./.:5:37,0:.:-0.27:0.993:. ./.:4:83,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:92,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:98,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:83,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:78,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 62350905 chr5.1_062350905 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:175,200:.: 0.54:1.000:. ./.:4:183,113:.:-0.14:1.000:. ./.:4:181,64:.:-0.57:1.000:. ./.:4:222,169:.: 0.68:1.000:. ./.:4:265,190:.: 1.22:1.000:. ./.:4:359,199:.: 2.10:1.000:. ./.:4:162,79:.:-0.61:1.000:. ./.:4:281,131:.: 0.85:1.000:. ./.:4:225,211:.: 1.06:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:70,65:.:-1.51:1.000:. ./.:4:178,146:.: 0.10:1.000:. ./.:4:337,151:.: 1.50:1.000:. ./.:4:216,136:.: 0.34:1.000:. ./.:4:209,200:.: 0.83:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:235,159:.: 0.70:0.944:. ./.:4:137,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:302,204:.: 1.66:1.000:. ./.:4:236,67:.:-0.08:1.000:. ./.:4:50,46:.:-1.84:1.000:. ./.:4:196,108:.:-0.07:1.000:. ./.:4:338,238:.: 2.26:1.000:. ./.:4:126,69:.:-1.00:1.000:. ./.:4:29,19:.:-2.25:1.000:. ./.:4:241,244:.: 1.48:1.000:. ./.:4:231,91:.: 0.09:1.000:. ./.:4:167,81:.:-0.55:1.000:. ./.:4:209,169:.: 0.56:1.000:. ./.:4:289,165:.: 1.21:1.000:. ./.:4:211,63:.:-0.32:1.000:. ./.:4:189,133:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,7:.:-2.49:1.000:. ./.:4:45,23:.:-2.08:1.000:. ./.:3:13,3:.:-2.53:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:222,61:.:-0.25:1.000:. ./.:4:342,135:.: 1.41:1.000:. ./.:4:183,183:.: 0.46:1.000:. ./.:4:219,72:.:-0.18:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:225,76:.:-0.09:1.000:. ./.:4:204,74:.:-0.29:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:184,77:.:-0.44:1.000:. ./.:4:242,139:.: 0.59:1.000:. ./.:4:174,74:.:-0.55:1.000:. ./.:4:160,105:.:-0.40:1.000:. ./.:4:177,56:.:-0.67:1.000:. ./.:4:215,93:.:-0.03:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:315,76:.: 0.68:1.000:. ./.:4:125,107:.:-0.68:1.000:. ./.:4:278,95:.: 0.52:1.000:. ./.:4:265,149:.: 0.87:1.000:. ./.:4:246,189:.: 1.05:1.000:. ./.:4:306,126:.: 1.03:1.000:. ./.:4:210,72:.:-0.26:1.000:. ./.:4:215,117:.: 0.17:1.000:. ./.:6:155,55:.:-0.87:1.000:. ./.:4:223,67:.:-0.19:1.000:. ./.:4:187,55:.:-0.60:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:93,67:.:-1.30:1.000:. ./.:4:264,69:.: 0.18:1.000:. ./.:4:129,144:.:-0.33:1.000:. ./.:4:161,47:.:-0.89:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:263,115:.: 0.56:0.996:. ./.:4:150,136:.:-0.22:1.000:. ./.:4:267,137:.: 0.79:1.000:. ./.:4:124,133:.:-0.47:1.000:. ./.:4:248,64:.: 0.00:1.000:. ./.:4:265,150:.: 0.88:1.000:. ./.:4:203,147:.: 0.33:1.000:. ./.:4:81,34:.:-1.68:1.000:. ./.:4:173,177:.: 0.33:1.000:. ./.:4:272,135:.: 0.81:1.000:. ./.:4:120,138:.:-0.46:1.000:. ./.:4:250,108:.: 0.39:1.000:. ./.:4:195,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:264,63:.: 0.13:1.000:. ./.:4:280,61:.: 0.25:1.000:. ./.:4:198,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:219,51:.:-0.36:1.000:. ./.:4:90,55:.:-1.43:1.000:. ./.:4:172,54:.:-0.73:1.000:. ./.:4:122,58:.:-1.13:1.000:. ./.:4:240,57:.:-0.13:1.000:. ./.:4:129,134:.:-0.42:1.000:. ./.:4:218,137:.: 0.37:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:241,119:.: 0.41:1.000:. ./.:4:114,61:.:-1.17:1.000:. ./.:4:244,122:.: 0.46:1.000:. ./.:4:224,124:.: 0.31:1.000:. ./.:4:212,109:.: 0.08:1.000:. ./.:4:169,147:.: 0.03:1.000:. ./.:4:259,197:.: 1.23:1.000:. ./.:4:82,94:.:-1.16:1.000:. ./.:4:200,62:.:-0.43:1.000:. ./.:4:199,48:.:-0.55:1.000:. ./.:4:320,143:.: 1.29:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:234,105:.: 0.23:1.000:. ./.:4:348,137:.: 1.48:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:193,66:.:-0.45:1.000:. ./.:4:234,118:.: 0.34:1.000:. ./.:4:385,186:.: 2.21:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:365,69:.: 1.04:1.000:. ./.:4:143,72:.:-0.83:1.000:. ./.:4:265,152:.: 0.90:1.000:. ./.:4:196,111:.:-0.04:1.000:. ./.:4:204,109:.: 0.01:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:150,59:.:-0.88:1.000:. ./.:4:197,74:.:-0.35:1.000:. ./.:4:145,200:.: 0.28:1.000:. ./.:4:166,128:.:-0.15:1.000:. ./.:4:314,177:.: 1.53:1.000:. ./.:4:100,140:.:-0.61:1.000:. ./.:4:327,154:.: 1.44:1.000:. ./.:4:270,116:.: 0.63:1.000:. ./.:4:78,164:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,42:.:-1.61:1.000:. ./.:4:138,103:.:-0.61:1.000:. ./.:4:270,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:251,144:.: 0.71:1.000:. ./.:5:131,72:.:-0.93:0.993:. ./.:4:225,148:.: 0.52:1.000:. ./.:4:208,135:.: 0.27:1.000:. ./.:4:200,99:.:-0.11:1.000:. ./.:4:271,120:.: 0.68:1.000:. ./.:4:156,58:.:-0.84:1.000:. ./.:4:157,105:.:-0.43:1.000:. ./.:4:114,59:.:-1.19:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:206,118:.: 0.10:1.000:. ./.:4:276,131:.: 0.81:1.000:. ./.:4:126,41:.:-1.24:1.000:. ./.:4:259,89:.: 0.31:1.000:. ./.:4:356,277:.: 2.74:1.000:. ./.:4:398,63:.: 1.27:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:322,238:.: 2.12:1.000:. ./.:4:204,122:.: 0.12:1.000:. ./.:4:335,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:294,224:.: 1.76:1.000:. ./.:4:55,48:.:-1.78:1.000:. ./.:4:93,72:.:-1.26:1.000:. ./.:4:319,74:.: 0.69:1.000:. ./.:4:303,141:.: 1.13:1.000:. ./.:4:272,192:.: 1.30:1.000:. ./.:4:274,80:.: 0.36:1.000:. ./.:4:203,195:.: 0.74:1.000:. ./.:4:156,163:.: 0.06:1.000:. ./.:4:180,69:.:-0.54:1.000:. ./.:4:239,112:.: 0.33:1.000:. ./.:4:239,131:.: 0.50:1.000:. ./.:4:160,151:.:-0.01:1.000:. ./.:4:152,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:345,159:.: 1.64:1.000:. ./.:4:213,53:.:-0.39:1.000:. ./.:4:315,63:.: 0.56:0.989:. ./.:4:304,156:.: 1.26:1.000:. ./.:4:322,131:.: 1.21:1.000:. ./.:4:216,76:.:-0.17:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:113,138:.:-0.52:1.000:. ./.:4:186,64:.:-0.53:1.000:. ./.:4:135,49:.:-1.09:1.000:. ./.:4:190,61:.:-0.52:1.000:. ./.:4:229,89:.: 0.05:1.000:. ./.:4:215,79:.:-0.15:1.000:. ./.:4:295,219:.: 1.73:1.000:. ./.:4:158,86:.:-0.58:1.000:. ./.:4:223,81:.:-0.07:1.000:. ./.:4:387,100:.: 1.50:1.000:. ./.:4:397,315:.: 3.42:1.000:. ./.:4:277,118:.: 0.71:1.000:. ./.:4:200,150:.: 0.33:1.000:. -chr5.1 62589488 chr5.1_062589488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:114,38:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,72:0.73:-1.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,35:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,19:0.17:-0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,93:0.55: 1.69:1.000:0.975 0/1/1/1:4:28,84:0.72:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,31:0.38:-1.54:1.000:0.620 0/1/1/1:4:29,82:0.71:-0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:55,65:0.54:-0.11:1.000:0.985 0/0/0/1:4:72,15:0.17:-1.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,52:0.38: 0.64:1.000:0.530 0/1/1/1:4:21,82:0.76:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,68:0.52: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,111:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,59:0.46: 0.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:92,21:0.19:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,40:0.42:-1.01:0.944:0.930 0/1/1/1:4:37,100:0.70: 0.52:1.000:0.987 0/0/1/1:4:69,85:0.55: 1.16:1.000:0.977 0/0/1/1:4:79,75:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,27:0.29:-1.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:80,32:0.29:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:80,43:0.35: 0.00:1.000:0.752 0/0/1/1:4:69,52:0.44:-0.07:1.000:0.964 0/0/0/0:4:76,7:0.08:-1.50:1.000:0.977 0/0/1/1:4:61,50:0.46:-0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:54,37:0.41:-1.20:1.000:0.886 0/0/0/1:4:73,20:0.22:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,104:0.71: 0.67:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,76:0.67:-0.52:1.000:0.938 0/0/0/1:4:88,21:0.19:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,18:0.20:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,34:0.59:-2.47:1.000:0.863 0/0/1/1:4:36,46:0.56:-1.54:1.000:0.967 0/0/1:3:30,18:0.38:-2.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,26:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,52:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,27:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,77:0.50: 1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,29:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,28:0.27:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,31:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,31:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,34:0.28: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:150,30:0.17: 2.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,106:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,52:0.33: 1.27:1.000:0.898 0/0/0/1:4:70,35:0.34:-0.67:1.000:0.886 0/0/0/1:4:86,23:0.21:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,28:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,25:0.27:-1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,44:0.28: 1.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,37:0.33:-0.30:1.000:0.939 0/0/0/1:4:104,30:0.22: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,23:0.19:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,53:0.41: 0.38:1.000:0.833 0/0/1/1:4:64,58:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,29:0.19: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,98:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:98,31:0.24: 0.23:1.000:0.628 0/0/0/1:4:120,45:0.27: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,49:0.48:-0.71:1.000:0.995 0/0/0/0:4:132,1:0.01: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,81:0.56: 0.79:1.000:0.964 0/0/0/1:4:132,34:0.20: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,35:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,57:0.57:-0.90:1.000:0.939 0/0/0/1:4:90,29:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,32:0.23: 0.60:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,95:0.49: 2.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,62:0.55:-0.34:0.999:0.983 0/0/0/1:4:103,37:0.26: 0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,48:0.42:-0.26:1.000:0.919 0/0/1/1:4:68,50:0.43:-0.19:1.000:0.951 0/0/0/1:4:82,33:0.29:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:56,51:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,72:0.48: 1.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:102,36:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,120:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,54:0.54:-0.86:1.000:0.986 0/0/1/1:4:83,71:0.47: 1.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:110,27:0.20: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,24:0.29:-1.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:110,35:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,43:0.44:-0.90:1.000:0.971 0/0/0/1:4:94,26:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,63:0.53:-0.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:76,25:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,47:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,52:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:106,40:0.28: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,44:0.55:-1.57:1.000:0.984 0/0/1/1:4:82,80:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,82:0.51: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,64:0.54:-0.11:1.000:0.989 0/0/0/1:4:61,29:0.33:-1.24:1.000:0.937 0/1/1/1:4:33,123:0.75: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,62:0.53:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:106,28:0.21: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,37:0.24: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,27:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,85:0.50: 1.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,23:0.21:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,33:0.29:-0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:78,33:0.30:-0.45:1.000:0.986 0/0/1/1:4:57,51:0.48:-0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:145,38:0.21: 2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,30:0.27:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,97:0.69: 0.45:1.000:0.977 0/0/1/1:4:80,76:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,36:0.23: 1.35:0.999:1.000 0/0/1/1:4:119,72:0.38: 2.55:1.000:0.606 0/1/1/1:4:20,62:0.72:-1.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,112:0.69: 1.24:1.000:0.976 0/0/0/1:4:100,40:0.29: 0.64:1.000:0.993 0/0/0/1:4:79,22:0.22:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,38:0.31: 0.00:1.000:0.971 0/0/0/1:4:85,39:0.32: 0.04:1.000:0.960 0/0/0/1:4:113,39:0.26: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,57:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,105:0.65: 1.27:1.000:0.799 0/0/1/1:4:72,57:0.45: 0.23:1.000:0.981 0/0/0/1:4:82,40:0.33:-0.04:1.000:0.915 0/0/1/1:4:61,72:0.54: 0.38:1.000:0.985 0/0/1/1:4:75,63:0.47: 0.56:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,55:0.63:-1.39:1.000:0.513 0/0/1/1:4:45,46:0.51:-1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,67:0.55:-0.04:1.000:0.979 0/0/1/1:4:55,66:0.55:-0.07:1.000:0.982 0/1/1/1:4:28,73:0.70:-0.82:1.000:0.981 0/0/0/1/1:5:56,39:0.42:-1.05:0.993:0.959 0/0/1/1:4:53,70:0.57: 0.00:1.000:0.953 0/0/0/1:4:85,19:0.18:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,48:0.46:-0.64:1.000:0.989 0/0/1/1:4:69,57:0.46: 0.11:1.000:0.989 0/0/1/1:4:82,74:0.48: 1.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,109:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,27:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,37:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,67:0.46: 0.97:1.000:0.987 0/0/1/1:4:46,47:0.51:-1.12:1.000:0.996 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,37:0.23: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,98:0.47: 3.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,63:0.56:-0.37:1.000:0.971 0/0/0/1:4:84,29:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,52:0.47:-0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:47,50:0.52:-0.97:1.000:0.994 0/0/0/1:4:92,33:0.26: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,58:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,53:0.54:-0.90:1.000:0.988 0/0/1/1:4:47,62:0.57:-0.52:1.000:0.954 0/0/1/1:4:61,57:0.49:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,94:0.69: 0.30:1.000:0.976 0/0/0/1:4:113,47:0.30: 1.39:1.000:0.988 0/0/1/1:4:73,73:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,63:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,36:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,27:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.50:-1.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,85:0.78:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,38:0.28: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,12:0.18:-2.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,43:0.40:-0.49:1.000:0.768 0/0/0/1:4:75,30:0.29:-0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,63:0.52: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,44:0.49:-1.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,34:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,22:0.21:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,25:0.34:-1.80:1.000:0.886 0/0/0/1:4:86,31:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,30:0.30:-0.79:1.000:0.988 0/0/0/1:4:66,21:0.24:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,43:0.31: 0.71:1.000:0.980 0/0/1/1:4:75,80:0.52: 1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,55:0.45: 0.11:1.000:0.974 0/0/0/1:4:90,32:0.26:-0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,42:0.29: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,67:0.48: 0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:99,73:0.43: 1.84:1.000:0.953 0/0/1/1:4:50,45:0.48:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,60:0.51:-0.07:1.000:0.997 -chr5.1 62735311 chr5.1_062735311 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:166,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:56,16:.:-1.12:1.000:. ./.:4:138,16:.: 0.95:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:134,13:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,12:.:-0.03:1.000:. ./.:4:78,4:.:-0.87:1.000:. ./.:4:118,14:.: 0.40:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:7,7:.:-2.59:1.000:. ./.:4:31,1:.:-2.14:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.84:1.000:. ./.:4:107,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:140,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:81,24:.:-0.29:1.000:. ./.:4:106,12:.: 0.04:0.944:. ./.:4:46,42:.:-0.72:1.000:. ./.:4:133,24:.: 1.03:1.000:. ./.:4:139,9:.: 0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:234,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:117,12:.: 0.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:143,16:.: 1.08:1.000:. ./.:4:99,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:150,18:.: 1.31:1.000:. ./.:4:100,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:118,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,1:.:-2.74:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.52:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:72,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:130,11:.: 0.62:1.000:. ./.:4:120,24:.: 0.70:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:109,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:57,31:.:-0.72:1.000:. ./.:4:118,11:.: 0.32:1.000:. ./.:4:89,12:.:-0.39:1.000:. ./.:4:66,19:.:-0.79:1.000:. ./.:4:80,22:.:-0.36:1.000:. ./.:4:102,11:.:-0.08:1.000:. ./.:4:145,16:.: 1.13:1.000:. ./.:4:24,3:.:-2.26:1.000:. ./.:4:94,14:.:-0.21:1.000:. ./.:4:69,7:.:-1.02:1.000:. ./.:4:48,22:.:-1.17:1.000:. ./.:4:124,16:.: 0.60:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:123,10:.: 0.42:1.000:. ./.:4:152,10:.: 1.16:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:93,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:85,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:86,14:.:-0.41:1.000:. ./.:6:94,14:.:-0.21:1.000:. ./.:4:86,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:98,15:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,18:.:-0.84:1.000:. ./.:4:88,4:.:-0.62:1.000:. ./.:4:146,14:.: 1.11:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:47,16:.:-1.35:1.000:. ./.:4:59,25:.:-0.82:1.000:. ./.:4:77,10:.:-0.74:0.996:. ./.:4:63,22:.:-0.79:1.000:. ./.:4:112,15:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:31,47:.:-0.97:1.000:. ./.:4:132,19:.: 0.88:1.000:. ./.:4:62,32:.:-0.57:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.41:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,17:.: 0.88:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:126,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:17,38:.:-1.55:1.000:. ./.:4:100,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:110,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:122,15:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,16:.:-1.12:1.000:. ./.:4:100,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:86,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:92,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:115,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:108,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:88,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:83,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:77,9:.:-0.77:1.000:. ./.:4:114,21:.: 0.47:1.000:. ./.:4:95,10:.:-0.29:1.000:. ./.:4:87,20:.:-0.24:1.000:. ./.:4:47,19:.:-1.28:1.000:. ./.:4:88,14:.:-0.36:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:184,1:.: 1.74:1.000:. ./.:4:113,18:.: 0.37:1.000:. ./.:4:60,12:.:-1.12:1.000:. ./.:4:112,21:.: 0.42:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.90:1.000:. ./.:4:63,22:.:-0.79:1.000:. ./.:4:81,15:.:-0.52:1.000:. ./.:4:126,13:.: 0.57:1.000:. ./.:4:108,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:117,12:.: 0.32:1.000:. ./.:4:84,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:145,12:.: 1.03:1.000:. ./.:4:73,30:.:-0.34:0.999:. ./.:4:92,56:.: 0.80:1.000:. ./.:4:62,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:123,19:.: 0.65:1.000:. ./.:4:93,17:.:-0.16:1.000:. ./.:4:89,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:78,27:.:-0.29:1.000:. ./.:4:110,12:.: 0.14:1.000:. ./.:4:112,16:.: 0.29:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:111,16:.: 0.27:1.000:. ./.:4:126,17:.: 0.67:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:114,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:102,14:.:-0.01:1.000:. ./.:4:81,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:62,8:.:-1.17:1.000:. ./.:4:77,10:.:-0.74:1.000:. ./.:4:67,31:.:-0.46:1.000:. ./.:4:113,11:.: 0.19:1.000:. ./.:5:106,10:.:-0.01:0.993:. ./.:4:86,13:.:-0.44:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:152,21:.: 1.43:1.000:. ./.:4:118,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:87,11:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:60,35:.:-0.54:1.000:. ./.:4:95,23:.: 0.04:1.000:. ./.:4:113,11:.: 0.19:1.000:. ./.:4:52,16:.:-1.22:1.000:. ./.:4:158,16:.: 1.46:1.000:. ./.:4:237,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:88,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:79,23:.:-0.36:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:101,11:.:-0.11:1.000:. ./.:4:91,46:.: 0.52:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,12:.:-0.29:1.000:. ./.:4:82,24:.:-0.26:1.000:. ./.:4:158,17:.: 1.49:1.000:. ./.:4:219,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:87,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:102,14:.:-0.01:1.000:. ./.:4:92,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:102,9:.:-0.14:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:84,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:116,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:116,8:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,35:.:-0.95:1.000:. ./.:4:103,13:.:-0.01:1.000:. ./.:4:122,16:.: 0.55:1.000:. ./.:4:89,17:.:-0.26:1.000:. ./.:4:57,13:.:-1.17:1.000:. ./.:4:91,15:.:-0.26:1.000:. ./.:4:113,11:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,6:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:131,19:.: 0.85:1.000:. ./.:4:125,13:.: 0.55:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:103,15:.: 0.04:1.000:. ./.:4:161,14:.: 1.49:1.000:. ./.:4:113,31:.: 0.70:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:119,9:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,33:.:-0.11:1.000:. -chr5.1 63130360 chr5.1_063130360 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:17,74:0.75:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,23:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,46:0.44: 0.35:1.000:0.958 0/0/1/1:4:51,57:0.53: 0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,66:0.52: 1.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:90,65:0.43: 2.15:1.000:0.953 0/0/0/1:4:57,19:0.27:-0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,49:0.55:-0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:59,54:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,7:0.18:-2.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,9:0.27:-2.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,28:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,55:0.54: 0.04:1.000:0.985 0/0/1/1:4:57,49:0.47: 0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:96,24:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,60:0.44: 1.52:0.944:0.974 0/1/1/1:4:33,96:0.70: 1.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:78,85:0.53: 2.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,59:0.40: 1.99:1.000:0.827 0/0/0/1:4:34,10:0.24:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,55:0.51: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:98,27:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,61:0.71:-0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:15,4:0.23:-3.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,55:0.46: 0.94:1.000:0.985 0/0/1/1:4:71,51:0.43: 0.86:1.000:0.950 0/1/1/1:4:35,75:0.65: 0.39:1.000:0.783 0/0/1/1:4:65,62:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,48:0.45: 0.39:1.000:0.979 0/0/0/1:4:98,21:0.19: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,50:0.46: 0.50:1.000:0.984 0/1/1/1:4:3,12:0.74:-3.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,28:0.68:-2.39:1.000:0.945 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:76,58:0.45: 1.33:1.000:0.975 0/0/1/1:4:55,56:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,22:0.21: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,25:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,63:0.55: 0.54:1.000:0.980 0/0/0/1:4:79,32:0.30: 0.43:1.000:0.981 0/0/1/1:4:50,41:0.46:-0.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:62,57:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,45:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,55:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,51:0.51: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,85:0.67: 0.74:1.000:0.936 0/0/0/0:4:36,3:0.08:-2.39:1.000:0.983 0/0/0/1:4:61,30:0.34:-0.36:1.000:0.836 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,39:0.49:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,33:0.26: 1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,40:0.46:-0.43:1.000:0.989 0/0/0/1:4:81,30:0.29: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:80,24:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,43:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,50:0.53:-0.20:1.000:0.992 0/0/0/1:4:84,13:0.14:-0.12:1.000:0.977 0/0/0/0/1/1:6:52,19:0.28:-1.14:1.000:0.791 0/0/0/1:4:52,19:0.28:-1.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,55:0.54: 0.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:78,27:0.27: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,44:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:98,27:0.23: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,63:0.63:-0.20:1.000:0.623 0/0/0/1:4:56,20:0.28:-0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:83,12:0.14:-0.20:1.000:0.948 0/0/0/1:4:71,30:0.31: 0.04:0.996:0.969 0/0/1/1:4:49,51:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.37:-1.06:0.999:0.554 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,19:0.20: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,22:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,59:0.66:-0.63:1.000:0.896 0/0/1/1:4:40,57:0.58:-0.12:1.000:0.927 0/0/0/1:4:71,28:0.30:-0.04:1.000:0.986 0/1/1/1:4:22,98:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,51:0.47: 0.47:1.000:0.991 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,23:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,24:0.25: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,20:0.22:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,18:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,50:0.47: 0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,33:0.50:-1.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,14:0.19:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,42:0.53:-0.82:1.000:0.991 0/0/1/1:4:53,32:0.39:-0.59:1.000:0.698 0/0/1/1:4:49,42:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/1:4:66,20:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,21:0.22: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,12:0.18:-1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,55:0.67:-0.86:1.000:0.907 0/0/1/1:4:57,34:0.39:-0.36:1.000:0.666 0/0/1/1:4:45,33:0.44:-0.86:1.000:0.960 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,49:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,53:0.47: 0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,34:0.49:-1.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,51:0.56:-0.36:1.000:0.974 0/0/0/1:4:51,21:0.31:-1.10:1.000:0.977 0/0/0/1:4:70,29:0.31:-0.04:1.000:0.975 0/0/1/1:4:34,31:0.49:-1.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,32:0.34:-0.08:1.000:0.858 0/0/0/1:4:66,13:0.18:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,20:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,59:0.43: 1.60:1.000:0.951 0/0/1/1:4:55,56:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,20:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,58:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,18:0.22:-0.47:0.999:1.000 0/0/0/0:4:112,1:0.01: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,28:0.48:-1.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,17:0.19:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,26:0.32:-0.59:1.000:0.950 0/0/0/1:4:58,24:0.31:-0.71:1.000:0.976 0/0/0/1:4:74,26:0.28: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,40:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,50:0.46: 0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:43,41:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,46:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,28:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,38:0.48:-0.71:1.000:0.994 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,37:0.44:-0.55:1.000:0.972 0/0/0/1:4:39,20:0.35:-1.61:1.000:0.756 0/0/1/1:4:34,30:0.48:-1.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,23:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,37:0.29: 1.40:1.000:0.993 0/0/1/1/1:5:39,44:0.53:-0.67:0.993:0.784 0/0/1/1:4:46,44:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,44:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,70:0.52: 1.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,25:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,33:0.50:-1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,30:0.48:-1.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,50:0.67:-1.18:1.000:0.936 0/0/0/1:4:66,29:0.32:-0.20:1.000:0.952 0/0/0/1:4:55,20:0.28:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,17:0.26:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,26:0.35:-0.86:1.000:0.807 0/0/0/1:4:103,41:0.30: 1.72:1.000:0.985 0/0/1/1:4:82,76:0.49: 2.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,24:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,52:0.51: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,77:0.54: 1.68:1.000:0.988 0/0/0/1:4:77,21:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,31:0.24: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,29:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,29:0.55:-1.88:1.000:0.976 0/1/1/1:4:23,85:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/0:4:134,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,26:0.28:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,64:0.46: 1.68:1.000:0.988 0/0/0/1:4:102,29:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,30:0.29: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:78,58:0.44: 1.40:1.000:0.966 0/0/1/1:4:66,47:0.43: 0.50:1.000:0.945 0/0/1/1:4:37,39:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,33:0.27: 1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,42:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/1:4:64,29:0.33:-0.28:1.000:0.932 0/0/0/1:4:109,17:0.14: 1.01:1.000:0.980 0/0/0/1:4:69,27:0.30:-0.16:1.000:0.987 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,35:0.29: 1.05:1.000:0.991 0/0/0/1:4:79,24:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:65,20:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,42:0.48:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,24:0.28:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,47:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,24:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,19:0.23:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,24:0.19: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,61:0.52: 0.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:102,29:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,45:0.41: 0.58:1.000:0.831 0/0/0/1:4:119,30:0.22: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,46:0.31: 2.15:1.000:0.969 0/0/1/1:4:80,53:0.41: 1.29:1.000:0.876 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,20:0.16: 1.25:1.000:0.996 -chr5.1 63172350 chr5.1_063172350 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:255,60:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,107:0.46:-0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:170,124:0.46: 0.39:1.000:0.987 0/0/0/1:4:243,44:0.18: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,135:0.47: 0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:202,147:0.46: 1.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:133,109:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,194:0.67: 0.39:1.000:0.918 0/0/0/1:4:260,66:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,41:0.50:-3.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,71:0.39:-1.18:1.000:0.666 0/0/1/1:4:167,132:0.48: 0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,114:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,155:0.51: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:234,69:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:88,158:0.65:-0.44:1.000:0.827 0/0/1/1:4:190,162:0.50: 1.39:0.944:0.997 0/0/0/1:4:249,74:0.27: 0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:267,162:0.42: 2.72:1.000:0.893 0/0/1/1:4:220,159:0.46: 1.86:1.000:0.985 0/0/0/0:4:135,4:0.03:-2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,64:0.27: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:278,71:0.24: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,140:0.52: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:119,42:0.30:-1.91:1.000:0.985 0/0/0/1:4:273,71:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,122:0.45: 0.41:1.000:0.980 0/0/1/1:4:176,109:0.42: 0.24:1.000:0.914 0/0/1/1:4:203,158:0.47: 1.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:89,191:0.69: 0.15:1.000:0.971 0/0/0/1:4:242,58:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,49:0.24:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,26:0.23:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,41:0.26:-1.44:1.000:0.999 0/0/1:3:84,16:0.19:-2.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,181:0.72:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,126:0.46: 0.44:1.000:0.988 0/1/1/1:4:99,201:0.68: 0.49:1.000:0.949 0/0/0/1:4:216,59:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,172:0.50: 1.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,179:0.72:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:149,111:0.46:-0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:181,123:0.44: 0.56:1.000:0.970 0/1/1/1:4:75,179:0.71:-0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:148,127:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:99,224:0.70: 0.89:1.000:0.984 0/0/1/1:4:201,169:0.49: 1.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,89:0.39:-0.33:1.000:0.705 0/0/1/1:4:103,113:0.55:-0.96:1.000:0.979 0/0/1/1:4:128,113:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,148:0.70:-0.99:1.000:0.982 0/0/1/1:4:215,134:0.42: 1.34:1.000:0.920 0/0/0/0:4:250,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,156:0.53: 0.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:151,120:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:177,119:0.44: 0.43:1.000:0.966 0/0/1/1:4:150,125:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,121:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:160,104:0.43:-0.13:1.000:0.950 0/0/0/0/1/1:6:156,73:0.36:-0.73:1.000:0.880 0/0/1/1:4:129,136:0.54:-0.11:1.000:0.986 0/0/1/1:4:129,111:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,171:0.71:-0.52:1.000:0.993 0/0/0/1:4:189,56:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:162,137:0.49: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:209,57:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,180:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,179:0.77:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,170:0.69:-0.42:0.996:0.979 0/0/1/1:4:146,104:0.45:-0.37:1.000:0.983 0/0/1/1:4:142,133:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:205,61:0.27:-0.09:0.999:0.998 0/1/1/1:4:80,192:0.71: 0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:149,105:0.45:-0.30:1.000:0.980 0/0/1/1:4:167,144:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,133:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:212,58:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,177:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,49:0.21: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,188:0.71:-0.06:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,133:0.75:-1.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,193:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,143:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,60:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,210:0.71: 0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:159,128:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:178,39:0.21:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,45:0.24:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,53:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,159:0.71:-0.82:1.000:0.993 0/0/0/1:4:204,65:0.28:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,99:0.41:-0.06:1.000:0.846 0/1/1/1:4:77,199:0.72: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,120:0.71:-1.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:179,134:0.46: 0.72:1.000:0.990 0/1/1/1:4:108,182:0.64: 0.32:1.000:0.705 0/1/1/1:4:70,132:0.66:-1.20:1.000:0.891 0/0/1/1:4:119,94:0.48:-1.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:183,147:0.48: 1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:162,154:0.52: 0.77:1.000:0.995 0/0/0/0:4:204,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,119:0.46: 0.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:87,86:0.53:-1.70:1.000:0.993 0/1/1/1:4:52,150:0.74:-1.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,128:0.69:-1.46:1.000:0.974 0/1/1/1:4:56,195:0.77:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,125:0.71:-1.65:1.000:0.993 0/1/1/1:4:76,187:0.71:-0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:101,231:0.70: 1.05:1.000:0.985 0/0/1/1:4:156,136:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,107:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,256:0.70: 1.67:1.000:0.985 0/0/1/1:4:119,104:0.50:-0.84:0.999:0.997 0/1/1/1:4:72,248:0.77: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,140:0.66:-0.99:1.000:0.895 0/0/1/1:4:195,149:0.47: 1.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:149,147:0.53: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:113,98:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,110:0.46:-0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:133,108:0.48:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,88:0.43:-0.78:1.000:0.938 0/0/0/1:4:198,42:0.21:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,139:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:147,103:0.45:-0.37:1.000:0.979 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,110:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,114:0.53:-0.73:1.000:0.992 0/0/0/1:4:203,49:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,42:0.23:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,85:0.47:-1.28:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,125:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1/1:5:114,136:0.57:-0.37:0.993:0.939 0/1/1/1:4:71,135:0.67:-1.13:1.000:0.900 0/0/0/1:4:181,53:0.27:-0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:358,97:0.25: 3.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,198:0.72: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,96:0.48:-0.92:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,114:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,106:0.47:-0.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:75,152:0.68:-0.77:1.000:0.948 0/0/1/1:4:115,122:0.54:-0.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:132,119:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,51:0.28:-1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:298,79:0.25: 1.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:223,154:0.45: 1.82:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,247:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,163:0.66:-0.33:1.000:0.856 0/0/1/1:4:224,154:0.44: 1.84:1.000:0.974 0/0/1/1:4:157,93:0.41:-0.37:1.000:0.862 0/1/1/1:4:102,244:0.71: 1.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:238,52:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,50:0.53:-2.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:139,103:0.46:-0.51:1.000:0.989 0/1/1/1:4:85,241:0.74: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:207,183:0.50: 2.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:304,61:0.20: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,224:0.70: 0.84:1.000:0.988 0/0/0/1:4:196,60:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:329,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,126:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,138:0.68:-1.16:1.000:0.962 0/0/1/1:4:133,111:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/0:4:302,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,172:0.52: 1.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:77,196:0.72: 0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:150,139:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,176:0.70:-0.28:1.000:0.981 0/0/1/1:4:155,112:0.46:-0.08:1.000:0.985 0/1/1/1:4:102,174:0.64: 0.08:1.000:0.732 0/0/0/1:4:203,51:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,160:0.69:-0.65:1.000:0.973 0/0/0/1:4:247,68:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,129:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:211,57:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,124:0.54:-0.46:1.000:0.989 0/0/0/1:4:313,91:0.27: 2.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:203,159:0.48: 1.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:274,67:0.23: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,63:0.28:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:262,63:0.23: 0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,326:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,153:0.45: 1.69:1.000:0.981 0/0/1/1:4:146,112:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:165,93:0.40:-0.23:1.000:0.776 -chr5.1 63595500 chr5.1_063595500 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:389,207:.: 0.62:1.000:. ./.:4:312,214:.: 0.09:1.000:. ./.:4:338,288:.: 0.85:1.000:. ./.:4:370,266:.: 0.93:1.000:. ./.:4:372,198:.: 0.42:1.000:. ./.:4:480,327:.: 2.23:1.000:. ./.:4:234,116:.:-1.26:1.000:. ./.:4:377,349:.: 1.61:1.000:. ./.:4:342,166:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,48:.:-3.04:1.000:. ./.:4:165,55:.:-2.25:1.000:. ./.:4:262,221:.:-0.24:1.000:. ./.:4:330,261:.: 0.58:1.000:. ./.:4:375,297:.: 1.20:1.000:. ./.:4:329,182:.:-0.03:1.000:. ./.:4:315,287:.: 0.67:1.000:. ./.:4:409,188:.: 0.63:0.944:. ./.:4:323,341:.: 1.14:1.000:. ./.:4:444,192:.: 0.93:1.000:. ./.:4:409,383:.: 2.12:1.000:. ./.:4:111,75:.:-2.51:1.000:. ./.:4:343,230:.: 0.45:1.000:. ./.:4:425,274:.: 1.41:1.000:. ./.:4:316,288:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,62:.:-2.87:1.000:. ./.:4:405,223:.: 0.86:1.000:. ./.:4:352,371:.: 1.59:1.000:. ./.:4:302,172:.:-0.31:1.000:. ./.:4:390,252:.: 0.97:1.000:. ./.:4:322,344:.: 1.15:1.000:. ./.:4:391,181:.: 0.44:1.000:. ./.:4:308,204:.:-0.02:1.000:. ./.:4:124,84:.:-2.34:1.000:. ./.:4:120,75:.:-2.44:1.000:. ./.:3:94,16:.:-3.09:1.000:. ./.:4:351,196:.: 0.25:1.000:. ./.:4:351,333:.: 1.29:1.000:. ./.:4:347,204:.: 0.28:1.000:. ./.:4:341,242:.: 0.52:1.000:. ./.:4:341,215:.: 0.32:1.000:. ./.:4:311,242:.: 0.29:1.000:. ./.:4:341,242:.: 0.52:1.000:. ./.:4:383,294:.: 1.24:1.000:. ./.:4:312,134:.:-0.52:1.000:. ./.:4:319,230:.: 0.26:1.000:. ./.:4:370,337:.: 1.47:1.000:. ./.:4:371,208:.: 0.49:1.000:. ./.:4:395,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:284,223:.:-0.06:1.000:. ./.:4:377,166:.: 0.22:1.000:. ./.:4:274,126:.:-0.87:1.000:. ./.:4:408,281:.: 1.33:1.000:. ./.:4:239,122:.:-1.17:1.000:. ./.:4:369,260:.: 0.87:1.000:. ./.:4:291,76:.:-1.13:1.000:. ./.:4:320,219:.: 0.19:1.000:. ./.:4:282,229:.:-0.03:1.000:. ./.:4:293,258:.: 0.28:1.000:. ./.:4:326,280:.: 0.70:1.000:. ./.:6:202,148:.:-1.26:1.000:. ./.:4:275,224:.:-0.12:1.000:. ./.:4:286,257:.: 0.22:1.000:. ./.:4:277,184:.:-0.41:1.000:. ./.:4:297,214:.:-0.03:1.000:. ./.:4:338,263:.: 0.66:1.000:. ./.:4:326,170:.:-0.14:1.000:. ./.:4:238,122:.:-1.18:1.000:. ./.:4:307,265:.: 0.44:1.000:. ./.:4:325,160:.:-0.23:0.996:. ./.:4:298,335:.: 0.90:1.000:. ./.:4:325,314:.: 0.95:1.000:. ./.:4:288,137:.:-0.68:0.999:. ./.:4:339,82:.:-0.71:1.000:. ./.:4:333,239:.: 0.44:1.000:. ./.:4:360,158:.: 0.03:1.000:. ./.:4:262,123:.:-0.99:1.000:. ./.:4:334,171:.:-0.07:1.000:. ./.:4:298,218:.: 0.01:1.000:. ./.:4:337,154:.:-0.18:1.000:. ./.:4:339,346:.: 1.30:1.000:. ./.:4:234,116:.:-1.26:1.000:. ./.:4:328,238:.: 0.39:1.000:. ./.:4:320,247:.: 0.40:1.000:. ./.:4:271,71:.:-1.32:1.000:. ./.:4:354,235:.: 0.57:1.000:. ./.:4:320,175:.:-0.15:1.000:. ./.:4:205,151:.:-1.21:1.000:. ./.:4:295,132:.:-0.67:1.000:. ./.:4:268,206:.:-0.31:1.000:. ./.:4:314,218:.: 0.13:1.000:. ./.:4:227,113:.:-1.33:1.000:. ./.:4:307,135:.:-0.55:1.000:. ./.:4:368,260:.: 0.86:1.000:. ./.:4:238,174:.:-0.78:1.000:. ./.:4:269,200:.:-0.35:1.000:. ./.:4:293,260:.: 0.29:1.000:. ./.:4:268,192:.:-0.42:1.000:. ./.:4:276,64:.:-1.33:1.000:. ./.:4:309,249:.: 0.33:1.000:. ./.:4:330,234:.: 0.38:1.000:. ./.:4:223,136:.:-1.19:1.000:. ./.:4:349,273:.: 0.82:1.000:. ./.:4:216,154:.:-1.10:1.000:. ./.:4:290,247:.: 0.17:1.000:. ./.:4:255,144:.:-0.88:1.000:. ./.:4:317,231:.: 0.25:1.000:. ./.:4:256,125:.:-1.02:1.000:. ./.:4:347,251:.: 0.64:1.000:. ./.:4:398,218:.: 0.77:1.000:. ./.:4:340,176:.: 0.01:1.000:. ./.:4:300,293:.: 0.60:1.000:. ./.:4:451,363:.: 2.28:1.000:. ./.:4:286,133:.:-0.73:0.999:. ./.:4:359,224:.: 0.52:1.000:. ./.:4:193,232:.:-0.68:1.000:. ./.:4:307,299:.: 0.70:1.000:. ./.:4:256,74:.:-1.41:1.000:. ./.:4:306,76:.:-1.01:1.000:. ./.:4:258,157:.:-0.76:1.000:. ./.:4:237,188:.:-0.68:1.000:. ./.:4:303,265:.: 0.41:1.000:. ./.:4:253,143:.:-0.90:1.000:. ./.:4:317,209:.: 0.09:1.000:. ./.:4:383,175:.: 0.33:1.000:. ./.:4:276,137:.:-0.77:1.000:. ./.:4:344,250:.: 0.61:1.000:. ./.:4:330,203:.: 0.14:1.000:. ./.:4:248,177:.:-0.68:1.000:. ./.:4:237,162:.:-0.88:1.000:. ./.:4:280,131:.:-0.79:1.000:. ./.:4:268,218:.:-0.22:1.000:. ./.:4:285,308:.: 0.60:1.000:. ./.:5:228,135:.:-1.16:0.993:. ./.:4:314,232:.: 0.24:1.000:. ./.:4:271,204:.:-0.30:1.000:. ./.:4:453,336:.: 2.09:1.000:. ./.:4:289,244:.: 0.14:1.000:. ./.:4:251,222:.:-0.32:1.000:. ./.:4:253,197:.:-0.49:1.000:. ./.:4:266,139:.:-0.84:1.000:. ./.:4:316,193:.:-0.04:1.000:. ./.:4:276,163:.:-0.58:1.000:. ./.:4:327,230:.: 0.32:1.000:. ./.:4:218,43:.:-1.93:1.000:. ./.:4:392,187:.: 0.49:1.000:. ./.:4:484,314:.: 2.16:1.000:. ./.:4:336,284:.: 0.80:1.000:. ./.:4:294,184:.:-0.28:1.000:. ./.:4:349,257:.: 0.70:1.000:. ./.:4:273,137:.:-0.80:1.000:. ./.:4:379,203:.: 0.51:1.000:. ./.:4:351,229:.: 0.50:1.000:. ./.:4:100,70:.:-2.63:1.000:. ./.:4:265,202:.:-0.36:1.000:. ./.:4:308,228:.: 0.16:1.000:. ./.:4:340,320:.: 1.11:1.000:. ./.:4:413,324:.: 1.70:1.000:. ./.:4:340,195:.: 0.16:1.000:. ./.:4:326,190:.: 0.01:1.000:. ./.:4:457,180:.: 0.93:1.000:. ./.:4:267,131:.:-0.89:1.000:. ./.:4:273,220:.:-0.16:1.000:. ./.:4:307,340:.: 1.01:1.000:. ./.:4:351,190:.: 0.20:1.000:. ./.:4:326,164:.:-0.19:1.000:. ./.:4:351,256:.: 0.70:1.000:. ./.:4:304,224:.: 0.10:1.000:. ./.:4:340,162:.:-0.10:1.000:. ./.:4:348,238:.: 0.54:1.000:. ./.:4:277,138:.:-0.76:1.000:. ./.:4:316,150:.:-0.37:1.000:. ./.:4:249,135:.:-1.00:1.000:. ./.:4:332,80:.:-0.78:1.000:. ./.:4:302,86:.:-0.97:1.000:. ./.:4:281,118:.:-0.88:1.000:. ./.:4:268,174:.:-0.55:1.000:. ./.:4:408,209:.: 0.78:1.000:. ./.:4:409,412:.: 2.34:1.000:. ./.:4:388,242:.: 0.88:1.000:. ./.:4:325,179:.:-0.08:1.000:. ./.:4:367,188:.: 0.31:1.000:. ./.:4:368,290:.: 1.09:1.000:. ./.:4:415,310:.: 1.60:1.000:. ./.:4:298,200:.:-0.13:1.000:. ./.:4:316,141:.:-0.44:1.000:. -chr5.1 63930905 chr5.1_063930905 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:167,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:343,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:65,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:373,0:.: 2.00:0.944:. ./.:4:189,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:419,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.52:1.000:. ./.:3:64,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:145,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.77:0.996:. ./.:4:55,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:228,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:313,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:73,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:381,0:.: 2.09:0.999:. ./.:4:369,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:385,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.21:1.000:. ./.:5:205,0:.: 0.17:0.993:. ./.:4:106,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:439,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:242,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:374,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:406,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:400,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.88:1.000:. -chr5.1 64229995 chr5.1_064229995 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:2,49:0.96: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,15:0.50:-0.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,25:0.92:-0.33:1.000:0.975 0/1/1/1:4:9,27:0.72: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,39:0.71: 1.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,41:0.55: 3.16:1.000:0.975 0/0/0/1:4:12,7:0.36:-0.94:1.000:0.700 0/0/1/1:4:21,24:0.53: 1.04:1.000:0.992 0/1/1/1:4:13,24:0.63: 0.43:1.000:0.589 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-1.62:1.000:0.871 0/1/1/1:4:4,10:0.69:-1.32:1.000:0.974 0/0/1/1:4:13,9:0.40:-0.71:1.000:0.812 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,24:0.55: 0.88:1.000:0.978 0/1/1/1:4:16,39:0.69: 1.80:1.000:0.966 0/0/1/1:4:19,13:0.40: 0.05:1.000:0.787 0/0/1/1:4:17,27:0.60: 0.96:0.944:0.783 0/0/1/1:4:25,42:0.61: 2.71:1.000:0.661 0/1/1/1:4:10,36:0.75: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,31:0.61: 1.42:1.000:0.729 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,32:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,13:0.41:-0.03:1.000:0.884 0/1/1/1:4:6,43:0.86: 1.34:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,27:0.69: 0.50:1.000:0.968 0/1/1/1:4:17,50:0.72: 2.71:1.000:0.995 1/1/1/1:4:3,43:0.93: 1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,31:0.62: 1.34:1.000:0.598 0/0/1/1:4:16,20:0.55: 0.35:1.000:0.980 0/0/1/1:4:14,11:0.44:-0.48:1.000:0.960 0/1/1/1:4:12,27:0.67: 0.58:1.000:0.924 0/1/1/1:4:1,8:0.87:-1.70:1.000:0.880 0/1/1/1:4:3,8:0.70:-1.55:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:6,37:0.84: 0.88:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,26:0.63: 0.66:1.000:0.605 0/0/1/1:4:13,17:0.56:-0.10:1.000:0.968 0/0/1/1:4:15,15:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,31:0.81: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,8:0.47:-1.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:6,25:0.78:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,34:0.68: 1.26:1.000:0.965 0/1/1/1:4:10,20:0.65:-0.10:1.000:0.774 0/1/1/1:4:3,20:0.85:-0.63:1.000:0.987 0/0/1/1:4:16,26:0.61: 0.81:1.000:0.737 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,31:0.41: 3.31:1.000:0.846 0/1/1/1:4:11,23:0.66: 0.20:1.000:0.847 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,19:0.60:-0.03:1.000:0.789 0/0/1/1:4:20,19:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,23:0.74:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,12:0.39:-0.10:1.000:0.723 0/0/1/1:4:16,10:0.38:-0.41:1.000:0.522 0/1/1/1:4:17,33:0.64: 1.42:1.000:0.712 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,17:0.66:-0.48:1.000:0.868 0/0/0/1:4:22,8:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:8,14:0.62:-0.71:1.000:0.789 0/0/1/1:4:16,11:0.40:-0.33:1.000:0.798 0/0/1/1:4:15,21:0.57: 0.35:1.000:0.935 0/0/1/1:4:9,10:0.52:-0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,21:0.62: 0.12:1.000:0.555 0/0/0/1:4:17,9:0.34:-0.41:1.000:0.897 1/1/1/1:4:2,43:0.95: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.28:-1.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,12:0.42:-0.26:1.000:0.927 0/0/1/1:4:14,13:0.48:-0.33:0.996:0.995 0/1/1/1:4:9,35:0.77: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,25:0.69: 0.28:0.999:0.974 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,20:0.55: 0.35:1.000:0.980 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-0.71:1.000:0.997 1/1/1/1:4:3,41:0.92: 0.96:1.000:0.992 0/1/1/1:4:13,28:0.66: 0.73:1.000:0.884 0/0/1/1:4:8,9:0.53:-1.09:1.000:0.993 1/1/1/1:4:4,47:0.91: 1.49:1.000:0.947 0/0/1/1:4:23,24:0.51: 1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:7,3:0.29:-1.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,12:0.44:-0.33:1.000:0.968 0/0/1/1:4:13,10:0.43:-0.63:1.000:0.947 0/0/1/1:4:10,11:0.52:-0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,11:0.36:-0.10:1.000:0.721 0/1/1/1:4:9,24:0.70: 0.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:8,13:0.61:-0.79:1.000:0.737 0/0/1/1:4:17,12:0.41:-0.18:1.000:0.849 0/1/1/1:4:12,23:0.64: 0.28:1.000:0.683 0/0/1/1:4:15,26:0.62: 0.73:1.000:0.581 0/1/1/1:4:4,20:0.81:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.32:-1.24:1.000:0.950 0/0/1/1:4:17,18:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,9:0.45:-0.86:1.000:0.976 0/1/1/1:4:9,32:0.75: 0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,19:0.66:-0.26:1.000:0.860 0/0/1/1:4:12,10:0.45:-0.71:1.000:0.981 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,33:0.62: 1.57:1.000:0.576 0/1/1/1:4:6,28:0.80: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,14:0.71:-0.94:1.000:0.992 0/1/1/1:4:8,23:0.71:-0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,9:0.53:-1.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:7,12:0.62:-0.94:1.000:0.610 0/0/0/1:4:21,11:0.33: 0.05:1.000:0.909 0/0/1/1:4:11,8:0.42:-0.94:1.000:0.894 0/0/0/1:4:15,8:0.34:-0.63:1.000:0.887 0/1/1/1:4:19,36:0.64: 1.80:1.000:0.655 0/1/1/1:4:9,29:0.73: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,11:0.34:-0.03:1.000:0.838 0/0/1/1:4:27,38:0.58: 2.55:1.000:0.932 0/0/1/1:4:8,6:0.42:-1.32:0.999:0.927 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,11:0.52:-0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,14:0.41: 0.20:1.000:0.834 0/0/1/1:4:9,14:0.60:-0.63:1.000:0.819 0/0/1/1:4:18,12:0.39:-0.10:1.000:0.723 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,27:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,33:0.71: 1.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:7,18:0.70:-0.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:21,14:0.39: 0.28:1.000:0.723 0/0/1/1:4:14,19:0.57: 0.12:1.000:0.953 0/1/1/1:4:9,18:0.65:-0.33:1.000:0.774 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,13:0.63:-0.86:1.000:0.605 0/0/0/1:4:14,8:0.35:-0.71:1.000:0.755 0/1/1/1:4:5,19:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.41:-0.56:1.000:0.868 0/0/1/1:4:20,14:0.41: 0.20:1.000:0.834 0/0/1/1/1:5:6,14:0.68:-0.86:0.993:0.732 0/1/1/1:4:12,31:0.70: 0.88:1.000:0.981 0/1/1/1:4:7,28:0.77: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,47:0.71: 2.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:22,12:0.34: 0.20:1.000:0.853 0/0/1/1:4:11,14:0.55:-0.48:1.000:0.976 0/1/1/1:4:8,15:0.64:-0.63:1.000:0.629 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,16:0.58:-0.33:1.000:0.905 0/0/0/1:4:14,5:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,9:0.38:-0.63:1.000:0.615 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-1.55:1.000:0.987 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,41:0.74: 1.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,17:0.46: 0.43:1.000:0.985 1/1/1/1:4:1,33:0.97: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,24:0.65: 0.35:1.000:0.774 0/0/1/1:4:16,13:0.44:-0.18:1.000:0.974 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,11:0.40:-0.33:1.000:0.798 0/1/1/1:4:1,4:0.77:-2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,26:0.82:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.46:-0.26:1.000:0.989 0/1/1/1:4:11,46:0.78: 1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,9:0.38:-0.63:1.000:0.615 0/1/1/1:4:8,30:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,16:0.65:-0.56:1.000:0.774 0/1/1/1:4:5,17:0.74:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,9:0.53:-1.09:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,22:0.67: 0.05:1.000:0.905 0/1/1/1:4:14,39:0.71: 1.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,11:0.48:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,10:0.38:-0.41:1.000:0.522 0/0/1/1:4:7,11:0.60:-1.01:1.000:0.802 0/0/1/1:4:9,11:0.54:-0.86:1.000:0.985 0/1/1/1:4:9,22:0.69:-0.03:1.000:0.967 0/0/1/1:4:14,13:0.48:-0.33:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,22:0.95:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.46:-1.39:1.000:0.987 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,15:0.47: 0.05:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,34:0.67: 1.34:1.000:0.929 0/0/0/1:4:24,13:0.34: 0.43:1.000:0.864 0/1/1/1:4:11,30:0.71: 0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:18,19:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,27:0.58: 1.11:1.000:0.925 0/1/1/1:4:9,36:0.77: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,17:0.56:-0.10:1.000:0.968 -chr5.1 64402236 chr5.1_064402236 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,125:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,73:.:-1.00:1.000:. ./.:4:36,109:.: 0.30:1.000:. ./.:4:38,113:.: 0.47:1.000:. ./.:4:49,183:.: 2.70:1.000:. ./.:4:40,133:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,92:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,103:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,61:.:-2.02:1.000:. ./.:4:14,36:.:-2.32:1.000:. ./.:4:32,103:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.60:1.000:. ./.:4:30,113:.: 0.24:1.000:. ./.:4:22,116:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.06:1.000:. ./.:4:29,111:.: 0.16:0.944:. ./.:4:35,75:.:-0.67:1.000:. ./.:4:41,165:.: 1.99:1.000:. ./.:4:48,160:.: 2.04:1.000:. ./.:4:5,25:.:-2.88:1.000:. ./.:4:30,103:.:-0.03:1.000:. ./.:4:35,135:.: 0.99:1.000:. ./.:4:28,95:.:-0.31:1.000:. ./.:4:8,15:.:-3.07:1.000:. ./.:4:17,102:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,93:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,106:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,142:.: 1.21:1.000:. ./.:4:33,98:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.06:1.000:. ./.:4:24,86:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,41:.:-2.30:1.000:. ./.:4:11,26:.:-2.68:1.000:. ./.:3:0,22:.:-3.10:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.25:1.000:. ./.:4:36,98:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.22:1.000:. ./.:4:22,83:.:-0.81:1.000:. ./.:4:23,91:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.24:1.000:. ./.:4:27,116:.: 0.24:1.000:. ./.:4:32,136:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.61:1.000:. ./.:4:32,107:.: 0.13:1.000:. ./.:4:30,92:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,128:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,38:.:-2.66:1.000:. ./.:4:27,93:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,187:.: 1.46:1.000:. ./.:4:26,103:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.27:1.000:. ./.:4:20,83:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,86:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,108:.: 0.22:1.000:. ./.:6:12,110:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.52:1.000:. ./.:4:20,114:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.02:1.000:. ./.:4:28,65:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.94:1.000:. ./.:4:27,118:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.28:0.996:. ./.:4:60,64:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,111:.: 0.44:1.000:. ./.:4:23,85:.:-0.72:0.999:. ./.:4:0,102:.:-0.89:1.000:. ./.:4:31,146:.: 1.18:1.000:. ./.:4:36,101:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,83:.:-0.86:1.000:. ./.:4:20,79:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.83:1.000:. ./.:4:30,123:.: 0.52:1.000:. ./.:4:30,120:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,91:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,174:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.91:1.000:. ./.:4:24,89:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,106:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.64:1.000:. ./.:4:22,74:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.92:1.000:. ./.:4:26,125:.: 0.47:1.000:. ./.:4:29,118:.: 0.36:1.000:. ./.:4:28,75:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.03:1.000:. ./.:4:39,109:.: 0.38:1.000:. ./.:4:38,114:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,91:.:-0.72:1.000:. ./.:4:33,115:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,227:.: 2.57:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.63:1.000:. ./.:4:37,106:.: 0.24:1.000:. ./.:4:52,145:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.71:0.999:. ./.:4:0,185:.: 1.41:1.000:. ./.:4:19,54:.:-1.69:1.000:. ./.:4:30,121:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.06:1.000:. ./.:4:34,82:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,118:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,100:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,96:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.71:1.000:. ./.:4:34,98:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.24:1.000:. ./.:4:42,49:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,96:.:-1.05:1.000:. ./.:4:22,79:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,131:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,108:.: 0.02:1.000:. ./.:5:22,110:.:-0.06:0.993:. ./.:4:23,62:.:-1.36:1.000:. ./.:4:22,88:.:-0.67:1.000:. ./.:4:35,136:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,78:.:-1.05:1.000:. ./.:4:21,93:.:-0.56:1.000:. ./.:4:35,109:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.49:1.000:. ./.:4:24,106:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,220:.: 2.37:1.000:. ./.:4:57,148:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.77:1.000:. ./.:4:36,128:.: 0.83:1.000:. ./.:4:44,115:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,200:.: 1.82:1.000:. ./.:4:35,108:.: 0.24:1.000:. ./.:4:5,30:.:-2.74:1.000:. ./.:4:48,119:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,153:.: 1.46:1.000:. ./.:4:39,177:.: 2.26:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.52:1.000:. ./.:4:35,119:.: 0.55:1.000:. ./.:4:42,134:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.33:1.000:. ./.:4:31,101:.:-0.06:1.000:. ./.:4:38,123:.: 0.74:1.000:. ./.:4:30,110:.: 0.16:1.000:. ./.:4:18,78:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.33:1.000:. ./.:4:29,107:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.61:1.000:. ./.:4:35,104:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.74:1.000:. ./.:4:43,142:.: 1.41:1.000:. ./.:4:31,96:.:-0.20:1.000:. ./.:4:25,99:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,176:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,199:.: 1.79:1.000:. ./.:4:31,150:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,124:.: 0.71:1.000:. -chr5.1 64764786 chr5.1_064764786 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.08:1.000:. ./.:4:46,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:36,36:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,36:.:-1.17:1.000:. ./.:4:2,10:.:-2.26:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.36:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.45:1.000:. ./.:4:30,33:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:35,21:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.60:0.944:. ./.:4:61,27:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:31,29:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,4:.:-2.58:1.000:. ./.:4:39,39:.: 0.73:1.000:. ./.:4:33,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.42:1.000:. ./.:4:30,35:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,48:.: 1.28:1.000:. ./.:4:25,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.54:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.95:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:28,40:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,65:.: 2.37:1.000:. ./.:4:41,43:.: 1.01:1.000:. ./.:4:32,54:.: 1.10:1.000:. ./.:4:43,58:.: 1.78:1.000:. ./.:4:57,47:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,55:.: 2.14:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,11:.:-2.31:1.000:. ./.:4:33,55:.: 1.19:1.000:. ./.:4:67,63:.: 3.10:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:38,38:.: 0.64:1.000:. ./.:4:41,45:.: 1.10:1.000:. ./.:4:49,50:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,46:.: 1.05:1.000:. ./.:4:47,56:.: 1.87:1.000:. ./.:4:40,51:.: 1.33:1.000:. ./.:6:27,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:41,43:.: 1.01:1.000:. ./.:4:50,44:.: 1.46:1.000:. ./.:4:43,35:.: 0.73:1.000:. ./.:4:37,60:.: 1.60:1.000:. ./.:4:38,52:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.67:1.000:. ./.:4:40,44:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.37:0.996:. ./.:4:0,40:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,60:.: 1.83:1.000:. ./.:4:1,38:.:-1.04:0.999:. ./.:4:0,73:.: 0.51:1.000:. ./.:4:34,47:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:49,45:.: 1.46:1.000:. ./.:4:33,46:.: 0.78:1.000:. ./.:4:47,48:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,25:.:-0.13:1.000:. ./.:4:42,34:.: 0.64:1.000:. ./.:4:31,36:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,52:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.17:1.000:. ./.:4:25,33:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,34:.: 0.60:1.000:. ./.:4:20,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:31,51:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:29,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.19:1.000:. ./.:4:31,47:.: 0.73:0.999:. ./.:4:32,41:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1,72:.: 0.51:1.000:. ./.:4:35,41:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,33:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,29:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,35:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:30,40:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,33:.: 0.96:1.000:. ./.:4:37,27:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.46:1.000:. ./.:4:27,22:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.19:1.000:. ./.:4:36,36:.: 0.46:1.000:. ./.:5:0,40:.:-0.99:0.993:. ./.:4:0,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:38,32:.: 0.37:1.000:. ./.:4:52,38:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1,66:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,40:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:24,47:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.08:1.000:. ./.:4:25,30:.:-0.31:1.000:. ./.:4:19,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,43:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:38,41:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,36:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.45:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.63:1.000:. ./.:4:36,58:.: 1.46:1.000:. ./.:4:45,39:.: 1.01:1.000:. ./.:4:37,34:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,29:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,40:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,24:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,47:.: 1.10:1.000:. ./.:4:41,45:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.67:1.000:. ./.:4:24,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:42,26:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.08:1.000:. ./.:4:23,28:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.99:1.000:. ./.:4:34,51:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,40:.: 0.46:1.000:. ./.:4:26,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:45,39:.: 1.01:1.000:. ./.:4:37,46:.: 0.96:1.000:. ./.:4:40,37:.: 0.69:1.000:. ./.:4:29,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,42:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.08:1.000:. ./.:4:26,37:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.08:1.000:. -chr5.1 64929027 chr5.1_064929027 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:15,8:0.53: 1.45:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,9:0.55: 1.59:1.000:0.981 0/0/1/1:4:13,5:0.46: 0.78:1.000:0.988 0/0/0/1:4:9,2:0.36:-0.16:1.000:0.742 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,1:0.23: 0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.36:-0.16:1.000:0.742 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,5:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,4:0.40: 0.78:1.000:0.790 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.58:-0.02:0.944:0.910 0/0/1/1:4:27,9:0.43: 3.20:1.000:0.948 0/0/1/1:4:22,10:0.50: 2.66:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,1:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,1:0.38:-0.96:1.000:0.507 0/0/1/1:4:9,4:0.49: 0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.55: 0.51:1.000:0.981 0/0/1/1:4:13,7:0.53: 1.05:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.53: 0.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,1:0.43:-1.10:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.10:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:12,20:0.74: 2.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,6:0.47: 1.18:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,4:0.43: 0.51:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.83:-0.56:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.29: 1.72:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.59: 2.12:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:7,8:0.67: 0.38:1.000:0.921 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,3:0.39: 0.24:1.000:0.704 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,10:0.65: 1.05:1.000:0.752 0/0/1/1:4:5,3:0.55:-0.56:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.57:-0.96:0.999:0.951 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,7:0.41: 2.39:1.000:0.877 0/0/1/1:4:12,6:0.52: 0.78:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,7:0.53: 1.05:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.25: 1.45:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,4:0.40: 0.78:1.000:0.790 0/0/1/1:4:13,5:0.46: 0.78:1.000:0.988 0/0/0/1:4:18,3:0.31: 1.18:1.000:0.970 0/0/0/1:4:13,1:0.24: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,5:0.65:-0.29:1.000:0.752 0/0/1/1:4:11,3:0.39: 0.24:1.000:0.704 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.54:-0.16:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,3:0.41: 0.11:1.000:0.860 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,2:0.40:-0.43:1.000:0.790 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,4:0.49: 0.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.58: 3.87:1.000:0.916 0/1/1/1:4:11,14:0.69: 1.72:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,11:0.68: 1.05:0.999:0.964 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,10:0.67: 0.92:1.000:0.904 0/0/1/1:4:10,6:0.55: 0.51:1.000:0.981 0/1/1/1:4:5,9:0.76: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.29:-0.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,8:0.44: 2.53:1.000:0.967 0/1/1/1:4:13,12:0.63: 1.72:1.000:0.567 0/0/0/1:4:13,2:0.30: 0.38:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,2:0.43:-0.56:1.000:0.948 0/0/1/1:4:6,5:0.61:-0.16:1.000:0.686 1/1/1/1:4:0,20:1.00: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:7,3:0.49:-0.29:0.993:0.635 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.29:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:13,1:0.24: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,3:0.38: 0.38:1.000:0.507 0/0/1/1:4:15,6:0.47: 1.18:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.53: 0.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.34:-0.02:1.000:0.879 0/0/1/1:4:27,9:0.43: 3.20:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.31: 1.18:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.56: 1.45:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,2:0.28: 0.78:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.61: 1.05:1.000:0.725 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,1:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,10:0.63: 1.18:1.000:0.527 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.34:-0.02:1.000:0.879 0/0/1/1:4:2,1:0.52:-1.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,6:0.57: 0.38:1.000:0.951 0/1/1/1:4:9,13:0.72: 1.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,7:0.65: 0.24:1.000:0.752 0/0/1/1:4:17,10:0.55: 1.99:1.000:0.984 0/0/1/1:4:14,7:0.52: 1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,3:0.30: 1.32:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,3:0.46:-0.16:1.000:0.985 0/0/1/1:4:13,7:0.53: 1.05:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.56:1.000:1.000 -chr5.1 65018296 chr5.1_065018296 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:78,293:0.77: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,83:0.28:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:164,172:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,181:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:101,335:0.74: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:217,247:0.51: 1.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,280:0.77: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,219:0.51: 1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:99,316:0.74: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,48:0.46:-2.85:1.000:0.986 0/1/1/1:4:21,94:0.80:-2.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:275,103:0.28: 0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:149,191:0.54: 0.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:167,247:0.58: 1.04:1.000:0.931 0/1/1/1:4:80,277:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,215:0.55: 0.62:1.000:0.984 0/1/1/1:4:78,305:0.77: 0.65:0.944:1.000 0/0/1/1:4:202,222:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:128,372:0.72: 2.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:224,248:0.51: 1.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,84:0.74:-2.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,185:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,228:0.55: 0.88:1.000:0.982 0/1/1/1:4:113,272:0.68: 0.68:1.000:0.962 0/0/1/1:4:24,33:0.56:-3.41:1.000:0.970 0/1/1/1:4:91,356:0.77: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,117:0.31: 0.71:1.000:0.974 0/1/1/1:4:89,229:0.70:-0.16:1.000:0.982 0/0/1/1:4:186,197:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:231,204:0.46: 1.30:1.000:0.985 0/0/1/1:4:205,193:0.47: 0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:176,177:0.48: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,36:0.63:-3.43:1.000:0.596 0/1/1/1:4:29,58:0.64:-3.03:1.000:0.738 0/1/1:3:9,25:0.71:-3.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,313:0.74: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:230,88:0.29:-0.16:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,355:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,192:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,214:0.52: 0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:161,153:0.47:-0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:146,178:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:154,166:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,220:0.76:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,207:0.55: 0.37:1.000:0.975 0/0/1/1:4:151,179:0.52:-0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:86,311:0.76: 0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,273:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,127:0.47:-0.84:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,202:0.78:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,171:0.77:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,177:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,167:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,193:0.49: 0.64:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,332:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,277:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:166,188:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,174:0.48: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:253,77:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:140,155:0.51:-0.44:1.000:0.887 0/0/1/1:4:183,184:0.48: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:199,83:0.30:-0.61:1.000:0.982 0/0/1/1:4:100,176:0.62:-0.68:1.000:0.622 0/0/0/1:4:207,89:0.31:-0.43:1.000:0.975 0/0/1/1:4:170,182:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,224:0.69:-0.18:1.000:0.967 0/1/1/1:4:70,251:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,195:0.52: 0.42:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,376:1.00: 0.57:0.996:1.000 0/0/0/0:4:258,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,247:0.54: 1.36:1.000:0.987 0/1/1/1:4:77,249:0.74:-0.06:0.999:0.999 0/1/1/1:4:77,277:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,155:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,153:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,248:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,240:0.74:-0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:71,243:0.75:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,262:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,226:0.54: 0.88:1.000:0.986 0/0/1/1:4:119,146:0.53:-0.82:1.000:0.992 0/1/1/1:4:75,236:0.74:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:210,221:0.49: 1.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,226:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,171:0.47: 0.25:1.000:0.993 0/1/1/1:4:94,311:0.74: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:177,93:0.35:-0.75:1.000:0.819 0/0/1/1:4:127,125:0.48:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:186,73:0.29:-0.89:1.000:0.991 0/1/1/1:4:76,223:0.72:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,236:0.77:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,239:0.79:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,197:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,183:0.76:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,191:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,277:0.71: 0.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:45,203:0.80:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,235:0.77:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,204:0.57: 0.15:1.000:0.936 0/1/1/1:4:88,264:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,157:0.54:-0.61:1.000:0.990 0/0/1/1:4:158,193:0.53: 0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:96,146:0.58:-1.10:1.000:0.905 0/1/1/1:4:68,259:0.77:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,189:0.73:-1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:156,149:0.47:-0.32:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,286:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,272:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,367:0.78: 1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,282:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,59:0.32:-1.80:1.000:0.945 0/1/1/1:4:96,366:0.77: 1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,143:0.50:-0.69:0.999:0.997 0/0/1/1:4:188,250:0.55: 1.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:124,141:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,62:0.19: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,344:0.99: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,285:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,160:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,166:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:161,160:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:68,227:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,198:0.52: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,284:0.74: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,144:0.51:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,158:0.52:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:146,176:0.53:-0.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:174,71:0.30:-1.07:1.000:0.986 0/0/1/1:4:120,127:0.49:-1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,172:0.75:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,215:0.72:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:282,106:0.28: 0.71:1.000:0.994 0/1/1/1/1:5:41,233:0.83:-0.71:0.993:0.999 0/1/1/1:4:63,231:0.76:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,162:0.55:-0.57:1.000:0.982 0/0/0/1:4:333,116:0.27: 1.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,252:0.72: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:177,68:0.29:-1.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:130,138:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,217:0.73:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,147:0.47:-0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:68,266:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,155:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,215:0.77:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,213:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,316:0.74: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,281:0.80: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,283:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,305:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,276:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,346:0.81: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,192:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,59:0.71:-3.11:1.000:0.989 0/0/1/1:4:128,176:0.56:-0.33:1.000:0.970 0/0/1/1:4:184,201:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,184:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:205,221:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:98,330:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,188:0.58:-0.19:1.000:0.930 0/0/1/1:4:161,232:0.57: 0.78:1.000:0.948 0/1/1/1:4:82,308:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,204:0.73:-0.75:1.000:0.998 0/0/0/1:4:240,99:0.30: 0.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:152,185:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:183,193:0.49: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,298:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,176:0.52:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,194:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,172:0.55:-0.34:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,405:1.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,152:0.49:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,228:0.74:-0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,252:0.74:-0.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,308:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,167:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,151:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:241,244:0.49: 1.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:285,93:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,198:0.53: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:156,179:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,237:0.55: 1.01:1.000:0.975 0/1/1/1:4:106,400:0.77: 2.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,402:0.74: 2.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,169:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,179:0.52: 0.03:1.000:0.995 -chr5.1 65217067 chr5.1_065217067 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:18,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,2:.:-1.58:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.50:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,4:.:-1.42:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:53,30:.: 1.25:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:28,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,3:.:-1.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.38:0.944:. ./.:4:11,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:22,5:.:-1.01:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.18:1.000:. ./.:4:48,18:.: 0.56:1.000:. ./.:4:11,6:.:-1.42:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,4:.:-1.30:1.000:. ./.:4:41,14:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.42:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:60,5:.: 0.52:1.000:. ./.:4:70,9:.: 1.09:1.000:. ./.:3:33,6:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,2:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:52,8:.: 0.32:1.000:. ./.:4:120,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:40,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:77,12:.: 1.49:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.13:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.28:1.000:. ./.:6:83,12:.: 1.73:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:51,11:.: 0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:56,14:.: 0.72:1.000:. ./.:4:35,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.34:0.996:. ./.:4:36,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.13:0.999:. ./.:4:61,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,14:.: 0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:59,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:117,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:27,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:79,17:.: 1.77:1.000:. ./.:4:45,11:.: 0.16:1.000:. ./.:4:44,13:.: 0.20:1.000:. ./.:4:52,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:59,13:.: 0.80:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:79,19:.: 1.86:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,20:.: 0.68:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.84:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.25:1.000:. ./.:4:38,5:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,11:.: 0.76:0.999:. ./.:4:70,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:50,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:42,18:.: 0.32:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:59,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,11:.: 0.44:1.000:. ./.:4:13,5:.:-1.38:1.000:. ./.:4:43,16:.: 0.28:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:47,7:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.04:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.42:1.000:. ./.:5:57,12:.: 0.68:0.993:. ./.:4:72,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:25,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:55,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:67,16:.: 1.25:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:51,12:.: 0.44:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:43,10:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,11:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.30:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.37:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.93:1.000:. ./.:4:20,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.73:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.30:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.18:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:19,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.97:1.000:. ./.:4:31,8:.:-0.53:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.37:1.000:. -chr5.1 65422746 chr5.1_065422746 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:185,222:.: 0.77:1.000:. ./.:4:285,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:103,179:.:-0.80:1.000:. ./.:4:200,190:.: 0.56:1.000:. ./.:4:233,102:.:-0.13:1.000:. ./.:4:332,89:.: 0.95:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:189,179:.: 0.28:1.000:. ./.:4:305,80:.: 0.49:1.000:. ./.:4:112,56:.:-2.22:1.000:. ./.:4:101,33:.:-2.65:1.000:. ./.:4:304,83:.: 0.52:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:312,86:.: 0.66:1.000:. ./.:4:267,79:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,97:.:-0.73:1.000:. ./.:4:207,109:.:-0.37:0.944:. ./.:4:239,98:.:-0.11:1.000:. ./.:4:290,115:.: 0.74:1.000:. ./.:4:122,228:.: 0.06:1.000:. ./.:4:77,81:.:-2.35:1.000:. ./.:4:169,154:.:-0.28:1.000:. ./.:4:310,95:.: 0.74:1.000:. ./.:4:81,177:.:-1.10:1.000:. ./.:4:63,23:.:-3.25:1.000:. ./.:4:331,100:.: 1.07:1.000:. ./.:4:208,195:.: 0.72:1.000:. ./.:4:112,179:.:-0.68:1.000:. ./.:4:317,100:.: 0.90:1.000:. ./.:4:251,217:.: 1.53:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:196,170:.: 0.26:1.000:. ./.:4:40,35:.:-3.39:1.000:. ./.:4:125,111:.:-1.37:1.000:. ./.:3:53,15:.:-3.48:1.000:. ./.:4:206,101:.:-0.48:1.000:. ./.:4:195,193:.: 0.53:1.000:. ./.:4:218,123:.:-0.06:1.000:. ./.:4:328,98:.: 1.01:1.000:. ./.:4:128,266:.: 0.61:1.000:. ./.:4:204,98:.:-0.55:1.000:. ./.:4:99,192:.:-0.68:1.000:. ./.:4:113,195:.:-0.47:1.000:. ./.:4:193,88:.:-0.81:1.000:. ./.:4:132,237:.: 0.29:1.000:. ./.:4:224,193:.: 0.90:1.000:. ./.:4:134,196:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,54:.:-2.17:1.000:. ./.:4:92,192:.:-0.77:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:191,83:.:-0.90:1.000:. ./.:4:307,105:.: 0.83:1.000:. ./.:4:294,84:.: 0.41:1.000:. ./.:4:320,122:.: 1.21:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:219,218:.: 1.15:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:124,204:.:-0.22:1.000:. ./.:4:344,105:.: 1.30:1.000:. ./.:6:290,87:.: 0.39:1.000:. ./.:4:335,130:.: 1.50:1.000:. ./.:4:156,196:.: 0.08:1.000:. ./.:4:163,123:.:-0.75:1.000:. ./.:4:325,104:.: 1.05:1.000:. ./.:4:323,100:.: 0.97:1.000:. ./.:4:225,188:.: 0.85:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:232,100:.:-0.17:1.000:. ./.:4:209,107:.:-0.37:0.996:. ./.:4:149,177:.:-0.24:1.000:. ./.:4:395,99:.: 1.86:1.000:. ./.:4:201,55:.:-1.12:0.999:. ./.:4:254,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:223,100:.:-0.28:1.000:. ./.:4:190,106:.:-0.62:1.000:. ./.:4:104,168:.:-0.92:1.000:. ./.:4:243,100:.:-0.03:1.000:. ./.:4:321,96:.: 0.90:1.000:. ./.:4:225,201:.: 1.01:1.000:. ./.:4:247,227:.: 1.61:1.000:. ./.:4:205,80:.:-0.76:1.000:. ./.:4:303,112:.: 0.87:1.000:. ./.:4:357,120:.: 1.65:1.000:. ./.:4:265,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:206,106:.:-0.42:1.000:. ./.:4:334,109:.: 1.22:1.000:. ./.:4:207,82:.:-0.71:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:298,86:.: 0.48:1.000:. ./.:4:190,169:.: 0.17:1.000:. ./.:4:178,135:.:-0.41:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:276,104:.: 0.43:1.000:. ./.:4:212,60:.:-0.92:1.000:. ./.:4:243,217:.: 1.43:1.000:. ./.:4:130,210:.:-0.07:1.000:. ./.:4:112,178:.:-0.70:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:369,105:.: 1.61:1.000:. ./.:4:199,171:.: 0.31:1.000:. ./.:4:209,75:.:-0.77:1.000:. ./.:4:105,211:.:-0.37:1.000:. ./.:4:261,89:.: 0.06:1.000:. ./.:4:277,105:.: 0.46:1.000:. ./.:4:189,77:.:-1.00:1.000:. ./.:4:195,89:.:-0.77:1.000:. ./.:4:189,82:.:-0.93:1.000:. ./.:4:331,101:.: 1.08:1.000:. ./.:4:222,116:.:-0.09:1.000:. ./.:4:302,102:.: 0.73:1.000:. ./.:4:267,100:.: 0.27:1.000:. ./.:4:165,253:.: 0.91:1.000:. ./.:4:219,103:.:-0.29:0.999:. ./.:4:362,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:183,157:.:-0.07:1.000:. ./.:4:395,113:.: 2.04:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:293,5:.:-0.60:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:101,153:.:-1.15:1.000:. ./.:4:121,184:.:-0.51:1.000:. ./.:4:260,105:.: 0.24:1.000:. ./.:4:327,127:.: 1.36:1.000:. ./.:4:400,5:.: 0.74:1.000:. ./.:4:288,97:.: 0.49:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:445,2:.: 1.27:1.000:. ./.:4:207,170:.: 0.39:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:205,95:.:-0.57:1.000:. ./.:4:201,94:.:-0.63:1.000:. ./.:4:176,173:.: 0.04:1.000:. ./.:5:170,135:.:-0.51:0.993:. ./.:4:210,100:.:-0.45:1.000:. ./.:4:194,181:.: 0.37:1.000:. ./.:4:356,134:.: 1.81:1.000:. ./.:4:294,105:.: 0.67:1.000:. ./.:4:201,166:.: 0.27:1.000:. ./.:4:298,80:.: 0.41:1.000:. ./.:4:114,196:.:-0.45:1.000:. ./.:4:259,96:.: 0.12:1.000:. ./.:4:400,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:195,120:.:-0.38:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:227,232:.: 1.42:1.000:. ./.:4:221,89:.:-0.45:1.000:. ./.:4:86,173:.:-1.08:1.000:. ./.:4:235,230:.: 1.50:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:286,97:.: 0.47:1.000:. ./.:4:99,72:.:-2.19:1.000:. ./.:4:143,144:.:-0.73:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:223,89:.:-0.42:1.000:. ./.:4:234,201:.: 1.12:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:235,84:.:-0.33:1.000:. ./.:4:305,90:.: 0.62:1.000:. ./.:4:262,97:.: 0.17:1.000:. ./.:4:86,136:.:-1.55:1.000:. ./.:4:282,89:.: 0.32:1.000:. ./.:4:274,82:.: 0.13:1.000:. ./.:4:210,111:.:-0.31:1.000:. ./.:4:318,72:.: 0.56:1.000:. ./.:4:263,96:.: 0.17:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:181,97:.:-0.85:1.000:. ./.:4:200,80:.:-0.82:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:155,57:.:-1.67:1.000:. ./.:4:298,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:194,98:.:-0.67:1.000:. ./.:4:355,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:181,73:.:-1.15:1.000:. ./.:4:524,1:.: 2.25:1.000:. ./.:4:209,192:.: 0.69:1.000:. ./.:4:297,97:.: 0.61:1.000:. ./.:4:237,73:.:-0.45:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:269,116:.: 0.49:1.000:. ./.:4:250,218:.: 1.53:1.000:. ./.:4:312,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:177,92:.:-0.96:1.000:. -chr5.1 65688457 chr5.1_065688457 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:204,73:.: 0.47:1.000:. ./.:4:215,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:152,169:.: 1.32:1.000:. ./.:4:163,195:.: 2.03:1.000:. ./.:4:111,121:.:-0.39:1.000:. ./.:4:189,62:.:-0.03:1.000:. ./.:4:119,130:.:-0.07:1.000:. ./.:4:137,4:.:-2.14:1.000:. ./.:4:66,77:.:-2.10:1.000:. ./.:4:232,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:176,71:.:-0.11:1.000:. ./.:4:144,155:.: 0.89:1.000:. ./.:4:135,156:.: 0.74:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:150,184:.: 1.57:0.944:. ./.:4:242,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,208:.: 2.09:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:174,26:.:-1.01:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:221,74:.: 0.82:1.000:. ./.:4:200,73:.: 0.39:1.000:. ./.:4:91,27:.:-2.59:1.000:. ./.:4:145,205:.: 1.87:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:178,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:139,177:.: 1.22:1.000:. ./.:4:203,85:.: 0.68:1.000:. ./.:4:252,97:.: 1.86:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,63:.:-1.70:1.000:. ./.:4:150,63:.:-0.76:1.000:. ./.:3:62,31:.:-3.07:1.000:. ./.:4:198,86:.: 0.61:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:207,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:281,98:.: 2.43:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:302,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:163,66:.:-0.45:1.000:. ./.:4:278,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:199,86:.: 0.63:1.000:. ./.:4:191,90:.: 0.55:1.000:. ./.:4:115,36:.:-1.95:1.000:. ./.:4:218,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:273,97:.: 2.26:1.000:. ./.:4:173,75:.:-0.09:1.000:. ./.:4:307,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:198,64:.: 0.18:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:110,138:.:-0.09:1.000:. ./.:4:225,90:.: 1.20:1.000:. ./.:4:170,67:.:-0.30:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:161,83:.:-0.16:1.000:. ./.:6:189,22:.:-0.80:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:209,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,85:.: 0.34:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:197,65:.: 0.18:1.000:. ./.:4:106,133:.:-0.26:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:192,56:.:-0.09:0.996:. ./.:4:199,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:231,88:.: 1.28:1.000:. ./.:4:164,159:.: 1.36:0.999:. ./.:4:262,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:165,67:.:-0.39:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:162,49:.:-0.80:1.000:. ./.:4:131,125:.: 0.07:1.000:. ./.:4:155,78:.:-0.37:1.000:. ./.:4:193,80:.: 0.39:1.000:. ./.:4:207,89:.: 0.84:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:183,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:153,86:.:-0.26:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:214,78:.: 0.76:1.000:. ./.:4:130,43:.:-1.53:1.000:. ./.:4:157,53:.:-0.82:1.000:. ./.:4:189,54:.:-0.18:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:180,47:.:-0.49:1.000:. ./.:4:109,151:.: 0.14:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,59:.:-1.41:1.000:. ./.:4:222,92:.: 1.18:1.000:. ./.:4:241,92:.: 1.55:1.000:. ./.:4:147,42:.:-1.22:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:139,149:.: 0.68:1.000:. ./.:4:204,68:.: 0.38:1.000:. ./.:4:170,60:.:-0.43:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:157,69:.:-0.51:1.000:. ./.:4:133,54:.:-1.26:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:159,67:.:-0.51:1.000:. ./.:4:176,79:.: 0.05:1.000:. ./.:4:235,73:.: 1.07:1.000:. ./.:4:188,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:149,52:.:-0.99:1.000:. ./.:4:274,104:.: 2.41:1.000:. ./.:4:172,59:.:-0.41:0.999:. ./.:4:238,74:.: 1.14:1.000:. ./.:4:128,49:.:-1.45:1.000:. ./.:4:201,80:.: 0.55:1.000:. ./.:4:140,163:.: 0.97:1.000:. ./.:4:109,137:.:-0.12:1.000:. ./.:4:176,79:.: 0.05:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:118,127:.:-0.14:1.000:. ./.:4:117,184:.: 0.93:1.000:. ./.:4:115,147:.: 0.18:1.000:. ./.:4:198,79:.: 0.47:1.000:. ./.:4:196,85:.: 0.55:1.000:. ./.:4:165,83:.:-0.09:1.000:. ./.:4:211,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:139,64:.:-0.95:1.000:. ./.:4:83,115:.:-1.05:1.000:. ./.:4:149,75:.:-0.55:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.22:1.000:. ./.:5:136,103:.:-0.26:0.993:. ./.:4:179,78:.: 0.09:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:254,96:.: 1.87:1.000:. ./.:4:188,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,112:.:-1.03:1.000:. ./.:4:129,50:.:-1.41:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:106,137:.:-0.18:1.000:. ./.:4:159,58:.:-0.68:1.000:. ./.:4:115,59:.:-1.51:1.000:. ./.:4:223,94:.: 1.24:1.000:. ./.:4:242,81:.: 1.36:1.000:. ./.:4:183,87:.: 0.34:1.000:. ./.:4:164,68:.:-0.39:1.000:. ./.:4:256,74:.: 1.49:1.000:. ./.:4:102,120:.:-0.59:1.000:. ./.:4:210,89:.: 0.89:1.000:. ./.:4:175,83:.: 0.11:1.000:. ./.:4:79,19:.:-2.97:1.000:. ./.:4:102,48:.:-1.97:1.000:. ./.:4:212,86:.: 0.87:1.000:. ./.:4:203,82:.: 0.63:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:141,194:.: 1.59:1.000:. ./.:4:148,51:.:-1.03:1.000:. ./.:4:209,87:.: 0.84:1.000:. ./.:4:168,68:.:-0.32:1.000:. ./.:4:150,58:.:-0.86:1.000:. ./.:4:166,64:.:-0.43:1.000:. ./.:4:167,77:.:-0.16:1.000:. ./.:4:202,73:.: 0.43:1.000:. ./.:4:179,78:.: 0.09:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:266,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:141,51:.:-1.16:1.000:. ./.:4:173,78:.:-0.03:1.000:. ./.:4:135,55:.:-1.20:1.000:. ./.:4:152,63:.:-0.72:1.000:. ./.:4:181,63:.:-0.16:1.000:. ./.:4:150,58:.:-0.86:1.000:. ./.:4:211,41:.:-0.01:1.000:. ./.:4:154,50:.:-0.93:1.000:. ./.:4:215,92:.: 1.05:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:219,77:.: 0.84:1.000:. ./.:4:173,57:.:-0.43:1.000:. ./.:4:203,69:.: 0.38:1.000:. ./.:4:218,87:.: 1.01:1.000:. ./.:4:220,88:.: 1.07:1.000:. ./.:4:182,69:.:-0.03:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.59:1.000:. -chr5.1 65945259 chr5.1_065945259 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:449,340:.: 0.67:1.000:. ./.:4:326,394:.: 0.34:1.000:. ./.:4:248,263:.:-0.65:1.000:. ./.:4:454,301:.: 0.51:1.000:. ./.:4:358,326:.: 0.17:1.000:. ./.:4:495,696:.: 2.58:1.000:. ./.:4:370,251:.:-0.13:1.000:. ./.:4:359,267:.:-0.10:1.000:. ./.:4:438,571:.: 1.72:1.000:. ./.:4:99,57:.:-2.34:1.000:. ./.:4:84,65:.:-2.37:1.000:. ./.:4:388,474:.: 1.02:1.000:. ./.:4:373,249:.:-0.12:1.000:. ./.:4:413,480:.: 1.17:1.000:. ./.:4:386,374:.: 0.53:1.000:. ./.:4:336,237:.:-0.35:1.000:. ./.:4:328,217:.:-0.49:0.944:. ./.:4:480,429:.: 1.24:1.000:. ./.:4:445,806:.: 2.87:1.000:. ./.:4:397,457:.: 0.98:1.000:. ./.:4:100,25:.:-2.49:1.000:. ./.:4:379,242:.:-0.13:1.000:. ./.:4:459,418:.: 1.09:1.000:. ./.:4:309,577:.: 1.13:1.000:. ./.:4:43,15:.:-2.80:1.000:. ./.:4:476,440:.: 1.28:1.000:. ./.:4:452,328:.: 0.63:1.000:. ./.:4:338,410:.: 0.48:1.000:. ./.:4:495,585:.: 2.06:1.000:. ./.:4:456,186:.:-0.03:1.000:. ./.:4:449,196:.:-0.01:1.000:. ./.:4:335,326:.: 0.06:1.000:. ./.:4:85,21:.:-2.58:1.000:. ./.:4:120,31:.:-2.36:1.000:. ./.:3:26,37:.:-2.78:1.000:. ./.:4:331,464:.: 0.70:1.000:. ./.:4:421,455:.: 1.09:1.000:. ./.:4:317,311:.:-0.09:1.000:. ./.:4:360,163:.:-0.59:1.000:. ./.:4:305,493:.: 0.72:1.000:. ./.:4:243,175:.:-1.09:1.000:. ./.:4:313,200:.:-0.64:1.000:. ./.:4:276,473:.: 0.48:1.000:. ./.:4:239,360:.:-0.23:1.000:. ./.:4:294,465:.: 0.53:1.000:. ./.:4:363,264:.:-0.10:1.000:. ./.:4:377,651:.: 1.81:1.000:. ./.:4:591,568:.: 2.43:1.000:. ./.:4:248,232:.:-0.80:1.000:. ./.:4:292,342:.:-0.06:1.000:. ./.:4:194,304:.:-0.71:1.000:. ./.:4:490,432:.: 1.31:1.000:. ./.:4:331,275:.:-0.20:1.000:. ./.:4:393,401:.: 0.70:1.000:. ./.:4:280,284:.:-0.40:1.000:. ./.:4:383,157:.:-0.51:1.000:. ./.:4:376,443:.: 0.82:1.000:. ./.:4:295,314:.:-0.18:1.000:. ./.:4:317,361:.: 0.14:1.000:. ./.:6:240,143:.:-1.26:1.000:. ./.:4:325,154:.:-0.80:1.000:. ./.:4:322,242:.:-0.40:1.000:. ./.:4:211,367:.:-0.33:1.000:. ./.:4:324,189:.:-0.64:1.000:. ./.:4:427,563:.: 1.63:1.000:. ./.:4:383,401:.: 0.65:1.000:. ./.:4:226,218:.:-0.97:1.000:. ./.:4:257,352:.:-0.18:1.000:. ./.:4:257,398:.: 0.04:0.996:. ./.:4:369,184:.:-0.45:1.000:. ./.:4:418,300:.: 0.34:1.000:. ./.:4:298,190:.:-0.76:0.999:. ./.:4:219,257:.:-0.82:1.000:. ./.:4:284,271:.:-0.44:1.000:. ./.:4:265,416:.: 0.16:1.000:. ./.:4:209,181:.:-1.23:1.000:. ./.:4:366,376:.: 0.45:1.000:. ./.:4:345,434:.: 0.63:1.000:. ./.:4:349,466:.: 0.80:1.000:. ./.:4:384,435:.: 0.82:1.000:. ./.:4:197,284:.:-0.79:1.000:. ./.:4:379,224:.:-0.21:1.000:. ./.:4:369,446:.: 0.80:1.000:. ./.:4:257,328:.:-0.30:1.000:. ./.:4:276,138:.:-1.11:1.000:. ./.:4:388,393:.: 0.63:1.000:. ./.:4:260,249:.:-0.66:1.000:. ./.:4:257,267:.:-0.59:1.000:. ./.:4:286,197:.:-0.78:1.000:. ./.:4:336,366:.: 0.26:1.000:. ./.:4:307,402:.: 0.29:1.000:. ./.:4:317,231:.:-0.47:1.000:. ./.:4:268,366:.:-0.06:1.000:. ./.:4:299,287:.:-0.29:1.000:. ./.:4:355,226:.:-0.32:1.000:. ./.:4:254,261:.:-0.63:1.000:. ./.:4:178,275:.:-0.93:1.000:. ./.:4:209,283:.:-0.74:1.000:. ./.:4:399,246:.:-0.01:1.000:. ./.:4:416,387:.: 0.74:1.000:. ./.:4:261,259:.:-0.61:1.000:. ./.:4:299,278:.:-0.34:1.000:. ./.:4:226,212:.:-1.00:1.000:. ./.:4:320,154:.:-0.83:1.000:. ./.:4:193,262:.:-0.92:1.000:. ./.:4:250,203:.:-0.93:1.000:. ./.:4:245,207:.:-0.93:1.000:. ./.:4:409,345:.: 0.51:1.000:. ./.:4:400,395:.: 0.70:1.000:. ./.:4:366,263:.:-0.09:1.000:. ./.:4:315,236:.:-0.46:1.000:. ./.:4:426,546:.: 1.54:1.000:. ./.:4:228,273:.:-0.70:0.999:. ./.:4:254,238:.:-0.74:1.000:. ./.:4:283,289:.:-0.36:1.000:. ./.:4:362,512:.: 1.08:1.000:. ./.:4:180,296:.:-0.82:1.000:. ./.:4:238,267:.:-0.68:1.000:. ./.:4:231,225:.:-0.91:1.000:. ./.:4:192,284:.:-0.82:1.000:. ./.:4:281,357:.:-0.05:1.000:. ./.:4:288,223:.:-0.65:1.000:. ./.:4:361,511:.: 1.07:1.000:. ./.:4:425,504:.: 1.34:1.000:. ./.:4:341,383:.: 0.36:1.000:. ./.:4:362,176:.:-0.52:1.000:. ./.:4:333,454:.: 0.66:1.000:. ./.:4:302,378:.: 0.15:1.000:. ./.:4:174,181:.:-1.39:1.000:. ./.:4:210,299:.:-0.66:1.000:. ./.:4:210,192:.:-1.17:1.000:. ./.:4:366,174:.:-0.51:1.000:. ./.:5:224,190:.:-1.11:0.993:. ./.:4:284,357:.:-0.03:1.000:. ./.:4:338,153:.:-0.74:1.000:. ./.:4:523,244:.: 0.57:1.000:. ./.:4:412,363:.: 0.61:1.000:. ./.:4:255,195:.:-0.94:1.000:. ./.:4:267,323:.:-0.27:1.000:. ./.:4:194,256:.:-0.94:1.000:. ./.:4:233,393:.:-0.10:1.000:. ./.:4:315,267:.:-0.31:1.000:. ./.:4:287,178:.:-0.87:1.000:. ./.:4:173,307:.:-0.80:1.000:. ./.:4:501,660:.: 2.44:1.000:. ./.:4:557,257:.: 0.79:1.000:. ./.:4:308,409:.: 0.33:1.000:. ./.:4:323,639:.: 1.50:1.000:. ./.:4:491,574:.: 1.99:1.000:. ./.:4:340,495:.: 0.89:1.000:. ./.:4:362,509:.: 1.06:1.000:. ./.:4:393,176:.:-0.37:1.000:. ./.:4:71,69:.:-2.41:1.000:. ./.:4:360,478:.: 0.91:1.000:. ./.:4:330,434:.: 0.55:1.000:. ./.:4:307,298:.:-0.20:1.000:. ./.:4:517,329:.: 0.94:1.000:. ./.:4:345,596:.: 1.40:1.000:. ./.:4:395,296:.: 0.21:1.000:. ./.:4:442,336:.: 0.62:1.000:. ./.:4:352,306:.: 0.05:1.000:. ./.:4:271,496:.: 0.57:1.000:. ./.:4:371,234:.:-0.20:1.000:. ./.:4:402,411:.: 0.79:1.000:. ./.:4:323,182:.:-0.68:1.000:. ./.:4:414,215:.:-0.09:1.000:. ./.:4:330,127:.:-0.91:1.000:. ./.:4:254,531:.: 0.65:1.000:. ./.:4:272,353:.:-0.11:1.000:. ./.:4:279,253:.:-0.55:1.000:. ./.:4:343,169:.:-0.64:1.000:. ./.:4:209,218:.:-1.05:1.000:. ./.:4:270,500:.: 0.58:1.000:. ./.:4:268,322:.:-0.27:1.000:. ./.:4:343,336:.: 0.15:1.000:. ./.:4:253,388:.:-0.03:1.000:. ./.:4:484,245:.: 0.39:1.000:. ./.:4:370,195:.:-0.39:1.000:. ./.:4:393,510:.: 1.22:1.000:. ./.:4:255,436:.: 0.21:1.000:. ./.:4:456,549:.: 1.70:1.000:. ./.:4:407,572:.: 1.58:1.000:. ./.:4:494,501:.: 1.65:1.000:. ./.:4:313,331:.:-0.02:1.000:. ./.:4:291,432:.: 0.36:1.000:. -chr5.1 66146178 chr5.1_066146178 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:44,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,8:.:-0.67:1.000:. ./.:4:69,21:.: 0.96:1.000:. ./.:4:44,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,5:.:-1.78:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:44,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:8,6:.:-2.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:56,13:.: 0.06:1.000:. ./.:4:50,22:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.10:0.944:. ./.:4:92,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:67,24:.: 1.00:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.47:1.000:. ./.:4:43,36:.: 0.49:1.000:. ./.:4:62,28:.: 0.96:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:4,4:.:-2.55:1.000:. ./.:4:35,19:.:-0.58:1.000:. ./.:4:32,8:.:-1.18:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:24,29:.:-0.62:1.000:. ./.:4:44,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:14,1:.:-2.25:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:45,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:82,12:.: 1.13:1.000:. ./.:4:61,36:.: 1.26:1.000:. ./.:4:80,12:.: 1.05:1.000:. ./.:4:65,18:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,13:.:-0.84:1.000:. ./.:4:70,15:.: 0.75:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:67,14:.: 0.58:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.59:1.000:. ./.:4:53,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:27,19:.:-0.92:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:52,26:.: 0.45:1.000:. ./.:4:25,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:52,34:.: 0.79:1.000:. ./.:4:50,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:83,21:.: 1.56:1.000:. ./.:4:61,31:.: 1.05:1.000:. ./.:4:57,14:.: 0.15:1.000:. ./.:4:79,16:.: 1.18:1.000:. ./.:6:45,26:.: 0.15:1.000:. ./.:4:58,46:.: 1.56:1.000:. ./.:4:60,16:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,19:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,8:.:-1.18:1.000:. ./.:4:57,40:.: 1.26:1.000:. ./.:4:48,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:65,18:.: 0.66:1.000:. ./.:4:72,13:.: 0.75:0.996:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,40:.: 1.09:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.91:0.999:. ./.:4:53,9:.:-0.24:1.000:. ./.:4:81,15:.: 1.22:1.000:. ./.:4:49,8:.:-0.45:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,13:.:-0.97:1.000:. ./.:4:86,13:.: 1.35:1.000:. ./.:4:52,27:.: 0.49:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:66,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:40,35:.: 0.32:1.000:. ./.:4:25,32:.:-0.45:1.000:. ./.:4:59,12:.: 0.15:1.000:. ./.:4:39,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:37,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:21,21:.:-1.09:1.000:. ./.:4:32,21:.:-0.62:1.000:. ./.:4:58,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:28,18:.:-0.92:1.000:. ./.:4:47,13:.:-0.32:1.000:. ./.:4:80,17:.: 1.26:1.000:. ./.:4:44,8:.:-0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:41,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,14:.: 1.48:1.000:. ./.:4:13,6:.:-2.08:1.000:. ./.:4:53,15:.: 0.02:1.000:. ./.:4:35,26:.:-0.28:1.000:. ./.:4:44,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:73,23:.: 1.22:1.000:. ./.:4:82,15:.: 1.26:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.40:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,11:.:-0.75:1.000:. ./.:4:57,21:.: 0.45:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:35,16:.:-0.71:0.999:. ./.:4:90,13:.: 1.52:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:89,22:.: 1.86:1.000:. ./.:4:32,7:.:-1.22:1.000:. ./.:4:32,12:.:-1.01:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,11:.: 0.28:1.000:. ./.:4:66,28:.: 1.13:1.000:. ./.:4:46,19:.:-0.11:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:43,12:.:-0.54:1.000:. ./.:4:21,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:39,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:53,44:.: 1.26:1.000:. ./.:4:53,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,10:.:-1.27:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:73,14:.: 0.83:1.000:. ./.:5:68,0:.: 0.02:0.993:. ./.:4:93,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:45,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:43,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,34:.: 1.43:1.000:. ./.:4:66,13:.: 0.49:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:59,15:.: 0.28:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,14:.: 0.40:1.000:. ./.:4:18,26:.:-1.01:1.000:. ./.:4:24,29:.:-0.62:1.000:. ./.:4:72,12:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:83,13:.: 1.22:1.000:. ./.:4:61,24:.: 0.75:1.000:. ./.:4:54,35:.: 0.92:1.000:. ./.:4:48,32:.: 0.53:1.000:. ./.:4:13,1:.:-2.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:84,17:.: 1.43:1.000:. ./.:4:75,14:.: 0.92:1.000:. ./.:4:46,29:.: 0.32:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:48,35:.: 0.66:1.000:. ./.:4:22,12:.:-1.44:1.000:. ./.:4:42,9:.:-0.71:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:74,11:.: 0.75:1.000:. ./.:4:26,28:.:-0.58:1.000:. ./.:4:30,12:.:-1.09:1.000:. ./.:4:64,9:.: 0.23:1.000:. ./.:4:32,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,13:.: 0.53:1.000:. ./.:4:71,12:.: 0.66:1.000:. ./.:4:68,11:.: 0.49:1.000:. ./.:4:13,30:.:-1.05:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:17,24:.:-1.14:1.000:. ./.:4:50,21:.: 0.15:1.000:. ./.:4:20,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:59,18:.: 0.40:1.000:. ./.:4:32,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:73,9:.: 0.62:1.000:. ./.:4:39,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.88:1.000:. ./.:4:17,25:.:-1.09:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:65,8:.: 0.23:1.000:. ./.:4:24,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:80,14:.: 1.13:1.000:. -chr5.1 66408114 chr5.1_066408114 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,239:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,252:.:-0.15:1.000:. ./.:4:213,197:.: 0.59:1.000:. ./.:4:97,246:.: 0.14:1.000:. ./.:4:257,315:.: 1.69:1.000:. ./.:4:260,423:.: 2.45:1.000:. ./.:4:114,372:.: 1.11:1.000:. ./.:4:212,313:.: 1.37:1.000:. ./.:4:147,362:.: 1.27:1.000:. ./.:4:13,61:.:-1.69:1.000:. ./.:4:82,88:.:-1.03:1.000:. ./.:4:65,192:.:-0.44:1.000:. ./.:4:132,416:.: 1.53:1.000:. ./.:4:88,190:.:-0.30:1.000:. ./.:4:71,239:.:-0.08:1.000:. ./.:4:171,387:.: 1.60:1.000:. ./.:4:85,293:.: 0.38:0.944:. ./.:4:254,467:.: 2.70:1.000:. ./.:4:123,261:.: 0.42:1.000:. ./.:4:116,372:.: 1.12:1.000:. ./.:4:18,49:.:-1.73:1.000:. ./.:4:190,312:.: 1.22:1.000:. ./.:4:227,391:.: 2.01:1.000:. ./.:4:146,322:.: 0.99:1.000:. ./.:4:33,54:.:-1.60:1.000:. ./.:4:83,396:.: 1.06:1.000:. ./.:4:268,181:.: 0.86:1.000:. ./.:4:204,276:.: 1.07:1.000:. ./.:4:101,444:.: 1.51:1.000:. ./.:4:250,330:.: 1.75:1.000:. ./.:4:151,381:.: 1.42:1.000:. ./.:4:60,284:.: 0.15:1.000:. ./.:4:16,81:.:-1.53:1.000:. ./.:4:32,65:.:-1.53:1.000:. ./.:3:0,48:.:-1.86:1.000:. ./.:4:16,269:.:-0.25:1.000:. ./.:4:202,275:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,144:.:-1.21:1.000:. ./.:4:201,212:.: 0.61:1.000:. ./.:4:16,405:.: 0.67:1.000:. ./.:4:20,130:.:-1.17:1.000:. ./.:4:184,163:.: 0.17:1.000:. ./.:4:226,300:.: 1.38:1.000:. ./.:4:105,101:.:-0.79:1.000:. ./.:4:167,148:.:-0.05:1.000:. ./.:4:175,203:.: 0.38:1.000:. ./.:4:250,182:.: 0.74:1.000:. ./.:4:220,333:.: 1.56:1.000:. ./.:4:158,131:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.73:1.000:. ./.:4:29,226:.:-0.46:1.000:. ./.:4:156,194:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,213:.: 0.11:1.000:. ./.:4:146,225:.: 0.33:1.000:. ./.:4:153,248:.: 0.53:1.000:. ./.:4:171,161:.: 0.06:1.000:. ./.:4:82,199:.:-0.28:1.000:. ./.:4:47,165:.:-0.75:1.000:. ./.:6:44,52:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,56:.:-1.81:1.000:. ./.:4:117,205:.: 0.00:1.000:. ./.:4:124,148:.:-0.34:1.000:. ./.:4:80,208:.:-0.23:1.000:. ./.:4:92,178:.:-0.36:1.000:. ./.:4:170,244:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,121:.:-1.33:1.000:. ./.:4:121,200:.:-0.01:1.000:. ./.:4:21,243:.:-0.40:0.996:. ./.:4:107,172:.:-0.30:1.000:. ./.:4:213,73:.:-0.25:1.000:. ./.:4:39,100:.:-1.24:0.999:. ./.:4:0,217:.:-0.72:1.000:. ./.:4:202,233:.: 0.76:1.000:. ./.:4:33,153:.:-0.93:1.000:. ./.:4:147,213:.: 0.25:1.000:. ./.:4:162,127:.:-0.23:1.000:. ./.:4:20,308:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,177:.:-0.59:1.000:. ./.:4:167,189:.: 0.23:1.000:. ./.:4:36,117:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,126:.:-1.33:1.000:. ./.:4:103,145:.:-0.51:1.000:. ./.:4:21,123:.:-1.21:1.000:. ./.:4:17,160:.:-0.99:1.000:. ./.:4:90,92:.:-0.95:1.000:. ./.:4:143,149:.:-0.21:1.000:. ./.:4:93,108:.:-0.82:1.000:. ./.:4:163,90:.:-0.47:1.000:. ./.:4:64,151:.:-0.73:1.000:. ./.:4:133,190:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.60:1.000:. ./.:4:128,112:.:-0.56:1.000:. ./.:4:110,274:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,209:.: 0.13:1.000:. ./.:4:170,239:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,76:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.85:1.000:. ./.:4:119,169:.:-0.23:1.000:. ./.:4:77,253:.: 0.05:1.000:. ./.:4:157,158:.:-0.05:1.000:. ./.:4:168,250:.: 0.65:1.000:. ./.:4:56,87:.:-1.22:1.000:. ./.:4:102,86:.:-0.91:1.000:. ./.:4:84,160:.:-0.53:1.000:. ./.:4:81,164:.:-0.53:1.000:. ./.:4:101,46:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,249:.:-0.40:1.000:. ./.:4:27,179:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.90:1.000:. ./.:4:49,249:.:-0.17:1.000:. ./.:4:278,456:.: 2.79:1.000:. ./.:4:147,130:.:-0.31:0.999:. ./.:4:98,146:.:-0.53:1.000:. ./.:4:106,116:.:-0.68:1.000:. ./.:4:172,113:.:-0.25:1.000:. ./.:4:87,136:.:-0.68:1.000:. ./.:4:117,144:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.71:1.000:. ./.:4:118,118:.:-0.59:1.000:. ./.:4:185,147:.: 0.06:1.000:. ./.:4:44,186:.:-0.63:1.000:. ./.:4:149,209:.: 0.24:1.000:. ./.:4:292,250:.: 1.49:1.000:. ./.:4:132,113:.:-0.53:1.000:. ./.:4:105,67:.:-1.02:1.000:. ./.:4:14,204:.:-0.71:1.000:. ./.:4:120,234:.: 0.21:1.000:. ./.:4:78,133:.:-0.76:1.000:. ./.:4:120,143:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.91:1.000:. ./.:4:221,361:.: 1.76:1.000:. ./.:5:77,152:.:-0.63:0.993:. ./.:4:12,169:.:-0.96:1.000:. ./.:4:74,108:.:-0.95:1.000:. ./.:4:252,182:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.77:1.000:. ./.:4:56,159:.:-0.73:1.000:. ./.:4:121,86:.:-0.78:1.000:. ./.:4:74,96:.:-1.03:1.000:. ./.:4:99,106:.:-0.80:1.000:. ./.:4:75,185:.:-0.42:1.000:. ./.:4:95,205:.:-0.15:1.000:. ./.:4:48,106:.:-1.14:1.000:. ./.:4:123,331:.: 0.89:1.000:. ./.:4:138,285:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,151:.:-1.16:1.000:. ./.:4:181,329:.: 1.27:1.000:. ./.:4:222,268:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,189:.:-0.91:1.000:. ./.:4:243,265:.: 1.26:1.000:. ./.:4:220,261:.: 1.08:1.000:. ./.:4:33,40:.:-1.69:1.000:. ./.:4:89,364:.: 0.89:1.000:. ./.:4:150,344:.: 1.16:1.000:. ./.:4:185,140:.: 0.02:1.000:. ./.:4:274,324:.: 1.87:1.000:. ./.:4:145,322:.: 0.98:1.000:. ./.:4:91,249:.: 0.12:1.000:. ./.:4:274,409:.: 2.45:1.000:. ./.:4:15,351:.: 0.30:1.000:. ./.:4:169,260:.: 0.72:1.000:. ./.:4:196,269:.: 0.97:1.000:. ./.:4:214,457:.: 2.36:1.000:. ./.:4:181,121:.:-0.14:1.000:. ./.:4:130,261:.: 0.46:1.000:. ./.:4:121,169:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.35:1.000:. ./.:4:218,237:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.26:1.000:. ./.:4:141,130:.:-0.35:1.000:. ./.:4:93,168:.:-0.42:1.000:. ./.:4:134,246:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,235:.: 0.28:1.000:. ./.:4:20,251:.:-0.35:1.000:. ./.:4:78,181:.:-0.43:1.000:. ./.:4:187,275:.: 0.95:1.000:. ./.:4:20,225:.:-0.53:1.000:. ./.:4:203,345:.: 1.53:1.000:. ./.:4:83,309:.: 0.47:1.000:. ./.:4:268,212:.: 1.07:1.000:. ./.:4:166,163:.: 0.04:1.000:. ./.:4:304,351:.: 2.26:1.000:. ./.:4:107,207:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,252:.: 0.09:1.000:. -chr5.1 66642668 chr5.1_066642668 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:175,216:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.57:1.000:. ./.:4:138,188:.:-0.73:1.000:. ./.:4:147,192:.:-0.59:1.000:. ./.:4:91,333:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,291:.:-0.48:1.000:. ./.:4:34,173:.:-2.03:1.000:. ./.:4:71,309:.:-0.14:1.000:. ./.:4:69,291:.:-0.36:1.000:. ./.:4:83,75:.:-2.56:1.000:. ./.:4:32,155:.:-2.25:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.39:1.000:. ./.:4:83,318:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,309:.: 0.02:1.000:. ./.:4:57,286:.:-0.55:1.000:. ./.:4:93,182:.:-1.29:1.000:. ./.:4:86,313:.: 0.06:0.944:. ./.:4:0,372:.:-0.23:1.000:. ./.:4:93,395:.: 1.03:1.000:. ./.:4:157,259:.: 0.25:1.000:. ./.:4:26,114:.:-2.76:1.000:. ./.:4:136,206:.:-0.56:1.000:. ./.:4:85,359:.: 0.55:1.000:. ./.:4:151,186:.:-0.61:1.000:. ./.:4:45,69:.:-3.04:1.000:. ./.:4:62,310:.:-0.23:1.000:. ./.:4:131,170:.:-1.00:1.000:. ./.:4:150,231:.:-0.13:1.000:. ./.:4:115,379:.: 1.10:1.000:. ./.:4:66,270:.:-0.62:1.000:. ./.:4:157,272:.: 0.39:1.000:. ./.:4:114,154:.:-1.36:1.000:. ./.:4:39,98:.:-2.79:1.000:. ./.:4:114,144:.:-1.47:1.000:. ./.:3:30,35:.:-3.58:1.000:. ./.:4:142,174:.:-0.84:1.000:. ./.:4:146,224:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,296:.:-0.21:1.000:. ./.:4:97,391:.: 1.03:1.000:. ./.:4:180,197:.:-0.18:1.000:. ./.:4:205,262:.: 0.81:1.000:. ./.:4:216,267:.: 0.98:1.000:. ./.:4:229,269:.: 1.14:1.000:. ./.:4:191,233:.: 0.34:1.000:. ./.:4:268,306:.: 1.97:1.000:. ./.:4:110,364:.: 0.88:1.000:. ./.:4:208,245:.: 0.65:1.000:. ./.:4:27,163:.:-2.21:1.000:. ./.:4:192,221:.: 0.22:1.000:. ./.:4:155,494:.: 2.79:1.000:. ./.:4:177,227:.: 0.12:1.000:. ./.:4:207,267:.: 0.88:1.000:. ./.:4:148,192:.:-0.58:1.000:. ./.:4:255,260:.: 1.33:1.000:. ./.:4:77,321:.: 0.05:1.000:. ./.:4:102,341:.: 0.54:1.000:. ./.:4:87,312:.: 0.06:1.000:. ./.:4:259,263:.: 1.40:1.000:. ./.:4:86,380:.: 0.79:1.000:. ./.:6:173,217:.:-0.03:1.000:. ./.:4:207,244:.: 0.63:1.000:. ./.:4:178,202:.:-0.14:1.000:. ./.:4:228,120:.:-0.49:1.000:. ./.:4:193,246:.: 0.50:1.000:. ./.:4:184,230:.: 0.23:1.000:. ./.:4:180,241:.: 0.30:1.000:. ./.:4:80,244:.:-0.75:1.000:. ./.:4:183,272:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,432:.: 1.60:0.996:. ./.:4:0,427:.: 0.37:1.000:. ./.:4:96,467:.: 1.85:1.000:. ./.:4:61,173:.:-1.73:0.999:. ./.:4:0,585:.: 2.09:1.000:. ./.:4:87,320:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,512:.: 1.30:1.000:. ./.:4:184,218:.: 0.10:1.000:. ./.:4:101,332:.: 0.43:1.000:. ./.:4:110,374:.: 0.99:1.000:. ./.:4:192,251:.: 0.54:1.000:. ./.:4:115,390:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,385:.:-0.09:1.000:. ./.:4:99,419:.: 1.36:1.000:. ./.:4:228,270:.: 1.14:1.000:. ./.:4:155,181:.:-0.62:1.000:. ./.:4:218,292:.: 1.27:1.000:. ./.:4:203,269:.: 0.86:1.000:. ./.:4:122,176:.:-1.04:1.000:. ./.:4:190,238:.: 0.38:1.000:. ./.:4:213,247:.: 0.73:1.000:. ./.:4:185,228:.: 0.22:1.000:. ./.:4:161,168:.:-0.70:1.000:. ./.:4:112,344:.: 0.69:1.000:. ./.:4:215,244:.: 0.72:1.000:. ./.:4:68,275:.:-0.55:1.000:. ./.:4:194,225:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,371:.: 0.96:1.000:. ./.:4:89,304:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.36:1.000:. ./.:4:92,395:.: 1.02:1.000:. ./.:4:72,291:.:-0.33:1.000:. ./.:4:127,149:.:-1.28:1.000:. ./.:4:216,256:.: 0.86:1.000:. ./.:4:169,210:.:-0.15:1.000:. ./.:4:100,348:.: 0.60:1.000:. ./.:4:187,215:.: 0.10:1.000:. ./.:4:163,218:.:-0.13:1.000:. ./.:4:84,320:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,291:.:-0.23:1.000:. ./.:4:177,252:.: 0.39:1.000:. ./.:4:172,215:.:-0.07:1.000:. ./.:4:93,352:.: 0.57:1.000:. ./.:4:93,353:.: 0.58:1.000:. ./.:4:199,240:.: 0.50:0.999:. ./.:4:105,452:.: 1.79:1.000:. ./.:4:79,321:.: 0.07:1.000:. ./.:4:116,452:.: 1.91:1.000:. ./.:4:78,251:.:-0.70:1.000:. ./.:4:81,331:.: 0.21:1.000:. ./.:4:170,213:.:-0.11:1.000:. ./.:4:152,191:.:-0.55:1.000:. ./.:4:208,199:.: 0.15:1.000:. ./.:4:96,364:.: 0.73:1.000:. ./.:4:103,399:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,295:.:-0.48:1.000:. ./.:4:212,242:.: 0.66:1.000:. ./.:4:119,386:.: 1.22:1.000:. ./.:4:102,380:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,444:.: 0.55:1.000:. ./.:4:133,172:.:-0.96:1.000:. ./.:4:106,305:.: 0.19:1.000:. ./.:4:100,333:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,146:.:-1.24:1.000:. ./.:5:116,210:.:-0.73:0.993:. ./.:4:79,402:.: 0.96:1.000:. ./.:4:183,222:.: 0.13:1.000:. ./.:4:193,272:.: 0.78:1.000:. ./.:4:78,363:.: 0.52:1.000:. ./.:4:194,216:.: 0.18:1.000:. ./.:4:111,340:.: 0.63:1.000:. ./.:4:204,228:.: 0.42:1.000:. ./.:4:170,272:.: 0.53:1.000:. ./.:4:105,401:.: 1.23:1.000:. ./.:4:73,291:.:-0.32:1.000:. ./.:4:140,193:.:-0.66:1.000:. ./.:4:248,245:.: 1.09:1.000:. ./.:4:125,439:.: 1.86:1.000:. ./.:4:68,317:.:-0.09:1.000:. ./.:4:173,230:.: 0.11:1.000:. ./.:4:85,335:.: 0.29:1.000:. ./.:4:89,300:.:-0.05:1.000:. ./.:4:78,338:.: 0.25:1.000:. ./.:4:65,235:.:-1.02:1.000:. ./.:4:38,94:.:-2.85:1.000:. ./.:4:86,136:.:-1.87:1.000:. ./.:4:76,328:.: 0.12:1.000:. ./.:4:94,254:.:-0.49:1.000:. ./.:4:141,243:.:-0.10:1.000:. ./.:4:100,345:.: 0.57:1.000:. ./.:4:66,302:.:-0.27:1.000:. ./.:4:172,230:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,157:.:-1.19:1.000:. ./.:4:70,294:.:-0.32:1.000:. ./.:4:76,309:.:-0.09:1.000:. ./.:4:168,214:.:-0.12:1.000:. ./.:4:136,184:.:-0.80:1.000:. ./.:4:56,257:.:-0.87:1.000:. ./.:4:136,157:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.72:1.000:. ./.:4:68,327:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,260:.:-0.87:1.000:. ./.:4:129,139:.:-1.36:1.000:. ./.:4:108,143:.:-1.55:1.000:. ./.:4:164,221:.:-0.09:1.000:. ./.:4:166,216:.:-0.12:1.000:. ./.:4:177,197:.:-0.21:1.000:. ./.:4:65,267:.:-0.67:1.000:. ./.:4:123,190:.:-0.87:1.000:. ./.:4:178,213:.:-0.02:1.000:. ./.:4:62,270:.:-0.67:1.000:. ./.:4:120,241:.:-0.35:1.000:. ./.:4:178,219:.: 0.04:1.000:. ./.:4:105,334:.: 0.50:1.000:. ./.:4:94,372:.: 0.79:1.000:. ./.:4:62,228:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,470:.: 0.84:1.000:. -chr5.1 66729846 chr5.1_066729846 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:280,61:.: 1.09:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:187,70:.:-0.12:1.000:. ./.:4:324,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:169,69:.:-0.40:1.000:. ./.:4:224,90:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,37:.:-2.01:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:179,84:.:-0.03:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:37,21:.:-3.00:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:206,59:.:-0.01:1.000:. ./.:4:199,58:.:-0.12:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:115,83:.:-0.97:0.944:. ./.:4:359,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:176,64:.:-0.37:1.000:. ./.:4:318,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:118,1:.:-2.12:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:182,48:.:-0.51:1.000:. ./.:4:81,20:.:-2.38:1.000:. ./.:4:199,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:371,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:209,72:.: 0.23:1.000:. ./.:4:225,73:.: 0.47:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:258,65:.: 0.83:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,13:.:-2.04:1.000:. ./.:4:171,37:.:-0.83:1.000:. ./.:3:61,11:.:-2.79:1.000:. ./.:4:224,69:.: 0.40:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:204,52:.:-0.14:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:213,69:.: 0.24:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:228,82:.: 0.65:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:215,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:434,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:108,48:.:-1.58:1.000:. ./.:4:423,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:101,49:.:-1.67:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.08:1.000:. ./.:6:290,25:.: 0.72:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:248,51:.: 0.49:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:263,64:.: 0.89:1.000:. ./.:4:70,36:.:-2.30:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:166,1:.:-1.42:0.996:. ./.:4:328,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:95,44:.:-1.83:0.999:. ./.:4:197,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:191,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:202,65:.: 0.02:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:278,62:.: 1.08:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:414,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:177,55:.:-0.48:1.000:. ./.:4:304,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:297,82:.: 1.64:1.000:. ./.:4:189,51:.:-0.37:1.000:. ./.:4:245,59:.: 0.56:1.000:. ./.:4:241,50:.: 0.37:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:155,27:.:-1.20:1.000:. ./.:4:175,69:.:-0.31:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:266,56:.: 0.82:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:193,64:.:-0.12:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:164,41:.:-0.87:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:159,60:.:-0.67:1.000:. ./.:4:157,46:.:-0.90:1.000:. ./.:4:266,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:169,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:280,64:.: 1.14:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:206,68:.: 0.12:0.999:. ./.:4:193,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:68,41:.:-2.26:1.000:. ./.:4:129,66:.:-1.02:1.000:. ./.:4:180,65:.:-0.29:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:193,68:.:-0.06:1.000:. ./.:4:174,66:.:-0.37:1.000:. ./.:4:224,78:.: 0.53:1.000:. ./.:4:264,62:.: 0.88:1.000:. ./.:4:337,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:157,64:.:-0.64:1.000:. ./.:4:92,52:.:-1.75:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:345,1:.: 1.17:1.000:. ./.:5:150,48:.:-0.97:0.993:. ./.:4:209,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:324,80:.: 2.00:1.000:. ./.:4:309,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:372,1:.: 1.56:1.000:. ./.:4:170,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:175,43:.:-0.68:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:180,53:.:-0.47:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:128,57:.:-1.16:1.000:. ./.:4:294,82:.: 1.60:1.000:. ./.:4:347,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:187,68:.:-0.15:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:163,69:.:-0.48:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:141,39:.:-1.23:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:193,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:413,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:146,54:.:-0.94:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:240,62:.: 0.53:1.000:. ./.:4:221,50:.: 0.08:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:253,66:.: 0.78:1.000:. ./.:4:197,68:.:-0.01:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:304,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:271,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:216,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:228,52:.: 0.21:1.000:. ./.:4:170,59:.:-0.53:1.000:. ./.:4:176,66:.:-0.34:1.000:. ./.:4:219,73:.: 0.39:1.000:. ./.:4:248,60:.: 0.62:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:303,84:.: 1.76:1.000:. ./.:4:421,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:235,55:.: 0.36:1.000:. ./.:4:307,51:.: 1.34:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.09:1.000:. -chr5.1 66904013 chr5.1_066904013 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:178,5:.: 1.08:1.000:. ./.:4:65,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:130,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:170,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:100,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:158,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:79,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:67,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:73,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:138,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:148,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:141,2:.: 0.45:0.944:. ./.:4:4,9:.:-1.61:1.000:. ./.:4:193,3:.: 1.29:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:144,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:92,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:161,4:.: 0.80:1.000:. ./.:4:87,6:.:-0.34:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.51:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:150,6:.: 0.66:1.000:. ./.:4:73,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:306,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,3:.:-0.78:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:94,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:154,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:133,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:116,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:116,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,1:.:-1.16:1.000:. ./.:6:55,3:.:-0.90:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.78:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:99,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.51:0.996:. ./.:4:5,5:.:-1.65:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.50:0.999:. ./.:4:145,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:103,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:77,4:.:-0.53:1.000:. ./.:4:95,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:98,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:124,3:.: 0.20:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.72:1.000:. ./.:4:46,4:.:-1.02:1.000:. ./.:4:2,5:.:-1.70:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:123,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:47,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:83,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:232,4:.: 1.92:1.000:. ./.:4:167,3:.: 0.88:1.000:. ./.:4:124,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:280,1:.: 2.63:1.000:. ./.:4:44,2:.:-1.08:0.999:. ./.:4:167,2:.: 0.86:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:47,4:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:74,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:48,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:160,2:.: 0.75:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:35,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:85,2:.:-0.44:1.000:. ./.:5:109,2:.:-0.06:0.993:. ./.:4:127,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.69:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.69:1.000:. ./.:4:311,0:.: 3.11:1.000:. ./.:4:218,3:.: 1.68:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:244,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:129,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:277,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:71,5:.:-0.61:1.000:. ./.:4:151,4:.: 0.64:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:163,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:73,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:141,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:207,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:70,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:239,2:.: 2.00:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:154,3:.: 0.67:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:345,0:.: 3.65:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.93:1.000:. ./.:4:132,4:.: 0.34:1.000:. ./.:4:122,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:202,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:47,4:.:-1.01:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:93,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:78,6:.:-0.48:1.000:. ./.:4:96,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:292,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:287,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:124,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.69:1.000:. -chr5.1 67096913 chr5.1_067096913 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:94,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:36,35:.: 0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,26:.: 0.87:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.48:1.000:. ./.:4:57,26:.: 0.77:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.39:1.000:. ./.:4:11,3:.:-2.54:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:40,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:60,29:.: 1.06:1.000:. ./.:4:52,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:64,16:.: 0.63:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.04:0.944:. ./.:4:59,22:.: 0.68:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:63,20:.: 0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,21:.: 0.63:1.000:. ./.:4:74,24:.: 1.49:1.000:. ./.:4:53,16:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:10,5:.:-2.49:1.000:. ./.:4:16,8:.:-2.06:1.000:. ./.:3:5,1:.:-2.93:1.000:. ./.:4:64,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:65,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:34,15:.:-0.86:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:42,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:27,12:.:-1.34:1.000:. ./.:4:74,26:.: 1.59:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:57,21:.: 0.53:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:46,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:66,11:.: 0.48:1.000:. ./.:6:36,5:.:-1.24:1.000:. ./.:4:47,19:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,23:.: 0.48:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:54,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:49,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:0.996:. ./.:4:19,29:.:-0.91:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.48:0.999:. ./.:4:58,13:.: 0.20:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:51,12:.:-0.19:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:49,22:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,9:.:-0.72:1.000:. ./.:4:71,25:.: 1.40:1.000:. ./.:4:51,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:43,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:48,18:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,15:.:-0.14:1.000:. ./.:4:44,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:52,19:.: 0.20:1.000:. ./.:4:51,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:52,14:.:-0.04:1.000:. ./.:4:65,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:32,6:.:-1.39:1.000:. ./.:4:68,20:.: 1.01:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:29,9:.:-1.39:1.000:. ./.:4:50,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:22,13:.:-1.53:1.000:. ./.:4:50,13:.:-0.19:1.000:. ./.:4:24,9:.:-1.63:1.000:. ./.:4:54,20:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:61,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:75,25:.: 1.59:1.000:. ./.:4:55,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.38:0.999:. ./.:4:77,7:.: 0.82:1.000:. ./.:4:20,12:.:-1.68:1.000:. ./.:4:62,20:.: 0.73:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:59,12:.: 0.20:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:51,15:.:-0.04:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.97:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:41,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:62,13:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:34,12:.:-1.00:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.91:1.000:. ./.:4:67,18:.: 0.87:1.000:. ./.:5:39,0:.:-1.34:0.993:. ./.:4:38,10:.:-0.91:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:70,21:.: 1.16:1.000:. ./.:4:40,16:.:-0.52:1.000:. ./.:4:29,9:.:-1.39:1.000:. ./.:4:19,13:.:-1.68:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:45,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:41,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:78,28:.: 1.88:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:68,17:.: 0.87:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:43,16:.:-0.38:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:49,18:.: 0.00:1.000:. ./.:4:62,21:.: 0.77:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:61,26:.: 0.97:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:33,19:.:-0.72:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:60,18:.: 0.53:1.000:. ./.:4:45,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:50,46:.: 1.40:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,12:.:-1.10:1.000:. ./.:4:60,21:.: 0.68:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:34,13:.:-0.96:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:87,30:.: 2.41:1.000:. ./.:4:57,27:.: 0.82:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:67,8:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.48:1.000:. ./.:4:61,26:.: 0.97:1.000:. ./.:4:117,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:50,19:.: 0.10:1.000:. ./.:4:66,19:.: 0.87:1.000:. -chr5.1 67206892 chr5.1_067206892 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:324,94:.: 1.37:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:259,75:.: 0.06:1.000:. ./.:4:288,77:.: 0.55:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:184,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:281,87:.: 0.59:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:100,49:.:-2.82:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:292,75:.: 0.58:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.22:0.944:. ./.:4:364,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:442,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:290,93:.: 0.83:1.000:. ./.:4:127,29:.:-2.71:1.000:. ./.:4:256,102:.: 0.44:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:224,82:.:-0.37:1.000:. ./.:4:192,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:258,113:.: 0.64:1.000:. ./.:4:254,71:.:-0.08:1.000:. ./.:4:386,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:260,82:.: 0.19:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:273,69:.: 0.19:1.000:. ./.:4:87,21:.:-3.46:1.000:. ./.:4:133,33:.:-2.56:1.000:. ./.:3:59,42:.:-3.57:1.000:. ./.:4:254,109:.: 0.51:1.000:. ./.:4:244,76:.:-0.16:1.000:. ./.:4:280,66:.: 0.25:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:278,94:.: 0.65:1.000:. ./.:4:289,86:.: 0.70:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:302,102:.: 1.15:1.000:. ./.:4:241,80:.:-0.14:1.000:. ./.:4:310,105:.: 1.33:1.000:. ./.:4:279,81:.: 0.47:1.000:. ./.:4:287,96:.: 0.83:1.000:. ./.:4:228,88:.:-0.22:1.000:. ./.:4:234,69:.:-0.42:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:261,68:.:-0.02:1.000:. ./.:4:360,91:.: 1.89:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:316,96:.: 1.28:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:283,99:.: 0.81:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:263,94:.: 0.42:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.33:1.000:. ./.:6:238,65:.:-0.42:1.000:. ./.:4:272,72:.: 0.22:1.000:. ./.:4:241,83:.:-0.09:1.000:. ./.:4:194,107:.:-0.45:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:292,79:.: 0.64:1.000:. ./.:4:264,76:.: 0.16:1.000:. ./.:4:196,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:273,76:.: 0.30:1.000:. ./.:4:304,87:.: 0.95:0.996:. ./.:4:318,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:198,0:.:-2.06:0.999:. ./.:4:415,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:200,68:.:-0.97:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:289,79:.: 0.59:1.000:. ./.:4:277,68:.: 0.23:1.000:. ./.:4:266,119:.: 0.86:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:279,81:.: 0.47:1.000:. ./.:4:300,92:.: 0.97:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:264,93:.: 0.42:1.000:. ./.:4:298,77:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:325,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:177,178:.: 0.39:1.000:. ./.:4:197,69:.:-1.00:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:296,91:.: 0.89:1.000:. ./.:4:219,83:.:-0.44:1.000:. ./.:4:242,84:.:-0.06:1.000:. ./.:4:269,95:.: 0.53:1.000:. ./.:4:225,75:.:-0.47:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:237,81:.:-0.19:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:276,91:.: 0.58:1.000:. ./.:4:221,62:.:-0.73:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:247,81:.:-0.03:1.000:. ./.:4:219,75:.:-0.56:1.000:. ./.:4:220,57:.:-0.83:1.000:. ./.:4:233,101:.: 0.06:1.000:. ./.:4:302,98:.: 1.09:1.000:. ./.:4:234,80:.:-0.25:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:354,115:.: 2.17:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:412,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:189,57:.:-1.31:1.000:. ./.:4:382,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:208,79:.:-0.67:1.000:. ./.:4:258,77:.: 0.08:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:248,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:222,86:.:-0.34:1.000:. ./.:4:241,80:.:-0.14:1.000:. ./.:5:209,60:.:-0.95:0.993:. ./.:4:295,82:.: 0.73:1.000:. ./.:4:227,92:.:-0.17:1.000:. ./.:4:403,2:.: 1.17:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:234,76:.:-0.31:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:205,56:.:-1.08:1.000:. ./.:4:262,98:.: 0.47:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:355,95:.: 1.87:1.000:. ./.:4:271,80:.: 0.33:1.000:. ./.:4:249,79:.:-0.03:1.000:. ./.:4:262,90:.: 0.34:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:392,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:133,30:.:-2.61:1.000:. ./.:4:193,76:.:-0.95:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:296,93:.: 0.92:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:334,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:241,69:.:-0.31:1.000:. ./.:4:229,55:.:-0.72:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:238,80:.:-0.19:1.000:. ./.:4:182,64:.:-1.31:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:200,68:.:-0.97:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:180,70:.:-1.25:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:253,87:.: 0.16:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:289,108:.: 1.04:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:311,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:369,112:.: 2.35:1.000:. ./.:4:294,92:.: 0.87:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.09:1.000:. -chr5.1 67388109 chr5.1_067388109 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:273,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:101,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:258,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.05:0.944:. ./.:4:219,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.57:1.000:. ./.:4:59,0:.:-3.21:1.000:. ./.:3:32,0:.:-3.76:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.15:1.000:. ./.:6:175,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.11:0.996:. ./.:4:212,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:300,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:242,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:280,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:238,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:209,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.00:1.000:. ./.:5:197,0:.:-0.39:0.993:. ./.:4:236,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:315,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:273,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:285,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:297,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.77:1.000:. -chr5.1 67621908 chr5.1_067621908 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:90,172:0.67:-0.07:1.000:0.922 0/1/1/1:4:79,157:0.68:-0.45:1.000:0.945 0/0/1/1:4:144,97:0.47:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:175,105:0.45: 0.19:1.000:0.977 0/0/0/1:4:251,58:0.26: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,117:0.44: 0.75:1.000:0.965 0/1/1/1:4:67,132:0.68:-0.98:1.000:0.940 0/0/1/1:4:215,120:0.43: 0.98:1.000:0.946 0/0/1/1:4:205,106:0.41: 0.63:1.000:0.877 0/0/1/1:4:20,18:0.53:-3.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:41,10:0.27:-3.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,165:0.67:-0.26:1.000:0.939 0/0/1/1:4:159,122:0.51: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:205,110:0.42: 0.69:1.000:0.917 0/0/1/1:4:174,82:0.39:-0.16:1.000:0.708 0/0/1/1:4:161,129:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:260,61:0.26: 0.78:0.944:0.999 0/0/1/1:4:187,122:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:334,53:0.19: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:328,85:0.28: 2.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,25:0.48:-2.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:168,98:0.44:-0.01:1.000:0.968 0/0/0/1:4:311,57:0.21: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,160:0.67:-0.33:1.000:0.919 0/0/0/1:4:24,6:0.27:-3.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:196,102:0.41: 0.45:1.000:0.885 0/0/1/1:4:175,113:0.46: 0.30:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,115:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,128:0.47: 0.83:1.000:0.991 0/0/1/1:4:180,153:0.52: 0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,138:0.60:-0.32:1.000:0.782 0/0/1/1:4:150,78:0.41:-0.56:1.000:0.884 0/1/1/1:4:6,23:0.78:-3.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,55:0.75:-2.81:1.000:0.999 1/1/1:3:0,17:1.00:-3.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,176:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,93:0.44:-0.23:1.000:0.971 0/0/1/1:4:162,136:0.52: 0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:321,44:0.17: 1.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:286,48:0.20: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,100:0.44: 0.06:1.000:0.969 0/0/0/1:4:213,47:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:233,58:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:49,122:0.71:-1.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:351,70:0.23: 2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,129:0.48: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,168:0.54: 1.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:68,59:0.53:-2.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:210,44:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,38:0.20:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,145:0.70:-0.85:1.000:0.985 0/1/1/1:4:96,165:0.65:-0.09:1.000:0.811 0/0/0/1:4:238,57:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,154:0.67:-0.43:1.000:0.899 0/0/1/1:4:147,111:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,74:0.38:-0.36:1.000:0.527 0/0/0/1:4:252,55:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:245,54:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:257,56:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:88,110:0.60:-0.99:1.000:0.607 0/1/1/1:4:87,183:0.69: 0.04:1.000:0.967 0/0/1/1:4:151,92:0.45:-0.35:1.000:0.980 0/0/0/1:4:159,55:0.33:-0.76:1.000:0.931 0/0/1/1:4:187,87:0.39: 0.10:1.000:0.676 0/1/1/1:4:107,183:0.65: 0.33:1.000:0.804 0/1/1/1:4:91,164:0.66:-0.17:1.000:0.871 0/0/1/1:4:161,108:0.47: 0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:157,140:0.53: 0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:140,98:0.48:-0.42:0.996:0.996 0/0/1/1:4:138,99:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:324,49:0.18: 1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,81:0.43:-0.58:0.999:0.943 0/0/1/1:4:108,87:0.51:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:321,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,89:0.47:-0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:127,82:0.46:-0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:168,85:0.41:-0.20:1.000:0.847 0/0/1/1:4:168,123:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:102,182:0.66: 0.24:1.000:0.860 0/1/1/1:4:106,172:0.64: 0.16:1.000:0.713 0/0/1/1:4:142,110:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:113,169:0.63: 0.22:1.000:0.533 0/1/1/1:4:100,191:0.67: 0.34:1.000:0.921 0/0/1/1:4:145,96:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:131,122:0.54:-0.20:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,87:0.47:-0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:63,146:0.70:-0.83:1.000:0.986 0/0/1/1:4:185,97:0.42: 0.22:1.000:0.894 1/1/1/1:4:0,171:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,143:0.65:-0.55:1.000:0.758 0/1/1/1:4:70,142:0.68:-0.79:1.000:0.954 0/0/1/1:4:202,131:0.47: 0.95:1.000:0.990 0/1/1/1:4:54,111:0.68:-1.47:1.000:0.959 0/1/1/1:4:101,183:0.66: 0.24:1.000:0.877 0/0/0/1:4:255,72:0.29: 0.86:1.000:0.992 0/0/0/1:4:238,52:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,146:0.70:-0.81:1.000:0.982 0/0/1/1:4:169,120:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,126:0.49: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,96:0.43:-0.03:1.000:0.956 0/0/0/1:4:223,75:0.32: 0.45:1.000:0.949 0/1/1/1:4:81,160:0.68:-0.37:1.000:0.942 0/1/1/1:4:82,186:0.70: 0.01:1.000:0.983 0/1/1/1:4:56,166:0.74:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,105:0.52:-0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,113:0.54:-0.48:1.000:0.987 0/1/1/1:4:118,181:0.63: 0.46:1.000:0.592 0/0/1/1:4:168,132:0.51: 0.47:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,232:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,50:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,61:0.23: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,50:0.22: 0.68:0.999:1.000 0/0/0/1:4:316,52:0.20: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,93:0.44:-0.16:1.000:0.958 0/0/0/1:4:285,81:0.29: 1.42:1.000:0.991 0/0/1/1:4:165,85:0.41:-0.24:1.000:0.873 0/0/1/1:4:114,73:0.46:-1.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:181,120:0.47: 0.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:187,49:0.28:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:242,72:0.30: 0.68:1.000:0.986 0/0/1/1:4:166,105:0.46: 0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:169,100:0.44: 0.03:1.000:0.973 0/0/1/1:4:175,125:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,102:0.46:-0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:190,98:0.41: 0.30:1.000:0.874 0/0/1/1:4:196,134:0.48: 0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,83:0.43:-0.52:1.000:0.949 0/0/1/1:4:133,80:0.45:-0.78:1.000:0.977 0/0/0/1:4:200,47:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,106:0.53:-0.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:197,129:0.47: 0.85:1.000:0.991 0/0/0/1/1:5:179,86:0.40:-0.03:0.993:0.971 0/0/1/1:4:145,112:0.51:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,111:0.46: 0.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:287,180:0.46: 2.88:1.000:0.986 0/0/1/1:4:175,110:0.46: 0.26:1.000:0.986 0/0/1/1:4:179,115:0.46: 0.39:1.000:0.989 0/0/1/1:4:170,99:0.44: 0.03:1.000:0.967 0/0/1/1:4:120,111:0.54:-0.52:1.000:0.988 0/0/1/1:4:144,102:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,177:0.68:-0.07:1.000:0.964 0/0/0/0:4:350,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,97:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:232,143:0.45: 1.55:1.000:0.983 0/0/1/1:4:188,127:0.48: 0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:144,138:0.55: 0.22:1.000:0.983 0/0/0/1:4:193,40:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,134:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,149:0.69:-0.69:1.000:0.970 0/0/0/1:4:279,70:0.27: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:254,67:0.28: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,34:0.60:-2.98:1.000:0.759 0/1/1/1:4:69,138:0.68:-0.86:1.000:0.948 0/0/0/1:4:273,37:0.17: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/0:4:376,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,126:0.44: 1.04:1.000:0.972 0/0/1/1:4:161,121:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:247,50:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,108:0.43: 0.45:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,232:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,39:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,53:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,100:0.43: 0.22:1.000:0.936 0/0/0/1:4:245,64:0.28: 0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,183:0.70:-0.07:1.000:0.986 0/1/1/1:4:85,158:0.67:-0.35:1.000:0.901 0/1/1/1:4:75,195:0.72: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,125:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,155:0.68:-0.50:1.000:0.951 0/1/1/1:4:45,150:0.76:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,82:0.45:-0.75:1.000:0.983 0/1/1/1:4:74,155:0.69:-0.55:1.000:0.966 0/0/1/1:4:94,136:0.62:-0.53:1.000:0.546 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,205:0.66: 0.78:1.000:0.849 0/0/1/1:4:220,120:0.42: 1.05:1.000:0.931 0/0/0/1:4:275,48:0.21: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,76:0.34: 0.20:1.000:0.863 0/1/1/1:4:94,193:0.68: 0.29:1.000:0.959 0/0/1/1:4:228,149:0.47: 1.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:207,186:0.53: 1.81:1.000:0.991 0/0/1/1:4:163,111:0.48: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:152,113:0.50:-0.03:1.000:0.997 -chr5.1 67940675 chr5.1_067940675 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:145,64:0.23: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,73:0.32: 0.60:1.000:0.945 0/0/1/1:4:45,61:0.52:-1.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,55:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,153:0.71: 1.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:72,103:0.54: 0.40:1.000:0.990 0/0/0/1:4:86,52:0.30:-0.42:1.000:0.984 0/0/1/1:4:83,110:0.52: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,128:0.53: 1.36:1.000:0.991 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-2.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,93:0.83:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,57:0.21: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,57:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,106:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,106:0.54: 0.51:1.000:0.990 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,95:0.66:-0.51:0.944:0.893 0/0/1/1:4:112,114:0.44: 1.54:1.000:0.972 0/1/1/1:4:51,173:0.73: 1.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,89:0.41: 0.71:1.000:0.838 0/0/1/1:4:76,94:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,62:0.34:-0.14:1.000:0.878 0/0/1/1:4:97,121:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,34:0.37:-1.76:1.000:0.604 0/0/1/1:4:70,105:0.55: 0.40:1.000:0.982 0/0/0/1:4:93,44:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,52:0.39:-0.94:1.000:0.633 0/0/1/1:4:84,139:0.57: 1.47:1.000:0.939 0/0/1/1:4:71,133:0.60: 1.05:1.000:0.761 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,51:0.28:-0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:48,20:0.22:-1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,58:0.39:-0.65:1.000:0.646 0/0/0:3:42,0:0.00:-2.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,60:0.29: 0.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:81,69:0.39:-0.16:1.000:0.732 0/0/1/1:4:87,118:0.52: 1.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,67:0.42:-0.42:1.000:0.923 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,55:0.41:-0.92:1.000:0.862 0/0/1/1:4:53,63:0.49:-0.92:1.000:0.996 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,63:0.34:-0.09:1.000:0.870 0/0/1/1:4:73,129:0.59: 1.00:1.000:0.869 0/0/1/1:4:87,72:0.39: 0.04:1.000:0.642 0/0/0/1:4:91,60:0.32:-0.14:1.000:0.943 0/0/1/1:4:60,60:0.44:-0.83:1.000:0.965 0/0/0/1:4:77,55:0.35:-0.56:1.000:0.831 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,66:0.41:-0.40:1.000:0.866 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,51:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,107:0.53: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,105:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,66:0.44:-0.58:1.000:0.971 0/1/1/1:4:55,122:0.64: 0.44:1.000:0.723 0/0/0/0/0/1:6:140,19:0.09: 0.04:1.000:0.796 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,56:0.28: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,70:0.32: 0.42:1.000:0.942 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,58:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,71:0.43:-0.31:1.000:0.957 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,59:0.28: 0.20:0.996:0.996 0/0/1/1:4:59,111:0.60: 0.29:1.000:0.751 0/0/1/1:4:115,149:0.51: 2.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,113:0.56: 0.62:0.999:0.968 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,120:0.71: 0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:83,45:0.27:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,55:0.35:-0.58:1.000:0.802 0/0/1/1:4:79,94:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,53:0.29:-0.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:141,59:0.22: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,54:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,44:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,46:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,124:0.58: 0.89:1.000:0.917 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,64:0.34:-0.05:1.000:0.862 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,65:0.28: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,47:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,48:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,67:0.27: 0.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,113:0.69:-0.07:1.000:0.974 0/1/1/1:4:34,96:0.70:-0.60:1.000:0.981 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,129:0.61: 0.85:1.000:0.650 0/0/1/1:4:106,134:0.50: 1.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,71:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,71:0.38: 0.02:1.000:0.594 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,66:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,43:0.29:-0.87:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,59:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,108:0.61: 0.13:1.000:0.637 0/1/1/1:4:47,144:0.71: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:83,66:0.37:-0.18:0.999:0.500 0/0/0/1:4:75,58:0.37:-0.54:1.000:0.602 0/0/1/1:4:42,72:0.58:-0.96:1.000:0.907 0/0/1/1:4:85,126:0.54: 1.20:1.000:0.984 0/0/1/1:4:90,77:0.39: 0.22:1.000:0.744 0/0/0/1:4:73,45:0.31:-0.87:1.000:0.979 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,63:0.46:-0.78:1.000:0.986 0/0/1/1:4:63,63:0.44:-0.69:1.000:0.965 0/0/1/1:4:63,96:0.55: 0.04:1.000:0.978 0/0/1/1:4:61,95:0.56:-0.02:1.000:0.971 0/0/0/1:4:96,68:0.34: 0.15:1.000:0.848 0/0/0/1:4:92,57:0.31:-0.18:1.000:0.977 0/0/0/1:4:107,54:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,53:0.22: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,121:0.58: 0.76:1.000:0.898 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,91:0.66:-0.63:1.000:0.871 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,59:0.21: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:40,85:0.63:-0.71:0.993:0.947 0/0/1/1:4:46,55:0.49:-1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:68,26:0.21:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,80:0.32: 1.02:1.000:0.953 0/0/0/1:4:110,44:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,61:0.32:-0.05:1.000:0.955 0/0/1/1:4:59,97:0.57:-0.02:1.000:0.943 0/0/0/1:4:59,44:0.36:-1.20:1.000:0.721 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,51:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,132:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,86:0.28: 1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,191:0.55: 3.56:1.000:0.979 0/0/0/1:4:88,62:0.34:-0.16:1.000:0.858 0/0/0/1:4:82,46:0.28:-0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,116:0.47: 1.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:115,61:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,77:0.35: 0.60:1.000:0.815 0/0/1/1:4:96,123:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,76:0.55:-0.67:1.000:0.983 0/0/0/1:4:96,52:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,44:0.29:-0.85:1.000:0.990 0/1/1/1:4:57,153:0.69: 1.18:1.000:0.965 0/0/0/1:4:174,82:0.24: 2.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,72:0.28: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:106,132:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:149,53:0.20: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,96:0.75:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,110:0.55: 0.58:1.000:0.981 0/0/0/1:4:129,64:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,34:0.43:-1.96:1.000:0.948 0/0/0/1:4:136,58:0.23: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,119:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,67:0.34: 0.15:1.000:0.891 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,113:0.68:-0.02:1.000:0.955 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,73:0.29: 0.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,123:0.57: 0.89:1.000:0.936 0/0/0/1:4:81,45:0.28:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/0:4:189,1:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,181:0.50: 3.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,63:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,52:0.28:-0.27:1.000:0.995 -chr5.1 68224434 chr5.1_068224434 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:190,704:.: 0.57:1.000:. ./.:4:247,570:.: 0.15:1.000:. ./.:4:166,741:.: 0.64:1.000:. ./.:4:177,598:.:-0.08:1.000:. ./.:4:204,685:.: 0.54:1.000:. ./.:4:228,729:.: 0.91:1.000:. ./.:4:205,424:.:-0.88:1.000:. ./.:4:83,762:.: 0.30:1.000:. ./.:4:176,584:.:-0.16:1.000:. ./.:4:93,236:.:-2.51:1.000:. ./.:4:63,215:.:-2.79:1.000:. ./.:4:284,630:.: 0.68:1.000:. ./.:4:279,407:.:-0.57:1.000:. ./.:4:228,672:.: 0.60:1.000:. ./.:4:179,515:.:-0.52:1.000:. ./.:4:294,676:.: 0.98:1.000:. ./.:4:215,719:.: 0.79:0.944:. ./.:4:321,526:.: 0.31:1.000:. ./.:4:319,842:.: 2.02:1.000:. ./.:4:266,877:.: 1.93:1.000:. ./.:4:48,273:.:-2.56:1.000:. ./.:4:193,629:.: 0.18:1.000:. ./.:4:214,460:.:-0.63:1.000:. ./.:4:281,717:.: 1.14:1.000:. ./.:4:45,210:.:-2.92:1.000:. ./.:4:218,529:.:-0.23:1.000:. ./.:4:195,631:.: 0.20:1.000:. ./.:4:168,690:.: 0.37:1.000:. ./.:4:215,603:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,827:.: 0.78:1.000:. ./.:4:486,469:.: 0.90:1.000:. ./.:4:157,536:.:-0.53:1.000:. ./.:4:24,176:.:-3.21:1.000:. ./.:4:63,383:.:-1.87:1.000:. ./.:3:30,104:.:-3.57:1.000:. ./.:4:316,799:.: 1.77:1.000:. ./.:4:210,681:.: 0.55:1.000:. ./.:4:195,744:.: 0.81:1.000:. ./.:4:218,473:.:-0.54:1.000:. ./.:4:274,787:.: 1.48:1.000:. ./.:4:286,680:.: 0.96:1.000:. ./.:4:290,479:.:-0.11:1.000:. ./.:4:221,715:.: 0.80:1.000:. ./.:4:240,718:.: 0.92:1.000:. ./.:4:208,759:.: 0.97:1.000:. ./.:4:86,748:.: 0.24:1.000:. ./.:4:213,813:.: 1.29:1.000:. ./.:4:57,214:.:-2.83:1.000:. ./.:4:176,603:.:-0.06:1.000:. ./.:4:277,440:.:-0.40:1.000:. ./.:4:207,682:.: 0.54:1.000:. ./.:4:325,623:.: 0.86:1.000:. ./.:4:327,455:.:-0.04:1.000:. ./.:4:261,555:.: 0.14:1.000:. ./.:4:259,478:.:-0.29:1.000:. ./.:4:85,663:.:-0.23:1.000:. ./.:4:176,446:.:-0.91:1.000:. ./.:4:188,636:.: 0.19:1.000:. ./.:4:186,496:.:-0.59:1.000:. ./.:6:207,474:.:-0.59:1.000:. ./.:4:295,533:.: 0.21:1.000:. ./.:4:175,576:.:-0.21:1.000:. ./.:4:214,555:.:-0.11:1.000:. ./.:4:281,474:.:-0.19:1.000:. ./.:4:305,634:.: 0.81:1.000:. ./.:4:159,636:.: 0.03:1.000:. ./.:4:243,530:.:-0.09:1.000:. ./.:4:250,640:.: 0.55:1.000:. ./.:4:180,719:.: 0.60:0.996:. ./.:4:144,647:.: 0.01:1.000:. ./.:4:221,466:.:-0.56:1.000:. ./.:4:160,378:.:-1.37:0.999:. ./.:4:389,716:.: 1.72:1.000:. ./.:4:184,495:.:-0.60:1.000:. ./.:4:240,589:.: 0.21:1.000:. ./.:4:208,660:.: 0.43:1.000:. ./.:4:91,613:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,679:.: 0.40:1.000:. ./.:4:201,746:.: 0.86:1.000:. ./.:4:221,836:.: 1.46:1.000:. ./.:4:227,521:.:-0.23:1.000:. ./.:4:218,706:.: 0.73:1.000:. ./.:4:305,621:.: 0.74:1.000:. ./.:4:326,310:.:-0.84:1.000:. ./.:4:301,657:.: 0.92:1.000:. ./.:4:317,761:.: 1.57:1.000:. ./.:4:139,386:.:-1.44:1.000:. ./.:4:291,293:.:-1.12:1.000:. ./.:4:249,444:.:-0.53:1.000:. ./.:4:158,718:.: 0.47:1.000:. ./.:4:175,632:.: 0.09:1.000:. ./.:4:279,459:.:-0.28:1.000:. ./.:4:343,709:.: 1.43:1.000:. ./.:4:116,501:.:-0.94:1.000:. ./.:4:225,974:.: 2.23:1.000:. ./.:4:125,795:.: 0.71:1.000:. ./.:4:69,682:.:-0.21:1.000:. ./.:4:342,498:.: 0.27:1.000:. ./.:4:202,587:.: 0.00:1.000:. ./.:4:112,728:.: 0.27:1.000:. ./.:4:235,392:.:-0.89:1.000:. ./.:4:154,673:.: 0.20:1.000:. ./.:4:191,440:.:-0.87:1.000:. ./.:4:266,472:.:-0.28:1.000:. ./.:4:195,631:.: 0.20:0.999:. ./.:4:268,627:.: 0.57:1.000:. ./.:4:186,598:.:-0.03:1.000:. ./.:4:193,708:.: 0.61:1.000:. ./.:4:325,800:.: 1.83:1.000:. ./.:4:298,688:.: 1.07:1.000:. ./.:4:160,402:.:-1.24:1.000:. ./.:4:139,1089:.: 2.39:1.000:. ./.:4:255,506:.:-0.16:0.999:. ./.:4:356,567:.: 0.73:1.000:. ./.:4:80,538:.:-0.94:1.000:. ./.:4:201,497:.:-0.50:1.000:. ./.:4:214,424:.:-0.83:1.000:. ./.:4:218,448:.:-0.67:1.000:. ./.:4:346,437:.:-0.04:1.000:. ./.:4:178,564:.:-0.26:1.000:. ./.:4:166,689:.: 0.36:1.000:. ./.:4:166,469:.:-0.84:1.000:. ./.:4:198,677:.: 0.46:1.000:. ./.:4:305,591:.: 0.58:1.000:. ./.:4:291,386:.:-0.61:1.000:. ./.:4:237,395:.:-0.86:1.000:. ./.:4:272,428:.:-0.49:1.000:. ./.:4:152,534:.:-0.57:1.000:. ./.:4:299,359:.:-0.72:1.000:. ./.:4:151,487:.:-0.83:1.000:. ./.:4:220,696:.: 0.69:1.000:. ./.:4:168,612:.:-0.05:1.000:. ./.:5:117,625:.:-0.26:0.993:. ./.:4:171,760:.: 0.77:1.000:. ./.:4:176,520:.:-0.51:1.000:. ./.:4:364,626:.: 1.09:1.000:. ./.:4:307,414:.:-0.37:1.000:. ./.:4:163,619:.:-0.04:1.000:. ./.:4:138,515:.:-0.75:1.000:. ./.:4:195,713:.: 0.64:1.000:. ./.:4:260,667:.: 0.75:1.000:. ./.:4:257,485:.:-0.26:1.000:. ./.:4:195,488:.:-0.58:1.000:. ./.:4:261,306:.:-1.21:1.000:. ./.:4:316,609:.: 0.74:1.000:. ./.:4:91,800:.: 0.55:1.000:. ./.:4:196,777:.: 1.00:1.000:. ./.:4:186,555:.:-0.27:1.000:. ./.:4:107,776:.: 0.51:1.000:. ./.:4:265,478:.:-0.26:1.000:. ./.:4:330,493:.: 0.18:1.000:. ./.:4:193,400:.:-1.07:1.000:. ./.:4:30,260:.:-2.72:1.000:. ./.:4:133,558:.:-0.54:1.000:. ./.:4:328,506:.: 0.24:1.000:. ./.:4:229,561:.: 0.00:1.000:. ./.:4:205,633:.: 0.26:1.000:. ./.:4:302,634:.: 0.80:1.000:. ./.:4:164,356:.:-1.47:1.000:. ./.:4:297,395:.:-0.53:1.000:. ./.:4:250,618:.: 0.43:1.000:. ./.:4:79,594:.:-0.64:1.000:. ./.:4:180,455:.:-0.84:1.000:. ./.:4:281,399:.:-0.60:1.000:. ./.:4:296,489:.:-0.03:1.000:. ./.:4:178,718:.: 0.58:1.000:. ./.:4:259,583:.: 0.28:1.000:. ./.:4:428,656:.: 1.60:1.000:. ./.:4:197,415:.:-0.97:1.000:. ./.:4:165,595:.:-0.16:1.000:. ./.:4:322,308:.:-0.87:1.000:. ./.:4:227,563:.: 0.00:1.000:. ./.:4:391,390:.:-0.05:1.000:. ./.:4:235,661:.: 0.58:1.000:. ./.:4:346,348:.:-0.52:1.000:. ./.:4:172,403:.:-1.17:1.000:. ./.:4:516,509:.: 1.28:1.000:. ./.:4:214,756:.: 0.98:1.000:. ./.:4:204,430:.:-0.85:1.000:. ./.:4:273,451:.:-0.36:1.000:. ./.:4:447,464:.: 0.66:1.000:. ./.:4:338,844:.: 2.14:1.000:. ./.:4:101,830:.: 0.77:1.000:. ./.:4:267,354:.:-0.92:1.000:. ./.:4:255,617:.: 0.45:1.000:. -chr5.1 68293717 chr5.1_068293717 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:491,167:0.22: 2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,139:0.53:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/0:4:416,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:318,139:0.27: 0.78:1.000:0.998 0/0/0/0:4:512,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:525,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,144:0.38: 0.00:1.000:0.504 0/0/0/0:4:434,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:414,1:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,6:0.05:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,128:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,136:0.45:-0.53:1.000:0.981 0/0/0/0:4:467,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:399,128:0.21: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,1:0.01:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:503,0:0.00: 1.11:0.944:1.000 0/0/0/0:4:292,1:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:627,1:0.00: 2.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:310,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,96:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:290,1:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,192:0.33: 1.28:1.000:0.913 0/0/0/1:4:258,156:0.34: 0.46:1.000:0.849 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:543,161:0.20: 2.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:287,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:392,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:487,1:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:475,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,198:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:254,116:0.28: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:315,2:0.01:-0.25:1.000:1.000 0/0/1:3:73,19:0.18:-1.91:1.000:0.991 0/0/0/0:4:330,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:288,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,168:0.34: 0.75:1.000:0.887 0/0/0/1:4:350,177:0.30: 1.29:1.000:0.983 0/0/0/0:4:299,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:308,2:0.01:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:368,1:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:285,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:394,4:0.01: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:489,1:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:450,1:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:431,266:0.35: 2.54:1.000:0.812 0/0/0/0:4:251,2:0.01:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,251:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/0:4:256,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,148:0.41:-0.16:1.000:0.888 0/0/0/0:4:231,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,194:0.53:-0.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:243,128:0.31: 0.14:1.000:0.971 0/0/0/1:4:540,182:0.22: 2.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:214,1:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:378,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:306,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:166,144:0.43:-0.31:1.000:0.603 0/0/1/1:4:135,159:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:200,1:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:356,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,169:0.52:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:442,175:0.25: 1.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:251,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,3:0.02:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,227:0.39: 1.37:0.996:0.666 0/0/0/0:4:265,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:391,222:0.33: 1.92:1.000:0.927 0/0/0/1:4:416,142:0.22: 1.52:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,234:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:259,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,157:0.46:-0.25:1.000:0.988 0/0/0/0:4:312,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:433,155:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,169:0.37: 0.46:1.000:0.508 0/0/0/1:4:442,149:0.22: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:481,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,153:0.52:-0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:368,201:0.32: 1.60:1.000:0.955 0/0/1/1:4:133,179:0.55:-0.29:1.000:0.983 0/0/1/1:4:107,123:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:318,163:0.31: 0.95:1.000:0.980 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,142:0.47:-0.51:1.000:0.992 0/0/0/0:4:307,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,117:0.30: 0.00:1.000:0.985 0/0/0/1:4:320,143:0.28: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:310,135:0.27: 0.69:1.000:0.998 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,117:0.28: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:422,1:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:455,1:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:367,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,297:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:423,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:482,157:0.22: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,133:0.32: 0.20:1.000:0.960 0/0/0/0:4:304,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,117:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:287,182:0.35: 0.86:1.000:0.753 0/0/0/0:4:251,0:0.00:-0.74:0.999:1.000 0/0/0/0:4:123,1:0.01:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,153:0.36: 0.28:1.000:0.696 0/0/0/1:4:276,151:0.32: 0.55:1.000:0.954 0/0/0/0:4:165,2:0.01:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,143:0.31: 0.47:1.000:0.972 0/0/0/0:4:257,1:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:615,0:0.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:337,1:0.00:-0.10:0.999:1.000 0/0/0/0:4:141,3:0.02:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:318,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:328,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,162:0.35: 0.48:1.000:0.748 0/0/0/1:4:294,169:0.33: 0.82:1.000:0.916 0/0/0/0:4:144,1:0.01:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:273,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:300,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:428,169:0.25: 1.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:456,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:261,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,175:0.37: 0.56:1.000:0.501 0/0/1/1:4:162,193:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,141:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,162:0.35: 0.55:1.000:0.823 0/0/0/0:4:99,1:0.01:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:362,1:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:272,1:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,1:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:308,1:0.00:-0.31:0.993:1.000 0/0/0/0:4:252,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,116:0.33:-0.24:1.000:0.922 0/0/0/0:4:339,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,150:0.47:-0.39:1.000:0.992 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:393,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:377,1:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:147,1:0.01:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,170:0.33: 0.83:1.000:0.913 0/0/0/0:4:236,1:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,136:0.52:-0.78:1.000:0.995 0/0/0/0:4:351,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:595,178:0.20: 3.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:295,1:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:249,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:466,147:0.21: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,110:0.32:-0.33:1.000:0.941 0/0/1/1:4:148,188:0.53:-0.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:280,140:0.30: 0.50:1.000:0.985 0/0/0/1:4:204,57:0.19:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,1:0.01:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:261,1:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,148:0.31: 0.60:1.000:0.976 0/0/0/1:4:316,166:0.31: 0.96:1.000:0.972 0/0/0/1:4:234,121:0.31: 0.03:1.000:0.977 0/0/0/1:4:315,146:0.28: 0.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:230,118:0.31:-0.03:1.000:0.980 0/0/0/0:4:349,2:0.01: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,120:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:257,2:0.01:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,141:0.32: 0.35:1.000:0.955 0/0/1/1:4:117,129:0.49:-0.78:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:295,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,135:0.34: 0.10:1.000:0.892 0/0/1/1:4:117,122:0.48:-0.83:1.000:0.994 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,166:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:258,122:0.29: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,141:0.51:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/0:4:251,1:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,164:0.46:-0.15:1.000:0.988 0/0/0/0:4:346,1:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,162:0.35: 0.55:1.000:0.823 0/0/0/0:4:237,29:0.10:-0.63:1.000:0.874 0/0/1/1:4:150,169:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:517,166:0.21: 2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,129:0.52:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,141:0.45:-0.46:1.000:0.983 -chr5.1 68510485 chr5.1_068510485 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,74:.:-2.04:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,166:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.18:0.944:. ./.:4:0,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,202:.: 2.70:1.000:. ./.:4:0,171:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,92:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,165:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,126:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,110:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,68:.:-2.26:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.97:1.000:. ./.:3:0,26:.:-3.82:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,224:.: 3.51:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,147:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,164:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,170:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.19:1.000:. ./.:6:0,112:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,179:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.03:0.996:. ./.:4:0,114:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.67:0.999:. ./.:4:0,170:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1,129:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,172:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,172:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,98:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,101:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,158:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.64:0.999:. ./.:4:0,116:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.30:1.000:. ./.:4:3,194:.: 2.51:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:0.999:. ./.:4:0,115:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.04:1.000:. ./.:4:1,135:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.22:1.000:. ./.:5:0,87:.:-1.56:0.993:. ./.:4:0,76:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,166:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,89:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,158:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,185:.: 2.07:1.000:. ./.:4:0,164:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,97:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,165:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,186:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,163:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,96:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,99:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,166:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,172:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.19:1.000:. -chr5.1 68892282 chr5.1_068892282 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:43,103:0.67: 1.61:1.000:0.900 0/0/1/1:4:28,19:0.38:-0.95:1.000:0.598 0/1/1/1:4:31,65:0.64: 0.31:1.000:0.657 0/0/1/1:4:27,30:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,131:0.61: 3.06:1.000:0.702 0/1/1/1:4:26,100:0.75: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,30:0.84:-1.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,16:0.31:-0.88:1.000:0.976 0/1/1/1:4:11,64:0.81:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.14:-1.63:1.000:0.970 0/0/1/1:4:19,24:0.52:-1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,11:0.41:-1.52:1.000:0.884 0/0/0/1:4:36,13:0.26:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,88:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,78:0.61: 0.94:1.000:0.685 0/0/0/1:4:46,24:0.33:-0.36:1.000:0.928 0/0/1/1:4:46,91:0.62: 1.38:0.944:0.508 1/1/1/1:4:7,126:0.90: 1.27:1.000:0.769 0/0/1/1:4:70,124:0.60: 2.85:1.000:0.792 0/0/1/1:4:47,40:0.43: 0.08:1.000:0.949 0/0/0/1:4:17,3:0.15:-1.65:1.000:0.985 0/0/1/1:4:17,30:0.60:-0.95:1.000:0.800 0/0/1/1:4:32,26:0.42:-0.67:1.000:0.917 0/0/1/1:4:34,41:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,18:0.74:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,53:0.54: 0.21:1.000:0.989 0/1/1/1:4:7,22:0.72:-1.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:37,75:0.63: 0.73:1.000:0.563 0/1/1/1:4:29,105:0.74: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,11:0.28:-1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,51:0.85:-0.70:1.000:0.989 0/0/1/1:4:22,26:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,5:0.47:-1.91:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,40:0.67:-0.72:1.000:0.937 0/0/1:3:13,6:0.30:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,71:0.61: 0.65:1.000:0.670 0/0/1/1:4:32,45:0.55:-0.18:1.000:0.984 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,32:0.54:-0.75:1.000:0.986 0/0/1/1:4:44,45:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:39,14:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,115:0.77: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,52:0.45: 0.60:1.000:0.983 0/0/1/1:4:48,59:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,27:0.39:-0.49:1.000:0.713 0/0/0/1:4:56,25:0.30:-0.07:1.000:0.987 0/1/1/1:4:36,125:0.74: 2.00:1.000:0.998 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,15:0.27:-0.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,83:0.64: 1.01:1.000:0.629 0/0/0/1:4:92,32:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,83:0.82: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,14:0.26:-0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,69:0.54: 0.91:1.000:0.987 0/0/0/1:4:57,10:0.15:-0.44:1.000:0.984 0/0/1/1:4:20,36:0.60:-0.72:1.000:0.759 0/0/1/1:4:40,43:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,31:0.62:-0.95:1.000:0.569 0/0/0/0/1/1:6:40,28:0.39:-0.41:1.000:0.727 0/0/1/1:4:26,19:0.40:-1.01:1.000:0.773 0/0/1/1:4:19,27:0.55:-0.98:1.000:0.982 0/0/0/1:4:43,23:0.33:-0.46:1.000:0.906 0/1/1/1:4:8,100:0.88: 0.63:1.000:0.797 0/0/0/1:4:39,17:0.29:-0.72:1.000:0.990 0/0/1/1:4:52,96:0.61: 1.66:1.000:0.700 0/0/1/1:4:39,45:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,13:0.23:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.08:0.996:1.000 0/1/1/1:4:13,42:0.72:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,44:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,77:0.63: 0.81:0.999:0.562 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,35:0.39: 0.00:1.000:0.725 0/0/0/1:4:51,15:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,36:0.60:-0.72:1.000:0.759 0/0/0/1:4:65,25:0.27: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,58:0.46: 0.91:1.000:0.984 0/1/1/1:4:30,87:0.70: 0.86:1.000:0.988 0/0/0/1:4:21,4:0.16:-1.52:1.000:0.994 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,22:0.35:-0.64:1.000:0.747 0/1/1/1:4:37,78:0.64: 0.81:1.000:0.672 0/0/0/1:4:40,20:0.32:-0.62:1.000:0.954 0/0/1/1:4:93,72:0.41: 2.10:1.000:0.866 0/0/1/1:4:12,11:0.45:-1.58:1.000:0.977 0/1/1/1:4:39,100:0.68: 1.43:1.000:0.952 1/1/1/1:4:2,85:0.93: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,52:0.77:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,72:0.45: 1.69:1.000:0.981 0/0/0/1:4:69,25:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,122:0.75: 1.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,23:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,25:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,107:0.75: 1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,31:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,78:0.84: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,40:0.42: 0.13:1.000:0.921 0/0/0/1:4:31,6:0.16:-1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,53:0.54: 0.18:1.000:0.985 0/0/1/1:4:36,40:0.49:-0.20:0.999:0.996 0/0/0/1:4:92,32:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,22:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,87:0.48: 2.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,64:0.67: 0.16:1.000:0.925 0/0/0/1:4:80,19:0.19: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,108:0.83: 1.04:0.999:0.999 0/0/0/1:4:61,21:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,8:0.25:-1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,39:0.58:-0.54:1.000:0.915 0/0/1/1:4:54,50:0.45: 0.52:1.000:0.979 0/0/1/1:4:43,43:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/1/1/1:4:36,96:0.69: 1.25:1.000:0.969 0/0/1/1:4:62,43:0.39: 0.55:1.000:0.655 0/0/1/1:4:73,58:0.42: 1.22:1.000:0.896 0/0/1/1:4:59,113:0.62: 2.28:1.000:0.602 0/1/1/1:4:18,68:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,75:0.69: 0.50:1.000:0.970 0/1/1/1:4:33,116:0.74: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,14:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,17:0.29:-0.72:1.000:0.990 0/1/1/1:4:7,16:0.66:-1.58:1.000:0.840 0/1/1/1:4:26,66:0.68: 0.21:1.000:0.946 0/1/1/1:4:25,59:0.66: 0.00:1.000:0.884 0/0/1/1:4:38,70:0.61: 0.63:1.000:0.706 0/0/1/1:4:12,19:0.57:-1.37:1.000:0.936 0/0/1/1/1:5:26,54:0.64:-0.10:0.993:0.943 0/0/0/1:4:29,16:0.34:-1.01:1.000:0.872 0/0/1/1:4:33,27:0.42:-0.62:1.000:0.923 0/1/1/1:4:17,159:0.86: 2.39:1.000:0.976 0/0/0/1:4:38,12:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,40:0.62:-0.59:1.000:0.617 0/1/1/1:4:20,60:0.71:-0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:48,106:0.65: 1.82:1.000:0.779 0/0/0/1:4:57,25:0.29:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:40,73:0.61: 0.75:1.000:0.728 0/0/1/1:4:22,29:0.53:-0.85:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,58:0.72:-0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:11,168:0.89: 2.46:1.000:0.523 0/0/0/1:4:58,23:0.28:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,28:0.45:-0.67:1.000:0.981 0/0/0/1:4:121,37:0.23: 1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,46:0.52:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,19:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,29:0.43:-0.54:1.000:0.950 0/0/1/1:4:12,8:0.38:-1.65:1.000:0.549 0/1/1/1:4:8,41:0.79:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,13:0.30:-1.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:45,66:0.56: 0.70:1.000:0.973 0/0/1/1:4:49,53:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,78:0.46: 1.97:1.000:0.984 0/0/1/1:4:15,11:0.40:-1.50:1.000:0.780 0/1/1/1:4:15,75:0.79: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,63:0.59: 0.42:1.000:0.860 0/0/0/1:4:73,10:0.12:-0.02:1.000:0.734 0/0/1/1:4:24,28:0.50:-0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,96:0.82: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,67:0.81:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,21:0.32:-0.51:1.000:0.964 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,31:0.39:-0.23:1.000:0.693 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,55:0.80:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,42:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,62:0.71:-0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:50,60:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,65:0.72: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,14:0.42:-1.37:1.000:0.928 0/1/1/1:4:29,78:0.69: 0.60:1.000:0.972 0/0/1/1:4:35,56:0.58: 0.18:1.000:0.928 0/0/1/1:4:44,53:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,76:0.69: 0.52:1.000:0.974 0/1/1/1:4:30,78:0.68: 0.63:1.000:0.959 0/0/0/1:4:29,9:0.23:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,33:0.34: 0.21:1.000:0.854 0/0/0/1:4:35,13:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:52,15:0.22:-0.44:1.000:1.000 -chr5.1 68971542 chr5.1_068971542 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:84,27:0.25: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,31:0.44:-0.87:1.000:0.963 0/0/0/1:4:71,10:0.13:-0.29:1.000:0.863 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,57:0.49: 1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,52:0.62:-0.29:1.000:0.564 0/1/1/1:4:18,36:0.64:-1.84:1.000:0.704 0/0/1/1:4:52,35:0.40: 0.05:1.000:0.824 0/1/1/1:4:15,53:0.74:-1.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,10:0.21:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,42:0.56:-0.75:1.000:0.960 0/0/1/1:4:40,52:0.56: 0.34:1.000:0.974 0/0/1/1:4:41,33:0.45:-0.69:1.000:0.977 0/1/1/1:4:18,51:0.70:-0.98:1.000:0.987 0/0/1/1:4:28,26:0.48:-1.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,13:0.18:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,47:0.56:-0.18:0.944:0.973 0/1/1/1:4:21,57:0.70:-0.47:1.000:0.981 0/0/1/1:4:62,48:0.44: 1.37:1.000:0.963 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,18:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,23:0.33:-0.87:1.000:0.932 0/0/0/1:4:74,20:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,10:0.14:-0.69:1.000:0.958 0/0/0/1:4:55,7:0.12:-1.38:1.000:0.638 0/0/0/1:4:37,21:0.36:-1.61:1.000:0.633 0/0/0/1:4:68,18:0.21:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,23:0.31:-0.69:1.000:0.966 0/1/1/1:4:15,58:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,44:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,31:0.43:-0.75:1.000:0.935 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,27:0.47:-1.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,45:0.53:-0.12:1.000:0.992 0/0/1:3:22,10:0.32:-3.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,35:0.46:-0.52:1.000:0.984 0/0/0/1:4:65,21:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,24:0.27: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,17:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,25:0.27: 0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:41,14:0.26:-1.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,42:0.52:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,66:0.59: 1.26:1.000:0.836 0/0/0/1:4:79,25:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,30:0.23: 2.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,20:0.28:-0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,28:0.37:-0.52:1.000:0.614 0/0/0/1:4:69,27:0.29: 0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,29:0.32: 0.28:1.000:0.948 0/0/0/1:4:58,27:0.32:-0.06:1.000:0.951 0/0/1/1:4:46,38:0.45:-0.12:1.000:0.983 0/0/0/1:4:65,16:0.20:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,37:0.41: 0.22:1.000:0.880 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,47:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:71,27:0.28: 0.68:1.000:0.761 0/0/0/1:4:79,34:0.30: 1.54:1.000:0.981 0/0/0/1:4:48,17:0.27:-1.21:1.000:0.998 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,40:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:75,25:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,22:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,80:0.70: 1.31:1.000:0.984 0/0/0/1:4:59,18:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,21:0.24: 0.28:0.996:1.000 0/0/1/1:4:40,33:0.45:-0.75:1.000:0.983 0/0/1/1:4:68,44:0.39: 1.49:1.000:0.743 0/0/1/1:4:31,22:0.42:-1.90:0.999:0.899 0/0/0/1:4:62,20:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,21:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,21:0.21: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,20:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,31:0.32: 0.68:1.000:0.954 0/0/0/1:4:85,38:0.31: 2.12:1.000:0.970 0/0/0/0:4:107,1:0.01: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,52:0.56: 0.34:1.000:0.974 0/0/0/1:4:68,29:0.30: 0.62:1.000:0.983 0/0/1/1:4:50,55:0.52: 1.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:90,30:0.25: 1.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,18:0.26:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,21:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,46:0.47: 0.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:31,41:0.56:-0.81:1.000:0.969 0/0/1/1:4:38,31:0.45:-0.98:1.000:0.980 0/0/1/1:4:43,35:0.45:-0.47:1.000:0.979 0/0/0/1:4:62,23:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,25:0.28: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,36:0.45:-0.29:1.000:0.975 0/0/0/1:4:97,38:0.29: 2.80:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,37:0.63:-1.67:1.000:0.517 0/0/1/1:4:63,67:0.51: 2.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,14:0.16: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,22:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,23:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,84:0.67: 1.89:1.000:0.938 0/0/0/1:4:70,28:0.29: 0.68:1.000:0.992 0/0/0/1:4:59,20:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,22:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,94:0.71: 2.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,42:0.53:-0.41:0.999:0.993 0/0/0/1:4:86,23:0.21: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,25:0.30:-0.18:1.000:0.980 0/0/1/1:4:40,43:0.52:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,18:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,52:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,45:0.55:-0.35:1.000:0.977 0/0/0/1:4:69,29:0.30: 0.68:1.000:0.985 0/0/0/1:4:67,34:0.34: 0.85:0.999:0.872 0/0/1/1:4:77,57:0.43: 2.75:1.000:0.938 0/0/1/1:4:25,29:0.53:-1.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,53:0.48: 1.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,32:0.43:-0.69:1.000:0.955 0/0/1/1:4:44,36:0.45:-0.35:1.000:0.981 0/0/1/1:4:62,51:0.45: 1.54:1.000:0.982 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,42:0.47: 0.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,70:0.71: 0.45:1.000:0.990 0/1/1/1:4:22,58:0.69:-0.35:1.000:0.975 0/0/0/1:4:72,21:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,48:0.54: 0.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:63,41:0.40: 1.03:1.000:0.756 0/0/0/1:4:58,14:0.20:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,41:0.58:-0.98:1.000:0.914 0/0/1/1:4:42,45:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,47:0.56:-0.18:1.000:0.973 0/0/0/1:4:49,24:0.33:-0.75:1.000:0.913 0/0/0/1/1:5:46,43:0.48: 0.17:0.993:0.660 0/0/0/1:4:47,26:0.36:-0.75:1.000:0.703 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,41:0.48:-0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,45:0.48: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,22:0.29:-0.58:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,66:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,23:0.29:-0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:54,23:0.30:-0.52:1.000:0.983 0/1/1/1:4:24,93:0.75: 1.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,18:0.21: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,17:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,52:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,35:0.33: 1.20:1.000:0.920 0/0/1/1:4:50,39:0.44: 0.17:1.000:0.966 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,21:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,65:0.68: 0.28:1.000:0.958 0/0/0/1:4:76,25:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,17:0.21:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,24:0.44:-1.78:1.000:0.963 0/0/1/1:4:26,34:0.56:-1.50:1.000:0.972 0/0/1/1:4:61,37:0.38: 0.68:1.000:0.566 0/0/0/1:4:69,29:0.30: 0.68:1.000:0.985 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,48:0.53: 0.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:69,15:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,16:0.19: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,44:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,11:0.21:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,44:0.56:-0.52:1.000:0.966 0/0/0/1:4:57,19:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,14:0.23:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,36:0.45:-0.35:1.000:0.981 0/0/0/1:4:62,17:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,29:0.44:-1.15:1.000:0.968 0/0/0/1:4:60,14:0.19:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,19:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,31:0.45:-0.98:1.000:0.980 0/0/1/1:4:38,26:0.41:-1.27:1.000:0.851 0/0/0/1:4:44,14:0.25:-1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,23:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,34:0.47:-0.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:48,22:0.32:-0.92:1.000:0.959 0/0/1/1:4:59,36:0.38: 0.51:1.000:0.584 0/0/0/1:4:87,17:0.17: 1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,14:0.17:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,20:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,47:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,19:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,22:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,35:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,20:0.25:-0.35:1.000:0.999 -chr5.1 69219886 chr5.1_069219886 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:64,121:0.57: 1.91:1.000:0.937 0/0/1/1:4:74,39:0.40: 0.28:1.000:0.768 0/0/1/1:4:47,50:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,124:0.76: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,39:0.43:-0.06:1.000:0.936 0/0/1/1:4:63,50:0.45: 0.28:1.000:0.980 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.51:-1.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,2:0.28:-1.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,54:0.41: 1.03:1.000:0.870 0/0/1/1:4:48,53:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,73:0.53: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,62:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.92:0.944:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,66:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,29:0.74:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,60:0.53: 0.03:1.000:0.991 0/1/1/1:4:5,72:0.74:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,114:0.60: 1.46:1.000:0.826 0/0/1/1:4:9,15:0.56:-1.74:1.000:0.973 0/0/1/1:4:77,64:0.46: 0.92:1.000:0.985 0/0/1/1:4:50,48:0.48:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,58:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,61:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,59:0.38: 1.91:1.000:0.610 1/1/1/1:4:2,111:0.92: 0.28:1.000:0.986 0/0/0/1:4:25,7:0.33:-1.56:1.000:0.927 0/0/1/1:4:23,31:0.52:-1.06:1.000:0.994 0/0/1:3:6,5:0.46:-2.03:1.000:0.946 0/0/1/1:4:115,56:0.39: 1.60:1.000:0.667 0/0/1/1:4:51,73:0.53: 0.53:1.000:0.991 0/1/1/1:4:3,120:0.89: 0.51:1.000:0.540 0/1/1/1:4:4,62:0.75:-0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,55:0.71:-0.85:1.000:0.990 0/0/1/1:4:45,50:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,59:0.85:-0.90:1.000:0.988 0/0/1/1:4:97,52:0.40: 1.10:1.000:0.787 0/1/1/1:4:4,48:0.74:-1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:47,71:0.54: 0.39:1.000:0.987 0/0/1/1:4:74,72:0.48: 1.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,132:0.87: 0.80:1.000:0.944 0/1/1/1:4:7,56:0.72:-0.85:1.000:0.994 0/1/1/1:4:4,48:0.74:-1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,60:0.46: 0.64:1.000:0.989 0/0/1/1:4:60,126:0.59: 1.94:1.000:0.879 0/0/0/0:4:61,1:0.05:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,118:0.61: 1.48:1.000:0.716 0/0/1/1:4:47,55:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,119:0.82: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,71:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:28,74:0.62: 0.03:1.000:0.762 0/0/1/1:4:53,87:0.55: 0.89:1.000:0.976 0/0/1/1:4:60,60:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,70:0.87:-0.65:1.000:0.881 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,109:0.61: 1.21:1.000:0.736 0/0/1/1:4:54,114:0.59: 1.53:1.000:0.875 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,72:0.56: 0.30:1.000:0.968 0/1/1/1:4:5,99:0.78: 0.08:0.996:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,58:0.92:-0.95:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,40:0.51:-0.65:0.999:0.996 0/0/1/1:4:56,59:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,61:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,53:0.49: 0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,121:0.93: 0.51:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,112:0.80: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,61:0.41: 1.48:1.000:0.862 0/0/1/1:4:36,39:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,125:0.59: 1.85:1.000:0.844 0/0/1/1:4:51,119:0.60: 1.57:1.000:0.781 0/0/1/1:4:44,50:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,72:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,114:0.50: 2.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,56:0.40: 1.32:1.000:0.802 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,167:0.67: 2.35:1.000:0.933 0/0/1/1:4:36,83:0.60: 0.42:1.000:0.794 0/0/1/1:4:48,59:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,71:0.54: 0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:42,82:0.58: 0.53:1.000:0.923 0/0/1/1:4:95,53:0.40: 1.07:1.000:0.827 0/1/1/1:4:5,57:0.73:-0.88:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,93:0.62: 0.62:1.000:0.605 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,118:0.85: 0.48:1.000:0.988 0/0/1/1:4:43,42:0.48:-0.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,55:0.73:-0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,62:0.56:-0.08:1.000:0.960 0/0/1/1:4:90,62:0.43: 1.17:1.000:0.951 0/0/1/1:4:65,35:0.40:-0.01:0.999:0.792 0/0/1/1:4:39,56:0.53:-0.13:1.000:0.991 1/1/1/1:4:2,97:0.91:-0.04:1.000:0.921 0/0/1/1:4:53,99:0.57: 1.17:1.000:0.942 0/0/1/1:4:63,78:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,103:0.49: 2.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,96:0.82:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.19:0.999:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,35:0.52:-0.90:1.000:0.994 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,46:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,51:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,38:0.73:-1.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,52:0.74:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,48:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,53:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,50:0.53:-0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,45:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,49:0.53:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,40:0.38: 0.60:1.000:0.582 0/0/1/1:4:43,47:0.49:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:44,24:0.40:-0.74:0.993:0.971 0/0/1/1:4:46,55:0.51: 0.01:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,100:0.95: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,56:0.49: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,44:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,44:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,65:0.52: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,45:0.39: 0.76:1.000:0.717 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,35:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,147:0.94: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,76:0.53: 0.71:1.000:0.994 0/1/1/1:4:3,53:0.75:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,126:0.96: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,52:0.41: 0.85:1.000:0.890 0/1/1/1:4:2,77:0.88:-0.49:1.000:0.665 0/1/1/1:4:5,65:0.74:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,43:0.74:-1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,26:0.38:-0.42:1.000:0.597 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-2.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,64:0.47: 0.78:1.000:0.991 0/1/1/1:4:3,51:0.75:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,65:0.47: 0.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:88,98:0.50: 1.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,65:0.86:-0.76:1.000:0.954 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,59:0.53:-0.01:1.000:0.990 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,114:0.58: 1.57:1.000:0.900 0/1/1/1:4:32,116:0.65: 1.07:1.000:0.810 0/0/1/1:4:96,46:0.39: 0.94:1.000:0.644 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,93:0.95:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,34:0.39: 0.05:1.000:0.683 0/0/1/1:4:87,52:0.41: 0.87:1.000:0.883 0/0/1/1:4:51,56:0.49: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,126:0.64: 1.44:1.000:0.718 0/0/1/1:4:84,52:0.42: 0.80:1.000:0.904 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,69:0.39: 2.37:1.000:0.722 0/0/1/1:4:50,62:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,61:0.75:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,10:0.29:-0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,53:0.41: 0.92:1.000:0.888 0/0/1/1:4:55,73:0.52: 0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,145:0.82: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,49:0.53:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,49:0.48:-0.01:1.000:0.994 -chr5.1 69252482 chr5.1_069252482 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:123,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:181,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:23,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.34:0.944:. ./.:4:82,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.83:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.64:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:108,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.53:1.000:. ./.:6:94,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.67:0.996:. ./.:4:126,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:157,2:.: 1.38:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.64:0.999:. ./.:4:149,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.28:1.000:. ./.:5:79,0:.:-1.23:0.993:. ./.:4:114,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:193,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:82,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.18:1.000:. -chr5.1 69403300 chr5.1_069403300 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:79,32:0.29: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:30,72:0.66:-0.16:1.000:0.891 0/0/0/1:4:47,25:0.34:-1.16:1.000:0.842 0/0/0/1:4:84,26:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,30:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,27:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,19:0.50:-2.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,31:0.27: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,25:0.33:-1.06:1.000:0.918 0/0/1/1:4:24,21:0.46:-2.07:1.000:0.986 0/0/0/1:4:22,9:0.29:-2.53:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,47:0.67:-1.36:1.000:0.917 0/0/1/1:4:60,57:0.48: 0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,21:0.29:-1.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:63,29:0.31:-0.49:1.000:0.968 0/0/1/1:4:73,55:0.42: 0.71:1.000:0.923 0/0/0/1:4:70,29:0.29:-0.26:0.944:0.991 0/0/1/1:4:43,64:0.57: 0.01:1.000:0.938 0/0/1/1:4:79,49:0.38: 0.71:1.000:0.540 0/0/0/1:4:114,31:0.22: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,9:0.21:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,31:0.26: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,35:0.25: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,42:0.56:-1.16:1.000:0.966 0/0/1/1:4:14,15:0.50:-2.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,40:0.31: 0.71:1.000:0.972 0/0/0/1:4:87,29:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,28:0.29:-0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:65,43:0.39: 0.04:1.000:0.717 0/0/0/1:4:90,43:0.32: 0.88:1.000:0.951 0/0/1/1:4:39,63:0.59:-0.16:1.000:0.867 0/0/0/1:4:91,33:0.27: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/0:4:18,2:0.10:-2.90:1.000:0.757 0/0/0/1:4:30,6:0.17:-2.37:1.000:0.998 0/0/1:3:10,7:0.41:-3.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,48:0.52:-0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,25:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,74:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,23:0.17: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,39:0.31: 0.61:1.000:0.973 0/0/1/1:4:59,67:0.52: 0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,29:0.28:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:119,40:0.25: 1.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,55:0.58:-0.56:1.000:0.897 0/0/0/1:4:122,37:0.23: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,32:0.22: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,26:0.30:-0.66:1.000:0.987 0/0/1/1:4:67,46:0.40: 0.21:1.000:0.798 0/0/0/1:4:89,38:0.30: 0.68:1.000:0.987 0/0/1/1:4:58,53:0.47: 0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,48:0.59:-0.96:1.000:0.878 0/0/0/1:4:95,58:0.37: 1.54:1.000:0.507 0/0/0/1:4:61,23:0.27:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,46:0.42: 0.04:1.000:0.909 0/0/1/1:4:41,62:0.58:-0.13:1.000:0.928 0/0/0/1:4:80,25:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,31:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,31:0.19: 2.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,28:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:59,41:0.40:-0.23:1.000:0.616 0/0/1/1:4:60,50:0.45: 0.11:1.000:0.975 0/0/0/1:4:101,31:0.24: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,24:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,39:0.36:-0.03:1.000:0.645 0/0/1/1:4:81,56:0.40: 1.01:1.000:0.811 0/0/0/1:4:81,35:0.30: 0.31:1.000:0.985 0/0/1/1:4:27,29:0.51:-1.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,67:0.47: 1.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:58,71:0.53: 0.74:0.996:0.991 0/0/1/1:4:64,77:0.53: 1.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:95,39:0.29: 0.91:1.000:0.992 0/0/0/1:4:46,14:0.23:-1.56:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,23:0.17: 0.94:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,74:0.71:-0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:63,21:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,23:0.22:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,74:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,29:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,35:0.35:-0.29:1.000:0.761 0/1/1/1:4:12,70:0.81:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,52:0.38: 0.94:1.000:0.569 0/0/1/1:4:75,68:0.47: 1.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:31,51:0.59:-0.83:1.000:0.844 0/0/1/1:4:53,52:0.48:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,69:0.63:-0.13:1.000:0.608 0/0/0/1:4:66,23:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,39:0.51:-1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,17:0.19:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,45:0.47:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:54,18:0.25:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,52:0.61:-0.86:1.000:0.692 0/0/1/1:4:79,81:0.50: 1.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,50:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,34:0.32:-0.09:1.000:0.940 0/0/0/1:4:109,36:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,31:0.27: 0.27:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,118:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,40:0.33: 0.44:1.000:0.918 0/0/0/1:4:111,30:0.21: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,15:0.30:-1.93:1.000:0.980 0/0/0/1:4:100,26:0.21: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,34:0.41:-0.83:1.000:0.851 0/0/1/1:4:52,68:0.55: 0.44:1.000:0.983 0/0/1/1:4:27,41:0.58:-1.30:0.999:0.925 0/0/1/1:4:61,59:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,51:0.41: 0.51:1.000:0.871 0/0/1/1:4:66,58:0.46: 0.57:1.000:0.987 0/0/1/1:4:88,70:0.43: 1.71:1.000:0.958 0/0/1/1:4:33,51:0.58:-0.76:1.000:0.912 0/0/0/1:4:85,37:0.30: 0.51:1.000:0.983 0/0/0/1:4:133,44:0.25: 2.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,23:0.24:-0.29:0.999:1.000 0/0/1/1:4:67,80:0.53: 1.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:73,18:0.20:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,19:0.15: 0.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,39:0.55:-1.26:1.000:0.984 0/0/1/1:4:38,44:0.52:-0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,53:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,29:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,26:0.21: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,24:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,37:0.35:-0.03:1.000:0.829 0/1/1/1:4:26,64:0.67:-0.56:1.000:0.913 0/0/0/1:4:67,18:0.21:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,57:0.44: 0.64:1.000:0.973 0/0/0/1:4:71,43:0.37: 0.24:1.000:0.531 0/0/1/1:4:55,40:0.41:-0.39:1.000:0.887 0/0/1/1:4:36,49:0.55:-0.73:1.000:0.975 0/0/0/1:4:56,19:0.25:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,58:0.58:-0.39:1.000:0.899 0/0/0/1:4:93,19:0.17: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/0/1:5:84,19:0.19:-0.13:0.993:0.998 0/0/1/1:4:85,55:0.39: 1.11:1.000:0.660 0/0/0/1:4:90,31:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,34:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,72:0.47: 1.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:84,18:0.18:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,22:0.28:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,31:0.35:-0.66:1.000:0.768 0/0/1/1:4:73,76:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,46:0.54:-0.83:1.000:0.987 0/0/0/1:4:78,16:0.17:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,47:0.63:-1.23:1.000:0.625 0/0/0/1:4:75,26:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,32:0.20: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,67:0.44: 1.38:1.000:0.973 0/0/0/1:4:93,34:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,40:0.25: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,60:0.58:-0.29:1.000:0.892 0/0/1/1:4:88,77:0.46: 1.95:1.000:0.986 0/0/0/1:4:110,28:0.20: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.35:-2.43:1.000:0.798 0/0/0/1:4:51,26:0.33:-1.00:1.000:0.899 0/0/1/1:4:57,60:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,32:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,29:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,55:0.60:-0.66:1.000:0.776 0/0/0/1:4:105,35:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,31:0.31:-0.26:1.000:0.971 0/1/1/1:4:33,76:0.66: 0.07:1.000:0.845 0/0/0/1:4:71,24:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,34:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,20:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,25:0.31:-0.86:1.000:0.977 0/0/1/1:4:58,57:0.48: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,51:0.50:-0.23:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,126:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,29:0.23: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,54:0.56:-0.46:1.000:0.970 0/0/1/1:4:33,61:0.62:-0.43:1.000:0.623 0/1/1/1:4:21,49:0.66:-1.23:1.000:0.861 0/0/1/1:4:32,50:0.58:-0.83:1.000:0.902 0/0/1/1:4:37,53:0.57:-0.56:1.000:0.958 0/1/1/1:4:26,56:0.64:-0.83:1.000:0.738 0/0/0/1:4:79,26:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,60:0.54: 0.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:100,23:0.19: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,28:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,50:0.48:-0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,42:0.47:-0.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,59:0.46: 0.64:1.000:0.987 0/0/0/1:4:102,34:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,37:0.44:-0.80:1.000:0.963 0/1/1/1:4:35,96:0.69: 0.81:1.000:0.968 -chr5.1 69631707 chr5.1_069631707 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:58,41:.:-1.31:1.000:. ./.:4:167,8:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,39:.:-1.36:1.000:. ./.:4:63,75:.:-0.40:1.000:. ./.:4:129,39:.: 0.29:1.000:. ./.:4:133,36:.: 0.32:1.000:. ./.:4:152,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:127,35:.: 0.16:1.000:. ./.:4:139,29:.: 0.29:1.000:. ./.:4:66,30:.:-1.38:1.000:. ./.:4:79,7:.:-1.61:1.000:. ./.:4:207,10:.: 1.43:1.000:. ./.:4:161,41:.: 1.09:1.000:. ./.:4:108,25:.:-0.52:1.000:. ./.:4:114,25:.:-0.38:1.000:. ./.:4:101,71:.: 0.39:1.000:. ./.:4:147,34:.: 0.60:0.944:. ./.:4:131,42:.: 0.41:1.000:. ./.:4:177,39:.: 1.41:1.000:. ./.:4:80,104:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,21:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,77:.:-0.31:1.000:. ./.:4:134,84:.: 1.46:1.000:. ./.:4:102,23:.:-0.70:1.000:. ./.:4:46,17:.:-2.15:1.000:. ./.:4:124,26:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,101:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,37:.:-1.26:1.000:. ./.:4:120,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:141,34:.: 0.46:1.000:. ./.:4:161,76:.: 1.90:1.000:. ./.:4:54,71:.:-0.70:1.000:. ./.:4:45,14:.:-2.24:1.000:. ./.:4:50,20:.:-1.98:1.000:. ./.:3:26,13:.:-2.70:1.000:. ./.:4:124,21:.:-0.24:1.000:. ./.:4:65,80:.:-0.24:1.000:. ./.:4:166,12:.: 0.53:1.000:. ./.:4:154,70:.: 1.60:1.000:. ./.:4:62,94:.: 0.02:1.000:. ./.:4:108,50:.: 0.06:1.000:. ./.:4:50,77:.:-0.66:1.000:. ./.:4:51,92:.:-0.29:1.000:. ./.:4:130,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:56,70:.:-0.68:1.000:. ./.:4:110,24:.:-0.50:1.000:. ./.:4:44,35:.:-1.77:1.000:. ./.:4:55,5:.:-2.22:1.000:. ./.:4:44,79:.:-0.75:1.000:. ./.:4:219,61:.: 2.90:1.000:. ./.:4:84,34:.:-0.87:1.000:. ./.:4:137,82:.: 1.48:1.000:. ./.:4:57,83:.:-0.36:1.000:. ./.:4:121,80:.: 1.06:1.000:. ./.:4:174,17:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,35:.: 0.60:1.000:. ./.:4:92,66:.: 0.06:1.000:. ./.:4:59,98:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,61:.: 0.41:1.000:. ./.:6:73,55:.:-0.64:1.000:. ./.:4:90,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:52,61:.:-0.98:1.000:. ./.:4:64,70:.:-0.50:1.000:. ./.:4:57,77:.:-0.50:1.000:. ./.:4:188,14:.: 1.09:1.000:. ./.:4:49,44:.:-1.45:1.000:. ./.:4:118,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:107,64:.: 0.36:1.000:. ./.:4:177,18:.: 0.92:0.996:. ./.:4:83,16:.:-1.31:1.000:. ./.:4:132,84:.: 1.41:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.84:0.999:. ./.:4:261,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:115,59:.: 0.43:1.000:. ./.:4:160,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:61,43:.:-1.19:1.000:. ./.:4:115,46:.: 0.13:1.000:. ./.:4:127,17:.:-0.26:1.000:. ./.:4:60,91:.:-0.10:1.000:. ./.:4:59,55:.:-0.96:1.000:. ./.:4:128,7:.:-0.47:1.000:. ./.:4:176,16:.: 0.85:1.000:. ./.:4:158,64:.: 1.55:1.000:. ./.:4:79,50:.:-0.61:1.000:. ./.:4:149,62:.: 1.29:1.000:. ./.:4:125,38:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,35:.:-0.98:1.000:. ./.:4:83,45:.:-0.64:1.000:. ./.:4:62,88:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,27:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,38:.:-1.63:1.000:. ./.:4:161,13:.: 0.43:1.000:. ./.:4:136,80:.: 1.41:1.000:. ./.:4:122,7:.:-0.61:1.000:. ./.:4:74,61:.:-0.47:1.000:. ./.:4:131,23:.:-0.03:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.84:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:128,28:.: 0.02:1.000:. ./.:4:101,25:.:-0.68:1.000:. ./.:4:30,69:.:-1.31:1.000:. ./.:4:63,74:.:-0.43:1.000:. ./.:4:79,37:.:-0.91:1.000:. ./.:4:153,15:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,58:.: 0.02:0.999:. ./.:4:107,76:.: 0.64:1.000:. ./.:4:150,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:185,13:.: 0.99:1.000:. ./.:4:131,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:123,29:.:-0.08:1.000:. ./.:4:108,48:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,27:.: 0.55:1.000:. ./.:4:48,85:.:-0.52:0.999:. ./.:4:178,41:.: 1.48:1.000:. ./.:4:85,16:.:-1.26:1.000:. ./.:4:120,65:.: 0.69:1.000:. ./.:4:148,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:165,12:.: 0.50:1.000:. ./.:4:99,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:50,71:.:-0.80:1.000:. ./.:4:63,63:.:-0.68:1.000:. ./.:4:92,23:.:-0.94:1.000:. ./.:4:142,43:.: 0.69:1.000:. ./.:4:198,10:.: 1.22:1.000:. ./.:4:47,56:.:-1.22:1.000:. ./.:4:144,44:.: 0.76:1.000:. ./.:4:154,45:.: 1.02:1.000:. ./.:4:91,30:.:-0.80:1.000:. ./.:4:89,44:.:-0.52:1.000:. ./.:4:81,25:.:-1.15:1.000:. ./.:4:115,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,90:.: 0.04:1.000:. ./.:5:70,39:.:-1.08:0.993:. ./.:4:102,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:65,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:71,109:.: 0.57:1.000:. ./.:4:160,67:.: 1.67:1.000:. ./.:4:44,43:.:-1.59:1.000:. ./.:4:93,31:.:-0.73:1.000:. ./.:4:46,47:.:-1.45:1.000:. ./.:4:99,57:.: 0.02:1.000:. ./.:4:164,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:88,55:.:-0.29:1.000:. ./.:4:87,51:.:-0.40:1.000:. ./.:4:52,111:.: 0.18:1.000:. ./.:4:123,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:179,12:.: 0.83:1.000:. ./.:4:45,89:.:-0.50:1.000:. ./.:4:144,34:.: 0.53:1.000:. ./.:4:175,17:.: 0.85:1.000:. ./.:4:217,63:.: 2.90:1.000:. ./.:4:144,62:.: 1.18:1.000:. ./.:4:49,16:.:-2.10:1.000:. ./.:4:37,32:.:-2.01:1.000:. ./.:4:205,60:.: 2.55:1.000:. ./.:4:118,77:.: 0.92:1.000:. ./.:4:70,85:.:-0.01:1.000:. ./.:4:193,16:.: 1.25:1.000:. ./.:4:107,43:.:-0.12:1.000:. ./.:4:78,80:.: 0.06:1.000:. ./.:4:100,26:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:107,60:.: 0.27:1.000:. ./.:4:60,69:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,97:.: 0.48:1.000:. ./.:4:177,19:.: 0.95:1.000:. ./.:4:94,48:.:-0.31:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:115,65:.: 0.57:1.000:. ./.:4:174,12:.: 0.71:1.000:. ./.:4:80,55:.:-0.47:1.000:. ./.:4:101,17:.:-0.87:1.000:. ./.:4:89,66:.:-0.01:1.000:. ./.:4:96,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:96,62:.: 0.06:1.000:. ./.:4:96,53:.:-0.15:1.000:. ./.:4:163,76:.: 1.95:1.000:. ./.:4:85,84:.: 0.32:1.000:. ./.:4:171,66:.: 1.90:1.000:. ./.:4:83,74:.: 0.04:1.000:. ./.:4:127,72:.: 1.02:1.000:. ./.:4:129,78:.: 1.20:1.000:. ./.:4:141,28:.: 0.32:1.000:. ./.:4:164,44:.: 1.22:1.000:. ./.:4:184,12:.: 0.95:1.000:. -chr5.1 69686056 chr5.1_069686056 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:55,81:0.55: 1.88:1.000:0.980 0/0/1/1:4:29,58:0.59: 0.04:1.000:0.859 0/0/1/1:4:48,63:0.53: 0.95:1.000:0.991 0/0/0/1:4:93,27:0.21: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,60:0.54: 0.68:1.000:0.988 0/1/1/1:4:5,105:0.81: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,34:0.61:-1.38:1.000:0.726 0/0/1/1:4:32,57:0.58: 0.12:1.000:0.930 1/1/1/1:4:2,75:0.89:-0.33:1.000:0.627 0/0/0/1:4:15,4:0.20:-2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.49:-2.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,65:0.62: 0.16:1.000:0.525 0/0/0/1:4:67,25:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,58:0.75:-0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,51:0.57:-0.22:1.000:0.936 0/0/0/1:4:74,32:0.28: 0.76:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,61:0.57: 0.46:0.944:0.958 0/1/1/1:4:27,101:0.66: 1.58:1.000:0.883 0/0/1/1:4:48,59:0.52: 0.80:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,24:0.20: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.19:-2.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,57:0.56: 0.27:1.000:0.968 0/0/0/1:4:61,23:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,33:0.33: 0.31:1.000:0.899 0/0/1/1:4:3,2:0.39:-3.03:1.000:0.637 0/0/1/1:4:27,62:0.61: 0.12:1.000:0.709 0/0/1/1:4:68,64:0.47: 1.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,62:0.48: 1.51:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,92:0.96: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,60:0.59: 0.16:1.000:0.859 0/0/1/1:4:49,59:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,26:0.28: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,3:0.64:-3.07:1.000:0.684 0/0/1/1:4:10,13:0.53:-2.36:1.000:0.992 0/0/1:3:5,3:0.36:-2.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,49:0.52: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,51:0.46: 0.87:1.000:0.985 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,28:0.36:-0.41:1.000:0.714 0/0/0/1:4:78,34:0.29: 0.98:1.000:0.994 0/0/0/1:4:74,23:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,57:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:93,21:0.17: 1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,42:0.44: 0.27:1.000:0.965 0/0/0/1:4:82,24:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,42:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,70:0.51: 1.77:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,29:0.32:-0.03:1.000:0.940 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,47:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:104,27:0.19: 1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,47:0.48: 0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,37:0.26: 1.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,21:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,29:0.31: 0.08:1.000:0.969 0/0/1/1:4:28,42:0.55:-0.59:1.000:0.978 0/0/0/1:4:85,28:0.23: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,48:0.55:-0.18:1.000:0.982 0/0/0/0/1/1:6:64,32:0.32: 0.38:1.000:0.912 0/0/0/1:4:78,23:0.21: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,54:0.49: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,67:0.63: 0.19:1.000:0.583 0/0/0/1:4:67,25:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,51:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,9:0.39:-2.39:1.000:0.742 0/0/0/1:4:60,22:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.63:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,26:0.35:-0.52:1.000:0.833 0/0/1/1:4:14,15:0.50:-2.13:0.999:0.997 0/0/0/1:4:71,21:0.21: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,40:0.38: 0.61:1.000:0.533 0/0/1/1:4:50,44:0.46: 0.31:1.000:0.985 0/0/1/1:4:38,31:0.44:-0.63:1.000:0.960 0/0/0/1:4:48,19:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,37:0.32: 0.95:1.000:0.962 0/1/1/1:4:24,80:0.65: 0.68:1.000:0.800 0/0/1/1:4:40,42:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,27:0.33:-0.29:1.000:0.922 0/0/0/1:4:75,26:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,27:0.28: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,22:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,50:0.49: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,25:0.53:-1.57:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,39:0.52:-0.56:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,56:0.66:-0.52:1.000:0.840 0/0/0/1:4:70,23:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,33:0.48:-0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,25:0.31:-0.33:1.000:0.977 0/0/0/1:4:81,31:0.26: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,23:0.36:-0.93:1.000:0.669 0/0/1/1:4:26,65:0.62: 0.19:1.000:0.586 0/0/0/1:4:52,27:0.33:-0.26:1.000:0.938 0/0/0/1:4:43,12:0.20:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,20:0.26:-0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,69:0.83:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:71,27:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,25:0.59:-1.79:1.000:0.888 0/0/0/1:4:86,19:0.17: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,16:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,56:0.61:-0.22:1.000:0.687 0/0/1/1:4:30,43:0.55:-0.48:0.999:0.984 0/0/0/1:4:68,24:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,31:0.32: 0.23:1.000:0.953 0/0/0/1:4:94,27:0.21: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,57:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,35:0.52:-0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,34:0.31: 0.68:1.000:0.974 0/0/1/1:4:41,41:0.49:-0.14:0.999:0.996 0/0/0/1:4:78,11:0.11: 0.12:1.000:0.635 0/0/1/1:4:31,38:0.52:-0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:32,50:0.56:-0.14:1.000:0.971 0/0/0/1:4:37,16:0.28:-1.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,24:0.29:-0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:39,34:0.45:-0.48:1.000:0.983 0/0/0/1:4:58,22:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,27:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,46:0.60:-0.67:1.000:0.819 0/1/1/1:4:5,82:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,61:0.63:-0.07:1.000:0.505 0/0/1/1:4:49,50:0.49: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,13:0.18:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,19:0.29:-0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:20,42:0.60:-0.89:1.000:0.814 0/0/1/1:4:32,36:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,46:0.63:-0.86:1.000:0.536 0/0/1/1:4:42,33:0.43:-0.41:1.000:0.937 0/0/1/1:4:55,55:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:49,33:0.39:-0.14:0.993:0.970 0/0/0/1:4:63,22:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,24:0.25: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,98:0.64: 1.73:1.000:0.630 0/0/0/1:4:44,25:0.35:-0.63:1.000:0.823 0/0/1/1:4:36,36:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,59:0.80:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,44:0.46: 0.31:1.000:0.985 0/0/0/1:4:74,33:0.29: 0.80:1.000:0.991 0/0/1/1:4:35,62:0.57: 0.42:1.000:0.933 0/0/0/1:4:47,20:0.28:-0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,24:0.29:-0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:44,95:0.60: 2.00:1.000:0.785 0/0/0/1:4:60,29:0.31: 0.12:1.000:0.975 0/0/0/1:4:44,26:0.36:-0.59:1.000:0.735 0/0/0/1:4:87,32:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,42:0.39: 0.65:1.000:0.728 0/0/1/1:4:26,44:0.57:-0.59:1.000:0.950 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,24:0.25: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.39:-3.03:1.000:0.637 0/1/1/1:4:20,70:0.66: 0.16:1.000:0.840 0/0/0/1:4:60,24:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,24:0.29:-0.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:111,31:0.20: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,15:0.21:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,28:0.32:-0.11:1.000:0.952 0/0/0/1:4:74,46:0.37: 1.28:1.000:0.588 0/0/1/1:4:44,52:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,29:0.31: 0.12:1.000:0.975 0/0/1/1:4:35,62:0.57: 0.42:1.000:0.933 0/0/1/1:4:46,43:0.47: 0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:66,49:0.41: 1.10:1.000:0.877 0/0/0/1:4:70,26:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,35:0.35: 0.38:1.000:0.803 0/0/1/1:4:56,55:0.48: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,22:0.29:-0.56:1.000:0.991 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,52:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,40:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,20:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,30:0.22: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,36:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:69,19:0.20: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,59:0.46: 1.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:49,58:0.52: 0.80:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,32:0.32: 0.38:1.000:0.962 0/0/1/1:4:49,45:0.47: 0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:65,48:0.41: 1.02:1.000:0.869 0/0/0/1:4:81,33:0.27: 1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,37:0.34: 0.65:1.000:0.847 0/0/0/1:4:37,11:0.21:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,67:0.52: 1.43:1.000:0.995 -chr5.1 69844458 chr5.1_069844458 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:105,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:73,35:.: 1.06:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:63,37:.: 0.72:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:14,1:.:-2.88:1.000:. ./.:4:15,8:.:-2.54:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:57,27:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,32:.: 1.70:0.944:. ./.:4:110,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:104,46:.: 2.84:1.000:. ./.:4:85,33:.: 1.48:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:60,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:22,7:.:-2.29:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:52,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.95:1.000:. ./.:3:7,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:58,38:.: 0.55:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:87,28:.: 1.36:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:77,33:.: 1.14:1.000:. ./.:4:69,18:.: 0.17:1.000:. ./.:4:74,18:.: 0.38:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.68:1.000:. ./.:4:54,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,20:.:-0.47:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:84,40:.: 1.74:1.000:. ./.:4:46,26:.:-0.47:1.000:. ./.:4:50,19:.:-0.59:1.000:. ./.:4:40,27:.:-0.68:1.000:. ./.:4:59,19:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:59,18:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.17:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:78,25:.: 0.85:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.25:1.000:. ./.:6:81,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,24:.:-0.42:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,23:.: 0.34:1.000:. ./.:4:51,27:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,29:.: 0.68:0.996:. ./.:4:89,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.36:0.999:. ./.:4:59,60:.: 1.53:1.000:. ./.:4:69,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:76,34:.: 1.14:1.000:. ./.:4:68,38:.: 0.97:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:50,15:.:-0.76:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,9:.:-0.89:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:64,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:59,25:.: 0.04:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:47,18:.:-0.76:1.000:. ./.:4:66,23:.: 0.25:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:63,27:.: 0.30:1.000:. ./.:4:51,10:.:-0.93:1.000:. ./.:4:41,17:.:-1.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,12:.:-0.98:0.999:. ./.:4:46,15:.:-0.93:1.000:. ./.:4:55,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:78,29:.: 1.02:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:103,26:.: 1.95:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.25:0.999:. ./.:4:61,29:.: 0.30:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:45,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:51,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:42,16:.:-1.06:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:67,31:.: 0.64:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:42,16:.:-1.06:1.000:. ./.:4:41,23:.:-0.81:1.000:. ./.:4:31,23:.:-1.23:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.34:1.000:. ./.:5:51,13:.:-0.81:0.993:. ./.:4:33,10:.:-1.70:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:38,18:.:-1.14:1.000:. ./.:4:49,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:61,28:.: 0.25:1.000:. ./.:4:49,18:.:-0.68:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:75,37:.: 1.23:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:101,37:.: 2.33:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:81,22:.: 0.85:1.000:. ./.:4:68,23:.: 0.34:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:81,41:.: 1.65:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:73,14:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:66,32:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:75,36:.: 1.19:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:42,25:.:-0.68:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.89:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:63,16:.:-0.17:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:71,21:.: 0.38:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:76,44:.: 1.57:1.000:. ./.:4:156,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:69,24:.: 0.42:1.000:. -chr5.1 69900843 chr5.1_069900843 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:151,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:62,1:.:-1.19:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:121,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.16:0.944:. ./.:4:149,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:15,10:.:-2.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:106,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:205,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:65,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.22:1.000:. ./.:3:11,2:.:-2.42:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:125,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,5:.:-0.78:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.53:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:225,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:24,7:.:-1.98:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:78,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:118,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:125,8:.: 0.52:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.69:1.000:. ./.:6:57,2:.:-1.29:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:121,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:113,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:96,3:.:-0.31:0.996:. ./.:4:205,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:92,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:69,6:.:-0.90:0.999:. ./.:4:114,5:.: 0.18:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:107,8:.: 0.08:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:106,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:99,6:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:108,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,7:.:-1.17:1.000:. ./.:4:48,3:.:-1.49:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:72,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:79,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:92,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:106,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:62,12:.:-0.92:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:128,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:41,2:.:-1.68:1.000:. ./.:4:97,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.01:0.999:. ./.:4:97,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.85:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:149,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:90,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:95,6:.:-0.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:114,7:.: 0.23:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:67,6:.:-0.95:1.000:. ./.:4:81,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:73,4:.:-0.85:1.000:. ./.:4:104,6:.:-0.04:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.03:1.000:. ./.:5:93,0:.:-0.46:0.993:. ./.:4:90,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,3:.:-1.39:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:85,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:118,3:.: 0.23:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:60,3:.:-1.19:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:169,2:.: 1.45:1.000:. ./.:4:197,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:173,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:88,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:31,18:.:-1.54:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:87,3:.:-0.53:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:128,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:128,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:60,2:.:-1.22:1.000:. ./.:4:123,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:136,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:69,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:69,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:74,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:90,4:.:-0.43:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:104,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:152,4:.: 1.08:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.96:1.000:. -chr5.1 70255652 chr5.1_070255652 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:309,98:.: 0.92:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:235,73:.:-0.84:1.000:. ./.:4:284,84:.: 0.23:1.000:. ./.:4:355,106:.: 1.89:1.000:. ./.:4:299,106:.: 0.89:1.000:. ./.:4:245,59:.:-0.91:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:258,85:.:-0.22:1.000:. ./.:4:185,60:.:-1.96:1.000:. ./.:4:197,73:.:-1.52:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:281,65:.:-0.16:1.000:. ./.:4:279,84:.: 0.14:1.000:. ./.:4:289,83:.: 0.30:1.000:. ./.:4:326,103:.: 1.32:1.000:. ./.:4:287,92:.: 0.43:0.944:. ./.:4:461,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:353,122:.: 2.14:1.000:. ./.:4:323,116:.: 1.49:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:271,100:.: 0.28:1.000:. ./.:4:338,90:.: 1.30:1.000:. ./.:4:234,70:.:-0.91:1.000:. ./.:4:167,65:.:-2.19:1.000:. ./.:4:304,81:.: 0.53:1.000:. ./.:4:262,57:.:-0.64:1.000:. ./.:4:245,80:.:-0.54:1.000:. ./.:4:329,112:.: 1.53:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:186,174:.: 0.09:1.000:. ./.:4:278,68:.:-0.16:1.000:. ./.:4:188,40:.:-2.27:1.000:. ./.:4:166,76:.:-2.02:1.000:. ./.:3:128,12:.:-3.83:1.000:. ./.:4:280,79:.: 0.07:1.000:. ./.:4:269,73:.:-0.23:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:255,95:.:-0.09:1.000:. ./.:4:278,95:.: 0.32:1.000:. ./.:4:293,92:.: 0.53:1.000:. ./.:4:188,178:.: 0.19:1.000:. ./.:4:292,99:.: 0.64:1.000:. ./.:4:261,86:.:-0.14:1.000:. ./.:4:299,83:.: 0.48:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:311,102:.: 1.03:1.000:. ./.:4:217,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:262,95:.: 0.03:1.000:. ./.:4:235,92:.:-0.50:1.000:. ./.:4:235,76:.:-0.79:1.000:. ./.:4:373,128:.: 2.60:1.000:. ./.:4:173,174:.:-0.14:1.000:. ./.:4:303,104:.: 0.92:1.000:. ./.:4:289,73:.: 0.12:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:249,74:.:-0.57:1.000:. ./.:4:292,103:.: 0.71:1.000:. ./.:4:249,82:.:-0.43:1.000:. ./.:6:230,96:.:-0.52:1.000:. ./.:4:266,88:.:-0.02:1.000:. ./.:4:246,80:.:-0.52:1.000:. ./.:4:218,102:.:-0.63:1.000:. ./.:4:174,193:.: 0.21:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:274,88:.: 0.12:1.000:. ./.:4:202,60:.:-1.66:1.000:. ./.:4:256,77:.:-0.39:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.12:0.996:. ./.:4:369,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:338,88:.: 1.26:1.000:. ./.:4:231,87:.:-0.66:0.999:. ./.:4:387,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:274,89:.: 0.14:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:257,82:.:-0.29:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:287,80:.: 0.21:1.000:. ./.:4:291,70:.: 0.10:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:353,88:.: 1.53:1.000:. ./.:4:166,168:.:-0.38:1.000:. ./.:4:257,84:.:-0.25:1.000:. ./.:4:305,96:.: 0.82:1.000:. ./.:4:208,84:.:-1.12:1.000:. ./.:4:189,183:.: 0.30:1.000:. ./.:4:160,155:.:-0.72:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:252,85:.:-0.32:1.000:. ./.:4:259,89:.:-0.13:1.000:. ./.:4:315,118:.: 1.39:1.000:. ./.:4:317,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:259,96:.: 0.00:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:305,103:.: 0.94:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:146,130:.:-1.41:1.000:. ./.:4:313,90:.: 0.85:1.000:. ./.:4:234,65:.:-1.00:1.000:. ./.:4:259,86:.:-0.18:1.000:. ./.:4:170,153:.:-0.57:0.999:. ./.:4:262,73:.:-0.36:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:360,100:.: 1.87:1.000:. ./.:4:293,108:.: 0.82:1.000:. ./.:4:260,96:.: 0.02:1.000:. ./.:4:474,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:197,190:.: 0.57:0.999:. ./.:4:338,93:.: 1.35:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:271,106:.: 0.39:1.000:. ./.:4:264,71:.:-0.36:1.000:. ./.:4:242,65:.:-0.86:1.000:. ./.:4:162,172:.:-0.38:1.000:. ./.:4:217,80:.:-1.04:1.000:. ./.:4:272,110:.: 0.48:1.000:. ./.:4:275,82:.: 0.03:1.000:. ./.:4:252,108:.: 0.09:1.000:. ./.:4:273,76:.:-0.11:1.000:. ./.:4:201,196:.: 0.75:1.000:. ./.:4:285,82:.: 0.21:1.000:. ./.:4:265,69:.:-0.38:1.000:. ./.:4:297,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:104,125:.:-2.25:1.000:. ./.:4:204,57:.:-1.68:1.000:. ./.:4:266,96:.: 0.12:1.000:. ./.:4:264,83:.:-0.14:1.000:. ./.:5:218,57:.:-1.43:0.993:. ./.:4:287,85:.: 0.30:1.000:. ./.:4:251,103:.:-0.02:1.000:. ./.:4:222,194:.: 1.08:1.000:. ./.:4:277,92:.: 0.25:1.000:. ./.:4:211,73:.:-1.27:1.000:. ./.:4:223,63:.:-1.23:1.000:. ./.:4:228,74:.:-0.95:1.000:. ./.:4:269,87:.: 0.02:1.000:. ./.:4:256,91:.:-0.14:1.000:. ./.:4:278,78:.: 0.02:1.000:. ./.:4:138,152:.:-1.16:1.000:. ./.:4:237,202:.: 1.49:1.000:. ./.:4:533,0:.: 3.17:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:304,99:.: 0.85:1.000:. ./.:4:466,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:264,80:.:-0.20:1.000:. ./.:4:324,89:.: 1.03:1.000:. ./.:4:289,101:.: 0.62:1.000:. ./.:4:268,6:.:-1.45:1.000:. ./.:4:221,79:.:-0.98:1.000:. ./.:4:292,81:.: 0.32:1.000:. ./.:4:325,106:.: 1.35:1.000:. ./.:4:344,91:.: 1.42:1.000:. ./.:4:325,98:.: 1.21:1.000:. ./.:4:242,71:.:-0.75:1.000:. ./.:4:227,195:.: 1.19:1.000:. ./.:4:265,90:.: 0.00:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:233,65:.:-1.02:1.000:. ./.:4:208,143:.:-0.07:1.000:. ./.:4:152,155:.:-0.86:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:221,75:.:-1.05:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:266,95:.: 0.10:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:187,170:.: 0.03:1.000:. ./.:4:227,80:.:-0.86:1.000:. ./.:4:166,145:.:-0.79:1.000:. ./.:4:239,60:.:-1.00:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:225,76:.:-0.96:1.000:. ./.:4:193,176:.: 0.25:1.000:. ./.:4:292,79:.: 0.28:1.000:. ./.:4:302,82:.: 0.51:1.000:. ./.:4:207,128:.:-0.36:1.000:. ./.:4:211,175:.: 0.55:1.000:. ./.:4:348,104:.: 1.73:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:227,83:.:-0.80:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.67:1.000:. -chr5.1 70480918 chr5.1_070480918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:57,129:0.75: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,42:0.54:-1.60:1.000:0.986 0/1/1/1:4:56,170:0.80: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,64:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,162:0.81: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,125:0.67: 1.16:1.000:0.913 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,85:0.73:-0.67:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,100:0.67: 0.22:1.000:0.899 0/1/1/1:4:15,25:0.68:-2.68:1.000:0.955 0/1/1/1:4:18,61:0.81:-1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,44:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,95:0.79:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,98:0.65: 0.27:1.000:0.750 0/1/1/1:4:60,126:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,76:0.62:-0.48:1.000:0.542 0/1/1/1:4:58,149:0.77: 1.23:0.944:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:69,192:0.78: 2.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,100:0.50: 1.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,78:0.85:-1.39:1.000:0.982 0/0/1/1:4:84,49:0.45:-0.50:1.000:0.979 0/0/1/1:4:124,103:0.51: 1.69:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,46:0.87:-2.33:1.000:0.937 0/1/1/1:4:82,168:0.73: 2.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,54:0.42: 0.34:1.000:0.901 0/1/1/1:4:48,134:0.78: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,129:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,83:0.59: 0.03:1.000:0.883 0/1/1/1:4:65,136:0.73: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,71:0.47: 0.55:1.000:0.992 1/1/1/1:4:4,32:0.91:-2.77:1.000:0.940 0/0/1/1:4:34,42:0.61:-1.84:1.000:0.720 1/1/1:3:0,24:1.00:-3.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,62:0.43: 0.67:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,87:0.49: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,131:0.73: 0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,73:0.60:-0.48:1.000:0.796 0/0/1/1:4:105,95:0.53: 1.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:111,128:0.59: 1.97:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,71:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,89:0.64:-0.04:1.000:0.650 0/1/1/1:4:62,164:0.78: 1.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-3.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,80:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,116:0.75: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,98:0.70:-0.08:1.000:0.989 0/1/1/1:4:75,102:0.63: 0.53:1.000:0.581 0/1/1/1:4:51,77:0.66:-0.62:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,150:0.74: 1.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,46:0.44:-0.55:1.000:0.963 0/0/1/1:4:111,101:0.53: 1.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:122,51:0.40: 0.43:1.000:0.797 0/0/1/1/1/1:6:61,69:0.59:-0.57:1.000:0.523 0/1/1/1:4:42,105:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,41:0.40:-0.34:1.000:0.786 0/1/1/1:4:53,95:0.70:-0.15:1.000:0.983 0/0/1/1:4:104,69:0.47: 0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,117:0.74: 0.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,148:0.81: 0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,69:0.72:-1.18:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.36:0.996:1.000 0/0/0/1:4:87,6:0.25:-1.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,100:0.53: 1.34:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,94:0.78:-0.60:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,86:0.49: 1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,91:0.71:-0.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:56,151:0.78: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,111:0.75: 0.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,183:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,86:0.51: 0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,119:0.76: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,61:0.73:-1.49:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,106:0.70: 0.22:1.000:0.987 0/1/1/1:4:42,109:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,97:0.71:-0.15:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,36:0.43:-1.13:1.000:0.947 0/1/1/1:4:39,68:0.69:-1.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:69,61:0.52:-0.57:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:47,120:0.77: 0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,99:0.78:-0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,108:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,138:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,108:0.79:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,99:0.71:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,136:0.82: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,79:0.61:-0.29:1.000:0.678 0/0/1/1:4:92,104:0.59: 0.97:1.000:0.891 0/1/1/1:4:37,63:0.69:-1.27:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,91:0.71:-0.36:0.999:0.992 0/1/1/1:4:48,85:0.69:-0.50:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,119:0.71: 0.64:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,51:0.46:-0.55:1.000:0.989 0/1/1/1:4:77,169:0.74: 2.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,96:0.60: 0.48:0.999:0.761 0/1/1/1:4:55,143:0.77: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,42:0.65:-1.95:1.000:0.762 0/0/1/1:4:108,61:0.44: 0.34:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,177:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,92:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,77:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,75:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,109:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,123:0.76: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,74:0.48: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,91:0.78:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,74:0.62:-0.55:1.000:0.572 0/0/1/1:4:89,34:0.39:-0.74:1.000:0.677 0/1/1/1:4:35,85:0.76:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,109:0.82:-0.36:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,44:0.41:-0.25:1.000:0.850 0/1/1/1/1:5:30,114:0.83:-0.25:0.993:0.999 0/1/1/1:4:46,88:0.71:-0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:85,75:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,66:0.44: 0.76:1.000:0.965 0/1/1/1:4:47,81:0.69:-0.62:1.000:0.971 0/0/1/1:4:69,29:0.40:-1.32:1.000:0.803 0/1/1/1:4:35,71:0.73:-1.13:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,99:0.79:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,69:0.46: 0.57:1.000:0.988 0/1/1/1:4:29,91:0.80:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,66:0.47: 0.24:1.000:0.992 0/1/1/1:4:52,147:0.79: 1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,79:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,133:0.76: 0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,142:0.73: 1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,84:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,65:0.84:-1.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,82:0.72:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,102:0.69: 0.17:1.000:0.965 0/0/1/1:4:110,89:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,94:0.49: 1.41:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,211:1.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,87:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,111:0.56: 1.51:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,107:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,37:0.38:-0.29:1.000:0.547 0/0/1/1:4:125,92:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,75:0.50: 0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,67:0.66:-1.02:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,95:0.55: 0.88:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,77:0.68:-0.71:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,145:0.81: 0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,152:1.00:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,68:0.52:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,135:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,123:0.74: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,75:0.45: 1.18:1.000:0.977 0/0/1/1:4:78,96:0.61: 0.46:1.000:0.729 0/1/1/1:4:73,127:0.69: 1.06:1.000:0.975 0/1/1/1:4:69,117:0.68: 0.74:1.000:0.964 0/1/1/1:4:49,162:0.81: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,72:0.69:-0.95:1.000:0.969 0/0/1/1:4:56,58:0.56:-0.95:1.000:0.962 -chr5.1 70548813 chr5.1_070548813 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:268,62:.: 1.78:1.000:. ./.:4:77,39:.:-1.72:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:175,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:254,71:.: 1.70:1.000:. ./.:4:144,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,57:.:-1.94:1.000:. ./.:4:128,55:.:-0.62:1.000:. ./.:4:144,48:.:-0.47:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:67,19:.:-2.21:1.000:. ./.:4:73,57:.:-1.49:1.000:. ./.:4:68,104:.:-0.80:1.000:. ./.:4:155,52:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,94:.:-0.20:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:205,44:.: 0.46:0.944:. ./.:4:220,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:269,66:.: 1.86:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:43,39:.:-2.27:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:145,111:.: 0.57:1.000:. ./.:4:204,53:.: 0.59:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:146,94:.: 0.31:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:170,62:.: 0.18:1.000:. ./.:4:158,49:.:-0.23:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.88:1.000:. ./.:4:207,48:.: 0.56:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.47:1.000:. ./.:3:25,5:.:-3.12:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:198,128:.: 1.72:1.000:. ./.:4:151,97:.: 0.44:1.000:. ./.:4:225,48:.: 0.85:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:388,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:167,71:.: 0.28:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:43,7:.:-2.79:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:90,44:.:-1.42:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:151,56:.:-0.23:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:149,104:.: 0.52:1.000:. ./.:4:129,82:.:-0.16:1.000:. ./.:4:145,44:.:-0.52:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:172,66:.: 0.28:1.000:. ./.:6:174,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:160,70:.: 0.15:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:157,122:.: 0.95:1.000:. ./.:4:206,56:.: 0.67:1.000:. ./.:4:114,31:.:-1.24:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,91:.:-0.05:0.996:. ./.:4:142,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:169,103:.: 0.83:1.000:. ./.:4:60,55:.:-1.73:0.999:. ./.:4:153,45:.:-0.38:1.000:. ./.:4:241,52:.: 1.18:1.000:. ./.:4:143,45:.:-0.54:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:137,118:.: 0.56:1.000:. ./.:4:154,117:.: 0.82:1.000:. ./.:4:257,51:.: 1.42:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,47:.:-0.96:1.000:. ./.:4:61,94:.:-1.08:1.000:. ./.:4:150,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,57:.: 0.44:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:170,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,29:.:-1.58:1.000:. ./.:4:129,53:.:-0.64:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:116,55:.:-0.82:1.000:. ./.:4:126,36:.:-0.96:1.000:. ./.:4:142,105:.: 0.43:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,84:.:-1.31:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:226,46:.: 0.83:1.000:. ./.:4:175,68:.: 0.36:1.000:. ./.:4:85,119:.:-0.28:1.000:. ./.:4:152,61:.:-0.13:1.000:. ./.:4:153,123:.: 0.90:1.000:. ./.:4:161,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:159,56:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,126:.:-0.23:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.05:0.999:. ./.:4:208,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,66:.:-0.78:1.000:. ./.:4:76,117:.:-0.46:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:164,53:.:-0.07:1.000:. ./.:4:161,58:.:-0.03:1.000:. ./.:4:269,71:.: 1.94:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.76:0.999:. ./.:4:219,50:.: 0.78:1.000:. ./.:4:93,23:.:-1.72:1.000:. ./.:4:169,65:.: 0.21:1.000:. ./.:4:123,112:.: 0.23:1.000:. ./.:4:133,86:.:-0.03:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:133,123:.: 0.57:1.000:. ./.:4:133,53:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,59:.:-0.15:1.000:. ./.:4:226,55:.: 0.98:1.000:. ./.:4:69,96:.:-0.91:1.000:. ./.:4:71,125:.:-0.41:1.000:. ./.:4:126,43:.:-0.85:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:180,47:.: 0.10:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:214,34:.: 0.44:0.993:. ./.:4:223,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:196,42:.: 0.28:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:65,85:.:-1.16:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,57:.:-0.41:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:78,116:.:-0.44:1.000:. ./.:4:209,58:.: 0.75:1.000:. ./.:4:190,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:159,147:.: 1.39:1.000:. ./.:4:165,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:129,89:.:-0.05:1.000:. ./.:4:63,103:.:-0.90:1.000:. ./.:4:193,124:.: 1.57:1.000:. ./.:4:170,118:.: 1.09:1.000:. ./.:4:73,47:.:-1.65:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:141,45:.:-0.57:1.000:. ./.:4:210,42:.: 0.51:1.000:. ./.:4:257,67:.: 1.68:1.000:. ./.:4:165,138:.: 1.34:1.000:. ./.:4:124,106:.: 0.15:1.000:. ./.:4:188,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:109,57:.:-0.90:1.000:. ./.:4:180,41:.: 0.00:1.000:. ./.:4:142,38:.:-0.67:1.000:. ./.:4:205,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:177,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:79,106:.:-0.59:1.000:. ./.:4:124,44:.:-0.87:1.000:. ./.:4:90,62:.:-1.13:1.000:. ./.:4:259,56:.: 1.54:1.000:. ./.:4:134,111:.: 0.39:1.000:. ./.:4:147,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:251,51:.: 1.32:1.000:. ./.:4:217,55:.: 0.83:1.000:. ./.:4:58,81:.:-1.34:1.000:. ./.:4:202,48:.: 0.47:1.000:. ./.:4:160,39:.:-0.36:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:150,102:.: 0.51:1.000:. ./.:4:264,10:.: 0.87:1.000:. ./.:4:152,73:.: 0.07:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:175,143:.: 1.59:1.000:. ./.:4:59,70:.:-1.50:1.000:. ./.:4:146,67:.:-0.13:1.000:. -chr5.1 70596113 chr5.1_070596113 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:319,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,98:.:-1.03:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:243,87:.: 0.67:1.000:. ./.:4:195,138:.: 0.73:1.000:. ./.:4:129,102:.:-0.98:1.000:. ./.:4:155,119:.:-0.26:1.000:. ./.:4:155,132:.:-0.04:1.000:. ./.:4:114,37:.:-2.31:1.000:. ./.:4:150,34:.:-1.76:1.000:. ./.:4:149,115:.:-0.43:1.000:. ./.:4:140,124:.:-0.43:1.000:. ./.:4:176,137:.: 0.39:1.000:. ./.:4:206,54:.:-0.49:1.000:. ./.:4:258,70:.: 0.64:1.000:. ./.:4:260,66:.: 0.61:0.944:. ./.:4:256,58:.: 0.41:1.000:. ./.:4:271,94:.: 1.26:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:111,13:.:-2.76:1.000:. ./.:4:235,56:.: 0.02:1.000:. ./.:4:259,62:.: 0.52:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:271,65:.: 0.78:1.000:. ./.:4:263,62:.: 0.59:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:169,152:.: 0.52:1.000:. ./.:4:197,152:.: 0.99:1.000:. ./.:4:288,83:.: 1.36:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:46,20:.:-3.73:1.000:. ./.:4:149,40:.:-1.68:1.000:. ./.:3:30,6:.:-4.23:1.000:. ./.:4:234,52:.:-0.06:1.000:. ./.:4:211,48:.:-0.51:1.000:. ./.:4:244,61:.: 0.26:1.000:. ./.:4:266,56:.: 0.54:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:230,66:.: 0.11:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:223,74:.: 0.12:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:165,147:.: 0.37:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:106,35:.:-2.48:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:195,57:.:-0.63:1.000:. ./.:4:216,62:.:-0.19:1.000:. ./.:4:262,72:.: 0.74:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:246,56:.: 0.21:1.000:. ./.:4:227,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:178,46:.:-1.09:1.000:. ./.:4:142,116:.:-0.53:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:154,135:.:-0.01:1.000:. ./.:6:241,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:247,76:.: 0.56:1.000:. ./.:4:202,55:.:-0.54:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:275,70:.: 0.93:1.000:. ./.:4:253,68:.: 0.52:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:125,105:.:-0.99:1.000:. ./.:4:202,59:.:-0.48:1.000:. ./.:4:269,68:.: 0.79:0.996:. ./.:4:131,105:.:-0.89:1.000:. ./.:4:280,77:.: 1.13:1.000:. ./.:4:155,40:.:-1.58:0.999:. ./.:4:268,68:.: 0.78:1.000:. ./.:4:238,71:.: 0.32:1.000:. ./.:4:224,53:.:-0.21:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:223,53:.:-0.23:1.000:. ./.:4:259,58:.: 0.46:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:255,72:.: 0.62:1.000:. ./.:4:222,66:.:-0.03:1.000:. ./.:4:229,151:.: 1.51:1.000:. ./.:4:318,77:.: 1.76:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:219,66:.:-0.08:1.000:. ./.:4:256,72:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,105:.:-1.09:1.000:. ./.:4:204,41:.:-0.74:1.000:. ./.:4:205,50:.:-0.58:1.000:. ./.:4:210,65:.:-0.24:1.000:. ./.:4:259,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:208,55:.:-0.44:1.000:. ./.:4:310,86:.: 1.78:1.000:. ./.:4:91,64:.:-2.25:1.000:. ./.:4:284,71:.: 1.09:1.000:. ./.:4:278,87:.: 1.26:1.000:. ./.:4:206,55:.:-0.48:1.000:. ./.:4:246,57:.: 0.22:1.000:. ./.:4:164,149:.: 0.39:1.000:. ./.:4:235,61:.: 0.11:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:195,66:.:-0.48:1.000:. ./.:4:188,125:.: 0.39:1.000:. ./.:4:222,61:.:-0.11:0.999:. ./.:4:188,54:.:-0.79:1.000:. ./.:4:217,67:.:-0.09:1.000:. ./.:4:171,110:.:-0.14:1.000:. ./.:4:282,82:.: 1.24:1.000:. ./.:4:237,64:.: 0.19:1.000:. ./.:4:136,125:.:-0.48:1.000:. ./.:4:283,74:.: 1.13:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:285,140:.: 2.26:1.000:. ./.:4:107,86:.:-1.61:1.000:. ./.:4:175,150:.: 0.59:1.000:. ./.:4:182,62:.:-0.76:1.000:. ./.:4:198,59:.:-0.54:1.000:. ./.:4:249,65:.: 0.41:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:215,51:.:-0.39:1.000:. ./.:4:171,113:.:-0.09:1.000:. ./.:4:174,134:.: 0.31:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:165,149:.: 0.41:1.000:. ./.:4:162,115:.:-0.21:1.000:. ./.:4:255,65:.: 0.51:1.000:. ./.:4:192,71:.:-0.44:1.000:. ./.:4:207,61:.:-0.36:1.000:. ./.:4:251,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:248,76:.: 0.57:1.000:. ./.:5:253,60:.: 0.39:0.993:. ./.:4:230,57:.:-0.04:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:275,92:.: 1.29:1.000:. ./.:4:131,123:.:-0.59:1.000:. ./.:4:216,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:163,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:241,51:.: 0.04:1.000:. ./.:4:217,62:.:-0.18:1.000:. ./.:4:158,139:.: 0.12:1.000:. ./.:4:189,53:.:-0.79:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:301,81:.: 1.54:1.000:. ./.:4:252,59:.: 0.36:1.000:. ./.:4:165,132:.: 0.12:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:259,66:.: 0.59:1.000:. ./.:4:157,118:.:-0.24:1.000:. ./.:4:285,73:.: 1.14:1.000:. ./.:4:243,60:.: 0.22:1.000:. ./.:4:119,27:.:-2.40:1.000:. ./.:4:142,44:.:-1.73:1.000:. ./.:4:143,139:.:-0.13:1.000:. ./.:4:248,67:.: 0.42:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:276,80:.: 1.11:1.000:. ./.:4:181,51:.:-0.96:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:200,54:.:-0.59:1.000:. ./.:4:174,47:.:-1.14:1.000:. ./.:4:144,98:.:-0.79:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:189,50:.:-0.84:1.000:. ./.:4:143,118:.:-0.48:1.000:. ./.:4:214,56:.:-0.33:1.000:. ./.:4:161,120:.:-0.14:1.000:. ./.:4:245,68:.: 0.39:1.000:. ./.:4:229,62:.: 0.02:1.000:. ./.:4:187,52:.:-0.84:1.000:. ./.:4:170,51:.:-1.14:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:139,131:.:-0.33:1.000:. ./.:4:215,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:274,87:.: 1.19:1.000:. ./.:4:248,77:.: 0.59:1.000:. ./.:4:224,58:.:-0.13:1.000:. ./.:4:239,20:.:-0.51:1.000:. ./.:4:269,87:.: 1.11:1.000:. ./.:4:312,86:.: 1.81:1.000:. ./.:4:307,58:.: 1.26:1.000:. ./.:4:118,122:.:-0.83:1.000:. ./.:4:221,58:.:-0.18:1.000:. -chr5.1 70800283 chr5.1_070800283 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:364,8:.: 1.47:1.000:. ./.:4:137,109:.:-0.23:1.000:. ./.:4:297,12:.: 0.62:1.000:. ./.:4:323,9:.: 0.93:1.000:. ./.:4:261,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:211,80:.: 0.38:1.000:. ./.:4:144,54:.:-0.87:1.000:. ./.:4:240,69:.: 0.62:1.000:. ./.:4:139,76:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,20:.:-2.69:1.000:. ./.:4:67,2:.:-2.61:1.000:. ./.:4:171,136:.: 0.59:1.000:. ./.:4:229,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:151,78:.:-0.46:1.000:. ./.:4:244,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:248,101:.: 1.16:1.000:. ./.:4:265,12:.: 0.19:0.944:. ./.:4:147,83:.:-0.44:1.000:. ./.:4:276,14:.: 0.36:1.000:. ./.:4:351,15:.: 1.39:1.000:. ./.:4:81,1:.:-2.43:1.000:. ./.:4:230,64:.: 0.42:1.000:. ./.:4:278,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:289,5:.: 0.42:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:323,7:.: 0.90:1.000:. ./.:4:220,68:.: 0.34:1.000:. ./.:4:271,6:.: 0.19:1.000:. ./.:4:177,72:.:-0.19:1.000:. ./.:4:286,73:.: 1.29:1.000:. ./.:4:288,83:.: 1.45:1.000:. ./.:4:380,6:.: 1.66:1.000:. ./.:4:41,8:.:-2.88:1.000:. ./.:4:61,21:.:-2.43:1.000:. ./.:3:36,10:.:-2.92:1.000:. ./.:4:225,75:.: 0.50:1.000:. ./.:4:212,81:.: 0.40:1.000:. ./.:4:393,6:.: 1.83:1.000:. ./.:4:319,8:.: 0.86:1.000:. ./.:4:421,5:.: 2.19:1.000:. ./.:4:204,56:.:-0.04:1.000:. ./.:4:195,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:260,14:.: 0.15:1.000:. ./.:4:191,55:.:-0.23:1.000:. ./.:4:239,5:.:-0.25:1.000:. ./.:4:205,56:.:-0.03:1.000:. ./.:4:323,13:.: 0.98:1.000:. ./.:4:186,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:258,6:.: 0.01:1.000:. ./.:4:242,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:181,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:313,83:.: 1.79:1.000:. ./.:4:180,8:.:-1.01:1.000:. ./.:4:297,76:.: 1.48:1.000:. ./.:4:253,11:.: 0.01:1.000:. ./.:4:382,4:.: 1.66:1.000:. ./.:4:134,74:.:-0.74:1.000:. ./.:4:257,15:.: 0.12:1.000:. ./.:4:150,95:.:-0.24:1.000:. ./.:6:200,42:.:-0.28:1.000:. ./.:4:252,60:.: 0.66:1.000:. ./.:4:195,56:.:-0.16:1.000:. ./.:4:216,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:144,66:.:-0.71:1.000:. ./.:4:351,7:.: 1.28:1.000:. ./.:4:301,6:.: 0.59:1.000:. ./.:4:101,49:.:-1.52:1.000:. ./.:4:204,65:.: 0.08:1.000:. ./.:4:342,2:.: 1.09:0.996:. ./.:4:92,102:.:-0.93:1.000:. ./.:4:250,8:.:-0.07:1.000:. ./.:4:140,6:.:-1.57:0.999:. ./.:4:228,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:182,8:.:-0.98:1.000:. ./.:4:176,65:.:-0.29:1.000:. ./.:4:261,10:.: 0.11:1.000:. ./.:4:271,10:.: 0.24:1.000:. ./.:4:280,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:316,5:.: 0.78:1.000:. ./.:4:244,70:.: 0.69:1.000:. ./.:4:161,54:.:-0.64:1.000:. ./.:4:268,66:.: 0.96:1.000:. ./.:4:311,72:.: 1.62:1.000:. ./.:4:221,10:.:-0.43:1.000:. ./.:4:216,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:308,64:.: 1.47:1.000:. ./.:4:111,37:.:-1.55:1.000:. ./.:4:140,54:.:-0.93:1.000:. ./.:4:132,66:.:-0.87:1.000:. ./.:4:308,47:.: 1.24:1.000:. ./.:4:230,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:226,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:258,90:.: 1.14:1.000:. ./.:4:198,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:232,82:.: 0.69:1.000:. ./.:4:267,6:.: 0.14:1.000:. ./.:4:174,12:.:-1.03:1.000:. ./.:4:203,59:.:-0.01:1.000:. ./.:4:153,60:.:-0.67:1.000:. ./.:4:328,9:.: 1.00:1.000:. ./.:4:145,4:.:-1.53:1.000:. ./.:4:238,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:180,54:.:-0.39:1.000:. ./.:4:165,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:117,43:.:-1.38:0.999:. ./.:4:222,65:.: 0.32:1.000:. ./.:4:257,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:274,89:.: 1.35:1.000:. ./.:4:218,67:.: 0.30:1.000:. ./.:4:296,57:.: 1.21:1.000:. ./.:4:122,57:.:-1.13:1.000:. ./.:4:363,5:.: 1.41:1.000:. ./.:4:180,15:.:-0.91:0.999:. ./.:4:198,89:.: 0.32:1.000:. ./.:4:158,51:.:-0.73:1.000:. ./.:4:160,82:.:-0.28:1.000:. ./.:4:177,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:196,4:.:-0.85:1.000:. ./.:4:131,75:.:-0.77:1.000:. ./.:4:217,10:.:-0.48:1.000:. ./.:4:239,16:.:-0.11:1.000:. ./.:4:196,12:.:-0.74:1.000:. ./.:4:178,85:.: 0.00:1.000:. ./.:4:173,71:.:-0.25:1.000:. ./.:4:229,7:.:-0.36:1.000:. ./.:4:189,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:171,61:.:-0.42:1.000:. ./.:4:173,52:.:-0.51:1.000:. ./.:4:105,44:.:-1.53:1.000:. ./.:4:145,9:.:-1.47:1.000:. ./.:4:199,64:.: 0.00:1.000:. ./.:4:232,93:.: 0.84:1.000:. ./.:5:192,6:.:-0.87:0.993:. ./.:4:197,52:.:-0.19:1.000:. ./.:4:300,5:.: 0.57:1.000:. ./.:4:199,98:.: 0.46:1.000:. ./.:4:203,78:.: 0.24:1.000:. ./.:4:171,63:.:-0.39:1.000:. ./.:4:108,42:.:-1.52:1.000:. ./.:4:145,52:.:-0.89:1.000:. ./.:4:213,71:.: 0.28:1.000:. ./.:4:157,57:.:-0.66:1.000:. ./.:4:193,9:.:-0.82:1.000:. ./.:4:194,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:179,77:.:-0.09:1.000:. ./.:4:344,6:.: 1.17:1.000:. ./.:4:216,77:.: 0.40:1.000:. ./.:4:252,10:.:-0.01:1.000:. ./.:4:358,5:.: 1.35:1.000:. ./.:4:189,73:.:-0.01:1.000:. ./.:4:365,13:.: 1.55:1.000:. ./.:4:282,12:.: 0.42:1.000:. ./.:4:79,1:.:-2.46:1.000:. ./.:4:166,40:.:-0.77:1.000:. ./.:4:167,87:.:-0.12:1.000:. ./.:4:217,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:371,5:.: 1.52:1.000:. ./.:4:312,6:.: 0.74:1.000:. ./.:4:229,10:.:-0.32:1.000:. ./.:4:288,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:272,67:.: 1.02:1.000:. ./.:4:236,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:170,75:.:-0.24:1.000:. ./.:4:276,5:.: 0.24:1.000:. ./.:4:253,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:299,70:.: 1.43:1.000:. ./.:4:269,53:.: 0.80:1.000:. ./.:4:182,133:.: 0.70:1.000:. ./.:4:163,8:.:-1.24:1.000:. ./.:4:324,7:.: 0.92:1.000:. ./.:4:182,75:.:-0.08:1.000:. ./.:4:194,71:.: 0.03:1.000:. ./.:4:257,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:314,9:.: 0.81:1.000:. ./.:4:229,69:.: 0.47:1.000:. ./.:4:198,17:.:-0.64:1.000:. ./.:4:304,83:.: 1.67:1.000:. ./.:4:261,76:.: 1.00:1.000:. ./.:4:303,12:.: 0.70:1.000:. ./.:4:172,29:.:-0.83:1.000:. ./.:4:234,84:.: 0.74:1.000:. ./.:4:295,82:.: 1.54:1.000:. ./.:4:373,4:.: 1.54:1.000:. ./.:4:176,67:.:-0.27:1.000:. ./.:4:226,83:.: 0.62:1.000:. -chr5.1 71164915 chr5.1_071164915 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:15,106:0.84: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,40:0.78:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,40:0.66:-1.16:1.000:0.870 0/0/1/1:4:61,107:0.61: 1.45:1.000:0.732 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.53:-1.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:59,54:0.47: 0.16:1.000:0.993 0/0/0/0:4:54,1:0.02:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.60:-2.06:1.000:0.775 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,63:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,43:0.35: 0.63:1.000:0.830 0/0/0/0:4:62,1:0.02:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,54:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,39:0.42:-0.27:1.000:0.905 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.09:0.944:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,69:0.44: 1.17:1.000:0.973 0/1/1/1:4:17,42:0.67:-1.12:1.000:0.915 0/0/1/1:4:46,41:0.47:-0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:113,54:0.35: 1.43:1.000:0.830 0/1/1/1:4:13,69:0.79:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-2.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:47,37:0.44:-0.53:1.000:0.971 0/0/1/1:4:59,40:0.41:-0.17:1.000:0.878 0/0/1/1:4:29,52:0.61:-0.60:1.000:0.687 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:71,48:0.41: 0.30:1.000:0.875 0/0/1/1:4:39,33:0.46:-0.81:1.000:0.986 0/0/1/1:4:45,69:0.58: 0.18:1.000:0.915 0/1/1/1:4:5,21:0.75:-1.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,17:0.80:-2.03:1.000:1.000 1/1/1:3:0,14:1.00:-2.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,46:0.73:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,37:0.43:-0.43:1.000:0.936 0/0/1/1:4:67,100:0.57: 1.43:1.000:0.934 0/0/0/1:4:91,47:0.36: 0.75:1.000:0.691 0/0/1/1:4:72,109:0.58: 1.76:1.000:0.924 0/0/1/1:4:48,37:0.44:-0.50:1.000:0.965 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,48:0.39: 0.46:1.000:0.727 0/1/1/1:4:12,41:0.72:-1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,60:0.40: 1.10:1.000:0.813 0/0/1/1:4:58,57:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,52:0.63:-0.67:1.000:0.576 0/0/1/1:4:74,93:0.54: 1.43:1.000:0.988 0/0/0/1:4:76,42:0.37: 0.27:1.000:0.529 0/0/0/1:4:76,38:0.35: 0.18:1.000:0.756 0/1/1/1:4:14,38:0.68:-1.28:1.000:0.964 0/1/1/1:4:54,117:0.65: 1.52:1.000:0.750 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,123:0.65: 1.66:1.000:0.830 0/0/1/1:4:69,58:0.46: 0.49:1.000:0.985 0/0/1/1:4:72,89:0.54: 1.29:1.000:0.990 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,50:0.39: 0.63:1.000:0.682 0/0/0/0:4:94,3:0.04:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:47,67:0.57: 0.18:1.000:0.640 0/1/1/1:4:46,115:0.67: 1.29:1.000:0.923 0/0/1/1:4:41,49:0.53:-0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,70:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,129:0.56: 2.68:1.000:0.960 1/1/1/1:4:9,108:0.90: 0.25:1.000:0.779 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,50:0.44: 0.16:1.000:0.974 0/0/1/1:4:72,92:0.54: 1.36:0.996:0.986 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,50:0.29: 2.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:58,36:0.40:-0.29:0.999:0.745 0/0/1/1:4:30,52:0.60:-0.57:1.000:0.755 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,39:0.54:-0.86:1.000:0.988 0/1/1/1:4:13,39:0.70:-1.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:54,86:0.59: 0.79:1.000:0.879 0/0/1/1:4:67,92:0.56: 1.24:1.000:0.971 0/0/1/1:4:71,112:0.59: 1.81:1.000:0.889 0/1/1/1:4:21,57:0.68:-0.67:1.000:0.964 0/0/1/1:4:31,51:0.59:-0.57:1.000:0.840 0/1/1/1:4:45,111:0.67: 1.17:1.000:0.914 0/0/1/1:4:58,102:0.61: 1.26:1.000:0.727 0/0/1/1:4:60,37:0.39:-0.22:1.000:0.732 0/0/1/1:4:49,48:0.49:-0.22:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,111:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,1:0.01:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,35:0.49:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,114:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,94:0.82: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,42:0.44:-0.27:1.000:0.973 0/0/1/1:4:75,54:0.42: 0.53:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,62:0.71:-0.57:1.000:0.989 0/0/0/1:4:89,46:0.36: 0.67:1.000:0.689 0/0/1/1:4:63,43:0.41:-0.01:1.000:0.886 0/1/1/1:4:13,76:0.81:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,124:0.58: 2.30:1.000:0.906 0/0/1/1:4:55,40:0.43:-0.27:1.000:0.937 0/0/1/1:4:72,51:0.42: 0.39:1.000:0.919 0/0/1/1:4:32,53:0.60:-0.50:1.000:0.830 0/0/1/1:4:45,46:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.26:0.999:1.000 0/0/1/1:4:68,53:0.44: 0.34:1.000:0.968 0/0/1/1:4:50,83:0.60: 0.63:1.000:0.827 0/0/1/1:4:57,109:0.62: 1.40:1.000:0.535 0/0/1/1:4:75,84:0.52: 1.24:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,58:0.42: 0.79:1.000:0.918 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.90:0.999:1.000 0/0/0/0:4:139,1:0.01: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,34:0.44:-0.67:1.000:0.965 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,39:0.42:-0.29:1.000:0.920 0/0/1/1:4:42,33:0.44:-0.74:1.000:0.971 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,41:0.40:-0.01:1.000:0.775 0/0/1/1:4:77,55:0.42: 0.60:1.000:0.925 0/0/1/1:4:46,51:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:82,2:0.03:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,55:0.47: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,41:0.35: 0.49:1.000:0.834 0/0/1/1:4:105,66:0.40: 1.52:1.000:0.768 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,48:0.69:-0.97:1.000:0.975 0/0/1/1:4:68,52:0.44: 0.32:1.000:0.962 0/0/0/1/1:5:62,30:0.35:-0.34:0.993:0.893 0/0/1/1:4:35,32:0.47:-0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,73:0.57: 0.42:1.000:0.956 0/0/0/0:4:75,1:0.02:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,44:0.33: 0.86:1.000:0.910 0/0/0/1:4:70,36:0.36:-0.01:1.000:0.700 0/0/0/0:4:59,1:0.02:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,51:0.75:-1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,59:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,51:0.54:-0.34:1.000:0.989 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,36:0.46:-0.64:1.000:0.984 0/0/0/0:4:86,1:0.01:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,114:0.56: 2.16:1.000:0.974 0/0/1/1:4:58,74:0.54: 0.60:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,40:0.38: 0.09:1.000:0.556 0/0/1/1:4:65,112:0.60: 1.66:1.000:0.766 0/0/1/1:4:65,67:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,66:0.34: 2.44:1.000:0.881 0/0/0/1:4:91,46:0.36: 0.72:1.000:0.735 0/1/1/1:4:13,29:0.65:-1.52:1.000:0.800 0/1/1/1:4:12,42:0.72:-1.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:117,1:0.01: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,137:0.60: 2.58:1.000:0.754 0/0/1/1:4:64,59:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:103,54:0.36: 1.19:1.000:0.658 0/0/1/1:4:63,54:0.46: 0.25:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,128:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,29:0.36:-0.48:1.000:0.722 0/0/0/0:4:97,1:0.01:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,72:0.54: 0.56:1.000:0.989 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,103:0.67: 0.91:1.000:0.909 0/0/1/1:4:56,92:0.59: 0.98:1.000:0.842 0/1/1/1:4:20,60:0.70:-0.62:1.000:0.985 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,98:0.57: 1.40:1.000:0.953 0/0/1/1:4:49,43:0.47:-0.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:8,19:0.66:-1.87:1.000:0.880 0/0/0/1:4:76,31:0.32: 0.01:1.000:0.959 0/1/1/1:4:14,79:0.80:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,99:0.66: 0.82:1.000:0.872 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,36:0.41:-0.36:1.000:0.834 0/0/1/1:4:69,60:0.46: 0.53:1.000:0.989 0/0/0/1:4:88,38:0.33: 0.46:1.000:0.931 0/0/0/1:4:38,10:0.25:-1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,58:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,53:0.40: 0.67:1.000:0.815 0/0/1/1:4:73,106:0.57: 1.71:1.000:0.949 0/0/1/1:4:88,50:0.38: 0.75:1.000:0.541 0/0/1/1:4:33,50:0.58:-0.55:1.000:0.924 -chr5.1 71376056 chr5.1_071376056 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:79,277:.: 1.11:1.000:. ./.:4:146,161:.: 0.39:1.000:. ./.:4:55,232:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,268:.: 1.01:1.000:. ./.:4:171,207:.: 1.44:1.000:. ./.:4:298,106:.: 1.82:1.000:. ./.:4:192,76:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,173:.: 0.86:1.000:. ./.:4:226,82:.: 0.41:1.000:. ./.:4:39,38:.:-2.99:1.000:. ./.:4:52,105:.:-1.81:1.000:. ./.:4:136,160:.: 0.23:1.000:. ./.:4:199,85:.: 0.05:1.000:. ./.:4:243,104:.: 0.98:1.000:. ./.:4:152,200:.: 1.06:1.000:. ./.:4:152,178:.: 0.73:1.000:. ./.:4:153,199:.: 1.06:0.944:. ./.:4:178,200:.: 1.44:1.000:. ./.:4:193,216:.: 1.89:1.000:. ./.:4:63,279:.: 0.91:1.000:. ./.:4:17,104:.:-2.34:1.000:. ./.:4:105,153:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,156:.: 0.44:1.000:. ./.:4:80,254:.: 0.79:1.000:. ./.:4:25,106:.:-2.20:1.000:. ./.:4:176,249:.: 2.13:1.000:. ./.:4:166,192:.: 1.14:1.000:. ./.:4:86,268:.: 1.08:1.000:. ./.:4:255,85:.: 0.88:1.000:. ./.:4:187,198:.: 1.54:1.000:. ./.:4:257,110:.: 1.28:1.000:. ./.:4:81,237:.: 0.56:1.000:. ./.:4:49,86:.:-2.14:1.000:. ./.:4:47,58:.:-2.58:1.000:. ./.:3:19,70:.:-2.81:1.000:. ./.:4:157,174:.: 0.75:1.000:. ./.:4:163,187:.: 1.03:1.000:. ./.:4:63,287:.: 1.03:1.000:. ./.:4:140,184:.: 0.64:1.000:. ./.:4:70,288:.: 1.14:1.000:. ./.:4:103,149:.:-0.42:1.000:. ./.:4:140,167:.: 0.39:1.000:. ./.:4:67,252:.: 0.57:1.000:. ./.:4:113,159:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,249:.: 0.70:1.000:. ./.:4:134,141:.:-0.08:1.000:. ./.:4:84,241:.: 0.66:1.000:. ./.:4:55,237:.: 0.17:1.000:. ./.:4:67,224:.: 0.16:1.000:. ./.:4:112,161:.:-0.11:1.000:. ./.:4:100,129:.:-0.75:1.000:. ./.:4:175,201:.: 1.41:1.000:. ./.:4:97,140:.:-0.64:1.000:. ./.:4:126,165:.: 0.16:1.000:. ./.:4:144,162:.: 0.38:1.000:. ./.:4:75,255:.: 0.73:1.000:. ./.:4:165,60:.:-0.81:1.000:. ./.:4:73,265:.: 0.85:1.000:. ./.:4:150,57:.:-1.08:1.000:. ./.:6:85,117:.:-1.15:1.000:. ./.:4:89,127:.:-0.95:1.000:. ./.:4:116,152:.:-0.18:1.000:. ./.:4:74,158:.:-0.71:1.000:. ./.:4:191,92:.: 0.04:1.000:. ./.:4:61,243:.: 0.35:1.000:. ./.:4:66,228:.: 0.20:1.000:. ./.:4:154,48:.:-1.15:1.000:. ./.:4:116,139:.:-0.37:1.000:. ./.:4:53,241:.: 0.20:0.996:. ./.:4:123,169:.: 0.17:1.000:. ./.:4:114,141:.:-0.37:1.000:. ./.:4:82,109:.:-1.31:0.999:. ./.:4:88,265:.: 1.07:1.000:. ./.:4:144,180:.: 0.64:1.000:. ./.:4:79,221:.: 0.29:1.000:. ./.:4:57,233:.: 0.14:1.000:. ./.:4:53,243:.: 0.23:1.000:. ./.:4:58,202:.:-0.30:1.000:. ./.:4:57,217:.:-0.09:1.000:. ./.:4:131,161:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,177:.:-0.78:1.000:. ./.:4:111,157:.:-0.18:1.000:. ./.:4:131,152:.: 0.04:1.000:. ./.:4:113,123:.:-0.65:1.000:. ./.:4:140,176:.: 0.53:1.000:. ./.:4:121,151:.:-0.12:1.000:. ./.:4:119,55:.:-1.56:1.000:. ./.:4:156,78:.:-0.68:1.000:. ./.:4:166,75:.:-0.58:1.000:. ./.:4:80,225:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,187:.:-0.73:1.000:. ./.:4:125,142:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,161:.: 0.04:1.000:. ./.:4:111,146:.:-0.34:1.000:. ./.:4:112,132:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,217:.:-0.08:1.000:. ./.:4:44,183:.:-0.78:1.000:. ./.:4:46,197:.:-0.55:1.000:. ./.:4:165,79:.:-0.53:1.000:. ./.:4:74,235:.: 0.42:1.000:. ./.:4:76,102:.:-1.50:1.000:. ./.:4:59,216:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,93:.:-1.73:1.000:. ./.:4:130,79:.:-1.05:1.000:. ./.:4:152,60:.:-1.00:0.999:. ./.:4:110,137:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,166:.:-1.03:1.000:. ./.:4:137,161:.: 0.26:1.000:. ./.:4:185,215:.: 1.76:1.000:. ./.:4:129,141:.:-0.15:1.000:. ./.:4:166,52:.:-0.92:1.000:. ./.:4:94,313:.: 1.86:1.000:. ./.:4:94,127:.:-0.87:0.999:. ./.:4:153,125:.:-0.03:1.000:. ./.:4:84,92:.:-1.53:1.000:. ./.:4:160,71:.:-0.73:1.000:. ./.:4:96,135:.:-0.73:1.000:. ./.:4:103,156:.:-0.31:1.000:. ./.:4:141,60:.:-1.17:1.000:. ./.:4:40,172:.:-1.00:1.000:. ./.:4:67,217:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,130:.:-0.92:1.000:. ./.:4:192,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,172:.: 0.54:1.000:. ./.:4:110,156:.:-0.21:1.000:. ./.:4:166,89:.:-0.37:1.000:. ./.:4:153,69:.:-0.86:1.000:. ./.:4:56,211:.:-0.20:1.000:. ./.:4:143,51:.:-1.27:1.000:. ./.:4:68,97:.:-1.70:1.000:. ./.:4:72,125:.:-1.23:1.000:. ./.:4:134,169:.: 0.33:1.000:. ./.:5:74,113:.:-1.37:0.993:. ./.:4:118,159:.:-0.05:1.000:. ./.:4:52,204:.:-0.36:1.000:. ./.:4:282,95:.: 1.42:1.000:. ./.:4:170,82:.:-0.42:1.000:. ./.:4:90,107:.:-1.23:1.000:. ./.:4:115,48:.:-1.73:1.000:. ./.:4:104,108:.:-1.00:1.000:. ./.:4:124,154:.:-0.03:1.000:. ./.:4:139,68:.:-1.08:1.000:. ./.:4:117,147:.:-0.24:1.000:. ./.:4:66,87:.:-1.87:1.000:. ./.:4:269,95:.: 1.23:1.000:. ./.:4:86,304:.: 1.61:1.000:. ./.:4:147,189:.: 0.82:1.000:. ./.:4:83,253:.: 0.82:1.000:. ./.:4:101,305:.: 1.85:1.000:. ./.:4:180,76:.:-0.36:1.000:. ./.:4:191,195:.: 1.56:1.000:. ./.:4:145,151:.: 0.23:1.000:. ./.:4:16,99:.:-2.43:1.000:. ./.:4:157,135:.: 0.17:1.000:. ./.:4:227,91:.: 0.56:1.000:. ./.:4:164,166:.: 0.73:1.000:. ./.:4:87,311:.: 1.73:1.000:. ./.:4:160,166:.: 0.67:1.000:. ./.:4:111,143:.:-0.39:1.000:. ./.:4:163,209:.: 1.35:1.000:. ./.:4:145,160:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,226:.: 0.22:1.000:. ./.:4:223,77:.: 0.29:1.000:. ./.:4:151,190:.: 0.89:1.000:. ./.:4:109,163:.:-0.12:1.000:. ./.:4:147,162:.: 0.42:1.000:. ./.:4:130,145:.:-0.08:1.000:. ./.:4:135,162:.: 0.25:1.000:. ./.:4:144,172:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,232:.: 0.10:1.000:. ./.:4:177,93:.:-0.15:1.000:. ./.:4:105,128:.:-0.70:1.000:. ./.:4:150,166:.: 0.53:1.000:. ./.:4:66,208:.:-0.09:1.000:. ./.:4:112,155:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,138:.:-0.30:1.000:. ./.:4:273,98:.: 1.34:1.000:. ./.:4:157,153:.: 0.44:1.000:. ./.:4:178,193:.: 1.34:1.000:. ./.:4:137,141:.:-0.03:1.000:. ./.:4:251,96:.: 0.98:1.000:. ./.:4:158,206:.: 1.23:1.000:. ./.:4:96,312:.: 1.88:1.000:. ./.:4:177,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:88,258:.: 0.97:1.000:. -chr5.1 71434923 chr5.1_071434923 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:341,55:.: 0.63:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:286,22:.:-0.49:1.000:. ./.:4:305,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:262,43:.:-0.53:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:191,26:.:-1.66:1.000:. ./.:4:173,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:308,45:.: 0.08:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.06:0.944:. ./.:4:403,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:496,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:353,44:.: 0.65:1.000:. ./.:4:108,19:.:-2.81:1.000:. ./.:4:311,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:276,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:94,20:.:-2.98:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:329,36:.: 0.24:1.000:. ./.:4:290,38:.:-0.24:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:295,50:.:-0.02:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:262,36:.:-0.62:1.000:. ./.:4:44,13:.:-3.71:1.000:. ./.:4:136,12:.:-2.54:1.000:. ./.:3:71,23:.:-3.24:1.000:. ./.:4:287,55:.:-0.06:1.000:. ./.:4:280,46:.:-0.26:1.000:. ./.:4:299,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:232,35:.:-1.02:1.000:. ./.:4:273,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:345,26:.: 0.31:1.000:. ./.:4:252,24:.:-0.90:1.000:. ./.:4:357,36:.: 0.60:1.000:. ./.:4:280,53:.:-0.17:1.000:. ./.:4:385,61:.: 1.28:1.000:. ./.:4:617,7:.: 3.56:1.000:. ./.:4:232,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:267,35:.:-0.57:1.000:. ./.:4:311,32:.:-0.04:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:310,53:.: 0.21:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:281,26:.:-0.51:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:264,27:.:-0.71:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:261,26:.:-0.76:1.000:. ./.:4:335,54:.: 0.54:1.000:. ./.:4:275,36:.:-0.46:1.000:. ./.:4:217,43:.:-1.11:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:345,44:.: 0.54:1.000:. ./.:4:287,41:.:-0.24:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:284,41:.:-0.28:1.000:. ./.:4:311,32:.:-0.04:0.996:. ./.:4:414,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.96:0.999:. ./.:4:342,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:224,17:.:-1.35:1.000:. ./.:4:222,26:.:-1.26:1.000:. ./.:4:347,64:.: 0.83:1.000:. ./.:4:294,36:.:-0.21:1.000:. ./.:4:306,29:.:-0.15:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:315,47:.: 0.20:1.000:. ./.:4:328,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:250,13:.:-1.07:1.000:. ./.:4:316,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:166,76:.:-1.34:1.000:. ./.:4:223,36:.:-1.12:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:303,45:.: 0.02:1.000:. ./.:4:233,39:.:-0.96:1.000:. ./.:4:276,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:276,30:.:-0.52:1.000:. ./.:4:287,44:.:-0.20:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:270,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:315,39:.: 0.10:1.000:. ./.:4:198,27:.:-1.56:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:246,33:.:-0.87:1.000:. ./.:4:266,32:.:-0.62:1.000:. ./.:4:300,44:.:-0.03:1.000:. ./.:4:409,59:.: 1.56:1.000:. ./.:4:268,37:.:-0.53:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:352,62:.: 0.87:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:547,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:280,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:222,30:.:-1.21:1.000:. ./.:4:302,59:.: 0.19:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:255,34:.:-0.74:1.000:. ./.:4:271,59:.:-0.21:1.000:. ./.:5:241,24:.:-1.04:0.993:. ./.:4:355,34:.: 0.54:1.000:. ./.:4:267,44:.:-0.46:1.000:. ./.:4:473,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:288,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:275,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:325,30:.: 0.11:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:513,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:416,66:.: 1.74:1.000:. ./.:4:308,64:.: 0.33:1.000:. ./.:4:344,46:.: 0.56:1.000:. ./.:4:344,44:.: 0.53:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:482,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:143,13:.:-2.44:1.000:. ./.:4:261,48:.:-0.48:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:362,58:.: 0.94:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:253,45:.:-0.62:1.000:. ./.:4:256,27:.:-0.81:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:270,37:.:-0.51:1.000:. ./.:4:202,41:.:-1.33:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:310,44:.: 0.10:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:251,34:.:-0.79:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:287,28:.:-0.40:1.000:. ./.:4:219,29:.:-1.26:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:276,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:405,58:.: 1.49:1.000:. ./.:4:380,58:.: 1.17:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.93:1.000:. -chr5.1 71633078 chr5.1_071633078 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:35,80:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.36:1.000:. ./.:4:29,82:.: 0.35:1.000:. ./.:4:24,65:.:-0.52:1.000:. ./.:4:63,67:.: 1.10:1.000:. ./.:4:75,77:.: 1.96:1.000:. ./.:4:22,34:.:-1.81:1.000:. ./.:4:27,70:.:-0.20:1.000:. ./.:4:45,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:9,29:.:-2.52:1.000:. ./.:4:21,21:.:-2.37:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.03:1.000:. ./.:4:47,45:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,47:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,44:.:-0.75:1.000:. ./.:4:32,73:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,56:.: 0.11:0.944:. ./.:4:28,108:.: 1.33:1.000:. ./.:4:50,60:.: 0.31:1.000:. ./.:4:24,83:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,50:.:-1.66:1.000:. ./.:4:27,70:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,46:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,70:.:-0.28:1.000:. ./.:4:5,29:.:-2.68:1.000:. ./.:4:69,60:.: 1.06:1.000:. ./.:4:18,61:.:-0.91:1.000:. ./.:4:23,50:.:-1.15:1.000:. ./.:4:56,51:.: 0.19:1.000:. ./.:4:20,93:.: 0.43:1.000:. ./.:4:64,56:.: 0.70:1.000:. ./.:4:25,66:.:-0.44:1.000:. ./.:4:7,15:.:-3.15:1.000:. ./.:4:12,38:.:-2.05:1.000:. ./.:3:3,12:.:-3.43:1.000:. ./.:4:33,72:.: 0.11:1.000:. ./.:4:29,93:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,71:.:-0.56:1.000:. ./.:4:69,43:.: 0.39:1.000:. ./.:4:36,82:.: 0.62:1.000:. ./.:4:28,76:.: 0.07:1.000:. ./.:4:59,54:.: 0.43:1.000:. ./.:4:54,108:.: 2.36:1.000:. ./.:4:24,74:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,77:.: 0.39:1.000:. ./.:4:35,80:.: 0.51:1.000:. ./.:4:28,71:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,3:.:-3.82:1.000:. ./.:4:34,97:.: 1.14:1.000:. ./.:4:67,54:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,70:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,99:.: 1.06:1.000:. ./.:4:63,71:.: 1.25:1.000:. ./.:4:23,98:.: 0.74:1.000:. ./.:4:52,61:.: 0.43:1.000:. ./.:4:32,109:.: 1.53:1.000:. ./.:4:47,48:.:-0.28:1.000:. ./.:4:26,120:.: 1.73:1.000:. ./.:4:60,44:.: 0.07:1.000:. ./.:6:32,57:.:-0.52:1.000:. ./.:4:37,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:23,77:.:-0.08:1.000:. ./.:4:37,79:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,70:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,73:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,107:.: 1.41:1.000:. ./.:4:37,35:.:-1.19:1.000:. ./.:4:20,68:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,84:.: 0.70:0.996:. ./.:4:0,110:.: 0.31:1.000:. ./.:4:63,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:59,62:.: 0.74:0.999:. ./.:4:0,125:.: 0.90:1.000:. ./.:4:65,52:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,99:.:-0.08:1.000:. ./.:4:12,70:.:-0.79:1.000:. ./.:4:32,91:.: 0.82:1.000:. ./.:4:21,89:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,122:.: 2.20:1.000:. ./.:4:23,96:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,76:.:-1.03:1.000:. ./.:4:41,95:.: 1.33:1.000:. ./.:4:22,93:.: 0.51:1.000:. ./.:4:60,58:.: 0.62:1.000:. ./.:4:37,87:.: 0.86:1.000:. ./.:4:25,84:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,42:.:-0.75:1.000:. ./.:4:44,53:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,59:.:-1.03:1.000:. ./.:4:59,57:.: 0.55:1.000:. ./.:4:36,114:.: 1.88:1.000:. ./.:4:11,77:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,75:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,96:.: 1.14:1.000:. ./.:4:37,85:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.40:1.000:. ./.:4:55,62:.: 0.59:1.000:. ./.:4:26,93:.: 0.66:1.000:. ./.:4:44,34:.:-0.95:1.000:. ./.:4:34,75:.: 0.27:1.000:. ./.:4:17,51:.:-1.34:1.000:. ./.:4:61,63:.: 0.86:1.000:. ./.:4:42,52:.:-0.32:0.999:. ./.:4:31,85:.: 0.55:1.000:. ./.:4:34,90:.: 0.86:1.000:. ./.:4:13,64:.:-0.99:1.000:. ./.:4:22,95:.: 0.59:1.000:. ./.:4:37,72:.: 0.27:1.000:. ./.:4:60,51:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,89:.: 0.74:1.000:. ./.:4:54,57:.: 0.35:0.999:. ./.:4:52,71:.: 0.82:1.000:. ./.:4:11,40:.:-2.01:1.000:. ./.:4:64,49:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,41:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:65,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:27,82:.: 0.27:1.000:. ./.:4:23,97:.: 0.70:1.000:. ./.:4:62,51:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,49:.:-0.16:1.000:. ./.:4:32,42:.:-1.11:1.000:. ./.:4:63,50:.: 0.43:1.000:. ./.:4:65,53:.: 0.62:1.000:. ./.:4:64,46:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:34,38:.:-1.19:1.000:. ./.:4:41,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:31,85:.: 0.55:1.000:. ./.:4:18,61:.:-0.91:1.000:. ./.:5:41,64:.: 0.11:0.993:. ./.:4:31,96:.: 0.98:1.000:. ./.:4:29,75:.: 0.07:1.000:. ./.:4:56,55:.: 0.35:1.000:. ./.:4:57,66:.: 0.82:1.000:. ./.:4:23,76:.:-0.12:1.000:. ./.:4:47,52:.:-0.12:1.000:. ./.:4:33,82:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,104:.: 1.37:1.000:. ./.:4:49,49:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:45,37:.:-0.79:1.000:. ./.:4:53,73:.: 0.94:1.000:. ./.:4:41,107:.: 1.81:1.000:. ./.:4:27,74:.:-0.04:1.000:. ./.:4:29,62:.:-0.44:1.000:. ./.:4:42,130:.: 2.75:1.000:. ./.:4:47,45:.:-0.40:1.000:. ./.:4:49,55:.: 0.07:1.000:. ./.:4:50,49:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,17:.:-2.17:1.000:. ./.:4:15,52:.:-1.38:1.000:. ./.:4:55,55:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,60:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,86:.: 0.23:1.000:. ./.:4:56,67:.: 0.82:1.000:. ./.:4:34,37:.:-1.22:1.000:. ./.:4:46,51:.:-0.20:1.000:. ./.:4:27,61:.:-0.56:1.000:. ./.:4:26,81:.: 0.19:1.000:. ./.:4:38,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:48,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:46,38:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,93:.: 0.94:1.000:. ./.:4:26,57:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:41,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:16,60:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,33:.:-1.58:1.000:. ./.:4:21,64:.:-0.67:1.000:. ./.:4:40,46:.:-0.63:1.000:. ./.:4:25,68:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,59:.:-0.91:1.000:. ./.:4:30,51:.:-0.83:1.000:. ./.:4:68,55:.: 0.82:1.000:. ./.:4:24,67:.:-0.44:1.000:. ./.:4:63,57:.: 0.70:1.000:. ./.:4:34,43:.:-0.99:1.000:. ./.:4:40,48:.:-0.56:1.000:. ./.:4:34,70:.: 0.07:1.000:. ./.:4:33,95:.: 1.02:1.000:. ./.:4:46,44:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.86:1.000:. -chr5.1 71783505 chr5.1_071783505 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.05:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.52:1.000:. ./.:4:20,7:.: 0.65:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.37:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:24,4:.: 0.75:1.000:. ./.:4:5,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:12,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:14,7:.: 0.01:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:10,8:.:-0.31:0.944:. ./.:4:10,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:12,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:17,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,9:.:-0.52:1.000:. ./.:4:17,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:3,3:.:-1.59:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:16,10:.: 0.54:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.05:1.000:. ./.:4:4,5:.:-1.27:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:10,9:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,5:.: 0.44:1.000:. ./.:3:7,2:.:-1.27:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:18,9:.: 0.65:1.000:. ./.:4:13,8:.: 0.01:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,3:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:14,10:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.52:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.05:1.000:. ./.:4:18,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,11:.: 1.50:1.000:. ./.:4:27,5:.: 1.18:1.000:. ./.:4:25,10:.: 1.50:1.000:. ./.:4:31,8:.: 1.92:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.37:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:26,6:.: 1.18:1.000:. ./.:4:20,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:22,12:.: 1.39:1.000:. ./.:6:24,11:.: 1.50:1.000:. ./.:4:15,14:.: 0.86:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,6:.: 0.33:1.000:. ./.:4:15,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:22,5:.: 0.65:0.996:. ./.:4:8,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:36,9:.: 2.56:1.000:. ./.:4:12,7:.:-0.20:0.999:. ./.:4:13,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:9,7:.:-0.52:1.000:. ./.:4:14,7:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:18,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:23,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:27,8:.: 1.50:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:15,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:25,9:.: 1.39:1.000:. ./.:4:11,6:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,13:.: 1.50:1.000:. ./.:4:27,7:.: 1.39:1.000:. ./.:4:23,14:.: 1.71:1.000:. ./.:4:15,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:31,8:.: 1.92:1.000:. ./.:4:16,6:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,4:.: 1.18:1.000:. ./.:4:15,8:.: 0.22:1.000:. ./.:4:20,11:.: 1.07:1.000:. ./.:4:5,4:.:-1.27:1.000:. ./.:4:24,5:.: 0.86:1.000:. ./.:4:24,3:.: 0.65:1.000:. ./.:4:12,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:22,22:.: 2.46:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,7:.: 0.65:1.000:. ./.:4:29,3:.: 1.18:1.000:. ./.:4:19,10:.: 0.86:1.000:. ./.:4:33,19:.: 3.31:1.000:. ./.:4:18,9:.: 0.65:0.999:. ./.:4:12,10:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:25,7:.: 1.18:1.000:. ./.:4:17,11:.: 0.75:1.000:. ./.:4:28,11:.: 1.92:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:18,11:.: 0.86:0.999:. ./.:4:34,13:.: 2.77:1.000:. ./.:4:8,6:.:-0.73:1.000:. ./.:4:29,14:.: 2.35:1.000:. ./.:4:32,11:.: 2.35:1.000:. ./.:4:19,5:.: 0.33:1.000:. ./.:4:23,13:.: 1.60:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,7:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:25,9:.: 1.39:1.000:. ./.:4:23,13:.: 1.60:1.000:. ./.:4:15,11:.: 0.54:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.52:1.000:. ./.:4:23,5:.: 0.75:1.000:. ./.:4:29,11:.: 2.03:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.84:1.000:. ./.:5:15,10:.: 0.44:0.993:. ./.:4:10,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:15,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:9,9:.:-0.31:1.000:. ./.:4:20,4:.: 0.33:1.000:. ./.:4:20,9:.: 0.86:1.000:. ./.:4:11,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:15,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:24,18:.: 2.24:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:18,9:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:5,4:.:-1.27:1.000:. ./.:4:11,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:7,7:.:-0.73:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:18,10:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:10,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:9,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:18,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.42:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:12,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:8,6:.:-0.73:1.000:. ./.:4:21,11:.: 1.18:1.000:. ./.:4:4,7:.:-1.05:1.000:. ./.:4:16,6:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,9:.: 0.33:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:11,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.95:1.000:. -chr5.1 71992976 chr5.1_071992976 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:39,53:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,63:.: 0.70:1.000:. ./.:4:39,88:.: 2.10:1.000:. ./.:4:39,52:.: 0.81:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.88:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.95:1.000:. ./.:4:27,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,4:.:-2.28:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:35,29:.:-0.16:1.000:. ./.:4:38,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:27,57:.: 0.56:1.000:. ./.:4:51,41:.: 0.85:1.000:. ./.:4:36,87:.: 1.96:0.944:. ./.:4:0,94:.: 0.92:1.000:. ./.:4:40,74:.: 1.64:1.000:. ./.:4:36,84:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.14:1.000:. ./.:4:25,43:.:-0.02:1.000:. ./.:4:32,70:.: 1.21:1.000:. ./.:4:21,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,5:.:-2.24:1.000:. ./.:4:35,73:.: 1.42:1.000:. ./.:4:16,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,64:.: 0.74:1.000:. ./.:4:30,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.06:1.000:. ./.:4:48,28:.: 0.27:1.000:. ./.:4:25,59:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.17:1.000:. ./.:4:8,4:.:-2.03:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.42:1.000:. ./.:4:41,51:.: 0.85:1.000:. ./.:4:36,41:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,79:.: 1.85:1.000:. ./.:4:31,72:.: 1.24:1.000:. ./.:4:24,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,54:.: 1.60:1.000:. ./.:4:34,74:.: 1.42:1.000:. ./.:4:16,40:.:-0.45:1.000:. ./.:4:28,49:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.24:1.000:. ./.:4:30,74:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.42:1.000:. ./.:4:24,55:.: 0.38:1.000:. ./.:4:29,39:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,30:.:-0.95:1.000:. ./.:4:44,45:.: 0.74:1.000:. ./.:4:35,34:.: 0.02:1.000:. ./.:4:23,33:.:-0.45:1.000:. ./.:4:24,41:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.66:1.000:. ./.:4:29,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:15,45:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,30:.:-0.12:1.000:. ./.:6:20,22:.:-0.95:1.000:. ./.:4:17,27:.:-0.88:1.000:. ./.:4:23,27:.:-0.66:1.000:. ./.:4:29,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:41,36:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.24:1.000:. ./.:4:29,52:.: 0.45:1.000:. ./.:4:12,13:.:-1.56:1.000:. ./.:4:29,39:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.02:0.996:. ./.:4:0,61:.:-0.27:1.000:. ./.:4:37,74:.: 1.53:1.000:. ./.:4:12,45:.:-0.41:0.999:. ./.:4:0,110:.: 1.49:1.000:. ./.:4:45,63:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.56:1.000:. ./.:4:11,37:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,69:.: 0.81:1.000:. ./.:4:35,37:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.02:1.000:. ./.:4:22,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,70:.: 1.89:1.000:. ./.:4:14,36:.:-0.66:1.000:. ./.:4:25,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,19:.:-1.31:1.000:. ./.:4:51,33:.: 0.56:1.000:. ./.:4:45,34:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.45:1.000:. ./.:4:16,35:.:-0.63:1.000:. ./.:4:19,54:.: 0.16:1.000:. ./.:4:46,44:.: 0.77:1.000:. ./.:4:20,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,29:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1,69:.: 0.06:1.000:. ./.:4:19,26:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.67:1.000:. ./.:4:28,34:.:-0.23:1.000:. ./.:4:25,50:.: 0.24:1.000:. ./.:4:19,22:.:-0.99:1.000:. ./.:4:19,16:.:-1.20:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.73:0.999:. ./.:4:34,39:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:1,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:24,34:.:-0.38:1.000:. ./.:4:25,38:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,35:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1,116:.: 1.75:1.000:. ./.:4:52,41:.: 0.88:0.999:. ./.:4:27,62:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.81:1.000:. ./.:4:31,39:.: 0.06:1.000:. ./.:4:18,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:12,34:.:-0.81:1.000:. ./.:4:59,18:.: 0.31:1.000:. ./.:4:19,27:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,73:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,47:.: 0.31:1.000:. ./.:4:26,33:.:-0.34:1.000:. ./.:4:29,49:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,49:.: 0.92:1.000:. ./.:4:25,38:.:-0.20:1.000:. ./.:4:26,30:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.16:1.000:. ./.:4:37,18:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:22,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:30,52:.: 0.49:1.000:. ./.:5:13,33:.:-0.81:0.993:. ./.:4:12,18:.:-1.38:1.000:. ./.:4:21,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:76,45:.: 1.89:1.000:. ./.:4:23,22:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,33:.:-0.16:1.000:. ./.:4:25,18:.:-0.91:1.000:. ./.:4:15,24:.:-1.06:1.000:. ./.:4:25,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:20,22:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,64:.: 0.63:1.000:. ./.:4:29,35:.:-0.16:1.000:. ./.:4:84,29:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.41:1.000:. ./.:4:27,53:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:38,85:.: 1.96:1.000:. ./.:4:33,67:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1,5:.:-2.24:1.000:. ./.:4:19,18:.:-1.13:1.000:. ./.:4:25,39:.:-0.16:1.000:. ./.:4:26,56:.: 0.49:1.000:. ./.:4:38,100:.: 2.50:1.000:. ./.:4:29,74:.: 1.24:1.000:. ./.:4:25,57:.: 0.49:1.000:. ./.:4:52,57:.: 1.46:1.000:. ./.:4:25,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.30:1.000:. ./.:4:22,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:57,63:.: 1.85:1.000:. ./.:4:31,63:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,33:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.16:1.000:. ./.:4:30,64:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:20,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:29,38:.:-0.05:1.000:. ./.:4:19,61:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.70:1.000:. ./.:4:16,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:69,33:.: 1.21:1.000:. ./.:4:39,49:.: 0.70:1.000:. ./.:4:34,72:.: 1.35:1.000:. ./.:4:55,58:.: 1.60:1.000:. ./.:4:63,30:.: 0.88:1.000:. ./.:4:44,42:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,91:.: 0.81:1.000:. ./.:4:23,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,106:.: 1.35:1.000:. -chr5.1 72173764 chr5.1_072173764 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:59,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:48,7:.:-0.10:1.000:. ./.:4:67,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:39,3:.:-0.79:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.80:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:20,2:.:-1.85:1.000:. ./.:4:27,10:.:-1.05:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:57,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:39,4:.:-0.74:0.944:. ./.:4:34,3:.:-1.05:1.000:. ./.:4:69,4:.: 0.86:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,6:.: 0.86:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:26,6:.:-1.32:1.000:. ./.:4:28,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:30,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:33,3:.:-1.11:1.000:. ./.:4:59,5:.: 0.38:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:24,6:.:-1.43:1.000:. ./.:4:28,7:.:-1.16:1.000:. ./.:3:4,5:.:-2.54:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:33,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:45,6:.:-0.31:1.000:. ./.:4:33,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:60,9:.: 0.65:1.000:. ./.:4:63,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:52,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,4:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:73,5:.: 1.13:1.000:. ./.:4:64,3:.: 0.54:1.000:. ./.:4:140,19:.: 5.43:1.000:. ./.:4:35,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:46,14:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:78,9:.: 1.61:1.000:. ./.:4:61,5:.: 0.49:1.000:. ./.:4:57,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,8:.: 0.06:1.000:. ./.:4:79,8:.: 1.61:1.000:. ./.:4:58,23:.: 1.29:1.000:. ./.:4:62,5:.: 0.54:1.000:. ./.:6:80,8:.: 1.66:1.000:. ./.:4:55,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:40,7:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:78,12:.: 1.76:1.000:. ./.:4:62,8:.: 0.70:1.000:. ./.:4:56,4:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,8:.: 0.44:0.996:. ./.:4:46,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,9:.: 1.39:1.000:. ./.:4:57,12:.: 0.65:0.999:. ./.:4:66,12:.: 1.13:1.000:. ./.:4:71,3:.: 0.91:1.000:. ./.:4:57,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:61,9:.: 0.70:1.000:. ./.:4:55,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:64,11:.: 0.97:1.000:. ./.:4:77,6:.: 1.39:1.000:. ./.:4:74,7:.: 1.29:1.000:. ./.:4:35,3:.:-1.00:1.000:. ./.:4:61,6:.: 0.54:1.000:. ./.:4:68,11:.: 1.18:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:64,10:.: 0.91:1.000:. ./.:4:89,4:.: 1.92:1.000:. ./.:4:56,2:.: 0.06:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:77,5:.: 1.34:1.000:. ./.:4:50,9:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,3:.: 0.44:1.000:. ./.:4:61,7:.: 0.59:1.000:. ./.:4:29,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:88,7:.: 2.03:1.000:. ./.:4:52,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:57,11:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,7:.: 0.65:1.000:. ./.:4:85,7:.: 1.87:1.000:. ./.:4:60,4:.: 0.38:1.000:. ./.:4:74,8:.: 1.34:1.000:. ./.:4:56,9:.: 0.44:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:73,9:.: 1.34:1.000:. ./.:4:57,9:.: 0.49:0.999:. ./.:4:49,9:.: 0.06:1.000:. ./.:4:46,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:80,8:.: 1.66:1.000:. ./.:4:61,4:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,3:.: 1.02:1.000:. ./.:4:33,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:70,3:.: 0.86:0.999:. ./.:4:76,4:.: 1.23:1.000:. ./.:4:58,6:.: 0.38:1.000:. ./.:4:68,7:.: 0.97:1.000:. ./.:4:87,10:.: 2.14:1.000:. ./.:4:35,6:.:-0.84:1.000:. ./.:4:63,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:73,7:.: 1.23:1.000:. ./.:4:44,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:48,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:78,7:.: 1.50:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:63,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,7:.: 0.81:1.000:. ./.:4:53,6:.: 0.12:1.000:. ./.:4:33,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.89:1.000:. ./.:4:52,6:.: 0.06:1.000:. ./.:4:43,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.84:1.000:. ./.:5:50,4:.:-0.15:0.993:. ./.:4:35,6:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:58,5:.: 0.33:1.000:. ./.:4:49,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,8:.: 0.75:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:56,2:.: 0.06:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:71,6:.: 1.07:1.000:. ./.:4:60,5:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:55,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:59,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:18,7:.:-1.69:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:36,4:.:-0.89:1.000:. ./.:4:65,5:.: 0.70:1.000:. ./.:4:54,6:.: 0.17:1.000:. ./.:4:58,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:49,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:32,6:.:-1.00:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:65,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.53:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:59,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,8:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:60,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:36,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:33,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:64,4:.: 0.59:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.58:1.000:. -chr5.1 72456519 chr5.1_072456519 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,71:0.56: 0.67:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,12:0.23:-1.17:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,103:0.59: 1.54:1.000:0.865 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,53:0.31: 1.71:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.31:0.944:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,63:0.48: 1.19:1.000:0.995 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.25:-1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,47:0.32: 1.19:1.000:0.956 0/0/1/1:4:81,58:0.46: 1.00:1.000:0.989 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,42:0.23: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,91:0.87:-0.11:1.000:0.866 0/0/1/1:4:60,88:0.57: 1.21:1.000:0.945 0/0/1/1:4:68,43:0.42: 0.34:1.000:0.905 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.24:-1.64:1.000:1.000 0/0/0:3:6,1:0.13:-2.11:1.000:0.864 0/0/1/1:4:68,45:0.43: 0.39:1.000:0.956 0/0/0/1:4:131,43:0.23: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,62:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,43:0.42: 0.32:1.000:0.926 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,32:0.23: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,29:0.28: 0.03:1.000:0.994 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,103:0.61: 1.35:1.000:0.741 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,1:0.08:-2.02:1.000:0.980 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,19:0.36:-0.98:1.000:0.727 0/0/1/1:4:54,38:0.46:-0.11:1.000:0.985 0/0/0/1:4:141,48:0.23: 2.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,47:0.24: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,47:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,18:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,78:0.61: 0.46:1.000:0.724 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,69:0.59: 0.27:1.000:0.856 0/0/0/0/0/1:6:71,24:0.23:-0.04:1.000:0.717 0/0/0/1:4:89,35:0.26: 0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:85,35:0.28: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,23:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,41:0.39: 0.34:1.000:0.709 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,51:0.29: 1.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:49,27:0.37:-0.48:0.996:0.551 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,47:0.44: 0.46:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.64:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,55:0.48: 0.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.27:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,34:0.44:-0.30:1.000:0.972 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,45:0.51: 0.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,62:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,42:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,26:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,32:0.38:-0.18:1.000:0.532 0/1/1/1:4:27,67:0.63:-0.06:1.000:0.508 0/0/1/1:4:42,33:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,27:0.39:-0.56:1.000:0.717 0/0/0/1:4:110,45:0.28: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,41:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,35:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,45:0.44: 0.34:1.000:0.973 0/0/1/1:4:58,33:0.38:-0.13:1.000:0.591 0/0/1/1:4:46,28:0.40:-0.53:1.000:0.829 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,59:0.55: 0.25:1.000:0.979 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,34:0.26: 0.58:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,26:0.32:-0.37:0.999:0.952 0/0/0/1:4:98,38:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,28:0.34:-0.32:1.000:0.837 0/0/1/1:4:54,95:0.59: 1.23:1.000:0.860 0/0/0/1:4:146,60:0.28: 2.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,36:0.34: 0.25:1.000:0.846 0/0/1/1:4:58,75:0.56: 0.86:1.000:0.973 0/0/1/1:4:80,56:0.45: 0.93:1.000:0.983 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.14:0.999:1.000 0/0/1/1:4:52,80:0.58: 0.83:1.000:0.929 0/0/1/1:4:22,44:0.60:-0.72:1.000:0.751 0/0/1/1:4:70,96:0.56: 1.64:1.000:0.962 0/1/1/1:4:1,30:0.75:-1.54:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,29:0.35:-0.27:1.000:0.790 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,89:0.60: 0.93:1.000:0.803 0/0/1/1:4:58,61:0.53: 0.53:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,35:0.54:-0.74:1.000:0.985 0/0/1/1:4:42,28:0.44:-0.63:1.000:0.961 0/0/0/1:4:54,28:0.35:-0.34:1.000:0.786 0/0/0/1:4:112,54:0.33: 1.64:1.000:0.932 0/0/0/1/1:5:42,24:0.38:-0.72:0.993:0.967 0/0/0/1:4:118,34:0.21: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,76:0.54: 1.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,88:0.60: 0.91:1.000:0.812 0/0/0/1:4:114,38:0.23: 1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,37:0.46:-0.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:107,27:0.18: 0.88:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,47:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,64:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,63:0.49: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,100:0.59: 1.40:1.000:0.849 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,63:0.51: 0.91:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,102:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,60:0.53: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:68,59:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,7:0.23:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,40:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,76:0.58: 0.62:1.000:0.908 0/0/1/1:4:70,46:0.43: 0.46:1.000:0.950 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,39:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,38:0.42: 0.03:1.000:0.908 0/0/1/1:4:52,29:0.37:-0.37:1.000:0.503 0/0/1/1:4:55,90:0.58: 1.14:1.000:0.902 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,37:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,114:0.60: 1.82:1.000:0.800 0/0/0/1:4:107,50:0.32: 1.42:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,36:0.33: 0.29:1.000:0.901 0/0/1/1:4:55,39:0.46:-0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:49,40:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,32:0.47:-0.48:1.000:0.991 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,66:0.57: 0.34:1.000:0.945 0/0/1/1:4:43,36:0.51:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,54:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,44:0.24: 1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,43:0.45: 0.20:1.000:0.980 0/0/0/1:4:51,14:0.20:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,54:0.26: 2.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,87:0.53: 1.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,66:0.57: 0.39:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.29:1.000:1.000 -chr5.1 72511331 chr5.1_072511331 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:254,70:.: 0.24:1.000:. ./.:4:173,140:.: 0.11:1.000:. ./.:4:259,88:.: 0.52:1.000:. ./.:4:231,69:.:-0.04:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:358,98:.: 1.83:1.000:. ./.:4:263,70:.: 0.35:1.000:. ./.:4:185,155:.: 0.44:1.000:. ./.:4:236,75:.: 0.09:1.000:. ./.:4:35,24:.:-2.94:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:196,135:.: 0.33:1.000:. ./.:4:234,67:.:-0.03:1.000:. ./.:4:266,73:.: 0.42:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:166,167:.: 0.35:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.01:0.944:. ./.:4:285,92:.: 0.88:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:330,99:.: 1.51:1.000:. ./.:4:78,19:.:-2.48:1.000:. ./.:4:190,137:.: 0.28:1.000:. ./.:4:379,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:235,71:.: 0.03:1.000:. ./.:4:39,4:.:-3.13:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:168,154:.: 0.22:1.000:. ./.:4:269,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:344,101:.: 1.70:1.000:. ./.:4:224,182:.: 1.23:1.000:. ./.:4:310,92:.: 1.18:1.000:. ./.:4:246,78:.: 0.24:1.000:. ./.:4:19,11:.:-3.29:1.000:. ./.:4:68,19:.:-2.60:1.000:. ./.:3:11,9:.:-3.41:1.000:. ./.:4:201,150:.: 0.57:1.000:. ./.:4:182,162:.: 0.48:1.000:. ./.:4:297,74:.: 0.81:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:352,77:.: 1.51:1.000:. ./.:4:141,127:.:-0.43:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:229,73:.:-0.02:1.000:. ./.:4:147,112:.:-0.54:1.000:. ./.:4:259,62:.: 0.21:1.000:. ./.:4:174,127:.:-0.03:1.000:. ./.:4:302,72:.: 0.84:1.000:. ./.:4:53,9:.:-2.90:1.000:. ./.:4:218,47:.:-0.46:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:129,87:.:-1.05:1.000:. ./.:4:201,210:.: 1.29:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:166,158:.: 0.24:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:232,68:.:-0.04:1.000:. ./.:4:265,70:.: 0.38:1.000:. ./.:4:229,62:.:-0.15:1.000:. ./.:4:231,50:.:-0.27:1.000:. ./.:6:153,51:.:-1.20:1.000:. ./.:4:169,134:.:-0.01:1.000:. ./.:4:171,125:.:-0.09:1.000:. ./.:4:162,60:.:-0.98:1.000:. ./.:4:222,58:.:-0.28:1.000:. ./.:4:300,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:240,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:206,48:.:-0.60:1.000:. ./.:4:178,109:.:-0.20:1.000:. ./.:4:279,66:.: 0.50:0.996:. ./.:4:153,127:.:-0.28:1.000:. ./.:4:372,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:272,1:.:-0.37:0.999:. ./.:4:275,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:244,54:.:-0.07:1.000:. ./.:4:223,70:.:-0.13:1.000:. ./.:4:175,52:.:-0.92:1.000:. ./.:4:229,47:.:-0.33:1.000:. ./.:4:266,84:.: 0.56:1.000:. ./.:4:197,138:.: 0.38:1.000:. ./.:4:215,40:.:-0.58:1.000:. ./.:4:158,122:.:-0.28:1.000:. ./.:4:149,131:.:-0.28:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:159,106:.:-0.46:1.000:. ./.:4:196,122:.: 0.17:1.000:. ./.:4:180,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:180,53:.:-0.85:1.000:. ./.:4:196,52:.:-0.67:1.000:. ./.:4:82,167:.:-0.66:1.000:. ./.:4:247,64:.: 0.09:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:174,159:.: 0.35:1.000:. ./.:4:127,93:.:-1.01:1.000:. ./.:4:200,115:.: 0.14:1.000:. ./.:4:275,68:.: 0.47:1.000:. ./.:4:178,48:.:-0.93:1.000:. ./.:4:219,61:.:-0.28:1.000:. ./.:4:224,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:301,76:.: 0.88:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:245,49:.:-0.12:1.000:. ./.:4:96,65:.:-1.71:1.000:. ./.:4:210,55:.:-0.46:1.000:. ./.:4:186,53:.:-0.78:0.999:. ./.:4:149,125:.:-0.36:1.000:. ./.:4:195,53:.:-0.67:1.000:. ./.:4:186,156:.: 0.46:1.000:. ./.:4:210,169:.: 0.90:1.000:. ./.:4:176,128:.: 0.00:1.000:. ./.:4:208,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:389,114:.: 2.39:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:298,74:.: 0.82:1.000:. ./.:4:108,63:.:-1.59:1.000:. ./.:4:221,69:.:-0.16:1.000:. ./.:4:257,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:224,62:.:-0.21:1.000:. ./.:4:225,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:245,71:.: 0.15:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:256,63:.: 0.18:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:249,57:.: 0.03:1.000:. ./.:4:217,51:.:-0.43:1.000:. ./.:4:220,49:.:-0.42:1.000:. ./.:4:161,39:.:-1.25:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:141,102:.:-0.73:1.000:. ./.:4:176,107:.:-0.25:1.000:. ./.:5:218,49:.:-0.44:0.993:. ./.:4:180,110:.:-0.16:1.000:. ./.:4:233,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:359,111:.: 2.00:1.000:. ./.:4:258,78:.: 0.39:1.000:. ./.:4:121,95:.:-1.05:1.000:. ./.:4:193,50:.:-0.73:1.000:. ./.:4:134,103:.:-0.80:1.000:. ./.:4:148,105:.:-0.61:1.000:. ./.:4:189,40:.:-0.90:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:358,86:.: 1.69:1.000:. ./.:4:344,103:.: 1.72:1.000:. ./.:4:158,132:.:-0.16:1.000:. ./.:4:252,79:.: 0.33:1.000:. ./.:4:339,81:.: 1.40:1.000:. ./.:4:215,51:.:-0.45:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:56,9:.:-2.87:1.000:. ./.:4:150,146:.:-0.09:1.000:. ./.:4:277,66:.: 0.47:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:304,87:.: 1.05:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:405,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:180,130:.: 0.08:1.000:. ./.:4:246,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:237,70:.: 0.04:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:159,172:.: 0.33:1.000:. ./.:4:171,145:.: 0.15:1.000:. ./.:4:191,143:.: 0.36:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:291,73:.: 0.72:1.000:. ./.:4:239,57:.:-0.09:1.000:. ./.:4:127,108:.:-0.82:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:231,69:.:-0.04:1.000:. ./.:4:115,119:.:-0.84:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:370,99:.: 1.99:1.000:. ./.:4:188,155:.: 0.47:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:335,23:.: 0.65:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:243,195:.: 1.61:1.000:. ./.:4:291,96:.: 1.00:1.000:. ./.:4:256,65:.: 0.21:1.000:. ./.:4:264,63:.: 0.28:1.000:. -chr5.1 72787051 chr5.1_072787051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,356:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1,391:.:-0.20:1.000:. ./.:4:100,292:.:-0.20:1.000:. ./.:4:140,321:.: 0.67:1.000:. ./.:4:256,248:.: 1.22:1.000:. ./.:4:273,233:.: 1.24:1.000:. ./.:4:150,149:.:-1.38:1.000:. ./.:4:121,323:.: 0.46:1.000:. ./.:4:224,192:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,127:.:-2.79:1.000:. ./.:4:170,100:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.98:1.000:. ./.:4:188,200:.:-0.25:1.000:. ./.:4:266,239:.: 1.23:1.000:. ./.:4:242,185:.: 0.24:1.000:. ./.:4:123,351:.: 0.84:1.000:. ./.:4:266,242:.: 1.27:0.944:. ./.:4:132,368:.: 1.17:1.000:. ./.:4:310,278:.: 2.28:1.000:. ./.:4:130,373:.: 1.20:1.000:. ./.:4:93,189:.:-1.60:1.000:. ./.:4:108,300:.: 0.00:1.000:. ./.:4:239,214:.: 0.57:1.000:. ./.:4:117,355:.: 0.81:1.000:. ./.:4:55,107:.:-3.12:1.000:. ./.:4:215,203:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,314:.: 0.27:1.000:. ./.:4:119,338:.: 0.62:1.000:. ./.:4:245,219:.: 0.71:1.000:. ./.:4:114,343:.: 0.62:1.000:. ./.:4:234,234:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,314:.: 0.08:1.000:. ./.:4:78,77:.:-3.21:1.000:. ./.:4:82,163:.:-2.07:1.000:. ./.:3:33,81:.:-3.73:1.000:. ./.:4:124,356:.: 0.91:1.000:. ./.:4:113,315:.: 0.25:1.000:. ./.:4:124,318:.: 0.43:1.000:. ./.:4:243,207:.: 0.53:1.000:. ./.:4:121,352:.: 0.82:1.000:. ./.:4:124,334:.: 0.63:1.000:. ./.:4:238,163:.:-0.09:1.000:. ./.:4:136,337:.: 0.82:1.000:. ./.:4:114,307:.: 0.16:1.000:. ./.:4:127,362:.: 1.03:1.000:. ./.:4:145,336:.: 0.93:1.000:. ./.:4:130,346:.: 0.86:1.000:. ./.:4:175,432:.: 2.52:1.000:. ./.:4:89,244:.:-0.95:1.000:. ./.:4:285,223:.: 1.27:1.000:. ./.:4:107,263:.:-0.48:1.000:. ./.:4:147,369:.: 1.37:1.000:. ./.:4:195,170:.:-0.55:1.000:. ./.:4:144,321:.: 0.72:1.000:. ./.:4:215,173:.:-0.25:1.000:. ./.:4:99,265:.:-0.56:1.000:. ./.:4:212,170:.:-0.33:1.000:. ./.:4:103,284:.:-0.27:1.000:. ./.:4:247,171:.: 0.13:1.000:. ./.:6:96,206:.:-1.34:1.000:. ./.:4:105,267:.:-0.46:1.000:. ./.:4:116,261:.:-0.39:1.000:. ./.:4:137,232:.:-0.49:1.000:. ./.:4:202,174:.:-0.41:1.000:. ./.:4:97,321:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,291:.: 0.15:1.000:. ./.:4:190,152:.:-0.84:1.000:. ./.:4:111,282:.:-0.19:1.000:. ./.:4:113,300:.: 0.06:0.996:. ./.:4:0,402:.:-0.08:1.000:. ./.:4:221,220:.: 0.42:1.000:. ./.:4:164,143:.:-1.28:0.999:. ./.:4:1,439:.: 0.41:1.000:. ./.:4:240,208:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,405:.:-0.04:1.000:. ./.:4:107,260:.:-0.52:1.000:. ./.:4:111,267:.:-0.38:1.000:. ./.:4:115,278:.:-0.19:1.000:. ./.:4:126,325:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,337:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,293:.:-1.46:1.000:. ./.:4:108,300:.: 0.00:1.000:. ./.:4:129,323:.: 0.56:1.000:. ./.:4:183,143:.:-1.04:1.000:. ./.:4:114,361:.: 0.85:1.000:. ./.:4:134,373:.: 1.26:1.000:. ./.:4:141,141:.:-1.60:1.000:. ./.:4:176,165:.:-0.85:1.000:. ./.:4:223,186:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,354:.:-0.68:1.000:. ./.:4:90,187:.:-1.66:1.000:. ./.:4:217,196:.: 0.06:1.000:. ./.:4:130,342:.: 0.81:1.000:. ./.:4:74,258:.:-0.96:1.000:. ./.:4:110,285:.:-0.16:1.000:. ./.:4:112,310:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,292:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,373:.:-0.44:1.000:. ./.:4:231,206:.: 0.37:1.000:. ./.:4:134,352:.: 0.99:1.000:. ./.:4:211,137:.:-0.76:1.000:. ./.:4:124,323:.: 0.49:1.000:. ./.:4:79,226:.:-1.31:1.000:. ./.:4:210,192:.:-0.08:1.000:. ./.:4:194,205:.:-0.11:0.999:. ./.:4:126,312:.: 0.38:1.000:. ./.:4:101,265:.:-0.53:1.000:. ./.:4:98,307:.:-0.04:1.000:. ./.:4:144,366:.: 1.29:1.000:. ./.:4:125,324:.: 0.52:1.000:. ./.:4:207,218:.: 0.22:1.000:. ./.:4:141,431:.: 2.08:1.000:. ./.:4:119,314:.: 0.32:0.999:. ./.:4:228,286:.: 1.34:1.000:. ./.:4:101,207:.:-1.27:1.000:. ./.:4:246,243:.: 1.03:1.000:. ./.:4:192,141:.:-0.95:1.000:. ./.:4:188,175:.:-0.57:1.000:. ./.:4:194,174:.:-0.51:1.000:. ./.:4:98,230:.:-1.01:1.000:. ./.:4:101,297:.:-0.13:1.000:. ./.:4:201,167:.:-0.51:1.000:. ./.:4:219,188:.:-0.01:1.000:. ./.:4:180,199:.:-0.37:1.000:. ./.:4:238,194:.: 0.30:1.000:. ./.:4:208,216:.: 0.20:1.000:. ./.:4:199,174:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,289:.:-1.51:1.000:. ./.:4:177,160:.:-0.90:1.000:. ./.:4:178,169:.:-0.77:1.000:. ./.:4:102,261:.:-0.57:1.000:. ./.:4:132,320:.: 0.56:1.000:. ./.:5:118,185:.:-1.33:0.993:. ./.:4:133,272:.:-0.04:1.000:. ./.:4:114,275:.:-0.24:1.000:. ./.:4:297,299:.: 2.38:1.000:. ./.:4:261,210:.: 0.80:1.000:. ./.:4:98,292:.:-0.23:1.000:. ./.:4:169,154:.:-1.08:1.000:. ./.:4:70,305:.:-0.42:1.000:. ./.:4:120,284:.:-0.05:1.000:. ./.:4:199,184:.:-0.32:1.000:. ./.:4:201,193:.:-0.18:1.000:. ./.:4:168,139:.:-1.28:1.000:. ./.:4:281,241:.: 1.45:1.000:. ./.:4:134,376:.: 1.29:1.000:. ./.:4:125,338:.: 0.70:1.000:. ./.:4:117,313:.: 0.28:1.000:. ./.:4:143,352:.: 1.10:1.000:. ./.:4:227,180:.:-0.01:1.000:. ./.:4:274,246:.: 1.42:1.000:. ./.:4:244,225:.: 0.77:1.000:. ./.:4:74,120:.:-2.71:1.000:. ./.:4:81,203:.:-1.57:1.000:. ./.:4:214,231:.: 0.47:1.000:. ./.:4:226,203:.: 0.27:1.000:. ./.:4:136,380:.: 1.37:1.000:. ./.:4:262,205:.: 0.75:1.000:. ./.:4:173,175:.:-0.76:1.000:. ./.:4:250,205:.: 0.60:1.000:. ./.:4:104,257:.:-0.60:1.000:. ./.:4:90,264:.:-0.68:1.000:. ./.:4:207,191:.:-0.13:1.000:. ./.:4:215,209:.: 0.20:1.000:. ./.:4:206,200:.:-0.03:1.000:. ./.:4:106,318:.: 0.20:1.000:. ./.:4:119,274:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,404:.:-0.05:1.000:. ./.:4:208,194:.:-0.08:1.000:. ./.:4:101,254:.:-0.67:1.000:. ./.:4:218,171:.:-0.24:1.000:. ./.:4:80,214:.:-1.45:1.000:. ./.:4:185,184:.:-0.49:1.000:. ./.:4:93,300:.:-0.19:1.000:. ./.:4:98,294:.:-0.20:1.000:. ./.:4:162,151:.:-1.20:1.000:. ./.:4:283,274:.: 1.89:1.000:. ./.:4:147,371:.: 1.40:1.000:. ./.:4:247,210:.: 0.62:1.000:. ./.:4:178,274:.: 0.56:1.000:. ./.:4:251,219:.: 0.79:1.000:. ./.:4:151,341:.: 1.07:1.000:. ./.:4:147,373:.: 1.42:1.000:. ./.:4:225,184:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,461:.: 0.67:1.000:. -chr5.1 72862547 chr5.1_072862547 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:21,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:32,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:35,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:42,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:26,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:0.944:. ./.:4:66,10:.: 1.78:1.000:. ./.:4:72,18:.: 2.68:1.000:. ./.:4:31,24:.: 0.43:1.000:. ./.:4:64,9:.: 1.58:1.000:. ./.:4:25,15:.:-0.54:1.000:. ./.:4:44,7:.: 0.17:1.000:. ./.:4:16,13:.:-1.25:1.000:. ./.:4:32,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:49,12:.: 0.81:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:34,18:.: 0.23:1.000:. ./.:4:13,3:.:-2.08:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.47:1.000:. ./.:3:34,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,6:.:-1.18:1.000:. ./.:4:45,17:.: 0.88:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.35:1.000:. ./.:4:48,16:.: 1.01:1.000:. ./.:4:32,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,26:.: 0.56:1.000:. ./.:4:44,14:.: 0.62:1.000:. ./.:4:35,24:.: 0.68:1.000:. ./.:4:29,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:35,20:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.86:1.000:. ./.:4:27,14:.:-0.47:1.000:. ./.:4:88,25:.: 4.16:1.000:. ./.:4:31,24:.: 0.43:1.000:. ./.:4:86,10:.: 3.07:1.000:. ./.:4:17,10:.:-1.38:1.000:. ./.:4:40,16:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,6:.:-0.60:1.000:. ./.:4:42,30:.: 1.52:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:49,11:.: 0.75:1.000:. ./.:4:49,18:.: 1.20:1.000:. ./.:4:46,33:.: 1.97:1.000:. ./.:4:54,15:.: 1.33:1.000:. ./.:6:38,17:.: 0.43:1.000:. ./.:4:47,24:.: 1.46:1.000:. ./.:4:30,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:24,34:.: 0.62:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,11:.:-0.54:1.000:. ./.:4:28,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:25,29:.: 0.36:1.000:. ./.:4:46,12:.: 0.62:0.996:. ./.:4:43,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:67,16:.: 2.23:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:48,8:.: 0.49:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:22,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:34,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:48,30:.: 1.91:1.000:. ./.:4:25,24:.: 0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,20:.: 0.68:1.000:. ./.:4:26,5:.:-1.12:1.000:. ./.:4:40,38:.: 1.91:1.000:. ./.:4:23,8:.:-1.12:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,14:.:-0.47:1.000:. ./.:4:17,12:.:-1.25:1.000:. ./.:4:26,21:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,9:.:-1.31:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:54,32:.: 2.42:1.000:. ./.:4:22,7:.:-1.25:1.000:. ./.:4:41,8:.: 0.04:1.000:. ./.:4:42,7:.: 0.04:1.000:. ./.:4:25,6:.:-1.12:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:22,15:.:-0.73:1.000:. ./.:4:25,6:.:-1.12:1.000:. ./.:4:36,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:16,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.86:0.999:. ./.:4:56,19:.: 1.71:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,24:.: 1.33:1.000:. ./.:4:22,13:.:-0.86:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:50,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:32,23:.: 0.43:0.999:. ./.:4:49,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:34,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:54,13:.: 1.20:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:38,11:.: 0.04:1.000:. ./.:4:35,16:.: 0.17:1.000:. ./.:4:38,22:.: 0.75:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:37,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:45,17:.: 0.88:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:26,6:.:-1.05:1.000:. ./.:4:44,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,18:.: 0.17:1.000:. ./.:5:25,5:.:-1.18:0.993:. ./.:4:37,25:.: 0.88:1.000:. ./.:4:34,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,21:.: 0.81:1.000:. ./.:4:48,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:34,17:.: 0.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:26,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:32,23:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:34,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:43,13:.: 0.49:1.000:. ./.:4:40,7:.:-0.09:1.000:. ./.:4:28,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:40,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:46,16:.: 0.88:1.000:. ./.:4:53,11:.: 1.01:1.000:. ./.:4:40,8:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,9:.:-1.25:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,13:.: 2.29:1.000:. ./.:4:40,27:.: 1.20:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:48,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:46,9:.: 0.43:1.000:. ./.:4:21,10:.:-1.12:1.000:. ./.:4:28,10:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:37,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:48,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:30,23:.: 0.30:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:51,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:24,6:.:-1.18:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.22:1.000:. ./.:4:17,10:.:-1.38:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.67:1.000:. ./.:4:11,10:.:-1.76:1.000:. ./.:4:31,13:.:-0.28:1.000:. ./.:4:38,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:40,24:.: 1.01:1.000:. ./.:4:51,14:.: 1.07:1.000:. ./.:4:22,6:.:-1.31:1.000:. ./.:4:28,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:50,22:.: 1.52:1.000:. ./.:4:33,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:36,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.56:1.000:. -chr5.1 73117851 chr5.1_073117851 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:450,32:.: 1.81:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:360,15:.: 0.65:1.000:. ./.:4:304,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:531,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:494,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:372,20:.: 0.84:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,16:.:-2.91:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:328,35:.: 0.52:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.58:0.944:. ./.:4:384,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:348,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:372,29:.: 0.94:1.000:. ./.:4:35,5:.:-2.97:1.000:. ./.:4:276,13:.:-0.28:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:402,29:.: 1.26:1.000:. ./.:4:25,10:.:-3.03:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:352,27:.: 0.70:1.000:. ./.:4:395,19:.: 1.08:1.000:. ./.:4:466,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:400,28:.: 1.23:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:277,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,2:.:-3.26:1.000:. ./.:4:65,12:.:-2.57:1.000:. ./.:3:20,2:.:-3.17:1.000:. ./.:4:394,26:.: 1.14:1.000:. ./.:4:278,24:.:-0.14:1.000:. ./.:4:314,21:.: 0.22:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:254,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:280,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:312,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:299,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:295,23:.: 0.04:1.000:. ./.:4:319,23:.: 0.30:1.000:. ./.:4:474,33:.: 2.08:1.000:. ./.:4:219,45:.:-0.55:1.000:. ./.:4:222,19:.:-0.80:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:260,16:.:-0.42:1.000:. ./.:4:326,21:.: 0.35:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:315,39:.: 0.43:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:312,24:.: 0.23:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:246,24:.:-0.48:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:228,7:.:-0.86:1.000:. ./.:4:274,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:271,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:148,21:.:-1.57:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:401,28:.: 1.24:1.000:. ./.:4:328,29:.: 0.46:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:250,26:.:-0.42:1.000:. ./.:4:293,25:.: 0.04:0.996:. ./.:4:412,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.11:0.999:. ./.:4:390,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:287,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:294,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:273,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:291,26:.: 0.03:1.000:. ./.:4:362,32:.: 0.86:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:326,25:.: 0.39:1.000:. ./.:4:307,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:163,12:.:-1.51:1.000:. ./.:4:398,40:.: 1.34:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:313,41:.: 0.43:1.000:. ./.:4:283,13:.:-0.20:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:303,24:.: 0.14:1.000:. ./.:4:280,17:.:-0.19:1.000:. ./.:4:346,22:.: 0.58:1.000:. ./.:4:278,23:.:-0.15:1.000:. ./.:4:250,25:.:-0.43:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:381,36:.: 1.11:1.000:. ./.:4:187,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:277,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:166,21:.:-1.38:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:210,24:.:-0.87:1.000:. ./.:4:260,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:356,19:.: 0.65:1.000:. ./.:4:452,37:.: 1.89:1.000:. ./.:4:396,27:.: 1.17:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:391,19:.: 1.03:1.000:. ./.:4:275,30:.:-0.10:0.999:. ./.:4:369,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:239,24:.:-0.56:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:234,21:.:-0.64:1.000:. ./.:4:328,25:.: 0.42:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:291,24:.: 0.01:1.000:. ./.:4:275,16:.:-0.25:1.000:. ./.:5:254,12:.:-0.53:0.993:. ./.:4:265,20:.:-0.32:1.000:. ./.:4:249,22:.:-0.47:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:170,18:.:-1.37:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:304,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:256,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:449,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:483,38:.: 2.23:1.000:. ./.:4:393,31:.: 1.18:1.000:. ./.:4:315,28:.: 0.31:1.000:. ./.:4:370,32:.: 0.95:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:70,2:.:-2.62:1.000:. ./.:4:392,37:.: 1.24:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:359,46:.: 0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:267,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:405,31:.: 1.31:1.000:. ./.:4:293,16:.:-0.06:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:293,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:367,33:.: 0.93:1.000:. ./.:4:238,23:.:-0.58:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:366,31:.: 0.89:1.000:. ./.:4:297,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:297,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:358,20:.: 0.69:1.000:. ./.:4:264,26:.:-0.27:1.000:. ./.:4:234,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:308,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:326,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:369,28:.: 0.89:1.000:. ./.:4:465,37:.: 2.03:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.55:1.000:. -chr5.1 73318656 chr5.1_073318656 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.82:0.944:. ./.:4:71,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:6:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.48:0.996:. ./.:4:44,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.90:0.999:. ./.:4:33,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.13:0.999:. ./.:4:48,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.82:1.000:. ./.:5:12,0:.:-1.72:0.993:. ./.:4:28,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:51,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:76,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.23:1.000:. -chr5.1 73503594 chr5.1_073503594 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:246,195:0.53: 1.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:243,64:0.26:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:267,150:0.45: 1.03:1.000:0.981 0/1/1/1:4:78,253:0.77: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,179:0.47: 1.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:443,130:0.29: 2.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:174,129:0.52:-0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:167,165:0.57: 0.04:1.000:0.942 0/0/1/1:4:262,153:0.46: 1.01:1.000:0.989 0/1/1/1:4:30,89:0.76:-2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,83:0.47:-1.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:282,84:0.29: 0.44:1.000:0.992 0/1/1/1:4:81,250:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:356,90:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:247,139:0.45: 0.67:1.000:0.982 0/1/1/1:4:93,255:0.74: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:324,163:0.42: 1.85:0.944:0.915 0/0/0/1:4:246,82:0.31: 0.00:1.000:0.965 0/1/1/1:4:123,322:0.74: 1.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:107,304:0.75: 0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,104:0.76:-2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,171:0.59: 0.00:1.000:0.868 0/1/1/1:4:94,298:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,242:0.62: 1.21:1.000:0.599 0/0/1/1:4:113,55:0.41:-1.87:1.000:0.871 0/0/1/1:4:337,179:0.44: 2.19:1.000:0.959 0/0/1/1:4:188,173:0.56: 0.38:1.000:0.969 0/0/1/1:4:237,160:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:400,98:0.25: 1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,208:0.58: 0.96:1.000:0.921 0/0/1/1:4:303,170:0.45: 1.69:1.000:0.981 0/1/1/1:4:78,207:0.74:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,18:0.15:-2.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:150,37:0.25:-1.64:1.000:0.999 0/0/1:3:63,14:0.23:-2.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:283,160:0.45: 1.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:167,181:0.59: 0.23:1.000:0.873 1/1/1/1:4:1,339:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,213:0.74:-0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,388:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,219:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:220,140:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,244:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:194,118:0.47:-0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:83,247:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,134:0.55:-0.50:1.000:0.978 0/0/1/1:4:303,183:0.47: 1.84:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,654:1.00: 3.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,194:0.73:-0.64:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,316:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,115:0.46:-0.14:1.000:0.985 0/1/1/1:4:87,280:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,119:0.47:-0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:81,247:0.76: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,280:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,247:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,156:0.59:-0.36:1.000:0.850 0/1/1/1:4:97,237:0.73: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:285,72:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:105,160:0.65:-0.74:1.000:0.898 0/1/1/1:4:78,218:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,109:0.53:-0.93:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,255:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:289,86:0.29: 0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:88,255:0.75: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,126:0.46: 0.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:182,98:0.44:-0.56:1.000:0.966 0/1/1/1:4:78,242:0.76:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,324:1.00:-0.05:0.996:1.000 0/0/0/0:4:295,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,248:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,94:0.50:-1.06:0.999:0.997 0/1/1/1:4:90,217:0.72:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,253:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,129:0.56:-0.72:1.000:0.962 0/0/1/1:4:192,117:0.47:-0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,190:0.75:-0.85:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,272:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,190:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,79:0.25: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,111:0.63:-1.56:1.000:0.516 0/1/1/1:4:54,230:0.82:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,241:0.78:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,192:0.60: 0.30:1.000:0.747 0/1/1/1:4:92,257:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:259,154:0.47: 0.99:1.000:0.991 0/0/1/1:4:122,113:0.56:-1.09:1.000:0.967 0/0/1/1:4:182,106:0.46:-0.47:1.000:0.989 0/0/0/1:4:247,68:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,199:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,106:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,183:0.62: 0.00:1.000:0.619 0/1/1/1:4:72,235:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,109:0.46:-0.39:1.000:0.990 0/0/0/1:4:331,62:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,198:0.72:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,153:0.76:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,187:0.80:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,60:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,278:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,99:0.53:-1.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:91,211:0.72:-0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,155:0.74:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,118:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:204,95:0.40:-0.34:0.999:0.783 0/1/1/1:4:57,179:0.77:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,214:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,275:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:122,262:0.71: 0.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:227,149:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,130:0.59:-0.96:1.000:0.834 0/1/1/1:4:121,346:0.75: 1.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,187:0.75:-0.89:0.999:0.999 0/1/1/1:4:76,246:0.77:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,120:0.59:-1.18:1.000:0.833 0/0/1/1:4:162,142:0.55:-0.28:1.000:0.980 0/1/1/1:4:131,175:0.63:-0.26:1.000:0.514 0/1/1/1:4:112,193:0.67:-0.27:1.000:0.924 0/0/1/1:4:217,131:0.47: 0.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:64,160:0.73:-1.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,202:0.71:-0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:190,121:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:324,72:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:294,180:0.48: 1.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:204,137:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,210:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,217:0.77:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,55:0.31:-1.26:1.000:0.965 0/0/1/1:4:142,116:0.54:-0.82:1.000:0.989 0/1/1/1:4:50,184:0.79:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,102:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,158:0.56: 0.02:1.000:0.970 0/0/1/1/1:5:171,132:0.53:-0.29:0.993:0.745 0/1/1/1:4:67,210:0.77:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,210:0.76:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:419,121:0.28: 2.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,242:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,125:0.55:-0.74:1.000:0.976 0/0/0/1:4:255,59:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,124:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,202:0.77:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,129:0.46: 0.25:1.000:0.989 0/1/1/1:4:86,209:0.73:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,143:0.61:-0.78:1.000:0.705 0/0/0/1:4:403,95:0.24: 1.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,304:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,231:0.76:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,222:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:97,270:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,220:0.80:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,396:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,233:0.77:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,79:0.72:-2.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:217,42:0.20:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,258:0.74: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,234:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,288:0.77: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:207,308:0.65: 2.17:1.000:0.748 0/1/1/1:4:76,188:0.73:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:251,168:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:231,138:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,215:0.78:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,155:0.53: 0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:272,141:0.43: 0.99:1.000:0.943 0/1/1/1:4:97,305:0.77: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,248:0.81:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,216:0.73:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,153:0.57:-0.26:1.000:0.936 0/1/1/1:4:87,203:0.72:-0.45:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,297:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,124:0.46: 0.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:204,110:0.44:-0.17:1.000:0.967 0/1/1/1:4:167,239:0.64: 0.91:1.000:0.671 0/1/1/1:4:127,172:0.63:-0.34:1.000:0.546 0/1/1/1:4:64,215:0.78:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,209:0.73:-0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:350,214:0.48: 2.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:100,269:0.74: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,242:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,134:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:324,192:0.47: 2.19:1.000:0.991 0/1/1/1:4:142,298:0.70: 1.30:1.000:0.988 0/1/1/1:4:95,312:0.77: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,178:0.73:-0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:160,167:0.58:-0.01:1.000:0.907 -chr5.1 73674771 chr5.1_073674771 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:285,88:.: 0.56:1.000:. ./.:4:233,66:.:-0.27:1.000:. ./.:4:230,77:.:-0.18:1.000:. ./.:4:280,85:.: 0.47:1.000:. ./.:4:335,82:.: 1.06:1.000:. ./.:4:346,93:.: 1.31:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:309,87:.: 0.82:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:50,3:.:-3.05:1.000:. ./.:4:56,11:.:-2.89:1.000:. ./.:4:296,91:.: 0.72:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:343,77:.: 1.09:1.000:. ./.:4:296,79:.: 0.58:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:314,112:.: 1.16:0.944:. ./.:4:342,88:.: 1.20:1.000:. ./.:4:391,101:.: 1.90:1.000:. ./.:4:322,97:.: 1.08:1.000:. ./.:4:36,14:.:-3.09:1.000:. ./.:4:287,70:.: 0.38:1.000:. ./.:4:339,91:.: 1.20:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,5:.:-3.29:1.000:. ./.:4:304,104:.: 0.96:1.000:. ./.:4:336,103:.: 1.31:1.000:. ./.:4:275,92:.: 0.49:1.000:. ./.:4:348,71:.: 1.08:1.000:. ./.:4:321,94:.: 1.03:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:244,80:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,6:.:-3.27:1.000:. ./.:4:64,13:.:-2.78:1.000:. ./.:3:23,0:.:-3.39:1.000:. ./.:4:408,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:314,81:.: 0.81:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:297,88:.: 0.70:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:292,69:.: 0.43:1.000:. ./.:4:278,83:.: 0.43:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:229,60:.:-0.39:1.000:. ./.:4:267,53:.:-0.04:1.000:. ./.:4:273,73:.: 0.26:1.000:. ./.:4:148,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:224,61:.:-0.43:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:454,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:225,42:.:-0.64:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:268,71:.: 0.18:1.000:. ./.:4:279,57:.: 0.14:1.000:. ./.:4:227,48:.:-0.55:1.000:. ./.:4:292,79:.: 0.54:1.000:. ./.:6:231,15:.:-0.87:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:278,70:.: 0.28:1.000:. ./.:4:266,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:207,66:.:-0.57:1.000:. ./.:4:272,72:.: 0.23:1.000:. ./.:4:266,69:.: 0.13:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.70:0.996:. ./.:4:170,114:.:-0.44:1.000:. ./.:4:270,54:.: 0.01:1.000:. ./.:4:235,55:.:-0.38:0.999:. ./.:4:316,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:318,77:.: 0.81:1.000:. ./.:4:229,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:205,58:.:-0.68:1.000:. ./.:4:216,58:.:-0.56:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:194,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:273,70:.: 0.22:1.000:. ./.:4:161,51:.:-1.26:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:240,37:.:-0.52:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:262,46:.:-0.17:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:194,38:.:-1.03:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:316,65:.: 0.65:1.000:. ./.:4:224,68:.:-0.35:1.000:. ./.:4:174,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:283,43:.: 0.03:1.000:. ./.:4:255,61:.:-0.08:1.000:. ./.:4:253,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:238,78:.:-0.08:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:244,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:230,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:279,41:.:-0.04:1.000:. ./.:4:372,135:.: 2.07:1.000:. ./.:4:209,37:.:-0.87:0.999:. ./.:4:454,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:218,63:.:-0.48:1.000:. ./.:4:321,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:170,46:.:-1.21:1.000:. ./.:4:212,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:200,38:.:-0.96:1.000:. ./.:4:304,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:271,101:.: 0.55:1.000:. ./.:4:213,54:.:-0.64:1.000:. ./.:4:403,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:159,106:.:-0.66:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:211,43:.:-0.78:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:258,80:.: 0.17:1.000:. ./.:5:203,32:.:-1.00:0.993:. ./.:4:306,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:190,46:.:-0.99:1.000:. ./.:4:385,89:.: 1.70:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:185,27:.:-1.26:1.000:. ./.:4:229,53:.:-0.47:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:244,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:422,71:.: 1.92:1.000:. ./.:4:326,98:.: 1.14:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:209,84:.:-0.34:1.000:. ./.:4:332,110:.: 1.34:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:286,79:.: 0.47:1.000:. ./.:4:38,5:.:-3.16:1.000:. ./.:4:216,65:.:-0.48:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:289,62:.: 0.31:1.000:. ./.:4:312,69:.: 0.65:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:241,68:.:-0.16:1.000:. ./.:4:318,86:.: 0.91:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:214,77:.:-0.36:1.000:. ./.:4:334,81:.: 1.03:1.000:. ./.:4:282,68:.: 0.30:1.000:. ./.:4:323,100:.: 1.13:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:261,68:.: 0.06:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:365,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:231,55:.:-0.42:1.000:. ./.:4:497,1:.: 1.97:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:312,95:.: 0.94:1.000:. ./.:4:299,50:.: 0.29:1.000:. ./.:4:344,80:.: 1.14:1.000:. ./.:4:494,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:317,83:.: 0.87:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:230,78:.:-0.17:1.000:. -chr5.1 73938512 chr5.1_073938512 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:608,632:.: 0.73:1.000:. ./.:4:428,525:.:-0.71:1.000:. ./.:4:498,637:.: 0.20:1.000:. ./.:4:481,634:.: 0.10:1.000:. ./.:4:617,753:.: 1.38:1.000:. ./.:4:549,792:.: 1.23:1.000:. ./.:4:464,610:.:-0.10:1.000:. ./.:4:485,642:.: 0.16:1.000:. ./.:4:505,636:.: 0.23:1.000:. ./.:4:253,318:.:-2.62:1.000:. ./.:4:287,356:.:-2.26:1.000:. ./.:4:543,638:.: 0.43:1.000:. ./.:4:431,601:.:-0.31:1.000:. ./.:4:556,685:.: 0.73:1.000:. ./.:4:461,504:.:-0.65:1.000:. ./.:4:456,660:.: 0.11:1.000:. ./.:4:574,705:.: 0.92:0.944:. ./.:4:523,629:.: 0.29:1.000:. ./.:4:579,905:.: 1.95:1.000:. ./.:4:535,821:.: 1.31:1.000:. ./.:4:262,337:.:-2.48:1.000:. ./.:4:434,589:.:-0.36:1.000:. ./.:4:506,729:.: 0.70:1.000:. ./.:4:562,608:.: 0.38:1.000:. ./.:4:192,342:.:-2.80:1.000:. ./.:4:639,685:.: 1.15:1.000:. ./.:4:454,665:.: 0.12:1.000:. ./.:4:488,634:.: 0.14:1.000:. ./.:4:622,755:.: 1.41:1.000:. ./.:4:577,742:.: 1.12:1.000:. ./.:4:584,781:.: 1.35:1.000:. ./.:4:375,542:.:-0.89:1.000:. ./.:4:92,177:.:-4.13:1.000:. ./.:4:293,308:.:-2.47:1.000:. ./.:3:72,151:.:-4.36:1.000:. ./.:4:512,646:.: 0.32:1.000:. ./.:4:491,621:.: 0.09:1.000:. ./.:4:542,684:.: 0.66:1.000:. ./.:4:535,752:.: 0.96:1.000:. ./.:4:468,769:.: 0.71:1.000:. ./.:4:458,744:.: 0.54:1.000:. ./.:4:460,674:.: 0.20:1.000:. ./.:4:542,763:.: 1.05:1.000:. ./.:4:459,612:.:-0.12:1.000:. ./.:4:602,874:.: 1.91:1.000:. ./.:4:474,565:.:-0.28:1.000:. ./.:4:608,710:.: 1.12:1.000:. ./.:4:324,625:.:-0.73:1.000:. ./.:4:376,624:.:-0.47:1.000:. ./.:4:543,812:.: 1.30:1.000:. ./.:4:479,626:.: 0.05:1.000:. ./.:4:488,693:.: 0.43:1.000:. ./.:4:386,568:.:-0.70:1.000:. ./.:4:493,665:.: 0.32:1.000:. ./.:4:375,548:.:-0.86:1.000:. ./.:4:509,751:.: 0.83:1.000:. ./.:4:388,506:.:-1.00:1.000:. ./.:4:545,899:.: 1.75:1.000:. ./.:4:486,647:.: 0.19:1.000:. ./.:6:407,608:.:-0.40:1.000:. ./.:4:434,654:.:-0.03:1.000:. ./.:4:379,587:.:-0.64:1.000:. ./.:4:348,817:.: 0.35:1.000:. ./.:4:485,762:.: 0.76:1.000:. ./.:4:505,714:.: 0.62:1.000:. ./.:4:482,733:.: 0.60:1.000:. ./.:4:505,677:.: 0.44:1.000:. ./.:4:421,588:.:-0.43:1.000:. ./.:4:550,711:.: 0.83:0.996:. ./.:4:501,554:.:-0.20:1.000:. ./.:4:561,791:.: 1.29:1.000:. ./.:4:406,563:.:-0.63:0.999:. ./.:4:561,805:.: 1.36:1.000:. ./.:4:434,588:.:-0.36:1.000:. ./.:4:493,597:.:-0.02:1.000:. ./.:4:372,599:.:-0.62:1.000:. ./.:4:479,666:.: 0.25:1.000:. ./.:4:524,640:.: 0.35:1.000:. ./.:4:452,666:.: 0.12:1.000:. ./.:4:552,723:.: 0.90:1.000:. ./.:4:409,532:.:-0.77:1.000:. ./.:4:572,755:.: 1.16:1.000:. ./.:4:498,663:.: 0.33:1.000:. ./.:4:360,533:.:-1.01:1.000:. ./.:4:508,685:.: 0.49:1.000:. ./.:4:592,714:.: 1.06:1.000:. ./.:4:301,429:.:-1.82:1.000:. ./.:4:385,588:.:-0.61:1.000:. ./.:4:426,618:.:-0.25:1.000:. ./.:4:443,524:.:-0.64:1.000:. ./.:4:422,571:.:-0.51:1.000:. ./.:4:462,615:.:-0.09:1.000:. ./.:4:484,670:.: 0.30:1.000:. ./.:4:444,498:.:-0.76:1.000:. ./.:4:566,674:.: 0.73:1.000:. ./.:4:477,697:.: 0.40:1.000:. ./.:4:429,561:.:-0.52:1.000:. ./.:4:433,569:.:-0.46:1.000:. ./.:4:516,710:.: 0.66:1.000:. ./.:4:487,716:.: 0.54:1.000:. ./.:4:418,687:.: 0.05:1.000:. ./.:4:453,697:.: 0.28:1.000:. ./.:4:340,512:.:-1.21:1.000:. ./.:4:567,678:.: 0.75:1.000:. ./.:4:363,589:.:-0.71:0.999:. ./.:4:368,543:.:-0.92:1.000:. ./.:4:414,583:.:-0.49:1.000:. ./.:4:583,669:.: 0.79:1.000:. ./.:4:551,832:.: 1.45:1.000:. ./.:4:470,557:.:-0.34:1.000:. ./.:4:388,559:.:-0.74:1.000:. ./.:4:700,797:.: 2.02:1.000:. ./.:4:479,666:.: 0.25:0.999:. ./.:4:577,628:.: 0.55:1.000:. ./.:4:395,535:.:-0.82:1.000:. ./.:4:555,755:.: 1.08:1.000:. ./.:4:478,623:.: 0.03:1.000:. ./.:4:453,605:.:-0.18:1.000:. ./.:4:396,688:.:-0.05:1.000:. ./.:4:366,547:.:-0.91:1.000:. ./.:4:412,610:.:-0.36:1.000:. ./.:4:450,633:.:-0.06:1.000:. ./.:4:545,664:.: 0.57:1.000:. ./.:4:562,642:.: 0.55:1.000:. ./.:4:446,664:.: 0.08:1.000:. ./.:4:482,731:.: 0.59:1.000:. ./.:4:463,702:.: 0.35:1.000:. ./.:4:428,552:.:-0.57:1.000:. ./.:4:347,491:.:-1.28:1.000:. ./.:4:411,563:.:-0.60:1.000:. ./.:4:450,577:.:-0.34:1.000:. ./.:4:384,597:.:-0.57:1.000:. ./.:5:379,438:.:-1.39:0.993:. ./.:4:431,722:.: 0.29:1.000:. ./.:4:401,568:.:-0.63:1.000:. ./.:4:614,822:.: 1.71:1.000:. ./.:4:432,621:.:-0.21:1.000:. ./.:4:420,617:.:-0.29:1.000:. ./.:4:494,608:.: 0.04:1.000:. ./.:4:427,570:.:-0.49:1.000:. ./.:4:469,632:.: 0.03:1.000:. ./.:4:502,733:.: 0.70:1.000:. ./.:4:447,663:.: 0.08:1.000:. ./.:4:353,464:.:-1.39:1.000:. ./.:4:551,773:.: 1.15:1.000:. ./.:4:632,765:.: 1.52:1.000:. ./.:4:567,651:.: 0.62:1.000:. ./.:4:446,568:.:-0.40:1.000:. ./.:4:581,666:.: 0.76:1.000:. ./.:4:438,586:.:-0.35:1.000:. ./.:4:560,773:.: 1.19:1.000:. ./.:4:398,586:.:-0.55:1.000:. ./.:4:262,234:.:-2.99:1.000:. ./.:4:453,487:.:-0.77:1.000:. ./.:4:409,655:.:-0.15:1.000:. ./.:4:447,633:.:-0.07:1.000:. ./.:4:532,779:.: 1.08:1.000:. ./.:4:603,712:.: 1.10:1.000:. ./.:4:352,537:.:-1.03:1.000:. ./.:4:519,677:.: 0.51:1.000:. ./.:4:443,533:.:-0.59:1.000:. ./.:4:422,532:.:-0.70:1.000:. ./.:4:410,624:.:-0.30:1.000:. ./.:4:442,659:.: 0.03:1.000:. ./.:4:417,631:.:-0.23:1.000:. ./.:4:477,551:.:-0.33:1.000:. ./.:4:372,588:.:-0.67:1.000:. ./.:4:490,616:.: 0.06:1.000:. ./.:4:429,633:.:-0.16:1.000:. ./.:4:470,577:.:-0.24:1.000:. ./.:4:387,565:.:-0.71:1.000:. ./.:4:362,438:.:-1.47:1.000:. ./.:4:507,700:.: 0.56:1.000:. ./.:4:468,545:.:-0.41:1.000:. ./.:4:447,556:.:-0.46:1.000:. ./.:4:398,620:.:-0.38:1.000:. ./.:4:513,749:.: 0.84:1.000:. ./.:4:551,702:.: 0.79:1.000:. ./.:4:442,553:.:-0.50:1.000:. ./.:4:413,584:.:-0.49:1.000:. ./.:4:540,685:.: 0.65:1.000:. ./.:4:565,808:.: 1.39:1.000:. ./.:4:574,815:.: 1.48:1.000:. ./.:4:370,572:.:-0.76:1.000:. ./.:4:509,589:.: 0.02:1.000:. -chr5.1 74145342 chr5.1_074145342 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:19,77:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.35:1.000:. ./.:4:12,62:.: 0.38:1.000:. ./.:4:18,69:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,98:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.95:1.000:. ./.:4:16,57:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:2,3:.:-2.79:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.74:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.25:1.000:. ./.:4:20,53:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.57:0.944:. ./.:4:19,58:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,91:.: 1.17:1.000:. ./.:4:16,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.84:1.000:. ./.:4:15,61:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.12:1.000:. ./.:4:7,50:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.84:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.44:1.000:. ./.:4:13,57:.: 0.20:1.000:. ./.:4:17,62:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.58:1.000:. ./.:4:17,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.38:1.000:. ./.:4:9,31:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,3:.:-2.70:1.000:. ./.:3:0,3:.:-2.88:1.000:. ./.:4:19,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:13,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,63:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:22,41:.:-0.12:1.000:. ./.:4:16,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.02:1.000:. ./.:4:12,38:.:-0.72:1.000:. ./.:4:15,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:16,68:.: 0.84:1.000:. ./.:4:24,64:.: 1.03:1.000:. ./.:4:21,97:.: 2.41:1.000:. ./.:4:2,12:.:-2.38:1.000:. ./.:4:11,33:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.78:1.000:. ./.:4:12,31:.:-1.04:1.000:. ./.:4:22,80:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.38:1.000:. ./.:4:19,54:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.11:1.000:. ./.:4:14,31:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.38:1.000:. ./.:4:12,34:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.26:1.000:. ./.:6:5,46:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,54:.:-0.08:1.000:. ./.:4:12,44:.:-0.44:1.000:. ./.:4:16,41:.:-0.40:1.000:. ./.:4:11,30:.:-1.13:1.000:. ./.:4:21,67:.: 1.03:1.000:. ./.:4:16,47:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.27:1.000:. ./.:4:11,54:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,39:.:-0.72:0.996:. ./.:4:0,74:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,19:.:-2.15:0.999:. ./.:4:0,42:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.67:1.000:. ./.:4:6,36:.:-1.09:1.000:. ./.:4:10,36:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,64:.: 0.71:1.000:. ./.:4:13,56:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,57:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.29:1.000:. ./.:4:12,37:.:-0.77:1.000:. ./.:4:12,45:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.71:1.000:. ./.:4:9,27:.:-1.36:1.000:. ./.:4:16,58:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.49:1.000:. ./.:4:18,40:.:-0.35:1.000:. ./.:4:6,28:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:18,66:.: 0.84:1.000:. ./.:4:15,34:.:-0.77:1.000:. ./.:4:21,57:.: 0.57:1.000:. ./.:4:11,43:.:-0.54:1.000:. ./.:4:9,37:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.40:1.000:. ./.:4:19,70:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.50:1.000:. ./.:4:11,44:.:-0.49:1.000:. ./.:4:12,51:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.40:0.999:. ./.:4:14,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,43:.:-0.12:1.000:. ./.:4:21,58:.: 0.61:1.000:. ./.:4:15,72:.: 0.98:1.000:. ./.:4:15,73:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.57:1.000:. ./.:4:30,76:.: 1.86:1.000:. ./.:4:13,45:.:-0.35:0.999:. ./.:4:0,87:.: 0.98:1.000:. ./.:4:10,41:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,30:.:-1.27:1.000:. ./.:4:16,58:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,45:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,65:.: 1.26:1.000:. ./.:5:5,51:.:-0.44:0.993:. ./.:4:14,44:.:-0.35:1.000:. ./.:4:10,65:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,107:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.63:1.000:. ./.:4:18,65:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:10,59:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,43:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,99:.: 1.53:1.000:. ./.:4:17,65:.: 0.75:1.000:. ./.:4:22,60:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.31:1.000:. ./.:4:18,48:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,94:.: 1.30:1.000:. ./.:4:1,90:.: 1.17:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.84:1.000:. ./.:4:14,48:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.61:1.000:. ./.:4:29,57:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.94:1.000:. ./.:4:15,61:.: 0.48:1.000:. ./.:4:8,43:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,88:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.90:1.000:. ./.:4:14,44:.:-0.35:1.000:. ./.:4:9,47:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.43:1.000:. ./.:4:13,49:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:10,35:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:18,81:.: 1.53:1.000:. ./.:4:15,30:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.84:1.000:. ./.:4:11,72:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.35:1.000:. ./.:4:19,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:17,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.35:1.000:. -chr5.1 74362899 chr5.1_074362899 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:278,0:.: 0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:244,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:240,0:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:272,0:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,231:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:312,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:238,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:265,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:211,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.03:1.000:. ./.:3:25,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:244,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:254,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:212,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:275,0:.: 0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:174,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:156,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:145,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:266,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.15:0.996:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:219,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:241,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:223,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:505,0:.: 3.66:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:233,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:194,1:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:266,0:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:214,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:188,2:.:-0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:167,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:256,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:330,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:311,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:1,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:171,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:203,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.48:1.000:. ./.:5:154,0:.:-0.80:0.993:. ./.:4:231,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:202,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:221,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:378,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:284,0:.: 0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:322,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:222,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:228,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:203,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:166,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:227,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:275,0:.: 0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:298,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 74618584 chr5.1_074618584 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:76,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:28,36:.:-0.49:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:170,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:7,4:.:-1.86:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:60,27:.: 0.10:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:66,39:.: 0.57:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.50:0.944:. ./.:4:156,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:120,41:.: 2.01:1.000:. ./.:4:85,57:.: 1.52:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:72,25:.: 0.36:1.000:. ./.:4:81,37:.: 0.90:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:79,47:.: 1.11:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:74,32:.: 0.59:1.000:. ./.:4:35,30:.:-0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,35:.: 0.70:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,27:.: 0.54:1.000:. ./.:4:39,38:.:-0.16:1.000:. ./.:4:47,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,29:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,28:.: 0.36:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:41,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:94,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:44,35:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,34:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.13:1.000:. ./.:4:22,23:.:-0.98:1.000:. ./.:4:53,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:65,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:60,25:.: 0.05:1.000:. ./.:6:23,10:.:-1.29:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.70:1.000:. ./.:4:58,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,22:.:-0.88:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.65:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,18:.:-0.03:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.11:0.996:. ./.:4:128,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:49,24:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.03:0.999:. ./.:4:69,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:127,43:.: 2.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:30,24:.:-0.75:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:23,15:.:-1.16:1.000:. ./.:4:62,26:.: 0.13:1.000:. ./.:4:43,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.44:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:44,17:.:-0.57:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.59:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:10,17:.:-1.45:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:61,14:.:-0.21:0.999:. ./.:4:42,19:.:-0.57:1.000:. ./.:4:33,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:99,40:.: 1.44:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.08:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:38,17:.:-0.72:0.999:. ./.:4:105,15:.: 0.95:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:66,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:63,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:44,19:.:-0.52:1.000:. ./.:4:51,28:.:-0.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:181,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:41,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.59:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,16:.:-0.18:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:68,33:.: 0.46:1.000:. ./.:5:52,0:.:-0.80:0.993:. ./.:4:64,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:36,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:172,55:.: 3.71:1.000:. ./.:4:57,23:.:-0.08:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:43,20:.:-0.52:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:95,34:.: 1.19:1.000:. ./.:4:50,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:141,35:.: 2.40:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:114,35:.: 1.70:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:97,51:.: 1.68:1.000:. ./.:4:79,41:.: 0.95:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,38:.: 1.42:1.000:. ./.:4:107,35:.: 1.52:1.000:. ./.:4:43,40:.: 0.00:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:60,45:.: 0.57:1.000:. ./.:4:88,40:.: 1.16:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:105,29:.: 1.31:1.000:. ./.:4:83,42:.: 1.08:1.000:. ./.:4:109,53:.: 2.04:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:36,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:93,42:.: 1.34:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:39,24:.:-0.52:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:71,27:.: 0.39:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.51:1.000:. ./.:4:99,52:.: 1.75:1.000:. ./.:4:80,27:.: 0.62:1.000:. ./.:4:84,31:.: 0.82:1.000:. ./.:4:113,30:.: 1.55:1.000:. ./.:4:67,37:.: 0.54:1.000:. ./.:4:112,49:.: 2.01:1.000:. ./.:4:42,50:.: 0.23:1.000:. ./.:4:60,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.31:1.000:. -chr5.1 74713717 chr5.1_074713717 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:478,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:465,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:384,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:94,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:379,1:.: 0.38:0.944:. ./.:4:363,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:85,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:437,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.80:1.000:. ./.:4:108,0:.:-2.92:1.000:. ./.:3:29,0:.:-3.88:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:449,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:176,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:332,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.09:1.000:. ./.:6:293,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.61:0.996:. ./.:4:360,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.23:0.999:. ./.:4:371,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:438,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:402,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:305,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:360,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:491,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:517,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:459,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:396,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.19:1.000:. ./.:5:291,0:.:-0.70:0.993:. ./.:4:421,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:477,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:437,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:262,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:487,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:468,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:104,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:404,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:308,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.44:1.000:. -chr5.1 74882340 chr5.1_074882340 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,9:.: 1.92:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.65:0.944:. ./.:4:23,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:57,1:.: 3.66:1.000:. ./.:4:39,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:43,0:.: 2.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.19:1.000:. ./.:3:0,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:27,3:.: 1.10:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.64:1.000:. ./.:6:11,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.20:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.38:0.996:. ./.:4:31,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:0,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:26,3:.: 1.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:14,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:36,3:.: 1.92:0.999:. ./.:4:11,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:32,2:.: 1.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.19:1.000:. ./.:5:9,3:.:-0.55:0.993:. ./.:4:6,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:23,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:20,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:36,4:.: 2.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:37,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,1:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:31,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.37:1.000:. -chr5.1 75050076 chr5.1_075050076 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:210,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.32:0.944:. ./.:4:199,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.93:1.000:. ./.:3:30,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:6:124,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.63:0.996:. ./.:4:165,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:220,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:147,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.85:0.999:. ./.:4:231,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.12:1.000:. ./.:5:136,0:.:-0.87:0.993:. ./.:4:185,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:278,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:234,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:270,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.17:1.000:. -chr5.1 75129771 chr5.1_075129771 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:0.944:. ./.:4:18,0:.: 7.87:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:0.999:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,3:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,3:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,3:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,3:.: 0.66:1.000:. ./.:5:0,2:.: 0.18:0.993:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr5.1 75545228 chr5.1_075545228 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:96,33:.: 0.40:1.000:. ./.:4:128,22:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,40:.: 0.91:1.000:. ./.:4:86,21:.:-0.08:1.000:. ./.:4:146,17:.: 1.15:1.000:. ./.:4:203,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:99,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,6:.: 0.56:1.000:. ./.:4:123,30:.: 0.93:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:66,44:.:-0.02:1.000:. ./.:4:136,19:.: 0.97:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:117,16:.: 0.49:1.000:. ./.:4:106,34:.: 0.64:1.000:. ./.:4:147,26:.: 1.37:0.944:. ./.:4:150,27:.: 1.46:1.000:. ./.:4:166,24:.: 1.74:1.000:. ./.:4:113,24:.: 0.58:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.97:1.000:. ./.:4:127,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:147,24:.: 1.33:1.000:. ./.:4:43,54:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:143,26:.: 1.28:1.000:. ./.:4:169,6:.: 1.41:1.000:. ./.:4:102,20:.: 0.25:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:130,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:165,34:.: 1.94:1.000:. ./.:4:74,22:.:-0.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,20:.:-0.10:1.000:. ./.:4:135,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:54,39:.:-0.39:1.000:. ./.:4:96,17:.: 0.05:1.000:. ./.:4:49,62:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,18:.:-0.63:1.000:. ./.:4:125,27:.: 0.91:1.000:. ./.:4:72,21:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:106,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,23:.: 0.45:1.000:. ./.:4:22,43:.:-1.00:1.000:. ./.:4:62,26:.:-0.50:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.89:1.000:. ./.:4:57,12:.:-0.92:1.000:. ./.:4:114,33:.: 0.80:1.000:. ./.:4:103,8:.: 0.01:1.000:. ./.:4:81,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:93,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:69,29:.:-0.28:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.67:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.36:1.000:. ./.:6:48,6:.:-1.25:1.000:. ./.:4:61,13:.:-0.81:1.000:. ./.:4:121,5:.: 0.34:1.000:. ./.:4:33,20:.:-1.27:1.000:. ./.:4:89,6:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,25:.:-0.19:1.000:. ./.:4:58,18:.:-0.76:1.000:. ./.:4:68,12:.:-0.67:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.74:1.000:. ./.:4:25,36:.:-1.09:0.996:. ./.:4:145,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:79,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:68,16:.:-0.59:0.999:. ./.:4:43,60:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,14:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,23:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,20:.:-0.32:1.000:. ./.:4:51,18:.:-0.92:1.000:. ./.:4:35,17:.:-1.29:1.000:. ./.:4:61,21:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,6:.:-0.32:1.000:. ./.:4:46,21:.:-0.96:1.000:. ./.:4:66,17:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:91,36:.: 0.36:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.17:1.000:. ./.:4:86,17:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:86,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:87,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:46,19:.:-1.00:1.000:. ./.:4:70,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:78,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:65,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:103,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,18:.:-0.87:1.000:. ./.:4:43,5:.:-1.38:1.000:. ./.:4:34,21:.:-1.22:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:113,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:67,10:.:-0.74:1.000:. ./.:4:64,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:41,5:.:-1.42:1.000:. ./.:4:70,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:71,11:.:-0.63:0.999:. ./.:4:51,20:.:-0.87:1.000:. ./.:4:25,22:.:-1.40:1.000:. ./.:4:95,22:.: 0.14:1.000:. ./.:4:110,16:.: 0.34:1.000:. ./.:4:83,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,29:.: 0.80:1.000:. ./.:4:55,5:.:-1.11:0.999:. ./.:4:101,26:.: 0.36:1.000:. ./.:4:72,3:.:-0.78:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:43,11:.:-1.25:1.000:. ./.:4:57,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,12:.:-0.37:1.000:. ./.:4:60,6:.:-0.98:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:79,13:.:-0.41:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:168,28:.: 1.88:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:93,10:.:-0.17:1.000:. ./.:4:85,6:.:-0.43:1.000:. ./.:4:68,11:.:-0.70:1.000:. ./.:4:66,6:.:-0.85:1.000:. ./.:4:76,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:71,14:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,6:.: 1.06:1.000:. ./.:5:72,9:.:-0.65:0.993:. ./.:4:49,12:.:-1.09:1.000:. ./.:4:79,13:.:-0.41:1.000:. ./.:4:269,1:.: 3.50:1.000:. ./.:4:113,14:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:51,11:.:-1.07:1.000:. ./.:4:65,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:93,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:136,21:.: 1.02:1.000:. ./.:4:68,8:.:-0.76:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:106,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:86,22:.:-0.06:1.000:. ./.:4:133,21:.: 0.95:1.000:. ./.:4:125,32:.: 1.02:1.000:. ./.:4:114,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:97,40:.: 0.58:1.000:. ./.:4:142,15:.: 1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:92,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:154,24:.: 1.48:1.000:. ./.:4:140,14:.: 0.95:1.000:. ./.:4:108,26:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,36:.: 0.49:1.000:. ./.:4:132,18:.: 0.86:1.000:. ./.:4:150,15:.: 1.19:1.000:. ./.:4:68,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:100,18:.: 0.16:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:149,15:.: 1.17:1.000:. ./.:4:207,27:.: 2.71:1.000:. ./.:4:89,25:.: 0.07:1.000:. ./.:4:69,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:105,33:.: 0.60:1.000:. ./.:4:124,16:.: 0.64:1.000:. ./.:4:41,30:.:-0.87:1.000:. ./.:4:117,26:.: 0.71:1.000:. ./.:4:82,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:82,44:.: 0.34:1.000:. ./.:4:47,26:.:-0.83:1.000:. ./.:4:71,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:178,38:.: 2.32:1.000:. ./.:4:102,25:.: 0.36:1.000:. ./.:4:159,35:.: 1.83:1.000:. ./.:4:121,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:155,16:.: 1.33:1.000:. ./.:4:137,31:.: 1.26:1.000:. ./.:4:97,23:.: 0.20:1.000:. ./.:4:120,15:.: 0.53:1.000:. ./.:4:96,31:.: 0.36:1.000:. -chr5.1 75647268 chr5.1_075647268 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:21,14:0.43:-0.84:1.000:0.939 0/1/1/1:4:13,25:0.63:-0.61:1.000:0.588 0/0/1/1:4:26,15:0.40:-0.38:1.000:0.745 0/0/0/1:4:38,10:0.25: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,32:0.50: 1.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,55:0.77: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.56:-1.76:1.000:0.959 0/0/1/1:4:22,17:0.46:-0.53:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,22:0.53:-0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:29,9:0.27:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,17:0.55:-1.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:16,22:0.57:-0.61:1.000:0.934 0/0/0/1:4:42,8:0.19: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,26:0.64:-0.53:1.000:0.669 0/0/1/1:4:20,18:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,14:0.27: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,18:0.39: 0.31:0.944:0.686 0/1/1/1:4:14,39:0.69: 0.54:1.000:0.971 0/0/0/1:4:51,13:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,10:0.17: 1.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,4:0.13:-0.84:1.000:0.943 0/0/1/1:4:19,21:0.54:-0.46:1.000:0.990 0/0/0/1:4:46,10:0.21: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,10:0.25: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,6:0.24:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,27:0.62:-0.30:1.000:0.557 0/0/1/1:4:29,23:0.47: 0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,18:0.39: 0.31:1.000:0.686 0/0/1/1:4:17,25:0.59:-0.30:1.000:0.885 0/0/1/1:4:22,14:0.42:-0.76:1.000:0.900 0/0/1/1:4:19,26:0.57:-0.07:1.000:0.937 0/0/0/1:4:30,10:0.29:-0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,28:0.79:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1:3:11,5:0.34:-2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,26:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,19:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,7:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,22:0.54:-0.38:1.000:0.985 0/0/0/1:4:55,8:0.15: 1.31:1.000:0.987 0/0/1/1:4:18,19:0.53:-0.69:1.000:0.993 0/0/0/1:4:46,12:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,15:0.43:-0.69:1.000:0.952 0/0/0/1:4:29,15:0.37:-0.15:1.000:0.544 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 3.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,8:0.28:-0.99:1.000:0.996 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,25:0.47: 0.77:1.000:0.993 0/0/0/1:4:52,14:0.25: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,20:0.44: 0.23:1.000:0.958 0/0/0/1:4:57,7:0.13: 1.38:1.000:0.897 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.27:-0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,12:0.39:-0.99:1.000:0.723 0/0/0/1:4:47,16:0.29: 1.31:1.000:0.992 0/1/1/1:4:9,19:0.65:-1.38:1.000:0.764 0/0/0/1/1/1:6:15,10:0.43:-1.61:1.000:0.580 0/0/0/1:4:25,8:0.28:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,16:0.42:-0.38:1.000:0.906 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,19:0.40: 0.39:1.000:0.802 0/0/0/1:4:36,6:0.17:-0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,11:0.36:-0.92:1.000:0.744 0/0/1/1:4:15,10:0.43:-1.61:1.000:0.939 0/0/0/1:4:29,10:0.29:-0.53:1.000:0.991 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.92:0.996:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,12:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,21:0.59:-0.84:0.999:0.866 0/0/0/1:4:43,9:0.20: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,11:0.20: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,27:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,16:0.35: 0.39:1.000:0.828 0/0/0/1:4:41,10:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,12:0.19: 2.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,37:0.68: 0.39:1.000:0.957 0/0/0/1:4:19,7:0.30:-1.53:1.000:0.982 0/0/0/1:4:45,10:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,5:0.08: 2.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:39,8:0.20: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,11:0.17: 2.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,30:0.46: 1.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-1.61:1.000:0.686 0/0/1/1:4:27,17:0.41:-0.15:1.000:0.889 0/1/1/1:4:10,26:0.68:-0.76:1.000:0.950 0/0/1/1:4:32,18:0.39: 0.31:1.000:0.686 0/0/1/1:4:22,15:0.43:-0.69:1.000:0.952 0/0/0/1:4:34,15:0.34: 0.23:1.000:0.878 0/0/0/1:4:55,19:0.29: 2.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,26:0.58:-0.15:1.000:0.901 0/0/1/1:4:34,31:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,12:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,6:0.16:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:21,8:0.31:-1.30:1.000:0.974 0/0/1/1:4:17,27:0.60:-0.15:1.000:0.794 0/0/0/1:4:36,8:0.21:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.44:-0.23:1.000:0.974 0/0/0/1:4:47,8:0.17: 0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,5:0.24:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,17:0.36: 0.39:1.000:0.637 0/0/1/1:4:29,16:0.39:-0.07:0.999:0.636 0/0/0/1:4:46,14:0.27: 1.08:1.000:0.998 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.26:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,12:0.20: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,19:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,25:0.44: 1.08:1.000:0.972 0/0/0/1:4:51,15:0.26: 1.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,10:0.24: 0.31:0.999:1.000 0/0/1/1:4:34,21:0.41: 0.69:1.000:0.865 0/0/1/1:4:11,9:0.47:-1.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,17:0.40: 0.00:1.000:0.778 0/0/0/1:4:39,11:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,13:0.31: 0.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:28,19:0.43: 0.08:1.000:0.950 0/0/0/1:4:40,10:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,4:0.10: 0.16:1.000:0.841 0/0/1/1:4:19,15:0.47:-0.92:1.000:0.991 0/0/1/1:4:13,22:0.61:-0.84:1.000:0.685 0/0/1/1:4:27,17:0.41:-0.15:1.000:0.889 0/0/1/1:4:33,21:0.42: 0.62:1.000:0.900 0/0/0/1:4:29,10:0.29:-0.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:35,6:0.17:-0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,25:0.74:-1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,9:0.32:-1.07:1.000:0.965 0/0/0/1:4:28,3:0.11:-1.15:1.000:0.605 0/0/1/1:4:21,20:0.51:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,14:0.42:-0.76:1.000:0.900 0/0/0/1/1:5:26,19:0.45:-0.07:0.993:0.887 0/0/0/1:4:42,10:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,7:0.20:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,54:0.71: 1.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,22:0.47: 0.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:22,10:0.34:-1.07:1.000:0.837 0/1/1/1:4:5,20:0.74:-1.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,9:0.39:-1.61:1.000:0.686 0/0/0/1:4:46,7:0.16: 0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,19:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,7:0.24:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.33:-0.92:1.000:0.932 0/1/1/1:4:22,43:0.63: 1.46:1.000:0.622 0/0/0/1:4:45,13:0.26: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,5:0.15:-0.46:1.000:0.984 0/0/0/1:4:40,20:0.36: 1.08:1.000:0.637 0/0/0/1:4:41,14:0.29: 0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:34,5:0.15:-0.53:1.000:0.989 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,10:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:39,2:0.06:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.44:-1.68:1.000:0.972 0/0/0/1:4:33,8:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.28: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:61,12:0.19: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,9:0.21: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,5:0.14:-0.30:1.000:0.967 0/0/1/1:4:22,24:0.53: 0.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:27,15:0.39:-0.30:1.000:0.654 0/0/0/1:4:33,8:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,22:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,10:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,10:0.25: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,3:0.11:-1.15:1.000:0.605 0/0/1/1:4:23,21:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,10:0.30:-0.61:1.000:0.987 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.47:-1.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:25,13:0.37:-0.61:1.000:0.529 0/0/0/1:4:25,8:0.28:-0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,6:0.16:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,10:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,4:0.22:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,17:0.39: 0.08:1.000:0.704 0/0/0/1:4:51,24:0.35: 2.23:1.000:0.777 0/0/0/1:4:48,12:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,16:0.36: 0.16:1.000:0.637 0/0/1/1:4:33,20:0.41: 0.54:1.000:0.837 0/0/0/1:4:30,10:0.29:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:55,14:0.24: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,7:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.48: 0.16:1.000:0.995 -chr5.1 75945578 chr5.1_075945578 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.48:0.944:. ./.:4:8,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:10,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.18:1.000:. ./.:5:6,0:.: 1.05:0.993:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:6,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,0:.: 3.65:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.68:1.000:. -chr5.1 76273135 chr5.1_076273135 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:282,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:154,51:.:-0.24:1.000:. ./.:4:287,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:223,61:.: 1.16:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:185,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:33,28:.:-2.79:1.000:. ./.:4:79,27:.:-1.99:1.000:. ./.:4:180,50:.: 0.20:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:191,48:.: 0.36:1.000:. ./.:4:230,52:.: 1.12:0.944:. ./.:4:275,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:234,65:.: 1.42:1.000:. ./.:4:238,64:.: 1.48:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:139,46:.:-0.59:1.000:. ./.:4:50,7:.:-2.86:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:268,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:185,59:.: 0.45:1.000:. ./.:4:290,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:281,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:102,0:.:-2.06:1.000:. ./.:3:14,0:.:-3.62:1.000:. ./.:4:195,59:.: 0.63:1.000:. ./.:4:235,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:225,54:.: 1.07:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:219,67:.: 1.19:1.000:. ./.:4:166,39:.:-0.24:1.000:. ./.:4:152,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:189,53:.: 0.42:1.000:. ./.:4:174,39:.:-0.10:1.000:. ./.:4:209,61:.: 0.91:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:228,65:.: 1.32:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:204,42:.: 0.49:1.000:. ./.:4:135,24:.:-1.05:1.000:. ./.:4:121,34:.:-1.12:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:153,47:.:-0.33:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:153,55:.:-0.19:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:195,43:.: 0.34:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.61:1.000:. ./.:6:167,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:124,48:.:-0.82:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:129,34:.:-0.98:1.000:. ./.:4:126,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:196,36:.: 0.24:0.996:. ./.:4:204,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.73:0.999:. ./.:4:126,105:.: 0.22:1.000:. ./.:4:205,60:.: 0.82:1.000:. ./.:4:156,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:140,40:.:-0.68:1.000:. ./.:4:239,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:157,58:.:-0.06:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:156,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:169,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:148,35:.:-0.63:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:193,41:.: 0.27:1.000:. ./.:4:178,34:.:-0.12:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:156,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:114,37:.:-1.20:1.000:. ./.:4:126,36:.:-1.00:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:185,46:.: 0.22:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:128,35:.:-0.98:0.999:. ./.:4:153,38:.:-0.49:1.000:. ./.:4:120,36:.:-1.11:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:237,75:.: 1.65:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:206,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:243,95:.: 2.11:1.000:. ./.:4:144,47:.:-0.49:0.999:. ./.:4:184,71:.: 0.65:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:163,52:.:-0.06:1.000:. ./.:4:144,48:.:-0.47:1.000:. ./.:4:126,38:.:-0.96:1.000:. ./.:4:193,46:.: 0.36:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:222,53:.: 1.00:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:124,25:.:-1.23:1.000:. ./.:4:114,31:.:-1.30:1.000:. ./.:4:146,29:.:-0.77:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.18:1.000:. ./.:5:130,27:.:-1.09:0.993:. ./.:4:159,42:.:-0.31:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:144,46:.:-0.50:1.000:. ./.:4:173,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:163,48:.:-0.13:1.000:. ./.:4:112,33:.:-1.30:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:345,1:.: 2.26:1.000:. ./.:4:192,50:.: 0.42:1.000:. ./.:4:184,46:.: 0.20:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:337,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:232,2:.: 0.27:1.000:. ./.:4:49,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:164,57:.: 0.04:1.000:. ./.:4:199,41:.: 0.38:1.000:. ./.:4:176,45:.: 0.04:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:223,58:.: 1.11:1.000:. ./.:4:199,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:156,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:174,35:.:-0.17:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:159,47:.:-0.22:1.000:. ./.:4:188,55:.: 0.43:1.000:. ./.:4:169,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:117,36:.:-1.16:1.000:. ./.:4:146,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:155,43:.:-0.36:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:161,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:213,58:.: 0.93:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:166,43:.:-0.17:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:233,58:.: 1.28:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:198,51:.: 0.54:1.000:. -chr5.1 76469102 chr5.1_076469102 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,102:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.20:1.000:. ./.:4:57,125:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.50:1.000:. ./.:4:50,123:.: 1.08:1.000:. ./.:4:56,152:.: 1.95:1.000:. ./.:4:28,64:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,179:.: 1.23:1.000:. ./.:4:41,111:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,6:.:-3.09:1.000:. ./.:4:11,16:.:-2.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,143:.: 0.33:1.000:. ./.:4:43,92:.: 0.13:1.000:. ./.:4:40,98:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.80:1.000:. ./.:4:52,129:.: 1.28:0.944:. ./.:4:0,170:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,177:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,175:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,14:.:-2.89:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.37:1.000:. ./.:4:46,94:.: 0.25:1.000:. ./.:4:4,6:.:-2.99:1.000:. ./.:4:57,117:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,176:.: 1.15:1.000:. ./.:4:32,133:.: 0.88:1.000:. ./.:4:45,117:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,174:.: 1.10:1.000:. ./.:4:65,165:.: 2.50:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.53:1.000:. ./.:4:5,9:.:-2.89:1.000:. ./.:4:16,17:.:-2.42:1.000:. ./.:3:1,4:.:-3.12:1.000:. ./.:4:41,118:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,179:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,188:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,208:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.38:1.000:. ./.:4:48,93:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.83:1.000:. ./.:4:39,93:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,138:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.85:1.000:. ./.:4:38,105:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,29:.:-2.52:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.83:1.000:. ./.:4:23,69:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,165:.: 0.88:1.000:. ./.:4:27,95:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1,161:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,124:.: 0.68:1.000:. ./.:6:16,90:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.95:1.000:. ./.:4:43,112:.: 0.63:1.000:. ./.:4:16,59:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.07:0.996:. ./.:4:0,123:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.30:1.000:. ./.:4:20,60:.:-1.24:0.999:. ./.:4:0,185:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.20:1.000:. ./.:4:46,76:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.15:1.000:. ./.:4:46,113:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,75:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.42:1.000:. ./.:4:42,67:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,107:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.67:1.000:. ./.:4:30,63:.:-0.92:1.000:. ./.:4:29,78:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.05:1.000:. ./.:4:31,66:.:-0.82:1.000:. ./.:4:46,73:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.10:1.000:. ./.:4:21,76:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,107:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.14:1.000:. ./.:4:30,80:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,41:.:-1.77:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.87:1.000:. ./.:4:30,76:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,77:.:-0.49:0.999:. ./.:4:0,122:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.57:1.000:. ./.:4:2,146:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,101:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,212:.: 2.05:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.89:0.999:. ./.:4:31,105:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.84:1.000:. ./.:4:25,41:.:-1.59:1.000:. ./.:4:27,80:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,76:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,62:.:-0.94:1.000:. ./.:4:40,110:.: 0.50:1.000:. ./.:4:50,118:.: 0.95:1.000:. ./.:4:25,79:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.79:1.000:. ./.:4:31,63:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.12:1.000:. ./.:4:35,79:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.65:1.000:. ./.:5:21,86:.:-0.57:0.993:. ./.:4:0,114:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,143:.: 1.45:1.000:. ./.:4:47,106:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.92:1.000:. ./.:4:35,77:.:-0.44:1.000:. ./.:4:35,73:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.07:1.000:. ./.:4:26,63:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,63:.:-1.09:1.000:. ./.:4:37,107:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,208:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,5:.:-3.12:1.000:. ./.:4:30,78:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.43:1.000:. ./.:4:51,102:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,122:.: 0.93:1.000:. ./.:4:34,93:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.98:1.000:. ./.:4:46,116:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.83:1.000:. ./.:4:32,83:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,96:.:-0.17:1.000:. ./.:4:44,101:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,88:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.38:1.000:. ./.:4:62,151:.: 2.08:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.43:1.000:. ./.:4:26,132:.: 0.70:1.000:. ./.:4:41,113:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.05:1.000:. -chr5.1 76656216 chr5.1_076656216 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:100,89:.: 1.28:1.000:. ./.:4:65,69:.:-0.17:1.000:. ./.:4:78,79:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,76:.: 0.14:1.000:. ./.:4:87,82:.: 0.75:1.000:. ./.:4:95,92:.: 1.23:1.000:. ./.:4:50,43:.:-1.26:1.000:. ./.:4:91,61:.: 0.30:1.000:. ./.:4:93,91:.: 1.15:1.000:. ./.:4:17,14:.:-2.89:1.000:. ./.:4:16,25:.:-2.63:1.000:. ./.:4:83,63:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,79:.: 0.12:1.000:. ./.:4:104,94:.: 1.52:1.000:. ./.:4:79,81:.: 0.51:1.000:. ./.:4:75,75:.: 0.25:1.000:. ./.:4:94,90:.: 1.15:0.944:. ./.:4:105,72:.: 0.96:1.000:. ./.:4:84,114:.: 1.52:1.000:. ./.:4:92,106:.: 1.52:1.000:. ./.:4:13,19:.:-2.87:1.000:. ./.:4:80,80:.: 0.51:1.000:. ./.:4:74,90:.: 0.62:1.000:. ./.:4:69,85:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,7:.:-3.21:1.000:. ./.:4:90,102:.: 1.36:1.000:. ./.:4:78,92:.: 0.78:1.000:. ./.:4:74,92:.: 0.67:1.000:. ./.:4:83,86:.: 0.75:1.000:. ./.:4:107,102:.: 1.81:1.000:. ./.:4:85,77:.: 0.57:1.000:. ./.:4:84,76:.: 0.51:1.000:. ./.:4:8,7:.:-3.32:1.000:. ./.:4:17,25:.:-2.60:1.000:. ./.:3:3,15:.:-3.24:1.000:. ./.:4:94,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:72,83:.: 0.38:1.000:. ./.:4:77,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:52,77:.:-0.30:1.000:. ./.:4:83,80:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,63:.:-0.41:1.000:. ./.:4:65,65:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,79:.: 0.59:1.000:. ./.:4:53,73:.:-0.38:1.000:. ./.:4:50,71:.:-0.52:1.000:. ./.:4:53,72:.:-0.41:1.000:. ./.:4:82,75:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,49:.:-1.49:1.000:. ./.:4:67,48:.:-0.67:1.000:. ./.:4:36,61:.:-1.15:1.000:. ./.:4:42,64:.:-0.91:1.000:. ./.:4:86,84:.: 0.78:1.000:. ./.:4:61,64:.:-0.41:1.000:. ./.:4:74,58:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,65:.: 0.07:1.000:. ./.:4:81,86:.: 0.70:1.000:. ./.:4:71,68:.:-0.04:1.000:. ./.:4:70,63:.:-0.20:1.000:. ./.:4:68,75:.: 0.07:1.000:. ./.:6:56,56:.:-0.75:1.000:. ./.:4:54,68:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,87:.: 0.44:1.000:. ./.:4:59,73:.:-0.23:1.000:. ./.:4:63,76:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,80:.: 0.20:1.000:. ./.:4:73,61:.:-0.17:1.000:. ./.:4:43,35:.:-1.65:1.000:. ./.:4:70,57:.:-0.36:1.000:. ./.:4:59,73:.:-0.23:0.996:. ./.:4:63,76:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,93:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,49:.:-1.07:0.999:. ./.:4:77,84:.: 0.54:1.000:. ./.:4:81,79:.: 0.51:1.000:. ./.:4:81,79:.: 0.51:1.000:. ./.:4:57,61:.:-0.60:1.000:. ./.:4:64,69:.:-0.20:1.000:. ./.:4:53,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:70,79:.: 0.22:1.000:. ./.:4:77,76:.: 0.33:1.000:. ./.:4:60,65:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,79:.: 0.14:1.000:. ./.:4:75,93:.: 0.73:1.000:. ./.:4:80,77:.: 0.44:1.000:. ./.:4:64,63:.:-0.36:1.000:. ./.:4:69,78:.: 0.17:1.000:. ./.:4:55,64:.:-0.57:1.000:. ./.:4:50,66:.:-0.65:1.000:. ./.:4:70,59:.:-0.30:1.000:. ./.:4:72,65:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,64:.:-0.70:1.000:. ./.:4:79,65:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,80:.: 0.38:1.000:. ./.:4:76,57:.:-0.20:1.000:. ./.:4:66,64:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,66:.: 0.04:1.000:. ./.:4:40,65:.:-0.94:1.000:. ./.:4:58,70:.:-0.33:1.000:. ./.:4:84,77:.: 0.54:1.000:. ./.:4:79,73:.: 0.30:1.000:. ./.:4:30,45:.:-1.73:1.000:. ./.:4:88,75:.: 0.59:1.000:. ./.:4:44,38:.:-1.55:1.000:. ./.:4:71,72:.: 0.07:1.000:. ./.:4:50,49:.:-1.10:0.999:. ./.:4:69,71:.:-0.01:1.000:. ./.:4:63,75:.:-0.07:1.000:. ./.:4:86,74:.: 0.51:1.000:. ./.:4:89,105:.: 1.41:1.000:. ./.:4:71,76:.: 0.17:1.000:. ./.:4:67,76:.: 0.07:1.000:. ./.:4:88,99:.: 1.23:1.000:. ./.:4:67,71:.:-0.07:0.999:. ./.:4:63,74:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,48:.:-1.47:1.000:. ./.:4:57,54:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,54:.:-0.78:1.000:. ./.:4:63,59:.:-0.49:1.000:. ./.:4:74,72:.: 0.14:1.000:. ./.:4:62,61:.:-0.46:1.000:. ./.:4:70,66:.:-0.12:1.000:. ./.:4:64,59:.:-0.46:1.000:. ./.:4:68,78:.: 0.14:1.000:. ./.:4:82,81:.: 0.59:1.000:. ./.:4:46,72:.:-0.60:1.000:. ./.:4:64,77:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,55:.:-0.44:1.000:. ./.:4:47,52:.:-1.10:1.000:. ./.:4:50,42:.:-1.28:1.000:. ./.:4:30,58:.:-1.39:1.000:. ./.:4:67,66:.:-0.20:1.000:. ./.:4:81,89:.: 0.78:1.000:. ./.:5:51,61:.:-0.75:0.993:. ./.:4:60,62:.:-0.49:1.000:. ./.:4:72,67:.:-0.04:1.000:. ./.:4:103,118:.: 2.13:1.000:. ./.:4:69,81:.: 0.25:1.000:. ./.:4:47,50:.:-1.15:1.000:. ./.:4:51,71:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,78:.:-0.07:1.000:. ./.:4:76,79:.: 0.38:1.000:. ./.:4:66,68:.:-0.17:1.000:. ./.:4:68,78:.: 0.14:1.000:. ./.:4:32,51:.:-1.52:1.000:. ./.:4:102,122:.: 2.21:1.000:. ./.:4:93,94:.: 1.23:1.000:. ./.:4:75,83:.: 0.46:1.000:. ./.:4:84,96:.: 1.04:1.000:. ./.:4:83,92:.: 0.91:1.000:. ./.:4:56,61:.:-0.62:1.000:. ./.:4:79,111:.: 1.31:1.000:. ./.:4:99,74:.: 0.86:1.000:. ./.:4:2,11:.:-3.37:1.000:. ./.:4:48,46:.:-1.23:1.000:. ./.:4:76,82:.: 0.46:1.000:. ./.:4:110,80:.: 1.31:1.000:. ./.:4:87,92:.: 1.02:1.000:. ./.:4:64,75:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,74:.:-0.07:1.000:. ./.:4:86,77:.: 0.59:1.000:. ./.:4:82,66:.: 0.20:1.000:. ./.:4:75,76:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,63:.: 0.04:1.000:. ./.:4:81,82:.: 0.59:1.000:. ./.:4:68,70:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,99:.: 1.41:1.000:. ./.:4:79,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:91,106:.: 1.49:1.000:. ./.:4:78,84:.: 0.57:1.000:. ./.:4:80,69:.: 0.22:1.000:. ./.:4:74,82:.: 0.41:1.000:. ./.:4:61,74:.:-0.15:1.000:. ./.:4:65,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,95:.: 0.75:1.000:. ./.:4:56,51:.:-0.89:1.000:. ./.:4:68,72:.:-0.01:1.000:. ./.:4:103,98:.: 1.60:1.000:. ./.:4:87,87:.: 0.88:1.000:. ./.:4:91,105:.: 1.47:1.000:. ./.:4:81,85:.: 0.67:1.000:. ./.:4:79,87:.: 0.67:1.000:. ./.:4:91,91:.: 1.10:1.000:. ./.:4:116,95:.: 1.86:1.000:. ./.:4:64,63:.:-0.36:1.000:. ./.:4:102,73:.: 0.91:1.000:. -chr5.1 76820778 chr5.1_076820778 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:187,166:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,191:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,231:0.73: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:206,64:0.25:-0.61:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,366:1.00: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,244:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,130:0.74:-1.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,208:0.75:-0.50:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,219:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,65:0.53:-2.61:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,153:1.00:-2.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,216:0.74:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:165,135:0.46:-0.19:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,286:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,199:0.72:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,110:0.48:-1.11:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,322:1.00: 0.11:0.944:1.000 1/1/1/1:4:0,319:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,287:0.73: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:163,145:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,85:0.56:-2.21:1.000:0.971 0/0/1/1:4:140,172:0.56:-0.03:1.000:0.967 0/0/1/1:4:175,142:0.46: 0.04:1.000:0.987 0/0/1/1:4:126,115:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,53:0.84:-3.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:77,209:0.73:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,91:0.46:-1.56:1.000:0.989 0/1/1/1:4:73,210:0.74:-0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,407:1.00: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,182:0.74:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,156:0.48: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:174,65:0.28:-1.04:1.000:0.994 1/1/1/1:4:3,73:0.96:-3.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,139:0.78:-1.88:1.000:1.000 0/1/1:3:25,50:0.67:-3.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,189:0.75:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,165:0.57:-0.30:1.000:0.937 0/0/1/1:4:177,161:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,188:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:281,84:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,183:0.54: 0.48:1.000:0.990 0/1/1/1:4:89,291:0.77: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,196:0.51: 1.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,274:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,240:0.53: 2.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:105,284:0.73: 1.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:104,272:0.73: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,20:0.48:-3.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:164,199:0.56: 0.68:1.000:0.971 0/0/1/1:4:202,222:0.53: 1.53:1.000:0.991 0/1/1/1:4:85,246:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:273,116:0.31: 1.05:1.000:0.972 0/1/1/1:4:80,238:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:315,109:0.27: 1.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:159,152:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,173:0.45: 1.16:1.000:0.977 0/1/1/1:4:89,223:0.72:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:222,237:0.53: 2.02:1.000:0.993 0/1/1/1:4:100,276:0.74: 0.86:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:200,117:0.38: 0.04:1.000:0.776 0/0/0/1:4:284,89:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,89:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,92:0.34:-0.46:1.000:0.871 0/0/1/1:4:188,190:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,174:0.49: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,187:0.52: 0.71:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,229:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,175:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,187:0.50: 0.95:0.996:0.997 1/1/1/1:4:0,293:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,225:0.56: 1.35:1.000:0.972 0/1/1/1:4:66,207:0.76:-0.57:0.999:1.000 0/1/1/1:4:99,356:0.78: 1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,232:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,296:0.77: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,261:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,162:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,175:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:274,106:0.29: 0.92:1.000:0.991 0/1/1/1:4:106,303:0.74: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,229:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,191:0.49: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:296,100:0.27: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,145:0.54:-0.60:1.000:0.984 0/0/1/1:4:189,162:0.47: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:201,208:0.52: 1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,217:0.78:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,171:0.53: 0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:83,259:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,176:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,130:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,223:0.75:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:227,197:0.48: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,100:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:103,313:0.75: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,307:0.75: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,272:0.74: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,164:0.52: 0.11:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,368:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,139:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,127:0.53:-0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:225,187:0.47: 1.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:219,77:0.27:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,256:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,249:0.78: 0.07:0.999:1.000 0/0/1/1:4:154,142:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,190:0.52: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,147:0.53:-0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:196,174:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,157:0.49: 0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,251:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,285:0.78: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,191:0.54: 0.68:0.999:0.990 1/1/1/1:4:0,405:1.00: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,242:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,280:0.72: 1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,219:0.74:-0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:85,263:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,301:0.76: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,151:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,152:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,258:0.78: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,367:1.00: 0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,185:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:172,178:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:176,169:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,252:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,229:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,236:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,269:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,123:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/1/1/1/1:5:72,238:0.77:-0.05:0.993:0.974 0/0/1/1:4:152,193:0.57: 0.43:1.000:0.951 0/0/0/1:4:220,82:0.28:-0.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,256:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,176:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:191,200:0.52: 1.07:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,304:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,253:0.76: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,199:0.53: 0.93:1.000:0.991 0/1/1/1:4:87,259:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,229:0.78:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,226:0.77:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,291:0.78: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,181:0.53: 0.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:87,187:0.69:-0.55:1.000:0.968 0/1/1/1:4:84,243:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,170:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,253:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:182,149:0.46: 0.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:133,125:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,55:0.50:-2.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,175:0.72:-0.96:1.000:0.995 0/1/1/1:4:82,259:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,249:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,92:0.28: 0.34:1.000:0.994 0/1/1/1:4:90,206:0.70:-0.25:1.000:0.985 0/0/1/1:4:159,118:0.44:-0.51:1.000:0.963 0/0/1/1:4:132,159:0.56:-0.32:1.000:0.974 0/0/1/1:4:126,115:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,190:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,195:0.77:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,152:0.53:-0.30:1.000:0.992 0/1/1/1:4:77,176:0.70:-0.85:1.000:0.985 0/0/1/1:4:144,119:0.46:-0.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:182,51:0.23:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,218:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,231:0.79:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,127:0.54:-1.04:1.000:0.987 0/0/1/1:4:136,138:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,184:0.78:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,152:0.47: 0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:167,122:0.43:-0.35:1.000:0.956 0/0/1/1:4:157,133:0.47:-0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:76,216:0.74:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,146:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,163:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,151:0.53:-0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,184:0.74:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,244:0.77: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,172:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:271,92:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:99,116:0.55:-1.38:1.000:0.981 0/1/1/1:4:101,217:0.69: 0.06:1.000:0.968 -chr5.1 76943339 chr5.1_076943339 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:0.944:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.67:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.57:1.000:. ./.:6:22,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:54,0:.: 3.23:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:0.996:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.47:0.999:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:42,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.57:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:0.999:. ./.:4:24,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:5:34,0:.: 1.19:0.993:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.37:1.000:. -chr5.1 77055358 chr5.1_077055358 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:29,59:0.60: 0.56:1.000:0.802 0/0/0/1:4:58,24:0.37: 0.32:1.000:0.524 0/0/1/1:4:28,46:0.55: 0.00:1.000:0.984 0/1/1/1:4:16,76:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,30:0.39: 0.56:1.000:0.737 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,26:0.43:-0.48:1.000:0.944 0/0/1/1:4:41,29:0.43:-0.16:1.000:0.937 0/0/0/1:4:72,30:0.37: 1.13:1.000:0.516 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-2.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-2.32:1.000:0.962 0/0/1/1:4:33,54:0.54: 0.52:1.000:0.985 0/0/1/1:4:27,61:0.62: 0.56:1.000:0.524 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,28:0.38: 0.69:1.000:0.564 0/1/1/1:4:16,96:0.81: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,40:0.45: 0.52:0.944:0.976 0/0/1/1:4:42,61:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,67:0.52: 1.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,100:0.81: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,10:0.55:-2.32:1.000:0.981 0/0/1/1:4:26,51:0.59: 0.12:1.000:0.865 0/0/1/1:4:37,59:0.54: 0.89:1.000:0.989 0/1/1/1:4:18,94:0.79: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.37:-2.68:1.000:0.565 0/0/1/1:4:63,41:0.42: 1.21:1.000:0.905 0/0/1/1:4:27,44:0.54:-0.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:21,40:0.58:-0.52:1.000:0.903 0/0/0/1:4:67,1:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,31:0.42: 0.16:1.000:0.911 0/0/1/1:4:36,69:0.58: 1.25:1.000:0.896 0/1/1/1:4:19,81:0.75: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.40:-2.52:1.000:0.826 0/1/1:3:3,19:0.82:-2.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:42,58:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,47:0.49: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,52:0.77:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,40:0.58:-0.52:1.000:0.903 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,60:0.70: 0.20:1.000:0.981 0/0/1/1:4:20,41:0.60:-0.52:1.000:0.787 0/1/1/1:4:15,73:0.78: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,40:0.55:-0.40:1.000:0.981 0/1/1/1:4:8,57:0.84:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,22:0.41:-0.64:1.000:0.871 0/0/1/1:4:46,73:0.54: 1.81:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,6:0.48:-2.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,54:0.72:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,37:0.82:-1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,28:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,85:0.75: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,51:0.55: 0.32:1.000:0.984 0/1/1/1:4:16,86:0.79: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,75:0.73: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,33:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,23:0.38: 0.08:1.000:0.534 0/1/1/1:4:10,60:0.81:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,16:0.36:-0.52:1.000:0.694 0/0/0/1/1/1:6:21,31:0.52:-0.88:1.000:0.872 0/1/1/1:4:15,80:0.79: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,76:0.76: 0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,33:0.50:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,43:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,39:0.55:-0.48:1.000:0.976 0/0/1/1:4:30,22:0.43:-0.88:1.000:0.948 0/1/1/1:4:12,79:0.83: 0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:17,74:0.76: 0.69:0.996:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,49:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,20:0.44:-1.16:0.999:0.967 0/1/1/1:4:26,64:0.64: 0.65:1.000:0.723 0/0/1/1:4:36,55:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,57:0.57: 0.61:1.000:0.956 0/1/1/1:4:21,52:0.64:-0.04:1.000:0.737 0/0/1/1:4:34,56:0.55: 0.65:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,53:0.74:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,67:0.76: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,24:0.41:-0.44:1.000:0.876 0/0/1/1:4:22,35:0.54:-0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:30,41:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,62:0.67: 0.40:1.000:0.930 0/1/1/1:4:14,74:0.79: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,54:0.81:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,32:0.46:-0.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,18:0.38:-0.60:1.000:0.549 0/0/1/1:4:21,22:0.47:-1.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,20:0.39:-0.48:1.000:0.647 0/0/1/1:4:37,47:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,36:0.53:-0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:21,38:0.57:-0.60:1.000:0.947 0/1/1/1:4:14,67:0.77: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,39:0.53:-0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:39,24:0.41:-0.44:1.000:0.876 0/0/1/1:4:23,37:0.54:-0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:25,31:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,35:0.72:-1.16:1.000:0.994 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,61:0.64: 0.48:1.000:0.701 0/0/1/1:4:18,26:0.51:-1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,71:0.73: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,36:0.72:-1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,21:0.39:-0.36:1.000:0.650 0/0/0/1:4:33,10:0.35:-1.24:0.999:0.824 0/1/1/1:4:18,67:0.73: 0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,59:0.81:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,56:0.59: 0.44:1.000:0.887 0/1/1/1:4:19,96:0.78: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,46:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,19:0.39:-0.60:1.000:0.644 0/0/1/1:4:49,51:0.47: 1.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,58:0.78:-0.16:0.999:1.000 0/0/1/1:4:44,32:0.43: 0.08:1.000:0.946 0/0/1/1:4:25,14:0.40:-1.40:1.000:0.810 0/0/0/1:4:56,21:0.36: 0.12:1.000:0.639 0/0/1/1:4:23,40:0.56:-0.44:1.000:0.967 0/0/1/1:4:22,32:0.51:-0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,38:0.54:-0.48:1.000:0.990 0/1/1/1:4:13,48:0.73:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,62:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,18:0.39:-0.84:1.000:0.731 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,32:0.41: 0.40:1.000:0.876 0/0/1/1:4:34,32:0.46:-0.32:1.000:0.986 0/0/1/1:4:28,30:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,36:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,15:0.38:-1.04:1.000:0.591 0/0/1/1:4:13,18:0.50:-1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,21:0.54:-1.60:1.000:0.987 0/0/1/1:4:23,41:0.57:-0.40:1.000:0.956 0/0/1/1:4:24,48:0.59:-0.08:1.000:0.834 0/0/0/1/1:5:26,24:0.46:-0.96:0.993:0.854 0/1/1/1:4:10,42:0.75:-0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,52:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,28:0.38: 0.61:1.000:0.603 0/0/1/1:4:17,33:0.59:-0.96:1.000:0.880 0/0/1/1:4:19,31:0.54:-0.96:1.000:0.985 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,43:0.64:-0.52:1.000:0.644 0/1/1/1:4:17,58:0.71: 0.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:41,14:0.36:-0.76:1.000:0.732 0/0/1/1:4:26,32:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,35:0.55:-0.72:1.000:0.981 0/0/1/1:4:57,32:0.40: 0.61:1.000:0.812 0/0/1/1:4:38,61:0.54: 1.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:42,47:0.48: 0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:33,62:0.58: 0.85:1.000:0.917 0/0/1/1:4:40,63:0.53: 1.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:49,24:0.39:-0.04:1.000:0.679 0/0/1/1:4:44,77:0.56: 1.89:1.000:0.965 0/0/1/1:4:31,60:0.59: 0.69:1.000:0.884 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,49:0.54: 0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:45,36:0.44: 0.28:1.000:0.967 0/0/1/1:4:33,65:0.59: 0.97:1.000:0.859 0/1/1/1:4:18,91:0.78: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,60:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,47:0.60:-0.16:1.000:0.793 0/0/1/1:4:35,56:0.54: 0.69:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,65:0.57: 1.09:1.000:0.948 0/0/1/1:4:32,53:0.55: 0.44:1.000:0.982 0/0/1/1:4:40,20:0.39:-0.56:1.000:0.702 0/0/1/1:4:27,59:0.62: 0.48:1.000:0.624 0/1/1/1:4:15,41:0.67:-0.72:1.000:0.903 0/0/1/1:4:36,56:0.53: 0.73:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,64:0.79: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,53:0.47: 1.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,52:0.59: 0.16:1.000:0.834 0/1/1/1:4:9,78:0.86: 0.52:1.000:0.948 0/0/1/1:4:26,48:0.57: 0.00:1.000:0.932 0/0/1/1:4:30,56:0.58: 0.48:1.000:0.923 0/1/1/1:4:16,74:0.77: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,55:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,26:0.56:-1.32:1.000:0.969 0/0/1/1:4:45,45:0.46: 0.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,82:0.59: 1.97:1.000:0.834 0/1/1/1:4:27,90:0.71: 1.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:38,74:0.59: 1.53:1.000:0.875 0/0/1/1:4:37,51:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,43:0.40: 1.77:1.000:0.828 0/1/1/1:4:29,93:0.70: 1.93:1.000:0.984 0/1/1/1:4:34,100:0.68: 2.41:1.000:0.957 0/0/1/1:4:31,61:0.59: 0.73:1.000:0.860 0/0/1/1:4:49,66:0.50: 1.65:1.000:0.997 -chr5.1 77283914 chr5.1_077283914 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:37,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,18:.: 0.50:1.000:. ./.:4:40,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:43,5:.: 0.64:1.000:. ./.:4:35,21:.: 1.19:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:32,7:.: 0.02:1.000:. ./.:4:26,13:.: 0.02:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.91:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:46,11:.: 1.26:1.000:. ./.:4:27,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,11:.: 1.05:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.29:0.944:. ./.:4:38,26:.: 1.74:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:34,15:.: 0.71:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:35,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:52,7:.: 1.40:1.000:. ./.:4:44,4:.: 0.64:1.000:. ./.:4:21,15:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.53:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.53:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.33:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:32,24:.: 1.19:1.000:. ./.:4:39,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:29,10:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.57:1.000:. ./.:4:49,12:.: 1.54:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:36,16:.: 0.92:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.26:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.46:1.000:. ./.:6:36,6:.: 0.23:1.000:. ./.:4:26,10:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,16:.: 0.98:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,6:.:-1.22:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,8:.:-1.43:1.000:. ./.:4:31,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.23:0.996:. ./.:4:13,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.77:0.999:. ./.:4:39,8:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,13:.:-0.05:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:61,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:24,14:.:-0.05:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:43,9:.: 0.92:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:22,12:.:-0.33:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.88:1.000:. ./.:4:25,11:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:38,14:.: 0.92:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.95:1.000:. ./.:4:16,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.53:1.000:. ./.:4:20,11:.:-0.53:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:27,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.53:0.999:. ./.:4:31,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,17:.: 1.12:1.000:. ./.:4:45,5:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,13:.: 0.29:1.000:. ./.:4:25,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:26,12:.:-0.05:1.000:. ./.:4:18,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:34,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.02:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:19,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,4:.: 0.98:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.19:1.000:. ./.:4:14,4:.:-1.43:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.08:1.000:. ./.:4:11,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:16,6:.:-1.15:1.000:. ./.:4:44,21:.: 1.81:1.000:. ./.:5:27,1:.:-0.74:0.993:. ./.:4:34,13:.: 0.57:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:33,14:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,11:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,5:.:-1.43:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,8:.:-1.36:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:40,21:.: 1.54:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:27,12:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:38,16:.: 1.05:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:36,14:.: 0.78:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:47,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:17,14:.:-0.53:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:28,11:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,7:.: 0.98:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:53,15:.: 2.02:1.000:. ./.:4:38,11:.: 0.71:1.000:. ./.:4:18,27:.: 0.43:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,18:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.29:1.000:. ./.:4:31,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:41,4:.: 0.43:1.000:. ./.:4:28,9:.:-0.12:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,20:.: 0.57:1.000:. ./.:4:31,17:.: 0.64:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:46,6:.: 0.92:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.23:1.000:. ./.:4:38,12:.: 0.78:1.000:. ./.:4:82,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.26:1.000:. ./.:4:39,9:.: 0.64:1.000:. -chr5.1 77552236 chr5.1_077552236 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:22,32:0.64: 0.13:1.000:0.681 0/1/1/1:4:14,21:0.65:-1.14:1.000:0.755 0/1/1/1:4:13,30:0.73:-0.60:1.000:0.998 0/1/1/1:4:16,40:0.75: 0.27:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,28:0.69:-0.60:1.000:0.977 0/1/1/1:4:4,17:0.83:-2.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,22:0.59:-0.74:1.000:0.873 0/1/1/1:4:14,30:0.72:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,23:0.50: 0.00:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-2.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,35:0.69: 0.13:1.000:0.973 0/1/1/1:4:17,46:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,27:0.86:-1.34:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,24:0.48: 0.33:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.80:0.944:1.000 0/0/1/1:4:29,20:0.47:-0.20:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,56:0.86: 1.00:1.000:0.977 0/1/1/1:4:6,18:0.78:-1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,36:0.58: 1.07:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,59:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,26:0.76:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,19:0.74:-1.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,14:0.42:-0.87:1.000:0.923 0/1/1/1:4:13,21:0.66:-1.20:1.000:0.882 0/1/1/1:4:19,47:0.75: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,25:0.59:-0.40:1.000:0.833 0/1/1/1:4:10,30:0.78:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,20:0.85:-1.87:1.000:0.982 0/1/1/1:4:7,20:0.77:-1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,19:0.66:-1.40:1.000:0.855 0/0/0:3:21,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,24:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,18:0.43:-0.20:1.000:0.948 0/1/1/1:4:18,34:0.70: 0.00:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,32:0.76:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,32:0.64: 0.13:1.000:0.681 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,29:0.53: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,23:0.62:-0.80:1.000:0.525 0/1/1/1:4:25,49:0.70: 1.47:1.000:0.987 0/0/1/1:4:45,23:0.40: 1.07:1.000:0.811 0/1/1/1:4:24,46:0.70: 1.20:1.000:0.983 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-3.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,50:0.79: 0.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-2.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,25:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,21:0.47: 0.00:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,27:0.44: 1.34:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,57:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,33:0.78:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,44:0.74: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,39:0.78: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,45:0.77: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:25,49:0.70: 1.47:1.000:0.861 0/0/1/1:4:45,40:0.53: 2.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,24:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,34:0.58: 0.80:1.000:0.898 0/0/1/1:4:25,26:0.56:-0.07:1.000:0.960 0/1/1/1:4:20,35:0.68: 0.20:1.000:0.951 0/1/1/1:4:11,42:0.82: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,31:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,45:0.58: 2.27:1.000:0.928 0/1/1/1:4:13,45:0.80: 0.40:0.996:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.50:-0.87:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.80:0.999:1.000 1/1/1/1:4:4,36:0.91:-0.80:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,30:0.71:-0.47:1.000:0.990 0/1/1/1:4:14,33:0.74:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,30:0.62: 0.07:1.000:0.630 0/1/1/1:4:22,32:0.64: 0.13:1.000:0.681 0/1/1/1:4:20,58:0.78: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,21:0.46: 0.07:1.000:0.987 0/1/1/1:4:13,27:0.71:-0.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:33,36:0.57: 1.14:1.000:0.932 0/0/1/1:4:44,32:0.48: 1.61:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.56:-1.34:1.000:0.974 0/0/1/1:4:45,23:0.40: 1.07:1.000:0.811 0/1/1/1:4:13,36:0.77:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,40:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,35:0.68: 0.20:1.000:0.951 0/0/0/1:4:50,11:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,26:0.65:-0.60:1.000:0.795 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,32:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,12:0.38:-0.94:1.000:0.579 0/0/1/1:4:40,29:0.48: 1.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,39:0.70: 0.47:1.000:0.986 0/1/1/1:4:17,44:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,45:0.82: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,48:0.65: 1.81:1.000:0.818 0/1/1/1:4:15,35:0.74:-0.13:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,41:0.67: 0.94:1.000:0.900 0/0/1/1:4:37,28:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,58:0.83: 1.34:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.27:0.999:1.000 0/0/1/1:4:31,34:0.58: 0.87:1.000:0.928 0/1/1/1:4:12,31:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,25:0.71:-1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,36:0.54: 1.47:1.000:0.986 0/0/1/1:4:36,23:0.45: 0.47:1.000:0.982 0/1/1/1:4:19,52:0.77: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,43:0.81: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,49:0.70: 1.47:0.999:0.987 0/1/1/1:4:20,40:0.71: 0.54:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,11:0.43:-1.47:1.000:0.946 0/1/1/1:4:18,53:0.78: 1.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,49:0.83: 0.60:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,45:0.82: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,54:0.82: 1.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,43:0.65: 1.27:1.000:0.803 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,43:0.70: 0.87:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,55:0.79: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,38:0.76: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,44:0.79: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,31:0.59: 0.40:1.000:0.884 0/0/1/1:4:39,29:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:11,31:0.77:-0.67:0.993:0.976 0/0/1/1:4:22,15:0.47:-1.00:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,30:0.71:-0.47:1.000:0.990 0/1/1/1:4:8,49:0.88: 0.33:1.000:0.817 0/1/1/1:4:13,43:0.80: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,35:0.48: 2.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,38:0.71: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:35,34:0.55: 1.14:1.000:0.981 0/0/1/1:4:33,38:0.59: 1.27:1.000:0.880 0/1/1/1:4:16,38:0.74: 0.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,59:0.72: 2.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,54:0.68: 2.21:1.000:0.949 0/0/1/1:4:37,25:0.47: 0.67:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,36:0.83:-0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,29:0.69:-0.47:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,13:0.79:-2.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,27:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,38:0.76: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,43:0.73: 0.67:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,32:0.63: 0.20:1.000:0.557 0/0/1/1:4:15,16:0.57:-1.40:1.000:0.947 0/1/1/1:4:11,34:0.79:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,15:0.44:-0.80:1.000:0.964 0/0/1/1:4:29,30:0.56: 0.47:1.000:0.962 0/0/1/1:4:27,26:0.55: 0.07:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,32:0.90:-1.07:1.000:0.856 0/1/1/1:4:12,28:0.74:-0.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,15:0.43:-0.74:1.000:0.944 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,23:0.65:-0.94:1.000:0.800 0/0/1/1:4:18,12:0.46:-1.47:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,43:0.86:-0.07:1.000:0.957 0/0/1/1:4:32,36:0.58: 1.07:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,49:0.98:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,22:0.53:-0.33:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,38:0.73: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,25:0.68:-0.87:1.000:0.962 0/1/1/1:4:12,35:0.78:-0.33:1.000:1.000 -chr5.1 77751123 chr5.1_077751123 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:27,14:0.37: 0.60:1.000:0.530 0/0/1/1:4:20,12:0.40: 0.00:1.000:0.786 0/0/0/1:4:30,7:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,13:0.38: 0.33:1.000:0.575 0/0/1/1:4:29,37:0.55: 2.28:1.000:0.975 0/0/1/1:4:38,38:0.50: 2.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,7:0.53:-1.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,15:0.46: 0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:22,29:0.56: 1.27:1.000:0.964 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.53:-1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,15:0.39: 0.67:1.000:0.634 0/0/1/1:4:19,22:0.53: 0.60:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,28:0.64: 0.74:1.000:0.641 0/1/1/1:4:10,33:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,6:0.15: 1.48:1.000:0.983 0/0/1/1:4:21,37:0.62: 1.75:0.944:0.515 0/1/1/1:4:25,48:0.64: 2.75:1.000:0.709 0/0/1/1:4:32,22:0.43: 1.48:1.000:0.934 0/0/0/1:4:43,8:0.21: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,5:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,28:0.64: 0.74:1.000:0.641 0/0/1/1:4:20,12:0.40: 0.00:1.000:0.786 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,32:0.74: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,22:0.41: 1.68:1.000:0.853 0/0/0/1:4:26,6:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,17:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,37:0.54: 2.42:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,17:0.38: 1.14:1.000:0.528 0/0/1/1:4:19,16:0.47: 0.20:1.000:0.990 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:30,7:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,3:0.17:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,32:0.68: 0.94:1.000:0.943 0/1/1/1:4:12,24:0.65: 0.27:1.000:0.792 0/0/1/1:4:23,20:0.47: 0.74:1.000:0.993 0/0/0/1:4:17,2:0.14:-0.88:1.000:0.964 0/0/0/1:4:10,5:0.37:-1.14:1.000:0.616 0/0/1/1:4:14,8:0.39:-0.67:1.000:0.695 0/0/1/1:4:15,10:0.42:-0.47:1.000:0.912 0/0/0/1:4:23,8:0.31:-0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:13,22:0.62: 0.20:1.000:0.624 0/0/0/1:4:28,14:0.37: 0.67:1.000:0.616 0/0/1/1:4:17,20:0.54: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,15:0.45: 0.13:1.000:0.982 0/1/1/1:4:11,24:0.67: 0.20:1.000:0.908 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,8:0.42:-0.81:1.000:0.912 0/1/1/1:4:11,31:0.71: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,12:0.56:-0.74:1.000:0.960 0/0/1/1:4:17,14:0.46:-0.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:12,10:0.46:-0.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:21,17:0.46: 0.40:1.000:0.986 0/0/0/0/1/1:6:13,6:0.35:-0.88:1.000:0.895 0/0/0/1:4:10,2:0.22:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,13:0.44:-0.07:1.000:0.958 0/0/1/1:4:9,7:0.45:-1.08:1.000:0.980 0/0/0/1:4:10,2:0.22:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.43: 0.74:1.000:0.957 0/0/1/1:4:16,14:0.47:-0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:13,4:0.29:-1.01:1.000:0.993 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,17:0.78:-0.74:0.996:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.31:-0.34:1.000:0.978 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-1.55:0.999:0.999 0/0/1/1:4:15,13:0.47:-0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,28:0.62: 0.80:1.000:0.534 0/0/1/1:4:14,10:0.43:-0.54:1.000:0.954 0/0/1/1:4:12,12:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,30:0.71: 0.60:1.000:0.991 0/1/1/1:4:11,22:0.65: 0.07:1.000:0.792 0/0/0/1:4:29,8:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,12:0.34: 0.54:1.000:0.874 0/0/1/1:4:9,15:0.61:-0.54:1.000:0.663 0/0/1/1:4:10,9:0.48:-0.88:1.000:0.995 0/0/0/1:4:12,2:0.19:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,3:0.30:-1.35:1.000:0.986 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-0.54:1.000:0.989 0/0/1/1:4:12,15:0.55:-0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-1.41:1.000:0.695 0/0/1/1:4:12,9:0.44:-0.74:1.000:0.971 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,11:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,22:0.65: 0.07:1.000:0.792 0/0/0/1:4:25,6:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-1.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:22,10:0.35: 0.00:1.000:0.800 0/0/1/1:4:16,24:0.59: 0.54:1.000:0.864 0/0/0/1:4:13,5:0.32:-0.94:1.000:0.950 0/1/1/1:4:4,13:0.74:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,10:0.46:-0.67:1.000:0.989 0/1/1/1:4:10,25:0.69: 0.20:1.000:0.977 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-1.48:1.000:0.864 0/0/0/1:4:23,5:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,10:0.55:-0.94:1.000:0.980 0/0/0/1:4:13,6:0.35:-0.88:0.999:0.775 0/0/0/1:4:29,12:0.33: 0.60:1.000:0.906 0/1/1/1:4:6,21:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,17:0.54:-0.07:1.000:0.985 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,5:0.25:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,14:0.53:-0.40:1.000:0.990 0/0/1/1:4:26,44:0.62: 2.55:1.000:0.624 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.55:0.999:1.000 0/0/1/1:4:22,23:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,8:0.53:-1.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,14:0.44: 0.07:1.000:0.966 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-0.54:1.000:0.989 0/1/1/1:4:7,15:0.66:-0.67:1.000:0.890 0/0/0/1:4:17,3:0.20:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,10:0.30: 0.54:1.000:0.986 0/0/1/1:4:12,10:0.46:-0.67:1.000:0.989 0/1/1/1:4:12,22:0.63: 0.13:1.000:0.594 0/0/1/1:4:31,27:0.47: 1.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,9:0.53:-1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:9,13:0.58:-0.67:1.000:0.906 0/0/1/1:4:13,14:0.52:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,12:0.56:-0.74:1.000:0.960 0/0/0/1:4:8,3:0.32:-1.41:1.000:0.960 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,7:0.39:-0.88:1.000:0.736 0/0/0/1:4:35,18:0.37: 1.41:1.000:0.550 0/0/0/1/1:5:12,8:0.42:-0.81:0.993:0.957 0/0/1/1:4:18,11:0.40:-0.20:1.000:0.815 0/0/0/0:4:22,1:0.06:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,5:0.15: 0.87:1.000:0.983 0/0/1/1:4:15,19:0.55: 0.13:1.000:0.977 0/0/0/0:4:15,1:0.08:-1.08:1.000:0.982 0/1/1/1:4:4,17:0.78:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,10:0.38:-0.20:1.000:0.506 0/0/0/1:4:11,2:0.20:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,18:0.72:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,22:0.53: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:7,3:0.34:-1.48:1.000:0.874 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,26:0.54: 1.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:25,15:0.40: 0.54:1.000:0.786 0/0/1/1:4:17,30:0.62: 1.01:1.000:0.511 0/1/1/1:4:8,28:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,27:0.59: 0.87:1.000:0.864 0/1/1/1:4:25,46:0.63: 2.62:1.000:0.604 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,7:0.29:-0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,26:0.62: 0.60:1.000:0.560 0/0/1/1:4:24,17:0.43: 0.60:1.000:0.950 0/0/1/1:4:21,15:0.43: 0.27:1.000:0.954 0/0/1/1:4:17,22:0.56: 0.47:1.000:0.971 0/1/1/1:4:18,34:0.64: 1.34:1.000:0.670 0/0/1/1:4:26,21:0.46: 1.01:1.000:0.986 0/0/0/1:4:24,7:0.28:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,39:0.57: 2.35:1.000:0.936 0/0/1/1:4:26,19:0.44: 0.87:1.000:0.963 0/0/1/1:4:30,18:0.40: 1.07:1.000:0.786 0/0/1/1:4:30,16:0.38: 0.94:1.000:0.538 0/0/1/1:4:18,18:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,10:0.41:-0.40:1.000:0.846 0/0/1/1:4:26,16:0.40: 0.67:1.000:0.825 0/0/1/1:4:17,26:0.59: 0.74:1.000:0.837 0/1/1/1:4:6,26:0.78: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,8:0.25: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,15:0.40: 0.54:1.000:0.786 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,17:0.47: 0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,11:0.33: 0.40:1.000:0.918 0/0/1/1:4:45,31:0.43: 2.95:1.000:0.935 0/0/0/1:4:29,8:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,31:0.66: 0.94:1.000:0.845 0/0/0/1:4:29,15:0.37: 0.80:1.000:0.536 0/0/1/1:4:11,15:0.57:-0.40:1.000:0.949 0/0/0/1:4:36,16:0.35: 1.34:1.000:0.832 0/0/1/1:4:30,26:0.47: 1.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,17:0.56:-0.14:1.000:0.967 0/0/1/1:4:15,20:0.56: 0.20:1.000:0.960 -chr5.1 78032497 chr5.1_078032497 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:138,51:0.29: 0.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:37,123:0.70:-0.64:1.000:0.986 0/0/0/0:4:175,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,43:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:177,55:0.26: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,75:0.45:-0.13:1.000:0.981 0/1/1/1:4:50,98:0.63:-0.97:1.000:0.575 0/0/1/1:4:93,91:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,95:0.56:-0.32:1.000:0.970 0/0/0/1:4:99,13:0.13:-1.94:1.000:0.864 0/0/0/0:4:109,8:0.07:-1.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,102:0.55: 0.17:1.000:0.982 0/1/1/1:4:47,111:0.66:-0.70:1.000:0.854 0/0/1/1:4:111,95:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,81:0.53:-0.70:1.000:0.992 0/0/0/1:4:114,30:0.23:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,52:0.32:-0.24:0.944:0.951 0/0/1/1:4:113,82:0.45: 0.30:1.000:0.982 0/0/0/1:4:199,55:0.23: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:288,1:0.00: 2.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,38:0.33:-1.56:1.000:0.937 0/0/0/1:4:140,45:0.26: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,105:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,32:0.19:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,76:0.48:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:110,36:0.27:-1.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,121:0.52: 1.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,87:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,78:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,25:0.26:-2.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,14:0.36:-3.82:1.000:0.692 0/0/0/1:4:102,23:0.20:-1.59:1.000:1.000 0/0/1:3:25,18:0.45:-3.80:1.000:0.964 0/0/0/1:4:128,41:0.26:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:142,45:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,86:0.54:-0.48:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,85:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,49:0.35:-0.91:1.000:0.768 0/0/0/1:4:130,44:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,33:0.21:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,101:0.46: 1.35:1.000:0.990 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,43:0.31:-0.94:1.000:0.970 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,69:0.40: 0.11:1.000:0.751 0/0/0/1:4:151,33:0.19: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,74:0.47:-0.40:1.000:0.993 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,109:0.53: 0.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:93,79:0.49:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,92:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,93:0.53: 0.03:1.000:0.994 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,34:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:102,62:0.41:-0.54:1.000:0.585 0/0/1/1:4:135,107:0.48: 1.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,77:0.53:-0.83:1.000:0.994 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,34:0.20:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,92:0.48: 0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,32:0.23:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,86:0.47: 0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:151,37:0.21: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,98:0.52: 0.38:0.996:0.995 0/0/1/1:4:82,70:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,96:0.46: 1.11:1.000:0.987 0/0/1/1:4:98,61:0.41:-0.67:0.999:0.883 0/0/1/1:4:113,75:0.43: 0.11:1.000:0.946 0/0/0/1:4:153,48:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,67:0.41:-0.18:1.000:0.851 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,74:0.52:-0.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,97:0.47: 1.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:163,48:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,46:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,66:0.43:-0.51:1.000:0.949 0/1/1/1:4:69,139:0.63: 0.65:1.000:0.628 0/0/1/1:4:124,95:0.47: 0.95:1.000:0.991 0/0/0/1:4:142,33:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,22:0.14:-0.35:1.000:0.965 0/0/1/1:4:127,104:0.48: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,65:0.42:-0.48:1.000:0.921 0/0/1/1:4:109,59:0.38:-0.43:1.000:0.553 0/0/0/1:4:128,35:0.23:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,28:0.18:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,38:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,85:0.46: 0.41:1.000:0.987 0/0/0/1:4:190,52:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,64:0.51:-1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:192,41:0.19: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,27:0.15: 0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:135,40:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,103:0.58:-0.24:1.000:0.905 0/0/1/1:4:121,101:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,122:0.54: 1.24:1.000:0.985 0/0/0/1:4:143,28:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,79:0.52:-0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,149:0.62: 1.24:1.000:0.551 0/0/0/1:4:141,27:0.17:-0.43:0.999:0.999 0/0/0/1:4:144,39:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,73:0.44:-0.18:1.000:0.973 0/1/1/1:4:56,137:0.66: 0.25:1.000:0.884 0/0/0/1:4:224,57:0.22: 2.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,81:0.46: 0.19:1.000:0.985 0/0/1/1:4:113,105:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,48:0.23: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 1.03:0.999:1.000 0/0/1/1:4:156,101:0.42: 1.97:1.000:0.927 0/0/1/1:4:83,72:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,116:0.51: 1.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,77:0.43: 0.27:1.000:0.940 0/0/1/1:4:111,74:0.43: 0.03:1.000:0.949 0/0/0/1:4:176,49:0.24: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:186,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,64:0.43:-0.62:1.000:0.942 0/0/1/1:4:115,120:0.53: 1.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:140,48:0.28: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:136,39:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,131:0.63: 0.41:1.000:0.541 0/0/1/1:4:63,115:0.62:-0.16:1.000:0.566 0/0/1/1:4:92,70:0.47:-0.59:1.000:0.990 0/0/0/1:4:141,36:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,27:0.23:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,32:0.21:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,48:0.27: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/0/1:5:137,28:0.18:-0.51:0.993:0.998 0/0/0/1:4:117,30:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,36:0.26:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:197,74:0.30: 2.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,64:0.38: 0.00:1.000:0.505 0/0/0/1:4:138,45:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,87:0.54:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:131,32:0.21:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,45:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,132:0.65: 0.17:1.000:0.814 0/0/0/1:4:139,46:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,63:0.30: 1.16:1.000:0.985 0/0/1/1:4:145,94:0.42: 1.49:1.000:0.928 0/0/1/1:4:100,115:0.55: 0.84:1.000:0.983 0/0/0/1:4:143,51:0.28: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,118:0.52: 1.38:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,151:0.80:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,110:0.52: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,93:0.53: 0.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,31:0.41:-2.75:1.000:0.847 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,70:0.47:-0.59:1.000:0.990 0/0/0/1:4:144,56:0.30: 0.44:1.000:0.983 0/0/0/1:4:162,50:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,101:0.44: 1.68:1.000:0.970 0/0/1/1:4:98,77:0.47:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:152,50:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,100:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,31:0.24:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,74:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,50:0.27: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,33:0.26:-1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,121:0.66:-0.35:1.000:0.876 0/0/1/1:4:87,75:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,138:0.65: 0.41:1.000:0.807 0/0/0/1:4:124,48:0.30:-0.32:1.000:0.983 0/0/1/1:4:114,78:0.44: 0.22:1.000:0.963 0/0/1/1:4:100,64:0.42:-0.54:1.000:0.916 0/0/0/1:4:111,38:0.28:-0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:127,36:0.24:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,47:0.32:-0.64:1.000:0.960 0/0/1/1:4:51,95:0.62:-1.02:1.000:0.526 0/0/0/1:4:103,43:0.32:-1.02:1.000:0.958 0/0/1/1:4:97,84:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:185,55:0.25: 1.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,72:0.46:-0.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:150,20:0.13:-0.37:1.000:0.885 0/0/1/1:4:115,100:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:183,57:0.26: 1.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:199,52:0.22: 1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,131:0.71:-0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,118:0.51: 1.60:1.000:0.996 -chr5.1 78160674 chr5.1_078160674 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:147,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:109,4:.: 1.24:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:80,10:.: 0.41:1.000:. ./.:4:110,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:117,3:.: 1.50:1.000:. ./.:4:79,4:.: 0.16:1.000:. ./.:4:31,5:.:-1.54:1.000:. ./.:4:30,4:.:-1.61:1.000:. ./.:4:94,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:73,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,3:.: 0.95:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:76,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,3:.:-0.24:0.944:. ./.:4:92,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:37,6:.:-1.29:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:45,3:.:-1.11:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:89,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:75,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:105,4:.: 1.10:1.000:. ./.:4:137,4:.: 2.25:1.000:. ./.:4:120,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:88,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,1:.:-2.19:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.30:1.000:. ./.:3:42,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:51,5:.:-0.82:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:84,4:.: 0.34:1.000:. ./.:4:73,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:56,4:.:-0.67:1.000:. ./.:4:79,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:125,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:34,4:.:-1.47:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:28,7:.:-1.58:1.000:. ./.:4:96,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:23,5:.:-1.83:1.000:. ./.:4:73,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:71,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.34:1.000:. ./.:6:87,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:93,6:.: 0.74:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:36,5:.:-1.36:1.000:. ./.:4:71,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:48,8:.:-0.82:0.996:. ./.:4:122,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:76,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,2:.:-0.35:0.999:. ./.:4:44,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.47:1.000:. ./.:4:92,8:.: 0.77:1.000:. ./.:4:79,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:80,3:.: 0.16:1.000:. ./.:4:45,8:.:-0.93:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:136,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:82,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:83,6:.: 0.37:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:49,3:.:-0.96:1.000:. ./.:4:157,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:80,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,5:.:-0.53:1.000:. ./.:4:74,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:62,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:43,5:.:-1.11:1.000:. ./.:4:85,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:93,5:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:92,7:.: 0.74:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:48,2:.:-1.04:1.000:. ./.:4:44,4:.:-1.11:1.000:. ./.:4:118,3:.: 1.53:1.000:. ./.:4:71,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:56,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:74,9:.: 0.16:1.000:. ./.:4:60,6:.:-0.46:0.999:. ./.:4:63,13:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,4:.:-1.04:1.000:. ./.:4:65,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:40,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:44,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:61,6:.:-0.42:1.000:. ./.:4:56,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:104,7:.: 1.17:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:51,3:.:-0.89:1.000:. ./.:4:67,5:.:-0.24:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:19,11:.:-1.76:1.000:. ./.:4:114,5:.: 1.46:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.35:1.000:. ./.:5:53,2:.:-0.86:0.993:. ./.:4:41,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:64,5:.:-0.35:1.000:. ./.:4:76,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:33,4:.:-1.51:1.000:. ./.:4:45,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:121,2:.: 1.60:1.000:. ./.:4:52,6:.:-0.75:1.000:. ./.:4:43,3:.:-1.18:1.000:. ./.:4:109,7:.: 1.35:1.000:. ./.:4:55,7:.:-0.60:1.000:. ./.:4:85,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:72,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:40,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:25,2:.:-1.87:1.000:. ./.:4:32,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:59,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:57,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:55,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:74,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:23,3:.:-1.90:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:105,3:.: 1.06:1.000:. ./.:4:33,4:.:-1.51:1.000:. ./.:4:62,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:58,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:93,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:58,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:34,4:.:-1.47:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:68,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:84,3:.: 0.30:1.000:. ./.:4:104,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:81,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:124,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.02:1.000:. -chr5.1 78296976 chr5.1_078296976 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:132,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:0.944:. ./.:4:124,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:136,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.88:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.32:1.000:. ./.:6:52,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.40:0.996:. ./.:4:83,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.47:0.999:. ./.:4:88,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:79,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.75:0.999:. ./.:4:93,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.57:1.000:. ./.:5:47,0:.:-1.16:0.993:. ./.:4:50,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:181,1:.: 2.53:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:176,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. -chr5.1 78495340 chr5.1_078495340 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:428,107:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,316:0.74:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:383,122:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:263,240:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:519,121:0.22: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:497,163:0.27: 2.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,172:0.50:-1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:434,126:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,215:0.49:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,189:0.73:-2.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:261,66:0.23:-1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,299:0.77:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,341:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:427,137:0.27: 0.98:1.000:0.998 0/0/0/1:4:409,122:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:126,354:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:425,127:0.26: 0.85:0.944:0.999 0/0/0/1:4:377,132:0.28: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:341,310:0.50: 1.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:325,252:0.46: 1.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:270,57:0.20:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,249:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:299,264:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:288,234:0.48: 0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:163,30:0.18:-3.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:440,131:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:279,251:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:381,104:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:490,101:0.20: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,100:0.25:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:289,234:0.47: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:251,225:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,32:0.29:-3.92:1.000:0.994 0/0/0/1:4:229,81:0.29:-1.84:1.000:0.993 0/1/1:3:33,69:0.70:-4.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,286:0.52: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:291,263:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:283,262:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:254,232:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:131,322:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:141,324:0.72:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:277,212:0.46: 0.15:1.000:0.988 0/0/0/1:4:411,119:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,229:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:280,234:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:403,104:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:467,134:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:208,80:0.30:-2.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:231,193:0.48:-0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:122,309:0.74:-0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:222,182:0.48:-0.80:1.000:0.994 0/1/1/1:4:144,449:0.77: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,243:0.53: 0.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:157,367:0.72: 0.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:119,294:0.73:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:372,130:0.28: 0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:224,227:0.53:-0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:280,265:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,211:0.49:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:146,248:0.65:-0.91:1.000:0.902 0/1/1/1:4:112,362:0.78:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,313:0.74:-0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:145,248:0.65:-0.92:1.000:0.816 0/0/1/1:4:242,222:0.51:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:468,115:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:416,127:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,192:0.48:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:119,306:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:306,215:0.44: 0.50:0.996:0.966 0/0/1/1:4:211,204:0.52:-0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:295,249:0.48: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:425,104:0.22: 0.59:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,521:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,216:0.47: 0.19:1.000:0.990 0/1/1/1:4:150,305:0.69:-0.23:1.000:0.974 0/0/0/1:4:352,86:0.22:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:375,130:0.28: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:284,192:0.43: 0.00:1.000:0.947 0/0/1/1:4:273,249:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:420,129:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:98,277:0.76:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,239:0.48: 0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:151,334:0.71: 0.10:1.000:0.991 0/1/1/1:4:135,286:0.70:-0.61:1.000:0.985 0/1/1/1:4:125,356:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:283,237:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:202,159:0.47:-1.27:1.000:0.991 0/1/1/1:4:117,265:0.71:-1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:272,223:0.48: 0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:347,111:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:271,109:0.31:-1.06:1.000:0.970 0/0/1/1:4:255,195:0.46:-0.29:1.000:0.988 0/1/1/1:4:152,415:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,161:0.50:-1.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:369,127:0.28: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:462,109:0.22: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:311,81:0.23:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,385:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:403,108:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:368,118:0.27: 0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:245,224:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:278,252:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:105,254:0.73:-1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:270,199:0.45:-0.07:1.000:0.981 0/0/1/1:4:225,181:0.47:-0.77:0.999:0.993 0/1/1/1:4:134,329:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:226,197:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:265,203:0.46:-0.09:1.000:0.988 0/1/1/1:4:148,399:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:245,222:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:235,173:0.45:-0.75:1.000:0.981 0/0/0/1:4:552,177:0.27: 2.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:261,211:0.47:-0.04:0.999:0.994 0/0/1/1:4:252,347:0.60: 1.37:1.000:0.765 0/0/0/1:4:289,81:0.24:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:322,235:0.45: 0.90:1.000:0.979 0/0/1/1:4:254,194:0.46:-0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:263,227:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:111,284:0.74:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,205:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:252,225:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:382,92:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:409,124:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:471,125:0.24: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:248,209:0.48:-0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:161,346:0.70: 0.35:1.000:0.987 0/1/1/1:4:132,340:0.74:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,194:0.49:-0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:120,272:0.71:-0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:190,169:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,228:0.55:-0.42:1.000:0.983 0/0/1/1:4:252,237:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/0/1:5:333,71:0.20:-0.80:0.993:0.995 0/1/1/1:4:125,357:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,169:0.47:-1.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:365,323:0.50: 2.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:128,376:0.76: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:268,189:0.44:-0.21:1.000:0.968 0/0/0/1:4:349,81:0.21:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,211:0.48:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:141,345:0.73: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:256,196:0.46:-0.26:1.000:0.988 0/0/1/1:4:267,198:0.45:-0.12:1.000:0.982 0/0/1/1:4:210,155:0.45:-1.23:1.000:0.981 0/0/1/1:4:321,301:0.51: 1.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:508,141:0.24: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,226:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:241,234:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:466,140:0.26: 1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,218:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:289,293:0.53: 1.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:253,236:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,50:0.25:-2.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,93:0.29:-1.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:152,397:0.74: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:293,236:0.47: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:320,224:0.44: 0.76:1.000:0.965 0/0/1/1:4:318,237:0.45: 0.88:1.000:0.983 0/0/1/1:4:222,215:0.52:-0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:304,237:0.47: 0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:251,232:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:334,117:0.28:-0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:235,197:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:278,241:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:291,268:0.51: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:274,210:0.46: 0.09:1.000:0.988 0/1/1/1:4:149,347:0.72: 0.23:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,466:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,201:0.45: 0.03:1.000:0.977 0/0/1/1:4:247,230:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:128,290:0.71:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:222,182:0.48:-0.80:1.000:0.994 0/1/1/1:4:146,318:0.71:-0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:241,216:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:217,184:0.49:-0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,179:0.53:-1.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:147,447:0.77: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:145,372:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:306,212:0.44: 0.47:1.000:0.960 0/0/1/1:4:219,218:0.53:-0.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:412,110:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:172,514:0.77: 2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,242:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:119,326:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:127,326:0.74:-0.25:1.000:0.999 -chr5.1 78664280 chr5.1_078664280 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:88,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:100,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:96,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.67:0.944:. ./.:4:127,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:59,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:105,1:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:128,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:116,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:164,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:221,0:.: 3.16:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:122,0:.: 0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:143,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.11:1.000:. ./.:6:34,0:.:-2.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:146,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:177,1:.: 1.97:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.30:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:133,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:117,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:128,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:116,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:154,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:111,0:.: 0.11:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.19:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:217,0:.: 3.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.:-0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.53:1.000:. ./.:5:74,0:.:-0.91:0.993:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:99,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:115,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:89,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:113,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:100,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.:-0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:117,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:118,0:.: 0.31:1.000:. -chr5.1 78734394 chr5.1_078734394 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:84,116:0.55: 1.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:42,126:0.71: 0.29:1.000:0.989 0/0/0/1:4:94,47:0.31:-0.38:1.000:0.975 0/0/0/1:4:116,53:0.29: 0.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:177,65:0.25: 2.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,113:0.54: 0.97:1.000:0.986 0/1/1/1:4:9,47:0.79:-2.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,37:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,87:0.55:-0.21:1.000:0.977 0/0/0/1:4:46,13:0.20:-2.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,13:0.20:-2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,53:0.50:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,80:0.43: 0.43:1.000:0.949 0/0/1/1:4:78,95:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:58,102:0.60: 0.09:1.000:0.795 0/0/0/1:4:126,41:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,43:0.26:-0.11:0.944:0.999 0/0/1/1:4:67,61:0.45:-0.70:1.000:0.977 0/0/0/0:4:208,1:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,17:0.21:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,46:0.27:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,46:0.28:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,81:0.56:-0.48:1.000:0.973 0/0/0/0:4:37,4:0.09:-2.83:1.000:0.948 0/0/1/1:4:64,92:0.55:-0.01:1.000:0.975 0/0/0/1:4:94,37:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,52:0.32:-0.13:1.000:0.955 0/0/1/1:4:87,107:0.52: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,26:0.20:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,88:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,36:0.27:-0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:7,19:0.69:-3.20:1.000:0.969 0/0/1/1:4:47,33:0.39:-1.87:1.000:0.636 0/1/1:3:3,20:0.82:-3.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,103:0.52: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,36:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,46:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,47:0.29:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:136,37:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,45:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:125,49:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,94:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,48:0.27: 0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:131,49:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,10:0.36:-3.20:1.000:0.707 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,36:0.35:-1.48:1.000:0.800 0/0/1/1:4:82,84:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,118:0.52: 1.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,36:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,112:0.49: 1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,41:0.28:-0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,58:0.33: 0.21:1.000:0.934 0/0/0/1:4:116,36:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,97:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:69,71:0.48:-0.40:1.000:0.858 0/0/1/1:4:95,98:0.48: 0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,92:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,41:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,51:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,118:0.54: 1.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:57,63:0.49:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,37:0.21: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,41:0.27:-0.45:0.996:0.997 0/0/1/1:4:90,98:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,57:0.29: 0.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:49,69:0.55:-0.94:0.999:0.980 0/0/1/1:4:68,98:0.56: 0.24:1.000:0.974 0/0/0/0:4:170,1:0.01: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,104:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,37:0.28:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,49:0.31:-0.28:1.000:0.968 0/0/0/1:4:124,51:0.27: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:148,57:0.26: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,78:0.44: 0.21:1.000:0.972 0/0/1/1:4:66,72:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,106:0.47: 1.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:92,85:0.45: 0.51:1.000:0.980 0/0/1/1:4:101,87:0.43: 0.78:1.000:0.955 0/0/0/1:4:82,22:0.19:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,151:0.69: 1.24:1.000:0.966 0/0/0/1:4:80,27:0.23:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,143:0.71: 0.82:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,98:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,38:0.22:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,67:0.64:-1.43:1.000:0.720 0/0/1/1:4:109,109:0.47: 1.51:1.000:0.992 0/0/0/1:4:176,67:0.25: 2.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,113:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,69:0.40: 0.11:1.000:0.798 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,120:0.70: 0.11:1.000:0.986 0/0/1/1:4:81,95:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,54:0.29: 0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,52:0.54:-1.63:1.000:0.985 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,70:0.44:-0.21:1.000:0.972 0/1/1/1:4:35,115:0.72:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,73:0.51:-0.55:0.999:0.996 0/0/0/1:4:132,48:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,56:0.29: 0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,76:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,53:0.23: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,171:0.69: 1.88:1.000:0.973 0/0/0/1:4:125,55:0.28: 0.58:1.000:0.995 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,1:0.01: 0.36:0.999:1.000 0/0/1/1:4:100,108:0.49: 1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,15:0.20:-2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,40:0.20: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,88:0.56:-0.23:1.000:0.962 0/0/1/1:4:79,64:0.42:-0.33:1.000:0.910 0/0/1/1:4:77,85:0.49: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,1:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,86:0.43: 0.80:1.000:0.936 0/0/1/1:4:73,86:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,41:0.28:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,98:0.46: 1.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:92,91:0.47: 0.65:1.000:0.991 0/0/1/1:4:78,77:0.47:-0.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:65,68:0.48:-0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,57:0.48:-1.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,96:0.49: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,50:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:99,27:0.20:-0.74:0.993:0.996 0/0/1/1:4:75,69:0.45:-0.30:1.000:0.979 0/0/0/1:4:136,48:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,102:0.48: 1.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,152:0.76: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,48:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,56:0.47:-1.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:68,85:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:123,40:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,126:0.70: 0.33:1.000:0.982 0/0/0/0:4:131,1:0.01:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,29:0.22:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,117:0.48: 1.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:153,58:0.25: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,55:0.30: 0.38:1.000:0.988 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,57:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,84:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,56:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,69:0.42:-0.06:1.000:0.912 0/0/1/1:4:22,16:0.39:-2.90:1.000:0.730 0/0/0/1:4:63,26:0.27:-1.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,39:0.30:-0.92:1.000:0.982 0/0/0/0:4:191,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,53:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,96:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,40:0.28:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,77:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,113:0.71:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/0:4:147,1:0.01:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,41:0.31:-0.79:1.000:0.978 0/0/1/1:4:72,83:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,109:0.53: 0.90:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,89:0.55:-0.11:1.000:0.979 0/1/1/1:4:48,153:0.72: 1.09:1.000:0.994 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,39:0.32:-1.09:1.000:0.945 0/1/1/1:4:29,118:0.75:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,92:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,62:0.48:-0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,89:0.47: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:44,77:0.60:-0.87:1.000:0.804 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,141:0.74: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,63:0.30: 1.00:1.000:0.988 0/0/0/1:4:123,37:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,64:0.42:-0.35:1.000:0.922 0/0/1/1:4:71,91:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:133,48:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,53:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,73:0.47:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,98:0.52: 0.53:1.000:0.995 -chr5.1 79116987 chr5.1_079116987 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:85,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.56:0.944:. ./.:4:23,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.73:1.000:. ./.:3:5,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.24:1.000:. ./.:6:78,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.63:0.996:. ./.:4:24,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.78:0.999:. ./.:4:29,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:118,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.34:0.999:. ./.:4:116,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:87,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.02:1.000:. ./.:5:79,0:.: 0.81:0.993:. ./.:4:97,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.24:1.000:. -chr5.1 79242263 chr5.1_079242263 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:408,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:569,2:.: 1.71:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:276,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:278,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:275,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:510,0:.: 1.06:0.944:. ./.:4:403,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:696,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:603,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:212,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:200,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:439,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:312,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:104,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.58:1.000:. ./.:3:137,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:554,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:410,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:593,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:567,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:566,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.63:1.000:. ./.:6:339,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:534,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:531,0:.: 1.28:0.996:. ./.:4:322,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.64:0.999:. ./.:4:648,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:413,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:552,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:333,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:574,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:279,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:481,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:266,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:515,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:412,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:612,1:.: 2.16:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:376,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:673,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.77:0.999:. ./.:4:690,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:277,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:408,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:379,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:426,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:287,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.75:1.000:. ./.:5:346,0:.:-0.70:0.993:. ./.:4:467,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:520,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:505,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:515,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:198,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:525,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:566,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:305,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:529,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:407,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.62:1.000:. -chr5.1 80277453 chr5.1_080277453 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:92,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:36,3:.:-0.92:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:99,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:87,3:.: 0.42:1.000:. ./.:4:53,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:58,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:121,2:.: 1.28:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.73:0.944:. ./.:4:0,8:.:-1.73:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.91:1.000:. ./.:4:99,4:.: 0.76:1.000:. ./.:4:47,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:45,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:43,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,4:.:-0.92:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.91:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:114,5:.: 1.17:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:171,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:98,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:92,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.86:1.000:. ./.:6:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:24,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:101,2:.: 0.76:0.996:. ./.:4:0,1:.:-1.91:1.000:. ./.:4:129,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.92:0.999:. ./.:4:114,4:.: 1.15:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:68,3:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:67,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.91:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:88,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:44,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,2:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.91:1.000:. ./.:4:37,3:.:-0.89:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.88:1.000:. ./.:4:76,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:90,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:86,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:73,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:85,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:111,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:95,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.31:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.79:1.000:. ./.:5:42,1:.:-0.81:0.993:. ./.:4:75,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:81,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:30,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:119,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:44,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:91,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:99,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:124,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:154,2:.: 2.14:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:107,3:.: 0.94:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:129,2:.: 1.49:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:83,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:87,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:43,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:126,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:78,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:78,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:112,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:138,2:.: 1.72:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:76,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:122,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:115,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.11:1.000:. -chr5.1 80343314 chr5.1_080343314 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:647,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:539,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:549,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:695,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:726,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:567,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:553,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:121,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:899,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:615,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:662,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:593,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:567,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:784,0:.: 1.36:0.944:. ./.:4:550,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:793,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:612,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:524,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:720,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:663,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:43,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:567,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:653,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:617,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:645,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:644,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.87:1.000:. ./.:3:14,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:542,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:536,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:650,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:836,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:546,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:567,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:490,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:604,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:704,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:582,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:571,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:719,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:534,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:533,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:618,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:647,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.47:1.000:. ./.:6:431,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:532,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:358,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:349,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:652,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:638,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:678,0:.: 0.73:0.996:. ./.:4:726,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:593,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:384,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:765,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:741,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:719,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:526,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:628,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:793,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:643,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:532,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:612,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:613,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:474,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:728,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:297,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:725,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:598,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:758,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:521,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:499,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:601,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:607,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:521,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:536,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:706,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:617,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:855,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:560,0:.: 0.03:0.999:. ./.:4:643,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:522,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:564,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:628,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:695,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:384,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:540,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:525,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:359,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:385,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:659,0:.: 0.61:1.000:. ./.:5:452,0:.:-0.62:0.993:. ./.:4:634,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1028,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:639,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:536,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:500,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:502,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:347,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:772,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:841,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:732,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:542,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:807,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:739,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:615,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:650,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:743,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:794,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:675,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:497,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:540,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:737,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:851,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:549,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:890,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:570,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:653,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:359,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:518,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:672,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:800,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:522,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:658,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:622,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:694,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:798,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:871,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:536,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:698,0:.: 0.85:1.000:. -chr5.1 80599170 chr5.1_080599170 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:443,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:225,85:.: 0.25:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:323,92:.: 1.24:1.000:. ./.:4:450,2:.: 1.59:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:271,64:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,24:.:-2.20:1.000:. ./.:4:50,19:.:-2.01:1.000:. ./.:4:262,75:.: 0.51:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:309,90:.: 1.09:1.000:. ./.:4:265,93:.: 0.71:0.944:. ./.:4:399,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:274,67:.: 0.55:1.000:. ./.:4:338,96:.: 1.42:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:312,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:398,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:280,76:.: 0.69:1.000:. ./.:4:24,10:.:-2.34:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:472,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:242,89:.: 0.45:1.000:. ./.:4:459,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,1:.:-2.27:1.000:. ./.:4:54,1:.:-2.14:1.000:. ./.:3:32,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:270,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:275,83:.: 0.71:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:260,66:.: 0.41:1.000:. ./.:4:172,63:.:-0.45:1.000:. ./.:4:210,66:.:-0.06:1.000:. ./.:4:194,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:161,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:156,46:.:-0.76:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:292,85:.: 0.88:1.000:. ./.:4:763,0:.: 4.51:1.000:. ./.:4:168,60:.:-0.52:1.000:. ./.:4:172,60:.:-0.48:1.000:. ./.:4:161,65:.:-0.53:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:160,55:.:-0.64:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:274,78:.: 0.65:1.000:. ./.:4:268,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:154,35:.:-0.88:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.84:1.000:. ./.:6:169,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:97,47:.:-1.30:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:148,34:.:-0.95:1.000:. ./.:4:218,72:.: 0.07:1.000:. ./.:4:165,49:.:-0.65:0.996:. ./.:4:292,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:264,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:111,107:.:-0.61:1.000:. ./.:4:300,90:.: 1.01:1.000:. ./.:4:153,61:.:-0.65:1.000:. ./.:4:141,40:.:-0.96:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:197,72:.:-0.13:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:142,54:.:-0.82:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:227,77:.: 0.20:1.000:. ./.:4:146,50:.:-0.82:1.000:. ./.:4:272,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:153,62:.:-0.64:1.000:. ./.:4:171,51:.:-0.57:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.85:1.000:. ./.:4:118,43:.:-1.15:1.000:. ./.:4:130,27:.:-1.18:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:171,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.09:0.999:. ./.:4:169,39:.:-0.70:1.000:. ./.:4:123,52:.:-1.01:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:333,99:.: 1.40:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:294,92:.: 0.97:1.000:. ./.:4:159,49:.:-0.70:0.999:. ./.:4:221,150:.: 0.83:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:138,34:.:-1.04:1.000:. ./.:4:153,56:.:-0.69:1.000:. ./.:4:141,51:.:-0.85:1.000:. ./.:4:169,55:.:-0.55:1.000:. ./.:4:206,78:.: 0.01:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:386,105:.: 1.96:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:227,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:121,37:.:-1.17:1.000:. ./.:4:106,36:.:-1.32:1.000:. ./.:4:134,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.02:1.000:. ./.:5:134,30:.:-1.12:0.993:. ./.:4:214,93:.: 0.23:1.000:. ./.:4:313,3:.: 0.31:1.000:. ./.:4:453,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:148,58:.:-0.72:1.000:. ./.:4:150,53:.:-0.75:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:247,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:129,30:.:-1.16:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:550,1:.: 2.52:1.000:. ./.:4:276,74:.: 0.63:1.000:. ./.:4:275,71:.: 0.59:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:350,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:269,73:.: 0.56:1.000:. ./.:4:226,69:.: 0.11:1.000:. ./.:4:264,85:.: 0.62:1.000:. ./.:4:444,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:271,88:.: 0.72:1.000:. ./.:4:346,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:460,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:348,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:206,73:.:-0.04:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:400,120:.: 2.23:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:264,64:.: 0.42:1.000:. ./.:4:279,85:.: 0.76:1.000:. ./.:4:286,88:.: 0.86:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:157,57:.:-0.65:1.000:. ./.:4:250,79:.: 0.43:1.000:. ./.:4:220,59:.:-0.04:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:208,54:.:-0.20:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:237,76:.: 0.28:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:222,72:.: 0.10:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:360,119:.: 1.84:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:302,95:.: 1.07:1.000:. -chr6.1 154781 chr6.1_000154781 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:96,183:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.38:1.000:. ./.:4:100,189:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.40:1.000:. ./.:4:116,258:.: 2.58:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,106:.:-2.17:1.000:. ./.:4:86,159:.: 0.30:1.000:. ./.:4:83,161:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,72:.:-1.85:1.000:. ./.:4:46,68:.:-2.03:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.19:1.000:. ./.:4:96,173:.: 0.72:1.000:. ./.:4:77,208:.: 1.00:1.000:. ./.:5:90,251:.: 2.00:0.734:. ./.:4:0,273:.: 0.79:1.000:. ./.:4:121,238:.: 2.32:1.000:. ./.:4:0,274:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:76,149:.:-0.06:1.000:. ./.:4:105,223:.: 1.77:1.000:. ./.:4:91,143:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,59:.:-3.00:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.07:1.000:. ./.:4:107,197:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,70:.:-2.81:1.000:. ./.:4:0,90:.:-2.45:1.000:. ./.:3:28,35:.:-2.93:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.40:1.000:. ./.:5:88,210:.: 1.24:0.999:. ./.:4:86,205:.: 1.11:1.000:. ./.:4:87,166:.: 0.44:1.000:. ./.:4:108,148:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.90:1.000:. ./.:4:89,149:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.61:1.000:. ./.:4:88,170:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,320:.: 1.63:0.999:. ./.:4:0,146:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,163:.:-1.16:1.000:. ./.:4:86,135:.:-0.13:1.000:. ./.:4:62,159:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,302:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.57:1.000:. ./.:4:81,188:.: 0.72:1.000:. ./.:4:102,182:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.18:1.000:. ./.:4:65,133:.:-0.54:1.000:. ./.:6:38,144:.:-0.82:1.000:. ./.:4:84,158:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,174:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.17:1.000:. ./.:4:97,183:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,114:.:-2.03:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.93:0.994:. ./.:4:0,251:.: 0.40:1.000:. ./.:4:91,197:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,144:.:-1.50:0.999:. ./.:4:0,188:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.56:1.000:. ./.:4:86,142:.:-0.01:1.000:. ./.:4:80,137:.:-0.20:1.000:. ./.:4:87,175:.: 0.60:1.000:. ./.:4:108,202:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,147:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.02:1.000:. ./.:4:77,159:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,155:.:-1.30:1.000:. ./.:4:102,193:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,160:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.82:1.000:. ./.:4:81,163:.: 0.28:1.000:. ./.:4:69,151:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.52:1.000:. ./.:4:82,169:.: 0.40:1.000:. ./.:4:69,124:.:-0.63:1.000:. ./.:4:79,159:.: 0.17:1.000:. ./.:4:98,155:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.77:1.000:. ./.:4:85,169:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,179:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,122:.:-1.89:1.000:. ./.:4:93,169:.: 0.60:1.000:. ./.:4:60,123:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.15:0.998:. ./.:4:0,244:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,147:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.38:1.000:. ./.:4:188,100:.: 1.06:1.000:. ./.:4:76,152:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,308:.: 1.41:1.000:. ./.:4:76,195:.: 0.76:1.000:. ./.:4:88,173:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,158:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,141:.:-1.55:1.000:. ./.:4:64,128:.:-0.64:1.000:. ./.:4:93,139:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.86:1.000:. ./.:4:83,165:.: 0.35:1.000:. ./.:4:87,150:.: 0.15:1.000:. ./.:4:100,167:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,226:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.84:1.000:. ./.:4:82,208:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,163:.:-1.16:1.000:. ./.:4:0,156:.:-1.28:1.000:. ./.:4:58,133:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.47:1.000:. ./.:4:81,121:.:-0.47:1.000:. ./.:4:97,69:.:-1.10:0.975:. ./.:4:0,230:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.93:1.000:. ./.:4:96,173:.: 0.72:1.000:. ./.:4:78,149:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,162:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.50:1.000:. ./.:4:65,123:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,292:.: 1.13:1.000:. ./.:4:104,210:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.54:1.000:. ./.:4:82,173:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.72:1.000:. ./.:4:69,142:.:-0.31:1.000:. ./.:4:116,219:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,61:.:-2.97:1.000:. ./.:4:66,120:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.69:1.000:. ./.:4:106,217:.: 1.68:1.000:. ./.:4:77,194:.: 0.76:1.000:. ./.:4:74,149:.:-0.09:1.000:. ./.:4:93,189:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,217:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.87:1.000:. ./.:4:97,171:.: 0.70:1.000:. ./.:4:98,179:.: 0.86:1.000:. ./.:4:103,158:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.06:1.000:. ./.:4:73,181:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1,270:.: 0.76:0.999:. ./.:4:0,223:.:-0.09:1.000:. ./.:4:88,145:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,168:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.08:1.000:. ./.:4:103,175:.: 0.88:1.000:. ./.:4:102,201:.: 1.32:1.000:. ./.:4:115,215:.: 1.80:1.000:. ./.:4:89,160:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.42:1.000:. -chr6.1 246226 chr6.1_000246226 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,12:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.39:1.000:. ./.:4:18,11:.:-1.14:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:29,25:.: 0.98:1.000:. ./.:4:31,26:.: 1.23:1.000:. ./.:4:12,11:.:-1.64:1.000:. ./.:4:21,26:.: 0.39:1.000:. ./.:4:18,22:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,6:.:-2.49:1.000:. ./.:4:12,5:.:-2.15:1.000:. ./.:4:14,16:.:-1.05:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:21,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.63:1.000:. ./.:5:49,9:.: 1.32:0.734:. ./.:4:32,10:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,25:.: 1.82:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:9,24:.:-0.80:1.000:. ./.:4:32,21:.: 0.89:1.000:. ./.:4:26,17:.: 0.05:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:29,12:.:-0.12:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,12:.: 0.64:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:5,1:.:-3.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:5,4:.:-2.83:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.12:1.000:. ./.:5:32,15:.: 0.39:0.999:. ./.:4:39,15:.: 0.98:1.000:. ./.:4:28,16:.: 0.13:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:28,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:43,14:.: 1.23:1.000:. ./.:4:43,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:41,13:.: 0.98:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:43,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:35,7:.:-0.04:1.000:. ./.:4:22,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:31,21:.: 0.81:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.97:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:39,9:.: 0.47:1.000:. ./.:4:30,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:25,17:.:-0.04:1.000:. ./.:6:32,7:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,11:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:41,21:.: 1.65:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:50,8:.: 1.32:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.13:1.000:. ./.:4:12,7:.:-1.98:1.000:. ./.:4:45,9:.: 0.98:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.81:0.994:. ./.:4:32,4:.:-0.54:1.000:. ./.:4:30,30:.: 1.48:1.000:. ./.:4:13,12:.:-1.48:0.999:. ./.:4:41,14:.: 1.06:1.000:. ./.:4:34,7:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,14:.: 0.89:1.000:. ./.:4:16,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:33,10:.: 0.05:1.000:. ./.:4:35,18:.: 0.89:1.000:. ./.:4:23,25:.: 0.47:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:23,5:.:-1.22:1.000:. ./.:4:47,9:.: 1.15:1.000:. ./.:4:43,11:.: 0.98:1.000:. ./.:4:19,12:.:-0.97:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,22:.: 1.32:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:27,20:.: 0.39:1.000:. ./.:4:28,14:.:-0.04:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,10:.: 1.15:1.000:. ./.:4:50,16:.: 1.99:1.000:. ./.:4:18,8:.:-1.39:1.000:. ./.:4:11,25:.:-0.54:1.000:. ./.:4:27,31:.: 1.32:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:37,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:40,8:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,17:.: 1.40:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:48,16:.: 1.82:1.000:. ./.:4:37,13:.: 0.64:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.81:0.998:. ./.:4:45,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:22,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:34,13:.: 0.39:1.000:. ./.:4:18,14:.:-0.88:1.000:. ./.:4:26,19:.: 0.22:1.000:. ./.:4:35,14:.: 0.55:1.000:. ./.:4:46,12:.: 1.32:1.000:. ./.:4:27,15:.:-0.04:1.000:. ./.:4:24,2:.:-1.39:1.000:. ./.:4:38,6:.: 0.13:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:26,18:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:29,20:.: 0.55:1.000:. ./.:4:32,12:.: 0.13:1.000:. ./.:4:37,15:.: 0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:20,21:.:-0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:16,13:.:-1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:31,11:.:-0.04:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:17,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:11,13:.:-1.56:0.975:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:40,6:.: 0.30:1.000:. ./.:4:45,14:.: 1.40:1.000:. ./.:4:39,9:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:31,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,7:.: 0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,7:.: 0.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:25,29:.: 0.98:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:30,13:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,9:.: 0.47:1.000:. ./.:4:40,26:.: 1.99:1.000:. ./.:4:32,8:.:-0.21:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:35,7:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,25:.: 0.13:1.000:. ./.:4:49,9:.: 1.32:1.000:. ./.:4:17,22:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,7:.: 0.13:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.63:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.47:1.000:. ./.:4:43,18:.: 1.57:1.000:. ./.:4:6,5:.:-2.66:1.000:. ./.:4:31,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:13,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:38,8:.: 0.30:0.999:. ./.:4:44,14:.: 1.32:1.000:. ./.:4:30,17:.: 0.39:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:38,14:.: 0.81:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,7:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,18:.:-0.12:1.000:. ./.:4:24,15:.:-0.29:1.000:. ./.:4:30,26:.: 1.15:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.05:1.000:. -chr6.1 499041 chr6.1_000499041 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:301,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:156,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:354,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.00:1.000:. ./.:5:329,0:.: 1.63:0.734:. ./.:4:263,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:294,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:96,0:.:-2.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:265,0:.: 0.62:1.000:. ./.:5:305,0:.: 1.25:0.999:. ./.:4:210,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.54:0.999:. ./.:4:39,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:233,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:162,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.44:0.994:. ./.:4:197,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.47:0.999:. ./.:4:202,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:266,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.09:0.998:. ./.:4:225,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:359,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.47:0.975:. ./.:4:207,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:360,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:368,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:204,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:370,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.15:1.000:. -chr6.1 791971 chr6.1_000791971 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:227,82:.: 1.55:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:176,60:.: 0.41:1.000:. ./.:4:224,99:.: 1.77:1.000:. ./.:4:208,99:.: 1.52:1.000:. ./.:4:127,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:186,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:62,20:.:-1.99:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:115,85:.:-0.15:1.000:. ./.:4:144,82:.: 0.26:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:181,66:.: 0.58:1.000:. ./.:5:219,82:.: 1.42:0.734:. ./.:4:266,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:144,114:.: 0.75:1.000:. ./.:4:34,28:.:-2.30:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:224,76:.: 1.41:1.000:. ./.:4:189,79:.: 0.91:1.000:. ./.:4:16,1:.:-3.00:1.000:. ./.:4:204,71:.: 1.02:1.000:. ./.:4:119,65:.:-0.40:1.000:. ./.:4:115,62:.:-0.51:1.000:. ./.:4:341,2:.: 2.08:1.000:. ./.:4:210,65:.: 1.02:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:118,48:.:-0.68:1.000:. ./.:4:10,11:.:-2.94:1.000:. ./.:4:47,21:.:-2.21:1.000:. ./.:3:18,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:122,62:.:-0.40:1.000:. ./.:5:169,1:.:-0.62:0.999:. ./.:4:222,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:205,82:.: 1.21:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:112,70:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,75:.:-0.09:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:115,88:.:-0.10:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:135,110:.: 0.55:0.999:. ./.:4:25,14:.:-2.66:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,86:.: 0.16:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:220,82:.: 1.44:1.000:. ./.:4:207,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:168,66:.: 0.38:1.000:. ./.:4:113,132:.: 0.55:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.71:1.000:. ./.:6:140,21:.:-0.76:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:135,76:.: 0.02:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:111,72:.:-0.41:1.000:. ./.:4:109,54:.:-0.73:1.000:. ./.:4:157,67:.: 0.22:1.000:. ./.:4:125,65:.:-0.31:1.000:. ./.:4:141,71:.: 0.04:1.000:. ./.:4:125,82:.:-0.04:0.994:. ./.:4:221,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:206,76:.: 1.13:1.000:. ./.:4:79,50:.:-1.26:0.999:. ./.:4:231,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:191,64:.: 0.71:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:161,47:.:-0.03:1.000:. ./.:4:174,85:.: 0.77:1.000:. ./.:4:184,73:.: 0.74:1.000:. ./.:4:196,65:.: 0.80:1.000:. ./.:4:119,86:.:-0.07:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:126,90:.: 0.10:1.000:. ./.:4:229,80:.: 1.55:1.000:. ./.:4:155,74:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,49:.:-1.27:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:135,63:.:-0.18:1.000:. ./.:4:155,60:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,89:.: 0.78:1.000:. ./.:4:145,73:.: 0.13:1.000:. ./.:4:82,62:.:-1.02:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:234,95:.: 1.86:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:165,64:.: 0.30:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:223,62:.: 1.17:1.000:. ./.:4:211,88:.: 1.39:1.000:. ./.:4:102,79:.:-0.45:1.000:. ./.:4:191,88:.: 1.08:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:208,98:.: 1.50:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.01:0.998:. ./.:4:147,66:.: 0.05:1.000:. ./.:4:167,51:.: 0.13:1.000:. ./.:4:223,82:.: 1.49:1.000:. ./.:4:181,90:.: 0.96:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:148,73:.: 0.18:1.000:. ./.:4:238,93:.: 1.89:1.000:. ./.:4:171,62:.: 0.36:1.000:. ./.:4:56,35:.:-1.85:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:109,70:.:-0.48:1.000:. ./.:4:150,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:147,68:.: 0.08:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:118,85:.:-0.10:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:199,88:.: 1.21:1.000:. ./.:4:173,54:.: 0.27:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:132,66:.:-0.18:1.000:. ./.:4:129,65:.:-0.24:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:139,55:.:-0.24:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.59:0.975:. ./.:4:70,57:.:-1.29:1.000:. ./.:4:107,57:.:-0.71:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:147,60:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,64:.:-0.76:1.000:. ./.:4:124,53:.:-0.51:1.000:. ./.:4:120,77:.:-0.20:1.000:. ./.:4:197,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:263,95:.: 2.31:1.000:. ./.:4:233,106:.: 2.02:1.000:. ./.:4:227,86:.: 1.61:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:130,175:.: 1.49:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:31,14:.:-2.56:1.000:. ./.:4:120,48:.:-0.65:1.000:. ./.:4:176,76:.: 0.66:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:102,75:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,57:.:-0.77:1.000:. ./.:4:173,69:.: 0.50:1.000:. ./.:4:188,77:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:195,78:.: 0.99:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.96:0.999:. ./.:4:171,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:119,60:.:-0.48:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:112,142:.: 0.69:1.000:. ./.:4:138,59:.:-0.20:1.000:. ./.:4:117,82:.:-0.17:1.000:. ./.:4:226,101:.: 1.83:1.000:. ./.:4:124,87:.: 0.02:1.000:. ./.:4:147,77:.: 0.22:1.000:. ./.:4:128,69:.:-0.20:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:211,93:.: 1.47:1.000:. ./.:4:274,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.46:1.000:. -chr6.1 945304 chr6.1_000945304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:115,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.91:1.000:. ./.:5:135,0:.:-0.27:0.734:. ./.:4:61,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:167,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:112,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.45:1.000:. ./.:3:50,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.50:1.000:. ./.:5:114,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:133,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:81,1:.:-1.14:0.999:. ./.:4:127,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:237,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:353,0:.: 3.31:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.34:1.000:. ./.:6:102,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.50:0.994:. ./.:4:144,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:281,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:153,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:286,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:296,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:276,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.16:0.998:. ./.:4:141,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:245,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:239,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:218,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.45:0.975:. ./.:4:170,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:230,1:.: 1.31:0.999:. ./.:4:143,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:216,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:390,0:.: 3.92:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.38:1.000:. -chr6.1 1415377 chr6.1_001415377 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:120,60:0.30: 0.29:1.000:0.989 0/0/0/1:4:91,50:0.31:-0.47:1.000:0.967 0/0/1/1:4:84,119:0.52: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,102:0.56:-0.02:1.000:0.970 0/0/0/1:4:113,56:0.29: 0.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:156,76:0.29: 1.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:70,45:0.35:-0.99:1.000:0.823 0/0/1/1:4:96,116:0.48: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:102,57:0.32:-0.12:1.000:0.960 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-3.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,20:0.78:-2.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,62:0.35:-0.16:1.000:0.796 0/0/1/1:4:61,112:0.58: 0.16:1.000:0.898 0/0/1/1:4:79,107:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,113:0.54: 0.45:1.000:0.989 0/0/0/1:4:132,84:0.34: 1.00:1.000:0.839 0/0/1/1/1:5:75,174:0.64: 1.65:0.734:0.943 0/0/0/1:4:130,68:0.30: 0.65:1.000:0.981 0/0/1/1:4:99,112:0.47: 0.90:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,136:0.53: 1.24:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,14:0.91:-2.96:1.000:0.956 0/0/0/1:4:105,59:0.32:-0.02:1.000:0.957 0/0/0/1:4:125,64:0.30: 0.47:1.000:0.985 0/0/0/1:4:83,56:0.36:-0.51:1.000:0.726 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-3.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,66:0.29: 0.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:89,111:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,122:0.60: 0.35:1.000:0.762 0/1/1/1:4:50,190:0.73: 1.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,145:0.76: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,253:1.00: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,108:0.57: 0.10:1.000:0.943 0/0/1/1:4:5,5:0.44:-3.06:1.000:0.971 0/0/1/1:4:8,15:0.59:-2.80:1.000:0.873 0/1/1:3:1,6:0.81:-3.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,186:0.78: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:84,184:0.62: 2.03:0.999:0.961 0/0/1/1:4:63,115:0.58: 0.25:1.000:0.904 0/1/1/1:4:44,154:0.72: 0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:139,64:0.28: 0.75:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,206:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,103:0.53: 0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,113:0.52: 0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,143:0.77: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,112:0.63:-0.08:1.000:0.597 0/0/1/1:4:70,105:0.54: 0.20:1.000:0.990 0/1/1/1:4:37,181:0.77: 1.04:0.999:1.000 0/1/1/1:4:79,253:0.70: 3.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:56,93:0.56:-0.32:1.000:0.967 0/0/1/1:4:98,128:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,148:0.80: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,186:0.63: 2.07:1.000:0.506 1/1/1/1:4:1,206:0.99: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,54:0.37:-0.71:1.000:0.555 0/1/1/1:4:28,180:0.82: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,181:0.82: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,122:0.56: 0.57:1.000:0.958 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,109:0.57: 0.16:1.000:0.956 0/1/1/1/1/1:6:24,115:0.77:-0.51:1.000:0.740 0/1/1/1:4:33,155:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,115:0.54: 0.47:1.000:0.985 0/1/1/1:4:23,186:0.85: 0.87:1.000:0.982 0/1/1/1:4:28,142:0.78: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,134:0.53: 1.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:78,87:0.47: 0.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,70:0.56:-1.05:1.000:0.965 0/0/1/1:4:54,93:0.57:-0.36:1.000:0.950 0/0/1/1:4:53,113:0.62: 0.02:0.994:0.602 0/0/1/1:4:65,85:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:95,52:0.31:-0.36:1.000:0.968 0/0/0/1:4:55,37:0.36:-1.44:0.999:0.733 0/0/1/1:4:77,106:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:132,66:0.30: 0.65:1.000:0.989 0/0/1/1:4:52,103:0.60:-0.20:1.000:0.782 0/0/0/1:4:97,45:0.28:-0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,50:0.36:-0.81:1.000:0.723 0/0/1/1:4:56,113:0.61: 0.08:1.000:0.742 0/0/1/1:4:64,113:0.57: 0.23:1.000:0.933 0/0/1/1:4:78,111:0.52: 0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,107:0.81:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,62:0.42:-0.67:1.000:0.910 0/1/1/1:4:41,110:0.67:-0.28:1.000:0.902 0/0/0/1:4:93,44:0.28:-0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,85:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,120:0.56: 0.51:1.000:0.959 0/1/1/1:4:21,101:0.77:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,42:0.31:-0.87:1.000:0.977 0/0/0/1:4:76,40:0.31:-0.97:1.000:0.980 0/0/1/1:4:61,98:0.55:-0.12:1.000:0.978 0/1/1/1:4:26,141:0.79: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,133:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,55:0.35:-0.53:1.000:0.765 0/0/1/1:4:48,104:0.62:-0.26:1.000:0.557 0/0/0/1:4:106,67:0.34: 0.16:1.000:0.850 0/0/1/1:4:45,95:0.62:-0.49:1.000:0.630 0/1/1/1:4:22,136:0.82:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,88:0.60:-0.65:1.000:0.762 0/0/1/1:4:79,71:0.42:-0.30:1.000:0.910 0/0/0/1:4:95,52:0.31:-0.36:1.000:0.968 0/1/1/1:4:24,128:0.79:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,112:0.61: 0.02:1.000:0.676 0/0/1/1:4:28,54:0.59:-1.64:1.000:0.831 0/1/1/1:4:27,116:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,159:0.89: 0.18:0.998:0.620 0/0/1/1:4:66,126:0.59: 0.53:1.000:0.847 0/0/0/1:4:76,44:0.32:-0.89:1.000:0.940 0/0/1/1:4:61,124:0.61: 0.39:1.000:0.726 0/0/1/1:4:90,136:0.54: 1.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:104,67:0.35: 0.12:1.000:0.819 0/0/1/1:4:58,104:0.58:-0.06:1.000:0.921 0/0/1/1:4:100,129:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,52:0.37:-0.81:1.000:0.546 0/0/0/1:4:100,53:0.31:-0.24:1.000:0.978 0/0/1/1:4:59,86:0.53:-0.40:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,152:0.82: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,138:0.81:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,91:0.57:-0.42:1.000:0.951 0/0/1/1:4:49,101:0.61:-0.30:1.000:0.692 0/0/0/1:4:92,51:0.32:-0.44:1.000:0.963 0/1/1/1:4:14,128:0.87:-0.46:1.000:0.917 0/0/1/1:4:53,106:0.60:-0.12:1.000:0.762 0/1/1/1:4:36,150:0.74: 0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,161:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,50:0.39:-1.01:1.000:0.672 0/1/1/1:4:38,130:0.71: 0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:45,92:0.61:-0.55:1.000:0.712 0/0/1/1:4:31,61:0.60:-1.44:1.000:0.795 0/0/1/1:4:40,79:0.60:-0.91:1.000:0.788 1/1/1/1:4:0,164:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,32:0.34:-1.60:0.975:0.885 0/0/1/1:4:59,107:0.58: 0.02:1.000:0.911 0/0/1/1:4:73,103:0.52: 0.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,254:0.75: 2.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,95:0.49: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,83:0.65:-0.97:1.000:0.816 0/0/1/1:4:36,78:0.62:-1.01:1.000:0.557 0/1/1/1:4:33,75:0.63:-1.13:1.000:0.581 0/1/1/1:4:44,99:0.63:-0.44:1.000:0.552 0/1/1/1:4:27,147:0.79: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,153:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,68:0.57:-1.13:1.000:0.957 0/0/1/1:4:89,137:0.54: 1.20:1.000:0.986 0/0/0/1:4:126,72:0.32: 0.65:1.000:0.948 0/0/1/1:4:66,129:0.60: 0.59:1.000:0.808 0/0/1/1:4:88,136:0.54: 1.16:1.000:0.986 0/0/0/1:4:170,82:0.29: 1.71:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,170:0.83: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,112:0.53: 0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,109:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.54:-3.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:56,90:0.55:-0.38:1.000:0.977 0/0/1/1:4:76,146:0.59: 1.12:1.000:0.837 0/0/1/1:4:66,124:0.59: 0.49:1.000:0.870 0/0/1/1:4:80,120:0.54: 0.69:1.000:0.990 0/0/0/1:4:103,68:0.35: 0.12:1.000:0.773 0/1/1/1:4:35,159:0.76: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,121:0.59: 0.41:1.000:0.882 0/0/0/1:4:94,60:0.34:-0.22:1.000:0.835 0/0/0/1:4:113,50:0.27:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,46:0.28:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,109:0.51: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,133:0.48: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,123:0.59: 0.43:1.000:0.837 0/0/0/1:4:70,45:0.35:-0.99:1.000:0.823 0/0/0/1:4:92,51:0.32:-0.44:0.999:0.963 0/0/1/1:4:58,98:0.56:-0.18:1.000:0.960 0/0/1/1:4:98,102:0.45: 0.69:1.000:0.981 0/0/1/1:4:57,108:0.59: 0.00:1.000:0.858 0/1/1/1:4:28,154:0.80: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,53:0.31:-0.32:1.000:0.965 0/0/1/1:4:59,113:0.59: 0.14:1.000:0.842 0/0/1/1:4:56,103:0.58:-0.12:1.000:0.896 0/1/1/1:4:37,175:0.77: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,112:0.53: 0.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,101:0.55:-0.02:1.000:0.978 0/0/1/1:4:74,83:0.47:-0.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:65,122:0.59: 0.43:1.000:0.871 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,118:0.53: 0.63:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,112:0.75:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,128:0.55: 0.85:1.000:0.979 -chr6.1 1698161 chr6.1_001698161 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:175,51:.:-0.22:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:133,131:.: 0.47:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:167,144:.: 1.32:1.000:. ./.:4:162,154:.: 1.41:1.000:. ./.:4:112,92:.:-0.62:1.000:. ./.:4:188,63:.: 0.23:1.000:. ./.:4:127,116:.: 0.09:1.000:. ./.:4:48,67:.:-2.23:1.000:. ./.:4:73,25:.:-2.54:1.000:. ./.:4:118,109:.:-0.20:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:123,128:.: 0.23:1.000:. ./.:4:177,67:.: 0.11:1.000:. ./.:5:280,64:.: 1.92:0.734:. ./.:4:221,71:.: 0.98:1.000:. ./.:4:178,167:.: 1.94:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:99,1:.:-2.51:1.000:. ./.:4:59,191:.: 0.21:1.000:. ./.:4:233,74:.: 1.25:1.000:. ./.:4:136,120:.: 0.32:1.000:. ./.:4:93,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:210,69:.: 0.74:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:217,71:.: 0.90:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:35,19:.:-3.34:1.000:. ./.:4:94,35:.:-1.98:1.000:. ./.:3:7,34:.:-3.58:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.50:1.000:. ./.:5:202,120:.: 1.52:0.999:. ./.:4:191,52:.: 0.09:1.000:. ./.:4:220,75:.: 1.03:1.000:. ./.:4:248,97:.: 1.94:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:178,64:.: 0.07:1.000:. ./.:4:196,66:.: 0.43:1.000:. ./.:4:189,71:.: 0.40:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.19:0.999:. ./.:4:24,0:.:-3.88:1.000:. ./.:4:157,51:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,52:.:-1.40:1.000:. ./.:4:140,54:.:-0.80:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:159,101:.: 0.40:1.000:. ./.:4:175,50:.:-0.24:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:192,62:.: 0.29:1.000:. ./.:4:135,113:.: 0.18:1.000:. ./.:4:113,100:.:-0.46:1.000:. ./.:6:155,35:.:-0.87:1.000:. ./.:4:195,62:.: 0.34:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:180,77:.: 0.34:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:231,73:.: 1.19:1.000:. ./.:4:178,48:.:-0.22:1.000:. ./.:4:176,53:.:-0.17:1.000:. ./.:4:195,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.61:0.994:. ./.:4:169,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:133,117:.: 0.21:1.000:. ./.:4:174,46:.:-0.33:0.999:. ./.:4:238,84:.: 1.52:1.000:. ./.:4:168,59:.:-0.20:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:130,114:.: 0.11:1.000:. ./.:4:193,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:166,52:.:-0.37:1.000:. ./.:4:120,158:.: 0.72:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:120,93:.:-0.46:1.000:. ./.:4:206,84:.: 0.94:1.000:. ./.:4:216,70:.: 0.87:1.000:. ./.:4:97,102:.:-0.71:1.000:. ./.:4:227,60:.: 0.89:1.000:. ./.:4:138,130:.: 0.54:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:155,51:.:-0.58:1.000:. ./.:4:108,124:.:-0.11:1.000:. ./.:4:142,59:.:-0.67:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:133,48:.:-1.04:1.000:. ./.:4:230,59:.: 0.92:1.000:. ./.:4:122,44:.:-1.31:1.000:. ./.:4:77,219:.: 1.05:1.000:. ./.:4:107,124:.:-0.13:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,46:.:-0.71:1.000:. ./.:4:198,70:.: 0.54:1.000:. ./.:4:196,63:.: 0.38:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:201,76:.: 0.70:1.000:. ./.:4:128,36:.:-1.35:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.03:0.998:. ./.:4:244,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:182,54:.:-0.04:1.000:. ./.:4:150,64:.:-0.44:1.000:. ./.:4:244,85:.: 1.65:1.000:. ./.:4:109,144:.: 0.27:1.000:. ./.:4:110,113:.:-0.28:1.000:. ./.:4:263,87:.: 2.03:1.000:. ./.:4:164,53:.:-0.38:1.000:. ./.:4:130,154:.: 0.83:1.000:. ./.:4:114,39:.:-1.55:1.000:. ./.:4:200,56:.: 0.32:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:103,95:.:-0.73:1.000:. ./.:4:157,60:.:-0.38:1.000:. ./.:4:207,3:.:-0.51:1.000:. ./.:4:119,114:.:-0.09:1.000:. ./.:4:147,52:.:-0.71:1.000:. ./.:4:205,62:.: 0.52:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:124,106:.:-0.15:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:106,90:.:-0.77:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:156,34:.:-0.87:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:122,52:.:-1.16:1.000:. ./.:4:89,75:.:-1.35:0.975:. ./.:4:226,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:173,65:.: 0.00:1.000:. ./.:4:141,42:.:-1.00:1.000:. ./.:4:164,38:.:-0.66:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:185,51:.:-0.04:1.000:. ./.:4:158,53:.:-0.49:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:129,57:.:-0.95:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:149,147:.: 1.05:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:180,62:.: 0.07:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:185,60:.: 0.12:1.000:. ./.:4:160,137:.: 1.07:1.000:. ./.:4:182,61:.: 0.09:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:169,49:.:-0.37:1.000:. ./.:4:306,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:214,68:.: 0.79:1.000:. ./.:4:159,154:.: 1.36:1.000:. ./.:4:143,136:.: 0.74:1.000:. ./.:4:187,47:.:-0.08:1.000:. ./.:4:135,134:.: 0.56:1.000:. ./.:4:178,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:165,52:.:-0.38:1.000:. ./.:4:176,62:.: 0.00:1.000:. ./.:4:208,57:.: 0.49:1.000:. ./.:4:154,55:.:-0.53:1.000:. ./.:4:185,60:.: 0.12:1.000:. ./.:4:133,119:.: 0.25:1.000:. ./.:4:190,57:.: 0.16:0.999:. ./.:4:173,44:.:-0.38:1.000:. ./.:4:193,68:.: 0.41:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:151,43:.:-0.80:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:125,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:226,80:.: 1.23:1.000:. ./.:4:195,71:.: 0.50:1.000:. ./.:4:190,55:.: 0.12:1.000:. ./.:4:132,150:.: 0.79:1.000:. ./.:4:160,179:.: 1.83:1.000:. ./.:4:167,136:.: 1.18:1.000:. ./.:4:179,57:.:-0.04:1.000:. ./.:4:183,62:.: 0.12:1.000:. -chr6.1 1887896 chr6.1_001887896 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:201,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.96:1.000:. ./.:5:299,0:.: 2.50:0.734:. ./.:4:156,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:319,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.00:1.000:. ./.:3:23,1:.:-2.85:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.57:1.000:. ./.:5:239,0:.: 1.33:0.999:. ./.:4:200,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.86:0.999:. ./.:4:75,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.96:1.000:. ./.:6:115,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.32:0.994:. ./.:4:112,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.18:0.999:. ./.:4:132,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.52:0.998:. ./.:4:152,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:312,0:.: 2.76:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.32:0.975:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:182,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:295,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.95:1.000:. -chr6.1 2091737 chr6.1_002091737 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:82,80:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,132:0.64: 0.64:1.000:0.730 0/0/1/1:4:75,65:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,72:0.45: 0.26:1.000:0.977 0/0/1/1:4:131,81:0.41: 1.12:1.000:0.852 0/1/1/1:4:60,128:0.63: 0.62:1.000:0.596 0/1/1/1:4:40,132:0.69: 0.28:1.000:0.970 0/1/1/1:4:69,163:0.65: 1.53:1.000:0.757 0/0/1/1:4:99,63:0.42: 0.07:1.000:0.892 0/0/1/1:4:31,62:0.62:-1.36:1.000:0.524 0/0/1/1:4:43,62:0.57:-1.11:1.000:0.932 0/1/1/1:4:33,219:0.75: 1.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,86:0.54: 0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,81:0.43: 0.89:1.000:0.945 0/0/1/1:4:97,77:0.47: 0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:107,63:0.40: 0.24:1.000:0.759 0/0/0/0/0:5:140,0:0.00:-0.38:0.734:1.000 0/1/1/1:4:40,264:0.75: 3.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,92:0.43: 1.47:1.000:0.941 0/0/1/1:4:102,113:0.53: 1.18:1.000:0.991 0/0/0/0:4:69,5:0.07:-1.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,142:0.66: 0.80:1.000:0.855 0/0/1/1:4:117,106:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,77:0.44: 0.53:1.000:0.974 0/0/0/1:4:29,12:0.32:-2.45:1.000:0.959 0/1/1/1:4:68,172:0.66: 1.70:1.000:0.836 0/0/1/1:4:101,69:0.43: 0.24:1.000:0.952 0/0/1/1:4:98,81:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/0:4:129,1:0.01:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,60:0.48:-0.53:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.82:1.000:1.000 0/1/1:3:7,45:0.75:-2.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:123,73:0.40: 0.78:0.999:0.971 0/0/1/1:4:94,93:0.52: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,73:0.43: 0.45:1.000:0.951 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,66:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,69:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,70:0.44: 0.22:1.000:0.968 0/0/1/1:4:72,77:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.82:0.999:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,120:0.65: 0.24:1.000:0.778 0/0/1/1:4:90,67:0.45:-0.03:1.000:0.983 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,84:0.46: 0.72:1.000:0.989 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,89:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,61:0.41: 0.03:1.000:0.847 0/0/1/1:4:92,65:0.44:-0.03:1.000:0.968 0/1/1/1:4:70,143:0.63: 1.14:1.000:0.516 0/0/1/1:4:75,77:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/0/0/0/1:6:72,21:0.25:-1.36:1.000:0.522 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,79:0.54:-0.22:1.000:0.988 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,87:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,56:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,71:0.49:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,59:0.42:-0.22:0.994:0.932 0/1/1/1:4:64,151:0.65: 1.18:1.000:0.756 0/0/1/1:4:90,78:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,67:0.51:-0.49:0.999:0.996 0/1/1/1:4:65,142:0.64: 1.01:1.000:0.637 0/1/1/1:4:63,151:0.65: 1.16:1.000:0.776 0/0/1/1:4:89,64:0.44:-0.11:1.000:0.974 0/0/1/1:4:49,49:0.52:-1.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,71:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,62:0.46:-0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:91,59:0.42:-0.18:1.000:0.912 0/1/1/1:4:30,122:0.71:-0.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:60,173:0.67: 1.55:1.000:0.928 0/0/1/1:4:99,85:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,62:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,54:0.42:-0.43:1.000:0.903 0/0/1/1:4:88,67:0.46:-0.07:1.000:0.987 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,133:0.64: 0.66:1.000:0.740 0/0/1/1:4:98,63:0.42: 0.05:1.000:0.903 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,72:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,63:0.41: 0.12:1.000:0.866 0/0/1/1:4:58,64:0.53:-0.76:1.000:0.991 0/1/1/1:4:61,175:0.67: 1.62:1.000:0.925 0/0/1/1:4:75,61:0.48:-0.47:1.000:0.994 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,87:0.61:-0.49:1.000:0.699 0/0/1/1:4:91,68:0.45: 0.01:1.000:0.984 0/0/1/1:4:87,99:0.54: 0.57:1.000:0.989 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,55:0.45:-0.59:1.000:0.979 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,63:0.44:-0.13:0.998:0.969 0/0/1/1:4:76,65:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,68:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,83:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,109:0.53: 1.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,77:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,74:0.46: 0.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:98,96:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,79:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,84:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,51:0.45:-0.78:1.000:0.978 0/0/1/1:4:90,75:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,124:0.66: 0.30:1.000:0.837 0/0/1/1:4:88,81:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,69:0.52:-0.49:1.000:0.994 0/1/1/1:4:59,168:0.67: 1.43:1.000:0.922 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,72:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,86:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,117:0.69:-0.11:1.000:0.967 0/0/1/1:4:86,58:0.43:-0.30:1.000:0.944 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,70:0.53:-0.53:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,53:0.48:-0.86:0.975:0.995 0/0/1/1:4:119,82:0.43: 0.89:1.000:0.957 0/0/1/1:4:109,72:0.42: 0.47:1.000:0.929 0/0/1/1:4:137,113:0.48: 1.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,78:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,67:0.53:-0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:82,63:0.46:-0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:99,79:0.47: 0.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,66:0.44: 0.05:1.000:0.961 0/0/1/1:4:88,68:0.46:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,47:0.44:-0.93:1.000:0.965 0/0/1/1:4:114,100:0.49: 1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,115:0.55: 1.03:1.000:0.979 0/0/1/1:4:111,77:0.44: 0.62:1.000:0.960 0/0/1/1:4:79,86:0.53: 0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:149,92:0.41: 1.72:1.000:0.850 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,101:0.52: 0.87:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,161:0.67: 1.22:1.000:0.926 0/0/1/1:4:46,51:0.53:-1.28:1.000:0.991 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,93:0.51: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,166:0.62: 1.95:1.000:0.590 0/0/1/1:4:123,108:0.49: 1.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,186:0.66: 2.05:1.000:0.868 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,95:0.47: 1.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:74,158:0.63: 1.53:1.000:0.597 0/0/1/1:4:62,117:0.62: 0.43:1.000:0.631 0/0/1/1:4:75,68:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,51:0.43:-0.68:1.000:0.949 0/0/1/1:4:113,98:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,149:0.66: 0.95:1.000:0.893 0/1/1/1:4:37,262:0.76: 2.93:0.999:1.000 0/1/1/1:4:59,159:0.66: 1.24:1.000:0.889 0/0/1/1:4:71,95:0.56: 0.16:1.000:0.961 0/0/1/1:4:77,85:0.53: 0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:75,67:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,61:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,52:0.48:-0.88:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,53:0.48:-0.88:1.000:0.996 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,95:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,86:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,90:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,95:0.51: 0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,207:0.65: 2.80:1.000:0.781 0/0/1/1:4:146,107:0.45: 1.97:1.000:0.979 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,172:0.69: 1.32:1.000:0.977 -chr6.1 2380285 chr6.1_002380285 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:47,14:0.26: 0.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,38:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,26:0.54:-0.41:1.000:0.989 0/0/0/1:4:46,12:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,18:0.27: 1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,29:0.51: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,15:0.50:-1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,20:0.45:-0.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:31,26:0.47: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:10,9:0.49:-2.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:23,2:0.09:-1.95:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,28:0.47: 0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:42,13:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,10:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,23:0.56:-0.93:1.000:0.962 0/0/0/0/1:5:50,13:0.24: 0.49:0.734:0.958 0/0/0/1:4:51,12:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,34:0.55: 0.49:1.000:0.984 0/0/1/1:4:34,36:0.52: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,13:0.40:-1.31:1.000:0.749 0/0/1/1:4:30,31:0.52: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,35:0.52: 0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,16:0.33:-0.16:1.000:0.918 0/0/0/1:4:11,3:0.25:-2.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,22:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,22:0.42: 0.04:1.000:0.894 0/0/0/1:4:42,7:0.17:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,20:0.30: 1.26:1.000:0.987 0/0/0/1:4:35,5:0.15:-0.99:1.000:0.980 0/0/0/1:4:34,11:0.28:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,19:0.49:-0.99:1.000:0.996 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-3.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,4:0.17:-1.76:1.000:0.997 0/1/1:3:5,8:0.61:-2.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,14:0.43:-1.38:1.000:0.954 0/0/0/1/1:5:37,33:0.49: 0.94:0.999:0.611 0/0/0/1:4:39,9:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,14:0.38:-1.05:1.000:0.618 0/0/0/1:4:54,11:0.20: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,10:0.22:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,23:0.38: 0.55:1.000:0.623 0/0/1/1:4:41,37:0.49: 1.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,8:0.18:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,24:0.47:-0.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:47,13:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,11:0.22: 0.10:0.999:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-3.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,27:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,14:0.65:-2.21:1.000:0.779 0/0/0/1:4:60,18:0.26: 1.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,20:0.27: 1.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,17:0.30: 0.55:1.000:0.988 0/0/0/1:4:50,19:0.31: 0.87:1.000:0.979 0/0/0/1:4:40,10:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,13:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,24:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,28:0.54:-0.22:1.000:0.985 0/0/1/1:4:29,30:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:39,12:0.27:-0.28:1.000:0.670 0/0/0/1:4:60,14:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,26:0.56:-0.54:1.000:0.972 0/0/0/1:4:50,21:0.32: 1.00:1.000:0.940 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,16:0.29: 0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:31,7:0.21:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,11:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,16:0.36:-0.48:0.994:0.690 0/1/1/1:4:13,43:0.73: 0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:48,21:0.33: 0.87:1.000:0.908 0/0/1/1:4:19,19:0.51:-1.12:0.999:0.996 0/1/1/1:4:10,46:0.79: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,37:0.53: 1.00:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,49:0.72: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,14:0.37:-0.93:1.000:0.596 0/0/0/1:4:40,19:0.35: 0.23:1.000:0.798 0/0/0/1:4:65,15:0.22: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,23:0.27: 2.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:55,12:0.21: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,30:0.70:-0.93:1.000:0.986 0/0/1/1:4:42,30:0.44: 1.06:1.000:0.963 0/0/0/1:4:55,9:0.16: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,24:0.44: 0.10:1.000:0.970 0/0/1/1:4:24,17:0.44:-0.93:1.000:0.959 0/0/0/1:4:43,17:0.31: 0.29:1.000:0.968 0/0/0/1:4:56,15:0.25: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,28:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,19:0.33: 0.49:1.000:0.920 0/0/0/1:4:59,11:0.18: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,12:0.28:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,41:0.58: 0.94:1.000:0.902 0/0/0/1:4:61,18:0.26: 1.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,9:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,26:0.45: 0.36:1.000:0.976 0/0/1/1:4:31,30:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,22:0.40: 0.23:1.000:0.762 0/1/1/1:4:16,44:0.70: 0.29:1.000:0.987 0/0/1/1:4:42,40:0.50: 1.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,24:0.46:-0.03:1.000:0.985 0/1/1/1:4:13,24:0.63:-1.18:1.000:0.614 0/0/0/1:4:54,7:0.13: 0.36:1.000:0.934 0/0/1/1:4:27,22:0.47:-0.41:1.000:0.991 0/0/0/1:4:56,15:0.25: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,14:0.27: 0.23:0.998:0.998 0/0/0/1:4:53,15:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,23:0.45:-0.16:1.000:0.983 0/0/1/1:4:24,30:0.56:-0.09:1.000:0.970 0/0/0/1:4:64,24:0.30: 2.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:26,29:0.54:-0.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:29,34:0.55: 0.49:1.000:0.984 0/0/1/1:4:36,32:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,24:0.42: 0.29:1.000:0.922 0/0/0/1:4:45,12:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.28:-1.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,18:0.29: 1.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,12:0.19: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,21:0.52:-0.93:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,9:0.16: 0.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,30:0.56:-0.09:1.000:0.970 0/0/1/1:4:41,28:0.43: 0.87:1.000:0.940 0/0/0/1:4:59,13:0.21: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,28:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,13:0.29:-0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:58,14:0.23: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,29:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,20:0.35: 0.49:1.000:0.833 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,19:0.43:-0.54:1.000:0.935 0/0/0/1:4:29,15:0.37:-0.73:1.000:0.603 0/0/0/1:4:37,10:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,10:0.31:-1.25:1.000:0.976 0/0/0/1:4:37,9:0.23:-0.61:0.975:1.000 0/0/1/1:4:28,40:0.58: 0.81:1.000:0.892 0/0/0/1:4:52,11:0.20: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,14:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,37:0.51: 1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,12:0.21: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,22:0.44:-0.22:1.000:0.972 0/0/1/1:4:37,21:0.39: 0.16:1.000:0.653 0/0/1/1:4:39,38:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,17:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,18:0.41:-0.61:1.000:0.886 0/0/0/1:4:33,14:0.33:-0.54:1.000:0.933 0/0/0/1:4:57,16:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,34:0.40: 2.28:1.000:0.768 0/0/0/1:4:54,23:0.33: 1.38:1.000:0.930 0/0/0/1:4:61,22:0.30: 1.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:32,36:0.54: 0.81:1.000:0.989 0/0/0/1:4:36,8:0.21:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.48: 0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,31:0.58:-0.16:1.000:0.905 0/0/1/1:4:9,6:0.42:-2.60:1.000:0.922 0/0/0/1:4:24,10:0.32:-1.38:1.000:0.944 0/0/0/1:4:41,14:0.29:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:33,24:0.44: 0.10:1.000:0.970 0/0/0/1:4:64,7:0.11: 1.00:1.000:0.620 0/0/1/1:4:34,27:0.46: 0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:29,9:0.27:-1.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,7:0.17:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,29:0.56:-0.22:1.000:0.967 0/0/1/1:4:27,20:0.45:-0.54:1.000:0.975 0/0/1/1:4:17,21:0.56:-1.12:1.000:0.973 0/0/0/1:4:41,13:0.27:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,16:0.44:-1.12:1.000:0.970 0/0/0/1:4:50,14:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,32:0.53: 0.42:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.35:0.999:1.000 0/0/1/1:4:26,23:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,7:0.19:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,13:0.34:-0.93:1.000:0.836 0/0/1/1:4:20,26:0.57:-0.61:1.000:0.955 0/0/0/1:4:40,12:0.26:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:35,7:0.19:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,18:0.40:-0.48:1.000:0.780 0/0/1/1:4:24,15:0.41:-1.05:1.000:0.849 0/0/0/1:4:46,11:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,28:0.45: 0.61:1.000:0.981 0/0/1/1:4:33,35:0.53: 0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,25:0.53:-0.48:1.000:0.992 0/0/0/1:4:37,8:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,27:0.46: 0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:56,16:0.26: 1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,10:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,49:0.71: 0.68:1.000:0.992 -chr6.1 2530116 chr6.1_002530116 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:63,15:.:-0.26:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:50,10:.:-0.93:1.000:. ./.:4:99,13:.: 1.01:1.000:. ./.:4:66,28:.: 0.33:1.000:. ./.:4:72,12:.:-0.04:1.000:. ./.:4:40,3:.:-1.57:1.000:. ./.:4:83,12:.: 0.37:1.000:. ./.:4:37,16:.:-1.19:1.000:. ./.:4:12,5:.:-2.54:1.000:. ./.:4:22,3:.:-2.24:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:48,22:.:-0.56:1.000:. ./.:4:54,23:.:-0.30:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:38,18:.:-1.08:1.000:. ./.:5:54,27:.:-0.15:0.734:. ./.:4:95,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,40:.: 0.52:1.000:. ./.:4:69,34:.: 0.67:1.000:. ./.:4:5,3:.:-2.87:1.000:. ./.:4:104,8:.: 1.01:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:41,14:.:-1.12:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.80:1.000:. ./.:4:60,5:.:-0.75:1.000:. ./.:4:53,22:.:-0.37:1.000:. ./.:4:53,21:.:-0.41:1.000:. ./.:4:124,13:.: 1.94:1.000:. ./.:4:70,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:71,8:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,9:.:-1.16:1.000:. ./.:4:6,5:.:-2.76:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.46:1.000:. ./.:3:2,1:.:-3.06:1.000:. ./.:4:39,21:.:-0.93:1.000:. ./.:5:52,15:.:-0.67:0.999:. ./.:4:59,20:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,8:.:-0.34:1.000:. ./.:4:56,13:.:-0.60:1.000:. ./.:4:119,10:.: 1.64:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,15:.:-0.52:1.000:. ./.:4:58,6:.:-0.78:1.000:. ./.:4:77,20:.: 0.45:1.000:. ./.:4:87,24:.: 0.97:1.000:. ./.:4:67,27:.: 0.33:0.999:. ./.:4:10,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:95,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:38,7:.:-1.49:1.000:. ./.:4:98,10:.: 0.86:1.000:. ./.:4:79,24:.: 0.67:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:96,22:.: 1.23:1.000:. ./.:4:83,12:.: 0.37:1.000:. ./.:4:113,7:.: 1.30:1.000:. ./.:4:108,11:.: 1.27:1.000:. ./.:4:43,6:.:-1.34:1.000:. ./.:4:99,11:.: 0.93:1.000:. ./.:6:85,13:.: 0.48:1.000:. ./.:4:82,13:.: 0.37:1.000:. ./.:4:87,3:.: 0.19:1.000:. ./.:4:134,5:.: 2.01:1.000:. ./.:4:67,14:.:-0.15:1.000:. ./.:4:82,25:.: 0.82:1.000:. ./.:4:77,23:.: 0.56:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:77,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:68,18:.: 0.04:0.994:. ./.:4:106,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:77,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,7:.:-1.53:0.999:. ./.:4:111,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:107,8:.: 1.12:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.67:1.000:. ./.:4:77,14:.: 0.22:1.000:. ./.:4:87,19:.: 0.78:1.000:. ./.:4:83,21:.: 0.71:1.000:. ./.:4:82,14:.: 0.41:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:82,20:.: 0.63:1.000:. ./.:4:117,8:.: 1.49:1.000:. ./.:4:54,25:.:-0.22:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:70,19:.: 0.15:1.000:. ./.:4:64,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:92,7:.: 0.52:1.000:. ./.:4:75,18:.: 0.30:1.000:. ./.:4:67,11:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.49:1.000:. ./.:4:121,7:.: 1.60:1.000:. ./.:4:91,25:.: 1.15:1.000:. ./.:4:42,7:.:-1.34:1.000:. ./.:4:77,24:.: 0.60:1.000:. ./.:4:95,6:.: 0.60:1.000:. ./.:4:85,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:74,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,16:.: 0.56:1.000:. ./.:4:37,11:.:-1.38:1.000:. ./.:4:83,18:.: 0.60:1.000:. ./.:4:51,22:.:-0.45:1.000:. ./.:4:112,16:.: 1.60:1.000:. ./.:4:104,7:.: 0.97:0.998:. ./.:4:110,6:.: 1.15:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.67:1.000:. ./.:4:115,10:.: 1.49:1.000:. ./.:4:61,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:59,18:.:-0.30:1.000:. ./.:4:64,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:59,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:78,21:.: 0.52:1.000:. ./.:4:83,19:.: 0.63:1.000:. ./.:4:67,14:.:-0.15:1.000:. ./.:4:101,7:.: 0.86:1.000:. ./.:4:44,12:.:-1.08:1.000:. ./.:4:63,9:.:-0.49:1.000:. ./.:4:88,6:.: 0.33:1.000:. ./.:4:90,9:.: 0.52:1.000:. ./.:4:120,16:.: 1.90:1.000:. ./.:4:68,18:.: 0.04:1.000:. ./.:4:63,28:.: 0.22:1.000:. ./.:4:38,24:.:-0.86:1.000:. ./.:4:112,6:.: 1.23:1.000:. ./.:4:54,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:104,9:.: 1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:79,7:.: 0.04:1.000:. ./.:4:67,23:.: 0.19:1.000:. ./.:4:99,3:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,19:.:-1.75:1.000:. ./.:4:52,9:.:-0.90:0.975:. ./.:4:68,10:.:-0.26:1.000:. ./.:4:62,15:.:-0.30:1.000:. ./.:4:85,9:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,26:.: 0.63:1.000:. ./.:4:59,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:66,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:69,16:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:103,13:.: 1.15:1.000:. ./.:4:80,10:.: 0.19:1.000:. ./.:4:66,15:.:-0.15:1.000:. ./.:4:113,21:.: 1.83:1.000:. ./.:4:76,30:.: 0.78:1.000:. ./.:4:90,15:.: 0.74:1.000:. ./.:4:52,23:.:-0.37:1.000:. ./.:4:60,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:103,8:.: 0.97:1.000:. ./.:4:108,14:.: 1.38:1.000:. ./.:4:73,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:22,3:.:-2.24:1.000:. ./.:4:34,18:.:-1.23:1.000:. ./.:4:117,6:.: 1.42:1.000:. ./.:4:112,11:.: 1.42:1.000:. ./.:4:53,26:.:-0.22:1.000:. ./.:4:86,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:60,23:.:-0.08:1.000:. ./.:4:57,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,18:.:-0.78:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.75:1.000:. ./.:4:58,17:.:-0.37:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.11:1.000:. ./.:4:48,12:.:-0.93:1.000:. ./.:4:75,12:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,18:.:-0.90:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.86:0.999:. ./.:4:78,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:38,21:.:-0.97:1.000:. ./.:4:29,4:.:-1.94:1.000:. ./.:4:80,8:.: 0.11:1.000:. ./.:4:54,28:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,13:.: 0.52:1.000:. ./.:4:57,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:74,18:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.07:1.000:. ./.:4:45,22:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:69,14:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.11:1.000:. ./.:4:52,39:.: 0.22:1.000:. ./.:4:37,18:.:-1.12:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.86:1.000:. -chr6.1 2746443 chr6.1_002746443 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:129,68:0.35: 0.24:1.000:0.780 0/1/1/1:4:39,141:0.80:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,128:0.72:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,102:0.48: 0.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:151,69:0.32: 0.72:1.000:0.957 0/1/1/1:4:65,192:0.76: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,92:0.68:-1.01:1.000:0.959 0/1/1/1:4:52,159:0.77: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,97:0.70:-0.93:1.000:0.984 0/1/1/1:4:35,60:0.65:-1.92:1.000:0.758 0/0/0/1:4:73,26:0.27:-1.84:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,203:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,123:0.52: 1.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:182,57:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,44:0.29:-0.69:1.000:0.991 0/1/1/1:4:58,150:0.74: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:191,63:0.25: 1.44:0.734:0.928 0/1/1/1:4:61,158:0.74: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,159:0.70: 0.98:1.000:0.986 0/0/1/1:4:115,142:0.57: 1.51:1.000:0.956 0/0/0/1:4:81,26:0.24:-1.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,115:0.76:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,59:0.41:-0.82:1.000:0.864 0/0/0/1:4:71,20:0.22:-2.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,175:0.74: 1.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:175,58:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,54:0.23: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,60:0.31: 0.22:1.000:0.973 0/0/1/1:4:110,134:0.56: 1.23:1.000:0.963 0/0/1/1:4:113,114:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,112:0.55: 0.47:1.000:0.978 0/0/1/1:4:20,16:0.45:-3.17:1.000:0.984 0/0/0/1:4:53,22:0.30:-2.35:1.000:0.987 0/1/1:3:12,33:0.75:-2.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,45:0.20: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:111,118:0.53: 0.91:0.999:0.754 0/0/0/1:4:104,41:0.29:-0.86:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,76:0.36: 0.60:1.000:0.668 0/0/0/1:4:119,61:0.34:-0.12:1.000:0.836 0/0/1/1:4:102,97:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,55:0.28: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,113:0.54: 0.58:1.000:0.985 0/0/0/1:4:109,46:0.30:-0.65:1.000:0.984 0/0/1/1:4:130,117:0.49: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,64:0.41:-0.55:1.000:0.855 0/0/0/1:4:187,66:0.26: 1.42:0.999:0.998 0/0/1/1:4:50,55:0.54:-1.71:1.000:0.989 0/1/1/1:4:50,149:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,77:0.67:-1.44:1.000:0.911 0/0/1/1:4:94,97:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:195,52:0.21: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,140:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,42:0.29:-0.84:1.000:0.991 0/0/1/1:4:86,99:0.55:-0.02:1.000:0.981 0/0/1/1:4:89,109:0.56: 0.26:1.000:0.960 0/1/1/1:4:43,151:0.79: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,113:0.66:-0.23:1.000:0.874 1/1/1/1:4:0,187:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:58,82:0.60:-0.97:1.000:0.643 0/0/0/1:4:108,42:0.28:-0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,170:0.82: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,107:0.66:-0.44:1.000:0.890 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,135:0.57: 1.19:1.000:0.943 0/0/0/1:4:112,45:0.29:-0.61:1.000:0.992 0/0/0/1:4:103,44:0.30:-0.82:1.000:0.982 0/0/0/1:4:145,58:0.29: 0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,106:0.57: 0.13:0.994:0.957 0/1/1/1:4:62,155:0.73: 0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,70:0.37: 0.15:1.000:0.569 0/0/1/1:4:75,90:0.56:-0.44:0.999:0.969 0/1/1/1:4:52,174:0.78: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,186:0.83: 0.89:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,136:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,49:0.35:-0.93:1.000:0.781 0/0/0/1:4:106,48:0.32:-0.67:1.000:0.962 0/0/0/1:4:92,40:0.31:-1.14:1.000:0.977 0/0/0/1:4:136,67:0.34: 0.36:1.000:0.895 0/0/0/1:4:182,39:0.18: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,152:0.80: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,113:0.55: 0.53:1.000:0.981 0/0/1/1:4:109,108:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,95:0.64:-0.74:1.000:0.732 0/0/1/1:4:83,97:0.55:-0.12:1.000:0.978 0/0/0/1:4:124,62:0.34: 0.00:1.000:0.875 0/0/1/1:4:75,70:0.49:-0.86:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,142:0.72: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,51:0.35:-0.80:1.000:0.786 0/0/1/1:4:75,55:0.43:-1.18:1.000:0.953 0/0/0/1:4:125,47:0.28:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,154:0.77: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,52:0.29:-0.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:99,49:0.34:-0.80:1.000:0.889 0/1/1/1:4:56,118:0.69:-0.25:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,189:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,150:0.77: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,134:0.80:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,121:0.72:-0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,111:0.73:-0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,70:0.46:-0.63:1.000:0.987 0/0/0/1:4:132,59:0.31: 0.11:1.000:0.968 0/1/1/1:4:39,84:0.70:-1.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:115,96:0.47: 0.53:1.000:0.991 0/1/1/1:4:89,153:0.65: 1.19:0.998:0.765 0/0/1/1:4:99,91:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,95:0.70:-1.01:1.000:0.988 0/1/1/1:4:54,203:0.80: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,83:0.28: 2.33:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,92:0.71:-1.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:133,171:0.58: 2.50:1.000:0.928 0/1/1/1:4:51,108:0.69:-0.57:1.000:0.980 0/0/1/1:4:95,61:0.40:-0.63:1.000:0.783 0/0/0/1:4:108,40:0.27:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,118:0.53: 0.91:1.000:0.993 0/0/0/1:4:141,32:0.19:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,98:0.64:-0.63:1.000:0.722 0/1/1/1:4:41,83:0.68:-1.31:1.000:0.965 0/1/1/1:4:48,136:0.76:-0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,44:0.30:-0.80:1.000:0.984 0/1/1/1:4:45,92:0.69:-1.03:1.000:0.969 0/0/0/1:4:179,74:0.30: 1.42:1.000:0.988 0/0/1/1:4:107,102:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,110:0.62:-0.08:1.000:0.586 0/0/1/1:4:89,115:0.58: 0.38:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,105:0.74:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,54:0.34:-0.53:1.000:0.862 0/0/1/1:4:121,115:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,54:0.53:-1.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,33:0.41:-2.18:0.975:0.838 0/0/1/1:4:105,110:0.52: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:168,56:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,123:0.46: 1.89:1.000:0.986 0/1/1/1:4:42,89:0.70:-1.16:1.000:0.980 0/0/0/1:4:104,52:0.34:-0.63:1.000:0.875 0/0/1/1:4:89,104:0.55: 0.15:1.000:0.978 0/1/1/1:4:59,99:0.64:-0.59:1.000:0.704 0/0/1/1:4:101,106:0.52: 0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,96:0.45: 0.72:1.000:0.976 0/1/1/1:4:57,181:0.78: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,34:0.31:-1.60:1.000:0.967 0/0/1/1:4:146,142:0.51: 2.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,127:0.64: 0.38:1.000:0.655 0/0/1/1:4:123,128:0.52: 1.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:106,48:0.32:-0.67:1.000:0.962 0/0/1/1:4:139,134:0.50: 1.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,108:0.72:-0.69:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,170:0.76: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,53:0.65:-2.16:1.000:0.752 0/0/1/1:4:67,44:0.40:-1.58:1.000:0.829 0/0/1/1:4:124,127:0.52: 1.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,196:0.77: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,72:0.33: 0.79:1.000:0.928 1/1/1/1:4:1,185:0.99: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,47:0.35:-1.03:1.000:0.800 0/0/0/1:4:127,73:0.37: 0.30:1.000:0.537 0/0/1/1:4:100,108:0.53: 0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,101:0.53: 0.17:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,115:0.72:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,63:0.39:-0.48:1.000:0.739 0/1/1/1:4:45,108:0.72:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,118:0.56: 0.60:1.000:0.958 0/1/1/1:4:39,112:0.76:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,212:1.00: 0.55:0.999:1.000 0/1/1/1:4:71,189:0.74: 1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,49:0.33:-0.69:1.000:0.938 0/0/0/1:4:152,45:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,125:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,109:0.48: 1.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:136,48:0.26:-0.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,121:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,94:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,135:0.56: 1.27:1.000:0.964 0/0/1/1:4:100,115:0.55: 0.62:1.000:0.982 0/0/1/1:4:113,98:0.48: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,129:0.60: 0.74:1.000:0.810 0/1/1/1:4:56,113:0.68:-0.36:1.000:0.963 0/1/1/1:4:65,135:0.69: 0.30:1.000:0.974 0/0/0/1:4:147,75:0.34: 0.77:1.000:0.844 0/0/1/1:4:80,48:0.38:-1.22:1.000:0.601 0/1/1/1:4:54,186:0.79: 1.15:1.000:1.000 -chr6.1 2976669 chr6.1_002976669 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:10,5:0.32:-0.23:1.000:0.939 0/1/1/1:4:2,7:0.70:-1.00:1.000:0.982 0/0/0/0:4:9,1:0.10:-0.87:1.000:0.801 0/0/0/1:4:14,7:0.32: 0.53:1.000:0.939 0/0/0/1:4:20,8:0.28: 1.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:21,4:0.16: 1.04:1.000:0.995 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.47:-0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,9:0.73:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,4:0.38:-0.87:1.000:0.632 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-0.87:1.000:0.972 0/1/1/1:4:1,6:0.77:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.42: 0.15:1.000:0.932 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,10:0.61:-0.23:1.000:0.699 0/0/0/1/1:5:8,7:0.44:-0.23:0.734:0.900 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.16: 1.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,17:0.69: 0.66:1.000:0.977 0/0/1/1:4:3,4:0.53:-1.25:1.000:0.991 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.61:-1.00:1.000:0.699 0/0/0/1:4:13,2:0.13:-0.23:1.000:0.935 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.47:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,9:0.47: 0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,7:0.37: 0.15:1.000:0.503 0/0/0/1:4:12,3:0.20:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.29:-0.87:1.000:0.989 0/0/0/1:4:8,1:0.11:-1.00:1.000:0.520 0/0/1/1:4:4,5:0.52:-1.00:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.32:-1.00:1.000:0.939 0/0/0:3:8,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.40:-0.62:1.000:0.791 0/0/0/0/1:5:25,3:0.11: 1.42:0.999:0.864 0/0/0/1:4:9,5:0.35:-0.36:1.000:0.823 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.32:-0.23:1.000:0.939 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.11:1.000:0.909 0/0/0/1:4:17,5:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.54: 0.27:1.000:0.987 0/0/0/0:4:11,1:0.08:-0.62:1.000:0.980 0/0/1/1:4:9,10:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,7:0.27: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,12:0.56: 0.40:0.999:0.972 0/0/1/1:4:46,38:0.43: 8.54:1.000:0.952 0/0/0/1:4:11,5:0.31:-0.11:1.000:0.979 0/0/1/1:4:16,14:0.44: 1.67:1.000:0.974 0/0/0/1:4:23,4:0.15: 1.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.11:1.000:0.909 0/0/0/1:4:13,2:0.13:-0.23:1.000:0.935 0/0/0/0:4:22,2:0.08: 0.91:1.000:0.980 0/0/0/1:4:10,5:0.32:-0.23:1.000:0.939 0/0/0/1:4:18,8:0.30: 1.17:1.000:0.983 0/0/0/1:4:7,4:0.35:-0.74:1.000:0.771 0/0/1/1:4:10,10:0.47: 0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:12,5:0.29: 0.02:1.000:0.825 0/0/1/1:4:11,7:0.37: 0.15:1.000:0.503 0/1/1/1:4:3,13:0.72:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,7:0.26: 1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,3:0.12: 1.17:1.000:0.648 0/0/0/1:4:13,8:0.37: 0.53:1.000:0.592 0/0/1/1:4:12,10:0.43: 0.66:1.000:0.956 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.43:-0.74:0.994:0.956 0/1/1/1:4:6,14:0.64: 0.40:1.000:0.635 0/0/0/1:4:12,7:0.36: 0.27:1.000:0.727 0/0/0/1:4:18,6:0.25: 0.91:0.999:0.999 0/0/1/1:4:9,10:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,6:0.26: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,9:0.59:-0.36:1.000:0.860 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.34: 0.02:1.000:0.852 0/0/1/1:4:11,9:0.43: 0.40:1.000:0.946 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.31: 0.27:1.000:0.975 0/0/1/1:4:12,8:0.38: 0.40:1.000:0.632 0/0/1/1:4:8,12:0.56: 0.40:1.000:0.972 0/0/0/1:4:14,4:0.22: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.47:-0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,13:0.60: 0.40:1.000:0.822 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,11:0.59: 0.02:1.000:0.839 0/1/1/1:4:2,5:0.65:-1.25:1.000:0.762 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.32:-0.62:1.000:0.939 0/0/0/1:4:6,2:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,3:0.19:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.11:1.000:0.909 0/0/0/0:4:14,1:0.07:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.32: 0.53:1.000:0.939 0/0/1/1:4:5,8:0.57:-0.49:1.000:0.949 0/0/0/1:4:11,3:0.21:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,15:0.81: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.69: 1.17:1.000:0.974 0/1/1/1:4:2,5:0.65:-1.25:1.000:0.762 0/0/0/1:4:7,4:0.35:-0.74:1.000:0.771 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-0.87:1.000:0.972 0/0/0/1:4:7,4:0.35:-0.74:1.000:0.771 0/0/0/1:4:21,3:0.12: 0.91:0.998:0.852 0/0/0/1:4:6,2:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,7:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,6:0.38:-0.23:1.000:0.632 0/0/0/1:4:14,6:0.29: 0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:9,6:0.38:-0.23:1.000:0.632 0/0/0/1:4:21,5:0.19: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.47: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:10,16:0.57: 1.17:1.000:0.949 0/0/0/1:4:19,7:0.27: 1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,4:0.19: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,6:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,5:0.19: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.63:-0.11:1.000:0.507 0/0/0/1:4:18,4:0.18: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,7:0.70:-1.00:1.000:0.982 0/0/1/1:4:7,5:0.40:-0.62:1.000:0.791 0/0/0/1:4:21,8:0.27: 1.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,9:0.59:-0.36:1.000:0.860 0/0/0/1:4:10,5:0.32:-0.23:1.000:0.939 0/0/0/1:4:8,5:0.37:-0.49:1.000:0.548 0/1/1/1:4:2,8:0.71:-0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,4:0.47:-1.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:18,5:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.61:-1.00:1.000:0.699 0/0/0/0:4:13,1:0.07:-0.36:0.975:0.998 0/1/1/1:4:2,10:0.74:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,7:0.54:-0.62:1.000:0.985 0/0/0/1:4:27,13:0.32: 2.95:1.000:0.960 0/0/1/1:4:4,5:0.52:-1.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,5:0.37:-0.49:1.000:0.548 0/0/0/1:4:8,4:0.32:-0.62:1.000:0.939 0/0/1/1:4:5,9:0.59:-0.36:1.000:0.860 0/0/1/1:4:8,9:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.47:-0.36:1.000:0.994 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.52: 0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,15:0.56: 1.04:1.000:0.972 0/0/1/1:4:8,8:0.47:-0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,6:0.44:-0.49:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,3:0.15: 0.40:1.000:0.988 0/0/0/1:4:22,6:0.21: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,4:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,14:0.80:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,5:0.37:-0.49:1.000:0.548 0/0/0/1:4:16,5:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.20: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,1:0.07:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,4:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.52:-1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:9,8:0.45: 0.02:1.000:0.978 0/1/1/1:4:4,10:0.65:-0.36:1.000:0.762 0/0/1/1:4:7,8:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,7:0.32: 0.53:1.000:0.939 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,6:0.34: 0.02:1.000:0.852 0/1/1/1:4:5,14:0.66: 0.27:0.999:0.896 0/0/0/1:4:11,3:0.21:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.11:1.000:0.909 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,5:0.29: 0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:6,8:0.53:-0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,11:0.54: 0.27:1.000:0.987 0/0/1/1:4:3,4:0.53:-1.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:6,7:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,9:0.43: 0.40:1.000:0.946 0/1/1/1:4:2,8:0.71:-0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:7,7:0.47:-0.36:1.000:0.994 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.31: 0.27:1.000:0.975 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,1:0.06:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.41: 0.53:1.000:0.868 -chr6.1 3181275 chr6.1_003181275 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-0.72:1.000:0.511 0/0/1/1:4:11,16:0.60:-0.40:1.000:0.801 0/0/1/1:4:13,13:0.53:-0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:19,8:0.34:-0.40:1.000:0.841 0/0/0/1:4:26,6:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,12:0.25: 3.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,6:0.20: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.32:-0.93:1.000:0.947 0/0/1/1:4:15,17:0.55: 0.13:1.000:0.980 0/1/1/1:4:4,21:0.81:-0.61:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,16:0.93:-1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,12:0.34: 1.09:1.000:0.864 0/1/1/1:4:10,19:0.65:-0.18:1.000:0.776 0/0/0/1:4:27,12:0.35: 0.88:1.000:0.750 0/0/1/1:4:26,16:0.42: 1.20:1.000:0.918 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:21,17:0.48: 0.77:0.734:0.677 0/0/1/1:4:24,18:0.46: 1.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:20,11:0.40: 0.03:1.000:0.767 0/1/1/1:4:12,21:0.63: 0.24:1.000:0.607 0/0/1/1:4:13,15:0.55:-0.29:1.000:0.976 0/0/0/1:4:26,9:0.31: 0.45:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,31:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,13:0.38: 0.88:1.000:0.540 0/0/1/1:4:9,8:0.50:-1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,14:0.45: 0.35:1.000:0.979 0/0/0/1:4:18,7:0.33:-0.61:1.000:0.924 0/0/1/1:4:12,16:0.58:-0.29:1.000:0.905 0/0/1/1:4:16,11:0.45:-0.40:1.000:0.974 0/0/1/1:4:20,14:0.45: 0.35:1.000:0.979 0/0/0/1:4:39,10:0.26: 1.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,16:0.71:-0.93:1.000:0.989 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,11:0.61:-1.36:1.000:0.652 0/0/0:3:3,0:0.00:-2.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,16:0.39: 1.63:1.000:0.702 0/0/0/1/1:5:29,17:0.41: 1.63:0.999:0.966 0/0/1/1:4:16,13:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:23,9:0.33: 0.13:1.000:0.919 0/1/1/1:4:8,21:0.70:-0.18:1.000:0.987 0/0/0/1:4:46,5:0.13: 2.16:1.000:0.879 0/0/0/1:4:42,7:0.19: 1.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,18:0.70:-0.61:1.000:0.985 0/0/1/1:4:14,10:0.45:-0.72:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,24:0.64: 0.67:1.000:0.724 0/0/0/1:4:28,12:0.35: 0.99:1.000:0.815 0/0/1/1:4:17,14:0.49: 0.03:0.999:0.996 0/1/1/1:4:1,7:0.86:-2.42:1.000:0.979 0/0/1/1:4:14,8:0.41:-0.93:1.000:0.833 0/1/1/1:4:2,9:0.79:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,5:0.18: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,22:0.51: 1.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,6:0.20: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.53: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,10:0.47:-0.82:1.000:0.992 0/0/0/1:4:20,6:0.28:-0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:24,12:0.38: 0.56:1.000:0.540 0/0/1/1:4:13,20:0.61: 0.24:1.000:0.698 0/0/1/1:4:15,16:0.54: 0.03:1.000:0.989 0/0/0/1/1/1:6:14,11:0.47:-0.61:1.000:0.853 0/0/1/1:4:15,17:0.55: 0.13:1.000:0.980 0/1/1/1:4:11,22:0.66: 0.24:1.000:0.851 0/0/1/1:4:19,15:0.48: 0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:22,5:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,22:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:22,2:0.11:-0.72:1.000:0.580 0/0/0/1:4:29,4:0.16: 0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:8,29:0.75: 0.67:0.994:0.999 0/1/1/1:4:8,21:0.70:-0.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:10,12:0.56:-0.93:1.000:0.965 0/0/0/1:4:21,4:0.21:-0.61:0.999:1.000 0/0/1/1:4:28,17:0.42: 1.52:1.000:0.906 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-0.50:1.000:0.987 0/1/1/1:4:12,27:0.68: 0.88:1.000:0.947 0/0/1/1:4:24,23:0.52: 1.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,29:0.72: 0.88:1.000:0.995 0/1/1/1:4:4,28:0.86: 0.13:1.000:0.979 0/0/0/1:4:22,10:0.36: 0.13:1.000:0.702 0/0/1/1:4:13,20:0.61: 0.24:1.000:0.698 0/0/0/1:4:21,6:0.28:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,14:0.42: 0.67:1.000:0.909 0/0/0/1:4:32,7:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,7:0.59:-2.00:1.000:0.855 0/0/1/1:4:26,17:0.43: 1.31:1.000:0.956 0/0/0/1:4:32,7:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,5:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,17:0.53: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:8,12:0.60:-1.14:1.000:0.748 0/0/1/1:4:17,16:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,11:0.38: 0.24:1.000:0.540 0/0/0/1:4:18,7:0.33:-0.61:1.000:0.924 0/1/1/1:4:11,23:0.67: 0.35:1.000:0.898 0/0/1/1:4:11,12:0.54:-0.82:1.000:0.986 0/0/0/1:4:27,8:0.28: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,18:0.46: 1.31:1.000:0.984 0/1/1/1:4:8,29:0.75: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,14:0.49: 0.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,18:0.79:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,22:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,22:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,16:0.64:-0.61:1.000:0.644 0/0/0/1:4:27,9:0.30: 0.56:0.998:0.983 0/0/1/1:4:22,17:0.47: 0.88:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.54: 0.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:28,12:0.35: 0.99:1.000:0.815 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.41: 0.24:1.000:0.833 0/0/1/1:4:28,30:0.54: 2.90:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:7,2:0.28:-2.31:1.000:0.996 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.53: 0.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:8,27:0.74: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,16:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,27:0.88:-0.08:1.000:0.655 0/0/0/1:4:18,8:0.35:-0.50:1.000:0.750 0/0/1/1:4:14,19:0.59: 0.24:1.000:0.889 0/1/1/1:4:7,20:0.72:-0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:25,9:0.32: 0.35:1.000:0.964 0/0/0/1:4:31,13:0.34: 1.41:1.000:0.847 0/1/1/1:4:8,18:0.68:-0.50:1.000:0.947 0/0/0/1:4:20,9:0.36:-0.18:1.000:0.724 0/0/1/1:4:20,10:0.38:-0.08:1.000:0.540 0/1/1/1:4:7,15:0.67:-0.93:1.000:0.918 0/1/1/1:4:6,16:0.71:-0.93:1.000:0.989 0/0/0/1:4:31,7:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.66:-0.40:1.000:0.851 0/1/1/1:4:5,19:0.76:-0.72:0.975:1.000 0/1/1/1:4:5,10:0.66:-1.68:1.000:0.851 0/0/1/1:4:10,10:0.53:-1.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:23,6:0.26:-0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-0.72:1.000:0.511 0/1/1/1:4:6,20:0.74:-0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,16:0.64:-0.61:1.000:0.644 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.48:-1.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.53:-0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,19:0.55: 0.56:1.000:0.982 0/0/1/1:4:14,16:0.55:-0.08:1.000:0.978 0/1/1/1:4:9,17:0.65:-0.50:1.000:0.766 0/0/0/1:4:15,7:0.36:-0.93:1.000:0.641 0/0/0/1:4:15,7:0.36:-0.93:1.000:0.641 0/1/1/1:4:5,17:0.74:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,19:0.59: 0.24:1.000:0.889 0/0/1/1:4:28,16:0.41: 1.41:1.000:0.833 0/0/0/1:4:31,7:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.66:-2.31:1.000:0.851 0/0/1/1:4:14,19:0.59: 0.24:1.000:0.889 0/0/0/1:4:24,10:0.34: 0.35:1.000:0.855 0/0/0/1:4:39,10:0.26: 1.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,8:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.31: 0.03:1.000:0.975 0/0/1/1:4:16,14:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,6:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,13:0.53:-0.50:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,14:0.39: 0.99:1.000:0.723 0/1/1/1:4:2,11:0.82:-1.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,8:0.23: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,8:0.39:-0.82:1.000:0.702 0/1/1/1:4:5,20:0.77:-0.61:0.999:1.000 0/0/0/1:4:25,6:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-0.72:1.000:0.511 0/0/1/1:4:23,13:0.40: 0.56:1.000:0.816 0/0/1/1:4:17,11:0.43:-0.29:1.000:0.951 0/0/0/0:4:35,3:0.10: 0.77:1.000:0.746 0/1/1/1:4:3,11:0.75:-1.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,12:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,17:0.74:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,22:0.45: 2.37:1.000:0.982 0/0/1/1:4:18,14:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,15:0.39: 1.31:1.000:0.712 0/0/1/1:4:22,13:0.41: 0.45:1.000:0.878 0/0/0/1:4:31,15:0.37: 1.63:1.000:0.548 0/1/1/1:4:11,21:0.65: 0.13:1.000:0.784 0/0/0/1:4:33,8:0.25: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,9:0.32: 0.24:1.000:0.947 0/0/0/1:4:18,8:0.35:-0.50:1.000:0.750 -chr6.1 3594302 chr6.1_003594302 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,42:.: 1.25:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,46:.: 0.96:1.000:. ./.:4:139,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:119,38:.: 1.71:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:77,28:.: 0.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,30:.: 0.61:1.000:. ./.:4:98,32:.: 0.93:1.000:. ./.:5:111,37:.: 1.45:0.734:. ./.:4:118,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:111,29:.: 1.22:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:85,38:.: 0.72:1.000:. ./.:4:103,40:.: 1.31:1.000:. ./.:4:65,17:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:101,30:.: 0.96:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.68:1.000:. ./.:3:5,3:.:-2.63:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:5:121,29:.: 1.51:0.999:. ./.:4:116,37:.: 1.60:1.000:. ./.:4:59,29:.:-0.30:1.000:. ./.:4:106,26:.: 0.99:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:67,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:94,27:.: 0.67:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.10:0.999:. ./.:4:107,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:70,21:.:-0.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:107,33:.: 1.22:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,21:.:-0.88:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.24:1.000:. ./.:6:63,12:.:-0.67:1.000:. ./.:4:95,19:.: 0.46:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:45,16:.:-1.08:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:63,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.41:0.994:. ./.:4:106,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:71,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.72:0.999:. ./.:4:73,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:47,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:85,33:.: 0.58:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:78,37:.: 0.49:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:38,14:.:-1.34:1.000:. ./.:4:71,28:.: 0.02:1.000:. ./.:4:58,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,29:.: 0.61:1.000:. ./.:4:94,29:.: 0.72:1.000:. ./.:4:66,17:.:-0.44:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:81,12:.:-0.15:1.000:. ./.:4:94,33:.: 0.84:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.41:1.000:. ./.:4:39,12:.:-1.37:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.27:0.998:. ./.:4:100,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.53:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:50,52:.: 0.11:1.000:. ./.:4:67,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:66,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:91,39:.: 0.93:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:58,22:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,24:.:-0.79:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:65,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:78,21:.: 0.02:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:57,21:.:-0.59:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:47,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:105,27:.: 0.99:1.000:. ./.:4:29,25:.:-1.29:0.975:. ./.:4:92,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:103,33:.: 1.10:1.000:. ./.:4:55,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.91:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:65,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:108,32:.: 1.22:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:103,35:.: 1.16:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:116,30:.: 1.39:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:78,30:.: 0.29:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:80,31:.: 0.37:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:95,28:.: 0.72:1.000:. ./.:4:104,29:.: 1.02:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:82,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:107,58:.: 1.95:1.000:. ./.:4:123,44:.: 2.01:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.20:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:107,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:78,30:.: 0.29:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:88,27:.: 0.49:1.000:. ./.:4:101,41:.: 1.28:1.000:. ./.:4:91,30:.: 0.67:1.000:. ./.:4:65,27:.:-0.18:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.49:1.000:. -chr6.1 3696242 chr6.1_003696242 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:152,60:.: 1.01:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:139,51:.: 0.51:1.000:. ./.:4:147,56:.: 0.80:1.000:. ./.:4:145,58:.: 0.80:1.000:. ./.:4:145,58:.: 0.80:1.000:. ./.:4:57,19:.:-2.07:1.000:. ./.:4:130,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:135,47:.: 0.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:21,10:.:-3.08:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:117,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:128,41:.: 0.04:1.000:. ./.:5:175,58:.: 1.48:0.734:. ./.:4:202,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:169,56:.: 1.30:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:22,0:.:-3.29:1.000:. ./.:4:100,108:.: 0.92:1.000:. ./.:4:156,62:.: 1.14:1.000:. ./.:4:100,47:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:111,67:.: 0.24:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:148,53:.: 0.76:1.000:. ./.:4:160,58:.: 1.14:1.000:. ./.:4:148,54:.: 0.78:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.47:1.000:. ./.:4:40,20:.:-2.43:1.000:. ./.:3:4,9:.:-3.49:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.15:1.000:. ./.:5:140,56:.: 0.65:0.999:. ./.:4:119,54:.: 0.13:1.000:. ./.:4:144,69:.: 1.03:1.000:. ./.:4:147,58:.: 0.85:1.000:. ./.:4:155,51:.: 0.87:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:96,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:132,52:.: 0.38:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:69,25:.:-1.66:1.000:. ./.:4:120,66:.: 0.42:1.000:. ./.:4:121,47:.: 0.01:1.000:. ./.:4:117,42:.:-0.19:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:67,75:.:-0.57:1.000:. ./.:4:154,55:.: 0.94:1.000:. ./.:4:121,44:.:-0.05:1.000:. ./.:4:120,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:133,55:.: 0.47:1.000:. ./.:4:129,46:.: 0.17:1.000:. ./.:4:99,87:.: 0.42:1.000:. ./.:6:114,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:145,55:.: 0.74:1.000:. ./.:4:120,59:.: 0.26:1.000:. ./.:4:101,97:.: 0.69:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:114,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.03:0.994:. ./.:4:173,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:136,40:.: 0.19:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.25:0.999:. ./.:4:172,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:142,50:.: 0.56:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:98,43:.:-0.60:1.000:. ./.:4:111,43:.:-0.30:1.000:. ./.:4:135,58:.: 0.58:1.000:. ./.:4:153,62:.: 1.08:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:158,70:.: 1.37:1.000:. ./.:4:122,48:.: 0.06:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:145,51:.: 0.65:1.000:. ./.:4:74,31:.:-1.41:1.000:. ./.:4:113,45:.:-0.21:1.000:. ./.:4:107,37:.:-0.53:1.000:. ./.:4:131,49:.: 0.28:1.000:. ./.:4:106,46:.:-0.35:1.000:. ./.:4:125,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:150,57:.: 0.90:1.000:. ./.:4:80,35:.:-1.18:1.000:. ./.:4:117,50:.:-0.01:1.000:. ./.:4:79,107:.: 0.42:1.000:. ./.:4:120,47:.:-0.01:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:108,50:.:-0.21:1.000:. ./.:4:129,49:.: 0.24:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:117,54:.: 0.08:1.000:. ./.:4:114,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,39:.:-0.85:1.000:. ./.:4:109,114:.: 1.26:0.998:. ./.:4:132,52:.: 0.38:1.000:. ./.:4:118,32:.:-0.39:1.000:. ./.:4:164,61:.: 1.30:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:100,83:.: 0.35:1.000:. ./.:4:110,34:.:-0.53:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:129,46:.: 0.17:1.000:. ./.:4:130,62:.: 0.56:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:148,51:.: 0.71:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:93,36:.:-0.87:1.000:. ./.:4:75,96:.: 0.08:1.000:. ./.:4:116,47:.:-0.10:1.000:. ./.:4:103,95:.: 0.69:1.000:. ./.:4:142,48:.: 0.51:1.000:. ./.:4:159,72:.: 1.44:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,51:.: 0.01:1.000:. ./.:4:124,58:.: 0.33:1.000:. ./.:4:121,42:.:-0.10:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:88,49:.:-0.69:1.000:. ./.:4:115,45:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,42:.: 0.06:1.000:. ./.:4:140,58:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,55:.:-1.75:0.975:. ./.:4:141,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:169,51:.: 1.19:1.000:. ./.:4:149,51:.: 0.74:1.000:. ./.:4:118,44:.:-0.12:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:120,47:.:-0.01:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:97,35:.:-0.80:1.000:. ./.:4:122,50:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,34:.:-0.94:1.000:. ./.:4:132,58:.: 0.51:1.000:. ./.:4:151,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:135,56:.: 0.53:1.000:. ./.:4:123,45:.: 0.01:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:116,33:.:-0.42:1.000:. ./.:4:92,112:.: 0.83:1.000:. ./.:4:132,59:.: 0.53:1.000:. ./.:4:34,5:.:-2.90:1.000:. ./.:4:77,44:.:-1.05:1.000:. ./.:4:121,66:.: 0.44:1.000:. ./.:4:111,45:.:-0.26:1.000:. ./.:4:143,62:.: 0.85:1.000:. ./.:4:135,60:.: 0.62:1.000:. ./.:4:126,38:.:-0.08:1.000:. ./.:4:126,41:.:-0.01:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:110,60:.: 0.06:1.000:. ./.:4:141,47:.: 0.47:1.000:. ./.:4:166,56:.: 1.23:1.000:. ./.:4:116,41:.:-0.24:1.000:. ./.:4:107,53:.:-0.17:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:139,47:.: 0.42:1.000:. ./.:4:102,45:.:-0.46:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:105,35:.:-0.62:1.000:. ./.:4:99,39:.:-0.66:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:121,39:.:-0.17:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:180,69:.: 1.84:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:105,108:.: 1.03:1.000:. ./.:4:197,73:.: 2.32:1.000:. ./.:4:131,52:.: 0.35:1.000:. ./.:4:98,40:.:-0.66:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.24:1.000:. -chr6.1 4037226 chr6.1_004037226 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:272,145:0.31: 0.85:1.000:0.968 0/0/0/0:4:365,2:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,79:0.37:-1.56:1.000:0.573 0/0/1/1:4:244,230:0.44: 1.47:1.000:0.971 0/0/1/1:4:183,234:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,337:0.60: 1.47:1.000:0.767 1/1/1/1:4:0,269:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,172:0.53:-0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:112,187:0.55:-0.42:1.000:0.980 0/0/0/1:4:127,50:0.25:-1.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,59:0.31:-1.83:1.000:0.966 0/0/0/1:4:200,119:0.34:-0.21:1.000:0.887 0/0/0/1:4:228,114:0.30: 0.04:1.000:0.985 0/0/0/1:4:256,126:0.30: 0.47:1.000:0.988 0/0/0/1:4:124,79:0.35:-1.46:1.000:0.771 0/0/0/1:4:277,88:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:246,126:0.30: 0.37:0.734:0.545 0/0/0/1:4:159,89:0.32:-0.97:1.000:0.943 0/0/1/1:4:143,123:0.42:-0.78:1.000:0.919 0/0/0/1:4:253,145:0.33: 0.65:1.000:0.925 0/0/0/1:4:160,69:0.27:-1.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,233:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,114:0.25: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,173:0.54:-0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:127,90:0.38:-1.31:1.000:0.521 0/0/1/1:4:134,269:0.58: 0.70:1.000:0.930 0/0/0/1:4:243,111:0.28: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:266,110:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:306,17:0.05:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,178:0.39: 0.83:1.000:0.688 0/0/0/1:4:249,101:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,79:0.26:-0.76:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,97:0.58:-2.11:1.000:0.904 0/0/0/1:4:127,48:0.24:-1.76:1.000:1.000 0/1/1:3:1,18:0.75:-3.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,85:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:124,88:0.38:-1.36:0.999:0.961 0/0/0/0:4:210,8:0.03:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,30:0.10:-0.71:1.000:0.860 0/0/0/1:4:247,109:0.27: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:246,95:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,173:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/0/0/1:4:303,122:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:240,28:0.09:-0.76:1.000:0.930 0/0/1/1:4:155,225:0.53: 0.45:1.000:0.993 0/0/0/0:4:306,20:0.05:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,126:0.29: 0.58:0.999:0.993 0/0/0/1:4:128,75:0.33:-1.46:1.000:0.904 0/0/1/1:4:150,179:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:254,50:0.15:-0.37:1.000:0.981 0/0/0/1:4:260,107:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:331,149:0.28: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,203:0.41: 1.24:1.000:0.850 0/0/1/1:4:120,204:0.55:-0.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:254,200:0.40: 1.25:1.000:0.796 0/0/0/1:4:277,131:0.29: 0.75:1.000:0.993 0/0/1/1:4:127,252:0.57: 0.44:1.000:0.935 0/0/1/1:4:165,154:0.44:-0.21:1.000:0.968 0/0/1/1:4:128,154:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/0/0/1:6:224,77:0.23:-0.40:1.000:0.752 0/0/0/0:4:315,31:0.08: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:245,187:0.39: 1.01:1.000:0.728 0/0/0/1:4:334,146:0.27: 1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,101:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,208:0.54: 0.00:1.000:0.986 0/0/0/1:4:253,130:0.31: 0.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:128,150:0.49:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,147:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,119:0.28: 0.45:0.994:0.995 0/0/0/0:4:423,1:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,194:0.52: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,91:0.33:-0.94:0.999:0.932 0/0/0/1:4:427,68:0.12: 1.69:1.000:0.789 0/0/1/1:4:139,326:0.60: 1.37:1.000:0.819 0/0/0/0:4:498,2:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,156:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:255,115:0.28: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:313,129:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:290,31:0.08:-0.18:1.000:0.976 0/0/0/1:4:284,134:0.29: 0.86:1.000:0.993 0/0/0/1:4:222,111:0.30:-0.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:155,207:0.52: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,276:0.56: 1.01:1.000:0.970 0/0/1/1:4:122,163:0.52:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,152:0.45:-0.33:1.000:0.980 0/0/0/1:4:157,93:0.34:-0.95:1.000:0.892 0/0/1/1:4:203,193:0.44: 0.62:1.000:0.974 0/0/1/1:4:139,239:0.55: 0.43:1.000:0.976 0/0/1/1:4:139,160:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:268,129:0.29: 0.64:1.000:0.991 0/0/0/1:4:294,115:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,161:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:373,153:0.26: 2.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:176,14:0.06:-1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,108:0.38:-0.83:1.000:0.509 0/0/1/1:4:121,187:0.54:-0.33:1.000:0.989 0/0/0/1:4:269,183:0.37: 1.23:1.000:0.602 0/0/0/0:4:355,42:0.09: 0.64:1.000:0.917 0/0/0/1:4:377,151:0.26: 2.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,114:0.26: 0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:288,112:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:304,113:0.24: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,14:0.05:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:315,303:0.45: 3.02:1.000:0.977 0/0/1/1:4:215,170:0.40: 0.51:0.998:0.804 0/0/1/1:4:259,204:0.40: 1.35:1.000:0.797 0/0/0/1:4:246,112:0.28: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,233:0.56: 0.30:1.000:0.972 0/0/1/1:4:156,253:0.55: 0.76:1.000:0.984 0/0/0/0:4:218,14:0.05:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,87:0.36:-1.28:1.000:0.710 0/0/1/1:4:133,204:0.54:-0.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:277,124:0.28: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,197:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,120:0.52:-1.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:159,210:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:256,112:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,157:0.47:-0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:247,82:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,194:0.37: 1.46:1.000:0.537 0/0/1/1:4:138,189:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:318,107:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:283,21:0.06:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,95:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:291,100:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,194:0.53:-0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:293,205:0.37: 1.73:1.000:0.518 0/0/0/1:4:222,114:0.31:-0.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:203,145:0.38: 0.11:1.000:0.545 0/0/0/1:4:210,90:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:254,112:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,97:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/0/0:4:185,25:0.10:-1.38:0.975:0.676 0/0/0/1:4:284,93:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,97:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:285,164:0.33: 1.20:1.000:0.922 0/0/0/0:4:285,21:0.06:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,115:0.27: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,160:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,109:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,147:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,200:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:221,78:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:240,29:0.09:-0.75:1.000:0.895 0/0/1/1:4:326,300:0.44: 3.11:1.000:0.962 0/0/1/1:4:202,275:0.52: 1.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:252,224:0.43: 1.49:1.000:0.944 0/0/0/0:4:232,11:0.04:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,246:0.40: 2.36:1.000:0.805 0/0/0/1:4:226,103:0.28:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,222:0.56: 0.04:1.000:0.960 0/0/0/1:4:228,87:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,69:0.33:-1.60:1.000:0.930 0/0/0/1:4:180,82:0.28:-0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:280,185:0.36: 1.37:1.000:0.684 0/0/1/1:4:144,216:0.53: 0.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:163,109:0.36:-0.71:1.000:0.651 0/0/1/1:4:130,187:0.53:-0.23:1.000:0.993 0/0/0/0:4:183,7:0.03:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,92:0.39:-1.32:1.000:0.655 0/0/1/1:4:114,189:0.55:-0.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:105,133:0.51:-1.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:224,83:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:278,4:0.01:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,12:0.05:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,275:0.58: 0.79:1.000:0.927 0/0/0/1:4:105,69:0.36:-1.77:1.000:0.698 0/0/0/1:4:365,80:0.16: 1.15:0.999:0.995 0/0/1/1:4:120,158:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/0:4:220,7:0.03:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,87:0.28:-0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,145:0.54:-1.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:210,106:0.30:-0.24:1.000:0.984 0/0/1/1:4:183,154:0.42:-0.01:1.000:0.897 0/0/1/1:4:114,194:0.55:-0.33:1.000:0.978 0/0/0/1:4:173,74:0.27:-0.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:285,212:0.39: 1.71:1.000:0.662 0/0/1/1:4:138,205:0.53: 0.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:125,191:0.54:-0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:137,139:0.46:-0.67:1.000:0.988 0/0/1/1:4:145,225:0.54: 0.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:175,216:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,93:0.36:-1.11:1.000:0.706 0/0/0/0:4:209,3:0.01:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:389,85:0.16: 1.47:1.000:0.995 -chr6.1 4178682 chr6.1_004178682 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:264,74:.: 0.47:1.000:. ./.:4:241,59:.:-0.03:1.000:. ./.:4:357,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:235,56:.:-0.14:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:213,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:234,58:.:-0.13:1.000:. ./.:4:372,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:73,14:.:-2.82:1.000:. ./.:4:104,18:.:-2.36:1.000:. ./.:4:195,60:.:-0.62:1.000:. ./.:4:261,65:.: 0.32:1.000:. ./.:4:259,75:.: 0.42:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:270,78:.: 0.60:1.000:. ./.:5:510,0:.: 2.73:0.734:. ./.:4:155,144:.:-0.04:1.000:. ./.:4:457,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:393,84:.: 2.30:1.000:. ./.:4:122,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:287,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:60,10:.:-3.04:1.000:. ./.:4:270,62:.: 0.39:1.000:. ./.:4:289,66:.: 0.70:1.000:. ./.:4:276,61:.: 0.46:1.000:. ./.:4:369,2:.: 0.91:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:249,66:.: 0.17:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:113,0:.:-2.48:1.000:. ./.:3:38,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.06:1.000:. ./.:5:441,1:.: 1.84:0.999:. ./.:4:280,79:.: 0.75:1.000:. ./.:4:399,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:278,80:.: 0.74:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:252,54:.: 0.05:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:253,63:.: 0.18:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.19:0.999:. ./.:4:63,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:198,46:.:-0.76:1.000:. ./.:4:255,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:231,58:.:-0.17:1.000:. ./.:4:306,70:.: 0.97:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:225,67:.:-0.13:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:253,64:.: 0.20:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.08:1.000:. ./.:6:226,23:.:-0.69:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:253,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:243,61:.: 0.03:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:234,52:.:-0.21:0.994:. ./.:4:152,119:.:-0.41:1.000:. ./.:4:356,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:231,60:.:-0.14:1.000:. ./.:4:222,77:.:-0.04:1.000:. ./.:4:255,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:244,57:.:-0.01:1.000:. ./.:4:241,61:.: 0.00:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:222,74:.:-0.08:1.000:. ./.:4:242,57:.:-0.04:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:232,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:187,42:.:-0.96:1.000:. ./.:4:276,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:262,67:.: 0.36:1.000:. ./.:4:168,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:240,53:.:-0.12:1.000:. ./.:4:302,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:169,41:.:-1.21:1.000:. ./.:4:237,58:.:-0.09:1.000:. ./.:4:228,67:.:-0.09:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:149,41:.:-1.47:1.000:. ./.:4:209,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:230,39:.:-0.43:0.998:. ./.:4:248,44:.:-0.13:1.000:. ./.:4:200,42:.:-0.79:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:216,52:.:-0.44:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:459,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:227,65:.:-0.13:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:203,48:.:-0.67:1.000:. ./.:4:208,47:.:-0.62:1.000:. ./.:4:219,38:.:-0.59:1.000:. ./.:4:213,64:.:-0.33:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:227,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:158,42:.:-1.34:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:293,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:267,67:.: 0.42:1.000:. ./.:4:125,37:.:-1.83:0.975:. ./.:4:233,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:240,49:.:-0.17:1.000:. ./.:4:393,100:.: 2.51:1.000:. ./.:4:245,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:222,67:.:-0.17:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:251,72:.: 0.28:1.000:. ./.:4:173,40:.:-1.17:1.000:. ./.:4:325,82:.: 1.38:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:276,62:.: 0.47:1.000:. ./.:4:238,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:280,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:58,9:.:-3.08:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:290,92:.: 1.05:1.000:. ./.:4:271,68:.: 0.49:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:246,72:.: 0.21:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:209,69:.:-0.31:1.000:. ./.:4:198,58:.:-0.60:1.000:. ./.:4:258,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:276,82:.: 0.74:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:260,61:.: 0.25:1.000:. ./.:4:144,148:.:-0.13:0.999:. ./.:4:222,71:.:-0.12:1.000:. ./.:4:258,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:241,63:.: 0.03:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:226,79:.: 0.04:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:197,47:.:-0.76:1.000:. ./.:4:478,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:390,2:.: 1.18:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:293,18:.: 0.12:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:351,94:.: 1.88:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:244,63:.: 0.07:1.000:. -chr6.1 4381122 chr6.1_004381122 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:220,161:.: 0.59:1.000:. ./.:4:173,51:.:-0.84:1.000:. ./.:4:196,126:.: 0.05:1.000:. ./.:4:254,67:.: 0.04:1.000:. ./.:4:288,182:.: 1.40:1.000:. ./.:4:335,221:.: 2.19:1.000:. ./.:4:146,100:.:-0.64:1.000:. ./.:4:225,134:.: 0.39:1.000:. ./.:4:209,134:.: 0.24:1.000:. ./.:4:61,44:.:-1.93:1.000:. ./.:4:52,61:.:-1.86:1.000:. ./.:4:174,77:.:-0.60:1.000:. ./.:4:223,125:.: 0.29:1.000:. ./.:4:238,138:.: 0.54:1.000:. ./.:4:241,164:.: 0.81:1.000:. ./.:4:240,204:.: 1.16:1.000:. ./.:5:277,210:.: 1.56:0.734:. ./.:4:270,237:.: 1.74:1.000:. ./.:4:295,197:.: 1.60:1.000:. ./.:4:268,161:.: 1.03:1.000:. ./.:4:54,20:.:-2.21:1.000:. ./.:4:210,216:.: 1.00:1.000:. ./.:4:291,186:.: 1.47:1.000:. ./.:4:214,131:.: 0.26:1.000:. ./.:4:45,27:.:-2.23:1.000:. ./.:4:219,136:.: 0.35:1.000:. ./.:4:278,141:.: 0.94:1.000:. ./.:4:241,149:.: 0.67:1.000:. ./.:4:289,69:.: 0.38:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:200,40:.:-0.70:1.000:. ./.:4:169,115:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,23:.:-2.53:1.000:. ./.:4:56,13:.:-2.26:1.000:. ./.:3:16,30:.:-2.47:1.000:. ./.:4:232,48:.:-0.33:1.000:. ./.:5:296,218:.: 1.80:0.999:. ./.:4:222,146:.: 0.47:1.000:. ./.:4:162,35:.:-1.09:1.000:. ./.:4:182,124:.:-0.10:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:206,120:.: 0.09:1.000:. ./.:4:183,59:.:-0.68:1.000:. ./.:4:164,86:.:-0.61:1.000:. ./.:4:197,154:.: 0.32:1.000:. ./.:4:185,218:.: 0.79:1.000:. ./.:4:306,168:.: 1.44:0.999:. ./.:4:144,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:144,151:.:-0.20:1.000:. ./.:4:108,93:.:-1.05:1.000:. ./.:4:152,108:.:-0.52:1.000:. ./.:4:262,179:.: 1.14:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:213,138:.: 0.32:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:167,91:.:-0.53:1.000:. ./.:4:193,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:175,139:.:-0.02:1.000:. ./.:4:137,114:.:-0.60:1.000:. ./.:6:161,81:.:-0.68:1.000:. ./.:4:182,121:.:-0.12:1.000:. ./.:4:215,53:.:-0.44:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:150,78:.:-0.81:1.000:. ./.:4:221,109:.: 0.12:1.000:. ./.:4:176,100:.:-0.37:1.000:. ./.:4:184,73:.:-0.54:1.000:. ./.:4:193,52:.:-0.65:1.000:. ./.:4:191,87:.:-0.35:0.994:. ./.:4:195,127:.: 0.05:1.000:. ./.:4:235,120:.: 0.35:1.000:. ./.:4:151,124:.:-0.38:0.999:. ./.:4:203,193:.: 0.73:1.000:. ./.:4:236,149:.: 0.63:1.000:. ./.:4:174,135:.:-0.07:1.000:. ./.:4:179,135:.:-0.02:1.000:. ./.:4:198,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:244,115:.: 0.39:1.000:. ./.:4:207,184:.: 0.68:1.000:. ./.:4:209,71:.:-0.33:1.000:. ./.:4:137,76:.:-0.95:1.000:. ./.:4:203,130:.: 0.15:1.000:. ./.:4:244,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:180,118:.:-0.17:1.000:. ./.:4:178,93:.:-0.42:1.000:. ./.:4:198,219:.: 0.92:1.000:. ./.:4:153,42:.:-1.11:1.000:. ./.:4:185,116:.:-0.14:1.000:. ./.:4:155,95:.:-0.61:1.000:. ./.:4:189,61:.:-0.61:1.000:. ./.:4:165,34:.:-1.07:1.000:. ./.:4:182,102:.:-0.30:1.000:. ./.:4:218,148:.: 0.45:1.000:. ./.:4:164,102:.:-0.46:1.000:. ./.:4:213,239:.: 1.24:1.000:. ./.:4:175,108:.:-0.31:1.000:. ./.:4:189,56:.:-0.65:1.000:. ./.:4:133,66:.:-1.07:1.000:. ./.:4:229,133:.: 0.42:1.000:. ./.:4:267,79:.: 0.27:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:259,115:.: 0.53:1.000:. ./.:4:132,119:.:-0.60:1.000:. ./.:4:222,55:.:-0.36:1.000:. ./.:4:163,62:.:-0.84:0.998:. ./.:4:169,76:.:-0.65:1.000:. ./.:4:172,110:.:-0.31:1.000:. ./.:4:226,57:.:-0.31:1.000:. ./.:4:309,215:.: 1.90:1.000:. ./.:4:196,197:.: 0.70:1.000:. ./.:4:197,176:.: 0.52:1.000:. ./.:4:263,182:.: 1.17:1.000:. ./.:4:208,138:.: 0.27:1.000:. ./.:4:187,113:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,63:.:-1.05:1.000:. ./.:4:196,123:.: 0.02:1.000:. ./.:4:179,55:.:-0.75:1.000:. ./.:4:162,142:.:-0.11:1.000:. ./.:4:177,118:.:-0.20:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:224,185:.: 0.85:1.000:. ./.:4:199,44:.:-0.67:1.000:. ./.:4:196,174:.: 0.49:1.000:. ./.:4:261,82:.: 0.24:1.000:. ./.:4:181,54:.:-0.74:1.000:. ./.:4:211,124:.: 0.17:1.000:. ./.:4:171,58:.:-0.80:1.000:. ./.:4:114,56:.:-1.34:1.000:. ./.:4:110,38:.:-1.54:1.000:. ./.:4:149,40:.:-1.16:1.000:. ./.:4:151,54:.:-1.02:1.000:. ./.:4:232,137:.: 0.48:1.000:. ./.:4:109,96:.:-1.02:0.975:. ./.:4:145,97:.:-0.68:1.000:. ./.:4:182,124:.:-0.10:1.000:. ./.:4:338,192:.: 1.95:1.000:. ./.:4:203,156:.: 0.39:1.000:. ./.:4:154,49:.:-1.04:1.000:. ./.:4:157,92:.:-0.62:1.000:. ./.:4:164,110:.:-0.39:1.000:. ./.:4:199,118:.: 0.00:1.000:. ./.:4:177,107:.:-0.30:1.000:. ./.:4:194,136:.: 0.12:1.000:. ./.:4:127,78:.:-1.02:1.000:. ./.:4:322,93:.: 0.90:1.000:. ./.:4:339,194:.: 1.98:1.000:. ./.:4:259,147:.: 0.82:1.000:. ./.:4:210,148:.: 0.38:1.000:. ./.:4:261,86:.: 0.28:1.000:. ./.:4:192,49:.:-0.69:1.000:. ./.:4:264,178:.: 1.15:1.000:. ./.:4:240,147:.: 0.64:1.000:. ./.:4:24,17:.:-2.52:1.000:. ./.:4:222,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:240,142:.: 0.60:1.000:. ./.:4:233,155:.: 0.65:1.000:. ./.:4:306,308:.: 2.72:1.000:. ./.:4:240,240:.: 1.49:1.000:. ./.:4:201,115:.: 0.00:1.000:. ./.:4:287,178:.: 1.36:1.000:. ./.:4:250,194:.: 1.16:1.000:. ./.:4:154,184:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,49:.:-0.73:1.000:. ./.:4:216,190:.: 0.82:1.000:. ./.:4:246,200:.: 1.18:1.000:. ./.:4:249,143:.: 0.69:1.000:. ./.:4:206,234:.: 1.13:1.000:. ./.:4:221,231:.: 1.24:0.999:. ./.:4:205,211:.: 0.91:1.000:. ./.:4:215,184:.: 0.75:1.000:. ./.:4:195,105:.:-0.15:1.000:. ./.:4:186,107:.:-0.21:1.000:. ./.:4:212,129:.: 0.22:1.000:. ./.:4:210,135:.: 0.26:1.000:. ./.:4:173,80:.:-0.58:1.000:. ./.:4:123,110:.:-0.76:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:216,154:.: 0.49:1.000:. ./.:4:255,165:.: 0.95:1.000:. ./.:4:209,156:.: 0.44:1.000:. ./.:4:236,175:.: 0.86:1.000:. ./.:4:326,296:.: 2.79:1.000:. ./.:4:353,311:.: 3.17:1.000:. ./.:4:171,63:.:-0.75:1.000:. ./.:4:303,155:.: 1.29:1.000:. -chr6.1 4463141 chr6.1_004463141 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:419,17:.: 0.68:1.000:. ./.:4:293,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:341,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:359,13:.: 0.15:1.000:. ./.:4:437,12:.: 0.78:1.000:. ./.:4:341,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:326,13:.:-0.12:1.000:. ./.:4:312,6:.:-0.29:1.000:. ./.:4:306,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:196,78:.:-0.65:1.000:. ./.:4:289,10:.:-0.44:1.000:. ./.:4:214,15:.:-1.01:1.000:. ./.:4:233,20:.:-0.82:1.000:. ./.:4:338,19:.: 0.03:1.000:. ./.:4:252,14:.:-0.71:1.000:. ./.:5:224,23:.:-0.87:0.734:. ./.:4:338,7:.:-0.07:1.000:. ./.:4:443,14:.: 0.85:1.000:. ./.:4:291,25:.:-0.30:1.000:. ./.:4:582,40:.: 2.19:1.000:. ./.:4:345,14:.: 0.05:1.000:. ./.:4:266,34:.:-0.43:1.000:. ./.:4:332,6:.:-0.12:1.000:. ./.:4:241,42:.:-0.57:1.000:. ./.:4:363,10:.: 0.16:1.000:. ./.:4:228,19:.:-0.87:1.000:. ./.:4:214,9:.:-1.06:1.000:. ./.:4:389,11:.: 0.38:1.000:. ./.:4:509,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:354,7:.: 0.06:1.000:. ./.:4:214,11:.:-1.05:1.000:. ./.:4:338,13:.:-0.02:1.000:. ./.:4:359,51:.: 0.46:1.000:. ./.:3:139,30:.:-1.50:1.000:. ./.:4:328,9:.:-0.13:1.000:. ./.:5:303,26:.:-0.20:0.999:. ./.:4:353,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:465,16:.: 1.04:1.000:. ./.:4:254,28:.:-0.58:1.000:. ./.:4:486,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:369,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:445,17:.: 0.89:1.000:. ./.:4:255,39:.:-0.48:1.000:. ./.:4:383,60:.: 0.73:1.000:. ./.:4:258,42:.:-0.43:1.000:. ./.:4:391,18:.: 0.46:0.999:. ./.:4:1300,2:.: 7.74:1.000:. ./.:4:229,45:.:-0.65:1.000:. ./.:4:236,83:.:-0.28:1.000:. ./.:4:280,52:.:-0.17:1.000:. ./.:4:401,17:.: 0.53:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:371,19:.: 0.30:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:325,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:425,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:414,55:.: 0.94:1.000:. ./.:4:342,21:.: 0.08:1.000:. ./.:6:351,28:.: 0.21:1.000:. ./.:4:377,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:328,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:811,0:.: 3.73:1.000:. ./.:4:563,37:.: 2.01:1.000:. ./.:4:391,21:.: 0.48:1.000:. ./.:4:259,38:.:-0.46:1.000:. ./.:4:375,17:.: 0.32:1.000:. ./.:4:313,18:.:-0.18:1.000:. ./.:4:274,52:.:-0.22:0.994:. ./.:4:208,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:461,31:.: 1.13:1.000:. ./.:4:260,52:.:-0.34:0.999:. ./.:4:279,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:359,12:.: 0.15:1.000:. ./.:4:248,33:.:-0.59:1.000:. ./.:4:255,24:.:-0.61:1.000:. ./.:4:317,12:.:-0.20:1.000:. ./.:4:293,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,60:.:-1.51:1.000:. ./.:4:421,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:271,40:.:-0.34:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:331,9:.:-0.11:1.000:. ./.:4:418,25:.: 0.73:1.000:. ./.:4:290,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:280,9:.:-0.52:1.000:. ./.:4:363,18:.: 0.23:1.000:. ./.:4:369,15:.: 0.25:1.000:. ./.:4:328,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:373,18:.: 0.31:1.000:. ./.:4:356,21:.: 0.19:1.000:. ./.:4:277,43:.:-0.27:1.000:. ./.:4:279,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:162,79:.:-0.92:1.000:. ./.:4:428,23:.: 0.80:1.000:. ./.:4:366,18:.: 0.25:1.000:. ./.:4:364,10:.: 0.17:1.000:. ./.:4:286,71:.: 0.03:1.000:. ./.:4:369,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:571,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:412,25:.: 0.68:1.000:. ./.:4:207,22:.:-1.01:1.000:. ./.:4:467,23:.: 1.12:1.000:. ./.:4:450,47:.: 1.17:0.998:. ./.:4:266,15:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,30:.:-0.60:1.000:. ./.:4:546,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:451,19:.: 0.95:1.000:. ./.:4:116,34:.:-1.66:1.000:. ./.:4:249,34:.:-0.57:1.000:. ./.:4:468,10:.: 1.02:1.000:. ./.:4:296,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:398,24:.: 0.56:1.000:. ./.:4:277,18:.:-0.47:1.000:. ./.:4:404,24:.: 0.61:1.000:. ./.:4:437,29:.: 0.92:1.000:. ./.:4:263,39:.:-0.42:1.000:. ./.:4:431,20:.: 0.80:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:249,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:413,19:.: 0.64:1.000:. ./.:4:144,53:.:-1.27:1.000:. ./.:4:334,7:.:-0.10:1.000:. ./.:4:388,17:.: 0.42:1.000:. ./.:4:446,11:.: 0.85:1.000:. ./.:4:390,21:.: 0.47:1.000:. ./.:4:384,21:.: 0.42:1.000:. ./.:4:322,10:.:-0.17:1.000:. ./.:4:287,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:351,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:217,12:.:-1.01:1.000:. ./.:4:84,34:.:-1.92:0.975:. ./.:4:269,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:224,30:.:-0.81:1.000:. ./.:4:264,23:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,29:.:-1.66:1.000:. ./.:4:366,18:.: 0.25:1.000:. ./.:4:386,7:.: 0.32:1.000:. ./.:4:214,31:.:-0.88:1.000:. ./.:4:367,15:.: 0.24:1.000:. ./.:4:385,22:.: 0.44:1.000:. ./.:4:382,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:221,38:.:-0.77:1.000:. ./.:4:428,11:.: 0.70:1.000:. ./.:4:451,14:.: 0.91:1.000:. ./.:4:248,32:.:-0.60:1.000:. ./.:4:212,27:.:-0.93:1.000:. ./.:4:429,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:316,14:.:-0.19:1.000:. ./.:4:455,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:207,20:.:-1.03:1.000:. ./.:4:469,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:279,10:.:-0.52:1.000:. ./.:4:244,25:.:-0.69:1.000:. ./.:4:237,31:.:-0.69:1.000:. ./.:4:254,27:.:-0.59:1.000:. ./.:4:247,20:.:-0.70:1.000:. ./.:4:205,22:.:-1.03:1.000:. ./.:4:360,14:.: 0.17:1.000:. ./.:4:204,19:.:-1.06:1.000:. ./.:4:236,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:313,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:122,27:.:-1.67:1.000:. ./.:4:101,21:.:-1.89:1.000:. ./.:4:347,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,24:.:-1.76:1.000:. ./.:4:190,23:.:-1.14:0.999:. ./.:4:237,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:111,34:.:-1.70:1.000:. ./.:4:166,20:.:-1.36:1.000:. ./.:4:245,7:.:-0.83:1.000:. ./.:4:353,13:.: 0.10:1.000:. ./.:4:318,19:.:-0.13:1.000:. ./.:4:312,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:206,18:.:-1.05:1.000:. ./.:4:536,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:393,10:.: 0.41:1.000:. ./.:4:364,8:.: 0.15:1.000:. ./.:4:281,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:408,10:.: 0.53:1.000:. ./.:4:276,27:.:-0.41:1.000:. ./.:4:284,19:.:-0.41:1.000:. ./.:4:287,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:376,17:.: 0.32:1.000:. -chr6.1 4886065 chr6.1_004886065 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:394,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:432,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:453,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:424,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.13:1.000:. ./.:5:551,0:.: 1.95:0.734:. ./.:4:377,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:558,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:612,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:372,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:443,2:.: 0.97:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:408,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:473,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:543,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:322,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.63:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.81:1.000:. ./.:5:474,0:.: 1.24:0.999:. ./.:4:429,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:328,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:294,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:460,0:.: 1.11:0.999:. ./.:4:157,2:.:-1.68:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:179,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:338,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:335,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.32:1.000:. ./.:6:242,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:232,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:308,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:321,1:.:-0.17:0.994:. ./.:4:263,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:326,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.73:0.999:. ./.:4:314,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:277,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:294,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:311,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:310,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:260,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:251,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:387,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:448,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:337,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.79:0.998:. ./.:4:327,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:244,3:.:-0.87:1.000:. ./.:4:520,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:332,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:231,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:300,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.19:0.975:. ./.:4:310,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:556,2:.: 2.01:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:267,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:440,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:464,3:.: 1.17:1.000:. ./.:4:426,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:335,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:490,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:529,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:395,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:523,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:512,3:.: 1.62:1.000:. ./.:4:321,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:481,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:320,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:366,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:323,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:365,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:333,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:343,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:437,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:346,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:544,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:541,1:.: 1.87:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.25:1.000:. -chr6.1 5216583 chr6.1_005216583 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:328,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:402,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:322,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.27:1.000:. ./.:5:391,1:.: 0.61:0.734:. ./.:4:347,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:551,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:547,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:195,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:497,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.90:1.000:. ./.:3:133,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.02:1.000:. ./.:5:593,2:.: 2.59:0.999:. ./.:4:490,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:352,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:257,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.73:1.000:. ./.:6:313,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:306,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:291,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.38:0.994:. ./.:4:205,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:446,1:.: 1.15:0.999:. ./.:4:365,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:283,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:343,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:342,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:417,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:500,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:177,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:516,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:491,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:394,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:410,3:.: 0.82:1.000:. ./.:4:345,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.19:0.998:. ./.:4:212,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:191,2:.:-1.33:1.000:. ./.:4:411,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:432,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:564,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:429,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.15:0.975:. ./.:4:250,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:396,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:371,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:546,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:677,0:.: 3.39:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:386,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:540,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:523,2:.: 1.91:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:290,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:389,1:.: 0.59:0.999:. ./.:4:500,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:481,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:296,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:261,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:531,1:.: 1.98:1.000:. ./.:4:463,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:387,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:625,1:.: 2.89:1.000:. ./.:4:266,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:316,1:.:-0.12:1.000:. -chr6.1 5586082 chr6.1_005586082 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:569,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:499,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:604,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:221,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:167,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.53:1.000:. ./.:5:604,0:.: 1.51:0.734:. ./.:4:594,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:182,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:408,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:138,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:677,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:344,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.70:1.000:. ./.:4:191,0:.:-2.47:1.000:. ./.:3:112,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.38:1.000:. ./.:5:499,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:486,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:600,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:592,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:588,0:.: 1.35:0.999:. ./.:4:545,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:231,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:567,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:565,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:628,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.60:1.000:. ./.:6:389,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:576,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:553,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:461,1:.: 0.14:0.994:. ./.:4:471,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:593,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:274,0:.:-1.67:0.999:. ./.:4:632,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:650,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:555,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:397,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:575,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:565,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:578,1:.: 1.26:0.998:. ./.:4:392,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:662,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:343,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:301,0:.:-1.41:0.975:. ./.:4:391,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:370,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:689,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:638,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:297,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:222,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:336,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:533,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:408,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:414,1:.:-0.32:0.999:. ./.:4:499,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:524,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:337,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:533,0:.: 0.82:1.000:. -chr6.1 5733560 chr6.1_005733560 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,57:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.75:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,66:.: 2.41:1.000:. ./.:5:0,54:.: 1.39:0.734:. ./.:4:0,52:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,54:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,49:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,53:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,48:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,51:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.92:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.66:1.000:. ./.:3:0,3:.:-2.92:1.000:. ./.:4:0,55:.: 1.48:1.000:. ./.:5:0,34:.:-0.30:0.999:. ./.:4:0,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,69:.: 2.66:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,53:.: 1.39:0.999:. ./.:4:0,24:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:6:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:0.994:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:0.999:. ./.:4:0,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,52:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1,33:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:0.998:. ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,53:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1,48:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,54:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1,42:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.31:0.975:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,65:.: 2.32:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,50:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,56:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.92:1.000:. ./.:4:1,25:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,53:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,55:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,59:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.80:0.999:. ./.:4:0,44:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,51:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,63:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.12:1.000:. -chr6.1 6400134 chr6.1_006400134 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:278,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:55,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.00:1.000:. ./.:5:384,0:.: 2.31:0.734:. ./.:4:269,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:48,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.90:1.000:. ./.:3:16,0:.:-3.80:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.05:1.000:. ./.:5:344,0:.: 1.65:0.999:. ./.:4:288,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.36:0.999:. ./.:4:92,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.52:1.000:. ./.:6:217,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.27:0.994:. ./.:4:208,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.56:0.999:. ./.:4:299,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.06:0.998:. ./.:4:220,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:366,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.39:0.975:. ./.:4:251,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:338,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:366,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:222,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.03:0.999:. ./.:4:235,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.13:1.000:. -chr6.1 6652566 chr6.1_006652566 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,376:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,366:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,394:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.80:1.000:. ./.:4:0,184:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,76:.:-2.34:1.000:. ./.:4:0,94:.:-2.15:1.000:. ./.:4:0,392:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,394:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,387:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.26:1.000:. ./.:5:0,471:.: 1.82:0.734:. ./.:4:0,335:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,497:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,69:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,54:.:-2.57:1.000:. ./.:4:0,172:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,440:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,365:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,539:.: 2.54:1.000:. ./.:4:0,364:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,372:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,43:.:-2.69:1.000:. ./.:4:0,96:.:-2.13:1.000:. ./.:3:0,22:.:-2.91:1.000:. ./.:4:0,451:.: 1.61:1.000:. ./.:5:0,433:.: 1.42:0.999:. ./.:4:0,332:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,342:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,393:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,296:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,475:.: 1.86:0.999:. ./.:4:0,83:.:-2.27:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,385:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,316:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.78:1.000:. ./.:6:0,192:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,236:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,403:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,297:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,439:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.25:0.994:. ./.:4:0,334:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.55:0.999:. ./.:4:0,276:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,189:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,282:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,353:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,351:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,425:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,275:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,274:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,360:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,173:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,129:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,266:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,192:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,288:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,190:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,357:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,119:.:-1.89:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.03:0.998:. ./.:4:1,191:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,461:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,304:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,502:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,282:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,516:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,253:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,160:.:-1.45:0.975:. ./.:4:0,313:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,413:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,317:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,396:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,442:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,60:.:-2.51:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,398:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,445:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,408:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,264:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,294:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,415:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,440:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,288:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,280:.:-0.19:0.999:. ./.:4:0,260:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,395:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,240:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,343:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,382:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,409:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,407:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,380:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,424:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,362:.: 0.67:1.000:. -chr6.1 6898203 chr6.1_006898203 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:5:114,0:.: 0.56:0.734:. ./.:4:54,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:135,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.89:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.07:1.000:. ./.:5:94,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:92,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:0.999:. ./.:4:45,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.17:1.000:. ./.:6:76,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.35:0.994:. ./.:4:133,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:98,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:121,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.91:0.998:. ./.:4:86,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:91,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.45:0.975:. ./.:4:118,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:186,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:179,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:183,1:.: 2.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.93:0.999:. ./.:4:165,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:122,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.32:1.000:. -chr6.1 7166654 chr6.1_007166654 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,65:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,27:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:2,34:.: 0.02:0.734:. ./.:4:0,23:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.00:1.000:. ./.:4:1,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,62:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.92:1.000:. ./.:3:0,10:.:-1.09:1.000:. ./.:4:1,40:.: 0.24:1.000:. ./.:5:1,0:.:-1.47:0.999:. ./.:4:0,61:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.32:1.000:. ./.:4:4,50:.: 0.79:0.999:. ./.:4:0,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,62:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,75:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.19:1.000:. ./.:6:0,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,72:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:2,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,39:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,70:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,93:.: 2.46:1.000:. ./.:4:1,91:.: 2.42:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,27:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,80:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,61:.: 1.09:0.998:. ./.:4:0,68:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,102:.: 2.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,41:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1,26:.:-0.36:0.975:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,73:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,85:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,87:.: 2.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,78:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,72:.: 1.56:1.000:. ./.:4:1,40:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,78:.: 1.82:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,89:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:3,38:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,70:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,65:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,68:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.02:1.000:. -chr6.1 7306201 chr6.1_007306201 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:18,34:0.60:-0.05:1.000:0.781 0/0/0/1:4:44,24:0.29: 0.73:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,18:0.34:-0.39:1.000:0.836 0/0/0/1:4:14,10:0.36:-1.42:1.000:0.629 0/1/1/1:4:14,32:0.63:-0.34:1.000:0.625 0/0/1/1:4:12,21:0.59:-0.98:1.000:0.881 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-2.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,18:0.31:-0.20:1.000:0.980 0/0/1/1:4:8,14:0.59:-1.52:1.000:0.881 0/0/0/1:4:21,14:0.34:-0.88:1.000:0.836 0/0/0/1:4:67,16:0.15: 1.47:1.000:0.988 0/0/0/1:4:50,12:0.15: 0.44:1.000:0.988 0/0/0/1:4:40,15:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,24:0.74:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,45:0.56: 1.07:1.000:0.971 0/0/0/1/1:5:40,35:0.43: 1.07:0.734:0.949 0/0/1/1:4:13,27:0.62:-0.64:1.000:0.594 0/0/0/1:4:32,18:0.30:-0.15:1.000:0.988 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.44: 0.39:1.000:0.960 0/0/0/1:4:32,19:0.31:-0.10:1.000:0.971 0/0/1/1:4:15,21:0.54:-0.83:1.000:0.985 0/0/1/1:4:8,8:0.47:-1.81:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,29:0.33: 1.03:1.000:0.898 0/0/0/1:4:52,21:0.22: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,14:0.20: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.41:-1.52:1.000:0.869 0/0/0:3:11,0:0.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:32,20:0.33:-0.05:0.999:0.763 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,15:0.17: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,10:0.17:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,51:0.61: 1.12:1.000:0.634 0/0/0/1:4:60,24:0.22: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,22:0.33: 0.19:1.000:0.930 0/0/0/1:4:49,23:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.10:0.999:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.40:-1.27:1.000:0.778 0/0/0/1:4:39,22:0.30: 0.39:1.000:0.987 0/0/0/1:4:45,21:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,30:0.58:-0.24:1.000:0.922 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,20:0.36:-0.24:1.000:0.629 0/0/0/1/1/1:6:26,32:0.52: 0.24:1.000:0.869 0/0/0/1:4:31,16:0.27:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,19:0.32:-0.15:1.000:0.952 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,48:0.72: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,23:0.25: 0.88:0.994:0.999 0/0/1/1:4:35,41:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,25:0.44:-0.05:1.000:0.971 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.54:0.999:1.000 0/0/1/1:4:32,51:0.57: 1.47:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,36:0.45: 1.03:1.000:0.979 0/0/1/1:4:9,14:0.56:-1.47:1.000:0.959 0/0/0/1:4:43,23:0.28: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,28:0.25: 1.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,69:0.55: 3.18:1.000:0.984 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,26:0.34: 0.63:1.000:0.885 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,28:0.43: 0.29:1.000:0.958 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,15:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.50:-1.66:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,25:0.58:-0.64:1.000:0.922 0/0/0/1:4:34,21:0.32: 0.10:1.000:0.946 0/0/0/1:4:34,11:0.19:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,44:0.57: 0.88:1.000:0.937 0/1/1/1:4:7,22:0.69:-1.17:1.000:0.966 0/1/1/1:4:19,48:0.65: 0.68:1.000:0.805 0/0/0/1:4:31,18:0.31:-0.20:1.000:0.980 0/0/0/1:4:32,22:0.35: 0.05:1.000:0.757 0/0/0/1:4:33,17:0.27:-0.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,57:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,28:0.31: 1.07:1.000:0.969 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,26:0.64:-0.78:1.000:0.693 0/0/1/1:4:13,23:0.59:-0.83:1.000:0.870 0/0/1/1:4:15,25:0.58:-0.64:1.000:0.922 0/0/0/1:4:64,25:0.22: 1.76:0.998:1.000 0/0/1/1:4:15,22:0.55:-0.78:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,39:0.58: 0.44:1.000:0.909 0/0/0/1:4:68,31:0.24: 2.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,22:0.19: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,28:0.59:-0.44:1.000:0.881 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,21:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,41:0.58: 0.59:1.000:0.903 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,24:0.26: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,26:0.48:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,26:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,14:0.26:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,15:0.39:-0.93:1.000:0.740 0/0/0/1:4:23,15:0.34:-0.73:1.000:0.879 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,70:0.72: 1.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,29:0.71:-0.78:0.975:0.989 0/0/0/1:4:62,19:0.18: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,20:0.20: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,24:0.33: 0.44:1.000:0.924 0/0/0/1:4:66,41:0.32: 2.64:1.000:0.941 0/0/0/1:4:51,22:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,24:0.43:-0.10:1.000:0.947 0/0/1/1:4:23,39:0.58: 0.44:1.000:0.909 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,40:0.56: 0.63:1.000:0.963 0/0/1/1:4:25,28:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,29:0.27: 1.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,51:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,29:0.39: 0.63:1.000:0.718 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,41:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,30:0.38: 0.83:1.000:0.561 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,13:0.34:-0.98:1.000:0.885 0/0/0/1:4:50,19:0.21: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,21:0.34: 0.00:1.000:0.868 0/0/0/1:4:51,30:0.31: 1.37:1.000:0.975 0/0/1/1:4:22,28:0.53:-0.15:1.000:0.994 1/1/1/1:4:4,55:0.89: 0.29:1.000:0.667 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,25:0.40: 0.15:1.000:0.799 0/0/1/1:4:25,19:0.38:-0.44:1.000:0.611 0/0/1/1:4:24,21:0.43:-0.39:1.000:0.933 0/0/1/1:4:29,59:0.61: 1.71:1.000:0.639 0/0/0/1:4:49,34:0.36: 1.47:1.000:0.729 0/0/1/1:4:17,27:0.57:-0.44:1.000:0.950 0/0/1/1:4:20,31:0.56:-0.10:1.000:0.960 0/0/1/1:4:28,30:0.49: 0.24:0.999:0.996 0/0/0/1:4:32,22:0.35: 0.05:1.000:0.757 0/0/0/1:4:46,32:0.36: 1.22:1.000:0.721 0/0/0/1:4:35,18:0.27: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,23:0.64:-0.98:1.000:0.638 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,16:0.20: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,6:0.09: 0.00:1.000:0.959 0/0/1/1:4:21,19:0.44:-0.64:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,27:0.23: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,13:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,27:0.36: 0.59:1.000:0.648 -chr6.1 7649948 chr6.1_007649948 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:31,3:.: 2.41:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.69:1.000:. ./.:5:22,0:.: 1.03:0.734:. ./.:4:23,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:5:1,0:.:-1.38:0.999:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:10,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:26,1:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:1,0:.:-1.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.57:0.994:. ./.:4:36,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.15:0.999:. ./.:4:24,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:30,1:.: 2.07:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.92:0.998:. ./.:4:17,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:0.975:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:42,2:.: 3.56:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:28,2:.: 1.95:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.49:0.999:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.38:1.000:. -chr6.1 8060020 chr6.1_008060020 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,71:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,119:.: 2.47:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,56:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,66:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,157:.: 3.88:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.18:1.000:. ./.:5:1,53:.: 0.07:0.734:. ./.:4:0,55:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:4,11:.:-1.38:1.000:. ./.:4:5,60:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,37:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,102:.: 1.84:1.000:. ./.:4:1,103:.: 1.92:1.000:. ./.:4:4,104:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,20:.:-1.19:1.000:. ./.:3:0,1:.:-1.89:1.000:. ./.:4:0,117:.: 2.40:1.000:. ./.:5:0,52:.:-0.01:0.999:. ./.:4:2,58:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1,72:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:2,37:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.92:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.25:0.999:. ./.:4:9,82:.: 1.43:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,35:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,69:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.05:1.000:. ./.:4:4,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:4,24:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,52:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,43:.:-0.19:1.000:. ./.:6:3,29:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,37:.:-0.53:1.000:. ./.:4:6,44:.:-0.08:1.000:. ./.:4:4,62:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,103:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.60:0.994:. ./.:4:0,105:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.04:0.999:. ./.:4:0,38:.:-0.53:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,80:.: 1.03:1.000:. ./.:4:1,23:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:3,36:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,49:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.12:1.000:. ./.:4:3,31:.:-0.67:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:3,32:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.82:1.000:. ./.:4:2,35:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,38:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,36:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,32:.:-0.71:0.998:. ./.:4:5,32:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,57:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,35:.:-0.56:1.000:. ./.:4:7,71:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,65:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,126:.: 2.73:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:2,27:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:5,28:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.90:0.975:. ./.:4:0,38:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,81:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,38:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,54:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.14:1.000:. ./.:4:1,57:.: 0.21:1.000:. ./.:4:7,69:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,134:.: 3.03:1.000:. ./.:4:3,85:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,51:.: 0.03:1.000:. ./.:4:5,6:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,103:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,59:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,57:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,54:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,55:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,43:.:-0.34:0.999:. ./.:4:6,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:1,50:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.16:1.000:. ./.:4:4,34:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,43:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.34:1.000:. ./.:4:3,116:.: 2.47:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:5,60:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,66:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,94:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,126:.: 2.73:1.000:. -chr6.1 8253262 chr6.1_008253262 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:136,67:.: 1.70:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:104,41:.: 0.36:1.000:. ./.:4:87,53:.: 0.24:1.000:. ./.:4:162,36:.: 1.58:1.000:. ./.:4:163,53:.: 2.00:1.000:. ./.:4:27,17:.:-1.97:1.000:. ./.:4:67,46:.:-0.38:1.000:. ./.:4:123,51:.: 1.03:1.000:. ./.:4:46,12:.:-1.65:1.000:. ./.:4:12,8:.:-2.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:96,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:127,45:.: 0.98:1.000:. ./.:4:110,54:.: 0.80:1.000:. ./.:4:103,38:.: 0.27:1.000:. ./.:5:144,83:.: 2.25:0.999:. ./.:4:114,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:130,48:.: 1.12:1.000:. ./.:4:159,49:.: 1.81:1.000:. ./.:4:16,8:.:-2.43:1.000:. ./.:4:68,45:.:-0.38:1.000:. ./.:4:130,31:.: 0.73:1.000:. ./.:4:88,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,3:.:-2.57:1.000:. ./.:4:68,28:.:-0.77:1.000:. ./.:4:118,56:.: 1.03:1.000:. ./.:4:109,52:.: 0.73:1.000:. ./.:4:113,52:.: 0.82:1.000:. ./.:4:79,56:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,27:.:-0.84:1.000:. ./.:4:83,30:.:-0.38:1.000:. ./.:4:17,9:.:-2.38:1.000:. ./.:4:47,9:.:-1.69:1.000:. ./.:3:21,5:.:-2.38:1.000:. ./.:4:106,39:.: 0.36:1.000:. ./.:6:109,58:.: 0.87:0.999:. ./.:4:95,48:.: 0.31:1.000:. ./.:4:84,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:89,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:79,49:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,57:.: 0.64:1.000:. ./.:4:50,46:.:-0.77:1.000:. ./.:4:76,29:.:-0.56:1.000:. ./.:4:88,52:.: 0.24:1.000:. ./.:4:139,39:.: 1.12:1.000:. ./.:4:164,55:.: 2.07:0.999:. ./.:4:31,15:.:-1.92:1.000:. ./.:4:63,42:.:-0.56:1.000:. ./.:4:34,15:.:-1.85:1.000:. ./.:4:59,40:.:-0.70:1.000:. ./.:4:143,45:.: 1.35:1.000:. ./.:4:53,40:.:-0.84:1.000:. ./.:4:178,54:.: 2.36:1.000:. ./.:4:89,42:.: 0.04:1.000:. ./.:4:49,37:.:-1.00:1.000:. ./.:4:64,42:.:-0.54:1.000:. ./.:4:76,26:.:-0.63:1.000:. ./.:4:61,61:.:-0.17:1.000:. ./.:6:54,29:.:-1.07:1.000:. ./.:4:99,47:.: 0.38:1.000:. ./.:4:52,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:77,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,31:.: 0.13:1.000:. ./.:4:109,43:.: 0.52:1.000:. ./.:4:88,51:.: 0.22:1.000:. ./.:4:66,20:.:-1.00:1.000:. ./.:4:129,43:.: 0.98:1.000:. ./.:4:71,45:.:-0.31:0.994:. ./.:4:71,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:102,26:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,14:.:-2.11:0.999:. ./.:4:69,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:72,51:.:-0.15:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:66,41:.:-0.52:1.000:. ./.:4:98,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:108,42:.: 0.47:1.000:. ./.:4:150,47:.: 1.56:1.000:. ./.:4:126,52:.: 1.12:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:82,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:96,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:90,41:.: 0.04:1.000:. ./.:4:68,33:.:-0.65:1.000:. ./.:4:130,51:.: 1.19:1.000:. ./.:4:46,20:.:-1.46:1.000:. ./.:4:48,39:.:-0.98:1.000:. ./.:4:112,33:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,36:.: 0.18:1.000:. ./.:4:83,26:.:-0.47:1.000:. ./.:4:66,58:.:-0.12:1.000:. ./.:4:139,61:.: 1.63:1.000:. ./.:4:75,36:.:-0.42:1.000:. ./.:4:128,52:.: 1.17:1.000:. ./.:4:108,24:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,48:.:-0.35:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:88,37:.:-0.10:1.000:. ./.:4:135,34:.: 0.91:1.000:. ./.:4:33,16:.:-1.85:1.000:. ./.:4:144,35:.: 1.14:1.000:. ./.:4:82,34:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:103,55:.: 0.66:0.998:. ./.:4:78,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:79,41:.:-0.22:1.000:. ./.:4:80,63:.: 0.31:1.000:. ./.:4:152,54:.: 1.77:1.000:. ./.:4:95,42:.: 0.18:1.000:. ./.:4:105,54:.: 0.68:1.000:. ./.:4:139,57:.: 1.54:1.000:. ./.:4:98,46:.: 0.34:1.000:. ./.:4:97,44:.: 0.27:1.000:. ./.:4:49,23:.:-1.32:1.000:. ./.:4:139,53:.: 1.44:1.000:. ./.:4:66,26:.:-0.86:1.000:. ./.:4:83,36:.:-0.24:1.000:. ./.:4:71,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:75,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:121,42:.: 0.77:1.000:. ./.:4:70,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:101,46:.: 0.41:1.000:. ./.:4:139,52:.: 1.42:1.000:. ./.:4:116,37:.: 0.54:1.000:. ./.:4:98,50:.: 0.43:1.000:. ./.:4:55,50:.:-0.56:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:54,26:.:-1.14:1.000:. ./.:4:100,27:.:-0.06:1.000:. ./.:4:57,36:.:-0.84:1.000:. ./.:4:113,52:.: 0.82:1.000:. ./.:4:59,24:.:-1.07:0.975:. ./.:4:80,42:.:-0.17:1.000:. ./.:4:93,46:.: 0.22:1.000:. ./.:4:97,48:.: 0.36:1.000:. ./.:4:96,43:.: 0.22:1.000:. ./.:4:97,35:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,57:.: 0.91:1.000:. ./.:4:92,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:102,43:.: 0.36:1.000:. ./.:4:89,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:117,42:.: 0.68:1.000:. ./.:4:70,25:.:-0.79:1.000:. ./.:4:86,63:.: 0.45:1.000:. ./.:4:140,63:.: 1.70:1.000:. ./.:4:97,64:.: 0.73:1.000:. ./.:4:86,68:.: 0.57:1.000:. ./.:4:109,46:.: 0.59:1.000:. ./.:4:77,47:.:-0.12:1.000:. ./.:4:152,79:.: 2.34:1.000:. ./.:4:79,54:.: 0.08:1.000:. ./.:4:28,11:.:-2.08:1.000:. ./.:4:73,26:.:-0.70:1.000:. ./.:4:84,35:.:-0.24:1.000:. ./.:4:75,28:.:-0.61:1.000:. ./.:4:149,48:.: 1.56:1.000:. ./.:4:105,47:.: 0.52:1.000:. ./.:4:112,47:.: 0.68:1.000:. ./.:4:110,45:.: 0.59:1.000:. ./.:4:98,36:.: 0.11:1.000:. ./.:4:82,32:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:115,47:.: 0.75:1.000:. ./.:4:71,35:.:-0.54:1.000:. ./.:4:135,40:.: 1.05:1.000:. ./.:4:103,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.07:0.999:. ./.:4:83,42:.:-0.10:1.000:. ./.:4:100,40:.: 0.24:1.000:. ./.:4:94,35:.:-0.01:1.000:. ./.:4:42,33:.:-1.25:1.000:. ./.:4:102,37:.: 0.22:1.000:. ./.:4:121,40:.: 0.73:1.000:. ./.:4:75,31:.:-0.54:1.000:. ./.:4:91,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:85,58:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,31:.: 0.43:1.000:. ./.:4:87,43:.: 0.01:1.000:. ./.:4:107,37:.: 0.34:1.000:. ./.:4:91,39:.: 0.01:1.000:. ./.:4:141,54:.: 1.51:1.000:. ./.:4:123,36:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.12:1.000:. -chr6.1 8737910 chr6.1_008737910 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,34:.: 0.38:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:89,26:.:-0.16:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:110,38:.: 0.83:1.000:. ./.:4:64,32:.:-0.72:1.000:. ./.:4:47,19:.:-1.62:1.000:. ./.:4:83,37:.:-0.01:1.000:. ./.:4:75,23:.:-0.66:1.000:. ./.:4:18,3:.:-2.96:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:81,27:.:-0.37:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.05:1.000:. ./.:5:152,0:.: 0.95:0.999:. ./.:4:61,61:.: 0.05:1.000:. ./.:4:99,56:.: 1.04:1.000:. ./.:4:86,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:93,41:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,54:.: 1.28:1.000:. ./.:4:60,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:65,36:.:-0.57:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.53:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.60:1.000:. ./.:3:5,1:.:-3.41:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.17:1.000:. ./.:6:108,31:.: 0.56:0.999:. ./.:4:95,31:.: 0.17:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:68,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,36:.: 1.42:1.000:. ./.:4:119,46:.: 1.34:1.000:. ./.:4:110,55:.: 1.34:0.999:. ./.:4:36,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:57,34:.:-0.87:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,50:.: 0.95:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:92,34:.: 0.17:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:98,33:.: 0.32:1.000:. ./.:4:90,48:.: 0.53:1.000:. ./.:4:100,37:.: 0.50:1.000:. ./.:6:102,27:.: 0.26:1.000:. ./.:4:113,59:.: 1.54:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:107,45:.: 0.95:1.000:. ./.:4:94,39:.: 0.38:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:76,29:.:-0.45:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.74:0.994:. ./.:4:115,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:108,43:.: 0.92:1.000:. ./.:4:53,25:.:-1.26:0.999:. ./.:4:103,40:.: 0.68:1.000:. ./.:4:95,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:60,62:.: 0.05:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:136,44:.: 1.78:1.000:. ./.:4:89,27:.:-0.13:1.000:. ./.:4:109,46:.: 1.04:1.000:. ./.:4:128,42:.: 1.48:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:78,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:83,36:.:-0.04:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:78,18:.:-0.72:1.000:. ./.:4:145,66:.: 2.71:1.000:. ./.:4:118,39:.: 1.10:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:80,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:116,50:.: 1.37:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:97,36:.: 0.38:1.000:. ./.:4:95,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.62:0.998:. ./.:4:170,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:92,35:.: 0.20:1.000:. ./.:4:91,39:.: 0.29:1.000:. ./.:4:107,45:.: 0.95:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:90,31:.: 0.02:1.000:. ./.:4:91,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:108,40:.: 0.83:1.000:. ./.:4:99,26:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,49:.: 1.19:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.01:1.000:. ./.:4:106,35:.: 0.62:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:135,49:.: 1.90:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:117,35:.: 0.95:1.000:. ./.:4:169,2:.: 1.51:1.000:. ./.:4:88,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.60:0.975:. ./.:4:102,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:98,39:.: 0.50:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:107,34:.: 0.62:1.000:. ./.:4:103,34:.: 0.50:1.000:. ./.:4:76,38:.:-0.19:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:147,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:97,25:.: 0.05:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:86,34:.:-0.01:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:17,7:.:-2.87:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:101,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.11:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:95,42:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,40:.:-0.10:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:74,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:86,36:.: 0.05:1.000:. ./.:4:68,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:89,35:.: 0.11:0.999:. ./.:4:63,34:.:-0.69:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,31:.:-0.99:1.000:. ./.:4:87,34:.: 0.02:1.000:. ./.:4:94,31:.: 0.14:1.000:. ./.:4:74,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:101,49:.: 0.89:1.000:. ./.:4:82,28:.:-0.31:1.000:. ./.:4:73,21:.:-0.78:1.000:. ./.:4:86,34:.:-0.01:1.000:. ./.:4:94,40:.: 0.41:1.000:. ./.:4:82,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:78,35:.:-0.22:1.000:. -chr6.1 8980089 chr6.1_008980089 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,391:.: 0.91:1.000:. ./.:4:275,174:.:-0.52:1.000:. ./.:4:219,261:.:-0.23:1.000:. ./.:4:207,328:.: 0.27:1.000:. ./.:4:261,393:.: 1.35:1.000:. ./.:4:231,429:.: 1.41:1.000:. ./.:4:117,186:.:-1.85:1.000:. ./.:4:219,355:.: 0.62:1.000:. ./.:4:202,268:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,106:.:-3.07:1.000:. ./.:4:109,140:.:-2.34:1.000:. ./.:4:226,120:.:-1.46:1.000:. ./.:4:258,163:.:-0.77:1.000:. ./.:4:208,339:.: 0.38:1.000:. ./.:4:205,318:.: 0.16:1.000:. ./.:4:203,276:.:-0.24:1.000:. ./.:5:293,430:.: 1.98:0.999:. ./.:4:317,266:.: 0.70:1.000:. ./.:4:271,325:.: 0.82:1.000:. ./.:4:247,343:.: 0.77:1.000:. ./.:4:86,93:.:-2.98:1.000:. ./.:4:273,221:.:-0.11:1.000:. ./.:4:222,290:.: 0.06:1.000:. ./.:4:167,323:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,128:.:-2.85:1.000:. ./.:4:222,356:.: 0.66:1.000:. ./.:4:196,339:.: 0.27:1.000:. ./.:4:201,325:.: 0.19:1.000:. ./.:4:214,330:.: 0.35:1.000:. ./.:4:214,266:.:-0.23:1.000:. ./.:4:293,217:.: 0.04:1.000:. ./.:4:207,232:.:-0.61:1.000:. ./.:4:32,61:.:-3.76:1.000:. ./.:4:97,113:.:-2.69:1.000:. ./.:3:31,82:.:-3.58:1.000:. ./.:4:219,308:.: 0.19:1.000:. ./.:6:295,377:.: 1.52:0.999:. ./.:4:317,266:.: 0.70:1.000:. ./.:4:230,288:.: 0.11:1.000:. ./.:4:265,360:.: 1.09:1.000:. ./.:4:222,219:.:-0.59:1.000:. ./.:4:202,262:.:-0.38:1.000:. ./.:4:332,210:.: 0.33:1.000:. ./.:4:276,198:.:-0.29:1.000:. ./.:4:326,317:.: 1.25:1.000:. ./.:4:370,316:.: 1.64:1.000:. ./.:4:238,388:.: 1.10:0.999:. ./.:4:314,465:.: 2.49:1.000:. ./.:4:272,244:.: 0.09:1.000:. ./.:4:318,301:.: 1.03:1.000:. ./.:4:272,279:.: 0.41:1.000:. ./.:4:246,403:.: 1.31:1.000:. ./.:4:199,221:.:-0.78:1.000:. ./.:4:237,353:.: 0.77:1.000:. ./.:4:206,281:.:-0.17:1.000:. ./.:4:295,303:.: 0.84:1.000:. ./.:4:207,267:.:-0.29:1.000:. ./.:4:238,412:.: 1.32:1.000:. ./.:4:278,221:.:-0.06:1.000:. ./.:6:227,214:.:-0.59:1.000:. ./.:4:327,200:.: 0.19:1.000:. ./.:4:140,249:.:-1.06:1.000:. ./.:4:265,305:.: 0.59:1.000:. ./.:4:220,290:.: 0.04:1.000:. ./.:4:259,312:.: 0.60:1.000:. ./.:4:230,324:.: 0.44:1.000:. ./.:4:157,244:.:-0.95:1.000:. ./.:4:208,280:.:-0.16:1.000:. ./.:4:247,309:.: 0.46:0.994:. ./.:4:273,197:.:-0.33:1.000:. ./.:4:251,400:.: 1.32:1.000:. ./.:4:213,143:.:-1.36:0.999:. ./.:4:308,247:.: 0.45:1.000:. ./.:4:243,394:.: 1.20:1.000:. ./.:4:297,192:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,302:.:-0.02:1.000:. ./.:4:213,267:.:-0.23:1.000:. ./.:4:235,278:.: 0.07:1.000:. ./.:4:304,285:.: 0.76:1.000:. ./.:4:231,319:.: 0.40:1.000:. ./.:4:255,184:.:-0.61:1.000:. ./.:4:314,274:.: 0.75:1.000:. ./.:4:262,402:.: 1.44:1.000:. ./.:4:200,241:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,313:.: 0.52:1.000:. ./.:4:315,326:.: 1.23:1.000:. ./.:4:155,219:.:-1.20:1.000:. ./.:4:197,307:.:-0.02:1.000:. ./.:4:203,322:.: 0.18:1.000:. ./.:4:193,262:.:-0.46:1.000:. ./.:4:172,179:.:-1.41:1.000:. ./.:4:273,218:.:-0.13:1.000:. ./.:4:268,405:.: 1.52:1.000:. ./.:4:203,211:.:-0.84:1.000:. ./.:4:334,308:.: 1.24:1.000:. ./.:4:262,254:.: 0.09:1.000:. ./.:4:200,270:.:-0.33:1.000:. ./.:4:286,175:.:-0.41:1.000:. ./.:4:289,281:.: 0.59:1.000:. ./.:4:186,278:.:-0.38:1.000:. ./.:4:147,160:.:-1.81:1.000:. ./.:4:252,359:.: 0.96:1.000:. ./.:4:257,222:.:-0.24:1.000:. ./.:4:198,300:.:-0.07:1.000:. ./.:4:286,275:.: 0.50:0.998:. ./.:4:216,321:.: 0.29:1.000:. ./.:4:190,303:.:-0.12:1.000:. ./.:4:223,274:.:-0.08:1.000:. ./.:4:242,415:.: 1.38:1.000:. ./.:4:228,298:.: 0.19:1.000:. ./.:4:269,194:.:-0.39:1.000:. ./.:4:304,351:.: 1.36:1.000:. ./.:4:213,279:.:-0.12:1.000:. ./.:4:210,336:.: 0.37:1.000:. ./.:4:158,288:.:-0.54:1.000:. ./.:4:236,373:.: 0.94:1.000:. ./.:4:191,239:.:-0.69:1.000:. ./.:4:205,305:.: 0.04:1.000:. ./.:4:187,244:.:-0.68:1.000:. ./.:4:180,256:.:-0.63:1.000:. ./.:4:202,343:.: 0.36:1.000:. ./.:4:297,190:.:-0.17:1.000:. ./.:4:291,325:.: 1.01:1.000:. ./.:4:196,306:.:-0.03:1.000:. ./.:4:242,266:.: 0.02:1.000:. ./.:4:218,293:.: 0.05:1.000:. ./.:4:223,293:.: 0.09:1.000:. ./.:4:246,169:.:-0.83:1.000:. ./.:4:192,224:.:-0.82:1.000:. ./.:4:164,226:.:-1.05:1.000:. ./.:4:286,183:.:-0.33:1.000:. ./.:4:207,385:.: 0.79:1.000:. ./.:4:121,213:.:-1.56:0.975:. ./.:4:246,267:.: 0.07:1.000:. ./.:4:200,279:.:-0.24:1.000:. ./.:4:339,344:.: 1.62:1.000:. ./.:4:307,220:.: 0.19:1.000:. ./.:4:212,246:.:-0.43:1.000:. ./.:4:198,255:.:-0.48:1.000:. ./.:4:213,272:.:-0.19:1.000:. ./.:4:240,328:.: 0.57:1.000:. ./.:4:279,244:.: 0.16:1.000:. ./.:4:205,247:.:-0.49:1.000:. ./.:4:188,205:.:-1.03:1.000:. ./.:4:252,410:.: 1.42:1.000:. ./.:4:251,319:.: 0.59:1.000:. ./.:4:290,276:.: 0.55:1.000:. ./.:4:252,285:.: 0.29:1.000:. ./.:4:252,315:.: 0.56:1.000:. ./.:4:272,176:.:-0.53:1.000:. ./.:4:307,244:.: 0.41:1.000:. ./.:4:278,270:.: 0.39:1.000:. ./.:4:93,115:.:-2.71:1.000:. ./.:4:142,160:.:-1.86:1.000:. ./.:4:231,314:.: 0.36:1.000:. ./.:4:278,291:.: 0.58:1.000:. ./.:4:319,314:.: 1.16:1.000:. ./.:4:214,357:.: 0.60:1.000:. ./.:4:189,247:.:-0.63:1.000:. ./.:4:196,355:.: 0.41:1.000:. ./.:4:141,298:.:-0.61:1.000:. ./.:4:188,304:.:-0.12:1.000:. ./.:4:192,245:.:-0.63:1.000:. ./.:4:290,335:.: 1.09:1.000:. ./.:4:291,325:.: 1.01:1.000:. ./.:4:205,354:.: 0.49:1.000:. ./.:4:246,265:.: 0.05:1.000:. ./.:4:264,207:.:-0.32:0.999:. ./.:4:270,258:.: 0.20:1.000:. ./.:4:274,242:.: 0.09:1.000:. ./.:4:189,265:.:-0.47:1.000:. ./.:4:216,168:.:-1.11:1.000:. ./.:4:252,264:.: 0.09:1.000:. ./.:4:164,312:.:-0.27:1.000:. ./.:4:167,305:.:-0.31:1.000:. ./.:4:171,224:.:-1.01:1.000:. ./.:4:265,308:.: 0.61:1.000:. ./.:4:227,345:.: 0.60:1.000:. ./.:4:186,242:.:-0.71:1.000:. ./.:4:239,257:.:-0.09:1.000:. ./.:4:285,256:.: 0.32:1.000:. ./.:4:234,462:.: 1.73:1.000:. ./.:4:336,281:.: 1.01:1.000:. ./.:4:172,237:.:-0.88:1.000:. ./.:4:298,213:.: 0.05:1.000:. -chr6.1 9284390 chr6.1_009284390 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:65,194:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,221:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,117:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,194:0.69: 0.36:1.000:0.977 0/1/1/1:4:76,236:0.74: 0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,210:0.74: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,77:0.44:-1.13:1.000:0.964 0/0/1/1:4:132,86:0.43:-0.67:1.000:0.954 0/0/1/1:4:125,106:0.48:-0.44:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,108:0.83:-2.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,191:0.85:-0.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:130,111:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,249:0.78: 1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,301:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,159:0.72:-0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:80,203:0.71: 0.48:1.000:0.989 1/1/1/1/1:5:1,385:1.00: 2.30:0.999:1.000 0/0/1/1:4:144,180:0.56: 1.21:1.000:0.963 0/0/1/1:4:172,141:0.47: 1.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:198,125:0.43: 1.19:1.000:0.940 0/1/1/1:4:51,132:0.71:-1.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:191,71:0.34: 0.11:1.000:0.858 0/0/1/1:4:131,104:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:70,213:0.74: 0.48:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,108:0.47:-0.19:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,265:1.00: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,222:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,197:0.68: 0.50:1.000:0.963 0/0/1/1:4:189,130:0.44: 1.12:1.000:0.971 0/0/1/1:4:176,164:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,130:0.68:-1.18:1.000:0.951 0/1/1/1:4:13,47:0.77:-3.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,141:0.84:-1.59:1.000:0.996 0/1/1:3:21,78:0.77:-2.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,202:0.73: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:110,162:0.60: 0.29:0.999:0.628 0/0/1/1:4:161,145:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,215:0.76: 0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,305:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,96:0.50:-1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,94:0.52:-1.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:112,166:0.60: 0.39:1.000:0.798 0/1/1/1:4:32,211:0.86:-0.23:1.000:0.973 0/0/1/1:4:127,193:0.60: 1.14:1.000:0.750 0/1/1/1:4:64,266:0.79: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,220:0.71: 0.83:0.999:0.993 0/1/1/1:4:104,180:0.63: 0.50:1.000:0.583 0/1/1/1:4:89,157:0.64:-0.17:1.000:0.633 0/1/1/1:4:50,225:0.80: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,226:0.78: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,195:0.69: 0.41:1.000:0.972 0/0/1/1:4:104,93:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,208:0.81:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,74:0.43:-1.13:1.000:0.937 0/1/1/1:4:52,250:0.81: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,32:0.26:-1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,218:0.78: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,97:0.43:-0.14:1.000:0.948 0/0/0/1/1/1:6:112,76:0.44:-1.20:1.000:0.681 0/0/1/1:4:137,82:0.42:-0.65:1.000:0.907 0/0/1/1:4:106,89:0.48:-1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,139:0.54: 0.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:59,234:0.78: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,31:0.24:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,252:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,253:0.72: 1.61:1.000:0.994 0/1/1/1:4:58,191:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,199:0.73: 0.22:0.994:0.997 0/1/1/1:4:55,198:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,221:0.73: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,156:0.61:-0.03:0.999:0.642 0/1/1/1:4:118,217:0.64: 1.40:1.000:0.731 0/0/1/1:4:128,85:0.44:-0.76:1.000:0.961 0/1/1/1:4:44,219:0.82: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,192:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,166:0.73:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,187:0.72: 0.00:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,338:1.00: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,228:0.80: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,60:0.37:-1.15:1.000:0.514 0/1/1/1:4:43,262:0.85: 0.87:1.000:0.990 0/0/1/1:4:123,129:0.52:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,81:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:165,50:0.31:-0.72:1.000:0.968 0/1/1/1:4:62,272:0.80: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,136:0.74:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,88:0.51:-1.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,190:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,167:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,177:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,127:0.57:-0.56:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,318:1.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,121:0.57:-0.76:1.000:0.937 0/1/1/1:4:67,302:0.80: 2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,139:0.56:-0.12:1.000:0.958 0/0/1/1:4:90,80:0.49:-1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,127:0.56:-0.49:1.000:0.960 0/0/1/1:4:120,156:0.57: 0.36:1.000:0.944 0/1/1/1:4:64,187:0.73:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,108:0.52:-0.79:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,196:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,116:0.60:-1.09:1.000:0.792 0/1/1/1:4:59,226:0.78: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,292:0.87: 1.35:0.998:0.909 0/1/1/1:4:51,200:0.78:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,176:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:221,30:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,236:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,169:0.72:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,142:0.57:-0.07:1.000:0.948 0/0/1/1:4:179,150:0.48: 1.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,226:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,203:0.74: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,160:0.83:-1.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:65,203:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,223:0.81: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,168:0.80:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,40:0.30:-1.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:100,99:0.51:-1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,170:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,139:0.63:-0.62:1.000:0.527 0/1/1/1:4:52,257:0.82: 0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,182:0.69: 0.11:1.000:0.965 0/1/1/1:4:60,166:0.72:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,110:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,134:0.53: 0.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:102,141:0.58:-0.23:1.000:0.895 0/0/1/1:4:79,95:0.55:-1.45:1.000:0.975 0/1/1/1:4:24,152:0.85:-1.41:1.000:0.984 0/0/1/1:4:102,164:0.62: 0.18:1.000:0.617 1/1/1/1:4:0,315:1.00: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,203:1.00:-0.93:0.975:1.000 0/1/1/1:4:47,168:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,167:0.69:-0.28:1.000:0.967 0/1/1/1:4:87,285:0.75: 2.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,213:0.81: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,165:0.78:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,94:0.52:-1.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,170:0.82:-0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,99:0.51:-0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,124:0.58:-0.72:1.000:0.909 0/0/1/1:4:127,108:0.48:-0.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,153:0.78:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,227:0.71: 1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,130:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,287:0.78: 1.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,224:0.78: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,208:0.69: 0.71:1.000:0.977 0/0/1/1:4:112,157:0.59: 0.23:1.000:0.880 0/0/1/1:4:186,192:0.52: 2.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:84,206:0.70: 0.60:1.000:0.984 0/0/0/1:4:79,34:0.36:-2.53:1.000:0.642 0/1/1/1:4:46,145:0.74:-1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,183:0.72:-0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:86,285:0.75: 2.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,292:0.80: 1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,248:0.75: 1.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,230:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,215:0.72: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,186:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,133:0.75:-1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,84:0.45:-0.95:1.000:0.979 0/1/1/1:4:84,233:0.72: 1.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,250:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,176:0.68:-0.03:1.000:0.962 0/1/1/1:4:76,258:0.75: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,157:0.54: 0.69:0.999:0.986 0/0/1/1:4:118,155:0.57: 0.30:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,355:1.00: 1.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,253:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,62:0.33:-0.28:1.000:0.911 0/0/1/1:4:127,183:0.59: 0.96:1.000:0.843 0/1/1/1:4:51,162:0.74:-0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,187:0.79:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,169:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,129:0.44: 1.08:1.000:0.971 0/0/1/1:4:150,126:0.48: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,95:0.45:-0.49:1.000:0.980 0/0/1/1:4:135,124:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,187:0.55: 1.61:1.000:0.982 0/1/1/1:4:96,238:0.70: 1.38:1.000:0.986 0/0/1/1:4:215,212:0.51: 3.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,158:0.69:-0.54:1.000:0.976 0/0/1/1:4:134,126:0.50: 0.07:1.000:0.997 -chr6.1 9495160 chr6.1_009495160 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:19,41:0.63: 0.86:1.000:0.621 0/1/1/1:4:13,45:0.71: 0.73:1.000:0.993 0/0/0/1:4:38,24:0.37: 0.99:1.000:0.545 0/0/1/1:4:17,33:0.61: 0.22:1.000:0.638 0/1/1/1:4:22,52:0.65: 1.77:1.000:0.801 0/0/1/1:4:19,33:0.59: 0.35:1.000:0.845 0/0/1/1:4:8,7:0.45:-2.05:1.000:0.975 0/0/0/1:4:42,15:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,10:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,1:0.07:-2.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,6:0.52:-2.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,26:0.52: 0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:33,10:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,23:0.63:-0.82:1.000:0.545 0/0/1/1:4:17,26:0.57:-0.24:1.000:0.953 0/1/1/1:4:15,34:0.64: 0.15:1.000:0.728 0/0/1/1/1:5:16,47:0.69: 1.06:0.999:0.628 0/0/1/1:4:42,37:0.45: 2.09:1.000:0.976 0/0/1/1:4:26,28:0.49: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-2.37:1.000:0.961 0/0/0/1:4:49,9:0.15: 0.73:1.000:0.989 0/0/0/1:4:34,16:0.31: 0.22:1.000:0.975 0/0/1/1:4:12,21:0.59:-0.88:1.000:0.835 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.40:-0.24:1.000:0.796 0/0/1/1:4:19,31:0.58: 0.22:1.000:0.912 0/1/1/1:4:7,33:0.76:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,19:0.31: 0.86:1.000:0.979 0/0/0/1:4:29,18:0.37: 0.02:1.000:0.595 0/0/0/1:4:50,18:0.26: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,16:0.35:-0.17:1.000:0.796 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,9:0.86:-2.37:1.000:0.959 1/1/1:3:0,2:1.00:-2.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,20:0.36: 0.48:1.000:0.735 0/0/0/0/0/1:6:42,11:0.20: 0.41:0.999:0.914 0/0/0/1:4:46,14:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,30:0.63:-0.17:1.000:0.605 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,10:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.44: 0.93:1.000:0.964 0/0/1/1:4:31,25:0.43: 0.61:1.000:0.937 0/0/0/1:4:34,14:0.28: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,36:0.52: 1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,23:0.42: 0.35:0.999:0.924 0/0/0/1:4:8,5:0.37:-2.18:1.000:0.576 0/0/0/1:4:29,9:0.23:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,13:0.40:-1.01:1.000:0.802 0/0/1/1:4:24,21:0.45:-0.11:1.000:0.975 0/0/1/1:4:22,16:0.40:-0.56:1.000:0.815 0/0/0/1:4:29,11:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,32:0.56: 0.48:1.000:0.971 0/0/0/1:4:28,15:0.34:-0.24:1.000:0.893 0/0/1/1:4:21,23:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,33:0.66:-0.04:1.000:0.890 0/0/0/1:4:33,15:0.30: 0.09:1.000:0.983 0/0/0/0/1/1:6:43,15:0.25: 0.73:1.000:0.500 0/0/0/1:4:45,26:0.35: 1.58:1.000:0.774 0/0/0/1:4:33,8:0.19:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,16:0.37:-0.37:1.000:0.506 0/0/0/1:4:29,10:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.32:-1.66:1.000:0.950 0/0/1/1:4:27,20:0.41: 0.02:1.000:0.845 0/0/1/1:4:21,17:0.43:-0.56:0.994:0.939 0/1/1/1:4:17,55:0.70: 1.64:1.000:0.988 0/0/1/1:4:17,27:0.58:-0.17:1.000:0.932 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.73:0.999:1.000 0/0/1/1:4:31,35:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,12:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,35:0.63: 0.35:1.000:0.507 0/1/1/1:4:13,35:0.67: 0.09:1.000:0.934 0/1/1/1:4:7,22:0.70:-1.14:1.000:0.984 0/0/1/1:4:24,16:0.38:-0.43:1.000:0.612 0/1/1/1:4:11,65:0.80: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.28: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/0:4:43,4:0.08: 0.02:1.000:0.981 0/0/1/1:4:24,39:0.58: 1.06:1.000:0.915 0/0/0/1:4:25,9:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,25:0.45: 0.41:1.000:0.980 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,29:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,18:0.64:-1.34:1.000:0.713 0/0/0/1:4:30,12:0.28:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,24:0.65:-0.82:1.000:0.824 0/1/1/1:4:13,28:0.63:-0.37:1.000:0.617 0/0/1/1:4:13,19:0.56:-0.95:1.000:0.970 0/0/0/1:4:47,12:0.20: 0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,33:0.53: 0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,29:0.43: 1.19:1.000:0.936 0/0/0/1:4:33,19:0.35: 0.35:1.000:0.781 0/0/0/1:4:30,12:0.28:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,25:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,29:0.53: 0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,33:0.55: 0.61:1.000:0.975 0/0/0/1:4:15,5:0.24:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,29:0.58: 0.02:1.000:0.922 0/0/1/1:4:27,19:0.40:-0.04:1.000:0.749 0/1/1/1:4:12,26:0.64:-0.56:1.000:0.631 0/0/1/1:4:36,27:0.41: 1.06:0.998:0.863 0/0/1/1:4:17,34:0.62: 0.28:1.000:0.566 0/1/1/1:4:11,30:0.68:-0.37:1.000:0.942 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,20:0.34: 0.61:1.000:0.845 0/1/1/1:4:15,35:0.65: 0.22:1.000:0.780 0/0/0/1:4:30,8:0.21:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,19:0.38: 0.09:1.000:0.562 0/0/1/1:4:19,29:0.57: 0.09:1.000:0.954 0/0/0/1:4:15,8:0.33:-1.53:1.000:0.898 0/0/1/1:4:16,29:0.60:-0.11:1.000:0.779 0/0/0/1:4:16,10:0.37:-1.34:1.000:0.576 0/1/1/1:4:5,36:0.83:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.27:-1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,32:0.61: 0.15:1.000:0.706 0/0/0/1:4:45,14:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,45:0.50: 2.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,17:0.33: 0.22:1.000:0.930 0/1/1/1:4:14,29:0.63:-0.24:1.000:0.522 0/0/0/1:4:28,13:0.31:-0.37:1.000:0.978 0/0/0/1:4:23,12:0.33:-0.75:1.000:0.920 0/0/1/1:4:21,27:0.53: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:19,8:0.29:-1.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,20:0.58:-0.95:1.000:0.893 0/0/0/1:4:54,20:0.26: 1.77:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.34:0.975:1.000 0/0/0/1:4:28,16:0.35:-0.17:1.000:0.796 0/0/1/1:4:21,20:0.46:-0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,33:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,28:0.48: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,28:0.63:-0.37:1.000:0.617 0/0/1/1:4:22,15:0.39:-0.62:1.000:0.673 0/0/1/1:4:13,26:0.62:-0.50:1.000:0.566 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,16:0.26: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,26:0.74:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,29:0.54: 0.28:1.000:0.989 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,23:0.36: 0.99:1.000:0.729 0/1/1/1:4:15,38:0.66: 0.41:1.000:0.888 0/0/1/1:4:17,20:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,13:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,48:0.55: 2.29:1.000:0.979 0/0/1/1:4:39,39:0.48: 2.03:1.000:0.994 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.46:-1.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:26,11:0.29:-0.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,27:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,31:0.45: 1.19:1.000:0.984 0/0/0/1:4:26,16:0.37:-0.30:1.000:0.620 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,19:0.39: 0.02:1.000:0.660 0/0/0/1:4:26,14:0.34:-0.43:1.000:0.887 0/0/0/1:4:23,11:0.31:-0.82:1.000:0.970 0/0/0/1:4:42,16:0.27: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,31:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,28:0.65:-0.43:1.000:0.780 0/0/1/1:4:12,24:0.62:-0.69:1.000:0.566 0/0/1/1:4:29,28:0.47: 0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:28,21:0.41: 0.15:0.999:0.863 0/0/0/1:4:44,16:0.26: 0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,35:0.67: 0.09:1.000:0.934 0/1/1/1:4:10,38:0.73: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,19:0.24: 2.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,34:0.67: 0.02:1.000:0.915 0/0/0/1:4:20,11:0.34:-1.01:1.000:0.860 0/0/0/1:4:30,6:0.16:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,25:0.40: 0.86:1.000:0.781 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,6:0.11: 0.35:1.000:0.563 0/0/1/1:4:37,41:0.50: 2.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,34:0.60: 0.41:1.000:0.801 0/0/0/1:4:62,17:0.21: 2.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,27:0.67:-0.62:1.000:0.936 0/0/1/1:4:28,37:0.54: 1.19:1.000:0.989 -chr6.1 9556727 chr6.1_009556727 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:243,97:.: 0.35:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:234,112:.: 0.44:1.000:. ./.:4:251,114:.: 0.72:1.000:. ./.:4:270,99:.: 0.77:1.000:. ./.:4:317,135:.: 1.98:1.000:. ./.:4:133,147:.:-0.52:1.000:. ./.:4:167,200:.: 0.74:1.000:. ./.:4:233,98:.: 0.22:1.000:. ./.:4:116,62:.:-2.00:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:272,108:.: 0.93:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.35:1.000:. ./.:5:424,0:.: 1.57:0.999:. ./.:4:183,210:.: 1.12:1.000:. ./.:4:304,136:.: 1.80:1.000:. ./.:4:266,133:.: 1.21:1.000:. ./.:4:140,65:.:-1.61:1.000:. ./.:4:167,186:.: 0.54:1.000:. ./.:4:243,116:.: 0.63:1.000:. ./.:4:223,129:.: 0.53:1.000:. ./.:4:90,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:157,247:.: 1.28:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:325,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:266,120:.: 1.02:1.000:. ./.:4:271,132:.: 1.27:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:69,35:.:-3.07:1.000:. ./.:4:157,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:53,21:.:-3.51:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:329,116:.: 1.88:0.999:. ./.:4:149,231:.: 0.93:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:223,94:.: 0.02:1.000:. ./.:4:232,99:.: 0.22:1.000:. ./.:4:244,113:.: 0.60:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:143,194:.: 0.31:1.000:. ./.:4:222,100:.: 0.09:1.000:. ./.:4:277,104:.: 0.95:0.999:. ./.:4:481,155:.: 4.65:1.000:. ./.:4:152,178:.: 0.21:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:171,85:.:-0.87:1.000:. ./.:4:276,105:.: 0.95:1.000:. ./.:4:243,112:.: 0.57:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:158,162:.: 0.06:1.000:. ./.:4:259,106:.: 0.72:1.000:. ./.:4:142,193:.: 0.28:1.000:. ./.:4:225,125:.: 0.50:1.000:. ./.:4:119,181:.:-0.23:1.000:. ./.:6:124,137:.:-0.79:1.000:. ./.:4:121,174:.:-0.30:1.000:. ./.:4:221,90:.:-0.07:1.000:. ./.:4:239,123:.: 0.67:1.000:. ./.:4:205,82:.:-0.42:1.000:. ./.:4:167,220:.: 1.04:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:200,76:.:-0.58:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.53:0.994:. ./.:4:237,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:274,100:.: 0.85:1.000:. ./.:4:247,111:.: 0.61:0.999:. ./.:4:254,109:.: 0.69:1.000:. ./.:4:156,192:.: 0.47:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:206,104:.:-0.08:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:90,157:.:-1.00:1.000:. ./.:4:264,129:.: 1.12:1.000:. ./.:4:157,216:.: 0.83:1.000:. ./.:4:193,64:.:-0.85:1.000:. ./.:4:177,247:.: 1.57:1.000:. ./.:4:254,98:.: 0.53:1.000:. ./.:4:193,80:.:-0.62:1.000:. ./.:4:111,155:.:-0.72:1.000:. ./.:4:167,83:.:-0.95:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:218,76:.:-0.31:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:105,145:.:-0.95:1.000:. ./.:4:249,107:.: 0.59:1.000:. ./.:4:249,121:.: 0.79:1.000:. ./.:4:163,89:.:-0.92:1.000:. ./.:4:202,95:.:-0.27:1.000:. ./.:4:153,188:.: 0.37:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:220,122:.: 0.38:1.000:. ./.:4:219,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,135:.:-1.20:1.000:. ./.:4:209,101:.:-0.08:1.000:. ./.:4:231,73:.:-0.17:0.998:. ./.:4:222,97:.: 0.05:1.000:. ./.:4:207,88:.:-0.30:1.000:. ./.:4:158,200:.: 0.61:1.000:. ./.:4:283,138:.: 1.53:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:188,90:.:-0.55:1.000:. ./.:4:283,154:.: 1.76:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:195,116:.:-0.07:1.000:. ./.:4:160,73:.:-1.20:1.000:. ./.:4:238,107:.: 0.43:1.000:. ./.:4:296,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:203,75:.:-0.55:1.000:. ./.:4:143,204:.: 0.45:1.000:. ./.:4:176,99:.:-0.59:1.000:. ./.:4:216,75:.:-0.36:1.000:. ./.:4:204,95:.:-0.24:1.000:. ./.:4:177,71:.:-0.98:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:244,96:.: 0.35:1.000:. ./.:4:196,109:.:-0.15:1.000:. ./.:4:191,67:.:-0.84:1.000:. ./.:4:169,92:.:-0.79:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:205,93:.:-0.26:1.000:. ./.:4:287,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:173,0:.:-2.07:0.975:. ./.:4:299,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:328,137:.: 2.17:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:166,88:.:-0.89:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:222,103:.: 0.14:1.000:. ./.:4:124,190:.:-0.02:1.000:. ./.:4:185,78:.:-0.76:1.000:. ./.:4:223,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:292,149:.: 1.82:1.000:. ./.:4:321,121:.: 1.83:1.000:. ./.:4:222,111:.: 0.25:1.000:. ./.:4:215,105:.: 0.06:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:185,96:.:-0.50:1.000:. ./.:4:298,116:.: 1.43:1.000:. ./.:4:208,105:.:-0.04:1.000:. ./.:4:88,87:.:-2.04:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:260,139:.: 1.21:1.000:. ./.:4:266,105:.: 0.80:1.000:. ./.:4:237,124:.: 0.66:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:246,98:.: 0.41:1.000:. ./.:4:243,100:.: 0.40:1.000:. ./.:4:211,67:.:-0.55:1.000:. ./.:4:201,94:.:-0.30:1.000:. ./.:4:225,110:.: 0.28:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:271,109:.: 0.93:1.000:. ./.:4:203,100:.:-0.18:1.000:. ./.:4:222,72:.:-0.31:0.999:. ./.:4:151,177:.: 0.18:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,171:.: 0.06:1.000:. ./.:4:148,192:.: 0.35:1.000:. ./.:4:200,79:.:-0.53:1.000:. ./.:4:212,101:.:-0.04:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:213,117:.: 0.21:1.000:. ./.:4:254,126:.: 0.93:1.000:. ./.:4:239,103:.: 0.38:1.000:. ./.:4:199,103:.:-0.20:1.000:. ./.:4:157,186:.: 0.40:1.000:. ./.:4:292,145:.: 1.76:1.000:. ./.:4:272,117:.: 1.06:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:261,107:.: 0.76:1.000:. -chr6.1 9755841 chr6.1_009755841 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:62,19:.: 0.48:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:68,21:.: 0.84:1.000:. ./.:4:57,22:.: 0.39:1.000:. ./.:4:67,16:.: 0.57:1.000:. ./.:4:80,26:.: 1.59:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:62,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:61,25:.: 0.70:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:61,22:.: 0.57:1.000:. ./.:4:63,17:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,18:.: 0.75:1.000:. ./.:5:96,24:.: 2.21:0.999:. ./.:4:81,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:71,25:.: 1.15:1.000:. ./.:4:85,17:.: 1.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:62,15:.: 0.31:1.000:. ./.:4:62,20:.: 0.53:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:84,12:.: 1.15:1.000:. ./.:4:69,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:51,24:.: 0.22:1.000:. ./.:4:78,22:.: 1.33:1.000:. ./.:4:55,20:.: 0.22:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:77,26:.: 1.46:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.84:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:61,29:.: 0.88:1.000:. ./.:6:87,18:.: 1.55:0.999:. ./.:4:89,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:55,18:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,18:.: 0.62:1.000:. ./.:4:49,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,24:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,21:.: 0.53:0.999:. ./.:4:87,23:.: 1.77:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:71,17:.: 0.79:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:69,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:42,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,7:.:-0.31:1.000:. ./.:4:47,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.39:1.000:. ./.:6:57,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:47,9:.:-0.62:1.000:. ./.:4:65,21:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:49,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:41,17:.:-0.54:1.000:. ./.:4:47,11:.:-0.54:1.000:. ./.:4:67,11:.: 0.35:1.000:. ./.:4:77,16:.: 1.01:0.994:. ./.:4:65,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:51,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:102,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:66,15:.: 0.48:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:51,15:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,10:.:-0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:59,19:.: 0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:64,16:.: 0.44:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:46,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.80:1.000:. ./.:4:37,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:41,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:40,13:.:-0.76:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,24:.: 1.06:1.000:. ./.:4:36,5:.:-1.29:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:51,20:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,13:.:-1.16:1.000:. ./.:4:43,21:.:-0.27:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:34,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.49:0.998:. ./.:4:54,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,26:.: 0.93:1.000:. ./.:4:72,14:.: 0.70:1.000:. ./.:4:55,18:.: 0.13:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:81,30:.: 1.81:1.000:. ./.:4:49,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:51,14:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,13:.:-0.71:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.80:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:43,6:.:-0.93:1.000:. ./.:4:58,16:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:64,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:42,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:34,16:.:-0.89:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:35,9:.:-1.16:1.000:. ./.:4:33,11:.:-1.16:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:65,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:37,9:.:-1.07:0.975:. ./.:4:35,10:.:-1.11:1.000:. ./.:4:56,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,10:.:-1.24:1.000:. ./.:4:34,9:.:-1.20:1.000:. ./.:4:38,8:.:-1.07:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:63,14:.: 0.31:1.000:. ./.:4:35,9:.:-1.16:1.000:. ./.:4:67,24:.: 0.93:1.000:. ./.:4:75,17:.: 0.97:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:72,16:.: 0.79:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:4,3:.:-2.80:1.000:. ./.:4:38,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:81,28:.: 1.72:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:58,26:.: 0.62:1.000:. ./.:4:65,21:.: 0.70:1.000:. ./.:4:75,9:.: 0.62:1.000:. ./.:4:50,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.14:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:67,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:62,9:.: 0.04:1.000:. ./.:4:53,15:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,20:.: 1.01:1.000:. ./.:4:52,16:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,31:.: 0.88:1.000:. ./.:4:64,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:78,31:.: 1.72:1.000:. ./.:4:118,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:37,16:.:-0.76:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.26:1.000:. -chr6.1 10183374 chr6.1_010183374 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:421,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:248,28:.:-0.21:1.000:. ./.:4:316,33:.: 0.65:1.000:. ./.:4:286,24:.: 0.19:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:494,1:.: 2.38:1.000:. ./.:4:232,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:300,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:344,32:.: 0.97:1.000:. ./.:4:90,20:.:-2.17:1.000:. ./.:4:80,73:.:-1.66:1.000:. ./.:4:187,58:.:-0.57:1.000:. ./.:4:82,64:.:-1.74:1.000:. ./.:4:330,17:.: 0.63:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:284,26:.: 0.19:1.000:. ./.:5:480,25:.: 2.49:0.999:. ./.:4:448,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:399,34:.: 1.64:1.000:. ./.:4:244,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:32,64:.:-2.33:1.000:. ./.:4:195,52:.:-0.55:1.000:. ./.:4:342,30:.: 0.93:1.000:. ./.:4:387,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:81,21:.:-2.26:1.000:. ./.:4:415,46:.: 1.97:1.000:. ./.:4:352,23:.: 0.96:1.000:. ./.:4:286,11:.: 0.04:1.000:. ./.:4:225,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:243,74:.: 0.28:1.000:. ./.:4:132,68:.:-1.10:1.000:. ./.:4:224,46:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,20:.:-2.32:1.000:. ./.:4:95,30:.:-1.99:1.000:. ./.:3:46,18:.:-2.71:1.000:. ./.:4:230,51:.:-0.15:1.000:. ./.:6:311,66:.: 0.98:0.999:. ./.:4:198,61:.:-0.41:1.000:. ./.:4:350,35:.: 1.08:1.000:. ./.:4:474,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:214,60:.:-0.23:1.000:. ./.:4:179,56:.:-0.69:1.000:. ./.:4:194,70:.:-0.35:1.000:. ./.:4:197,60:.:-0.43:1.000:. ./.:4:163,60:.:-0.83:1.000:. ./.:4:308,31:.: 0.54:1.000:. ./.:4:368,20:.: 1.11:0.999:. ./.:4:149,109:.:-0.42:1.000:. ./.:4:146,45:.:-1.21:1.000:. ./.:4:152,84:.:-0.68:1.000:. ./.:4:108,42:.:-1.69:1.000:. ./.:4:343,16:.: 0.77:1.000:. ./.:4:208,66:.:-0.23:1.000:. ./.:4:290,26:.: 0.26:1.000:. ./.:4:329,38:.: 0.87:1.000:. ./.:4:227,84:.: 0.21:1.000:. ./.:4:185,52:.:-0.67:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:237,73:.: 0.19:1.000:. ./.:6:166,62:.:-0.77:1.000:. ./.:4:208,62:.:-0.28:1.000:. ./.:4:193,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:205,60:.:-0.34:1.000:. ./.:4:252,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:231,68:.: 0.06:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:210,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:208,62:.:-0.28:1.000:. ./.:4:214,88:.: 0.10:0.994:. ./.:4:216,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:465,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:91,80:.:-1.45:0.999:. ./.:4:326,60:.: 1.09:1.000:. ./.:4:298,37:.: 0.49:1.000:. ./.:4:270,26:.: 0.03:1.000:. ./.:4:303,31:.: 0.48:1.000:. ./.:4:291,39:.: 0.43:1.000:. ./.:4:186,64:.:-0.51:1.000:. ./.:4:277,28:.: 0.13:1.000:. ./.:4:222,76:.: 0.05:1.000:. ./.:4:249,26:.:-0.22:1.000:. ./.:4:213,76:.:-0.05:1.000:. ./.:4:387,37:.: 1.54:1.000:. ./.:4:249,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:199,68:.:-0.31:1.000:. ./.:4:359,28:.: 1.10:1.000:. ./.:4:228,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:229,32:.:-0.38:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:264,21:.:-0.10:1.000:. ./.:4:237,24:.:-0.38:1.000:. ./.:4:91,87:.:-1.36:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:211,22:.:-0.71:1.000:. ./.:4:304,37:.: 0.56:1.000:. ./.:4:368,50:.: 1.47:1.000:. ./.:4:153,50:.:-1.07:1.000:. ./.:4:212,24:.:-0.68:1.000:. ./.:4:266,37:.: 0.11:1.000:. ./.:4:320,26:.: 0.62:1.000:. ./.:4:133,51:.:-1.29:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:230,22:.:-0.49:1.000:. ./.:4:274,35:.: 0.18:1.000:. ./.:4:132,85:.:-0.90:0.998:. ./.:4:250,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:202,61:.:-0.36:1.000:. ./.:4:354,26:.: 1.02:1.000:. ./.:4:265,36:.: 0.09:1.000:. ./.:4:165,72:.:-0.67:1.000:. ./.:4:289,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:180,55:.:-0.69:1.000:. ./.:4:502,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:237,25:.:-0.37:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:188,60:.:-0.54:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:170,79:.:-0.53:1.000:. ./.:4:157,53:.:-0.99:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:76,69:.:-1.75:1.000:. ./.:4:294,34:.: 0.41:1.000:. ./.:4:251,50:.: 0.09:1.000:. ./.:4:286,28:.: 0.24:1.000:. ./.:4:311,39:.: 0.67:1.000:. ./.:4:170,54:.:-0.82:1.000:. ./.:4:249,35:.:-0.11:1.000:. ./.:4:143,58:.:-1.09:1.000:. ./.:4:223,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:95,88:.:-1.30:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.91:0.975:. ./.:4:161,55:.:-0.91:1.000:. ./.:4:193,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:249,47:.: 0.03:1.000:. ./.:4:195,52:.:-0.55:1.000:. ./.:4:268,33:.: 0.09:1.000:. ./.:4:247,23:.:-0.28:1.000:. ./.:4:261,34:.: 0.02:1.000:. ./.:4:204,60:.:-0.35:1.000:. ./.:4:201,48:.:-0.53:1.000:. ./.:4:176,47:.:-0.83:1.000:. ./.:4:229,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:336,25:.: 0.80:1.000:. ./.:4:275,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:203,59:.:-0.37:1.000:. ./.:4:267,27:.: 0.01:1.000:. ./.:4:367,35:.: 1.28:1.000:. ./.:4:91,79:.:-1.46:1.000:. ./.:4:356,30:.: 1.09:1.000:. ./.:4:168,44:.:-0.96:1.000:. ./.:4:56,39:.:-2.34:1.000:. ./.:4:262,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:249,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:199,36:.:-0.69:1.000:. ./.:4:349,19:.: 0.88:1.000:. ./.:4:352,22:.: 0.95:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:370,28:.: 1.23:1.000:. ./.:4:299,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:275,10:.:-0.10:1.000:. ./.:4:166,56:.:-0.84:1.000:. ./.:4:298,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:307,17:.: 0.36:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:287,10:.: 0.04:1.000:. ./.:4:279,38:.: 0.28:0.999:. ./.:4:159,36:.:-1.16:1.000:. ./.:4:297,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:246,12:.:-0.42:1.000:. ./.:4:96,56:.:-1.67:1.000:. ./.:4:179,51:.:-0.75:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:304,18:.: 0.34:1.000:. ./.:4:161,35:.:-1.15:1.000:. ./.:4:260,72:.: 0.45:1.000:. ./.:4:214,62:.:-0.21:1.000:. ./.:4:224,40:.:-0.35:1.000:. ./.:4:221,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:318,34:.: 0.69:1.000:. ./.:4:496,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:257,60:.: 0.28:1.000:. ./.:4:276,36:.: 0.22:1.000:. ./.:4:270,29:.: 0.06:1.000:. -chr6.1 10374715 chr6.1_010374715 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:53,98:0.70: 1.22:1.000:0.985 0/1/1/1:4:28,58:0.72:-0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,77:0.69: 0.20:1.000:0.978 0/1/1/1:4:41,84:0.72: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,110:0.73: 1.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,77:0.70: 0.17:1.000:0.984 0/0/1/1:4:42,33:0.50:-1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,52:0.47: 0.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,86:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,7:0.24:-2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.37:-2.61:1.000:0.625 0/1/1/1:4:27,68:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,18:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,53:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,93:0.76: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,94:0.77: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:88,95:0.58: 2.26:0.999:0.951 0/0/0/1:4:155,28:0.24: 2.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,100:0.71: 1.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:91,59:0.46: 1.18:1.000:0.986 0/0/1/1:4:17,16:0.54:-2.64:1.000:0.986 0/1/1/1:4:34,74:0.74:-0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,83:0.69: 0.53:1.000:0.974 0/1/1/1:4:31,59:0.71:-0.78:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,14:0.49:-2.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,78:0.71: 0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,50:0.44: 0.59:1.000:0.972 0/0/1/1:4:62,43:0.47:-0.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,89:0.70: 0.76:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,97:0.76: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,56:0.52: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,6:0.56:-3.33:1.000:0.971 1/1/1/1:4:1,37:0.98:-2.48:1.000:1.000 0/0/1:3:14,7:0.40:-3.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,69:0.79:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:69,74:0.57: 0.95:0.999:0.567 0/0/1/1:4:73,58:0.50: 0.56:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,67:0.66:-0.09:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,49:0.49:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,104:0.78: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,48:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,20:0.23: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,46:0.45: 0.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:87,66:0.49: 1.28:0.999:0.996 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,21:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,33:0.57:-1.63:1.000:0.940 0/0/1/1:4:51,48:0.54:-0.48:1.000:0.986 0/0/1/1:4:98,73:0.49: 1.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,120:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,107:0.75: 1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,52:0.46: 0.53:1.000:0.989 0/1/1/1:4:41,95:0.75: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,54:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,73:0.76:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:25,63:0.76:-0.84:1.000:0.659 0/1/1/1:4:43,90:0.73: 0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,91:0.74: 0.59:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,44:0.46:-0.09:1.000:0.987 0/1/1/1:4:50,105:0.73: 1.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,70:0.66: 0.04:1.000:0.880 0/0/1/1:4:49,27:0.42:-1.24:1.000:0.921 0/1/1/1:4:40,91:0.74: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,61:0.52: 0.56:0.994:0.994 0/0/1/1:4:58,45:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,88:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,15:0.24:-0.65:0.999:1.000 0/0/0/1:4:101,33:0.32: 0.66:1.000:0.951 0/0/1/1:4:81,61:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,56:0.57:-0.16:1.000:0.945 0/1/1/1:4:28,57:0.72:-0.94:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,43:0.44: 0.01:1.000:0.970 0/0/1/1:4:89,64:0.48: 1.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,98:0.70: 1.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:57,49:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,54:0.46: 0.79:1.000:0.984 0/1/1/1:4:38,83:0.74: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,87:0.73: 0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,58:0.80:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,56:0.53: 0.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:22,71:0.80:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,46:0.53:-0.55:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,71:0.73:-0.32:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,96:0.98:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,59:0.59:-0.09:1.000:0.877 0/1/1/1:4:51,105:0.72: 1.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,66:0.85:-1.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:108,20:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,81:0.82:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,71:0.78:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,30:0.41:-0.88:1.000:0.876 0/0/1/1:4:89,69:0.50: 1.44:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,52:0.68:-1.01:1.000:0.951 0/1/1/1:4:24,51:0.73:-1.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,79:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,44:0.42: 0.40:0.998:0.897 0/1/1/1:4:38,75:0.71:-0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:85,47:0.42: 0.59:1.000:0.923 0/1/1/1:4:54,77:0.64: 0.56:1.000:0.708 0/0/1/1:4:91,69:0.49: 1.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,72:0.74:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,47:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/0/1/1:4:92,87:0.54: 2.13:1.000:0.985 0/0/1/1:4:77,58:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,85:0.79:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,24:0.45:-1.66:1.000:0.975 0/1/1/1:4:28,68:0.76:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,54:0.71:-1.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:44,35:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,67:0.78:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,56:0.54: 0.10:1.000:0.989 0/1/1/1:4:32,85:0.77: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,24:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,91:0.73: 0.66:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,88:0.98:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,68:0.67:-0.09:1.000:0.900 0/1/1/1:4:29,79:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,39:0.48:-0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,58:0.79:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,68:0.71:-0.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:40,93:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,49:0.75:-1.43:0.975:0.999 0/0/1/1:4:52,49:0.54:-0.42:1.000:0.985 0/0/1/1:4:72,44:0.44: 0.07:1.000:0.973 0/0/1/1:4:91,56:0.45: 1.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:85,40:0.39: 0.37:1.000:0.682 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,84:0.72: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,71:0.79:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,49:0.53:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:65,52:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,60:0.53: 0.40:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,43:0.68:-1.47:1.000:0.941 0/1/1/1:4:43,108:0.76: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,85:0.53: 2.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,59:0.45: 1.31:1.000:0.977 0/1/1/1:4:33,85:0.77: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,79:0.72: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,111:0.71: 1.77:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,66:0.50: 1.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,27:0.68:-2.32:1.000:0.954 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,59:0.52: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,66:0.52: 0.92:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,73:0.53: 1.35:1.000:0.992 0/0/0/1:4:100,21:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,74:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,56:0.46: 0.92:1.000:0.986 0/0/0/1:4:111,35:0.32: 1.05:1.000:0.965 0/0/0/1:4:96,23:0.27: 0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,76:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,28:0.30: 0.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:49,38:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,64:0.69:-0.45:1.000:0.976 0/0/0/1:4:82,21:0.28:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,22:0.28:-0.16:0.999:0.996 0/0/0/1:4:96,30:0.31: 0.40:1.000:0.968 0/0/1/1:4:80,45:0.43: 0.37:1.000:0.936 0/0/1/1:4:48,49:0.56:-0.55:1.000:0.963 0/0/1/1:4:71,47:0.46: 0.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:73,43:0.44: 0.07:1.000:0.960 0/1/1/1:4:32,71:0.74:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,40:0.39: 0.37:1.000:0.682 0/0/1/1:4:48,38:0.50:-0.91:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,58:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,59:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,37:0.47:-0.78:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,96:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,47:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,66:0.51: 1.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,64:0.48: 1.28:1.000:0.995 -chr6.1 10649888 chr6.1_010649888 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:190,55:.: 1.10:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:161,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:188,67:.: 1.29:1.000:. ./.:4:167,59:.: 0.74:1.000:. ./.:4:103,28:.:-1.10:1.000:. ./.:4:169,53:.: 0.66:1.000:. ./.:4:124,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:58,6:.:-2.39:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:156,50:.: 0.35:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.08:1.000:. ./.:5:282,0:.: 1.81:0.999:. ./.:4:116,111:.: 0.75:1.000:. ./.:4:264,73:.: 2.87:1.000:. ./.:4:211,46:.: 1.33:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:132,39:.:-0.33:1.000:. ./.:4:160,36:.: 0.16:1.000:. ./.:4:153,43:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:187,44:.: 0.83:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:25,15:.:-2.85:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.18:1.000:. ./.:3:8,0:.:-3.47:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:224,58:.: 1.81:0.999:. ./.:4:165,49:.: 0.50:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:180,54:.: 0.89:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:139,40:.:-0.17:1.000:. ./.:4:157,57:.: 0.50:1.000:. ./.:4:201,49:.: 1.20:0.999:. ./.:4:64,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:152,37:.: 0.02:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:176,45:.: 0.64:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:181,46:.: 0.75:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:144,31:.:-0.25:1.000:. ./.:4:137,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:139,41:.:-0.15:1.000:. ./.:6:99,24:.:-1.25:1.000:. ./.:4:89,43:.:-1.08:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:134,29:.:-0.48:1.000:. ./.:4:171,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:95,30:.:-1.21:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.23:0.994:. ./.:4:197,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:131,46:.:-0.21:1.000:. ./.:4:125,29:.:-0.65:0.999:. ./.:4:162,35:.: 0.18:1.000:. ./.:4:150,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:79,60:.:-0.94:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,50:.:-0.04:1.000:. ./.:4:142,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,27:.:-0.96:1.000:. ./.:4:141,43:.:-0.07:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:125,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:116,42:.:-0.58:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:149,35:.:-0.07:1.000:. ./.:4:152,47:.: 0.21:1.000:. ./.:4:124,43:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:115,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:119,38:.:-0.60:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:135,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:103,34:.:-0.98:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.27:0.998:. ./.:4:223,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:131,33:.:-0.46:1.000:. ./.:4:143,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:204,57:.: 1.41:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:155,53:.: 0.39:1.000:. ./.:4:247,63:.: 2.35:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:151,50:.: 0.25:1.000:. ./.:4:90,23:.:-1.44:1.000:. ./.:4:140,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:110,37:.:-0.79:1.000:. ./.:4:127,30:.:-0.60:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:176,45:.: 0.64:1.000:. ./.:4:161,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:146,37:.:-0.09:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:131,57:.: 0.00:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:112,36:.:-0.77:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.66:0.975:. ./.:4:200,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:304,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:122,34:.:-0.61:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:138,45:.:-0.09:1.000:. ./.:4:123,40:.:-0.48:1.000:. ./.:4:141,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:231,79:.: 2.35:1.000:. ./.:4:243,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:239,63:.: 2.20:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:38,7:.:-2.75:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:201,71:.: 1.62:1.000:. ./.:4:171,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:173,38:.: 0.45:1.000:. ./.:4:174,55:.: 0.79:1.000:. ./.:4:137,46:.:-0.09:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:150,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:201,53:.: 1.27:1.000:. ./.:4:130,44:.:-0.27:1.000:. ./.:4:155,48:.: 0.29:0.999:. ./.:4:163,42:.: 0.33:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:123,49:.:-0.31:1.000:. ./.:4:153,51:.: 0.31:1.000:. ./.:4:146,37:.:-0.09:1.000:. ./.:4:138,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:164,51:.: 0.52:1.000:. ./.:4:172,54:.: 0.74:1.000:. ./.:4:144,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:191,47:.: 0.97:1.000:. ./.:4:171,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:208,63:.: 1.60:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:182,65:.: 1.14:1.000:. -chr6.1 10835231 chr6.1_010835231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:199,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:161,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.38:1.000:. ./.:5:276,0:.: 1.01:0.999:. ./.:4:201,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.27:1.000:. ./.:3:38,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.08:1.000:. ./.:6:228,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:197,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:138,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:361,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.64:1.000:. ./.:6:219,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.42:0.994:. ./.:4:193,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.13:0.999:. ./.:4:366,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.68:0.998:. ./.:4:199,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:276,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.45:0.975:. ./.:4:224,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:167,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.63:1.000:. -chr6.1 10896273 chr6.1_010896273 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:118,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:124,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.78:1.000:. ./.:5:148,0:.: 2.00:0.999:. ./.:4:121,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:148,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.40:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.89:1.000:. ./.:6:120,0:.: 1.03:0.999:. ./.:4:128,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:21,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.18:1.000:. ./.:6:68,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.70:0.994:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:77,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:122,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.18:0.998:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.57:0.975:. ./.:4:71,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:102,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:147,1:.: 2.00:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. -chr6.1 11243981 chr6.1_011243981 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:242,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:142,44:.:-0.46:1.000:. ./.:4:181,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:335,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:199,55:.: 0.84:1.000:. ./.:4:58,10:.:-2.70:1.000:. ./.:4:37,36:.:-2.61:1.000:. ./.:4:137,90:.: 0.32:1.000:. ./.:4:56,115:.:-0.74:1.000:. ./.:4:165,39:.:-0.12:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:229,51:.: 1.33:1.000:. ./.:5:272,51:.: 2.15:0.999:. ./.:4:313,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:215,55:.: 1.14:1.000:. ./.:4:147,98:.: 0.66:1.000:. ./.:4:54,21:.:-2.57:1.000:. ./.:4:165,52:.: 0.13:1.000:. ./.:4:244,50:.: 1.60:1.000:. ./.:4:246,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:36,5:.:-3.22:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:177,50:.: 0.32:1.000:. ./.:4:175,35:.: 0.00:1.000:. ./.:4:148,72:.: 0.19:1.000:. ./.:4:184,48:.: 0.42:1.000:. ./.:4:143,103:.: 0.68:1.000:. ./.:4:120,81:.:-0.17:1.000:. ./.:4:38,10:.:-3.08:1.000:. ./.:4:55,17:.:-2.63:1.000:. ./.:3:29,6:.:-3.33:1.000:. ./.:4:145,90:.: 0.47:1.000:. ./.:6:181,72:.: 0.82:0.999:. ./.:4:153,55:.:-0.04:1.000:. ./.:4:176,43:.: 0.17:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:142,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:124,86:.: 0.00:1.000:. ./.:4:193,42:.: 0.47:1.000:. ./.:4:91,75:.:-0.84:1.000:. ./.:4:184,40:.: 0.26:1.000:. ./.:4:198,46:.: 0.65:1.000:. ./.:4:214,44:.: 0.91:0.999:. ./.:4:262,60:.: 2.13:1.000:. ./.:4:137,41:.:-0.61:1.000:. ./.:4:111,102:.: 0.06:1.000:. ./.:4:142,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:237,58:.: 1.62:1.000:. ./.:4:202,48:.: 0.76:1.000:. ./.:4:175,44:.: 0.17:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:184,55:.: 0.55:1.000:. ./.:4:180,61:.: 0.59:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:182,59:.: 0.59:1.000:. ./.:6:159,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,52:.: 0.61:1.000:. ./.:4:199,47:.: 0.68:1.000:. ./.:4:175,40:.: 0.09:1.000:. ./.:4:133,40:.:-0.71:1.000:. ./.:4:174,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:97,19:.:-1.79:1.000:. ./.:4:119,95:.: 0.07:1.000:. ./.:4:110,75:.:-0.48:0.994:. ./.:4:129,45:.:-0.69:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:36,57:.:-2.23:0.999:. ./.:4:161,49:.: 0.00:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:150,37:.:-0.44:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:165,35:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,85:.:-0.40:1.000:. ./.:4:167,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:135,104:.: 0.55:1.000:. ./.:4:129,30:.:-0.97:1.000:. ./.:4:166,47:.: 0.06:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:144,33:.:-0.63:1.000:. ./.:4:212,37:.: 0.74:1.000:. ./.:4:185,38:.: 0.25:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:206,40:.: 0.68:1.000:. ./.:4:162,36:.:-0.23:1.000:. ./.:4:80,72:.:-1.11:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:185,50:.: 0.47:1.000:. ./.:4:176,36:.: 0.04:1.000:. ./.:4:141,37:.:-0.61:1.000:. ./.:4:129,31:.:-0.95:1.000:. ./.:4:165,39:.:-0.12:1.000:. ./.:4:160,42:.:-0.15:1.000:. ./.:4:84,20:.:-2.02:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:114,56:.:-0.76:0.998:. ./.:4:212,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:166,45:.: 0.02:1.000:. ./.:4:202,53:.: 0.85:1.000:. ./.:4:170,57:.: 0.32:1.000:. ./.:4:103,77:.:-0.57:1.000:. ./.:4:171,128:.: 1.69:1.000:. ./.:4:101,66:.:-0.82:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:161,24:.:-0.48:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:101,75:.:-0.65:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:166,52:.: 0.15:1.000:. ./.:4:144,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:67,75:.:-1.30:1.000:. ./.:4:213,47:.: 0.95:1.000:. ./.:4:133,122:.: 0.85:1.000:. ./.:4:159,34:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,41:.:-0.04:1.000:. ./.:4:157,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:163,32:.:-0.29:1.000:. ./.:4:135,25:.:-0.95:1.000:. ./.:4:114,25:.:-1.35:1.000:. ./.:4:96,79:.:-0.67:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.18:0.975:. ./.:4:92,82:.:-0.69:1.000:. ./.:4:92,77:.:-0.78:1.000:. ./.:4:191,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:122,88:.: 0.00:1.000:. ./.:4:131,36:.:-0.82:1.000:. ./.:4:134,37:.:-0.74:1.000:. ./.:4:123,44:.:-0.82:1.000:. ./.:4:110,90:.:-0.19:1.000:. ./.:4:132,39:.:-0.74:1.000:. ./.:4:99,70:.:-0.78:1.000:. ./.:4:115,34:.:-1.16:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:116,108:.: 0.26:1.000:. ./.:4:176,36:.: 0.04:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:222,35:.: 0.89:1.000:. ./.:4:124,84:.:-0.04:1.000:. ./.:4:202,58:.: 0.95:1.000:. ./.:4:195,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:38,13:.:-3.03:1.000:. ./.:4:190,41:.: 0.40:1.000:. ./.:4:138,116:.: 0.84:1.000:. ./.:4:204,59:.: 1.01:1.000:. ./.:4:195,48:.: 0.63:1.000:. ./.:4:182,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:208,41:.: 0.74:1.000:. ./.:4:192,44:.: 0.49:1.000:. ./.:4:158,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:178,37:.: 0.09:1.000:. ./.:4:197,60:.: 0.89:1.000:. ./.:4:185,53:.: 0.53:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:151,40:.:-0.36:1.000:. ./.:4:127,40:.:-0.82:0.999:. ./.:4:165,36:.:-0.17:1.000:. ./.:4:194,26:.: 0.19:1.000:. ./.:4:153,37:.:-0.38:1.000:. ./.:4:91,72:.:-0.90:1.000:. ./.:4:170,39:.:-0.02:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:104,34:.:-1.37:1.000:. ./.:4:91,102:.:-0.33:1.000:. ./.:4:219,58:.: 1.27:1.000:. ./.:4:143,93:.: 0.49:1.000:. ./.:4:120,93:.: 0.06:1.000:. ./.:4:111,91:.:-0.15:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:336,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:128,91:.: 0.17:1.000:. ./.:4:159,33:.:-0.34:1.000:. ./.:4:188,34:.: 0.23:1.000:. -chr6.1 11528532 chr6.1_011528532 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:331,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:201,57:.:-0.34:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:223,110:.: 0.71:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:133,49:.:-1.41:1.000:. ./.:4:228,80:.: 0.36:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:44,14:.:-3.15:1.000:. ./.:4:86,27:.:-2.38:1.000:. ./.:4:229,65:.: 0.16:1.000:. ./.:4:210,81:.: 0.12:1.000:. ./.:4:223,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:256,88:.: 0.87:1.000:. ./.:5:315,77:.: 1.54:0.999:. ./.:4:271,87:.: 1.06:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:308,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:22,10:.:-3.52:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:195,82:.:-0.08:1.000:. ./.:4:248,63:.: 0.40:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:202,73:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.72:1.000:. ./.:4:54,0:.:-3.21:1.000:. ./.:3:39,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.30:1.000:. ./.:6:396,0:.: 1.60:0.999:. ./.:4:290,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:244,88:.: 0.70:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:262,104:.: 1.18:1.000:. ./.:4:225,77:.: 0.28:1.000:. ./.:4:218,89:.: 0.35:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:282,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:233,65:.: 0.22:1.000:. ./.:4:236,91:.: 0.63:1.000:. ./.:4:153,66:.:-0.89:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:248,74:.: 0.56:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:247,88:.: 0.74:1.000:. ./.:4:296,1:.: 0.21:1.000:. ./.:6:184,13:.:-1.20:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:228,73:.: 0.26:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:213,80:.: 0.15:1.000:. ./.:4:126,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:195,88:.: 0.01:0.994:. ./.:4:146,135:.:-0.02:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:139,168:.: 0.35:1.000:. ./.:4:208,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:153,178:.: 0.68:1.000:. ./.:4:171,63:.:-0.68:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:189,69:.:-0.34:1.000:. ./.:4:245,74:.: 0.51:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:213,81:.: 0.16:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:175,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:201,71:.:-0.15:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:196,66:.:-0.29:1.000:. ./.:4:267,83:.: 0.95:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:215,89:.: 0.30:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:150,56:.:-1.07:1.000:. ./.:4:179,72:.:-0.44:1.000:. ./.:4:263,89:.: 0.98:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:185,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:221,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:208,62:.:-0.17:1.000:. ./.:4:210,64:.:-0.12:0.998:. ./.:4:190,71:.:-0.30:1.000:. ./.:4:180,60:.:-0.60:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:411,2:.: 1.84:1.000:. ./.:4:216,73:.: 0.09:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:240,67:.: 0.35:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:211,89:.: 0.25:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:202,84:.: 0.05:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:179,79:.:-0.34:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:212,71:.: 0.01:1.000:. ./.:4:181,69:.:-0.46:1.000:. ./.:4:138,58:.:-1.21:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:222,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:137,48:.:-1.37:0.975:. ./.:4:215,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:203,59:.:-0.29:1.000:. ./.:4:318,103:.: 1.95:1.000:. ./.:4:240,87:.: 0.63:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:171,76:.:-0.50:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:327,109:.: 2.16:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:233,80:.: 0.43:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:251,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:228,86:.: 0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:240,90:.: 0.67:1.000:. ./.:4:239,98:.: 0.77:1.000:. ./.:4:361,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:254,93:.: 0.91:1.000:. ./.:4:205,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:318,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:248,74:.: 0.56:1.000:. ./.:4:228,69:.: 0.21:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:201,85:.: 0.05:1.000:. ./.:4:214,83:.: 0.21:1.000:. ./.:4:343,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:184,52:.:-0.65:1.000:. ./.:4:150,180:.: 0.67:0.999:. ./.:4:198,87:.: 0.04:1.000:. ./.:4:215,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:202,63:.:-0.24:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:227,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:168,62:.:-0.74:1.000:. ./.:4:349,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:237,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:298,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:278,96:.: 1.29:1.000:. ./.:4:388,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:240,89:.: 0.66:1.000:. -chr6.1 11786133 chr6.1_011786133 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:156,76:0.45: 0.84:1.000:0.975 1/1/1/1:4:5,66:0.93:-1.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,119:0.59: 0.72:1.000:0.882 0/1/1/1:4:53,84:0.65:-0.72:1.000:0.812 0/0/1/1:4:148,90:0.48: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,73:0.48: 0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,109:0.68:-0.20:1.000:0.945 0/1/1/1:4:76,143:0.68: 0.62:1.000:0.961 0/0/1/1:4:111,142:0.61: 1.18:1.000:0.668 0/0/1/1:4:46,31:0.49:-1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,23:0.47:-1.96:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,64:0.46: 0.05:1.000:0.986 0/0/0/1:4:120,1:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,90:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,80:0.47: 0.62:1.000:0.992 0/0/0/0/0:5:211,0:0.00: 0.49:0.999:1.000 1/1/1/1:4:2,143:0.99:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,153:0.56: 2.07:1.000:0.962 0/0/1/1:4:125,153:0.60: 1.60:1.000:0.758 0/0/1/1:4:39,53:0.62:-1.47:1.000:0.523 0/1/1/1:4:59,183:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,175:0.60: 2.29:1.000:0.783 0/0/1/1:4:108,69:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,124:0.67: 0.21:1.000:0.930 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,85:0.47: 0.77:1.000:0.993 0/1/1/1:4:75,149:0.69: 0.71:1.000:0.977 0/1/1/1:4:45,132:0.76:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,55:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,11:0.45:-2.44:1.000:0.979 0/0/1/1:4:51,42:0.53:-1.45:1.000:0.993 0/1/1:3:17,13:0.51:-2.49:1.000:0.701 0/0/1/1:4:125,76:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:185,142:0.51: 2.40:0.999:0.879 0/1/1/1:4:67,161:0.72: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,56:0.46:-0.38:1.000:0.989 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,118:0.71:-0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:122,147:0.60: 1.45:1.000:0.786 0/1/1/1:4:52,138:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,56:0.46:-0.33:1.000:0.986 0/1/1/1:4:69,125:0.68: 0.21:1.000:0.944 0/0/1/1:4:120,70:0.47: 0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:171,71:0.42: 1.00:0.999:0.930 0/1/1/1:4:18,51:0.75:-1.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,133:0.73: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,64:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,57:0.59:-1.20:1.000:0.886 0/0/1/1:4:175,104:0.47: 1.61:1.000:0.993 0/1/1/1:4:77,117:0.64: 0.21:1.000:0.738 0/0/1/1:4:108,71:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,144:0.69: 0.62:1.000:0.968 0/0/1/1:4:68,71:0.57:-0.69:1.000:0.939 0/1/1/1:4:48,214:0.82: 1.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,76:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,194:0.80: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:39,145:0.80: 0.05:1.000:0.911 0/1/1/1:4:48,211:0.82: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,127:0.72:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:73,132:0.68: 0.39:1.000:0.943 0/0/1/1:4:101,55:0.46:-0.41:1.000:0.988 0/1/1/1:4:58,213:0.79: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,1:0.24:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,57:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,78:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:110,62:0.47:-0.15:0.994:0.990 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,81:0.47: 0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:111,123:0.58: 0.87:0.999:0.895 1/1/1/1:4:0,145:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,167:0.73: 0.90:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,68:0.65:-1.15:1.000:0.809 0/0/1/1:4:94,45:0.44:-0.69:1.000:0.971 0/0/1/1:4:97,61:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,58:0.45:-0.12:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,86:0.64:-0.61:1.000:0.688 0/1/1/1:4:62,153:0.73: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,120:0.57: 0.95:1.000:0.956 0/1/1/1:4:50,186:0.80: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,70:0.46: 0.33:1.000:0.986 0/0/1/1:4:53,57:0.58:-1.17:1.000:0.919 0/1/1/1:4:48,119:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,76:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,59:0.45:-0.12:1.000:0.982 0/0/1/1:4:98,57:0.47:-0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:62,118:0.69:-0.02:1.000:0.965 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,113:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,84:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,110:0.57: 0.59:1.000:0.947 0/1/1/1:4:51,91:0.67:-0.64:1.000:0.935 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,135:0.69: 0.38:1.000:0.973 0/0/1/1:4:150,73:0.45: 0.69:1.000:0.974 0/1/1/1:4:40,98:0.73:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,63:0.46: 0.03:1.000:0.985 0/1/1/1:4:45,91:0.70:-0.74:1.000:0.981 0/0/1/1:4:55,62:0.59:-1.05:1.000:0.877 0/0/1/1:4:78,42:0.46:-1.00:0.998:0.987 0/0/1/1:4:62,62:0.56:-0.94:1.000:0.959 0/0/1/1:4:83,59:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,205:0.76: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,81:0.44: 1.25:1.000:0.963 0/0/1/1:4:127,75:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:118,125:0.58: 1.02:1.000:0.930 0/0/1/1:4:169,184:0.58: 2.83:1.000:0.910 0/0/1/1:4:113,62:0.46:-0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:114,78:0.49: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,54:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,75:0.48: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,63:0.46:-0.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:109,54:0.45:-0.30:1.000:0.977 0/1/1/1:4:57,185:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,133:0.72: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,58:0.44: 0.08:1.000:0.959 0/1/1/1:4:46,133:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,67:0.46: 0.11:1.000:0.989 0/0/1/1:4:127,77:0.48: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:125,58:0.44: 0.03:1.000:0.965 0/0/1/1:4:106,125:0.60: 0.82:1.000:0.820 0/1/1/1:4:53,137:0.74: 0.15:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,79:0.70:-1.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:75,37:0.45:-1.14:1.000:0.977 0/1/1/1:4:39,124:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.91:0.975:1.000 0/0/1/1:4:124,64:0.45: 0.11:1.000:0.983 0/0/1/1:4:132,69:0.45: 0.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:92,107:0.59: 0.30:1.000:0.840 0/0/1/1:4:115,60:0.45:-0.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:90,57:0.48:-0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,94:0.62:-0.25:1.000:0.622 0/0/1/1:4:90,41:0.44:-0.82:1.000:0.961 0/0/1/1:4:158,150:0.55: 2.09:1.000:0.975 0/1/1/1:4:52,131:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:104,127:0.60: 0.82:1.000:0.763 0/0/1/1:4:81,79:0.56:-0.35:1.000:0.968 0/0/1/1:4:80,102:0.61: 0.02:1.000:0.676 0/0/1/1:4:182,188:0.57: 3.11:1.000:0.945 0/0/1/1:4:82,55:0.49:-0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,127:0.73:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,88:0.46: 1.12:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,139:0.77: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,191:0.62: 2.53:1.000:0.583 0/0/1/1:4:51,62:0.60:-1.12:1.000:0.771 0/1/1/1:4:15,92:0.87:-1.22:1.000:0.942 0/0/1/1:4:103,78:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,86:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,61:0.53:-0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:146,89:0.48: 0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,86:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,94:0.49: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,61:0.43: 0.33:1.000:0.948 0/0/1/1:4:87,65:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,135:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,92:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:100,1:0.25:-1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,78:0.47: 0.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:103,66:0.48:-0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.81:0.999:1.000 0/1/1/1:4:66,129:0.69: 0.23:1.000:0.973 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,170:0.83: 0.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,136:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,57:0.46:-0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:93,61:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,54:0.48:-0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:72,159:0.71: 0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,148:0.58: 1.76:1.000:0.931 0/0/1/1:4:143,124:0.54: 1.41:1.000:0.989 0/1/1/1:4:70,135:0.69: 0.39:1.000:0.969 0/1/1/1:4:55,135:0.73: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,91:0.47: 1.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:159,165:0.57: 2.35:1.000:0.942 0/0/1/1:4:117,71:0.48: 0.11:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.61:1.000:1.000 -chr6.1 11921606 chr6.1_011921606 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:110,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:101,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,25:.: 0.00:1.000:. ./.:4:124,37:.: 0.76:1.000:. ./.:4:149,44:.: 1.49:1.000:. ./.:4:173,28:.: 1.68:1.000:. ./.:4:92,37:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,68:.: 1.08:1.000:. ./.:4:120,26:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,9:.:-2.49:1.000:. ./.:4:9,6:.:-2.60:1.000:. ./.:4:108,17:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,22:.: 0.25:1.000:. ./.:4:153,18:.: 0.99:1.000:. ./.:4:110,35:.: 0.39:1.000:. ./.:4:166,23:.: 1.40:1.000:. ./.:5:166,37:.: 1.72:0.999:. ./.:4:113,30:.: 0.34:1.000:. ./.:4:153,35:.: 1.38:1.000:. ./.:4:148,38:.: 1.33:1.000:. ./.:4:48,4:.:-1.75:1.000:. ./.:4:99,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:88,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:107,21:.: 0.00:1.000:. ./.:4:7,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:140,62:.: 1.70:1.000:. ./.:4:132,30:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,25:.: 0.00:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:116,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:99,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,31:.:-0.14:1.000:. ./.:4:16,5:.:-2.46:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:5,2:.:-2.79:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.11:1.000:. ./.:6:124,25:.: 0.48:0.999:. ./.:4:117,61:.: 1.15:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:143,23:.: 0.87:1.000:. ./.:4:83,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:94,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:110,60:.: 0.96:1.000:. ./.:4:88,22:.:-0.42:1.000:. ./.:4:89,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:90,23:.:-0.35:1.000:. ./.:4:124,36:.: 0.73:0.999:. ./.:4:29,13:.:-1.98:1.000:. ./.:4:98,69:.: 0.89:1.000:. ./.:4:76,15:.:-0.85:1.000:. ./.:4:78,51:.: 0.02:1.000:. ./.:4:128,26:.: 0.60:1.000:. ./.:4:94,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:131,20:.: 0.53:1.000:. ./.:4:101,55:.: 0.64:1.000:. ./.:4:107,43:.: 0.50:1.000:. ./.:4:72,45:.:-0.26:1.000:. ./.:4:94,39:.: 0.11:1.000:. ./.:4:78,29:.:-0.49:1.000:. ./.:6:56,29:.:-0.99:1.000:. ./.:4:69,45:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,28:.: 0.25:1.000:. ./.:4:98,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:82,21:.:-0.58:1.000:. ./.:4:103,52:.: 0.62:1.000:. ./.:4:109,29:.: 0.23:1.000:. ./.:4:89,15:.:-0.55:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:76,15:.:-0.85:0.994:. ./.:4:82,49:.: 0.07:1.000:. ./.:4:96,29:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,23:.:-0.23:0.999:. ./.:4:96,69:.: 0.85:1.000:. ./.:4:102,84:.: 1.33:1.000:. ./.:4:86,40:.:-0.05:1.000:. ./.:4:114,37:.: 0.53:1.000:. ./.:4:112,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,15:.:-0.83:1.000:. ./.:4:108,22:.: 0.04:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:48,21:.:-1.36:1.000:. ./.:4:107,41:.: 0.46:1.000:. ./.:4:115,50:.: 0.85:1.000:. ./.:4:116,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:88,11:.:-0.67:1.000:. ./.:4:124,26:.: 0.50:1.000:. ./.:4:69,26:.:-0.76:1.000:. ./.:4:85,55:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,32:.: 0.14:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:74,42:.:-0.28:1.000:. ./.:4:122,17:.: 0.25:1.000:. ./.:4:87,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:114,56:.: 0.96:1.000:. ./.:4:83,25:.:-0.46:1.000:. ./.:4:71,37:.:-0.46:1.000:. ./.:4:85,29:.:-0.32:1.000:. ./.:4:83,62:.: 0.39:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:104,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:41,24:.:-1.45:1.000:. ./.:4:88,34:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,56:.: 0.71:1.000:. ./.:4:98,46:.: 0.37:1.000:. ./.:4:77,39:.:-0.28:1.000:. ./.:4:171,25:.: 1.56:1.000:. ./.:4:115,40:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,13:.:-0.65:1.000:. ./.:4:154,32:.: 1.33:1.000:. ./.:4:78,19:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,25:.:-0.42:1.000:. ./.:4:58,9:.:-1.41:1.000:. ./.:4:106,29:.: 0.16:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:85,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:86,36:.:-0.14:1.000:. ./.:4:70,18:.:-0.92:1.000:. ./.:4:113,53:.: 0.87:1.000:. ./.:4:75,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:90,43:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:93,26:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:50,23:.:-1.27:1.000:. ./.:4:52,23:.:-1.22:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:83,17:.:-0.65:1.000:. ./.:4:127,25:.: 0.55:1.000:. ./.:4:72,10:.:-1.06:0.975:. ./.:4:77,22:.:-0.67:1.000:. ./.:4:102,27:.: 0.02:1.000:. ./.:4:191,85:.: 3.40:1.000:. ./.:4:100,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:62,11:.:-1.27:1.000:. ./.:4:74,18:.:-0.83:1.000:. ./.:4:99,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:82,29:.:-0.39:1.000:. ./.:4:101,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,8:.:-1.27:1.000:. ./.:4:153,81:.: 2.44:1.000:. ./.:4:138,24:.: 0.78:1.000:. ./.:4:124,58:.: 1.24:1.000:. ./.:4:113,48:.: 0.76:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:102,12:.:-0.32:1.000:. ./.:4:155,30:.: 1.31:1.000:. ./.:4:129,50:.: 1.17:1.000:. ./.:4:16,2:.:-2.53:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:142,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:163,68:.: 2.37:1.000:. ./.:4:144,38:.: 1.24:1.000:. ./.:4:146,65:.: 1.91:1.000:. ./.:4:90,15:.:-0.53:1.000:. ./.:4:123,29:.: 0.55:1.000:. ./.:4:105,42:.: 0.43:1.000:. ./.:4:84,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:81,20:.:-0.62:1.000:. ./.:4:132,48:.: 1.19:1.000:. ./.:4:99,24:.:-0.12:1.000:. ./.:4:116,26:.: 0.32:1.000:. ./.:4:105,46:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,94:.: 1.24:0.999:. ./.:4:107,62:.: 0.94:1.000:. ./.:4:111,18:.: 0.02:1.000:. ./.:4:93,16:.:-0.44:1.000:. ./.:4:101,43:.: 0.37:1.000:. ./.:4:80,38:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,20:.:-0.46:1.000:. ./.:4:58,14:.:-1.29:1.000:. ./.:4:69,16:.:-0.99:1.000:. ./.:4:135,19:.: 0.60:1.000:. ./.:4:132,28:.: 0.73:1.000:. ./.:4:125,36:.: 0.76:1.000:. ./.:4:94,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:119,45:.: 0.83:1.000:. ./.:4:153,61:.: 1.98:1.000:. ./.:4:168,33:.: 1.68:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:122,44:.: 0.87:1.000:. -chr6.1 12354147 chr6.1_012354147 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:245,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:21,20:.:-2.12:1.000:. ./.:4:29,5:.:-2.21:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:154,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:259,90:.: 1.95:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.19:1.000:. ./.:5:230,65:.: 1.24:0.999:. ./.:4:153,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:124,89:.: 0.16:1.000:. ./.:4:13,11:.:-2.34:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:194,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:209,69:.: 1.01:1.000:. ./.:4:203,50:.: 0.68:1.000:. ./.:4:139,95:.: 0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:128,70:.:-0.04:1.000:. ./.:4:113,53:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.19:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:103,78:.:-0.27:1.000:. ./.:6:144,69:.: 0.16:0.999:. ./.:4:232,78:.: 1.44:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:87,65:.:-0.65:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:133,49:.:-0.25:1.000:. ./.:4:289,58:.: 1.92:1.000:. ./.:4:135,58:.:-0.11:1.000:. ./.:4:200,83:.: 1.08:0.999:. ./.:4:54,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:198,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:66,37:.:-1.30:1.000:. ./.:4:175,56:.: 0.39:1.000:. ./.:4:161,82:.: 0.55:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:162,43:.: 0.05:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.76:1.000:. ./.:6:157,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:95,34:.:-0.95:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:130,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:97,48:.:-0.74:1.000:. ./.:4:106,67:.:-0.37:1.000:. ./.:4:110,70:.:-0.28:0.994:. ./.:4:288,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:24,93:.:-1.11:0.999:. ./.:4:155,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:382,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:122,67:.:-0.16:1.000:. ./.:4:199,52:.: 0.66:1.000:. ./.:4:90,70:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:205,61:.: 0.85:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:166,72:.: 0.49:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:147,61:.: 0.09:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:189,58:.: 0.60:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:223,76:.: 1.29:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:214,42:.: 0.72:0.998:. ./.:4:228,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:197,94:.: 1.18:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:86,53:.:-0.82:1.000:. ./.:4:107,52:.:-0.56:1.000:. ./.:4:145,64:.: 0.10:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:99,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:81,57:.:-0.83:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:122,44:.:-0.47:1.000:. ./.:4:203,66:.: 0.89:1.000:. ./.:4:95,66:.:-0.53:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:110,60:.:-0.41:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.81:0.975:. ./.:4:123,70:.:-0.11:1.000:. ./.:4:147,59:.: 0.06:1.000:. ./.:4:333,96:.: 3.01:1.000:. ./.:4:142,61:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:92,72:.:-0.49:1.000:. ./.:4:200,65:.: 0.84:1.000:. ./.:4:87,67:.:-0.62:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:418,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:164,97:.: 0.79:1.000:. ./.:4:289,82:.: 2.24:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:152,61:.: 0.16:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:237,59:.: 1.25:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:145,63:.: 0.09:1.000:. ./.:4:317,82:.: 2.61:1.000:. ./.:4:187,93:.: 1.04:1.000:. ./.:4:235,79:.: 1.49:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:161,90:.: 0.66:1.000:. ./.:4:224,70:.: 1.22:1.000:. ./.:4:155,59:.: 0.17:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:218,87:.: 1.37:1.000:. ./.:4:187,62:.: 0.63:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:203,52:.: 0.71:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.84:0.999:. ./.:4:275,63:.: 1.80:1.000:. ./.:4:207,71:.: 1.01:1.000:. ./.:4:189,57:.: 0.59:1.000:. ./.:4:129,64:.:-0.11:1.000:. ./.:4:222,67:.: 1.16:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:101,46:.:-0.72:1.000:. ./.:4:125,55:.:-0.28:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:115,70:.:-0.21:1.000:. ./.:4:111,69:.:-0.28:1.000:. ./.:4:119,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:370,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:138,111:.: 0.63:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.46:1.000:. -chr6.1 12620723 chr6.1_012620723 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:148,134:0.48: 1.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,93:0.56:-0.44:1.000:0.961 0/0/0/1:4:145,41:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,138:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:170,126:0.43: 1.59:1.000:0.944 0/0/1/1:4:136,121:0.47: 0.99:1.000:0.993 0/0/0/1:4:93,26:0.22:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,59:0.30: 0.11:1.000:0.987 0/0/0/1:4:150,62:0.30: 0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:20,19:0.49:-2.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,7:0.18:-2.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,65:0.32: 0.21:1.000:0.957 0/0/1/1:4:118,103:0.47: 0.44:1.000:0.992 0/1/1/1:4:62,190:0.73: 0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:112,112:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:209,68:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:113,193:0.62: 1.74:0.999:0.963 0/0/1/1:4:123,113:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:203,65:0.25: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,121:0.47: 1.04:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,10:0.65:-2.73:1.000:0.826 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,70:0.25: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,107:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,24:0.67:-2.42:1.000:0.926 0/0/1/1:4:102,78:0.44:-0.19:1.000:0.961 0/1/1/1:4:83,175:0.66: 1.01:1.000:0.895 0/1/1/1:4:51,192:0.77: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,187:0.74: 0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,111:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,92:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,83:0.45:-0.10:1.000:0.979 0/1/1/1:4:5,23:0.80:-2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,18:0.44:-2.33:1.000:0.971 0/0/1:3:12,5:0.30:-2.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,172:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:141,120:0.46: 1.05:0.999:0.811 0/0/1/1:4:118,117:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,85:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,117:0.56: 0.22:1.000:0.964 0/0/1/1:4:99,92:0.48:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,81:0.41: 0.07:1.000:0.888 0/0/0/0:4:220,1:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,86:0.54:-0.52:1.000:0.988 0/0/0/1:4:144,40:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,97:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,200:0.71: 1.24:0.999:0.993 0/0/1/1:4:249,284:0.53: 5.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:131,47:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:147,53:0.27: 0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,73:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,197:0.73: 1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,81:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,54:0.27: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,97:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:83,76:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,87:0.46:-0.01:1.000:0.985 0/0/0/1:4:104,35:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:118,12:0.09:-0.96:1.000:0.844 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,51:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,89:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,106:0.77:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,60:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,77:0.45:-0.33:1.000:0.983 0/1/1/1:4:34,105:0.73:-0.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,165:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,95:0.52:-0.12:0.994:0.996 0/0/0/1:4:183,54:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,81:0.48:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,57:0.52:-1.26:0.999:0.996 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,64:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,38:0.22:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,65:0.52:-1.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,98:0.57:-0.35:1.000:0.940 0/0/1/1:4:97,83:0.46:-0.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:111,95:0.46: 0.21:1.000:0.990 0/1/1/1:4:35,130:0.76:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,44:0.34:-0.96:1.000:0.859 0/0/1/1:4:91,84:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,95:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,48:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,86:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:138,97:0.42: 0.65:1.000:0.896 0/0/1/1:4:47,60:0.56:-1.32:1.000:0.970 0/0/0/1:4:123,33:0.21:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,74:0.42:-0.21:1.000:0.899 0/0/1/1:4:98,99:0.51: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,79:0.51:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,47:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,86:0.48:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,52:0.28:-0.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:117,49:0.30:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/1:4:115,39:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,33:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,31:0.23:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,39:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,141:0.57: 0.84:1.000:0.953 0/0/1/1:4:61,52:0.46:-1.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:113,100:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:83,41:0.33:-1.06:1.000:0.904 0/0/1/1:4:74,88:0.54:-0.47:1.000:0.986 0/1/1/1:4:58,109:0.64:-0.39:0.998:0.704 0/0/1/1:4:85,84:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,46:0.32:-0.76:1.000:0.940 0/0/0/1:4:178,73:0.29: 0.90:1.000:0.990 0/1/1/1:4:71,189:0.71: 1.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:158,52:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,31:0.23:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,124:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,76:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,154:0.72: 0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,90:0.65:-0.87:1.000:0.788 0/0/1/1:4:78,89:0.53:-0.39:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,86:0.76:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,28:0.21:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,41:0.28:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,72:0.56:-0.99:1.000:0.968 0/0/0/1:4:152,57:0.28: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,88:0.49:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,38:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,231:0.75: 1.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,86:0.46:-0.04:1.000:0.985 0/0/0/1:4:137,48:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,36:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,41:0.31:-0.92:1.000:0.971 0/0/0/1:4:76,30:0.29:-1.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,79:0.51:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,64:0.55:-1.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:128,112:0.47: 0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,51:0.46:-1.24:0.975:0.987 0/0/1/1:4:87,101:0.54:-0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,82:0.41: 0.14:1.000:0.859 0/0/1/1:4:184,159:0.47: 2.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:153,40:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,79:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,25:0.22:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,33:0.28:-1.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,77:0.46:-0.36:1.000:0.987 0/0/1/1:4:91,95:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,96:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,29:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,144:0.48: 1.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:162,133:0.45: 1.58:1.000:0.983 0/0/1/1:4:137,139:0.51: 1.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:154,35:0.19:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,135:0.52: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,94:0.55:-0.32:1.000:0.984 0/0/0/0:4:262,0:0.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,118:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,93:0.52:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:115,115:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,105:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,159:0.52: 1.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,105:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,131:0.53: 0.85:1.000:0.993 0/1/1/1:4:55,185:0.75: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,83:0.45:-0.09:1.000:0.977 0/0/1/1:4:101,71:0.42:-0.32:1.000:0.896 0/0/1/1:4:106,150:0.58: 0.98:1.000:0.911 0/0/0/1:4:159,50:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,163:0.56: 1.53:1.000:0.973 0/0/1/1:4:113,101:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:123,26:0.18:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:226,1:0.00: 0.53:0.999:1.000 0/0/0/1:4:187,43:0.19: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,106:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,138:0.68: 0.10:1.000:0.949 0/0/0/1:4:117,52:0.31:-0.36:1.000:0.972 0/0/1/1:4:100,89:0.47:-0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,113:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,126:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,98:0.58:-0.39:1.000:0.907 0/0/1/1:4:141,130:0.48: 1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,112:0.48: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,104:0.48: 0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,89:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:199,55:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,80:0.26: 1.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,57:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,75:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,82:0.30: 1.34:1.000:0.988 -chr6.1 12799840 chr6.1_012799840 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,65:.: 1.04:1.000:. ./.:4:25,48:.: 0.25:1.000:. ./.:4:39,18:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.75:1.000:. ./.:4:31,66:.: 1.44:1.000:. ./.:4:24,67:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,92:.: 1.19:1.000:. ./.:4:58,36:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,14:.:-2.67:1.000:. ./.:4:7,13:.:-2.37:1.000:. ./.:4:56,33:.: 1.04:1.000:. ./.:4:28,52:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,43:.: 1.44:1.000:. ./.:5:17,80:.: 1.44:0.999:. ./.:4:25,48:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,43:.: 2.13:1.000:. ./.:4:39,60:.: 1.54:1.000:. ./.:4:10,4:.:-2.67:1.000:. ./.:4:40,37:.: 0.45:1.000:. ./.:4:51,35:.: 0.90:1.000:. ./.:4:30,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,11:.:-2.82:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.19:1.000:. ./.:4:27,54:.: 0.65:1.000:. ./.:4:26,53:.: 0.55:1.000:. ./.:4:20,52:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,50:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.57:1.000:. ./.:4:23,5:.:-1.98:1.000:. ./.:3:0,3:.:-3.21:1.000:. ./.:4:29,60:.: 1.04:1.000:. ./.:6:43,45:.: 1.00:0.999:. ./.:4:0,70:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,26:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,54:.: 0.40:1.000:. ./.:4:18,44:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,39:.: 0.01:1.000:. ./.:4:40,39:.: 0.55:1.000:. ./.:4:18,31:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.20:1.000:. ./.:4:17,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.35:0.999:. ./.:4:9,40:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.59:1.000:. ./.:4:25,32:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,43:.:-0.64:1.000:. ./.:4:36,45:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:17,41:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,37:.:-0.84:1.000:. ./.:4:27,32:.:-0.44:1.000:. ./.:6:27,26:.:-0.74:1.000:. ./.:4:40,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:20,53:.: 0.25:1.000:. ./.:4:28,39:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,63:.: 1.44:1.000:. ./.:4:19,47:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.85:1.000:. ./.:4:29,48:.: 0.45:1.000:. ./.:4:21,47:.: 0.01:0.994:. ./.:4:29,60:.: 1.04:1.000:. ./.:4:25,55:.: 0.60:1.000:. ./.:4:13,27:.:-1.38:0.999:. ./.:4:17,56:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.20:1.000:. ./.:4:23,54:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.13:1.000:. ./.:4:49,36:.: 0.85:1.000:. ./.:4:23,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:20,57:.: 0.45:1.000:. ./.:4:13,46:.:-0.44:1.000:. ./.:4:18,33:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.44:1.000:. ./.:4:49,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:23,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:24,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.43:1.000:. ./.:4:43,27:.: 0.10:1.000:. ./.:4:22,24:.:-1.08:1.000:. ./.:4:19,44:.:-0.24:1.000:. ./.:4:28,47:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:21,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:40,32:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,43:.:-0.04:1.000:. ./.:4:13,45:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,30:.:-0.74:1.000:. ./.:4:16,40:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,42:.:-0.19:1.000:. ./.:4:16,23:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.19:0.998:. ./.:4:0,47:.:-1.03:1.000:. ./.:4:11,29:.:-1.38:1.000:. ./.:4:25,54:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.65:1.000:. ./.:4:42,42:.: 0.80:1.000:. ./.:4:38,29:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,76:.: 2.23:1.000:. ./.:4:21,33:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.63:1.000:. ./.:4:23,44:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,31:.:-1.33:1.000:. ./.:4:18,53:.: 0.15:1.000:. ./.:4:13,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:27,45:.: 0.20:1.000:. ./.:4:16,36:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:35,54:.: 1.04:1.000:. ./.:4:38,31:.: 0.05:1.000:. ./.:4:35,24:.:-0.44:1.000:. ./.:4:25,43:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,26:.:-1.03:1.000:. ./.:4:12,30:.:-1.28:1.000:. ./.:4:26,17:.:-1.23:1.000:. ./.:4:25,43:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,62:.: 0.85:1.000:. ./.:4:14,35:.:-0.94:0.975:. ./.:4:10,27:.:-1.53:1.000:. ./.:4:17,34:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,108:.: 1.99:1.000:. ./.:4:40,28:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,36:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:32,19:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,34:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:28,45:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,16:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,100:.: 1.59:1.000:. ./.:4:35,49:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,92:.: 1.19:1.000:. ./.:4:27,36:.:-0.24:1.000:. ./.:4:50,31:.: 0.65:1.000:. ./.:4:26,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:104,25:.: 3.03:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,24:.:-2.07:1.000:. ./.:4:44,27:.: 0.15:1.000:. ./.:4:24,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.65:1.000:. ./.:4:35,73:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,58:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,86:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.69:1.000:. ./.:4:19,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:22,60:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,53:.: 0.30:1.000:. ./.:4:17,50:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:33,64:.: 1.44:0.999:. ./.:4:0,58:.:-0.49:1.000:. ./.:4:19,47:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,47:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.45:1.000:. ./.:4:21,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.13:1.000:. ./.:4:21,60:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,85:.: 2.08:1.000:. ./.:4:21,59:.: 0.60:1.000:. ./.:4:21,59:.: 0.60:1.000:. ./.:4:31,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,61:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,74:.: 2.08:1.000:. ./.:4:59,44:.: 1.74:1.000:. ./.:4:44,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:24,60:.: 0.80:1.000:. -chr6.1 12945227 chr6.1_012945227 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:277,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:283,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.85:1.000:. ./.:5:358,0:.: 1.70:0.999:. ./.:4:372,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:307,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:282,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:320,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.23:1.000:. ./.:3:51,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.62:1.000:. ./.:6:355,0:.: 1.66:0.999:. ./.:4:352,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.74:0.999:. ./.:4:71,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:174,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.55:0.994:. ./.:4:269,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.51:0.999:. ./.:4:272,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:307,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.85:0.998:. ./.:4:220,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.39:0.975:. ./.:4:190,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:408,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:148,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:409,1:.: 2.40:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.90:0.999:. ./.:4:312,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:174,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:281,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:417,1:.: 2.50:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.19:1.000:. -chr6.1 13310078 chr6.1_013310078 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:331,106:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,173:0.53:-0.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:216,204:0.48: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,208:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:374,124:0.25: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:325,116:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,126:0.54:-1.79:1.000:0.987 0/0/1/1:4:212,197:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:170,172:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,42:0.27:-2.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,153:0.70:-1.96:1.000:0.983 0/1/1/1:4:70,273:0.79:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,165:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:342,122:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:301,116:0.28: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,328:0.77: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:345,221:0.39: 2.40:0.999:0.970 0/0/0/0:4:296,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,259:0.52: 1.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:304,130:0.30: 0.75:1.000:0.987 0/0/1/1:4:68,69:0.50:-2.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:97,313:0.76: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:264,243:0.48: 1.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:247,105:0.30:-0.28:1.000:0.988 0/0/0/1:4:116,46:0.28:-2.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:282,89:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,119:0.27: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:315,100:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:361,124:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,173:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:189,184:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,174:0.51:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-3.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,116:0.50:-1.80:1.000:0.997 0/0/1:3:84,28:0.25:-3.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,99:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:303,166:0.35: 1.18:0.999:0.894 0/0/0/1:4:338,106:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,188:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,200:0.47: 0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:214,201:0.48: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:277,102:0.27: 0.06:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,419:0.99: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,162:0.47:-0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:209,253:0.55: 1.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:340,97:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:509,0:0.00: 1.69:0.999:1.000 0/0/1/1:4:119,111:0.48:-1.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:156,155:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,220:0.72:-0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:155,179:0.53:-0.51:1.000:0.991 0/0/0/0:4:499,0:0.00: 1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,183:0.54:-0.48:1.000:0.986 0/1/1/1:4:123,306:0.71: 0.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:259,76:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,173:0.48:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:261,87:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:187,194:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,256:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:94,239:0.71:-0.52:1.000:0.809 0/1/1/1:4:98,293:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,233:0.71:-0.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:228,196:0.46: 0.62:1.000:0.988 0/0/0/0:4:356,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,210:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,181:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:319,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,107:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,195:0.55:-0.23:0.994:0.984 0/1/1/1:4:91,264:0.74:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:329,99:0.23: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,71:0.22:-0.71:0.999:1.000 0/1/1/1:4:111,241:0.68:-0.28:1.000:0.955 0/0/1/1:4:224,173:0.43: 0.28:1.000:0.956 0/1/1/1:4:112,276:0.71: 0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,154:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,166:0.52:-0.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:214,203:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:212,190:0.47: 0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:280,111:0.28: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:216,75:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,198:0.45: 0.81:1.000:0.979 0/0/0/1:4:349,104:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,189:0.47: 0.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:215,206:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:309,92:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,122:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:177,158:0.47:-0.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:294,69:0.19:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,177:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,143:0.50:-1.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:98,305:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:223,195:0.47: 0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:166,182:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:188,186:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,208:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,265:0.75:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,157:0.52:-0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:214,251:0.54: 1.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:320,94:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,168:0.55:-0.87:1.000:0.981 0/0/0/1:4:319,121:0.27: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,143:0.46:-0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:212,213:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:228,160:0.41: 0.17:0.998:0.868 0/0/1/1:4:181,179:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,142:0.51:-1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,226:0.55: 0.48:1.000:0.984 0/0/0/0:4:507,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,276:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,192:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:424,121:0.22: 2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,206:0.48: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/0:4:416,1:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:265,1:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:383,108:0.22: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,90:0.27:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:194,180:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:183,177:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,161:0.55:-1.02:1.000:0.982 0/0/1/1:4:204,185:0.47: 0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:187,176:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:191,224:0.54: 0.51:1.000:0.989 0/0/0/1:4:321,107:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:210,181:0.46: 0.21:1.000:0.988 0/0/1/1:4:230,239:0.51: 1.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,311:0.76: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,165:0.57:-1.10:1.000:0.940 0/1/1/1:4:56,187:0.76:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,152:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:195,150:0.43:-0.37:1.000:0.954 0/0/1/1:4:185,193:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,140:0.54:-1.45:0.975:0.988 0/0/1/1:4:217,198:0.48: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:170,175:0.51:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:262,284:0.52: 2.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:121,300:0.71: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:193,185:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,170:0.52:-0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,260:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:293,100:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:291,102:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,79:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,158:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:258,235:0.48: 1.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:422,135:0.24: 2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,217:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,179:0.45: 0.23:1.000:0.983 0/0/1/1:4:210,194:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,167:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:237,235:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,197:0.51: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,64:0.40:-2.71:1.000:0.819 0/0/1/1:4:126,127:0.50:-1.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,197:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:193,216:0.53: 0.43:1.000:0.993 0/0/0/1:4:372,130:0.26: 1.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:292,113:0.28: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,166:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/0:4:424,1:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,94:0.29:-0.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:241,84:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,183:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,174:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:193,214:0.52: 0.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:287,73:0.20:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,161:0.52:-0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:104,276:0.72: 0.07:0.999:0.996 0/0/1/1:4:191,192:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,169:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:232,53:0.18:-1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,128:0.46:-1.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:335,91:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,121:0.30: 0.32:1.000:0.985 0/0/0/0:4:335,2:0.01:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,126:0.51:-1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,218:0.49: 0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:336,121:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:264,95:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:227,143:0.38:-0.06:1.000:0.630 0/0/1/1:4:256,199:0.44: 1.01:1.000:0.960 0/0/1/1:4:250,251:0.50: 1.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:240,282:0.54: 1.85:1.000:0.989 0/0/1/1:4:179,155:0.46:-0.51:1.000:0.989 0/0/1/1:4:195,191:0.49: 0.14:1.000:0.997 -chr6.1 13594745 chr6.1_013594745 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,7:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:34,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:47,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:47,13:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,3:.:-1.30:1.000:. ./.:4:12,3:.:-1.48:1.000:. ./.:4:21,3:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.25:1.000:. ./.:4:88,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:161,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.61:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:24,3:.:-1.18:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.18:1.000:. ./.:5:60,1:.:-0.33:0.999:. ./.:4:45,6:.:-0.58:1.000:. ./.:4:47,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:40,10:.:-0.61:1.000:. ./.:4:20,3:.:-1.28:1.000:. ./.:4:118,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:12,2:.:-1.50:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:62,6:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.11:1.000:. ./.:3:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:24,2:.:-1.20:1.000:. ./.:6:26,2:.:-1.15:0.999:. ./.:4:47,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:35,5:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:50,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:85,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:170,6:.: 2.52:1.000:. ./.:4:109,3:.: 0.93:1.000:. ./.:4:47,12:.:-0.38:0.999:. ./.:4:198,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:60,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:43,7:.:-0.61:1.000:. ./.:4:101,3:.: 0.74:1.000:. ./.:4:102,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,4:.:-0.61:1.000:. ./.:4:91,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:84,1:.: 0.26:1.000:. ./.:6:149,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:137,3:.: 1.63:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:70,5:.: 0.02:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.83:1.000:. ./.:4:87,6:.: 0.46:1.000:. ./.:4:110,2:.: 0.93:0.994:. ./.:4:63,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,4:.: 0.14:1.000:. ./.:4:79,2:.: 0.16:0.999:. ./.:4:74,5:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,6:.:-0.48:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:149,4:.: 1.95:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:77,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:81,9:.: 0.39:1.000:. ./.:4:35,3:.:-0.90:1.000:. ./.:4:92,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:107,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:82,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:68,9:.: 0.06:1.000:. ./.:4:76,5:.: 0.16:1.000:. ./.:4:84,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:113,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:37,2:.:-0.88:1.000:. ./.:4:134,3:.: 1.56:1.000:. ./.:4:75,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:111,4:.: 1.01:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:146,5:.: 1.90:1.000:. ./.:4:35,16:.:-0.58:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:50,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:101,4:.: 0.76:1.000:. ./.:4:156,3:.: 2.10:1.000:. ./.:4:128,2:.: 1.38:0.998:. ./.:4:71,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,13:.: 0.54:1.000:. ./.:4:26,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.58:1.000:. ./.:4:60,8:.:-0.16:1.000:. ./.:4:117,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:185,3:.: 2.82:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,15:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:65,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,6:.: 0.24:1.000:. ./.:4:122,3:.: 1.26:1.000:. ./.:4:54,9:.:-0.28:1.000:. ./.:4:157,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:136,5:.: 1.65:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:108,5:.: 0.96:1.000:. ./.:4:92,8:.: 0.64:1.000:. ./.:4:133,3:.: 1.53:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:101,4:.: 0.76:1.000:. ./.:4:75,11:.: 0.29:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:70,4:.:-0.01:0.975:. ./.:4:104,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:67,5:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:118,5:.: 1.21:1.000:. ./.:4:68,11:.: 0.11:1.000:. ./.:4:120,13:.: 1.46:1.000:. ./.:4:68,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:135,6:.: 1.65:1.000:. ./.:4:43,6:.:-0.63:1.000:. ./.:4:64,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:71,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:68,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:49,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:29,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:62,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.51:1.000:. ./.:4:33,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:20,7:.:-1.18:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.25:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:47,4:.:-0.58:0.999:. ./.:4:39,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:34,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:33,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:30,2:.:-1.05:1.000:. ./.:4:30,2:.:-1.05:1.000:. ./.:4:47,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,3:.:-0.90:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:17,5:.:-1.30:1.000:. ./.:4:54,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:60,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:70,4:.:-0.01:1.000:. -chr6.1 13697405 chr6.1_013697405 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:183,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.43:1.000:. ./.:5:171,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:116,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:211,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.70:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.90:1.000:. ./.:6:126,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:155,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:195,2:.: 1.00:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.18:0.999:. ./.:4:76,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.61:1.000:. ./.:6:136,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.57:0.994:. ./.:4:136,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.80:0.999:. ./.:4:193,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:274,1:.: 2.57:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:230,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.15:0.998:. ./.:4:255,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:296,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:184,2:.: 0.78:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:163,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.53:0.975:. ./.:4:108,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:154,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:203,2:.: 1.16:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.54:1.000:. -chr6.1 13729773 chr6.1_013729773 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-2.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:197,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,175:0.70: 0.52:1.000:0.984 0/0/0/0:4:291,1:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:265,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,138:0.46: 0.59:1.000:0.987 0/0/1/1:4:139,148:0.43: 1.07:1.000:0.949 0/0/0/0:4:229,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,25:0.20:-1.61:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,62:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,95:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/0:4:230,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,90:0.27: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/0/1:5:244,95:0.22: 1.80:0.999:0.986 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:271,1:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,30:0.42:-2.13:1.000:0.899 0/0/0/1:4:154,88:0.29: 0.43:1.000:0.991 0/0/0/0:4:269,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:207,1:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,23:0.50:-2.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:199,99:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,65:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,96:0.30: 0.64:1.000:0.985 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,83:0.49:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,73:0.38:-0.72:1.000:0.521 0/0/0/1:4:141,86:0.31: 0.22:1.000:0.980 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/0:3:39,0:0.00:-2.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:337,0:0.00: 1.77:0.999:1.000 0/0/0/1:4:185,95:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,119:0.31: 1.36:1.000:0.970 0/0/1/1:4:88,78:0.39:-0.64:1.000:0.679 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,191:0.68: 0.90:1.000:0.954 0/0/0/1:4:122,69:0.29:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:149,134:0.39: 1.01:1.000:0.715 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:285,0:0.00: 1.04:0.999:1.000 0/0/1/1:4:27,43:0.54:-1.99:1.000:0.987 0/0/1/1:4:132,133:0.42: 0.76:1.000:0.907 0/0/0/1:4:163,69:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,102:0.52:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:267,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,68:0.39:-0.96:1.000:0.735 0/0/0/1:4:160,100:0.31: 0.69:1.000:0.973 0/0/0/1:4:160,88:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,156:0.58: 0.46:1.000:0.895 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,83:0.19: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,63:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:105,68:0.32:-0.54:1.000:0.914 0/0/0/1:4:135,72:0.28:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,133:0.65:-0.20:1.000:0.758 0/0/1/1:4:86,83:0.41:-0.59:1.000:0.854 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,67:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,62:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:176,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,69:0.27:-0.14:0.994:0.997 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.38:0.999:1.000 0/0/1/1:4:94,144:0.52: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:178,181:0.42: 2.08:1.000:0.916 1/1/1/1:4:0,128:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,159:0.60: 0.47:1.000:0.782 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,60:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,86:0.30: 0.28:1.000:0.986 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,144:0.64: 0.04:1.000:0.717 0/0/0/1:4:156,70:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,74:0.42:-0.90:1.000:0.913 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,112:0.57:-0.48:1.000:0.938 0/0/1/1:4:129,117:0.39: 0.49:1.000:0.736 0/0/0/1:4:129,60:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,1:0.01:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,118:0.57:-0.34:1.000:0.947 0/0/0/1:4:184,86:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,52:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,95:0.22: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,116:0.55:-0.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:48,63:0.48:-1.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,146:0.40: 1.25:1.000:0.825 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,68:0.47:-1.24:1.000:0.990 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,47:0.26:-0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,131:0.56:-0.03:1.000:0.963 0/0/0/1:4:109,59:0.28:-0.61:0.998:0.996 0/1/1/1:4:59,130:0.67:-0.31:1.000:0.914 0/0/0/1:4:202,60:0.18: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,72:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:324,0:0.00: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,82:0.28: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,122:0.22: 3.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,66:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,77:0.22: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,65:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,68:0.45:-1.20:1.000:0.983 0/0/0/1:4:224,70:0.19: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,69:0.45:-1.17:1.000:0.982 0/0/0/1:4:217,61:0.17: 0.94:1.000:0.998 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,162:0.68: 0.31:1.000:0.957 0/0/1/1:4:44,55:0.47:-1.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:56,109:0.62:-0.65:1.000:0.553 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,72:0.45:-1.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:146,73:0.26: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:97,55:0.29:-0.83:0.975:0.992 0/0/0/1:4:128,46:0.21:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,64:0.24:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,235:0.70: 1.73:1.000:0.981 0/0/0/1:4:158,74:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,70:0.29:-0.23:1.000:0.993 0/0/0/0:4:225,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,68:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:188,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,202:0.68: 1.11:1.000:0.962 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,181:0.66: 0.77:1.000:0.839 0/0/0/1:4:145,77:0.28: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:205,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,54:0.36:-1.23:1.000:0.720 0/0/0/0:4:273,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,159:0.60: 0.47:1.000:0.782 0/0/0/1:4:70,25:0.21:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,114:0.33: 0.98:1.000:0.922 0/1/1/1:4:78,185:0.70: 0.73:1.000:0.981 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:283,103:0.21: 2.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,66:0.28:-0.36:1.000:0.995 0/0/0/0:4:283,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,82:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,72:0.22: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,81:0.43:-0.76:1.000:0.950 0/0/0/1:4:228,94:0.23: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,92:0.31: 0.42:1.000:0.977 0/0/0/0:4:225,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,72:0.20: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,133:0.54: 0.08:0.999:0.988 0/0/1/1:4:150,128:0.38: 0.94:1.000:0.572 0/0/0/1:4:141,92:0.32: 0.31:1.000:0.954 0/0/0/1:4:122,49:0.22:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,65:0.28:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,68:0.28:-0.26:1.000:0.995 0/0/0/0:4:205,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,57:0.30:-0.83:1.000:0.984 0/0/1/1:4:78,113:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/0:4:279,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:253,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,28:0.10: 0.17:1.000:0.834 0/0/0/1:4:157,83:0.27: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:278,121:0.24: 2.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,57:0.31:-0.90:1.000:0.968 -chr6.1 13982516 chr6.1_013982516 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:227,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.42:1.000:. ./.:5:342,0:.: 2.72:0.999:. ./.:4:241,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:212,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:32,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.98:1.000:. ./.:3:20,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:286,1:.: 1.65:0.999:. ./.:4:242,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:211,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.07:1.000:. ./.:6:198,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.11:0.994:. ./.:4:228,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.30:0.999:. ./.:4:213,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:194,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:150,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:218,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:138,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.92:0.998:. ./.:4:174,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:205,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:233,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.56:0.975:. ./.:4:218,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:355,1:.: 2.99:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:310,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.17:0.999:. ./.:4:186,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.44:1.000:. -chr6.1 14426774 chr6.1_014426774 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:401,1:.: 2.42:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:245,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.30:1.000:. ./.:5:282,0:.: 0.63:0.999:. ./.:4:330,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:393,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:379,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:94,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.99:1.000:. ./.:3:63,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.31:1.000:. ./.:6:331,0:.: 1.36:0.999:. ./.:4:244,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.77:0.999:. ./.:4:165,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:105,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.03:1.000:. ./.:6:241,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:384,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.48:0.994:. ./.:4:251,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.54:0.999:. ./.:4:228,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:105,1:.:-2.01:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.67:0.998:. ./.:4:170,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:365,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.60:0.975:. ./.:4:222,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:399,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:372,1:.: 1.99:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:197,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.42:1.000:. -chr6.1 15022048 chr6.1_015022048 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,122:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.79:1.000:. ./.:4:20,132:.:-0.06:1.000:. ./.:4:69,85:.:-0.02:1.000:. ./.:4:22,124:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,143:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,27:.:-1.73:1.000:. ./.:4:96,56:.:-0.06:1.000:. ./.:4:21,106:.:-0.58:1.000:. ./.:4:31,15:.:-2.27:1.000:. ./.:4:26,83:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,234:.: 1.65:1.000:. ./.:4:77,88:.: 0.21:1.000:. ./.:4:59,113:.: 0.35:1.000:. ./.:4:25,112:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,191:.: 0.98:1.000:. ./.:5:100,203:.: 3.08:0.999:. ./.:4:66,119:.: 0.62:1.000:. ./.:4:38,144:.: 0.56:1.000:. ./.:4:95,66:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,49:.:-1.59:1.000:. ./.:4:67,109:.: 0.44:1.000:. ./.:4:17,138:.: 0.00:1.000:. ./.:4:18,90:.:-0.98:1.000:. ./.:4:12,25:.:-2.46:1.000:. ./.:4:83,70:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,115:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,117:.: 0.83:1.000:. ./.:4:78,138:.: 1.27:1.000:. ./.:4:88,124:.: 1.19:1.000:. ./.:4:143,134:.: 2.54:1.000:. ./.:4:71,127:.: 0.90:1.000:. ./.:4:10,27:.:-2.46:1.000:. ./.:4:1,57:.:-2.02:1.000:. ./.:3:4,20:.:-2.73:1.000:. ./.:4:82,150:.: 1.60:1.000:. ./.:6:92,136:.: 1.52:0.999:. ./.:4:114,79:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,189:.: 0.81:1.000:. ./.:4:10,207:.: 1.29:1.000:. ./.:4:58,105:.: 0.17:1.000:. ./.:4:62,46:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,172:.: 1.19:1.000:. ./.:4:68,108:.: 0.44:1.000:. ./.:4:114,63:.: 0.46:1.000:. ./.:4:56,98:.:-0.02:1.000:. ./.:4:76,61:.:-0.38:0.999:. ./.:4:109,247:.: 4.19:1.000:. ./.:4:110,46:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,181:.: 1.58:1.000:. ./.:4:70,86:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,82:.: 0.06:1.000:. ./.:4:59,102:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,166:.: 0.46:1.000:. ./.:4:68,47:.:-0.84:1.000:. ./.:4:126,100:.: 1.48:1.000:. ./.:4:72,56:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,114:.:-0.54:1.000:. ./.:4:57,95:.:-0.06:1.000:. ./.:6:47,84:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,113:.: 0.21:1.000:. ./.:4:79,118:.: 0.87:1.000:. ./.:4:22,101:.:-0.67:1.000:. ./.:4:77,64:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,168:.: 1.12:1.000:. ./.:4:54,41:.:-1.25:1.000:. ./.:4:47,134:.: 0.54:1.000:. ./.:4:42,105:.:-0.17:0.994:. ./.:4:0,201:.: 0.96:1.000:. ./.:4:20,108:.:-0.56:1.000:. ./.:4:70,44:.:-0.86:0.999:. ./.:4:10,155:.: 0.21:1.000:. ./.:4:63,59:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,218:.: 1.31:1.000:. ./.:4:49,101:.:-0.11:1.000:. ./.:4:5,130:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,92:.:-0.31:1.000:. ./.:4:55,163:.: 1.31:1.000:. ./.:4:81,131:.: 1.19:1.000:. ./.:4:14,120:.:-0.44:1.000:. ./.:4:79,95:.: 0.39:1.000:. ./.:4:76,57:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,95:.:-0.81:1.000:. ./.:4:46,130:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,116:.: 0.33:1.000:. ./.:4:43,73:.:-0.81:1.000:. ./.:4:46,51:.:-1.21:1.000:. ./.:4:59,53:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,155:.: 0.10:1.000:. ./.:4:10,138:.:-0.15:1.000:. ./.:4:86,90:.: 0.44:1.000:. ./.:4:10,158:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,75:.:-0.54:1.000:. ./.:4:54,77:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,124:.:-0.33:1.000:. ./.:4:46,77:.:-0.67:1.000:. ./.:4:12,165:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,43:.:-0.44:1.000:. ./.:4:24,112:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,67:.:-1.23:1.000:. ./.:4:23,117:.:-0.31:1.000:. ./.:4:57,82:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,95:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,82:.: 0.27:0.998:. ./.:4:62,78:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,77:.:-1.34:1.000:. ./.:4:93,62:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,61:.:-0.54:1.000:. ./.:4:13,162:.: 0.42:1.000:. ./.:4:41,94:.:-0.42:1.000:. ./.:4:98,70:.: 0.27:1.000:. ./.:4:61,87:.:-0.15:1.000:. ./.:4:22,58:.:-1.56:1.000:. ./.:4:49,55:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,107:.:-0.69:1.000:. ./.:4:38,70:.:-0.98:1.000:. ./.:4:18,73:.:-1.34:1.000:. ./.:4:51,49:.:-1.15:1.000:. ./.:4:63,76:.:-0.33:1.000:. ./.:4:24,80:.:-1.06:1.000:. ./.:4:85,88:.: 0.37:1.000:. ./.:4:54,100:.:-0.02:1.000:. ./.:4:66,129:.: 0.83:1.000:. ./.:4:12,147:.: 0.08:1.000:. ./.:4:18,124:.:-0.27:1.000:. ./.:4:69,88:.: 0.04:1.000:. ./.:4:8,135:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,77:.:-0.63:1.000:. ./.:4:7,106:.:-0.88:1.000:. ./.:4:78,82:.: 0.10:1.000:. ./.:4:11,167:.: 0.48:1.000:. ./.:4:6,73:.:-1.59:0.975:. ./.:4:34,83:.:-0.79:1.000:. ./.:4:65,55:.:-0.73:1.000:. ./.:4:128,141:.: 2.38:1.000:. ./.:4:47,143:.: 0.73:1.000:. ./.:4:3,135:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,82:.:-1.27:1.000:. ./.:4:7,112:.:-0.75:1.000:. ./.:4:74,56:.:-0.52:1.000:. ./.:4:93,36:.:-0.54:1.000:. ./.:4:81,56:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,64:.:-1.63:1.000:. ./.:4:70,113:.: 0.58:1.000:. ./.:4:102,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:113,117:.: 1.56:1.000:. ./.:4:60,89:.:-0.13:1.000:. ./.:4:16,166:.: 0.56:1.000:. ./.:4:94,111:.: 1.04:1.000:. ./.:4:29,139:.: 0.27:1.000:. ./.:4:104,113:.: 1.29:1.000:. ./.:4:16,21:.:-2.46:1.000:. ./.:4:13,124:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,122:.: 0.79:1.000:. ./.:4:93,110:.: 1.00:1.000:. ./.:4:83,117:.: 0.94:1.000:. ./.:4:57,53:.:-0.94:1.000:. ./.:4:8,135:.:-0.25:1.000:. ./.:4:96,55:.:-0.08:1.000:. ./.:4:71,44:.:-0.84:1.000:. ./.:4:70,49:.:-0.75:1.000:. ./.:4:71,126:.: 0.87:1.000:. ./.:4:61,111:.: 0.35:1.000:. ./.:4:78,188:.: 2.31:1.000:. ./.:4:19,121:.:-0.31:1.000:. ./.:4:72,86:.: 0.06:1.000:. ./.:4:11,147:.: 0.06:0.999:. ./.:4:111,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:48,130:.: 0.48:1.000:. ./.:4:65,104:.: 0.29:1.000:. ./.:4:108,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:117,52:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,89:.:-1.11:1.000:. ./.:4:74,52:.:-0.61:1.000:. ./.:4:68,103:.: 0.33:1.000:. ./.:4:86,170:.: 2.10:1.000:. ./.:4:88,70:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,67:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,86:.: 0.23:1.000:. ./.:4:75,119:.: 0.81:1.000:. ./.:4:25,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:64,192:.: 2.10:1.000:. ./.:4:8,132:.:-0.31:1.000:. ./.:4:11,167:.: 0.48:1.000:. -chr6.1 15716053 chr6.1_015716053 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:215,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.32:1.000:. ./.:5:447,0:.: 2.00:0.999:. ./.:4:334,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:346,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:441,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:15,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.89:1.000:. ./.:6:325,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:331,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:297,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:258,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:62,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:224,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:305,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:270,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.15:0.994:. ./.:4:326,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:319,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.06:0.998:. ./.:4:241,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:252,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:314,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.79:0.975:. ./.:4:271,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:516,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:180,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:395,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:234,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:449,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:497,2:.: 2.57:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.61:0.999:. ./.:4:279,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:412,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:185,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:561,0:.: 3.24:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.66:1.000:. -chr6.1 16478424 chr6.1_016478424 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:128,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.06:1.000:. ./.:5:375,0:.: 1.00:0.999:. ./.:4:280,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:286,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:404,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:35,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.00:1.000:. ./.:6:388,1:.: 1.14:0.999:. ./.:4:374,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.02:0.999:. ./.:4:80,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.26:1.000:. ./.:6:316,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.36:0.994:. ./.:4:245,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:482,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:242,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:472,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:617,0:.: 3.35:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.66:0.998:. ./.:4:354,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:391,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:274,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:472,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:527,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:537,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.90:0.975:. ./.:4:258,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:489,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:126,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:486,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:386,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:326,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:567,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:319,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.05:1.000:. -chr6.1 16566728 chr6.1_016566728 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:113,40:0.27: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,51:0.59:-1.09:1.000:0.860 0/0/1/1:4:84,65:0.46: 1.05:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,57:0.46: 0.38:1.000:0.989 0/0/0/1:4:124,43:0.27: 1.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,37:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,44:0.45:-0.53:1.000:0.975 0/0/1/1:4:56,67:0.56: 0.14:1.000:0.966 0/0/1/1:4:60,63:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:34,8:0.20:-2.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,33:0.64:-2.36:1.000:0.666 0/1/1/1:4:37,102:0.72: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,50:0.47:-0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:90,30:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,32:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,84:0.64: 0.42:1.000:0.731 0/0/0/1/1:5:118,79:0.42: 2.74:0.999:0.954 0/0/1/1:4:85,66:0.46: 1.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:88,90:0.53: 2.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:117,35:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,25:0.56:-2.57:1.000:0.968 0/1/1/1:4:24,78:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,64:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,27:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,5:0.12:-2.68:1.000:0.798 0/0/0/1:4:111,31:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,41:0.27: 1.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:92,33:0.28: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,36:0.28: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,86:0.54: 1.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:75,65:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,57:0.48: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-2.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,21:0.42:-2.33:1.000:0.903 0/0/1:3:24,11:0.33:-2.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,30:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:93,62:0.42: 1.26:0.999:0.531 0/0/0/1:4:108,34:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,57:0.48: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,52:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,53:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,24:0.21: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,49:0.47:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,62:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,33:0.26: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/0:4:134,1:0.01: 0.56:0.999:1.000 0/1/1/1:4:21,42:0.67:-1.97:1.000:0.901 0/0/1/1:4:72,52:0.44: 0.17:1.000:0.970 0/1/1/1:4:27,80:0.74:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,52:0.54:-0.67:1.000:0.988 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,43:0.44:-0.53:1.000:0.959 0/1/1/1:4:40,68:0.63:-0.39:1.000:0.613 0/0/0/1:4:89,25:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,61:0.56:-0.21:1.000:0.972 0/0/0/1:4:72,21:0.24:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,70:0.52: 0.74:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,89:0.66: 0.52:1.000:0.890 0/0/1/1/1/1:6:31,74:0.70:-0.50:1.000:0.876 0/1/1/1:4:29,91:0.74: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,54:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,67:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,30:0.19: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,55:0.44: 0.49:1.000:0.959 0/0/1/1:4:83,67:0.47: 1.09:1.000:0.993 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,30:0.29:-0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:77,57:0.45: 0.52:0.994:0.978 0/1/1/1:4:29,80:0.72:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,30:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,10:0.13:-1.45:0.999:0.941 0/1/1/1:4:22,101:0.81: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,69:0.49: 1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,89:0.70: 0.28:1.000:0.980 0/0/1/1:4:53,44:0.48:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,40:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,48:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,81:0.55: 1.12:1.000:0.976 0/0/0/1:4:126,36:0.23: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,15:0.19:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,56:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,20:0.16: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,35:0.49:-1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,52:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,27:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,33:0.43:-1.38:1.000:0.957 0/0/1/1:4:73,46:0.41: 0.00:1.000:0.845 0/0/1/1:4:51,44:0.49:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,43:0.44:-0.53:1.000:0.959 0/0/1/1:4:67,39:0.39:-0.46:1.000:0.660 0/1/1/1:4:38,93:0.70: 0.42:1.000:0.987 0/0/1/1:4:70,64:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,58:0.55:-0.36:1.000:0.980 0/0/1/1:4:63,57:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,67:0.57: 0.03:1.000:0.940 0/1/1/1:4:25,67:0.72:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:67,50:0.45:-0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:63,58:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,37:0.28: 0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,25:0.40:-1.90:1.000:0.831 0/0/0/1:4:92,27:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,38:0.49:-1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,58:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,50:0.34: 1.30:0.998:0.888 0/0/1/1:4:69,66:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,49:0.55:-0.95:1.000:0.979 0/0/1/1:4:64,50:0.46:-0.18:1.000:0.989 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 2.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,82:0.79:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,55:0.47: 0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:124,46:0.28: 1.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,50:0.45:-0.04:1.000:0.976 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,26:0.26:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,24:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,38:0.45:-1.06:1.000:0.980 0/0/1/1:4:60,56:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,42:0.42:-0.46:1.000:0.903 0/0/1/1:4:63,65:0.53: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,56:0.45: 0.42:1.000:0.980 0/0/1/1:4:63,54:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,25:0.21: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,54:0.53:-0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,49:0.46:-0.21:1.000:0.986 0/0/1/1:4:49,79:0.62: 0.31:1.000:0.529 0/0/1/1:4:53,54:0.53:-0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,48:0.60:-1.30:1.000:0.825 0/0/1/1:4:42,32:0.46:-1.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:58,41:0.44:-0.71:1.000:0.961 0/0/1/1:4:94,52:0.37: 0.95:1.000:0.500 0/0/1/1:4:51,41:0.47:-0.95:0.975:0.992 0/0/1/1:4:68,64:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,28:0.28:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,71:0.53: 0.74:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,84:0.69: 0.07:1.000:0.972 0/0/1/1:4:71,53:0.45: 0.17:1.000:0.980 0/0/1/1:4:63,47:0.45:-0.32:1.000:0.980 0/1/1/1:4:31,88:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,32:0.27: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,33:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:82,27:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,39:0.43:-0.85:1.000:0.953 0/0/1/1:4:109,91:0.48: 2.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,28:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,62:0.53: 0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,62:0.52: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,75:0.52: 1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,58:0.46: 0.45:1.000:0.989 0/0/1/1:4:83,74:0.50: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,71:0.54: 0.63:1.000:0.989 0/0/1/1:4:24,20:0.48:-2.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,49:0.51:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,79:0.55: 1.02:1.000:0.978 0/0/1/1:4:55,63:0.55:-0.04:1.000:0.978 0/0/0/1:4:118,35:0.24: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,34:0.29: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,46:0.46:-0.50:1.000:0.989 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,24:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,30:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,69:0.54: 0.52:1.000:0.990 0/0/1/1:4:80,73:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,41:0.56:-1.55:1.000:0.963 0/0/0/1:4:121,31:0.21: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,46:0.48:-0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,91:0.75: 0.00:0.999:0.999 0/0/1/1:4:59,50:0.48:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,51:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,16:0.18:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,34:0.40:-1.02:1.000:0.771 0/0/0/1:4:88,18:0.18:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,27:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,42:0.43:-0.60:1.000:0.956 0/0/1/1:4:76,57:0.45: 0.49:1.000:0.981 0/0/0/1:4:119,33:0.23: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,26:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,28:0.27:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,55:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,72:0.52: 0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,131:0.77: 1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,37:0.41:-0.81:1.000:0.837 0/0/1/1:4:67,77:0.55: 0.88:1.000:0.978 -chr6.1 17140629 chr6.1_017140629 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:299,6:.: 1.00:1.000:. ./.:4:177,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:304,3:.: 1.02:1.000:. ./.:4:296,6:.: 0.95:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:274,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:178,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:284,8:.: 0.81:1.000:. ./.:4:306,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:118,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:58,5:.:-2.43:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:285,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:265,4:.: 0.49:1.000:. ./.:4:263,3:.: 0.44:1.000:. ./.:4:154,3:.:-1.10:1.000:. ./.:5:316,11:.: 1.31:0.999:. ./.:4:175,4:.:-0.79:1.000:. ./.:4:343,10:.: 1.68:1.000:. ./.:4:321,5:.: 1.29:1.000:. ./.:4:53,4:.:-2.51:1.000:. ./.:4:323,5:.: 1.32:1.000:. ./.:4:236,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:171,4:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,2:.:-2.85:1.000:. ./.:4:240,7:.: 0.18:1.000:. ./.:4:267,5:.: 0.53:1.000:. ./.:4:195,2:.:-0.53:1.000:. ./.:4:323,2:.: 1.28:1.000:. ./.:4:259,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:205,5:.:-0.35:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:78,7:.:-2.12:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.66:1.000:. ./.:3:49,3:.:-2.58:1.000:. ./.:4:251,7:.: 0.33:1.000:. ./.:6:313,11:.: 1.27:0.999:. ./.:4:259,5:.: 0.42:1.000:. ./.:4:304,4:.: 1.04:1.000:. ./.:4:170,4:.:-0.86:1.000:. ./.:4:230,9:.: 0.06:1.000:. ./.:4:236,3:.: 0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:220,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:313,11:.: 1.27:1.000:. ./.:4:319,7:.: 1.29:1.000:. ./.:4:339,3:.: 1.52:0.999:. ./.:4:374,92:.: 3.27:1.000:. ./.:4:218,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:103,6:.:-1.78:1.000:. ./.:4:117,5:.:-1.59:1.000:. ./.:4:304,3:.: 1.02:1.000:. ./.:4:229,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:376,8:.: 2.11:1.000:. ./.:4:231,7:.: 0.05:1.000:. ./.:4:197,10:.:-0.39:1.000:. ./.:4:206,9:.:-0.28:1.000:. ./.:4:220,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:309,8:.: 1.17:1.000:. ./.:6:181,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:232,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:237,4:.: 0.09:1.000:. ./.:4:254,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:297,11:.: 1.04:1.000:. ./.:4:382,7:.: 2.18:1.000:. ./.:4:192,5:.:-0.53:1.000:. ./.:4:179,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:195,3:.:-0.52:1.000:. ./.:4:234,4:.: 0.05:0.994:. ./.:4:165,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:319,4:.: 1.25:1.000:. ./.:4:113,6:.:-1.63:0.999:. ./.:4:196,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:340,3:.: 1.53:1.000:. ./.:4:177,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:216,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:263,9:.: 0.53:1.000:. ./.:4:191,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:130,2:.:-1.45:1.000:. ./.:4:280,13:.: 0.83:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:251,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:387,5:.: 2.23:1.000:. ./.:4:272,9:.: 0.66:1.000:. ./.:4:239,8:.: 0.18:1.000:. ./.:4:214,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:159,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:259,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:255,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:186,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:135,8:.:-1.30:1.000:. ./.:4:240,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:251,9:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:221,4:.:-0.14:1.000:. ./.:4:243,8:.: 0.23:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:196,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:314,8:.: 1.24:1.000:. ./.:4:142,4:.:-1.25:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:179,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:190,5:.:-0.56:0.998:. ./.:4:239,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:301,3:.: 0.98:1.000:. ./.:4:200,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:189,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:341,3:.: 1.55:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:330,4:.: 1.41:1.000:. ./.:4:214,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:249,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:165,7:.:-0.89:1.000:. ./.:4:247,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:268,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:249,2:.: 0.23:1.000:. ./.:4:313,2:.: 1.14:1.000:. ./.:4:186,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:127,12:.:-1.35:1.000:. ./.:4:265,5:.: 0.50:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:410,6:.: 2.57:1.000:. ./.:4:169,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:199,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:194,8:.:-0.46:1.000:. ./.:4:194,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:246,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:140,2:.:-1.31:0.975:. ./.:4:179,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:219,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:183,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:300,3:.: 0.97:1.000:. ./.:4:261,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:265,4:.: 0.49:1.000:. ./.:4:278,4:.: 0.67:1.000:. ./.:4:213,10:.:-0.16:1.000:. ./.:4:309,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:189,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:352,4:.: 1.72:1.000:. ./.:4:239,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:225,5:.:-0.06:1.000:. ./.:4:270,5:.: 0.57:1.000:. ./.:4:135,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:316,5:.: 1.22:1.000:. ./.:4:188,7:.:-0.56:1.000:. ./.:4:96,2:.:-1.93:1.000:. ./.:4:246,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:326,4:.: 1.35:1.000:. ./.:4:125,2:.:-1.52:1.000:. ./.:4:270,4:.: 0.56:1.000:. ./.:4:273,8:.: 0.66:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:245,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:248,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:290,6:.: 0.87:1.000:. ./.:4:211,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:185,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:241,7:.: 0.19:1.000:. ./.:4:210,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:226,2:.:-0.09:0.999:. ./.:4:224,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:104,7:.:-1.75:1.000:. ./.:4:245,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:143,3:.:-1.25:1.000:. ./.:4:242,5:.: 0.18:1.000:. ./.:4:275,4:.: 0.63:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:230,3:.:-0.02:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:259,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:187,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:353,8:.: 1.79:1.000:. ./.:4:200,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:214,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:255,2:.: 0.32:1.000:. -chr6.1 19995644 chr6.1_019995644 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:191,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:149,22:.: 0.40:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:96,28:.:-0.57:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:39,15:.:-2.02:1.000:. ./.:4:97,30:.:-0.51:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,8:.:-2.74:1.000:. ./.:4:22,15:.:-2.37:1.000:. ./.:4:159,33:.: 0.83:1.000:. ./.:4:121,50:.: 0.40:1.000:. ./.:4:81,61:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:134,73:.: 1.14:0.999:. ./.:4:73,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:265,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:192,38:.: 1.62:1.000:. ./.:4:15,3:.:-2.76:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,4:.:-2.80:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:66,65:.:-0.43:1.000:. ./.:4:66,65:.:-0.43:1.000:. ./.:4:187,37:.: 1.49:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:99,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:105,48:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,3:.:-2.80:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.75:1.000:. ./.:3:10,3:.:-2.86:1.000:. ./.:4:130,28:.: 0.13:1.000:. ./.:6:168,30:.: 0.96:0.999:. ./.:4:96,33:.:-0.47:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:113,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:172,36:.: 1.16:1.000:. ./.:4:121,37:.: 0.13:1.000:. ./.:4:113,54:.: 0.32:1.000:. ./.:4:48,82:.:-0.45:1.000:. ./.:4:129,27:.: 0.09:1.000:. ./.:4:181,39:.: 1.41:0.999:. ./.:4:19,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:48,70:.:-0.69:1.000:. ./.:4:60,27:.:-1.33:1.000:. ./.:4:40,45:.:-1.38:1.000:. ./.:4:174,32:.: 1.12:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:197,42:.: 1.80:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:40,45:.:-1.38:1.000:. ./.:4:157,22:.: 0.57:1.000:. ./.:4:141,27:.: 0.34:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.50:1.000:. ./.:6:139,7:.:-0.12:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:92,27:.:-0.67:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:66,62:.:-0.49:1.000:. ./.:4:75,10:.:-1.38:1.000:. ./.:4:188,44:.: 1.66:1.000:. ./.:4:126,38:.: 0.26:0.994:. ./.:4:83,58:.:-0.22:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:53,23:.:-1.56:0.999:. ./.:4:101,59:.: 0.17:1.000:. ./.:4:137,43:.: 0.59:1.000:. ./.:4:104,60:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,28:.:-1.13:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:165,76:.: 1.85:1.000:. ./.:4:71,80:.:-0.01:1.000:. ./.:4:174,38:.: 1.25:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:50,66:.:-0.74:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:159,40:.: 0.98:1.000:. ./.:4:66,14:.:-1.48:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.55:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,66:.:-0.53:1.000:. ./.:4:133,43:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:92,63:.: 0.07:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:117,32:.:-0.05:1.000:. ./.:4:158,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:51,63:.:-0.78:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:91,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:139,22:.: 0.19:0.998:. ./.:4:81,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:105,25:.:-0.45:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:196,34:.: 1.62:1.000:. ./.:4:157,31:.: 0.75:1.000:. ./.:4:145,36:.: 0.61:1.000:. ./.:4:108,77:.: 0.69:1.000:. ./.:4:122,67:.: 0.77:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:94,24:.:-0.69:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:118,24:.:-0.20:1.000:. ./.:4:101,26:.:-0.51:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:154,39:.: 0.85:1.000:. ./.:4:114,22:.:-0.32:1.000:. ./.:4:98,82:.: 0.59:1.000:. ./.:4:180,36:.: 1.33:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:131,36:.: 0.32:1.000:. ./.:4:139,28:.: 0.32:1.000:. ./.:4:94,23:.:-0.72:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:110,31:.:-0.22:1.000:. ./.:4:116,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,25:.:-1.17:0.975:. ./.:4:109,44:.: 0.03:1.000:. ./.:4:158,27:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,68:.:-1.00:1.000:. ./.:4:130,70:.: 1.00:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:109,41:.:-0.03:1.000:. ./.:4:178,29:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,34:.:-0.80:1.000:. ./.:4:153,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:121,32:.: 0.03:1.000:. ./.:4:219,40:.: 2.22:1.000:. ./.:4:45,63:.:-0.90:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:100,24:.:-0.57:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:34,48:.:-1.44:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:104,57:.: 0.19:1.000:. ./.:4:28,68:.:-1.15:1.000:. ./.:4:122,29:.:-0.01:1.000:. ./.:4:100,74:.: 0.46:1.000:. ./.:4:122,35:.: 0.11:1.000:. ./.:4:139,24:.: 0.24:1.000:. ./.:4:84,52:.:-0.32:1.000:. ./.:4:87,54:.:-0.22:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:81,72:.: 0.03:1.000:. ./.:4:59,63:.:-0.61:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:65,50:.:-0.76:1.000:. ./.:4:104,76:.: 0.59:0.999:. ./.:4:39,65:.:-0.98:1.000:. ./.:4:62,41:.:-1.00:1.000:. ./.:4:143,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:84,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:77,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,70:.: 0.83:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:173,32:.: 1.10:1.000:. ./.:4:172,25:.: 0.94:1.000:. ./.:4:130,21:.:-0.01:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:175,31:.: 1.12:1.000:. ./.:4:75,67:.:-0.20:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:144,34:.: 0.54:1.000:. -chr6.1 20904400 chr6.1_020904400 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:165,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:183,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.28:1.000:. ./.:5:258,0:.: 2.25:0.999:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:268,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.01:1.000:. ./.:3:38,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.98:1.000:. ./.:6:182,0:.: 0.96:0.999:. ./.:4:67,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:185,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:78,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.42:1.000:. ./.:6:65,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.79:0.990:. ./.:4:198,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:304,1:.: 3.05:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.64:0.998:. ./.:4:121,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:306,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.88:0.775:. ./.:4:186,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:281,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:263,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:226,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.82:1.000:. -chr6.1 21189627 chr6.1_021189627 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:187,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:128,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:105,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:27,4:.:-2.53:1.000:. ./.:4:82,14:.:-1.01:1.000:. ./.:4:122,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:134,3:.:-0.06:1.000:. ./.:5:216,0:.: 1.78:0.999:. ./.:4:156,8:.: 0.57:1.000:. ./.:4:164,9:.: 0.78:1.000:. ./.:4:159,9:.: 0.66:1.000:. ./.:4:17,3:.:-2.78:1.000:. ./.:4:135,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:144,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:139,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:107,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:132,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:29,4:.:-2.48:1.000:. ./.:3:10,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:119,3:.:-0.41:1.000:. ./.:6:184,3:.: 1.10:0.999:. ./.:4:159,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:124,5:.:-0.25:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:105,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:148,8:.: 0.38:1.000:. ./.:4:129,9:.:-0.04:1.000:. ./.:4:90,3:.:-1.08:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.48:0.999:. ./.:4:16,7:.:-2.71:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:83,4:.:-1.22:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:123,6:.:-0.25:1.000:. ./.:4:135,7:.: 0.06:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:148,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:121,5:.:-0.32:1.000:. ./.:6:115,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:150,6:.: 0.38:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:118,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:127,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:128,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:122,9:.:-0.20:0.990:. ./.:4:115,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:77,3:.:-1.39:0.999:. ./.:4:126,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:134,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:114,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:115,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:146,12:.: 0.43:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:147,7:.: 0.34:1.000:. ./.:4:90,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:106,5:.:-0.66:1.000:. ./.:4:97,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:138,7:.: 0.13:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:105,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:134,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:100,5:.:-0.80:1.000:. ./.:4:99,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:118,7:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:96,5:.:-0.90:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:58,7:.:-1.74:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:112,3:.:-0.57:0.998:. ./.:4:179,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:110,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:234,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:143,10:.: 0.31:1.000:. ./.:4:107,3:.:-0.69:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:129,7:.:-0.08:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:134,12:.: 0.15:1.000:. ./.:4:99,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:105,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:114,12:.:-0.32:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:101,7:.:-0.73:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:145,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:126,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:126,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:92,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:107,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:102,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:95,6:.:-0.90:1.000:. ./.:4:134,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.73:0.775:. ./.:4:117,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,3:.:-0.32:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:105,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:129,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:101,6:.:-0.76:1.000:. ./.:4:139,8:.: 0.17:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:108,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:100,6:.:-0.78:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:179,7:.: 1.08:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:163,4:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:173,7:.: 0.94:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:114,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:154,5:.: 0.45:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:107,7:.:-0.59:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:154,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:131,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:96,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:110,3:.:-0.62:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:104,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:152,6:.: 0.43:1.000:. ./.:4:127,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:131,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:114,4:.:-0.50:1.000:. ./.:4:174,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:84,5:.:-1.18:1.000:. ./.:4:141,6:.: 0.17:1.000:. -chr6.1 21289253 chr6.1_021289253 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:16,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:5:46,13:.: 1.44:0.999:. ./.:4:7,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:27,42:.: 2.06:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:22,18:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:28,19:.: 0.71:1.000:. ./.:4:36,6:.: 0.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:52,17:.: 2.06:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.26:1.000:. ./.:3:13,5:.:-1.08:1.000:. ./.:4:10,9:.:-1.01:1.000:. ./.:6:8,10:.:-1.08:0.999:. ./.:4:19,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:26,22:.: 0.77:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,18:.: 0.40:1.000:. ./.:4:32,13:.: 0.58:1.000:. ./.:4:47,16:.: 1.69:0.999:. ./.:4:8,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:20,18:.: 0.15:1.000:. ./.:4:6,7:.:-1.38:1.000:. ./.:4:29,11:.: 0.28:1.000:. ./.:4:45,12:.: 1.32:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,22:.: 2.18:1.000:. ./.:4:32,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.15:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:54,31:.: 3.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.89:1.000:. ./.:6:23,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,12:.: 1.32:1.000:. ./.:4:42,19:.: 1.57:1.000:. ./.:4:28,20:.: 0.77:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,27:.: 1.75:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:50,10:.: 1.51:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.03:0.990:. ./.:4:23,24:.: 0.71:1.000:. ./.:4:49,24:.: 2.31:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.51:0.999:. ./.:4:31,28:.: 1.44:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:32,19:.: 0.95:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,17:.: 1.32:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:23,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:56,20:.: 2.49:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:28,16:.: 0.52:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:12,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:29,16:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,10:.:-1.01:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,11:.: 0.58:1.000:. ./.:4:26,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:43,17:.: 1.51:1.000:. ./.:4:32,15:.: 0.71:1.000:. ./.:4:60,22:.: 2.86:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.65:0.998:. ./.:4:46,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:29,18:.: 0.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:38,12:.: 0.89:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:41,17:.: 1.38:1.000:. ./.:4:20,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:14,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,18:.: 2.18:1.000:. ./.:4:50,11:.: 1.57:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,21:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:16,34:.: 0.89:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,10:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,10:.:-0.09:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.34:0.775:. ./.:4:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:19,12:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:51,11:.: 1.63:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,14:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:32,20:.: 1.01:1.000:. ./.:4:26,16:.: 0.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:23,19:.: 0.40:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:27,9:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:36,15:.: 0.95:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.46:1.000:. ./.:4:39,12:.: 0.95:1.000:. ./.:4:37,18:.: 1.20:1.000:. ./.:4:40,9:.: 0.83:1.000:. ./.:4:22,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,16:.:-0.09:1.000:. ./.:4:34,6:.: 0.28:1.000:. ./.:4:26,14:.: 0.28:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.77:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,6:.: 0.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:20,21:.: 0.34:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.08:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.52:1.000:. ./.:4:14,11:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:14,14:.:-0.46:1.000:. -chr6.1 21526343 chr6.1_021526343 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:109,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.14:1.000:. ./.:5:145,0:.: 1.87:0.999:. ./.:4:8,63:.:-0.42:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.93:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.29:1.000:. ./.:6:154,0:.: 2.15:0.999:. ./.:4:113,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.77:0.999:. ./.:4:28,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.76:1.000:. ./.:6:74,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.85:0.990:. ./.:4:9,0:.:-2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:7,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.82:0.998:. ./.:4:96,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.04:0.775:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.55:1.000:. -chr6.1 21894287 chr6.1_021894287 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:138,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:183,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:165,1:.: 1.67:1.000:. ./.:5:216,0:.: 2.94:0.999:. ./.:4:160,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.71:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.36:1.000:. ./.:6:132,0:.: 0.81:0.999:. ./.:4:154,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:47,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.31:1.000:. ./.:6:67,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:76,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:134,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.90:0.990:. ./.:4:39,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.23:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:131,1:.: 0.81:0.998:. ./.:4:87,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:50,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.42:0.775:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:187,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:171,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.43:1.000:. -chr6.1 22274165 chr6.1_022274165 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:75,0:.: 0.41:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:65,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:105,0:.: 1.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.: 1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:17,0:.:-1.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:65,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:90,0:.: 1.02:0.990:. ./.:4:119,0:.: 2.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:153,0:.: 3.58:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:59,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.42:0.775:. ./.:4:57,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:78,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:95,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:127,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.44:1.000:. -chr6.1 22386279 chr6.1_022386279 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.20:1.000:. ./.:5:109,0:.: 1.35:0.999:. ./.:4:41,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:18,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.40:1.000:. ./.:6:96,0:.: 0.91:0.999:. ./.:4:108,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:30,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.54:1.000:. ./.:6:53,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.78:0.990:. ./.:4:1,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.03:0.999:. ./.:4:20,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:0.998:. ./.:4:45,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:133,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.95:0.775:. ./.:4:40,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:139,1:.: 2.39:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:93,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.32:1.000:. -chr6.1 23722487 chr6.1_023722487 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:62,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.23:1.000:. ./.:5:89,0:.: 2.25:0.999:. ./.:4:73,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.62:1.000:. ./.:3:11,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.10:1.000:. ./.:6:59,1:.: 0.58:0.999:. ./.:4:48,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.50:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:6:22,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.46:0.990:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.62:0.999:. ./.:4:64,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:0.998:. ./.:4:47,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.16:0.775:. ./.:4:50,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.56:1.000:. -chr6.1 24250408 chr6.1_024250408 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:294,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:183,28:.:-0.19:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:256,41:.: 0.89:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:491,0:.: 3.34:1.000:. ./.:4:221,32:.: 0.34:1.000:. ./.:4:268,39:.: 1.02:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,11:.:-2.10:1.000:. ./.:4:37,17:.:-2.17:1.000:. ./.:4:130,27:.:-0.87:1.000:. ./.:4:146,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:243,29:.: 0.58:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.14:1.000:. ./.:5:417,64:.: 3.21:0.999:. ./.:4:252,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:69,13:.:-1.81:1.000:. ./.:4:439,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:258,41:.: 0.92:1.000:. ./.:4:258,26:.: 0.73:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:190,62:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.21:1.000:. ./.:3:35,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.36:1.000:. ./.:6:296,0:.: 0.88:0.999:. ./.:4:239,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:348,54:.: 2.22:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:230,50:.: 0.68:1.000:. ./.:4:168,42:.:-0.20:1.000:. ./.:4:140,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:455,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:160,52:.:-0.18:1.000:. ./.:4:203,71:.: 0.60:1.000:. ./.:4:140,30:.:-0.71:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:248,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:249,35:.: 0.73:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:234,53:.: 0.77:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:370,72:.: 2.72:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.09:1.000:. ./.:6:165,6:.:-0.69:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:198,44:.: 0.20:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:205,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:160,48:.:-0.23:0.990:. ./.:4:117,42:.:-0.84:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.93:0.999:. ./.:4:199,127:.: 1.26:1.000:. ./.:4:191,22:.:-0.16:1.000:. ./.:4:156,80:.: 0.12:1.000:. ./.:4:293,51:.: 1.48:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:136,24:.:-0.83:1.000:. ./.:4:151,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:148,32:.:-0.58:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:200,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:122,31:.:-0.92:1.000:. ./.:4:178,26:.:-0.28:1.000:. ./.:4:183,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:83,30:.:-1.42:1.000:. ./.:4:299,39:.: 1.41:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:113,32:.:-1.02:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:154,7:.:-0.82:1.000:. ./.:4:153,32:.:-0.52:1.000:. ./.:4:106,18:.:-1.29:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:180,24:.:-0.28:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.05:0.998:. ./.:4:250,33:.: 0.72:1.000:. ./.:4:210,30:.: 0.18:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:200,31:.: 0.06:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:328,67:.: 2.13:1.000:. ./.:4:147,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:245,37:.: 0.70:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:213,36:.: 0.29:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:237,24:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:130,36:.:-0.76:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:184,30:.:-0.15:1.000:. ./.:4:178,37:.:-0.14:1.000:. ./.:4:129,20:.:-0.97:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:312,22:.: 1.36:1.000:. ./.:4:169,13:.:-0.56:0.775:. ./.:4:145,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:155,42:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,27:.:-1.35:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:157,18:.:-0.64:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:249,24:.: 0.59:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:136,17:.:-0.92:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:151,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,48:.:-0.14:1.000:. ./.:4:152,32:.:-0.53:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:195,32:.: 0.01:1.000:. ./.:4:204,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:180,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:209,46:.: 0.36:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:192,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:278,48:.: 1.26:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:159,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:116,52:.:-0.73:1.000:. ./.:4:121,21:.:-1.06:1.000:. ./.:4:121,26:.:-1.00:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:154,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:413,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:147,3:.:-0.96:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:313,47:.: 1.69:1.000:. ./.:4:136,25:.:-0.82:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:133,43:.:-0.63:1.000:. -chr6.1 24313782 chr6.1_024313782 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:426,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:317,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:318,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.43:1.000:. ./.:5:260,0:.: 0.10:0.983:. ./.:4:333,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:233,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:379,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.52:1.000:. ./.:3:13,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.96:1.000:. ./.:6:214,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:187,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.18:0.999:. ./.:4:114,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:377,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:292,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.07:1.000:. ./.:6:204,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:287,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:149,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.02:0.990:. ./.:4:245,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.26:0.999:. ./.:4:253,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:418,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:361,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:260,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:509,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:422,1:.: 1.55:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:190,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.42:0.998:. ./.:4:238,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:210,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:172,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:258,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:508,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.22:0.775:. ./.:4:281,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:471,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:534,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:454,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:258,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:224,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:87,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:43,1:.:-1.83:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:596,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:326,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:414,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:431,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:197,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:319,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:338,1:.: 0.80:1.000:. -chr6.1 24706304 chr6.1_024706304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:807,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:761,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:422,59:.:-0.63:1.000:. ./.:4:863,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:859,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:553,47:.:-0.02:1.000:. ./.:4:704,64:.: 0.84:1.000:. ./.:4:878,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:393,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:337,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:552,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:536,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:670,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:681,0:.: 0.40:1.000:. ./.:5:757,0:.: 0.79:0.983:. ./.:4:819,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1172,0:.: 2.92:1.000:. ./.:4:1017,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:152,19:.:-2.22:1.000:. ./.:4:832,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:996,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:774,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:186,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:755,86:.: 1.22:1.000:. ./.:4:562,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:695,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:619,60:.: 0.39:1.000:. ./.:4:426,82:.:-0.49:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.47:1.000:. ./.:3:185,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:628,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:974,0:.: 1.90:0.999:. ./.:4:553,67:.: 0.08:1.000:. ./.:4:703,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:691,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:541,74:.: 0.06:1.000:. ./.:4:830,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:421,64:.:-0.61:1.000:. ./.:4:538,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:524,60:.:-0.10:1.000:. ./.:4:626,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:856,0:.: 1.29:0.999:. ./.:4:1071,137:.: 3.10:1.000:. ./.:4:528,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:509,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:229,48:.:-1.68:1.000:. ./.:4:860,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:562,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:622,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:627,43:.: 0.34:1.000:. ./.:4:264,64:.:-1.42:1.000:. ./.:4:626,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:911,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:624,60:.: 0.41:1.000:. ./.:6:474,48:.:-0.42:1.000:. ./.:4:609,70:.: 0.39:1.000:. ./.:4:453,52:.:-0.51:1.000:. ./.:4:597,61:.: 0.28:1.000:. ./.:4:788,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:796,55:.: 1.27:1.000:. ./.:4:375,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:567,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:574,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:673,0:.: 0.36:0.990:. ./.:4:247,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:891,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.78:0.999:. ./.:4:603,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:541,58:.:-0.02:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:404,52:.:-0.76:1.000:. ./.:4:504,53:.:-0.24:1.000:. ./.:4:558,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:408,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:633,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:598,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:207,43:.:-1.82:1.000:. ./.:4:859,54:.: 1.59:1.000:. ./.:4:717,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:640,74:.: 0.57:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:329,42:.:-1.20:1.000:. ./.:4:588,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:636,47:.: 0.41:1.000:. ./.:4:557,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:500,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:309,50:.:-1.26:1.000:. ./.:4:614,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:308,54:.:-1.24:1.000:. ./.:4:582,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:927,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:421,50:.:-0.68:1.000:. ./.:4:519,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:486,48:.:-0.36:1.000:. ./.:4:784,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:756,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:375,44:.:-0.95:1.000:. ./.:4:390,43:.:-0.88:1.000:. ./.:4:485,36:.:-0.43:0.998:. ./.:4:449,58:.:-0.50:1.000:. ./.:4:675,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:795,53:.: 1.25:1.000:. ./.:4:836,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:613,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:563,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1051,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:464,51:.:-0.46:1.000:. ./.:4:568,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:654,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:649,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:652,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:683,50:.: 0.66:1.000:. ./.:4:402,42:.:-0.82:1.000:. ./.:4:753,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:239,34:.:-1.70:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:593,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:577,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:845,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:573,66:.: 0.18:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:386,44:.:-0.89:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:296,41:.:-1.37:1.000:. ./.:4:579,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.40:0.775:. ./.:4:550,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:693,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:322,89:.:-0.99:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:497,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:711,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:420,41:.:-0.73:1.000:. ./.:4:789,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:429,41:.:-0.69:1.000:. ./.:4:734,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:653,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:581,65:.: 0.22:1.000:. ./.:4:971,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:261,48:.:-1.51:1.000:. ./.:4:491,55:.:-0.30:1.000:. ./.:4:622,66:.: 0.43:1.000:. ./.:4:276,42:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1003,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:269,48:.:-1.47:1.000:. ./.:4:338,23:.:-1.25:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:739,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:299,63:.:-1.24:1.000:. ./.:4:687,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:839,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:823,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:626,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:584,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:460,67:.:-0.39:1.000:. ./.:4:582,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:616,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:798,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:603,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:534,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:469,65:.:-0.36:1.000:. ./.:4:313,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:367,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:481,62:.:-0.31:1.000:. ./.:4:718,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:661,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:517,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:669,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:912,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:851,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:791,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:540,68:.: 0.02:1.000:. ./.:4:989,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:513,0:.:-0.47:1.000:. -chr6.1 24896251 chr6.1_024896251 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:117,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:53,13:.:-0.97:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:46,28:.:-0.69:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:25,15:.:-1.88:1.000:. ./.:4:60,21:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:11,7:.:-2.66:1.000:. ./.:4:10,6:.:-2.73:1.000:. ./.:4:66,17:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:66,22:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.97:1.000:. ./.:5:87,31:.: 0.86:0.983:. ./.:4:75,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:14,5:.:-2.62:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:64,11:.:-0.65:1.000:. ./.:4:65,25:.:-0.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:67,18:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.59:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.83:1.000:. ./.:6:129,0:.: 1.25:0.999:. ./.:4:79,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:65,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:96,27:.: 1.04:1.000:. ./.:4:86,23:.: 0.54:1.000:. ./.:4:84,29:.: 0.68:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.79:0.999:. ./.:4:22,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:55,35:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:63,24:.:-0.23:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:121,42:.: 2.44:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:59,36:.: 0.05:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:68,32:.: 0.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:60,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:63,36:.: 0.19:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:70,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:125,33:.: 2.27:0.990:. ./.:4:59,48:.: 0.47:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.40:0.999:. ./.:4:62,58:.: 0.93:1.000:. ./.:4:78,33:.: 0.61:1.000:. ./.:4:53,61:.: 0.72:1.000:. ./.:4:50,22:.:-0.76:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:110,27:.: 1.53:1.000:. ./.:4:61,31:.:-0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:74,31:.: 0.40:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:89,40:.: 1.25:1.000:. ./.:4:54,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:69,25:.: 0.02:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,35:.: 1.32:1.000:. ./.:4:81,30:.: 0.61:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:76,37:.: 0.68:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:89,18:.: 0.47:1.000:. ./.:4:56,22:.:-0.55:1.000:. ./.:4:81,29:.: 0.58:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:50,27:.:-0.58:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.54:0.998:. ./.:4:81,25:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:70,27:.: 0.12:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:91,26:.: 0.83:1.000:. ./.:4:126,24:.: 1.99:1.000:. ./.:4:66,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.40:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:105,25:.: 1.28:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:93,22:.: 0.76:1.000:. ./.:4:64,15:.:-0.51:1.000:. ./.:4:47,38:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:47,20:.:-0.93:1.000:. ./.:4:36,28:.:-1.04:0.775:. ./.:4:110,26:.: 1.49:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:56,28:.:-0.34:1.000:. ./.:4:100,26:.: 1.14:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:79,22:.: 0.26:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:72,39:.: 0.61:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:56,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.44:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:98,24:.: 1.00:1.000:. ./.:4:75,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:74,19:.:-0.02:1.000:. ./.:4:51,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.51:1.000:. ./.:4:82,26:.: 0.51:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:81,19:.: 0.23:1.000:. ./.:4:64,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.41:1.000:. ./.:4:57,32:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,25:.: 0.33:1.000:. ./.:4:40,17:.:-1.29:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:51,18:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:94,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:69,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:52,28:.:-0.48:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:91,26:.: 0.83:1.000:. -chr6.1 25534619 chr6.1_025534619 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:331,533:.:-0.34:1.000:. ./.:4:383,379:.:-0.78:1.000:. ./.:4:242,351:.:-1.51:1.000:. ./.:4:223,503:.:-0.94:1.000:. ./.:4:538,636:.: 1.00:1.000:. ./.:4:319,572:.:-0.22:1.000:. ./.:4:162,374:.:-1.76:1.000:. ./.:4:369,513:.:-0.26:1.000:. ./.:4:221,568:.:-0.67:1.000:. ./.:4:143,280:.:-2.25:1.000:. ./.:4:189,497:.:-1.11:1.000:. ./.:4:289,481:.:-0.75:1.000:. ./.:4:358,509:.:-0.33:1.000:. ./.:4:442,592:.: 0.39:1.000:. ./.:4:301,743:.: 0.44:1.000:. ./.:4:210,657:.:-0.33:1.000:. ./.:5:428,686:.: 0.74:0.983:. ./.:4:349,406:.:-0.81:1.000:. ./.:4:501,732:.: 1.25:1.000:. ./.:4:270,600:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:187,638:.:-0.51:1.000:. ./.:4:370,663:.: 0.39:1.000:. ./.:4:332,469:.:-0.61:1.000:. ./.:4:75,322:.:-2.36:1.000:. ./.:4:297,662:.: 0.07:1.000:. ./.:4:210,439:.:-1.27:1.000:. ./.:4:239,674:.:-0.13:1.000:. ./.:4:426,709:.: 0.83:1.000:. ./.:4:165,632:.:-0.63:1.000:. ./.:4:255,708:.: 0.09:1.000:. ./.:4:228,497:.:-0.94:1.000:. ./.:4:98,218:.:-2.71:1.000:. ./.:4:109,411:.:-1.83:1.000:. ./.:3:66,212:.:-2.87:1.000:. ./.:4:278,690:.: 0.11:1.000:. ./.:6:525,603:.: 0.80:0.999:. ./.:4:389,485:.:-0.30:1.000:. ./.:4:310,698:.: 0.28:1.000:. ./.:4:388,880:.: 1.41:1.000:. ./.:4:277,550:.:-0.50:1.000:. ./.:4:297,733:.: 0.38:1.000:. ./.:4:249,786:.: 0.40:1.000:. ./.:4:532,584:.: 0.75:1.000:. ./.:4:776,770:.: 2.61:1.000:. ./.:4:221,690:.:-0.14:1.000:. ./.:4:419,613:.: 0.39:0.999:. ./.:4:263,877:.: 0.85:1.000:. ./.:4:318,658:.: 0.14:1.000:. ./.:4:794,951:.: 3.47:1.000:. ./.:4:521,651:.: 0.99:1.000:. ./.:4:213,492:.:-1.03:1.000:. ./.:4:314,626:.:-0.01:1.000:. ./.:4:293,503:.:-0.63:1.000:. ./.:4:229,653:.:-0.26:1.000:. ./.:4:380,1112:.: 2.37:1.000:. ./.:4:438,661:.: 0.68:1.000:. ./.:4:430,793:.: 1.21:1.000:. ./.:4:346,743:.: 0.63:1.000:. ./.:6:350,632:.: 0.17:1.000:. ./.:4:470,762:.: 1.25:1.000:. ./.:4:356,687:.: 0.43:1.000:. ./.:4:434,706:.: 0.85:1.000:. ./.:4:349,618:.: 0.10:1.000:. ./.:4:548,712:.: 1.37:1.000:. ./.:4:373,630:.: 0.26:1.000:. ./.:4:166,455:.:-1.39:1.000:. ./.:4:416,694:.: 0.72:1.000:. ./.:4:425,553:.: 0.15:0.990:. ./.:4:331,504:.:-0.47:1.000:. ./.:4:351,694:.: 0.44:1.000:. ./.:4:220,509:.:-0.92:0.999:. ./.:4:495,541:.: 0.40:1.000:. ./.:4:328,738:.: 0.53:1.000:. ./.:4:569,673:.: 1.29:1.000:. ./.:4:337,649:.: 0.19:1.000:. ./.:4:307,508:.:-0.55:1.000:. ./.:4:477,524:.: 0.25:1.000:. ./.:4:199,743:.: 0.00:1.000:. ./.:4:302,568:.:-0.31:1.000:. ./.:4:486,476:.: 0.08:1.000:. ./.:4:421,828:.: 1.32:1.000:. ./.:4:354,1020:.: 1.86:1.000:. ./.:4:331,528:.:-0.36:1.000:. ./.:4:527,950:.: 2.31:1.000:. ./.:4:389,752:.: 0.86:1.000:. ./.:4:312,521:.:-0.47:1.000:. ./.:4:355,696:.: 0.47:1.000:. ./.:4:398,711:.: 0.72:1.000:. ./.:4:280,593:.:-0.30:1.000:. ./.:4:177,544:.:-0.96:1.000:. ./.:4:248,548:.:-0.63:1.000:. ./.:4:603,667:.: 1.41:1.000:. ./.:4:181,522:.:-1.04:1.000:. ./.:4:482,598:.: 0.59:1.000:. ./.:4:249,617:.:-0.33:1.000:. ./.:4:382,597:.: 0.16:1.000:. ./.:4:354,637:.: 0.21:1.000:. ./.:4:532,718:.: 1.33:1.000:. ./.:4:333,766:.: 0.68:1.000:. ./.:4:245,379:.:-1.38:1.000:. ./.:4:250,588:.:-0.45:1.000:. ./.:4:224,331:.:-1.68:1.000:. ./.:4:511,791:.: 1.55:1.000:. ./.:4:390,547:.:-0.03:0.998:. ./.:4:346,687:.: 0.39:1.000:. ./.:4:298,576:.:-0.30:1.000:. ./.:4:353,688:.: 0.42:1.000:. ./.:4:369,694:.: 0.52:1.000:. ./.:4:354,534:.:-0.24:1.000:. ./.:4:226,619:.:-0.42:1.000:. ./.:4:502,714:.: 1.18:1.000:. ./.:4:397,702:.: 0.68:1.000:. ./.:4:416,729:.: 0.87:1.000:. ./.:4:281,412:.:-1.08:1.000:. ./.:4:596,595:.: 1.07:1.000:. ./.:4:290,650:.:-0.01:1.000:. ./.:4:304,666:.: 0.12:1.000:. ./.:4:391,622:.: 0.30:1.000:. ./.:4:417,534:.: 0.04:1.000:. ./.:4:350,593:.: 0.00:1.000:. ./.:4:220,676:.:-0.20:1.000:. ./.:4:389,600:.: 0.20:1.000:. ./.:4:306,389:.:-1.07:1.000:. ./.:4:281,482:.:-0.78:1.000:. ./.:4:468,826:.: 1.52:1.000:. ./.:4:283,629:.:-0.13:1.000:. ./.:4:314,608:.:-0.09:1.000:. ./.:4:168,451:.:-1.40:1.000:. ./.:4:365,498:.:-0.35:1.000:. ./.:4:512,595:.: 0.71:1.000:. ./.:4:286,455:.:-0.87:1.000:. ./.:4:198,383:.:-1.56:0.775:. ./.:4:438,584:.: 0.34:1.000:. ./.:4:297,647:.: 0.01:1.000:. ./.:4:444,885:.: 1.67:1.000:. ./.:4:511,716:.: 1.23:1.000:. ./.:4:347,488:.:-0.47:1.000:. ./.:4:385,581:.: 0.10:1.000:. ./.:4:421,650:.: 0.55:1.000:. ./.:4:564,843:.: 2.01:1.000:. ./.:4:381,791:.: 0.99:1.000:. ./.:4:268,659:.:-0.07:1.000:. ./.:4:239,622:.:-0.35:1.000:. ./.:4:330,698:.: 0.37:1.000:. ./.:4:592,936:.: 2.53:1.000:. ./.:4:434,606:.: 0.42:1.000:. ./.:4:272,649:.:-0.09:1.000:. ./.:4:426,799:.: 1.22:1.000:. ./.:4:280,440:.:-0.96:1.000:. ./.:4:415,664:.: 0.59:1.000:. ./.:4:283,766:.: 0.46:1.000:. ./.:4:104,337:.:-2.17:1.000:. ./.:4:173,452:.:-1.37:1.000:. ./.:4:444,718:.: 0.95:1.000:. ./.:4:352,666:.: 0.32:1.000:. ./.:4:290,649:.:-0.02:1.000:. ./.:4:334,552:.:-0.25:1.000:. ./.:4:287,524:.:-0.57:1.000:. ./.:4:286,663:.: 0.03:1.000:. ./.:4:174,469:.:-1.30:1.000:. ./.:4:326,583:.:-0.15:1.000:. ./.:4:223,603:.:-0.51:1.000:. ./.:4:305,589:.:-0.21:1.000:. ./.:4:412,657:.: 0.55:1.000:. ./.:4:178,409:.:-1.54:1.000:. ./.:4:243,493:.:-0.89:1.000:. ./.:4:381,468:.:-0.41:1.000:. ./.:4:353,615:.: 0.11:1.000:. ./.:4:174,573:.:-0.85:1.000:. ./.:4:197,545:.:-0.87:1.000:. ./.:4:245,398:.:-1.30:1.000:. ./.:4:363,501:.:-0.34:1.000:. ./.:4:337,466:.:-0.60:1.000:. ./.:4:295,406:.:-1.05:1.000:. ./.:4:296,533:.:-0.49:1.000:. ./.:4:184,535:.:-0.97:1.000:. ./.:4:404,638:.: 0.43:1.000:. ./.:4:438,689:.: 0.80:1.000:. ./.:4:250,580:.:-0.49:1.000:. ./.:4:476,577:.: 0.48:1.000:. ./.:4:548,779:.: 1.66:1.000:. ./.:4:204,573:.:-0.72:1.000:. ./.:4:219,600:.:-0.54:1.000:. ./.:4:389,560:.: 0.03:1.000:. -chr6.1 25687233 chr6.1_025687233 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:176,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:55,9:.:-2.32:1.000:. ./.:4:41,8:.:-2.71:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:96,40:.:-0.43:1.000:. ./.:4:103,42:.:-0.20:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.54:1.000:. ./.:5:189,37:.: 1.92:0.983:. ./.:4:226,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:217,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:195,48:.: 2.36:1.000:. ./.:4:60,9:.:-2.18:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,8:.:-2.81:1.000:. ./.:4:163,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:107,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:103,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:151,66:.: 1.68:1.000:. ./.:4:182,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:154,36:.: 0.98:1.000:. ./.:4:116,37:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,5:.:-3.23:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.37:1.000:. ./.:3:21,11:.:-3.15:1.000:. ./.:4:102,30:.:-0.54:1.000:. ./.:6:136,37:.: 0.53:0.999:. ./.:4:118,37:.: 0.06:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:128,41:.: 0.43:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:123,36:.: 0.17:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:109,44:.: 0.01:1.000:. ./.:4:124,38:.: 0.24:0.999:. ./.:4:11,0:.:-3.70:1.000:. ./.:4:103,34:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,12:.:-1.92:1.000:. ./.:4:112,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,46:.: 0.85:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:106,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:99,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:137,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:107,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:126,29:.: 0.06:1.000:. ./.:4:117,43:.: 0.19:1.000:. ./.:4:152,47:.: 1.21:0.990:. ./.:4:130,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:49,44:.:-1.56:0.999:. ./.:4:211,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:143,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:104,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:140,51:.: 1.00:1.000:. ./.:4:136,35:.: 0.48:1.000:. ./.:4:148,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:135,45:.: 0.71:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:143,39:.: 0.77:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:95,31:.:-0.70:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:160,43:.: 1.32:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:118,30:.:-0.12:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:153,33:.: 0.87:0.998:. ./.:4:169,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:138,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:136,65:.: 1.26:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:142,31:.: 0.53:1.000:. ./.:4:161,58:.: 1.73:1.000:. ./.:4:129,42:.: 0.48:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:51,17:.:-2.21:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:106,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:126,51:.: 0.64:1.000:. ./.:4:121,38:.: 0.17:1.000:. ./.:4:125,43:.: 0.40:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:90,36:.:-0.70:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.19:0.775:. ./.:4:93,31:.:-0.75:1.000:. ./.:4:100,30:.:-0.59:1.000:. ./.:4:128,40:.: 0.40:1.000:. ./.:4:130,40:.: 0.45:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:123,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:100,42:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:140,49:.: 0.95:1.000:. ./.:4:123,52:.: 0.58:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:94,44:.:-0.38:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:92,45:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:122,39:.: 0.22:1.000:. ./.:4:125,44:.: 0.43:1.000:. ./.:4:122,42:.: 0.30:1.000:. ./.:4:164,54:.: 1.71:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:102,38:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,45:.: 0.22:1.000:. ./.:4:100,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:116,41:.: 0.11:1.000:. ./.:4:60,16:.:-2.00:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,31:.:-0.57:1.000:. ./.:4:141,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:106,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:101,45:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,44:.:-0.36:1.000:. ./.:4:95,33:.:-0.64:1.000:. ./.:4:113,39:.:-0.02:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:112,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:114,42:.: 0.09:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:114,63:.: 0.64:1.000:. ./.:4:115,46:.: 0.22:1.000:. ./.:4:120,37:.: 0.11:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:134,40:.: 0.56:1.000:. ./.:4:139,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.25:1.000:. -chr6.1 25863000 chr6.1_025863000 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:308,93:.:-0.17:1.000:. ./.:4:85,230:.:-0.99:1.000:. ./.:4:211,82:.:-1.20:1.000:. ./.:4:169,164:.:-0.82:1.000:. ./.:4:231,202:.: 0.13:1.000:. ./.:4:163,197:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,111:.:-1.93:1.000:. ./.:4:166,168:.:-0.81:1.000:. ./.:4:202,77:.:-1.33:1.000:. ./.:4:157,181:.:-0.77:1.000:. ./.:4:170,68:.:-1.72:1.000:. ./.:4:186,174:.:-0.56:1.000:. ./.:4:360,84:.: 0.23:1.000:. ./.:4:314,217:.: 1.06:1.000:. ./.:4:160,127:.:-1.25:1.000:. ./.:4:270,79:.:-0.67:1.000:. ./.:5:375,184:.: 1.32:0.983:. ./.:4:165,238:.:-0.15:1.000:. ./.:4:337,93:.: 0.10:1.000:. ./.:4:388,94:.: 0.59:1.000:. ./.:4:160,47:.:-2.01:1.000:. ./.:4:242,93:.:-0.80:1.000:. ./.:4:295,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:185,142:.:-0.87:1.000:. ./.:4:97,90:.:-2.20:1.000:. ./.:4:152,125:.:-1.35:1.000:. ./.:4:323,71:.:-0.24:1.000:. ./.:4:259,151:.:-0.09:1.000:. ./.:4:280,204:.: 0.61:1.000:. ./.:4:236,58:.:-1.19:1.000:. ./.:4:256,56:.:-1.02:1.000:. ./.:4:272,69:.:-0.74:1.000:. ./.:4:50,34:.:-3.17:1.000:. ./.:4:213,65:.:-1.34:1.000:. ./.:3:57,70:.:-2.77:1.000:. ./.:4:353,78:.: 0.11:1.000:. ./.:4:346,84:.: 0.10:1.000:. ./.:4:294,186:.: 0.57:1.000:. ./.:4:325,110:.: 0.15:1.000:. ./.:4:177,138:.:-0.99:1.000:. ./.:4:319,97:.:-0.03:1.000:. ./.:4:415,101:.: 0.91:1.000:. ./.:4:269,115:.:-0.33:1.000:. ./.:4:365,101:.: 0.44:1.000:. ./.:4:283,290:.: 1.45:1.000:. ./.:4:282,179:.: 0.39:1.000:. ./.:4:332,215:.: 1.21:0.999:. ./.:4:226,43:.:-1.42:1.000:. ./.:4:255,166:.: 0.02:1.000:. ./.:4:461,114:.: 1.47:1.000:. ./.:4:336,243:.: 1.51:1.000:. ./.:4:294,190:.: 0.61:1.000:. ./.:4:267,98:.:-0.51:1.000:. ./.:4:308,103:.:-0.08:1.000:. ./.:4:156,181:.:-0.78:1.000:. ./.:4:309,223:.: 1.07:1.000:. ./.:4:352,81:.: 0.13:1.000:. ./.:4:246,246:.: 0.69:1.000:. ./.:4:264,92:.:-0.60:1.000:. ./.:6:316,115:.: 0.11:1.000:. ./.:4:317,126:.: 0.22:1.000:. ./.:4:152,165:.:-0.97:1.000:. ./.:4:469,121:.: 1.62:1.000:. ./.:4:220,248:.: 0.46:1.000:. ./.:4:291,81:.:-0.45:1.000:. ./.:4:281,172:.: 0.32:1.000:. ./.:4:255,144:.:-0.19:1.000:. ./.:4:385,92:.: 0.55:1.000:. ./.:4:446,88:.: 1.09:0.990:. ./.:4:84,262:.:-0.69:1.000:. ./.:4:292,241:.: 1.08:1.000:. ./.:4:471,83:.: 1.27:0.999:. ./.:4:93,339:.: 0.12:1.000:. ./.:4:255,107:.:-0.54:1.000:. ./.:4:105,306:.:-0.08:1.000:. ./.:4:168,169:.:-0.78:1.000:. ./.:4:306,87:.:-0.25:1.000:. ./.:4:502,132:.: 2.03:1.000:. ./.:4:309,234:.: 1.17:1.000:. ./.:4:482,119:.: 1.72:1.000:. ./.:4:79,237:.:-0.98:1.000:. ./.:4:362,230:.: 1.63:1.000:. ./.:4:243,230:.: 0.51:1.000:. ./.:4:233,74:.:-1.06:1.000:. ./.:4:307,97:.:-0.15:1.000:. ./.:4:500,128:.: 1.98:1.000:. ./.:4:171,140:.:-1.03:1.000:. ./.:4:203,229:.: 0.12:1.000:. ./.:4:327,113:.: 0.20:1.000:. ./.:4:267,92:.:-0.57:1.000:. ./.:4:333,104:.: 0.17:1.000:. ./.:4:376,90:.: 0.44:1.000:. ./.:4:245,247:.: 0.69:1.000:. ./.:4:114,132:.:-1.64:1.000:. ./.:4:361,196:.: 1.30:1.000:. ./.:4:197,210:.:-0.12:1.000:. ./.:4:341,123:.: 0.42:1.000:. ./.:4:89,262:.:-0.65:1.000:. ./.:4:443,291:.: 2.98:1.000:. ./.:4:150,187:.:-0.78:1.000:. ./.:4:295,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:222,234:.: 0.35:1.000:. ./.:4:179,201:.:-0.37:1.000:. ./.:4:257,262:.: 0.94:1.000:. ./.:4:563,111:.: 2.41:0.998:. ./.:4:157,160:.:-0.97:1.000:. ./.:4:205,231:.: 0.16:1.000:. ./.:4:290,102:.:-0.26:1.000:. ./.:4:354,223:.: 1.49:1.000:. ./.:4:270,96:.:-0.51:1.000:. ./.:4:397,108:.: 0.81:1.000:. ./.:4:328,210:.: 1.12:1.000:. ./.:4:461,132:.: 1.64:1.000:. ./.:4:232,209:.: 0.20:1.000:. ./.:4:313,158:.: 0.49:1.000:. ./.:4:360,117:.: 0.55:1.000:. ./.:4:454,91:.: 1.19:1.000:. ./.:4:210,183:.:-0.25:1.000:. ./.:4:391,113:.: 0.80:1.000:. ./.:4:317,87:.:-0.15:1.000:. ./.:4:194,199:.:-0.25:1.000:. ./.:4:444,102:.: 1.20:1.000:. ./.:4:299,196:.: 0.72:1.000:. ./.:4:344,84:.: 0.08:1.000:. ./.:4:273,110:.:-0.34:1.000:. ./.:4:324,102:.: 0.06:1.000:. ./.:4:321,143:.: 0.42:1.000:. ./.:4:77,278:.:-0.61:1.000:. ./.:4:268,97:.:-0.51:1.000:. ./.:4:255,83:.:-0.77:1.000:. ./.:4:427,92:.: 0.94:1.000:. ./.:4:154,152:.:-1.07:1.000:. ./.:4:167,156:.:-0.91:0.775:. ./.:4:543,155:.: 2.64:1.000:. ./.:4:385,98:.: 0.60:1.000:. ./.:4:377,248:.: 1.95:1.000:. ./.:4:354,105:.: 0.38:1.000:. ./.:4:370,115:.: 0.62:1.000:. ./.:4:282,95:.:-0.40:1.000:. ./.:4:282,108:.:-0.28:1.000:. ./.:4:479,111:.: 1.62:1.000:. ./.:4:399,260:.: 2.27:1.000:. ./.:4:355,84:.: 0.19:1.000:. ./.:4:315,92:.:-0.12:1.000:. ./.:4:243,227:.: 0.48:1.000:. ./.:4:419,106:.: 1.00:1.000:. ./.:4:307,201:.: 0.84:1.000:. ./.:4:163,169:.:-0.83:1.000:. ./.:4:270,91:.:-0.55:1.000:. ./.:4:361,77:.: 0.18:1.000:. ./.:4:296,103:.:-0.19:1.000:. ./.:4:236,144:.:-0.37:1.000:. ./.:4:146,62:.:-2.00:1.000:. ./.:4:170,59:.:-1.80:1.000:. ./.:4:389,105:.: 0.71:1.000:. ./.:4:307,187:.: 0.71:1.000:. ./.:4:334,209:.: 1.17:1.000:. ./.:4:308,195:.: 0.79:1.000:. ./.:4:154,143:.:-1.16:1.000:. ./.:4:257,160:.:-0.02:1.000:. ./.:4:259,147:.:-0.13:1.000:. ./.:4:214,129:.:-0.72:1.000:. ./.:4:203,64:.:-1.44:1.000:. ./.:4:214,160:.:-0.43:1.000:. ./.:4:271,150:.: 0.02:1.000:. ./.:4:147,177:.:-0.90:1.000:. ./.:4:249,166:.:-0.04:1.000:. ./.:4:92,299:.:-0.27:1.000:. ./.:4:249,176:.: 0.05:1.000:. ./.:4:209,148:.:-0.59:1.000:. ./.:4:295,85:.:-0.37:1.000:. ./.:4:302,55:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,174:.: 0.04:1.000:. ./.:4:163,167:.:-0.85:1.000:. ./.:4:220,131:.:-0.65:1.000:. ./.:4:302,75:.:-0.40:1.000:. ./.:4:295,87:.:-0.35:1.000:. ./.:4:443,112:.: 1.28:1.000:. ./.:4:363,88:.: 0.30:1.000:. ./.:4:308,121:.: 0.09:1.000:. ./.:4:167,205:.:-0.45:1.000:. ./.:4:230,208:.: 0.18:1.000:. ./.:4:338,209:.: 1.21:1.000:. ./.:4:224,75:.:-1.14:1.000:. ./.:4:71,255:.:-0.88:1.000:. -chr6.1 26237200 chr6.1_026237200 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./.:5:5,0:.: 0.47:0.983:. ./.:4:4,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:2,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,2:.: 2.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:6:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:7,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:5,2:.: 1.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:3,3:.: 0.94:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:9,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.: 4.22:1.000:. ./.:4:4,3:.: 1.41:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:0.998:. ./.:4:3,3:.: 0.94:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:4,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.00:0.775:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:6,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:2,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:7,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:10,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:3,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:6,2:.: 1.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:6,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:6,1:.: 1.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,2:.: 1.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.47:1.000:. -chr6.1 27111942 chr6.1_027111942 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:156,53:.: 1.02:1.000:. ./.:4:128,52:.: 0.50:1.000:. ./.:4:117,28:.:-0.12:1.000:. ./.:4:184,28:.: 1.07:1.000:. ./.:4:131,72:.: 0.91:1.000:. ./.:4:163,82:.: 1.66:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:133,33:.: 0.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:32,5:.:-2.04:1.000:. ./.:4:154,21:.: 0.41:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:175,35:.: 1.04:1.000:. ./.:4:140,72:.: 1.07:1.000:. ./.:4:148,77:.: 1.30:1.000:. ./.:5:177,93:.: 2.10:0.983:. ./.:4:95,92:.: 0.63:1.000:. ./.:4:152,41:.: 0.73:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,2:.:-2.27:1.000:. ./.:4:130,28:.: 0.11:1.000:. ./.:4:110,24:.:-0.31:1.000:. ./.:4:96,60:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,2:.:-2.31:1.000:. ./.:4:186,36:.: 1.25:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:180,34:.: 1.11:1.000:. ./.:4:166,37:.: 0.91:1.000:. ./.:4:165,39:.: 0.93:1.000:. ./.:4:177,48:.: 1.30:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:22,8:.:-2.16:1.000:. ./.:4:33,16:.:-1.83:1.000:. ./.:3:3,3:.:-2.59:1.000:. ./.:4:207,33:.: 1.57:1.000:. ./.:4:143,41:.: 0.57:1.000:. ./.:4:211,30:.: 1.59:1.000:. ./.:4:109,57:.: 0.25:1.000:. ./.:4:114,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:109,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:92,31:.:-0.51:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:91,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:191,33:.: 1.29:0.999:. ./.:4:419,62:.: 5.85:1.000:. ./.:4:97,26:.:-0.51:1.000:. ./.:4:121,45:.: 0.25:1.000:. ./.:4:92,15:.:-0.79:1.000:. ./.:4:160,35:.: 0.77:1.000:. ./.:4:85,51:.:-0.28:1.000:. ./.:4:110,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:129,31:.: 0.15:1.000:. ./.:4:154,30:.: 0.57:1.000:. ./.:4:110,30:.:-0.21:1.000:. ./.:4:100,16:.:-0.63:1.000:. ./.:4:110,34:.:-0.14:1.000:. ./.:6:68,13:.:-1.26:1.000:. ./.:4:77,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:133,19:.: 0.01:1.000:. ./.:4:127,23:.:-0.03:1.000:. ./.:4:86,35:.:-0.55:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:101,45:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,11:.:-1.56:1.000:. ./.:4:141,27:.: 0.29:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.23:0.990:. ./.:4:150,36:.: 0.61:1.000:. ./.:4:92,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.43:0.999:. ./.:4:160,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:153,22:.: 0.41:1.000:. ./.:4:123,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,27:.: 0.08:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:91,39:.:-0.39:1.000:. ./.:4:117,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,15:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,30:.: 0.01:1.000:. ./.:4:97,24:.:-0.55:1.000:. ./.:4:84,19:.:-0.87:1.000:. ./.:4:145,34:.: 0.49:1.000:. ./.:4:95,26:.:-0.55:1.000:. ./.:4:82,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:110,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,30:.:-1.10:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:89,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:97,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:105,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,30:.:-0.37:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:106,26:.:-0.35:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:103,53:.: 0.08:1.000:. ./.:4:66,16:.:-1.24:1.000:. ./.:4:100,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:71,34:.:-0.83:1.000:. ./.:4:101,18:.:-0.58:1.000:. ./.:4:140,11:.:-0.01:0.998:. ./.:4:100,32:.:-0.35:1.000:. ./.:4:69,21:.:-1.10:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:171,36:.: 0.98:1.000:. ./.:4:109,31:.:-0.21:1.000:. ./.:4:76,18:.:-1.03:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:115,22:.:-0.26:1.000:. ./.:4:123,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:112,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:77,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:89,11:.:-0.92:1.000:. ./.:4:98,31:.:-0.40:1.000:. ./.:4:94,14:.:-0.78:1.000:. ./.:4:106,52:.: 0.11:1.000:. ./.:4:207,42:.: 1.73:1.000:. ./.:4:91,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:123,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:111,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,15:.:-1.35:1.000:. ./.:4:61,36:.:-0.97:1.000:. ./.:4:94,24:.:-0.60:1.000:. ./.:4:111,78:.: 0.66:1.000:. ./.:4:57,40:.:-0.97:0.775:. ./.:4:127,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:215,45:.: 1.93:1.000:. ./.:4:102,33:.:-0.30:1.000:. ./.:4:87,34:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,13:.:-1.36:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:109,18:.:-0.44:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,20:.:-1.29:1.000:. ./.:4:177,39:.: 1.14:1.000:. ./.:4:189,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:201,29:.: 1.39:1.000:. ./.:4:116,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:129,31:.: 0.15:1.000:. ./.:4:147,40:.: 0.63:1.000:. ./.:4:189,39:.: 1.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:88,48:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:165,31:.: 0.79:1.000:. ./.:4:128,74:.: 0.89:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:113,66:.: 0.49:1.000:. ./.:4:171,21:.: 0.72:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:130,28:.: 0.11:1.000:. ./.:4:103,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:274,49:.: 3.05:1.000:. ./.:4:138,60:.: 0.82:1.000:. ./.:4:96,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:123,71:.: 0.75:1.000:. ./.:4:139,31:.: 0.33:1.000:. ./.:4:91,55:.:-0.10:1.000:. ./.:4:145,34:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,41:.: 0.34:1.000:. ./.:4:121,28:.:-0.05:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:220,45:.: 2.01:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:134,61:.: 0.77:1.000:. ./.:4:158,39:.: 0.81:1.000:. ./.:4:150,78:.: 1.36:1.000:. ./.:4:112,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:163,33:.: 0.79:1.000:. -chr6.1 28604209 chr6.1_028604209 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:103,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:148,0:.: 1.86:0.983:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.76:1.000:. ./.:3:10,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.43:0.999:. ./.:4:73,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:6:74,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:127,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.01:0.990:. ./.:4:77,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.25:0.999:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.39:0.998:. ./.:4:113,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.88:0.775:. ./.:4:59,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:171,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.20:1.000:. -chr6.1 29191689 chr6.1_029191689 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:5:1,0:.:-0.73:0.983:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 2.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,1:.: 2.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:0.990:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:3,0:.: 2.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,2:.: 2.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr6.1 30140972 chr6.1_030140972 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,4:0.38:-1.55:1.000:0.558 0/1/1/1:4:7,31:0.79:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,32:0.72:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,6:0.45:-1.46:1.000:0.981 0/0/0/1:4:6,2:0.33:-1.78:1.000:0.904 0/0/1/1:4:12,7:0.43:-1.27:1.000:0.938 0/0/1/1:4:41,45:0.55: 1.80:1.000:0.981 0/0/1/1:4:21,32:0.61: 0.29:1.000:0.664 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,34:0.73:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1/1:5:39,47:0.57: 1.80:0.983:0.934 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,46:0.73: 0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,49:0.51: 2.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,41:0.80: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.53:-1.78:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,52:0.59: 2.03:1.000:0.882 0/1/1/1:4:27,45:0.63: 1.16:1.000:0.553 0/0/1/1:4:54,43:0.49: 2.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,57:0.82: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,8:0.31:-0.49:1.000:0.970 0/0/1/1:4:27,27:0.53: 0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,6:0.84:-1.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,3:0.61:-1.92:1.000:0.698 0/0/0:3:5,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,30:0.46: 1.25:1.000:0.985 0/0/1/1:4:34,32:0.52: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,14:0.38:-0.03:1.000:0.523 0/1/1/1:4:10,18:0.64:-0.86:1.000:0.726 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,31:0.67:-0.03:1.000:0.912 0/0/1/1:4:46,36:0.48: 1.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,24:0.66:-0.49:1.000:0.882 0/0/1/1:4:31,22:0.46: 0.29:1.000:0.989 0/1/1/1:4:8,45:0.83: 0.29:1.000:0.998 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,29:0.39: 1.94:0.999:0.728 0/0/1/1:4:11,10:0.51:-1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,8:0.44:-1.18:1.000:0.961 0/0/0/1:4:26,4:0.23:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,17:0.44:-0.13:1.000:0.969 0/0/1/1:4:34,38:0.55: 1.16:1.000:0.977 0/1/1/1:4:10,30:0.73:-0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,42:0.80: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,46:0.89: 0.19:1.000:0.506 0/0/1/1/1/1:6:7,19:0.71:-0.95:1.000:0.811 0/0/1/1:4:7,6:0.50:-1.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,49:0.79: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,27:0.41: 1.39:1.000:0.880 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,29:0.71:-0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,11:0.46:-0.91:1.000:0.986 0/0/1/1:4:20,9:0.38:-0.81:1.000:0.585 0/0/1/1:4:36,26:0.47: 0.70:1.000:0.991 0/0/1/1:4:40,33:0.49: 1.20:0.990:0.996 0/1/1/1:4:12,24:0.66:-0.49:1.000:0.882 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,6:0.26:-0.40:0.999:0.999 0/1/1/1:4:10,17:0.63:-0.91:1.000:0.601 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.53:-0.59:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,33:0.47: 1.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:27,8:0.32:-0.54:1.000:0.961 0/0/1/1:4:29,40:0.59: 1.02:1.000:0.842 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,8:0.29:-0.22:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,33:0.67: 0.10:1.000:0.910 1/1/1/1:4:3,29:0.89:-0.68:1.000:0.657 0/0/0/1:4:39,7:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,40:0.78: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,31:0.82:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,20:0.63:-0.68:1.000:0.553 0/1/1/1:4:8,48:0.84: 0.42:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,48:1.00: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,43:0.93:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,38:0.71: 0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,4:0.40:-1.59:1.000:0.784 0/0/0/1:4:59,22:0.35: 1.57:1.000:0.785 0/1/1/1:4:12,46:0.77: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.45:-1.69:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,50:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,23:0.63:-0.45:0.998:0.517 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,28:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,42:0.78: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,56:0.61: 2.17:1.000:0.733 0/1/1/1:4:11,32:0.72:-0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,40:0.79: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,55:0.57: 2.40:1.000:0.934 0/0/1/1:4:38,36:0.52: 1.25:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,22:0.56:-0.26:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,37:0.52: 1.39:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,33:0.83:-0.36:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,5:0.16: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:36,7:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,41:0.48: 2.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,34:0.68: 0.10:1.000:0.962 0/1/1/1:4:5,34:0.86:-0.36:1.000:0.978 0/1/1/1:4:11,41:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,34:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,34:0.79:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,6:0.22: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.00:0.775:1.000 0/0/1/1:4:36,37:0.54: 1.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:45,33:0.47: 1.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,22:0.44: 0.47:1.000:0.968 0/0/0/1:4:39,8:0.27: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,25:0.64:-0.36:1.000:0.710 0/1/1/1:4:8,21:0.71:-0.81:1.000:0.991 0/1/1/1:4:12,42:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,27:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,5:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,32:0.46: 1.39:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,40:0.45: 2.53:1.000:0.975 0/0/1/1:4:37,35:0.52: 1.16:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,67:0.81: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,7:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,39:0.68: 0.47:1.000:0.942 0/0/1/1:4:30,28:0.52: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,9:0.51:-1.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,23:0.70:-0.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:49,42:0.50: 2.03:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,25:0.96:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,45:0.59: 1.43:1.000:0.856 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,35:0.55: 0.93:1.000:0.982 0/0/1/1:4:37,40:0.55: 1.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:27,32:0.56: 0.56:1.000:0.960 0/1/1/1:4:10,37:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,6:0.26:-0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,24:0.58:-0.17:1.000:0.928 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,10:0.38:-0.63:1.000:0.509 0/1/1/1:4:7,24:0.75:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,26:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,16:0.43:-0.17:1.000:0.946 0/1/1/1:4:18,39:0.68: 0.47:1.000:0.942 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.29:-0.03:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,27:0.58: 0.06:1.000:0.915 0/0/1/1:4:32,26:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,72:0.84: 1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,41:0.50: 1.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,46:0.51: 2.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,35:0.52: 1.16:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,16:0.39: 0.10:1.000:0.734 0/1/1/1:4:10,20:0.66:-0.77:1.000:0.882 0/1/1/1:4:12,21:0.64:-0.63:1.000:0.667 -chr6.1 30579415 chr6.1_030579415 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:141,124:.: 1.16:1.000:. ./.:4:81,91:.:-0.97:1.000:. ./.:4:164,58:.: 0.18:1.000:. ./.:4:182,69:.: 0.84:1.000:. ./.:4:142,151:.: 1.80:1.000:. ./.:4:136,128:.: 1.14:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:177,56:.: 0.43:1.000:. ./.:4:128,1:.:-1.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:163,94:.: 0.98:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:133,69:.:-0.28:1.000:. ./.:4:117,118:.: 0.47:1.000:. ./.:4:107,137:.: 0.68:1.000:. ./.:5:158,118:.: 1.41:0.983:. ./.:4:169,65:.: 0.45:1.000:. ./.:4:196,66:.: 1.09:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:115,30:.:-1.58:1.000:. ./.:4:170,52:.: 0.18:1.000:. ./.:4:195,63:.: 1.00:1.000:. ./.:4:105,127:.: 0.41:1.000:. ./.:4:95,20:.:-2.27:1.000:. ./.:4:125,52:.:-0.85:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:162,62:.: 0.22:1.000:. ./.:4:241,82:.: 2.49:1.000:. ./.:4:167,51:.: 0.09:1.000:. ./.:4:125,60:.:-0.67:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:41,19:.:-3.53:1.000:. ./.:4:89,85:.:-0.92:1.000:. ./.:3:24,37:.:-3.50:1.000:. ./.:4:167,51:.: 0.09:1.000:. ./.:4:188,64:.: 0.86:1.000:. ./.:4:184,62:.: 0.73:1.000:. ./.:4:84,124:.:-0.14:1.000:. ./.:4:89,113:.:-0.28:1.000:. ./.:4:160,71:.: 0.38:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:133,44:.:-0.85:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:116,122:.: 0.54:1.000:. ./.:4:211,64:.: 1.39:0.999:. ./.:4:192,70:.: 1.09:1.000:. ./.:4:102,34:.:-1.79:1.000:. ./.:4:93,38:.:-1.90:1.000:. ./.:4:169,59:.: 0.31:1.000:. ./.:4:176,62:.: 0.54:1.000:. ./.:4:112,133:.: 0.70:1.000:. ./.:4:170,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:177,61:.: 0.54:1.000:. ./.:4:120,48:.:-1.06:1.000:. ./.:4:143,42:.:-0.67:1.000:. ./.:4:146,45:.:-0.53:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.10:1.000:. ./.:6:182,47:.: 0.34:1.000:. ./.:4:185,65:.: 0.82:1.000:. ./.:4:150,51:.:-0.30:1.000:. ./.:4:175,77:.: 0.86:1.000:. ./.:4:98,93:.:-0.53:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:93,105:.:-0.37:1.000:. ./.:4:122,48:.:-1.01:1.000:. ./.:4:166,58:.: 0.22:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.70:0.990:. ./.:4:165,61:.: 0.27:1.000:. ./.:4:115,128:.: 0.66:1.000:. ./.:4:125,0:.:-2.04:0.999:. ./.:4:206,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:154,65:.: 0.11:1.000:. ./.:4:128,79:.:-0.17:1.000:. ./.:4:153,55:.:-0.14:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:114,127:.: 0.61:1.000:. ./.:4:155,66:.: 0.15:1.000:. ./.:4:158,48:.:-0.19:1.000:. ./.:4:133,47:.:-0.78:1.000:. ./.:4:201,63:.: 1.14:1.000:. ./.:4:151,66:.: 0.06:1.000:. ./.:4:127,48:.:-0.90:1.000:. ./.:4:159,67:.: 0.27:1.000:. ./.:4:128,51:.:-0.81:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:108,128:.: 0.50:1.000:. ./.:4:122,107:.: 0.34:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:102,95:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,86:.:-0.94:1.000:. ./.:4:99,128:.: 0.29:1.000:. ./.:4:128,46:.:-0.92:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:110,130:.: 0.59:1.000:. ./.:4:102,149:.: 0.84:1.000:. ./.:4:129,124:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,91:.:-0.58:1.000:. ./.:4:168,76:.: 0.68:1.000:. ./.:4:159,50:.:-0.12:0.998:. ./.:4:153,55:.:-0.14:1.000:. ./.:4:139,51:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:214,82:.: 1.87:1.000:. ./.:4:143,66:.:-0.12:1.000:. ./.:4:102,43:.:-1.58:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:149,54:.:-0.26:1.000:. ./.:4:114,35:.:-1.49:1.000:. ./.:4:127,118:.: 0.70:1.000:. ./.:4:190,2:.:-0.51:1.000:. ./.:4:117,57:.:-0.92:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:126,54:.:-0.78:1.000:. ./.:4:167,54:.: 0.15:1.000:. ./.:4:152,56:.:-0.14:1.000:. ./.:4:121,128:.: 0.79:1.000:. ./.:4:211,80:.: 1.75:1.000:. ./.:4:102,120:.: 0.18:1.000:. ./.:4:191,67:.: 1.00:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:130,39:.:-1.03:1.000:. ./.:4:122,45:.:-1.08:1.000:. ./.:4:83,105:.:-0.60:1.000:. ./.:4:177,58:.: 0.47:1.000:. ./.:4:119,125:.: 0.68:1.000:. ./.:4:78,71:.:-1.49:0.775:. ./.:4:230,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:196,68:.: 1.14:1.000:. ./.:4:149,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,120:.: 0.20:1.000:. ./.:4:150,69:.: 0.11:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:155,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:112,54:.:-1.10:1.000:. ./.:4:162,68:.: 0.36:1.000:. ./.:4:324,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:177,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:112,123:.: 0.47:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:166,42:.:-0.14:1.000:. ./.:4:242,62:.: 2.05:1.000:. ./.:4:156,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:137,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:98,123:.: 0.15:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:124,150:.: 1.37:1.000:. ./.:4:137,155:.: 1.78:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,132:.: 0.68:1.000:. ./.:4:182,64:.: 0.73:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:155,60:.: 0.02:1.000:. ./.:4:146,53:.:-0.35:1.000:. ./.:4:103,40:.:-1.63:1.000:. ./.:4:101,120:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,44:.:-1.33:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:135,94:.: 0.34:1.000:. ./.:4:174,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:79,95:.:-0.92:1.000:. ./.:4:145,56:.:-0.30:1.000:. ./.:4:107,109:.: 0.04:1.000:. ./.:4:105,39:.:-1.61:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:160,67:.: 0.29:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:231,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:128,151:.: 1.48:1.000:. ./.:4:230,75:.: 2.07:1.000:. ./.:4:161,144:.: 2.07:1.000:. ./.:4:101,103:.:-0.23:1.000:. ./.:4:182,67:.: 0.79:1.000:. -chr6.1 30804913 chr6.1_030804913 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:388,11:.: 1.50:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:195,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:262,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:315,10:.: 0.68:1.000:. ./.:4:321,8:.: 0.72:1.000:. ./.:4:265,13:.: 0.15:1.000:. ./.:4:241,7:.:-0.18:1.000:. ./.:4:286,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:70,11:.:-2.04:1.000:. ./.:4:134,2:.:-1.43:1.000:. ./.:4:473,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:226,8:.:-0.34:1.000:. ./.:4:245,22:.: 0.03:1.000:. ./.:4:259,3:.:-0.02:1.000:. ./.:4:396,9:.: 1.57:1.000:. ./.:5:383,14:.: 1.48:0.983:. ./.:4:334,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:369,12:.: 1.30:1.000:. ./.:4:167,25:.:-0.81:1.000:. ./.:4:150,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:250,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:302,11:.: 0.54:1.000:. ./.:4:247,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:36,8:.:-2.46:1.000:. ./.:4:258,7:.: 0.01:1.000:. ./.:4:249,9:.:-0.07:1.000:. ./.:4:213,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:175,16:.:-0.82:1.000:. ./.:4:403,7:.: 1.63:1.000:. ./.:4:422,7:.: 1.84:1.000:. ./.:4:187,11:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,9:.:-2.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:61,4:.:-2.22:1.000:. ./.:4:258,19:.: 0.14:1.000:. ./.:4:244,15:.:-0.06:1.000:. ./.:4:273,9:.: 0.20:1.000:. ./.:4:291,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:451,7:.: 2.16:1.000:. ./.:4:291,11:.: 0.42:1.000:. ./.:4:134,14:.:-1.30:1.000:. ./.:4:474,1:.: 2.35:1.000:. ./.:4:214,8:.:-0.47:1.000:. ./.:4:242,7:.:-0.17:1.000:. ./.:4:208,3:.:-0.59:1.000:. ./.:4:176,27:.:-0.68:0.999:. ./.:4:463,3:.: 2.25:1.000:. ./.:4:189,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:260,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:242,16:.:-0.07:1.000:. ./.:4:182,18:.:-0.72:1.000:. ./.:4:276,8:.: 0.22:1.000:. ./.:4:347,11:.: 1.05:1.000:. ./.:4:235,9:.:-0.23:1.000:. ./.:4:327,9:.: 0.80:1.000:. ./.:4:187,11:.:-0.74:1.000:. ./.:4:213,9:.:-0.47:1.000:. ./.:4:186,9:.:-0.77:1.000:. ./.:6:231,3:.:-0.34:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:301,5:.: 0.47:1.000:. ./.:4:201,23:.:-0.45:1.000:. ./.:4:187,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:249,14:.:-0.01:1.000:. ./.:4:315,7:.: 0.64:1.000:. ./.:4:121,20:.:-1.37:1.000:. ./.:4:182,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:189,17:.:-0.65:0.990:. ./.:4:397,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:259,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:220,10:.:-0.38:0.999:. ./.:4:337,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:412,3:.: 1.68:1.000:. ./.:4:325,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:252,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:291,4:.: 0.34:1.000:. ./.:4:199,18:.:-0.53:1.000:. ./.:4:285,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:220,15:.:-0.33:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:322,6:.: 0.71:1.000:. ./.:4:268,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:195,6:.:-0.71:1.000:. ./.:4:338,7:.: 0.90:1.000:. ./.:4:364,18:.: 1.31:1.000:. ./.:4:228,6:.:-0.34:1.000:. ./.:4:201,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:170,6:.:-0.98:1.000:. ./.:4:244,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:340,21:.: 1.08:1.000:. ./.:4:259,8:.: 0.03:1.000:. ./.:4:311,8:.: 0.61:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:233,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:217,7:.:-0.45:1.000:. ./.:4:224,6:.:-0.38:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:243,11:.:-0.11:1.000:. ./.:4:295,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:270,6:.: 0.13:1.000:. ./.:4:261,7:.: 0.04:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:274,11:.: 0.23:1.000:. ./.:4:196,8:.:-0.67:0.998:. ./.:4:280,9:.: 0.28:1.000:. ./.:4:197,6:.:-0.68:1.000:. ./.:4:279,8:.: 0.25:1.000:. ./.:4:181,26:.:-0.64:1.000:. ./.:4:283,9:.: 0.31:1.000:. ./.:4:195,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:174,30:.:-0.67:1.000:. ./.:4:181,17:.:-0.74:1.000:. ./.:4:299,11:.: 0.51:1.000:. ./.:4:81,6:.:-1.98:1.000:. ./.:4:296,18:.: 0.56:1.000:. ./.:4:132,14:.:-1.32:1.000:. ./.:4:191,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:177,9:.:-0.87:1.000:. ./.:4:281,11:.: 0.31:1.000:. ./.:4:226,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:263,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:289,9:.: 0.38:1.000:. ./.:4:221,11:.:-0.36:1.000:. ./.:4:260,8:.: 0.04:1.000:. ./.:4:230,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:276,6:.: 0.20:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:180,7:.:-0.86:1.000:. ./.:4:228,4:.:-0.36:1.000:. ./.:4:239,3:.:-0.25:1.000:. ./.:4:325,18:.: 0.88:1.000:. ./.:4:155,7:.:-1.14:0.775:. ./.:4:181,8:.:-0.84:1.000:. ./.:4:116,15:.:-1.49:1.000:. ./.:4:473,8:.: 2.42:1.000:. ./.:4:335,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:234,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:162,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:222,9:.:-0.37:1.000:. ./.:4:111,24:.:-1.44:1.000:. ./.:4:196,6:.:-0.69:1.000:. ./.:4:128,13:.:-1.37:1.000:. ./.:4:192,5:.:-0.75:1.000:. ./.:4:472,10:.: 2.43:1.000:. ./.:4:188,17:.:-0.66:1.000:. ./.:4:384,8:.: 1.43:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:423,13:.: 1.92:1.000:. ./.:4:284,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:322,9:.: 0.74:1.000:. ./.:4:318,6:.: 0.67:1.000:. ./.:4:92,8:.:-1.83:1.000:. ./.:4:296,10:.: 0.47:1.000:. ./.:4:281,15:.: 0.35:1.000:. ./.:4:466,1:.: 2.26:1.000:. ./.:4:353,5:.: 1.05:1.000:. ./.:4:165,20:.:-0.88:1.000:. ./.:4:266,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:307,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:122,17:.:-1.40:1.000:. ./.:4:113,10:.:-1.58:1.000:. ./.:4:355,8:.: 1.10:1.000:. ./.:4:280,15:.: 0.34:1.000:. ./.:4:235,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:280,6:.: 0.24:1.000:. ./.:4:236,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:374,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:219,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:332,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:168,12:.:-0.94:1.000:. ./.:4:244,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:237,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:210,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:118,16:.:-1.45:1.000:. ./.:4:171,14:.:-0.88:1.000:. ./.:4:479,4:.: 2.44:1.000:. ./.:4:186,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:139,16:.:-1.22:1.000:. ./.:4:169,14:.:-0.91:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:357,6:.: 1.10:1.000:. ./.:4:431,7:.: 1.94:1.000:. ./.:4:267,8:.: 0.12:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.48:1.000:. -chr6.1 31304897 chr6.1_031304897 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:45,131:0.72: 2.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,82:0.87: 0.12:1.000:0.933 0/1/1/1:4:25,84:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,42:0.38: 0.60:1.000:0.590 0/1/1/1:4:41,80:0.65: 1.02:1.000:0.779 0/1/1/1:4:17,60:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,49:0.71:-0.71:1.000:0.992 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,7:0.63:-2.50:1.000:0.523 0/1/1/1:4:21,80:0.77: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,32:0.35:-0.01:1.000:0.815 0/0/0/1:4:60,32:0.33: 0.09:1.000:0.904 0/1/1/1:4:26,64:0.69: 0.03:1.000:0.976 0/1/1/1:4:20,95:0.80: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:77,67:0.47: 1.76:0.983:0.764 0/0/1/1:4:33,29:0.47:-0.87:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,59:0.67:-0.10:1.000:0.922 0/0/0/1:4:54,31:0.35:-0.13:1.000:0.759 0/1/1/1:4:1,4:0.78:-2.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,91:0.71: 1.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,65:0.63: 0.41:1.000:0.533 0/1/1/1:4:21,45:0.67:-0.74:1.000:0.906 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,17:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,25:0.23: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,35:0.34: 0.35:1.000:0.891 0/0/1/1:4:70,46:0.39: 0.86:1.000:0.698 0/0/1/1:4:41,50:0.55: 0.06:1.000:0.979 0/1/1/1:4:41,72:0.63: 0.76:1.000:0.532 0/0/0/1:4:64,28:0.28: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,14:0.68:-2.22:1.000:0.959 0/1/1:3:2,8:0.78:-2.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,47:0.54:-0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:36,62:0.62: 0.28:1.000:0.520 0/0/1/1:4:56,36:0.38: 0.09:1.000:0.626 0/1/1/1:4:28,97:0.75: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,71:0.58: 1.08:1.000:0.931 0/0/1/1:4:65,70:0.52: 1.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,28:0.42:-0.74:1.000:0.925 0/0/1/1:4:62,72:0.54: 1.44:1.000:0.987 0/0/0/1:4:69,36:0.33: 0.51:1.000:0.929 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,70:0.74: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,36:0.35: 0.32:0.999:0.772 0/1/1/1:4:1,9:0.89:-2.54:1.000:0.560 0/0/1/1:4:25,26:0.52:-1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,50:0.57:-0.07:1.000:0.937 0/0/0/1:4:69,32:0.30: 0.38:1.000:0.987 0/0/0/1:4:59,28:0.30:-0.07:1.000:0.982 0/0/1/1:4:56,57:0.51: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,89:0.57: 2.17:1.000:0.955 0/0/1/1:4:50,34:0.40:-0.17:1.000:0.792 0/0/0/1:4:71,26:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,58:0.68:-0.20:1.000:0.957 0/0/1/1:4:29,24:0.46:-1.16:1.000:0.985 0/0/0/1:4:69,30:0.28: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:41,38:0.49:-0.33:1.000:0.882 0/1/1/1:4:29,94:0.74: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,41:0.29: 1.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,54:0.57: 0.19:1.000:0.952 0/1/1/1:4:26,67:0.70: 0.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:70,47:0.40: 0.89:1.000:0.760 0/0/1/1:4:36,55:0.60: 0.06:1.000:0.798 0/0/1/1:4:15,15:0.51:-1.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,71:0.58: 1.08:1.000:0.931 0/0/0/1:4:63,20:0.22:-0.20:0.990:1.000 0/0/1/1:4:56,62:0.53: 0.92:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,61:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,6:0.30:-2.25:0.999:0.988 0/0/1/1:4:31,30:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,50:0.31: 2.08:1.000:0.978 0/0/1/1:4:38,59:0.60: 0.25:1.000:0.769 0/0/0/1:4:52,15:0.20:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,45:0.47: 0.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:84,45:0.33: 1.28:1.000:0.898 0/0/1/1:4:45,68:0.60: 0.76:1.000:0.817 0/0/1/1:4:50,63:0.56: 0.76:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,34:0.30: 0.60:1.000:0.989 0/0/0/1:4:94,41:0.28: 1.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,70:0.71: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:46,37:0.45:-0.20:1.000:0.978 0/1/1/1:4:32,65:0.66: 0.25:1.000:0.844 0/0/0/1:4:48,19:0.26:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,25:0.30:-0.36:1.000:0.983 0/1/1/1:4:34,96:0.72: 1.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,58:0.70:-0.29:1.000:0.988 0/0/0/1:4:70,18:0.19:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,75:0.53: 1.69:1.000:0.991 0/1/1/1:4:20,52:0.70:-0.55:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,72:0.79:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,28:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,42:0.67:-0.90:1.000:0.930 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,75:0.67: 0.67:1.000:0.906 0/1/1/1:4:6,44:0.87:-1.25:1.000:0.945 0/1/1/1:4:29,51:0.63:-0.29:1.000:0.536 0/0/1/1:4:29,45:0.60:-0.49:1.000:0.770 0/0/0/1:4:75,23:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,36:0.37: 0.16:0.998:0.500 0/0/0/1:4:89,35:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,22:0.32:-0.74:1.000:0.961 0/0/0/1:4:57,34:0.36: 0.06:1.000:0.642 0/0/0/1:4:71,38:0.33: 0.64:1.000:0.899 0/0/1/1:4:52,66:0.56: 0.92:1.000:0.967 0/1/1/1:4:23,70:0.73: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,43:0.34: 1.02:1.000:0.852 0/0/0/1:4:90,37:0.27: 1.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,22:0.33:-0.81:1.000:0.925 0/1/1/1:4:33,107:0.74: 1.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,17:0.41:-1.54:1.000:0.873 0/0/0/1:4:47,23:0.31:-0.61:1.000:0.971 0/0/1/1:4:37,25:0.40:-0.87:1.000:0.776 0/0/1/1:4:54,52:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,38:0.41: 0.09:1.000:0.862 0/0/1/1:4:42,53:0.56: 0.19:1.000:0.969 0/1/1/1:4:47,91:0.65: 1.56:1.000:0.765 0/0/1/1:4:38,59:0.60: 0.25:1.000:0.769 0/1/1/1:4:27,109:0.78: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,70:0.65: 0.51:1.000:0.821 0/0/0/1:4:72,30:0.27: 0.41:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,43:0.57:-0.45:1.000:0.941 0/1/1/1:4:40,88:0.67: 1.24:1.000:0.927 0/0/1/1:4:58,54:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,60:0.62: 0.19:1.000:0.532 0/0/1/1:4:30,38:0.56:-0.68:0.775:0.968 0/0/0/1:4:67,29:0.28: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,34:0.41:-0.23:1.000:0.873 0/0/0/1:4:88,24:0.19: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,80:0.63: 1.18:1.000:0.506 0/1/1/1:4:24,91:0.77: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,65:0.65: 0.28:1.000:0.796 0/0/0/1:4:67,36:0.34: 0.44:1.000:0.894 0/0/0/1:4:41,22:0.34:-0.84:1.000:0.896 0/0/1/1:4:47,37:0.44:-0.17:1.000:0.970 0/0/1/1:4:49,36:0.42:-0.13:1.000:0.922 0/1/1/1:4:20,39:0.65:-0.97:1.000:0.778 0/0/0/1:4:100,38:0.25: 1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,42:0.43: 0.28:1.000:0.941 0/0/0/1:4:80,39:0.31: 0.96:1.000:0.973 0/1/1/1:4:10,78:0.87:-0.04:1.000:0.887 0/0/0/1:4:88,44:0.32: 1.37:1.000:0.961 0/0/1/1:4:51,64:0.56: 0.83:1.000:0.971 0/1/1/1:4:20,82:0.78: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,26:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,4:0.29:-2.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,85:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,35:0.34: 0.28:1.000:0.837 0/0/1/1:4:54,66:0.55: 0.99:1.000:0.978 0/1/1/1:4:14,60:0.79:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,55:0.52: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,22:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,71:0.55: 1.31:1.000:0.981 0/0/1/1:4:40,35:0.47:-0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:54,30:0.34:-0.17:1.000:0.837 0/1/1/1:4:21,54:0.70:-0.45:1.000:0.985 0/0/1/1:4:29,24:0.46:-1.16:1.000:0.985 0/0/0/1:4:38,23:0.37:-0.90:1.000:0.592 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,64:0.65: 0.22:1.000:0.821 0/0/1/1:4:38,41:0.52:-0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,64:0.80:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,34:0.43:-0.33:1.000:0.946 0/1/1/1:4:29,78:0.71: 0.57:1.000:0.991 0/0/0/1:4:50,24:0.31:-0.49:1.000:0.978 0/0/0/1:4:68,32:0.30: 0.35:1.000:0.984 0/0/0/1:4:63,24:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,38:0.52:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:41,31:0.43:-0.55:1.000:0.947 0/0/1/1:4:30,23:0.43:-1.16:1.000:0.956 0/1/1/1:4:25,58:0.68:-0.20:1.000:0.957 0/0/1/1:4:62,40:0.39: 0.41:1.000:0.638 0/0/1/1:4:37,60:0.61: 0.25:1.000:0.675 0/1/1/1:4:22,52:0.68:-0.49:1.000:0.964 0/1/1/1:4:14,81:0.83: 0.19:1.000:0.997 -chr6.1 31734270 chr6.1_031734270 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.62:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:10,0:.:-0.51:0.983:. ./.:4:4,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:13,4:.: 0.21:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:3:9,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:15,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:20,3:.: 0.83:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:28,2:.: 1.55:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:21,7:.: 1.34:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.52:1.000:. ./.:6:23,6:.: 1.44:1.000:. ./.:4:31,3:.: 1.96:1.000:. ./.:4:11,7:.: 0.31:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:24,7:.: 1.65:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:17,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:0.990:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:15,6:.: 0.62:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:7,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:10,7:.: 0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:16,11:.: 1.24:1.000:. ./.:4:37,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.41:1.000:. ./.:4:18,11:.: 1.44:1.000:. ./.:4:22,6:.: 1.34:1.000:. ./.:4:18,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:26,4:.: 1.55:1.000:. ./.:4:25,3:.: 1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:20,6:.: 1.13:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,0:.: 3.19:1.000:. ./.:4:23,3:.: 1.13:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:14,6:.: 0.52:1.000:. ./.:4:34,5:.: 2.47:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:26,4:.: 1.55:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,6:.: 1.44:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.21:0.998:. ./.:4:24,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:19,3:.: 0.72:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:16,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:8,2:.:-0.51:0.775:. ./.:4:12,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:29,5:.: 1.96:1.000:. ./.:4:22,6:.: 1.34:1.000:. ./.:4:13,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,4:.: 0.31:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.93:1.000:. -chr6.1 31803356 chr6.1_031803356 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,27:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,17:.:-1.72:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:205,26:.: 1.33:1.000:. ./.:4:164,13:.: 0.38:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:172,13:.: 0.52:1.000:. ./.:4:99,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:9,2:.:-2.55:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:133,21:.:-0.03:1.000:. ./.:4:235,20:.: 1.75:1.000:. ./.:4:130,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:106,28:.:-0.38:1.000:. ./.:5:180,0:.: 0.43:0.983:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:190,25:.: 1.05:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.57:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:135,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:16,6:.:-2.36:1.000:. ./.:4:169,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:135,20:.:-0.01:1.000:. ./.:4:170,8:.: 0.40:1.000:. ./.:4:175,17:.: 0.64:1.000:. ./.:4:145,17:.: 0.11:1.000:. ./.:4:98,16:.:-0.73:1.000:. ./.:4:108,11:.:-0.65:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:14,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:89,21:.:-0.80:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:140,22:.: 0.11:1.000:. ./.:4:336,37:.: 3.83:1.000:. ./.:4:141,13:.:-0.03:1.000:. ./.:4:149,44:.: 0.66:1.000:. ./.:4:117,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.71:0.999:. ./.:4:15,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,26:.:-1.46:1.000:. ./.:4:180,13:.: 0.66:1.000:. ./.:4:187,20:.: 0.91:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:203,21:.: 1.21:1.000:. ./.:4:204,42:.: 1.59:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:172,18:.: 0.61:1.000:. ./.:4:127,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:143,11:.:-0.03:1.000:. ./.:6:120,18:.:-0.31:1.000:. ./.:4:150,19:.: 0.24:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:83,23:.:-0.87:1.000:. ./.:4:93,10:.:-0.93:1.000:. ./.:4:195,21:.: 1.07:1.000:. ./.:4:158,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:187,18:.: 0.87:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:138,16:.:-0.03:0.990:. ./.:4:93,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:141,28:.: 0.24:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.35:0.999:. ./.:4:99,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:168,46:.: 1.03:1.000:. ./.:4:170,12:.: 0.47:1.000:. ./.:4:108,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:208,15:.: 1.19:1.000:. ./.:4:259,19:.: 2.16:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:128,19:.:-0.15:1.000:. ./.:4:149,14:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:164,18:.: 0.47:1.000:. ./.:4:67,10:.:-1.39:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:90,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:94,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:161,30:.: 0.62:1.000:. ./.:4:198,15:.: 1.01:1.000:. ./.:4:163,17:.: 0.43:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:275,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:118,44:.: 0.11:1.000:. ./.:4:91,36:.:-0.50:1.000:. ./.:4:176,38:.: 1.03:1.000:. ./.:4:149,30:.: 0.41:0.998:. ./.:4:210,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:167,20:.: 0.55:1.000:. ./.:4:157,36:.: 0.66:1.000:. ./.:4:168,32:.: 0.78:1.000:. ./.:4:171,39:.: 0.96:1.000:. ./.:4:102,41:.:-0.22:1.000:. ./.:4:214,23:.: 1.44:1.000:. ./.:4:183,48:.: 1.33:1.000:. ./.:4:143,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:104,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:127,39:.: 0.18:1.000:. ./.:4:191,21:.: 1.00:1.000:. ./.:4:150,14:.: 0.15:1.000:. ./.:4:96,14:.:-0.80:1.000:. ./.:4:85,13:.:-1.02:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:133,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:210,19:.: 1.29:1.000:. ./.:4:95,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:54,36:.:-1.16:1.000:. ./.:4:119,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:153,21:.: 0.32:1.000:. ./.:4:53,29:.:-1.30:1.000:. ./.:4:81,10:.:-1.14:1.000:. ./.:4:126,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:128,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:130,17:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,16:.:-0.01:0.775:. ./.:4:221,13:.: 1.38:1.000:. ./.:4:158,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:144,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:106,13:.:-0.65:1.000:. ./.:4:153,37:.: 0.61:1.000:. ./.:4:128,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:157,10:.: 0.20:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,36:.:-0.42:1.000:. ./.:4:239,43:.: 2.23:1.000:. ./.:4:200,14:.: 1.03:1.000:. ./.:4:164,13:.: 0.38:1.000:. ./.:4:126,40:.: 0.18:1.000:. ./.:4:210,19:.: 1.29:1.000:. ./.:4:121,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:100,32:.:-0.42:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:70,22:.:-1.12:1.000:. ./.:4:160,48:.: 0.92:1.000:. ./.:4:156,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:213,19:.: 1.35:1.000:. ./.:4:69,13:.:-1.30:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:158,7:.: 0.17:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,21:.: 0.18:1.000:. ./.:4:139,11:.:-0.10:1.000:. ./.:4:109,11:.:-0.63:1.000:. ./.:4:142,7:.:-0.12:1.000:. ./.:4:103,17:.:-0.63:1.000:. ./.:4:115,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,17:.: 0.34:1.000:. ./.:4:115,24:.:-0.29:1.000:. ./.:4:78,9:.:-1.21:1.000:. ./.:4:165,10:.: 0.34:1.000:. ./.:4:151,17:.: 0.22:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:142,28:.: 0.25:1.000:. ./.:4:126,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:213,19:.: 1.35:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:160,18:.: 0.40:1.000:. ./.:4:134,49:.: 0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:188,33:.: 1.15:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:106,21:.:-0.50:1.000:. -chr6.1 33523970 chr6.1_033523970 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:233,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:34,15:.:-2.76:1.000:. ./.:4:29,19:.:-2.78:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:164,60:.: 0.28:1.000:. ./.:4:192,56:.: 0.70:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.23:1.000:. ./.:5:257,58:.: 1.86:0.983:. ./.:4:259,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:221,72:.: 1.48:1.000:. ./.:4:32,14:.:-2.81:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:31,20:.:-2.73:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:179,71:.: 0.73:1.000:. ./.:4:172,55:.: 0.33:1.000:. ./.:4:216,65:.: 1.27:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:160,60:.: 0.21:1.000:. ./.:4:137,53:.:-0.31:1.000:. ./.:4:16,6:.:-3.23:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.76:1.000:. ./.:3:8,10:.:-3.30:1.000:. ./.:4:169,66:.: 0.47:1.000:. ./.:4:253,57:.: 1.77:1.000:. ./.:4:170,61:.: 0.40:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,56:.: 0.19:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:136,43:.:-0.50:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:171,49:.: 0.21:1.000:. ./.:4:212,65:.: 1.20:0.999:. ./.:4:35,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:148,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:92,38:.:-1.35:1.000:. ./.:4:106,42:.:-1.04:1.000:. ./.:4:213,86:.: 1.58:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:150,51:.:-0.12:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.94:1.000:. ./.:6:136,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:175,58:.: 0.44:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:129,66:.:-0.22:1.000:. ./.:4:131,55:.:-0.38:1.000:. ./.:4:139,47:.:-0.38:1.000:. ./.:4:165,40:.:-0.05:0.990:. ./.:4:169,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:198,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:120,62:.:-0.45:0.999:. ./.:4:228,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:140,42:.:-0.45:1.000:. ./.:4:189,56:.: 0.64:1.000:. ./.:4:193,51:.: 0.63:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:186,61:.: 0.68:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:187,55:.: 0.59:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:200,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:164,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:147,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:129,65:.:-0.24:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:116,39:.:-0.92:0.998:. ./.:4:200,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:223,62:.: 1.34:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:237,86:.: 2.00:1.000:. ./.:4:157,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:84,37:.:-1.51:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:182,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:136,60:.:-0.21:1.000:. ./.:4:175,69:.: 0.63:1.000:. ./.:4:180,71:.: 0.75:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:134,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.67:0.775:. ./.:4:146,68:.: 0.11:1.000:. ./.:4:137,57:.:-0.24:1.000:. ./.:4:208,72:.: 1.25:1.000:. ./.:4:165,45:.: 0.04:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:137,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:145,55:.:-0.14:1.000:. ./.:4:149,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:212,77:.: 1.41:1.000:. ./.:4:166,55:.: 0.23:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:129,76:.:-0.05:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:178,67:.: 0.64:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:204,82:.: 1.36:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:214,72:.: 1.36:1.000:. ./.:4:222,61:.: 1.31:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:167,62:.: 0.37:1.000:. ./.:4:143,31:.:-0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:203,55:.: 0.87:1.000:. ./.:4:134,52:.:-0.38:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:163,61:.: 0.28:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:158,57:.: 0.12:1.000:. ./.:4:195,51:.: 0.66:1.000:. ./.:4:124,50:.:-0.59:1.000:. ./.:4:150,70:.: 0.21:1.000:. ./.:4:157,56:.: 0.09:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,59:.:-0.28:1.000:. ./.:4:104,41:.:-1.09:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:218,78:.: 1.53:1.000:. ./.:4:210,64:.: 1.15:1.000:. ./.:4:164,28:.:-0.28:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:228,64:.: 1.46:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.03:1.000:. -chr6.1 33615740 chr6.1_033615740 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:275,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:145,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:172,67:.: 0.34:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:83,99:.:-0.57:1.000:. ./.:4:104,135:.: 0.34:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:14,8:.:-3.13:1.000:. ./.:4:17,9:.:-3.06:1.000:. ./.:4:174,66:.: 0.36:1.000:. ./.:4:165,41:.:-0.18:1.000:. ./.:4:135,58:.:-0.39:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.21:1.000:. ./.:5:290,77:.: 2.39:0.983:. ./.:4:221,68:.: 1.14:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:13,5:.:-3.19:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:5,8:.:-3.27:1.000:. ./.:4:164,82:.: 0.45:1.000:. ./.:4:205,77:.: 1.03:1.000:. ./.:4:192,67:.: 0.66:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:203,81:.: 1.06:1.000:. ./.:4:216,84:.: 1.32:1.000:. ./.:4:162,57:.: 0.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.14:1.000:. ./.:3:22,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:179,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:224,83:.: 1.43:1.000:. ./.:4:155,68:.: 0.09:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:167,145:.: 1.51:1.000:. ./.:4:143,54:.:-0.33:1.000:. ./.:4:108,149:.: 0.63:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:45,29:.:-2.29:1.000:. ./.:4:138,63:.:-0.26:1.000:. ./.:4:121,31:.:-1.05:1.000:. ./.:4:71,76:.:-1.13:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:152,67:.: 0.02:1.000:. ./.:4:167,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:187,57:.: 0.42:1.000:. ./.:4:139,151:.: 1.16:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:124,67:.:-0.42:1.000:. ./.:4:166,46:.:-0.09:1.000:. ./.:6:92,59:.:-1.06:1.000:. ./.:4:167,58:.: 0.12:1.000:. ./.:4:108,117:.: 0.12:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:171,78:.: 0.50:1.000:. ./.:4:156,61:.:-0.01:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:146,68:.:-0.06:0.990:. ./.:4:104,103:.:-0.17:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,34:.:-1.67:0.999:. ./.:4:89,149:.: 0.33:1.000:. ./.:4:124,132:.: 0.61:1.000:. ./.:4:130,49:.:-0.62:1.000:. ./.:4:107,106:.:-0.07:1.000:. ./.:4:112,59:.:-0.74:1.000:. ./.:4:164,63:.: 0.15:1.000:. ./.:4:197,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:96,129:.: 0.12:1.000:. ./.:4:157,65:.: 0.07:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:130,72:.:-0.25:1.000:. ./.:4:181,58:.: 0.34:1.000:. ./.:4:67,92:.:-0.94:1.000:. ./.:4:74,88:.:-0.89:1.000:. ./.:4:131,48:.:-0.62:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:89,116:.:-0.20:1.000:. ./.:4:182,70:.: 0.55:1.000:. ./.:4:125,55:.:-0.60:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:153,70:.: 0.09:1.000:. ./.:4:84,79:.:-0.87:1.000:. ./.:4:124,45:.:-0.78:1.000:. ./.:4:103,110:.:-0.07:1.000:. ./.:4:175,66:.: 0.37:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:103,48:.:-1.06:1.000:. ./.:4:88,112:.:-0.28:1.000:. ./.:4:178,36:.:-0.06:0.998:. ./.:4:91,88:.:-0.62:1.000:. ./.:4:159,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:175,79:.: 0.58:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:171,67:.: 0.33:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:235,88:.: 1.69:1.000:. ./.:4:146,54:.:-0.28:1.000:. ./.:4:127,125:.: 0.55:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:113,61:.:-0.70:1.000:. ./.:4:139,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,60:.:-0.02:1.000:. ./.:4:186,67:.: 0.57:1.000:. ./.:4:95,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:157,64:.: 0.06:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:115,125:.: 0.36:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:135,38:.:-0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:145,52:.:-0.33:1.000:. ./.:4:186,92:.: 0.97:1.000:. ./.:4:115,47:.:-0.89:0.775:. ./.:4:153,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:155,179:.: 1.86:1.000:. ./.:4:167,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:93,109:.:-0.25:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:127,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:133,144:.: 0.95:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:143,159:.: 1.35:1.000:. ./.:4:167,67:.: 0.26:1.000:. ./.:4:154,151:.: 1.40:1.000:. ./.:4:159,60:.: 0.02:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:138,135:.: 0.89:1.000:. ./.:4:12,12:.:-3.09:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,76:.: 0.44:1.000:. ./.:4:135,132:.: 0.79:1.000:. ./.:4:285,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:163,61:.: 0.10:1.000:. ./.:4:170,59:.: 0.18:1.000:. ./.:4:187,78:.: 0.76:1.000:. ./.:4:150,61:.:-0.10:1.000:. ./.:4:151,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:179,73:.: 0.55:1.000:. ./.:4:194,86:.: 1.00:1.000:. ./.:4:244,81:.: 1.72:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:156,60:.:-0.02:1.000:. ./.:4:105,125:.: 0.20:1.000:. ./.:4:117,123:.: 0.36:1.000:. ./.:4:190,78:.: 0.81:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:191,57:.: 0.49:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:163,61:.: 0.10:1.000:. ./.:4:137,174:.: 1.49:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:188,15:.:-0.23:1.000:. ./.:4:195,63:.: 0.65:1.000:. ./.:4:223,76:.: 1.30:1.000:. ./.:4:189,76:.: 0.76:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:179,85:.: 0.74:1.000:. -chr6.1 33728347 chr6.1_033728347 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:40,101:0.69: 0.45:1.000:0.972 0/1/1/1:4:34,88:0.69:-0.08:1.000:0.978 0/0/1/1:4:55,66:0.53:-0.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:97,39:0.29: 0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:84,81:0.48: 1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,106:0.56: 1.61:1.000:0.960 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,72:0.57:-0.02:1.000:0.957 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.57:-2.80:1.000:0.952 0/1/1/1:4:35,105:0.72: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,30:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,39:0.30: 0.17:1.000:0.983 0/0/1/1:4:67,67:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,119:0.73: 0.86:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:114,92:0.44: 2.25:0.983:0.910 0/0/1/1:4:54,44:0.44:-0.74:1.000:0.973 0/0/1/1:4:91,92:0.49: 1.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,49:0.32: 0.84:1.000:0.954 0/0/0/1:4:16,9:0.36:-2.77:1.000:0.678 0/0/1/1:4:72,60:0.45: 0.20:1.000:0.979 0/0/1/1:4:84,87:0.50: 1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,66:0.53:-0.11:1.000:0.991 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,32:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,42:0.24: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,43:0.27: 1.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:122,50:0.30: 1.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:97,73:0.43: 1.25:1.000:0.935 0/0/1/1:4:74,74:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:109,26:0.20: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-3.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,20:0.77:-2.77:1.000:1.000 0/1/1:3:3,10:0.74:-3.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,79:0.53: 0.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:115,83:0.42: 2.03:1.000:0.898 0/0/0/1:4:111,38:0.26: 0.67:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,112:0.74: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,87:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,50:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,19:0.17:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:99,54:0.35: 0.78:1.000:0.751 0/0/0/1:4:83,20:0.20:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,62:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:129,45:0.27: 1.36:0.999:0.998 0/0/1/1:4:123,86:0.41: 2.34:1.000:0.858 0/0/0/1:4:96,27:0.23:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,57:0.45:-0.02:1.000:0.983 0/0/0/1:4:82,31:0.28:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:121,53:0.31: 1.36:1.000:0.975 0/0/1/1:4:52,55:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,67:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,40:0.30: 0.25:1.000:0.982 0/0/0/1:4:123,40:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,59:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,30:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,26:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:53,21:0.29:-1.41:1.000:0.825 0/0/1/1:4:53,70:0.55:-0.05:1.000:0.974 0/0/0/1:4:90,29:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,61:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,61:0.52:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:123,32:0.21: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,54:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:53,28:0.35:-1.22:1.000:0.814 0/0/1/1:4:66,59:0.47: 0.00:1.000:0.990 0/0/0/0:4:106,11:0.10:-0.22:0.990:0.854 0/0/1/1:4:59,73:0.54: 0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,75:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,13:0.21:-1.66:0.999:1.000 0/0/0/1:4:87,18:0.18:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,23:0.17: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,55:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:69,37:0.35:-0.52:1.000:0.786 0/0/1/1:4:52,53:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,19:0.22:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,67:0.43: 0.86:1.000:0.935 0/0/1/1:4:53,73:0.56: 0.03:1.000:0.960 0/0/1/1:4:45,46:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,30:0.27:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:89,34:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,64:0.47: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,52:0.42:-0.05:1.000:0.912 0/0/1/1:4:61,45:0.42:-0.52:1.000:0.919 0/0/0/1:4:70,27:0.28:-0.77:1.000:0.994 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,18:0.21:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,86:0.74:-0.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,67:0.68:-0.83:1.000:0.950 0/0/0/1:4:78,27:0.26:-0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,86:0.57: 0.64:1.000:0.956 0/0/1/1:4:57,69:0.54: 0.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,71:0.55: 0.00:1.000:0.976 0/0/0/1:4:96,29:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,17:0.21:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,59:0.53:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,89:0.52: 1.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,83:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,66:0.55:-0.24:1.000:0.975 0/0/1/1:4:48,54:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:68,35:0.34:-0.61:1.000:0.856 0/0/1/1:4:61,47:0.43:-0.47:0.998:0.950 0/0/0/1:4:94,32:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,26:0.29:-0.88:1.000:0.994 0/0/0/1:4:119,26:0.19: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,44:0.26: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,49:0.43:-0.30:1.000:0.936 0/0/1/1:4:52,62:0.53:-0.30:1.000:0.992 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,26:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,36:0.27: 0.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:81,16:0.17:-0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,101:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,19:0.22:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,28:0.30:-0.80:1.000:0.988 0/0/0/1:4:65,27:0.30:-0.91:1.000:0.986 0/0/1/1:4:48,54:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:89,26:0.23:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,28:0.35:-1.24:1.000:0.778 0/0/1/1:4:81,73:0.47: 0.81:1.000:0.991 0/0/1/1:4:84,79:0.48: 1.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,74:0.75:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,74:0.54: 0.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:96,20:0.18:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,44:0.53:-1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,41:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,74:0.73:-0.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,42:0.51:-1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,67:0.55:-0.13:1.000:0.984 0/0/1/1:4:35,42:0.53:-1.33:0.775:0.991 0/0/0/1:4:87,24:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,26:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,34:0.20: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,66:0.46: 0.48:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,85:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,56:0.56:-0.77:1.000:0.963 0/0/0/1:4:71,20:0.23:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,12:0.13:-0.80:1.000:0.905 0/0/0/1:4:81,37:0.32:-0.19:1.000:0.960 0/0/0/1:4:98,22:0.19:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,49:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,36:0.20: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,21:0.14: 0.92:1.000:0.958 0/0/0/1:4:100,42:0.30: 0.48:1.000:0.984 0/0/1/1:4:72,68:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,29:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,61:0.47: 0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,84:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,35:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,7:0.25:-2.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,91:0.69: 0.06:1.000:0.972 0/0/0/1:4:109,24:0.19: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,68:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,87:0.53: 1.00:1.000:0.993 0/0/0/0:4:150,1:0.01: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,69:0.52: 0.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:116,42:0.27: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,61:0.46: 0.17:1.000:0.987 0/0/0/1:4:105,44:0.30: 0.67:1.000:0.985 0/0/0/1:4:120,45:0.28: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,76:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,43:0.32: 0.28:1.000:0.948 0/0/0/1:4:94,32:0.26: 0.03:0.999:0.999 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,78:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,67:0.47: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,68:0.67:-0.77:1.000:0.939 0/0/0/1:4:107,33:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,78:0.55: 0.37:1.000:0.978 0/0/0/1:4:82,32:0.29:-0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:113,32:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,53:0.29: 1.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:112,26:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,16:0.13:-0.05:1.000:0.944 0/0/0/1:4:103,27:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,81:0.46: 1.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:136,44:0.25: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,106:0.51: 2.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,90:0.79:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,70:0.45: 0.78:1.000:0.982 -chr6.1 34513265 chr6.1_034513265 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:197,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.05:1.000:. ./.:5:255,0:.: 1.44:0.983:. ./.:4:206,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.91:1.000:. ./.:3:46,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:307,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.31:0.999:. ./.:4:103,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.13:1.000:. ./.:6:155,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,1:.:-0.45:0.990:. ./.:4:149,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.48:0.999:. ./.:4:196,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:244,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.24:0.998:. ./.:4:201,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.59:0.775:. ./.:4:196,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:331,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:188,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.59:0.999:. ./.:4:203,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.45:1.000:. -chr6.1 34756647 chr6.1_034756647 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,96:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,39:.:-1.87:1.000:. ./.:4:72,100:.: 0.08:1.000:. ./.:4:105,107:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,75:.:-0.22:1.000:. ./.:4:87,90:.: 0.18:1.000:. ./.:4:71,33:.:-1.22:1.000:. ./.:4:143,99:.: 1.43:1.000:. ./.:4:83,98:.: 0.26:1.000:. ./.:4:80,57:.:-0.59:1.000:. ./.:4:27,46:.:-1.81:1.000:. ./.:4:25,71:.:-1.37:1.000:. ./.:4:85,98:.: 0.30:1.000:. ./.:4:103,76:.: 0.22:1.000:. ./.:4:61,90:.:-0.32:1.000:. ./.:4:43,94:.:-0.59:1.000:. ./.:5:143,136:.: 2.13:0.983:. ./.:4:131,135:.: 1.89:1.000:. ./.:4:68,130:.: 0.58:1.000:. ./.:4:128,131:.: 1.75:1.000:. ./.:4:41,20:.:-2.04:1.000:. ./.:4:85,120:.: 0.72:1.000:. ./.:4:69,75:.:-0.45:1.000:. ./.:4:62,58:.:-0.91:1.000:. ./.:4:42,51:.:-1.43:1.000:. ./.:4:137,150:.: 2.29:1.000:. ./.:4:119,127:.: 1.50:1.000:. ./.:4:86,94:.: 0.24:1.000:. ./.:4:112,80:.: 0.47:1.000:. ./.:4:93,135:.: 1.16:1.000:. ./.:4:76,132:.: 0.77:1.000:. ./.:4:94,66:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,16:.:-2.20:1.000:. ./.:4:20,36:.:-2.14:1.000:. ./.:3:25,29:.:-2.18:1.000:. ./.:4:76,114:.: 0.43:1.000:. ./.:4:102,74:.: 0.16:1.000:. ./.:4:114,76:.: 0.43:1.000:. ./.:4:44,111:.:-0.24:1.000:. ./.:4:88,152:.: 1.39:1.000:. ./.:4:59,117:.: 0.16:1.000:. ./.:4:91,65:.:-0.22:1.000:. ./.:4:103,82:.: 0.33:1.000:. ./.:4:93,125:.: 0.97:1.000:. ./.:4:116,100:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,108:.: 0.18:1.000:. ./.:4:115,104:.: 0.99:0.999:. ./.:4:129,173:.: 2.58:1.000:. ./.:4:80,90:.: 0.05:1.000:. ./.:4:63,116:.: 0.22:1.000:. ./.:4:89,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:115,108:.: 1.06:1.000:. ./.:4:64,85:.:-0.36:1.000:. ./.:4:70,106:.: 0.16:1.000:. ./.:4:78,91:.: 0.03:1.000:. ./.:4:106,121:.: 1.14:1.000:. ./.:4:70,95:.:-0.05:1.000:. ./.:4:94,112:.: 0.74:1.000:. ./.:4:106,123:.: 1.18:1.000:. ./.:6:62,86:.:-0.37:1.000:. ./.:4:66,101:.:-0.01:1.000:. ./.:4:89,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:73,107:.: 0.24:1.000:. ./.:4:131,126:.: 1.71:1.000:. ./.:4:47,106:.:-0.28:1.000:. ./.:4:61,66:.:-0.78:1.000:. ./.:4:60,86:.:-0.41:1.000:. ./.:4:92,98:.: 0.43:0.990:. ./.:4:53,46:.:-1.31:1.000:. ./.:4:78,114:.: 0.47:1.000:. ./.:4:61,34:.:-1.39:0.999:. ./.:4:89,67:.:-0.22:1.000:. ./.:4:89,100:.: 0.41:1.000:. ./.:4:53,58:.:-1.08:1.000:. ./.:4:86,111:.: 0.56:1.000:. ./.:4:60,68:.:-0.76:1.000:. ./.:4:84,84:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,108:.:-0.22:1.000:. ./.:4:71,120:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,23:.:-1.74:1.000:. ./.:4:96,95:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,89:.: 0.43:1.000:. ./.:4:49,70:.:-0.93:1.000:. ./.:4:55,108:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,71:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,45:.:-1.08:1.000:. ./.:4:92,47:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,105:.: 0.39:1.000:. ./.:4:17,100:.:-0.97:1.000:. ./.:4:22,56:.:-1.72:1.000:. ./.:4:85,80:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,91:.:-0.39:1.000:. ./.:4:53,76:.:-0.74:1.000:. ./.:4:52,111:.:-0.09:1.000:. ./.:4:100,86:.: 0.35:1.000:. ./.:4:63,48:.:-1.08:1.000:. ./.:4:46,48:.:-1.41:1.000:. ./.:4:125,70:.: 0.53:1.000:. ./.:4:64,67:.:-0.70:1.000:. ./.:4:15,30:.:-2.35:1.000:. ./.:4:72,93:.:-0.05:1.000:. ./.:4:41,74:.:-1.01:1.000:. ./.:4:67,62:.:-0.74:1.000:. ./.:4:74,98:.: 0.08:0.998:. ./.:4:88,80:.: 0.01:1.000:. ./.:4:55,68:.:-0.85:1.000:. ./.:4:102,99:.: 0.64:1.000:. ./.:4:115,72:.: 0.37:1.000:. ./.:4:58,73:.:-0.70:1.000:. ./.:4:55,89:.:-0.45:1.000:. ./.:4:174,147:.: 2.94:1.000:. ./.:4:86,81:.:-0.01:1.000:. ./.:4:121,70:.: 0.45:1.000:. ./.:4:82,95:.: 0.18:1.000:. ./.:4:37,70:.:-1.16:1.000:. ./.:4:75,67:.:-0.49:1.000:. ./.:4:81,77:.:-0.18:1.000:. ./.:4:93,99:.: 0.47:1.000:. ./.:4:46,45:.:-1.47:1.000:. ./.:4:110,111:.: 1.02:1.000:. ./.:4:54,92:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,119:.: 0.53:1.000:. ./.:4:81,109:.: 0.43:1.000:. ./.:4:23,84:.:-1.16:1.000:. ./.:4:58,71:.:-0.74:1.000:. ./.:4:76,82:.:-0.18:1.000:. ./.:4:49,90:.:-0.55:1.000:. ./.:4:56,86:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,44:.:-1.83:1.000:. ./.:4:61,67:.:-0.76:1.000:. ./.:4:82,125:.: 0.76:1.000:. ./.:4:50,76:.:-0.80:0.775:. ./.:4:96,91:.: 0.37:1.000:. ./.:4:74,75:.:-0.36:1.000:. ./.:4:119,94:.: 0.87:1.000:. ./.:4:63,99:.:-0.11:1.000:. ./.:4:21,55:.:-1.75:1.000:. ./.:4:57,63:.:-0.91:1.000:. ./.:4:85,62:.:-0.39:1.000:. ./.:4:86,63:.:-0.36:1.000:. ./.:4:71,91:.:-0.11:1.000:. ./.:4:106,100:.: 0.74:1.000:. ./.:4:51,48:.:-1.31:1.000:. ./.:4:125,95:.: 1.00:1.000:. ./.:4:142,99:.: 1.41:1.000:. ./.:4:132,138:.: 1.96:1.000:. ./.:4:64,95:.:-0.16:1.000:. ./.:4:124,94:.: 0.97:1.000:. ./.:4:66,106:.: 0.08:1.000:. ./.:4:92,135:.: 1.14:1.000:. ./.:4:123,87:.: 0.81:1.000:. ./.:4:48,37:.:-1.58:1.000:. ./.:4:25,61:.:-1.56:1.000:. ./.:4:125,133:.: 1.73:1.000:. ./.:4:74,92:.:-0.03:1.000:. ./.:4:67,124:.: 0.45:1.000:. ./.:4:131,69:.: 0.62:1.000:. ./.:4:53,87:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,105:.: 0.91:1.000:. ./.:4:135,75:.: 0.81:1.000:. ./.:4:113,62:.: 0.14:1.000:. ./.:4:78,96:.: 0.12:1.000:. ./.:4:110,104:.: 0.89:1.000:. ./.:4:149,112:.: 1.79:1.000:. ./.:4:80,95:.: 0.14:1.000:. ./.:4:112,93:.: 0.72:1.000:. ./.:4:99,61:.:-0.15:0.999:. ./.:4:118,113:.: 1.22:1.000:. ./.:4:68,71:.:-0.55:1.000:. ./.:4:59,78:.:-0.59:1.000:. ./.:4:25,66:.:-1.47:1.000:. ./.:4:89,81:.: 0.05:1.000:. ./.:4:67,88:.:-0.24:1.000:. ./.:4:101,83:.: 0.31:1.000:. ./.:4:88,91:.: 0.22:1.000:. ./.:4:153,148:.: 2.56:1.000:. ./.:4:107,122:.: 1.18:1.000:. ./.:4:126,77:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,89:.: 0.47:1.000:. ./.:4:90,75:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,175:.: 2.23:1.000:. ./.:4:74,130:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,89:.:-0.97:1.000:. ./.:4:62,50:.:-1.06:1.000:. -chr6.1 36253851 chr6.1_036253851 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:50,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:136,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.48:1.000:. ./.:5:53,0:.:-0.32:0.983:. ./.:4:165,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:92,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:180,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.41:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:91,0:.: 0.66:0.999:. ./.:4:59,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.:-0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:34,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.26:0.990:. ./.:4:114,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.36:0.999:. ./.:4:78,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.10:0.998:. ./.:4:28,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.79:0.775:. ./.:4:32,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:136,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:198,0:.: 3.44:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.57:0.999:. ./.:4:134,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:134,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.66:1.000:. -chr6.1 36697523 chr6.1_036697523 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.24:1.000:. ./.:5:22,0:.: 1.12:0.983:. ./.:4:43,0:.: 3.97:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.19:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 1.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:20,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:47,0:.: 4.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.: 0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:35,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:0.998:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.24:0.775:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr6.1 38512908 chr6.1_038512908 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:264,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.18:1.000:. ./.:5:315,0:.: 1.44:0.983:. ./.:4:252,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:65,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.09:1.000:. ./.:3:36,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:309,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:156,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.26:1.000:. ./.:6:162,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.01:0.990:. ./.:4:252,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.94:0.999:. ./.:4:181,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:190,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.83:0.998:. ./.:4:167,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:392,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.33:0.775:. ./.:4:217,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:374,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:385,1:.: 2.43:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.37:0.999:. ./.:4:244,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:368,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:359,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.40:1.000:. -chr6.1 39322084 chr6.1_039322084 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:286,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:442,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.40:1.000:. ./.:5:312,0:.: 0.76:0.983:. ./.:4:220,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:516,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:491,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:315,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:171,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:208,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.26:1.000:. ./.:3:35,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:456,1:.: 2.23:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:291,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:78,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:376,4:.: 1.45:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.46:1.000:. ./.:6:266,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.56:0.990:. ./.:4:47,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:269,1:.: 0.33:0.999:. ./.:4:197,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:134,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:197,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:166,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.77:0.998:. ./.:4:107,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:119,1:.:-1.19:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:418,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.85:0.775:. ./.:4:176,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:440,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:222,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:332,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:158,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:186,3:.:-0.49:0.999:. ./.:4:219,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:501,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:281,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.33:1.000:. -chr6.1 42851438 chr6.1_042851438 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:628,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.12:1.000:. ./.:5:533,0:.: 0.82:0.983:. ./.:4:440,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:258,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.13:1.000:. ./.:3:157,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:802,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:1623,0:.: 8.20:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:620,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:422,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.28:0.990:. ./.:4:601,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:526,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:566,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:567,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.42:0.998:. ./.:4:460,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:612,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:535,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.63:0.775:. ./.:4:420,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:676,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:686,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:625,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:648,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:332,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:628,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.58:1.000:. -chr6.1 43311212 chr6.1_043311212 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:546,310:.: 0.46:1.000:. ./.:4:482,76:.:-0.71:1.000:. ./.:4:647,83:.:-0.04:1.000:. ./.:4:608,348:.: 0.85:1.000:. ./.:4:469,4:.:-1.05:1.000:. ./.:4:643,111:.: 0.06:1.000:. ./.:4:352,48:.:-1.33:1.000:. ./.:4:528,162:.:-0.20:1.000:. ./.:4:537,69:.:-0.52:1.000:. ./.:4:223,100:.:-1.63:1.000:. ./.:4:153,41:.:-2.14:1.000:. ./.:4:499,84:.:-0.61:1.000:. ./.:4:615,178:.: 0.21:1.000:. ./.:4:583,271:.: 0.45:1.000:. ./.:4:571,253:.: 0.33:1.000:. ./.:4:604,2:.:-0.52:1.000:. ./.:5:362,155:.:-0.87:0.983:. ./.:4:762,272:.: 1.15:1.000:. ./.:4:1208,427:.: 3.51:1.000:. ./.:4:455,295:.: 0.04:1.000:. ./.:4:154,59:.:-2.06:1.000:. ./.:4:571,275:.: 0.42:1.000:. ./.:4:908,231:.: 1.56:1.000:. ./.:4:254,73:.:-1.62:1.000:. ./.:4:69,75:.:-2.33:1.000:. ./.:4:358,168:.:-0.84:1.000:. ./.:4:177,165:.:-1.56:1.000:. ./.:4:631,189:.: 0.31:1.000:. ./.:4:528,294:.: 0.32:1.000:. ./.:4:491,152:.:-0.38:1.000:. ./.:4:483,177:.:-0.31:1.000:. ./.:4:385,65:.:-1.14:1.000:. ./.:4:148,46:.:-2.14:1.000:. ./.:4:222,107:.:-1.61:1.000:. ./.:3:57,68:.:-2.41:1.000:. ./.:4:408,165:.:-0.65:1.000:. ./.:4:235,90:.:-1.63:1.000:. ./.:4:547,311:.: 0.46:1.000:. ./.:4:556,190:.: 0.02:1.000:. ./.:4:485,135:.:-0.47:1.000:. ./.:4:567,179:.: 0.02:1.000:. ./.:4:764,226:.: 0.98:1.000:. ./.:4:704,304:.: 1.05:1.000:. ./.:4:608,180:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1024,129:.: 1.62:1.000:. ./.:4:441,206:.:-0.36:1.000:. ./.:4:718,285:.: 1.03:0.999:. ./.:4:103,64:.:-2.24:1.000:. ./.:4:600,98:.:-0.16:1.000:. ./.:4:628,295:.: 0.72:1.000:. ./.:4:630,393:.: 1.11:1.000:. ./.:4:672,191:.: 0.48:1.000:. ./.:4:341,55:.:-1.35:1.000:. ./.:4:634,204:.: 0.38:1.000:. ./.:4:623,80:.:-0.14:1.000:. ./.:4:734,103:.: 0.38:1.000:. ./.:4:460,95:.:-0.72:1.000:. ./.:4:366,300:.:-0.29:1.000:. ./.:4:357,140:.:-0.95:1.000:. ./.:6:673,207:.: 0.55:1.000:. ./.:4:778,314:.: 1.38:1.000:. ./.:4:748,148:.: 0.61:1.000:. ./.:4:742,203:.: 0.80:1.000:. ./.:4:799,318:.: 1.48:1.000:. ./.:4:757,204:.: 0.87:1.000:. ./.:4:735,182:.: 0.69:1.000:. ./.:4:513,77:.:-0.59:1.000:. ./.:4:552,190:.: 0.01:1.000:. ./.:4:704,303:.: 1.05:0.990:. ./.:4:352,82:.:-1.20:1.000:. ./.:4:777,302:.: 1.33:1.000:. ./.:4:580,142:.:-0.07:0.999:. ./.:4:619,93:.:-0.11:1.000:. ./.:4:444,172:.:-0.49:1.000:. ./.:4:494,100:.:-0.57:1.000:. ./.:4:398,77:.:-1.04:1.000:. ./.:4:953,202:.: 1.63:1.000:. ./.:4:594,179:.: 0.13:1.000:. ./.:4:647,294:.: 0.79:1.000:. ./.:4:846,310:.: 1.63:1.000:. ./.:4:442,79:.:-0.86:1.000:. ./.:4:725,324:.: 1.21:1.000:. ./.:4:970,283:.: 2.01:1.000:. ./.:4:372,160:.:-0.81:1.000:. ./.:4:897,274:.: 1.69:1.000:. ./.:4:977,328:.: 2.21:1.000:. ./.:4:436,42:.:-1.03:1.000:. ./.:4:758,93:.: 0.44:1.000:. ./.:4:728,97:.: 0.33:1.000:. ./.:4:518,241:.: 0.07:1.000:. ./.:4:558,137:.:-0.18:1.000:. ./.:4:497,95:.:-0.58:1.000:. ./.:4:653,184:.: 0.38:1.000:. ./.:4:436,208:.:-0.38:1.000:. ./.:4:691,109:.: 0.24:1.000:. ./.:4:489,295:.: 0.17:1.000:. ./.:4:536,303:.: 0.39:1.000:. ./.:4:520,198:.:-0.09:1.000:. ./.:4:988,231:.: 1.88:1.000:. ./.:4:685,169:.: 0.45:1.000:. ./.:4:483,97:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1076,202:.: 2.11:1.000:. ./.:4:695,242:.: 0.77:1.000:. ./.:4:634,178:.: 0.28:1.000:. ./.:4:423,160:.:-0.61:0.998:. ./.:4:698,196:.: 0.60:1.000:. ./.:4:584,217:.: 0.24:1.000:. ./.:4:644,324:.: 0.89:1.000:. ./.:4:966,439:.: 2.61:1.000:. ./.:4:602,181:.: 0.17:1.000:. ./.:4:463,165:.:-0.44:1.000:. ./.:4:739,115:.: 0.45:1.000:. ./.:6:1082,219:.: 2.20:1.000:. ./.:4:526,182:.:-0.12:1.000:. ./.:4:454,70:.:-0.85:1.000:. ./.:4:485,179:.:-0.30:1.000:. ./.:4:511,250:.: 0.08:1.000:. ./.:4:413,177:.:-0.59:1.000:. ./.:4:628,252:.: 0.55:1.000:. ./.:4:648,255:.: 0.64:1.000:. ./.:4:589,285:.: 0.53:1.000:. ./.:4:457,192:.:-0.36:1.000:. ./.:4:656,98:.: 0.06:1.000:. ./.:4:532,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:703,184:.: 0.58:1.000:. ./.:4:656,339:.: 1.00:1.000:. ./.:4:588,199:.: 0.18:1.000:. ./.:4:485,90:.:-0.65:1.000:. ./.:4:481,84:.:-0.69:1.000:. ./.:4:537,218:.: 0.06:1.000:. ./.:4:257,95:.:-1.52:1.000:. ./.:4:363,95:.:-1.10:1.000:. ./.:4:513,105:.:-0.48:0.775:. ./.:4:385,191:.:-0.64:1.000:. ./.:4:606,163:.: 0.11:1.000:. ./.:4:675,342:.: 1.09:1.000:. ./.:4:655,373:.: 1.13:1.000:. ./.:4:574,174:.: 0.03:1.000:. ./.:4:562,76:.:-0.40:1.000:. ./.:4:596,79:.:-0.25:1.000:. ./.:4:439,205:.:-0.38:1.000:. ./.:4:925,276:.: 1.81:1.000:. ./.:4:570,166:.:-0.02:1.000:. ./.:4:631,162:.: 0.21:1.000:. ./.:4:706,221:.: 0.73:1.000:. ./.:4:466,223:.:-0.20:1.000:. ./.:4:410,201:.:-0.50:1.000:. ./.:4:834,181:.: 1.08:1.000:. ./.:4:553,178:.:-0.03:1.000:. ./.:4:369,143:.:-0.89:1.000:. ./.:4:688,260:.: 0.82:1.000:. ./.:4:668,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:116,48:.:-2.26:1.000:. ./.:4:435,220:.:-0.33:1.000:. ./.:4:613,115:.:-0.05:1.000:. ./.:4:522,157:.:-0.24:1.000:. ./.:4:454,2:.:-1.11:1.000:. ./.:4:855,293:.: 1.60:1.000:. ./.:4:418,246:.:-0.30:1.000:. ./.:4:509,156:.:-0.29:1.000:. ./.:4:404,76:.:-1.02:1.000:. ./.:4:338,73:.:-1.29:1.000:. ./.:4:509,97:.:-0.52:1.000:. ./.:4:684,262:.: 0.81:1.000:. ./.:4:689,200:.: 0.58:1.000:. ./.:4:655,183:.: 0.38:1.000:. ./.:4:551,169:.:-0.08:1.000:. ./.:4:660,3:.:-0.30:0.999:. ./.:4:534,82:.:-0.49:1.000:. ./.:4:481,156:.:-0.40:1.000:. ./.:4:425,116:.:-0.78:1.000:. ./.:4:310,59:.:-1.45:1.000:. ./.:4:595,181:.: 0.14:1.000:. ./.:4:573,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:455,139:.:-0.57:1.000:. ./.:4:560,140:.:-0.16:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:515,429:.: 0.80:1.000:. ./.:4:769,193:.: 0.87:1.000:. ./.:4:558,70:.:-0.44:1.000:. ./.:4:434,184:.:-0.48:1.000:. ./.:4:963,348:.: 2.24:1.000:. ./.:4:610,98:.:-0.12:1.000:. ./.:4:482,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:595,95:.:-0.20:1.000:. -chr6.1 43713480 chr6.1_043713480 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:366,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:239,48:.: 0.46:1.000:. ./.:4:222,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:385,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:66,59:.:-1.24:1.000:. ./.:4:115,77:.:-0.53:1.000:. ./.:4:181,76:.: 0.15:1.000:. ./.:4:22,23:.:-2.07:1.000:. ./.:4:57,22:.:-1.72:1.000:. ./.:4:134,84:.:-0.26:1.000:. ./.:4:138,75:.:-0.31:1.000:. ./.:4:246,70:.: 0.77:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.45:1.000:. ./.:5:468,108:.: 3.49:0.983:. ./.:4:165,86:.: 0.09:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:241,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:40,18:.:-1.94:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:157,85:.:-0.01:1.000:. ./.:4:268,88:.: 1.19:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:124,95:.:-0.25:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.75:1.000:. ./.:3:46,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:413,92:.: 2.75:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:232,84:.: 0.77:1.000:. ./.:4:114,76:.:-0.55:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.81:0.999:. ./.:4:123,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:175,55:.:-0.13:1.000:. ./.:4:258,80:.: 1.00:1.000:. ./.:4:149,38:.:-0.58:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:317,71:.: 1.52:1.000:. ./.:4:204,66:.: 0.29:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:245,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:217,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.41:1.000:. ./.:6:114,17:.:-1.17:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:223,62:.: 0.44:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:348,67:.: 1.81:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,74:.:-0.68:0.990:. ./.:4:115,116:.:-0.12:1.000:. ./.:4:361,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.95:0.999:. ./.:4:27,170:.:-0.48:1.000:. ./.:4:102,67:.:-0.77:1.000:. ./.:4:133,84:.:-0.27:1.000:. ./.:4:191,62:.: 0.11:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:115,63:.:-0.68:1.000:. ./.:4:296,66:.: 1.25:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:187,75:.: 0.20:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:165,77:.:-0.01:1.000:. ./.:4:166,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:91,51:.:-1.06:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:228,63:.: 0.51:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:86,52:.:-1.10:1.000:. ./.:4:305,77:.: 1.46:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:252,69:.: 0.82:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:125,62:.:-0.58:1.000:. ./.:4:105,61:.:-0.81:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:206,60:.: 0.24:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.40:0.998:. ./.:4:188,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:182,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:171,76:.: 0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:245,125:.: 1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:204,93:.: 0.57:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:189,52:.:-0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:209,70:.: 0.38:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:326,66:.: 1.57:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:69,62:.:-1.17:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:111,51:.:-0.85:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:338,75:.: 1.79:1.000:. ./.:4:197,65:.: 0.20:0.775:. ./.:4:111,85:.:-0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:277,90:.: 1.30:1.000:. ./.:4:209,66:.: 0.34:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:74,63:.:-1.11:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:246,102:.: 1.10:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:261,93:.: 1.17:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:91,92:.:-0.63:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:242,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:195,81:.: 0.35:1.000:. ./.:4:277,70:.: 1.09:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:155,98:.: 0.11:1.000:. ./.:4:322,71:.: 1.58:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:139,62:.:-0.44:1.000:. ./.:4:147,58:.:-0.40:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:258,78:.: 0.98:1.000:. ./.:4:291,93:.: 1.48:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:192,54:.: 0.03:1.000:. ./.:4:20,126:.:-1.02:0.999:. ./.:4:135,87:.:-0.22:1.000:. ./.:4:301,65:.: 1.29:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:277,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:128,57:.:-0.61:1.000:. ./.:4:263,97:.: 1.23:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:128,26:.:-0.93:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:324,104:.: 1.94:1.000:. ./.:4:335,82:.: 1.83:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:180,90:.: 0.29:1.000:. -chr6.1 47822574 chr6.1_047822574 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:75,116:.: 0.32:1.000:. ./.:4:48,169:.: 0.73:1.000:. ./.:4:108,25:.:-0.58:1.000:. ./.:4:132,93:.: 0.86:1.000:. ./.:4:116,135:.: 1.26:1.000:. ./.:4:114,136:.: 1.25:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:129,27:.:-0.22:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:15,9:.:-2.29:1.000:. ./.:4:37,88:.:-0.71:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:114,96:.: 0.62:1.000:. ./.:4:115,111:.: 0.87:1.000:. ./.:4:67,126:.: 0.36:1.000:. ./.:5:129,139:.: 1.53:0.983:. ./.:4:67,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:167,45:.: 0.65:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,23:.:-1.91:1.000:. ./.:4:96,29:.:-0.71:1.000:. ./.:4:124,26:.:-0.32:1.000:. ./.:4:118,112:.: 0.93:1.000:. ./.:4:18,17:.:-2.12:1.000:. ./.:4:140,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:113,68:.: 0.17:1.000:. ./.:4:147,103:.: 1.25:1.000:. ./.:4:140,111:.: 1.26:1.000:. ./.:4:96,77:.: 0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:3,8:.:-2.49:1.000:. ./.:4:26,26:.:-1.85:1.000:. ./.:3:7,2:.:-2.52:1.000:. ./.:4:78,86:.:-0.10:1.000:. ./.:4:145,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:160,102:.: 1.44:1.000:. ./.:4:66,97:.:-0.11:1.000:. ./.:4:113,118:.: 0.95:1.000:. ./.:4:109,65:.: 0.06:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:161,16:.: 0.10:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:159,90:.: 1.23:1.000:. ./.:4:113,113:.: 0.87:1.000:. ./.:4:127,114:.: 1.11:0.999:. ./.:4:18,21:.:-2.05:1.000:. ./.:4:103,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:70,12:.:-1.38:1.000:. ./.:4:107,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:109,82:.: 0.32:1.000:. ./.:4:82,103:.: 0.23:1.000:. ./.:4:115,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:155,81:.: 1.03:1.000:. ./.:4:125,66:.: 0.32:1.000:. ./.:4:72,82:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,33:.:-0.72:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.55:1.000:. ./.:6:114,14:.:-0.66:1.000:. ./.:4:159,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:114,64:.: 0.12:1.000:. ./.:4:69,82:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,92:.:-0.07:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:102,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:96,102:.: 0.43:1.000:. ./.:4:75,69:.:-0.41:1.000:. ./.:4:101,1:.:-1.07:0.990:. ./.:4:65,73:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,123:.: 0.87:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:81,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:54,83:.:-0.52:1.000:. ./.:4:101,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:96,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:113,124:.: 1.04:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:80,58:.:-0.51:1.000:. ./.:4:130,92:.: 0.81:1.000:. ./.:4:118,90:.: 0.59:1.000:. ./.:4:113,29:.:-0.44:1.000:. ./.:4:58,49:.:-0.99:1.000:. ./.:4:130,27:.:-0.21:1.000:. ./.:4:119,83:.: 0.50:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:89,17:.:-1.01:1.000:. ./.:4:58,106:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,79:.: 0.48:1.000:. ./.:4:128,136:.: 1.47:1.000:. ./.:4:87,57:.:-0.41:1.000:. ./.:4:119,129:.: 1.22:1.000:. ./.:4:129,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:53,51:.:-1.04:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:136,144:.: 1.72:1.000:. ./.:4:61,102:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,118:.: 0.37:1.000:. ./.:4:121,106:.: 0.89:1.000:. ./.:4:146,82:.: 0.90:1.000:. ./.:4:118,58:.: 0.09:0.998:. ./.:4:141,76:.: 0.73:1.000:. ./.:4:121,16:.:-0.52:1.000:. ./.:4:175,86:.: 1.42:1.000:. ./.:4:114,108:.: 0.81:1.000:. ./.:4:130,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:98,20:.:-0.82:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:204,36:.: 1.09:1.000:. ./.:4:136,75:.: 0.64:1.000:. ./.:4:67,43:.:-0.94:1.000:. ./.:4:101,115:.: 0.72:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:116,16:.:-0.60:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:92,74:.:-0.07:1.000:. ./.:4:122,30:.:-0.29:1.000:. ./.:4:104,76:.: 0.15:1.000:. ./.:4:107,110:.: 0.73:1.000:. ./.:4:82,124:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,93:.:-0.29:1.000:. ./.:4:101,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:50,71:.:-0.77:1.000:. ./.:4:99,19:.:-0.82:1.000:. ./.:4:48,81:.:-0.65:1.000:. ./.:4:84,73:.:-0.21:1.000:. ./.:4:160,126:.: 1.81:1.000:. ./.:4:69,72:.:-0.46:0.775:. ./.:4:82,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:91,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:214,110:.: 2.41:1.000:. ./.:4:103,27:.:-0.63:1.000:. ./.:4:74,108:.: 0.18:1.000:. ./.:4:101,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:187,84:.: 1.58:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:108,13:.:-0.77:1.000:. ./.:4:180,132:.: 2.22:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:135,86:.: 0.79:1.000:. ./.:4:142,109:.: 1.26:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:85,83:.:-0.04:1.000:. ./.:4:162,43:.: 0.54:1.000:. ./.:4:159,94:.: 1.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:62,105:.:-0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:156,137:.: 1.92:1.000:. ./.:4:116,154:.: 1.56:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:104,123:.: 0.89:1.000:. ./.:4:159,105:.: 1.47:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:103,90:.: 0.36:1.000:. ./.:4:147,37:.: 0.21:1.000:. ./.:4:92,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:118,123:.: 1.11:1.000:. ./.:4:151,28:.: 0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:169,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:147,134:.: 1.73:1.000:. ./.:4:81,79:.:-0.16:1.000:. ./.:4:69,81:.:-0.32:1.000:. ./.:4:157,81:.: 1.06:1.000:. ./.:4:124,104:.: 0.90:1.000:. ./.:4:78,61:.:-0.49:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:222,105:.: 2.45:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:185,148:.: 2.55:1.000:. ./.:4:214,38:.: 1.28:1.000:. ./.:4:145,190:.: 2.58:1.000:. ./.:4:80,86:.:-0.07:1.000:. ./.:4:79,84:.:-0.11:1.000:. -chr6.1 48027907 chr6.1_048027907 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:330,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:472,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.43:1.000:. ./.:5:447,0:.: 1.48:0.983:. ./.:4:196,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:443,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:86,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.73:1.000:. ./.:3:52,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:143,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:383,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:327,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:401,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:385,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.02:0.990:. ./.:4:254,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:520,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.34:0.999:. ./.:4:367,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:264,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:267,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:518,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.56:0.998:. ./.:4:393,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.37:1.000:. ./.:6:510,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.08:0.775:. ./.:4:193,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:467,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:511,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:479,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:451,1:.: 1.53:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:267,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:172,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:537,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:283,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:527,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.01:1.000:. -chr6.1 48160921 chr6.1_048160921 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:5,2:0.21: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.12:-0.20:1.000:0.852 0/0/0/1:4:8,5:0.27: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,10:0.44: 1.03:1.000:0.963 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,3:0.31:-0.20:1.000:0.969 0/0/0/1:4:2,1:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:5,0:0.00:-0.41:0.983:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:12,1:0.06: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:5,1:0.12:-0.20:1.000:0.852 0/0/0/1:4:9,2:0.14: 0.83:1.000:0.953 0/0/0/0:4:8,1:0.08: 0.41:1.000:0.980 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,4:0.31: 0.21:1.000:0.969 0/0/0/1:4:7,4:0.26: 0.83:0.957:0.999 0/0/0/1:4:1,1:0.31:-1.03:1.000:0.969 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,1:0.31:-1.03:1.000:0.969 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,1:0.09: 0.21:1.000:0.908 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:4,2:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.19: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:0.999:1.000 0/0/1/1:4:1,6:0.45: 0.00:1.000:0.976 0/0/0/1:4:8,4:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.26: 2.68:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.27: 1.86:1.000:0.998 0/0/0/0:4:11,1:0.06: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:4,3:0.29: 0.00:1.000:0.802 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 3.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.15:-0.41:1.000:0.988 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.19:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,2:0.14: 0.83:0.990:0.953 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 4.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:0.999:1.000 0/0/1/1:4:0,10:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,2:0.28:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/0/0:4:13,2:0.10: 1.65:1.000:0.801 0/0/0/1:4:11,3:0.16: 1.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,1:0.09: 0.21:1.000:0.908 0/0/1/1:4:0,5:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,3:0.41:-0.62:1.000:0.840 0/0/0/1:4:5,5:0.31: 0.62:1.000:0.969 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.25: 1.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.24: 2.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,1:0.08: 0.41:1.000:0.980 0/0/0/1:4:6,8:0.34: 1.45:0.998:0.873 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:21,0:0.00: 2.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.26: 2.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,2:0.11: 1.45:1.000:0.606 0/0/0/1:4:7,4:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:11,2:0.12: 1.24:1.000:0.648 0/0/0/1:4:9,2:0.14: 0.83:1.000:0.953 0/0/0/1:4:3,4:0.34: 0.00:1.000:0.873 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.19: 0.21:0.775:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.15:-0.41:1.000:0.988 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:5,2:0.21: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.12:-0.20:1.000:0.852 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,1:0.31:-1.03:1.000:0.969 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.23:1.000:0.997 -chr6.1 48700476 chr6.1_048700476 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,176:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,176:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,118:.: 0.25:1.000:. ./.:4:58,198:.: 1.13:1.000:. ./.:4:43,187:.: 0.65:1.000:. ./.:4:56,74:.:-1.20:1.000:. ./.:4:78,119:.: 0.04:1.000:. ./.:4:37,143:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,7:.:-3.46:1.000:. ./.:4:0,13:.:-3.37:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.06:1.000:. ./.:4:44,166:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,201:.: 1.08:1.000:. ./.:4:50,154:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,159:.: 0.38:1.000:. ./.:5:58,281:.: 2.67:0.983:. ./.:4:47,177:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,223:.: 1.54:1.000:. ./.:4:48,207:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1,4:.:-3.52:1.000:. ./.:4:52,163:.: 0.38:1.000:. ./.:4:53,203:.: 1.13:1.000:. ./.:4:35,140:.:-0.37:1.000:. ./.:4:5,2:.:-3.48:1.000:. ./.:4:98,138:.: 0.76:1.000:. ./.:4:47,164:.: 0.30:1.000:. ./.:4:43,176:.: 0.45:1.000:. ./.:4:53,203:.: 1.13:1.000:. ./.:4:82,115:.: 0.04:1.000:. ./.:4:53,165:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,137:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,9:.:-3.44:1.000:. ./.:4:2,23:.:-3.15:1.000:. ./.:4:0,5:.:-3.52:0.957:. ./.:4:35,183:.: 0.43:1.000:. ./.:4:47,244:.: 1.78:1.000:. ./.:4:51,170:.: 0.49:1.000:. ./.:4:51,186:.: 0.78:1.000:. ./.:4:66,190:.: 1.13:1.000:. ./.:4:90,100:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,149:.:-0.14:1.000:. ./.:4:90,181:.: 1.41:1.000:. ./.:4:40,142:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,101:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.38:1.000:. ./.:4:48,182:.: 0.65:0.999:. ./.:4:96,97:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.09:1.000:. ./.:4:34,119:.:-0.77:1.000:. ./.:4:55,192:.: 0.97:1.000:. ./.:4:32,162:.:-0.01:1.000:. ./.:4:32,178:.: 0.28:1.000:. ./.:4:90,125:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,104:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.36:1.000:. ./.:4:35,150:.:-0.18:1.000:. ./.:4:64,100:.:-0.57:1.000:. ./.:6:29,97:.:-1.27:1.000:. ./.:4:42,149:.:-0.07:1.000:. ./.:4:80,122:.: 0.13:1.000:. ./.:4:35,186:.: 0.49:1.000:. ./.:4:30,167:.: 0.04:1.000:. ./.:4:83,132:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,134:.:-0.68:1.000:. ./.:4:30,145:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,165:.: 0.21:0.990:. ./.:4:0,200:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,190:.: 0.76:1.000:. ./.:4:46,137:.:-0.22:0.999:. ./.:4:0,202:.: 0.13:1.000:. ./.:4:100,118:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,106:.:-0.20:1.000:. ./.:4:79,107:.:-0.16:1.000:. ./.:4:33,147:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,255:.: 1.12:1.000:. ./.:4:41,194:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,140:.:-1.01:1.000:. ./.:4:46,146:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,129:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,160:.: 0.12:1.000:. ./.:4:104,106:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.04:1.000:. ./.:4:57,76:.:-1.14:1.000:. ./.:4:85,70:.:-0.74:1.000:. ./.:4:62,82:.:-0.94:1.000:. ./.:4:46,138:.:-0.20:1.000:. ./.:4:31,151:.:-0.24:1.000:. ./.:4:71,98:.:-0.48:1.000:. ./.:4:38,162:.: 0.10:1.000:. ./.:4:34,115:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,249:.: 1.01:1.000:. ./.:4:35,163:.: 0.06:1.000:. ./.:4:58,81:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.05:1.000:. ./.:4:30,140:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,204:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.30:1.000:. ./.:4:41,136:.:-0.33:1.000:. ./.:4:26,114:.:-1.01:1.000:. ./.:4:51,100:.:-0.81:1.000:. ./.:4:71,131:.: 0.13:0.998:. ./.:4:85,97:.:-0.24:1.000:. ./.:4:37,135:.:-0.42:1.000:. ./.:4:89,106:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,208:.: 1.28:1.000:. ./.:4:44,184:.: 0.62:1.000:. ./.:4:31,122:.:-0.77:1.000:. ./.:4:66,212:.: 1.54:1.000:. ./.:6:105,145:.: 1.02:1.000:. ./.:4:93,114:.: 0.23:1.000:. ./.:4:29,104:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,174:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,123:.:-0.76:1.000:. ./.:4:28,138:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,109:.:-0.16:1.000:. ./.:4:65,104:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,167:.: 0.15:1.000:. ./.:4:39,135:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.56:1.000:. ./.:4:44,171:.: 0.38:1.000:. ./.:4:37,145:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,189:.: 0.30:1.000:. ./.:4:82,122:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.50:1.000:. ./.:4:26,126:.:-0.79:1.000:. ./.:4:25,121:.:-0.90:1.000:. ./.:4:36,137:.:-0.40:1.000:. ./.:4:51,167:.: 0.43:1.000:. ./.:4:25,98:.:-1.33:0.775:. ./.:4:38,165:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.43:1.000:. ./.:4:59,212:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,141:.:-0.44:1.000:. ./.:4:36,127:.:-0.59:1.000:. ./.:4:62,76:.:-1.05:1.000:. ./.:4:44,107:.:-0.81:1.000:. ./.:4:33,133:.:-0.53:1.000:. ./.:4:48,173:.: 0.49:1.000:. ./.:4:32,109:.:-1.00:1.000:. ./.:4:104,140:.: 0.91:1.000:. ./.:4:40,191:.: 0.67:1.000:. ./.:4:36,187:.: 0.52:1.000:. ./.:4:32,134:.:-0.53:1.000:. ./.:4:121,155:.: 1.51:1.000:. ./.:4:53,132:.:-0.18:1.000:. ./.:4:54,190:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,158:.: 0.21:1.000:. ./.:4:2,10:.:-3.39:1.000:. ./.:4:28,119:.:-0.88:1.000:. ./.:4:53,183:.: 0.76:1.000:. ./.:4:59,164:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.65:1.000:. ./.:4:67,178:.: 0.93:1.000:. ./.:4:40,142:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,120:.: 0.23:1.000:. ./.:4:39,160:.: 0.08:1.000:. ./.:4:46,153:.: 0.08:1.000:. ./.:4:53,106:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.63:1.000:. ./.:4:46,201:.: 0.97:1.000:. ./.:4:58,153:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.82:0.999:. ./.:4:31,138:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,123:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.33:1.000:. ./.:4:46,139:.:-0.18:1.000:. ./.:4:37,145:.:-0.24:1.000:. ./.:4:55,151:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,149:.:-0.22:1.000:. ./.:4:90,128:.: 0.43:1.000:. ./.:4:50,241:.: 1.78:1.000:. ./.:4:44,190:.: 0.73:1.000:. ./.:4:43,146:.:-0.11:1.000:. ./.:4:40,192:.: 0.69:1.000:. ./.:4:66,236:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,272:.: 1.43:1.000:. ./.:4:27,163:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.50:1.000:. -chr6.1 48918934 chr6.1_048918934 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.64:1.000:0.987 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:4,2:0.39: 0.64:1.000:0.679 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,5:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,5:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,3:0.59:-0.06:1.000:0.840 0/1/1/1:4:0,6:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,1:0.27: 5.89:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.64:1.000:0.752 0/0/0/1:4:5,2:0.37: 0.99:1.000:0.576 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:2,1:0.39:-0.41:0.983:0.970 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,3:0.38: 2.04:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.36: 2.39:1.000:0.645 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.39: 0.64:1.000:0.679 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 3.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00: 3.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 3.79:0.957:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.64:1.000:0.752 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:1,4:0.62: 0.29:1.000:0.503 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:0.999:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.46: 1.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.64:1.000:0.987 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:5,2:0.37: 0.99:1.000:0.576 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.33: 0.29:1.000:0.906 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:4,2:0.39: 0.64:1.000:0.679 0/0/1/1:4:2,4:0.54: 0.64:1.000:0.987 0/1/1/1/1/1:6:0,5:0.75: 0.29:1.000:0.522 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:4,1:0.33: 0.29:1.000:0.906 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.06:0.990:0.987 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.41:1.000:0.679 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.76:0.999:0.999 0/0/1/1:4:2,6:0.59: 1.34:1.000:0.840 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.64:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.57: 0.99:1.000:0.943 0/0/0/1:4:5,1:0.32: 0.64:1.000:0.955 0/0/1/1:4:1,4:0.62: 0.29:1.000:0.503 0/0/0/1:4:6,2:0.35: 1.34:1.000:0.752 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.54: 0.64:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.64:1.000:0.987 0/0/1/1:4:1,4:0.62: 0.29:1.000:0.503 0/1/1/1:4:0,6:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.67: 1.34:1.000:0.928 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.64:1.000:0.752 0/0/1/1:4:3,7:0.56: 2.04:1.000:0.963 0/0/1/1:4:3,4:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.46:-0.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:3,7:0.56: 2.04:1.000:0.963 0/0/1/1:4:3,6:0.54: 1.69:0.998:0.987 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-0.41:1.000:0.679 0/0/0/1/1/1:6:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.889 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.57: 0.99:1.000:0.943 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.64:1.000:0.752 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,2:0.39: 0.64:1.000:0.679 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,3:0.46: 0.64:1.000:0.987 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.54: 0.64:1.000:0.987 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.41:0.775:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42: 0.29:1.000:0.900 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,6:0.59: 1.34:1.000:0.840 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/1/1/1:4:0,5:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,4:0.62: 0.29:1.000:0.503 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:1,2:0.54:-0.41:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,5:0.65: 0.64:0.999:0.752 0/1/1/1:4:0,1:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.50: 0.29:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.33: 0.29:1.000:0.906 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:1,1:0.46:-0.76:1.000:0.987 0/0/1/1:4:6,3:0.39: 1.69:1.000:0.679 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.35:-0.06:1.000:0.752 -chr6.1 49045313 chr6.1_049045313 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:26,41:.: 1.97:1.000:. ./.:4:24,12:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.48:1.000:. ./.:4:16,35:.: 0.94:1.000:. ./.:4:22,52:.: 2.43:1.000:. ./.:4:7,28:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.18:1.000:. ./.:4:12,31:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.48:1.000:. ./.:4:17,35:.: 1.00:1.000:. ./.:4:19,37:.: 1.26:1.000:. ./.:4:12,35:.: 0.68:1.000:. ./.:5:19,48:.: 1.97:0.983:. ./.:4:15,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,61:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,54:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1,2:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,56:.: 1.26:1.000:. ./.:4:17,30:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.85:1.000:. ./.:4:9,26:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,37:.: 0.94:1.000:. ./.:4:25,31:.: 1.26:1.000:. ./.:4:17,29:.: 0.61:1.000:. ./.:4:15,29:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.18:1.000:. ./.:4:2,2:.:-2.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,29:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.68:1.000:. ./.:4:16,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:12,24:.:-0.04:1.000:. ./.:4:5,44:.: 0.81:1.000:. ./.:4:13,20:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:11,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,21:.:-0.04:1.000:. ./.:4:22,40:.: 1.65:0.999:. ./.:4:0,1:.:-2.31:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1,11:.:-1.59:1.000:. ./.:4:16,51:.: 1.97:1.000:. ./.:4:7,20:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:12,31:.: 0.42:1.000:. ./.:4:6,13:.:-1.14:1.000:. ./.:4:5,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.81:1.000:. ./.:6:0,15:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.69:1.000:. ./.:4:8,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,29:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,16:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.87:1.000:. ./.:4:14,24:.: 0.09:1.000:. ./.:4:2,10:.:-1.59:1.000:. ./.:4:8,31:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.56:0.990:. ./.:4:12,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,28:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.59:0.999:. ./.:4:0,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,54:.: 1.13:1.000:. ./.:4:14,24:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,24:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:16,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:11,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:11,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,33:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.16:1.000:. ./.:4:7,12:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.16:1.000:. ./.:4:5,15:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:12,31:.: 0.42:1.000:. ./.:4:12,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,30:.: 0.48:1.000:. ./.:4:10,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:15,25:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.20:1.000:. ./.:4:12,14:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:11,34:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,11:.:-1.40:1.000:. ./.:4:6,20:.:-0.69:1.000:. ./.:4:4,11:.:-1.40:1.000:. ./.:4:13,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:3,17:.:-1.07:0.998:. ./.:4:8,21:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,20:.:-0.62:1.000:. ./.:4:18,38:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,71:.: 2.23:1.000:. ./.:6:0,55:.: 1.19:1.000:. ./.:4:10,20:.:-0.43:1.000:. ./.:4:3,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:8,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.20:1.000:. ./.:4:9,12:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.81:1.000:. ./.:4:7,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:6,19:.:-0.75:1.000:. ./.:4:17,34:.: 0.94:1.000:. ./.:4:9,21:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.09:1.000:. ./.:4:5,25:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.14:1.000:. ./.:4:6,18:.:-0.81:1.000:. ./.:4:3,22:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,36:.: 0.94:1.000:. ./.:4:5,21:.:-0.69:0.775:. ./.:4:0,27:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.09:1.000:. ./.:4:16,33:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:9,16:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.07:1.000:. ./.:4:7,19:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,45:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.33:1.000:. ./.:4:18,33:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,80:.: 2.82:1.000:. ./.:4:10,34:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,30:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.16:1.000:. ./.:4:14,30:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,57:.: 1.32:1.000:. ./.:4:8,31:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.85:1.000:. ./.:4:3,16:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,52:.: 1.00:1.000:. ./.:4:18,29:.: 0.68:1.000:. ./.:4:20,45:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.94:1.000:. ./.:4:11,21:.:-0.30:1.000:. ./.:4:13,34:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.04:1.000:. ./.:4:13,24:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.81:1.000:. ./.:4:8,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:18,29:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,53:.: 1.07:0.999:. ./.:4:0,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:15,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:16,33:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:14,39:.: 1.07:1.000:. ./.:4:18,28:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:16,33:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,53:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.55:1.000:. ./.:4:15,41:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,55:.: 1.19:1.000:. ./.:4:17,46:.: 1.71:1.000:. ./.:4:22,27:.: 0.81:1.000:. ./.:4:12,34:.: 0.61:1.000:. -chr6.1 49865886 chr6.1_049865886 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:875,144:.: 0.36:1.000:. ./.:4:593,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:898,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:877,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1287,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:1077,122:.: 1.08:1.000:. ./.:4:749,110:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1346,128:.: 2.17:1.000:. ./.:4:734,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:552,62:.:-1.24:1.000:. ./.:4:462,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:575,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:975,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1120,127:.: 1.27:1.000:. ./.:4:1045,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:846,108:.: 0.10:1.000:. ./.:5:883,0:.:-0.18:0.983:. ./.:4:1029,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1466,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:1047,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:327,69:.:-2.11:1.000:. ./.:4:1061,127:.: 1.03:1.000:. ./.:4:1174,145:.: 1.55:1.000:. ./.:4:603,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:469,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:823,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:960,3:.: 0.14:1.000:. ./.:4:935,112:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1174,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:998,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:554,101:.:-1.08:1.000:. ./.:4:710,108:.:-0.43:1.000:. ./.:4:353,36:.:-2.14:1.000:. ./.:4:733,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:276,0:.:-2.58:0.957:. ./.:4:855,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:551,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:733,112:.:-0.33:1.000:. ./.:4:785,101:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1148,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:997,132:.: 0.80:1.000:. ./.:4:891,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:860,98:.: 0.12:1.000:. ./.:4:831,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1097,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:871,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:871,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:769,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:687,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:647,87:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1199,97:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1047,124:.: 0.97:1.000:. ./.:4:921,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:965,119:.: 0.62:1.000:. ./.:4:927,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:988,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:829,131:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1237,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:781,110:.:-0.15:1.000:. ./.:6:822,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:818,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:846,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1210,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:823,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:753,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:549,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:878,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:995,114:.: 0.72:1.000:. ./.:4:980,97:.: 0.59:0.990:. ./.:4:510,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:989,133:.: 0.77:1.000:. ./.:4:625,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:531,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:824,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:744,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:854,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:843,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1387,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:645,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1029,131:.: 0.92:1.000:. ./.:4:394,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:630,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1223,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:905,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:879,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:848,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:918,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:840,105:.: 0.07:1.000:. ./.:4:792,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1069,90:.: 0.92:1.000:. ./.:4:1081,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1199,110:.: 1.51:1.000:. ./.:4:923,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:748,93:.:-0.34:1.000:. ./.:4:768,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1252,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:954,109:.: 0.54:1.000:. ./.:4:575,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:990,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1174,121:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1084,114:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1114,142:.: 1.30:1.000:. ./.:4:511,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:1296,132:.: 1.99:1.000:. ./.:4:897,101:.: 0.28:0.998:. ./.:4:1033,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:928,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1164,146:.: 1.52:1.000:. ./.:4:1144,151:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1281,133:.: 1.93:1.000:. ./.:4:871,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1245,0:.: 1.26:1.000:. ./.:6:1389,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:919,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:612,69:.:-0.98:1.000:. ./.:4:983,126:.: 0.72:1.000:. ./.:4:898,109:.: 0.32:1.000:. ./.:4:965,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1014,99:.: 0.74:1.000:. ./.:4:696,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:1021,105:.: 0.79:1.000:. ./.:4:673,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:1167,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1018,126:.: 0.86:1.000:. ./.:4:667,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:815,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1329,2:.: 1.60:1.000:. ./.:4:394,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:621,85:.:-0.88:1.000:. ./.:4:649,105:.:-0.69:1.000:. ./.:4:653,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:1196,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:733,1:.:-0.77:0.775:. ./.:4:1037,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:671,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:857,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:648,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:910,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:868,94:.: 0.14:1.000:. ./.:4:858,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:870,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:668,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1173,2:.: 0.98:1.000:. ./.:4:995,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1363,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:1161,176:.: 1.62:1.000:. ./.:4:554,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:796,136:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1227,134:.: 1.72:1.000:. ./.:4:492,97:.:-1.34:1.000:. ./.:4:833,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1001,104:.: 0.70:1.000:. ./.:4:598,68:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1150,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:895,128:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1157,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:586,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:995,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:966,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1161,119:.: 1.40:1.000:. ./.:4:955,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:751,95:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1047,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:520,111:.:-1.18:1.000:. ./.:4:368,118:.:-1.75:1.000:. ./.:4:920,99:.: 0.36:1.000:. ./.:4:401,112:.:-1.64:1.000:. ./.:4:946,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:831,136:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1217,4:.: 1.16:1.000:. ./.:4:755,125:.:-0.19:1.000:. ./.:4:665,84:.:-0.71:1.000:. ./.:4:882,136:.: 0.36:1.000:. ./.:4:896,117:.: 0.34:1.000:. ./.:4:715,88:.:-0.49:1.000:. ./.:4:756,106:.:-0.26:1.000:. ./.:4:955,144:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1046,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:794,123:.:-0.04:1.000:. ./.:4:899,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:772,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:1363,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:1069,164:.: 1.21:1.000:. ./.:4:665,102:.:-0.64:1.000:. ./.:4:637,0:.:-1.15:1.000:. -chr6.1 50062706 chr6.1_050062706 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:654,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:490,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:669,3:.: 0.07:1.000:. ./.:4:803,2:.: 0.76:1.000:. ./.:4:703,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:847,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:634,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:776,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:809,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:262,3:.:-2.03:1.000:. ./.:4:234,2:.:-2.18:1.000:. ./.:4:700,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:936,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:640,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:973,3:.: 1.65:1.000:. ./.:4:815,0:.: 0.81:1.000:. ./.:5:776,0:.: 0.61:0.983:. ./.:4:641,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1319,1:.: 3.43:1.000:. ./.:4:1044,2:.: 2.01:1.000:. ./.:4:163,1:.:-2.56:1.000:. ./.:4:785,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:663,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:782,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:122,1:.:-2.77:1.000:. ./.:4:801,3:.: 0.76:1.000:. ./.:4:616,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:549,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:739,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:939,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:585,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:317,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-2.98:0.957:. ./.:4:852,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:785,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:657,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:594,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:726,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:614,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:674,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:385,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:562,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:677,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:614,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:813,1:.: 0.81:0.999:. ./.:4:116,2:.:-2.80:1.000:. ./.:4:482,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:484,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:353,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:864,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:691,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:677,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:713,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:567,3:.:-0.46:1.000:. ./.:4:568,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:854,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:570,1:.:-0.45:1.000:. ./.:6:554,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:679,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:812,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:487,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:553,3:.:-0.53:1.000:. ./.:4:729,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:570,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:612,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:609,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:431,2:.:-1.16:0.990:. ./.:4:607,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:701,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:610,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:520,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:918,1:.: 1.35:1.000:. ./.:4:461,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:863,4:.: 1.08:1.000:. ./.:4:598,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:486,3:.:-0.87:1.000:. ./.:4:611,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:694,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:472,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:939,2:.: 1.47:1.000:. ./.:4:632,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:736,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:695,4:.: 0.21:1.000:. ./.:4:457,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:602,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:659,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:881,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:549,4:.:-0.54:1.000:. ./.:4:605,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:749,4:.: 0.49:1.000:. ./.:4:374,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:600,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:541,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:626,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:450,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:752,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1135,2:.: 2.48:1.000:. ./.:4:683,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:669,3:.: 0.07:1.000:. ./.:4:401,1:.:-1.32:1.000:. ./.:4:754,5:.: 0.52:1.000:. ./.:4:366,0:.:-1.51:0.998:. ./.:4:582,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:555,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:704,3:.: 0.25:1.000:. ./.:4:850,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:847,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:532,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:704,2:.: 0.25:1.000:. ./.:6:594,5:.:-0.30:1.000:. ./.:4:780,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:392,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:912,2:.: 1.33:1.000:. ./.:4:690,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:590,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:830,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:660,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:737,7:.: 0.45:1.000:. ./.:4:704,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:710,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:715,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:587,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:680,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:780,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:329,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:571,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:513,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:565,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:689,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.99:0.775:. ./.:4:592,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:645,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:777,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:805,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:629,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:673,4:.: 0.10:1.000:. ./.:4:614,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:872,8:.: 1.15:1.000:. ./.:4:605,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:900,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:576,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1222,3:.: 2.94:1.000:. ./.:4:918,2:.: 1.36:1.000:. ./.:4:659,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:518,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:1102,4:.: 2.32:1.000:. ./.:4:545,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:919,5:.: 1.38:1.000:. ./.:4:698,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:226,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:564,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:695,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:689,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:881,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:782,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:621,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:842,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:765,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:592,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:803,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:512,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:421,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:813,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:655,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:566,2:.:-0.47:0.999:. ./.:4:606,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:694,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:651,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:708,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:820,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:566,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:790,3:.: 0.70:1.000:. ./.:4:366,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:871,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:567,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:815,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:718,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:739,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1005,2:.: 1.81:1.000:. ./.:4:908,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:696,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:713,0:.: 0.29:1.000:. -chr6.1 50536032 chr6.1_050536032 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:144,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.83:1.000:. ./.:5:207,0:.: 0.34:0.983:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.89:0.957:. ./.:4:126,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:58,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:179,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:0.990:. ./.:4:212,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:270,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.27:0.998:. ./.:4:193,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:301,0:.: 2.00:1.000:. ./.:6:307,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.78:0.775:. ./.:4:126,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:349,0:.: 2.84:0.999:. ./.:4:216,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:321,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:309,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.45:1.000:. -chr6.1 50598088 chr6.1_050598088 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:126,200:0.56: 1.18:1.000:0.968 0/0/1/1:4:95,148:0.55: 0.13:1.000:0.975 0/0/1/1:4:169,142:0.43: 0.99:1.000:0.936 0/1/1/1:4:50,205:0.77: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,123:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,210:0.69: 0.67:1.000:0.980 0/0/1/1:4:62,69:0.48:-1.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,121:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:151,121:0.42: 0.50:1.000:0.905 0/0/1/1:4:6,7:0.49:-2.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,12:0.31:-2.42:1.000:0.976 0/0/1/1:4:179,186:0.46: 1.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:246,64:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,84:0.34: 0.19:1.000:0.853 0/1/1/1:4:45,152:0.73:-0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:161,179:0.48: 1.36:1.000:0.994 0/0/0/1/1:5:159,116:0.40: 0.54:0.983:0.971 0/1/1/1:4:78,222:0.70: 0.86:1.000:0.983 0/0/1/1:4:153,200:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,135:0.33: 2.30:1.000:0.911 0/1/1/1:4:7,27:0.76:-2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,168:0.51: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,211:0.57: 1.36:1.000:0.953 0/1/1/1:4:39,154:0.76:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.43:-2.77:1.000:0.946 0/1/1/1:4:34,154:0.79:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,65:0.20: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,66:0.26: 0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,139:0.43: 0.82:1.000:0.957 0/0/1/1:4:150,184:0.49: 1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,207:0.47: 2.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:276,64:0.23: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,25:0.77:-2.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,35:0.76:-2.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.35:-2.72:0.957:0.777 0/0/1/1:4:219,139:0.38: 1.59:1.000:0.531 0/0/1/1:4:156,129:0.42: 0.67:1.000:0.927 0/0/1/1:4:104,175:0.57: 0.59:1.000:0.933 0/0/1/1:4:116,180:0.55: 0.80:1.000:0.976 0/0/1/1:4:90,155:0.58: 0.16:1.000:0.912 0/0/1/1:4:96,181:0.60: 0.56:1.000:0.761 0/0/1/1:4:160,115:0.40: 0.54:1.000:0.779 0/0/1/1:4:133,172:0.51: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,50:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,173:0.62: 0.31:1.000:0.504 0/1/1/1:4:72,166:0.65: 0.07:1.000:0.806 0/0/1/1:4:170,123:0.40: 0.77:0.999:0.789 0/0/1/1:4:171,255:0.54: 2.45:1.000:0.985 0/0/1/1:4:82,97:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,97:0.45:-0.41:1.000:0.976 0/0/1/1:4:59,90:0.55:-1.05:1.000:0.981 0/0/1/1:4:129,102:0.42:-0.02:1.000:0.894 0/0/1/1:4:52,92:0.59:-1.12:1.000:0.879 0/0/1/1:4:137,110:0.42: 0.19:1.000:0.906 0/1/1/1:4:31,158:0.81:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,111:0.60:-0.78:1.000:0.803 0/0/1/1:4:145,154:0.47: 0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:100,111:0.48:-0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,152:0.54: 0.29:1.000:0.987 0/0/1/1/1/1:6:66,120:0.59:-0.59:1.000:0.599 0/1/1/1:4:74,177:0.66: 0.24:1.000:0.869 0/0/1/1:4:72,105:0.54:-0.70:1.000:0.989 0/0/0/1:4:179,84:0.33: 0.39:1.000:0.931 0/1/1/1:4:22,115:0.81:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,176:0.54: 0.78:1.000:0.985 0/0/1/1:4:87,117:0.52:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,63:0.50:-1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,117:0.38: 0.79:1.000:0.609 0/0/0/1:4:179,56:0.27: 0.03:0.990:0.998 0/0/1/1:4:152,98:0.38: 0.22:1.000:0.566 0/1/1/1:4:24,156:0.84:-0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,90:0.49:-0.83:0.999:0.996 0/0/1/1:4:133,105:0.42: 0.07:1.000:0.892 0/0/0/1:4:175,109:0.37: 0.65:1.000:0.512 0/0/1/1:4:102,147:0.53: 0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,87:0.54:-1.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,144:0.59:-0.12:1.000:0.831 0/0/0/1:4:184,41:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,118:0.52:-0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:203,55:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,173:0.57: 0.56:1.000:0.942 0/0/1/1:4:78,85:0.47:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:113,161:0.53: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:122,154:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,166:0.55: 0.54:1.000:0.981 0/0/1/1:4:155,112:0.40: 0.44:1.000:0.787 0/1/1/1:4:25,67:0.69:-1.77:1.000:0.965 0/0/1/1:4:46,73:0.56:-1.43:1.000:0.968 0/0/1/1:4:77,129:0.57:-0.33:1.000:0.937 0/0/1/1:4:135,98:0.40: 0.01:1.000:0.794 0/0/1/1:4:71,119:0.57:-0.54:1.000:0.936 0/0/1/1:4:61,110:0.59:-0.78:1.000:0.850 0/1/1/1:4:44,105:0.66:-1.05:1.000:0.866 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,168:0.71:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,90:0.54:-1.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:77,110:0.53:-0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,145:0.62:-0.21:1.000:0.531 0/0/1/1:4:79,95:0.49:-0.74:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,197:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,106:0.60:-0.86:1.000:0.826 0/0/1/1:4:98,141:0.53: 0.08:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,142:0.99:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,105:0.65:-1.04:1.000:0.829 0/0/1/1:4:142,117:0.42: 0.34:0.998:0.924 0/1/1/1:4:46,96:0.63:-1.14:1.000:0.538 0/0/1/1:4:42,76:0.59:-1.45:1.000:0.844 0/1/1/1:4:34,193:0.82:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,159:0.46: 1.04:1.000:0.988 0/0/1/1:4:75,102:0.52:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,143:0.54: 0.11:1.000:0.989 0/0/0/1:4:257,89:0.28: 1.44:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:118,119:0.46: 0.06:1.000:0.793 0/0/1/1:4:53,100:0.60:-1.00:1.000:0.759 0/0/1/1:4:47,88:0.60:-1.23:1.000:0.777 0/0/1/1:4:104,149:0.53: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:71,39:0.35:-1.55:1.000:0.766 0/1/1/1:4:35,73:0.63:-1.57:1.000:0.536 0/0/1/1:4:89,117:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,123:0.61:-0.59:1.000:0.669 0/0/1/1:4:72,92:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,144:0.53: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,123:0.54:-0.35:1.000:0.984 0/0/1/1:4:136,193:0.53: 1.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,127:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,156:0.56: 0.29:1.000:0.971 0/0/1/1:4:113,96:0.43:-0.30:1.000:0.942 0/1/1/1:4:67,182:0.69: 0.21:1.000:0.971 0/0/1/1:4:70,91:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,111:0.57:-0.67:1.000:0.954 0/0/1/1:4:89,138:0.55:-0.07:1.000:0.976 0/0/1/1:4:99,135:0.52: 0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,59:0.64:-1.85:0.999:0.677 0/0/0/1:4:175,47:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,133:0.43: 0.67:1.000:0.955 0/1/1/1:4:101,219:0.64: 1.11:1.000:0.655 0/0/0/1:4:185,105:0.36: 0.73:1.000:0.709 0/0/1/1:4:77,141:0.60:-0.18:1.000:0.823 0/0/1/1:4:116,85:0.40:-0.40:1.000:0.807 0/0/1/1:4:118,86:0.40:-0.36:1.000:0.800 0/0/1/1:4:130,87:0.39:-0.19:1.000:0.647 0/0/1/1:4:52,95:0.60:-1.08:1.000:0.827 0/0/0/1:4:165,96:0.36: 0.36:1.000:0.661 0/0/1/1:4:37,75:0.62:-1.52:1.000:0.555 0/0/1/1:4:95,146:0.55: 0.11:1.000:0.979 0/0/0/1:4:253,156:0.37: 2.23:1.000:0.535 0/0/1/1:4:168,128:0.41: 0.80:1.000:0.857 0/1/1/1:4:44,178:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,130:0.39: 1.15:1.000:0.660 0/0/1/1:4:110,155:0.53: 0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:203,145:0.40: 1.46:1.000:0.769 0/0/1/1:4:180,128:0.40: 0.96:1.000:0.761 0/0/1/1:4:22,23:0.47:-2.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:94,116:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:291,46:0.18: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,197:0.80: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,191:0.58: 0.87:1.000:0.903 0/0/0/1:4:198,64:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,115:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,197:0.77: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,34:0.22:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,45:0.27:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:122,194:0.56: 1.06:1.000:0.967 0/0/1/1:4:150,102:0.39: 0.25:1.000:0.680 0/0/0/1:4:253,67:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,174:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,123:0.48: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:176,110:0.37: 0.68:0.999:0.504 0/0/1/1:4:141,108:0.41: 0.21:1.000:0.863 0/0/0/1:4:216,61:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,126:0.40: 0.87:1.000:0.781 0/0/1/1:4:135,121:0.44: 0.30:1.000:0.963 0/0/1/1:4:90,164:0.59: 0.27:1.000:0.832 0/1/1/1:4:51,145:0.70:-0.46:1.000:0.983 0/0/1/1:4:86,121:0.53:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:233,52:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,155:0.48: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:209,121:0.36: 1.23:1.000:0.671 0/0/1/1:4:124,188:0.55: 1.01:1.000:0.982 0/0/0/1:4:175,105:0.37: 0.60:1.000:0.596 1/1/1/1:4:0,267:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,155:0.47: 0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:199,134:0.39: 1.27:1.000:0.660 0/0/1/1:4:86,112:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,169:0.52: 0.79:1.000:0.996 -chr6.1 50894072 chr6.1_050894072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:31,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,19:.:-0.54:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:24,14:.:-0.69:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.48:1.000:. ./.:4:24,12:.:-0.83:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.90:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.76:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:5:57,0:.: 0.68:0.983:. ./.:4:18,7:.:-1.62:1.000:. ./.:4:38,15:.: 0.39:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,9:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,11:.:-0.11:1.000:. ./.:4:42,9:.: 0.25:1.000:. ./.:4:25,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:21,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:41,13:.: 0.47:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:24,3:.:-1.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.12:0.957:. ./.:4:33,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:38,7:.:-0.18:1.000:. ./.:4:31,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:34,18:.: 0.32:1.000:. ./.:4:52,15:.: 1.40:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:42,21:.: 1.11:1.000:. ./.:4:35,17:.: 0.32:0.999:. ./.:4:59,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:48,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:21,10:.:-1.19:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:28,12:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:43,21:.: 1.19:1.000:. ./.:6:48,10:.: 0.75:1.000:. ./.:4:60,16:.: 2.05:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:38,17:.: 0.54:1.000:. ./.:4:43,9:.: 0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:20,7:.:-1.48:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.97:0.990:. ./.:4:42,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,18:.: 0.68:1.000:. ./.:4:36,12:.: 0.03:0.999:. ./.:4:45,11:.: 0.61:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:42,16:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:43,15:.: 0.75:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:23,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,14:.: 0.39:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:43,16:.: 0.83:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.03:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:47,10:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,20:.: 2.34:1.000:. ./.:4:46,15:.: 0.97:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,4:.:-1.33:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.90:0.998:. ./.:4:51,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:45,17:.: 1.04:1.000:. ./.:4:20,15:.:-0.90:1.000:. ./.:4:45,15:.: 0.90:1.000:. ./.:4:34,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:43,13:.: 0.61:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.54:1.000:. ./.:6:109,0:.: 4.43:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:18,11:.:-1.33:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:28,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:26,16:.:-0.40:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,14:.: 0.90:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:45,15:.: 0.90:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:20,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.41:0.999:. ./.:4:46,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:42,16:.: 0.75:1.000:. ./.:4:34,14:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:39,16:.: 0.54:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:46,13:.: 0.83:1.000:. ./.:4:27,23:.: 0.18:1.000:. ./.:4:22,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:33,10:.:-0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:41,22:.: 1.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:21,12:.:-1.05:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:22,6:.:-1.41:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:47,11:.: 0.75:1.000:. ./.:4:37,13:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:38,13:.: 0.25:1.000:. ./.:4:29,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.47:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:22,11:.:-1.05:1.000:. ./.:4:37,15:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,15:.: 0.68:0.999:. ./.:4:33,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:30,8:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,14:.:-0.69:1.000:. ./.:4:23,17:.:-0.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:34,23:.: 0.68:1.000:. ./.:4:31,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:34,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,14:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,12:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:32,11:.:-0.33:1.000:. -chr6.1 51359309 chr6.1_051359309 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:155,22:.: 0.18:1.000:. ./.:4:88,23:.:-1.24:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:109,34:.:-0.55:1.000:. ./.:4:175,23:.: 0.63:1.000:. ./.:4:136,42:.: 0.20:1.000:. ./.:4:108,9:.:-1.11:1.000:. ./.:4:162,10:.: 0.07:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:71,6:.:-1.97:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:146,15:.:-0.17:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:168,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:124,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:213,20:.: 1.38:1.000:. ./.:5:227,18:.: 1.64:0.983:. ./.:4:196,16:.: 0.93:1.000:. ./.:4:192,15:.: 0.82:1.000:. ./.:4:175,24:.: 0.65:1.000:. ./.:4:48,13:.:-2.32:1.000:. ./.:4:176,19:.: 0.56:1.000:. ./.:4:167,16:.: 0.31:1.000:. ./.:4:100,27:.:-0.90:1.000:. ./.:4:76,5:.:-1.89:1.000:. ./.:4:126,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:149,14:.:-0.12:1.000:. ./.:4:122,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:156,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:152,13:.:-0.08:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:44,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:70,4:.:-2.04:1.000:. ./.:4:47,3:.:-2.56:0.957:. ./.:4:194,13:.: 0.82:1.000:. ./.:5:246,14:.: 1.96:1.000:. ./.:4:108,23:.:-0.81:1.000:. ./.:4:174,22:.: 0.59:1.000:. ./.:4:199,17:.: 1.02:1.000:. ./.:4:84,19:.:-1.42:1.000:. ./.:4:155,17:.: 0.07:1.000:. ./.:4:299,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:168,11:.: 0.22:1.000:. ./.:4:94,34:.:-0.88:1.000:. ./.:4:89,36:.:-0.94:0.999:. ./.:4:253,26:.: 2.37:1.000:. ./.:4:134,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:133,5:.:-0.66:1.000:. ./.:4:137,35:.: 0.07:1.000:. ./.:4:179,13:.: 0.50:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:112,23:.:-0.73:1.000:. ./.:4:171,23:.: 0.54:1.000:. ./.:4:157,6:.:-0.12:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:148,15:.:-0.12:1.000:. ./.:6:153,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:180,12:.: 0.50:1.000:. ./.:4:179,18:.: 0.61:1.000:. ./.:4:171,21:.: 0.50:1.000:. ./.:4:99,29:.:-0.88:1.000:. ./.:4:174,14:.: 0.41:1.000:. ./.:4:164,11:.: 0.13:1.000:. ./.:4:68,13:.:-1.89:1.000:. ./.:4:133,9:.:-0.58:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.08:0.990:. ./.:4:117,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:117,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:152,7:.:-0.21:0.999:. ./.:4:170,9:.: 0.22:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:99,23:.:-1.01:1.000:. ./.:4:172,21:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,8:.: 0.41:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:187,29:.: 1.02:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:58,17:.:-2.02:1.000:. ./.:4:173,12:.: 0.35:1.000:. ./.:4:212,15:.: 1.25:1.000:. ./.:4:144,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:188,7:.: 0.56:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:121,11:.:-0.79:1.000:. ./.:4:129,10:.:-0.64:1.000:. ./.:4:145,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:156,14:.: 0.03:1.000:. ./.:4:141,10:.:-0.38:1.000:. ./.:4:214,26:.: 1.53:1.000:. ./.:4:64,12:.:-2.00:1.000:. ./.:4:114,38:.:-0.36:1.000:. ./.:4:181,16:.: 0.61:1.000:. ./.:4:135,15:.:-0.40:1.000:. ./.:4:82,16:.:-1.52:1.000:. ./.:4:177,11:.: 0.41:1.000:. ./.:4:126,35:.:-0.17:1.000:. ./.:4:91,9:.:-1.48:1.000:. ./.:4:172,10:.: 0.28:1.000:. ./.:4:75,17:.:-1.65:1.000:. ./.:4:137,15:.:-0.36:1.000:. ./.:4:172,17:.: 0.44:0.998:. ./.:4:187,17:.: 0.76:1.000:. ./.:4:182,8:.: 0.46:1.000:. ./.:4:101,19:.:-1.05:1.000:. ./.:4:135,33:.:-0.02:1.000:. ./.:4:154,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:179,6:.: 0.35:1.000:. ./.:4:208,19:.: 1.25:1.000:. ./.:6:310,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:174,17:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,18:.:-1.97:1.000:. ./.:4:157,13:.: 0.03:1.000:. ./.:4:151,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:144,10:.:-0.32:1.000:. ./.:4:166,8:.: 0.11:1.000:. ./.:4:149,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:175,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:132,15:.:-0.47:1.000:. ./.:4:169,13:.: 0.28:1.000:. ./.:4:171,24:.: 0.56:1.000:. ./.:4:144,8:.:-0.36:1.000:. ./.:4:152,13:.:-0.08:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,40:.:-1.97:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:125,10:.:-0.73:1.000:. ./.:4:163,17:.: 0.24:1.000:. ./.:4:158,12:.: 0.03:1.000:. ./.:4:103,14:.:-1.11:0.999:. ./.:4:214,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:137,15:.:-0.36:1.000:. ./.:4:130,36:.:-0.06:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:112,17:.:-0.86:1.000:. ./.:4:125,9:.:-0.75:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:177,11:.: 0.41:1.000:. ./.:4:85,16:.:-1.46:1.000:. ./.:4:121,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:177,19:.: 0.59:1.000:. ./.:4:166,16:.: 0.28:1.000:. ./.:4:159,9:.:-0.02:1.000:. ./.:4:127,28:.:-0.30:1.000:. ./.:4:289,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:154,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:168,18:.: 0.37:1.000:. ./.:4:72,3:.:-2.02:1.000:. ./.:4:137,9:.:-0.49:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:185,14:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,25:.:-0.43:1.000:. ./.:4:158,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:137,8:.:-0.51:1.000:. ./.:4:138,44:.: 0.28:1.000:. ./.:4:140,9:.:-0.43:1.000:. ./.:4:153,16:.: 0.00:1.000:. ./.:4:159,11:.: 0.03:1.000:. ./.:4:158,8:.:-0.06:1.000:. ./.:4:188,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:122,33:.:-0.30:1.000:. ./.:4:132,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:165,6:.: 0.05:0.999:. ./.:4:127,16:.:-0.55:1.000:. ./.:4:139,15:.:-0.32:1.000:. ./.:4:116,12:.:-0.88:1.000:. ./.:4:162,10:.: 0.07:1.000:. ./.:4:102,19:.:-1.03:1.000:. ./.:4:107,31:.:-0.66:1.000:. ./.:4:102,13:.:-1.16:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:207,15:.: 1.15:1.000:. ./.:4:171,17:.: 0.41:1.000:. ./.:4:181,13:.: 0.54:1.000:. ./.:4:141,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:112,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:199,30:.: 1.30:1.000:. ./.:4:200,14:.: 0.97:1.000:. ./.:4:146,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:105,24:.:-0.86:1.000:. -chr6.1 52266116 chr6.1_052266116 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.11:1.000:. ./.:5:231,0:.: 1.83:0.983:. ./.:4:208,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:192,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.72:0.957:. ./.:4:138,0:.: 0.44:1.000:. ./.:5:132,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:242,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:9,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:184,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.24:1.000:. ./.:6:51,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.40:0.990:. ./.:4:159,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:223,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:207,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.09:0.998:. ./.:4:110,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:275,1:.: 2.51:1.000:. ./.:6:121,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:239,1:.: 1.97:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:163,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.05:0.999:. ./.:4:190,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:293,0:.: 2.76:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.30:1.000:. -chr6.1 52827999 chr6.1_052827999 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:84,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:76,21:.: 0.38:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:56,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:82,33:.: 1.01:1.000:. ./.:4:144,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.39:1.000:. ./.:5:119,1:.: 1.18:0.983:. ./.:4:44,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,5:.:-2.66:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:118,34:.: 2.30:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:105,31:.: 1.74:1.000:. ./.:4:58,37:.: 0.31:1.000:. ./.:4:95,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.28:0.957:. ./.:4:89,0:.: 0.10:1.000:. ./.:5:122,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:43,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:97,33:.: 1.53:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,31:.: 1.11:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:146,40:.: 3.49:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:105,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:34,21:.:-1.09:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:76,21:.: 0.38:1.000:. ./.:4:87,41:.: 1.46:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:81,22:.: 0.59:1.000:. ./.:6:57,19:.:-0.36:1.000:. ./.:4:58,24:.:-0.15:1.000:. ./.:4:78,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:81,36:.: 1.08:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:79,2:.:-0.18:0.990:. ./.:4:74,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:31,7:.:-1.68:0.999:. ./.:4:111,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:67,26:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:72,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:92,10:.: 0.55:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:73,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,28:.: 0.34:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:49,19:.:-0.64:1.000:. ./.:4:58,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:75,28:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,12:.:-0.88:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:44,13:.:-1.02:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:37,21:.:-0.99:1.000:. ./.:4:66,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,19:.:-1.19:1.000:. ./.:4:64,20:.:-0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.18:0.998:. ./.:4:59,23:.:-0.15:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:87,25:.: 0.90:1.000:. ./.:4:85,3:.: 0.06:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.15:1.000:. ./.:6:94,15:.: 0.80:1.000:. ./.:4:81,22:.: 0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:48,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:57,22:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,13:.:-0.53:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:29,21:.:-1.26:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:56,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:41,24:.:-0.74:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:59,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:66,24:.: 0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:54,9:.:-0.81:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:17,15:.:-1.89:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:89,34:.: 1.29:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:55,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,25:.:-0.11:1.000:. ./.:4:84,18:.: 0.55:1.000:. ./.:4:38,26:.:-0.78:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:51,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:80,15:.: 0.31:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:111,27:.: 1.81:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:111,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.41:0.999:. ./.:4:57,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:58,21:.:-0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:114,27:.: 1.91:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:91,39:.: 1.53:1.000:. ./.:4:154,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.31:1.000:. -chr6.1 53006010 chr6.1_053006010 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:121,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.52:1.000:. ./.:5:147,0:.: 0.79:0.983:. ./.:4:122,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.96:0.957:. ./.:4:145,0:.: 0.75:1.000:. ./.:5:146,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.83:0.999:. ./.:4:56,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.92:1.000:. ./.:6:65,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.65:0.990:. ./.:4:71,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.03:0.999:. ./.:4:46,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.03:0.998:. ./.:4:89,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.92:0.999:. ./.:4:64,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.07:0.999:. ./.:4:150,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:231,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:292,0:.: 3.53:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.67:1.000:. -chr6.1 53162352 chr6.1_053162352 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:50,0:.: 0.09:0.983:. ./.:4:34,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.87:0.957:. ./.:4:28,0:.:-0.89:1.000:. ./.:5:63,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.94:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.58:1.000:. ./.:6:28,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.16:0.990:. ./.:4:72,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:118,0:.: 3.13:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.98:0.998:. ./.:4:37,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:104,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:113,0:.: 2.90:1.000:. ./.:6:44,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.61:0.999:. ./.:4:49,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:96,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:95,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:96,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.05:0.999:. ./.:4:79,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.: 0.89:1.000:. -chr6.1 53461474 chr6.1_053461474 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:340,139:.: 1.85:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:210,95:.:-0.15:1.000:. ./.:4:335,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:292,134:.: 1.24:1.000:. ./.:4:268,97:.: 0.54:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:251,113:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:24,17:.:-3.19:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:316,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:241,96:.: 0.22:1.000:. ./.:4:259,102:.: 0.50:1.000:. ./.:5:324,115:.: 1.39:0.983:. ./.:4:195,105:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,127:.: 0.89:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:30,1:.:-3.30:1.000:. ./.:4:256,121:.: 0.68:1.000:. ./.:4:319,144:.: 1.67:1.000:. ./.:4:226,110:.: 0.21:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.47:1.000:. ./.:4:322,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:46,20:.:-2.90:1.000:. ./.:4:7,5:.:-3.52:0.957:. ./.:4:297,0:.:-0.24:1.000:. ./.:5:345,86:.: 1.30:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:232,85:.:-0.01:1.000:. ./.:4:228,104:.: 0.16:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:382,118:.: 2.10:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:279,105:.: 0.76:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.97:0.999:. ./.:4:72,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:216,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:249,102:.: 0.38:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:238,98:.: 0.21:1.000:. ./.:4:288,131:.: 1.16:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:286,112:.: 0.92:1.000:. ./.:4:199,98:.:-0.24:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:207,74:.:-0.42:1.000:. ./.:4:259,110:.: 0.59:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:197,91:.:-0.34:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:249,103:.: 0.39:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:351,1:.: 0.39:0.990:. ./.:4:313,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:278,126:.: 0.99:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:350,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:340,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:193,109:.:-0.18:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:213,87:.:-0.21:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:212,118:.: 0.14:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:276,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:245,107:.: 0.39:1.000:. ./.:4:179,75:.:-0.74:1.000:. ./.:4:307,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:237,118:.: 0.43:1.000:. ./.:4:180,73:.:-0.75:1.000:. ./.:4:216,129:.: 0.31:1.000:. ./.:4:240,126:.: 0.55:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:265,97:.: 0.51:1.000:. ./.:4:158,87:.:-0.84:1.000:. ./.:4:297,111:.: 1.04:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:203,106:.:-0.10:0.998:. ./.:4:278,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:224,96:.: 0.02:1.000:. ./.:4:351,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:254,98:.: 0.39:1.000:. ./.:4:224,95:.: 0.01:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.66:1.000:. ./.:6:395,112:.: 2.18:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:284,112:.: 0.90:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:224,109:.: 0.17:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:251,109:.: 0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:246,118:.: 0.53:1.000:. ./.:4:259,117:.: 0.67:1.000:. ./.:4:222,125:.: 0.33:1.000:. ./.:4:235,117:.: 0.39:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,84:.:-0.77:1.000:. ./.:4:155,86:.:-0.88:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:207,99:.:-0.14:1.000:. ./.:4:161,59:.:-1.13:0.999:. ./.:4:307,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:257,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:277,115:.: 0.85:1.000:. ./.:4:212,83:.:-0.26:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:252,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:169,93:.:-0.64:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:321,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:275,146:.: 1.19:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:238,101:.: 0.24:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:287,104:.: 0.84:1.000:. ./.:4:278,127:.: 1.00:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:236,91:.: 0.10:1.000:. ./.:4:357,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:300,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:215,105:.: 0.02:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:222,104:.: 0.09:1.000:. ./.:4:162,83:.:-0.84:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:292,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:317,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:297,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:207,92:.:-0.22:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:243,99:.: 0.28:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:279,107:.: 0.78:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:255,116:.: 0.61:1.000:. ./.:4:334,144:.: 1.84:1.000:. ./.:4:274,139:.: 1.09:1.000:. ./.:4:204,92:.:-0.25:1.000:. ./.:4:349,1:.: 0.37:1.000:. -chr6.1 53676941 chr6.1_053676941 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-3.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:53,0:.: 3.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.25:1.000:. ./.:6:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.95:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:34,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,1:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr6.1 54168303 chr6.1_054168303 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:275,51:.: 0.42:1.000:. ./.:4:225,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:234,95:.: 0.46:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:293,112:.: 1.26:1.000:. ./.:4:471,66:.: 2.65:1.000:. ./.:4:247,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:311,47:.: 0.76:1.000:. ./.:4:282,116:.: 1.19:1.000:. ./.:4:57,24:.:-2.16:1.000:. ./.:4:76,55:.:-1.64:1.000:. ./.:4:248,59:.: 0.22:1.000:. ./.:4:186,111:.: 0.12:1.000:. ./.:4:331,63:.: 1.14:1.000:. ./.:4:252,46:.: 0.13:1.000:. ./.:4:397,67:.: 1.88:1.000:. ./.:5:234,172:.: 1.27:0.983:. ./.:4:284,57:.: 0.58:1.000:. ./.:4:341,69:.: 1.31:1.000:. ./.:4:414,78:.: 2.18:1.000:. ./.:4:91,21:.:-1.84:1.000:. ./.:4:253,61:.: 0.30:1.000:. ./.:4:299,74:.: 0.92:1.000:. ./.:4:278,45:.: 0.39:1.000:. ./.:4:40,10:.:-2.49:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:347,113:.: 1.84:1.000:. ./.:4:297,91:.: 1.08:1.000:. ./.:4:341,54:.: 1.15:1.000:. ./.:4:438,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:267,59:.: 0.42:1.000:. ./.:4:179,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:67,4:.:-2.27:1.000:. ./.:4:71,10:.:-2.16:1.000:. ./.:4:30,11:.:-2.59:0.957:. ./.:4:380,57:.: 1.60:1.000:. ./.:5:322,109:.: 1.53:1.000:. ./.:4:254,120:.: 0.93:1.000:. ./.:4:261,41:.: 0.17:1.000:. ./.:4:236,87:.: 0.39:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:232,41:.:-0.14:1.000:. ./.:4:257,96:.: 0.71:1.000:. ./.:4:168,91:.:-0.28:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:200,94:.: 0.09:1.000:. ./.:4:319,61:.: 1.00:0.999:. ./.:4:216,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:178,54:.:-0.57:1.000:. ./.:4:154,112:.:-0.21:1.000:. ./.:4:127,74:.:-0.90:1.000:. ./.:4:300,35:.: 0.52:1.000:. ./.:4:157,73:.:-0.59:1.000:. ./.:4:193,106:.: 0.14:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:230,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:175,71:.:-0.42:1.000:. ./.:4:239,31:.:-0.17:1.000:. ./.:4:234,1:.:-0.54:1.000:. ./.:6:151,26:.:-1.15:1.000:. ./.:4:149,36:.:-1.07:1.000:. ./.:4:246,43:.: 0.03:1.000:. ./.:4:234,48:.:-0.04:1.000:. ./.:4:230,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:145,96:.:-0.47:1.000:. ./.:4:177,47:.:-0.65:1.000:. ./.:4:215,39:.:-0.34:1.000:. ./.:4:157,73:.:-0.59:0.990:. ./.:4:169,88:.:-0.30:1.000:. ./.:4:223,41:.:-0.23:1.000:. ./.:4:262,49:.: 0.27:0.999:. ./.:4:246,90:.: 0.53:1.000:. ./.:4:265,49:.: 0.30:1.000:. ./.:4:162,32:.:-0.97:1.000:. ./.:4:199,41:.:-0.48:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:144,76:.:-0.70:1.000:. ./.:4:124,127:.:-0.37:1.000:. ./.:4:180,87:.:-0.20:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:163,82:.:-0.43:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:266,39:.: 0.20:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:201,93:.: 0.09:1.000:. ./.:4:164,35:.:-0.92:1.000:. ./.:4:166,31:.:-0.94:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:202,75:.:-0.09:1.000:. ./.:4:198,47:.:-0.43:1.000:. ./.:4:209,21:.:-0.59:1.000:. ./.:4:199,101:.: 0.15:1.000:. ./.:4:228,30:.:-0.29:1.000:. ./.:4:151,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:183,67:.:-0.38:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:143,26:.:-1.23:1.000:. ./.:4:196,80:.:-0.10:1.000:. ./.:4:265,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:151,55:.:-0.84:1.000:. ./.:4:238,45:.:-0.03:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:184,44:.:-0.61:1.000:. ./.:4:182,55:.:-0.52:0.998:. ./.:4:234,49:.:-0.03:1.000:. ./.:4:147,71:.:-0.72:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:350,46:.: 1.16:1.000:. ./.:4:189,93:.:-0.04:1.000:. ./.:4:155,28:.:-1.09:1.000:. ./.:4:410,152:.: 2.92:1.000:. ./.:6:209,69:.:-0.08:1.000:. ./.:4:266,34:.: 0.15:1.000:. ./.:4:139,30:.:-1.23:1.000:. ./.:4:165,50:.:-0.75:1.000:. ./.:4:147,55:.:-0.89:1.000:. ./.:4:128,77:.:-0.85:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:212,80:.: 0.07:1.000:. ./.:4:131,35:.:-1.27:1.000:. ./.:4:151,115:.:-0.21:1.000:. ./.:4:309,72:.: 1.01:1.000:. ./.:4:177,41:.:-0.72:1.000:. ./.:4:189,43:.:-0.57:1.000:. ./.:4:183,33:.:-0.74:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:110,48:.:-1.35:1.000:. ./.:4:125,32:.:-1.36:1.000:. ./.:4:193,36:.:-0.60:1.000:. ./.:4:281,119:.: 1.21:1.000:. ./.:4:87,48:.:-1.59:0.999:. ./.:4:165,74:.:-0.49:1.000:. ./.:4:202,79:.:-0.05:1.000:. ./.:4:357,85:.: 1.65:1.000:. ./.:4:150,122:.:-0.15:1.000:. ./.:4:156,29:.:-1.07:1.000:. ./.:4:109,32:.:-1.53:1.000:. ./.:4:143,34:.:-1.15:1.000:. ./.:4:224,39:.:-0.24:1.000:. ./.:4:112,31:.:-1.51:1.000:. ./.:4:253,50:.: 0.18:1.000:. ./.:4:124,36:.:-1.33:1.000:. ./.:4:343,69:.: 1.33:1.000:. ./.:4:381,71:.: 1.76:1.000:. ./.:4:220,94:.: 0.30:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:292,76:.: 0.87:1.000:. ./.:4:228,37:.:-0.22:1.000:. ./.:4:304,133:.: 1.60:1.000:. ./.:4:218,79:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,4:.:-2.13:1.000:. ./.:4:235,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:308,111:.: 1.41:1.000:. ./.:4:269,95:.: 0.83:1.000:. ./.:4:285,130:.: 1.36:1.000:. ./.:4:383,104:.: 2.13:1.000:. ./.:4:184,79:.:-0.24:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:208,95:.: 0.18:1.000:. ./.:4:240,76:.: 0.32:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:216,164:.: 1.00:1.000:. ./.:4:225,83:.: 0.23:1.000:. ./.:4:327,46:.: 0.92:1.000:. ./.:4:167,140:.: 0.22:1.000:. ./.:4:235,100:.: 0.52:0.999:. ./.:4:237,92:.: 0.46:1.000:. ./.:4:234,109:.: 0.60:1.000:. ./.:4:255,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:154,54:.:-0.82:1.000:. ./.:4:245,53:.: 0.13:1.000:. ./.:4:247,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:176,46:.:-0.67:1.000:. ./.:4:163,78:.:-0.47:1.000:. ./.:4:413,59:.: 1.97:1.000:. ./.:4:327,60:.: 1.07:1.000:. ./.:4:361,45:.: 1.27:1.000:. ./.:4:252,60:.: 0.28:1.000:. ./.:4:334,53:.: 1.07:1.000:. ./.:4:329,151:.: 2.05:1.000:. ./.:4:217,219:.: 1.59:1.000:. ./.:4:250,44:.: 0.09:1.000:. ./.:4:269,45:.: 0.30:1.000:. -chr6.1 54456218 chr6.1_054456218 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:255,327:0.55: 0.00:1.000:0.984 0/1/1/1:4:111,340:0.74:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:347,169:0.32:-0.42:1.000:0.956 0/1/1/1:4:99,369:0.78:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:508,167:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,227:0.52:-1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:159,161:0.49:-1.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:231,231:0.48:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:304,128:0.29:-0.94:1.000:0.992 0/0/0/1:4:231,118:0.33:-1.47:1.000:0.925 0/0/0/1:4:249,78:0.23:-1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:129,445:0.76:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:331,148:0.30:-0.65:1.000:0.984 0/0/1/1:4:263,369:0.57: 0.32:1.000:0.951 0/0/1/1:4:225,234:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,255:0.55:-0.81:1.000:0.983 0/0/0/0/1:5:546,143:0.20: 0.68:0.983:0.995 0/1/1/1:4:110,270:0.70:-1.27:1.000:0.983 0/0/1/1:4:339,406:0.53: 1.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:255,331:0.55: 0.03:1.000:0.981 0/1/1/1:4:117,476:0.79: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,277:0.53:-0.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:337,377:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,238:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,57:0.26:-2.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:153,416:0.72:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:239,139:0.36:-1.29:1.000:0.719 0/0/0/1:4:297,106:0.26:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:340,372:0.51: 0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:112,377:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:143,410:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:264,78:0.22:-1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,208:0.63:-1.63:1.000:0.560 0/0/1/1:4:167,247:0.58:-1.06:1.000:0.909 0/0/1/1:4:83,115:0.57:-2.42:0.957:0.958 0/0/1/1:4:209,284:0.56:-0.56:1.000:0.967 0/0/0/1/1:5:377,281:0.41: 0.48:1.000:0.963 0/0/1/1:4:245,236:0.47:-0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:332,376:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:399,140:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:166,460:0.72: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:321,338:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:561,441:0.43: 2.65:1.000:0.937 0/0/0/1:4:449,184:0.28: 0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:223,690:0.74: 2.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:343,307:0.46: 0.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:318,331:0.49: 0.42:0.999:0.996 0/1/1/1:4:15,73:0.82:-3.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:456,139:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:814,421:0.33: 4.12:1.000:0.914 0/0/1/1:4:340,367:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:313,310:0.48: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:406,116:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:458,246:0.34: 0.77:1.000:0.870 0/1/1/1:4:140,318:0.68:-0.78:1.000:0.957 0/0/1/1:4:339,329:0.48: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:255,317:0.54:-0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:503,568:0.51: 3.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:154,515:0.76: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:163,391:0.69:-0.18:1.000:0.893 0/1/1/1:4:174,546:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:257,279:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:477,507:0.50: 2.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:400,441:0.51: 1.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:162,507:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:410,142:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:289,312:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:318,352:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:472,240:0.33: 0.82:0.990:0.929 0/0/1/1:4:245,309:0.54:-0.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:381,379:0.48: 1.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:184,535:0.73: 0.86:0.999:0.998 0/0/1/1:4:409,528:0.55: 2.24:1.000:0.982 0/0/1/1:4:253,290:0.52:-0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:155,521:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,257:0.48:-0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:143,458:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:510,233:0.31: 1.02:1.000:0.979 0/0/0/1:4:506,171:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:476,209:0.30: 0.65:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,557:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:376,350:0.47: 0.91:1.000:0.991 0/1/1/1:4:180,544:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,279:0.55:-0.57:1.000:0.979 0/1/1/1:4:165,640:0.79: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:499,234:0.31: 0.95:1.000:0.972 0/0/1/1:4:227,238:0.49:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:323,308:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:167,495:0.74: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:347,164:0.31:-0.45:1.000:0.969 0/0/1/1:4:282,287:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:296,312:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:446,146:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,314:0.75:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:377,333:0.45: 0.81:1.000:0.983 0/0/0/1:4:503,194:0.27: 0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:165,491:0.74: 0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:140,458:0.75: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:389,415:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:132,433:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,399:0.55: 0.74:1.000:0.974 0/0/1/1:4:360,390:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:142,359:0.70:-0.51:1.000:0.988 0/0/1/1:4:356,359:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:510,404:0.43: 2.09:0.998:0.942 0/0/1/1:4:261,232:0.46:-0.56:1.000:0.985 0/0/0/1:4:446,157:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:116,358:0.74:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:305,351:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:365,125:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:260,345:0.55: 0.15:1.000:0.975 0/0/0/1:4:442,130:0.22:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:673,394:0.36: 3.06:1.000:0.876 0/0/1/1:4:335,377:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:274,269:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:396,443:0.51: 1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:498,169:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:534,162:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:171,602:0.77: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,499:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:458,131:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:155,495:0.75: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:467,180:0.27: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,246:0.56:-0.97:1.000:0.969 0/0/1/1:4:336,358:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:317,421:0.55: 0.98:1.000:0.975 0/0/1/1:4:362,410:0.51: 1.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,647:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:410,188:0.31: 0.10:1.000:0.979 0/0/1/1:4:243,339:0.57: 0.00:1.000:0.954 0/1/1/1:4:128,475:0.78: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:276,115:0.29:-1.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:314,113:0.26:-0.98:0.999:0.999 0/0/0/1:4:415,197:0.31: 0.19:1.000:0.968 0/0/1/1:4:249,236:0.47:-0.61:1.000:0.993 0/1/1/1:4:168,465:0.72: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:417,190:0.30: 0.16:1.000:0.980 0/0/1/1:4:357,390:0.51: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:290,359:0.54: 0.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:326,360:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:331,425:0.55: 1.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:198,296:0.58:-0.55:1.000:0.897 0/0/1/1:4:259,254:0.48:-0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:407,151:0.26:-0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:328,354:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:314,387:0.54: 0.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:228,263:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:136,409:0.74:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:278,294:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:110,380:0.76:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,196:0.36:-0.29:1.000:0.740 0/0/1/1:4:203,189:0.47:-1.20:1.000:0.991 0/1/1/1:4:94,316:0.76:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,167:0.54:-1.78:1.000:0.987 0/0/0/1:4:435,181:0.29: 0.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:262,248:0.47:-0.45:1.000:0.992 0/0/1/1:4:270,294:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:412,152:0.26:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:334,122:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:138,462:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,74:0.21:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:294,92:0.23:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,425:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:352,121:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:277,109:0.28:-1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:232,223:0.47:-0.80:1.000:0.994 0/0/0/1:4:301,90:0.22:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,225:0.54:-1.13:0.999:0.986 0/0/1/1:4:213,267:0.54:-0.64:1.000:0.988 0/0/0/1:4:280,125:0.30:-1.11:1.000:0.984 0/0/1/1:4:186,256:0.56:-0.88:1.000:0.961 0/0/1/1:4:153,224:0.58:-1.29:1.000:0.919 0/1/1/1:4:136,412:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:237,248:0.49:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:239,243:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:296,162:0.34:-0.78:1.000:0.842 0/0/1/1:4:238,272:0.52:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:308,347:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:226,284:0.54:-0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:187,201:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:103,378:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:434,161:0.26: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:395,154:0.27:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,245:0.54:-0.90:1.000:0.986 0/1/1/1:4:141,422:0.74:-0.12:1.000:0.999 -chr6.1 55088564 chr6.1_055088564 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:439,51:.: 1.40:1.000:. ./.:4:310,66:.: 0.34:1.000:. ./.:4:219,85:.:-0.34:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:437,61:.: 1.47:1.000:. ./.:4:627,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:193,38:.:-1.02:1.000:. ./.:4:224,50:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,99:.:-0.11:1.000:. ./.:4:49,7:.:-2.65:1.000:. ./.:4:79,24:.:-2.22:1.000:. ./.:4:242,130:.: 0.30:1.000:. ./.:4:153,82:.:-0.98:1.000:. ./.:4:334,50:.: 0.41:1.000:. ./.:4:529,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:427,52:.: 1.30:1.000:. ./.:5:611,0:.: 2.53:0.983:. ./.:4:339,71:.: 0.65:1.000:. ./.:4:408,65:.: 1.24:1.000:. ./.:4:360,53:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:327,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:324,44:.: 0.26:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:45,12:.:-2.65:1.000:. ./.:4:522,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:193,113:.:-0.32:1.000:. ./.:4:313,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:377,71:.: 1.01:1.000:. ./.:4:400,45:.: 0.98:1.000:. ./.:4:307,47:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:100,21:.:-2.05:1.000:. ./.:4:37,16:.:-2.68:0.957:. ./.:4:378,54:.: 0.86:1.000:. ./.:5:417,62:.: 1.30:1.000:. ./.:4:298,41:.:-0.01:1.000:. ./.:4:375,43:.: 0.73:1.000:. ./.:4:395,50:.: 0.98:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:283,47:.:-0.09:1.000:. ./.:4:293,110:.: 0.59:1.000:. ./.:4:158,76:.:-0.99:1.000:. ./.:4:285,48:.:-0.07:1.000:. ./.:4:465,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.75:0.999:. ./.:4:524,68:.: 2.35:1.000:. ./.:4:260,44:.:-0.34:1.000:. ./.:4:209,65:.:-0.62:1.000:. ./.:4:183,46:.:-1.04:1.000:. ./.:4:498,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:312,42:.: 0.13:1.000:. ./.:4:246,95:.: 0.01:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:394,65:.: 1.11:1.000:. ./.:4:396,37:.: 0.87:1.000:. ./.:4:390,40:.: 0.84:1.000:. ./.:4:265,54:.:-0.20:1.000:. ./.:6:172,39:.:-1.21:1.000:. ./.:4:233,51:.:-0.52:1.000:. ./.:4:286,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:322,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:267,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:370,50:.: 0.75:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:296,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:170,89:.:-0.76:0.986:. ./.:4:188,124:.:-0.26:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:180,22:.:-1.29:0.999:. ./.:4:166,188:.: 0.13:1.000:. ./.:4:217,116:.:-0.07:1.000:. ./.:4:270,79:.: 0.08:1.000:. ./.:4:262,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:280,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,66:.:-1.42:1.000:. ./.:4:362,49:.: 0.66:1.000:. ./.:4:174,95:.:-0.66:1.000:. ./.:4:275,79:.: 0.13:1.000:. ./.:4:286,57:.: 0.03:1.000:. ./.:4:334,53:.: 0.44:1.000:. ./.:4:285,53:.:-0.02:1.000:. ./.:4:355,42:.: 0.53:1.000:. ./.:4:180,80:.:-0.75:1.000:. ./.:4:206,32:.:-0.95:1.000:. ./.:4:179,27:.:-1.25:1.000:. ./.:4:204,37:.:-0.93:1.000:. ./.:4:226,78:.:-0.34:1.000:. ./.:4:327,47:.: 0.32:1.000:. ./.:4:282,45:.:-0.12:1.000:. ./.:4:338,66:.: 0.60:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:268,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:160,38:.:-1.33:1.000:. ./.:4:208,69:.:-0.59:1.000:. ./.:4:211,42:.:-0.81:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:200,24:.:-1.08:1.000:. ./.:4:344,43:.: 0.44:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:237,36:.:-0.63:1.000:. ./.:4:303,35:.:-0.02:0.998:. ./.:4:291,53:.: 0.04:1.000:. ./.:4:210,51:.:-0.74:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:567,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:257,44:.:-0.37:1.000:. ./.:4:237,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:298,52:.: 0.09:1.000:. ./.:6:243,74:.:-0.22:1.000:. ./.:4:151,96:.:-0.87:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:324,47:.: 0.29:1.000:. ./.:4:167,33:.:-1.31:1.000:. ./.:4:241,37:.:-0.58:1.000:. ./.:4:228,40:.:-0.67:1.000:. ./.:4:260,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:275,52:.:-0.12:1.000:. ./.:4:269,38:.:-0.31:1.000:. ./.:4:300,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:403,57:.: 1.12:1.000:. ./.:4:335,49:.: 0.41:1.000:. ./.:4:279,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:140,72:.:-1.20:1.000:. ./.:4:334,33:.: 0.25:1.000:. ./.:4:136,68:.:-1.27:1.000:. ./.:4:240,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:261,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:358,38:.: 0.52:1.000:. ./.:4:186,27:.:-1.19:0.999:. ./.:4:134,84:.:-1.14:1.000:. ./.:4:324,38:.: 0.20:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:197,103:.:-0.37:1.000:. ./.:4:214,26:.:-0.94:1.000:. ./.:4:183,45:.:-1.05:1.000:. ./.:4:204,38:.:-0.92:1.000:. ./.:4:223,37:.:-0.75:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:267,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:177,20:.:-1.34:1.000:. ./.:4:379,57:.: 0.90:1.000:. ./.:4:310,58:.: 0.26:1.000:. ./.:4:277,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:213,122:.:-0.05:1.000:. ./.:4:315,54:.: 0.27:1.000:. ./.:4:275,124:.: 0.55:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:30,5:.:-2.85:1.000:. ./.:4:395,40:.: 0.89:1.000:. ./.:4:237,103:.: 0.00:1.000:. ./.:4:374,53:.: 0.81:1.000:. ./.:4:576,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:250,34:.:-0.52:1.000:. ./.:4:329,39:.: 0.26:1.000:. ./.:4:400,50:.: 1.03:1.000:. ./.:4:267,52:.:-0.20:1.000:. ./.:4:228,59:.:-0.50:1.000:. ./.:4:311,49:.: 0.19:1.000:. ./.:4:302,58:.: 0.19:1.000:. ./.:4:346,40:.: 0.43:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:218,35:.:-0.81:1.000:. ./.:4:138,120:.:-0.77:0.999:. ./.:4:233,47:.:-0.56:1.000:. ./.:4:315,48:.: 0.21:1.000:. ./.:4:332,41:.: 0.31:1.000:. ./.:4:338,44:.: 0.39:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:114,83:.:-1.34:1.000:. ./.:4:393,50:.: 0.96:1.000:. ./.:4:273,54:.:-0.12:1.000:. ./.:4:386,54:.: 0.93:1.000:. ./.:4:257,67:.:-0.15:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:371,49:.: 0.75:1.000:. ./.:4:464,61:.: 1.73:1.000:. ./.:4:373,33:.: 0.62:1.000:. ./.:4:370,103:.: 1.24:1.000:. -chr6.1 55144952 chr6.1_055144952 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:209,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.74:1.000:. ./.:5:258,0:.: 1.38:0.983:. ./.:4:251,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.30:0.957:. ./.:4:218,0:.: 0.58:1.000:. ./.:5:262,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:116,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.55:1.000:. ./.:6:181,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.08:0.986:. ./.:4:205,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:272,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:173,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:189,1:.: 0.02:0.998:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.82:1.000:. ./.:6:217,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.35:0.999:. ./.:4:171,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:329,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:263,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:323,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.69:0.999:. ./.:4:212,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:292,0:.: 2.07:1.000:. -chr6.1 55381041 chr6.1_055381041 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:75,11:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,15:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,123:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,9:0.19:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,107:0.65: 0.86:1.000:0.757 0/0/1/1:4:74,105:0.59: 1.15:1.000:0.871 0/1/1/1:4:91,165:0.64: 2.75:1.000:0.719 0/0/0/1:4:135,15:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.51:-2.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,2:0.22:-2.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,11:0.15: 0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:86,6:0.13:-0.65:1.000:0.894 0/0/1/1:4:37,61:0.62:-0.53:1.000:0.541 0/0/0/1:4:111,21:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:50,109:0.68: 0.74:0.983:0.702 0/0/1/1:4:93,75:0.47: 0.92:1.000:0.992 0/0/1/1:4:104,99:0.50: 1.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,76:0.45: 1.15:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,74:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,83:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,68:0.60:-0.22:1.000:0.765 0/0/0/1:4:5,1:0.28:-2.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,116:0.67: 1.01:1.000:0.923 0/0/0/1:4:172,26:0.25: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,25:0.31:-0.22:1.000:0.965 0/0/1/1:4:57,80:0.59: 0.28:1.000:0.885 0/0/1/1:4:111,86:0.46: 1.52:1.000:0.989 0/1/1/1:4:59,122:0.67: 1.19:1.000:0.921 0/0/0/1:4:110,16:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,12:0.74:-2.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:18,1:0.10:-2.17:1.000:0.711 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.46:0.957:1.000 0/0/0/1:4:108,16:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:79,75:0.50: 0.63:1.000:0.528 0/1/1/1:4:50,89:0.64: 0.32:1.000:0.673 0/0/0/1:4:111,25:0.29: 0.26:1.000:0.992 0/0/0/1:4:126,21:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,129:0.77: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,63:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,89:0.47: 1.59:1.000:0.992 0/0/0/1:4:106,12:0.20:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,62:0.50: 0.05:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,72:0.63:-0.20:0.999:0.571 0/0/1/1:4:32,21:0.43:-1.46:1.000:0.958 0/0/1/1:4:67,60:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,30:0.34:-0.16:1.000:0.867 0/1/1/1:4:24,59:0.70:-0.84:1.000:0.988 0/0/1/1:4:44,64:0.59:-0.32:1.000:0.835 0/0/0/1:4:76,11:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,9:0.16:-0.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,117:0.69: 0.92:1.000:0.975 0/0/1/1:4:85,101:0.55: 1.30:1.000:0.981 0/0/0/1:4:46,20:0.37:-1.19:1.000:0.551 0/0/0/1:4:64,11:0.26:-1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,108:0.56: 1.50:1.000:0.973 0/0/1/1/1/1:6:31,95:0.74: 0.05:1.000:0.539 0/1/1/1:4:23,153:0.86: 1.09:1.000:0.951 0/0/1/1:4:76,47:0.43:-0.01:1.000:0.933 0/0/0/1:4:58,9:0.26:-1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,57:0.63:-0.67:1.000:0.507 0/1/1/1:4:73,130:0.64: 1.65:1.000:0.675 0/0/0/1:4:30,13:0.37:-1.67:1.000:0.558 0/0/1/1:4:43,51:0.55:-0.61:1.000:0.982 0/0/0/1:4:79,8:0.18:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,8:0.12: 0.11:0.986:0.804 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,59:0.58:-0.43:1.000:0.929 0/1/1/1:4:27,79:0.74:-0.36:0.999:0.998 0/0/1/1:4:122,55:0.38: 1.11:1.000:0.519 0/0/0/1:4:129,57:0.37: 1.30:1.000:0.520 0/0/1/1:4:58,45:0.46:-0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:64,63:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,70:0.57: 0.01:1.000:0.951 0/0/0/1:4:102,15:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,12:0.31:-1.40:1.000:0.974 0/0/0/1:4:141,11:0.14: 0.59:1.000:0.974 0/0/1/1:4:67,38:0.41:-0.38:1.000:0.872 0/1/1/1:4:27,50:0.65:-0.96:1.000:0.765 0/0/1/1:4:104,86:0.47: 1.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:68,64:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,53:0.43: 0.24:1.000:0.952 0/0/0/1:4:113,8:0.13:-0.05:1.000:0.911 0/0/1/1:4:47,49:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,93:0.62: 0.55:1.000:0.571 0/0/1/1:4:67,70:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:105,7:0.12:-0.24:1.000:0.821 0/0/0/1:4:58,6:0.18:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,49:0.47:-0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:72,19:0.31:-0.67:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,60:0.45: 0.40:1.000:0.981 0/1/1/1:4:45,82:0.64: 0.07:1.000:0.730 0/0/1/1:4:50,45:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,105:0.75: 0.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.37:-2.08:1.000:0.539 0/0/0/1:4:64,13:0.28:-0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,82:0.72:-0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,49:0.47:-0.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,18:0.33:-1.01:0.998:0.930 0/0/1/1:4:76,43:0.41:-0.09:1.000:0.870 0/0/1/1:4:43,59:0.58:-0.45:1.000:0.909 0/1/1/1:4:61,178:0.74: 2.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,74:0.57: 0.16:1.000:0.950 0/0/1/1:4:78,62:0.47: 0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:70,48:0.44:-0.11:1.000:0.970 0/0/1/1:4:102,93:0.49: 1.48:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:126,57:0.38: 1.23:1.000:0.801 0/0/1/1:4:116,68:0.42: 1.25:1.000:0.899 0/0/1/1:4:32,45:0.59:-0.96:1.000:0.882 0/0/0/1:4:73,8:0.19:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,22:0.41:-1.32:1.000:0.889 0/0/1/1:4:54,42:0.46:-0.57:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,84:0.56: 0.57:1.000:0.966 0/0/1/1:4:72,48:0.44:-0.07:1.000:0.963 0/0/1/1:4:65,62:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,53:0.69:-0.99:1.000:0.976 0/0/1/1:4:44,26:0.42:-1.11:1.000:0.905 0/0/0/1:4:100,15:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,6:0.21:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,56:0.54:-0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:97,59:0.42: 0.67:1.000:0.924 0/1/1/1:4:30,73:0.70:-0.43:1.000:0.987 0/0/0/1:4:55,14:0.30:-1.13:1.000:0.983 0/0/0/1:4:58,4:0.13:-1.28:1.000:0.878 0/1/1/1:4:18,57:0.75:-1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,12:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,10:0.25:-0.99:0.999:0.999 0/0/0/1:4:119,9:0.14: 0.09:1.000:0.961 0/0/1/1:4:55,74:0.58: 0.11:1.000:0.926 1/1/1/1:4:0,197:1.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,21:0.33:-0.78:1.000:0.919 0/0/0/1:4:63,13:0.28:-0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,45:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:52,85:0.62: 0.28:1.000:0.566 0/0/1/1:4:51,51:0.51:-0.45:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,81:0.46: 1.38:1.000:0.985 0/0/1/1:4:43,48:0.53:-0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:99,72:0.45: 0.99:1.000:0.982 0/0/1/1:4:76,73:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,83:0.64: 0.11:1.000:0.707 0/1/1/1:4:38,122:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,78:0.39: 2.29:1.000:0.710 0/0/1/1:4:47,61:0.57:-0.32:1.000:0.950 0/0/0/1:4:180,18:0.18: 1.55:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.56:-1.86:1.000:0.962 0/0/0/1:4:85,7:0.15:-0.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:147,13:0.16: 0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,82:0.68:-0.07:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,76:0.47: 0.96:1.000:0.992 0/0/0/1:4:77,14:0.27:-0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,64:0.44: 0.72:1.000:0.969 0/0/1/1:4:97,76:0.46: 1.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:66,54:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,59:0.44: 0.49:1.000:0.964 0/1/1/1:4:46,90:0.66: 0.26:1.000:0.860 0/0/0/1:4:134,20:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,98:0.66: 0.49:1.000:0.888 0/1/1/1:4:40,87:0.68: 0.07:1.000:0.954 0/0/1/1:4:129,68:0.40: 1.52:0.999:0.789 0/1/1/1:4:39,134:0.77: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,10:0.22:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,9:0.17:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:47,26:0.41:-1.05:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,62:0.60:-0.43:1.000:0.763 0/0/1/1:4:50,60:0.55:-0.28:1.000:0.979 0/0/0/0:4:129,7:0.10: 0.26:1.000:0.770 0/0/1/1:4:126,103:0.47: 2.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,59:0.45: 0.32:1.000:0.984 0/0/1/1:4:89,72:0.47: 0.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:104,76:0.45: 1.17:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,125:0.48: 2.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,30:0.41:-0.86:1.000:0.887 0/0/0/1:4:82,11:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,69:0.45: 0.90:1.000:0.976 -chr6.1 55702136 chr6.1_055702136 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:231,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:131,34:.:-0.58:1.000:. ./.:4:164,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:164,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:80,30:.:-1.74:1.000:. ./.:4:145,48:.: 0.01:1.000:. ./.:4:160,53:.: 0.43:1.000:. ./.:4:21,8:.:-3.44:1.000:. ./.:4:33,12:.:-3.11:1.000:. ./.:4:133,32:.:-0.58:1.000:. ./.:4:187,57:.: 1.08:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.87:1.000:. ./.:5:279,0:.: 1.82:0.983:. ./.:4:237,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:13,9:.:-3.59:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:143,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:155,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:135,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.93:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.78:0.957:. ./.:4:150,46:.: 0.07:1.000:. ./.:5:221,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:139,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:192,49:.: 1.02:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,32:.: 0.58:1.000:. ./.:4:133,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.33:0.999:. ./.:4:52,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:130,31:.:-0.66:1.000:. ./.:4:132,52:.:-0.18:1.000:. ./.:4:139,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:128,51:.:-0.29:1.000:. ./.:4:173,53:.: 0.70:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:143,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.85:1.000:. ./.:6:171,12:.:-0.20:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:154,49:.: 0.22:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:159,32:.:-0.03:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:157,35:.:-0.01:0.986:. ./.:4:61,71:.:-1.27:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:101,102:.: 0.22:1.000:. ./.:4:152,47:.: 0.14:1.000:. ./.:4:147,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:134,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:162,46:.: 0.32:1.000:. ./.:4:115,43:.:-0.73:1.000:. ./.:4:157,48:.: 0.26:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:163,54:.: 0.51:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:174,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:127,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:144,42:.:-0.14:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:147,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:169,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:218,65:.: 1.90:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:143,52:.: 0.05:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:137,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:171,68:.: 0.98:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:144,37:.:-0.24:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.33:0.998:. ./.:4:133,38:.:-0.45:1.000:. ./.:4:147,51:.: 0.11:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:162,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:180,50:.: 0.79:1.000:. ./.:6:259,53:.: 2.51:1.000:. ./.:4:148,43:.:-0.03:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:135,52:.:-0.12:1.000:. ./.:4:141,37:.:-0.31:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:132,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,68:.: 0.89:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:159,56:.: 0.47:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:110,42:.:-0.85:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:174,54:.: 0.75:1.000:. ./.:4:104,23:.:-1.38:0.999:. ./.:4:166,46:.: 0.41:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:158,44:.: 0.20:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:115,43:.:-0.73:1.000:. ./.:4:184,68:.: 1.25:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:173,41:.: 0.45:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:168,52:.: 0.58:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:164,46:.: 0.37:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:30,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:160,45:.: 0.26:1.000:. ./.:4:163,42:.: 0.26:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:170,46:.: 0.49:1.000:. ./.:4:148,38:.:-0.14:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:157,50:.: 0.30:1.000:. ./.:4:125,39:.:-0.60:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,45:.:-0.45:1.000:. ./.:4:130,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:135,41:.:-0.35:1.000:. ./.:4:123,79:.: 0.20:1.000:. ./.:4:141,35:.:-0.35:1.000:. ./.:4:147,42:.:-0.08:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:128,46:.:-0.39:1.000:. ./.:4:171,55:.: 0.70:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:154,20:.:-0.39:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:186,58:.: 1.08:1.000:. ./.:4:181,65:.: 1.12:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:136,41:.:-0.33:1.000:. -chr6.1 55923540 chr6.1_055923540 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:245,61:.: 1.43:1.000:. ./.:4:90,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:134,92:.: 0.27:1.000:. ./.:4:148,138:.: 1.14:1.000:. ./.:4:201,128:.: 1.76:1.000:. ./.:4:206,129:.: 1.85:1.000:. ./.:4:43,59:.:-1.52:1.000:. ./.:4:85,143:.: 0.30:1.000:. ./.:4:116,84:.:-0.10:1.000:. ./.:4:2,32:.:-2.50:1.000:. ./.:4:6,18:.:-2.65:1.000:. ./.:4:101,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:89,161:.: 0.62:1.000:. ./.:4:159,97:.: 0.70:1.000:. ./.:4:163,116:.: 1.04:1.000:. ./.:4:217,62:.: 1.04:1.000:. ./.:5:157,156:.: 1.53:0.983:. ./.:4:158,58:.: 0.13:1.000:. ./.:4:164,125:.: 1.18:1.000:. ./.:4:128,194:.: 1.66:1.000:. ./.:4:9,10:.:-2.72:1.000:. ./.:4:149,108:.: 0.72:1.000:. ./.:4:185,132:.: 1.59:1.000:. ./.:4:134,84:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,14:.:-2.68:1.000:. ./.:4:97,78:.:-0.47:1.000:. ./.:4:125,177:.: 1.37:1.000:. ./.:4:96,143:.: 0.46:1.000:. ./.:4:135,215:.: 2.06:1.000:. ./.:4:193,39:.: 0.36:1.000:. ./.:4:90,34:.:-1.20:1.000:. ./.:4:82,108:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,11:.:-2.78:1.000:. ./.:4:34,7:.:-2.40:1.000:. ./.:4:2,4:.:-2.91:0.957:. ./.:4:97,160:.: 0.72:1.000:. ./.:5:134,147:.: 1.07:1.000:. ./.:4:100,114:.: 0.10:1.000:. ./.:4:138,29:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,66:.:-0.37:1.000:. ./.:4:104,103:.: 0.00:1.000:. ./.:4:87,161:.: 0.59:1.000:. ./.:4:172,103:.: 0.98:1.000:. ./.:4:79,125:.:-0.05:1.000:. ./.:4:168,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:93,94:.:-0.29:1.000:. ./.:4:138,202:.: 1.92:0.999:. ./.:4:99,28:.:-1.16:1.000:. ./.:4:59,98:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,43:.:-1.77:1.000:. ./.:4:73,83:.:-0.74:1.000:. ./.:4:127,206:.: 1.82:1.000:. ./.:4:144,104:.: 0.59:1.000:. ./.:4:132,114:.: 0.56:1.000:. ./.:4:165,125:.: 1.20:1.000:. ./.:4:108,73:.:-0.38:1.000:. ./.:4:120,37:.:-0.73:1.000:. ./.:4:138,29:.:-0.58:1.000:. ./.:4:79,77:.:-0.74:1.000:. ./.:6:107,35:.:-0.94:1.000:. ./.:4:131,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,87:.: 0.55:1.000:. ./.:4:97,72:.:-0.55:1.000:. ./.:4:99,53:.:-0.80:1.000:. ./.:4:149,112:.: 0.78:1.000:. ./.:4:83,62:.:-0.90:1.000:. ./.:4:49,59:.:-1.43:1.000:. ./.:4:140,98:.: 0.44:1.000:. ./.:4:82,121:.:-0.06:0.986:. ./.:4:105,107:.: 0.07:1.000:. ./.:4:134,81:.: 0.11:1.000:. ./.:4:34,57:.:-1.68:0.999:. ./.:4:41,87:.:-1.15:1.000:. ./.:4:145,126:.: 0.92:1.000:. ./.:4:78,100:.:-0.42:1.000:. ./.:4:90,56:.:-0.89:1.000:. ./.:4:131,48:.:-0.41:1.000:. ./.:4:93,143:.: 0.42:1.000:. ./.:4:38,91:.:-1.13:1.000:. ./.:4:97,136:.: 0.37:1.000:. ./.:4:99,30:.:-1.13:1.000:. ./.:4:81,94:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:135,100:.: 0.40:1.000:. ./.:4:95,27:.:-1.23:1.000:. ./.:4:129,93:.: 0.21:1.000:. ./.:4:92,73:.:-0.61:1.000:. ./.:4:76,124:.:-0.10:1.000:. ./.:4:129,80:.: 0.03:1.000:. ./.:4:130,94:.: 0.24:1.000:. ./.:4:111,33:.:-0.91:1.000:. ./.:4:135,89:.: 0.24:1.000:. ./.:4:143,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:123,41:.:-0.63:1.000:. ./.:4:87,76:.:-0.64:1.000:. ./.:4:87,111:.:-0.13:1.000:. ./.:4:127,79:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,51:.:-1.13:1.000:. ./.:4:52,153:.:-0.03:1.000:. ./.:4:147,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:75,23:.:-1.58:1.000:. ./.:4:171,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:96,69:.:-0.61:1.000:. ./.:4:128,107:.: 0.40:1.000:. ./.:4:148,64:.: 0.07:0.998:. ./.:4:116,90:.:-0.02:1.000:. ./.:4:84,115:.:-0.12:1.000:. ./.:4:157,85:.: 0.50:1.000:. ./.:4:149,176:.: 1.70:1.000:. ./.:4:91,141:.: 0.36:1.000:. ./.:4:125,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:45,201:.: 0.56:1.000:. ./.:6:237,134:.: 2.37:1.000:. ./.:4:141,111:.: 0.65:1.000:. ./.:4:40,113:.:-0.78:1.000:. ./.:4:205,47:.: 0.65:1.000:. ./.:4:24,95:.:-1.28:1.000:. ./.:4:70,120:.:-0.25:1.000:. ./.:4:139,79:.: 0.16:1.000:. ./.:4:170,46:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,169:.: 1.11:1.000:. ./.:4:130,40:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,107:.: 0.00:1.000:. ./.:4:220,45:.: 0.83:1.000:. ./.:4:151,37:.:-0.28:1.000:. ./.:4:172,122:.: 1.25:1.000:. ./.:4:104,71:.:-0.47:1.000:. ./.:4:39,58:.:-1.59:1.000:. ./.:4:72,45:.:-1.30:1.000:. ./.:4:136,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:142,48:.:-0.25:1.000:. ./.:4:140,108:.: 0.59:1.000:. ./.:4:98,54:.:-0.80:0.999:. ./.:4:94,146:.: 0.47:1.000:. ./.:4:113,116:.: 0.31:1.000:. ./.:4:117,130:.: 0.57:1.000:. ./.:4:103,102:.:-0.03:1.000:. ./.:4:174,49:.: 0.23:1.000:. ./.:4:100,146:.: 0.56:1.000:. ./.:4:127,94:.: 0.20:1.000:. ./.:4:103,146:.: 0.60:1.000:. ./.:4:55,76:.:-1.10:1.000:. ./.:4:82,142:.: 0.24:1.000:. ./.:4:61,92:.:-0.78:1.000:. ./.:4:191,123:.: 1.54:1.000:. ./.:4:160,247:.: 2.89:1.000:. ./.:4:126,110:.: 0.42:1.000:. ./.:4:151,107:.: 0.73:1.000:. ./.:4:157,108:.: 0.83:1.000:. ./.:4:76,159:.: 0.40:1.000:. ./.:4:164,118:.: 1.08:1.000:. ./.:4:102,117:.: 0.17:1.000:. ./.:4:18,14:.:-2.53:1.000:. ./.:4:165,43:.: 0.01:1.000:. ./.:4:92,162:.: 0.68:1.000:. ./.:4:155,64:.: 0.17:1.000:. ./.:4:120,117:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,179:.: 0.17:1.000:. ./.:4:158,109:.: 0.86:1.000:. ./.:4:215,56:.: 0.92:1.000:. ./.:4:40,173:.: 0.08:1.000:. ./.:4:25,165:.:-0.25:1.000:. ./.:4:129,86:.: 0.11:1.000:. ./.:4:60,176:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,149:.: 0.69:1.000:. ./.:4:115,95:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,108:.:-0.80:1.000:. ./.:4:57,144:.:-0.09:1.000:. ./.:4:54,161:.: 0.11:1.000:. ./.:4:91,137:.: 0.30:1.000:. ./.:4:116,84:.:-0.10:1.000:. ./.:4:106,37:.:-0.93:1.000:. ./.:4:90,104:.:-0.19:1.000:. ./.:4:153,103:.: 0.70:1.000:. ./.:4:53,94:.:-0.87:1.000:. ./.:4:75,100:.:-0.47:1.000:. ./.:4:146,114:.: 0.76:1.000:. ./.:4:98,134:.: 0.36:1.000:. ./.:4:201,50:.: 0.63:1.000:. ./.:4:81,134:.: 0.11:1.000:. ./.:4:189,58:.: 0.57:1.000:. ./.:4:101,173:.: 0.96:1.000:. ./.:4:101,161:.: 0.79:1.000:. ./.:4:128,28:.:-0.74:1.000:. ./.:4:117,125:.: 0.50:1.000:. -chr6.1 56115899 chr6.1_056115899 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:22,0:.: 0.92:0.983:. ./.:4:24,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-2.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:5:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:0.999:. ./.:4:1,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:6:19,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:36,0:.: 3.24:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:0.986:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.73:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:0.998:. ./.:4:24,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:6:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.06:0.999:. ./.:4:8,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.90:0.947:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.59:1.000:. -chr6.1 56760518 chr6.1_056760518 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:153,77:.:-0.50:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:146,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:252,106:.: 1.35:1.000:. ./.:4:251,94:.: 1.16:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,78:.:-1.12:1.000:. ./.:4:84,62:.:-1.71:1.000:. ./.:4:86,58:.:-1.74:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:173,74:.:-0.25:1.000:. ./.:4:187,59:.:-0.26:1.000:. ./.:4:215,73:.: 0.34:1.000:. ./.:4:182,84:.: 0.02:1.000:. ./.:5:286,163:.: 2.66:0.983:. ./.:4:244,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:167,96:.:-0.02:1.000:. ./.:4:173,90:.:-0.02:1.000:. ./.:4:139,56:.:-1.00:1.000:. ./.:4:164,72:.:-0.41:1.000:. ./.:4:173,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:167,74:.:-0.34:1.000:. ./.:4:59,21:.:-2.66:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:192,88:.: 0.23:1.000:. ./.:4:225,78:.: 0.56:1.000:. ./.:4:309,84:.: 1.86:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:200,77:.: 0.18:1.000:. ./.:4:216,67:.: 0.27:1.000:. ./.:4:80,28:.:-2.26:1.000:. ./.:4:64,63:.:-1.98:1.000:. ./.:4:32,32:.:-2.89:0.957:. ./.:4:252,75:.: 0.90:1.000:. ./.:5:187,155:.: 1.12:1.000:. ./.:4:247,75:.: 0.83:1.000:. ./.:4:133,84:.:-0.68:1.000:. ./.:4:215,84:.: 0.50:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:189,68:.:-0.11:1.000:. ./.:4:222,85:.: 0.62:1.000:. ./.:4:153,75:.:-0.52:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:171,161:.: 0.98:1.000:. ./.:4:280,87:.: 1.48:0.999:. ./.:4:508,0:.: 3.51:1.000:. ./.:4:174,80:.:-0.15:1.000:. ./.:4:150,222:.: 1.55:1.000:. ./.:4:207,75:.: 0.25:1.000:. ./.:4:332,104:.: 2.48:1.000:. ./.:4:231,100:.: 0.96:1.000:. ./.:4:161,94:.:-0.13:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:308,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:102,153:.:-0.13:1.000:. ./.:4:156,106:.:-0.03:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.67:1.000:. ./.:6:133,72:.:-0.86:1.000:. ./.:4:153,75:.:-0.52:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:178,92:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,74:.:-0.28:1.000:. ./.:4:240,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:176,155:.: 0.96:1.000:. ./.:4:142,46:.:-1.10:1.000:. ./.:4:159,75:.:-0.44:1.000:. ./.:4:184,108:.: 0.40:0.986:. ./.:4:164,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:259,83:.: 1.12:1.000:. ./.:4:133,60:.:-1.03:0.999:. ./.:4:311,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:193,84:.: 0.18:1.000:. ./.:4:188,80:.: 0.05:1.000:. ./.:4:203,74:.: 0.18:1.000:. ./.:4:106,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:272,86:.: 1.35:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:123,79:.:-0.90:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:167,91:.:-0.09:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:265,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:148,78:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,75:.:-0.77:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:291,91:.: 1.70:1.000:. ./.:4:147,54:.:-0.91:1.000:. ./.:4:198,140:.: 1.06:1.000:. ./.:4:195,90:.: 0.30:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:273,105:.: 1.64:1.000:. ./.:4:200,70:.: 0.08:1.000:. ./.:4:61,128:.:-1.09:1.000:. ./.:4:170,88:.:-0.09:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:139,149:.: 0.34:0.998:. ./.:4:279,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:234,69:.: 0.56:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:314,115:.: 2.37:1.000:. ./.:4:227,94:.: 0.82:1.000:. ./.:4:124,75:.:-0.94:1.000:. ./.:4:254,94:.: 1.21:1.000:. ./.:6:315,90:.: 2.03:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:229,76:.: 0.59:1.000:. ./.:4:153,82:.:-0.42:1.000:. ./.:4:143,141:.: 0.28:1.000:. ./.:4:260,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:219,95:.: 0.72:1.000:. ./.:4:162,68:.:-0.50:1.000:. ./.:4:204,171:.: 1.60:1.000:. ./.:4:143,99:.:-0.32:1.000:. ./.:4:136,76:.:-0.76:1.000:. ./.:4:171,104:.: 0.15:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:86,59:.:-1.72:1.000:. ./.:4:111,68:.:-1.23:1.000:. ./.:4:203,86:.: 0.36:1.000:. ./.:4:186,75:.:-0.05:1.000:. ./.:4:145,54:.:-0.94:0.999:. ./.:4:199,95:.: 0.43:1.000:. ./.:4:86,168:.:-0.15:1.000:. ./.:4:282,90:.: 1.55:1.000:. ./.:4:134,163:.: 0.47:1.000:. ./.:4:141,72:.:-0.74:1.000:. ./.:4:196,75:.: 0.10:1.000:. ./.:4:208,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:198,93:.: 0.38:1.000:. ./.:4:169,65:.:-0.44:1.000:. ./.:4:157,66:.:-0.60:1.000:. ./.:4:174,82:.:-0.12:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:232,94:.: 0.89:1.000:. ./.:4:263,89:.: 1.26:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:257,80:.: 1.05:1.000:. ./.:4:152,87:.:-0.37:1.000:. ./.:4:247,86:.: 0.99:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:144,81:.:-0.57:1.000:. ./.:4:208,85:.: 0.41:1.000:. ./.:4:243,83:.: 0.89:1.000:. ./.:4:221,182:.: 2.00:1.000:. ./.:4:243,81:.: 0.86:1.000:. ./.:4:189,83:.: 0.11:0.947:. ./.:4:228,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:156,73:.:-0.51:1.000:. ./.:4:233,79:.: 0.69:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:186,165:.: 1.25:1.000:. ./.:4:292,66:.: 1.35:1.000:. ./.:4:224,77:.: 0.53:1.000:. ./.:4:138,125:.:-0.02:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:226,77:.: 0.56:1.000:. ./.:4:232,84:.: 0.75:1.000:. ./.:4:140,70:.:-0.78:1.000:. ./.:4:91,131:.:-0.61:1.000:. ./.:4:161,69:.:-0.50:1.000:. ./.:4:217,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:181,63:.:-0.29:1.000:. ./.:4:155,60:.:-0.71:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:190,93:.: 0.27:1.000:. ./.:4:158,78:.:-0.41:1.000:. ./.:4:180,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,76:.: 0.28:1.000:. ./.:4:241,102:.: 1.13:1.000:. ./.:4:302,90:.: 1.84:1.000:. ./.:4:94,74:.:-1.39:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.31:1.000:. -chr6.1 57548882 chr6.1_057548882 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.85:1.000:. ./.:5:71,0:.: 1.90:0.983:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.62:1.000:. ./.:5:56,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:60,1:.: 1.36:0.999:. ./.:4:21,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.: 1.31:1.000:. ./.:6:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.94:0.986:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.46:0.999:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:75,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.94:0.998:. ./.:4:61,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.90:1.000:. ./.:6:23,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.85:0.999:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:101,0:.: 3.51:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.35:1.000:. -chr6.1 57790617 chr6.1_057790617 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-2.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.04:1.000:. ./.:5:28,0:.:-0.64:0.983:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:35,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:108,0:.: 4.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.03:1.000:. ./.:6:44,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.77:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:51,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:73,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.70:0.998:. ./.:4:33,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:98,0:.: 4.04:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.30:0.947:. ./.:4:31,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr6.1 59131007 chr6.1_059131007 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.69:1.000:. ./.:5:122,0:.:-0.45:0.983:. ./.:4:232,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.81:0.957:. ./.:4:6,0:.:-2.01:1.000:. ./.:5:214,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:233,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:250,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.72:1.000:. ./.:6:239,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:324,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.35:0.986:. ./.:4:107,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.52:0.999:. ./.:4:135,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:225,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:308,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:324,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:310,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:254,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.57:0.998:. ./.:4:201,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:6:240,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.97:0.999:. ./.:4:120,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.08:0.947:. ./.:4:217,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:313,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.09:1.000:. -chr6.1 59234337 chr6.1_059234337 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.73:1.000:. ./.:5:91,0:.: 1.91:0.983:. ./.:4:91,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:120,0:.: 3.10:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:16,1:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.52:0.957:. ./.:4:7,0:.:-1.52:1.000:. ./.:5:83,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.36:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:6,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.24:1.000:. ./.:6:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:71,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.48:0.986:. ./.:4:6,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.01:0.998:. ./.:4:67,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.73:1.000:. ./.:6:62,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:86,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:0.947:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.25:1.000:. -chr6.1 59554851 chr6.1_059554851 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:240,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:150,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:93,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:356,1:.: 1.96:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.88:1.000:. ./.:5:212,0:.:-0.21:0.983:. ./.:4:205,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:205,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:410,1:.: 2.78:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:184,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:389,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.36:0.957:. ./.:4:143,0:.:-1.25:1.000:. ./.:5:202,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:423,0:.: 2.96:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:390,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:429,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:272,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.85:0.986:. ./.:4:163,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:354,2:.: 1.95:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:226,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:379,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:252,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.84:0.998:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:281,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.45:1.000:. ./.:6:414,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:290,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:289,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:270,2:.: 0.69:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:212,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:179,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:199,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.12:0.947:. ./.:4:176,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:138,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:175,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.18:1.000:. -chr6.1 60394751 chr6.1_060394751 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:69,233:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,194:0.64:-0.49:1.000:0.685 0/0/1/1:4:122,94:0.45:-0.85:1.000:0.976 1/1/1/1:4:67,727:0.90: 1.78:1.000:0.833 0/1/1/1:4:61,258:0.78:-0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,343:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,343:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:140,584:0.77: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,95:0.42:-0.78:1.000:0.926 0/0/1/1:4:58,47:0.46:-1.36:1.000:0.986 0/1/1/1:4:110,197:0.63:-0.44:1.000:0.509 0/0/1/1:4:173,120:0.42:-0.50:1.000:0.926 0/0/0/1:4:197,58:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,211:0.60:-0.25:1.000:0.827 1/1/1/1:4:0,254:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,281:0.73:-0.16:1.000:0.998 0/1/1/1/1:5:86,311:0.75:-0.03:0.983:0.920 0/0/0/1:4:218,59:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,200:0.67:-0.52:1.000:0.909 0/0/1/1:4:154,120:0.45:-0.59:1.000:0.978 0/1/1/1:4:78,236:0.72:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,105:0.47:-0.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:74,214:0.71:-0.52:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,250:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,54:0.55:-1.39:1.000:0.977 1/1/1/1:4:73,767:0.90: 1.98:1.000:0.768 0/0/0/1:4:220,74:0.28:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,160:0.59:-0.63:1.000:0.843 0/1/1/1:4:80,231:0.71:-0.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:159,688:0.78: 2.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:179,497:0.71: 1.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:121,131:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,73:0.75:-1.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,108:0.80:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,56:0.81:-1.53:0.957:1.000 0/0/1/1:4:158,185:0.54:-0.27:1.000:0.989 0/0/1/1/1:5:133,154:0.54:-0.53:1.000:0.805 0/1/1/1:4:226,620:0.70: 2.01:1.000:0.989 0/1/1/1:4:60,239:0.77:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,287:0.74:-0.15:1.000:0.999 1/1/1/1:4:57,629:0.90: 1.28:1.000:0.860 0/0/1/1:4:125,97:0.45:-0.82:1.000:0.978 0/1/1/1:4:161,722:0.79: 2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,50:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,252:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,211:0.71:-0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:81,247:0.72:-0.34:0.999:0.996 0/1/1/1:4:97,309:0.73: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,137:0.71:-0.99:1.000:0.991 0/0/0/1:4:178,49:0.25:-0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:147,398:0.70: 0.64:1.000:0.987 0/1/1/1:4:82,234:0.71:-0.40:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,219:0.79:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,116:0.50:-0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:66,645:0.89: 1.40:1.000:0.568 0/1/1/1:4:106,559:0.81: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,159:0.56:-0.55:1.000:0.969 0/1/1/1:4:62,244:0.76:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,511:0.80: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:131,417:0.73: 0.66:1.000:0.696 0/1/1/1:4:115,564:0.80: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,537:0.79: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,158:0.52:-0.46:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,282:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:143,700:0.80: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,54:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,116:0.70:-1.11:1.000:0.983 0/0/1/1:4:143,159:0.53:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:166,39:0.23:-0.90:0.986:1.000 0/0/1/1:4:173,104:0.39:-0.57:1.000:0.722 1/1/1/1:4:0,328:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:197,387:0.64: 0.82:0.999:0.733 0/0/1/1:4:107,169:0.60:-0.58:1.000:0.785 0/1/1/1:4:191,538:0.71: 1.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:122,147:0.54:-0.61:1.000:0.985 0/1/1/1:4:98,479:0.80: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,539:0.79: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,46:0.24:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:149,569:0.76: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,63:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,130:0.61:-0.88:1.000:0.730 0/1/1/1:4:199,520:0.70: 1.43:1.000:0.981 0/1/1/1:4:193,570:0.72: 1.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,144:0.69:-0.92:1.000:0.969 0/1/1/1:4:145,552:0.76: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,130:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,441:0.82: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:98,489:0.81: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,469:0.79: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,106:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,125:0.64:-0.97:1.000:0.652 0/1/1/1:4:135,562:0.77: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,124:0.45:-0.56:1.000:0.983 1/1/1/1:4:39,500:0.92: 0.62:1.000:0.976 0/1/1/1:4:72,247:0.74:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,181:0.73:-0.76:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,537:0.89: 0.87:1.000:0.548 0/0/1/1:4:119,163:0.57:-0.55:1.000:0.944 0/1/1/1:4:222,536:0.68: 1.61:1.000:0.959 1/1/1/1:4:68,693:0.90: 1.63:1.000:0.692 0/0/1/1:4:102,94:0.49:-0.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,222:0.77:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:46,532:0.91: 0.79:1.000:0.918 0/1/1/1:4:138,653:0.80: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,197:0.59:-0.33:0.998:0.887 0/1/1/1:4:107,545:0.81: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,137:0.71:-0.99:1.000:0.992 1/1/1/1:4:60,706:0.91: 1.65:1.000:0.933 0/1/1/1:4:73,240:0.73:-0.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,159:0.69:-0.82:1.000:0.974 0/1/1/1:4:54,132:0.68:-0.99:1.000:0.964 0/0/1/1:4:172,165:0.49:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:187,565:0.72: 1.58:1.000:0.762 0/1/1/1:4:188,608:0.73: 1.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,158:0.78:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,263:0.73:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:106,95:0.48:-0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,419:0.80: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:126,537:0.78: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,516:0.80: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,116:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:173,556:0.73: 1.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:127,147:0.54:-0.59:1.000:0.990 0/1/1/1:4:64,218:0.74:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,196:0.79:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,168:0.68:-0.76:1.000:0.962 0/1/1/1:4:196,459:0.68: 1.14:1.000:0.945 0/1/1/1:4:58,199:0.74:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,90:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,156:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:153,485:0.73: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,260:0.78:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,136:0.73:-1.03:0.999:0.998 0/0/0/1:4:214,46:0.21:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:137,549:0.77: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,282:0.70:-0.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:219,55:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,147:0.70:-0.91:1.000:0.982 0/0/1/1:4:118,103:0.47:-0.83:1.000:0.993 1/1/1/1:4:52,596:0.91: 1.11:1.000:0.909 0/0/1/1:4:143,99:0.42:-0.73:1.000:0.925 0/1/1/1:4:126,472:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,90:0.41:-0.80:1.000:0.873 0/1/1/1:4:49,121:0.69:-1.06:1.000:0.967 0/1/1/1:4:161,851:0.81: 2.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,136:0.47:-0.48:1.000:0.990 0/1/1/1:4:230,642:0.71: 2.13:1.000:0.990 1/1/1/1:4:63,644:0.90: 1.38:1.000:0.700 0/1/1/1:4:234,573:0.68: 1.83:1.000:0.964 0/1/1/1:4:54,199:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,149:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:123,602:0.80: 1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,206:0.79:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,158:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,69:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:148,684:0.79: 1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,275:0.74:-0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,132:0.48:-0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,177:0.73:-0.77:0.947:0.997 0/1/1/1:4:161,752:0.79: 2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,137:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,100:0.48:-0.87:1.000:0.994 0/1/1/1:4:74,680:0.89: 1.59:1.000:0.624 0/0/1/1:4:126,125:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,157:0.53:-0.47:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,291:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,103:0.47:-0.83:1.000:0.993 0/0/0/1:4:190,54:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:171,431:0.69: 0.90:1.000:0.973 0/0/1/1:4:103,157:0.59:-0.65:1.000:0.842 0/0/1/1:4:104,94:0.48:-0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,132:0.55:-0.74:1.000:0.984 0/1/1/1:4:196,519:0.70: 1.42:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,235:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,195:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,49:0.26:-0.87:1.000:0.998 0/1/1/1:4:72,307:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,137:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:69,252:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,96:0.43:-0.78:1.000:0.943 1/1/1/1:4:68,674:0.89: 1.54:1.000:0.612 0/1/1/1:4:67,210:0.73:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,238:0.59:-0.02:1.000:0.881 0/1/1/1:4:104,539:0.81: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,173:0.55:-0.42:1.000:0.979 -chr6.1 62006497 chr6.1_062006497 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:145,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:185,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:193,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:8,7:.:-1.83:1.000:. ./.:4:17,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:52,3:.:-0.83:1.000:. ./.:4:108,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:189,0:.: 2.51:1.000:. ./.:5:150,10:.: 1.79:0.983:. ./.:4:65,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:68,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:23,6:.:-1.48:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:13,4:.:-1.78:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:61,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,4:.: 0.86:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:58,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:14,4:.:-1.75:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.63:0.957:. ./.:4:107,5:.: 0.59:1.000:. ./.:5:92,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:57,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:178,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:45,3:.:-1.00:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:31,5:.:-1.30:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:103,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:120,3:.: 0.86:0.999:. ./.:4:115,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:43,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:46,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:106,4:.: 0.54:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:89,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.56:1.000:. ./.:6:38,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.88:1.000:. ./.:4:51,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:100,2:.: 0.34:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.20:0.986:. ./.:4:53,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.58:0.999:. ./.:4:43,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:47,6:.:-0.88:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:40,4:.:-1.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:74,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:26,5:.:-1.43:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.42:0.998:. ./.:4:71,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:123,4:.: 0.96:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.46:1.000:. ./.:6:163,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:73,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:34,6:.:-1.20:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:53,9:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,4:.:-0.36:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:58,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:45,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:125,10:.: 1.16:1.000:. ./.:4:43,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,4:.:-1.48:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:49,6:.:-0.83:1.000:. ./.:4:31,6:.:-1.28:1.000:. ./.:4:72,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:76,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:75,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:83,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:82,6:.:-0.01:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:69,3:.:-0.41:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:121,6:.: 0.96:1.000:. ./.:4:65,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.39:0.947:. ./.:4:155,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:59,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:40,6:.:-1.05:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:109,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:39,3:.:-1.15:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.53:1.000:. ./.:4:89,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:47,7:.:-0.85:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.60:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:77,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:179,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:52,3:.:-0.83:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:59,5:.:-0.61:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:134,6:.: 1.29:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.75:1.000:. -chr6.1 62337651 chr6.1_062337651 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:95,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.34:1.000:. ./.:5:24,0:.:-0.64:0.983:. ./.:4:4,10:.:-1.14:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:59,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.69:0.957:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:5:30,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.55:1.000:. ./.:6:48,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.55:0.986:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.90:0.999:. ./.:4:56,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:65,1:.: 1.45:0.998:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:105,0:.: 3.39:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:40,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:53,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:41,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:53,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:127,0:.: 4.48:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:0.947:. ./.:4:27,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:1.000:. -chr6.1 62389890 chr6.1_062389890 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:271,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.12:1.000:. ./.:5:277,1:.: 1.62:0.965:. ./.:4:214,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:223,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:194,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:225,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.42:1.000:. ./.:3:40,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.70:1.000:. ./.:5:247,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:247,2:.: 1.13:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:307,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:232,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.53:0.999:. ./.:4:66,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.89:1.000:. ./.:6:97,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:267,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:220,1:.: 0.67:0.986:. ./.:4:215,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:239,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:283,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:237,2:.: 0.97:1.000:. ./.:4:108,2:.:-1.19:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.83:0.998:. ./.:4:106,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:244,1:.: 1.07:1.000:. ./.:6:293,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:167,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:192,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:131,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:230,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:247,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:173,1:.:-0.12:0.947:. ./.:4:193,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:303,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:260,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.20:1.000:. -chr6.1 62617671 chr6.1_062617671 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:211,103:.: 1.11:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:172,112:.: 0.54:1.000:. ./.:4:243,38:.: 0.48:1.000:. ./.:4:194,116:.: 1.03:1.000:. ./.:4:192,147:.: 1.58:1.000:. ./.:4:162,44:.:-0.95:1.000:. ./.:4:212,38:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,112:.: 0.50:1.000:. ./.:4:108,11:.:-2.60:1.000:. ./.:4:138,4:.:-2.17:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:253,41:.: 0.73:1.000:. ./.:4:229,56:.: 0.55:1.000:. ./.:4:171,101:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,110:.: 0.17:1.000:. ./.:5:226,90:.: 1.14:0.965:. ./.:4:359,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:202,131:.: 1.47:1.000:. ./.:4:284,60:.: 1.68:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:159,94:.:-0.05:1.000:. ./.:4:177,118:.: 0.75:1.000:. ./.:4:159,107:.: 0.19:1.000:. ./.:4:72,15:.:-3.21:1.000:. ./.:4:271,50:.: 1.24:1.000:. ./.:4:208,47:.:-0.02:1.000:. ./.:4:234,59:.: 0.71:1.000:. ./.:4:289,44:.: 1.47:1.000:. ./.:4:219,51:.: 0.27:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:170,98:.: 0.23:1.000:. ./.:4:85,18:.:-2.91:1.000:. ./.:4:97,53:.:-2.01:1.000:. ./.:3:70,15:.:-3.25:1.000:. ./.:4:251,48:.: 0.82:1.000:. ./.:5:202,98:.: 0.84:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:155,96:.:-0.09:1.000:. ./.:4:161,103:.: 0.16:1.000:. ./.:4:182,49:.:-0.47:1.000:. ./.:4:215,68:.: 0.52:1.000:. ./.:4:251,121:.: 2.21:1.000:. ./.:4:191,42:.:-0.43:1.000:. ./.:4:176,93:.: 0.25:1.000:. ./.:4:188,63:.:-0.09:1.000:. ./.:4:247,41:.: 0.61:0.999:. ./.:4:222,64:.: 0.57:1.000:. ./.:4:156,98:.:-0.03:1.000:. ./.:4:237,56:.: 0.71:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:268,71:.: 1.58:1.000:. ./.:4:164,84:.:-0.15:1.000:. ./.:4:165,91:.: 0.00:1.000:. ./.:4:194,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:191,54:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,47:.: 0.16:1.000:. ./.:4:212,119:.: 1.43:1.000:. ./.:4:196,36:.:-0.45:1.000:. ./.:6:207,22:.:-0.51:1.000:. ./.:4:240,40:.: 0.46:1.000:. ./.:4:219,47:.: 0.19:1.000:. ./.:4:187,53:.:-0.30:1.000:. ./.:4:171,62:.:-0.43:1.000:. ./.:4:248,62:.: 1.03:1.000:. ./.:4:220,35:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,32:.:-1.44:1.000:. ./.:4:226,44:.: 0.27:1.000:. ./.:4:225,52:.: 0.40:0.986:. ./.:4:252,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:201,112:.: 1.09:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:325,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:240,56:.: 0.76:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:187,50:.:-0.36:1.000:. ./.:4:189,62:.:-0.09:1.000:. ./.:4:186,36:.:-0.64:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:203,52:.:-0.02:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:221,62:.: 0.52:1.000:. ./.:4:130,90:.:-0.68:1.000:. ./.:4:214,46:.: 0.08:1.000:. ./.:4:189,121:.: 1.03:1.000:. ./.:4:142,43:.:-1.35:1.000:. ./.:4:183,38:.:-0.66:1.000:. ./.:4:160,43:.:-1.01:1.000:. ./.:4:198,89:.: 0.59:1.000:. ./.:4:103,86:.:-1.27:1.000:. ./.:4:212,45:.: 0.02:1.000:. ./.:4:160,118:.: 0.42:1.000:. ./.:4:165,33:.:-1.10:1.000:. ./.:4:211,36:.:-0.17:1.000:. ./.:4:158,71:.:-0.51:1.000:. ./.:4:201,31:.:-0.45:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:262,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:233,50:.: 0.52:1.000:. ./.:4:172,32:.:-0.99:1.000:. ./.:4:197,91:.: 0.61:1.000:. ./.:4:163,35:.:-1.10:1.000:. ./.:4:209,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:124,50:.:-1.56:0.998:. ./.:4:178,36:.:-0.80:1.000:. ./.:4:136,74:.:-0.87:1.000:. ./.:4:200,45:.:-0.21:1.000:. ./.:4:321,57:.: 2.32:1.000:. ./.:4:172,116:.: 0.61:1.000:. ./.:4:190,78:.: 0.23:1.000:. ./.:4:257,62:.: 1.20:1.000:. ./.:6:184,143:.: 1.35:1.000:. ./.:4:168,54:.:-0.64:1.000:. ./.:4:148,28:.:-1.52:1.000:. ./.:4:167,73:.:-0.30:1.000:. ./.:4:183,44:.:-0.55:1.000:. ./.:4:160,41:.:-1.04:1.000:. ./.:4:201,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:202,36:.:-0.34:1.000:. ./.:4:171,89:.: 0.08:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:174,46:.:-0.68:1.000:. ./.:4:145,106:.:-0.09:1.000:. ./.:4:182,90:.: 0.31:1.000:. ./.:4:199,99:.: 0.80:1.000:. ./.:4:185,39:.:-0.61:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:123,55:.:-1.48:1.000:. ./.:4:107,52:.:-1.84:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:146,105:.:-0.09:1.000:. ./.:4:107,60:.:-1.69:0.999:. ./.:4:194,40:.:-0.42:1.000:. ./.:4:220,28:.:-0.15:1.000:. ./.:4:254,53:.: 0.97:1.000:. ./.:4:240,40:.: 0.46:1.000:. ./.:4:136,71:.:-0.93:1.000:. ./.:4:153,34:.:-1.31:1.000:. ./.:4:158,25:.:-1.39:1.000:. ./.:4:227,34:.: 0.10:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:187,48:.:-0.40:1.000:. ./.:4:135,58:.:-1.20:1.000:. ./.:4:307,51:.: 1.94:1.000:. ./.:4:316,69:.: 2.46:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:228,53:.: 0.48:1.000:. ./.:4:235,64:.: 0.82:1.000:. ./.:4:208,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:206,124:.: 1.41:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:107,12:.:-2.60:1.000:. ./.:4:130,93:.:-0.62:1.000:. ./.:4:226,70:.: 0.76:1.000:. ./.:4:220,54:.: 0.35:1.000:. ./.:4:261,61:.: 1.26:1.000:. ./.:4:268,63:.: 1.43:1.000:. ./.:4:133,96:.:-0.51:0.947:. ./.:4:229,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:257,57:.: 1.11:1.000:. ./.:4:187,50:.:-0.36:1.000:. ./.:4:196,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:205,51:.: 0.00:1.000:. ./.:4:203,57:.: 0.08:1.000:. ./.:4:182,126:.: 0.99:1.000:. ./.:4:183,45:.:-0.53:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:212,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:158,45:.:-1.01:1.000:. ./.:4:178,49:.:-0.55:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:119,89:.:-0.91:1.000:. ./.:4:176,45:.:-0.66:1.000:. ./.:4:195,39:.:-0.42:1.000:. ./.:4:188,114:.: 0.88:1.000:. ./.:4:211,42:.:-0.05:1.000:. ./.:4:186,132:.: 1.18:1.000:. ./.:4:255,32:.: 0.59:1.000:. ./.:4:206,65:.: 0.29:1.000:. ./.:4:218,117:.: 1.51:1.000:. ./.:4:258,63:.: 1.24:1.000:. ./.:4:226,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.55:1.000:. -chr6.1 62976299 chr6.1_062976299 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:124,107:0.47: 0.92:1.000:0.992 0/0/0/1:4:102,42:0.30:-0.92:1.000:0.981 0/0/1/1:4:122,91:0.44: 0.54:1.000:0.959 0/1/1/1:4:38,147:0.80:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,62:0.31: 0.37:1.000:0.965 0/0/1/1:4:99,90:0.48: 0.03:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,145:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,95:0.51: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,48:0.61:-2.27:1.000:0.738 0/0/1/1:4:24,18:0.44:-3.08:1.000:0.962 0/0/1/1:4:82,105:0.57:-0.01:1.000:0.953 0/0/1/1:4:100,94:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,119:0.62: 0.14:1.000:0.582 0/0/1/1:4:102,108:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,110:0.59:-0.01:1.000:0.838 0/0/0/1/1:5:149,111:0.44: 1.53:0.965:0.929 0/1/1/1:4:58,157:0.74: 0.58:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,206:0.79: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,196:0.79: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,33:0.48:-2.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,107:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,167:0.78: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,89:0.52:-0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,6:0.19:-3.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,193:0.73: 1.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,107:0.55: 0.22:1.000:0.983 0/0/0/1:4:126,50:0.30:-0.24:1.000:0.988 0/0/1/1:4:97,121:0.56: 0.64:1.000:0.966 0/1/1/1:4:52,137:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:151,63:0.31: 0.56:1.000:0.978 0/0/0/1:4:117,34:0.24:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,13:0.44:-3.33:1.000:0.969 0/0/0/1:4:43,22:0.35:-2.59:1.000:0.796 0/0/1:3:9,8:0.48:-3.61:1.000:0.819 0/0/0/1:4:154,47:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:101,165:0.63: 1.66:1.000:0.958 0/0/0/1:4:145,43:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,128:0.52: 1.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:124,51:0.30:-0.27:1.000:0.981 0/1/1/1:4:41,137:0.77:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,151:0.70: 0.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:137,190:0.59: 2.95:1.000:0.882 0/0/1/1:4:110,92:0.46: 0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:123,96:0.45: 0.66:1.000:0.976 0/0/1/1:4:96,92:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,113:0.55: 0.43:0.999:0.981 0/1/1/1:4:17,65:0.80:-2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,119:0.52: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:141,45:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,44:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,138:0.49: 2.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:136,44:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,134:0.48: 2.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,136:0.74:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,106:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,39:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,89:0.44: 0.41:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:53,112:0.68:-0.48:1.000:0.911 0/1/1/1:4:51,144:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,107:0.58:-0.01:1.000:0.922 0/0/1/1:4:101,119:0.55: 0.69:1.000:0.983 0/0/1/1:4:90,78:0.47:-0.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,160:0.79: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,44:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,82:0.59:-0.98:1.000:0.879 0/0/1/1:4:97,93:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,85:0.44: 0.22:0.986:0.963 0/0/0/1:4:167,41:0.21: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,106:0.47: 0.85:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,108:0.75:-0.90:0.999:0.999 0/0/0/1:4:168,60:0.28: 0.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,146:0.69: 0.54:1.000:0.975 0/0/1/1:4:92,84:0.48:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,77:0.47:-0.44:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,136:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,106:0.54: 0.20:1.000:0.985 0/0/0/1:4:126,56:0.32:-0.12:1.000:0.954 0/0/1/1:4:94,121:0.57: 0.58:1.000:0.950 0/1/1/1:4:45,98:0.69:-0.94:1.000:0.975 0/0/0/1:4:159,49:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,191:0.78: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,134:0.79:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,152:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,115:0.52: 0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:117,26:0.20:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,119:0.66:-0.12:1.000:0.865 0/1/1/1:4:50,129:0.73:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,92:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,113:0.78:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,47:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,111:0.53: 0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,91:0.55:-0.46:1.000:0.975 0/0/0/1:4:125,46:0.28:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,103:0.46: 0.83:1.000:0.988 0/1/1/1:4:36,102:0.74:-1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,95:0.56:-0.37:1.000:0.959 0/0/1/1:4:106,95:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,80:0.47:-0.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:131,43:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,107:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,92:0.69:-1.13:1.000:0.976 0/0/1/1:4:97,94:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,98:0.47: 0.47:0.998:0.993 0/1/1/1:4:43,140:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,83:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,162:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,103:0.47: 0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,104:0.57:-0.08:1.000:0.944 0/1/1/1:4:55,137:0.72: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:149,143:0.50: 2.21:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:94,194:0.68: 2.12:1.000:0.917 0/1/1/1:4:54,160:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,60:0.45:-1.11:1.000:0.982 0/0/1/1:4:133,115:0.47: 1.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:152,38:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,144:0.76: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,114:0.70:-0.50:1.000:0.986 0/0/1/1:4:102,108:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,81:0.54:-0.73:1.000:0.990 0/0/0/0:4:214,1:0.02: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,91:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,75:0.48:-0.58:1.000:0.994 0/1/1/1:4:55,164:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:57,127:0.70:-0.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:80,69:0.47:-0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,60:0.49:-1.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,105:0.71:-0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:103,82:0.45:-0.05:1.000:0.981 0/0/0/1:4:143,51:0.28: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,19:0.23:-2.06:0.999:1.000 0/0/1/1:4:91,104:0.54: 0.16:1.000:0.988 0/1/1/1:4:51,135:0.73:-0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,122:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,124:0.62: 0.28:1.000:0.536 0/1/1/1:4:35,110:0.76:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,139:0.77:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,112:0.76:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,156:0.81: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,123:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,59:0.51:-1.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,137:0.55: 1.38:1.000:0.982 0/1/1/1:4:61,198:0.77: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,96:0.45: 0.60:1.000:0.982 0/1/1/1:4:52,153:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,130:0.69: 0.05:1.000:0.973 0/0/1/1:4:80,88:0.53:-0.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,108:0.56: 0.14:1.000:0.963 0/0/1/1:4:83,113:0.58: 0.18:1.000:0.904 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-3.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,76:0.53:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:129,110:0.47: 1.09:1.000:0.991 0/0/0/1:4:136,49:0.28:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,59:0.28: 0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,112:0.53: 0.54:1.000:0.992 0/0/0/1:4:126,31:0.21:-0.65:0.947:1.000 0/1/1/1:4:60,161:0.73: 0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,107:0.72:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,82:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,128:0.74:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,47:0.29:-0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:154,50:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,110:0.52: 0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:109,32:0.24:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,90:0.46: 0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:120,107:0.48: 0.83:1.000:0.995 0/0/0/1:4:140,44:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,129:0.80:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,39:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,170:0.81: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,82:0.46:-0.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:81,92:0.54:-0.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:80,76:0.49:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,59:0.27: 0.92:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,159:0.72: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,89:0.47: 0.14:1.000:0.991 0/1/1/1:4:45,126:0.74:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,108:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,136:0.51: 1.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,60:0.24: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,80:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,122:0.57: 0.64:1.000:0.957 -chr6.1 63214795 chr6.1_063214795 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:226,82:.: 0.77:1.000:. ./.:4:47,129:.:-1.44:1.000:. ./.:4:220,38:.:-0.07:1.000:. ./.:4:203,68:.: 0.15:1.000:. ./.:4:182,109:.: 0.49:1.000:. ./.:4:273,108:.: 2.00:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:215,27:.:-0.33:1.000:. ./.:4:183,34:.:-0.75:1.000:. ./.:4:128,4:.:-2.18:1.000:. ./.:4:111,11:.:-2.35:1.000:. ./.:4:126,92:.:-0.74:1.000:. ./.:4:208,25:.:-0.49:1.000:. ./.:4:193,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:235,78:.: 0.86:1.000:. ./.:4:226,81:.: 0.76:1.000:. ./.:5:312,79:.: 2.17:0.965:. ./.:4:222,87:.: 0.79:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:97,32:.:-2.23:1.000:. ./.:4:190,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:325,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:101,112:.:-0.82:1.000:. ./.:4:36,42:.:-3.09:1.000:. ./.:4:243,97:.: 1.31:1.000:. ./.:4:204,43:.:-0.25:1.000:. ./.:4:145,124:.: 0.12:1.000:. ./.:4:243,90:.: 1.19:1.000:. ./.:4:225,102:.: 1.09:1.000:. ./.:4:157,123:.: 0.30:1.000:. ./.:4:144,128:.: 0.17:1.000:. ./.:4:40,7:.:-3.61:1.000:. ./.:4:148,42:.:-1.21:1.000:. ./.:3:69,11:.:-3.06:1.000:. ./.:4:191,44:.:-0.45:1.000:. ./.:5:335,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:139,80:.:-0.72:1.000:. ./.:4:250,80:.: 1.14:1.000:. ./.:4:130,110:.:-0.37:1.000:. ./.:4:223,82:.: 0.72:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:321,89:.: 2.49:1.000:. ./.:4:227,43:.: 0.14:1.000:. ./.:4:276,67:.: 1.36:1.000:. ./.:4:255,71:.: 1.08:1.000:. ./.:4:232,79:.: 0.82:0.999:. ./.:4:283,99:.: 2.02:1.000:. ./.:4:229,47:.: 0.24:1.000:. ./.:4:235,62:.: 0.59:1.000:. ./.:4:158,126:.: 0.37:1.000:. ./.:4:289,107:.: 2.25:1.000:. ./.:4:131,91:.:-0.67:1.000:. ./.:4:250,50:.: 0.64:1.000:. ./.:4:190,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:177,168:.: 1.39:1.000:. ./.:4:223,67:.: 0.47:1.000:. ./.:4:246,87:.: 1.19:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.20:1.000:. ./.:6:214,10:.:-0.64:1.000:. ./.:4:294,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:136,115:.:-0.18:1.000:. ./.:4:249,85:.: 1.21:1.000:. ./.:4:217,53:.: 0.14:1.000:. ./.:4:267,70:.: 1.26:1.000:. ./.:4:273,38:.: 0.82:1.000:. ./.:4:141,35:.:-1.44:1.000:. ./.:4:208,66:.: 0.20:1.000:. ./.:4:245,51:.: 0.57:0.986:. ./.:4:76,137:.:-0.82:1.000:. ./.:4:232,85:.: 0.92:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:94,198:.: 0.50:1.000:. ./.:4:231,37:.: 0.10:1.000:. ./.:4:150,147:.: 0.59:1.000:. ./.:4:139,107:.:-0.27:1.000:. ./.:4:244,65:.: 0.79:1.000:. ./.:4:241,35:.: 0.24:1.000:. ./.:4:79,111:.:-1.21:1.000:. ./.:4:247,39:.: 0.40:1.000:. ./.:4:174,57:.:-0.52:1.000:. ./.:4:174,117:.: 0.49:1.000:. ./.:4:233,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:240,57:.: 0.59:1.000:. ./.:4:205,35:.:-0.37:1.000:. ./.:4:154,28:.:-1.34:1.000:. ./.:4:167,30:.:-1.09:1.000:. ./.:4:192,22:.:-0.81:1.000:. ./.:4:189,30:.:-0.72:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:143,113:.:-0.10:1.000:. ./.:4:297,41:.: 1.28:1.000:. ./.:4:166,64:.:-0.54:1.000:. ./.:4:216,71:.: 0.42:1.000:. ./.:4:233,28:.:-0.02:1.000:. ./.:4:188,83:.: 0.15:1.000:. ./.:4:156,73:.:-0.55:1.000:. ./.:4:227,34:.:-0.02:1.000:. ./.:4:245,67:.: 0.84:1.000:. ./.:4:143,41:.:-1.31:1.000:. ./.:4:229,81:.: 0.81:1.000:. ./.:4:171,54:.:-0.62:1.000:. ./.:4:116,93:.:-0.89:1.000:. ./.:4:219,55:.: 0.20:0.998:. ./.:4:183,33:.:-0.77:1.000:. ./.:4:233,36:.: 0.12:1.000:. ./.:4:173,87:.:-0.03:1.000:. ./.:4:248,108:.: 1.58:1.000:. ./.:4:210,30:.:-0.37:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:282,44:.: 1.08:1.000:. ./.:6:359,25:.: 2.05:1.000:. ./.:4:213,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:169,43:.:-0.84:1.000:. ./.:4:261,74:.: 1.23:1.000:. ./.:4:192,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:273,86:.: 1.63:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:181,66:.:-0.25:1.000:. ./.:4:217,36:.:-0.15:1.000:. ./.:4:213,84:.: 0.59:1.000:. ./.:4:165,102:.: 0.08:1.000:. ./.:4:219,71:.: 0.47:1.000:. ./.:4:230,74:.: 0.71:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:192,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:101,122:.:-0.65:1.000:. ./.:4:135,10:.:-1.96:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:228,80:.: 0.77:1.000:. ./.:4:128,103:.:-0.52:1.000:. ./.:4:105,67:.:-1.51:0.999:. ./.:4:236,31:.: 0.08:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:256,90:.: 1.41:1.000:. ./.:4:264,27:.: 0.49:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:202,66:.: 0.10:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:162,21:.:-1.33:1.000:. ./.:4:157,107:.: 0.03:1.000:. ./.:4:394,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:229,63:.: 0.50:1.000:. ./.:4:188,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:255,34:.: 0.45:1.000:. ./.:4:166,60:.:-0.60:1.000:. ./.:4:235,45:.: 0.30:1.000:. ./.:4:214,80:.: 0.54:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:150,62:.:-0.84:1.000:. ./.:4:272,34:.: 0.74:1.000:. ./.:4:151,121:.: 0.17:1.000:. ./.:4:248,92:.: 1.31:1.000:. ./.:4:213,24:.:-0.42:1.000:. ./.:4:102,76:.:-1.41:0.947:. ./.:4:225,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:220,36:.:-0.10:1.000:. ./.:4:197,63:.:-0.03:1.000:. ./.:4:196,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:219,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:204,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:177,34:.:-0.86:1.000:. ./.:4:201,36:.:-0.42:1.000:. ./.:4:205,20:.:-0.62:1.000:. ./.:4:125,83:.:-0.91:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:164,49:.:-0.82:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:174,78:.:-0.17:1.000:. ./.:4:171,48:.:-0.72:1.000:. ./.:4:163,37:.:-1.04:1.000:. ./.:4:133,124:.:-0.08:1.000:. ./.:4:295,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:215,66:.: 0.32:1.000:. ./.:4:228,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:210,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:273,43:.: 0.91:1.000:. ./.:4:151,114:.: 0.05:1.000:. ./.:4:168,67:.:-0.45:1.000:. ./.:4:168,114:.: 0.34:1.000:. -chr6.1 63320971 chr6.1_063320971 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:216,56:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,39:0.22: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,91:0.47: 0.47:1.000:0.993 0/0/0/1:4:219,37:0.19: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,74:0.44: 0.01:1.000:0.971 0/0/1/1:4:204,130:0.48: 1.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:187,34:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,105:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,111:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,49:0.69:-2.09:1.000:0.979 0/0/0/1:4:113,40:0.33:-0.76:1.000:0.932 0/0/0/1:4:232,45:0.21: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,101:0.48: 0.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:223,54:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,98:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:302,58:0.21: 2.30:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:160,89:0.44: 0.66:1.000:0.964 0/0/1/1:4:174,120:0.50: 1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,90:0.43: 0.76:1.000:0.950 0/0/0/1:4:72,30:0.36:-1.52:1.000:0.629 0/0/1/1:4:141,108:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,95:0.44: 0.91:1.000:0.964 0/0/0/1:4:208,43:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,36:0.48:-1.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:319,82:0.26: 2.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,115:0.45: 1.59:1.000:0.981 0/0/1/1:4:142,101:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,87:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/0:4:360,0:0.00: 2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,117:0.45: 1.65:1.000:0.983 0/0/1/1:4:171,101:0.45: 1.00:1.000:0.984 0/0/1/1:4:39,46:0.57:-1.77:1.000:0.949 0/0/0/1:4:99,14:0.16:-1.35:1.000:0.995 0/0/1:3:48,12:0.26:-2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,157:0.64: 0.41:1.000:0.698 0/0/1/1/1:5:184,140:0.51: 1.77:1.000:0.611 0/1/1/1:4:77,153:0.63: 0.38:1.000:0.625 0/0/0/1:4:202,46:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,99:0.47: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:161,30:0.20:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,93:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:294,43:0.16: 1.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,68:0.44:-0.23:1.000:0.969 0/0/0/1:4:141,36:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,71:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,81:0.44: 0.29:0.999:0.972 0/0/0/0:4:318,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,122:0.64:-0.36:1.000:0.705 0/1/1/1:4:78,146:0.63: 0.29:1.000:0.532 0/0/0/1:4:87,36:0.36:-1.21:1.000:0.649 0/0/1/1:4:148,107:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,63:0.53:-1.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:178,37:0.22: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,63:0.41:-0.21:1.000:0.854 0/0/0/1:4:188,47:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,57:0.45:-0.75:1.000:0.983 0/0/0/1:4:217,48:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,25:0.15: 0.07:1.000:0.991 0/0/0/1/1/1:6:71,50:0.50:-1.23:1.000:0.889 0/0/1/1:4:91,57:0.47:-0.84:1.000:0.992 0/0/0/1:4:178,40:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,42:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,82:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/0:4:264,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,107:0.62:-0.51:1.000:0.623 0/0/1/1:4:75,51:0.49:-1.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,45:0.30:-0.27:1.000:0.981 0/0/1/1:4:122,81:0.49:-0.02:0.986:0.996 0/0/1/1:4:104,81:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,74:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,26:0.18:-0.30:0.999:0.999 0/1/1/1:4:73,149:0.64: 0.26:1.000:0.664 0/0/0/1:4:233,41:0.19: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,76:0.39: 0.51:1.000:0.720 0/0/1/1:4:95,72:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:162,39:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,55:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,37:0.33:-0.97:1.000:0.910 0/1/1/1:4:46,97:0.64:-0.91:1.000:0.708 0/0/0/1:4:137,21:0.17:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,65:0.47:-0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:156,40:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,71:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/0:4:250,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,59:0.47:-0.73:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,39:0.47:-1.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,51:0.52:-1.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,36:0.28:-0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,72:0.46:-0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:104,55:0.42:-0.67:1.000:0.932 0/0/1/1:4:96,79:0.52:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,72:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,56:0.46:-0.84:1.000:0.989 0/1/1/1:4:38,78:0.64:-1.31:1.000:0.672 0/0/1/1:4:73,114:0.61:-0.26:1.000:0.741 0/0/0/1:4:79,25:0.30:-1.49:1.000:0.983 0/0/1/1:4:80,57:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,75:0.62:-1.29:1.000:0.544 0/0/1/1:4:113,82:0.51:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,52:0.47:-1.01:1.000:0.991 0/0/0/1:4:172,31:0.20:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,23:0.26:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,19:0.17:-0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:131,44:0.32:-0.44:0.998:0.964 0/0/1/1:4:86,84:0.54:-0.51:1.000:0.985 0/1/1/1:4:44,98:0.65:-0.92:1.000:0.773 0/0/0/1:4:225,52:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,80:0.46: 0.10:1.000:0.989 0/1/1/1:4:57,115:0.64:-0.48:1.000:0.647 0/0/1/1:4:70,54:0.51:-1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:234,135:0.45: 2.43:1.000:0.978 0/0/0/1/1/1:6:104,80:0.51:-0.30:1.000:0.880 0/0/0/1:4:156,23:0.16:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,50:0.54:-1.52:1.000:0.986 0/0/0/1:4:146,32:0.23:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,82:0.97:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,26:0.18:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,30:0.24:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,74:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,28:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,96:0.63:-0.87:1.000:0.572 0/0/0/1:4:290,53:0.20: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,38:0.29:-0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:109,67:0.47:-0.42:1.000:0.990 0/0/0/1:4:113,19:0.18:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,25:0.22:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,32:0.45:-1.74:1.000:0.980 0/0/1/1:4:76,51:0.49:-1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,48:0.35:-0.50:1.000:0.798 0/0/1/1:4:150,100:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,28:0.40:-1.75:0.999:0.803 0/0/1/1:4:111,75:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,61:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,111:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,74:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,57:0.48:-0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,41:0.43:-1.28:1.000:0.938 0/0/0/1:4:113,26:0.24:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,60:0.45:-0.63:1.000:0.983 0/0/0/1:4:74,22:0.29:-1.60:1.000:0.992 0/0/1/1:4:114,96:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,61:0.65:-1.72:1.000:0.788 0/0/0/1:4:231,49:0.22: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,106:0.45: 1.25:1.000:0.979 0/0/0/1:4:256,53:0.22: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,42:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,43:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,94:0.53:-0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:154,101:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,109:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:115,12:0.12:-1.15:1.000:0.787 0/0/0/1:4:214,42:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,117:0.44: 1.78:1.000:0.969 0/0/0/1:4:138,56:0.36:-0.16:1.000:0.704 0/1/1/1:4:79,177:0.65: 0.76:1.000:0.780 0/0/1/1:4:81,128:0.61: 0.07:1.000:0.726 0/0/1/1:4:120,75:0.47:-0.14:0.947:0.992 0/0/0/0:4:336,1:0.00: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,81:0.45: 0.20:1.000:0.984 0/1/1/1:4:66,131:0.63:-0.11:1.000:0.623 0/0/0/1:4:201,35:0.19: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,166:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,102:0.41: 1.56:1.000:0.834 0/0/1/1:4:151,79:0.42: 0.38:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,81:0.44: 0.30:1.000:0.969 0/0/1/1:4:141,94:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,78:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:145,87:0.46: 0.41:1.000:0.987 0/0/1/1:4:122,76:0.47:-0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:155,87:0.44: 0.55:1.000:0.968 0/0/1/1:4:98,69:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,58:0.44:-0.61:1.000:0.961 0/0/1/1:4:109,67:0.47:-0.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:188,131:0.50: 1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,77:0.48:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:220,66:0.29: 1.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:168,95:0.44: 0.86:1.000:0.971 0/0/1/1:4:169,97:0.45: 0.91:1.000:0.976 0/1/1/1:4:98,181:0.63: 1.10:1.000:0.511 0/0/1/1:4:183,131:0.50: 1.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:195,42:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,88:0.47: 0.33:1.000:0.993 -chr6.1 64332572 chr6.1_064332572 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:83,67:0.48: 0.14:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,124:0.60: 1.31:1.000:0.755 0/0/1/1:4:36,48:0.58:-1.18:1.000:0.905 0/0/1/1:4:88,85:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,1:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,44:0.68:-1.58:1.000:0.962 0/1/1/1:4:40,122:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,114:0.60: 0.96:1.000:0.749 0/1/1/1:4:23,53:0.69:-1.34:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,187:0.80: 1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,123:0.73: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,64:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1/1:5:108,73:0.46: 0.76:0.965:0.830 0/1/1/1:4:37,148:0.79: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,84:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:47,132:0.73: 0.72:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,55:0.98:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,115:0.63: 0.80:1.000:0.591 0/0/1/1:4:70,81:0.55: 0.16:1.000:0.978 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,29:0.84:-2.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,75:0.67:-0.64:1.000:0.934 0/1/1/1:4:41,170:0.79: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,63:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,60:0.54:-0.58:1.000:0.986 0/1/1/1:4:37,109:0.74: 0.06:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,150:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,65:0.49: 0.00:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,22:0.91:-2.38:1.000:0.959 0/0/1/1:4:22,16:0.47:-2.10:1.000:0.992 0/1/1:3:8,15:0.65:-2.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,133:0.71: 0.84:1.000:0.992 0/0/1/1/1:5:77,143:0.65: 1.55:1.000:0.898 0/1/1/1:4:40,139:0.76: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,69:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,73:0.53: 0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,59:0.65:-1.04:1.000:0.788 0/1/1/1:4:50,121:0.70: 0.56:1.000:0.986 0/1/1/1:4:99,165:0.63: 2.43:1.000:0.552 0/1/1/1:4:38,179:0.82: 1.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,68:0.56:-0.36:1.000:0.970 0/1/1/1:4:42,72:0.63:-0.58:1.000:0.626 0/0/1/1:4:54,63:0.55:-0.52:0.999:0.976 0/1/1/1:4:19,68:0.77:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,52:0.49:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,97:0.82:-0.52:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,152:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,50:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,204:0.88: 1.73:1.000:0.644 0/1/1/1:4:38,100:0.72:-0.10:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,117:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,107:0.68: 0.26:1.000:0.959 0/0/1/1:4:84,58:0.46:-0.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:43,141:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:21,147:0.87: 0.50:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,153:0.79: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,94:0.69:-0.16:1.000:0.976 0/1/1/1:4:23,152:0.86: 0.64:1.000:0.963 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,154:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,210:0.81: 2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,27:0.62:-1.98:1.000:0.580 0/1/1/1:4:37,101:0.72:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,154:0.81: 0.90:0.986:1.000 1/1/1/1:4:0,188:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,97:0.78:-0.40:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,185:0.80: 1.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,157:0.99: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,46:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,71:0.54:-0.16:1.000:0.986 0/1/1/1:4:39,213:0.84: 2.19:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,125:0.73: 0.50:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,188:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,171:0.83: 1.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,55:0.46:-0.18:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,115:0.81:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,132:0.61: 1.51:1.000:0.668 0/1/1/1:4:40,94:0.70:-0.18:1.000:0.981 0/1/1/1:4:40,113:0.73: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,145:0.82: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,96:0.59: 0.44:1.000:0.856 0/1/1/1:4:21,79:0.78:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,57:0.45: 0.12:1.000:0.979 0/1/1/1:4:70,139:0.66: 1.33:1.000:0.893 0/0/1/1:4:31,34:0.54:-1.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:39,54:0.59:-1.00:1.000:0.862 0/0/1/1:4:85,66:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,60:0.66:-1.04:1.000:0.864 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,176:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,68:0.60:-0.54:1.000:0.829 0/1/1/1:4:18,66:0.77:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,66:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:32,55:0.64:-1.12:1.000:0.633 0/1/1/1:4:29,106:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,122:0.65: 0.92:0.998:0.765 0/1/1/1:4:38,138:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,52:0.46:-0.32:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,59:0.66:-1.06:1.000:0.841 0/1/1/1:4:50,88:0.64:-0.10:1.000:0.691 0/0/1/1:4:95,54:0.44: 0.12:1.000:0.964 0/0/1/1:4:81,74:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,208:0.79: 2.37:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:124,133:0.54: 2.29:1.000:0.819 0/1/1/1:4:40,194:0.82: 1.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,34:0.70:-1.90:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,61:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,93:0.77:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,57:0.62:-1.02:1.000:0.512 0/1/1/1:4:30,136:0.81: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,112:0.73: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,123:0.60: 1.27:1.000:0.747 1/1/1/1:4:0,182:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,115:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,64:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,64:0.49:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,66:0.47: 0.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:38,178:0.81: 1.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,102:0.67: 0.16:1.000:0.933 0/0/1/1:4:51,47:0.50:-0.90:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,60:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,38:0.47:-1.08:0.999:0.993 0/1/1/1:4:26,152:0.85: 0.70:1.000:0.992 0/1/1/1:4:39,92:0.70:-0.24:1.000:0.982 0/0/1/1:4:51,69:0.59:-0.46:1.000:0.890 0/1/1/1:4:36,175:0.82: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,59:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,90:0.79:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,58:0.58:-0.82:1.000:0.915 0/0/1/1:4:40,57:0.60:-0.92:1.000:0.820 0/1/1/1:4:31,55:0.64:-1.14:1.000:0.710 0/1/1/1:4:38,119:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,41:0.51:-1.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,157:0.75: 1.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,140:0.69: 1.17:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,36:0.49:-1.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,184:0.76: 1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,57:0.63:-1.04:1.000:0.567 0/0/1/1:4:107,133:0.57: 1.95:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,42:0.72:-1.70:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,32:0.44:-1.14:1.000:0.972 0/1/1/1:4:34,177:0.83: 1.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,120:0.73: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,67:0.55:-0.36:1.000:0.979 0/1/1/1:4:34,99:0.73:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,49:0.46:-0.38:0.947:0.985 0/1/1/1:4:41,111:0.72: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,102:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,114:0.77: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,50:0.56:-1.02:1.000:0.970 0/1/1/1:4:36,115:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,153:0.79: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,103:0.74:-0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,118:0.80: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,87:0.72:-0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,98:0.78:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,90:0.68:-0.24:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,52:0.65:-1.26:1.000:0.801 0/1/1/1:4:24,130:0.84: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,81:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,168:0.78: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,59:0.46: 0.06:1.000:0.988 0/1/1/1:4:26,129:0.82: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,54:0.58:-0.98:1.000:0.892 0/0/1/1:4:86,76:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,155:0.78: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,98:0.77:-0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.82:1.000:1.000 -chr6.1 64448712 chr6.1_064448712 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,100:1.00: 0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,46:0.45: 1.28:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,114:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,67:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,35:0.54:-0.57:1.000:0.986 0/0/1/1:4:41,45:0.57: 0.11:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,19:0.70:-2.29:1.000:0.981 0/0/0/1:4:18,4:0.24:-2.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,61:0.84:-0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,68:0.73: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,57:0.72: 0.02:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:49,58:0.58: 0.99:0.965:0.962 0/1/1/1:4:28,44:0.65:-0.48:1.000:0.815 0/1/1/1:4:44,110:0.75: 2.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,70:0.51: 2.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,12:0.37:-1.91:1.000:0.599 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,67:0.68: 0.90:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-2.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,29:0.53:-0.99:1.000:0.993 0/1/1/1:4:23,66:0.78: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,60:0.56: 1.36:1.000:0.968 0/1/1/1:4:21,70:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,45:0.58: 0.02:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.54:-3.17:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-2.54:1.000:1.000 1/1/1:3:1,7:0.89:-3.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,29:0.41:-0.15:1.000:0.871 0/0/1/1/1:5:48,63:0.61: 1.15:1.000:0.971 0/0/1/1:4:35,48:0.62:-0.02:1.000:0.568 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,38:0.41: 0.86:1.000:0.886 0/0/1/1:4:50,33:0.44:-0.02:1.000:0.973 0/1/1/1:4:19,105:0.87: 1.70:1.000:0.926 0/1/1/1:4:15,72:0.85: 0.15:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,51:0.54: 0.78:1.000:0.986 0/0/1/1:4:73,46:0.43: 1.49:0.999:0.956 0/1/1/1:4:15,43:0.78:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,45:0.80:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,31:0.81:-1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,31:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,25:0.26: 1.57:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,89:0.79: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,43:0.52: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,42:0.72:-0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,66:0.80: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,33:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:30,31:0.55:-0.94:1.000:0.739 0/0/1/1:4:43,40:0.52:-0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,44:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,55:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,59:0.80:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,67:0.71: 0.69:1.000:0.992 0/1/1/1:4:24,43:0.68:-0.69:1.000:0.960 0/0/1/1:4:37,34:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,76:0.78: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,63:0.78: 0.02:0.986:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,74:0.75: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,31:0.55:-0.94:0.999:0.979 0/1/1/1:4:22,47:0.72:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,67:0.72: 0.65:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,54:0.73:-0.23:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,57:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,42:0.80:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,42:0.57:-0.19:1.000:0.935 0/1/1/1:4:26,53:0.71:-0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:60,35:0.42: 0.48:1.000:0.900 0/1/1/1:4:24,75:0.79: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,65:0.73: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,62:0.73: 0.27:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,50:0.52: 0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,47:0.72:-0.61:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,34:0.50:-0.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,31:0.44:-0.19:1.000:0.966 0/0/1/1:4:49,36:0.47: 0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,50:0.73:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,37:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,47:0.67:-0.36:1.000:0.912 0/0/0/1:4:93,22:0.25: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,46:0.47: 0.99:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,53:0.78:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,35:0.49:-0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,61:0.72: 0.27:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,60:0.76:-0.02:0.998:1.000 0/0/1/1:4:48,43:0.52: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,34:0.64:-1.11:1.000:0.666 0/0/1/1:4:61,50:0.49: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,57:0.50: 1.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,49:0.68:-0.27:1.000:0.947 0/1/1/1:4:19,50:0.76:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,42:0.44: 0.94:1.000:0.972 0/0/1/1/1/1:6:48,97:0.71: 2.58:1.000:0.828 0/1/1/1:4:24,63:0.76: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,15:0.49:-2.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,98:1.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,33:0.45:-0.06:1.000:0.979 0/0/1/1:4:33,27:0.49:-0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,51:0.76:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,41:0.44: 0.82:1.000:0.974 0/1/1/1:4:29,62:0.72: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,65:0.73: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,52:0.83:-0.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,43:0.78:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,63:0.83:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,36:0.54:-0.44:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.49:0.999:1.000 0/1/1/1:4:22,52:0.74:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,26:0.41:-0.48:1.000:0.863 0/0/1/1:4:54,44:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,65:0.80: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,35:0.67:-1.15:1.000:0.904 0/0/1/1:4:43,36:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,46:0.60:-0.02:1.000:0.821 0/0/1/1:4:49,38:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,15:0.31:-1.07:1.000:0.968 0/0/1/1:4:45,62:0.62: 0.99:1.000:0.553 0/1/1/1:4:13,45:0.81:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,80:0.73: 1.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:78,57:0.47: 2.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,46:0.45: 1.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:55,41:0.47: 0.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,70:0.69: 1.03:1.000:0.972 0/0/1/1:4:49,26:0.40:-0.36:1.000:0.757 1/1/1/1:4:0,108:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,22:0.30: 0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:15,1:0.13:-2.83:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,73:0.80: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,56:0.78:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,67:0.52: 2.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,52:0.48: 1.53:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.57:0.947:1.000 0/1/1/1:4:27,55:0.71:-0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,47:0.56: 0.27:1.000:0.959 0/0/1/1:4:36,36:0.54:-0.48:1.000:0.986 0/0/1/1:4:48,45:0.53: 0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:58,48:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,50:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,57:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.54:-0.10:1.000:0.989 0/1/1/1:4:21,45:0.72:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,42:0.46: 0.78:1.000:0.986 0/1/1/1:4:21,61:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,38:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,51:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,27:0.32: 0.73:1.000:0.949 0/1/1/1:4:27,54:0.71:-0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:39,43:0.57:-0.06:1.000:0.954 0/1/1/1:4:28,53:0.70:-0.10:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,49:0.53: 0.69:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,42:0.60:-0.36:1.000:0.773 0/0/1/1:4:59,48:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,69:0.79: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,84:0.73: 1.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,69:0.82: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,65:0.72: 0.53:1.000:0.995 -chr6.1 64803434 chr6.1_064803434 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:5,8:0.60: 0.64:1.000:0.747 0/1/1/1:4:3,13:0.79: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.56: 2.49:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.53: 1.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:2,14:0.86: 1.20:1.000:0.964 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,6:0.41: 1.56:1.000:0.854 0/0/0/1:4:10,1:0.28: 0.27:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,9:0.59: 1.01:1.000:0.859 0/0/1/1:4:9,5:0.42: 0.83:1.000:0.920 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-0.10:1.000:0.805 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-0.10:1.000:0.979 0/1/1/1/1:5:3,14:0.80: 1.38:0.965:0.996 0/1/1/1:4:3,10:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,3:0.38: 0.27:1.000:0.503 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-0.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.42: 1.38:1.000:0.910 0/0/0/1:4:6,2:0.36:-0.28:1.000:0.659 0/1/1/1:4:3,7:0.68: 0.09:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-0.10:1.000:0.805 0/0/1/1:4:9,15:0.61: 2.67:1.000:0.651 0/0/1/1:4:8,13:0.61: 2.12:1.000:0.712 0/1/1/1:4:2,9:0.80: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.44: 0.09:1.000:0.974 0/1/1/1:4:4,13:0.74: 1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,11:0.52: 2.12:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:6,11:0.63: 1.38:1.000:0.610 1/1/1/1/1:5:0,5:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,14:0.80: 1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.65:-0.65:1.000:0.805 0/0/1/1:4:6,10:0.61: 1.20:1.000:0.651 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.21:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,7:0.58: 0.46:1.000:0.930 0/1/1/1:4:2,6:0.73:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,0:0.21:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,6:0.73:-0.28:0.999:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,8:0.71: 0.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:1,6:0.84:-0.46:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-0.83:1.000:0.859 0/0/1/1:4:5,8:0.60: 0.64:1.000:0.747 0/0/1/1:4:7,8:0.53: 1.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,5:0.61:-0.28:1.000:0.651 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/1/1/1/1/1:6:1,5:0.81:-0.65:1.000:0.963 0/1/1/1:4:1,2:0.65:-1.20:1.000:0.805 0/1/1/1:4:4,14:0.75: 1.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.46:1.000:0.958 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-0.83:1.000:0.859 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.28:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.34:-0.83:1.000:0.898 0/0/1/1:4:6,7:0.53: 0.64:0.986:0.990 0/0/1/1:4:7,10:0.58: 1.38:1.000:0.913 0/0/0/1:4:3,1:0.36:-1.02:1.000:0.659 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.57:0.999:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.80: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.56: 0.83:1.000:0.958 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-1.20:1.000:0.854 1/1/1/1:4:1,10:0.90: 0.27:1.000:0.775 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,14:0.68: 1.93:1.000:0.958 0/1/1/1:4:3,8:0.71: 0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-0.10:1.000:0.979 0/1/1/1:4:1,4:0.78:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,11:0.83: 0.64:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,8:0.88:-0.10:1.000:0.830 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-1.20:1.000:0.854 0/0/1/1:4:7,4:0.43: 0.27:1.000:0.932 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,8:0.71: 0.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:3,7:0.68: 0.09:1.000:0.958 0/0/1/1:4:5,5:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,7:0.86:-0.28:1.000:0.964 0/0/1/1:4:4,6:0.59: 0.09:1.000:0.859 0/1/1/1:4:3,15:0.81: 1.56:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,5:0.81:-0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,4:0.78:-0.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,2:0.65:-1.20:1.000:0.805 0/0/0/1:4:3,1:0.36:-1.02:1.000:0.659 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,17:0.75: 2.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.39:0.998:0.997 0/0/1/1:4:5,6:0.54: 0.27:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.69:-0.46:1.000:0.980 0/0/1/1:4:7,7:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,5:0.55:-0.10:1.000:0.979 0/0/1/1/1/1:6:4,10:0.69: 0.83:1.000:0.888 0/0/1/1:4:5,8:0.60: 0.64:1.000:0.747 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,8:0.65: 0.46:1.000:0.805 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,2:0.65:-1.20:1.000:0.805 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-0.10:1.000:0.805 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,10:0.90: 0.27:1.000:0.775 0/1/1/1:4:2,4:0.65:-0.65:1.000:0.805 0/1/1/1:4:1,4:0.78:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.41:-1.20:1.000:0.854 0/1/1/1:4:2,6:0.73:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,4:0.65:-0.65:1.000:0.805 0/0/1/1:4:7,5:0.45: 0.46:1.000:0.984 0/0/0/1:4:2,0:0.21:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.50: 1.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-0.83:0.999:0.859 0/0/1/1:4:3,2:0.44:-0.83:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,8:0.65: 0.46:1.000:0.805 0/1/1/1:4:4,8:0.65: 0.46:1.000:0.805 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,6:0.84:-0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,4:0.65:-0.65:1.000:0.805 0/0/1/1:4:3,2:0.44:-0.83:1.000:0.974 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,5:0.81:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.44:-0.83:1.000:0.974 0/1/1/1:4:4,9:0.67: 0.64:1.000:0.938 0/0/1/1:4:6,5:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:5,4:0.47:-0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,9:0.59: 1.01:1.000:0.859 0/1/1/1:4:1,6:0.84:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,8:0.43: 2.12:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.10:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,5:0.69:-0.46:1.000:0.980 0/0/1/1:4:6,3:0.41:-0.10:1.000:0.854 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.62: 0.27:1.000:0.519 0/1/1/1:4:4,9:0.67: 0.64:0.947:0.938 0/0/1/1:4:6,9:0.59: 1.01:1.000:0.859 0/0/1/1:4:6,7:0.53: 0.64:1.000:0.990 0/1/1/1:4:5,9:0.63: 0.83:1.000:0.560 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,12:0.69: 1.38:1.000:0.969 0/0/1/1:4:7,6:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,9:0.80: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,15:0.77: 1.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.69: 0.83:1.000:0.980 0/0/1/1:4:7,11:0.60: 1.56:1.000:0.783 0/1/1/1:4:1,4:0.78:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.89: 0.09:1.000:0.524 0/1/1/1:4:1,7:0.86:-0.28:1.000:0.964 0/0/1/1:4:3,5:0.61:-0.28:1.000:0.651 0/0/0/1:4:2,0:0.21:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.47: 1.20:1.000:0.990 0/1/1/1:4:5,9:0.63: 0.83:1.000:0.560 0/0/0/1:4:6,2:0.36:-0.28:1.000:0.659 0/0/1/1:4:9,4:0.39: 0.64:1.000:0.737 0/0/1/1:4:8,9:0.53: 1.38:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.58: 2.67:1.000:0.930 0/1/1/1:4:3,8:0.71: 0.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-0.10:1.000:0.805 0/1/1/1:4:4,19:0.81: 2.49:1.000:1.000 -chr6.1 65124873 chr6.1_065124873 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:312,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:104,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.86:1.000:. ./.:5:541,0:.: 1.04:0.965:. ./.:4:273,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:537,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:126,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:47,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:448,1:.: 0.35:1.000:. ./.:5:497,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:550,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:29,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:599,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:295,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:390,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.33:1.000:. ./.:6:432,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:512,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.15:0.986:. ./.:4:236,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:556,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:540,2:.: 1.05:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:303,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:380,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:291,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:603,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:630,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:549,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:574,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:484,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:413,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:523,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:535,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:612,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:754,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:370,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:612,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.49:0.998:. ./.:4:612,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:548,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:550,0:.: 1.11:1.000:. ./.:6:1082,0:.: 5.08:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:506,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:318,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:508,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:645,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:330,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:505,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:412,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:652,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:536,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:536,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:543,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.68:0.947:. ./.:4:267,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:381,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:538,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:226,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:449,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:236,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:197,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:463,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:433,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.90:1.000:. -chr6.1 65450573 chr6.1_065450573 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:53,83:0.59: 0.03:1.000:0.874 0/0/1/1:4:67,82:0.52: 0.24:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,92:0.71:-0.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,71:0.42: 0.56:1.000:0.894 0/0/1/1:4:51,60:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,90:0.52: 0.48:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-2.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,21:0.72:-1.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,124:0.75: 0.49:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,256:1.00: 1.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,219:0.79: 2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,43:0.37:-0.21:1.000:0.597 0/0/1/1:4:83,50:0.38:-0.02:1.000:0.604 0/0/1/1/1:5:78,121:0.59: 1.04:0.965:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:45,110:0.70: 0.33:1.000:0.988 0/1/1/1:4:61,247:0.80: 2.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.29:-1.96:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,117:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,10:0.91:-1.98:1.000:0.938 0/0/0/1:4:111,42:0.31: 0.30:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,294:1.00: 2.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,96:0.72:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,132:0.53: 1.62:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,110:0.56: 0.88:1.000:0.974 0/0/1/1:4:67,115:0.61: 0.76:1.000:0.654 0/0/1/1:4:37,58:0.59:-0.63:1.000:0.872 0/0/1/1:4:3,2:0.40:-2.08:1.000:0.796 0/0/1/1:4:2,3:0.58:-2.08:1.000:0.927 1/1/1:3:0,1:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,183:0.80: 1.52:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:34,144:0.81: 0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,124:0.68: 0.72:1.000:0.962 0/0/1/1:4:29,44:0.58:-0.98:1.000:0.916 0/1/1/1:4:32,72:0.68:-0.49:1.000:0.961 0/0/0/1:4:96,33:0.29:-0.09:1.000:0.990 0/1/1/1:4:39,158:0.80: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,48:0.44:-0.44:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,53:0.61:-0.81:1.000:0.666 0/1/1/1:4:63,123:0.65: 0.83:1.000:0.767 0/0/1/1:4:103,149:0.57: 1.89:0.999:0.955 0/0/1/1:4:43,57:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,47:0.67:-1.05:1.000:0.922 0/1/1/1:4:30,70:0.69:-0.55:1.000:0.977 0/0/1/1:4:34,57:0.61:-0.70:1.000:0.725 0/1/1/1:4:62,116:0.64: 0.70:1.000:0.643 0/1/1/1:4:30,69:0.69:-0.57:1.000:0.971 0/1/1/1:4:31,104:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,122:0.77: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,44:0.45:-0.65:1.000:0.981 0/1/1/1:4:30,103:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,36:0.75:-1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,52:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:31,38:0.52:-1.05:1.000:0.868 0/0/1/1:4:44,31:0.41:-0.95:1.000:0.867 0/0/1/1:4:56,61:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,87:0.74:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,21:0.41:-1.34:1.000:0.860 0/0/1/1:4:75,76:0.48: 0.27:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,58:0.57:-0.58:1.000:0.954 0/1/1/1:4:38,132:0.78: 0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.31:0.986:1.000 0/1/1/1:4:32,108:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,32:0.35:-0.63:1.000:0.757 0/0/1/1:4:40,38:0.47:-0.90:0.999:0.990 0/0/1/1:4:44,55:0.52:-0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,134:0.79: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,54:0.45:-0.29:1.000:0.979 0/1/1/1:4:28,51:0.63:-0.89:1.000:0.552 0/0/1/1:4:29,48:0.60:-0.92:1.000:0.760 1/1/1/1:4:0,179:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,34:0.37:-0.62:1.000:0.609 0/1/1/1:4:42,151:0.78: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,54:0.55:-0.66:1.000:0.975 0/1/1/1:4:38,79:0.66:-0.28:1.000:0.889 0/1/1/1:4:31,96:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,81:0.61:-0.09:1.000:0.706 0/0/1/1:4:35,39:0.49:-0.97:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,57:0.52:-0.50:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,96:0.83:-0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,28:0.39:-1.00:1.000:0.717 0/0/1/1:4:39,59:0.58:-0.58:1.000:0.919 1/1/1/1:4:1,113:0.99:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,57:0.45:-0.18:1.000:0.977 0/1/1/1:4:22,42:0.64:-1.13:1.000:0.706 0/0/0/1:4:87,21:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,39:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,82:0.60:-0.02:1.000:0.827 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,70:0.76:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,69:0.61:-0.39:1.000:0.714 0/0/0/1:4:48,22:0.34:-1.03:1.000:0.887 0/0/1/1:4:50,62:0.52:-0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:14,82:0.85:-0.62:0.998:0.982 0/0/1/1:4:53,61:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,44:0.72:-1.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,40:0.30: 0.27:1.000:0.985 0/1/1/1:4:91,207:0.69: 2.63:1.000:0.967 0/1/1/1:4:46,85:0.63:-0.05:1.000:0.602 0/0/1/1:4:29,47:0.60:-0.94:1.000:0.810 0/0/1/1:4:102,92:0.46: 0.96:1.000:0.985 0/0/0/1/1/1:6:74,104:0.56: 0.70:1.000:0.691 0/1/1/1:4:30,94:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,86:0.64:-0.04:1.000:0.641 0/1/1/1:4:37,81:0.68:-0.26:1.000:0.944 0/1/1/1:4:22,75:0.77:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,24:0.31:-0.74:1.000:0.979 0/0/1/1:4:35,55:0.59:-0.71:1.000:0.868 0/0/1/1:4:47,56:0.51:-0.50:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,100:0.99:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,73:0.64:-0.37:1.000:0.724 0/1/1/1:4:35,83:0.70:-0.26:1.000:0.981 0/1/1/1:4:42,108:0.72: 0.25:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,51:0.65:-0.92:1.000:0.779 0/1/1/1:4:26,48:0.63:-0.97:1.000:0.598 0/0/1/1:4:42,50:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,14:0.27:-1.18:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,77:0.99:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,28:0.49:-1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,86:0.55: 0.25:1.000:0.984 0/1/1/1:4:34,105:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,45:0.80:-1.26:0.999:1.000 0/1/1/1:4:28,83:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,44:0.42:-0.52:1.000:0.928 0/0/1/1:4:128,213:0.60: 3.32:1.000:0.745 1/1/1/1:4:0,168:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,48:0.62:-0.95:1.000:0.534 1/1/1/1:4:6,91:0.94:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,19:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,81:0.57: 0.04:1.000:0.955 0/0/0/1:4:57,31:0.37:-0.74:1.000:0.626 0/1/1/1:4:36,137:0.79: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,36:0.68:-1.32:1.000:0.961 0/0/1/1:4:96,110:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,224:0.78: 2.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,125:0.55: 1.34:1.000:0.984 0/0/0/1:4:134,46:0.29: 0.73:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,158:0.77: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,113:0.61: 0.72:1.000:0.662 1/1/1/1:4:1,178:0.99: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,111:0.45: 1.71:1.000:0.975 0/1/1/1:4:2,4:0.65:-2.06:1.000:0.823 0/1/1/1:4:40,104:0.72: 0.15:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,224:1.00: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,50:0.37: 0.04:1.000:0.503 0/0/1/1:4:109,110:0.48: 1.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,201:0.80: 1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,88:0.68:-0.10:0.947:0.947 0/0/1/1:4:79,104:0.54: 0.78:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,168:0.79: 1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,125:0.65: 0.86:1.000:0.806 0/0/0/1:4:117,26:0.23: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,117:0.73: 0.41:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,271:1.00: 2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,58:0.38: 0.36:1.000:0.541 0/1/1/1:4:32,102:0.76:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,86:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,79:0.46: 0.49:1.000:0.987 0/1/1/1:4:38,188:0.83: 1.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,156:0.79: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,96:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,133:0.64: 1.09:1.000:0.733 0/0/0/1:4:68,36:0.36:-0.49:1.000:0.682 0/1/1/1:4:44,89:0.66:-0.02:1.000:0.845 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,112:0.69: 0.41:1.000:0.977 0/1/1/1:4:39,170:0.81: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,93:0.64: 0.12:1.000:0.688 0/1/1/1:4:53,175:0.77: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,106:0.65: 0.40:1.000:0.823 0/1/1/1:4:52,240:0.82: 2.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,38:0.35:-0.34:1.000:0.762 0/0/1/1:4:81,104:0.53: 0.81:1.000:0.991 -chr6.1 65685012 chr6.1_065685012 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:67,64:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,72:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,66:0.51: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,61:0.44: 1.08:1.000:0.966 0/1/1/1:4:40,91:0.69: 0.69:1.000:0.975 0/0/1/1:4:66,78:0.55: 1.12:1.000:0.981 0/0/1/1:4:34,32:0.50:-1.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,86:0.80:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,49:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,13:0.42:-2.61:1.000:0.913 0/1/1/1:4:3,13:0.81:-3.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,47:0.42: 0.15:1.000:0.922 0/0/1/1:4:81,52:0.40: 0.75:1.000:0.831 0/0/1/1:4:80,64:0.46: 1.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:62,44:0.43:-0.15:1.000:0.942 0/0/1/1:4:47,53:0.54:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/1/1:5:86,63:0.44: 1.28:0.965:0.927 0/0/0/1:4:80,24:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,34:0.26: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,30:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,12:0.47:-2.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,56:0.45: 0.62:1.000:0.976 0/0/0/1:4:150,39:0.23: 2.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,75:0.75:-0.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,9:0.90:-3.34:1.000:0.724 0/1/1/1:4:15,78:0.83:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,67:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,96:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,60:0.39: 1.62:1.000:0.712 0/1/1/1:4:16,78:0.82:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,93:0.85:-0.05:1.000:0.989 0/1/1/1:4:19,64:0.76:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.39:-3.41:1.000:0.686 0/1/1/1:4:8,31:0.79:-2.37:1.000:1.000 0/1/1:3:3,10:0.76:-3.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,57:0.45: 0.62:1.000:0.984 0/0/0/0/1:5:83,31:0.29: 0.12:1.000:0.630 0/0/1/1:4:63,61:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,50:0.62:-0.98:1.000:0.578 0/1/1/1:4:18,90:0.83:-0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,76:0.76:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,20:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,86:0.69: 0.49:1.000:0.965 0/0/1/1:4:40,52:0.57:-0.61:1.000:0.944 0/0/1/1:4:68,45:0.41: 0.09:1.000:0.876 0/0/1/1:4:70,66:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,62:0.45: 1.08:0.999:0.976 0/1/1/1:4:28,141:0.83: 1.95:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,51:0.56:-0.58:1.000:0.974 0/1/1/1:4:24,69:0.74:-0.58:1.000:0.998 0/1/1/1:4:28,61:0.68:-0.71:1.000:0.960 0/0/1/1:4:80,75:0.49: 1.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,78:0.68: 0.15:1.000:0.943 0/1/1/1:4:29,80:0.73:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,67:0.69:-0.45:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,128:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,34:0.24: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,59:0.67:-0.74:1.000:0.916 0/0/1/1:4:57,45:0.45:-0.28:1.000:0.983 0/0/0/0/1/1:6:85,27:0.26: 0.05:1.000:0.586 0/0/0/1:4:119,26:0.20: 1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,71:0.60: 0.29:1.000:0.790 0/0/1/1:4:33,36:0.53:-1.38:1.000:0.992 0/1/1/1:4:29,75:0.72:-0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,36:0.38:-0.38:1.000:0.550 0/0/1/1:4:29,27:0.49:-1.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,50:0.42: 0.42:1.000:0.914 0/0/1/1:4:42,56:0.58:-0.41:0.986:0.927 0/1/1/1:4:33,64:0.66:-0.45:1.000:0.862 0/0/1/1:4:70,64:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,29:0.55:-1.91:0.999:0.975 0/1/1/1:4:15,96:0.86: 0.02:1.000:0.965 0/1/1/1:4:48,94:0.66: 1.05:1.000:0.875 0/0/1/1:4:41,56:0.58:-0.45:1.000:0.905 0/1/1/1:4:28,84:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,37:0.40:-0.45:1.000:0.752 0/0/1/1:4:70,50:0.43: 0.32:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,56:0.52:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:72,23:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,85:0.82:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,93:0.66: 0.98:1.000:0.888 0/0/0/1:4:102,21:0.19: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,71:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,60:0.47: 0.72:1.000:0.991 0/0/1/1:4:48,53:0.53:-0.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:30,63:0.68:-0.58:1.000:0.940 0/1/1/1:4:31,66:0.68:-0.45:1.000:0.949 0/0/1/1:4:73,48:0.41: 0.35:1.000:0.867 0/0/0/1:4:68,16:0.21:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,79:0.73:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,57:0.45: 0.62:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,44:0.43:-0.15:1.000:0.942 0/0/0/1:4:86,36:0.31: 0.39:1.000:0.970 0/0/1/1:4:48,69:0.59: 0.22:1.000:0.840 0/1/1/1:4:29,56:0.66:-0.84:1.000:0.856 0/0/1/1:4:46,45:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,67:0.53: 0.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,53:0.38: 1.15:1.000:0.574 0/0/0/1:4:60,22:0.29:-0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:62,54:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,44:0.71:-1.61:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,34:0.37:-0.45:0.998:0.617 0/1/1/1:4:33,74:0.69:-0.11:1.000:0.971 0/0/1/1:4:45,47:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,75:0.66: 0.09:1.000:0.885 0/0/0/1:4:100,56:0.37: 1.52:1.000:0.509 0/0/1/1:4:59,78:0.57: 0.89:1.000:0.933 0/0/0/1:4:79,29:0.29:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,89:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:75,112:0.60: 2.55:1.000:0.662 0/1/1/1:4:26,90:0.77: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,52:0.58:-0.68:1.000:0.903 0/0/1/1:4:87,63:0.43: 1.32:1.000:0.954 0/0/0/1:4:81,24:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,65:0.78:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,48:0.47:-0.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:22,64:0.74:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,58:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,48:0.51:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,57:0.46: 0.52:1.000:0.990 0/0/1/1:4:73,64:0.48: 0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,59:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/0/0/1:4:108,25:0.21: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,77:0.68: 0.09:1.000:0.951 0/0/1/1:4:44,45:0.52:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,24:0.31:-0.98:1.000:0.968 0/0/0/1:4:64,20:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,64:0.56: 0.19:1.000:0.970 0/1/1/1:4:34,77:0.69: 0.02:1.000:0.974 0/1/1/1:4:18,52:0.74:-1.34:0.999:0.998 0/0/0/1:4:102,24:0.21: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,25:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,77:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,37:0.37:-0.21:1.000:0.551 0/0/1/1:4:73,52:0.43: 0.49:1.000:0.945 0/0/0/1:4:87,24:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,73:0.65: 0.05:1.000:0.805 0/0/1/1:4:62,52:0.47: 0.12:1.000:0.991 0/1/1/1:4:30,51:0.63:-0.98:1.000:0.574 0/0/0/1:4:109,16:0.15: 0.49:1.000:0.987 0/0/1/1:4:35,36:0.52:-1.31:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,125:1.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,29:0.19: 2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,59:0.46: 0.75:1.000:0.985 0/1/1/1:4:32,76:0.70:-0.08:1.000:0.985 0/1/1/1:4:31,106:0.77: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,60:0.55: 0.02:1.000:0.982 0/0/1/1:4:51,60:0.55: 0.02:1.000:0.982 0/0/1/1:4:64,63:0.51: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,16:0.48:-2.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,31:0.29: 0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:59,60:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,96:0.72: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,37:0.26: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,64:0.53: 0.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,91:0.75: 0.32:0.947:0.999 0/1/1/1:4:38,86:0.69: 0.45:1.000:0.974 0/0/0/1:4:85,28:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,61:0.60:-0.28:1.000:0.779 0/1/1/1:4:31,77:0.71:-0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:76,23:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,50:0.47:-0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,61:0.53: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,20:0.26:-0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,64:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,73:0.65: 0.09:1.000:0.755 0/1/1/1:4:36,93:0.72: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,25:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,30:0.31:-0.25:1.000:0.976 0/0/0/1:4:83,22:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,64:0.43: 1.45:1.000:0.943 0/0/1/1:4:36,37:0.52:-1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,58:0.57:-0.25:1.000:0.949 0/1/1/1:4:28,86:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,28:0.25: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,62:0.53: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:87,31:0.28: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,72:0.53: 0.92:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,72:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,119:0.76: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,42:0.48:-0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,55:0.41: 0.95:1.000:0.861 -chr6.1 66915751 chr6.1_066915751 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:389,127:.: 0.15:1.000:. ./.:4:254,279:.: 0.30:1.000:. ./.:4:205,267:.:-0.24:1.000:. ./.:4:257,268:.: 0.23:1.000:. ./.:4:455,153:.: 0.96:1.000:. ./.:4:320,121:.:-0.51:1.000:. ./.:4:121,383:.: 0.05:1.000:. ./.:4:141,391:.: 0.29:1.000:. ./.:4:280,272:.: 0.47:1.000:. ./.:4:89,77:.:-2.93:1.000:. ./.:4:40,113:.:-3.05:1.000:. ./.:4:140,441:.: 0.72:1.000:. ./.:4:235,241:.:-0.20:1.000:. ./.:4:488,154:.: 1.26:1.000:. ./.:4:346,126:.:-0.24:1.000:. ./.:4:419,123:.: 0.38:1.000:. ./.:5:554,160:.: 1.90:0.965:. ./.:4:280,238:.: 0.17:1.000:. ./.:4:359,340:.: 1.76:1.000:. ./.:4:330,330:.: 1.42:1.000:. ./.:4:74,103:.:-2.84:1.000:. ./.:4:227,257:.:-0.13:1.000:. ./.:4:316,321:.: 1.22:1.000:. ./.:4:366,150:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,31:.:-3.65:1.000:. ./.:4:301,324:.: 1.11:1.000:. ./.:4:287,297:.: 0.75:1.000:. ./.:4:340,124:.:-0.31:1.000:. ./.:4:471,153:.: 1.10:1.000:. ./.:4:333,324:.: 1.39:1.000:. ./.:4:365,322:.: 1.66:1.000:. ./.:4:367,130:.:-0.02:1.000:. ./.:4:53,17:.:-3.78:1.000:. ./.:4:140,63:.:-2.61:1.000:. ./.:3:42,23:.:-3.82:1.000:. ./.:4:255,258:.: 0.13:1.000:. ./.:5:370,277:.: 1.31:1.000:. ./.:4:396,119:.: 0.14:1.000:. ./.:4:439,159:.: 0.87:1.000:. ./.:4:485,185:.: 1.51:1.000:. ./.:4:218,274:.:-0.06:1.000:. ./.:4:221,236:.:-0.37:1.000:. ./.:4:405,282:.: 1.66:1.000:. ./.:4:239,228:.:-0.28:1.000:. ./.:4:460,176:.: 1.21:1.000:. ./.:4:349,131:.:-0.17:1.000:. ./.:4:414,152:.: 0.59:0.999:. ./.:4:172,196:.:-1.15:1.000:. ./.:4:205,211:.:-0.73:1.000:. ./.:4:387,150:.: 0.34:1.000:. ./.:4:196,221:.:-0.72:1.000:. ./.:4:251,303:.: 0.49:1.000:. ./.:4:346,132:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,392:.: 0.16:1.000:. ./.:4:113,336:.:-0.44:1.000:. ./.:4:286,305:.: 0.81:1.000:. ./.:4:341,121:.:-0.32:1.000:. ./.:4:363,122:.:-0.12:1.000:. ./.:4:122,414:.: 0.33:1.000:. ./.:6:101,364:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,400:.: 0.13:1.000:. ./.:4:227,242:.:-0.26:1.000:. ./.:4:441,149:.: 0.80:1.000:. ./.:4:341,152:.:-0.05:1.000:. ./.:4:253,294:.: 0.42:1.000:. ./.:4:221,237:.:-0.36:1.000:. ./.:4:452,152:.: 0.93:1.000:. ./.:4:357,125:.:-0.15:1.000:. ./.:4:231,261:.:-0.06:0.986:. ./.:4:119,254:.:-1.11:1.000:. ./.:4:347,146:.:-0.05:1.000:. ./.:4:115,353:.:-0.27:0.999:. ./.:4:141,452:.: 0.83:1.000:. ./.:4:119,370:.:-0.09:1.000:. ./.:4:112,344:.:-0.38:1.000:. ./.:4:347,101:.:-0.45:1.000:. ./.:4:346,114:.:-0.34:1.000:. ./.:4:222,241:.:-0.32:1.000:. ./.:4:132,281:.:-0.76:1.000:. ./.:4:262,298:.: 0.54:1.000:. ./.:4:97,297:.:-0.92:1.000:. ./.:4:285,277:.: 0.56:1.000:. ./.:4:134,435:.: 0.62:1.000:. ./.:4:205,169:.:-1.10:1.000:. ./.:4:273,309:.: 0.73:1.000:. ./.:4:295,293:.: 0.79:1.000:. ./.:4:172,182:.:-1.28:1.000:. ./.:4:80,305:.:-1.00:1.000:. ./.:4:112,340:.:-0.41:1.000:. ./.:4:199,245:.:-0.48:1.000:. ./.:4:113,345:.:-0.36:1.000:. ./.:4:274,108:.:-1.03:1.000:. ./.:4:242,287:.: 0.27:1.000:. ./.:4:176,162:.:-1.42:1.000:. ./.:4:477,186:.: 1.45:1.000:. ./.:4:271,273:.: 0.40:1.000:. ./.:4:202,224:.:-0.64:1.000:. ./.:4:109,336:.:-0.47:1.000:. ./.:4:146,428:.: 0.66:1.000:. ./.:4:294,271:.: 0.58:1.000:. ./.:4:378,149:.: 0.25:1.000:. ./.:4:361,137:.:-0.01:1.000:. ./.:4:184,214:.:-0.89:1.000:. ./.:4:264,292:.: 0.50:1.000:. ./.:4:420,105:.: 0.23:0.998:. ./.:4:113,329:.:-0.50:1.000:. ./.:4:176,236:.:-0.76:1.000:. ./.:4:254,283:.: 0.34:1.000:. ./.:4:457,172:.: 1.15:1.000:. ./.:4:244,265:.: 0.09:1.000:. ./.:4:186,244:.:-0.61:1.000:. ./.:4:172,559:.: 2.05:1.000:. ./.:6:302,364:.: 1.47:1.000:. ./.:4:139,424:.: 0.57:1.000:. ./.:4:313,114:.:-0.63:1.000:. ./.:4:408,145:.: 0.48:1.000:. ./.:4:248,251:.: 0.00:1.000:. ./.:4:202,259:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,349:.:-0.30:1.000:. ./.:4:206,237:.:-0.49:1.000:. ./.:4:221,248:.:-0.26:1.000:. ./.:4:208,254:.:-0.32:1.000:. ./.:4:382,117:.: 0.00:1.000:. ./.:4:334,141:.:-0.21:1.000:. ./.:4:331,105:.:-0.55:1.000:. ./.:4:241,255:.:-0.02:1.000:. ./.:4:122,418:.: 0.36:1.000:. ./.:4:237,264:.: 0.02:1.000:. ./.:4:204,236:.:-0.52:1.000:. ./.:4:188,183:.:-1.13:1.000:. ./.:4:248,206:.:-0.39:1.000:. ./.:4:401,154:.: 0.50:1.000:. ./.:4:265,81:.:-1.35:0.999:. ./.:4:261,249:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,339:.:-0.48:1.000:. ./.:4:523,169:.: 1.70:1.000:. ./.:4:277,269:.: 0.42:1.000:. ./.:4:228,227:.:-0.39:1.000:. ./.:4:205,184:.:-0.97:1.000:. ./.:4:209,233:.:-0.50:1.000:. ./.:4:391,118:.: 0.09:1.000:. ./.:4:123,283:.:-0.82:1.000:. ./.:4:243,259:.: 0.03:1.000:. ./.:4:179,204:.:-1.02:1.000:. ./.:4:307,299:.: 0.94:1.000:. ./.:4:294,303:.: 0.87:1.000:. ./.:4:263,293:.: 0.50:1.000:. ./.:4:204,203:.:-0.81:1.000:. ./.:4:141,462:.: 0.92:1.000:. ./.:4:336,127:.:-0.32:1.000:. ./.:4:323,332:.: 1.38:1.000:. ./.:4:211,263:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,151:.:-2.67:1.000:. ./.:4:304,104:.:-0.80:1.000:. ./.:4:291,298:.: 0.79:1.000:. ./.:4:259,263:.: 0.20:1.000:. ./.:4:417,152:.: 0.62:1.000:. ./.:4:319,360:.: 1.59:1.000:. ./.:4:345,105:.:-0.43:0.947:. ./.:4:274,315:.: 0.79:1.000:. ./.:4:267,293:.: 0.54:1.000:. ./.:4:97,307:.:-0.84:1.000:. ./.:4:254,247:.: 0.02:1.000:. ./.:4:249,258:.: 0.07:1.000:. ./.:4:260,281:.: 0.37:1.000:. ./.:4:365,129:.:-0.04:1.000:. ./.:4:255,263:.: 0.17:1.000:. ./.:4:122,388:.: 0.10:1.000:. ./.:4:117,346:.:-0.32:1.000:. ./.:4:416,131:.: 0.42:1.000:. ./.:4:212,262:.:-0.22:1.000:. ./.:4:340,95:.:-0.56:1.000:. ./.:4:167,430:.: 0.87:1.000:. ./.:4:331,105:.:-0.55:1.000:. ./.:4:379,109:.:-0.10:1.000:. ./.:4:225,228:.:-0.40:1.000:. ./.:4:531,186:.: 1.92:1.000:. ./.:4:313,332:.: 1.29:1.000:. ./.:4:388,126:.: 0.13:1.000:. ./.:4:222,231:.:-0.40:1.000:. ./.:4:250,280:.: 0.27:1.000:. ./.:4:329,389:.: 1.93:1.000:. ./.:4:480,174:.: 1.37:1.000:. ./.:4:258,247:.: 0.05:1.000:. ./.:4:128,356:.:-0.13:1.000:. -chr6.1 67578375 chr6.1_067578375 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:85,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:148,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.78:1.000:. ./.:5:160,0:.: 1.03:0.965:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:110,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:219,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:270,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.59:1.000:. ./.:3:28,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.43:1.000:. ./.:5:78,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:0.999:. ./.:4:26,0:.:-1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:144,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:271,0:.: 3.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.85:1.000:. ./.:6:71,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:0.986:. ./.:4:61,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.83:0.999:. ./.:4:91,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:243,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:150,0:.: 0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.03:0.998:. ./.:4:39,0:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:146,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:218,0:.: 2.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:191,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:209,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:76,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:182,0:.: 1.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:120,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.58:0.947:. ./.:4:150,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.62:1.000:. -chr6.1 67680518 chr6.1_067680518 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:42,47:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,42:0.84:-0.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,40:0.47: 0.74:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,47:0.71: 0.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,75:0.81: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,85:0.77: 2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.46:-2.06:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,34:0.54:-0.24:1.000:0.985 0/0/1/1:4:45,27:0.39: 0.29:1.000:0.634 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.50:-2.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,23:0.48:-0.86:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,44:0.65: 0.07:1.000:0.790 0/0/1/1:4:32,28:0.45:-0.24:1.000:0.983 0/1/1/1:4:22,56:0.72: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,87:0.78: 2.07:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:34,84:0.71: 2.34:0.965:0.679 0/0/1/1:4:68,54:0.44: 2.52:1.000:0.959 0/0/1/1:4:39,55:0.57: 1.27:1.000:0.957 0/0/1/1:4:32,32:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,8:0.55:-2.29:1.000:0.980 0/0/1/1:4:37,44:0.52: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,42:0.47: 0.92:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,28:0.66:-1.04:1.000:0.878 0/1/1/1:4:1,6:0.86:-2.60:1.000:0.961 0/0/1/1:4:40,39:0.47: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,55:0.56: 1.32:1.000:0.970 0/1/1/1:4:19,73:0.80: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,50:0.72: 0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,21:0.36:-0.20:1.000:0.663 0/0/1/1:4:42,45:0.49: 0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,56:0.69: 0.69:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-2.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.35:-2.37:1.000:0.753 0/0/1:3:3,3:0.48:-2.64:1.000:0.812 0/1/1/1:4:19,46:0.71:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1/1:5:42,48:0.50: 1.09:1.000:0.546 0/1/1/1:4:21,46:0.68: 0.07:1.000:0.965 0/0/1/1:4:42,38:0.46: 0.65:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,62:0.73: 0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,41:0.63:-0.06:1.000:0.574 0/0/1/1:4:41,54:0.55: 1.32:1.000:0.984 0/0/0/1:4:80,43:0.37: 2.56:1.000:0.613 0/0/1/1:4:32,43:0.55: 0.43:1.000:0.978 0/0/1/1:4:25,30:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,46:0.54: 0.74:1.000:0.989 0/1/1/1:4:25,59:0.70: 0.83:0.999:0.988 0/0/0/1:4:25,6:0.25:-1.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,60:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,39:0.85:-0.86:1.000:0.984 0/1/1/1:4:19,36:0.65:-0.46:1.000:0.766 0/0/1/1:4:59,47:0.44: 1.81:1.000:0.960 0/1/1/1:4:19,54:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,40:0.42: 1.32:1.000:0.911 0/0/1/1:4:44,27:0.39: 0.25:1.000:0.680 0/0/1/1:4:30,43:0.57: 0.34:1.000:0.946 0/0/1/1:4:27,38:0.56:-0.02:1.000:0.958 0/1/1/1:4:27,48:0.63: 0.43:1.000:0.564 0/0/1/1:4:38,26:0.41:-0.06:1.000:0.854 0/0/0/0/1/1:6:28,17:0.39:-0.91:1.000:0.738 0/0/1/1:4:32,23:0.42:-0.46:1.000:0.902 0/1/1/1:4:24,48:0.66: 0.29:1.000:0.878 0/0/1/1:4:31,43:0.56: 0.38:1.000:0.966 0/1/1/1:4:15,52:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,42:0.42: 1.45:1.000:0.932 0/0/1/1:4:32,44:0.56: 0.47:1.000:0.970 0/1/1/1:4:5,15:0.76:-2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,36:0.57:-0.20:1.000:0.943 0/0/1/1:4:19,28:0.58:-0.82:0.986:0.922 0/1/1/1:4:21,47:0.69: 0.12:1.000:0.974 0/1/1/1:4:11,44:0.81:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.39:-1.97:0.999:0.686 1/1/1/1:4:1,57:0.98:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,38:0.43: 0.96:1.000:0.949 0/1/1/1:4:7,41:0.86:-0.77:1.000:0.971 0/1/1/1:4:10,52:0.84:-0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,46:0.55: 0.69:1.000:0.984 0/1/1/1:4:15,46:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,39:0.55: 0.12:1.000:0.978 0/1/1/1:4:8,60:0.89: 0.12:1.000:0.607 0/0/1/1:4:27,20:0.42:-0.82:1.000:0.924 0/0/1/1:4:27,33:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,21:0.41:-0.64:1.000:0.878 0/0/1/1:4:39,40:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:50,23:0.34: 0.34:1.000:0.866 0/0/1/1:4:28,44:0.60: 0.29:1.000:0.822 0/0/1/1:4:21,19:0.46:-1.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:27,27:0.48:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,19:0.46:-1.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:24,28:0.51:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,8:0.30:-1.53:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,56:0.73: 0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,49:0.53: 1.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:25,43:0.62: 0.12:1.000:0.555 0/1/1/1:4:20,53:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,55:0.85:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:19,32:0.62:-0.64:1.000:0.629 0/1/1/1:4:7,32:0.83:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,36:0.61:-0.33:1.000:0.720 0/0/1/1:4:32,44:0.56: 0.47:1.000:0.970 0/0/0/1:4:9,3:0.29:-2.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,30:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,21:0.63:-1.44:1.000:0.507 0/1/1/1:4:16,37:0.70:-0.55:1.000:0.984 0/0/1/1:4:32,34:0.49: 0.03:0.998:0.996 0/0/1/1:4:36,45:0.53: 0.69:1.000:0.992 0/1/1/1:4:17,57:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,32:0.57:-0.51:1.000:0.934 0/1/1/1:4:26,76:0.75: 1.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,49:0.63: 0.52:1.000:0.507 0/0/1/1:4:23,38:0.61:-0.20:1.000:0.691 0/0/1/1:4:32,51:0.60: 0.78:1.000:0.791 0/0/1/1/1/1:6:19,40:0.67:-0.28:1.000:0.920 0/0/1/1:4:41,26:0.39: 0.07:1.000:0.742 0/1/1/1:4:5,35:0.88:-1.13:1.000:0.785 0/0/1/1:4:31,43:0.56: 0.38:1.000:0.966 1/1/1/1:4:3,26:0.90:-1.62:1.000:0.796 0/0/1/1:4:24,34:0.57:-0.33:1.000:0.954 0/0/1/1:4:32,32:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,21:0.39:-0.42:1.000:0.634 0/0/1/1:4:30,44:0.58: 0.38:1.000:0.927 0/0/0/1:4:46,18:0.32:-0.06:1.000:0.964 0/1/1/1:4:19,59:0.76: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,41:0.47: 0.78:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,42:0.74:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,30:0.47:-0.20:1.000:0.993 0/1/1/1:4:18,41:0.69:-0.28:1.000:0.980 0/0/1/1:4:16,25:0.59:-1.08:1.000:0.834 0/1/1/1:4:10,28:0.74:-1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,31:0.71:-0.95:1.000:0.990 0/0/0/1:4:46,21:0.34: 0.07:1.000:0.874 0/1/1/1:4:19,57:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,28:0.72:-1.17:0.999:0.996 0/0/1/1:4:24,29:0.52:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,31:0.41: 0.43:1.000:0.884 0/1/1/1:4:26,70:0.73: 1.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,45:0.56: 0.56:1.000:0.973 0/1/1/1:4:14,39:0.74:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,21:0.41:-0.60:1.000:0.842 0/1/1/1:4:20,40:0.66:-0.24:1.000:0.878 0/1/1/1:4:15,37:0.71:-0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:20,22:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,36:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,41:0.86:-0.77:1.000:0.971 0/0/1/1:4:38,58:0.59: 1.36:1.000:0.876 0/0/1/1:4:31,41:0.55: 0.29:1.000:0.983 0/0/1/1:4:48,28:0.38: 0.47:1.000:0.572 0/1/1/1:4:26,51:0.66: 0.52:1.000:0.844 0/0/1/1:4:48,48:0.48: 1.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,64:0.69: 1.23:1.000:0.968 0/0/1/1:4:46,50:0.49: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,57:0.61: 1.18:1.000:0.734 0/0/0/1:4:10,3:0.28:-2.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,23:0.51:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,49:0.52: 1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,38:0.53: 0.12:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,55:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,46:0.83:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,44:0.82:-0.51:0.947:0.999 0/0/1/1:4:43,31:0.42: 0.38:1.000:0.905 0/0/1/1:4:36,31:0.45: 0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:35,41:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,43:0.53: 0.52:1.000:0.991 0/1/1/1:4:22,77:0.78: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,33:0.44: 0.38:1.000:0.964 0/1/1/1:4:27,65:0.71: 1.18:1.000:0.991 0/1/1/1:4:9,41:0.83:-0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,42:0.65:-0.06:1.000:0.785 0/0/1/1:4:28,39:0.56: 0.07:1.000:0.964 0/1/1/1:4:8,43:0.85:-0.64:1.000:0.990 0/0/1/1:4:21,34:0.60:-0.46:1.000:0.750 0/0/1/1:4:39,37:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/0/0/1:4:37,20:0.37:-0.37:1.000:0.601 0/1/1/1:4:13,45:0.78:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,46:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,41:0.59: 0.12:1.000:0.884 0/1/1/1:4:22,71:0.77: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,39:0.54: 0.16:1.000:0.986 0/0/1/1:4:40,42:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,43:0.58: 0.29:1.000:0.915 0/1/1/1:4:22,43:0.66:-0.02:1.000:0.837 0/1/1/1:4:14,56:0.81: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,63:0.81: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,14:0.37:-1.17:1.000:0.521 0/1/1/1:4:20,49:0.71: 0.16:1.000:0.993 -chr6.1 67885309 chr6.1_067885309 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:142,15:0.17:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,10:0.23:-1.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,10:0.09: 0.28:1.000:0.951 0/0/0/1:4:138,10:0.12:-0.68:1.000:0.798 0/0/0/0:4:257,1:0.01: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:258,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,13:0.22:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,10:0.09: 0.19:1.000:0.932 0/0/0/1:4:142,20:0.22:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,48:0.46:-1.18:1.000:0.984 0/1/1/1:4:44,85:0.67:-1.02:1.000:0.913 0/0/0/1:4:61,18:0.32:-1.92:1.000:0.954 0/0/1/1:4:164,104:0.45: 1.46:1.000:0.975 0/1/1/1:4:61,101:0.64:-0.43:1.000:0.673 0/0/0/0:4:220,2:0.02: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:227,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:208,92:0.38: 2.03:0.965:0.966 0/0/0/1:4:240,18:0.13: 1.28:1.000:0.862 0/0/0/1:4:273,19:0.12: 1.89:1.000:0.698 0/0/1/1:4:127,96:0.48: 0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,92:0.75:-1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:206,23:0.18: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,15:0.12: 0.71:1.000:0.754 0/0/0/1:4:61,8:0.21:-2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,39:0.55:-1.97:1.000:0.983 0/0/0/1:4:145,14:0.16:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,91:0.47: 0.51:1.000:0.993 0/0/0/0:4:226,1:0.01: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,105:0.46: 1.32:1.000:0.987 0/0/0/1:4:73,19:0.30:-1.68:1.000:0.982 0/0/1/1:4:67,90:0.60:-0.52:1.000:0.817 0/0/0/0:4:182,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,21:0.35:-1.92:1.000:0.794 0/0/0/1:4:44,11:0.30:-2.35:1.000:0.987 0/0/1:3:74,15:0.27:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,84:0.38: 1.52:1.000:0.627 0/0/0/1/1:5:190,102:0.42: 1.89:1.000:0.962 0/0/1/1:4:106,82:0.48: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:142,16:0.18:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:190,1:0.01: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,24:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,109:0.47: 1.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:155,50:0.33: 0.34:1.000:0.909 0/0/1/1:4:129,111:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,31:0.28:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,112:0.61: 0.05:1.000:0.658 0/0/0/0:4:276,1:0.01: 1.62:0.999:1.000 0/1/1/1:4:33,59:0.65:-1.68:1.000:0.822 0/0/0/0:4:252,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,92:0.47: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,86:0.58:-0.52:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:173,2:0.02:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,52:0.32: 0.77:1.000:0.955 0/0/0/1:4:128,33:0.30:-0.45:1.000:0.983 0/0/0/1:4:123,29:0.29:-0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:65,103:0.63:-0.33:1.000:0.563 0/0/0/1:4:133,26:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:115,39:0.34:-0.58:1.000:0.869 0/0/0/1/1/1:6:81,55:0.46:-0.90:1.000:0.791 0/0/0/1:4:157,56:0.35: 0.48:1.000:0.814 0/0/0/1:4:151,24:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,118:0.63: 0.10:1.000:0.580 0/0/0/0:4:167,3:0.03:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,46:0.46:-1.29:1.000:0.986 0/0/1/1:4:124,106:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,46:0.38:-0.67:1.000:0.615 0/0/1/1:4:82,96:0.57:-0.15:1.000:0.950 0/0/1/1:4:127,111:0.51: 0.93:0.986:0.996 0/0/0/1:4:131,14:0.17:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/0:4:226,5:0.04: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,28:0.32:-1.17:0.999:0.946 0/0/0/0:4:210,5:0.04: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,38:0.31:-0.09:1.000:0.979 0/0/0/1:4:155,31:0.27: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:175,5:0.05:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,20:0.24:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,104:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,47:0.48:-1.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,63:0.34: 1.02:1.000:0.836 0/0/1/1:4:61,33:0.42:-1.65:1.000:0.900 0/1/1/1:4:56,133:0.71: 0.05:1.000:0.989 0/0/0/1:4:166,60:0.35: 0.71:1.000:0.796 0/0/0/1:4:190,20:0.17: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,46:0.46:-1.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:204,29:0.22: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,13:0.14:-0.33:1.000:0.965 0/0/0/1:4:188,29:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,41:0.35:-0.63:1.000:0.751 0/0/0/0:4:205,13:0.11: 0.57:1.000:0.596 0/0/0/1:4:109,43:0.36:-0.61:1.000:0.649 0/0/0/0:4:189,4:0.04: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,26:0.19: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,17:0.25:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,57:0.41:-0.36:1.000:0.869 0/0/0/0:4:275,0:0.00: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,40:0.32:-0.15:1.000:0.959 0/0/0/1:4:113,21:0.26:-0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:134,103:0.48: 0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:131,26:0.27:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,74:0.58:-0.93:1.000:0.917 0/0/0/1:4:129,31:0.29:-0.47:1.000:0.990 0/0/0/1:4:113,14:0.20:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,45:0.34:-0.20:1.000:0.849 0/0/1/1:4:107,85:0.49: 0.10:0.998:0.996 0/0/0/1:4:188,27:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:185,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,10:0.14:-1.09:1.000:0.978 0/0/1/1:4:190,112:0.43: 2.07:1.000:0.952 0/0/0/0:4:253,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,28:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:245,16:0.11: 1.34:1.000:0.501 0/0/0/0/0/1:6:334,31:0.15: 3.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:119,45:0.36:-0.40:1.000:0.727 0/0/1/1:4:101,87:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,21:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,69:0.37: 0.87:1.000:0.541 0/0/0/1:4:109,21:0.27:-1.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,43:0.37:-0.72:1.000:0.531 0/0/1/1:4:58,40:0.46:-1.58:1.000:0.989 0/0/0/1:4:195,17:0.14: 0.46:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,78:0.41: 0.71:1.000:0.877 0/0/0/0:4:147,9:0.10:-0.54:1.000:0.701 0/0/0/0:4:225,2:0.02: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,14:0.12: 0.55:1.000:0.672 0/0/0/1:4:195,26:0.21: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,23:0.40:-2.06:1.000:0.750 0/0/1/1:4:86,75:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,12:0.11: 0.07:1.000:0.603 1/1/1/1:4:0,137:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,3:0.04:-0.79:0.999:1.000 0/0/1/1:4:111,71:0.45:-0.08:1.000:0.977 0/0/0/1:4:111,20:0.26:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,105:0.45: 1.48:1.000:0.977 0/0/1/1:4:133,98:0.47: 0.80:1.000:0.994 0/0/0/0:4:249,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,69:0.47:-0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:118,16:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,94:0.46: 0.78:1.000:0.989 0/0/0/1:4:127,20:0.25:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,92:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/0:4:179,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,16:0.16:-0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:164,138:0.50: 2.07:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,13:0.15:-0.50:1.000:0.985 0/0/0/1:4:154,25:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,75:0.47:-0.09:1.000:0.991 0/0/0/0:4:210,8:0.07: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,96:0.59:-0.29:1.000:0.866 0/0/1/1:4:60,72:0.57:-0.97:1.000:0.936 0/0/1/1:4:80,98:0.58:-0.15:1.000:0.922 0/0/1/1:4:141,101:0.47: 1.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:158,38:0.29: 0.18:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,74:0.40: 0.69:1.000:0.786 0/0/0/1:4:227,83:0.35: 2.21:1.000:0.780 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.14:0.947:1.000 0/0/1/1:4:85,38:0.38:-1.13:1.000:0.617 0/0/1/1:4:96,77:0.49:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,89:0.46: 0.62:1.000:0.986 0/0/0/1:4:126,13:0.17:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,73:0.36: 1.32:1.000:0.670 0/0/1/1:4:140,87:0.44: 0.73:1.000:0.970 0/0/0/0:4:232,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,68:0.40: 0.43:1.000:0.748 0/0/0/1:4:126,15:0.19:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,7:0.06: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,83:0.45: 0.50:1.000:0.975 0/0/1/1:4:143,93:0.45: 0.89:1.000:0.980 0/0/1/1:4:75,88:0.57:-0.41:1.000:0.949 0/0/0/1:4:137,21:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:173,2:0.02:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,52:0.42:-0.70:1.000:0.910 0/0/1/1:4:111,87:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,81:0.58:-0.72:1.000:0.908 0/0/0/0:4:168,10:0.10:-0.15:1.000:0.773 0/0/1/1:4:158,81:0.41: 0.94:1.000:0.847 0/0/0/1:4:162,17:0.17:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:318,0:0.00: 2.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,100:0.41: 1.87:1.000:0.870 0/0/0/1:4:67,21:0.33:-1.76:1.000:0.927 0/0/0/1:4:120,18:0.24:-0.86:1.000:1.000 -chr6.1 67956726 chr6.1_067956726 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,34:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,17:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,30:0.52:-0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,50:0.64: 0.06:1.000:0.635 0/0/1/1:4:25,26:0.47:-0.98:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,17:0.53:-1.97:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,38:0.72:-1.07:1.000:0.995 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.30: 0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:54,27:0.27: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,21:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,24:0.29:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/1/1:5:60,38:0.33: 1.24:0.965:0.821 0/0/1/1:4:19,38:0.62:-0.69:1.000:0.580 0/0/0/1:4:76,32:0.24: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,68:0.49: 2.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,34:0.59:-0.83:1.000:0.887 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,23:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,15:0.16: 0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,13:0.51:-2.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,34:0.47:-0.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:50,30:0.32: 0.39:1.000:0.955 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,49:0.48: 1.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:74,31:0.24: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,40:0.58:-0.36:1.000:0.907 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,24:0.77:-2.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0:3:9,0:0.00:-2.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,39:0.61:-0.60:1.000:0.644 0/0/0/1/1:5:50,43:0.42: 1.00:1.000:0.959 0/0/0/1:4:44,22:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,47:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,45:0.49: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,18:0.13: 1.76:1.000:0.923 0/0/0/1:4:45,22:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,22:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,32:0.22: 2.18:0.999:1.000 0/0/0/1:4:117,48:0.23: 4.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,38:0.41: 0.58:1.000:0.846 0/1/1/1:4:19,41:0.63:-0.55:1.000:0.617 0/0/1/1:4:42,33:0.39: 0.16:1.000:0.726 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,27:0.34:-0.13:1.000:0.882 0/0/1/1:4:33,28:0.41:-0.50:1.000:0.890 0/0/0/1:4:51,27:0.29: 0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,31:0.38: 0.01:1.000:0.601 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,42:0.45: 0.67:1.000:0.978 0/0/0/1/1/1:6:34,42:0.52: 0.20:1.000:0.874 0/0/1/1:4:27,42:0.57:-0.13:1.000:0.954 0/0/0/1:4:46,18:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,28:0.22: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,25:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,22:0.19: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,17:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,53:0.51: 1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,23:0.21: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,31:0.35: 0.25:0.986:0.785 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,41:0.28: 2.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,29:0.42:-0.41:0.999:0.898 0/0/1/1:4:17,26:0.56:-1.35:1.000:0.961 0/0/0/1:4:41,20:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,14:0.26:-1.35:1.000:0.998 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,23:0.34:-0.65:1.000:0.842 0/0/0/1:4:37,26:0.36:-0.41:1.000:0.662 0/1/1/1:4:24,56:0.65: 0.39:1.000:0.785 0/0/0/1:4:63,21:0.20: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,44:0.59:-0.13:1.000:0.844 0/0/0/1:4:55,25:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,19:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,14:0.16:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,48:0.65:-0.13:1.000:0.746 0/0/0/1:4:39,19:0.27:-0.65:1.000:0.998 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,38:0.48: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,16:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,60:0.53: 1.57:1.000:0.991 0/0/1/1:4:35,27:0.39:-0.46:1.000:0.669 0/0/1/1:4:31,38:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:37,23:0.33:-0.55:1.000:0.925 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,61:0.57: 1.29:1.000:0.936 0/0/0/1:4:49,27:0.30: 0.20:1.000:0.987 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,31:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,26:0.29: 0.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:59,15:0.16: 0.11:0.998:0.996 0/1/1/1:4:19,50:0.67:-0.13:1.000:0.926 0/0/1/1:4:31,32:0.47:-0.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,47:0.46: 1.10:1.000:0.984 0/0/1/1:4:64,56:0.42: 2.28:1.000:0.927 0/0/0/1:4:31,22:0.36:-0.88:1.000:0.629 0/0/0/1:4:39,21:0.29:-0.55:1.000:0.991 0/1/1/1:4:27,58:0.63: 0.63:1.000:0.606 0/0/0/0/1/1:6:75,44:0.31: 2.23:1.000:0.907 0/0/0/1:4:44,25:0.31:-0.13:1.000:0.980 0/0/1/1:4:35,60:0.59: 1.10:1.000:0.878 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,47:0.67:-0.32:1.000:0.921 0/0/1/1:4:31,28:0.43:-0.60:1.000:0.952 0/0/1/1:4:45,51:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,13:0.18:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,45:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,26:0.39:-0.55:1.000:0.640 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,21:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,25:0.28: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,36:0.62:-0.83:1.000:0.580 0/0/0/1:4:40,23:0.31:-0.41:1.000:0.976 0/0/0/1:4:34,13:0.22:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,11:0.18:-1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,46:0.60:-0.03:1.000:0.770 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.83:0.999:1.000 0/0/1/1:4:28,35:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,30:0.50:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,77:0.54: 2.94:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,27:0.38:-0.41:1.000:0.572 0/0/0/1:4:36,20:0.30:-0.74:1.000:0.986 0/0/1/1:4:38,41:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,35:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,52:0.45: 1.62:1.000:0.980 0/1/1/1:4:19,42:0.64:-0.50:1.000:0.675 0/0/1/1:4:38,44:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,18:0.36:-1.31:1.000:0.710 0/0/0/1:4:68,33:0.26: 1.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,20:0.19: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,49:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,49:0.44: 1.38:1.000:0.973 0/0/0/1:4:56,30:0.29: 0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,52:0.54: 0.86:1.000:0.988 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,58:0.63: 0.67:1.000:0.512 0/0/1/1:4:18,15:0.41:-1.83:1.000:0.862 0/0/0/1:4:37,22:0.32:-0.60:1.000:0.961 0/0/1/1:4:24,45:0.61:-0.13:1.000:0.733 0/0/0/1:4:41,23:0.30:-0.36:1.000:0.984 0/0/1/1:4:45,44:0.45: 0.82:1.000:0.984 0/1/1/1:4:27,59:0.64: 0.67:1.000:0.648 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.65:0.947:1.000 0/0/0/1:4:70,19:0.17: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,52:0.52: 1.00:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,58:0.59: 0.96:1.000:0.883 0/1/1/1:4:12,47:0.74:-0.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,20:0.29:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,22:0.20: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,48:0.66:-0.22:1.000:0.892 0/0/0/1:4:45,32:0.37: 0.25:1.000:0.622 0/1/1/1:4:18,38:0.63:-0.74:1.000:0.562 0/0/0/1:4:53,29:0.30: 0.49:1.000:0.989 0/0/0/1:4:50,35:0.36: 0.63:1.000:0.675 0/0/0/1:4:40,15:0.22:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,45:0.57: 0.06:1.000:0.935 0/0/0/1:4:55,23:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,51:0.55: 0.72:1.000:0.983 0/0/1/1:4:30,23:0.39:-0.88:1.000:0.649 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,33:0.27: 1.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,24:0.33:-0.41:1.000:0.935 0/0/1/1:4:47,61:0.53: 1.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:52,34:0.34: 0.67:1.000:0.852 0/0/0/1:4:62,36:0.31: 1.24:1.000:0.972 0/0/0/1:4:36,26:0.37:-0.46:1.000:0.566 0/0/0/1:4:43,24:0.30:-0.22:1.000:0.985 -chr6.1 68705068 chr6.1_068705068 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:535,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:413,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:484,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:395,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:244,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:246,22:.:-1.90:1.000:. ./.:4:520,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:422,3:.:-0.67:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:379,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.35:1.000:. ./.:5:572,0:.: 0.49:0.965:. ./.:4:503,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:619,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:488,31:.: 0.07:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:669,7:.: 1.31:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:300,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:570,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:317,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:389,4:.:-0.92:1.000:. ./.:4:352,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:150,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:357,23:.:-1.02:1.000:. ./.:3:240,18:.:-1.98:1.000:. ./.:4:439,1:.:-0.55:1.000:. ./.:5:628,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:568,3:.: 0.48:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:572,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:558,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:636,3:.: 1.02:1.000:. ./.:4:407,2:.:-0.79:1.000:. ./.:4:716,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:479,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:672,0:.: 1.28:0.999:. ./.:4:79,7:.:-3.34:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:524,14:.: 0.22:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:587,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:495,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:624,7:.: 0.96:1.000:. ./.:4:496,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:486,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:435,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:558,10:.: 0.46:1.000:. ./.:4:467,9:.:-0.26:1.000:. ./.:6:560,12:.: 0.49:1.000:. ./.:4:715,20:.: 1.78:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:799,9:.: 2.35:1.000:. ./.:4:661,6:.: 1.24:1.000:. ./.:4:526,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:460,4:.:-0.36:1.000:. ./.:4:555,4:.: 0.39:0.986:. ./.:4:494,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:741,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:752,2:.: 1.93:0.999:. ./.:4:673,5:.: 1.33:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:611,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:496,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:710,5:.: 1.62:1.000:. ./.:4:491,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:665,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:619,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:618,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:438,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:538,5:.: 0.26:1.000:. ./.:4:643,4:.: 1.08:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:586,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:538,5:.: 0.26:1.000:. ./.:4:554,6:.: 0.40:1.000:. ./.:4:602,14:.: 0.84:1.000:. ./.:4:483,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:719,3:.: 1.67:1.000:. ./.:4:321,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:616,6:.: 0.89:1.000:. ./.:4:530,4:.: 0.19:1.000:. ./.:4:576,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:508,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:724,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:547,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:748,4:.: 1.91:1.000:. ./.:4:767,4:.: 2.06:1.000:. ./.:4:488,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:734,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:497,6:.:-0.05:0.998:. ./.:4:414,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:678,5:.: 1.37:1.000:. ./.:4:457,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:586,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:457,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:487,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.13:1.000:. ./.:6:850,1:.: 2.69:1.000:. ./.:4:606,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:733,2:.: 1.78:1.000:. ./.:4:538,4:.: 0.26:1.000:. ./.:4:572,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:590,4:.: 0.67:1.000:. ./.:4:452,4:.:-0.42:1.000:. ./.:4:542,5:.: 0.30:1.000:. ./.:4:473,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:763,2:.: 2.01:1.000:. ./.:4:416,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:488,8:.:-0.11:1.000:. ./.:4:572,6:.: 0.54:1.000:. ./.:4:569,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:500,6:.:-0.03:1.000:. ./.:4:542,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:427,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:504,3:.:-0.02:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:393,3:.:-0.89:0.999:. ./.:4:468,5:.:-0.29:1.000:. ./.:4:491,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:477,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:502,7:.: 0.00:1.000:. ./.:4:535,9:.: 0.27:1.000:. ./.:4:634,10:.: 1.06:1.000:. ./.:4:643,9:.: 1.12:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:381,3:.:-0.99:1.000:. ./.:4:528,6:.: 0.19:1.000:. ./.:4:710,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:737,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:382,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:535,4:.: 0.23:1.000:. ./.:4:509,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:536,3:.: 0.23:1.000:. ./.:4:372,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:324,17:.:-1.33:1.000:. ./.:4:286,2:.:-1.75:1.000:. ./.:4:668,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:642,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:633,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:502,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:377,0:.:-1.04:0.947:. ./.:4:507,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:359,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:452,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:367,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:481,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:507,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:337,1:.:-1.35:1.000:. ./.:4:331,1:.:-1.40:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:458,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:494,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:272,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:611,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:501,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:325,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:471,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:577,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:594,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:422,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:494,1:.:-0.11:1.000:. -chr6.1 68937560 chr6.1_068937560 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:3,137:.:-0.03:1.000:. ./.:4:15,170:.: 0.84:1.000:. ./.:4:16,61:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,194:.: 1.01:1.000:. ./.:4:14,94:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,141:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.40:1.000:. ./.:4:23,137:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,109:.:-0.43:1.000:. ./.:4:7,43:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,52:.:-1.72:1.000:. ./.:4:16,197:.: 1.38:1.000:. ./.:4:19,107:.:-0.30:1.000:. ./.:4:3,167:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,127:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,133:.:-0.14:1.000:. ./.:5:1,166:.: 0.49:0.965:. ./.:4:49,139:.: 0.90:1.000:. ./.:4:1,164:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,216:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,43:.:-1.90:1.000:. ./.:4:15,61:.:-1.26:1.000:. ./.:4:3,153:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,145:.: 0.09:1.000:. ./.:4:6,24:.:-2.15:1.000:. ./.:4:1,198:.: 1.11:1.000:. ./.:4:8,131:.:-0.05:1.000:. ./.:4:20,45:.:-1.47:1.000:. ./.:4:2,244:.: 2.01:1.000:. ./.:4:1,200:.: 1.15:1.000:. ./.:4:19,161:.: 0.74:1.000:. ./.:4:19,59:.:-1.22:1.000:. ./.:4:1,31:.:-2.11:1.000:. ./.:4:2,36:.:-1.99:1.000:. ./.:3:0,10:.:-2.53:1.000:. ./.:4:24,148:.: 0.59:1.000:. ./.:5:3,193:.: 1.05:1.000:. ./.:4:19,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,87:.:-1.03:1.000:. ./.:4:15,44:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.51:1.000:. ./.:4:2,194:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.86:1.000:. ./.:4:16,112:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,135:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1,202:.: 1.19:1.000:. ./.:4:2,152:.: 0.24:0.999:. ./.:4:1,173:.: 0.63:1.000:. ./.:4:21,60:.:-1.16:1.000:. ./.:4:12,90:.:-0.76:1.000:. ./.:4:10,155:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,278:.: 2.63:1.000:. ./.:4:24,51:.:-1.28:1.000:. ./.:4:23,121:.: 0.05:1.000:. ./.:4:23,96:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1,150:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,125:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.99:1.000:. ./.:6:5,127:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1,175:.: 0.67:1.000:. ./.:4:16,105:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,83:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,211:.: 1.34:1.000:. ./.:4:16,101:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,105:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,179:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,106:.:-0.16:0.986:. ./.:4:34,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.24:1.000:. ./.:4:3,147:.: 0.16:0.999:. ./.:4:46,149:.: 1.03:1.000:. ./.:4:12,138:.: 0.16:1.000:. ./.:4:26,202:.: 1.67:1.000:. ./.:4:16,42:.:-1.61:1.000:. ./.:4:1,115:.:-0.49:1.000:. ./.:4:20,116:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,94:.:-0.53:1.000:. ./.:4:13,137:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,182:.: 1.11:1.000:. ./.:4:20,112:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.84:1.000:. ./.:4:1,161:.: 0.40:1.000:. ./.:4:25,56:.:-1.16:1.000:. ./.:4:19,52:.:-1.36:1.000:. ./.:4:17,86:.:-0.74:1.000:. ./.:4:13,109:.:-0.37:1.000:. ./.:4:12,49:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.13:1.000:. ./.:4:23,62:.:-1.09:1.000:. ./.:4:19,63:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,161:.: 0.40:1.000:. ./.:4:16,57:.:-1.32:1.000:. ./.:4:1,123:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.34:1.000:. ./.:4:16,192:.: 1.28:1.000:. ./.:4:3,177:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1,129:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,67:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,135:.: 0.20:1.000:. ./.:4:2,141:.: 0.03:0.998:. ./.:4:19,95:.:-0.53:1.000:. ./.:4:13,40:.:-1.70:1.000:. ./.:4:1,189:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1,281:.: 2.71:1.000:. ./.:4:20,53:.:-1.32:1.000:. ./.:4:4,108:.:-0.57:1.000:. ./.:4:29,168:.: 1.07:1.000:. ./.:6:26,106:.:-0.18:1.000:. ./.:4:22,93:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.63:1.000:. ./.:4:15,103:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,152:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,161:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,58:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,233:.: 1.76:1.000:. ./.:4:18,113:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,159:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.51:1.000:. ./.:4:3,114:.:-0.47:1.000:. ./.:4:20,113:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.18:1.000:. ./.:4:13,66:.:-1.20:1.000:. ./.:4:2,80:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,225:.: 1.61:1.000:. ./.:4:18,56:.:-1.30:1.000:. ./.:4:9,34:.:-1.90:0.999:. ./.:4:0,159:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,238:.: 1.86:1.000:. ./.:4:14,121:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,40:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,134:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,147:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,189:.: 0.95:1.000:. ./.:4:9,38:.:-1.82:1.000:. ./.:4:26,147:.: 0.61:1.000:. ./.:4:24,186:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,195:.: 1.03:1.000:. ./.:4:17,165:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,148:.: 0.15:1.000:. ./.:4:23,80:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,256:.: 2.21:1.000:. ./.:4:1,40:.:-1.94:1.000:. ./.:4:1,204:.: 1.22:1.000:. ./.:4:16,130:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,126:.: 0.07:1.000:. ./.:4:2,254:.: 2.21:1.000:. ./.:4:18,118:.:-0.10:1.000:. ./.:4:16,57:.:-1.32:0.947:. ./.:4:0,205:.: 1.22:1.000:. ./.:4:1,163:.: 0.43:1.000:. ./.:4:9,157:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,156:.: 0.36:1.000:. ./.:4:23,134:.: 0.30:1.000:. ./.:4:26,129:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.55:1.000:. ./.:4:15,100:.:-0.51:1.000:. ./.:4:9,179:.: 0.90:1.000:. ./.:4:20,144:.: 0.43:1.000:. ./.:4:20,130:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,163:.: 0.43:1.000:. ./.:4:3,136:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,184:.: 0.84:1.000:. ./.:4:2,106:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.13:1.000:. ./.:4:11,114:.:-0.32:1.000:. ./.:4:16,72:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,194:.: 1.01:1.000:. ./.:4:2,118:.:-0.41:1.000:. ./.:4:4,184:.: 0.90:1.000:. ./.:4:21,121:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,85:.:-0.68:1.000:. ./.:4:23,183:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1,157:.: 0.32:1.000:. ./.:4:22,213:.: 1.80:1.000:. -chr6.1 69183694 chr6.1_069183694 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:323,104:.:-0.33:1.000:. ./.:4:266,90:.:-0.90:1.000:. ./.:4:269,147:.:-0.42:1.000:. ./.:4:353,98:.:-0.14:1.000:. ./.:4:440,116:.: 0.69:1.000:. ./.:4:448,98:.: 0.61:1.000:. ./.:4:220,145:.:-0.83:1.000:. ./.:4:427,214:.: 1.36:1.000:. ./.:4:324,168:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,36:.:-2.79:1.000:. ./.:4:188,166:.:-0.91:1.000:. ./.:4:285,212:.: 0.22:1.000:. ./.:4:296,158:.:-0.12:1.000:. ./.:4:366,85:.:-0.14:1.000:. ./.:4:387,100:.: 0.14:1.000:. ./.:5:497,177:.: 1.62:0.965:. ./.:4:168,213:.:-0.70:1.000:. ./.:4:334,202:.: 0.53:1.000:. ./.:4:341,194:.: 0.52:1.000:. ./.:4:94,20:.:-2.82:1.000:. ./.:4:342,106:.:-0.17:1.000:. ./.:4:319,189:.: 0.31:1.000:. ./.:4:380,57:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,8:.:-3.24:1.000:. ./.:4:400,192:.: 0.97:1.000:. ./.:4:309,168:.: 0.06:1.000:. ./.:4:388,94:.: 0.10:1.000:. ./.:4:427,212:.: 1.35:1.000:. ./.:4:320,160:.: 0.09:1.000:. ./.:4:450,210:.: 1.51:1.000:. ./.:4:333,90:.:-0.37:1.000:. ./.:4:70,9:.:-3.09:1.000:. ./.:4:100,9:.:-2.85:1.000:. ./.:3:24,8:.:-3.47:1.000:. ./.:4:385,194:.: 0.87:1.000:. ./.:5:392,221:.: 1.14:1.000:. ./.:4:380,108:.: 0.15:1.000:. ./.:4:317,125:.:-0.21:1.000:. ./.:4:408,145:.: 0.67:1.000:. ./.:4:368,176:.: 0.59:1.000:. ./.:4:276,147:.:-0.37:1.000:. ./.:4:366,180:.: 0.61:1.000:. ./.:4:269,212:.: 0.09:1.000:. ./.:4:331,133:.:-0.04:1.000:. ./.:4:331,180:.: 0.33:1.000:. ./.:4:429,124:.: 0.67:0.999:. ./.:4:192,18:.:-2.05:1.000:. ./.:4:365,145:.: 0.32:1.000:. ./.:4:252,83:.:-1.06:1.000:. ./.:4:297,134:.:-0.30:1.000:. ./.:4:317,180:.: 0.22:1.000:. ./.:4:302,89:.:-0.62:1.000:. ./.:4:288,245:.: 0.51:1.000:. ./.:4:280,189:.: 0.00:1.000:. ./.:4:434,205:.: 1.35:1.000:. ./.:4:262,100:.:-0.85:1.000:. ./.:4:328,98:.:-0.34:1.000:. ./.:4:315,218:.: 0.51:1.000:. ./.:6:236,158:.:-0.60:1.000:. ./.:4:289,177:.:-0.02:1.000:. ./.:4:322,156:.: 0.07:1.000:. ./.:4:307,176:.: 0.11:1.000:. ./.:4:363,91:.:-0.12:1.000:. ./.:4:288,165:.:-0.13:1.000:. ./.:4:293,165:.:-0.09:1.000:. ./.:4:344,149:.: 0.19:1.000:. ./.:4:293,196:.: 0.16:1.000:. ./.:4:284,242:.: 0.45:0.986:. ./.:4:228,121:.:-0.95:1.000:. ./.:4:449,124:.: 0.82:1.000:. ./.:4:140,124:.:-1.63:0.999:. ./.:4:422,155:.: 0.86:1.000:. ./.:4:305,154:.:-0.08:1.000:. ./.:4:268,152:.:-0.39:1.000:. ./.:4:329,116:.:-0.19:1.000:. ./.:4:236,89:.:-1.14:1.000:. ./.:4:283,186:.: 0.00:1.000:. ./.:4:168,196:.:-0.83:1.000:. ./.:4:421,277:.: 1.82:1.000:. ./.:4:161,152:.:-1.24:1.000:. ./.:4:343,192:.: 0.52:1.000:. ./.:4:345,283:.: 1.26:1.000:. ./.:4:295,87:.:-0.69:1.000:. ./.:4:264,172:.:-0.26:1.000:. ./.:4:301,187:.: 0.15:1.000:. ./.:4:188,112:.:-1.34:1.000:. ./.:4:281,164:.:-0.19:1.000:. ./.:4:267,201:.:-0.01:1.000:. ./.:4:235,136:.:-0.78:1.000:. ./.:4:238,133:.:-0.78:1.000:. ./.:4:326,113:.:-0.24:1.000:. ./.:4:322,199:.: 0.41:1.000:. ./.:4:206,80:.:-1.45:1.000:. ./.:4:399,165:.: 0.75:1.000:. ./.:4:404,201:.: 1.08:1.000:. ./.:4:305,134:.:-0.24:1.000:. ./.:4:269,160:.:-0.32:1.000:. ./.:4:387,216:.: 1.06:1.000:. ./.:4:432,107:.: 0.55:1.000:. ./.:4:203,86:.:-1.43:1.000:. ./.:4:278,164:.:-0.21:1.000:. ./.:4:292,114:.:-0.50:1.000:. ./.:4:357,150:.: 0.30:1.000:. ./.:4:311,116:.:-0.33:0.998:. ./.:4:333,213:.: 0.61:1.000:. ./.:4:361,150:.: 0.33:1.000:. ./.:4:433,194:.: 1.25:1.000:. ./.:4:436,188:.: 1.23:1.000:. ./.:4:410,192:.: 1.05:1.000:. ./.:4:260,154:.:-0.44:1.000:. ./.:4:496,262:.: 2.29:1.000:. ./.:6:540,273:.: 2.73:1.000:. ./.:4:311,240:.: 0.65:1.000:. ./.:4:292,105:.:-0.57:1.000:. ./.:4:311,128:.:-0.24:1.000:. ./.:4:270,159:.:-0.32:1.000:. ./.:4:321,171:.: 0.18:1.000:. ./.:4:234,195:.:-0.32:1.000:. ./.:4:218,128:.:-0.98:1.000:. ./.:4:275,232:.: 0.30:1.000:. ./.:4:230,142:.:-0.77:1.000:. ./.:4:412,123:.: 0.52:1.000:. ./.:4:346,100:.:-0.18:1.000:. ./.:4:336,157:.: 0.19:1.000:. ./.:4:289,176:.:-0.03:1.000:. ./.:4:377,216:.: 0.98:1.000:. ./.:4:267,116:.:-0.68:1.000:. ./.:4:195,139:.:-1.07:1.000:. ./.:4:228,140:.:-0.80:1.000:. ./.:4:278,150:.:-0.33:1.000:. ./.:4:395,108:.: 0.27:1.000:. ./.:4:252,78:.:-1.10:0.999:. ./.:4:271,198:.: 0.00:1.000:. ./.:4:269,146:.:-0.43:1.000:. ./.:4:492,194:.: 1.72:1.000:. ./.:4:285,224:.: 0.32:1.000:. ./.:4:387,198:.: 0.92:1.000:. ./.:4:249,167:.:-0.42:1.000:. ./.:4:319,143:.:-0.06:1.000:. ./.:4:357,106:.:-0.05:1.000:. ./.:4:268,166:.:-0.28:1.000:. ./.:4:282,239:.: 0.41:1.000:. ./.:4:296,122:.:-0.40:1.000:. ./.:4:377,211:.: 0.94:1.000:. ./.:4:316,198:.: 0.36:1.000:. ./.:4:321,168:.: 0.16:1.000:. ./.:4:367,173:.: 0.56:1.000:. ./.:4:350,271:.: 1.20:1.000:. ./.:4:363,190:.: 0.67:1.000:. ./.:4:372,171:.: 0.59:1.000:. ./.:4:409,165:.: 0.83:1.000:. ./.:4:55,23:.:-3.10:1.000:. ./.:4:238,78:.:-1.21:1.000:. ./.:4:439,267:.: 1.88:1.000:. ./.:4:398,112:.: 0.32:1.000:. ./.:4:417,119:.: 0.53:1.000:. ./.:4:442,256:.: 1.82:1.000:. ./.:4:389,120:.: 0.32:0.947:. ./.:4:314,160:.: 0.04:1.000:. ./.:4:274,191:.:-0.03:1.000:. ./.:4:302,202:.: 0.28:1.000:. ./.:4:368,143:.: 0.33:1.000:. ./.:4:345,170:.: 0.36:1.000:. ./.:4:314,171:.: 0.13:1.000:. ./.:4:390,112:.: 0.26:1.000:. ./.:4:376,172:.: 0.63:1.000:. ./.:4:294,158:.:-0.14:1.000:. ./.:4:389,188:.: 0.86:1.000:. ./.:4:376,155:.: 0.49:1.000:. ./.:4:269,199:.:-0.01:1.000:. ./.:4:225,98:.:-1.16:1.000:. ./.:4:319,134:.:-0.13:1.000:. ./.:4:365,153:.: 0.39:1.000:. ./.:4:381,157:.: 0.55:1.000:. ./.:4:271,224:.: 0.21:1.000:. ./.:4:465,134:.: 1.03:1.000:. ./.:4:265,181:.:-0.18:1.000:. ./.:4:307,105:.:-0.45:1.000:. ./.:4:297,178:.: 0.05:1.000:. ./.:4:451,182:.: 1.30:1.000:. ./.:4:503,220:.: 2.01:1.000:. ./.:4:441,211:.: 1.45:1.000:. ./.:4:246,76:.:-1.17:1.000:. ./.:4:282,181:.:-0.05:1.000:. -chr6.1 69396016 chr6.1_069396016 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,3:0.55: 0.43:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.70: 1.34:1.000:0.986 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,1:0.40:-0.18:1.000:0.791 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:2,0:0.25:-1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,2:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,6:0.62: 1.64:1.000:0.615 0/1/1/1/1:5:1,6:0.83: 0.43:0.965:0.999 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,7:0.67: 1.64:1.000:0.904 0/1/1/1:4:2,11:0.82: 2.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,2:0.50: 0.13:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00: 0.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.71: 0.43:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,2:0.46: 0.43:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,3:0.65:-0.18:1.000:0.757 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.13:1.000:1.000 1/1/1:3:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.68: 0.13:1.000:0.961 0/0/1/1/1:5:4,3:0.55: 0.43:1.000:0.889 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.74: 1.04:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.55: 2.55:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,12:0.91: 2.25:1.000:0.936 0/0/1/1:4:1,1:0.59:-1.09:1.000:0.855 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.59:-0.48:1.000:0.855 0/0/1/1:4:5,2:0.46: 0.43:0.999:0.990 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 4.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.80: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,3:0.65:-0.18:1.000:0.757 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 2.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,3:0.65:-0.18:1.000:0.757 0/0/1/1/1/1:6:4,6:0.65: 1.34:1.000:0.891 0/1/1/1:4:2,9:0.78: 1.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-0.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,4:0.63: 0.43:1.000:0.572 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:0.986:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:4,7:0.67: 1.64:1.000:0.904 0/0/1/1:4:6,5:0.57: 1.64:0.999:0.955 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-0.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 1.94:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,2:0.68:-0.78:1.000:0.961 0/0/1/1:4:3,1:0.44:-0.48:1.000:0.963 0/0/1/1:4:5,1:0.38: 0.13:1.000:0.503 0/0/0/1:4:3,0:0.25:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-0.48:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.78:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.85: 0.73:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,0:0.25: 0.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.76: 1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.68: 0.13:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,7:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,0:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,1:0.36: 0.43:1.000:0.721 0/1/1/1:4:3,5:0.66: 0.73:1.000:0.869 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.59: 0.13:1.000:0.855 0/1/1/1:4:1,9:0.88: 1.34:1.000:0.727 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:0.998:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.73: 0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,7:0.70: 1.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,5:0.71: 0.43:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,9:0.67: 2.55:1.000:0.920 1/1/1/1/1/1:6:0,6:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.83: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,5:0.62: 1.04:1.000:0.544 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,2:0.44: 0.73:1.000:0.963 0/1/1/1:4:2,6:0.73: 0.73:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.59:-0.48:1.000:0.855 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-0.48:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,8:0.65: 2.25:1.000:0.832 0/1/1/1:4:4,8:0.68: 1.94:1.000:0.961 0/0/0/1:4:5,0:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,4:0.76:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:0.999:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.59:-1.09:1.000:0.855 0/1/1/1:4:1,5:0.80: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/1/1/1:4:2,6:0.73: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,3:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,4:0.50: 1.94:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,0:0.25:-1.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.80: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.76: 1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.68: 1.04:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,4:0.63: 0.43:1.000:0.572 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,1:0.40:-0.18:1.000:0.791 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.59: 1.34:1.000:0.855 0/0/1/1:4:4,2:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.59:-0.48:0.947:0.855 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,1:0.44:-0.48:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/1/1/1:4:1,2:0.68:-0.78:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.55: 0.43:1.000:0.977 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,5:0.71: 0.43:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,3:0.65:-0.18:1.000:0.757 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.54: 1.34:1.000:0.989 0/1/1/1:4:2,4:0.68: 0.13:1.000:0.961 0/0/1/1:4:2,2:0.59:-0.48:1.000:0.855 0/1/1/1:4:1,5:0.80: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,6:0.68: 1.04:1.000:0.961 0/0/1/1:4:6,3:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,4:0.76:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. -chr6.1 71276073 chr6.1_071276073 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:149,24:.: 0.67:1.000:. ./.:4:114,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,17:.:-0.09:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:222,1:.: 1.86:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,23:.:-1.65:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,27:.: 0.29:1.000:. ./.:4:35,3:.:-2.53:1.000:. ./.:4:21,9:.:-2.72:1.000:. ./.:4:64,43:.:-0.89:1.000:. ./.:4:79,35:.:-0.73:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.25:1.000:. ./.:5:160,18:.: 0.79:0.965:. ./.:4:147,40:.: 1.00:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:161,22:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,3:.:-2.48:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:149,27:.: 0.74:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:9,1:.:-3.19:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:72,26:.:-1.11:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:135,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:108,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:69,4:.:-1.70:1.000:. ./.:3:14,12:.:-2.81:1.000:. ./.:4:128,7:.:-0.23:1.000:. ./.:5:108,37:.: 0.01:1.000:. ./.:4:122,13:.:-0.23:1.000:. ./.:4:121,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:167,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:89,34:.:-0.51:1.000:. ./.:4:185,30:.: 1.67:1.000:. ./.:4:83,31:.:-0.73:1.000:. ./.:4:152,21:.: 0.67:1.000:. ./.:4:167,19:.: 0.98:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.36:0.999:. ./.:4:15,3:.:-3.00:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:99,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:117,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:106,42:.: 0.08:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:155,26:.: 0.86:1.000:. ./.:4:130,21:.: 0.15:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:89,46:.:-0.23:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.18:1.000:. ./.:4:128,21:.: 0.10:1.000:. ./.:6:100,21:.:-0.56:1.000:. ./.:4:143,17:.: 0.36:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,50:.:-1.13:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:119,18:.:-0.18:1.000:. ./.:4:119,36:.: 0.24:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:79,33:.:-0.78:1.000:. ./.:4:85,41:.:-0.44:0.986:. ./.:4:114,12:.:-0.44:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:110,17:.:-0.42:0.999:. ./.:4:161,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:137,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:118,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:124,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:87,36:.:-0.51:1.000:. ./.:4:120,45:.: 0.48:1.000:. ./.:4:143,13:.: 0.27:1.000:. ./.:4:80,32:.:-0.78:1.000:. ./.:4:127,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:149,36:.: 0.96:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:102,15:.:-0.66:1.000:. ./.:4:160,19:.: 0.81:1.000:. ./.:4:115,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:126,19:.: 0.01:1.000:. ./.:4:113,26:.:-0.14:1.000:. ./.:4:141,19:.: 0.36:1.000:. ./.:4:100,23:.:-0.51:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:184,25:.: 1.52:1.000:. ./.:4:112,26:.:-0.16:1.000:. ./.:4:173,16:.: 1.05:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:106,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:167,21:.: 1.03:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:70,25:.:-1.18:1.000:. ./.:4:144,23:.: 0.53:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:109,26:.:-0.23:0.998:. ./.:4:149,26:.: 0.72:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:184,17:.: 1.33:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:150,30:.: 0.84:1.000:. ./.:4:208,1:.: 1.52:1.000:. ./.:6:268,0:.: 2.92:1.000:. ./.:4:134,23:.: 0.29:1.000:. ./.:4:82,10:.:-1.25:1.000:. ./.:4:85,40:.:-0.47:1.000:. ./.:4:116,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:168,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:126,30:.: 0.27:1.000:. ./.:4:145,18:.: 0.43:1.000:. ./.:4:70,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:147,18:.: 0.48:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:145,13:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,30:.: 0.74:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:111,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:79,15:.:-1.20:1.000:. ./.:4:107,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:108,11:.:-0.61:1.000:. ./.:4:170,14:.: 0.93:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:92,27:.:-0.61:1.000:. ./.:4:130,25:.: 0.24:1.000:. ./.:4:153,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:158,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:120,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:77,23:.:-1.06:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:144,12:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,29:.:-1.51:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:239,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:172,31:.: 1.38:1.000:. ./.:4:89,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:153,29:.: 0.88:1.000:. ./.:4:115,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:168,19:.: 1.00:1.000:. ./.:4:107,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:38,6:.:-2.39:1.000:. ./.:4:64,23:.:-1.37:1.000:. ./.:4:122,13:.:-0.23:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:161,19:.: 0.84:1.000:. ./.:4:128,13:.:-0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.40:0.947:. ./.:4:130,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:81,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:89,19:.:-0.87:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:91,29:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,27:.:-1.91:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:90,6:.:-1.15:1.000:. ./.:4:122,27:.: 0.10:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:97,8:.:-0.94:1.000:. ./.:4:55,28:.:-1.46:1.000:. ./.:4:62,30:.:-1.25:1.000:. ./.:4:122,21:.:-0.04:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:99,10:.:-0.85:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:87,39:.:-0.44:1.000:. ./.:4:136,24:.: 0.36:1.000:. ./.:4:74,33:.:-0.89:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:161,14:.: 0.72:1.000:. ./.:4:110,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:138,26:.: 0.46:1.000:. -chr6.1 71434924 chr6.1_071434924 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:64,98:0.59: 0.23:1.000:0.884 0/0/1/1:4:87,111:0.55: 0.86:1.000:0.983 0/1/1/1:4:35,173:0.80: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,87:0.46: 0.67:1.000:0.988 0/0/0/1:4:160,63:0.30: 1.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:83,101:0.54: 0.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:92,82:0.47: 0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:77,138:0.62: 1.16:1.000:0.573 0/1/1/1:4:4,14:0.74:-2.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,9:0.29:-2.06:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,200:0.79: 1.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,182:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,160:0.69: 1.29:1.000:0.975 0/0/0/1:4:112,30:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,57:0.28: 1.15:1.000:0.995 0/0/0/1/1:5:170,103:0.38: 2.18:0.965:0.966 0/1/1/1:4:54,167:0.72: 1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,53:0.30: 0.60:1.000:0.983 0/0/1/1:4:99,159:0.60: 1.92:1.000:0.818 0/0/1/1:4:14,13:0.48:-2.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,86:0.48: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,140:0.58: 1.52:1.000:0.921 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,10:0.64:-2.36:1.000:0.712 0/0/0/1:4:139,58:0.31: 0.85:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,261:1.00: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,81:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,71:0.46: 0.09:1.000:0.985 0/0/1/1:4:111,141:0.55: 1.81:1.000:0.984 0/0/1/1:4:118,101:0.46: 1.23:1.000:0.986 0/0/1/1:4:76,95:0.54: 0.39:1.000:0.986 0/0/0/1:4:5,1:0.18:-2.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,9:0.41:-2.23:1.000:0.864 1/1/1:3:1,18:0.94:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,157:0.77: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:124,110:0.46: 1.50:1.000:0.819 0/0/1/1:4:92,90:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,104:0.56: 0.58:1.000:0.973 0/0/1/1:4:115,102:0.46: 1.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:74,32:0.31:-0.75:1.000:0.968 0/1/1/1:4:45,109:0.68: 0.09:1.000:0.951 0/0/1/1:4:100,88:0.46: 0.69:1.000:0.989 0/1/1/1:4:17,101:0.83:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,79:0.54:-0.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,88:0.55: 0.14:1.000:0.983 0/0/0/1:4:122,45:0.28: 0.32:0.999:0.994 0/0/1/1:4:80,85:0.51: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,52:0.47:-0.68:1.000:0.991 0/0/1/1:4:52,50:0.48:-0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,47:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,105:0.51: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,56:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,143:0.79: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,132:0.75: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,40:0.30:-0.21:1.000:0.981 0/0/1/1:4:56,101:0.62: 0.14:1.000:0.556 0/0/1/1:4:60,94:0.59: 0.09:1.000:0.856 0/0/1/1:4:53,85:0.60:-0.19:1.000:0.821 0/0/0/1/1/1:6:52,57:0.51:-0.70:1.000:0.880 0/0/1/1:4:66,42:0.39:-0.72:1.000:0.712 0/0/1/1:4:74,76:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,126:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,28:0.26:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,102:0.57: 0.42:1.000:0.940 0/1/1/1:4:19,121:0.84:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,32:0.30:-0.67:1.000:0.984 0/1/1/1:4:43,99:0.67:-0.12:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,152:1.00: 0.05:0.986:1.000 0/0/1/1:4:52,85:0.60:-0.21:1.000:0.787 0/0/0/1:4:92,30:0.26:-0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,93:0.56: 0.23:0.999:0.969 0/0/1/1:4:64,58:0.47:-0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,105:0.53: 0.78:1.000:0.992 0/1/1/1:4:24,112:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,65:0.44:-0.02:1.000:0.962 0/0/1/1:4:66,88:0.56: 0.09:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,89:0.71:-0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:29,106:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,67:0.63:-0.83:1.000:0.605 0/0/1/1:4:61,55:0.47:-0.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,85:0.69:-0.54:1.000:0.974 0/0/0/1:4:91,25:0.23:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,96:0.57: 0.25:1.000:0.941 0/1/1/1:4:36,114:0.73: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,73:0.78:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,54:0.75:-1.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,106:0.82:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,150:0.78: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,42:0.29: 0.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:55,54:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,123:0.69: 0.41:1.000:0.966 0/0/1/1:4:87,52:0.38:-0.17:1.000:0.550 0/0/0/1:4:94,26:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,55:0.46:-0.54:1.000:0.988 0/0/0/1:4:56,21:0.29:-1.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,37:0.35:-0.72:1.000:0.791 0/0/1/1:4:42,50:0.53:-1.00:1.000:0.992 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,64:0.47:-0.24:1.000:0.992 0/1/1/1:4:24,109:0.79:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,10:0.22:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,45:0.53:-1.16:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,64:0.59:-0.75:0.998:0.890 0/0/1/1:4:52,83:0.60:-0.24:1.000:0.828 0/0/1/1:4:46,48:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,41:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,79:0.44: 0.55:1.000:0.962 0/0/1/1:4:76,72:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,84:0.77:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,57:0.29: 1.04:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:41,53:0.55:-0.97:1.000:0.748 0/1/1/1:4:21,110:0.81:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,50:0.52:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,75:0.55:-0.28:1.000:0.980 0/0/1/1:4:46,51:0.52:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,21:0.21:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,20:0.22:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,52:0.59:-1.11:1.000:0.886 0/1/1/1:4:30,111:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,58:0.59:-0.93:1.000:0.888 0/0/1/1:4:52,61:0.53:-0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:150,51:0.27: 0.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,35:0.33:-0.68:1.000:0.928 0/0/1/1:4:46,62:0.56:-0.72:1.000:0.969 0/0/1/1:4:42,56:0.56:-0.90:1.000:0.973 0/0/0/1:4:63,36:0.37:-0.88:1.000:0.575 0/1/1/1:4:18,88:0.80:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,55:0.55:-0.91:1.000:0.978 0/0/0/1:4:69,14:0.18:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,145:0.57: 1.76:1.000:0.956 0/0/0/1:4:48,26:0.36:-1.32:0.999:0.711 0/1/1/1:4:21,72:0.74:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,38:0.31:-0.35:1.000:0.978 0/0/1/1:4:139,127:0.47: 2.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:93,39:0.31:-0.30:1.000:0.977 0/1/1/1:4:16,46:0.71:-1.53:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,64:0.74:-1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,15:0.21:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,21:0.28:-1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,17:0.35:-1.74:1.000:0.811 0/1/1/1:4:29,134:0.79: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,17:0.28:-1.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,89:0.45: 0.83:1.000:0.980 0/0/1/1:4:99,135:0.56: 1.50:1.000:0.965 0/0/1/1:4:100,93:0.48: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:113,34:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,194:0.75: 1.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,67:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,188:0.79: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,40:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.34:-2.25:1.000:0.857 0/0/1/1:4:49,80:0.60:-0.35:1.000:0.790 0/1/1/1:4:51,148:0.71: 0.88:1.000:0.993 0/0/0/1:4:136,36:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,41:0.22: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,167:0.74: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,28:0.21:-0.10:0.947:1.000 0/0/1/1:4:108,130:0.53: 1.57:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,157:0.80: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,76:0.54:-0.23:1.000:0.984 0/0/0/1:4:119,36:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,149:0.79: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,37:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,77:0.55:-0.23:1.000:0.978 0/0/1/1:4:100,110:0.51: 1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,89:0.54: 0.23:1.000:0.990 0/1/1/1:4:40,128:0.73: 0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,147:0.80: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.51: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,43:0.33:-0.23:1.000:0.935 0/0/0/1:4:89,45:0.34:-0.26:1.000:0.841 0/0/1/1:4:63,54:0.46:-0.56:1.000:0.986 0/0/1/1:4:63,55:0.46:-0.54:1.000:0.988 0/0/1/1:4:137,132:0.48: 2.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,195:0.73: 1.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:113,132:0.53: 1.69:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,130:0.71: 0.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:149,62:0.31: 1.09:1.000:0.979 0/0/0/1:4:192,67:0.27: 1.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,168:0.70: 1.43:1.000:0.985 0/0/1/1:4:110,71:0.39: 0.56:1.000:0.743 0/1/1/1:4:60,116:0.64: 0.48:1.000:0.631 -chr6.1 71635271 chr6.1_071635271 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:175,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:274,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.57:1.000:. ./.:5:264,0:.: 1.87:0.965:. ./.:4:178,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:280,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:264,1:.: 1.88:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:303,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:267,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:24,1:.:-2.10:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.97:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.40:1.000:. ./.:6:212,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:272,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:115,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.84:0.999:. ./.:4:114,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.24:1.000:. ./.:6:83,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.54:0.986:. ./.:4:133,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.92:0.999:. ./.:4:149,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:144,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.52:0.998:. ./.:4:134,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.68:1.000:. ./.:6:110,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:109,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:282,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.06:0.947:. ./.:4:197,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:304,1:.: 2.55:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.02:1.000:. -chr6.1 71858428 chr6.1_071858428 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:330,276:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:134,328:0.74:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:301,261:0.51:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:296,270:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:173,521:0.78: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:354,301:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:473,136:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:163,443:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:326,263:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,92:0.44:-3.02:1.000:0.963 0/0/1/1:4:197,134:0.44:-2.17:1.000:0.973 0/0/1/1:4:308,260:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:297,241:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:316,270:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:277,255:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:302,300:0.54: 0.14:1.000:0.988 0/0/0/1/1:5:469,293:0.42: 1.50:0.965:0.952 0/0/0/1:4:512,140:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:426,341:0.49: 1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:540,165:0.27: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:150,104:0.45:-2.82:1.000:0.979 0/1/1/1:4:133,402:0.78:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:507,156:0.27: 0.65:1.000:0.998 0/1/1/1:4:158,390:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,89:0.47:-3.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:203,540:0.76: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:304,256:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:147,357:0.74:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:411,284:0.45: 0.93:1.000:0.978 0/1/1/1:4:179,444:0.75: 0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,649:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,364:0.78:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,65:0.44:-3.61:1.000:0.968 0/0/1/1:4:207,130:0.42:-2.12:1.000:0.930 0/1/1:3:42,65:0.64:-4.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:316,262:0.49:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/0/0/1:6:613,161:0.24: 1.60:1.000:0.635 0/0/1/1:4:291,260:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:343,285:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:170,424:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:184,420:0.73: 0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:341,336:0.54: 0.77:1.000:0.989 0/0/1/1:4:376,506:0.61: 2.52:1.000:0.669 0/0/1/1:4:326,281:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:438,315:0.46: 1.42:1.000:0.987 0/1/1/1:4:164,398:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:381,284:0.47: 0.67:0.999:0.991 0/1/1/1:4:187,577:0.78: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:349,274:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:220,499:0.73: 1.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:147,346:0.74:-0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:366,358:0.54: 1.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:160,406:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:190,421:0.72: 0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:171,370:0.72:-0.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:198,535:0.76: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:454,166:0.30: 0.29:1.000:0.984 0/0/1/1:4:455,317:0.45: 1.58:1.000:0.980 0/0/1/1:4:327,261:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:514,144:0.25: 0.61:1.000:0.522 0/0/0/1:4:569,134:0.22: 1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,558:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:616,158:0.24: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:354,263:0.47: 0.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:330,269:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:544,161:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:133,307:0.73:-1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:305,276:0.52:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:376,336:0.51: 1.07:0.986:0.996 0/0/1/1:4:257,214:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:404,351:0.51: 1.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:381,314:0.49: 0.93:0.999:0.997 0/1/1/1:4:220,538:0.74: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:345,277:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:495,108:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:153,386:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:311,260:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:344,260:0.47: 0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:157,273:0.67:-1.33:1.000:0.926 0/0/1/1:4:357,328:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:465,108:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:185,452:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:203,451:0.72: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:266,236:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:188,471:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:402,312:0.48: 1.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:290,223:0.48:-0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:312,247:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:165,397:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:285,289:0.54:-0.10:1.000:0.985 0/0/0/1:4:514,130:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:165,329:0.70:-0.78:1.000:0.986 0/0/1/1:4:397,275:0.45: 0.73:1.000:0.979 0/0/1/1:4:238,193:0.49:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:556,133:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:344,268:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:139,296:0.72:-1.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:472,111:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:428,341:0.48: 1.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:293,267:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:450,115:0.24:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:390,304:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:131,288:0.72:-1.42:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,560:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:448,224:0.37: 0.73:0.998:0.568 0/0/1/1:4:318,252:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:322,227:0.45:-0.31:1.000:0.983 0/1/1/1:4:145,341:0.74:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:370,362:0.54: 1.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:294,231:0.48:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:347,276:0.48: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:460,344:0.47: 1.85:1.000:0.992 0/0/1/1/1/1:6:309,407:0.61: 1.11:1.000:0.697 0/1/1/1:4:188,423:0.73: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:302,236:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:552,150:0.25: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:531,157:0.26: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:185,384:0.71:-0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:178,409:0.73: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:312,250:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:172,407:0.74:-0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:338,253:0.47: 0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:368,268:0.46: 0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:302,269:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:330,239:0.46:-0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:572,150:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:185,408:0.72: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:340,264:0.48: 0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:416,113:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:384,97:0.23:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:314,206:0.44:-0.56:1.000:0.959 0/0/1/1:4:271,336:0.59: 0.18:1.000:0.848 0/1/1/1:4:109,247:0.73:-1.96:0.999:0.997 0/0/0/1:4:536,112:0.21: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:406,145:0.30:-0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:397,353:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:159,347:0.72:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:310,243:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:436,127:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:155,330:0.72:-0.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:535,160:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:170,277:0.66:-1.18:1.000:0.846 0/0/0/1:4:429,108:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:358,108:0.26:-1.02:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,616:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:407,388:0.53: 1.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:305,245:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:186,443:0.74: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:156,455:0.78: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:271,258:0.53:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:339,289:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:440,134:0.27:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:134,87:0.43:-3.11:1.000:0.953 0/0/0/1:4:431,133:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:315,295:0.52: 0.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:154,433:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:574,165:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:361,298:0.49: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:251,218:0.51:-1.00:0.947:0.997 0/1/1/1:4:150,412:0.76:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:483,106:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,241:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,332:0.76:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:419,141:0.28:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:305,285:0.52: 0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:305,276:0.52:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:407,116:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:281,199:0.45:-0.90:1.000:0.984 0/1/1/1:4:169,371:0.72:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:295,244:0.49:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:419,126:0.26:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:372,96:0.24:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:507,143:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:150,320:0.72:-0.99:1.000:0.994 0/0/1/1:4:279,241:0.51:-0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:117,342:0.78:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:199,466:0.74: 0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:323,303:0.53: 0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:307,330:0.56: 0.43:1.000:0.970 0/0/0/1:4:421,130:0.27:-0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:316,267:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:401,296:0.47: 0.94:1.000:0.990 0/1/1/1:4:208,519:0.75: 1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:291,246:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:309,271:0.51:-0.05:1.000:0.996 -chr6.1 71935214 chr6.1_071935214 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:276,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:126,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:260,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:116,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.62:1.000:. ./.:5:363,0:.: 1.78:0.965:. ./.:4:290,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:121,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:75,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:87,1:.:-2.63:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.65:1.000:. ./.:6:340,3:.: 1.46:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:435,0:.: 2.93:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.19:0.999:. ./.:4:640,0:.: 6.22:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:199,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.68:0.986:. ./.:4:244,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:330,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.22:0.998:. ./.:4:252,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:323,1:.: 1.15:1.000:. ./.:6:297,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.41:0.999:. ./.:4:298,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:106,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.98:0.947:. ./.:4:256,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:291,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:275,1:.: 0.38:1.000:. -chr6.1 72112174 chr6.1_072112174 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:115,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:107,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.42:1.000:. ./.:5:143,0:.: 2.67:0.965:. ./.:4:107,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.02:1.000:. ./.:3:9,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:6:81,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.90:0.999:. ./.:4:41,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.73:1.000:. ./.:6:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.52:0.986:. ./.:4:85,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.71:0.999:. ./.:4:85,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:129,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.09:0.998:. ./.:4:79,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:137,0:.: 2.41:1.000:. ./.:6:128,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.78:0.999:. ./.:4:60,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:24,1:.:-2.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.39:0.947:. ./.:4:83,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.04:1.000:. -chr6.1 72452539 chr6.1_072452539 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.41:1.000:. ./.:5:13,0:.: 0.14:0.965:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:3:2,0:.:-1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:31,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:6:22,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.94:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:0.998:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.67:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.: 3.63:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 3.50:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-0.67:0.947:. ./.:4:3,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:11,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.: 1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr6.1 72658707 chr6.1_072658707 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,181:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.06:1.000:. ./.:4:71,124:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.08:1.000:. ./.:4:98,128:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,69:.:-0.57:1.000:. ./.:4:80,139:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.63:1.000:. ./.:4:68,33:.:-1.83:1.000:. ./.:4:43,42:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,141:.:-1.04:1.000:. ./.:4:139,81:.: 0.52:1.000:. ./.:4:88,127:.: 0.42:1.000:. ./.:4:59,100:.:-0.68:1.000:. ./.:4:90,111:.: 0.14:1.000:. ./.:5:179,163:.: 2.92:0.965:. ./.:4:0,224:.: 0.60:1.000:. ./.:4:91,155:.: 1.03:1.000:. ./.:4:107,146:.: 1.17:1.000:. ./.:4:74,28:.:-1.81:1.000:. ./.:4:0,122:.:-1.41:1.000:. ./.:4:82,125:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.63:1.000:. ./.:4:36,29:.:-2.54:1.000:. ./.:4:110,148:.: 1.27:1.000:. ./.:4:62,114:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.82:1.000:. ./.:4:168,100:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,219:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,139:.:-1.08:1.000:. ./.:4:29,28:.:-2.69:1.000:. ./.:4:0,61:.:-2.62:1.000:. ./.:3:0,52:.:-2.79:1.000:. ./.:4:169,92:.: 1.32:1.000:. ./.:6:179,153:.: 2.72:1.000:. ./.:4:96,143:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.35:1.000:. ./.:4:72,107:.:-0.29:1.000:. ./.:4:79,132:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,277:.: 1.64:1.000:. ./.:4:84,120:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,115:.: 0.08:0.999:. ./.:4:0,58:.:-2.67:1.000:. ./.:4:91,126:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.03:1.000:. ./.:4:72,95:.:-0.53:1.000:. ./.:4:106,164:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.76:1.000:. ./.:4:103,136:.: 0.89:1.000:. ./.:4:68,121:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,130:.: 0.24:1.000:. ./.:6:81,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:81,115:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.61:1.000:. ./.:4:215,96:.: 2.31:1.000:. ./.:4:103,128:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.80:1.000:. ./.:4:91,133:.: 0.60:1.000:. ./.:4:74,64:.:-1.10:1.000:. ./.:4:73,136:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,163:.: 1.07:0.986:. ./.:4:66,137:.: 0.18:1.000:. ./.:4:85,136:.: 0.54:1.000:. ./.:4:70,137:.: 0.26:0.999:. ./.:4:134,153:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,158:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.66:1.000:. ./.:4:73,119:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.80:1.000:. ./.:4:210,89:.: 2.07:1.000:. ./.:4:70,109:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,134:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.27:1.000:. ./.:4:77,109:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,104:.:-1.77:1.000:. ./.:4:135,85:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,109:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.30:1.000:. ./.:4:215,84:.: 2.07:1.000:. ./.:4:81,123:.: 0.20:1.000:. ./.:4:132,84:.: 0.44:1.000:. ./.:4:153,83:.: 0.83:1.000:. ./.:4:169,89:.: 1.27:1.000:. ./.:4:90,144:.: 0.79:1.000:. ./.:4:51,89:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.80:1.000:. ./.:4:61,83:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.86:1.000:. ./.:4:67,149:.: 0.44:0.998:. ./.:4:78,153:.: 0.73:1.000:. ./.:4:77,128:.: 0.22:1.000:. ./.:4:70,91:.:-0.65:1.000:. ./.:4:200,101:.: 2.11:1.000:. ./.:4:80,115:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,122:.:-1.41:1.000:. ./.:4:117,138:.: 1.21:1.000:. ./.:4:72,112:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.45:1.000:. ./.:4:96,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:101,154:.: 1.21:1.000:. ./.:4:144,63:.: 0.26:1.000:. ./.:4:83,99:.:-0.23:1.000:. ./.:4:84,114:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,136:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.29:1.000:. ./.:4:156,52:.: 0.28:1.000:. ./.:4:97,115:.: 0.36:1.000:. ./.:4:72,104:.:-0.35:1.000:. ./.:4:153,71:.: 0.60:1.000:. ./.:4:66,110:.:-0.35:1.000:. ./.:4:83,87:.:-0.47:1.000:. ./.:4:88,82:.:-0.47:1.000:. ./.:4:85,93:.:-0.31:1.000:. ./.:4:52,89:.:-1.04:1.000:. ./.:4:164,86:.: 1.11:1.000:. ./.:4:157,115:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,98:.:-1.89:0.999:. ./.:4:167,82:.: 1.09:1.000:. ./.:4:58,125:.:-0.21:1.000:. ./.:4:211,85:.: 2.01:1.000:. ./.:4:95,117:.: 0.36:1.000:. ./.:4:126,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:121,77:.: 0.08:1.000:. ./.:4:71,127:.: 0.08:1.000:. ./.:4:68,161:.: 0.69:1.000:. ./.:4:71,58:.:-1.28:1.000:. ./.:4:79,108:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,104:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,247:.: 1.05:1.000:. ./.:4:81,143:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,105:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.03:1.000:. ./.:4:167,68:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,81:.: 0.52:1.000:. ./.:4:19,37:.:-2.71:1.000:. ./.:4:52,84:.:-1.14:1.000:. ./.:4:171,83:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.33:1.000:. ./.:4:166,84:.: 1.11:1.000:. ./.:4:215,79:.: 1.98:1.000:. ./.:4:59,91:.:-0.86:0.947:. ./.:4:0,173:.:-0.41:1.000:. ./.:4:139,108:.: 1.05:1.000:. ./.:4:150,70:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,115:.:-0.29:1.000:. ./.:4:150,86:.: 0.83:1.000:. ./.:4:90,112:.: 0.16:1.000:. ./.:4:76,109:.:-0.17:1.000:. ./.:4:163,59:.: 0.56:1.000:. ./.:4:75,123:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,112:.:-0.37:1.000:. ./.:4:124,84:.: 0.28:1.000:. ./.:4:113,69:.:-0.23:1.000:. ./.:4:62,99:.:-0.65:1.000:. ./.:4:67,134:.: 0.14:1.000:. ./.:4:72,93:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,58:.: 0.34:1.000:. ./.:4:61,93:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.61:1.000:. ./.:4:104,138:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.70:1.000:. ./.:4:75,105:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,124:.: 0.12:1.000:. ./.:4:84,142:.: 0.64:1.000:. ./.:4:94,131:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,116:.:-1.53:1.000:. ./.:4:74,131:.: 0.22:1.000:. -chr6.1 73913902 chr6.1_073913902 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:169,141:0.45: 1.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:105,109:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,204:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,258:0.76: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,167:0.55: 0.93:1.000:0.978 0/0/1/1:4:180,163:0.47: 1.52:1.000:0.992 0/1/1/1:4:52,156:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,139:0.47: 0.84:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,286:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.47:-2.39:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:67,225:0.77: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,55:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,147:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,135:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,158:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:228,159:0.41: 2.11:0.965:0.966 0/1/1/1:4:67,230:0.77: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,176:0.50: 1.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,294:0.76: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.49:-2.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,133:0.48: 0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:86,262:0.75: 1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,116:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,2:0.26:-2.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,126:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,214:0.54: 2.19:1.000:0.989 0/0/1/1:4:145,151:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:239,68:0.24: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,150:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,163:0.53: 1.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,119:0.47: 0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:20,3:0.15:-2.74:1.000:0.982 0/0/1/1:4:28,24:0.46:-2.36:1.000:0.986 0/1/1:3:15,16:0.51:-2.64:1.000:0.640 0/0/1/1:4:133,131:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1/1/1:6:76,284:0.78: 1.75:1.000:0.848 0/0/1/1:4:138,145:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,127:0.49: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,124:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,93:0.47:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:162,65:0.30:-0.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:126,161:0.55: 0.77:1.000:0.975 0/0/1/1:4:101,100:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,128:0.54: 0.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:100,122:0.54:-0.09:1.000:0.986 0/0/1/1:4:174,148:0.46: 1.24:0.999:0.985 0/0/1/1:4:46,43:0.48:-1.87:1.000:0.994 0/1/1/1:4:55,137:0.71:-0.49:1.000:0.991 0/1/1/1:4:58,146:0.71:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,71:0.45:-0.96:1.000:0.979 0/1/1/1:4:80,205:0.71: 0.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:45,151:0.77:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,186:0.76: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,200:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,142:0.73:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,109:0.52:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,91:0.55:-0.89:1.000:0.975 0/1/1/1:4:51,111:0.68:-0.89:1.000:0.953 1/1/1/1/1/1:6:11,154:0.93:-0.85:1.000:0.767 1/1/1/1:4:0,227:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,104:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:112,43:0.29:-0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,87:0.46:-0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:129,145:0.52: 0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,128:0.78:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,79:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,73:0.31: 0.21:1.000:0.978 0/0/1/1:4:80,96:0.54:-0.71:0.986:0.989 0/1/1/1:4:77,162:0.67: 0.13:1.000:0.929 0/0/1/1:4:101,104:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,114:0.76:-1.07:0.999:1.000 0/1/1/1:4:44,118:0.72:-0.89:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,275:1.00: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,203:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,97:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,89:0.53:-0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:132,53:0.30:-0.59:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,174:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,126:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:30,137:0.82:-0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:117,97:0.45:-0.20:1.000:0.980 0/1/1/1:4:57,172:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,119:0.54:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,108:0.54:-0.41:1.000:0.989 0/1/1/1:4:55,184:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,124:0.76:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,76:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,143:0.69:-0.32:1.000:0.977 0/1/1/1:4:63,159:0.71:-0.09:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,200:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,99:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,167:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,195:0.85: 0.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:84,100:0.54:-0.60:1.000:0.990 0/1/1/1:4:42,129:0.75:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,46:0.30:-0.97:1.000:0.981 0/1/1/1:4:35,121:0.77:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,147:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,190:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,168:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,160:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,61:0.44:-1.21:1.000:0.966 0/0/1/1:4:92,99:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,82:0.46:-0.72:0.998:0.990 0/1/1/1:4:45,127:0.73:-0.76:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,105:0.66:-0.96:1.000:0.887 0/0/1/1:4:155,153:0.49: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:252,78:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,175:0.77:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,88:0.45:-0.48:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,334:1.00: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,141:0.73:-0.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,180:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,33:0.24:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,101:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,104:0.67:-1.00:1.000:0.919 0/0/1/1:4:76,91:0.54:-0.83:1.000:0.989 0/0/1/1:4:80,83:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,148:0.81:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,195:0.79: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,79:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,113:0.54:-0.32:1.000:0.985 0/0/1/1:4:166,185:0.52: 1.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,92:0.58:-0.95:1.000:0.930 0/1/1/1:4:63,153:0.70:-0.17:1.000:0.988 0/1/1/1:4:47,132:0.73:-0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,94:0.56:-0.85:1.000:0.962 0/1/1/1:4:37,102:0.73:-1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,126:0.76:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,89:0.54:-0.89:1.000:0.986 0/0/1/1:4:216,143:0.40: 1.73:1.000:0.785 0/0/1/1:4:67,61:0.47:-1.35:0.999:0.993 0/0/1/1:4:107,107:0.49:-0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,234:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,86:0.28: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,139:0.54: 0.36:1.000:0.990 0/0/1/1:4:77,76:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,94:0.53:-0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,86:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,136:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,86:0.63:-1.24:1.000:0.513 0/1/1/1:4:56,190:0.77: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,165:0.52: 1.13:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,343:1.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,140:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,121:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,225:0.76: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,66:0.29: 0.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:101,274:0.73: 1.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,147:0.52: 0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,24:0.34:-2.08:1.000:0.897 0/0/1/1:4:125,127:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,161:0.49: 1.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,212:0.79: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,169:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:209,77:0.28: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,137:0.54: 0.28:0.947:0.987 0/0/1/1:4:150,163:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,145:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,161:0.72:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,147:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,152:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,160:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,141:0.54: 0.36:1.000:0.985 0/1/1/1:4:43,161:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,195:0.72: 0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,200:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,157:0.55: 0.72:1.000:0.982 0/0/1/1:4:107,116:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,114:0.51:-0.09:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,263:1.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,132:0.53: 0.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:141,45:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,166:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:157,185:0.53: 1.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:225,73:0.26: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,137:0.47: 0.83:1.000:0.991 0/1/1/1:4:54,200:0.78: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,334:1.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,211:0.54: 2.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:262,96:0.28: 1.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,184:0.73: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,230:0.75: 1.01:1.000:0.999 -chr6.1 73984871 chr6.1_073984871 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:138,88:0.45:-0.24:1.000:0.974 0/0/1/1:4:115,121:0.56:-0.07:1.000:0.966 0/0/0/1:4:172,30:0.16:-0.63:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,117:0.64:-0.87:1.000:0.735 0/0/1/1:4:159,107:0.46: 0.42:1.000:0.988 0/0/1/1:4:146,113:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:141,16:0.11:-1.38:1.000:0.547 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,50:0.27:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,43:0.53:-2.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:200,61:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,89:0.33: 1.00:1.000:0.930 0/0/1/1:4:152,103:0.46: 0.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:144,94:0.45:-0.04:1.000:0.982 0/0/1/1:4:182,110:0.43: 0.85:1.000:0.944 0/0/0/1/1:5:212,104:0.37: 1.25:0.965:0.952 0/0/0/1:4:253,88:0.28: 1.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:226,152:0.46: 2.27:1.000:0.988 0/0/0/1:4:284,42:0.14: 1.41:1.000:0.959 0/0/1/1:4:78,39:0.37:-2.04:1.000:0.501 0/0/1/1:4:120,97:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,38:0.15: 0.62:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,205:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.54:-3.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:126,98:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:319,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,84:0.40:-0.04:1.000:0.785 0/0/0/1:4:244,85:0.28: 1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,128:0.48: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:184,111:0.43: 0.90:1.000:0.943 0/0/1/1:4:127,92:0.48:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,5:0.16:-3.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,36:0.40:-2.29:1.000:0.785 0/0/1:3:15,11:0.49:-3.54:1.000:0.701 0/0/0/0:4:302,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:207,62:0.25: 0.47:1.000:0.560 0/0/1/1:4:151,119:0.51: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,115:0.52: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,103:0.45: 0.37:1.000:0.978 0/0/1/1:4:134,95:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:203,62:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,135:0.55: 0.45:1.000:0.976 0/0/1/1:4:117,79:0.46:-0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:153,121:0.51: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,93:0.43: 0.09:1.000:0.949 0/0/1/1:4:189,122:0.45: 1.16:0.999:0.978 0/0/1/1:4:85,69:0.51:-1.43:1.000:0.996 0/0/0/0:4:175,11:0.06:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,108:0.65:-1.16:1.000:0.827 0/0/1/1:4:124,81:0.45:-0.59:1.000:0.982 0/1/1/1:4:92,157:0.65: 0.14:1.000:0.796 0/0/0/0:4:190,21:0.11:-0.49:1.000:0.627 0/0/0/1:4:236,29:0.12: 0.41:1.000:0.693 0/0/0/1:4:187,31:0.15:-0.37:1.000:0.990 0/0/0/0:4:173,18:0.10:-0.82:1.000:0.783 0/0/1/1:4:141,95:0.46:-0.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:140,120:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:177,27:0.14:-0.60:1.000:0.972 0/0/0/0/0/1:6:136,37:0.23:-1.11:1.000:0.743 0/0/0/1:4:150,53:0.28:-0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,87:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:258,117:0.35: 2.22:1.000:0.809 0/0/1/1:4:106,83:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,104:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:191,19:0.10:-0.50:1.000:0.864 0/0/1/1:4:141,97:0.47:-0.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:191,79:0.32: 0.49:1.000:0.943 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 1.23:0.986:1.000 0/0/0/1:4:157,61:0.31:-0.37:1.000:0.977 0/0/1/1:4:149,117:0.51: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,23:0.12:-0.62:0.999:0.787 0/0/0/1:4:240,91:0.30: 1.49:1.000:0.984 0/0/0/1:4:150,55:0.29:-0.59:1.000:0.990 0/0/0/0:4:257,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,88:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:130,78:0.43:-0.54:1.000:0.938 0/0/0/1:4:205,75:0.29: 0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:165,24:0.14:-0.85:1.000:0.950 0/0/0/0:4:318,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,53:0.27:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:153,99:0.45: 0.19:1.000:0.979 0/0/0/0:4:287,29:0.10: 1.25:1.000:0.839 0/0/1/1:4:124,88:0.48:-0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:145,122:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/0/0/0:4:262,30:0.11: 0.85:1.000:0.519 0/0/0/0:4:126,12:0.09:-1.69:1.000:0.916 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,27:0.12:-0.14:1.000:0.844 0/0/0/0:4:188,20:0.10:-0.54:1.000:0.732 0/0/0/1:4:106,41:0.31:-1.54:1.000:0.978 0/0/1/1:4:124,94:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:251,35:0.13: 0.75:1.000:0.918 0/1/1/1:4:62,99:0.64:-1.31:1.000:0.671 0/0/1/1:4:174,103:0.42: 0.60:1.000:0.926 0/0/0/1:4:193,26:0.13:-0.35:1.000:0.878 0/0/0/1:4:181,69:0.30: 0.16:1.000:0.982 0/0/1/1:4:167,86:0.38: 0.21:1.000:0.609 0/0/0/1:4:215,29:0.13: 0.06:1.000:0.880 0/1/1/1:4:91,146:0.64:-0.06:1.000:0.681 0/0/0/1:4:181,36:0.18:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:198,22:0.11:-0.34:1.000:0.612 0/0/1/1:4:113,80:0.48:-0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:168,112:0.46: 0.65:1.000:0.987 0/0/0/1:4:173,75:0.34: 0.12:0.998:0.892 0/0/0/1:4:222,27:0.12: 0.14:1.000:0.665 0/0/0/0:4:200,22:0.11:-0.30:1.000:0.641 0/0/1/1:4:138,101:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:263,96:0.29: 1.96:1.000:0.991 0/0/0/0:4:220,22:0.10: 0.03:1.000:0.856 0/0/1/1:4:139,85:0.43:-0.27:1.000:0.953 0/0/0/1:4:213,66:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,30:0.13: 0.16:1.000:0.894 0/0/0/0:4:230,22:0.09: 0.19:1.000:0.912 0/0/0/1:4:163,58:0.29:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:157,117:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/0:4:228,17:0.07: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,85:0.48:-0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,114:0.53: 0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:191,30:0.15:-0.32:1.000:0.980 0/0/0/1:4:199,23:0.11:-0.30:1.000:0.510 0/0/1/1:4:135,82:0.43:-0.39:1.000:0.948 0/0/1/1:4:127,103:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,108:0.52:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:151,99:0.45: 0.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:214,26:0.12:-0.01:1.000:0.662 0/0/0/1:4:216,25:0.11: 0.01:1.000:0.515 0/0/1/1:4:113,116:0.56:-0.19:1.000:0.973 0/0/0/0:4:192,17:0.09:-0.52:1.000:0.965 0/0/0/0:4:151,8:0.05:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,98:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:232,64:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,66:0.49:-1.39:0.999:0.996 0/0/0/0:4:305,0:0.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,47:0.28:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:337,113:0.27: 3.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,89:0.44:-0.19:1.000:0.973 0/0/0/0:4:263,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:227,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,80:0.47:-0.75:1.000:0.993 0/1/1/1:4:76,131:0.65:-0.55:1.000:0.811 0/0/0/1:4:143,27:0.17:-1.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:183,28:0.14:-0.49:1.000:0.973 0/0/0/1:4:134,35:0.22:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,141:0.53: 0.92:1.000:0.991 0/0/0/1:4:170,83:0.37: 0.21:1.000:0.587 0/0/1/1:4:178,93:0.39: 0.50:1.000:0.659 0/0/1/1:4:139,104:0.49: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:269,28:0.10: 0.93:1.000:0.782 0/0/0/1:4:202,64:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:257,25:0.09: 0.69:1.000:0.894 0/0/1/1:4:174,105:0.43: 0.64:1.000:0.943 0/0/1/1:4:56,41:0.49:-2.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,82:0.48:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/0:4:332,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,170:0.71: 0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:176,127:0.48: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:244,94:0.31: 1.61:1.000:0.979 0/0/1/1:4:113,75:0.46:-0.87:0.947:0.986 0/0/1/1:4:168,100:0.42: 0.45:1.000:0.931 0/0/0/0:4:279,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,24:0.13:-0.82:1.000:0.942 0/0/1/1:4:140,103:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:298,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,107:0.46: 0.45:1.000:0.986 0/0/0/0:4:204,23:0.11:-0.22:1.000:0.567 0/0/0/1:4:221,87:0.31: 1.11:1.000:0.972 0/0/0/0:4:204,23:0.11:-0.22:1.000:0.567 0/0/0/0:4:262,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,102:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,63:0.36:-0.72:1.000:0.713 0/0/1/1:4:135,99:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,80:0.34: 0.31:1.000:0.840 0/0/0/1:4:173,23:0.13:-0.73:1.000:0.859 0/0/1/1:4:191,136:0.48: 1.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:259,81:0.26: 1.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,105:0.51:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,40:0.18:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:235,27:0.11: 0.36:1.000:0.508 0/0/1/1:4:175,131:0.49: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:321,94:0.24: 2.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,130:0.68:-0.75:1.000:0.948 0/0/0/1:4:242,71:0.24: 1.20:1.000:1.000 -chr6.1 74613971 chr6.1_074613971 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:132,324:0.71: 0.08:1.000:0.991 1/1/1/1:4:1,356:0.99:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,224:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:364,115:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:258,277:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:274,274:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:231,174:0.43:-0.37:1.000:0.955 0/0/0/1:4:311,182:0.37: 0.41:1.000:0.511 0/0/0/1:4:298,109:0.27:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,48:0.33:-2.62:1.000:0.938 0/0/1/1:4:85,66:0.44:-2.62:1.000:0.969 0/1/1/1:4:82,315:0.79:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,304:0.61: 0.50:1.000:0.743 0/0/1/1:4:222,201:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:213,208:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:246,283:0.54: 0.73:1.000:0.989 0/0/1/1/1:5:357,353:0.50: 2.33:0.965:0.501 0/0/0/1:4:389,129:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:267,281:0.52: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:406,150:0.28: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,55:0.38:-2.67:1.000:0.620 0/0/1/1:4:187,217:0.54:-0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:257,264:0.51: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:183,185:0.51:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,45:0.45:-3.06:1.000:0.979 0/0/1/1:4:253,229:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:266,331:0.56: 1.33:1.000:0.973 0/0/1/1:4:210,224:0.52:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:244,343:0.59: 1.24:1.000:0.889 0/1/1/1:4:120,364:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:238,241:0.51: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:198,204:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,64:0.86:-3.30:1.000:0.958 0/0/1/1:4:88,93:0.52:-2.35:1.000:0.996 0/0/1:3:24,21:0.47:-3.55:1.000:0.881 0/0/1/1:4:353,243:0.41: 1.32:1.000:0.875 0/0/0/0/1/1:6:410,215:0.35: 1.58:1.000:0.901 0/0/1/1:4:354,238:0.41: 1.28:1.000:0.840 0/1/1/1:4:133,293:0.69:-0.18:1.000:0.969 0/0/1/1:4:215,218:0.51:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,221:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,424:0.82: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:217,294:0.58: 0.57:1.000:0.926 0/0/1/1:4:261,194:0.43: 0.07:1.000:0.947 0/1/1/1:4:121,326:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:123,311:0.72:-0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:266,261:0.50: 0.71:0.999:0.997 0/0/1/1:4:159,173:0.52:-1.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:281,80:0.23:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,76:0.23:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,170:0.39:-0.09:1.000:0.729 0/0/1/1:4:258,255:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:309,95:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,215:0.48: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,210:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:225,195:0.47:-0.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:195,320:0.62: 0.60:1.000:0.545 0/1/1/1:4:94,270:0.74:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,184:0.48:-0.55:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:253,114:0.32:-0.71:1.000:0.911 0/0/0/1:4:345,111:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,298:0.59: 0.49:1.000:0.833 0/1/1/1:4:196,391:0.67: 1.24:1.000:0.901 0/0/1/1:4:178,176:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:129,381:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:292,204:0.42: 0.44:1.000:0.894 0/0/1/1:4:179,175:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,412:0.83: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,302:0.62: 0.37:0.986:0.577 0/0/1/1:4:204,206:0.51:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:256,234:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:162,158:0.50:-1.12:0.999:0.997 0/0/0/1:4:291,120:0.30:-0.32:1.000:0.987 0/0/0/1:4:382,125:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,177:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:195,326:0.63: 0.66:1.000:0.512 0/0/1/1:4:181,253:0.58:-0.11:1.000:0.896 0/1/1/1:4:105,327:0.75:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,100:0.33:-1.20:1.000:0.932 0/0/1/1:4:338,219:0.40: 0.98:1.000:0.769 0/1/1/1:4:83,239:0.74:-1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:306,212:0.41: 0.63:1.000:0.884 0/0/1/1:4:233,250:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:186,204:0.53:-0.50:1.000:0.994 0/1/1/1:4:107,302:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:217,224:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,143:0.50:-1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:237,164:0.41:-0.40:1.000:0.882 0/0/1/1:4:197,182:0.48:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:173,193:0.53:-0.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:298,103:0.26:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:201,180:0.48:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:240,212:0.47: 0.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:170,160:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:338,117:0.26: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:285,197:0.41: 0.31:1.000:0.881 0/0/1/1:4:269,175:0.40:-0.02:1.000:0.778 0/0/1/1:4:176,174:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:431,122:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:341,107:0.25: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:246,145:0.38:-0.49:1.000:0.511 0/0/1/1:4:321,194:0.38: 0.60:1.000:0.587 0/0/1/1:4:157,141:0.48:-1.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:210,172:0.45:-0.57:1.000:0.983 0/1/1/1:4:183,346:0.65: 0.73:0.998:0.826 0/0/1/1:4:262,200:0.44: 0.14:1.000:0.961 0/0/0/1:4:257,93:0.27:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:233,222:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:296,426:0.59: 2.43:1.000:0.857 0/0/0/1:4:333,123:0.28: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,201:0.53:-0.59:1.000:0.992 0/0/0/0:4:608,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:329,125:0.28: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:207,210:0.51:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:143,233:0.62:-0.63:1.000:0.567 0/0/1/1:4:208,320:0.61: 0.72:1.000:0.726 0/0/0/1:4:336,92:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,179:0.52:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,188:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,196:0.53:-0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:199,198:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:314,200:0.39: 0.60:1.000:0.730 0/0/1/1:4:324,230:0.42: 0.95:1.000:0.911 0/0/1/1:4:268,237:0.47: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:317,204:0.40: 0.66:1.000:0.754 0/0/1/1:4:238,235:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:305,110:0.27:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,230:0.77:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,151:0.41:-0.63:1.000:0.837 0/0/1/1:4:172,146:0.46:-1.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:320,182:0.37: 0.49:1.000:0.597 0/0/1/1:4:343,322:0.49: 1.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,143:0.51:-1.47:0.999:0.996 0/0/1/1:4:214,291:0.58: 0.52:1.000:0.923 0/0/0/1:4:318,91:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:297,433:0.59: 2.51:1.000:0.836 0/0/1/1:4:199,245:0.55:-0.02:1.000:0.976 0/0/1/1:4:273,184:0.41: 0.09:1.000:0.844 0/0/1/1:4:194,272:0.58: 0.17:1.000:0.892 0/0/1/1:4:194,174:0.48:-0.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:319,100:0.25:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,101:0.36:-1.42:1.000:0.710 0/0/1/1:4:206,200:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/0:4:273,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:285,291:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:451,132:0.23: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,319:0.59: 0.82:1.000:0.845 0/0/1/1:4:248,209:0.46: 0.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:224,244:0.52: 0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:183,313:0.63: 0.44:1.000:0.581 0/0/1/1:4:276,263:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:351,210:0.38: 1.01:1.000:0.557 0/0/1/1:4:64,46:0.42:-2.98:1.000:0.923 0/0/1/1:4:177,246:0.58:-0.21:1.000:0.902 0/0/1/1:4:346,239:0.41: 1.22:1.000:0.880 0/0/0/1:4:351,128:0.27: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:370,243:0.40: 1.47:1.000:0.798 0/1/1/1:4:188,349:0.65: 0.80:1.000:0.791 0/0/1/1:4:191,206:0.52:-0.44:0.947:0.995 0/1/1/1:4:136,356:0.72: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:222,345:0.61: 1.06:1.000:0.700 0/0/0/1:4:365,69:0.16:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,228:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:324,288:0.47: 1.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:246,382:0.61: 1.60:1.000:0.702 0/0/1/1:4:191,214:0.53:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:426,118:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,232:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,207:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:289,203:0.42: 0.40:1.000:0.900 0/0/1/1:4:165,267:0.62:-0.13:1.000:0.587 0/0/1/1:4:181,230:0.56:-0.32:1.000:0.965 0/0/0/1:4:312,96:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:336,226:0.41: 1.02:1.000:0.841 0/0/1/1:4:178,277:0.61: 0.07:1.000:0.697 0/0/0/1:4:284,82:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:404,280:0.41: 2.10:1.000:0.884 0/1/1/1:4:127,478:0.79: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,387:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,222:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:355,127:0.27: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:262,328:0.56: 1.27:1.000:0.971 0/0/1/1:4:270,392:0.59: 1.90:1.000:0.843 0/0/1/1:4:151,190:0.56:-0.94:1.000:0.969 0/0/1/1:4:227,226:0.50: 0.06:1.000:0.997 -chr6.1 74737274 chr6.1_074737274 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:36,2:.: 1.18:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:5:71,0:.: 4.20:0.965:. ./.:4:16,3:.:-0.55:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 0.09:1.000:. ./.:6:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:48,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.00:0.999:. ./.:4:5,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.92:1.000:. ./.:6:18,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:0.986:. ./.:4:7,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.37:0.999:. ./.:4:13,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:0.998:. ./.:4:23,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:13,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.09:0.947:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.83:1.000:. -chr6.1 74921247 chr6.1_074921247 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:26,146:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.06:1.000:. ./.:4:49,66:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,197:.: 1.40:1.000:. ./.:4:66,111:.: 0.91:1.000:. ./.:4:34,209:.: 2.52:1.000:. ./.:4:15,63:.:-1.50:1.000:. ./.:4:76,45:.:-0.45:1.000:. ./.:4:19,132:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,21:.:-2.31:1.000:. ./.:4:7,57:.:-1.84:1.000:. ./.:4:31,121:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,114:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,206:.: 1.62:1.000:. ./.:4:22,133:.: 0.38:1.000:. ./.:4:30,143:.: 0.82:1.000:. ./.:5:66,175:.: 2.47:0.965:. ./.:4:24,108:.:-0.18:1.000:. ./.:4:36,193:.: 2.18:1.000:. ./.:4:0,213:.: 1.79:1.000:. ./.:4:12,43:.:-2.06:1.000:. ./.:4:64,103:.: 0.67:1.000:. ./.:4:23,157:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,196:.: 1.38:1.000:. ./.:4:24,14:.:-2.48:1.000:. ./.:4:24,132:.: 0.40:1.000:. ./.:4:91,46:.:-0.06:1.000:. ./.:4:46,89:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,107:.: 1.30:1.000:. ./.:4:15,135:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,55:.:-0.89:1.000:. ./.:4:44,90:.:-0.14:1.000:. ./.:4:13,50:.:-1.87:1.000:. ./.:4:19,43:.:-1.89:1.000:. ./.:3:7,18:.:-2.80:1.000:. ./.:4:80,60:.: 0.01:1.000:. ./.:6:41,173:.: 1.82:1.000:. ./.:4:59,108:.: 0.67:1.000:. ./.:4:15,110:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,100:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,131:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,73:.:-0.33:1.000:. ./.:4:19,164:.: 1.06:1.000:. ./.:4:35,69:.:-0.87:1.000:. ./.:4:11,121:.:-0.18:1.000:. ./.:4:14,104:.:-0.53:1.000:. ./.:4:24,164:.: 1.18:0.999:. ./.:4:64,136:.: 1.47:1.000:. ./.:4:28,57:.:-1.33:1.000:. ./.:4:13,102:.:-0.60:1.000:. ./.:4:56,75:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.77:1.000:. ./.:4:42,87:.:-0.26:1.000:. ./.:4:37,68:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,73:.:-0.87:1.000:. ./.:4:19,84:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,103:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,105:.:-0.23:1.000:. ./.:4:13,97:.:-0.72:1.000:. ./.:6:7,109:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.45:1.000:. ./.:4:59,40:.:-0.99:1.000:. ./.:4:74,75:.: 0.23:1.000:. ./.:4:21,121:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,126:.: 0.08:1.000:. ./.:4:37,55:.:-1.16:1.000:. ./.:4:22,117:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,70:.:-0.33:1.000:. ./.:4:57,38:.:-1.09:0.986:. ./.:4:16,95:.:-0.70:1.000:. ./.:4:17,143:.: 0.50:1.000:. ./.:4:11,86:.:-1.04:0.999:. ./.:4:59,80:.:-0.01:1.000:. ./.:4:15,118:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:32,122:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,101:.:-0.38:1.000:. ./.:4:27,107:.:-0.14:1.000:. ./.:4:25,64:.:-1.23:1.000:. ./.:4:83,48:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.99:1.000:. ./.:4:58,79:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,73:.:-0.62:1.000:. ./.:4:57,98:.: 0.38:1.000:. ./.:4:18,141:.: 0.47:1.000:. ./.:4:51,87:.:-0.04:1.000:. ./.:4:27,59:.:-1.31:1.000:. ./.:4:63,35:.:-1.01:1.000:. ./.:4:37,67:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,75:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.11:1.000:. ./.:4:42,78:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,54:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.99:1.000:. ./.:4:53,80:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,111:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,77:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,211:.: 1.74:1.000:. ./.:4:42,64:.:-0.82:1.000:. ./.:4:55,72:.:-0.31:1.000:. ./.:4:15,136:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,108:.: 0.50:1.000:. ./.:4:41,114:.: 0.38:0.998:. ./.:4:38,87:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,61:.:-1.43:1.000:. ./.:4:17,190:.: 1.65:1.000:. ./.:4:69,108:.: 0.91:1.000:. ./.:4:41,98:.:-0.01:1.000:. ./.:4:40,82:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,177:.: 1.62:1.000:. ./.:4:39,96:.:-0.11:1.000:. ./.:4:44,84:.:-0.28:1.000:. ./.:4:31,62:.:-1.14:1.000:. ./.:4:29,125:.: 0.35:1.000:. ./.:4:49,74:.:-0.40:1.000:. ./.:4:19,118:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,115:.:-0.14:1.000:. ./.:4:15,81:.:-1.06:1.000:. ./.:4:52,70:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,122:.: 0.33:1.000:. ./.:4:45,94:.:-0.01:1.000:. ./.:4:32,158:.: 1.23:1.000:. ./.:4:28,119:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,97:.:-0.75:1.000:. ./.:4:36,75:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,90:.:-1.21:1.000:. ./.:4:30,45:.:-1.58:1.000:. ./.:4:17,80:.:-1.04:1.000:. ./.:4:30,112:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,105:.: 1.18:1.000:. ./.:4:27,63:.:-1.21:0.999:. ./.:4:40,51:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.36:1.000:. ./.:4:61,109:.: 0.74:1.000:. ./.:4:15,143:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,37:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,58:.:-0.72:1.000:. ./.:4:27,118:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.38:1.000:. ./.:4:17,79:.:-1.06:1.000:. ./.:4:28,141:.: 0.72:1.000:. ./.:4:15,93:.:-0.77:1.000:. ./.:4:59,151:.: 1.72:1.000:. ./.:4:28,163:.: 1.25:1.000:. ./.:4:30,182:.: 1.77:1.000:. ./.:4:13,124:.:-0.06:1.000:. ./.:4:42,82:.:-0.38:1.000:. ./.:4:41,79:.:-0.48:1.000:. ./.:4:67,120:.: 1.16:1.000:. ./.:4:44,162:.: 1.62:1.000:. ./.:4:18,24:.:-2.38:1.000:. ./.:4:19,100:.:-0.50:1.000:. ./.:4:91,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:27,143:.: 0.74:1.000:. ./.:4:57,205:.: 2.99:1.000:. ./.:4:99,55:.: 0.35:1.000:. ./.:4:15,151:.: 0.64:0.947:. ./.:4:24,149:.: 0.82:1.000:. ./.:4:53,84:.:-0.06:1.000:. ./.:4:30,72:.:-0.92:1.000:. ./.:4:26,146:.: 0.79:1.000:. ./.:4:101,30:.:-0.21:1.000:. ./.:4:64,28:.:-1.16:1.000:. ./.:4:24,121:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,119:.: 0.94:1.000:. ./.:4:30,146:.: 0.89:1.000:. ./.:4:21,138:.: 0.47:1.000:. ./.:4:92,68:.: 0.50:1.000:. ./.:4:46,68:.:-0.62:1.000:. ./.:4:28,98:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,162:.: 0.60:1.000:. ./.:4:25,111:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,89:.:-0.31:1.000:. ./.:4:34,82:.:-0.58:1.000:. ./.:4:80,114:.: 1.33:1.000:. ./.:4:75,107:.: 1.04:1.000:. ./.:4:32,139:.: 0.77:1.000:. ./.:4:27,116:.: 0.08:1.000:. ./.:4:49,103:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,219:.: 2.84:1.000:. ./.:4:125,76:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.55:1.000:. ./.:4:23,104:.:-0.31:1.000:. -chr6.1 75556698 chr6.1_075556698 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:47,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:33,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:92,2:.: 1.91:1.000:. ./.:4:49,5:.:-0.17:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:52,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.57:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:36,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,5:.: 0.51:1.000:. ./.:5:79,1:.: 1.18:0.965:. ./.:4:72,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:45,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,7:.:-2.61:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:72,4:.: 0.97:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:65,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:67,3:.: 0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,8:.:-0.74:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:77,1:.: 1.08:0.999:. ./.:4:59,8:.: 0.51:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:86,2:.: 1.60:1.000:. ./.:4:69,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:42,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.72:1.000:. ./.:4:38,8:.:-0.58:1.000:. ./.:4:65,5:.: 0.66:1.000:. ./.:4:29,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:44,8:.:-0.27:1.000:. ./.:6:48,4:.:-0.27:1.000:. ./.:4:59,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:77,5:.: 1.28:1.000:. ./.:4:63,6:.: 0.61:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,2:.:-1.26:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:40,5:.:-0.64:1.000:. ./.:4:31,3:.:-1.21:0.986:. ./.:4:69,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:61,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:18,4:.:-1.83:0.999:. ./.:4:68,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:87,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:46,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:40,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:46,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,6:.:-1.10:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.32:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:36,4:.:-0.89:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:53,11:.: 0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,7:.:-1.05:1.000:. ./.:4:61,5:.: 0.45:1.000:. ./.:4:34,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:57,3:.: 0.14:1.000:. ./.:4:27,8:.:-1.15:1.000:. ./.:4:34,4:.:-1.00:1.000:. ./.:4:31,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:55,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:52,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:63,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:45,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:91,7:.: 2.12:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:67,6:.: 0.82:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:61,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:32,6:.:-1.00:0.998:. ./.:4:61,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:51,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:68,3:.: 0.71:1.000:. ./.:4:68,5:.: 0.82:1.000:. ./.:4:107,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:58,5:.: 0.30:1.000:. ./.:4:31,7:.:-1.00:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:69,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:51,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.64:1.000:. ./.:4:43,6:.:-0.43:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:39,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:39,6:.:-0.64:1.000:. ./.:4:32,5:.:-1.05:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:32,7:.:-0.95:0.999:. ./.:4:40,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:67,5:.: 0.77:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.64:1.000:. ./.:4:33,4:.:-1.05:1.000:. ./.:4:53,6:.: 0.09:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:39,9:.:-0.48:1.000:. ./.:4:34,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:92,2:.: 1.91:1.000:. ./.:4:71,3:.: 0.87:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:66,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:86,3:.: 1.65:1.000:. ./.:4:23,5:.:-1.52:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:80,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:84,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:49,3:.:-0.27:0.947:. ./.:4:45,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:59,3:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:78,3:.: 1.23:1.000:. ./.:4:74,2:.: 0.97:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:36,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:97,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:79,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:43,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,2:.: 0.92:1.000:. -chr6.1 75777170 chr6.1_075777170 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:274,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.11:1.000:. ./.:5:320,0:.: 1.68:0.965:. ./.:4:165,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:68,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.17:1.000:. ./.:6:278,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.63:0.999:. ./.:4:51,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.25:1.000:. ./.:6:212,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.06:0.986:. ./.:4:243,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.55:0.999:. ./.:4:205,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.28:0.998:. ./.:4:230,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:355,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:251,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:343,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:114,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.05:0.947:. ./.:4:289,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.65:1.000:. -chr6.1 76084166 chr6.1_076084166 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:110,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.49:1.000:. ./.:5:136,0:.: 1.35:0.965:. ./.:4:69,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.83:1.000:. ./.:3:7,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:6:129,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.86:0.999:. ./.:4:50,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.69:1.000:. ./.:6:58,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.74:0.986:. ./.:4:107,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.40:0.999:. ./.:4:101,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.13:0.998:. ./.:4:79,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.37:0.999:. ./.:4:127,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.01:0.947:. ./.:4:110,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:129,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.73:1.000:. -chr6.1 76232452 chr6.1_076232452 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:436,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:280,11:.: 0.27:1.000:. ./.:4:289,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:369,12:.: 1.19:1.000:. ./.:4:419,15:.: 1.73:1.000:. ./.:4:223,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:208,30:.:-0.28:1.000:. ./.:4:368,21:.: 1.27:1.000:. ./.:4:41,13:.:-2.17:1.000:. ./.:4:105,13:.:-1.51:1.000:. ./.:4:407,12:.: 1.58:1.000:. ./.:4:209,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:532,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:305,11:.: 0.52:1.000:. ./.:4:333,5:.: 0.75:1.000:. ./.:5:355,37:.: 1.30:0.965:. ./.:4:205,26:.:-0.35:1.000:. ./.:4:458,14:.: 2.12:1.000:. ./.:4:435,12:.: 1.87:1.000:. ./.:4:136,29:.:-1.03:1.000:. ./.:4:293,16:.: 0.45:1.000:. ./.:4:359,10:.: 1.07:1.000:. ./.:4:347,12:.: 0.96:1.000:. ./.:4:71,19:.:-1.80:1.000:. ./.:4:343,5:.: 0.85:1.000:. ./.:4:230,18:.:-0.17:1.000:. ./.:4:295,14:.: 0.45:1.000:. ./.:4:260,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:580,1:.: 3.24:1.000:. ./.:4:393,19:.: 1.51:1.000:. ./.:4:341,5:.: 0.83:1.000:. ./.:4:101,4:.:-1.64:1.000:. ./.:4:144,7:.:-1.17:1.000:. ./.:3:84,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:119,36:.:-1.13:1.000:. ./.:6:316,23:.: 0.76:1.000:. ./.:4:228,30:.:-0.07:1.000:. ./.:4:283,11:.: 0.30:1.000:. ./.:4:393,18:.: 1.50:1.000:. ./.:4:269,16:.: 0.20:1.000:. ./.:4:256,12:.: 0.03:1.000:. ./.:4:452,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:152,21:.:-0.94:1.000:. ./.:4:418,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:320,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:328,12:.: 0.77:0.999:. ./.:4:252,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:155,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:278,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:144,25:.:-0.99:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:164,28:.:-0.75:1.000:. ./.:4:243,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:259,15:.: 0.09:1.000:. ./.:4:314,11:.: 0.61:1.000:. ./.:4:261,16:.: 0.12:1.000:. ./.:4:306,22:.: 0.65:1.000:. ./.:4:232,9:.:-0.25:1.000:. ./.:6:161,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:252,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:173,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:186,39:.:-0.41:1.000:. ./.:4:275,8:.: 0.18:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:129,35:.:-1.04:1.000:. ./.:4:314,12:.: 0.63:1.000:. ./.:4:290,22:.: 0.48:1.000:. ./.:4:177,30:.:-0.60:0.986:. ./.:4:167,24:.:-0.76:1.000:. ./.:4:303,17:.: 0.56:1.000:. ./.:4:237,11:.:-0.17:0.999:. ./.:4:102,43:.:-1.23:1.000:. ./.:4:300,14:.: 0.50:1.000:. ./.:4:147,28:.:-0.92:1.000:. ./.:4:252,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:220,17:.:-0.29:1.000:. ./.:4:294,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:160,16:.:-0.91:1.000:. ./.:4:113,41:.:-1.14:1.000:. ./.:4:200,13:.:-0.53:1.000:. ./.:4:164,52:.:-0.50:1.000:. ./.:4:272,13:.: 0.20:1.000:. ./.:4:248,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:460,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:259,18:.: 0.12:1.000:. ./.:4:204,11:.:-0.51:1.000:. ./.:4:54,34:.:-1.82:1.000:. ./.:4:217,14:.:-0.35:1.000:. ./.:4:259,17:.: 0.11:1.000:. ./.:4:273,14:.: 0.23:1.000:. ./.:4:211,20:.:-0.35:1.000:. ./.:4:266,20:.: 0.21:1.000:. ./.:4:301,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:148,30:.:-0.89:1.000:. ./.:4:108,26:.:-1.34:1.000:. ./.:4:118,18:.:-1.32:1.000:. ./.:4:80,47:.:-1.42:1.000:. ./.:4:311,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:148,34:.:-0.85:1.000:. ./.:4:197,41:.:-0.28:1.000:. ./.:4:108,17:.:-1.44:1.000:. ./.:4:238,20:.:-0.07:1.000:. ./.:4:227,11:.:-0.28:0.998:. ./.:4:135,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:137,24:.:-1.07:1.000:. ./.:4:362,9:.: 1.09:1.000:. ./.:4:256,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:175,32:.:-0.60:1.000:. ./.:4:197,12:.:-0.58:1.000:. ./.:4:289,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:129,35:.:-1.04:1.000:. ./.:4:234,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:153,12:.:-1.03:1.000:. ./.:4:269,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:96,40:.:-1.32:1.000:. ./.:4:168,7:.:-0.92:1.000:. ./.:4:233,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:195,16:.:-0.55:1.000:. ./.:4:210,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,23:.:-1.20:1.000:. ./.:4:196,33:.:-0.37:1.000:. ./.:4:383,11:.: 1.32:1.000:. ./.:4:134,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:273,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:135,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:207,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:121,19:.:-1.28:1.000:. ./.:4:211,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:186,11:.:-0.70:1.000:. ./.:4:204,37:.:-0.25:1.000:. ./.:4:166,16:.:-0.85:0.999:. ./.:4:161,24:.:-0.82:1.000:. ./.:4:267,9:.: 0.11:1.000:. ./.:4:280,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:264,11:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,43:.:-1.62:1.000:. ./.:4:142,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:200,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:249,11:.:-0.05:1.000:. ./.:4:166,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:297,15:.: 0.48:1.000:. ./.:4:106,16:.:-1.47:1.000:. ./.:4:377,17:.: 1.32:1.000:. ./.:4:366,16:.: 1.20:1.000:. ./.:4:324,12:.: 0.73:1.000:. ./.:4:276,14:.: 0.26:1.000:. ./.:4:350,13:.: 1.00:1.000:. ./.:4:179,25:.:-0.63:1.000:. ./.:4:401,10:.: 1.50:1.000:. ./.:4:200,16:.:-0.50:1.000:. ./.:4:108,1:.:-1.60:1.000:. ./.:4:283,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,72:.:-0.45:1.000:. ./.:4:307,16:.: 0.59:1.000:. ./.:4:135,46:.:-0.86:1.000:. ./.:4:265,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:258,7:.: 0.00:0.947:. ./.:4:521,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:214,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:96,35:.:-1.38:1.000:. ./.:4:343,8:.: 0.88:1.000:. ./.:4:99,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:262,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:331,11:.: 0.79:1.000:. ./.:4:100,38:.:-1.30:1.000:. ./.:4:230,17:.:-0.19:1.000:. ./.:4:290,14:.: 0.40:1.000:. ./.:4:122,35:.:-1.11:1.000:. ./.:4:179,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:281,11:.: 0.28:1.000:. ./.:4:173,31:.:-0.63:1.000:. ./.:4:189,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:177,15:.:-0.75:1.000:. ./.:4:319,42:.: 0.98:1.000:. ./.:4:371,17:.: 1.26:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:286,10:.: 0.32:1.000:. ./.:4:263,22:.: 0.20:1.000:. ./.:4:424,13:.: 1.76:1.000:. ./.:4:286,26:.: 0.48:1.000:. ./.:4:417,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:216,24:.:-0.26:1.000:. -chr6.1 76648241 chr6.1_076648241 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:215,76:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,114:0.45:-0.05:1.000:0.979 0/0/1/1:4:109,114:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:212,65:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,170:0.49: 1.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:325,0:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,55:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,145:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:217,73:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,38:0.51:-2.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,46:0.55:-2.76:1.000:0.979 0/0/1/1:4:120,190:0.59: 1.04:1.000:0.889 0/0/1/1:4:127,136:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:221,80:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:195,54:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,71:0.22: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:228,154:0.39: 2.23:0.965:0.969 0/0/0/1:4:205,84:0.28: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:257,76:0.22: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:348,0:0.00: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,35:0.52:-3.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,153:0.55: 0.36:1.000:0.984 0/0/0/0:4:319,1:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,196:0.67: 0.48:1.000:0.936 0/1/1/1:4:11,34:0.72:-3.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:209,56:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,155:0.48: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,138:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,150:0.47: 1.04:1.000:0.991 0/0/0/1:4:223,102:0.30: 1.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:130,192:0.57: 1.24:1.000:0.946 0/0/1/1:4:109,127:0.52:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,31:0.54:-3.17:1.000:0.987 0/0/1/1:4:32,38:0.52:-2.92:1.000:0.995 0/0/1:3:22,11:0.32:-3.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,174:0.53: 1.11:1.000:0.992 0/0/0/0/0/1:6:280,73:0.20: 1.75:1.000:0.933 0/1/1/1:4:51,209:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,127:0.46: 0.31:1.000:0.987 0/0/1/1:4:121,171:0.56: 0.74:1.000:0.966 0/0/0/1:4:164,53:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,131:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:270,70:0.20: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,183:0.71:-0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:213,83:0.27: 0.81:1.000:0.998 0/0/0/1:4:176,66:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:216,80:0.26: 0.81:0.999:0.999 0/0/1/1:4:82,108:0.54:-0.94:1.000:0.984 0/0/0/1:4:151,62:0.28:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,157:0.49: 1.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,172:0.71:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:246,83:0.24: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,54:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,86:0.28: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,61:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:208,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,124:0.42: 0.64:1.000:0.900 0/0/1/1:4:132,114:0.45:-0.02:1.000:0.975 0/0/0/0:4:235,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:166,15:0.08:-1.09:1.000:0.542 0/0/0/0:4:230,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,223:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,209:0.69: 0.68:1.000:0.971 0/0/0/1:4:130,64:0.32:-0.88:1.000:0.963 0/0/0/1:4:207,77:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,106:0.47:-0.50:1.000:0.992 0/0/0/1:4:128,39:0.22:-1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,186:0.72:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,124:0.52:-0.26:0.986:0.996 0/0/1/1:4:121,118:0.48:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:170,51:0.22:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-1.73:0.999:1.000 0/1/1/1:4:60,222:0.74: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:235,85:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,71:0.30:-0.38:1.000:0.982 0/0/1/1:4:122,109:0.45:-0.26:1.000:0.983 0/0/1/1:4:120,131:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,62:0.28:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,75:0.31:-0.25:1.000:0.974 0/0/1/1:4:131,145:0.51: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:153,52:0.24:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,215:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:193,82:0.29: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:99,125:0.54:-0.38:1.000:0.990 0/0/0/1:4:168,69:0.28:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:201,81:0.27: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,47:0.23:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,91:0.49:-1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,41:0.21:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,62:0.29:-0.71:1.000:0.991 0/0/0/0:4:229,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,115:0.48:-0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:209,73:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:138,53:0.26:-0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:217,70:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,214:0.74: 0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,118:0.52:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,66:0.30:-0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:126,132:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:190,56:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,96:0.49:-0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,123:0.43: 0.46:1.000:0.947 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,128:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,117:0.46:-0.02:0.998:0.986 0/0/0/1:4:182,55:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,91:0.44:-0.83:1.000:0.973 0/0/0/1:4:214,72:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,181:0.52: 1.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:191,73:0.26: 0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,118:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,108:0.28: 2.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:174,54:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,67:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,97:0.49:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,143:0.48: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,116:0.54:-0.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:181,64:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:159,56:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:194,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,78:0.29: 0.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:121,107:0.45:-0.31:1.000:0.981 0/1/1/1:4:53,209:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:209,73:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,127:0.52:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:249,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,71:0.28:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,114:0.52:-0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,87:0.44:-0.93:1.000:0.964 0/0/0/0:4:169,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,46:0.22:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,138:0.39: 1.55:1.000:0.677 0/0/1/1:4:65,66:0.49:-1.92:0.999:0.996 0/0/0/1:4:180,53:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:283,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,170:0.54: 0.88:1.000:0.985 0/0/0/1:4:175,53:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,95:0.50:-1.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:149,53:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,50:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,71:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:157,2:0.01:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:239,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,56:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,247:0.73: 1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:244,79:0.23: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,137:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,71:0.30:-0.30:1.000:0.988 0/0/0/1:4:229,56:0.19: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,124:0.45: 0.33:1.000:0.976 0/0/0/1:4:231,91:0.27: 1.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:121,136:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,49:0.58:-2.74:1.000:0.921 0/0/1/1:4:113,119:0.49:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,123:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,162:0.51: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,133:0.44: 0.71:1.000:0.969 0/1/1/1:4:60,235:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:162,66:0.28:-0.31:0.947:0.996 0/0/0/1:4:229,79:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,47:0.18: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,122:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,68:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,236:0.73: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,141:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,52:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,138:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,43:0.20:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,60:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,132:0.52:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,68:0.28:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,57:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:274,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,116:0.45: 0.00:1.000:0.982 0/0/1/1:4:83,102:0.53:-1.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:179,65:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,234:0.69: 1.24:1.000:0.972 0/0/1/1:4:132,146:0.51: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:210,83:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/0:4:272,13:0.04: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,84:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,90:0.27: 1.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,255:0.76: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,63:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,142:0.48: 0.63:1.000:0.995 -chr6.1 76850973 chr6.1_076850973 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:141,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:118,18:.: 0.34:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:152,23:.: 1.35:1.000:. ./.:4:50,9:.:-1.65:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:17,4:.:-2.63:1.000:. ./.:4:14,5:.:-2.68:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:90,7:.:-0.67:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:102,24:.: 0.08:1.000:. ./.:4:112,25:.: 0.36:1.000:. ./.:5:123,26:.: 0.67:0.965:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:123,20:.: 0.52:1.000:. ./.:4:159,25:.: 1.58:1.000:. ./.:4:17,2:.:-2.68:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:130,33:.: 1.04:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:91,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:120,20:.: 0.44:1.000:. ./.:4:115,2:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.68:1.000:. ./.:3:2,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.49:1.000:. ./.:6:120,20:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:116,22:.: 0.39:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:144,21:.: 1.09:0.999:. ./.:4:26,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:98,10:.:-0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:131,22:.: 0.78:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:105,15:.:-0.08:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:122,20:.: 0.49:1.000:. ./.:6:121,18:.: 0.42:1.000:. ./.:4:148,26:.: 1.32:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:77,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:77,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.05:0.986:. ./.:4:118,28:.: 0.60:1.000:. ./.:4:114,26:.: 0.44:1.000:. ./.:4:44,13:.:-1.70:0.999:. ./.:4:80,15:.:-0.72:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:104,12:.:-0.18:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:126,23:.: 0.67:1.000:. ./.:4:79,13:.:-0.80:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:210,1:.: 2.27:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:129,14:.: 0.52:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.95:1.000:. ./.:4:64,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:107,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:141,27:.: 1.16:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.75:0.998:. ./.:4:117,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:108,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:135,20:.: 0.83:1.000:. ./.:4:118,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:164,21:.: 1.60:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:158,21:.: 1.45:1.000:. ./.:4:125,19:.: 0.54:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:45,9:.:-1.78:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:62,13:.:-1.24:1.000:. ./.:4:52,16:.:-1.42:1.000:. ./.:4:88,17:.:-0.46:1.000:. ./.:4:106,10:.:-0.18:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:84,15:.:-0.62:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:124,19:.: 0.52:1.000:. ./.:4:59,21:.:-1.11:1.000:. ./.:4:123,24:.: 0.62:1.000:. ./.:4:122,22:.: 0.54:1.000:. ./.:4:67,15:.:-1.06:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:101,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:97,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:129,23:.: 0.75:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.05:0.999:. ./.:4:85,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:170,16:.: 1.63:1.000:. ./.:4:129,27:.: 0.85:1.000:. ./.:4:104,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:96,23:.:-0.10:1.000:. ./.:4:94,23:.:-0.15:1.000:. ./.:4:86,13:.:-0.62:1.000:. ./.:4:105,18:.: 0.00:1.000:. ./.:4:90,14:.:-0.49:1.000:. ./.:4:135,19:.: 0.80:1.000:. ./.:4:103,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:164,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:112,14:.: 0.08:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:84,18:.:-0.54:1.000:. ./.:4:176,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:91,19:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:124,14:.: 0.39:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:104,27:.: 0.21:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:93,16:.:-0.36:0.947:. ./.:4:126,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:109,16:.: 0.05:1.000:. ./.:4:103,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:109,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:104,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:93,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:102,20:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:119,20:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,24:.: 0.18:1.000:. ./.:4:73,10:.:-1.03:1.000:. ./.:4:124,24:.: 0.65:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:115,21:.: 0.34:1.000:. ./.:4:136,16:.: 0.75:1.000:. ./.:4:135,19:.: 0.80:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:124,22:.: 0.60:1.000:. -chr6.1 76896319 chr6.1_076896319 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,410:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,339:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,365:.:-0.19:1.000:. ./.:4:102,294:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,416:.: 0.57:1.000:. ./.:4:112,376:.: 1.64:1.000:. ./.:4:75,210:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,395:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,340:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,167:.:-1.93:1.000:. ./.:4:84,191:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,360:.:-0.26:1.000:. ./.:4:93,302:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,432:.: 0.81:1.000:. ./.:4:112,280:.: 0.21:1.000:. ./.:4:103,328:.: 0.79:1.000:. ./.:5:129,442:.: 2.87:0.965:. ./.:4:0,289:.:-1.31:1.000:. ./.:4:137,362:.: 1.80:1.000:. ./.:4:145,347:.: 1.70:1.000:. ./.:4:41,153:.:-2.72:1.000:. ./.:4:0,386:.: 0.12:1.000:. ./.:4:127,313:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,280:.:-1.45:1.000:. ./.:4:119,326:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,401:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,423:.: 0.67:1.000:. ./.:4:128,321:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,373:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,464:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,343:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,215:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,255:.:-1.82:1.000:. ./.:3:0,149:.:-3.39:1.000:. ./.:4:108,309:.: 0.58:1.000:. ./.:6:122,370:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,437:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,412:.: 0.51:1.000:. ./.:4:99,291:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,402:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,514:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,333:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,473:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,418:.: 0.60:1.000:. ./.:4:117,306:.: 0.67:0.999:. ./.:4:0,262:.:-1.71:1.000:. ./.:4:104,327:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,458:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,363:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,412:.: 0.51:1.000:. ./.:4:107,220:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,383:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,339:.:-0.57:1.000:. ./.:4:133,288:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,349:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.42:1.000:. ./.:4:94,272:.:-0.17:1.000:. ./.:6:117,195:.:-0.97:1.000:. ./.:4:132,303:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,354:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,386:.: 0.12:1.000:. ./.:4:134,304:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,327:.:-0.75:1.000:. ./.:4:88,227:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,375:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.02:0.986:. ./.:4:95,263:.:-0.29:1.000:. ./.:4:151,326:.: 1.47:1.000:. ./.:4:85,214:.:-1.16:0.999:. ./.:4:154,359:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.28:1.000:. ./.:4:106,310:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,342:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1,356:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,292:.:-1.27:1.000:. ./.:4:103,285:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,215:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,377:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,371:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,356:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,427:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,361:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,258:.:-1.77:1.000:. ./.:4:0,320:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,326:.:-0.76:1.000:. ./.:4:108,242:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,379:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,277:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,338:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.30:1.000:. ./.:4:91,226:.:-0.90:1.000:. ./.:4:195,141:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,216:.:-1.24:1.000:. ./.:4:109,253:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,341:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.48:1.000:. ./.:4:186,148:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,348:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,438:.: 0.90:0.998:. ./.:4:89,237:.:-0.76:1.000:. ./.:4:97,226:.:-0.81:1.000:. ./.:4:115,311:.: 0.72:1.000:. ./.:4:122,382:.: 1.87:1.000:. ./.:4:115,239:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.69:1.000:. ./.:4:158,421:.: 2.98:1.000:. ./.:4:92,252:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,372:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,236:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,435:.: 0.85:1.000:. ./.:4:97,251:.:-0.44:1.000:. ./.:4:120,239:.:-0.28:1.000:. ./.:4:107,275:.: 0.07:1.000:. ./.:4:100,228:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.32:1.000:. ./.:4:106,254:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,374:.:-0.05:1.000:. ./.:4:105,299:.: 0.39:1.000:. ./.:4:118,304:.: 0.66:1.000:. ./.:4:119,267:.: 0.12:1.000:. ./.:4:131,264:.: 0.26:1.000:. ./.:4:103,272:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,296:.:-1.21:1.000:. ./.:4:98,209:.:-1.05:1.000:. ./.:4:115,267:.: 0.07:1.000:. ./.:4:90,357:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,249:.:-1.91:0.999:. ./.:4:120,303:.: 0.67:1.000:. ./.:4:68,238:.:-1.06:1.000:. ./.:4:137,363:.: 1.81:1.000:. ./.:4:101,299:.: 0.33:1.000:. ./.:4:91,286:.:-0.01:1.000:. ./.:4:81,202:.:-1.40:1.000:. ./.:4:94,251:.:-0.48:1.000:. ./.:4:121,250:.:-0.10:1.000:. ./.:4:124,189:.:-0.96:1.000:. ./.:4:90,294:.: 0.10:1.000:. ./.:4:98,213:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,471:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,495:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,263:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,373:.:-0.07:1.000:. ./.:4:96,267:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,478:.: 1.49:1.000:. ./.:4:96,288:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,232:.:-2.16:1.000:. ./.:4:0,262:.:-1.71:1.000:. ./.:4:114,318:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,369:.:-0.13:1.000:. ./.:4:113,337:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1,422:.: 0.67:1.000:. ./.:4:95,269:.:-0.20:0.947:. ./.:4:0,412:.: 0.51:1.000:. ./.:4:96,256:.:-0.38:1.000:. ./.:4:82,247:.:-0.72:1.000:. ./.:4:89,289:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,371:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,385:.: 0.11:1.000:. ./.:4:112,315:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,354:.:-0.35:1.000:. ./.:4:216,199:.: 0.55:1.000:. ./.:4:100,285:.: 0.11:1.000:. ./.:4:79,278:.:-0.30:1.000:. ./.:4:87,272:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,306:.:-1.06:1.000:. ./.:4:124,280:.: 0.39:1.000:. ./.:4:99,268:.:-0.16:1.000:. ./.:4:111,259:.:-0.11:1.000:. ./.:4:91,231:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,493:.: 1.71:1.000:. ./.:4:1,419:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,422:.: 0.66:1.000:. ./.:4:121,277:.: 0.30:1.000:. ./.:4:126,329:.: 1.15:1.000:. ./.:4:147,417:.: 2.76:1.000:. ./.:4:0,486:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,336:.:-0.62:1.000:. ./.:4:117,294:.: 0.50:1.000:. -chr6.1 77477051 chr6.1_077477051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:114,90:0.47: 0.73:1.000:0.992 0/0/1/1:4:87,75:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,38:0.27:-0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,141:0.76: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,55:0.26: 1.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,179:0.80: 1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,88:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,121:0.72:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,39:0.43:-1.96:1.000:0.949 0/1/1/1:4:31,52:0.65:-2.31:1.000:0.800 0/0/1/1:4:104,90:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,86:0.46: 0.55:1.000:0.990 0/1/1/1:4:52,126:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,102:0.55: 0.53:1.000:0.983 0/0/1/1:4:103,111:0.55: 0.98:1.000:0.984 0/0/1/1/1:5:100,131:0.59: 1.41:0.965:0.968 0/0/0/1:4:147,50:0.29: 0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:119,120:0.53: 1.61:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,236:1.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,33:0.53:-2.76:1.000:0.990 0/0/0/1:4:137,36:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,136:0.72: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,91:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,27:0.43:-2.71:1.000:0.952 0/0/1/1:4:110,100:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,109:0.58: 0.53:1.000:0.906 0/0/0/1:4:147,38:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,119:0.53: 1.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:93,113:0.57: 0.78:1.000:0.934 0/0/0/1:4:175,41:0.22: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,40:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,35:0.62:-2.91:1.000:0.592 0/0/0/1:4:89,7:0.11:-1.98:1.000:0.554 0/0/1:3:28,15:0.38:-3.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,86:0.49: 0.30:1.000:0.996 1/1/1/1/1/1:6:0,201:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,112:0.53: 1.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,126:0.71: 0.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:177,49:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,80:0.48: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,94:0.53: 0.28:1.000:0.991 0/1/1/1:4:88,134:0.63: 1.18:1.000:0.542 0/0/1/1:4:88,75:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:134,104:0.47: 1.58:1.000:0.990 0/0/1/1:4:96,86:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,121:0.53: 1.68:0.999:0.993 0/0/0/1:4:114,32:0.25:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,76:0.51:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,54:0.42:-0.88:1.000:0.892 0/0/1/1:4:84,58:0.44:-0.83:1.000:0.963 0/1/1/1:4:50,144:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,85:0.57:-0.45:1.000:0.953 0/0/1/1:4:124,101:0.48: 1.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:104,48:0.35:-0.58:1.000:0.820 0/1/1/1:4:40,105:0.75:-0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,119:0.71:-0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:48,104:0.71:-0.58:1.000:0.990 0/1/1/1:4:43,112:0.74:-0.50:1.000:0.999 1/1/1/1/1/1:6:0,135:1.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,189:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,37:0.27:-0.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,136:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,55:0.39:-0.58:1.000:0.711 0/0/1/1:4:100,79:0.47: 0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:44,129:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,64:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,46:0.29: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:97,84:0.49: 0.15:0.986:0.996 0/0/1/1:4:92,88:0.52: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,88:0.44: 0.98:1.000:0.967 0/1/1/1:4:43,66:0.63:-1.66:0.999:0.566 0/0/0/1:4:141,27:0.20:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,137:0.80:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,119:0.71:-0.02:1.000:0.990 0/1/1/1:4:52,97:0.67:-0.65:1.000:0.939 0/1/1/1:4:46,132:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,98:0.56: 0.18:1.000:0.959 0/0/1/1:4:61,81:0.60:-0.83:1.000:0.824 0/0/1/1:4:106,89:0.48: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,109:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,62:0.46:-0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:113,117:0.54: 1.38:1.000:0.990 0/0/0/1:4:108,39:0.30:-0.70:1.000:0.987 0/0/1/1:4:96,56:0.40:-0.58:1.000:0.775 0/0/1/1:4:96,110:0.56: 0.78:1.000:0.967 0/0/1/1:4:71,63:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,75:0.47:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,62:0.46:-0.78:1.000:0.987 0/0/1/1:4:90,80:0.50:-0.13:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,145:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,36:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,86:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,91:0.71:-1.05:1.000:0.990 0/1/1/1:4:44,137:0.78: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,83:0.46: 0.43:1.000:0.988 0/1/1/1:4:46,114:0.74:-0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,107:0.76:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,186:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,134:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,82:0.70:-1.36:1.000:0.986 0/1/1/1:4:54,159:0.77: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,93:0.79:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,51:0.28: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,108:0.62: 0.15:0.998:0.548 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,91:0.68:-0.93:1.000:0.961 0/1/1/1:4:50,148:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,104:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,76:0.54:-0.70:1.000:0.985 0/0/0/1:4:154,31:0.20: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,137:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,83:0.45: 0.55:1.000:0.980 0/0/1/1:4:100,74:0.45:-0.02:1.000:0.983 0/1/1/1:4:42,84:0.69:-1.23:1.000:0.974 0/1/1/1:4:51,138:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,122:0.75:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,76:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,84:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,100:0.72:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,81:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,108:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,81:0.44: 0.50:1.000:0.973 0/1/1/1:4:51,161:0.78: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,110:0.74:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,124:0.72: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,73:0.47:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,63:0.49:-1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,93:0.76:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,71:0.72:-1.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:37,100:0.75:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,127:0.59: 1.21:1.000:0.831 0/0/0/1:4:105,19:0.19:-1.28:0.999:1.000 0/1/1/1:4:48,120:0.74:-0.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,115:0.49: 1.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,92:0.52: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,80:0.48: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,125:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,72:0.46:-0.25:1.000:0.990 0/1/1/1:4:42,112:0.75:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,84:0.71:-1.31:1.000:0.990 0/1/1/1:4:44,127:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,117:0.78:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,69:0.29: 2.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,170:0.80: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,133:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,95:0.53: 0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:108,109:0.53: 1.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,68:0.48:-0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,120:0.53: 1.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:46,144:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,2:0.07:-2.89:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,148:0.75: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,77:0.53:-0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:107,88:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:81,196:0.73: 2.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:175,36:0.21: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,117:0.74:-0.33:0.947:0.999 0/0/1/1:4:109,101:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,145:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,112:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,39:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,129:0.80:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,53:0.43:-1.05:1.000:0.940 0/0/1/1:4:85,89:0.54:-0.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,111:0.73:-0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,121:0.68: 0.25:1.000:0.948 0/0/1/1:4:120,96:0.47: 1.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:93,104:0.55: 0.55:1.000:0.975 0/1/1/1:4:44,127:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,57:0.49:-1.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,137:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,118:0.71:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:62,64:0.53:-1.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:93,71:0.46:-0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:121,115:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,89:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,71:0.46:-0.30:1.000:0.990 0/1/1/1:4:50,127:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,119:0.52: 1.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,123:0.54: 1.63:1.000:0.988 0/0/0/1:4:217,68:0.27: 2.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,133:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,95:0.52: 0.40:1.000:0.994 -chr6.1 77582530 chr6.1_077582530 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:187,0:0.00:11.49:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,1:0.32: 0.38:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1:3:3,11:0.67: 0.63:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/0/1/1:4:2,2:0.56: 0.00:1.000:0.963 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.52: 0.07:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,5:0.69: 0.13:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.66: 0.25:1.000:0.843 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:1.000:0.503 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,2:0.52: 0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,6:0.66: 0.25:1.000:0.843 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/0/1/1:4:3,1:0.44: 0.00:1.000:0.963 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.660 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.64: 0.19:1.000:0.721 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/1/1/1:4:1,4:0.68: 0.07:1.000:0.939 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.60: 0.07:0.986:0.791 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,2:0.56: 0.00:0.999:0.963 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,4:0.68: 0.07:1.000:0.939 0/0/1/1:4:4,2:0.50: 0.13:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,3:0.66: 0.00:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.56: 0.00:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,4:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,1:0.44: 0.00:1.000:0.963 0/0/1/1:4:2,3:0.60: 0.07:1.000:0.791 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.12:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,3:0.66: 0.00:1.000:0.843 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.66: 0.00:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.54: 0.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.66: 0.00:1.000:0.843 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.50:-0.06:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.06:0.947:0.503 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.06:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.66: 0.00:1.000:0.843 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.56:-0.12:1.000:0.963 ./:.:.,.:.:.:.:. -chr6.1 77824301 chr6.1_077824301 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:318,149:.: 0.30:1.000:. ./.:4:279,133:.:-0.12:1.000:. ./.:4:144,139:.:-1.10:1.000:. ./.:4:465,68:.: 0.80:1.000:. ./.:4:179,178:.:-0.54:1.000:. ./.:4:572,84:.: 1.73:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:335,65:.:-0.21:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:115,26:.:-2.18:1.000:. ./.:4:185,10:.:-1.77:1.000:. ./.:4:371,58:.: 0.01:1.000:. ./.:4:318,111:.: 0.01:1.000:. ./.:4:574,68:.: 1.63:1.000:. ./.:4:318,129:.: 0.14:1.000:. ./.:4:320,151:.: 0.33:1.000:. ./.:5:526,153:.: 1.91:0.965:. ./.:4:406,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:474,217:.: 2.00:1.000:. ./.:4:835,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:169,28:.:-1.76:1.000:. ./.:4:145,141:.:-1.08:1.000:. ./.:4:589,74:.: 1.79:1.000:. ./.:4:331,147:.: 0.38:1.000:. ./.:4:81,3:.:-2.61:1.000:. ./.:4:300,122:.:-0.05:1.000:. ./.:4:325,59:.:-0.33:1.000:. ./.:4:144,122:.:-1.23:1.000:. ./.:4:364,189:.: 0.95:1.000:. ./.:4:367,177:.: 0.88:1.000:. ./.:4:137,147:.:-1.09:1.000:. ./.:4:139,153:.:-1.03:1.000:. ./.:4:56,9:.:-2.76:1.000:. ./.:4:87,59:.:-2.14:1.000:. ./.:3:38,4:.:-2.93:1.000:. ./.:4:337,76:.:-0.11:1.000:. ./.:6:728,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:359,76:.: 0.05:1.000:. ./.:4:500,67:.: 1.06:1.000:. ./.:4:176,157:.:-0.72:1.000:. ./.:4:323,153:.: 0.36:1.000:. ./.:4:300,108:.:-0.15:1.000:. ./.:4:480,117:.: 1.28:1.000:. ./.:4:267,53:.:-0.82:1.000:. ./.:4:350,145:.: 0.51:1.000:. ./.:4:321,117:.: 0.08:1.000:. ./.:4:353,158:.: 0.63:0.999:. ./.:4:58,17:.:-2.68:1.000:. ./.:4:276,51:.:-0.77:1.000:. ./.:4:167,26:.:-1.79:1.000:. ./.:4:289,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:470,86:.: 0.97:1.000:. ./.:4:265,63:.:-0.76:1.000:. ./.:4:382,69:.: 0.17:1.000:. ./.:4:156,125:.:-1.12:1.000:. ./.:4:420,55:.: 0.36:1.000:. ./.:4:430,74:.: 0.58:1.000:. ./.:4:430,69:.: 0.54:1.000:. ./.:4:463,83:.: 0.90:1.000:. ./.:6:523,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:580,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:127,132:.:-1.28:1.000:. ./.:4:539,78:.: 1.44:1.000:. ./.:4:298,105:.:-0.19:1.000:. ./.:4:338,124:.: 0.26:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:273,106:.:-0.37:1.000:. ./.:4:171,139:.:-0.90:1.000:. ./.:4:307,58:.:-0.48:0.986:. ./.:4:249,61:.:-0.90:1.000:. ./.:4:345,139:.: 0.43:1.000:. ./.:4:255,26:.:-1.12:0.999:. ./.:4:141,49:.:-1.81:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:419,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:424,57:.: 0.40:1.000:. ./.:4:296,128:.:-0.03:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:315,74:.:-0.30:1.000:. ./.:4:402,42:.: 0.12:1.000:. ./.:4:289,72:.:-0.51:1.000:. ./.:4:370,88:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,134:.:-1.32:1.000:. ./.:4:273,75:.:-0.61:1.000:. ./.:4:360,65:.:-0.02:1.000:. ./.:4:232,57:.:-1.06:1.000:. ./.:4:225,44:.:-1.21:1.000:. ./.:4:321,71:.:-0.27:1.000:. ./.:4:286,65:.:-0.59:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:157,123:.:-1.12:1.000:. ./.:4:371,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:366,54:.:-0.06:1.000:. ./.:4:495,71:.: 1.05:1.000:. ./.:4:310,57:.:-0.46:1.000:. ./.:4:399,59:.: 0.23:1.000:. ./.:4:424,59:.: 0.42:1.000:. ./.:4:660,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:524,67:.: 1.24:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:422,55:.: 0.37:1.000:. ./.:4:166,133:.:-0.98:1.000:. ./.:4:394,108:.: 0.56:0.998:. ./.:4:598,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:522,87:.: 1.38:1.000:. ./.:4:366,147:.: 0.65:1.000:. ./.:4:351,72:.:-0.04:1.000:. ./.:4:142,117:.:-1.28:1.000:. ./.:4:663,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:312,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:320,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:213,21:.:-1.47:1.000:. ./.:4:505,75:.: 1.15:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:254,102:.:-0.55:1.000:. ./.:4:304,136:.: 0.09:1.000:. ./.:4:363,53:.:-0.09:1.000:. ./.:4:292,127:.:-0.07:1.000:. ./.:4:438,60:.: 0.53:1.000:. ./.:4:312,62:.:-0.41:1.000:. ./.:4:505,77:.: 1.17:1.000:. ./.:4:434,45:.: 0.39:1.000:. ./.:4:443,57:.: 0.55:1.000:. ./.:4:305,52:.:-0.54:1.000:. ./.:4:253,115:.:-0.46:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:334,45:.:-0.37:1.000:. ./.:4:483,68:.: 0.93:1.000:. ./.:4:560,137:.: 2.04:1.000:. ./.:4:93,87:.:-1.88:0.999:. ./.:4:362,48:.:-0.14:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:377,190:.: 1.06:1.000:. ./.:4:298,148:.: 0.14:1.000:. ./.:4:270,41:.:-0.89:1.000:. ./.:4:413,50:.: 0.27:1.000:. ./.:4:263,114:.:-0.39:1.000:. ./.:4:419,60:.: 0.39:1.000:. ./.:4:318,62:.:-0.36:1.000:. ./.:4:503,74:.: 1.13:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:206,168:.:-0.41:1.000:. ./.:4:562,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:535,89:.: 1.49:1.000:. ./.:4:282,120:.:-0.20:1.000:. ./.:4:317,71:.:-0.30:1.000:. ./.:4:295,111:.:-0.17:1.000:. ./.:4:406,70:.: 0.36:1.000:. ./.:4:483,66:.: 0.92:1.000:. ./.:4:66,30:.:-2.52:1.000:. ./.:4:334,51:.:-0.33:1.000:. ./.:4:346,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:354,87:.: 0.10:1.000:. ./.:4:565,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:195,153:.:-0.61:1.000:. ./.:4:421,67:.: 0.46:0.947:. ./.:4:348,140:.: 0.46:1.000:. ./.:4:500,61:.: 1.01:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,206:.:-0.61:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:219,65:.:-1.09:1.000:. ./.:4:311,139:.: 0.17:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:523,88:.: 1.39:1.000:. ./.:4:325,140:.: 0.28:1.000:. ./.:4:331,84:.:-0.10:1.000:. ./.:4:467,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:251,119:.:-0.44:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:450,69:.: 0.69:1.000:. ./.:4:246,116:.:-0.50:1.000:. ./.:4:275,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:441,97:.: 0.84:1.000:. ./.:4:328,177:.: 0.58:1.000:. ./.:4:322,153:.: 0.36:1.000:. ./.:4:513,80:.: 1.25:1.000:. ./.:4:356,75:.: 0.02:1.000:. ./.:4:414,197:.: 1.39:1.000:. ./.:4:211,175:.:-0.32:1.000:. ./.:4:485,74:.: 1.00:1.000:. ./.:4:309,81:.:-0.29:1.000:. -chr6.1 78103633 chr6.1_078103633 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:137,113:0.44: 1.49:1.000:0.969 0/0/0/1:4:108,68:0.37: 0.15:1.000:0.521 0/1/1/1:4:27,74:0.67:-1.21:1.000:0.912 0/0/0/1:4:179,43:0.18: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,123:0.55: 0.80:1.000:0.976 0/0/0/1:4:161,36:0.17: 0.53:1.000:0.998 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,37:0.26:-0.65:1.000:0.998 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.55:-2.54:1.000:0.982 0/0/0/1:4:38,16:0.28:-2.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,44:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,81:0.52:-0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:210,58:0.20: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,75:0.37: 0.47:1.000:0.518 0/0/1/1:4:96,75:0.43: 0.06:1.000:0.940 0/0/0/1/1:5:142,89:0.37: 1.15:0.965:0.956 0/0/0/1:4:99,54:0.34:-0.27:1.000:0.879 0/0/1/1:4:145,104:0.41: 1.47:1.000:0.836 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 2.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,23:0.54:-2.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:87,85:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:211,59:0.20: 1.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,81:0.44: 0.24:1.000:0.962 0/0/1/1:4:14,11:0.43:-2.59:1.000:0.944 0/0/1/1:4:106,83:0.43: 0.38:1.000:0.941 0/0/0/1:4:79,28:0.24:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,81:0.53:-0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,105:0.54: 0.31:1.000:0.985 0/0/0/1:4:123,68:0.34: 0.42:1.000:0.858 0/0/1/1:4:50,74:0.57:-0.80:1.000:0.955 0/0/1/1:4:50,83:0.59:-0.63:1.000:0.883 0/1/1/1:4:12,55:0.73:-1.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,32:0.60:-2.14:1.000:0.802 1/1/1:3:0,4:0.89:-2.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,36:0.35:-1.23:1.000:0.828 0/0/0/0/0/0:6:223,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,51:0.29:-0.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:147,38:0.19: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,79:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,99:0.47: 0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:85,90:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,89:0.24: 3.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,45:0.31:-0.54:1.000:0.973 0/0/0/1:4:154,93:0.36: 1.44:1.000:0.653 0/0/0/1:4:165,77:0.30: 1.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:131,115:0.46: 1.42:0.999:0.986 0/0/1/1:4:9,16:0.60:-2.59:1.000:0.802 0/0/1/1:4:64,41:0.38:-1.14:1.000:0.536 0/0/0/1:4:96,35:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,48:0.36:-0.70:1.000:0.708 0/0/0/1:4:254,62:0.18: 2.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,26:0.26:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,64:0.28: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,75:0.53:-0.56:1.000:0.992 0/0/0/1:4:125,33:0.19:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,32:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,32:0.16: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:137,37:0.20: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:180,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:214,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,58:0.63:-1.50:1.000:0.568 0/0/0/1:4:130,48:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,73:0.43:-0.05:1.000:0.950 0/0/1/1:4:124,91:0.41: 0.85:1.000:0.873 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,70:0.46:-0.34:1.000:0.988 0/1/1/1:4:31,92:0.68:-0.81:1.000:0.952 0/0/0/1:4:80,44:0.34:-0.80:0.986:0.867 0/0/0/1:4:110,34:0.22:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,113:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,32:0.23:-0.70:0.999:1.000 0/0/1/1:4:32,37:0.52:-1.79:1.000:0.995 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,42:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,44:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,107:0.42: 1.42:1.000:0.928 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,48:0.44:-1.12:1.000:0.971 0/0/0/1:4:139,33:0.18: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,46:0.29:-0.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:158,64:0.27: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,79:0.57:-0.67:1.000:0.944 0/0/1/1:4:107,72:0.39: 0.20:1.000:0.688 0/0/0/1:4:164,55:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,27:0.21:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,48:0.32:-0.45:1.000:0.952 0/0/0/1:4:121,42:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,50:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/0:4:188,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,77:0.48:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:127,44:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,31:0.14: 0.58:1.000:0.979 0/0/0/1:4:199,38:0.15: 1.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:96,43:0.29:-0.52:1.000:0.990 0/0/0/1:4:124,60:0.31: 0.29:1.000:0.973 0/0/0/1:4:119,35:0.21:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,53:0.21: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,1:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,42:0.28:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,112:0.61: 0.04:1.000:0.660 0/0/0/1:4:126,70:0.34: 0.51:0.998:0.850 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,47:0.20: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,118:0.54: 0.78:1.000:0.989 0/0/0/1:4:105,40:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,101:0.60:-0.22:1.000:0.752 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,40:0.28:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:132,32:0.18:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,31:0.28:-1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:236,54:0.17: 2.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,77:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,94:0.46: 0.62:1.000:0.984 0/0/0/1:4:137,37:0.20: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,76:0.35: 0.75:1.000:0.797 0/0/1/1:4:94,60:0.38:-0.25:1.000:0.524 0/0/0/1:4:110,46:0.28:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,51:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,36:0.20:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,57:0.23: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,33:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,78:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,46:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,36:0.19: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,95:0.37: 1.44:1.000:0.545 0/0/1/1:4:44,62:0.56:-1.12:0.999:0.971 0/0/0/1:4:119,36:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,121:0.54: 0.84:1.000:0.986 0/0/1/1:4:107,89:0.44: 0.51:1.000:0.972 0/0/1/1:4:60,53:0.46:-0.99:1.000:0.987 0/0/0/1:4:101,51:0.32:-0.29:1.000:0.953 0/0/1/1:4:82,80:0.48:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:159,44:0.20: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,52:0.32:-0.27:1.000:0.940 0/0/0/1:4:185,35:0.15: 0.95:1.000:0.986 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,113:0.67:-0.23:1.000:0.899 0/0/0/0:4:266,0:0.00: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,46:0.17: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,97:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,53:0.29: 0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:76,62:0.44:-0.54:1.000:0.965 0/0/0/1:4:174,53:0.22: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,34:0.19: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,32:0.75:-2.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,21:0.17:-0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,46:0.35:-0.74:1.000:0.809 0/0/0/1:4:115,33:0.21:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:230,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,105:0.68:-0.49:1.000:0.946 0/0/0/1:4:123,47:0.26: 0.04:0.947:0.999 0/0/1/1:4:137,105:0.42: 1.34:1.000:0.924 0/0/0/1:4:118,51:0.29: 0.02:1.000:0.994 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,114:0.67:-0.22:1.000:0.906 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,31:0.28:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,70:0.42:-0.07:1.000:0.893 0/0/0/1:4:96,38:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:138,39:0.21: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,80:0.40: 0.46:1.000:0.811 0/0/0/1:4:51,28:0.34:-1.61:1.000:0.869 0/0/0/1:4:130,31:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,50:0.39:-0.80:1.000:0.700 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,47:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,79:0.56:-0.60:1.000:0.971 0/0/0/1:4:72,43:0.36:-0.96:1.000:0.686 0/0/0/1:4:117,43:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,114:0.49: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,86:0.35: 1.24:1.000:0.789 0/0/0/1:4:163,38:0.18: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:118,34:0.21:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,84:0.37: 0.93:1.000:0.560 0/1/1/1:4:47,122:0.66: 0.02:1.000:0.869 0/0/0/1:4:127,34:0.20:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,39:0.23:-0.23:1.000:1.000 -chr6.1 78298786 chr6.1_078298786 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:351,411:0.53: 0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:200,245:0.54:-1.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:433,142:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:274,314:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:673,230:0.25: 1.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:266,330:0.54:-0.10:1.000:0.987 0/1/1/1:4:80,265:0.75:-1.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:388,304:0.43: 0.52:1.000:0.944 0/1/1/1:4:193,418:0.67: 0.00:1.000:0.912 0/0/0/1:4:131,76:0.36:-2.61:1.000:0.699 0/0/1/1:4:83,106:0.55:-2.72:1.000:0.982 0/0/1/1:4:366,305:0.44: 0.38:1.000:0.973 0/0/0/1:4:423,148:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:178,566:0.74: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:274,297:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:351,137:0.28:-0.80:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:413,335:0.44: 0.88:0.965:0.923 0/0/1/1:4:355,335:0.47: 0.51:1.000:0.993 0/0/0/1:4:580,256:0.30: 1.45:1.000:0.985 0/1/1/1:4:157,538:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,92:0.43:-2.59:1.000:0.946 0/0/0/1:4:529,171:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:413,423:0.49: 1.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:275,289:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,88:0.74:-3.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:433,146:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:301,270:0.46:-0.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:431,144:0.25:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:556,197:0.26: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,255:0.52:-0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:412,119:0.22:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,118:0.28:-1.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,202:0.85:-2.44:1.000:0.987 0/0/0/1:4:108,58:0.34:-2.87:1.000:0.857 0/0/1:3:41,42:0.49:-3.40:1.000:0.602 0/0/0/1:4:424,125:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:134,623:0.80: 0.94:1.000:0.935 0/0/1/1:4:395,337:0.45: 0.78:1.000:0.979 0/1/1/1:4:132,441:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:493,176:0.26: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:387,159:0.29:-0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:264,330:0.54:-0.11:1.000:0.986 0/0/1/1:4:365,630:0.62: 2.47:1.000:0.594 0/0/1/1:4:294,316:0.51:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:308,370:0.53: 0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:317,403:0.55: 0.70:1.000:0.983 0/0/0/1:4:532,195:0.26: 0.74:0.999:0.998 0/0/0/1:4:251,120:0.32:-1.55:1.000:0.961 0/0/0/1:4:428,142:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:239,277:0.52:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:349,323:0.47: 0.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:183,624:0.76: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:508,171:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:381,389:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:522,171:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:258,355:0.57: 0.01:1.000:0.958 0/1/1/1:4:144,452:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:131,470:0.76:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,332:0.55:-0.15:1.000:0.979 0/0/1/1/1/1:6:131,409:0.74:-0.46:1.000:0.591 0/1/1/1:4:132,498:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:469,145:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,478:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:345,160:0.31:-0.69:1.000:0.973 0/0/1/1:4:319,365:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:173,443:0.70: 0.03:1.000:0.987 0/0/0/1:4:404,111:0.21:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:468,156:0.25: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:313,311:0.49: 0.08:0.986:0.996 0/0/0/1:4:467,176:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:537,206:0.27: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:262,297:0.52:-0.34:0.999:0.995 0/0/0/0:4:682,1:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:288,586:0.65: 1.69:1.000:0.831 0/0/1/1:4:316,356:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:102,384:0.77:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:121,455:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:285,388:0.56: 0.40:1.000:0.963 0/0/1/1:4:222,296:0.56:-0.60:1.000:0.971 0/0/0/1:4:553,161:0.22: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,240:0.54:-1.16:1.000:0.985 0/0/1/1:4:440,406:0.47: 1.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:411,415:0.49: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:468,164:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:216,319:0.58:-0.49:1.000:0.906 0/0/1/1:4:455,443:0.48: 1.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:282,253:0.46:-0.49:1.000:0.989 0/0/1/1:4:345,305:0.46: 0.25:1.000:0.986 0/0/1/1:4:322,335:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:328,300:0.47: 0.11:1.000:0.991 0/1/1/1:4:120,386:0.74:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:499,150:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:389,400:0.49: 1.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:131,367:0.72:-0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:177,506:0.72: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:370,310:0.45: 0.44:1.000:0.974 0/0/1/1:4:280,307:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:289,129:0.30:-1.25:1.000:0.983 0/1/1/1:4:167,577:0.76: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:351,437:0.54: 1.14:1.000:0.987 0/1/1/1:4:220,437:0.65: 0.29:1.000:0.786 0/1/1/1:4:250,543:0.67: 1.17:1.000:0.914 0/0/0/1:4:279,145:0.33:-1.21:1.000:0.899 0/0/0/1:4:516,180:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:229,398:0.62: 0.10:0.998:0.574 0/1/1/1:4:159,440:0.72:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:301,291:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:322,303:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:588,214:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:541,174:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:556,221:0.28: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:380,362:0.48: 0.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:525,192:0.26: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:357,347:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:180,194:0.51:-1.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:179,616:0.76: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:359,295:0.44: 0.27:1.000:0.968 0/0/0/1:4:381,161:0.29:-0.45:1.000:0.991 0/0/0/1:4:367,147:0.28:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:281,350:0.54: 0.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:356,392:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:249,321:0.55:-0.27:1.000:0.980 0/0/1/1:4:396,343:0.45: 0.82:1.000:0.983 0/0/1/1:4:284,297:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:277,322:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:309,380:0.54: 0.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:480,167:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:292,126:0.30:-1.25:1.000:0.989 0/1/1/1:4:132,332:0.70:-0.95:1.000:0.984 0/0/1/1:4:197,251:0.55:-1.05:1.000:0.983 0/0/1/1:4:249,311:0.54:-0.33:1.000:0.986 0/0/1/1:4:347,252:0.41:-0.08:1.000:0.870 0/0/0/1:4:342,112:0.24:-1.01:0.999:1.000 0/0/1/1:4:267,332:0.54:-0.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:160,476:0.73: 0.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:490,186:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:483,192:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:430,143:0.24:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,312:0.56:-0.45:1.000:0.964 0/0/0/1:4:418,173:0.29:-0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:333,435:0.55: 1.01:1.000:0.977 0/0/0/1:4:294,171:0.36:-0.94:1.000:0.692 0/0/1/1:4:268,284:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:244,265:0.51:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:691,217:0.23: 1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:313,730:0.68: 2.78:1.000:0.961 0/1/1/1:4:147,564:0.77: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:442,206:0.31: 0.24:1.000:0.971 0/0/1/1:4:460,425:0.47: 1.76:1.000:0.992 0/0/0/1:4:413,124:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:403,347:0.45: 0.89:1.000:0.981 0/0/1/1:4:265,261:0.48:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,62:0.34:-2.79:1.000:0.876 0/1/1/1:4:67,295:0.80:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:477,154:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:449,393:0.46: 1.48:1.000:0.985 0/1/1/1:4:292,616:0.66: 1.91:1.000:0.883 0/0/0/1:4:561,187:0.25: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,268:0.54:-0.83:0.947:0.986 0/0/1/1:4:355,354:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:252,278:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:270,269:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/0:4:501,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:219,430:0.65: 0.24:1.000:0.762 0/0/1/1:4:262,270:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:382,154:0.28:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:316,294:0.47:-0.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:379,165:0.30:-0.43:1.000:0.987 0/0/0/1:4:392,152:0.27:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:452,122:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,209:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,222:0.51:-1.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:193,504:0.71: 0.55:1.000:0.990 0/0/1/1:4:303,289:0.48:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:356,97:0.21:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:394,122:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:373,317:0.45: 0.51:1.000:0.978 0/1/1/1:4:178,530:0.73: 0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:255,307:0.53:-0.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:251,261:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:522,166:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:561,211:0.27: 1.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:644,170:0.20: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,453:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:568,187:0.24: 0.92:1.000:1.000 -chr6.1 78535456 chr6.1_078535456 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:391,324:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:297,305:0.54: 0.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:326,272:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:308,289:0.52:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:436,379:0.50: 1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:470,390:0.49: 1.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:131,328:0.75:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:166,443:0.76: 0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,591:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,59:0.39:-3.28:1.000:0.688 0/0/1/1:4:296,198:0.44:-0.81:1.000:0.961 0/1/1/1:4:152,396:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:436,137:0.27:-0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:198,513:0.75: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:329,315:0.53: 0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:525,168:0.27: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:571,328:0.40: 2.24:0.965:0.971 1/1/1/1:4:0,521:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:685,249:0.30: 2.51:1.000:0.987 0/1/1/1:4:218,529:0.74: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:327,154:0.35:-0.91:1.000:0.761 0/0/1/1:4:334,300:0.51: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:376,346:0.52: 0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:300,310:0.54: 0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:89,244:0.76:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:670,169:0.23: 1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:174,462:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:346,294:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:590,163:0.25: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:369,357:0.53: 0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:398,316:0.48: 0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:308,287:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,122:0.52:-2.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:209,117:0.39:-2.07:1.000:0.727 0/0/1:3:101,77:0.47:-3.19:1.000:0.885 0/0/1/1:4:344,284:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1/1/1:6:193,581:0.78: 1.30:1.000:0.804 0/1/1/1:4:181,470:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:212,489:0.73: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:377,336:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:494,145:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:347,290:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:486,529:0.56: 3.12:1.000:0.971 0/1/1/1:4:147,468:0.79: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:382,316:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:385,324:0.49: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:662,173:0.24: 1.76:0.999:1.000 0/0/1/1:4:334,287:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:355,321:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:199,424:0.71: 0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:184,335:0.68:-0.62:1.000:0.950 0/1/1/1:4:179,508:0.77: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,198:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:156,456:0.77: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:306,241:0.48:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:376,310:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,355:0.78:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:214,491:0.73: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:314,268:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:106,256:0.74:-1.80:1.000:0.596 0/1/1/1:4:130,339:0.75:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:258,231:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:217,509:0.73: 0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:382,290:0.47: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:362,341:0.52: 0.77:1.000:0.994 1/1/1/1:4:1,592:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:422,114:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:301,289:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:193,415:0.71: 0.05:0.986:0.994 0/0/1/1:4:301,255:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:615,183:0.26: 1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:333,295:0.51: 0.20:0.999:0.996 0/0/1/1:4:470,412:0.50: 2.11:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,594:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:175,431:0.74: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:125,301:0.74:-1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:164,377:0.73:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:308,249:0.48:-0.33:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,436:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:379,344:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:302,237:0.48:-0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:219,429:0.69: 0.35:1.000:0.980 0/1/1/1:4:170,430:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:306,252:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:330,317:0.53: 0.34:1.000:0.993 0/1/1/1:4:158,466:0.78: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,332:0.76:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:142,371:0.75:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:169,374:0.72:-0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:141,373:0.76:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,315:0.75:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:282,247:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:176,432:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,274:0.76:-1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:164,386:0.73:-0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:159,460:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:273,162:0.41:-1.25:1.000:0.846 0/0/0/1:4:431,114:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:153,365:0.74:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:302,281:0.52:-0.14:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,474:1.00:-0.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,564:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,137:0.34:-1.21:1.000:0.846 0/0/1/1:4:286,250:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:305,329:0.56: 0.25:0.998:0.974 0/1/1/1:4:155,378:0.74:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:147,360:0.74:-0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:168,480:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:665,174:0.24: 1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:318,310:0.53: 0.20:1.000:0.992 0/0/1/1:4:297,257:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:258,610:0.73: 2.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:278,234:0.49:-0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:145,440:0.78:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,177:0.47:-1.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:173,396:0.73:-0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:152,319:0.71:-0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:485,137:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:504,128:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:279,241:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:335,311:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:327,247:0.47:-0.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:177,476:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:367,296:0.48: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:357,276:0.47: 0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:339,294:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:292,277:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:418,135:0.27:-0.36:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,379:1.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:248,190:0.47:-1.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:282,231:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:440,284:0.43: 0.92:1.000:0.941 0/0/1/1:4:210,161:0.47:-1.73:0.999:0.993 0/0/1/1:4:323,278:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:118,348:0.78:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:665,173:0.23: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:489,137:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:279,221:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:238,206:0.50:-1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:445,120:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:328,284:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:302,93:0.27:-1.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:331,285:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:98,272:0.76:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:397,388:0.53: 1.38:1.000:0.992 1/1/1/1:4:1,791:1.00: 1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:165,452:0.76: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:481,123:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:197,514:0.75: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:422,130:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:242,553:0.73: 1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:312,294:0.52: 0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:165,116:0.45:-2.41:1.000:0.979 0/1/1/1:4:141,325:0.73:-1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:360,277:0.47: 0.27:1.000:0.993 0/1/1/1:4:154,393:0.75:-0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,771:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:375,316:0.49: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:295,247:0.49:-0.45:0.947:0.996 0/0/1/1:4:389,320:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:300,261:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:181,396:0.72:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/0:4:633,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,575:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:186,435:0.73: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:558,170:0.26: 0.95:1.000:0.998 0/1/1/1:4:174,415:0.74:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:510,156:0.26: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:539,156:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:321,266:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:297,264:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:276,239:0.50:-0.65:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,669:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,285:0.52:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:485,128:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,252:0.52:-0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:211,565:0.76: 1.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:202,482:0.74: 0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:335,292:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:319,243:0.47:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:361,324:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:626,213:0.28: 1.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:466,392:0.49: 1.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:158,401:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:314,265:0.50:-0.17:1.000:0.997 -chr6.1 78755957 chr6.1_078755957 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:393,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:165,109:.: 0.05:1.000:. ./.:4:256,67:.: 0.66:1.000:. ./.:4:279,63:.: 0.90:1.000:. ./.:4:300,91:.: 1.51:1.000:. ./.:4:138,102:.:-0.38:1.000:. ./.:4:162,128:.: 0.25:1.000:. ./.:4:219,55:.: 0.05:1.000:. ./.:4:17,36:.:-2.70:1.000:. ./.:4:48,35:.:-2.33:1.000:. ./.:4:210,72:.: 0.15:1.000:. ./.:4:176,141:.: 0.58:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:295,88:.: 1.41:1.000:. ./.:5:276,160:.: 2.07:0.965:. ./.:4:125,251:.: 1.32:1.000:. ./.:4:308,80:.: 1.47:1.000:. ./.:4:288,60:.: 0.97:1.000:. ./.:4:44,26:.:-2.49:1.000:. ./.:4:240,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:278,86:.: 1.17:1.000:. ./.:4:244,67:.: 0.51:1.000:. ./.:4:20,33:.:-2.70:1.000:. ./.:4:297,88:.: 1.43:1.000:. ./.:4:208,175:.: 1.41:1.000:. ./.:4:237,68:.: 0.43:1.000:. ./.:4:196,141:.: 0.83:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:272,79:.: 1.01:1.000:. ./.:4:226,68:.: 0.30:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:42,11:.:-2.70:1.000:. ./.:3:53,2:.:-2.68:1.000:. ./.:4:82,177:.:-0.14:1.000:. ./.:6:275,128:.: 1.66:1.000:. ./.:4:169,128:.: 0.33:1.000:. ./.:4:232,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:207,71:.: 0.10:1.000:. ./.:4:186,64:.:-0.25:1.000:. ./.:4:227,73:.: 0.37:1.000:. ./.:4:414,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:133,118:.:-0.24:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:283,60:.: 0.91:0.999:. ./.:4:413,130:.: 3.40:1.000:. ./.:4:123,82:.:-0.81:1.000:. ./.:4:202,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:106,94:.:-0.87:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:115,106:.:-0.61:1.000:. ./.:4:252,62:.: 0.55:1.000:. ./.:4:247,70:.: 0.58:1.000:. ./.:4:216,58:.: 0.05:1.000:. ./.:4:222,52:.: 0.05:1.000:. ./.:4:214,60:.: 0.05:1.000:. ./.:4:184,51:.:-0.44:1.000:. ./.:6:110,44:.:-1.45:1.000:. ./.:4:219,44:.:-0.09:1.000:. ./.:4:147,91:.:-0.40:1.000:. ./.:4:149,122:.: 0.01:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:120,114:.:-0.45:1.000:. ./.:4:144,35:.:-1.13:1.000:. ./.:4:148,126:.: 0.05:1.000:. ./.:4:129,121:.:-0.25:0.986:. ./.:4:142,121:.:-0.09:1.000:. ./.:4:225,75:.: 0.37:1.000:. ./.:4:163,42:.:-0.81:0.999:. ./.:4:89,208:.: 0.33:1.000:. ./.:4:274,70:.: 0.92:1.000:. ./.:4:136,103:.:-0.39:1.000:. ./.:4:164,41:.:-0.81:1.000:. ./.:4:210,61:.: 0.01:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:136,41:.:-1.16:1.000:. ./.:4:75,159:.:-0.45:1.000:. ./.:4:150,56:.:-0.80:1.000:. ./.:4:178,115:.: 0.29:1.000:. ./.:4:234,77:.: 0.51:1.000:. ./.:4:203,55:.:-0.15:1.000:. ./.:4:256,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:199,50:.:-0.26:1.000:. ./.:4:175,37:.:-0.72:1.000:. ./.:4:131,94:.:-0.56:1.000:. ./.:4:176,59:.:-0.44:1.000:. ./.:4:228,54:.: 0.15:1.000:. ./.:4:176,30:.:-0.80:1.000:. ./.:4:212,54:.:-0.05:1.000:. ./.:4:246,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:263,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:120,101:.:-0.61:1.000:. ./.:4:97,84:.:-1.11:1.000:. ./.:4:91,74:.:-1.31:1.000:. ./.:4:132,115:.:-0.29:1.000:. ./.:4:258,74:.: 0.77:1.000:. ./.:4:101,77:.:-1.15:1.000:. ./.:4:163,138:.: 0.38:1.000:. ./.:4:82,76:.:-1.40:1.000:. ./.:4:213,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:199,46:.:-0.31:0.998:. ./.:4:121,90:.:-0.74:1.000:. ./.:4:55,140:.:-0.94:1.000:. ./.:4:226,74:.: 0.37:1.000:. ./.:4:217,174:.: 1.51:1.000:. ./.:4:83,170:.:-0.21:1.000:. ./.:4:180,46:.:-0.55:1.000:. ./.:4:225,161:.: 1.44:1.000:. ./.:4:127,109:.:-0.42:1.000:. ./.:4:220,59:.: 0.11:1.000:. ./.:4:132,96:.:-0.52:1.000:. ./.:4:206,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:69,142:.:-0.74:1.000:. ./.:4:232,57:.: 0.24:1.000:. ./.:4:180,34:.:-0.70:1.000:. ./.:4:207,53:.:-0.13:1.000:. ./.:4:303,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:123,82:.:-0.81:1.000:. ./.:4:136,101:.:-0.41:1.000:. ./.:4:300,73:.: 1.28:1.000:. ./.:4:146,85:.:-0.49:1.000:. ./.:4:211,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:146,93:.:-0.39:1.000:. ./.:4:155,53:.:-0.77:1.000:. ./.:4:71,60:.:-1.73:1.000:. ./.:4:146,27:.:-1.21:1.000:. ./.:4:170,46:.:-0.67:1.000:. ./.:4:235,106:.: 0.88:1.000:. ./.:4:119,32:.:-1.48:0.999:. ./.:4:149,114:.:-0.09:1.000:. ./.:4:182,57:.:-0.39:1.000:. ./.:4:197,157:.: 1.04:1.000:. ./.:4:230,73:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,122:.:-1.35:1.000:. ./.:4:103,79:.:-1.10:1.000:. ./.:4:175,45:.:-0.62:1.000:. ./.:4:228,45:.: 0.04:1.000:. ./.:4:110,46:.:-1.42:1.000:. ./.:4:217,54:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,68:.:-1.35:1.000:. ./.:4:202,178:.: 1.37:1.000:. ./.:4:365,92:.: 2.33:1.000:. ./.:4:233,57:.: 0.25:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:261,74:.: 0.81:1.000:. ./.:4:126,114:.:-0.38:1.000:. ./.:4:271,79:.: 0.99:1.000:. ./.:4:167,118:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,8:.:-2.68:1.000:. ./.:4:179,68:.:-0.29:1.000:. ./.:4:97,221:.: 0.60:1.000:. ./.:4:253,51:.: 0.42:1.000:. ./.:4:219,149:.: 1.22:1.000:. ./.:4:185,150:.: 0.81:1.000:. ./.:4:178,146:.: 0.67:0.947:. ./.:4:426,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:139,124:.:-0.09:1.000:. ./.:4:74,185:.:-0.14:1.000:. ./.:4:184,61:.:-0.31:1.000:. ./.:4:76,212:.: 0.22:1.000:. ./.:4:207,134:.: 0.88:1.000:. ./.:4:231,68:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,118:.:-0.64:1.000:. ./.:4:134,95:.:-0.51:1.000:. ./.:4:254,56:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,179:.:-0.05:1.000:. ./.:4:137,94:.:-0.49:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:233,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:125,114:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,109:.:-0.57:1.000:. ./.:4:126,102:.:-0.52:1.000:. ./.:4:175,147:.: 0.65:1.000:. ./.:4:218,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:186,62:.:-0.28:1.000:. ./.:4:162,118:.: 0.12:1.000:. ./.:4:357,79:.: 2.07:1.000:. ./.:4:177,182:.: 1.11:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:180,135:.: 0.56:1.000:. -chr6.1 79127138 chr6.1_079127138 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:145,103:0.45: 0.61:1.000:0.981 0/0/1/1:4:119,76:0.43:-0.42:1.000:0.937 0/0/0/1:4:183,47:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,174:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:232,90:0.32: 2.04:1.000:0.949 0/1/1/1:4:55,139:0.74:-0.44:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,95:0.47: 0.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,123:0.76:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,68:0.59:-1.83:1.000:0.888 0/1/1/1:4:25,41:0.65:-2.91:1.000:0.754 0/0/1/1:4:105,109:0.54:-0.05:1.000:0.987 0/0/1/1:4:125,87:0.45:-0.09:1.000:0.976 0/1/1/1:4:64,174:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,83:0.46:-0.42:1.000:0.988 0/0/1/1:4:119,94:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1/1:5:140,186:0.60: 2.11:0.965:0.971 0/0/0/1:4:194,48:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,137:0.50: 1.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,233:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,80:0.71:-1.94:1.000:0.992 0/0/0/1:4:192,44:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,186:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,105:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,30:0.47:-2.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:134,84:0.42: 0.03:1.000:0.923 0/0/1/1:4:95,66:0.45:-1.07:1.000:0.975 0/0/0/1:4:177,39:0.23:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,146:0.51: 1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,84:0.43:-0.03:1.000:0.940 0/0/0/1:4:191,46:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,31:0.23:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,20:0.46:-3.28:1.000:0.988 0/0/0/1:4:69,25:0.31:-2.37:1.000:0.975 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:125,76:0.42:-0.30:1.000:0.894 1/1/1/1/1/1:6:0,280:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,97:0.46: 0.20:1.000:0.989 0/1/1/1:4:51,153:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,50:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,130:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,121:0.52: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,163:0.57: 1.61:1.000:0.940 0/0/1/1:4:89,83:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,132:0.47: 1.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,104:0.48: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:176,118:0.44: 1.50:0.999:0.963 0/0/0/1:4:26,3:0.15:-3.63:1.000:0.992 0/0/1/1:4:134,105:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,70:0.52:-1.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:99,89:0.51:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,225:0.77: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,101:0.45: 0.47:1.000:0.984 0/0/1/1:4:141,153:0.55: 1.50:1.000:0.979 0/0/0/1:4:186,39:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,145:0.70:-0.05:1.000:0.985 0/1/1/1:4:71,157:0.71: 0.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:71,166:0.72: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,154:0.78:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,191:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,250:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,62:0.28: 0.80:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,193:0.77: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,108:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,106:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,170:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,80:0.53:-1.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:183,61:0.29: 0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:134,90:0.44: 0.14:0.986:0.964 0/0/1/1:4:111,106:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,117:0.46: 1.19:1.000:0.985 0/1/1/1:4:49,93:0.68:-1.44:0.999:0.948 0/0/0/1:4:193,45:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,168:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,148:0.80:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,130:0.76:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,150:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,121:0.56: 0.22:1.000:0.967 0/0/1/1:4:88,125:0.61:-0.07:1.000:0.651 0/0/1/1:4:133,132:0.53: 0.93:1.000:0.992 0/1/1/1:4:56,136:0.73:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,130:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,134:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:199,54:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,93:0.53:-0.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:138,143:0.54: 1.24:1.000:0.988 0/0/1/1:4:90,106:0.57:-0.40:1.000:0.947 0/0/1/1:4:107,93:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,116:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,103:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,149:0.80:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,73:0.31: 1.05:1.000:0.970 0/0/1/1:4:158,116:0.46: 1.11:1.000:0.987 0/1/1/1:4:55,138:0.73:-0.46:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,182:0.75: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,101:0.45: 0.47:1.000:0.984 0/1/1/1:4:69,145:0.70:-0.05:1.000:0.985 0/1/1/1:4:53,135:0.74:-0.55:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,245:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,187:0.77: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,121:0.76:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,189:0.79: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,130:0.76:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,63:0.28: 0.90:1.000:0.994 0/1/1/1:4:90,137:0.63: 0.20:0.998:0.554 1/1/1/1:4:0,202:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,134:0.72:-0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,91:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,133:0.46: 1.84:1.000:0.988 0/0/1/1:4:135,111:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:168,66:0.32: 0.34:1.000:0.942 0/1/1/1:4:80,178:0.71: 0.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:117,114:0.53: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,133:0.55: 0.76:1.000:0.980 0/1/1/1:4:34,115:0.79:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,212:0.78: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,103:0.72:-1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,92:0.57:-0.88:1.000:0.953 0/0/1/1:4:113,102:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,172:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,122:0.47: 1.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,160:0.76:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,141:0.55: 1.11:1.000:0.984 0/1/1/1:4:63,132:0.70:-0.42:1.000:0.984 0/1/1/1:4:70,181:0.74: 0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,195:0.80: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,117:0.55: 0.14:1.000:0.977 0/0/1/1:4:95,92:0.52:-0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,126:0.78:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,127:0.77:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,153:0.73:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,144:0.56: 1.09:1.000:0.971 0/0/0/1:4:125,27:0.22:-1.25:0.999:1.000 0/1/1/1:4:69,204:0.77: 1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,193:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,111:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,90:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,117:0.57: 0.03:1.000:0.956 0/1/1/1:4:68,141:0.70:-0.15:1.000:0.982 0/0/1/1:4:107,114:0.55: 0.08:1.000:0.983 0/1/1/1:4:76,161:0.70: 0.39:1.000:0.986 0/1/1/1:4:67,123:0.67:-0.51:1.000:0.924 0/1/1/1:4:53,149:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,113:0.70:-0.96:1.000:0.984 0/0/0/1:4:256,64:0.25: 2.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,204:0.75: 1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,158:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:201,63:0.28: 0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:145,111:0.47: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:127,102:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:139,117:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,141:0.73:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,22:0.31:-2.62:1.000:0.967 0/1/1/1:4:53,137:0.74:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,105:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,118:0.52: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,194:0.72: 1.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,52:0.27: 0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,128:0.73:-0.71:0.947:0.998 0/0/1/1:4:168,91:0.39: 0.82:1.000:0.691 0/1/1/1:4:54,127:0.72:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,152:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:164,55:0.29: 0.05:1.000:0.989 0/1/1/1:4:76,163:0.70: 0.43:1.000:0.988 0/0/1/1:4:75,46:0.42:-1.85:1.000:0.903 0/0/1/1:4:115,87:0.47:-0.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:86,75:0.50:-1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,61:0.47:-1.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:129,82:0.43:-0.11:1.000:0.934 0/0/1/1:4:110,90:0.48:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,135:0.71:-0.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:85,82:0.52:-0.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,174:0.79: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,110:0.68:-0.96:1.000:0.957 0/0/1/1:4:81,106:0.59:-0.57:1.000:0.834 0/0/1/1:4:104,105:0.53:-0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:133,100:0.46: 0.32:1.000:0.990 0/1/1/1:4:86,157:0.67: 0.51:1.000:0.919 0/0/1/1:4:109,90:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,110:0.69:-1.02:1.000:0.977 0/0/1/1:4:141,89:0.42: 0.26:1.000:0.928 0/0/1/1:4:133,113:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,59:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,118:0.78:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,118:0.49: 0.84:1.000:0.996 -chr6.1 79199038 chr6.1_079199038 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:546,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:400,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:620,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:750,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.08:1.000:. ./.:5:251,0:.:-0.60:0.965:. ./.:4:251,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:814,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.52:1.000:. ./.:3:18,0:.:-1.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:739,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:923,0:.: 2.93:1.000:. ./.:4:237,3:.:-0.66:1.000:. ./.:4:601,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.52:0.999:. ./.:4:209,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:954,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:587,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:577,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.66:1.000:. ./.:6:557,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:720,0:.: 1.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:311,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:526,2:.: 0.86:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:259,0:.:-0.56:0.986:. ./.:4:225,0:.:-0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:437,0:.: 0.38:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:712,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:590,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:435,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:277,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:581,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:251,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:672,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:590,2:.: 1.19:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:571,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.04:0.998:. ./.:4:413,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:258,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:555,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:234,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:718,0:.: 1.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:240,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:199,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:948,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:446,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:521,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:212,0:.:-0.80:0.947:. ./.:4:513,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:222,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:193,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:742,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:190,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:655,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.65:1.000:. -chr6.1 79588662 chr6.1_079588662 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:249,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,171:.: 0.49:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:230,147:.: 1.51:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:178,133:.: 0.67:1.000:. ./.:4:195,171:.: 1.37:1.000:. ./.:4:26,82:.:-1.90:1.000:. ./.:4:45,1:.:-2.68:1.000:. ./.:4:211,144:.: 1.23:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:193,155:.: 1.14:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.35:1.000:. ./.:5:311,0:.: 0.67:0.965:. ./.:4:207,119:.: 0.86:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:200,136:.: 0.99:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:20,34:.:-2.58:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:168,175:.: 1.08:1.000:. ./.:4:229,146:.: 1.48:1.000:. ./.:4:199,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:252,185:.: 2.27:1.000:. ./.:4:190,148:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:78,56:.:-1.57:1.000:. ./.:3:34,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:148,151:.: 0.52:1.000:. ./.:6:263,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:155,165:.: 0.78:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:210,145:.: 1.23:1.000:. ./.:4:196,122:.: 0.76:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:123,127:.:-0.10:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:126,167:.: 0.44:1.000:. ./.:4:151,99:.:-0.10:1.000:. ./.:4:123,127:.:-0.10:1.000:. ./.:4:88,101:.:-0.87:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:153,104:.:-0.01:1.000:. ./.:4:232,143:.: 1.48:1.000:. ./.:4:182,124:.: 0.61:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.35:1.000:. ./.:6:197,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:124,140:.: 0.08:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,143:.: 0.27:1.000:. ./.:4:186,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:149,147:.: 0.48:1.000:. ./.:4:145,122:.: 0.11:0.986:. ./.:4:164,99:.: 0.06:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.42:0.999:. ./.:4:139,292:.: 2.19:1.000:. ./.:4:192,151:.: 1.08:1.000:. ./.:4:200,131:.: 0.92:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:128,141:.: 0.14:1.000:. ./.:4:128,168:.: 0.48:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:116,152:.: 0.13:1.000:. ./.:4:223,164:.: 1.63:1.000:. ./.:4:169,103:.: 0.18:1.000:. ./.:4:207,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:209,144:.: 1.20:1.000:. ./.:4:144,97:.:-0.21:1.000:. ./.:4:82,109:.:-0.85:1.000:. ./.:4:182,116:.: 0.51:1.000:. ./.:4:199,152:.: 1.18:1.000:. ./.:4:149,136:.: 0.34:1.000:. ./.:4:145,127:.: 0.18:1.000:. ./.:4:210,152:.: 1.32:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:155,158:.: 0.70:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:115,99:.:-0.56:1.000:. ./.:4:148,147:.: 0.47:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:197,141:.: 1.01:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.49:0.998:. ./.:4:178,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:110,123:.:-0.32:1.000:. ./.:4:214,164:.: 1.52:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:121,148:.: 0.14:1.000:. ./.:4:161,122:.: 0.32:1.000:. ./.:4:253,203:.: 2.51:1.000:. ./.:4:188,116:.: 0.58:1.000:. ./.:4:213,141:.: 1.22:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:99,102:.:-0.72:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:125,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:128,147:.: 0.22:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:183,132:.: 0.72:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:118,112:.:-0.35:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:118,100:.:-0.51:0.999:. ./.:4:170,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:120,115:.:-0.29:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,96:.:-0.53:1.000:. ./.:4:148,165:.: 0.70:1.000:. ./.:4:225,138:.: 1.33:1.000:. ./.:4:230,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:194,144:.: 1.01:1.000:. ./.:4:162,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:238,167:.: 1.86:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:46,36:.:-2.23:1.000:. ./.:4:154,2:.:-1.29:1.000:. ./.:4:145,177:.: 0.81:1.000:. ./.:4:186,126:.: 0.68:1.000:. ./.:4:166,177:.: 1.08:1.000:. ./.:4:157,153:.: 0.66:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.61:0.947:. ./.:4:331,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:129,114:.:-0.19:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:67,151:.:-0.51:1.000:. ./.:4:152,156:.: 0.63:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:130,127:.:-0.01:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:122,143:.: 0.09:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:204,161:.: 1.35:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:203,142:.: 1.10:1.000:. ./.:4:183,198:.: 1.56:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:207,161:.: 1.39:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:199,207:.: 1.87:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:181,151:.: 0.94:1.000:. -chr6.1 79624970 chr6.1_079624970 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:192,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.91:1.000:. ./.:5:160,0:.: 0.83:0.965:. ./.:4:114,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:222,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:272,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.96:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.45:1.000:. ./.:6:221,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.11:0.999:. ./.:4:80,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.66:1.000:. ./.:6:146,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.08:0.986:. ./.:4:133,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:86,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.31:0.998:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.21:0.999:. ./.:4:90,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.28:0.947:. ./.:4:149,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.72:1.000:. -chr6.1 79982386 chr6.1_079982386 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.22:1.000:. ./.:5:77,0:.: 0.84:0.965:. ./.:4:68,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.60:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.13:1.000:. ./.:6:100,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:112,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.38:1.000:. ./.:6:73,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.60:0.986:. ./.:4:27,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.55:0.999:. ./.:4:64,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:108,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.84:0.998:. ./.:4:82,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:49,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.59:0.947:. ./.:4:52,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.72:1.000:. -chr6.1 80096025 chr6.1_080096025 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:261,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:212,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.94:1.000:. ./.:5:273,0:.: 1.84:0.965:. ./.:4:179,61:.: 1.24:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:258,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.59:1.000:. ./.:3:13,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:189,1:.: 0.34:1.000:. ./.:6:226,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.62:0.999:. ./.:4:66,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:209,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.36:1.000:. ./.:6:111,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.88:0.986:. ./.:4:193,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:139,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.63:0.998:. ./.:4:163,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:278,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:179,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:165,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:164,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:286,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.52:0.947:. ./.:4:200,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:247,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.04:1.000:. -chr7.1 174886 chr7.1_000174886 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:12,33:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.61:1.000:. ./.:4:11,28:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.08:1.000:. ./.:4:8,41:.: 1.23:1.000:. ./.:4:9,20:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.05:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.43:1.000:. ./.:4:12,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:1,11:.:-2.01:1.000:. ./.:4:1,5:.:-2.54:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.96:1.000:. ./.:4:5,18:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,21:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:8,27:.: 0.00:1.000:. ./.:4:19,24:.: 0.71:0.803:. ./.:4:23,16:.: 0.35:1.000:. ./.:4:9,38:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1,44:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.45:1.000:. ./.:4:9,28:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,29:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,27:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.63:1.000:. ./.:4:10,39:.: 1.23:1.000:. ./.:4:6,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,25:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,32:.: 0.79:1.000:. ./.:4:14,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:13,41:.: 1.67:1.000:. ./.:4:14,35:.: 1.23:1.000:. ./.:4:2,2:.:-2.71:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.45:1.000:. ./.:3:1,1:.:-2.89:1.000:. ./.:4:6,25:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.08:1.000:. ./.:4:13,38:.: 1.41:1.000:. ./.:4:16,28:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,41:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.43:1.000:. ./.:4:13,34:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1,36:.: 0.18:1.000:. ./.:4:6,33:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,53:.: 1.58:1.000:. ./.:4:10,41:.: 1.41:0.997:. ./.:4:1,2:.:-2.80:1.000:. ./.:4:8,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:11,25:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,60:.: 2.28:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.62:1.000:. ./.:4:19,23:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.61:1.000:. ./.:4:1,47:.: 1.14:1.000:. ./.:4:12,37:.: 1.23:1.000:. ./.:6:2,21:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1,44:.: 0.88:1.000:. ./.:4:8,34:.: 0.62:1.000:. ./.:4:15,29:.: 0.79:1.000:. ./.:4:16,41:.: 1.93:1.000:. ./.:4:15,30:.: 0.88:1.000:. ./.:4:12,40:.: 1.49:1.000:. ./.:4:2,24:.:-0.79:1.000:. ./.:4:18,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:11,35:.: 0.97:0.974:. ./.:4:0,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:10,36:.: 0.97:1.000:. ./.:4:3,10:.:-1.93:0.999:. ./.:4:0,45:.: 0.88:1.000:. ./.:4:9,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,23:.: 0.18:1.000:. ./.:4:13,20:.:-0.17:1.000:. ./.:4:9,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:18,40:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:1,39:.: 0.44:0.999:. ./.:4:10,30:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:4,20:.:-0.96:1.000:. ./.:4:12,23:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,41:.: 0.62:1.000:. ./.:4:2,19:.:-1.22:1.000:. ./.:4:5,19:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,19:.:-0.43:1.000:. ./.:4:4,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:11,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:11,21:.:-0.26:1.000:. ./.:4:13,27:.: 0.44:1.000:. ./.:4:14,20:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,50:.: 1.32:1.000:. ./.:4:14,29:.: 0.71:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:6,22:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.57:1.000:. ./.:4:19,30:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,21:.: 0.09:0.981:. ./.:4:16,25:.: 0.53:1.000:. ./.:4:14,27:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.08:1.000:. ./.:4:8,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:9,24:.:-0.17:1.000:. ./.:4:10,28:.: 0.27:1.000:. ./.:4:3,21:.:-0.96:1.000:. ./.:4:10,31:.: 0.53:1.000:. ./.:4:11,25:.: 0.09:0.999:. ./.:4:35,24:.: 2.11:1.000:. ./.:4:12,4:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.62:1.000:. ./.:4:4,16:.:-1.31:1.000:. ./.:4:6,30:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,21:.:-0.26:1.000:. ./.:4:11,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:6,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:22,19:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.97:1.000:. ./.:4:11,33:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,38:.: 0.35:1.000:. ./.:4:12,25:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,34:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,19:.:-0.70:1.000:. ./.:4:13,29:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:21,30:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.14:1.000:. ./.:4:10,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,31:.: 2.28:1.000:. ./.:4:13,36:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:9,30:.: 0.35:1.000:. ./.:4:13,23:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,18:.:-0.43:1.000:. ./.:4:14,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:4,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,36:.: 0.18:1.000:. ./.:4:20,19:.: 0.35:1.000:. ./.:4:7,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.08:1.000:. ./.:4:12,34:.: 0.97:1.000:. ./.:4:10,36:.: 0.97:1.000:. ./.:4:13,28:.: 0.53:1.000:. ./.:4:3,3:.:-2.54:1.000:. ./.:4:12,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:23,25:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,50:.: 1.32:1.000:. ./.:4:16,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:6,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1,33:.:-0.08:1.000:. ./.:4:11,9:.:-1.31:1.000:. ./.:4:16,27:.: 0.71:1.000:. ./.:4:6,30:.: 0.09:1.000:. ./.:4:9,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,20:.:-0.87:1.000:. ./.:4:6,16:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1,36:.: 0.18:0.999:. ./.:4:1,21:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,29:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,10:.:-1.49:1.000:. ./.:4:9,17:.:-0.79:1.000:. ./.:4:8,32:.: 0.44:1.000:. ./.:4:8,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:11,29:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.88:1.000:. ./.:4:11,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:12,26:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.61:1.000:. ./.:4:19,19:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.70:1.000:. ./.:4:4,18:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.96:1.000:. -chr7.1 352052 chr7.1_000352052 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:32,152:0.80: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,44:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,49:0.25: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,33:0.28:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,103:0.55: 0.52:1.000:0.983 0/0/1/1:4:70,108:0.57: 0.59:1.000:0.957 0/0/1/1:4:56,65:0.49:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,74:0.49:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-3.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,9:0.20:-2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,123:0.60: 0.91:1.000:0.787 0/0/1/1:4:50,85:0.59:-0.41:1.000:0.869 0/0/0/1:4:104,56:0.33: 0.17:1.000:0.926 0/0/0/1:4:100,40:0.27:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,58:0.34: 0.19:1.000:0.882 0/1/1/1:4:37,171:0.79: 1.28:0.803:1.000 0/0/0/1:4:103,54:0.32: 0.10:1.000:0.944 0/1/1/1:4:42,186:0.78: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,130:0.54: 1.65:1.000:0.988 0/1/1/1:4:4,12:0.71:-3.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,95:0.46: 0.87:1.000:0.989 0/0/0/1:4:116,57:0.31: 0.47:1.000:0.973 0/0/0/1:4:113,49:0.29: 0.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,10:0.26:-2.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,98:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,128:0.73: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,99:0.57: 0.22:1.000:0.946 0/0/1/1:4:72,96:0.53: 0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:110,129:0.50: 2.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,81:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,41:0.30:-0.50:1.000:0.988 0/0/0/1:4:4,2:0.31:-3.41:1.000:0.967 0/1/1/1:4:5,32:0.84:-2.69:1.000:0.994 0/0/1:3:2,1:0.31:-3.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,163:0.80: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,33:0.21:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,113:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,92:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:147,52:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,87:0.45: 0.59:1.000:0.982 0/0/1/1:4:75,94:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,109:0.56: 0.63:1.000:0.959 0/0/0/1:4:107,40:0.26:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,114:0.58: 0.73:1.000:0.919 0/0/1/1:4:57,77:0.53:-0.44:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,261:1.00: 2.51:0.997:1.000 0/0/1/1:4:30,30:0.46:-2.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:53,88:0.58:-0.27:1.000:0.899 0/0/1/1:4:36,61:0.59:-1.29:1.000:0.874 0/0/1/1:4:79,74:0.45: 0.01:1.000:0.977 0/0/1/1:4:69,98:0.55: 0.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:62,82:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:77,71:0.44:-0.11:1.000:0.973 0/0/0/1:4:91,42:0.30:-0.46:1.000:0.986 0/0/0/1:4:100,40:0.27:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,95:0.60:-0.11:1.000:0.776 0/0/1/1:4:68,93:0.54: 0.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,89:0.48: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:58,60:0.47:-0.81:1.000:0.836 0/0/1/1:4:71,88:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,100:0.71:-0.44:1.000:0.991 0/1/1/1:4:48,174:0.75: 1.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,69:0.46:-0.32:1.000:0.987 0/0/1/1:4:87,130:0.56: 1.49:1.000:0.971 0/0/1/1:4:64,84:0.53:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,38:0.29:-0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:66,96:0.55: 0.22:1.000:0.979 0/1/1/1:4:26,129:0.80: 0.05:0.974:1.000 0/0/1/1:4:59,77:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,137:0.74: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,35:0.32:-1.13:0.999:0.961 0/0/1/1:4:76,86:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,140:0.71: 0.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:57,91:0.57:-0.11:1.000:0.935 0/0/0/1:4:75,46:0.36:-0.74:1.000:0.738 0/0/1/1:4:68,91:0.53: 0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:99,38:0.26:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,55:0.31: 0.33:1.000:0.973 0/1/1/1:4:40,145:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,129:0.80: 0.08:0.999:1.000 0/0/1/1:4:69,96:0.54: 0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:60,108:0.60: 0.35:1.000:0.767 0/0/0/1:4:87,36:0.28:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,77:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,106:0.56: 0.52:1.000:0.959 0/0/1/1:4:61,87:0.55:-0.11:1.000:0.983 0/0/1/1:4:43,50:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,73:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,70:0.50:-0.57:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,83:0.56:-0.34:1.000:0.967 0/0/1/1:4:78,101:0.52: 0.61:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,85:0.81:-1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,206:0.84: 2.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,86:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,72:0.56:-0.76:1.000:0.969 0/0/0/1:4:80,35:0.29:-0.88:1.000:0.993 0/0/0/1:4:122,50:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,143:0.78: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,94:0.72:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,116:0.72: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,58:0.54:-1.25:1.000:0.985 0/0/0/1:4:133,39:0.22: 0.45:0.981:1.000 0/0/1/1:4:62,61:0.46:-0.69:1.000:0.987 0/0/1/1:4:60,96:0.57: 0.08:1.000:0.934 0/0/0/1:4:83,35:0.28:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,92:0.47: 0.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:130,61:0.30: 0.89:1.000:0.984 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,40:0.29:-0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:52,171:0.73: 1.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,77:0.45: 0.15:0.999:0.978 0/0/1/1:4:78,125:0.57: 1.17:1.000:0.933 0/1/1/1:4:28,56:0.63:-1.60:1.000:0.525 0/0/1/1:4:61,91:0.56:-0.02:1.000:0.971 0/0/0/1:4:94,46:0.31:-0.30:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,47:0.32:-0.32:1.000:0.958 0/0/1/1:4:47,65:0.54:-0.95:1.000:0.988 0/1/1/1:4:34,127:0.75: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,76:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,96:0.54: 0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:70,89:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,77:0.56:-0.55:1.000:0.974 0/1/1/1:4:40,128:0.72: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,95:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,41:0.35:-0.99:1.000:0.802 0/0/1/1:4:59,66:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,109:0.83:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,67:0.51:-0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,100:0.48: 0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:55,59:0.48:-0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:70,69:0.46:-0.32:1.000:0.987 0/1/1/1:4:43,110:0.68: 0.01:1.000:0.956 0/1/1/1:4:47,162:0.74: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,88:0.52: 0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:91,39:0.28:-0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,81:0.56:-0.41:1.000:0.969 0/1/1/1:4:25,132:0.81: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,71:0.46:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:45,78:0.59:-0.69:1.000:0.840 0/0/1/1:4:80,90:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,69:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,100:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,103:0.54: 0.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:73,108:0.56: 0.66:1.000:0.974 0/0/0/1:4:86,44:0.32:-0.53:1.000:0.957 0/0/1/1:4:63,87:0.54:-0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,82:0.52:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,122:0.48: 1.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,108:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,20:0.77:-2.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,89:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,76:0.46:-0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:74,84:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,122:0.50: 1.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,107:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,96:0.53: 0.38:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,153:0.81: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,92:0.53: 0.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:93,35:0.26:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,88:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,118:0.56: 1.03:1.000:0.971 0/0/1/1:4:42,72:0.59:-0.90:1.000:0.857 0/0/0/1:4:118,46:0.27: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:120,45:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,98:0.51: 0.59:0.999:0.996 0/0/1/1:4:80,79:0.46: 0.15:1.000:0.987 0/0/0/1:4:119,52:0.29: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:81,69:0.43:-0.06:1.000:0.937 0/0/1/1:4:58,64:0.48:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,128:0.74: 0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,106:0.78:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,48:0.29: 0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:114,130:0.49: 2.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,125:0.56: 1.26:1.000:0.963 0/0/1/1:4:65,95:0.55: 0.17:1.000:0.977 0/1/1/1:4:44,131:0.71: 0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:94,117:0.51: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:132,59:0.29: 0.89:1.000:0.991 0/1/1/1:4:57,202:0.74: 2.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,69:0.45:-0.25:1.000:0.979 0/0/1/1:4:56,81:0.55:-0.37:1.000:0.980 -chr7.1 632834 chr7.1_000632834 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:83,6:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/0:4:167,3:0.06: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,6:0.12: 0.62:1.000:0.659 0/0/0/1:4:90,10:0.26:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:186,6:0.11: 0.65:1.000:0.625 0/0/0/0:4:171,4:0.08: 0.40:1.000:0.979 0/0/0/1:4:43,3:0.24:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:233,6:0.09: 1.33:1.000:0.927 0/0/0/0:4:218,3:0.05: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,17:0.34:-1.24:1.000:0.855 0/0/0/1:4:71,9:0.27:-0.99:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,8:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:144,2:0.05:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,1:0.03:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,3:0.06: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:241,3:0.05: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,6:0.10: 0.94:0.803:0.706 0/0/0/0:4:300,3:0.04: 2.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,10:0.28:-1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,9:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,7:0.24:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,10:0.29:-1.21:1.000:0.992 0/0/0/0:4:247,5:0.07: 1.52:1.000:0.997 0/0/0/0:4:138,1:0.03:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.50:-1.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:179,5:0.10: 0.53:1.000:0.809 0/0/0/0:4:195,2:0.04: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,4:0.22:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,8:0.14: 0.91:1.000:0.966 0/0/0/0:4:184,5:0.10: 0.60:1.000:0.860 0/0/0/1:4:185,6:0.12: 0.63:1.000:0.642 0/0/0/0:4:174,2:0.04: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,9:0.39:-1.81:1.000:0.694 0/0/0/1:4:64,12:0.29:-1.05:1.000:0.991 0/0/1:3:41,3:0.25:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,2:0.05: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:243,4:0.06: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,9:0.27:-0.98:1.000:0.998 0/0/0/1:4:177,18:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,8:0.19: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,13:0.29:-0.99:1.000:0.990 0/0/0/1:4:85,23:0.32:-0.58:1.000:0.963 0/0/0/1:4:248,11:0.16: 1.63:1.000:0.993 0/0/0/1:4:133,12:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,7:0.13: 0.74:1.000:0.906 0/0/0/1:4:75,26:0.34:-0.68:1.000:0.890 0/0/0/1:4:69,6:0.26:-1.06:0.997:0.999 0/0/0/1:4:89,12:0.27:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,18:0.27: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,17:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,8:0.27:-1.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:93,12:0.27:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,18:0.31:-0.81:1.000:0.976 0/0/0/0:4:229,5:0.08: 1.26:1.000:0.991 0/0/0/0:4:168,2:0.04: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,13:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,17:0.30:-0.73:1.000:0.987 0/0/0/1:4:72,35:0.37:-0.60:1.000:0.585 0/0/0/1:4:144,27:0.29: 0.34:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:84,21:0.31:-0.62:1.000:0.900 0/0/0/1:4:68,22:0.33:-0.84:1.000:0.919 0/0/0/1:4:80,23:0.32:-0.65:1.000:0.951 0/0/0/1:4:72,33:0.36:-0.62:1.000:0.659 0/0/0/1:4:128,14:0.26:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:200,13:0.22: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,27:0.34:-0.62:1.000:0.891 0/0/0/0:4:97,3:0.11:-0.70:1.000:0.516 0/0/0/0:4:223,4:0.06: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,23:0.32:-0.58:0.974:0.963 0/0/0/1:4:132,5:0.13:-0.16:1.000:0.939 0/0/0/1:4:167,25:0.28: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,14:0.26: 0.06:0.999:0.999 0/0/0/1:4:169,24:0.28: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:178,8:0.16: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/1:4:155,11:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,11:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,7:0.17:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:159,15:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:254,7:0.10: 1.66:1.000:0.836 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,22:0.32:-0.74:0.999:0.947 0/0/0/1:4:154,13:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,26:0.32:-0.39:1.000:0.961 0/0/0/1:4:141,8:0.20: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,13:0.19: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,22:0.33:-0.81:1.000:0.928 0/0/0/1:4:98,10:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,13:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,7:0.12: 0.94:1.000:0.785 0/0/0/1:4:179,6:0.12: 0.55:1.000:0.738 0/0/0/1:4:67,21:0.33:-0.87:1.000:0.929 0/0/0/1:4:77,11:0.28:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:248,12:0.17: 1.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:73,5:0.24:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,25:0.28: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:169,7:0.15: 0.41:1.000:0.982 0/0/0/1:4:144,7:0.17: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:229,8:0.12: 1.31:1.000:0.833 0/0/0/1:4:147,7:0.17: 0.09:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,20:0.27: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,9:0.30:-1.44:1.000:0.983 0/0/0/0:4:357,0:0.00: 3.06:0.981:1.000 0/0/0/1:4:152,8:0.18: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,11:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,12:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:158,2:0.05: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:296,2:0.02: 2.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,2:0.03: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,12:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,12:0.26:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:133,12:0.26:-0.04:0.999:0.999 0/0/0/0:4:317,4:0.05: 2.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:273,1:0.01: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,18:0.30:-0.67:1.000:0.986 0/0/0/1:4:99,12:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,28:0.36:-0.81:1.000:0.712 0/0/0/1:4:191,14:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,24:0.28: 0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:83,11:0.27:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/0:4:183,3:0.06: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,20:0.30:-0.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:90,12:0.27:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,16:0.30:-0.84:1.000:0.985 0/0/0/1:4:171,8:0.16: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,16:0.31:-0.99:1.000:0.973 0/0/0/1:4:186,10:0.19: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,7:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,14:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,23:0.35:-0.98:1.000:0.805 0/0/0/1:4:143,5:0.12: 0.00:1.000:0.835 0/0/0/1:4:44,16:0.34:-1.28:1.000:0.865 0/0/0/0:4:234,5:0.08: 1.33:1.000:0.993 0/0/0/0:4:173,2:0.04: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:283,4:0.05: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,9:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,18:0.33:-1.03:1.000:0.937 0/0/0/1:4:52,26:0.37:-1.02:1.000:0.548 0/0/0/1:4:177,16:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,8:0.16: 0.60:1.000:0.993 0/0/0/0:4:149,4:0.10: 0.08:1.000:0.879 0/0/0/1:4:127,13:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,7:0.26:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,13:0.27:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,4:0.09: 0.34:1.000:0.971 0/0/0/1:4:79,9:0.27:-0.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:141,6:0.15:-0.01:1.000:0.987 0/0/0/0:4:162,2:0.04: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:266,2:0.03: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,10:0.30:-1.30:1.000:0.988 0/0/0/1:4:120,6:0.17:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:257,6:0.08: 1.69:1.000:0.979 0/0/0/1:4:81,8:0.26:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,8:0.26:-0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:220,3:0.05: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:226,1:0.02: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,4:0.09: 0.14:1.000:0.912 0/0/0/1:4:61,6:0.26:-1.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,8:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,3:0.07: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:199,1:0.02: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,7:0.19:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,3:0.08:-0.16:0.999:0.988 0/0/0/1:4:77,7:0.26:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/0:4:164,1:0.02: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,4:0.10:-0.11:1.000:0.678 0/0/0/0:4:189,2:0.04: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,14:0.29:-0.90:1.000:0.990 0/0/0/1:4:73,6:0.25:-1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,13:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,7:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,12:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,13:0.28:-0.80:1.000:0.995 0/0/0/0:4:175,3:0.06: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,7:0.18:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,6:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/0:4:438,1:0.01: 4.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,7:0.15: 0.41:1.000:0.982 -chr7.1 683234 chr7.1_000683234 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:182,219:.: 0.64:1.000:. ./.:4:165,150:.:-0.21:1.000:. ./.:4:221,150:.: 0.34:1.000:. ./.:4:184,106:.:-0.46:1.000:. ./.:4:262,264:.: 1.88:1.000:. ./.:4:212,53:.:-0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:189,129:.:-0.18:1.000:. ./.:4:199,152:.: 0.14:1.000:. ./.:4:37,52:.:-2.45:1.000:. ./.:4:39,73:.:-2.23:1.000:. ./.:4:178,54:.:-1.04:1.000:. ./.:4:240,120:.: 0.23:1.000:. ./.:4:193,112:.:-0.31:1.000:. ./.:4:192,244:.: 0.99:1.000:. ./.:4:188,188:.: 0.39:1.000:. ./.:4:253,221:.: 1.36:0.803:. ./.:4:237,102:.: 0.03:1.000:. ./.:4:278,132:.: 0.73:1.000:. ./.:4:227,261:.: 1.50:1.000:. ./.:4:40,72:.:-2.23:1.000:. ./.:4:211,175:.: 0.49:1.000:. ./.:4:257,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:188,186:.: 0.37:1.000:. ./.:4:24,48:.:-2.62:1.000:. ./.:4:254,275:.: 1.91:1.000:. ./.:4:210,240:.: 1.13:1.000:. ./.:4:185,121:.:-0.30:1.000:. ./.:4:276,228:.: 1.66:1.000:. ./.:4:223,307:.: 1.92:1.000:. ./.:4:220,155:.: 0.38:1.000:. ./.:4:186,36:.:-1.13:1.000:. ./.:4:36,27:.:-2.71:1.000:. ./.:4:45,25:.:-2.64:1.000:. ./.:3:24,7:.:-3.03:1.000:. ./.:4:196,216:.: 0.75:1.000:. ./.:4:220,242:.: 1.25:1.000:. ./.:4:206,150:.: 0.19:1.000:. ./.:4:192,201:.: 0.56:1.000:. ./.:4:221,260:.: 1.43:1.000:. ./.:4:220,104:.:-0.12:1.000:. ./.:4:204,154:.: 0.21:1.000:. ./.:4:247,287:.: 1.96:1.000:. ./.:4:204,49:.:-0.83:1.000:. ./.:4:207,242:.: 1.12:1.000:. ./.:4:202,106:.:-0.28:1.000:. ./.:4:250,110:.: 0.23:0.997:. ./.:4:56,102:.:-1.77:1.000:. ./.:4:203,124:.:-0.09:1.000:. ./.:4:112,93:.:-1.30:1.000:. ./.:4:172,193:.: 0.28:1.000:. ./.:4:251,194:.: 1.08:1.000:. ./.:4:209,243:.: 1.15:1.000:. ./.:4:239,60:.:-0.37:1.000:. ./.:4:197,154:.: 0.14:1.000:. ./.:4:233,166:.: 0.62:1.000:. ./.:4:220,125:.: 0.08:1.000:. ./.:4:237,191:.: 0.91:1.000:. ./.:4:179,172:.: 0.14:1.000:. ./.:6:191,67:.:-0.78:1.000:. ./.:4:221,63:.:-0.52:1.000:. ./.:4:175,111:.:-0.50:1.000:. ./.:4:233,130:.: 0.26:1.000:. ./.:4:233,188:.: 0.84:1.000:. ./.:4:256,170:.: 0.89:1.000:. ./.:4:207,161:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,127:.:-0.54:1.000:. ./.:4:219,60:.:-0.57:1.000:. ./.:4:214,128:.: 0.06:0.974:. ./.:4:156,116:.:-0.64:1.000:. ./.:4:237,174:.: 0.74:1.000:. ./.:4:160,42:.:-1.33:0.999:. ./.:4:273,189:.: 1.25:1.000:. ./.:4:214,159:.: 0.36:1.000:. ./.:4:177,54:.:-1.05:1.000:. ./.:4:234,124:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,61:.:-0.93:1.000:. ./.:4:189,120:.:-0.27:1.000:. ./.:4:225,66:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,177:.: 0.57:1.000:. ./.:4:173,140:.:-0.23:0.999:. ./.:4:203,88:.:-0.45:1.000:. ./.:4:258,127:.: 0.48:1.000:. ./.:4:191,34:.:-1.11:1.000:. ./.:4:148,202:.: 0.13:1.000:. ./.:4:207,61:.:-0.68:1.000:. ./.:4:173,98:.:-0.65:1.000:. ./.:4:167,215:.: 0.45:1.000:. ./.:4:183,252:.: 0.98:1.000:. ./.:4:200,278:.: 1.40:1.000:. ./.:4:190,110:.:-0.36:1.000:. ./.:4:195,313:.: 1.70:1.000:. ./.:4:257,210:.: 1.29:1.000:. ./.:4:116,113:.:-1.07:1.000:. ./.:4:284,285:.: 2.31:1.000:. ./.:4:180,232:.: 0.75:1.000:. ./.:4:152,190:.: 0.06:1.000:. ./.:4:138,111:.:-0.87:1.000:. ./.:4:205,308:.: 1.75:1.000:. ./.:4:213,220:.: 0.96:1.000:. ./.:4:177,231:.: 0.71:1.000:. ./.:4:200,232:.: 0.95:1.000:. ./.:4:143,81:.:-1.12:1.000:. ./.:4:272,283:.: 2.17:0.981:. ./.:4:173,113:.:-0.50:1.000:. ./.:4:198,61:.:-0.77:1.000:. ./.:4:187,105:.:-0.44:1.000:. ./.:4:187,176:.: 0.26:1.000:. ./.:4:269,125:.: 0.57:1.000:. ./.:4:181,198:.: 0.42:1.000:. ./.:4:174,1:.:-1.60:1.000:. ./.:4:240,212:.: 1.15:1.000:. ./.:4:185,152:.: 0.01:0.999:. ./.:4:267,159:.: 0.89:1.000:. ./.:4:132,70:.:-1.33:1.000:. ./.:4:216,116:.:-0.04:1.000:. ./.:4:158,103:.:-0.75:1.000:. ./.:4:186,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:186,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:179,106:.:-0.51:1.000:. ./.:4:211,199:.: 0.73:1.000:. ./.:4:190,183:.: 0.36:1.000:. ./.:4:263,78:.: 0.05:1.000:. ./.:4:235,177:.: 0.75:1.000:. ./.:4:196,41:.:-0.99:1.000:. ./.:4:202,117:.:-0.17:1.000:. ./.:4:207,176:.: 0.46:1.000:. ./.:4:173,59:.:-1.04:1.000:. ./.:4:175,43:.:-1.17:1.000:. ./.:4:150,121:.:-0.65:1.000:. ./.:4:229,194:.: 0.86:1.000:. ./.:4:215,148:.: 0.26:1.000:. ./.:4:154,173:.:-0.09:1.000:. ./.:4:170,154:.:-0.12:1.000:. ./.:4:180,161:.: 0.05:1.000:. ./.:4:234,247:.: 1.43:1.000:. ./.:4:214,89:.:-0.33:1.000:. ./.:4:158,173:.:-0.05:1.000:. ./.:4:200,193:.: 0.56:1.000:. ./.:4:162,127:.:-0.47:1.000:. ./.:4:185,68:.:-0.83:1.000:. ./.:4:161,233:.: 0.57:1.000:. ./.:4:202,95:.:-0.39:1.000:. ./.:4:151,171:.:-0.14:1.000:. ./.:4:264,69:.:-0.03:1.000:. ./.:4:268,148:.: 0.79:1.000:. ./.:4:193,160:.: 0.16:1.000:. ./.:4:177,160:.: 0.01:1.000:. ./.:4:226,191:.: 0.80:1.000:. ./.:4:199,158:.: 0.20:1.000:. ./.:4:232,193:.: 0.88:1.000:. ./.:4:226,138:.: 0.27:1.000:. ./.:4:44,24:.:-2.66:1.000:. ./.:4:192,33:.:-1.11:1.000:. ./.:4:215,220:.: 0.98:1.000:. ./.:4:256,254:.: 1.72:1.000:. ./.:4:257,170:.: 0.90:1.000:. ./.:4:246,105:.: 0.14:1.000:. ./.:4:193,97:.:-0.46:1.000:. ./.:4:233,201:.: 0.97:1.000:. ./.:4:225,181:.: 0.69:1.000:. ./.:4:173,92:.:-0.71:1.000:. ./.:4:204,191:.: 0.58:1.000:. ./.:4:236,48:.:-0.52:1.000:. ./.:4:143,118:.:-0.75:1.000:. ./.:4:181,147:.:-0.08:1.000:. ./.:4:165,86:.:-0.85:1.000:. ./.:4:174,169:.: 0.07:0.999:. ./.:4:176,148:.:-0.12:1.000:. ./.:4:186,93:.:-0.57:1.000:. ./.:4:172,53:.:-1.11:1.000:. ./.:4:175,161:.: 0.00:1.000:. ./.:4:194,247:.: 1.04:1.000:. ./.:4:162,141:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,159:.:-0.28:1.000:. ./.:4:185,35:.:-1.15:1.000:. ./.:4:221,164:.: 0.48:1.000:. ./.:4:219,137:.: 0.19:1.000:. ./.:4:210,112:.:-0.14:1.000:. ./.:4:162,106:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,96:.:-0.34:1.000:. ./.:4:253,71:.:-0.12:1.000:. ./.:4:220,266:.: 1.48:1.000:. ./.:4:146,37:.:-1.52:1.000:. ./.:4:190,95:.:-0.51:1.000:. -chr7.1 824387 chr7.1_000824387 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:31,104:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,28:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,59:0.54:-0.31:1.000:0.988 0/1/1/1:4:34,121:0.76: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,85:0.60: 0.58:1.000:0.774 0/0/1/1:4:74,90:0.53: 1.36:1.000:0.991 0/1/1/1:4:13,63:0.81:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,39:0.28: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:105,37:0.26: 0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,25:0.64:-2.26:1.000:0.668 0/0/0/1:4:35,17:0.32:-1.86:1.000:0.947 0/0/1/1:4:67,70:0.50: 0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,82:0.58: 0.58:1.000:0.912 0/0/1/1:4:62,76:0.53: 0.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:72,65:0.46: 0.58:1.000:0.988 0/0/0/1:4:98,49:0.33: 0.87:1.000:0.927 0/0/1/1:4:70,91:0.55: 1.27:0.803:0.981 0/0/1/1:4:86,78:0.46: 1.36:1.000:0.989 0/1/1/1:4:53,152:0.72: 2.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,115:0.70: 1.21:1.000:0.987 0/0/0/1:4:51,19:0.27:-1.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,95:0.68: 0.55:1.000:0.948 0/0/0/1:4:107,39:0.27: 0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,73:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,25:0.76:-2.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,71:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:82,99:0.53: 1.85:1.000:0.992 0/1/1/1:4:34,110:0.74: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,74:0.48: 0.96:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,80:0.51: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,68:0.54: 0.15:1.000:0.987 0/0/1/1:4:51,54:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,22:0.74:-2.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:28,12:0.30:-2.20:1.000:0.987 0/1/1:3:3,15:0.82:-2.83:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,93:0.55: 1.36:1.000:0.980 0/0/0/1:4:105,51:0.32: 1.13:1.000:0.947 0/1/1/1:4:29,113:0.78: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,71:0.56: 0.15:1.000:0.959 0/0/1/1:4:60,85:0.57: 0.81:1.000:0.950 0/1/1/1:4:16,74:0.80:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,96:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,33:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,43:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,38:0.31: 0.15:1.000:0.976 0/1/1/1:4:31,98:0.74: 0.35:1.000:0.998 0/1/1/1:4:34,120:0.76: 1.07:0.997:1.000 0/0/1/1:4:100,106:0.50: 2.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,58:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,67:0.54: 0.10:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,70:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,132:0.75: 1.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,84:0.81:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,34:0.27: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,62:0.47: 0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:54,54:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,90:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,83:0.80:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,43:0.49:-0.88:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:24,68:0.72:-0.71:1.000:0.784 0/1/1/1:4:33,61:0.63:-0.65:1.000:0.557 0/1/1/1:4:38,97:0.70: 0.53:1.000:0.982 0/1/1/1:4:22,91:0.79:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,44:0.53:-1.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:65,63:0.48: 0.32:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,67:0.76:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,27:0.28:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,34:0.32:-0.34:1.000:0.955 0/1/1/1:4:28,76:0.71:-0.36:0.974:0.991 0/0/1/1:4:48,64:0.55:-0.13:1.000:0.975 0/0/1/1:4:60,56:0.47:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,38:0.53:-1.34:0.999:0.993 0/0/1/1:4:57,77:0.56: 0.50:1.000:0.971 0/0/1/1:4:73,72:0.48: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,46:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,39:0.48:-1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,53:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,53:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,33:0.25: 0.44:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,63:0.77:-1.05:0.999:1.000 0/0/1/1:4:53,71:0.56: 0.21:1.000:0.974 0/1/1/1:4:27,77:0.72:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,63:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,29:0.31:-0.68:1.000:0.976 0/1/1/1:4:15,82:0.83:-0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,48:0.45:-0.39:1.000:0.983 0/0/1/1:4:54,51:0.47:-0.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:62,23:0.27:-0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,76:0.61: 0.12:1.000:0.699 0/1/1/1:4:20,70:0.76:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,81:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,32:0.29:-0.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:22,76:0.75:-0.54:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,51:0.52:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,28:0.34:-1.05:1.000:0.840 0/0/0/1:4:64,20:0.24:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,28:0.27:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,74:0.55: 0.38:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,50:0.45:-0.28:1.000:0.984 0/1/1/1:4:13,48:0.77:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,1:0.01: 0.21:0.981:1.000 0/0/0/1:4:50,19:0.27:-1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,51:0.48:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,44:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,79:0.56: 0.61:1.000:0.974 0/0/0/1:4:121,47:0.28: 1.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:88,22:0.20:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,47:0.49:-0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,150:0.76: 2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,47:0.46:-0.51:0.999:0.989 0/0/0/1:4:103,31:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,92:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,47:0.52:-0.85:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,72:0.74:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,22:0.24:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,53:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,89:0.74:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,21:0.27:-1.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,71:0.77:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,115:0.82: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,76:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,67:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,67:0.78:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,15:0.21:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,33:0.46:-1.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:28,34:0.53:-1.57:1.000:0.992 0/1/1/1:4:22,71:0.74:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,72:0.45: 1.10:1.000:0.982 0/1/1/1:4:18,46:0.70:-1.51:1.000:0.983 0/0/0/1:4:71,31:0.30:-0.42:1.000:0.984 0/0/1/1:4:55,65:0.53: 0.10:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,37:0.31:-0.02:1.000:0.965 0/0/1/1:4:39,50:0.54:-0.79:1.000:0.984 0/1/1/1:4:25,57:0.67:-1.00:1.000:0.937 0/1/1/1:4:26,60:0.68:-0.88:1.000:0.945 0/0/1/1:4:40,53:0.55:-0.68:1.000:0.977 0/0/0/1:4:51,21:0.29:-1.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:53,77:0.57: 0.38:1.000:0.934 0/0/1/1:4:34,38:0.51:-1.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,131:0.71: 1.79:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,137:0.69: 2.16:1.000:0.977 0/0/0/1:4:97,36:0.27: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,69:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,112:0.70: 1.10:1.000:0.986 0/0/1/1:4:46,60:0.55:-0.31:1.000:0.981 0/0/1/1:4:72,108:0.58: 1.82:1.000:0.905 0/0/0/1:4:92,44:0.32: 0.55:1.000:0.956 0/0/1/1:4:17,11:0.38:-2.54:1.000:0.627 0/0/1/1:4:60,65:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,43:0.31: 0.64:1.000:0.979 0/1/1/1:4:44,120:0.71: 1.36:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,112:0.73: 0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:90,30:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,24:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,91:0.57: 1.13:1.000:0.956 0/1/1/1:4:34,103:0.73: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/0:4:95,1:0.01:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,69:0.60:-0.13:1.000:0.810 0/0/1/1:4:64,57:0.46: 0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,83:0.53: 1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,82:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,56:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,66:0.48: 0.47:0.999:0.995 0/1/1/1:4:25,102:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,37:0.27: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,67:0.54: 0.12:1.000:0.989 0/0/0/1:4:79,26:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,79:0.73:-0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,97:0.82:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,57:0.54:-0.42:1.000:0.986 0/0/1/1:4:40,52:0.55:-0.71:1.000:0.981 0/1/1/1:4:40,107:0.71: 0.87:1.000:0.990 0/1/1/1:4:25,117:0.81: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,83:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,76:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,114:0.73: 0.98:1.000:0.998 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,205:1.00: 2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,71:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,81:0.51: 1.10:1.000:0.996 -chr7.1 981187 chr7.1_000981187 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:62,143:0.72: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,43:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,105:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,144:0.72: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:159,128:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,126:0.49: 1.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,81:0.71:-1.80:1.000:0.990 0/0/0/1:4:175,47:0.27: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,41:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,63:0.74:-2.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,45:0.41:-1.68:1.000:0.846 0/0/1/1:4:123,96:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,65:0.40:-0.46:1.000:0.813 0/0/1/1:4:116,100:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,85:0.46:-0.06:1.000:0.990 0/0/0/1:4:227,42:0.20: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,117:0.47: 1.41:0.803:0.993 0/0/1/1:4:131,108:0.49: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,179:0.71: 1.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:77,190:0.74: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,14:0.18:-2.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,170:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:229,46:0.22: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,94:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,38:0.51:-2.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,94:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,113:0.48: 1.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,142:0.73:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,104:0.46: 0.93:1.000:0.988 0/0/1/1:4:134,105:0.48: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:140,110:0.48: 0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,99:0.48: 0.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,27:0.63:-3.35:1.000:0.591 0/0/1/1:4:55,41:0.47:-2.28:1.000:0.992 0/1/1:3:23,26:0.57:-3.27:1.000:0.989 0/0/1/1:4:111,105:0.53: 0.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:191,43:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,169:0.75: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,101:0.48: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:167,122:0.47: 1.76:1.000:0.991 0/1/1/1:4:54,125:0.72:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,136:0.71:-0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:190,45:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,82:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:203,45:0.23: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,135:0.71:-0.12:1.000:0.989 0/1/1/1:4:68,146:0.71: 0.19:0.997:0.991 0/0/1/1:4:194,179:0.52: 3.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,92:0.47: 0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:127,106:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,124:0.76:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,169:0.72: 0.82:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,111:0.68:-0.73:1.000:0.957 0/0/0/1:4:177,42:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,86:0.45: 0.15:1.000:0.980 0/0/1/1:4:123,85:0.45: 0.07:1.000:0.983 0/1/1/1:4:57,112:0.69:-0.75:1.000:0.975 0/1/1/1:4:66,145:0.71: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:134,81:0.42: 0.21:1.000:0.925 0/0/1/1/1/1:6:67,103:0.64:-0.73:1.000:0.864 0/1/1/1:4:56,148:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,132:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,159:0.71: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:124,93:0.47: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:151,103:0.45: 1.03:1.000:0.980 0/1/1/1:4:52,142:0.76:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,23:0.26:-1.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,35:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,156:0.77: 0.11:0.974:1.000 0/0/1/1:4:120,83:0.45:-0.04:1.000:0.983 0/0/1/1:4:153,101:0.44: 1.03:1.000:0.971 0/0/1/1:4:87,64:0.47:-1.13:0.999:0.991 0/0/1/1:4:107,104:0.53: 0.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:153,112:0.47: 1.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:122,82:0.45:-0.02:1.000:0.976 0/0/1/1:4:106,90:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,87:0.47:-0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,72:0.44:-0.48:1.000:0.968 0/0/0/1:4:208,42:0.22: 0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,204:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,85:0.69:-1.59:0.999:0.969 0/0/1/1:4:129,92:0.46: 0.34:1.000:0.988 0/1/1/1:4:72,147:0.70: 0.30:1.000:0.984 0/0/1/1:4:117,81:0.45:-0.14:1.000:0.983 0/0/0/1:4:179,50:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,146:0.72: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,77:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,77:0.46:-0.46:1.000:0.990 0/0/0/1:4:180,47:0.26: 0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,103:0.53: 0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,106:0.71:-1.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,129:0.73:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:229,41:0.20: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,111:0.69:-0.79:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,240:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,92:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,29:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,35:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,46:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,94:0.43: 0.84:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-2.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,82:0.45:-0.02:1.000:0.976 0/0/1/1:4:51,66:0.60:-1.84:1.000:0.803 0/0/0/0:4:275,0:0.00: 1.47:0.981:1.000 0/0/0/1:4:148,52:0.31:-0.10:1.000:0.969 0/0/1/1:4:103,75:0.46:-0.56:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,62:0.43:-0.94:1.000:0.954 0/0/1/1:4:106,94:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:233,51:0.23: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,46:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,85:0.53:-0.69:1.000:0.991 0/1/1/1:4:79,217:0.76: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,79:0.46:-0.29:0.999:0.986 0/0/0/1:4:233,64:0.27: 1.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:190,1:0.01:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,140:0.69: 0.15:1.000:0.971 0/0/1/1:4:71,96:0.61:-0.79:1.000:0.707 0/1/1/1:4:41,115:0.76:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,33:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,72:0.45:-0.56:1.000:0.979 0/1/1/1:4:65,147:0.72: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:152,56:0.32: 0.07:1.000:0.949 0/1/1/1:4:53,141:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,147:0.75:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,113:0.66:-0.54:1.000:0.877 0/0/1/1:4:127,94:0.47: 0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:45,118:0.75:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,30:0.20:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.55:-0.92:1.000:0.982 0/0/1/1:4:98,68:0.45:-0.82:1.000:0.983 0/1/1/1:4:53,104:0.69:-1.00:1.000:0.974 0/0/1/1:4:117,93:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,78:0.69:-1.84:1.000:0.979 0/0/0/1:4:191,38:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,87:0.48:-0.10:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,63:0.29: 1.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:120,69:0.41:-0.33:1.000:0.875 0/1/1/1:4:51,85:0.66:-1.44:1.000:0.838 0/1/1/1:4:49,131:0.75:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,93:0.51:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,31:0.21:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,68:0.44:-0.71:1.000:0.971 0/0/1/1:4:91,75:0.49:-0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,158:0.68: 0.76:1.000:0.963 0/1/1/1:4:70,150:0.71: 0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:204,57:0.27: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,87:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,173:0.78: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,87:0.47:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:163,131:0.49: 1.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,51:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,47:0.50:-2.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,72:0.51:-1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:229,41:0.20: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,140:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:59,136:0.72:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:206,56:0.27: 1.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:155,44:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,95:0.46: 0.44:1.000:0.990 0/1/1/1:4:57,130:0.72:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:189,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,112:0.53: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,131:0.59: 0.61:1.000:0.834 0/0/1/1:4:149,107:0.46: 1.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:120,89:0.47: 0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:112,88:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:113,100:0.51: 0.17:0.999:0.996 0/1/1/1:4:51,131:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,38:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,82:0.52:-0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,41:0.29:-0.71:1.000:0.990 0/1/1/1:4:46,118:0.74:-0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,111:0.71:-0.88:1.000:0.991 0/0/1/1:4:102,93:0.52:-0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,78:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,176:0.72: 1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,141:0.65: 0.51:1.000:0.762 0/0/1/1:4:123,95:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:116,82:0.46:-0.14:1.000:0.986 0/1/1/1:4:65,147:0.72: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/0:4:332,0:0.00: 2.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,211:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,82:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,124:0.50: 1.32:1.000:0.997 -chr7.1 1198751 chr7.1_001198751 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:229,168:.: 1.85:1.000:. ./.:4:131,116:.: 0.06:1.000:. ./.:4:161,73:.:-0.09:1.000:. ./.:4:167,189:.: 1.36:1.000:. ./.:4:214,158:.: 1.55:1.000:. ./.:4:264,67:.: 1.06:1.000:. ./.:4:121,40:.:-0.96:1.000:. ./.:4:146,39:.:-0.68:1.000:. ./.:4:166,86:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,43:.:-2.02:1.000:. ./.:4:15,5:.:-2.64:1.000:. ./.:4:157,167:.: 0.98:1.000:. ./.:4:143,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:173,105:.: 0.43:1.000:. ./.:4:185,140:.: 0.99:1.000:. ./.:4:207,130:.: 1.13:1.000:. ./.:4:172,157:.: 1.04:0.803:. ./.:4:194,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:192,153:.: 1.23:1.000:. ./.:4:188,141:.: 1.04:1.000:. ./.:4:36,38:.:-2.00:1.000:. ./.:4:153,186:.: 1.16:1.000:. ./.:4:176,161:.: 1.13:1.000:. ./.:4:137,73:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,5:.:-2.67:1.000:. ./.:4:177,33:.:-0.38:1.000:. ./.:4:188,122:.: 0.81:1.000:. ./.:4:218,79:.: 0.66:1.000:. ./.:4:194,137:.: 1.06:1.000:. ./.:4:208,83:.: 0.59:1.000:. ./.:4:178,40:.:-0.28:1.000:. ./.:4:167,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,12:.:-2.56:1.000:. ./.:4:30,23:.:-2.25:1.000:. ./.:3:20,9:.:-2.53:1.000:. ./.:4:198,158:.: 1.36:1.000:. ./.:4:180,45:.:-0.20:1.000:. ./.:4:169,188:.: 1.37:1.000:. ./.:4:138,106:.: 0.03:1.000:. ./.:4:171,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,97:.:-0.03:1.000:. ./.:4:147,37:.:-0.69:1.000:. ./.:4:169,158:.: 1.01:1.000:. ./.:4:153,95:.: 0.07:1.000:. ./.:4:149,70:.:-0.27:1.000:. ./.:4:170,132:.: 0.72:1.000:. ./.:4:225,123:.: 1.26:0.997:. ./.:4:116,44:.:-0.97:1.000:. ./.:4:158,55:.:-0.34:1.000:. ./.:4:130,59:.:-0.63:1.000:. ./.:4:141,105:.: 0.05:1.000:. ./.:4:185,224:.: 1.99:1.000:. ./.:4:123,47:.:-0.86:1.000:. ./.:4:184,80:.: 0.26:1.000:. ./.:4:179,72:.: 0.11:1.000:. ./.:4:152,64:.:-0.31:1.000:. ./.:4:157,73:.:-0.14:1.000:. ./.:4:128,36:.:-0.93:1.000:. ./.:4:135,67:.:-0.47:1.000:. ./.:6:117,89:.:-0.43:1.000:. ./.:4:132,144:.: 0.41:1.000:. ./.:4:154,54:.:-0.40:1.000:. ./.:4:175,113:.: 0.55:1.000:. ./.:4:132,127:.: 0.20:1.000:. ./.:4:163,115:.: 0.43:1.000:. ./.:4:148,54:.:-0.47:1.000:. ./.:4:86,65:.:-1.08:1.000:. ./.:4:155,43:.:-0.52:1.000:. ./.:4:127,180:.: 0.78:0.974:. ./.:4:161,131:.: 0.60:1.000:. ./.:4:144,122:.: 0.29:1.000:. ./.:4:90,30:.:-1.45:0.999:. ./.:4:150,131:.: 0.47:1.000:. ./.:4:195,145:.: 1.17:1.000:. ./.:4:156,123:.: 0.44:1.000:. ./.:4:153,66:.:-0.27:1.000:. ./.:4:147,130:.: 0.42:1.000:. ./.:4:146,41:.:-0.65:1.000:. ./.:4:144,109:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,137:.: 0.60:1.000:. ./.:4:128,45:.:-0.82:0.999:. ./.:4:124,121:.: 0.04:1.000:. ./.:4:144,153:.: 0.66:1.000:. ./.:4:136,156:.: 0.60:1.000:. ./.:4:130,97:.:-0.18:1.000:. ./.:4:167,34:.:-0.49:1.000:. ./.:4:120,34:.:-1.05:1.000:. ./.:4:121,32:.:-1.06:1.000:. ./.:4:130,62:.:-0.59:1.000:. ./.:4:144,148:.: 0.60:1.000:. ./.:4:113,19:.:-1.31:1.000:. ./.:4:148,78:.:-0.19:1.000:. ./.:4:179,105:.: 0.50:1.000:. ./.:4:129,87:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,48:.:-0.43:1.000:. ./.:4:118,104:.:-0.24:1.000:. ./.:4:135,28:.:-0.94:1.000:. ./.:4:96,50:.:-1.14:1.000:. ./.:4:138,27:.:-0.92:1.000:. ./.:4:198,120:.: 0.91:1.000:. ./.:4:92,47:.:-1.22:1.000:. ./.:4:143,135:.: 0.43:1.000:. ./.:4:82,27:.:-1.58:1.000:. ./.:4:151,52:.:-0.46:0.981:. ./.:4:104,126:.:-0.14:1.000:. ./.:4:139,24:.:-0.94:1.000:. ./.:4:133,82:.:-0.32:1.000:. ./.:4:180,96:.: 0.41:1.000:. ./.:4:253,100:.: 1.32:1.000:. ./.:4:158,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.80:1.000:. ./.:4:246,247:.: 2.99:1.000:. ./.:4:142,49:.:-0.61:0.999:. ./.:4:169,162:.: 1.06:1.000:. ./.:4:103,32:.:-1.27:1.000:. ./.:4:148,159:.: 0.78:1.000:. ./.:4:108,62:.:-0.86:1.000:. ./.:4:131,105:.:-0.07:1.000:. ./.:4:127,71:.:-0.52:1.000:. ./.:4:137,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:151,162:.: 0.85:1.000:. ./.:4:119,62:.:-0.72:1.000:. ./.:4:144,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:233,75:.: 0.79:1.000:. ./.:4:117,96:.:-0.34:1.000:. ./.:4:131,101:.:-0.12:1.000:. ./.:4:110,51:.:-0.96:1.000:. ./.:4:111,56:.:-0.89:1.000:. ./.:4:99,68:.:-0.89:1.000:. ./.:4:88,24:.:-1.55:1.000:. ./.:4:111,106:.:-0.30:1.000:. ./.:4:161,84:.: 0.04:1.000:. ./.:4:87,4:.:-1.80:1.000:. ./.:4:148,137:.: 0.51:1.000:. ./.:4:186,133:.: 0.92:1.000:. ./.:4:232,139:.: 1.54:1.000:. ./.:4:151,60:.:-0.37:1.000:. ./.:4:120,44:.:-0.93:1.000:. ./.:4:106,69:.:-0.80:1.000:. ./.:4:108,74:.:-0.71:1.000:. ./.:4:125,2:.:-1.37:1.000:. ./.:4:125,95:.:-0.26:1.000:. ./.:4:139,103:.: 0.00:1.000:. ./.:4:109,4:.:-1.53:1.000:. ./.:4:207,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:225,262:.: 2.92:1.000:. ./.:4:174,72:.: 0.05:1.000:. ./.:4:200,126:.: 1.00:1.000:. ./.:4:194,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:143,203:.: 1.24:1.000:. ./.:4:186,105:.: 0.59:1.000:. ./.:4:165,92:.: 0.18:1.000:. ./.:4:28,21:.:-2.30:1.000:. ./.:4:123,3:.:-1.38:1.000:. ./.:4:176,116:.: 0.60:1.000:. ./.:4:193,78:.: 0.35:1.000:. ./.:4:219,152:.: 1.54:1.000:. ./.:4:178,103:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,99:.: 0.13:1.000:. ./.:4:174,89:.: 0.25:1.000:. ./.:4:158,121:.: 0.44:1.000:. ./.:4:169,105:.: 0.38:1.000:. ./.:4:159,34:.:-0.58:1.000:. ./.:4:174,88:.: 0.24:1.000:. ./.:4:209,113:.: 0.95:1.000:. ./.:4:196,103:.: 0.68:1.000:. ./.:4:152,88:.:-0.02:1.000:. ./.:4:174,74:.: 0.07:0.999:. ./.:4:184,173:.: 1.37:1.000:. ./.:4:169,112:.: 0.47:1.000:. ./.:4:127,123:.: 0.10:1.000:. ./.:4:149,42:.:-0.61:1.000:. ./.:4:165,32:.:-0.53:1.000:. ./.:4:151,128:.: 0.44:1.000:. ./.:4:150,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:131,137:.: 0.31:1.000:. ./.:4:226,259:.: 2.89:1.000:. ./.:4:161,177:.: 1.14:1.000:. ./.:4:183,95:.: 0.43:1.000:. ./.:4:168,162:.: 1.05:1.000:. ./.:4:197,115:.: 0.84:1.000:. ./.:4:242,109:.: 1.30:1.000:. ./.:4:211,159:.: 1.53:1.000:. ./.:4:155,64:.:-0.27:1.000:. ./.:4:170,100:.: 0.34:1.000:. -chr7.1 1382264 chr7.1_001382264 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:230,64:.: 0.31:1.000:. ./.:4:142,112:.:-0.41:1.000:. ./.:4:142,118:.:-0.30:1.000:. ./.:4:210,86:.: 0.35:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:178,62:.:-0.66:1.000:. ./.:4:147,155:.: 0.46:1.000:. ./.:4:140,153:.: 0.30:1.000:. ./.:4:105,2:.:-3.07:1.000:. ./.:4:75,49:.:-2.76:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:154,125:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,162:.: 0.55:1.000:. ./.:4:233,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:181,166:.: 1.27:1.000:. ./.:4:226,103:.: 0.95:0.803:. ./.:4:93,259:.: 1.36:1.000:. ./.:4:287,104:.: 2.07:1.000:. ./.:4:264,85:.: 1.31:1.000:. ./.:4:104,19:.:-2.78:1.000:. ./.:4:208,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:153,162:.: 0.69:1.000:. ./.:4:148,138:.: 0.17:1.000:. ./.:4:71,13:.:-3.48:1.000:. ./.:4:259,85:.: 1.22:1.000:. ./.:4:252,83:.: 1.06:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:166,158:.: 0.86:1.000:. ./.:4:147,171:.: 0.75:1.000:. ./.:4:226,90:.: 0.71:1.000:. ./.:4:163,61:.:-0.95:1.000:. ./.:4:81,29:.:-3.01:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.82:1.000:. ./.:3:48,0:.:-4.14:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:161,164:.: 0.87:1.000:. ./.:4:252,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:148,160:.: 0.57:1.000:. ./.:4:258,76:.: 1.04:1.000:. ./.:4:189,92:.: 0.08:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:269,101:.: 1.69:1.000:. ./.:4:205,60:.:-0.21:1.000:. ./.:4:238,79:.: 0.73:1.000:. ./.:4:206,87:.: 0.30:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.82:0.997:. ./.:4:213,67:.: 0.06:1.000:. ./.:4:254,65:.: 0.77:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:190,72:.:-0.26:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:171,160:.: 0.98:1.000:. ./.:4:236,75:.: 0.62:1.000:. ./.:4:240,59:.: 0.40:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:223,75:.: 0.39:1.000:. ./.:4:125,138:.:-0.25:1.000:. ./.:6:239,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:216,64:.: 0.06:1.000:. ./.:4:215,82:.: 0.37:1.000:. ./.:4:99,102:.:-1.37:1.000:. ./.:4:132,140:.:-0.08:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.57:0.974:. ./.:4:202,58:.:-0.30:1.000:. ./.:4:234,85:.: 0.77:1.000:. ./.:4:119,135:.:-0.41:0.999:. ./.:4:224,84:.: 0.57:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:192,63:.:-0.39:1.000:. ./.:4:138,142:.: 0.06:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,140:.: 0.33:1.000:. ./.:4:192,69:.:-0.28:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:166,57:.:-0.97:0.999:. ./.:4:206,72:.: 0.02:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:108,133:.:-0.64:1.000:. ./.:4:226,72:.: 0.39:1.000:. ./.:4:225,91:.: 0.71:1.000:. ./.:4:117,105:.:-0.99:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:118,142:.:-0.30:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:168,54:.:-0.99:1.000:. ./.:4:247,79:.: 0.89:1.000:. ./.:4:219,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:234,78:.: 0.64:1.000:. ./.:4:109,112:.:-1.01:1.000:. ./.:4:150,66:.:-1.10:1.000:. ./.:4:233,76:.: 0.59:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:310,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:167,49:.:-1.10:1.000:. ./.:4:201,122:.: 0.84:0.981:. ./.:4:114,132:.:-0.55:1.000:. ./.:4:133,142:.:-0.03:1.000:. ./.:4:158,56:.:-1.13:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:265,92:.: 1.45:1.000:. ./.:4:125,155:.: 0.06:1.000:. ./.:4:147,156:.: 0.48:1.000:. ./.:4:296,104:.: 2.23:1.000:. ./.:4:168,141:.: 0.59:0.999:. ./.:4:188,135:.: 0.84:1.000:. ./.:4:167,36:.:-1.33:1.000:. ./.:4:222,76:.: 0.39:1.000:. ./.:4:134,136:.:-0.12:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:190,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:182,67:.:-0.50:1.000:. ./.:4:204,81:.: 0.15:1.000:. ./.:4:138,126:.:-0.23:1.000:. ./.:4:206,65:.:-0.10:1.000:. ./.:4:207,77:.: 0.13:1.000:. ./.:4:205,80:.: 0.15:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:211,62:.:-0.07:1.000:. ./.:4:132,128:.:-0.30:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:224,76:.: 0.42:1.000:. ./.:4:203,80:.: 0.12:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:235,62:.: 0.37:1.000:. ./.:4:114,111:.:-0.93:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:187,70:.:-0.36:1.000:. ./.:4:229,66:.: 0.33:1.000:. ./.:4:176,56:.:-0.81:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:392,1:.: 2.10:1.000:. ./.:4:146,159:.: 0.51:1.000:. ./.:4:164,146:.: 0.60:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:146,144:.: 0.24:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:191,71:.:-0.26:1.000:. ./.:4:93,32:.:-2.74:1.000:. ./.:4:154,45:.:-1.40:1.000:. ./.:4:159,164:.: 0.84:1.000:. ./.:4:217,72:.: 0.22:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:245,85:.: 0.97:1.000:. ./.:4:122,115:.:-0.72:1.000:. ./.:4:216,78:.: 0.31:1.000:. ./.:4:216,63:.: 0.04:1.000:. ./.:4:103,157:.:-0.30:1.000:. ./.:4:125,148:.:-0.07:1.000:. ./.:4:204,68:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,163:.: 0.37:1.000:. ./.:4:156,131:.: 0.19:1.000:. ./.:4:173,70:.:-0.61:1.000:. ./.:4:214,71:.: 0.15:0.999:. ./.:4:200,52:.:-0.45:1.000:. ./.:4:189,80:.:-0.14:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:187,58:.:-0.57:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:150,64:.:-1.13:1.000:. ./.:4:235,77:.: 0.64:1.000:. ./.:4:239,86:.: 0.87:1.000:. ./.:4:258,72:.: 0.97:1.000:. ./.:4:255,11:.:-0.19:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:177,190:.: 1.63:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:194,71:.:-0.21:1.000:. ./.:4:240,81:.: 0.80:1.000:. -chr7.1 1556123 chr7.1_001556123 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,22:0.73: 0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:18,5:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,5:0.15: 1.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,17:0.56: 0.74:1.000:0.960 0/0/1/1:4:18,11:0.38: 0.74:1.000:0.630 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-2.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,24:0.62: 1.65:1.000:0.523 0/0/1/1:4:14,12:0.46: 0.35:1.000:0.989 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-2.76:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:8,9:0.52:-0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:20,6:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.37:-0.17:1.000:0.565 0/1/1/1:4:9,20:0.64: 0.74:1.000:0.695 0/0/1/1:4:13,15:0.53: 0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:21,5:0.20: 0.35:0.803:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.44: 1.13:1.000:0.968 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.31:-0.04:1.000:0.968 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-2.76:1.000:0.997 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:19,4:0.18:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.45:-0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:9,18:0.62: 0.48:1.000:0.523 0/0/0/1:4:14,6:0.31:-0.43:1.000:0.975 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,7:0.29: 0.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,12:0.33: 1.78:1.000:0.911 0/0/0/1:4:21,6:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.76:1.000:1.000 1/1/1:3:0,2:1.00:-2.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,15:0.63:-0.17:1.000:0.625 0/0/1/1:4:13,13:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,9:0.32: 0.74:1.000:0.956 0/0/0/1:4:20,6:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.33: 0.22:1.000:0.928 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.14: 0.74:1.000:0.980 0/1/1/1:4:5,22:0.73: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,9:0.43:-0.30:1.000:0.951 0/0/1/1:4:10,15:0.57: 0.22:1.000:0.935 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.48:1.000:0.520 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.48:0.997:0.520 0/0/0/1:4:7,4:0.37:-1.59:1.000:0.565 0/0/1/1:4:9,12:0.55:-0.30:1.000:0.977 0/0/1/1:4:13,12:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:18,4:0.19:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,6:0.19: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.48:1.000:0.520 0/0/1/1:4:25,22:0.47: 3.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,13:0.53: 0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,11:0.41: 0.48:1.000:0.874 0/0/0/1:4:22,8:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,5:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:15,10:0.40: 0.22:1.000:0.608 0/0/1/1:4:11,9:0.45:-0.43:1.000:0.982 0/0/0/1:4:23,8:0.27: 1.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:18,5:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.48:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,16:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.69:-1.98:1.000:0.965 0/0/1/1:4:15,10:0.40: 0.22:1.000:0.827 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.43:0.974:0.999 0/0/1/1:4:12,13:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,11:0.46: 0.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:2,1:0.34:-2.63:0.999:0.863 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.17:1.000:0.953 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.17:1.000:0.953 0/0/1/1:4:7,14:0.62:-0.30:1.000:0.523 0/0/0/1:4:9,5:0.36:-1.20:1.000:0.645 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-1.59:1.000:0.985 0/0/0/1:4:16,3:0.17:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,16:0.59: 0.35:1.000:0.889 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.55:-0.94:0.999:0.983 0/0/1/1:4:11,15:0.56: 0.35:1.000:0.972 0/0/0/1:4:14,5:0.27:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,5:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,14:0.68:-0.56:1.000:0.941 0/0/0/1:4:15,8:0.35:-0.04:1.000:0.746 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-1.59:1.000:0.885 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,12:0.53:-0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:7,9:0.55:-0.94:1.000:0.983 0/0/0/1:4:13,2:0.14:-1.07:1.000:0.967 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,28:0.74: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,4:0.17: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-0.43:1.000:0.827 0/0/1/1:4:8,14:0.60:-0.17:1.000:0.782 1/1/1/1:4:2,27:0.89: 0.74:1.000:0.643 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.48:1.000:0.520 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.42:-0.56:1.000:0.931 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-0.94:1.000:0.951 0/1/1/1:4:3,13:0.73:-0.94:0.981:0.998 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-0.43:1.000:0.827 0/0/0/1:4:22,12:0.36: 1.39:1.000:0.693 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,10:0.52:-0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,28:0.77: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.56: 1.65:1.000:0.964 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.48:1.000:0.520 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,5:0.19: 0.48:0.999:1.000 0/0/1/1:4:17,20:0.53: 1.78:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,1:0.15:-2.11:1.000:0.988 0/0/0/0:4:19,2:0.10:-0.30:1.000:0.801 0/1/1/1:4:4,19:0.74:-0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,15:0.69:-0.43:1.000:0.965 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.48: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,10:0.34: 0.87:1.000:0.863 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.31:-0.43:1.000:0.975 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-0.94:1.000:0.968 0/0/1/1:4:15,12:0.45: 0.48:1.000:0.977 0/1/1/1:4:3,21:0.81: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-0.94:1.000:0.968 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-0.69:1.000:0.987 0/0/0/1:4:22,8:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,8:0.32: 0.35:1.000:0.962 0/0/0/1:4:10,2:0.17:-1.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,16:0.83:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,13:0.41: 1.13:1.000:0.867 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,17:0.54: 1.00:1.000:0.990 0/0/0/1:4:14,5:0.27:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,5:0.30:-0.81:1.000:0.982 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,6:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,15:0.69:-0.43:1.000:0.965 0/0/1/1:4:14,17:0.54: 1.00:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,10:0.62:-1.07:1.000:0.523 0/0/0/1:4:22,9:0.30: 1.00:1.000:0.985 0/0/0/1:4:20,11:0.36: 1.00:1.000:0.672 0/0/1/1:4:15,11:0.43: 0.35:1.000:0.937 0/0/0/1:4:29,12:0.30: 2.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:20,12:0.38: 1.13:1.000:0.578 0/0/0/1:4:26,6:0.20: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,18:0.52: 1.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,26:0.84: 0.74:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:11,8:0.42:-0.56:1.000:0.931 0/0/1/1:4:11,13:0.53: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:15,5:0.26:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,6:0.27:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,9:0.41:-0.17:1.000:0.882 0/0/1/1:4:7,13:0.61:-0.43:1.000:0.678 0/0/1/1:4:15,12:0.45: 0.48:1.000:0.977 0/0/1/1:4:16,11:0.41: 0.48:1.000:0.874 0/0/1/1:4:8,16:0.62: 0.09:1.000:0.523 0/0/0/1:4:17,5:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,11:0.40: 0.61:1.000:0.771 0/0/0/1:4:20,6:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.44: 0.22:1.000:0.971 0/0/0/1:4:12,5:0.30:-0.81:1.000:0.982 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.69:0.999:0.997 0/0/1/1:4:13,12:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,17:0.63: 0.22:1.000:0.608 0/0/1/1:4:14,11:0.44: 0.22:1.000:0.971 0/1/1/1:4:6,17:0.68:-0.04:1.000:0.946 0/0/0/1:4:13,7:0.36:-0.43:1.000:0.724 0/0/0/1:4:22,4:0.16: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,11:0.61:-0.81:1.000:0.703 0/0/1/1:4:17,15:0.47: 1.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:22,7:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,6:0.30:-0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:12,16:0.55: 0.61:1.000:0.977 0/0/1/1:4:11,13:0.53: 0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,9:0.28: 1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,17:0.55: 0.87:1.000:0.980 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.47: 1.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:13,14:0.51: 0.48:1.000:0.996 -chr7.1 1787161 chr7.1_001787161 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:64,21:0.31: 0.73:1.000:0.979 0/1/1/1:4:20,42:0.67:-0.45:1.000:0.919 0/0/1/1:4:44,24:0.41:-0.14:1.000:0.851 0/0/0/1:4:71,19:0.27: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,46:0.50: 1.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,30:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,7:0.30:-2.14:1.000:0.985 0/1/1/1:4:19,46:0.69:-0.29:1.000:0.977 0/1/1/1:4:18,34:0.65:-0.96:1.000:0.812 0/0/0/1:4:29,7:0.26:-1.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,12:0.48:-2.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,26:0.51:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,24:0.40:-0.09:1.000:0.816 0/0/1/1:4:34,32:0.53:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,28:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,44:0.73:-0.65:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,37:0.56:-0.09:0.803:0.958 0/1/1/1:4:28,60:0.67: 0.88:1.000:0.932 0/0/0/1:4:93,22:0.25: 2.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,18:0.28: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,36:0.86:-1.52:1.000:0.974 0/0/0/1:4:68,10:0.17: 0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,62:0.66: 1.14:1.000:0.879 0/0/1/1:4:42,32:0.48: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,11:0.52:-2.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,32:0.45: 0.52:1.000:0.978 0/0/1/1:4:36,30:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,16:0.35:-0.86:1.000:0.759 0/0/1/1:4:51,35:0.46: 0.78:1.000:0.988 0/0/1/1:4:30,36:0.57:-0.24:1.000:0.942 0/0/1/1:4:32,20:0.44:-0.96:1.000:0.965 0/0/1/1:4:31,25:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,11:0.71:-2.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:28,19:0.46:-1.22:1.000:0.986 0/0/1:3:16,9:0.41:-2.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,32:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,40:0.61:-0.19:1.000:0.691 0/0/0/1:4:61,13:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,26:0.42: 0.01:1.000:0.917 0/0/1/1:4:37,22:0.43:-0.60:1.000:0.939 0/0/0/1:4:55,8:0.17:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:69,18:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,51:0.62: 0.68:1.000:0.601 0/0/1/1:4:52,26:0.39: 0.37:1.000:0.682 0/1/1/1:4:25,46:0.65: 0.01:1.000:0.772 0/0/0/1:4:65,20:0.29: 0.73:1.000:0.989 0/0/0/1:4:85,15:0.20: 1.50:0.997:1.000 0/0/1/1:4:20,10:0.39:-2.09:1.000:0.682 0/0/1/1:4:38,18:0.38:-0.76:1.000:0.539 0/0/1/1:4:31,16:0.40:-1.22:1.000:0.754 0/0/0/1:4:72,16:0.24: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,24:0.30: 1.39:1.000:0.981 0/0/0/1:4:80,14:0.20: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,39:0.60:-0.19:1.000:0.800 0/0/1/1:4:48,40:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,29:0.43: 0.37:1.000:0.936 0/0/0/1:4:68,22:0.30: 0.98:1.000:0.982 0/0/0/1:4:80,13:0.19: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,27:0.42: 0.17:1.000:0.912 0/0/0/0/0/1:6:56,11:0.22:-0.19:1.000:0.832 0/0/0/1:4:78,18:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,13:0.19: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,16:0.24: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,22:0.34: 0.37:1.000:0.870 0/0/1/1:4:48,33:0.46: 0.52:1.000:0.988 0/0/0/1:4:69,21:0.29: 0.98:1.000:0.990 0/1/1/1:4:10,36:0.75:-1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,48:0.68:-0.09:1.000:0.961 0/0/0/1:4:55,10:0.20:-0.29:0.974:1.000 0/0/1/1:4:58,31:0.40: 0.93:1.000:0.820 0/0/1/1:4:54,44:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,19:0.41:-0.91:0.999:0.883 0/0/1/1:4:38,26:0.46:-0.35:1.000:0.987 0/0/1/1:4:43,33:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,26:0.45:-0.29:1.000:0.983 0/0/1/1:4:38,24:0.44:-0.45:1.000:0.968 0/0/1/1:4:34,26:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,21:0.37:-0.14:1.000:0.621 0/1/1/1:4:25,44:0.64:-0.09:1.000:0.691 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,11:0.25:-0.60:0.999:0.999 0/0/1/1:4:48,39:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/0:4:87,6:0.09: 1.14:1.000:0.972 0/0/1/1:4:50,37:0.48: 0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,30:0.64:-1.22:1.000:0.696 0/0/0/1:4:82,14:0.19: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,21:0.42:-0.70:1.000:0.925 0/0/1/1:4:34,34:0.54:-0.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,34:0.58:-0.50:1.000:0.911 0/0/1/1:4:43,29:0.46: 0.06:1.000:0.985 0/0/0/1:4:46,6:0.15:-0.96:1.000:0.991 0/0/0/1:4:52,16:0.29:-0.14:1.000:0.989 0/1/1/1:4:31,53:0.64: 0.68:1.000:0.631 0/0/0/1:4:43,10:0.25:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 3.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,30:0.52:-0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,45:0.67:-0.19:1.000:0.900 0/1/1/1:4:18,43:0.69:-0.50:1.000:0.974 0/1/1/1:4:20,37:0.65:-0.70:1.000:0.780 0/0/1/1:4:39,46:0.57: 0.73:1.000:0.950 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,29:0.41: 0.52:1.000:0.880 0/0/0/1:4:55,11:0.22:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.47:0.981:1.000 0/1/1/1:4:17,37:0.68:-0.86:1.000:0.941 0/0/1/1:4:32,37:0.56:-0.09:1.000:0.958 0/0/1/1:4:37,28:0.48:-0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,31:0.54:-0.45:1.000:0.989 0/1/1/1:4:35,66:0.65: 1.55:1.000:0.809 0/1/1/1:4:30,49:0.63: 0.42:1.000:0.527 0/0/1/1:4:42,40:0.53: 0.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,17:0.26: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,30:0.48:-0.04:0.999:0.995 0/1/1/1:4:32,53:0.63: 0.73:1.000:0.559 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,8:0.15: 0.01:1.000:0.987 0/0/1/1:4:46,22:0.38:-0.14:1.000:0.565 0/0/0/1:4:65,11:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,66:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,33:0.40: 1.24:1.000:0.813 0/0/0/1:4:53,20:0.33: 0.11:1.000:0.912 0/1/1/1:4:19,40:0.67:-0.60:1.000:0.921 0/0/0/1:4:58,10:0.19:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,12:0.28:-0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,10:0.15: 0.93:1.000:0.986 0/0/0/1:4:52,15:0.28:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,11:0.18: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,36:0.77:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,26:0.52:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:33,19:0.42:-0.96:1.000:0.914 0/0/0/1:4:77,10:0.15: 0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,21:0.44:-0.81:1.000:0.960 0/0/0/1:4:44,10:0.25:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,48:0.67: 0.01:1.000:0.915 0/0/1/1:4:30,24:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,54:0.69: 0.27:1.000:0.979 0/0/1/1:4:33,24:0.47:-0.70:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,9:0.22:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,8:0.18:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,39:0.53: 0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,37:0.69:-0.91:1.000:0.965 0/0/1/1:4:38,27:0.47:-0.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:36,10:0.28:-1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,20:0.26: 1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,27:0.29: 2.42:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,56:0.72: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,26:0.44:-0.14:1.000:0.961 0/0/0/1:4:92,27:0.29: 2.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:40,24:0.43:-0.35:1.000:0.944 0/0/1/1:4:50,42:0.51: 1.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,49:0.80:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.55:-2.04:1.000:0.980 0/0/1/1:4:30,32:0.55:-0.45:1.000:0.980 0/1/1/1:4:16,55:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,24:0.28: 1.96:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,11:0.17: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,62:0.82: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,43:0.68:-0.45:1.000:0.958 0/0/1/1:4:45,30:0.45: 0.22:1.000:0.983 0/0/0/1:4:71,27:0.33: 1.39:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,20:0.45:-1.01:1.000:0.975 0/0/1/1:4:40,41:0.54: 0.52:1.000:0.986 0/0/1/1:4:29,17:0.42:-1.27:1.000:0.929 0/0/1/1:4:44,33:0.48: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,31:0.48: 0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,36:0.48: 0.73:0.999:0.994 0/0/0/1:4:62,12:0.21: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,29:0.62:-1.22:1.000:0.505 0/0/1/1:4:24,19:0.49:-1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,47:0.68:-0.14:1.000:0.953 0/0/0/1:4:53,7:0.15:-0.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:58,16:0.28: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,26:0.44:-0.19:1.000:0.970 0/0/1/1:4:29,19:0.45:-1.16:1.000:0.979 0/0/0/1:4:61,9:0.17:-0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,27:0.38: 0.63:1.000:0.587 0/0/1/1:4:46,32:0.46: 0.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,26:0.41: 0.11:1.000:0.870 0/0/0/1:4:69,14:0.22: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,36:0.58:-0.29:1.000:0.922 0/0/1/1:4:47,25:0.40: 0.06:1.000:0.811 -chr7.1 1840205 chr7.1_001840205 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:178,1:0.01: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,102:0.71:-0.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:132,30:0.19: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,33:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,111:0.51: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,99:0.48: 1.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:53,21:0.29:-1.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:69,75:0.53:-0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:94,63:0.41: 0.11:1.000:0.877 0/0/0/1:4:32,11:0.26:-2.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,12:0.24:-2.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,63:0.45:-0.21:1.000:0.979 0/0/0/1:4:136,36:0.21: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,32:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,61:0.44:-0.26:1.000:0.969 0/0/1/1:4:113,94:0.47: 1.33:1.000:0.991 0/0/0/1:4:145,41:0.23: 0.81:0.803:1.000 0/1/1/1:4:44,157:0.75: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:229,0:0.00: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,38:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,25:0.65:-2.79:1.000:0.749 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,71:0.46: 0.13:1.000:0.989 0/0/0/1:4:106,36:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,7:0.28:-3.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,80:0.44: 0.86:1.000:0.962 0/0/1/1:4:93,77:0.47: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:125,31:0.20: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,41:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,44:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,21:0.17:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,40:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-3.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,16:0.39:-2.69:1.000:0.705 0/0/1:3:12,9:0.44:-3.20:1.000:0.982 0/0/1/1:4:76,80:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,78:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:142,38:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,35:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,47:0.27: 0.62:1.000:0.998 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,49:0.27: 0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,143:0.74: 0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,68:0.46:-0.04:1.000:0.989 0/1/1/1:4:37,87:0.68:-0.69:1.000:0.960 0/0/0/1:4:115,44:0.28: 0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,38:0.25: 0.13:0.997:0.999 0/0/1/1:4:144,144:0.51: 3.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,72:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,92:0.49: 0.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:116,36:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,51:0.26: 1.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,39:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,82:0.48: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,80:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,75:0.47: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:133,44:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,39:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,28:0.19: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:94,53:0.37:-0.13:1.000:0.833 0/0/0/1:4:106,39:0.28:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,47:0.26: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,43:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,60:0.54:-0.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:87,67:0.45: 0.04:1.000:0.977 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,35:0.52:-2.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,75:0.54:-0.31:1.000:0.986 0/0/0/1:4:129,26:0.17: 0.06:0.974:0.998 0/0/1/1:4:80,78:0.51: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,96:0.54: 0.69:1.000:0.989 0/0/0/1:4:94,25:0.22:-0.82:0.999:1.000 0/0/1/1:4:82,69:0.47:-0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,101:0.50: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,73:0.48: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:102,27:0.21:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,71:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,39:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,140:0.69: 1.11:1.000:0.969 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,27:0.26:-1.11:0.999:0.999 0/0/1/1:4:111,96:0.48: 1.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:127,40:0.25: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,22:0.14: 0.11:1.000:0.977 0/1/1/1:4:45,107:0.68:-0.01:1.000:0.964 0/0/0/1:4:141,46:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,31:0.28:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,79:0.53: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:76,64:0.47:-0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:100,81:0.46: 0.69:1.000:0.988 0/0/0/1:4:65,22:0.26:-1.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,146:0.73: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,34:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:168,1:0.01: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,67:0.44: 0.11:1.000:0.965 0/0/1/1:4:74,78:0.52:-0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,87:0.69:-0.74:1.000:0.977 0/1/1/1:4:41,126:0.73: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,86:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,72:0.43: 0.52:1.000:0.933 0/0/0/1:4:62,18:0.23:-1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,114:0.77:-0.26:0.981:1.000 0/0/1/1:4:63,61:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:110,41:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,84:0.46: 0.84:1.000:0.989 0/0/1/1:4:75,55:0.43:-0.55:1.000:0.958 0/1/1/1:4:58,175:0.72: 1.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,84:0.45: 0.94:1.000:0.982 0/0/0/1:4:138,34:0.20: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,25:0.18:-0.21:0.999:0.999 0/0/1/1:4:74,100:0.57: 0.52:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,49:0.28: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:109,35:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,40:0.31:-0.45:1.000:0.979 0/1/1/1:4:34,89:0.70:-0.72:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,73:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/0/0/0:4:192,1:0.01: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,60:0.46:-0.45:1.000:0.988 0/0/0/1:4:121,33:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,38:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,78:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,34:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,70:0.71:-1.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,62:0.53:-0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,33:0.42:-1.77:1.000:0.928 0/0/0/1:4:137,47:0.26: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,36:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,17:0.17:-1.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,106:0.67: 0.04:1.000:0.926 0/0/0/1:4:122,42:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:239,0:0.00: 2.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,82:0.47: 0.67:1.000:0.992 0/0/0/1:4:94,28:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,23:0.19:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,43:0.23: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,107:0.71:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:66,62:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,50:0.52:-1.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:155,57:0.28: 1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,55:0.27: 1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,62:0.41: 0.04:1.000:0.884 0/0/0/1:4:128,44:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,58:0.25: 1.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,40:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,71:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,124:0.68: 0.64:1.000:0.939 0/0/1/1:4:11,17:0.60:-3.03:1.000:0.769 0/0/1/1:4:73,58:0.46:-0.52:1.000:0.984 0/0/1/1:4:78,90:0.54: 0.38:1.000:0.986 0/0/0/1:4:131,62:0.33: 0.99:1.000:0.922 0/0/0/1:4:123,45:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,72:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,56:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,77:0.53:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:103,41:0.29:-0.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:46,101:0.67:-0.13:1.000:0.922 0/0/0/1:4:106,27:0.21:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,71:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,41:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:160,41:0.21: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,41:0.30:-0.33:1.000:0.983 0/0/1/1:4:85,80:0.50: 0.30:0.999:0.997 0/0/0/1:4:100,32:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,107:0.73:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,62:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,82:0.61:-0.45:1.000:0.729 0/0/0/1:4:107,30:0.22:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,46:0.33:-0.21:1.000:0.930 0/0/1/1:4:61,55:0.49:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,60:0.55:-1.01:1.000:0.983 0/0/0/1:4:149,41:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,21:0.13: 0.47:1.000:0.852 0/0/1/1:4:105,88:0.47: 0.99:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,83:0.54: 0.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:165,39:0.20: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,137:0.68: 1.08:1.000:0.946 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,57:0.44:-0.48:1.000:0.968 0/0/1/1:4:99,72:0.43: 0.45:1.000:0.953 -chr7.1 2122072 chr7.1_002122072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:60,134:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,70:0.46: 0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:107,73:0.46: 0.48:1.000:0.986 0/1/1/1:4:52,124:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,122:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,179:0.77: 2.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,70:0.73:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:150,48:0.31: 0.89:1.000:0.975 0/0/1/1:4:90,75:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,27:0.49:-2.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,34:0.47:-1.77:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,80:0.48: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,100:0.54: 1.00:1.000:0.986 0/1/1/1:4:51,108:0.73: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,101:0.49: 1.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,81:0.44: 1.21:0.803:0.961 0/0/1/1:4:110,77:0.46: 0.64:1.000:0.990 0/1/1/1:4:57,167:0.79: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,145:0.74: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,9:0.26:-2.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,98:0.69:-0.13:1.000:0.978 0/0/1/1:4:111,90:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,84:0.52: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:8,10:0.61:-3.20:1.000:0.730 0/0/1/1:4:131,85:0.45: 1.30:1.000:0.977 0/0/1/1:4:105,94:0.52: 0.91:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,180:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,75:0.51: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,92:0.45: 1.60:1.000:0.984 0/1/1/1:4:68,113:0.68: 0.50:1.000:0.945 0/1/1/1:4:56,128:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,37:0.89:-2.63:1.000:0.628 0/1/1/1:4:23,48:0.73:-1.99:1.000:0.998 0/1/1:3:6,5:0.50:-3.36:1.000:0.550 0/1/1/1:4:60,132:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,83:0.44: 1.23:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,172:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,87:0.44: 1.50:1.000:0.968 0/1/1/1:4:75,122:0.67: 0.87:1.000:0.927 0/1/1/1:4:50,111:0.74: 0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,80:0.43: 1.25:1.000:0.944 0/1/1/1:4:75,104:0.63: 0.46:1.000:0.596 0/0/1/1:4:121,71:0.43: 0.75:1.000:0.933 0/1/1/1:4:66,108:0.67: 0.35:1.000:0.933 0/1/1/1:4:53,149:0.78: 0.98:0.997:1.000 0/1/1/1:4:65,108:0.68: 0.32:1.000:0.945 0/0/1/1:4:91,43:0.38:-0.56:1.000:0.579 0/1/1/1:4:81,134:0.68: 1.28:1.000:0.942 0/1/1/1:4:37,59:0.67:-1.43:1.000:0.907 1/1/1/1:4:2,152:0.99:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,30:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,91:0.68:-0.34:1.000:0.964 0/1/1/1:4:61,95:0.66:-0.06:1.000:0.876 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,86:0.67:-0.45:1.000:0.925 0/0/1/1:4:123,62:0.39: 0.60:1.000:0.732 0/1/1/1/1/1:6:12,84:0.90:-1.43:1.000:0.929 1/1/1/1:4:1,122:0.99:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,94:0.72:-0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,94:0.62: 0.14:1.000:0.558 0/1/1/1:4:52,93:0.69:-0.31:1.000:0.979 0/0/1/1:4:123,75:0.43: 0.89:1.000:0.955 0/1/1/1:4:54,102:0.71:-0.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:58,34:0.43:-1.52:1.000:0.933 0/0/0/1:4:176,38:0.25: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,97:0.73:-0.34:0.974:0.997 0/1/1/1:4:43,96:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,70:0.43: 0.60:1.000:0.954 0/0/1/1:4:60,47:0.49:-1.18:0.999:0.996 0/0/1/1:4:84,102:0.60: 0.62:1.000:0.799 0/1/1/1:4:63,100:0.67: 0.10:1.000:0.901 0/1/1/1:4:50,79:0.66:-0.68:1.000:0.896 0/0/1/1:4:82,43:0.40:-0.77:1.000:0.806 0/1/1/1:4:40,79:0.72:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,47:0.39:-0.38:1.000:0.691 0/0/1/1:4:112,62:0.41: 0.35:1.000:0.882 1/1/1/1:4:1,153:0.99:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,79:0.75:-1.02:0.999:0.999 0/0/1/1:4:110,65:0.43: 0.37:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,72:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,67:0.41: 0.71:1.000:0.862 0/1/1/1:4:46,102:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,40:0.42:-1.13:1.000:0.925 0/1/1/1:4:39,79:0.72:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,30:0.26:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:46,82:0.69:-0.70:1.000:0.978 0/1/1/1:4:21,56:0.78:-1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,90:0.69:-0.38:1.000:0.968 0/0/1/1:4:121,68:0.42: 0.69:1.000:0.898 0/1/1/1:4:39,85:0.74:-0.79:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,63:0.43: 0.23:1.000:0.941 0/0/0/1:4:132,17:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,81:0.70:-0.77:1.000:0.986 0/0/0/1:4:98,44:0.37:-0.38:1.000:0.554 0/1/1/1:4:60,107:0.69: 0.19:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,91:0.75:-0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,67:0.68:-1.18:1.000:0.950 0/0/1/1:4:108,66:0.43: 0.35:0.981:0.956 0/0/0/1:4:154,33:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,68:0.43: 0.57:1.000:0.933 0/1/1/1:4:46,75:0.67:-0.86:1.000:0.930 0/1/1/1:4:58,133:0.75: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,76:0.52: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,82:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,53:0.45:-0.56:1.000:0.979 0/1/1/1:4:80,181:0.75: 2.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,53:0.41:-0.25:0.999:0.890 0/0/0/1:4:190,28:0.21: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,36:0.28: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,92:0.59: 0.23:1.000:0.831 0/0/1/1:4:74,41:0.41:-0.99:1.000:0.883 0/1/1/1:4:60,94:0.66:-0.11:1.000:0.884 0/0/1/1:4:97,60:0.44:-0.04:1.000:0.961 0/0/1/1:4:83,66:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,109:0.73: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:133,26:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,91:0.65:-0.15:1.000:0.798 0/1/1/1:4:48,140:0.79: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,94:0.75:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,94:0.70:-0.31:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,95:0.99:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,68:0.66:-1.09:1.000:0.897 0/1/1/1:4:29,66:0.75:-1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,73:0.60:-0.61:1.000:0.756 0/0/1/1:4:87,92:0.56: 0.46:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,53:0.40:-0.06:1.000:0.773 0/0/1/1:4:101,55:0.41:-0.06:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,234:1.00: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,53:0.38: 0.10:1.000:0.628 0/0/1/1:4:85,40:0.38:-0.77:1.000:0.569 1/1/1/1:4:1,79:0.99:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,64:0.67:-1.27:1.000:0.935 0/1/1/1:4:49,79:0.67:-0.70:1.000:0.919 0/0/1/1:4:88,48:0.41:-0.52:1.000:0.864 0/1/1/1:4:56,126:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,72:0.74:-1.22:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,188:1.00: 0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,49:0.30: 1.16:1.000:0.984 0/0/1/1:4:91,74:0.50: 0.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,191:1.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,55:0.43:-0.27:1.000:0.945 0/1/1/1:4:63,174:0.78: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,96:0.52: 1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,26:0.45:-2.11:1.000:0.977 0/0/1/1:4:68,57:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:186,35:0.23: 1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,140:0.79: 0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,169:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,70:0.47: 0.16:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,39:0.29: 0.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:102,83:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,103:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,27:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,85:0.52: 0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,99:0.54: 1.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:117,108:0.53: 1.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:107,73:0.46: 0.48:1.000:0.986 0/1/1/1:4:47,104:0.74:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,132:0.77: 0.55:0.999:1.000 0/1/1/1:4:39,120:0.80: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,88:0.56: 0.30:1.000:0.965 0/1/1/1:4:50,111:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,51:0.45:-0.72:1.000:0.984 0/1/1/1:4:59,109:0.70: 0.21:1.000:0.987 0/1/1/1:4:59,96:0.67:-0.09:1.000:0.928 0/1/1/1:4:48,97:0.72:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,125:0.79: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,134:0.68: 1.28:1.000:0.942 0/1/1/1:4:55,134:0.76: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,106:0.51: 1.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,127:0.75: 0.55:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,201:1.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,60:0.30: 2.23:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,80:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,97:0.74:-0.38:1.000:0.998 -chr7.1 2257846 chr7.1_002257846 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:214,84:0.30: 0.22:1.000:0.984 0/0/1/1:4:124,110:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:219,77:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,202:0.72:-0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:161,149:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,162:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:180,59:0.27:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:212,72:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,128:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,43:0.22:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,47:0.32:-2.36:1.000:0.949 0/1/1/1:4:72,202:0.72:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:236,64:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,164:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,113:0.42:-0.07:1.000:0.907 0/0/0/1:4:227,71:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,67:0.23: 0.45:0.803:1.000 0/0/1/1:4:136,136:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:298,74:0.22: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,71:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,29:0.23:-2.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,124:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:306,89:0.24: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,129:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,46:0.39:-2.91:1.000:0.679 0/0/1/1:4:129,154:0.55:-0.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:171,81:0.34:-0.61:1.000:0.870 0/0/1/1:4:148,119:0.46:-0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:326,83:0.22: 2.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:282,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,91:0.29: 0.91:1.000:0.992 0/1/1/1:4:73,165:0.68:-0.86:1.000:0.951 0/0/1/1:4:56,53:0.50:-3.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,82:0.39:-1.22:1.000:0.735 0/1/1:3:45,45:0.51:-3.53:1.000:0.721 0/0/0/1:4:229,92:0.31: 0.64:1.000:0.980 0/0/0/1:4:226,61:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,140:0.47: 0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:224,78:0.28: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,200:0.70:-0.10:1.000:0.982 0/0/1/1:4:164,117:0.43:-0.09:1.000:0.956 0/1/1/1:4:71,215:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:245,82:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:154,111:0.44:-0.37:1.000:0.961 0/0/0/1:4:240,68:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,133:0.45: 0.36:1.000:0.982 0/0/0/1:4:270,86:0.26: 1.27:0.997:0.999 0/0/1/1:4:27,46:0.63:-3.83:1.000:0.502 0/0/1/1:4:99,103:0.52:-1.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:114,116:0.52:-1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,126:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,266:0.71: 1.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:67,180:0.71:-0.70:1.000:0.991 0/0/0/1:4:235,78:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:135,122:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,132:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,193:0.70:-0.32:1.000:0.987 0/0/0/1:4:268,72:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,63:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:109,128:0.55:-0.88:1.000:0.753 0/0/1/1:4:178,131:0.44: 0.42:1.000:0.969 0/0/1/1:4:126,124:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,149:0.46: 0.94:1.000:0.986 0/0/1/1:4:153,121:0.46:-0.21:1.000:0.987 0/0/0/1:4:228,72:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,130:0.48:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:221,51:0.20:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,56:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,143:0.47: 0.49:0.974:0.993 0/0/1/1:4:137,128:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:345,0:0.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,180:0.55: 0.89:0.999:0.983 0/0/1/1:4:175,150:0.48: 0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:243,87:0.28: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:162,151:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,141:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,187:0.74:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,145:0.48: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,165:0.53: 0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:155,136:0.48: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,100:0.43:-0.79:0.999:0.948 0/0/1/1:4:141,142:0.52:-0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:116,232:0.66: 1.12:1.000:0.844 0/0/0/1:4:175,49:0.24:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,87:0.28: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,153:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/0:4:254,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,120:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/0/0/0:4:269,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,130:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,70:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,114:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,75:0.24: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,95:0.56:-2.03:1.000:0.973 0/0/0/1:4:279,88:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,61:0.23:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,66:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,191:0.70:-0.37:1.000:0.987 0/0/1/1:4:160,148:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,140:0.54:-0.41:1.000:0.986 0/0/1/1:4:210,147:0.43: 1.28:1.000:0.945 0/0/1/1:4:166,147:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,118:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:255,164:0.41: 2.40:0.981:0.859 0/0/0/0:4:285,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,55:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,110:0.42:-0.28:1.000:0.932 0/1/1/1:4:52,192:0.76:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,179:0.53: 1.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:161,129:0.46: 0.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:223,79:0.28: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:288,104:0.28: 1.91:1.000:0.994 0/0/0/0:4:336,0:0.00: 0.91:0.999:1.000 0/0/0/0:4:418,0:0.00: 2.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,60:0.34:-1.81:1.000:0.850 0/0/0/1:4:313,86:0.23: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,74:0.26: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:218,52:0.21:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,161:0.55: 0.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:114,119:0.52:-0.95:1.000:0.994 0/0/0/1:4:224,72:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:257,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,129:0.44: 0.38:1.000:0.963 0/0/1/1:4:146,128:0.48:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:227,70:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:252,93:0.29: 1.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:94,224:0.69: 0.58:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,238:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,126:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,112:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,68:0.22: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,68:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,133:0.67:-1.62:1.000:0.905 0/0/0/1:4:200,69:0.28:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:205,57:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,187:0.50: 1.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:214,63:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:281,61:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,171:0.69:-0.77:1.000:0.970 0/0/0/1:4:235,56:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,74:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,77:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:77,193:0.70:-0.28:1.000:0.983 0/0/1/1:4:107,98:0.49:-1.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,234:0.70: 0.73:1.000:0.985 0/1/1/1:4:101,263:0.70: 1.41:1.000:0.988 0/0/0/0:4:309,1:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,130:0.48:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,161:0.48: 1.18:1.000:0.994 0/0/0/0:4:285,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,159:0.51: 0.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:208,72:0.28:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/0:4:192,7:0.04:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,55:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,70:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,168:0.49: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:201,181:0.49: 1.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:233,71:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:277,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:328,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,54:0.21:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,58:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/0/0/0:4:285,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,63:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,70:0.25: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,139:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,179:0.67:-0.43:1.000:0.922 0/0/1/1:4:168,131:0.46: 0.24:0.999:0.984 0/0/0/1:4:245,71:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,126:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,116:0.53:-1.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:167,59:0.28:-1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,125:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:173,53:0.25:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,124:0.54:-0.90:1.000:0.990 0/0/1/1:4:118,120:0.52:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:177,187:0.53: 1.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:209,150:0.44: 1.32:1.000:0.959 0/0/0/1:4:210,80:0.29: 0.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:111,159:0.59:-0.28:1.000:0.864 0/1/1/1:4:75,182:0.69:-0.52:1.000:0.976 0/0/0/1:4:271,96:0.28: 1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:186,174:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:195,50:0.22:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,137:0.51:-0.16:1.000:0.996 -chr7.1 2410592 chr7.1_002410592 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:53,173:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.21:1.000:. ./.:4:66,201:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,296:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,381:.: 2.33:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.24:1.000:. ./.:4:57,221:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,223:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,68:.:-2.51:1.000:. ./.:4:9,57:.:-2.54:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,132:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,209:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.44:1.000:. ./.:4:53,188:.: 0.16:1.000:. ./.:4:80,232:.: 1.26:0.803:. ./.:4:56,227:.: 0.81:1.000:. ./.:4:105,241:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,353:.: 1.90:1.000:. ./.:4:1,70:.:-2.47:1.000:. ./.:4:73,219:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,210:.: 0.80:1.000:. ./.:4:69,202:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,59:.:-2.65:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.04:1.000:. ./.:4:69,188:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,186:.: 0.55:1.000:. ./.:4:80,210:.: 0.92:1.000:. ./.:4:59,214:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,40:.:-2.82:1.000:. ./.:4:0,87:.:-2.22:1.000:. ./.:3:0,31:.:-3.09:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.13:1.000:. ./.:4:46,168:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.44:1.000:. ./.:4:75,165:.: 0.15:1.000:. ./.:4:93,250:.: 1.74:1.000:. ./.:4:53,166:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,166:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.75:0.997:. ./.:4:0,93:.:-2.13:1.000:. ./.:4:0,151:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,131:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,206:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,153:.:-0.32:1.000:. ./.:6:0,182:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.29:1.000:. ./.:4:50,165:.:-0.24:1.000:. ./.:4:63,128:.:-0.61:1.000:. ./.:4:56,200:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.29:0.974:. ./.:4:0,202:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,241:.: 0.18:1.000:. ./.:4:47,139:.:-0.69:0.999:. ./.:4:0,235:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.45:1.000:. ./.:4:56,222:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.75:1.000:. ./.:4:51,170:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,122:.:-1.68:0.999:. ./.:4:0,249:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.51:1.000:. ./.:4:52,182:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.55:1.000:. ./.:4:44,97:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.72:1.000:. ./.:4:72,147:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.59:1.000:. ./.:4:67,178:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.69:1.000:. ./.:4:52,173:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,225:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,141:.:-1.38:1.000:. ./.:4:52,198:.: 0.30:0.981:. ./.:4:59,130:.:-0.64:1.000:. ./.:4:80,167:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,324:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,338:.: 1.67:1.000:. ./.:4:61,216:.: 0.72:1.000:. ./.:4:60,181:.: 0.16:1.000:. ./.:4:96,231:.: 1.50:1.000:. ./.:4:54,155:.:-0.33:0.999:. ./.:4:79,275:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,130:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.23:1.000:. ./.:4:57,186:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,153:.:-0.22:1.000:. ./.:4:59,136:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,250:.: 0.30:1.000:. ./.:4:66,232:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,144:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,144:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,208:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,141:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.75:1.000:. ./.:4:54,180:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,305:.: 1.16:1.000:. ./.:4:78,216:.: 0.99:1.000:. ./.:4:58,133:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.18:1.000:. ./.:4:51,122:.:-0.89:1.000:. ./.:4:68,132:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,297:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.34:1.000:. ./.:4:73,210:.: 0.81:1.000:. ./.:4:68,170:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,287:.: 0.88:1.000:. ./.:4:58,155:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,370:.: 2.16:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,57:.:-2.68:1.000:. ./.:4:0,163:.:-1.04:1.000:. ./.:4:88,246:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.75:1.000:. ./.:4:95,279:.: 2.22:1.000:. ./.:4:52,162:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.04:1.000:. ./.:4:52,149:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,178:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.22:1.000:. ./.:4:59,198:.: 0.41:1.000:. ./.:4:69,215:.: 0.83:1.000:. ./.:4:61,188:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,331:.: 1.56:0.999:. ./.:4:0,213:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1,172:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,343:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,300:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,303:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,312:.: 1.26:1.000:. ./.:4:95,259:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.18:1.000:. -chr7.1 2611065 chr7.1_002611065 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:50,162:0.76: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,47:0.26:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,104:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,163:0.72: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,104:0.47: 0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:113,141:0.55: 1.56:1.000:0.983 0/1/1/1:4:24,66:0.73:-2.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:167,60:0.26: 0.95:1.000:0.998 0/0/0/1:4:110,36:0.25:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,46:0.65:-2.59:1.000:0.815 0/0/1/1:4:25,23:0.47:-3.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,74:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,82:0.47:-0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:91,98:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,100:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,59:0.29: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:123,125:0.49: 1.43:0.803:0.997 0/0/0/1:4:166,54:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,191:0.77: 1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,183:0.74: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,17:0.29:-2.84:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,151:0.79: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,53:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,79:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,23:0.60:-3.31:1.000:0.801 0/0/1/1:4:108,126:0.53: 1.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:94,101:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,142:0.69: 0.46:1.000:0.973 0/0/1/1:4:119,104:0.46: 0.86:1.000:0.986 0/0/1/1:4:103,126:0.54: 1.00:1.000:0.986 0/0/1/1:4:103,102:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,110:0.49: 0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,23:0.77:-3.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,38:0.47:-2.39:1.000:0.993 0/0/1:3:11,8:0.41:-3.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,101:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:138,54:0.28: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,158:0.71: 0.86:1.000:0.989 0/0/1/1:4:103,107:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,136:0.58: 1.04:1.000:0.907 0/1/1/1:4:50,175:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,168:0.74: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,55:0.28: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,77:0.47:-0.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:138,46:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,162:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,160:0.74: 0.71:0.997:0.999 0/0/1/1:4:113,143:0.55: 1.61:1.000:0.979 0/0/1/1:4:75,93:0.55:-0.38:1.000:0.984 0/0/1/1:4:90,114:0.55: 0.43:1.000:0.979 0/1/1/1:4:32,111:0.78:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,183:0.79: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,146:0.72: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,63:0.28: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,101:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:116,124:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:41,160:0.80: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,126:0.71:-0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:112,87:0.43: 0.32:1.000:0.946 0/0/1/1/1/1:6:58,120:0.67:-0.15:1.000:0.921 0/1/1/1:4:48,124:0.72:-0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,145:0.70: 0.46:1.000:0.989 0/1/1/1:4:63,170:0.73: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,85:0.44: 0.12:1.000:0.967 0/0/1/1:4:109,123:0.52: 1.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,160:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,25:0.21:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,50:0.29:-0.29:1.000:0.992 0/1/1/1:4:41,125:0.75:-0.42:0.974:0.999 0/0/1/1:4:84,97:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,119:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,43:0.53:-2.37:0.999:0.993 0/0/1/1:4:93,104:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,108:0.53: 0.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,110:0.54: 0.37:1.000:0.988 0/0/1/1:4:77,113:0.59: 0.12:1.000:0.876 0/0/1/1:4:81,85:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,112:0.53: 0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:147,59:0.28: 0.48:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,131:0.78:-0.38:0.999:1.000 0/0/1/1:4:112,100:0.46: 0.62:1.000:0.989 0/1/1/1:4:47,155:0.77: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,80:0.45:-0.27:1.000:0.984 0/0/0/1:4:120,38:0.24:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,142:0.72: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:52,74:0.58:-1.33:1.000:0.913 0/0/1/1:4:75,69:0.47:-0.92:1.000:0.992 0/0/0/1:4:94,39:0.29:-1.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:76,80:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,114:0.76:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,139:0.72: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:178,76:0.30: 1.56:1.000:0.988 0/1/1/1:4:46,125:0.73:-0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,119:0.52: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,38:0.23:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,36:0.25:-0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,45:0.28:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,95:0.49: 0.16:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,84:0.46:-0.15:1.000:0.989 0/1/1/1:4:37,100:0.73:-1.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:215,0:0.00: 0.68:0.981:1.000 0/0/0/1:4:119,40:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,100:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:93,105:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,106:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,67:0.29: 0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:136,55:0.29: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,87:0.52:-0.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,158:0.71: 0.84:1.000:0.991 0/0/1/1:4:85,99:0.53:-0.02:0.999:0.992 0/0/0/1:4:186,42:0.18: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,136:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,69:0.59:-1.55:1.000:0.876 0/1/1/1:4:30,138:0.82:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,50:0.27:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,91:0.52:-0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,159:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,49:0.31:-0.58:1.000:0.980 0/1/1/1:4:63,199:0.76: 1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,156:0.72: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,122:0.72:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,91:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,135:0.70: 0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:119,44:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,61:0.51:-1.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,67:0.48:-1.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,120:0.70:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:108,105:0.48: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,123:0.81:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,53:0.29:-0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:91,93:0.50:-0.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,257:1.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,58:0.27: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,98:0.57:-0.33:1.000:0.949 0/1/1/1:4:57,149:0.72: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,140:0.79:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,89:0.47:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,47:0.28:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,81:0.48:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,72:0.47:-0.76:1.000:0.992 0/1/1/1:4:48,197:0.80: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,178:0.74: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,31:0.18:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,96:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,175:0.75: 1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,96:0.53:-0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:123,128:0.50: 1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,39:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,24:0.45:-3.00:1.000:0.983 0/0/1/1:4:73,71:0.48:-0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,57:0.27: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,149:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,148:0.73: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:129,47:0.27:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,39:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,97:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,145:0.79:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,103:0.48: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,100:0.51: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,127:0.52: 1.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:115,110:0.48: 0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,84:0.49:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,91:0.50:-0.15:0.999:0.997 0/1/1/1:4:49,120:0.71:-0.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:132,37:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,69:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,36:0.22:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,129:0.69: 0.01:1.000:0.979 0/1/1/1:4:45,157:0.78: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,89:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,97:0.53:-0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:55,192:0.78: 1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,150:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,115:0.55: 0.50:1.000:0.982 0/0/1/1:4:81,96:0.53:-0.17:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,138:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:228,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,202:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,71:0.53:-1.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:95,102:0.51: 0.28:1.000:0.996 -chr7.1 2678640 chr7.1_002678640 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:557,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:437,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:576,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:473,166:.: 1.49:1.000:. ./.:4:462,158:.: 1.26:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:390,135:.: 0.08:1.000:. ./.:4:510,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:318,76:.:-1.55:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:473,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:497,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:433,155:.: 0.86:0.803:. ./.:4:596,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:611,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:381,125:.:-0.16:1.000:. ./.:4:517,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:377,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:525,163:.: 2.10:1.000:. ./.:4:435,107:.: 0.29:1.000:. ./.:4:534,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:598,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:644,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:356,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:326,86:.:-1.32:1.000:. ./.:3:317,60:.:-1.76:1.000:. ./.:4:406,144:.: 0.39:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:489,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:604,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:509,175:.: 2.05:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:492,148:.: 1.50:1.000:. ./.:4:553,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:494,145:.: 1.49:0.997:. ./.:4:439,119:.: 0.49:1.000:. ./.:4:413,151:.: 0.56:1.000:. ./.:4:551,157:.: 2.35:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:450,154:.: 1.06:1.000:. ./.:4:511,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:610,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:498,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:664,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.08:1.000:. ./.:6:408,33:.:-0.96:1.000:. ./.:4:478,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:385,144:.: 0.13:1.000:. ./.:4:469,150:.: 1.24:1.000:. ./.:4:408,120:.: 0.11:1.000:. ./.:4:419,155:.: 0.69:1.000:. ./.:4:497,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:404,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:341,141:.:-0.46:1.000:. ./.:4:449,138:.: 0.85:0.974:. ./.:4:493,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:451,178:.: 1.37:1.000:. ./.:4:495,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:674,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:394,140:.: 0.19:1.000:. ./.:4:566,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:385,153:.: 0.24:1.000:. ./.:4:480,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:346,121:.:-0.64:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:427,0:.:-1.14:0.999:. ./.:4:439,125:.: 0.56:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:536,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:412,126:.: 0.24:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:382,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:355,108:.:-0.69:1.000:. ./.:4:346,116:.:-0.70:1.000:. ./.:4:421,121:.: 0.29:1.000:. ./.:4:325,115:.:-0.98:1.000:. ./.:4:517,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:395,122:.:-0.02:1.000:. ./.:4:336,124:.:-0.73:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:387,124:.:-0.10:1.000:. ./.:4:309,106:.:-1.29:1.000:. ./.:4:381,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:379,142:.: 0.03:1.000:. ./.:4:394,137:.: 0.15:1.000:. ./.:4:457,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:390,191:.: 0.77:1.000:. ./.:4:350,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:519,124:.: 1.54:0.981:. ./.:4:301,112:.:-1.31:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:358,107:.:-0.67:1.000:. ./.:4:529,166:.: 2.19:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:656,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:469,1:.:-0.60:0.999:. ./.:4:381,259:.: 1.50:1.000:. ./.:4:205,189:.:-1.55:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:400,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:415,153:.: 0.61:1.000:. ./.:4:357,88:.:-0.92:1.000:. ./.:4:359,127:.:-0.41:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:340,118:.:-0.75:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:486,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:432,137:.: 0.62:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:438,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:271,94:.:-1.91:1.000:. ./.:4:284,92:.:-1.77:1.000:. ./.:4:462,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:438,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:350,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:445,135:.: 0.76:1.000:. ./.:4:365,107:.:-0.58:1.000:. ./.:4:681,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:383,160:.: 0.30:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:400,124:.: 0.07:1.000:. ./.:4:364,110:.:-0.56:1.000:. ./.:4:259,119:.:-1.75:1.000:. ./.:4:698,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:783,1:.: 3.29:1.000:. ./.:4:370,143:.:-0.07:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:465,143:.: 1.11:1.000:. ./.:4:336,121:.:-0.77:1.000:. ./.:4:294,100:.:-1.55:1.000:. ./.:4:300,99:.:-1.49:1.000:. ./.:4:439,145:.: 0.81:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:384,126:.:-0.11:1.000:. ./.:4:321,123:.:-0.93:1.000:. ./.:4:454,161:.: 1.19:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:337,115:.:-0.83:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:367,157:.: 0.07:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:508,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:472,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:548,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:346,133:.:-0.49:1.000:. ./.:4:351,113:.:-0.68:1.000:. ./.:4:326,90:.:-1.28:1.000:. ./.:4:420,134:.: 0.44:1.000:. ./.:4:343,99:.:-0.95:1.000:. ./.:4:340,123:.:-0.69:1.000:. ./.:4:420,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:363,130:.:-0.32:1.000:. ./.:4:365,79:.:-0.93:1.000:. ./.:4:577,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:467,128:.: 0.95:1.000:. ./.:4:655,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:389,118:.:-0.15:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.44:1.000:. -chr7.1 2888102 chr7.1_002888102 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:27,98:0.78: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,52:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,44:0.32: 0.63:1.000:0.962 0/0/0/1:4:99,30:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,77:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,68:0.55: 0.01:1.000:0.978 0/0/1/1:4:27,28:0.50:-2.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,40:0.34:-0.11:1.000:0.857 0/0/0/1:4:87,34:0.29:-0.02:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,32:0.66:-2.37:1.000:0.872 0/0/0/1:4:30,6:0.17:-2.76:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,65:0.60:-0.47:1.000:0.777 0/0/0/1:4:96,35:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,60:0.57:-0.53:1.000:0.957 0/0/1/1:4:58,76:0.56: 0.40:1.000:0.965 0/0/1/1:4:66,70:0.51: 0.47:0.803:0.996 0/0/0/1:4:123,30:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,140:0.79: 1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,77:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,24:0.44:-2.18:1.000:0.970 0/0/1/1:4:61,82:0.57: 0.69:1.000:0.952 0/0/1/1:4:67,51:0.43:-0.11:1.000:0.948 0/0/0/1:4:59,27:0.32:-1.15:1.000:0.958 0/0/1/1:4:15,11:0.42:-3.08:1.000:0.921 0/0/0/1:4:97,27:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,47:0.49:-0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,101:0.77: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,76:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,72:0.53: 0.40:1.000:0.992 0/1/1/1:4:28,118:0.80: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,60:0.60:-0.73:1.000:0.789 0/0/1/1:4:9,11:0.54:-3.27:1.000:0.985 0/1/1/1:4:16,30:0.65:-2.44:1.000:0.755 1/1/1:3:0,7:1.00:-3.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,97:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,48:0.43:-0.37:1.000:0.957 0/1/1/1:4:32,117:0.78: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,51:0.44:-0.21:1.000:0.969 0/0/1/1:4:68,63:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,64:0.51: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,109:0.73: 0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,74:0.55: 0.40:1.000:0.983 0/0/1/1:4:64,60:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,70:0.52: 0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,68:0.56:-0.05:1.000:0.965 0/1/1/1:4:45,102:0.69: 0.82:0.997:0.970 0/0/0/1:4:18,6:0.26:-3.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,27:0.25:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,35:0.50:-1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,47:0.45:-0.57:1.000:0.979 0/1/1/1:4:44,146:0.76: 2.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,117:0.77: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,40:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,83:0.60: 0.50:1.000:0.791 0/0/1/1:4:59,57:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,105:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,54:0.44:-0.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:71,67:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:46,98:0.67: 0.72:1.000:0.920 0/1/1/1:4:40,118:0.74: 1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,70:0.52: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,69:0.45: 0.95:1.000:0.983 0/0/1/1:4:42,65:0.60:-0.47:1.000:0.777 0/0/0/1:4:104,42:0.29: 0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:66,66:0.49: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,32:0.48:-1.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,32:0.28:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,62:0.48: 0.18:0.974:0.996 0/1/1/1:4:20,101:0.83:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,68:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:59,9:0.14:-1.73:0.999:0.970 0/1/1/1:4:34,92:0.72: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,103:0.79: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,75:0.72:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,35:0.28: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,75:0.58: 0.24:1.000:0.930 0/0/0/1:4:84,45:0.35: 0.24:1.000:0.781 0/0/0/1:4:125,58:0.32: 1.98:1.000:0.951 0/1/1/1:4:26,98:0.78: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,85:0.77:-0.37:0.999:1.000 0/0/0/1:4:116,43:0.28: 1.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,103:0.70: 0.79:1.000:0.984 0/0/0/1:4:91,31:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,51:0.51:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,74:0.49: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,49:0.44:-0.37:1.000:0.972 0/0/1/1:4:49,53:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:83,36:0.31:-0.08:1.000:0.977 0/0/1/1:4:68,64:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,76:0.68:-0.37:1.000:0.964 0/0/1/1:4:69,55:0.44: 0.08:1.000:0.969 0/0/1/1:4:88,81:0.48: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,56:0.53:-0.53:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,115:0.75: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,35:0.28: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,33:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,95:0.79:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,32:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,112:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,39:0.63:-1.95:1.000:0.607 0/1/1/1:4:32,86:0.72:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,33:0.44:-1.50:1.000:0.964 0/0/0/1:4:115,60:0.35: 1.72:0.981:0.830 0/0/0/1:4:96,31:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,72:0.56: 0.18:1.000:0.965 0/0/1/1:4:57,54:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,72:0.56: 0.21:1.000:0.972 0/0/0/1:4:117,45:0.28: 1.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:105,34:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,29:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,126:0.73: 1.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,62:0.44: 0.56:0.999:0.972 0/0/0/1:4:136,33:0.20: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,26:0.36:-1.60:1.000:0.654 0/0/1/1:4:84,84:0.49: 1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,15:0.17:-0.92:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,89:0.77:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,37:0.29: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:102,35:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,103:0.80: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,34:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:98,74:0.43: 1.63:1.000:0.943 0/0/1/1:4:63,55:0.46:-0.11:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,57:0.53:-0.47:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,101:0.72: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,96:0.76: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,53:0.58:-1.02:1.000:0.901 0/1/1/1:4:26,67:0.71:-0.92:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,61:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,76:0.53: 0.63:1.000:0.991 0/1/1/1:4:23,50:0.68:-1.57:1.000:0.950 0/0/1/1:4:75,62:0.45: 0.50:1.000:0.980 0/0/1/1:4:66,71:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,111:0.71: 1.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,67:0.53: 0.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:74,19:0.21:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,96:0.79:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,85:0.71:-0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:36,98:0.72: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,70:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,77:0.53: 0.72:1.000:0.992 0/0/1/1:4:46,51:0.52:-0.79:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,104:0.69: 0.88:1.000:0.976 0/1/1/1:4:38,89:0.69: 0.18:1.000:0.979 0/0/0/1:4:95,29:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,27:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,113:0.80: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,69:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,93:0.60: 1.05:1.000:0.807 0/0/1/1:4:73,68:0.48: 0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,15:0.47:-2.89:1.000:0.990 0/0/0/1:4:76,29:0.28:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:88,32:0.27:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,64:0.47: 0.47:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,107:0.68: 1.11:1.000:0.953 0/0/1/1:4:58,68:0.53: 0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:83,22:0.22:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,75:0.55: 0.47:1.000:0.984 0/0/1/1:4:77,53:0.41: 0.27:1.000:0.846 0/0/0/1:4:84,38:0.32: 0.01:1.000:0.964 0/0/1/1:4:63,59:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,30:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,39:0.58:-1.76:1.000:0.928 0/0/0/1:4:90,22:0.20:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,42:0.46:-1.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:31,73:0.70:-0.57:0.999:0.981 0/0/1/1:4:65,66:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,34:0.34:-0.66:1.000:0.872 0/0/1/1:4:63,56:0.47:-0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:47,55:0.53:-0.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:61,68:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,107:0.77: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,72:0.77:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,50:0.49:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,73:0.52: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,80:0.56: 0.66:1.000:0.971 0/0/0/1:4:97,30:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,104:0.74: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,107:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,32:0.22: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,110:0.73: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,26:0.30:-1.05:1.000:0.987 0/1/1/1:4:31,101:0.76: 0.34:1.000:1.000 -chr7.1 3057288 chr7.1_003057288 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:16,6:.: 2.31:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,6:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,10:.: 1.80:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:11,5:.: 1.30:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,5:.: 0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,10:.: 3.32:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.39:0.803:. ./.:4:38,12:.: 7.04:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:14,4:.: 1.64:1.000:. ./.:4:11,4:.: 1.13:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,5:.: 1.30:1.000:. ./.:4:9,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.23:1.000:. ./.:3:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:7,8:.: 1.13:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:5,6:.: 0.45:0.997:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:3,4:.:-0.22:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./.:6:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:9,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:2,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.39:0.999:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:7,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.73:0.981:. ./.:4:6,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,8:.: 2.65:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.39:0.999:. ./.:4:7,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,5:.: 2.82:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:13,5:.: 1.64:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,4:.:-0.05:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:10,1:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:7,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,6:.: 0.79:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.79:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:5,6:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.96:1.000:. ./.:4:8,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:19,11:.: 3.66:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:8,6:.: 0.96:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:6,5:.: 0.45:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:12,5:.: 1.47:1.000:. ./.:4:9,3:.: 0.62:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:5,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:8,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:10,3:.: 0.79:1.000:. ./.:4:15,3:.: 1.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.12:1.000:. -chr7.1 3353771 chr7.1_003353771 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:156,70:0.24: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,75:0.31: 0.65:1.000:0.977 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,148:0.73: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,209:0.82: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,66:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,69:0.23: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,40:0.58:-1.63:1.000:0.927 0/0/0/1:4:72,12:0.11:-1.25:1.000:0.564 0/1/1/1:4:25,63:0.63:-1.19:1.000:0.500 0/0/0/0:4:239,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:275,0:0.00: 1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,178:0.60: 1.58:0.803:0.752 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,96:0.25: 2.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,90:0.23: 2.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,13:0.15:-1.50:1.000:0.986 0/0/0/1:4:79,53:0.34:-0.47:1.000:0.891 0/0/0/0:4:248,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,91:0.40: 0.56:1.000:0.815 0/0/0/1:4:179,105:0.30: 2.01:1.000:0.982 0/0/1/1:4:81,65:0.38:-0.24:1.000:0.582 0/0/0/0:4:244,1:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,90:0.21: 2.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,87:0.24: 2.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,1:0.01:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,22:0.38:-1.82:1.000:0.630 0/0/0/1:4:44,9:0.13:-1.76:1.000:0.938 0/0/1:3:20,12:0.31:-2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,164:0.55: 1.66:1.000:0.979 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,73:0.36: 0.16:1.000:0.663 0/0/0/0:4:221,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,50:0.28:-0.27:1.000:0.995 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,70:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,55:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,134:0.56: 0.83:0.997:0.971 0/0/0/1:4:93,61:0.33:-0.11:1.000:0.918 0/0/0/1:4:86,51:0.31:-0.39:1.000:0.979 0/1/1/1:4:30,100:0.67:-0.50:1.000:0.914 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,1:0.01:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,53:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,56:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:71,44:0.32:-0.75:1.000:0.912 0/0/0/1:4:92,50:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,109:0.71:-0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,96:0.70:-0.68:1.000:0.984 0/1/1/1:4:29,102:0.68:-0.49:1.000:0.943 0/0/1/1:4:81,127:0.54: 0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:71,68:0.43:-0.36:1.000:0.935 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,64:0.36:-0.16:1.000:0.699 0/1/1/1:4:18,113:0.74:-0.49:0.974:0.999 0/0/1/1:4:53,58:0.46:-0.81:1.000:0.988 0/0/1/1:4:139,113:0.38: 1.48:1.000:0.623 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.29:0.999:1.000 0/0/0/1:4:102,69:0.34: 0.16:1.000:0.880 0/0/1/1:4:78,142:0.57: 0.96:1.000:0.951 0/0/0/1:4:77,55:0.35:-0.47:1.000:0.776 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,41:0.51:-1.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,49:0.34:-0.67:1.000:0.848 0/0/0/1:4:91,52:0.30:-0.29:1.000:0.987 0/0/0/1:4:67,31:0.25:-1.02:0.999:0.999 0/0/0/1:4:110,62:0.29: 0.18:1.000:0.989 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,48:0.20: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,55:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,53:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,92:0.66:-0.63:1.000:0.843 0/0/1/1:4:94,77:0.39: 0.16:1.000:0.647 0/1/1/1:4:17,121:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,86:0.48:-0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:74,47:0.32:-0.65:1.000:0.946 0/0/0/1:4:119,48:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,86:0.80:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,127:0.55: 0.70:1.000:0.980 0/0/1/1:4:66,116:0.56: 0.34:1.000:0.965 0/0/0/1:4:87,36:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,44:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,65:0.37:-0.21:1.000:0.500 0/0/0/1:4:85,54:0.32:-0.36:1.000:0.946 0/0/0/1:4:74,50:0.34:-0.60:1.000:0.882 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,34:0.16: 0.15:0.981:0.994 0/0/1/1:4:84,79:0.42: 0.03:1.000:0.919 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,64:0.64:-1.20:1.000:0.703 0/0/1/1:4:96,77:0.38: 0.20:1.000:0.580 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,44:0.25:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,86:0.21: 2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,44:0.19: 0.34:0.999:1.000 0/0/1/1:4:102,151:0.53: 1.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,91:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/0/0/1:4:106,51:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,53:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,88:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:82,46:0.29:-0.54:1.000:0.990 0/0/0/1:4:72,47:0.33:-0.68:1.000:0.923 0/0/0/1:4:117,52:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,64:0.33:-0.01:1.000:0.900 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,69:0.33: 0.21:1.000:0.916 0/0/0/1:4:110,40:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,120:0.59: 0.26:1.000:0.834 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,69:0.71:-1.25:1.000:0.992 0/0/0/1:4:68,34:0.27:-0.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,49:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,57:0.27: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,96:0.53:-0.01:1.000:0.992 0/0/0/1:4:128,87:0.34: 0.88:1.000:0.873 0/0/1/1:4:68,116:0.56: 0.38:1.000:0.973 0/0/0/1:4:84,35:0.23:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,37:0.23:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,40:0.19: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,26:0.17:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,63:0.70:-1.35:1.000:0.985 0/1/1/1:4:17,62:0.68:-1.33:1.000:0.956 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,133:0.44: 1.73:1.000:0.958 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,80:0.33: 0.67:1.000:0.918 0/0/0/1:4:168,72:0.24: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,180:0.81: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,73:0.27: 0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,39:0.38:-1.19:1.000:0.555 0/0/1/1:4:88,131:0.53: 0.95:1.000:0.992 0/0/0/1:4:170,98:0.30: 1.74:1.000:0.986 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,90:0.37: 0.73:1.000:0.531 0/0/1/1:4:75,139:0.57: 0.87:1.000:0.943 0/0/1/1:4:136,121:0.41: 1.57:1.000:0.846 0/0/1/1:4:159,145:0.41: 2.33:1.000:0.884 0/0/0/1:4:150,57:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,68:0.28: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:195,74:0.22: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,134:0.52: 1.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:249,1:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,61:0.36:-0.27:0.999:0.702 0/0/0/1:4:148,66:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,82:0.42: 0.13:1.000:0.921 0/1/1/1:4:11,108:0.78:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,60:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,116:0.80:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,111:0.59: 0.08:1.000:0.881 0/0/1/1:4:64,56:0.40:-0.67:1.000:0.815 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:217,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,141:0.55: 1.04:1.000:0.977 0/0/1/1:4:94,74:0.38: 0.12:1.000:0.518 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,108:0.27: 2.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,100:0.39: 0.93:1.000:0.742 0/0/1/1:4:78,126:0.55: 0.70:1.000:0.984 0/0/1/1:4:70,55:0.38:-0.58:1.000:0.511 -chr7.1 3453072 chr7.1_003453072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:329,200:.: 0.85:1.000:. ./.:4:171,188:.:-0.70:1.000:. ./.:4:163,322:.: 0.45:1.000:. ./.:4:310,106:.:-0.18:1.000:. ./.:4:510,138:.: 1.94:1.000:. ./.:4:523,140:.: 2.08:1.000:. ./.:4:257,171:.:-0.07:1.000:. ./.:4:200,189:.:-0.42:1.000:. ./.:4:205,195:.:-0.32:1.000:. ./.:4:132,62:.:-2.20:1.000:. ./.:4:70,82:.:-2.58:1.000:. ./.:4:359,93:.: 0.15:1.000:. ./.:4:214,188:.:-0.30:1.000:. ./.:4:223,214:.: 0.02:1.000:. ./.:4:295,94:.:-0.42:1.000:. ./.:4:234,197:.:-0.04:1.000:. ./.:4:311,223:.: 0.90:0.803:. ./.:4:360,121:.: 0.42:1.000:. ./.:4:359,269:.: 1.76:1.000:. ./.:4:378,241:.: 1.67:1.000:. ./.:4:142,47:.:-2.25:1.000:. ./.:4:324,213:.: 0.93:1.000:. ./.:4:289,260:.: 1.04:1.000:. ./.:4:168,190:.:-0.70:1.000:. ./.:4:60,29:.:-3.16:1.000:. ./.:4:356,124:.: 0.41:1.000:. ./.:4:338,130:.: 0.30:1.000:. ./.:4:345,110:.: 0.18:1.000:. ./.:4:229,278:.: 0.65:1.000:. ./.:4:196,287:.: 0.43:1.000:. ./.:4:341,204:.: 1.00:1.000:. ./.:4:267,83:.:-0.78:1.000:. ./.:4:81,63:.:-2.66:1.000:. ./.:4:211,1:.:-2.04:1.000:. ./.:3:77,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:419,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:235,232:.: 0.29:1.000:. ./.:4:357,101:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,163:.:-0.82:1.000:. ./.:4:289,91:.:-0.50:1.000:. ./.:4:261,163:.:-0.10:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:301,91:.:-0.39:1.000:. ./.:4:290,89:.:-0.51:1.000:. ./.:4:299,109:.:-0.25:1.000:. ./.:4:301,98:.:-0.33:1.000:. ./.:4:459,111:.: 1.23:0.997:. ./.:4:529,152:.: 2.24:1.000:. ./.:4:255,75:.:-0.96:1.000:. ./.:4:428,83:.: 0.69:1.000:. ./.:4:238,83:.:-1.04:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:187,228:.:-0.19:1.000:. ./.:4:291,95:.:-0.45:1.000:. ./.:4:335,94:.:-0.06:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:287,204:.: 0.51:1.000:. ./.:4:173,168:.:-0.86:1.000:. ./.:6:318,39:.:-0.71:1.000:. ./.:4:406,105:.: 0.69:1.000:. ./.:4:416,100:.: 0.74:1.000:. ./.:4:436,111:.: 1.02:1.000:. ./.:4:337,77:.:-0.19:1.000:. ./.:4:320,223:.: 0.98:1.000:. ./.:4:262,173:.: 0.00:1.000:. ./.:4:140,126:.:-1.54:1.000:. ./.:4:193,205:.:-0.34:1.000:. ./.:4:369,104:.: 0.34:0.974:. ./.:4:254,165:.:-0.15:1.000:. ./.:4:340,208:.: 1.03:1.000:. ./.:4:180,177:.:-0.71:0.999:. ./.:4:355,210:.: 1.18:1.000:. ./.:4:439,104:.: 0.98:1.000:. ./.:4:295,185:.: 0.41:1.000:. ./.:4:219,190:.:-0.24:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:215,195:.:-0.23:1.000:. ./.:4:299,87:.:-0.45:1.000:. ./.:4:337,112:.: 0.12:1.000:. ./.:4:234,159:.:-0.39:0.999:. ./.:4:330,108:.: 0.02:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:189,259:.: 0.12:1.000:. ./.:4:295,99:.:-0.38:1.000:. ./.:4:298,106:.:-0.29:1.000:. ./.:4:154,248:.:-0.30:1.000:. ./.:4:339,77:.:-0.18:1.000:. ./.:4:173,271:.: 0.08:1.000:. ./.:4:373,101:.: 0.35:1.000:. ./.:4:421,78:.: 0.58:1.000:. ./.:4:266,179:.: 0.09:1.000:. ./.:4:309,116:.:-0.09:1.000:. ./.:4:336,65:.:-0.31:1.000:. ./.:4:393,173:.: 1.19:1.000:. ./.:4:261,191:.: 0.15:1.000:. ./.:4:212,154:.:-0.63:1.000:. ./.:4:214,66:.:-1.42:1.000:. ./.:4:321,99:.:-0.14:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:393,101:.: 0.54:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:192,57:.:-1.70:1.000:. ./.:4:304,232:.: 0.92:0.981:. ./.:4:166,204:.:-0.60:1.000:. ./.:4:172,184:.:-0.72:1.000:. ./.:4:270,101:.:-0.59:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:382,132:.: 0.72:1.000:. ./.:4:192,195:.:-0.44:1.000:. ./.:4:134,252:.:-0.45:1.000:. ./.:4:385,288:.: 2.17:1.000:. ./.:4:153,294:.: 0.11:0.999:. ./.:4:318,322:.: 1.87:1.000:. ./.:4:257,74:.:-0.95:1.000:. ./.:4:337,240:.: 1.29:1.000:. ./.:4:210,287:.: 0.56:1.000:. ./.:4:397,87:.: 0.44:1.000:. ./.:4:291,92:.:-0.48:1.000:. ./.:4:227,88:.:-1.10:1.000:. ./.:4:288,194:.: 0.43:1.000:. ./.:4:157,284:.: 0.05:1.000:. ./.:4:317,108:.:-0.09:1.000:. ./.:4:333,231:.: 1.17:1.000:. ./.:4:256,172:.:-0.07:1.000:. ./.:4:450,118:.: 1.21:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:272,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:228,57:.:-1.37:1.000:. ./.:4:239,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:320,169:.: 0.49:1.000:. ./.:4:182,186:.:-0.61:1.000:. ./.:4:246,1:.:-1.72:1.000:. ./.:4:296,112:.:-0.25:1.000:. ./.:4:264,168:.:-0.03:1.000:. ./.:4:565,136:.: 2.42:1.000:. ./.:4:327,197:.: 0.81:1.000:. ./.:4:144,253:.:-0.35:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:268,150:.:-0.16:1.000:. ./.:4:276,191:.: 0.29:1.000:. ./.:4:287,102:.:-0.42:1.000:. ./.:4:372,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:290,82:.:-0.58:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:212,319:.: 0.87:1.000:. ./.:4:218,210:.:-0.07:1.000:. ./.:4:477,122:.: 1.49:1.000:. ./.:4:194,274:.: 0.30:1.000:. ./.:4:445,119:.: 1.17:1.000:. ./.:4:270,100:.:-0.60:1.000:. ./.:4:94,56:.:-2.60:1.000:. ./.:4:321,188:.: 0.67:1.000:. ./.:4:242,228:.: 0.32:1.000:. ./.:4:396,104:.: 0.59:1.000:. ./.:4:492,113:.: 1.55:1.000:. ./.:4:329,225:.: 1.08:1.000:. ./.:4:198,256:.: 0.17:1.000:. ./.:4:356,223:.: 1.31:1.000:. ./.:4:298,182:.: 0.41:1.000:. ./.:4:166,172:.:-0.89:1.000:. ./.:4:176,259:.: 0.00:1.000:. ./.:4:334,215:.: 1.04:1.000:. ./.:4:207,210:.:-0.17:1.000:. ./.:4:220,183:.:-0.29:1.000:. ./.:4:256,89:.:-0.82:1.000:. ./.:4:316,196:.: 0.70:0.999:. ./.:4:279,194:.: 0.34:1.000:. ./.:4:298,95:.:-0.39:1.000:. ./.:4:366,78:.: 0.08:1.000:. ./.:4:235,68:.:-1.21:1.000:. ./.:4:423,108:.: 0.87:1.000:. ./.:4:323,96:.:-0.15:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:198,72:.:-1.51:1.000:. ./.:4:321,110:.:-0.04:1.000:. ./.:4:306,110:.:-0.18:1.000:. ./.:4:362,246:.: 1.57:1.000:. ./.:4:368,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:295,301:.: 1.47:1.000:. ./.:4:532,174:.: 2.47:1.000:. ./.:4:222,156:.:-0.52:1.000:. ./.:4:329,216:.: 1.00:1.000:. -chr7.1 3635156 chr7.1_003635156 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:219,103:.: 0.32:1.000:. ./.:4:136,41:.:-1.40:1.000:. ./.:4:160,134:.:-0.01:1.000:. ./.:4:153,154:.: 0.14:1.000:. ./.:4:221,104:.: 0.36:1.000:. ./.:4:171,68:.:-0.66:1.000:. ./.:4:69,18:.:-2.46:1.000:. ./.:4:181,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:152,86:.:-0.67:1.000:. ./.:4:58,32:.:-2.43:1.000:. ./.:4:73,49:.:-2.05:1.000:. ./.:4:153,99:.:-0.51:1.000:. ./.:4:159,105:.:-0.37:1.000:. ./.:4:168,102:.:-0.30:1.000:. ./.:4:167,85:.:-0.51:1.000:. ./.:4:170,139:.: 0.17:1.000:. ./.:4:177,126:.: 0.10:0.803:. ./.:4:189,80:.:-0.31:1.000:. ./.:4:184,148:.: 0.44:1.000:. ./.:4:177,80:.:-0.45:1.000:. ./.:4:65,9:.:-2.62:1.000:. ./.:4:183,84:.:-0.33:1.000:. ./.:4:195,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:144,29:.:-1.45:1.000:. ./.:4:29,12:.:-3.01:1.000:. ./.:4:206,112:.: 0.27:1.000:. ./.:4:161,107:.:-0.32:1.000:. ./.:4:171,116:.:-0.09:1.000:. ./.:4:233,86:.: 0.29:1.000:. ./.:4:137,35:.:-1.46:1.000:. ./.:4:185,160:.: 0.59:1.000:. ./.:4:132,72:.:-1.08:1.000:. ./.:4:30,7:.:-3.06:1.000:. ./.:4:70,23:.:-2.39:1.000:. ./.:3:32,4:.:-3.07:1.000:. ./.:4:158,85:.:-0.62:1.000:. ./.:4:182,94:.:-0.22:1.000:. ./.:4:182,114:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,176:.: 0.84:1.000:. ./.:4:183,112:.: 0.00:1.000:. ./.:4:206,116:.: 0.32:1.000:. ./.:4:161,125:.:-0.11:1.000:. ./.:4:256,154:.: 1.36:1.000:. ./.:4:204,184:.: 1.10:1.000:. ./.:4:244,144:.: 1.10:1.000:. ./.:4:212,151:.: 0.81:1.000:. ./.:4:206,122:.: 0.39:0.997:. ./.:4:354,196:.: 3.02:1.000:. ./.:4:222,162:.: 1.06:1.000:. ./.:4:268,251:.: 2.66:1.000:. ./.:4:193,141:.: 0.46:1.000:. ./.:4:230,260:.: 2.31:1.000:. ./.:4:214,139:.: 0.69:1.000:. ./.:4:237,195:.: 1.62:1.000:. ./.:4:207,109:.: 0.25:1.000:. ./.:4:229,205:.: 1.65:1.000:. ./.:4:194,178:.: 0.91:1.000:. ./.:4:219,153:.: 0.91:1.000:. ./.:4:184,136:.: 0.30:1.000:. ./.:6:168,127:.: 0.00:1.000:. ./.:4:204,123:.: 0.38:1.000:. ./.:4:219,187:.: 1.32:1.000:. ./.:4:266,172:.: 1.70:1.000:. ./.:4:191,155:.: 0.61:1.000:. ./.:4:210,222:.: 1.62:1.000:. ./.:4:242,146:.: 1.10:1.000:. ./.:4:105,38:.:-1.80:1.000:. ./.:4:155,168:.: 0.33:1.000:. ./.:4:193,140:.: 0.45:0.974:. ./.:4:193,33:.:-0.82:1.000:. ./.:4:237,183:.: 1.48:1.000:. ./.:4:144,60:.:-1.08:0.999:. ./.:4:223,180:.: 1.28:1.000:. ./.:4:199,150:.: 0.64:1.000:. ./.:4:193,178:.: 0.90:1.000:. ./.:4:173,87:.:-0.41:1.000:. ./.:4:219,159:.: 0.98:1.000:. ./.:4:211,158:.: 0.88:1.000:. ./.:4:195,174:.: 0.88:1.000:. ./.:4:212,98:.: 0.18:1.000:. ./.:4:177,117:.:-0.01:0.999:. ./.:4:189,91:.:-0.18:1.000:. ./.:4:233,126:.: 0.76:1.000:. ./.:4:172,130:.: 0.08:1.000:. ./.:4:204,156:.: 0.77:1.000:. ./.:4:203,143:.: 0.61:1.000:. ./.:4:172,97:.:-0.31:1.000:. ./.:4:165,148:.: 0.21:1.000:. ./.:4:156,89:.:-0.59:1.000:. ./.:4:179,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:126,101:.:-0.81:1.000:. ./.:4:192,114:.: 0.13:1.000:. ./.:4:232,182:.: 1.41:1.000:. ./.:4:164,162:.: 0.37:1.000:. ./.:4:176,119:.: 0.00:1.000:. ./.:4:193,116:.: 0.17:1.000:. ./.:4:181,87:.:-0.32:1.000:. ./.:4:173,118:.:-0.05:1.000:. ./.:4:223,124:.: 0.62:1.000:. ./.:4:194,132:.: 0.37:1.000:. ./.:4:114,57:.:-1.47:1.000:. ./.:4:231,162:.: 1.16:1.000:. ./.:4:130,92:.:-0.86:1.000:. ./.:4:240,96:.: 0.49:0.981:. ./.:4:179,139:.: 0.27:1.000:. ./.:4:210,138:.: 0.63:1.000:. ./.:4:201,129:.: 0.42:1.000:. ./.:4:161,74:.:-0.71:1.000:. ./.:4:236,129:.: 0.83:1.000:. ./.:4:199,104:.: 0.10:1.000:. ./.:4:216,128:.: 0.58:1.000:. ./.:4:202,96:.: 0.04:1.000:. ./.:4:199,157:.: 0.72:0.999:. ./.:4:230,182:.: 1.39:1.000:. ./.:4:192,132:.: 0.34:1.000:. ./.:4:216,152:.: 0.87:1.000:. ./.:4:160,74:.:-0.72:1.000:. ./.:4:146,128:.:-0.25:1.000:. ./.:4:201,121:.: 0.32:1.000:. ./.:4:203,99:.: 0.08:1.000:. ./.:4:234,197:.: 1.61:1.000:. ./.:4:197,75:.:-0.27:1.000:. ./.:4:187,131:.: 0.27:1.000:. ./.:4:166,64:.:-0.77:1.000:. ./.:4:214,118:.: 0.44:1.000:. ./.:4:237,150:.: 1.09:1.000:. ./.:4:185,134:.: 0.29:1.000:. ./.:4:173,101:.:-0.25:1.000:. ./.:4:149,120:.:-0.31:1.000:. ./.:4:150,132:.:-0.15:1.000:. ./.:4:180,84:.:-0.37:1.000:. ./.:4:143,77:.:-0.89:1.000:. ./.:4:158,118:.:-0.22:1.000:. ./.:4:238,136:.: 0.94:1.000:. ./.:4:209,112:.: 0.31:1.000:. ./.:4:235,109:.: 0.58:1.000:. ./.:4:230,158:.: 1.10:1.000:. ./.:4:210,85:.: 0.00:1.000:. ./.:4:205,115:.: 0.30:1.000:. ./.:4:196,91:.:-0.09:1.000:. ./.:4:220,110:.: 0.42:1.000:. ./.:4:230,100:.: 0.42:1.000:. ./.:4:156,103:.:-0.43:1.000:. ./.:4:167,125:.:-0.03:1.000:. ./.:4:255,147:.: 1.27:1.000:. ./.:4:231,100:.: 0.43:1.000:. ./.:4:140,76:.:-0.94:1.000:. ./.:4:190,140:.: 0.42:1.000:. ./.:4:233,120:.: 0.69:1.000:. ./.:4:192,78:.:-0.30:1.000:. ./.:4:198,81:.:-0.19:1.000:. ./.:4:139,95:.:-0.72:1.000:. ./.:4:36,30:.:-2.71:1.000:. ./.:4:123,36:.:-1.61:1.000:. ./.:4:223,170:.: 1.16:1.000:. ./.:4:203,98:.: 0.07:1.000:. ./.:4:171,114:.:-0.12:1.000:. ./.:4:147,69:.:-0.94:1.000:. ./.:4:144,108:.:-0.51:1.000:. ./.:4:167,81:.:-0.56:1.000:. ./.:4:155,78:.:-0.73:1.000:. ./.:4:158,81:.:-0.66:1.000:. ./.:4:153,85:.:-0.67:1.000:. ./.:4:181,153:.: 0.46:1.000:. ./.:4:232,161:.: 1.16:1.000:. ./.:4:143,76:.:-0.90:1.000:. ./.:4:133,60:.:-1.21:1.000:. ./.:4:152,79:.:-0.76:0.999:. ./.:4:185,84:.:-0.31:1.000:. ./.:4:134,65:.:-1.14:1.000:. ./.:4:147,101:.:-0.56:1.000:. ./.:4:139,97:.:-0.70:1.000:. ./.:4:182,120:.: 0.08:1.000:. ./.:4:180,134:.: 0.23:1.000:. ./.:4:138,80:.:-0.91:1.000:. ./.:4:161,82:.:-0.62:1.000:. ./.:4:134,118:.:-0.51:1.000:. ./.:4:181,54:.:-0.71:1.000:. ./.:4:205,130:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,89:.:-0.76:1.000:. ./.:4:165,111:.:-0.22:1.000:. ./.:4:232,168:.: 1.25:1.000:. ./.:4:151,63:.:-0.96:1.000:. ./.:4:100,71:.:-1.47:1.000:. ./.:4:193,92:.:-0.12:1.000:. -chr7.1 3856349 chr7.1_003856349 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:167,182:.: 0.41:1.000:. ./.:4:245,59:.:-0.31:1.000:. ./.:4:230,94:.: 0.01:1.000:. ./.:4:264,86:.: 0.42:1.000:. ./.:4:333,108:.: 1.88:1.000:. ./.:4:276,87:.: 0.63:1.000:. ./.:4:236,62:.:-0.40:1.000:. ./.:4:255,89:.: 0.33:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:87,112:.:-1.98:1.000:. ./.:4:139,45:.:-2.22:1.000:. ./.:4:168,155:.:-0.01:1.000:. ./.:4:262,77:.: 0.25:1.000:. ./.:4:292,96:.: 1.03:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:199,177:.: 0.84:0.803:. ./.:4:157,195:.: 0.46:1.000:. ./.:4:230,215:.: 1.94:1.000:. ./.:4:363,97:.: 2.18:1.000:. ./.:4:198,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:175,171:.: 0.36:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:240,70:.:-0.21:1.000:. ./.:4:121,37:.:-2.64:1.000:. ./.:4:263,94:.: 0.54:1.000:. ./.:4:310,96:.: 1.32:1.000:. ./.:4:269,76:.: 0.34:1.000:. ./.:4:295,111:.: 1.32:1.000:. ./.:4:258,98:.: 0.52:1.000:. ./.:4:288,95:.: 0.95:1.000:. ./.:4:176,73:.:-1.19:1.000:. ./.:4:56,70:.:-3.15:1.000:. ./.:4:144,42:.:-2.19:1.000:. ./.:3:52,16:.:-4.07:1.000:. ./.:4:295,87:.: 0.93:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:244,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:274,86:.: 0.58:1.000:. ./.:4:269,94:.: 0.63:1.000:. ./.:4:177,158:.: 0.19:1.000:. ./.:4:254,71:.: 0.03:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:255,100:.: 0.50:1.000:. ./.:4:185,205:.: 1.06:0.997:. ./.:4:161,54:.:-1.73:1.000:. ./.:4:246,81:.: 0.06:1.000:. ./.:4:215,102:.:-0.10:1.000:. ./.:4:217,99:.:-0.12:1.000:. ./.:4:304,93:.: 1.17:1.000:. ./.:4:204,87:.:-0.52:1.000:. ./.:4:279,86:.: 0.66:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:225,61:.:-0.60:1.000:. ./.:4:268,104:.: 0.78:1.000:. ./.:4:223,75:.:-0.40:1.000:. ./.:6:208,67:.:-0.77:1.000:. ./.:4:258,88:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,134:.:-0.84:1.000:. ./.:4:221,204:.: 1.62:1.000:. ./.:4:250,79:.: 0.09:1.000:. ./.:4:264,97:.: 0.60:1.000:. ./.:4:141,138:.:-0.71:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:217,75:.:-0.50:1.000:. ./.:4:161,186:.: 0.38:0.974:. ./.:4:141,136:.:-0.74:1.000:. ./.:4:257,84:.: 0.28:1.000:. ./.:4:222,72:.:-0.47:0.999:. ./.:4:201,202:.: 1.27:1.000:. ./.:4:251,84:.: 0.19:1.000:. ./.:4:148,148:.:-0.44:1.000:. ./.:4:220,77:.:-0.42:1.000:. ./.:4:229,88:.:-0.10:1.000:. ./.:4:270,96:.: 0.68:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:151,182:.: 0.15:1.000:. ./.:4:54,184:.:-1.36:0.999:. ./.:4:246,91:.: 0.22:1.000:. ./.:4:278,100:.: 0.87:1.000:. ./.:4:188,70:.:-1.04:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:253,92:.: 0.34:1.000:. ./.:4:203,87:.:-0.53:1.000:. ./.:4:209,69:.:-0.72:1.000:. ./.:4:236,77:.:-0.17:1.000:. ./.:4:256,74:.: 0.11:1.000:. ./.:4:140,147:.:-0.58:1.000:. ./.:4:154,158:.:-0.18:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:121,130:.:-1.15:1.000:. ./.:4:168,168:.: 0.20:1.000:. ./.:4:250,72:.:-0.02:1.000:. ./.:4:199,77:.:-0.76:1.000:. ./.:4:185,70:.:-1.09:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:257,84:.: 0.28:1.000:. ./.:4:140,146:.:-0.60:1.000:. ./.:4:261,113:.: 0.81:1.000:. ./.:4:206,65:.:-0.84:1.000:. ./.:4:459,0:.: 2.16:0.981:. ./.:4:220,74:.:-0.47:1.000:. ./.:4:204,80:.:-0.63:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:274,91:.: 0.66:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:201,62:.:-0.96:1.000:. ./.:4:221,263:.: 2.56:1.000:. ./.:4:261,69:.: 0.11:0.999:. ./.:4:318,95:.: 1.43:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:259,109:.: 0.71:1.000:. ./.:4:233,99:.: 0.14:1.000:. ./.:4:156,150:.:-0.28:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:206,72:.:-0.72:1.000:. ./.:4:158,157:.:-0.13:1.000:. ./.:4:235,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:258,83:.: 0.28:1.000:. ./.:4:177,196:.: 0.79:1.000:. ./.:4:232,73:.:-0.29:1.000:. ./.:4:295,69:.: 0.65:1.000:. ./.:4:234,90:.: 0.01:1.000:. ./.:4:222,70:.:-0.50:1.000:. ./.:4:177,74:.:-1.15:1.000:. ./.:4:171,62:.:-1.44:1.000:. ./.:4:220,67:.:-0.58:1.000:. ./.:4:261,86:.: 0.38:1.000:. ./.:4:143,48:.:-2.11:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:129,141:.:-0.85:1.000:. ./.:4:207,202:.: 1.37:1.000:. ./.:4:239,68:.:-0.26:1.000:. ./.:4:206,80:.:-0.60:1.000:. ./.:4:190,74:.:-0.95:1.000:. ./.:4:142,142:.:-0.63:1.000:. ./.:4:249,98:.: 0.38:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:254,79:.: 0.15:1.000:. ./.:4:188,45:.:-1.44:1.000:. ./.:4:326,116:.: 1.89:1.000:. ./.:4:338,102:.: 1.86:1.000:. ./.:4:241,85:.: 0.04:1.000:. ./.:4:238,78:.:-0.12:1.000:. ./.:4:341,91:.: 1.73:1.000:. ./.:4:196,78:.:-0.79:1.000:. ./.:4:318,101:.: 1.52:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:138,66:.:-1.90:1.000:. ./.:4:202,70:.:-0.82:1.000:. ./.:4:248,92:.: 0.27:1.000:. ./.:4:235,93:.: 0.07:1.000:. ./.:4:365,113:.: 2.47:1.000:. ./.:4:299,104:.: 1.27:1.000:. ./.:4:208,73:.:-0.68:1.000:. ./.:4:278,91:.: 0.73:1.000:. ./.:4:251,66:.:-0.10:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:209,94:.:-0.33:1.000:. ./.:4:239,80:.:-0.07:1.000:. ./.:4:254,73:.: 0.06:1.000:. ./.:4:256,90:.: 0.36:1.000:. ./.:4:235,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,164:.:-0.01:0.999:. ./.:4:231,83:.:-0.15:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:223,60:.:-0.64:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:164,167:.: 0.12:1.000:. ./.:4:154,137:.:-0.52:1.000:. ./.:4:223,82:.:-0.29:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:337,90:.: 1.65:1.000:. ./.:4:264,103:.: 0.70:1.000:. ./.:4:245,74:.:-0.07:1.000:. ./.:4:206,82:.:-0.56:1.000:. ./.:4:313,95:.: 1.35:1.000:. ./.:4:385,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:244,224:.: 2.31:1.000:. ./.:4:221,71:.:-0.50:1.000:. ./.:4:138,158:.:-0.44:1.000:. -chr7.1 4108271 chr7.1_004108271 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:203,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:282,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:344,5:.: 0.85:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:311,8:.: 0.52:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:194,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:312,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:226,4:.:-0.44:0.803:. ./.:4:369,3:.: 1.10:1.000:. ./.:4:227,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:362,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:174,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:524,1:.: 2.77:1.000:. ./.:4:300,6:.: 0.38:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:321,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:372,5:.: 1.16:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:363,12:.: 1.13:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:276,4:.: 0.10:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.52:1.000:. ./.:3:33,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:363,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:245,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:260,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:156,3:.:-1.22:1.000:. ./.:4:280,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:259,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:218,5:.:-0.52:0.997:. ./.:4:444,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:239,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:216,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:224,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:396,5:.: 1.42:1.000:. ./.:4:253,6:.:-0.13:1.000:. ./.:4:260,12:.: 0.01:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:270,4:.: 0.03:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:240,3:.:-0.30:1.000:. ./.:6:186,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:230,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:173,10:.:-0.96:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:159,4:.:-1.17:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:248,11:.:-0.13:1.000:. ./.:4:165,5:.:-1.10:0.974:. ./.:4:161,7:.:-1.12:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:249,3:.:-0.20:0.999:. ./.:4:178,8:.:-0.92:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:190,4:.:-0.84:1.000:. ./.:4:258,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:287,2:.: 0.20:1.000:. ./.:4:272,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:166,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:54,11:.:-2.24:0.999:. ./.:4:259,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:290,8:.: 0.30:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:316,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:282,4:.: 0.17:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:171,7:.:-1.01:1.000:. ./.:4:145,7:.:-1.29:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:145,5:.:-1.31:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:180,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:183,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:272,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:216,14:.:-0.44:1.000:. ./.:4:305,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:188,7:.:-0.83:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.34:0.981:. ./.:4:161,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:215,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:270,4:.: 0.03:1.000:. ./.:4:552,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:223,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:393,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:165,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:308,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:223,7:.:-0.44:1.000:. ./.:4:191,8:.:-0.78:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:260,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:244,7:.:-0.22:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:197,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:215,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:171,7:.:-1.01:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:315,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:196,4:.:-0.77:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:178,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:265,6:.: 0.00:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:213,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:142,7:.:-1.33:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:250,5:.:-0.17:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:348,5:.: 0.89:1.000:. ./.:4:435,8:.: 1.87:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:324,8:.: 0.67:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:371,7:.: 1.17:1.000:. ./.:4:346,6:.: 0.88:1.000:. ./.:4:379,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:389,6:.: 1.35:1.000:. ./.:4:317,5:.: 0.56:1.000:. ./.:4:273,4:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,2:.:-0.57:0.999:. ./.:4:262,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:161,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:163,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:232,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:300,5:.: 0.37:1.000:. ./.:4:328,6:.: 0.69:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:275,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:338,7:.: 0.81:1.000:. ./.:4:626,0:.: 3.86:1.000:. ./.:4:290,4:.: 0.25:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:206,3:.:-0.67:1.000:. -chr7.1 4435501 chr7.1_004435501 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:61,70:0.56: 0.88:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,73:0.55: 1.10:1.000:0.982 0/0/1/1:4:70,74:0.54: 1.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:84,66:0.47: 1.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:70,86:0.57: 1.55:1.000:0.939 0/0/0/1:4:50,20:0.32:-0.76:1.000:0.951 1/1/1/1:4:1,153:0.99: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,103:0.83: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:7,6:0.49:-2.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,10:0.78:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,86:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,96:0.78: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,92:0.81: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,64:0.55: 0.64:1.000:0.982 0/1/1/1:4:45,114:0.73: 1.63:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,99:0.69: 1.31:0.803:0.974 1/1/1/1:4:0,124:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,68:0.51: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,36:0.29: 1.12:1.000:0.990 0/1/1/1:4:5,12:0.72:-2.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,54:0.47: 0.64:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,102:0.75: 1.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,86:0.69: 0.77:1.000:0.979 0/0/1/1:4:5,6:0.57:-2.35:1.000:0.953 0/1/1/1:4:41,125:0.77: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,71:0.52: 1.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,29:0.29: 0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:29,97:0.78: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,79:0.51: 1.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,88:0.54: 1.90:1.000:0.985 0/1/1/1:4:42,99:0.72: 1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,4:0.37:-2.32:1.000:0.618 0/1/1/1:4:2,12:0.87:-2.27:1.000:0.944 0/1/1:3:2,3:0.62:-2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,76:0.52: 1.45:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,93:0.74: 0.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,35:0.29: 1.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:38,96:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,92:0.79: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,45:0.55:-0.36:1.000:0.978 0/0/1/1:4:39,57:0.61:-0.06:1.000:0.647 0/1/1/1:4:32,78:0.72: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,46:0.52:-0.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,47:0.76:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,52:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,48:0.48: 0.18:0.997:0.995 0/1/1/1:4:9,19:0.70:-1.89:1.000:0.981 0/1/1/1:4:24,67:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,43:0.56:-0.49:1.000:0.968 0/0/1/1:4:29,25:0.49:-1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,56:0.45: 0.88:1.000:0.984 0/0/1/1:4:35,36:0.53:-0.73:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,108:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,48:0.56:-0.25:1.000:0.965 0/0/1/1:4:68,55:0.47: 0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:51,54:0.54: 0.18:1.000:0.989 0/0/0/1:4:75,25:0.29: 0.05:1.000:0.993 0/1/1/1:4:29,69:0.72:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:21,33:0.63:-1.19:1.000:0.836 0/0/1/1:4:37,31:0.48:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,52:0.51: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,37:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,46:0.62:-0.57:1.000:0.604 0/0/1/1:4:59,44:0.45: 0.13:1.000:0.984 0/0/1/1:4:38,41:0.54:-0.52:1.000:0.987 0/1/1/1:4:8,43:0.85:-1.27:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,45:0.54:-0.30:0.974:0.988 0/1/1/1:4:21,68:0.78:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,43:0.55:-0.44:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,40:0.77:-1.22:0.999:1.000 0/1/1/1:4:30,73:0.72: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,60:0.56: 0.37:1.000:0.970 0/1/1/1:4:26,71:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,71:0.84:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,69:0.78:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,49:0.79:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,65:0.67: 0.02:1.000:0.937 0/0/0/1:4:84,32:0.31: 0.48:1.000:0.971 0/1/1/1:4:26,55:0.70:-0.46:0.999:0.981 0/1/1/1:4:29,62:0.70:-0.19:1.000:0.983 0/0/1/1:4:37,53:0.61:-0.22:1.000:0.701 0/0/1/1:4:51,52:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,75:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,48:0.56:-0.22:1.000:0.974 0/0/1/1:4:35,29:0.48:-0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,27:0.46:-0.97:1.000:0.989 0/1/1/1:4:30,58:0.68:-0.27:1.000:0.945 0/0/1/1:4:54,62:0.56: 0.48:1.000:0.972 0/0/1/1:4:31,41:0.59:-0.71:1.000:0.862 0/0/1/1:4:45,38:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,67:0.85:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:55,37:0.43:-0.17:1.000:0.948 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,51:0.51: 0.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,43:0.73:-1.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,62:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,21:0.50:-1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,71:0.75:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,16:0.46:-1.65:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.30:0.981:1.000 0/1/1/1:4:14,37:0.74:-1.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,63:0.74:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,35:0.60:-1.03:1.000:0.757 0/1/1/1:4:24,87:0.80: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,78:0.72: 0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,67:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,26:0.44:-0.95:1.000:0.968 0/0/1/1:4:89,79:0.49: 1.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,43:0.50:-0.22:0.999:0.997 0/1/1/1:4:23,79:0.79: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,10:0.16:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,25:0.42:-0.92:1.000:0.913 0/0/1/1:4:34,24:0.44:-1.08:1.000:0.970 0/1/1/1:4:15,39:0.74:-1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,36:0.70:-1.22:1.000:0.981 0/0/1/1:4:49,44:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,37:0.77:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,44:0.47: 0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,79:0.50: 1.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,12:0.23:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,34:0.45:-0.49:1.000:0.982 0/0/1/1:4:38,32:0.48:-0.76:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,31:0.63:-1.27:1.000:0.529 0/1/1/1:4:15,33:0.70:-1.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:60,16:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,117:0.77: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.37:-1.30:1.000:0.536 0/1/1/1:4:22,50:0.71:-0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,57:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,30:0.24: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,87:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,31:0.58:-1.16:1.000:0.893 0/0/1/1:4:28,25:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,23:0.43:-1.08:1.000:0.933 0/0/1/1:4:32,45:0.60:-0.57:1.000:0.746 0/1/1/1:4:14,46:0.78:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,87:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,21:0.49:-1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,52:0.45: 0.67:1.000:0.980 0/0/1/1:4:63,55:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,91:0.72: 0.85:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,62:0.72:-0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,31:0.28: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,53:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,69:0.49: 1.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,107:0.70: 1.58:1.000:0.984 0/0/1/1:4:8,12:0.62:-2.10:1.000:0.572 0/0/1/1:4:41,53:0.58:-0.11:1.000:0.892 1/1/1/1:4:0,128:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,49:0.47: 0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:114,36:0.28: 1.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,73:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,91:0.80: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,64:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,35:0.35: 0.37:1.000:0.825 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,63:0.55: 0.59:1.000:0.982 0/0/1/1:4:55,62:0.55: 0.51:1.000:0.977 0/1/1/1:4:39,98:0.73: 1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,82:0.67: 0.75:1.000:0.916 0/1/1/1:4:21,87:0.82: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,80:0.73: 0.37:0.999:0.998 0/0/0/1:4:98,35:0.30: 0.94:1.000:0.985 0/1/1/1:4:37,83:0.71: 0.59:1.000:0.991 0/0/1/1:4:69,58:0.48: 0.77:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,69:0.71: 0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,48:0.46: 0.32:1.000:0.989 0/0/1/1:4:52,39:0.46:-0.19:1.000:0.985 0/1/1/1:4:24,68:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,63:0.54: 0.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:92,82:0.50: 2.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,67:0.48: 1.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,62:0.48: 1.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,87:0.78: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,69:0.55: 0.91:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,52:0.34: 1.93:1.000:0.870 0/0/1/1:4:66,57:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,96:0.75: 0.85:1.000:0.999 -chr7.1 4707293 chr7.1_004707293 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,84:.: 0.67:1.000:. ./.:4:103,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:119,47:.: 0.78:1.000:. ./.:4:129,46:.: 1.03:1.000:. ./.:4:133,49:.: 1.22:1.000:. ./.:4:102,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.50:1.000:. ./.:4:148,51:.: 1.70:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,31:.:-1.97:1.000:. ./.:4:55,22:.:-1.69:1.000:. ./.:4:80,74:.: 0.45:1.000:. ./.:4:111,36:.: 0.25:1.000:. ./.:4:138,35:.: 0.97:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:85,103:.: 1.39:0.803:. ./.:4:129,38:.: 0.81:1.000:. ./.:4:108,119:.: 2.48:1.000:. ./.:4:151,49:.: 1.73:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:66,73:.: 0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:98,43:.: 0.09:1.000:. ./.:4:29,27:.:-2.28:1.000:. ./.:4:124,51:.: 1.03:1.000:. ./.:4:117,42:.: 0.59:1.000:. ./.:4:113,59:.: 0.95:1.000:. ./.:4:135,43:.: 1.11:1.000:. ./.:4:146,59:.: 1.86:1.000:. ./.:4:125,43:.: 0.84:1.000:. ./.:4:88,53:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,18:.:-2.81:1.000:. ./.:4:70,9:.:-1.64:1.000:. ./.:3:43,3:.:-2.55:1.000:. ./.:4:106,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:116,44:.: 0.61:1.000:. ./.:4:135,43:.: 1.11:1.000:. ./.:4:124,52:.: 1.06:1.000:. ./.:4:59,65:.:-0.39:1.000:. ./.:4:119,29:.: 0.28:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,24:.: 0.14:1.000:. ./.:4:99,90:.: 1.42:0.997:. ./.:4:34,12:.:-2.55:1.000:. ./.:4:94,31:.:-0.36:1.000:. ./.:4:54,20:.:-1.78:1.000:. ./.:4:73,22:.:-1.19:1.000:. ./.:4:130,35:.: 0.75:1.000:. ./.:4:87,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:111,36:.: 0.25:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:88,26:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,32:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,19:.:-0.97:1.000:. ./.:6:79,31:.:-0.78:1.000:. ./.:4:89,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:58,76:.:-0.11:1.000:. ./.:4:63,66:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:87,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,72:.:-0.05:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:98,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,56:.:-0.83:0.974:. ./.:4:66,77:.: 0.14:1.000:. ./.:4:106,33:.: 0.03:1.000:. ./.:4:71,21:.:-1.28:0.999:. ./.:4:75,72:.: 0.25:1.000:. ./.:4:118,38:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:83,23:.:-0.89:1.000:. ./.:4:101,32:.:-0.14:1.000:. ./.:4:97,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:70,86:.: 0.50:1.000:. ./.:4:24,68:.:-1.28:0.999:. ./.:4:105,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.03:1.000:. ./.:4:108,41:.: 0.31:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:102,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:67,30:.:-1.14:1.000:. ./.:4:79,30:.:-0.80:1.000:. ./.:4:78,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:52,49:.:-1.03:1.000:. ./.:4:77,66:.: 0.14:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,57:.:-0.41:1.000:. ./.:4:75,81:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,36:.:-0.44:1.000:. ./.:4:76,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:69,20:.:-1.36:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:138,40:.: 1.11:1.000:. ./.:4:60,53:.:-0.69:1.000:. ./.:4:111,30:.: 0.09:1.000:. ./.:4:72,17:.:-1.36:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.09:0.981:. ./.:4:96,22:.:-0.55:1.000:. ./.:4:123,26:.: 0.31:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:98,30:.:-0.28:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:90,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:112,132:.: 2.95:1.000:. ./.:4:82,36:.:-0.55:0.999:. ./.:4:111,36:.: 0.25:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:109,29:.: 0.00:1.000:. ./.:4:82,32:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,54:.:-0.75:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:86,19:.:-0.92:1.000:. ./.:4:58,69:.:-0.30:1.000:. ./.:4:88,23:.:-0.75:1.000:. ./.:4:93,35:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,97:.: 0.84:1.000:. ./.:4:98,48:.: 0.22:1.000:. ./.:4:96,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:85,38:.:-0.41:1.000:. ./.:4:86,23:.:-0.80:1.000:. ./.:4:69,35:.:-0.94:1.000:. ./.:4:80,18:.:-1.11:1.000:. ./.:4:64,36:.:-1.05:1.000:. ./.:4:114,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,25:.:-1.64:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:72,52:.:-0.39:1.000:. ./.:4:95,109:.: 1.84:1.000:. ./.:4:108,37:.: 0.20:1.000:. ./.:4:67,24:.:-1.30:1.000:. ./.:4:75,21:.:-1.17:1.000:. ./.:4:57,45:.:-1.00:1.000:. ./.:4:90,26:.:-0.61:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:126,38:.: 0.72:1.000:. ./.:4:50,29:.:-1.64:1.000:. ./.:4:158,51:.: 1.98:1.000:. ./.:4:180,41:.: 2.31:1.000:. ./.:4:114,36:.: 0.34:1.000:. ./.:4:130,47:.: 1.09:1.000:. ./.:4:131,51:.: 1.22:1.000:. ./.:4:109,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:141,59:.: 1.73:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:58,14:.:-1.83:1.000:. ./.:4:106,39:.: 0.20:1.000:. ./.:4:135,47:.: 1.22:1.000:. ./.:4:113,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:140,40:.: 1.17:1.000:. ./.:4:124,36:.: 0.61:1.000:. ./.:4:90,45:.:-0.08:1.000:. ./.:4:133,45:.: 1.11:1.000:. ./.:4:119,44:.: 0.70:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:114,47:.: 0.64:1.000:. ./.:4:114,49:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,27:.:-1.30:1.000:. ./.:4:120,34:.: 0.45:1.000:. ./.:4:79,23:.:-1.00:1.000:. ./.:4:82,80:.: 0.67:0.999:. ./.:4:123,33:.: 0.50:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:116,39:.: 0.47:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:80,73:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:123,49:.: 0.95:1.000:. ./.:4:157,42:.: 1.70:1.000:. ./.:4:104,51:.: 0.47:1.000:. ./.:4:96,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:131,63:.: 1.56:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:94,99:.: 1.53:1.000:. ./.:4:98,47:.: 0.20:1.000:. ./.:4:77,104:.: 1.20:1.000:. -chr7.1 4892887 chr7.1_004892887 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:71,163:0.68:-0.11:1.000:0.949 0/0/0/0:4:215,5:0.02:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,125:0.45: 0.57:1.000:0.983 0/0/1/1:4:97,153:0.60: 0.14:1.000:0.775 0/0/1/1:4:173,152:0.47: 1.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:186,175:0.49: 1.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,124:0.73:-1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:149,74:0.34:-0.28:1.000:0.856 0/0/0/1:4:223,56:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,28:0.49:-2.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,16:0.21:-2.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,67:0.30:-0.11:1.000:0.986 0/0/0/1:4:152,71:0.33:-0.28:1.000:0.924 0/0/0/1:4:155,77:0.34:-0.14:1.000:0.856 0/0/1/1:4:119,128:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:286,80:0.23: 1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,100:0.38: 0.37:0.803:0.632 0/0/0/1:4:160,78:0.34:-0.05:1.000:0.881 0/1/1/1:4:97,192:0.65: 0.73:1.000:0.784 0/1/1/1:4:87,225:0.70: 1.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:107,15:0.13:-1.83:1.000:0.919 0/0/1/1:4:81,142:0.62:-0.28:1.000:0.514 0/0/0/1:4:240,77:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,61:0.30:-0.42:1.000:0.987 0/0/0/1:4:22,8:0.28:-3.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,76:0.35:-0.29:1.000:0.775 0/1/1/1:4:96,171:0.63: 0.40:1.000:0.530 0/1/1/1:4:75,193:0.70: 0.41:1.000:0.985 0/0/1/1:4:151,94:0.39: 0.06:1.000:0.702 0/0/1/1:4:182,155:0.46: 1.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:176,139:0.45: 1.13:1.000:0.975 0/0/0/1:4:155,62:0.30:-0.37:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-3.45:1.000:0.970 0/0/0/1:4:98,16:0.15:-1.95:1.000:0.987 0/0/0:3:37,4:0.10:-3.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:155,117:0.43: 0.47:1.000:0.958 0/0/0/1:4:232,69:0.24: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,191:0.65: 0.72:1.000:0.774 0/0/0/1:4:171,70:0.30: 0.00:1.000:0.982 0/0/0/1:4:195,80:0.30: 0.52:1.000:0.982 0/0/1/1:4:89,131:0.59:-0.32:1.000:0.882 0/1/1/1:4:73,149:0.66:-0.29:1.000:0.836 0/0/0/1:4:249,75:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,110:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:269,66:0.21: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,134:0.61:-0.37:1.000:0.726 0/1/1/1:4:91,176:0.64: 0.40:0.997:0.737 0/0/0/1:4:278,113:0.30: 2.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:132,57:0.31:-0.80:1.000:0.968 0/0/1/1:4:154,132:0.46: 0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,124:0.62:-0.69:1.000:0.563 0/1/1/1:4:84,174:0.66: 0.26:1.000:0.857 0/1/1/1:4:52,110:0.66:-1.21:1.000:0.883 0/0/0/0:4:258,5:0.02: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,148:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,142:0.47: 1.01:1.000:0.990 0/1/1/1:4:63,136:0.67:-0.65:1.000:0.904 0/1/1/1:4:95,219:0.68: 1.12:1.000:0.951 0/0/0/1:4:132,68:0.35:-0.63:1.000:0.795 0/0/0/0/1/1:6:126,88:0.42:-0.42:1.000:0.504 0/0/1/1:4:137,124:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,134:0.62:-0.45:1.000:0.570 0/0/1/1:4:103,147:0.58: 0.14:1.000:0.913 0/0/1/1:4:168,115:0.41: 0.64:1.000:0.878 0/0/1/1:4:154,138:0.47: 0.78:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,137:0.66:-0.60:1.000:0.879 0/0/0/1:4:137,48:0.27:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:217,3:0.01:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,138:0.63:-0.43:0.974:0.618 0/0/0/1:4:129,73:0.37:-0.60:1.000:0.565 0/0/1/1:4:179,137:0.44: 1.15:1.000:0.964 0/0/0/1:4:88,27:0.25:-1.93:0.999:0.999 0/0/0/1:4:158,62:0.29:-0.32:1.000:0.989 0/0/1/1:4:163,154:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,64:0.33:-0.60:1.000:0.930 0/0/0/1:4:125,64:0.35:-0.80:1.000:0.807 0/0/0/1:4:168,51:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,69:0.32:-0.26:1.000:0.955 0/0/0/1:4:250,66:0.22: 1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,198:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,67:0.53:-1.78:0.999:0.991 0/0/0/1:4:145,71:0.34:-0.39:1.000:0.875 0/0/1/1:4:95,132:0.57:-0.22:1.000:0.934 0/0/1/1:4:144,123:0.46: 0.40:1.000:0.990 0/0/0/1:4:241,84:0.27: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,143:0.61:-0.17:1.000:0.685 0/0/1/1:4:113,91:0.45:-0.57:1.000:0.980 0/0/1/1:4:147,118:0.45: 0.37:1.000:0.979 0/0/0/1:4:182,54:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,133:0.46: 0.75:1.000:0.989 0/1/1/1:4:52,93:0.63:-1.47:1.000:0.541 0/0/1/1:4:69,106:0.60:-1.01:1.000:0.822 0/0/0/1:4:255,82:0.26: 1.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,100:0.63:-1.32:1.000:0.586 1/1/1/1:4:0,311:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,127:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/0:4:178,1:0.01:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,2:0.01:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,82:0.29: 0.81:1.000:0.991 0/0/0/1:4:152,76:0.34:-0.20:1.000:0.846 0/1/1/1:4:36,79:0.67:-1.93:1.000:0.918 0/0/0/1:4:163,76:0.33:-0.03:1.000:0.925 0/1/1/1:4:51,121:0.68:-1.06:1.000:0.964 0/0/0/0:4:370,1:0.00: 1.99:0.981:1.000 0/0/0/1:4:192,49:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,72:0.33:-0.19:1.000:0.938 0/0/1/1:4:124,116:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,66:0.32:-0.43:1.000:0.951 0/0/0/1:4:291,83:0.24: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,66:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,101:0.43:-0.09:1.000:0.957 0/1/1/1:4:96,187:0.65: 0.64:1.000:0.752 0/0/1/1:4:150,151:0.50: 0.92:0.999:0.997 0/0/0/1:4:302,71:0.20: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,202:0.72: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,104:0.46:-0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:80,97:0.54:-0.98:1.000:0.985 0/0/0/1:4:217,58:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,68:0.41:-1.09:1.000:0.840 0/1/1/1:4:85,160:0.64: 0.06:1.000:0.675 0/0/0/1:4:186,55:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,168:0.67: 0.04:1.000:0.924 0/1/1/1:4:70,148:0.66:-0.36:1.000:0.882 0/1/1/1:4:68,175:0.70: 0.03:1.000:0.985 0/0/1/1:4:162,150:0.48: 1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,128:0.59:-0.43:1.000:0.852 0/0/0/0:4:160,1:0.01:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,109:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:116,57:0.34:-1.05:1.000:0.871 0/1/1/1:4:49,170:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:133,67:0.34:-0.63:1.000:0.835 0/0/1/1:4:58,73:0.55:-1.69:1.000:0.977 0/0/0/1:4:232,68:0.24: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,77:0.35:-0.22:1.000:0.802 1/1/1/1:4:1,272:1.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,68:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,130:0.52: 0.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,101:0.61:-1.20:1.000:0.706 0/0/1/1:4:73,116:0.60:-0.80:1.000:0.760 0/0/1/1:4:143,142:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:212,58:0.23: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,78:0.40:-0.68:1.000:0.812 0/0/1/1:4:127,101:0.45:-0.20:1.000:0.977 0/1/1/1:4:83,170:0.66: 0.18:1.000:0.841 0/1/1/1:4:72,157:0.67:-0.19:1.000:0.913 0/0/0/1:4:219,75:0.27: 0.81:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,71:0.32:-0.12:1.000:0.962 0/1/1/1:4:122,242:0.65: 1.88:1.000:0.788 0/0/1/1:4:166,151:0.48: 1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:168,154:0.48: 1.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:235,72:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,19:0.22:-2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,90:0.42:-0.36:1.000:0.908 0/0/0/0:4:257,3:0.01: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,141:0.63:-0.32:1.000:0.535 0/1/1/1:4:94,237:0.70: 1.38:1.000:0.981 0/0/0/1:4:218,70:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:186,55:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,132:0.46: 0.72:1.000:0.988 0/1/1/1:4:64,164:0.70:-0.20:1.000:0.984 0/0/0/0:4:252,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,142:0.45: 1.21:1.000:0.977 0/0/1/1:4:157,136:0.47: 0.80:1.000:0.991 0/0/0/1:4:155,70:0.32:-0.25:1.000:0.947 0/0/0/1:4:152,75:0.34:-0.22:1.000:0.865 0/0/0/1:4:141,64:0.32:-0.55:1.000:0.944 0/0/0/1:4:146,79:0.36:-0.25:0.999:0.687 0/1/1/1:4:85,206:0.69: 0.76:1.000:0.971 0/0/0/1:4:202,62:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,107:0.41: 0.38:1.000:0.855 0/0/0/1:4:198,71:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,124:0.61:-0.62:1.000:0.732 0/1/1/1:4:68,125:0.63:-0.74:1.000:0.615 0/0/0/1:4:128,47:0.28:-1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,136:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,155:0.67:-0.22:1.000:0.901 0/0/1/1:4:92,136:0.59:-0.20:1.000:0.877 0/0/1/1:4:143,134:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,69:0.32:-0.23:1.000:0.961 0/1/1/1:4:81,153:0.64:-0.11:1.000:0.684 0/0/0/0:4:402,0:0.00: 2.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,229:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,117:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,69:0.34:-0.48:1.000:0.876 -chr7.1 4988104 chr7.1_004988104 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:250,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:491,1:.: 2.76:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:279,1:.:-0.22:0.803:. ./.:4:325,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:447,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:288,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:273,1:.:-0.30:1.000:. ./.:3:103,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.61:0.997:. ./.:4:387,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.82:1.000:. ./.:6:275,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.60:0.974:. ./.:4:243,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.80:0.999:. ./.:4:257,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:231,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:121,0:.:-2.46:0.999:. ./.:4:283,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:228,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:493,2:.: 2.81:0.981:. ./.:4:284,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:447,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.75:0.999:. ./.:4:422,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:370,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:133,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:366,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:451,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:300,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:462,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:459,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.26:0.999:. ./.:4:355,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:426,2:.: 1.86:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.25:1.000:. -chr7.1 5052892 chr7.1_005052892 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:421,82:.: 0.15:1.000:. ./.:4:321,59:.:-0.86:1.000:. ./.:4:387,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:568,87:.: 1.40:1.000:. ./.:4:564,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:473,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:331,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:430,79:.: 0.20:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:184,22:.:-2.29:1.000:. ./.:4:165,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:345,60:.:-0.66:1.000:. ./.:4:362,54:.:-0.57:1.000:. ./.:4:507,55:.: 0.64:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:468,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:468,65:.: 0.40:0.803:. ./.:4:339,71:.:-0.61:1.000:. ./.:4:487,91:.: 0.77:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:223,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:361,70:.:-0.44:1.000:. ./.:4:507,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:306,60:.:-0.98:1.000:. ./.:4:118,18:.:-2.87:1.000:. ./.:4:491,70:.: 0.63:1.000:. ./.:4:479,52:.: 0.38:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:515,82:.: 0.93:1.000:. ./.:4:357,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:300,50:.:-1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:74,16:.:-3.25:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:467,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:665,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:420,57:.:-0.06:1.000:. ./.:4:559,58:.: 1.09:1.000:. ./.:4:396,75:.:-0.11:1.000:. ./.:4:404,74:.:-0.05:1.000:. ./.:4:661,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:609,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:694,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:528,83:.: 1.04:1.000:. ./.:4:518,86:.: 0.98:0.997:. ./.:4:421,46:.:-0.15:1.000:. ./.:4:484,68:.: 0.55:1.000:. ./.:4:631,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:499,88:.: 0.84:1.000:. ./.:4:581,109:.: 1.69:1.000:. ./.:4:392,80:.:-0.10:1.000:. ./.:4:485,82:.: 0.68:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:631,2:.: 1.22:1.000:. ./.:4:345,79:.:-0.50:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:370,60:.:-0.45:1.000:. ./.:6:465,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:417,75:.: 0.06:1.000:. ./.:4:472,79:.: 0.55:1.000:. ./.:4:491,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:462,78:.: 0.46:1.000:. ./.:4:419,3:.:-0.52:1.000:. ./.:4:400,73:.:-0.10:1.000:. ./.:4:508,76:.: 0.82:0.974:. ./.:4:409,82:.: 0.05:1.000:. ./.:4:471,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:308,58:.:-0.98:0.999:. ./.:4:467,74:.: 0.46:1.000:. ./.:4:552,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:417,80:.: 0.10:1.000:. ./.:4:515,70:.: 0.83:1.000:. ./.:4:385,67:.:-0.27:1.000:. ./.:4:540,83:.: 1.14:1.000:. ./.:4:609,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:385,68:.:-0.26:1.000:. ./.:4:173,133:.:-1.47:0.999:. ./.:4:527,72:.: 0.94:1.000:. ./.:4:507,76:.: 0.81:1.000:. ./.:4:357,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:479,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:327,85:.:-0.60:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:476,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:557,4:.: 0.63:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:240,66:.:-1.47:1.000:. ./.:4:379,65:.:-0.33:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:325,44:.:-0.95:1.000:. ./.:4:554,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:423,77:.: 0.13:1.000:. ./.:4:292,49:.:-1.18:1.000:. ./.:4:761,3:.: 2.30:1.000:. ./.:4:416,74:.: 0.04:1.000:. ./.:4:336,60:.:-0.73:1.000:. ./.:4:437,84:.: 0.30:1.000:. ./.:4:257,49:.:-1.47:1.000:. ./.:4:746,0:.: 2.15:0.981:. ./.:4:437,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:397,70:.:-0.15:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:373,76:.:-0.29:1.000:. ./.:4:784,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:499,72:.: 0.71:1.000:. ./.:4:614,0:.: 1.07:0.999:. ./.:4:544,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:682,3:.: 1.65:1.000:. ./.:4:440,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:438,74:.: 0.23:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:329,62:.:-0.77:1.000:. ./.:4:468,72:.: 0.46:1.000:. ./.:4:564,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:518,75:.: 0.89:1.000:. ./.:4:389,58:.:-0.31:1.000:. ./.:4:422,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:507,64:.: 0.71:1.000:. ./.:4:311,69:.:-0.86:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:284,50:.:-1.24:1.000:. ./.:4:503,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:311,77:.:-0.80:1.000:. ./.:4:329,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:321,66:.:-0.80:1.000:. ./.:4:778,94:.: 3.19:1.000:. ./.:4:696,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:314,77:.:-0.77:1.000:. ./.:4:377,55:.:-0.43:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:683,2:.: 1.65:1.000:. ./.:4:427,62:.: 0.04:1.000:. ./.:4:354,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:640,92:.: 2.04:1.000:. ./.:4:526,84:.: 1.03:1.000:. ./.:4:679,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:413,78:.: 0.05:1.000:. ./.:4:537,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:427,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:157,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:458,75:.: 0.40:1.000:. ./.:4:493,90:.: 0.81:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:559,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:530,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:464,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:489,69:.: 0.60:1.000:. ./.:4:292,77:.:-0.95:1.000:. ./.:4:377,54:.:-0.44:1.000:. ./.:4:374,72:.:-0.32:0.999:. ./.:4:517,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:518,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:400,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:346,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:458,79:.: 0.43:1.000:. ./.:4:347,62:.:-0.62:1.000:. ./.:4:337,52:.:-0.79:1.000:. ./.:4:482,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:464,59:.: 0.32:1.000:. ./.:4:377,70:.:-0.31:1.000:. ./.:4:452,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:337,65:.:-0.68:1.000:. ./.:4:479,72:.: 0.55:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:532,90:.: 1.13:1.000:. ./.:4:429,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:423,76:.: 0.12:1.000:. -chr7.1 6068288 chr7.1_006068288 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:162,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:86,40:.:-0.75:1.000:. ./.:4:61,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:175,66:.: 0.77:1.000:. ./.:4:79,37:.:-0.89:1.000:. ./.:4:42,28:.:-1.49:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:64,29:.:-1.19:1.000:. ./.:4:424,0:.: 3.19:1.000:. ./.:4:398,98:.: 4.14:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:106,42:.:-0.46:1.000:. ./.:4:77,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.85:0.803:. ./.:4:63,69:.:-0.67:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:509,3:.: 4.35:1.000:. ./.:4:122,37:.:-0.32:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:88,25:.:-0.93:1.000:. ./.:4:266,67:.: 1.99:1.000:. ./.:4:60,35:.:-1.16:1.000:. ./.:4:61,30:.:-1.22:1.000:. ./.:4:71,32:.:-1.06:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:66,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:51,22:.:-1.45:1.000:. ./.:4:350,96:.: 3.48:1.000:. ./.:4:286,117:.: 2.91:1.000:. ./.:3:191,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:81,44:.:-0.77:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:83,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:156,53:.: 0.34:1.000:. ./.:4:156,60:.: 0.44:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:143,62:.: 0.29:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:174,69:.: 0.79:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.15:0.997:. ./.:4:209,109:.: 1.79:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.29:1.000:. ./.:4:159,64:.: 0.53:1.000:. ./.:4:203,74:.: 1.24:1.000:. ./.:4:153,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:146,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,39:.:-0.81:1.000:. ./.:4:183,51:.: 0.68:1.000:. ./.:4:123,42:.:-0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:189,0:.: 0.08:1.000:. ./.:6:191,81:.: 1.18:1.000:. ./.:4:189,80:.: 1.14:1.000:. ./.:4:99,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:208,96:.: 1.60:1.000:. ./.:4:189,91:.: 1.28:1.000:. ./.:4:139,63:.: 0.25:1.000:. ./.:4:168,75:.: 0.79:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,56:.: 0.01:0.974:. ./.:4:159,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:170,64:.: 0.68:0.999:. ./.:4:255,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:148,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:156,61:.: 0.45:1.000:. ./.:4:179,67:.: 0.83:1.000:. ./.:4:157,61:.: 0.46:1.000:. ./.:4:172,74:.: 0.83:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.12:0.997:. ./.:4:199,83:.: 1.31:1.000:. ./.:4:142,70:.: 0.38:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.78:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:151,69:.: 0.49:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:153,60:.: 0.40:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:118,55:.:-0.13:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:138,49:.: 0.05:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:83,36:.:-0.85:1.000:. ./.:4:183,79:.: 1.05:1.000:. ./.:4:153,78:.: 0.64:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:194,81:.: 1.22:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:112,65:.:-0.08:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,57:.:-0.16:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.92:0.981:. ./.:4:217,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:135,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:97,39:.:-0.62:1.000:. ./.:4:196,75:.: 1.16:1.000:. ./.:4:91,44:.:-0.63:1.000:. ./.:4:179,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:245,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:184,64:.: 0.86:1.000:. ./.:4:150,75:.: 0.56:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:143,73:.: 0.44:1.000:. ./.:4:155,59:.: 0.41:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:180,66:.: 0.83:1.000:. ./.:4:103,37:.:-0.57:1.000:. ./.:4:185,70:.: 0.95:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:142,60:.: 0.25:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:97,52:.:-0.45:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:164,60:.: 0.54:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:107,58:.:-0.24:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:150,72:.: 0.52:1.000:. ./.:4:138,64:.: 0.25:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:110,36:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:137,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:178,66:.: 0.81:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,38:.:-0.66:1.000:. ./.:4:112,51:.:-0.26:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:86,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:394,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:58,33:.:-1.22:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:129,58:.: 0.05:1.000:. ./.:4:127,75:.: 0.25:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:80,41:.:-0.82:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:76,41:.:-0.87:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:78,35:.:-0.93:1.000:. ./.:4:82,34:.:-0.89:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:106,40:.:-0.49:1.000:. ./.:4:84,40:.:-0.78:1.000:. ./.:4:85,36:.:-0.82:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:102,51:.:-0.40:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:69,27:.:-1.15:1.000:. ./.:4:83,41:.:-0.78:1.000:. ./.:4:135,54:.: 0.08:1.000:. ./.:4:78,38:.:-0.89:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:99,42:.:-0.56:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:129,48:.:-0.08:1.000:. ./.:4:74,29:.:-1.06:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.42:1.000:. -chr7.1 6220074 chr7.1_006220074 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:96,55:0.41: 1.87:1.000:0.859 0/0/1/1:4:36,53:0.61:-0.25:1.000:0.644 0/0/1/1:4:58,50:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,19:0.20: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,101:0.83: 0.81:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,89:0.79: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,23:0.78:-2.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,91:0.71: 1.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,54:0.63:-0.32:1.000:0.615 0/1/1/1:4:7,23:0.75:-2.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,13:0.50:-2.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,60:0.64:-0.04:1.000:0.718 0/0/1/1:4:78,47:0.42: 0.98:1.000:0.920 0/0/0/1:4:72,21:0.26:-0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,68:0.77:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,68:0.70: 0.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:75,43:0.41: 0.74:0.803:0.861 0/0/1/1:4:82,65:0.49: 1.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,45:0.42: 0.85:1.000:0.902 0/1/1/1:4:22,82:0.77: 0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-2.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,24:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,81:0.74: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,24:0.33:-0.46:1.000:0.917 0/0/1/1:4:4,5:0.58:-2.99:1.000:0.903 0/0/1/1:4:42,43:0.54:-0.39:1.000:0.985 0/0/1/1:4:64,44:0.45: 0.40:1.000:0.984 0/1/1/1:4:26,88:0.75: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,53:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,49:0.67:-0.76:1.000:0.906 0/1/1/1:4:17,70:0.79:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,18:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,9:0.69:-2.85:1.000:0.974 0/0/0/1:4:24,11:0.36:-2.10:1.000:0.721 0/1/1:3:3,4:0.60:-3.06:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,99:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,70:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,63:0.70:-0.22:1.000:0.982 0/0/1/1:4:60,48:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,24:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,12:0.17:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,54:0.48: 0.95:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,88:0.99:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,62:0.78:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,58:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,107:0.67: 2.21:0.997:0.915 0/0/1/1:4:7,9:0.59:-2.75:1.000:0.876 0/0/1/1:4:43,37:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,34:0.70:-1.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:48,47:0.53:-0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:68,51:0.48: 0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,47:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,45:0.42: 0.78:1.000:0.928 0/1/1/1:4:18,77:0.80:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,60:0.76:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,64:0.52: 1.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,46:0.71:-1.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:58,39:0.45: 0.02:1.000:0.979 0/0/1/1/1/1:6:25,63:0.71:-0.28:1.000:0.831 0/1/1/1:4:38,81:0.68: 0.78:1.000:0.957 0/0/1/1:4:64,41:0.44: 0.30:1.000:0.961 0/0/1/1:4:53,39:0.47:-0.15:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,41:0.70:-1.31:1.000:0.987 0/1/1/1:4:14,72:0.82:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,17:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,34:0.80:-1.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,57:0.54: 0.64:1.000:0.990 0/0/1/1:4:57,41:0.47: 0.06:0.974:0.991 0/0/1/1:4:45,62:0.60: 0.37:1.000:0.779 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,15:0.38:-1.79:0.999:0.631 0/0/1/1:4:40,43:0.55:-0.46:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,68:0.63: 0.47:1.000:0.589 0/0/0/1:4:69,21:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,46:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,26:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,101:0.74: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,57:0.44: 1.70:1.000:0.961 0/0/1/1:4:63,49:0.49: 0.54:0.997:0.996 0/0/1/1:4:71,52:0.47: 0.91:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,53:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,43:0.52:-0.18:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,50:0.47: 0.74:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,36:0.71:-1.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,44:0.71:-1.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,61:0.71:-0.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,77:0.83:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,73:0.68: 0.40:1.000:0.947 0/0/0/1:4:98,23:0.23: 0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,137:1.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,38:0.53:-0.63:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,98:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,59:0.77:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,52:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,52:0.62:-0.35:1.000:0.552 0/1/1/1:4:16,68:0.80:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,102:0.68: 1.87:1.000:0.946 0/0/1/1:4:15,20:0.60:-2.10:1.000:0.830 0/0/1/1:4:45,65:0.61: 0.47:1.000:0.687 0/0/1/1:4:48,25:0.39:-0.80:1.000:0.651 0/1/1/1:4:13,110:0.89: 0.91:0.981:0.598 0/1/1/1:4:23,51:0.69:-0.76:1.000:0.970 0/0/1/1:4:69,39:0.41: 0.40:1.000:0.838 0/1/1/1:4:20,53:0.72:-0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,60:0.50: 1.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,91:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,52:0.54: 0.26:1.000:0.988 0/0/1/1:4:38,25:0.44:-1.14:1.000:0.972 0/0/1/1:4:73,46:0.43: 0.78:1.000:0.953 0/1/1/1:4:13,71:0.83:-0.42:0.999:0.997 0/1/1/1:4:28,99:0.76: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,81:0.81: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,35:0.58:-1.14:1.000:0.903 0/1/1/1:4:28,53:0.66:-0.52:1.000:0.872 0/1/1/1:4:22,73:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,44:0.48: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,59:0.51: 1.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,57:0.69:-0.49:1.000:0.977 0/0/1/1:4:63,63:0.54: 1.02:1.000:0.988 0/0/0/1:4:83,27:0.29: 0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,44:0.71:-1.21:1.000:0.993 1/1/1/1:4:1,88:0.99:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,50:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,65:0.73:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,59:0.73:-0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,60:0.66:-0.15:1.000:0.862 0/1/1/1:4:22,63:0.73:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,66:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,44:0.53:-0.22:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,44:0.46: 0.37:1.000:0.987 0/0/1/1:4:75,66:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,72:0.79:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,45:0.62:-0.73:1.000:0.600 0/0/1/1:4:59,56:0.53: 0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:56,42:0.48: 0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:10,64:0.85:-0.76:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,53:0.52: 0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,55:0.82:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,65:0.51: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,74:0.59: 1.22:1.000:0.884 0/1/1/1:4:27,78:0.73: 0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,30:0.26: 1.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,76:0.77: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,90:0.80: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,104:0.75: 1.32:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,55:0.70:-0.63:1.000:0.986 0/0/1/1:4:46,59:0.59: 0.30:1.000:0.878 0/0/1/1:4:71,46:0.44: 0.71:1.000:0.966 0/1/1/1:4:28,82:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,93:0.83: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,72:0.79:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,77:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,69:0.79:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,73:0.78:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,92:0.82: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,53:0.55: 0.19:1.000:0.975 0/0/0/1:4:85,23:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,24:0.31:-0.28:1.000:0.967 0/1/1/1:4:43,82:0.66: 0.98:0.999:0.880 0/1/1/1:4:23,93:0.79: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,66:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,64:0.77:-0.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,54:0.54: 0.40:1.000:0.988 0/1/1/1:4:44,89:0.67: 1.26:1.000:0.930 0/0/1/1:4:32,42:0.59:-0.76:1.000:0.851 0/1/1/1:4:28,58:0.68:-0.35:1.000:0.944 0/0/1/1:4:67,49:0.47: 0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,62:0.49: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,59:0.72:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,75:0.69: 0.40:1.000:0.977 0/0/1/1:4:86,55:0.44: 1.53:1.000:0.961 0/1/1/1:4:26,91:0.76: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,60:0.52: 0.98:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,52:0.74:-0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,67:0.65: 0.26:1.000:0.815 -chr7.1 6273129 chr7.1_006273129 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:119,38:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,47:0.45:-0.70:1.000:0.979 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,37:0.27: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:159,15:0.09: 1.24:1.000:0.947 0/0/0/1:4:129,26:0.17: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,44:0.31: 0.40:1.000:0.969 0/0/0/1:4:81,14:0.15:-0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,6:0.16:-2.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-2.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,65:0.71:-1.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:87,30:0.27:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,36:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,11:0.11:-0.59:1.000:0.668 0/0/0/1:4:98,19:0.17:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:147,50:0.26: 1.89:0.803:0.998 0/0/0/1:4:110,47:0.31: 0.76:1.000:0.978 0/0/0/1:4:142,50:0.27: 1.75:1.000:0.998 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.26:-2.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,44:0.32: 0.31:1.000:0.956 0/0/0/1:4:107,18:0.15:-0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:95,39:0.30: 0.12:1.000:0.986 0/0/0/1:4:26,5:0.17:-2.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,45:0.31: 0.54:1.000:0.974 0/0/0/1:4:82,33:0.29:-0.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:75,9:0.11:-1.29:1.000:0.535 0/0/0/1:4:146,53:0.28: 1.95:1.000:0.997 0/0/0/0:4:137,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,14:0.10: 0.48:1.000:0.818 0/0/1/1:4:59,36:0.38:-0.98:1.000:0.608 0/0/0/1:4:32,5:0.14:-2.61:1.000:0.970 0/0/0/1:4:43,9:0.18:-2.19:1.000:0.999 0/0/1:3:5,3:0.38:-3.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,14:0.12:-0.22:1.000:0.752 0/0/0/1:4:92,21:0.19:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,10:0.10:-0.67:1.000:0.837 0/0/0/1:4:139,35:0.21: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,60:0.44: 0.23:1.000:0.961 0/0/0/1:4:109,44:0.30: 0.65:1.000:0.989 0/0/0/1:4:90,42:0.32: 0.06:1.000:0.940 0/0/0/0:4:141,12:0.08: 0.65:1.000:0.985 0/0/0/1:4:116,16:0.13: 0.06:1.000:0.869 0/0/0/0:4:139,6:0.04: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,54:0.27: 2.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,49:0.26: 1.83:0.997:0.999 0/0/0/1:4:22,12:0.36:-2.70:1.000:0.710 0/0/0/1:4:96,44:0.32: 0.29:1.000:0.951 0/0/0/0:4:119,12:0.10: 0.03:1.000:0.885 0/0/0/1:4:100,35:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:99,66:0.40: 0.99:1.000:0.817 0/0/0/1:4:94,55:0.37: 0.54:1.000:0.515 0/0/0/1:4:127,41:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:107,9:0.08:-0.39:1.000:0.987 0/0/0/0:4:123,11:0.09: 0.12:1.000:0.972 0/0/1/1:4:76,61:0.45: 0.20:1.000:0.976 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,39:0.26: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:88,12:0.12:-0.84:1.000:0.987 0/0/0/0:4:130,4:0.03: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,53:0.31: 1.35:1.000:0.980 0/0/0/1:4:113,48:0.31: 0.88:1.000:0.979 0/0/0/0:4:125,12:0.09: 0.20:1.000:0.935 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,57:0.31: 1.61:1.000:0.970 0/0/0/0:4:84,3:0.04:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,38:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,44:0.27: 1.10:0.974:0.998 0/0/1/1:4:63,38:0.38:-0.81:1.000:0.575 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,19:0.22:-1.12:0.999:1.000 0/0/1/1:4:99,66:0.40: 0.99:1.000:0.817 0/0/0/0:4:141,15:0.10: 0.74:1.000:0.798 0/0/0/1:4:81,45:0.36:-0.11:1.000:0.663 0/0/0/1:4:119,37:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,60:0.44: 0.23:1.000:0.961 0/0/0/1:4:108,41:0.28: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/0:4:120,14:0.11: 0.12:1.000:0.553 0/0/0/1:4:135,45:0.26: 1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,62:0.54:-0.42:0.997:0.989 0/0/0/1:4:131,34:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,69:0.46: 0.54:1.000:0.990 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,6:0.05:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,58:0.33: 1.35:1.000:0.911 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,5:0.05:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,8:0.07:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,43:0.30: 0.45:1.000:0.983 0/0/0/1:4:111,41:0.28: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/0:4:141,8:0.06: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,22:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,31:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,52:0.57:-1.09:1.000:0.945 0/0/0/0:4:124,13:0.10: 0.20:1.000:0.826 0/0/1/1:4:76,48:0.39:-0.16:1.000:0.701 0/0/0/1:4:78,30:0.29:-0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:93,44:0.33: 0.20:1.000:0.930 0/0/0/1:4:65,18:0.23:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,26:0.19: 0.37:0.981:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,40:0.25: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,8:0.08:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,50:0.44:-0.45:1.000:0.967 0/0/0/1:4:102,14:0.13:-0.39:1.000:0.862 0/0/0/0:4:98,10:0.10:-0.61:1.000:0.869 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,45:0.28: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 1.13:0.999:1.000 0/0/0/0:4:188,0:0.00: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,3:0.04:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,32:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,8:0.07:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,28:0.23:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,36:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,34:0.20: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,34:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,11:0.08: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,51:0.41:-0.16:1.000:0.887 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,3:0.04:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,34:0.37:-1.04:1.000:0.560 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,36:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,31:0.44:-1.68:1.000:0.973 0/0/0/0:4:119,8:0.07:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,35:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,48:0.28: 1.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:137,12:0.08: 0.54:1.000:0.978 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,38:0.45:-1.26:1.000:0.978 0/0/0/1:4:99,27:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,11:0.10:-0.36:1.000:0.843 0/0/0/0:4:100,5:0.05:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,52:0.45:-0.42:1.000:0.983 0/0/0/0:4:74,3:0.04:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,62:0.43: 0.45:1.000:0.938 0/0/1/1:4:85,62:0.42: 0.48:1.000:0.929 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,43:0.27: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:124,12:0.09: 0.17:1.000:0.928 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,20:0.14: 0.45:1.000:0.975 0/0/0/1:4:118,21:0.16: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-2.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,40:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,51:0.36: 0.40:1.000:0.696 0/0/0/1:4:108,20:0.16:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/0:4:94,11:0.11:-0.70:1.000:0.544 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,7:0.06:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,46:0.29: 0.88:1.000:0.990 0/0/0/1:4:92,48:0.35: 0.29:1.000:0.806 0/0/1/1:4:42,34:0.45:-1.52:1.000:0.978 0/0/1/1:4:59,35:0.38:-1.01:0.999:0.526 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,17:0.17:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,12:0.14:-1.09:1.000:0.957 0/0/0/1:4:72,10:0.13:-1.35:1.000:0.879 0/0/0/1:4:104,31:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,36:0.28: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,55:0.46:-0.28:1.000:0.987 0/0/0/0:4:97,10:0.10:-0.64:1.000:0.854 0/0/0/1:4:127,41:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,53:0.35: 0.65:1.000:0.775 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,43:0.41:-0.67:1.000:0.855 0/0/1/1:4:77,53:0.41: 0.00:1.000:0.867 0/0/0/0:4:131,13:0.09: 0.40:1.000:0.904 0/0/0/1:4:97,36:0.28: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,61:0.44: 0.23:1.000:0.972 -chr7.1 6496412 chr7.1_006496412 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:134,60:.: 0.83:1.000:. ./.:4:125,33:.: 0.06:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:134,60:.: 0.83:1.000:. ./.:4:210,5:.: 1.27:1.000:. ./.:4:246,1:.: 1.96:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:137,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:19,11:.:-2.67:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:139,37:.: 0.44:1.000:. ./.:4:123,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:146,60:.: 1.08:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:146,55:.: 0.98:0.803:. ./.:4:173,46:.: 1.36:1.000:. ./.:4:176,58:.: 1.68:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:138,52:.: 0.74:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:134,37:.: 0.33:1.000:. ./.:4:7,6:.:-3.04:1.000:. ./.:4:104,32:.:-0.41:1.000:. ./.:4:157,58:.: 1.27:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:160,46:.: 1.08:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:156,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:118,53:.: 0.33:1.000:. ./.:4:12,6:.:-2.93:1.000:. ./.:4:25,14:.:-2.48:1.000:. ./.:3:3,1:.:-3.23:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:91,34:.:-0.65:1.000:. ./.:4:106,46:.:-0.07:1.000:. ./.:4:100,43:.:-0.26:1.000:. ./.:4:102,50:.:-0.07:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,51:.: 0.36:1.000:. ./.:4:160,59:.: 1.36:0.997:. ./.:4:41,24:.:-1.93:1.000:. ./.:4:92,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:93,32:.:-0.65:1.000:. ./.:4:120,50:.: 0.31:1.000:. ./.:4:98,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:118,54:.: 0.36:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:114,42:.: 0.01:1.000:. ./.:6:106,10:.:-0.84:1.000:. ./.:4:144,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:107,51:.: 0.06:1.000:. ./.:4:111,31:.:-0.28:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:180,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:86,34:.:-0.75:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:125,48:.: 0.38:1.000:. ./.:4:88,25:.:-0.90:0.974:. ./.:4:138,44:.: 0.57:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:72,14:.:-1.48:0.999:. ./.:4:103,31:.:-0.45:1.000:. ./.:4:187,4:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,37:.:-0.39:1.000:. ./.:4:108,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,44:.:-0.18:1.000:. ./.:4:107,43:.:-0.11:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:109,50:.: 0.08:1.000:. ./.:4:73,76:.:-0.13:0.997:. ./.:4:106,26:.:-0.50:1.000:. ./.:4:133,50:.: 0.59:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:149,48:.: 0.89:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:158,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:78,33:.:-0.95:1.000:. ./.:4:103,43:.:-0.20:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:77,32:.:-0.99:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:98,24:.:-0.71:1.000:. ./.:4:113,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:149,37:.: 0.66:1.000:. ./.:4:90,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:116,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:84,32:.:-0.84:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.57:0.981:. ./.:4:93,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:85,25:.:-0.97:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:124,57:.: 0.55:1.000:. ./.:4:168,5:.: 0.38:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:167,78:.: 1.91:1.000:. ./.:4:145,3:.:-0.16:0.999:. ./.:4:186,4:.: 0.74:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:82,29:.:-0.95:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:103,27:.:-0.54:1.000:. ./.:4:129,36:.: 0.21:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:119,31:.:-0.11:1.000:. ./.:4:181,66:.: 1.96:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:147,6:.:-0.05:1.000:. ./.:4:112,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:108,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:94,25:.:-0.77:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:154,51:.: 1.06:1.000:. ./.:4:71,21:.:-1.35:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:99,33:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,76:.: 2.34:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:102,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:95,32:.:-0.60:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:144,46:.: 0.74:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:130,59:.: 0.72:1.000:. ./.:4:185,71:.: 2.15:1.000:. ./.:4:188,8:.: 0.87:1.000:. ./.:4:127,41:.: 0.27:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:123,44:.: 0.25:1.000:. ./.:4:152,52:.: 1.04:1.000:. ./.:4:217,6:.: 1.44:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:131,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:137,43:.: 0.53:1.000:. ./.:4:145,53:.: 0.91:1.000:. ./.:4:146,47:.: 0.80:1.000:. ./.:4:156,50:.: 1.08:0.999:. ./.:4:208,6:.: 1.25:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:135,35:.: 0.31:1.000:. ./.:4:122,40:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,36:.:-0.75:1.000:. ./.:4:173,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:139,60:.: 0.93:1.000:. ./.:4:158,64:.: 1.42:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:133,46:.: 0.51:1.000:. ./.:4:136,45:.: 0.55:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:188,67:.: 2.13:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:130,41:.: 0.33:1.000:. -chr7.1 6712489 chr7.1_006712489 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,18:.:-0.26:1.000:. ./.:4:38,17:.:-0.34:1.000:. ./.:4:24,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:86,16:.: 1.54:1.000:. ./.:4:96,17:.: 1.98:1.000:. ./.:4:6,6:.:-2.06:1.000:. ./.:4:65,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:40,31:.: 0.30:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:6,10:.:-1.90:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:43,23:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,35:.: 0.70:1.000:. ./.:4:74,22:.: 1.30:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.50:0.803:. ./.:4:79,20:.: 1.42:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:35,24:.:-0.18:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:60,13:.: 0.38:1.000:. ./.:4:73,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:24,16:.:-0.94:1.000:. ./.:4:3,2:.:-2.34:1.000:. ./.:4:40,32:.: 0.34:1.000:. ./.:4:37,27:.: 0.02:1.000:. ./.:4:48,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:71,14:.: 0.86:1.000:. ./.:4:50,14:.: 0.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:56,16:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,4:.:-1.90:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:59,19:.: 0.58:1.000:. ./.:4:76,14:.: 1.06:1.000:. ./.:4:46,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:62,18:.: 0.66:1.000:. ./.:4:48,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,15:.: 0.10:1.000:. ./.:4:41,37:.: 0.58:1.000:. ./.:4:37,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:25,4:.:-1.38:1.000:. ./.:4:37,33:.: 0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.62:0.997:. ./.:4:17,15:.:-1.26:1.000:. ./.:4:34,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,7:.:-0.74:1.000:. ./.:4:34,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:88,18:.: 1.70:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.62:1.000:. ./.:4:71,23:.: 1.22:1.000:. ./.:4:29,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:59,21:.: 0.66:1.000:. ./.:4:34,26:.:-0.14:1.000:. ./.:4:61,11:.: 0.34:1.000:. ./.:6:36,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:43,15:.:-0.22:1.000:. ./.:4:39,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,2:.:-1.14:1.000:. ./.:4:37,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:92,15:.: 1.74:1.000:. ./.:4:20,6:.:-1.50:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.62:1.000:. ./.:4:35,4:.:-0.98:0.974:. ./.:4:52,20:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:19,15:.:-1.18:0.999:. ./.:4:69,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:48,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:24,10:.:-1.18:1.000:. ./.:4:59,13:.: 0.34:1.000:. ./.:4:33,24:.:-0.26:1.000:. ./.:4:64,34:.: 1.38:1.000:. ./.:4:65,13:.: 0.58:1.000:. ./.:4:27,9:.:-1.10:0.997:. ./.:4:39,34:.: 0.38:1.000:. ./.:4:52,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.22:1.000:. ./.:4:51,17:.: 0.18:1.000:. ./.:4:46,30:.: 0.50:1.000:. ./.:4:20,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:64,11:.: 0.46:1.000:. ./.:4:77,18:.: 1.26:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:72,11:.: 0.78:1.000:. ./.:4:63,28:.: 1.10:1.000:. ./.:4:48,16:.: 0.02:1.000:. ./.:4:72,13:.: 0.86:1.000:. ./.:4:38,38:.: 0.50:1.000:. ./.:4:55,10:.: 0.06:1.000:. ./.:4:61,7:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,22:.:-0.50:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:11,3:.:-1.98:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:20,15:.:-1.14:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.38:0.981:. ./.:4:42,9:.:-0.50:1.000:. ./.:4:70,16:.: 0.90:1.000:. ./.:4:35,32:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,14:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,43:.: 1.14:1.000:. ./.:4:61,39:.: 1.46:1.000:. ./.:4:28,32:.:-0.14:1.000:. ./.:4:125,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:42,8:.:-0.54:0.999:. ./.:4:64,14:.: 0.58:1.000:. ./.:4:23,6:.:-1.38:1.000:. ./.:4:26,22:.:-0.62:1.000:. ./.:4:20,15:.:-1.14:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:38,28:.: 0.10:1.000:. ./.:4:42,22:.: 0.02:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:43,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:51,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:46,37:.: 0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.82:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:34,24:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,13:.: 0.14:1.000:. ./.:4:23,10:.:-1.22:1.000:. ./.:4:37,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:92,20:.: 1.94:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:25,24:.:-0.58:1.000:. ./.:4:22,7:.:-1.38:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:38,11:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,8:.:-0.70:1.000:. ./.:4:33,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:115,23:.: 2.98:1.000:. ./.:4:64,13:.: 0.54:1.000:. ./.:4:62,12:.: 0.42:1.000:. ./.:4:32,29:.:-0.10:1.000:. ./.:4:103,34:.: 2.94:1.000:. ./.:4:39,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:72,15:.: 0.94:1.000:. ./.:4:85,20:.: 1.66:1.000:. ./.:4:6,3:.:-2.18:1.000:. ./.:4:18,20:.:-1.02:1.000:. ./.:4:67,15:.: 0.74:1.000:. ./.:4:51,45:.: 1.30:1.000:. ./.:4:71,27:.: 1.38:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:36,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:54,13:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,27:.: 0.06:1.000:. ./.:4:74,36:.: 1.86:1.000:. ./.:4:46,19:.: 0.06:1.000:. ./.:4:33,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:56,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,40:.: 1.34:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,14:.: 0.10:0.999:. ./.:4:27,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:29,16:.:-0.74:1.000:. ./.:4:27,4:.:-1.30:1.000:. ./.:4:58,8:.: 0.10:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.18:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:39,38:.: 0.54:1.000:. ./.:4:44,30:.: 0.42:1.000:. ./.:4:44,36:.: 0.66:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:43,8:.:-0.50:1.000:. ./.:4:52,12:.: 0.02:1.000:. ./.:4:55,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.10:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.38:1.000:. -chr7.1 6974346 chr7.1_006974346 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.39:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.44:1.000:. ./.:4:16,4:.: 0.92:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:0.803:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:9,5:.: 0.11:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:13,3:.: 0.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:17,5:.: 1.20:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.52:1.000:. ./.:3:6,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,5:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:7,7:.: 0.11:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,4:.: 0.24:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:7,7:.: 0.11:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.79:0.997:. ./.:4:27,13:.: 3.65:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:13,6:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,7:.: 1.74:1.000:. ./.:4:19,4:.: 1.33:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.71:1.000:. ./.:6:20,4:.: 1.47:1.000:. ./.:4:29,5:.: 2.83:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,3:.: 2.28:1.000:. ./.:4:17,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.24:0.974:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:9,5:.: 0.11:0.999:. ./.:4:17,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:23,5:.: 2.01:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,7:.: 2.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:0.997:. ./.:4:14,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,2:.: 1.88:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:15,3:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:9,6:.: 0.24:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.11:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.30:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:17,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:19,8:.: 1.88:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:12,8:.: 0.92:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:34,0:.: 2.83:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.38:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.60:0.981:. ./.:4:9,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.16:1.000:. ./.:4:11,6:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.12:1.000:. ./.:4:8,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.47:0.999:. ./.:4:15,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,4:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:12,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:13,9:.: 1.20:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:15,5:.: 0.92:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.16:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:11,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:20,3:.: 1.33:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:14,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:16,6:.: 1.20:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,3:.:-1.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.38:1.000:. ./.:4:11,5:.: 0.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:4,6:.:-0.44:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:7,7:.: 0.11:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.57:0.999:. ./.:4:8,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:3,3:.:-0.98:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:5,3:.:-0.71:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.16:1.000:. -chr7.1 7181329 chr7.1_007181329 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:149,390:.: 0.77:1.000:. ./.:4:169,288:.: 0.01:1.000:. ./.:4:120,364:.: 0.26:1.000:. ./.:4:54,483:.: 0.75:1.000:. ./.:4:205,393:.: 1.32:1.000:. ./.:4:165,505:.: 1.99:1.000:. ./.:4:125,228:.:-0.96:1.000:. ./.:4:204,329:.: 0.72:1.000:. ./.:4:124,361:.: 0.27:1.000:. ./.:4:76,129:.:-2.34:1.000:. ./.:4:55,202:.:-1.85:1.000:. ./.:4:180,348:.: 0.67:1.000:. ./.:4:132,377:.: 0.49:1.000:. ./.:4:70,441:.: 0.51:1.000:. ./.:4:211,321:.: 0.71:1.000:. ./.:4:207,400:.: 1.41:1.000:. ./.:4:144,449:.: 1.28:0.803:. ./.:4:194,247:.:-0.14:1.000:. ./.:4:180,541:.: 2.47:1.000:. ./.:4:216,356:.: 1.08:1.000:. ./.:4:89,105:.:-2.44:1.000:. ./.:4:58,412:.: 0.13:1.000:. ./.:4:189,358:.: 0.85:1.000:. ./.:4:62,428:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,161:.:-2.20:1.000:. ./.:4:225,370:.: 1.29:1.000:. ./.:4:144,387:.: 0.70:1.000:. ./.:4:236,342:.: 1.14:1.000:. ./.:4:114,390:.: 0.45:1.000:. ./.:4:237,422:.: 1.89:1.000:. ./.:4:247,344:.: 1.26:1.000:. ./.:4:55,414:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,173:.:-2.37:1.000:. ./.:4:65,153:.:-2.22:1.000:. ./.:3:51,87:.:-2.96:1.000:. ./.:4:257,267:.: 0.63:1.000:. ./.:4:186,340:.: 0.65:1.000:. ./.:4:198,363:.: 0.98:1.000:. ./.:4:146,427:.: 1.09:1.000:. ./.:4:83,518:.: 1.35:1.000:. ./.:4:46,411:.: 0.01:1.000:. ./.:4:130,346:.: 0.19:1.000:. ./.:4:176,304:.: 0.22:1.000:. ./.:4:166,253:.:-0.35:1.000:. ./.:4:234,299:.: 0.72:1.000:. ./.:4:106,343:.:-0.07:1.000:. ./.:4:227,366:.: 1.28:0.997:. ./.:4:46,109:.:-2.80:1.000:. ./.:4:92,295:.:-0.64:1.000:. ./.:4:134,245:.:-0.72:1.000:. ./.:4:76,260:.:-1.12:1.000:. ./.:4:153,425:.: 1.14:1.000:. ./.:4:72,316:.:-0.63:1.000:. ./.:4:107,364:.: 0.14:1.000:. ./.:4:172,287:.: 0.03:1.000:. ./.:4:165,227:.:-0.60:1.000:. ./.:4:89,372:.: 0.05:1.000:. ./.:4:161,327:.: 0.30:1.000:. ./.:4:105,334:.:-0.16:1.000:. ./.:6:113,223:.:-1.12:1.000:. ./.:4:119,239:.:-0.91:1.000:. ./.:4:116,301:.:-0.36:1.000:. ./.:4:108,389:.: 0.38:1.000:. ./.:4:147,286:.:-0.22:1.000:. ./.:4:183,286:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,359:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,206:.:-1.21:1.000:. ./.:4:89,337:.:-0.28:1.000:. ./.:4:110,312:.:-0.32:0.974:. ./.:4:172,316:.: 0.30:1.000:. ./.:4:261,241:.: 0.43:1.000:. ./.:4:60,180:.:-2.01:0.999:. ./.:4:178,269:.:-0.08:1.000:. ./.:4:209,263:.: 0.15:1.000:. ./.:4:165,306:.: 0.14:1.000:. ./.:4:45,290:.:-1.13:1.000:. ./.:4:109,368:.: 0.19:1.000:. ./.:4:69,349:.:-0.35:1.000:. ./.:4:160,275:.:-0.20:1.000:. ./.:4:133,357:.: 0.32:1.000:. ./.:4:91,286:.:-0.74:0.997:. ./.:4:102,340:.:-0.13:1.000:. ./.:4:102,372:.: 0.17:1.000:. ./.:4:97,298:.:-0.57:1.000:. ./.:4:228,203:.:-0.23:1.000:. ./.:4:124,375:.: 0.40:1.000:. ./.:4:112,206:.:-1.29:1.000:. ./.:4:125,262:.:-0.64:1.000:. ./.:4:126,278:.:-0.49:1.000:. ./.:4:166,287:.:-0.03:1.000:. ./.:4:130,226:.:-0.93:1.000:. ./.:4:41,364:.:-0.48:1.000:. ./.:4:236,247:.: 0.25:1.000:. ./.:4:87,259:.:-1.03:1.000:. ./.:4:144,286:.:-0.24:1.000:. ./.:4:171,298:.: 0.12:1.000:. ./.:4:76,290:.:-0.84:1.000:. ./.:4:154,254:.:-0.45:1.000:. ./.:4:157,276:.:-0.22:1.000:. ./.:4:187,271:.: 0.02:1.000:. ./.:4:69,211:.:-1.64:1.000:. ./.:4:186,334:.: 0.60:1.000:. ./.:4:75,289:.:-0.86:1.000:. ./.:4:184,332:.: 0.56:0.981:. ./.:4:120,246:.:-0.84:1.000:. ./.:4:104,318:.:-0.32:1.000:. ./.:4:107,236:.:-1.05:1.000:. ./.:4:147,433:.: 1.15:1.000:. ./.:4:228,389:.: 1.50:1.000:. ./.:4:131,372:.: 0.44:1.000:. ./.:4:73,290:.:-0.87:1.000:. ./.:4:229,569:.: 3.18:1.000:. ./.:4:151,290:.:-0.14:0.999:. ./.:4:195,290:.: 0.27:1.000:. ./.:4:125,138:.:-1.80:1.000:. ./.:4:157,327:.: 0.26:1.000:. ./.:4:79,229:.:-1.38:1.000:. ./.:4:133,232:.:-0.85:1.000:. ./.:4:158,269:.:-0.27:1.000:. ./.:4:89,253:.:-1.06:1.000:. ./.:4:125,351:.: 0.19:1.000:. ./.:4:131,279:.:-0.43:1.000:. ./.:4:99,361:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,496:.: 0.92:1.000:. ./.:4:168,244:.:-0.41:1.000:. ./.:4:224,256:.: 0.22:1.000:. ./.:4:115,335:.:-0.06:1.000:. ./.:4:132,249:.:-0.70:1.000:. ./.:4:110,181:.:-1.54:1.000:. ./.:4:108,225:.:-1.15:1.000:. ./.:4:106,314:.:-0.34:1.000:. ./.:4:134,403:.: 0.75:1.000:. ./.:4:68,201:.:-1.74:1.000:. ./.:4:214,212:.:-0.28:1.000:. ./.:4:108,303:.:-0.42:1.000:. ./.:4:153,471:.: 1.56:1.000:. ./.:4:168,265:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,277:.:-0.93:1.000:. ./.:4:108,242:.:-0.99:1.000:. ./.:4:87,329:.:-0.37:1.000:. ./.:4:153,258:.:-0.42:1.000:. ./.:4:182,236:.:-0.35:1.000:. ./.:4:122,362:.: 0.26:1.000:. ./.:4:105,213:.:-1.29:1.000:. ./.:4:165,436:.: 1.35:1.000:. ./.:4:151,452:.: 1.37:1.000:. ./.:4:192,323:.: 0.55:1.000:. ./.:4:128,353:.: 0.23:1.000:. ./.:4:208,358:.: 1.02:1.000:. ./.:4:140,284:.:-0.30:1.000:. ./.:4:231,452:.: 2.11:1.000:. ./.:4:269,264:.: 0.72:1.000:. ./.:4:156,121:.:-1.67:1.000:. ./.:4:131,244:.:-0.76:1.000:. ./.:4:142,373:.: 0.55:1.000:. ./.:4:111,332:.:-0.12:1.000:. ./.:4:224,398:.: 1.55:1.000:. ./.:4:245,311:.: 0.93:1.000:. ./.:4:153,264:.:-0.36:1.000:. ./.:4:263,241:.: 0.45:1.000:. ./.:4:159,291:.:-0.06:1.000:. ./.:4:162,237:.:-0.53:1.000:. ./.:4:177,333:.: 0.50:1.000:. ./.:4:186,375:.: 0.98:1.000:. ./.:4:113,316:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,455:.: 0.66:1.000:. ./.:4:58,425:.: 0.25:1.000:. ./.:4:190,304:.: 0.35:0.999:. ./.:4:164,313:.: 0.19:1.000:. ./.:4:188,273:.: 0.05:1.000:. ./.:4:161,286:.:-0.08:1.000:. ./.:4:176,230:.:-0.47:1.000:. ./.:4:104,374:.: 0.20:1.000:. ./.:4:168,263:.:-0.23:1.000:. ./.:4:146,261:.:-0.46:1.000:. ./.:4:143,272:.:-0.38:1.000:. ./.:4:157,483:.: 1.71:1.000:. ./.:4:136,369:.: 0.46:1.000:. ./.:4:225,359:.: 1.19:1.000:. ./.:4:246,305:.: 0.88:1.000:. ./.:4:127,430:.: 0.94:1.000:. ./.:4:236,425:.: 1.91:1.000:. ./.:4:170,498:.: 1.97:1.000:. ./.:4:158,260:.:-0.35:1.000:. ./.:4:212,307:.: 0.59:1.000:. -chr7.1 7327409 chr7.1_007327409 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:30,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:25,12:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,16:.: 0.57:1.000:. ./.:4:64,24:.: 2.64:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:38,9:.: 0.22:1.000:. ./.:4:27,17:.: 0.04:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.67:1.000:. ./.:4:17,15:.:-0.67:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:15,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:29,13:.:-0.08:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:17,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.87:0.803:. ./.:4:13,19:.:-0.67:1.000:. ./.:4:42,18:.: 0.98:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:39,17:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,13:.:-0.97:1.000:. ./.:4:31,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:6,2:.:-2.09:1.000:. ./.:4:43,10:.: 0.57:1.000:. ./.:4:28,11:.:-0.26:1.000:. ./.:4:35,11:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:21,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:20,11:.:-0.73:1.000:. ./.:3:11,3:.:-1.73:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:15,13:.:-0.91:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:43,10:.: 0.57:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:27,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:0.997:. ./.:4:84,41:.: 4.82:1.000:. ./.:4:51,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,12:.: 0.04:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,25:.:-0.20:1.000:. ./.:6:54,8:.: 1.10:1.000:. ./.:4:55,14:.: 1.52:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:71,25:.: 3.11:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:57,16:.: 1.75:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:8,16:.:-1.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:54,8:.: 1.10:0.974:. ./.:4:38,13:.: 0.45:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:29,8:.:-0.38:0.999:. ./.:4:35,22:.: 0.81:1.000:. ./.:4:44,14:.: 0.87:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:29,8:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,16:.: 0.87:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:52,15:.: 1.40:1.000:. ./.:4:45,20:.: 1.28:1.000:. ./.:4:37,12:.: 0.33:0.997:. ./.:4:49,12:.: 1.04:1.000:. ./.:4:40,15:.: 0.69:1.000:. ./.:4:26,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,15:.: 0.45:1.000:. ./.:4:31,23:.: 0.63:1.000:. ./.:4:7,14:.:-1.32:1.000:. ./.:4:45,14:.: 0.92:1.000:. ./.:4:24,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:53,7:.: 0.98:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:35,18:.: 0.57:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:53,14:.: 1.40:1.000:. ./.:4:39,10:.: 0.33:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:38,13:.: 0.45:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:59,21:.: 2.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.81:0.981:. ./.:4:16,11:.:-0.97:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.49:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:32,18:.: 0.39:1.000:. ./.:4:31,15:.: 0.16:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,12:.: 0.04:0.999:. ./.:4:51,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:46,12:.: 0.87:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:32,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:42,21:.: 1.16:1.000:. ./.:4:35,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:26,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.38:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:28,13:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:37,14:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:16,15:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.73:1.000:. ./.:4:26,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:24,11:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,9:.:-1.02:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:25,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:52,18:.: 1.57:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:23,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,22:.: 1.63:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.62:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:43,12:.: 0.69:1.000:. ./.:4:38,18:.: 0.75:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:56,28:.: 2.40:1.000:. ./.:4:13,7:.:-1.38:1.000:. ./.:4:32,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:37,26:.: 1.16:0.999:. ./.:4:25,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.67:1.000:. ./.:4:46,10:.: 0.75:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,19:.: 1.16:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,19:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:64,22:.: 2.52:1.000:. ./.:4:41,15:.: 0.75:1.000:. ./.:4:44,16:.: 0.98:1.000:. -chr7.1 7427726 chr7.1_007427726 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:27,13:0.30:-0.41:1.000:0.980 0/0/1/1:4:15,11:0.41:-1.23:1.000:0.870 0/0/1/1:4:24,19:0.43:-0.24:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,27:0.28: 2.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,24:0.43: 0.41:1.000:0.956 0/0/0/1:4:11,7:0.37:-1.70:1.000:0.510 0/0/1/1:4:18,12:0.39:-1.00:1.000:0.645 0/0/0/1:4:30,19:0.37: 0.12:1.000:0.526 0/0/0/1:4:17,5:0.21:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.23:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,16:0.17: 2.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,17:0.60:-1.18:1.000:0.807 0/0/1/1:4:18,20:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,13:0.42:-1.00:1.000:0.922 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,14:0.20: 0.94:0.803:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,18:0.29: 0.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,23:0.53:-0.29:1.000:0.991 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,40:0.57: 1.23:1.000:0.957 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,31:0.74:-0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,14:0.28:-0.06:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,13:0.29:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,17:0.41:-0.41:1.000:0.882 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,24:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,12:0.66:-1.76:1.000:0.857 0/0/1/1:4:24,26:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1:3:5,4:0.43:-2.23:1.000:0.988 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,23:0.41: 0.47:1.000:0.836 0/0/1/1:4:16,16:0.49:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,27:0.48: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,28:0.39: 1.35:1.000:0.645 0/0/1/1:4:18,31:0.60: 0.12:1.000:0.787 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-1.00:1.000:0.981 0/0/1/1:4:14,9:0.38:-1.41:1.000:0.525 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,7:0.15:-0.24:0.997:0.986 0/0/1/1:4:23,37:0.59: 0.76:1.000:0.877 0/0/1/1:4:16,18:0.52:-0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,11:0.16: 1.00:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,32:0.60: 0.23:1.000:0.821 0/0/1/1:4:27,24:0.46: 0.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:39,22:0.34: 0.82:1.000:0.846 0/0/1/1:4:12,14:0.53:-1.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,22:0.57:-0.59:1.000:0.945 0/0/1/1:4:16,30:0.62:-0.06:1.000:0.622 0/0/1/1:4:19,13:0.39:-0.88:1.000:0.722 0/0/0/1:4:17,10:0.35:-1.18:1.000:0.754 0/0/0/0/0/1:6:47,14:0.21: 0.82:1.000:0.882 0/0/0/1:4:55,22:0.26: 1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,37:0.54: 1.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:34,45:0.55: 1.88:1.000:0.979 0/0/0/1:4:53,18:0.23: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,13:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,28:0.41: 1.11:1.000:0.877 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,13:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,24:0.51:-0.06:0.974:0.996 0/0/1/1:4:25,16:0.38:-0.35:1.000:0.510 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,33:0.61: 0.23:0.999:0.671 0/0/0/1:4:39,18:0.29: 0.59:1.000:0.989 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,9:0.16: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,20:0.58:-0.82:1.000:0.916 0/0/1/1:4:32,29:0.47: 0.82:1.000:0.991 0/1/1/1:4:6,29:0.76:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,16:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,35:0.62: 0.35:1.000:0.539 0/0/1/1:4:17,32:0.62: 0.12:0.997:0.613 0/1/1/1:4:12,32:0.68:-0.18:1.000:0.940 0/0/1/1:4:29,42:0.57: 1.41:1.000:0.951 0/0/0/1:4:35,17:0.31: 0.29:1.000:0.978 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,11:0.17: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,12:0.18: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,9:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,46:0.56: 1.88:1.000:0.966 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,20:0.40: 0.06:1.000:0.824 0/0/0/1:4:52,11:0.16: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,16:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,14:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,11:0.29:-0.71:1.000:0.990 0/0/1/1:4:39,30:0.42: 1.29:1.000:0.928 0/0/1/1:4:35,28:0.43: 0.94:1.000:0.956 0/0/1/1:4:34,24:0.40: 0.64:1.000:0.799 0/0/0/1:4:33,20:0.36: 0.35:1.000:0.670 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 1.76:0.981:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.40:-0.35:1.000:0.807 0/0/1/1:4:9,12:0.55:-1.53:1.000:0.978 0/0/1/1:4:25,23:0.47: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:64,23:0.24: 2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,18:0.31: 0.41:1.000:0.967 0/0/0/1:4:43,12:0.20: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,22:0.37: 0.59:1.000:0.552 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.53:0.999:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,14:0.46:-1.00:1.000:0.986 0/0/0/1:4:32,18:0.34: 0.17:1.000:0.851 0/0/0/1:4:32,12:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,15:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,31:0.62: 0.00:1.000:0.547 0/0/0/1:4:29,17:0.35:-0.06:1.000:0.763 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,28:0.40: 1.23:1.000:0.780 0/0/1/1:4:16,12:0.42:-1.12:1.000:0.901 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,45:0.62: 1.29:1.000:0.622 0/0/0/1:4:42,12:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,17:0.36:-0.12:1.000:0.665 0/0/0/1:4:46,14:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.57:-0.88:1.000:0.947 0/1/1/1:4:5,19:0.73:-1.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,12:0.16: 1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,42:0.64: 0.88:1.000:0.638 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.22:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.45:-1.47:1.000:0.974 0/0/0/1:4:39,17:0.28: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,19:0.28: 0.88:1.000:0.994 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.45: 0.06:1.000:0.979 0/0/0/1:4:29,13:0.29:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,41:0.56: 1.35:1.000:0.961 0/0/1/1:4:31,36:0.53: 1.17:1.000:0.994 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,16:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,22:0.32: 1.06:1.000:0.955 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,22:0.24: 2.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,16:0.31: 0.06:1.000:0.967 0/0/0/1:4:31,8:0.19:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,20:0.30: 0.94:1.000:0.988 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 2.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.43:-0.88:1.000:0.937 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,16:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,8:0.63:-2.06:1.000:0.527 0/1/1/1:4:17,36:0.64: 0.35:1.000:0.655 0/0/1/1:4:31,38:0.54: 1.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:39,21:0.33: 0.76:0.999:0.913 0/0/1/1:4:22,16:0.41:-0.53:1.000:0.857 0/0/0/1:4:40,22:0.34: 0.88:1.000:0.886 0/0/0/1:4:39,13:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,22:0.49:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,16:0.29: 0.23:1.000:0.990 0/0/0/1:4:21,9:0.28:-1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,12:0.47:-1.29:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.88:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,10:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,45:0.65: 1.06:1.000:0.769 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,57:0.69: 1.70:1.000:0.978 0/0/0/1:4:34,15:0.28: 0.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:37,19:0.32: 0.53:1.000:0.953 -chr7.1 8078032 chr7.1_008078032 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:56,20:.: 0.52:1.000:. ./.:4:49,21:.: 0.19:1.000:. ./.:4:68,11:.: 0.68:1.000:. ./.:4:20,51:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,13:.: 1.33:1.000:. ./.:4:56,38:.: 1.49:1.000:. ./.:4:40,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:65,19:.: 0.95:1.000:. ./.:4:67,15:.: 0.84:1.000:. ./.:4:13,4:.:-2.69:1.000:. ./.:4:18,3:.:-2.47:1.000:. ./.:4:55,14:.: 0.14:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.95:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,19:.: 0.14:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:80,20:.: 1.82:0.803:. ./.:4:74,18:.: 1.39:1.000:. ./.:4:82,16:.: 1.71:1.000:. ./.:4:92,17:.: 2.31:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:40,40:.: 0.73:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:35,28:.:-0.19:1.000:. ./.:4:5,4:.:-3.12:1.000:. ./.:4:57,9:.:-0.03:1.000:. ./.:4:48,42:.: 1.28:1.000:. ./.:4:70,13:.: 0.90:1.000:. ./.:4:60,13:.: 0.35:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:39,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.85:1.000:. ./.:4:9,9:.:-2.64:1.000:. ./.:3:6,2:.:-3.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:58,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:46,19:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,26:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,27:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:69,10:.: 0.68:1.000:. ./.:4:36,11:.:-1.06:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:35,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:53,26:.: 0.68:0.997:. ./.:4:11,10:.:-2.47:1.000:. ./.:4:36,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:33,8:.:-1.39:1.000:. ./.:4:31,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:30,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:44,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:54,10:.:-0.14:1.000:. ./.:4:55,8:.:-0.19:1.000:. ./.:4:24,25:.:-0.95:1.000:. ./.:4:50,10:.:-0.35:1.000:. ./.:4:55,17:.: 0.30:1.000:. ./.:6:44,11:.:-0.62:1.000:. ./.:4:52,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:32,28:.:-0.35:1.000:. ./.:4:37,26:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,14:.: 0.73:1.000:. ./.:4:34,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,23:.:-0.24:0.974:. ./.:4:40,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:28,19:.:-1.06:0.999:. ./.:4:66,22:.: 1.17:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,30:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,31:.: 0.14:1.000:. ./.:4:31,23:.:-0.68:1.000:. ./.:4:84,12:.: 1.60:1.000:. ./.:4:35,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:31,25:.:-0.57:0.997:. ./.:4:38,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:44,38:.: 0.84:1.000:. ./.:4:59,12:.: 0.24:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:40,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:58,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:52,13:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:40,25:.:-0.08:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:25,28:.:-0.73:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.03:1.000:. ./.:4:51,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,11:.:-1.22:1.000:. ./.:4:35,20:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,13:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,17:.: 0.30:1.000:. ./.:4:27,24:.:-0.84:1.000:. ./.:4:75,17:.: 1.39:1.000:. ./.:4:34,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.22:0.981:. ./.:4:64,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:48,15:.:-0.19:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.95:1.000:. ./.:4:38,20:.:-0.46:1.000:. ./.:4:42,5:.:-1.06:1.000:. ./.:4:61,13:.: 0.41:1.000:. ./.:4:36,11:.:-1.06:1.000:. ./.:4:84,17:.: 1.87:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:84,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,8:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,7:.:-1.01:1.000:. ./.:4:59,16:.: 0.46:1.000:. ./.:4:55,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:32,19:.:-0.84:1.000:. ./.:4:57,15:.: 0.30:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:45,28:.: 0.35:1.000:. ./.:4:45,38:.: 0.90:1.000:. ./.:4:47,15:.:-0.24:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:44,26:.: 0.19:1.000:. ./.:4:51,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:32,5:.:-1.60:1.000:. ./.:4:61,16:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,13:.: 0.95:1.000:. ./.:4:20,12:.:-1.87:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.52:1.000:. ./.:4:41,35:.: 0.52:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.95:1.000:. ./.:4:43,10:.:-0.73:1.000:. ./.:4:43,18:.:-0.30:1.000:. ./.:4:57,11:.: 0.08:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,24:.:-0.62:1.000:. ./.:4:43,5:.:-1.01:1.000:. ./.:4:42,23:.:-0.08:1.000:. ./.:4:54,28:.: 0.84:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:50,13:.:-0.19:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.03:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:69,7:.: 0.52:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.79:1.000:. ./.:4:53,15:.: 0.08:1.000:. ./.:4:48,40:.: 1.17:1.000:. ./.:4:59,13:.: 0.30:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:58,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:70,15:.: 1.01:1.000:. ./.:4:69,16:.: 1.01:1.000:. ./.:4:38,31:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,39:.: 0.57:1.000:. ./.:4:58,21:.: 0.68:0.999:. ./.:4:69,6:.: 0.46:1.000:. ./.:4:62,14:.: 0.52:1.000:. ./.:4:58,13:.: 0.24:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:44,38:.: 0.84:1.000:. ./.:4:62,13:.: 0.46:1.000:. ./.:4:31,13:.:-1.22:1.000:. ./.:4:63,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:45,53:.: 1.71:1.000:. ./.:4:59,38:.: 1.66:1.000:. ./.:4:50,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:66,10:.: 0.52:1.000:. ./.:4:33,41:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:45,40:.: 1.01:1.000:. ./.:4:56,14:.: 0.19:1.000:. ./.:4:56,15:.: 0.24:1.000:. -chr7.1 8305591 chr7.1_008305591 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:172,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:146,1:.: 0.56:0.803:. ./.:4:214,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.11:1.000:. ./.:3:35,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:158,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:229,1:.: 2.07:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.06:0.997:. ./.:4:32,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:128,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.06:1.000:. ./.:6:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:86,1:.:-0.54:0.974:. ./.:4:94,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:64,1:.:-0.94:0.999:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:95,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:0.997:. ./.:4:73,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:56,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.19:0.981:. ./.:4:36,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:45,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:235,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.19:0.999:. ./.:4:30,1:.:-1.56:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:31,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:293,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:284,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:105,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:197,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. -chr7.1 8505279 chr7.1_008505279 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:27,13:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,10:.: 0.86:1.000:. ./.:4:9,32:.: 0.68:1.000:. ./.:4:35,14:.: 1.37:1.000:. ./.:4:17,16:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,8:.:-0.85:1.000:. ./.:4:19,14:.: 0.00:1.000:. ./.:4:35,12:.: 1.20:1.000:. ./.:4:4,7:.:-1.87:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.38:1.000:. ./.:4:40,11:.: 1.54:1.000:. ./.:4:19,10:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,17:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:25,12:.: 0.34:0.803:. ./.:4:31,4:.: 0.17:1.000:. ./.:4:32,26:.: 2.13:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.43:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:19,28:.: 1.20:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,13:.: 0.00:1.000:. ./.:4:3,3:.:-2.30:1.000:. ./.:4:42,16:.: 2.13:1.000:. ./.:4:12,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.36:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,21:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.47:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.85:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:30,22:.: 1.62:1.000:. ./.:4:22,23:.: 1.03:1.000:. ./.:4:5,15:.:-1.10:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:8,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:12,13:.:-0.68:0.997:. ./.:4:13,10:.:-0.85:1.000:. ./.:4:27,24:.: 1.54:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:10,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:8,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:31,10:.: 0.68:1.000:. ./.:4:17,10:.:-0.51:1.000:. ./.:4:27,10:.: 0.34:1.000:. ./.:4:10,23:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.60:1.000:. ./.:4:21,15:.: 0.26:1.000:. ./.:6:26,11:.: 0.34:1.000:. ./.:4:37,6:.: 0.86:1.000:. ./.:4:18,33:.: 1.54:1.000:. ./.:4:24,24:.: 1.28:1.000:. ./.:4:27,16:.: 0.86:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.09:1.000:. ./.:4:22,26:.: 1.28:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:26,16:.: 0.77:1.000:. ./.:4:15,18:.: 0.00:0.974:. ./.:4:20,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.59:0.999:. ./.:4:48,16:.: 2.64:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.00:1.000:. ./.:4:22,20:.: 0.77:1.000:. ./.:4:12,17:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,10:.: 1.03:1.000:. ./.:4:9,19:.:-0.42:1.000:. ./.:4:23,13:.: 0.26:0.997:. ./.:4:19,19:.: 0.43:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,10:.: 0.77:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:8,20:.:-0.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:17,4:.:-1.02:1.000:. ./.:4:19,16:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,10:.:-1.10:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.25:1.000:. ./.:4:37,12:.: 1.37:1.000:. ./.:4:10,8:.:-1.27:1.000:. ./.:4:38,7:.: 1.03:1.000:. ./.:4:32,13:.: 1.03:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.26:1.000:. ./.:4:7,10:.:-1.36:1.000:. ./.:4:16,11:.:-0.51:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:0.981:. ./.:4:27,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,18:.: 0.86:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:30,21:.: 1.54:1.000:. ./.:4:24,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.08:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,18:.: 1.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.27:0.999:. ./.:4:41,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:23,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,11:.:-0.68:1.000:. ./.:4:28,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:12,13:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.09:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:10,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:19,26:.: 1.03:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.34:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:6,13:.:-1.19:1.000:. ./.:4:32,7:.: 0.51:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:12,3:.:-1.53:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.08:1.000:. ./.:4:34,12:.: 1.11:1.000:. ./.:4:5,9:.:-1.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:12,14:.:-0.59:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,5:.:-0.93:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:15,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:19,21:.: 0.60:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.25:1.000:. ./.:4:11,22:.: 0.00:1.000:. ./.:4:7,17:.:-0.76:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.25:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.25:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:35,22:.: 2.05:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.60:1.000:. ./.:4:27,8:.: 0.17:1.000:. ./.:4:5,19:.:-0.76:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.77:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:33,9:.: 0.77:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:35,13:.: 1.28:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.27:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:26,22:.: 1.28:1.000:. ./.:4:37,8:.: 1.03:0.999:. ./.:4:20,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:38,7:.: 1.03:1.000:. ./.:4:44,17:.: 2.39:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:28,20:.: 1.28:1.000:. ./.:4:10,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.17:1.000:. ./.:4:12,36:.: 1.28:1.000:. ./.:4:11,24:.: 0.17:1.000:. ./.:4:29,14:.: 0.86:1.000:. ./.:4:32,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:16,30:.: 1.11:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:11,34:.: 1.03:1.000:. ./.:4:30,14:.: 0.94:1.000:. ./.:4:33,7:.: 0.60:1.000:. -chr7.1 8812453 chr7.1_008812453 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:6,5:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-0.16:1.000:0.973 0/1/1/1:4:1,5:0.67:-0.48:1.000:0.906 0/0/1/1:4:5,5:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,1:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-1.43:1.000:0.900 0/0/0/1:4:7,2:0.28: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,5:0.61:-0.16:1.000:0.723 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.30: 0.15:1.000:0.982 0/0/1/1:4:2,4:0.58:-0.48:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.32: 1.11:1.000:0.950 0/0/0/1:4:4,2:0.37:-0.48:1.000:0.576 0/0/1/1:4:2,3:0.55:-0.80:0.803:0.980 0/0/1/1:4:6,7:0.52: 1.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,6:0.47: 1.74:1.000:0.992 0/0/0/1:4:9,2:0.25: 1.11:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,3:0.40: 0.15:1.000:0.806 0/1/1/1:4:1,4:0.65:-0.80:1.000:0.792 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:7,5:0.43: 1.42:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-0.80:1.000:0.920 0/0/1/1:4:3,8:0.61: 1.11:1.000:0.649 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:2,5:0.61:-0.16:1.000:0.723 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.37:-0.48:1.000:0.576 0/0/0/1:4:6,1:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,7:0.64: 0.47:1.000:0.675 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.40: 0.15:1.000:0.806 0/0/0/1:4:9,2:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,1:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-0.16:1.000:0.973 0/0/0/1:4:7,2:0.28: 0.47:0.997:0.995 0/0/1/1:4:2,4:0.58:-0.48:1.000:0.900 0/0/0/1:4:4,1:0.26:-0.80:1.000:0.998 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.39: 2.06:1.000:0.666 0/1/1/1:4:2,7:0.64: 0.47:1.000:0.675 0/0/1/1:4:6,4:0.42: 0.79:1.000:0.920 0/0/0/1:4:8,2:0.26: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:7,2:0.28: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,5:0.61:-0.16:1.000:0.723 0/0/1/1:4:5,3:0.40: 0.15:1.000:0.806 0/1/1/1:4:1,8:0.69: 0.47:1.000:0.979 0/0/0/0/1/1:6:8,2:0.26: 0.79:1.000:0.629 0/0/0/1:4:9,3:0.30: 1.42:1.000:0.982 0/0/1/1:4:5,4:0.46: 0.47:1.000:0.985 0/0/1/1:4:2,5:0.61:-0.16:1.000:0.723 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.56: 0.15:1.000:0.963 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-0.16:1.000:0.973 0/0/1/1:4:7,4:0.39: 1.11:1.000:0.723 0/1/1/1:4:2,8:0.65: 0.79:0.974:0.792 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.12:1.000:0.982 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.75:0.999:0.997 0/0/1/1:4:2,5:0.61:-0.16:1.000:0.723 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.56: 0.15:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,11:0.67: 1.74:1.000:0.933 0/0/0/1:4:6,1:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-0.16:0.997:0.990 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,1:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.33:-0.16:1.000:0.914 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,6:0.42: 2.37:1.000:0.920 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-0.80:1.000:0.920 0/0/0/1:4:4,2:0.37:-0.48:1.000:0.576 0/0/0/1:4:4,2:0.37:-0.48:1.000:0.576 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,1:0.15: 0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:2,3:0.55:-0.80:1.000:0.980 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.43: 1.42:1.000:0.957 0/0/0/1:4:9,2:0.25: 1.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-0.80:1.000:0.920 0/0/0/1:4:8,2:0.26: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:7,1:0.17: 0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,2:0.28: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.75:1.000:0.997 0/0/0/0:4:14,1:0.09: 2.37:0.981:0.931 0/0/0/1:4:7,1:0.17: 0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-1.43:1.000:0.900 0/0/0/1:4:10,5:0.37: 2.37:1.000:0.576 0/0/1/1:4:2,6:0.62: 0.15:1.000:0.503 0/0/1/1:4:5,4:0.46: 0.47:1.000:0.985 0/0/0/1:4:9,4:0.35: 1.74:1.000:0.802 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-0.80:1.000:0.920 0/0/1/1:4:7,4:0.39: 1.11:1.000:0.723 0/0/0/1:4:6,3:0.37: 0.47:0.999:0.576 0/0/0/1:4:10,2:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.33:-0.16:1.000:0.914 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,6:0.52: 1.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:10,2:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-0.16:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-0.80:1.000:0.920 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-0.80:1.000:0.920 0/0/0/1:4:7,2:0.28: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,4:0.58:-0.48:1.000:0.900 0/0/1/1:4:4,6:0.55: 0.79:1.000:0.980 0/0/0/1:4:2,1:0.37:-1.43:1.000:0.576 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.61:-0.16:1.000:0.723 0/0/1/1:4:1,2:0.58:-1.43:1.000:0.900 0/0/0/1:4:8,3:0.32: 1.11:1.000:0.950 0/0/1/1:4:4,6:0.55: 0.79:1.000:0.980 0/0/1/1:4:5,5:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,4:0.65:-0.80:1.000:0.792 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.65:-0.80:1.000:0.792 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.12:1.000:0.982 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-0.80:1.000:0.920 0/0/1/1:4:3,7:0.60: 0.79:1.000:0.791 0/0/1/1:4:6,5:0.46: 1.11:1.000:0.990 0/0/0/1:4:4,1:0.26:-0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:5,1:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.33:-0.16:1.000:0.914 0/0/1/1:4:4,5:0.53: 0.47:1.000:0.993 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.44: 3.64:1.000:0.964 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-1.12:1.000:0.503 0/0/0/1:4:5,2:0.33:-0.16:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.28: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:3,1:0.30:-1.12:1.000:0.982 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-0.16:1.000:0.973 0/0/0/1:4:9,1:0.14: 0.79:1.000:0.958 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,6:0.62: 0.15:1.000:0.503 0/0/1/1:4:2,3:0.55:-0.80:1.000:0.980 0/0/0/1:4:5,1:0.23:-0.48:0.999:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.37: 0.47:1.000:0.576 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,4:0.39: 1.11:1.000:0.723 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-0.16:1.000:0.973 0/0/0/1:4:7,1:0.17: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:7,1:0.17: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:9,1:0.14: 0.79:1.000:0.958 0/1/1/1:4:2,7:0.64: 0.47:1.000:0.675 0/0/1/1:4:4,5:0.53: 0.47:1.000:0.993 0/0/0/1:4:10,1:0.12: 1.11:1.000:0.852 0/0/1/1:4:5,5:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,6:0.62: 0.15:1.000:0.503 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.28: 0.47:1.000:0.995 -chr7.1 8863225 chr7.1_008863225 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:51,2:0.15: 0.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:19,3:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,3:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,3:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,2:0.09: 2.28:1.000:0.971 0/0/0/0:4:53,1:0.07: 0.50:1.000:0.995 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.26:-0.75:1.000:0.998 0/0/0/1:4:35,1:0.11:-0.31:1.000:0.547 0/0/0/1:4:18,2:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,3:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,3:0.27:-0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:49,1:0.08: 0.32:0.803:0.987 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,4:0.25: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,3:0.19: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,9:0.50:-1.51:1.000:0.997 0/0/0/0:4:76,1:0.05: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,2:0.19:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,2:0.16: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:38,2:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,1:0.25:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,3:0.28:-1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,2:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1:3:6,1:0.27:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,2:0.26:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,2:0.16: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,5:0.30:-0.97:1.000:0.988 0/0/0/0:4:41,1:0.10:-0.04:1.000:0.877 0/0/0/0:4:93,2:0.08: 2.32:1.000:0.975 0/0/0/1:4:53,4:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,1:0.16:-0.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,5:0.28:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:67,1:0.06: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,2:0.10: 1.70:0.997:0.811 0/0/0/1:4:27,6:0.28:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:33,3:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,5:0.26: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/0:4:53,1:0.07: 0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:61,3:0.19: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,7:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,7:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/1:4:21,3:0.27:-0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,5:0.29:-0.80:1.000:0.993 0/0/0/1:4:39,5:0.26: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,6:0.26: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,7:0.29:-0.48:1.000:0.991 0/0/0/0/1/1:6:41,5:0.26: 0.14:1.000:0.611 0/0/0/1:4:58,4:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/0:4:72,1:0.06: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,3:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,4:0.22: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,3:0.16: 1.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,5:0.28:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,5:0.25: 0.90:0.974:0.999 0/0/0/1:4:46,4:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,4:0.28:-0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,2:0.18: 0.14:0.999:0.999 0/0/0/1:4:49,2:0.16: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:29,2:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,4:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,5:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,2:0.17: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,4:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,13:0.31: 0.05:1.000:0.970 0/0/0/0:4:92,1:0.04: 2.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,1:0.07: 0.76:0.997:0.999 0/0/0/1:4:51,2:0.15: 0.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:68,4:0.22: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,3:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,12:0.50:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,4:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,5:0.27:-0.04:1.000:0.998 0/0/0/0:4:51,1:0.08: 0.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:20,5:0.29:-0.80:1.000:0.993 0/0/0/1:4:53,2:0.15: 0.54:1.000:0.983 0/0/0/1:4:51,3:0.22: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,3:0.16: 1.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,5:0.17: 3.35:1.000:0.998 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,6:0.29:-0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:24,7:0.29:-0.53:1.000:0.990 0/0/0/1:4:32,3:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,3:0.25:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:73,1:0.05: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,3:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,3:0.22: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,15:0.50:-1.24:0.981:0.997 0/0/0/1:4:15,5:0.30:-1.02:1.000:0.985 0/0/0/1:4:26,3:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,6:0.30:-0.80:1.000:0.987 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,3:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,4:0.27:-0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,5:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,3:0.17: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:53,6:0.26: 0.72:0.999:0.999 0/0/0/1:4:41,3:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,9:0.47:-1.46:1.000:0.993 0/0/0/0:4:70,1:0.06: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,5:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,2:0.18: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,1:0.15:-0.71:1.000:0.987 0/0/0/1:4:50,4:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,5:0.25: 1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,6:0.28:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,2:0.16: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:25,8:0.30:-0.44:1.000:0.987 0/0/0/1:4:68,3:0.17: 1.25:1.000:0.998 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,5:0.28:-0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,4:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,2:0.26:-1.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,3:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,2:0.14: 0.72:1.000:0.954 0/0/0/0:4:83,1:0.05: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,2:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,4:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,2:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,2:0.14: 0.59:1.000:0.978 0/0/0/0:4:55,1:0.07: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,12:0.50:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,1:0.12:-0.35:1.000:0.642 0/0/0/1:4:29,2:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,7:0.26: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,4:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,3:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,4:0.28:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,2:0.15: 0.50:1.000:0.987 0/0/0/1:4:29,7:0.29:-0.31:1.000:0.994 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-1.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,6:0.38:-1.42:1.000:0.554 0/0/0/0:4:50,1:0.08: 0.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:23,3:0.26:-0.75:1.000:0.998 0/0/0/0:4:63,1:0.06: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,2:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,1:0.12:-0.44:1.000:0.805 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,1:0.13:-0.57:1.000:0.942 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,9:0.36:-1.06:1.000:0.692 0/0/0/0:4:40,1:0.10:-0.08:1.000:0.836 0/0/0/0:4:42,1:0.09: 0.01:1.000:0.908 0/0/0/0:4:55,1:0.07: 0.59:0.999:0.997 0/0/0/0:4:48,1:0.08: 0.27:1.000:0.983 0/0/0/1:4:18,1:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:75,1:0.05: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,1:0.08: 0.27:1.000:0.983 0/0/0/1:4:11,3:0.29:-1.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:17,2:0.26:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,8:0.27: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/0:4:48,1:0.08: 0.27:1.000:0.983 0/0/0/1:4:26,1:0.15:-0.71:1.000:0.987 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 2.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,1:0.11:-0.31:1.000:0.547 0/0/0/0:4:56,1:0.07: 0.63:1.000:0.998 -chr7.1 8904545 chr7.1_008904545 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:31,16:0.32: 1.04:1.000:0.962 0/0/0/1:4:30,10:0.23: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.33:-0.18:1.000:0.930 0/1/1/1:4:7,33:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,7:0.19:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,11:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.29:-1.86:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,8:0.19: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,14:0.32: 0.48:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,4:0.91:-2.98:1.000:0.938 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-3.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,11:0.29:-0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:35,8:0.17: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,22:0.42: 1.13:1.000:0.931 0/0/0/1:4:25,10:0.27:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,2:0.06:-0.36:0.803:1.000 0/0/1/1:4:23,31:0.53: 1.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:45,16:0.24: 2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,11:0.19: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,23:0.51: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 2.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,20:0.56:-0.27:1.000:0.971 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:32,14:0.28: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,20:0.45: 0.48:1.000:0.981 0/0/0/1:4:33,7:0.16: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,9:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,19:0.44: 0.38:1.000:0.967 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,1:0.91:-3.26:1.000:0.938 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.18: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,9:0.20: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,26:0.53: 0.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,23:0.57: 0.10:1.000:0.943 0/0/0/1:4:19,11:0.34:-0.55:1.000:0.867 0/0/0/0:4:29,3:0.09:-0.36:1.000:0.963 0/0/0/1:4:14,5:0.25:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,21:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,14:0.26: 1.32:0.997:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.46:-2.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:11,17:0.56:-0.74:1.000:0.969 0/0/0/1:4:18,8:0.29:-0.92:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,15:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,31:0.43: 2.81:1.000:0.958 0/0/1/1:4:14,14:0.46:-0.74:1.000:0.989 0/0/0/1:4:30,11:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,12:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,12:0.29: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,22:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,8:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,12:0.31: 0.01:1.000:0.974 0/0/0/0/1/1:6:21,9:0.28:-0.55:1.000:0.758 0/0/0/1:4:17,10:0.34:-0.83:1.000:0.844 0/0/1/1:4:19,23:0.51: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,19:0.41: 0.66:1.000:0.860 0/0/0/1:4:11,4:0.25:-1.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,12:0.33:-0.18:1.000:0.930 0/0/1/1:4:16,19:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,11:0.33:-0.46:1.000:0.923 0/0/1/1:4:16,20:0.51: 0.01:0.974:0.996 0/0/0/1:4:17,6:0.24:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.51:-0.83:0.999:0.996 0/0/0/1:4:27,4:0.12:-0.46:1.000:0.767 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,7:0.20:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.46: 0.57:1.000:0.989 0/0/1/1:4:16,23:0.54: 0.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:14,18:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:32,11:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,27:0.49: 1.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,8:0.28:-0.83:0.997:0.997 0/0/1/1:4:18,14:0.41:-0.36:1.000:0.833 0/0/1/1:4:18,21:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,15:0.30: 1.04:1.000:0.988 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,18:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.29:-1.86:1.000:0.991 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.38: 0.48:1.000:0.625 0/0/0/1:4:19,8:0.28:-0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,18:0.54:-0.46:1.000:0.990 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,18:0.48:-0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:30,9:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,7:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,8:0.20: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,5:0.13:-0.08:1.000:0.934 0/0/0/1:4:33,11:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,18:0.59:-0.74:1.000:0.865 0/0/0/1:4:22,9:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,18:0.57:-0.64:1.000:0.945 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.57:0.981:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,11:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,8:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,20:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:28,8:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,9:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.30:-1.02:1.000:0.987 0/0/0/1:4:34,14:0.27: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.55:0.999:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,10:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,8:0.21:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,7:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,18:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,13:0.30: 0.38:1.000:0.983 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,19:0.39: 0.85:1.000:0.707 0/0/0/1:4:22,4:0.14:-0.92:1.000:0.976 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,15:0.46:-0.55:1.000:0.989 0/0/0/1:4:17,7:0.27:-1.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.23: 0.01:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:34,13:0.26: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,8:0.32:-1.20:1.000:0.945 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.30: 0.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:32,21:0.37: 1.60:1.000:0.596 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,7:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.23:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,4:0.16:-1.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,17:0.37: 0.66:1.000:0.606 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,19:0.56:-0.46:1.000:0.961 0/0/0/1:4:13,5:0.26:-1.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,23:0.44: 1.13:1.000:0.972 0/0/1/1:4:19,20:0.47: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,13:0.29: 0.57:1.000:0.993 0/0/0/1:4:32,13:0.27: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,5:0.13: 0.10:1.000:0.864 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-3.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.33:-0.18:1.000:0.930 0/0/0/1:4:33,13:0.26: 0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,26:0.56: 0.66:1.000:0.973 0/0/0/1:4:32,15:0.30: 1.04:1.000:0.988 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.30: 0.10:1.000:0.984 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,9:0.19: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,12:0.22: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.46:-0.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:17,20:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,14:0.26: 1.41:0.999:0.999 0/0/0/1:4:27,9:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,13:0.35:-0.18:1.000:0.746 0/0/0/1:4:25,12:0.30: 0.10:1.000:0.984 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,15:0.30: 0.94:1.000:0.982 0/0/0/1:4:30,11:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,6:0.16:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:25,9:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,30:0.52: 1.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:19,22:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,9:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,18:0.42: 0.38:1.000:0.900 0/0/1/1:4:16,20:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,27:0.59: 0.57:1.000:0.865 0/0/0/1:4:21,9:0.28:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,13:0.22: 1.69:1.000:1.000 -chr7.1 9226540 chr7.1_009226540 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,324:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,323:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,341:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,139:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,305:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,276:.: 0.19:1.000:. ./.:4:1,31:.:-3.18:1.000:. ./.:4:0,38:.:-3.09:1.000:. ./.:4:1,257:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.72:0.803:. ./.:4:0,272:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,352:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,25:.:-3.27:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,20:.:-3.34:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,330:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,301:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,335:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,18:.:-3.37:1.000:. ./.:4:0,54:.:-2.87:1.000:. ./.:3:0,11:.:-3.47:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,300:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,317:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1,258:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,360:.: 1.35:0.997:. ./.:4:1,618:.: 4.93:1.000:. ./.:4:2,267:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,343:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,352:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,249:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.18:1.000:. ./.:6:0,189:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,286:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,340:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1,180:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.38:1.000:. ./.:4:2,239:.:-0.29:0.974:. ./.:4:0,281:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,148:.:-1.58:0.999:. ./.:4:0,293:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,266:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,301:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.80:0.997:. ./.:4:0,256:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,268:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,315:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,257:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,139:.:-1.69:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.37:0.981:. ./.:4:0,230:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.20:1.000:. ./.:4:2,188:.:-1.00:1.000:. ./.:4:1,364:.: 1.42:1.000:. ./.:4:1,249:.:-0.17:0.999:. ./.:4:0,341:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,215:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,275:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,224:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,308:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,330:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.39:1.000:. ./.:4:4,186:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,227:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,254:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1,376:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1,244:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,249:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,169:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,12:.:-3.45:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1,233:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,278:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,274:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,254:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,242:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,352:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1,341:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1,274:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,233:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.11:0.999:. ./.:4:0,293:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,269:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,187:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,256:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,301:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,330:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,364:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.41:1.000:. -chr7.1 9446204 chr7.1_009446204 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:111,34:.: 1.64:1.000:. ./.:4:67,21:.:-0.39:1.000:. ./.:4:75,13:.:-0.39:1.000:. ./.:4:35,68:.: 0.14:1.000:. ./.:4:103,20:.: 0.85:1.000:. ./.:4:89,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:43,4:.:-1.85:1.000:. ./.:4:89,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,20:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,6:.:-2.89:1.000:. ./.:4:13,1:.:-3.03:1.000:. ./.:4:79,23:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,19:.: 0.46:1.000:. ./.:4:63,33:.:-0.11:1.000:. ./.:4:88,22:.: 0.39:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:106,27:.: 1.21:0.803:. ./.:4:116,32:.: 1.74:1.000:. ./.:4:91,24:.: 0.57:1.000:. ./.:4:87,15:.: 0.10:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:67,46:.: 0.50:1.000:. ./.:4:132,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:55,39:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:111,24:.: 1.28:1.000:. ./.:4:55,59:.: 0.53:1.000:. ./.:4:69,22:.:-0.29:1.000:. ./.:4:107,35:.: 1.53:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:64,48:.: 0.46:1.000:. ./.:4:7,3:.:-3.17:1.000:. ./.:4:17,7:.:-2.67:1.000:. ./.:3:4,1:.:-3.35:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:83,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:82,31:.: 0.50:1.000:. ./.:4:63,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:44,50:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,43:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,13:.:-0.11:1.000:. ./.:4:70,11:.:-0.64:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:55,54:.: 0.35:1.000:. ./.:4:75,29:.: 0.18:0.997:. ./.:4:10,7:.:-2.92:1.000:. ./.:4:58,30:.:-0.39:1.000:. ./.:4:72,15:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,31:.:-0.71:1.000:. ./.:4:85,71:.: 2.03:1.000:. ./.:4:81,52:.: 1.21:1.000:. ./.:4:99,39:.: 1.39:1.000:. ./.:4:95,16:.: 0.43:1.000:. ./.:4:98,21:.: 0.71:1.000:. ./.:4:57,49:.: 0.25:1.000:. ./.:4:73,10:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,35:.: 0.03:1.000:. ./.:6:68,25:.:-0.22:1.000:. ./.:4:85,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:53,60:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,40:.: 0.03:1.000:. ./.:4:59,17:.:-0.82:1.000:. ./.:4:87,22:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,49:.:-0.07:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:78,25:.: 0.14:1.000:. ./.:4:53,38:.:-0.29:0.974:. ./.:4:75,21:.:-0.11:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:39,11:.:-1.75:0.999:. ./.:4:106,30:.: 1.32:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:85,32:.: 0.64:1.000:. ./.:4:56,40:.:-0.11:1.000:. ./.:4:48,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,37:.: 0.00:1.000:. ./.:4:95,15:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,48:.:-0.36:1.000:. ./.:4:39,50:.:-0.36:0.997:. ./.:4:64,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:73,18:.:-0.29:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:63,41:.: 0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,14:.: 0.14:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,18:.: 0.21:1.000:. ./.:4:58,14:.:-0.96:1.000:. ./.:4:52,43:.:-0.14:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:32,32:.:-1.25:1.000:. ./.:4:80,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:92,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,20:.: 0.46:1.000:. ./.:4:65,21:.:-0.47:1.000:. ./.:4:101,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:102,25:.: 1.00:1.000:. ./.:4:23,19:.:-2.03:1.000:. ./.:4:74,32:.: 0.25:1.000:. ./.:4:42,19:.:-1.36:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.21:0.981:. ./.:4:80,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,29:.: 0.57:1.000:. ./.:4:100,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:61,56:.: 0.64:1.000:. ./.:4:112,24:.: 1.32:1.000:. ./.:4:78,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:70,17:.:-0.43:1.000:. ./.:4:124,31:.: 1.99:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:143,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:83,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:61,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:67,24:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,11:.:-0.39:1.000:. ./.:4:42,41:.:-0.57:1.000:. ./.:4:83,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:59,45:.: 0.18:1.000:. ./.:4:54,40:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:52,34:.:-0.47:1.000:. ./.:4:60,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:57,16:.:-0.93:1.000:. ./.:4:73,15:.:-0.39:1.000:. ./.:4:65,26:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,27:.:-1.32:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:79,27:.: 0.25:1.000:. ./.:4:54,67:.: 0.78:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:64,12:.:-0.82:1.000:. ./.:4:77,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:80,17:.:-0.07:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:54,36:.:-0.32:1.000:. ./.:4:50,7:.:-1.50:1.000:. ./.:4:74,49:.: 0.85:1.000:. ./.:4:68,47:.: 0.57:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:84,30:.: 0.53:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:95,24:.: 0.71:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:68,21:.:-0.36:1.000:. ./.:4:98,28:.: 0.96:1.000:. ./.:4:70,51:.: 0.78:1.000:. ./.:4:96,25:.: 0.78:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:82,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:81,20:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,28:.: 0.18:1.000:. ./.:4:66,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:46,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:81,25:.: 0.25:0.999:. ./.:4:72,9:.:-0.64:1.000:. ./.:4:66,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:68,11:.:-0.71:1.000:. ./.:4:108,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:55,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:89,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,20:.:-0.64:1.000:. ./.:4:67,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,58:.: 0.89:1.000:. ./.:4:54,53:.: 0.28:1.000:. ./.:4:107,16:.: 0.85:1.000:. ./.:4:85,22:.: 0.28:1.000:. ./.:4:61,48:.: 0.35:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:64,60:.: 0.89:1.000:. ./.:4:64,16:.:-0.68:1.000:. ./.:4:90,36:.: 0.96:1.000:. -chr7.1 9686644 chr7.1_009686644 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:295,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:361,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:256,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:267,2:.: 0.49:0.803:. ./.:4:312,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:387,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:394,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.40:1.000:. ./.:3:28,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:286,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:248,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.26:0.997:. ./.:4:36,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:108,1:.:-1.65:1.000:. ./.:4:152,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.22:1.000:. ./.:6:168,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.19:0.974:. ./.:4:214,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:247,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.04:0.997:. ./.:4:170,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:243,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:204,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.58:0.981:. ./.:4:144,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:190,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:300,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:400,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:153,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:383,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:402,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:277,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:276,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.32:0.999:. ./.:4:244,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:228,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:319,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:355,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:365,2:.: 1.80:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.78:1.000:. -chr7.1 9909429 chr7.1_009909429 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:231,69:0.20: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,139:0.49: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,167:0.49: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,226:0.52: 2.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:246,98:0.24: 1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,93:0.53:-1.06:1.000:0.993 0/0/0/0:4:228,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,54:0.22:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.54:-3.03:1.000:0.987 0/0/1/1:4:25,24:0.44:-2.77:1.000:0.970 0/0/0/1:4:152,58:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,74:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,83:0.29: 0.29:1.000:0.993 0/0/0/0:4:263,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,70:0.23: 0.49:0.803:1.000 0/0/0/1:4:182,92:0.29: 0.67:1.000:0.991 0/0/0/1:4:213,90:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,170:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:19,1:0.04:-3.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,133:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/0:4:308,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,66:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,1:0.09:-3.38:1.000:0.900 0/0/1/1:4:113,147:0.52: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:198,78:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,162:0.51: 0.95:1.000:0.997 0/0/0/0:4:321,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,68:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,60:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,50:0.22:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,18:0.55:-3.06:1.000:0.983 0/0/1/1:4:28,35:0.51:-2.56:1.000:0.997 0/0/1:3:5,5:0.45:-3.37:1.000:0.961 0/0/0/1:4:170,61:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:248,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,151:0.49: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,88:0.29: 0.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:100,141:0.53: 0.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:177,64:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,62:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,61:0.28:-0.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,67:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:229,105:0.27: 1.59:0.997:0.998 0/0/0/1:4:86,25:0.19:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,57:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,99:0.45:-0.48:1.000:0.980 0/0/0/1:4:129,63:0.28:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:188,79:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,62:0.26:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:243,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,80:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,54:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,68:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,132:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:203,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:106,80:0.38:-0.68:1.000:0.762 0/0/1/1:4:113,122:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,108:0.46:-0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:109,157:0.54: 0.55:1.000:0.989 0/0/1/1:4:83,84:0.46:-0.97:1.000:0.984 0/0/1/1:4:110,163:0.54: 0.66:1.000:0.985 0/0/1/1:4:103,126:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,111:0.46:-0.20:0.974:0.990 0/0/0/1:4:176,59:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,64:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,60:0.23:-0.11:0.999:1.000 0/0/0/1:4:165,71:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:210,72:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,78:0.29: 0.03:1.000:0.991 0/0/0/1:4:128,51:0.24:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,67:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,57:0.21: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,71:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,136:0.46: 0.58:1.000:0.987 0/0/0/1:4:119,62:0.30:-0.75:0.997:0.987 0/0/0/1:4:166,77:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,70:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,137:0.47: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,67:0.22: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,61:0.29:-0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,134:0.57:-0.26:1.000:0.936 0/0/0/1:4:150,74:0.29:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,116:0.45: 0.03:1.000:0.982 0/0/0/1:4:129,58:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:163,62:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,106:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,244:0.75: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,112:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,63:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,102:0.46:-0.48:1.000:0.990 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,39:0.23:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 0.17:0.981:1.000 0/0/0/1:4:123,49:0.24:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,57:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,76:0.27: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:250,114:0.27: 2.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:160,78:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:107,130:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,98:0.26: 1.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,79:0.28: 0.26:0.999:0.997 0/0/0/1:4:216,73:0.21: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,153:0.53: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:88,117:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:142,59:0.25:-0.45:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:156,49:0.20:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,70:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,71:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:218,64:0.19: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,162:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,126:0.56:-0.35:1.000:0.974 0/0/0/1:4:163,76:0.27: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:178,58:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,40:0.24:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,101:0.47:-0.52:1.000:0.991 0/0/0/0:4:238,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,43:0.29:-1.58:1.000:0.990 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,59:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,213:0.51: 2.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,74:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,116:0.56:-0.61:1.000:0.972 0/0/0/1:4:151,65:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,57:0.27:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,143:0.52: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:194,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,73:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,94:0.47:-0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:232,100:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,112:0.26: 2.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:179,91:0.29: 0.61:1.000:0.991 0/0/0/1:4:171,78:0.27: 0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,178:0.45: 1.93:1.000:0.982 0/0/0/1:4:169,60:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,208:0.54: 1.86:1.000:0.988 0/0/0/0:4:240,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.21:-3.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,107:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,72:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,190:0.52: 1.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:189,97:0.29: 0.85:1.000:0.990 0/0/0/1:4:161,61:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,88:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,131:0.48: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:220,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,51:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,154:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/0:4:306,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,95:0.30: 0.73:1.000:0.988 0/0/0/0:4:220,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,79:0.26: 0.47:0.999:0.999 0/0/1/1:4:103,169:0.57: 0.64:1.000:0.955 0/0/0/1:4:174,63:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,120:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:203,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,135:0.58:-0.26:1.000:0.922 0/0/0/1:4:153,73:0.28:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,66:0.26:-0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:205,91:0.26: 1.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:189,86:0.27: 0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:137,152:0.48: 0.90:1.000:0.994 0/0/0/0:4:235,14:0.05: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,79:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,196:0.48: 2.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,130:0.55:-0.25:1.000:0.976 0/0/0/1:4:182,90:0.29: 0.64:1.000:0.994 -chr7.1 9975993 chr7.1_009975993 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:269,365:.: 0.35:1.000:. ./.:4:80,508:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,543:.: 0.38:1.000:. ./.:4:76,580:.: 0.49:1.000:. ./.:4:89,568:.: 0.49:1.000:. ./.:4:189,504:.: 0.72:1.000:. ./.:4:85,494:.:-0.01:1.000:. ./.:4:293,436:.: 0.95:1.000:. ./.:4:88,571:.: 0.51:1.000:. ./.:4:72,63:.:-2.84:1.000:. ./.:4:19,108:.:-2.89:1.000:. ./.:4:94,555:.: 0.44:1.000:. ./.:4:275,399:.: 0.60:1.000:. ./.:4:206,574:.: 1.28:1.000:. ./.:4:68,529:.: 0.11:1.000:. ./.:4:207,558:.: 1.18:1.000:. ./.:4:296,464:.: 1.15:0.803:. ./.:4:189,417:.: 0.17:1.000:. ./.:4:378,560:.: 2.29:1.000:. ./.:4:124,742:.: 1.83:1.000:. ./.:4:53,137:.:-2.49:1.000:. ./.:4:198,443:.: 0.39:1.000:. ./.:4:200,555:.: 1.12:1.000:. ./.:4:201,524:.: 0.93:1.000:. ./.:4:34,84:.:-2.95:1.000:. ./.:4:83,575:.: 0.50:1.000:. ./.:4:202,548:.: 1.09:1.000:. ./.:4:82,491:.:-0.04:1.000:. ./.:4:348,468:.: 1.51:1.000:. ./.:4:202,615:.: 1.52:1.000:. ./.:4:240,581:.: 1.54:1.000:. ./.:4:184,401:.: 0.03:1.000:. ./.:4:32,64:.:-3.09:1.000:. ./.:4:77,93:.:-2.62:1.000:. ./.:3:46,31:.:-3.21:1.000:. ./.:4:169,510:.: 0.63:1.000:. ./.:4:201,493:.: 0.73:1.000:. ./.:4:84,575:.: 0.51:1.000:. ./.:4:266,414:.: 0.64:1.000:. ./.:4:229,579:.: 1.46:1.000:. ./.:4:156,405:.:-0.12:1.000:. ./.:4:154,378:.:-0.31:1.000:. ./.:4:96,503:.: 0.12:1.000:. ./.:4:74,420:.:-0.55:1.000:. ./.:4:164,481:.: 0.42:1.000:. ./.:4:168,415:.: 0.02:1.000:. ./.:4:314,361:.: 0.61:0.997:. ./.:4:116,264:.:-1.28:1.000:. ./.:4:150,367:.:-0.40:1.000:. ./.:4:88,496:.: 0.03:1.000:. ./.:4:161,294:.:-0.80:1.000:. ./.:4:189,501:.: 0.70:1.000:. ./.:4:158,351:.:-0.45:1.000:. ./.:4:274,362:.: 0.36:1.000:. ./.:4:77,511:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,544:.: 0.45:1.000:. ./.:4:172,402:.:-0.04:1.000:. ./.:4:58,429:.:-0.59:1.000:. ./.:4:237,311:.:-0.20:1.000:. ./.:6:104,317:.:-1.02:1.000:. ./.:4:89,426:.:-0.41:1.000:. ./.:4:141,373:.:-0.42:1.000:. ./.:4:196,412:.: 0.18:1.000:. ./.:4:74,454:.:-0.33:1.000:. ./.:4:92,531:.: 0.28:1.000:. ./.:4:158,384:.:-0.24:1.000:. ./.:4:182,463:.: 0.42:1.000:. ./.:4:231,345:.:-0.02:1.000:. ./.:4:178,365:.:-0.24:0.974:. ./.:4:59,414:.:-0.68:1.000:. ./.:4:193,432:.: 0.29:1.000:. ./.:4:132,329:.:-0.76:0.999:. ./.:4:82,496:.:-0.01:1.000:. ./.:4:170,408:.:-0.01:1.000:. ./.:4:86,418:.:-0.49:1.000:. ./.:4:167,360:.:-0.34:1.000:. ./.:4:159,349:.:-0.46:1.000:. ./.:4:152,337:.:-0.58:1.000:. ./.:4:92,507:.: 0.12:1.000:. ./.:4:204,386:.: 0.06:1.000:. ./.:4:131,317:.:-0.84:0.997:. ./.:4:157,406:.:-0.11:1.000:. ./.:4:198,422:.: 0.26:1.000:. ./.:4:66,421:.:-0.59:1.000:. ./.:4:211,469:.: 0.64:1.000:. ./.:4:169,429:.: 0.12:1.000:. ./.:4:148,272:.:-1.02:1.000:. ./.:4:54,362:.:-1.05:1.000:. ./.:4:122,314:.:-0.92:1.000:. ./.:4:78,408:.:-0.60:1.000:. ./.:4:235,298:.:-0.30:1.000:. ./.:4:221,268:.:-0.58:1.000:. ./.:4:185,470:.: 0.48:1.000:. ./.:4:64,360:.:-1.00:1.000:. ./.:4:99,474:.:-0.04:1.000:. ./.:4:98,502:.: 0.13:1.000:. ./.:4:182,167:.:-1.48:1.000:. ./.:4:60,407:.:-0.72:1.000:. ./.:4:91,470:.:-0.12:1.000:. ./.:4:279,440:.: 0.89:1.000:. ./.:4:136,329:.:-0.73:1.000:. ./.:4:215,311:.:-0.34:1.000:. ./.:4:125,278:.:-1.13:1.000:. ./.:4:150,486:.: 0.36:0.981:. ./.:4:130,311:.:-0.89:1.000:. ./.:4:238,309:.:-0.21:1.000:. ./.:4:63,396:.:-0.77:1.000:. ./.:4:197,526:.: 0.91:1.000:. ./.:4:102,617:.: 0.89:1.000:. ./.:4:76,461:.:-0.27:1.000:. ./.:4:86,400:.:-0.60:1.000:. ./.:4:335,494:.: 1.59:1.000:. ./.:4:141,346:.:-0.59:0.999:. ./.:4:253,508:.: 1.16:1.000:. ./.:4:161,361:.:-0.37:1.000:. ./.:4:105,449:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,448:.:-0.33:1.000:. ./.:4:218,238:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,450:.:-0.29:1.000:. ./.:4:130,271:.:-1.14:1.000:. ./.:4:232,306:.:-0.27:1.000:. ./.:4:130,279:.:-1.09:1.000:. ./.:4:196,403:.: 0.12:1.000:. ./.:4:203,496:.: 0.76:1.000:. ./.:4:78,382:.:-0.77:1.000:. ./.:4:121,359:.:-0.64:1.000:. ./.:4:175,389:.:-0.10:1.000:. ./.:4:62,447:.:-0.45:1.000:. ./.:4:129,283:.:-1.07:1.000:. ./.:4:202,239:.:-0.89:1.000:. ./.:4:68,406:.:-0.68:1.000:. ./.:4:298,489:.: 1.32:1.000:. ./.:4:106,243:.:-1.48:1.000:. ./.:4:146,348:.:-0.55:1.000:. ./.:4:216,322:.:-0.27:1.000:. ./.:4:243,687:.: 2.24:1.000:. ./.:4:188,399:.: 0.05:1.000:. ./.:4:78,331:.:-1.09:1.000:. ./.:4:55,377:.:-0.95:1.000:. ./.:4:181,195:.:-1.30:1.000:. ./.:4:73,398:.:-0.70:1.000:. ./.:4:153,356:.:-0.45:1.000:. ./.:4:165,458:.: 0.28:1.000:. ./.:4:62,303:.:-1.37:1.000:. ./.:4:201,560:.: 1.16:1.000:. ./.:4:206,543:.: 1.08:1.000:. ./.:4:186,511:.: 0.75:1.000:. ./.:4:91,468:.:-0.13:1.000:. ./.:4:99,613:.: 0.84:1.000:. ./.:4:155,450:.: 0.16:1.000:. ./.:4:107,721:.: 1.59:1.000:. ./.:4:195,472:.: 0.56:1.000:. ./.:4:49,92:.:-2.81:1.000:. ./.:4:66,432:.:-0.52:1.000:. ./.:4:342,500:.: 1.68:1.000:. ./.:4:219,514:.: 0.98:1.000:. ./.:4:88,618:.: 0.81:1.000:. ./.:4:203,604:.: 1.45:1.000:. ./.:4:153,392:.:-0.22:1.000:. ./.:4:176,493:.: 0.57:1.000:. ./.:4:70,555:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,372:.:-0.52:1.000:. ./.:4:155,480:.: 0.35:1.000:. ./.:4:85,586:.: 0.58:1.000:. ./.:4:286,490:.: 1.25:1.000:. ./.:4:173,491:.: 0.54:1.000:. ./.:4:278,443:.: 0.90:1.000:. ./.:4:106,533:.: 0.38:0.999:. ./.:4:73,466:.:-0.26:1.000:. ./.:4:92,656:.: 1.07:1.000:. ./.:4:74,462:.:-0.28:1.000:. ./.:4:149,398:.:-0.21:1.000:. ./.:4:163,429:.: 0.08:1.000:. ./.:4:211,289:.:-0.51:1.000:. ./.:4:228,339:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,501:.:-0.06:1.000:. ./.:4:218,655:.: 1.87:1.000:. ./.:4:193,583:.: 1.25:1.000:. ./.:4:107,586:.: 0.72:1.000:. ./.:4:152,448:.: 0.13:1.000:. ./.:4:210,594:.: 1.43:1.000:. ./.:4:246,714:.: 2.43:1.000:. ./.:4:230,613:.: 1.68:1.000:. ./.:4:86,496:.: 0.01:1.000:. ./.:4:80,529:.: 0.19:1.000:. -chr7.1 10103033 chr7.1_010103033 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:321,92:0.24: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,160:0.55:-0.38:1.000:0.981 0/1/1/1:4:94,263:0.76: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,275:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,321:0.76: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,222:0.53: 1.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:75,171:0.72:-1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,204:0.55: 0.63:1.000:0.979 0/0/1/1:4:221,191:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,49:0.44:-2.66:1.000:0.960 0/0/1/1:4:41,50:0.58:-3.03:1.000:0.913 0/0/0/1:4:264,69:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,86:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,194:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,163:0.48: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:327,81:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,193:0.51: 0.81:0.803:0.996 0/0/1/1:4:212,183:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:403,119:0.25: 2.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,318:0.76: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,36:0.44:-3.06:1.000:0.967 0/0/1/1:4:188,204:0.55: 0.61:1.000:0.977 0/0/0/1:4:344,102:0.25: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:209,198:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,22:0.34:-3.27:1.000:0.894 1/1/1/1:4:0,424:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,173:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:205,202:0.53: 0.79:1.000:0.993 0/0/0/1:4:350,106:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:210,188:0.51: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:320,72:0.20: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,83:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,35:0.49:-3.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,73:0.68:-2.77:1.000:0.951 0/0/0:3:38,4:0.10:-3.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:189,199:0.55: 0.56:1.000:0.984 0/0/0/1:4:333,91:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,149:0.43: 0.38:1.000:0.947 0/0/0/1:4:268,90:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:302,86:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,161:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:283,79:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,199:0.54: 0.60:1.000:0.987 0/0/1/1:4:150,152:0.54:-0.47:1.000:0.990 0/0/1/1:4:218,158:0.45: 0.42:1.000:0.982 0/0/1/1:4:198,157:0.48: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:227,184:0.48: 0.84:0.997:0.995 0/1/1/1:4:96,309:0.78: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,218:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,225:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,119:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:356,121:0.28: 1.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:249,83:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,174:0.47: 0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:181,132:0.45:-0.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:162,184:0.56: 0.06:1.000:0.961 0/0/0/1:4:271,79:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,212:0.71:-0.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:278,61:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:100,175:0.66:-0.80:1.000:0.919 0/1/1/1:4:92,224:0.73:-0.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:87,228:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,270:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,225:0.78:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,369:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,181:0.51: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:203,66:0.27:-0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,148:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,222:0.74:-0.37:0.974:0.999 0/0/1/1:4:177,151:0.49:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:125,247:0.69: 0.37:1.000:0.974 0/1/1/1:4:73,213:0.77:-0.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:193,150:0.47: 0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:180,169:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:188,151:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:158,129:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,150:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:171,147:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:116,291:0.74: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,164:0.48: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,115:0.49:-1.10:0.997:0.997 0/1/1/1:4:79,247:0.78:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:289,86:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,238:0.78:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,147:0.43: 0.36:1.000:0.937 0/0/1/1:4:213,198:0.52: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,115:0.48:-1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,193:0.73:-0.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:92,185:0.69:-0.78:1.000:0.979 0/1/1/1:4:96,216:0.72:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,121:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:231,69:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,170:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,184:0.75:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,266:0.75: 0.33:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,326:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,138:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:249,49:0.18:-0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,263:0.72: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:282,101:0.29: 0.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:56,196:0.80:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,90:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,111:0.48:-1.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:280,122:0.33: 0.73:0.981:0.925 0/1/1/1:4:55,179:0.79:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,75:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,125:0.48:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:226,211:0.52: 1.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:115,373:0.79: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,171:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:84,207:0.74:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:431,122:0.24: 2.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,89:0.28: 0.13:0.999:0.997 0/1/1/1:4:85,306:0.80: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,158:0.72:-1.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,277:0.77: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,215:0.74:-0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,124:0.47:-0.72:1.000:0.993 0/1/1/1:4:94,228:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:188,122:0.42:-0.38:1.000:0.928 0/0/0/1:4:304,84:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,188:0.72:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,135:0.46:-0.29:1.000:0.986 0/0/1/1:4:189,153:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:103,231:0.72:-0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:201,163:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:274,92:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:296,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,115:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,60:0.24:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,229:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:330,85:0.22: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,56:0.29:-1.59:1.000:0.992 0/0/1/1:4:184,158:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,124:0.47:-0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:243,212:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,165:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,234:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:184,140:0.46:-0.21:1.000:0.990 0/0/0/1:4:241,72:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,137:0.45:-0.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:156,137:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,162:0.52:-0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,192:0.78:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:341,99:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:365,135:0.29: 1.92:1.000:0.990 0/1/1/1:4:116,263:0.72: 0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:186,187:0.53: 0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:217,190:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,123:0.47:-0.69:1.000:0.990 0/1/1/1:4:135,293:0.71: 1.05:1.000:0.992 0/0/1/1:4:195,174:0.51: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,35:0.59:-3.38:1.000:0.832 1/1/1/1:4:0,221:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,178:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:220,192:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:223,222:0.53: 1.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:251,215:0.50: 1.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,199:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,270:0.73: 0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:97,245:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,163:0.52:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:158,134:0.49:-0.60:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,351:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:293,81:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,164:0.48: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:273,87:0.26: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,190:0.55: 0.29:0.999:0.977 0/1/1/1:4:105,252:0.73: 0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:95,232:0.73:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,244:0.77:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,151:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:102,259:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,155:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,83:0.28:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,139:0.53:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:239,245:0.54: 1.72:1.000:0.988 0/0/1/1:4:243,234:0.52: 1.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:98,254:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,156:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:309,100:0.27: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:226,217:0.52: 1.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:282,214:0.46: 1.87:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,281:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,174:0.48: 0.58:1.000:0.995 -chr7.1 10354173 chr7.1_010354173 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:270,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:154,58:.:-0.26:1.000:. ./.:4:130,153:.: 0.93:1.000:. ./.:4:166,143:.: 1.37:1.000:. ./.:4:133,152:.: 0.97:1.000:. ./.:4:145,55:.:-0.46:1.000:. ./.:4:187,58:.: 0.29:1.000:. ./.:4:187,67:.: 0.45:1.000:. ./.:4:88,69:.:-1.19:1.000:. ./.:4:58,19:.:-2.53:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:224,93:.: 1.51:1.000:. ./.:4:178,67:.: 0.29:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:191,64:.: 0.46:0.803:. ./.:4:290,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:205,64:.: 0.70:1.000:. ./.:4:60,34:.:-2.25:1.000:. ./.:4:190,54:.: 0.28:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:187,73:.: 0.55:1.000:. ./.:4:29,35:.:-2.75:1.000:. ./.:4:116,129:.: 0.29:1.000:. ./.:4:198,70:.: 0.68:1.000:. ./.:4:190,78:.: 0.68:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:143,52:.:-0.55:1.000:. ./.:4:32,8:.:-3.16:1.000:. ./.:4:67,68:.:-1.56:1.000:. ./.:3:24,3:.:-3.37:1.000:. ./.:4:177,65:.: 0.24:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,82:.: 0.65:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:169,84:.: 0.43:1.000:. ./.:4:148,51:.:-0.48:1.000:. ./.:4:139,70:.:-0.31:1.000:. ./.:4:152,76:.: 0.01:1.000:. ./.:4:122,54:.:-0.87:1.000:. ./.:4:182,79:.: 0.56:1.000:. ./.:4:164,67:.: 0.06:1.000:. ./.:4:229,92:.: 1.57:0.997:. ./.:4:42,51:.:-2.26:1.000:. ./.:4:94,87:.:-0.78:1.000:. ./.:4:115,105:.:-0.13:1.000:. ./.:4:145,62:.:-0.34:1.000:. ./.:4:194,82:.: 0.82:1.000:. ./.:4:147,53:.:-0.46:1.000:. ./.:4:169,57:.:-0.03:1.000:. ./.:4:220,59:.: 0.87:1.000:. ./.:4:148,58:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,51:.:-0.63:1.000:. ./.:4:164,53:.:-0.18:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.73:1.000:. ./.:6:80,92:.:-0.93:1.000:. ./.:4:134,123:.: 0.50:1.000:. ./.:4:103,105:.:-0.33:1.000:. ./.:4:111,138:.: 0.36:1.000:. ./.:4:78,96:.:-0.90:1.000:. ./.:4:109,136:.: 0.29:1.000:. ./.:4:141,40:.:-0.78:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:150,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:93,115:.:-0.33:0.974:. ./.:4:247,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:161,52:.:-0.24:1.000:. ./.:4:116,96:.:-0.26:0.999:. ./.:4:232,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:206,76:.: 0.92:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:134,44:.:-0.83:1.000:. ./.:4:89,115:.:-0.40:1.000:. ./.:4:167,63:.: 0.04:1.000:. ./.:4:111,105:.:-0.19:1.000:. ./.:4:145,58:.:-0.41:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.34:0.997:. ./.:4:116,141:.: 0.50:1.000:. ./.:4:158,61:.:-0.14:1.000:. ./.:4:171,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:144,53:.:-0.51:1.000:. ./.:4:163,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:78,99:.:-0.85:1.000:. ./.:4:151,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:89,115:.:-0.40:1.000:. ./.:4:172,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:175,51:.:-0.03:1.000:. ./.:4:93,100:.:-0.58:1.000:. ./.:4:114,62:.:-0.87:1.000:. ./.:4:85,98:.:-0.75:1.000:. ./.:4:138,38:.:-0.87:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:124,136:.: 0.55:1.000:. ./.:4:180,75:.: 0.46:1.000:. ./.:4:124,126:.: 0.38:1.000:. ./.:4:164,61:.:-0.04:1.000:. ./.:4:97,53:.:-1.30:1.000:. ./.:4:229,71:.: 1.22:0.981:. ./.:4:140,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:151,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:108,152:.: 0.55:1.000:. ./.:4:178,210:.: 2.70:1.000:. ./.:4:175,67:.: 0.24:1.000:. ./.:4:165,53:.:-0.16:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:158,109:.: 0.67:1.000:. ./.:4:79,98:.:-0.85:1.000:. ./.:4:196,88:.: 0.95:1.000:. ./.:4:160,52:.:-0.26:1.000:. ./.:4:135,60:.:-0.55:1.000:. ./.:4:102,122:.:-0.06:1.000:. ./.:4:169,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:148,49:.:-0.51:1.000:. ./.:4:153,54:.:-0.34:1.000:. ./.:4:171,70:.: 0.23:1.000:. ./.:4:151,51:.:-0.43:1.000:. ./.:4:171,76:.: 0.33:1.000:. ./.:4:151,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:136,47:.:-0.75:1.000:. ./.:4:112,54:.:-1.04:1.000:. ./.:4:146,45:.:-0.61:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:84,46:.:-1.64:1.000:. ./.:4:197,65:.: 0.58:1.000:. ./.:4:236,69:.: 1.30:1.000:. ./.:4:311,105:.: 3.17:1.000:. ./.:4:137,59:.:-0.53:1.000:. ./.:4:147,54:.:-0.45:1.000:. ./.:4:134,53:.:-0.68:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:128,61:.:-0.65:1.000:. ./.:4:193,68:.: 0.56:1.000:. ./.:4:115,135:.: 0.38:1.000:. ./.:4:82,94:.:-0.87:1.000:. ./.:4:283,93:.: 2.50:1.000:. ./.:4:278,78:.: 2.16:1.000:. ./.:4:206,70:.: 0.82:1.000:. ./.:4:227,76:.: 1.27:1.000:. ./.:4:207,82:.: 1.04:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:164,172:.: 1.83:1.000:. ./.:4:164,52:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,13:.:-2.95:1.000:. ./.:4:107,123:.: 0.04:1.000:. ./.:4:183,70:.: 0.43:1.000:. ./.:4:245,81:.: 1.66:1.000:. ./.:4:265,81:.: 1.99:1.000:. ./.:4:201,71:.: 0.75:1.000:. ./.:4:154,60:.:-0.23:1.000:. ./.:4:232,65:.: 1.17:1.000:. ./.:4:211,67:.: 0.85:1.000:. ./.:4:152,53:.:-0.38:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:137,143:.: 0.88:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:191,77:.: 0.68:1.000:. ./.:4:145,63:.:-0.33:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:196,60:.: 0.48:1.000:. ./.:4:111,142:.: 0.43:1.000:. ./.:4:130,127:.: 0.50:1.000:. ./.:4:143,49:.:-0.60:1.000:. ./.:4:111,133:.: 0.28:1.000:. ./.:4:192,57:.: 0.36:1.000:. ./.:4:122,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:139,45:.:-0.73:1.000:. ./.:4:223,65:.: 1.02:1.000:. ./.:4:174,70:.: 0.28:1.000:. ./.:4:141,152:.: 1.10:1.000:. ./.:4:210,53:.: 0.60:1.000:. ./.:4:198,78:.: 0.82:1.000:. ./.:4:250,81:.: 1.74:1.000:. ./.:4:268,95:.: 2.28:1.000:. ./.:4:131,118:.: 0.36:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.72:1.000:. -chr7.1 10633897 chr7.1_010633897 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,53:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.21:1.000:. ./.:4:13,30:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,43:.: 1.48:1.000:. ./.:4:33,84:.: 2.51:1.000:. ./.:4:23,62:.: 1.33:1.000:. ./.:4:11,15:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.17:1.000:. ./.:4:14,23:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.87:1.000:. ./.:4:20,28:.:-0.02:1.000:. ./.:4:21,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,63:.: 0.56:0.803:. ./.:4:0,82:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.31:1.000:. ./.:4:31,37:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.64:1.000:. ./.:4:20,59:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.87:1.000:. ./.:4:18,23:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.64:1.000:. ./.:4:16,47:.: 0.53:1.000:. ./.:4:36,33:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,64:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,41:.: 0.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,3:.:-1.56:1.000:. ./.:3:0,5:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.16:1.000:. ./.:4:34,60:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.90:1.000:. ./.:4:19,44:.: 0.53:1.000:. ./.:4:10,31:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,35:.:-0.24:1.000:. ./.:4:19,17:.:-0.46:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.21:1.000:. ./.:4:17,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,81:.: 1.19:0.997:. ./.:4:4,24:.:-0.76:1.000:. ./.:4:19,28:.:-0.06:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.98:1.000:. ./.:4:9,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:21,49:.: 0.78:1.000:. ./.:4:14,22:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.61:1.000:. ./.:4:21,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:16,11:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,40:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.01:1.000:. ./.:6:8,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:11,46:.: 0.31:1.000:. ./.:4:13,40:.: 0.16:1.000:. ./.:4:6,42:.:-0.02:1.000:. ./.:4:6,27:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,49:.: 0.67:1.000:. ./.:4:14,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.13:1.000:. ./.:4:7,42:.: 0.01:0.974:. ./.:4:0,81:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.98:1.000:. ./.:4:3,11:.:-1.27:0.999:. ./.:4:0,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,78:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.98:1.000:. ./.:4:11,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:17,20:.:-0.43:1.000:. ./.:4:14,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,40:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.21:0.997:. ./.:4:10,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,31:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,22:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.12:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.01:1.000:. ./.:4:7,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:16,63:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:20,60:.: 1.15:1.000:. ./.:4:14,27:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,30:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:16,29:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.97:1.000:. ./.:4:6,25:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:8,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.21:0.981:. ./.:4:0,20:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.98:1.000:. ./.:4:6,17:.:-0.94:1.000:. ./.:4:22,94:.: 2.47:1.000:. ./.:4:30,59:.: 1.48:1.000:. ./.:4:13,18:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,15:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.65:0.999:. ./.:4:0,56:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.61:1.000:. ./.:4:19,17:.:-0.46:1.000:. ./.:4:5,7:.:-1.34:1.000:. ./.:4:1,22:.:-0.94:1.000:. ./.:4:14,22:.:-0.46:1.000:. ./.:4:19,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.50:1.000:. ./.:4:21,16:.:-0.43:1.000:. ./.:4:35,81:.: 2.47:1.000:. ./.:4:12,20:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.17:1.000:. ./.:4:11,33:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.35:1.000:. ./.:4:9,15:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:6,15:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:29,66:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,20:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.09:1.000:. ./.:4:6,25:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.05:1.000:. ./.:4:30,84:.: 2.40:1.000:. ./.:4:12,20:.:-0.61:1.000:. ./.:4:19,46:.: 0.60:1.000:. ./.:4:32,73:.: 2.07:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:19,47:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,123:.: 3.79:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.53:1.000:. ./.:4:25,59:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:17,30:.:-0.06:1.000:. ./.:4:29,60:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:29,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:30,59:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:23,20:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,76:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,99:.: 1.85:0.999:. ./.:4:19,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,51:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,77:.: 2.36:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.50:1.000:. ./.:4:26,72:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.05:1.000:. ./.:4:29,27:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,33:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,20:.:-0.39:1.000:. ./.:4:19,79:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.93:1.000:. ./.:4:25,63:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.45:1.000:. ./.:4:33,73:.: 2.10:1.000:. ./.:4:17,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,81:.: 1.19:1.000:. -chr7.1 10739345 chr7.1_010739345 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:17,29:0.62:-0.69:1.000:0.515 0/0/0/1:4:36,12:0.28:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,17:0.30: 0.23:1.000:0.984 0/0/0/1:4:35,12:0.28:-0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,29:0.30: 2.88:1.000:0.988 0/0/0/1:4:52,14:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,15:0.48:-1.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,22:0.41: 0.00:1.000:0.839 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.69:-2.53:1.000:0.974 0/0/0/0:4:24,2:0.09:-1.84:1.000:0.967 0/0/1/1:4:33,24:0.45:-0.05:1.000:0.977 0/0/1/1:4:21,27:0.57:-0.57:1.000:0.946 0/0/0/1:4:46,17:0.30: 0.29:1.000:0.987 0/0/0/1:4:45,13:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,7:0.14: 0.00:1.000:0.950 0/0/1/1:4:33,24:0.45:-0.05:0.803:0.977 0/1/1/1:4:16,35:0.67:-0.40:1.000:0.914 0/1/1/1:4:18,60:0.73: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,36:0.47: 1.38:1.000:0.990 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.55:-0.51:1.000:0.984 0/0/0/1:4:65,11:0.16: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:41,21:0.37: 0.23:1.000:0.617 0/0/1/1:4:4,5:0.56:-2.81:1.000:0.958 0/0/0/1:4:38,10:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,32:0.47: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,23:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,27:0.41: 0.75:1.000:0.846 0/0/1/1:4:26,28:0.54:-0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,12:0.43:-1.61:1.000:0.938 0/0/0/1:4:41,16:0.31:-0.05:1.000:0.976 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.50:-2.35:1.000:0.997 0/1/1:3:2,2:0.52:-3.10:1.000:0.801 0/0/1/1:4:39,24:0.41: 0.29:1.000:0.850 0/0/0/1:4:45,6:0.13:-0.40:1.000:0.929 0/0/1/1:4:40,25:0.41: 0.41:1.000:0.873 0/0/1/1:4:18,19:0.53:-1.20:1.000:0.992 0/0/0/1:4:33,6:0.17:-1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,32:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,25:0.45: 0.06:1.000:0.980 0/0/0/1:4:52,16:0.26: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,11:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,16:0.20: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,24:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,57:0.70: 1.21:0.997:0.981 0/0/1/1:4:4,3:0.46:-2.93:1.000:0.984 0/0/0/1:4:43,13:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,4:0.13:-1.38:1.000:0.929 0/0/1/1:4:29,18:0.41:-0.63:1.000:0.863 0/0/1/1:4:38,24:0.41: 0.23:1.000:0.886 0/0/1/1:4:43,29:0.43: 0.81:1.000:0.945 0/0/0/0:4:71,7:0.10: 1.15:1.000:0.779 0/0/0/1:4:48,18:0.30: 0.46:1.000:0.985 0/0/0/1:4:42,18:0.33: 0.12:1.000:0.931 0/0/0/1:4:31,16:0.37:-0.63:1.000:0.596 0/0/1/1:4:21,22:0.53:-0.86:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,25:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/0/0/0/0/1:6:42,11:0.23:-0.28:1.000:0.698 0/0/0/1:4:54,12:0.20: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,20:0.45:-0.63:1.000:0.982 0/0/1/1:4:44,25:0.39: 0.64:1.000:0.683 0/0/0/1:4:37,10:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,7:0.18:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,23:0.43:-0.05:1.000:0.947 0/0/0/1:4:28,9:0.27:-1.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,18:0.26: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,27:0.50:-0.05:0.974:0.997 0/0/1/1:4:31,27:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,26:0.39: 0.75:1.000:0.726 0/0/0/1:4:37,7:0.18:-0.80:0.999:0.999 0/0/1/1:4:21,25:0.56:-0.69:1.000:0.974 0/0/1/1:4:38,30:0.47: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:37,22:0.40: 0.06:1.000:0.789 0/0/0/1:4:44,10:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,13:0.20: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,11:0.19: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,35:0.64:-0.23:1.000:0.666 0/1/1/1:4:15,30:0.65:-0.74:0.997:0.816 0/0/0/1:4:56,16:0.25: 0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,30:0.39: 1.38:1.000:0.722 0/0/0/1:4:41,17:0.32: 0.00:1.000:0.952 0/0/0/0:4:32,3:0.10:-1.32:1.000:0.870 0/0/1/1:4:30,38:0.57: 0.58:1.000:0.953 0/0/1/1:4:20,21:0.53:-0.97:1.000:0.992 0/0/0/1:4:51,10:0.18: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,16:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.26:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,17:0.71:-2.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,46:0.71: 0.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:60,15:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,8:0.17:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,37:0.71:-0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:42,7:0.16:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,13:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,8:0.15: 0.18:1.000:0.984 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,37:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,19:0.46:-0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:34,32:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,17:0.33:-0.05:1.000:0.937 0/0/0/1:4:84,20:0.22: 2.65:0.981:1.000 0/0/0/1:4:47,6:0.13:-0.28:1.000:0.882 0/0/1/1:4:26,22:0.48:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,11:0.20: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,20:0.40:-0.23:1.000:0.767 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,16:0.20: 1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,48:0.70: 0.46:1.000:0.986 0/0/1/1:4:49,27:0.38: 1.04:0.999:0.599 0/0/0/1:4:55,11:0.19: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,25:0.41: 0.46:1.000:0.835 0/0/0/1:4:42,13:0.26:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,30:0.57:-0.28:1.000:0.938 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.47: 1.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,39:0.62: 0.29:1.000:0.632 0/0/0/1:4:50,10:0.19: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.32: 0.58:1.000:0.950 0/0/1/1:4:40,31:0.46: 0.75:1.000:0.989 0/0/1/1:4:38,24:0.41: 0.23:1.000:0.886 0/0/1/1:4:32,31:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,18:0.45:-0.86:1.000:0.975 0/0/0/1:4:42,8:0.18:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,8:0.17:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,15:0.42:-1.15:1.000:0.920 0/0/0/1:4:51,10:0.18: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,29:0.49: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,11:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,9:0.28:-1.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,11:0.24:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,52:0.74: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,10:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,7:0.12: 0.41:1.000:0.786 0/0/0/1:4:42,7:0.16:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,36:0.70:-0.46:1.000:0.980 0/0/1/1:4:41,33:0.47: 0.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:69,18:0.23: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,15:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,11:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,53:0.53: 2.59:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,34:0.43: 1.50:1.000:0.950 0/0/0/1:4:63,14:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,28:0.45: 0.46:1.000:0.981 0/0/1/1:4:31,34:0.54: 0.41:1.000:0.988 0/0/0/1:4:69,19:0.24: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,13:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,14:0.27: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,5:0.16:-1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,34:0.57: 0.18:1.000:0.955 0/0/1/1:4:56,33:0.40: 1.79:1.000:0.770 0/0/0/1:4:45,20:0.33: 0.41:1.000:0.898 0/0/0/1:4:44,17:0.31: 0.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:34,21:0.41:-0.17:1.000:0.856 0/0/1/1:4:45,27:0.40: 0.81:1.000:0.807 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,17:0.43:-0.92:1.000:0.950 0/0/0/1:4:49,11:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,15:0.52:-1.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,10:0.18: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,16:0.30: 0.06:1.000:0.986 0/0/1/1:4:34,39:0.55: 0.87:0.999:0.982 0/0/1/1:4:33,27:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,14:0.29:-0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:28,9:0.27:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,21:0.46:-0.51:1.000:0.984 0/1/1/1:4:12,45:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,14:0.37:-0.97:1.000:0.582 0/0/1/1:4:34,19:0.39:-0.28:1.000:0.639 0/0/1/1:4:33,27:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:34,27:0.47: 0.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:61,19:0.27: 1.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,16:0.29: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,36:0.57: 0.35:1.000:0.946 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,53:0.67: 1.10:1.000:0.920 0/0/0/1:4:35,17:0.35:-0.34:1.000:0.753 0/0/1/1:4:36,25:0.44: 0.18:1.000:0.961 -chr7.1 10877021 chr7.1_010877021 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,133:.: 0.61:1.000:. ./.:4:5,79:.:-1.36:1.000:. ./.:4:12,100:.:-0.24:1.000:. ./.:4:23,103:.: 0.33:1.000:. ./.:4:39,87:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,68:.:-1.16:1.000:. ./.:4:8,71:.:-1.56:1.000:. ./.:4:13,104:.:-0.04:1.000:. ./.:4:26,93:.: 0.04:1.000:. ./.:4:9,82:.:-1.08:1.000:. ./.:4:5,87:.:-1.04:1.000:. ./.:4:19,84:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.72:1.000:. ./.:4:10,114:.: 0.25:1.000:. ./.:4:20,96:.:-0.08:1.000:. ./.:4:10,99:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,113:.: 0.41:0.803:. ./.:4:19,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.78:1.000:. ./.:4:12,135:.: 1.17:1.000:. ./.:4:27,103:.: 0.49:1.000:. ./.:4:5,107:.:-0.24:1.000:. ./.:4:10,108:.: 0.00:1.000:. ./.:4:10,95:.:-0.52:1.000:. ./.:4:14,60:.:-1.77:1.000:. ./.:4:21,71:.:-1.04:1.000:. ./.:4:10,90:.:-0.72:1.000:. ./.:4:12,95:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,144:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.77:1.000:. ./.:4:9,84:.:-1.00:1.000:. ./.:4:14,67:.:-1.48:1.000:. ./.:4:39,218:.: 5.60:1.000:. ./.:4:35,57:.:-1.04:1.000:. ./.:3:8,56:.:-2.17:1.000:. ./.:4:21,74:.:-0.92:1.000:. ./.:4:11,78:.:-1.16:1.000:. ./.:4:13,88:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,152:.: 1.37:1.000:. ./.:4:21,99:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,117:.: 0.41:1.000:. ./.:4:37,94:.: 0.53:1.000:. ./.:4:40,132:.: 2.18:1.000:. ./.:4:28,72:.:-0.72:1.000:. ./.:4:34,125:.: 1.65:1.000:. ./.:4:9,137:.: 1.13:1.000:. ./.:4:11,138:.: 1.25:0.997:. ./.:4:13,57:.:-1.93:1.000:. ./.:4:33,73:.:-0.48:1.000:. ./.:4:29,54:.:-1.40:1.000:. ./.:4:15,127:.: 0.97:1.000:. ./.:4:35,120:.: 1.49:1.000:. ./.:4:32,87:.: 0.04:1.000:. ./.:4:18,137:.: 1.49:1.000:. ./.:4:20,78:.:-0.80:1.000:. ./.:4:25,99:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,92:.:-0.20:1.000:. ./.:4:10,121:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.00:1.000:. ./.:6:38,71:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,90:.: 0.97:1.000:. ./.:4:17,82:.:-0.76:1.000:. ./.:4:26,138:.: 1.86:1.000:. ./.:4:28,91:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:9,98:.:-0.44:1.000:. ./.:4:7,121:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,117:.: 0.41:1.000:. ./.:4:26,116:.: 0.97:0.974:. ./.:4:13,97:.:-0.32:1.000:. ./.:4:14,124:.: 0.81:1.000:. ./.:4:19,74:.:-1.00:0.999:. ./.:4:10,111:.: 0.13:1.000:. ./.:4:23,87:.:-0.32:1.000:. ./.:4:15,105:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,130:.: 1.21:1.000:. ./.:4:43,71:.:-0.16:1.000:. ./.:4:15,97:.:-0.24:1.000:. ./.:4:34,76:.:-0.32:1.000:. ./.:4:13,119:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1,117:.: 0.00:0.997:. ./.:4:33,93:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,111:.: 0.81:1.000:. ./.:4:14,116:.: 0.49:1.000:. ./.:4:36,120:.: 1.53:1.000:. ./.:4:13,127:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.24:1.000:. ./.:4:26,75:.:-0.68:1.000:. ./.:4:19,100:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,84:.: 0.29:1.000:. ./.:4:16,104:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,103:.: 0.97:1.000:. ./.:4:30,68:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,112:.: 0.49:1.000:. ./.:4:27,100:.: 0.37:1.000:. ./.:4:11,92:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,79:.:-1.04:1.000:. ./.:4:37,89:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,122:.: 1.57:1.000:. ./.:4:20,97:.:-0.04:1.000:. ./.:4:43,116:.: 1.65:1.000:. ./.:4:7,85:.:-1.04:1.000:. ./.:4:26,131:.: 1.57:0.981:. ./.:4:14,83:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.17:1.000:. ./.:4:19,74:.:-1.00:1.000:. ./.:4:26,69:.:-0.92:1.000:. ./.:4:55,108:.: 1.82:1.000:. ./.:4:19,97:.:-0.08:1.000:. ./.:4:10,122:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,174:.: 2.26:1.000:. ./.:4:9,121:.: 0.49:0.999:. ./.:4:25,109:.: 0.65:1.000:. ./.:4:11,38:.:-2.77:1.000:. ./.:4:17,116:.: 0.61:1.000:. ./.:4:10,103:.:-0.20:1.000:. ./.:4:12,94:.:-0.48:1.000:. ./.:4:38,77:.:-0.12:1.000:. ./.:4:11,133:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1,112:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,92:.:-0.32:1.000:. ./.:4:11,118:.: 0.45:1.000:. ./.:4:11,119:.: 0.49:1.000:. ./.:4:11,104:.:-0.12:1.000:. ./.:4:33,95:.: 0.41:1.000:. ./.:4:25,88:.:-0.20:1.000:. ./.:4:33,59:.:-1.04:1.000:. ./.:4:19,62:.:-1.48:1.000:. ./.:4:17,61:.:-1.61:1.000:. ./.:4:10,105:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,53:.:-1.77:1.000:. ./.:4:19,61:.:-1.52:1.000:. ./.:4:7,83:.:-1.12:1.000:. ./.:4:13,133:.: 1.13:1.000:. ./.:4:24,81:.:-0.52:1.000:. ./.:4:8,100:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,77:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,89:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,94:.: 0.17:1.000:. ./.:4:39,79:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,74:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,131:.: 1.65:1.000:. ./.:4:35,109:.: 1.05:1.000:. ./.:4:10,116:.: 0.33:1.000:. ./.:4:18,95:.:-0.20:1.000:. ./.:4:35,95:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.25:1.000:. ./.:4:35,99:.: 0.65:1.000:. ./.:4:21,85:.:-0.48:1.000:. ./.:4:31,102:.: 0.61:1.000:. ./.:4:16,69:.:-1.32:1.000:. ./.:4:11,121:.: 0.57:1.000:. ./.:4:14,108:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,107:.: 0.61:1.000:. ./.:4:20,100:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,128:.: 0.89:1.000:. ./.:4:18,116:.: 0.65:1.000:. ./.:4:7,93:.:-0.72:1.000:. ./.:4:12,69:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.60:1.000:. ./.:4:15,104:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,69:.:-1.97:1.000:. ./.:4:8,79:.:-1.24:1.000:. ./.:4:20,82:.:-0.64:1.000:. ./.:4:14,98:.:-0.24:0.999:. ./.:4:5,102:.:-0.44:1.000:. ./.:4:32,89:.: 0.13:1.000:. ./.:4:38,73:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,84:.:-0.72:1.000:. ./.:4:21,90:.:-0.28:1.000:. ./.:4:6,86:.:-1.04:1.000:. ./.:4:22,86:.:-0.40:1.000:. ./.:4:17,99:.:-0.08:1.000:. ./.:4:10,116:.: 0.33:1.000:. ./.:4:12,151:.: 1.82:1.000:. ./.:4:31,70:.:-0.68:1.000:. ./.:4:21,61:.:-1.44:1.000:. ./.:4:23,103:.: 0.33:1.000:. ./.:4:32,108:.: 0.89:1.000:. ./.:4:10,131:.: 0.93:1.000:. ./.:4:21,85:.:-0.48:1.000:. ./.:4:15,117:.: 0.57:1.000:. -chr7.1 11050562 chr7.1_011050562 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:322,107:.: 1.32:1.000:. ./.:4:231,55:.:-0.47:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:258,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:276,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:254,91:.: 0.27:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:64,13:.:-3.10:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:240,42:.:-0.52:1.000:. ./.:4:221,83:.:-0.25:1.000:. ./.:4:239,61:.:-0.30:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:250,66:.:-0.10:0.803:. ./.:4:270,81:.: 0.34:1.000:. ./.:4:341,95:.: 1.41:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:53,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:251,65:.:-0.10:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:240,53:.:-0.39:1.000:. ./.:4:27,6:.:-3.65:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:299,71:.: 0.58:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:286,82:.: 0.56:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:356,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:211,71:.:-0.52:1.000:. ./.:4:20,0:.:-3.81:1.000:. ./.:4:70,11:.:-3.05:1.000:. ./.:3:16,4:.:-3.81:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:265,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:273,60:.: 0.12:1.000:. ./.:4:270,77:.: 0.29:1.000:. ./.:4:286,76:.: 0.48:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:321,71:.: 0.86:1.000:. ./.:4:349,89:.: 1.43:0.997:. ./.:4:262,76:.: 0.18:1.000:. ./.:4:272,73:.: 0.27:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:217,48:.:-0.74:1.000:. ./.:4:343,89:.: 1.36:1.000:. ./.:4:254,52:.:-0.22:1.000:. ./.:4:347,93:.: 1.46:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:285,57:.: 0.23:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:235,72:.:-0.21:1.000:. ./.:6:274,16:.:-0.42:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:260,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:253,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:280,70:.: 0.33:1.000:. ./.:4:208,1:.:-1.44:1.000:. ./.:4:268,63:.: 0.09:1.000:. ./.:4:296,78:.: 0.63:0.974:. ./.:4:281,79:.: 0.46:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:192,38:.:-1.18:0.999:. ./.:4:285,65:.: 0.33:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:271,86:.: 0.42:1.000:. ./.:4:199,63:.:-0.78:1.000:. ./.:4:245,65:.:-0.17:1.000:. ./.:4:290,70:.: 0.46:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:291,72:.: 0.49:1.000:. ./.:4:139,113:.:-0.90:0.997:. ./.:4:280,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:307,62:.: 0.57:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:285,79:.: 0.51:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:320,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:177,47:.:-1.25:1.000:. ./.:4:258,83:.: 0.22:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:223,79:.:-0.27:1.000:. ./.:4:247,59:.:-0.22:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:289,69:.: 0.43:1.000:. ./.:4:155,33:.:-1.70:1.000:. ./.:4:294,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:206,47:.:-0.89:1.000:. ./.:4:304,60:.: 0.51:0.981:. ./.:4:291,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:268,61:.: 0.07:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:267,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:494,1:.: 2.15:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:381,84:.: 1.77:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:424,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:194,50:.:-1.00:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:215,53:.:-0.70:1.000:. ./.:4:299,76:.: 0.64:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:243,56:.:-0.31:1.000:. ./.:4:293,78:.: 0.59:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:267,64:.: 0.09:1.000:. ./.:4:190,51:.:-1.04:1.000:. ./.:4:217,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:227,54:.:-0.54:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:245,61:.:-0.22:1.000:. ./.:4:153,46:.:-1.57:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:269,63:.: 0.10:1.000:. ./.:4:353,85:.: 1.43:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:247,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:237,67:.:-0.25:1.000:. ./.:4:269,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:355,90:.: 1.52:1.000:. ./.:4:380,109:.: 2.08:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:471,1:.: 1.86:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:58,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:233,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:289,84:.: 0.62:1.000:. ./.:4:279,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:374,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:219,67:.:-0.47:1.000:. ./.:4:321,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:267,69:.: 0.15:1.000:. ./.:4:222,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:241,63:.:-0.25:0.999:. ./.:4:334,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:245,63:.:-0.20:1.000:. ./.:4:257,65:.:-0.02:1.000:. ./.:4:202,63:.:-0.74:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:269,72:.: 0.22:1.000:. ./.:4:258,74:.: 0.10:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:320,14:.: 0.13:1.000:. ./.:4:296,65:.: 0.47:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:341,69:.: 1.08:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:311,72:.: 0.74:1.000:. -chr7.1 11083742 chr7.1_011083742 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:89,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.19:0.803:. ./.:4:142,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.60:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.28:0.997:. ./.:4:138,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.04:1.000:. ./.:6:72,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:174,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.90:0.974:. ./.:4:96,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:141,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.34:0.997:. ./.:4:151,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:164,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.08:0.981:. ./.:4:135,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.69:0.999:. ./.:4:161,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.25:0.999:. ./.:4:96,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.31:1.000:. -chr7.1 11227396 chr7.1_011227396 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,17:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:52,11:.: 0.72:1.000:. ./.:4:31,15:.:-0.36:1.000:. ./.:4:12,11:.:-1.81:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:40,17:.: 0.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:16,11:.:-1.56:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:25,14:.:-0.80:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.46:0.803:. ./.:4:54,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:42,17:.: 0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:37,12:.:-0.17:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,3:.:-3.08:1.000:. ./.:4:58,27:.: 2.11:1.000:. ./.:4:32,12:.:-0.48:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.94:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:3,1:.:-3.01:1.000:. ./.:4:8,6:.:-2.38:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.74:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:56,14:.: 1.16:1.000:. ./.:4:32,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,24:.: 2.04:1.000:. ./.:4:59,19:.: 1.67:1.000:. ./.:4:52,11:.: 0.72:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:41,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.40:0.997:. ./.:4:12,1:.:-2.44:1.000:. ./.:4:42,19:.: 0.59:1.000:. ./.:4:43,20:.: 0.72:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:70,21:.: 2.49:1.000:. ./.:4:51,10:.: 0.59:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.29:1.000:. ./.:4:53,20:.: 1.35:1.000:. ./.:4:26,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,22:.: 2.23:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:6:28,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:41,21:.: 0.65:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.55:1.000:. ./.:4:49,22:.: 1.22:1.000:. ./.:4:50,22:.: 1.29:1.000:. ./.:4:43,17:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,13:.: 1.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:43,11:.: 0.15:0.974:. ./.:4:43,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.23:0.999:. ./.:4:96,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:47,12:.: 0.46:1.000:. ./.:4:47,16:.: 0.72:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:54,12:.: 0.91:1.000:. ./.:4:44,21:.: 0.84:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.78:0.997:. ./.:4:58,14:.: 1.29:1.000:. ./.:4:46,17:.: 0.72:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:51,22:.: 1.35:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.23:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,5:.:-1.31:1.000:. ./.:4:35,13:.:-0.23:1.000:. ./.:4:42,17:.: 0.46:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:47,18:.: 0.84:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.12:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:23,13:.:-0.99:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.73:0.981:. ./.:4:63,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,13:.: 0.15:1.000:. ./.:4:34,10:.:-0.48:1.000:. ./.:4:47,27:.: 1.41:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.23:1.000:. ./.:4:46,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:73,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:39,12:.:-0.04:1.000:. ./.:4:30,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:42,15:.: 0.34:1.000:. ./.:4:44,15:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.23:1.000:. ./.:4:30,13:.:-0.55:1.000:. ./.:4:45,14:.: 0.46:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:22,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:46,18:.: 0.78:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,11:.:-0.61:1.000:. ./.:4:40,11:.:-0.04:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:48,12:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.99:1.000:. ./.:4:37,10:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,17:.: 0.65:1.000:. ./.:4:46,12:.: 0.40:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.55:1.000:. ./.:4:41,11:.: 0.02:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,21:.: 1.16:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:22,12:.:-1.12:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:40,13:.: 0.09:1.000:. ./.:4:47,13:.: 0.53:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,17:.:-0.29:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:50,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:42,13:.: 0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:29,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:26,7:.:-1.18:1.000:. ./.:4:22,9:.:-1.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:27,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:17,12:.:-1.43:1.000:. ./.:4:44,22:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,14:.: 0.59:1.000:. ./.:4:31,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,16:.: 0.28:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:52,10:.: 0.65:1.000:. ./.:4:35,14:.:-0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.02:1.000:. -chr7.1 11451133 chr7.1_011451133 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:183,61:0.29: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:87,86:0.53:-0.59:1.000:0.993 0/0/0/1:4:109,52:0.36:-0.72:1.000:0.661 0/0/0/1:4:227,61:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:302,73:0.23: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,109:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:166,45:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,98:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:220,32:0.15: 0.27:1.000:0.985 0/0/1/1:4:21,18:0.50:-2.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,8:0.35:-2.19:1.000:0.822 0/0/0/1:4:224,57:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,72:0.41:-0.37:1.000:0.887 0/0/1/1:4:152,89:0.41: 0.15:1.000:0.865 0/0/0/0:4:322,32:0.11: 1.38:1.000:0.658 0/0/0/1:4:229,38:0.17: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,86:0.67:-1.12:0.803:0.913 0/0/1/1:4:52,66:0.57:-1.19:1.000:0.938 0/0/1/1:4:154,115:0.47: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:313,78:0.23: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,22:0.28:-1.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:146,38:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,43:0.16: 0.96:1.000:0.995 0/0/0/1:4:118,57:0.37:-0.57:1.000:0.626 0/0/0/1:4:30,6:0.19:-2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,66:0.43:-0.64:1.000:0.957 0/0/0/1:4:189,53:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/0:4:358,13:0.04: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,66:0.34:-0.11:1.000:0.850 0/0/0/1:4:139,65:0.36:-0.25:1.000:0.714 0/0/0/0:4:250,15:0.07: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,35:0.19:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-2.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,13:0.31:-1.95:1.000:0.976 0/0/0:3:47,0:0.00:-1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,48:0.22: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,31:0.14: 0.39:1.000:0.958 0/0/0/1:4:264,65:0.23: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,51:0.35:-0.69:1.000:0.793 0/0/0/1:4:258,29:0.12: 0.65:1.000:0.714 0/0/0/1:4:152,47:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:316,33:0.11: 1.33:1.000:0.505 0/0/0/0:4:355,30:0.09: 1.72:1.000:0.938 0/0/0/1:4:263,30:0.12: 0.72:1.000:0.751 0/0/0/1:4:264,74:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,56:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,105:0.45: 0.30:0.997:0.983 0/1/1/1:4:11,19:0.63:-2.15:1.000:0.503 0/0/1/1:4:85,69:0.49:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,20:0.15:-0.81:1.000:0.990 0/0/0/1:4:174,44:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:384,27:0.08: 2.00:1.000:0.994 0/0/0/0:4:300,19:0.07: 1.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,90:0.69:-1.11:1.000:0.968 0/0/0/0:4:316,23:0.08: 1.22:1.000:0.990 0/0/0/0:4:232,21:0.10: 0.28:1.000:0.863 0/0/0/1:4:304,37:0.13: 1.24:1.000:0.873 0/0/0/1:4:189,27:0.15:-0.12:1.000:0.982 0/0/0/1:4:110,33:0.27:-0.92:1.000:0.998 0/0/0/0/0/1:6:164,42:0.24:-0.23:1.000:0.654 0/0/0/1:4:224,71:0.28: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,57:0.47:-1.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:127,90:0.46:-0.11:1.000:0.986 0/0/0/1:4:177,28:0.16:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:132,101:0.48: 0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:105,41:0.32:-0.88:1.000:0.957 0/0/0/1:4:215,31:0.15: 0.21:1.000:0.984 0/1/1/1:4:26,108:0.75:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,59:0.44:-0.85:0.974:0.963 0/0/1/1:4:108,65:0.42:-0.59:1.000:0.900 0/0/1/1:4:96,71:0.47:-0.65:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,53:0.50:-1.21:0.999:0.997 0/0/1/1:4:96,59:0.42:-0.79:1.000:0.921 0/0/0/1:4:208,65:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,85:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:108,54:0.37:-0.71:1.000:0.524 0/0/0/1:4:200,44:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,57:0.32:-0.25:1.000:0.960 0/0/0/1:4:225,50:0.21: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,48:0.20: 0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-1.53:0.997:1.000 0/0/1/1:4:95,87:0.52:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/0:4:317,26:0.09: 1.26:1.000:0.956 0/0/1/1:4:116,61:0.38:-0.55:1.000:0.628 0/0/0/1:4:155,33:0.20:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,68:0.24: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,38:0.28:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,48:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,72:0.75:-1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,36:0.18: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,67:0.48:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,51:0.34:-0.62:1.000:0.878 0/0/0/1:4:212,61:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,38:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,50:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,80:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,81:0.70:-1.28:1.000:0.984 0/0/0/1:4:150,61:0.33:-0.18:1.000:0.931 0/0/0/1:4:212,58:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,77:0.29: 0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:108,74:0.45:-0.49:1.000:0.978 0/0/0/1:4:237,70:0.26: 0.87:1.000:0.998 0/0/0/1:4:192,54:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,83:0.45:-0.25:0.981:0.979 0/1/1/1:4:24,51:0.66:-1.66:1.000:0.860 0/0/0/1:4:121,59:0.37:-0.51:1.000:0.599 0/0/0/0:4:265,24:0.10: 0.67:1.000:0.862 0/0/0/1:4:248,78:0.28: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:306,95:0.27: 1.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:220,26:0.12: 0.21:1.000:0.825 0/0/0/1:4:145,52:0.30:-0.33:1.000:0.984 0/0/0/1:4:167,79:0.36: 0.21:1.000:0.684 0/0/0/0:4:255,22:0.09: 0.54:0.999:0.920 0/1/1/1:4:24,117:0.78:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,47:0.50:-1.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:223,62:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,44:0.33:-0.82:1.000:0.930 0/0/1/1:4:79,61:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:204,68:0.29: 0.49:1.000:0.993 0/0/0/1:4:198,49:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,63:0.33:-0.15:1.000:0.902 0/1/1/1:4:33,84:0.69:-1.20:1.000:0.966 0/0/0/1:4:220,70:0.28: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,59:0.37:-0.53:1.000:0.549 0/0/0/1:4:215,53:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,44:0.19: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:354,30:0.09: 1.71:1.000:0.936 0/0/0/1:4:158,21:0.14:-0.52:1.000:0.955 0/0/0/1:4:114,32:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,59:0.31:-0.11:1.000:0.974 0/0/0/1:4:105,41:0.32:-0.88:1.000:0.957 0/0/1/1:4:144,75:0.38:-0.09:1.000:0.600 0/0/0/0:4:181,17:0.10:-0.32:1.000:0.797 0/0/0/1:4:188,38:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,81:0.69:-1.25:1.000:0.972 0/0/0/1:4:265,54:0.20: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,36:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,50:0.32:-0.55:1.000:0.952 0/0/0/1:4:278,39:0.14: 0.98:1.000:0.977 0/0/0/1:4:136,53:0.32:-0.42:1.000:0.958 0/0/0/0:4:312,16:0.06: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,72:0.27: 0.95:1.000:0.998 0/0/0/1:4:237,77:0.28: 0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:151,36:0.22:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:465,40:0.09: 3.03:1.000:0.923 0/0/0/0:4:505,47:0.10: 3.54:1.000:0.815 0/1/1/1:4:34,103:0.71:-0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:270,31:0.12: 0.81:1.000:0.766 0/0/0/0:4:381,13:0.04: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,39:0.31:-0.89:1.000:0.978 0/0/0/1:4:263,73:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,72:0.34: 0.14:1.000:0.878 0/0/0/1:4:23,10:0.34:-2.11:1.000:0.858 0/0/1/1:4:66,67:0.53:-1.03:1.000:0.991 0/1/1/1:4:27,103:0.74:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:248,80:0.28: 1.10:1.000:0.995 0/0/0/0:4:463,29:0.07: 2.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:180,56:0.27: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:23,101:0.76:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,68:0.37:-0.25:1.000:0.524 0/0/0/1:4:206,56:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,45:0.30:-0.63:1.000:0.982 0/0/1/1:4:129,65:0.37:-0.36:1.000:0.500 0/0/1/1:4:101,106:0.54:-0.22:1.000:0.988 0/0/0/1:4:101,41:0.33:-0.93:1.000:0.933 0/0/1/1:4:154,80:0.38: 0.08:1.000:0.593 0/0/0/1:4:130,65:0.37:-0.35:1.000:0.524 0/0/1/1:4:127,99:0.48:-0.01:0.999:0.995 0/0/0/1:4:257,52:0.20: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,81:0.31: 0.74:1.000:0.970 0/0/0/1:4:188,48:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,47:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,75:0.39:-0.15:1.000:0.717 0/0/1/1:4:96,74:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,43:0.21: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,36:0.16: 0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:239,83:0.29: 1.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:255,80:0.28: 1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:227,64:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,66:0.31: 0.13:1.000:0.967 0/0/0/1:4:376,46:0.13: 2.12:1.000:0.880 0/0/0/1:4:172,83:0.36: 0.30:1.000:0.629 0/0/0/1:4:301,74:0.23: 1.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,82:0.54:-0.71:1.000:0.990 0/0/1/1:4:137,92:0.44: 0.02:1.000:0.972 -chr7.1 11506367 chr7.1_011506367 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:99,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,28:.: 0.50:1.000:. ./.:4:71,58:.: 0.88:1.000:. ./.:4:72,50:.: 0.70:1.000:. ./.:4:25,55:.:-0.37:1.000:. ./.:4:143,43:.: 2.33:1.000:. ./.:4:71,61:.: 0.95:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:70,52:.: 0.70:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.82:1.000:. ./.:4:26,27:.:-1.05:1.000:. ./.:4:39,65:.: 0.24:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:103,30:.: 0.98:1.000:. ./.:4:70,42:.: 0.45:1.000:. ./.:4:127,33:.: 1.67:1.000:. ./.:4:119,29:.: 1.36:0.803:. ./.:4:144,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:129,28:.: 1.59:1.000:. ./.:4:84,66:.: 1.41:1.000:. ./.:4:36,4:.:-1.38:1.000:. ./.:4:59,43:.: 0.19:1.000:. ./.:4:121,17:.: 1.11:1.000:. ./.:4:104,26:.: 0.90:1.000:. ./.:4:26,12:.:-1.43:1.000:. ./.:4:94,70:.: 1.77:1.000:. ./.:4:146,51:.: 2.61:1.000:. ./.:4:31,74:.: 0.27:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:148,38:.: 2.33:1.000:. ./.:4:91,68:.: 1.64:1.000:. ./.:4:83,60:.: 1.23:1.000:. ./.:4:7,7:.:-2.04:1.000:. ./.:4:17,19:.:-1.49:1.000:. ./.:3:19,1:.:-1.89:1.000:. ./.:4:98,52:.: 1.41:1.000:. ./.:4:98,27:.: 0.78:1.000:. ./.:4:53,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:61,46:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,34:.:-0.27:1.000:. ./.:4:57,35:.:-0.06:1.000:. ./.:4:46,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:41,32:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,13:.:-0.47:1.000:. ./.:4:62,19:.:-0.34:1.000:. ./.:4:77,20:.: 0.07:0.997:. ./.:4:45,9:.:-1.03:1.000:. ./.:4:95,18:.: 0.47:1.000:. ./.:4:18,45:.:-0.80:1.000:. ./.:4:37,11:.:-1.18:1.000:. ./.:4:58,29:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,33:.:-0.62:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:56,40:.: 0.04:1.000:. ./.:4:59,44:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,26:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,37:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.24:1.000:. ./.:6:28,23:.:-1.10:1.000:. ./.:4:20,33:.:-1.05:1.000:. ./.:4:33,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:50,49:.: 0.12:1.000:. ./.:4:22,61:.:-0.29:1.000:. ./.:4:66,34:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,35:.:-0.39:1.000:. ./.:4:59,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:64,37:.: 0.17:0.974:. ./.:4:60,29:.:-0.14:1.000:. ./.:4:59,15:.:-0.52:1.000:. ./.:4:52,15:.:-0.70:0.999:. ./.:4:82,22:.: 0.24:1.000:. ./.:4:65,40:.: 0.27:1.000:. ./.:4:53,23:.:-0.47:1.000:. ./.:4:91,20:.: 0.42:1.000:. ./.:4:45,25:.:-0.62:1.000:. ./.:4:49,10:.:-0.90:1.000:. ./.:4:53,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:46,42:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,6:.:-0.65:0.997:. ./.:4:88,10:.: 0.09:1.000:. ./.:4:42,21:.:-0.80:1.000:. ./.:4:42,35:.:-0.44:1.000:. ./.:4:88,22:.: 0.40:1.000:. ./.:4:75,20:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:11,26:.:-1.46:1.000:. ./.:4:54,6:.:-0.88:1.000:. ./.:4:15,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:62,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,9:.:-0.77:1.000:. ./.:4:75,12:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,44:.:-0.62:1.000:. ./.:4:18,47:.:-0.75:1.000:. ./.:4:49,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:35,22:.:-0.95:1.000:. ./.:4:26,26:.:-1.08:1.000:. ./.:4:89,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:45,26:.:-0.60:1.000:. ./.:4:44,22:.:-0.72:1.000:. ./.:4:21,14:.:-1.51:1.000:. ./.:4:65,8:.:-0.54:0.981:. ./.:4:39,10:.:-1.15:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:42,31:.:-0.54:1.000:. ./.:4:72,67:.: 1.13:1.000:. ./.:4:68,44:.: 0.45:1.000:. ./.:4:47,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:32,22:.:-1.03:1.000:. ./.:4:161,35:.: 2.58:1.000:. ./.:4:31,17:.:-1.18:0.999:. ./.:4:92,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.38:1.000:. ./.:4:37,33:.:-0.62:1.000:. ./.:4:29,26:.:-1.00:1.000:. ./.:4:68,15:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.98:1.000:. ./.:4:43,18:.:-0.85:1.000:. ./.:4:59,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:36,5:.:-1.36:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,69:.: 1.64:1.000:. ./.:4:37,28:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,21:.:-1.15:1.000:. ./.:4:21,23:.:-1.28:1.000:. ./.:4:27,40:.:-0.70:1.000:. ./.:4:14,15:.:-1.66:1.000:. ./.:4:38,14:.:-1.08:1.000:. ./.:4:38,31:.:-0.65:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:26,10:.:-1.49:1.000:. ./.:4:40,11:.:-1.10:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:107,74:.: 2.20:1.000:. ./.:4:44,36:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,19:.:-1.36:1.000:. ./.:4:24,13:.:-1.46:1.000:. ./.:4:43,9:.:-1.08:1.000:. ./.:4:15,32:.:-1.21:1.000:. ./.:4:43,12:.:-1.00:1.000:. ./.:4:49,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:10,34:.:-1.28:1.000:. ./.:4:86,38:.: 0.75:1.000:. ./.:4:59,36:.: 0.01:1.000:. ./.:4:106,26:.: 0.95:1.000:. ./.:4:52,28:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,92:.: 0.78:1.000:. ./.:4:63,15:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,95:.: 1.39:1.000:. ./.:4:140,25:.: 1.79:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:68,49:.: 0.57:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:109,22:.: 0.93:1.000:. ./.:4:35,78:.: 0.47:1.000:. ./.:4:81,43:.: 0.75:1.000:. ./.:4:89,14:.: 0.22:1.000:. ./.:4:105,23:.: 0.85:1.000:. ./.:4:83,46:.: 0.88:1.000:. ./.:4:81,24:.: 0.27:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:66,31:.: 0.07:1.000:. ./.:4:139,28:.: 1.84:1.000:. ./.:4:96,32:.: 0.85:1.000:. ./.:4:99,14:.: 0.47:1.000:. ./.:4:70,40:.: 0.40:0.999:. ./.:4:53,51:.: 0.24:1.000:. ./.:4:74,65:.: 1.13:1.000:. ./.:4:36,72:.: 0.34:1.000:. ./.:4:79,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,34:.:-0.21:1.000:. ./.:4:64,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,10:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,47:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,32:.: 2.20:1.000:. ./.:4:82,13:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,85:.: 0.60:1.000:. ./.:4:87,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:99,58:.: 1.59:1.000:. ./.:4:140,32:.: 1.97:1.000:. ./.:4:81,69:.: 1.41:1.000:. ./.:4:67,44:.: 0.42:1.000:. ./.:4:70,26:.: 0.04:1.000:. -chr7.1 11617830 chr7.1_011617830 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:193,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.46:0.803:. ./.:4:181,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.02:1.000:. ./.:3:78,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:139,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.11:0.997:. ./.:4:118,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.33:1.000:. ./.:6:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:0.974:. ./.:4:44,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:53,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.58:0.997:. ./.:4:148,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:26,1:.:-2.35:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.16:0.981:. ./.:4:119,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:161,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.76:0.999:. ./.:4:113,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:216,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.03:1.000:. -chr7.1 12139025 chr7.1_012139025 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:87,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:29,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:46,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.45:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.61:0.803:. ./.:4:15,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:38,5:.:-0.90:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.37:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:84,5:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:70,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:91,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.06:1.000:. ./.:3:50,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:52,4:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,5:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:74,5:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:77,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.45:0.997:. ./.:4:123,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:79,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:24,6:.:-1.26:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:30,2:.:-1.20:1.000:. ./.:4:90,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:20,7:.:-1.34:1.000:. ./.:4:241,0:.: 4.55:1.000:. ./.:4:134,1:.: 1.63:1.000:. ./.:6:139,3:.: 1.83:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:64,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:89,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:57,6:.:-0.35:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:101,2:.: 0.75:0.974:. ./.:4:81,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.28:0.999:. ./.:4:78,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:119,3:.: 1.28:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:134,8:.: 1.83:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.60:0.997:. ./.:4:83,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:91,4:.: 0.53:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.34:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:127,4:.: 1.52:1.000:. ./.:4:132,5:.: 1.69:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.25:0.981:. ./.:4:141,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:53,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:104,3:.: 0.86:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:124,3:.: 1.41:0.999:. ./.:4:130,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,5:.:-0.21:1.000:. ./.:4:109,5:.: 1.05:1.000:. ./.:4:61,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:86,7:.: 0.48:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:94,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:119,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:74,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:38,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.34:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:55,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:53,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:59,3:.:-0.38:1.000:. ./.:4:69,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:86,3:.: 0.37:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:55,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.85:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:47,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:82,3:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:54,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.64:1.000:. ./.:4:38,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.56:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:42,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:42,5:.:-0.79:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:87,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.76:1.000:. -chr7.1 12345814 chr7.1_012345814 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:249,268:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,335:0.78: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,212:0.47: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:200,242:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:384,150:0.27: 1.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:143,427:0.73: 1.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:200,83:0.28:-1.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:110,378:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,211:0.47: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,110:0.55:-2.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:101,139:0.56:-1.89:1.000:0.966 0/0/0/1:4:269,84:0.22:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,367:0.77: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,385:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:340,117:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,238:0.46: 0.86:1.000:0.987 0/1/1/1:4:165,406:0.69: 1.64:0.803:0.977 1/1/1/1:4:0,540:1.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:292,316:0.50: 2.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:369,150:0.27: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,121:0.60:-2.36:1.000:0.802 0/0/1/1:4:239,230:0.47: 0.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:305,276:0.46: 1.75:1.000:0.986 0/1/1/1:4:99,363:0.77: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,149:0.66:-2.12:1.000:0.897 0/0/1/1:4:269,290:0.50: 1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,236:0.51: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:446,1:0.00: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,570:0.99: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,193:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:383,132:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,181:0.48:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,198:0.81:-1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,164:0.60:-1.64:1.000:0.745 0/1/1:3:55,79:0.57:-3.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:354,118:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:227,246:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:345,118:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,364:0.73: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:248,275:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,195:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:321,109:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,125:0.26: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:291,133:0.30: 0.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:162,226:0.56:-0.31:1.000:0.961 0/0/1/1:4:199,201:0.48:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:291,347:0.53: 2.36:0.997:0.994 0/1/1/1:4:83,261:0.74:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,307:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:275,103:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:238,86:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:400,140:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,89:0.28:-1.26:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,478:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:315,103:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:306,116:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:270,116:0.28:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:332,126:0.26: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,307:0.73:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:209,111:0.33:-1.03:1.000:0.921 0/0/0/1:4:197,88:0.29:-1.41:1.000:0.990 0/0/1/1:4:187,215:0.52:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:212,248:0.52: 0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:238,97:0.27:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,209:0.47: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:189,196:0.49:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,181:0.51:-0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,417:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,199:0.50:-0.33:0.974:0.997 0/0/1/1:4:202,229:0.51: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:243,220:0.46: 0.49:1.000:0.986 0/1/1/1:4:89,351:0.78: 0.25:0.999:1.000 0/1/1/1:4:128,404:0.74: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:367,139:0.26: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,210:0.47: 0.15:1.000:0.992 0/1/1/1:4:87,319:0.77:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,244:0.58:-0.13:1.000:0.897 0/1/1/1:4:73,313:0.80:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,224:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:294,97:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,252:0.73:-0.84:0.997:0.997 0/1/1/1:4:84,320:0.78:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:283,95:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,180:0.48:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:225,275:0.53: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:200,242:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:143,129:0.46:-1.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:211,97:0.30:-1.16:1.000:0.986 0/1/1/1:4:79,286:0.77:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,111:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,177:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:194,182:0.47:-0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:216,225:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:239,97:0.27:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:377,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,208:0.48:-0.01:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,311:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,162:0.46:-0.83:1.000:0.987 0/0/1/1:4:160,176:0.51:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:228,228:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,194:0.54:-0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:198,234:0.52: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,157:0.55:-1.48:1.000:0.983 0/1/1/1:4:92,394:0.80: 0.74:0.981:1.000 0/1/1/1:4:68,271:0.78:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,283:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,102:0.29:-0.86:1.000:0.993 0/0/1/1:4:200,229:0.52: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:247,293:0.52: 1.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:201,190:0.47:-0.28:1.000:0.991 0/0/1/1:4:149,208:0.56:-0.64:1.000:0.960 0/0/1/1:4:312,312:0.48: 2.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:263,110:0.28:-0.47:0.999:0.996 0/1/1/1:4:99,440:0.80: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,233:0.74:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:317,117:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,209:0.57:-0.67:1.000:0.942 0/0/1/1:4:186,189:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,194:0.53:-0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:157,200:0.54:-0.64:1.000:0.987 0/0/1/1:4:211,223:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,301:0.72:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,250:0.54: 0.32:1.000:0.987 0/0/1/1:4:232,245:0.49: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:259,89:0.24:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,114:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:245,111:0.30:-0.65:1.000:0.988 0/0/0/1:4:231,90:0.26:-1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,172:0.56:-1.27:1.000:0.970 0/0/1/1:4:127,133:0.49:-1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,183:0.52:-0.84:1.000:0.994 0/1/1/1:4:105,304:0.72:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,67:0.26:-1.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,249:0.52: 0.48:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,411:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:407,185:0.30: 1.87:1.000:0.988 0/0/1/1:4:243,222:0.46: 0.51:1.000:0.987 0/0/1/1:4:144,211:0.58:-0.66:1.000:0.930 0/0/0/1:4:198,55:0.20:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,177:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/0:4:358,1:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,174:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:198,236:0.53: 0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:167,83:0.32:-1.78:1.000:0.963 0/0/0/1:4:436,149:0.24: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:444,160:0.25: 1.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,375:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,218:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:508,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,211:0.52:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:385,161:0.28: 1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:260,218:0.44: 0.65:1.000:0.964 0/0/1/1:4:106,106:0.48:-2.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:130,146:0.51:-1.50:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,531:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,237:0.52: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:564,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,287:0.50: 1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:111,324:0.73: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:246,271:0.51: 1.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:303,87:0.21:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,292:0.72:-0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:106,331:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:234,274:0.52: 0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:221,238:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:106,338:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,279:0.71:-0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:218,246:0.51: 0.50:0.999:0.996 0/0/0/1:4:332,124:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:190,209:0.51:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:277,107:0.26:-0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:168,178:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,220:0.48: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:194,192:0.48:-0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:189,192:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:227,79:0.24:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,276:0.48: 1.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:243,278:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:377,103:0.20: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,234:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:353,113:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:158,463:0.73: 2.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:453,161:0.25: 2.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:183,194:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:279,257:0.46: 1.27:1.000:0.988 -chr7.1 12496212 chr7.1_012496212 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:134,146:.: 1.16:1.000:. ./.:4:45,129:.:-0.87:1.000:. ./.:4:40,146:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,281:.: 1.18:1.000:. ./.:4:129,153:.: 1.20:1.000:. ./.:4:1,259:.: 0.78:1.000:. ./.:4:55,64:.:-1.92:1.000:. ./.:4:38,183:.: 0.03:1.000:. ./.:4:46,174:.: 0.01:1.000:. ./.:4:72,61:.:-1.66:1.000:. ./.:4:43,126:.:-0.97:1.000:. ./.:4:123,58:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,169:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.72:1.000:. ./.:4:110,113:.: 0.07:1.000:. ./.:4:122,123:.: 0.49:1.000:. ./.:4:50,179:.: 0.18:0.803:. ./.:4:0,264:.: 0.86:1.000:. ./.:4:150,134:.: 1.24:1.000:. ./.:4:110,153:.: 0.84:1.000:. ./.:4:61,63:.:-1.83:1.000:. ./.:4:58,147:.:-0.28:1.000:. ./.:4:129,148:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,80:.:-2.31:1.000:. ./.:4:31,136:.:-1.00:1.000:. ./.:4:59,203:.: 0.82:1.000:. ./.:4:146,64:.:-0.18:1.000:. ./.:4:3,306:.: 1.72:1.000:. ./.:4:74,130:.:-0.30:1.000:. ./.:4:112,46:.:-1.18:1.000:. ./.:4:41,146:.:-0.62:1.000:. ./.:4:25,52:.:-2.73:1.000:. ./.:4:36,109:.:-1.43:1.000:. ./.:3:12,49:.:-3.04:1.000:. ./.:4:156,70:.: 0.13:1.000:. ./.:4:98,112:.:-0.18:1.000:. ./.:4:112,113:.: 0.11:1.000:. ./.:4:49,139:.:-0.60:1.000:. ./.:4:38,174:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,150:.:-0.45:1.000:. ./.:4:105,129:.: 0.28:1.000:. ./.:4:121,159:.: 1.16:1.000:. ./.:4:106,111:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,132:.: 0.30:1.000:. ./.:4:73,207:.: 1.16:1.000:. ./.:4:139,144:.: 1.22:0.997:. ./.:4:0,488:.: 5.15:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.31:1.000:. ./.:4:77,109:.:-0.64:1.000:. ./.:4:99,103:.:-0.33:1.000:. ./.:4:119,155:.: 1.05:1.000:. ./.:4:83,100:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.45:1.000:. ./.:4:118,110:.: 0.16:1.000:. ./.:4:96,108:.:-0.30:1.000:. ./.:4:98,104:.:-0.33:1.000:. ./.:4:71,106:.:-0.81:1.000:. ./.:4:57,154:.:-0.16:1.000:. ./.:6:77,106:.:-0.70:1.000:. ./.:4:104,130:.: 0.28:1.000:. ./.:4:56,146:.:-0.33:1.000:. ./.:4:38,171:.:-0.20:1.000:. ./.:4:87,102:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,163:.:-0.26:1.000:. ./.:4:45,166:.:-0.16:1.000:. ./.:4:71,79:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.26:1.000:. ./.:4:46,152:.:-0.41:0.974:. ./.:4:111,116:.: 0.15:1.000:. ./.:4:122,150:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.66:0.999:. ./.:4:53,177:.: 0.20:1.000:. ./.:4:173,64:.: 0.34:1.000:. ./.:4:99,128:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.06:1.000:. ./.:4:45,177:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,283:.: 1.22:1.000:. ./.:4:50,208:.: 0.74:1.000:. ./.:4:111,119:.: 0.20:1.000:. ./.:4:47,128:.:-0.85:0.997:. ./.:4:2,279:.: 1.18:1.000:. ./.:4:115,129:.: 0.47:1.000:. ./.:4:45,166:.:-0.16:1.000:. ./.:4:96,95:.:-0.54:1.000:. ./.:4:58,200:.: 0.74:1.000:. ./.:4:75,97:.:-0.91:1.000:. ./.:4:105,115:.: 0.01:1.000:. ./.:4:55,163:.:-0.03:1.000:. ./.:4:102,101:.:-0.31:1.000:. ./.:4:64,85:.:-1.35:1.000:. ./.:4:106,105:.:-0.16:1.000:. ./.:4:103,109:.:-0.14:1.000:. ./.:4:86,115:.:-0.35:1.000:. ./.:4:132,60:.:-0.53:1.000:. ./.:4:57,145:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.43:1.000:. ./.:4:99,111:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,212:.: 1.26:1.000:. ./.:4:113,115:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,135:.:-0.83:1.000:. ./.:4:105,115:.: 0.01:1.000:. ./.:4:51,117:.:-0.99:1.000:. ./.:4:69,232:.: 1.56:0.981:. ./.:4:42,121:.:-1.08:1.000:. ./.:4:31,146:.:-0.81:1.000:. ./.:4:94,97:.:-0.54:1.000:. ./.:4:58,186:.: 0.47:1.000:. ./.:4:80,278:.: 2.66:1.000:. ./.:4:67,209:.: 1.09:1.000:. ./.:4:58,184:.: 0.43:1.000:. ./.:4:118,143:.: 0.80:1.000:. ./.:4:138,60:.:-0.41:0.999:. ./.:4:56,225:.: 1.18:1.000:. ./.:4:28,155:.:-0.70:1.000:. ./.:4:122,136:.: 0.74:1.000:. ./.:4:50,156:.:-0.26:1.000:. ./.:4:86,89:.:-0.85:1.000:. ./.:4:59,172:.: 0.22:1.000:. ./.:4:49,171:.: 0.01:1.000:. ./.:4:130,112:.: 0.43:1.000:. ./.:4:52,179:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,162:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,202:.: 0.63:1.000:. ./.:4:119,129:.: 0.55:1.000:. ./.:4:220,71:.: 1.37:1.000:. ./.:4:112,109:.: 0.03:1.000:. ./.:4:77,37:.:-2.02:1.000:. ./.:4:71,78:.:-1.35:1.000:. ./.:4:74,92:.:-1.02:1.000:. ./.:4:34,137:.:-0.93:1.000:. ./.:4:34,160:.:-0.49:1.000:. ./.:4:63,88:.:-1.31:1.000:. ./.:4:117,144:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.76:1.000:. ./.:4:154,156:.: 1.74:1.000:. ./.:4:125,156:.: 1.18:1.000:. ./.:4:65,197:.: 0.82:1.000:. ./.:4:109,79:.:-0.60:1.000:. ./.:4:112,99:.:-0.16:1.000:. ./.:4:187,69:.: 0.70:1.000:. ./.:4:104,141:.: 0.49:1.000:. ./.:4:55,151:.:-0.26:1.000:. ./.:4:76,90:.:-1.02:1.000:. ./.:4:147,172:.: 1.91:1.000:. ./.:4:144,166:.: 1.74:1.000:. ./.:4:62,217:.: 1.14:1.000:. ./.:4:47,196:.: 0.45:1.000:. ./.:4:245,93:.: 2.27:1.000:. ./.:4:87,75:.:-1.10:1.000:. ./.:4:120,146:.: 0.89:1.000:. ./.:4:112,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,44:.:-2.56:1.000:. ./.:4:36,122:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,204:.: 0.64:1.000:. ./.:4:208,81:.: 1.33:1.000:. ./.:4:105,133:.: 0.36:1.000:. ./.:4:38,157:.:-0.47:1.000:. ./.:4:95,138:.: 0.26:1.000:. ./.:4:127,108:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,150:.:-0.45:1.000:. ./.:4:45,158:.:-0.31:1.000:. ./.:4:42,146:.:-0.60:1.000:. ./.:4:95,91:.:-0.64:1.000:. ./.:4:4,266:.: 0.97:1.000:. ./.:4:48,139:.:-0.62:1.000:. ./.:4:112,115:.: 0.15:0.999:. ./.:4:99,123:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,160:.:-0.22:1.000:. ./.:4:86,99:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,107:.:-0.81:1.000:. ./.:4:39,126:.:-1.04:1.000:. ./.:4:85,113:.:-0.41:1.000:. ./.:4:61,74:.:-1.62:1.000:. ./.:4:57,85:.:-1.48:1.000:. ./.:4:57,195:.: 0.63:1.000:. ./.:4:53,166:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,141:.: 0.45:1.000:. ./.:4:103,115:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,110:.: 0.20:1.000:. ./.:4:65,192:.: 0.72:1.000:. ./.:4:132,166:.: 1.51:1.000:. ./.:4:47,151:.:-0.41:1.000:. ./.:4:126,124:.: 0.59:1.000:. -chr7.1 12793856 chr7.1_012793856 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,88:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,118:.: 1.24:1.000:. ./.:4:29,46:.: 0.02:1.000:. ./.:4:44,69:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:26,18:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:44,72:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:62,44:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.24:0.803:. ./.:4:41,79:.: 1.29:1.000:. ./.:4:56,102:.: 2.37:1.000:. ./.:4:63,83:.: 2.03:1.000:. ./.:4:16,19:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.44:1.000:. ./.:4:54,38:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.35:1.000:. ./.:4:7,16:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:40,75:.: 1.15:1.000:. ./.:4:47,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.16:1.000:. ./.:4:49,79:.: 1.52:1.000:. ./.:4:45,29:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.85:1.000:. ./.:4:1,26:.:-1.34:1.000:. ./.:3:3,5:.:-1.88:1.000:. ./.:4:44,37:.: 0.19:1.000:. ./.:4:45,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,83:.: 1.75:1.000:. ./.:4:45,66:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.52:1.000:. ./.:4:37,29:.:-0.24:1.000:. ./.:4:39,41:.: 0.16:1.000:. ./.:4:37,29:.:-0.24:1.000:. ./.:4:53,36:.: 0.41:1.000:. ./.:4:43,52:.: 0.58:1.000:. ./.:4:51,94:.: 2.00:0.997:. ./.:4:0,21:.:-1.51:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.57:1.000:. ./.:4:35,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:51,46:.: 0.64:1.000:. ./.:4:50,31:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.38:1.000:. ./.:4:49,35:.: 0.27:1.000:. ./.:4:44,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:49,31:.: 0.16:1.000:. ./.:4:50,56:.: 0.90:1.000:. ./.:4:39,67:.: 0.90:1.000:. ./.:6:0,32:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:39,14:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.78:0.974:. ./.:4:0,104:.: 0.84:1.000:. ./.:4:47,55:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.92:0.999:. ./.:4:0,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:55,48:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.12:1.000:. ./.:4:49,58:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.73:0.997:. ./.:4:0,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,33:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.72:1.000:. ./.:4:38,25:.:-0.32:1.000:. ./.:4:54,73:.: 1.49:1.000:. ./.:4:37,35:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:47,49:.: 0.61:1.000:. ./.:4:38,66:.: 0.84:1.000:. ./.:4:55,35:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.37:1.000:. ./.:4:57,79:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.43:1.000:. ./.:4:50,49:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:43,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.12:0.981:. ./.:4:0,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:52,69:.: 1.32:1.000:. ./.:4:38,42:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.32:1.000:. ./.:4:55,103:.: 2.37:1.000:. ./.:4:42,29:.:-0.10:0.999:. ./.:4:0,69:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.54:1.000:. ./.:4:48,70:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:29,43:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:50,65:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.58:1.000:. ./.:4:63,78:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.39:1.000:. ./.:4:37,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:44,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:53,42:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.74:1.000:. ./.:4:35,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.44:1.000:. ./.:4:52,102:.: 2.26:1.000:. ./.:4:27,22:.:-0.72:1.000:. ./.:4:33,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:60,86:.: 2.03:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:28,16:.:-0.86:1.000:. ./.:4:44,53:.: 0.64:1.000:. ./.:4:57,25:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,35:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.83:1.000:. ./.:4:56,55:.: 1.04:1.000:. ./.:4:71,32:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.00:1.000:. ./.:4:41,41:.: 0.22:1.000:. ./.:4:35,59:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.83:1.000:. ./.:4:46,39:.: 0.30:1.000:. ./.:4:14,33:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,64:.: 1.32:1.000:. ./.:4:74,44:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.04:1.000:. ./.:4:43,79:.: 1.35:1.000:. ./.:4:54,88:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.23:1.000:. ./.:4:42,68:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.61:1.000:. ./.:4:36,61:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,134:.: 1.69:0.999:. ./.:4:36,66:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.17:1.000:. ./.:4:36,30:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:41,64:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:50,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:67,94:.: 2.46:1.000:. ./.:4:39,91:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.86:1.000:. ./.:4:38,60:.: 0.67:1.000:. ./.:4:60,40:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,90:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.75:1.000:. -chr7.1 13054392 chr7.1_013054392 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:119,52:.: 0.17:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:133,43:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,89:.:-0.23:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:159,48:.: 0.98:1.000:. ./.:4:64,90:.:-0.21:1.000:. ./.:4:136,43:.: 0.35:1.000:. ./.:4:115,49:.: 0.02:1.000:. ./.:4:29,12:.:-2.73:1.000:. ./.:4:32,10:.:-2.71:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:126,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:122,57:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,96:.: 0.35:1.000:. ./.:4:144,47:.: 0.62:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.11:0.803:. ./.:4:174,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:158,63:.: 1.29:1.000:. ./.:4:95,126:.: 1.29:1.000:. ./.:4:44,17:.:-2.29:1.000:. ./.:4:129,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:138,47:.: 0.49:1.000:. ./.:4:135,43:.: 0.33:1.000:. ./.:4:16,10:.:-3.07:1.000:. ./.:4:184,67:.: 1.96:1.000:. ./.:4:115,94:.: 1.02:1.000:. ./.:4:91,77:.: 0.11:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:142,42:.: 0.46:1.000:. ./.:4:197,76:.: 2.45:1.000:. ./.:4:149,43:.: 0.64:1.000:. ./.:4:15,1:.:-3.29:1.000:. ./.:4:31,8:.:-2.78:1.000:. ./.:3:18,0:.:-3.25:1.000:. ./.:4:136,44:.: 0.38:1.000:. ./.:4:116,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:106,96:.: 0.87:1.000:. ./.:4:168,60:.: 1.45:1.000:. ./.:4:171,58:.: 1.47:1.000:. ./.:4:106,42:.:-0.34:1.000:. ./.:4:84,93:.: 0.31:1.000:. ./.:4:94,104:.: 0.78:1.000:. ./.:4:89,83:.: 0.20:1.000:. ./.:4:130,55:.: 0.49:1.000:. ./.:4:64,88:.:-0.25:1.000:. ./.:4:139,44:.: 0.44:0.997:. ./.:4:32,17:.:-2.55:1.000:. ./.:4:129,44:.: 0.22:1.000:. ./.:4:122,40:.:-0.03:1.000:. ./.:4:43,75:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,108:.: 0.55:1.000:. ./.:4:81,88:.: 0.13:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:73,117:.: 0.60:1.000:. ./.:4:110,141:.: 1.96:1.000:. ./.:4:73,99:.: 0.20:1.000:. ./.:4:80,89:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,42:.: 0.17:1.000:. ./.:6:96,36:.:-0.70:1.000:. ./.:4:97,49:.:-0.39:1.000:. ./.:4:109,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:142,52:.: 0.69:1.000:. ./.:4:102,48:.:-0.30:1.000:. ./.:4:112,63:.: 0.26:1.000:. ./.:4:127,54:.: 0.40:1.000:. ./.:4:96,43:.:-0.54:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:123,50:.: 0.22:0.974:. ./.:4:111,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:158,58:.: 1.18:1.000:. ./.:4:111,47:.:-0.12:0.999:. ./.:4:215,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:113,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:146,45:.: 0.62:1.000:. ./.:4:93,50:.:-0.45:1.000:. ./.:4:99,47:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,46:.: 0.53:1.000:. ./.:4:91,113:.: 0.91:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.99:0.997:. ./.:4:156,64:.: 1.27:1.000:. ./.:4:98,115:.: 1.11:1.000:. ./.:4:111,36:.:-0.36:1.000:. ./.:4:148,68:.: 1.18:1.000:. ./.:4:80,105:.: 0.49:1.000:. ./.:4:104,29:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,40:.:-0.83:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:108,44:.:-0.25:1.000:. ./.:4:99,43:.:-0.47:1.000:. ./.:4:86,42:.:-0.79:1.000:. ./.:4:148,58:.: 0.96:1.000:. ./.:4:73,30:.:-1.35:1.000:. ./.:4:99,114:.: 1.11:1.000:. ./.:4:139,63:.: 0.87:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:126,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:121,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:78,37:.:-1.08:1.000:. ./.:4:116,46:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,49:.:-1.68:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.42:0.981:. ./.:4:112,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:128,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,82:.:-0.34:1.000:. ./.:4:115,53:.: 0.11:1.000:. ./.:4:129,47:.: 0.29:1.000:. ./.:4:122,53:.: 0.26:1.000:. ./.:4:115,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:189,52:.: 1.74:1.000:. ./.:4:94,39:.:-0.68:0.999:. ./.:4:230,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:89,90:.: 0.35:1.000:. ./.:4:89,40:.:-0.77:1.000:. ./.:4:99,42:.:-0.50:1.000:. ./.:4:113,58:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,74:.:-0.32:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.63:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:68,94:.:-0.03:1.000:. ./.:4:140,45:.: 0.49:1.000:. ./.:4:71,72:.:-0.45:1.000:. ./.:4:111,44:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,80:.:-0.27:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:69,32:.:-1.39:1.000:. ./.:4:109,43:.:-0.25:1.000:. ./.:4:152,55:.: 0.98:1.000:. ./.:4:42,63:.:-1.30:1.000:. ./.:4:80,40:.:-0.97:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:100,142:.: 1.76:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:86,30:.:-1.06:1.000:. ./.:4:49,75:.:-0.88:1.000:. ./.:4:84,41:.:-0.85:1.000:. ./.:4:90,85:.: 0.26:1.000:. ./.:4:82,31:.:-1.12:1.000:. ./.:4:96,45:.:-0.50:1.000:. ./.:4:76,29:.:-1.30:1.000:. ./.:4:108,129:.: 1.65:1.000:. ./.:4:91,113:.: 0.91:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:134,50:.: 0.46:1.000:. ./.:4:120,128:.: 1.90:1.000:. ./.:4:117,31:.:-0.34:1.000:. ./.:4:149,55:.: 0.91:1.000:. ./.:4:153,55:.: 1.00:1.000:. ./.:4:26,12:.:-2.80:1.000:. ./.:4:105,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:110,120:.: 1.49:1.000:. ./.:4:93,106:.: 0.80:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:158,42:.: 0.82:1.000:. ./.:4:82,92:.: 0.24:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:113,48:.:-0.05:1.000:. ./.:4:130,54:.: 0.46:1.000:. ./.:4:141,51:.: 0.64:1.000:. ./.:4:140,44:.: 0.46:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:80,73:.:-0.23:1.000:. ./.:4:113,55:.: 0.11:1.000:. ./.:4:114,39:.:-0.23:1.000:. ./.:4:117,31:.:-0.34:1.000:. ./.:4:95,47:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,44:.:-0.23:1.000:. ./.:4:111,41:.:-0.25:1.000:. ./.:4:66,82:.:-0.34:1.000:. ./.:4:120,117:.: 1.65:1.000:. ./.:4:88,102:.: 0.60:1.000:. ./.:4:137,48:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,32:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,102:.: 0.62:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:102,128:.: 1.49:1.000:. ./.:4:126,53:.: 0.35:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.14:1.000:. -chr7.1 13262048 chr7.1_013262048 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,291:.:-0.23:1.000:. ./.:4:153,123:.:-0.44:1.000:. ./.:4:88,227:.: 0.10:1.000:. ./.:4:97,272:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,403:.: 1.33:1.000:. ./.:4:111,277:.: 1.12:1.000:. ./.:4:59,198:.:-0.70:1.000:. ./.:4:107,247:.: 0.65:1.000:. ./.:4:96,221:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,60:.:-3.44:1.000:. ./.:4:62,84:.:-2.24:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.06:1.000:. ./.:4:96,229:.: 0.24:1.000:. ./.:4:95,257:.: 0.62:1.000:. ./.:4:88,260:.: 0.56:1.000:. ./.:4:96,235:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.47:0.803:. ./.:4:202,198:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,417:.: 1.52:1.000:. ./.:4:105,253:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,77:.:-2.64:1.000:. ./.:4:1,266:.:-0.56:1.000:. ./.:4:99,286:.: 1.08:1.000:. ./.:4:99,259:.: 0.70:1.000:. ./.:4:34,37:.:-3.28:1.000:. ./.:4:110,299:.: 1.41:1.000:. ./.:4:84,252:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.47:1.000:. ./.:4:104,299:.: 1.33:1.000:. ./.:4:114,234:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,275:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,60:.:-3.44:1.000:. ./.:4:3,98:.:-2.87:1.000:. ./.:3:0,15:.:-4.06:1.000:. ./.:4:0,333:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,271:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.47:1.000:. ./.:4:121,264:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,349:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,341:.: 0.47:1.000:. ./.:4:103,311:.: 1.48:1.000:. ./.:4:81,219:.:-0.10:1.000:. ./.:4:92,235:.: 0.27:1.000:. ./.:4:87,251:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,344:.: 0.51:0.997:. ./.:4:128,285:.: 1.47:1.000:. ./.:4:91,259:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,424:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,219:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,386:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,264:.:-0.60:1.000:. ./.:4:110,272:.: 1.04:1.000:. ./.:4:87,238:.: 0.24:1.000:. ./.:4:96,306:.: 1.31:1.000:. ./.:4:3,325:.: 0.29:1.000:. ./.:4:107,267:.: 0.92:1.000:. ./.:4:101,203:.:-0.05:1.000:. ./.:6:0,230:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,282:.:-0.35:1.000:. ./.:4:95,212:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.15:1.000:. ./.:4:75,186:.:-0.65:1.000:. ./.:4:74,225:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.08:0.974:. ./.:4:96,237:.: 0.35:1.000:. ./.:4:109,247:.: 0.67:1.000:. ./.:4:83,239:.: 0.20:0.999:. ./.:4:226,217:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,336:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,240:.: 0.17:1.000:. ./.:4:70,174:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,282:.:-0.35:1.000:. ./.:4:64,183:.:-0.84:1.000:. ./.:4:95,193:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,173:.:-1.16:0.997:. ./.:4:100,252:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.17:1.000:. ./.:4:82,216:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,275:.: 1.05:1.000:. ./.:4:89,223:.: 0.06:1.000:. ./.:4:71,206:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.49:1.000:. ./.:4:86,222:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,238:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.28:1.000:. ./.:4:88,236:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,268:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.77:1.000:. ./.:4:97,221:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,164:.:-1.05:1.000:. ./.:4:72,167:.:-0.95:1.000:. ./.:4:82,225:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,333:.: 0.35:1.000:. ./.:4:69,152:.:-1.20:1.000:. ./.:4:60,263:.: 0.22:0.981:. ./.:4:0,220:.:-1.21:1.000:. ./.:4:90,211:.:-0.09:1.000:. ./.:4:79,153:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.24:1.000:. ./.:4:125,319:.: 1.90:1.000:. ./.:4:92,222:.: 0.09:1.000:. ./.:4:80,215:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,433:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,270:.:-0.52:0.999:. ./.:4:81,274:.: 0.66:1.000:. ./.:4:74,177:.:-0.78:1.000:. ./.:4:96,239:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,195:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,196:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,205:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,305:.:-0.03:1.000:. ./.:4:69,205:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,210:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.33:1.000:. ./.:4:85,215:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,195:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,224:.:-1.16:1.000:. ./.:4:67,194:.:-0.65:1.000:. ./.:4:77,210:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,169:.:-1.92:1.000:. ./.:4:83,206:.:-0.26:1.000:. ./.:4:87,228:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,470:.: 2.26:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.10:1.000:. ./.:4:67,202:.:-0.53:1.000:. ./.:4:63,177:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,202:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.33:1.000:. ./.:4:82,208:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,214:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,455:.: 2.05:1.000:. ./.:4:0,415:.: 1.49:1.000:. ./.:4:88,239:.: 0.27:1.000:. ./.:4:89,247:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,373:.: 0.91:1.000:. ./.:4:79,225:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,369:.: 0.85:1.000:. ./.:4:99,225:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,276:.:-0.44:1.000:. ./.:4:102,259:.: 0.74:1.000:. ./.:4:115,242:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,395:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,395:.: 1.22:1.000:. ./.:4:81,189:.:-0.52:1.000:. ./.:4:84,261:.: 0.52:1.000:. ./.:4:97,209:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,211:.:-0.41:1.000:. ./.:4:88,222:.: 0.04:1.000:. ./.:4:74,226:.:-0.10:1.000:. ./.:4:103,264:.: 0.83:1.000:. ./.:4:88,245:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,279:.:-0.40:1.000:. ./.:4:84,201:.:-0.31:0.999:. ./.:4:89,233:.: 0.20:1.000:. ./.:4:86,209:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.80:1.000:. ./.:4:83,230:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,301:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,261:.:-0.65:1.000:. ./.:4:81,197:.:-0.41:1.000:. ./.:4:114,297:.: 1.44:1.000:. ./.:4:101,241:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,354:.: 0.65:1.000:. ./.:4:77,194:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,359:.: 0.72:1.000:. ./.:4:113,283:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,382:.: 1.04:1.000:. ./.:4:95,234:.: 0.30:1.000:. ./.:4:106,269:.: 0.94:1.000:. -chr7.1 13782897 chr7.1_013782897 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:288,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:286,2:.: 1.61:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:299,1:.: 1.81:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.21:0.803:. ./.:4:294,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:304,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.12:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:211,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:207,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.10:0.997:. ./.:4:208,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.50:1.000:. ./.:6:95,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.05:0.974:. ./.:4:197,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.54:0.999:. ./.:4:172,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.14:0.997:. ./.:4:154,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:186,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:188,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.46:0.981:. ./.:4:135,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:324,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.25:0.999:. ./.:4:196,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:320,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:278,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:202,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:186,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:312,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:323,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.23:1.000:. -chr7.1 13916559 chr7.1_013916559 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,125:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,53:.:-2.31:1.000:. ./.:4:0,55:.:-2.24:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.50:0.985:. ./.:4:39,117:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,174:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.88:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,42:.:-2.67:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,31:.:-3.03:1.000:. ./.:4:0,56:.:-2.21:1.000:. ./.:3:0,12:.:-3.66:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,171:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,158:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.49:0.997:. ./.:4:0,8:.:-3.79:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,62:.:-2.01:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.30:1.000:. ./.:4:2,153:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,164:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,177:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:6:0,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:2,168:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,112:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,89:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.20:0.974:. ./.:4:2,122:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.69:0.999:. ./.:4:0,147:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.20:0.997:. ./.:4:0,154:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,158:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,159:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,171:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,86:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,185:.: 2.04:0.981:. ./.:4:0,93:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.95:0.999:. ./.:4:0,170:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,57:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,163:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,160:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,89:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.92:1.000:. ./.:4:1,107:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,178:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,154:.: 1.02:1.000:. ./.:4:2,149:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,56:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,172:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,185:.: 2.04:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,67:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.26:0.999:. ./.:4:0,126:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,92:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,165:.: 1.38:1.000:. ./.:4:1,102:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.10:1.000:. -chr7.1 14190064 chr7.1_014190064 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:28,60:0.61: 0.02:1.000:0.719 0/0/1/1:4:21,51:0.62:-0.49:1.000:0.531 0/0/0/1:4:79,37:0.35: 0.93:1.000:0.832 0/0/1/1:4:65,45:0.42: 0.73:1.000:0.928 0/0/0/1:4:80,37:0.34: 0.96:1.000:0.849 0/0/1/1:4:42,86:0.60: 1.31:1.000:0.776 0/0/1/1:4:45,33:0.44:-0.30:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,44:0.37: 1.28:1.000:0.573 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-2.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,4:0.34:-2.40:1.000:0.895 0/0/0/1:4:87,15:0.19: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,62:0.56: 0.51:1.000:0.965 0/0/0/1:4:72,26:0.30: 0.34:1.000:0.986 0/1/1/1:4:30,84:0.64: 0.86:1.000:0.683 0/0/1/1:4:32,60:0.59: 0.15:0.985:0.862 0/0/1/1:4:69,45:0.41: 0.86:1.000:0.871 0/0/1/1:4:48,68:0.55: 0.93:1.000:0.978 0/0/1/1:4:70,55:0.45: 1.22:1.000:0.980 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-2.49:1.000:0.967 0/0/1/1:4:71,42:0.39: 0.83:1.000:0.704 0/0/1/1:4:29,39:0.54:-0.62:1.000:0.985 0/0/1/1:4:35,65:0.59: 0.41:1.000:0.870 0/0/1/1:4:4,7:0.58:-2.46:1.000:0.910 0/0/0/1:4:79,42:0.37: 1.09:1.000:0.566 0/0/1/1:4:43,71:0.57: 0.86:1.000:0.938 0/0/0/1:4:109,21:0.20: 1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,84:0.96:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,75:0.58: 0.96:1.000:0.897 0/0/0/1:4:73,31:0.33: 0.54:1.000:0.932 0/0/1/1:4:53,35:0.41: 0.02:1.000:0.885 0/0/1/1:4:4,8:0.60:-2.43:1.000:0.802 0/0/1/1:4:9,18:0.60:-1.95:1.000:0.802 0/1/1:3:8,13:0.57:-2.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:57,27:0.35:-0.11:1.000:0.814 0/0/1/1:4:39,62:0.57: 0.44:1.000:0.952 0/0/1/1:4:75,41:0.38: 0.93:1.000:0.507 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,40:0.35: 1.15:1.000:0.785 0/0/0/1:4:71,28:0.31: 0.38:1.000:0.967 0/0/0/1:4:60,31:0.36: 0.12:1.000:0.638 0/0/0/1:4:73,33:0.34: 0.60:1.000:0.877 0/0/1/1:4:42,23:0.38:-0.72:1.000:0.512 0/0/1/1:4:37,45:0.53:-0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,49:0.60:-0.46:1.000:0.779 0/0/1/1:4:44,66:0.56: 0.73:0.997:0.967 0/1/1/1:4:4,26:0.72:-1.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:25,41:0.57:-0.69:1.000:0.940 0/0/0/1:4:72,8:0.15:-0.24:1.000:0.982 0/0/0/1:4:59,25:0.33:-0.11:1.000:0.933 0/0/1/1:4:73,43:0.39: 0.93:1.000:0.695 0/0/1/1:4:49,35:0.43:-0.11:1.000:0.947 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,34:0.38: 0.25:1.000:0.559 0/0/0/1:4:72,23:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,32:0.35: 0.31:1.000:0.745 0/0/0/1:4:65,17:0.25:-0.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:61,22:0.30:-0.14:1.000:0.865 0/0/0/1:4:98,11:0.15: 0.70:1.000:0.984 0/0/0/1:4:73,18:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,40:0.37: 0.93:1.000:0.592 0/0/0/1:4:72,14:0.21:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.30: 0.70:1.000:0.986 0/0/0/1:4:55,25:0.34:-0.24:1.000:0.871 0/0/1/1:4:30,39:0.54:-0.59:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,23:0.34:-0.46:0.974:0.856 0/0/1/1:4:50,31:0.40:-0.20:1.000:0.797 0/0/1/1:4:25,47:0.59:-0.49:1.000:0.860 0/0/1/1:4:30,28:0.49:-0.95:0.999:0.996 0/0/1/1:4:29,33:0.52:-0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,47:0.42: 0.93:1.000:0.915 0/0/0/1:4:56,15:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,30:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,22:0.31:-0.24:1.000:0.978 0/0/1/1:4:34,35:0.51:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,31:0.39:-0.14:1.000:0.721 0/0/0/1:4:57,22:0.31:-0.27:1.000:0.973 0/0/1/1:4:28,33:0.53:-0.85:0.997:0.994 0/0/1/1:4:36,46:0.54:-0.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:52,26:0.36:-0.30:1.000:0.713 0/0/0/1:4:64,29:0.34: 0.18:1.000:0.874 0/0/1/1:4:26,38:0.56:-0.75:1.000:0.973 0/0/1/1:4:38,70:0.59: 0.67:1.000:0.876 0/0/1/1:4:18,28:0.57:-1.33:1.000:0.958 0/0/0/1:4:69,8:0.15:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,46:0.61:-0.66:1.000:0.688 0/0/0/1:4:94,11:0.15: 0.57:1.000:0.989 0/0/1/1:4:18,22:0.53:-1.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,40:0.53:-0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,51:0.57:-0.14:1.000:0.951 0/0/0/1:4:104,7:0.11: 0.76:1.000:0.526 0/0/0/1:4:97,21:0.22: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,26:0.33:-0.07:1.000:0.903 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,16:0.26:-0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,32:0.38: 0.09:1.000:0.532 0/0/1/1:4:40,63:0.57: 0.51:1.000:0.954 0/0/1/1:4:46,27:0.39:-0.46:1.000:0.687 0/0/1/1:4:30,38:0.54:-0.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:20,26:0.54:-1.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:23,54:0.62:-0.33:0.981:0.584 0/0/1/1:4:22,30:0.55:-1.14:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,32:0.40:-0.14:1.000:0.817 0/0/1/1:4:75,41:0.38: 0.93:1.000:0.507 0/0/1/1:4:74,45:0.40: 1.02:1.000:0.762 0/0/0/1:4:63,24:0.31:-0.01:1.000:0.977 0/0/1/1:4:25,29:0.52:-1.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:42,79:0.59: 1.09:1.000:0.860 0/0/0/1:4:69,28:0.32: 0.31:0.999:0.956 0/0/1/1:4:26,49:0.59:-0.40:1.000:0.858 0/0/1/1:4:20,12:0.39:-1.78:1.000:0.735 0/0/1/1:4:55,42:0.44: 0.31:1.000:0.974 0/0/1/1:4:31,20:0.41:-1.17:1.000:0.858 0/0/1/1:4:25,36:0.55:-0.85:1.000:0.975 0/0/0/1:4:64,19:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,39:0.60:-0.95:1.000:0.773 0/0/1/1:4:33,40:0.53:-0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,33:0.52:-0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,49:0.60:-0.46:1.000:0.779 0/0/0/1:4:83,45:0.37: 1.31:1.000:0.514 0/0/0/1:4:55,19:0.29:-0.43:1.000:0.991 0/0/0/1:4:61,29:0.35: 0.09:1.000:0.809 0/0/0/1:4:55,25:0.34:-0.24:1.000:0.871 0/0/0/0:4:70,4:0.10:-0.43:1.000:0.734 0/0/1/1:4:35,22:0.40:-0.98:1.000:0.820 0/0/1/1:4:21,43:0.60:-0.75:1.000:0.776 0/0/1/1:4:40,28:0.43:-0.62:1.000:0.935 1/1/1/1:4:0,97:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,19:0.37:-1.04:1.000:0.585 0/0/1/1:4:41,40:0.50:-0.20:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,55:0.38: 2.12:1.000:0.576 0/0/0/1:4:77,32:0.32: 0.70:1.000:0.945 0/0/1/1:4:39,25:0.41:-0.75:1.000:0.849 0/0/0/1:4:57,19:0.29:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,42:0.59:-0.75:1.000:0.847 0/0/0/1:4:77,13:0.19: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,36:0.52:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:76,39:0.36: 0.89:1.000:0.654 0/0/0/0:4:61,3:0.10:-0.75:1.000:0.877 0/0/1/1:4:74,60:0.46: 1.51:1.000:0.986 0/0/1/1:4:87,51:0.39: 1.64:1.000:0.684 0/0/1/1:4:38,82:0.61: 1.05:1.000:0.709 0/0/0/1:4:79,35:0.33: 0.86:1.000:0.898 0/0/0/1:4:117,33:0.26: 2.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,47:0.59:-0.49:1.000:0.860 0/0/0/1:4:151,29:0.20: 2.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,76:0.62: 0.70:1.000:0.614 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,24:0.45:-1.04:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,60:0.58: 0.22:1.000:0.905 0/0/0/1:4:134,29:0.22: 2.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,45:0.35: 1.73:1.000:0.830 0/0/1/1:4:27,39:0.55:-0.69:1.000:0.975 0/0/1/1:4:31,46:0.56:-0.33:1.000:0.970 0/0/1/1:4:72,40:0.38: 0.80:1.000:0.550 0/0/1/1:4:24,48:0.60:-0.49:1.000:0.802 1/1/1/1:4:1,76:0.96:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,38:0.35: 1.02:1.000:0.829 0/0/0/1:4:64,32:0.36: 0.28:1.000:0.713 0/0/1/1:4:40,83:0.60: 1.15:1.000:0.760 0/0/1/1:4:29,55:0.59:-0.11:1.000:0.853 0/0/1/1:4:72,49:0.42: 1.09:0.999:0.914 0/0/0/1:4:87,41:0.35: 1.31:1.000:0.822 0/0/1/1:4:63,43:0.42: 0.60:1.000:0.917 0/0/0/1:4:102,13:0.16: 0.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,49:0.61:-0.49:1.000:0.726 0/0/0/1:4:72,32:0.34: 0.54:1.000:0.895 0/0/1/1:4:26,46:0.58:-0.49:1.000:0.903 0/0/1/1:4:24,34:0.55:-0.95:1.000:0.978 0/0/0/1:4:48,26:0.37:-0.43:1.000:0.517 0/0/1/1:4:39,89:0.62: 1.31:1.000:0.628 0/0/1/1:4:41,61:0.56: 0.47:1.000:0.969 0/0/0/1:4:107,19:0.19: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,65:0.58: 0.47:1.000:0.907 0/0/1/1:4:86,51:0.39: 1.60:1.000:0.710 0/0/1/1:4:49,87:0.58: 1.57:1.000:0.901 0/0/1/1:4:100,74:0.44: 2.80:1.000:0.963 0/0/0/1:4:76,38:0.36: 0.86:1.000:0.713 0/0/0/1:4:78,38:0.35: 0.93:1.000:0.766 -chr7.1 14589787 chr7.1_014589787 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:281,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:383,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:290,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.02:0.985:. ./.:4:81,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:320,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:221,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:401,1:.: 2.78:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.44:1.000:. ./.:3:74,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:211,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:301,1:.: 1.35:0.997:. ./.:4:72,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:221,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.62:1.000:. ./.:6:195,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:255,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.10:0.974:. ./.:4:148,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.64:0.999:. ./.:4:78,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.12:0.997:. ./.:4:104,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:290,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.84:0.981:. ./.:4:169,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:256,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:188,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:179,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:372,1:.: 2.36:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:409,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:378,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:360,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:239,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.64:1.000:. -chr7.1 14925493 chr7.1_014925493 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:180,32:.: 0.05:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:156,21:.:-0.58:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:207,37:.: 0.62:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:184,41:.: 0.28:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:41,1:.:-3.00:1.000:. ./.:4:28,2:.:-3.22:1.000:. ./.:4:181,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:234,37:.: 1.11:0.985:. ./.:4:256,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:197,46:.: 0.61:1.000:. ./.:4:208,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:149,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:199,31:.: 0.37:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:177,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:219,41:.: 0.91:1.000:. ./.:4:220,51:.: 1.11:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:24,2:.:-3.29:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.68:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.67:1.000:. ./.:4:185,34:.: 0.18:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:177,32:.: 0.00:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:177,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:197,36:.: 0.43:0.997:. ./.:4:29,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:125,14:.:-1.26:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:221,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:217,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:231,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:214,27:.: 0.57:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.13:1.000:. ./.:6:187,12:.:-0.18:1.000:. ./.:4:202,27:.: 0.35:1.000:. ./.:4:146,28:.:-0.63:1.000:. ./.:4:206,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:205,24:.: 0.35:1.000:. ./.:4:168,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:170,23:.:-0.29:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:207,31:.: 0.52:0.974:. ./.:4:153,23:.:-0.60:1.000:. ./.:4:218,35:.: 0.79:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:276,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:158,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:145,21:.:-0.78:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:201,25:.: 0.30:1.000:. ./.:4:128,26:.:-0.99:0.997:. ./.:4:257,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:138,29:.:-0.76:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:117,21:.:-1.28:1.000:. ./.:4:142,20:.:-0.85:1.000:. ./.:4:148,24:.:-0.67:1.000:. ./.:4:170,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:176,25:.:-0.15:1.000:. ./.:4:159,26:.:-0.44:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:117,21:.:-1.28:1.000:. ./.:4:151,59:.: 0.01:1.000:. ./.:4:159,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:191,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:266,1:.: 1.04:1.000:. ./.:4:172,30:.:-0.13:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.70:0.981:. ./.:4:140,15:.:-0.97:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:152,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:241,41:.: 1.31:1.000:. ./.:4:174,23:.:-0.22:0.999:. ./.:4:213,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:175,27:.:-0.13:1.000:. ./.:4:148,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:128,21:.:-1.08:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:167,31:.:-0.20:1.000:. ./.:4:144,27:.:-0.69:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:181,31:.: 0.05:1.000:. ./.:4:118,29:.:-1.12:1.000:. ./.:4:169,13:.:-0.49:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:145,17:.:-0.85:1.000:. ./.:4:131,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,30:.:-0.24:1.000:. ./.:4:237,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:227,43:.: 1.09:1.000:. ./.:4:159,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:156,20:.:-0.60:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:116,28:.:-1.17:1.000:. ./.:4:175,27:.:-0.13:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:140,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:352,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:217,33:.: 0.73:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,26:.: 0.14:1.000:. ./.:4:148,26:.:-0.63:1.000:. ./.:4:257,38:.: 1.54:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:27,1:.:-3.25:1.000:. ./.:4:146,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:230,38:.: 1.06:1.000:. ./.:4:209,36:.: 0.64:1.000:. ./.:4:151,35:.:-0.42:1.000:. ./.:4:173,37:.: 0.01:1.000:. ./.:4:182,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:211,33:.: 0.62:1.000:. ./.:4:161,48:.: 0.00:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:218,43:.: 0.93:0.999:. ./.:4:158,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:168,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:141,23:.:-0.81:1.000:. ./.:4:143,35:.:-0.56:1.000:. ./.:4:158,37:.:-0.26:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:350,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:199,30:.: 0.35:1.000:. ./.:4:199,25:.: 0.27:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:241,26:.: 1.04:1.000:. ./.:4:175,40:.: 0.10:1.000:. ./.:4:157,46:.:-0.11:1.000:. -chr7.1 15153209 chr7.1_015153209 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:53,2:.: 2.40:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:27,5:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.83:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:17,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.28:1.000:. ./.:4:42,4:.: 1.69:1.000:. ./.:4:32,2:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.81:0.985:. ./.:4:0,6:.:-1.44:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.91:1.000:. ./.:4:19,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:4,5:.:-1.20:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.91:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.51:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:16,9:.: 0.05:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:17,5:.:-0.18:1.000:. ./.:4:46,3:.: 1.93:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.59:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:23,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:26,3:.: 0.36:1.000:. ./.:4:24,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,3:.: 1.07:0.997:. ./.:4:0,2:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.67:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,4:.: 0.44:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,5:.: 0.91:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,3:.: 0.05:1.000:. ./.:6:10,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:12,5:.:-0.58:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.28:0.974:. ./.:4:25,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.75:0.999:. ./.:4:9,11:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:23,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:11,6:.:-0.58:0.997:. ./.:4:0,3:.:-1.67:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.68:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:37,2:.: 1.14:1.000:. ./.:4:31,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:15,4:.:-0.42:1.000:. ./.:4:11,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:41,6:.: 1.77:0.981:. ./.:4:16,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:26,5:.: 0.52:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:12,6:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:50,3:.: 2.24:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.93:0.999:. ./.:4:23,5:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:28,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.28:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:45,2:.: 1.77:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:36,3:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.83:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:9,4:.:-0.89:1.000:. ./.:4:34,4:.: 1.07:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:22,3:.: 0.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:42,3:.: 1.61:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:10,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:17,5:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,0:.: 3.80:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:37,2:.: 1.14:1.000:. ./.:4:29,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:25,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.44:0.999:. ./.:4:25,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:28,4:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:25,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:23,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.11:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,2:.: 1.30:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,4:.: 1.14:1.000:. ./.:4:47,6:.: 2.24:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.20:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.68:1.000:. -chr7.1 15360798 chr7.1_015360798 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:85,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:172,0:.: 3.16:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:131,1:.: 1.90:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.13:0.985:. ./.:4:151,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:156,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.12:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.13:0.997:. ./.:4:66,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:27,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:0.974:. ./.:4:54,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:74,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:78,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.66:0.997:. ./.:4:66,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.28:0.981:. ./.:4:30,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.42:0.999:. ./.:4:79,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:103,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.04:0.999:. ./.:4:105,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:149,1:.: 2.47:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.22:1.000:. -chr7.1 15649225 chr7.1_015649225 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.26:0.985:. ./.:4:39,8:.: 1.77:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.74:1.000:. ./.:3:4,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.57:0.997:. ./.:4:44,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:6:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:0.974:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:0.999:. ./.:4:34,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:0.997:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:0.981:. ./.:4:7,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:32,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.63:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.09:1.000:. -chr7.1 16012873 chr7.1_016012873 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:39,22:0.35: 0.97:1.000:0.792 0/0/0/1:4:40,13:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,7:0.16:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,43:0.63: 0.63:1.000:0.517 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,4:0.21:-1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.47:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-2.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-2.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,35:0.58: 0.29:1.000:0.900 0/0/0/1:4:36,14:0.28: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:33,13:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,23:0.35: 1.10:1.000:0.754 0/0/1/1:4:30,37:0.51: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,43:0.51: 2.19:0.985:0.996 0/0/0/1:4:46,11:0.19: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,16:0.31: 0.29:1.000:0.976 0/0/0/1:4:55,19:0.26: 1.85:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,27:0.54:-0.19:1.000:0.985 0/0/0/1:4:32,10:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,12:0.28:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,23:0.39: 0.70:1.000:0.669 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,33:0.56: 0.29:1.000:0.963 0/0/0/1:4:44,12:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,29:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,39:0.62: 0.36:1.000:0.607 0/0/1/1:4:29,20:0.39: 0.15:1.000:0.715 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-2.97:1.000:0.937 0/0/0/0:4:12,1:0.08:-2.29:1.000:0.992 0/1/1:3:0,4:0.75:-2.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,25:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,32:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,7:0.14: 0.29:1.000:0.962 0/0/0/1:4:49,17:0.26: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,28:0.43: 1.03:1.000:0.948 0/0/1/1:4:23,29:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,12:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,12:0.18: 1.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,15:0.35:-0.39:1.000:0.747 0/0/0/1:4:20,9:0.31:-1.21:1.000:0.980 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,9:0.17: 0.36:0.997:0.999 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,34:0.43: 1.92:1.000:0.952 0/0/0/1:4:32,11:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,12:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,9:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,16:0.24: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,13:0.29:-0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:42,15:0.26: 0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:53,18:0.26: 1.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,6:0.14:-0.19:1.000:0.958 0/0/0/1:4:34,11:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:22,18:0.43:-0.46:1.000:0.596 0/0/1/1:4:27,19:0.40:-0.05:1.000:0.759 0/0/0/1:4:24,15:0.37:-0.53:1.000:0.546 0/0/0/1:4:32,10:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,32:0.55: 0.29:1.000:0.978 0/0/0/1:4:59,16:0.22: 1.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,36:0.51: 1.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,8:0.38:-1.82:1.000:0.632 0/0/0/1:4:36,13:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,13:0.25: 0.36:0.974:0.999 0/0/1/1:4:23,18:0.42:-0.39:1.000:0.912 0/0/0/1:4:40,17:0.29: 0.70:1.000:0.989 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-2.36:0.999:1.000 0/0/0/1:4:49,10:0.17: 0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,31:0.43: 1.44:1.000:0.957 0/0/1/1:4:21,17:0.43:-0.60:1.000:0.938 0/0/0/1:4:29,5:0.15:-0.87:1.000:0.986 0/0/0/1:4:30,6:0.17:-0.73:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,14:0.37:-0.66:1.000:0.618 0/0/0/1:4:43,16:0.27: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,17:0.28: 0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,16:0.38:-0.39:0.997:0.520 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,14:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,16:0.35:-0.19:1.000:0.767 0/0/0/1:4:32,8:0.20:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,18:0.46:-0.66:1.000:0.988 0/0/1/1:4:14,16:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,15:0.32:-0.05:1.000:0.955 0/0/1/1:4:22,26:0.51: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,9:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,29:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,13:0.20: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,16:0.45:-0.87:1.000:0.977 0/0/1/1:4:31,35:0.50: 1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,8:0.20:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.24:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,21:0.51:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,12:0.20: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,14:0.18: 2.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,3:0.22:-2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.25:-1.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,19:0.37: 0.22:0.981:0.600 0/0/1/1:4:24,17:0.40:-0.39:1.000:0.772 0/0/0/1:4:45,9:0.17: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,5:0.12:-0.39:1.000:0.821 0/0/0/1:4:39,14:0.26: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,12:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,12:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,22:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,34:0.44: 1.78:1.000:0.972 0/0/1/1:4:9,28:0.62:-0.66:0.999:0.561 0/0/0/1:4:45,18:0.28: 1.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:27,7:0.21:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,21:0.35: 0.76:1.000:0.781 0/0/1/1:4:14,11:0.42:-1.48:1.000:0.915 0/0/0/1:4:22,9:0.29:-1.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:33,18:0.34: 0.29:1.000:0.847 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,28:0.54: 0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:23,30:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,34:0.55: 0.56:1.000:0.983 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,22:0.46:-0.12:1.000:0.990 0/0/0/1:4:35,18:0.33: 0.42:1.000:0.915 0/1/1/1:4:10,33:0.63:-0.26:1.000:0.514 0/0/1/1:4:10,30:0.62:-0.46:1.000:0.607 0/0/0/1:4:32,5:0.14:-0.66:1.000:0.952 0/0/1/1:4:26,21:0.43: 0.02:1.000:0.936 0/0/0/1:4:28,15:0.34:-0.26:1.000:0.872 0/0/0/1:4:26,7:0.21:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,12:0.28:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,11:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,10:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,44:0.56: 1.51:1.000:0.971 0/0/1/1:4:28,20:0.40: 0.08:1.000:0.788 0/0/0/1:4:27,12:0.30:-0.53:1.000:0.982 0/0/1/1:4:24,18:0.41:-0.32:1.000:0.865 0/0/1/1:4:18,26:0.53:-0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:23,9:0.28:-1.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,12:0.28:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,12:0.37:-1.07:1.000:0.517 0/0/0/1:4:38,19:0.33: 0.70:1.000:0.937 0/0/0/1:4:31,12:0.28:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,33:0.53: 0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,29:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,33:0.52: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,29:0.43: 1.24:1.000:0.935 0/0/1/1:4:33,35:0.49: 1.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,12:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,9:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,7:0.16:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,24:0.40: 0.70:1.000:0.820 0/0/1/1:4:17,37:0.58: 0.49:1.000:0.903 0/0/1/1:4:27,18:0.38:-0.12:1.000:0.632 0/0/0/1:4:31,10:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,11:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,27:0.46: 0.63:1.000:0.986 0/0/0/1:4:28,7:0.20:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,12:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,33:0.53: 0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:40,7:0.15: 0.02:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,25:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,21:0.44:-0.12:0.999:0.973 0/0/0/1:4:24,13:0.34:-0.66:1.000:0.857 0/0/0/1:4:37,12:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,18:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,5:0.12:-0.26:1.000:0.699 0/0/0/1:4:28,13:0.31:-0.39:1.000:0.971 0/0/0/1:4:35,6:0.15:-0.39:1.000:0.985 0/0/0/1:4:25,14:0.35:-0.53:1.000:0.805 0/0/0/1:4:52,16:0.24: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,32:0.53: 0.49:1.000:0.991 0/0/0/1:4:37,16:0.30: 0.42:1.000:0.987 0/0/0/1:4:43,18:0.29: 0.97:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,42:0.50: 2.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,8:0.22:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,16:0.34:-0.05:1.000:0.877 0/0/1/1:4:28,30:0.49: 0.76:1.000:0.996 -chr7.1 16246573 chr7.1_016246573 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:93,63:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:42,76:0.70:-0.76:1.000:0.983 0/1/1/1:4:54,74:0.63:-0.53:1.000:0.607 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,74:0.52: 0.25:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,80:0.79:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,104:0.69: 0.32:1.000:0.971 0/0/1/1:4:70,57:0.51:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,32:0.73:-2.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,34:0.83:-2.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,48:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,54:0.42:-0.06:1.000:0.924 0/1/1/1:4:44,98:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,73:0.54: 0.03:1.000:0.989 0/0/0/1:4:98,24:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,107:0.72: 0.25:0.985:0.995 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,101:0.71: 0.11:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,13:0.33:-2.43:1.000:0.902 0/1/1/1:4:36,101:0.78:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,90:0.51: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,81:0.78:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,17:0.60:-2.81:1.000:0.752 0/1/1/1:4:86,124:0.65: 1.40:1.000:0.749 0/1/1/1:4:30,80:0.78:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,55:0.52:-0.76:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,115:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,65:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:176,42:0.25: 1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,58:0.52:-0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,5:0.68:-3.35:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-2.43:1.000:1.000 0/0/1:3:9,2:0.24:-3.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,54:0.46:-0.39:1.000:0.988 0/0/0/1:4:134,35:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,101:0.70: 0.13:1.000:0.986 0/0/1/1:4:129,78:0.43: 1.33:1.000:0.957 0/0/1/1:4:84,76:0.53: 0.22:1.000:0.991 0/1/1/1:4:46,108:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,86:0.55: 0.58:1.000:0.981 0/0/1/1:4:151,73:0.38: 1.73:1.000:0.614 0/0/1/1:4:101,62:0.44: 0.29:1.000:0.964 0/0/1/1:4:130,100:0.49: 1.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,124:0.69: 1.02:1.000:0.978 0/1/1/1:4:46,104:0.75:-0.01:0.997:0.999 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,139:0.75: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,75:0.46: 0.86:1.000:0.987 0/0/1/1:4:134,90:0.46: 1.73:1.000:0.987 0/0/1/1:4:116,76:0.45: 0.97:1.000:0.983 0/1/1/1:4:52,130:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,50:0.44:-0.43:1.000:0.961 0/0/1/1:4:120,97:0.50: 1.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,74:0.45: 0.88:1.000:0.981 0/1/1/1:4:63,120:0.71: 0.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:120,69:0.42: 0.90:1.000:0.924 0/0/1/1/1/1:6:38,82:0.74:-0.72:1.000:0.620 0/1/1/1:4:49,123:0.76: 0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,107:0.75: 0.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,111:0.79:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,32:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,114:0.79: 0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 0.76:0.974:1.000 0/1/1/1:4:24,65:0.78:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,119:0.64: 1.26:1.000:0.671 1/1/1/1:4:0,145:1.00:-0.13:0.999:1.000 0/1/1/1:4:63,135:0.74: 1.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,71:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,118:0.75: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,108:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,116:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,107:0.80:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,129:0.77: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,122:0.69: 1.00:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,104:1.00:-1.09:0.997:1.000 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,86:0.43: 1.91:1.000:0.942 0/1/1/1:4:28,80:0.79:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,91:0.48: 1.59:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,132:0.67: 1.49:1.000:0.926 0/0/1/1:4:88,41:0.38:-0.51:1.000:0.509 0/1/1/1:4:42,82:0.71:-0.62:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,106:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,105:0.69: 0.36:1.000:0.968 0/0/1/1:4:107,70:0.45: 0.62:1.000:0.983 0/0/1/1:4:127,111:0.52: 2.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,65:0.73:-1.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:75,140:0.71: 1.52:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,105:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,59:0.48:-0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,115:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,63:0.45: 0.22:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,74:0.44: 1.00:1.000:0.969 0/1/1/1:4:58,87:0.65:-0.13:1.000:0.833 0/0/1/1/1/1:6:111,124:0.58: 1.99:0.981:0.511 0/1/1/1:4:50,92:0.70:-0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:111,80:0.48: 0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,60:0.43: 0.29:1.000:0.935 0/1/1/1:4:27,96:0.82:-0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,124:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,115:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,107:0.74: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,80:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,33:0.24: 0.79:0.999:1.000 0/1/1/1:4:65,165:0.77: 1.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,100:0.73:-0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,135:0.73: 1.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,120:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,109:0.64: 0.81:1.000:0.736 0/1/1/1:4:45,105:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,110:0.72: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,64:0.43: 0.53:1.000:0.940 0/1/1/1:4:39,107:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,122:0.70: 0.90:1.000:0.985 0/1/1/1:4:43,70:0.67:-0.88:1.000:0.936 0/1/1/1:4:64,125:0.72: 0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:115,59:0.40: 0.55:1.000:0.761 0/0/1/1:4:87,87:0.56: 0.55:1.000:0.972 0/0/1/1:4:82,72:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,60:0.52:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,57:0.41: 0.22:1.000:0.886 0/1/1/1:4:49,107:0.74: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,57:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,57:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,68:0.47: 0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,70:0.70:-1.00:1.000:0.987 0/1/1/1:4:56,136:0.76: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,76:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,76:0.77:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,67:0.47: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,67:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,86:0.47: 1.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:126,78:0.44: 1.26:1.000:0.967 0/1/1/1:4:40,84:0.73:-0.62:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,85:0.73:-0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,71:0.42: 1.09:1.000:0.906 0/0/0/1:4:136,62:0.37: 1.12:1.000:0.554 0/1/1/1:4:40,79:0.72:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,67:0.53:-0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,81:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,65:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,91:0.78:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,62:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,18:0.68:-2.85:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,134:0.76: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,114:0.73: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:85,65:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,73:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,66:0.77:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,110:0.73: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,81:0.70:-0.60:1.000:0.987 0/0/1/1:4:74,54:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,60:0.45: 0.03:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,89:0.55: 0.74:1.000:0.983 0/1/1/1:4:37,90:0.76:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,54:0.48:-0.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,65:0.73:-1.28:0.999:0.998 0/1/1/1:4:52,88:0.68:-0.25:1.000:0.960 0/1/1/1:4:30,65:0.74:-1.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,62:0.73:-1.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,52:0.49:-0.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,88:0.70:-0.32:1.000:0.982 0/1/1/1:4:59,97:0.68: 0.13:1.000:0.943 0/0/1/1:4:79,45:0.42:-0.62:1.000:0.916 0/1/1/1:4:56,100:0.70: 0.13:1.000:0.980 0/1/1/1:4:73,112:0.66: 0.81:1.000:0.870 0/1/1/1:4:39,126:0.80: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,61:0.77:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,53:0.44:-0.27:1.000:0.965 0/0/1/1:4:88,83:0.54: 0.48:1.000:0.986 0/1/1/1:4:53,89:0.68:-0.20:1.000:0.956 1/1/1/1:4:1,123:0.99:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,69:0.70:-1.05:1.000:0.989 -chr7.1 16393650 chr7.1_016393650 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:0.985:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,11:.: 2.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:4,6:.: 1.91:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,7:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:0.997:. ./.:4:2,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,6:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:2,5:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,5:.: 0.39:1.000:. ./.:6:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:3,6:.: 1.53:1.000:. ./.:4:1,8:.: 1.53:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:0.974:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,15:.: 3.82:1.000:. ./.:4:3,6:.: 1.53:0.999:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:0.997:. ./.:4:3,4:.: 0.77:1.000:. ./.:4:2,5:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:2,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:6:2,11:.: 3.06:0.981:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,8:.: 1.53:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,10:.: 2.30:0.999:. ./.:4:0,8:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,2:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,12:.: 3.06:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,11:.: 2.30:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,9:.: 3.82:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:2,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,7:.: 1.91:1.000:. ./.:4:3,5:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:2,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.53:1.000:. ./.:4:4,8:.: 2.68:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.77:1.000:. ./.:4:2,6:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.52:1.000:. ./.:4:1,7:.: 1.15:1.000:. ./.:4:2,3:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:0.999:. ./.:4:3,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:3,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.37:1.000:. -chr7.1 16638667 chr7.1_016638667 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:56,50:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,29:0.47:-1.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:96,15:0.18: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,18:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,47:0.62:-0.63:1.000:0.602 0/0/0/1:4:87,28:0.29: 0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:34,7:0.22:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,23:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,21:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,17:0.39:-1.78:1.000:0.658 0/0/0/1:4:38,13:0.30:-1.74:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,30:0.34: 0.47:1.000:0.883 0/0/0/1:4:56,19:0.30:-0.72:1.000:0.986 0/0/0/1:4:88,14:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,23:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,37:0.49:-0.38:0.985:0.997 0/0/0/1:4:66,25:0.32:-0.04:1.000:0.951 0/0/1/1:4:62,49:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,17:0.20: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,14:0.38:-2.12:1.000:0.574 0/0/1/1:4:38,43:0.56:-0.46:1.000:0.969 0/0/0/1:4:86,19:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,17:0.20: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.46:-3.40:1.000:0.990 0/0/0/1:4:83,17:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,16:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,27:0.43:-0.89:1.000:0.941 0/0/1/1:4:54,30:0.40:-0.34:1.000:0.826 0/0/0/1:4:83,19:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,40:0.45: 0.35:1.000:0.978 0/0/1/1:4:42,39:0.52:-0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,15:0.55:-2.68:1.000:0.981 0/0/1/1:4:22,25:0.56:-1.91:1.000:0.968 0/1/1:3:4,15:0.75:-3.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,28:0.44:-0.85:1.000:0.961 0/0/0/1:4:91,17:0.21: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,37:0.43: 0.26:1.000:0.932 0/0/0/1:4:105,26:0.24: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,49:0.56: 0.00:1.000:0.967 0/0/1/1:4:60,52:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,53:0.55: 0.39:1.000:0.975 0/0/0/1:4:103,20:0.21: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,29:0.31: 0.86:1.000:0.980 0/0/0/1:4:94,22:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,30:0.28: 1.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,57:0.51: 1.24:0.997:0.996 0/0/1/1:4:34,17:0.38:-1.74:1.000:0.574 0/0/0/1:4:61,28:0.36:-0.12:1.000:0.672 0/0/1/1:4:32,38:0.57:-0.93:1.000:0.953 0/0/1/1:4:56,46:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,49:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,49:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,24:0.27: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,13:0.18: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,19:0.25: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,48:0.52: 0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:111,39:0.31: 2.47:1.000:0.979 0/0/0/1:4:93,31:0.30: 1.37:1.000:0.988 0/0/0/1/1/1:6:45,41:0.52:-0.25:1.000:0.870 0/0/1/1:4:58,41:0.46: 0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,48:0.54: 0.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:70,62:0.51: 1.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,48:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,22:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,48:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,15:0.39:-2.04:1.000:0.669 0/0/0/1:4:63,23:0.31:-0.25:1.000:0.967 0/0/1/1:4:48,35:0.47:-0.38:0.974:0.992 0/1/1/1:4:21,46:0.67:-1.06:1.000:0.935 0/0/0/1:4:83,26:0.28: 0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:45,7:0.18:-1.70:0.999:0.999 0/0/1/1:4:68,52:0.48: 1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,41:0.48: 0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,69:0.68: 0.30:1.000:0.957 0/0/0/1:4:78,22:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,37:0.47:-0.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:96,29:0.28: 1.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,22:0.26: 0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,39:0.45: 0.26:1.000:0.975 0/1/1/1:4:21,64:0.72:-0.29:0.997:0.996 0/0/0/1:4:88,24:0.26: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,45:0.45: 0.81:1.000:0.983 0/0/0/1:4:64,20:0.28:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,18:0.25:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,33:0.33: 1.07:1.000:0.927 0/0/0/1:4:68,13:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,39:0.51:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,21:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,38:0.48:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,37:0.52:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,44:0.45: 0.73:1.000:0.981 0/0/0/1:4:94,23:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.58:-2.25:1.000:0.900 0/0/1/1:4:57,33:0.41:-0.08:1.000:0.887 0/0/0/1:4:85,18:0.22: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,17:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,49:0.66:-0.80:1.000:0.884 0/0/0/1:4:76,11:0.18:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,41:0.49: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,20:0.48:-1.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,45:0.51: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,18:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:63,53:0.50: 1.03:0.981:0.888 0/0/1/1:4:40,56:0.60: 0.18:1.000:0.812 0/0/0/1:4:83,25:0.28: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,33:0.31: 1.45:1.000:0.976 0/0/1/1:4:56,54:0.53: 0.77:1.000:0.993 0/0/0/1:4:102,17:0.19: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,16:0.20: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,18:0.29:-0.80:1.000:0.990 0/0/1/1:4:66,50:0.48: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,34:0.42:-0.04:0.999:0.918 0/0/0/1:4:99,25:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,9:0.25:-2.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,20:0.22: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,15:0.30:-1.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:40,51:0.58:-0.04:1.000:0.912 0/0/0/1:4:86,19:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,27:0.27: 1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,49:0.53: 0.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:62,22:0.31:-0.34:1.000:0.976 0/0/0/1:4:100,35:0.31: 1.84:1.000:0.980 0/0/1/1:4:47,46:0.53: 0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:67,17:0.25:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,37:0.46:-0.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:65,50:0.48: 0.98:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,19:0.41:-1.66:1.000:0.836 0/0/1/1:4:40,40:0.54:-0.51:1.000:0.990 0/0/0/1:4:88,16:0.20: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,17:0.21: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,24:0.45:-1.36:1.000:0.978 0/0/0/1:4:52,11:0.22:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,20:0.29:-0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:54,36:0.45:-0.08:1.000:0.978 0/0/1/1:4:33,54:0.63:-0.21:1.000:0.502 0/0/0/1:4:69,18:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,16:0.19: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,42:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,25:0.32:-0.04:1.000:0.951 0/0/0/1:4:86,26:0.28: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,38:0.48:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,23:0.43:-1.36:1.000:0.949 0/0/1/1:4:84,61:0.47: 2.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:65,46:0.46: 0.81:1.000:0.989 0/0/0/1:4:74,16:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,13:0.21:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,31:0.41:-0.29:1.000:0.876 0/0/0/1:4:84,14:0.19: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,39:0.46: 0.09:1.000:0.989 0/0/0/1:4:92,17:0.20: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,7:0.22:-2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,36:0.54:-0.85:1.000:0.990 0/0/0/1:4:88,27:0.28: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,30:0.32: 0.81:1.000:0.962 0/0/0/1:4:74,35:0.37: 0.73:1.000:0.590 0/0/1/1:4:44,27:0.43:-0.89:1.000:0.941 0/0/0/1:4:61,18:0.27:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,18:0.28:-0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:84,18:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,21:0.33:-0.72:1.000:0.935 0/0/0/1:4:84,14:0.19: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,18:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,29:0.47:-1.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:73,13:0.20:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,43:0.59:-0.72:1.000:0.864 0/1/1/1:4:24,60:0.69:-0.34:0.999:0.979 0/0/0/1:4:84,13:0.18: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,15:0.25:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,26:0.42:-0.93:1.000:0.909 0/0/0/1:4:60,14:0.24:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.53:-0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,36:0.48:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,32:0.47:-0.68:1.000:0.992 0/0/0/1:4:72,12:0.19:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,28:0.25: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,25:0.23: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,42:0.52:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,24:0.31:-0.08:1.000:0.969 0/0/1/1:4:58,41:0.46: 0.30:1.000:0.989 0/0/0/1:4:86,18:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,34:0.38: 0.39:1.000:0.616 0/0/0/1:4:47,10:0.22:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,71:0.68: 0.43:1.000:0.956 -chr7.1 16949461 chr7.1_016949461 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,105:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.90:1.000:. ./.:4:64,106:.: 1.99:1.000:. ./.:4:93,78:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.21:1.000:. ./.:4:13,9:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,132:.: 1.03:1.000:. ./.:4:86,59:.: 1.36:0.985:. ./.:4:0,91:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,101:.: 1.94:1.000:. ./.:4:83,47:.: 0.98:1.000:. ./.:4:14,13:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.39:1.000:. ./.:4:91,98:.: 2.47:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.54:1.000:. ./.:4:14,11:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:79,81:.: 1.74:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.78:1.000:. ./.:4:24,9:.:-1.48:1.000:. ./.:3:10,13:.:-1.73:1.000:. ./.:4:89,80:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,43:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.72:1.000:. ./.:4:59,85:.: 1.33:0.997:. ./.:4:196,73:.: 4.50:1.000:. ./.:4:58,34:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.95:1.000:. ./.:4:69,74:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,52:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.14:1.000:. ./.:6:46,20:.:-0.64:1.000:. ./.:4:46,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:58,41:.: 0.19:1.000:. ./.:4:79,34:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,32:.:-0.19:1.000:. ./.:4:71,49:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,50:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.02:1.000:. ./.:4:73,57:.: 0.98:1.000:. ./.:4:63,42:.: 0.34:0.974:. ./.:4:0,80:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,58:.: 0.55:1.000:. ./.:4:69,21:.:-0.04:0.999:. ./.:4:0,102:.: 0.27:1.000:. ./.:4:77,79:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.95:1.000:. ./.:4:52,25:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.64:0.997:. ./.:4:61,45:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1,58:.:-0.82:1.000:. ./.:4:69,32:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:53,20:.:-0.47:1.000:. ./.:4:44,43:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,68:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.64:1.000:. ./.:4:63,67:.: 0.98:1.000:. ./.:4:39,32:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.95:1.000:. ./.:4:67,40:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,41:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,32:.:-0.39:1.000:. ./.:4:56,69:.: 0.85:1.000:. ./.:4:63,33:.: 0.12:1.000:. ./.:4:60,51:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.38:1.000:. ./.:6:35,80:.: 0.60:0.981:. ./.:4:39,34:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.02:1.000:. ./.:4:69,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:78,62:.: 1.23:1.000:. ./.:4:60,50:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,43:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.97:0.999:. ./.:4:100,61:.: 1.76:1.000:. ./.:4:87,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.15:1.000:. ./.:4:64,54:.: 0.67:1.000:. ./.:4:35,27:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,43:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.10:1.000:. ./.:4:53,52:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.62:1.000:. ./.:4:42,27:.:-0.57:1.000:. ./.:4:40,45:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,52:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.51:1.000:. ./.:4:55,34:.:-0.06:1.000:. ./.:4:59,50:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,67:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.62:1.000:. ./.:4:46,41:.:-0.11:1.000:. ./.:4:74,61:.: 1.11:1.000:. ./.:4:34,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.60:1.000:. ./.:4:67,82:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.16:1.000:. ./.:4:70,75:.: 1.36:1.000:. ./.:4:95,71:.: 1.89:1.000:. ./.:4:22,12:.:-1.45:1.000:. ./.:4:64,62:.: 0.88:1.000:. ./.:4:82,69:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.09:1.000:. ./.:4:73,79:.: 1.54:1.000:. ./.:4:63,93:.: 1.64:1.000:. ./.:4:71,75:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:51,65:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.09:1.000:. ./.:4:64,64:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,90:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,81:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.52:0.999:. ./.:4:0,86:.:-0.14:1.000:. ./.:4:71,66:.: 1.16:1.000:. ./.:4:49,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,68:.: 0.90:1.000:. ./.:4:67,54:.: 0.75:1.000:. ./.:4:50,53:.: 0.29:1.000:. ./.:4:49,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,61:.: 1.64:1.000:. ./.:4:70,80:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.24:1.000:. ./.:4:96,127:.: 3.34:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.83:1.000:. ./.:4:52,49:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.40:1.000:. -chr7.1 17143305 chr7.1_017143305 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:142,17:0.23: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,13:0.32:-0.35:1.000:0.952 0/0/0/1:4:79,16:0.28: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:73,7:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,27:0.37: 0.55:1.000:0.542 0/0/0/1:4:88,7:0.20: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,2:0.18:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,9:0.20: 0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,13:0.41:-0.76:1.000:0.837 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,11:0.29:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:109,3:0.16: 0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:67,11:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,7:0.25:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,5:0.18: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,8:0.22: 0.00:0.985:1.000 0/0/0/1:4:80,12:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,15:0.20: 2.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,14:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,11:0.26: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,15:0.28: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,5:0.17: 0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,4:0.44:-1.46:1.000:0.970 0/0/0/1:4:75,6:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,5:0.17: 1.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,12:0.28:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:93,15:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,11:0.28:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,10:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,2:0.16:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,9:0.59:-1.40:1.000:0.879 0/0/1/1:4:18,18:0.55:-0.94:1.000:0.984 0/0/0:3:5,0:0.14:-1.62:1.000:0.772 0/0/0/1:4:81,14:0.26: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:70,14:0.28: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,9:0.18: 1.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,7:0.17: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,11:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,18:0.37:-0.21:1.000:0.526 0/0/0/1:4:118,6:0.18: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,10:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,15:0.28: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,17:0.33: 0.03:1.000:0.934 0/0/0/1:4:153,13:0.20: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,14:0.23: 1.21:0.997:1.000 0/0/0/1:4:139,13:0.21: 1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,20:0.40:-0.24:1.000:0.828 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,9:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,9:0.18: 2.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,10:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,18:0.33: 0.11:1.000:0.928 0/0/0/1:4:117,11:0.21: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,15:0.33:-0.17:1.000:0.938 0/0/0/1:4:106,11:0.22: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,12:0.28:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:127,9:0.19: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:12,14:0.56:-1.16:1.000:0.668 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,15:0.31:-0.04:1.000:0.974 0/0/1/1:4:64,25:0.39: 0.22:1.000:0.713 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,17:0.36:-0.19:1.000:0.738 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,13:0.31:-0.26:1.000:0.975 0/0/0/1:4:57,17:0.34:-0.10:0.974:0.849 0/0/0/1:4:57,18:0.35:-0.08:1.000:0.766 0/0/1/1:4:67,27:0.40: 0.33:1.000:0.773 0/0/0/1:4:42,11:0.32:-0.57:0.999:0.949 0/0/0/1:4:70,12:0.26: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,27:0.39: 0.42:1.000:0.655 0/0/0/1:4:69,20:0.34: 0.22:1.000:0.880 0/0/0/1:4:53,15:0.33:-0.24:1.000:0.902 0/0/1/1:4:60,22:0.38: 0.07:1.000:0.568 0/0/1/1:4:69,26:0.39: 0.36:1.000:0.633 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,15:0.21: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,13:0.25: 0.42:0.997:0.999 0/0/0/1:4:74,22:0.34: 0.38:1.000:0.853 0/0/0/1:4:141,7:0.18: 1.52:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,8:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,11:0.20: 1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,24:0.47:-0.26:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,15:0.73:-1.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:84,18:0.29: 0.51:1.000:0.991 0/0/0/1:4:121,16:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,24:0.35: 0.46:1.000:0.766 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,39:0.50: 0.46:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,20:0.37:-0.06:1.000:0.503 0/0/1/1:4:58,22:0.39: 0.03:1.000:0.649 0/1/1/1:4:1,28:0.74:-1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,11:0.20: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,15:0.46:-0.78:1.000:0.986 0/0/0/1:4:123,9:0.19: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,16:0.28: 0.40:1.000:0.995 0/0/0/1/1/1:6:56,40:0.51: 0.38:0.981:0.884 0/0/1/1:4:54,23:0.41:-0.04:1.000:0.858 0/0/0/1:4:125,7:0.18: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:50,14:0.33:-0.32:1.000:0.910 0/0/0/1:4:63,8:0.23:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,13:0.19: 2.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,31:0.50:-0.02:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,21:0.41:-0.21:1.000:0.889 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,18:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,29:0.74:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,12:0.22: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,18:0.23: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,24:0.42:-0.04:1.000:0.920 0/0/0/1:4:137,12:0.20: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,12:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,19:0.27: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,27:0.43: 0.11:1.000:0.949 0/0/0/1:4:108,11:0.22: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,20:0.43:-0.35:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,8:0.20: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,7:0.19: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,4:0.19:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,12:0.33:-0.50:1.000:0.928 0/0/0/1:4:58,4:0.19:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,6:0.17: 1.85:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,15:0.35:-0.32:1.000:0.815 0/0/0/1:4:96,24:0.31: 0.90:1.000:0.966 0/0/1/1:4:49,25:0.45:-0.10:1.000:0.976 0/0/1/1:4:59,29:0.44: 0.20:1.000:0.965 0/0/0/1:4:44,10:0.30:-0.54:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,26:0.36: 0.62:1.000:0.737 0/0/0/1:4:139,9:0.19: 1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,20:0.31: 0.51:1.000:0.972 0/0/0/1:4:65,16:0.31: 0.05:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,7:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.55:-1.24:1.000:0.984 0/0/0/1:4:37,8:0.29:-0.74:1.000:0.990 0/0/0/1:4:75,7:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,9:0.19: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,18:0.31: 0.31:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,15:0.29: 0.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,8:0.24:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,8:0.19: 1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,9:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,12:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:63,4:0.19:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,17:0.39:-0.39:0.999:0.690 0/0/0/1:4:66,12:0.27:-0.02:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,1:0.14: 0.33:1.000:0.979 0/0/0/1:4:58,16:0.33:-0.10:1.000:0.921 0/0/0/1:4:110,6:0.18: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,10:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,5:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,3:0.15: 1.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:176,8:0.17: 2.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,6:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,6:0.18: 0.75:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,10:0.18: 2.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,20:0.37:-0.04:1.000:0.541 -chr7.1 17252409 chr7.1_017252409 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:200,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:79,74:.:-0.29:1.000:. ./.:4:139,33:.: 0.20:1.000:. ./.:4:146,32:.: 0.36:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:150,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:75,21:.:-1.77:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:147,43:.: 0.67:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:56,13:.:-2.47:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:130,53:.: 0.49:1.000:. ./.:4:144,51:.: 0.80:1.000:. ./.:4:134,41:.: 0.28:1.000:. ./.:4:148,43:.: 0.69:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.25:0.985:. ./.:4:144,49:.: 0.75:1.000:. ./.:4:245,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:144,50:.: 0.77:1.000:. ./.:4:47,13:.:-2.70:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:135,44:.: 0.38:1.000:. ./.:4:118,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,7:.:-3.24:1.000:. ./.:4:170,44:.: 1.29:1.000:. ./.:4:135,49:.: 0.51:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:133,35:.: 0.10:1.000:. ./.:4:140,43:.: 0.49:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:26,0:.:-3.58:1.000:. ./.:4:78,0:.:-2.23:1.000:. ./.:3:30,0:.:-3.48:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:139,41:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:150,43:.: 0.75:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:135,45:.: 0.41:1.000:. ./.:4:141,41:.: 0.46:1.000:. ./.:4:124,35:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,50:.: 0.57:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.42:0.997:. ./.:4:27,11:.:-3.27:1.000:. ./.:4:141,42:.: 0.49:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:142,42:.: 0.51:1.000:. ./.:4:132,30:.:-0.06:1.000:. ./.:4:135,46:.: 0.44:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:133,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,35:.:-0.06:1.000:. ./.:6:132,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:128,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:66,29:.:-1.79:1.000:. ./.:4:127,33:.:-0.11:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.18:0.974:. ./.:4:123,30:.:-0.29:1.000:. ./.:4:152,49:.: 0.95:1.000:. ./.:4:86,30:.:-1.25:0.999:. ./.:4:98,105:.: 1.01:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:117,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:105,29:.:-0.78:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:146,34:.: 0.41:1.000:. ./.:4:148,42:.: 0.67:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:107,24:.:-0.86:0.997:. ./.:4:127,45:.: 0.20:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:136,44:.: 0.41:1.000:. ./.:4:124,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:131,39:.: 0.15:1.000:. ./.:4:99,30:.:-0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:113,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:138,45:.: 0.49:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:105,48:.:-0.29:1.000:. ./.:4:98,45:.:-0.55:1.000:. ./.:4:113,36:.:-0.39:1.000:. ./.:4:124,48:.: 0.20:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:98,29:.:-0.96:1.000:. ./.:6:148,31:.: 0.38:0.981:. ./.:4:147,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:152,36:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:157,40:.: 0.85:1.000:. ./.:4:171,48:.: 1.42:1.000:. ./.:4:102,39:.:-0.60:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:175,50:.: 1.58:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.55:1.000:. ./.:4:134,40:.: 0.25:1.000:. ./.:4:100,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:111,35:.:-0.47:1.000:. ./.:4:107,42:.:-0.39:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:136,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:135,45:.: 0.41:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:125,38:.:-0.03:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:126,34:.:-0.11:1.000:. ./.:4:135,36:.: 0.18:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:155,39:.: 0.77:1.000:. ./.:4:110,30:.:-0.63:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:93,32:.:-1.02:1.000:. ./.:4:93,34:.:-0.96:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:114,35:.:-0.39:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:215,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:204,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:132,52:.: 0.51:1.000:. ./.:4:143,45:.: 0.62:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:124,48:.: 0.20:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:146,43:.: 0.64:1.000:. ./.:4:41,13:.:-2.86:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:159,44:.: 1.01:1.000:. ./.:4:101,29:.:-0.89:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:113,30:.:-0.55:1.000:. ./.:4:127,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:135,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:120,35:.:-0.24:1.000:. ./.:4:134,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:125,41:.: 0.05:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:139,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:138,46:.: 0.51:0.999:. ./.:4:120,32:.:-0.32:1.000:. ./.:4:119,44:.:-0.03:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:85,40:.:-1.02:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:107,33:.:-0.63:1.000:. ./.:4:168,55:.: 1.52:1.000:. ./.:4:129,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:131,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:198,53:.: 2.25:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:119,40:.:-0.13:1.000:. ./.:4:133,48:.: 0.44:1.000:. -chr7.1 17458141 chr7.1_017458141 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:250,69:.:-0.17:1.000:. ./.:4:130,80:.:-1.81:1.000:. ./.:4:190,161:.: 0.31:1.000:. ./.:4:284,65:.: 0.28:1.000:. ./.:4:342,72:.: 1.25:1.000:. ./.:4:313,92:.: 1.11:1.000:. ./.:4:120,79:.:-1.97:1.000:. ./.:4:286,65:.: 0.31:1.000:. ./.:4:251,43:.:-0.55:1.000:. ./.:4:122,24:.:-2.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:278,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:282,71:.: 0.34:1.000:. ./.:4:281,58:.: 0.13:1.000:. ./.:4:278,64:.: 0.17:1.000:. ./.:4:280,68:.: 0.26:1.000:. ./.:4:315,82:.: 0.99:0.985:. ./.:4:297,78:.: 0.66:1.000:. ./.:4:338,90:.: 1.46:1.000:. ./.:4:225,142:.: 0.55:1.000:. ./.:4:159,17:.:-2.31:1.000:. ./.:4:277,76:.: 0.34:1.000:. ./.:4:300,67:.: 0.55:1.000:. ./.:4:252,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:125,11:.:-2.91:1.000:. ./.:4:211,150:.: 0.46:1.000:. ./.:4:302,71:.: 0.64:1.000:. ./.:4:291,57:.: 0.26:1.000:. ./.:4:335,87:.: 1.37:1.000:. ./.:4:205,132:.: 0.10:1.000:. ./.:4:278,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:93,14:.:-3.35:1.000:. ./.:4:172,21:.:-2.06:1.000:. ./.:3:123,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:307,66:.: 0.64:1.000:. ./.:4:274,63:.: 0.10:1.000:. ./.:4:304,74:.: 0.71:1.000:. ./.:4:323,70:.: 0.93:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:297,43:.: 0.14:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:331,53:.: 0.80:1.000:. ./.:4:262,49:.:-0.29:1.000:. ./.:4:256,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:264,46:.:-0.31:1.000:. ./.:4:327,66:.: 0.93:0.997:. ./.:4:345,79:.: 1.40:1.000:. ./.:4:240,61:.:-0.44:1.000:. ./.:4:308,62:.: 0.59:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:339,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:327,61:.: 0.86:1.000:. ./.:4:255,59:.:-0.25:1.000:. ./.:4:307,62:.: 0.58:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:246,167:.: 1.23:1.000:. ./.:4:273,68:.: 0.16:1.000:. ./.:6:303,42:.: 0.22:1.000:. ./.:4:300,73:.: 0.64:1.000:. ./.:4:259,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:312,59:.: 0.61:1.000:. ./.:4:261,58:.:-0.17:1.000:. ./.:4:236,152:.: 0.86:1.000:. ./.:4:283,49:.: 0.02:1.000:. ./.:4:210,45:.:-1.13:1.000:. ./.:4:241,53:.:-0.55:1.000:. ./.:4:313,53:.: 0.53:0.974:. ./.:4:168,104:.:-0.88:1.000:. ./.:4:206,140:.: 0.23:1.000:. ./.:4:271,48:.:-0.17:0.999:. ./.:4:231,154:.: 0.81:1.000:. ./.:4:271,71:.: 0.17:1.000:. ./.:4:189,109:.:-0.49:1.000:. ./.:4:284,60:.: 0.20:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:300,54:.: 0.35:1.000:. ./.:4:307,63:.: 0.59:1.000:. ./.:4:303,77:.: 0.74:1.000:. ./.:4:149,88:.:-1.40:0.997:. ./.:4:312,68:.: 0.74:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:155,94:.:-1.22:1.000:. ./.:4:294,55:.: 0.28:1.000:. ./.:4:270,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:125,89:.:-1.75:1.000:. ./.:4:258,51:.:-0.32:1.000:. ./.:4:183,120:.:-0.41:1.000:. ./.:4:241,68:.:-0.32:1.000:. ./.:4:274,65:.: 0.13:1.000:. ./.:4:266,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:292,85:.: 0.69:1.000:. ./.:4:221,46:.:-0.95:1.000:. ./.:4:195,119:.:-0.25:1.000:. ./.:4:201,111:.:-0.28:1.000:. ./.:4:213,56:.:-0.92:1.000:. ./.:4:268,53:.:-0.14:1.000:. ./.:4:309,68:.: 0.69:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:288,77:.: 0.52:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:180,44:.:-1.60:1.000:. ./.:6:444,76:.: 2.84:0.981:. ./.:4:234,46:.:-0.76:1.000:. ./.:4:220,52:.:-0.88:1.000:. ./.:4:263,54:.:-0.20:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:343,83:.: 1.43:1.000:. ./.:4:248,48:.:-0.52:1.000:. ./.:4:170,105:.:-0.83:1.000:. ./.:4:343,74:.: 1.29:1.000:. ./.:4:259,56:.:-0.23:0.999:. ./.:4:288,138:.: 1.43:1.000:. ./.:4:221,49:.:-0.91:1.000:. ./.:4:227,131:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,101:.:-0.91:1.000:. ./.:4:282,59:.: 0.16:1.000:. ./.:4:243,61:.:-0.40:1.000:. ./.:4:195,50:.:-1.28:1.000:. ./.:4:270,76:.: 0.23:1.000:. ./.:4:259,59:.:-0.19:1.000:. ./.:4:315,76:.: 0.90:1.000:. ./.:4:341,83:.: 1.40:1.000:. ./.:4:275,48:.:-0.11:1.000:. ./.:4:296,66:.: 0.47:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:278,63:.: 0.16:1.000:. ./.:4:200,50:.:-1.21:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:190,110:.:-0.46:1.000:. ./.:4:260,62:.:-0.13:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:259,61:.:-0.16:1.000:. ./.:4:248,53:.:-0.44:1.000:. ./.:4:445,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:317,76:.: 0.93:1.000:. ./.:4:153,90:.:-1.31:1.000:. ./.:4:219,75:.:-0.55:1.000:. ./.:4:253,59:.:-0.28:1.000:. ./.:4:285,66:.: 0.31:1.000:. ./.:4:296,55:.: 0.31:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:202,38:.:-1.36:1.000:. ./.:4:337,77:.: 1.25:1.000:. ./.:4:466,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:170,141:.:-0.29:1.000:. ./.:4:249,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:287,61:.: 0.26:1.000:. ./.:4:184,116:.:-0.46:1.000:. ./.:4:324,76:.: 1.04:1.000:. ./.:4:285,62:.: 0.25:1.000:. ./.:4:110,41:.:-2.69:1.000:. ./.:4:206,47:.:-1.16:1.000:. ./.:4:337,77:.: 1.25:1.000:. ./.:4:270,70:.: 0.14:1.000:. ./.:4:329,78:.: 1.14:1.000:. ./.:4:293,76:.: 0.58:1.000:. ./.:4:135,116:.:-1.19:1.000:. ./.:4:189,137:.:-0.07:1.000:. ./.:4:208,108:.:-0.22:1.000:. ./.:4:226,68:.:-0.55:1.000:. ./.:4:270,71:.: 0.16:1.000:. ./.:4:191,136:.:-0.05:1.000:. ./.:4:288,76:.: 0.50:1.000:. ./.:4:257,53:.:-0.31:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:159,105:.:-1.00:0.999:. ./.:4:204,128:.: 0.02:1.000:. ./.:4:260,56:.:-0.22:1.000:. ./.:4:249,68:.:-0.20:1.000:. ./.:4:221,44:.:-0.98:1.000:. ./.:4:303,77:.: 0.74:1.000:. ./.:4:242,46:.:-0.64:1.000:. ./.:4:241,46:.:-0.65:1.000:. ./.:4:212,39:.:-1.19:1.000:. ./.:4:348,82:.: 1.49:1.000:. ./.:4:322,82:.: 1.10:1.000:. ./.:4:275,71:.: 0.23:1.000:. ./.:4:175,128:.:-0.41:1.000:. ./.:4:372,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:334,82:.: 1.28:1.000:. ./.:4:406,99:.: 2.61:1.000:. ./.:4:181,103:.:-0.70:1.000:. ./.:4:167,134:.:-0.44:1.000:. -chr7.1 17705748 chr7.1_017705748 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:150,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:26,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.33:0.985:. ./.:4:127,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:150,1:.: 1.04:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.55:1.000:. ./.:3:13,0:.:-3.42:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.55:0.997:. ./.:4:35,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.20:1.000:. ./.:6:105,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:0.974:. ./.:4:123,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.61:0.999:. ./.:4:120,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:0.997:. ./.:4:110,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.71:1.000:. ./.:6:206,0:.: 2.81:0.981:. ./.:4:119,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:185,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:185,0:.: 2.13:0.999:. ./.:4:151,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:116,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.00:0.999:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:168,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.03:1.000:. -chr7.1 18047678 chr7.1_018047678 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:166,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:168,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:135,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.50:0.985:. ./.:4:153,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:166,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:230,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.84:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.84:0.997:. ./.:4:36,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.06:1.000:. ./.:6:139,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.62:0.974:. ./.:4:145,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.42:0.999:. ./.:4:150,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:158,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.05:0.997:. ./.:4:166,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:168,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:159,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:198,0:.: 1.30:0.981:. ./.:4:108,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:252,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.88:0.999:. ./.:4:207,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:45,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.25:0.999:. ./.:4:170,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.67:1.000:. -chr7.1 18323333 chr7.1_018323333 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,129:1.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.19:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,53:0.69:-0.46:1.000:0.968 0/0/0/1:4:40,19:0.33:-1.15:1.000:0.917 0/1/1/1:4:29,95:0.77: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,32:0.43:-0.57:1.000:0.949 0/1/1/1:4:16,33:0.67:-1.53:1.000:0.926 0/1/1/1:4:22,45:0.67:-0.84:1.000:0.918 0/0/0/1:4:57,27:0.33:-0.19:1.000:0.920 0/1/1/1:4:9,25:0.74:-2.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,22:0.79:-2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,42:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,75:0.72: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,26:0.35:-0.46:1.000:0.834 0/0/1/1:4:46,30:0.40:-0.49:1.000:0.761 0/0/1/1:4:39,41:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:27,82:0.75: 0.77:0.985:0.999 0/1/1/1:4:25,50:0.66:-0.53:1.000:0.894 0/1/1/1:4:33,118:0.78: 2.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,22:0.33:-0.80:1.000:0.911 0/0/0/1:4:43,13:0.25:-1.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,74:0.99:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,23:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,38:0.64:-1.15:1.000:0.697 0/0/1/1:4:19,23:0.54:-1.80:1.000:0.987 0/1/1/1:4:29,55:0.65:-0.19:1.000:0.808 0/1/1/1:4:20,34:0.63:-1.34:1.000:0.506 0/1/1/1:4:24,45:0.65:-0.76:1.000:0.784 0/0/1/1:4:62,72:0.53: 1.73:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,58:0.78:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,93:0.80: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,28:0.62:-1.68:1.000:0.595 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-3.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,22:0.73:-2.26:1.000:0.998 1/1/1:3:1,10:0.91:-2.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,47:0.46: 0.50:1.000:0.985 0/0/1/1:4:46,46:0.49: 0.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,82:0.99:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,81:0.80: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,47:0.61:-0.49:1.000:0.645 0/0/1/1:4:41,54:0.56: 0.24:1.000:0.964 0/0/1/1:4:38,63:0.62: 0.47:1.000:0.575 0/0/1/1:4:61,36:0.38: 0.31:1.000:0.508 0/1/1/1:4:28,61:0.68: 0.00:1.000:0.962 0/0/0/1:4:105,36:0.27: 2.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,45:0.61:-0.61:1.000:0.669 0/1/1/1:4:39,113:0.74: 2.42:0.986:0.999 0/0/0/0:4:13,1:0.08:-2.87:1.000:0.993 0/0/0/1:4:66,20:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,33:0.47:-0.72:1.000:0.991 0/1/1/1:4:36,63:0.63: 0.39:1.000:0.598 0/1/1/1:4:26,81:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,60:0.71:-0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,68:0.48: 1.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,51:0.63:-0.30:1.000:0.506 0/0/1/1:4:37,38:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,68:0.71: 0.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:33,60:0.64: 0.16:1.000:0.710 0/1/1/1:4:24,91:0.79: 1.00:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:58,42:0.42: 0.43:1.000:0.912 0/1/1/1:4:26,51:0.66:-0.46:1.000:0.867 0/1/1/1:4:31,62:0.66: 0.16:1.000:0.894 0/0/0/1:4:56,29:0.35:-0.15:1.000:0.808 0/0/0/1:4:68,36:0.35: 0.58:1.000:0.767 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,14:0.26:-1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,44:0.46: 0.24:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,60:0.73:-0.26:0.974:0.998 0/0/1/1:4:42,54:0.56: 0.27:1.000:0.973 0/0/1/1:4:69,56:0.44: 1.39:1.000:0.974 0/0/0/1:4:40,20:0.34:-1.11:0.999:0.862 0/0/0/1:4:104,24:0.20: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,63:0.57: 0.81:1.000:0.955 0/0/1/1:4:60,63:0.50: 1.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,61:0.68: 0.00:1.000:0.962 0/0/0/1:4:57,25:0.32:-0.26:1.000:0.964 0/0/1/1:4:31,49:0.61:-0.34:1.000:0.715 0/0/0/0:4:102,1:0.01: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,73:0.74: 0.39:0.997:0.999 0/0/0/1:4:69,34:0.34: 0.54:1.000:0.880 0/1/1/1:4:39,68:0.63: 0.70:1.000:0.587 0/1/1/1:4:24,58:0.71:-0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:69,25:0.28: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,56:0.58: 0.24:1.000:0.897 0/1/1/1:4:29,57:0.66:-0.11:1.000:0.870 0/0/0/1:4:49,24:0.34:-0.61:1.000:0.887 0/0/1/1:4:50,33:0.40:-0.23:1.000:0.785 0/0/0/1:4:48,26:0.36:-0.57:1.000:0.718 1/1/1/1:4:2,86:0.98:-0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,37:0.28: 1.85:1.000:0.994 0/0/0/1:4:43,17:0.30:-1.11:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,31:0.36:-0.07:1.000:0.666 0/0/1/1:4:56,58:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,28:0.27: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,23:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,67:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,58:0.45: 1.46:1.000:0.982 0/0/1/1:4:25,36:0.58:-1.07:1.000:0.893 0/0/0/0/1/1:6:110,67:0.38: 3.38:0.981:0.771 0/1/1/1:4:35,87:0.71: 1.27:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,84:0.69: 1.23:1.000:0.977 0/0/0/1:4:48,15:0.25:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,24:0.31:-0.30:1.000:0.977 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,48:0.46: 0.58:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,101:0.74: 1.85:0.999:0.999 0/0/1/1:4:77,58:0.43: 1.77:1.000:0.942 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,75:0.67: 0.89:1.000:0.909 0/1/1/1:4:16,60:0.79:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,80:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,50:0.58:-0.15:1.000:0.903 1/1/1/1:4:2,95:0.98: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,61:0.48: 1.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,71:0.77: 0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,65:0.98:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,71:0.67: 0.66:1.000:0.910 0/0/1/1:4:63,66:0.50: 1.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,56:0.63:-0.03:1.000:0.598 0/0/1/1:4:56,54:0.48: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,42:0.52:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,46:0.47: 0.31:1.000:0.992 0/1/1/1:4:26,54:0.67:-0.34:1.000:0.932 0/1/1/1:4:19,71:0.79: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,49:0.72:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,28:0.31: 0.24:1.000:0.979 0/0/1/1:4:43,48:0.52: 0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,60:0.63: 0.20:1.000:0.624 0/0/1/1:4:55,61:0.52: 1.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,70:0.70: 0.43:1.000:0.984 0/0/0/1:4:61,29:0.33: 0.04:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,118:1.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,69:0.58: 1.08:1.000:0.895 0/0/0/1:4:95,22:0.20: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,27:0.42:-0.95:1.000:0.919 0/0/0/1:4:46,25:0.36:-0.69:1.000:0.710 0/1/1/1:4:35,63:0.64: 0.35:1.000:0.682 0/1/1/1:4:38,76:0.66: 0.96:1.000:0.894 0/0/1/1:4:47,53:0.52: 0.43:1.000:0.994 0/0/0/1:4:53,26:0.34:-0.38:1.000:0.885 0/1/1/1:4:24,42:0.63:-0.88:1.000:0.598 0/1/1/1:4:30,67:0.69: 0.31:1.000:0.972 0/0/0/1:4:59,30:0.34: 0.00:1.000:0.838 0/0/0/1:4:79,24:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,9:0.31:-2.26:1.000:0.972 0/1/1/1:4:12,33:0.73:-1.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,60:0.46: 1.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:24,41:0.63:-0.92:1.000:0.522 0/1/1/1:4:24,73:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,53:0.48: 0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,46:0.48: 0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,46:0.55:-0.23:1.000:0.982 0/1/1/1:4:16,39:0.71:-1.30:1.000:0.991 0/0/0/1:4:82,18:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,64:0.72: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:50,26:0.35:-0.49:1.000:0.801 0/1/1/1:4:15,44:0.75:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,26:0.49:-1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,44:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,43:0.58:-0.57:0.999:0.931 0/1/1/1:4:16,47:0.75:-0.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,24:0.36:-0.80:1.000:0.702 0/0/1/1:4:36,37:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,61:0.77:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,64:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,84:0.79: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.36:-0.61:1.000:0.668 0/1/1/1:4:22,45:0.67:-0.84:1.000:0.918 0/1/1/1:4:34,70:0.67: 0.58:1.000:0.924 0/0/0/1:4:54,31:0.37:-0.15:1.000:0.570 0/0/1/1:4:42,47:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:33,54:0.62:-0.07:1.000:0.616 0/0/0/1:4:90,32:0.28: 1.27:1.000:0.996 1/1/1/1:4:5,99:0.95: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,20:0.34:-1.07:1.000:0.892 0/0/1/1:4:45,49:0.51: 0.20:1.000:0.996 -chr7.1 18574139 chr7.1_018574139 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,35:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,42:0.20: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,48:0.20: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,31:0.30:-0.78:1.000:0.980 0/0/0/1:4:88,63:0.32: 0.98:1.000:0.958 0/0/0/1:4:78,45:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,30:0.61:-1.63:1.000:0.656 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,62:0.33: 0.83:1.000:0.906 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.30:0.985:1.000 0/0/1/1:4:53,51:0.42:-0.13:1.000:0.928 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,53:0.22: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,54:0.33: 0.44:1.000:0.939 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,54:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,49:0.22: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,63:0.28: 1.21:1.000:0.995 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,60:0.51:-0.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,18:0.52:-1.84:1.000:0.995 0/0/0:3:21,0:0.00:-2.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,1:0.01: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,1:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,40:0.40:-0.59:1.000:0.817 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,49:0.42:-0.22:1.000:0.926 0/0/1/1:4:47,49:0.45:-0.31:1.000:0.982 0/0/0/1:4:83,51:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,62:0.23: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,50:0.30: 0.34:1.000:0.987 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,53:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.15:0.986:1.000 0/0/0/1:4:79,54:0.30: 0.55:1.000:0.983 0/0/0/1:4:74,49:0.29: 0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:69,45:0.29: 0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:77,50:0.28: 0.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:91,75:0.37: 1.33:1.000:0.588 0/0/0/1:4:87,46:0.23: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,50:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,46:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,50:0.33: 0.20:1.000:0.930 0/0/0/1:4:74,58:0.35: 0.53:1.000:0.790 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:71,33:0.21:-0.13:1.000:0.852 0/0/0/1:4:72,55:0.34: 0.41:1.000:0.862 0/0/1/1:4:37,38:0.45:-0.81:1.000:0.977 0/0/1/1:4:42,51:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,38:0.23: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,62:0.33: 0.83:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,27:0.27:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,65:0.50: 0.20:0.974:0.997 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,25:0.33:-1.18:0.999:0.930 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,24:0.36:-1.30:1.000:0.717 0/0/0/1:4:74,57:0.34: 0.51:1.000:0.841 0/0/1/1:4:51,55:0.46:-0.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:163,56:0.17: 2.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,60:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.65:0.997:1.000 0/0/0/1:4:72,45:0.27: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,63:0.34: 0.86:1.000:0.876 0/0/1/1:4:40,34:0.38:-0.83:1.000:0.558 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,60:0.24: 1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,1:0.01:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,46:0.34:-0.06:1.000:0.889 0/0/0/1:4:65,49:0.34: 0.11:1.000:0.890 0/0/0/1:4:75,38:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,38:0.53:-1.09:1.000:0.991 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,63:0.45: 0.34:1.000:0.979 0/0/1/1:4:37,34:0.41:-0.90:1.000:0.845 0/0/0/1:4:89,35:0.19: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,59:0.22: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,42:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,32:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:121,0:0.00: 0.27:0.981:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,51:0.21: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,57:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,43:0.13: 2.50:1.000:0.943 0/0/0/1:4:134,52:0.19: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.67:0.999:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,56:0.28: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,22:0.47:-1.58:1.000:0.993 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,34:0.18: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,54:0.43:-0.01:1.000:0.949 0/0/1/1:4:37,56:0.53:-0.38:1.000:0.991 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,40:0.21: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,43:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,44:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,44:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,21:0.21:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,65:0.22: 2.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,1:0.01:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,58:0.60:-0.69:1.000:0.796 0/0/0/1:4:107,53:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,47:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,40:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,36:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,60:0.24: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,59:0.28: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,43:0.21: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,50:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,59:0.28: 0.98:1.000:0.995 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,43:0.53:-0.90:1.000:0.991 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,43:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,57:0.30: 0.76:1.000:0.989 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,41:0.25: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,56:0.29: 0.76:1.000:0.994 0/0/0/1:4:90,64:0.32: 1.05:1.000:0.963 0/0/1/1:4:33,52:0.54:-0.57:1.000:0.989 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-1.02:0.999:1.000 0/0/0/1:4:101,67:0.29: 1.37:1.000:0.991 0/0/0/1:4:68,44:0.28: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:77,44:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,42:0.46:-0.64:1.000:0.984 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,44:0.19: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,66:0.24: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,70:0.33: 1.28:1.000:0.911 0/0/0/1:4:76,58:0.34: 0.58:1.000:0.864 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,55:0.28: 0.74:1.000:0.996 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,63:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,28:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 -chr7.1 18737833 chr7.1_018737833 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,68:.: 0.64:1.000:. ./.:4:115,22:.: 1.52:1.000:. ./.:4:44,37:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,36:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,88:.: 2.11:1.000:. ./.:4:48,48:.: 0.18:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:44,28:.:-0.61:1.000:. ./.:4:72,38:.: 0.64:1.000:. ./.:4:20,21:.:-1.62:1.000:. ./.:4:51,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:90,26:.: 0.83:1.000:. ./.:4:29,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:47,34:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:86,54:.: 1.62:1.000:. ./.:4:41,81:.: 1.03:0.985:. ./.:4:96,56:.: 2.01:1.000:. ./.:4:47,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:31,1:.:-1.91:1.000:. ./.:4:35,66:.: 0.34:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:30,30:.:-1.00:1.000:. ./.:4:7,13:.:-2.31:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,36:.:-0.25:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,65:.: 1.13:1.000:. ./.:4:85,33:.: 0.90:1.000:. ./.:4:113,30:.: 1.72:1.000:. ./.:4:41,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:3,7:.:-2.63:1.000:. ./.:4:29,10:.:-1.69:1.000:. ./.:3:11,17:.:-2.05:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:83,51:.: 1.42:1.000:. ./.:4:47,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:45,81:.: 1.16:1.000:. ./.:4:47,67:.: 0.77:1.000:. ./.:4:42,30:.:-0.61:1.000:. ./.:4:42,25:.:-0.77:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:49,37:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,24:.:-0.90:0.986:. ./.:4:20,23:.:-1.56:1.000:. ./.:4:33,33:.:-0.80:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:38,28:.:-0.80:1.000:. ./.:4:53,40:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,36:.:-0.44:1.000:. ./.:4:39,65:.: 0.44:1.000:. ./.:4:34,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:35,27:.:-0.93:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:36,71:.: 0.54:1.000:. ./.:6:59,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:36,28:.:-0.87:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.28:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:33,61:.: 0.11:1.000:. ./.:4:44,26:.:-0.67:1.000:. ./.:4:43,61:.: 0.44:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.97:0.974:. ./.:4:106,27:.: 1.39:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:33,24:.:-1.10:0.999:. ./.:4:175,50:.: 4.40:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:137,35:.: 2.67:1.000:. ./.:4:26,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:41,31:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,42:.:-0.05:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:31,27:.:-1.06:1.000:. ./.:4:73,44:.: 0.87:0.997:. ./.:4:53,36:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:98,32:.: 1.29:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:54,33:.:-0.12:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,26:.:-1.03:1.000:. ./.:4:52,60:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:47,57:.: 0.44:1.000:. ./.:4:105,24:.: 1.26:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:43,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:31,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:37,29:.:-0.80:1.000:. ./.:4:35,21:.:-1.13:1.000:. ./.:6:94,64:.: 2.21:0.981:. ./.:4:36,43:.:-0.38:1.000:. ./.:4:51,52:.: 0.41:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:45,34:.:-0.38:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:79,42:.: 1.00:1.000:. ./.:4:66,89:.: 2.11:1.000:. ./.:4:100,22:.: 1.03:0.999:. ./.:4:78,30:.: 0.57:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,21:.: 0.02:1.000:. ./.:4:42,34:.:-0.48:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:36,33:.:-0.70:1.000:. ./.:4:61,47:.: 0.57:1.000:. ./.:4:34,60:.: 0.11:1.000:. ./.:4:27,35:.:-0.93:1.000:. ./.:4:49,55:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,42:.:-0.44:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,22:.:-0.93:1.000:. ./.:4:79,20:.: 0.28:1.000:. ./.:4:60,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:26,23:.:-1.36:1.000:. ./.:4:92,29:.: 1.00:1.000:. ./.:4:36,63:.: 0.28:1.000:. ./.:4:27,26:.:-1.23:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:39,63:.: 0.38:1.000:. ./.:4:72,45:.: 0.87:1.000:. ./.:4:89,32:.: 1.00:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.31:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:35,63:.: 0.24:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,27:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:48,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:65,35:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,28:.: 0.87:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:86,28:.: 0.77:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:23,14:.:-1.75:1.000:. ./.:4:42,78:.: 0.96:1.000:. ./.:4:38,35:.:-0.57:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:90,40:.: 1.29:1.000:. ./.:4:59,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:82,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:36,60:.: 0.18:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:68,73:.: 1.65:1.000:. ./.:4:39,35:.:-0.54:1.000:. ./.:4:110,37:.: 1.85:0.999:. ./.:4:83,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,24:.:-1.23:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,21:.:-1.29:1.000:. ./.:4:32,26:.:-1.06:1.000:. ./.:4:31,21:.:-1.26:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:49,30:.:-0.38:1.000:. ./.:4:41,25:.:-0.80:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:89,6:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,37:.:-0.44:1.000:. ./.:4:109,46:.: 2.11:1.000:. ./.:4:43,42:.:-0.18:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:141,35:.: 2.80:1.000:. -chr7.1 18966923 chr7.1_018966923 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:141,353:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,404:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,428:.:-0.10:1.000:. ./.:4:129,336:.: 0.33:1.000:. ./.:4:274,281:.: 1.36:1.000:. ./.:4:139,382:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,292:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,460:.: 0.27:1.000:. ./.:4:132,311:.: 0.08:1.000:. ./.:4:28,137:.:-3.12:1.000:. ./.:4:129,169:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,422:.:-0.16:1.000:. ./.:4:138,388:.: 1.03:1.000:. ./.:4:148,353:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,419:.:-0.20:1.000:. ./.:4:132,351:.: 0.54:1.000:. ./.:4:274,297:.: 1.55:0.985:. ./.:4:0,438:.: 0.02:1.000:. ./.:4:174,480:.: 2.50:1.000:. ./.:4:120,383:.: 0.77:1.000:. ./.:4:107,175:.:-1.77:1.000:. ./.:4:119,352:.: 0.40:1.000:. ./.:4:157,414:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,478:.: 0.48:1.000:. ./.:4:57,124:.:-2.93:1.000:. ./.:4:0,422:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,501:.: 0.74:1.000:. ./.:4:2,420:.:-0.16:1.000:. ./.:4:294,289:.: 1.69:1.000:. ./.:4:127,368:.: 0.67:1.000:. ./.:4:141,344:.: 0.56:1.000:. ./.:4:103,331:.:-0.03:1.000:. ./.:4:58,100:.:-3.20:1.000:. ./.:4:98,111:.:-2.61:1.000:. ./.:3:55,57:.:-3.73:1.000:. ./.:4:118,383:.: 0.74:1.000:. ./.:4:143,338:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,482:.: 0.53:1.000:. ./.:4:135,374:.: 0.84:1.000:. ./.:4:135,349:.: 0.55:1.000:. ./.:4:116,320:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,426:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,419:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,376:.:-0.69:1.000:. ./.:4:137,335:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,448:.: 0.13:1.000:. ./.:4:153,364:.: 0.93:0.986:. ./.:4:160,342:.: 0.75:1.000:. ./.:4:114,226:.:-1.11:1.000:. ./.:4:147,297:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,386:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,530:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,332:.:-1.20:1.000:. ./.:4:273,228:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1,419:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,373:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,364:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,399:.:-0.43:1.000:. ./.:4:133,325:.: 0.25:1.000:. ./.:6:96,267:.:-0.84:1.000:. ./.:4:106,300:.:-0.35:1.000:. ./.:4:106,264:.:-0.76:1.000:. ./.:4:140,340:.: 0.50:1.000:. ./.:4:127,285:.:-0.28:1.000:. ./.:4:143,358:.: 0.74:1.000:. ./.:4:123,316:.: 0.03:1.000:. ./.:4:74,255:.:-1.23:1.000:. ./.:4:247,214:.: 0.28:1.000:. ./.:4:122,272:.:-0.49:0.974:. ./.:4:0,380:.:-0.65:1.000:. ./.:4:143,386:.: 1.07:1.000:. ./.:4:90,239:.:-1.23:0.999:. ./.:4:0,371:.:-0.75:1.000:. ./.:4:101,359:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,375:.:-0.70:1.000:. ./.:4:109,261:.:-0.76:1.000:. ./.:4:134,284:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,326:.: 0.13:1.000:. ./.:4:128,338:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,517:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,333:.:-1.19:0.997:. ./.:4:122,325:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,500:.: 0.73:1.000:. ./.:4:94,292:.:-0.58:1.000:. ./.:4:132,334:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,501:.: 0.74:1.000:. ./.:4:66,258:.:-1.29:1.000:. ./.:4:97,283:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,270:.:-0.81:1.000:. ./.:4:113,286:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,278:.:-1.82:1.000:. ./.:4:110,344:.: 0.20:1.000:. ./.:4:134,325:.: 0.26:1.000:. ./.:4:86,221:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,505:.: 0.79:1.000:. ./.:4:110,304:.:-0.26:1.000:. ./.:4:196,206:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,400:.:-0.42:1.000:. ./.:4:112,344:.: 0.23:1.000:. ./.:4:138,350:.: 0.59:1.000:. ./.:4:190,190:.:-0.65:1.000:. ./.:4:136,385:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,339:.:-1.12:1.000:. ./.:6:235,312:.: 1.27:0.981:. ./.:4:222,220:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,314:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,381:.:-0.64:1.000:. ./.:4:115,406:.: 0.97:1.000:. ./.:4:145,380:.: 1.02:1.000:. ./.:4:132,342:.: 0.43:1.000:. ./.:4:230,188:.:-0.21:1.000:. ./.:4:199,488:.: 2.88:1.000:. ./.:4:117,300:.:-0.22:0.999:. ./.:4:345,223:.: 1.51:1.000:. ./.:4:181,163:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,511:.: 0.86:1.000:. ./.:4:105,275:.:-0.65:1.000:. ./.:4:89,307:.:-0.46:1.000:. ./.:4:125,250:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,374:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,416:.:-0.23:1.000:. ./.:4:251,218:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,412:.:-0.28:1.000:. ./.:4:129,337:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,441:.: 0.05:1.000:. ./.:4:122,383:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,387:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,370:.:-0.76:1.000:. ./.:4:181,172:.:-0.96:1.000:. ./.:4:87,277:.:-0.83:1.000:. ./.:4:104,281:.:-0.59:1.000:. ./.:4:120,369:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,332:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,431:.:-0.06:1.000:. ./.:4:221,186:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,659:.: 2.56:1.000:. ./.:4:252,231:.: 0.54:1.000:. ./.:4:136,281:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,321:.:-1.33:1.000:. ./.:4:116,346:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,414:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,280:.:-0.43:1.000:. ./.:4:130,295:.:-0.13:1.000:. ./.:4:83,247:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,524:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,521:.: 0.97:1.000:. ./.:4:280,258:.: 1.17:1.000:. ./.:4:110,301:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,504:.: 0.78:1.000:. ./.:4:121,321:.: 0.07:1.000:. ./.:4:140,394:.: 1.12:1.000:. ./.:4:106,352:.: 0.25:1.000:. ./.:4:77,133:.:-2.60:1.000:. ./.:4:85,217:.:-1.54:1.000:. ./.:4:281,253:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,492:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,565:.: 1.48:1.000:. ./.:4:240,239:.: 0.49:1.000:. ./.:4:228,182:.:-0.30:1.000:. ./.:4:136,337:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,423:.:-0.15:1.000:. ./.:4:218,170:.:-0.56:1.000:. ./.:4:121,356:.: 0.47:1.000:. ./.:4:105,296:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,466:.: 0.34:1.000:. ./.:4:117,373:.: 0.62:1.000:. ./.:4:113,360:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,515:.: 0.90:0.999:. ./.:4:0,452:.: 0.18:1.000:. ./.:4:114,306:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,282:.:-0.42:1.000:. ./.:4:96,251:.:-1.03:1.000:. ./.:4:114,350:.: 0.32:1.000:. ./.:4:137,325:.: 0.30:1.000:. ./.:4:95,356:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,386:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,554:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,556:.: 1.38:1.000:. ./.:4:131,322:.: 0.19:1.000:. ./.:4:97,378:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,448:.: 0.13:1.000:. ./.:4:318,275:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,597:.: 1.85:1.000:. ./.:4:135,347:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,450:.: 0.16:1.000:. -chr7.1 19045805 chr7.1_019045805 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,55:.: 1.00:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:24,60:.: 0.72:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,49:.: 0.96:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:13,12:.:-1.66:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:38,62:.: 1.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:45,46:.: 1.00:1.000:. ./.:4:15,64:.: 0.52:0.985:. ./.:4:70,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:43,51:.: 1.12:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:83,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:27,68:.: 1.16:1.000:. ./.:4:49,51:.: 1.36:1.000:. ./.:4:80,48:.: 2.49:1.000:. ./.:4:31,58:.: 0.92:1.000:. ./.:4:1,2:.:-2.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:4,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:88,50:.: 2.89:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:38,44:.: 0.64:1.000:. ./.:4:36,48:.: 0.72:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.94:0.986:. ./.:4:17,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:19,48:.: 0.03:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:37,51:.: 0.88:1.000:. ./.:6:48,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:36,46:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,31:.: 0.39:1.000:. ./.:4:13,46:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.10:0.974:. ./.:4:46,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:86,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,50:.: 0.60:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:36,51:.: 0.84:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.50:0.997:. ./.:4:53,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:42,46:.: 0.88:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:58,35:.: 1.08:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:18,43:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:18,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.26:1.000:. ./.:6:36,46:.: 0.64:0.981:. ./.:4:12,40:.:-0.57:1.000:. ./.:4:37,48:.: 0.76:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:35,50:.: 0.76:1.000:. ./.:4:62,73:.: 2.77:1.000:. ./.:4:45,49:.: 1.12:0.999:. ./.:4:44,43:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:61,41:.: 1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,43:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,51:.: 1.00:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:32,36:.: 0.07:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:64,50:.: 1.93:1.000:. ./.:4:30,60:.: 0.96:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:20,46:.:-0.01:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:34,41:.: 0.35:1.000:. ./.:4:55,39:.: 1.12:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:39,56:.: 1.16:1.000:. ./.:4:68,58:.: 2.41:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:62,46:.: 1.68:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:22,44:.:-0.01:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:43,61:.: 1.52:1.000:. ./.:4:38,57:.: 1.16:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:33,46:.: 0.52:1.000:. ./.:4:39,46:.: 0.76:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:31,60:.: 1.00:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:66,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:57,70:.: 2.45:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. -chr7.1 19308605 chr7.1_019308605 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,139:.: 1.32:1.000:. ./.:4:97,31:.:-0.45:1.000:. ./.:4:86,84:.: 0.81:1.000:. ./.:4:35,121:.: 0.39:1.000:. ./.:4:48,106:.: 0.33:1.000:. ./.:4:93,62:.: 0.36:1.000:. ./.:4:13,60:.:-2.10:1.000:. ./.:4:62,75:.:-0.18:1.000:. ./.:4:41,122:.: 0.60:1.000:. ./.:4:16,41:.:-2.58:1.000:. ./.:4:13,47:.:-2.49:1.000:. ./.:4:37,96:.:-0.30:1.000:. ./.:4:81,81:.: 0.57:1.000:. ./.:4:92,90:.: 1.17:1.000:. ./.:4:24,116:.:-0.09:1.000:. ./.:4:87,79:.: 0.69:1.000:. ./.:4:33,119:.: 0.27:0.985:. ./.:4:124,47:.: 0.84:1.000:. ./.:4:49,151:.: 1.71:1.000:. ./.:4:38,141:.: 1.08:1.000:. ./.:4:19,40:.:-2.52:1.000:. ./.:4:40,114:.: 0.33:1.000:. ./.:4:47,142:.: 1.38:1.000:. ./.:4:59,93:.: 0.27:1.000:. ./.:4:32,25:.:-2.58:1.000:. ./.:4:56,125:.: 1.14:1.000:. ./.:4:93,88:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.33:1.000:. ./.:4:91,103:.: 1.53:1.000:. ./.:4:43,118:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.15:1.000:. ./.:4:33,118:.: 0.24:1.000:. ./.:4:3,29:.:-3.33:1.000:. ./.:4:13,71:.:-1.77:1.000:. ./.:3:6,26:.:-3.33:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.06:1.000:. ./.:4:26,113:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,115:.: 0.66:1.000:. ./.:4:80,64:.: 0.03:1.000:. ./.:4:45,122:.: 0.72:1.000:. ./.:4:31,117:.: 0.15:1.000:. ./.:4:33,112:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,128:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,126:.: 0.48:1.000:. ./.:4:37,115:.: 0.27:1.000:. ./.:4:73,95:.: 0.75:1.000:. ./.:4:38,133:.: 0.84:0.986:. ./.:4:40,63:.:-1.20:1.000:. ./.:4:68,82:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,106:.:-1.11:1.000:. ./.:4:23,85:.:-1.05:1.000:. ./.:4:41,140:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,63:.:-1.68:1.000:. ./.:4:68,94:.: 0.57:1.000:. ./.:4:84,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:51,119:.: 0.81:1.000:. ./.:4:38,104:.:-0.03:1.000:. ./.:4:39,121:.: 0.51:1.000:. ./.:4:75,66:.:-0.06:1.000:. ./.:6:7,108:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.33:1.000:. ./.:4:46,99:.: 0.06:1.000:. ./.:4:42,103:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.18:1.000:. ./.:4:42,130:.: 0.87:1.000:. ./.:4:48,129:.: 1.02:1.000:. ./.:4:17,63:.:-1.89:1.000:. ./.:4:57,76:.:-0.30:1.000:. ./.:4:30,109:.:-0.12:0.974:. ./.:4:74,66:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,115:.: 0.69:1.000:. ./.:4:40,41:.:-1.86:0.999:. ./.:4:126,44:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.81:1.000:. ./.:4:74,67:.:-0.06:1.000:. ./.:4:60,70:.:-0.39:1.000:. ./.:4:39,97:.:-0.21:1.000:. ./.:4:78,78:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,117:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,108:.: 0.00:1.000:. ./.:4:78,22:.:-1.29:0.997:. ./.:4:75,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:39,141:.: 1.11:1.000:. ./.:4:37,99:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,89:.:-0.81:1.000:. ./.:4:67,74:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,69:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.87:1.000:. ./.:4:47,85:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.60:1.000:. ./.:4:21,60:.:-1.86:1.000:. ./.:4:41,86:.:-0.48:1.000:. ./.:4:46,117:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1,114:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.48:1.000:. ./.:4:44,116:.: 0.51:1.000:. ./.:4:56,56:.:-0.93:1.000:. ./.:4:49,64:.:-0.90:1.000:. ./.:4:37,91:.:-0.45:1.000:. ./.:4:32,113:.: 0.06:1.000:. ./.:4:14,84:.:-1.35:1.000:. ./.:4:34,123:.: 0.42:1.000:. ./.:4:55,54:.:-1.02:1.000:. ./.:6:56,101:.: 0.42:0.981:. ./.:4:32,87:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,67:.:-0.39:1.000:. ./.:4:17,81:.:-1.35:1.000:. ./.:4:43,118:.: 0.54:1.000:. ./.:4:41,145:.: 1.29:1.000:. ./.:4:51,99:.: 0.21:1.000:. ./.:4:35,109:.: 0.03:1.000:. ./.:4:53,157:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.51:0.999:. ./.:4:44,150:.: 1.53:1.000:. ./.:4:22,81:.:-1.20:1.000:. ./.:4:34,122:.: 0.39:1.000:. ./.:4:31,90:.:-0.66:1.000:. ./.:4:37,102:.:-0.12:1.000:. ./.:4:28,101:.:-0.42:1.000:. ./.:4:46,60:.:-1.11:1.000:. ./.:4:34,122:.: 0.39:1.000:. ./.:4:64,73:.:-0.18:1.000:. ./.:4:87,85:.: 0.87:1.000:. ./.:4:41,138:.: 1.08:1.000:. ./.:4:66,68:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,114:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,87:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,69:.:-1.47:1.000:. ./.:4:38,82:.:-0.69:1.000:. ./.:4:38,123:.: 0.54:1.000:. ./.:4:86,81:.: 0.72:1.000:. ./.:4:30,62:.:-1.53:1.000:. ./.:4:31,97:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,55:.:-0.60:1.000:. ./.:4:54,133:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.78:1.000:. ./.:4:29,87:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,92:.:-0.78:1.000:. ./.:4:27,89:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,100:.:-0.51:1.000:. ./.:4:36,109:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,98:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.45:1.000:. ./.:4:58,119:.: 1.02:1.000:. ./.:4:37,122:.: 0.48:1.000:. ./.:4:44,123:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,185:.: 1.26:1.000:. ./.:4:50,119:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,189:.: 1.38:1.000:. ./.:4:40,145:.: 1.26:1.000:. ./.:4:24,40:.:-2.37:1.000:. ./.:4:25,91:.:-0.81:1.000:. ./.:4:83,99:.: 1.17:1.000:. ./.:4:63,81:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.63:1.000:. ./.:4:30,139:.: 0.78:1.000:. ./.:4:51,123:.: 0.93:1.000:. ./.:4:32,93:.:-0.54:1.000:. ./.:4:42,93:.:-0.24:1.000:. ./.:4:86,60:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,131:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.06:1.000:. ./.:4:85,71:.: 0.39:1.000:. ./.:4:29,98:.:-0.48:1.000:. ./.:4:77,81:.: 0.45:0.999:. ./.:4:41,135:.: 0.99:1.000:. ./.:4:85,73:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.33:1.000:. ./.:4:69,63:.:-0.33:1.000:. ./.:4:25,130:.: 0.36:1.000:. ./.:4:42,118:.: 0.51:1.000:. ./.:4:30,88:.:-0.75:1.000:. ./.:4:35,78:.:-0.90:1.000:. ./.:4:105,102:.: 1.92:1.000:. ./.:4:81,84:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,115:.: 0.45:1.000:. ./.:4:39,128:.: 0.72:1.000:. ./.:4:59,151:.: 2.01:1.000:. ./.:4:47,176:.: 2.40:1.000:. ./.:4:41,111:.: 0.27:1.000:. ./.:4:77,85:.: 0.57:1.000:. -chr7.1 19441496 chr7.1_019441496 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:24,19:0.48: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,9:0.48:-1.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,6:0.20: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,30:0.79: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,22:0.61: 0.37:1.000:0.674 0/0/1/1:4:21,13:0.42: 0.08:1.000:0.920 0/0/0/1:4:9,4:0.35:-1.91:1.000:0.753 0/0/0/1:4:38,16:0.34: 1.98:1.000:0.843 0/1/1/1:4:9,19:0.69:-0.49:1.000:0.967 0/0/1/1:4:9,9:0.53:-1.43:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,27:0.68: 0.65:1.000:0.961 0/0/1/1:4:21,11:0.39:-0.11:1.000:0.653 0/0/1/1:4:12,16:0.59:-0.49:1.000:0.858 0/1/1/1:4:7,16:0.70:-0.96:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,5:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,20:0.61: 0.08:0.985:0.736 0/0/1/1:4:24,21:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,23:0.50: 1.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,35:0.76: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.72:-1.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,15:0.62:-0.77:1.000:0.616 0/0/1/1:4:28,21:0.46: 1.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:19,5:0.26:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:7,2:0.28:-2.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,10:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,9:0.31: 0.18:1.000:0.976 0/1/1/1:4:7,18:0.72:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,18:0.41: 1.41:1.000:0.891 0/0/1/1:4:24,20:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,15:0.79:-1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,17:0.66:-0.68:1.000:0.894 0/0/1/1:4:1,1:0.53:-2.95:1.000:0.993 0/1/1/1:4:5,11:0.69:-1.62:1.000:0.979 0/1/1:3:1,3:0.75:-2.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,24:0.80:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,19:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,6:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,23:0.79:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,33:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,17:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:18,21:0.56: 0.56:1.000:0.965 0/1/1/1:4:9,17:0.66:-0.68:1.000:0.894 0/0/1/1:4:16,24:0.62: 0.65:1.000:0.616 0/0/0/1:4:25,4:0.20:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.55: 0.27:0.986:0.978 0/0/1/1:4:9,7:0.47:-1.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:22,11:0.38:-0.01:1.000:0.533 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.43:-0.96:1.000:0.945 0/0/1/1:4:18,15:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,24:0.49: 1.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,16:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,8:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,13:0.59:-0.96:1.000:0.890 0/0/1/1:4:23,22:0.52: 1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,14:0.45: 0.08:1.000:0.978 0/0/0/1:4:35,12:0.31: 1.32:1.000:0.978 0/1/1/1/1/1:6:4,25:0.86:-0.39:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,25:0.78:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,42:0.89: 1.32:1.000:0.630 1/1/1/1:4:0,37:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,31:0.68: 1.22:1.000:0.959 0/1/1/1:4:9,25:0.74: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,30:0.77: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,20:0.53: 0.65:1.000:0.993 0/1/1/1:4:8,41:0.84: 1.50:0.974:0.996 0/0/1/1:4:16,15:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,17:0.60:-0.39:1.000:0.754 0/1/1/1:4:5,11:0.69:-1.62:0.999:0.979 0/0/0/1:4:24,7:0.28:-0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,27:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,10:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,17:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,22:0.79:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,15:0.56:-0.49:1.000:0.969 0/1/1/1:4:13,31:0.71: 1.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,23:0.48: 1.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:27,7:0.26: 0.08:0.997:0.999 0/0/1/1:4:26,17:0.43: 0.94:1.000:0.954 0/0/1/1:4:35,19:0.39: 1.98:1.000:0.734 0/1/1/1:4:7,23:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,18:0.55: 0.08:1.000:0.976 0/0/0/1:4:31,8:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,13:0.51:-0.58:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,27:0.82:-0.01:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,15:0.43: 0.46:1.000:0.953 0/0/1/1:4:16,19:0.57: 0.18:1.000:0.957 0/0/1/1:4:24,29:0.57: 1.88:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,41:0.73: 2.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,17:0.66:-0.68:1.000:0.894 0/0/1/1:4:20,12:0.41:-0.11:1.000:0.891 0/0/1/1:4:24,16:0.44: 0.65:1.000:0.963 0/1/1/1:4:9,37:0.80: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,31:0.78: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.87:-1.72:1.000:0.935 0/0/1/1:4:16,15:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,8:0.31:-0.20:1.000:0.974 0/0/1/1/1/1:6:20,33:0.64: 1.88:0.981:0.860 0/1/1/1:4:8,15:0.66:-0.96:1.000:0.886 0/0/1/1:4:19,13:0.44:-0.11:1.000:0.972 0/0/1/1:4:18,16:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,23:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,29:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,23:0.65: 0.27:1.000:0.801 0/1/1/1:4:8,18:0.70:-0.68:1.000:0.984 0/0/1/1:4:34,19:0.40: 1.88:1.000:0.790 0/1/1/1:4:6,27:0.82:-0.01:0.999:0.999 0/1/1/1:4:15,34:0.70: 1.50:1.000:0.985 0/1/1/1:4:5,11:0.69:-1.62:1.000:0.979 0/0/1/1:4:21,25:0.57: 1.22:1.000:0.956 0/1/1/1:4:3,23:0.88:-0.68:1.000:0.648 0/0/1/1:4:17,11:0.43:-0.49:1.000:0.949 0/1/1/1:4:12,24:0.68: 0.27:1.000:0.942 0/0/0/1:4:27,12:0.35: 0.56:1.000:0.753 0/0/1/1:4:19,21:0.55: 0.65:1.000:0.980 0/0/1/1:4:19,18:0.52: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,16:0.36: 1.69:1.000:0.694 0/1/1/1:4:10,30:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-0.68:1.000:0.986 0/1/1/1:4:14,34:0.71: 1.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:20,14:0.45: 0.08:1.000:0.978 0/1/1/1:4:8,28:0.78: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,20:0.72:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,15:0.72:-1.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,22:0.76:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,7:0.21: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,15:0.69:-1.05:1.000:0.972 0/0/1/1:4:13,8:0.42:-1.15:1.000:0.915 0/0/1/1:4:11,12:0.55:-0.96:1.000:0.983 0/1/1/1:4:10,16:0.63:-0.68:1.000:0.564 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,31:0.78: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,12:0.37: 0.37:1.000:0.575 0/0/1/1:4:18,19:0.54: 0.37:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,20:0.74:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,18:0.55: 0.08:1.000:0.976 0/1/1/1:4:11,22:0.68:-0.01:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,31:0.72: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,13:0.37: 0.65:1.000:0.567 0/1/1/1:4:12,27:0.70: 0.56:1.000:0.984 0/1/1/1:4:10,26:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,26:0.71: 0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,13:0.40: 0.27:1.000:0.810 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,8:0.42:-1.15:1.000:0.915 0/1/1/1:4:6,11:0.66:-1.53:1.000:0.858 0/1/1/1:4:6,28:0.82: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,13:0.38: 0.56:1.000:0.533 0/0/0/1:4:29,10:0.31: 0.56:1.000:0.977 0/1/1/1:4:15,38:0.72: 1.88:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,24:0.71: 0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,14:0.40: 0.56:1.000:0.794 0/0/1/1:4:18,22:0.57: 0.65:1.000:0.942 0/1/1/1:4:5,15:0.75:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,4:0.17: 0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,15:0.44: 0.37:1.000:0.971 0/0/1/1:4:9,8:0.50:-1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,10:0.37:-0.20:1.000:0.595 0/0/1/1:4:18,17:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,21:0.51: 1.03:0.999:0.996 0/0/1/1:4:18,18:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,15:0.60:-0.68:1.000:0.825 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.25:-1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,19:0.69:-0.49:1.000:0.967 0/0/1/1:4:24,16:0.44: 0.65:1.000:0.963 0/1/1/1:4:10,16:0.63:-0.68:1.000:0.564 0/0/1/1:4:10,12:0.57:-1.05:1.000:0.952 0/0/0/1:4:28,6:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,9:0.30: 0.27:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,19:0.46: 1.13:1.000:0.986 0/0/1/1:4:21,13:0.42: 0.08:1.000:0.920 0/1/1/1:4:15,27:0.65: 0.84:1.000:0.831 0/0/0/1:4:23,9:0.33:-0.11:1.000:0.920 0/1/1/1:4:6,18:0.75:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,18:0.48: 0.65:1.000:0.995 -chr7.1 19505223 chr7.1_019505223 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:361,347:0.48: 0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:362,126:0.24:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:440,140:0.23:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:313,327:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:374,380:0.49: 1.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:582,232:0.27: 1.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:232,260:0.52:-0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:456,161:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:150,444:0.74:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:232,115:0.32:-1.99:1.000:0.958 0/1/1/1:4:80,479:0.84:-0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:153,465:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:481,139:0.21: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:510,172:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,307:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:439,164:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:329,318:0.48: 0.39:0.985:0.995 0/0/0/1:4:469,158:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:593,193:0.23: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:343,372:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:277,164:0.36:-1.24:1.000:0.698 0/1/1/1:4:157,497:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:509,191:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:458,156:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00:-2.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:344,409:0.53: 1.22:1.000:0.991 0/0/0/1:4:477,191:0.27: 0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:138,478:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:539,172:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:352,319:0.46: 0.58:1.000:0.990 0/1/1/1:4:185,551:0.74: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:128,382:0.74:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,189:0.83:-2.95:1.000:0.998 0/0/1/1:4:154,209:0.56:-1.86:1.000:0.958 0/0/1:3:75,45:0.36:-3.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:301,332:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:310,328:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:289,351:0.54: 0.33:1.000:0.989 0/0/0/1:4:488,183:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:148,548:0.78: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,299:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:267,314:0.53:-0.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:356,395:0.52: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:274,282:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:511,206:0.27: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:473,172:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:532,182:0.24: 0.92:0.986:1.000 0/0/0/1:4:1018,370:0.25: 6.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:421,163:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:171,655:0.78: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,280:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:310,382:0.54: 0.74:1.000:0.987 0/0/1/1:4:274,246:0.46:-0.62:1.000:0.989 0/0/0/1:4:465,203:0.29: 0.55:1.000:0.992 0/0/0/0:4:580,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:344,348:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:274,306:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:320,374:0.53: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:348,142:0.28:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:157,374:0.69:-0.53:1.000:0.891 0/1/1/1:4:143,436:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:281,266:0.48:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:334,371:0.52: 0.84:1.000:0.996 0/1/1/1:4:152,527:0.77: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:304,343:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:160,488:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:134,368:0.72:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:412,150:0.25:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:269,320:0.53:-0.07:0.974:0.991 0/0/1/1:4:262,262:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:500,181:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:307,138:0.30:-1.21:0.999:0.988 0/0/0/1:4:541,198:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:323,333:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:287,350:0.54: 0.31:1.000:0.988 0/0/1/1:4:269,278:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:287,310:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:310,301:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:300,289:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:317,332:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:349,133:0.26:-0.92:0.997:0.999 0/0/0/1:4:468,146:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:349,372:0.51: 0.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:143,356:0.70:-0.78:1.000:0.987 0/0/0/1:4:447,183:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:472,193:0.28: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:238,224:0.47:-1.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:109,384:0.77:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,278:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:146,423:0.73:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:220,277:0.55:-0.80:1.000:0.983 0/0/1/1:4:266,300:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:452,176:0.27: 0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:103,330:0.75:-1.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:156,523:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:322,323:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:360,120:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:252,250:0.49:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:321,335:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:298,306:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:293,232:0.43:-0.58:1.000:0.947 0/0/0/1:4:463,171:0.26: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,111:0.25:-1.41:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:419,274:0.38: 0.75:0.981:0.765 0/0/1/1:4:198,242:0.54:-1.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:368,149:0.27:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:242,330:0.57:-0.21:1.000:0.956 0/0/1/1:4:332,338:0.49: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:361,406:0.52: 1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,289:0.52:-0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:279,271:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:408,407:0.49: 1.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:137,464:0.76: 0.02:0.999:1.000 0/0/1/1:4:421,346:0.44: 1.33:1.000:0.966 0/0/0/1:4:349,122:0.25:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:293,340:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/1/1/1:4:146,475:0.75: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:407,133:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,291:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:365,140:0.26:-0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:295,336:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:372,134:0.25:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:478,179:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:144,453:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:430,147:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,285:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:333,308:0.47: 0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:125,416:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,216:0.53:-1.57:1.000:0.992 0/0/0/1:4:327,117:0.25:-1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:118,413:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:376,125:0.24:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,180:0.48:-1.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:306,310:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:408,118:0.21:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:411,406:0.49: 1.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:157,490:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:115,447:0.78:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,238:0.52:-1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:246,268:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:153,467:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:399,139:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:294,265:0.46:-0.31:1.000:0.989 0/1/1/1:4:114,371:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:166,544:0.76: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:404,426:0.50: 1.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:307,323:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:152,468:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:180,580:0.75: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,246:0.49:-0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:174,556:0.75: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:448,159:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:209,122:0.36:-2.11:1.000:0.735 0/0/1/1:4:231,213:0.47:-1.22:1.000:0.992 0/0/0/0:4:657,1:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:467,143:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:199,554:0.72: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:188,544:0.73: 1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:287,264:0.47:-0.37:1.000:0.991 0/0/0/1:4:510,179:0.25: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:277,259:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:201,284:0.57:-0.90:1.000:0.933 0/0/0/1:4:409,143:0.25:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:438,162:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:167,449:0.72: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:322,311:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:406,147:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:266,299:0.52:-0.26:0.999:0.995 0/0/1/1:4:304,283:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:446,144:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,382:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:483,1:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,349:0.53: 0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:415,133:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,122:0.25:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:235,235:0.49:-1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:565,185:0.23: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:506,183:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:150,463:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:393,129:0.23:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:322,338:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:406,404:0.49: 1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:408,395:0.48: 1.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:259,265:0.49:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:293,322:0.51: 0.13:1.000:0.996 -chr7.1 19623691 chr7.1_019623691 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:196,3:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:311,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:324,3:0.14: 1.69:1.000:0.976 0/0/0/1:4:133,6:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,2:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:245,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,4:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:309,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,1:0.13:-0.57:1.000:0.898 0/0/0/1:4:81,3:0.25:-0.97:1.000:0.999 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,4:0.26:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/0:4:310,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,3:0.21: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,5:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:309,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,4:0.25:-0.52:0.985:0.999 0/0/0/0:4:343,1:0.05: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:273,0:0.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,2:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,1:0.13:-0.61:1.000:0.935 0/0/0/1:4:127,2:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:281,3:0.16: 1.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,3:0.16: 1.40:1.000:0.993 0/0/0/0:4:309,2:0.10: 1.52:1.000:0.796 0/0/0/1:4:92,2:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:253,2:0.12: 0.90:1.000:0.806 0/0/0/1:4:245,3:0.19: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,5:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,6:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,12:0.37:-1.63:1.000:0.524 0/0/0/1:4:43,7:0.28:-1.35:1.000:0.995 0/0/0:3:31,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,1:0.17:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:221,2:0.14: 0.55:1.000:0.966 0/0/0/1:4:211,3:0.22: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:373,0:0.00: 2.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,1:0.14:-0.63:1.000:0.948 0/0/0/1:4:91,6:0.26:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:226,2:0.14: 0.61:1.000:0.954 0/0/0/1:4:231,4:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:226,3:0.20: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:226,1:0.07: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:349,0:0.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:229,1:0.07: 0.63:0.986:0.999 0/0/0/1:4:86,3:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:188,3:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,8:0.50:-1.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:179,3:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:262,1:0.06: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,5:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:299,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,2:0.12: 0.88:1.000:0.823 0/0/0/1:4:215,3:0.21: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:255,1:0.06: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:29,7:0.30:-1.50:1.000:0.852 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,2:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,3:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,5:0.50:-1.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,3:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,2:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,5:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,3:0.25:-0.33:0.974:0.999 0/0/0/1:4:181,6:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,2:0.13: 0.81:1.000:0.874 0/0/0/0:4:176,1:0.09: 0.05:0.999:0.959 0/0/0/1:4:387,4:0.16: 2.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,3:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:213,6:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:222,1:0.07: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,2:0.25:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:199,4:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,6:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:216,1:0.07: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:272,1:0.06: 1.10:0.997:1.000 0/0/0/0:4:235,1:0.07: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:270,4:0.23: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,4:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:253,3:0.18: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/0:4:353,0:0.00: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,1:0.11:-0.39:1.000:0.601 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-1.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,7:0.27:-0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:0,7:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,2:0.17: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:207,2:0.15: 0.40:1.000:0.987 0/0/0/1:4:204,10:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,4:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,4:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,2:0.15: 0.42:1.000:0.985 0/0/0/1:4:100,6:0.26:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,1:0.15:-0.73:1.000:0.984 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,3:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,2:0.14: 0.60:1.000:0.957 0/0/0/0/0/1:6:188,3:0.24: 0.20:0.981:0.580 0/0/0/1:4:83,2:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/0:4:280,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,2:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,6:0.26:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,2:0.25:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:266,2:0.12: 1.05:1.000:0.673 0/0/0/1:4:105,6:0.26:-0.68:0.999:0.999 0/0/0/1:4:117,2:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,2:0.14: 0.48:1.000:0.979 0/0/0/1:4:92,1:0.17:-0.87:1.000:0.998 0/0/0/0:4:171,1:0.09:-0.01:1.000:0.940 0/0/0/1:4:102,5:0.26:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:239,2:0.13: 0.75:1.000:0.903 0/0/0/1:4:209,5:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:387,2:0.08: 2.37:1.000:0.988 0/0/0/1:4:103,7:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:294,2:0.11: 1.35:1.000:0.663 0/0/0/1:4:109,3:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,4:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,5:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,3:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,3:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/0:4:302,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,1:0.11:-0.39:1.000:0.601 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,4:0.24: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,7:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,3:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:160,4:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:173,1:0.09: 0.01:1.000:0.949 0/0/0/1:4:100,8:0.26:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,4:0.26:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,7:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,11:0.27:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:219,3:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,2:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,1:0.16:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,7:0.26:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:184,1:0.08: 0.14:1.000:0.977 0/0/1/1:4:0,14:0.50:-1.74:1.000:0.997 0/0/0/0:4:218,1:0.07: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:74,1:0.21:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,1:0.21:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:359,0:0.00: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:314,1:0.05: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,6:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,2:0.42:-1.86:1.000:0.893 0/0/0/1:4:95,2:0.25:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/0:4:221,1:0.07: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:195,4:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,1:0.17:-0.87:1.000:0.998 0/0/0/0:4:313,1:0.05: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,6:0.26:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:194,3:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,2:0.17: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:178,4:0.25: 0.10:0.999:0.999 0/0/0/1:4:184,3:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,3:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-1.85:1.000:0.997 0/0/0/0:4:265,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,6:0.26:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/0:4:178,1:0.09: 0.07:1.000:0.965 0/0/0/0:4:246,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,4:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:370,6:0.25: 2.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:367,1:0.04: 2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,7:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/0/0/0:4:223,1:0.07: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:223,5:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,2:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,7:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,3:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,4:0.25: 0.07:1.000:0.999 -chr7.1 19872449 chr7.1_019872449 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,90:.: 0.04:1.000:. ./.:4:51,21:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,44:.:-0.77:1.000:. ./.:4:31,50:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.98:1.000:. ./.:4:29,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:18,32:.:-1.80:1.000:. ./.:4:32,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:38,55:.: 0.13:1.000:. ./.:4:4,61:.:-1.12:1.000:. ./.:4:23,40:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,66:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,59:.: 0.09:1.000:. ./.:4:24,45:.:-0.94:1.000:. ./.:4:31,43:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,61:.:-1.30:0.985:. ./.:4:73,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,85:.: 2.24:1.000:. ./.:4:13,46:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.90:1.000:. ./.:4:44,53:.: 0.31:1.000:. ./.:4:37,54:.: 0.04:1.000:. ./.:4:13,25:.:-2.34:1.000:. ./.:4:23,38:.:-1.30:1.000:. ./.:4:36,44:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,56:.:-1.53:1.000:. ./.:4:47,93:.: 2.24:1.000:. ./.:4:37,51:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,50:.:-1.80:1.000:. ./.:4:0,40:.:-2.25:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.54:1.000:. ./.:3:0,46:.:-1.98:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.09:1.000:. ./.:4:31,51:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.00:1.000:. ./.:4:24,59:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,55:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.68:1.000:. ./.:4:38,79:.: 1.21:1.000:. ./.:4:31,59:.: 0.00:1.000:. ./.:4:55,82:.: 2.11:1.000:. ./.:4:37,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.27:0.986:. ./.:4:21,42:.:-1.21:1.000:. ./.:4:31,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,61:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,80:.: 1.61:1.000:. ./.:4:31,41:.:-0.81:1.000:. ./.:4:46,55:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.90:1.000:. ./.:4:39,67:.: 0.71:1.000:. ./.:4:36,64:.: 0.45:1.000:. ./.:6:0,114:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,127:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,51:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,65:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.36:1.000:. ./.:4:32,44:.:-0.63:1.000:. ./.:4:39,70:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.05:0.974:. ./.:4:36,57:.: 0.13:1.000:. ./.:4:31,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:24,39:.:-1.21:0.999:. ./.:4:78,39:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.27:1.000:. ./.:4:32,59:.: 0.04:1.000:. ./.:4:36,45:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.36:1.000:. ./.:4:41,83:.: 1.52:1.000:. ./.:4:31,76:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.68:1.000:. ./.:4:39,68:.: 0.76:0.997:. ./.:4:37,78:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.76:1.000:. ./.:4:35,57:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,59:.: 0.31:1.000:. ./.:4:48,74:.: 1.43:1.000:. ./.:4:24,55:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,78:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,58:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.23:1.000:. ./.:4:45,81:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,59:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.80:1.000:. ./.:4:31,64:.: 0.22:1.000:. ./.:4:35,89:.: 1.52:1.000:. ./.:4:28,57:.:-0.23:1.000:. ./.:4:40,85:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.45:1.000:. ./.:4:34,73:.: 0.76:1.000:. ./.:6:39,112:.: 2.73:0.981:. ./.:4:0,98:.: 0.36:1.000:. ./.:4:36,56:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,62:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.09:1.000:. ./.:4:35,92:.: 1.66:1.000:. ./.:4:35,67:.: 0.54:1.000:. ./.:4:45,62:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.67:0.999:. ./.:4:52,102:.: 2.87:1.000:. ./.:4:17,43:.:-1.35:1.000:. ./.:4:42,85:.: 1.66:1.000:. ./.:4:29,75:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.05:1.000:. ./.:4:35,63:.: 0.36:1.000:. ./.:4:32,70:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.32:1.000:. ./.:4:45,72:.: 1.21:1.000:. ./.:4:43,84:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,61:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.31:1.000:. ./.:4:31,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.59:1.000:. ./.:4:35,68:.: 0.58:1.000:. ./.:4:44,81:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.21:1.000:. ./.:4:21,34:.:-1.57:1.000:. ./.:4:26,43:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,57:.:-1.48:1.000:. ./.:4:52,64:.: 1.16:1.000:. ./.:4:36,71:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.22:1.000:. ./.:4:34,73:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.45:1.000:. ./.:4:41,78:.: 1.30:1.000:. ./.:4:37,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,66:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,71:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.76:1.000:. ./.:4:36,54:.: 0.00:1.000:. ./.:4:28,66:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:31,49:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,72:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,67:.: 1.16:1.000:. ./.:4:39,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,56:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,36:.:-1.17:1.000:. ./.:4:37,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:33,66:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,35:.:-2.47:1.000:. ./.:4:34,51:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.94:1.000:. ./.:4:41,74:.: 1.12:0.999:. ./.:4:29,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:31,70:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:20,41:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,72:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,54:.:-1.62:1.000:. ./.:4:32,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:40,46:.:-0.18:1.000:. ./.:4:51,79:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,65:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,54:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,70:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.71:1.000:. ./.:4:33,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:46,56:.: 0.54:1.000:. -chr7.1 19905571 chr7.1_019905571 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:84,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.94:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:83,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:77,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.70:0.985:. ./.:4:105,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:61,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,3:.:-1.76:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:69,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:21,8:.:-1.62:1.000:. ./.:3:13,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:146,1:.: 2.55:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.52:0.986:. ./.:4:9,1:.:-2.29:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:49,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:89,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.21:1.000:. ./.:6:59,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:68,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:56,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.91:0.974:. ./.:4:69,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:51,2:.:-0.77:1.000:. ./.:4:62,1:.:-0.42:0.999:. ./.:4:160,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:57,1:.:-0.59:0.997:. ./.:4:75,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:52,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:86,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:95,2:.: 0.78:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:65,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:85,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:90,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:6:112,0:.: 1.31:0.981:. ./.:4:48,4:.:-0.81:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:87,2:.: 0.50:0.999:. ./.:4:44,2:.:-1.02:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:82,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:28,2:.:-1.58:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:75,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:66,4:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.97:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:78,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:72,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:133,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:63,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.49:0.999:. ./.:4:69,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:41,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:50,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:38,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:88,1:.: 0.50:1.000:. -chr7.1 20142198 chr7.1_020142198 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:44,6:.:-1.32:1.000:. ./.:4:144,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:161,4:.: 1.19:1.000:. ./.:4:163,2:.: 1.19:1.000:. ./.:4:112,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:276,0:.: 3.61:1.000:. ./.:4:90,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:171,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:112,7:.: 0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.80:1.000:. ./.:4:49,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:99,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:140,3:.: 0.71:1.000:. ./.:4:119,3:.: 0.25:1.000:. ./.:4:147,4:.: 0.88:0.985:. ./.:4:211,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:131,6:.: 0.58:1.000:. ./.:4:199,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:43,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:132,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:134,10:.: 0.73:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:128,5:.: 0.49:1.000:. ./.:4:148,2:.: 0.86:1.000:. ./.:4:50,2:.:-1.27:1.000:. ./.:4:186,1:.: 1.67:1.000:. ./.:4:59,1:.:-1.10:1.000:. ./.:4:2,7:.:-2.21:1.000:. ./.:4:96,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:31,5:.:-1.62:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:56,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:128,8:.: 0.56:1.000:. ./.:4:117,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,4:.: 0.71:1.000:. ./.:4:101,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:130,3:.: 0.49:0.986:. ./.:4:180,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:79,3:.:-0.62:1.000:. ./.:4:95,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:85,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:151,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:101,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:93,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:110,1:.: 0.01:1.000:. ./.:6:70,5:.:-0.77:1.000:. ./.:4:91,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:90,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,2:.: 0.82:1.000:. ./.:4:70,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:69,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:140,3:.: 0.71:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.21:0.974:. ./.:4:92,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:109,3:.: 0.03:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:196,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:76,4:.:-0.66:1.000:. ./.:4:99,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:165,2:.: 1.23:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:135,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:180,2:.: 1.56:1.000:. ./.:4:111,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.51:0.997:. ./.:4:184,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:120,6:.: 0.34:1.000:. ./.:4:86,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:134,3:.: 0.58:1.000:. ./.:4:145,2:.: 0.80:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:76,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:123,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:103,4:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:48,7:.:-1.21:1.000:. ./.:4:109,6:.: 0.10:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:61,5:.:-0.97:1.000:. ./.:4:153,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:161,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:65,2:.:-0.95:1.000:. ./.:4:95,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.32:1.000:. ./.:6:102,6:.:-0.05:0.981:. ./.:4:70,2:.:-0.84:1.000:. ./.:4:94,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:80,2:.:-0.62:1.000:. ./.:4:155,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:189,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:142,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:77,3:.:-0.66:1.000:. ./.:4:68,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:5,7:.:-2.15:0.999:. ./.:4:148,2:.: 0.86:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:82,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:72,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:151,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:110,2:.: 0.03:1.000:. ./.:4:123,3:.: 0.34:1.000:. ./.:4:135,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:126,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:111,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,3:.:-1.30:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.88:1.000:. ./.:4:27,1:.:-1.80:1.000:. ./.:4:79,5:.:-0.58:1.000:. ./.:4:66,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:94,4:.:-0.27:1.000:. ./.:4:49,4:.:-1.25:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:61,3:.:-1.01:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:32,4:.:-1.62:1.000:. ./.:4:33,7:.:-1.54:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:59,8:.:-0.95:1.000:. ./.:4:132,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:122,3:.: 0.32:1.000:. ./.:4:101,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:62,6:.:-0.93:1.000:. ./.:4:49,4:.:-1.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:150,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:179,3:.: 1.56:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:111,5:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,4:.:-1.36:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.88:1.000:. ./.:4:123,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:98,4:.:-0.18:1.000:. ./.:4:103,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:101,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:121,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:75,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:89,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:107,4:.: 0.01:0.999:. ./.:4:110,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:85,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:137,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:82,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:99,3:.:-0.18:1.000:. ./.:4:98,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:195,1:.: 1.86:1.000:. ./.:4:173,3:.: 1.43:1.000:. ./.:4:135,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:102,4:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:146,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:128,6:.: 0.51:1.000:. ./.:4:136,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:87,2:.:-0.47:1.000:. -chr7.1 20239243 chr7.1_020239243 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:336,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:460,1:.: 2.05:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:135,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:159,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.19:0.985:. ./.:4:409,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:347,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:121,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:103,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:313,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:152,0:.:-2.10:1.000:. ./.:3:86,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.56:0.986:. ./.:4:574,0:.: 3.57:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:338,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:349,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:334,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.27:1.000:. ./.:6:271,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.35:0.974:. ./.:4:281,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:379,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:330,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:349,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.93:0.997:. ./.:4:365,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:296,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.60:1.000:. ./.:6:342,0:.: 0.46:0.981:. ./.:4:217,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:294,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:474,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:477,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:360,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:234,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:330,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:196,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:255,2:.:-0.69:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:438,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:112,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:393,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:373,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.09:0.999:. ./.:4:284,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:270,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:389,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:296,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.66:1.000:. -chr7.1 20569471 chr7.1_020569471 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:321,110:0.26: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:134,170:0.56:-0.36:1.000:0.960 0/0/1/1:4:157,158:0.51:-0.22:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,356:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:241,200:0.46: 1.34:1.000:0.988 0/1/1/1:4:104,352:0.77: 1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,214:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,207:0.55: 0.56:1.000:0.977 0/1/1/1:4:108,260:0.71: 0.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,35:0.51:-3.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,83:0.84:-2.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:226,87:0.28:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:281,87:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,323:0.78: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,244:0.73: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:293,91:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,242:0.54: 1.54:0.985:0.990 0/0/1/1:4:203,174:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:249,208:0.46: 1.54:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,422:1.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,44:0.51:-3.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,186:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,180:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,184:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,19:0.46:-3.61:1.000:0.987 0/1/1/1:4:93,322:0.77: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,173:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,178:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:225,224:0.51: 1.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:208,185:0.48: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:327,128:0.29: 1.51:1.000:0.993 0/0/0/1:4:242,107:0.31: 0.20:1.000:0.970 0/0/1/1:4:15,21:0.59:-3.68:1.000:0.880 0/1/1/1:4:28,69:0.71:-2.93:1.000:0.992 0/0/1:3:20,17:0.47:-3.67:1.000:0.906 0/0/1/1:4:206,199:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:278,113:0.29: 0.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:159,191:0.55: 0.21:1.000:0.979 0/0/0/1:4:289,90:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:318,108:0.26: 1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,247:0.74:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:233,107:0.32: 0.09:1.000:0.953 0/0/1/1:4:161,189:0.55: 0.21:1.000:0.984 0/1/1/1:4:69,230:0.77:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,161:0.53:-0.35:1.000:0.991 0/0/1/1:4:173,159:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,209:0.54: 0.75:0.986:0.990 0/1/1/1:4:88,197:0.69:-0.60:1.000:0.976 0/1/1/1:4:70,212:0.75:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,198:0.73:-0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,69:0.29:-1.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:318,124:0.29: 1.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:262,81:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,206:0.51: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,182:0.53: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:186,197:0.52: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:222,69:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,221:0.72:-0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:221,85:0.28:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:96,180:0.65:-0.71:1.000:0.906 0/1/1/1:4:74,285:0.79: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,241:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,275:0.74: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,253:0.83:-0.34:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,376:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,173:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,142:0.46:-0.22:1.000:0.986 0/0/1/1:4:175,163:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,236:0.77:-0.32:0.974:1.000 0/0/1/1:4:142,144:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,317:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,240:0.79:-0.36:0.999:1.000 0/0/1/1:4:166,168:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,172:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,152:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,167:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,122:0.50:-1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,163:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:70,261:0.79:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,187:0.52: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,114:0.50:-1.24:0.997:0.997 0/1/1/1:4:73,274:0.79: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,81:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,186:0.69:-0.81:1.000:0.979 0/0/1/1:4:189,194:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,204:0.53: 0.72:1.000:0.993 0/0/1/1:4:141,130:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,205:0.76:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,304:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,231:0.73:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,151:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:240,67:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,178:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,173:0.73:-1.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:119,331:0.73: 1.45:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,346:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,128:0.47:-0.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:180,70:0.29:-1.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:82,248:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,213:0.57: 0.53:1.000:0.944 0/0/1/1:4:139,123:0.48:-0.88:1.000:0.994 0/0/0/1:4:247,82:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,100:0.48:-1.51:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:251,170:0.41: 1.09:0.981:0.563 0/0/1/1:4:148,129:0.47:-0.70:1.000:0.993 0/0/0/1:4:236,86:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,163:0.52:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:191,200:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/1/1/1:4:106,337:0.76: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,244:0.70: 0.18:1.000:0.986 0/1/1/1:4:91,218:0.71:-0.30:1.000:0.989 0/0/0/1:4:370,120:0.25: 1.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,78:0.23: 0.25:0.999:1.000 0/1/1/1:4:96,347:0.78: 1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,182:0.76:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,286:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,244:0.72: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,141:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:76,252:0.77:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,148:0.53:-0.65:1.000:0.991 0/0/1/1:4:179,204:0.54: 0.62:1.000:0.989 0/0/1/1:4:163,157:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,174:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:199,172:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:143,144:0.51:-0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,139:0.43:-0.09:1.000:0.953 0/0/0/1:4:218,85:0.29:-0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:176,62:0.27:-1.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:81,167:0.67:-1.06:1.000:0.937 0/0/0/1:4:165,65:0.29:-1.28:1.000:0.993 0/1/1/1:4:88,227:0.72:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:238,96:0.29: 0.01:1.000:0.990 0/0/0/1:4:143,62:0.31:-1.59:1.000:0.976 0/0/1/1:4:182,168:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,181:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:323,105:0.25: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,199:0.53: 0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:77,229:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,154:0.52:-0.45:1.000:0.994 0/0/0/1:4:237,80:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,142:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,159:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:178,154:0.47:-0.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,182:0.77:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,213:0.51: 1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:327,87:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,284:0.71: 0.83:1.000:0.992 0/0/1/1:4:192,161:0.46: 0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:211,216:0.51: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:211,179:0.47: 0.70:1.000:0.990 0/1/1/1:4:92,353:0.79: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:203,174:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,83:0.87:-2.95:1.000:0.881 0/1/1/1:4:67,215:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,197:0.52: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:214,187:0.47: 0.84:1.000:0.993 0/0/1/1:4:194,192:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:212,241:0.54: 1.49:1.000:0.989 0/1/1/1:4:83,233:0.74:-0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:89,304:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,224:0.72:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:153,151:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:296,102:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,258:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,187:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,176:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:237,95:0.29:-0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:149,173:0.54:-0.14:0.999:0.986 0/1/1/1:4:81,220:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,250:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,225:0.78:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,141:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:99,235:0.70: 0.01:1.000:0.988 0/0/1/1:4:143,143:0.51:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,146:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,122:0.47:-0.87:1.000:0.992 0/0/1/1:4:201,260:0.57: 1.59:1.000:0.950 0/0/1/1:4:210,214:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:84,299:0.78: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,209:0.66:-0.20:1.000:0.873 0/0/0/1:4:296,101:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:259,224:0.47: 1.86:1.000:0.992 0/0/1/1:4:207,198:0.50: 0.89:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,315:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,179:0.54: 0.04:1.000:0.989 -chr7.1 20609809 chr7.1_020609809 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:45,130:0.70: 1.83:1.000:0.981 0/0/1/1:4:47,62:0.53:-0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:70,29:0.28:-0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,50:0.35: 0.45:1.000:0.808 0/1/1/1:4:30,140:0.78: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,36:0.37:-0.99:1.000:0.583 0/0/0/1:4:39,18:0.30:-2.13:1.000:0.988 0/0/0/1:4:67,30:0.29:-0.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,66:0.62:-0.69:1.000:0.628 0/0/1/1:4:35,44:0.52:-1.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,76:0.71:-0.69:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,80:0.62: 0.02:1.000:0.614 0/0/0/1:4:71,33:0.30:-0.55:1.000:0.987 0/0/1/1:4:45,33:0.39:-1.42:1.000:0.727 0/0/1/1:4:41,68:0.58:-0.38:1.000:0.913 0/1/1/1:4:22,116:0.80: 0.59:0.985:1.000 0/0/1/1:4:43,38:0.43:-1.32:1.000:0.958 0/0/1/1:4:62,104:0.58: 1.53:1.000:0.902 0/0/0/1:4:90,58:0.37: 0.92:1.000:0.626 0/0/0/1:4:28,15:0.33:-2.60:1.000:0.935 0/1/1/1:4:24,92:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,38:0.29: 0.05:1.000:0.990 0/0/0/1:4:64,24:0.26:-1.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,21:0.50:-2.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,33:0.27:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:49,26:0.32:-1.52:1.000:0.941 0/0/1/1:4:57,75:0.53: 0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,101:0.54: 1.73:1.000:0.984 0/0/1/1:4:54,92:0.59: 0.86:1.000:0.884 0/1/1/1:4:26,80:0.71:-0.48:1.000:0.990 0/1/1/1:4:18,75:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,42:0.87:-2.46:1.000:0.927 0/0/1/1:4:28,52:0.61:-1.36:1.000:0.738 0/0/1:3:4,4:0.46:-3.77:1.000:0.923 0/0/1/1:4:47,66:0.54:-0.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:43,59:0.54:-0.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,70:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,66:0.45: 0.49:1.000:0.982 0/1/1/1:4:27,96:0.73: 0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,104:0.63: 1.16:1.000:0.511 0/0/1/1:4:45,76:0.58: 0.02:1.000:0.894 0/0/0/1:4:86,47:0.33: 0.42:1.000:0.919 0/0/0/1:4:71,42:0.35:-0.25:1.000:0.819 0/0/0/1:4:114,37:0.23: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,37:0.30:-0.18:1.000:0.983 0/0/1/1:4:66,128:0.62: 2.46:0.986:0.630 0/0/1/1:4:43,48:0.49:-0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,30:0.26:-0.45:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,61:0.63:-1.02:1.000:0.598 0/0/1/1:4:42,77:0.60:-0.05:1.000:0.765 0/0/1/1:4:50,69:0.54:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:44,51:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,92:0.57: 0.96:1.000:0.935 0/0/0/1:4:80,38:0.30:-0.08:1.000:0.983 0/0/0/1:4:65,37:0.34:-0.62:1.000:0.876 0/0/1/1:4:44,81:0.60: 0.15:1.000:0.757 0/0/1/1:4:67,53:0.41:-0.02:1.000:0.865 0/1/1/1:4:29,115:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:55,101:0.60: 1.19:1.000:0.670 0/0/1/1:4:63,96:0.56: 1.29:1.000:0.966 0/0/1/1:4:45,72:0.57:-0.12:1.000:0.941 0/0/1/1:4:60,120:0.62: 2.00:1.000:0.545 0/0/1/1:4:58,105:0.60: 1.43:1.000:0.791 0/0/0/1:4:102,48:0.30: 0.99:1.000:0.985 0/1/1/1:4:24,151:0.83: 1.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,52:0.52:-0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,73:0.58:-0.12:1.000:0.913 0/1/1/1:4:49,107:0.64: 1.19:0.974:0.695 0/1/1/1:4:16,115:0.85: 0.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:75,55:0.39: 0.32:1.000:0.727 0/0/1/1:4:38,27:0.39:-1.86:0.999:0.649 0/0/1/1:4:54,80:0.55: 0.45:1.000:0.975 0/0/1/1:4:39,73:0.61:-0.28:1.000:0.720 0/1/1/1:4:26,131:0.79: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,60:0.58:-0.82:1.000:0.908 0/0/1/1:4:52,50:0.45:-0.62:1.000:0.983 0/0/1/1:4:74,72:0.46: 0.86:1.000:0.985 0/0/0/1:4:94,40:0.28: 0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,124:0.75: 1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,112:0.77: 0.59:0.997:1.000 0/0/0/1:4:96,35:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,86:0.55: 0.82:1.000:0.979 0/0/1/1:4:54,84:0.57: 0.59:1.000:0.957 0/0/0/1:4:72,31:0.28:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,40:0.34:-0.32:1.000:0.889 0/0/1/1:4:35,66:0.61:-0.65:1.000:0.702 0/1/1/1:4:31,78:0.67:-0.38:1.000:0.918 0/0/1/1:4:56,43:0.40:-0.72:1.000:0.819 0/0/1/1:4:49,61:0.51:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,65:0.55:-0.38:1.000:0.976 0/1/1/1:4:34,113:0.72: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,54:0.33: 1.09:1.000:0.921 0/0/1/1:4:40,59:0.55:-0.72:1.000:0.976 0/0/1/1:4:72,121:0.58: 2.43:1.000:0.900 0/0/1/1:4:78,63:0.41: 0.69:1.000:0.890 0/0/1/1:4:41,42:0.47:-1.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:32,96:0.70: 0.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:87,37:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,68:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,83:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,67:0.57:-0.38:1.000:0.943 0/0/0/1:4:64,25:0.26:-1.05:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:63,140:0.64: 2.77:0.981:0.885 0/1/1/1:4:27,120:0.77: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,63:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,36:0.30:-0.28:1.000:0.984 0/0/1/1:4:47,80:0.59: 0.22:1.000:0.886 0/0/0/1:4:81,51:0.36: 0.39:1.000:0.687 0/0/0/1:4:78,34:0.29:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,90:0.68: 0.12:1.000:0.952 0/1/1/1:4:45,128:0.69: 1.76:1.000:0.978 0/1/1/1:4:17,123:0.85: 0.65:0.999:0.989 0/0/1/1:4:67,88:0.53: 1.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,25:0.36:-1.89:1.000:0.640 0/0/0/1:4:77,43:0.33:-0.02:1.000:0.899 0/1/1/1:4:37,77:0.63:-0.22:1.000:0.568 0/0/1/1:4:38,75:0.62:-0.25:1.000:0.582 0/0/0/1:4:73,35:0.30:-0.42:1.000:0.981 0/0/0/1:4:68,37:0.33:-0.52:1.000:0.923 0/0/1/1:4:50,88:0.59: 0.59:1.000:0.840 0/0/1/1:4:49,77:0.57: 0.19:1.000:0.952 0/0/0/1:4:92,57:0.36: 0.96:1.000:0.725 0/1/1/1:4:30,109:0.74: 0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,42:0.40:-0.79:1.000:0.810 0/1/1/1:4:47,101:0.64: 0.92:1.000:0.655 0/0/1/1:4:52,62:0.50:-0.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,124:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,70:0.59:-0.35:1.000:0.848 0/0/1/1:4:42,46:0.48:-1.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,93:0.63: 0.55:1.000:0.611 0/0/1/1:4:50,65:0.52:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:42,39:0.45:-1.32:1.000:0.976 0/0/0/1:4:63,26:0.28:-1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,45:0.47:-1.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,85:0.57: 0.59:1.000:0.939 0/1/1/1:4:19,96:0.79:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,76:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,26:0.28:-1.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,100:0.74: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,84:0.55: 0.72:1.000:0.981 0/0/0/1:4:71,35:0.31:-0.48:1.000:0.974 0/0/1/1:4:43,70:0.58:-0.25:1.000:0.929 0/0/1/1:4:38,61:0.57:-0.72:1.000:0.939 0/0/1/1:4:72,100:0.54: 1.73:1.000:0.988 0/0/1/1:4:67,102:0.56: 1.63:1.000:0.966 0/0/1/1:4:75,83:0.49: 1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,77:0.56: 0.22:1.000:0.961 0/0/1/1:4:50,84:0.58: 0.45:1.000:0.900 0/0/1/1:4:48,81:0.58: 0.29:1.000:0.895 0/0/1/1:4:73,89:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,28:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,38:0.55:-1.89:1.000:0.979 0/0/1/1:4:56,59:0.47:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,42:0.38:-0.62:1.000:0.609 0/0/0/1:4:84,33:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,93:0.53: 1.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:19,119:0.83: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,71:0.54: 0.05:1.000:0.988 0/0/0/1:4:73,42:0.34:-0.18:1.000:0.862 0/0/0/1:4:75,35:0.30:-0.35:1.000:0.986 0/0/1/1:4:36,63:0.59:-0.72:1.000:0.848 0/0/1/1:4:58,82:0.54: 0.65:1.000:0.985 0/0/0/1:4:89,55:0.36: 0.79:1.000:0.731 0/0/1/1:4:31,58:0.61:-1.05:1.000:0.721 0/0/1/1:4:41,56:0.54:-0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:44,67:0.56:-0.32:1.000:0.966 0/1/1/1:4:21,110:0.80: 0.35:0.999:1.000 0/0/0/1:4:96,52:0.33: 0.92:1.000:0.927 0/0/0/1:4:70,42:0.35:-0.28:1.000:0.793 0/0/1/1:4:47,72:0.56:-0.05:1.000:0.964 0/0/0/1:4:53,23:0.28:-1.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,69:0.54:-0.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:50,70:0.54:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:45,59:0.53:-0.55:1.000:0.994 0/0/0/1:4:65,33:0.32:-0.75:1.000:0.964 0/0/0/1:4:71,36:0.32:-0.45:1.000:0.965 0/0/0/1:4:87,35:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,74:0.62:-0.28:1.000:0.619 0/0/1/1:4:58,67:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,61:0.47:-0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,78:0.56: 0.29:1.000:0.964 0/0/1/1:4:67,113:0.58: 2.00:1.000:0.896 0/0/0/1:4:56,35:0.36:-0.99:1.000:0.705 0/1/1/1:4:29,128:0.77: 1.22:1.000:1.000 -chr7.1 20654480 chr7.1_020654480 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:291,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:402,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:288,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:270,2:.: 0.34:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:333,3:.: 1.39:0.985:. ./.:4:316,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:391,1:.: 2.30:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:287,2:.: 0.62:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.49:1.000:. ./.:3:54,0:.:-3.22:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:335,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:302,3:.: 0.88:0.986:. ./.:4:256,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.70:1.000:. ./.:6:203,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:311,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:106,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.68:0.974:. ./.:4:190,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.44:0.999:. ./.:4:292,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:293,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.18:0.997:. ./.:4:324,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.43:1.000:. ./.:6:298,0:.: 0.77:0.981:. ./.:4:263,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:180,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:429,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:367,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:183,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:245,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:310,5:.: 1.04:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:341,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:299,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:324,2:.: 1.22:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.69:0.999:. ./.:4:279,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:234,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:345,4:.: 1.60:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:255,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.00:1.000:. -chr7.1 20962088 chr7.1_020962088 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:395,114:.: 1.79:1.000:. ./.:4:78,207:.:-0.72:1.000:. ./.:4:264,92:.: 0.07:1.000:. ./.:4:211,203:.: 0.73:1.000:. ./.:4:333,101:.: 0.95:1.000:. ./.:4:382,124:.: 1.76:1.000:. ./.:4:154,145:.:-0.57:1.000:. ./.:4:303,92:.: 0.51:1.000:. ./.:4:187,181:.: 0.21:1.000:. ./.:4:142,32:.:-1.97:1.000:. ./.:4:91,64:.:-2.18:1.000:. ./.:4:109,273:.: 0.37:1.000:. ./.:4:330,103:.: 0.94:1.000:. ./.:4:318,106:.: 0.84:1.000:. ./.:4:218,212:.: 0.91:1.000:. ./.:4:345,111:.: 1.20:1.000:. ./.:4:338,100:.: 0.99:0.985:. ./.:4:239,228:.: 1.32:1.000:. ./.:4:388,107:.: 1.64:1.000:. ./.:4:245,178:.: 0.83:1.000:. ./.:4:74,88:.:-2.10:1.000:. ./.:4:265,74:.:-0.12:1.000:. ./.:4:201,186:.: 0.42:1.000:. ./.:4:318,95:.: 0.71:1.000:. ./.:4:127,23:.:-2.24:1.000:. ./.:4:255,210:.: 1.30:1.000:. ./.:4:335,116:.: 1.14:1.000:. ./.:4:209,174:.: 0.38:1.000:. ./.:4:355,110:.: 1.30:1.000:. ./.:4:207,188:.: 0.51:1.000:. ./.:4:191,162:.: 0.04:1.000:. ./.:4:325,78:.: 0.60:1.000:. ./.:4:68,19:.:-2.95:1.000:. ./.:4:141,26:.:-2.05:1.000:. ./.:3:61,15:.:-3.07:1.000:. ./.:4:223,182:.: 0.62:1.000:. ./.:4:227,179:.: 0.64:1.000:. ./.:4:277,86:.: 0.15:1.000:. ./.:4:290,85:.: 0.29:1.000:. ./.:4:361,68:.: 0.89:1.000:. ./.:4:265,62:.:-0.25:1.000:. ./.:4:283,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:222,172:.: 0.50:1.000:. ./.:4:174,152:.:-0.26:1.000:. ./.:4:180,143:.:-0.30:1.000:. ./.:4:272,76:.:-0.02:1.000:. ./.:4:336,93:.: 0.89:0.986:. ./.:4:373,115:.: 1.56:1.000:. ./.:4:251,80:.:-0.21:1.000:. ./.:4:193,142:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,56:.:-1.02:1.000:. ./.:4:353,106:.: 1.23:1.000:. ./.:4:227,79:.:-0.49:1.000:. ./.:4:255,89:.:-0.06:1.000:. ./.:4:276,77:.: 0.04:1.000:. ./.:4:219,200:.: 0.78:1.000:. ./.:4:261,90:.: 0.02:1.000:. ./.:4:187,154:.:-0.09:1.000:. ./.:4:292,82:.: 0.28:1.000:. ./.:6:153,75:.:-1.36:1.000:. ./.:4:164,136:.:-0.55:1.000:. ./.:4:286,97:.: 0.38:1.000:. ./.:4:306,81:.: 0.42:1.000:. ./.:4:164,117:.:-0.77:1.000:. ./.:4:172,175:.:-0.03:1.000:. ./.:4:274,88:.: 0.14:1.000:. ./.:4:119,76:.:-1.73:1.000:. ./.:4:265,81:.:-0.04:1.000:. ./.:4:244,79:.:-0.30:0.974:. ./.:4:88,241:.:-0.23:1.000:. ./.:4:223,159:.: 0.37:1.000:. ./.:4:281,63:.:-0.06:0.999:. ./.:4:113,258:.: 0.24:1.000:. ./.:4:230,205:.: 0.96:1.000:. ./.:4:77,242:.:-0.34:1.000:. ./.:4:263,75:.:-0.13:1.000:. ./.:4:277,62:.:-0.12:1.000:. ./.:4:243,63:.:-0.49:1.000:. ./.:4:163,143:.:-0.49:1.000:. ./.:4:280,51:.:-0.21:1.000:. ./.:4:148,112:.:-1.00:0.997:. ./.:4:245,64:.:-0.45:1.000:. ./.:4:260,80:.:-0.11:1.000:. ./.:4:160,147:.:-0.48:1.000:. ./.:4:178,126:.:-0.51:1.000:. ./.:4:263,72:.:-0.16:1.000:. ./.:4:154,113:.:-0.93:1.000:. ./.:4:138,121:.:-1.02:1.000:. ./.:4:148,115:.:-0.97:1.000:. ./.:4:198,172:.: 0.23:1.000:. ./.:4:238,55:.:-0.63:1.000:. ./.:4:226,66:.:-0.64:1.000:. ./.:4:189,153:.:-0.08:1.000:. ./.:4:163,119:.:-0.76:1.000:. ./.:4:153,110:.:-0.97:1.000:. ./.:4:194,128:.:-0.31:1.000:. ./.:4:180,51:.:-1.33:1.000:. ./.:4:61,165:.:-1.39:1.000:. ./.:4:187,144:.:-0.21:1.000:. ./.:4:287,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:204,58:.:-0.98:1.000:. ./.:4:260,72:.:-0.20:1.000:. ./.:4:179,34:.:-1.53:1.000:. ./.:6:215,141:.: 0.07:0.981:. ./.:4:235,45:.:-0.78:1.000:. ./.:4:201,75:.:-0.82:1.000:. ./.:4:149,133:.:-0.76:1.000:. ./.:4:284,88:.: 0.25:1.000:. ./.:4:284,235:.: 1.90:1.000:. ./.:4:207,172:.: 0.33:1.000:. ./.:4:153,119:.:-0.87:1.000:. ./.:4:427,123:.: 2.25:1.000:. ./.:4:140,127:.:-0.93:0.999:. ./.:4:244,163:.: 0.65:1.000:. ./.:4:136,126:.:-0.98:1.000:. ./.:4:174,172:.:-0.04:1.000:. ./.:4:165,152:.:-0.36:1.000:. ./.:4:260,64:.:-0.29:1.000:. ./.:4:169,141:.:-0.44:1.000:. ./.:4:223,69:.:-0.64:1.000:. ./.:4:295,69:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,55:.:-1.18:1.000:. ./.:4:265,75:.:-0.11:1.000:. ./.:4:338,104:.: 1.04:1.000:. ./.:4:236,59:.:-0.61:1.000:. ./.:4:194,144:.:-0.13:1.000:. ./.:4:235,66:.:-0.54:1.000:. ./.:4:59,162:.:-1.44:1.000:. ./.:4:118,93:.:-1.55:1.000:. ./.:4:178,60:.:-1.25:1.000:. ./.:4:138,146:.:-0.73:1.000:. ./.:4:325,97:.: 0.82:1.000:. ./.:4:160,48:.:-1.59:1.000:. ./.:4:166,133:.:-0.57:1.000:. ./.:4:301,76:.: 0.31:1.000:. ./.:4:449,135:.: 2.63:1.000:. ./.:4:212,120:.:-0.20:1.000:. ./.:4:120,100:.:-1.45:1.000:. ./.:4:139,86:.:-1.40:1.000:. ./.:4:213,54:.:-0.93:1.000:. ./.:4:177,141:.:-0.35:1.000:. ./.:4:151,112:.:-0.97:1.000:. ./.:4:285,68:.: 0.04:1.000:. ./.:4:126,108:.:-1.30:1.000:. ./.:4:256,238:.: 1.62:1.000:. ./.:4:368,105:.: 1.39:1.000:. ./.:4:186,174:.: 0.12:1.000:. ./.:4:191,191:.: 0.37:1.000:. ./.:4:271,216:.: 1.55:1.000:. ./.:4:190,145:.:-0.16:1.000:. ./.:4:287,175:.: 1.26:1.000:. ./.:4:210,199:.: 0.67:1.000:. ./.:4:57,53:.:-2.69:1.000:. ./.:4:268,73:.:-0.09:1.000:. ./.:4:384,101:.: 1.52:1.000:. ./.:4:386,91:.: 1.43:1.000:. ./.:4:423,114:.: 2.11:1.000:. ./.:4:251,202:.: 1.16:1.000:. ./.:4:209,167:.: 0.30:1.000:. ./.:4:238,190:.: 0.88:1.000:. ./.:4:227,198:.: 0.85:1.000:. ./.:4:186,185:.: 0.24:1.000:. ./.:4:270,80:.: 0.01:1.000:. ./.:4:205,174:.: 0.33:1.000:. ./.:4:217,220:.: 0.98:1.000:. ./.:4:378,107:.: 1.52:1.000:. ./.:4:264,74:.:-0.13:1.000:. ./.:4:94,245:.:-0.12:0.999:. ./.:4:189,171:.: 0.12:1.000:. ./.:4:293,80:.: 0.27:1.000:. ./.:4:192,162:.: 0.05:1.000:. ./.:4:298,77:.: 0.29:1.000:. ./.:4:288,65:.: 0.04:1.000:. ./.:4:267,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:215,55:.:-0.89:1.000:. ./.:4:157,124:.:-0.77:1.000:. ./.:4:384,105:.: 1.57:1.000:. ./.:4:326,80:.: 0.64:1.000:. ./.:4:210,232:.: 1.04:1.000:. ./.:4:184,181:.: 0.18:1.000:. ./.:4:344,94:.: 0.99:1.000:. ./.:4:266,219:.: 1.52:1.000:. ./.:4:418,111:.: 2.02:1.000:. ./.:4:193,162:.: 0.06:1.000:. ./.:4:120,262:.: 0.37:1.000:. -chr7.1 21019918 chr7.1_021019918 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:75,33:0.34:-0.63:1.000:0.893 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,28:0.27:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:114,23:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,31:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,17:0.12: 1.22:1.000:0.799 0/0/1/1:4:22,39:0.57:-1.62:1.000:0.955 0/0/0/1:4:87,23:0.27:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,50:0.58:-1.30:1.000:0.914 0/0/0/1:4:18,5:0.28:-2.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,17:0.37:-1.91:1.000:0.514 0/0/0/0:4:181,10:0.07: 1.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,25:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/0:4:204,16:0.10: 1.73:1.000:0.751 0/0/0/0:4:167,10:0.08: 0.82:1.000:0.990 0/0/0/1:4:118,25:0.25: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,36:0.29: 0.34:0.985:0.993 0/0/0/0:4:215,15:0.09: 1.94:1.000:0.931 0/0/0/1:4:196,37:0.22: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,28:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:56,4:0.09:-1.64:1.000:0.909 0/0/1/1:4:63,41:0.40:-0.71:1.000:0.750 0/0/0/1:4:178,19:0.14: 1.24:1.000:0.948 0/0/0/1:4:108,31:0.28: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/0:4:22,1:0.06:-2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,70:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,23:0.27:-0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,45:0.37:-0.19:1.000:0.628 0/0/0/0:4:201,14:0.09: 1.62:1.000:0.933 0/0/1/1:4:29,45:0.54:-1.35:1.000:0.985 0/0/1/1:4:72,55:0.42:-0.23:1.000:0.921 0/0/0/1:4:113,34:0.29: 0.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:1,8:0.75:-2.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,12:0.30:-1.87:1.000:0.989 0/0/1:3:10,4:0.32:-2.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,26:0.21: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,37:0.30: 0.23:1.000:0.987 0/0/0/1:4:74,34:0.34:-0.63:1.000:0.855 0/0/0/1:4:110,33:0.29: 0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:136,38:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,23:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,23:0.19: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,26:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,44:0.52:-1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,25:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,29:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:165,20:0.15: 0.99:0.986:0.990 0/0/0/1:4:9,3:0.30:-2.65:1.000:0.986 0/0/0/0:4:143,5:0.05: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,38:0.31: 0.17:1.000:0.980 0/0/0/1:4:99,13:0.16:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:166,18:0.14: 0.97:1.000:0.957 0/0/0/1:4:126,27:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:173,6:0.05: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,18:0.15: 0.70:1.000:0.985 0/0/0/1:4:115,27:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,27:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,39:0.50:-1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,37:0.38:-0.80:1.000:0.560 0/0/0/0/0/1:6:108,16:0.18:-0.29:1.000:0.970 0/0/0/1:4:127,21:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,35:0.29: 0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:141,39:0.28: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,32:0.27: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:85,38:0.34:-0.31:1.000:0.880 0/0/0/1:4:68,36:0.36:-0.71:1.000:0.650 0/0/0/1:4:89,26:0.28:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,13:0.12: 0.40:1.000:0.672 0/0/0/1:4:115,28:0.26: 0.11:0.974:0.999 0/0/0/0:4:161,9:0.07: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,34:0.29: 0.17:1.000:0.993 0/0/0/0:4:173,12:0.09: 0.99:0.999:0.936 0/0/0/0:4:230,0:0.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,28:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,11:0.09: 0.55:1.000:0.902 0/0/0/1:4:99,16:0.20:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:201,12:0.08: 1.58:1.000:0.990 0/0/0/1:4:86,24:0.28:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:165,22:0.17: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,60:0.44:-0.15:1.000:0.965 0/0/0/0:4:123,10:0.11:-0.10:0.997:0.654 0/0/0/1:4:164,15:0.12: 0.87:1.000:0.709 0/0/0/1:4:114,26:0.26: 0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,36:0.47:-1.39:1.000:0.991 0/0/0/0:4:136,8:0.08: 0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:97,30:0.29:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:30,41:0.52:-1.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:107,25:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,34:0.29: 0.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:144,24:0.20: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,51:0.43:-0.48:1.000:0.943 0/0/1/1:4:68,43:0.39:-0.57:1.000:0.702 0/0/0/0:4:172,12:0.09: 0.97:1.000:0.931 0/0/0/1:4:108,22:0.24:-0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,79:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,37:0.30: 0.11:1.000:0.981 0/0/0/1:4:121,12:0.13:-0.10:1.000:0.874 0/0/0/0:4:188,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,14:0.10: 1.41:1.000:0.878 0/0/0/0:4:242,9:0.05: 2.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,29:0.28:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:204,11:0.07: 1.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,25:0.27:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/0/0/1:6:208,15:0.09: 1.79:0.981:0.857 0/0/0/1:4:101,16:0.19:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,30:0.30:-0.46:1.000:0.981 0/0/0/1:4:86,17:0.23:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,14:0.09: 1.48:1.000:0.898 0/0/0/0:4:259,18:0.09: 2.93:1.000:0.935 0/0/0/0:4:153,3:0.03: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,31:0.35:-0.92:1.000:0.772 0/0/1/1:4:105,67:0.39: 0.72:1.000:0.718 0/0/1/1:4:59,52:0.45:-0.57:0.999:0.975 0/0/0/1:4:123,28:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,38:0.50:-1.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,46:0.54:-1.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:101,26:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/0:4:146,11:0.10: 0.40:1.000:0.835 0/0/0/1:4:84,21:0.26:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,36:0.35:-0.55:1.000:0.822 0/0/0/1:4:134,13:0.12: 0.19:1.000:0.839 0/0/0/1:4:103,26:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,44:0.37:-0.29:1.000:0.576 0/0/0/1:4:104,23:0.25:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,33:0.27: 0.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,26:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,13:0.12: 0.40:1.000:0.672 0/0/0/1:4:77,31:0.32:-0.63:1.000:0.944 0/0/0/0:4:110,7:0.08:-0.44:1.000:0.978 0/0/1/1:4:28,36:0.51:-1.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,30:0.27: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,16:0.19:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,28:0.30:-0.63:1.000:0.980 0/0/0/1:4:148,15:0.13: 0.53:1.000:0.902 0/0/0/1:4:191,49:0.27: 2.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:128,32:0.26: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,28:0.54:-1.93:1.000:0.985 0/0/0/1:4:70,23:0.30:-0.95:1.000:0.988 0/0/1/1:4:50,32:0.39:-1.18:1.000:0.723 0/0/0/1:4:77,33:0.33:-0.59:1.000:0.912 0/0/0/0:4:150,8:0.07: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/0:4:177,10:0.08: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,22:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:100,39:0.32: 0.02:1.000:0.956 0/0/0/1:4:198,34:0.21: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,25:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,14:0.16:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:102,53:0.36: 0.36:1.000:0.684 0/0/1/1:4:28,38:0.52:-1.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,29:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:133,11:0.11: 0.13:1.000:0.602 0/0/1/1:4:18,15:0.44:-2.21:1.000:0.960 0/0/0/1:4:103,11:0.14:-0.50:1.000:0.948 0/0/0/1:4:177,16:0.12: 1.16:1.000:0.676 0/0/0/1:4:123,24:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,36:0.33:-0.33:1.000:0.926 0/0/0/1:4:148,32:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,26:0.29:-0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:110,35:0.29: 0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:29,42:0.53:-1.41:1.000:0.992 0/0/0/0:4:148,10:0.09: 0.42:1.000:0.954 0/0/0/1:4:91,24:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:81,24:0.28:-0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,52:0.49:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:132,28:0.25: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,11:0.08: 1.41:1.000:0.995 0/0/0/0:4:161,13:0.10: 0.76:0.999:0.674 0/0/1/1:4:34,24:0.41:-1.68:1.000:0.856 0/0/0/1:4:157,16:0.13: 0.74:1.000:0.908 0/0/0/1:4:124,16:0.16: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:160,14:0.11: 0.76:1.000:0.578 0/0/0/1:4:118,34:0.28: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:111,24:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,36:0.28: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,15:0.22:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,31:0.27: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:102,30:0.28:-0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:159,27:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,27:0.29:-0.50:1.000:0.992 0/0/0/1:4:154,32:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,17:0.12: 1.41:1.000:0.677 0/0/0/1:4:103,40:0.32: 0.11:1.000:0.957 0/0/0/1:4:83,28:0.30:-0.57:1.000:0.985 0/0/0/0:4:162,9:0.07: 0.70:1.000:0.996 -chr7.1 21226955 chr7.1_021226955 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,11:.:-0.24:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.97:1.000:. ./.:4:41,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:39,14:.: 0.13:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:51,14:.: 0.87:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,17:.: 0.13:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,6:.:-1.59:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,14:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:12,12:.:-1.65:1.000:. ./.:4:18,12:.:-1.28:0.985:. ./.:4:51,19:.: 1.17:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.24:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:43,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,12:.:-1.10:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,9:.:-0.11:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:29,14:.:-0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:39,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.02:1.000:. ./.:4:49,14:.: 0.74:1.000:. ./.:3:22,9:.:-1.22:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:48,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:24,5:.:-1.34:1.000:. ./.:4:46,6:.: 0.07:1.000:. ./.:4:49,18:.: 0.99:1.000:. ./.:4:54,14:.: 1.05:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:57,12:.: 1.11:1.000:. ./.:4:28,10:.:-0.79:0.986:. ./.:4:36,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,16:.: 0.56:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,20:.: 1.05:1.000:. ./.:4:58,11:.: 1.11:1.000:. ./.:4:49,8:.: 0.38:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.11:1.000:. ./.:4:18,16:.:-1.03:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:51,12:.: 0.74:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:25,15:.:-0.67:1.000:. ./.:6:85,6:.: 2.46:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:32,11:.:-0.48:1.000:. ./.:4:73,18:.: 2.46:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:60,13:.: 1.36:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.30:1.000:. ./.:4:49,16:.: 0.87:0.974:. ./.:4:28,8:.:-0.91:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:34,12:.:-0.30:0.999:. ./.:4:39,19:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:48,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:48,17:.: 0.87:1.000:. ./.:4:59,13:.: 1.30:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:63,15:.: 1.66:1.000:. ./.:4:14,21:.:-0.97:0.997:. ./.:4:70,12:.: 1.91:1.000:. ./.:4:66,14:.: 1.79:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:57,11:.: 1.05:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:32,7:.:-0.73:1.000:. ./.:4:24,12:.:-0.91:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,17:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:42,15:.: 0.38:1.000:. ./.:4:17,8:.:-1.59:1.000:. ./.:4:35,7:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,14:.: 0.25:1.000:. ./.:6:65,13:.: 1.66:0.981:. ./.:4:28,10:.:-0.79:1.000:. ./.:4:32,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:52,10:.: 0.68:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:27,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:56,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,17:.: 0.31:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:63,11:.: 1.42:1.000:. ./.:4:58,17:.: 1.48:1.000:. ./.:4:49,13:.: 0.68:1.000:. ./.:4:46,13:.: 0.50:1.000:. ./.:4:39,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:55,17:.: 1.30:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,18:.: 0.44:1.000:. ./.:4:27,9:.:-0.91:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:26,8:.:-1.03:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:25,8:.:-1.10:1.000:. ./.:4:46,12:.: 0.44:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,15:.: 0.31:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:36,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:71,16:.: 2.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:27,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:57,13:.: 1.17:1.000:. ./.:4:59,8:.: 0.99:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:16,10:.:-1.53:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:41,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,5:.:-1.53:1.000:. ./.:4:20,8:.:-1.40:0.999:. ./.:4:61,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:59,7:.: 0.93:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:14,12:.:-1.53:1.000:. ./.:4:46,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:29,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:19,10:.:-1.34:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:49,7:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,7:.: 0.31:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:48,9:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:51,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,12:.:-0.73:1.000:. -chr7.1 21520422 chr7.1_021520422 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:142,81:.: 0.60:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:161,48:.: 0.35:1.000:. ./.:4:145,41:.:-0.05:1.000:. ./.:4:222,36:.: 1.21:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:49,53:.:-1.53:1.000:. ./.:4:141,34:.:-0.25:1.000:. ./.:4:129,33:.:-0.47:1.000:. ./.:4:18,5:.:-2.92:1.000:. ./.:4:18,1:.:-2.99:1.000:. ./.:4:175,32:.: 0.32:1.000:. ./.:4:174,39:.: 0.42:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:153,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:211,34:.: 0.99:1.000:. ./.:4:186,36:.: 0.58:0.985:. ./.:4:159,43:.: 0.23:1.000:. ./.:4:173,92:.: 1.34:1.000:. ./.:4:182,55:.: 0.85:1.000:. ./.:4:18,2:.:-2.97:1.000:. ./.:4:178,28:.: 0.30:1.000:. ./.:4:218,46:.: 1.32:1.000:. ./.:4:135,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:14,1:.:-3.06:1.000:. ./.:4:83,45:.:-1.07:1.000:. ./.:4:170,54:.: 0.62:1.000:. ./.:4:95,74:.:-0.35:1.000:. ./.:4:306,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:122,74:.: 0.12:1.000:. ./.:4:124,60:.:-0.09:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,1:.:-3.18:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.87:1.000:. ./.:3:1,2:.:-3.27:1.000:. ./.:4:116,81:.: 0.14:1.000:. ./.:4:182,30:.: 0.41:1.000:. ./.:4:108,71:.:-0.17:1.000:. ./.:4:184,23:.: 0.32:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:178,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:145,27:.:-0.30:1.000:. ./.:4:171,30:.: 0.21:1.000:. ./.:4:77,52:.:-1.05:1.000:. ./.:4:182,35:.: 0.49:1.000:. ./.:4:160,27:.:-0.03:1.000:. ./.:4:160,76:.: 0.83:0.986:. ./.:4:60,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:162,30:.: 0.05:1.000:. ./.:4:97,9:.:-1.46:1.000:. ./.:4:139,22:.:-0.49:1.000:. ./.:4:172,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:151,28:.:-0.17:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:211,30:.: 0.92:1.000:. ./.:4:139,19:.:-0.54:1.000:. ./.:4:143,48:.: 0.04:1.000:. ./.:4:68,39:.:-1.44:1.000:. ./.:4:120,51:.:-0.32:1.000:. ./.:6:153,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:145,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:145,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:150,26:.:-0.23:1.000:. ./.:4:150,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:175,36:.: 0.39:1.000:. ./.:4:163,28:.: 0.04:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:136,25:.:-0.49:0.974:. ./.:4:197,26:.: 0.60:1.000:. ./.:4:126,58:.:-0.09:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.32:0.999:. ./.:4:214,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:168,69:.: 0.85:1.000:. ./.:4:143,20:.:-0.46:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:127,79:.: 0.30:1.000:. ./.:4:167,21:.:-0.02:0.997:. ./.:4:221,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:178,29:.: 0.32:1.000:. ./.:4:136,36:.:-0.30:1.000:. ./.:4:152,10:.:-0.47:1.000:. ./.:4:171,24:.: 0.11:1.000:. ./.:4:98,33:.:-1.02:1.000:. ./.:4:118,22:.:-0.86:1.000:. ./.:4:161,12:.:-0.28:1.000:. ./.:4:142,18:.:-0.51:1.000:. ./.:4:59,39:.:-1.60:1.000:. ./.:4:127,57:.:-0.09:1.000:. ./.:4:217,28:.: 0.99:1.000:. ./.:4:120,34:.:-0.61:1.000:. ./.:4:31,93:.:-1.14:1.000:. ./.:4:152,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:119,12:.:-1.02:1.000:. ./.:4:176,25:.: 0.21:1.000:. ./.:4:98,19:.:-1.26:1.000:. ./.:6:307,0:.: 2.08:0.981:. ./.:4:152,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:186,31:.: 0.49:1.000:. ./.:4:123,37:.:-0.51:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:163,36:.: 0.18:1.000:. ./.:4:174,92:.: 1.36:1.000:. ./.:4:140,44:.:-0.09:0.999:. ./.:4:267,36:.: 2.01:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:114,51:.:-0.42:1.000:. ./.:4:100,19:.:-1.23:1.000:. ./.:4:91,35:.:-1.11:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:137,23:.:-0.51:1.000:. ./.:4:95,70:.:-0.42:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:171,32:.: 0.25:1.000:. ./.:4:157,48:.: 0.28:1.000:. ./.:4:144,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:129,60:.: 0.00:1.000:. ./.:4:148,31:.:-0.17:1.000:. ./.:4:151,24:.:-0.25:1.000:. ./.:4:127,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:110,23:.:-0.98:1.000:. ./.:4:116,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:195,55:.: 1.07:1.000:. ./.:4:109,17:.:-1.11:1.000:. ./.:4:137,14:.:-0.67:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:193,42:.: 0.81:1.000:. ./.:4:226,24:.: 1.07:1.000:. ./.:4:124,29:.:-0.63:1.000:. ./.:4:147,17:.:-0.44:1.000:. ./.:4:105,50:.:-0.60:1.000:. ./.:4:104,49:.:-0.63:1.000:. ./.:4:179,28:.: 0.32:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:113,18:.:-1.02:1.000:. ./.:4:133,94:.: 0.67:1.000:. ./.:4:234,40:.: 1.50:1.000:. ./.:4:190,48:.: 0.86:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:102,68:.:-0.33:1.000:. ./.:4:123,73:.: 0.12:1.000:. ./.:4:213,33:.: 1.00:1.000:. ./.:4:191,40:.: 0.74:1.000:. ./.:4:6,1:.:-3.20:1.000:. ./.:4:121,36:.:-0.56:1.000:. ./.:4:200,27:.: 0.67:1.000:. ./.:4:176,34:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,88:.: 0.42:1.000:. ./.:4:220,38:.: 1.21:1.000:. ./.:4:179,37:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,77:.: 0.67:1.000:. ./.:4:110,81:.: 0.04:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:217,41:.: 1.21:1.000:. ./.:4:145,57:.: 0.23:1.000:. ./.:4:126,74:.: 0.19:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:157,37:.: 0.09:1.000:. ./.:4:203,48:.: 1.09:0.999:. ./.:4:114,82:.: 0.12:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:144,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:151,34:.:-0.07:1.000:. ./.:4:156,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:146,76:.: 0.58:1.000:. ./.:4:125,41:.:-0.40:1.000:. ./.:4:146,39:.:-0.07:1.000:. ./.:4:168,47:.: 0.46:1.000:. ./.:4:177,39:.: 0.48:1.000:. ./.:4:136,45:.:-0.14:1.000:. ./.:4:114,62:.:-0.23:1.000:. ./.:4:187,48:.: 0.81:1.000:. ./.:4:310,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:110,96:.: 0.30:1.000:. ./.:4:118,34:.:-0.65:1.000:. ./.:4:176,44:.: 0.55:1.000:. -chr7.1 21556422 chr7.1_021556422 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:94,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.05:0.985:. ./.:4:119,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:242,0:.: 3.42:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.72:1.000:. ./.:3:51,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.43:0.986:. ./.:4:243,0:.: 3.44:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.13:1.000:. ./.:6:143,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.15:0.974:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:117,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.85:0.997:. ./.:4:122,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:202,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.13:1.000:. ./.:6:254,0:.: 3.73:0.981:. ./.:4:89,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:206,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.13:0.999:. ./.:4:168,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:75,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.16:1.000:. -chr7.1 21632850 chr7.1_021632850 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,28:.: 1.20:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:59,36:.: 2.73:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:25,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:26,19:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,4:.:-3.01:1.000:. ./.:4:11,11:.:-1.93:1.000:. ./.:4:27,17:.:-0.53:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:28,21:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:44,19:.: 0.68:0.985:. ./.:4:69,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:53,30:.: 1.96:1.000:. ./.:4:49,26:.: 1.45:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:34,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:36,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:26,14:.:-0.78:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:25,19:.:-0.53:1.000:. ./.:4:40,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:5,6:.:-2.63:1.000:. ./.:4:16,6:.:-1.93:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:38,19:.: 0.30:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,22:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:37,25:.: 0.62:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:36,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:50,12:.: 0.62:0.986:. ./.:4:6,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:28,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:42,21:.: 0.68:1.000:. ./.:4:35,27:.: 0.62:1.000:. ./.:6:42,13:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,24:.: 1.39:1.000:. ./.:4:41,28:.: 1.07:1.000:. ./.:4:50,29:.: 1.71:1.000:. ./.:4:33,33:.: 0.88:1.000:. ./.:4:38,18:.: 0.24:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:43,23:.: 0.88:0.974:. ./.:4:30,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:48,24:.: 1.26:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.11:0.999:. ./.:4:68,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:41,23:.: 0.75:1.000:. ./.:4:42,41:.: 1.96:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:35,26:.: 0.56:1.000:. ./.:4:33,17:.:-0.14:0.997:. ./.:4:63,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:35,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:28,26:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,22:.: 0.30:1.000:. ./.:4:30,39:.: 1.07:1.000:. ./.:4:42,32:.: 1.39:1.000:. ./.:4:29,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:37,19:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,42:.: 1.26:1.000:. ./.:4:38,25:.: 0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,27:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.34:1.000:. ./.:6:71,0:.: 1.20:0.981:. ./.:4:34,21:.: 0.17:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:30,25:.: 0.17:1.000:. ./.:4:42,18:.: 0.49:1.000:. ./.:4:56,38:.: 2.66:0.999:. ./.:4:48,18:.: 0.88:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:45,26:.: 1.20:1.000:. ./.:4:32,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:44,26:.: 1.13:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:35,29:.: 0.75:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:22,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:40,29:.: 1.07:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:22,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:58,34:.: 2.53:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:23,27:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:32,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:33,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,20:.:-0.78:1.000:. ./.:4:46,22:.: 1.00:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:28,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:47,17:.: 0.75:1.000:. ./.:4:38,23:.: 0.56:1.000:. ./.:4:40,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:8,8:.:-2.31:1.000:. ./.:4:20,7:.:-1.61:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,27:.: 1.20:1.000:. ./.:4:32,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:34,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:37,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:28,19:.:-0.34:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:38,23:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,7:.:-1.93:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:35,14:.:-0.21:0.999:. ./.:4:20,19:.:-0.85:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:25,14:.:-0.85:1.000:. ./.:4:33,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.27:1.000:. ./.:4:30,16:.:-0.40:1.000:. ./.:4:26,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:38,36:.: 1.39:1.000:. ./.:4:34,21:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,23:.: 1.32:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,15:.: 0.37:1.000:. -chr7.1 21909718 chr7.1_021909718 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:67,192:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.06:1.000:. ./.:4:65,209:.:-0.03:1.000:. ./.:4:87,295:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,340:.: 1.11:1.000:. ./.:4:34,181:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.14:1.000:. ./.:4:59,179:.:-0.65:1.000:. ./.:4:28,144:.:-1.78:1.000:. ./.:4:11,120:.:-2.48:1.000:. ./.:4:51,201:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1,262:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,342:.: 1.14:1.000:. ./.:4:72,240:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,301:.: 0.44:1.000:. ./.:4:66,216:.: 0.11:0.985:. ./.:4:1,357:.: 1.41:1.000:. ./.:4:105,305:.: 2.31:1.000:. ./.:4:65,245:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,164:.:-1.90:1.000:. ./.:4:63,157:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,117:.:-2.72:1.000:. ./.:4:86,280:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.06:1.000:. ./.:4:58,194:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,348:.: 1.24:1.000:. ./.:4:62,219:.: 0.09:1.000:. ./.:4:59,191:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,218:.:-0.97:1.000:. ./.:4:10,56:.:-3.60:1.000:. ./.:4:33,149:.:-1.61:1.000:. ./.:3:0,67:.:-3.58:1.000:. ./.:4:65,214:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,306:.: 0.54:1.000:. ./.:4:57,223:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,292:.: 0.28:1.000:. ./.:4:53,226:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,357:.: 1.40:1.000:. ./.:4:59,201:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.83:1.000:. ./.:4:74,246:.: 0.76:0.986:. ./.:4:0,211:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,289:.: 0.23:1.000:. ./.:4:86,249:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,381:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,311:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,354:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.35:1.000:. ./.:4:75,268:.: 1.16:1.000:. ./.:4:61,196:.:-0.32:1.000:. ./.:6:31,176:.:-1.18:1.000:. ./.:4:68,197:.:-0.18:1.000:. ./.:4:58,203:.:-0.25:1.000:. ./.:4:61,254:.: 0.68:1.000:. ./.:4:45,220:.:-0.18:1.000:. ./.:4:59,220:.: 0.06:1.000:. ./.:4:65,257:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,199:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,218:.: 0.14:0.974:. ./.:4:46,180:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,248:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,301:.: 0.44:0.999:. ./.:4:0,320:.: 0.76:1.000:. ./.:4:70,219:.: 0.23:1.000:. ./.:4:61,207:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1,277:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,320:.: 0.78:1.000:. ./.:4:69,226:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,173:.:-0.94:0.997:. ./.:4:0,362:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,345:.: 1.19:1.000:. ./.:4:59,199:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.92:1.000:. ./.:4:46,146:.:-1.44:1.000:. ./.:4:58,178:.:-0.68:1.000:. ./.:4:55,215:.:-0.10:1.000:. ./.:4:55,189:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,170:.:-0.73:1.000:. ./.:4:63,221:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.73:1.000:. ./.:4:32,165:.:-1.35:1.000:. ./.:4:119,117:.:-0.68:1.000:. ./.:4:68,244:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,338:.: 1.07:1.000:. ./.:4:63,192:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.97:1.000:. ./.:6:0,398:.: 2.10:0.981:. ./.:4:46,159:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,405:.: 2.22:1.000:. ./.:4:1,292:.: 0.30:1.000:. ./.:4:77,219:.: 0.35:1.000:. ./.:4:70,281:.: 1.29:1.000:. ./.:4:68,227:.: 0.33:0.999:. ./.:4:63,282:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,218:.:-0.99:1.000:. ./.:4:77,249:.: 0.86:1.000:. ./.:4:61,241:.: 0.45:1.000:. ./.:4:42,187:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,283:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.35:1.000:. ./.:4:79,255:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,306:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1,267:.:-0.13:1.000:. ./.:4:68,178:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.78:1.000:. ./.:4:74,228:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,139:.:-1.62:1.000:. ./.:4:46,153:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,169:.:-1.83:1.000:. ./.:4:63,213:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,239:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,189:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,313:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,288:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,376:.: 1.72:1.000:. ./.:4:72,208:.: 0.08:1.000:. ./.:4:58,202:.:-0.27:1.000:. ./.:4:45,167:.:-1.09:1.000:. ./.:4:51,197:.:-0.47:1.000:. ./.:4:53,258:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,211:.:-1.11:1.000:. ./.:4:47,140:.:-1.52:1.000:. ./.:4:96,310:.: 2.24:1.000:. ./.:4:0,387:.: 1.91:1.000:. ./.:4:66,215:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.86:1.000:. ./.:4:75,300:.: 1.71:1.000:. ./.:4:59,202:.:-0.25:1.000:. ./.:4:80,220:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,268:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,156:.:-1.81:1.000:. ./.:4:60,135:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,345:.: 1.19:1.000:. ./.:4:68,256:.: 0.83:1.000:. ./.:4:67,229:.: 0.35:1.000:. ./.:4:60,187:.:-0.49:1.000:. ./.:4:82,238:.: 0.76:1.000:. ./.:4:68,211:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,250:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.77:1.000:. ./.:4:59,218:.: 0.02:1.000:. ./.:4:69,168:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,326:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.44:1.000:. ./.:4:59,195:.:-0.37:0.999:. ./.:4:68,171:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,255:.:-0.35:1.000:. ./.:4:52,167:.:-0.97:1.000:. ./.:4:63,210:.:-0.04:1.000:. ./.:4:50,191:.:-0.59:1.000:. ./.:4:52,167:.:-0.97:1.000:. ./.:4:53,161:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,186:.:-1.54:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,316:.: 0.71:1.000:. ./.:4:72,215:.: 0.20:1.000:. ./.:4:53,159:.:-1.09:1.000:. ./.:4:1,296:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.81:1.000:. ./.:4:87,298:.: 1.88:1.000:. ./.:4:51,220:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,213:.:-0.04:1.000:. -chr7.1 22360539 chr7.1_022360539 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:132,68:.: 2.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:17,43:.:-0.60:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:139,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:52,42:.: 0.24:1.000:. ./.:4:26,53:.:-0.13:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:13,5:.:-1.64:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,47:.: 0.76:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:71,67:.: 1.32:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.25:0.985:. ./.:4:63,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:106,74:.: 2.36:1.000:. ./.:4:108,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:3,15:.:-1.64:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:22,69:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:11,5:.:-1.69:1.000:. ./.:4:58,66:.: 0.98:1.000:. ./.:4:21,71:.: 0.19:1.000:. ./.:4:70,59:.: 1.10:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:129,78:.: 3.03:1.000:. ./.:4:104,53:.: 1.79:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.76:1.000:. ./.:3:3,7:.:-1.83:1.000:. ./.:4:61,45:.: 0.53:1.000:. ./.:4:70,51:.: 0.90:1.000:. ./.:4:91,63:.: 1.72:1.000:. ./.:4:57,43:.: 0.39:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:18,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:25,50:.:-0.23:1.000:. ./.:4:45,47:.: 0.19:1.000:. ./.:4:17,77:.: 0.24:1.000:. ./.:4:25,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:80,55:.: 1.25:0.986:. ./.:4:83,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,62:.: 0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,38:.:-0.77:1.000:. ./.:4:27,55:.:-0.06:1.000:. ./.:4:28,57:.: 0.02:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:19,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:17,66:.:-0.03:1.000:. ./.:4:71,50:.: 0.90:1.000:. ./.:4:82,45:.: 1.05:1.000:. ./.:6:37,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.58:0.974:. ./.:4:58,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:62,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.54:0.999:. ./.:4:29,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:78,67:.: 1.50:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:62,48:.: 0.63:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.07:0.997:. ./.:4:30,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:22,60:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:29,56:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,68:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,52:.: 1.23:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,56:.: 0.44:1.000:. ./.:4:79,47:.: 1.03:1.000:. ./.:4:17,71:.: 0.09:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:79,73:.: 1.67:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:18,50:.:-0.40:1.000:. ./.:4:13,49:.:-0.55:1.000:. ./.:5:57,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:77,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:47,42:.: 0.12:1.000:. ./.:4:14,37:.:-0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:131,92:.: 3.42:1.000:. ./.:4:89,45:.: 1.23:0.999:. ./.:4:109,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:66,65:.: 1.15:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:24,33:.:-0.67:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:18,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:69,58:.: 1.05:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:22,61:.:-0.03:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:43,59:.: 0.44:1.000:. ./.:4:23,55:.:-0.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,42:.:-0.63:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:70,56:.: 1.03:1.000:. ./.:4:14,32:.:-0.95:1.000:. ./.:4:15,68:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,85:.: 0.90:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,47:.: 0.24:1.000:. ./.:4:87,53:.: 1.37:1.000:. ./.:4:52,51:.: 0.46:1.000:. ./.:4:21,44:.:-0.48:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:78,73:.: 1.64:1.000:. ./.:4:17,72:.: 0.12:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:25,78:.: 0.46:1.000:. ./.:4:90,56:.: 1.52:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:21,63:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,5:.:-1.76:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:20,63:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,84:.: 0.63:1.000:. ./.:4:88,72:.: 1.87:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,59:.: 1.10:1.000:. ./.:4:121,51:.: 2.16:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:66,55:.: 0.90:1.000:. ./.:4:56,52:.: 0.58:1.000:. ./.:4:64,52:.: 0.78:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,63:.:-0.11:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:21,51:.:-0.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:40,43:.:-0.03:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:51,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:63,56:.: 0.86:1.000:. ./.:4:26,54:.:-0.11:1.000:. ./.:4:22,87:.: 0.61:1.000:. ./.:4:37,66:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:82,50:.: 1.18:1.000:. ./.:4:29,58:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,92:.: 2.71:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.55:1.000:. -chr7.1 22597908 chr7.1_022597908 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:128,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:97,54:.:-0.55:1.000:. ./.:4:101,54:.:-0.48:1.000:. ./.:4:166,45:.: 0.50:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:157,63:.: 0.66:1.000:. ./.:4:129,39:.:-0.25:1.000:. ./.:4:109,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:106,61:.:-0.27:1.000:. ./.:4:81,1:.:-1.76:1.000:. ./.:4:35,21:.:-2.22:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,52:.:-1.31:1.000:. ./.:4:133,58:.: 0.15:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:64,67:.:-0.90:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.71:0.985:. ./.:4:80,148:.: 0.80:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:229,73:.: 2.10:1.000:. ./.:4:74,18:.:-1.59:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:211,49:.: 1.36:1.000:. ./.:4:131,57:.: 0.10:1.000:. ./.:4:36,17:.:-2.27:1.000:. ./.:4:195,52:.: 1.13:1.000:. ./.:4:109,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:63,65:.:-0.96:1.000:. ./.:4:132,55:.: 0.08:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.36:1.000:. ./.:3:37,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:240,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:100,59:.:-0.41:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:69,62:.:-0.90:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:220,48:.: 1.50:1.000:. ./.:4:166,62:.: 0.80:1.000:. ./.:4:180,58:.: 0.98:1.000:. ./.:4:141,67:.: 0.45:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.06:0.986:. ./.:4:166,71:.: 0.96:1.000:. ./.:4:104,45:.:-0.59:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,56:.:-1.20:1.000:. ./.:4:122,51:.:-0.17:1.000:. ./.:4:192,52:.: 1.08:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:185,49:.: 0.91:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.20:1.000:. ./.:6:214,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:169,58:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:50,43:.:-1.57:1.000:. ./.:4:73,46:.:-1.11:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.19:0.974:. ./.:4:93,57:.:-0.57:1.000:. ./.:4:237,56:.: 1.94:1.000:. ./.:4:108,39:.:-0.62:0.999:. ./.:4:65,111:.:-0.11:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:95,43:.:-0.78:1.000:. ./.:4:52,45:.:-1.50:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:65,60:.:-1.01:1.000:. ./.:4:197,80:.: 1.66:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,31:.:-1.92:0.997:. ./.:4:101,68:.:-0.24:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:110,53:.:-0.34:1.000:. ./.:4:178,59:.: 0.96:1.000:. ./.:4:146,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:93,43:.:-0.82:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:161,55:.: 0.59:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:200,71:.: 1.56:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:209,62:.: 1.56:1.000:. ./.:4:201,49:.: 1.19:1.000:. ./.:4:44,50:.:-1.55:1.000:. ./.:4:127,57:.: 0.03:1.000:. ./.:4:217,87:.: 2.14:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:110,50:.:-0.39:1.000:. ./.:5:118,51:.:-0.24:0.999:. ./.:4:99,1:.:-1.45:1.000:. ./.:4:65,54:.:-1.11:1.000:. ./.:4:148,54:.: 0.34:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:269,69:.: 2.73:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:105,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.38:0.999:. ./.:4:209,52:.: 1.38:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.13:1.000:. ./.:4:197,60:.: 1.31:1.000:. ./.:4:88,56:.:-0.67:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:204,59:.: 1.42:1.000:. ./.:4:119,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,31:.:-1.73:1.000:. ./.:4:119,50:.:-0.24:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:101,49:.:-0.57:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:101,59:.:-0.39:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:53,67:.:-1.10:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:182,64:.: 1.12:1.000:. ./.:4:57,60:.:-1.15:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:94,39:.:-0.87:1.000:. ./.:4:133,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:185,61:.: 1.12:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:306,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:137,59:.: 0.24:1.000:. ./.:4:115,63:.:-0.08:1.000:. ./.:4:240,74:.: 2.31:1.000:. ./.:4:116,44:.:-0.39:1.000:. ./.:4:333,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:187,57:.: 1.08:1.000:. ./.:4:91,22:.:-1.22:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:132,55:.: 0.08:1.000:. ./.:4:133,57:.: 0.13:1.000:. ./.:4:204,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:129,50:.:-0.06:1.000:. ./.:4:213,57:.: 1.54:1.000:. ./.:4:115,65:.:-0.04:1.000:. ./.:4:110,39:.:-0.59:1.000:. ./.:4:68,54:.:-1.06:1.000:. ./.:4:165,43:.: 0.45:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:51,67:.:-1.13:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:119,68:.: 0.08:0.999:. ./.:4:116,44:.:-0.39:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:160,46:.: 0.41:1.000:. ./.:4:163,69:.: 0.87:1.000:. ./.:4:156,64:.: 0.66:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:169,53:.: 0.70:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:153,83:.: 0.94:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:159,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:136,52:.: 0.10:1.000:. -chr7.1 22688838 chr7.1_022688838 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:123,139:0.48: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,62:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,158:0.52: 0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,162:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:241,120:0.29: 1.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:117,147:0.51: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,78:0.29: 0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:162,78:0.28: 0.33:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,46:0.73:-2.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,27:0.30:-1.77:1.000:0.982 0/0/0/1:4:178,78:0.26: 0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:158,86:0.31: 0.38:1.000:0.974 0/0/0/1:4:189,87:0.27: 0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,155:0.52: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,183:0.58: 0.96:1.000:0.897 0/0/1/1:4:129,183:0.54: 1.26:0.985:0.989 0/0/0/1:4:197,78:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,298:0.71: 2.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:161,217:0.52: 2.11:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,42:0.54:-1.86:1.000:0.987 0/0/0/1:4:164,66:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:124,176:0.54: 1.10:1.000:0.989 0/0/0/1:4:174,83:0.28: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,23:0.43:-2.16:1.000:0.950 0/0/1/1:4:132,167:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,103:0.30: 1.14:1.000:0.987 0/0/1/1:4:104,142:0.53: 0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:194,87:0.27: 0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:158,176:0.48: 1.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:134,175:0.52: 1.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:205,2:0.01:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,13:0.25:-2.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,39:0.59:-1.99:1.000:0.863 0/0/1:3:19,16:0.41:-2.33:1.000:0.998 0/1/1/1:4:71,266:0.74: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,91:0.29: 0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:100,158:0.56: 0.56:1.000:0.962 0/0/0/1:4:159,73:0.27: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:264,1:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,118:0.55:-0.23:1.000:0.981 0/0/0/1:4:126,63:0.29:-0.34:1.000:0.991 0/0/0/1:4:150,61:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,96:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,50:0.29:-0.84:1.000:0.991 0/0/0/1:4:126,49:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,273:0.81: 1.35:0.986:1.000 0/0/0/1:4:225,112:0.29: 1.58:1.000:0.992 0/0/0/1:4:117,58:0.29:-0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,108:0.55:-0.47:1.000:0.976 0/0/0/1:4:95,44:0.27:-0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,79:0.26: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,50:0.27:-0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,59:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,146:0.57: 0.27:1.000:0.949 0/0/0/1:4:143,80:0.32: 0.10:1.000:0.964 0/0/0/1:4:126,68:0.31:-0.27:1.000:0.977 0/0/1/1:4:64,113:0.59:-0.49:1.000:0.869 0/0/1/1:4:56,112:0.62:-0.61:1.000:0.596 0/0/1/1/1/1:6:54,93:0.58:-0.88:1.000:0.507 0/0/1/1:4:68,116:0.58:-0.40:1.000:0.909 0/0/1/1:4:81,110:0.53:-0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,118:0.55:-0.24:1.000:0.977 0/0/1/1:4:70,84:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,142:0.53: 0.36:1.000:0.990 0/0/0/1:4:122,31:0.17:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,61:0.30:-0.50:1.000:0.981 0/0/1/1:4:73,101:0.53:-0.53:0.974:0.992 0/0/0/1:4:124,59:0.28:-0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,213:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,50:0.29:-0.83:0.999:0.992 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,230:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,50:0.30:-0.89:1.000:0.985 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,52:0.27:-0.59:1.000:0.998 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,64:0.34:-0.65:1.000:0.845 0/1/1/1:4:62,157:0.67: 0.05:1.000:0.916 0/0/0/1:4:83,35:0.26:-1.26:0.995:0.999 0/0/0/1:4:128,57:0.27:-0.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,71:0.37:-0.56:1.000:0.596 0/0/0/1:4:120,41:0.22:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,133:0.55: 0.09:1.000:0.980 0/0/0/1:4:140,83:0.33: 0.10:1.000:0.927 0/0/1/1:4:72,101:0.53:-0.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,92:0.54:-0.78:1.000:0.985 0/1/1/1:4:49,104:0.63:-0.80:1.000:0.579 0/0/1/1:4:98,130:0.52: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,125:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:72,109:0.55:-0.44:1.000:0.977 0/0/1/1:4:88,145:0.57: 0.23:1.000:0.939 0/0/1/1:4:76,104:0.53:-0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:77,122:0.56:-0.21:1.000:0.961 0/0/1/1:4:76,91:0.49:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,49:0.36:-1.23:1.000:0.650 0/0/0/0:4:89,1:0.01:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,52:0.35:-1.07:1.000:0.798 0/0/0/1:4:168,79:0.28: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,77:0.51:-1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,124:0.58:-0.22:1.000:0.926 0/0/1/1:4:55,44:0.40:-1.50:1.000:0.773 0/0/0/0/1:5:131,51:0.24:-0.43:0.999:0.954 0/0/1/1:4:43,76:0.59:-1.24:1.000:0.867 0/0/0/1:4:108,54:0.29:-0.69:1.000:0.991 0/0/1/1:4:77,57:0.38:-1.05:1.000:0.565 0/0/0/1:4:203,78:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,80:0.21: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,135:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,111:0.54:-0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:167,222:0.52: 2.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,86:0.52:-0.84:0.999:0.994 0/1/1/1:4:87,201:0.65: 0.95:1.000:0.789 0/1/1/1:4:32,83:0.67:-1.29:1.000:0.935 0/0/1/1:4:73,121:0.57:-0.27:1.000:0.934 0/0/0/1:4:107,56:0.30:-0.67:1.000:0.984 0/1/1/1:4:20,155:0.83:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,44:0.30:-1.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:88,41:0.28:-1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,118:0.52:-0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:83,42:0.29:-1.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:105,60:0.32:-0.65:1.000:0.953 0/0/0/1:4:189,90:0.28: 0.83:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,62:0.35:-0.72:1.000:0.830 0/1/1/1:4:43,178:0.76: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,57:0.33:-0.81:1.000:0.916 0/0/0/1:4:80,38:0.28:-1.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,75:0.54:-1.14:1.000:0.987 0/0/1/1:4:43,84:0.61:-1.14:1.000:0.662 0/0/0/1:4:81,43:0.30:-1.18:1.000:0.981 0/0/0/1:4:158,89:0.32: 0.42:1.000:0.961 0/0/0/1:4:63,42:0.36:-1.42:1.000:0.741 0/0/0/1:4:119,75:0.34:-0.27:1.000:0.854 0/0/0/1:4:137,74:0.31:-0.05:1.000:0.977 0/0/0/1:4:241,129:0.31: 2.01:1.000:0.979 0/0/1/1:4:86,123:0.54:-0.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:62,33:0.30:-1.55:1.000:0.981 0/0/1/1:4:45,72:0.57:-1.27:1.000:0.956 0/0/1/1:4:55,72:0.52:-1.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,133:0.69:-0.44:1.000:0.969 0/1/1/1:4:51,114:0.64:-0.65:1.000:0.717 0/0/0/1:4:137,75:0.31:-0.04:1.000:0.972 0/0/1/1:4:42,77:0.60:-1.24:1.000:0.807 0/0/1/1:4:139,190:0.53: 1.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:211,106:0.29: 1.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:142,139:0.45: 0.86:1.000:0.976 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,92:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,122:0.55:-0.15:1.000:0.979 0/0/1/1:4:144,206:0.54: 1.75:1.000:0.988 0/0/1/1:4:114,183:0.57: 1.06:1.000:0.955 0/1/1/1:4:11,49:0.77:-2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,131:0.53: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:131,188:0.54: 1.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:180,86:0.28: 0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,192:0.50: 1.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,72:0.23: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,150:0.55: 0.47:1.000:0.982 0/1/1/1:4:58,264:0.77: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,154:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:112,53:0.28:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:175,70:0.25: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,232:0.74: 1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,171:0.48: 1.41:1.000:0.995 0/0/0/0:4:243,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,171:0.58: 0.74:1.000:0.917 0/0/0/1:4:144,65:0.27:-0.08:0.999:0.998 0/0/0/1:4:166,78:0.28: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,168:0.49: 1.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,127:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,200:0.83: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,113:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,198:0.73: 0.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,165:0.73:-0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:117,56:0.28:-0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:255,105:0.25: 1.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,118:0.32: 1.48:1.000:0.964 0/0/1/1:4:157,178:0.48: 1.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,181:0.70: 0.36:1.000:0.983 0/0/0/1:4:226,93:0.25: 1.35:0.999:0.999 0/0/0/1:4:234,116:0.29: 1.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:161,195:0.50: 1.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,129:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,67:0.24: 0.33:1.000:1.000 -chr7.1 22766953 chr7.1_022766953 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:290,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:183,36:.:-0.34:1.000:. ./.:4:178,57:.:-0.05:1.000:. ./.:4:173,68:.: 0.06:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:276,58:.: 1.76:1.000:. ./.:4:86,11:.:-2.57:1.000:. ./.:4:206,42:.: 0.19:1.000:. ./.:4:173,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,1:.:-2.04:1.000:. ./.:4:62,7:.:-3.08:1.000:. ./.:4:223,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:155,56:.:-0.49:1.000:. ./.:4:222,44:.: 0.52:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.00:0.985:. ./.:4:205,57:.: 0.45:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:258,53:.: 1.34:1.000:. ./.:4:75,10:.:-2.79:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:191,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:170,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:61,12:.:-3.01:1.000:. ./.:4:186,48:.:-0.06:1.000:. ./.:4:200,65:.: 0.50:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:197,69:.: 0.52:1.000:. ./.:4:220,73:.: 1.01:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:48,0:.:-3.47:1.000:. ./.:4:116,0:.:-2.22:1.000:. ./.:3:70,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:164,49:.:-0.45:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:200,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:233,63:.: 1.07:1.000:. ./.:4:210,43:.: 0.28:1.000:. ./.:4:191,63:.: 0.30:1.000:. ./.:4:185,49:.:-0.06:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.72:0.986:. ./.:4:82,16:.:-2.55:1.000:. ./.:4:192,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:226,66:.: 1.00:1.000:. ./.:4:169,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:237,59:.: 1.07:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:165,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.15:1.000:. ./.:6:249,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:187,76:.: 0.47:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:122,28:.:-1.60:1.000:. ./.:4:220,44:.: 0.48:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.42:0.974:. ./.:4:188,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:212,43:.: 0.32:1.000:. ./.:4:111,24:.:-1.88:0.999:. ./.:4:139,94:.:-0.08:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:175,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:206,46:.: 0.26:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:199,66:.: 0.50:1.000:. ./.:4:224,58:.: 0.81:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:143,53:.:-0.76:0.995:. ./.:4:212,52:.: 0.48:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:161,48:.:-0.52:1.000:. ./.:4:244,52:.: 1.07:1.000:. ./.:4:212,47:.: 0.39:1.000:. ./.:4:111,24:.:-1.88:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:179,42:.:-0.30:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:220,58:.: 0.74:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:202,57:.: 0.39:1.000:. ./.:4:239,47:.: 0.89:1.000:. ./.:4:174,54:.:-0.17:1.000:. ./.:4:188,55:.: 0.10:1.000:. ./.:4:206,47:.: 0.28:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:108,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:119,41:.:-1.42:1.000:. ./.:5:219,46:.: 0.50:0.999:. ./.:4:220,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:221,66:.: 0.90:1.000:. ./.:4:170,62:.:-0.10:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:229,61:.: 0.96:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,61:.:-0.12:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:259,66:.: 1.60:1.000:. ./.:4:134,30:.:-1.34:1.000:. ./.:4:175,63:.: 0.01:1.000:. ./.:4:115,26:.:-1.77:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:178,29:.:-0.56:1.000:. ./.:4:159,36:.:-0.78:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:178,60:.: 0.01:1.000:. ./.:4:197,42:.: 0.03:1.000:. ./.:4:203,50:.: 0.28:1.000:. ./.:4:200,42:.: 0.08:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:122,43:.:-1.33:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:180,49:.:-0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:211,69:.: 0.78:1.000:. ./.:4:198,50:.: 0.19:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:165,44:.:-0.52:1.000:. ./.:4:155,46:.:-0.67:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:198,68:.: 0.52:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:349,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:184,53:.:-0.01:1.000:. ./.:4:193,57:.: 0.23:1.000:. ./.:4:198,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:190,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:226,67:.: 1.01:1.000:. ./.:4:47,33:.:-2.88:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:200,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:178,48:.:-0.21:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:160,48:.:-0.54:1.000:. ./.:4:185,55:.: 0.05:1.000:. ./.:4:147,31:.:-1.09:1.000:. ./.:4:166,60:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,57:.: 0.36:1.000:. ./.:4:197,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:167,48:.:-0.41:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:175,61:.:-0.03:0.999:. ./.:4:158,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:189,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:251,58:.: 1.31:1.000:. ./.:4:227,51:.: 0.74:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:180,52:.:-0.10:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.25:0.999:. ./.:4:249,58:.: 1.27:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:132,42:.:-1.16:1.000:. ./.:4:184,51:.:-0.05:1.000:. -chr7.1 23098359 chr7.1_023098359 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:16,16:0.28: 2.11:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,17:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.39: 1.63:1.000:0.701 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:12,11:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,10:0.22: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,16:0.75: 0.19:0.985:0.999 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:9,17:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,14:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,16:0.26: 2.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,8:0.20: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.17: 0.79:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,13:0.35: 1.15:1.000:0.828 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,12:0.22: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,21:0.57: 1.63:1.000:0.933 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.31:0.986:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,12:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,7:0.19: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:4,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,6:0.43:-0.54:1.000:0.956 0/1/1/1:4:0,7:0.75:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:0.974:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.38:0.999:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:5,8:0.46:-0.18:1.000:0.986 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.63:-1.02:1.000:0.603 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,5:0.28:-0.54:1.000:0.995 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.20:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,15:0.34: 1.63:1.000:0.888 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,15:0.75: 0.06:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:0,12:0.75:-0.30:0.999:0.928 0/1/1/1:4:0,8:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,14:0.37: 1.27:1.000:0.516 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,9:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,29:0.50: 3.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,13:0.38: 1.03:0.999:0.588 0/1/1/1:4:0,9:0.75:-0.66:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:16,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.55:-0.90:1.000:0.980 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,11:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:14,14:0.28: 1.63:1.000:0.995 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,8:0.39:-0.06:1.000:0.701 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,12:0.35: 0.91:1.000:0.778 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,13:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,5:0.20:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,10:0.22: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,7:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,12:0.43: 0.67:1.000:0.956 0/1/1/1:4:0,11:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,18:0.57: 1.15:1.000:0.933 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,10:0.37: 0.43:1.000:0.604 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 2.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.67:0.999:1.000 0/1/1/1:4:0,12:0.75:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 3.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. -chr7.1 23169812 chr7.1_023169812 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:361,112:.: 0.69:1.000:. ./.:4:225,43:.:-1.28:1.000:. ./.:4:263,128:.:-0.10:1.000:. ./.:4:294,219:.: 1.07:1.000:. ./.:4:389,118:.: 1.02:1.000:. ./.:4:353,147:.: 0.95:1.000:. ./.:4:263,143:.: 0.05:1.000:. ./.:4:315,138:.: 0.50:1.000:. ./.:4:292,130:.: 0.20:1.000:. ./.:4:63,25:.:-3.01:1.000:. ./.:4:114,25:.:-2.52:1.000:. ./.:4:363,35:.:-0.03:1.000:. ./.:4:305,79:.:-0.17:1.000:. ./.:4:328,138:.: 0.62:1.000:. ./.:4:295,140:.: 0.32:1.000:. ./.:4:370,99:.: 0.65:1.000:. ./.:4:369,122:.: 0.86:0.985:. ./.:4:338,175:.: 1.07:1.000:. ./.:4:455,227:.: 2.70:1.000:. ./.:4:393,249:.: 2.31:1.000:. ./.:4:79,15:.:-2.95:1.000:. ./.:4:353,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:307,175:.: 0.78:1.000:. ./.:4:305,130:.: 0.32:1.000:. ./.:4:76,18:.:-2.95:1.000:. ./.:4:275,188:.: 0.59:1.000:. ./.:4:325,125:.: 0.47:1.000:. ./.:4:337,131:.: 0.64:1.000:. ./.:4:363,99:.: 0.58:1.000:. ./.:4:368,153:.: 1.15:1.000:. ./.:4:274,105:.:-0.21:1.000:. ./.:4:256,54:.:-0.88:1.000:. ./.:4:71,8:.:-3.09:1.000:. ./.:4:124,31:.:-2.36:1.000:. ./.:3:54,12:.:-3.22:1.000:. ./.:4:278,164:.: 0.39:1.000:. ./.:4:294,86:.:-0.20:1.000:. ./.:4:299,150:.: 0.46:1.000:. ./.:4:323,80:.: 0.02:1.000:. ./.:4:342,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:251,95:.:-0.53:1.000:. ./.:4:307,89:.:-0.05:1.000:. ./.:4:329,146:.: 0.71:1.000:. ./.:4:245,123:.:-0.32:1.000:. ./.:4:389,122:.: 1.05:1.000:. ./.:4:294,121:.: 0.13:1.000:. ./.:4:361,194:.: 1.48:0.986:. ./.:4:113,21:.:-2.57:1.000:. ./.:4:270,106:.:-0.24:1.000:. ./.:4:205,33:.:-1.57:1.000:. ./.:4:248,49:.:-1.00:1.000:. ./.:4:365,126:.: 0.86:1.000:. ./.:4:300,57:.:-0.42:1.000:. ./.:4:313,77:.:-0.11:1.000:. ./.:4:301,115:.: 0.14:1.000:. ./.:4:301,109:.: 0.08:1.000:. ./.:4:287,87:.:-0.26:1.000:. ./.:4:283,150:.: 0.31:1.000:. ./.:4:299,66:.:-0.35:1.000:. ./.:6:238,59:.:-1.00:1.000:. ./.:4:303,91:.:-0.07:1.000:. ./.:4:268,115:.:-0.17:1.000:. ./.:4:333,119:.: 0.49:1.000:. ./.:4:282,104:.:-0.15:1.000:. ./.:4:322,227:.: 1.42:1.000:. ./.:4:328,74:.: 0.01:1.000:. ./.:4:253,78:.:-0.67:1.000:. ./.:4:292,85:.:-0.23:1.000:. ./.:4:262,110:.:-0.28:0.974:. ./.:4:288,67:.:-0.44:1.000:. ./.:4:329,165:.: 0.89:1.000:. ./.:4:206,57:.:-1.33:0.999:. ./.:4:287,74:.:-0.39:1.000:. ./.:4:313,133:.: 0.43:1.000:. ./.:4:281,64:.:-0.54:1.000:. ./.:4:291,60:.:-0.48:1.000:. ./.:4:319,49:.:-0.32:1.000:. ./.:4:329,81:.: 0.08:1.000:. ./.:4:306,129:.: 0.32:1.000:. ./.:4:311,123:.: 0.31:1.000:. ./.:4:276,75:.:-0.48:0.995:. ./.:4:288,124:.: 0.10:1.000:. ./.:4:347,97:.: 0.41:1.000:. ./.:4:243,133:.:-0.24:1.000:. ./.:4:238,98:.:-0.63:1.000:. ./.:4:276,153:.: 0.27:1.000:. ./.:4:238,95:.:-0.65:1.000:. ./.:4:226,80:.:-0.91:1.000:. ./.:4:249,136:.:-0.16:1.000:. ./.:4:263,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:261,96:.:-0.42:1.000:. ./.:4:294,75:.:-0.31:1.000:. ./.:4:290,147:.: 0.34:1.000:. ./.:4:220,118:.:-0.61:1.000:. ./.:4:284,220:.: 0.99:1.000:. ./.:4:265,142:.: 0.06:1.000:. ./.:4:221,51:.:-1.24:1.000:. ./.:4:268,33:.:-0.96:1.000:. ./.:4:316,132:.: 0.45:1.000:. ./.:4:355,114:.: 0.65:1.000:. ./.:4:286,59:.:-0.54:1.000:. ./.:4:284,82:.:-0.34:1.000:. ./.:4:207,78:.:-1.12:1.000:. ./.:5:391,77:.: 0.64:0.999:. ./.:4:279,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:309,111:.: 0.18:1.000:. ./.:4:277,81:.:-0.41:1.000:. ./.:4:313,99:.: 0.10:1.000:. ./.:4:393,180:.: 1.65:1.000:. ./.:4:266,143:.: 0.07:1.000:. ./.:4:290,101:.:-0.10:1.000:. ./.:4:398,144:.: 1.35:1.000:. ./.:4:312,86:.:-0.03:0.999:. ./.:4:351,155:.: 1.01:1.000:. ./.:4:165,41:.:-1.87:1.000:. ./.:4:323,191:.: 1.08:1.000:. ./.:4:282,99:.:-0.19:1.000:. ./.:4:242,96:.:-0.61:1.000:. ./.:4:258,109:.:-0.33:1.000:. ./.:4:248,81:.:-0.69:1.000:. ./.:4:289,111:.:-0.01:1.000:. ./.:4:262,69:.:-0.67:1.000:. ./.:4:281,138:.: 0.17:1.000:. ./.:4:352,140:.: 0.87:1.000:. ./.:4:254,97:.:-0.48:1.000:. ./.:4:297,94:.:-0.10:1.000:. ./.:4:277,77:.:-0.45:1.000:. ./.:4:302,21:.:-0.75:1.000:. ./.:4:167,89:.:-1.39:1.000:. ./.:4:187,64:.:-1.44:1.000:. ./.:4:269,67:.:-0.63:1.000:. ./.:4:329,95:.: 0.22:1.000:. ./.:4:205,52:.:-1.38:1.000:. ./.:4:281,91:.:-0.28:1.000:. ./.:4:307,86:.:-0.08:1.000:. ./.:4:409,136:.: 1.38:1.000:. ./.:4:312,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:234,111:.:-0.54:1.000:. ./.:4:226,116:.:-0.57:1.000:. ./.:4:237,69:.:-0.91:1.000:. ./.:4:286,140:.: 0.24:1.000:. ./.:4:253,122:.:-0.25:1.000:. ./.:4:285,107:.:-0.09:1.000:. ./.:4:238,91:.:-0.69:1.000:. ./.:4:376,265:.: 2.30:1.000:. ./.:4:376,115:.: 0.86:1.000:. ./.:4:330,166:.: 0.91:1.000:. ./.:4:328,96:.: 0.22:1.000:. ./.:4:364,159:.: 1.17:1.000:. ./.:4:298,126:.: 0.22:1.000:. ./.:4:389,204:.: 1.84:1.000:. ./.:4:318,168:.: 0.81:1.000:. ./.:4:87,33:.:-2.70:1.000:. ./.:4:300,136:.: 0.33:1.000:. ./.:4:310,141:.: 0.48:1.000:. ./.:4:334,156:.: 0.85:1.000:. ./.:4:410,180:.: 1.81:1.000:. ./.:4:397,118:.: 1.09:1.000:. ./.:4:267,136:.: 0.02:1.000:. ./.:4:328,218:.: 1.39:1.000:. ./.:4:335,166:.: 0.96:1.000:. ./.:4:258,71:.:-0.69:1.000:. ./.:4:248,99:.:-0.52:1.000:. ./.:4:332,149:.: 0.77:1.000:. ./.:4:238,83:.:-0.77:1.000:. ./.:4:326,98:.: 0.22:1.000:. ./.:4:244,90:.:-0.65:1.000:. ./.:4:328,94:.: 0.20:0.999:. ./.:4:309,151:.: 0.56:1.000:. ./.:4:313,157:.: 0.66:1.000:. ./.:4:284,136:.: 0.18:1.000:. ./.:4:260,116:.:-0.24:1.000:. ./.:4:333,143:.: 0.72:1.000:. ./.:4:282,131:.: 0.11:1.000:. ./.:4:251,107:.:-0.41:1.000:. ./.:4:247,144:.:-0.10:1.000:. ./.:4:352,189:.: 1.34:1.000:. ./.:4:382,154:.: 1.29:1.000:. ./.:4:323,169:.: 0.87:1.000:. ./.:4:283,160:.: 0.40:1.000:. ./.:4:353,124:.: 0.73:0.999:. ./.:4:362,104:.: 0.62:1.000:. ./.:4:423,219:.: 2.31:1.000:. ./.:4:267,183:.: 0.47:1.000:. ./.:4:338,102:.: 0.37:1.000:. -chr7.1 23407525 chr7.1_023407525 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:64,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:109,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:119,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.72:0.985:. ./.:4:100,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.89:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:0.986:. ./.:4:17,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:45,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:0.974:. ./.:4:80,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:76,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.48:0.995:. ./.:4:65,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.60:1.000:. ./.:5:68,0:.: 0.55:0.999:. ./.:4:35,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:75,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:105,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:50,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.89:1.000:. -chr7.1 23536033 chr7.1_023536033 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:261,66:.: 0.87:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:137,132:.: 0.11:1.000:. ./.:4:144,161:.: 0.58:1.000:. ./.:4:232,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:233,57:.: 0.39:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:191,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:28,13:.:-2.85:1.000:. ./.:4:44,19:.:-2.56:1.000:. ./.:4:173,66:.:-0.28:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:205,88:.: 0.43:1.000:. ./.:4:112,130:.:-0.24:1.000:. ./.:4:271,72:.: 1.07:1.000:. ./.:4:156,144:.: 0.52:0.985:. ./.:4:286,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:220,174:.: 1.74:1.000:. ./.:4:144,173:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,11:.:-2.70:1.000:. ./.:4:184,58:.:-0.24:1.000:. ./.:4:280,80:.: 1.30:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:29,5:.:-2.94:1.000:. ./.:4:261,74:.: 0.97:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:242,62:.: 0.57:1.000:. ./.:4:259,88:.: 1.13:1.000:. ./.:4:283,80:.: 1.33:1.000:. ./.:4:277,89:.: 1.37:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:18,3:.:-3.11:1.000:. ./.:4:27,35:.:-2.57:1.000:. ./.:3:8,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:189,135:.: 0.83:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:260,62:.: 0.80:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:108,118:.:-0.44:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:216,54:.: 0.13:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:247,150:.: 1.78:0.986:. ./.:4:78,26:.:-2.03:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:87,82:.:-1.19:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:182,67:.:-0.15:1.000:. ./.:4:232,46:.: 0.23:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,49:.: 0.02:1.000:. ./.:4:185,63:.:-0.16:1.000:. ./.:6:111,96:.:-0.69:1.000:. ./.:4:105,95:.:-0.78:1.000:. ./.:4:120,117:.:-0.30:1.000:. ./.:4:132,132:.: 0.05:1.000:. ./.:4:109,113:.:-0.50:1.000:. ./.:4:165,126:.: 0.40:1.000:. ./.:4:137,51:.:-0.94:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:178,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:100,119:.:-0.54:0.974:. ./.:4:163,55:.:-0.55:1.000:. ./.:4:212,132:.: 1.09:1.000:. ./.:4:156,48:.:-0.73:0.999:. ./.:4:257,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:169,109:.: 0.23:1.000:. ./.:4:179,43:.:-0.50:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:168,55:.:-0.48:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:176,64:.:-0.26:1.000:. ./.:4:266,70:.: 0.98:1.000:. ./.:4:160,54:.:-0.60:0.995:. ./.:4:177,66:.:-0.22:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:157,38:.:-0.85:1.000:. ./.:4:210,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:178,60:.:-0.29:1.000:. ./.:4:108,72:.:-1.04:1.000:. ./.:4:130,97:.:-0.43:1.000:. ./.:4:106,99:.:-0.72:1.000:. ./.:4:214,59:.: 0.17:1.000:. ./.:4:203,52:.:-0.07:1.000:. ./.:4:252,63:.: 0.71:1.000:. ./.:4:80,85:.:-1.24:1.000:. ./.:4:265,75:.: 1.04:1.000:. ./.:4:124,133:.:-0.04:1.000:. ./.:4:119,39:.:-1.33:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:206,79:.: 0.32:1.000:. ./.:4:195,77:.: 0.15:1.000:. ./.:4:121,89:.:-0.65:1.000:. ./.:4:223,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.73:1.000:. ./.:5:226,60:.: 0.33:0.999:. ./.:4:97,87:.:-0.99:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:215,82:.: 0.48:1.000:. ./.:4:218,71:.: 0.37:1.000:. ./.:4:102,92:.:-0.86:1.000:. ./.:4:90,84:.:-1.12:1.000:. ./.:4:294,101:.: 1.75:1.000:. ./.:4:192,69:.: 0.01:0.999:. ./.:4:113,143:.:-0.06:1.000:. ./.:4:86,93:.:-1.06:1.000:. ./.:4:235,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:141,53:.:-0.86:1.000:. ./.:4:138,76:.:-0.60:1.000:. ./.:4:146,40:.:-0.96:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:216,56:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,55:.:-0.55:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:198,72:.: 0.13:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:169,118:.: 0.35:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:130,50:.:-1.04:1.000:. ./.:4:83,89:.:-1.15:1.000:. ./.:4:174,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:142,53:.:-0.85:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:157,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:475,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:94,111:.:-0.72:1.000:. ./.:4:164,33:.:-0.82:1.000:. ./.:4:171,47:.:-0.55:1.000:. ./.:4:170,50:.:-0.52:1.000:. ./.:4:203,46:.:-0.15:1.000:. ./.:4:179,51:.:-0.39:1.000:. ./.:4:191,66:.:-0.04:1.000:. ./.:4:84,81:.:-1.24:1.000:. ./.:4:319,65:.: 1.61:1.000:. ./.:4:420,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:110,138:.:-0.16:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:223,56:.: 0.24:1.000:. ./.:4:174,176:.: 1.17:1.000:. ./.:4:249,85:.: 0.96:1.000:. ./.:4:14,7:.:-3.11:1.000:. ./.:4:122,129:.:-0.12:1.000:. ./.:4:233,67:.: 0.52:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:332,72:.: 1.87:1.000:. ./.:4:207,65:.: 0.15:1.000:. ./.:4:113,120:.:-0.35:1.000:. ./.:4:238,139:.: 1.52:1.000:. ./.:4:247,57:.: 0.57:1.000:. ./.:4:138,41:.:-1.06:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:195,133:.: 0.88:1.000:. ./.:4:277,70:.: 1.13:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:240,68:.: 0.62:1.000:. ./.:4:212,66:.: 0.23:0.999:. ./.:4:264,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:111,144:.:-0.07:1.000:. ./.:4:122,125:.:-0.17:1.000:. ./.:4:126,92:.:-0.55:1.000:. ./.:4:138,124:.: 0.02:1.000:. ./.:4:163,113:.: 0.20:1.000:. ./.:4:153,89:.:-0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:432,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:126,133:.:-0.02:1.000:. ./.:4:208,119:.: 0.87:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.59:0.999:. ./.:4:246,86:.: 0.93:1.000:. ./.:4:354,76:.: 2.20:1.000:. ./.:4:115,128:.:-0.22:1.000:. ./.:4:223,64:.: 0.35:1.000:. -chr7.1 23692897 chr7.1_023692897 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.54:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.46:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,0:.: 3.45:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.92:0.985:. ./.:4:42,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:48,1:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.62:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,1:.:-1.07:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,3:.: 0.72:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.92:0.986:. ./.:4:5,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:33,2:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.21:1.000:. ./.:6:23,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.70:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.45:0.974:. ./.:4:23,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:23,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:15,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.76:0.995:. ./.:4:16,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:40,3:.: 1.50:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:23,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:7,5:.:-0.92:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:42,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.70:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.88:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.15:1.000:. ./.:5:11,1:.:-0.92:0.999:. ./.:4:8,4:.:-0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:28,3:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:20,4:.: 0.02:0.999:. ./.:4:17,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:24,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.70:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:39,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:39,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:26,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.53:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:57,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.35:0.999:. ./.:4:20,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:30,2:.: 0.64:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.18:1.000:. -chr7.1 23859823 chr7.1_023859823 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,16:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.24: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,33:0.26: 1.81:1.000:0.998 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 2.48:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,30:0.29: 0.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:68,20:0.21: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,18:0.22: 0.70:0.985:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,33:0.27: 1.66:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,1:0.01: 2.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,29:0.26: 1.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,3:0.30:-1.81:1.000:0.982 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,11:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.51:0.986:1.000 0/0/0/1:4:51,14:0.20: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,19:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,20:0.27: 0.19:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:42,9:0.16:-0.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:34,15:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,11:0.17: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,21:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,24:0.27: 0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,25:0.26: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,11:0.18: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,17:0.26:-0.07:0.974:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,25:0.26: 0.89:0.999:0.998 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.33:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,20:0.27: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,19:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:68,31:0.26: 1.59:1.000:0.998 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,15:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,7:0.13:-0.26:1.000:0.913 0/0/0/1:4:39,16:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,21:0.21: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,1:0.02:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,17:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,10:0.17:-0.03:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:52,15:0.20: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,22:0.27: 0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:48,7:0.12:-0.03:1.000:0.669 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:46,14:0.21: 0.15:0.999:0.990 0/0/0/1:4:37,10:0.19:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,17:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,32:0.22: 2.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,21:0.28: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,18:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.11:0.999:1.000 0/0/0/1:4:44,30:0.30: 0.67:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,18:0.25: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,12:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:27,6:0.17:-0.85:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,20:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,16:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,20:0.25: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,14:0.26:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,26:0.26: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,1:0.01: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.24: 1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.92:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:34,17:0.27:-0.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,1:0.01: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,14:0.21: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,17:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 3.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.33:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,15:0.17: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,24:0.27: 0.67:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,13:0.20: 0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,25:0.24: 1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.18:0.999:1.000 0/0/0/1:4:86,27:0.22: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,19:0.25: 0.45:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. -chr7.1 24109724 chr7.1_024109724 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,52:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,73:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1,37:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,5:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,27:.:-1.02:0.985:. ./.:4:31,47:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,88:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,68:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.41:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,78:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,72:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.38:1.000:. ./.:4:2,48:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.46:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,70:.: 1.23:1.000:. ./.:4:1,35:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,73:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,39:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,67:.: 1.07:0.986:. ./.:4:0,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,30:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.12:1.000:. ./.:4:2,35:.:-0.54:1.000:. ./.:6:0,25:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,61:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,20:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.37:0.974:. ./.:4:0,62:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.70:0.999:. ./.:4:0,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,34:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.96:0.995:. ./.:4:0,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,34:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,69:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.75:1.000:. ./.:5:0,43:.:-0.22:0.999:. ./.:4:0,19:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,83:.: 1.92:1.000:. ./.:4:0,77:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:0.999:. ./.:4:0,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:2,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,59:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,110:.: 3.37:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,24:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,78:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,76:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,74:.: 1.44:1.000:. ./.:4:1,34:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,81:.: 1.82:1.000:. ./.:4:0,67:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.46:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,69:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:1,42:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,64:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1,53:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,128:.: 4.33:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,70:.: 1.23:0.999:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,71:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,71:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,71:.: 1.28:0.999:. ./.:4:0,68:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1,67:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.80:1.000:. -chr7.1 24436683 chr7.1_024436683 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:81,11:0.22: 1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,8:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,3:0.11:-0.37:1.000:0.659 0/0/0/1:4:86,10:0.19: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,14:0.41:-0.79:1.000:0.869 0/0/0/0:4:61,2:0.06:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,13:0.30: 0.09:1.000:0.986 0/0/0/1:4:70,9:0.21: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.31:-1.41:1.000:0.966 0/0/0/1:4:17,4:0.29:-1.48:1.000:0.990 0/0/0/1:4:36,9:0.30:-0.65:1.000:0.984 0/0/0/1:4:40,12:0.32:-0.40:1.000:0.940 0/0/0/1:4:22,9:0.37:-1.13:1.000:0.549 0/0/0/1:4:59,11:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/0:4:80,3:0.07: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,15:0.35:-0.19:0.985:0.822 0/0/1/1:4:32,15:0.39:-0.58:1.000:0.729 0/0/0/1:4:84,9:0.18: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,10:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.43:-1.83:1.000:0.941 0/0/0/1:4:70,10:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,8:0.28:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,11:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,1:0.26:-1.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:138,10:0.13: 2.96:1.000:0.863 0/0/0/1:4:66,7:0.18: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:105,3:0.05: 1.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,10:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,6:0.11: 1.38:1.000:0.564 0/0/1/1:4:23,15:0.45:-0.89:1.000:0.982 0/0/0/1:4:15,5:0.34:-1.52:1.000:0.870 0/0/0/1:4:18,5:0.31:-1.41:1.000:0.966 0/0/0:3:6,0:0.00:-2.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,12:0.24: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.33:-0.30:1.000:0.924 0/0/0/0:4:99,3:0.05: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,17:0.36:-0.02:1.000:0.742 0/0/1/1:4:33,19:0.43:-0.40:1.000:0.945 0/0/0/1:4:90,8:0.15: 1.21:1.000:0.990 0/0/0/1:4:70,7:0.17: 0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,18:0.30: 1.03:1.000:0.988 0/0/0/0:4:130,4:0.06: 2.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,13:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,11:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,11:0.20: 1.42:0.986:1.000 0/0/1/1:4:29,54:0.59: 0.68:1.000:0.868 0/0/0/1:4:76,11:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,20:0.29: 1.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,10:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,12:0.26: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,7:0.25:-0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,9:0.31:-0.75:1.000:0.970 0/0/0/1:4:76,10:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,11:0.27: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:121,5:0.07: 2.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,7:0.17: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:38,11:0.32:-0.51:1.000:0.916 0/0/0/1:4:58,7:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,12:0.27: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,14:0.27: 0.96:1.000:0.998 0/0/0/0:4:81,4:0.09: 0.75:1.000:0.961 0/0/0/1:4:78,10:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,8:0.18: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,4:0.28:-1.41:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,6:0.16: 0.19:0.974:0.996 0/0/0/1:4:34,10:0.32:-0.68:1.000:0.948 0/0/0/1:4:94,8:0.15: 1.35:1.000:0.982 0/0/1/1:4:22,12:0.42:-1.03:0.999:0.913 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,10:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.37:-0.30:1.000:0.543 0/0/0/1:4:17,7:0.37:-1.38:1.000:0.535 0/0/0/1:4:24,10:0.37:-1.03:1.000:0.510 0/0/1/1:4:25,21:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,10:0.38:-1.06:1.000:0.582 0/0/0/0:4:124,4:0.06: 2.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.27:-1.10:0.995:0.998 0/0/0/1:4:34,10:0.32:-0.68:1.000:0.948 0/0/0/1:4:60,12:0.28: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,5:0.13: 0.19:1.000:0.945 0/0/1/1:4:22,13:0.43:-1.00:1.000:0.956 0/0/0/1:4:75,8:0.18: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/0:4:63,1:0.03: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,17:0.30: 0.72:1.000:0.982 0/0/0/1:4:58,8:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,10:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,3:0.10:-0.30:1.000:0.764 0/0/0/1:4:74,10:0.22: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,11:0.35:-0.75:1.000:0.801 0/0/0/1:4:58,14:0.30: 0.30:1.000:0.988 0/0/0/0:4:89,3:0.06: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,11:0.21: 1.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,12:0.38:-0.82:1.000:0.551 0/0/0/1:4:24,10:0.37:-1.03:1.000:0.510 0/0/1/1:4:20,9:0.39:-1.20:1.000:0.652 0/0/0/1:4:44,12:0.31:-0.26:1.000:0.970 0/0/0/1:4:51,9:0.26:-0.12:1.000:0.999 1/1/1/1/1:5:0,20:1.00:-1.52:0.999:1.000 0/0/0/1:4:36,13:0.35:-0.51:1.000:0.777 0/0/0/1:4:31,12:0.36:-0.72:1.000:0.661 0/0/0/1:4:52,8:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,17:0.39:-0.30:1.000:0.641 0/0/1/1:4:37,17:0.39:-0.33:1.000:0.692 0/0/0/1:4:65,13:0.28: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:26,7:0.31:-1.06:1.000:0.973 0/0/0/1:4:94,9:0.16: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,6:0.17: 0.02:0.999:0.999 0/0/1/1:4:34,15:0.38:-0.51:1.000:0.612 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,2:0.04: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,5:0.22:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,7:0.16: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,13:0.43:-1.00:1.000:0.956 0/0/0/1:4:42,6:0.23:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,4:0.06: 2.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,10:0.27:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,5:0.12: 0.51:1.000:0.749 0/0/0/0:4:111,3:0.05: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,9:0.20: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,10:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,13:0.31:-0.12:1.000:0.967 0/0/1/1:4:31,13:0.38:-0.68:1.000:0.504 0/0/1/1:4:20,12:0.44:-1.10:1.000:0.962 0/0/0/1:4:52,4:0.13:-0.26:1.000:0.933 0/0/1/1:4:33,16:0.40:-0.51:1.000:0.784 0/0/0/1:4:43,4:0.16:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:72,11:0.25: 0.68:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,11:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,21:0.39: 0.12:1.000:0.680 0/0/0/1:4:57,5:0.15:-0.05:1.000:0.988 0/0/0/0:4:85,5:0.10: 0.93:1.000:0.715 0/0/0/1:4:64,8:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,3:0.05: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,16:0.43:-0.72:1.000:0.957 0/0/1/1:4:23,16:0.46:-0.86:1.000:0.990 0/0/0/1:4:44,7:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:105,2:0.03: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,12:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,4:0.18:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,16:0.40:-0.51:1.000:0.784 0/0/0/1:4:62,14:0.29: 0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:60,5:0.14: 0.05:1.000:0.976 0/0/0/1:4:72,9:0.21: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,10:0.31:-0.58:1.000:0.972 0/0/0/0:4:22,1:0.08:-1.41:1.000:0.987 0/0/0/1:4:50,7:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,9:0.28:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,5:0.16:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/0:4:102,4:0.07: 1.49:1.000:0.998 0/0/0/0:4:110,4:0.07: 1.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,12:0.41:-1.00:1.000:0.875 0/0/0/1:4:77,5:0.11: 0.65:1.000:0.595 0/0/0/1:4:66,5:0.13: 0.26:1.000:0.920 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,10:0.28:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/0:4:90,5:0.10: 1.10:1.000:0.842 0/0/0/1:4:113,8:0.12: 2.01:1.000:0.822 0/0/1/1:4:28,15:0.42:-0.72:1.000:0.899 0/0/0/1:4:37,11:0.32:-0.54:1.000:0.943 0/0/0/1:4:25,3:0.20:-1.24:0.999:1.000 0/0/0/1:4:64,10:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,6:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,4:0.11: 0.09:1.000:0.574 0/0/0/1:4:42,5:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,14:0.26: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,9:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,7:0.19: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,7:0.20: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,16:0.29: 0.79:1.000:0.992 0/0/0/1:4:66,13:0.27: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,10:0.25: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,11:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,16:0.32: 0.30:0.999:0.958 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,4:0.07: 1.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,7:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,11:0.31:-0.37:1.000:0.978 -chr7.1 24481453 chr7.1_024481453 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:301,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:93,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:394,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.37:0.985:. ./.:4:176,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:462,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.52:1.000:. ./.:3:34,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:419,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.67:0.986:. ./.:4:92,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:416,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:110,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.46:0.974:. ./.:4:152,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:211,1:.:-0.06:0.999:. ./.:4:288,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.34:0.995:. ./.:4:295,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:295,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.80:1.000:. ./.:5:338,0:.: 1.40:0.999:. ./.:4:265,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:383,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:328,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:189,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:393,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:271,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:399,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.01:0.999:. ./.:4:310,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.31:1.000:. -chr7.1 24654751 chr7.1_024654751 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:104,291:0.70: 1.46:1.000:0.984 0/0/1/1:4:94,124:0.52:-1.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:180,95:0.41:-0.28:1.000:0.846 0/1/1/1:4:85,296:0.74: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,329:0.76: 1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:270,123:0.39: 1.43:1.000:0.716 0/0/1/1:4:85,136:0.57:-1.06:1.000:0.943 0/0/1/1:4:212,87:0.38: 0.07:1.000:0.597 0/0/1/1:4:130,178:0.53: 0.20:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,75:0.72:-2.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,111:0.60:-1.75:1.000:0.800 0/1/1/1:4:91,261:0.70: 0.83:1.000:0.988 0/0/1/1:4:158,167:0.48: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,82:0.38:-0.08:1.000:0.554 0/1/1/1:4:90,262:0.71: 0.83:1.000:0.990 0/1/1/1:4:84,280:0.73: 1.01:1.000:0.998 0/1/1/1:4:72,237:0.73: 0.21:0.985:0.998 0/0/0/1:4:277,1:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,334:0.72: 2.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:150,198:0.52: 0.78:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,105:0.82:-2.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,196:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,317:0.78: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,86:0.38:-0.05:1.000:0.623 0/0/1/1:4:41,37:0.47:-3.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:140,197:0.54: 0.62:1.000:0.988 0/0/1/1:4:228,89:0.38: 0.33:1.000:0.536 0/1/1/1:4:79,245:0.72: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,203:0.52: 0.95:1.000:0.995 0/1/1/1:4:59,245:0.77: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,327:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,140:0.53:-0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,33:0.53:-3.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,95:0.59:-2.10:1.000:0.833 0/1/1:3:21,59:0.70:-3.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,375:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,244:0.81:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,162:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:114,153:0.53:-0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:135,171:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,177:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,193:0.52: 0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,169:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,163:0.60:-0.57:1.000:0.820 0/0/1/1:4:131,171:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:218,83:0.38: 0.10:1.000:0.505 0/1/1/1:4:85,328:0.76: 1.72:0.986:1.000 0/0/1/1:4:166,90:0.41:-0.55:1.000:0.864 0/0/1/1:4:197,84:0.39:-0.19:1.000:0.643 0/1/1/1:4:60,197:0.73:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:131,144:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,197:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,134:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,191:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,148:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,161:0.56:-0.42:1.000:0.962 0/0/1/1:4:141,168:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:130,160:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,240:0.77: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:76,161:0.64:-0.83:1.000:0.867 0/1/1/1:4:83,246:0.71: 0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:123,160:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,165:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,223:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,181:0.52: 0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:134,167:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,53:0.40:-1.94:1.000:0.797 0/0/1/1:4:122,171:0.54:-0.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:141,146:0.48:-0.11:0.974:0.995 0/0/1/1:4:115,164:0.54:-0.22:1.000:0.986 0/1/1/1:4:39,278:0.86: 0.33:1.000:0.977 0/0/1/1:4:109,74:0.43:-1.61:0.999:0.957 0/0/1/1:4:164,79:0.40:-0.74:1.000:0.772 1/1/1/1:4:0,378:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,163:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,56:0.37:-1.22:1.000:0.550 0/0/1/1:4:123,116:0.47:-0.80:1.000:0.993 0/0/1/1:4:187,78:0.38:-0.42:1.000:0.617 0/0/1/1:4:105,150:0.54:-0.57:1.000:0.986 0/0/1/1:4:149,179:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,61:0.38:-1.16:0.995:0.562 0/0/1/1:4:205,86:0.38:-0.05:1.000:0.623 0/0/1/1:4:188,197:0.48: 1.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,161:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,196:0.77:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,166:0.53:-0.12:1.000:0.990 0/1/1/1:4:32,211:0.85:-0.74:1.000:0.991 0/1/1/1:4:70,228:0.73: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,172:0.63:-0.57:1.000:0.608 0/1/1/1:4:75,229:0.72: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,127:0.53:-1.06:1.000:0.993 0/1/1/1:4:71,235:0.73: 0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,246:0.79: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,218:0.78:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,140:0.53:-0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:100,152:0.56:-0.61:1.000:0.969 0/0/1/1:4:89,139:0.57:-0.96:1.000:0.957 0/0/1/1:4:118,129:0.49:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,187:0.55: 0.27:1.000:0.977 0/0/1/1:4:151,161:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,200:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,253:0.73: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:139,72:0.41:-1.20:1.000:0.833 0/0/1/1/1:5:117,242:0.63: 0.94:0.999:0.948 0/1/1/1:4:57,199:0.74:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,147:0.55:-0.70:1.000:0.977 0/0/1/1:4:83,138:0.58:-1.06:1.000:0.910 0/0/1/1:4:163,190:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:202,198:0.48: 1.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:86,283:0.73: 1.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,223:0.81:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,349:0.73: 2.32:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,318:1.00: 0.34:0.999:1.000 0/1/1/1:4:54,322:0.83: 1.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:29,176:0.84:-1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:130,198:0.56: 0.49:1.000:0.968 0/0/1/1:4:94,143:0.56:-0.83:1.000:0.969 0/1/1/1:4:69,235:0.74: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:127,130:0.48:-0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:155,85:0.41:-0.78:1.000:0.871 0/0/1/1:4:154,160:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,146:0.55:-0.73:1.000:0.976 0/0/1/1:4:197,89:0.39:-0.12:1.000:0.707 0/0/1/1:4:166,187:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,151:0.54:-0.51:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,320:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,148:0.47: 0.11:1.000:0.993 0/1/1/1:4:56,178:0.72:-0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,189:0.85:-1.12:1.000:0.988 0/1/1/1:4:53,213:0.77:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,132:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,176:0.52: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,98:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,166:0.52:-0.03:1.000:0.994 0/0/1/1:4:110,172:0.57:-0.18:1.000:0.957 0/0/1/1:4:213,221:0.48: 2.02:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,359:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,146:0.57:-0.81:1.000:0.948 0/0/1/1:4:99,126:0.51:-1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,200:0.79:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,259:0.77: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,235:0.84:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,176:0.52: 0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,173:0.76:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,202:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,243:0.49: 2.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,286:0.80: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,176:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,196:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,200:0.79:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,287:0.68: 1.53:1.000:0.950 0/1/1/1:4:71,265:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,76:0.73:-2.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:156,174:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,195:0.54: 0.57:1.000:0.989 0/0/1/1:4:229,96:0.38: 0.44:1.000:0.623 0/0/1/1:4:195,242:0.51: 2.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:87,295:0.74: 1.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,215:0.81:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,313:0.80: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,285:0.83: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,224:0.79:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,150:0.52:-0.45:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,314:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,285:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,166:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,209:0.72:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,184:0.50: 0.66:0.999:0.997 0/0/1/1:4:216,86:0.38: 0.11:1.000:0.560 0/0/1/1:4:146,145:0.48:-0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,266:0.82: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,191:0.72:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:158,173:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,239:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,167:0.68:-0.89:1.000:0.948 0/0/1/1:4:110,148:0.53:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:232,93:0.38: 0.44:1.000:0.569 0/0/1/1:4:212,81:0.38:-0.02:1.000:0.510 0/1/1/1:4:95,292:0.72: 1.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,245:0.80: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,191:0.50: 0.79:0.999:0.997 0/1/1/1:4:64,334:0.81: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,232:0.49: 2.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,121:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,191:0.52: 0.63:1.000:0.995 -chr7.1 24777525 chr7.1_024777525 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:66,20:0.29: 1.88:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,19:0.44:-0.09:1.000:0.962 0/0/0/1:4:51,13:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:38,24:0.43: 0.63:1.000:0.944 0/0/1/1:4:45,33:0.46: 1.47:1.000:0.989 0/0/0/1:4:24,6:0.26:-1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,19:0.39: 0.32:1.000:0.633 0/0/1/1:4:35,20:0.41: 0.27:1.000:0.848 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,35:0.59: 0.27:1.000:0.881 0/0/1/1:4:20,25:0.55:-0.25:1.000:0.983 0/0/1/1:4:35,28:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,9:0.17: 1.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:51,23:0.36: 1.26:1.000:0.702 0/0/1/1:4:37,29:0.48: 0.84:0.985:0.994 0/0/1/1:4:24,28:0.54: 0.11:1.000:0.989 0/0/0/1:4:85,11:0.15: 2.40:1.000:0.986 0/0/0/1:4:52,14:0.27: 0.84:1.000:0.998 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:30,21:0.45: 0.06:1.000:0.981 0/0/1/1:4:42,27:0.43: 1.00:1.000:0.954 0/0/1/1:4:37,20:0.40: 0.37:1.000:0.751 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,13:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,21:0.35: 1.10:1.000:0.834 0/0/0/1:4:83,12:0.16: 2.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,40:0.61: 0.48:1.000:0.712 0/0/1/1:4:32,20:0.43: 0.11:1.000:0.938 0/0/0/1:4:48,23:0.37: 1.10:1.000:0.551 0/0/1/1:4:26,34:0.55: 0.53:1.000:0.978 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,1:0.12:-2.02:1.000:0.719 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:52,6:0.13: 0.43:1.000:0.942 0/0/1/1:4:20,38:0.60: 0.43:1.000:0.819 0/0/0/1:4:61,20:0.30: 1.62:1.000:0.985 0/0/1/1:4:20,40:0.60: 0.53:1.000:0.769 0/1/1/1:4:17,45:0.63: 0.63:1.000:0.594 0/0/0/1:4:38,4:0.12:-0.41:1.000:0.832 0/0/0/1:4:34,16:0.37: 0.01:1.000:0.598 0/0/1/1:4:32,22:0.45: 0.22:1.000:0.977 0/0/0/1:4:44,12:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,8:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,19:0.42: 0.01:1.000:0.924 0/0/0/0:4:81,6:0.09: 1.93:0.986:0.948 0/0/0/1:4:12,5:0.34:-1.71:1.000:0.845 0/0/1/1:4:27,24:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,9:0.28:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,7:0.25:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,21:0.34: 1.21:1.000:0.884 0/0/0/1:4:26,10:0.33:-0.72:1.000:0.927 0/0/1/1:4:14,26:0.59:-0.51:1.000:0.838 0/0/1/1:4:36,23:0.43: 0.48:1.000:0.950 0/0/1/1:4:37,21:0.41: 0.43:1.000:0.838 0/0/0/1:4:43,12:0.27: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,8:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,11:0.34:-0.62:1.000:0.874 0/0/0/0/1/1:6:26,15:0.41:-0.46:1.000:0.567 0/0/0/1:4:41,4:0.12:-0.25:1.000:0.650 0/0/0/0:4:48,3:0.08: 0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:35,7:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,5:0.18:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,8:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,20:0.43: 0.11:1.000:0.938 0/0/1/1:4:6,13:0.61:-1.60:1.000:0.677 0/0/1/1:4:15,23:0.57:-0.62:1.000:0.943 0/0/0/1:4:35,7:0.22:-0.41:0.974:1.000 0/0/1/1:4:20,34:0.58: 0.22:1.000:0.898 0/0/0/1:4:43,4:0.11:-0.15:1.000:0.502 0/0/0/0:4:14,1:0.09:-1.81:0.999:0.967 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,12:0.22: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.56:-1.34:1.000:0.967 0/1/1/1:4:9,24:0.63:-0.88:1.000:0.603 0/0/1/1:4:19,17:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,21:0.57:-0.77:1.000:0.950 0/0/1/1:4:34,21:0.42: 0.27:1.000:0.929 0/0/0/1:4:44,6:0.16: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,19:0.55:-0.82:0.995:0.982 0/0/1/1:4:27,14:0.39:-0.46:1.000:0.657 0/0/0/1:4:29,7:0.25:-0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,23:0.37: 1.15:1.000:0.605 0/0/1/1:4:14,14:0.52:-1.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,16:0.38:-0.09:1.000:0.564 0/0/1/1:4:18,9:0.38:-1.19:1.000:0.564 0/0/0/1:4:37,5:0.15:-0.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:38,5:0.15:-0.36:1.000:0.989 0/0/0/0:4:54,5:0.11: 0.48:1.000:0.513 0/0/0/1:4:28,4:0.16:-0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,18:0.37: 0.32:1.000:0.581 0/0/1/1:4:38,26:0.45: 0.74:1.000:0.976 0/0/0/1:4:61,7:0.13: 0.95:1.000:0.938 0/0/0/1:4:42,7:0.19:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,8:0.20: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,19:0.53:-0.72:1.000:0.991 0/1/1/1:4:1,23:0.75:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,10:0.41:-1.19:1.000:0.885 0/0/0/1:4:44,17:0.33: 0.58:1.000:0.924 0/0/1/1:4:6,5:0.49:-2.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,17:0.36: 0.27:1.000:0.719 0/0/0/1:4:14,6:0.35:-1.55:1.000:0.802 0/0/1/1/1:5:10,22:0.61:-0.93:0.999:0.969 0/0/1/1:4:18,11:0.42:-1.08:1.000:0.921 0/0/1/1:4:17,27:0.58:-0.30:1.000:0.930 0/0/1/1:4:20,13:0.44:-0.88:1.000:0.959 0/0/0/1:4:41,20:0.37: 0.58:1.000:0.503 0/0/1/1:4:33,21:0.43: 0.22:1.000:0.948 0/0/0/1:4:54,11:0.22: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-1.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:59,46:0.48: 2.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:22,8:0.32:-1.03:0.999:0.958 0/0/0/0:4:56,4:0.09: 0.53:1.000:0.967 0/0/0/1:4:19,9:0.37:-1.14:1.000:0.581 0/0/0/1:4:39,7:0.20:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,9:0.42:-1.34:1.000:0.905 0/0/0/0:4:33,1:0.04:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,14:0.43:-0.72:1.000:0.948 0/0/1/1:4:14,11:0.48:-1.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,6:0.13: 0.63:1.000:0.862 0/0/1/1:4:14,17:0.54:-0.98:1.000:0.986 0/0/0/1:4:25,12:0.37:-0.67:1.000:0.546 0/0/1/1:4:35,21:0.42: 0.32:1.000:0.905 0/0/0/1:4:40,6:0.17:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,8:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,12:0.40:-0.82:1.000:0.769 0/0/1/1:4:9,15:0.58:-1.34:1.000:0.909 0/0/0/1:4:19,7:0.32:-1.24:1.000:0.952 0/0/0/1:4:20,9:0.36:-1.08:1.000:0.707 0/0/0/1:4:31,10:0.30:-0.46:1.000:0.987 0/0/1/1:4:30,39:0.55: 1.00:1.000:0.979 0/0/1/1:4:12,8:0.44:-1.55:1.000:0.969 0/0/0/1:4:27,9:0.30:-0.72:1.000:0.982 0/0/1/1:4:16,23:0.56:-0.56:1.000:0.961 0/0/0/1:4:41,17:0.34: 0.43:1.000:0.852 0/0/1/1:4:34,19:0.40: 0.17:1.000:0.813 0/0/1/1:4:14,9:0.43:-1.40:1.000:0.954 0/0/0/1:4:31,12:0.33:-0.36:1.000:0.922 0/0/0/1:4:22,10:0.36:-0.93:1.000:0.684 0/0/0/1:4:47,7:0.17: 0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,8:0.42:-1.50:1.000:0.927 0/0/0/1:4:33,16:0.37:-0.04:1.000:0.519 0/0/0/0:4:25,2:0.10:-1.19:1.000:0.873 0/0/0/1:4:77,12:0.18: 2.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,26:0.48: 0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,29:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,28:0.62:-0.51:1.000:0.579 0/0/0/1:4:53,21:0.33: 1.26:1.000:0.903 0/0/1/1:4:37,19:0.39: 0.32:1.000:0.633 0/0/0/1:4:65,14:0.23: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,25:0.42: 0.84:1.000:0.919 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,4:0.11:-0.15:1.000:0.502 0/0/0/1:4:52,18:0.31: 1.05:1.000:0.974 0/0/0/1:4:48,19:0.33: 0.89:1.000:0.904 0/0/0/1:4:73,17:0.25: 2.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,6:0.13: 0.63:1.000:0.862 0/0/1/1:4:30,26:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:53,12:0.24: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,16:0.32: 0.53:1.000:0.958 0/0/1/1:4:29,38:0.55: 0.89:1.000:0.978 0/1/1/1:4:16,47:0.64: 0.69:1.000:0.718 0/0/0/1:4:53,8:0.17: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,17:0.26: 1.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,28:0.57:-0.15:1.000:0.955 0/0/0/1:4:29,12:0.34:-0.46:1.000:0.855 0/0/1/1:4:23,26:0.53:-0.04:0.999:0.991 0/0/1/1:4:35,26:0.46: 0.58:1.000:0.990 0/0/0/1:4:60,8:0.15: 0.95:1.000:0.991 0/0/0/1:4:43,6:0.16:-0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,5:0.14:-0.15:1.000:0.961 0/0/0/1:4:55,9:0.18: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,11:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,12:0.34:-0.46:1.000:0.855 0/0/1/1:4:37,22:0.42: 0.48:1.000:0.896 0/0/1/1:4:47,26:0.40: 1.21:1.000:0.796 0/0/1/1:4:48,25:0.39: 1.21:1.000:0.668 0/0/0/1:4:70,12:0.19: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,11:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,18:0.35: 0.53:0.999:0.802 0/0/1/1:4:26,48:0.59: 1.26:1.000:0.843 0/0/0/1:4:60,14:0.25: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,7:0.22:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,40:0.61: 0.48:1.000:0.712 -chr7.1 25156873 chr7.1_025156873 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:106,2:0.02:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,49:0.31: 1.05:1.000:0.970 0/0/1/1:4:76,80:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,40:0.33: 0.10:1.000:0.921 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,91:0.54: 1.62:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,43:0.75:-1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,90:0.55: 1.39:1.000:0.977 0/1/1/1:4:39,97:0.68: 0.68:1.000:0.956 0/0/0/0:4:14,1:0.06:-2.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,20:0.90:-2.63:1.000:0.728 0/0/0/0:4:95,2:0.02:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,42:0.27: 0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,79:0.54: 0.93:1.000:0.987 0/0/1/1:4:67,44:0.39:-0.04:1.000:0.672 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.04:0.985:1.000 0/0/1/1:4:86,82:0.49: 1.60:1.000:0.996 0/0/0/0:4:74,1:0.01:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,110:0.72: 0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,10:0.39:-2.51:1.000:0.717 0/0/1/1:4:55,50:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,52:0.28: 1.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,85:0.60: 0.76:1.000:0.819 0/0/0/1:4:14,5:0.24:-2.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,95:0.71: 0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,98:0.54: 2.00:1.000:0.990 0/0/1/1:4:59,44:0.42:-0.27:1.000:0.926 0/0/0/1:4:112,52:0.30: 1.48:1.000:0.986 0/0/1/1:4:62,41:0.39:-0.27:1.000:0.693 0/0/0/0:4:89,3:0.03:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,67:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-3.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.45:-2.66:1.000:0.979 0/0/0:3:5,0:0.00:-3.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,47:0.30: 0.96:1.000:0.981 0/0/1/1:4:63,49:0.43:-0.01:1.000:0.957 0/0/0/1:4:96,42:0.28: 0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:107,31:0.20: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,29:0.31:-0.70:1.000:0.969 0/0/0/1:4:110,32:0.21: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,85:0.57: 1.02:1.000:0.957 0/1/1/1:4:25,59:0.67:-0.82:1.000:0.929 0/1/1/1:4:20,64:0.72:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,60:0.52: 0.07:1.000:0.994 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.04:0.986:1.000 0/0/1/1:4:55,58:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,65:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,24:0.27:-0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,23:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,39:0.23: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,34:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,35:0.22: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,36:0.25: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,59:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,33:0.20: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,82:0.63: 0.39:1.000:0.552 0/0/0/0:4:81,4:0.04:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:51,22:0.28:-1.13:1.000:0.770 0/0/1/1:4:60,49:0.45:-0.10:1.000:0.978 0/0/0/1:4:69,38:0.34:-0.16:1.000:0.858 0/0/0/1:4:66,25:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,36:0.36:-0.42:1.000:0.739 0/1/1/1:4:37,107:0.71: 0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:65,42:0.38:-0.16:1.000:0.619 0/1/1/1:4:23,45:0.64:-1.28:1.000:0.668 0/0/0/1:4:97,38:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,32:0.27:-0.10:0.974:0.997 0/0/0/1:4:67,26:0.26:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,41:0.38:-0.19:1.000:0.535 0/0/1/1:4:42,48:0.53:-0.64:0.999:0.992 0/0/1/1:4:66,82:0.55: 1.02:1.000:0.981 0/0/0/0:4:104,1:0.01:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,42:0.42:-0.39:1.000:0.913 0/0/1/1:4:64,62:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,36:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,53:0.43: 0.27:1.000:0.950 0/0/1/1:4:87,70:0.44: 1.28:1.000:0.973 0/0/0/1:4:65,32:0.31:-0.44:1.000:0.968 0/0/0/1:4:65,37:0.35:-0.30:0.995:0.790 0/0/1/1:4:65,66:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,41:0.28: 0.73:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,67:0.67:-0.47:1.000:0.913 0/0/0/1:4:75,28:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,88:0.55: 1.34:1.000:0.981 0/0/0/1:4:51,27:0.33:-0.99:1.000:0.915 0/0/0/1:4:47,29:0.37:-1.05:1.000:0.543 0/0/1/1:4:38,54:0.58:-0.59:1.000:0.928 0/0/1/1:4:62,46:0.42:-0.13:1.000:0.920 0/0/1/1:4:34,25:0.42:-1.54:1.000:0.910 0/0/0/0:4:89,3:0.03:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,45:0.26: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,27:0.30:-0.82:1.000:0.982 0/1/1/1:4:40,82:0.65: 0.27:1.000:0.763 0/1/1/1:4:32,86:0.69: 0.16:1.000:0.979 0/0/0/1:4:89,35:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,37:0.37:-0.42:1.000:0.603 0/0/1/1:4:63,66:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,51:0.41: 0.33:1.000:0.831 0/0/0/0:4:47,3:0.05:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,46:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/0/1:5:120,31:0.19: 1.11:0.999:0.998 0/0/0/0:4:80,1:0.01:-0.90:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:81,32:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,31:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,95:0.58: 1.39:1.000:0.919 0/0/0/1:4:77,39:0.32: 0.10:1.000:0.953 0/0/0/1:4:50,30:0.36:-0.93:1.000:0.640 0/0/0/0:4:123,3:0.02: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,4:0.04:-0.73:0.999:1.000 0/0/0/1:4:114,40:0.24: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,24:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,78:0.71:-0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:23,62:0.69:-0.79:1.000:0.979 0/0/0/0:4:79,5:0.05:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,53:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,61:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,37:0.29: 0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:70,26:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,87:0.53: 1.45:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,90:0.70: 0.30:1.000:0.982 0/1/1/1:4:25,47:0.63:-1.16:1.000:0.574 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,23:0.19:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,2:0.02:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,29:0.36:-0.96:1.000:0.742 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,38:0.34:-0.16:1.000:0.858 0/0/0/1:4:110,50:0.29: 1.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:47,25:0.33:-1.16:1.000:0.909 0/0/1/1:4:70,58:0.45: 0.45:1.000:0.982 0/0/0/1:4:88,34:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,53:0.31: 1.37:1.000:0.966 0/0/0/0:4:104,1:0.01:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,45:0.65:-1.31:1.000:0.759 0/1/1/1:4:23,60:0.69:-0.85:1.000:0.972 0/0/0/0:4:84,2:0.02:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,33:0.40:-0.90:1.000:0.797 0/0/0/1:4:88,27:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,41:0.30: 0.45:1.000:0.983 0/0/0/1:4:53,28:0.33:-0.90:1.000:0.917 0/1/1/1:4:25,98:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,55:0.33: 1.39:1.000:0.935 0/0/1/1:4:73,47:0.38: 0.22:1.000:0.607 0/0/1/1:4:62,74:0.54: 0.68:1.000:0.987 0/0/1/1:4:84,90:0.52: 1.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:60,43:0.41:-0.27:1.000:0.876 0/0/1/1:4:72,66:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,52:0.33: 1.14:1.000:0.933 0/0/1/1:4:6,7:0.54:-2.86:1.000:0.990 0/0/1/1:4:46,38:0.45:-0.82:1.000:0.981 0/0/0/1:4:109,49:0.29: 1.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:71,82:0.53: 1.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:78,51:0.39: 0.48:1.000:0.658 0/0/1/1:4:62,53:0.46: 0.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:68,40:0.36:-0.13:1.000:0.702 0/0/1/1:4:75,47:0.38: 0.27:1.000:0.512 0/0/0/1:4:61,38:0.37:-0.39:1.000:0.509 0/0/0/1:4:106,26:0.18: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,35:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,53:0.37: 0.82:1.000:0.627 0/0/1/1:4:64,101:0.60: 1.51:1.000:0.815 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,45:0.39:-0.01:0.999:0.738 0/0/1/1:4:71,81:0.53: 1.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:63,46:0.42:-0.10:1.000:0.902 0/0/1/1:4:58,44:0.43:-0.30:1.000:0.941 0/0/0/0:4:90,1:0.01:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,32:0.37:-0.79:1.000:0.619 0/0/0/0:4:108,3:0.02:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,5:0.06:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,81:0.57: 0.82:1.000:0.956 0/0/1/1:4:76,97:0.55: 1.74:1.000:0.975 0/0/1/1:4:68,98:0.58: 1.54:1.000:0.918 0/0/1/1:4:65,44:0.40:-0.10:1.000:0.759 0/0/0/1:4:63,36:0.35:-0.39:1.000:0.781 0/0/0/1:4:87,43:0.31: 0.50:0.999:0.967 0/0/0/1:4:135,57:0.28: 2.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,45:0.37: 0.19:1.000:0.594 0/1/1/1:4:34,86:0.68: 0.22:1.000:0.963 0/0/0/1:4:70,43:0.37: 0.02:1.000:0.559 -chr7.1 25313828 chr7.1_025313828 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:21,9:0.34: 0.83:1.000:0.888 0/0/0/1:4:15,2:0.20:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,3:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,4:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,9:0.34: 0.71:1.000:0.850 0/0/0/1:4:11,3:0.29:-1.16:1.000:0.993 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.15:-0.04:1.000:0.980 0/0/0/1:4:21,2:0.15:-0.04:1.000:0.980 0/0/0/1:4:6,1:0.24:-2.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.34:-0.91:1.000:0.841 0/0/1/1:4:11,11:0.45:-0.16:1.000:0.982 0/0/0/0:4:21,1:0.08:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:10,4:0.33:-1.16:1.000:0.926 0/0/1/1:4:10,13:0.49:-0.04:0.985:0.996 0/0/0/1:4:14,7:0.36:-0.29:1.000:0.732 0/0/0/1:4:25,13:0.36: 1.83:1.000:0.674 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.31:-0.91:1.000:0.976 0/0/0/0:4:25,1:0.06: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,4:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,4:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,12:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:19,1:0.08:-0.41:1.000:0.980 0/0/0/1:4:12,2:0.24:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.38:-0.54:1.000:0.523 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.19:-1.78:1.000:0.999 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.31:-0.41:1.000:0.976 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,3:0.18: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-1.41:1.000:0.732 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-2.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,4:0.29:-0.66:1.000:0.991 0/0/0/1:4:29,6:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 2.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,6:0.27: 1.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,15:0.40: 1.58:0.986:0.826 0/0/0/1:4:15,5:0.31:-0.41:1.000:0.976 0/0/0/1:4:15,3:0.26:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,3:0.19: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,2:0.18:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.29: 1.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:11,16:0.51: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,3:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,2:0.16:-0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 3.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.42: 0.21:1.000:0.905 0/0/0/0/0/1:6:29,2:0.11: 0.96:1.000:0.953 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.27:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,8:0.33: 0.58:1.000:0.926 0/0/0/0:4:17,1:0.09:-0.66:1.000:0.920 0/0/0/1:4:25,4:0.23: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,8:0.36:-0.04:1.000:0.634 0/0/0/1:4:9,2:0.27:-1.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,9:0.51:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:16,6:0.32:-0.16:0.974:0.951 0/0/0/1:4:22,3:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.32:-1.53:0.999:0.951 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,1:0.08:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/0:4:23,1:0.07: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,2:0.18:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,5:0.34:-0.91:1.000:0.841 0/0/0/1:4:14,3:0.27:-0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:28,5:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,3:0.17: 0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:14,4:0.29:-0.66:0.995:0.991 0/0/0/1:4:22,10:0.34: 1.08:1.000:0.841 0/0/0/1:4:29,6:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,6:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,3:0.30:-1.29:1.000:0.988 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,2:0.12: 0.46:1.000:0.830 0/0/0/0:4:16,1:0.10:-0.79:1.000:0.839 0/0/0/1:4:26,5:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,2:0.13: 0.33:1.000:0.893 0/0/0/1:4:21,3:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,4:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,6:0.26: 1.71:1.000:0.999 0/0/0/0:4:21,1:0.08:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 1.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,1:0.10:-0.91:1.000:0.692 0/0/1/1:4:6,8:0.49:-1.16:1.000:0.997 0/0/0/0:4:20,1:0.08:-0.29:1.000:0.990 0/0/0/0:4:33,2:0.10: 1.46:1.000:0.886 0/0/0/1:4:15,8:0.36:-0.04:1.000:0.634 0/0/1/1:4:6,4:0.39:-1.66:1.000:0.742 0/0/0/1:4:17,4:0.27:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,3:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:22,12:0.37: 1.33:0.999:0.949 0/0/1/1:4:10,9:0.44:-0.54:1.000:0.963 0/0/0/1:4:14,7:0.36:-0.29:1.000:0.732 0/0/0/1:4:26,2:0.12: 0.58:1.000:0.744 0/0/1/1:4:6,9:0.51:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,2:0.12: 0.46:1.000:0.830 0/0/0/1:4:28,2:0.11: 0.83:1.000:0.524 0/0/0/1:4:13,5:0.32:-0.66:1.000:0.942 0/0/0/1:4:16,5:0.30:-0.29:1.000:0.984 0/0/0/1:4:37,3:0.13: 2.08:0.999:0.854 0/0/0/1:4:22,9:0.33: 0.96:1.000:0.915 0/0/0/0:4:16,1:0.10:-0.79:1.000:0.839 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 3.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,7:0.33: 0.21:1.000:0.938 0/0/0/1:4:14,6:0.34:-0.41:1.000:0.888 0/0/0/0:4:26,1:0.06: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,2:0.11: 0.96:1.000:0.590 0/0/0/1:4:27,4:0.22: 0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,14:0.62:-0.66:1.000:0.607 0/0/0/0:4:21,1:0.08:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:21,3:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.15:-0.04:1.000:0.980 0/0/0/1:4:22,7:0.30: 0.71:1.000:0.982 0/0/0/1:4:19,5:0.28: 0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:17,6:0.31:-0.04:1.000:0.966 0/0/1/1:4:8,5:0.39:-1.29:1.000:0.643 0/0/0/1:4:17,6:0.31:-0.04:1.000:0.966 0/0/0/1:4:11,5:0.34:-0.91:1.000:0.841 0/0/0/1:4:16,2:0.19:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:21,2:0.15:-0.04:1.000:0.980 0/0/0/1:4:15,5:0.31:-0.41:1.000:0.976 0/0/0/0:4:17,1:0.09:-0.66:1.000:0.920 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.32: 0.71:1.000:0.946 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,1:0.05: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.34:-0.41:1.000:0.888 0/0/0/1:4:25,2:0.12: 0.46:1.000:0.830 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,5:0.25: 1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,5:0.29:-0.16:1.000:0.989 0/0/0/1:4:17,7:0.33: 0.09:1.000:0.912 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,1:0.07:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,1:0.06: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,3:0.15: 1.21:1.000:0.990 0/0/0/1:4:13,1:0.12:-1.16:1.000:0.744 0/0/0/1:4:9,1:0.17:-1.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,5:0.31:-0.41:1.000:0.976 0/0/0/1:4:14,2:0.21:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,2:0.10: 1.33:1.000:0.839 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.42: 0.21:1.000:0.905 0/0/0/1:4:18,2:0.17:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,2:0.11: 0.83:1.000:0.524 0/0/0/1:4:9,3:0.31:-1.41:1.000:0.976 0/0/0/1:4:12,5:0.33:-0.79:1.000:0.905 0/0/0/1:4:17,5:0.29:-0.16:1.000:0.989 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,3:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,3:0.32:-1.53:1.000:0.951 0/0/0/1:4:26,4:0.22: 0.83:0.999:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,4:0.29:-0.66:1.000:0.991 0/0/0/1:4:20,2:0.15:-0.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:21,3:0.21: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,6:0.30: 0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,6:0.38:-0.91:1.000:0.573 0/0/0/1:4:12,2:0.24:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,1:0.08:-0.41:1.000:0.980 0/0/0/1:4:18,5:0.29:-0.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:28,2:0.11: 0.83:1.000:0.524 0/0/0/1:4:24,4:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.19: 0.33:0.999:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.34:-0.04:1.000:0.873 0/0/0/0:4:29,1:0.06: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,1:0.07: 0.21:1.000:0.999 -chr7.1 25558222 chr7.1_025558222 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:176,49:.: 0.92:1.000:. ./.:4:126,24:.:-0.99:1.000:. ./.:4:145,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:158,47:.: 0.41:1.000:. ./.:4:161,43:.: 0.39:1.000:. ./.:4:188,48:.: 1.20:1.000:. ./.:4:51,42:.:-2.44:1.000:. ./.:4:165,35:.: 0.29:1.000:. ./.:4:85,76:.:-0.71:1.000:. ./.:4:118,15:.:-1.42:1.000:. ./.:4:79,28:.:-2.08:1.000:. ./.:4:161,37:.: 0.23:1.000:. ./.:4:145,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:156,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:151,35:.:-0.07:1.000:. ./.:4:179,38:.: 0.72:1.000:. ./.:4:160,48:.: 0.49:0.985:. ./.:4:156,28:.:-0.12:1.000:. ./.:4:184,42:.: 0.95:1.000:. ./.:4:110,72:.:-0.17:1.000:. ./.:4:78,28:.:-2.11:1.000:. ./.:4:128,37:.:-0.61:1.000:. ./.:4:157,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:146,30:.:-0.33:1.000:. ./.:4:82,17:.:-2.29:1.000:. ./.:4:122,116:.: 1.25:1.000:. ./.:4:177,57:.: 1.15:1.000:. ./.:4:171,30:.: 0.31:1.000:. ./.:4:187,26:.: 0.62:1.000:. ./.:4:109,65:.:-0.38:1.000:. ./.:4:185,53:.: 1.25:1.000:. ./.:4:124,33:.:-0.81:1.000:. ./.:4:65,18:.:-2.70:1.000:. ./.:4:108,25:.:-1.42:1.000:. ./.:3:79,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:167,48:.: 0.67:1.000:. ./.:4:170,40:.: 0.54:1.000:. ./.:4:152,41:.: 0.11:1.000:. ./.:4:194,25:.: 0.77:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:172,36:.: 0.49:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:216,40:.: 1.71:1.000:. ./.:4:110,51:.:-0.71:1.000:. ./.:4:146,65:.: 0.57:1.000:. ./.:4:186,35:.: 0.82:1.000:. ./.:4:158,33:.: 0.06:0.986:. ./.:4:190,55:.: 1.43:1.000:. ./.:4:168,29:.: 0.21:1.000:. ./.:4:253,59:.: 3.14:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:198,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:133,33:.:-0.58:1.000:. ./.:4:185,34:.: 0.77:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:125,82:.: 0.46:1.000:. ./.:4:164,21:.:-0.10:1.000:. ./.:6:167,19:.:-0.07:1.000:. ./.:4:182,39:.: 0.82:1.000:. ./.:4:166,33:.: 0.26:1.000:. ./.:4:189,45:.: 1.15:1.000:. ./.:4:166,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:107,60:.:-0.56:1.000:. ./.:4:168,36:.: 0.39:1.000:. ./.:4:86,15:.:-2.24:1.000:. ./.:4:159,21:.:-0.22:1.000:. ./.:4:195,31:.: 0.95:0.974:. ./.:4:100,75:.:-0.35:1.000:. ./.:4:143,72:.: 0.67:1.000:. ./.:4:104,17:.:-1.73:0.999:. ./.:4:129,76:.: 0.41:1.000:. ./.:4:160,44:.: 0.39:1.000:. ./.:4:122,75:.: 0.21:1.000:. ./.:4:152,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:153,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:140,24:.:-0.63:1.000:. ./.:4:169,33:.: 0.34:1.000:. ./.:4:111,65:.:-0.33:0.995:. ./.:4:195,16:.: 0.57:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:94,65:.:-0.76:1.000:. ./.:4:199,32:.: 1.08:1.000:. ./.:4:171,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,44:.:-1.22:1.000:. ./.:4:143,27:.:-0.48:1.000:. ./.:4:117,43:.:-0.73:1.000:. ./.:4:154,37:.: 0.06:1.000:. ./.:4:149,33:.:-0.17:1.000:. ./.:4:171,32:.: 0.36:1.000:. ./.:4:197,34:.: 1.08:1.000:. ./.:4:130,30:.:-0.73:1.000:. ./.:4:109,47:.:-0.84:1.000:. ./.:4:120,67:.:-0.05:1.000:. ./.:4:134,20:.:-0.89:1.000:. ./.:4:153,20:.:-0.40:1.000:. ./.:4:182,30:.: 0.59:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:125,27:.:-0.94:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:159,20:.:-0.25:1.000:. ./.:5:220,18:.: 1.25:0.999:. ./.:4:161,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:192,18:.: 0.54:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:173,28:.: 0.31:1.000:. ./.:4:133,30:.:-0.66:1.000:. ./.:4:106,46:.:-0.94:1.000:. ./.:4:202,59:.: 1.84:1.000:. ./.:4:181,33:.: 0.64:0.999:. ./.:4:152,72:.: 0.90:1.000:. ./.:4:141,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:126,63:.: 0.01:1.000:. ./.:4:85,40:.:-1.63:1.000:. ./.:4:179,41:.: 0.79:1.000:. ./.:4:141,23:.:-0.63:1.000:. ./.:4:173,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:145,36:.:-0.20:1.000:. ./.:4:169,18:.:-0.05:1.000:. ./.:4:175,22:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,82:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,76:.:-0.15:1.000:. ./.:4:217,46:.: 1.89:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:185,30:.: 0.67:1.000:. ./.:4:64,36:.:-2.26:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:156,24:.:-0.22:1.000:. ./.:4:133,26:.:-0.76:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:190,29:.: 0.77:1.000:. ./.:4:142,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:170,43:.: 0.62:1.000:. ./.:4:83,35:.:-1.80:1.000:. ./.:4:106,36:.:-1.19:1.000:. ./.:4:162,19:.:-0.20:1.000:. ./.:4:162,41:.: 0.36:1.000:. ./.:4:168,13:.:-0.20:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,18:.:-1.04:1.000:. ./.:4:111,67:.:-0.28:1.000:. ./.:4:272,1:.: 2.15:1.000:. ./.:4:109,87:.: 0.18:1.000:. ./.:4:177,23:.: 0.29:1.000:. ./.:4:181,33:.: 0.64:1.000:. ./.:4:78,68:.:-1.09:1.000:. ./.:4:214,32:.: 1.46:1.000:. ./.:4:126,25:.:-0.96:1.000:. ./.:4:68,25:.:-2.44:1.000:. ./.:4:112,32:.:-1.14:1.000:. ./.:4:165,41:.: 0.44:1.000:. ./.:4:145,31:.:-0.33:1.000:. ./.:4:167,46:.: 0.62:1.000:. ./.:4:170,34:.: 0.39:1.000:. ./.:4:85,50:.:-1.37:1.000:. ./.:4:112,99:.: 0.57:1.000:. ./.:4:92,64:.:-0.84:1.000:. ./.:4:139,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:162,27:.: 0.01:1.000:. ./.:4:182,37:.: 0.77:1.000:. ./.:4:155,49:.: 0.39:1.000:. ./.:4:135,21:.:-0.84:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:91,62:.:-0.91:0.999:. ./.:4:158,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:141,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:134,28:.:-0.68:1.000:. ./.:4:110,31:.:-1.22:1.000:. ./.:4:152,38:.: 0.03:1.000:. ./.:4:123,34:.:-0.81:1.000:. ./.:4:118,24:.:-1.19:1.000:. ./.:4:131,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:179,43:.: 0.85:1.000:. ./.:4:153,33:.:-0.07:1.000:. ./.:4:172,36:.: 0.49:1.000:. ./.:4:98,51:.:-1.01:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.97:0.999:. ./.:4:205,38:.: 1.38:1.000:. ./.:4:184,58:.: 1.36:1.000:. ./.:4:72,51:.:-1.68:1.000:. ./.:4:94,84:.:-0.28:1.000:. -chr7.1 25680448 chr7.1_025680448 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:207,87:0.22: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,173:0.57: 0.45:1.000:0.954 0/0/0/0:4:300,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,104:0.51:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:249,114:0.23: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:297,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,83:0.39:-0.64:1.000:0.736 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,182:0.56: 0.66:1.000:0.961 0/0/0/1:4:168,73:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,86:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:230,101:0.23: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,103:0.39:-0.07:0.985:0.703 0/0/0/1:4:211,107:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,43:0.32:-1.57:1.000:0.955 0/0/0/1:4:187,94:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,92:0.38:-0.34:1.000:0.590 0/0/0/0:4:314,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:286,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,98:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,97:0.40:-0.28:1.000:0.790 0/0/1/1:4:117,100:0.43:-0.31:1.000:0.941 0/0/1/1:4:140,202:0.55: 1.18:1.000:0.979 0/0/0/1:4:175,81:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,15:0.27:-2.40:1.000:0.998 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.85:1.000:1.000 0/0/0:3:85,11:0.09:-1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,80:0.38:-0.66:1.000:0.546 0/0/1/1:4:122,147:0.52: 0.31:1.000:0.994 0/0/0/0:4:318,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,122:0.24: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,212:0.42: 2.69:1.000:0.901 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:310,101:0.18: 2.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:248,104:0.22: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:200,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:231,0:0.00:-0.15:0.986:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:269,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,104:0.47:-0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:233,93:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,98:0.17: 2.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:280,92:0.18: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,104:0.38: 0.02:1.000:0.527 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,115:0.28: 0.92:1.000:0.994 0/0/0/1:4:281,76:0.16: 1.36:1.000:0.995 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,102:0.26: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:116,84:0.37:-0.52:1.000:0.832 0/0/0/1:4:127,92:0.37:-0.29:1.000:0.556 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:305,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,107:0.39: 0.02:1.000:0.735 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,90:0.22: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,71:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,99:0.43:-0.34:1.000:0.940 0/0/0/0:4:232,0:0.00:-0.13:0.974:1.000 0/0/0/1:4:107,76:0.36:-0.72:1.000:0.643 0/0/0/0:4:175,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-0.54:0.999:1.000 0/1/1/1:4:41,221:0.71: 0.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:120,76:0.32:-0.56:1.000:0.939 0/0/1/1:4:101,76:0.38:-0.79:1.000:0.616 0/0/0/1:4:174,99:0.29: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:170,86:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:204,113:0.28: 0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,108:0.43:-0.13:1.000:0.957 0/0/0/0:4:320,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-0.62:0.995:1.000 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,108:0.19: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,67:0.32:-0.80:1.000:0.965 0/0/0/1:4:152,82:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:252,88:0.19: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,71:0.40:-0.98:1.000:0.791 0/0/1/1:4:114,94:0.42:-0.42:1.000:0.894 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,77:0.36:-0.68:1.000:0.665 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,80:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,112:0.41: 0.07:1.000:0.878 0/0/0/1:4:81,56:0.35:-1.27:1.000:0.748 0/0/0/0:4:253,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,88:0.42:-0.60:1.000:0.918 0/0/1/1:4:94,152:0.57: 0.03:1.000:0.951 0/0/1/1:4:135,119:0.44: 0.13:1.000:0.965 0/0/0/1:4:228,99:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,78:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:217,96:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:140,190:0.54: 1.04:0.999:0.838 0/0/0/1:4:111,67:0.31:-0.78:1.000:0.975 0/0/0/1:4:204,86:0.22: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,98:0.21: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,89:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,131:0.51: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,94:0.37:-0.22:1.000:0.598 0/0/1/1:4:37,88:0.62:-1.41:1.000:0.520 0/0/0/1:4:264,122:0.24: 1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,204:0.59: 0.86:0.999:0.879 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,71:0.45:-1.11:1.000:0.975 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,84:0.40:-0.64:1.000:0.804 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,99:0.32: 0.15:1.000:0.944 0/0/0/0:4:258,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,102:0.43:-0.28:1.000:0.951 0/0/0/0:4:315,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,95:0.37:-0.19:1.000:0.585 0/0/0/0:4:185,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,114:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:277,95:0.19: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,191:0.57: 0.75:1.000:0.940 0/0/1/1:4:38,73:0.59:-1.58:1.000:0.839 0/0/0/1:4:160,68:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,80:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,99:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,67:0.18: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,91:0.22: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,87:0.46:-0.77:1.000:0.990 0/0/0/1:4:351,122:0.19: 2.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,180:0.75:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,90:0.37:-0.36:1.000:0.510 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,87:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:213,104:0.25: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,87:0.39:-0.50:1.000:0.675 0/0/0/1:4:175,88:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,83:0.44:-0.78:1.000:0.959 0/0/0/0:4:265,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:373,115:0.18: 2.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,96:0.63:-1.29:1.000:0.541 0/0/1/1:4:90,179:0.60: 0.31:1.000:0.800 0/0/0/1:4:213,91:0.22: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,99:0.50:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,114:0.47:-0.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:109,76:0.36:-0.70:1.000:0.717 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:310,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:369,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,102:0.19: 1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,72:0.62:-1.67:1.000:0.618 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,104:0.38: 0.01:1.000:0.559 0/1/1/1:4:13,138:0.76:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,86:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,82:0.31:-0.32:1.000:0.968 0/0/0/1:4:186,99:0.27: 0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,156:0.58: 0.03:1.000:0.919 0/0/0/1:4:192,97:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,107:0.43:-0.13:0.999:0.943 0/0/0/0:4:266,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,73:0.35:-0.77:1.000:0.761 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,64:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,105:0.21: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:362,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,93:0.41:-0.42:1.000:0.856 0/0/0/1:4:108,22:0.13:-1.35:1.000:0.871 0/0/0/1:4:340,86:0.15: 2.19:0.999:0.989 0/0/1/1:4:128,112:0.44:-0.04:1.000:0.960 0/0/0/0:4:318,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,70:0.48:-1.23:1.000:0.995 -chr7.1 25865927 chr7.1_025865927 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:206,77:.: 1.19:1.000:. ./.:4:133,46:.:-1.11:1.000:. ./.:4:120,64:.:-1.00:1.000:. ./.:4:126,101:.:-0.05:1.000:. ./.:4:260,65:.: 2.12:1.000:. ./.:4:118,98:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,78:.:-2.51:1.000:. ./.:4:120,111:.: 0.04:1.000:. ./.:4:69,113:.:-1.05:1.000:. ./.:4:104,37:.:-1.96:1.000:. ./.:4:49,73:.:-2.38:1.000:. ./.:4:168,53:.:-0.18:1.000:. ./.:4:173,40:.:-0.36:1.000:. ./.:4:125,84:.:-0.45:1.000:. ./.:4:116,110:.:-0.07:1.000:. ./.:4:162,51:.:-0.36:1.000:. ./.:4:171,64:.: 0.13:0.985:. ./.:4:138,89:.:-0.05:1.000:. ./.:4:222,93:.: 1.90:1.000:. ./.:4:91,203:.: 1.43:1.000:. ./.:4:123,72:.:-0.76:1.000:. ./.:4:122,91:.:-0.36:1.000:. ./.:4:210,35:.: 0.35:1.000:. ./.:4:116,84:.:-0.65:1.000:. ./.:4:105,18:.:-2.36:1.000:. ./.:4:63,130:.:-0.80:1.000:. ./.:4:110,76:.:-0.96:1.000:. ./.:4:96,96:.:-0.83:1.000:. ./.:4:227,50:.: 1.06:1.000:. ./.:4:101,114:.:-0.32:1.000:. ./.:4:150,48:.:-0.69:1.000:. ./.:4:72,64:.:-2.07:1.000:. ./.:4:88,39:.:-2.27:1.000:. ./.:4:91,68:.:-1.56:1.000:. ./.:3:69,11:.:-3.31:1.000:. ./.:4:173,55:.:-0.03:1.000:. ./.:4:159,41:.:-0.65:1.000:. ./.:4:111,121:.: 0.06:1.000:. ./.:4:219,62:.: 1.15:1.000:. ./.:4:231,42:.: 0.97:1.000:. ./.:4:132,96:.:-0.03:1.000:. ./.:4:169,48:.:-0.27:1.000:. ./.:4:138,97:.: 0.13:1.000:. ./.:4:62,134:.:-0.74:1.000:. ./.:4:91,159:.: 0.46:1.000:. ./.:4:151,90:.: 0.26:1.000:. ./.:4:200,65:.: 0.79:0.986:. ./.:4:180,130:.: 1.79:1.000:. ./.:4:95,78:.:-1.25:1.000:. ./.:4:118,92:.:-0.43:1.000:. ./.:4:174,41:.:-0.32:1.000:. ./.:4:234,54:.: 1.30:1.000:. ./.:4:226,47:.: 0.97:1.000:. ./.:4:248,48:.: 1.48:1.000:. ./.:4:183,50:.: 0.08:1.000:. ./.:4:116,91:.:-0.49:1.000:. ./.:4:169,48:.:-0.27:1.000:. ./.:4:82,154:.: 0.15:1.000:. ./.:4:228,85:.: 1.86:1.000:. ./.:6:173,72:.: 0.35:1.000:. ./.:4:145,115:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,92:.:-0.76:1.000:. ./.:4:147,130:.: 1.06:1.000:. ./.:4:135,120:.: 0.57:1.000:. ./.:4:64,150:.:-0.34:1.000:. ./.:4:151,115:.: 0.81:1.000:. ./.:4:135,77:.:-0.38:1.000:. ./.:4:185,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,87:.: 0.17:0.974:. ./.:4:121,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:201,128:.: 2.21:1.000:. ./.:4:112,81:.:-0.80:0.999:. ./.:4:152,91:.: 0.30:1.000:. ./.:4:205,53:.: 0.64:1.000:. ./.:4:117,96:.:-0.36:1.000:. ./.:4:146,71:.:-0.27:1.000:. ./.:4:187,44:.: 0.04:1.000:. ./.:4:142,99:.: 0.26:1.000:. ./.:4:144,93:.: 0.17:1.000:. ./.:4:157,128:.: 1.24:1.000:. ./.:4:92,94:.:-0.96:0.995:. ./.:4:143,118:.: 0.70:1.000:. ./.:4:252,47:.: 1.55:1.000:. ./.:4:55,133:.:-0.91:1.000:. ./.:4:216,40:.: 0.59:1.000:. ./.:4:154,106:.: 0.68:1.000:. ./.:4:113,105:.:-0.25:1.000:. ./.:4:140,116:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,122:.:-0.52:1.000:. ./.:4:128,100:.:-0.03:1.000:. ./.:4:115,70:.:-0.98:1.000:. ./.:4:215,64:.: 1.10:1.000:. ./.:4:263,54:.: 1.94:1.000:. ./.:4:96,91:.:-0.94:1.000:. ./.:4:92,214:.: 1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:196,50:.: 0.37:1.000:. ./.:4:195,42:.: 0.17:1.000:. ./.:4:159,121:.: 1.12:1.000:. ./.:4:222,38:.: 0.68:1.000:. ./.:4:187,35:.:-0.16:1.000:. ./.:4:280,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:124,60:.:-1.00:1.000:. ./.:5:308,49:.: 2.83:0.999:. ./.:4:196,57:.: 0.53:1.000:. ./.:4:212,55:.: 0.84:1.000:. ./.:4:184,47:.: 0.04:1.000:. ./.:4:189,34:.:-0.14:1.000:. ./.:4:150,96:.: 0.37:1.000:. ./.:4:99,122:.:-0.18:1.000:. ./.:4:161,134:.: 1.46:1.000:. ./.:4:222,68:.: 1.35:1.000:. ./.:4:233,80:.: 1.86:0.999:. ./.:4:194,122:.: 1.92:1.000:. ./.:4:137,27:.:-1.45:1.000:. ./.:4:76,166:.: 0.28:1.000:. ./.:4:75,161:.: 0.15:1.000:. ./.:4:193,58:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,93:.: 0.13:1.000:. ./.:4:101,112:.:-0.36:1.000:. ./.:4:111,105:.:-0.29:1.000:. ./.:4:214,45:.: 0.66:1.000:. ./.:4:146,78:.:-0.12:1.000:. ./.:4:72,117:.:-0.89:1.000:. ./.:4:68,152:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,67:.: 1.21:1.000:. ./.:4:243,46:.: 1.32:1.000:. ./.:4:154,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:94,92:.:-0.96:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:107,97:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:145,29:.:-1.22:1.000:. ./.:4:116,75:.:-0.85:1.000:. ./.:4:184,55:.: 0.22:1.000:. ./.:4:257,43:.: 1.57:1.000:. ./.:4:172,56:.:-0.03:1.000:. ./.:4:77,143:.:-0.21:1.000:. ./.:4:56,117:.:-1.25:1.000:. ./.:4:178,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:121,108:.:-0.01:1.000:. ./.:4:219,38:.: 0.61:1.000:. ./.:4:178,45:.:-0.14:1.000:. ./.:4:131,84:.:-0.32:1.000:. ./.:4:85,199:.: 1.21:1.000:. ./.:4:234,56:.: 1.35:1.000:. ./.:4:137,142:.: 1.10:1.000:. ./.:4:134,101:.: 0.13:1.000:. ./.:4:157,94:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,111:.: 0.02:1.000:. ./.:4:159,134:.: 1.41:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.83:1.000:. ./.:4:97,51:.:-1.80:1.000:. ./.:4:84,57:.:-1.96:1.000:. ./.:4:140,41:.:-1.07:1.000:. ./.:4:145,90:.: 0.13:1.000:. ./.:4:146,128:.: 0.99:1.000:. ./.:4:149,125:.: 0.99:1.000:. ./.:4:103,81:.:-1.00:1.000:. ./.:4:125,106:.: 0.04:1.000:. ./.:4:120,102:.:-0.16:1.000:. ./.:4:150,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:186,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:187,57:.: 0.33:1.000:. ./.:4:88,75:.:-1.47:1.000:. ./.:4:103,72:.:-1.20:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:128,111:.: 0.22:0.999:. ./.:4:128,64:.:-0.83:1.000:. ./.:4:121,82:.:-0.58:1.000:. ./.:4:89,71:.:-1.54:1.000:. ./.:4:139,51:.:-0.87:1.000:. ./.:4:124,87:.:-0.40:1.000:. ./.:4:161,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:186,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:113,72:.:-0.98:1.000:. ./.:4:190,46:.: 0.15:1.000:. ./.:4:137,102:.: 0.22:1.000:. ./.:4:111,120:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,95:.:-0.85:1.000:. ./.:4:220,38:.: 0.64:0.999:. ./.:4:197,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:150,139:.: 1.32:1.000:. ./.:4:46,120:.:-1.40:1.000:. ./.:4:128,125:.: 0.53:1.000:. -chr7.1 25926132 chr7.1_025926132 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:217,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:127,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.63:0.985:. ./.:4:288,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:346,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:120,2:.:-2.22:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:126,0:.:-2.14:1.000:. ./.:3:68,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:266,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.44:0.986:. ./.:4:219,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.78:1.000:. ./.:6:201,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.17:0.974:. ./.:4:182,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.30:0.999:. ./.:4:252,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.18:0.995:. ./.:4:269,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:179,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:177,0:.:-1.06:1.000:. ./.:5:325,0:.: 2.07:0.999:. ./.:4:194,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:303,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:216,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:336,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:331,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.37:0.999:. ./.:4:325,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.64:1.000:. -chr7.1 26429671 chr7.1_026429671 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:102,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:54,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,45:.: 0.66:1.000:. ./.:4:48,26:.: 0.08:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:56,44:.: 1.15:1.000:. ./.:4:18,20:.:-1.40:1.000:. ./.:4:29,31:.:-0.50:1.000:. ./.:4:38,34:.: 0.00:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:5,4:.:-2.60:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:75,19:.: 0.91:1.000:. ./.:4:38,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:52,24:.: 0.16:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.95:0.985:. ./.:4:21,56:.: 0.21:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:39,42:.: 0.37:1.000:. ./.:4:5,4:.:-2.60:1.000:. ./.:4:51,21:.: 0.00:1.000:. ./.:4:42,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,50:.: 0.82:1.000:. ./.:4:5,2:.:-2.68:1.000:. ./.:4:37,28:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,37:.:-0.25:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.04:1.000:. ./.:4:75,34:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.93:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:30,25:.:-0.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.23:1.000:. ./.:3:3,2:.:-2.77:0.999:. ./.:4:77,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:58,11:.:-0.12:1.000:. ./.:4:73,20:.: 0.87:1.000:. ./.:4:45,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:51,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:44,42:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,44:.: 0.21:1.000:. ./.:4:39,54:.: 0.87:1.000:. ./.:4:51,48:.: 1.11:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.16:0.986:. ./.:4:13,13:.:-1.90:1.000:. ./.:4:36,35:.:-0.04:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.74:1.000:. ./.:4:59,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:79,30:.: 1.53:1.000:. ./.:4:52,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:26,9:.:-1.53:1.000:. ./.:4:52,28:.: 0.33:1.000:. ./.:4:27,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:54,36:.: 0.74:1.000:. ./.:4:42,32:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.08:1.000:. ./.:6:70,16:.: 0.58:1.000:. ./.:4:72,32:.: 1.32:1.000:. ./.:4:83,23:.: 1.40:1.000:. ./.:4:40,13:.:-0.78:1.000:. ./.:4:43,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:51,42:.: 0.87:1.000:. ./.:4:51,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:25,18:.:-1.20:1.000:. ./.:4:49,22:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,26:.: 0.33:0.974:. ./.:4:72,19:.: 0.78:1.000:. ./.:4:57,22:.: 0.29:1.000:. ./.:4:17,13:.:-1.73:0.999:. ./.:4:28,34:.:-0.41:1.000:. ./.:4:130,1:.: 2.43:1.000:. ./.:4:59,22:.: 0.37:1.000:. ./.:4:27,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:50,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:34,49:.: 0.45:1.000:. ./.:4:35,43:.: 0.25:1.000:. ./.:4:38,11:.:-0.95:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.33:0.995:. ./.:4:32,33:.:-0.29:1.000:. ./.:4:12,6:.:-2.23:1.000:. ./.:4:37,46:.: 0.45:1.000:. ./.:4:45,19:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,39:.:-0.25:1.000:. ./.:4:47,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:39,19:.:-0.58:1.000:. ./.:4:23,32:.:-0.70:1.000:. ./.:4:67,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:33,17:.:-0.91:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:51,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,28:.:-0.45:1.000:. ./.:4:24,31:.:-0.70:1.000:. ./.:4:49,21:.:-0.08:1.000:. ./.:4:44,12:.:-0.66:1.000:. ./.:4:33,46:.: 0.29:1.000:. ./.:4:67,26:.: 0.87:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:27,25:.:-0.83:1.000:. ./.:5:73,26:.: 1.11:0.999:. ./.:4:67,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:38,23:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,23:.: 0.16:1.000:. ./.:4:68,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:58,57:.: 1.77:1.000:. ./.:4:34,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:32,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.74:0.999:. ./.:4:84,24:.: 1.48:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,60:.: 1.28:1.000:. ./.:4:19,26:.:-1.11:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:31,36:.:-0.21:1.000:. ./.:4:39,38:.: 0.21:1.000:. ./.:4:69,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,24:.:-1.03:1.000:. ./.:4:43,49:.: 0.82:1.000:. ./.:4:31,57:.: 0.66:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:56,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:36,14:.:-0.91:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:39,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:52,16:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,25:.: 0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:28,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:63,16:.: 0.29:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,29:.: 0.87:1.000:. ./.:4:52,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:42,61:.: 1.28:1.000:. ./.:4:75,47:.: 2.06:1.000:. ./.:4:71,29:.: 1.15:1.000:. ./.:4:65,52:.: 1.86:1.000:. ./.:4:48,39:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,16:.:-1.20:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.99:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.21:1.000:. ./.:4:7,3:.:-2.56:1.000:. ./.:4:66,25:.: 0.78:1.000:. ./.:4:57,35:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,38:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,27:.: 1.15:1.000:. ./.:4:30,14:.:-1.16:1.000:. ./.:4:71,35:.: 1.40:1.000:. ./.:4:63,25:.: 0.66:1.000:. ./.:4:53,15:.:-0.17:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.04:1.000:. ./.:4:57,22:.: 0.29:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:86,22:.: 1.48:1.000:. ./.:4:36,42:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:56,27:.: 0.45:0.999:. ./.:4:49,64:.: 1.69:1.000:. ./.:4:62,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:27,23:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,31:.:-0.83:1.000:. ./.:4:67,22:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,49:.: 0.91:1.000:. ./.:4:46,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:59,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,16:.: 0.25:0.999:. ./.:4:55,13:.:-0.17:1.000:. ./.:4:47,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:25,31:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,36:.: 1.40:1.000:. -chr7.1 26522469 chr7.1_026522469 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:97,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.61:0.985:. ./.:4:81,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:4,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.40:0.986:. ./.:4:21,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:50,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:0.974:. ./.:4:92,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.96:0.999:. ./.:4:95,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:0.995:. ./.:4:78,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.85:1.000:. ./.:5:94,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:135,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.38:0.999:. ./.:4:101,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:107,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:123,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.04:1.000:. -chr7.1 26786645 chr7.1_026786645 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,15:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,4:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:21,11:.:-0.08:1.000:. ./.:4:13,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:25,8:.:-0.01:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:7,3:.:-1.63:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:14,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,10:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.31:0.985:. ./.:4:33,13:.: 0.90:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.19:1.000:. ./.:4:33,6:.: 0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:42,19:.: 1.96:1.000:. ./.:4:25,11:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,18:.: 1.39:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:68,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:34,13:.: 0.97:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.77:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:44,10:.: 1.46:1.000:. ./.:4:34,12:.: 0.90:1.000:. ./.:4:32,9:.: 0.55:1.000:. ./.:4:29,7:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.58:1.000:. ./.:4:26,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.62:0.986:. ./.:4:30,15:.: 0.83:1.000:. ./.:4:36,16:.: 1.32:1.000:. ./.:4:67,23:.: 3.99:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:43,13:.: 1.60:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:46,15:.: 1.96:1.000:. ./.:4:30,6:.: 0.20:1.000:. ./.:4:41,14:.: 1.53:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.32:1.000:. ./.:6:30,9:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:25,14:.: 0.41:1.000:. ./.:4:39,8:.: 0.97:1.000:. ./.:4:31,9:.: 0.48:1.000:. ./.:4:32,11:.: 0.69:1.000:. ./.:4:49,11:.: 1.89:1.000:. ./.:4:8,6:.:-1.35:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:49,11:.: 1.89:0.974:. ./.:4:20,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.51:0.999:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,6:.:-0.93:1.000:. ./.:4:16,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,10:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,10:.: 1.81:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.22:0.995:. ./.:4:32,17:.: 1.11:1.000:. ./.:4:32,8:.: 0.48:1.000:. ./.:4:9,10:.:-1.00:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:5,4:.:-1.70:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,5:.:-1.21:1.000:. ./.:4:17,8:.:-0.58:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.01:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.69:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:19,9:.:-0.36:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.72:1.000:. ./.:4:27,10:.: 0.27:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:13,2:.:-1.28:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.56:1.000:. ./.:5:23,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:43,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,10:.: 1.04:1.000:. ./.:4:18,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:25,8:.:-0.01:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.08:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:34,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,10:.:-0.86:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.07:1.000:. ./.:4:14,6:.:-0.93:1.000:. ./.:4:30,6:.: 0.20:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.58:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:35,18:.: 1.39:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.21:1.000:. ./.:4:8,6:.:-1.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:14,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.20:1.000:. ./.:4:14,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.48:1.000:. ./.:4:26,8:.: 0.06:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.44:1.000:. ./.:4:24,11:.: 0.13:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,12:.: 1.67:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.62:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:11,8:.:-1.00:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:57,12:.: 2.52:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:16,4:.:-0.93:1.000:. ./.:4:29,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.22:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:23,15:.: 0.34:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.51:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,13:.:-0.08:1.000:. ./.:4:36,16:.: 1.32:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.15:0.999:. ./.:4:39,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:29,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:13,8:.:-0.86:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.44:1.000:. -chr7.1 26941970 chr7.1_026941970 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:145,0:.: 1.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:128,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:93,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.51:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.61:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:83,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:213,1:.: 3.60:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:18,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:0.974:. ./.:4:65,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.57:0.999:. ./.:4:171,0:.: 2.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.15:0.995:. ./.:4:104,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 0.02:1.000:. ./.:5:82,0:.: 0.34:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:71,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:92,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:89,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.82:0.999:. ./.:4:104,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.05:1.000:. -chr7.1 27057580 chr7.1_027057580 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:32,14:0.32: 0.20:1.000:0.961 0/0/0/1:4:19,8:0.31:-1.20:1.000:0.974 0/0/1/1:4:13,18:0.57:-0.91:1.000:0.944 0/0/0/1:4:34,5:0.14:-0.32:1.000:0.959 0/0/0/1:4:57,12:0.19: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,14:0.39:-0.46:1.000:0.648 0/1/1/1:4:6,22:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,33:0.75:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,18:0.48:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:3,1:0.27:-2.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-2.52:1.000:0.748 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,26:0.54: 0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:26,23:0.47: 0.42:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,9:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:28,10:0.28:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.17:0.985:1.000 0/0/1/1:4:23,28:0.54: 0.56:1.000:0.986 0/0/0/1:4:43,14:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,29:0.48: 1.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,5:0.96:-2.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,10:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,28:0.42: 1.81:1.000:0.903 0/1/1/1:4:10,36:0.75: 0.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:0.96:-2.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,27:0.64:-0.17:1.000:0.682 0/1/1/1:4:12,35:0.72: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,15:0.36:-0.02:1.000:0.705 0/0/0/1:4:47,12:0.22: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,14:0.40:-0.54:1.000:0.755 0/0/0/1:4:25,12:0.34:-0.46:1.000:0.894 0/0/1/1:4:14,18:0.55:-0.83:1.000:0.974 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-3.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:19,2:0.10:-1.64:1.000:0.746 0/1/1:3:2,3:0.59:-2.82:0.999:0.997 0/0/0/1:4:40,8:0.18: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,18:0.44:-0.17:1.000:0.972 0/0/1/1:4:22,21:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,18:0.48:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:35,15:0.31: 0.49:1.000:0.969 0/0/0/1:4:30,10:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,17:0.45:-0.39:1.000:0.981 0/1/1/1:4:11,37:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,16:0.67:-1.49:1.000:0.929 0/1/1/1:4:15,37:0.69: 0.64:1.000:0.967 0/1/1/1:4:4,27:0.83:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,14:0.29: 0.56:0.986:0.992 0/0/1/1:4:8,5:0.39:-2.23:1.000:0.714 0/1/1/1:4:8,31:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.47:-0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,22:0.57:-0.39:1.000:0.948 0/0/0/1:4:26,15:0.37:-0.17:1.000:0.503 0/0/0/1:4:41,11:0.23: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,18:0.45:-0.24:1.000:0.983 0/1/1/1:4:3,32:0.87:-0.61:1.000:0.859 0/0/1/1:4:32,21:0.40: 0.71:1.000:0.815 0/1/1/1:4:9,30:0.74:-0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:35,15:0.31: 0.49:1.000:0.969 0/0/0/0/1/1:6:32,12:0.29: 0.05:1.000:0.812 0/0/0/1:4:43,13:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,12:0.43:-1.13:1.000:0.954 0/0/0/1:4:42,15:0.28: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,13:0.32:-0.02:1.000:0.965 0/0/1/1:4:25,15:0.38:-0.24:1.000:0.609 0/0/0/1:4:23,7:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,19:0.54:-0.61:1.000:0.989 0/0/0/1:4:39,9:0.20: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.21: 0.20:0.966:1.000 0/0/0/1:4:37,8:0.19: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,30:0.61: 0.34:1.000:0.692 0/0/1/1:4:21,20:0.49:-0.17:0.999:0.996 0/0/1/1:4:22,24:0.52: 0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,14:0.31: 0.34:1.000:0.980 0/0/0/1:4:24,10:0.31:-0.69:1.000:0.977 0/0/1/1:4:21,25:0.54: 0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:27,8:0.25:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,26:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,25:0.47: 0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,27:0.58: 0.20:1.000:0.927 0/0/0/1:4:34,9:0.22:-0.02:0.995:1.000 0/0/0/1:4:26,13:0.34:-0.32:1.000:0.841 0/0/1/1:4:27,23:0.46: 0.49:1.000:0.989 0/0/1/1:4:26,26:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,26:0.60:-0.10:1.000:0.747 0/1/1/1:4:14,35:0.69: 0.42:1.000:0.971 0/0/0/1:4:32,4:0.12:-0.54:1.000:0.748 0/0/0/1:4:29,12:0.31:-0.17:1.000:0.979 0/0/0/1:4:37,17:0.33: 0.78:1.000:0.933 0/0/0/1:4:36,5:0.13:-0.17:1.000:0.918 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-1.42:1.000:0.989 0/0/0/1:4:36,9:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,37:0.59: 1.37:1.000:0.891 0/0/0/1:4:20,5:0.21:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,45:0.69: 1.45:1.000:0.971 0/0/1/1:4:23,19:0.46:-0.10:1.000:0.985 0/0/0/1:4:45,9:0.18: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,14:0.34:-0.10:1.000:0.841 0/0/1/1:4:37,23:0.39: 1.23:1.000:0.701 0/0/0/1:4:50,16:0.26: 1.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,11:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,40:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:74,16:0.19: 3.43:0.999:0.997 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,24:0.46: 0.71:1.000:0.985 0/0/1/1:4:22,15:0.41:-0.46:1.000:0.873 0/0/0/1:4:27,13:0.34:-0.24:1.000:0.891 0/0/1/1:4:27,37:0.57: 1.52:1.000:0.950 0/0/0/1:4:34,12:0.28: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,16:0.27: 1.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,19:0.29: 1.89:1.000:0.992 0/0/0/1:4:45,14:0.25: 1.15:0.999:0.999 0/0/0/1:4:47,23:0.34: 1.96:1.000:0.871 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,28:0.60: 0.20:1.000:0.826 0/0/1/1:4:25,24:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,6:0.30:-1.64:1.000:0.985 0/0/1/1:4:21,22:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,27:0.72:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,20:0.45: 0.12:1.000:0.978 0/0/0/1:4:29,9:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,47:0.73: 1.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,28:0.48: 1.15:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,34:0.70: 0.27:1.000:0.982 0/0/0/1:4:28,14:0.34:-0.10:1.000:0.841 0/0/1/1:4:33,23:0.42: 0.93:1.000:0.899 0/0/0/0:4:51,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,7:0.20:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.25:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,11:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,24:0.54: 0.05:1.000:0.988 0/0/1/1:4:9,14:0.60:-1.49:1.000:0.826 0/1/1/1:4:6,21:0.74:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,6:0.22:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,24:0.41: 1.15:1.000:0.880 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,14:0.31: 0.34:1.000:0.980 0/1/1/1:4:17,41:0.68: 1.08:1.000:0.958 0/0/0/1:4:38,19:0.34: 1.01:1.000:0.841 0/0/1/1:4:21,16:0.44:-0.46:1.000:0.962 0/0/1/1:4:25,26:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,7:0.17:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,6:0.21:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,37:0.64: 0.93:1.000:0.704 0/0/1/1:4:33,28:0.46: 1.30:1.000:0.989 0/0/0/1:4:41,12:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,21:0.59:-0.61:1.000:0.876 0/1/1/1:4:11,35:0.73: 0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,24:0.44: 0.86:1.000:0.968 0/0/0/1:4:44,12:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,21:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,1:0.27:-2.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,13:0.42:-0.91:1.000:0.931 0/0/1/1:4:19,13:0.41:-0.83:1.000:0.877 0/0/1/1:4:19,31:0.61: 0.49:1.000:0.739 0/0/1/1:4:33,33:0.50: 1.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,15:0.44:-0.69:1.000:0.974 0/0/0/1:4:32,6:0.17:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,30:0.57: 0.64:1.000:0.952 0/0/1/1:4:28,20:0.42: 0.34:1.000:0.922 0/0/0/1:4:25,6:0.21:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,21:0.53:-0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:41,12:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,16:0.47:-0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,25:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,11:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,9:0.15: 1.59:0.999:0.986 0/0/1/1:4:15,19:0.55:-0.69:1.000:0.978 0/0/0/1:4:33,8:0.21:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.22:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.22:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,15:0.33: 0.27:1.000:0.917 0/0/0/1:4:24,11:0.33:-0.61:1.000:0.935 0/0/0/1:4:26,5:0.17:-0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,28:0.73:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,33:0.53: 1.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,43:0.72: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,13:0.38:-0.61:1.000:0.566 0/0/1/1:4:17,22:0.56:-0.32:1.000:0.972 0/0/1/1:4:30,29:0.49: 1.15:0.999:0.996 0/0/1/1:4:25,27:0.52: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,30:0.47: 1.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:24,17:0.42:-0.17:1.000:0.915 0/0/0/1:4:26,10:0.29:-0.54:1.000:0.991 -chr7.1 27221392 chr7.1_027221392 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:114,284:0.72: 0.95:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,244:0.81:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,189:0.53: 0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:199,191:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:99,325:0.77: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:376,123:0.25: 2.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,168:0.60:-0.39:1.000:0.793 0/0/1/1:4:166,168:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:275,82:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,67:0.86:-2.72:1.000:0.956 0/0/0/1:4:41,17:0.29:-2.95:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,330:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,173:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:286,98:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,183:0.53: 0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:93,270:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,172:0.49: 0.39:0.985:0.996 0/0/1/1:4:190,191:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/1/1/1:4:113,312:0.74: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:353,107:0.23: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,61:0.72:-2.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:196,173:0.47: 0.62:1.000:0.991 0/0/1/1:4:238,223:0.48: 1.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:182,177:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,16:0.48:-3.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,151:0.53:-0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:167,189:0.53: 0.47:1.000:0.992 0/1/1/1:4:83,277:0.78: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:383,128:0.25: 2.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,159:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:87,256:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,70:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,28:0.56:-3.04:1.000:0.966 0/0/1/1:4:34,35:0.51:-2.82:1.000:0.997 1/1/1:3:3,18:0.86:-3.37:0.999:0.668 0/1/1/1:4:85,269:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,174:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:87,280:0.77: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,133:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,161:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,140:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:84,267:0.77: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,186:0.55: 0.25:1.000:0.977 0/0/1/1:4:96,130:0.58:-1.02:1.000:0.928 0/0/1/1:4:146,134:0.48:-0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:167,167:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,329:0.74: 1.56:0.986:0.998 0/0/0/1:4:359,149:0.29: 2.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:118,136:0.54:-0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:126,127:0.50:-0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,179:0.74:-0.80:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,281:0.78: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,219:0.81:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,98:0.27: 0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:154,165:0.52: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,142:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,235:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,117:0.51:-0.96:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,215:0.73:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:103,103:0.50:-1.25:1.000:0.889 0/0/1/1:4:152,163:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:242,88:0.27: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:131,165:0.56:-0.22:1.000:0.970 0/0/1/1:4:96,121:0.56:-1.12:1.000:0.970 0/0/0/1:4:249,87:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,136:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,69:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,89:0.26: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,127:0.50:-0.69:0.966:0.997 0/1/1/1:4:100,238:0.71: 0.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:161,155:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,67:0.30:-1.06:0.999:0.985 0/0/1/1:4:127,110:0.46:-0.90:1.000:0.989 0/1/1/1:4:114,278:0.71: 0.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:78,243:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,84:0.29:-0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:116,121:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:220,77:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:247,82:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,279:0.81: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,180:0.74:-0.78:0.995:0.998 0/0/0/1:4:182,68:0.27:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,251:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:245,64:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,134:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,157:0.47: 0.24:1.000:0.991 0/1/1/1:4:74,183:0.72:-0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,126:0.54:-0.92:1.000:0.990 0/0/0/1:4:182,73:0.29:-0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:137,155:0.53:-0.26:1.000:0.992 0/1/1/1:4:72,240:0.78:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,216:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,192:0.54: 0.47:1.000:0.988 0/0/1/1:4:120,124:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,161:0.49: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:212,69:0.25:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,88:0.33:-0.52:1.000:0.937 0/1/1/1:4:62,172:0.74:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,85:0.29:-0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:165,164:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,144:0.48:-0.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:67,235:0.78:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,117:0.53:-1.10:1.000:0.991 0/0/0/1/1:5:230,156:0.40: 0.81:0.999:0.970 0/0/1/1:4:116,135:0.54:-0.73:1.000:0.989 0/0/1/1:4:137,139:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,180:0.82:-1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,154:0.47: 0.10:1.000:0.993 0/0/0/1:4:344,117:0.25: 1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,183:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:166,56:0.25:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,338:0.76: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,221:0.70: 0.05:0.999:0.983 0/0/1/1:4:223,154:0.41: 0.71:1.000:0.849 0/0/1/1:4:123,111:0.47:-0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:172,164:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:187,66:0.26:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,119:0.54:-1.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:228,48:0.17:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,139:0.54:-0.65:1.000:0.988 0/1/1/1:4:77,244:0.77: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,66:0.28:-0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:148,162:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:276,101:0.27: 0.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,145:0.53:-0.47:1.000:0.993 0/1/1/1:4:92,267:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,236:0.74: 0.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,239:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,50:0.25:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,199:0.82:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,136:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:204,166:0.45: 0.63:1.000:0.977 0/1/1/1:4:45,143:0.77:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,152:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:225,72:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:133,354:0.73: 1.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:176,171:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:204,64:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,127:0.53:-0.87:1.000:0.992 0/1/1/1:4:75,199:0.73:-0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,232:0.79:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,138:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,169:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,118:0.52:-1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:234,199:0.46: 1.35:1.000:0.987 0/1/1/1:4:124,379:0.76: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,103:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:278,96:0.26: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,199:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,164:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:218,213:0.49: 1.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:199,203:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,22:0.54:-3.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:179,165:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,164:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:202,192:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,349:0.76: 1.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,275:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,72:0.21: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,184:0.49: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,171:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:221,65:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,167:0.53:-0.02:1.000:0.991 0/1/1/1:4:105,267:0.72: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,305:0.74: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:291,89:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,228:0.74:-0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,252:0.70: 0.56:0.999:0.983 0/0/1/1:4:201,186:0.48: 0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,183:0.52: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,177:0.55: 0.09:1.000:0.982 0/1/1/1:4:73,216:0.75:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,178:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,243:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,171:0.73:-0.92:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,131:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:196,213:0.52: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:204,197:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,179:0.47: 0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:165,219:0.57: 0.79:1.000:0.943 0/1/1/1:4:122,299:0.72: 1.22:0.999:0.994 0/0/1/1:4:257,219:0.46: 1.85:1.000:0.987 0/1/1/1:4:122,339:0.74: 1.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:252,67:0.21: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,265:0.75: 0.48:1.000:0.999 -chr7.1 27318051 chr7.1_027318051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:393,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:235,81:.:-0.45:1.000:. ./.:4:130,189:.:-0.41:1.000:. ./.:4:258,95:.: 0.03:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:181,237:.: 0.88:1.000:. ./.:4:122,132:.:-1.25:1.000:. ./.:4:168,212:.: 0.38:1.000:. ./.:4:158,166:.:-0.34:1.000:. ./.:4:137,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:71,107:.:-2.24:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:270,107:.: 0.35:1.000:. ./.:4:170,260:.: 1.03:1.000:. ./.:4:254,83:.:-0.17:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.19:0.985:. ./.:4:165,224:.: 0.50:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:216,258:.: 1.60:1.000:. ./.:4:71,89:.:-2.47:1.000:. ./.:4:237,124:.: 0.14:1.000:. ./.:4:291,120:.: 0.79:1.000:. ./.:4:157,210:.: 0.22:1.000:. ./.:4:53,35:.:-3.41:1.000:. ./.:4:182,240:.: 0.93:1.000:. ./.:4:196,231:.: 0.99:1.000:. ./.:4:242,105:.:-0.04:1.000:. ./.:4:287,135:.: 0.93:1.000:. ./.:4:249,104:.: 0.03:1.000:. ./.:4:335,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:203,164:.: 0.22:1.000:. ./.:4:30,24:.:-3.85:1.000:. ./.:4:112,49:.:-2.46:1.000:. ./.:3:60,15:.:-3.58:0.999:. ./.:4:335,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:250,98:.:-0.03:1.000:. ./.:4:262,110:.: 0.28:1.000:. ./.:4:236,115:.: 0.01:1.000:. ./.:4:287,84:.: 0.27:1.000:. ./.:4:229,96:.:-0.33:1.000:. ./.:4:253,94:.:-0.04:1.000:. ./.:4:198,205:.: 0.68:1.000:. ./.:4:136,170:.:-0.58:1.000:. ./.:4:173,233:.: 0.72:1.000:. ./.:4:194,228:.: 0.93:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.12:0.986:. ./.:4:351,289:.: 3.76:1.000:. ./.:4:147,161:.:-0.55:1.000:. ./.:4:205,99:.:-0.60:1.000:. ./.:4:225,77:.:-0.63:1.000:. ./.:4:309,115:.: 0.96:1.000:. ./.:4:255,99:.: 0.05:1.000:. ./.:4:274,118:.: 0.54:1.000:. ./.:4:265,108:.: 0.29:1.000:. ./.:4:174,211:.: 0.45:1.000:. ./.:4:246,100:.:-0.06:1.000:. ./.:4:167,217:.: 0.44:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:230,76:.:-0.58:1.000:. ./.:4:259,117:.: 0.33:1.000:. ./.:4:153,173:.:-0.32:1.000:. ./.:4:262,118:.: 0.38:1.000:. ./.:4:210,92:.:-0.63:1.000:. ./.:4:194,233:.: 0.99:1.000:. ./.:4:260,90:.:-0.01:1.000:. ./.:4:122,137:.:-1.19:1.000:. ./.:4:272,120:.: 0.54:1.000:. ./.:4:265,93:.: 0.10:0.966:. ./.:4:232,91:.:-0.36:1.000:. ./.:4:274,96:.: 0.25:1.000:. ./.:4:101,162:.:-1.14:0.999:. ./.:4:183,220:.: 0.68:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:262,118:.: 0.38:1.000:. ./.:4:139,192:.:-0.25:1.000:. ./.:4:229,90:.:-0.41:1.000:. ./.:4:181,208:.: 0.50:1.000:. ./.:4:164,202:.: 0.20:1.000:. ./.:4:271,97:.: 0.23:1.000:. ./.:4:230,87:.:-0.43:0.995:. ./.:4:159,230:.: 0.50:1.000:. ./.:4:288,131:.: 0.89:1.000:. ./.:4:158,196:.: 0.05:1.000:. ./.:4:238,119:.: 0.09:1.000:. ./.:4:207,238:.: 1.23:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:224,84:.:-0.55:1.000:. ./.:4:159,190:.:-0.02:1.000:. ./.:4:242,79:.:-0.38:1.000:. ./.:4:171,83:.:-1.25:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:297,124:.: 0.92:1.000:. ./.:4:211,57:.:-1.07:1.000:. ./.:4:195,220:.: 0.84:1.000:. ./.:4:149,199:.:-0.03:1.000:. ./.:4:226,97:.:-0.36:1.000:. ./.:4:232,109:.:-0.12:1.000:. ./.:4:192,238:.: 1.03:1.000:. ./.:4:299,120:.: 0.89:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:104,131:.:-1.50:1.000:. ./.:5:356,99:.: 1.36:0.999:. ./.:4:246,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:170,169:.:-0.15:1.000:. ./.:4:216,82:.:-0.68:1.000:. ./.:4:273,116:.: 0.50:1.000:. ./.:4:220,265:.: 1.75:1.000:. ./.:4:221,109:.:-0.27:1.000:. ./.:4:262,99:.: 0.14:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.12:0.999:. ./.:4:333,111:.: 1.22:1.000:. ./.:4:193,81:.:-0.99:1.000:. ./.:4:190,251:.: 1.18:1.000:. ./.:4:163,186:.:-0.02:1.000:. ./.:4:221,85:.:-0.58:1.000:. ./.:4:157,193:.:-0.01:1.000:. ./.:4:173,164:.:-0.17:1.000:. ./.:4:255,101:.: 0.07:1.000:. ./.:4:261,120:.: 0.40:1.000:. ./.:4:188,233:.: 0.92:1.000:. ./.:4:187,191:.: 0.36:1.000:. ./.:4:164,202:.: 0.20:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:247,120:.: 0.22:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:175,81:.:-1.23:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:201,79:.:-0.91:1.000:. ./.:4:238,98:.:-0.19:1.000:. ./.:4:165,58:.:-1.65:1.000:. ./.:4:174,209:.: 0.42:1.000:. ./.:4:225,113:.:-0.16:1.000:. ./.:4:366,154:.: 2.20:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:161,180:.:-0.12:1.000:. ./.:4:180,198:.: 0.36:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:282,115:.: 0.60:1.000:. ./.:4:255,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:219,99:.:-0.42:1.000:. ./.:4:199,72:.:-1.03:1.000:. ./.:4:233,278:.: 2.09:1.000:. ./.:4:321,128:.: 1.28:1.000:. ./.:4:294,123:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,221:.: 0.44:1.000:. ./.:4:202,232:.: 1.09:1.000:. ./.:4:253,103:.: 0.07:1.000:. ./.:4:293,124:.: 0.86:1.000:. ./.:4:258,109:.: 0.22:1.000:. ./.:4:99,39:.:-2.76:1.000:. ./.:4:173,85:.:-1.20:1.000:. ./.:4:304,113:.: 0.86:1.000:. ./.:4:186,246:.: 1.06:1.000:. ./.:4:306,133:.: 1.15:1.000:. ./.:4:272,111:.: 0.42:1.000:. ./.:4:223,96:.:-0.41:1.000:. ./.:4:277,146:.: 0.94:1.000:. ./.:4:264,105:.: 0.24:1.000:. ./.:4:232,93:.:-0.33:1.000:. ./.:4:230,93:.:-0.36:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:265,96:.: 0.14:1.000:. ./.:4:166,209:.: 0.32:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:269,104:.: 0.29:0.999:. ./.:4:179,218:.: 0.60:1.000:. ./.:4:220,114:.:-0.21:1.000:. ./.:4:238,75:.:-0.49:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:243,100:.:-0.10:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:132,168:.:-0.65:1.000:. ./.:4:263,116:.: 0.37:1.000:. ./.:4:183,210:.: 0.55:1.000:. ./.:4:277,104:.: 0.40:1.000:. ./.:4:226,103:.:-0.28:1.000:. ./.:4:280,121:.: 0.66:0.999:. ./.:4:333,125:.: 1.40:1.000:. ./.:4:330,142:.: 1.58:1.000:. ./.:4:158,161:.:-0.41:1.000:. ./.:4:303,110:.: 0.81:1.000:. -chr7.1 27544980 chr7.1_027544980 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,5:.: 0.17:1.000:. ./.:4:18,56:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,34:.: 0.51:1.000:. ./.:4:90,28:.: 0.91:1.000:. ./.:4:97,7:.: 0.39:1.000:. ./.:4:122,26:.: 2.02:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.86:1.000:. ./.:4:88,28:.: 0.84:1.000:. ./.:4:59,30:.:-0.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:14,9:.:-2.60:1.000:. ./.:4:60,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:51,31:.:-0.42:1.000:. ./.:4:86,21:.: 0.51:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:103,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:98,3:.: 0.28:0.985:. ./.:4:60,23:.:-0.38:1.000:. ./.:4:173,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:105,16:.: 1.02:1.000:. ./.:4:11,9:.:-2.71:1.000:. ./.:4:69,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:68,57:.: 1.17:1.000:. ./.:4:89,14:.: 0.36:1.000:. ./.:4:14,2:.:-2.86:1.000:. ./.:4:95,31:.: 1.21:1.000:. ./.:4:97,28:.: 1.17:1.000:. ./.:4:75,20:.: 0.06:1.000:. ./.:4:60,31:.:-0.09:1.000:. ./.:4:83,23:.: 0.47:1.000:. ./.:4:100,30:.: 1.36:1.000:. ./.:4:64,33:.: 0.14:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.53:1.000:. ./.:3:7,5:.:-3.01:0.999:. ./.:4:102,31:.: 1.47:1.000:. ./.:4:31,55:.:-0.27:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:64,34:.: 0.17:1.000:. ./.:4:101,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:79,21:.: 0.25:1.000:. ./.:4:73,52:.: 1.17:1.000:. ./.:4:67,24:.:-0.09:1.000:. ./.:4:84,17:.: 0.28:1.000:. ./.:4:76,19:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.69:0.986:. ./.:4:40,18:.:-1.31:1.000:. ./.:4:73,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:73,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:77,21:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,25:.: 0.99:1.000:. ./.:4:62,17:.:-0.53:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:66,18:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,57:.: 0.25:1.000:. ./.:4:64,26:.:-0.12:1.000:. ./.:4:75,28:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,6:.:-0.12:1.000:. ./.:6:66,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:70,24:.: 0.03:1.000:. ./.:4:70,17:.:-0.23:1.000:. ./.:4:118,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:63,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,30:.: 0.99:1.000:. ./.:4:68,5:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,20:.:-0.94:1.000:. ./.:4:47,27:.:-0.71:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.47:0.966:. ./.:4:35,42:.:-0.60:1.000:. ./.:4:57,41:.: 0.17:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.86:0.999:. ./.:4:26,86:.: 0.69:1.000:. ./.:4:84,30:.: 0.76:1.000:. ./.:4:44,58:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,32:.:-0.75:1.000:. ./.:4:60,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:56,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:40,47:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:40,35:.:-0.68:0.995:. ./.:4:66,13:.:-0.53:1.000:. ./.:4:75,22:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,29:.:-0.83:1.000:. ./.:4:51,37:.:-0.20:1.000:. ./.:4:46,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:47,3:.:-1.60:1.000:. ./.:4:69,26:.: 0.06:1.000:. ./.:4:61,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,25:.: 0.21:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,3:.:-1.12:1.000:. ./.:4:44,45:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:81,26:.: 0.51:1.000:. ./.:4:93,20:.: 0.73:1.000:. ./.:4:39,18:.:-1.34:1.000:. ./.:4:19,53:.:-0.79:1.000:. ./.:4:45,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:74,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:42,1:.:-1.86:1.000:. ./.:4:77,24:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,11:.:-0.94:1.000:. ./.:5:49,40:.:-0.16:0.999:. ./.:4:61,3:.:-1.08:1.000:. ./.:4:71,32:.: 0.36:1.000:. ./.:4:67,21:.:-0.20:1.000:. ./.:4:113,20:.: 1.47:1.000:. ./.:4:65,65:.: 1.36:1.000:. ./.:4:67,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:38,13:.:-1.56:1.000:. ./.:4:119,6:.: 1.17:1.000:. ./.:4:52,19:.:-0.83:0.999:. ./.:4:79,23:.: 0.32:1.000:. ./.:4:43,33:.:-0.64:1.000:. ./.:4:71,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:39,27:.:-1.01:1.000:. ./.:4:54,15:.:-0.90:1.000:. ./.:4:38,28:.:-1.01:1.000:. ./.:4:53,16:.:-0.90:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:40,32:.:-0.79:1.000:. ./.:4:101,24:.: 1.17:1.000:. ./.:4:59,24:.:-0.38:1.000:. ./.:4:77,29:.: 0.47:1.000:. ./.:4:66,40:.: 0.47:1.000:. ./.:4:72,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:48,35:.:-0.38:1.000:. ./.:4:41,24:.:-1.05:1.000:. ./.:4:60,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:60,4:.:-1.08:1.000:. ./.:4:58,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:41,21:.:-1.16:1.000:. ./.:4:48,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,21:.:-1.16:1.000:. ./.:4:121,39:.: 2.47:1.000:. ./.:4:65,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,20:.:-0.60:1.000:. ./.:4:55,10:.:-1.05:1.000:. ./.:4:59,3:.:-1.16:1.000:. ./.:4:82,26:.: 0.54:1.000:. ./.:4:53,48:.: 0.28:1.000:. ./.:4:82,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,22:.:-0.60:1.000:. ./.:4:85,33:.: 0.91:1.000:. ./.:4:85,31:.: 0.84:1.000:. ./.:4:68,36:.: 0.39:1.000:. ./.:4:23,62:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,66:.: 1.62:1.000:. ./.:4:53,20:.:-0.75:1.000:. ./.:4:117,27:.: 1.87:1.000:. ./.:4:52,52:.: 0.39:1.000:. ./.:4:21,7:.:-2.42:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:88,28:.: 0.84:1.000:. ./.:4:66,21:.:-0.23:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:99,29:.: 1.28:1.000:. ./.:4:50,27:.:-0.60:1.000:. ./.:4:100,20:.: 0.99:1.000:. ./.:4:60,26:.:-0.27:1.000:. ./.:4:28,45:.:-0.75:1.000:. ./.:4:55,18:.:-0.75:1.000:. ./.:4:103,29:.: 1.43:1.000:. ./.:4:120,33:.: 2.21:1.000:. ./.:4:30,65:.: 0.06:1.000:. ./.:4:72,18:.:-0.12:1.000:. ./.:4:49,37:.:-0.27:0.999:. ./.:4:86,25:.: 0.65:1.000:. ./.:4:105,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:77,36:.: 0.73:1.000:. ./.:4:81,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:67,40:.: 0.51:1.000:. ./.:4:88,36:.: 1.13:1.000:. ./.:4:87,24:.: 0.65:1.000:. ./.:4:92,34:.: 1.21:1.000:. ./.:4:88,26:.: 0.76:1.000:. ./.:4:98,29:.: 1.25:0.999:. ./.:4:66,60:.: 1.21:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:74,15:.:-0.16:1.000:. ./.:4:50,52:.: 0.32:1.000:. -chr7.1 27683672 chr7.1_027683672 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,2:0.31:-0.93:1.000:0.979 0/1/1/1:4:3,8:0.76:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,12:0.83:-0.53:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,7:0.89:-1.09:1.000:0.536 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.78:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,58:0.86: 3.77:1.000:0.965 0/0/1/1:4:6,4:0.46:-0.93:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.57:-0.53:1.000:0.938 0/1/1/1:4:3,11:0.81:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.17:0.985:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.66:-1.09:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,17:0.36: 3.29:1.000:0.704 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.60:-0.45:1.000:0.776 1/1/1/1:4:2,14:0.89:-0.45:1.000:0.536 0/1/1/1:4:10,45:0.84: 2.65:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,7:0.81:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.88:-1.17:1.000:0.852 0/1/1/1:4:4,14:0.81:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,8:0.90:-1.01:1.000:0.856 0/1/1/1:4:1,5:0.85:-1.25:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 1.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 3.37:1.000:1.000 0/0/1:3:43,29:0.46: 4.01:0.999:0.942 0/1/1/1:4:4,11:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.44:-1.09:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.48:-0.61:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,20:0.73: 0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,9:0.36: 0.90:1.000:0.679 0/1/1/1:4:5,15:0.78:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,17:0.65: 0.50:1.000:0.747 0/1/1/1:4:10,23:0.73: 0.90:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.53:0.986:1.000 0/1/1/1:4:12,37:0.79: 2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,9:0.64:-0.53:1.000:0.669 0/1/1/1:4:11,23:0.71: 0.98:1.000:0.993 0/1/1/1:4:9,38:0.83: 2.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,22:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,21:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.52:-0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,12:0.83:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,11:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,17:0.77: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,26:0.66: 1.62:1.000:0.849 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:9,15:0.66: 0.18:1.000:0.918 0/1/1/1:4:10,17:0.67: 0.42:1.000:0.909 0/1/1/1:4:6,15:0.75:-0.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,43:1.00: 1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,24:0.65: 1.38:1.000:0.821 0/1/1/1:4:8,12:0.64:-0.14:1.000:0.669 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,10:0.66:-0.45:1.000:0.886 0/1/1/1:4:3,18:0.88:-0.06:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.82:0.966:1.000 0/1/1/1:4:8,14:0.67: 0.02:1.000:0.935 0/0/1/1:4:20,17:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,26:0.76: 1.14:0.999:1.000 0/0/0/1:4:22,7:0.34: 0.58:1.000:0.885 0/0/1/1:4:9,8:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,25:0.63: 1.62:1.000:0.612 0/1/1/1:4:15,22:0.63: 1.22:1.000:0.603 0/1/1/1:4:6,17:0.77: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,25:0.77: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.44: 0.98:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,29:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.47: 0.18:0.995:0.992 0/0/1/1:4:13,11:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,22:0.77: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.81:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,19:0.46: 2.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:12,13:0.56: 0.26:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,18:0.73: 0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,26:0.69: 1.46:1.000:0.969 0/1/1/1:4:9,19:0.72: 0.50:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,8:0.65:-0.69:1.000:0.821 0/1/1/1:4:8,19:0.74: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,14:0.74:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,18:0.68: 0.50:1.000:0.954 0/0/1/1:4:19,10:0.41: 0.58:1.000:0.891 0/0/1/1:4:22,10:0.39: 0.82:1.000:0.699 1/1/1/1:4:1,10:0.92:-0.85:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,19:0.72: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,17:0.61: 0.66:1.000:0.736 0/0/1/1/1:5:21,25:0.58: 1.94:0.999:0.961 1/1/1/1:4:0,26:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.76:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,16:0.70: 0.18:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,5:0.39:-0.45:1.000:0.699 0/1/1/1:4:5,17:0.80: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,22:0.75: 0.74:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,19:0.72: 0.50:0.999:0.994 0/1/1/1:4:10,31:0.79: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.57:-0.22:1.000:0.955 0/1/1/1:4:12,23:0.69: 1.06:1.000:0.979 0/1/1/1:4:7,12:0.67:-0.22:1.000:0.918 0/1/1/1:4:7,16:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,10:0.39: 0.82:1.000:0.699 0/1/1/1:4:13,22:0.67: 1.06:1.000:0.904 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,10:0.63:-0.37:1.000:0.522 0/1/1/1:4:4,12:0.78:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,11:0.93:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,11:0.62:-0.22:1.000:0.598 0/0/1/1:4:18,17:0.53: 1.06:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,12:0.83:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,11:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:10,13:0.60: 0.10:1.000:0.750 0/1/1/1:4:10,17:0.67: 0.42:1.000:0.909 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.62:-0.22:1.000:0.598 0/1/1/1:4:4,9:0.73:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,10:0.54:-0.14:1.000:0.987 0/1/1/1:4:4,16:0.83:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,11:0.62:-0.22:1.000:0.598 0/1/1/1:4:6,10:0.66:-0.45:1.000:0.886 0/0/1/1:4:10,13:0.60: 0.10:1.000:0.750 0/1/1/1:4:4,14:0.81:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,17:0.67: 0.42:1.000:0.909 0/0/0/1:4:16,5:0.33:-0.06:1.000:0.899 0/1/1/1:4:5,16:0.79:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.72:-0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,16:0.79:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.62: 0.34:1.000:0.623 0/1/1/1:4:6,16:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,2:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,11:0.59:-0.14:1.000:0.867 0/1/1/1:4:3,13:0.84:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,8:0.70:-0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:4,2:0.41:-1.25:1.000:0.840 0/1/1/1:4:10,50:0.85: 3.05:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,18:0.84: 0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,11:0.87:-0.69:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,4:0.70:-1.25:1.000:0.988 0/1/1/1:4:3,15:0.85:-0.29:1.000:0.982 0/1/1/1:4:3,7:0.74:-0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,5:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,12:0.88:-0.61:1.000:0.852 0/1/1/1:4:5,12:0.74:-0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,7:0.74:-0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,7:0.62:-0.77:1.000:0.542 0/1/1/1:4:2,6:0.78:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.75:-0.61:0.999:0.999 1/1/1/1:4:1,7:0.89:-1.09:1.000:0.536 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,3:0.33:-0.69:1.000:0.924 0/1/1/1:4:5,8:0.65:-0.69:1.000:0.821 0/1/1/1:4:4,8:0.70:-0.77:1.000:0.988 0/1/1/1:4:2,6:0.78:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,14:0.89:-0.45:1.000:0.536 0/0/1/1:4:7,7:0.54:-0.61:0.999:0.987 0/0/1/1:4:8,8:0.54:-0.45:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.54:-0.93:1.000:0.987 0/0/1/1:4:9,10:0.57:-0.22:1.000:0.955 -chr7.1 27958961 chr7.1_027958961 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:129,36:0.23: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,68:0.63:-0.28:1.000:0.555 0/0/1/1:4:72,54:0.45: 0.20:1.000:0.980 0/0/1/1:4:62,77:0.57: 0.62:1.000:0.935 0/0/0/1:4:122,37:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,55:0.38: 0.97:1.000:0.627 0/0/1/1:4:28,17:0.40:-2.38:1.000:0.757 0/0/1/1:4:81,59:0.44: 0.65:1.000:0.971 0/1/1/1:4:25,85:0.78:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,2:0.06:-2.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,18:0.38:-2.22:1.000:0.535 0/0/1/1:4:49,57:0.56:-0.44:1.000:0.969 0/0/1/1:4:77,61:0.46: 0.59:1.000:0.990 0/0/1/1:4:66,61:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,75:0.50: 1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,38:0.24: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,42:0.32: 0.52:0.985:0.946 0/1/1/1:4:32,88:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,47:0.43:-0.15:1.000:0.945 0/1/1/1:4:6,17:0.75:-3.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,69:0.55: 0.33:1.000:0.977 0/0/1/1:4:80,62:0.46: 0.71:1.000:0.987 0/0/1/1:4:48,35:0.44:-1.17:1.000:0.972 0/0/0/1:4:30,4:0.12:-2.73:1.000:0.810 0/0/1/1:4:76,53:0.43: 0.30:1.000:0.950 0/0/1/1:4:93,52:0.38: 0.81:1.000:0.516 0/0/1/1:4:68,85:0.58: 1.07:1.000:0.930 0/0/1/1:4:56,51:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,44:0.36: 0.30:1.000:0.719 0/0/1/1:4:69,68:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,88:0.81:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,17:0.67:-2.99:1.000:0.913 0/0/1/1:4:31,21:0.42:-2.16:1.000:0.929 0/1/1:3:7,7:0.52:-3.37:0.999:0.826 0/0/0/1:4:90,42:0.33: 0.39:1.000:0.908 0/1/1/1:4:45,79:0.65: 0.14:1.000:0.813 0/0/0/1:4:98,31:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,50:0.40: 0.36:1.000:0.795 0/0/1/1:4:73,76:0.53: 0.94:1.000:0.991 0/0/0/1:4:89,29:0.26:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,85:0.56: 1.19:1.000:0.963 0/1/1/1:4:48,81:0.64: 0.30:1.000:0.731 0/0/1/1:4:75,54:0.44: 0.30:1.000:0.967 0/0/1/1:4:48,44:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,55:0.42: 0.52:1.000:0.931 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.39:0.986:1.000 0/0/1/1:4:28,31:0.55:-1.94:1.000:0.982 0/0/1/1:4:62,41:0.42:-0.53:1.000:0.905 0/0/1/1:4:78,105:0.59: 2.02:1.000:0.846 0/0/1/1:4:62,67:0.54: 0.30:1.000:0.987 0/0/1/1:4:85,106:0.58: 2.28:1.000:0.932 0/0/1/1:4:81,69:0.48: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,63:0.49: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,12:0.13:-0.69:1.000:0.883 0/1/1/1:4:35,97:0.74: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,59:0.54:-0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:77,52:0.42: 0.30:1.000:0.926 0/0/0/1:4:130,44:0.26: 1.74:1.000:0.998 0/0/0/1/1/1:6:50,41:0.47:-0.91:1.000:0.850 0/0/1/1:4:75,73:0.52: 0.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,56:0.46: 0.27:1.000:0.988 0/0/0/1:4:127,38:0.24: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,78:0.54: 1.00:1.000:0.988 0/0/1/1:4:73,52:0.44: 0.17:1.000:0.962 0/0/1/1:4:79,87:0.55: 1.48:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,42:0.77:-2.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,46:0.41:-0.05:1.000:0.859 0/0/0/1:4:108,33:0.24: 0.68:0.966:1.000 0/0/1/1:4:71,52:0.44: 0.11:1.000:0.973 0/0/0/1:4:76,38:0.35:-0.18:1.000:0.801 0/0/1/1:4:49,37:0.45:-1.07:0.999:0.982 0/0/1/1:4:43,61:0.60:-0.50:1.000:0.746 0/0/0/1:4:113,39:0.27: 1.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:87,47:0.37: 0.46:1.000:0.595 0/1/1/1:4:33,87:0.74: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,88:0.60: 1.03:1.000:0.810 0/1/1/1:4:38,86:0.71: 0.14:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,87:0.70: 0.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:112,45:0.30: 1.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:43,31:0.44:-1.46:0.995:0.967 0/0/1/1:4:75,49:0.41: 0.14:1.000:0.891 0/0/1/1:4:89,86:0.52: 1.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,67:0.68:-0.63:1.000:0.961 0/0/1/1:4:62,43:0.43:-0.47:1.000:0.947 0/1/1/1:4:34,90:0.74: 0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,21:0.25:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,71:0.56: 0.36:1.000:0.962 0/0/0/1:4:66,30:0.33:-0.75:1.000:0.933 0/0/1/1:4:81,58:0.44: 0.62:1.000:0.964 0/0/0/1:4:58,22:0.29:-1.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:98,30:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,56:0.47: 0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:48,60:0.58:-0.37:1.000:0.930 0/0/1/1:4:64,52:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:62,47:0.45:-0.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:51,44:0.49:-0.79:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,69:0.70:-0.63:1.000:0.987 0/1/1/1:4:35,93:0.74: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,72:0.53: 0.68:1.000:0.991 0/0/0/1:4:57,28:0.34:-1.11:1.000:0.835 0/0/0/1:4:107,40:0.28: 0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,28:0.43:-1.62:1.000:0.936 0/0/0/1/1:5:74,67:0.50: 0.68:0.999:0.500 0/0/0/1:4:66,33:0.35:-0.66:1.000:0.801 0/0/1/1:4:62,63:0.53: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:63,73:0.56: 0.52:1.000:0.970 0/0/1/1:4:64,68:0.54: 0.39:1.000:0.989 0/1/1/1:4:38,110:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,69:0.56: 0.30:1.000:0.973 0/0/1/1:4:53,43:0.47:-0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:162,39:0.20: 2.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,74:0.55: 0.65:0.999:0.980 0/0/0/0:4:126,11:0.08: 0.55:1.000:0.980 0/0/1/1:4:39,38:0.52:-1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,45:0.36: 0.33:1.000:0.657 0/1/1/1:4:28,79:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,23:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,73:0.68:-0.34:1.000:0.961 0/0/1/1:4:67,40:0.39:-0.40:1.000:0.715 0/0/0/1:4:114,38:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,46:0.43:-0.21:1.000:0.940 0/0/0/1:4:82,44:0.37: 0.20:1.000:0.616 0/1/1/1:4:36,92:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,54:0.48:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,55:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,65:0.56: 0.04:1.000:0.970 0/0/1/1:4:61,60:0.52: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,32:0.43:-1.30:1.000:0.933 0/0/0/1:4:78,31:0.30:-0.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:60,66:0.55: 0.20:1.000:0.984 0/0/0/1:4:76,40:0.36:-0.12:1.000:0.674 0/0/0/1:4:47,23:0.34:-1.58:1.000:0.842 0/1/1/1:4:35,81:0.71:-0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:47,43:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,88:0.52: 1.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,91:0.56: 1.54:1.000:0.963 0/1/1/1:4:36,68:0.67:-0.50:1.000:0.913 0/0/1/1:4:59,41:0.43:-0.63:1.000:0.948 0/0/0/1:4:94,36:0.29: 0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,65:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,47:0.48:-0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,69:0.57: 0.20:1.000:0.951 0/0/1/1:4:37,51:0.60:-1.01:1.000:0.806 0/0/1/1:4:67,44:0.42:-0.28:1.000:0.897 0/0/1/1:4:88,80:0.50: 1.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,41:0.44:-0.69:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,101:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,53:0.48:-0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,81:0.53: 1.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,59:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,5:0.12:-2.38:1.000:0.654 0/0/0/1:4:77,23:0.24:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,19:0.15: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:53,44:0.48:-0.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:127,49:0.29: 1.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:67,59:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,54:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,17:0.13: 0.62:1.000:0.881 0/0/1/1:4:50,41:0.47:-0.91:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,90:0.71: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,34:0.40:-0.95:1.000:0.757 0/0/0/1:4:104,38:0.28: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,66:0.51: 0.52:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,22:0.24:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,33:0.33:-0.50:0.999:0.912 0/0/1/1:4:69,51:0.45: 0.01:1.000:0.976 0/0/0/1:4:78,29:0.28:-0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,51:0.53:-0.63:1.000:0.991 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,31:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,80:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,47:0.38: 0.30:1.000:0.596 0/0/1/1:4:78,61:0.46: 0.62:1.000:0.988 0/0/1/1:4:71,74:0.53: 0.81:1.000:0.991 0/0/0/1:4:91,18:0.17:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,75:0.56: 0.59:0.999:0.959 0/0/0/1:4:94,44:0.33: 0.59:1.000:0.905 0/0/0/1:4:105,40:0.29: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,46:0.49:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,40:0.47:-0.95:1.000:0.991 -chr7.1 28227502 chr7.1_028227502 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:86,40:0.33: 0.96:1.000:0.927 0/0/0/1:4:47,25:0.36:-0.75:1.000:0.668 0/0/0/1:4:110,22:0.17: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,56:0.56: 0.08:1.000:0.967 0/0/0/1:4:93,36:0.29: 1.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:121,26:0.18: 1.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,37:0.52:-0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,23:0.19: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,61:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.29:-1.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,19:0.42:-1.51:1.000:0.897 0/0/1/1:4:33,43:0.56:-0.62:1.000:0.972 0/0/0/1:4:94,13:0.12: 0.36:1.000:0.819 0/0/0/1:4:87,29:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,79:0.59: 0.96:1.000:0.842 0/0/0/1:4:111,45:0.30: 1.92:1.000:0.988 0/0/0/1:4:96,45:0.33: 1.44:0.985:0.919 0/0/1/1:4:63,61:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:169,26:0.13: 3.15:1.000:0.945 0/0/1/1:4:61,36:0.39: 0.05:1.000:0.674 0/0/1/1:4:18,21:0.54:-1.79:1.000:0.987 0/0/1/1:4:47,52:0.53: 0.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:104,18:0.15: 0.84:1.000:0.987 0/0/0/1:4:88,20:0.19: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,53:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:114,30:0.21: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,47:0.53:-0.14:1.000:0.993 0/0/0/0:4:96,11:0.10: 0.36:1.000:0.700 0/0/1/1:4:57,47:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,51:0.59:-0.40:1.000:0.887 0/0/1/1:4:54,48:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,24:0.68:-2.05:1.000:0.957 0/0/1/1:4:24,28:0.54:-1.38:1.000:0.987 0/1/1:3:5,5:0.52:-2.71:0.999:0.761 0/0/0/1:4:88,40:0.32: 1.03:1.000:0.945 0/0/1/1:4:61,53:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,43:0.41: 0.43:1.000:0.889 0/0/0/1:4:117,17:0.13: 1.22:1.000:0.893 0/0/1/1:4:44,73:0.59: 0.68:1.000:0.854 0/0/0/1:4:65,26:0.29:-0.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:96,38:0.29: 1.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:55,39:0.44:-0.05:1.000:0.963 0/0/1/1:4:43,48:0.53:-0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:44,29:0.42:-0.72:1.000:0.904 0/0/0/1:4:92,13:0.13: 0.30:1.000:0.855 0/0/0/0:4:150,18:0.11: 2.30:0.986:0.567 0/0/0/1:4:51,28:0.37:-0.53:1.000:0.565 0/0/0/1:4:101,16:0.14: 0.68:1.000:0.961 0/0/1/1:4:49,65:0.56: 0.58:1.000:0.968 0/0/0/1:4:82,17:0.17: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,38:0.29: 1.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,29:0.34:-0.24:1.000:0.856 0/0/0/0:4:102,9:0.08: 0.49:1.000:0.984 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,38:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,27:0.28: 0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,84:0.80:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,41:0.42: 0.20:1.000:0.925 0/0/0/0/1/1:6:47,22:0.33:-0.84:1.000:0.921 0/0/1/1:4:33,26:0.47:-1.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:86,14:0.14: 0.14:1.000:0.972 0/0/0/1:4:73,38:0.36: 0.49:1.000:0.730 0/0/1/1:4:45,74:0.59: 0.74:1.000:0.862 0/0/1/1:4:65,51:0.46: 0.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:43,55:0.55: 0.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:27,17:0.41:-1.63:1.000:0.834 0/0/0/1:4:76,10:0.12:-0.30:1.000:0.708 0/0/0/1:4:81,31:0.28: 0.52:0.966:0.995 0/0/0/1:4:44,23:0.36:-0.91:1.000:0.718 0/0/0/1:4:95,16:0.15: 0.49:1.000:0.982 0/0/0/1:4:78,16:0.17:-0.05:0.999:0.998 0/1/1/1:4:19,56:0.67:-0.65:1.000:0.898 0/0/0/1:4:128,51:0.29: 2.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:44,37:0.48:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,33:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,27:0.28: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,20:0.33:-1.06:1.000:0.901 0/0/1/1:4:42,32:0.46:-0.68:1.000:0.986 0/0/0/1:4:81,32:0.29: 0.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:40,16:0.29:-1.25:0.995:0.990 0/0/0/1:4:66,15:0.19:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,39:0.31: 1.06:1.000:0.971 0/1/1/1:4:7,33:0.71:-1.76:1.000:0.993 0/0/0/1:4:66,10:0.13:-0.62:1.000:0.934 0/0/1/1:4:43,32:0.45:-0.65:1.000:0.980 0/0/0/1:4:66,17:0.21:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,43:0.56:-0.65:1.000:0.965 0/0/1/1:4:27,27:0.52:-1.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,43:0.61:-0.94:1.000:0.713 0/0/0/1:4:53,19:0.27:-0.75:1.000:0.998 0/0/0/1:4:73,36:0.34: 0.43:1.000:0.850 0/0/0/1:4:92,18:0.17: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,43:0.55:-0.56:1.000:0.982 0/0/1/1:4:48,30:0.40:-0.56:1.000:0.820 0/0/1/1:4:56,35:0.40:-0.14:1.000:0.820 0/0/0/1:4:58,12:0.17:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,18:0.38:-1.44:1.000:0.517 0/0/1/1:4:46,29:0.41:-0.65:1.000:0.837 0/0/0/1:4:70,25:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:76,17:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:111,11:0.09: 0.84:1.000:0.935 0/0/0/1:4:64,8:0.11:-0.75:1.000:0.560 0/0/0/0/1:5:71,26:0.27: 0.05:0.999:0.793 0/0/0/1:4:43,19:0.32:-1.06:1.000:0.962 0/0/0/1:4:81,27:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,40:0.35: 0.74:1.000:0.798 0/0/0/1:4:87,40:0.33: 1.00:1.000:0.937 0/0/1/1:4:61,51:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,46:0.56:-0.46:1.000:0.970 0/0/0/1:4:36,16:0.32:-1.38:1.000:0.959 0/0/0/1:4:102,42:0.30: 1.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:62,20:0.25:-0.43:0.999:0.999 0/0/0/1:4:115,16:0.12: 1.12:1.000:0.829 0/0/0/0:4:52,3:0.06:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,30:0.48:-0.94:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,35:0.69:-1.63:1.000:0.979 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,32:0.45:-0.65:1.000:0.980 0/0/0/1:4:70,12:0.15:-0.43:1.000:0.985 0/0/0/1:4:78,21:0.21: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,14:0.18:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,15:0.15: 0.24:1.000:0.984 0/1/1/1:4:7,86:0.78:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,39:0.58:-0.97:1.000:0.925 0/0/0/0:4:84,9:0.10:-0.08:1.000:0.844 0/0/0/1:4:45,25:0.37:-0.81:1.000:0.525 0/0/1/1:4:33,42:0.55:-0.65:1.000:0.976 0/0/0/1:4:38,14:0.27:-1.38:1.000:0.997 0/0/0/0:4:66,7:0.10:-0.72:1.000:0.860 0/0/1/1:4:36,35:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,21:0.19: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,16:0.30:-1.32:1.000:0.980 0/0/0/1:4:47,24:0.35:-0.78:1.000:0.778 0/0/0/0:4:83,7:0.08:-0.18:1.000:0.991 0/0/0/1:4:106,44:0.30: 1.73:1.000:0.984 0/0/1/1:4:33,34:0.52:-0.91:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,29:0.79:-2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,23:0.42:-1.22:1.000:0.931 0/0/0/1:4:51,17:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,33:0.50:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/0:4:69,2:0.03:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,29:0.29: 0.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:34,22:0.41:-1.25:1.000:0.880 0/0/1/1:4:64,44:0.43: 0.39:1.000:0.944 0/0/0/1:4:131,43:0.25: 2.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,39:0.45:-0.11:1.000:0.977 0/1/1/1:4:6,44:0.74:-1.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,58:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,28:0.45:-0.94:1.000:0.978 0/0/1/1:4:59,87:0.57: 1.60:1.000:0.933 0/0/0/1:4:92,26:0.22: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.30:-1.95:1.000:0.983 0/0/0/1:4:61,26:0.31:-0.27:1.000:0.977 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,25:0.19: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,57:0.36: 2.14:1.000:0.634 0/0/1/1:4:39,75:0.61: 0.58:1.000:0.670 0/0/0/1:4:48,26:0.37:-0.68:1.000:0.610 0/0/0/1:4:91,33:0.27: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,45:0.48: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,33:0.45:-0.56:1.000:0.976 0/0/0/1:4:66,12:0.16:-0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,37:0.32: 0.74:1.000:0.950 0/0/1/1:4:50,45:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,69:0.71:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:103,16:0.14: 0.74:1.000:0.951 0/0/1/1:4:37,39:0.53:-0.62:0.999:0.994 0/0/0/1:4:86,20:0.19: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,43:0.40: 0.58:1.000:0.747 0/0/1/1:4:34,51:0.58:-0.34:1.000:0.925 0/0/0/0:4:116,13:0.10: 1.06:1.000:0.755 0/0/0/1:4:63,31:0.34:-0.05:1.000:0.854 0/0/0/0:4:110,9:0.08: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:96,16:0.14: 0.52:1.000:0.979 0/0/1/1:4:47,33:0.43:-0.49:1.000:0.957 0/0/0/1:4:108,22:0.17: 1.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,22:0.17: 1.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:47,80:0.60: 1.00:1.000:0.830 0/0/0/1:4:74,22:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,34:0.29: 0.81:0.999:0.993 0/0/0/1:4:133,22:0.14: 1.88:1.000:0.977 0/0/0/1:4:88,49:0.37: 1.31:1.000:0.517 0/0/1/1:4:55,42:0.46: 0.05:1.000:0.986 0/0/1/1:4:55,40:0.44:-0.02:1.000:0.973 -chr7.1 28466781 chr7.1_028466781 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:70,206:.: 0.66:1.000:. ./.:4:106,136:.: 0.00:1.000:. ./.:4:122,147:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.04:1.000:. ./.:4:70,197:.: 0.48:1.000:. ./.:4:158,151:.: 1.30:1.000:. ./.:4:42,124:.:-1.47:1.000:. ./.:4:128,135:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,204:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,79:.:-2.64:1.000:. ./.:4:29,67:.:-2.83:1.000:. ./.:4:64,163:.:-0.29:1.000:. ./.:4:153,151:.: 1.20:1.000:. ./.:4:118,129:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,189:.:-1.03:1.000:. ./.:4:64,208:.: 0.58:1.000:. ./.:4:72,237:.: 1.30:0.985:. ./.:4:126,115:.:-0.02:1.000:. ./.:4:81,262:.: 1.96:1.000:. ./.:4:87,225:.: 1.36:1.000:. ./.:4:23,54:.:-3.20:1.000:. ./.:4:75,210:.: 0.83:1.000:. ./.:4:59,182:.:-0.02:1.000:. ./.:4:119,144:.: 0.41:1.000:. ./.:4:31,29:.:-3.53:1.000:. ./.:4:79,233:.: 1.36:1.000:. ./.:4:140,154:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.12:1.000:. ./.:4:137,120:.: 0.29:1.000:. ./.:4:71,222:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,322:.: 1.55:1.000:. ./.:4:118,113:.:-0.21:1.000:. ./.:4:4,34:.:-3.95:1.000:. ./.:4:26,97:.:-2.31:1.000:. ./.:3:12,28:.:-3.91:0.999:. ./.:4:0,256:.: 0.27:1.000:. ./.:4:53,193:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,172:.: 0.00:1.000:. ./.:4:151,144:.: 1.03:1.000:. ./.:4:58,218:.: 0.66:1.000:. ./.:4:54,197:.: 0.17:1.000:. ./.:4:63,182:.: 0.06:1.000:. ./.:4:79,215:.: 1.01:1.000:. ./.:4:78,190:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,197:.: 0.62:1.000:. ./.:4:159,150:.: 1.30:1.000:. ./.:4:85,219:.: 1.20:0.986:. ./.:4:99,43:.:-1.94:1.000:. ./.:4:120,109:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.93:1.000:. ./.:4:65,150:.:-0.52:1.000:. ./.:4:59,198:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,166:.:-0.23:1.000:. ./.:4:120,135:.: 0.25:1.000:. ./.:4:120,99:.:-0.45:1.000:. ./.:4:62,205:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,167:.:-0.06:1.000:. ./.:4:73,172:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,211:.: 0.68:1.000:. ./.:6:9,186:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.52:1.000:. ./.:4:116,126:.: 0.00:1.000:. ./.:4:67,193:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,256:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,223:.: 1.01:1.000:. ./.:4:69,201:.: 0.54:1.000:. ./.:4:84,119:.:-0.76:1.000:. ./.:4:117,120:.:-0.10:1.000:. ./.:4:65,184:.: 0.14:0.966:. ./.:4:118,104:.:-0.39:1.000:. ./.:4:78,239:.: 1.45:1.000:. ./.:4:94,77:.:-1.38:0.999:. ./.:4:163,149:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.06:1.000:. ./.:4:136,120:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,122:.:-0.16:1.000:. ./.:4:61,186:.: 0.10:1.000:. ./.:4:127,133:.: 0.35:1.000:. ./.:4:64,205:.: 0.52:1.000:. ./.:4:69,178:.: 0.10:1.000:. ./.:4:104,104:.:-0.66:0.995:. ./.:4:137,131:.: 0.50:1.000:. ./.:4:74,225:.: 1.10:1.000:. ./.:4:54,159:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,187:.: 0.48:1.000:. ./.:4:66,210:.: 0.66:1.000:. ./.:4:44,127:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.64:1.000:. ./.:4:56,153:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.39:1.000:. ./.:4:59,155:.:-0.54:1.000:. ./.:4:55,169:.:-0.35:1.000:. ./.:4:71,226:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,160:.:-1.59:1.000:. ./.:4:62,197:.: 0.33:1.000:. ./.:4:71,212:.: 0.79:1.000:. ./.:4:99,105:.:-0.74:1.000:. ./.:4:96,111:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,168:.:-0.25:1.000:. ./.:4:65,216:.: 0.76:1.000:. ./.:4:43,110:.:-1.73:1.000:. ./.:4:58,188:.: 0.08:1.000:. ./.:4:95,123:.:-0.47:1.000:. ./.:5:99,183:.: 0.77:0.999:. ./.:4:56,176:.:-0.19:1.000:. ./.:4:102,127:.:-0.25:1.000:. ./.:4:64,152:.:-0.50:1.000:. ./.:4:62,200:.: 0.39:1.000:. ./.:4:68,230:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,230:.:-0.23:1.000:. ./.:4:59,146:.:-0.72:1.000:. ./.:4:79,274:.: 2.15:1.000:. ./.:4:67,193:.: 0.35:0.999:. ./.:4:64,236:.: 1.12:1.000:. ./.:4:52,114:.:-1.47:1.000:. ./.:4:66,174:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,161:.:-0.52:1.000:. ./.:4:124,121:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,165:.:-0.41:1.000:. ./.:4:122,113:.:-0.14:1.000:. ./.:4:68,180:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,109:.:-0.27:1.000:. ./.:4:142,112:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,226:.: 0.99:1.000:. ./.:4:58,169:.:-0.29:1.000:. ./.:4:64,182:.: 0.08:1.000:. ./.:4:60,212:.: 0.58:1.000:. ./.:4:54,175:.:-0.25:1.000:. ./.:4:43,160:.:-0.76:1.000:. ./.:4:52,183:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,195:.: 0.21:1.000:. ./.:4:105,134:.:-0.06:1.000:. ./.:4:56,135:.:-0.99:1.000:. ./.:4:45,186:.:-0.21:1.000:. ./.:4:110,124:.:-0.16:1.000:. ./.:4:65,231:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.17:1.000:. ./.:4:58,174:.:-0.19:1.000:. ./.:4:49,145:.:-0.93:1.000:. ./.:4:66,169:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.16:1.000:. ./.:4:46,180:.:-0.31:1.000:. ./.:4:54,204:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,224:.: 0.83:1.000:. ./.:4:76,249:.: 1.61:1.000:. ./.:4:68,212:.: 0.74:1.000:. ./.:4:53,171:.:-0.35:1.000:. ./.:4:66,218:.: 0.81:1.000:. ./.:4:52,154:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,304:.: 1.20:1.000:. ./.:4:69,229:.: 1.08:1.000:. ./.:4:21,50:.:-3.31:1.000:. ./.:4:42,110:.:-1.74:1.000:. ./.:4:91,146:.:-0.10:1.000:. ./.:4:116,125:.:-0.02:1.000:. ./.:4:66,190:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,266:.: 0.46:1.000:. ./.:4:51,158:.:-0.64:1.000:. ./.:4:66,229:.: 1.03:1.000:. ./.:4:70,157:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,151:.:-0.70:1.000:. ./.:4:112,114:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,300:.: 1.12:1.000:. ./.:4:70,198:.: 0.50:1.000:. ./.:4:65,165:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,133:.: 0.12:0.999:. ./.:4:116,127:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,187:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,149:.:-0.76:1.000:. ./.:4:69,201:.: 0.54:1.000:. ./.:4:60,169:.:-0.25:1.000:. ./.:4:56,173:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,202:.: 0.12:1.000:. ./.:4:133,161:.: 1.01:1.000:. ./.:4:128,147:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,267:.: 0.48:1.000:. ./.:4:70,214:.: 0.81:1.000:. ./.:4:76,195:.: 0.56:0.999:. ./.:4:72,234:.: 1.24:1.000:. ./.:4:66,234:.: 1.12:1.000:. ./.:4:50,191:.:-0.02:1.000:. ./.:4:134,112:.: 0.08:1.000:. -chr7.1 28518805 chr7.1_028518805 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:162,450:.:-0.04:1.000:. ./.:4:122,346:.:-1.17:1.000:. ./.:4:259,254:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,572:.:-0.35:1.000:. ./.:4:183,516:.: 0.65:1.000:. ./.:4:338,349:.: 0.55:1.000:. ./.:4:211,240:.:-1.31:1.000:. ./.:4:313,249:.:-0.43:1.000:. ./.:4:124,401:.:-0.72:1.000:. ./.:4:69,278:.:-2.12:1.000:. ./.:4:116,301:.:-1.57:1.000:. ./.:4:0,469:.:-1.16:1.000:. ./.:4:252,273:.:-0.72:1.000:. ./.:4:135,463:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,596:.:-0.16:1.000:. ./.:4:166,427:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,619:.: 0.02:0.985:. ./.:4:162,521:.: 0.52:1.000:. ./.:4:185,578:.: 1.15:1.000:. ./.:4:164,472:.: 0.15:1.000:. ./.:4:147,211:.:-2.04:1.000:. ./.:4:0,497:.:-0.94:1.000:. ./.:4:318,306:.: 0.06:1.000:. ./.:4:280,248:.:-0.70:1.000:. ./.:4:94,176:.:-2.73:1.000:. ./.:4:330,321:.: 0.27:1.000:. ./.:4:250,298:.:-0.54:1.000:. ./.:4:139,385:.:-0.73:1.000:. ./.:4:157,469:.: 0.07:1.000:. ./.:4:306,290:.:-0.16:1.000:. ./.:4:161,438:.:-0.14:1.000:. ./.:4:139,403:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,226:.:-3.08:1.000:. ./.:4:0,423:.:-1.53:1.000:. ./.:3:24,209:.:-3.02:0.999:. ./.:4:184,398:.:-0.27:1.000:. ./.:4:301,279:.:-0.29:1.000:. ./.:4:139,478:.: 0.00:1.000:. ./.:4:362,360:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,637:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,611:.:-0.05:1.000:. ./.:4:171,494:.: 0.38:1.000:. ./.:4:367,394:.: 1.13:1.000:. ./.:4:318,328:.: 0.23:1.000:. ./.:4:423,506:.: 2.46:1.000:. ./.:4:347,331:.: 0.48:1.000:. ./.:4:172,461:.: 0.13:0.986:. ./.:4:81,336:.:-1.57:1.000:. ./.:4:330,299:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,1004:.: 3.05:1.000:. ./.:4:165,546:.: 0.74:1.000:. ./.:4:187,485:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,438:.:-0.36:1.000:. ./.:4:179,525:.: 0.69:1.000:. ./.:4:282,282:.:-0.42:1.000:. ./.:4:374,385:.: 1.12:1.000:. ./.:4:157,438:.:-0.17:1.000:. ./.:4:212,704:.: 2.35:1.000:. ./.:4:159,446:.:-0.09:1.000:. ./.:6:57,576:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,839:.: 1.76:1.000:. ./.:4:159,410:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,967:.: 2.75:1.000:. ./.:4:0,771:.: 1.21:1.000:. ./.:4:167,484:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,674:.: 0.45:1.000:. ./.:4:111,447:.:-0.46:1.000:. ./.:4:154,407:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,688:.: 0.56:0.966:. ./.:4:156,380:.:-0.64:1.000:. ./.:4:440,445:.: 2.11:1.000:. ./.:4:181,533:.: 0.76:0.999:. ./.:4:414,477:.: 2.16:1.000:. ./.:4:129,412:.:-0.60:1.000:. ./.:4:164,533:.: 0.63:1.000:. ./.:4:145,487:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,711:.: 0.74:1.000:. ./.:4:162,539:.: 0.66:1.000:. ./.:4:182,517:.: 0.65:1.000:. ./.:4:171,554:.: 0.85:1.000:. ./.:4:132,419:.:-0.52:0.995:. ./.:4:218,511:.: 0.88:1.000:. ./.:4:163,504:.: 0.39:1.000:. ./.:4:134,389:.:-0.74:1.000:. ./.:4:341,417:.: 1.11:1.000:. ./.:4:393,401:.: 1.39:1.000:. ./.:4:112,343:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,666:.: 0.39:1.000:. ./.:4:175,546:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,564:.:-0.42:1.000:. ./.:4:152,469:.: 0.03:1.000:. ./.:4:149,443:.:-0.20:1.000:. ./.:4:364,377:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,423:.:-1.53:1.000:. ./.:4:314,345:.: 0.33:1.000:. ./.:4:187,532:.: 0.80:1.000:. ./.:4:127,498:.: 0.06:1.000:. ./.:4:175,448:.: 0.05:1.000:. ./.:4:191,600:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,650:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,644:.: 0.21:1.000:. ./.:4:196,590:.: 1.33:1.000:. ./.:4:247,276:.:-0.74:1.000:. ./.:5:168,768:.: 2.51:0.999:. ./.:4:0,686:.: 0.54:1.000:. ./.:4:304,308:.:-0.04:1.000:. ./.:4:129,535:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,499:.:-0.93:1.000:. ./.:4:193,591:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,509:.:-0.85:1.000:. ./.:4:166,501:.: 0.39:1.000:. ./.:4:208,576:.: 1.31:1.000:. ./.:4:167,544:.: 0.74:0.999:. ./.:4:339,462:.: 1.45:1.000:. ./.:4:269,260:.:-0.69:1.000:. ./.:4:341,354:.: 0.61:1.000:. ./.:4:142,466:.:-0.07:1.000:. ./.:4:328,342:.: 0.42:1.000:. ./.:4:197,615:.: 1.53:1.000:. ./.:4:277,275:.:-0.51:1.000:. ./.:4:136,503:.: 0.17:1.000:. ./.:4:170,531:.: 0.66:1.000:. ./.:4:310,337:.: 0.24:1.000:. ./.:4:143,388:.:-0.68:1.000:. ./.:4:395,358:.: 1.07:1.000:. ./.:4:367,398:.: 1.16:1.000:. ./.:4:183,553:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,661:.: 0.35:1.000:. ./.:4:115,424:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,357:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,644:.: 0.21:1.000:. ./.:4:267,256:.:-0.74:1.000:. ./.:4:112,307:.:-1.56:1.000:. ./.:4:362,356:.: 0.80:1.000:. ./.:4:135,380:.:-0.80:1.000:. ./.:4:188,567:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,579:.:-0.30:1.000:. ./.:4:136,464:.:-0.13:1.000:. ./.:4:233,233:.:-1.19:1.000:. ./.:4:136,489:.: 0.06:1.000:. ./.:4:181,606:.: 1.34:1.000:. ./.:4:317,374:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,503:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,587:.:-0.24:1.000:. ./.:4:381,348:.: 0.88:1.000:. ./.:4:183,538:.: 0.82:1.000:. ./.:4:147,449:.:-0.16:1.000:. ./.:4:164,422:.:-0.24:1.000:. ./.:4:303,362:.: 0.38:1.000:. ./.:4:251,270:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,632:.: 0.12:1.000:. ./.:4:270,294:.:-0.42:1.000:. ./.:4:183,193:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,412:.:-1.61:1.000:. ./.:4:344,316:.: 0.34:1.000:. ./.:4:315,286:.:-0.13:1.000:. ./.:4:182,594:.: 1.25:1.000:. ./.:4:178,490:.: 0.40:1.000:. ./.:4:139,321:.:-1.23:1.000:. ./.:4:336,299:.: 0.14:1.000:. ./.:4:244,260:.:-0.89:1.000:. ./.:4:119,375:.:-0.97:1.000:. ./.:4:255,244:.:-0.93:1.000:. ./.:4:155,413:.:-0.38:1.000:. ./.:4:140,405:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,426:.:-0.35:1.000:. ./.:4:131,391:.:-0.75:1.000:. ./.:4:146,413:.:-0.46:0.999:. ./.:4:321,252:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,455:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,490:.:-1.00:1.000:. ./.:4:87,353:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,546:.:-0.56:1.000:. ./.:4:129,402:.:-0.68:1.000:. ./.:4:127,375:.:-0.90:1.000:. ./.:4:257,214:.:-1.15:1.000:. ./.:4:358,344:.: 0.67:1.000:. ./.:4:338,316:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,645:.: 0.22:1.000:. ./.:4:246,282:.:-0.70:1.000:. ./.:4:149,452:.:-0.13:0.999:. ./.:4:365,348:.: 0.76:1.000:. ./.:4:185,564:.: 1.04:1.000:. ./.:4:135,363:.:-0.94:1.000:. ./.:4:133,412:.:-0.57:1.000:. -chr7.1 28710615 chr7.1_028710615 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,58:0.78: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,18:0.37: 0.64:1.000:0.556 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,43:0.65: 1.07:1.000:0.796 0/1/1/1:4:10,29:0.79:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,48:0.64: 1.55:1.000:0.718 0/0/1/1:4:31,32:0.53: 0.69:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,13:0.80:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.44:-1.62:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,23:0.42: 0.74:1.000:0.899 0/0/1/1:4:33,15:0.39:-0.11:1.000:0.636 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,20:0.49:-0.38:0.985:0.996 0/0/0/1:4:57,19:0.34: 1.39:1.000:0.844 0/1/1/1:4:20,40:0.71: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:49,53:0.54: 2.78:1.000:0.987 0/0/1/1:4:7,10:0.62:-1.78:1.000:0.568 0/0/1/1:4:22,17:0.47:-0.60:1.000:0.991 0/1/1/1:4:19,33:0.67: 0.10:1.000:0.936 0/1/1/1:4:14,39:0.78: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.85:-2.10:1.000:0.989 0/1/1/1:4:29,56:0.70: 1.87:1.000:0.987 0/1/1/1:4:16,53:0.81: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,28:0.56: 0.10:1.000:0.963 0/1/1/1:4:18,27:0.63:-0.27:1.000:0.613 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 1.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.55:-0.44:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.31:-2.42:1.000:0.973 0/1/1:3:1,2:0.71:-2.53:0.999:1.000 0/0/1/1:4:22,29:0.60: 0.05:1.000:0.813 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,41:0.73: 0.53:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,22:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,21:0.46:-0.06:1.000:0.989 0/1/1/1:4:19,29:0.64:-0.11:1.000:0.673 0/1/1/1:4:20,51:0.77: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,45:0.65: 1.23:1.000:0.817 0/1/1/1:4:18,61:0.81: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,31:0.67:-0.06:1.000:0.928 0/1/1/1:4:24,42:0.68: 0.85:0.986:0.943 0/0/0/1:4:11,3:0.32:-1.94:1.000:0.954 0/1/1/1:4:16,35:0.73: 0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,16:0.43:-0.44:1.000:0.949 0/0/1/1:4:12,15:0.58:-1.24:1.000:0.905 0/0/1/1:4:30,28:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,14:0.44:-0.81:1.000:0.972 0/0/1/1:4:15,19:0.59:-0.87:1.000:0.887 0/1/1/1:4:13,36:0.78:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,42:0.77: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,18:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,42:0.74: 0.58:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:19,13:0.45:-0.97:1.000:0.730 0/0/0/1:4:29,9:0.33:-0.65:1.000:0.898 0/0/1/1:4:36,19:0.41: 0.26:1.000:0.846 0/0/1/1:4:46,24:0.41: 1.07:1.000:0.834 0/0/1/1:4:42,27:0.44: 1.01:1.000:0.963 0/0/1/1:4:44,49:0.55: 2.30:1.000:0.981 0/0/1/1:4:21,23:0.54:-0.33:1.000:0.985 0/0/1/1:4:12,14:0.56:-1.29:1.000:0.963 0/0/1/1:4:23,24:0.53:-0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:34,20:0.42: 0.21:0.966:0.928 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,35:0.60: 0.58:1.000:0.761 0/0/1/1:4:21,13:0.43:-0.87:0.999:0.951 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,26:0.64:-0.38:1.000:0.679 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.47:-0.60:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,2:0.21:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,18:0.53:-0.81:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,21:0.38: 1.07:1.000:0.529 0/1/1/1:4:23,48:0.72: 1.12:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.08:0.995:1.000 0/0/1/1:4:37,27:0.46: 0.74:1.000:0.986 0/0/1/1:4:18,19:0.53:-0.70:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,44:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,36:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,43:0.71: 0.80:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,15:0.44:-0.65:1.000:0.967 0/0/1/1:4:28,29:0.53: 0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:37,13:0.35:-0.01:1.000:0.789 0/1/1/1:4:9,34:0.83:-0.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,51:0.80: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,14:0.42:-0.60:1.000:0.897 0/1/1/1:4:27,58:0.73: 1.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,33:0.49: 1.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,19:0.67:-1.08:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,17:0.39: 0.21:1.000:0.655 0/0/0/1:4:65,2:0.18: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,16:0.63:-1.24:1.000:0.501 0/0/1/1:4:15,15:0.52:-1.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,32:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:25,17:0.45:-0.44:0.999:0.893 0/0/1/1:4:21,14:0.44:-0.81:1.000:0.972 0/1/1/1:4:12,43:0.82: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,18:0.44:-0.27:1.000:0.972 0/0/0/1:4:41,6:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,21:0.40: 0.64:1.000:0.813 0/0/0/1:4:36,15:0.37: 0.05:1.000:0.523 0/1/1/1:4:11,28:0.76:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.10:0.999:1.000 0/0/1/1:4:39,54:0.61: 2.30:1.000:0.677 0/1/1/1:4:13,21:0.65:-0.87:1.000:0.829 0/1/1/1:4:13,67:0.86: 1.60:1.000:0.948 0/1/1/1:4:9,19:0.73:-1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,34:0.68: 0.15:1.000:0.959 0/0/1/1:4:37,20:0.41: 0.37:1.000:0.869 0/1/1/1:4:19,30:0.65:-0.06:1.000:0.774 0/1/1/1:4:17,31:0.69:-0.11:1.000:0.969 0/0/1/1:4:15,19:0.59:-0.87:1.000:0.887 0/1/1/1:4:21,56:0.77: 1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,46:0.64: 1.39:1.000:0.688 0/1/1/1:4:19,49:0.77: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,42:0.76: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,21:0.49:-0.33:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-2.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,30:0.69:-0.22:1.000:0.979 0/0/1/1:4:10,13:0.59:-1.46:1.000:0.842 0/0/1/1:4:17,16:0.50:-0.92:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.61:-1.40:1.000:0.640 0/0/1/1:4:24,29:0.57: 0.15:1.000:0.940 0/0/1/1:4:24,17:0.45:-0.49:1.000:0.983 0/0/1/1:4:25,26:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/0/0/1:4:43,16:0.36: 0.48:1.000:0.714 0/0/1/1:4:18,26:0.62:-0.33:1.000:0.527 0/1/1/1:4:12,41:0.81: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.61:-0.76:1.000:0.640 0/1/1/1:4:20,34:0.67: 0.21:1.000:0.913 0/0/0/1:4:40,4:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,7:0.33:-1.03:1.000:0.930 0/1/1/1:4:16,63:0.83: 1.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,24:0.54:-0.22:1.000:0.986 0/1/1/1:4:20,47:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,17:0.49:-0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,36:0.70: 0.26:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,23:0.41: 0.85:1.000:0.859 0/1/1/1:4:26,46:0.68: 1.17:1.000:0.951 0/1/1/1:4:3,13:0.84:-1.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,15:0.38:-0.06:1.000:0.583 0/1/1/1:4:15,51:0.81: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,35:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,48:0.71: 1.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:13,33:0.76:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,28:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,63:0.69: 2.52:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,16:0.43:-0.44:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,43:0.61: 1.28:1.000:0.671 0/0/1/1:4:18,26:0.62:-0.33:1.000:0.527 0/0/1/1:4:25,16:0.44:-0.49:1.000:0.962 0/0/1/1:4:20,25:0.58:-0.27:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.38:0.999:1.000 0/1/1/1:4:16,53:0.81: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,13:0.35:-0.06:1.000:0.755 0/0/1/1:4:44,21:0.39: 0.80:1.000:0.717 0/1/1/1:4:19,37:0.70: 0.32:1.000:0.988 0/0/0/1:4:34,9:0.32:-0.38:1.000:0.962 0/1/1/1:4:19,44:0.75: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,32:0.59: 0.37:1.000:0.870 0/1/1/1:4:21,38:0.69: 0.48:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,57:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,52:0.68: 1.66:1.000:0.960 0/0/0/1:4:59,16:0.32: 1.34:1.000:0.955 0/1/1/1:4:12,52:0.84: 0.74:1.000:0.993 0/0/1/1:4:17,20:0.56:-0.70:0.999:0.959 0/1/1/1:4:21,54:0.77: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,37:0.68: 0.42:1.000:0.948 0/1/1/1:4:29,47:0.66: 1.39:1.000:0.836 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.76:1.000:1.000 -chr7.1 28845173 chr7.1_028845173 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:245,7:.: 0.16:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:219,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:245,26:.: 0.54:1.000:. ./.:4:252,21:.: 0.58:1.000:. ./.:4:265,15:.: 0.71:1.000:. ./.:4:147,20:.:-1.51:1.000:. ./.:4:243,32:.: 0.62:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:142,13:.:-1.75:1.000:. ./.:4:118,10:.:-2.28:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:221,10:.:-0.25:1.000:. ./.:4:262,9:.: 0.54:1.000:. ./.:4:208,7:.:-0.57:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.34:0.985:. ./.:4:213,26:.:-0.09:1.000:. ./.:4:321,24:.: 1.99:1.000:. ./.:4:279,21:.: 1.11:1.000:. ./.:4:85,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:226,14:.:-0.07:1.000:. ./.:4:228,26:.: 0.20:1.000:. ./.:4:228,23:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:237,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:303,34:.: 1.84:1.000:. ./.:4:257,21:.: 0.67:1.000:. ./.:4:244,12:.: 0.24:1.000:. ./.:4:208,7:.:-0.57:1.000:. ./.:4:64,10:.:-3.34:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.75:1.000:. ./.:3:56,0:.:-3.70:0.999:. ./.:4:238,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:236,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:247,23:.: 0.52:1.000:. ./.:4:240,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:214,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:237,14:.: 0.14:1.000:. ./.:4:234,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:312,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:238,18:.: 0.24:1.000:. ./.:4:267,13:.: 0.71:0.986:. ./.:4:56,1:.:-3.68:1.000:. ./.:4:204,11:.:-0.57:1.000:. ./.:4:249,13:.: 0.36:1.000:. ./.:4:217,17:.:-0.19:1.000:. ./.:4:264,39:.: 1.17:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:261,14:.: 0.62:1.000:. ./.:4:167,11:.:-1.29:1.000:. ./.:4:301,17:.: 1.46:1.000:. ./.:4:224,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:206,20:.:-0.35:1.000:. ./.:4:248,20:.: 0.48:1.000:. ./.:6:213,19:.:-0.23:1.000:. ./.:4:258,16:.: 0.60:1.000:. ./.:4:206,16:.:-0.43:1.000:. ./.:4:331,19:.: 2.09:1.000:. ./.:4:280,32:.: 1.34:1.000:. ./.:4:222,16:.:-0.11:1.000:. ./.:4:211,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:190,17:.:-0.72:1.000:. ./.:4:225,15:.:-0.07:1.000:. ./.:4:240,28:.: 0.48:0.966:. ./.:4:188,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:293,14:.: 1.25:1.000:. ./.:4:169,19:.:-1.10:0.999:. ./.:4:282,6:.: 0.87:1.000:. ./.:4:218,24:.:-0.03:1.000:. ./.:4:257,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:214,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:230,14:.: 0.01:1.000:. ./.:4:257,31:.: 0.87:1.000:. ./.:4:240,33:.: 0.58:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.16:0.995:. ./.:4:275,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:280,9:.: 0.89:1.000:. ./.:4:288,21:.: 1.28:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:194,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:215,17:.:-0.23:1.000:. ./.:4:312,18:.: 1.70:1.000:. ./.:4:176,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:290,4:.: 0.99:1.000:. ./.:4:261,10:.: 0.54:1.000:. ./.:4:187,41:.:-0.31:1.000:. ./.:4:238,3:.:-0.05:1.000:. ./.:4:253,29:.: 0.75:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:209,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:240,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:197,1:.:-0.90:1.000:. ./.:5:326,19:.: 1.99:0.999:. ./.:4:244,16:.: 0.32:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:268,10:.: 0.67:1.000:. ./.:4:288,14:.: 1.15:1.000:. ./.:4:221,39:.: 0.32:1.000:. ./.:4:216,29:.: 0.02:1.000:. ./.:4:313,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:207,37:.: 0.01:0.999:. ./.:4:318,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:197,12:.:-0.68:1.000:. ./.:4:251,54:.: 1.21:1.000:. ./.:4:196,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:206,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:234,37:.: 0.54:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:242,22:.: 0.40:1.000:. ./.:4:208,14:.:-0.43:1.000:. ./.:4:226,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:237,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:207,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:247,13:.: 0.32:1.000:. ./.:4:254,39:.: 0.97:1.000:. ./.:4:222,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:206,15:.:-0.45:1.000:. ./.:4:202,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:200,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:247,19:.: 0.44:1.000:. ./.:4:174,25:.:-0.88:1.000:. ./.:4:246,10:.: 0.24:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:232,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:210,45:.: 0.22:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:261,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:280,23:.: 1.17:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:267,28:.: 1.01:1.000:. ./.:4:314,33:.: 2.03:1.000:. ./.:4:234,17:.: 0.14:1.000:. ./.:4:211,22:.:-0.21:1.000:. ./.:4:240,15:.: 0.22:1.000:. ./.:4:235,16:.: 0.14:1.000:. ./.:4:294,37:.: 1.72:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:116,4:.:-2.44:1.000:. ./.:4:163,10:.:-1.39:1.000:. ./.:4:282,15:.: 1.05:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:283,33:.: 1.42:1.000:. ./.:4:259,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:214,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:255,27:.: 0.75:1.000:. ./.:4:195,20:.:-0.57:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:226,25:.: 0.14:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:242,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:217,15:.:-0.23:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.03:0.999:. ./.:4:217,16:.:-0.21:1.000:. ./.:4:237,39:.: 0.64:1.000:. ./.:4:184,13:.:-0.92:1.000:. ./.:4:173,13:.:-1.14:1.000:. ./.:4:217,28:.: 0.02:1.000:. ./.:4:231,11:.:-0.03:1.000:. ./.:4:224,15:.:-0.09:1.000:. ./.:4:187,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:307,38:.: 1.99:1.000:. ./.:4:273,34:.: 1.25:1.000:. ./.:4:213,13:.:-0.35:1.000:. ./.:4:249,16:.: 0.42:1.000:. ./.:4:242,12:.: 0.20:0.999:. ./.:4:304,25:.: 1.68:1.000:. ./.:4:276,19:.: 1.01:1.000:. ./.:4:202,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.29:1.000:. -chr7.1 29128354 chr7.1_029128354 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:173,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:198,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.40:0.985:. ./.:4:125,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.53:1.000:. ./.:3:27,0:.:-2.71:0.999:. ./.:4:180,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.09:0.986:. ./.:4:48,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:6:105,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:0.966:. ./.:4:124,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:130,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.53:0.999:. ./.:4:81,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.81:0.995:. ./.:4:107,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:172,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.17:1.000:. ./.:5:120,1:.:-0.12:0.999:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.60:0.999:. ./.:4:130,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:152,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:207,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:216,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.02:0.999:. ./.:4:132,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:161,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:206,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.82:1.000:. -chr7.1 29447729 chr7.1_029447729 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:247,58:.: 0.12:1.000:. ./.:4:191,38:.:-1.21:1.000:. ./.:4:225,50:.:-0.40:1.000:. ./.:4:251,68:.: 0.37:1.000:. ./.:4:272,80:.: 0.95:1.000:. ./.:4:314,69:.: 1.50:1.000:. ./.:4:137,90:.:-1.25:1.000:. ./.:4:236,56:.:-0.10:1.000:. ./.:4:175,120:.:-0.05:1.000:. ./.:4:190,45:.:-1.11:1.000:. ./.:4:106,83:.:-1.92:1.000:. ./.:4:250,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:209,49:.:-0.70:1.000:. ./.:4:235,70:.: 0.12:1.000:. ./.:4:210,55:.:-0.58:1.000:. ./.:4:255,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:261,70:.: 0.58:0.985:. ./.:4:242,55:.:-0.02:1.000:. ./.:4:323,81:.: 1.87:1.000:. ./.:4:189,148:.: 0.69:1.000:. ./.:4:169,40:.:-1.57:1.000:. ./.:4:236,50:.:-0.21:1.000:. ./.:4:246,52:.: 0.00:1.000:. ./.:4:233,71:.: 0.11:1.000:. ./.:4:134,29:.:-2.37:1.000:. ./.:4:217,119:.: 0.67:1.000:. ./.:4:264,66:.: 0.57:1.000:. ./.:4:205,59:.:-0.60:1.000:. ./.:4:250,81:.: 0.58:1.000:. ./.:4:215,147:.: 1.13:1.000:. ./.:4:308,79:.: 1.57:1.000:. ./.:4:231,55:.:-0.21:1.000:. ./.:4:139,22:.:-2.41:1.000:. ./.:4:175,45:.:-1.37:1.000:. ./.:3:103,0:.:-3.43:0.999:. ./.:4:252,66:.: 0.35:1.000:. ./.:4:253,56:.: 0.20:1.000:. ./.:4:222,58:.:-0.32:1.000:. ./.:4:309,82:.: 1.64:1.000:. ./.:4:289,70:.: 1.08:1.000:. ./.:4:242,80:.: 0.42:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:272,71:.: 0.79:1.000:. ./.:4:171,105:.:-0.39:1.000:. ./.:4:211,164:.: 1.36:1.000:. ./.:4:297,73:.: 1.27:1.000:. ./.:4:259,48:.: 0.16:0.986:. ./.:4:146,35:.:-2.06:1.000:. ./.:4:197,65:.:-0.63:1.000:. ./.:4:321,86:.: 1.92:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:246,61:.: 0.16:1.000:. ./.:4:201,60:.:-0.65:1.000:. ./.:4:299,68:.: 1.22:1.000:. ./.:4:213,67:.:-0.32:1.000:. ./.:4:218,159:.: 1.39:1.000:. ./.:4:249,58:.: 0.16:1.000:. ./.:6:293,31:.: 0.46:1.000:. ./.:4:300,58:.: 1.06:1.000:. ./.:4:220,45:.:-0.58:1.000:. ./.:4:316,81:.: 1.74:1.000:. ./.:4:282,72:.: 0.99:1.000:. ./.:4:186,125:.: 0.23:1.000:. ./.:4:272,75:.: 0.86:1.000:. ./.:4:171,43:.:-1.48:1.000:. ./.:4:239,61:.: 0.04:1.000:. ./.:4:291,68:.: 1.08:0.966:. ./.:4:105,72:.:-2.13:1.000:. ./.:4:294,82:.: 1.37:1.000:. ./.:4:162,46:.:-1.58:0.999:. ./.:4:89,213:.: 0.07:1.000:. ./.:4:275,51:.: 0.49:1.000:. ./.:4:159,124:.:-0.26:1.000:. ./.:4:261,66:.: 0.51:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:267,59:.: 0.49:1.000:. ./.:4:279,53:.: 0.60:1.000:. ./.:4:276,86:.: 1.13:1.000:. ./.:4:158,107:.:-0.58:0.995:. ./.:4:254,80:.: 0.64:1.000:. ./.:4:369,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:105,81:.:-1.97:1.000:. ./.:4:286,69:.: 1.01:1.000:. ./.:4:265,72:.: 0.69:1.000:. ./.:4:174,44:.:-1.41:1.000:. ./.:4:195,42:.:-1.07:1.000:. ./.:4:174,106:.:-0.32:1.000:. ./.:4:221,55:.:-0.39:1.000:. ./.:4:221,68:.:-0.16:1.000:. ./.:4:209,53:.:-0.63:1.000:. ./.:4:346,71:.: 2.10:1.000:. ./.:4:156,40:.:-1.79:1.000:. ./.:4:192,121:.: 0.27:1.000:. ./.:4:192,147:.: 0.72:1.000:. ./.:4:232,42:.:-0.42:1.000:. ./.:4:248,69:.: 0.34:1.000:. ./.:4:311,77:.: 1.59:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:215,59:.:-0.42:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:200,29:.:-1.21:1.000:. ./.:5:314,51:.: 1.18:0.999:. ./.:4:211,58:.:-0.51:1.000:. ./.:4:231,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:296,79:.: 1.36:1.000:. ./.:4:220,59:.:-0.33:1.000:. ./.:4:155,104:.:-0.68:1.000:. ./.:4:345,78:.: 2.20:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:250,112:.: 1.13:1.000:. ./.:4:199,57:.:-0.74:1.000:. ./.:4:183,127:.: 0.21:1.000:. ./.:4:150,117:.:-0.54:1.000:. ./.:4:234,45:.:-0.33:1.000:. ./.:4:260,68:.: 0.53:1.000:. ./.:4:213,55:.:-0.53:1.000:. ./.:4:238,71:.: 0.20:1.000:. ./.:4:229,56:.:-0.23:1.000:. ./.:4:272,69:.: 0.76:1.000:. ./.:4:177,118:.:-0.05:1.000:. ./.:4:184,120:.: 0.11:1.000:. ./.:4:233,77:.: 0.21:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:271,61:.: 0.60:1.000:. ./.:4:128,97:.:-1.28:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:247,49:.:-0.03:1.000:. ./.:4:209,65:.:-0.42:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:250,60:.: 0.21:1.000:. ./.:4:200,49:.:-0.86:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:251,59:.: 0.21:1.000:. ./.:4:156,133:.:-0.16:1.000:. ./.:4:165,105:.:-0.49:1.000:. ./.:4:242,47:.:-0.16:1.000:. ./.:4:270,61:.: 0.58:1.000:. ./.:4:226,59:.:-0.23:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:198,48:.:-0.91:1.000:. ./.:4:190,138:.: 0.53:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:150,100:.:-0.84:1.000:. ./.:4:205,46:.:-0.83:1.000:. ./.:4:290,74:.: 1.16:1.000:. ./.:4:152,114:.:-0.56:1.000:. ./.:4:303,72:.: 1.36:1.000:. ./.:4:274,73:.: 0.86:1.000:. ./.:4:101,74:.:-2.16:1.000:. ./.:4:228,55:.:-0.26:1.000:. ./.:4:296,74:.: 1.27:1.000:. ./.:4:236,56:.:-0.10:1.000:. ./.:4:268,67:.: 0.65:1.000:. ./.:4:265,52:.: 0.34:1.000:. ./.:4:142,80:.:-1.34:1.000:. ./.:4:156,111:.:-0.54:1.000:. ./.:4:149,83:.:-1.16:1.000:. ./.:4:176,60:.:-1.09:1.000:. ./.:4:214,51:.:-0.58:1.000:. ./.:4:221,52:.:-0.44:1.000:. ./.:4:294,72:.: 1.20:1.000:. ./.:4:218,61:.:-0.33:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:149,102:.:-0.83:0.999:. ./.:4:216,47:.:-0.61:1.000:. ./.:4:235,49:.:-0.24:1.000:. ./.:4:175,49:.:-1.30:1.000:. ./.:4:182,52:.:-1.12:1.000:. ./.:4:209,54:.:-0.61:1.000:. ./.:4:194,38:.:-1.16:1.000:. ./.:4:232,53:.:-0.23:1.000:. ./.:4:204,45:.:-0.86:1.000:. ./.:4:278,75:.: 0.97:1.000:. ./.:4:253,76:.: 0.55:1.000:. ./.:4:265,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:133,95:.:-1.23:1.000:. ./.:4:347,5:.: 0.95:0.999:. ./.:4:278,79:.: 1.04:1.000:. ./.:4:257,69:.: 0.49:1.000:. ./.:4:117,79:.:-1.79:1.000:. ./.:4:115,97:.:-1.51:1.000:. -chr7.1 29793605 chr7.1_029793605 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:121,123:.: 0.88:1.000:. ./.:4:141,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:138,53:.:-0.22:1.000:. ./.:4:233,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:124,131:.: 1.11:1.000:. ./.:4:216,70:.: 1.75:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:158,42:.:-0.04:1.000:. ./.:4:174,54:.: 0.55:1.000:. ./.:4:91,10:.:-2.10:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:151,45:.:-0.12:1.000:. ./.:4:115,119:.: 0.67:1.000:. ./.:4:194,56:.: 1.00:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:122,132:.: 1.09:1.000:. ./.:4:108,116:.: 0.46:0.985:. ./.:4:182,59:.: 0.82:1.000:. ./.:4:189,60:.: 0.98:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:145,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:104,119:.: 0.44:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:147,77:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,67:.:-1.16:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,67:.: 1.17:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:121,116:.: 0.73:1.000:. ./.:4:171,68:.: 0.77:1.000:. ./.:4:158,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:103,84:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,53:.:-2.30:1.000:. ./.:4:68,40:.:-1.95:1.000:. ./.:3:41,24:.:-2.84:0.999:. ./.:4:269,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:161,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:178,61:.: 0.77:1.000:. ./.:4:82,70:.:-1.04:1.000:. ./.:4:114,106:.: 0.38:1.000:. ./.:4:162,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,51:.:-0.22:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:141,43:.:-0.37:1.000:. ./.:4:191,59:.: 1.00:0.986:. ./.:4:343,145:.: 5.95:1.000:. ./.:4:112,41:.:-1.01:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:148,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:200,63:.: 1.27:1.000:. ./.:4:148,61:.: 0.15:1.000:. ./.:4:118,129:.: 0.94:1.000:. ./.:4:176,66:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:152,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:167,36:.: 0.03:1.000:. ./.:4:94,93:.:-0.31:1.000:. ./.:6:139,12:.:-1.06:1.000:. ./.:4:185,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,34:.: 0.23:1.000:. ./.:4:148,54:.: 0.00:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:100,88:.:-0.29:1.000:. ./.:4:73,70:.:-1.22:1.000:. ./.:4:131,103:.: 0.67:1.000:. ./.:4:157,41:.:-0.08:0.966:. ./.:4:143,48:.:-0.22:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:120,29:.:-1.10:0.999:. ./.:4:181,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:152,53:.: 0.07:1.000:. ./.:4:107,94:.:-0.02:1.000:. ./.:4:141,32:.:-0.60:1.000:. ./.:4:94,87:.:-0.43:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:134,44:.:-0.49:1.000:. ./.:4:115,30:.:-1.18:0.995:. ./.:4:155,42:.:-0.10:1.000:. ./.:4:167,38:.: 0.07:1.000:. ./.:4:139,51:.:-0.24:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:83,85:.:-0.70:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:168,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:228,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:107,51:.:-0.91:1.000:. ./.:4:110,87:.:-0.10:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:89,80:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,36:.:-1.28:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:168,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:64,72:.:-1.37:1.000:. ./.:4:136,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:105,28:.:-1.43:1.000:. ./.:5:120,76:.:-0.12:0.999:. ./.:4:57,76:.:-1.43:1.000:. ./.:4:136,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:141,44:.:-0.35:1.000:. ./.:4:168,58:.: 0.50:1.000:. ./.:4:301,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:164,46:.: 0.17:1.000:. ./.:4:144,129:.: 1.48:1.000:. ./.:4:90,76:.:-0.74:0.999:. ./.:4:225,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:139,41:.:-0.45:1.000:. ./.:4:103,40:.:-1.22:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:134,52:.:-0.33:1.000:. ./.:4:148,41:.:-0.27:1.000:. ./.:4:85,87:.:-0.62:1.000:. ./.:4:128,40:.:-0.70:1.000:. ./.:4:204,61:.: 1.32:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:121,41:.:-0.83:1.000:. ./.:4:138,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:108,26:.:-1.41:1.000:. ./.:4:96,29:.:-1.60:1.000:. ./.:4:96,91:.:-0.31:1.000:. ./.:4:117,96:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,24:.:-2.12:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:111,108:.: 0.36:1.000:. ./.:4:241,64:.: 2.15:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:149,31:.:-0.45:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:89,72:.:-0.85:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:143,51:.:-0.16:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:223,71:.: 1.92:1.000:. ./.:4:146,56:.: 0.00:1.000:. ./.:4:167,72:.: 0.77:1.000:. ./.:4:305,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.20:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:151,38:.:-0.27:1.000:. ./.:4:189,58:.: 0.94:1.000:. ./.:4:170,50:.: 0.38:1.000:. ./.:4:218,68:.: 1.75:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,41:.:-0.68:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:156,55:.: 0.19:1.000:. ./.:4:118,36:.:-0.99:1.000:. ./.:4:90,98:.:-0.29:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:187,65:.: 1.04:1.000:. ./.:4:143,37:.:-0.45:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.30:0.999:. ./.:4:136,53:.:-0.27:1.000:. ./.:4:163,48:.: 0.19:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:138,39:.:-0.52:1.000:. ./.:4:144,54:.:-0.08:1.000:. ./.:4:154,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:81,74:.:-0.97:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:126,136:.: 1.25:1.000:. ./.:4:169,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:286,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:176,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:198,65:.: 1.27:0.999:. ./.:4:271,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:199,76:.: 1.52:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:175,48:.: 0.44:1.000:. -chr7.1 29993860 chr7.1_029993860 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,41:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,19:0.27:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,13:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.80:0.985:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,1:0.11:-2.21:1.000:0.552 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,24:0.23: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,20:0.29:-0.47:1.000:0.992 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,15:0.27:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.28:1.000:1.000 0/1/1:3:1,3:0.78:-2.46:0.999:1.000 0/0/0/1:4:59,10:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,18:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,1:0.01: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,18:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,23:0.24: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,2:0.04:-0.52:0.986:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,15:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,10:0.16:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,21:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,14:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:137,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,16:0.16: 1.47:1.000:0.994 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:96,18:0.25: 0.31:1.000:0.545 0/0/0/1:4:109,19:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,12:0.18: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.17:0.966:1.000 0/0/0/1:4:44,11:0.27:-1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:163,19:0.16: 2.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-1.15:0.999:1.000 0/0/0/1:4:95,11:0.16: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,19:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,12:0.28:-1.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,13:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:162,0:0.00: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,18:0.18: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,23:0.33:-0.82:0.995:0.907 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,15:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,1:0.01: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,12:0.16: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,21:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,26:0.29: 0.21:1.000:0.993 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,17:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,25:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,14:0.28:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,25:0.42:-1.33:1.000:0.903 0/0/0/1:4:142,17:0.17: 1.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,21:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,16:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:133,19:0.20: 1.27:0.999:0.996 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,16:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,20:0.29:-0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:130,15:0.16: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,22:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,24:0.26: 0.64:0.999:0.998 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 2.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,11:0.13: 0.74:1.000:0.925 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,19:0.22: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 2.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,23:0.20: 2.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,12:0.18: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,15:0.28:-0.90:1.000:0.995 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,20:0.26: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,11:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,9:0.09: 1.29:1.000:0.924 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,29:0.30: 0.26:1.000:0.987 0/0/0/1:4:92,20:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,20:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,18:0.18: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,22:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,13:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,35:0.29: 0.99:1.000:0.990 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,16:0.17: 1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:123,18:0.20: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,27:0.31:-0.19:1.000:0.972 0/0/0/1:4:93,25:0.28: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,20:0.28:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,12:0.15: 0.51:1.000:0.992 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,21:0.27:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,17:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/1:4:67,16:0.27:-0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,23:0.32:-0.62:1.000:0.962 0/0/0/1:4:35,12:0.30:-1.38:0.999:0.988 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,20:0.30:-0.60:1.000:0.988 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,21:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,22:0.28:-0.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:88,4:0.07:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,20:0.28:-0.22:0.999:0.996 0/0/0/1:4:129,34:0.27: 1.54:1.000:0.997 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,17:0.32:-1.18:1.000:0.950 -chr7.1 30221228 chr7.1_030221228 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.19:0.985:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:62,1:.: 2.96:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.19:1.000:. ./.:3:7,0:.:-1.12:0.999:. ./.:4:5,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.26:0.986:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.97:1.000:. ./.:6:25,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.41:0.966:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:6,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:0.995:. ./.:4:33,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.12:1.000:. ./.:5:21,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:51,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:0.999:. ./.:4:33,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.51:0.999:. ./.:4:6,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.83:1.000:. -chr7.1 31588295 chr7.1_031588295 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,236:.: 1.37:1.000:. ./.:4:168,146:.: 1.13:1.000:. ./.:4:56,167:.:-0.56:1.000:. ./.:4:144,140:.: 0.57:1.000:. ./.:4:82,235:.: 1.19:1.000:. ./.:4:91,242:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,164:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,279:.: 0.48:1.000:. ./.:4:103,179:.: 0.54:1.000:. ./.:4:28,91:.:-2.49:1.000:. ./.:4:50,141:.:-1.15:1.000:. ./.:4:120,114:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,210:.: 0.46:1.000:. ./.:4:71,193:.: 0.20:1.000:. ./.:4:153,119:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,234:.: 1.06:1.000:. ./.:4:159,111:.: 0.31:0.985:. ./.:4:86,226:.: 1.09:1.000:. ./.:4:89,256:.: 1.71:1.000:. ./.:4:103,238:.: 1.63:1.000:. ./.:4:49,86:.:-2.19:1.000:. ./.:4:77,176:.: 0.00:1.000:. ./.:4:152,146:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,102:.:-1.89:1.000:. ./.:4:80,225:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.59:1.000:. ./.:4:84,229:.: 1.11:1.000:. ./.:4:149,119:.: 0.28:1.000:. ./.:4:70,211:.: 0.52:1.000:. ./.:4:87,195:.: 0.54:1.000:. ./.:4:81,179:.: 0.13:1.000:. ./.:4:37,100:.:-2.15:1.000:. ./.:4:51,113:.:-1.65:1.000:. ./.:3:24,62:.:-3.10:0.999:. ./.:4:165,158:.: 1.30:1.000:. ./.:4:171,129:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,259:.: 0.13:1.000:. ./.:4:67,223:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,209:.: 0.82:1.000:. ./.:4:72,208:.: 0.50:1.000:. ./.:4:59,224:.: 0.56:1.000:. ./.:4:79,231:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.07:1.000:. ./.:4:99,204:.: 0.93:0.986:. ./.:4:110,346:.: 3.77:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.85:1.000:. ./.:4:155,176:.: 1.45:1.000:. ./.:4:56,149:.:-0.89:1.000:. ./.:4:73,229:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,209:.:-0.82:1.000:. ./.:4:135,133:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,173:.:-0.52:1.000:. ./.:4:63,208:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,254:.: 0.04:1.000:. ./.:4:77,235:.: 1.09:1.000:. ./.:4:60,153:.:-0.74:1.000:. ./.:6:108,101:.:-0.82:1.000:. ./.:4:107,99:.:-0.87:1.000:. ./.:4:59,177:.:-0.32:1.000:. ./.:4:66,201:.: 0.26:1.000:. ./.:4:143,125:.: 0.28:1.000:. ./.:4:81,171:.:-0.02:1.000:. ./.:4:64,193:.: 0.07:1.000:. ./.:4:45,105:.:-1.91:1.000:. ./.:4:119,130:.:-0.08:1.000:. ./.:4:62,190:.:-0.02:0.966:. ./.:4:62,186:.:-0.09:1.000:. ./.:4:143,159:.: 0.91:1.000:. ./.:4:39,125:.:-1.65:0.999:. ./.:4:74,196:.: 0.31:1.000:. ./.:4:142,135:.: 0.44:1.000:. ./.:4:62,170:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,169:.:-0.39:1.000:. ./.:4:105,117:.:-0.58:1.000:. ./.:4:61,155:.:-0.69:1.000:. ./.:4:108,131:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.11:1.000:. ./.:4:40,151:.:-1.15:0.995:. ./.:4:62,201:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,182:.:-0.08:1.000:. ./.:4:68,183:.:-0.04:1.000:. ./.:4:168,127:.: 0.78:1.000:. ./.:4:58,202:.: 0.13:1.000:. ./.:4:40,108:.:-1.95:1.000:. ./.:4:90,104:.:-1.10:1.000:. ./.:4:58,159:.:-0.67:1.000:. ./.:4:115,115:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,185:.:-1.26:1.000:. ./.:4:63,182:.:-0.15:1.000:. ./.:4:131,119:.:-0.06:1.000:. ./.:4:113,104:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,170:.:-0.13:1.000:. ./.:4:86,103:.:-1.19:1.000:. ./.:4:102,102:.:-0.91:1.000:. ./.:4:126,126:.:-0.02:1.000:. ./.:4:130,130:.: 0.13:1.000:. ./.:4:93,82:.:-1.45:1.000:. ./.:4:121,124:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,153:.:-1.86:1.000:. ./.:5:173,97:.: 0.31:0.999:. ./.:4:106,96:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,221:.:-0.60:1.000:. ./.:4:48,160:.:-0.84:1.000:. ./.:4:159,124:.: 0.56:1.000:. ./.:4:183,143:.: 1.35:1.000:. ./.:4:74,174:.:-0.09:1.000:. ./.:4:155,123:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,296:.: 2.49:1.000:. ./.:4:56,151:.:-0.86:0.999:. ./.:4:95,141:.:-0.32:1.000:. ./.:4:49,164:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,123:.:-1.56:1.000:. ./.:4:51,148:.:-1.00:1.000:. ./.:4:116,114:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,193:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.15:1.000:. ./.:4:107,114:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,246:.:-0.13:1.000:. ./.:4:84,192:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.30:1.000:. ./.:4:130,155:.: 0.59:1.000:. ./.:4:55,175:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,197:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,93:.:-1.08:1.000:. ./.:4:92,95:.:-1.23:1.000:. ./.:4:63,145:.:-0.84:1.000:. ./.:4:74,171:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,100:.:-2.08:1.000:. ./.:4:59,209:.: 0.28:1.000:. ./.:4:133,126:.: 0.11:1.000:. ./.:4:110,252:.: 2.02:1.000:. ./.:4:164,145:.: 1.04:1.000:. ./.:4:50,114:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,179:.:-1.37:1.000:. ./.:4:57,134:.:-1.15:1.000:. ./.:4:55,184:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,117:.:-0.61:1.000:. ./.:4:142,129:.: 0.33:1.000:. ./.:4:97,78:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,336:.: 1.54:1.000:. ./.:4:91,247:.: 1.58:1.000:. ./.:4:159,172:.: 1.45:1.000:. ./.:4:202,70:.: 0.35:1.000:. ./.:4:82,218:.: 0.87:1.000:. ./.:4:50,159:.:-0.82:1.000:. ./.:4:152,154:.: 0.98:1.000:. ./.:4:131,143:.: 0.39:1.000:. ./.:4:20,119:.:-2.12:1.000:. ./.:4:64,151:.:-0.71:1.000:. ./.:4:67,209:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,290:.: 0.69:1.000:. ./.:4:78,232:.: 1.06:1.000:. ./.:4:56,179:.:-0.34:1.000:. ./.:4:95,211:.: 0.98:1.000:. ./.:4:70,211:.: 0.52:1.000:. ./.:4:169,54:.:-0.56:1.000:. ./.:4:76,179:.: 0.04:1.000:. ./.:4:131,134:.: 0.22:1.000:. ./.:4:63,203:.: 0.24:1.000:. ./.:4:158,150:.: 1.02:1.000:. ./.:4:130,111:.:-0.22:1.000:. ./.:4:86,201:.: 0.63:0.999:. ./.:4:0,283:.: 0.56:1.000:. ./.:4:70,182:.:-0.02:1.000:. ./.:4:146,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:57,193:.:-0.06:1.000:. ./.:4:76,181:.: 0.07:1.000:. ./.:4:74,181:.: 0.04:1.000:. ./.:4:133,79:.:-0.76:1.000:. ./.:4:52,168:.:-0.61:1.000:. ./.:4:102,247:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,308:.: 1.02:1.000:. ./.:4:162,122:.: 0.57:1.000:. ./.:4:61,201:.: 0.17:1.000:. ./.:4:77,220:.: 0.82:0.999:. ./.:4:191,165:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,322:.: 1.28:1.000:. ./.:4:66,180:.:-0.13:1.000:. ./.:4:79,212:.: 0.70:1.000:. -chr7.1 31722150 chr7.1_031722150 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:83,28:.: 0.02:1.000:. ./.:4:139,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:129,22:.: 1.10:1.000:. ./.:4:101,22:.: 0.35:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.73:1.000:. ./.:4:157,24:.: 1.91:1.000:. ./.:4:73,6:.:-0.84:1.000:. ./.:4:138,13:.: 1.10:1.000:. ./.:4:143,11:.: 1.18:1.000:. ./.:4:14,5:.:-2.46:1.000:. ./.:4:23,6:.:-2.19:1.000:. ./.:4:96,17:.: 0.08:1.000:. ./.:4:129,10:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,12:.: 1.16:1.000:. ./.:4:109,24:.: 0.62:1.000:. ./.:4:69,23:.:-0.49:1.000:. ./.:4:101,39:.: 0.81:0.971:. ./.:4:181,13:.: 2.26:1.000:. ./.:4:81,35:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,18:.: 2.18:1.000:. ./.:4:26,2:.:-2.22:1.000:. ./.:4:103,24:.: 0.46:1.000:. ./.:4:124,17:.: 0.83:1.000:. ./.:4:122,12:.: 0.64:1.000:. ./.:4:11,1:.:-2.65:1.000:. ./.:4:112,11:.: 0.35:1.000:. ./.:4:176,16:.: 2.21:1.000:. ./.:4:64,14:.:-0.87:1.000:. ./.:4:144,20:.: 1.45:1.000:. ./.:4:139,17:.: 1.24:1.000:. ./.:4:86,29:.: 0.13:1.000:. ./.:4:142,17:.: 1.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:20,18:.:-1.95:1.000:. ./.:3:3,1:.:-2.87:0.999:. ./.:4:77,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:127,15:.: 0.86:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.49:1.000:. ./.:4:105,19:.: 0.37:1.000:. ./.:4:107,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:63,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:61,22:.:-0.73:1.000:. ./.:4:107,18:.: 0.40:1.000:. ./.:4:90,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:77,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:90,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:79,38:.: 0.19:0.986:. ./.:4:24,3:.:-2.24:1.000:. ./.:4:87,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:31,21:.:-1.57:1.000:. ./.:4:46,20:.:-1.19:1.000:. ./.:4:79,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:117,23:.: 0.81:1.000:. ./.:4:120,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:95,20:.: 0.13:1.000:. ./.:4:62,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:124,18:.: 0.86:1.000:. ./.:4:47,20:.:-1.16:1.000:. ./.:6:50,29:.:-0.84:1.000:. ./.:4:83,39:.: 0.32:1.000:. ./.:4:142,24:.: 1.51:1.000:. ./.:4:73,28:.:-0.25:1.000:. ./.:4:70,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:135,30:.: 1.48:1.000:. ./.:4:76,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:71,14:.:-0.68:1.000:. ./.:4:110,28:.: 0.75:1.000:. ./.:4:73,41:.: 0.10:0.966:. ./.:4:114,13:.: 0.46:1.000:. ./.:4:115,24:.: 0.78:1.000:. ./.:4:49,5:.:-1.52:0.999:. ./.:4:146,13:.: 1.32:1.000:. ./.:4:70,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:109,15:.: 0.37:1.000:. ./.:4:108,10:.: 0.21:1.000:. ./.:4:69,28:.:-0.35:1.000:. ./.:4:107,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:108,28:.: 0.70:1.000:. ./.:4:51,26:.:-0.89:1.000:. ./.:4:96,8:.:-0.17:0.995:. ./.:4:100,17:.: 0.19:1.000:. ./.:4:72,27:.:-0.30:1.000:. ./.:4:122,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:50,19:.:-1.11:1.000:. ./.:4:87,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:39,19:.:-1.41:1.000:. ./.:4:65,18:.:-0.73:1.000:. ./.:4:87,29:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:56,27:.:-0.73:1.000:. ./.:4:53,12:.:-1.22:1.000:. ./.:4:90,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:65,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:89,20:.:-0.03:1.000:. ./.:4:103,29:.: 0.59:1.000:. ./.:4:99,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:85,11:.:-0.38:1.000:. ./.:4:83,32:.: 0.13:1.000:. ./.:4:83,15:.:-0.33:1.000:. ./.:4:53,25:.:-0.87:1.000:. ./.:4:45,21:.:-1.19:1.000:. ./.:4:61,12:.:-1.00:1.000:. ./.:5:97,37:.: 0.64:0.999:. ./.:4:54,25:.:-0.84:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.92:1.000:. ./.:4:48,18:.:-1.19:1.000:. ./.:4:90,22:.: 0.05:1.000:. ./.:4:147,13:.: 1.35:1.000:. ./.:4:72,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:88,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:100,22:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,28:.:-0.87:0.999:. ./.:4:142,30:.: 1.67:1.000:. ./.:4:64,19:.:-0.73:1.000:. ./.:4:104,15:.: 0.24:1.000:. ./.:4:86,11:.:-0.35:1.000:. ./.:4:90,15:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:102,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:61,18:.:-0.84:1.000:. ./.:4:97,18:.: 0.13:1.000:. ./.:4:97,27:.: 0.37:1.000:. ./.:4:198,16:.: 2.80:1.000:. ./.:4:84,13:.:-0.35:1.000:. ./.:4:102,26:.: 0.48:1.000:. ./.:4:34,23:.:-1.43:1.000:. ./.:4:106,11:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:38,20:.:-1.41:1.000:. ./.:4:72,22:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,12:.: 0.13:1.000:. ./.:4:41,17:.:-1.41:1.000:. ./.:4:84,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:129,24:.: 1.16:1.000:. ./.:4:75,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:99,39:.: 0.75:1.000:. ./.:4:93,13:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,19:.:-0.14:1.000:. ./.:4:46,22:.:-1.14:1.000:. ./.:4:61,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:92,18:.: 0.00:1.000:. ./.:4:83,25:.:-0.06:1.000:. ./.:4:61,24:.:-0.68:1.000:. ./.:4:111,19:.: 0.54:1.000:. ./.:4:84,22:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,9:.: 1.40:1.000:. ./.:4:126,18:.: 0.91:1.000:. ./.:4:133,16:.: 1.05:1.000:. ./.:4:102,15:.: 0.19:1.000:. ./.:4:108,27:.: 0.67:1.000:. ./.:4:115,18:.: 0.62:1.000:. ./.:4:17,5:.:-2.38:1.000:. ./.:4:115,31:.: 0.97:1.000:. ./.:4:126,23:.: 1.05:1.000:. ./.:4:124,10:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,19:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.79:1.000:. ./.:4:162,19:.: 1.91:1.000:. ./.:4:140,12:.: 1.13:1.000:. ./.:4:87,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:123,20:.: 0.89:1.000:. ./.:4:109,15:.: 0.37:1.000:. ./.:4:76,29:.:-0.14:1.000:. ./.:4:81,29:.: 0.00:1.000:. ./.:4:132,15:.: 1.00:1.000:. ./.:4:71,15:.:-0.65:1.000:. ./.:4:127,13:.: 0.81:0.999:. ./.:4:90,11:.:-0.25:1.000:. ./.:4:88,23:.: 0.02:1.000:. ./.:4:76,21:.:-0.35:1.000:. ./.:4:64,11:.:-0.95:1.000:. ./.:4:90,13:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,29:.:-0.98:1.000:. ./.:4:65,31:.:-0.38:1.000:. ./.:4:97,17:.: 0.10:1.000:. ./.:4:145,22:.: 1.54:1.000:. ./.:4:98,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:94,18:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,13:.: 0.24:1.000:. ./.:4:85,17:.:-0.22:0.999:. ./.:4:166,28:.: 2.26:1.000:. ./.:4:85,21:.:-0.11:1.000:. ./.:4:94,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,16:.: 2.18:1.000:. -chr7.1 32183304 chr7.1_032183304 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:49,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:1,0:.:-1.62:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:0.986:. ./.:4:16,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:6:3,0:.:-1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:0.995:. ./.:4:25,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:5:22,0:.:-0.38:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.15:0.999:. ./.:4:42,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.50:0.999:. ./.:4:52,0:.: 1.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:76,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:63,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.73:1.000:. -chr7.1 32293677 chr7.1_032293677 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:81,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.81:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:101,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.10:0.971:. ./.:4:85,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:108,0:.: 2.73:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.81:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.21:0.999:. ./.:4:52,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.70:0.966:. ./.:4:45,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.10:1.000:. ./.:6:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.06:0.966:. ./.:4:46,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.57:0.999:. ./.:4:45,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.43:0.995:. ./.:4:50,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.58:1.000:. ./.:5:46,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:42,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:111,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:80,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:51,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. -chr7.1 32426368 chr7.1_032426368 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:129,7:.: 0.32:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:111,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:131,7:.: 0.38:1.000:. ./.:4:156,11:.: 1.18:1.000:. ./.:4:51,3:.:-1.97:1.000:. ./.:4:142,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:18,2:.:-2.92:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:99,8:.:-0.49:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:148,8:.: 0.88:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.74:0.971:. ./.:4:189,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:169,11:.: 1.55:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:23,1:.:-2.81:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:134,12:.: 0.60:1.000:. ./.:4:99,7:.:-0.52:1.000:. ./.:4:21,4:.:-2.78:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:129,7:.: 0.32:1.000:. ./.:4:121,5:.: 0.04:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:111,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:126,6:.: 0.21:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:6,1:.:-3.28:0.999:. ./.:4:132,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:124,3:.: 0.07:1.000:. ./.:4:108,3:.:-0.38:1.000:. ./.:4:137,4:.: 0.46:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:99,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:110,6:.:-0.24:1.000:. ./.:4:122,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:106,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:88,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:134,8:.: 0.49:0.966:. ./.:4:187,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:92,8:.:-0.69:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:98,6:.:-0.57:1.000:. ./.:4:137,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:76,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:93,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:114,7:.:-0.10:1.000:. ./.:4:100,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:99,4:.:-0.60:1.000:. ./.:6:116,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:90,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:115,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.10:0.966:. ./.:4:127,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:122,5:.: 0.07:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:165,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:144,11:.: 0.85:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:128,8:.: 0.32:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.35:0.995:. ./.:4:169,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:106,6:.:-0.35:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:107,15:.:-0.07:1.000:. ./.:4:127,5:.: 0.21:1.000:. ./.:4:77,4:.:-1.22:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:76,2:.:-1.30:1.000:. ./.:4:80,7:.:-1.05:1.000:. ./.:4:114,12:.: 0.04:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:117,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,9:.:-0.69:1.000:. ./.:4:58,2:.:-1.80:1.000:. ./.:5:172,0:.: 1.32:0.999:. ./.:4:113,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:114,6:.:-0.13:1.000:. ./.:4:86,5:.:-0.94:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:148,7:.: 0.85:1.000:. ./.:4:110,11:.:-0.10:0.999:. ./.:4:146,8:.: 0.82:1.000:. ./.:4:67,3:.:-1.52:1.000:. ./.:4:114,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:118,8:.: 0.04:1.000:. ./.:4:88,7:.:-0.82:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:102,4:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:134,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:97,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:102,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:88,7:.:-0.82:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:60,4:.:-1.69:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,9:.:-0.35:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:102,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:143,13:.: 0.88:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:89,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:65,6:.:-1.49:1.000:. ./.:4:99,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:157,14:.: 1.30:1.000:. ./.:4:149,10:.: 0.96:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:150,7:.: 0.91:1.000:. ./.:4:109,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:121,5:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,2:.:-2.58:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:143,11:.: 0.82:1.000:. ./.:4:126,7:.: 0.24:1.000:. ./.:4:160,5:.: 1.13:1.000:. ./.:4:111,7:.:-0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:115,12:.: 0.07:1.000:. ./.:4:116,6:.:-0.07:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:120,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:138,11:.: 0.68:1.000:. ./.:4:107,7:.:-0.29:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:98,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.88:0.999:. ./.:4:115,8:.:-0.04:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:78,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:82,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:95,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:76,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:132,13:.: 0.57:1.000:. ./.:4:123,8:.: 0.18:1.000:. ./.:4:127,10:.: 0.35:1.000:. ./.:4:115,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:119,9:.: 0.10:0.999:. ./.:4:141,10:.: 0.74:1.000:. ./.:4:153,6:.: 0.96:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.71:1.000:. -chr7.1 32679931 chr7.1_032679931 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:46,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.57:0.971:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.23:0.966:. ./.:4:9,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:53,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.00:0.966:. ./.:4:53,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.81:0.999:. ./.:4:64,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.16:0.995:. ./.:4:60,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.00:1.000:. ./.:5:89,0:.: 1.62:0.999:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:62,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.28:0.999:. ./.:4:84,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.97:1.000:. -chr7.1 33217416 chr7.1_033217416 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,12:.: 2.64:0.971:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,13:.: 3.03:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.: 3.42:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:0.966:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:6:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,6:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:0.966:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:0.999:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,11:.: 2.26:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:0.995:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,14:.: 3.42:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:5:0,5:.:-0.07:0.999:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:0.999:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,8:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,9:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:0.999:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,10:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.46:0.999:. ./.:4:0,10:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,7:.: 0.70:1.000:. -chr7.1 33473416 chr7.1_033473416 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:46,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 3.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.14:0.971:. ./.:4:49,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:71,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.26:1.000:. ./.:3:15,0:.:-1.08:0.999:. ./.:4:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.69:0.966:. ./.:4:35,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:6:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.09:0.966:. ./.:4:36,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:0.995:. ./.:4:41,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:5:25,0:.:-0.46:0.999:. ./.:4:28,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.22:0.999:. ./.:4:40,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:52,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.44:0.999:. ./.:4:27,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.83:1.000:. -chr7.1 33672204 chr7.1_033672204 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:65,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:46,4:.:-1.10:1.000:. ./.:4:85,4:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:106,2:.: 1.08:1.000:. ./.:4:92,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:86,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,12:.:-1.44:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,5:.:-1.51:1.000:. ./.:4:66,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:51,3:.:-0.95:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.63:0.971:. ./.:4:115,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:139,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:51,10:.:-0.69:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,6:.:-1.10:1.000:. ./.:4:77,2:.:-0.01:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:26,3:.:-1.89:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.36:1.000:. ./.:3:11,11:.:-2.15:0.999:. ./.:4:23,3:.:-2.00:1.000:. ./.:4:60,5:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:71,4:.:-0.16:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,15:.: 0.85:1.000:. ./.:4:73,7:.: 0.03:1.000:. ./.:4:85,17:.: 0.85:1.000:. ./.:4:101,7:.: 1.08:1.000:. ./.:4:89,1:.: 0.40:0.966:. ./.:4:41,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:91,8:.: 0.74:1.000:. ./.:4:32,9:.:-1.44:1.000:. ./.:4:66,23:.: 0.37:1.000:. ./.:4:77,9:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.76:1.000:. ./.:4:118,17:.: 2.09:1.000:. ./.:4:114,6:.: 1.53:1.000:. ./.:4:49,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:69,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:82,8:.: 0.40:1.000:. ./.:6:68,16:.: 0.18:1.000:. ./.:4:72,8:.: 0.03:1.000:. ./.:4:56,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.82:0.966:. ./.:4:78,5:.: 0.14:1.000:. ./.:4:75,20:.: 0.59:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.40:0.999:. ./.:4:61,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:37,7:.:-1.32:1.000:. ./.:4:72,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.80:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:80,11:.: 0.44:1.000:. ./.:4:58,4:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,8:.:-0.80:0.995:. ./.:4:123,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:70,25:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:43,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:71,23:.: 0.55:1.000:. ./.:4:56,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:46,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:45,4:.:-1.14:1.000:. ./.:4:51,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:66,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:73,14:.: 0.29:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:50,14:.:-0.57:1.000:. ./.:4:79,22:.: 0.82:1.000:. ./.:4:91,4:.: 0.59:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:48,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:74,9:.: 0.14:1.000:. ./.:5:149,9:.: 2.95:0.999:. ./.:4:97,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:61,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:47,8:.:-0.91:1.000:. ./.:4:112,3:.: 1.34:1.000:. ./.:4:126,3:.: 1.87:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:71,25:.: 0.63:0.999:. ./.:4:89,8:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,5:.:-1.21:1.000:. ./.:4:66,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:58,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:78,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:92,18:.: 1.15:1.000:. ./.:4:79,10:.: 0.37:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:121,13:.: 2.05:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:69,10:.:-0.01:1.000:. ./.:4:62,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:67,16:.: 0.14:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:113,5:.: 1.45:1.000:. ./.:4:37,12:.:-1.14:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:68,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:56,5:.:-0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:72,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:48,12:.:-0.72:1.000:. ./.:4:40,15:.:-0.91:1.000:. ./.:4:69,22:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,2:.: 0.78:1.000:. ./.:4:42,6:.:-1.17:1.000:. ./.:4:85,5:.: 0.40:1.000:. ./.:4:121,3:.: 1.68:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:108,2:.: 1.15:1.000:. ./.:4:67,2:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,3:.:-0.35:1.000:. ./.:4:79,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:27,23:.:-1.10:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:104,2:.: 1.00:1.000:. ./.:4:96,3:.: 0.74:1.000:. ./.:4:72,8:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,4:.:-1.51:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:62,5:.:-0.46:1.000:. ./.:4:61,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:42,3:.:-1.29:1.000:. ./.:4:12,3:.:-2.41:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,4:.:-0.99:1.000:. ./.:4:69,3:.:-0.27:0.999:. ./.:4:99,3:.: 0.85:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:44,6:.:-1.10:1.000:. ./.:4:37,2:.:-1.51:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:57,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:41,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:94,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:19,3:.:-2.15:1.000:. ./.:4:63,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:60,1:.:-0.69:0.999:. ./.:4:61,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:91,5:.: 0.63:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.20:1.000:. -chr7.1 34132832 chr7.1_034132832 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:972,102:.: 0.43:1.000:. ./.:4:832,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:726,181:.:-0.44:1.000:. ./.:4:862,197:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1156,114:.: 1.44:1.000:. ./.:4:938,228:.: 0.91:1.000:. ./.:4:678,179:.:-0.69:1.000:. ./.:4:800,210:.: 0.10:1.000:. ./.:4:895,105:.: 0.05:1.000:. ./.:4:397,90:.:-2.61:1.000:. ./.:4:397,91:.:-2.60:1.000:. ./.:4:1015,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:833,104:.:-0.28:1.000:. ./.:4:893,224:.: 0.65:1.000:. ./.:4:791,91:.:-0.56:1.000:. ./.:4:985,95:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1056,113:.: 0.92:0.971:. ./.:4:768,185:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1139,286:.: 2.25:1.000:. ./.:4:979,244:.: 1.20:1.000:. ./.:4:398,87:.:-2.62:1.000:. ./.:4:871,111:.:-0.05:1.000:. ./.:4:930,227:.: 0.86:1.000:. ./.:4:732,168:.:-0.47:1.000:. ./.:4:328,33:.:-3.26:1.000:. ./.:4:1066,107:.: 0.94:1.000:. ./.:4:727,188:.:-0.39:1.000:. ./.:4:738,168:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1270,134:.: 2.14:1.000:. ./.:4:841,216:.: 0.34:1.000:. ./.:4:839,199:.: 0.24:1.000:. ./.:4:709,75:.:-1.07:1.000:. ./.:4:312,22:.:-3.40:1.000:. ./.:4:578,41:.:-1.93:1.000:. ./.:3:271,37:.:-3.54:0.999:. ./.:4:803,187:.:-0.01:1.000:. ./.:4:965,106:.: 0.41:1.000:. ./.:4:782,199:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1154,105:.: 1.39:1.000:. ./.:4:985,115:.: 0.56:1.000:. ./.:4:801,182:.:-0.04:1.000:. ./.:4:795,186:.:-0.05:1.000:. ./.:4:964,202:.: 0.91:1.000:. ./.:4:750,193:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1005,239:.: 1.31:1.000:. ./.:4:830,216:.: 0.28:1.000:. ./.:4:939,240:.: 0.97:0.966:. ./.:4:645,113:.:-1.21:1.000:. ./.:4:750,182:.:-0.31:1.000:. ./.:4:864,177:.: 0.26:1.000:. ./.:4:764,172:.:-0.29:1.000:. ./.:4:901,227:.: 0.71:1.000:. ./.:4:717,189:.:-0.44:1.000:. ./.:4:809,222:.: 0.21:1.000:. ./.:4:668,165:.:-0.82:1.000:. ./.:4:830,195:.: 0.18:1.000:. ./.:4:678,162:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1134,118:.: 1.35:1.000:. ./.:4:892,96:.:-0.02:1.000:. ./.:6:678,151:.:-0.84:1.000:. ./.:4:845,210:.: 0.33:1.000:. ./.:4:645,161:.:-0.96:1.000:. ./.:4:1017,245:.: 1.40:1.000:. ./.:4:927,213:.: 0.77:1.000:. ./.:4:945,227:.: 0.94:1.000:. ./.:4:961,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1011,97:.: 0.60:1.000:. ./.:4:863,98:.:-0.16:1.000:. ./.:4:965,221:.: 1.01:0.966:. ./.:4:934,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:956,248:.: 1.10:1.000:. ./.:4:923,231:.: 0.84:0.999:. ./.:4:1361,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:743,200:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1097,3:.: 0.56:1.000:. ./.:4:820,86:.:-0.44:1.000:. ./.:4:756,179:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1010,121:.: 0.72:1.000:. ./.:4:889,184:.: 0.42:1.000:. ./.:4:875,230:.: 0.59:1.000:. ./.:4:894,0:.:-0.50:0.995:. ./.:4:940,215:.: 0.85:1.000:. ./.:4:997,246:.: 1.30:1.000:. ./.:4:799,95:.:-0.50:1.000:. ./.:4:860,204:.: 0.38:1.000:. ./.:4:953,242:.: 1.06:1.000:. ./.:4:702,69:.:-1.14:1.000:. ./.:4:722,140:.:-0.67:1.000:. ./.:4:727,188:.:-0.39:1.000:. ./.:4:661,180:.:-0.78:1.000:. ./.:4:757,190:.:-0.23:1.000:. ./.:4:891,97:.:-0.02:1.000:. ./.:4:833,197:.: 0.20:1.000:. ./.:4:612,163:.:-1.12:1.000:. ./.:4:870,207:.: 0.44:1.000:. ./.:4:878,226:.: 0.58:1.000:. ./.:4:817,91:.:-0.43:1.000:. ./.:4:963,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:921,212:.: 0.73:1.000:. ./.:4:905,206:.: 0.62:1.000:. ./.:4:967,103:.: 0.41:1.000:. ./.:4:852,217:.: 0.40:1.000:. ./.:4:684,159:.:-0.77:1.000:. ./.:5:1197,220:.: 2.20:0.999:. ./.:4:857,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:790,191:.:-0.05:1.000:. ./.:4:698,168:.:-0.65:1.000:. ./.:4:721,193:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1057,258:.: 1.68:1.000:. ./.:4:691,176:.:-0.64:1.000:. ./.:4:946,95:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1254,132:.: 2.04:1.000:. ./.:4:783,200:.:-0.04:0.999:. ./.:4:1024,324:.: 1.85:1.000:. ./.:4:586,133:.:-1.41:1.000:. ./.:4:962,208:.: 0.93:1.000:. ./.:4:971,86:.: 0.34:1.000:. ./.:4:839,195:.: 0.22:1.000:. ./.:4:846,221:.: 0.39:1.000:. ./.:4:702,164:.:-0.65:1.000:. ./.:4:815,186:.: 0.05:1.000:. ./.:4:973,112:.: 0.49:1.000:. ./.:4:950,226:.: 0.96:1.000:. ./.:4:877,103:.:-0.06:1.000:. ./.:4:807,162:.:-0.11:1.000:. ./.:4:865,216:.: 0.47:1.000:. ./.:4:830,212:.: 0.26:1.000:. ./.:4:980,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:705,60:.:-1.17:1.000:. ./.:4:606,142:.:-1.26:1.000:. ./.:4:905,101:.: 0.08:1.000:. ./.:4:829,89:.:-0.38:1.000:. ./.:4:498,113:.:-1.97:1.000:. ./.:4:926,103:.: 0.20:1.000:. ./.:4:817,69:.:-0.54:1.000:. ./.:4:984,255:.: 1.28:1.000:. ./.:4:818,191:.: 0.09:1.000:. ./.:4:901,92:.: 0.01:1.000:. ./.:4:725,185:.:-0.42:1.000:. ./.:4:890,75:.:-0.14:1.000:. ./.:4:876,216:.: 0.52:1.000:. ./.:4:822,200:.: 0.16:1.000:. ./.:4:948,103:.: 0.31:1.000:. ./.:4:630,149:.:-1.10:1.000:. ./.:4:1016,234:.: 1.34:1.000:. ./.:4:1093,242:.: 1.78:1.000:. ./.:4:1027,86:.: 0.63:1.000:. ./.:4:800,102:.:-0.46:1.000:. ./.:4:917,223:.: 0.77:1.000:. ./.:4:777,86:.:-0.66:1.000:. ./.:4:922,263:.: 1.00:1.000:. ./.:4:714,194:.:-0.43:1.000:. ./.:4:408,65:.:-2.68:1.000:. ./.:4:549,168:.:-1.42:1.000:. ./.:4:798,177:.:-0.08:1.000:. ./.:4:816,208:.: 0.17:1.000:. ./.:4:948,224:.: 0.94:1.000:. ./.:4:868,234:.: 0.57:1.000:. ./.:4:657,170:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1036,103:.: 0.77:1.000:. ./.:4:827,89:.:-0.39:1.000:. ./.:4:718,67:.:-1.07:1.000:. ./.:4:668,182:.:-0.73:1.000:. ./.:4:797,189:.:-0.03:1.000:. ./.:4:718,185:.:-0.46:1.000:. ./.:4:866,116:.:-0.05:1.000:. ./.:4:712,164:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1048,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:760,202:.:-0.15:1.000:. ./.:4:681,180:.:-0.67:1.000:. ./.:4:666,144:.:-0.94:1.000:. ./.:4:562,115:.:-1.63:1.000:. ./.:4:760,178:.:-0.28:1.000:. ./.:4:660,151:.:-0.93:1.000:. ./.:4:766,85:.:-0.73:1.000:. ./.:4:580,151:.:-1.35:1.000:. ./.:4:1116,114:.: 1.24:1.000:. ./.:4:903,224:.: 0.70:1.000:. ./.:4:780,217:.: 0.03:1.000:. ./.:4:725,135:.:-0.68:1.000:. ./.:4:782,233:.: 0.12:0.999:. ./.:4:997,235:.: 1.25:1.000:. ./.:4:982,242:.: 1.21:1.000:. ./.:4:699,176:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1109,2:.: 0.62:1.000:. -chr7.1 34521381 chr7.1_034521381 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,357:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,624:.: 1.35:1.000:. ./.:4:182,343:.: 0.41:1.000:. ./.:4:180,279:.:-0.02:1.000:. ./.:4:59,455:.: 0.34:1.000:. ./.:4:104,337:.:-0.13:1.000:. ./.:4:28,128:.:-1.98:1.000:. ./.:4:105,307:.:-0.32:1.000:. ./.:4:90,277:.:-0.61:1.000:. ./.:4:1,140:.:-2.08:1.000:. ./.:4:26,77:.:-2.32:1.000:. ./.:4:70,579:.: 1.21:1.000:. ./.:4:188,419:.: 0.94:1.000:. ./.:4:141,487:.: 1.08:1.000:. ./.:4:134,407:.: 0.51:1.000:. ./.:4:112,534:.: 1.19:1.000:. ./.:4:173,625:.: 2.18:0.971:. ./.:4:158,744:.: 2.85:1.000:. ./.:4:177,371:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,369:.:-0.26:1.000:. ./.:4:49,79:.:-2.16:1.000:. ./.:4:105,339:.:-0.12:1.000:. ./.:4:157,377:.: 0.47:1.000:. ./.:4:36,212:.:-1.38:1.000:. ./.:4:21,92:.:-2.26:1.000:. ./.:4:141,543:.: 1.44:1.000:. ./.:4:121,449:.: 0.70:1.000:. ./.:4:4,292:.:-1.07:1.000:. ./.:4:60,515:.: 0.73:1.000:. ./.:4:117,385:.: 0.26:1.000:. ./.:4:159,431:.: 0.83:1.000:. ./.:4:80,359:.:-0.15:1.000:. ./.:4:23,52:.:-2.50:1.000:. ./.:4:36,140:.:-1.85:1.000:. ./.:3:25,53:.:-2.48:1.000:. ./.:4:141,375:.: 0.35:1.000:. ./.:4:61,415:.: 0.09:1.000:. ./.:4:101,476:.: 0.75:1.000:. ./.:4:63,615:.: 1.40:1.000:. ./.:4:167,332:.: 0.24:1.000:. ./.:4:153,345:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,296:.:-0.64:1.000:. ./.:4:111,446:.: 0.62:1.000:. ./.:4:98,35:.:-2.13:1.000:. ./.:4:112,153:.:-1.27:1.000:. ./.:4:146,496:.: 1.17:1.000:. ./.:4:124,301:.:-0.24:0.966:. ./.:4:46,109:.:-1.99:1.000:. ./.:4:62,199:.:-1.30:1.000:. ./.:4:154,360:.: 0.34:1.000:. ./.:4:78,316:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,450:.: 0.56:1.000:. ./.:4:97,439:.: 0.48:1.000:. ./.:4:120,424:.: 0.53:1.000:. ./.:4:58,350:.:-0.35:1.000:. ./.:4:107,333:.:-0.14:1.000:. ./.:4:167,438:.: 0.93:1.000:. ./.:4:100,165:.:-1.27:1.000:. ./.:4:56,307:.:-0.64:1.000:. ./.:6:116,215:.:-0.85:1.000:. ./.:4:120,206:.:-0.88:1.000:. ./.:4:147,201:.:-0.74:1.000:. ./.:4:60,244:.:-1.02:1.000:. ./.:4:166,410:.: 0.74:1.000:. ./.:4:138,255:.:-0.45:1.000:. ./.:4:136,422:.: 0.62:1.000:. ./.:4:119,183:.:-1.03:1.000:. ./.:4:95,450:.: 0.54:1.000:. ./.:4:189,377:.: 0.67:0.966:. ./.:4:28,415:.:-0.12:1.000:. ./.:4:177,533:.: 1.61:1.000:. ./.:4:51,262:.:-0.96:0.999:. ./.:4:62,673:.: 1.77:1.000:. ./.:4:52,178:.:-1.50:1.000:. ./.:4:197,508:.: 1.57:1.000:. ./.:4:100,242:.:-0.78:1.000:. ./.:4:177,360:.: 0.49:1.000:. ./.:4:174,489:.: 1.30:1.000:. ./.:4:165,352:.: 0.36:1.000:. ./.:4:185,561:.: 1.84:1.000:. ./.:4:123,693:.: 2.29:0.988:. ./.:4:44,379:.:-0.25:1.000:. ./.:4:50,449:.: 0.24:1.000:. ./.:4:160,170:.:-0.85:1.000:. ./.:4:161,314:.: 0.09:1.000:. ./.:4:135,378:.: 0.33:1.000:. ./.:4:95,391:.: 0.16:1.000:. ./.:4:127,376:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,386:.:-0.25:1.000:. ./.:4:145,297:.:-0.13:1.000:. ./.:4:195,229:.:-0.25:1.000:. ./.:4:165,422:.: 0.81:1.000:. ./.:4:111,336:.:-0.10:1.000:. ./.:4:127,299:.:-0.23:1.000:. ./.:4:149,464:.: 0.98:1.000:. ./.:4:67,396:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,500:.: 0.25:1.000:. ./.:4:28,605:.: 1.11:1.000:. ./.:4:165,468:.: 1.11:1.000:. ./.:4:37,306:.:-0.77:1.000:. ./.:4:28,257:.:-1.14:1.000:. ./.:4:65,358:.:-0.25:1.000:. ./.:4:101,382:.: 0.14:1.000:. ./.:5:44,217:.:-1.30:0.999:. ./.:4:86,339:.:-0.24:1.000:. ./.:4:65,372:.:-0.16:1.000:. ./.:4:122,383:.: 0.28:1.000:. ./.:4:162,467:.: 1.08:1.000:. ./.:4:172,504:.: 1.39:1.000:. ./.:4:91,429:.: 0.38:1.000:. ./.:4:60,355:.:-0.30:1.000:. ./.:4:131,566:.: 1.52:1.000:. ./.:4:107,522:.: 1.08:0.999:. ./.:4:193,243:.:-0.17:1.000:. ./.:4:123,478:.: 0.90:1.000:. ./.:4:113,370:.: 0.14:1.000:. ./.:4:40,121:.:-1.95:1.000:. ./.:4:108,345:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,197:.:-1.06:1.000:. ./.:4:45,174:.:-1.57:1.000:. ./.:4:53,363:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,298:.:-0.81:1.000:. ./.:4:189,405:.: 0.86:1.000:. ./.:4:130,343:.: 0.07:1.000:. ./.:4:89,232:.:-0.91:1.000:. ./.:4:106,518:.: 1.05:1.000:. ./.:4:136,363:.: 0.24:1.000:. ./.:4:44,449:.: 0.20:1.000:. ./.:4:75,106:.:-1.82:1.000:. ./.:4:111,392:.: 0.27:1.000:. ./.:4:107,363:.: 0.05:1.000:. ./.:4:169,430:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,249:.:-0.74:1.000:. ./.:4:64,147:.:-1.62:1.000:. ./.:4:91,359:.:-0.08:1.000:. ./.:4:54,675:.: 1.73:1.000:. ./.:4:108,339:.:-0.10:1.000:. ./.:4:178,262:.:-0.14:1.000:. ./.:4:90,292:.:-0.52:1.000:. ./.:4:162,280:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1,319:.:-0.92:1.000:. ./.:4:39,364:.:-0.38:1.000:. ./.:4:95,406:.: 0.25:1.000:. ./.:4:123,292:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,260:.:-0.89:1.000:. ./.:4:185,319:.: 0.27:1.000:. ./.:4:97,280:.:-0.55:1.000:. ./.:4:136,351:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,323:.:-0.59:1.000:. ./.:4:53,489:.: 0.52:1.000:. ./.:4:120,423:.: 0.53:1.000:. ./.:4:141,450:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1,78:.:-2.48:1.000:. ./.:4:77,260:.:-0.81:1.000:. ./.:4:113,475:.: 0.82:1.000:. ./.:4:144,430:.: 0.73:1.000:. ./.:4:53,432:.: 0.15:1.000:. ./.:4:156,236:.:-0.45:1.000:. ./.:4:87,231:.:-0.93:1.000:. ./.:4:57,332:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,446:.: 1.16:1.000:. ./.:4:84,188:.:-1.23:1.000:. ./.:4:97,516:.: 0.98:1.000:. ./.:4:130,571:.: 1.55:1.000:. ./.:4:122,318:.:-0.14:1.000:. ./.:4:98,368:.: 0.03:1.000:. ./.:4:45,357:.:-0.39:1.000:. ./.:4:147,485:.: 1.10:0.999:. ./.:4:94,448:.: 0.52:1.000:. ./.:4:93,381:.: 0.08:1.000:. ./.:4:123,342:.: 0.02:1.000:. ./.:4:143,331:.: 0.08:1.000:. ./.:4:90,422:.: 0.32:1.000:. ./.:4:168,441:.: 0.95:1.000:. ./.:4:139,358:.: 0.23:1.000:. ./.:4:100,274:.:-0.57:1.000:. ./.:4:153,359:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,587:.: 1.13:1.000:. ./.:4:62,385:.:-0.10:1.000:. ./.:4:94,442:.: 0.48:1.000:. ./.:4:55,302:.:-0.68:0.999:. ./.:4:205,382:.: 0.81:1.000:. ./.:4:111,444:.: 0.60:1.000:. ./.:4:93,237:.:-0.85:1.000:. ./.:4:102,562:.: 1.31:1.000:. -chr7.1 35061499 chr7.1_035061499 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:294,54:.: 0.52:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:324,47:.: 0.80:1.000:. ./.:4:284,53:.: 0.39:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:168,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:321,59:.: 0.90:1.000:. ./.:4:99,25:.:-2.13:1.000:. ./.:4:76,17:.:-2.50:1.000:. ./.:4:264,108:.: 0.81:1.000:. ./.:4:258,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:226,62:.:-0.19:1.000:. ./.:4:263,69:.: 0.33:1.000:. ./.:4:267,81:.: 0.52:0.971:. ./.:4:264,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:348,69:.: 1.34:1.000:. ./.:4:377,55:.: 1.52:1.000:. ./.:4:72,4:.:-2.70:1.000:. ./.:4:238,53:.:-0.15:1.000:. ./.:4:334,50:.: 0.95:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:44,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:231,71:.:-0.02:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:360,54:.: 1.31:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:360,52:.: 1.28:1.000:. ./.:4:410,72:.: 2.11:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:49,8:.:-2.93:1.000:. ./.:4:101,21:.:-2.16:1.000:. ./.:3:48,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:309,59:.: 0.76:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:338,45:.: 0.94:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:351,65:.: 1.33:1.000:. ./.:4:276,61:.: 0.39:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:284,48:.: 0.33:1.000:. ./.:4:355,61:.: 1.33:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:292,57:.: 0.53:0.966:. ./.:4:103,20:.:-2.15:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:238,45:.:-0.25:1.000:. ./.:4:276,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:218,46:.:-0.47:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:289,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:293,60:.: 0.58:1.000:. ./.:4:258,58:.: 0.14:1.000:. ./.:6:249,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:296,59:.: 0.61:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:305,61:.: 0.74:1.000:. ./.:4:256,48:.: 0.00:1.000:. ./.:4:305,65:.: 0.78:1.000:. ./.:4:280,62:.: 0.45:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:230,56:.:-0.21:0.966:. ./.:4:254,44:.:-0.07:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:120,32:.:-1.80:0.999:. ./.:4:302,78:.: 0.90:1.000:. ./.:4:373,65:.: 1.59:1.000:. ./.:4:231,47:.:-0.31:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:251,53:.: 0.00:1.000:. ./.:4:335,59:.: 1.07:1.000:. ./.:4:218,36:.:-0.59:0.988:. ./.:4:215,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:205,32:.:-0.79:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:186,43:.:-0.89:1.000:. ./.:4:264,36:.:-0.05:1.000:. ./.:4:219,46:.:-0.46:1.000:. ./.:4:304,50:.: 0.59:1.000:. ./.:4:218,46:.:-0.47:1.000:. ./.:4:175,49:.:-0.95:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:235,40:.:-0.34:1.000:. ./.:4:310,56:.: 0.74:1.000:. ./.:4:259,64:.: 0.23:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:104,24:.:-2.09:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:180,0:.:-1.47:1.000:. ./.:5:295,0:.:-0.11:0.999:. ./.:4:166,39:.:-1.17:1.000:. ./.:4:272,63:.: 0.37:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:276,43:.: 0.18:1.000:. ./.:4:185,41:.:-0.92:1.000:. ./.:4:331,73:.: 1.19:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:307,66:.: 0.82:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:363,50:.: 1.29:1.000:. ./.:4:164,46:.:-1.11:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:332,52:.: 0.95:1.000:. ./.:4:167,1:.:-1.61:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:317,71:.: 1.00:1.000:. ./.:4:293,46:.: 0.42:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:211,37:.:-0.66:1.000:. ./.:4:156,40:.:-1.28:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:216,40:.:-0.57:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:449,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:306,63:.: 0.77:1.000:. ./.:4:204,47:.:-0.63:1.000:. ./.:4:232,48:.:-0.28:1.000:. ./.:4:214,50:.:-0.47:1.000:. ./.:4:306,41:.: 0.51:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:190,40:.:-0.88:1.000:. ./.:4:331,64:.: 1.08:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:270,68:.: 0.40:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:259,62:.: 0.20:1.000:. ./.:4:386,67:.: 1.77:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:76,8:.:-2.61:1.000:. ./.:4:209,34:.:-0.72:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:385,71:.: 1.80:1.000:. ./.:4:374,61:.: 1.55:1.000:. ./.:4:262,55:.: 0.15:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:226,50:.:-0.33:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:305,59:.: 0.71:1.000:. ./.:4:394,47:.: 1.63:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:283,56:.: 0.42:0.999:. ./.:4:306,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:243,52:.:-0.11:1.000:. ./.:4:286,58:.: 0.48:1.000:. ./.:4:208,42:.:-0.64:1.000:. ./.:4:232,54:.:-0.21:1.000:. ./.:4:232,45:.:-0.32:1.000:. ./.:4:193,48:.:-0.75:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:351,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:349,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:286,65:.: 0.56:1.000:. ./.:4:278,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.10:0.999:. ./.:4:451,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:387,58:.: 1.67:1.000:. ./.:4:227,48:.:-0.34:1.000:. ./.:4:257,59:.: 0.14:1.000:. -chr7.1 35758408 chr7.1_035758408 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:160,59:.:-0.54:1.000:. ./.:4:165,109:.: 0.16:1.000:. ./.:4:258,55:.: 0.65:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:205,68:.: 0.15:1.000:. ./.:4:349,89:.: 2.23:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:164,58:.:-0.50:1.000:. ./.:4:168,69:.:-0.31:1.000:. ./.:4:82,13:.:-2.11:1.000:. ./.:4:130,1:.:-1.65:1.000:. ./.:4:214,66:.: 0.23:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:180,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:193,78:.: 0.12:1.000:. ./.:4:249,78:.: 0.83:0.971:. ./.:4:94,59:.:-1.37:1.000:. ./.:4:241,91:.: 0.89:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:108,63:.:-1.15:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:163,45:.:-0.68:1.000:. ./.:4:52,21:.:-2.39:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:181,76:.:-0.06:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:185,90:.: 0.17:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:73,62:.:-1.60:1.000:. ./.:4:28,8:.:-2.85:1.000:. ./.:4:54,19:.:-2.39:1.000:. ./.:3:24,6:.:-2.93:1.000:. ./.:4:373,4:.: 1.46:1.000:. ./.:4:256,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:157,80:.:-0.31:1.000:. ./.:4:239,57:.: 0.44:1.000:. ./.:4:118,95:.:-0.61:1.000:. ./.:4:174,64:.:-0.30:1.000:. ./.:4:183,71:.:-0.09:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:203,49:.:-0.12:1.000:. ./.:4:281,59:.: 0.99:0.966:. ./.:4:139,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:186,40:.:-0.45:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:156,53:.:-0.66:1.000:. ./.:4:207,73:.: 0.23:1.000:. ./.:4:154,61:.:-0.59:1.000:. ./.:4:285,76:.: 1.26:1.000:. ./.:4:239,63:.: 0.51:1.000:. ./.:4:302,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:176,71:.:-0.18:1.000:. ./.:4:203,2:.:-0.71:1.000:. ./.:4:211,64:.: 0.17:1.000:. ./.:6:257,13:.: 0.11:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:220,68:.: 0.34:1.000:. ./.:4:298,3:.: 0.50:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:90,61:.:-1.40:1.000:. ./.:4:75,44:.:-1.80:1.000:. ./.:4:149,72:.:-0.51:1.000:. ./.:4:180,56:.:-0.32:0.978:. ./.:4:213,57:.: 0.11:1.000:. ./.:4:456,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:156,53:.:-0.66:0.999:. ./.:4:419,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:226,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:84,49:.:-1.63:1.000:. ./.:4:282,40:.: 0.77:1.000:. ./.:4:87,45:.:-1.64:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:247,80:.: 0.83:1.000:. ./.:4:227,55:.: 0.26:0.988:. ./.:4:221,68:.: 0.35:1.000:. ./.:4:208,78:.: 0.31:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:451,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:106,37:.:-1.50:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:171,44:.:-0.59:1.000:. ./.:4:165,48:.:-0.61:1.000:. ./.:4:339,89:.: 2.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:155,64:.:-0.54:1.000:. ./.:4:315,59:.: 1.42:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:210,54:.: 0.03:1.000:. ./.:4:113,38:.:-1.40:1.000:. ./.:4:312,66:.: 1.47:1.000:. ./.:4:155,52:.:-0.69:1.000:. ./.:5:348,54:.: 1.78:0.999:. ./.:4:180,41:.:-0.51:1.000:. ./.:4:166,63:.:-0.41:1.000:. ./.:4:184,57:.:-0.26:1.000:. ./.:4:208,91:.: 0.47:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:171,84:.:-0.08:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:229,104:.: 0.91:1.000:. ./.:4:165,66:.:-0.39:0.999:. ./.:4:480,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:239,45:.: 0.28:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:237,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:234,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:267,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:183,45:.:-0.42:1.000:. ./.:4:196,66:.: 0.01:1.000:. ./.:4:142,49:.:-0.89:1.000:. ./.:4:199,71:.: 0.11:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:394,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:255,53:.: 0.59:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:222,71:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,65:.:-1.47:1.000:. ./.:4:207,61:.: 0.08:1.000:. ./.:4:144,44:.:-0.93:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:160,55:.:-0.59:1.000:. ./.:4:254,86:.: 0.99:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:210,56:.: 0.06:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:93,71:.:-1.23:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:190,75:.: 0.04:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:383,3:.: 1.58:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:126,37:.:-1.25:1.000:. ./.:4:301,70:.: 1.39:1.000:. ./.:4:192,68:.:-0.02:1.000:. ./.:4:193,87:.: 0.23:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:196,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:295,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:258,60:.: 0.72:1.000:. ./.:4:294,73:.: 1.34:0.999:. ./.:4:160,53:.:-0.61:1.000:. ./.:4:149,60:.:-0.66:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:195,44:.:-0.28:1.000:. ./.:4:158,60:.:-0.55:1.000:. ./.:4:280,53:.: 0.91:1.000:. ./.:4:168,48:.:-0.58:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:229,72:.: 0.50:1.000:. ./.:4:203,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:348,10:.: 1.22:1.000:. ./.:4:169,67:.:-0.32:0.999:. ./.:4:494,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:194,83:.: 0.20:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:245,58:.: 0.53:1.000:. -chr7.1 36344892 chr7.1_036344892 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:69,4:0.16: 0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,10:0.29:-0.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:45,6:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,6:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,10:0.27: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,5:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:34,1:0.08:-0.55:1.000:0.987 0/0/0/1:4:25,16:0.33:-0.31:1.000:0.908 0/0/0/1:4:28,5:0.27:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,4:0.12: 1.68:1.000:0.823 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,9:0.26: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:50,6:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,3:0.13: 0.66:1.000:0.898 0/0/0/1:4:53,11:0.27: 0.59:0.971:0.997 0/0/0/1:4:41,4:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,6:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:100,4:0.11: 2.15:1.000:0.548 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,3:0.13: 0.63:1.000:0.916 0/0/0/1:4:55,7:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:41,5:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:5,3:0.33:-1.60:1.000:0.926 0/0/0/1:4:69,3:0.12: 0.90:1.000:0.718 0/0/0/1:4:43,3:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,17:0.28: 1.37:1.000:0.995 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,1:0.09:-0.67:1.000:0.956 0/0/0/1:4:12,3:0.28:-1.33:1.000:0.995 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:36,8:0.28:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,2:0.12:-0.04:1.000:0.718 0/0/0/1:4:39,2:0.14:-0.31:1.000:0.961 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,10:0.28: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.84:1.000:0.997 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,1:0.07:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,4:0.20: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,10:0.27: 0.74:0.966:0.998 0/0/0/1:4:59,7:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,1:0.10:-0.78:1.000:0.848 0/0/0/1:4:37,2:0.15:-0.39:1.000:0.981 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-1.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,4:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,11:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,10:0.28: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,1:0.07:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.26:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:21,7:0.29:-0.82:1.000:0.848 0/0/0/1:4:52,4:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,3:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,9:0.28:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:23,3:0.26:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,4:0.11: 2.07:1.000:0.520 0/0/0/1:4:31,3:0.25:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,3:0.26:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,9:0.36:-1.21:1.000:0.654 0/0/0/1:4:23,7:0.29:-0.74:0.978:0.992 0/0/0/0:4:87,3:0.09: 1.60:1.000:0.899 0/0/0/1:4:37,9:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,5:0.28:-0.90:0.999:0.996 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,3:0.13: 0.59:1.000:0.932 0/0/0/0:4:100,4:0.11: 2.15:1.000:0.548 0/0/0/0:4:33,1:0.08:-0.59:1.000:0.980 0/0/1/1:4:0,9:0.50:-1.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,5:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:73,1:0.04: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,2:0.15:-0.39:1.000:0.981 0/0/0/1:4:59,4:0.18: 0.55:0.988:0.999 0/0/0/1:4:38,12:0.29: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:0,5:0.50:-1.72:1.000:0.997 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,3:0.21:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,5:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,6:0.20: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,11:0.30:-0.31:1.000:0.986 0/0/0/1:4:35,5:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,8:0.28:-0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,6:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,4:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,6:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,9:0.27: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:27,2:0.20:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,13:0.50:-1.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,7:0.29:-0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:0,7:0.50:-1.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,2:0.18:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:39,8:0.27:-0.08:0.999:0.801 0/0/0/1:4:32,10:0.29:-0.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:36,2:0.15:-0.43:1.000:0.987 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,5:0.50:-1.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,6:0.20: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,9:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,4:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,4:0.16: 0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.84:0.999:0.997 0/0/0/1:4:78,8:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,4:0.26:-0.82:1.000:0.998 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,12:0.30:-0.12:1.000:0.987 0/0/0/1:4:36,6:0.26:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,1:0.12:-0.98:1.000:0.718 0/0/0/1:4:46,4:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,4:0.23: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,5:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,4:0.20: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,1:0.06:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,6:0.50:-1.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,4:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,3:0.15: 0.35:1.000:0.983 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.84:1.000:0.997 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,7:0.26: 0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:0,8:0.50:-1.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,5:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,3:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,3:0.16: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,1:0.26:-1.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,3:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 3.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,14:0.50:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:120,3:0.07: 2.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,4:0.20: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,4:0.17: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,5:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,2:0.10: 0.27:1.000:0.774 0/0/0/1:4:29,2:0.18:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,19:0.31: 0.63:1.000:0.979 0/0/0/1:4:49,3:0.16: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,5:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,9:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,2:0.14:-0.35:1.000:0.972 0/0/0/1:4:37,6:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,10:0.50:-1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,4:0.12: 1.80:0.999:0.747 0/0/0/1:4:54,4:0.20: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,12:0.28: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,6:0.26:-0.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:26,11:0.31:-0.47:1.000:0.977 0/0/0/1:4:34,7:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,5:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,10:0.29:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,3:0.18:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:0,10:0.50:-1.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:46,4:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,1:0.03: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,7:0.50:-1.64:0.999:0.997 0/0/0/1:4:47,4:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,3:0.12: 0.86:1.000:0.756 0/0/0/1:4:57,3:0.14: 0.43:1.000:0.972 0/0/0/1:4:109,6:0.15: 2.58:1.000:0.985 -chr7.1 36466711 chr7.1_036466711 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:105,97:.: 0.32:1.000:. ./.:4:101,86:.: 0.07:1.000:. ./.:4:131,154:.: 1.71:1.000:. ./.:4:37,100:.:-0.76:1.000:. ./.:4:126,140:.: 1.39:1.000:. ./.:4:106,168:.: 1.53:1.000:. ./.:4:27,52:.:-1.73:1.000:. ./.:4:92,75:.:-0.26:1.000:. ./.:4:57,78:.:-0.79:1.000:. ./.:4:30,15:.:-2.29:1.000:. ./.:4:15,12:.:-2.59:1.000:. ./.:4:49,117:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,114:.: 0.14:1.000:. ./.:4:75,126:.: 0.31:1.000:. ./.:4:93,130:.: 0.67:1.000:. ./.:4:85,121:.: 0.39:1.000:. ./.:4:106,155:.: 1.31:0.971:. ./.:4:90,90:.:-0.04:1.000:. ./.:4:74,137:.: 0.47:1.000:. ./.:4:57,145:.: 0.32:1.000:. ./.:4:8,6:.:-2.81:1.000:. ./.:4:65,77:.:-0.68:1.000:. ./.:4:118,169:.: 1.74:1.000:. ./.:4:60,76:.:-0.78:1.000:. ./.:4:15,9:.:-2.64:1.000:. ./.:4:104,125:.: 0.77:1.000:. ./.:4:51,111:.:-0.34:1.000:. ./.:4:59,79:.:-0.74:1.000:. ./.:4:141,144:.: 1.71:1.000:. ./.:4:55,100:.:-0.46:1.000:. ./.:4:83,87:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,70:.:-0.74:1.000:. ./.:4:6,9:.:-2.79:1.000:. ./.:4:32,6:.:-2.41:1.000:. ./.:3:11,7:.:-2.74:1.000:. ./.:4:78,137:.: 0.54:1.000:. ./.:4:107,111:.: 0.59:1.000:. ./.:4:79,90:.:-0.23:1.000:. ./.:4:172,87:.: 1.28:1.000:. ./.:4:93,87:.:-0.04:1.000:. ./.:4:90,76:.:-0.28:1.000:. ./.:4:126,79:.: 0.37:1.000:. ./.:4:143,69:.: 0.49:1.000:. ./.:4:70,57:.:-0.93:1.000:. ./.:4:86,74:.:-0.38:1.000:. ./.:4:108,52:.:-0.38:1.000:. ./.:4:104,151:.: 1.21:0.966:. ./.:4:18,34:.:-2.18:1.000:. ./.:4:113,45:.:-0.41:1.000:. ./.:4:85,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:106,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:127,99:.: 0.72:1.000:. ./.:4:74,63:.:-0.76:1.000:. ./.:4:178,121:.: 1.94:1.000:. ./.:4:115,112:.: 0.74:1.000:. ./.:4:129,70:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,56:.:-1.21:1.000:. ./.:4:83,53:.:-0.78:1.000:. ./.:4:127,82:.: 0.44:1.000:. ./.:6:117,63:.:-0.04:1.000:. ./.:4:95,96:.: 0.14:1.000:. ./.:4:148,99:.: 1.07:1.000:. ./.:4:145,89:.: 0.86:1.000:. ./.:4:86,73:.:-0.39:1.000:. ./.:4:67,100:.:-0.26:1.000:. ./.:4:72,68:.:-0.71:1.000:. ./.:4:66,60:.:-0.94:1.000:. ./.:4:153,92:.: 1.04:1.000:. ./.:4:72,93:.:-0.29:0.978:. ./.:4:69,82:.:-0.53:1.000:. ./.:4:163,129:.: 1.83:1.000:. ./.:4:51,52:.:-1.33:0.999:. ./.:4:125,81:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,126:.: 1.13:1.000:. ./.:4:107,71:.:-0.08:1.000:. ./.:4:103,53:.:-0.44:1.000:. ./.:4:152,113:.: 1.38:1.000:. ./.:4:109,74:.: 0.01:1.000:. ./.:4:85,95:.:-0.04:1.000:. ./.:4:85,68:.:-0.49:1.000:. ./.:4:86,67:.:-0.49:0.988:. ./.:4:126,83:.: 0.44:1.000:. ./.:4:138,57:.: 0.21:1.000:. ./.:4:45,78:.:-0.99:1.000:. ./.:4:186,78:.: 1.36:1.000:. ./.:4:132,61:.: 0.17:1.000:. ./.:4:92,66:.:-0.41:1.000:. ./.:4:93,72:.:-0.29:1.000:. ./.:4:72,81:.:-0.49:1.000:. ./.:4:67,108:.:-0.13:1.000:. ./.:4:78,56:.:-0.81:1.000:. ./.:4:76,115:.: 0.14:1.000:. ./.:4:218,132:.: 2.79:1.000:. ./.:4:40,79:.:-1.06:1.000:. ./.:4:82,99:.:-0.03:1.000:. ./.:4:92,76:.:-0.24:1.000:. ./.:4:123,81:.: 0.36:1.000:. ./.:4:163,64:.: 0.74:1.000:. ./.:4:122,69:.: 0.14:1.000:. ./.:4:105,104:.: 0.44:1.000:. ./.:4:68,63:.:-0.86:1.000:. ./.:4:156,114:.: 1.46:1.000:. ./.:4:79,63:.:-0.68:1.000:. ./.:5:176,162:.: 2.59:0.999:. ./.:4:89,73:.:-0.34:1.000:. ./.:4:65,61:.:-0.94:1.000:. ./.:4:109,68:.:-0.09:1.000:. ./.:4:82,110:.: 0.16:1.000:. ./.:4:104,118:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,102:.:-0.19:1.000:. ./.:4:107,96:.: 0.34:1.000:. ./.:4:129,143:.: 1.49:1.000:. ./.:4:107,70:.:-0.09:0.999:. ./.:4:159,167:.: 2.39:1.000:. ./.:4:115,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:90,83:.:-0.16:1.000:. ./.:4:101,72:.:-0.16:1.000:. ./.:4:143,69:.: 0.49:1.000:. ./.:4:117,90:.: 0.41:1.000:. ./.:4:80,60:.:-0.71:1.000:. ./.:4:67,82:.:-0.56:1.000:. ./.:4:132,83:.: 0.54:1.000:. ./.:4:150,87:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,106:.:-0.49:1.000:. ./.:4:78,52:.:-0.88:1.000:. ./.:4:130,100:.: 0.79:1.000:. ./.:4:124,68:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,67:.:-0.39:1.000:. ./.:4:103,83:.: 0.06:1.000:. ./.:4:119,82:.: 0.31:1.000:. ./.:4:87,66:.:-0.49:1.000:. ./.:4:114,145:.: 1.28:1.000:. ./.:4:66,44:.:-1.21:1.000:. ./.:4:100,48:.:-0.58:1.000:. ./.:4:126,93:.: 0.61:1.000:. ./.:4:133,109:.: 0.99:1.000:. ./.:4:85,102:.: 0.07:1.000:. ./.:4:62,54:.:-1.11:1.000:. ./.:4:67,56:.:-0.99:1.000:. ./.:4:91,70:.:-0.36:1.000:. ./.:4:83,77:.:-0.38:1.000:. ./.:4:126,116:.: 0.99:1.000:. ./.:4:93,75:.:-0.24:1.000:. ./.:4:54,70:.:-0.98:1.000:. ./.:4:73,102:.:-0.13:1.000:. ./.:4:115,122:.: 0.91:1.000:. ./.:4:76,138:.: 0.52:1.000:. ./.:4:137,114:.: 1.14:1.000:. ./.:4:106,87:.: 0.17:1.000:. ./.:4:94,111:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,141:.: 0.29:1.000:. ./.:4:106,163:.: 1.44:1.000:. ./.:4:25,11:.:-2.44:1.000:. ./.:4:61,77:.:-0.74:1.000:. ./.:4:181,108:.: 1.78:1.000:. ./.:4:87,72:.:-0.39:1.000:. ./.:4:69,110:.:-0.06:1.000:. ./.:4:51,90:.:-0.69:1.000:. ./.:4:50,101:.:-0.53:1.000:. ./.:4:115,103:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,112:.:-0.14:1.000:. ./.:4:91,79:.:-0.21:1.000:. ./.:4:93,66:.:-0.39:1.000:. ./.:4:73,141:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,89:.:-0.49:1.000:. ./.:4:84,81:.:-0.29:1.000:. ./.:4:101,121:.: 0.66:1.000:. ./.:4:72,124:.: 0.22:0.999:. ./.:4:72,45:.:-1.09:1.000:. ./.:4:48,110:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,116:.: 0.16:1.000:. ./.:4:65,98:.:-0.33:1.000:. ./.:4:64,90:.:-0.48:1.000:. ./.:4:91,133:.: 0.69:1.000:. ./.:4:99,99:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:119,137:.: 1.23:1.000:. ./.:4:144,127:.: 1.48:1.000:. ./.:4:91,149:.: 0.96:1.000:. ./.:4:59,135:.: 0.19:1.000:. ./.:4:90,103:.: 0.17:0.999:. ./.:4:157,177:.: 2.53:1.000:. ./.:4:53,109:.:-0.34:1.000:. ./.:4:40,91:.:-0.86:1.000:. ./.:4:78,101:.:-0.06:1.000:. -chr7.1 36565621 chr7.1_036565621 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:174,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.40:0.971:. ./.:4:144,46:.: 0.76:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:183,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.77:1.000:. ./.:3:22,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.20:0.966:. ./.:4:269,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.90:1.000:. ./.:6:124,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.20:0.978:. ./.:4:114,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.44:0.999:. ./.:4:189,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.55:0.988:. ./.:4:176,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:144,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.60:1.000:. ./.:5:205,0:.: 1.12:0.999:. ./.:4:132,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:137,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:182,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:249,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:149,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:145,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:164,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.01:1.000:. -chr7.1 36795943 chr7.1_036795943 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:342,0:0.00: 2.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,72:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,62:0.33:-0.22:1.000:0.933 0/0/0/0:4:329,0:0.00: 2.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,96:0.24: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:232,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,25:0.23:-1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,27:0.44:-1.64:1.000:0.973 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,78:0.43:-0.11:1.000:0.952 0/0/0/1:4:152,83:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:326,0:0.00: 2.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,85:0.18: 2.60:0.971:0.999 0/0/1/1:4:70,96:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,89:0.24: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,98:0.49: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,73:0.23: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,18:0.28:-1.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:187,117:0.28: 2.18:1.000:0.996 0/0/0/0:4:162,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,92:0.23: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0:3:9,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,81:0.23: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:240,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:262,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,61:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,71:0.17: 2.01:0.966:0.998 0/0/1/1:4:64,100:0.53: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,73:0.40:-0.16:1.000:0.821 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,68:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,89:0.29: 1.00:1.000:0.992 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:54,45:0.36:-0.93:1.000:0.859 0/0/1/1:4:47,66:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,69:0.48:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,86:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,60:0.36:-0.41:1.000:0.692 0/0/1/1:4:68,81:0.47:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,1:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,51:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,75:0.25: 0.74:0.978:0.999 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,84:0.53:-0.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:111,63:0.25: 0.21:0.999:0.999 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,69:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,75:0.27: 0.60:1.000:0.998 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,64:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.85:0.988:1.000 0/0/0/1:4:82,51:0.28:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,79:0.49:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,44:0.32:-0.82:1.000:0.965 0/0/1/1:4:49,44:0.39:-1.02:1.000:0.656 0/0/1/1:4:61,72:0.47:-0.41:1.000:0.993 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,43:0.13: 1.00:1.000:0.920 0/0/0/1:4:123,56:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,63:0.52:-0.84:1.000:0.994 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,79:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,51:0.22: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,70:0.41:-0.26:1.000:0.846 0/0/0/1:4:187,63:0.17: 1.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,77:0.29: 0.51:1.000:0.990 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:88,43:0.23:-0.44:0.999:0.979 0/0/0/1:4:149,85:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,81:0.41: 0.09:1.000:0.833 0/1/1/1:4:3,82:0.75:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,53:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,60:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:383,0:0.00: 3.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.08:0.999:1.000 0/0/1/1:4:85,118:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,53:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,71:0.33: 0.10:1.000:0.931 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,54:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,74:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,54:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,46:0.22:-0.25:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:217,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,56:0.21: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:200,1:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,70:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,56:0.52:-1.02:1.000:0.994 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,51:0.43:-0.91:1.000:0.953 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,106:0.41: 0.83:1.000:0.873 0/0/0/1:4:161,64:0.20: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,67:0.34:-0.11:1.000:0.847 0/0/0/0:4:163,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,84:0.42: 0.10:1.000:0.929 0/0/0/1:4:76,62:0.36:-0.34:1.000:0.718 0/0/0/1:4:39,21:0.24:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,61:0.46:-0.70:1.000:0.990 0/0/0/1:4:158,81:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:256,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,79:0.51:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:220,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,92:0.26: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,86:0.34: 0.57:1.000:0.876 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.67:0.999:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,76:0.26: 0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,65:0.27: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:188,53:0.15: 1.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:129,77:0.26: 0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:171,65:0.19: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,52:0.14: 1.41:1.000:0.972 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,70:0.39:-0.22:1.000:0.742 0/0/0/1:4:171,72:0.20: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,59:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.01:0.999:1.000 0/0/0/1:4:107,91:0.37: 0.57:1.000:0.561 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,65:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 -chr7.1 37108527 chr7.1_037108527 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:217,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:227,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.59:0.971:. ./.:4:156,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:153,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.55:1.000:. ./.:3:14,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:217,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:110,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:168,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.13:0.966:. ./.:4:67,4:.:-1.00:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.79:1.000:. ./.:6:66,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:83,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:100,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:106,1:.:-0.20:0.978:. ./.:4:119,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:91,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.84:0.999:. ./.:4:131,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:94,3:.:-0.42:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.31:0.988:. ./.:4:109,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:95,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:36,1:.:-1.75:1.000:. ./.:4:80,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:67,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.64:1.000:. ./.:5:130,1:.: 0.33:0.985:. ./.:4:126,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:270,0:.: 3.40:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.06:0.999:. ./.:4:166,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:136,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:68,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:53,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:187,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:155,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:208,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:139,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:123,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:222,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.40:0.999:. ./.:4:132,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.48:1.000:. -chr7.1 37198413 chr7.1_037198413 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:141,65:0.37: 0.28:1.000:0.581 0/0/0/1:4:209,65:0.27: 1.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,101:0.58: 0.04:1.000:0.927 0/0/1/1:4:150,83:0.42: 0.62:1.000:0.915 0/0/0/1:4:147,66:0.36: 0.37:1.000:0.672 0/0/1/1:4:155,117:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,64:0.50:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,105:0.54: 0.44:1.000:0.988 0/0/0/1:4:184,62:0.29: 0.79:1.000:0.993 0/1/1/1:4:33,65:0.66:-1.12:1.000:0.856 0/1/1/1:4:14,67:0.78:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,33:0.21: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,73:0.43: 0.22:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,43:0.30:-0.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:177,96:0.41: 1.14:1.000:0.889 0/1/1/1:4:18,119:0.83:-0.61:0.971:0.998 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,143:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,134:0.71:-0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,26:0.55:-1.70:1.000:0.983 0/1/1/1:4:21,73:0.73:-1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:295,31:0.13: 1.82:1.000:0.886 0/0/1/1:4:128,125:0.55: 0.88:1.000:0.981 1/1/1/1:4:1,55:0.98:-1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,110:0.79:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,137:0.60: 0.73:1.000:0.818 0/0/0/1:4:246,29:0.14: 1.17:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,97:0.44: 0.99:1.000:0.967 0/0/0/1:4:294,32:0.13: 1.82:1.000:0.915 0/1/1/1:4:25,95:0.74:-0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,43:0.51:-1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,38:0.68:-1.67:1.000:0.942 0/0/1:3:61,20:0.28:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,40:0.15: 2.12:1.000:0.983 0/0/0/1:4:274,76:0.25: 2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,74:0.37: 0.66:1.000:0.613 0/0/1/1:4:144,98:0.48: 0.74:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,85:0.68:-0.82:1.000:0.962 0/1/1/1:4:21,52:0.69:-1.44:1.000:0.973 0/0/0/1:4:189,52:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,58:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,39:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,66:0.40: 0.12:1.000:0.790 0/0/1/1:4:108,79:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:180,65:0.30: 0.78:0.966:0.980 0/1/1/1:4:38,92:0.69:-0.70:1.000:0.968 0/0/1/1:4:88,75:0.53:-0.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:103,41:0.33:-0.52:1.000:0.923 0/0/1/1:4:82,61:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:279,54:0.19: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,53:0.39:-0.30:1.000:0.644 0/0/1/1:4:99,78:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,92:0.54: 0.06:1.000:0.985 0/0/0/1:4:223,33:0.16: 0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,46:0.35:-0.40:1.000:0.816 0/1/1/1:4:17,69:0.75:-1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,48:0.35:-0.32:1.000:0.802 0/0/0/0/1/1:6:96,44:0.37:-0.58:1.000:0.846 0/0/1/1:4:102,56:0.42:-0.34:1.000:0.905 0/0/0/1:4:157,35:0.21: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,65:0.40: 0.10:1.000:0.771 0/1/1/1:4:18,101:0.81:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,73:0.87:-1.34:1.000:0.875 0/1/1/1:4:14,82:0.81:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,52:0.31: 0.10:1.000:0.970 0/1/1/1:4:23,71:0.72:-1.17:0.978:0.995 0/0/1/1:4:123,63:0.40: 0.02:1.000:0.773 0/0/0/1:4:236,71:0.26: 1.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,43:0.69:-1.61:0.999:0.977 0/0/1/1:4:149,74:0.39: 0.50:1.000:0.684 0/0/0/1:4:238,26:0.13: 1.02:1.000:0.918 0/0/1/1:4:105,52:0.39:-0.36:1.000:0.675 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,39:0.22: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,78:0.74:-1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:133,34:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,42:0.50:-1.08:0.988:0.997 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,52:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,91:0.80:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,33:0.18: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:246,49:0.20: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,30:0.35:-1.11:1.000:0.766 0/0/0/1:4:89,32:0.30:-0.82:1.000:0.981 0/1/1/1:4:15,62:0.75:-1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,43:0.37:-0.64:1.000:0.531 0/0/1/1:4:82,46:0.42:-0.73:1.000:0.930 0/1/1/1:4:23,79:0.73:-1.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,77:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:115,47:0.34:-0.29:1.000:0.890 0/0/0/1:4:150,58:0.32: 0.30:1.000:0.948 0/1/1/1:4:20,73:0.74:-1.18:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,47:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,53:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:135,91:0.48: 0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,60:0.75:-1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:188,32:0.18: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,73:0.55:-0.50:1.000:0.977 0/0/0/1/1:5:151,71:0.37: 0.48:0.985:0.958 0/1/1/1:4:11,71:0.83:-1.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:122,54:0.36:-0.11:1.000:0.716 0/0/0/1:4:128,39:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,108:0.54: 0.56:1.000:0.990 0/0/1/1:4:130,116:0.53: 0.79:1.000:0.991 0/1/1/1:4:20,84:0.75:-1.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,68:0.71:-1.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:198,94:0.38: 1.39:1.000:0.526 0/0/0/1:4:153,36:0.22: 0.06:0.999:1.000 0/0/1/1:4:132,84:0.46: 0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:42,60:0.61:-1.07:1.000:0.697 0/0/0/1:4:119,49:0.34:-0.21:1.000:0.879 0/0/0/1:4:109,44:0.33:-0.41:1.000:0.907 0/0/1/1:4:99,81:0.52:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:118,58:0.39:-0.11:1.000:0.650 0/0/1/1:4:68,63:0.54:-0.69:1.000:0.988 0/0/0/1:4:115,48:0.34:-0.28:1.000:0.856 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,77:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,124:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,40:0.34:-0.61:1.000:0.877 0/0/0/1:4:186,42:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,46:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,39:0.38:-0.82:1.000:0.533 0/1/1/1:4:5,40:0.86:-1.80:1.000:0.975 0/0/0/1:4:144,35:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,60:0.74:-1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,81:0.43: 0.47:1.000:0.954 0/0/0/1:4:104,26:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,41:0.37:-0.73:1.000:0.501 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:322,72:0.21: 2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,47:0.29: 0.00:1.000:0.991 0/1/1/1:4:17,68:0.75:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,48:0.48:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:97,28:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:218,27:0.14: 0.78:1.000:0.974 0/0/0/1:4:186,53:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,103:0.53: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:77,33:0.35:-0.96:1.000:0.802 0/0/0/1:4:196,70:0.30: 1.05:1.000:0.983 0/0/1/1:4:156,106:0.48: 1.00:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,119:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,85:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:158,114:0.50: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,41:0.32:-0.49:1.000:0.948 0/0/1/1:4:199,109:0.42: 1.59:1.000:0.902 0/0/0/1:4:227,77:0.29: 1.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:32,75:0.68:-1.00:1.000:0.960 0/0/1/1:4:73,80:0.57:-0.41:1.000:0.953 0/0/1/1:4:121,93:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,108:0.52: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:175,83:0.38: 0.95:1.000:0.523 0/0/0/1:4:393,36:0.12: 3.15:1.000:0.689 0/1/1/1:4:20,91:0.77:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,76:0.30: 1.39:1.000:0.986 0/0/1/1:4:142,69:0.38: 0.34:1.000:0.610 0/0/0/1:4:187,50:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,114:0.55: 0.57:1.000:0.979 0/0/0/1:4:271,40:0.16: 1.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:229,28:0.14: 0.93:1.000:0.970 0/0/1/1:4:122,121:0.55: 0.75:1.000:0.979 0/0/0/1:4:242,71:0.26: 1.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,86:0.42: 0.71:0.999:0.925 0/0/1/1:4:97,93:0.55: 0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:23,118:0.79:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,36:0.18: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,57:0.42:-0.33:1.000:0.926 0/1/1/1:4:20,79:0.75:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,60:0.41:-0.18:1.000:0.884 0/1/1/1:4:18,76:0.75:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,53:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,146:0.55: 1.45:1.000:0.983 0/0/1/1:4:137,114:0.52: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:260,31:0.14: 1.37:1.000:0.962 0/0/0/1:4:150,65:0.35: 0.39:1.000:0.775 0/0/0/1:4:250,87:0.30: 1.97:0.999:0.988 0/0/0/1:4:315,90:0.25: 2.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,107:0.40: 1.64:1.000:0.819 0/1/1/1:4:18,114:0.82:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,73:0.44: 0.17:1.000:0.960 -chr7.1 37551629 chr7.1_037551629 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:105,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:139,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:0.971:. ./.:4:96,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:140,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.15:1.000:. ./.:3:10,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:118,1:.: 1.25:0.966:. ./.:4:95,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.15:1.000:. ./.:6:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.44:0.978:. ./.:4:77,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:99,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:0.988:. ./.:4:92,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.86:1.000:. ./.:5:111,0:.: 0.92:0.985:. ./.:4:64,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:130,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:123,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.60:0.999:. ./.:4:96,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:80,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.45:0.999:. ./.:4:115,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:147,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.76:1.000:. -chr7.1 37685747 chr7.1_037685747 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:330,94:.: 1.36:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:287,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:338,98:.: 1.49:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:160,74:.:-0.67:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:256,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:287,88:.: 0.84:1.000:. ./.:4:334,93:.: 1.39:0.971:. ./.:4:243,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:469,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:281,89:.: 0.78:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:10,8:.:-2.97:1.000:. ./.:4:214,79:.:-0.04:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:223,82:.: 0.09:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:183,86:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:37,14:.:-2.62:1.000:. ./.:3:22,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:286,94:.: 0.89:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:232,93:.: 0.30:1.000:. ./.:4:343,103:.: 1.60:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.53:0.966:. ./.:4:83,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:163,102:.:-0.34:1.000:. ./.:4:274,86:.: 0.68:1.000:. ./.:6:272,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:193,88:.:-0.17:1.000:. ./.:4:164,28:.:-1.12:1.000:. ./.:4:270,85:.: 0.62:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.57:0.978:. ./.:4:265,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.31:0.999:. ./.:4:219,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:154,83:.:-0.64:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:182,77:.:-0.40:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.87:0.988:. ./.:4:240,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:160,76:.:-0.65:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:206,49:.:-0.44:1.000:. ./.:4:204,67:.:-0.27:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:281,73:.: 0.61:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:134,60:.:-1.09:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:289,78:.: 0.75:1.000:. ./.:4:101,32:.:-1.75:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.16:1.000:. ./.:5:263,0:.:-0.36:0.985:. ./.:4:212,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:154,53:.:-0.96:1.000:. ./.:4:382,138:.: 2.39:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:362,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:90,48:.:-1.69:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:174,75:.:-0.51:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:205,99:.: 0.08:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:123,60:.:-1.21:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:222,63:.:-0.12:1.000:. ./.:4:229,61:.:-0.07:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:180,78:.:-0.41:1.000:. ./.:4:171,94:.:-0.34:1.000:. ./.:4:504,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:163,68:.:-0.70:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:242,79:.: 0.26:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:253,95:.: 0.55:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:222,114:.: 0.42:1.000:. ./.:4:173,112:.:-0.12:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:177,64:.:-0.59:1.000:. ./.:4:475,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:188,74:.:-0.37:1.000:. ./.:4:149,78:.:-0.74:1.000:. ./.:4:168,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:145,77:.:-0.80:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:247,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:249,69:.: 0.23:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:273,119:.: 1.02:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:210,59:.:-0.29:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.23:0.999:. ./.:4:320,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.39:1.000:. -chr7.1 37885830 chr7.1_037885830 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:586,1:.: 2.29:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:500,3:.: 1.65:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:567,4:.: 2.17:1.000:. ./.:4:375,2:.: 0.69:0.971:. ./.:4:284,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:550,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:483,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:177,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:476,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.53:1.000:. ./.:3:21,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:354,2:.: 0.53:1.000:. ./.:4:134,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:489,1:.: 1.55:0.966:. ./.:4:147,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:200,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:447,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:432,1:.: 1.12:1.000:. ./.:6:110,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:162,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.51:0.978:. ./.:4:386,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:305,1:.: 0.15:0.999:. ./.:4:266,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:410,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:238,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.15:0.988:. ./.:4:185,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:199,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:361,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:423,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:510,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.75:1.000:. ./.:5:286,0:.: 0.00:0.985:. ./.:4:231,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:444,3:.: 1.22:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:123,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:392,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:298,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:283,2:.:-0.01:0.999:. ./.:4:425,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:407,2:.: 0.93:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:302,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:567,1:.: 2.14:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:278,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:404,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:331,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:317,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:453,2:.: 1.28:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:494,2:.: 1.59:1.000:. ./.:4:534,3:.: 1.91:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:341,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:423,2:.: 1.05:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.70:0.999:. ./.:4:284,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:441,3:.: 1.20:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:341,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:340,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:337,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:525,2:.: 1.83:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:147,1:.:-1.05:0.999:. ./.:4:491,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:662,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.09:1.000:. -chr7.1 38156723 chr7.1_038156723 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.30:0.988:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 3.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:5:10,0:.: 0.25:0.985:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,1:.:-0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.: 1.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.25:0.999:. ./.:4:12,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.64:1.000:. -chr7.1 38440523 chr7.1_038440523 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:232,70:0.27: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/0:4:287,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,48:0.17: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,144:0.55:-0.32:1.000:0.977 0/0/0/1:4:304,115:0.31: 1.83:1.000:0.975 0/0/0/1:4:298,74:0.23: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,149:0.75:-1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,147:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,148:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,35:0.21:-1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,104:0.71:-2.18:1.000:0.992 0/0/1/1:4:156,127:0.48:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:151,123:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,136:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:232,64:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:315,79:0.23: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,74:0.26: 0.40:0.971:0.998 0/1/1/1:4:92,236:0.72: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:223,166:0.46: 1.39:1.000:0.988 0/1/1/1:4:95,266:0.73: 0.98:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,77:0.67:-2.62:1.000:0.920 0/0/1/1:4:150,144:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:266,73:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,118:0.47:-0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:82,20:0.23:-2.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,159:0.46: 1.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:168,159:0.52: 0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:129,128:0.53:-0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:272,68:0.23: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,253:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,143:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,199:0.72:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,43:0.51:-3.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,74:0.45:-1.73:1.000:0.981 0/0/0:3:70,9:0.13:-3.17:1.000:0.840 0/0/0/1:4:242,86:0.30: 0.49:1.000:0.988 0/0/0/0:4:375,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,119:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:266,63:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,149:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:150,110:0.46:-0.51:1.000:0.985 0/0/0/1:4:262,53:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,165:0.49: 0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,199:0.68:-0.02:1.000:0.961 0/0/1/1:4:143,128:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,152:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:262,88:0.29: 0.81:0.966:0.994 0/1/1/1:4:177,406:0.70: 4.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:192,107:0.39: 0.07:1.000:0.711 0/0/1/1:4:195,134:0.44: 0.51:1.000:0.969 0/0/0/1:4:196,53:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:337,99:0.26: 2.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,130:0.47: 0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:158,114:0.45:-0.33:1.000:0.982 0/0/0/1:4:243,82:0.29: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:220,178:0.48: 1.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,124:0.47:-0.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:119,245:0.68: 1.02:1.000:0.947 0/0/0/1:4:236,83:0.29: 0.36:1.000:0.989 0/0/0/0/1/1:6:186,86:0.35:-0.33:1.000:0.898 0/0/1/1:4:153,143:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:250,68:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,153:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,118:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,235:0.72: 0.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,234:0.72: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,82:0.53:-1.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:249,55:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,119:0.48:-0.42:0.978:0.995 0/0/1/1:4:123,96:0.47:-1.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:331,64:0.19: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,129:0.49:-0.18:0.999:0.996 0/1/1/1:4:110,241:0.69: 0.83:1.000:0.972 0/0/0/1:4:284,97:0.29: 1.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:184,124:0.44: 0.20:1.000:0.961 0/0/1/1:4:158,131:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:304,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,116:0.44:-0.15:1.000:0.970 0/1/1/1:4:91,219:0.71: 0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:167,149:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,101:0.50:-1.15:0.988:0.997 0/0/1/1:4:201,160:0.48: 0.98:1.000:0.994 0/0/0/1:4:317,92:0.26: 1.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,192:0.73:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:275,49:0.18: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,143:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:190,66:0.29:-0.57:1.000:0.991 0/0/0/1:4:196,53:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,161:0.68:-0.85:1.000:0.961 0/0/1/1:4:149,124:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,115:0.48:-0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:219,65:0.26:-0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:323,82:0.24: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,114:0.57:-1.27:1.000:0.946 0/1/1/1:4:92,223:0.71: 0.30:1.000:0.991 0/1/1/1:4:79,211:0.72:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:212,53:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,57:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:251,71:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:263,77:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:170,47:0.25:-1.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:290,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,72:0.47:-1.90:1.000:0.992 0/0/0/0/1:5:273,54:0.19: 0.48:0.985:0.997 0/0/0/1:4:169,42:0.23:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,138:0.47: 0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:271,77:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,55:0.23:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,200:0.52: 1.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:174,130:0.46: 0.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:128,119:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:359,87:0.23: 2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,76:0.30:-0.13:0.999:0.985 0/0/1/1:4:260,142:0.39: 1.58:1.000:0.659 0/0/0/1:4:197,37:0.18:-0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,210:0.71: 0.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:174,135:0.47: 0.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:244,58:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,107:0.45:-0.55:1.000:0.980 0/0/1/1:4:162,120:0.46:-0.18:1.000:0.987 0/0/1/1:4:160,140:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:221,58:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,125:0.44: 0.20:1.000:0.966 0/1/1/1:4:67,210:0.75:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:66,191:0.74:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:259,67:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,97:0.46:-0.98:1.000:0.987 0/0/1/1:4:129,84:0.43:-1.20:1.000:0.941 0/0/1/1:4:111,99:0.50:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,132:0.44: 0.46:1.000:0.965 0/0/0/1:4:238,84:0.30: 0.40:1.000:0.989 0/0/0/1:4:138,43:0.27:-1.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,147:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:233,55:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,184:0.48: 1.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:198,156:0.47: 0.87:1.000:0.994 0/1/1/1:4:51,158:0.75:-1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,162:0.72:-1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:176,50:0.26:-1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:168,132:0.47: 0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:223,64:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,75:0.32:-0.52:1.000:0.943 0/0/1/1:4:123,100:0.48:-1.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:118,255:0.69: 1.15:1.000:0.968 0/0/0/1:4:297,89:0.27: 1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:136,141:0.54:-0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:251,65:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,200:0.51: 1.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,150:0.54: 0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:170,170:0.53: 0.67:1.000:0.993 0/0/0/1:4:236,64:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,42:0.39:-2.59:1.000:0.690 0/0/0/1:4:171,51:0.26:-1.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:288,79:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,151:0.48: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:184,161:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,158:0.55: 0.07:1.000:0.976 0/1/1/1:4:67,150:0.69:-1.14:1.000:0.978 0/0/0/1:4:220,73:0.28:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:153,121:0.48:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:229,73:0.28: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,116:0.51:-0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,66:0.26:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:174,138:0.48: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:161,145:0.51: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,124:0.53:-0.65:0.999:0.994 0/0/1/1:4:135,133:0.53:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:160,140:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:201,54:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:249,55:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,92:0.42:-0.85:1.000:0.922 0/0/0/1:4:190,58:0.27:-0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:206,63:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,101:0.47:-0.95:1.000:0.993 0/0/0/1:4:314,77:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,69:0.27: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:306,79:0.24: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,120:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:250,65:0.24: 0.30:0.999:1.000 0/0/0/1:4:304,98:0.28: 1.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,178:0.52: 1.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,179:0.73:-0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,124:0.45: 0.07:1.000:0.978 -chr7.1 38715717 chr7.1_038715717 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:340,324:.: 1.50:1.000:. ./.:4:212,263:.:-0.41:1.000:. ./.:4:363,141:.:-0.12:1.000:. ./.:4:403,146:.: 0.33:1.000:. ./.:4:273,353:.: 1.11:1.000:. ./.:4:466,157:.: 1.08:1.000:. ./.:4:313,123:.:-0.81:1.000:. ./.:4:373,135:.:-0.08:1.000:. ./.:4:232,280:.:-0.04:1.000:. ./.:4:99,170:.:-2.50:1.000:. ./.:4:171,63:.:-2.85:1.000:. ./.:4:135,435:.: 0.55:1.000:. ./.:4:394,110:.:-0.12:1.000:. ./.:4:436,161:.: 0.82:1.000:. ./.:4:366,148:.:-0.02:1.000:. ./.:4:242,286:.: 0.12:1.000:. ./.:4:256,324:.: 0.65:0.971:. ./.:4:228,224:.:-0.65:1.000:. ./.:4:339,367:.: 1.92:1.000:. ./.:4:446,135:.: 0.66:1.000:. ./.:4:256,79:.:-1.83:1.000:. ./.:4:284,295:.: 0.64:1.000:. ./.:4:472,161:.: 1.18:1.000:. ./.:4:382,134:.: 0.00:1.000:. ./.:4:94,54:.:-3.72:1.000:. ./.:4:422,151:.: 0.58:1.000:. ./.:4:362,150:.:-0.04:1.000:. ./.:4:353,139:.:-0.24:1.000:. ./.:4:478,175:.: 1.39:1.000:. ./.:4:448,147:.: 0.80:1.000:. ./.:4:438,171:.: 0.94:1.000:. ./.:4:331,141:.:-0.44:1.000:. ./.:4:105,40:.:-3.75:1.000:. ./.:4:153,192:.:-1.73:1.000:. ./.:3:118,15:.:-3.87:1.000:. ./.:4:419,145:.: 0.49:1.000:. ./.:4:382,162:.: 0.28:1.000:. ./.:4:294,298:.: 0.77:1.000:. ./.:4:401,143:.: 0.28:1.000:. ./.:4:293,326:.: 1.04:1.000:. ./.:4:296,295:.: 0.76:1.000:. ./.:4:416,145:.: 0.46:1.000:. ./.:4:651,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:369,136:.:-0.11:1.000:. ./.:4:336,335:.: 1.57:1.000:. ./.:4:406,152:.: 0.43:1.000:. ./.:4:305,325:.: 1.15:0.966:. ./.:4:106,31:.:-3.83:1.000:. ./.:4:342,145:.:-0.29:1.000:. ./.:4:297,96:.:-1.24:1.000:. ./.:4:385,137:.: 0.06:1.000:. ./.:4:440,179:.: 1.04:1.000:. ./.:4:254,238:.:-0.24:1.000:. ./.:4:466,158:.: 1.09:1.000:. ./.:4:352,141:.:-0.23:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:249,247:.:-0.20:1.000:. ./.:4:424,155:.: 0.64:1.000:. ./.:4:241,284:.: 0.09:1.000:. ./.:6:341,115:.:-0.61:1.000:. ./.:4:405,135:.: 0.24:1.000:. ./.:4:401,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:487,168:.: 1.41:1.000:. ./.:4:408,113:.: 0.05:1.000:. ./.:4:449,168:.: 1.02:1.000:. ./.:4:385,147:.: 0.16:1.000:. ./.:4:233,242:.:-0.41:1.000:. ./.:4:397,147:.: 0.28:1.000:. ./.:4:326,320:.: 1.32:0.978:. ./.:4:255,243:.:-0.18:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:186,238:.:-0.93:0.999:. ./.:4:484,148:.: 1.17:1.000:. ./.:4:384,97:.:-0.35:1.000:. ./.:4:277,281:.: 0.43:1.000:. ./.:4:303,109:.:-1.05:1.000:. ./.:4:345,129:.:-0.42:1.000:. ./.:4:427,122:.: 0.33:1.000:. ./.:4:394,134:.: 0.12:1.000:. ./.:4:262,306:.: 0.53:1.000:. ./.:4:250,214:.:-0.53:0.988:. ./.:4:551,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:466,153:.: 1.04:1.000:. ./.:4:304,118:.:-0.95:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:183,203:.:-1.31:1.000:. ./.:4:334,112:.:-0.71:1.000:. ./.:4:428,129:.: 0.41:1.000:. ./.:4:345,115:.:-0.57:1.000:. ./.:4:195,250:.:-0.72:1.000:. ./.:4:255,265:.: 0.04:1.000:. ./.:4:412,128:.: 0.24:1.000:. ./.:4:269,95:.:-1.54:1.000:. ./.:4:428,139:.: 0.52:1.000:. ./.:4:411,127:.: 0.22:1.000:. ./.:4:367,111:.:-0.38:1.000:. ./.:4:339,117:.:-0.61:1.000:. ./.:4:386,137:.: 0.07:1.000:. ./.:4:420,154:.: 0.59:1.000:. ./.:4:226,251:.:-0.39:1.000:. ./.:4:422,155:.: 0.62:1.000:. ./.:4:340,123:.:-0.54:1.000:. ./.:5:514,137:.: 1.37:0.985:. ./.:4:244,244:.:-0.28:1.000:. ./.:4:217,247:.:-0.53:1.000:. ./.:4:335,126:.:-0.56:1.000:. ./.:4:420,173:.: 0.78:1.000:. ./.:4:507,162:.: 1.55:1.000:. ./.:4:253,261:.:-0.02:1.000:. ./.:4:329,132:.:-0.56:1.000:. ./.:4:316,335:.: 1.37:1.000:. ./.:4:386,143:.: 0.13:0.999:. ./.:4:542,150:.: 1.78:1.000:. ./.:4:291,99:.:-1.27:1.000:. ./.:4:499,146:.: 1.30:1.000:. ./.:4:348,121:.:-0.48:1.000:. ./.:4:402,142:.: 0.28:1.000:. ./.:4:512,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:337,122:.:-0.58:1.000:. ./.:4:254,267:.: 0.05:1.000:. ./.:4:397,116:.:-0.03:1.000:. ./.:4:408,163:.: 0.56:1.000:. ./.:4:431,151:.: 0.67:1.000:. ./.:4:363,123:.:-0.30:1.000:. ./.:4:608,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:209,259:.:-0.49:1.000:. ./.:4:285,119:.:-1.13:1.000:. ./.:4:369,116:.:-0.31:1.000:. ./.:4:248,244:.:-0.24:1.000:. ./.:4:258,238:.:-0.20:1.000:. ./.:4:250,89:.:-1.79:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:369,120:.:-0.27:1.000:. ./.:4:469,172:.: 1.26:1.000:. ./.:4:410,144:.: 0.38:1.000:. ./.:4:355,126:.:-0.35:1.000:. ./.:4:349,130:.:-0.37:1.000:. ./.:4:255,250:.:-0.11:1.000:. ./.:4:431,137:.: 0.53:1.000:. ./.:4:576,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:335,133:.:-0.49:1.000:. ./.:4:311,107:.:-0.99:1.000:. ./.:4:453,174:.: 1.12:1.000:. ./.:4:529,165:.: 1.80:1.000:. ./.:4:409,125:.: 0.18:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:421,135:.: 0.40:1.000:. ./.:4:324,97:.:-0.96:1.000:. ./.:4:459,142:.: 0.86:1.000:. ./.:4:515,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:197,60:.:-2.62:1.000:. ./.:4:355,120:.:-0.41:1.000:. ./.:4:412,156:.: 0.53:1.000:. ./.:4:381,149:.: 0.14:1.000:. ./.:4:324,346:.: 1.56:1.000:. ./.:4:425,141:.: 0.51:1.000:. ./.:4:363,137:.:-0.16:1.000:. ./.:4:555,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:337,109:.:-0.71:1.000:. ./.:4:412,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:356,127:.:-0.33:1.000:. ./.:4:425,148:.: 0.58:1.000:. ./.:4:363,124:.:-0.29:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:331,112:.:-0.74:1.000:. ./.:4:243,253:.:-0.20:0.999:. ./.:4:379,132:.:-0.05:1.000:. ./.:4:253,273:.: 0.10:1.000:. ./.:4:350,138:.:-0.28:1.000:. ./.:4:205,205:.:-1.07:1.000:. ./.:4:254,263:.: 0.01:1.000:. ./.:4:240,254:.:-0.22:1.000:. ./.:4:219,250:.:-0.48:1.000:. ./.:4:426,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:451,145:.: 0.81:1.000:. ./.:4:418,148:.: 0.51:1.000:. ./.:4:417,150:.: 0.52:1.000:. ./.:4:349,170:.: 0.03:1.000:. ./.:4:413,153:.: 0.51:0.999:. ./.:4:631,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:298,352:.: 1.36:1.000:. ./.:4:337,110:.:-0.70:1.000:. ./.:4:239,287:.: 0.10:1.000:. -chr7.1 39044866 chr7.1_039044866 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 2.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.43:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.43:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr7.1 39201586 chr7.1_039201586 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:461,522:.: 1.06:1.000:. ./.:4:363,380:.: 0.06:1.000:. ./.:4:388,469:.: 0.53:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:546,624:.: 1.85:1.000:. ./.:4:495,657:.: 1.77:1.000:. ./.:4:340,192:.:-0.83:1.000:. ./.:4:471,517:.: 1.08:1.000:. ./.:4:424,484:.: 0.75:1.000:. ./.:4:229,320:.:-0.76:1.000:. ./.:4:239,2:.:-2.05:1.000:. ./.:4:450,252:.:-0.12:1.000:. ./.:4:393,231:.:-0.44:1.000:. ./.:4:504,276:.: 0.21:1.000:. ./.:4:469,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:475,497:.: 1.02:1.000:. ./.:4:500,286:.: 0.24:0.971:. ./.:4:552,273:.: 0.40:1.000:. ./.:4:637,343:.: 1.05:1.000:. ./.:4:537,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:295,149:.:-1.20:1.000:. ./.:4:467,267:.: 0.02:1.000:. ./.:4:497,309:.: 0.32:1.000:. ./.:4:463,484:.: 0.91:1.000:. ./.:4:158,80:.:-2.06:1.000:. ./.:4:508,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:485,537:.: 1.23:1.000:. ./.:4:451,257:.:-0.09:1.000:. ./.:4:535,321:.: 0.53:1.000:. ./.:4:495,285:.: 0.21:1.000:. ./.:4:535,280:.: 0.36:1.000:. ./.:4:398,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:137,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:232,136:.:-1.51:1.000:. ./.:3:127,126:.:-2.00:1.000:. ./.:4:479,247:.:-0.01:1.000:. ./.:4:466,486:.: 0.93:1.000:. ./.:4:526,490:.: 1.20:1.000:. ./.:4:448,580:.: 1.25:1.000:. ./.:4:548,291:.: 0.46:1.000:. ./.:4:450,251:.:-0.12:1.000:. ./.:4:492,471:.: 0.98:1.000:. ./.:4:519,292:.: 0.34:1.000:. ./.:4:436,225:.:-0.29:1.000:. ./.:4:526,692:.: 2.05:1.000:. ./.:4:448,520:.: 1.00:1.000:. ./.:4:477,593:.: 1.43:0.966:. ./.:4:228,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:438,418:.: 0.53:1.000:. ./.:4:444,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:410,228:.:-0.38:1.000:. ./.:4:556,663:.: 2.05:1.000:. ./.:4:433,491:.: 0.82:1.000:. ./.:4:493,541:.: 1.28:1.000:. ./.:4:476,516:.: 1.10:1.000:. ./.:4:502,269:.: 0.17:1.000:. ./.:4:472,483:.: 0.95:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:417,493:.: 0.76:1.000:. ./.:6:417,183:.:-0.54:1.000:. ./.:4:483,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:424,217:.:-0.37:1.000:. ./.:4:574,322:.: 0.70:1.000:. ./.:4:517,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:457,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:341,195:.:-0.81:1.000:. ./.:4:417,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:472,295:.: 0.16:0.978:. ./.:4:350,230:.:-0.63:1.000:. ./.:4:538,280:.: 0.37:1.000:. ./.:4:447,215:.:-0.28:0.999:. ./.:4:486,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:476,261:.: 0.03:1.000:. ./.:4:403,236:.:-0.38:1.000:. ./.:4:438,233:.:-0.24:1.000:. ./.:4:445,478:.: 0.81:1.000:. ./.:4:456,249:.:-0.10:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:517,626:.: 1.73:1.000:. ./.:4:386,202:.:-0.59:0.988:. ./.:4:538,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:608,604:.: 2.02:1.000:. ./.:4:372,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:552,331:.: 0.64:1.000:. ./.:4:350,422:.: 0.18:1.000:. ./.:4:430,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:411,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:448,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:408,456:.: 0.56:1.000:. ./.:4:399,217:.:-0.48:1.000:. ./.:4:510,593:.: 1.57:1.000:. ./.:4:341,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:578,319:.: 0.70:1.000:. ./.:4:528,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:355,240:.:-0.56:1.000:. ./.:4:424,225:.:-0.34:1.000:. ./.:4:560,627:.: 1.92:1.000:. ./.:4:442,218:.:-0.29:1.000:. ./.:4:352,238:.:-0.58:1.000:. ./.:4:478,556:.: 1.28:1.000:. ./.:4:354,379:.: 0.01:1.000:. ./.:5:581,557:.: 1.71:0.985:. ./.:4:344,256:.:-0.54:1.000:. ./.:4:440,509:.: 0.92:1.000:. ./.:4:489,507:.: 1.12:1.000:. ./.:4:460,255:.:-0.06:1.000:. ./.:4:614,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:487,260:.: 0.07:1.000:. ./.:4:403,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:554,590:.: 1.74:1.000:. ./.:4:504,586:.: 1.51:0.999:. ./.:4:577,293:.: 0.59:1.000:. ./.:4:321,375:.:-0.14:1.000:. ./.:4:536,283:.: 0.38:1.000:. ./.:4:436,252:.:-0.17:1.000:. ./.:4:376,471:.: 0.49:1.000:. ./.:4:513,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:419,508:.: 0.83:1.000:. ./.:4:418,523:.: 0.89:1.000:. ./.:4:393,246:.:-0.38:1.000:. ./.:4:521,573:.: 1.53:1.000:. ./.:4:460,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:459,245:.:-0.11:1.000:. ./.:4:510,272:.: 0.22:1.000:. ./.:4:474,280:.: 0.10:1.000:. ./.:4:411,223:.:-0.40:1.000:. ./.:4:345,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:362,434:.: 0.28:1.000:. ./.:4:403,203:.:-0.52:1.000:. ./.:4:432,484:.: 0.78:1.000:. ./.:4:325,375:.:-0.12:1.000:. ./.:4:473,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:439,246:.:-0.19:1.000:. ./.:4:638,359:.: 1.12:1.000:. ./.:4:520,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:407,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:401,267:.:-0.26:1.000:. ./.:4:375,486:.: 0.55:1.000:. ./.:4:513,262:.: 0.19:1.000:. ./.:4:484,258:.: 0.05:1.000:. ./.:4:417,222:.:-0.38:1.000:. ./.:4:395,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:600,347:.: 0.91:1.000:. ./.:4:620,312:.: 0.85:1.000:. ./.:4:430,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:492,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:588,701:.: 2.35:1.000:. ./.:4:405,232:.:-0.39:1.000:. ./.:4:590,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:455,243:.:-0.13:1.000:. ./.:4:240,111:.:-1.59:1.000:. ./.:4:369,162:.:-0.83:1.000:. ./.:4:486,549:.: 1.28:1.000:. ./.:4:488,591:.: 1.46:1.000:. ./.:4:563,631:.: 1.95:1.000:. ./.:4:564,304:.: 0.58:1.000:. ./.:4:329,1:.:-1.67:1.000:. ./.:4:501,277:.: 0.20:1.000:. ./.:4:469,252:.:-0.04:1.000:. ./.:4:345,209:.:-0.74:1.000:. ./.:4:406,500:.: 0.74:1.000:. ./.:4:466,272:.: 0.04:1.000:. ./.:4:408,228:.:-0.39:1.000:. ./.:4:481,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:384,470:.: 0.52:1.000:. ./.:4:412,256:.:-0.26:0.999:. ./.:4:400,456:.: 0.53:1.000:. ./.:4:439,211:.:-0.33:1.000:. ./.:4:363,203:.:-0.69:1.000:. ./.:4:323,370:.:-0.15:1.000:. ./.:4:401,228:.:-0.42:1.000:. ./.:4:364,420:.: 0.23:1.000:. ./.:4:387,244:.:-0.41:1.000:. ./.:4:390,207:.:-0.56:1.000:. ./.:4:509,281:.: 0.25:1.000:. ./.:4:545,319:.: 0.56:1.000:. ./.:4:475,242:.:-0.05:1.000:. ./.:4:387,34:.:-1.29:1.000:. ./.:4:537,582:.: 1.63:0.999:. ./.:4:546,323:.: 0.58:1.000:. ./.:4:558,648:.: 2.00:1.000:. ./.:4:373,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:509,258:.: 0.16:1.000:. -chr7.1 39298431 chr7.1_039298431 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:322,116:.: 0.45:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:304,88:.: 0.02:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:334,134:.: 0.73:1.000:. ./.:4:362,133:.: 0.99:1.000:. ./.:4:410,148:.: 1.57:1.000:. ./.:4:280,124:.: 0.14:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:110,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:86,38:.:-2.48:1.000:. ./.:4:557,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:195,253:.: 0.55:1.000:. ./.:4:373,132:.: 1.08:1.000:. ./.:4:361,123:.: 0.88:1.000:. ./.:4:376,114:.: 0.94:1.000:. ./.:4:330,137:.: 0.72:0.971:. ./.:4:529,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:394,158:.: 1.52:1.000:. ./.:4:71,28:.:-2.71:1.000:. ./.:4:320,110:.: 0.38:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:331,135:.: 0.72:1.000:. ./.:4:15,39:.:-3.13:1.000:. ./.:4:281,245:.: 1.28:1.000:. ./.:4:382,139:.: 1.23:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:280,245:.: 1.27:1.000:. ./.:4:457,143:.: 1.97:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:189,199:.:-0.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-3.25:1.000:. ./.:4:88,24:.:-2.59:1.000:. ./.:3:43,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:343,127:.: 0.75:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:172,208:.:-0.09:1.000:. ./.:4:341,110:.: 0.57:1.000:. ./.:4:355,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:274,79:.:-0.34:1.000:. ./.:4:236,77:.:-0.71:1.000:. ./.:4:358,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:249,104:.:-0.34:1.000:. ./.:4:476,4:.: 0.85:0.966:. ./.:4:509,183:.: 2.83:1.000:. ./.:4:272,85:.:-0.30:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:277,114:.: 0.01:1.000:. ./.:4:294,104:.: 0.08:1.000:. ./.:4:284,99:.:-0.06:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:218,215:.: 0.41:1.000:. ./.:4:232,97:.:-0.56:1.000:. ./.:6:253,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:330,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:325,102:.: 0.35:1.000:. ./.:4:318,112:.: 0.38:1.000:. ./.:4:279,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:352,112:.: 0.70:1.000:. ./.:4:166,176:.:-0.44:1.000:. ./.:4:202,73:.:-1.07:1.000:. ./.:4:287,83:.:-0.18:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.01:0.978:. ./.:4:235,99:.:-0.52:1.000:. ./.:4:355,110:.: 0.71:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:186,228:.: 0.23:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:275,96:.:-0.17:1.000:. ./.:4:161,212:.:-0.15:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:153,168:.:-0.64:1.000:. ./.:4:275,99:.:-0.14:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:263,1:.:-1.17:0.988:. ./.:4:175,204:.:-0.10:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:179,200:.:-0.10:1.000:. ./.:4:284,116:.: 0.10:1.000:. ./.:4:251,94:.:-0.42:1.000:. ./.:4:212,99:.:-0.73:1.000:. ./.:4:240,76:.:-0.69:1.000:. ./.:4:254,104:.:-0.29:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:389,4:.: 0.03:1.000:. ./.:4:246,93:.:-0.47:1.000:. ./.:4:273,106:.:-0.10:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:302,112:.: 0.23:1.000:. ./.:4:267,93:.:-0.28:1.000:. ./.:4:139,135:.:-1.08:1.000:. ./.:4:189,69:.:-1.23:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:330,118:.: 0.55:1.000:. ./.:4:242,81:.:-0.62:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:166,47:.:-1.65:1.000:. ./.:5:378,103:.: 0.86:0.985:. ./.:4:212,69:.:-1.01:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:619,1:.: 2.15:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:181,165:.:-0.41:1.000:. ./.:4:384,122:.: 1.09:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:391,106:.: 1.00:1.000:. ./.:4:233,87:.:-0.65:1.000:. ./.:4:293,92:.:-0.04:1.000:. ./.:4:206,185:.: 0.01:1.000:. ./.:4:223,90:.:-0.71:1.000:. ./.:4:254,91:.:-0.42:1.000:. ./.:4:248,97:.:-0.42:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,146:.:-1.12:1.000:. ./.:4:320,101:.: 0.29:1.000:. ./.:4:217,211:.: 0.36:1.000:. ./.:4:246,78:.:-0.61:1.000:. ./.:4:356,110:.: 0.72:1.000:. ./.:4:254,94:.:-0.39:1.000:. ./.:4:223,63:.:-0.97:1.000:. ./.:4:121,138:.:-1.22:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:229,96:.:-0.60:1.000:. ./.:4:328,102:.: 0.38:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:210,248:.: 0.64:1.000:. ./.:4:201,171:.:-0.16:1.000:. ./.:4:550,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:142,131:.:-1.09:1.000:. ./.:4:187,69:.:-1.25:1.000:. ./.:4:197,71:.:-1.13:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:247,87:.:-0.52:1.000:. ./.:4:259,118:.:-0.12:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:426,146:.: 1.71:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:189,224:.: 0.22:1.000:. ./.:4:221,228:.: 0.56:1.000:. ./.:4:342,126:.: 0.73:1.000:. ./.:4:196,229:.: 0.33:1.000:. ./.:4:521,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:306,143:.: 0.56:1.000:. ./.:4:68,26:.:-2.76:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:385,128:.: 1.15:1.000:. ./.:4:419,127:.: 1.46:1.000:. ./.:4:532,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:551,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:265,83:.:-0.39:1.000:. ./.:4:246,281:.: 1.28:1.000:. ./.:4:237,224:.: 0.67:1.000:. ./.:4:177,176:.:-0.34:1.000:. ./.:4:260,91:.:-0.36:1.000:. ./.:4:432,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:471,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:253,247:.: 1.03:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:242,103:.:-0.42:0.999:. ./.:4:302,100:.: 0.12:1.000:. ./.:4:497,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:233,87:.:-0.65:1.000:. ./.:4:292,94:.:-0.03:1.000:. ./.:4:254,287:.: 1.42:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:206,167:.:-0.15:1.000:. ./.:4:476,3:.: 0.84:0.999:. ./.:4:458,163:.: 2.16:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:331,109:.: 0.47:1.000:. ./.:4:287,114:.: 0.11:1.000:. -chr7.1 39612287 chr7.1_039612287 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:966,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:792,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:619,155:.:-0.73:1.000:. ./.:4:711,157:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1142,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:907,177:.: 0.97:1.000:. ./.:4:439,309:.:-0.87:1.000:. ./.:4:559,386:.: 0.21:1.000:. ./.:4:723,192:.: 0.04:1.000:. ./.:4:279,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:374,109:.:-2.33:1.000:. ./.:4:845,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:704,185:.:-0.10:1.000:. ./.:4:592,432:.: 0.64:1.000:. ./.:4:831,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:887,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1030,0:.: 0.68:0.971:. ./.:4:756,194:.: 0.24:1.000:. ./.:4:960,248:.: 1.65:1.000:. ./.:4:707,403:.: 1.12:1.000:. ./.:4:241,185:.:-2.64:1.000:. ./.:4:694,192:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1133,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:590,346:.: 0.16:1.000:. ./.:4:221,84:.:-3.31:1.000:. ./.:4:744,209:.: 0.25:1.000:. ./.:4:550,312:.:-0.25:1.000:. ./.:4:715,170:.:-0.12:1.000:. ./.:4:849,200:.: 0.78:1.000:. ./.:4:572,356:.: 0.12:1.000:. ./.:4:704,201:.:-0.01:1.000:. ./.:4:473,275:.:-0.87:1.000:. ./.:4:192,66:.:-3.57:1.000:. ./.:4:328,94:.:-2.66:1.000:. ./.:3:176,44:.:-3.77:1.000:. ./.:4:953,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:882,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:797,208:.: 0.54:1.000:. ./.:4:757,225:.: 0.41:1.000:. ./.:4:739,208:.: 0.22:1.000:. ./.:4:753,222:.: 0.37:1.000:. ./.:4:750,199:.: 0.23:1.000:. ./.:4:735,491:.: 1.75:1.000:. ./.:4:524,377:.:-0.03:1.000:. ./.:4:888,298:.: 1.53:1.000:. ./.:4:753,211:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1104,1:.: 1.09:0.966:. ./.:4:506,483:.: 0.45:1.000:. ./.:4:484,362:.:-0.34:1.000:. ./.:4:725,229:.: 0.26:1.000:. ./.:4:694,199:.:-0.08:1.000:. ./.:4:809,213:.: 0.63:1.000:. ./.:4:615,174:.:-0.65:1.000:. ./.:4:659,481:.: 1.28:1.000:. ./.:4:622,154:.:-0.72:1.000:. ./.:4:573,371:.: 0.20:1.000:. ./.:4:652,179:.:-0.42:1.000:. ./.:4:561,430:.: 0.46:1.000:. ./.:4:718,219:.: 0.16:1.000:. ./.:6:657,118:.:-0.73:1.000:. ./.:4:698,216:.: 0.04:1.000:. ./.:4:629,149:.:-0.71:1.000:. ./.:4:664,496:.: 1.39:1.000:. ./.:4:637,213:.:-0.31:1.000:. ./.:4:586,394:.: 0.40:1.000:. ./.:4:563,419:.: 0.41:1.000:. ./.:4:737,231:.: 0.34:1.000:. ./.:4:927,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:786,212:.: 0.50:0.978:. ./.:4:682,185:.:-0.22:1.000:. ./.:4:818,245:.: 0.86:1.000:. ./.:4:617,166:.:-0.68:0.999:. ./.:4:612,459:.: 0.90:1.000:. ./.:4:835,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:706,201:.: 0.00:1.000:. ./.:4:508,374:.:-0.14:1.000:. ./.:4:767,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:650,403:.: 0.80:1.000:. ./.:4:482,372:.:-0.29:1.000:. ./.:4:756,232:.: 0.45:1.000:. ./.:4:773,1:.:-0.73:0.988:. ./.:4:619,426:.: 0.76:1.000:. ./.:4:868,235:.: 1.08:1.000:. ./.:4:526,335:.:-0.25:1.000:. ./.:4:608,466:.: 0.92:1.000:. ./.:4:647,478:.: 1.20:1.000:. ./.:4:722,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:755,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:542,400:.: 0.19:1.000:. ./.:4:669,188:.:-0.27:1.000:. ./.:4:592,197:.:-0.65:1.000:. ./.:4:730,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:820,237:.: 0.82:1.000:. ./.:4:529,139:.:-1.31:1.000:. ./.:4:626,448:.: 0.92:1.000:. ./.:4:609,431:.: 0.73:1.000:. ./.:4:638,175:.:-0.52:1.000:. ./.:4:642,205:.:-0.33:1.000:. ./.:4:782,239:.: 0.63:1.000:. ./.:4:716,188:.:-0.02:1.000:. ./.:4:765,224:.: 0.45:1.000:. ./.:4:989,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:497,374:.:-0.20:1.000:. ./.:5:876,223:.: 1.06:0.985:. ./.:4:808,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:602,158:.:-0.81:1.000:. ./.:4:608,161:.:-0.76:1.000:. ./.:4:767,197:.: 0.31:1.000:. ./.:4:888,222:.: 1.12:1.000:. ./.:4:732,166:.:-0.05:1.000:. ./.:4:710,199:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1112,2:.: 1.14:1.000:. ./.:4:697,191:.:-0.10:0.999:. ./.:4:845,187:.: 0.69:1.000:. ./.:4:563,177:.:-0.92:1.000:. ./.:4:664,468:.: 1.24:1.000:. ./.:4:674,207:.:-0.14:1.000:. ./.:4:666,165:.:-0.42:1.000:. ./.:4:607,408:.: 0.59:1.000:. ./.:4:479,360:.:-0.37:1.000:. ./.:4:715,199:.: 0.04:1.000:. ./.:4:735,202:.: 0.16:1.000:. ./.:4:770,219:.: 0.45:1.000:. ./.:4:604,342:.: 0.21:1.000:. ./.:4:553,440:.: 0.47:1.000:. ./.:4:735,239:.: 0.37:1.000:. ./.:4:583,427:.: 0.57:1.000:. ./.:4:586,178:.:-0.79:1.000:. ./.:4:539,162:.:-1.13:1.000:. ./.:4:734,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:648,180:.:-0.43:1.000:. ./.:4:839,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:466,144:.:-1.63:1.000:. ./.:4:479,405:.:-0.13:1.000:. ./.:4:628,174:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1195,266:.: 3.04:1.000:. ./.:4:693,232:.: 0.10:1.000:. ./.:4:526,426:.: 0.25:1.000:. ./.:4:468,372:.:-0.37:1.000:. ./.:4:843,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:726,226:.: 0.25:1.000:. ./.:4:655,212:.:-0.22:1.000:. ./.:4:795,209:.: 0.53:1.000:. ./.:4:601,160:.:-0.80:1.000:. ./.:4:772,518:.: 2.10:1.000:. ./.:4:1014,271:.: 2.08:1.000:. ./.:4:788,198:.: 0.43:1.000:. ./.:4:704,196:.:-0.04:1.000:. ./.:4:694,476:.: 1.45:1.000:. ./.:4:645,168:.:-0.52:1.000:. ./.:4:928,195:.: 1.19:1.000:. ./.:4:659,157:.:-0.50:1.000:. ./.:4:249,51:.:-3.34:1.000:. ./.:4:519,135:.:-1.39:1.000:. ./.:4:748,211:.: 0.29:1.000:. ./.:4:565,395:.: 0.29:1.000:. ./.:4:886,216:.: 1.07:1.000:. ./.:4:862,191:.: 0.80:1.000:. ./.:4:504,292:.:-0.61:1.000:. ./.:4:775,184:.: 0.29:1.000:. ./.:4:648,135:.:-0.68:1.000:. ./.:4:536,154:.:-1.19:1.000:. ./.:4:541,332:.:-0.19:1.000:. ./.:4:871,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:757,198:.: 0.26:1.000:. ./.:4:607,392:.: 0.51:1.000:. ./.:4:857,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:746,185:.: 0.13:0.999:. ./.:4:581,359:.: 0.18:1.000:. ./.:4:726,171:.:-0.05:1.000:. ./.:4:802,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:687,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:760,237:.: 0.49:1.000:. ./.:4:840,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:780,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:436,312:.:-0.87:1.000:. ./.:4:845,211:.: 0.82:1.000:. ./.:4:875,222:.: 1.04:1.000:. ./.:4:922,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:711,178:.:-0.10:1.000:. ./.:4:848,221:.: 0.89:0.999:. ./.:4:984,254:.: 1.82:1.000:. ./.:4:997,242:.: 1.82:1.000:. ./.:4:537,310:.:-0.33:1.000:. ./.:4:763,201:.: 0.31:1.000:. -chr7.1 39990964 chr7.1_039990964 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:396,88:.: 0.51:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:409,106:.: 0.76:1.000:. ./.:4:397,103:.: 0.64:1.000:. ./.:4:701,1:.: 2.26:1.000:. ./.:4:278,66:.:-0.61:1.000:. ./.:4:553,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:379,113:.: 0.57:1.000:. ./.:4:115,23:.:-2.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:230,173:.:-0.14:1.000:. ./.:4:338,100:.: 0.14:1.000:. ./.:4:598,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:344,100:.: 0.19:1.000:. ./.:4:438,133:.: 1.21:1.000:. ./.:4:440,106:.: 1.01:0.971:. ./.:4:533,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:538,130:.: 1.99:1.000:. ./.:4:487,130:.: 1.58:1.000:. ./.:4:104,23:.:-2.36:1.000:. ./.:4:370,84:.: 0.27:1.000:. ./.:4:429,104:.: 0.90:1.000:. ./.:4:352,104:.: 0.28:1.000:. ./.:4:140,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:454,111:.: 1.16:1.000:. ./.:4:530,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:377,89:.: 0.36:1.000:. ./.:4:563,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:438,136:.: 1.23:1.000:. ./.:4:455,109:.: 1.15:1.000:. ./.:4:310,72:.:-0.31:1.000:. ./.:4:62,11:.:-2.79:1.000:. ./.:4:86,19:.:-2.53:1.000:. ./.:3:88,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:387,102:.: 0.55:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:426,105:.: 0.89:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:528,105:.: 1.70:1.000:. ./.:4:295,82:.:-0.35:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:285,75:.:-0.49:1.000:. ./.:4:297,81:.:-0.34:1.000:. ./.:4:345,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:434,114:.: 1.02:0.966:. ./.:4:239,69:.:-0.90:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:433,117:.: 1.04:1.000:. ./.:4:370,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:234,41:.:-1.17:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:247,75:.:-0.79:1.000:. ./.:4:324,85:.:-0.09:1.000:. ./.:4:297,55:.:-0.55:1.000:. ./.:6:251,35:.:-1.08:1.000:. ./.:4:300,52:.:-0.55:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:351,90:.: 0.16:1.000:. ./.:4:359,95:.: 0.27:1.000:. ./.:4:280,73:.:-0.54:1.000:. ./.:4:284,71:.:-0.53:1.000:. ./.:4:300,78:.:-0.34:1.000:. ./.:4:261,56:.:-0.83:0.978:. ./.:4:318,68:.:-0.28:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:287,69:.:-0.52:0.999:. ./.:4:350,94:.: 0.19:1.000:. ./.:4:383,86:.: 0.39:1.000:. ./.:4:315,85:.:-0.17:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:416,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:270,72:.:-0.63:1.000:. ./.:4:307,84:.:-0.24:1.000:. ./.:4:202,60:.:-1.27:0.988:. ./.:4:418,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:453,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:292,93:.:-0.29:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:210,41:.:-1.36:1.000:. ./.:4:243,53:.:-1.00:1.000:. ./.:4:268,62:.:-0.73:1.000:. ./.:4:272,56:.:-0.74:1.000:. ./.:4:236,54:.:-1.05:1.000:. ./.:4:300,84:.:-0.29:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:283,69:.:-0.55:1.000:. ./.:4:319,92:.:-0.08:1.000:. ./.:4:299,83:.:-0.31:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:294,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:462,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:243,0:.:-1.43:1.000:. ./.:5:433,0:.: 0.10:0.985:. ./.:4:249,53:.:-0.95:1.000:. ./.:4:256,57:.:-0.86:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:509,135:.: 1.79:1.000:. ./.:4:337,81:.:-0.02:1.000:. ./.:4:235,61:.:-1.00:1.000:. ./.:4:579,148:.: 2.46:1.000:. ./.:4:337,1:.:-0.66:0.999:. ./.:4:408,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:253,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:341,92:.: 0.10:1.000:. ./.:4:268,55:.:-0.78:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:332,92:.: 0.03:1.000:. ./.:4:296,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:389,105:.: 0.59:1.000:. ./.:4:246,67:.:-0.86:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:208,55:.:-1.27:1.000:. ./.:4:204,43:.:-1.39:1.000:. ./.:4:292,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:224,55:.:-1.14:1.000:. ./.:4:397,98:.: 0.60:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:514,125:.: 1.75:1.000:. ./.:4:314,79:.:-0.22:1.000:. ./.:4:236,59:.:-1.01:1.000:. ./.:4:210,45:.:-1.33:1.000:. ./.:4:267,41:.:-0.90:1.000:. ./.:4:259,70:.:-0.74:1.000:. ./.:4:317,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:230,48:.:-1.14:1.000:. ./.:4:477,98:.: 1.24:1.000:. ./.:4:679,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:438,117:.: 1.08:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:599,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:289,77:.:-0.44:1.000:. ./.:4:657,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,38:.:-2.36:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:559,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:514,103:.: 1.58:1.000:. ./.:4:484,124:.: 1.50:1.000:. ./.:4:302,79:.:-0.32:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:371,83:.: 0.27:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:378,98:.: 0.44:1.000:. ./.:4:415,101:.: 0.77:1.000:. ./.:4:522,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:475,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:425,92:.: 0.77:0.999:. ./.:4:432,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:397,91:.: 0.54:1.000:. ./.:4:292,73:.:-0.45:1.000:. ./.:4:321,80:.:-0.16:1.000:. ./.:4:327,85:.:-0.07:1.000:. ./.:4:335,84:.:-0.01:1.000:. ./.:4:341,73:.:-0.05:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:491,115:.: 1.49:1.000:. ./.:4:588,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:403,101:.: 0.67:1.000:. ./.:4:358,93:.: 0.24:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.07:0.999:. ./.:4:679,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:529,145:.: 2.03:1.000:. ./.:4:370,91:.: 0.32:1.000:. ./.:4:354,89:.: 0.18:1.000:. -chr7.1 40126845 chr7.1_040126845 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:537,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:394,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:286,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:280,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.68:0.971:. ./.:4:425,166:.: 1.34:1.000:. ./.:4:672,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:534,4:.: 0.75:1.000:. ./.:4:253,2:.:-2.35:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:571,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:155,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:508,3:.: 0.46:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:573,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:149,0:.:-3.52:1.000:. ./.:4:278,0:.:-2.10:1.000:. ./.:3:98,0:.:-4.08:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:591,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.97:0.966:. ./.:4:340,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.53:1.000:. ./.:6:442,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:564,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:280,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.50:0.978:. ./.:4:436,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:581,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:473,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:365,0:.:-1.15:0.988:. ./.:4:544,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:581,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:544,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:460,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:567,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:320,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:534,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:514,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:363,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:330,0:.:-1.53:1.000:. ./.:5:535,0:.: 0.72:0.985:. ./.:4:384,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:625,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:447,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:666,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:629,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:378,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:527,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:462,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:466,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:466,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:367,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:554,2:.: 0.95:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:372,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:366,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:663,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:648,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:514,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:590,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:172,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:459,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:362,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:438,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:621,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:685,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:597,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.38:1.000:. -chr7.1 40369149 chr7.1_040369149 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1256,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1245,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1248,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1349,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1421,2:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1700,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:1214,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1406,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1394,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:291,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:524,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:1360,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1267,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1457,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1284,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1523,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:1500,0:.: 1.02:0.971:. ./.:4:1059,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:2006,1:.: 2.62:1.000:. ./.:4:1724,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:478,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:1254,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1567,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1312,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:283,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:1806,2:.: 1.99:1.000:. ./.:4:1444,4:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1242,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1476,3:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1582,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:1593,3:.: 1.33:1.000:. ./.:4:1289,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:229,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:417,0:.:-2.38:1.000:. ./.:3:159,5:.:-3.18:1.000:. ./.:4:1451,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1518,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1495,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1319,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1693,3:.: 1.64:1.000:. ./.:4:1009,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1086,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1291,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1033,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1253,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1135,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1481,0:.: 0.96:0.966:. ./.:4:903,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1081,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1240,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:833,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1357,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:885,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1164,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1246,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1229,2:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1080,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1287,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1158,1:.:-0.05:1.000:. ./.:6:816,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1012,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:986,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1247,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1125,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1264,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1076,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1243,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1139,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1064,4:.:-0.33:0.978:. ./.:4:959,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1217,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1181,2:.: 0.03:0.999:. ./.:4:1403,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1269,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1018,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1003,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1000,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:961,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1106,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1197,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:861,1:.:-0.98:0.988:. ./.:4:1109,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1154,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:896,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:1242,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1126,2:.:-0.15:1.000:. ./.:4:857,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:849,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:952,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1011,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:989,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1014,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1223,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:903,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1247,4:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1228,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:757,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:954,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1023,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1248,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1002,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1039,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:686,2:.:-1.53:1.000:. ./.:5:1145,0:.:-0.09:0.985:. ./.:4:843,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1011,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:988,4:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1575,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:1562,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:1192,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:923,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1824,3:.: 2.05:1.000:. ./.:4:954,1:.:-0.69:0.999:. ./.:4:1435,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:819,3:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1017,2:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1005,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:953,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1000,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:872,3:.:-0.94:1.000:. ./.:4:1136,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:818,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:1144,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1388,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:921,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:973,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:1054,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1038,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:828,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:789,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:838,2:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1283,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:705,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1027,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:991,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1877,1:.: 2.21:1.000:. ./.:4:1241,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:832,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:815,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:810,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1027,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:935,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1264,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:784,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:1550,3:.: 1.19:1.000:. ./.:4:1590,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:1353,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1158,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1578,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:1051,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1784,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:1324,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:306,1:.:-2.73:1.000:. ./.:4:959,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1404,3:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1355,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1582,3:.: 1.29:1.000:. ./.:4:1636,2:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1077,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1460,4:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1354,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1074,3:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1302,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1285,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1512,3:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1409,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1425,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1389,0:.: 0.68:0.999:. ./.:4:1175,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1268,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1200,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1129,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1253,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1208,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1174,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1088,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1829,2:.: 2.07:1.000:. ./.:4:1420,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1683,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:1205,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1459,4:.: 0.91:0.999:. ./.:4:1873,2:.: 2.20:1.000:. ./.:4:1792,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:1298,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1182,1:.: 0.03:1.000:. -chr7.1 40509863 chr7.1_040509863 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:276,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.36:0.999:. ./.:4:220,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:23,0:.:-3.04:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:254,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.86:1.000:. ./.:3:17,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:218,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.13:0.966:. ./.:4:238,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:191,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:146,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.48:0.978:. ./.:4:242,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.20:0.999:. ./.:4:220,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:203,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.31:0.988:. ./.:4:184,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:156,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:113,1:.:-1.40:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.53:1.000:. ./.:5:160,0:.:-0.58:0.985:. ./.:4:142,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.49:0.999:. ./.:4:207,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:185,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:226,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:265,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.00:0.999:. ./.:4:264,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.95:1.000:. -chr7.1 40953761 chr7.1_040953761 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:112,98:0.46: 0.46:1.000:0.985 0/0/1/1:4:135,123:0.47: 1.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:87,74:0.45:-0.24:1.000:0.979 0/0/1/1:4:104,88:0.45: 0.20:1.000:0.977 0/0/1/1:4:75,80:0.51:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,112:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,63:0.58:-0.98:1.000:0.927 0/1/1/1:4:100,168:0.63: 1.29:1.000:0.589 1/1/1/1:4:0,174:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-2.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,92:0.58:-0.28:1.000:0.909 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,165:0.66: 1.09:1.000:0.854 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,105:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,100:0.51: 0.22:0.999:0.996 0/1/1/1:4:89,204:0.71: 1.64:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,258:1.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,104:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,29:0.42:-1.58:1.000:0.922 0/1/1/1:4:98,167:0.64: 1.24:1.000:0.637 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,80:0.51:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,23:0.32:-1.54:1.000:0.960 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,225:0.68: 2.24:1.000:0.960 0/0/1/1:4:82,90:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:174,89:0.33: 1.21:1.000:0.931 0/0/1/1:4:128,112:0.46: 0.89:1.000:0.985 0/0/1/1:4:109,99:0.47: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:197,101:0.33: 1.71:1.000:0.930 0/0/1/1:4:11,7:0.38:-2.28:1.000:0.541 0/1/1/1:4:34,64:0.66:-1.14:1.000:0.880 1/1/1:3:6,36:0.87:-1.94:1.000:0.832 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,80:0.28: 1.33:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,94:0.31: 1.64:1.000:0.974 0/0/1/1:4:122,187:0.61: 1.87:1.000:0.721 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,154:0.65: 0.86:1.000:0.833 0/0/0/1:4:160,80:0.32: 0.89:1.000:0.948 0/0/1/1:4:62,79:0.56:-0.53:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,165:1.00:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-1.00:0.807:1.000 0/0/1/1:4:53,37:0.40:-1.25:1.000:0.792 0/0/1/1:4:86,124:0.59: 0.46:1.000:0.860 0/0/1/1:4:66,59:0.46:-0.75:1.000:0.988 0/1/1/1:4:55,118:0.69:-0.07:1.000:0.980 0/1/1/1:4:93,163:0.64: 1.12:1.000:0.724 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,144:0.66: 0.62:1.000:0.869 0/0/1/1:4:71,70:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,73:0.33: 0.47:1.000:0.899 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,84:0.33: 0.99:1.000:0.925 0/1/1/1:4:72,162:0.71: 0.80:1.000:0.990 0/0/0/1/1/1:6:42,52:0.55:-1.20:1.000:0.754 0/0/1/1:4:65,66:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,181:0.66: 1.40:1.000:0.897 0/0/1/1:4:90,65:0.41:-0.33:1.000:0.854 0/0/1/1:4:88,80:0.47:-0.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:137,81:0.36: 0.57:1.000:0.683 0/1/1/1:4:55,91:0.63:-0.45:1.000:0.535 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,137:1.00:-0.58:0.978:1.000 0/0/0/1:4:134,80:0.36: 0.52:1.000:0.655 0/0/0/0:4:161,1:0.01:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-1.32:0.999:1.000 0/0/0/0:4:312,0:0.00: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,73:0.31: 0.74:1.000:0.979 0/0/1/1:4:135,146:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,58:0.51:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,137:0.46: 1.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:77,67:0.45:-0.48:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,137:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,52:0.32:-0.27:0.988:0.963 0/0/0/1:4:189,69:0.26: 1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,155:0.67: 0.80:1.000:0.930 0/0/0/1:4:149,65:0.29: 0.52:1.000:0.990 0/0/1/1:4:122,86:0.40: 0.43:1.000:0.812 0/0/0/1:4:156,62:0.27: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,51:0.47:-1.01:1.000:0.991 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,62:0.53:-0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:56,70:0.55:-0.74:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,58:0.46:-0.78:1.000:0.988 0/0/1/1:4:73,71:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,65:0.53:-0.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,65:0.46:-0.57:1.000:0.988 0/0/1/1:4:82,58:0.40:-0.54:1.000:0.818 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,53:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,156:0.67: 0.84:1.000:0.910 0/0/1/1:4:163,139:0.45: 1.77:1.000:0.979 0/0/0/1:4:100,46:0.30:-0.45:1.000:0.981 0/0/1/1:4:62,78:0.55:-0.54:1.000:0.977 0/1/1/1:4:50,85:0.64:-0.61:1.000:0.629 0/0/0/0/1:5:114,50:0.29:-0.20:0.985:0.586 0/0/1/1:4:61,53:0.45:-0.91:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,100:0.57:-0.05:1.000:0.939 0/1/1/1:4:94,179:0.66: 1.36:1.000:0.896 0/0/1/1:4:96,120:0.55: 0.54:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,107:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,133:0.71: 0.19:0.999:0.992 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,52:0.48:-1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,77:0.54:-0.54:1.000:0.984 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,65:0.52:-0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,118:0.69:-0.05:1.000:0.974 0/1/1/1:4:42,114:0.75:-0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,60:0.34:-0.08:1.000:0.883 0/0/0/1:4:153,77:0.32: 0.74:1.000:0.944 0/0/0/1:4:197,103:0.33: 1.74:1.000:0.911 0/0/1/1:4:54,64:0.54:-0.85:1.000:0.990 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,54:0.49:-1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,67:0.37:-0.05:1.000:0.510 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,47:0.45:-1.10:1.000:0.984 0/1/1/1:4:49,106:0.70:-0.33:1.000:0.982 0/0/1/1:4:78,76:0.48:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,75:0.72:-1.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:208,61:0.22: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,68:0.33: 0.27:1.000:0.903 0/0/1/1:4:88,85:0.48:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,83:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:131,57:0.29: 0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,69:0.58:-0.84:1.000:0.920 0/0/1/1:4:60,62:0.50:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,74:0.57:-0.68:1.000:0.955 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,155:0.50: 1.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,49:0.46:-1.05:1.000:0.988 0/0/1/1:4:87,85:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:100,228:0.71: 2.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,78:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,198:0.68: 1.70:1.000:0.946 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,106:0.31: 2.13:1.000:0.969 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-2.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,154:0.68: 0.76:1.000:0.946 0/1/1/1:4:94,196:0.69: 1.60:1.000:0.970 0/1/1/1:4:72,153:0.69: 0.67:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,218:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,102:0.55: 0.09:1.000:0.980 0/0/1/1:4:81,98:0.54: 0.02:1.000:0.986 0/0/0/0:4:292,0:0.00: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:228,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,139:0.62: 0.66:1.000:0.506 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,108:0.52: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:245,84:0.24: 2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,78:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:165,84:0.33: 1.02:0.999:0.935 0/1/1/1:4:101,179:0.65: 1.46:1.000:0.755 1/1/1/1:4:0,157:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,172:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,65:0.47:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:144,85:0.36: 0.73:1.000:0.687 0/0/0/0:4:226,1:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,162:0.74: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:160,15:0.08:-0.04:1.000:0.984 0/1/1/1:4:92,195:0.69: 1.56:0.999:0.976 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,78:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,97:0.34: 1.44:1.000:0.890 -chr7.1 41256682 chr7.1_041256682 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:217,59:.: 0.94:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:246,82:.: 1.85:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:184,62:.: 0.41:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:186,58:.: 0.38:1.000:. ./.:4:199,59:.: 0.62:1.000:. ./.:4:158,50:.:-0.25:0.999:. ./.:4:263,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:315,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:185,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:34,1:.:-3.27:1.000:. ./.:4:174,60:.: 0.20:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:214,80:.: 1.25:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:210,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:139,47:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:48,13:.:-2.82:1.000:. ./.:3:32,2:.:-3.29:1.000:. ./.:4:191,41:.: 0.17:1.000:. ./.:4:171,50:.:-0.02:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:133,34:.:-0.97:1.000:. ./.:4:184,47:.: 0.15:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:258,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.34:0.807:. ./.:4:58,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:172,51:.: 0.01:1.000:. ./.:4:147,50:.:-0.44:1.000:. ./.:6:187,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:161,55:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,41:.:-1.23:1.000:. ./.:4:209,61:.: 0.83:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.13:0.978:. ./.:4:225,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:200,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:122,40:.:-1.05:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:148,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.03:0.988:. ./.:4:241,70:.: 1.55:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:181,51:.: 0.17:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:133,36:.:-0.93:1.000:. ./.:4:140,51:.:-0.55:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:164,60:.: 0.03:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:147,64:.:-0.20:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:222,52:.: 0.90:1.000:. ./.:4:140,44:.:-0.67:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.90:1.000:. ./.:5:305,0:.: 1.44:0.985:. ./.:4:120,45:.:-1.00:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:340,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:178,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:213,63:.: 0.94:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:231,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:129,44:.:-0.86:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:172,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:203,52:.: 0.57:1.000:. ./.:4:188,58:.: 0.41:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:102,35:.:-1.49:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:115,45:.:-1.09:1.000:. ./.:4:171,61:.: 0.17:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:173,59:.: 0.17:1.000:. ./.:4:191,59:.: 0.48:1.000:. ./.:4:360,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:167,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:167,64:.: 0.15:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:170,58:.: 0.10:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:267,109:.: 2.68:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:198,72:.: 0.83:1.000:. ./.:4:295,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:154,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:207,52:.: 0.64:1.000:. ./.:4:166,54:.:-0.04:1.000:. ./.:4:158,62:.:-0.04:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:231,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:173,65:.: 0.27:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:266,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:212,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:121,45:.:-0.98:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:173,63:.: 0.24:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:155,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.32:0.999:. ./.:4:287,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:214,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.13:1.000:. -chr7.1 42023850 chr7.1_042023850 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:118,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:122,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.47:0.807:. ./.:4:26,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.81:1.000:. ./.:6:64,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:154,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:176,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.26:0.978:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:88,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:101,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.04:1.000:. ./.:5:77,0:.: 0.04:0.985:. ./.:4:40,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:140,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:109,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:162,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:153,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:111,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:122,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:127,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.50:1.000:. -chr7.1 42343261 chr7.1_042343261 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:68,34:.: 0.36:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:97,36:.: 1.45:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:80,33:.: 0.75:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:58,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:59,28:.:-0.16:1.000:. ./.:4:64,23:.:-0.16:0.999:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:100,27:.: 1.24:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:28,9:.:-1.92:1.000:. ./.:4:51,18:.:-0.80:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:91,42:.: 1.45:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:74,34:.: 0.57:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:44,13:.:-1.22:1.000:. ./.:3:27,3:.:-2.17:1.000:. ./.:4:53,24:.:-0.52:1.000:. ./.:4:60,27:.:-0.16:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:43,26:.:-0.80:1.000:. ./.:4:66,23:.:-0.09:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.87:0.807:. ./.:4:79,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,34:.: 0.61:1.000:. ./.:4:98,23:.: 1.03:1.000:. ./.:6:75,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,26:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:33,31:.:-0.97:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.61:0.978:. ./.:4:130,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.01:0.999:. ./.:4:92,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:91,35:.: 1.21:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:104,28:.: 1.42:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.15:0.988:. ./.:4:97,30:.: 1.24:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:100,26:.: 1.21:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:56,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:38,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:66,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:122,33:.: 2.23:1.000:. ./.:4:35,19:.:-1.33:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.01:1.000:. ./.:5:113,0:.: 0.75:0.985:. ./.:4:44,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:154,1:.: 2.23:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:75,36:.: 0.68:1.000:. ./.:4:79,38:.: 0.89:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.64:0.999:. ./.:4:50,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:57,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.26:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:139,44:.: 3.21:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:44,18:.:-1.04:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:103,43:.: 1.91:1.000:. ./.:4:59,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:59,19:.:-0.48:1.000:. ./.:4:59,29:.:-0.13:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:88,29:.: 0.89:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,39:.: 0.64:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:97,23:.: 1.00:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:103,39:.: 1.77:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.26:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:65,32:.: 0.19:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:69,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:88,32:.: 1.00:1.000:. ./.:4:53,20:.:-0.66:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:112,37:.: 2.02:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.59:0.999:. ./.:4:97,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:93,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:35,12:.:-1.57:1.000:. ./.:4:73,2:.:-0.59:1.000:. ./.:4:70,45:.: 0.82:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:74,23:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:70,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:155,2:.: 2.30:1.000:. -chr7.1 42424238 chr7.1_042424238 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:52,54:0.47:-0.14:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,46:0.48:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,24:0.29:-0.64:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,93:0.99:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,70:0.55: 0.22:1.000:0.981 0/0/0/1:4:55,33:0.37:-0.67:1.000:0.543 0/0/1/1:4:19,24:0.51:-2.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,17:0.27:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,43:0.54:-1.11:1.000:0.984 0/1/1/1:4:7,28:0.77:-2.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,24:0.69:-2.30:1.000:0.980 0/1/1/1:4:17,72:0.78:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,39:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,72:0.53: 0.42:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,116:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,43:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,87:0.76: 0.01:0.999:1.000 0/0/1/1:4:38,50:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,89:0.72: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,93:0.71: 0.42:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,30:0.70:-2.06:1.000:0.985 0/1/1/1:4:24,88:0.76: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,101:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,55:0.53:-0.46:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,16:0.63:-2.56:1.000:0.550 0/1/1/1:4:26,83:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,17:0.33:-1.70:1.000:0.916 0/1/1/1:4:12,56:0.80:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,77:0.55: 0.57:1.000:0.981 0/0/1/1:4:30,49:0.58:-0.94:1.000:0.919 0/1/1/1:4:27,77:0.71:-0.20:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,42:0.71:-1.59:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-2.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,46:0.87:-1.73:1.000:0.909 1/1/1:3:0,5:1.00:-3.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,56:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,67:0.60:-0.17:1.000:0.807 0/0/1/1:4:61,41:0.39:-0.26:1.000:0.709 0/1/1/1:4:26,96:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,129:0.82: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,66:0.55: 0.04:1.000:0.984 0/0/1/1:4:50,65:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,74:0.64:-0.02:1.000:0.636 0/0/1/1:4:61,86:0.54: 1.07:1.000:0.987 0/0/1/1:4:54,102:0.62: 1.34:1.000:0.631 0/0/1/1:4:38,61:0.57:-0.35:0.807:0.935 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,34:0.39:-0.73:1.000:0.653 1/1/1/1:4:0,136:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,126:0.84: 1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,101:0.62: 1.28:1.000:0.604 0/0/1/1:4:62,72:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,46:0.36: 0.57:1.000:0.735 0/0/0/1:4:75,34:0.32:-0.05:1.000:0.940 0/0/1/1:4:46,75:0.58: 0.31:1.000:0.921 0/0/1/1:4:70,84:0.50: 1.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,106:0.84: 0.36:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,128:0.82: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1/1/1:6:15,111:0.87: 0.45:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,55:0.47:-0.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:70,82:0.49: 1.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,154:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,120:0.86: 0.78:1.000:0.966 1/1/1/1:4:12,112:0.89: 0.39:1.000:0.547 0/1/1/1:4:15,89:0.84:-0.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,138:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,123:0.80: 1.16:0.978:1.000 0/0/1/1:4:34,50:0.55:-0.79:1.000:0.978 0/1/1/1:4:42,104:0.68: 1.04:1.000:0.950 0/1/1/1:4:18,79:0.79:-0.40:0.999:1.000 0/1/1/1:4:46,92:0.63: 0.81:1.000:0.550 0/1/1/1:4:33,106:0.73: 0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,90:0.57: 1.10:1.000:0.957 0/0/1/1:4:48,67:0.54: 0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:52,72:0.54: 0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,86:0.59: 0.78:1.000:0.882 0/1/1/1:4:31,128:0.78: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,77:0.53: 0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:10,72:0.86:-0.85:0.988:0.957 0/1/1/1:4:33,149:0.80: 2.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,105:0.62: 1.46:1.000:0.599 0/1/1/1:4:16,90:0.83:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,138:0.84: 1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,98:0.55: 1.58:1.000:0.975 0/1/1/1:4:26,56:0.65:-0.85:1.000:0.761 1/1/1/1:4:0,149:1.00: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,126:0.83: 1.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,63:0.60:-0.35:1.000:0.822 0/1/1/1:4:28,124:0.79: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,45:0.37: 0.33:1.000:0.603 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,84:0.56: 0.84:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 2.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,70:0.60:-0.02:1.000:0.822 0/0/1/1:4:56,104:0.61: 1.46:1.000:0.681 0/1/1/1:4:25,133:0.82: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,72:0.60: 0.07:1.000:0.815 0/0/1/1:4:70,80:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,35:0.38:-0.58:1.000:0.552 0/0/1/1/1:5:65,85:0.52: 1.16:0.985:0.694 0/1/1/1:4:29,67:0.66:-0.43:1.000:0.887 0/0/1/1:4:56,81:0.55: 0.78:1.000:0.982 0/0/1/1:4:54,71:0.52: 0.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,81:0.82:-0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,152:1.00: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,98:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,110:0.80: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,51:0.46:-0.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:65,97:0.56: 1.52:0.999:0.974 0/1/1/1:4:42,132:0.73: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,30:0.39:-1.08:1.000:0.736 0/0/1/1:4:62,99:0.57: 1.49:1.000:0.939 0/1/1/1:4:36,85:0.67: 0.31:1.000:0.912 0/0/1/1:4:49,37:0.41:-0.73:1.000:0.879 0/0/1/1:4:45,82:0.61: 0.48:1.000:0.732 0/0/0/1:4:82,22:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,83:0.54: 0.90:1.000:0.985 0/0/1/1:4:43,74:0.59: 0.19:1.000:0.852 0/0/0/1:4:88,39:0.32: 0.48:1.000:0.951 0/1/1/1:4:17,43:0.68:-1.50:1.000:0.961 0/1/1/1:4:35,77:0.65: 0.04:1.000:0.807 0/0/1/1:4:55,76:0.54: 0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:46,70:0.56: 0.16:1.000:0.966 0/1/1/1:4:22,62:0.71:-0.79:1.000:0.990 0/1/1/1:4:27,56:0.64:-0.82:1.000:0.662 0/1/1/1:4:30,67:0.66:-0.40:1.000:0.835 0/1/1/1:4:15,115:0.87: 0.57:1.000:0.909 0/0/1/1:4:38,51:0.53:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,48:0.48:-0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,122:0.88: 0.78:1.000:0.826 0/0/1/1:4:34,66:0.62:-0.32:1.000:0.546 0/1/1/1:4:20,84:0.78:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,97:0.80: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,76:0.54: 0.57:1.000:0.988 0/0/1/1:4:49,86:0.60: 0.72:1.000:0.817 0/1/1/1:4:28,135:0.81: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,89:0.59: 0.93:1.000:0.888 0/1/1/1:4:18,71:0.77:-0.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,61:0.49: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,116:0.82: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,69:0.65:-0.32:1.000:0.829 0/1/1/1:4:21,86:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,29:0.32:-0.46:1.000:0.954 0/0/1/1:4:55,73:0.52: 0.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,92:0.81: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,46:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,37:0.80:-1.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,57:0.88:-1.38:1.000:0.824 0/0/0/1:4:68,32:0.33:-0.32:1.000:0.918 0/0/0/1:4:72,35:0.34:-0.11:1.000:0.893 0/0/1/1:4:48,69:0.55: 0.19:1.000:0.984 0/1/1/1:4:30,86:0.71: 0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:21,75:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,66:0.57:-0.11:1.000:0.932 0/0/1/1:4:45,57:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,54:0.58:-0.70:1.000:0.918 0/0/1/1:4:54,36:0.39:-0.61:1.000:0.693 0/1/1/1:4:19,80:0.78:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,67:0.76:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,87:0.81:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,54:0.61:-0.82:1.000:0.673 0/0/1/1:4:52,63:0.50: 0.13:0.999:0.997 0/0/0/1:4:48,23:0.33:-1.17:1.000:0.905 0/1/1/1:4:16,76:0.80:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,53:0.75:-1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,40:0.46:-0.91:1.000:0.990 0/1/1/1:4:23,68:0.72:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,74:0.57: 0.28:1.000:0.933 0/1/1/1:4:15,95:0.85:-0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:37,29:0.42:-1.32:1.000:0.912 0/0/1/1:4:46,45:0.46:-0.58:1.000:0.988 0/1/1/1:4:20,109:0.83: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,80:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,54:0.68:-1.03:1.000:0.944 0/0/1/1:4:36,57:0.57:-0.52:0.999:0.945 0/0/1/1:4:43,63:0.55:-0.14:1.000:0.979 0/0/1/1:4:53,67:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,44:0.53:-1.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:37,57:0.56:-0.49:1.000:0.961 -chr7.1 42689702 chr7.1_042689702 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:692,143:.: 1.30:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:585,131:.: 0.73:1.000:. ./.:4:402,150:.:-0.06:1.000:. ./.:4:707,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:613,109:.: 0.76:1.000:. ./.:4:572,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:513,101:.: 0.24:1.000:. ./.:4:130,32:.:-1.92:1.000:. ./.:4:152,28:.:-1.83:1.000:. ./.:4:125,220:.:-1.04:1.000:. ./.:4:361,142:.:-0.29:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:297,121:.:-0.70:1.000:. ./.:4:296,123:.:-0.69:1.000:. ./.:4:153,109:.:-1.44:0.999:. ./.:4:855,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:640,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:675,167:.: 1.33:1.000:. ./.:4:162,23:.:-1.81:1.000:. ./.:4:310,147:.:-0.51:1.000:. ./.:4:729,189:.: 1.69:1.000:. ./.:4:627,111:.: 0.83:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:286,121:.:-0.75:1.000:. ./.:4:792,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:594,115:.: 0.69:1.000:. ./.:4:503,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:631,109:.: 0.84:1.000:. ./.:4:408,96:.:-0.29:1.000:. ./.:4:333,104:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,16:.:-2.36:1.000:. ./.:4:96,29:.:-2.10:1.000:. ./.:3:53,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:473,131:.: 0.19:1.000:. ./.:4:313,139:.:-0.53:1.000:. ./.:4:621,154:.: 1.01:1.000:. ./.:4:342,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:246,100:.:-1.04:1.000:. ./.:4:362,130:.:-0.34:1.000:. ./.:4:715,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:764,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:682,89:.: 0.99:1.000:. ./.:4:509,112:.: 0.27:1.000:. ./.:4:524,144:.: 0.50:1.000:. ./.:4:558,159:.: 0.73:0.807:. ./.:4:166,36:.:-1.73:1.000:. ./.:4:588,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:234,57:.:-1.30:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:968,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:446,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:797,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:618,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:750,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:495,112:.: 0.21:1.000:. ./.:4:480,118:.: 0.16:1.000:. ./.:4:250,96:.:-1.04:1.000:. ./.:6:463,63:.:-0.18:1.000:. ./.:4:598,139:.: 0.83:1.000:. ./.:4:715,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:347,79:.:-0.66:1.000:. ./.:4:652,126:.: 1.02:1.000:. ./.:4:427,97:.:-0.19:1.000:. ./.:4:170,75:.:-1.52:1.000:. ./.:4:172,138:.:-1.21:1.000:. ./.:4:458,111:.: 0.03:0.978:. ./.:4:299,140:.:-0.60:1.000:. ./.:4:852,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:364,85:.:-0.55:0.999:. ./.:4:456,101:.:-0.03:1.000:. ./.:4:721,142:.: 1.43:1.000:. ./.:4:323,118:.:-0.59:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:495,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:474,91:.: 0.01:1.000:. ./.:4:530,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:380,89:.:-0.45:0.988:. ./.:4:437,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:787,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:290,121:.:-0.73:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:778,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:265,101:.:-0.94:1.000:. ./.:4:160,98:.:-1.46:1.000:. ./.:4:354,117:.:-0.44:1.000:. ./.:4:415,132:.:-0.08:1.000:. ./.:4:508,98:.: 0.20:1.000:. ./.:4:175,93:.:-1.41:1.000:. ./.:4:596,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:507,112:.: 0.26:1.000:. ./.:4:603,111:.: 0.72:1.000:. ./.:4:489,97:.: 0.11:1.000:. ./.:4:288,105:.:-0.82:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:708,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:493,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:625,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:337,0:.:-1.08:1.000:. ./.:5:794,0:.: 1.10:0.985:. ./.:4:298,93:.:-0.82:1.000:. ./.:4:385,89:.:-0.43:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:515,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:830,181:.: 2.14:1.000:. ./.:4:372,111:.:-0.39:1.000:. ./.:4:380,105:.:-0.38:1.000:. ./.:4:332,136:.:-0.46:1.000:. ./.:4:675,0:.: 0.53:0.999:. ./.:4:485,116:.: 0.18:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:781,144:.: 1.73:1.000:. ./.:4:560,94:.: 0.43:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:513,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:518,121:.: 0.36:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:543,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:545,167:.: 0.71:1.000:. ./.:4:667,118:.: 1.06:1.000:. ./.:4:816,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:611,111:.: 0.76:1.000:. ./.:4:227,86:.:-1.20:1.000:. ./.:4:250,59:.:-1.22:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:300,93:.:-0.82:1.000:. ./.:4:261,119:.:-0.88:1.000:. ./.:4:343,61:.:-0.76:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:730,142:.: 1.47:1.000:. ./.:4:747,120:.: 1.45:1.000:. ./.:4:430,93:.:-0.19:1.000:. ./.:4:835,123:.: 1.88:1.000:. ./.:4:275,85:.:-0.97:1.000:. ./.:4:865,107:.: 1.95:1.000:. ./.:4:528,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:413,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:347,67:.:-0.71:1.000:. ./.:4:1055,150:.: 3.06:1.000:. ./.:4:525,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:546,128:.: 0.53:1.000:. ./.:4:534,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:656,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:507,95:.: 0.18:1.000:. ./.:4:815,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:713,0:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:628,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:694,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:760,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:910,153:.: 2.38:1.000:. ./.:4:663,129:.: 1.09:1.000:. ./.:4:630,136:.: 0.97:1.000:. ./.:4:587,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:500,117:.: 0.25:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:579,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:650,162:.: 1.19:1.000:. ./.:4:639,128:.: 0.97:1.000:. ./.:4:625,3:.: 0.31:1.000:. ./.:4:446,3:.:-0.55:1.000:. ./.:4:259,133:.:-0.82:0.999:. ./.:4:782,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:492,133:.: 0.29:1.000:. ./.:4:534,137:.: 0.51:1.000:. ./.:4:305,85:.:-0.83:1.000:. ./.:4:612,153:.: 0.96:1.000:. ./.:4:338,124:.:-0.49:1.000:. ./.:4:125,78:.:-1.72:1.000:. ./.:4:602,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:508,127:.: 0.34:1.000:. ./.:4:506,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:585,119:.: 0.67:1.000:. ./.:4:307,114:.:-0.68:1.000:. ./.:4:888,4:.: 1.57:0.999:. ./.:4:966,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:787,197:.: 2.01:1.000:. ./.:4:434,108:.:-0.10:1.000:. ./.:4:303,148:.:-0.54:1.000:. -chr7.1 42860899 chr7.1_042860899 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:499,141:.: 1.99:1.000:. ./.:4:231,242:.: 0.57:1.000:. ./.:4:139,146:.:-1.02:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:481,169:.: 2.08:1.000:. ./.:4:148,143:.:-0.97:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:131,145:.:-1.10:1.000:. ./.:4:351,148:.: 0.80:1.000:. ./.:4:150,97:.:-1.34:1.000:. ./.:4:213,8:.:-1.56:1.000:. ./.:4:393,145:.: 1.13:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:141,146:.:-1.00:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:374,126:.: 0.80:1.000:. ./.:4:294,130:.: 0.16:0.999:. ./.:4:441,171:.: 1.75:1.000:. ./.:4:374,165:.: 1.13:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:365,144:.: 0.88:1.000:. ./.:4:460,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:54,64:.:-2.44:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:241,142:.:-0.19:1.000:. ./.:4:533,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:151,157:.:-0.82:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:474,160:.: 1.94:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:158,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:274,112:.:-0.16:1.000:. ./.:3:88,11:.:-2.60:1.000:. ./.:4:537,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:390,128:.: 0.96:1.000:. ./.:4:409,132:.: 1.15:1.000:. ./.:4:268,149:.: 0.10:1.000:. ./.:4:428,158:.: 1.53:1.000:. ./.:4:241,126:.:-0.32:1.000:. ./.:4:430,154:.: 1.52:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:503,157:.: 2.16:1.000:. ./.:4:415,128:.: 1.17:1.000:. ./.:4:305,162:.: 0.52:0.807:. ./.:4:272,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:232,118:.:-0.47:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:267,125:.:-0.11:1.000:. ./.:4:444,141:.: 1.52:1.000:. ./.:4:404,154:.: 1.30:1.000:. ./.:4:322,140:.: 0.48:1.000:. ./.:4:138,126:.:-1.20:1.000:. ./.:4:465,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:399,107:.: 0.85:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:428,138:.: 1.36:1.000:. ./.:6:342,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:274,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:181,193:.:-0.26:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:277,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:314,102:.: 0.09:1.000:. ./.:4:377,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:282,172:.: 0.41:0.978:. ./.:4:255,117:.:-0.28:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:249,126:.:-0.26:0.999:. ./.:4:332,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:433,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:283,150:.: 0.24:1.000:. ./.:4:277,135:.: 0.06:1.000:. ./.:4:239,128:.:-0.32:1.000:. ./.:4:252,163:.: 0.08:1.000:. ./.:4:260,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:423,151:.: 1.43:1.000:. ./.:4:313,124:.: 0.27:0.988:. ./.:4:430,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:469,155:.: 1.86:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:252,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:301,101:.:-0.03:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:241,2:.:-1.38:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:330,113:.: 0.32:1.000:. ./.:4:273,111:.:-0.18:1.000:. ./.:4:178,156:.:-0.60:1.000:. ./.:4:278,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:456,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:256,115:.:-0.29:1.000:. ./.:4:449,144:.: 1.59:1.000:. ./.:4:432,150:.: 1.50:1.000:. ./.:4:116,106:.:-1.55:1.000:. ./.:4:323,148:.: 0.56:1.000:. ./.:4:193,103:.:-0.93:1.000:. ./.:5:296,134:.: 0.21:0.985:. ./.:4:250,107:.:-0.41:1.000:. ./.:4:349,133:.: 0.65:1.000:. ./.:4:333,106:.: 0.29:1.000:. ./.:4:301,138:.: 0.29:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:238,151:.:-0.14:1.000:. ./.:4:248,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:500,168:.: 2.23:1.000:. ./.:4:411,130:.: 1.15:0.999:. ./.:4:322,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:131,109:.:-1.40:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:126,148:.:-1.11:1.000:. ./.:4:132,119:.:-1.31:1.000:. ./.:4:286,122:.: 0.02:1.000:. ./.:4:449,160:.: 1.73:1.000:. ./.:4:119,122:.:-1.39:1.000:. ./.:4:289,155:.: 0.33:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:406,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:241,104:.:-0.51:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:197,99:.:-0.93:1.000:. ./.:4:378,115:.: 0.74:1.000:. ./.:4:345,119:.: 0.50:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:133,139:.:-1.13:1.000:. ./.:4:744,0:.: 2.87:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:360,113:.: 0.57:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:273,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:361,149:.: 0.89:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:506,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:323,187:.: 0.89:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:277,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:282,187:.: 0.54:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:108,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:212,107:.:-0.73:1.000:. ./.:4:361,161:.: 0.99:1.000:. ./.:4:274,133:.: 0.01:1.000:. ./.:4:472,166:.: 1.97:1.000:. ./.:4:621,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:450,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:406,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:255,135:.:-0.13:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:582,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:244,116:.:-0.38:1.000:. ./.:4:261,131:.:-0.11:0.999:. ./.:4:281,121:.:-0.03:1.000:. ./.:4:256,144:.:-0.04:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:213,107:.:-0.72:1.000:. ./.:4:248,161:.: 0.03:1.000:. ./.:4:242,126:.:-0.32:1.000:. ./.:4:222,124:.:-0.50:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:256,127:.:-0.19:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:241,12:.:-1.29:1.000:. ./.:4:469,173:.: 2.01:0.999:. ./.:4:338,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:497,195:.: 2.43:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:273,133:.: 0.01:1.000:. -chr7.1 42908612 chr7.1_042908612 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:202,57:0.23: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,75:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,81:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,32:0.22:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,54:0.23: 1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,101:0.55: 0.54:1.000:0.981 0/0/1/1:4:45,34:0.45:-1.61:1.000:0.977 0/0/1/1:4:77,81:0.53:-0.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:128,39:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,8:0.20:-2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.48:-2.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:126,37:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,84:0.51: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,43:0.27: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,34:0.23: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,46:0.29: 0.16:1.000:0.992 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.38:0.999:1.000 0/1/1/1:4:51,142:0.71: 0.66:1.000:0.994 0/0/0/1:4:206,49:0.20: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,56:0.26: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:15,1:0.07:-2.86:1.000:0.999 0/0/0/0:4:178,1:0.01: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,101:0.47: 1.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,78:0.51:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,5:0.43:-2.94:1.000:0.955 0/0/0/1:4:106,38:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,68:0.45:-0.08:1.000:0.982 0/0/1/1:4:86,80:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:175,63:0.28: 1.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,72:0.52:-0.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,15:0.17:-1.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:126,28:0.19:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.33:-2.86:1.000:0.927 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-2.72:1.000:1.000 0/0/0:3:8,0:0.00:-3.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,35:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,31:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,55:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,58:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,68:0.43: 0.12:1.000:0.936 0/1/1/1:4:57,124:0.67: 0.42:1.000:0.926 0/0/1/1:4:79,59:0.44:-0.43:1.000:0.973 0/0/0/1:4:152,51:0.27: 0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:136,56:0.31: 0.64:1.000:0.977 0/0/0/1:4:219,61:0.23: 2.39:0.807:1.000 0/0/0/1:4:32,5:0.14:-2.44:1.000:0.978 0/0/1/1:4:66,56:0.48:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,10:0.13:-1.59:1.000:0.935 0/0/0/1:4:111,30:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,91:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,38:0.30:-0.51:1.000:0.986 0/0/1/1:4:99,91:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,92:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,83:0.69:-0.83:1.000:0.968 0/0/0/1:4:149,38:0.22: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,34:0.28:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:84,38:0.33:-0.75:1.000:0.921 0/0/0/1:4:148,55:0.29: 0.86:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,91:0.66:-0.49:1.000:0.882 0/0/0/1:4:128,40:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,22:0.20:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,42:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,44:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,34:0.21: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.32:0.978:1.000 0/0/1/1:4:116,95:0.47: 1.02:1.000:0.991 0/1/1/1:4:59,117:0.65: 0.32:1.000:0.828 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.17:0.999:1.000 0/1/1/1:4:34,119:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,95:0.53: 0.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,78:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:78,24:0.25:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,68:0.52:-0.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:152,38:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,42:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,78:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,54:0.47:-0.83:0.988:0.994 0/0/1/1:4:86,79:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,89:0.48: 0.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:133,43:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,33:0.46:-1.69:1.000:0.986 0/1/1/1:4:42,141:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,31:0.28:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:131,31:0.20: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,45:0.35:-0.49:1.000:0.797 0/0/0/1:4:103,29:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,24:0.26:-1.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,97:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,27:0.23:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,93:0.55: 0.20:1.000:0.975 0/0/0/1:4:128,29:0.20:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,42:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,118:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,76:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:138,38:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,38:0.31:-0.63:1.000:0.969 0/0/1/1:4:103,87:0.47: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:62,80:0.57:-0.36:1.000:0.951 0/0/1/1/1:5:83,140:0.62: 1.26:0.985:0.962 0/0/0/1:4:115,33:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,40:0.30:-0.41:1.000:0.982 0/0/1/1:4:60,67:0.54:-0.65:1.000:0.989 0/0/0/1:4:146,38:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,42:0.20: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,53:0.28: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:166,50:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,104:0.55: 0.62:0.999:0.978 0/0/0/1:4:144,70:0.34: 1.08:1.000:0.847 0/0/1/1:4:53,44:0.47:-1.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,97:0.52: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,53:0.47:-0.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,54:0.47:-0.81:1.000:0.992 0/0/0/1:4:125,36:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,75:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,52:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,34:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,98:0.58: 0.18:1.000:0.905 0/0/0/1:4:134,42:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,84:0.52: 0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,137:0.73: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,89:0.48: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:64,44:0.42:-1.03:1.000:0.929 0/0/1/1:4:67,57:0.48:-0.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,58:0.55:-1.05:1.000:0.980 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,36:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,60:0.57:-1.07:1.000:0.945 0/0/1/1:4:61,51:0.47:-0.95:1.000:0.993 0/0/0/1:4:135,32:0.20: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,95:0.43: 1.43:1.000:0.936 0/0/0/1:4:124,42:0.27: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,28:0.19: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,73:0.53:-0.36:1.000:0.993 0/0/0/1:4:122,48:0.30: 0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:86,70:0.47:-0.08:1.000:0.990 0/1/1/1:4:45,125:0.71: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:147,40:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,30:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,113:0.49: 1.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:231,60:0.22: 2.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,53:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,91:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,102:0.47: 1.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,62:0.44:-0.30:1.000:0.973 0/0/1/1:4:122,116:0.50: 1.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,144:0.72: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,17:0.48:-2.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:93,38:0.31:-0.57:1.000:0.979 0/0/1/1:4:70,68:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,90:0.46: 0.84:1.000:0.989 0/0/0/1:4:190,78:0.31: 2.15:1.000:0.978 0/0/1/1:4:101,103:0.52: 0.88:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,47:0.28: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,120:0.70: 0.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:79,63:0.46:-0.36:1.000:0.988 0/1/1/1:4:33,96:0.72:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,68:0.44: 0.04:1.000:0.961 0/0/1/1:4:77,87:0.54: 0.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:42,40:0.50:-1.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,88:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,74:0.49:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,109:0.50: 1.26:0.999:0.997 0/0/1/1:4:105,72:0.42: 0.34:1.000:0.927 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,80:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,38:0.31:-0.57:1.000:0.979 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,41:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,91:0.71:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:86,108:0.56: 0.68:1.000:0.963 0/0/0/1:4:177,41:0.20: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,70:0.48:-0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:125,57:0.33: 0.44:1.000:0.924 0/0/1/1:4:102,83:0.47: 0.50:0.999:0.990 0/1/1/1:4:59,146:0.69: 0.90:1.000:0.979 0/0/0/1:4:203,64:0.26: 2.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,69:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,84:0.42: 0.96:1.000:0.916 -chr7.1 43386208 chr7.1_043386208 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:374,127:.: 0.59:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:275,77:.:-0.72:1.000:. ./.:4:196,216:.:-0.19:1.000:. ./.:4:402,129:.: 0.86:1.000:. ./.:4:289,103:.:-0.37:1.000:. ./.:4:154,54:.:-1.99:1.000:. ./.:4:314,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:252,94:.:-0.78:1.000:. ./.:4:30,47:.:-3.15:1.000:. ./.:4:49,78:.:-2.71:1.000:. ./.:4:173,167:.:-0.83:1.000:. ./.:4:259,80:.:-0.84:1.000:. ./.:4:341,100:.: 0.06:1.000:. ./.:4:193,198:.:-0.38:1.000:. ./.:4:280,103:.:-0.45:1.000:. ./.:4:226,228:.: 0.18:0.999:. ./.:4:434,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:446,116:.: 1.13:1.000:. ./.:4:237,235:.: 0.34:1.000:. ./.:4:74,24:.:-2.97:1.000:. ./.:4:328,111:.: 0.05:1.000:. ./.:4:225,258:.: 0.43:1.000:. ./.:4:259,83:.:-0.81:1.000:. ./.:4:43,34:.:-3.15:1.000:. ./.:4:215,226:.: 0.06:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:285,99:.:-0.44:1.000:. ./.:4:353,130:.: 0.43:1.000:. ./.:4:257,87:.:-0.79:1.000:. ./.:4:352,103:.: 0.19:1.000:. ./.:4:224,59:.:-1.33:1.000:. ./.:4:15,39:.:-3.35:1.000:. ./.:4:92,45:.:-2.62:1.000:. ./.:3:25,1:.:-3.60:1.000:. ./.:4:287,90:.:-0.50:1.000:. ./.:4:249,91:.:-0.83:1.000:. ./.:4:325,105:.:-0.03:1.000:. ./.:4:511,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:339,117:.: 0.20:1.000:. ./.:4:266,285:.: 1.03:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:411,142:.: 1.05:1.000:. ./.:4:536,159:.: 2.31:1.000:. ./.:4:469,149:.: 1.63:1.000:. ./.:4:274,275:.: 1.02:0.807:. ./.:4:159,40:.:-2.07:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:281,281:.: 1.13:1.000:. ./.:4:338,104:.: 0.07:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:327,99:.:-0.07:1.000:. ./.:4:611,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:279,90:.:-0.57:1.000:. ./.:4:567,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:319,110:.:-0.04:1.000:. ./.:4:417,123:.: 0.94:1.000:. ./.:4:380,130:.: 0.67:1.000:. ./.:6:254,221:.: 0.36:1.000:. ./.:4:298,280:.: 1.27:1.000:. ./.:4:312,118:.:-0.03:1.000:. ./.:4:470,145:.: 1.60:1.000:. ./.:4:244,247:.: 0.50:1.000:. ./.:4:290,296:.: 1.34:1.000:. ./.:4:364,147:.: 0.68:1.000:. ./.:4:233,58:.:-1.26:1.000:. ./.:4:237,236:.: 0.35:1.000:. ./.:4:270,300:.: 1.20:0.978:. ./.:4:281,98:.:-0.48:1.000:. ./.:4:424,161:.: 1.33:1.000:. ./.:4:163,158:.:-1.00:0.999:. ./.:4:423,137:.: 1.11:1.000:. ./.:4:228,237:.: 0.27:1.000:. ./.:4:373,138:.: 0.68:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:317,111:.:-0.05:1.000:. ./.:4:540,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:241,268:.: 0.66:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:540,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:287,95:.:-0.46:1.000:. ./.:4:426,133:.: 1.10:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:257,80:.:-0.86:1.000:. ./.:4:209,208:.:-0.15:1.000:. ./.:4:229,246:.: 0.36:1.000:. ./.:4:227,223:.: 0.14:1.000:. ./.:4:316,105:.:-0.11:1.000:. ./.:4:251,258:.: 0.66:1.000:. ./.:4:445,131:.: 1.26:1.000:. ./.:4:152,178:.:-0.92:1.000:. ./.:4:358,130:.: 0.48:1.000:. ./.:4:292,282:.: 1.24:1.000:. ./.:4:230,220:.: 0.14:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:242,82:.:-0.97:1.000:. ./.:4:407,128:.: 0.89:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.25:1.000:. ./.:5:509,120:.: 1.72:0.985:. ./.:4:203,236:.: 0.05:1.000:. ./.:4:329,114:.: 0.08:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:293,111:.:-0.26:1.000:. ./.:4:258,275:.: 0.88:1.000:. ./.:4:208,224:.:-0.02:1.000:. ./.:4:265,245:.: 0.67:1.000:. ./.:4:354,138:.: 0.51:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.27:0.999:. ./.:4:231,356:.: 1.35:1.000:. ./.:4:332,111:.: 0.08:1.000:. ./.:4:463,122:.: 1.33:1.000:. ./.:4:306,136:.: 0.07:1.000:. ./.:4:350,125:.: 0.36:1.000:. ./.:4:349,108:.: 0.20:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:376,125:.: 0.59:1.000:. ./.:4:366,132:.: 0.57:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:285,90:.:-0.52:1.000:. ./.:4:387,145:.: 0.87:1.000:. ./.:4:376,145:.: 0.77:1.000:. ./.:4:375,114:.: 0.49:1.000:. ./.:4:358,96:.: 0.18:1.000:. ./.:4:274,89:.:-0.63:1.000:. ./.:4:296,114:.:-0.21:1.000:. ./.:4:334,114:.: 0.12:1.000:. ./.:4:261,95:.:-0.69:1.000:. ./.:4:263,97:.:-0.65:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:314,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:409,130:.: 0.93:1.000:. ./.:4:228,251:.: 0.40:1.000:. ./.:4:368,146:.: 0.71:1.000:. ./.:4:349,119:.: 0.30:1.000:. ./.:4:345,113:.: 0.21:1.000:. ./.:4:356,146:.: 0.60:1.000:. ./.:4:401,144:.: 0.98:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:214,183:.:-0.33:1.000:. ./.:4:394,115:.: 0.66:1.000:. ./.:4:446,129:.: 1.25:1.000:. ./.:4:215,199:.:-0.18:1.000:. ./.:4:353,93:.: 0.11:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:308,98:.:-0.25:1.000:. ./.:4:348,113:.: 0.24:1.000:. ./.:4:275,93:.:-0.58:1.000:. ./.:4:29,60:.:-3.05:1.000:. ./.:4:183,75:.:-1.55:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:360,97:.: 0.20:1.000:. ./.:4:277,90:.:-0.59:1.000:. ./.:4:183,198:.:-0.47:1.000:. ./.:4:396,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:235,73:.:-1.11:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:176,209:.:-0.43:1.000:. ./.:4:355,88:.: 0.08:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:255,74:.:-0.93:1.000:. ./.:4:282,103:.:-0.43:0.999:. ./.:4:388,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:142,171:.:-1.07:1.000:. ./.:4:155,161:.:-1.04:1.000:. ./.:4:130,157:.:-1.30:1.000:. ./.:4:223,201:.:-0.09:1.000:. ./.:4:196,218:.:-0.18:1.000:. ./.:4:194,220:.:-0.18:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:308,111:.:-0.13:1.000:. ./.:4:335,134:.: 0.31:1.000:. ./.:4:204,198:.:-0.28:1.000:. ./.:4:201,185:.:-0.42:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.45:0.999:. ./.:4:357,134:.: 0.50:1.000:. ./.:4:321,106:.:-0.06:1.000:. ./.:4:156,177:.:-0.89:1.000:. ./.:4:330,102:.:-0.02:1.000:. -chr7.1 43695737 chr7.1_043695737 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:875,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:635,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:717,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:751,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:944,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1045,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:504,1:.:-2.15:1.000:. ./.:4:824,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:743,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:710,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:748,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:657,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:769,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:786,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:788,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:830,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:805,0:.: 0.04:0.999:. ./.:4:872,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:997,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:844,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:563,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:803,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:826,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:711,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:462,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:964,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:758,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:736,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:944,3:.: 1.08:1.000:. ./.:4:708,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:689,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:657,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:487,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:593,2:.:-1.49:1.000:. ./.:3:289,1:.:-3.72:1.000:. ./.:4:827,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:849,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:741,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:760,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:775,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:825,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:849,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1001,2:.: 1.49:1.000:. ./.:4:859,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:917,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:980,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:860,0:.: 0.44:0.807:. ./.:4:930,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:751,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:997,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:831,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1012,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:806,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:926,3:.: 0.95:1.000:. ./.:4:697,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:915,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:765,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1050,1:.: 1.84:1.000:. ./.:4:822,2:.: 0.18:1.000:. ./.:6:735,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:847,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:782,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1035,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:771,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:775,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:944,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:555,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:795,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:838,0:.: 0.28:0.978:. ./.:4:780,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1072,2:.: 2.01:1.000:. ./.:4:876,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:1026,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:908,2:.: 0.81:1.000:. ./.:4:943,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:752,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:830,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:876,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:805,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:862,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:648,1:.:-1.10:0.988:. ./.:4:982,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:942,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:672,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:868,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:963,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:669,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:768,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:827,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:758,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:582,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:837,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:899,2:.: 0.74:1.000:. ./.:4:617,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:788,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:855,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:757,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:712,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:972,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:782,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:740,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:906,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:679,0:.:-0.88:1.000:. ./.:5:997,1:.: 1.45:0.985:. ./.:4:710,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:752,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:773,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:686,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1048,2:.: 1.83:1.000:. ./.:4:849,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:921,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1005,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:839,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:1039,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:681,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1023,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:813,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:847,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:789,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:768,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:910,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:905,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:875,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:802,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:963,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:974,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:800,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:711,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:614,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:654,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:871,2:.: 0.54:1.000:. ./.:4:634,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:462,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:911,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:685,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:969,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:884,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:791,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:655,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:777,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:897,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:843,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:684,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:701,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:941,1:.: 1.04:1.000:. ./.:4:1140,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:779,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:763,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1081,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:688,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:816,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:811,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:615,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:523,1:.:-2.01:1.000:. ./.:4:931,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:745,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:904,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:808,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:630,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:760,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:711,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:643,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:639,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:707,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:713,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:858,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:645,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:730,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:734,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:685,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:649,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:609,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:711,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:697,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:718,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:530,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:825,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:850,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:849,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:705,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:768,1:.:-0.22:0.999:. ./.:4:987,2:.: 1.39:1.000:. ./.:4:1048,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:683,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:808,0:.: 0.06:1.000:. -chr7.1 43916744 chr7.1_043916744 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,28:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,32:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,8:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,43:.: 1.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,21:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.40:0.999:. ./.:4:0,82:.: 3.98:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1,35:.: 0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,45:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,51:.: 1.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.: 0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,26:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,46:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,36:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 1.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.15:1.000:. ./.:5:0,28:.: 0.35:0.985:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.47:0.999:. ./.:4:1,35:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,23:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:1,28:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,33:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,36:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,41:.: 1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.: 0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1,24:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,34:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.62:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,24:.: 0.15:0.999:. ./.:4:0,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,46:.: 1.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,24:.: 0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,26:.: 0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.32:1.000:. -chr7.1 44001635 chr7.1_044001635 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:189,13:.: 0.48:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:218,11:.: 0.95:1.000:. ./.:4:209,12:.: 0.81:1.000:. ./.:4:219,9:.: 0.93:1.000:. ./.:4:224,13:.: 1.09:1.000:. ./.:4:86,15:.:-1.28:1.000:. ./.:4:230,12:.: 1.17:1.000:. ./.:4:123,11:.:-0.71:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:39,2:.:-2.33:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:233,13:.: 1.24:1.000:. ./.:4:221,8:.: 0.95:1.000:. ./.:4:295,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:220,17:.: 1.09:1.000:. ./.:4:291,0:.: 2.03:0.999:. ./.:4:190,13:.: 0.49:1.000:. ./.:4:257,13:.: 1.66:1.000:. ./.:4:272,15:.: 1.96:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:239,7:.: 1.24:1.000:. ./.:4:224,14:.: 1.10:1.000:. ./.:4:138,12:.:-0.43:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:303,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:160,31:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,17:.:-0.74:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:170,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:161,23:.: 0.16:1.000:. ./.:4:205,11:.: 0.72:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.99:1.000:. ./.:4:68,3:.:-1.80:1.000:. ./.:3:12,1:.:-2.81:1.000:. ./.:4:201,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:202,7:.: 0.60:1.000:. ./.:4:163,33:.: 0.37:1.000:. ./.:4:226,7:.: 1.02:1.000:. ./.:4:251,6:.: 1.43:1.000:. ./.:4:171,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:117,8:.:-0.86:1.000:. ./.:4:137,13:.:-0.43:1.000:. ./.:4:103,6:.:-1.14:1.000:. ./.:4:96,13:.:-1.14:1.000:. ./.:4:124,17:.:-0.59:1.000:. ./.:4:190,14:.: 0.51:0.807:. ./.:4:186,10:.: 0.37:1.000:. ./.:4:106,11:.:-1.00:1.000:. ./.:4:157,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:124,3:.:-0.83:1.000:. ./.:4:129,16:.:-0.52:1.000:. ./.:4:95,11:.:-1.20:1.000:. ./.:4:115,17:.:-0.74:1.000:. ./.:4:164,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:118,9:.:-0.83:1.000:. ./.:4:123,17:.:-0.60:1.000:. ./.:4:178,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:156,9:.:-0.17:1.000:. ./.:6:130,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:160,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:173,10:.: 0.15:1.000:. ./.:4:187,13:.: 0.44:1.000:. ./.:4:163,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:214,5:.: 0.77:1.000:. ./.:4:173,7:.: 0.09:1.000:. ./.:4:122,6:.:-0.81:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:180,4:.: 0.16:0.978:. ./.:4:181,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:183,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:130,5:.:-0.69:0.999:. ./.:4:265,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:173,9:.: 0.13:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:208,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:163,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:116,2:.:-0.99:1.000:. ./.:4:187,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:139,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.10:0.988:. ./.:4:175,7:.: 0.13:1.000:. ./.:4:130,14:.:-0.53:1.000:. ./.:4:152,12:.:-0.19:1.000:. ./.:4:159,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:114,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:146,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:172,5:.: 0.04:1.000:. ./.:4:73,11:.:-1.58:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:192,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:125,7:.:-0.74:1.000:. ./.:4:124,12:.:-0.67:1.000:. ./.:4:179,8:.: 0.22:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:108,12:.:-0.95:1.000:. ./.:4:201,9:.: 0.62:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:173,5:.: 0.06:1.000:. ./.:4:62,10:.:-1.79:1.000:. ./.:5:229,7:.: 1.07:0.985:. ./.:4:141,9:.:-0.43:1.000:. ./.:4:107,11:.:-0.99:1.000:. ./.:4:92,5:.:-1.35:1.000:. ./.:4:187,8:.: 0.35:1.000:. ./.:4:208,7:.: 0.70:1.000:. ./.:4:175,8:.: 0.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:284,10:.: 2.08:1.000:. ./.:4:87,11:.:-1.33:0.999:. ./.:4:236,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:119,3:.:-0.92:1.000:. ./.:4:122,13:.:-0.69:1.000:. ./.:4:123,5:.:-0.81:1.000:. ./.:4:123,6:.:-0.79:1.000:. ./.:4:151,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,9:.:-1.58:1.000:. ./.:4:125,15:.:-0.60:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:183,9:.: 0.30:1.000:. ./.:4:211,13:.: 0.86:1.000:. ./.:4:93,12:.:-1.21:1.000:. ./.:4:192,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:98,12:.:-1.13:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:122,6:.:-0.81:1.000:. ./.:4:126,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:158,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:195,13:.: 0.58:1.000:. ./.:4:75,6:.:-1.63:1.000:. ./.:4:164,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:189,18:.: 0.56:1.000:. ./.:4:212,4:.: 0.72:1.000:. ./.:4:120,3:.:-0.90:1.000:. ./.:4:101,9:.:-1.13:1.000:. ./.:4:146,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:111,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:139,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:167,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,7:.:-0.52:1.000:. ./.:4:144,18:.:-0.22:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:231,9:.: 1.14:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:134,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:255,13:.: 1.63:1.000:. ./.:4:192,11:.: 0.49:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:116,8:.:-0.88:1.000:. ./.:4:160,14:.:-0.01:1.000:. ./.:4:131,25:.:-0.32:1.000:. ./.:4:110,28:.:-0.64:1.000:. ./.:4:141,19:.:-0.26:1.000:. ./.:4:155,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:201,11:.: 0.65:1.000:. ./.:4:191,7:.: 0.41:1.000:. ./.:4:163,9:.:-0.05:1.000:. ./.:4:130,15:.:-0.52:1.000:. ./.:4:206,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:165,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:192,13:.: 0.53:1.000:. ./.:4:197,7:.: 0.51:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.07:0.999:. ./.:4:125,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:177,9:.: 0.20:1.000:. ./.:4:176,6:.: 0.13:1.000:. ./.:4:174,11:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,9:.:-0.05:1.000:. ./.:4:184,4:.: 0.23:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:116,18:.:-0.71:1.000:. ./.:4:257,13:.: 1.66:1.000:. ./.:4:224,11:.: 1.05:1.000:. ./.:4:209,10:.: 0.77:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:147,15:.:-0.22:0.999:. ./.:4:277,21:.: 2.15:1.000:. ./.:4:151,22:.:-0.03:1.000:. ./.:4:157,13:.:-0.08:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.49:1.000:. -chr7.1 44475230 chr7.1_044475230 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:291,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:238,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:192,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:238,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.69:0.807:. ./.:4:25,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.06:1.000:. ./.:6:65,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.52:0.978:. ./.:4:100,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.32:0.999:. ./.:4:175,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.50:0.988:. ./.:4:185,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.25:1.000:. ./.:5:188,0:.: 1.12:0.985:. ./.:4:67,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:186,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:247,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:146,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:184,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.65:0.999:. ./.:4:271,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.74:1.000:. -chr7.1 44794241 chr7.1_044794241 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,70:0.48: 0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,107:0.81: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,71:0.68:-0.56:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,121:0.80: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,58:0.67:-1.06:1.000:0.929 0/1/1/1:4:31,105:0.81: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-2.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,35:0.76:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,51:0.53:-0.81:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,89:0.76:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,124:0.80: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,72:0.61:-0.24:1.000:0.664 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,139:1.00: 0.11:0.999:1.000 0/1/1/1:4:69,128:0.69: 1.57:1.000:0.978 0/1/1/1:4:59,161:0.78: 2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,111:0.69: 0.91:1.000:0.977 0/1/1/1:4:6,39:0.89:-2.24:1.000:0.540 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,86:0.64: 0.24:1.000:0.635 0/1/1/1:4:35,90:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,31:0.80:-2.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,67:0.63:-0.51:1.000:0.501 0/1/1/1:4:45,120:0.77: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,64:0.63:-0.66:1.000:0.570 0/0/1/1:4:103,110:0.55: 1.97:1.000:0.982 0/1/1/1:4:40,90:0.74:-0.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,68:0.82:-1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,16:0.77:-2.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-2.39:1.000:1.000 0/1/1:3:6,15:0.76:-2.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,69:0.67:-0.61:1.000:0.914 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,102:0.77: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,117:0.69: 1.14:1.000:0.978 0/0/1/1:4:102,94:0.51: 1.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,71:0.76:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,139:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,145:1.00: 0.26:0.807:1.000 0/1/1/1:4:48,96:0.71: 0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,118:0.83: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,85:0.66: 0.06:1.000:0.875 0/1/1/1:4:31,85:0.78:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,136:0.81: 1.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:47,132:0.78: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,95:0.83:-0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,118:0.80: 0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,91:0.69: 0.14:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:50,85:0.67: 0.01:1.000:0.921 0/1/1/1:4:59,90:0.64: 0.36:1.000:0.723 0/0/1/1:4:79,88:0.56: 0.81:1.000:0.969 0/1/1/1:4:46,129:0.78: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,89:0.71:-0.04:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,84:0.73:-0.29:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,83:0.75:-0.39:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,96:0.75: 0.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.84:0.978:1.000 0/0/1/1:4:61,33:0.43:-1.01:1.000:0.952 0/0/1/1:4:119,98:0.49: 2.07:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,123:1.00:-0.29:0.999:1.000 0/0/0/1:4:135,3:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,73:0.58:-0.04:1.000:0.903 0/0/1/1:4:81,31:0.39:-0.56:1.000:0.705 0/1/1/1:4:31,110:0.82: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,106:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,116:0.81: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,75:0.72:-0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,118:0.69: 1.19:1.000:0.976 0/0/1/1:4:71,25:0.38:-0.96:0.988:0.597 0/0/1/1:4:92,75:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,119:0.66: 1.44:1.000:0.871 0/1/1/1:4:30,75:0.76:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,60:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:111,80:0.47: 1.42:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,78:0.73:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,61:0.59:-0.64:1.000:0.835 0/1/1/1:4:52,80:0.65:-0.06:1.000:0.747 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,137:0.80: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,57:0.61:-0.86:1.000:0.737 0/1/1/1:4:48,69:0.63:-0.44:1.000:0.529 0/0/1/1:4:59,82:0.62: 0.16:1.000:0.589 0/1/1/1:4:34,79:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,31:0.38:-0.39:1.000:0.597 0/1/1/1:4:68,138:0.72: 1.79:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,113:0.70: 0.96:1.000:0.982 0/1/1/1:4:23,106:0.85:-0.14:1.000:0.987 0/1/1/1:4:45,134:0.79: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,76:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:107,117:0.55: 2.24:0.951:0.894 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,110:0.67: 1.01:1.000:0.920 0/1/1/1:4:49,129:0.77: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,109:0.64: 1.14:1.000:0.741 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,84:0.63: 0.19:1.000:0.555 1/1/1/1:4:0,155:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,120:0.79: 0.61:0.999:1.000 0/1/1/1:4:41,123:0.79: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,86:0.76:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,83:0.73:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,73:0.73:-0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,101:0.86:-0.31:1.000:0.979 0/1/1/1:4:43,104:0.75: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,105:0.80: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,102:0.77: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,113:0.81: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,82:0.64: 0.04:1.000:0.710 0/1/1/1:4:28,77:0.78:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,77:0.52: 0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,70:0.72:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,37:0.42:-0.49:1.000:0.897 0/0/1/1:4:47,57:0.58:-0.76:1.000:0.907 0/1/1/1:4:24,59:0.76:-1.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,150:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,48:0.67:-1.46:1.000:0.933 0/0/1/1:4:61,45:0.47:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,64:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,102:0.64: 0.86:1.000:0.717 0/1/1/1:4:39,70:0.68:-0.64:1.000:0.965 0/1/1/1:4:25,55:0.73:-1.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,64:0.79:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,78:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,61:0.52:-0.29:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,110:0.68: 0.96:1.000:0.948 0/1/1/1:4:35,55:0.65:-1.11:1.000:0.799 0/1/1/1:4:50,112:0.74: 0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,172:0.75: 2.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,92:0.69: 0.21:1.000:0.967 0/0/1/1:4:75,70:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,148:0.79: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,65:0.65:-0.69:1.000:0.762 0/0/1/1:4:106,99:0.51: 1.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,87:0.48: 1.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,26:0.75:-2.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,140:0.75: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,136:0.80: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,127:0.77: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,177:0.80: 2.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,90:0.61: 0.56:1.000:0.699 0/1/1/1:4:32,69:0.73:-0.84:1.000:0.998 0/1/1/1:4:78,146:0.70: 2.24:1.000:0.980 0/1/1/1:4:46,91:0.71: 0.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:89,80:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,115:0.85: 0.16:1.000:0.992 0/1/1/1:4:48,75:0.65:-0.29:1.000:0.786 0/0/1/1:4:53,68:0.60:-0.34:1.000:0.815 0/0/1/1:4:118,85:0.47: 1.72:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,109:0.76: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,29:0.36:-0.06:0.999:0.693 0/1/1/1:4:29,109:0.82: 0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,136:0.99: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,84:0.77:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,66:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,81:0.73:-0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,117:0.74: 0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,94:0.71: 0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:45,70:0.65:-0.49:1.000:0.775 0/1/1/1:4:46,122:0.77: 0.84:0.999:1.000 0/0/1/1:4:114,111:0.52: 2.27:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,174:1.00: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,84:0.72:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,38:0.41:-0.24:1.000:0.840 -chr7.1 44994040 chr7.1_044994040 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:179,90:0.42: 1.03:1.000:0.903 1/1/1/1:4:1,60:0.98:-1.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,184:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,60:0.28: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,108:0.53: 0.84:1.000:0.994 1/1/1/1:4:8,218:0.96: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,77:0.52:-0.11:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,205:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,106:0.43: 1.54:1.000:0.953 0/0/1/1:4:31,33:0.59:-1.69:1.000:0.877 0/1/1/1:4:29,54:0.68:-1.44:1.000:0.952 0/0/0/1:4:253,45:0.17: 1.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:153,142:0.56: 1.37:1.000:0.959 0/1/1/1:4:46,146:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,88:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:181,162:0.56: 2.01:1.000:0.969 0/0/1/1:4:162,170:0.59: 1.86:0.999:0.889 1/1/1/1:4:0,146:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,114:0.68:-0.23:1.000:0.959 0/0/1/1:4:196,96:0.41: 1.33:1.000:0.852 0/0/1/1:4:36,20:0.45:-1.79:1.000:0.983 0/0/0/1:4:208,81:0.33: 1.29:1.000:0.921 0/0/1/1:4:164,100:0.49: 0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,86:0.43: 0.78:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,192:0.60: 2.22:1.000:0.784 0/1/1/1:4:55,205:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,67:0.32: 0.71:1.000:0.956 1/1/1/1:4:1,106:0.99:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,129:0.45: 2.25:1.000:0.983 0/0/1/1:4:199,126:0.50: 1.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,115:0.51: 1.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,20:0.52:-1.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,23:0.39:-1.57:1.000:0.644 0/1/1:3:2,10:0.83:-2.38:1.000:0.964 0/0/0/1:4:179,49:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,145:0.59: 1.20:1.000:0.882 0/0/1/1:4:188,102:0.45: 1.31:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,111:0.46: 1.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:156,72:0.39: 0.48:1.000:0.658 0/1/1/1:4:40,81:0.69:-0.93:1.000:0.976 0/1/1/1:4:40,111:0.74:-0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:135,87:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,75:0.41: 0.46:1.000:0.881 0/0/1/1:4:168,83:0.41: 0.79:1.000:0.871 0/0/1/1:4:150,96:0.50: 0.72:0.807:0.997 0/0/1/1:4:251,148:0.48: 2.75:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,128:0.80:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,57:0.34: 0.13:1.000:0.897 0/1/1/1:4:27,53:0.69:-1.48:1.000:0.969 0/1/1/1:4:58,119:0.69:-0.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:173,78:0.38: 0.79:1.000:0.556 0/1/1/1:4:34,117:0.77:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,178:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,159:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,85:0.40: 0.96:1.000:0.764 0/0/1/1:4:158,96:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:187,62:0.28: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:80,54:0.51:-0.76:1.000:0.882 0/0/0/1:4:137,33:0.21:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,141:0.99:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,134:0.86:-0.47:1.000:0.978 0/0/0/1:4:150,48:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:164,90:0.45: 0.83:1.000:0.979 0/0/1/1:4:140,72:0.43: 0.27:1.000:0.934 0/0/1/1:4:83,46:0.45:-0.83:1.000:0.982 0/0/1/1:4:102,66:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,99:0.47: 1.04:0.978:0.992 0/0/1/1:4:113,73:0.50:-0.07:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,45:0.40:-0.69:0.999:0.790 0/0/1/1:4:140,102:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:153,91:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:99,76:0.53:-0.22:1.000:0.991 0/1/1/1:4:30,138:0.82:-0.31:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,86:0.70:-0.87:1.000:0.986 0/0/1/1:4:171,112:0.51: 1.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,98:0.70:-0.61:1.000:0.982 0/0/0/1:4:77,23:0.25:-1.21:0.988:0.999 0/1/1/1:4:37,86:0.71:-0.91:1.000:0.993 0/1/1/1:4:34,97:0.74:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,63:0.35: 0.29:1.000:0.745 0/1/1/1:4:37,88:0.72:-0.88:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,109:0.74:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,78:0.59:-0.56:1.000:0.844 0/0/1/1:4:77,48:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:155,68:0.37: 0.42:1.000:0.568 0/0/0/1:4:176,53:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,74:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,99:0.54: 0.42:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,169:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,39:0.27:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,90:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:163,46:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,56:0.46:-0.48:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,71:0.72:-1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,70:0.67:-1.09:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-1.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,65:0.82:-1.49:1.000:0.999 1/1/1/1/1:5:0,108:1.00:-1.10:0.951:1.000 0/0/1/1:4:79,81:0.58:-0.42:1.000:0.908 0/0/1/1:4:161,83:0.43: 0.70:1.000:0.936 0/1/1/1:4:31,69:0.71:-1.21:1.000:0.989 0/1/1/1:4:58,99:0.67:-0.46:1.000:0.901 0/0/0/1:4:213,48:0.20: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,82:0.40: 0.82:1.000:0.795 0/0/1/1:4:114,90:0.54: 0.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:169,169:0.58: 1.94:1.000:0.924 0/1/1/1:4:29,49:0.66:-1.50:0.999:0.893 0/0/1/1:4:133,147:0.59: 1.17:1.000:0.837 1/1/1/1:4:0,123:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,72:0.35: 0.70:1.000:0.757 0/0/1/1:4:66,84:0.62:-0.55:1.000:0.597 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,100:0.83:-0.95:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,85:0.72:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:170,86:0.42: 0.86:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,127:0.46: 2.14:1.000:0.986 0/0/1/1:4:123,74:0.48: 0.07:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,65:0.38: 0.25:1.000:0.530 0/0/1/1:4:119,59:0.41:-0.18:1.000:0.878 0/0/1/1:4:74,85:0.60:-0.43:1.000:0.785 0/0/1/1:4:82,47:0.47:-0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:142,66:0.39: 0.22:1.000:0.686 0/0/1/1:4:148,125:0.55: 1.08:1.000:0.981 0/0/0/1:4:91,32:0.30:-0.91:1.000:0.987 0/1/1/1:4:42,63:0.64:-1.14:1.000:0.743 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:210,61:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,57:0.30: 0.35:1.000:0.985 0/0/0/1:4:127,47:0.31:-0.23:1.000:0.968 0/0/1/1:4:105,64:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,79:0.57:-0.39:1.000:0.949 0/0/0/1:4:129,43:0.28:-0.26:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,70:0.68:-1.10:1.000:0.947 0/0/0/1:4:95,31:0.27:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:216,104:0.40: 1.70:1.000:0.807 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,102:0.44: 1.37:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,159:0.73: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,123:0.57: 0.76:1.000:0.938 0/1/1/1:4:53,102:0.68:-0.48:1.000:0.963 1/1/1/1:4:5,152:0.97:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,21:0.55:-1.93:1.000:0.982 0/1/1/1:4:47,78:0.66:-0.88:1.000:0.876 0/1/1/1:4:57,170:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,145:0.74: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,156:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,50:0.22: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,77:0.41: 0.54:1.000:0.882 1/1/1/1:4:0,147:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,126:0.56: 0.97:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,153:0.78: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,86:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:233,60:0.22: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,76:0.70:-1.05:1.000:0.983 1/1/1/1:4:3,112:0.97:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,53:0.34:-0.08:0.999:0.870 0/1/1/1:4:32,111:0.77:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,72:0.35: 0.75:1.000:0.826 0/0/1/1:4:135,99:0.53: 0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,123:0.62: 0.35:1.000:0.560 0/0/1/1:4:171,106:0.49: 1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,101:0.55: 0.34:1.000:0.976 0/0/1/1:4:94,115:0.61: 0.23:1.000:0.677 0/1/1/1:4:35,94:0.73:-0.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:135,188:0.63: 1.74:1.000:0.600 0/0/1/1:4:60,74:0.61:-0.76:1.000:0.661 0/0/1/1:4:159,109:0.51: 1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,104:0.53: 0.64:1.000:0.991 0/1/1/1:4:42,81:0.68:-0.91:0.999:0.964 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,90:0.36: 1.49:1.000:0.741 0/0/1/1:4:118,132:0.60: 0.78:1.000:0.822 0/0/1/1:4:143,65:0.38: 0.22:1.000:0.593 -chr7.1 45158183 chr7.1_045158183 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:2,11:0.86: 0.09:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,12:0.61: 1.59:1.000:0.677 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,10:0.66: 0.65:1.000:0.850 0/1/1/1:4:5,11:0.71: 0.65:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,5:0.84:-1.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:4,5:0.60:-0.66:1.000:0.810 0/1/1/1:4:5,15:0.77: 1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.47:-0.47:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,8:0.69:-0.09:1.000:0.977 0/0/1/1:4:8,6:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,14:0.69: 1.59:0.999:0.977 0/1/1/1:4:12,20:0.66: 3.64:1.000:0.850 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,12:0.87: 0.28:1.000:0.939 0/0/0/1:4:2,0:0.19:-1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,12:0.81: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,9:0.67: 0.28:1.000:0.930 0/0/1/1:4:3,4:0.61:-1.03:1.000:0.677 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:5,14:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,13:0.68: 1.40:1.000:0.950 0/0/1/1:4:6,7:0.58: 0.09:1.000:0.901 0/1/1/1:4:2,10:0.84:-0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:6,6:0.55:-0.09:1.000:0.980 0/1/1/1:4:6,15:0.73: 1.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,14:0.72: 1.40:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.78:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:4,18:0.83: 1.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,10:0.51: 1.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,14:0.88: 0.65:1.000:0.696 0/0/0/1:4:9,3:0.37:-0.09:1.000:0.581 1/1/1/1:4:2,19:0.91: 1.59:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,11:0.68: 0.84:1.000:0.943 0/1/1/1:4:5,10:0.69: 0.47:1.000:0.977 0/1/1/1:4:3,5:0.66:-0.84:1.000:0.850 0/0/1/1:4:5,6:0.59:-0.28:1.000:0.870 0/1/1/1:4:5,8:0.65: 0.09:1.000:0.783 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.28:0.807:1.000 0/0/0/1:4:4,0:0.19:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,7:0.67:-0.28:1.000:0.907 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,11:0.57: 1.59:1.000:0.945 0/1/1/1:4:8,15:0.68: 1.96:1.000:0.955 0/1/1/1:4:4,11:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,11:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,6:0.55:-0.09:1.000:0.980 0/1/1/1:4:6,15:0.73: 1.59:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,15:0.89: 0.84:1.000:0.506 1/1/1/1/1/1:6:0,7:1.00:-1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,6:0.64:-0.47:1.000:0.637 1/1/1/1:4:2,15:0.89: 0.84:1.000:0.506 1/1/1/1:4:0,15:1.00: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,11:0.92:-0.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,9:0.67: 0.28:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.74: 1.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:0.978:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,9:0.67: 0.28:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.59:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,11:0.75: 0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.61:-1.03:1.000:0.677 0/1/1/1:4:3,9:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.77:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,15:0.80: 1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.22:0.988:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.77:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.72:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,3:0.45:-0.84:1.000:0.984 0/1/1/1:4:1,4:0.81:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.87:-1.03:1.000:0.939 0/1/1/1:4:2,3:0.64:-1.40:1.000:0.637 0/1/1/1:4:2,7:0.79:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.55:-0.09:1.000:0.980 0/1/1/1:4:2,12:0.87: 0.28:1.000:0.939 0/1/1/1:4:3,13:0.82: 0.65:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,6:0.64:-0.47:1.000:0.637 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.79:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,14:0.79: 1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,16:0.90: 1.03:1.000:0.695 0/1/1/1:4:1,2:0.69:-1.78:1.000:0.977 0/1/1/1:4:3,9:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.61:-1.03:1.000:0.677 0/0/1/1/1:5:4,5:0.60:-0.66:0.951:0.970 0/0/1/1:4:7,8:0.58: 0.47:1.000:0.919 0/1/1/1:4:5,10:0.69: 0.47:1.000:0.977 0/1/1/1:4:4,22:0.86: 2.52:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 2.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.44: 0.28:1.000:0.970 0/0/1/1:4:8,9:0.58: 0.84:1.000:0.931 0/1/1/1:4:2,5:0.73:-1.03:0.999:0.998 0/1/1/1:4:4,11:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,0:0.19:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,13:0.78: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.33:-1.40:1.000:0.901 0/1/1/1:4:4,6:0.64:-0.47:1.000:0.637 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,7:0.67:-0.28:1.000:0.907 1/1/1/1:4:1,16:0.94: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.84:-1.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:7,7:0.55: 0.28:1.000:0.980 0/1/1/1:4:4,12:0.77: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,9:0.83:-0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:4,11:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,5:0.66:-0.84:1.000:0.850 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,7:0.79:-0.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,9:0.91:-0.47:1.000:0.908 0/0/1/1:4:8,9:0.58: 0.84:1.000:0.931 0/1/1/1:4:2,8:0.81:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.61:-1.03:1.000:0.677 0/1/1/1:4:4,8:0.69:-0.09:1.000:0.977 0/0/1/1:4:5,5:0.55:-0.47:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.52: 0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,3:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,5:0.60:-0.66:1.000:0.810 1/1/1/1:4:1,11:0.92:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:4,2:0.43:-1.22:1.000:0.935 1/1/1/1:4:1,14:0.94: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.55: 0.65:1.000:0.980 0/1/1/1:4:4,11:0.75: 0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.71: 0.65:1.000:0.992 0/1/1/1:4:3,11:0.80: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,11:0.86: 0.09:1.000:0.978 1/1/1/1:4:1,14:0.94: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.69:-0.66:1.000:0.977 0/0/0/1:4:1,0:0.19:-2.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,18:0.80: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.58: 0.47:1.000:0.919 0/0/1/1:4:4,3:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,8:0.65: 0.09:1.000:0.783 1/1/1/1:4:1,13:0.93: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,7:0.45: 1.21:1.000:0.980 0/0/0/1:4:12,1:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,3:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,7:0.58: 0.09:1.000:0.901 0/1/1/1:4:5,15:0.77: 1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.73:-1.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:2,9:0.83:-0.28:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,10:0.91:-0.28:0.999:0.973 0/1/1/1:4:4,11:0.75: 0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,20:1.00: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,8:0.74:-0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,8:0.90:-0.66:1.000:0.695 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,14:0.94: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.73: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,6:0.59:-0.28:1.000:0.870 0/0/1/1:4:10,4:0.39: 0.28:1.000:0.726 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,17:0.90: 1.21:1.000:0.829 0/1/1/1:4:3,6:0.69:-0.66:1.000:0.977 0/1/1/1:4:5,12:0.73: 0.84:0.999:0.997 0/1/1/1:4:3,9:0.77:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,12:0.66: 1.21:1.000:0.886 0/1/1/1:4:3,6:0.69:-0.66:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.09:1.000:1.000 -chr7.1 45429790 chr7.1_045429790 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:624,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:375,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:482,169:.: 1.86:1.000:. ./.:4:692,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:354,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:400,145:.: 0.75:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:343,144:.: 0.15:1.000:. ./.:4:456,185:.: 1.75:1.000:. ./.:4:408,165:.: 1.04:0.999:. ./.:4:384,145:.: 0.58:1.000:. ./.:4:657,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:367,94:.:-0.13:1.000:. ./.:4:374,131:.: 0.33:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:395,101:.: 0.24:1.000:. ./.:4:404,184:.: 1.20:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:456,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:457,191:.: 1.83:1.000:. ./.:4:567,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:309,114:.:-0.52:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:280,131:.:-0.65:1.000:. ./.:3:200,44:.:-2.39:1.000:. ./.:4:355,176:.: 0.61:1.000:. ./.:4:459,151:.: 1.43:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:349,135:.: 0.12:1.000:. ./.:4:412,170:.: 1.14:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:493,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:630,0:.: 1.64:0.807:. ./.:4:392,208:.: 1.33:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:295,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:346,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:382,170:.: 0.83:1.000:. ./.:4:316,126:.:-0.32:1.000:. ./.:6:310,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:596,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:376,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:349,145:.: 0.22:1.000:. ./.:4:247,106:.:-1.25:1.000:. ./.:4:327,120:.:-0.27:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.15:0.978:. ./.:4:494,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.87:0.999:. ./.:4:575,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:337,131:.:-0.05:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:361,153:.: 0.43:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:294,0:.:-1.87:0.988:. ./.:4:316,114:.:-0.45:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:328,114:.:-0.32:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:243,95:.:-1.41:1.000:. ./.:4:298,96:.:-0.82:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:380,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:318,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:313,123:.:-0.39:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:262,99:.:-1.17:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:314,149:.:-0.10:1.000:. ./.:4:329,115:.:-0.30:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:345,0:.:-1.34:1.000:. ./.:5:469,0:.:-0.04:0.951:. ./.:4:349,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:375,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:590,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:344,117:.:-0.13:1.000:. ./.:4:554,206:.: 3.00:1.000:. ./.:4:324,0:.:-1.56:0.999:. ./.:4:559,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:268,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:537,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:306,97:.:-0.73:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:356,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:443,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:377,119:.: 0.24:1.000:. ./.:4:384,128:.: 0.41:1.000:. ./.:4:366,162:.: 0.57:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:257,89:.:-1.33:1.000:. ./.:4:318,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:270,113:.:-0.94:1.000:. ./.:4:383,124:.: 0.36:1.000:. ./.:4:221,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:276,138:.:-0.62:1.000:. ./.:4:279,132:.:-0.65:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:347,121:.:-0.05:1.000:. ./.:4:375,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:301,93:.:-0.82:1.000:. ./.:4:372,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:325,151:.: 0.03:1.000:. ./.:4:284,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:647,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:534,182:.: 2.54:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:389,153:.: 0.72:1.000:. ./.:4:570,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:366,155:.: 0.50:1.000:. ./.:4:602,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:527,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:293,1:.:-1.87:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:684,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:375,151:.: 0.55:1.000:. ./.:4:357,135:.: 0.20:1.000:. ./.:4:337,140:.: 0.04:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:350,173:.: 0.52:1.000:. ./.:4:455,2:.:-0.17:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:533,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:329,123:.:-0.22:1.000:. ./.:4:373,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:443,214:.: 1.92:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:377,116:.: 0.21:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.75:0.999:. ./.:4:615,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:676,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.62:1.000:. -chr7.1 45536518 chr7.1_045536518 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:783,148:.:-0.54:1.000:. ./.:4:833,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:908,140:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1213,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1132,184:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1083,136:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1024,133:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1012,140:.: 0.22:1.000:. ./.:4:869,141:.:-0.27:1.000:. ./.:4:283,108:.:-2.40:1.000:. ./.:4:511,106:.:-1.62:1.000:. ./.:4:1255,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:1230,126:.: 0.92:1.000:. ./.:4:1052,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1333,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1052,147:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1117,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:951,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1332,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1554,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:629,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:999,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1290,170:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1207,147:.: 0.91:1.000:. ./.:4:320,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:1659,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:1002,130:.: 0.15:1.000:. ./.:4:1033,130:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1705,1:.: 2.13:1.000:. ./.:4:1452,174:.: 1.85:1.000:. ./.:4:1010,141:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1260,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:343,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:497,1:.:-2.03:1.000:. ./.:3:217,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:1390,3:.: 1.05:1.000:. ./.:4:832,114:.:-0.49:1.000:. ./.:4:879,144:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1037,162:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1135,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:781,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:834,121:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1204,147:.: 0.90:1.000:. ./.:4:962,129:.: 0.01:1.000:. ./.:4:808,187:.:-0.32:1.000:. ./.:4:754,120:.:-0.74:1.000:. ./.:4:946,157:.: 0.05:0.807:. ./.:4:613,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:743,126:.:-0.76:1.000:. ./.:4:799,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:714,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:1034,165:.: 0.38:1.000:. ./.:4:722,133:.:-0.80:1.000:. ./.:4:829,140:.:-0.41:1.000:. ./.:4:917,137:.:-0.12:1.000:. ./.:4:926,143:.:-0.07:1.000:. ./.:4:709,126:.:-0.87:1.000:. ./.:4:1310,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:864,1:.:-0.77:1.000:. ./.:6:914,38:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1114,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1043,107:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1007,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1098,2:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1173,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1219,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:694,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:1157,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:810,0:.:-0.96:0.978:. ./.:4:1050,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1348,168:.: 1.47:1.000:. ./.:4:643,0:.:-1.54:0.999:. ./.:4:1731,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:1222,139:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1124,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:974,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:767,128:.:-0.67:1.000:. ./.:4:899,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1053,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:918,140:.:-0.11:1.000:. ./.:4:960,0:.:-0.44:0.988:. ./.:4:1478,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:972,169:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1065,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:1212,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1337,162:.: 1.41:1.000:. ./.:4:738,96:.:-0.88:1.000:. ./.:4:1016,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:1017,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:989,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:658,130:.:-1.04:1.000:. ./.:4:821,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:1020,135:.: 0.23:1.000:. ./.:4:839,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1304,173:.: 1.34:1.000:. ./.:4:1194,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1085,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1106,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:965,152:.: 0.10:1.000:. ./.:4:903,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:812,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:858,160:.:-0.24:1.000:. ./.:4:560,110:.:-1.44:1.000:. ./.:5:1239,167:.: 1.09:0.951:. ./.:4:598,137:.:-1.22:1.000:. ./.:4:761,143:.:-0.64:1.000:. ./.:4:722,146:.:-0.76:1.000:. ./.:4:919,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1545,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:813,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:1206,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1277,178:.: 1.26:1.000:. ./.:4:795,150:.:-0.49:0.999:. ./.:4:1354,142:.: 1.40:1.000:. ./.:4:448,84:.:-1.92:1.000:. ./.:4:1041,167:.: 0.41:1.000:. ./.:4:1162,172:.: 0.85:1.000:. ./.:4:692,128:.:-0.93:1.000:. ./.:4:819,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:715,110:.:-0.91:1.000:. ./.:4:717,148:.:-0.77:1.000:. ./.:4:924,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1102,157:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1412,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:909,133:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1118,164:.: 0.67:1.000:. ./.:4:986,130:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1057,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:844,111:.:-0.46:1.000:. ./.:4:758,118:.:-0.73:1.000:. ./.:4:793,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:974,161:.: 0.16:1.000:. ./.:4:682,119:.:-0.99:1.000:. ./.:4:995,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1186,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1554,184:.: 2.24:1.000:. ./.:4:1106,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1005,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:794,120:.:-0.60:1.000:. ./.:4:769,153:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1036,149:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1081,139:.: 0.45:1.000:. ./.:4:930,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:829,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1374,174:.: 1.58:1.000:. ./.:4:1288,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:1260,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1322,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1141,181:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1219,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1678,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:1264,136:.: 1.07:1.000:. ./.:4:383,91:.:-2.12:1.000:. ./.:4:737,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:998,150:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1037,141:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1203,180:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1441,178:.: 1.83:1.000:. ./.:4:1020,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1141,146:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1362,164:.: 1.51:1.000:. ./.:4:1143,118:.: 0.59:1.000:. ./.:4:909,126:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1145,113:.: 0.58:1.000:. ./.:4:970,100:.:-0.06:1.000:. ./.:4:1432,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:867,139:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1375,0:.: 0.99:0.999:. ./.:4:750,113:.:-0.78:1.000:. ./.:4:904,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1054,134:.: 0.34:1.000:. ./.:4:675,132:.:-0.97:1.000:. ./.:4:733,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:638,132:.:-1.10:1.000:. ./.:4:836,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:955,105:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1775,187:.: 3.01:1.000:. ./.:4:1114,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1240,144:.: 1.02:1.000:. ./.:4:1212,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1101,178:.: 0.66:0.999:. ./.:4:1685,157:.: 2.60:1.000:. ./.:4:1023,191:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1149,136:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1265,0:.: 0.61:1.000:. -chr7.1 45738668 chr7.1_045738668 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:140,54:.: 0.95:1.000:. ./.:4:60,47:.:-0.90:1.000:. ./.:4:137,12:.:-0.01:1.000:. ./.:4:65,31:.:-1.14:1.000:. ./.:4:92,80:.: 0.48:1.000:. ./.:4:141,19:.: 0.23:1.000:. ./.:4:60,14:.:-1.61:1.000:. ./.:4:147,21:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,46:.:-0.54:1.000:. ./.:4:40,13:.:-2.06:1.000:. ./.:4:22,7:.:-2.57:1.000:. ./.:4:31,83:.:-0.76:1.000:. ./.:4:29,51:.:-1.48:1.000:. ./.:4:196,20:.: 1.42:1.000:. ./.:4:41,59:.:-1.05:1.000:. ./.:4:58,76:.:-0.33:1.000:. ./.:4:84,59:.:-0.14:0.999:. ./.:4:87,74:.: 0.25:1.000:. ./.:4:161,41:.: 1.12:1.000:. ./.:4:137,42:.: 0.63:1.000:. ./.:4:18,13:.:-2.53:1.000:. ./.:4:91,61:.: 0.06:1.000:. ./.:4:105,32:.:-0.26:1.000:. ./.:4:97,22:.:-0.65:1.000:. ./.:4:29,2:.:-2.53:1.000:. ./.:4:80,43:.:-0.56:1.000:. ./.:4:141,22:.: 0.29:1.000:. ./.:4:76,50:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,42:.:-0.39:1.000:. ./.:4:96,23:.:-0.65:1.000:. ./.:4:139,56:.: 0.97:1.000:. ./.:4:45,40:.:-1.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:40,11:.:-2.10:1.000:. ./.:3:28,4:.:-2.50:1.000:. ./.:4:26,72:.:-1.10:1.000:. ./.:4:74,50:.:-0.54:1.000:. ./.:4:99,42:.:-0.18:1.000:. ./.:4:151,28:.: 0.63:1.000:. ./.:4:89,69:.: 0.18:1.000:. ./.:4:135,59:.: 0.95:1.000:. ./.:4:113,18:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,19:.: 0.23:1.000:. ./.:4:118,21:.:-0.22:1.000:. ./.:4:196,54:.: 2.15:1.000:. ./.:4:158,38:.: 0.99:1.000:. ./.:4:129,67:.: 0.99:0.807:. ./.:4:62,34:.:-1.14:1.000:. ./.:4:127,13:.:-0.20:1.000:. ./.:4:98,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:135,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:182,33:.: 1.40:1.000:. ./.:4:138,47:.: 0.76:1.000:. ./.:4:213,26:.: 1.91:1.000:. ./.:4:129,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:183,20:.: 1.14:1.000:. ./.:4:141,36:.: 0.59:1.000:. ./.:4:87,42:.:-0.44:1.000:. ./.:4:95,48:.:-0.14:1.000:. ./.:6:121,37:.: 0.18:1.000:. ./.:4:131,46:.: 0.59:1.000:. ./.:4:119,15:.:-0.33:1.000:. ./.:4:242,22:.: 2.44:1.000:. ./.:4:89,42:.:-0.39:1.000:. ./.:4:124,32:.: 0.14:1.000:. ./.:4:96,40:.:-0.29:1.000:. ./.:4:78,54:.:-0.37:1.000:. ./.:4:56,61:.:-0.69:1.000:. ./.:4:130,53:.: 0.72:0.978:. ./.:4:85,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:197,17:.: 1.38:1.000:. ./.:4:118,33:.: 0.03:0.999:. ./.:4:92,42:.:-0.33:1.000:. ./.:4:110,46:.: 0.14:1.000:. ./.:4:84,51:.:-0.31:1.000:. ./.:4:136,27:.: 0.29:1.000:. ./.:4:143,25:.: 0.40:1.000:. ./.:4:169,42:.: 1.31:1.000:. ./.:4:143,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:183,39:.: 1.55:1.000:. ./.:4:32,65:.:-1.12:0.988:. ./.:4:106,32:.:-0.24:1.000:. ./.:4:181,31:.: 1.34:1.000:. ./.:4:71,57:.:-0.46:1.000:. ./.:4:166,8:.: 0.52:1.000:. ./.:4:175,15:.: 0.87:1.000:. ./.:4:78,54:.:-0.37:1.000:. ./.:4:47,43:.:-1.27:1.000:. ./.:4:152,36:.: 0.82:1.000:. ./.:4:78,38:.:-0.71:1.000:. ./.:4:136,37:.: 0.50:1.000:. ./.:4:100,57:.: 0.16:1.000:. ./.:4:239,19:.: 2.32:1.000:. ./.:4:64,41:.:-0.95:1.000:. ./.:4:218,47:.: 2.47:1.000:. ./.:4:109,41:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,73:.:-0.90:1.000:. ./.:4:95,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:159,42:.: 1.10:1.000:. ./.:4:112,59:.: 0.46:1.000:. ./.:4:110,27:.:-0.26:1.000:. ./.:4:175,34:.: 1.27:1.000:. ./.:4:127,8:.:-0.31:1.000:. ./.:5:217,34:.: 2.17:0.951:. ./.:4:125,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:145,43:.: 0.82:1.000:. ./.:4:127,29:.: 0.14:1.000:. ./.:4:123,32:.: 0.12:1.000:. ./.:4:100,53:.: 0.08:1.000:. ./.:4:151,47:.: 1.04:1.000:. ./.:4:103,57:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,85:.: 0.48:1.000:. ./.:4:177,45:.: 1.55:0.999:. ./.:4:206,23:.: 1.70:1.000:. ./.:4:174,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:181,35:.: 1.42:1.000:. ./.:4:95,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:201,5:.: 1.21:1.000:. ./.:4:224,24:.: 2.10:1.000:. ./.:4:164,22:.: 0.78:1.000:. ./.:4:164,56:.: 1.51:1.000:. ./.:4:162,42:.: 1.16:1.000:. ./.:4:169,35:.: 1.16:1.000:. ./.:4:55,40:.:-1.16:1.000:. ./.:4:154,33:.: 0.80:1.000:. ./.:4:139,14:.: 0.08:1.000:. ./.:4:140,31:.: 0.46:1.000:. ./.:4:67,49:.:-0.71:1.000:. ./.:4:80,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:79,34:.:-0.78:1.000:. ./.:4:82,51:.:-0.35:1.000:. ./.:4:74,64:.:-0.24:1.000:. ./.:4:74,36:.:-0.84:1.000:. ./.:4:143,24:.: 0.38:1.000:. ./.:4:99,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:124,65:.: 0.84:1.000:. ./.:4:103,48:.: 0.03:1.000:. ./.:4:95,34:.:-0.44:1.000:. ./.:4:144,29:.: 0.50:1.000:. ./.:4:100,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:109,62:.: 0.46:1.000:. ./.:4:190,13:.: 1.14:1.000:. ./.:4:65,47:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,49:.:-0.39:1.000:. ./.:4:140,27:.: 0.38:1.000:. ./.:4:99,62:.: 0.25:1.000:. ./.:4:111,29:.:-0.20:1.000:. ./.:4:72,39:.:-0.82:1.000:. ./.:4:206,28:.: 1.80:1.000:. ./.:4:117,52:.: 0.42:1.000:. ./.:4:126,24:.: 0.01:1.000:. ./.:4:90,17:.:-0.90:1.000:. ./.:4:27,5:.:-2.50:1.000:. ./.:4:69,18:.:-1.33:1.000:. ./.:4:199,15:.: 1.38:1.000:. ./.:4:161,24:.: 0.76:1.000:. ./.:4:164,24:.: 0.82:1.000:. ./.:4:83,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:86,29:.:-0.73:1.000:. ./.:4:80,54:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,36:.:-1.12:1.000:. ./.:4:59,27:.:-1.35:1.000:. ./.:4:149,20:.: 0.42:1.000:. ./.:4:78,48:.:-0.50:1.000:. ./.:4:103,38:.:-0.18:1.000:. ./.:4:55,30:.:-1.37:1.000:. ./.:4:84,29:.:-0.78:1.000:. ./.:4:61,83:.:-0.12:0.999:. ./.:4:101,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:83,45:.:-0.46:1.000:. ./.:4:50,29:.:-1.50:1.000:. ./.:4:86,32:.:-0.67:1.000:. ./.:4:99,38:.:-0.26:1.000:. ./.:4:110,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:75,63:.:-0.24:1.000:. ./.:4:91,11:.:-1.01:1.000:. ./.:4:80,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:135,40:.: 0.55:1.000:. ./.:4:75,38:.:-0.78:1.000:. ./.:4:68,55:.:-0.56:1.000:. ./.:4:104,34:.:-0.24:0.999:. ./.:4:135,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,53:.: 0.31:1.000:. ./.:4:108,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,60:.:-0.31:1.000:. -chr7.1 45904952 chr7.1_045904952 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:332,98:.: 0.87:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:266,73:.:-0.48:1.000:. ./.:4:318,103:.: 0.73:1.000:. ./.:4:496,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:210,66:.:-1.41:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:287,79:.:-0.08:1.000:. ./.:4:129,47:.:-2.88:1.000:. ./.:4:126,59:.:-2.75:1.000:. ./.:4:201,193:.: 0.33:1.000:. ./.:4:285,115:.: 0.42:1.000:. ./.:4:421,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:273,77:.:-0.32:1.000:. ./.:4:327,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:318,102:.: 0.72:0.999:. ./.:4:279,27:.:-0.97:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:332,106:.: 0.98:1.000:. ./.:4:152,60:.:-2.35:1.000:. ./.:4:290,82:.: 0.01:1.000:. ./.:4:319,128:.: 1.12:1.000:. ./.:4:299,83:.: 0.16:1.000:. ./.:4:124,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:274,84:.:-0.20:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:267,91:.:-0.20:1.000:. ./.:4:455,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:312,113:.: 0.79:1.000:. ./.:4:315,111:.: 0.81:1.000:. ./.:4:246,85:.:-0.60:1.000:. ./.:4:63,28:.:-4.14:1.000:. ./.:4:166,53:.:-2.25:1.000:. ./.:3:84,0:.:-4.24:1.000:. ./.:4:298,96:.: 0.33:1.000:. ./.:4:292,66:.:-0.20:1.000:. ./.:4:281,87:.:-0.05:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:327,81:.: 0.54:1.000:. ./.:4:325,120:.: 1.09:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:248,98:.:-0.37:1.000:. ./.:4:317,121:.: 0.98:1.000:. ./.:4:310,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:316,84:.: 0.42:0.807:. ./.:4:425,167:.: 3.26:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:294,72:.:-0.08:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:250,94:.:-0.40:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:298,91:.: 0.26:1.000:. ./.:4:328,106:.: 0.92:1.000:. ./.:4:288,93:.: 0.14:1.000:. ./.:6:307,55:.:-0.14:1.000:. ./.:4:283,116:.: 0.41:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:246,74:.:-0.76:1.000:. ./.:4:284,104:.: 0.25:1.000:. ./.:4:291,89:.: 0.13:1.000:. ./.:4:281,79:.:-0.17:1.000:. ./.:4:310,86:.: 0.36:1.000:. ./.:4:293,128:.: 0.73:0.978:. ./.:4:234,80:.:-0.85:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:208,75:.:-1.30:0.999:. ./.:4:274,112:.: 0.22:1.000:. ./.:4:288,99:.: 0.23:1.000:. ./.:4:282,104:.: 0.22:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:295,81:.: 0.07:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:240,76:.:-0.82:0.988:. ./.:4:373,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:267,82:.:-0.33:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:241,82:.:-0.71:1.000:. ./.:4:275,75:.:-0.32:1.000:. ./.:4:291,88:.: 0.11:1.000:. ./.:4:250,90:.:-0.46:1.000:. ./.:4:283,105:.: 0.25:1.000:. ./.:4:247,82:.:-0.63:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:226,77:.:-1.01:1.000:. ./.:4:300,113:.: 0.61:1.000:. ./.:4:294,96:.: 0.28:1.000:. ./.:4:291,94:.: 0.20:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.61:1.000:. ./.:5:456,0:.: 1.25:0.951:. ./.:4:265,96:.:-0.15:1.000:. ./.:4:245,82:.:-0.65:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:355,119:.: 1.52:1.000:. ./.:4:307,99:.: 0.51:1.000:. ./.:4:290,95:.: 0.20:1.000:. ./.:4:386,116:.: 1.93:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.33:0.999:. ./.:4:358,111:.: 1.44:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:338,115:.: 1.21:1.000:. ./.:4:274,75:.:-0.33:1.000:. ./.:4:297,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:357,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:255,73:.:-0.64:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:310,91:.: 0.44:1.000:. ./.:4:258,97:.:-0.24:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:285,97:.: 0.16:1.000:. ./.:4:234,93:.:-0.65:1.000:. ./.:4:205,71:.:-1.41:1.000:. ./.:4:259,84:.:-0.42:1.000:. ./.:4:290,111:.: 0.44:1.000:. ./.:4:247,72:.:-0.77:1.000:. ./.:4:212,65:.:-1.39:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:391,108:.: 1.88:1.000:. ./.:4:291,100:.: 0.29:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:258,74:.:-0.58:1.000:. ./.:4:254,92:.:-0.37:1.000:. ./.:4:293,83:.: 0.07:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:222,65:.:-1.25:1.000:. ./.:4:296,118:.: 0.63:1.000:. ./.:4:468,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:302,90:.: 0.30:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:374,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:277,96:.: 0.02:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,48:.:-2.72:1.000:. ./.:4:277,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:299,84:.: 0.17:1.000:. ./.:4:274,98:.: 0.01:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:267,68:.:-0.54:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:247,82:.:-0.63:1.000:. ./.:4:312,100:.: 0.60:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:289,92:.: 0.14:0.999:. ./.:4:352,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:250,68:.:-0.79:1.000:. ./.:4:237,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:217,62:.:-1.36:1.000:. ./.:4:279,83:.:-0.14:1.000:. ./.:4:267,92:.:-0.18:1.000:. ./.:4:244,77:.:-0.74:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:351,92:.: 1.06:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:278,110:.: 0.25:1.000:. ./.:4:301,75:.: 0.07:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.66:0.999:. ./.:4:485,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:308,100:.: 0.54:1.000:. ./.:4:248,102:.:-0.32:1.000:. ./.:4:296,90:.: 0.22:1.000:. -chr7.1 46529707 chr7.1_046529707 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.73:0.999:. ./.:4:51,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.21:1.000:. ./.:3:12,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:0.807:. ./.:4:93,1:.: 3.03:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.90:1.000:. ./.:6:39,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.59:0.978:. ./.:4:38,0:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:96,1:.: 3.18:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:76,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.85:0.988:. ./.:4:26,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:5:42,0:.: 0.46:0.951:. ./.:4:56,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:0.999:. ./.:4:28,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:62,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:97,0:.: 3.18:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.65:0.999:. ./.:4:11,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.24:1.000:. -chr7.1 47220053 chr7.1_047220053 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:55,170:0.80: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,71:0.45: 0.74:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,242:1.00: 2.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,71:0.72:-0.64:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,99:0.69: 0.29:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-2.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-2.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,112:0.77: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,163:0.80: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,116:0.75: 0.52:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.39:0.999:1.000 0/0/1/1:4:120,72:0.44: 1.05:1.000:0.964 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,87:0.56: 0.42:1.000:0.968 0/1/1/1:4:8,31:0.83:-1.92:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,128:0.78: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,107:0.70: 0.48:1.000:0.983 0/1/1/1:4:58,122:0.72: 0.81:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-2.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,38:0.46:-0.95:1.000:0.990 0/0/1/1:4:120,97:0.48: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,89:0.59: 0.35:1.000:0.849 0/1/1/1:4:49,113:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,130:0.74: 0.99:1.000:0.998 0/1/1/1:4:45,106:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,12:0.49:-2.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,31:0.87:-1.96:1.000:0.943 0/0/1:3:4,3:0.47:-2.54:1.000:0.909 0/0/1/1:4:98,86:0.49: 0.89:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,106:0.71: 0.41:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,116:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,68:0.58:-0.31:1.000:0.928 0/0/1/1:4:124,63:0.42: 0.95:1.000:0.908 0/0/1/1:4:120,64:0.42: 0.89:1.000:0.929 0/1/1/1:4:50,128:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,132:0.76: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,127:0.70: 1.08:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,143:1.00: 0.09:0.807:1.000 0/1/1/1:4:7,18:0.77:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,56:0.53:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:55,30:0.43:-1.03:1.000:0.937 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,76:0.42: 1.76:1.000:0.896 0/1/1/1:4:51,107:0.72: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,71:0.54:-0.06:1.000:0.989 1/1/1/1:4:1,80:0.99:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,50:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,123:0.78: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,115:0.68: 0.79:1.000:0.956 0/1/1/1:4:55,117:0.73: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:88,57:0.45: 0.13:1.000:0.728 0/0/1/1:4:122,53:0.40: 0.72:1.000:0.799 0/0/1/1:4:55,55:0.51:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,1:0.25:-1.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,53:0.42: 0.31:1.000:0.922 0/0/1/1:4:70,68:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:58,118:0.72: 0.74:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,89:0.78:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,184:0.80: 2.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,57:0.54:-0.58:0.978:0.988 0/0/1/1:4:48,60:0.57:-0.58:1.000:0.935 0/0/1/1:4:70,73:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,38:0.59:-1.38:0.999:0.875 0/0/1/1:4:80,82:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,144:0.74: 1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,65:0.54:-0.29:1.000:0.987 0/0/1/1:4:59,54:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,68:0.55:-0.23:1.000:0.975 0/0/1/1:4:52,54:0.52:-0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,63:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:124,64:0.42: 0.97:1.000:0.915 0/0/1/1:4:89,53:0.44: 0.08:0.988:0.962 0/0/1/1:4:122,53:0.40: 0.72:1.000:0.799 0/0/1/1:4:130,63:0.41: 1.06:1.000:0.882 0/1/1/1:4:49,110:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,1:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,64:0.43: 0.74:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,122:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,84:0.69:-0.16:1.000:0.965 0/0/1/1:4:105,51:0.41: 0.35:1.000:0.883 0/1/1/1:4:42,99:0.75: 0.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,132:1.00:-0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,44:0.43:-0.25:1.000:0.936 0/1/1/1:4:58,115:0.71: 0.68:1.000:0.991 0/0/1/1:4:113,68:0.44: 0.83:1.000:0.964 0/1/1/1:4:50,103:0.72: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,79:0.44: 1.32:1.000:0.971 0/0/1/1:4:110,70:0.45: 0.81:1.000:0.975 1/1/1/1:4:1,37:0.98:-1.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,73:0.54: 0.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:78,62:0.47: 0.04:1.000:0.993 0/0/1/1/1:5:58,59:0.51:-0.41:0.951:0.607 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,119:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,50:0.41: 0.31:1.000:0.877 0/0/0/1:4:107,1:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,82:0.44: 1.61:1.000:0.960 0/0/1/1:4:56,63:0.54:-0.37:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,240:1.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,65:0.43: 0.83:0.999:0.946 1/1/1/1:4:0,138:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-2.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,104:0.63: 0.66:1.000:0.619 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,57:0.56:-0.66:1.000:0.959 0/1/1/1:4:64,138:0.73: 1.24:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,140:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,122:0.72: 0.83:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,104:0.61: 0.75:1.000:0.653 0/0/1/1:4:64,73:0.55:-0.02:1.000:0.983 0/1/1/1:4:56,115:0.72: 0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,56:0.56:-0.68:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,100:0.77: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,107:0.75: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,77:0.56: 0.06:1.000:0.963 0/0/1/1:4:42,56:0.59:-0.78:1.000:0.842 0/0/1/1:4:43,55:0.58:-0.78:1.000:0.910 0/0/1/1:4:144,146:0.51: 2.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,64:0.44: 0.66:1.000:0.961 0/0/1/1:4:123,58:0.41: 0.83:1.000:0.864 0/1/1/1:4:42,103:0.76: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,133:0.54: 2.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:69,49:0.46:-0.39:1.000:0.987 0/0/1/1:4:82,68:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,46:0.43:-0.16:1.000:0.939 0/1/1/1:4:65,170:0.77: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,83:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,69:0.55:-0.20:1.000:0.976 0/0/1/1:4:57,67:0.56:-0.27:1.000:0.974 0/0/1/1:4:55,54:0.50:-0.56:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,67:0.56:-0.29:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-2.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,73:0.57:-0.10:1.000:0.957 0/0/1/1:4:49,54:0.54:-0.68:1.000:0.990 0/0/1/1:4:61,77:0.58: 0.00:1.000:0.926 0/1/1/1:4:94,145:0.64: 1.96:1.000:0.650 0/0/1/1:4:48,60:0.57:-0.58:1.000:0.935 0/1/1/1:4:68,132:0.70: 1.20:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,157:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,90:0.67: 0.08:1.000:0.921 0/0/1/1:4:42,61:0.62:-0.68:1.000:0.582 0/1/1/1:4:61,123:0.71: 0.89:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,96:0.55: 0.81:1.000:0.983 0/0/1/1:4:80,65:0.48: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,45:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:59,45:0.47:-0.66:0.999:0.991 0/0/1/1:4:59,71:0.56:-0.16:1.000:0.963 0/0/1/1:4:44,57:0.58:-0.72:1.000:0.893 0/1/1/1:4:46,103:0.74: 0.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,47:0.50:-0.82:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,65:0.48: 0.13:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,111:0.74: 0.42:1.000:0.999 1/1/1/1:4:10,105:0.93:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,76:0.45: 1.06:0.999:0.977 0/0/1/1:4:63,58:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,150:0.73: 1.57:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,64:0.56:-0.41:1.000:0.961 -chr7.1 47641790 chr7.1_047641790 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:207,132:0.38: 0.29:1.000:0.568 0/0/1/1:4:164,165:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,208:0.57: 0.72:1.000:0.955 0/0/0/1:4:176,104:0.36:-0.46:1.000:0.713 0/0/0/1:4:323,104:0.21: 1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,233:0.49: 2.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,142:0.72:-1.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:204,211:0.52: 1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,115:0.35:-0.04:1.000:0.764 0/0/1/1:4:108,108:0.51:-1.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,127:0.68:-1.64:1.000:0.955 0/0/0/1:4:234,121:0.32: 0.50:1.000:0.953 0/0/1/1:4:194,203:0.52: 1.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:214,114:0.33: 0.15:1.000:0.926 0/0/0/1:4:261,102:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,119:0.25: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:409,1:0.00: 1.19:0.999:1.000 0/0/0/1:4:316,101:0.21: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,136:0.36: 0.59:1.000:0.651 0/0/1/1:4:229,146:0.38: 0.75:1.000:0.568 0/0/1/1:4:83,63:0.43:-2.16:1.000:0.951 0/0/0/0:4:275,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,221:0.55: 1.17:1.000:0.979 0/1/1/1:4:83,194:0.70:-0.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:79,36:0.29:-2.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:265,97:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,219:0.71:-0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:77,182:0.70:-0.72:1.000:0.987 0/0/1/1:4:207,255:0.56: 1.85:1.000:0.966 0/1/1/1:4:111,195:0.64:-0.13:1.000:0.703 0/0/0/1:4:182,108:0.36:-0.33:1.000:0.699 0/0/0/1:4:178,88:0.31:-0.63:1.000:0.976 0/0/0/1:4:49,22:0.28:-3.11:1.000:0.995 0/0/0/0:4:174,1:0.01:-1.79:1.000:1.000 0/0/1:3:55,46:0.46:-2.73:1.000:0.931 0/0/0/1:4:196,106:0.33:-0.18:1.000:0.908 0/0/0/1:4:278,113:0.26: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,119:0.41:-0.34:1.000:0.847 0/0/1/1:4:166,193:0.55: 0.55:1.000:0.982 0/0/0/0:4:276,1:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:233,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,201:0.69:-0.29:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,310:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,216:0.71:-0.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:158,119:0.43:-0.49:1.000:0.945 0/0/0/1:4:179,103:0.35:-0.43:1.000:0.790 0/0/0/1:4:299,121:0.26: 1.32:0.807:0.999 0/0/0/1:4:309,126:0.26: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,203:0.70:-0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:133,90:0.40:-1.18:1.000:0.767 0/0/0/1:4:149,61:0.26:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,123:0.36: 0.15:1.000:0.662 0/0/1/1:4:146,121:0.46:-0.62:1.000:0.986 0/1/1/1:4:90,239:0.73: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,195:0.56: 0.48:1.000:0.967 0/1/1/1:4:78,255:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,116:0.42:-0.54:1.000:0.927 0/0/1/1:4:190,151:0.45: 0.32:1.000:0.975 0/0/0/0:4:250,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:129,118:0.49:-0.87:1.000:0.881 0/0/0/1:4:170,86:0.31:-0.76:1.000:0.966 0/1/1/1:4:84,325:0.79: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,132:0.42:-0.02:1.000:0.905 0/0/0/1:4:149,73:0.31:-1.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:193,141:0.42: 0.23:1.000:0.915 0/0/1/1:4:152,116:0.43:-0.61:1.000:0.954 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,212:0.57: 0.80:1.000:0.952 0/0/0/0:4:256,0:0.00:-0.76:0.978:1.000 0/0/1/1:4:164,172:0.52: 0.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:105,340:0.76: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,1:0.00:-1.74:0.999:1.000 0/1/1/1:4:98,327:0.77: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,186:0.49: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:172,224:0.57: 1.02:1.000:0.936 0/0/0/1:4:164,90:0.34:-0.79:1.000:0.887 0/0/1/1:4:167,207:0.56: 0.74:1.000:0.963 0/0/1/1:4:175,137:0.44:-0.05:1.000:0.969 0/0/0/1:4:170,103:0.37:-0.54:1.000:0.627 0/1/1/1:4:87,215:0.71:-0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:142,134:0.50:-0.51:0.988:0.997 0/0/0/1:4:186,109:0.36:-0.27:1.000:0.738 0/1/1/1:4:118,207:0.64: 0.12:1.000:0.699 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,197:0.72:-0.52:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,350:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,85:0.28:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:205,80:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,101:0.39:-0.81:1.000:0.734 0/0/0/1:4:140,78:0.34:-1.24:1.000:0.861 0/0/0/1:4:150,86:0.35:-1.01:1.000:0.799 0/0/0/0:4:313,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,272:0.58: 1.98:1.000:0.897 0/0/0/1:4:117,67:0.35:-1.67:1.000:0.802 0/1/1/1:4:86,258:0.75: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:183,89:0.30:-0.56:1.000:0.982 0/0/0/1:4:241,85:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,255:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,254:0.72: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,95:0.36:-0.76:1.000:0.717 0/0/0/1:4:169,82:0.30:-0.82:1.000:0.982 0/0/1/1:4:204,224:0.53: 1.42:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,223:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:148,269:0.65: 1.28:0.951:0.907 0/0/0/1:4:200,88:0.28:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,102:0.40:-0.80:1.000:0.762 0/1/1/1:4:80,168:0.68:-0.86:1.000:0.951 0/0/0/1:4:184,90:0.31:-0.53:1.000:0.980 0/0/0/1:4:184,109:0.36:-0.29:1.000:0.705 0/0/0/0:4:260,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,118:0.34: 0.20:1.000:0.880 0/0/1/1:4:248,254:0.52: 2.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:84,214:0.72:-0.23:0.999:0.995 0/0/1/1:4:278,266:0.50: 2.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,221:0.60: 0.72:1.000:0.799 0/1/1/1:4:90,260:0.74: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,193:0.62:-0.02:1.000:0.570 0/0/1/1:4:153,240:0.62: 0.98:1.000:0.617 0/0/1/1:4:160,129:0.45:-0.34:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,283:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,122:0.39:-0.14:1.000:0.724 0/0/0/1:4:217,113:0.32: 0.18:1.000:0.947 0/0/1/1:4:170,244:0.60: 1.25:1.000:0.822 0/0/0/1:4:220,135:0.37: 0.50:1.000:0.580 0/1/1/1:4:72,258:0.78: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,339:0.82: 1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,249:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,166:0.57:-0.23:1.000:0.957 0/0/1/1:4:123,192:0.62:-0.01:1.000:0.631 0/0/1/1:4:134,172:0.57:-0.13:1.000:0.945 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,110:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,119:0.77:-2.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,127:0.44:-0.30:1.000:0.960 0/0/1/1:4:173,205:0.55: 0.79:1.000:0.978 0/1/1/1:4:93,269:0.74: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,108:0.35:-0.21:1.000:0.831 0/1/1/1:4:61,205:0.77:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,238:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,112:0.33: 0.10:1.000:0.935 0/1/1/1:4:82,200:0.71:-0.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:85,304:0.78: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,86:0.32:-0.84:1.000:0.942 0/0/0/1:4:141,63:0.28:-1.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:231,135:0.35: 0.64:1.000:0.747 0/0/0/1:4:317,127:0.25: 1.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:179,105:0.36:-0.40:1.000:0.735 0/0/1/1:4:183,195:0.53: 0.79:1.000:0.993 0/1/1/1:4:96,296:0.75: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:248,106:0.27: 0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,205:0.69:-0.25:1.000:0.978 0/1/1/1:4:88,300:0.77: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,140:0.69:-1.42:1.000:0.969 0/0/0/1:4:156,58:0.24:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,229:0.67: 0.36:1.000:0.912 0/1/1/1:4:98,244:0.71: 0.33:1.000:0.993 0/1/1/1:4:114,272:0.70: 0.89:1.000:0.989 0/1/1/1:4:90,183:0.67:-0.54:1.000:0.930 0/0/0/1:4:179,103:0.35:-0.43:1.000:0.790 0/0/1/1:4:216,238:0.53: 1.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:154,208:0.58: 0.59:1.000:0.905 0/1/1/1:4:96,253:0.72: 0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,181:0.75:-0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,191:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:129,225:0.64: 0.48:1.000:0.685 0/1/1/1:4:77,216:0.74:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:117,173:0.60:-0.33:1.000:0.765 0/0/1/1:4:181,212:0.55: 0.98:0.999:0.981 0/1/1/1:4:78,179:0.70:-0.75:1.000:0.982 0/0/0/0:4:254,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,190:0.54: 0.51:1.000:0.985 0/0/0/1:4:247,100:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:230,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,93:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:268,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,237:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,237:0.54: 1.66:1.000:0.987 0/0/0/1:4:169,98:0.35:-0.62:1.000:0.769 0/0/1/1:4:206,224:0.53: 1.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:235,125:0.33: 0.56:1.000:0.928 0/1/1/1:4:94,226:0.71: 0.05:0.999:0.990 0/1/1/1:4:116,403:0.77: 2.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,130:0.35: 0.53:1.000:0.812 0/0/1/1:4:156,191:0.56: 0.39:1.000:0.968 0/0/1/1:4:152,181:0.55: 0.22:1.000:0.977 -chr7.1 47862095 chr7.1_047862095 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:108,360:0.77: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,157:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:180,205:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:282,77:0.21: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,340:0.75: 1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,242:0.55: 0.75:1.000:0.977 0/0/1/1:4:102,146:0.57:-1.19:1.000:0.944 0/0/1/1:4:178,194:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,243:0.72:-0.21:1.000:0.995 1/1/1/1:4:6,55:0.90:-3.26:1.000:0.779 0/0/1/1:4:42,50:0.52:-2.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:87,260:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:183,205:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:270,112:0.28: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:291,101:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,265:0.71: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:188,215:0.51: 0.53:0.999:0.996 0/0/0/1:4:322,100:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:360,105:0.22: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,112:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.31:-3.35:1.000:0.975 0/0/1/1:4:201,171:0.44: 0.19:1.000:0.967 0/0/1/1:4:208,261:0.54: 1.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:189,150:0.42:-0.18:1.000:0.927 0/0/0/1:4:31,17:0.34:-3.40:1.000:0.865 0/0/0/1:4:266,88:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,209:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,210:0.49: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/0:4:462,2:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,225:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:109,314:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:233,92:0.27:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,18:0.38:-3.44:1.000:0.616 0/0/1/1:4:36,52:0.57:-2.96:1.000:0.937 0/1/1:3:19,27:0.57:-3.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:242,91:0.26:-0.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:102,323:0.76: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,313:0.79: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,209:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:187,216:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:191,167:0.45: 0.03:1.000:0.976 0/0/1/1:4:193,214:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:316,136:0.29: 1.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:182,228:0.54: 0.61:1.000:0.990 0/1/1/1:4:103,337:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:91,326:0.78: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:136,344:0.71: 1.38:0.807:0.992 0/0/0/1:4:556,168:0.23: 4.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,158:0.45:-0.19:1.000:0.977 0/0/0/1:4:272,91:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,97:0.28:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:257,228:0.45: 1.44:1.000:0.979 0/1/1/1:4:84,236:0.73:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:161,232:0.57: 0.42:1.000:0.939 0/0/1/1:4:173,171:0.47:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:179,227:0.54: 0.56:1.000:0.988 0/1/1/1:4:91,261:0.74:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:240,90:0.26:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:179,199:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:181,123:0.39:-0.57:1.000:0.733 0/0/0/1:4:299,102:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:233,116:0.32:-0.07:1.000:0.953 0/0/0/1:4:310,97:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,81:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:308,101:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:238,94:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,124:0.50:-1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:192,183:0.47: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:179,165:0.46:-0.12:0.978:0.987 0/0/1/1:4:170,167:0.47:-0.20:1.000:0.993 0/0/0/1:4:298,118:0.27: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,142:0.55:-1.18:0.999:0.979 0/0/0/1:4:290,89:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,206:0.48: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,206:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:199,96:0.31:-0.67:1.000:0.967 0/0/1/1:4:195,203:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:287,93:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,97:0.29:-0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:192,208:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,161:0.49:-0.46:0.988:0.996 0/0/0/1:4:262,117:0.30: 0.26:1.000:0.987 0/0/1/1:4:212,186:0.45: 0.47:1.000:0.977 0/0/1/1:4:142,161:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:314,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,116:0.30: 0.22:1.000:0.986 0/1/1/1:4:76,220:0.74:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,68:0.21:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,75:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,74:0.21:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,251:0.76:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,156:0.45:-0.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:187,204:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:219,75:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,201:0.57:-0.17:1.000:0.936 0/0/0/1:4:271,76:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,73:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,92:0.32:-0.87:1.000:0.954 0/0/1/1:4:209,212:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:282,93:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,84:0.29:-0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:191,238:0.53: 0.82:1.000:0.991 0/0/0/1:4:166,94:0.35:-1.05:1.000:0.814 0/0/0/1/1:5:204,165:0.43: 0.15:0.951:0.944 0/1/1/1:4:85,231:0.73:-0.43:1.000:0.997 0/1/1/1:4:86,261:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,151:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,107:0.28: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:378,124:0.24: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,188:0.52:-0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:222,55:0.19:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,244:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,159:0.50:-0.56:0.999:0.997 0/0/1/1:4:242,229:0.46: 1.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:125,160:0.54:-0.78:1.000:0.987 0/0/1/1:4:169,209:0.53: 0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:118,162:0.56:-0.83:1.000:0.967 0/0/1/1:4:151,181:0.52:-0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:193,65:0.24:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,87:0.29:-0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:98,287:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:224,99:0.30:-0.36:1.000:0.988 0/0/1/1:4:161,224:0.56: 0.33:1.000:0.961 0/0/0/1:4:332,103:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,191:0.56:-0.30:1.000:0.960 0/0/0/1:4:279,115:0.28: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:178,187:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,169:0.55:-0.63:1.000:0.982 0/0/1/1:4:105,118:0.51:-1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,140:0.49:-0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,186:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:100,280:0.73: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,101:0.42:-1.38:1.000:0.908 0/0/0/1:4:232,93:0.28:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/0:4:325,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,223:0.47: 1.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:293,105:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:315,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,163:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,226:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,186:0.56:-0.36:1.000:0.972 0/0/0/1:4:206,103:0.32:-0.51:1.000:0.951 0/0/0/1:4:282,106:0.26: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:190,77:0.28:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:365,117:0.24: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:383,116:0.23: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,97:0.24: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:377,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,210:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:229,89:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:444,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,114:0.31:-0.02:1.000:0.971 0/0/1/1:4:15,26:0.62:-3.48:1.000:0.560 0/0/0/1:4:298,91:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,204:0.51: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:191,203:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:201,229:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:208,194:0.46: 0.52:1.000:0.988 0/0/0/1:4:254,82:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,249:0.52: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,154:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,98:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,170:0.47:-0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:185,209:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:260,239:0.46: 1.59:1.000:0.986 0/0/0/0:4:376,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,157:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,160:0.46:-0.27:0.999:0.989 0/0/1/1:4:189,208:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,165:0.48:-0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:173,190:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,206:0.78:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,214:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,286:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:167,148:0.45:-0.45:1.000:0.979 0/0/0/1:4:231,71:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,221:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:316,113:0.26: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:195,210:0.49: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:227,107:0.31:-0.23:1.000:0.975 0/0/1/1:4:249,219:0.45: 1.25:0.999:0.977 0/0/0/1:4:342,124:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:140,358:0.71: 1.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:144,176:0.53:-0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:198,220:0.50: 0.70:1.000:0.997 -chr7.1 48022990 chr7.1_048022990 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:186,0:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:130,0:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:150,0:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:202,0:.: 1.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:237,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:158,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:150,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.78:1.000:. ./.:3:28,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:172,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:158,0:.: 0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:111,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.44:1.000:. ./.:6:68,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:168,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:119,0:.: 0.09:0.978:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.14:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:104,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:0.988:. ./.:4:129,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:105,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:107,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.35:1.000:. ./.:5:2,0:.:-1.70:0.951:. ./.:4:3,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:122,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:155,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:164,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:138,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:136,1:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:84,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:192,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:135,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:157,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:168,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:117,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:134,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:134,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:127,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:183,0:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:156,0:.: 0.65:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:226,0:.: 1.72:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr7.1 48219006 chr7.1_048219006 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:184,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:301,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:164,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.86:0.999:. ./.:4:220,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:236,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:101,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:216,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.54:1.000:. ./.:3:38,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:167,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:313,0:.: 2.38:0.807:. ./.:4:18,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:296,1:.: 2.10:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.42:1.000:. ./.:6:238,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.33:0.978:. ./.:4:131,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:124,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.98:0.988:. ./.:4:215,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:233,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:151,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:252,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:295,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.80:1.000:. ./.:5:309,0:.: 2.31:0.951:. ./.:4:242,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:210,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.39:0.998:. ./.:4:261,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:240,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.37:0.999:. ./.:4:100,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:209,1:.: 0.58:0.999:. ./.:4:193,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.06:1.000:. -chr7.1 48610484 chr7.1_048610484 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:464,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:487,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:570,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:536,2:.: 0.83:1.000:. ./.:4:190,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:350,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:497,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:570,3:.: 1.19:0.999:. ./.:4:541,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:655,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:547,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:235,3:.:-2.23:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:535,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:495,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:211,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:468,2:.: 0.14:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:524,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:572,2:.: 1.20:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:178,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:188,0:.:-2.74:1.000:. ./.:3:77,0:.:-3.87:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:502,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:615,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:481,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:545,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:428,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:478,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.60:0.807:. ./.:4:579,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:645,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:547,2:.: 0.95:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:491,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:612,1:.: 1.60:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.56:1.000:. ./.:6:351,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:442,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:559,1:.: 1.06:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:409,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:470,1:.: 0.15:0.978:. ./.:4:400,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:559,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:624,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:427,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:447,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:511,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.66:0.988:. ./.:4:514,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:382,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:393,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:373,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:349,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:515,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:403,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:439,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:523,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:303,0:.:-1.57:1.000:. ./.:5:594,0:.: 1.41:0.951:. ./.:4:376,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:579,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:630,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.69:0.998:. ./.:4:581,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:302,1:.:-1.57:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:404,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:367,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:391,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:446,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:410,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:449,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:335,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:442,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:288,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:631,2:.: 1.80:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:411,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:304,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:409,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:402,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:591,2:.: 1.40:1.000:. ./.:4:591,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:492,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:194,1:.:-2.67:1.000:. ./.:4:380,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:607,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:524,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:561,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:462,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:533,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:439,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:466,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:431,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:337,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:720,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:503,1:.: 0.49:0.999:. ./.:4:597,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:667,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.01:1.000:. -chr7.1 48651987 chr7.1_048651987 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,13:.: 1.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:39,8:.: 1.08:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.37:1.000:. ./.:4:11,2:.:-2.01:1.000:. ./.:4:38,6:.: 0.81:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.37:1.000:. ./.:4:9,4:.:-2.01:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:37,4:.: 0.54:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.99:0.999:. ./.:4:50,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:53,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:39,14:.: 1.63:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.83:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,7:.: 0.63:1.000:. ./.:4:33,10:.: 0.72:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:41,4:.: 0.90:1.000:. ./.:4:26,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.28:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:32,4:.: 0.08:1.000:. ./.:4:30,6:.: 0.08:1.000:. ./.:4:38,6:.: 0.81:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.37:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,16:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:38,9:.: 1.08:0.807:. ./.:4:16,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:34,11:.: 0.90:1.000:. ./.:4:32,5:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.92:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:6:30,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:0.978:. ./.:4:35,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.37:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.92:0.999:. ./.:4:44,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:34,4:.: 0.26:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.01:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:44,11:.: 1.81:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.55:0.988:. ./.:4:37,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:36,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:38,9:.: 1.08:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.46:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:24,4:.:-0.65:1.000:. ./.:5:30,19:.: 1.26:0.951:. ./.:4:22,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,10:.: 1.44:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:35,17:.: 1.53:1.000:. ./.:4:34,8:.: 0.63:0.998:. ./.:4:38,11:.: 1.26:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,12:.:-0.10:1.000:. ./.:4:20,3:.:-1.10:1.000:. ./.:4:25,12:.: 0.17:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.17:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.44:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.37:1.000:. ./.:4:40,12:.: 1.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:16,11:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:36,9:.: 0.90:1.000:. ./.:4:14,6:.:-1.37:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,13:.: 1.26:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.10:1.000:. ./.:4:32,9:.: 0.54:1.000:. ./.:4:11,7:.:-1.55:1.000:. ./.:4:16,7:.:-1.10:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.72:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,7:.: 2.17:1.000:. ./.:4:35,9:.: 0.81:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:31,8:.: 0.35:1.000:. ./.:4:34,7:.: 0.54:1.000:. ./.:4:43,5:.: 1.17:1.000:. ./.:4:33,9:.: 0.63:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:30,13:.: 0.72:1.000:. ./.:4:19,4:.:-1.10:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.83:1.000:. ./.:4:35,10:.: 0.90:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.46:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.17:0.999:. ./.:4:27,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:29,7:.: 0.08:1.000:. ./.:4:15,9:.:-1.01:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:36,5:.: 0.54:1.000:. ./.:4:46,8:.: 1.72:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:32,10:.: 0.63:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,10:.: 0.26:0.999:. ./.:4:41,15:.: 1.90:1.000:. ./.:4:35,8:.: 0.72:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.10:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.72:1.000:. -chr7.1 48888280 chr7.1_048888280 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:122,27:0.23:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,86:1.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,29:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,29:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,47:0.28: 1.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,31:0.29:-0.74:1.000:0.991 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,24:0.21:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,29:0.31:-1.12:1.000:0.977 0/0/0/1:4:45,7:0.17:-2.48:1.000:0.998 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-2.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,57:0.49:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:122,25:0.21:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,34:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,20:0.17:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,27:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,38:0.27: 0.34:0.999:0.998 0/1/1/1:4:49,83:0.63:-0.57:1.000:0.618 0/0/1/1:4:85,90:0.53: 0.46:1.000:0.993 0/0/0/0:4:185,1:0.01: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,24:0.20:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,41:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,9:0.28:-2.79:1.000:0.996 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,26:0.30:-1.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:81,25:0.28:-1.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:205,34:0.18: 1.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,30:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.45:-3.10:1.000:0.975 0/0/0/1:4:72,17:0.24:-1.59:1.000:1.000 0/0/1:3:9,3:0.29:-3.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,36:0.31:-0.52:1.000:0.974 0/0/0/1:4:121,36:0.28: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,36:0.30:-0.33:1.000:0.988 0/0/0/1:4:113,25:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,22:0.19:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,33:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,53:0.42:-0.54:1.000:0.928 0/0/0/1:4:131,33:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,36:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,31:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,37:0.25: 0.67:0.807:0.999 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-3.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,12:0.14:-1.21:1.000:0.974 0/0/1/1:4:95,75:0.46: 0.34:1.000:0.988 0/0/0/1:4:160,29:0.19: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,35:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,52:0.29: 1.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:135,22:0.17: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,23:0.20:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,45:0.29: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,35:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:134,45:0.29: 0.55:1.000:0.849 0/0/0/1:4:204,26:0.14: 1.77:1.000:0.970 0/0/0/1:4:126,28:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,37:0.22: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,31:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,37:0.30:-0.28:1.000:0.986 0/0/0/1:4:149,28:0.20: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,37:0.21: 1.41:0.978:1.000 0/0/1/1:4:76,45:0.40:-0.83:1.000:0.794 0/0/0/1:4:182,41:0.23: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,30:0.26:-0.31:0.999:0.999 0/0/0/1:4:141,33:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,18:0.15:-0.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:98,60:0.41: 0.05:1.000:0.846 0/0/0/1:4:125,31:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,83:0.46: 0.74:1.000:0.989 0/0/0/1:4:172,47:0.26: 1.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,79:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,103:0.72:-0.33:0.988:0.997 0/0/0/1:4:159,47:0.27: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,98:0.46: 1.65:1.000:0.985 0/0/0/1:4:115,26:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,33:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,33:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,21:0.18:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,26:0.17: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,30:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,23:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,32:0.21: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,50:0.27: 1.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,23:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,32:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,44:0.24: 1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,88:0.66:-0.52:1.000:0.871 0/0/1/1:4:104,98:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,59:0.39: 0.22:1.000:0.666 0/0/0/1:4:140,48:0.30: 0.77:1.000:0.987 0/0/1/1:4:140,83:0.40: 1.60:1.000:0.796 0/0/0/1:4:107,24:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:216,34:0.17: 2.25:0.951:0.999 0/0/0/1:4:141,30:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,24:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,55:0.45:-0.62:1.000:0.975 0/0/1/1:4:91,59:0.42:-0.14:1.000:0.910 0/0/0/1:4:176,35:0.21: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,34:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,48:0.28: 1.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,84:0.47: 0.77:0.998:0.991 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 2.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,27:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,25:0.19: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,44:0.27: 1.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:122,30:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,34:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,33:0.21: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,38:0.24: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,51:0.29: 1.20:1.000:0.991 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,56:0.46:-0.71:1.000:0.990 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,19:0.15:-0.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:144,38:0.26: 0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,22:0.24:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,16:0.18:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,25:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,29:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,40:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,33:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,33:0.21: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,40:0.28: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,37:0.22: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,60:0.44:-0.26:1.000:0.962 0/0/0/1:4:117,31:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,63:0.33: 1.51:1.000:0.934 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,25:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,24:0.18: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,31:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,28:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,21:0.21:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,40:0.41:-1.24:1.000:0.873 0/0/0/1:4:143,35:0.25: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,35:0.28:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,25:0.19: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,35:0.30:-0.50:1.000:0.984 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,66:0.45:-0.02:1.000:0.977 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,25:0.28:-1.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,27:0.27:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,32:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:69,17:0.25:-1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,23:0.23:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,64:0.46:-0.23:1.000:0.987 0/0/1/1:4:78,63:0.47:-0.35:0.999:0.991 0/0/0/1:4:83,36:0.34:-0.88:1.000:0.872 0/0/0/1:4:106,22:0.21:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,29:0.28:-0.83:1.000:0.994 0/0/0/1:4:98,23:0.24:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,27:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,35:0.29:-0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,22:0.19:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,31:0.31:-1.00:1.000:0.969 0/0/0/0:4:158,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,73:0.47: 0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:121,19:0.17:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/0:4:140,12:0.10:-0.09:1.000:0.834 0/0/1/1:4:71,67:0.50:-0.43:0.999:0.997 0/0/0/1:4:157,46:0.27: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,46:0.34:-0.14:1.000:0.848 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,44:0.39:-0.76:1.000:0.637 -chr7.1 49280996 chr7.1_049280996 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:304,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:334,84:.: 0.85:1.000:. ./.:4:684,100:.: 3.81:1.000:. ./.:4:462,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:280,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:56,22:.:-1.91:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:284,86:.: 0.46:1.000:. ./.:4:343,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:349,91:.: 1.02:1.000:. ./.:4:225,77:.:-0.09:0.999:. ./.:4:472,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:43,29:.:-1.96:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:25,24:.:-2.14:1.000:. ./.:4:285,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:260,87:.: 0.27:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.79:1.000:. ./.:3:43,27:.:-1.97:1.000:. ./.:4:251,79:.: 0.13:1.000:. ./.:4:254,83:.: 0.19:1.000:. ./.:4:368,88:.: 1.15:1.000:. ./.:4:258,74:.: 0.15:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:182,74:.:-0.47:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:165,88:.:-0.49:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:362,89:.: 1.11:0.807:. ./.:4:219,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:242,84:.: 0.10:1.000:. ./.:4:298,76:.: 0.49:1.000:. ./.:4:279,111:.: 0.62:1.000:. ./.:4:196,73:.:-0.36:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:268,68:.: 0.18:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.29:1.000:. ./.:6:170,19:.:-1.01:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:230,87:.: 0.03:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:122,69:.:-0.99:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:184,94:.:-0.29:1.000:. ./.:4:202,64:.:-0.39:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.05:0.978:. ./.:4:409,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:217,89:.:-0.06:1.000:. ./.:4:269,41:.:-0.03:0.999:. ./.:4:418,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:259,83:.: 0.23:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.12:0.988:. ./.:4:286,103:.: 0.61:1.000:. ./.:4:301,85:.: 0.59:1.000:. ./.:4:270,72:.: 0.23:1.000:. ./.:4:300,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:176,59:.:-0.64:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:230,84:.: 0.00:1.000:. ./.:4:253,67:.: 0.05:1.000:. ./.:4:447,97:.: 1.87:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:219,72:.:-0.18:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:293,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:167,81:.:-0.53:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.89:1.000:. ./.:5:213,0:.:-0.81:0.951:. ./.:4:176,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:61,58:.:-1.58:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:654,143:.: 3.91:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:262,119:.: 0.55:1.000:. ./.:4:385,91:.: 1.31:0.998:. ./.:4:318,113:.: 0.95:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:317,98:.: 0.82:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:349,81:.: 0.94:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:252,84:.: 0.18:1.000:. ./.:4:342,103:.: 1.06:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:267,95:.: 0.39:1.000:. ./.:4:326,81:.: 0.76:1.000:. ./.:4:318,99:.: 0.84:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:258,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:231,74:.:-0.07:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:288,82:.: 0.46:1.000:. ./.:4:260,88:.: 0.28:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:318,81:.: 0.69:1.000:. ./.:4:251,48:.:-0.12:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:226,92:.: 0.04:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:274,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:162,68:.:-0.68:1.000:. ./.:4:392,103:.: 1.47:1.000:. ./.:4:375,87:.: 1.20:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:237,86:.: 0.08:1.000:. ./.:4:347,97:.: 1.06:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:289,82:.: 0.46:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:477,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:298,69:.: 0.43:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:419,64:.: 1.37:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:327,57:.: 0.57:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.31:0.999:. ./.:4:245,81:.: 0.10:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:308,67:.: 0.50:1.000:. ./.:4:294,84:.: 0.52:1.000:. ./.:4:157,48:.:-0.88:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:342,65:.: 0.76:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.18:0.999:. ./.:4:584,107:.: 3.06:1.000:. ./.:4:570,106:.: 2.93:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:539,0:.: 1.82:1.000:. -chr7.1 49807679 chr7.1_049807679 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:341,129:.: 0.54:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:336,109:.: 0.28:1.000:. ./.:4:333,141:.: 0.58:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:381,192:.: 1.60:1.000:. ./.:4:129,125:.:-1.69:1.000:. ./.:4:319,120:.: 0.22:1.000:. ./.:4:294,106:.:-0.18:1.000:. ./.:4:92,1:.:-3.35:1.000:. ./.:4:106,44:.:-2.76:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:340,123:.: 0.47:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.95:0.999:. ./.:4:470,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:364,136:.: 0.85:1.000:. ./.:4:252,268:.: 1.05:1.000:. ./.:4:44,62:.:-3.21:1.000:. ./.:4:347,108:.: 0.38:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:188,187:.:-0.44:1.000:. ./.:4:63,31:.:-3.33:1.000:. ./.:4:373,125:.: 0.83:1.000:. ./.:4:220,221:.: 0.24:1.000:. ./.:4:296,97:.:-0.26:1.000:. ./.:4:337,137:.: 0.58:1.000:. ./.:4:213,232:.: 0.28:1.000:. ./.:4:377,117:.: 0.78:1.000:. ./.:4:207,204:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,26:.:-3.65:1.000:. ./.:4:126,51:.:-2.48:1.000:. ./.:3:79,13:.:-3.36:1.000:. ./.:4:308,131:.: 0.22:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:303,117:.: 0.02:1.000:. ./.:4:378,138:.: 1.01:1.000:. ./.:4:340,143:.: 0.67:1.000:. ./.:4:330,132:.: 0.46:1.000:. ./.:4:337,124:.: 0.45:1.000:. ./.:4:230,266:.: 0.81:1.000:. ./.:4:206,246:.: 0.35:1.000:. ./.:4:346,173:.: 1.04:1.000:. ./.:4:390,120:.: 0.95:1.000:. ./.:4:469,0:.: 0.53:0.807:. ./.:4:231,317:.: 1.34:1.000:. ./.:4:200,252:.: 0.35:1.000:. ./.:4:433,188:.: 2.09:1.000:. ./.:4:332,135:.: 0.51:1.000:. ./.:4:420,148:.: 1.55:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:234,277:.: 0.96:1.000:. ./.:4:271,105:.:-0.43:1.000:. ./.:4:230,268:.: 0.83:1.000:. ./.:4:273,99:.:-0.47:1.000:. ./.:4:298,321:.: 2.07:1.000:. ./.:4:349,101:.: 0.33:1.000:. ./.:6:291,81:.:-0.47:1.000:. ./.:4:328,124:.: 0.35:1.000:. ./.:4:336,117:.: 0.36:1.000:. ./.:4:275,303:.: 1.65:1.000:. ./.:4:373,141:.: 0.99:1.000:. ./.:4:233,254:.: 0.71:1.000:. ./.:4:221,258:.: 0.63:1.000:. ./.:4:205,71:.:-1.46:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:372,132:.: 0.89:0.978:. ./.:4:291,103:.:-0.25:1.000:. ./.:4:355,135:.: 0.74:1.000:. ./.:4:213,69:.:-1.40:0.999:. ./.:4:300,288:.: 1.75:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:348,126:.: 0.58:1.000:. ./.:4:215,247:.: 0.46:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:192,242:.: 0.17:1.000:. ./.:4:215,239:.: 0.37:1.000:. ./.:4:363,131:.: 0.78:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.10:0.988:. ./.:4:307,112:.: 0.01:1.000:. ./.:4:333,153:.: 0.70:1.000:. ./.:4:259,102:.:-0.58:1.000:. ./.:4:287,304:.: 1.78:1.000:. ./.:4:218,207:.: 0.07:1.000:. ./.:4:272,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:281,103:.:-0.35:1.000:. ./.:4:297,106:.:-0.15:1.000:. ./.:4:260,112:.:-0.47:1.000:. ./.:4:421,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:345,139:.: 0.68:1.000:. ./.:4:146,165:.:-1.10:1.000:. ./.:4:176,190:.:-0.53:1.000:. ./.:4:347,125:.: 0.56:1.000:. ./.:4:334,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:285,115:.:-0.18:1.000:. ./.:4:292,117:.:-0.09:1.000:. ./.:4:317,101:.: 0.00:1.000:. ./.:4:223,90:.:-1.08:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:169,155:.:-0.97:1.000:. ./.:5:349,106:.: 0.38:0.951:. ./.:4:375,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:290,100:.:-0.29:1.000:. ./.:4:299,124:.: 0.05:1.000:. ./.:4:356,123:.: 0.63:1.000:. ./.:4:328,143:.: 0.55:1.000:. ./.:4:304,96:.:-0.18:1.000:. ./.:4:285,109:.:-0.25:1.000:. ./.:4:560,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:294,111:.:-0.13:0.998:. ./.:4:410,131:.: 1.27:1.000:. ./.:4:309,91:.:-0.18:1.000:. ./.:4:222,249:.: 0.55:1.000:. ./.:4:225,69:.:-1.27:1.000:. ./.:4:284,115:.:-0.19:1.000:. ./.:4:200,238:.: 0.21:1.000:. ./.:4:192,214:.:-0.12:1.000:. ./.:4:310,126:.: 0.19:1.000:. ./.:4:282,136:.: 0.00:1.000:. ./.:4:341,101:.: 0.25:1.000:. ./.:4:218,247:.: 0.49:1.000:. ./.:4:232,197:.: 0.12:1.000:. ./.:4:338,132:.: 0.54:1.000:. ./.:4:216,232:.: 0.31:1.000:. ./.:4:317,97:.:-0.04:1.000:. ./.:4:198,101:.:-1.22:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:280,122:.:-0.16:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,89:.:-1.54:1.000:. ./.:4:187,256:.: 0.26:1.000:. ./.:4:282,108:.:-0.29:1.000:. ./.:4:358,146:.: 0.89:1.000:. ./.:4:205,253:.: 0.41:1.000:. ./.:4:196,249:.: 0.28:1.000:. ./.:4:156,178:.:-0.86:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:203,231:.: 0.17:1.000:. ./.:4:263,126:.:-0.30:1.000:. ./.:4:286,101:.:-0.32:1.000:. ./.:4:233,95:.:-0.92:1.000:. ./.:4:243,265:.: 0.93:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:226,211:.: 0.20:1.000:. ./.:4:305,115:.: 0.02:1.000:. ./.:4:247,263:.: 0.95:1.000:. ./.:4:307,81:.:-0.31:1.000:. ./.:4:372,145:.: 1.02:1.000:. ./.:4:319,132:.: 0.34:1.000:. ./.:4:62,22:.:-3.44:1.000:. ./.:4:178,74:.:-1.71:1.000:. ./.:4:274,261:.: 1.21:1.000:. ./.:4:195,230:.: 0.07:1.000:. ./.:4:258,241:.: 0.84:1.000:. ./.:4:295,128:.: 0.05:1.000:. ./.:4:178,188:.:-0.53:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:264,90:.:-0.66:1.000:. ./.:4:285,111:.:-0.22:1.000:. ./.:4:192,229:.: 0.03:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:360,119:.: 0.63:1.000:. ./.:4:204,210:.:-0.04:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:268,97:.:-0.54:0.999:. ./.:4:194,210:.:-0.14:1.000:. ./.:4:273,100:.:-0.46:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:193,175:.:-0.51:1.000:. ./.:4:381,150:.: 1.17:1.000:. ./.:4:359,119:.: 0.62:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:287,118:.:-0.13:1.000:. ./.:4:316,125:.: 0.24:0.999:. ./.:4:432,167:.: 1.87:1.000:. ./.:4:356,142:.: 0.83:1.000:. ./.:4:239,74:.:-1.08:1.000:. ./.:4:287,124:.:-0.07:1.000:. -chr7.1 50362057 chr7.1_050362057 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,71:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:285,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:306,1:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,99:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:195,81:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,93:0.26: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/0:4:269,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,56:0.18: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:310,1:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:239,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:203,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:219,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.36:0.999:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:330,115:0.21: 2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,56:0.22:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:398,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,80:0.19: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,40:0.32:-1.43:1.000:0.955 0/0/0/1:4:247,76:0.19: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,81:0.33:-0.50:1.000:0.923 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,117:0.36: 0.05:1.000:0.683 0/0/0/1:4:279,101:0.21: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,73:0.28:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0:3:28,0:0.00:-2.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:230,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,61:0.34:-1.01:1.000:0.889 0/0/0/0:4:169,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:219,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,81:0.32:-0.39:1.000:0.963 0/0/0/1:4:208,70:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:304,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:248,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:413,0:0.00: 2.01:0.807:1.000 0/0/0/1:4:22,16:0.31:-2.01:1.000:0.970 0/0/0/1:4:234,67:0.18: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:223,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,96:0.33:-0.11:1.000:0.936 0/0/0/1:4:161,106:0.30: 0.44:1.000:0.986 0/0/0/1:4:79,66:0.33:-0.86:1.000:0.917 0/0/0/0:4:262,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,88:0.28: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:185,1:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:287,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,82:0.28: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,102:0.36:-0.24:1.000:0.722 0/0/0/0:4:223,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,102:0.22: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,68:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:238,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.20:0.978:1.000 0/0/0/1:4:159,98:0.29: 0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:207,85:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:169,0:0.00:-0.61:0.999:1.000 0/0/0/1:4:175,158:0.34: 1.15:1.000:0.859 0/0/0/0:4:330,1:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,69:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,70:0.58:-1.49:1.000:0.917 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,80:0.75:-1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,61:0.16: 0.82:1.000:0.997 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.86:0.988:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,61:0.33:-0.95:1.000:0.938 0/0/0/1:4:124,85:0.30:-0.18:1.000:0.981 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:223,1:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,77:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,72:0.37:-0.97:1.000:0.509 0/0/0/1:4:301,99:0.20: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:238,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,70:0.50:-1.43:1.000:0.997 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-2.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,52:0.34:-1.23:1.000:0.880 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,55:0.29:-0.90:1.000:0.990 0/0/0/0/1:5:314,80:0.16: 1.80:0.951:0.998 0/0/0/0:4:251,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:209,1:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,1:0.01:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:332,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,75:0.20: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:355,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-1.28:0.998:1.000 0/0/0/1:4:401,90:0.15: 2.84:1.000:0.985 0/0/0/1:4:60,29:0.26:-1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:305,84:0.17: 1.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,71:0.19: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,49:0.21:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,65:0.31:-0.76:1.000:0.972 0/0/0/1:4:91,90:0.35:-0.48:1.000:0.753 0/0/0/0:4:227,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,64:0.30:-0.67:1.000:0.988 0/0/0/1:4:94,94:0.36:-0.40:1.000:0.737 0/0/0/1:4:209,115:0.28: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:237,86:0.22: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,91:0.28: 0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:262,82:0.19: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,55:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,51:0.18: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:264,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,60:0.63:-1.65:1.000:0.580 0/0/0/1:4:73,75:0.36:-0.83:1.000:0.696 0/0/0/0:4:316,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,93:0.38:-0.60:1.000:0.591 0/0/1/1:4:24,64:0.48:-1.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:242,63:0.17: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,92:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,81:0.27: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-2.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:372,108:0.18: 2.73:1.000:0.999 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,101:0.22: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,89:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,101:0.37:-0.33:1.000:0.620 0/0/0/1:4:85,78:0.34:-0.67:1.000:0.843 0/0/0/1:4:254,118:0.25: 1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,85:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,30:0.17:-0.89:1.000:0.998 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,74:0.30:-0.45:1.000:0.984 0/0/0/1:4:118,82:0.31:-0.27:1.000:0.979 0/0/0/1:4:145,128:0.34: 0.51:1.000:0.879 0/0/0/0:4:295,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,95:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,89:0.20: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,64:0.32:-0.82:1.000:0.961 0/0/0/1:4:96,87:0.34:-0.46:1.000:0.856 0/0/0/0:4:334,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,96:0.57:-1.13:1.000:0.944 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:171,122:0.31: 0.72:0.999:0.974 0/0/0/1:4:112,89:0.32:-0.26:1.000:0.942 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:307,2:0.01: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:252,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:294,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,78:0.33:-0.60:1.000:0.908 0/0/0/1:4:272,111:0.23: 1.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:375,0:0.00: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,87:0.22: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.86:0.999:1.000 0/0/0/1:4:231,119:0.27: 1.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:362,1:0.00: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:320,84:0.17: 1.91:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,100:0.28: 0.51:1.000:0.995 -chr7.1 51253503 chr7.1_051253503 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:345,118:0.26: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:344,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:131,326:0.69: 0.56:1.000:0.977 0/0/0/1:4:289,102:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:395,103:0.21: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,385:0.70: 1.40:1.000:0.981 0/0/1/1:4:148,127:0.47:-1.35:1.000:0.993 0/1/1/1:4:121,294:0.69: 0.12:1.000:0.971 0/0/0/1:4:300,111:0.28: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,81:0.56:-2.73:1.000:0.962 0/1/1/1:4:33,167:0.80:-2.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:405,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,121:0.28: 0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:327,118:0.27: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:327,102:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:362,102:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:355,124:0.27: 0.79:0.999:0.998 0/0/0/1:4:379,119:0.24: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:386,131:0.26: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:252,194:0.44: 0.44:1.000:0.974 0/0/0/1:4:67,26:0.29:-3.27:1.000:0.993 0/0/0/0:4:402,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,232:0.48: 0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:227,208:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,36:0.52:-3.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,244:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,222:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:289,100:0.26:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:257,227:0.48: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:236,199:0.47: 0.33:1.000:0.991 0/0/0/1:4:323,84:0.21: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,101:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,18:0.40:-3.76:1.000:0.791 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-2.89:1.000:1.000 0/0/0:3:48,0:0.00:-3.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:475,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,109:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,92:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,198:0.44: 0.64:1.000:0.958 0/0/0/0:4:496,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,98:0.26:-0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:374,104:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,238:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,190:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:302,82:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:343,89:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,211:0.50: 0.29:0.807:0.997 0/0/1/1:4:393,385:0.50: 3.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,185:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:332,102:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,82:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:369,122:0.25: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,96:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:240,224:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,284:0.73:-0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:220,236:0.52: 0.55:1.000:0.994 0/0/0/1:4:314,105:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:383,114:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:449,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:240,129:0.36:-0.37:1.000:0.880 0/0/0/1:4:309,106:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,265:0.70:-0.37:1.000:0.982 0/0/1/1:4:232,216:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:273,86:0.25:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:246,217:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:351,90:0.21: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:332,117:0.27: 0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:272,96:0.27:-0.38:0.978:0.998 0/0/0/1:4:241,95:0.29:-0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:122,335:0.71: 0.56:1.000:0.992 0/0/0/1:4:297,91:0.24:-0.17:0.999:1.000 0/0/1/1:4:228,191:0.47: 0.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:208,240:0.54: 0.46:1.000:0.988 0/0/0/1:4:342,109:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:333,103:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,159:0.48:-0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:276,89:0.25:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,207:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:386,125:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:326,0:0.00:-0.82:0.988:1.000 0/0/0/0:4:454,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:391,121:0.24: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:335,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,194:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:245,210:0.47: 0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:239,86:0.27:-0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:279,95:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:256,89:0.26:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:308,101:0.25: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:280,72:0.21:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,91:0.27:-0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:118,356:0.72: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,131:0.47:-1.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:246,162:0.41: 0.04:1.000:0.837 0/0/0/1:4:331,122:0.28: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:271,71:0.21:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,84:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:345,117:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:405,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,168:0.52:-0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:201,219:0.53: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,113:0.44:-1.50:1.000:0.971 0/0/1/1/1:5:173,290:0.62: 0.62:0.951:0.966 0/0/1/1:4:168,174:0.52:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:269,96:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:305,88:0.23:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:331,102:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:376,142:0.28: 1.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:328,102:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,154:0.46:-0.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:442,124:0.22: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,104:0.26: 0.08:0.998:0.999 0/1/1/1:4:123,441:0.75: 1.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,199:0.73:-1.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:202,219:0.53: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:196,198:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,298:0.74:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:201,165:0.46:-0.40:1.000:0.988 0/0/0/1:4:308,86:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,97:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,169:0.46:-0.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:240,211:0.48: 0.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:348,114:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:209,212:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,323:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,188:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:260,87:0.26:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:139,169:0.55:-1.01:1.000:0.979 0/0/1/1:4:162,168:0.52:-0.78:1.000:0.995 0/0/0/0:4:368,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:275,100:0.27:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,77:0.29:-1.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:273,84:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,85:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:475,153:0.25: 2.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:247,231:0.49: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:277,83:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,171:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:267,105:0.29:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:247,205:0.46: 0.51:1.000:0.989 0/0/1/1:4:187,166:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/0:4:418,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,75:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,255:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:443,116:0.21: 1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,206:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:123,294:0.69: 0.14:1.000:0.966 0/0/1/1:4:254,262:0.52: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:226,166:0.43:-0.12:1.000:0.953 0/1/1/1:4:128,306:0.69: 0.32:1.000:0.966 0/1/1/1:4:114,325:0.72: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:54,40:0.43:-3.26:1.000:0.958 0/0/0/1:4:222,76:0.26:-1.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:267,255:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:288,231:0.45: 1.21:1.000:0.984 0/0/1/1:4:269,258:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:327,103:0.25: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,172:0.45:-0.14:1.000:0.980 0/0/0/1:4:352,114:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:216,181:0.47:-0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:232,180:0.45: 0.09:1.000:0.976 0/0/1/1:4:179,207:0.54:-0.19:1.000:0.987 0/0/1/1:4:194,196:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:353,106:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,206:0.49: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:193,176:0.49:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:255,97:0.28:-0.54:0.999:0.995 0/0/1/1:4:211,188:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:296,93:0.25:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,173:0.51:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,178:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,190:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:182,188:0.52:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:295,109:0.28: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,149:0.49:-0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:287,247:0.47: 1.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:370,110:0.23: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,241:0.53: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:221,173:0.45:-0.10:1.000:0.978 0/0/0/1:4:316,96:0.24: 0.09:0.999:1.000 0/1/1/1:4:137,390:0.72: 1.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:413,142:0.26: 1.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,246:0.69:-0.60:1.000:0.972 0/0/0/1:4:324,80:0.20: 0.00:1.000:1.000 -chr7.1 51441120 chr7.1_051441120 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:360,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:233,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:304,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:329,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:243,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:351,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.60:1.000:. ./.:3:14,0:.:-3.29:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.18:0.807:. ./.:4:153,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:310,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:323,1:.: 0.69:1.000:. ./.:6:179,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.39:0.978:. ./.:4:269,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:236,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.30:0.999:. ./.:4:301,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:365,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.04:0.988:. ./.:4:326,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:294,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.28:1.000:. ./.:5:306,0:.: 0.46:0.951:. ./.:4:187,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.81:0.998:. ./.:4:273,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:177,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:292,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:339,2:.: 0.91:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:188,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:331,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:335,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:477,1:.: 2.67:1.000:. ./.:4:267,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:251,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:298,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:213,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:181,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.43:0.999:. ./.:4:331,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:259,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.37:0.999:. ./.:4:339,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.34:1.000:. -chr7.1 51590876 chr7.1_051590876 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:524,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:290,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:521,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:500,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:97,1:.:-2.06:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:452,2:.: 1.45:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:360,1:.: 0.53:0.999:. ./.:4:366,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:430,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:425,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:80,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:234,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:79,1:.:-2.23:1.000:. ./.:3:28,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:539,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:252,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:322,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:424,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:547,2:.: 2.38:0.807:. ./.:4:75,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:410,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:382,3:.: 0.77:1.000:. ./.:4:174,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:352,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.12:1.000:. ./.:6:219,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:217,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:279,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:190,1:.:-1.14:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:250,1:.:-0.55:0.978:. ./.:4:352,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:246,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:204,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:338,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:292,1:.:-0.14:0.988:. ./.:4:223,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:379,3:.: 0.74:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:340,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:347,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:317,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.74:1.000:. ./.:5:386,1:.: 0.79:0.951:. ./.:4:360,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:394,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:384,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.43:0.998:. ./.:4:366,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:198,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:305,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:504,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:197,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:502,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:184,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:313,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:338,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:424,2:.: 1.17:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:279,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:500,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:385,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:419,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:462,0:.: 1.53:0.999:. ./.:4:352,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:303,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:426,1:.: 1.18:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:286,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:443,1:.: 1.35:0.999:. ./.:4:357,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:606,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:298,2:.:-0.07:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.87:1.000:. -chr7.1 52465795 chr7.1_052465795 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:629,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:666,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:621,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:182,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:227,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:637,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:656,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:661,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:193,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:644,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:589,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:560,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:644,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:129,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:202,0:.:-2.56:1.000:. ./.:3:104,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:622,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:518,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:600,1:.: 0.98:0.807:. ./.:4:362,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:720,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:588,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:484,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.40:1.000:. ./.:6:390,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:482,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:485,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:513,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:597,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:510,1:.: 0.18:0.978:. ./.:4:456,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:601,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:486,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:545,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:564,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.89:0.988:. ./.:4:573,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:347,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:449,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:452,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:410,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:338,0:.:-1.35:1.000:. ./.:5:620,0:.: 1.15:0.951:. ./.:4:354,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:431,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:677,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:525,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:675,2:.: 1.66:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.12:0.998:. ./.:4:673,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:292,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:471,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:308,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:350,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:474,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:428,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:618,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:571,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:456,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:332,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:654,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:820,0:.: 2.93:1.000:. ./.:4:591,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:434,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:636,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:164,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:386,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:558,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:699,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:581,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:666,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:484,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:457,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:472,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:519,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:362,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:575,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:575,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:554,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:679,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:635,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:550,1:.: 0.54:1.000:. -chr7.1 52643683 chr7.1_052643683 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:56,6:.: 0.83:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:29,11:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,16:.: 1.24:1.000:. ./.:4:58,15:.: 1.57:1.000:. ./.:4:41,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:18,17:.:-1.00:1.000:. ./.:4:30,20:.: 0.02:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:17,8:.:-1.68:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.15:1.000:. ./.:4:52,18:.: 1.37:1.000:. ./.:4:54,6:.: 0.69:1.000:. ./.:4:55,4:.: 0.63:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.19:1.000:. ./.:4:43,5:.:-0.12:1.000:. ./.:4:73,4:.: 1.84:0.999:. ./.:4:68,16:.: 2.32:1.000:. ./.:4:60,11:.: 1.44:1.000:. ./.:4:48,9:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:16,21:.:-0.87:1.000:. ./.:4:65,3:.: 1.24:1.000:. ./.:4:32,11:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,3:.:-2.29:1.000:. ./.:4:31,13:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:37,5:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:30,5:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,2:.:-1.34:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.61:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:39,11:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,9:.:-0.19:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:27,4:.:-1.27:1.000:. ./.:4:40,5:.:-0.32:1.000:. ./.:4:51,3:.: 0.29:1.000:. ./.:4:44,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:32,26:.: 0.56:1.000:. ./.:4:44,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,13:.: 1.44:0.807:. ./.:4:36,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:26,9:.:-1.00:1.000:. ./.:4:26,4:.:-1.34:1.000:. ./.:4:49,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:54,15:.: 1.30:1.000:. ./.:4:57,4:.: 0.76:1.000:. ./.:4:51,14:.: 1.03:1.000:. ./.:4:50,7:.: 0.49:1.000:. ./.:4:21,9:.:-1.34:1.000:. ./.:4:36,15:.: 0.08:1.000:. ./.:4:36,19:.: 0.35:1.000:. ./.:4:23,10:.:-1.14:1.000:. ./.:6:46,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:47,7:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,16:.: 1.17:1.000:. ./.:4:52,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:54,16:.: 1.37:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.61:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.07:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:45,6:.: 0.08:0.978:. ./.:4:66,7:.: 1.57:1.000:. ./.:4:41,15:.: 0.42:1.000:. ./.:4:32,5:.:-0.87:0.999:. ./.:4:47,30:.: 1.84:1.000:. ./.:4:44,27:.: 1.44:1.000:. ./.:4:62,6:.: 1.24:1.000:. ./.:4:39,6:.:-0.32:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:40,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:37,13:.: 0.02:0.988:. ./.:4:44,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:50,16:.: 1.10:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:16,4:.:-2.02:1.000:. ./.:4:31,7:.:-0.80:1.000:. ./.:4:41,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,26:.: 1.17:1.000:. ./.:4:37,14:.: 0.08:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:38,19:.: 0.49:1.000:. ./.:4:36,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:21,7:.:-1.48:1.000:. ./.:4:26,14:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,7:.:-0.05:1.000:. ./.:4:35,7:.:-0.53:1.000:. ./.:4:39,9:.:-0.12:1.000:. ./.:4:41,10:.: 0.08:1.000:. ./.:4:63,9:.: 1.51:1.000:. ./.:4:50,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,14:.: 1.51:1.000:. ./.:4:29,11:.:-0.66:1.000:. ./.:5:73,11:.: 2.32:0.951:. ./.:4:33,7:.:-0.66:1.000:. ./.:4:55,18:.: 1.57:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:36,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:58,8:.: 1.10:1.000:. ./.:4:34,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:26,9:.:-1.00:1.000:. ./.:4:49,5:.: 0.29:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.69:0.998:. ./.:4:46,12:.: 0.56:1.000:. ./.:4:12,4:.:-2.29:1.000:. ./.:4:42,20:.: 0.83:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:43,36:.: 1.98:1.000:. ./.:4:25,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:50,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:51,23:.: 1.64:1.000:. ./.:4:37,12:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,7:.:-0.39:1.000:. ./.:4:44,8:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,7:.: 0.42:1.000:. ./.:4:42,8:.: 0.02:1.000:. ./.:4:25,4:.:-1.41:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,4:.:-1.07:1.000:. ./.:4:72,7:.: 1.98:1.000:. ./.:4:23,2:.:-1.68:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.48:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.05:1.000:. ./.:4:28,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:42,8:.: 0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:43,14:.: 0.49:1.000:. ./.:4:23,21:.:-0.39:1.000:. ./.:4:36,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:41,25:.: 1.10:1.000:. ./.:4:61,19:.: 2.05:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,19:.: 0.76:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:40,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:34,17:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,11:.:-0.32:1.000:. ./.:4:25,13:.:-0.80:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:73,15:.: 2.59:1.000:. ./.:4:43,5:.:-0.12:1.000:. ./.:4:38,11:.:-0.05:1.000:. ./.:4:31,27:.: 0.56:1.000:. ./.:4:40,6:.:-0.26:1.000:. ./.:4:56,7:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.66:1.000:. ./.:4:26,17:.:-0.46:1.000:. ./.:4:36,8:.:-0.39:1.000:. ./.:4:49,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.07:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:32,15:.:-0.19:1.000:. ./.:4:49,17:.: 1.10:0.999:. ./.:4:31,27:.: 0.56:1.000:. ./.:4:30,3:.:-1.14:1.000:. ./.:4:48,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:27,6:.:-1.14:1.000:. ./.:4:26,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:57,10:.: 1.17:1.000:. ./.:4:39,11:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,5:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,14:.: 0.56:1.000:. ./.:4:30,12:.:-0.53:1.000:. ./.:4:24,10:.:-1.07:1.000:. ./.:4:36,17:.: 0.22:0.999:. ./.:4:52,24:.: 1.78:1.000:. ./.:4:50,15:.: 1.03:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:47,16:.: 0.90:1.000:. -chr7.1 52766185 chr7.1_052766185 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:269,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.90:0.999:. ./.:4:134,129:.:-0.36:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.96:1.000:. ./.:4:496,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:27,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:111,0:.:-2.15:1.000:. ./.:3:58,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.45:0.807:. ./.:4:160,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:408,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.76:1.000:. ./.:6:297,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:399,0:.: 1.25:0.978:. ./.:4:214,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.61:0.999:. ./.:4:563,0:.: 3.18:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.17:0.988:. ./.:4:399,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:321,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:305,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:205,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.53:1.000:. ./.:5:334,0:.: 0.48:0.951:. ./.:4:268,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.12:0.998:. ./.:4:450,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:442,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:229,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:186,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:190,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:331,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.84:1.000:. -chr7.1 52880921 chr7.1_052880921 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:163,94:0.39: 0.46:1.000:0.709 0/1/1/1:4:42,83:0.65:-1.10:1.000:0.771 0/0/1/1:4:101,88:0.47:-0.34:1.000:0.993 0/1/1/1:4:63,115:0.63:-0.47:1.000:0.587 0/0/1/1:4:123,114:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,72:0.44:-0.56:1.000:0.962 0/0/1/1:4:47,51:0.52:-1.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,77:0.43:-0.37:1.000:0.945 0/0/1/1:4:72,61:0.47:-1.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,22:0.45:-1.97:1.000:0.975 0/0/1/1:4:25,16:0.41:-2.09:1.000:0.874 0/1/1/1:4:21,84:0.77:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,97:0.44: 0.09:1.000:0.973 0/0/1/1:4:104,83:0.46:-0.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:75,79:0.51:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,72:0.41:-0.42:1.000:0.889 0/0/1/1:4:76,119:0.60:-0.27:0.999:0.790 0/0/1/1:4:121,107:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,122:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,124:0.54: 0.10:1.000:0.985 0/0/1/1:4:14,13:0.49:-2.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,136:0.60: 0.05:1.000:0.771 0/0/1/1:4:184,174:0.49: 1.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,70:0.75:-1.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,9:0.35:-2.25:1.000:0.744 0/0/1/1:4:56,60:0.52:-1.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,64:0.55:-1.22:1.000:0.977 0/1/1/1:4:33,71:0.66:-1.35:1.000:0.894 0/0/1/1:4:155,133:0.47: 0.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:58,59:0.51:-1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,72:0.45:-0.63:1.000:0.980 0/0/1/1:4:39,61:0.60:-1.40:1.000:0.792 0/1/1/1:4:3,14:0.80:-2.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.54:-1.79:1.000:0.990 0/0/1:3:15,2:0.18:-2.38:1.000:0.986 0/1/1/1:4:58,105:0.63:-0.65:1.000:0.565 0/0/1/1:4:107,99:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,91:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,77:0.40:-0.17:1.000:0.801 0/1/1/1:4:49,87:0.63:-0.97:1.000:0.512 0/0/1/1:4:146,134:0.48: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,165:0.57: 0.81:1.000:0.949 0/0/1/1:4:151,149:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:155,143:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,169:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,169:0.59: 0.75:1.000:0.861 0/0/1/1:4:96,162:0.62: 0.47:0.807:0.623 0/0/1/1:4:9,8:0.48:-2.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,101:0.54:-0.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:98,97:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,109:0.41: 0.71:1.000:0.883 0/0/1/1:4:184,171:0.49: 1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:182,80:0.34: 0.52:1.000:0.858 0/0/1/1:4:127,174:0.57: 0.98:1.000:0.942 0/0/0/1:4:191,93:0.36: 0.78:1.000:0.690 0/0/0/1:4:180,90:0.36: 0.61:1.000:0.631 0/0/1/1:4:155,112:0.44: 0.58:1.000:0.960 0/0/1/1:4:101,110:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:151,116:0.45: 0.58:1.000:0.978 0/0/0/1/1/1:6:175,135:0.45: 1.09:1.000:0.739 0/0/1/1:4:200,148:0.44: 1.53:1.000:0.968 0/0/1/1:4:138,148:0.52: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,170:0.54: 1.13:1.000:0.988 0/1/1/1:4:32,84:0.70:-1.21:1.000:0.986 0/0/1/1:4:116,168:0.58: 0.78:1.000:0.898 0/0/1/1:4:90,96:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,78:0.50:-0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,154:0.59: 0.45:1.000:0.848 0/1/1/1:4:50,142:0.71:-0.31:0.978:0.994 0/1/1/1:4:33,131:0.77:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,138:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,79:0.49:-0.68:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,96:0.40: 0.46:1.000:0.773 0/1/1/1:4:43,201:0.80: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,125:0.61:-0.21:1.000:0.655 0/0/1/1:4:163,101:0.41: 0.54:1.000:0.834 0/0/1/1:4:152,207:0.57: 1.66:1.000:0.946 0/0/1/1:4:76,126:0.61:-0.19:1.000:0.668 0/0/1/1:4:118,98:0.46:-0.03:1.000:0.990 0/1/1/1:4:34,139:0.78:-0.53:0.988:1.000 0/0/1/1:4:137,171:0.55: 1.06:1.000:0.978 0/0/1/1:4:227,191:0.47: 2.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:51,88:0.62:-0.94:1.000:0.565 0/0/1/1:4:78,107:0.57:-0.39:1.000:0.941 0/0/1/1:4:147,168:0.53: 1.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:173,122:0.43: 0.91:1.000:0.949 0/0/1/1:4:184,173:0.49: 1.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,132:0.67:-0.32:1.000:0.927 0/1/1/1:4:31,125:0.77:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,120:0.45: 0.70:1.000:0.977 0/0/1/1:4:175,107:0.40: 0.75:1.000:0.814 0/0/1/1:4:161,135:0.47: 0.92:1.000:0.991 0/1/1/1:4:26,71:0.71:-1.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:75,108:0.58:-0.42:1.000:0.904 0/1/1/1:4:49,142:0.72:-0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:132,151:0.53: 0.77:1.000:0.991 0/1/1/1:4:40,125:0.73:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:197,189:0.49: 1.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,101:0.47: 0.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:301,112:0.31: 2.30:1.000:0.968 0/0/1/1:4:260,195:0.44: 2.80:1.000:0.972 0/0/1/1:4:131,106:0.46: 0.22:1.000:0.987 0/0/0/1/1:5:190,159:0.47: 1.55:0.951:0.797 0/0/0/1:4:216,109:0.37: 1.26:1.000:0.609 0/0/1/1:4:163,96:0.40: 0.48:1.000:0.750 0/0/1/1:4:101,115:0.53:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,119:0.55:-0.05:1.000:0.978 0/1/1/1:4:83,161:0.64: 0.31:1.000:0.733 0/0/1/1:4:101,157:0.60: 0.47:1.000:0.803 0/0/1/1:4:127,137:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,120:0.57:-0.12:1.000:0.945 0/0/1/1:4:227,171:0.44: 2.13:0.998:0.973 0/0/1/1:4:190,128:0.42: 1.18:1.000:0.921 0/0/1/1:4:121,116:0.49: 0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,167:0.63: 0.47:1.000:0.601 0/0/1/1:4:75,90:0.54:-0.63:1.000:0.986 0/0/1/1:4:192,148:0.45: 1.44:1.000:0.979 0/0/1/1:4:160,123:0.45: 0.77:1.000:0.978 0/0/1/1:4:115,122:0.52: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:142,132:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,173:0.49: 1.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,188:0.53: 1.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:67,64:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,171:0.58: 0.87:1.000:0.920 0/0/1/1:4:173,164:0.49: 1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,180:0.55: 1.26:1.000:0.980 0/1/1/1:4:42,106:0.69:-0.83:1.000:0.979 0/0/1/1:4:99,111:0.53:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,144:0.56: 0.45:1.000:0.970 0/0/1/1:4:193,108:0.39: 0.98:1.000:0.643 0/0/1/1:4:87,61:0.43:-0.83:1.000:0.946 0/1/1/1:4:38,119:0.73:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,129:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,147:0.64: 0.09:1.000:0.636 0/0/1/1:4:138,127:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,161:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,97:0.66:-0.89:1.000:0.871 0/0/1/1:4:137,138:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,102:0.40: 0.59:1.000:0.822 0/1/1/1:4:89,161:0.63: 0.38:1.000:0.563 0/0/1/1:4:133,161:0.54: 0.90:1.000:0.984 0/0/1/1:4:85,100:0.54:-0.39:1.000:0.988 0/0/1/1:4:67,104:0.60:-0.56:1.000:0.805 0/0/1/1:4:178,122:0.43: 0.97:1.000:0.933 0/0/1/1:4:206,204:0.50: 2.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,59:0.46:-1.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:129,90:0.43: 0.01:1.000:0.944 0/0/1/1:4:130,87:0.42:-0.01:1.000:0.916 0/0/0/1:4:202,103:0.37: 1.03:1.000:0.585 0/0/1/1:4:67,109:0.61:-0.50:1.000:0.712 0/0/1/1:4:99,70:0.43:-0.58:1.000:0.950 0/0/1/1:4:43,26:0.40:-1.76:1.000:0.797 0/0/1/1:4:39,49:0.55:-1.54:1.000:0.977 0/0/1/1:4:88,155:0.62: 0.29:1.000:0.509 0/0/1/1:4:142,95:0.42: 0.22:1.000:0.916 0/0/1/1:4:99,93:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,85:0.52:-0.65:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,115:0.71:-0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:131,129:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,87:0.55:-0.73:1.000:0.976 0/1/1/1:4:43,90:0.66:-1.01:1.000:0.862 0/0/1/1:4:128,92:0.43: 0.02:1.000:0.958 0/0/1/1:4:104,130:0.55: 0.19:1.000:0.978 0/1/1/1:4:56,107:0.64:-0.65:1.000:0.700 0/1/1/1:4:15,84:0.83:-1.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,66:0.45:-0.77:1.000:0.975 0/1/1/1:4:24,105:0.79:-1.05:0.999:1.000 0/0/1/1:4:145,100:0.43: 0.32:1.000:0.937 0/0/1/1:4:88,84:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,80:0.55:-0.86:1.000:0.981 0/0/0/1:4:136,59:0.34:-0.27:1.000:0.873 0/0/1/1:4:129,131:0.51: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,126:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,101:0.46: 0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:56,78:0.58:-0.99:1.000:0.931 0/0/1/1:4:98,101:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,135:0.59: 0.07:1.000:0.842 0/0/1/1:4:70,76:0.52:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,100:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,111:0.48: 0.18:0.999:0.995 0/0/1/1:4:109,109:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,105:0.57:-0.42:1.000:0.952 0/0/1/1:4:42,64:0.59:-1.33:1.000:0.835 0/1/1/1:4:36,129:0.75:-0.63:1.000:0.999 -chr7.1 53175597 chr7.1_053175597 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:194,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.68:0.999:. ./.:4:180,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:216,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.25:1.000:. ./.:3:40,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.33:0.807:. ./.:4:86,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.73:1.000:. ./.:6:110,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.25:0.978:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:150,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.41:0.988:. ./.:4:114,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.96:1.000:. ./.:5:153,0:.: 0.78:0.951:. ./.:4:119,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:208,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:214,1:.: 2.42:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.27:0.998:. ./.:4:118,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:110,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:88,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:46,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.99:0.999:. ./.:4:131,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,2:.: 0.25:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.47:0.999:. ./.:4:127,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:69,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.97:1.000:. -chr7.1 53356380 chr7.1_053356380 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:681,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:655,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:829,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:588,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:984,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:876,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:380,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:758,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:692,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:612,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:544,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:800,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:656,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:605,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:786,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:804,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:596,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:857,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:880,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:616,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:919,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:595,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1037,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:554,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:548,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:481,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:866,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:752,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:886,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:525,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:670,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:692,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:466,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:607,0:.:-0.70:1.000:. ./.:3:505,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:849,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:780,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:607,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:643,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:743,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:488,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:1075,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:1062,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:676,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:867,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:644,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:700,0:.:-0.23:0.807:. ./.:4:535,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:442,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:709,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:868,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1035,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:716,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:838,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:921,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:849,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:731,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:599,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:562,0:.:-0.93:1.000:. ./.:6:729,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:829,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:711,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:859,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:681,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:584,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:736,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:696,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:534,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.96:0.978:. ./.:4:751,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:850,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:563,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:778,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:925,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:760,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:624,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:966,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:839,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:765,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:776,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:487,0:.:-1.31:0.988:. ./.:4:676,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1169,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:449,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:934,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:896,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:445,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:710,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:576,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:749,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:419,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:503,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:1107,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:715,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:558,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:540,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:560,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:1031,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:1093,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:1020,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:761,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:1126,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:482,0:.:-1.34:1.000:. ./.:5:1100,0:.: 1.81:0.951:. ./.:4:476,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:494,2:.:-1.27:1.000:. ./.:4:1005,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:991,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:1056,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:813,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:554,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:677,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1017,0:.: 1.38:0.998:. ./.:4:830,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:744,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:725,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:522,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:770,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:900,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:571,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:723,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:820,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:642,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:606,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:1156,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:773,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:836,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:605,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:616,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:489,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:548,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:1007,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:701,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:723,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1119,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:689,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:683,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:566,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:853,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:978,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:926,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:607,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:955,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:1453,0:.: 3.60:1.000:. ./.:4:575,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:992,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:1049,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:641,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1062,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:952,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:505,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:609,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:780,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:891,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1265,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:834,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:495,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:815,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:484,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:770,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:633,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:600,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:858,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:737,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:878,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:839,0:.: 0.48:0.999:. ./.:4:784,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:724,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:693,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:591,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:533,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:556,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:429,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:715,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:604,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:865,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:810,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:578,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1066,0:.: 1.63:0.999:. ./.:4:1332,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:727,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:511,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:849,0:.: 0.53:1.000:. -chr7.1 53492890 chr7.1_053492890 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:230,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:233,10:.:-0.40:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:481,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:201,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:200,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:113,3:.:-1.73:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:228,16:.:-0.39:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:506,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:327,15:.: 0.64:1.000:. ./.:4:266,25:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,5:.:-1.92:1.000:. ./.:4:211,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:182,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:372,23:.: 1.19:1.000:. ./.:4:190,16:.:-0.79:1.000:. ./.:4:476,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:186,16:.:-0.83:1.000:. ./.:4:192,13:.:-0.80:1.000:. ./.:4:158,10:.:-1.18:1.000:. ./.:4:45,1:.:-2.46:1.000:. ./.:4:138,1:.:-1.49:1.000:. ./.:3:88,1:.:-2.01:1.000:. ./.:4:188,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:218,9:.:-0.57:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,15:.:-1.07:1.000:. ./.:4:203,4:.:-0.78:1.000:. ./.:4:287,12:.: 0.19:1.000:. ./.:4:291,8:.: 0.19:1.000:. ./.:4:151,6:.:-1.30:1.000:. ./.:4:197,12:.:-0.75:1.000:. ./.:4:196,7:.:-0.82:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.01:0.807:. ./.:4:420,12:.: 1.58:1.000:. ./.:4:137,8:.:-1.42:1.000:. ./.:4:133,4:.:-1.51:1.000:. ./.:4:268,6:.:-0.07:1.000:. ./.:4:223,13:.:-0.47:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:341,14:.: 0.78:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:276,14:.: 0.09:1.000:. ./.:4:210,9:.:-0.65:1.000:. ./.:4:176,10:.:-1.00:1.000:. ./.:4:158,5:.:-1.24:1.000:. ./.:6:243,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:244,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:263,7:.:-0.12:1.000:. ./.:4:128,6:.:-1.54:1.000:. ./.:4:218,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:151,10:.:-1.26:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:217,8:.:-0.59:0.978:. ./.:4:285,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:132,10:.:-1.46:0.999:. ./.:4:222,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:257,13:.:-0.12:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:353,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:150,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:278,7:.: 0.04:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.16:0.988:. ./.:4:187,7:.:-0.91:1.000:. ./.:4:354,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:200,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:255,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,9:.:-0.04:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:258,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:199,8:.:-0.78:1.000:. ./.:4:226,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:156,15:.:-1.15:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:229,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:163,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:157,9:.:-1.20:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:288,5:.: 0.13:1.000:. ./.:4:307,18:.: 0.46:1.000:. ./.:4:504,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:146,2:.:-1.39:1.000:. ./.:5:399,3:.: 1.27:0.951:. ./.:4:256,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:132,11:.:-1.45:1.000:. ./.:4:236,13:.:-0.34:1.000:. ./.:4:291,18:.: 0.29:1.000:. ./.:4:259,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:172,12:.:-1.02:1.000:. ./.:4:280,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:344,12:.: 0.79:0.998:. ./.:4:403,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:242,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:262,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:273,9:.: 0.01:1.000:. ./.:4:174,7:.:-1.05:1.000:. ./.:4:215,12:.:-0.57:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:259,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:174,8:.:-1.04:1.000:. ./.:4:492,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:190,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:169,6:.:-1.11:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:129,7:.:-1.52:1.000:. ./.:4:382,10:.: 1.16:1.000:. ./.:4:370,9:.: 1.03:1.000:. ./.:4:248,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:354,18:.: 0.95:1.000:. ./.:4:256,9:.:-0.17:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:214,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:305,9:.: 0.35:1.000:. ./.:4:340,8:.: 0.70:1.000:. ./.:4:155,6:.:-1.26:1.000:. ./.:4:242,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:625,0:.: 3.60:1.000:. ./.:4:212,5:.:-0.67:1.000:. ./.:4:480,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:295,12:.: 0.27:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:133,3:.:-1.52:1.000:. ./.:4:302,14:.: 0.37:1.000:. ./.:4:324,11:.: 0.57:1.000:. ./.:4:338,15:.: 0.75:1.000:. ./.:4:386,16:.: 1.27:1.000:. ./.:4:205,14:.:-0.65:1.000:. ./.:4:222,16:.:-0.45:1.000:. ./.:4:496,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:258,12:.:-0.12:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:241,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:305,17:.: 0.43:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:349,13:.: 0.85:1.000:. ./.:4:205,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:246,9:.:-0.27:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:294,12:.: 0.26:1.000:. ./.:4:324,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:424,21:.: 1.72:0.999:. ./.:4:550,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:287,20:.: 0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.93:1.000:. -chr7.1 53787999 chr7.1_053787999 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:81,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.61:0.999:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.29:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.41:0.807:. ./.:4:102,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:93,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.16:1.000:. ./.:6:59,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.82:0.978:. ./.:4:53,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:67,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.10:0.988:. ./.:4:57,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.65:1.000:. ./.:5:129,0:.: 2.00:0.951:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.76:0.998:. ./.:4:121,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:132,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:80,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:88,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:71,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.16:0.999:. ./.:4:102,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:104,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.48:1.000:. -chr7.1 54162053 chr7.1_054162053 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,81:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,104:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.49:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.10:0.999:. ./.:4:0,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,191:.: 4.49:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,91:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.52:1.000:. ./.:3:0,6:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,118:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,96:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,27:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.79:0.807:. ./.:4:0,99:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,118:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,108:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.00:1.000:. ./.:6:0,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,97:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,91:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.73:0.978:. ./.:4:0,55:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.14:0.999:. ./.:4:1,34:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,98:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,94:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.69:0.988:. ./.:4:0,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,90:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,104:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.83:1.000:. ./.:5:0,64:.: 0.10:0.951:. ./.:4:0,42:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,114:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,109:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,104:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.21:1.000:. ./.:4:1,32:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.62:0.998:. ./.:4:0,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,32:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,31:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,32:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,21:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,97:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,127:.: 2.28:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,102:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,24:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,85:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.03:0.999:. ./.:4:0,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,105:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,148:.: 3.01:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,122:.: 2.11:0.999:. ./.:4:0,85:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,110:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.03:1.000:. -chr7.1 54242595 chr7.1_054242595 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:545,473:.: 1.02:1.000:. ./.:4:281,173:.:-1.56:1.000:. ./.:4:470,248:.:-0.36:1.000:. ./.:4:328,430:.:-0.17:1.000:. ./.:4:637,271:.: 0.51:1.000:. ./.:4:599,283:.: 0.39:1.000:. ./.:4:247,343:.:-0.94:1.000:. ./.:4:508,235:.:-0.24:1.000:. ./.:4:450,344:.:-0.01:1.000:. ./.:4:325,114:.:-1.63:1.000:. ./.:4:205,139:.:-2.07:1.000:. ./.:4:159,293:.:-1.57:1.000:. ./.:4:300,328:.:-0.77:1.000:. ./.:4:549,296:.: 0.22:1.000:. ./.:4:290,243:.:-1.20:1.000:. ./.:4:505,254:.:-0.17:1.000:. ./.:4:555,113:.:-0.58:0.999:. ./.:4:336,228:.:-1.06:1.000:. ./.:4:652,462:.: 1.45:1.000:. ./.:4:490,490:.: 0.84:1.000:. ./.:4:290,176:.:-1.51:1.000:. ./.:4:566,307:.: 0.35:1.000:. ./.:4:272,391:.:-0.61:1.000:. ./.:4:402,464:.: 0.32:1.000:. ./.:4:247,28:.:-2.38:1.000:. ./.:4:507,274:.:-0.07:1.000:. ./.:4:639,452:.: 1.35:1.000:. ./.:4:336,534:.: 0.34:1.000:. ./.:4:505,269:.:-0.10:1.000:. ./.:4:444,559:.: 0.95:1.000:. ./.:4:450,466:.: 0.55:1.000:. ./.:4:477,393:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,54:.:-3.02:1.000:. ./.:4:398,136:.:-1.20:1.000:. ./.:3:155,41:.:-2.74:1.000:. ./.:4:446,406:.: 0.26:1.000:. ./.:4:505,231:.:-0.27:1.000:. ./.:4:507,320:.: 0.14:1.000:. ./.:4:661,271:.: 0.62:1.000:. ./.:4:654,366:.: 1.02:1.000:. ./.:4:527,307:.: 0.17:1.000:. ./.:4:527,414:.: 0.66:1.000:. ./.:4:577,659:.: 2.01:1.000:. ./.:4:517,517:.: 1.09:1.000:. ./.:4:652,429:.: 1.30:1.000:. ./.:4:625,462:.: 1.33:1.000:. ./.:4:245,415:.:-0.62:0.807:. ./.:4:700,315:.: 1.00:1.000:. ./.:4:408,470:.: 0.38:1.000:. ./.:4:451,419:.: 0.34:1.000:. ./.:4:525,266:.:-0.02:1.000:. ./.:4:642,385:.: 1.06:1.000:. ./.:4:429,204:.:-0.74:1.000:. ./.:4:707,466:.: 1.72:1.000:. ./.:4:506,230:.:-0.27:1.000:. ./.:4:769,521:.: 2.26:1.000:. ./.:4:512,394:.: 0.50:1.000:. ./.:4:648,450:.: 1.38:1.000:. ./.:4:573,344:.: 0.55:1.000:. ./.:6:342,335:.:-0.54:1.000:. ./.:4:345,440:.:-0.05:1.000:. ./.:4:335,316:.:-0.66:1.000:. ./.:4:843,384:.: 1.97:1.000:. ./.:4:382,423:.: 0.04:1.000:. ./.:4:503,483:.: 0.87:1.000:. ./.:4:516,365:.: 0.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:340,330:.:-0.58:1.000:. ./.:4:361,413:.:-0.10:0.978:. ./.:4:287,301:.:-0.95:1.000:. ./.:4:411,433:.: 0.22:1.000:. ./.:4:404,230:.:-0.74:0.999:. ./.:4:280,503:.:-0.06:1.000:. ./.:4:240,387:.:-0.77:1.000:. ./.:4:277,327:.:-0.88:1.000:. ./.:4:620,291:.: 0.53:1.000:. ./.:4:399,196:.:-0.92:1.000:. ./.:4:815,336:.: 1.62:1.000:. ./.:4:500,427:.: 0.60:1.000:. ./.:4:625,482:.: 1.42:1.000:. ./.:4:153,279:.:-1.66:0.988:. ./.:4:548,480:.: 1.06:1.000:. ./.:4:633,448:.: 1.30:1.000:. ./.:4:537,249:.:-0.05:1.000:. ./.:4:551,431:.: 0.85:1.000:. ./.:4:501,636:.: 1.56:1.000:. ./.:4:388,193:.:-0.98:1.000:. ./.:4:308,322:.:-0.76:1.000:. ./.:4:498,341:.: 0.20:1.000:. ./.:4:419,354:.:-0.10:1.000:. ./.:4:458,297:.:-0.19:1.000:. ./.:4:516,93:.:-0.85:1.000:. ./.:4:633,283:.: 0.55:1.000:. ./.:4:358,345:.:-0.42:1.000:. ./.:4:547,579:.: 1.51:1.000:. ./.:4:366,467:.: 0.17:1.000:. ./.:4:337,165:.:-1.34:1.000:. ./.:4:291,312:.:-0.88:1.000:. ./.:4:582,472:.: 1.18:1.000:. ./.:4:681,313:.: 0.91:1.000:. ./.:4:453,66:.:-1.27:1.000:. ./.:4:446,231:.:-0.54:1.000:. ./.:4:291,380:.:-0.57:1.000:. ./.:5:537,302:.: 0.20:0.951:. ./.:4:364,156:.:-1.26:1.000:. ./.:4:479,379:.: 0.28:1.000:. ./.:4:526,391:.: 0.55:1.000:. ./.:4:502,339:.: 0.21:1.000:. ./.:4:419,510:.: 0.61:1.000:. ./.:4:505,300:.: 0.04:1.000:. ./.:4:429,225:.:-0.65:1.000:. ./.:4:461,430:.: 0.43:1.000:. ./.:4:532,423:.: 0.73:0.998:. ./.:4:468,382:.: 0.25:1.000:. ./.:4:381,175:.:-1.10:1.000:. ./.:4:527,586:.: 1.45:1.000:. ./.:4:314,282:.:-0.91:1.000:. ./.:4:562,203:.:-0.14:1.000:. ./.:4:606,305:.: 0.53:1.000:. ./.:4:354,476:.: 0.16:1.000:. ./.:4:608,463:.: 1.26:1.000:. ./.:4:637,122:.:-0.17:1.000:. ./.:4:663,265:.: 0.60:1.000:. ./.:4:560,428:.: 0.88:1.000:. ./.:4:488,490:.: 0.83:1.000:. ./.:4:426,351:.:-0.09:1.000:. ./.:4:497,497:.: 0.91:1.000:. ./.:4:267,303:.:-1.03:1.000:. ./.:4:338,245:.:-0.97:1.000:. ./.:4:173,246:.:-1.72:1.000:. ./.:4:606,288:.: 0.45:1.000:. ./.:4:391,192:.:-0.97:1.000:. ./.:4:231,307:.:-1.18:1.000:. ./.:4:856,354:.: 1.89:1.000:. ./.:4:525,345:.: 0.34:1.000:. ./.:4:435,675:.: 1.44:1.000:. ./.:4:501,497:.: 0.92:1.000:. ./.:4:576,363:.: 0.65:1.000:. ./.:4:289,287:.:-1.00:1.000:. ./.:4:470,200:.:-0.58:1.000:. ./.:4:508,516:.: 1.04:1.000:. ./.:4:536,512:.: 1.15:1.000:. ./.:4:539,295:.: 0.17:1.000:. ./.:4:377,308:.:-0.51:1.000:. ./.:4:485,525:.: 0.98:1.000:. ./.:4:674,138:.: 0.07:1.000:. ./.:4:481,419:.: 0.48:1.000:. ./.:4:348,373:.:-0.34:1.000:. ./.:4:702,518:.: 1.94:1.000:. ./.:4:594,102:.:-0.46:1.000:. ./.:4:372,398:.:-0.12:1.000:. ./.:4:342,362:.:-0.42:1.000:. ./.:4:242,93:.:-2.11:1.000:. ./.:4:310,205:.:-1.28:1.000:. ./.:4:703,434:.: 1.56:1.000:. ./.:4:604,416:.: 1.02:1.000:. ./.:4:719,456:.: 1.73:1.000:. ./.:4:382,543:.: 0.59:1.000:. ./.:4:356,333:.:-0.49:1.000:. ./.:4:528,260:.:-0.04:1.000:. ./.:4:414,173:.:-0.95:1.000:. ./.:4:377,278:.:-0.64:1.000:. ./.:4:588,364:.: 0.71:1.000:. ./.:4:209,322:.:-1.21:1.000:. ./.:4:336,554:.: 0.43:1.000:. ./.:4:455,505:.: 0.75:1.000:. ./.:4:325,184:.:-1.31:1.000:. ./.:4:264,343:.:-0.86:0.999:. ./.:4:581,415:.: 0.91:1.000:. ./.:4:446,267:.:-0.38:1.000:. ./.:4:176,241:.:-1.73:1.000:. ./.:4:318,163:.:-1.44:1.000:. ./.:4:311,284:.:-0.92:1.000:. ./.:4:358,230:.:-0.95:1.000:. ./.:4:449,100:.:-1.13:1.000:. ./.:4:311,419:.:-0.30:1.000:. ./.:4:511,388:.: 0.47:1.000:. ./.:4:533,350:.: 0.40:1.000:. ./.:4:253,335:.:-0.95:1.000:. ./.:4:359,241:.:-0.90:1.000:. ./.:4:548,408:.: 0.73:0.999:. ./.:4:422,441:.: 0.31:1.000:. ./.:4:633,478:.: 1.44:1.000:. ./.:4:287,296:.:-0.97:1.000:. ./.:4:257,304:.:-1.07:1.000:. -chr7.1 54601074 chr7.1_054601074 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:95,18:0.19: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,21:0.35:-0.71:1.000:0.831 0/1/1/1:4:17,38:0.65:-1.07:1.000:0.831 0/0/0/1:4:90,36:0.32: 1.04:1.000:0.956 0/0/0/1:4:106,24:0.22: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,51:0.75:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,16:0.19: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,43:0.72:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,20:0.20: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,4:0.34:-2.32:1.000:0.870 0/0/0/1:4:111,25:0.22: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,31:0.29: 0.89:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,21:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,27:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,14:0.18: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,30:0.25: 1.46:0.999:0.999 0/1/1/1:4:14,64:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,41:0.40: 0.57:1.000:0.805 0/0/0/1:4:114,20:0.18: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,60:0.52: 0.83:1.000:0.995 0/0/0/0:4:94,9:0.10: 0.36:1.000:0.740 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:115,29:0.24: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,18:0.30:-0.65:1.000:0.989 0/0/0/1:4:71,31:0.34: 0.33:1.000:0.891 0/0/0/1:4:57,25:0.34:-0.27:1.000:0.886 0/0/0/1:4:111,30:0.25: 1.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,34:0.29: 1.28:1.000:0.992 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.36:-2.52:1.000:0.637 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-2.05:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-2.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,10:0.07: 2.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:105,20:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,19:0.18: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,30:0.43:-0.50:1.000:0.953 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 2.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,22:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,38:0.45:-0.03:1.000:0.979 0/0/1/1:4:48,46:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,27:0.30: 0.36:1.000:0.988 0/0/0/1:4:79,16:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,12:0.14: 0.30:1.000:0.965 0/0/1/1:4:52,54:0.52: 0.45:0.807:0.994 0/0/0/1:4:16,7:0.34:-2.02:1.000:0.888 0/0/0/1:4:71,19:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,33:0.39: 0.03:1.000:0.673 0/0/1/1:4:41,30:0.45:-0.59:1.000:0.979 0/0/0/1:4:110,25:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,22:0.27: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,21:0.29:-0.30:1.000:0.990 0/1/1/1:4:10,41:0.74:-1.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,21:0.35:-0.77:1.000:0.749 0/0/0/1:4:104,19:0.18: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:117,1:0.01: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:54,25:0.35:-0.36:1.000:0.903 0/0/0/1:4:78,35:0.34: 0.65:1.000:0.857 0/1/1/1:4:10,53:0.77:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,19:0.30:-0.56:1.000:0.987 0/0/0/1:4:81,28:0.29: 0.54:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,15:0.15: 0.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:44,40:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,35:0.32: 0.95:1.000:0.959 0/0/0/1:4:88,30:0.29: 0.80:0.978:0.992 0/0/1/1:4:34,22:0.42:-1.04:1.000:0.917 0/1/1/1:4:16,61:0.73:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,13:0.15: 0.30:0.999:0.989 0/0/0/1:4:48,22:0.35:-0.62:1.000:0.825 0/0/1/1:4:62,44:0.44: 0.45:1.000:0.970 0/0/1/1:4:45,27:0.40:-0.56:1.000:0.822 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,59:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,25:0.28: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,43:0.44: 0.42:1.000:0.961 0/0/1/1:4:42,23:0.38:-0.77:0.988:0.618 0/0/0/1:4:105,19:0.18: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,39:0.43: 0.21:1.000:0.934 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,37:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,43:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,16:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,26:0.34:-0.18:1.000:0.880 0/0/0/1:4:69,10:0.15:-0.36:1.000:0.986 0/0/0/1:4:128,20:0.16: 1.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,10:0.16:-0.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:76,6:0.09:-0.27:1.000:0.971 0/1/1/1:4:14,51:0.72:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,27:0.47:-0.89:1.000:0.992 0/0/0/1:4:92,18:0.19: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,40:0.28: 2.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,19:0.28:-0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,30:0.66:-1.42:1.000:0.865 0/0/0/1:4:60,26:0.33:-0.15:1.000:0.899 0/0/0/1:4:94,16:0.17: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:37,9:0.23:-1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,58:0.71:-0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,14:0.22:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:36,33:0.50:-0.65:0.951:0.515 0/0/1/1:4:37,25:0.43:-0.86:1.000:0.948 0/0/0/1:4:97,17:0.17: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,28:0.47:-0.83:1.000:0.992 0/0/1/1:4:65,42:0.42: 0.48:1.000:0.916 0/0/0/1:4:111,41:0.30: 1.81:1.000:0.981 0/0/0/1:4:82,20:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,23:0.33:-0.41:1.000:0.915 0/0/0/1:4:133,69:0.37: 3.30:1.000:0.535 0/0/0/1:4:32,16:0.36:-1.28:0.998:0.637 0/0/1/1:4:55,51:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,20:0.79:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,25:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,32:0.43:-0.36:1.000:0.952 0/1/1/1:4:15,34:0.66:-1.25:1.000:0.847 0/0/0/1:4:55,18:0.28:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:72,26:0.30: 0.21:1.000:0.985 0/0/0/1:4:94,17:0.18: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,15:0.31:-1.07:1.000:0.978 0/0/0/1:4:46,23:0.36:-0.65:1.000:0.637 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,15:0.17: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:7,58:0.81:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,15:0.18: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,16:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,26:0.39:-0.53:1.000:0.645 0/0/1/1:4:32,33:0.52:-0.77:1.000:0.994 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,21:0.18: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,17:0.26:-0.47:1.000:0.998 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,13:0.15: 0.30:1.000:0.989 0/0/0/1:4:113,37:0.28: 1.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,50:0.52: 0.27:1.000:0.995 0/0/0/1:4:61,10:0.17:-0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,27:0.40:-0.53:1.000:0.782 0/0/0/1:4:57,8:0.14:-0.77:1.000:0.979 0/0/0/1:4:69,13:0.19:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,22:0.39:-0.89:1.000:0.694 0/0/0/1:4:86,22:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,8:0.10: 0.00:1.000:0.723 0/0/0/1:4:93,19:0.20: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,35:0.39: 0.15:1.000:0.734 0/0/0/1:4:95,25:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,53:0.77:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,13:0.21:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,18:0.30:-0.71:1.000:0.982 0/1/1/1:4:17,76:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,61:0.75:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,2:0.26:-2.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,26:0.46:-0.92:1.000:0.987 0/0/0/1:4:47,21:0.34:-0.68:1.000:0.863 0/0/0/1:4:74,19:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,30:0.36: 0.00:1.000:0.679 0/0/0/1:4:105,34:0.28: 1.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,15:0.19: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,39:0.41: 0.30:1.000:0.889 0/0/0/1:4:97,16:0.17: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,39:0.45: 0.06:1.000:0.975 0/0/0/1:4:50,15:0.27:-0.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,48:0.52: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,41:0.40: 0.57:1.000:0.805 0/0/1/1:4:39,37:0.51:-0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,57:0.76:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,16:0.27:-0.71:0.999:0.997 0/0/0/1:4:41,11:0.25:-1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,16:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,46:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,44:0.57:-0.41:1.000:0.950 0/0/1/1:4:64,40:0.41: 0.39:1.000:0.881 0/0/1/1:4:45,26:0.40:-0.59:1.000:0.749 0/0/0/1:4:87,22:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,43:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:144,32:0.21: 2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,45:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,64:0.56: 0.68:1.000:0.965 0/0/0/1:4:67,14:0.20:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,34:0.51:-0.65:0.999:0.996 0/1/1/1:4:16,68:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,22:0.19: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,28:0.39:-0.41:1.000:0.725 0/0/0/1:4:59,19:0.28:-0.39:1.000:0.996 -chr7.1 54679087 chr7.1_054679087 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,549:.:-0.10:1.000:. ./.:4:84,213:.:-1.34:1.000:. ./.:4:189,242:.:-0.68:1.000:. ./.:4:179,351:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,426:.:-0.70:1.000:. ./.:4:180,255:.:-0.66:1.000:. ./.:4:57,333:.:-0.88:1.000:. ./.:4:195,237:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,441:.:-0.63:1.000:. ./.:4:51,194:.:-1.59:1.000:. ./.:4:100,114:.:-1.74:1.000:. ./.:4:89,225:.:-1.25:1.000:. ./.:4:84,239:.:-1.21:1.000:. ./.:4:112,522:.: 0.31:1.000:. ./.:4:162,161:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,292:.:-1.36:1.000:. ./.:4:56,186:.:-1.61:0.999:. ./.:4:204,151:.:-1.05:1.000:. ./.:4:198,430:.: 0.28:1.000:. ./.:4:197,447:.: 0.36:1.000:. ./.:4:85,192:.:-1.43:1.000:. ./.:4:1,525:.:-0.22:1.000:. ./.:4:235,223:.:-0.55:1.000:. ./.:4:72,505:.: 0.03:1.000:. ./.:4:96,62:.:-2.02:1.000:. ./.:4:201,248:.:-0.59:1.000:. ./.:4:79,364:.:-0.62:1.000:. ./.:4:72,333:.:-0.81:1.000:. ./.:4:413,225:.: 0.33:1.000:. ./.:4:90,398:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,510:.:-0.29:1.000:. ./.:4:54,336:.:-0.88:1.000:. ./.:4:105,63:.:-1.97:1.000:. ./.:4:7,316:.:-1.21:1.000:. ./.:3:7,142:.:-2.06:1.000:. ./.:4:60,352:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,430:.:-0.69:1.000:. ./.:4:86,391:.:-0.45:1.000:. ./.:4:139,453:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,575:.: 0.02:1.000:. ./.:4:171,551:.: 0.74:1.000:. ./.:4:149,531:.: 0.54:1.000:. ./.:4:367,632:.: 2.10:1.000:. ./.:4:138,595:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,874:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,683:.: 0.55:1.000:. ./.:4:234,271:.:-0.32:0.807:. ./.:4:54,92:.:-2.08:1.000:. ./.:4:138,583:.: 0.74:1.000:. ./.:4:357,480:.: 1.31:1.000:. ./.:4:316,462:.: 1.02:1.000:. ./.:4:137,674:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,472:.:-0.48:1.000:. ./.:4:162,736:.: 1.61:1.000:. ./.:4:183,250:.:-0.67:1.000:. ./.:4:185,734:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,611:.: 0.20:1.000:. ./.:4:179,817:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,572:.: 0.01:1.000:. ./.:6:257,318:.: 0.02:1.000:. ./.:4:349,495:.: 1.34:1.000:. ./.:4:354,192:.:-0.12:1.000:. ./.:4:401,685:.: 2.53:1.000:. ./.:4:341,472:.: 1.19:1.000:. ./.:4:284,526:.: 1.18:1.000:. ./.:4:249,287:.:-0.17:1.000:. ./.:4:1,535:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,309:.:-0.71:1.000:. ./.:4:317,453:.: 0.98:0.978:. ./.:4:181,229:.:-0.78:1.000:. ./.:4:514,267:.: 1.03:1.000:. ./.:4:118,616:.: 0.80:0.999:. ./.:4:536,382:.: 1.70:1.000:. ./.:4:209,196:.:-0.81:1.000:. ./.:4:288,341:.: 0.29:1.000:. ./.:4:138,593:.: 0.79:1.000:. ./.:4:281,276:.:-0.06:1.000:. ./.:4:175,797:.: 1.97:1.000:. ./.:4:287,538:.: 1.25:1.000:. ./.:4:168,523:.: 0.59:1.000:. ./.:4:247,177:.:-0.71:0.988:. ./.:4:176,614:.: 1.08:1.000:. ./.:4:188,689:.: 1.50:1.000:. ./.:4:1,488:.:-0.40:1.000:. ./.:4:477,524:.: 2.11:1.000:. ./.:4:318,630:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,361:.:-1.02:1.000:. ./.:4:148,282:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,618:.: 0.24:1.000:. ./.:4:104,488:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,704:.: 0.66:1.000:. ./.:4:165,311:.:-0.46:1.000:. ./.:4:316,403:.: 0.73:1.000:. ./.:4:241,261:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,786:.: 1.93:1.000:. ./.:4:288,428:.: 0.72:1.000:. ./.:4:295,161:.:-0.56:1.000:. ./.:4:383,175:.:-0.06:1.000:. ./.:4:158,727:.: 1.54:1.000:. ./.:4:121,540:.: 0.45:1.000:. ./.:4:318,271:.: 0.09:1.000:. ./.:4:357,266:.: 0.26:1.000:. ./.:4:125,441:.:-0.02:1.000:. ./.:5:341,582:.: 1.73:0.951:. ./.:4:141,275:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,650:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,543:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,304:.:-0.57:1.000:. ./.:4:300,504:.: 1.15:1.000:. ./.:4:126,478:.: 0.17:1.000:. ./.:4:307,300:.: 0.18:1.000:. ./.:4:100,265:.:-1.00:1.000:. ./.:4:183,587:.: 0.98:0.998:. ./.:4:145,622:.: 0.96:1.000:. ./.:4:232,314:.:-0.12:1.000:. ./.:4:189,809:.: 2.10:1.000:. ./.:4:314,370:.: 0.56:1.000:. ./.:4:285,300:.: 0.07:1.000:. ./.:4:299,592:.: 1.57:1.000:. ./.:4:153,510:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,605:.: 0.17:1.000:. ./.:4:308,318:.: 0.27:1.000:. ./.:4:151,465:.: 0.23:1.000:. ./.:4:52,379:.:-0.68:1.000:. ./.:4:127,663:.: 1.08:1.000:. ./.:4:480,242:.: 0.74:1.000:. ./.:4:151,700:.: 1.38:1.000:. ./.:4:260,311:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,383:.:-0.43:1.000:. ./.:4:219,174:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,623:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,264:.:-1.50:1.000:. ./.:4:107,403:.:-0.29:1.000:. ./.:4:152,662:.: 1.20:1.000:. ./.:4:227,427:.: 0.41:1.000:. ./.:4:131,533:.: 0.46:1.000:. ./.:4:377,415:.: 1.09:1.000:. ./.:4:304,553:.: 1.41:1.000:. ./.:4:269,261:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,409:.:-0.79:1.000:. ./.:4:169,789:.: 1.90:1.000:. ./.:4:319,607:.: 1.74:1.000:. ./.:4:91,396:.:-0.41:1.000:. ./.:4:131,435:.:-0.02:1.000:. ./.:4:298,621:.: 1.71:1.000:. ./.:4:302,217:.:-0.25:1.000:. ./.:4:191,379:.: 0.00:1.000:. ./.:4:321,185:.:-0.31:1.000:. ./.:4:115,651:.: 0.96:1.000:. ./.:4:202,315:.:-0.26:1.000:. ./.:4:266,150:.:-0.75:1.000:. ./.:4:262,113:.:-0.95:1.000:. ./.:4:142,71:.:-1.75:1.000:. ./.:4:120,242:.:-1.02:1.000:. ./.:4:111,668:.: 1.02:1.000:. ./.:4:111,654:.: 0.96:1.000:. ./.:4:87,569:.: 0.42:1.000:. ./.:4:117,433:.:-0.10:1.000:. ./.:4:170,339:.:-0.30:1.000:. ./.:4:102,265:.:-0.99:1.000:. ./.:4:152,214:.:-1.00:1.000:. ./.:4:152,216:.:-0.99:1.000:. ./.:4:96,419:.:-0.27:1.000:. ./.:4:184,153:.:-1.14:1.000:. ./.:4:91,426:.:-0.26:1.000:. ./.:4:172,388:.:-0.05:1.000:. ./.:4:135,117:.:-1.56:1.000:. ./.:4:153,229:.:-0.92:0.999:. ./.:4:75,386:.:-0.53:1.000:. ./.:4:61,346:.:-0.80:1.000:. ./.:4:136,138:.:-1.45:1.000:. ./.:4:74,194:.:-1.48:1.000:. ./.:4:196,262:.:-0.55:1.000:. ./.:4:92,226:.:-1.23:1.000:. ./.:4:117,275:.:-0.87:1.000:. ./.:4:132,314:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,335:.:-0.70:1.000:. ./.:4:245,394:.: 0.34:1.000:. ./.:4:178,215:.:-0.87:1.000:. ./.:4:119,158:.:-1.43:1.000:. ./.:4:105,444:.:-0.10:0.999:. ./.:4:346,208:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,551:.:-0.09:1.000:. ./.:4:145,202:.:-1.09:1.000:. ./.:4:219,309:.:-0.21:1.000:. -chr7.1 54887678 chr7.1_054887678 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:161,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:104,51:.: 0.53:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:117,48:.: 0.83:1.000:. ./.:4:63,25:.:-1.45:1.000:. ./.:4:127,41:.: 0.92:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.68:1.000:. ./.:4:17,4:.:-3.44:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:145,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:113,39:.: 0.45:1.000:. ./.:4:14,4:.:-3.53:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:82,40:.:-0.44:1.000:. ./.:4:6,4:.:-3.77:1.000:. ./.:4:115,37:.: 0.45:1.000:. ./.:4:100,47:.: 0.30:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:117,53:.: 0.98:1.000:. ./.:4:107,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:91,44:.:-0.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.53:1.000:. ./.:4:47,0:.:-2.67:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.89:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:110,34:.: 0.21:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:111,37:.: 0.33:1.000:. ./.:4:127,32:.: 0.65:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.13:0.807:. ./.:4:76,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:105,37:.: 0.15:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:125,53:.: 1.22:1.000:. ./.:4:124,47:.: 1.01:1.000:. ./.:4:105,33:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:108,36:.: 0.21:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.56:1.000:. ./.:6:124,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:101,58:.: 0.65:1.000:. ./.:4:128,47:.: 1.13:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,49:.: 0.83:1.000:. ./.:4:105,43:.: 0.33:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:0.978:. ./.:4:82,29:.:-0.77:1.000:. ./.:4:130,55:.: 1.43:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.86:0.999:. ./.:4:73,60:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:113,31:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:101,41:.: 0.15:1.000:. ./.:4:129,45:.: 1.10:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.92:0.988:. ./.:4:147,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,41:.: 0.42:1.000:. ./.:4:146,34:.: 1.28:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:117,45:.: 0.74:1.000:. ./.:4:83,23:.:-0.92:1.000:. ./.:4:126,47:.: 1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:114,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:95,28:.:-0.42:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,40:.:-0.86:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.95:1.000:. ./.:5:136,35:.: 1.01:0.951:. ./.:4:121,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.39:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.45:0.998:. ./.:4:125,44:.: 0.95:1.000:. ./.:4:88,25:.:-0.71:1.000:. ./.:4:120,46:.: 0.86:1.000:. ./.:4:94,33:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,31:.:-0.47:1.000:. ./.:4:126,41:.: 0.89:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:88,36:.:-0.39:1.000:. ./.:4:107,49:.: 0.56:1.000:. ./.:4:110,39:.: 0.36:1.000:. ./.:4:102,36:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,33:.: 0.48:1.000:. ./.:4:105,37:.: 0.15:1.000:. ./.:4:96,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:71,33:.:-0.98:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:92,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:102,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:213,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:114,50:.: 0.80:1.000:. ./.:4:99,32:.:-0.18:1.000:. ./.:4:111,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:101,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:104,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:144,41:.: 1.43:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:92,51:.: 0.18:1.000:. ./.:4:105,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:121,54:.: 1.13:1.000:. ./.:4:105,32:.: 0.00:1.000:. ./.:4:107,52:.: 0.65:1.000:. ./.:4:121,45:.: 0.86:1.000:. ./.:4:19,6:.:-3.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:122,63:.: 1.43:1.000:. ./.:4:118,48:.: 0.86:1.000:. ./.:4:106,54:.: 0.68:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:100,38:.: 0.03:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:74,35:.:-0.83:1.000:. ./.:4:88,43:.:-0.18:1.000:. ./.:4:99,47:.: 0.27:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:83,28:.:-0.77:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:108,33:.: 0.12:0.999:. ./.:4:96,39:.:-0.06:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:86,33:.:-0.53:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:81,31:.:-0.74:1.000:. ./.:4:110,54:.: 0.80:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:95,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.80:0.999:. ./.:4:139,57:.: 1.75:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:84,32:.:-0.62:1.000:. ./.:4:130,51:.: 1.31:1.000:. -chr7.1 55241150 chr7.1_055241150 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:19,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:45,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,14:.: 0.74:1.000:. ./.:4:17,13:.:-1.28:1.000:. ./.:4:53,6:.: 0.55:1.000:. ./.:4:48,3:.: 0.05:1.000:. ./.:4:30,4:.:-1.03:1.000:. ./.:4:47,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:21,5:.:-1.54:1.000:. ./.:4:44,12:.: 0.36:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,8:.:-0.71:1.000:. ./.:4:20,11:.:-1.22:1.000:. ./.:4:32,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:34,22:.: 0.36:0.999:. ./.:4:56,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:52,14:.: 1.00:1.000:. ./.:4:22,28:.:-0.02:1.000:. ./.:4:34,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:36,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,17:.:-0.33:1.000:. ./.:4:29,8:.:-0.84:1.000:. ./.:4:47,6:.: 0.17:1.000:. ./.:4:22,16:.:-0.78:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:31,4:.:-0.97:1.000:. ./.:4:55,7:.: 0.74:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.73:1.000:. ./.:4:39,9:.:-0.14:1.000:. ./.:4:42,4:.:-0.27:1.000:. ./.:4:11,2:.:-2.36:1.000:. ./.:4:33,6:.:-0.71:1.000:. ./.:3:20,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:41,10:.: 0.05:1.000:. ./.:4:32,5:.:-0.84:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.73:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:35,6:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,10:.:-1.28:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:41,5:.:-0.27:1.000:. ./.:4:48,5:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,7:.:-0.02:1.000:. ./.:4:28,15:.:-0.46:0.807:. ./.:4:5,6:.:-2.49:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,5:.:-2.36:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,5:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:54,5:.: 0.55:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.21:1.000:. ./.:4:57,5:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.08:1.000:. ./.:6:49,11:.: 0.62:1.000:. ./.:4:28,16:.:-0.40:1.000:. ./.:4:43,5:.:-0.14:1.000:. ./.:4:47,6:.: 0.17:1.000:. ./.:4:18,10:.:-1.41:1.000:. ./.:4:31,16:.:-0.21:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:42,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:56,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:41,11:.: 0.11:0.978:. ./.:4:33,6:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,2:.: 2.71:1.000:. ./.:4:14,11:.:-1.60:0.999:. ./.:4:69,3:.: 1.38:1.000:. ./.:4:30,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:61,8:.: 1.19:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:38,8:.:-0.27:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:34,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:44,13:.: 0.43:0.988:. ./.:4:43,11:.: 0.24:1.000:. ./.:4:96,0:.: 2.90:1.000:. ./.:4:34,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:41,4:.:-0.33:1.000:. ./.:4:56,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:51,5:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,6:.: 0.05:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:38,4:.:-0.52:1.000:. ./.:4:64,9:.: 1.44:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.98:1.000:. ./.:4:55,11:.: 1.00:1.000:. ./.:4:24,10:.:-1.03:1.000:. ./.:4:35,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:39,7:.:-0.27:1.000:. ./.:4:81,5:.: 2.27:1.000:. ./.:4:51,8:.: 0.55:1.000:. ./.:5:81,11:.: 2.65:0.951:. ./.:4:39,8:.:-0.21:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,16:.: 0.43:1.000:. ./.:4:55,14:.: 1.19:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.08:0.998:. ./.:4:45,10:.: 0.30:1.000:. ./.:4:17,5:.:-1.79:1.000:. ./.:4:49,9:.: 0.49:1.000:. ./.:4:43,11:.: 0.24:1.000:. ./.:4:59,5:.: 0.87:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.27:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:58,6:.: 0.87:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:27,7:.:-1.03:1.000:. ./.:4:43,7:.:-0.02:1.000:. ./.:4:62,5:.: 1.06:1.000:. ./.:4:51,7:.: 0.49:1.000:. ./.:4:51,8:.: 0.55:1.000:. ./.:4:49,3:.: 0.11:1.000:. ./.:4:30,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:62,6:.: 1.12:1.000:. ./.:4:48,10:.: 0.49:1.000:. ./.:4:31,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:28,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:33,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,9:.:-0.33:1.000:. ./.:4:71,4:.: 1.57:1.000:. ./.:4:42,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:49,8:.: 0.43:1.000:. ./.:4:25,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:47,7:.: 0.24:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:63,8:.: 1.31:1.000:. ./.:4:52,16:.: 1.12:1.000:. ./.:4:40,5:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:19,8:.:-1.47:1.000:. ./.:4:81,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:20,19:.:-0.71:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:28,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,3:.:-2.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:37,10:.:-0.21:0.999:. ./.:4:42,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:27,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:26,16:.:-0.52:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.84:1.000:. ./.:4:27,11:.:-0.78:1.000:. ./.:4:21,17:.:-0.78:1.000:. ./.:4:25,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:64,12:.: 1.63:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:38,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:60,8:.: 1.12:1.000:. ./.:4:50,13:.: 0.81:1.000:. ./.:4:15,12:.:-1.47:1.000:. ./.:4:38,5:.:-0.46:1.000:. -chr7.1 55360439 chr7.1_055360439 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:27,0:.: 2.75:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:0.807:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:28,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:24,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:1.000:. ./.:6:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:0.978:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.81:0.999:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:0.988:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:5:20,0:.: 1.42:0.951:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:0.998:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:18,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:20,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:20,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:19,0:.: 1.23:0.999:. ./.:4:6,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.09:1.000:. -chr7.1 55594264 chr7.1_055594264 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:354,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:258,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:57,1:.:-2.49:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:310,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.73:0.999:. ./.:4:532,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:634,0:.: 2.96:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:31,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:383,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:323,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.55:0.807:. ./.:4:84,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:365,3:.: 0.45:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.63:1.000:. ./.:6:322,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:616,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.44:0.978:. ./.:4:281,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:284,1:.:-0.34:0.999:. ./.:4:370,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:336,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:468,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:425,2:.: 1.01:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.36:0.988:. ./.:4:402,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:462,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:305,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:320,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:445,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:330,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:557,2:.: 2.25:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.22:1.000:. ./.:5:379,1:.: 0.56:0.951:. ./.:4:203,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:210,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:395,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.24:0.998:. ./.:4:376,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:529,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:485,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:211,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:452,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:273,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:560,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:430,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:440,2:.: 1.15:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:302,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:420,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:175,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:366,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:395,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:358,1:.: 0.36:0.999:. ./.:4:317,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:565,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:441,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:310,1:.:-0.09:1.000:. -chr7.1 55951351 chr7.1_055951351 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:130,35:.:-0.04:1.000:. ./.:4:115,14:.:-0.88:1.000:. ./.:4:123,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:152,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:209,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:115,30:.:-0.51:1.000:. ./.:4:134,23:.:-0.23:1.000:. ./.:4:114,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:94,14:.:-1.37:1.000:. ./.:4:164,31:.: 0.66:1.000:. ./.:4:151,27:.: 0.27:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,20:.:-0.74:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.03:0.999:. ./.:4:94,25:.:-1.12:1.000:. ./.:4:125,27:.:-0.34:1.000:. ./.:4:193,32:.: 1.37:1.000:. ./.:4:98,15:.:-1.26:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:178,21:.: 0.76:1.000:. ./.:4:157,27:.: 0.41:1.000:. ./.:4:22,7:.:-3.23:1.000:. ./.:4:141,23:.:-0.06:1.000:. ./.:4:141,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:137,25:.:-0.11:1.000:. ./.:4:59,53:.:-1.28:1.000:. ./.:4:197,34:.: 1.51:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:112,24:.:-0.72:1.000:. ./.:4:49,9:.:-2.55:1.000:. ./.:4:98,1:.:-1.59:1.000:. ./.:3:14,11:.:-3.32:1.000:. ./.:4:130,18:.:-0.44:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:135,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:117,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:105,57:.:-0.11:1.000:. ./.:4:164,29:.: 0.62:1.000:. ./.:4:294,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:185,19:.: 0.87:0.807:. ./.:4:72,15:.:-1.87:1.000:. ./.:4:140,28:.: 0.03:1.000:. ./.:4:85,20:.:-1.44:1.000:. ./.:4:101,26:.:-0.93:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:149,19:.: 0.03:1.000:. ./.:4:144,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:164,25:.: 0.52:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:204,23:.: 1.41:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.43:1.000:. ./.:6:144,18:.:-0.11:1.000:. ./.:4:159,36:.: 0.66:1.000:. ./.:4:92,40:.:-0.81:1.000:. ./.:4:151,27:.: 0.27:1.000:. ./.:4:179,19:.: 0.73:1.000:. ./.:4:175,37:.: 1.06:1.000:. ./.:4:102,42:.:-0.53:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:161,33:.: 0.64:1.000:. ./.:4:153,17:.: 0.08:0.978:. ./.:4:89,41:.:-0.86:1.000:. ./.:4:127,66:.: 0.62:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.07:0.999:. ./.:4:102,88:.: 0.55:1.000:. ./.:4:158,27:.: 0.43:1.000:. ./.:4:121,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:145,22:.: 0.01:1.000:. ./.:4:145,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:119,29:.:-0.44:1.000:. ./.:4:136,30:.:-0.02:1.000:. ./.:4:168,29:.: 0.71:1.000:. ./.:4:114,57:.: 0.10:0.988:. ./.:4:186,34:.: 1.25:1.000:. ./.:4:158,26:.: 0.41:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:65,29:.:-1.70:1.000:. ./.:4:118,56:.: 0.17:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:168,27:.: 0.66:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:135,18:.:-0.32:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:144,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:172,30:.: 0.83:1.000:. ./.:4:42,39:.:-2.01:1.000:. ./.:4:222,26:.: 1.91:1.000:. ./.:4:169,38:.: 0.94:1.000:. ./.:4:139,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:24,73:.:-1.63:1.000:. ./.:4:183,24:.: 0.94:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.70:1.000:. ./.:4:115,23:.:-0.67:1.000:. ./.:4:151,20:.: 0.10:1.000:. ./.:4:181,22:.: 0.85:1.000:. ./.:5:229,33:.: 2.23:0.951:. ./.:4:224,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:163,30:.: 0.62:1.000:. ./.:4:105,26:.:-0.84:1.000:. ./.:4:145,40:.: 0.43:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:138,26:.:-0.06:1.000:. ./.:4:237,39:.: 2.56:1.000:. ./.:4:172,32:.: 0.87:0.998:. ./.:4:227,30:.: 2.12:1.000:. ./.:4:94,15:.:-1.35:1.000:. ./.:4:204,28:.: 1.53:1.000:. ./.:4:173,26:.: 0.76:1.000:. ./.:4:137,25:.:-0.11:1.000:. ./.:4:126,24:.:-0.39:1.000:. ./.:4:152,23:.: 0.20:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:158,20:.: 0.27:1.000:. ./.:4:136,29:.:-0.04:1.000:. ./.:4:170,19:.: 0.52:1.000:. ./.:4:111,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:196,28:.: 1.34:1.000:. ./.:4:109,59:.: 0.03:1.000:. ./.:4:164,19:.: 0.38:1.000:. ./.:4:145,25:.: 0.08:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:147,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,26:.:-1.80:1.000:. ./.:4:66,47:.:-1.26:1.000:. ./.:4:187,26:.: 1.09:1.000:. ./.:4:49,49:.:-1.61:1.000:. ./.:4:90,52:.:-0.58:1.000:. ./.:4:152,28:.: 0.31:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:168,33:.: 0.80:1.000:. ./.:4:114,52:.:-0.02:1.000:. ./.:4:114,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:158,34:.: 0.59:1.000:. ./.:4:147,32:.: 0.29:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.70:1.000:. ./.:4:142,31:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,57:.:-0.46:1.000:. ./.:4:141,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:97,27:.:-1.00:1.000:. ./.:4:120,75:.: 0.66:1.000:. ./.:4:93,56:.:-0.41:1.000:. ./.:4:64,7:.:-2.24:1.000:. ./.:4:79,16:.:-1.68:1.000:. ./.:4:138,23:.:-0.13:1.000:. ./.:4:139,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:168,28:.: 0.69:1.000:. ./.:4:182,29:.: 1.04:1.000:. ./.:4:126,30:.:-0.25:1.000:. ./.:4:151,36:.: 0.48:1.000:. ./.:4:116,38:.:-0.30:1.000:. ./.:4:81,38:.:-1.12:1.000:. ./.:4:136,16:.:-0.34:1.000:. ./.:4:176,29:.: 0.90:1.000:. ./.:4:95,20:.:-1.21:1.000:. ./.:4:109,60:.: 0.05:1.000:. ./.:4:120,32:.:-0.34:1.000:. ./.:4:124,63:.: 0.48:0.999:. ./.:4:121,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:171,34:.: 0.90:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:133,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:82,45:.:-0.93:1.000:. ./.:4:209,31:.: 1.72:1.000:. ./.:4:99,36:.:-0.74:1.000:. ./.:4:146,26:.: 0.12:1.000:. ./.:4:128,27:.:-0.27:1.000:. ./.:4:168,25:.: 0.62:0.999:. ./.:4:127,57:.: 0.41:1.000:. ./.:4:292,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:126,18:.:-0.53:1.000:. ./.:4:82,53:.:-0.74:1.000:. -chr7.1 56177571 chr7.1_056177571 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:62,98:.: 0.40:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:118,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:57,78:.:-0.15:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:106,41:.: 0.11:1.000:. ./.:4:59,30:.:-1.18:1.000:. ./.:4:142,42:.: 0.93:1.000:. ./.:4:76,34:.:-0.71:1.000:. ./.:4:8,26:.:-2.40:1.000:. ./.:4:14,7:.:-2.69:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:55,89:.: 0.05:1.000:. ./.:4:108,39:.: 0.11:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:88,37:.:-0.38:0.999:. ./.:4:112,41:.: 0.25:1.000:. ./.:4:126,74:.: 1.29:1.000:. ./.:4:66,96:.: 0.45:1.000:. ./.:4:14,11:.:-2.60:1.000:. ./.:4:103,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:113,40:.: 0.25:1.000:. ./.:4:92,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:4,9:.:-2.86:1.000:. ./.:4:74,30:.:-0.84:1.000:. ./.:4:150,35:.: 0.96:1.000:. ./.:4:105,33:.:-0.09:1.000:. ./.:4:196,55:.: 2.42:1.000:. ./.:4:92,30:.:-0.44:1.000:. ./.:4:82,33:.:-0.60:1.000:. ./.:4:74,37:.:-0.69:1.000:. ./.:4:7,9:.:-2.80:1.000:. ./.:4:18,2:.:-2.71:1.000:. ./.:3:10,2:.:-2.89:1.000:. ./.:4:106,40:.: 0.09:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:51,78:.:-0.29:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:98,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:36,88:.:-0.40:1.000:. ./.:4:128,60:.: 1.02:1.000:. ./.:4:125,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:83,27:.:-0.71:1.000:. ./.:4:122,42:.: 0.49:1.000:. ./.:4:82,31:.:-0.64:1.000:. ./.:4:126,49:.: 0.73:0.807:. ./.:4:3,15:.:-2.75:1.000:. ./.:4:63,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:43,55:.:-0.98:1.000:. ./.:4:79,74:.: 0.25:1.000:. ./.:4:57,81:.:-0.09:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:168,34:.: 1.33:1.000:. ./.:4:130,39:.: 0.60:1.000:. ./.:4:101,32:.:-0.20:1.000:. ./.:4:90,35:.:-0.38:1.000:. ./.:4:75,35:.:-0.71:1.000:. ./.:4:83,24:.:-0.78:1.000:. ./.:6:62,48:.:-0.71:1.000:. ./.:4:52,92:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,26:.:-0.22:1.000:. ./.:4:91,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:42,54:.:-1.02:1.000:. ./.:4:57,83:.:-0.04:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:68,29:.:-1.00:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:46,74:.:-0.49:0.978:. ./.:4:147,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:136,38:.: 0.71:1.000:. ./.:4:46,38:.:-1.29:0.999:. ./.:4:116,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:116,42:.: 0.36:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:136,36:.: 0.67:1.000:. ./.:4:142,52:.: 1.16:1.000:. ./.:4:40,79:.:-0.51:1.000:. ./.:4:157,46:.: 1.36:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.51:0.988:. ./.:4:78,43:.:-0.47:1.000:. ./.:4:159,44:.: 1.36:1.000:. ./.:4:96,29:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,60:.:-0.24:1.000:. ./.:4:164,39:.: 1.36:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:89,43:.:-0.22:1.000:. ./.:4:95,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:79,41:.:-0.49:1.000:. ./.:4:69,32:.:-0.91:1.000:. ./.:4:148,42:.: 1.07:1.000:. ./.:4:76,58:.:-0.18:1.000:. ./.:4:81,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:33,73:.:-0.80:1.000:. ./.:4:84,29:.:-0.64:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:155,41:.: 1.20:1.000:. ./.:4:157,54:.: 1.53:1.000:. ./.:4:157,30:.: 1.00:1.000:. ./.:4:143,39:.: 0.89:1.000:. ./.:4:68,40:.:-0.75:1.000:. ./.:5:146,38:.: 0.93:0.951:. ./.:4:83,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:74,33:.:-0.78:1.000:. ./.:4:117,32:.: 0.16:1.000:. ./.:4:114,92:.: 1.42:1.000:. ./.:4:53,97:.: 0.18:1.000:. ./.:4:57,89:.: 0.09:1.000:. ./.:4:75,44:.:-0.51:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:167,52:.: 1.71:0.998:. ./.:4:86,79:.: 0.51:1.000:. ./.:4:86,31:.:-0.55:1.000:. ./.:4:74,37:.:-0.69:1.000:. ./.:4:94,46:.:-0.04:1.000:. ./.:4:100,33:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,67:.: 0.20:1.000:. ./.:4:85,31:.:-0.58:1.000:. ./.:4:84,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:127,49:.: 0.76:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,38:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,34:.:-0.40:1.000:. ./.:4:167,34:.: 1.31:1.000:. ./.:4:112,29:.:-0.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:71,39:.:-0.71:1.000:. ./.:4:89,34:.:-0.42:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:58,31:.:-1.18:1.000:. ./.:4:138,33:.: 0.65:1.000:. ./.:4:150,28:.: 0.80:1.000:. ./.:4:149,53:.: 1.33:1.000:. ./.:4:101,71:.: 0.67:1.000:. ./.:4:101,28:.:-0.29:1.000:. ./.:4:83,34:.:-0.55:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:74,41:.:-0.60:1.000:. ./.:4:140,44:.: 0.93:1.000:. ./.:4:125,36:.: 0.42:1.000:. ./.:4:62,33:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,120:.: 1.04:1.000:. ./.:4:215,57:.: 2.89:1.000:. ./.:4:54,93:.: 0.11:1.000:. ./.:4:140,43:.: 0.91:1.000:. ./.:4:174,32:.: 1.42:1.000:. ./.:4:118,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:176,51:.: 1.89:1.000:. ./.:4:154,37:.: 1.09:1.000:. ./.:4:15,3:.:-2.75:1.000:. ./.:4:94,61:.: 0.29:1.000:. ./.:4:147,43:.: 1.07:1.000:. ./.:4:172,59:.: 1.98:1.000:. ./.:4:182,45:.: 1.89:1.000:. ./.:4:97,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,76:.:-0.53:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:95,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:131,34:.: 0.51:1.000:. ./.:4:109,40:.: 0.16:1.000:. ./.:4:108,36:.: 0.05:1.000:. ./.:4:122,32:.: 0.27:1.000:. ./.:4:141,42:.: 0.91:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:155,45:.: 1.29:1.000:. ./.:4:40,66:.:-0.80:1.000:. ./.:4:85,30:.:-0.60:1.000:. ./.:4:73,28:.:-0.91:1.000:. ./.:4:93,42:.:-0.15:1.000:. ./.:4:105,48:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,35:.:-0.86:1.000:. ./.:4:138,30:.: 0.58:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:103,76:.: 0.82:1.000:. ./.:4:103,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,30:.:-0.38:1.000:. ./.:4:138,47:.: 0.96:0.999:. ./.:4:163,49:.: 1.56:1.000:. ./.:4:106,62:.: 0.58:1.000:. ./.:4:72,26:.:-0.98:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.87:1.000:. -chr7.1 56268915 chr7.1_056268915 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:289,82:.: 1.00:1.000:. ./.:4:187,85:.:-0.10:1.000:. ./.:4:187,61:.:-0.36:1.000:. ./.:4:300,95:.: 1.27:1.000:. ./.:4:163,185:.: 0.75:1.000:. ./.:4:318,122:.: 1.77:1.000:. ./.:4:165,164:.: 0.54:1.000:. ./.:4:256,93:.: 0.76:1.000:. ./.:4:168,218:.: 1.17:1.000:. ./.:4:29,23:.:-2.55:1.000:. ./.:4:77,69:.:-1.50:1.000:. ./.:4:159,149:.: 0.30:1.000:. ./.:4:157,180:.: 0.63:1.000:. ./.:4:238,78:.: 0.39:1.000:. ./.:4:263,85:.: 0.75:1.000:. ./.:4:203,241:.: 1.82:1.000:. ./.:4:263,89:.: 0.79:0.999:. ./.:4:406,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:290,96:.: 1.17:1.000:. ./.:4:88,44:.:-1.66:1.000:. ./.:4:196,67:.:-0.20:1.000:. ./.:4:148,177:.: 0.49:1.000:. ./.:4:161,167:.: 0.53:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:280,105:.: 1.16:1.000:. ./.:4:317,117:.: 1.70:1.000:. ./.:4:210,186:.: 1.28:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:198,225:.: 1.58:1.000:. ./.:4:175,232:.: 1.40:1.000:. ./.:4:227,87:.: 0.37:1.000:. ./.:4:59,9:.:-2.37:1.000:. ./.:4:104,21:.:-1.73:1.000:. ./.:3:33,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:286,122:.: 1.42:1.000:. ./.:4:149,208:.: 0.85:1.000:. ./.:4:240,84:.: 0.48:1.000:. ./.:4:229,80:.: 0.31:1.000:. ./.:4:239,80:.: 0.43:1.000:. ./.:4:177,61:.:-0.48:1.000:. ./.:4:191,66:.:-0.26:1.000:. ./.:4:258,70:.: 0.53:1.000:. ./.:4:126,103:.:-0.58:1.000:. ./.:4:126,119:.:-0.40:1.000:. ./.:4:126,136:.:-0.21:1.000:. ./.:4:192,197:.: 1.20:0.807:. ./.:4:101,46:.:-1.49:1.000:. ./.:4:162,103:.:-0.18:1.000:. ./.:4:169,73:.:-0.43:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:248,86:.: 0.59:1.000:. ./.:4:93,116:.:-0.80:1.000:. ./.:4:232,68:.: 0.21:1.000:. ./.:4:239,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:246,89:.: 0.60:1.000:. ./.:4:136,106:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,68:.: 0.18:1.000:. ./.:4:150,47:.:-0.93:1.000:. ./.:6:124,44:.:-1.25:1.000:. ./.:4:143,55:.:-0.92:1.000:. ./.:4:236,77:.: 0.36:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:187,49:.:-0.50:1.000:. ./.:4:212,63:.:-0.06:1.000:. ./.:4:211,67:.:-0.03:1.000:. ./.:4:140,45:.:-1.07:1.000:. ./.:4:116,108:.:-0.63:1.000:. ./.:4:226,80:.: 0.28:0.978:. ./.:4:188,71:.:-0.24:1.000:. ./.:4:237,71:.: 0.30:1.000:. ./.:4:190,69:.:-0.24:0.999:. ./.:4:263,88:.: 0.78:1.000:. ./.:4:155,158:.: 0.36:1.000:. ./.:4:215,63:.:-0.03:1.000:. ./.:4:175,62:.:-0.49:1.000:. ./.:4:225,80:.: 0.27:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:158,54:.:-0.77:1.000:. ./.:4:189,60:.:-0.35:1.000:. ./.:4:144,58:.:-0.88:0.988:. ./.:4:202,61:.:-0.20:1.000:. ./.:4:184,59:.:-0.42:1.000:. ./.:4:178,71:.:-0.35:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:181,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:82,89:.:-1.22:1.000:. ./.:4:105,111:.:-0.72:1.000:. ./.:4:102,86:.:-1.03:1.000:. ./.:4:218,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:129,106:.:-0.51:1.000:. ./.:4:182,61:.:-0.42:1.000:. ./.:4:208,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:107,103:.:-0.79:1.000:. ./.:4:174,74:.:-0.36:1.000:. ./.:4:144,45:.:-1.02:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:185,56:.:-0.44:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:196,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:198,74:.:-0.10:1.000:. ./.:4:91,75:.:-1.28:1.000:. ./.:5:137,87:.:-0.63:0.951:. ./.:4:59,81:.:-1.57:1.000:. ./.:4:125,137:.:-0.21:1.000:. ./.:4:173,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:348,117:.: 2.05:1.000:. ./.:4:167,58:.:-0.62:1.000:. ./.:4:160,48:.:-0.81:1.000:. ./.:4:238,280:.: 2.64:1.000:. ./.:4:151,50:.:-0.89:0.999:. ./.:4:159,120:.:-0.02:1.000:. ./.:4:126,39:.:-1.29:1.000:. ./.:4:126,122:.:-0.36:1.000:. ./.:4:125,104:.:-0.58:1.000:. ./.:4:177,51:.:-0.59:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:112,97:.:-0.80:1.000:. ./.:4:138,121:.:-0.24:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:163,57:.:-0.68:1.000:. ./.:4:293,124:.: 1.52:1.000:. ./.:4:138,103:.:-0.44:1.000:. ./.:4:172,57:.:-0.58:1.000:. ./.:4:123,95:.:-0.70:1.000:. ./.:4:173,58:.:-0.55:1.000:. ./.:4:79,72:.:-1.44:1.000:. ./.:4:65,70:.:-1.62:1.000:. ./.:4:133,46:.:-1.13:1.000:. ./.:4:139,165:.: 0.26:1.000:. ./.:4:58,63:.:-1.78:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:258,246:.: 2.48:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:81,91:.:-1.21:1.000:. ./.:4:77,81:.:-1.37:1.000:. ./.:4:143,121:.:-0.19:1.000:. ./.:4:159,29:.:-1.03:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:125,38:.:-1.31:1.000:. ./.:4:288,93:.: 1.12:1.000:. ./.:4:418,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:259,90:.: 0.76:1.000:. ./.:4:276,89:.: 0.94:1.000:. ./.:4:318,100:.: 1.53:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:310,100:.: 1.44:1.000:. ./.:4:271,88:.: 0.87:1.000:. ./.:4:87,15:.:-1.99:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:266,88:.: 0.81:1.000:. ./.:4:223,66:.: 0.09:1.000:. ./.:4:348,120:.: 2.08:1.000:. ./.:4:180,194:.: 1.04:1.000:. ./.:4:176,67:.:-0.42:1.000:. ./.:4:279,104:.: 1.14:1.000:. ./.:4:261,90:.: 0.78:1.000:. ./.:4:252,81:.: 0.58:1.000:. ./.:4:197,62:.:-0.24:1.000:. ./.:4:183,173:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,183:.: 0.71:1.000:. ./.:4:329,95:.: 1.59:1.000:. ./.:4:192,74:.:-0.16:1.000:. ./.:4:249,95:.: 0.70:0.999:. ./.:4:232,91:.: 0.47:1.000:. ./.:4:244,96:.: 0.66:1.000:. ./.:4:140,132:.:-0.10:1.000:. ./.:4:117,145:.:-0.21:1.000:. ./.:4:149,146:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,129:.:-0.55:1.000:. ./.:4:170,66:.:-0.50:1.000:. ./.:4:204,63:.:-0.15:1.000:. ./.:4:221,240:.: 2.01:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:179,215:.: 1.26:1.000:. ./.:4:206,99:.: 0.27:1.000:. ./.:4:277,74:.: 0.78:0.999:. ./.:4:316,107:.: 1.58:1.000:. ./.:4:202,245:.: 1.85:1.000:. ./.:4:172,153:.: 0.49:1.000:. ./.:4:274,104:.: 1.08:1.000:. -chr7.1 56484720 chr7.1_056484720 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:139,290:.:-0.13:1.000:. ./.:4:2,328:.:-1.00:1.000:. ./.:4:146,425:.: 1.11:1.000:. ./.:4:160,324:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,402:.:-0.36:1.000:. ./.:4:162,500:.: 1.90:1.000:. ./.:4:1,339:.:-0.91:1.000:. ./.:4:147,487:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,463:.: 0.16:1.000:. ./.:4:110,228:.:-0.93:1.000:. ./.:4:312,426:.: 2.57:1.000:. ./.:4:1,249:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,384:.:-0.53:1.000:. ./.:4:166,296:.: 0.15:1.000:. ./.:4:123,263:.:-0.51:1.000:. ./.:4:2,410:.:-0.28:1.000:. ./.:4:151,356:.: 0.55:0.999:. ./.:4:285,321:.: 1.41:1.000:. ./.:4:153,578:.: 2.51:1.000:. ./.:4:155,328:.: 0.34:1.000:. ./.:4:16,462:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,396:.:-0.41:1.000:. ./.:4:169,278:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,380:.:-0.55:1.000:. ./.:4:83,295:.:-0.58:1.000:. ./.:4:208,370:.: 1.17:1.000:. ./.:4:1,622:.: 1.56:1.000:. ./.:4:2,390:.:-0.46:1.000:. ./.:4:163,462:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,452:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,510:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,360:.:-0.74:1.000:. ./.:4:67,268:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,368:.:-0.57:1.000:. ./.:3:0,390:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,435:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,435:.:-0.08:1.000:. ./.:4:169,278:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,657:.: 1.86:1.000:. ./.:4:1,509:.: 0.57:1.000:. ./.:4:115,244:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,515:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,584:.: 1.22:1.000:. ./.:4:5,384:.:-0.48:1.000:. ./.:4:8,425:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,388:.:-0.49:1.000:. ./.:4:164,305:.: 0.22:0.807:. ./.:4:254,525:.: 2.93:1.000:. ./.:4:3,393:.:-0.42:1.000:. ./.:4:192,434:.: 1.59:1.000:. ./.:4:103,333:.:-0.07:1.000:. ./.:4:187,331:.: 0.64:1.000:. ./.:4:4,303:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,510:.: 0.57:1.000:. ./.:4:136,354:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,631:.: 1.63:1.000:. ./.:4:4,294:.:-1.28:1.000:. ./.:4:2,452:.: 0.08:1.000:. ./.:4:7,347:.:-0.79:1.000:. ./.:6:102,223:.:-1.04:1.000:. ./.:4:129,225:.:-0.79:1.000:. ./.:4:124,358:.: 0.33:1.000:. ./.:4:139,434:.: 1.13:1.000:. ./.:4:148,303:.: 0.06:1.000:. ./.:4:133,292:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,488:.: 0.38:1.000:. ./.:4:3,333:.:-0.95:1.000:. ./.:4:3,320:.:-1.06:1.000:. ./.:4:154,266:.:-0.21:0.978:. ./.:4:3,296:.:-1.27:1.000:. ./.:4:149,452:.: 1.37:1.000:. ./.:4:127,308:.:-0.08:0.999:. ./.:4:2,520:.: 0.68:1.000:. ./.:4:144,239:.:-0.54:1.000:. ./.:4:3,447:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,539:.: 0.84:1.000:. ./.:4:131,391:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,431:.:-0.12:1.000:. ./.:4:125,214:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,556:.: 0.98:1.000:. ./.:4:4,333:.:-0.94:0.988:. ./.:4:4,407:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,494:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.99:1.000:. ./.:4:137,463:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,493:.: 0.43:1.000:. ./.:4:2,263:.:-1.57:1.000:. ./.:4:4,279:.:-1.41:1.000:. ./.:4:4,342:.:-0.86:1.000:. ./.:4:6,312:.:-1.11:1.000:. ./.:4:2,325:.:-1.03:1.000:. ./.:4:133,223:.:-0.77:1.000:. ./.:4:126,404:.: 0.75:1.000:. ./.:4:115,310:.:-0.17:1.000:. ./.:4:8,312:.:-1.09:1.000:. ./.:4:151,261:.:-0.28:1.000:. ./.:4:106,152:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,454:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,488:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,443:.:-0.01:1.000:. ./.:4:101,399:.: 0.49:1.000:. ./.:4:125,404:.: 0.74:1.000:. ./.:4:2,241:.:-1.76:1.000:. ./.:5:134,322:.: 0.10:0.951:. ./.:4:113,214:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,340:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,445:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,437:.: 1.06:1.000:. ./.:4:174,316:.: 0.40:1.000:. ./.:4:147,226:.:-0.62:1.000:. ./.:4:111,185:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,544:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,365:.:-0.69:0.999:. ./.:4:2,428:.:-0.13:1.000:. ./.:4:108,282:.:-0.48:1.000:. ./.:4:10,351:.:-0.73:1.000:. ./.:4:139,183:.:-1.07:1.000:. ./.:4:128,397:.: 0.71:1.000:. ./.:4:132,311:.:-0.01:1.000:. ./.:4:2,348:.:-0.83:1.000:. ./.:4:4,351:.:-0.78:1.000:. ./.:4:107,300:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,531:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1,471:.: 0.24:1.000:. ./.:4:5,313:.:-1.11:1.000:. ./.:4:157,406:.: 1.04:1.000:. ./.:4:8,287:.:-1.31:1.000:. ./.:4:2,380:.:-0.55:1.000:. ./.:4:1,262:.:-1.59:1.000:. ./.:4:96,192:.:-1.37:1.000:. ./.:4:4,346:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,404:.:-0.34:1.000:. ./.:4:2,219:.:-1.95:1.000:. ./.:4:0,473:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,408:.:-0.32:1.000:. ./.:4:2,536:.: 0.82:1.000:. ./.:4:126,397:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,407:.:-0.33:1.000:. ./.:4:100,168:.:-1.54:1.000:. ./.:4:4,257:.:-1.60:1.000:. ./.:4:3,315:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,424:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,487:.: 0.37:1.000:. ./.:4:2,220:.:-1.95:1.000:. ./.:4:154,304:.: 0.12:1.000:. ./.:4:168,534:.: 2.25:1.000:. ./.:4:145,274:.:-0.22:1.000:. ./.:4:132,372:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,642:.: 1.73:1.000:. ./.:4:117,315:.:-0.11:1.000:. ./.:4:137,482:.: 1.53:1.000:. ./.:4:147,360:.: 0.55:1.000:. ./.:4:149,182:.:-0.99:1.000:. ./.:4:105,309:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,693:.: 2.18:1.000:. ./.:4:0,569:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,596:.: 1.33:1.000:. ./.:4:2,477:.: 0.30:1.000:. ./.:4:120,211:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,646:.: 1.76:1.000:. ./.:4:120,233:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,476:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,604:.: 1.41:1.000:. ./.:4:123,274:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1,524:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,584:.: 1.22:1.000:. ./.:4:118,396:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1,352:.:-0.80:0.999:. ./.:4:0,514:.: 0.61:1.000:. ./.:4:123,232:.:-0.78:1.000:. ./.:4:120,210:.:-1.00:1.000:. ./.:4:93,211:.:-1.23:1.000:. ./.:4:126,275:.:-0.38:1.000:. ./.:4:124,218:.:-0.90:1.000:. ./.:4:116,261:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,431:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,568:.: 1.08:1.000:. ./.:4:171,462:.: 1.65:1.000:. ./.:4:151,288:.:-0.05:1.000:. ./.:4:80,249:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,634:.: 1.66:0.999:. ./.:4:201,542:.: 2.61:1.000:. ./.:4:0,520:.: 0.66:1.000:. ./.:4:113,238:.:-0.82:1.000:. ./.:4:2,395:.:-0.41:1.000:. -chr7.1 56688448 chr7.1_056688448 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:224,76:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,125:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,200:0.70: 0.49:1.000:0.983 0/0/0/0:4:249,3:0.01: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,160:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,232:0.75: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,106:0.47:-0.63:1.000:0.992 0/1/1/1:4:66,231:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,133:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,18:0.18:-2.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,62:0.65:-2.67:1.000:0.744 0/0/0/1:4:207,63:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,67:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,81:0.27: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,167:0.50: 1.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:216,75:0.24: 0.70:0.999:1.000 0/0/0/1:4:184,82:0.29: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:259,91:0.24: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,67:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,27:0.29:-2.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:211,68:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,68:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,150:0.54: 0.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:17,19:0.50:-3.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:247,90:0.25: 1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,196:0.70: 0.36:1.000:0.988 0/0/0/1:4:174,71:0.27:-0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:207,79:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,164:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,147:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:184,58:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,1:0.03:-3.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,20:0.23:-2.91:1.000:1.000 0/0/1:3:20,11:0.33:-3.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:284,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,154:0.45: 1.24:1.000:0.980 0/0/0/1:4:212,65:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,209:0.71: 0.63:1.000:0.992 0/0/0/1:4:188,82:0.28: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:188,72:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,152:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,169:0.51: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,127:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:149,158:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,142:0.45: 0.80:1.000:0.981 0/0/0/1:4:224,84:0.25: 0.99:0.807:0.999 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-2.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,123:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/0:4:208,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,55:0.26:-0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:240,94:0.26: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,131:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,220:0.72: 0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,204:0.78: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,213:0.71: 0.71:1.000:0.992 0/0/1/1:4:154,145:0.46: 0.83:1.000:0.986 0/0/0/1:4:204,93:0.29: 0.80:1.000:0.992 0/0/0/1:4:200,86:0.28: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:157,30:0.15:-1.07:1.000:0.994 0/0/0/0:4:250,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,132:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,163:0.54: 0.66:1.000:0.989 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,70:0.24: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,144:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,44:0.25:-1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,89:0.32: 0.13:1.000:0.950 0/0/0/0:4:235,0:0.00:-0.26:0.978:1.000 0/0/1/1:4:116,120:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,157:0.54: 0.49:1.000:0.990 0/0/0/1:4:131,47:0.24:-1.23:0.999:1.000 0/0/1/1:4:159,161:0.48: 1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:144,140:0.47: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:115,147:0.53: 0.20:1.000:0.990 0/1/1/1:4:55,181:0.75:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,123:0.54:-0.56:1.000:0.987 0/0/1/1:4:126,160:0.53: 0.61:1.000:0.991 0/0/0/1:4:175,68:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,155:0.54: 0.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:113,112:0.47:-0.43:0.988:0.992 0/0/0/0:4:276,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,148:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:157,63:0.26:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:150,57:0.25:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,153:0.55: 0.27:1.000:0.980 0/0/1/1:4:88,99:0.50:-1.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:160,56:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,135:0.53:-0.14:1.000:0.992 0/0/0/0:4:257,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,111:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:195,66:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,250:0.73: 1.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,43:0.23:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,146:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:263,3:0.01: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:205,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,128:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,157:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:203,70:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,107:0.57:-1.19:1.000:0.948 0/0/1/1:4:122,146:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:121,55:0.29:-1.26:1.000:0.992 0/0/1/1/1:5:121,176:0.57: 0.80:0.951:0.935 0/0/1/1:4:114,102:0.45:-0.58:1.000:0.975 0/0/1/1:4:117,117:0.47:-0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:103,127:0.53:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:177,77:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/0:4:308,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,67:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,77:0.30:-0.21:1.000:0.985 0/0/0/1:4:227,90:0.26: 1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,137:0.54:-0.17:0.999:0.984 0/0/1/1:4:189,142:0.40: 1.38:1.000:0.818 0/1/1/1:4:49,161:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,149:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,99:0.46:-0.78:1.000:0.986 0/1/1/1:4:48,182:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,128:0.53:-0.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:163,56:0.23:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,133:0.47: 0.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:105,104:0.47:-0.70:1.000:0.992 0/1/1/1:4:67,201:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:190,72:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,115:0.43: 0.03:1.000:0.947 0/0/1/1:4:137,169:0.53: 0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:129,125:0.46: 0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:100,109:0.49:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,86:0.46:-1.26:1.000:0.988 0/0/0/1:4:126,52:0.27:-1.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:182,55:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,122:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,38:0.22:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,123:0.54:-0.53:1.000:0.990 0/0/0/1:4:162,69:0.28:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:232,88:0.25: 1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,69:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,66:0.26:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:114,87:0.41:-0.84:1.000:0.845 0/0/1/1:4:93,147:0.59:-0.17:1.000:0.874 0/0/1/1:4:127,158:0.53: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,130:0.54:-0.38:1.000:0.985 0/0/0/1:4:146,55:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,51:0.27:-1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:254,83:0.23: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,84:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,79:0.27: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:137,144:0.48: 0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,257:0.75: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,149:0.54: 0.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:159,172:0.49: 1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:146,163:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,33:0.44:-3.05:1.000:0.964 0/0/0/1:4:161,63:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,214:0.77: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,203:0.73: 0.36:1.000:0.998 0/1/1/1:4:93,248:0.71: 1.55:1.000:0.991 0/0/0/1:4:205,77:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,72:0.29:-0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:151,167:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:211,64:0.21: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,122:0.48:-0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,171:0.78:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,53:0.20:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,66:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,170:0.53: 0.95:1.000:0.993 0/0/1/1:4:99,123:0.53:-0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:140,134:0.46: 0.41:0.999:0.989 0/1/1/1:4:52,175:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:177,67:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,53:0.20:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,134:0.58:-0.51:1.000:0.893 0/0/1/1:4:128,128:0.47: 0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,116:0.46:-0.24:1.000:0.990 0/0/0/1:4:128,46:0.24:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,110:0.48:-0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:210,175:0.43: 2.30:1.000:0.942 0/0/0/1:4:198,74:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,75:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:174,69:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,176:0.59: 0.61:0.999:0.855 0/0/1/1:4:132,161:0.52: 0.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:180,143:0.42: 1.24:1.000:0.900 0/0/1/1:4:133,106:0.42:-0.19:1.000:0.903 0/0/1/1:4:129,132:0.48: 0.19:1.000:0.995 -chr7.1 57068472 chr7.1_057068472 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:648,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:138,341:0.72:-0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:271,254:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:383,136:0.29:-0.41:1.000:0.993 0/1/1/1:4:165,446:0.73: 0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:340,302:0.49: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:399,116:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:321,245:0.46: 0.02:1.000:0.986 0/0/1/1:4:316,278:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:235,103:0.33:-2.05:1.000:0.921 0/0/0/1:4:228,56:0.22:-2.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:253,272:0.54:-0.36:1.000:0.988 0/1/1/1:4:142,381:0.73:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:511,127:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:290,264:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:162,420:0.73: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:350,263:0.45: 0.44:0.999:0.983 0/0/1/1:4:318,257:0.47: 0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:349,363:0.53: 1.34:1.000:0.992 0/0/0/0:4:770,1:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,52:0.21:-2.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:302,271:0.50: 0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:319,318:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:505,146:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,97:0.49:-3.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:529,174:0.27: 1.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:280,262:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:288,262:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:368,309:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:520,176:0.28: 1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:380,283:0.45: 0.89:1.000:0.981 0/0/0/1:4:427,116:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,31:0.31:-4.12:1.000:0.974 0/0/1/1:4:198,179:0.50:-1.69:1.000:0.997 0/1/1:3:17,94:0.85:-4.10:1.000:0.730 0/0/1/1:4:302,279:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:174,386:0.70:-0.04:1.000:0.982 0/0/0/1:4:461,161:0.28: 0.52:1.000:0.994 0/1/1/1:4:156,429:0.74: 0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:370,313:0.48: 1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:504,131:0.23: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:137,390:0.74:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:339,258:0.46: 0.30:1.000:0.985 0/0/0/1:4:461,109:0.21: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:437,390:0.50: 2.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:313,259:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:358,373:0.53: 1.51:0.807:0.992 0/0/0/1:4:164,41:0.22:-3.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:391,126:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:479,130:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:268,255:0.51:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:461,146:0.27: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:158,366:0.70:-0.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:359,263:0.45: 0.52:1.000:0.977 0/0/1/1:4:286,222:0.46:-0.51:1.000:0.988 0/0/1/1:4:397,300:0.45: 1.20:1.000:0.984 0/0/1/1:4:297,264:0.49:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:566,156:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:339,260:0.46: 0.31:1.000:0.986 0/0/0/0/1/1:6:313,200:0.41:-0.46:1.000:0.526 0/0/0/1:4:475,148:0.26: 0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:245,223:0.50:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:613,161:0.23: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:481,140:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:647,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:165,384:0.71:-0.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:313,273:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:147,438:0.75: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:553,164:0.25: 1.38:0.978:0.999 0/0/1/1:4:269,207:0.46:-0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:363,337:0.50: 1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:381,109:0.25:-0.67:0.999:0.999 0/0/0/1:4:597,161:0.24: 1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:415,114:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:319,256:0.47: 0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:136,371:0.74:-0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:144,381:0.73:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:288,256:0.49:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:565,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:129,466:0.79: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,230:0.51:-0.83:0.988:0.996 0/0/1/1:4:316,262:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:170,447:0.73: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:243,216:0.49:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:519,175:0.28: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:353,321:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:111,335:0.75:-1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:123,364:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:275,269:0.52:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:287,223:0.46:-0.49:1.000:0.988 0/0/1/1:4:260,277:0.54:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:256,225:0.49:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:357,287:0.47: 0.72:1.000:0.992 0/0/0/1:4:298,103:0.28:-1.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:484,130:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:512,154:0.26: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:296,258:0.49:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:162,407:0.72: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:188,470:0.72: 0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:141,408:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,251:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/1/1/1:4:149,444:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:279,227:0.47:-0.53:1.000:0.993 0/0/0/1/1:5:418,281:0.43: 1.22:0.951:0.947 0/0/1/1:4:241,285:0.56:-0.35:1.000:0.966 0/0/1/1:4:215,230:0.54:-1.08:1.000:0.989 0/1/1/1:4:109,334:0.76:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:288,292:0.53: 0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:527,154:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:420,107:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:410,109:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:204,472:0.70: 1.01:1.000:0.989 0/1/1/1:4:152,392:0.73:-0.18:0.999:0.997 0/0/0/1:4:585,153:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,201:0.48:-1.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:587,144:0.22: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:394,139:0.29:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:280,239:0.48:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:475,118:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,229:0.49:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:317,259:0.47: 0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:281,249:0.49:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:172,428:0.72: 0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:484,144:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:481,139:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:352,297:0.48: 0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:499,141:0.25: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:261,257:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:241,261:0.54:-0.56:1.000:0.987 0/0/1/1:4:241,244:0.52:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:260,258:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:127,385:0.75:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,187:0.51:-1.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:317,270:0.48: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:270,212:0.46:-0.74:1.000:0.990 0/0/1/1:4:444,346:0.46: 2.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:477,116:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,263:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:418,131:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:147,390:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:489,135:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:307,294:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:164,405:0.72: 0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:220,232:0.53:-1.02:1.000:0.991 0/0/0/0:4:700,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:184,479:0.73: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/0:4:630,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:282,223:0.47:-0.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:348,284:0.47: 0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:249,243:0.52:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:349,300:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:277,252:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:218,47:0.20:-2.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:269,240:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:369,292:0.47: 0.87:1.000:0.991 0/0/1/1:4:320,276:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:351,300:0.48: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:363,315:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:566,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,538:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:445,120:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,323:0.73:-1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:284,258:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:302,236:0.46:-0.24:1.000:0.989 0/0/1/1:4:316,293:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:284,232:0.47:-0.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:144,396:0.74:-0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:271,265:0.52:-0.26:0.999:0.995 0/0/1/1:4:298,242:0.47:-0.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:419,125:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,245:0.52:-0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:248,191:0.46:-1.13:1.000:0.987 0/0/0/1:4:456,142:0.26: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:256,239:0.51:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:268,281:0.53:-0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:233,237:0.53:-0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:363,304:0.48: 0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:318,292:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:324,279:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:396,156:0.31:-0.11:1.000:0.976 0/1/1/1:4:205,484:0.71: 1.13:0.999:0.991 0/0/1/1:4:403,400:0.52: 2.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:377,339:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:395,131:0.27:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:272,284:0.53:-0.08:1.000:0.992 -chr7.1 57346246 chr7.1_057346246 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:279,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:202,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:369,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.63:1.000:. ./.:3:37,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.89:0.807:. ./.:4:352,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:240,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.27:1.000:. ./.:6:108,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.62:0.978:. ./.:4:190,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:174,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.95:0.988:. ./.:4:152,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.41:1.000:. ./.:5:120,0:.:-0.95:0.951:. ./.:4:103,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.07:0.999:. ./.:4:197,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:327,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:323,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:227,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.74:0.999:. ./.:4:212,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.41:0.999:. ./.:4:310,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.55:1.000:. -chr7.1 57471464 chr7.1_057471464 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:79,51:0.39: 0.49:1.000:0.721 1/1/1/1:4:1,112:0.92:-0.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:60,40:0.40:-0.41:1.000:0.819 0/0/1/1:4:49,41:0.48:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,168:0.79: 2.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,45:0.41:-0.05:1.000:0.837 0/0/1/1:4:51,33:0.39:-0.89:1.000:0.729 0/0/0/1:4:89,48:0.33: 0.70:1.000:0.903 0/1/1/1:4:40,92:0.67: 0.55:1.000:0.908 0/1/1/1:4:17,33:0.64:-1.91:1.000:0.689 0/0/1/1:4:23,22:0.51:-2.06:1.000:0.996 1/1/1/1:4:4,139:0.90: 0.88:1.000:0.805 0/1/1/1:4:34,77:0.66:-0.08:1.000:0.897 0/0/1/1:4:55,89:0.61: 0.91:1.000:0.699 0/1/1/1:4:22,73:0.72:-0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,115:0.77: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,123:0.75: 1.12:0.999:1.000 1/1/1/1:4:1,124:0.92: 0.34:1.000:0.986 0/0/1/1:4:71,63:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,63:0.44: 1.06:1.000:0.959 0/0/1/1:4:15,23:0.60:-2.27:1.000:0.792 0/1/1/1:4:40,74:0.63: 0.01:1.000:0.590 0/0/1/1:4:67,48:0.43: 0.04:1.000:0.941 0/0/1/1:4:66,45:0.41:-0.08:1.000:0.870 0/0/1/1:4:15,22:0.59:-2.30:1.000:0.851 0/1/1/1:4:54,106:0.64: 1.39:1.000:0.710 0/0/0/1:4:69,25:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,44:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,47:0.48:-0.29:1.000:0.994 0/0/0/1:4:84,44:0.32: 0.43:1.000:0.940 0/1/1/1:4:42,85:0.65: 0.40:1.000:0.763 0/0/1/1:4:45,72:0.61: 0.10:1.000:0.720 0/0/0/1:4:11,6:0.34:-2.90:1.000:0.884 0/1/1/1:4:4,46:0.85:-1.91:1.000:0.985 0/0/1:3:17,9:0.33:-2.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,84:0.70:-0.02:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,128:0.85: 0.76:1.000:0.984 0/1/1/1:4:46,121:0.69: 1.60:1.000:0.969 0/1/1/1:4:51,96:0.63: 1.00:1.000:0.628 0/1/1/1:4:33,145:0.75: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,88:0.62: 0.73:1.000:0.521 0/0/1/1:4:55,52:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,46:0.35: 0.37:1.000:0.748 0/1/1/1:4:58,109:0.63: 1.60:1.000:0.624 0/0/1/1:4:55,90:0.61: 0.94:1.000:0.678 0/0/1/1:4:62,59:0.51: 0.22:0.807:0.996 0/0/1/1:4:57,35:0.38:-0.65:1.000:0.518 0/0/1/1:4:61,40:0.40:-0.38:1.000:0.772 0/0/0/1:4:58,32:0.34:-0.71:1.000:0.861 0/0/1/1:4:62,42:0.41:-0.29:1.000:0.857 0/1/1/1:4:56,111:0.64: 1.60:1.000:0.728 0/1/1/1:4:26,144:0.78: 1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,54:0.41: 0.58:1.000:0.875 0/0/0/1:4:75,45:0.37: 0.19:1.000:0.583 0/0/1/1:4:92,67:0.43: 1.36:1.000:0.955 0/1/1/1:4:45,97:0.66: 0.85:1.000:0.849 0/0/1/1:4:65,98:0.60: 1.48:1.000:0.816 0/1/1/1:4:20,133:0.81: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:51,41:0.47:-0.65:1.000:0.828 0/0/1/1:4:53,44:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,50:0.33: 0.94:1.000:0.935 0/0/1/1:4:68,63:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,47:0.35: 0.52:1.000:0.828 0/0/1/1:4:60,47:0.46:-0.20:1.000:0.987 0/1/1/1:4:31,120:0.74: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,76:0.66:-0.11:1.000:0.885 0/0/1/1:4:46,55:0.56:-0.38:0.978:0.974 0/1/1/1:4:21,76:0.73:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,81:0.67: 0.07:0.999:0.913 0/0/1/1:4:73,57:0.46: 0.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:88,36:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,73:0.69:-0.41:1.000:0.976 0/1/1/1:4:45,81:0.63: 0.37:1.000:0.530 0/0/1/1:4:47,32:0.41:-1.04:1.000:0.867 0/0/1/1:4:42,71:0.62:-0.02:1.000:0.610 0/0/0/1:4:88,48:0.34: 0.67:1.000:0.884 0/0/1/1:4:70,55:0.46: 0.34:1.000:0.987 0/1/1/1:4:30,61:0.65:-0.68:0.988:0.770 0/1/1/1:4:31,98:0.71: 0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,59:0.54:-0.05:1.000:0.986 0/1/1/1:4:18,125:0.81: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,117:0.80: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,69:0.69:-0.56:1.000:0.971 0/1/1/1:4:36,77:0.66:-0.02:1.000:0.840 0/1/1/1:4:29,53:0.63:-0.95:1.000:0.564 0/1/1/1:4:36,69:0.64:-0.26:1.000:0.664 0/1/1/1:4:14,102:0.81: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,64:0.35: 1.93:1.000:0.819 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,71:0.44: 1.63:1.000:0.958 0/0/1/1:4:65,47:0.43:-0.05:1.000:0.949 0/1/1/1:4:22,89:0.74:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,33:0.51:-1.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,31:0.26:-0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,99:0.70: 0.61:1.000:0.983 0/1/1/1:4:36,67:0.63:-0.32:1.000:0.603 0/0/1/1:4:59,50:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,31:0.55:-1.67:1.000:0.982 0/0/1/1/1:5:72,87:0.56: 1.36:0.951:0.907 0/0/1/1:4:40,61:0.60:-0.38:1.000:0.800 0/1/1/1:4:51,93:0.63: 0.91:1.000:0.559 0/0/0/1:4:59,34:0.36:-0.62:1.000:0.741 0/0/1/1:4:55,50:0.51:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,72:0.59: 0.28:1.000:0.890 0/1/1/1:4:47,97:0.65: 0.91:1.000:0.793 0/0/1/1:4:53,92:0.62: 0.94:1.000:0.552 0/1/1/1:4:38,127:0.72: 1.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,42:0.49:-0.68:0.999:0.996 0/0/0/1:4:101,52:0.32: 1.18:1.000:0.955 0/0/1/1:4:38,24:0.39:-1.55:1.000:0.637 0/0/1/1:4:69,61:0.50: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,44:0.34: 0.31:1.000:0.867 0/0/0/1:4:50,27:0.33:-1.10:1.000:0.901 0/0/0/1:4:83,40:0.30: 0.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:50,45:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,90:0.65: 0.61:1.000:0.779 0/0/1/1:4:53,73:0.58: 0.37:1.000:0.910 0/0/1/1:4:51,74:0.59: 0.34:1.000:0.863 0/1/1/1:4:44,103:0.67: 1.00:1.000:0.920 0/0/0/1:4:75,27:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,42:0.26: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,82:0.65: 0.22:1.000:0.819 0/0/1/1:4:40,71:0.63:-0.08:1.000:0.502 0/0/1/1:4:28,31:0.54:-1.64:1.000:0.987 0/1/1/1:4:20,133:0.81: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,124:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,30:0.53:-1.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:42,52:0.56:-0.59:1.000:0.964 0/0/0/1:4:44,24:0.34:-1.37:1.000:0.884 0/0/1/1:4:54,56:0.53:-0.11:1.000:0.992 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,31:0.35:-0.86:1.000:0.753 0/0/1/1:4:58,46:0.46:-0.29:1.000:0.989 0/1/1/1:4:21,112:0.78: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,54:0.46: 0.28:1.000:0.986 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,83:0.76:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,28:0.35:-1.10:1.000:0.768 0/0/1/1:4:92,58:0.38: 1.09:1.000:0.630 0/1/1/1:4:33,114:0.72: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,61:0.43: 0.97:1.000:0.942 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,40:0.33: 0.04:1.000:0.919 0/0/1/1:4:61,82:0.58: 0.88:1.000:0.927 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,13:0.36:-2.36:1.000:0.647 0/0/1/1:4:50,32:0.39:-0.95:1.000:0.689 0/0/0/1:4:85,49:0.36: 0.61:1.000:0.739 0/0/0/1:4:95,56:0.36: 1.12:1.000:0.657 0/0/0/1:4:95,50:0.33: 0.94:1.000:0.935 0/0/0/1:4:63,35:0.34:-0.47:1.000:0.845 0/0/1/1:4:65,41:0.38:-0.23:1.000:0.632 0/1/1/1:4:30,105:0.73: 0.64:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,99:0.63: 1.21:1.000:0.530 0/1/1/1:4:29,61:0.65:-0.71:1.000:0.819 0/0/1/1:4:60,53:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,49:0.46:-0.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,39:0.54:-1.16:1.000:0.989 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,37:0.38:-0.50:1.000:0.536 0/1/1/1:4:24,89:0.73:-0.02:0.999:0.998 0/0/0/1:4:60,36:0.37:-0.53:1.000:0.583 0/1/1/1:4:40,77:0.64: 0.10:1.000:0.673 0/0/1/1:4:41,31:0.45:-1.25:1.000:0.976 0/1/1/1:4:21,78:0.73:-0.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,55:0.47: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,90:0.62: 0.85:1.000:0.558 0/1/1/1:4:19,142:0.82: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,122:0.64: 2.14:1.000:0.685 0/0/1/1:4:66,52:0.46: 0.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:43,41:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,84:0.64: 0.40:1.000:0.701 0/0/1/1:4:60,46:0.45:-0.23:0.999:0.981 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,138:0.68: 2.35:1.000:0.961 0/0/1/1:4:66,47:0.43:-0.02:1.000:0.934 0/1/1/1:4:27,83:0.71:-0.11:1.000:0.991 -chr7.1 57617863 chr7.1_057617863 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:111,263:0.72: 0.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:240,62:0.22:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,132:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:91,241:0.74: 0.20:1.000:0.998 0/0/0/0:4:432,0:0.00: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,164:0.48: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,123:0.51:-0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:181,163:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:279,80:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,52:0.41:-2.54:1.000:0.849 0/0/1/1:4:59,53:0.50:-2.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:252,84:0.27: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:229,78:0.28:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:187,174:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,183:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/0/0:4:330,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:257,85:0.27: 0.34:0.999:0.998 0/0/0/1:4:307,91:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:119,292:0.72: 1.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,262:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,38:0.39:-2.98:1.000:0.706 0/0/0/1:4:272,74:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,195:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:170,118:0.43:-0.41:1.000:0.952 0/0/1/1:4:49,29:0.39:-3.33:1.000:0.737 0/0/1/1:4:220,207:0.51: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,148:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,158:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:108,261:0.72: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:181,160:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:281,72:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,117:0.47:-0.77:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,73:0.85:-3.21:1.000:0.992 0/0/0/1:4:87,33:0.30:-2.75:1.000:0.988 0/1/1:3:21,20:0.51:-3.85:1.000:0.668 0/0/1/1:4:188,137:0.44: 0.11:1.000:0.973 0/0/0/0:4:363,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,150:0.47: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:232,65:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,79:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,157:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:209,187:0.50: 1.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,262:0.75: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,139:0.52:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:270,73:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,83:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,207:0.53: 1.29:0.807:0.993 0/1/1/1:4:16,66:0.81:-3.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,142:0.48:-0.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,153:0.76:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,182:0.71:-0.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:218,203:0.51: 1.44:1.000:0.997 0/0/0/0:4:362,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,178:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:174,163:0.51: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,181:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:273,79:0.25: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,165:0.51: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:263,77:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:86,193:0.70:-0.54:1.000:0.853 0/1/1/1:4:79,223:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,231:0.74:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,252:0.73: 0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:68,193:0.75:-0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,259:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,178:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,52:0.26:-1.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:290,65:0.20: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,257:0.77: 0.26:0.978:1.000 0/0/1/1:4:186,128:0.43:-0.05:1.000:0.947 0/1/1/1:4:99,258:0.73: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:164,147:0.50:-0.09:0.999:0.997 0/1/1/1:4:133,269:0.68: 1.18:1.000:0.961 0/0/1/1:4:171,184:0.54: 0.52:1.000:0.988 0/0/1/1:4:163,174:0.54: 0.27:1.000:0.989 0/0/0/1:4:247,80:0.27: 0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,162:0.55:-0.12:1.000:0.984 0/0/1/1:4:169,134:0.47:-0.20:1.000:0.990 0/1/1/1:4:88,203:0.71:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:181,150:0.48: 0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:145,133:0.50:-0.55:0.988:0.997 0/0/1/1:4:182,164:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:192,173:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:209,65:0.26:-0.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,304:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,292:0.76: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:298,2:0.01:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,82:0.28: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:262,79:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,151:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:209,51:0.21:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,89:0.27: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:187,161:0.49: 0.43:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,248:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,164:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,224:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,125:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/1/1/1:4:59,172:0.75:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,179:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,168:0.53: 0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,115:0.50:-1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,149:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,98:0.43:-1.04:1.000:0.935 0/0/0/1/1:5:254,126:0.35: 0.87:0.951:0.915 0/0/0/1:4:198,58:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,77:0.30:-0.56:1.000:0.985 0/0/1/1:4:165,151:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,235:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:120,354:0.76: 2.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,157:0.47: 0.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:164,144:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:335,106:0.26: 1.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,165:0.48: 0.65:0.999:0.994 0/0/1/1:4:158,207:0.59: 0.66:1.000:0.887 0/0/1/1:4:131,125:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,165:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,133:0.47:-0.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:167,150:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,206:0.71:-0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:158,144:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:268,87:0.27: 0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:154,129:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:263,64:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,148:0.46: 0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:151,152:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:95,242:0.73: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:152,164:0.54:-0.02:1.000:0.988 0/0/1/1:4:161,143:0.49:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,66:0.29:-0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:123,131:0.54:-0.88:1.000:0.989 0/0/0/1:4:233,63:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:298,3:0.01:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,110:0.54:-1.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:176,132:0.45:-0.13:1.000:0.981 0/1/1/1:4:87,247:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:206,181:0.49: 0.97:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,304:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,202:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,124:0.53:-1.02:1.000:0.992 0/0/0/0:4:306,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,184:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,243:0.77: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,143:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,140:0.70:-1.59:1.000:0.987 0/1/1/1:4:119,352:0.76: 2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,219:0.51: 1.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:95,234:0.72: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:102,273:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:227,192:0.48: 1.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:163,136:0.48:-0.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:98,276:0.75: 0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:102,241:0.71: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:63,31:0.35:-3.11:1.000:0.775 0/1/1/1:4:63,192:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,168:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,199:0.51: 1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:229,209:0.50: 1.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:178,151:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,199:0.78:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:331,95:0.24: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,150:0.48: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:247,76:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,125:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:178,126:0.44:-0.19:1.000:0.962 0/0/1/1:4:163,125:0.46:-0.41:1.000:0.986 0/1/1/1:4:83,255:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,111:0.46:-0.87:1.000:0.986 0/0/1/1:4:173,178:0.53: 0.47:0.999:0.993 0/0/1/1:4:157,159:0.53:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:148,161:0.54:-0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:186,164:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:230,59:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,147:0.54:-0.48:1.000:0.987 0/0/0/1:4:247,76:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:190,49:0.22:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,187:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,91:0.25: 1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,231:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:191,177:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,141:0.47:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:189,167:0.49: 0.54:0.999:0.996 0/1/1/1:4:100,271:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:338,120:0.28: 1.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:178,131:0.45:-0.12:1.000:0.976 0/0/1/1:4:184,179:0.52: 0.63:1.000:0.996 -chr7.1 57829076 chr7.1_057829076 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:121,257:0.66: 0.53:1.000:0.841 0/0/0/1:4:218,67:0.27:-0.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:257,83:0.28:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:100,248:0.68: 0.11:1.000:0.950 0/0/0/1:4:361,87:0.22: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,77:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,82:0.43:-1.81:1.000:0.943 0/0/0/1:4:283,86:0.26: 0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:173,137:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,118:0.63:-2.20:1.000:0.583 0/0/1/1:4:119,115:0.52:-1.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:189,143:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:269,78:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,220:0.64:-0.10:1.000:0.718 0/0/1/1:4:171,126:0.47:-0.61:1.000:0.991 0/0/0/1:4:257,70:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,160:0.49: 0.25:0.999:0.996 0/0/0/1:4:242,80:0.28:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:261,195:0.47: 1.61:1.000:0.992 0/1/1/1:4:108,287:0.69: 0.76:1.000:0.971 0/0/1/1:4:98,83:0.50:-2.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,140:0.43: 0.26:1.000:0.947 0/0/1/1:4:232,188:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:203,132:0.43:-0.07:1.000:0.957 0/0/1/1:4:146,75:0.38:-1.67:1.000:0.521 0/0/1/1:4:149,121:0.49:-0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:250,78:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:173,118:0.45:-0.69:1.000:0.976 0/0/0/1:4:386,114:0.26: 2.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,159:0.54:-0.40:1.000:0.989 0/0/1/1:4:127,82:0.43:-1.83:1.000:0.953 0/0/1/1:4:89,87:0.53:-2.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,119:0.75:-2.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,79:0.48:-2.25:1.000:0.996 0/0/1:3:130,24:0.18:-2.60:1.000:0.983 0/0/1/1:4:142,149:0.54:-0.69:1.000:0.988 0/0/0/1:4:271,84:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:116,251:0.66: 0.37:1.000:0.861 0/0/0/0:4:353,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,150:0.52:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,233:0.66:-0.03:1.000:0.884 0/0/0/1:4:278,80:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:328,74:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,125:0.48:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:285,212:0.47: 2.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:198,145:0.46: 0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:251,184:0.47: 1.32:0.807:0.990 0/1/1/1:4:91,202:0.66:-0.66:1.000:0.885 0/0/1/1:4:162,113:0.45:-0.91:1.000:0.982 0/1/1/1:4:57,147:0.68:-1.90:1.000:0.963 0/0/1/1:4:178,158:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:104,225:0.66:-0.16:1.000:0.861 0/0/0/1:4:294,64:0.20: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,112:0.30: 1.06:1.000:0.984 0/0/0/1:4:288,64:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,78:0.27:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:206,159:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:185,164:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,150:0.51:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:149,175:0.56:-0.23:1.000:0.687 0/1/1/1:4:112,285:0.68: 0.79:1.000:0.959 0/0/0/1:4:222,71:0.27:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:251,218:0.51: 1.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,242:0.70:-0.21:1.000:0.986 0/1/1/1:4:112,287:0.68: 0.82:1.000:0.961 0/0/0/0:4:332,1:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:215,152:0.46: 0.37:1.000:0.985 0/0/0/1:4:292,88:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,265:0.69: 0.36:0.978:0.968 0/0/0/1:4:294,81:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:349,100:0.25: 1.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,145:0.67:-1.87:0.999:0.931 0/0/0/1:4:310,77:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,161:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,90:0.29: 0.15:1.000:0.993 0/0/0/0:4:275,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,75:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:322,89:0.25: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,198:0.66:-0.69:1.000:0.844 0/0/0/1:4:296,73:0.22: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:258,79:0.26:-0.05:0.988:0.998 0/0/1/1:4:179,151:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:337,97:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,158:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,126:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:311,88:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:218,65:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:269,83:0.27: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:173,145:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:151,130:0.50:-0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,131:0.53:-1.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:146,152:0.54:-0.59:1.000:0.989 0/0/0/1:4:302,79:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,134:0.48:-0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:182,163:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:87,203:0.67:-0.70:1.000:0.921 0/0/1/1:4:196,131:0.44:-0.19:1.000:0.969 0/0/0/0:4:352,2:0.01: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:315,95:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:322,83:0.23: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:322,79:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:312,99:0.27: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,138:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:347,185:0.39: 2.67:0.951:0.968 0/0/1/1:4:179,139:0.48:-0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:152,117:0.48:-1.00:1.000:0.994 0/0/0/1:4:198,57:0.25:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:176,144:0.49:-0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:136,302:0.66: 1.36:1.000:0.885 0/1/1/1:4:89,210:0.67:-0.58:1.000:0.927 0/0/1/1:4:186,153:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:352,104:0.26: 1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:307,103:0.28: 0.97:0.999:0.995 0/0/1/1:4:210,228:0.55: 1.36:1.000:0.984 0/0/0/1:4:159,33:0.19:-2.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:218,180:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,172:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:287,72:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,154:0.47: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:177,159:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:196,166:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:288,66:0.21: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:401,1:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,170:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:199,147:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:279,70:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,164:0.45: 0.86:1.000:0.979 0/0/0/1:4:231,64:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:219,56:0.23:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,107:0.42:-0.79:1.000:0.897 0/0/1/1:4:147,116:0.48:-1.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,77:0.26: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,106:0.53:-1.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:189,53:0.25:-1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:224,64:0.25:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,148:0.43: 0.50:1.000:0.956 0/0/1/1:4:176,152:0.51:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:284,71:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,126:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:287,66:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,174:0.51: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:297,81:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,77:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,50:0.20:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:149,348:0.67: 2.19:1.000:0.921 0/0/0/1:4:383,96:0.23: 1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:145,274:0.64: 1.10:1.000:0.664 0/0/0/1:4:290,65:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:322,93:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:258,80:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:376,84:0.21: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:299,76:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,106:0.48:-1.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,124:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:271,72:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:291,102:0.29: 0.73:1.000:0.991 0/0/0/1:4:398,108:0.24: 2.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,207:0.52: 1.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,238:0.69:-0.20:1.000:0.975 0/0/0/0:4:430,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,137:0.46:-0.17:1.000:0.987 0/0/0/0:4:260,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:296,65:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,158:0.46: 0.58:1.000:0.984 0/0/1/1:4:118,87:0.47:-1.89:1.000:0.991 0/0/0/1:4:241,68:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:243,78:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:289,70:0.22: 0.26:0.999:1.000 0/0/0/1:4:269,84:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,229:0.66:-0.09:1.000:0.869 0/0/1/1:4:190,159:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,89:0.47:-1.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:199,128:0.43:-0.19:1.000:0.951 0/0/1/1:4:194,138:0.46:-0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:171,128:0.47:-0.58:1.000:0.992 0/0/0/1:4:264,80:0.26: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:287,73:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,154:0.46: 0.41:1.000:0.986 0/0/1/1:4:155,131:0.50:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,115:0.41:-0.44:1.000:0.871 0/0/0/1:4:289,93:0.27: 0.58:0.999:0.997 0/0/0/1:4:382,78:0.19: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:306,212:0.45: 2.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:164,117:0.46:-0.83:1.000:0.986 0/0/0/1:4:328,85:0.23: 1.01:1.000:1.000 -chr7.1 58300056 chr7.1_058300056 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:118,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:154,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.75:0.807:. ./.:4:14,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.53:1.000:. ./.:6:79,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.00:0.978:. ./.:4:132,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.42:0.999:. ./.:4:134,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.01:0.984:. ./.:4:137,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:91,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:5:135,0:.: 1.27:0.951:. ./.:4:106,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.58:0.999:. ./.:4:138,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.40:0.999:. ./.:4:68,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:57,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.20:0.999:. ./.:4:109,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:165,0:.: 2.25:1.000:. -chr7.1 58785641 chr7.1_058785641 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:202,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.63:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:187,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.91:1.000:. ./.:3:9,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.47:0.807:. ./.:4:39,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.43:1.000:. ./.:6:120,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.15:0.978:. ./.:4:184,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.57:0.999:. ./.:4:218,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.72:0.984:. ./.:4:192,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:147,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:182,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:299,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.87:1.000:. ./.:5:258,0:.: 1.82:0.951:. ./.:4:124,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:166,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:236,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:272,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:174,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:212,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.68:1.000:. -chr7.1 59221510 chr7.1_059221510 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:176,22:.: 2.59:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:147,25:.: 2.02:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:101,26:.: 1.03:1.000:. ./.:4:117,33:.: 1.54:1.000:. ./.:4:133,19:.: 1.58:0.999:. ./.:4:111,31:.: 1.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:137,26:.: 1.82:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:152,23:.: 2.09:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,27:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,4:.:-1.31:1.000:. ./.:3:5,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:122,34:.: 1.67:1.000:. ./.:4:152,17:.: 1.95:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:110,13:.: 0.95:1.000:. ./.:4:133,26:.: 1.74:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.15:0.807:. ./.:4:2,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:148,19:.: 1.91:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:100,17:.: 0.81:1.000:. ./.:4:111,12:.: 0.95:1.000:. ./.:6:27,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:118,8:.: 1.01:1.000:. ./.:4:126,16:.: 1.36:1.000:. ./.:4:158,13:.: 2.00:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.10:0.978:. ./.:4:53,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.90:0.999:. ./.:4:61,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:105,12:.: 0.81:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:103,19:.: 0.92:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.83:0.984:. ./.:4:107,10:.: 0.81:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,35:.: 1.27:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.40:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:111,6:.: 0.81:1.000:. ./.:4:118,9:.: 1.03:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:117,15:.: 1.14:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,11:.: 0.64:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:87,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,24:.: 1.47:1.000:. ./.:4:70,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.31:1.000:. ./.:5:73,0:.:-0.15:0.951:. ./.:4:52,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:109,18:.: 1.03:1.000:. ./.:4:140,30:.: 1.98:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.74:0.999:. ./.:4:106,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:83,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:129,15:.: 1.41:1.000:. ./.:4:143,25:.: 1.93:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:109,12:.: 0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:83,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:173,41:.: 2.94:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:65,12:.:-0.06:1.000:. ./.:4:115,13:.: 1.06:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:73,15:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:89,15:.: 0.53:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:86,30:.: 0.79:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:133,32:.: 1.87:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:100,31:.: 1.12:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:123,30:.: 1.60:1.000:. ./.:4:157,42:.: 2.61:1.000:. ./.:4:89,20:.: 0.64:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:74,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:105,11:.: 0.79:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:185,27:.: 2.90:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:114,24:.: 1.27:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:84,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.55:1.000:. -chr7.1 59455194 chr7.1_059455194 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:25,118:.: 1.00:1.000:. ./.:4:35,45:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,103:.: 0.53:1.000:. ./.:4:28,95:.: 0.45:1.000:. ./.:4:41,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,71:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,81:.:-0.59:1.000:. ./.:4:19,61:.:-0.73:1.000:. ./.:4:27,95:.: 0.42:1.000:. ./.:4:2,7:.:-2.67:1.000:. ./.:4:2,15:.:-2.45:1.000:. ./.:4:36,80:.: 0.26:1.000:. ./.:4:38,114:.: 1.25:1.000:. ./.:4:34,60:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,84:.: 0.78:1.000:. ./.:4:26,65:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,47:.:-0.15:0.999:. ./.:4:53,106:.: 1.44:1.000:. ./.:4:31,81:.: 0.15:1.000:. ./.:4:30,150:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,17:.:-2.45:1.000:. ./.:4:19,128:.: 1.11:1.000:. ./.:4:33,103:.: 0.81:1.000:. ./.:4:10,114:.: 0.48:1.000:. ./.:4:2,9:.:-2.62:1.000:. ./.:4:23,61:.:-0.62:1.000:. ./.:4:15,99:.: 0.20:1.000:. ./.:4:19,150:.: 1.71:1.000:. ./.:4:41,96:.: 0.83:1.000:. ./.:4:15,139:.: 1.30:1.000:. ./.:4:21,92:.: 0.18:1.000:. ./.:4:31,122:.: 1.27:1.000:. ./.:4:5,10:.:-2.51:1.000:. ./.:4:6,6:.:-2.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,122:.: 1.38:1.000:. ./.:4:27,59:.:-0.56:1.000:. ./.:4:44,68:.: 0.15:1.000:. ./.:4:20,77:.:-0.26:1.000:. ./.:4:26,66:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,51:.:-0.64:1.000:. ./.:4:22,100:.: 0.42:1.000:. ./.:4:14,99:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,117:.: 0.62:1.000:. ./.:4:23,83:.:-0.01:1.000:. ./.:4:24,94:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,123:.: 1.63:0.807:. ./.:4:11,18:.:-2.12:1.000:. ./.:4:6,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:17,41:.:-1.33:1.000:. ./.:4:21,51:.:-0.95:1.000:. ./.:4:40,82:.: 0.42:1.000:. ./.:4:26,49:.:-0.86:1.000:. ./.:4:10,112:.: 0.42:1.000:. ./.:4:14,85:.:-0.21:1.000:. ./.:4:10,71:.:-0.70:1.000:. ./.:4:19,103:.: 0.42:1.000:. ./.:4:21,77:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,51:.:-0.67:1.000:. ./.:6:23,61:.:-0.62:1.000:. ./.:4:33,91:.: 0.48:1.000:. ./.:4:23,103:.: 0.53:1.000:. ./.:4:20,58:.:-0.78:1.000:. ./.:4:32,71:.:-0.10:1.000:. ./.:4:22,117:.: 0.89:1.000:. ./.:4:23,80:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,33:.:-1.66:1.000:. ./.:4:29,113:.: 0.97:1.000:. ./.:4:23,85:.: 0.04:0.978:. ./.:4:34,114:.: 1.14:1.000:. ./.:4:23,70:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,22:.:-2.15:0.999:. ./.:4:14,104:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,107:.: 0.59:1.000:. ./.:4:28,85:.: 0.18:1.000:. ./.:4:18,57:.:-0.86:1.000:. ./.:4:23,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,78:.:-0.18:1.000:. ./.:4:19,99:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,98:.: 0.34:1.000:. ./.:4:32,82:.: 0.20:0.984:. ./.:4:20,118:.: 0.86:1.000:. ./.:4:29,119:.: 1.14:1.000:. ./.:4:30,77:.: 0.01:1.000:. ./.:4:11,59:.:-1.00:1.000:. ./.:4:18,125:.: 1.00:1.000:. ./.:4:13,41:.:-1.44:1.000:. ./.:4:16,69:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,75:.:-0.45:1.000:. ./.:4:32,103:.: 0.78:1.000:. ./.:4:15,67:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,27:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,85:.: 0.01:1.000:. ./.:4:20,74:.:-0.34:1.000:. ./.:4:7,109:.: 0.26:1.000:. ./.:4:25,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:33,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:17,83:.:-0.18:1.000:. ./.:4:17,83:.:-0.18:1.000:. ./.:4:22,72:.:-0.34:1.000:. ./.:4:12,15:.:-2.18:1.000:. ./.:4:30,58:.:-0.51:1.000:. ./.:4:12,80:.:-0.40:1.000:. ./.:5:21,88:.: 0.07:0.951:. ./.:4:20,38:.:-1.33:1.000:. ./.:4:19,103:.: 0.42:1.000:. ./.:4:27,87:.: 0.20:1.000:. ./.:4:38,72:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,121:.: 1.27:1.000:. ./.:4:29,68:.:-0.26:1.000:. ./.:4:14,46:.:-1.27:1.000:. ./.:4:49,130:.: 1.99:1.000:. ./.:4:25,100:.: 0.51:0.999:. ./.:4:11,132:.: 1.00:1.000:. ./.:4:9,26:.:-1.96:1.000:. ./.:4:8,123:.: 0.67:1.000:. ./.:4:15,55:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,40:.:-1.49:1.000:. ./.:4:21,60:.:-0.70:1.000:. ./.:4:13,120:.: 0.73:1.000:. ./.:4:11,80:.:-0.43:1.000:. ./.:4:25,29:.:-1.44:1.000:. ./.:4:25,77:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,158:.: 2.48:1.000:. ./.:4:11,89:.:-0.18:1.000:. ./.:4:14,77:.:-0.43:1.000:. ./.:4:6,98:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:15,62:.:-0.81:1.000:. ./.:4:16,81:.:-0.26:1.000:. ./.:4:29,59:.:-0.51:1.000:. ./.:4:54,90:.: 1.03:1.000:. ./.:4:8,59:.:-1.08:1.000:. ./.:4:14,40:.:-1.44:1.000:. ./.:4:19,102:.: 0.40:1.000:. ./.:4:15,134:.: 1.16:1.000:. ./.:4:16,136:.: 1.25:1.000:. ./.:4:15,81:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,76:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,57:.:-0.59:1.000:. ./.:4:6,114:.: 0.37:1.000:. ./.:4:4,102:.:-0.01:1.000:. ./.:4:30,79:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,78:.:-0.26:1.000:. ./.:4:23,106:.: 0.62:1.000:. ./.:4:56,36:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,113:.: 0.73:1.000:. ./.:4:22,115:.: 0.83:1.000:. ./.:4:14,114:.: 0.59:1.000:. ./.:4:30,40:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,146:.: 1.85:1.000:. ./.:4:29,133:.: 1.52:1.000:. ./.:4:4,13:.:-2.45:1.000:. ./.:4:31,58:.:-0.48:1.000:. ./.:4:10,106:.: 0.26:1.000:. ./.:4:11,118:.: 0.62:1.000:. ./.:4:14,113:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,126:.: 0.94:1.000:. ./.:4:24,121:.: 1.05:1.000:. ./.:4:24,77:.:-0.15:1.000:. ./.:4:29,94:.: 0.45:1.000:. ./.:4:27,58:.:-0.59:1.000:. ./.:4:10,112:.: 0.42:1.000:. ./.:4:42,120:.: 1.52:1.000:. ./.:4:9,60:.:-1.03:1.000:. ./.:4:10,137:.: 1.11:1.000:. ./.:4:34,65:.:-0.21:1.000:. ./.:4:43,124:.: 1.66:0.999:. ./.:4:9,115:.: 0.48:1.000:. ./.:4:45,70:.: 0.23:1.000:. ./.:4:30,104:.: 0.75:1.000:. ./.:4:24,49:.:-0.92:1.000:. ./.:4:18,93:.: 0.12:1.000:. ./.:4:30,68:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,26:.:-1.25:1.000:. ./.:4:20,144:.: 1.57:1.000:. ./.:4:29,126:.: 1.33:1.000:. ./.:4:34,89:.: 0.45:1.000:. ./.:4:40,114:.: 1.30:1.000:. ./.:4:41,66:.: 0.01:1.000:. ./.:4:19,103:.: 0.42:0.999:. ./.:4:23,130:.: 1.27:1.000:. ./.:4:20,114:.: 0.75:1.000:. ./.:4:13,87:.:-0.18:1.000:. ./.:4:46,125:.: 1.77:1.000:. -chr7.1 59723838 chr7.1_059723838 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:62,128:0.71: 0.65:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,131:0.76: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,127:0.73: 0.50:1.000:0.998 0/1/1/1:4:64,108:0.66: 0.26:1.000:0.889 0/0/0/1:4:199,71:0.28: 2.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,190:0.78: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,33:0.36:-1.35:1.000:0.666 0/1/1/1:4:51,155:0.78: 0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,80:0.46: 0.54:1.000:0.988 0/1/1/1:4:16,35:0.72:-2.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,16:0.38:-2.47:1.000:0.549 0/0/1/1:4:101,86:0.49: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:152,25:0.16: 0.37:1.000:0.993 0/1/1/1:4:52,129:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,81:0.43: 0.93:1.000:0.933 0/0/0/1:4:210,65:0.25: 2.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,190:0.79: 1.96:0.999:1.000 0/1/1/1:4:67,151:0.73: 1.25:1.000:0.998 1/1/1/1:4:2,193:0.99: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,134:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.27:-2.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:95,48:0.36:-0.36:1.000:0.722 0/0/1/1:4:119,82:0.44: 0.89:1.000:0.958 0/0/0/1:4:107,50:0.34:-0.06:1.000:0.879 0/1/1/1:4:10,23:0.73:-2.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:122,99:0.48: 1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,146:0.70: 1.30:1.000:0.985 0/0/1/1:4:102,59:0.39: 0.03:1.000:0.694 0/1/1/1:4:61,117:0.69: 0.39:1.000:0.978 0/0/0/1:4:139,61:0.32: 0.87:1.000:0.943 0/0/1/1:4:131,102:0.47: 1.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:120,49:0.31: 0.20:1.000:0.977 0/0/1/1:4:10,9:0.51:-3.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,34:0.58:-2.10:1.000:0.906 0/0/1:3:11,8:0.45:-3.02:1.000:0.968 0/0/0/1:4:98,45:0.33:-0.36:1.000:0.901 0/0/0/1:4:139,64:0.33: 0.93:1.000:0.898 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,93:0.44: 1.38:1.000:0.971 0/0/1/1:4:154,85:0.38: 1.70:1.000:0.551 0/1/1/1:4:44,149:0.80: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,96:0.68:-0.25:1.000:0.964 0/0/1/1:4:58,77:0.60:-0.53:1.000:0.750 0/0/0/1:4:101,31:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,86:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,71:0.40: 0.61:1.000:0.810 0/0/1/1:4:115,91:0.47: 0.99:0.807:0.993 0/0/1/1:4:33,39:0.58:-1.89:1.000:0.932 0/0/0/1:4:96,45:0.34:-0.40:1.000:0.874 0/0/1/1:4:49,69:0.62:-0.90:1.000:0.580 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,153:0.73: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:130,53:0.31: 0.50:1.000:0.977 0/1/1/1:4:59,115:0.70: 0.31:1.000:0.982 0/1/1/1:4:57,125:0.72: 0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,89:0.67:-0.40:1.000:0.906 0/0/1/1:4:112,94:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,43:0.34:-0.51:1.000:0.893 0/0/1/1:4:99,85:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:41,90:0.72:-0.62:1.000:0.736 0/1/1/1:4:52,104:0.70:-0.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:54,114:0.72: 0.18:1.000:0.994 1/1/1/1:4:1,164:0.99: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,100:0.70:-0.19:1.000:0.984 0/1/1/1:4:46,115:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,52:0.32: 0.31:1.000:0.960 0/0/0/1:4:52,27:0.36:-1.74:1.000:0.645 0/0/0/1:4:147,24:0.16: 0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,81:0.65:-0.62:0.978:0.822 0/1/1/1:4:53,103:0.70:-0.08:1.000:0.982 0/1/1/1:4:51,91:0.68:-0.38:1.000:0.944 0/1/1/1:4:27,79:0.78:-1.15:0.999:1.000 0/0/1/1:4:59,78:0.60:-0.49:1.000:0.760 0/0/1/1:4:125,82:0.42: 1.02:1.000:0.923 0/1/1/1:4:50,96:0.69:-0.29:1.000:0.978 0/0/1/1:4:90,67:0.46:-0.06:1.000:0.984 0/1/1/1:4:29,105:0.81:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,95:0.65:-0.12:1.000:0.810 0/1/1/1:4:54,116:0.72: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,107:0.66: 0.26:1.000:0.851 0/1/1/1:4:44,77:0.67:-0.83:0.984:0.929 0/0/0/1:4:113,43:0.29:-0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:44,93:0.72:-0.49:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,75:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,63:0.55:-0.83:1.000:0.976 0/0/0/1:4:129,41:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,19:0.16:-0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:85,75:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,46:0.34:-0.38:1.000:0.839 0/0/1/1:4:66,51:0.47:-0.92:1.000:0.990 0/0/1/1:4:94,127:0.61: 1.32:1.000:0.704 0/1/1/1:4:55,151:0.77: 0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,40:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,88:0.66:-0.40:1.000:0.865 0/0/1/1:4:64,44:0.43:-1.11:1.000:0.957 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,94:0.65:-0.12:1.000:0.748 0/1/1/1:4:54,126:0.74: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,49:0.74:-1.93:1.000:0.998 0/1/1/1:4:57,114:0.70: 0.24:1.000:0.987 0/0/1/1:4:68,38:0.38:-1.15:1.000:0.591 0/0/1/1/1:5:88,107:0.58: 0.76:0.951:0.960 0/1/1/1:4:64,97:0.64: 0.03:1.000:0.657 0/0/1/1:4:99,71:0.45: 0.22:1.000:0.975 0/0/1/1:4:67,78:0.57:-0.32:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,134:0.72: 0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,123:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,73:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,68:0.32: 1.40:1.000:0.951 0/1/1/1:4:48,96:0.70:-0.34:0.999:0.987 0/0/0/1:4:101,49:0.35:-0.21:1.000:0.816 0/1/1/1:4:47,87:0.69:-0.55:1.000:0.965 0/0/0/1:4:101,47:0.34:-0.25:1.000:0.884 0/0/1/1:4:59,52:0.50:-1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,116:0.80:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,135:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,35:0.31:-0.85:1.000:0.974 0/0/1/1:4:125,79:0.41: 0.95:1.000:0.880 0/1/1/1:4:44,125:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,62:0.43:-0.10:1.000:0.937 0/0/0/1:4:120,49:0.31: 0.20:1.000:0.977 0/0/0/1:4:88,46:0.37:-0.55:1.000:0.625 0/1/1/1:4:48,96:0.70:-0.34:1.000:0.987 0/0/0/1:4:117,38:0.26:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,78:0.63:-0.64:1.000:0.625 0/0/0/1:4:117,17:0.14:-0.55:1.000:0.974 0/0/0/1:4:91,49:0.37:-0.42:1.000:0.530 0/0/1/1:4:95,75:0.47: 0.22:1.000:0.993 0/0/0/1:4:182,56:0.25: 1.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,21:0.23:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,87:0.61:-0.21:1.000:0.641 0/1/1/1:4:54,79:0.63:-0.57:1.000:0.545 0/0/1/1:4:143,78:0.38: 1.32:1.000:0.512 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,37:0.50:-1.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,75:0.53:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:129,40:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,38:0.32:-0.70:1.000:0.959 0/1/1/1:4:41,64:0.64:-1.18:1.000:0.739 0/1/1/1:4:50,100:0.70:-0.21:1.000:0.987 0/0/1/1:4:47,44:0.52:-1.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,132:0.68: 0.99:1.000:0.944 0/1/1/1:4:56,176:0.79: 1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,124:0.73: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,93:0.70:-0.40:1.000:0.981 0/1/1/1:4:84,156:0.69: 1.73:1.000:0.967 0/1/1/1:4:65,143:0.72: 1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,140:0.72: 0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,101:0.71:-0.19:1.000:0.989 0/0/0/1:4:23,8:0.27:-2.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,103:0.68: 0.03:1.000:0.941 0/1/1/1:4:57,98:0.67:-0.10:1.000:0.911 0/1/1/1:4:60,106:0.67: 0.14:1.000:0.937 0/0/0/1:4:120,45:0.29: 0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,94:0.72:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,92:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,69:0.44: 0.18:1.000:0.964 0/0/1/1:4:110,80:0.45: 0.65:1.000:0.979 0/1/1/1:4:46,96:0.71:-0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:106,79:0.46: 0.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:144,52:0.28: 0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,79:0.54:-0.10:1.000:0.986 0/1/1/1:4:43,131:0.78: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,108:0.76:-0.25:0.999:1.000 0/1/1/1:4:35,106:0.78:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,143:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,75:0.45: 0.39:1.000:0.979 0/0/1/1:4:79,89:0.56: 0.18:1.000:0.962 0/0/1/1:4:89,79:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,126:0.60: 1.34:1.000:0.777 0/0/1/1:4:99,93:0.52: 0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:55,80:0.63:-0.53:1.000:0.526 0/0/0/1:4:199,37:0.17: 1.64:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,89:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,66:0.44: 0.01:1.000:0.967 0/1/1/1:4:50,100:0.70:-0.21:0.999:0.987 0/0/1/1:4:66,91:0.61:-0.06:1.000:0.646 0/0/1/1:4:137,104:0.46: 1.75:1.000:0.988 0/0/1/1:4:83,58:0.44:-0.40:1.000:0.965 0/1/1/1:4:61,132:0.72: 0.72:1.000:0.996 -chr7.1 59942925 chr7.1_059942925 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:210,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:37,1:.:-2.30:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:240,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.20:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.97:0.807:. ./.:4:82,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.84:1.000:. ./.:6:106,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.27:0.978:. ./.:4:191,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.11:0.999:. ./.:4:160,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.56:0.984:. ./.:4:119,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:134,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.97:1.000:. ./.:5:171,0:.: 0.29:0.951:. ./.:4:126,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:155,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:102,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:263,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.88:0.999:. ./.:4:191,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.99:0.999:. ./.:4:269,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:281,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.36:1.000:. -chr7.1 61039610 chr7.1_061039610 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:35,14:0.29:-0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:10,17:0.61:-1.56:1.000:0.692 0/0/1/1:4:22,28:0.55:-0.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:28,10:0.27:-0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,41:0.49: 2.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,21:0.54:-0.86:1.000:0.988 0/0/0/1:4:12,7:0.37:-2.08:1.000:0.614 0/0/1/1:4:17,27:0.60:-0.47:1.000:0.828 0/0/0/1:4:26,14:0.35:-0.73:1.000:0.805 0/0/0/1:4:19,9:0.32:-1.50:1.000:0.950 0/0/0/1:4:12,5:0.30:-2.20:1.000:0.989 0/0/1/1:4:21,20:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,19:0.39:-0.22:1.000:0.715 0/0/0/1:4:31,18:0.37:-0.15:1.000:0.627 0/0/1/1:4:29,18:0.38:-0.28:1.000:0.568 0/0/1/1:4:16,21:0.55:-0.92:1.000:0.976 0/1/1/1:4:13,32:0.68:-0.41:0.999:0.964 0/0/1/1:4:20,15:0.42:-1.05:1.000:0.926 0/0/1/1:4:26,31:0.53: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:44,16:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,16:0.49:-1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,6:0.15:-0.73:1.000:0.992 0/0/0/1:4:42,18:0.30: 0.55:1.000:0.984 0/0/0/1:4:29,9:0.24:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,17:0.83:-2.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,13:0.46:-1.50:1.000:0.986 0/0/1/1:4:24,16:0.40:-0.73:1.000:0.755 0/0/0/1:4:22,8:0.27:-1.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,41:0.74: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,7:0.20:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.16:-1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,11:0.49:-1.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,12:0.72:-2.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,21:0.48:-0.54:1.000:0.995 0/0/1:3:4,4:0.49:-2.78:1.000:0.645 0/0/0/1:4:25,15:0.37:-0.73:1.000:0.533 0/0/0/1:4:16,6:0.28:-1.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,25:0.58:-0.60:1.000:0.920 0/0/1/1:4:20,24:0.53:-0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:18,15:0.45:-1.18:1.000:0.978 0/0/0/1:4:59,12:0.17: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,28:0.53: 0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,23:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:27,13:0.32:-0.73:1.000:0.940 0/0/0/1:4:48,18:0.28: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:61,12:0.17: 1.39:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,15:0.25: 0.68:0.807:1.000 0/0/0/1:4:19,6:0.24:-1.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,13:0.31:-0.60:1.000:0.973 0/0/0/1:4:33,7:0.18:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,28:0.55:-0.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:38,13:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,24:0.49:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,50:0.52: 2.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,26:0.54:-0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:33,25:0.43: 0.43:1.000:0.934 0/0/0/1:4:44,17:0.28: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:27,39:0.57: 0.94:1.000:0.934 0/0/1/1:4:28,31:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:39,24:0.38: 0.75:1.000:0.794 0/0/0/1:4:66,14:0.18: 1.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,24:0.63:-0.92:1.000:0.529 0/0/1/1:4:31,32:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,19:0.25: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,18:0.25: 1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,43:0.71: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:25,27:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,31:0.53: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:39,17:0.30: 0.30:0.978:0.981 0/1/1/1:4:10,50:0.81: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,39:0.54: 1.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:25,14:0.36:-0.79:0.999:0.721 0/1/1/1:4:12,24:0.64:-0.98:1.000:0.732 0/0/1/1:4:22,16:0.42:-0.86:1.000:0.897 0/1/1/1:4:16,36:0.67: 0.04:1.000:0.909 0/1/1/1:4:14,31:0.66:-0.41:1.000:0.894 0/0/1/1:4:27,26:0.48: 0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,59:0.74: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,19:0.27: 1.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,30:0.57:-0.02:1.000:0.941 0/1/1/1:4:10,40:0.77:-0.09:0.984:1.000 0/0/1/1:4:38,41:0.51: 1.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,32:0.48: 0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,26:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,22:0.46:-0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:26,27:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,24:0.54:-0.54:1.000:0.985 0/0/1/1:4:29,24:0.45: 0.11:1.000:0.976 0/0/0/1:4:43,15:0.26: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,25:0.43: 0.36:1.000:0.953 0/0/0/1:4:21,12:0.36:-1.18:1.000:0.671 0/0/1/1:4:25,18:0.41:-0.54:1.000:0.885 0/0/1/1:4:31,46:0.58: 1.64:1.000:0.912 0/0/1/1:4:22,24:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,20:0.30: 0.94:1.000:0.981 0/0/0/1:4:55,18:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,28:0.41: 1.07:1.000:0.846 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,51:0.60: 1.97:1.000:0.764 0/1/1/1:4:18,40:0.66: 0.43:1.000:0.897 0/1/1/1:4:5,29:0.83:-1.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,41:0.63: 0.75:1.000:0.555 0/0/0/1:4:48,15:0.24: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:64,44:0.40: 3.63:0.951:0.970 0/0/0/1:4:31,17:0.35:-0.22:1.000:0.769 0/0/0/1:4:48,10:0.18: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,27:0.47: 0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:20,24:0.53:-0.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:42,16:0.28: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,15:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,37:0.57: 0.75:1.000:0.943 0/1/1/1:4:12,45:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,32:0.39: 1.90:0.999:0.707 0/0/0/1:4:42,20:0.32: 0.68:1.000:0.947 0/0/1/1:4:20,22:0.51:-0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,16:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,14:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,25:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,35:0.55: 0.68:1.000:0.979 0/0/0/1:4:36,8:0.19:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,21:0.31: 1.00:1.000:0.967 0/0/1/1:4:20,35:0.62: 0.23:1.000:0.618 0/1/1/1:4:20,58:0.71: 1.71:1.000:0.994 0/0/1/1:4:26,31:0.53: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:45,19:0.30: 0.81:1.000:0.987 0/0/1/1:4:32,38:0.53: 1.20:1.000:0.992 0/0/0/1:4:57,17:0.23: 1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,44:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,30:0.48: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,11:0.21: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,32:0.56: 0.30:1.000:0.972 0/0/1/1:4:20,16:0.44:-0.98:1.000:0.964 0/0/0/1:4:27,5:0.16:-1.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,25:0.69:-1.05:1.000:0.969 0/1/1/1:4:10,30:0.72:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,9:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,28:0.55:-0.09:1.000:0.983 0/1/1/1:4:22,49:0.67: 1.26:1.000:0.900 0/0/0/1:4:52,9:0.15: 0.62:1.000:0.990 0/0/1/1:4:34,43:0.54: 1.64:1.000:0.984 0/0/1/1:4:35,22:0.38: 0.36:1.000:0.604 0/0/1/1:4:30,32:0.51: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,34:0.68:-0.22:1.000:0.959 0/1/1/1:4:9,51:0.83: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,16:0.23: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,45:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,23:0.42: 0.17:1.000:0.917 0/0/1/1:4:27,24:0.46:-0.02:1.000:0.989 0/0/1/1:4:26,36:0.57: 0.68:1.000:0.958 0/1/1/1:4:11,44:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,26:0.56:-0.41:1.000:0.963 0/0/1/1:4:14,20:0.57:-1.11:1.000:0.941 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:27,25:0.47: 0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,34:0.60: 0.23:1.000:0.795 0/0/1/1:4:17,31:0.62:-0.22:1.000:0.506 0/0/1/1:4:23,41:0.62: 0.81:1.000:0.569 0/0/0/1:4:28,10:0.27:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,9:0.18:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,38:0.73:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,29:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,18:0.75:-1.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,27:0.60:-0.47:1.000:0.828 0/0/0/1:4:40,17:0.30: 0.36:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,5:0.20:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,26:0.46: 0.30:1.000:0.986 0/0/1/1:4:20,18:0.47:-0.86:1.000:0.991 0/1/1/1:4:13,43:0.74: 0.30:0.999:0.998 0/0/1/1:4:19,25:0.55:-0.47:1.000:0.976 0/0/0/1:4:29,15:0.34:-0.47:1.000:0.869 0/0/0/1:4:38,14:0.27: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:19,9:0.32:-1.50:1.000:0.950 0/0/0/1:4:32,14:0.31:-0.34:1.000:0.980 0/0/0/1:4:34,13:0.28:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,26:0.53:-0.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,17:0.48:-1.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,25:0.51:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,41:0.50: 1.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:45,14:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,30:0.55: 0.11:1.000:0.978 0/0/1/1:4:24,22:0.47:-0.34:0.999:0.992 0/0/0/1:4:44,25:0.36: 1.13:1.000:0.685 0/0/0/1:4:39,18:0.32: 0.36:1.000:0.963 0/0/0/1:4:25,8:0.25:-1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,43:0.78: 0.11:1.000:1.000 -chr7.1 61562597 chr7.1_061562597 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:221,69:0.27: 1.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:180,39:0.20:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,135:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,92:0.44: 0.02:1.000:0.969 0/0/0/1:4:232,61:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,155:0.50: 1.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:137,29:0.20:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,117:0.48: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:175,69:0.31: 0.41:1.000:0.971 0/0/0/1:4:40,8:0.19:-2.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,47:0.50:-2.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:181,43:0.22: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,100:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:189,59:0.27: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:138,137:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:230,50:0.20: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,65:0.27: 0.97:0.999:0.998 0/0/1/1:4:166,134:0.47: 1.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:171,154:0.50: 1.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:240,63:0.24: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,1:0.01:-1.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,125:0.53: 0.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:74,178:0.68: 0.55:1.000:0.964 0/0/0/1:4:183,53:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,11:0.17:-2.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:245,65:0.24: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,63:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,126:0.46: 1.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:122,106:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:250,63:0.23: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:230,77:0.28: 1.48:1.000:0.995 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,46:0.50:-2.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1:3:38,10:0.24:-2.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,58:0.23: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,47:0.18: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,132:0.53: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,107:0.52:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,46:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,104:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,102:0.47: 0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:170,48:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,57:0.30:-0.19:1.000:0.983 0/0/0/1:4:190,46:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,182:0.68: 0.68:0.807:0.952 0/0/1/1:4:213,160:0.45: 2.60:1.000:0.983 0/0/0/1:4:152,63:0.32:-0.08:1.000:0.949 0/0/1/1:4:109,79:0.45:-0.54:1.000:0.975 0/0/1/1:4:82,87:0.53:-0.87:1.000:0.992 0/0/0/1:4:220,73:0.28: 1.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,38:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,66:0.31: 0.24:1.000:0.972 0/0/1/1:4:126,103:0.47: 0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:153,53:0.29:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:147,49:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:227,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:77,71:0.50:-1.22:1.000:0.889 0/0/1/1:4:96,93:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,153:0.68:-0.02:1.000:0.949 0/0/0/1:4:154,52:0.28:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,99:0.55:-0.61:1.000:0.980 0/0/0/1:4:178,62:0.29: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,109:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,108:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:106,90:0.48:-0.41:0.978:0.995 0/0/0/1:4:225,51:0.21: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,153:0.73:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:103,46:0.34:-1.21:0.999:0.887 0/0/0/1:4:202,48:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,111:0.46: 0.58:1.000:0.989 0/0/0/1:4:168,39:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,50:0.28:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,153:0.75:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,42:0.21: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,108:0.49: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,36:0.28:-1.29:0.984:0.996 0/0/0/1:4:170,36:0.20:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,95:0.48:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,103:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,110:0.53:-0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:110,35:0.27:-1.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,72:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,42:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,40:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,41:0.26:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,50:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,119:0.52: 0.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,102:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,60:0.31:-0.17:1.000:0.965 0/0/1/1:4:119,111:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,71:0.50:-1.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,68:0.44:-0.98:1.000:0.974 0/0/1/1:4:99,102:0.52:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/1:4:187,58:0.27: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,27:0.23:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,167:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,80:0.55:-1.19:1.000:0.984 0/0/0/1/1:5:117,80:0.43:-0.39:0.951:0.937 0/0/1/1:4:80,82:0.52:-0.98:1.000:0.994 0/0/0/1:4:145,45:0.27:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,85:0.53:-0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:135,110:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:183,123:0.43: 1.46:1.000:0.940 0/0/0/1:4:195,47:0.22: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,44:0.33:-1.24:1.000:0.929 0/0/1/1:4:195,154:0.47: 2.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,78:0.48:-0.83:0.999:0.995 0/0/0/1:4:163,56:0.29:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,64:0.46:-1.22:1.000:0.986 0/0/0/1:4:147,54:0.30:-0.32:1.000:0.987 0/1/1/1:4:28,99:0.74:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,74:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,50:0.32:-0.78:1.000:0.962 0/0/1/1:4:76,78:0.52:-1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:184,55:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,50:0.28:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,54:0.30:-0.30:1.000:0.988 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,35:0.24:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,173:0.71: 0.27:1.000:0.989 0/0/0/1:4:136,35:0.23:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,24:0.20:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,34:0.31:-1.67:1.000:0.976 0/1/1/1:4:32,135:0.77:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,69:0.30: 0.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:53,56:0.53:-1.89:1.000:0.992 0/0/0/0:4:251,1:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,46:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,163:0.50: 2.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,114:0.47: 0.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:124,26:0.20:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,85:0.52:-0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:143,52:0.30:-0.42:1.000:0.988 0/0/0/1:4:141,37:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,81:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,44:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,42:0.36:-1.61:1.000:0.646 0/0/0/1:4:227,80:0.29: 1.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:166,145:0.49: 1.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:207,69:0.28: 0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:77,137:0.63:-0.10:1.000:0.581 0/0/0/1:4:220,54:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,53:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,216:0.70: 1.34:1.000:0.983 0/1/1/1:4:84,178:0.66: 0.72:1.000:0.886 0/0/0/1:4:65,13:0.19:-2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,83:0.53:-0.98:1.000:0.993 0/0/0/1:4:231,62:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,53:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:248,59:0.22: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,117:0.47: 0.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:148,48:0.28:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,115:0.46: 0.77:1.000:0.987 0/0/0/1:4:174,40:0.21:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,104:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,57:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:74,169:0.68: 0.39:1.000:0.941 0/0/1/1:4:153,108:0.44: 0.70:1.000:0.966 0/0/1/1:4:138,123:0.49: 0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,129:0.65:-0.46:1.000:0.826 0/0/0/1:4:205,57:0.25: 0.72:0.999:0.999 0/0/0/1:4:188,52:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,47:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,98:0.46: 0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:109,93:0.48:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:118,119:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,93:0.46:-0.10:1.000:0.987 0/0/0/1:4:175,54:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:167,35:0.20:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,75:0.24: 2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,107:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:74,174:0.68: 0.48:1.000:0.955 0/0/0/1:4:207,54:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,138:0.51: 1.11:0.999:0.997 0/0/1/1:4:164,137:0.48: 1.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:273,69:0.23: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,87:0.46:-0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:211,49:0.22: 0.68:1.000:1.000 -chr7.1 61607194 chr7.1_061607194 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:6,2:.: 1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.: 3.05:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.94:0.999:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:8,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:6,3:.: 1.64:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:7,2:.: 1.64:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./.:6:2,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:8,2:.: 2.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,3:.: 1.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:8,2:.: 2.00:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:9,3:.: 2.70:0.984:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:8,3:.: 2.35:0.951:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:0.999:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,6:.: 3.05:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:7,1:.: 1.29:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,0:.: 0.23:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:4,1:.: 0.23:1.000:. -chr7.1 61907545 chr7.1_061907545 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:158,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.14:0.999:. ./.:4:153,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.86:1.000:. ./.:3:20,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:0.807:. ./.:4:224,0:.: 3.28:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.21:1.000:. ./.:6:91,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.83:0.978:. ./.:4:69,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.80:0.999:. ./.:4:45,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.08:0.984:. ./.:4:139,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.55:1.000:. ./.:5:112,0:.: 0.42:0.951:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:222,0:.: 3.22:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.06:0.999:. ./.:4:93,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:178,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:93,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.50:0.999:. ./.:4:81,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:187,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.29:1.000:. -chr7.1 62120252 chr7.1_062120252 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:639,248:.: 0.72:1.000:. ./.:4:543,192:.: 0.07:1.000:. ./.:4:606,99:.:-0.06:1.000:. ./.:4:624,282:.: 0.81:1.000:. ./.:4:767,162:.: 0.90:1.000:. ./.:4:894,143:.: 1.37:1.000:. ./.:4:474,174:.:-0.30:1.000:. ./.:4:702,137:.: 0.52:1.000:. ./.:4:724,122:.: 0.55:1.000:. ./.:4:105,19:.:-2.56:1.000:. ./.:4:133,62:.:-2.25:1.000:. ./.:4:509,356:.: 0.63:1.000:. ./.:4:573,243:.: 0.42:1.000:. ./.:4:858,123:.: 1.13:1.000:. ./.:4:596,254:.: 0.56:1.000:. ./.:4:907,140:.: 1.41:1.000:. ./.:4:811,119:.: 0.91:0.999:. ./.:4:465,192:.:-0.27:1.000:. ./.:4:960,176:.: 1.79:1.000:. ./.:4:834,336:.: 1.94:1.000:. ./.:4:116,61:.:-2.33:1.000:. ./.:4:591,216:.: 0.38:1.000:. ./.:4:794,307:.: 1.64:1.000:. ./.:4:601,259:.: 0.61:1.000:. ./.:4:93,23:.:-2.59:1.000:. ./.:4:527,216:.: 0.10:1.000:. ./.:4:891,113:.: 1.23:1.000:. ./.:4:592,262:.: 0.58:1.000:. ./.:4:759,320:.: 1.55:1.000:. ./.:4:629,273:.: 0.79:1.000:. ./.:4:671,100:.: 0.22:1.000:. ./.:4:455,188:.:-0.33:1.000:. ./.:4:74,43:.:-2.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:44,11:.:-2.85:1.000:. ./.:4:643,255:.: 0.77:1.000:. ./.:4:724,118:.: 0.53:1.000:. ./.:4:854,141:.: 1.19:1.000:. ./.:4:555,92:.:-0.31:1.000:. ./.:4:845,161:.: 1.23:1.000:. ./.:4:604,108:.:-0.03:1.000:. ./.:4:502,94:.:-0.53:1.000:. ./.:4:469,183:.:-0.29:1.000:. ./.:4:369,151:.:-0.85:1.000:. ./.:4:588,101:.:-0.13:1.000:. ./.:4:602,105:.:-0.05:1.000:. ./.:4:754,271:.: 1.32:0.807:. ./.:4:685,305:.: 1.17:1.000:. ./.:4:381,177:.:-0.69:1.000:. ./.:4:302,132:.:-1.22:1.000:. ./.:4:420,81:.:-0.94:1.000:. ./.:4:739,116:.: 0.59:1.000:. ./.:4:403,160:.:-0.67:1.000:. ./.:4:649,102:.: 0.14:1.000:. ./.:4:668,95:.: 0.19:1.000:. ./.:4:450,85:.:-0.79:1.000:. ./.:4:599,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:370,141:.:-0.89:1.000:. ./.:4:425,90:.:-0.88:1.000:. ./.:6:372,112:.:-1.01:1.000:. ./.:4:416,176:.:-0.54:1.000:. ./.:4:412,195:.:-0.48:1.000:. ./.:4:584,99:.:-0.15:1.000:. ./.:4:336,117:.:-1.14:1.000:. ./.:4:586,200:.: 0.29:1.000:. ./.:4:392,161:.:-0.71:1.000:. ./.:4:581,100:.:-0.16:1.000:. ./.:4:505,229:.: 0.07:1.000:. ./.:4:375,193:.:-0.65:0.978:. ./.:4:442,284:.: 0.03:1.000:. ./.:4:499,191:.:-0.12:1.000:. ./.:4:425,81:.:-0.91:0.999:. ./.:4:218,316:.:-0.79:1.000:. ./.:4:607,238:.: 0.54:1.000:. ./.:4:341,270:.:-0.46:1.000:. ./.:4:455,78:.:-0.80:1.000:. ./.:4:517,70:.:-0.57:1.000:. ./.:4:561,78:.:-0.34:1.000:. ./.:4:396,163:.:-0.69:1.000:. ./.:4:601,102:.:-0.07:1.000:. ./.:4:290,188:.:-1.04:0.984:. ./.:4:415,154:.:-0.64:1.000:. ./.:4:551,105:.:-0.27:1.000:. ./.:4:598,97:.:-0.10:1.000:. ./.:4:427,179:.:-0.48:1.000:. ./.:4:499,179:.:-0.18:1.000:. ./.:4:413,67:.:-1.03:1.000:. ./.:4:365,122:.:-1.00:1.000:. ./.:4:494,89:.:-0.58:1.000:. ./.:4:433,144:.:-0.61:1.000:. ./.:4:506,87:.:-0.54:1.000:. ./.:4:586,94:.:-0.17:1.000:. ./.:4:551,78:.:-0.39:1.000:. ./.:4:502,179:.:-0.16:1.000:. ./.:4:535,213:.: 0.13:1.000:. ./.:4:441,177:.:-0.43:1.000:. ./.:4:325,120:.:-1.18:1.000:. ./.:4:276,197:.:-1.06:1.000:. ./.:4:609,101:.:-0.04:1.000:. ./.:4:822,130:.: 1.00:1.000:. ./.:4:495,74:.:-0.64:1.000:. ./.:4:577,89:.:-0.23:1.000:. ./.:4:347,140:.:-1.00:1.000:. ./.:5:643,172:.: 0.41:0.951:. ./.:4:442,76:.:-0.86:1.000:. ./.:4:522,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:407,75:.:-1.02:1.000:. ./.:4:964,158:.: 1.73:1.000:. ./.:4:767,307:.: 1.53:1.000:. ./.:4:607,110:.:-0.01:1.000:. ./.:4:274,97:.:-1.50:1.000:. ./.:4:767,306:.: 1.52:1.000:. ./.:4:486,74:.:-0.68:0.999:. ./.:4:462,181:.:-0.33:1.000:. ./.:4:431,70:.:-0.94:1.000:. ./.:4:539,196:.: 0.07:1.000:. ./.:4:470,155:.:-0.40:1.000:. ./.:4:400,70:.:-1.07:1.000:. ./.:4:558,85:.:-0.33:1.000:. ./.:4:365,134:.:-0.94:1.000:. ./.:4:634,90:.: 0.02:1.000:. ./.:4:462,81:.:-0.76:1.000:. ./.:4:621,96:.:-0.01:1.000:. ./.:4:643,283:.: 0.89:1.000:. ./.:4:392,180:.:-0.63:1.000:. ./.:4:517,190:.:-0.05:1.000:. ./.:4:427,170:.:-0.52:1.000:. ./.:4:263,197:.:-1.11:1.000:. ./.:4:302,123:.:-1.26:1.000:. ./.:4:353,165:.:-0.86:1.000:. ./.:4:368,80:.:-1.16:1.000:. ./.:4:837,120:.: 1.02:1.000:. ./.:4:302,122:.:-1.27:1.000:. ./.:4:583,87:.:-0.21:1.000:. ./.:4:507,200:.:-0.05:1.000:. ./.:4:912,324:.: 2.22:1.000:. ./.:4:566,230:.: 0.33:1.000:. ./.:4:405,178:.:-0.58:1.000:. ./.:4:368,121:.:-0.99:1.000:. ./.:4:507,66:.:-0.63:1.000:. ./.:4:460,161:.:-0.42:1.000:. ./.:4:440,160:.:-0.51:1.000:. ./.:4:700,121:.: 0.44:1.000:. ./.:4:343,125:.:-1.08:1.000:. ./.:4:830,284:.: 1.70:1.000:. ./.:4:957,155:.: 1.69:1.000:. ./.:4:688,287:.: 1.10:1.000:. ./.:4:540,222:.: 0.19:1.000:. ./.:4:764,129:.: 0.75:1.000:. ./.:4:588,93:.:-0.16:1.000:. ./.:4:808,353:.: 1.90:1.000:. ./.:4:643,233:.: 0.68:1.000:. ./.:4:157,33:.:-2.27:1.000:. ./.:4:672,114:.: 0.29:1.000:. ./.:4:817,132:.: 0.99:1.000:. ./.:4:792,150:.: 0.96:1.000:. ./.:4:1016,164:.: 1.98:1.000:. ./.:4:793,301:.: 1.61:1.000:. ./.:4:501,222:.: 0.02:1.000:. ./.:4:859,128:.: 1.15:1.000:. ./.:4:588,248:.: 0.50:1.000:. ./.:4:561,102:.:-0.24:1.000:. ./.:4:693,119:.: 0.40:1.000:. ./.:4:616,243:.: 0.60:1.000:. ./.:4:687,263:.: 0.99:1.000:. ./.:4:577,242:.: 0.43:1.000:. ./.:4:720,125:.: 0.54:1.000:. ./.:4:592,396:.: 1.16:0.999:. ./.:4:708,104:.: 0.40:1.000:. ./.:4:812,129:.: 0.96:1.000:. ./.:4:667,93:.: 0.18:1.000:. ./.:4:578,95:.:-0.20:1.000:. ./.:4:583,213:.: 0.33:1.000:. ./.:4:678,124:.: 0.36:1.000:. ./.:4:541,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:503,184:.:-0.14:1.000:. ./.:4:768,333:.: 1.64:1.000:. ./.:4:823,126:.: 0.99:1.000:. ./.:4:607,222:.: 0.47:1.000:. ./.:4:541,234:.: 0.24:1.000:. ./.:4:935,163:.: 1.63:0.999:. ./.:4:908,357:.: 2.35:1.000:. ./.:4:1040,172:.: 2.12:1.000:. ./.:4:536,184:.: 0.01:1.000:. ./.:4:509,398:.: 0.81:1.000:. -chr7.1 62532170 chr7.1_062532170 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,17:0.27: 0.82:1.000:0.998 0/0/0/0:4:48,3:0.07: 0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:71,16:0.22: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,18:0.26: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,5:0.26:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,19:0.28: 0.74:1.000:0.995 0/0/0/1:4:68,11:0.17: 1.42:1.000:0.998 0/0/0/0:4:13,1:0.09:-1.19:1.000:0.969 0/0/0/1:4:9,2:0.22:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 2.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,14:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/0:4:77,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,1:0.03:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,23:0.25: 2.70:1.000:0.999 0/0/0/0:4:54,3:0.06: 0.54:0.999:0.999 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 3.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,4:0.09: 0.50:1.000:0.969 0/0/0/0:4:42,3:0.08: 0.05:1.000:0.988 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.28: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,16:0.28: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,12:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,1:0.03: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,15:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,9:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.13:-1.39:1.000:0.940 0/0/0/1:4:32,12:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:86,17:0.20: 2.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0:3:6,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,13:0.20: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,3:0.08:-0.03:1.000:0.977 0/0/0/1:4:40,7:0.18: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,1:0.03: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,17:0.30: 0.13:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,13:0.28:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:48,12:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,14:0.22: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,19:0.28: 0.66:0.807:0.994 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,8:0.24:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,1:0.09:-1.19:1.000:0.969 0/0/0/0:4:25,1:0.05:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,19:0.31: 0.13:1.000:0.970 0/0/0/1:4:36,10:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,16:0.29: 0.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:29,9:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,14:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:32,2:0.07:-0.39:1.000:0.690 0/0/0/0:4:29,1:0.04:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,1:0.05:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,1:0.06:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,14:0.46:-1.11:1.000:0.988 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,13:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.75:0.978:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,1:0.06:-0.95:0.999:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,18:0.28: 0.58:1.000:0.995 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,12:0.28:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:28,10:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,1:0.03:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.20:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 0.46:0.984:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.29: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,6:0.14: 0.33:1.000:0.964 0/0/0/1:4:24,8:0.26:-0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,9:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,13:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,18:0.29: 0.50:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:24,15:0.31:-0.19:1.000:0.979 0/0/0/0:4:28,1:0.04:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,13:0.29:-0.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,10:0.30:-0.67:1.000:0.984 0/0/0/0/1:5:58,6:0.11: 0.82:0.951:0.921 0/0/0/0:4:45,4:0.10: 0.21:1.000:0.833 0/0/0/1:4:67,11:0.17: 1.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:25,4:0.17:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/0:4:33,2:0.07:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/0:4:35,1:0.03:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,1:0.02: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,6:0.22:-0.43:0.999:1.000 0/0/0/1:4:30,11:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:12,5:0.28:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,15:0.31:-0.23:1.000:0.975 0/0/0/1:4:11,13:0.36:-0.79:1.000:0.739 0/0/0/1:4:24,13:0.30:-0.27:1.000:0.989 0/0/0/0:4:26,1:0.04:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,16:0.32:-0.27:1.000:0.951 0/0/0/1:4:68,8:0.13: 1.30:1.000:0.878 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,13:0.27: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,10:0.29:-0.55:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,14:0.32:-0.47:1.000:0.946 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,10:0.29:-0.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:21,11:0.29:-0.47:1.000:0.990 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,16:0.19: 2.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.27:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,21:0.30: 0.58:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,10:0.30:-0.63:1.000:0.987 0/0/0/0:4:60,5:0.09: 0.86:1.000:0.919 0/0/0/1:4:38,5:0.14:-0.03:1.000:0.968 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:38,1:0.03:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,4:0.10: 0.21:1.000:0.833 0/0/0/0:4:41,3:0.08: 0.01:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,14:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,17:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,7:0.26:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,11:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,18:0.30: 0.21:1.000:0.985 0/0/0/0:4:24,2:0.09:-0.71:1.000:0.919 0/0/0/1:4:45,13:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,13:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,13:0.29:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:41,26:0.31: 0.94:1.000:0.978 0/0/0/1:4:38,20:0.29: 0.58:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,16:0.31:-0.19:1.000:0.967 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 1.06:0.999:1.000 0/0/0/1:4:30,11:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/0:4:76,1:0.02: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,11:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,9:0.13: 1.54:1.000:0.929 0/0/0/1:4:39,18:0.28: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,15:0.21: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,1:0.02: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,18:0.26: 1.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,19:0.31: 0.21:1.000:0.978 0/0/0/0:4:33,1:0.04:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,12:0.18: 1.46:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,16:0.17: 2.82:1.000:0.998 0/0/0/1:4:27,12:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 -chr7.1 62608738 chr7.1_062608738 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.59:0.999:. ./.:4:95,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:68,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-2.38:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.05:0.807:. ./.:4:47,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:6:81,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:66,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:0.978:. ./.:4:80,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:109,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.69:0.984:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:120,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.05:1.000:. ./.:5:117,0:.: 1.88:0.951:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:125,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.43:0.999:. ./.:4:82,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:99,1:.: 1.04:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:79,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.44:0.999:. ./.:4:81,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.84:1.000:. -chr7.1 62874747 chr7.1_062874747 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:95,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:63,29:.: 0.20:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:69,12:.:-0.15:1.000:. ./.:4:71,27:.: 0.38:1.000:. ./.:4:37,27:.:-0.68:1.000:. ./.:4:45,26:.:-0.46:1.000:. ./.:4:87,18:.: 0.60:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:12,6:.:-2.12:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:73,34:.: 0.66:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:68,29:.: 0.35:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:139,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:93,39:.: 1.44:1.000:. ./.:4:133,30:.: 2.41:1.000:. ./.:4:71,24:.: 0.29:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:41,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:68,22:.: 0.13:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:60,32:.: 0.20:1.000:. ./.:4:116,38:.: 2.13:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.18:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:81,34:.: 0.91:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:70,21:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:84,27:.: 0.79:1.000:. ./.:4:55,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,25:.:-0.68:1.000:. ./.:4:73,24:.: 0.35:1.000:. ./.:4:75,20:.: 0.29:1.000:. ./.:4:93,31:.: 1.19:0.807:. ./.:4:67,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:41,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:49,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:49,30:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,28:.:-0.90:1.000:. ./.:4:52,54:.: 0.63:1.000:. ./.:4:74,24:.: 0.38:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.16:1.000:. ./.:6:74,9:.:-0.09:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:63,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:39,24:.:-0.71:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:74,31:.: 0.60:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.94:0.978:. ./.:4:92,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:48,41:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.02:0.999:. ./.:4:57,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:90,38:.: 1.32:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:33,27:.:-0.80:1.000:. ./.:4:65,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:98,30:.: 1.32:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.21:0.984:. ./.:4:92,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:87,34:.: 1.10:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:61,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:48,16:.:-0.68:1.000:. ./.:4:58,19:.:-0.27:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:72,30:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,22:.:-0.05:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:55,30:.:-0.02:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:69,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.54:1.000:. ./.:4:57,17:.:-0.37:1.000:. ./.:5:47,25:.:-0.43:0.951:. ./.:4:61,18:.:-0.21:1.000:. ./.:4:85,23:.: 0.69:1.000:. ./.:4:93,29:.: 1.13:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:49,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,13:.:-1.02:0.999:. ./.:4:63,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:32,26:.:-0.87:1.000:. ./.:4:58,36:.: 0.26:1.000:. ./.:4:67,28:.: 0.29:1.000:. ./.:4:48,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:67,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:78,28:.: 0.63:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:19,26:.:-1.27:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.99:1.000:. ./.:4:45,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,26:.:-0.77:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.12:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:72,29:.: 0.48:1.000:. ./.:4:62,18:.:-0.18:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:142,38:.: 2.94:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.77:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:31,20:.:-1.08:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:47,36:.:-0.09:1.000:. ./.:4:53,40:.: 0.23:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:62,33:.: 0.29:1.000:. ./.:4:53,26:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:49,41:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,31:.: 0.35:1.000:. ./.:4:36,32:.:-0.55:1.000:. ./.:4:110,37:.: 1.91:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:68,36:.: 0.57:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:45,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:56,29:.:-0.02:1.000:. ./.:4:101,31:.: 1.44:1.000:. ./.:4:133,35:.: 2.57:1.000:. ./.:4:63,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.45:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:31,19:.:-1.12:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:88,24:.: 0.82:1.000:. ./.:4:62,22:.:-0.05:1.000:. ./.:4:83,38:.: 1.10:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:58,30:.: 0.07:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:111,29:.: 1.69:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:92,30:.: 1.13:0.999:. ./.:4:102,35:.: 1.60:1.000:. ./.:4:104,20:.: 1.19:1.000:. ./.:4:61,33:.: 0.26:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.63:1.000:. -chr7.1 63163614 chr7.1_063163614 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,65:.: 1.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,58:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1,51:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,69:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1,61:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.80:1.000:. ./.:4:2,8:.:-1.78:1.000:. ./.:4:1,4:.:-2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,23:.:-1.07:1.000:. ./.:4:2,52:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:2,26:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.61:0.999:. ./.:4:0,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,73:.: 1.41:1.000:. ./.:4:1,68:.: 1.21:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,78:.: 1.66:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.08:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1,66:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:2,6:.:-1.88:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:2,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1,48:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.90:1.000:. ./.:4:1,56:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,67:.: 1.11:0.807:. ./.:4:2,18:.:-1.27:1.000:. ./.:4:2,67:.: 1.21:1.000:. ./.:4:7,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,22:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,70:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,64:.: 1.16:1.000:. ./.:4:2,58:.: 0.75:1.000:. ./.:4:2,30:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.36:1.000:. ./.:6:2,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,58:.: 0.75:1.000:. ./.:4:3,59:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1,39:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,90:.: 2.27:1.000:. ./.:4:5,24:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1,20:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.90:0.978:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,55:.: 0.55:1.000:. ./.:4:5,40:.:-0.01:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,48:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:2,23:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,42:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.87:1.000:. ./.:4:1,49:.: 0.25:1.000:. ./.:4:2,59:.: 0.80:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.13:0.984:. ./.:4:1,33:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,61:.: 0.85:1.000:. ./.:4:1,21:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,37:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,38:.:-0.31:1.000:. ./.:4:2,18:.:-1.27:1.000:. ./.:4:2,26:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.40:1.000:. ./.:4:2,50:.: 0.35:1.000:. ./.:4:2,54:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,12:.:-1.62:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:1,55:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,21:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.41:1.000:. ./.:5:1,49:.: 0.25:0.951:. ./.:4:0,36:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1,72:.: 1.41:1.000:. ./.:4:1,56:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.70:0.999:. ./.:4:0,66:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,39:.:-0.16:1.000:. ./.:4:2,73:.: 1.51:1.000:. ./.:4:2,38:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,42:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:1,21:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,35:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,22:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,40:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1,84:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1,16:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:2,31:.:-0.61:1.000:. ./.:4:4,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,86:.: 2.07:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.05:1.000:. ./.:4:1,72:.: 1.41:1.000:. ./.:4:1,26:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.09:1.000:. ./.:4:3,49:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.13:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,85:.: 2.02:1.000:. ./.:4:0,88:.: 2.17:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,73:.: 1.41:1.000:. ./.:4:2,50:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.31:1.000:. ./.:4:4,48:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,65:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,52:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,70:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,51:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.52:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.02:1.000:. ./.:4:2,72:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,69:.: 1.21:0.999:. ./.:4:4,93:.: 2.62:1.000:. ./.:4:0,76:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr7.1 64068161 chr7.1_064068161 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:730,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:420,89:.:-0.48:1.000:. ./.:4:628,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:453,110:.:-0.09:1.000:. ./.:4:688,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:722,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:638,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:647,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:112,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:88,0:.:-3.50:1.000:. ./.:4:475,119:.: 0.13:1.000:. ./.:4:460,101:.:-0.11:1.000:. ./.:4:629,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:459,119:.: 0.02:1.000:. ./.:4:590,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:737,0:.: 1.16:0.995:. ./.:4:306,220:.:-0.36:1.000:. ./.:4:629,129:.: 1.31:1.000:. ./.:4:703,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:103,0:.:-3.39:1.000:. ./.:4:497,108:.: 0.21:1.000:. ./.:4:566,143:.: 0.96:1.000:. ./.:4:608,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,1:.:-3.65:1.000:. ./.:4:736,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:571,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:452,96:.:-0.20:1.000:. ./.:4:532,107:.: 0.45:1.000:. ./.:4:684,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:762,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:578,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:47,12:.:-3.71:1.000:. ./.:4:132,2:.:-3.17:1.000:. ./.:3:9,1:.:-4.06:1.000:. ./.:4:495,119:.: 0.27:1.000:. ./.:4:666,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:495,132:.: 0.37:1.000:. ./.:4:706,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:613,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:667,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:512,105:.: 0.30:1.000:. ./.:4:571,115:.: 0.79:1.000:. ./.:4:653,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:872,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:695,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:534,115:.: 0.53:0.807:. ./.:4:205,17:.:-2.54:1.000:. ./.:4:673,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:377,61:.:-0.99:1.000:. ./.:4:477,97:.:-0.01:1.000:. ./.:4:779,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:525,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:727,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:622,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:536,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:656,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:615,0:.: 0.28:1.000:. ./.:6:448,46:.:-0.59:1.000:. ./.:4:486,94:.: 0.03:1.000:. ./.:4:445,79:.:-0.37:1.000:. ./.:4:748,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:470,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:711,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:446,109:.:-0.15:1.000:. ./.:4:508,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:445,95:.:-0.26:1.000:. ./.:4:521,88:.: 0.24:0.978:. ./.:4:460,97:.:-0.13:1.000:. ./.:4:548,102:.: 0.53:1.000:. ./.:4:537,1:.:-0.27:0.999:. ./.:4:550,86:.: 0.43:1.000:. ./.:4:656,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:533,107:.: 0.46:1.000:. ./.:4:510,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:477,93:.:-0.04:1.000:. ./.:4:650,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:629,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:497,112:.: 0.24:1.000:. ./.:4:410,79:.:-0.62:0.984:. ./.:4:521,105:.: 0.36:1.000:. ./.:4:521,112:.: 0.41:1.000:. ./.:4:530,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:434,77:.:-0.46:1.000:. ./.:4:518,125:.: 0.48:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:421,102:.:-0.38:1.000:. ./.:4:658,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:404,103:.:-0.49:1.000:. ./.:4:534,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:629,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:705,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:331,80:.:-1.18:1.000:. ./.:4:614,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:443,100:.:-0.24:1.000:. ./.:4:443,80:.:-0.38:1.000:. ./.:4:298,159:.:-0.85:1.000:. ./.:4:541,81:.: 0.33:1.000:. ./.:4:479,121:.: 0.17:1.000:. ./.:4:551,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:481,120:.: 0.18:1.000:. ./.:4:373,78:.:-0.90:1.000:. ./.:5:821,1:.: 1.77:0.951:. ./.:4:534,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:496,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:393,57:.:-0.90:1.000:. ./.:4:446,99:.:-0.22:1.000:. ./.:4:548,126:.: 0.71:1.000:. ./.:4:571,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:552,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:576,138:.: 0.99:1.000:. ./.:4:515,101:.: 0.29:0.999:. ./.:4:626,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:487,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:741,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:412,90:.:-0.53:1.000:. ./.:4:613,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:595,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:399,85:.:-0.66:1.000:. ./.:4:635,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:602,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:661,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:662,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:642,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:503,119:.: 0.33:1.000:. ./.:4:671,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:439,102:.:-0.25:1.000:. ./.:4:453,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:394,75:.:-0.77:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:572,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:309,61:.:-1.48:1.000:. ./.:4:679,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:396,90:.:-0.64:1.000:. ./.:4:553,124:.: 0.73:1.000:. ./.:4:467,94:.:-0.11:1.000:. ./.:4:472,91:.:-0.09:1.000:. ./.:4:550,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:631,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:679,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:500,105:.: 0.21:1.000:. ./.:4:450,109:.:-0.12:1.000:. ./.:4:379,47:.:-1.08:1.000:. ./.:4:763,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:677,173:.: 1.97:1.000:. ./.:4:683,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:462,117:.: 0.02:1.000:. ./.:4:611,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:505,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:540,145:.: 0.78:1.000:. ./.:4:431,107:.:-0.27:1.000:. ./.:4:110,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:345,84:.:-1.05:1.000:. ./.:4:601,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:594,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:713,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:501,128:.: 0.38:1.000:. ./.:4:536,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:520,121:.: 0.47:1.000:. ./.:4:493,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:406,82:.:-0.63:1.000:. ./.:4:637,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:482,133:.: 0.28:1.000:. ./.:4:471,78:.:-0.19:1.000:. ./.:4:413,100:.:-0.45:1.000:. ./.:4:406,103:.:-0.48:1.000:. ./.:4:422,108:.:-0.33:0.999:. ./.:4:591,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:562,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:570,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:645,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:575,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:543,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:390,108:.:-0.56:1.000:. ./.:4:743,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:531,123:.: 0.56:1.000:. ./.:4:466,105:.:-0.03:1.000:. ./.:4:549,19:.:-0.06:1.000:. ./.:4:703,1:.: 0.92:0.999:. ./.:4:612,125:.: 1.16:1.000:. ./.:4:787,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:492,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:486,117:.: 0.20:1.000:. -chr7.1 64602866 chr7.1_064602866 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:3,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:3,0:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,1:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:3,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:6:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.59:0.999:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:0.984:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:3,1:.: 3.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.: 0.87:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:5:1,0:.:-0.59:0.951:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,1:.: 2.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:3,0:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.: 0.87:1.000:. -chr7.1 65049271 chr7.1_065049271 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:376,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:259,81:.: 0.67:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:315,96:.: 1.74:1.000:. ./.:4:358,79:.: 2.13:1.000:. ./.:4:197,47:.:-0.78:1.000:. ./.:4:290,89:.: 1.26:1.000:. ./.:4:266,68:.: 0.58:1.000:. ./.:4:235,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:132,42:.:-1.83:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:170,61:.:-0.97:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:262,77:.: 0.65:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.44:0.995:. ./.:4:200,82:.:-0.20:1.000:. ./.:4:355,4:.: 0.96:1.000:. ./.:4:411,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:167,76:.:-0.79:1.000:. ./.:4:213,75:.:-0.11:1.000:. ./.:4:250,70:.: 0.37:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:403,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:272,81:.: 0.86:1.000:. ./.:4:161,79:.:-0.84:1.000:. ./.:4:266,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:189,72:.:-0.52:1.000:. ./.:4:277,87:.: 1.03:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.29:1.000:. ./.:3:71,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:267,64:.: 0.53:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:277,91:.: 1.09:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:161,74:.:-0.91:1.000:. ./.:4:178,50:.:-1.02:1.000:. ./.:4:259,59:.: 0.34:1.000:. ./.:4:308,76:.: 1.33:1.000:. ./.:4:314,83:.: 1.53:1.000:. ./.:4:176,105:.:-0.22:0.807:. ./.:4:165,49:.:-1.23:1.000:. ./.:4:235,58:.:-0.04:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:240,55:.:-0.01:1.000:. ./.:4:266,61:.: 0.47:1.000:. ./.:4:223,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:323,92:.: 1.80:1.000:. ./.:4:76,26:.:-2.92:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.55:1.000:. ./.:6:245,14:.:-0.55:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:169,59:.:-1.02:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:169,89:.:-0.57:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:182,70:.:-0.66:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.43:0.978:. ./.:4:244,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:223,71:.:-0.02:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:301,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:306,85:.: 1.44:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:277,77:.: 0.88:1.000:. ./.:4:174,64:.:-0.87:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:183,78:.:-0.52:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.64:0.984:. ./.:4:283,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:213,90:.: 0.11:1.000:. ./.:4:300,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:190,85:.:-0.31:1.000:. ./.:4:193,63:.:-0.60:1.000:. ./.:4:169,71:.:-0.84:1.000:. ./.:4:250,48:.: 0.04:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:259,60:.: 0.35:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:303,88:.: 1.44:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:303,81:.: 1.33:1.000:. ./.:4:206,88:.:-0.02:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:177,76:.:-0.64:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:180,83:.:-0.49:1.000:. ./.:4:123,57:.:-1.74:1.000:. ./.:5:291,56:.: 0.77:0.951:. ./.:4:203,61:.:-0.48:1.000:. ./.:4:242,80:.: 0.40:1.000:. ./.:4:143,53:.:-1.50:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:274,97:.: 1.14:1.000:. ./.:4:177,53:.:-0.99:0.999:. ./.:4:267,73:.: 0.67:1.000:. ./.:4:202,40:.:-0.81:1.000:. ./.:4:281,64:.: 0.74:1.000:. ./.:4:174,81:.:-0.61:1.000:. ./.:4:253,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:167,54:.:-1.12:1.000:. ./.:4:240,68:.: 0.19:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:278,80:.: 0.94:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:238,58:.: 0.01:1.000:. ./.:4:194,48:.:-0.81:1.000:. ./.:4:264,70:.: 0.58:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:186,59:.:-0.76:1.000:. ./.:4:131,67:.:-1.47:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:257,75:.: 0.55:1.000:. ./.:4:109,41:.:-2.19:1.000:. ./.:4:363,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:237,81:.: 0.34:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:210,51:.:-0.52:1.000:. ./.:4:233,56:.:-0.10:1.000:. ./.:4:259,78:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,56:.:-1.24:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:203,1:.:-1.38:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:183,67:.:-0.69:1.000:. ./.:4:288,78:.: 1.06:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:215,84:.: 0.05:1.000:. ./.:4:217,64:.:-0.22:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:307,80:.: 1.38:1.000:. ./.:4:338,77:.: 1.80:1.000:. ./.:4:300,97:.: 1.53:1.000:. ./.:4:200,80:.:-0.23:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:173,59:.:-0.96:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:139,61:.:-1.44:1.000:. ./.:4:220,61:.:-0.22:1.000:. ./.:4:162,65:.:-1.03:1.000:. ./.:4:190,60:.:-0.69:1.000:. ./.:4:186,65:.:-0.67:1.000:. ./.:4:157,66:.:-1.09:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:269,55:.: 0.43:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:244,72:.: 0.31:1.000:. ./.:4:206,58:.:-0.48:1.000:. ./.:4:257,67:.: 0.43:1.000:. ./.:4:234,63:.: 0.02:1.000:. ./.:4:295,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:307,95:.: 1.60:1.000:. ./.:4:299,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:201,85:.:-0.14:1.000:. ./.:4:404,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:287,89:.: 1.21:0.999:. ./.:4:223,101:.: 0.43:1.000:. ./.:4:306,82:.: 1.39:1.000:. ./.:4:243,68:.: 0.23:1.000:. ./.:4:266,1:.:-0.43:1.000:. -chr7.1 65295546 chr7.1_065295546 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:216,143:0.39: 0.72:1.000:0.726 1/1/1/1:4:0,228:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,139:0.54:-1.09:1.000:0.986 0/0/1/1:4:106,210:0.62: 0.05:1.000:0.519 0/0/1/1:4:169,188:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,144:0.53:-0.83:1.000:0.993 0/0/0/1:4:156,59:0.29:-1.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:113,131:0.51:-1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,134:0.54:-1.22:1.000:0.987 0/1/1/1:4:70,197:0.69:-0.72:1.000:0.970 0/0/1/1:4:92,125:0.55:-1.50:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,288:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,106:0.46:-1.39:1.000:0.986 0/0/1/1:4:130,197:0.57: 0.22:1.000:0.948 0/1/1/1:4:78,181:0.65:-0.84:1.000:0.825 0/0/1/1:4:110,146:0.54:-0.89:1.000:0.987 0/0/1/1:4:207,149:0.41: 0.67:0.995:0.867 0/0/1/1:4:101,181:0.60:-0.49:1.000:0.755 0/1/1/1:4:144,304:0.64: 2.11:1.000:0.642 0/0/1/1:4:280,196:0.40: 2.54:1.000:0.828 0/0/0/1:4:338,74:0.20: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,69:0.27:-0.63:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,269:0.86:-0.19:1.000:0.964 0/0/0/1:4:223,59:0.23:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,115:0.50:-1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,93:0.36:-0.91:1.000:0.636 0/0/0/1:4:233,79:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,120:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:256,175:0.40: 1.84:1.000:0.789 0/0/1/1:4:120,150:0.53:-0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,109:0.45:-1.25:1.000:0.982 0/0/0/1:4:219,53:0.21:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,134:0.72:-2.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:215,118:0.36: 0.31:1.000:0.739 0/0/1:3:88,76:0.45:-2.33:1.000:0.968 0/0/1/1:4:183,128:0.40:-0.03:1.000:0.827 0/0/1/1:4:103,119:0.51:-1.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:107,229:0.64: 0.36:1.000:0.673 0/0/1/1:4:143,151:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,136:0.38: 0.69:1.000:0.547 0/1/1/1:4:104,228:0.64: 0.30:1.000:0.725 0/0/1/1:4:106,174:0.59:-0.52:1.000:0.886 0/0/0/1:4:229,76:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:209,73:0.27:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:167,216:0.54: 1.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:127,156:0.52:-0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,274:0.88:-0.19:0.807:0.698 0/1/1/1:4:83,351:0.75: 1.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:168,65:0.29:-1.25:1.000:0.991 0/1/1/1:4:103,226:0.64: 0.25:1.000:0.727 0/1/1/1:4:95,252:0.68: 0.53:1.000:0.948 0/1/1/1:4:113,238:0.64: 0.59:1.000:0.636 0/0/0/1:4:278,72:0.23: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,76:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,144:0.51:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:205,69:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,131:0.48:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:205,191:0.47: 1.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:190,161:0.44: 0.59:1.000:0.974 0/0/1/1/1/1:6:120,210:0.60: 0.26:1.000:0.638 0/1/1/1:4:124,304:0.66: 1.79:1.000:0.892 0/0/1/1:4:100,141:0.55:-1.13:1.000:0.975 0/0/1/1:4:259,180:0.40: 1.97:1.000:0.817 0/0/1/1:4:133,250:0.61: 1.09:1.000:0.651 0/0/1/1:4:229,175:0.42: 1.42:1.000:0.925 0/0/0/1:4:234,63:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:286,177:0.38: 2.34:1.000:0.562 0/0/1/1:4:140,160:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,231:0.63: 0.47:0.978:0.585 0/1/1/1:4:80,193:0.66:-0.63:1.000:0.875 0/0/1/1:4:164,175:0.49: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,206:0.62:-0.03:0.999:0.544 0/0/0/1:4:193,115:0.37:-0.08:1.000:0.540 0/0/1/1:4:136,162:0.52:-0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:79,212:0.68:-0.35:1.000:0.953 0/0/0/1:4:194,70:0.28:-0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,228:0.83:-0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:294,82:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,183:0.45: 1.28:1.000:0.979 0/0/1/1:4:180,171:0.47: 0.59:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,196:0.70:-0.84:0.984:0.989 0/0/1/1:4:207,154:0.42: 0.75:1.000:0.903 0/0/0/1:4:287,83:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,118:0.40:-0.33:1.000:0.774 0/0/1/1:4:211,157:0.42: 0.86:1.000:0.903 0/0/0/1:4:290,70:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,122:0.49:-1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,158:0.55:-0.63:1.000:0.981 0/0/1/1:4:153,160:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,115:0.38:-0.20:1.000:0.573 0/0/1/1:4:180,167:0.46: 0.53:1.000:0.990 0/1/1/1:4:91,225:0.67: 0.05:1.000:0.900 0/0/1/1:4:158,195:0.53: 0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,110:0.43:-1.02:1.000:0.951 0/0/0/1:4:337,105:0.26: 2.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,289:0.85: 0.20:1.000:0.986 0/1/1/1:4:88,217:0.66:-0.13:1.000:0.897 0/1/1/1:4:93,242:0.67: 0.34:1.000:0.937 0/0/1/1:4:158,200:0.53: 0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:236,184:0.43: 1.67:1.000:0.939 0/0/1/1:4:196,207:0.49: 1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,242:0.81:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:119,139:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:178,293:0.59: 2.47:0.951:0.964 0/1/1/1:4:28,252:0.87:-0.52:1.000:0.916 0/0/1/1:4:133,146:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,160:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:96,214:0.65:-0.05:1.000:0.758 0/1/1/1:4:134,269:0.63: 1.40:1.000:0.515 0/1/1/1:4:88,212:0.66:-0.20:1.000:0.873 0/0/1/1:4:209,187:0.46: 1.29:1.000:0.985 0/0/0/1:4:266,80:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,190:0.52: 0.56:0.999:0.995 0/0/1/1:4:148,136:0.46:-0.45:1.000:0.989 0/0/1/1:4:91,112:0.53:-1.72:1.000:0.994 0/0/0/1:4:279,84:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,293:0.82: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,126:0.53:-1.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:218,189:0.45: 1.47:1.000:0.980 0/0/1/1:4:141,138:0.48:-0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,156:0.57:-0.83:1.000:0.953 0/0/1/1:4:211,155:0.41: 0.83:1.000:0.890 0/0/0/1:4:245,100:0.30: 0.50:1.000:0.985 0/0/0/1:4:341,63:0.18: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,86:0.30:-0.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:133,170:0.53:-0.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:280,97:0.27: 1.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,212:0.64:-0.08:1.000:0.740 0/0/0/1:4:195,76:0.29:-0.66:1.000:0.991 0/1/1/1:4:33,211:0.82:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:210,155:0.42: 0.81:1.000:0.895 0/0/1/1:4:117,147:0.53:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:119,130:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:312,71:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,75:0.21: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,179:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:211,147:0.40: 0.70:1.000:0.821 0/0/0/1:4:295,71:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,154:0.52:-0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:144,141:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:265,82:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,88:0.25: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:206,156:0.42: 0.76:1.000:0.918 0/0/0/1:4:280,66:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,200:0.41: 2.62:1.000:0.852 0/1/1/1:4:123,281:0.65: 1.42:1.000:0.801 0/0/1/1:4:204,153:0.42: 0.69:1.000:0.910 0/0/1/1:4:105,149:0.56:-0.92:1.000:0.973 0/0/0/1:4:253,75:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:212,138:0.39: 0.58:1.000:0.688 0/0/1/1:4:149,166:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:133,130:0.48:-0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:176,116:0.39:-0.33:1.000:0.716 0/0/1/1:4:82,159:0.62:-1.13:1.000:0.574 0/0/0/1:4:221,81:0.28:-0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:278,89:0.26: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:304,82:0.23: 1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,192:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,139:0.41: 0.25:1.000:0.886 0/0/1/1:4:127,124:0.48:-0.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:186,137:0.42: 0.15:1.000:0.893 0/0/1/1:4:87,81:0.46:-2.27:1.000:0.990 0/0/0/1:4:205,50:0.22:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,202:0.84:-1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,130:0.47:-0.72:1.000:0.992 0/0/0/1:4:237,68:0.24:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:17,204:0.90:-1.44:1.000:0.789 0/0/1/1:4:121,207:0.59: 0.23:0.999:0.834 0/0/0/1:4:213,58:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,226:0.63: 0.40:1.000:0.506 0/0/1/1:4:98,123:0.53:-1.44:1.000:0.992 1/1/1/1:4:11,175:0.92:-1.98:1.000:0.993 0/0/1/1:4:112,152:0.55:-0.77:1.000:0.983 1/1/1/1:4:12,195:0.92:-1.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,173:0.62:-0.81:1.000:0.539 0/0/0/1:4:282,58:0.19: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,84:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:117,280:0.66: 1.31:1.000:0.866 1/1/1/1:4:15,210:0.91:-1.38:1.000:0.964 0/0/1/1:4:173,139:0.43:-0.02:1.000:0.955 0/0/1/1:4:140,151:0.50:-0.35:0.999:0.997 0/0/1/1:4:172,196:0.51: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:252,108:0.31: 0.73:1.000:0.975 0/0/1/1:4:104,113:0.50:-1.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,189:0.59:-0.20:1.000:0.841 -chr7.1 65489201 chr7.1_065489201 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:358,135:.: 1.85:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:255,114:.: 0.34:1.000:. ./.:4:322,125:.: 1.29:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:370,133:.: 1.97:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:306,140:.: 1.28:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:127,34:.:-2.21:1.000:. ./.:4:207,71:.:-0.78:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:280,158:.: 1.18:1.000:. ./.:4:259,121:.: 0.47:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:245,124:.: 0.34:0.995:. ./.:4:454,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:359,150:.: 2.05:1.000:. ./.:4:352,155:.: 2.02:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:347,152:.: 1.92:1.000:. ./.:4:398,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:205,72:.:-0.79:1.000:. ./.:4:257,141:.: 0.69:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:331,126:.: 1.41:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:178,44:.:-1.46:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.37:1.000:. ./.:3:155,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:235,118:.: 0.14:1.000:. ./.:4:211,106:.:-0.30:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:230,102:.:-0.12:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:361,2:.: 0.26:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:344,143:.: 1.78:0.807:. ./.:4:219,99:.:-0.29:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:160,88:.:-1.14:1.000:. ./.:4:237,70:.:-0.42:1.000:. ./.:4:307,114:.: 0.97:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:268,113:.: 0.48:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.63:1.000:. ./.:6:173,63:.:-1.29:1.000:. ./.:4:256,85:.:-0.01:1.000:. ./.:4:247,76:.:-0.23:1.000:. ./.:4:254,110:.: 0.27:1.000:. ./.:4:227,90:.:-0.30:1.000:. ./.:4:311,112:.: 1.00:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:247,99:.: 0.05:0.978:. ./.:4:347,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:294,121:.: 0.90:1.000:. ./.:4:223,87:.:-0.39:0.999:. ./.:4:388,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:355,123:.: 1.67:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:241,73:.:-0.34:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:226,87:.:-0.35:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.47:0.984:. ./.:4:364,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:170,101:.:-0.86:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:256,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:249,78:.:-0.18:1.000:. ./.:4:275,109:.: 0.52:1.000:. ./.:4:204,73:.:-0.79:1.000:. ./.:4:252,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:227,96:.:-0.23:1.000:. ./.:4:215,81:.:-0.56:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:206,88:.:-0.58:1.000:. ./.:4:223,84:.:-0.42:1.000:. ./.:4:193,0:.:-1.81:1.000:. ./.:5:294,89:.: 0.51:0.951:. ./.:4:155,76:.:-1.35:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:227,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:268,136:.: 0.76:1.000:. ./.:4:396,137:.: 2.34:1.000:. ./.:4:229,96:.:-0.20:1.000:. ./.:4:232,82:.:-0.34:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:325,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:129,43:.:-2.07:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:225,80:.:-0.45:1.000:. ./.:4:219,103:.:-0.24:1.000:. ./.:4:194,72:.:-0.92:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:218,71:.:-0.64:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:219,104:.:-0.23:1.000:. ./.:4:237,87:.:-0.21:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:231,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:174,78:.:-1.09:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:261,104:.: 0.29:1.000:. ./.:4:251,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:200,70:.:-0.87:1.000:. ./.:4:245,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:211,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:405,165:.: 2.79:1.000:. ./.:4:323,145:.: 1.55:1.000:. ./.:4:314,140:.: 1.37:1.000:. ./.:4:280,98:.: 0.45:1.000:. ./.:4:453,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:191,77:.:-0.90:1.000:. ./.:4:361,160:.: 2.19:1.000:. ./.:4:369,144:.: 2.10:1.000:. ./.:4:316,46:.: 0.25:1.000:. ./.:4:258,125:.: 0.51:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:507,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:274,95:.: 0.34:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:238,124:.: 0.25:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:293,126:.: 0.95:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:231,132:.: 0.26:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:363,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:283,138:.: 0.97:1.000:. ./.:4:244,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:207,89:.:-0.56:1.000:. ./.:4:251,103:.: 0.15:1.000:. ./.:4:196,83:.:-0.76:1.000:. ./.:4:165,87:.:-1.09:1.000:. ./.:4:225,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:277,129:.: 0.79:1.000:. ./.:4:342,119:.: 1.46:1.000:. ./.:4:257,97:.: 0.15:1.000:. ./.:4:440,0:.: 1.20:0.999:. ./.:4:522,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:549,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:269,125:.: 0.64:1.000:. ./.:4:429,1:.: 1.08:1.000:. -chr7.1 65692753 chr7.1_065692753 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:44,4:0.18: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,3:0.34:-1.42:1.000:0.842 0/0/0/1:4:39,5:0.21:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,5:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,19:0.60:-0.61:1.000:0.820 0/0/0/1:4:31,1:0.13:-0.53:1.000:0.942 0/0/0/1:4:4,1:0.28:-1.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,2:0.16:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,4:0.63:-1.59:1.000:0.536 0/0/1/1:4:32,26:0.44: 0.53:1.000:0.973 0/0/1/1:4:33,29:0.46: 0.69:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,13:0.56:-0.94:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,13:0.34: 0.00:1.000:0.890 0/0/0/1:4:26,5:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-1.42:1.000:0.873 0/0/0/1:4:35,6:0.24:-0.16:0.995:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.45:-1.38:1.000:0.978 0/0/0/1:4:52,4:0.17: 0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,12:0.31: 0.12:1.000:0.973 0/1/1/1:4:26,60:0.66: 1.67:1.000:0.851 0/1/1/1:4:8,17:0.64:-0.81:1.000:0.695 0/0/0/1:4:26,11:0.34:-0.32:1.000:0.855 0/1/1/1:4:4,10:0.67:-1.26:1.000:0.932 0/0/0/1:4:57,23:0.34: 1.42:1.000:0.895 0/0/0/1:4:19,1:0.15:-1.02:1.000:0.989 0/0/0/0:4:5,0:0.11:-1.63:1.000:0.628 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,9:0.22: 1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.11:-1.79:1.000:0.628 0/0/1/1:4:12,18:0.56:-0.61:1.000:0.958 0/0/1/1:4:28,30:0.49: 0.53:1.000:0.996 1/1/1:3:2,27:0.92:-0.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.65:-1.18:1.000:0.770 0/0/0/1:4:38,10:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,7:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,12:0.67:-1.14:1.000:0.898 0/0/1/1:4:43,23:0.38: 0.86:1.000:0.526 0/1/1/1:4:11,22:0.63:-0.49:1.000:0.536 0/1/1/1:4:9,20:0.65:-0.65:1.000:0.789 0/0/1/1:4:13,22:0.59:-0.41:1.000:0.852 0/0/1/1:4:26,32:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,34:0.70: 0.04:1.000:0.982 0/0/0/1:4:38,16:0.34: 0.37:0.807:0.859 0/1/1/1:4:14,45:0.72: 0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,22:0.65:-0.53:1.000:0.770 0/1/1/1:4:14,34:0.67: 0.12:1.000:0.909 0/0/0/1:4:47,19:0.34: 0.86:1.000:0.893 0/0/0/1:4:50,18:0.32: 0.94:1.000:0.953 0/1/1/1:4:14,39:0.69: 0.33:1.000:0.978 0/0/1/1:4:35,19:0.38: 0.37:1.000:0.556 0/0/0/1:4:51,4:0.17: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,23:0.59:-0.32:1.000:0.890 0/1/1/1:4:14,30:0.64:-0.04:1.000:0.714 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,34:0.59: 0.37:1.000:0.845 0/0/0/1/1/1:6:47,41:0.46: 1.75:1.000:0.777 0/0/1/1:4:35,39:0.50: 1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,11:0.31: 0.00:1.000:0.978 0/0/0/1:4:95,12:0.21: 2.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,48:0.59: 1.30:1.000:0.881 0/0/0/1:4:51,14:0.29: 0.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,24:0.58:-0.24:1.000:0.916 0/0/1/1:4:12,23:0.62:-0.41:1.000:0.583 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,40:0.52: 1.10:0.978:0.994 0/0/1/1:4:13,7:0.38:-1.02:1.000:0.540 0/0/0/1:4:73,26:0.32: 2.20:1.000:0.957 0/0/0/1:4:29,14:0.36:-0.08:0.999:0.674 0/0/1/1:4:17,17:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:47,8:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.49:-0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:29,8:0.29:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:56,27:0.36: 1.55:1.000:0.676 0/0/1/1:4:40,31:0.44: 1.06:1.000:0.960 0/0/1/1:4:44,26:0.39: 1.02:1.000:0.716 0/0/1/1:4:18,35:0.62: 0.33:1.000:0.543 0/0/1/1:4:23,18:0.44:-0.16:0.984:0.963 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,37:0.60: 0.53:1.000:0.784 0/1/1/1:4:6,15:0.67:-0.98:1.000:0.932 0/0/1/1:4:52,38:0.43: 1.83:1.000:0.937 0/1/1/1:4:19,41:0.64: 0.61:1.000:0.730 0/1/1/1:4:10,38:0.75: 0.12:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,52:0.68: 1.10:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,28:0.68:-0.24:1.000:0.944 0/0/0/1:4:40,11:0.29: 0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,11:0.23: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.32:-0.57:1.000:0.963 0/1/1/1:4:21,50:0.66: 1.06:1.000:0.889 0/0/1/1:4:36,36:0.48: 1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,34:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,24:0.44: 0.37:1.000:0.969 0/1/1/1:4:27,59:0.65: 1.67:1.000:0.757 0/0/1/1:4:13,17:0.53:-0.61:1.000:0.991 0/0/0/1:4:61,9:0.22: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,21:0.36: 0.77:1.000:0.653 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:100,40:0.33: 3.87:0.951:0.824 0/0/0/1:4:60,28:0.36: 1.75:1.000:0.730 0/1/1/1:4:7,21:0.71:-0.69:1.000:0.990 0/1/1/1:4:15,38:0.68: 0.33:1.000:0.941 0/0/0/1:4:43,2:0.15: 0.00:1.000:0.982 0/0/0/1:4:49,13:0.28: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:40,11:0.29: 0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,34:0.38: 2.16:1.000:0.512 0/0/1/1:4:6,5:0.45:-1.38:1.000:0.978 0/1/1/1:4:21,48:0.66: 0.98:0.999:0.837 0/0/1/1:4:21,33:0.58: 0.37:1.000:0.931 0/0/0/1:4:49,11:0.27: 0.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:27,43:0.58: 1.02:1.000:0.920 0/0/0/1:4:53,21:0.33: 1.18:1.000:0.907 0/0/0/1:4:62,16:0.28: 1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,14:0.24: 1.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,9:0.21: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,17:0.33: 0.65:1.000:0.922 0/1/1/1:4:1,4:0.76:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,21:0.36: 0.86:1.000:0.730 0/0/1/1:4:47,28:0.39: 1.22:1.000:0.729 0/1/1/1:4:17,41:0.67: 0.53:1.000:0.903 0/0/1/1:4:25,28:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,39:0.66: 0.45:1.000:0.842 0/0/1/1:4:23,21:0.46:-0.04:1.000:0.990 0/1/1/1:4:14,37:0.68: 0.24:1.000:0.962 0/0/1/1:4:4,6:0.56:-1.42:1.000:0.958 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,28:0.45: 0.69:1.000:0.976 0/1/1/1:4:7,16:0.66:-0.89:1.000:0.837 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,18:0.35: 0.57:1.000:0.815 0/1/1/1:4:15,34:0.65: 0.16:1.000:0.824 0/0/1/1:4:49,26:0.38: 1.22:1.000:0.510 0/1/1/1:4:18,39:0.64: 0.49:1.000:0.739 0/0/1/1:4:19,31:0.58: 0.20:1.000:0.897 0/0/1/1:4:18,34:0.62: 0.29:1.000:0.622 0/1/1/1:4:3,14:0.78:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,34:0.62: 0.29:1.000:0.622 0/0/0/1:4:51,7:0.21: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,10:0.27: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,8:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,4:0.18: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,8:0.37:-0.85:1.000:0.609 0/0/0/1:4:68,5:0.17: 1.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,3:0.16: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,3:0.16: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,33:0.34: 2.73:1.000:0.867 0/0/0/1:4:38,4:0.19:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,12:0.45:-0.77:1.000:0.983 0/0/1/1:4:18,15:0.45:-0.49:1.000:0.978 0/0/1/1:4:14,13:0.47:-0.73:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,8:0.29:-0.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,12:0.76:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,1:0.13:-0.16:1.000:0.892 0/1/1/1:4:2,4:0.63:-1.59:1.000:0.536 0/1/1/1:4:3,14:0.78:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,13:0.35:-0.12:1.000:0.788 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.48:-1.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:41,8:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,13:0.45:-0.69:0.999:0.984 0/0/0/1:4:7,3:0.34:-1.42:1.000:0.842 0/0/0/1:4:32,8:0.28:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,6:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,2:0.18:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,3:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,4:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,10:0.30:-0.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-1.46:1.000:0.969 0/1/1/1:4:1,7:0.85:-1.50:1.000:0.991 0/0/0/1:4:38,10:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,6:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,4:0.26:-0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,11:0.58:-1.10:0.999:0.931 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.43:-0.89:1.000:0.958 0/0/0/1:4:36,4:0.20:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.39:-0.49:1.000:0.656 -chr7.1 66135035 chr7.1_066135035 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:50,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:46,1:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.88:0.995:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:42,2:.: 1.39:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,2:.: 0.37:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.45:0.807:. ./.:4:9,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,1:.: 2.18:1.000:. ./.:4:39,1:.: 1.10:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:6:3,0:.:-1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,1:.: 0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:32,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:37,1:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:5:28,1:.: 0.30:0.951:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.88:0.999:. ./.:4:35,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:32,2:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:61,3:.: 2.84:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:43,1:.: 1.39:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:29,2:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:69,1:.: 3.27:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.65:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:24,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.73:1.000:. -chr7.1 66328424 chr7.1_066328424 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:92,0:.: 2.71:0.995:. ./.:4:77,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.59:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:82,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:0.807:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.89:1.000:. ./.:6:38,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:0.978:. ./.:4:37,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:0.999:. ./.:4:77,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:90,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.05:0.984:. ./.:4:50,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.31:1.000:. ./.:5:29,0:.:-0.76:0.951:. ./.:4:15,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:0.999:. ./.:4:27,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.50:0.999:. ./.:4:54,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:44,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.23:1.000:. -chr7.1 66535399 chr7.1_066535399 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:311,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:323,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:408,1:.: 1.34:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:62,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:431,1:.: 1.64:0.995:. ./.:4:325,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:419,2:.: 1.49:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:377,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:414,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:33,0:.:-3.57:1.000:. ./.:4:96,0:.:-2.75:1.000:. ./.:3:53,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.36:0.807:. ./.:4:65,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.36:1.000:. ./.:6:245,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:391,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:280,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:211,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:369,1:.: 0.83:0.978:. ./.:4:264,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:400,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.18:0.999:. ./.:4:365,3:.: 0.80:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:288,2:.:-0.22:1.000:. ./.:4:278,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.52:0.984:. ./.:4:345,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:364,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:260,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:295,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:324,2:.: 0.25:1.000:. ./.:4:308,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:357,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:238,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:301,2:.:-0.05:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:326,4:.: 0.31:1.000:. ./.:4:195,1:.:-1.44:1.000:. ./.:5:395,0:.: 1.15:0.951:. ./.:4:275,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:386,2:.: 1.06:1.000:. ./.:4:291,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:457,1:.: 1.98:1.000:. ./.:4:258,1:.:-0.62:0.999:. ./.:4:393,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:367,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:267,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:350,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:390,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:348,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:56,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:426,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:370,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:368,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.43:0.999:. ./.:4:339,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:336,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:259,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:495,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:358,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.57:0.999:. ./.:4:458,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:339,1:.: 0.44:1.000:. -chr7.1 66979462 chr7.1_066979462 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:62,162:0.71: 0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:85,69:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,95:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,87:0.56:-0.28:1.000:0.964 0/0/1/1:4:114,85:0.47: 0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:92,85:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,130:0.71: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,84:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,62:0.47:-0.55:1.000:0.991 0/0/0/1:4:77,15:0.30:-1.67:1.000:0.988 0/1/1/1:4:22,47:0.68:-2.13:1.000:0.953 0/1/1/1:4:54,169:0.74: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,94:0.56:-0.04:1.000:0.960 0/0/1/1:4:113,78:0.46: 0.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:86,80:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,85:0.57:-0.45:1.000:0.934 0/0/1/1:4:112,81:0.47: 0.36:0.995:0.992 1/1/1/1:4:27,284:0.90: 2.73:1.000:0.680 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,213:0.74: 2.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,48:0.57:-1.75:1.000:0.956 0/0/1/1:4:98,67:0.46:-0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:123,103:0.49: 1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,165:0.73: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,18:0.49:-2.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,161:0.72: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,79:0.60:-0.79:1.000:0.826 0/0/1/1:4:67,79:0.56:-0.59:1.000:0.963 0/0/1/1:4:122,103:0.49: 1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,79:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,97:0.53: 0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,118:0.70:-0.14:1.000:0.983 0/1/1/1:4:7,12:0.64:-3.14:1.000:0.666 0/0/1/1:4:53,29:0.42:-1.87:1.000:0.928 0/0/1:3:20,4:0.30:-3.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,68:0.48:-0.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,75:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,81:0.49: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,97:0.55: 0.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:93,95:0.53: 0.26:1.000:0.991 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,81:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,158:0.70: 1.00:1.000:0.983 0/0/1/1:4:128,96:0.47: 0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:102,79:0.48: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,93:0.48: 0.70:0.807:0.996 0/1/1/1:4:9,17:0.66:-3.00:1.000:0.847 0/1/1/1:4:49,139:0.73: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,72:0.66:-1.33:1.000:0.884 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,98:0.52: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,166:0.67: 1.44:1.000:0.929 0/0/1/1:4:104,93:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:81,69:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,89:0.52: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,161:0.68: 1.22:1.000:0.955 0/0/1/1:4:101,93:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,82:0.44: 0.76:1.000:0.974 0/0/0/1/1/1:6:111,59:0.42:-0.10:1.000:0.514 0/0/1/1:4:127,93:0.47: 0.90:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,78:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,86:0.48: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,81:0.49: 0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:80,162:0.67: 1.34:1.000:0.920 0/0/1/1:4:99,86:0.50: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,77:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,75:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,78:0.47: 0.18:0.978:0.993 0/1/1/1:4:48,118:0.70:-0.18:1.000:0.989 0/0/1/1:4:132,107:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,57:0.49:-0.99:0.999:0.996 0/1/1/1:4:30,268:0.88: 2.47:1.000:0.723 0/1/1/1:4:54,188:0.76: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,143:0.69: 0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:86,74:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,87:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,174:0.77: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,143:0.65: 0.94:0.984:0.780 0/0/1/1:4:97,93:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,112:0.51: 1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,69:0.55:-0.91:1.000:0.976 0/0/1/1:4:74,70:0.52:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,93:0.47: 0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:89,55:0.44:-0.63:1.000:0.971 0/0/1/1:4:94,72:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,77:0.48: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,81:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,80:0.47: 0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,68:0.45:-0.02:1.000:0.979 0/0/1/1:4:128,95:0.47: 0.96:1.000:0.993 0/0/1/1:4:47,51:0.54:-1.55:1.000:0.984 0/1/1/1:4:81,183:0.69: 1.78:1.000:0.973 0/0/1/1:4:115,81:0.46: 0.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:113,70:0.44: 0.16:1.000:0.972 0/0/1/1:4:87,60:0.46:-0.57:1.000:0.988 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,88:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,75:0.54:-0.57:1.000:0.990 0/0/1/1/1:5:140,139:0.53: 2.08:0.951:0.740 0/0/1/1:4:71,60:0.49:-0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,74:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,98:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,75:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:77,134:0.64: 0.72:1.000:0.700 0/0/1/1:4:102,95:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.10:0.999:1.000 0/0/1/1:4:122,75:0.44: 0.44:1.000:0.970 0/0/1/1:4:45,48:0.54:-1.65:1.000:0.987 0/1/1/1:4:95,188:0.67: 2.16:1.000:0.901 0/0/0/0:4:108,3:0.07:-1.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:106,73:0.46: 0.08:1.000:0.988 0/0/1/1:4:122,84:0.46: 0.62:1.000:0.988 0/0/1/1:4:85,65:0.48:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,68:0.45:-0.04:1.000:0.980 0/0/1/1:4:117,66:0.43: 0.16:1.000:0.943 0/0/1/1:4:143,94:0.45: 1.24:1.000:0.982 0/1/1/1:4:44,169:0.78: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,151:0.67: 0.98:1.000:0.935 0/0/1/1:4:106,92:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,162:0.68: 1.28:1.000:0.945 0/1/1/1:4:56,156:0.73: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,132:0.69: 0.28:1.000:0.979 0/0/1/1:4:88,60:0.46:-0.55:1.000:0.987 0/0/1/1:4:124,73:0.44: 0.44:1.000:0.958 0/0/1/1:4:100,61:0.44:-0.28:1.000:0.968 0/0/1/1:4:73,56:0.48:-0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,81:0.60:-0.73:1.000:0.815 0/0/1/1:4:90,66:0.47:-0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,98:0.57: 0.04:1.000:0.939 0/0/1/1:4:86,97:0.55: 0.16:1.000:0.977 0/0/1/1:4:109,66:0.44: 0.00:1.000:0.967 0/0/1/1:4:82,131:0.62: 0.76:1.000:0.514 0/0/1/1:4:101,85:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,180:0.68: 1.76:1.000:0.959 0/0/1/1:4:96,69:0.47:-0.20:1.000:0.991 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,57:0.45:-0.63:1.000:0.982 0/1/1/1:4:69,205:0.74: 1.98:1.000:0.998 0/0/1/1:4:129,86:0.45: 0.80:1.000:0.984 0/1/1/1:4:55,164:0.74: 0.88:1.000:0.998 0/0/1/1:4:84,63:0.47:-0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,84:0.52:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,64:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,104:0.57: 0.28:1.000:0.947 0/0/1/1:4:81,91:0.55:-0.06:1.000:0.978 0/0/1/1:4:30,24:0.48:-2.43:1.000:0.996 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,99:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,101:0.55: 0.38:1.000:0.984 0/0/1/1:4:117,96:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,73:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,178:0.73: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,123:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,1:0.03:-1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,134:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,76:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,89:0.69:-0.95:1.000:0.976 0/0/1/1:4:83,69:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:18,226:0.91: 1.38:0.999:0.928 0/0/1/1:4:76,87:0.56:-0.24:1.000:0.973 0/0/1/1:4:76,76:0.53:-0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,70:0.54:-0.81:1.000:0.985 0/0/1/1:4:78,58:0.47:-0.79:1.000:0.993 0/1/1/1:4:61,158:0.71: 0.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,67:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,59:0.53:-1.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,72:0.55:-0.79:1.000:0.977 0/1/1/1:4:71,166:0.70: 1.24:1.000:0.981 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,89:0.52: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,166:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,86:0.47: 0.54:0.999:0.993 0/0/1/1:4:101,118:0.56: 0.88:1.000:0.967 0/0/1/1:4:109,96:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,134:0.71: 0.26:1.000:0.990 0/1/1/1:4:59,142:0.70: 0.52:1.000:0.986 -chr7.1 67279501 chr7.1_067279501 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:403,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:595,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:247,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:322,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:200,1:.:-2.19:1.000:. ./.:4:269,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:481,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.89:0.995:. ./.:4:530,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:228,1:.:-1.92:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:555,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:172,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:559,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:585,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:319,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:329,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:83,3:.:-3.32:1.000:. ./.:4:174,2:.:-2.44:1.000:. ./.:3:117,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:358,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:364,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:399,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:376,3:.:-0.45:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:348,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:440,4:.: 0.18:1.000:. ./.:4:444,3:.: 0.21:1.000:. ./.:4:622,0:.: 1.93:0.807:. ./.:4:778,1:.: 3.46:1.000:. ./.:4:320,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:351,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:505,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:429,3:.: 0.07:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:389,4:.:-0.31:1.000:. ./.:4:355,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:398,3:.:-0.24:1.000:. ./.:4:330,3:.:-0.90:1.000:. ./.:6:389,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:404,7:.:-0.14:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:682,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:352,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:391,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:333,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:531,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:480,1:.: 0.55:0.978:. ./.:4:451,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:371,5:.:-0.48:0.999:. ./.:4:588,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:518,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:467,4:.: 0.45:1.000:. ./.:4:394,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:373,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.16:0.984:. ./.:4:405,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:394,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:419,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:367,4:.:-0.53:1.000:. ./.:4:428,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:377,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:328,1:.:-0.94:0.999:. ./.:4:479,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:577,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:280,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:400,3:.:-0.22:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:490,2:.: 0.65:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:458,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:345,3:.:-0.76:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:310,2:.:-1.11:1.000:. ./.:5:655,0:.: 2.25:0.951:. ./.:4:491,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:300,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:357,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:399,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:463,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:604,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:409,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:477,5:.: 0.56:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:363,5:.:-0.56:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:384,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:375,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:595,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:530,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:440,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:552,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:387,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:395,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:382,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:448,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:425,3:.: 0.03:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:445,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:420,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:397,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:439,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:441,5:.: 0.20:1.000:. ./.:4:316,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:309,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:626,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:358,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:444,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:443,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:188,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:297,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:413,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:390,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:473,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:592,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:365,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:317,3:.:-1.03:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:331,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:348,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:314,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:375,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:479,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:267,1:.:-1.54:1.000:. ./.:4:582,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:408,2:.:-0.15:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:347,1:.:-0.76:0.999:. ./.:4:437,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:496,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.36:1.000:. -chr7.1 68001334 chr7.1_068001334 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:170,0:.: 3.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.49:0.995:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:6,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.07:0.807:. ./.:4:25,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:133,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.51:1.000:. ./.:6:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.75:0.978:. ./.:4:67,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.42:0.999:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:0.984:. ./.:4:24,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.72:1.000:. ./.:5:120,0:.: 1.78:0.951:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:65,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.03:0.999:. ./.:4:89,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:37,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.31:1.000:. -chr7.1 68170376 chr7.1_068170376 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:151,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:179,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:340,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:306,2:.: 1.79:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:163,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:332,0:.: 2.10:0.995:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:197,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:155,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:356,0:.: 2.41:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:189,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:170,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.:-1.45:1.000:. ./.:3:58,0:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:139,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:333,2:.: 2.14:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:135,0:.:-0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:124,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:284,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:129,0:.:-0.55:1.000:. ./.:6:72,0:.:-1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:106,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:165,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:276,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.00:0.999:. ./.:4:315,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.69:0.984:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:160,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:119,0:.:-0.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:118,0:.:-0.70:0.999:. ./.:4:133,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:327,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:213,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:357,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:249,0:.: 1.02:0.951:. ./.:4:120,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:150,1:.:-0.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:113,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:132,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:236,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:298,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:119,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:270,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:128,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:319,3:.: 1.97:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:371,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.83:0.999:. ./.:4:282,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:159,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.24:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:368,1:.: 2.58:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:314,2:.: 1.89:1.000:. -chr7.1 68419770 chr7.1_068419770 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:150,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:46,63:.:-0.16:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:89,82:.: 1.76:1.000:. ./.:4:108,40:.: 1.05:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,34:.: 0.74:1.000:. ./.:4:9,7:.:-3.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:82,34:.: 0.06:1.000:. ./.:4:71,36:.:-0.22:1.000:. ./.:4:96,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:97,27:.: 0.31:1.000:. ./.:4:59,91:.: 1.11:1.000:. ./.:4:74,83:.: 1.32:0.995:. ./.:4:160,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:137,41:.: 1.97:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:15,3:.:-2.96:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,5:.:-3.36:1.000:. ./.:4:126,58:.: 2.16:1.000:. ./.:4:84,37:.: 0.21:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:94,26:.: 0.18:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:83,38:.: 0.21:1.000:. ./.:4:86,37:.: 0.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.43:1.000:. ./.:4:12,3:.:-3.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:109,37:.: 0.98:1.000:. ./.:4:63,89:.: 1.17:1.000:. ./.:4:95,37:.: 0.55:1.000:. ./.:4:97,33:.: 0.49:1.000:. ./.:4:65,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:84,27:.:-0.09:1.000:. ./.:4:99,30:.: 0.46:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:72,37:.:-0.16:1.000:. ./.:4:91,48:.: 0.77:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.24:0.807:. ./.:4:15,1:.:-3.02:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:65,25:.:-0.74:1.000:. ./.:4:53,24:.:-1.14:1.000:. ./.:4:123,50:.: 1.82:1.000:. ./.:4:90,28:.: 0.12:1.000:. ./.:4:109,38:.: 1.02:1.000:. ./.:4:85,33:.: 0.12:1.000:. ./.:4:81,22:.:-0.34:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:59,35:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,62:.: 0.06:1.000:. ./.:6:69,8:.:-1.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:91,40:.: 0.52:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:93,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:26,37:.:-1.57:1.000:. ./.:4:96,39:.: 0.65:1.000:. ./.:4:82,34:.: 0.06:0.978:. ./.:4:88,38:.: 0.37:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:63,24:.:-0.83:0.999:. ./.:4:117,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:73,28:.:-0.40:1.000:. ./.:4:61,63:.: 0.31:1.000:. ./.:4:84,32:.: 0.06:1.000:. ./.:4:52,64:.: 0.06:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:93,30:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,23:.:-1.05:0.989:. ./.:4:101,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:56,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:98,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:35,43:.:-1.11:1.000:. ./.:4:76,23:.:-0.46:1.000:. ./.:4:72,29:.:-0.40:1.000:. ./.:4:82,35:.: 0.09:1.000:. ./.:4:62,20:.:-0.99:0.999:. ./.:4:69,72:.: 0.83:1.000:. ./.:4:94,40:.: 0.61:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,18:.:-0.93:1.000:. ./.:4:62,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,25:.:-0.09:1.000:. ./.:4:60,71:.: 0.52:1.000:. ./.:4:50,19:.:-1.39:1.000:. ./.:4:67,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.11:1.000:. ./.:5:90,18:.:-0.19:0.951:. ./.:4:49,21:.:-1.36:1.000:. ./.:4:68,42:.:-0.13:1.000:. ./.:4:75,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,34:.: 0.28:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:113,47:.: 1.42:1.000:. ./.:4:86,31:.: 0.09:1.000:. ./.:4:110,45:.: 1.26:1.000:. ./.:4:82,26:.:-0.19:0.999:. ./.:4:83,38:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,24:.:-1.05:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:77,25:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,20:.:-0.06:1.000:. ./.:4:81,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:46,62:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,68:.: 0.80:1.000:. ./.:4:94,29:.: 0.28:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,23:.:-0.99:1.000:. ./.:4:56,24:.:-1.05:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:47,60:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,58:.:-0.06:1.000:. ./.:4:55,26:.:-1.02:1.000:. ./.:4:58,50:.:-0.19:1.000:. ./.:4:91,27:.: 0.12:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:54,18:.:-1.30:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:48,49:.:-0.53:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:56,51:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,15:.:-1.33:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:90,70:.: 1.42:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:129,51:.: 2.03:1.000:. ./.:4:49,63:.:-0.06:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:3,2:.:-3.36:1.000:. ./.:4:77,21:.:-0.50:1.000:. ./.:4:105,37:.: 0.86:1.000:. ./.:4:125,38:.: 1.51:1.000:. ./.:4:54,71:.: 0.34:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,86:.: 1.39:1.000:. ./.:4:107,32:.: 0.77:1.000:. ./.:4:85,69:.: 1.23:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:69,28:.:-0.53:1.000:. ./.:4:96,27:.: 0.28:0.999:. ./.:4:83,31:.: 0.00:1.000:. ./.:4:87,29:.: 0.06:1.000:. ./.:4:89,31:.: 0.18:1.000:. ./.:4:85,26:.:-0.09:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:103,33:.: 0.68:1.000:. ./.:4:42,59:.:-0.40:1.000:. ./.:4:75,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:107,35:.: 0.86:1.000:. ./.:4:90,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:76,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:94,39:.: 0.58:0.999:. ./.:4:120,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:115,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:88,40:.: 0.43:1.000:. -chr7.1 68597466 chr7.1_068597466 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:155,37:.: 1.85:1.000:. ./.:4:74,51:.: 0.20:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:128,31:.: 1.04:1.000:. ./.:4:68,56:.: 0.17:1.000:. ./.:4:108,31:.: 0.54:1.000:. ./.:4:78,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:133,21:.: 0.91:1.000:. ./.:4:66,37:.:-0.35:1.000:. ./.:4:6,6:.:-2.60:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:108,25:.: 0.40:1.000:. ./.:4:125,23:.: 0.77:1.000:. ./.:4:96,51:.: 0.74:1.000:. ./.:4:131,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:70,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:86,55:.: 0.59:0.995:. ./.:4:149,27:.: 1.46:1.000:. ./.:4:118,59:.: 1.48:1.000:. ./.:4:170,29:.: 2.03:1.000:. ./.:4:12,7:.:-2.43:1.000:. ./.:4:78,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:169,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:108,31:.: 0.54:1.000:. ./.:4:4,4:.:-2.70:1.000:. ./.:4:118,21:.: 0.54:1.000:. ./.:4:55,50:.:-0.30:1.000:. ./.:4:115,18:.: 0.40:1.000:. ./.:4:142,39:.: 1.58:1.000:. ./.:4:91,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:41,34:.:-1.04:1.000:. ./.:4:117,19:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.75:1.000:. ./.:4:8,9:.:-2.47:1.000:. ./.:3:6,2:.:-2.70:1.000:. ./.:4:90,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:53,38:.:-0.64:1.000:. ./.:4:96,58:.: 0.91:1.000:. ./.:4:83,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,51:.:-0.54:1.000:. ./.:4:58,55:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,51:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,14:.:-0.35:1.000:. ./.:4:85,16:.:-0.40:1.000:. ./.:4:64,51:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,45:.:-0.35:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.81:0.807:. ./.:4:15,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:79,21:.:-0.42:1.000:. ./.:4:52,4:.:-1.51:1.000:. ./.:4:63,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:107,42:.: 0.79:1.000:. ./.:4:74,32:.:-0.27:1.000:. ./.:4:70,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:105,22:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,26:.:-1.06:1.000:. ./.:4:96,27:.: 0.15:1.000:. ./.:4:60,34:.:-0.57:1.000:. ./.:4:32,59:.:-0.64:1.000:. ./.:6:84,17:.:-0.40:1.000:. ./.:4:107,22:.: 0.30:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:101,28:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,27:.: 0.17:1.000:. ./.:4:112,18:.: 0.32:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.22:1.000:. ./.:4:13,44:.:-1.49:1.000:. ./.:4:94,21:.:-0.05:1.000:. ./.:4:90,19:.:-0.20:0.978:. ./.:4:146,19:.: 1.19:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:43,26:.:-1.19:0.999:. ./.:4:115,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:119,20:.: 0.54:1.000:. ./.:4:42,33:.:-1.04:1.000:. ./.:4:100,13:.:-0.10:1.000:. ./.:4:35,67:.:-0.37:1.000:. ./.:4:136,26:.: 1.11:1.000:. ./.:4:58,49:.:-0.25:1.000:. ./.:4:99,13:.:-0.12:0.989:. ./.:4:87,50:.: 0.49:1.000:. ./.:4:119,33:.: 0.87:1.000:. ./.:4:32,53:.:-0.79:1.000:. ./.:4:62,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:114,21:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,37:.:-0.87:1.000:. ./.:4:76,20:.:-0.52:1.000:. ./.:4:54,41:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,31:.:-0.50:1.000:. ./.:4:34,42:.:-1.02:0.999:. ./.:4:68,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:100,24:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,21:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,26:.: 0.22:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:74,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:58,39:.:-0.50:1.000:. ./.:4:45,77:.: 0.12:1.000:. ./.:4:41,40:.:-0.89:1.000:. ./.:4:92,24:.:-0.03:1.000:. ./.:4:62,22:.:-0.82:1.000:. ./.:5:163,30:.: 1.88:0.951:. ./.:4:69,16:.:-0.79:1.000:. ./.:4:56,41:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,45:.:-0.89:1.000:. ./.:4:84,59:.: 0.64:1.000:. ./.:4:155,35:.: 1.81:1.000:. ./.:4:93,33:.: 0.22:1.000:. ./.:4:109,33:.: 0.62:1.000:. ./.:4:117,34:.: 0.84:1.000:. ./.:4:55,52:.:-0.25:0.999:. ./.:4:56,39:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:98,28:.: 0.22:1.000:. ./.:4:85,15:.:-0.42:1.000:. ./.:4:47,34:.:-0.89:1.000:. ./.:4:63,39:.:-0.37:1.000:. ./.:4:79,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:115,21:.: 0.47:1.000:. ./.:4:72,37:.:-0.20:1.000:. ./.:4:65,41:.:-0.27:1.000:. ./.:4:122,23:.: 0.69:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:105,29:.: 0.42:1.000:. ./.:4:79,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:50,25:.:-1.04:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:20,45:.:-1.29:1.000:. ./.:4:56,58:.:-0.07:1.000:. ./.:4:54,8:.:-1.36:1.000:. ./.:4:31,33:.:-1.31:1.000:. ./.:4:83,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:129,26:.: 0.94:1.000:. ./.:4:126,33:.: 1.04:1.000:. ./.:4:76,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:52,26:.:-0.97:1.000:. ./.:4:97,12:.:-0.20:1.000:. ./.:4:83,23:.:-0.27:1.000:. ./.:4:40,72:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,31:.:-0.99:1.000:. ./.:4:209,45:.: 3.39:1.000:. ./.:4:119,59:.: 1.51:1.000:. ./.:4:172,28:.: 2.05:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:53,41:.:-0.57:1.000:. ./.:4:83,57:.: 0.57:1.000:. ./.:4:194,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:5,8:.:-2.57:1.000:. ./.:4:81,37:.: 0.02:1.000:. ./.:4:60,31:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,58:.: 0.25:1.000:. ./.:4:90,78:.: 1.26:1.000:. ./.:4:99,22:.: 0.10:1.000:. ./.:4:134,23:.: 0.99:1.000:. ./.:4:61,44:.:-0.30:1.000:. ./.:4:163,29:.: 1.85:1.000:. ./.:4:57,40:.:-0.50:1.000:. ./.:4:111,18:.: 0.30:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:72,11:.:-0.84:1.000:. ./.:4:113,27:.: 0.57:1.000:. ./.:4:95,18:.:-0.10:1.000:. ./.:4:139,32:.: 1.34:0.999:. ./.:4:70,30:.:-0.42:1.000:. ./.:4:106,54:.: 1.06:1.000:. ./.:4:83,20:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,19:.:-0.35:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:106,13:.: 0.05:1.000:. ./.:4:55,21:.:-1.02:1.000:. ./.:4:89,41:.: 0.32:1.000:. ./.:4:116,28:.: 0.67:1.000:. ./.:4:91,36:.: 0.25:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:138,21:.: 1.04:1.000:. ./.:4:64,49:.:-0.10:0.999:. ./.:4:104,26:.: 0.32:1.000:. ./.:4:78,52:.: 0.32:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:154,42:.: 1.95:1.000:. -chr7.1 68777119 chr7.1_068777119 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:401,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:454,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:428,0:.: 1.64:0.995:. ./.:4:330,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:499,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:404,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.31:1.000:. ./.:3:80,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:538,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.68:0.807:. ./.:4:56,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.88:1.000:. ./.:6:152,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.09:0.978:. ./.:4:227,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.56:0.999:. ./.:4:221,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.04:0.989:. ./.:4:265,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:313,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.33:1.000:. ./.:5:288,0:.: 0.23:0.951:. ./.:4:208,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.89:0.999:. ./.:4:262,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:495,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:528,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:369,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:466,0:.: 2.02:0.999:. ./.:4:327,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.53:0.999:. ./.:4:301,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.16:1.000:. -chr7.1 69121018 chr7.1_069121018 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:335,66:.: 1.67:1.000:. ./.:4:177,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:286,40:.: 0.73:1.000:. ./.:4:305,18:.: 0.69:1.000:. ./.:4:368,26:.: 1.58:1.000:. ./.:4:345,50:.: 1.59:1.000:. ./.:4:243,50:.: 0.32:1.000:. ./.:4:305,30:.: 0.84:1.000:. ./.:4:336,19:.: 1.09:1.000:. ./.:4:168,12:.:-1.10:1.000:. ./.:4:184,27:.:-0.71:1.000:. ./.:4:279,33:.: 0.55:1.000:. ./.:4:252,42:.: 0.33:1.000:. ./.:4:360,21:.: 1.42:1.000:. ./.:4:294,35:.: 0.77:1.000:. ./.:4:351,25:.: 1.35:1.000:. ./.:4:251,46:.: 0.37:0.995:. ./.:4:136,127:.:-0.06:1.000:. ./.:4:335,18:.: 1.07:1.000:. ./.:4:313,52:.: 1.22:1.000:. ./.:4:90,22:.:-1.95:1.000:. ./.:4:140,54:.:-0.92:1.000:. ./.:4:409,41:.: 2.28:1.000:. ./.:4:253,55:.: 0.50:1.000:. ./.:4:124,7:.:-1.71:1.000:. ./.:4:386,40:.: 1.98:1.000:. ./.:4:270,25:.: 0.34:1.000:. ./.:4:266,38:.: 0.45:1.000:. ./.:4:200,67:.:-0.01:1.000:. ./.:4:253,16:.: 0.02:1.000:. ./.:4:364,23:.: 1.49:1.000:. ./.:4:262,66:.: 0.75:1.000:. ./.:4:78,11:.:-2.23:1.000:. ./.:4:148,5:.:-1.43:1.000:. ./.:3:43,4:.:-2.76:1.000:. ./.:4:260,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:354,27:.: 1.42:1.000:. ./.:4:224,29:.:-0.18:1.000:. ./.:4:304,32:.: 0.85:1.000:. ./.:4:329,21:.: 1.03:1.000:. ./.:4:329,16:.: 0.97:1.000:. ./.:4:214,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:142,62:.:-0.80:1.000:. ./.:4:254,36:.: 0.28:1.000:. ./.:4:350,8:.: 1.13:1.000:. ./.:4:335,20:.: 1.09:1.000:. ./.:4:413,40:.: 2.32:0.807:. ./.:4:219,21:.:-0.35:1.000:. ./.:4:270,50:.: 0.65:1.000:. ./.:4:252,46:.: 0.38:1.000:. ./.:4:144,9:.:-1.43:1.000:. ./.:4:394,13:.: 1.74:1.000:. ./.:4:228,40:.: 0.00:1.000:. ./.:4:259,25:.: 0.20:1.000:. ./.:4:255,36:.: 0.29:1.000:. ./.:4:296,22:.: 0.63:1.000:. ./.:4:220,47:.:-0.01:1.000:. ./.:4:216,37:.:-0.18:1.000:. ./.:4:264,21:.: 0.22:1.000:. ./.:6:168,17:.:-1.03:1.000:. ./.:4:233,39:.: 0.05:1.000:. ./.:4:175,75:.:-0.22:1.000:. ./.:4:300,35:.: 0.84:1.000:. ./.:4:247,29:.: 0.10:1.000:. ./.:4:283,47:.: 0.78:1.000:. ./.:4:156,50:.:-0.77:1.000:. ./.:4:207,10:.:-0.63:1.000:. ./.:4:222,28:.:-0.22:1.000:. ./.:4:289,31:.: 0.65:0.978:. ./.:4:117,67:.:-1.05:1.000:. ./.:4:194,59:.:-0.18:1.000:. ./.:4:222,15:.:-0.38:0.999:. ./.:4:132,82:.:-0.67:1.000:. ./.:4:301,61:.: 1.18:1.000:. ./.:4:181,103:.: 0.20:1.000:. ./.:4:190,26:.:-0.65:1.000:. ./.:4:234,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,16:.:-1.73:1.000:. ./.:4:246,47:.: 0.32:1.000:. ./.:4:184,18:.:-0.82:1.000:. ./.:4:140,41:.:-1.08:0.989:. ./.:4:202,39:.:-0.33:1.000:. ./.:4:131,41:.:-1.20:1.000:. ./.:4:239,24:.:-0.06:1.000:. ./.:4:251,14:.:-0.03:1.000:. ./.:4:155,61:.:-0.65:1.000:. ./.:4:210,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:204,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:257,13:.: 0.03:1.000:. ./.:4:193,37:.:-0.47:1.000:. ./.:4:257,18:.: 0.09:0.999:. ./.:4:250,8:.:-0.12:1.000:. ./.:4:247,40:.: 0.24:1.000:. ./.:4:103,33:.:-1.65:1.000:. ./.:4:200,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:326,34:.: 1.15:1.000:. ./.:4:207,17:.:-0.55:1.000:. ./.:4:62,29:.:-2.21:1.000:. ./.:4:244,14:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,14:.:-1.31:1.000:. ./.:4:172,38:.:-0.72:1.000:. ./.:4:245,17:.:-0.07:1.000:. ./.:4:170,22:.:-0.95:1.000:. ./.:5:331,30:.: 1.17:0.951:. ./.:4:259,13:.: 0.05:1.000:. ./.:4:257,14:.: 0.04:1.000:. ./.:4:121,12:.:-1.68:1.000:. ./.:4:252,16:.: 0.00:1.000:. ./.:4:302,45:.: 0.99:1.000:. ./.:4:317,16:.: 0.82:1.000:. ./.:4:252,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:209,58:.:-0.01:1.000:. ./.:4:155,18:.:-1.18:0.999:. ./.:4:276,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:156,12:.:-1.25:1.000:. ./.:4:252,31:.: 0.19:1.000:. ./.:4:206,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:170,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:144,19:.:-1.31:1.000:. ./.:4:194,20:.:-0.67:1.000:. ./.:4:244,25:.: 0.02:1.000:. ./.:4:173,20:.:-0.93:1.000:. ./.:4:187,30:.:-0.63:1.000:. ./.:4:305,55:.: 1.15:1.000:. ./.:4:291,32:.: 0.69:1.000:. ./.:4:197,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:198,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:169,32:.:-0.83:1.000:. ./.:4:128,43:.:-1.21:1.000:. ./.:4:230,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:229,23:.:-0.20:1.000:. ./.:4:327,11:.: 0.88:1.000:. ./.:4:132,22:.:-1.42:1.000:. ./.:4:111,21:.:-1.70:1.000:. ./.:4:65,41:.:-2.02:1.000:. ./.:4:338,26:.: 1.20:1.000:. ./.:4:144,35:.:-1.11:1.000:. ./.:4:75,34:.:-1.98:1.000:. ./.:4:241,53:.: 0.33:1.000:. ./.:4:233,12:.:-0.28:1.000:. ./.:4:227,48:.: 0.09:1.000:. ./.:4:114,45:.:-1.36:1.000:. ./.:4:154,14:.:-1.25:1.000:. ./.:4:56,24:.:-2.35:1.000:. ./.:4:350,73:.: 1.94:1.000:. ./.:4:479,18:.: 2.87:1.000:. ./.:4:258,47:.: 0.47:1.000:. ./.:4:220,63:.: 0.19:1.000:. ./.:4:234,29:.:-0.06:1.000:. ./.:4:195,24:.:-0.61:1.000:. ./.:4:263,47:.: 0.53:1.000:. ./.:4:212,33:.:-0.28:1.000:. ./.:4:107,14:.:-1.83:1.000:. ./.:4:210,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:245,45:.: 0.28:1.000:. ./.:4:208,41:.:-0.23:1.000:. ./.:4:266,60:.: 0.73:1.000:. ./.:4:276,29:.: 0.47:1.000:. ./.:4:248,46:.: 0.33:1.000:. ./.:4:267,25:.: 0.30:1.000:. ./.:4:263,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:191,5:.:-0.90:1.000:. ./.:4:230,42:.: 0.05:1.000:. ./.:4:302,28:.: 0.78:1.000:. ./.:4:272,28:.: 0.40:1.000:. ./.:4:161,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:206,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:295,65:.: 1.15:0.999:. ./.:4:227,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:330,19:.: 1.02:1.000:. ./.:4:276,22:.: 0.38:1.000:. ./.:4:319,16:.: 0.84:1.000:. ./.:4:334,34:.: 1.25:1.000:. ./.:4:292,12:.: 0.45:1.000:. ./.:4:262,14:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,29:.:-1.67:1.000:. ./.:4:283,51:.: 0.83:1.000:. ./.:4:249,12:.:-0.08:1.000:. ./.:4:369,39:.: 1.75:1.000:. ./.:4:248,55:.: 0.44:1.000:. ./.:4:373,27:.: 1.65:0.999:. ./.:4:308,50:.: 1.13:1.000:. ./.:4:310,29:.: 0.89:1.000:. ./.:4:268,36:.: 0.45:1.000:. ./.:4:171,58:.:-0.48:1.000:. -chr7.1 69573178 chr7.1_069573178 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:717,106:.: 0.49:1.000:. ./.:4:674,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:527,85:.:-0.88:1.000:. ./.:4:746,97:.: 0.62:1.000:. ./.:4:652,276:.: 1.18:1.000:. ./.:4:506,120:.:-0.79:1.000:. ./.:4:529,205:.:-0.09:1.000:. ./.:4:465,109:.:-1.13:1.000:. ./.:4:619,232:.: 0.67:1.000:. ./.:4:314,43:.:-2.54:1.000:. ./.:4:311,62:.:-2.44:1.000:. ./.:4:894,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:613,199:.: 0.42:1.000:. ./.:4:685,113:.: 0.33:1.000:. ./.:4:761,104:.: 0.77:1.000:. ./.:4:534,224:.: 0.07:1.000:. ./.:4:629,155:.: 0.24:0.995:. ./.:4:781,117:.: 0.98:1.000:. ./.:4:837,125:.: 1.40:1.000:. ./.:4:769,120:.: 0.92:1.000:. ./.:4:397,78:.:-1.77:1.000:. ./.:4:514,230:.:-0.02:1.000:. ./.:4:728,114:.: 0.62:1.000:. ./.:4:533,191:.:-0.15:1.000:. ./.:4:278,79:.:-2.54:1.000:. ./.:4:845,134:.: 1.51:1.000:. ./.:4:431,237:.:-0.52:1.000:. ./.:4:709,240:.: 1.31:1.000:. ./.:4:727,114:.: 0.61:1.000:. ./.:4:636,266:.: 1.01:1.000:. ./.:4:699,311:.: 1.71:1.000:. ./.:4:612,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:309,39:.:-2.60:1.000:. ./.:4:432,104:.:-1.38:1.000:. ./.:3:252,56:.:-2.86:1.000:. ./.:4:794,264:.: 2.02:1.000:. ./.:4:560,197:.: 0.06:1.000:. ./.:4:729,95:.: 0.50:1.000:. ./.:4:612,128:.:-0.05:1.000:. ./.:4:769,271:.: 1.91:1.000:. ./.:4:755,109:.: 0.76:1.000:. ./.:4:559,256:.: 0.44:1.000:. ./.:4:581,262:.: 0.62:1.000:. ./.:4:526,217:.:-0.03:1.000:. ./.:4:739,245:.: 1.54:1.000:. ./.:4:597,214:.: 0.41:1.000:. ./.:4:742,132:.: 0.82:0.807:. ./.:4:494,89:.:-1.07:1.000:. ./.:4:577,215:.: 0.29:1.000:. ./.:4:974,155:.: 2.49:1.000:. ./.:4:566,80:.:-0.66:1.000:. ./.:4:718,116:.: 0.56:1.000:. ./.:4:426,156:.:-1.08:1.000:. ./.:4:504,237:.:-0.04:1.000:. ./.:4:441,93:.:-1.39:1.000:. ./.:4:650,266:.: 1.10:1.000:. ./.:4:528,213:.:-0.04:1.000:. ./.:4:778,276:.: 2.00:1.000:. ./.:4:787,216:.: 1.66:1.000:. ./.:6:622,79:.:-0.30:1.000:. ./.:4:771,99:.: 0.80:1.000:. ./.:4:492,89:.:-1.08:1.000:. ./.:4:564,118:.:-0.43:1.000:. ./.:4:709,127:.: 0.58:1.000:. ./.:4:675,117:.: 0.29:1.000:. ./.:4:565,203:.: 0.13:1.000:. ./.:4:664,218:.: 0.88:1.000:. ./.:4:611,201:.: 0.42:1.000:. ./.:4:881,146:.: 1.82:0.978:. ./.:4:722,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:705,134:.: 0.60:1.000:. ./.:4:559,84:.:-0.68:0.999:. ./.:4:1026,2:.: 1.83:1.000:. ./.:4:591,107:.:-0.32:1.000:. ./.:4:749,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:393,173:.:-1.18:1.000:. ./.:4:518,82:.:-0.96:1.000:. ./.:4:561,198:.: 0.08:1.000:. ./.:4:702,113:.: 0.44:1.000:. ./.:4:581,218:.: 0.34:1.000:. ./.:4:697,0:.:-0.33:0.989:. ./.:4:716,212:.: 1.18:1.000:. ./.:4:602,237:.: 0.60:1.000:. ./.:4:546,188:.:-0.09:1.000:. ./.:4:919,111:.: 1.84:1.000:. ./.:4:567,240:.: 0.39:1.000:. ./.:4:431,155:.:-1.05:1.000:. ./.:4:510,173:.:-0.42:1.000:. ./.:4:489,198:.:-0.39:1.000:. ./.:4:688,184:.: 0.81:1.000:. ./.:4:507,171:.:-0.45:0.999:. ./.:4:610,89:.:-0.32:1.000:. ./.:4:539,125:.:-0.54:1.000:. ./.:4:419,139:.:-1.23:1.000:. ./.:4:514,203:.:-0.20:1.000:. ./.:4:817,119:.: 1.23:1.000:. ./.:4:637,82:.:-0.19:1.000:. ./.:4:839,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:608,200:.: 0.39:1.000:. ./.:4:573,209:.: 0.23:1.000:. ./.:4:516,84:.:-0.96:1.000:. ./.:4:689,127:.: 0.45:1.000:. ./.:4:456,149:.:-0.93:1.000:. ./.:5:708,99:.: 0.39:0.951:. ./.:4:511,84:.:-0.99:1.000:. ./.:4:499,167:.:-0.53:1.000:. ./.:4:474,188:.:-0.56:1.000:. ./.:4:699,111:.: 0.41:1.000:. ./.:4:919,134:.: 1.99:1.000:. ./.:4:647,90:.:-0.07:1.000:. ./.:4:596,91:.:-0.39:1.000:. ./.:4:721,314:.: 1.87:1.000:. ./.:4:561,187:.: 0.00:0.999:. ./.:4:532,203:.:-0.08:1.000:. ./.:4:398,94:.:-1.66:1.000:. ./.:4:548,205:.: 0.04:1.000:. ./.:4:489,89:.:-1.10:1.000:. ./.:4:401,185:.:-1.05:1.000:. ./.:4:549,66:.:-0.86:1.000:. ./.:4:510,171:.:-0.43:1.000:. ./.:4:633,182:.: 0.44:1.000:. ./.:4:547,95:.:-0.69:1.000:. ./.:4:467,230:.:-0.33:1.000:. ./.:4:543,255:.: 0.33:1.000:. ./.:4:625,95:.:-0.18:1.000:. ./.:4:627,100:.:-0.13:1.000:. ./.:4:562,183:.:-0.02:1.000:. ./.:4:764,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:444,171:.:-0.86:1.000:. ./.:4:572,81:.:-0.62:1.000:. ./.:4:552,176:.:-0.13:1.000:. ./.:4:533,194:.:-0.13:1.000:. ./.:4:392,136:.:-1.43:1.000:. ./.:4:495,225:.:-0.18:1.000:. ./.:4:532,171:.:-0.29:1.000:. ./.:4:844,262:.: 2.34:1.000:. ./.:4:689,115:.: 0.37:1.000:. ./.:4:543,196:.:-0.05:1.000:. ./.:4:444,77:.:-1.48:1.000:. ./.:4:511,175:.:-0.40:1.000:. ./.:4:525,195:.:-0.18:1.000:. ./.:4:522,183:.:-0.28:1.000:. ./.:4:605,196:.: 0.35:1.000:. ./.:4:435,149:.:-1.06:1.000:. ./.:4:766,124:.: 0.93:1.000:. ./.:4:809,137:.: 1.29:1.000:. ./.:4:610,111:.:-0.17:1.000:. ./.:4:560,102:.:-0.56:1.000:. ./.:4:449,218:.:-0.52:1.000:. ./.:4:536,113:.:-0.64:1.000:. ./.:4:675,127:.: 0.36:1.000:. ./.:4:527,196:.:-0.16:1.000:. ./.:4:264,53:.:-2.80:1.000:. ./.:4:468,77:.:-1.32:1.000:. ./.:4:489,280:.: 0.14:1.000:. ./.:4:414,213:.:-0.78:1.000:. ./.:4:491,250:.:-0.04:1.000:. ./.:4:735,245:.: 1.51:1.000:. ./.:4:597,92:.:-0.38:1.000:. ./.:4:538,197:.:-0.08:1.000:. ./.:4:444,90:.:-1.39:1.000:. ./.:4:475,183:.:-0.58:1.000:. ./.:4:522,193:.:-0.21:1.000:. ./.:4:638,108:.:-0.01:1.000:. ./.:4:713,254:.: 1.43:1.000:. ./.:4:516,187:.:-0.29:1.000:. ./.:4:499,94:.:-1.01:1.000:. ./.:4:739,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:469,229:.:-0.32:1.000:. ./.:4:573,104:.:-0.46:1.000:. ./.:4:419,108:.:-1.44:1.000:. ./.:4:414,80:.:-1.65:1.000:. ./.:4:581,102:.:-0.42:1.000:. ./.:4:515,203:.:-0.19:1.000:. ./.:4:678,106:.: 0.24:1.000:. ./.:4:563,215:.: 0.20:1.000:. ./.:4:691,293:.: 1.54:1.000:. ./.:4:669,106:.: 0.18:1.000:. ./.:4:728,120:.: 0.66:1.000:. ./.:4:664,113:.: 0.19:1.000:. ./.:4:593,260:.: 0.69:0.999:. ./.:4:814,302:.: 2.40:1.000:. ./.:4:522,264:.: 0.25:1.000:. ./.:4:546,101:.:-0.65:1.000:. ./.:4:712,0:.:-0.23:1.000:. -chr7.1 69639650 chr7.1_069639650 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,98:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.20:1.000:. ./.:4:29,104:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,113:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.89:1.000:. ./.:4:21,60:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.33:1.000:. ./.:4:26,121:.: 0.56:1.000:. ./.:4:11,57:.:-2.05:1.000:. ./.:4:0,73:.:-1.88:1.000:. ./.:4:0,96:.:-1.12:1.000:. ./.:4:30,98:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,90:.:-0.46:1.000:. ./.:4:39,99:.: 0.26:1.000:. ./.:4:57,110:.: 1.22:1.000:. ./.:4:48,94:.: 0.39:0.995:. ./.:4:68,135:.: 2.40:1.000:. ./.:4:43,127:.: 1.31:1.000:. ./.:4:42,127:.: 1.28:1.000:. ./.:4:20,14:.:-3.17:1.000:. ./.:4:30,102:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.52:1.000:. ./.:4:35,85:.:-0.33:1.000:. ./.:4:29,40:.:-2.01:1.000:. ./.:4:42,100:.: 0.39:1.000:. ./.:4:30,104:.: 0.13:1.000:. ./.:4:35,104:.: 0.29:1.000:. ./.:4:55,130:.: 1.81:1.000:. ./.:4:29,108:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,85:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,84:.:-0.86:1.000:. ./.:4:5,17:.:-3.56:1.000:. ./.:4:48,47:.:-1.16:1.000:. ./.:3:18,9:.:-3.40:1.000:. ./.:4:86,67:.: 0.75:1.000:. ./.:4:43,79:.:-0.27:1.000:. ./.:4:28,98:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.17:1.000:. ./.:4:78,56:.: 0.13:1.000:. ./.:4:35,84:.:-0.37:1.000:. ./.:4:37,143:.: 1.64:1.000:. ./.:4:29,132:.: 1.02:1.000:. ./.:4:36,88:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,102:.:-0.14:1.000:. ./.:4:29,91:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,186:.: 1.84:0.807:. ./.:4:0,82:.:-1.59:1.000:. ./.:4:26,86:.:-0.60:1.000:. ./.:4:44,95:.: 0.29:1.000:. ./.:4:32,81:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,137:.: 1.94:1.000:. ./.:4:56,88:.: 0.46:1.000:. ./.:4:34,88:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,124:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,119:.: 0.56:1.000:. ./.:4:26,80:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:76,50:.:-0.14:1.000:. ./.:6:22,86:.:-0.73:1.000:. ./.:4:34,85:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.72:1.000:. ./.:4:14,99:.:-0.56:1.000:. ./.:4:33,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:41,97:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,40:.:-1.35:1.000:. ./.:4:49,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:40,88:.:-0.07:0.969:. ./.:4:1,106:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,72:.:-1.22:0.999:. ./.:4:0,147:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,131:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.76:1.000:. ./.:4:35,89:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,119:.:-0.37:1.000:. ./.:4:84,68:.: 0.72:1.000:. ./.:4:47,77:.:-0.20:1.000:. ./.:4:34,131:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,91:.:-1.29:0.989:. ./.:4:88,90:.: 1.58:1.000:. ./.:4:39,126:.: 1.15:1.000:. ./.:4:89,48:.: 0.23:1.000:. ./.:4:28,103:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,123:.: 0.92:1.000:. ./.:4:40,73:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,117:.: 0.75:1.000:. ./.:4:35,77:.:-0.60:1.000:. ./.:4:77,66:.: 0.42:1.000:. ./.:4:19,81:.:-0.99:0.999:. ./.:4:45,77:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.23:1.000:. ./.:4:22,96:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,117:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,90:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.16:1.000:. ./.:4:38,157:.: 2.14:1.000:. ./.:4:95,68:.: 1.08:1.000:. ./.:4:28,65:.:-1.22:1.000:. ./.:4:1,148:.: 0.62:1.000:. ./.:4:28,73:.:-0.96:1.000:. ./.:5:0,178:.: 1.58:0.951:. ./.:4:0,94:.:-1.19:1.000:. ./.:4:20,79:.:-1.03:1.000:. ./.:4:35,91:.:-0.14:1.000:. ./.:4:26,88:.:-0.53:1.000:. ./.:4:51,154:.: 2.47:1.000:. ./.:4:40,68:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,89:.: 0.23:1.000:. ./.:4:57,112:.: 1.28:1.000:. ./.:4:23,96:.:-0.37:0.999:. ./.:4:25,109:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,108:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.89:1.000:. ./.:4:30,85:.:-0.50:1.000:. ./.:4:33,85:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,111:.: 0.75:1.000:. ./.:4:31,117:.: 0.59:1.000:. ./.:4:44,89:.: 0.10:1.000:. ./.:4:45,87:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,105:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,135:.: 0.26:1.000:. ./.:4:31,100:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.89:1.000:. ./.:4:39,65:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.99:1.000:. ./.:4:70,56:.:-0.14:1.000:. ./.:4:36,91:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,81:.:-0.53:1.000:. ./.:4:88,80:.: 1.25:1.000:. ./.:4:79,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,136:.: 1.41:1.000:. ./.:4:28,94:.:-0.27:1.000:. ./.:4:66,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.79:1.000:. ./.:4:35,82:.:-0.43:1.000:. ./.:4:33,110:.: 0.42:1.000:. ./.:4:28,107:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,59:.: 0.13:1.000:. ./.:4:59,51:.:-0.66:1.000:. ./.:4:41,119:.: 0.98:1.000:. ./.:4:61,138:.: 2.27:1.000:. ./.:4:34,80:.:-0.53:1.000:. ./.:4:3,161:.: 1.12:1.000:. ./.:4:43,145:.: 1.91:1.000:. ./.:4:51,104:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,167:.: 1.22:1.000:. ./.:4:37,99:.: 0.19:1.000:. ./.:4:16,28:.:-2.84:1.000:. ./.:4:28,77:.:-0.83:1.000:. ./.:4:26,122:.: 0.59:1.000:. ./.:4:40,97:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,92:.: 0.49:1.000:. ./.:4:34,99:.: 0.10:1.000:. ./.:4:28,76:.:-0.86:1.000:. ./.:4:49,120:.: 1.28:1.000:. ./.:4:49,88:.: 0.23:1.000:. ./.:4:34,105:.: 0.29:1.000:. ./.:4:21,72:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,119:.: 0.66:1.000:. ./.:4:39,127:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.79:0.999:. ./.:4:28,108:.: 0.19:1.000:. ./.:4:34,70:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,85:.:-0.40:1.000:. ./.:4:42,68:.:-0.66:1.000:. ./.:4:55,56:.:-0.63:1.000:. ./.:4:49,114:.: 1.08:1.000:. ./.:4:36,102:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,164:.: 1.12:1.000:. ./.:4:34,69:.:-0.89:1.000:. ./.:4:41,85:.:-0.14:0.999:. ./.:4:39,150:.: 1.94:1.000:. ./.:4:38,122:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.29:1.000:. -chr7.1 69797102 chr7.1_069797102 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,39:.: 0.56:1.000:. ./.:4:24,9:.:-1.05:1.000:. ./.:4:31,25:.: 0.19:1.000:. ./.:4:19,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:31,53:.: 1.69:1.000:. ./.:4:25,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:12,27:.:-0.73:1.000:. ./.:4:38,21:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,34:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,19:.:-1.21:1.000:. ./.:4:15,7:.:-1.64:1.000:. ./.:4:28,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:25,32:.: 0.24:1.000:. ./.:4:23,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,25:.:-0.40:1.000:. ./.:4:19,31:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,39:.: 0.35:0.995:. ./.:4:21,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:35,43:.: 1.37:1.000:. ./.:4:23,46:.: 0.89:1.000:. ./.:4:2,21:.:-1.58:1.000:. ./.:4:17,21:.:-0.78:1.000:. ./.:4:24,46:.: 0.94:1.000:. ./.:4:14,27:.:-0.62:1.000:. ./.:4:9,20:.:-1.26:1.000:. ./.:4:24,37:.: 0.46:1.000:. ./.:4:15,18:.:-1.05:1.000:. ./.:4:15,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:17,55:.: 1.05:1.000:. ./.:4:18,37:.: 0.13:1.000:. ./.:4:24,35:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:13,5:.:-1.85:1.000:. ./.:4:5,15:.:-1.74:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:12,36:.:-0.24:1.000:. ./.:4:18,25:.:-0.51:1.000:. ./.:4:17,22:.:-0.73:1.000:. ./.:4:33,37:.: 0.94:1.000:. ./.:4:11,15:.:-1.42:1.000:. ./.:4:24,26:.:-0.13:1.000:. ./.:4:22,17:.:-0.73:1.000:. ./.:4:25,30:.: 0.13:1.000:. ./.:4:13,20:.:-1.05:1.000:. ./.:4:23,34:.: 0.24:1.000:. ./.:4:27,19:.:-0.35:1.000:. ./.:3:24,29:.: 0.03:0.633:. ./.:4:12,9:.:-1.69:1.000:. ./.:4:18,19:.:-0.83:1.000:. ./.:4:4,15:.:-1.80:1.000:. ./.:4:14,15:.:-1.26:1.000:. ./.:4:22,18:.:-0.67:1.000:. ./.:4:31,10:.:-0.62:1.000:. ./.:4:30,55:.: 1.74:1.000:. ./.:4:13,42:.: 0.13:1.000:. ./.:4:26,21:.:-0.30:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.83:1.000:. ./.:4:18,41:.: 0.35:1.000:. ./.:4:18,28:.:-0.35:1.000:. ./.:6:19,21:.:-0.67:1.000:. ./.:4:27,36:.: 0.56:1.000:. ./.:4:27,17:.:-0.46:1.000:. ./.:4:56,48:.: 2.76:1.000:. ./.:4:22,22:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,40:.: 0.40:1.000:. ./.:4:22,22:.:-0.46:1.000:. ./.:4:9,19:.:-1.32:1.000:. ./.:4:16,47:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,23:.:-0.62:0.969:. ./.:4:28,26:.: 0.08:1.000:. ./.:4:46,60:.: 2.87:1.000:. ./.:4:15,26:.:-0.62:0.999:. ./.:4:42,30:.: 1.05:1.000:. ./.:4:23,29:.:-0.03:1.000:. ./.:4:44,36:.: 1.48:1.000:. ./.:4:17,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,19:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:33,44:.: 1.31:1.000:. ./.:4:25,28:.: 0.03:1.000:. ./.:4:24,25:.:-0.19:0.989:. ./.:4:18,34:.:-0.03:1.000:. ./.:4:24,23:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:19,23:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,40:.: 1.05:1.000:. ./.:4:18,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:20,21:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,42:.: 0.83:1.000:. ./.:4:12,19:.:-1.15:1.000:. ./.:4:9,19:.:-1.32:0.999:. ./.:4:27,31:.: 0.29:1.000:. ./.:4:44,51:.: 2.28:1.000:. ./.:4:11,15:.:-1.42:1.000:. ./.:4:33,59:.: 2.12:1.000:. ./.:4:45,44:.: 1.96:1.000:. ./.:4:27,55:.: 1.58:1.000:. ./.:4:32,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,34:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,16:.:-0.89:1.000:. ./.:4:12,31:.:-0.51:1.000:. ./.:4:37,36:.: 1.10:1.000:. ./.:4:22,34:.: 0.19:1.000:. ./.:5:45,65:.: 3.09:0.951:. ./.:4:31,36:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,35:.: 0.89:1.000:. ./.:4:27,19:.:-0.35:1.000:. ./.:4:19,10:.:-1.26:1.000:. ./.:4:27,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:27,19:.:-0.35:1.000:. ./.:4:20,60:.: 1.48:1.000:. ./.:4:27,52:.: 1.42:1.000:. ./.:4:32,61:.: 2.17:0.999:. ./.:4:36,62:.: 2.44:1.000:. ./.:4:10,32:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,46:.: 0.46:1.000:. ./.:4:25,42:.: 0.78:1.000:. ./.:4:16,26:.:-0.56:1.000:. ./.:4:31,25:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,34:.: 0.40:1.000:. ./.:4:27,24:.:-0.08:1.000:. ./.:4:35,41:.: 1.26:1.000:. ./.:4:27,27:.: 0.08:1.000:. ./.:4:20,31:.:-0.08:1.000:. ./.:4:32,27:.: 0.35:1.000:. ./.:4:30,44:.: 1.15:1.000:. ./.:4:32,16:.:-0.24:1.000:. ./.:4:28,15:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,35:.:-0.13:1.000:. ./.:4:19,23:.:-0.56:1.000:. ./.:4:19,25:.:-0.46:1.000:. ./.:4:16,47:.: 0.56:1.000:. ./.:4:20,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:19,13:.:-1.10:1.000:. ./.:4:5,23:.:-1.32:1.000:. ./.:4:17,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:22,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:14,49:.: 0.56:1.000:. ./.:4:36,37:.: 1.10:1.000:. ./.:4:32,43:.: 1.21:1.000:. ./.:4:27,36:.: 0.56:1.000:. ./.:4:30,45:.: 1.21:1.000:. ./.:4:14,15:.:-1.26:1.000:. ./.:4:5,22:.:-1.37:1.000:. ./.:4:28,43:.: 0.99:1.000:. ./.:4:19,24:.:-0.51:1.000:. ./.:4:31,61:.: 2.12:1.000:. ./.:4:16,25:.:-0.62:1.000:. ./.:4:16,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:16,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:28,20:.:-0.24:1.000:. ./.:4:23,37:.: 0.40:1.000:. ./.:4:9,8:.:-1.91:1.000:. ./.:4:26,23:.:-0.19:1.000:. ./.:4:25,34:.: 0.35:1.000:. ./.:4:26,24:.:-0.13:1.000:. ./.:4:31,35:.: 0.72:1.000:. ./.:4:24,26:.:-0.13:1.000:. ./.:4:21,42:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,55:.: 1.10:1.000:. ./.:4:22,58:.: 1.48:1.000:. ./.:4:20,26:.:-0.35:1.000:. ./.:4:24,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,54:.: 1.64:1.000:. ./.:4:8,12:.:-1.74:1.000:. ./.:4:22,29:.:-0.08:1.000:. ./.:4:30,30:.: 0.40:1.000:. ./.:4:36,37:.: 1.10:0.999:. ./.:4:17,28:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,25:.:-0.40:1.000:. ./.:4:26,14:.:-0.67:1.000:. ./.:4:16,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:23,27:.:-0.13:1.000:. ./.:4:16,36:.:-0.03:1.000:. ./.:4:18,25:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,15:.:-1.21:1.000:. ./.:4:33,35:.: 0.83:1.000:. ./.:4:27,38:.: 0.67:1.000:. ./.:4:25,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:28,48:.: 1.26:1.000:. ./.:4:29,13:.:-0.56:0.999:. ./.:4:25,24:.:-0.19:1.000:. ./.:4:26,35:.: 0.46:1.000:. ./.:4:32,34:.: 0.72:1.000:. ./.:4:23,24:.:-0.30:1.000:. -chr7.1 69958756 chr7.1_069958756 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:415,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:248,51:.:-0.47:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:290,77:.: 0.31:1.000:. ./.:4:293,61:.: 0.16:1.000:. ./.:4:212,37:.:-1.04:1.000:. ./.:4:254,58:.:-0.32:1.000:. ./.:4:279,52:.:-0.10:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:106,5:.:-2.62:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:232,67:.:-0.47:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:284,59:.: 0.03:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.01:0.995:. ./.:4:406,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:478,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:378,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,0:.:-3.16:1.000:. ./.:4:290,55:.: 0.06:1.000:. ./.:4:324,63:.: 0.54:1.000:. ./.:4:264,59:.:-0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:385,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:256,61:.:-0.26:1.000:. ./.:4:290,65:.: 0.17:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:326,55:.: 0.47:1.000:. ./.:4:351,58:.: 0.79:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:67,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:164,3:.:-1.98:1.000:. ./.:3:39,0:.:-3.45:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:295,60:.: 0.17:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:269,76:.: 0.06:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:304,56:.: 0.23:1.000:. ./.:4:323,65:.: 0.55:1.000:. ./.:4:266,60:.:-0.16:1.000:. ./.:4:436,81:.: 2.03:1.000:. ./.:4:331,59:.: 0.57:1.000:. ./.:3:327,80:.: 0.77:0.633:. ./.:4:790,32:.: 5.52:1.000:. ./.:4:284,62:.: 0.07:1.000:. ./.:4:540,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:461,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:192,42:.:-1.21:1.000:. ./.:4:344,79:.: 0.95:1.000:. ./.:4:263,57:.:-0.23:1.000:. ./.:4:393,59:.: 1.28:1.000:. ./.:4:249,57:.:-0.39:1.000:. ./.:4:522,2:.: 2.11:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.60:1.000:. ./.:6:289,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:242,54:.:-0.50:1.000:. ./.:4:324,64:.: 0.55:1.000:. ./.:4:382,2:.: 0.50:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:232,60:.:-0.55:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:305,76:.: 0.47:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.46:0.969:. ./.:4:363,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:296,49:.: 0.06:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.94:0.999:. ./.:4:478,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:250,59:.:-0.35:1.000:. ./.:4:459,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:238,46:.:-0.64:1.000:. ./.:4:249,45:.:-0.53:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:308,54:.: 0.25:1.000:. ./.:4:352,1:.: 0.15:0.989:. ./.:4:408,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:311,81:.: 0.60:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:301,58:.: 0.22:1.000:. ./.:4:212,44:.:-0.96:1.000:. ./.:4:247,49:.:-0.50:1.000:. ./.:4:284,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:346,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:282,38:.:-0.23:0.999:. ./.:4:334,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:255,44:.:-0.47:1.000:. ./.:4:214,49:.:-0.88:1.000:. ./.:4:291,48:.:-0.01:1.000:. ./.:4:304,67:.: 0.35:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:346,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:367,50:.: 0.88:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:307,56:.: 0.26:1.000:. ./.:4:225,45:.:-0.80:1.000:. ./.:5:335,61:.: 0.64:0.763:. ./.:4:259,45:.:-0.41:1.000:. ./.:4:267,39:.:-0.39:1.000:. ./.:4:266,31:.:-0.49:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:450,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:293,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:340,77:.: 0.88:1.000:. ./.:4:336,61:.: 0.65:0.999:. ./.:4:309,52:.: 0.24:1.000:. ./.:4:188,50:.:-1.17:1.000:. ./.:4:306,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:215,49:.:-0.87:1.000:. ./.:4:281,67:.: 0.09:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:287,44:.:-0.10:1.000:. ./.:4:297,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:285,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:247,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:299,48:.: 0.08:1.000:. ./.:4:258,51:.:-0.35:1.000:. ./.:4:297,70:.: 0.31:1.000:. ./.:4:277,52:.:-0.13:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,43:.:-1.20:1.000:. ./.:4:192,42:.:-1.21:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:250,57:.:-0.38:1.000:. ./.:4:215,27:.:-1.12:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:371,68:.: 1.13:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:218,44:.:-0.89:1.000:. ./.:4:256,46:.:-0.43:1.000:. ./.:4:273,53:.:-0.16:1.000:. ./.:4:308,58:.: 0.30:1.000:. ./.:4:383,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:245,56:.:-0.45:1.000:. ./.:4:339,68:.: 0.77:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:284,79:.: 0.26:1.000:. ./.:4:285,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:51,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:306,51:.: 0.19:1.000:. ./.:4:292,52:.: 0.05:1.000:. ./.:4:253,67:.:-0.23:1.000:. ./.:4:311,70:.: 0.47:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:308,56:.: 0.27:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:247,52:.:-0.47:1.000:. ./.:4:252,53:.:-0.40:1.000:. ./.:4:262,46:.:-0.37:1.000:. ./.:4:334,74:.: 0.78:1.000:. ./.:4:286,51:.:-0.03:1.000:. ./.:4:230,54:.:-0.64:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:271,70:.: 0.01:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:246,49:.:-0.51:1.000:. ./.:4:216,40:.:-0.96:1.000:. ./.:4:263,47:.:-0.34:1.000:. ./.:4:232,44:.:-0.73:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:250,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:313,66:.: 0.45:1.000:. ./.:4:422,2:.: 0.96:1.000:. ./.:4:310,65:.: 0.40:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:317,57:.: 0.39:0.999:. ./.:4:412,75:.: 1.68:1.000:. ./.:4:343,83:.: 0.98:1.000:. ./.:4:211,46:.:-0.95:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.44:1.000:. -chr7.1 70131521 chr7.1_070131521 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:110,52:0.27: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,74:0.61:-0.59:1.000:0.679 0/0/0/1:4:102,53:0.30: 0.59:1.000:0.989 0/0/0/0:4:120,1:0.01:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,59:0.37: 0.32:1.000:0.502 0/0/1/1:4:102,99:0.46: 1.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:41,18:0.25:-1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,72:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,33:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.29:-2.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:3,5:0.56:-2.76:1.000:0.971 0/0/1/1:4:36,42:0.51:-1.16:1.000:0.996 0/0/0/0:4:126,1:0.01:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,30:0.23:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,56:0.33: 0.48:1.000:0.918 0/0/1/1:4:81,96:0.51: 1.09:0.995:0.996 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,45:0.20: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,49:0.33: 0.02:1.000:0.900 0/0/1/1:4:2,2:0.47:-2.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,42:0.19: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,43:0.31:-0.21:1.000:0.967 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,41:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,103:0.46: 1.89:1.000:0.985 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,53:0.22: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,29:0.15: 0.71:1.000:0.988 0/0/0/1:4:90,43:0.27: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,37:0.28:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.47:-2.89:1.000:0.993 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.85:1.000:1.000 0/1/1:3:0,1:0.78:-2.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,41:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,51:0.21: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,88:0.44: 1.30:1.000:0.971 0/0/0/1:4:108,42:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,48:0.36:-0.23:1.000:0.638 0/0/0/1:4:95,36:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,34:0.16: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,39:0.29:-0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:71,44:0.34:-0.32:1.000:0.863 0/0/0/1:4:76,48:0.35:-0.11:1.000:0.826 0/0/0:3:120,1:0.01:-0.18:0.633:1.000 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 2.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,52:0.33: 0.23:1.000:0.915 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:106,41:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,47:0.27: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,36:0.30:-0.59:1.000:0.981 0/0/1/1:4:99,96:0.46: 1.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:80,96:0.51: 1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,35:0.28:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:86,46:0.30: 0.07:1.000:0.983 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,50:0.32: 0.20:1.000:0.958 0/0/0/0/0/1:6:77,31:0.24:-0.48:1.000:0.652 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,49:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,61:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,46:0.34:-0.18:1.000:0.880 0/0/0/1:4:135,30:0.15: 0.82:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,21:0.39:-1.82:1.000:0.719 0/0/0/0:4:121,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.39:0.969:1.000 0/0/1/1:4:43,90:0.59: 0.09:1.000:0.880 0/0/0/1:4:115,51:0.26: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,7:0.19:-2.26:0.999:1.000 0/0/1/1:4:44,78:0.57:-0.16:1.000:0.956 0/0/0/1:4:92,52:0.32: 0.34:1.000:0.961 0/0/1/1:4:32,75:0.60:-0.50:1.000:0.782 0/0/1/1:4:73,69:0.46: 0.30:1.000:0.985 0/0/0/1:4:100,41:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,83:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,46:0.36:-0.32:1.000:0.683 0/0/0/1:4:125,57:0.26: 1.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,85:0.61:-0.25:0.989:0.667 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,43:0.19: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,34:0.22:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,37:0.20: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,31:0.32:-1.00:1.000:0.951 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,31:0.38:-1.25:1.000:0.591 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,24:0.23:-0.98:0.999:1.000 0/0/0/1:4:79,29:0.22:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,95:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,47:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,41:0.27:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:113,1:0.01:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,64:0.45: 0.09:1.000:0.981 0/0/0/1:4:89,37:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,45:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,35:0.56:-1.66:1.000:0.971 0/0/0/1:4:108,30:0.18: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:59,72:0.51: 0.05:0.763:0.640 0/0/0/1:4:62,22:0.22:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,28:0.24:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,31:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,32:0.16: 0.87:1.000:0.995 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,36:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,33:0.29:-0.68:1.000:0.994 0/0/0/1:4:150,41:0.18: 1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,43:0.24: 0.48:0.999:1.000 0/0/0/1:4:80,41:0.29:-0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:80,65:0.41: 0.36:1.000:0.889 0/0/0/1:4:83,46:0.31: 0.00:1.000:0.971 0/0/0/1:4:58,24:0.24:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,58:0.49:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,72:0.50: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,67:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,95:0.51: 1.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:110,59:0.30: 0.91:1.000:0.982 0/0/0/1:4:76,32:0.25:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,25:0.15: 0.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:75,44:0.33:-0.23:1.000:0.934 0/0/1/1:4:25,65:0.61:-0.89:1.000:0.654 0/0/0/1:4:65,28:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,36:0.32:-0.66:1.000:0.964 0/0/0/1:4:96,46:0.28: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,73:0.48: 0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:132,32:0.16: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,54:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,34:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,37:0.35:-0.77:1.000:0.804 0/0/1/1:4:53,38:0.38:-0.87:1.000:0.572 0/0/0/1:4:81,38:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,40:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,41:0.19: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,20:0.19:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,56:0.31: 0.68:1.000:0.978 0/0/0/1:4:102,61:0.33: 0.77:1.000:0.914 0/0/0/1:4:94,56:0.33: 0.48:1.000:0.918 0/0/0/1:4:133,35:0.17: 0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:112,106:0.46: 2.03:1.000:0.986 0/0/1/1:4:95,70:0.39: 0.82:1.000:0.664 0/0/0/1:4:172,46:0.17: 2.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,52:0.33: 0.23:1.000:0.915 0/0/1/1:4:4,7:0.56:-2.69:1.000:0.960 0/0/0/1:4:75,35:0.27:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,93:0.46: 1.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,101:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,118:0.53: 1.71:1.000:0.992 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,52:0.38:-0.09:1.000:0.548 0/0/0/1:4:124,66:0.30: 1.39:1.000:0.984 0/0/1/1:4:61,87:0.54: 0.43:1.000:0.990 0/0/0/1:4:77,32:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,45:0.27: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:147,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,39:0.19: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,23:0.17:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,74:0.75:-1.18:0.999:0.999 0/0/1/1:4:87,88:0.48: 1.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,25:0.21:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,74:0.47: 0.48:1.000:0.990 0/0/0/1:4:68,44:0.35:-0.39:1.000:0.769 0/0/0/1:4:101,45:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,49:0.33: 0.05:1.000:0.915 0/0/0/1:4:62,33:0.30:-0.77:1.000:0.984 0/0/0/1:4:118,50:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,51:0.31: 0.36:1.000:0.978 0/0/0/1:4:124,54:0.25: 1.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,69:0.44: 0.39:1.000:0.970 0/0/0/1:4:81,49:0.33: 0.02:0.999:0.900 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,111:0.54: 1.28:1.000:0.985 0/0/0/1:4:60,28:0.27:-0.93:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,104:0.58: 0.64:1.000:0.918 -chr7.1 70364057 chr7.1_070364057 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:61,62:0.46: 0.62:1.000:0.987 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,57:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:88,38:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,84:0.56: 1.06:1.000:0.973 0/0/1/1:4:60,68:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,29:0.29:-0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,75:0.55: 0.68:1.000:0.984 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,3:0.13:-2.60:1.000:0.904 0/0/1/1:4:11,8:0.38:-2.63:1.000:0.547 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,43:0.31: 0.62:1.000:0.976 0/0/0/1:4:95,43:0.27: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,79:0.51: 1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,38:0.28: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,113:0.74: 1.03:0.995:0.998 0/0/0/0:4:137,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,47:0.24: 2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,94:0.51: 2.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,22:0.60:-2.19:1.000:0.785 0/0/0/1:4:73,36:0.29: 0.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:81,41:0.30: 0.59:1.000:0.989 0/0/0/1:4:65,36:0.32:-0.07:1.000:0.965 0/1/1/1:4:3,29:0.80:-2.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,104:0.74: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,42:0.29: 0.75:1.000:0.992 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,122:0.71: 1.53:1.000:0.993 0/0/0/0:4:111,1:0.01: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,86:0.67: 0.34:1.000:0.934 0/1/1/1:4:4,11:0.66:-2.75:1.000:0.842 0/0/0/1:4:32,13:0.25:-1.82:1.000:0.999 0/1/1:3:3,7:0.63:-2.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,43:0.31: 0.65:1.000:0.979 0/0/0/1:4:66,29:0.27:-0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:103,61:0.33: 1.90:1.000:0.920 0/0/1/1:4:34,53:0.55:-0.50:1.000:0.977 0/0/0/1:4:71,29:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,25:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,26:0.20: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,23:0.22:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1:3:84,45:0.31: 0.81:0.633:1.000 0/0/0/1:4:24,14:0.33:-2.04:1.000:0.933 0/0/0/1:4:72,20:0.19:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.49:-1.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,20:0.25:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,46:0.26: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,60:0.48: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:62,32:0.30:-0.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:58,70:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,43:0.36: 0.12:1.000:0.694 0/0/0/1:4:68,19:0.19:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,26:0.28:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/0/1/1:6:40,33:0.41:-0.94:1.000:0.575 0/0/0/1:4:67,27:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,50:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,60:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,30:0.30:-0.47:1.000:0.985 0/0/1/1:4:69,62:0.43: 0.87:1.000:0.945 0/0/1/1:4:50,53:0.47: 0.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:49,19:0.24:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,20:0.16: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,41:0.43:-0.53:0.969:0.953 0/0/0/1:4:89,21:0.16: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,53:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,30:0.39:-1.07:0.999:0.711 0/0/1/1:4:43,38:0.43:-0.69:1.000:0.933 0/0/1/1:4:63,83:0.52: 1.34:1.000:0.995 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,50:0.59:-0.82:1.000:0.885 0/0/1/1:4:54,45:0.41:-0.13:1.000:0.870 0/0/1/1:4:39,48:0.51:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,64:0.48: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,23:0.23:-0.57:0.989:1.000 0/0/0/1:4:79,29:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,33:0.29:-0.10:1.000:0.992 0/0/0/1:4:90,36:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,34:0.35:-0.53:1.000:0.763 0/0/0/1:4:74,29:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,25:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,24:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,26:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.57:0.999:1.000 0/0/1/1:4:50,53:0.47: 0.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,59:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,18:0.19:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,23:0.22:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,22:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,52:0.53:-0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:35,30:0.42:-1.19:1.000:0.905 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,42:0.30: 0.65:1.000:0.987 0/0/1/1:4:30,66:0.62:-0.22:1.000:0.595 0/0/0/1:4:59,31:0.30:-0.41:1.000:0.982 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:95,56:0.33: 1.50:0.763:0.787 0/0/0/1:4:54,20:0.23:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,39:0.31: 0.28:1.000:0.978 0/0/0/1:4:128,53:0.25: 2.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,31:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,74:0.59: 0.31:1.000:0.858 0/0/1/1:4:75,92:0.50: 2.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:86,1:0.01:-0.50:0.999:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.48:-1.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,29:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.25:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,18:0.23:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,58:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,76:0.76:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.40:-0.85:1.000:0.824 0/0/1/1:4:68,79:0.49: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,53:0.45: 0.15:1.000:0.976 0/0/1/1:4:39,51:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,28:0.31:-0.72:1.000:0.975 0/0/0/1:4:50,10:0.14:-1.35:1.000:0.977 0/0/1/1:4:37,37:0.46:-0.91:1.000:0.985 0/0/0/1:4:49,20:0.25:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,29:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,49:0.33: 0.93:1.000:0.933 0/0/0/1:4:54,15:0.19:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,27:0.47:-1.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:49,56:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,50:0.47:-0.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,43:0.47:-0.63:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,45:0.47:-0.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:76,21:0.19:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,24:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,28:0.27:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:79,29:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,37:0.52:-1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,108:0.52: 2.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,102:0.52: 2.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,83:0.53: 1.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:48,63:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:96,49:0.30: 1.31:1.000:0.988 0/1/1/1:4:16,98:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,101:0.53: 2.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,27:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,21:0.81:-2.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,42:0.28: 0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,33:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,45:0.30: 0.87:1.000:0.983 0/0/1/1:4:72,93:0.52: 1.93:1.000:0.996 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,57:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,47:0.34: 0.59:1.000:0.847 0/1/1/1:4:23,117:0.74: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,23:0.19:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,41:0.32: 0.31:1.000:0.950 0/0/0/1:4:79,36:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,35:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,39:0.31: 0.25:1.000:0.973 0/0/0/1:4:90,33:0.23: 0.62:0.999:1.000 0/0/0/1:4:74,44:0.33: 0.47:1.000:0.916 0/0/0/1:4:82,42:0.30: 0.65:1.000:0.987 0/0/1/1:4:50,82:0.56: 0.90:1.000:0.962 0/0/0/1:4:63,26:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,74:0.54: 0.65:1.000:0.986 0/0/0/1:4:70,28:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,42:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,48:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,71:0.47: 1.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:93,52:0.32: 1.31:1.000:0.960 0/0/0/1:4:91,39:0.26: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,81:0.58: 0.75:1.000:0.926 0/0/0/0:4:111,1:0.01: 0.28:0.999:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,42:0.22: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,60:0.48: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:88,31:0.22: 0.50:1.000:1.000 -chr7.1 70509352 chr7.1_070509352 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:53,33:0.31: 0.14:1.000:0.970 0/0/0/1:4:43,26:0.30:-0.46:1.000:0.982 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,69:0.68: 0.43:1.000:0.954 0/0/0/0:4:150,0:0.00: 2.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,17:0.28:-1.25:1.000:0.995 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,27:0.29:-0.32:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,7:0.55:-2.50:1.000:0.979 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,34:0.47:-0.50:1.000:0.991 0/0/0/1:4:56,26:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,29:0.34:-0.36:1.000:0.882 0/0/1/1:4:51,40:0.39: 0.32:1.000:0.654 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:92,1:0.01: 0.39:0.995:1.000 0/0/1/1:4:36,66:0.61: 0.72:1.000:0.741 0/0/1/1:4:59,81:0.55: 2.07:1.000:0.983 0/0/0/1:4:47,25:0.26:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:4,2:0.25:-2.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,66:0.54: 1.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:49,38:0.38: 0.18:1.000:0.609 0/0/0/1:4:44,24:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-2.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,29:0.19: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,49:0.63:-0.32:1.000:0.511 0/0/0/1:4:97,40:0.22: 1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,66:0.54: 1.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:44,28:0.32:-0.36:1.000:0.955 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,8:0.62:-2.50:1.000:0.541 0/0/1/1:4:3,3:0.47:-2.71:1.000:0.991 0/1/1:3:3,7:0.65:-2.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,65:0.71: 0.11:1.000:0.990 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,64:0.54: 1.07:1.000:0.987 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,34:0.37:-0.11:1.000:0.503 0/0/0/1:4:40,27:0.34:-0.53:1.000:0.881 0/0/1/1:4:51,71:0.55: 1.43:1.000:0.980 0/0/1/1:4:68,76:0.50: 2.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,32:0.40:-0.39:1.000:0.805 0/0/1/1:4:46,42:0.44: 0.22:1.000:0.962 0/0/0/1:4:52,28:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/0/1:3:56,33:0.30: 0.25:0.633:1.000 0/0/0/1:4:11,5:0.23:-2.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,27:0.30:-0.36:1.000:0.984 0/0/1/1:4:26,25:0.45:-1.11:1.000:0.984 0/0/1/1:4:38,58:0.57: 0.50:1.000:0.950 0/0/0/1:4:59,38:0.32: 0.54:1.000:0.945 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,35:0.21: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,33:0.36:-0.11:1.000:0.715 0/0/0/1:4:50,35:0.35: 0.11:1.000:0.794 0/1/1/1:4:28,67:0.66: 0.47:1.000:0.837 0/0/0/1:4:43,27:0.32:-0.43:1.000:0.965 0/0/0/1/1/1:6:39,34:0.42:-0.32:1.000:0.533 0/0/1/1:4:22,41:0.61:-0.68:1.000:0.708 0/0/0/1:4:74,35:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,53:0.72:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,29:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,29:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,10:0.22:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,26:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,26:0.27:-0.28:0.969:0.998 0/0/0/1:4:43,29:0.34:-0.36:1.000:0.882 0/0/1/1:4:72,55:0.38: 1.61:1.000:0.545 0/0/0/1:4:37,22:0.30:-0.82:0.999:0.987 0/0/0/1:4:41,23:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,35:0.37: 0.00:1.000:0.565 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,31:0.21: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,36:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,27:0.36:-0.64:1.000:0.650 0/0/1/1:4:51,70:0.55: 1.39:1.000:0.983 0/0/0/1:4:44,23:0.26:-0.53:0.989:0.999 0/1/1/1:4:26,60:0.65: 0.14:1.000:0.782 0/0/1/1:4:41,67:0.58: 0.93:1.000:0.904 0/0/0/1:4:55,28:0.25: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,57:0.69:-0.21:1.000:0.979 0/0/1/1:4:41,64:0.57: 0.82:1.000:0.938 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,19:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,32:0.31: 0.04:1.000:0.965 0/1/1/1:4:15,59:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,25:0.47:-1.14:0.999:0.991 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,53:0.51: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,25:0.36:-0.78:1.000:0.730 0/0/1/1:4:33,27:0.40:-0.78:1.000:0.797 0/0/1/1:4:38,29:0.38:-0.53:1.000:0.541 0/0/1/1:4:31,52:0.59: 0.04:1.000:0.878 0/0/1/1:4:45,63:0.55: 0.93:1.000:0.979 0/0/1/1:4:50,75:0.56: 1.54:1.000:0.958 0/0/1/1:4:25,25:0.47:-1.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:75,30:0.21: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,55:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:74,0:0.00:-0.28:0.763:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,21:0.35:-1.11:1.000:0.794 0/0/1/1:4:52,63:0.52: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:52,51:0.46: 0.75:1.000:0.988 0/1/1/1:4:36,79:0.64: 1.18:1.000:0.684 0/0/0/1:4:64,27:0.22: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,36:0.23: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,56:0.49: 0.93:0.999:0.996 0/0/1/1:4:33,26:0.39:-0.82:1.000:0.672 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,57:0.43: 1.36:1.000:0.956 0/0/0/1:4:48,24:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,27:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,24:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,61:0.70:-0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:34,57:0.59: 0.32:1.000:0.878 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,32:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,29:0.32:-0.28:1.000:0.944 0/0/1/1:4:29,32:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,24:0.35:-0.86:1.000:0.769 0/0/0/1:4:32,19:0.30:-1.11:1.000:0.987 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,15:0.33:-1.57:1.000:0.932 0/0/0/1:4:63,32:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,66:0.46: 1.82:1.000:0.989 0/1/1/1:4:38,78:0.63: 1.22:1.000:0.525 0/0/1/1:4:53,55:0.48: 0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:33,57:0.59: 0.29:1.000:0.841 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.42:-0.18:1.000:0.929 0/0/1/1:4:35,64:0.60: 0.61:1.000:0.746 0/0/1/1:4:45,66:0.56: 1.04:1.000:0.967 0/0/1/1:4:35,36:0.48:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,43:0.36: 0.72:1.000:0.655 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,33:0.29: 0.29:1.000:0.992 0/0/0/1:4:92,44:0.24: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,48:0.27: 1.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,40:0.24: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,41:0.35: 0.64:1.000:0.815 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,54:0.60: 0.11:1.000:0.829 0/0/0/1:4:78,34:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,33:0.22: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,66:0.67: 0.32:1.000:0.931 0/0/1/1:4:37,32:0.42:-0.46:1.000:0.910 0/0/0/1:4:78,25:0.18: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,39:0.48:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,29:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,56:0.63: 0.04:1.000:0.551 0/0/1/1:4:65,68:0.48: 1.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:61,26:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.03:0.999:1.000 0/0/0/1:4:71,35:0.25: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,23:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,54:0.56: 0.29:1.000:0.958 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,59:0.57: 0.54:1.000:0.941 0/0/0/1:4:57,39:0.34: 0.50:1.000:0.853 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,40:0.38: 0.36:0.999:0.575 0/1/1/1:4:22,57:0.67:-0.11:1.000:0.918 0/0/0/1:4:78,42:0.27: 1.36:1.000:0.998 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,39:0.35: 0.43:1.000:0.755 -chr7.1 70938494 chr7.1_070938494 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,826:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,850:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,544:.:-1.04:1.000:. ./.:4:2,845:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,990:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,1062:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,510:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,774:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,847:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,235:.:-2.49:1.000:. ./.:4:0,167:.:-2.81:1.000:. ./.:4:0,653:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,726:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,830:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,760:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,852:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,1023:.: 1.20:0.995:. ./.:4:0,815:.: 0.23:1.000:. ./.:4:2,1402:.: 2.99:1.000:. ./.:4:0,907:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,140:.:-2.93:1.000:. ./.:4:0,859:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,744:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,722:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,151:.:-2.88:1.000:. ./.:4:0,704:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,992:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,970:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,963:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,1164:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,951:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,679:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,101:.:-3.12:1.000:. ./.:4:0,213:.:-2.59:1.000:. ./.:3:0,101:.:-3.12:1.000:. ./.:4:0,1035:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,804:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,1174:.: 1.91:1.000:. ./.:4:1,818:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,965:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,702:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1,1006:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,975:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,608:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,778:.: 0.05:1.000:. ./.:4:2,837:.: 0.34:1.000:. ./.:3:0,760:.:-0.03:0.633:. ./.:4:0,1116:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,595:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,742:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,823:.: 0.26:1.000:. ./.:4:3,822:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,509:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,905:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,655:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,750:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,633:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,855:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,887:.: 0.56:1.000:. ./.:6:0,584:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,761:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,718:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,775:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,744:.:-0.11:1.000:. ./.:4:3,759:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,855:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,808:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,751:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,658:.:-0.51:0.969:. ./.:4:0,775:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,836:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,557:.:-0.98:0.999:. ./.:4:1,723:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,594:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,812:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,673:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,708:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,927:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,744:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,1135:.: 1.73:1.000:. ./.:4:0,638:.:-0.60:0.989:. ./.:4:0,803:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,938:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,793:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,763:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,979:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,446:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,634:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,657:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,750:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,552:.:-1.00:0.999:. ./.:4:0,633:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,756:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,694:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,695:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,650:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,548:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,956:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,928:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,1104:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,714:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,849:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,617:.:-0.70:1.000:. ./.:5:0,737:.:-0.14:0.763:. ./.:4:0,531:.:-1.10:1.000:. ./.:4:3,660:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,824:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,1143:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,966:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,785:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,542:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,1234:.: 2.19:1.000:. ./.:4:0,957:.: 0.89:0.999:. ./.:4:0,777:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,606:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,722:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,669:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,704:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,738:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,643:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,780:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,679:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,787:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,715:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,508:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,776:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,606:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,634:.:-0.62:1.000:. ./.:4:1,452:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,551:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,648:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,799:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,472:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,861:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,932:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,1139:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,912:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,857:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,391:.:-1.76:1.000:. ./.:4:0,634:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,609:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,876:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,1058:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,683:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,859:.: 0.43:1.000:. ./.:4:4,819:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,800:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,736:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,1002:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,769:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,1029:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,820:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,171:.:-2.79:1.000:. ./.:4:0,614:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,960:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,931:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,985:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,1002:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,664:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,1017:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,833:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,569:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,726:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,702:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,981:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,996:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,863:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,662:.:-0.49:0.999:. ./.:4:0,955:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,796:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,686:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,556:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,571:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,723:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,691:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,913:.: 0.69:1.000:. ./.:4:1,907:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,1066:.: 1.40:1.000:. ./.:4:5,760:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,709:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,842:.: 0.35:0.999:. ./.:4:3,1157:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,1150:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,521:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,824:.: 0.27:1.000:. -chr7.1 72776878 chr7.1_072776878 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:0.995:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:3:6,0:.: 0.06:0.633:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:6:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:0.969:. ./.:4:11,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:0.999:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:10,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.06:0.989:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:19,0:.: 3.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.60:0.999:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:5:7,0:.: 0.33:0.763:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:0.999:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:16,0:.: 2.78:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:19,0:.: 3.60:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.51:0.999:. ./.:4:8,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:9,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.51:1.000:. -chr7.1 73025728 chr7.1_073025728 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.58:0.995:. ./.:4:51,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:63,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:3:9,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.58:1.000:. ./.:3:37,0:.: 0.38:0.633:. ./.:4:11,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.45:1.000:. ./.:6:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:0.969:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.45:0.999:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.42:0.989:. ./.:4:28,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:62,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.02:1.000:. ./.:5:40,0:.: 0.58:0.763:. ./.:4:30,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:59,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:76,0:.: 2.99:0.999:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:56,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:0.999:. ./.:4:33,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:65,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.38:0.999:. ./.:4:36,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.05:1.000:. -chr7.1 73242026 chr7.1_073242026 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:222,149:.:-0.28:1.000:. ./.:4:291,168:.: 0.57:1.000:. ./.:4:329,130:.: 0.57:1.000:. ./.:4:337,64:.: 0.01:1.000:. ./.:4:351,222:.: 1.68:1.000:. ./.:4:244,119:.:-0.36:1.000:. ./.:4:136,79:.:-1.80:1.000:. ./.:4:303,138:.: 0.40:1.000:. ./.:4:282,115:.:-0.03:1.000:. ./.:4:38,9:.:-3.43:1.000:. ./.:4:59,20:.:-3.12:1.000:. ./.:4:244,158:.: 0.02:1.000:. ./.:4:322,138:.: 0.58:1.000:. ./.:4:298,131:.: 0.28:1.000:. ./.:4:229,123:.:-0.47:1.000:. ./.:4:284,161:.: 0.44:1.000:. ./.:4:223,190:.: 0.13:0.995:. ./.:4:328,151:.: 0.77:1.000:. ./.:4:416,90:.: 1.03:1.000:. ./.:4:373,162:.: 1.31:1.000:. ./.:4:23,19:.:-3.48:1.000:. ./.:4:318,59:.:-0.22:1.000:. ./.:4:395,74:.: 0.67:1.000:. ./.:4:300,126:.: 0.25:1.000:. ./.:4:35,16:.:-3.39:1.000:. ./.:4:292,206:.: 0.95:1.000:. ./.:4:322,126:.: 0.47:1.000:. ./.:4:380,55:.: 0.34:1.000:. ./.:4:292,166:.: 0.56:1.000:. ./.:4:377,49:.: 0.25:1.000:. ./.:4:346,153:.: 0.96:1.000:. ./.:4:210,156:.:-0.33:1.000:. ./.:4:10,6:.:-3.73:1.000:. ./.:4:41,24:.:-3.26:1.000:. ./.:3:31,3:.:-3.56:1.000:. ./.:4:269,128:.:-0.03:1.000:. ./.:4:271,211:.: 0.80:1.000:. ./.:4:343,64:.: 0.07:1.000:. ./.:4:252,143:.:-0.05:1.000:. ./.:4:257,219:.: 0.74:1.000:. ./.:4:254,112:.:-0.33:1.000:. ./.:4:369,61:.: 0.29:1.000:. ./.:4:434,57:.: 0.88:1.000:. ./.:4:310,143:.: 0.51:1.000:. ./.:4:343,119:.: 0.60:1.000:. ./.:4:276,130:.: 0.06:1.000:. ./.:3:392,56:.: 0.47:0.633:. ./.:4:269,75:.:-0.55:1.000:. ./.:4:240,109:.:-0.50:1.000:. ./.:4:242,123:.:-0.34:1.000:. ./.:4:342,67:.: 0.09:1.000:. ./.:4:368,174:.: 1.38:1.000:. ./.:4:243,163:.: 0.06:1.000:. ./.:4:286,129:.: 0.14:1.000:. ./.:4:285,130:.: 0.14:1.000:. ./.:4:305,142:.: 0.46:1.000:. ./.:4:244,138:.:-0.18:1.000:. ./.:4:355,122:.: 0.75:1.000:. ./.:4:216,188:.: 0.04:1.000:. ./.:6:236,97:.:-0.65:1.000:. ./.:4:326,83:.: 0.09:1.000:. ./.:4:310,57:.:-0.32:1.000:. ./.:4:249,127:.:-0.23:1.000:. ./.:4:352,76:.: 0.27:1.000:. ./.:4:300,164:.: 0.62:1.000:. ./.:4:253,122:.:-0.24:1.000:. ./.:4:164,126:.:-1.07:1.000:. ./.:4:317,108:.: 0.24:1.000:. ./.:4:263,129:.:-0.08:0.969:. ./.:4:272,200:.: 0.70:1.000:. ./.:4:346,67:.: 0.13:1.000:. ./.:4:182,85:.:-1.29:0.999:. ./.:4:302,225:.: 1.23:1.000:. ./.:4:360,138:.: 0.95:1.000:. ./.:4:321,184:.: 1.02:1.000:. ./.:4:192,169:.:-0.38:1.000:. ./.:4:310,71:.:-0.19:1.000:. ./.:4:288,171:.: 0.57:1.000:. ./.:4:289,125:.: 0.13:1.000:. ./.:4:443,57:.: 0.97:1.000:. ./.:4:250,125:.:-0.24:0.989:. ./.:4:287,151:.: 0.37:1.000:. ./.:4:317,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:228,160:.:-0.12:1.000:. ./.:4:282,74:.:-0.43:1.000:. ./.:4:474,76:.: 1.46:1.000:. ./.:4:199,136:.:-0.63:1.000:. ./.:4:341,110:.: 0.49:1.000:. ./.:4:320,112:.: 0.31:1.000:. ./.:4:241,115:.:-0.43:1.000:. ./.:4:195,91:.:-1.11:0.999:. ./.:4:175,173:.:-0.51:1.000:. ./.:4:363,147:.: 1.07:1.000:. ./.:4:263,59:.:-0.76:1.000:. ./.:4:375,157:.: 1.28:1.000:. ./.:4:363,69:.: 0.31:1.000:. ./.:4:286,91:.:-0.22:1.000:. ./.:4:319,94:.: 0.13:1.000:. ./.:4:397,61:.: 0.56:1.000:. ./.:4:332,163:.: 0.92:1.000:. ./.:4:253,88:.:-0.57:1.000:. ./.:4:373,72:.: 0.44:1.000:. ./.:4:284,46:.:-0.68:1.000:. ./.:5:283,160:.: 0.42:0.763:. ./.:4:216,78:.:-1.03:1.000:. ./.:4:275,104:.:-0.21:1.000:. ./.:4:269,44:.:-0.85:1.000:. ./.:4:333,73:.: 0.06:1.000:. ./.:4:428,73:.: 0.98:1.000:. ./.:4:331,132:.: 0.61:1.000:. ./.:4:232,153:.:-0.15:1.000:. ./.:4:391,155:.: 1.42:1.000:. ./.:4:344,50:.:-0.06:0.999:. ./.:4:305,139:.: 0.43:1.000:. ./.:4:231,86:.:-0.81:1.000:. ./.:4:282,152:.: 0.33:1.000:. ./.:4:311,45:.:-0.43:1.000:. ./.:4:277,140:.: 0.16:1.000:. ./.:4:286,124:.: 0.10:1.000:. ./.:4:338,48:.:-0.14:1.000:. ./.:4:370,62:.: 0.31:1.000:. ./.:4:261,154:.: 0.14:1.000:. ./.:4:265,181:.: 0.45:1.000:. ./.:4:265,212:.: 0.75:1.000:. ./.:4:295,114:.: 0.09:1.000:. ./.:4:289,64:.:-0.46:1.000:. ./.:4:353,120:.: 0.71:1.000:. ./.:4:239,134:.:-0.26:1.000:. ./.:4:193,142:.:-0.63:1.000:. ./.:4:263,36:.:-0.98:1.000:. ./.:4:227,147:.:-0.25:1.000:. ./.:4:227,191:.: 0.17:1.000:. ./.:4:178,81:.:-1.37:1.000:. ./.:4:248,162:.: 0.10:1.000:. ./.:4:272,123:.:-0.05:1.000:. ./.:4:448,85:.: 1.29:1.000:. ./.:4:324,58:.:-0.18:1.000:. ./.:4:207,97:.:-0.93:1.000:. ./.:4:222,112:.:-0.64:1.000:. ./.:4:217,177:.:-0.06:1.000:. ./.:4:280,113:.:-0.07:1.000:. ./.:4:283,61:.:-0.55:1.000:. ./.:4:280,123:.: 0.03:1.000:. ./.:4:167,68:.:-1.60:1.000:. ./.:4:395,166:.: 1.56:1.000:. ./.:4:331,263:.: 1.88:1.000:. ./.:4:329,134:.: 0.61:1.000:. ./.:4:341,61:.: 0.02:1.000:. ./.:4:442,162:.: 1.98:1.000:. ./.:4:256,159:.: 0.14:1.000:. ./.:4:353,70:.: 0.22:1.000:. ./.:4:305,117:.: 0.21:1.000:. ./.:4:20,12:.:-3.58:1.000:. ./.:4:186,44:.:-1.65:1.000:. ./.:4:301,140:.: 0.40:1.000:. ./.:4:320,163:.: 0.81:1.000:. ./.:4:240,222:.: 0.60:1.000:. ./.:4:382,55:.: 0.36:1.000:. ./.:4:277,123:.: 0.00:1.000:. ./.:4:361,139:.: 0.97:1.000:. ./.:4:215,164:.:-0.21:1.000:. ./.:4:221,158:.:-0.21:1.000:. ./.:4:238,117:.:-0.44:1.000:. ./.:4:355,58:.: 0.13:1.000:. ./.:4:426,76:.: 0.99:1.000:. ./.:4:385,64:.: 0.47:1.000:. ./.:4:315,54:.:-0.30:1.000:. ./.:4:264,231:.: 0.92:0.999:. ./.:4:266,135:.: 0.01:1.000:. ./.:4:243,125:.:-0.31:1.000:. ./.:4:207,82:.:-1.08:1.000:. ./.:4:180,122:.:-0.95:1.000:. ./.:4:256,107:.:-0.36:1.000:. ./.:4:234,221:.: 0.53:1.000:. ./.:4:213,153:.:-0.33:1.000:. ./.:4:250,104:.:-0.45:1.000:. ./.:4:266,229:.: 0.92:1.000:. ./.:4:392,79:.: 0.69:1.000:. ./.:4:357,82:.: 0.38:1.000:. ./.:4:194,180:.:-0.25:1.000:. ./.:4:381,125:.: 1.03:0.999:. ./.:4:526,105:.: 2.24:1.000:. ./.:4:306,138:.: 0.43:1.000:. ./.:4:186,152:.:-0.60:1.000:. ./.:4:333,195:.: 1.24:1.000:. -chr7.1 73454919 chr7.1_073454919 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:24,17:0.44: 0.12:1.000:0.966 0/0/1/1:4:13,13:0.51:-1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,10:0.28: 0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:10,31:0.71: 0.12:1.000:0.991 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.33:-2.00:1.000:0.923 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,19:0.45: 0.38:1.000:0.984 0/0/1/1:4:7,7:0.51:-2.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:24,3:0.13:-1.12:1.000:0.941 0/1/1/1:4:7,19:0.69:-1.21:1.000:0.973 0/0/1/1:4:18,15:0.48:-0.59:1.000:0.994 0/0/1/1:4:25,23:0.50: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,15:0.46:-0.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:32,8:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.47:0.995:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,21:0.54:-0.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:18,15:0.48:-0.59:1.000:0.994 0/0/0/0:4:13,1:0.09:-2.27:1.000:0.968 0/0/1/1:4:14,19:0.57:-0.59:1.000:0.942 0/0/1/1:4:13,21:0.60:-0.50:1.000:0.759 0/0/0/1:4:28,3:0.12:-0.77:1.000:0.690 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,16:0.32: 1.44:1.000:0.949 0/0/0/1:4:38,12:0.28: 0.91:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,26:0.63: 0.03:1.000:0.538 0/0/0/1:4:30,13:0.34: 0.29:1.000:0.888 0/0/1/1:4:26,23:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,12:0.48:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,10:0.23: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.56:-2.71:1.000:0.973 0/0/1/1:4:7,9:0.56:-2.09:1.000:0.964 0/0/1:3:7,5:0.44:-2.44:1.000:0.981 0/0/1/1:4:14,25:0.62:-0.06:1.000:0.552 0/0/0/1:4:50,10:0.20: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,13:0.37:-0.15:1.000:0.522 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.45: 1.00:1.000:0.984 0/0/1/1:4:23,18:0.46: 0.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:27,26:0.51: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,22:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,18:0.47: 0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,21:0.59:-0.41:1.000:0.863 0/0/1/1:4:33,21:0.42: 1.26:1.000:0.895 0/0/1:3:17,14:0.47:-0.77:0.633:0.860 0/0/1/1:4:34,28:0.47: 1.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,23:0.47: 1.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,29:0.47: 2.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,25:0.57: 0.38:1.000:0.956 0/0/1/1:4:26,30:0.54: 1.44:1.000:0.987 0/0/0/1:4:39,10:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,10:0.28: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,27:0.48: 1.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,19:0.55:-0.41:1.000:0.983 0/1/1/1:4:13,26:0.64:-0.06:1.000:0.698 0/0/1/1:4:23,19:0.47: 0.20:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:21,17:0.47:-0.15:1.000:0.834 0/1/1/1:4:6,20:0.72:-1.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:42,10:0.23: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,37:0.79: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,21:0.46: 0.73:1.000:0.988 0/0/0/1:4:53,12:0.22: 2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.40:-2.09:1.000:0.816 0/0/0/1:4:30,12:0.32: 0.20:1.000:0.949 0/0/1/1:4:18,17:0.50:-0.41:0.969:0.997 0/0/0/1:4:33,16:0.36: 0.82:1.000:0.701 0/0/0/0:4:42,4:0.11: 0.56:1.000:0.669 0/0/0/1:4:13,4:0.28:-2.00:0.999:0.997 0/0/1/1:4:31,19:0.41: 0.91:1.000:0.849 0/0/0/1:4:47,15:0.28: 1.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,21:0.54:-0.06:1.000:0.985 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,15:0.31: 1.35:1.000:0.974 0/0/0/1:4:21,5:0.23:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,24:0.55: 0.38:1.000:0.981 0/0/1/1:4:35,22:0.41: 1.53:1.000:0.881 0/0/1/1:4:15,12:0.47:-1.12:0.989:0.991 0/1/1/1:4:7,32:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,25:0.48: 1.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,17:0.47:-0.15:1.000:0.992 0/1/1/1:4:11,36:0.72: 0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,10:0.37:-0.86:1.000:0.626 0/0/0/1:4:26,6:0.23:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,14:0.44:-0.50:1.000:0.961 0/0/1/1:4:13,8:0.41:-1.65:1.000:0.854 0/1/1/1:4:7,28:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,11:0.50:-1.47:0.999:0.997 0/0/0/1:4:39,5:0.14: 0.38:1.000:0.957 0/0/0/0:4:55,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,25:0.58: 0.29:1.000:0.929 0/0/1/1:4:22,12:0.38:-0.50:1.000:0.607 0/0/0/1:4:23,8:0.30:-0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:20,23:0.54: 0.29:1.000:0.987 0/0/0/1:4:41,9:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,23:0.59:-0.15:1.000:0.837 0/0/1/1:4:29,25:0.48: 1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:13,2:0.16:-2.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,9:0.30:-0.41:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,28:0.74:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/0/0:5:50,4:0.09: 1.26:0.763:0.536 0/0/0/1:4:28,6:0.21:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,21:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,18:0.48:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,15:0.54:-1.03:1.000:0.987 0/1/1/1:4:12,22:0.63:-0.50:1.000:0.508 0/0/1/1:4:32,25:0.46: 1.53:1.000:0.988 0/0/0/1:4:37,4:0.12: 0.12:1.000:0.714 0/0/0/1:4:38,9:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.51:-0.15:0.999:0.996 0/0/1/1:4:17,14:0.47:-0.77:1.000:0.993 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,24:0.56: 0.29:1.000:0.970 0/0/0/1:4:23,6:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,13:0.34: 0.20:1.000:0.846 0/0/0/1:4:34,7:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,26:0.60: 0.20:1.000:0.749 0/1/1/1:4:16,34:0.65: 0.91:1.000:0.801 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,10:0.26: 0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,11:0.27: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,15:0.35: 0.73:1.000:0.825 0/0/1/1:4:18,13:0.44:-0.77:1.000:0.972 0/0/1/1:4:19,14:0.45:-0.59:1.000:0.978 0/0/0/1:4:24,7:0.27:-0.77:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,11:0.40:-0.86:1.000:0.749 0/0/1/1:4:32,21:0.42: 1.18:1.000:0.923 0/0/0/1:4:23,8:0.30:-0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:14,18:0.56:-0.68:1.000:0.964 0/0/0/1:4:45,18:0.32: 2.06:1.000:0.949 0/0/1/1:4:13,23:0.62:-0.33:1.000:0.574 0/0/1/1:4:20,31:0.60: 1.00:1.000:0.823 0/0/1/1:4:20,13:0.42:-0.59:1.000:0.915 0/0/1/1:4:19,22:0.54: 0.12:1.000:0.986 0/0/0/1:4:35,6:0.18: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,11:0.33:-0.15:1.000:0.939 0/0/1/1:4:25,24:0.51: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,16:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,16:0.58:-1.12:1.000:0.894 0/0/1/1:4:26,19:0.45: 0.47:1.000:0.976 0/0/0/1:4:32,16:0.37: 0.73:1.000:0.626 0/0/0/0:4:40,1:0.03: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,26:0.53: 0.91:1.000:0.992 0/0/0/1:4:21,9:0.33:-0.86:1.000:0.899 0/0/0/1:4:57,10:0.18: 2.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,9:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,21:0.52: 0.12:1.000:0.994 0/0/0/0:4:16,1:0.07:-2.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,15:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,6:0.15: 0.82:1.000:0.985 0/0/0/1:4:30,6:0.20:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,21:0.73:-1.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,11:0.43:-1.12:1.000:0.953 0/0/0/1:4:32,8:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,9:0.20: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,17:0.54:-0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,19:0.51:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,21:0.70:-1.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:22,15:0.43:-0.24:1.000:0.948 0/0/0/1:4:19,5:0.25:-1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,21:0.59:-0.41:0.999:0.863 0/0/0/1:4:27,6:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.47:-1.12:1.000:0.991 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,2:0.08:-0.86:1.000:0.987 0/0/0/1:4:28,5:0.18:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,15:0.40: 0.03:1.000:0.816 0/0/0/1:4:22,5:0.22:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,13:0.38:-0.24:1.000:0.589 0/0/0/1:4:31,9:0.27: 0.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,20:0.47: 0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:20,21:0.52: 0.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:30,10:0.29: 0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,19:0.45: 0.38:0.999:0.984 0/1/1/1:4:12,25:0.65:-0.24:1.000:0.770 0/0/0/1:4:41,7:0.18: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,7:0.34:-1.47:1.000:0.877 0/0/1/1:4:27,22:0.47: 0.82:1.000:0.992 -chr7.1 73605188 chr7.1_073605188 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:239,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.68:0.995:. ./.:4:222,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.26:1.000:. ./.:3:16,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.71:1.000:. ./.:3:190,0:.: 0.91:0.633:. ./.:4:49,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:143,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.64:1.000:. ./.:6:135,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.62:0.969:. ./.:4:187,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:208,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.22:0.989:. ./.:4:188,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:98,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.61:0.999:. ./.:4:159,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.17:1.000:. ./.:5:166,0:.: 0.37:0.763:. ./.:4:120,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:282,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:205,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:126,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:86,1:.:-1.42:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:250,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.43:0.999:. ./.:4:148,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.40:0.999:. ./.:4:164,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.45:1.000:. -chr7.1 73830550 chr7.1_073830550 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:193,80:.: 0.09:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:183,77:.:-0.15:1.000:. ./.:4:248,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:296,88:.: 2.08:1.000:. ./.:4:216,64:.: 0.21:1.000:. ./.:4:122,47:.:-1.78:1.000:. ./.:4:233,93:.: 1.04:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:176,64:.:-0.50:1.000:. ./.:4:185,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:218,74:.: 0.43:0.995:. ./.:4:250,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:375,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:184,70:.:-0.25:1.000:. ./.:4:136,41:.:-1.63:1.000:. ./.:4:219,74:.: 0.45:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:178,84:.:-0.11:1.000:. ./.:4:130,36:.:-1.83:1.000:. ./.:4:171,60:.:-0.67:1.000:. ./.:4:212,65:.: 0.16:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:265,98:.: 1.70:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:141,46:.:-1.45:1.000:. ./.:4:119,101:.:-0.86:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.49:1.000:. ./.:3:81,0:.:-3.36:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:268,88:.: 1.57:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:328,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:283,108:.: 2.20:1.000:. ./.:4:180,79:.:-0.16:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:305,1:.: 0.68:1.000:. ./.:3:290,0:.: 0.39:0.633:. ./.:4:207,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:194,90:.: 0.28:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:322,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:159,80:.:-0.52:1.000:. ./.:4:284,100:.: 2.08:1.000:. ./.:4:191,71:.:-0.11:1.000:. ./.:4:338,1:.: 1.27:1.000:. ./.:4:199,74:.: 0.09:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.18:1.000:. ./.:6:215,23:.:-0.54:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:218,83:.: 0.59:1.000:. ./.:4:313,81:.: 2.26:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:178,95:.: 0.09:1.000:. ./.:4:227,72:.: 0.55:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.09:0.969:. ./.:4:159,70:.:-0.70:1.000:. ./.:4:270,90:.: 1.65:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:150,176:.: 1.04:1.000:. ./.:4:188,74:.:-0.11:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:187,53:.:-0.50:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:213,78:.: 0.41:1.000:. ./.:4:187,88:.: 0.12:1.000:. ./.:4:366,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:126,68:.:-1.33:0.989:. ./.:4:233,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:358,89:.: 3.21:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:274,97:.: 1.84:1.000:. ./.:4:204,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:287,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.90:0.999:. ./.:4:228,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:261,102:.: 1.70:1.000:. ./.:4:203,58:.:-0.13:1.000:. ./.:4:181,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:106,169:.: 0.12:1.000:. ./.:4:372,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:219,83:.: 0.61:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.38:1.000:. ./.:5:290,85:.: 1.92:0.763:. ./.:4:229,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:297,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:171,82:.:-0.27:1.000:. ./.:4:276,66:.: 1.32:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.79:0.999:. ./.:4:272,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:193,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:215,87:.: 0.61:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:239,83:.: 0.97:1.000:. ./.:4:178,65:.:-0.45:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:201,89:.: 0.39:1.000:. ./.:4:290,84:.: 1.90:1.000:. ./.:4:149,48:.:-1.28:1.000:. ./.:4:199,74:.: 0.09:1.000:. ./.:4:230,90:.: 0.93:1.000:. ./.:4:166,66:.:-0.65:1.000:. ./.:4:153,78:.:-0.67:1.000:. ./.:4:147,64:.:-1.02:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:149,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:206,92:.: 0.54:1.000:. ./.:4:183,65:.:-0.36:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:221,76:.: 0.52:1.000:. ./.:4:201,73:.: 0.10:1.000:. ./.:4:153,62:.:-0.95:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:211,92:.: 0.62:1.000:. ./.:4:263,71:.: 1.18:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:164,61:.:-0.77:1.000:. ./.:4:226,95:.: 0.95:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:173,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:263,68:.: 1.13:1.000:. ./.:4:252,98:.: 1.47:1.000:. ./.:4:178,55:.:-0.63:1.000:. ./.:4:180,55:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,55:.:-1.26:1.000:. ./.:4:149,43:.:-1.37:1.000:. ./.:4:201,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:237,67:.: 0.64:1.000:. ./.:4:244,77:.: 0.95:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:151,54:.:-1.13:1.000:. ./.:4:326,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:170,62:.:-0.65:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:172,81:.:-0.27:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:231,82:.: 0.80:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:55,135:.:-1.40:0.999:. ./.:4:231,81:.: 0.79:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:196,54:.:-0.33:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:183,59:.:-0.47:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:162,47:.:-1.06:1.000:. ./.:4:212,87:.: 0.55:1.000:. ./.:4:320,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:128,83:.:-1.02:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.31:0.999:. ./.:4:265,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:289,101:.: 2.18:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:196,75:.: 0.05:1.000:. -chr7.1 73960786 chr7.1_073960786 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:55,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:82,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.67:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:45,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:56,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.22:0.995:. ./.:4:56,2:.: 0.71:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.35:1.000:. ./.:4:50,2:.: 0.34:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.99:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:61,2:.: 1.03:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:45,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:45,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:51,1:.: 0.34:1.000:. ./.:3:45,3:.: 0.09:0.633:. ./.:4:18,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.74:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:53,3:.: 0.59:1.000:. ./.:4:25,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:41,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:42,3:.:-0.10:1.000:. ./.:6:35,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:38,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:25,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:31,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.67:0.969:. ./.:4:40,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:23,2:.:-1.36:0.999:. ./.:4:43,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,3:.: 0.15:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:41,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.35:0.989:. ./.:4:28,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:52,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:26,5:.:-0.98:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:26,2:.:-1.17:1.000:. ./.:4:33,3:.:-0.67:1.000:. ./.:4:39,2:.:-0.35:1.000:. ./.:4:45,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:38,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.40:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.73:1.000:. ./.:5:40,2:.:-0.29:0.763:. ./.:4:36,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:53,2:.: 0.53:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:48,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:40,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:40,4:.:-0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,4:.: 0.27:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:33,5:.:-0.54:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:23,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:53,5:.: 0.71:1.000:. ./.:4:31,3:.:-0.79:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:48,4:.: 0.34:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.23:1.000:. ./.:4:36,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:48,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,3:.: 0.78:1.000:. ./.:4:56,3:.: 0.78:1.000:. ./.:4:51,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:48,4:.: 0.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:84,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:41,6:.: 0.02:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,4:.: 0.71:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.98:0.999:. ./.:4:66,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:46,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:52,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:65,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.28:0.999:. ./.:4:50,5:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.04:1.000:. -chr7.1 75394478 chr7.1_075394478 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,51:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,118:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,143:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,142:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,139:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,58:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,49:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,70:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.08:0.995:. ./.:4:0,138:.: 1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.58:1.000:. ./.:4:0,113:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,139:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,121:.: 1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,142:.: 1.80:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.46:1.000:. ./.:3:0,75:.: 0.00:0.633:. ./.:4:0,40:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,124:.: 1.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,104:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,120:.: 1.21:1.000:. ./.:4:1,122:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:0,33:.:-1.13:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:0,113:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,145:.: 1.88:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,56:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,129:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,64:.:-0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,56:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,125:.: 1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,148:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,126:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,56:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,44:.:-0.83:0.989:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,142:.: 1.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,119:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,54:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,51:.:-0.64:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,125:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,43:.:-0.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.78:1.000:. ./.:5:0,102:.: 0.73:0.763:. ./.:4:0,44:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,51:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,167:.: 2.47:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.40:0.999:. ./.:4:0,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,92:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,104:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,57:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,115:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,52:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,117:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,136:.: 1.64:1.000:. ./.:4:0,140:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,61:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,117:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1,32:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.99:0.999:. ./.:4:0,104:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,93:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1,51:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,134:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.72:0.999:. ./.:4:0,77:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,122:.: 1.26:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.48:1.000:. -chr7.1 75838046 chr7.1_075838046 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:20,29:0.58: 2.16:1.000:0.909 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.19:1.000:0.514 0/1/1/1:4:13,28:0.66: 1.45:1.000:0.880 0/0/0/1:4:30,7:0.20: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.54:-0.26:1.000:0.987 0/0/0/1:4:27,15:0.36: 1.53:1.000:0.651 0/1/1/1:4:1,3:0.72:-1.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,6:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,14:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,2:0.34:-1.69:1.000:0.867 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:13,15:0.53: 0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,7:0.39:-0.62:1.000:0.730 0/0/0/1:4:20,9:0.32: 0.37:1.000:0.958 0/0/1/1:4:18,14:0.44: 0.64:1.000:0.967 0/0/1/1:4:14,17:0.54: 0.55:1.000:0.986 0/0/0/1:4:17,5:0.24:-0.26:0.995:1.000 0/1/1/1:4:9,29:0.73: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,12:0.23: 2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,11:0.36: 0.55:1.000:0.678 0/1/1/1:4:1,2:0.65:-1.96:1.000:0.768 0/0/1/1:4:14,10:0.42:-0.08:1.000:0.915 0/0/0/1:4:18,9:0.34: 0.19:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,23:0.71: 0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,19:0.57: 0.73:1.000:0.954 0/0/1/1:4:25,25:0.50: 2.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,2:0.12:-0.70:1.000:0.821 0/0/0/1:4:22,9:0.30: 0.55:1.000:0.986 0/0/1/1:4:14,21:0.59: 0.91:1.000:0.873 1/1/1/1:4:3,30:0.90: 0.73:1.000:0.685 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:19,25:0.56: 1.71:1.000:0.967 0/1/1/1:4:5,11:0.67:-0.79:1.000:0.902 0/0/0/1:4:31,13:0.30: 1.71:1.000:0.981 0/0/0/1:4:21,8:0.29: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:19,9:0.33: 0.28:1.000:0.925 0/0/1/1:4:18,19:0.51: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,8:0.28: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.88:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,28:0.83: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,6:0.54:-1.24:1.000:0.987 0/0/1/1:4:18,15:0.46: 0.73:1.000:0.985 0/1/1:3:13,16:0.55: 0.37:0.633:0.955 0/0/1/1:4:6,9:0.59:-0.88:1.000:0.873 0/1/1/1:4:4,13:0.73:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:8,4:0.34:-1.15:1.000:0.867 0/0/0/1:4:16,2:0.12:-0.62:1.000:0.670 0/0/0/1:4:30,12:0.29: 1.53:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.57: 1.00:1.000:0.936 0/0/1/1:4:17,15:0.47: 0.64:1.000:0.992 0/0/1/1:4:8,5:0.39:-1.06:1.000:0.685 0/0/1/1:4:10,14:0.57:-0.08:1.000:0.936 0/0/1/1:4:9,12:0.56:-0.35:1.000:0.962 0/0/1/1:4:25,21:0.46: 1.89:1.000:0.987 0/0/0/1/1/1:6:8,8:0.50:-0.79:1.000:0.889 0/0/0/1:4:33,18:0.36: 2.34:1.000:0.699 0/0/0/0:4:18,1:0.06:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:28,10:0.27: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,21:0.45: 1.98:1.000:0.979 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.88:1.000:0.992 0/0/0/1:4:5,2:0.29:-1.60:1.000:0.989 0/0/1/1:4:13,16:0.55: 0.37:1.000:0.984 0/0/1/1:4:22,14:0.39: 1.00:0.969:0.730 0/0/1/1:4:13,13:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,10:0.36: 0.28:1.000:0.651 0/0/1/1:4:2,3:0.59:-1.78:0.999:0.873 0/0/1/1:4:10,9:0.47:-0.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,15:0.66:-0.26:1.000:0.874 0/0/0/1:4:18,8:0.32: 0.10:1.000:0.963 0/0/1/1:4:9,6:0.40:-0.88:1.000:0.825 0/0/0/1:4:26,11:0.31: 1.09:1.000:0.979 0/0/0/1:4:12,3:0.21:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,16:0.39: 1.45:1.000:0.743 0/0/0/1:4:25,10:0.29: 0.91:1.000:0.989 0/0/0/1:4:14,6:0.31:-0.44:0.989:0.976 0/0/1/1:4:18,15:0.46: 0.73:1.000:0.985 0/0/1/1:4:14,12:0.46: 0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:14,13:0.48: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:17,9:0.35: 0.10:1.000:0.768 0/0/0/1:4:17,6:0.27:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,5:0.61:-1.51:1.000:0.685 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-1.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,8:0.47:-0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:18,11:0.38: 0.37:1.000:0.625 0/0/1/1:4:7,6:0.46:-1.06:0.999:0.989 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,21:0.52: 1.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:7,2:0.23:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,16:0.58: 0.19:1.000:0.906 0/0/1/1:4:15,16:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-0.79:1.000:0.967 0/0/0/1:4:10,4:0.29:-0.97:1.000:0.989 0/0/0/1:4:24,7:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.29: 0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:7,2:0.23:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.30: 0.19:1.000:0.980 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-0.79:1.000:0.953 0/0/0/1/1:5:15,15:0.50: 0.46:0.763:0.500 0/1/1/1:4:5,10:0.65:-0.88:1.000:0.768 0/0/1/1:4:10,10:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,6:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,11:0.24: 2.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,3:0.13:-0.08:1.000:0.916 0/0/1/1:4:34,23:0.41: 2.88:1.000:0.849 0/0/1/1:4:5,8:0.60:-1.06:1.000:0.773 0/0/1/1:4:14,21:0.59: 0.91:1.000:0.873 0/0/0/1:4:16,7:0.31:-0.17:0.999:0.969 0/0/1/1:4:12,16:0.56: 0.28:1.000:0.962 0/0/0/1:4:12,5:0.30:-0.70:1.000:0.983 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-1.33:1.000:0.873 0/0/0/1:4:17,4:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.56:-0.17:1.000:0.971 0/0/1/1:4:27,22:0.45: 2.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:11,14:0.55: 0.01:1.000:0.977 0/0/1/1:4:5,4:0.45:-1.42:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,16:0.82:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:13,1:0.07:-0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,11:0.46:-0.08:1.000:0.988 0/1/1/1:4:5,9:0.63:-0.97:1.000:0.515 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,14:0.55: 0.01:1.000:0.977 0/0/0/1:4:12,4:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,18:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,16:0.56: 0.28:1.000:0.962 0/0/0/1:4:12,7:0.37:-0.53:1.000:0.511 0/0/1/1:4:10,7:0.42:-0.70:1.000:0.894 0/0/0/1:4:24,9:0.28: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,14:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,6:0.59:-1.33:1.000:0.873 0/1/1/1:4:5,11:0.67:-0.79:1.000:0.902 0/0/1/1:4:8,12:0.59:-0.44:1.000:0.873 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-0.79:1.000:0.953 0/0/0/1:4:21,8:0.29: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-0.79:1.000:0.953 0/0/1/1:4:12,13:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-0.44:1.000:0.825 0/0/1/1:4:18,14:0.44: 0.64:1.000:0.967 0/0/0/0:4:21,2:0.09:-0.17:1.000:0.937 0/0/1/1:4:15,11:0.43: 0.10:1.000:0.936 0/0/1/1:4:14,9:0.40:-0.17:1.000:0.753 0/0/1/1:4:13,19:0.58: 0.64:1.000:0.901 0/0/1/1:4:8,13:0.61:-0.35:1.000:0.741 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:10,4:0.29:-0.97:1.000:0.989 0/0/1/1:4:15,10:0.40: 0.01:1.000:0.825 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.19:1.000:0.514 0/1/1/1:4:7,24:0.74: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-0.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:20,8:0.29: 0.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:12,13:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.70:-0.26:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,13:0.58:-0.26:1.000:0.912 0/0/1/1:4:22,21:0.49: 1.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,15:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,14:0.45: 0.55:1.000:0.983 0/0/0/1:4:30,8:0.22: 1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.24:0.999:1.000 0/0/1/1:4:17,16:0.49: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:14,8:0.37:-0.26:1.000:0.572 0/0/1/1:4:13,9:0.41:-0.26:1.000:0.881 0/0/1/1:4:10,12:0.54:-0.26:1.000:0.987 0/1/1/1:4:8,22:0.71: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,12:0.59:-0.44:1.000:0.873 0/0/1/1:4:12,9:0.43:-0.35:1.000:0.950 0/0/0/1:4:20,11:0.36: 0.55:1.000:0.678 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,7:0.14: 2.61:1.000:0.949 0/0/1/1:4:19,13:0.41: 0.64:1.000:0.865 0/1/1/1:4:7,29:0.78: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.25:-0.35:0.999:0.999 0/0/1/1:4:18,11:0.38: 0.37:1.000:0.625 0/0/1/1:4:16,19:0.54: 0.91:1.000:0.989 0/0/1/1:4:10,13:0.56:-0.17:1.000:0.971 0/0/0/1:4:19,6:0.25: 0.01:1.000:0.999 -chr7.1 76052706 chr7.1_076052706 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:154,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:69,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:116,35:.: 0.50:1.000:. ./.:4:128,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:114,32:.: 0.39:1.000:. ./.:4:123,32:.: 0.59:1.000:. ./.:4:23,2:.:-2.31:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:91,31:.:-0.15:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:117,27:.: 0.34:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:119,33:.: 0.52:1.000:. ./.:4:124,30:.: 0.57:0.995:. ./.:4:125,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:148,42:.: 1.37:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:27,2:.:-2.22:1.000:. ./.:4:254,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:118,31:.: 0.45:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:137,30:.: 0.86:1.000:. ./.:4:213,49:.: 2.98:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.47:1.000:. ./.:3:22,2:.:-2.34:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:127,26:.: 0.54:1.000:. ./.:4:103,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:168,39:.: 1.75:1.000:. ./.:4:135,35:.: 0.92:1.000:. ./.:4:106,32:.: 0.21:1.000:. ./.:4:111,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:82,37:.:-0.22:1.000:. ./.:4:93,28:.:-0.17:1.000:. ./.:3:128,0:.:-0.01:0.633:. ./.:4:76,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:73,15:.:-0.91:1.000:. ./.:4:124,43:.: 0.86:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,29:.:-0.35:1.000:. ./.:4:99,19:.:-0.24:1.000:. ./.:4:125,29:.: 0.57:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:138,26:.: 0.79:1.000:. ./.:6:91,7:.:-0.68:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:147,25:.: 0.97:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:61,16:.:-1.15:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.66:0.969:. ./.:4:71,17:.:-0.91:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:113,22:.: 0.14:0.999:. ./.:4:272,1:.: 3.22:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:65,64:.: 0.01:1.000:. ./.:4:137,23:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,27:.:-0.13:1.000:. ./.:4:68,26:.:-0.77:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:106,33:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,17:.:-0.73:0.989:. ./.:4:106,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:82,26:.:-0.46:1.000:. ./.:4:178,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:55,12:.:-1.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:86,19:.:-0.53:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:97,12:.:-0.44:0.999:. ./.:4:82,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:110,26:.: 0.16:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,19:.:-0.86:1.000:. ./.:4:70,10:.:-1.09:1.000:. ./.:4:85,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:90,20:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.35:1.000:. ./.:5:74,23:.:-0.71:0.763:. ./.:4:75,11:.:-0.95:1.000:. ./.:4:97,22:.:-0.22:1.000:. ./.:4:85,19:.:-0.55:1.000:. ./.:4:118,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:92,18:.:-0.42:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:55,17:.:-1.26:0.999:. ./.:4:98,24:.:-0.15:1.000:. ./.:4:76,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:74,12:.:-0.95:1.000:. ./.:4:97,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:84,16:.:-0.64:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:58,15:.:-1.24:1.000:. ./.:4:116,17:.: 0.10:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:131,28:.: 0.68:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:77,25:.:-0.59:1.000:. ./.:4:114,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:78,22:.:-0.64:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:58,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:95,22:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:124,35:.: 0.68:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,28:.: 0.92:1.000:. ./.:4:85,21:.:-0.51:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:30,5:.:-2.09:1.000:. ./.:4:78,17:.:-0.75:1.000:. ./.:4:184,50:.: 2.35:1.000:. ./.:4:101,21:.:-0.15:1.000:. ./.:4:134,30:.: 0.79:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:104,28:.: 0.07:1.000:. ./.:4:122,19:.: 0.28:1.000:. ./.:4:113,30:.: 0.32:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:97,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.54:0.999:. ./.:4:89,19:.:-0.46:1.000:. ./.:4:117,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:105,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:102,26:.:-0.01:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.55:1.000:. ./.:4:102,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:229,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:134,28:.: 0.74:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:124,50:.: 1.01:0.999:. ./.:4:183,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:142,29:.: 0.95:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:92,20:.:-0.37:1.000:. -chr7.1 76361830 chr7.1_076361830 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:257,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.41:0.995:. ./.:4:218,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:298,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.45:1.000:. ./.:3:16,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:241,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.41:1.000:. ./.:3:249,0:.: 1.15:0.633:. ./.:4:50,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:159,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:166,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:0.969:. ./.:4:192,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.08:0.999:. ./.:4:176,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.10:0.989:. ./.:4:150,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.73:0.999:. ./.:4:155,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.02:1.000:. ./.:5:199,0:.: 0.23:0.763:. ./.:4:150,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:309,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.05:0.999:. ./.:4:203,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.44:0.999:. ./.:4:209,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.33:0.999:. ./.:4:264,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.58:1.000:. -chr7.1 76520525 chr7.1_076520525 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:439,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:433,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:586,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:506,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:128,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:510,2:.: 1.13:0.995:. ./.:4:453,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:556,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:142,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:109,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:595,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:526,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:501,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:491,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:549,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:134,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:160,2:.:-1.96:1.000:. ./.:3:89,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:515,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:429,2:.: 0.42:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:418,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.40:1.000:. ./.:3:476,0:.: 0.81:0.633:. ./.:4:1077,0:.: 6.12:1.000:. ./.:4:332,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:395,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:276,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:427,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.19:0.969:. ./.:4:326,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:530,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:270,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:311,1:.:-0.64:0.989:. ./.:4:387,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:357,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:248,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:307,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.03:0.999:. ./.:4:287,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:303,2:.:-0.70:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.93:1.000:. ./.:5:399,0:.: 0.13:0.763:. ./.:4:299,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:511,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:343,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.12:0.999:. ./.:4:356,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:285,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:316,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:340,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:402,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:237,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:527,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:309,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:507,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:347,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:337,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:514,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:147,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:542,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:567,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:423,1:.: 0.35:0.999:. ./.:4:383,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:676,1:.: 2.59:1.000:. ./.:4:500,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:451,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:512,0:.: 1.13:0.999:. ./.:4:600,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.04:1.000:. -chr7.1 76632332 chr7.1_076632332 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:41,24:0.39: 0.28:1.000:0.683 0/0/0/1:4:27,10:0.29:-1.40:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,44:0.64: 0.47:1.000:0.714 0/0/1/1:4:38,27:0.44: 0.28:1.000:0.961 0/0/0/1:4:65,14:0.19: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,30:0.38: 1.37:1.000:0.586 0/0/1/1:4:12,18:0.60:-1.83:1.000:0.765 0/0/1/1:4:32,21:0.42:-0.44:1.000:0.901 0/0/1/1:4:30,36:0.56: 0.35:1.000:0.971 0/0/0/1:4:26,4:0.14:-1.83:1.000:0.975 0/1/1/1:4:2,11:0.82:-2.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,23:0.41:-0.08:1.000:0.867 0/0/1/1:4:40,31:0.46: 0.65:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,24:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,17:0.37:-0.68:1.000:0.611 0/0/1/1:4:41,43:0.53: 1.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:56,24:0.32: 1.19:0.995:0.958 0/0/1/1:4:31,32:0.53: 0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:57,15:0.22: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,27:0.46: 0.10:1.000:0.986 0/0/0/1:4:17,7:0.31:-2.19:1.000:0.974 0/0/0/1:4:56,12:0.19: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,43:0.71:-0.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,37:0.76:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-2.97:1.000:0.856 0/0/1/1:4:40,43:0.53: 1.37:1.000:0.990 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,19:0.45:-0.98:1.000:0.983 0/0/0/1:4:50,10:0.18:-0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,16:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,35:0.53: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,27:0.44: 0.28:1.000:0.961 0/0/0/1:4:13,3:0.20:-2.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,4:0.16:-2.07:1.000:0.997 0/0/0:3:7,1:0.13:-3.15:1.000:0.810 0/0/0/1:4:41,13:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,30:0.43: 0.83:1.000:0.937 0/0/0/1:4:50,13:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,28:0.36: 1.31:1.000:0.680 0/0/0/1:4:53,17:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,24:0.51:-0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,14:0.22: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,19:0.26: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,23:0.42:-0.20:1.000:0.931 0/0/1/1:4:33,24:0.44:-0.20:1.000:0.971 0/0/1/1:4:36,34:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/1/1:3:23,48:0.67: 0.65:0.633:1.000 0/0/1/1:4:28,39:0.59: 0.41:1.000:0.876 0/0/1/1:4:36,26:0.44: 0.10:1.000:0.968 0/0/1/1:4:46,30:0.42: 0.95:1.000:0.894 0/0/0/1:4:74,15:0.18: 1.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,28:0.40: 0.77:1.000:0.823 0/0/1/1:4:30,32:0.53: 0.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:51,28:0.37: 1.13:1.000:0.509 0/0/1/1:4:32,23:0.44:-0.32:1.000:0.966 0/0/1/1:4:34,30:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,24:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:65,17:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,18:0.29: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1/1/1:6:16,23:0.59:-1.28:1.000:0.599 0/0/1/1:4:23,26:0.54:-0.68:1.000:0.984 0/0/0/1:4:37,18:0.35:-0.32:1.000:0.825 0/0/1/1:4:31,33:0.53: 0.22:1.000:0.991 0/0/1/1:4:29,33:0.55: 0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:44,37:0.48: 1.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:39,12:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,6:0.27:-2.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,31:0.53:-0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,26:0.43: 0.22:0.969:0.939 0/0/0/1:4:39,16:0.31:-0.32:1.000:0.975 0/0/1/1:4:31,18:0.39:-0.68:1.000:0.661 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-2.67:0.999:0.942 0/0/0/1:4:61,12:0.18: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,49:0.62: 1.13:1.000:0.572 0/0/0/1:4:73,16:0.19: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.23:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,31:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,15:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,44:0.51: 1.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,28:0.41: 0.71:1.000:0.861 0/0/0/1:4:32,7:0.19:-1.28:0.989:1.000 0/0/0/1:4:53,17:0.26: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,21:0.33: 0.41:1.000:0.913 0/0/0/1:4:58,20:0.27: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,34:0.55: 0.16:1.000:0.977 0/0/0/1:4:58,14:0.21: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,27:0.58:-0.80:1.000:0.908 0/0/1/1:4:33,23:0.43:-0.26:1.000:0.951 0/0/1/1:4:29,25:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,7:0.17:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,24:0.49:-0.56:0.999:0.997 0/0/0/1:4:46,23:0.35: 0.53:1.000:0.770 0/0/1/1:4:40,27:0.42: 0.41:1.000:0.929 0/0/0/1:4:39,17:0.32:-0.26:1.000:0.949 0/0/1/1:4:26,27:0.53:-0.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,38:0.64:-0.08:1.000:0.685 0/0/1/1:4:28,25:0.49:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,12:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.27:-2.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,29:0.54:-0.32:1.000:0.986 0/0/1/1:4:19,23:0.56:-1.10:1.000:0.969 0/0/1/1/1:5:34,41:0.56: 0.89:0.763:0.910 0/1/1/1:4:13,42:0.74:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,26:0.44: 0.10:1.000:0.968 0/0/0/1:4:36,12:0.27:-0.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:39,12:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,39:0.54: 0.89:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,30:0.44: 0.65:1.000:0.973 0/0/1/1:4:38,21:0.38:-0.08:1.000:0.511 0/0/0/1:4:71,30:0.32: 2.46:1.000:0.965 0/0/0/1:4:45,21:0.34: 0.35:0.999:0.888 0/0/1/1:4:36,30:0.48: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,26:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,10:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:21,19:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,18:0.33:-0.14:1.000:0.926 0/0/0/1:4:47,12:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,27:0.57:-0.74:1.000:0.942 0/0/1/1:4:33,28:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,14:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,18:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,37:0.54: 0.65:1.000:0.989 0/1/1/1:4:12,39:0.74:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,43:0.56: 1.13:1.000:0.973 0/0/1/1:4:28,25:0.49:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,9:0.16: 0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:21,19:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,38:0.74:-0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:52,21:0.31: 0.77:1.000:0.980 0/0/1/1:4:37,25:0.42: 0.10:1.000:0.930 0/0/1/1:4:18,18:0.52:-1.46:1.000:0.995 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,30:0.45: 0.59:1.000:0.980 0/0/0/1:4:48,9:0.17:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,34:0.72:-0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,26:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,37:0.60: 0.10:1.000:0.789 0/0/0/1:4:52,22:0.32: 0.83:1.000:0.964 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,44:0.54: 1.37:1.000:0.985 0/0/1/1:4:40,27:0.42: 0.41:1.000:0.929 0/0/1/1:4:34,31:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,29:0.40: 1.01:1.000:0.763 0/0/0/1:4:59,13:0.19: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,14:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,34:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,30:0.44: 0.71:1.000:0.964 0/0/0/1:4:14,5:0.28:-2.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,5:0.16:-1.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,47:0.52: 2.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,24:0.35: 0.77:1.000:0.813 0/0/0/1:4:63,12:0.17: 0.89:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,24:0.46:-0.32:1.000:0.987 0/0/1/1:4:32,34:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:62,13:0.19: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,10:0.31:-1.58:1.000:0.970 0/0/1/1:4:33,34:0.53: 0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,25:0.42: 0.10:1.000:0.930 0/1/1/1:4:16,46:0.72: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,30:0.46: 0.47:1.000:0.989 0/0/0/1:4:52,18:0.27: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,17:0.53:-1.64:1.000:0.991 0/0/0/1:4:49,26:0.37: 0.89:0.999:0.614 0/0/0/1:4:56,17:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,26:0.42: 0.28:1.000:0.918 0/0/1/1:4:27,22:0.47:-0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,29:0.67:-1.04:1.000:0.898 0/1/1/1:4:17,42:0.70:-0.08:1.000:0.982 0/0/1/1:4:24,25:0.53:-0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,31:0.47: 0.53:1.000:0.993 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,26:0.38: 0.77:1.000:0.515 0/0/0/1:4:56,18:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,38:0.74:-0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:24,24:0.52:-0.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,31:0.46: 0.65:0.999:0.987 0/0/1/1:4:51,40:0.46: 1.85:1.000:0.988 0/0/0/1:4:54,20:0.29: 0.83:1.000:0.993 0/0/1/1:4:20,24:0.56:-0.98:1.000:0.971 0/0/0/1:4:64,18:0.23: 1.31:1.000:1.000 -chr7.1 76787449 chr7.1_076787449 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:280,0:.: 2.85:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.11:0.995:. ./.:4:212,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.87:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:228,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.62:1.000:. ./.:3:30,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:270,1:.: 2.68:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:109,1:.:-0.26:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.34:1.000:. ./.:3:110,0:.:-0.26:0.633:. ./.:4:36,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.19:1.000:. ./.:6:53,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.33:0.969:. ./.:4:146,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.04:0.999:. ./.:4:141,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.64:0.989:. ./.:4:137,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.21:1.000:. ./.:5:82,0:.:-0.77:0.763:. ./.:4:59,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:246,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:122,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:253,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:196,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:266,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.14:0.999:. ./.:4:154,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:300,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:218,0:.: 1.72:0.999:. ./.:4:197,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:221,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.76:1.000:. -chr7.1 76987160 chr7.1_076987160 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:132,62:.: 1.32:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:95,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:106,46:.: 0.30:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:140,51:.: 1.24:1.000:. ./.:4:84,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:108,48:.: 0.40:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:22,9:.:-2.63:1.000:. ./.:4:15,5:.:-2.90:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:101,41:.: 0.06:1.000:. ./.:4:101,38:.:-0.02:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:106,42:.: 0.20:0.995:. ./.:4:164,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:175,60:.: 2.31:1.000:. ./.:4:157,51:.: 1.66:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:114,48:.: 0.54:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:11,1:.:-3.09:1.000:. ./.:4:122,35:.: 0.42:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:140,51:.: 1.24:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:185,60:.: 2.55:1.000:. ./.:4:118,41:.: 0.47:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.95:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.71:1.000:. ./.:3:8,0:.:-3.19:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:125,42:.: 0.66:1.000:. ./.:4:111,33:.: 0.11:1.000:. ./.:4:190,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:124,33:.: 0.42:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.72:1.000:. ./.:3:155,47:.: 1.51:0.633:. ./.:4:47,19:.:-1.79:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:70,19:.:-1.23:1.000:. ./.:4:75,32:.:-0.79:1.000:. ./.:4:119,40:.: 0.47:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:122,50:.: 0.78:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.06:1.000:. ./.:6:66,28:.:-1.11:1.000:. ./.:4:114,52:.: 0.64:1.000:. ./.:4:89,34:.:-0.40:1.000:. ./.:4:99,31:.:-0.23:1.000:. ./.:4:97,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:103,45:.: 0.20:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:101,42:.: 0.08:0.969:. ./.:4:112,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:118,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:52,21:.:-1.62:0.999:. ./.:4:142,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:88,42:.:-0.23:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:96,29:.:-0.36:1.000:. ./.:4:107,27:.:-0.14:1.000:. ./.:4:141,50:.: 1.24:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.72:0.989:. ./.:4:122,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:88,23:.:-0.69:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:95,44:.:-0.02:1.000:. ./.:4:111,53:.: 0.59:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:118,46:.: 0.59:1.000:. ./.:4:90,26:.:-0.57:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:122,38:.: 0.49:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.89:1.000:. ./.:5:125,34:.: 0.47:0.763:. ./.:4:67,30:.:-1.03:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:146,52:.: 1.41:1.000:. ./.:4:105,45:.: 0.25:1.000:. ./.:4:118,44:.: 0.54:1.000:. ./.:4:71,32:.:-0.89:1.000:. ./.:4:233,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:134,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,30:.:-1.11:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:74,22:.:-1.06:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.57:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:62,38:.:-0.96:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:84,33:.:-0.55:1.000:. ./.:4:90,40:.:-0.23:1.000:. ./.:4:109,52:.: 0.52:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:82,31:.:-0.65:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:108,46:.: 0.35:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:71,25:.:-1.06:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,60:.: 1.03:1.000:. ./.:4:115,53:.: 0.69:1.000:. ./.:4:132,34:.: 0.64:1.000:. ./.:4:96,47:.: 0.08:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:108,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:150,49:.: 1.44:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:7,7:.:-3.05:1.000:. ./.:4:82,40:.:-0.43:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:112,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:128,30:.: 0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:109,48:.: 0.42:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:110,33:.: 0.08:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.66:0.999:. ./.:4:155,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:136,34:.: 0.74:1.000:. ./.:4:110,42:.: 0.30:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:88,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:147,54:.: 1.49:1.000:. ./.:4:136,55:.: 1.24:1.000:. ./.:4:112,38:.: 0.25:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.24:0.999:. ./.:4:220,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.04:1.000:. -chr7.1 77078448 chr7.1_077078448 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:210,182:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:366,114:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:355,101:0.24: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:326,82:0.22:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:415,133:0.27: 1.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:414,100:0.21: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:345,69:0.18:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:381,105:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:408,101:0.22: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,86:0.47:-2.66:1.000:0.992 0/0/0/1:4:188,53:0.24:-2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,112:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:326,100:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:395,137:0.28: 1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:368,103:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:472,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:421,114:0.23: 1.18:0.995:1.000 0/0/0/1:4:382,100:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:297,278:0.51: 1.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:312,280:0.50: 1.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,109:0.49:-2.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,303:0.73:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:399,107:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:406,127:0.26: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,49:0.25:-2.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:384,102:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,143:0.39:-0.45:1.000:0.692 0/0/1/1:4:192,182:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:258,252:0.52: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:258,209:0.47: 0.42:1.000:0.993 0/0/0/1:4:464,117:0.22: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:352,78:0.20: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,108:0.77:-3.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,63:0.27:-1.96:1.000:0.998 0/0/1:3:39,33:0.48:-4.02:1.000:0.765 0/0/1/1:4:264,210:0.47: 0.50:1.000:0.991 0/0/0/0:4:515,2:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,225:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:384,117:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:448,130:0.25: 1.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:304,119:0.30:-0.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:218,178:0.47:-0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:116,314:0.72: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,178:0.52:-0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:386,121:0.26: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:363,111:0.26: 0.50:1.000:0.999 0/0/1:3:369,119:0.27: 0.65:0.633:1.000 0/0/0/1:4:568,149:0.23: 3.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,168:0.51:-0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:367,100:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,171:0.51:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:382,122:0.26: 0.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:331,99:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,194:0.49:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,187:0.49:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:363,99:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,191:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:247,224:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:368,92:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:200,138:0.43:-1.03:1.000:0.618 0/0/1/1:4:186,202:0.54:-0.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:207,188:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:385,108:0.24: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,207:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:254,236:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:240,199:0.48: 0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:356,122:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:328,109:0.27: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:330,93:0.24:-0.08:0.969:1.000 0/0/1/1:4:182,140:0.46:-1.21:1.000:0.987 0/0/1/1:4:226,233:0.53: 0.33:1.000:0.993 0/0/0/1:4:313,102:0.27:-0.17:0.999:0.998 0/1/1/1:4:129,324:0.70: 0.26:1.000:0.989 0/0/0/1:4:337,95:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,93:0.26:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:349,116:0.27: 0.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:353,106:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:220,177:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/0/1:4:335,108:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:254,228:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,168:0.51:-1.00:0.989:0.996 0/0/1/1:4:231,218:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:119,330:0.72: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:303,0:0.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:301,274:0.50: 1.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:128,406:0.74: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:338,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,83:0.26:-0.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:320,87:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,187:0.48:-0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:314,105:0.27:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:364,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:370,129:0.28: 0.78:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,203:0.70:-1.59:1.000:0.981 0/0/1/1:4:300,255:0.48: 1.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:371,106:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:272,59:0.20:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,312:0.73:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:220,202:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:251,233:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,209:0.54:-0.30:1.000:0.990 0/0/0/1:4:361,110:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,128:0.46:-1.56:1.000:0.990 0/0/0/0/1:5:383,94:0.22: 0.53:0.763:0.988 0/0/0/0:4:367,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:318,95:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,159:0.46:-0.74:1.000:0.988 0/0/1/1:4:243,202:0.48: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:244,230:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:349,104:0.25: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:299,94:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:304,247:0.47: 1.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:169,144:0.48:-1.31:0.999:0.996 0/0/0/1:4:388,124:0.26: 0.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:224,66:0.25:-1.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,228:0.53: 0.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:346,92:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,154:0.48:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:224,217:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,143:0.49:-1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,186:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:266,84:0.26:-0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:335,105:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:335,100:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:287,118:0.31:-0.28:1.000:0.966 0/0/1/1:4:214,187:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,207:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:218,190:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:260,79:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,81:0.25:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:316,97:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/0:4:516,2:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,49:0.20:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,164:0.48:-0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:95,269:0.72:-0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:313,295:0.51: 2.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:263,191:0.44: 0.27:1.000:0.974 0/1/1/1:4:89,262:0.73:-0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:260,72:0.24:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:391,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,183:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:90,299:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:222,205:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,234:0.71:-1.19:1.000:0.992 0/0/1/1:4:291,271:0.51: 1.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:535,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,200:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:214,174:0.47:-0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:318,245:0.46: 1.50:1.000:0.987 0/0/0/1:4:340,82:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,229:0.48: 0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:235,193:0.47:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:123,57:0.34:-2.81:1.000:0.870 0/0/1/1:4:156,140:0.50:-1.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:442,130:0.25: 1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:288,223:0.46: 0.91:1.000:0.988 0/0/0/1:4:403,105:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,271:0.52: 1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:195,178:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:403,100:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:351,88:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:377,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:242,158:0.42:-0.34:1.000:0.908 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:246,208:0.48: 0.27:1.000:0.995 0/1/1/1:4:138,291:0.67:-0.01:1.000:0.932 0/0/0/1:4:382,104:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,210:0.52:-0.16:0.999:0.994 0/0/1/1:4:234,167:0.44:-0.32:1.000:0.967 0/0/0/1:4:388,101:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:317,73:0.21:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:437,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:350,98:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:428,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:414,1:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,282:0.75:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:449,107:0.21: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:293,265:0.50: 1.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:373,112:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:341,94:0.24: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:431,117:0.23: 1.33:0.999:1.000 0/0/1/1:4:281,238:0.48: 1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:260,244:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:394,95:0.21: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,177:0.48:-0.50:1.000:0.996 -chr7.1 77166737 chr7.1_077166737 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:119,82:0.42: 0.95:1.000:0.903 0/0/0/1:4:148,57:0.32: 1.04:1.000:0.955 0/0/1/1:4:53,86:0.61:-0.47:1.000:0.669 0/1/1/1:4:39,104:0.73:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,46:0.32: 0.10:1.000:0.950 0/0/1/1:4:136,74:0.38: 1.15:1.000:0.510 0/1/1/1:4:36,86:0.71:-0.86:1.000:0.991 0/0/0/1:4:100,49:0.36:-0.24:1.000:0.714 0/0/1/1:4:89,87:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-2.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,65:0.74:-1.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,109:0.49: 1.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:46,114:0.72: 0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,77:0.42: 0.58:1.000:0.927 0/1/1/1:4:50,119:0.71: 0.21:1.000:0.990 0/1/1/1:4:74,145:0.66: 1.36:1.000:0.870 0/0/1/1:4:95,57:0.39:-0.17:0.995:0.719 0/0/1/1:4:119,129:0.50: 2.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,29:0.18: 1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,87:0.42: 1.15:1.000:0.922 0/1/1/1:4:21,49:0.70:-2.05:1.000:0.987 0/0/0/1:4:145,33:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,117:0.73: 0.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,110:0.67: 0.12:1.000:0.899 0/0/0/1:4:28,9:0.29:-2.80:1.000:0.990 0/1/1/1:4:47,123:0.73: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,55:0.29: 1.52:1.000:0.990 0/0/1/1:4:115,99:0.46: 1.24:1.000:0.987 0/0/0/1:4:112,49:0.34: 0.03:1.000:0.873 0/0/0/1:4:158,28:0.20: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,101:0.55: 0.44:1.000:0.978 0/1/1/1:4:51,95:0.65:-0.31:1.000:0.769 0/0/0/1:4:21,2:0.12:-3.12:1.000:0.692 0/0/1/1:4:53,45:0.46:-1.41:1.000:0.985 0/0/0:3:28,1:0.05:-2.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,115:0.50: 1.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,134:0.79: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,23:0.19: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,33:0.32:-0.93:1.000:0.956 0/0/1/1:4:83,72:0.46:-0.11:1.000:0.988 0/0/1/1:4:86,66:0.44:-0.17:1.000:0.962 0/0/0/1:4:152,25:0.19: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,20:0.16: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,79:0.48: 0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,86:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:84,76:0.47: 0.01:1.000:0.991 0/1/1:3:60,137:0.70: 0.85:0.633:1.000 0/1/1/1:4:105,250:0.71: 4.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:95,65:0.42: 0.01:1.000:0.897 0/1/1/1:4:41,85:0.67:-0.77:1.000:0.936 0/0/0/1:4:114,16:0.17:-0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:130,88:0.41: 1.33:1.000:0.887 0/1/1/1:4:43,101:0.70:-0.36:1.000:0.988 0/0/0/1:4:171,20:0.14: 0.72:1.000:0.970 0/0/0/1:4:109,46:0.33:-0.11:1.000:0.905 0/0/1/1:4:93,79:0.46: 0.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:97,80:0.45: 0.40:1.000:0.980 0/0/1/1:4:68,64:0.48:-0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,52:0.39:-0.47:1.000:0.712 0/0/0/0/1/1:6:93,44:0.35:-0.52:1.000:0.895 0/0/1/1:4:93,67:0.43: 0.01:1.000:0.934 0/0/0/1:4:107,50:0.35:-0.06:1.000:0.793 0/0/0/1:4:118,40:0.30:-0.04:1.000:0.984 0/0/1/1:4:65,67:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,81:0.46: 0.35:1.000:0.987 0/0/0/1:4:78,38:0.36:-1.00:1.000:0.725 0/0/1/1:4:52,63:0.53:-1.02:1.000:0.991 0/1/1/1:4:42,85:0.67:-0.75:1.000:0.913 0/0/1/1:4:51,80:0.60:-0.65:0.969:0.763 0/0/0/1:4:148,53:0.31: 0.95:1.000:0.975 0/0/0/1:4:98,38:0.32:-0.54:1.000:0.952 0/0/1/1:4:99,61:0.40: 0.01:0.999:0.766 0/0/0/1:4:136,62:0.35: 0.88:1.000:0.827 0/1/1/1:4:55,108:0.66: 0.08:1.000:0.873 0/0/0/1:4:133,61:0.35: 0.79:1.000:0.819 0/0/0/1:4:85,31:0.31:-1.00:1.000:0.971 0/0/0/1:4:90,32:0.31:-0.86:1.000:0.977 0/0/0/1:4:122,17:0.16:-0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,104:0.67:-0.11:1.000:0.921 0/0/0/1:4:146,20:0.16: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,36:0.31:-0.52:0.989:0.976 0/0/1/1:4:85,96:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,34:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,116:0.72: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,63:0.46:-0.56:1.000:0.988 0/0/0/1:4:142,21:0.17: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,82:0.65:-0.79:1.000:0.821 0/1/1/1:4:39,79:0.67:-0.95:1.000:0.914 0/0/1/1:4:95,83:0.46: 0.42:1.000:0.988 0/0/1/1:4:89,78:0.46: 0.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:72,82:0.52:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,101:0.74:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,45:0.36:-0.61:1.000:0.629 0/0/0/1:4:109,38:0.30:-0.29:1.000:0.980 0/0/1/1:4:90,75:0.45: 0.12:1.000:0.982 0/1/1/1:4:49,104:0.68:-0.15:1.000:0.953 0/1/1/1:4:42,85:0.67:-0.75:1.000:0.913 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,19:0.15: 0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:140,19:0.16:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:111,12:0.13:-0.84:1.000:0.921 0/0/1/1:4:80,48:0.39:-0.72:1.000:0.719 0/0/1/1:4:50,56:0.51:-1.23:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:85,79:0.47: 0.10:0.763:0.747 0/0/1/1:4:44,74:0.62:-0.95:1.000:0.552 0/0/1/1:4:88,84:0.48: 0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:103,14:0.16:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,18:0.15: 0.03:1.000:0.988 0/0/1/1:4:120,106:0.46: 1.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:106,72:0.41: 0.42:1.000:0.890 0/1/1/1:4:33,87:0.73:-0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:140,102:0.43: 1.88:1.000:0.940 0/0/0/1:4:130,27:0.23:-0.06:0.999:1.000 0/0/1/1:4:89,79:0.46: 0.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:77,18:0.25:-1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,84:0.45: 0.60:1.000:0.980 0/0/0/1:4:83,28:0.30:-1.11:1.000:0.985 0/0/0/1:4:117,18:0.18:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:143,15:0.13:-0.04:1.000:0.887 0/0/1/1:4:69,66:0.48:-0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,86:0.48: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,38:0.34:-0.84:1.000:0.851 0/0/0/1:4:93,46:0.36:-0.47:1.000:0.696 0/1/1/1:4:65,146:0.69: 1.17:1.000:0.978 0/1/1/1:4:51,100:0.66:-0.20:1.000:0.871 0/0/0/1:4:102,21:0.23:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,65:0.43:-0.15:1.000:0.947 0/0/0/1:4:89,30:0.30:-0.93:1.000:0.985 0/0/1/1:4:37,62:0.62:-1.39:1.000:0.564 0/1/1/1:4:26,59:0.70:-1.71:1.000:0.981 0/0/1/1:4:83,76:0.47:-0.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:56,132:0.70: 0.65:1.000:0.989 0/1/1/1:4:36,62:0.63:-1.41:1.000:0.530 0/0/0/1:4:157,16:0.12: 0.31:1.000:0.844 0/0/0/1:4:107,19:0.20:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,125:0.47: 2.32:1.000:0.992 0/0/0/1:4:116,12:0.13:-0.72:1.000:0.868 0/0/0/1:4:140,13:0.11:-0.15:1.000:0.618 0/1/1/1:4:36,82:0.70:-0.95:1.000:0.982 0/1/1/1:4:36,89:0.72:-0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:90,107:0.53: 0.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:155,14:0.11: 0.21:1.000:0.531 0/0/0/1:4:139,26:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,31:0.29:-0.72:1.000:0.990 0/0/1/1:4:129,97:0.43: 1.52:1.000:0.955 0/1/1/1:4:76,161:0.68: 1.77:1.000:0.952 0/0/1/1:4:100,69:0.42: 0.21:1.000:0.904 0/0/0/1:4:111,48:0.34:-0.01:1.000:0.884 0/0/0/1:4:219,43:0.22: 2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,32:0.32:-1.07:1.000:0.944 0/0/1/1:4:115,74:0.40: 0.67:1.000:0.830 0/0/1/1:4:83,101:0.53: 0.56:1.000:0.990 0/0/0/1:4:53,11:0.23:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,12:0.11:-0.40:1.000:0.600 0/0/1/1:4:114,109:0.48: 1.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:188,28:0.17: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,95:0.42: 1.61:1.000:0.919 0/0/1/1:4:105,97:0.47: 0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:70,76:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,68:0.41: 0.24:1.000:0.872 0/0/0/1:4:121,50:0.33: 0.26:1.000:0.920 0/0/1/1:4:66,98:0.59: 0.10:1.000:0.873 0/0/1/1:4:80,82:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,108:0.69:-0.06:1.000:0.972 0/0/1/1:4:96,123:0.55: 1.36:1.000:0.981 0/0/0/1:4:153,35:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,44:0.36:-0.68:1.000:0.628 0/0/1/1:4:109,106:0.48: 1.26:0.999:0.995 0/0/0/1:4:136,27:0.22: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,58:0.39:-0.06:1.000:0.672 0/0/1/1:4:83,49:0.39:-0.63:1.000:0.688 0/1/1/1:4:28,81:0.75:-1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,89:0.67:-0.61:1.000:0.912 0/1/1/1:4:50,106:0.68:-0.08:1.000:0.952 0/0/1/1:4:40,55:0.57:-1.48:1.000:0.952 0/0/0/1:4:99,23:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,144:0.74: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:166,18:0.13: 0.56:1.000:0.923 0/1/1/1:4:55,109:0.66: 0.10:1.000:0.887 0/1/1/1:4:47,99:0.68:-0.31:1.000:0.948 0/0/1/1:4:111,118:0.50: 1.58:0.999:0.997 0/0/1/1:4:113,109:0.48: 1.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:185,46:0.26: 1.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,129:0.70: 0.56:1.000:0.988 0/0/0/1:4:154,61:0.32: 1.26:1.000:0.943 -chr7.1 77351871 chr7.1_077351871 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:89,89:0.45:-0.02:1.000:0.976 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,90:0.33: 0.64:1.000:0.908 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,87:0.17: 3.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,76:0.23: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,42:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,70:0.23: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:227,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-2.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,30:0.20:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:204,1:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,1:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:283,0:0.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,70:0.25: 0.45:0.995:0.999 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,90:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:59,22:0.20:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,89:0.53:-0.47:1.000:0.992 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,66:0.20: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,14:0.23:-2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,79:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,75:0.24: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,90:0.44: 0.05:1.000:0.962 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,58:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,11:0.75:-2.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:91,1:0.01:-1.30:1.000:1.000 0/0/0:3:12,0:0.00:-2.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:307,0:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,66:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,91:0.43: 0.09:1.000:0.955 0/0/0/1:4:130,63:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:232,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/0:3:174,0:0.00:-0.08:0.633:1.000 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,69:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,59:0.16: 1.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,87:0.30: 0.81:1.000:0.989 0/0/1/1:4:78,85:0.47:-0.25:1.000:0.993 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,60:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:217,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:74,15:0.13:-1.35:1.000:0.988 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,62:0.39:-0.65:1.000:0.739 0/0/0/1:4:142,67:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,74:0.44:-0.46:1.000:0.971 0/0/0/1:4:140,79:0.28: 0.58:1.000:0.995 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:186,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.90:0.969:1.000 0/0/0/1:4:130,68:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,75:0.44:-0.41:1.000:0.965 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.69:0.999:1.000 0/0/1/1:4:67,134:0.57: 0.32:1.000:0.955 0/0/0/1:4:148,84:0.28: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:181,59:0.18: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/0:4:109,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,83:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:153,80:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/0:4:129,1:0.01:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,66:0.26: 0.20:0.989:0.999 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,71:0.44:-0.54:1.000:0.971 0/0/0/0:4:280,0:0.00: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,78:0.42:-0.23:1.000:0.904 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,1:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,68:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,61:0.48:-0.96:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,89:0.29: 0.93:1.000:0.991 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,109:0.56:-0.20:1.000:0.965 0/0/0/0:4:156,1:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,54:0.27:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:220,64:0.17: 1.55:0.763:0.999 0/0/0/0:4:175,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,58:0.21: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,110:0.30: 1.73:1.000:0.989 0/0/0/0:4:142,0:0.00:-0.56:0.999:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,58:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:151,66:0.23: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,1:0.01:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,73:0.30: 0.23:1.000:0.986 0/0/1/1:4:57,57:0.45:-0.97:1.000:0.976 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,59:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,82:0.20: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,98:0.20: 2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,61:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,71:0.43:-0.50:1.000:0.947 0/0/0/1:4:84,59:0.34:-0.54:1.000:0.846 0/0/0/1:4:116,59:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,44:0.17: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:261,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,64:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,51:0.29:-0.62:1.000:0.990 0/0/0/0:4:209,1:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,66:0.39:-0.48:1.000:0.649 0/0/1/1:4:60,64:0.47:-0.83:1.000:0.990 0/0/0/1:4:129,57:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:274,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,90:0.26: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,61:0.37:-0.57:1.000:0.602 0/0/0/0:4:156,1:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,53:0.51:-1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,89:0.46:-0.08:1.000:0.988 0/0/0/0:4:298,0:0.00: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,76:0.44:-0.37:1.000:0.958 0/0/1/1:4:87,84:0.44:-0.13:1.000:0.960 0/0/0/1:4:180,96:0.27: 1.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:115,73:0.31: 0.12:1.000:0.965 0/0/1/1:4:95,84:0.41:-0.01:1.000:0.865 0/0/0/1:4:147,72:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,30:0.29:-1.45:1.000:0.993 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,85:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,99:0.20: 2.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:180,1:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,65:0.34:-0.32:1.000:0.856 0/0/0/0:4:246,1:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,71:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,98:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,153:0.46: 1.76:0.999:0.989 0/0/0/1:4:127,68:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,71:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,84:0.29: 0.76:1.000:0.994 0/0/0/0:4:293,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,64:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:272,109:0.21: 2.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,85:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:240,0:0.00: 0.90:0.999:1.000 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,106:0.24: 2.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,93:0.28: 1.22:1.000:0.997 -chr7.1 77507194 chr7.1_077507194 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:124,58:0.31: 0.38:1.000:0.980 0/0/0/1:4:119,43:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/0:4:155,1:0.01:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,90:0.52:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:175,57:0.24: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,21:0.19:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,47:0.28:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,32:0.66:-2.97:1.000:0.877 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-2.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,43:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,75:0.40: 0.26:1.000:0.806 0/0/0/1:4:116,54:0.30: 0.09:1.000:0.981 0/0/1/1:4:73,87:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,29:0.15: 0.55:1.000:0.986 0/0/0/1:4:132,49:0.26: 0.36:0.995:0.999 0/0/0/1:4:147,50:0.25: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,131:0.56: 1.39:1.000:0.974 0/0/0/1:4:138,60:0.29: 0.78:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,35:0.61:-2.77:1.000:0.635 0/0/1/1:4:71,82:0.51:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,52:0.28: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,21:0.58:-3.26:1.000:0.892 0/0/0/1:4:146,50:0.25: 0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,93:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,88:0.45: 0.43:1.000:0.982 0/0/1/1:4:82,114:0.55: 0.73:1.000:0.980 0/0/1/1:4:87,96:0.49: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:150,45:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,29:0.20:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,21:0.60:-3.29:1.000:0.761 0/0/1/1:4:22,23:0.48:-2.99:1.000:0.995 1/1/1:3:1,11:0.87:-3.81:1.000:0.932 0/1/1/1:4:39,126:0.73:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,38:0.21: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,96:0.55:-0.04:1.000:0.980 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,93:0.44: 0.87:1.000:0.959 0/0/0/1:4:119,31:0.20:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,111:0.52: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,108:0.47: 1.27:1.000:0.991 0/0/0/1:4:144,49:0.25: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,46:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,56:0.27: 0.75:1.000:0.997 0/0/1:3:138,55:0.27: 0.65:0.633:1.000 0/0/0/1:4:71,26:0.26:-1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,50:0.24: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,80:0.44: 0.09:1.000:0.974 0/1/1/1:4:43,118:0.70:-0.14:1.000:0.983 0/0/0/1:4:146,47:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,22:0.14:-0.41:1.000:0.973 0/0/0/1:4:167,53:0.23: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,52:0.31:-0.16:1.000:0.972 0/0/0/1:4:169,49:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,45:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,139:0.70: 0.55:1.000:0.985 0/0/1/1:4:104,90:0.44: 0.68:1.000:0.965 0/0/0/1/1/1:6:87,70:0.42:-0.23:1.000:0.537 0/1/1/1:4:47,132:0.70: 0.31:1.000:0.987 0/0/0/1:4:133,46:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,100:0.55: 0.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:130,50:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,114:0.47: 1.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:61,58:0.46:-1.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:88,104:0.51: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,97:0.55:-0.01:0.969:0.977 0/0/0/1:4:132,30:0.18:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:132,50:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:88,45:0.32:-0.83:0.999:0.944 0/0/0/1:4:184,59:0.23: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,46:0.22: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,34:0.19: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,53:0.33:-0.36:1.000:0.908 0/0/0/1:4:95,34:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,47:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,99:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,32:0.22:-0.65:0.989:1.000 0/1/1/1:4:42,157:0.75: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,107:0.47: 1.19:1.000:0.992 0/0/0/1:4:120,37:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,124:0.55: 1.15:1.000:0.980 0/0/1/1:4:96,104:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,28:0.22:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,59:0.36:-0.31:1.000:0.634 0/0/0/1:4:110,43:0.27:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,129:0.74:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,42:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,40:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,59:0.42:-0.83:1.000:0.914 0/0/0/1:4:137,60:0.29: 0.75:1.000:0.990 0/0/0/1:4:142,57:0.28: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,60:0.50:-1.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,42:0.28:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,94:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,148:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:97,30:0.23:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,42:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,70:0.47:-0.60:1.000:0.990 0/0/0/0/0:5:171,0:0.00: 0.11:0.763:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,37:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,89:0.48: 0.21:1.000:0.995 0/0/1/1:4:76,94:0.52: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,148:0.54: 2.23:1.000:0.985 0/0/0/1:4:128,50:0.27: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,27:0.18:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,103:0.46: 1.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:101,104:0.48: 0.95:0.999:0.995 0/0/0/1:4:123,46:0.26: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,74:0.42:-0.04:1.000:0.930 0/0/0/1:4:81,52:0.37:-0.83:1.000:0.540 0/0/0/1:4:124,46:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,59:0.33: 0.14:1.000:0.930 0/0/1/1:4:76,79:0.48:-0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:95,91:0.46: 0.48:1.000:0.989 0/0/0/1:4:99,41:0.28:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:155,37:0.19: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,35:0.18: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,49:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,31:0.24:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,38:0.26:-0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:93,26:0.21:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,40:0.32:-1.12:1.000:0.962 0/0/1/1:4:72,78:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,48:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,47:0.50:-1.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,74:0.43:-0.09:1.000:0.945 0/1/1/1:4:46,149:0.73: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,144:0.50: 2.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,44:0.26:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,108:0.63:-0.11:1.000:0.601 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,35:0.23:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,42:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,85:0.46: 0.21:1.000:0.987 0/1/1/1:4:53,152:0.71: 0.95:1.000:0.990 0/1/1/1:4:19,89:0.79:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,68:0.31: 1.07:1.000:0.973 0/0/0/1:4:139,60:0.29: 0.80:1.000:0.992 0/0/0/1:4:130,52:0.28: 0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,49:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:174,89:0.32: 2.38:1.000:0.944 0/0/0/1:4:136,32:0.18: 0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,55:0.28: 0.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,53:0.29: 0.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:30,14:0.30:-3.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:57,96:0.59:-0.33:1.000:0.834 0/0/0/1:4:141,42:0.22: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,51:0.28: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:159,39:0.19: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,116:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,45:0.30:-0.55:1.000:0.985 0/0/1/1:4:110,93:0.43: 0.90:1.000:0.955 0/0/0/1:4:109,35:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,28:0.19:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,109:0.54: 0.60:1.000:0.988 0/0/0/1:4:118,39:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,100:0.52: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,105:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,50:0.34:-0.65:1.000:0.865 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.21:0.999:1.000 0/0/0/1:4:118,38:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,42:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,1:0.01:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,25:0.18:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,37:0.24:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,116:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:153,58:0.27: 1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:99,101:0.48: 0.83:1.000:0.994 0/0/0/1:4:96,43:0.30:-0.68:1.000:0.988 0/0/0/1:4:118,27:0.18:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,58:0.30: 0.46:0.999:0.985 0/0/1/1:4:99,112:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,51:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,68:0.49:-0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,44:0.22: 0.58:1.000:1.000 -chr7.1 77638573 chr7.1_077638573 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:71,24:.: 0.99:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,24:.: 0.62:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:90,21:.: 1.66:1.000:. ./.:4:53,15:.:-0.14:1.000:. ./.:4:71,20:.: 0.82:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:9,2:.:-2.52:1.000:. ./.:4:29,9:.:-1.39:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.24:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:53,18:.:-0.01:0.995:. ./.:4:114,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:96,21:.: 1.91:1.000:. ./.:4:72,21:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:63,17:.: 0.37:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:19,5:.:-1.97:1.000:. ./.:4:138,0:.: 2.79:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:67,24:.: 0.82:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:71,12:.: 0.49:1.000:. ./.:4:73,22:.: 0.99:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.97:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.97:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,11:.: 0.32:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:47,12:.:-0.51:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:74,1:.: 0.16:1.000:. ./.:3:73,17:.: 0.78:0.633:. ./.:4:111,14:.: 2.24:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.18:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:56,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:60,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.05:1.000:. ./.:6:51,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,8:.:-0.68:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:56,13:.:-0.09:1.000:. ./.:4:59,15:.: 0.11:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.16:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:44,12:.:-0.64:0.969:. ./.:4:47,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:47,18:.:-0.26:1.000:. ./.:4:56,17:.: 0.07:0.999:. ./.:4:100,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:55,15:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:43,12:.:-0.68:1.000:. ./.:4:33,10:.:-1.18:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.26:0.989:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:74,10:.: 0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,15:.: 0.20:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:29,7:.:-1.47:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.68:1.000:. ./.:5:52,11:.:-0.34:0.763:. ./.:4:38,13:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:58,23:.: 0.41:1.000:. ./.:4:54,26:.: 0.37:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.05:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:132,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.14:0.999:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,9:.:-1.35:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:53,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:49,10:.:-0.51:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:30,6:.:-1.47:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:38,13:.:-0.85:1.000:. ./.:4:44,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:38,10:.:-0.97:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:26,6:.:-1.64:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:29,8:.:-1.43:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:52,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:30,10:.:-1.30:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:77,13:.: 0.78:1.000:. ./.:4:60,19:.: 0.32:1.000:. ./.:4:70,17:.: 0.66:1.000:. ./.:4:56,12:.:-0.14:1.000:. ./.:4:128,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:51,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:79,15:.: 0.95:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:59,13:.: 0.03:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:47,12:.:-0.51:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:71,19:.: 0.78:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:56,30:.: 0.62:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.37:0.999:. ./.:4:74,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:70,19:.: 0.74:1.000:. ./.:4:51,16:.:-0.18:1.000:. ./.:4:74,25:.: 1.16:1.000:. ./.:4:53,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,11:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:124,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:52,23:.: 0.16:1.000:. ./.:4:64,19:.: 0.49:1.000:. ./.:4:70,17:.: 0.66:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:133,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:134,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.62:1.000:. -chr7.1 77803720 chr7.1_077803720 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,26:.: 0.20:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:79,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:166,50:.: 2.65:1.000:. ./.:4:100,33:.: 0.85:1.000:. ./.:4:101,27:.: 0.74:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:8,9:.:-1.66:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.99:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:72,27:.: 0.11:1.000:. ./.:4:87,33:.: 0.57:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:142,37:.: 1.84:0.995:. ./.:4:133,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:140,36:.: 1.78:1.000:. ./.:4:123,32:.: 1.32:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:85,18:.: 0.20:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:34,12:.:-1.04:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:100,28:.: 0.74:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:134,42:.: 1.78:1.000:. ./.:4:135,33:.: 1.61:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.51:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.69:1.000:. ./.:3:12,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:104,26:.: 0.78:1.000:. ./.:4:84,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:44,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.65:1.000:. ./.:3:88,18:.: 0.26:0.633:. ./.:4:85,21:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:49,19:.:-0.56:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:90,27:.: 0.50:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:65,18:.:-0.23:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.28:1.000:. ./.:6:37,12:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,6:.:-1.12:1.000:. ./.:4:55,19:.:-0.43:1.000:. ./.:4:66,19:.:-0.19:1.000:. ./.:4:43,18:.:-0.71:1.000:. ./.:4:79,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,17:.:-0.34:0.969:. ./.:4:57,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:46,11:.:-0.80:1.000:. ./.:4:52,12:.:-0.65:0.999:. ./.:4:108,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:70,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:59,12:.:-0.49:1.000:. ./.:4:40,10:.:-0.95:1.000:. ./.:4:68,15:.:-0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.91:0.989:. ./.:4:70,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:74,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,10:.:-0.71:1.000:. ./.:4:72,12:.:-0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:28,13:.:-1.14:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:70,12:.:-0.26:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.23:1.000:. ./.:5:45,8:.:-0.88:0.763:. ./.:4:37,8:.:-1.06:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:87,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:87,28:.: 0.46:1.000:. ./.:4:79,25:.: 0.22:1.000:. ./.:4:32,13:.:-1.06:1.000:. ./.:4:202,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.32:0.999:. ./.:4:66,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:19,8:.:-1.45:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,10:.:-1.01:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:36,17:.:-0.88:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:32,5:.:-1.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:48,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.93:1.000:. ./.:4:40,12:.:-0.91:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:32,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:24,11:.:-1.27:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.54:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:32,3:.:-1.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:102,29:.: 0.81:1.000:. ./.:4:86,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,34:.: 1.41:1.000:. ./.:4:60,21:.:-0.28:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:79,18:.: 0.07:1.000:. ./.:4:120,45:.: 1.54:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:95,29:.: 0.65:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:93,21:.: 0.44:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:112,34:.: 1.13:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:91,30:.: 0.59:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:92,33:.: 0.68:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.06:0.999:. ./.:4:112,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:100,18:.: 0.52:1.000:. ./.:4:87,29:.: 0.48:1.000:. ./.:4:73,32:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,19:.:-0.60:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:210,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:109,23:.: 0.83:1.000:. ./.:4:117,24:.: 1.02:1.000:. ./.:4:133,19:.: 1.26:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.09:0.999:. ./.:4:188,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:199,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.46:1.000:. -chr7.1 78180633 chr7.1_078180633 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:176,151:.: 0.83:1.000:. ./.:4:166,71:.:-0.21:1.000:. ./.:4:161,192:.: 1.13:1.000:. ./.:4:143,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:200,83:.: 0.32:1.000:. ./.:4:197,251:.: 2.23:1.000:. ./.:4:115,119:.:-0.24:1.000:. ./.:4:158,79:.:-0.21:1.000:. ./.:4:223,112:.: 0.92:1.000:. ./.:4:16,16:.:-2.57:1.000:. ./.:4:23,37:.:-2.25:1.000:. ./.:4:219,155:.: 1.37:1.000:. ./.:4:184,102:.: 0.36:1.000:. ./.:4:156,220:.: 1.40:1.000:. ./.:4:155,156:.: 0.65:1.000:. ./.:4:223,53:.: 0.24:1.000:. ./.:4:175,133:.: 0.61:0.995:. ./.:4:198,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:235,233:.: 2.46:1.000:. ./.:4:234,209:.: 2.17:1.000:. ./.:4:31,18:.:-2.38:1.000:. ./.:4:227,74:.: 0.53:1.000:. ./.:4:190,103:.: 0.44:1.000:. ./.:4:209,114:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,7:.:-2.74:1.000:. ./.:4:193,183:.: 1.40:1.000:. ./.:4:247,152:.: 1.66:1.000:. ./.:4:227,83:.: 0.64:1.000:. ./.:4:200,207:.: 1.76:1.000:. ./.:4:270,223:.: 2.75:1.000:. ./.:4:189,127:.: 0.71:1.000:. ./.:4:156,216:.: 1.35:1.000:. ./.:4:6,7:.:-2.79:1.000:. ./.:4:36,8:.:-2.43:1.000:. ./.:3:3,2:.:-2.88:1.000:. ./.:4:212,88:.: 0.52:1.000:. ./.:4:201,68:.: 0.16:1.000:. ./.:4:141,120:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,230:.: 1.35:1.000:. ./.:4:235,125:.: 1.21:1.000:. ./.:4:125,91:.:-0.45:1.000:. ./.:4:160,47:.:-0.55:1.000:. ./.:4:166,96:.: 0.08:1.000:. ./.:4:116,71:.:-0.78:1.000:. ./.:4:189,63:.:-0.03:1.000:. ./.:4:135,60:.:-0.69:1.000:. ./.:3:168,175:.: 1.02:0.633:. ./.:4:77,89:.:-1.03:1.000:. ./.:4:129,53:.:-0.84:1.000:. ./.:4:113,107:.:-0.40:1.000:. ./.:4:110,63:.:-0.94:1.000:. ./.:4:161,158:.: 0.74:1.000:. ./.:4:155,63:.:-0.43:1.000:. ./.:4:188,131:.: 0.74:1.000:. ./.:4:145,113:.: 0.04:1.000:. ./.:4:165,61:.:-0.33:1.000:. ./.:4:163,34:.:-0.67:1.000:. ./.:4:123,106:.:-0.30:1.000:. ./.:4:151,87:.:-0.19:1.000:. ./.:6:93,77:.:-0.98:1.000:. ./.:4:120,93:.:-0.48:1.000:. ./.:4:120,130:.:-0.06:1.000:. ./.:4:131,142:.: 0.21:1.000:. ./.:4:91,45:.:-1.37:1.000:. ./.:4:146,189:.: 0.92:1.000:. ./.:4:158,92:.:-0.06:1.000:. ./.:4:173,63:.:-0.22:1.000:. ./.:4:181,28:.:-0.53:1.000:. ./.:4:130,88:.:-0.43:0.969:. ./.:4:154,75:.:-0.30:1.000:. ./.:4:133,134:.: 0.14:1.000:. ./.:4:61,50:.:-1.66:0.999:. ./.:4:168,142:.: 0.64:1.000:. ./.:4:157,84:.:-0.16:1.000:. ./.:4:159,86:.:-0.11:1.000:. ./.:4:144,65:.:-0.53:1.000:. ./.:4:111,136:.:-0.09:1.000:. ./.:4:119,142:.: 0.07:1.000:. ./.:4:145,118:.: 0.09:1.000:. ./.:4:208,71:.: 0.28:1.000:. ./.:4:124,51:.:-0.92:0.989:. ./.:4:158,88:.:-0.10:1.000:. ./.:4:189,80:.: 0.16:1.000:. ./.:4:142,104:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,121:.:-0.14:1.000:. ./.:4:167,34:.:-0.62:1.000:. ./.:4:140,73:.:-0.48:1.000:. ./.:4:121,36:.:-1.13:1.000:. ./.:4:133,86:.:-0.41:1.000:. ./.:4:135,102:.:-0.21:1.000:. ./.:4:166,29:.:-0.69:1.000:. ./.:4:116,85:.:-0.62:1.000:. ./.:4:143,198:.: 0.99:1.000:. ./.:4:159,25:.:-0.82:1.000:. ./.:4:178,124:.: 0.54:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:89,34:.:-1.52:1.000:. ./.:4:134,67:.:-0.62:1.000:. ./.:4:144,88:.:-0.26:1.000:. ./.:4:195,89:.: 0.34:1.000:. ./.:4:119,125:.:-0.13:1.000:. ./.:4:111,90:.:-0.62:1.000:. ./.:4:113,115:.:-0.31:1.000:. ./.:5:139,78:.:-0.44:0.763:. ./.:4:94,94:.:-0.77:1.000:. ./.:4:150,53:.:-0.60:1.000:. ./.:4:134,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:158,145:.: 0.56:1.000:. ./.:4:198,138:.: 0.94:1.000:. ./.:4:154,42:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,49:.:-1.18:1.000:. ./.:4:256,88:.: 1.03:1.000:. ./.:4:128,38:.:-1.03:0.999:. ./.:4:177,95:.: 0.20:1.000:. ./.:4:92,101:.:-0.71:1.000:. ./.:4:171,145:.: 0.71:1.000:. ./.:4:96,71:.:-1.01:1.000:. ./.:4:132,28:.:-1.09:1.000:. ./.:4:116,118:.:-0.24:1.000:. ./.:4:118,79:.:-0.67:1.000:. ./.:4:174,74:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,74:.:-0.96:1.000:. ./.:4:179,92:.: 0.19:1.000:. ./.:4:245,143:.: 1.54:1.000:. ./.:4:133,88:.:-0.39:1.000:. ./.:4:119,137:.: 0.01:1.000:. ./.:4:105,89:.:-0.70:1.000:. ./.:4:152,72:.:-0.36:1.000:. ./.:4:137,71:.:-0.54:1.000:. ./.:4:97,70:.:-1.01:1.000:. ./.:4:124,60:.:-0.82:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:75,55:.:-1.44:1.000:. ./.:4:154,81:.:-0.23:1.000:. ./.:4:181,100:.: 0.30:1.000:. ./.:4:273,158:.: 2.03:1.000:. ./.:4:120,86:.:-0.56:1.000:. ./.:4:133,72:.:-0.58:1.000:. ./.:4:103,115:.:-0.43:1.000:. ./.:4:121,46:.:-1.01:1.000:. ./.:4:117,22:.:-1.34:1.000:. ./.:4:141,37:.:-0.89:1.000:. ./.:4:207,96:.: 0.56:1.000:. ./.:4:103,54:.:-1.13:1.000:. ./.:4:188,179:.: 1.29:1.000:. ./.:4:162,135:.: 0.49:1.000:. ./.:4:153,270:.: 1.94:1.000:. ./.:4:132,150:.: 0.31:1.000:. ./.:4:216,133:.: 1.09:1.000:. ./.:4:147,136:.: 0.32:1.000:. ./.:4:189,258:.: 2.22:1.000:. ./.:4:206,130:.: 0.94:1.000:. ./.:4:24,23:.:-2.40:1.000:. ./.:4:147,114:.: 0.07:1.000:. ./.:4:192,125:.: 0.72:1.000:. ./.:4:183,115:.: 0.50:1.000:. ./.:4:241,89:.: 0.87:1.000:. ./.:4:264,89:.: 1.13:1.000:. ./.:4:152,199:.: 1.11:1.000:. ./.:4:196,174:.: 1.33:1.000:. ./.:4:135,121:.: 0.01:1.000:. ./.:4:152,58:.:-0.52:1.000:. ./.:4:183,107:.: 0.41:1.000:. ./.:4:158,145:.: 0.56:1.000:. ./.:4:229,99:.: 0.84:1.000:. ./.:4:208,78:.: 0.36:1.000:. ./.:4:176,84:.: 0.06:1.000:. ./.:4:222,75:.: 0.49:0.999:. ./.:4:183,81:.: 0.11:1.000:. ./.:4:142,139:.: 0.30:1.000:. ./.:4:150,162:.: 0.66:1.000:. ./.:4:146,89:.:-0.23:1.000:. ./.:4:132,131:.: 0.09:1.000:. ./.:4:170,76:.:-0.10:1.000:. ./.:4:116,99:.:-0.46:1.000:. ./.:4:212,79:.: 0.42:1.000:. ./.:4:269,136:.: 1.73:1.000:. ./.:4:177,130:.: 0.60:1.000:. ./.:4:165,158:.: 0.79:1.000:. ./.:4:159,115:.: 0.22:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:310,118:.: 2.00:1.000:. ./.:4:235,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:200,76:.: 0.24:1.000:. ./.:4:173,105:.: 0.27:1.000:. -chr7.1 78278521 chr7.1_078278521 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:280,232:.:-0.47:1.000:. ./.:4:137,496:.: 0.42:1.000:. ./.:4:364,379:.: 1.23:1.000:. ./.:4:270,283:.:-0.17:1.000:. ./.:4:319,523:.: 1.96:1.000:. ./.:4:263,502:.: 1.40:1.000:. ./.:4:262,207:.:-0.79:1.000:. ./.:4:219,328:.:-0.21:1.000:. ./.:4:303,252:.:-0.15:1.000:. ./.:4:98,220:.:-1.90:1.000:. ./.:4:129,205:.:-1.78:1.000:. ./.:4:276,253:.:-0.35:1.000:. ./.:4:396,173:.:-0.05:1.000:. ./.:4:198,377:.:-0.01:1.000:. ./.:4:261,222:.:-0.69:1.000:. ./.:4:355,184:.:-0.27:1.000:. ./.:4:211,376:.: 0.08:0.995:. ./.:4:240,247:.:-0.66:1.000:. ./.:4:214,423:.: 0.45:1.000:. ./.:4:385,277:.: 0.64:1.000:. ./.:4:154,403:.:-0.14:1.000:. ./.:4:389,180:.:-0.05:1.000:. ./.:4:413,396:.: 1.72:1.000:. ./.:4:367,64:.:-1.07:1.000:. ./.:4:60,169:.:-2.56:1.000:. ./.:4:476,349:.: 1.84:1.000:. ./.:4:286,456:.: 1.23:1.000:. ./.:4:323,170:.:-0.61:1.000:. ./.:4:329,374:.: 0.94:1.000:. ./.:4:297,213:.:-0.49:1.000:. ./.:4:210,318:.:-0.35:1.000:. ./.:4:249,158:.:-1.25:1.000:. ./.:4:101,188:.:-2.12:1.000:. ./.:4:112,134:.:-2.43:1.000:. ./.:3:76,210:.:-2.14:1.000:. ./.:4:402,169:.:-0.04:1.000:. ./.:4:347,364:.: 1.00:1.000:. ./.:4:184,452:.: 0.44:1.000:. ./.:4:209,471:.: 0.77:1.000:. ./.:4:287,262:.:-0.20:1.000:. ./.:4:170,306:.:-0.74:1.000:. ./.:4:334,279:.: 0.27:1.000:. ./.:4:335,283:.: 0.31:1.000:. ./.:4:345,232:.: 0.01:1.000:. ./.:4:222,303:.:-0.38:1.000:. ./.:4:297,282:.: 0.02:1.000:. ./.:3:320,378:.: 0.90:0.633:. ./.:4:347,230:.: 0.01:1.000:. ./.:4:349,177:.:-0.37:1.000:. ./.:4:268,285:.:-0.17:1.000:. ./.:4:212,198:.:-1.22:1.000:. ./.:4:259,282:.:-0.26:1.000:. ./.:4:388,142:.:-0.34:1.000:. ./.:4:282,489:.: 1.44:1.000:. ./.:4:309,310:.: 0.32:1.000:. ./.:4:407,241:.: 0.53:1.000:. ./.:4:370,234:.: 0.21:1.000:. ./.:4:413,194:.: 0.23:1.000:. ./.:4:292,194:.:-0.66:1.000:. ./.:6:203,388:.: 0.11:1.000:. ./.:4:307,449:.: 1.33:1.000:. ./.:4:309,330:.: 0.47:1.000:. ./.:4:200,493:.: 0.86:1.000:. ./.:4:271,317:.: 0.09:1.000:. ./.:4:330,417:.: 1.26:1.000:. ./.:4:350,241:.: 0.11:1.000:. ./.:4:194,215:.:-1.23:1.000:. ./.:4:375,94:.:-0.79:1.000:. ./.:4:304,258:.:-0.10:0.969:. ./.:4:228,186:.:-1.19:1.000:. ./.:4:323,366:.: 0.83:1.000:. ./.:4:254,514:.: 1.42:0.999:. ./.:4:440,269:.: 0.98:1.000:. ./.:4:343,210:.:-0.17:1.000:. ./.:4:181,429:.: 0.25:1.000:. ./.:4:325,297:.: 0.34:1.000:. ./.:4:175,432:.: 0.23:1.000:. ./.:4:162,271:.:-1.05:1.000:. ./.:4:314,259:.:-0.02:1.000:. ./.:4:288,363:.: 0.55:1.000:. ./.:4:228,414:.: 0.49:0.989:. ./.:4:386,270:.: 0.59:1.000:. ./.:4:415,240:.: 0.58:1.000:. ./.:4:246,323:.:-0.05:1.000:. ./.:4:307,267:.:-0.01:1.000:. ./.:4:346,234:.: 0.03:1.000:. ./.:4:268,312:.: 0.03:1.000:. ./.:4:298,191:.:-0.64:1.000:. ./.:4:269,177:.:-0.96:1.000:. ./.:4:441,188:.: 0.39:1.000:. ./.:4:358,405:.: 1.38:1.000:. ./.:4:162,357:.:-0.42:1.000:. ./.:4:221,462:.: 0.79:1.000:. ./.:4:213,235:.:-0.94:1.000:. ./.:4:459,257:.: 1.03:1.000:. ./.:4:401,206:.: 0.23:1.000:. ./.:4:229,121:.:-1.67:1.000:. ./.:4:182,221:.:-1.28:1.000:. ./.:4:285,455:.: 1.21:1.000:. ./.:4:239,305:.:-0.24:1.000:. ./.:4:332,161:.:-0.61:1.000:. ./.:4:197,304:.:-0.55:1.000:. ./.:4:226,167:.:-1.35:1.000:. ./.:5:293,447:.: 1.21:0.763:. ./.:4:128,242:.:-1.52:1.000:. ./.:4:326,276:.: 0.19:1.000:. ./.:4:271,367:.: 0.46:1.000:. ./.:4:240,216:.:-0.88:1.000:. ./.:4:373,422:.: 1.62:1.000:. ./.:4:193,465:.: 0.61:1.000:. ./.:4:256,161:.:-1.17:1.000:. ./.:4:460,299:.: 1.35:1.000:. ./.:4:244,317:.:-0.11:0.999:. ./.:4:387,489:.: 2.21:1.000:. ./.:4:153,204:.:-1.61:1.000:. ./.:4:409,295:.: 0.95:1.000:. ./.:4:200,399:.: 0.17:1.000:. ./.:4:237,378:.: 0.29:1.000:. ./.:4:155,391:.:-0.22:1.000:. ./.:4:387,294:.: 0.78:1.000:. ./.:4:372,147:.:-0.42:1.000:. ./.:4:129,151:.:-2.18:1.000:. ./.:4:327,446:.: 1.45:1.000:. ./.:4:447,436:.: 2.27:1.000:. ./.:4:234,301:.:-0.30:1.000:. ./.:4:329,433:.: 1.37:1.000:. ./.:4:237,222:.:-0.86:1.000:. ./.:4:242,263:.:-0.52:1.000:. ./.:4:269,126:.:-1.33:1.000:. ./.:4:227,225:.:-0.91:1.000:. ./.:4:269,176:.:-0.97:1.000:. ./.:4:281,350:.: 0.41:1.000:. ./.:4:170,246:.:-1.18:1.000:. ./.:4:257,231:.:-0.65:1.000:. ./.:4:352,271:.: 0.35:1.000:. ./.:4:466,69:.:-0.30:1.000:. ./.:4:201,306:.:-0.51:1.000:. ./.:4:248,256:.:-0.53:1.000:. ./.:4:262,90:.:-1.65:1.000:. ./.:4:215,318:.:-0.32:1.000:. ./.:4:418,191:.: 0.24:1.000:. ./.:4:221,124:.:-1.70:1.000:. ./.:4:212,264:.:-0.74:1.000:. ./.:4:245,151:.:-1.33:1.000:. ./.:4:348,306:.: 0.58:1.000:. ./.:4:245,693:.: 2.67:1.000:. ./.:4:226,215:.:-0.99:1.000:. ./.:4:306,370:.: 0.74:1.000:. ./.:4:335,254:.: 0.10:1.000:. ./.:4:170,246:.:-1.18:1.000:. ./.:4:342,237:.: 0.02:1.000:. ./.:4:424,118:.:-0.25:1.000:. ./.:4:120,167:.:-2.13:1.000:. ./.:4:188,393:.: 0.04:1.000:. ./.:4:371,469:.: 1.95:1.000:. ./.:4:359,570:.: 2.60:1.000:. ./.:4:325,318:.: 0.50:1.000:. ./.:4:435,294:.: 1.13:1.000:. ./.:4:281,249:.:-0.34:1.000:. ./.:4:335,344:.: 0.76:1.000:. ./.:4:161,397:.:-0.13:1.000:. ./.:4:257,262:.:-0.42:1.000:. ./.:4:320,201:.:-0.40:1.000:. ./.:4:305,254:.:-0.12:1.000:. ./.:4:454,257:.: 1.00:1.000:. ./.:4:419,216:.: 0.44:1.000:. ./.:4:223,411:.: 0.43:1.000:. ./.:4:394,251:.: 0.51:0.999:. ./.:4:251,267:.:-0.43:1.000:. ./.:4:220,397:.: 0.30:1.000:. ./.:4:160,270:.:-1.08:1.000:. ./.:4:219,482:.: 0.92:1.000:. ./.:4:289,217:.:-0.52:1.000:. ./.:4:252,303:.:-0.15:1.000:. ./.:4:246,261:.:-0.51:1.000:. ./.:4:277,85:.:-1.58:1.000:. ./.:4:509,194:.: 0.94:1.000:. ./.:4:184,568:.: 1.30:1.000:. ./.:4:373,190:.:-0.10:1.000:. ./.:4:286,211:.:-0.58:1.000:. ./.:4:302,440:.: 1.23:0.999:. ./.:4:555,328:.: 2.27:1.000:. ./.:4:360,301:.: 0.63:1.000:. ./.:4:364,115:.:-0.71:1.000:. ./.:4:280,428:.: 0.97:1.000:. -chr7.1 78445464 chr7.1_078445464 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:251,76:.: 0.19:1.000:. ./.:4:217,70:.:-0.35:1.000:. ./.:4:246,77:.: 0.13:1.000:. ./.:4:222,106:.: 0.20:1.000:. ./.:4:373,3:.: 0.84:1.000:. ./.:4:400,1:.: 1.17:1.000:. ./.:4:197,77:.:-0.52:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:238,87:.: 0.16:1.000:. ./.:4:85,1:.:-3.03:1.000:. ./.:4:44,36:.:-3.11:1.000:. ./.:4:139,154:.:-0.27:1.000:. ./.:4:220,76:.:-0.23:1.000:. ./.:4:279,97:.: 0.84:1.000:. ./.:4:233,111:.: 0.41:1.000:. ./.:4:265,107:.: 0.79:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.45:0.995:. ./.:4:262,100:.: 0.65:1.000:. ./.:4:471,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:328,108:.: 1.64:1.000:. ./.:4:53,33:.:-3.03:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:266,86:.: 0.52:1.000:. ./.:4:236,82:.: 0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.:-3.56:1.000:. ./.:4:289,100:.: 1.01:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:211,78:.:-0.32:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:294,115:.: 1.28:1.000:. ./.:4:235,67:.:-0.15:1.000:. ./.:4:51,1:.:-3.48:1.000:. ./.:4:92,29:.:-2.56:1.000:. ./.:3:48,0:.:-3.53:1.000:. ./.:4:283,93:.: 0.84:1.000:. ./.:4:235,79:.: 0.01:1.000:. ./.:4:302,2:.:-0.12:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:314,97:.: 1.31:1.000:. ./.:4:260,93:.: 0.53:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:239,102:.: 0.37:1.000:. ./.:4:259,111:.: 0.76:1.000:. ./.:4:258,96:.: 0.55:1.000:. ./.:3:231,97:.: 0.20:0.633:. ./.:4:356,142:.: 2.47:1.000:. ./.:4:221,88:.:-0.05:1.000:. ./.:4:200,103:.:-0.13:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:280,87:.: 0.72:1.000:. ./.:4:184,79:.:-0.67:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:300,94:.: 1.08:1.000:. ./.:4:232,75:.:-0.08:1.000:. ./.:4:264,85:.: 0.48:1.000:. ./.:4:232,78:.:-0.04:1.000:. ./.:6:222,49:.:-0.56:1.000:. ./.:4:249,80:.: 0.21:1.000:. ./.:4:319,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:237,95:.: 0.25:1.000:. ./.:4:310,87:.: 1.12:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:177,56:.:-1.07:1.000:. ./.:4:229,81:.:-0.04:1.000:. ./.:4:238,113:.: 0.51:0.936:. ./.:4:185,64:.:-0.85:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:203,82:.:-0.37:0.999:. ./.:4:297,107:.: 1.21:1.000:. ./.:4:253,89:.: 0.39:1.000:. ./.:4:239,99:.: 0.33:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:217,88:.:-0.11:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:187,69:.:-0.76:0.989:. ./.:4:270,108:.: 0.87:1.000:. ./.:4:378,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:170,73:.:-0.93:1.000:. ./.:4:305,110:.: 1.36:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:152,66:.:-1.27:1.000:. ./.:4:182,76:.:-0.73:1.000:. ./.:4:206,88:.:-0.25:1.000:. ./.:4:236,71:.:-0.08:1.000:. ./.:4:217,83:.:-0.17:1.000:. ./.:4:200,70:.:-0.57:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:196,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:281,98:.: 0.88:1.000:. ./.:4:256,97:.: 0.53:1.000:. ./.:4:183,60:.:-0.93:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:342,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:324,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:154,55:.:-1.39:1.000:. ./.:5:235,56:.:-0.29:0.763:. ./.:4:197,72:.:-0.59:1.000:. ./.:4:201,85:.:-0.36:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:305,103:.: 1.27:1.000:. ./.:4:224,97:.: 0.11:1.000:. ./.:4:219,94:.: 0.00:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:276,95:.: 0.77:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:240,88:.: 0.20:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:289,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:207,69:.:-0.49:1.000:. ./.:4:258,74:.: 0.25:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:218,81:.:-0.19:1.000:. ./.:4:233,91:.: 0.15:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:229,100:.: 0.21:1.000:. ./.:4:225,74:.:-0.19:1.000:. ./.:4:187,67:.:-0.79:1.000:. ./.:4:215,75:.:-0.31:1.000:. ./.:4:196,75:.:-0.56:1.000:. ./.:4:247,81:.: 0.20:1.000:. ./.:4:172,65:.:-1.01:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:311,124:.: 1.63:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:190,71:.:-0.69:1.000:. ./.:4:225,71:.:-0.23:1.000:. ./.:4:219,82:.:-0.16:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:285,101:.: 0.97:1.000:. ./.:4:242,113:.: 0.56:1.000:. ./.:4:267,78:.: 0.43:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:222,81:.:-0.13:1.000:. ./.:4:63,0:.:-3.33:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:288,106:.: 1.08:1.000:. ./.:4:340,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:295,90:.: 0.96:1.000:. ./.:4:200,84:.:-0.39:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:205,83:.:-0.33:1.000:. ./.:4:226,84:.:-0.04:1.000:. ./.:4:269,81:.: 0.49:1.000:. ./.:4:278,98:.: 0.84:1.000:. ./.:4:352,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:169,163:.: 0.25:0.999:. ./.:4:304,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:245,80:.: 0.16:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:212,76:.:-0.33:1.000:. ./.:4:206,80:.:-0.36:1.000:. ./.:4:214,70:.:-0.39:1.000:. ./.:4:190,88:.:-0.47:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:310,125:.: 1.63:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:284,83:.: 0.72:1.000:. ./.:4:207,76:.:-0.40:1.000:. ./.:4:249,91:.: 0.36:0.999:. ./.:4:347,139:.: 2.31:1.000:. ./.:4:392,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:199,59:.:-0.73:1.000:. ./.:4:228,66:.:-0.25:1.000:. -chr7.1 78629127 chr7.1_078629127 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,3:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:0.995:. ./.:4:0,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,3:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,13:.: 5.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,4:.: 0.10:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:8,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:11,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.56:1.000:. ./.:4:9,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.37:1.000:. ./.:6:7,5:.: 1.48:1.000:. ./.:4:5,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:13,3:.: 2.41:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:16,0:.: 2.41:0.936:. ./.:4:1,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:13,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:0.999:. ./.:4:10,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:0.989:. ./.:4:4,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:5,5:.: 1.02:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.79:1.000:. ./.:4:3,3:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:6,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:11,3:.: 1.95:1.000:. ./.:4:9,4:.: 1.72:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.14:1.000:. ./.:5:5,1:.: 0.10:0.763:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:7,2:.: 0.79:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.79:0.999:. ./.:4:1,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:12,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:7,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,3:.: 1.48:1.000:. ./.:4:6,3:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:8,5:.: 1.72:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,2:.: 0.56:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:13,5:.: 2.87:1.000:. ./.:4:4,3:.: 0.33:1.000:. ./.:4:10,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:9,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:5,6:.: 1.25:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:4,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:8,3:.: 1.25:1.000:. ./.:4:14,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:4,5:.: 0.79:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:12,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:2,2:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:5,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,3:.:-0.37:0.999:. ./.:4:0,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:2,1:.:-0.60:0.999:. ./.:4:1,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:6,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:3,2:.:-0.14:1.000:. -chr7.1 78682539 chr7.1_078682539 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:66,42:0.35: 0.27:1.000:0.827 0/0/0/1:4:39,21:0.31:-1.22:1.000:0.973 0/0/0/1:4:57,28:0.29:-0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,41:0.41:-0.28:1.000:0.841 0/0/0/1:4:75,34:0.28: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,21:0.27:-0.94:1.000:0.998 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-2.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,24:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,45:0.53:-0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:11,11:0.45:-2.39:1.000:0.976 0/0/0/1:4:15,8:0.31:-2.36:1.000:0.976 0/0/0/1:4:36,20:0.32:-1.34:1.000:0.961 0/1/1/1:4:22,50:0.64:-0.84:1.000:0.666 0/0/0/1:4:65,20:0.21:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,33:0.39:-0.72:1.000:0.658 0/0/0/1:4:43,28:0.35:-0.87:1.000:0.784 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.38:0.995:1.000 0/0/0/1:4:59,34:0.32:-0.19:1.000:0.940 0/1/1/1:4:34,86:0.66: 0.65:1.000:0.873 0/0/0/1:4:51,34:0.36:-0.44:1.000:0.733 0/0/0/1:4:11,3:0.19:-2.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,92:0.79: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,63:0.58: 0.00:1.000:0.918 0/1/1/1:4:18,49:0.68:-1.00:1.000:0.941 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,31:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,20:0.26:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,46:0.52:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:67,47:0.37: 0.46:1.000:0.601 0/1/1/1:4:17,86:0.78: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,32:0.28: 0.03:1.000:0.995 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.45:-3.02:1.000:0.976 0/0/0/0:4:26,2:0.06:-2.21:1.000:1.000 0/0/1:3:7,2:0.20:-2.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,59:0.57:-0.16:1.000:0.946 0/0/0/1:4:72,34:0.28: 0.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,66:0.63:-0.10:1.000:0.577 0/0/0/1:4:98,31:0.21: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,27:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,44:0.33: 0.65:1.000:0.937 0/1/1/1:4:21,108:0.78: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,105:0.68: 1.33:1.000:0.963 0/0/1/1:4:56,72:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,82:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,86:0.55: 1.33:1.000:0.982 0/1/1:3:35,67:0.60: 0.09:0.633:0.999 0/0/1/1:4:17,22:0.51:-1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,71:0.53: 0.65:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,27:0.19: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,94:0.69: 0.83:1.000:0.974 0/0/0/1:4:70,46:0.35: 0.52:1.000:0.766 0/0/0/1:4:70,42:0.33: 0.40:1.000:0.906 0/0/1/1:4:71,71:0.45: 1.33:1.000:0.976 0/0/1/1:4:38,67:0.58: 0.18:1.000:0.911 0/0/1/1:4:57,85:0.54: 1.33:1.000:0.987 0/0/1/1:4:71,75:0.46: 1.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:53,83:0.55: 1.14:1.000:0.977 0/0/0/1:4:82,24:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:45,40:0.42:-0.44:1.000:0.520 0/0/1/1:4:54,68:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,62:0.57: 0.00:1.000:0.950 0/0/0/1:4:109,34:0.21: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,80:0.51: 1.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,42:0.31: 0.68:1.000:0.976 0/0/1/1:4:55,81:0.54: 1.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:45,22:0.29:-1.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,62:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,35:0.30: 0.15:0.936:0.987 0/0/0/1:4:60,18:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,74:0.47: 1.33:1.000:0.991 0/0/0/1:4:59,21:0.23:-0.59:0.999:1.000 0/0/0/1:4:80,39:0.29: 0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:75,53:0.37: 0.90:1.000:0.580 0/0/0/1:4:89,31:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,41:0.38:-0.13:1.000:0.629 0/0/1/1:4:39,64:0.56: 0.12:1.000:0.960 0/0/0/1:4:84,44:0.30: 0.90:1.000:0.980 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,119:0.79: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,27:0.25:-0.07:0.989:1.000 0/0/1/1:4:60,75:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,162:0.75: 3.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,30:0.29:-0.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:50,73:0.54: 0.74:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,115:0.76: 1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,17:0.25:-1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,61:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,41:0.33: 0.37:1.000:0.928 0/0/1/1:4:34,67:0.61: 0.06:1.000:0.729 0/0/1/1:4:48,54:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,44:0.24: 1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,97:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,84:0.48: 1.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:60,85:0.53: 1.42:1.000:0.993 0/0/0/1:4:63,44:0.37: 0.24:1.000:0.613 0/0/0/1:4:72,24:0.22:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,122:0.70: 1.95:1.000:0.983 0/0/1/1:4:48,62:0.51: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,40:0.46:-0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:47,67:0.53: 0.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,80:0.72: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/0/1:5:90,45:0.30: 1.11:0.763:0.565 0/0/0/1:4:60,28:0.28:-0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,60:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,107:0.75: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,58:0.53:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:53,84:0.56: 1.17:1.000:0.974 0/0/0/1:4:84,37:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,71:0.58: 0.40:1.000:0.927 0/1/1/1:4:24,106:0.76: 0.96:0.999:1.000 0/0/1/1:4:41,79:0.60: 0.65:1.000:0.778 0/0/0/1:4:88,30:0.22: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,47:0.35: 0.62:1.000:0.779 0/0/1/1:4:36,43:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,56:0.53:-0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:86,34:0.25: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,97:0.68: 0.99:1.000:0.965 0/1/1/1:4:37,119:0.71: 1.76:1.000:0.991 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,41:0.27: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,27:0.42:-1.31:1.000:0.925 0/0/0/1:4:69,34:0.29: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,74:0.52: 0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,33:0.26: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,29:0.29:-0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:57,25:0.27:-0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,53:0.53:-0.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:61,37:0.34:-0.04:1.000:0.895 0/0/1/1:4:33,26:0.39:-1.25:1.000:0.723 0/0/0/1:4:60,22:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,34:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,86:0.66: 0.65:1.000:0.873 0/1/1/1:4:31,121:0.74: 1.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,29:0.28:-0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,60:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,26:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,36:0.29: 0.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:48,65:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,88:0.73: 0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,46:0.54:-0.69:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,54:0.54:-0.28:1.000:0.986 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,34:0.34:-0.32:1.000:0.871 0/0/1/1:4:48,55:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,99:0.62: 1.45:1.000:0.550 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,58:0.55:-0.13:1.000:0.977 0/0/1/1:4:34,52:0.55:-0.41:1.000:0.983 0/0/0/1:4:8,2:0.18:-2.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,46:0.63:-1.00:1.000:0.565 0/0/1/1:4:47,85:0.59: 1.02:1.000:0.882 0/0/1/1:4:33,58:0.58:-0.25:1.000:0.914 0/0/1/1:4:43,36:0.41:-0.63:1.000:0.842 0/1/1/1:4:17,93:0.79: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,34:0.37:-0.53:1.000:0.573 0/0/1/1:4:39,53:0.52:-0.22:1.000:0.995 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,25:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,75:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,58:0.52: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,100:0.85: 0.34:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,86:0.78: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,39:0.51:-0.94:1.000:0.996 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-1.28:0.999:1.000 0/0/1/1:4:27,48:0.58:-0.75:1.000:0.902 0/0/1/1:4:25,24:0.44:-1.56:1.000:0.963 0/0/1/1:4:30,26:0.41:-1.34:1.000:0.888 0/0/0/1:4:43,18:0.26:-1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,22:0.30:-1.09:1.000:0.980 0/0/0/1:4:49,21:0.27:-0.90:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,30:0.27:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,52:0.53:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:67,31:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,71:0.58: 0.37:1.000:0.904 0/0/1/1:4:36,64:0.58: 0.03:1.000:0.902 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,45:0.50:-0.59:0.999:0.997 0/1/1/1:4:21,108:0.78: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,65:0.61:-0.04:1.000:0.730 0/0/1/1:4:19,38:0.61:-1.31:1.000:0.693 0/0/1/1:4:47,41:0.42:-0.35:1.000:0.896 -chr7.1 79844136 chr7.1_079844136 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:37,127:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,94:.: 0.13:1.000:. ./.:4:52,157:.: 0.70:1.000:. ./.:4:84,93:.: 0.09:1.000:. ./.:4:104,113:.: 0.85:1.000:. ./.:4:119,141:.: 1.67:1.000:. ./.:4:33,52:.:-1.66:1.000:. ./.:4:107,118:.: 1.00:1.000:. ./.:4:35,133:.:-0.08:1.000:. ./.:4:29,42:.:-1.93:1.000:. ./.:4:22,54:.:-1.83:1.000:. ./.:4:25,112:.:-0.67:1.000:. ./.:4:43,131:.: 0.03:1.000:. ./.:4:116,117:.: 1.15:1.000:. ./.:4:101,105:.: 0.64:1.000:. ./.:4:132,137:.: 1.84:1.000:. ./.:4:195,70:.: 1.76:0.995:. ./.:4:130,108:.: 1.25:1.000:. ./.:4:113,147:.: 1.67:1.000:. ./.:4:54,174:.: 1.06:1.000:. ./.:4:16,46:.:-2.10:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.01:1.000:. ./.:4:52,136:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,180:.: 0.15:1.000:. ./.:4:29,9:.:-2.55:1.000:. ./.:4:102,136:.: 1.25:1.000:. ./.:4:109,109:.: 0.87:1.000:. ./.:4:45,135:.: 0.15:1.000:. ./.:4:108,112:.: 0.91:1.000:. ./.:4:51,141:.: 0.38:1.000:. ./.:4:102,90:.: 0.38:1.000:. ./.:4:97,105:.: 0.57:1.000:. ./.:4:6,35:.:-2.50:1.000:. ./.:4:38,36:.:-1.87:1.000:. ./.:3:12,18:.:-2.70:1.000:. ./.:4:57,174:.: 1.12:1.000:. ./.:4:110,134:.: 1.36:1.000:. ./.:4:113,104:.: 0.85:1.000:. ./.:4:105,115:.: 0.91:1.000:. ./.:4:104,110:.: 0.79:1.000:. ./.:4:73,85:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,132:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,99:.:-0.96:1.000:. ./.:4:35,179:.: 0.79:1.000:. ./.:3:43,141:.: 0.22:0.633:. ./.:4:23,49:.:-1.91:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.75:1.000:. ./.:4:75,70:.:-0.52:1.000:. ./.:4:48,96:.:-0.54:1.000:. ./.:4:109,113:.: 0.95:1.000:. ./.:4:31,91:.:-0.96:1.000:. ./.:4:31,114:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1,144:.:-0.52:1.000:. ./.:4:37,128:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.44:1.000:. ./.:4:39,134:.: 0.01:1.000:. ./.:4:77,87:.:-0.16:1.000:. ./.:6:41,64:.:-1.28:1.000:. ./.:4:37,104:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,101:.:-0.71:1.000:. ./.:4:100,99:.: 0.51:1.000:. ./.:4:48,124:.:-0.01:1.000:. ./.:4:50,149:.: 0.51:1.000:. ./.:4:44,126:.:-0.04:1.000:. ./.:4:31,57:.:-1.60:1.000:. ./.:4:34,115:.:-0.44:1.000:. ./.:4:69,54:.:-0.94:0.936:. ./.:4:32,113:.:-0.52:1.000:. ./.:4:36,164:.: 0.53:1.000:. ./.:4:55,46:.:-1.35:0.999:. ./.:4:0,192:.: 0.38:1.000:. ./.:4:47,171:.: 0.87:1.000:. ./.:4:90,85:.: 0.05:1.000:. ./.:4:83,82:.:-0.14:1.000:. ./.:4:76,78:.:-0.35:1.000:. ./.:4:83,81:.:-0.16:1.000:. ./.:4:83,86:.:-0.06:1.000:. ./.:4:52,175:.: 1.04:1.000:. ./.:4:27,78:.:-1.28:0.989:. ./.:4:41,167:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.24:1.000:. ./.:4:88,74:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,183:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.55:1.000:. ./.:4:51,50:.:-1.35:1.000:. ./.:4:31,102:.:-0.75:1.000:. ./.:4:69,70:.:-0.63:1.000:. ./.:4:39,123:.:-0.20:1.000:. ./.:4:21,76:.:-1.43:1.000:. ./.:4:102,42:.:-0.54:1.000:. ./.:4:105,114:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.39:1.000:. ./.:4:2,239:.: 1.31:1.000:. ./.:4:62,152:.: 0.79:1.000:. ./.:4:74,59:.:-0.75:1.000:. ./.:4:49,124:.: 0.01:1.000:. ./.:4:33,100:.:-0.75:1.000:. ./.:4:100,111:.: 0.74:1.000:. ./.:4:31,54:.:-1.66:1.000:. ./.:4:71,74:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,111:.:-1.16:1.000:. ./.:5:66,104:.:-0.04:0.763:. ./.:4:85,62:.:-0.48:1.000:. ./.:4:58,162:.: 0.91:1.000:. ./.:4:44,93:.:-0.67:1.000:. ./.:4:45,147:.: 0.38:1.000:. ./.:4:52,165:.: 0.85:1.000:. ./.:4:82,100:.: 0.19:1.000:. ./.:4:96,76:.:-0.01:1.000:. ./.:4:82,231:.: 2.68:1.000:. ./.:4:35,120:.:-0.33:0.999:. ./.:4:42,116:.:-0.27:1.000:. ./.:4:54,59:.:-1.13:1.000:. ./.:4:41,116:.:-0.29:1.000:. ./.:4:49,76:.:-0.90:1.000:. ./.:4:34,106:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,94:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.01:1.000:. ./.:4:104,36:.:-0.61:1.000:. ./.:4:76,86:.:-0.20:1.000:. ./.:4:50,140:.: 0.34:1.000:. ./.:4:43,111:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,107:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,97:.:-0.92:1.000:. ./.:4:27,95:.:-0.96:1.000:. ./.:4:32,94:.:-0.88:1.000:. ./.:4:30,82:.:-1.15:1.000:. ./.:4:133,50:.: 0.20:1.000:. ./.:4:99,114:.: 0.77:1.000:. ./.:4:55,49:.:-1.30:1.000:. ./.:4:41,56:.:-1.43:1.000:. ./.:4:33,127:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,285:.: 2.14:1.000:. ./.:4:88,112:.: 0.53:1.000:. ./.:4:37,97:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,82:.:-1.15:1.000:. ./.:4:40,109:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,115:.:-1.09:1.000:. ./.:4:72,70:.:-0.58:1.000:. ./.:4:33,98:.:-0.78:1.000:. ./.:4:132,119:.: 1.50:1.000:. ./.:4:142,50:.: 0.38:1.000:. ./.:4:71,184:.: 1.57:1.000:. ./.:4:29,132:.:-0.21:1.000:. ./.:4:78,210:.: 2.20:1.000:. ./.:4:125,47:.:-0.01:1.000:. ./.:4:52,205:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,250:.: 1.48:1.000:. ./.:4:31,28:.:-2.15:1.000:. ./.:4:49,48:.:-1.43:1.000:. ./.:4:67,203:.: 1.86:1.000:. ./.:4:55,169:.: 0.98:1.000:. ./.:4:115,132:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.87:1.000:. ./.:4:38,97:.:-0.71:1.000:. ./.:4:86,89:.: 0.05:1.000:. ./.:4:122,45:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,80:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.81:1.000:. ./.:4:35,115:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.39:1.000:. ./.:4:44,174:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,246:.: 1.40:0.999:. ./.:4:38,109:.:-0.48:1.000:. ./.:4:77,76:.:-0.37:1.000:. ./.:4:75,60:.:-0.71:1.000:. ./.:4:118,101:.: 0.89:1.000:. ./.:4:28,101:.:-0.82:1.000:. ./.:4:81,79:.:-0.23:1.000:. ./.:4:92,105:.: 0.47:1.000:. ./.:4:26,86:.:-1.15:1.000:. ./.:4:65,243:.: 2.58:1.000:. ./.:4:123,130:.: 1.53:1.000:. ./.:4:54,166:.: 0.91:1.000:. ./.:4:68,115:.: 0.20:1.000:. ./.:4:35,152:.: 0.28:0.999:. ./.:4:0,225:.: 1.00:1.000:. ./.:4:50,147:.: 0.47:1.000:. ./.:4:50,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:45,131:.: 0.07:1.000:. -chr7.1 80085927 chr7.1_080085927 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,172:.: 1.64:1.000:. ./.:4:47,39:.:-1.19:1.000:. ./.:4:63,123:.: 0.67:1.000:. ./.:4:52,165:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,55:.:-1.77:1.000:. ./.:4:41,69:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,92:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,11:.:-2.59:1.000:. ./.:4:6,7:.:-2.55:1.000:. ./.:4:80,39:.:-0.58:1.000:. ./.:4:49,127:.: 0.49:1.000:. ./.:4:52,96:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,143:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,122:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.32:0.995:. ./.:4:111,111:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.84:1.000:. ./.:4:70,194:.: 2.13:1.000:. ./.:4:7,15:.:-2.39:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.67:1.000:. ./.:4:64,147:.: 1.14:1.000:. ./.:4:61,125:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,14:.:-2.53:1.000:. ./.:4:68,103:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.30:1.000:. ./.:4:57,126:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,228:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.39:1.000:. ./.:4:75,92:.: 0.32:1.000:. ./.:4:61,132:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.63:1.000:. ./.:4:17,7:.:-2.35:1.000:. ./.:3:1,16:.:-2.48:1.000:. ./.:4:51,145:.: 0.86:1.000:. ./.:4:45,91:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.37:1.000:. ./.:4:71,112:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,72:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,210:.: 1.12:1.000:. ./.:4:45,113:.: 0.15:1.000:. ./.:4:62,86:.:-0.04:1.000:. ./.:4:42,83:.:-0.46:1.000:. ./.:3:68,188:.: 1.98:1.000:. ./.:4:74,182:.: 1.98:1.000:. ./.:4:56,123:.: 0.54:1.000:. ./.:4:57,116:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.04:1.000:. ./.:4:72,123:.: 0.84:1.000:. ./.:4:32,124:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.82:1.000:. ./.:4:54,82:.:-0.26:1.000:. ./.:4:55,112:.: 0.32:1.000:. ./.:4:41,112:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,88:.:-0.11:1.000:. ./.:6:23,88:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,133:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.26:1.000:. ./.:4:44,122:.: 0.30:1.000:. ./.:4:63,144:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,174:.: 0.45:1.000:. ./.:4:42,40:.:-1.27:1.000:. ./.:4:47,115:.: 0.23:1.000:. ./.:4:45,93:.:-0.22:0.936:. ./.:4:43,76:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.51:1.000:. ./.:4:33,38:.:-1.47:0.999:. ./.:4:48,126:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,157:.: 1.14:1.000:. ./.:4:27,31:.:-1.71:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.33:1.000:. ./.:4:67,151:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.26:1.000:. ./.:4:32,73:.:-0.84:0.989:. ./.:4:34,132:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.36:1.000:. ./.:4:53,107:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,75:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,54:.:-1.21:1.000:. ./.:4:46,91:.:-0.24:1.000:. ./.:4:36,57:.:-1.06:1.000:. ./.:4:55,112:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,52:.:-1.27:1.000:. ./.:4:52,97:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,138:.: 0.64:1.000:. ./.:4:42,78:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,183:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.87:1.000:. ./.:4:31,66:.:-0.99:1.000:. ./.:5:48,99:.:-0.05:0.763:. ./.:4:49,84:.:-0.31:1.000:. ./.:4:29,75:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,77:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.97:1.000:. ./.:4:63,207:.: 2.24:1.000:. ./.:4:47,82:.:-0.39:1.000:. ./.:4:42,112:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,262:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.50:0.999:. ./.:4:51,88:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,49:.:-1.32:1.000:. ./.:4:48,111:.: 0.17:1.000:. ./.:4:1,90:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,92:.:-1.08:1.000:. ./.:4:1,115:.:-0.63:1.000:. ./.:4:39,105:.:-0.11:1.000:. ./.:4:51,135:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.37:1.000:. ./.:4:54,134:.: 0.71:1.000:. ./.:4:35,115:.: 0.00:1.000:. ./.:4:1,156:.: 0.13:1.000:. ./.:4:43,127:.: 0.38:1.000:. ./.:4:37,62:.:-0.95:1.000:. ./.:4:34,75:.:-0.76:1.000:. ./.:4:32,91:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,65:.:-1.04:1.000:. ./.:4:66,87:.: 0.06:1.000:. ./.:4:29,70:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.00:1.000:. ./.:4:101,211:.: 3.02:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.74:1.000:. ./.:4:45,103:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,76:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,117:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,175:.: 1.74:1.000:. ./.:4:63,121:.: 0.64:1.000:. ./.:4:65,171:.: 1.61:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,181:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,221:.: 1.33:1.000:. ./.:4:69,173:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,15:.:-2.52:1.000:. ./.:4:0,89:.:-1.14:1.000:. ./.:4:55,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.08:1.000:. ./.:4:69,149:.: 1.27:1.000:. ./.:4:50,107:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.18:1.000:. ./.:4:39,84:.:-0.50:1.000:. ./.:4:49,133:.: 0.60:1.000:. ./.:4:50,165:.: 1.21:1.000:. ./.:4:56,139:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,204:.: 1.01:1.000:. ./.:4:51,112:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,93:.: 0.75:0.999:. ./.:4:0,163:.: 0.24:1.000:. ./.:4:65,85:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.95:1.000:. ./.:4:43,69:.:-0.71:1.000:. ./.:4:58,103:.: 0.21:1.000:. ./.:4:49,86:.:-0.28:1.000:. ./.:4:40,69:.:-0.76:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.08:1.000:. ./.:4:96,162:.: 2.02:1.000:. ./.:4:1,149:.: 0.00:1.000:. ./.:4:68,152:.: 1.31:1.000:. ./.:4:58,142:.: 0.93:1.000:. ./.:4:54,92:.:-0.07:0.999:. ./.:4:63,152:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.77:1.000:. ./.:4:45,137:.: 0.60:1.000:. ./.:4:54,108:.: 0.23:1.000:. -chr7.1 80411685 chr7.1_080411685 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:178,143:0.46: 0.43:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,233:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,56:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,165:0.50: 0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:276,91:0.26: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:297,93:0.25: 1.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,39:0.26:-1.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:228,66:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,221:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,90:0.77:-2.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,37:0.23:-1.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,246:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,149:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:100,236:0.71: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:147,133:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,174:0.53: 0.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:295,89:0.24: 1.36:0.995:1.000 0/0/1/1:4:147,167:0.55: 0.32:1.000:0.980 0/1/1/1:4:112,272:0.72: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,179:0.53: 0.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:69,57:0.47:-2.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:133,117:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,146:0.47: 0.50:1.000:0.991 0/0/0/1:4:207,65:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,37:0.27:-2.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:202,174:0.48: 1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,149:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,161:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:259,80:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,224:0.70: 0.49:1.000:0.987 0/1/1/1:4:93,229:0.72: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,71:0.29:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,67:0.58:-2.55:1.000:0.930 0/1/1/1:4:33,121:0.79:-2.05:1.000:1.000 0/1/1:3:26,60:0.71:-3.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,194:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,138:0.53:-0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:67,223:0.78:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,93:0.24: 1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,239:0.73: 0.57:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,231:0.75: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,160:0.66:-0.69:1.000:0.895 0/0/1/1:4:200,198:0.52: 1.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,132:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,278:0.73: 1.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:75,240:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/1/1:3:161,173:0.54: 0.62:1.000:0.921 0/0/1/1:4:370,313:0.48: 5.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:150,160:0.54: 0.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:203,186:0.50: 1.43:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,279:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,317:0.78: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,68:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,165:0.50: 0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,137:0.47: 0.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,266:0.80: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,141:0.55:-0.40:1.000:0.979 0/1/1/1:4:87,277:0.77: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,228:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:107,132:0.57:-0.79:1.000:0.602 0/1/1/1:4:87,195:0.70:-0.15:1.000:0.988 0/0/0/1:4:200,63:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:316,97:0.25: 1.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:106,261:0.72: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,135:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:276,81:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,129:0.80:-1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,123:0.48:-0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:145,147:0.52: 0.00:0.936:0.994 0/1/1/1:4:62,188:0.76:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,88:0.27: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,94:0.46:-1.19:0.999:0.989 0/0/1/1:4:194,172:0.49: 1.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:241,70:0.24: 0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,299:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,69:0.29:-0.70:1.000:0.989 0/0/1/1:4:154,137:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,151:0.51: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:260,81:0.25: 0.72:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,222:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,184:0.72:-0.46:0.989:0.995 0/0/1/1:4:174,167:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:178,168:0.51: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,141:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,253:0.69: 1.17:1.000:0.980 0/0/1/1:4:167,154:0.50: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,123:0.58:-1.09:1.000:0.918 0/0/1/1:4:119,133:0.55:-0.60:1.000:0.983 0/0/1/1:4:150,153:0.52: 0.16:1.000:0.994 0/1/1/1:4:73,185:0.73:-0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,142:0.73:-1.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,144:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:234,80:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:132,108:0.47:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:179,149:0.47: 0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:201,171:0.48: 1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:129,118:0.50:-0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:173,140:0.47: 0.31:1.000:0.991 0/1/1/1:4:87,214:0.72: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:84,240:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,70:0.50:-2.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,163:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,155:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:208,144:0.43: 0.89:0.763:0.947 0/0/1/1:4:149,124:0.47:-0.29:1.000:0.993 0/1/1/1:4:77,218:0.75: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,193:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,147:0.45: 0.71:1.000:0.981 0/1/1/1:4:107,288:0.74: 1.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,205:0.80:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,63:0.26:-0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:309,95:0.25: 1.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,228:0.77: 0.14:0.999:1.000 0/1/1/1:4:89,210:0.71: 0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:146,128:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:184,149:0.47: 0.60:1.000:0.991 0/0/1/1:4:119,109:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,120:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,135:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:79,176:0.70:-0.55:1.000:0.987 0/1/1/1:4:68,232:0.78: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,73:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:282,75:0.22: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,95:0.31: 0.47:1.000:0.978 0/0/0/1:4:233,73:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:210,69:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,156:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,191:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:150,42:0.23:-1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,99:0.47:-1.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:122,107:0.49:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,115:0.44:-0.26:1.000:0.960 0/0/1/1:4:103,91:0.49:-1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:175,143:0.47: 0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:142,142:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:83,271:0.78: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,145:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:210,70:0.26:-0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,67:0.28:-0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:78,214:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,158:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,130:0.47:-0.02:1.000:0.991 0/1/1/1:4:84,188:0.70:-0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:116,107:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:277,83:0.24: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,178:0.49: 1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,154:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,64:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,146:0.49: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,60:0.23:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,64:0.19: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,197:0.75:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,70:0.55:-2.39:1.000:0.977 0/1/1/1:4:52,149:0.75:-1.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,222:0.73: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,149:0.56:-0.23:1.000:0.973 0/0/0/1:4:270,91:0.26: 1.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,228:0.74: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,133:0.54:-0.54:1.000:0.989 0/0/1/1:4:176,142:0.47: 0.38:1.000:0.990 0/0/0/1:4:174,40:0.20:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,133:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:80,194:0.72:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,136:0.44: 0.49:1.000:0.961 0/0/1/1:4:156,146:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,154:0.56:-0.09:1.000:0.972 0/0/0/1:4:185,63:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,123:0.54:-0.80:1.000:0.990 0/0/1/1:4:155,142:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,203:0.77:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,56:0.26:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,108:0.49:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:209,74:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,185:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,179:0.75:-0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:126,134:0.53:-0.48:1.000:0.990 0/0/0/1:4:240,68:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,227:0.73: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:168,155:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:186,69:0.28:-0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,246:0.75: 0.63:0.999:0.999 0/1/1/1:4:86,247:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:205,174:0.48: 1.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,115:0.51:-0.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,243:0.77: 0.38:1.000:1.000 -chr7.1 80515644 chr7.1_080515644 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:32,17:0.25: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,31:0.40: 2.65:1.000:0.803 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,27:0.48: 1.65:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,27:0.49: 1.59:1.000:0.996 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,5:0.60:-1.32:1.000:0.829 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:31,15:0.24: 1.26:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:17,21:0.51: 0.73:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:18,21:0.50: 0.80:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,34:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,8:0.60:-1.06:1.000:0.771 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,24:0.39: 1.72:1.000:0.677 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,19:0.45: 0.73:1.000:0.980 0/0/0/1:4:32,17:0.25: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,27:0.38: 2.18:1.000:0.633 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:6,7:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/1/1:3:1,3:0.61:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,26:0.56: 0.86:1.000:0.966 0/0/0/1:4:38,24:0.30: 2.32:1.000:0.982 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:47,18:0.20: 2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,19:0.47: 0.66:1.000:0.991 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,25:0.52: 1.13:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1:3:14,23:0.55: 0.66:1.000:0.953 0/1/1/1:4:1,5:0.66:-1.39:1.000:0.867 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,25:0.43: 1.65:1.000:0.932 0/0/1/1:4:19,32:0.55: 1.59:1.000:0.982 0/0/1/1:4:14,16:0.49: 0.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,19:0.55: 0.20:1.000:0.978 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0/0/0:6:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.86:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,19:0.56: 0.13:1.000:0.962 0/0/1/1:4:14,15:0.47: 0.13:1.000:0.993 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.45:-0.33:0.936:0.980 0/0/0/0:4:24,1:0.03:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.19:0.999:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,16:0.62:-0.40:1.000:0.556 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,15:0.56:-0.26:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.38: 0.00:1.000:0.540 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,23:0.40: 1.52:1.000:0.773 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,24:0.40: 1.65:1.000:0.791 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,33:0.53: 1.92:1.000:0.993 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,18:0.37: 0.93:1.000:0.553 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,12:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,18:0.42: 0.73:1.000:0.895 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:21,0:0.00:-0.40:0.763:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.45:-0.33:1.000:0.980 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.53: 0.33:1.000:0.992 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.66:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,15:0.23: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:9,15:0.55:-0.20:1.000:0.983 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.51:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,21:0.47: 0.93:1.000:0.991 0/1/1/1:4:5,23:0.65: 0.07:1.000:0.820 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,14:0.39: 0.27:1.000:0.658 0/0/1/1:4:11,20:0.56: 0.27:1.000:0.970 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:17,9:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,14:0.26: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,23:0.67: 0.00:1.000:0.920 0/0/1/1:4:12,18:0.53: 0.20:1.000:0.991 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,28:0.32: 2.85:1.000:0.954 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,26:0.35: 2.32:1.000:0.833 0/0/1/1:4:20,21:0.47: 0.93:1.000:0.991 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,16:0.23: 1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,22:0.36: 1.59:1.000:0.679 0/0/0/1:4:43,22:0.24: 2.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:13,22:0.55: 0.53:1.000:0.981 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,14:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,19:0.60:-0.06:1.000:0.753 0/0/1/1:4:12,14:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,27:0.54: 1.13:1.000:0.987 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,32:0.39: 2.85:1.000:0.737 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.73:0.999:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:16,27:0.55: 1.06:1.000:0.981 0/0/1/1:4:14,20:0.53: 0.46:1.000:0.993 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 -chr7.1 81431902 chr7.1_081431902 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:219,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:40,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:34,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.86:0.995:. ./.:4:176,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:29,0:.:-3.24:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-3.03:1.000:. ./.:3:28,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:203,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.08:1.000:. ./.:3:253,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.37:1.000:. ./.:6:149,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.06:0.936:. ./.:4:189,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.55:0.999:. ./.:4:193,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.99:0.989:. ./.:4:190,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.26:1.000:. ./.:5:211,0:.: 0.51:0.679:. ./.:4:156,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.77:0.999:. ./.:4:199,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:284,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:237,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:175,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:241,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.05:1.000:. -chr7.1 81681554 chr7.1_081681554 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:23,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:17,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:24,2:.:-0.11:1.000:. ./.:4:24,14:.: 0.96:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.11:1.000:. ./.:4:9,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:15,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:8,7:.:-1.09:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:4,2:.:-1.89:1.000:. ./.:4:12,7:.:-0.73:1.000:. ./.:4:9,10:.:-0.73:1.000:. ./.:4:14,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,7:.:-1.18:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.52:0.995:. ./.:4:12,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:20,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:5,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:8,6:.:-1.18:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.52:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.44:1.000:. ./.:3:7,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:8,5:.:-1.26:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:16,16:.: 0.43:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,15:.: 0.87:1.000:. ./.:4:22,9:.: 0.34:1.000:. ./.:4:10,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,16:.: 1.14:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.28:1.000:. ./.:3:22,11:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.07:1.000:. ./.:4:9,11:.:-0.64:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:22,13:.: 0.70:1.000:. ./.:4:34,17:.: 2.12:1.000:. ./.:4:20,10:.: 0.25:1.000:. ./.:4:13,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,13:.: 0.96:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.34:1.000:. ./.:6:37,3:.: 1.14:1.000:. ./.:4:32,2:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,8:.: 1.14:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.87:1.000:. ./.:4:33,4:.: 0.87:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.25:1.000:. ./.:4:28,11:.: 1.05:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:14,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.39:0.936:. ./.:4:13,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:34,26:.: 2.92:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.80:0.999:. ./.:4:30,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:17,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:25,5:.: 0.25:1.000:. ./.:4:14,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:39,4:.: 1.41:1.000:. ./.:4:43,4:.: 1.77:1.000:. ./.:4:28,17:.: 1.59:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.43:0.989:. ./.:4:17,15:.: 0.43:1.000:. ./.:4:43,16:.: 2.84:1.000:. ./.:4:8,9:.:-0.91:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:41,11:.: 2.21:1.000:. ./.:4:7,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:17,15:.: 0.43:1.000:. ./.:4:6,9:.:-1.09:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.25:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,1:.:-1.26:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.79:1.000:. ./.:4:22,8:.: 0.25:1.000:. ./.:4:34,15:.: 1.94:1.000:. ./.:4:26,9:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:27,18:.: 1.59:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:11,4:.:-1.09:1.000:. ./.:4:27,14:.: 1.23:1.000:. ./.:4:18,19:.: 0.87:1.000:. ./.:5:31,13:.: 1.50:0.679:. ./.:4:19,12:.: 0.34:1.000:. ./.:4:15,18:.: 0.52:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:35,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:33,12:.: 1.59:1.000:. ./.:4:30,18:.: 1.86:0.999:. ./.:4:14,18:.: 0.43:1.000:. ./.:4:3,8:.:-1.44:1.000:. ./.:4:43,2:.: 1.59:1.000:. ./.:4:10,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:50,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:22,14:.: 0.79:1.000:. ./.:4:20,10:.: 0.25:1.000:. ./.:4:16,20:.: 0.79:1.000:. ./.:4:36,12:.: 1.86:1.000:. ./.:4:40,3:.: 1.41:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:29,15:.: 1.50:1.000:. ./.:4:25,16:.: 1.23:1.000:. ./.:4:30,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:6,12:.:-0.82:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.34:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:32,12:.: 1.50:1.000:. ./.:4:18,11:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,8:.:-1.00:1.000:. ./.:4:23,11:.: 0.61:1.000:. ./.:4:16,15:.: 0.34:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:26,6:.: 0.43:1.000:. ./.:4:8,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:28,10:.: 0.96:1.000:. ./.:4:7,7:.:-1.18:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:11,7:.:-0.82:1.000:. ./.:4:22,10:.: 0.43:1.000:. ./.:4:21,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:23,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,11:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:10,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.61:1.000:. ./.:4:8,6:.:-1.18:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,9:.:-0.28:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.37:1.000:. ./.:4:17,16:.: 0.52:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,5:.:-1.35:1.000:. ./.:4:10,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,18:.: 0.52:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:19,10:.: 0.16:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:2,5:.:-1.80:0.999:. ./.:4:12,8:.:-0.64:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.96:1.000:. ./.:4:15,10:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.20:1.000:. -chr7.1 81840825 chr7.1_081840825 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:51,77:0.58:-0.13:1.000:0.917 0/0/0/1:4:69,6:0.26:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,60:0.61:-0.74:1.000:0.709 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,162:0.47: 3.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:105,89:0.45: 1.16:1.000:0.981 0/0/1/1:4:22,25:0.49:-1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,53:0.41: 0.12:1.000:0.866 0/1/1/1:4:43,97:0.74: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,44:0.60:-1.23:1.000:0.826 0/0/1/1:4:23,30:0.52:-1.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,3:0.26:-1.86:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,70:0.55:-0.29:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,128:0.80: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,124:0.51: 1.71:0.995:0.997 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,83:0.47: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,68:0.54:-0.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:25,90:0.82:-0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,122:0.78: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,109:0.76: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,19:0.43:-1.74:1.000:0.944 0/1/1/1:4:41,106:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,94:0.54: 0.53:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,83:0.54: 0.18:1.000:0.990 0/1/1/1:4:34,82:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,61:0.57:-0.64:1.000:0.938 0/0/1/1:4:23,35:0.58:-1.51:1.000:0.904 0/0/1/1:4:19,27:0.55:-1.74:1.000:0.975 0/1/1/1:4:34,60:0.64:-0.80:1.000:0.715 1/1/1:3:0,38:1.00:-1.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,119:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,56:0.48:-0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,71:0.44: 0.55:1.000:0.967 0/1/1/1:4:40,93:0.75:-0.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,97:0.59: 0.49:1.000:0.880 0/1/1/1:4:50,146:0.79: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,144:0.76: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,72:0.59:-0.31:1.000:0.891 0/1/1/1:4:42,121:0.78: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,142:0.75: 1.30:1.000:1.000 1/1/1:3:0,74:1.00:-1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,93:0.70: 0.06:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,109:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,97:0.48: 1.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,105:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,135:0.48: 2.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,120:0.73: 0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:51,89:0.64: 0.10:1.000:0.664 0/1/1/1:4:60,113:0.67: 0.75:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,99:0.70: 0.24:1.000:0.987 0/1/1/1/1/1:6:15,64:0.84:-1.09:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,65:0.55:-0.47:1.000:0.978 0/0/1/1:4:104,95:0.46: 1.26:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,68:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,135:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,59:0.65:-0.84:1.000:0.769 1/1/1/1:4:0,128:1.00:-0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.47:0.936:1.000 0/0/0/1:4:94,3:0.14:-0.74:1.000:0.971 0/0/1/1:4:61,81:0.53: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,47:0.52:-1.02:0.999:0.995 0/0/0/1:4:98,7:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,72:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:121,7:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,73:0.47: 0.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,64:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,93:0.61: 0.30:1.000:0.682 0/0/1/1:4:62,85:0.54: 0.24:1.000:0.988 0/1/1/1:4:59,150:0.76: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,5:0.27:-1.51:0.989:0.998 1/1/1/1:4:0,170:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,139:0.76: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,109:0.67: 0.63:1.000:0.908 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,167:0.77: 1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,89:0.78:-0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,128:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,122:0.75: 0.77:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,76:0.70:-0.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:54,41:0.44:-0.78:1.000:0.964 0/0/1/1:4:119,89:0.44: 1.43:1.000:0.961 0/1/1/1:4:59,108:0.66: 0.63:1.000:0.848 0/1/1/1:4:47,152:0.80: 1.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,4:0.14:-0.02:1.000:0.953 0/1/1/1:4:65,149:0.74: 1.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,149:0.76: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,86:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,96:0.69: 0.18:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:97,76:0.44: 0.75:0.679:0.910 0/0/1/1:4:30,50:0.62:-1.07:1.000:0.576 0/1/1/1:4:41,105:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,100:0.65: 0.39:1.000:0.828 0/1/1/1:4:37,66:0.65:-0.62:1.000:0.760 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,61:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,74:0.53:-0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:52,152:0.79: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,144:0.76: 1.32:0.999:1.000 0/1/1/1:4:64,117:0.66: 0.90:1.000:0.844 0/0/1/1:4:28,42:0.58:-1.27:1.000:0.927 0/1/1/1:4:62,142:0.74: 1.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,72:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,113:0.58: 1.02:1.000:0.897 0/0/1/1:4:84,77:0.46: 0.51:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,127:0.99:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,75:0.45: 0.65:1.000:0.975 0/0/1/1:4:112,133:0.49: 2.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,90:0.71:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:55,75:0.54:-0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:69,59:0.45:-0.13:1.000:0.982 0/1/1/1:4:43,73:0.63:-0.37:1.000:0.522 0/0/0/1:4:65,3:0.20:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,76:0.65:-0.33:1.000:0.812 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,67:0.65:-0.60:1.000:0.815 0/1/1/1:4:36,110:0.79: 0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,117:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,111:0.75: 0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,53:0.39: 0.47:1.000:0.681 0/1/1/1:4:37,116:0.80: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,45:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,99:0.58: 0.57:1.000:0.902 0/1/1/1:4:51,120:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,126:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,117:0.79: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,82:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,61:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,77:0.48: 0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,62:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/0/1/1:4:49,77:0.60:-0.17:1.000:0.826 0/0/1/1:4:120,152:0.51: 2.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,68:0.44: 0.47:1.000:0.960 0/0/1/1:4:48,71:0.57:-0.31:1.000:0.945 0/1/1/1:4:46,111:0.76: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,42:0.46:-0.94:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,41:0.51:-1.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,121:0.74: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,152:0.55: 2.43:1.000:0.976 0/0/1/1:4:109,148:0.53: 2.39:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,149:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,75:0.70:-0.45:1.000:0.982 0/1/1/1:4:48,138:0.78: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,48:0.40: 0.04:1.000:0.769 0/0/1/1:4:55,84:0.58: 0.08:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,100:0.83:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:59,95:0.61: 0.38:1.000:0.739 0/0/1/1:4:38,44:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,102:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,47:0.52:-1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,45:0.43:-0.51:1.000:0.943 0/0/1/1:4:46,41:0.46:-0.94:1.000:0.986 0/0/1/1:4:43,65:0.58:-0.53:1.000:0.915 0/1/1/1:4:49,120:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,104:0.72: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,79:0.81:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,109:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,67:0.47: 0.02:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,80:0.61:-0.11:1.000:0.679 0/1/1/1:4:58,120:0.70: 0.85:0.999:0.988 1/1/1/1:4:0,139:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,145:0.50: 2.47:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,3:0.11:-0.11:1.000:0.632 -chr7.1 82052629 chr7.1_082052629 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,354:.: 0.22:1.000:. ./.:4:114,150:.:-1.15:1.000:. ./.:4:94,220:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,338:.:-0.03:1.000:. ./.:4:232,201:.: 1.42:1.000:. ./.:4:189,210:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.33:1.000:. ./.:4:168,201:.: 0.44:1.000:. ./.:4:161,184:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,150:.:-2.22:1.000:. ./.:4:51,247:.:-0.64:1.000:. ./.:4:68,242:.:-0.45:1.000:. ./.:4:84,226:.:-0.45:1.000:. ./.:4:91,310:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,358:.: 0.28:1.000:. ./.:4:157,183:.: 0.00:1.000:. ./.:4:178,199:.: 0.57:0.995:. ./.:4:0,409:.: 1.05:1.000:. ./.:4:121,379:.: 2.44:1.000:. ./.:4:0,452:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,316:.:-0.36:1.000:. ./.:4:87,223:.:-0.45:1.000:. ./.:4:91,294:.: 0.69:1.000:. ./.:4:164,170:.:-0.09:1.000:. ./.:4:32,140:.:-2.55:1.000:. ./.:4:209,217:.: 1.31:1.000:. ./.:4:69,290:.: 0.29:1.000:. ./.:4:68,233:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,426:.: 1.33:1.000:. ./.:4:185,188:.: 0.50:1.000:. ./.:4:83,294:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,313:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,152:.:-2.86:1.000:. ./.:4:32,152:.:-2.37:1.000:. ./.:3:27,79:.:-3.56:1.000:. ./.:4:0,330:.:-0.15:1.000:. ./.:4:181,184:.: 0.38:1.000:. ./.:4:67,249:.:-0.36:1.000:. ./.:4:191,179:.: 0.46:1.000:. ./.:4:93,335:.: 1.34:1.000:. ./.:4:73,249:.:-0.27:1.000:. ./.:4:161,181:.: 0.03:1.000:. ./.:4:100,324:.: 1.28:1.000:. ./.:4:67,252:.:-0.32:1.000:. ./.:4:155,207:.: 0.34:1.000:. ./.:4:168,184:.: 0.18:1.000:. ./.:3:85,296:.: 0.63:1.000:. ./.:4:58,203:.:-1.20:1.000:. ./.:4:76,257:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,407:.: 1.02:1.000:. ./.:4:52,222:.:-1.00:1.000:. ./.:4:100,309:.: 1.05:1.000:. ./.:4:73,241:.:-0.39:1.000:. ./.:4:175,182:.: 0.26:1.000:. ./.:4:90,244:.:-0.09:1.000:. ./.:4:184,237:.: 1.23:1.000:. ./.:4:63,265:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,431:.: 1.39:1.000:. ./.:4:69,246:.:-0.38:1.000:. ./.:6:54,240:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,290:.:-0.76:1.000:. ./.:4:76,217:.:-0.71:1.000:. ./.:4:204,227:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,377:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,373:.: 0.50:1.000:. ./.:4:81,282:.: 0.35:1.000:. ./.:4:75,218:.:-0.71:1.000:. ./.:4:75,248:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.81:0.936:. ./.:4:82,203:.:-0.83:1.000:. ./.:4:107,339:.: 1.61:1.000:. ./.:4:153,208:.: 0.32:0.999:. ./.:4:0,464:.: 1.89:1.000:. ./.:4:74,252:.:-0.21:1.000:. ./.:4:165,199:.: 0.37:1.000:. ./.:4:143,164:.:-0.50:1.000:. ./.:4:157,182:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,351:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,376:.: 0.55:1.000:. ./.:4:172,183:.: 0.23:1.000:. ./.:4:57,216:.:-1.02:0.989:. ./.:4:106,304:.: 1.07:1.000:. ./.:4:84,290:.: 0.52:1.000:. ./.:4:127,148:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,379:.: 0.60:1.000:. ./.:4:80,313:.: 0.81:1.000:. ./.:4:127,148:.:-0.99:1.000:. ./.:4:61,240:.:-0.59:1.000:. ./.:4:149,168:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,331:.:-0.13:1.000:. ./.:4:153,169:.:-0.27:1.000:. ./.:4:78,224:.:-0.58:1.000:. ./.:4:170,197:.: 0.41:1.000:. ./.:4:70,182:.:-1.34:1.000:. ./.:4:84,294:.: 0.58:1.000:. ./.:4:72,288:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,272:.:-1.03:1.000:. ./.:4:59,213:.:-1.03:1.000:. ./.:4:190,221:.: 1.08:1.000:. ./.:4:75,262:.:-0.04:1.000:. ./.:4:133,151:.:-0.85:1.000:. ./.:4:135,188:.:-0.26:1.000:. ./.:4:57,149:.:-2.04:1.000:. ./.:5:142,256:.: 0.88:0.679:. ./.:4:99,131:.:-1.67:1.000:. ./.:4:141,175:.:-0.36:1.000:. ./.:4:126,160:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,493:.: 2.33:1.000:. ./.:4:79,269:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,375:.: 0.53:1.000:. ./.:4:104,372:.: 2.07:1.000:. ./.:4:142,176:.:-0.33:0.999:. ./.:4:151,185:.:-0.06:1.000:. ./.:4:110,144:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.76:1.000:. ./.:4:159,220:.: 0.60:1.000:. ./.:4:141,166:.:-0.50:1.000:. ./.:4:82,250:.:-0.12:1.000:. ./.:4:77,253:.:-0.15:1.000:. ./.:4:82,260:.: 0.03:1.000:. ./.:4:89,241:.:-0.15:1.000:. ./.:4:183,171:.: 0.22:1.000:. ./.:4:92,259:.: 0.17:1.000:. ./.:4:69,237:.:-0.51:1.000:. ./.:4:95,282:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.97:1.000:. ./.:4:66,228:.:-0.70:1.000:. ./.:4:49,173:.:-1.79:1.000:. ./.:4:57,197:.:-1.31:1.000:. ./.:4:74,236:.:-0.45:1.000:. ./.:4:167,150:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,230:.:-1.67:1.000:. ./.:4:78,261:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.47:1.000:. ./.:4:99,366:.: 1.90:1.000:. ./.:4:99,271:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,222:.:-0.73:1.000:. ./.:4:72,229:.:-0.59:1.000:. ./.:4:115,162:.:-0.96:1.000:. ./.:4:76,269:.: 0.08:1.000:. ./.:4:61,268:.:-0.16:1.000:. ./.:4:76,245:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,259:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,491:.: 2.30:1.000:. ./.:4:108,387:.: 2.36:1.000:. ./.:4:0,362:.: 0.34:1.000:. ./.:4:82,283:.: 0.38:1.000:. ./.:4:208,193:.: 0.93:1.000:. ./.:4:72,220:.:-0.73:1.000:. ./.:4:96,326:.: 1.25:1.000:. ./.:4:153,168:.:-0.29:1.000:. ./.:4:30,169:.:-2.14:1.000:. ./.:4:75,240:.:-0.38:1.000:. ./.:4:194,209:.: 0.96:1.000:. ./.:4:161,206:.: 0.41:1.000:. ./.:4:195,207:.: 0.95:1.000:. ./.:4:90,336:.: 1.31:1.000:. ./.:4:0,316:.:-0.36:1.000:. ./.:4:189,202:.: 0.78:1.000:. ./.:4:87,271:.: 0.28:1.000:. ./.:4:132,156:.:-0.79:1.000:. ./.:4:67,228:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,274:.: 0.31:1.000:. ./.:4:68,286:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,305:.: 0.63:1.000:. ./.:4:56,217:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,352:.: 0.18:1.000:. ./.:4:163,163:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,256:.:-0.04:1.000:. ./.:4:135,135:.:-1.06:1.000:. ./.:4:119,129:.:-1.40:1.000:. ./.:4:78,251:.:-0.16:1.000:. ./.:4:64,217:.:-0.89:1.000:. ./.:4:64,219:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,237:.:-1.56:1.000:. ./.:4:103,327:.: 1.37:1.000:. ./.:4:110,288:.: 0.88:1.000:. ./.:4:97,289:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.86:1.000:. ./.:4:186,204:.: 0.76:0.999:. ./.:4:91,352:.: 1.57:1.000:. ./.:4:214,278:.: 2.31:1.000:. ./.:4:65,266:.:-0.13:1.000:. ./.:4:83,281:.: 0.37:1.000:. -chr7.1 82178135 chr7.1_082178135 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.94:0.995:. ./.:4:36,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:82,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-2.46:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:125,0:.: 3.50:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:113,0:.: 2.91:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.20:1.000:. ./.:3:43,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.27:1.000:. ./.:6:55,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:95,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.22:0.936:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:131,0:.: 3.79:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.31:0.989:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.05:1.000:. ./.:5:64,0:.: 0.52:0.679:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.75:0.999:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:69,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.71:1.000:. -chr7.1 82470737 chr7.1_082470737 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:41,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,7:.:-1.23:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.65:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:41,10:.: 1.00:1.000:. ./.:4:44,12:.: 1.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:31,10:.: 0.28:1.000:. ./.:4:25,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,9:.:-1.01:1.000:. ./.:4:49,8:.: 1.43:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.44:1.000:. ./.:4:18,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:24,9:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,10:.: 0.85:1.000:. ./.:4:32,6:.: 0.06:0.995:. ./.:4:39,10:.: 0.85:1.000:. ./.:4:39,6:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:12,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:29,18:.: 0.71:1.000:. ./.:4:16,25:.: 0.28:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.21:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:43,16:.: 1.57:1.000:. ./.:4:6,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.16:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.01:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.51:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:8,16:.:-0.94:1.000:. ./.:4:19,26:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.01:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.01:1.000:. ./.:4:22,11:.:-0.30:1.000:. ./.:3:21,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,81:.: 8.10:1.000:. ./.:4:34,7:.: 0.28:1.000:. ./.:4:75,31:.: 4.94:1.000:. ./.:4:30,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.06:1.000:. ./.:4:29,11:.: 0.21:1.000:. ./.:4:17,19:.:-0.08:1.000:. ./.:4:47,18:.: 2.00:1.000:. ./.:4:26,13:.: 0.13:1.000:. ./.:4:51,14:.: 2.00:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:6:25,10:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,8:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,21:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,10:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,22:.: 1.64:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:19,19:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,21:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,13:.:-0.01:0.936:. ./.:4:11,19:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,15:.: 0.42:0.999:. ./.:4:36,9:.: 0.56:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.44:1.000:. ./.:4:22,12:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,6:.:-0.37:1.000:. ./.:4:23,29:.: 1.07:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,26:.: 0.64:1.000:. ./.:4:9,6:.:-1.59:0.989:. ./.:4:19,15:.:-0.22:1.000:. ./.:4:16,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.94:1.000:. ./.:4:39,13:.: 1.07:1.000:. ./.:4:19,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:13,12:.:-0.87:1.000:. ./.:4:16,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,12:.: 0.49:1.000:. ./.:4:31,9:.: 0.21:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:38,8:.: 0.64:1.000:. ./.:4:9,20:.:-0.58:1.000:. ./.:4:23,14:.:-0.01:1.000:. ./.:4:18,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,8:.:-0.37:1.000:. ./.:4:23,7:.:-0.51:1.000:. ./.:4:19,33:.: 1.07:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.51:1.000:. ./.:4:30,13:.: 0.42:1.000:. ./.:4:20,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.87:1.000:. ./.:5:39,9:.: 0.78:0.679:. ./.:4:18,11:.:-0.58:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:32,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:57,8:.: 2.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:26,16:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,13:.:-0.58:0.999:. ./.:4:30,7:.:-0.01:1.000:. ./.:4:32,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:21,14:.:-0.15:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:25,21:.: 0.64:1.000:. ./.:4:21,20:.: 0.28:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:31,10:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,9:.: 0.28:1.000:. ./.:4:28,14:.: 0.35:1.000:. ./.:4:14,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:24,10:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,7:.:-0.58:1.000:. ./.:4:14,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:27,9:.:-0.08:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.51:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,28:.: 1.86:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:6,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:15,7:.:-1.08:1.000:. ./.:4:25,13:.: 0.06:1.000:. ./.:4:16,13:.:-0.58:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.08:1.000:. ./.:4:26,6:.:-0.37:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.16:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,16:.:-0.30:1.000:. ./.:4:36,16:.: 1.07:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,19:.: 0.56:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:33,6:.: 0.13:1.000:. ./.:4:28,8:.:-0.08:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,11:.: 0.64:1.000:. ./.:4:21,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:24,28:.: 1.07:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.44:1.000:. ./.:4:14,14:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,17:.: 0.49:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.44:1.000:. ./.:4:17,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:23,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,16:.: 0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,5:.:-0.08:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.30:1.000:. ./.:4:24,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,20:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:33,10:.: 0.42:0.999:. ./.:4:14,18:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,26:.: 2.36:1.000:. ./.:4:22,22:.: 0.49:1.000:. ./.:4:19,13:.:-0.37:1.000:. -chr7.1 82776961 chr7.1_082776961 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:244,224:.: 0.37:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:312,94:.:-0.24:1.000:. ./.:4:376,123:.: 0.68:1.000:. ./.:4:281,224:.: 0.74:1.000:. ./.:4:447,152:.: 1.68:1.000:. ./.:4:227,212:.: 0.09:1.000:. ./.:4:363,108:.: 0.40:1.000:. ./.:4:337,113:.: 0.19:1.000:. ./.:4:170,38:.:-2.21:1.000:. ./.:4:208,49:.:-1.72:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:343,98:.: 0.11:1.000:. ./.:4:375,117:.: 0.61:1.000:. ./.:4:341,111:.: 0.21:1.000:. ./.:4:437,125:.: 1.31:1.000:. ./.:4:269,235:.: 0.73:0.995:. ./.:4:368,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:536,143:.: 2.47:1.000:. ./.:4:299,285:.: 1.53:1.000:. ./.:4:79,208:.:-1.43:1.000:. ./.:4:307,90:.:-0.33:1.000:. ./.:4:542,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:348,123:.: 0.40:1.000:. ./.:4:96,110:.:-2.23:1.000:. ./.:4:491,167:.: 2.26:1.000:. ./.:4:144,362:.: 0.75:1.000:. ./.:4:333,97:.: 0.00:1.000:. ./.:4:301,262:.: 1.32:1.000:. ./.:4:448,128:.: 1.45:1.000:. ./.:4:454,147:.: 1.69:1.000:. ./.:4:220,221:.: 0.11:1.000:. ./.:4:88,60:.:-2.81:1.000:. ./.:4:90,139:.:-2.00:1.000:. ./.:3:70,62:.:-2.97:1.000:. ./.:4:261,225:.: 0.55:1.000:. ./.:4:418,142:.: 1.29:1.000:. ./.:4:336,112:.: 0.17:1.000:. ./.:4:416,135:.: 1.20:1.000:. ./.:4:325,261:.: 1.55:1.000:. ./.:4:205,210:.:-0.15:1.000:. ./.:4:334,102:.: 0.06:1.000:. ./.:4:263,223:.: 0.55:1.000:. ./.:4:321,92:.:-0.17:1.000:. ./.:4:364,88:.: 0.21:1.000:. ./.:4:319,97:.:-0.14:1.000:. ./.:3:546,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:779,1:.: 3.47:1.000:. ./.:4:214,175:.:-0.41:1.000:. ./.:4:395,122:.: 0.86:1.000:. ./.:4:176,147:.:-1.07:1.000:. ./.:4:404,146:.: 1.19:1.000:. ./.:4:195,187:.:-0.48:1.000:. ./.:4:254,196:.: 0.19:1.000:. ./.:4:207,199:.:-0.24:1.000:. ./.:4:387,119:.: 0.75:1.000:. ./.:4:173,173:.:-0.84:1.000:. ./.:4:262,270:.: 1.01:1.000:. ./.:4:202,185:.:-0.43:1.000:. ./.:6:213,74:.:-1.43:1.000:. ./.:4:308,74:.:-0.48:1.000:. ./.:4:286,105:.:-0.39:1.000:. ./.:4:354,134:.: 0.57:1.000:. ./.:4:350,89:.: 0.09:1.000:. ./.:4:261,236:.: 0.66:1.000:. ./.:4:219,200:.:-0.11:1.000:. ./.:4:180,163:.:-0.87:1.000:. ./.:4:291,98:.:-0.41:1.000:. ./.:4:331,96:.:-0.03:0.936:. ./.:4:423,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:313,92:.:-0.25:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:263,253:.: 0.85:1.000:. ./.:4:364,92:.: 0.25:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:238,214:.: 0.21:1.000:. ./.:4:388,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:204,172:.:-0.54:1.000:. ./.:4:231,219:.: 0.19:1.000:. ./.:4:360,111:.: 0.40:1.000:. ./.:4:247,84:.:-0.99:0.989:. ./.:4:346,83:.:-0.01:1.000:. ./.:4:246,210:.: 0.25:1.000:. ./.:4:287,86:.:-0.57:1.000:. ./.:4:322,95:.:-0.13:1.000:. ./.:4:227,181:.:-0.22:1.000:. ./.:4:162,137:.:-1.31:1.000:. ./.:4:243,71:.:-1.16:1.000:. ./.:4:309,77:.:-0.44:1.000:. ./.:4:192,171:.:-0.67:1.000:. ./.:4:340,114:.: 0.23:1.000:. ./.:4:273,75:.:-0.82:1.000:. ./.:4:370,129:.: 0.68:1.000:. ./.:4:171,135:.:-1.24:1.000:. ./.:4:234,184:.:-0.12:1.000:. ./.:4:328,113:.: 0.11:1.000:. ./.:4:224,56:.:-1.49:1.000:. ./.:4:179,151:.:-1.00:1.000:. ./.:4:345,111:.: 0.25:1.000:. ./.:4:225,213:.: 0.08:1.000:. ./.:4:238,194:.: 0.02:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:195,62:.:-1.72:1.000:. ./.:5:366,112:.: 0.47:0.679:. ./.:4:348,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:315,81:.:-0.34:1.000:. ./.:4:251,105:.:-0.74:1.000:. ./.:4:252,234:.: 0.55:1.000:. ./.:4:414,137:.: 1.20:1.000:. ./.:4:314,86:.:-0.30:1.000:. ./.:4:209,179:.:-0.42:1.000:. ./.:4:315,312:.: 1.95:1.000:. ./.:4:264,85:.:-0.81:0.999:. ./.:4:364,97:.: 0.30:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:256,230:.: 0.55:1.000:. ./.:4:390,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:196,168:.:-0.66:1.000:. ./.:4:195,169:.:-0.66:1.000:. ./.:4:259,76:.:-0.95:1.000:. ./.:4:303,111:.:-0.16:1.000:. ./.:4:179,158:.:-0.93:1.000:. ./.:4:203,185:.:-0.42:1.000:. ./.:4:270,212:.: 0.51:1.000:. ./.:4:254,82:.:-0.94:1.000:. ./.:4:312,101:.:-0.17:1.000:. ./.:4:214,195:.:-0.21:1.000:. ./.:4:272,94:.:-0.64:1.000:. ./.:4:139,135:.:-1.55:1.000:. ./.:4:282,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:283,83:.:-0.64:1.000:. ./.:4:388,110:.: 0.67:1.000:. ./.:4:205,69:.:-1.55:1.000:. ./.:4:104,318:.:-0.08:1.000:. ./.:4:108,255:.:-0.67:1.000:. ./.:4:423,152:.: 1.44:1.000:. ./.:4:258,196:.: 0.23:1.000:. ./.:4:169,165:.:-0.96:1.000:. ./.:4:172,60:.:-1.97:1.000:. ./.:4:209,68:.:-1.52:1.000:. ./.:4:214,194:.:-0.22:1.000:. ./.:4:174,159:.:-0.97:1.000:. ./.:4:230,177:.:-0.23:1.000:. ./.:4:66,203:.:-1.60:1.000:. ./.:4:416,146:.: 1.31:1.000:. ./.:4:455,158:.: 1.81:1.000:. ./.:4:261,199:.: 0.29:1.000:. ./.:4:315,80:.:-0.35:1.000:. ./.:4:262,250:.: 0.81:1.000:. ./.:4:186,203:.:-0.41:1.000:. ./.:4:401,115:.: 0.85:1.000:. ./.:4:370,108:.: 0.47:1.000:. ./.:4:68,145:.:-2.16:1.000:. ./.:4:290,84:.:-0.56:1.000:. ./.:4:455,138:.: 1.62:1.000:. ./.:4:245,206:.: 0.20:1.000:. ./.:4:286,306:.: 1.61:1.000:. ./.:4:417,126:.: 1.12:1.000:. ./.:4:180,176:.:-0.74:1.000:. ./.:4:408,134:.: 1.11:1.000:. ./.:4:226,192:.:-0.12:1.000:. ./.:4:292,101:.:-0.37:1.000:. ./.:4:286,82:.:-0.62:1.000:. ./.:4:444,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:290,274:.: 1.33:1.000:. ./.:4:263,226:.: 0.58:1.000:. ./.:4:333,104:.: 0.07:1.000:. ./.:4:245,213:.: 0.27:1.000:. ./.:4:215,185:.:-0.30:1.000:. ./.:4:333,113:.: 0.15:1.000:. ./.:4:282,98:.:-0.50:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:311,120:.: 0.01:1.000:. ./.:4:223,190:.:-0.17:1.000:. ./.:4:198,164:.:-0.68:1.000:. ./.:4:95,267:.:-0.68:1.000:. ./.:4:310,317:.: 1.95:1.000:. ./.:4:347,146:.: 0.62:1.000:. ./.:4:568,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:111,299:.:-0.20:1.000:. ./.:4:417,104:.: 0.90:0.999:. ./.:4:470,160:.: 1.98:1.000:. ./.:4:327,244:.: 1.40:1.000:. ./.:4:340,98:.: 0.08:1.000:. ./.:4:363,101:.: 0.33:1.000:. -chr7.1 83012389 chr7.1_083012389 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:32,27:0.42: 0.57:1.000:0.912 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,42:0.45: 1.63:1.000:0.982 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,53:0.61: 1.23:1.000:0.680 0/0/1/1:4:17,36:0.60: 0.33:1.000:0.801 0/0/0/1:4:27,11:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,47:0.54: 1.35:1.000:0.986 0/0/1/1:4:14,22:0.55:-0.34:1.000:0.977 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:8,7:0.43:-1.16:1.000:0.944 0/0/0/0:4:26,1:0.03:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,10:0.33:-0.69:1.000:0.937 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,17:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,31:0.47: 0.64:0.995:0.993 0/0/0/1:4:65,19:0.19: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.21:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,18:0.27: 0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,5:0.15:-0.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:27,30:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,24:0.50: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,50:0.55: 1.47:1.000:0.978 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,17:0.42:-0.30:1.000:0.919 0/0/1/1:4:14,26:0.58:-0.18:1.000:0.918 0/1/1/1:4:14,41:0.64: 0.41:1.000:0.727 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,25:0.67:-0.49:1.000:0.910 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,22:0.37: 0.37:1.000:0.622 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0:3:6,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.38:-0.06:1.000:0.536 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,35:0.42: 1.23:1.000:0.924 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,11:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,16:0.56:-0.73:1.000:0.973 0/0/1/1:4:37,36:0.46: 1.12:1.000:0.986 0/0/0/1:4:60,31:0.29: 1.82:1.000:0.990 0/0/0/1:4:28,13:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:25,15:0.33:-0.18:1.000:0.918 0/1/1:3:23,28:0.51: 0.25:1.000:0.676 0/1/1/1:4:0,1:0.83:-1.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,43:0.41: 2.02:1.000:0.858 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,32:0.36: 1.39:1.000:0.717 0/0/1/1:4:36,37:0.47: 1.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,43:0.64: 0.53:1.000:0.696 0/0/1/1:4:19,18:0.45:-0.30:1.000:0.980 0/0/1/1:4:49,40:0.41: 1.74:1.000:0.868 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,1:0.04:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:29,8:0.18:-0.30:1.000:0.972 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,38:0.53: 0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,32:0.31: 1.74:1.000:0.967 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,19:0.24: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,30:0.52: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,13:0.31:-0.30:1.000:0.980 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.00:0.936:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,18:0.35: 0.06:1.000:0.809 0/0/0/1:4:22,11:0.29:-0.45:0.999:0.994 0/0/0/1:4:118,31:0.17: 4.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,52:0.49: 2.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,24:0.37: 0.53:1.000:0.533 0/0/1/1:4:9,22:0.62:-0.53:1.000:0.578 0/0/0/1:4:47,17:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,16:0.16: 1.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,18:0.65:-0.81:1.000:0.759 0/0/0/1:4:34,19:0.31: 0.33:0.989:0.969 0/0/0/1:4:32,14:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,48:0.58: 1.12:1.000:0.896 0/0/1/1:4:24,20:0.42:-0.02:1.000:0.897 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,48:0.57: 1.19:1.000:0.940 0/0/1/1:4:18,26:0.54:-0.02:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,20:0.45:-0.14:1.000:0.982 0/0/1/1:4:17,20:0.51:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.45:-0.69:1.000:0.974 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,28:0.35: 1.04:1.000:0.779 0/0/1/1:4:18,38:0.60: 0.45:1.000:0.805 0/0/1/1:4:29,34:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,16:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,25:0.30: 1.12:1.000:0.988 0/1/1/1:4:1,19:0.79:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.21:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,35:0.59: 0.33:1.000:0.886 0/0/1/1:4:10,20:0.59:-0.57:1.000:0.862 0/0/0/1:4:18,5:0.18:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:43,30:0.37: 1.12:0.679:0.952 0/0/0/1:4:21,14:0.36:-0.38:1.000:0.717 0/0/0/1:4:21,10:0.27:-0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,13:0.66:-1.08:1.000:0.845 0/0/1/1:4:22,25:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,18:0.20: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,53:0.53: 1.90:1.000:0.994 0/1/1/1:4:5,16:0.65:-0.93:0.999:0.830 0/0/0/1:4:34,18:0.30: 0.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:7,12:0.57:-1.00:1.000:0.954 0/0/0/1:4:59,16:0.18: 1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,14:0.55:-0.85:1.000:0.979 0/0/1/1:4:31,33:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:23,13:0.32:-0.34:1.000:0.963 0/0/0/1:4:23,12:0.30:-0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:16,12:0.39:-0.65:1.000:0.671 0/0/0/1:4:27,14:0.29:-0.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,35:0.52: 0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,41:0.49: 1.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,24:0.27: 1.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,35:0.46: 1.00:1.000:0.990 0/0/0/1:4:53,20:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,15:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,24:0.39: 0.45:1.000:0.671 0/0/1/1:4:17,13:0.39:-0.57:1.000:0.727 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,19:0.51:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,12:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,12:0.34:-0.53:1.000:0.844 0/0/1/1:4:12,27:0.61:-0.22:1.000:0.718 0/0/1/1:4:23,18:0.40:-0.14:1.000:0.786 0/0/1/1:4:18,29:0.56: 0.09:1.000:0.972 0/0/0/1:4:34,19:0.31: 0.33:1.000:0.969 0/0/0/1:4:28,14:0.29:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,41:0.38: 2.10:1.000:0.533 0/0/0/1:4:45,31:0.37: 1.23:1.000:0.616 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,11:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,18:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,43:0.62: 0.61:1.000:0.516 0/1/1/1:4:17,47:0.64: 0.76:1.000:0.640 0/0/1/1:4:23,26:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,46:0.62: 0.80:1.000:0.595 0/0/1/1:4:11,15:0.53:-0.73:1.000:0.992 0/0/0/1:4:6,3:0.29:-1.40:1.000:0.994 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,22:0.34: 0.49:1.000:0.853 0/1/1/1:4:19,50:0.63: 0.96:1.000:0.555 0/0/1/1:4:37,45:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,18:0.45:-0.30:1.000:0.980 0/0/0/1:4:26,17:0.35:-0.06:1.000:0.769 0/1/1/1:4:4,24:0.72:-0.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,26:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,12:0.29:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:18,20:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,20:0.52:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,34:0.54: 0.49:1.000:0.986 0/0/1/1:4:26,42:0.56: 0.92:1.000:0.971 0/0/1/1:4:31,28:0.44: 0.57:1.000:0.963 0/0/0/1:4:64,29:0.26: 1.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,49:0.59: 1.15:1.000:0.880 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,29:0.62:-0.14:1.000:0.599 0/0/1/1:4:22,24:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,60:0.56: 2.06:1.000:0.970 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.44:-0.26:1.000:0.961 0/0/1/1:4:39,45:0.50: 1.55:1.000:0.997 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,21:0.44:-0.02:1.000:0.968 0/0/0/1:4:35,18:0.29: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:29,28:0.46: 0.49:0.999:0.985 0/0/1/1:4:25,29:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,47:0.59: 1.00:1.000:0.841 0/0/1/1:4:15,23:0.55:-0.26:1.000:0.981 0/0/0/1:4:45,20:0.26: 0.80:1.000:0.999 -chr7.1 83605195 chr7.1_083605195 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:42,34:0.41:-0.47:1.000:0.860 0/1/1/1:4:19,60:0.80:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,53:0.42: 1.28:1.000:0.910 0/0/1/1:4:26,42:0.58:-0.82:1.000:0.913 0/1/1/1:4:26,60:0.72:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,71:0.83: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,24:0.38:-1.23:1.000:0.569 0/1/1/1:4:30,72:0.74: 0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,73:0.81: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,26:0.49:-1.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,21:0.36:-1.36:1.000:0.723 0/0/1/1:4:56,43:0.40: 0.56:1.000:0.790 0/0/1/1:4:23,37:0.58:-1.18:1.000:0.920 0/0/1/1:4:34,58:0.60: 0.25:1.000:0.764 0/0/1/1:4:36,48:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,61:0.73: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,72:0.54: 1.54:0.995:0.988 0/0/0/1:4:54,32:0.35:-0.02:1.000:0.745 1/1/1/1:4:15,97:0.91: 1.14:1.000:0.952 0/0/1/1:4:52,42:0.41: 0.34:1.000:0.857 0/0/1/1:4:30,25:0.41:-1.41:1.000:0.889 0/0/1/1:4:40,62:0.56: 0.69:1.000:0.962 0/1/1/1:4:29,55:0.65:-0.11:1.000:0.757 0/0/1/1:4:55,47:0.42: 0.69:1.000:0.910 0/0/1/1:4:19,19:0.45:-2.17:1.000:0.977 0/0/1/1:4:52,66:0.49: 1.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,65:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,44:0.65:-0.87:1.000:0.790 0/1/1/1:4:24,57:0.73:-0.24:1.000:0.998 1/1/1/1:4:13,100:0.93: 1.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,80:0.68: 1.45:1.000:0.947 0/0/1/1:4:45,32:0.39:-0.42:1.000:0.649 0/0/1/1:4:24,30:0.49:-1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,36:0.49:-1.00:1.000:0.996 0/1/1:3:10,19:0.65:-2.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,56:0.65:-0.06:1.000:0.822 0/1/1/1:4:32,70:0.70: 0.69:1.000:0.987 0/1/1/1:4:16,80:0.88: 0.43:1.000:0.828 0/1/1/1:4:33,82:0.75: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,77:0.67: 1.28:1.000:0.931 0/0/1/1:4:32,53:0.59:-0.06:1.000:0.860 0/1/1/1:4:15,78:0.88: 0.29:1.000:0.712 0/1/1/1:4:44,85:0.65: 1.90:1.000:0.823 0/0/1/1:4:57,40:0.38: 0.47:1.000:0.620 0/0/1/1:4:44,73:0.59: 1.37:1.000:0.855 0/0/1/1:4:39,59:0.55: 0.52:1.000:0.977 0/1/1:3:21,56:0.76:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,81:0.66: 1.59:1.000:0.885 0/0/0/1:4:60,33:0.34: 0.29:1.000:0.853 0/0/1/1:4:36,56:0.56: 0.25:1.000:0.960 0/1/1/1:4:23,52:0.71:-0.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,66:0.63: 0.69:1.000:0.596 0/0/1/1:4:38,30:0.40:-0.82:1.000:0.830 0/0/1/1:4:41,56:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,58:0.64: 0.11:1.000:0.697 0/0/1/1:4:49,78:0.57: 1.81:1.000:0.935 0/0/1/1:4:37,37:0.45:-0.56:1.000:0.977 0/0/1/1:4:61,75:0.48: 2.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,76:0.55: 1.77:1.000:0.975 0/0/1/1/1/1:6:23,40:0.61:-1.05:1.000:0.726 0/0/1/1:4:33,47:0.53:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,62:0.60: 0.56:1.000:0.827 0/1/1/1:4:39,85:0.70: 1.68:1.000:0.986 0/0/1/1:4:52,71:0.51: 1.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,38:0.41:-0.06:1.000:0.859 0/0/1/1:4:37,56:0.55: 0.29:1.000:0.977 0/0/1/1:4:27,37:0.51:-1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,68:0.69: 0.61:1.000:0.975 0/0/1/1:4:50,71:0.53: 1.54:0.936:0.994 0/1/1/1:4:23,44:0.65:-0.87:1.000:0.790 0/0/1/1:4:47,62:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,51:0.68:-0.47:0.999:0.940 0/0/0/1:4:136,40:0.25: 4.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,26:0.35:-0.69:1.000:0.787 0/0/1/1:4:33,37:0.47:-0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,58:0.50: 0.65:1.000:0.997 1/1/1/1:4:10,70:0.92:-0.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:41,28:0.38:-0.78:1.000:0.560 0/0/1/1:4:52,39:0.40: 0.20:1.000:0.752 1/1/1/1:4:12,85:0.92: 0.47:1.000:0.991 0/0/0/1:4:50,28:0.35:-0.38:0.989:0.831 0/0/1/1:4:48,58:0.48: 0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,55:0.47: 0.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:25,45:0.63:-0.74:1.000:0.503 0/0/1/1:4:39,68:0.61: 0.92:1.000:0.669 0/0/1/1:4:46,44:0.44: 0.16:1.000:0.966 0/1/1/1:4:19,45:0.73:-1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,32:0.46:-1.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:32,35:0.46:-0.87:1.000:0.990 0/0/1/1:4:32,49:0.56:-0.24:1.000:0.971 0/0/1/1:4:29,44:0.55:-0.60:1.000:0.976 0/1/1/1:4:23,48:0.68:-0.69:1.000:0.963 0/0/1/1:4:43,70:0.58: 1.19:1.000:0.899 0/1/1/1:4:20,38:0.65:-1.27:1.000:0.764 0/0/1/1:4:56,65:0.47: 1.54:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,75:0.66: 1.19:1.000:0.882 0/1/1/1:4:19,36:0.65:-1.41:1.000:0.753 0/0/1/1:4:42,43:0.45:-0.06:1.000:0.981 0/1/1/1:4:22,53:0.74:-0.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:8,75:0.95:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,44:0.72:-1.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,77:0.82: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,23:0.49:-2.03:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:43,37:0.42:-0.29:0.679:0.956 0/0/1/1:4:52,61:0.48: 1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,50:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,69:0.85:-0.06:1.000:0.982 0/1/1/1:4:28,55:0.66:-0.15:1.000:0.871 0/0/1/1:4:32,54:0.60:-0.02:1.000:0.804 0/0/1/1:4:32,45:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:50,32:0.37:-0.20:1.000:0.590 0/1/1/1:4:42,89:0.69: 1.99:1.000:0.974 0/1/1/1:4:15,48:0.80:-1.05:0.999:1.000 0/0/1/1:4:32,47:0.54:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:29,43:0.54:-0.65:1.000:0.985 0/0/1/1:4:46,33:0.39:-0.33:1.000:0.667 0/1/1/1:4:11,51:0.87:-1.09:1.000:0.944 0/0/1/1:4:37,63:0.60: 0.61:1.000:0.772 0/0/1/1:4:35,45:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,33:0.59:-1.50:1.000:0.870 0/0/1/1:4:40,52:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,36:0.42:-0.42:1.000:0.929 0/0/1/1:4:38,54:0.53: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:41,26:0.37:-0.87:1.000:0.610 0/0/0/1:4:50,30:0.36:-0.29:1.000:0.723 0/0/1/1:4:26,35:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,30:0.41:-0.87:1.000:0.862 0/0/1/1:4:34,35:0.45:-0.78:1.000:0.982 0/0/0/1:4:48,22:0.31:-0.74:1.000:0.969 0/1/1/1:4:23,46:0.67:-0.78:1.000:0.910 0/0/1/1:4:42,48:0.47: 0.16:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,75:0.67: 1.14:1.000:0.931 0/0/1/1:4:25,26:0.45:-1.58:1.000:0.984 0/1/1/1:4:14,26:0.64:-2.08:1.000:0.662 0/1/1/1:4:11,35:0.80:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,58:0.60: 0.25:1.000:0.764 0/0/1/1:4:26,41:0.57:-0.87:1.000:0.947 0/1/1/1:4:18,35:0.66:-1.50:1.000:0.843 0/0/0/1:4:29,18:0.36:-1.76:1.000:0.656 0/0/1/1:4:22,38:0.61:-1.18:1.000:0.712 0/0/1/1:4:46,38:0.41:-0.11:1.000:0.881 0/0/1/1:4:35,27:0.40:-1.09:1.000:0.797 1/1/1/1:4:11,76:0.92: 0.02:1.000:0.986 0/0/1/1:4:29,27:0.43:-1.36:1.000:0.957 0/0/1/1:4:51,44:0.42: 0.38:1.000:0.917 0/1/1/1:4:17,45:0.76:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,31:0.30: 0.83:1.000:0.986 0/0/1/1:4:41,68:0.59: 1.01:1.000:0.856 0/1/1/1:4:26,68:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,53:0.52: 0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:37,75:0.67: 1.14:1.000:0.931 0/0/1/1:4:34,53:0.57: 0.02:1.000:0.958 0/0/1/1:4:23,34:0.54:-1.32:1.000:0.986 1/1/1/1:4:6,56:0.95:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,78:0.58: 1.77:1.000:0.903 0/0/1/1:4:40,47:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:41,59:0.53: 0.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,68:0.57: 1.10:1.000:0.943 0/0/1/1:4:45,43:0.44: 0.07:1.000:0.966 0/1/1/1:4:21,81:0.84: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,63:0.67: 0.34:1.000:0.935 0/0/1/1:4:30,50:0.59:-0.29:1.000:0.843 0/0/1/1:4:29,52:0.62:-0.24:1.000:0.523 0/1/1/1:4:40,76:0.65: 1.32:1.000:0.764 0/0/1/1:4:38,29:0.40:-0.87:1.000:0.781 0/1/1/1:4:24,60:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,50:0.43: 0.87:1.000:0.938 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,56:0.67:-0.11:1.000:0.910 0/1/1/1:4:29,53:0.63:-0.20:1.000:0.580 0/1/1/1:4:32,65:0.67: 0.47:1.000:0.934 0/0/1/1:4:30,49:0.58:-0.33:1.000:0.892 0/0/0/1:4:58,31:0.34: 0.11:1.000:0.883 0/1/1/1:4:15,47:0.80:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,64:0.64: 0.52:1.000:0.725 0/1/1/1:4:29,67:0.72: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,57:0.42: 1.59:1.000:0.928 1/1/1/1:4:11,93:0.94: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,48:0.58:-0.38:1.000:0.928 0/0/0/1:4:49,25:0.33:-0.56:1.000:0.921 0/0/1/1:4:52,74:0.53: 1.77:0.999:0.993 0/1/1/1:4:31,72:0.73: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,71:0.63: 1.05:1.000:0.559 0/1/1/1:4:19,55:0.78:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,25:0.35:-0.78:1.000:0.812 -chr7.1 83676873 chr7.1_083676873 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,26:0.58:-0.28:1.000:0.893 0/1/1/1:4:13,38:0.79:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,31:0.71:-0.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:33,42:0.60: 1.34:1.000:0.750 0/1/1/1:4:15,51:0.81: 0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,37:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,30:0.60: 0.08:1.000:0.794 0/1/1/1:4:2,9:0.85:-2.49:1.000:0.987 0/0/1/1:4:9,5:0.42:-2.31:1.000:0.911 0/0/0/1:4:18,3:0.26:-1.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,14:0.36:-0.10:1.000:0.734 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,30:0.67:-0.28:1.000:0.936 0/1/1/1:4:11,27:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,54:0.73: 1.64:0.995:0.997 0/0/0/1:4:47,7:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,56:0.80: 1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-2.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,26:0.45: 0.74:1.000:0.982 0/0/1/1:4:30,13:0.38:-0.57:1.000:0.533 0/0/0/1:4:34,13:0.36:-0.34:1.000:0.717 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-2.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,43:0.70: 0.80:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,16:0.43:-0.57:1.000:0.948 0/1/1/1:4:17,37:0.74: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,27:0.45: 0.86:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,59:1.00: 0.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.79:-2.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.83:1.000:1.000 0/1/1:3:5,13:0.77:-2.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,27:0.73:-0.75:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,23:0.55:-0.45:1.000:0.978 0/1/1/1:4:15,44:0.79: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,51:0.67: 1.76:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,30:0.65:-0.16:1.000:0.767 0/0/1/1:4:53,44:0.49: 2.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,40:0.49: 2.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,28:0.60:-0.16:1.000:0.750 0/0/1/1:4:25,28:0.57: 0.02:1.000:0.946 0/0/1/1:4:20,27:0.62:-0.34:1.000:0.570 0/1/1:3:21,20:0.53:-0.69:1.000:0.858 0/0/1/1:4:11,6:0.42:-2.13:1.000:0.896 0/0/1/1:4:25,31:0.60: 0.20:1.000:0.811 0/1/1/1:4:25,52:0.73: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,43:0.74: 0.62:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,37:0.65: 0.50:1.000:0.829 0/1/1/1:4:32,45:0.63: 1.46:1.000:0.571 0/0/1/1:4:39,30:0.48: 0.98:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,35:0.65: 0.32:1.000:0.802 0/1/1/1:4:14,44:0.80: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,34:0.68: 0.08:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:10,24:0.76:-1.11:1.000:0.614 0/1/1/1:4:18,27:0.65:-0.45:1.000:0.767 0/0/1/1:4:42,32:0.48: 1.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,58:0.76: 1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,35:0.56: 0.86:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,39:0.59: 1.10:1.000:0.845 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,17:0.38: 0.14:1.000:0.600 0/1/1/1:4:28,39:0.63: 0.86:0.936:0.538 0/0/1/1:4:25,11:0.38:-0.99:1.000:0.565 0/1/1/1:4:25,51:0.72: 1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,20:0.62:-1.05:0.999:0.612 0/1/1/1:4:33,47:0.63: 1.64:1.000:0.614 0/0/1/1:4:28,30:0.56: 0.32:1.000:0.969 0/0/1/1:4:29,20:0.46:-0.22:1.000:0.986 0/0/1/1:4:26,30:0.58: 0.20:1.000:0.920 0/0/1/1:4:44,25:0.42: 0.98:1.000:0.926 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.49: 1.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,19:0.53:-0.81:0.989:0.993 0/0/1/1:4:36,20:0.42: 0.20:1.000:0.911 0/0/1/1:4:44,30:0.46: 1.28:1.000:0.985 0/1/1/1:4:12,33:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,31:0.67:-0.16:1.000:0.916 0/0/1/1:4:60,39:0.45: 2.77:1.000:0.977 0/1/1/1:4:22,36:0.67: 0.32:1.000:0.919 0/0/0/1:4:32,10:0.33:-0.63:1.000:0.929 0/1/1/1:4:19,30:0.66:-0.22:1.000:0.872 0/0/1/1:4:26,31:0.59: 0.26:1.000:0.881 0/0/1/1:4:12,16:0.62:-1.47:1.000:0.612 1/1/1/1:4:0,54:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,47:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,27:0.47: 0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:43,17:0.36: 0.44:1.000:0.657 0/0/1/1:4:18,15:0.49:-1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,33:0.67: 0.02:1.000:0.927 0/0/1/1:4:47,28:0.43: 1.34:1.000:0.950 0/0/1/1:4:50,34:0.46: 1.88:1.000:0.985 0/1/1/1:4:10,23:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,19:0.34: 1.40:1.000:0.886 0/0/0/1:4:28,11:0.36:-0.81:1.000:0.669 0/1/1/1/1:5:21,51:0.76: 1.16:0.679:0.958 0/0/1/1:4:19,22:0.58:-0.69:1.000:0.917 0/0/1/1:4:20,26:0.61:-0.39:1.000:0.691 0/0/1/1:4:43,23:0.41: 0.80:1.000:0.879 0/1/1/1:4:15,47:0.80: 0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,33:0.71:-0.16:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,43:0.98:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,44:0.50: 2.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,26:0.45: 0.74:0.999:0.982 0/1/1/1:4:14,30:0.74:-0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:26,20:0.48:-0.39:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,21:0.47:-0.16:1.000:0.991 0/1/1/1:4:14,37:0.77:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,12:0.37:-0.69:1.000:0.566 0/0/1/1:4:36,22:0.44: 0.32:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,42:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,32:0.69:-0.16:1.000:0.974 0/0/1/1:4:28,28:0.54: 0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:45,31:0.46: 1.40:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,24:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,29:0.77:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,11:0.32:-0.22:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,23:0.71:-1.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,18:0.53:-0.93:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,33:0.65: 0.14:1.000:0.767 0/0/1/1:4:30,31:0.55: 0.50:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,30:0.53: 0.50:1.000:0.992 0/1/1/1:4:16,25:0.66:-0.69:1.000:0.855 0/0/1/1:4:12,14:0.58:-1.59:1.000:0.909 0/0/1/1:4:20,24:0.59:-0.51:1.000:0.871 0/0/1/1:4:26,29:0.57: 0.14:1.000:0.948 0/1/1/1:4:20,48:0.76: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,34:0.72:-0.10:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,33:0.60: 0.38:1.000:0.757 0/1/1/1:4:16,51:0.80: 0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,31:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,25:0.73:-0.93:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,33:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,33:0.64: 0.20:1.000:0.638 0/1/1/1:4:17,42:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,48:0.75: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,18:0.44:-0.34:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,30:0.51: 0.62:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,57:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,30:0.74:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:37,13:0.34:-0.16:1.000:0.836 0/0/1/1:4:29,26:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,46:0.82: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,37:0.56: 1.10:1.000:0.962 0/1/1/1:4:12,28:0.75:-0.75:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,34:0.75:-0.22:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,32:0.78:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,17:0.71:-1.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,28:0.59:-0.10:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,50:0.79: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,49:0.72: 1.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,46:0.78: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,25:0.45: 0.56:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,30:0.57: 0.26:0.999:0.951 0/0/0/1:4:32,13:0.37:-0.45:1.000:0.604 0/1/1/1:4:21,42:0.72: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,15:0.38:-0.22:1.000:0.571 0/0/1/1:4:18,24:0.62:-0.63:1.000:0.612 -chr7.1 84062273 chr7.1_084062273 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:24,44:0.58: 1.84:1.000:0.913 0/0/1/1:4:19,19:0.43:-0.19:1.000:0.932 0/0/1/1:4:19,34:0.57: 0.83:1.000:0.934 0/1/1/1:4:12,27:0.63:-0.12:1.000:0.540 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,14:0.18: 1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,12:0.53:-1.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:43,22:0.26: 1.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,8:0.15: 0.01:1.000:0.982 0/0/1/1:4:2,3:0.53:-2.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,5:0.65:-2.29:1.000:0.806 0/1/1/1:4:9,33:0.73: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,17:0.32: 0.08:1.000:0.939 0/0/1/1:4:18,34:0.59: 0.76:1.000:0.879 0/1/1/1:4:6,32:0.78:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,17:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.56:0.995:1.000 0/0/0/1:4:25,16:0.31: 0.01:1.000:0.974 0/0/1/1:4:19,20:0.44:-0.12:1.000:0.965 0/0/1/1:4:24,46:0.59: 1.98:1.000:0.858 0/0/0/1:4:3,1:0.19:-2.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.40:-0.19:1.000:0.767 0/1/1/1:4:8,32:0.74:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,15:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.19:-2.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,10:0.15: 0.69:1.000:0.984 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.44:-0.67:1.000:0.970 0/1/1/1:4:9,37:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,32:0.43: 1.51:1.000:0.955 0/0/1/1:4:26,43:0.55: 1.91:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,3:0.93:-2.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:8,5:0.30:-1.89:1.000:0.981 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,22:0.34: 0.83:1.000:0.893 0/0/0/1:4:39,22:0.28: 1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,22:0.46: 0.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:47,20:0.22: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,21:0.37: 0.42:1.000:0.574 0/0/0/1:4:29,12:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,36:0.64: 0.69:1.000:0.719 0/0/0/1:4:28,14:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,17:0.26: 0.56:1.000:0.998 0/1/1:3:14,45:0.70: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.72:-2.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,12:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,10:0.56:-1.68:1.000:0.972 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,36:0.50: 1.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,10:0.18: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,14:0.18: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,14:0.19: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,6:0.16:-0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,23:0.41: 0.42:1.000:0.886 0/0/0/1/1/1:6:15,19:0.49:-0.46:1.000:0.879 0/0/1/1:4:16,33:0.61: 0.56:1.000:0.710 0/0/0/1:4:25,12:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,23:0.40: 0.49:1.000:0.817 0/1/1/1:4:10,24:0.64:-0.46:1.000:0.719 0/0/1/1:4:27,38:0.51: 1.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.20:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,29:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,33:0.79:-0.12:0.936:1.000 0/0/1/1:4:8,16:0.60:-1.14:1.000:0.782 0/0/0/1:4:27,16:0.29: 0.15:1.000:0.991 0/1/1/1:4:5,13:0.66:-1.55:0.999:0.869 0/0/1/1:4:13,15:0.46:-0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,36:0.50: 1.51:1.000:0.997 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,11:0.30:-0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:26,38:0.52: 1.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,35:0.47: 1.57:1.000:0.994 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.45: 0.08:0.989:0.980 0/0/0/1:4:25,15:0.29:-0.05:1.000:0.990 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,17:0.26: 0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,23:0.68:-0.67:1.000:0.956 0/0/0/0:4:43,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,17:0.37:-0.19:1.000:0.567 0/0/0/1:4:23,12:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,27:0.45: 0.76:1.000:0.975 0/0/0/1:4:29,11:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,34:0.56: 0.90:1.000:0.964 0/0/0/1:4:33,20:0.30: 0.83:1.000:0.988 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,22:0.43: 0.22:1.000:0.932 0/0/1/1:4:25,23:0.40: 0.49:1.000:0.817 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,16:0.37:-0.33:1.000:0.607 0/0/1/1:4:11,15:0.51:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:23,26:0.46: 0.56:0.679:0.847 0/0/1/1:4:17,26:0.54: 0.15:1.000:0.990 0/0/1/1:4:17,18:0.44:-0.39:1.000:0.967 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.40:-0.19:1.000:0.767 0/1/1/1:4:13,43:0.71: 1.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:21,27:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,24:0.60:-0.33:1.000:0.782 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.12:0.999:1.000 0/0/0/1:4:33,21:0.31: 0.90:1.000:0.976 0/0/1/1:4:16,15:0.41:-0.67:1.000:0.852 0/0/1/1:4:30,42:0.51: 2.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:11,4:0.20:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,16:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,16:0.41:-0.53:1.000:0.858 0/0/1/1:4:13,14:0.44:-0.94:1.000:0.974 0/0/0/1:4:21,13:0.30:-0.46:1.000:0.984 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,18:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,29:0.61: 0.15:1.000:0.699 0/0/1/1:4:14,12:0.38:-1.00:1.000:0.628 0/0/1/1:4:18,38:0.61: 1.03:1.000:0.649 0/0/1/1:4:16,16:0.43:-0.60:1.000:0.932 0/0/0/1:4:23,11:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,29:0.66:-0.05:1.000:0.887 0/0/1/1:4:22,40:0.58: 1.44:1.000:0.921 0/0/0/1:4:43,17:0.21: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,19:0.67:-1.00:1.000:0.917 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,14:0.36:-0.60:1.000:0.696 0/0/0/1:4:26,19:0.34: 0.28:1.000:0.846 0/0/0/1:4:43,12:0.16: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,43:0.58: 1.71:1.000:0.892 0/0/1/1:4:26,22:0.38: 0.49:1.000:0.586 0/0/0/1:4:29,23:0.36: 0.76:1.000:0.635 0/0/0/1:4:24,12:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,46:0.75: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,41:0.50: 2.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,32:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,18:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:44,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,20:0.30: 0.83:1.000:0.988 0/0/1/1:4:27,26:0.42: 0.83:1.000:0.892 0/0/0/1:4:33,18:0.27: 0.69:1.000:0.998 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,10:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,19:0.28: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,16:0.31: 0.01:1.000:0.974 0/0/1/1:4:30,44:0.52: 2.25:1.000:0.994 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,13:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,17:0.29: 0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,17:0.40:-0.33:1.000:0.753 0/1/1/1:4:14,36:0.66: 0.62:1.000:0.853 0/0/0/1:4:30,10:0.19:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,30:0.49: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,26:0.54: 0.15:1.000:0.990 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,27:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:36,18:0.25: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,32:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,38:0.63: 0.96:1.000:0.520 0/0/0/1:4:26,21:0.37: 0.42:1.000:0.574 0/0/0/1:4:21,10:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,18:0.23: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,17:0.40:-0.33:1.000:0.753 0/1/1/1:4:15,40:0.67: 0.96:1.000:0.900 0/0/0/1:4:41,11:0.16: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:32,18:0.28: 0.62:0.999:0.996 0/0/0/1:4:29,17:0.29: 0.35:1.000:0.993 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.51:-1.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,11:0.30:-0.80:1.000:0.987 -chr7.1 84445319 chr7.1_084445319 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:101,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.94:0.995:. ./.:4:44,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:171,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:157,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.35:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.25:1.000:. ./.:3:93,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.30:1.000:. ./.:6:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:0.936:. ./.:4:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.50:0.999:. ./.:4:18,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:106,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.83:0.989:. ./.:4:91,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:145,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.10:1.000:. ./.:5:59,0:.:-0.71:0.679:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:0.999:. ./.:4:91,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.39:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:81,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:102,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.58:0.999:. ./.:4:106,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.77:1.000:. -chr7.1 84738912 chr7.1_084738912 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:35,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:62,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:0.995:. ./.:4:74,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:112,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:60,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.93:1.000:. ./.:3:5,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:22,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:73,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.10:1.000:. ./.:3:86,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.66:1.000:. ./.:6:74,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.44:0.936:. ./.:4:83,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:0.999:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:0.989:. ./.:4:64,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:5:77,0:.: 1.16:0.679:. ./.:4:74,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.53:0.999:. ./.:4:57,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:74,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:98,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:52,1:.: 0.15:0.999:. ./.:4:79,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.57:1.000:. -chr7.1 84780404 chr7.1_084780404 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:73,21:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,14:0.30:-1.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:35,28:0.44:-0.61:1.000:0.962 0/0/0/1:4:36,12:0.25:-1.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,18:0.19: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,11:0.22:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,7:0.27:-1.75:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,12:0.28:-1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,25:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,33:0.32: 0.60:1.000:0.952 0/0/1/1:4:24,20:0.45:-1.20:1.000:0.976 0/0/1/1:4:30,37:0.54:-0.48:1.000:0.990 0/0/0/1:4:44,17:0.28:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,16:0.31:-0.98:1.000:0.972 0/0/1/1:4:18,22:0.53:-1.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:59,19:0.24:-0.14:0.995:1.000 0/1/1/1:4:11,47:0.75:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,18:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,24:0.20: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,14:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,15:0.19:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,38:0.68:-0.95:1.000:0.962 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 2.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,34:0.48:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/0:4:27,1:0.04:-1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,25:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:81,9:0.10: 0.23:1.000:0.801 0/0/0/1:4:30,9:0.23:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,13:0.29:-1.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:23,14:0.37:-1.41:1.000:0.519 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,28:0.27: 0.67:1.000:0.998 0/0/0:3:30,0:0.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,9:0.24:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,29:0.58:-1.07:1.000:0.921 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,15:0.14: 0.73:1.000:0.972 0/0/0/1:4:48,13:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,52:0.48: 0.76:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,20:0.26:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,18:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,43:0.39: 0.82:1.000:0.678 0/0/1/1:4:68,72:0.50: 1.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,54:0.45: 1.13:1.000:0.975 0/1/1:3:34,52:0.58: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:127,129:0.49: 5.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,54:0.53: 0.48:1.000:0.991 0/0/0/1:4:110,32:0.23: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,21:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,65:0.50: 1.35:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,23:0.23: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,9:0.15:-0.70:1.000:0.988 0/0/1/1:4:51,68:0.55: 1.13:1.000:0.979 0/0/1/1:4:44,38:0.46:-0.02:1.000:0.984 0/0/0/1:4:133,50:0.27: 3.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,29:0.24: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:80,32:0.28: 0.91:1.000:0.793 0/0/0/1:4:77,24:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,25:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,35:0.28: 1.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,31:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,18:0.17: 0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:94,19:0.17: 0.95:1.000:0.998 0/0/0/1:4:41,21:0.34:-0.64:1.000:0.896 0/0/1/1:4:37,39:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,28:0.25: 0.85:0.936:0.999 0/0/0/1:4:48,13:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00: 2.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,51:0.41: 1.26:0.999:0.853 0/0/0/1:4:107,35:0.25: 1.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,45:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/0:4:101,1:0.01: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,31:0.32: 0.45:1.000:0.961 0/0/0/1:4:67,26:0.28: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,22:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,31:0.24: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,34:0.28: 1.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,19:0.22: 0.11:0.989:1.000 0/0/1/1:4:61,56:0.47: 1.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:64,31:0.32: 0.39:1.000:0.944 0/0/1/1:4:30,27:0.46:-0.79:1.000:0.990 0/0/0/1:4:83,36:0.30: 1.13:1.000:0.985 0/0/0/1:4:102,36:0.26: 1.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,19:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,43:0.45: 0.36:1.000:0.979 0/0/1/1:4:42,46:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,19:0.26:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,42:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,19:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,30:0.22: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,12:0.26:-1.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,47:0.48: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,31:0.34: 0.23:1.000:0.864 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,40:0.25: 2.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,21:0.30:-0.42:1.000:0.983 0/0/0/1:4:60,26:0.30: 0.11:1.000:0.985 0/0/0/1:4:72,28:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,42:0.63:-0.61:1.000:0.567 0/0/0/0/1:5:101,39:0.28: 1.78:0.679:0.758 0/0/1/1:4:58,60:0.50: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,52:0.53: 0.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:77,27:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,27:0.33:-0.08:1.000:0.902 0/0/0/1:4:59,15:0.20:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,25:0.23: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,27:0.46:-0.76:1.000:0.986 0/0/0/1:4:72,17:0.19: 0.20:0.999:1.000 0/0/1/1:4:35,54:0.58: 0.20:1.000:0.912 0/0/1/1:4:38,44:0.52:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:73,29:0.28: 0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,18:0.22: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,26:0.28: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,41:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,37:0.46:-0.11:1.000:0.987 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,32:0.27: 1.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,21:0.42:-1.04:1.000:0.920 0/0/0/1:4:72,25:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,22:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,20:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,33:0.48:-0.45:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,19:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,28:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,25:0.51:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,11:0.21:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,14:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.35:-0.30:1.000:0.774 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,23:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,52:0.52: 0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:53,28:0.34:-0.05:1.000:0.856 0/0/1/1:4:42,34:0.44:-0.20:1.000:0.967 0/0/1/1:4:44,41:0.47: 0.08:1.000:0.993 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,47:0.58:-0.17:1.000:0.899 0/0/0/1:4:54,28:0.34:-0.02:1.000:0.882 0/0/0/1:4:46,22:0.32:-0.45:1.000:0.952 0/0/0/1:4:50,13:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,15:0.19:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,14:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,22:0.48:-1.16:1.000:0.995 0/0/0/0:4:152,0:0.00: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,36:0.45:-0.14:1.000:0.983 0/0/0/1:4:70,16:0.19: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,10:0.16:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,39:0.48:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,21:0.33:-0.58:1.000:0.939 0/0/1/1:4:44,27:0.38:-0.36:1.000:0.506 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,30:0.51:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,20:0.47:-1.26:1.000:0.991 0/0/1/1:4:28,25:0.46:-0.92:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,25:0.46:-0.92:1.000:0.989 0/0/0/1:4:39,9:0.19:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,29:0.60:-1.13:1.000:0.790 0/0/1/1:4:30,30:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:35,16:0.31:-0.98:1.000:0.972 0/0/0/1:4:43,25:0.36:-0.45:1.000:0.652 0/0/0/1:4:35,11:0.24:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,16:0.38:-1.29:1.000:0.630 0/0/1/1:4:35,41:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:31,14:0.31:-1.16:1.000:0.975 0/0/0/1:4:41,19:0.31:-0.70:1.000:0.967 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,25:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,33:0.61:-0.98:1.000:0.645 0/0/0/1:4:43,14:0.25:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,26:0.47:-0.89:0.999:0.993 0/0/1/1:4:31,41:0.55:-0.33:1.000:0.980 0/0/0/1:4:44,11:0.20:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,34:0.58:-0.82:1.000:0.911 0/0/0/1:4:45,15:0.25:-0.70:1.000:0.999 -chr7.1 84905743 chr7.1_084905743 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:641,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:543,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:729,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:588,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:825,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:908,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:476,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:757,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:711,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:406,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:403,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:636,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:754,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:696,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:559,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:857,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:862,0:.: 0.84:0.995:. ./.:4:776,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:776,2:.: 0.36:1.000:. ./.:4:795,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:297,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:726,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:663,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:926,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:173,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:796,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:614,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:684,2:.:-0.18:1.000:. ./.:4:761,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:816,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:682,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:567,1:.:-0.86:1.000:. ./.:4:130,0:.:-3.38:1.000:. ./.:4:357,0:.:-2.07:1.000:. ./.:3:125,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:615,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:747,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:613,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:777,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:750,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:808,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:689,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:924,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:702,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1113,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:802,0:.: 0.49:1.000:. ./.:3:891,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:1574,0:.: 4.94:1.000:. ./.:4:666,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:668,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:614,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:743,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:709,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:834,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:692,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:849,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:735,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:644,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:637,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:662,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:764,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:663,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:1019,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:746,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:678,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:770,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:659,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:692,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:645,0:.:-0.41:0.936:. ./.:4:501,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:795,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:764,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:718,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:810,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:663,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:750,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:745,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:701,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:610,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:889,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:522,0:.:-1.12:0.989:. ./.:4:862,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:1079,1:.: 2.10:1.000:. ./.:4:666,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:698,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:883,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:619,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:755,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:850,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:548,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:732,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:555,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:915,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:531,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:718,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:863,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:609,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:583,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:945,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:814,1:.: 0.57:1.000:. ./.:4:740,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:872,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:696,1:.:-0.11:1.000:. ./.:5:1030,0:.: 1.81:0.679:. ./.:4:717,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:744,2:.: 0.17:1.000:. ./.:4:760,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:619,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:747,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:631,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:577,1:.:-0.80:1.000:. ./.:4:941,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:851,0:.: 0.78:0.999:. ./.:4:926,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:676,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:735,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:824,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:770,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:662,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:809,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:775,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:592,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:787,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:819,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:655,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:705,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:657,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:572,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:698,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:532,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:623,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:782,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:420,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:658,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:559,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:1006,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:646,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:874,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:733,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:774,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:861,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:831,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:574,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:561,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:805,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:856,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:596,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:686,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:995,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:561,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:956,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:765,2:.: 0.29:1.000:. ./.:4:240,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:478,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:850,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:841,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:951,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:900,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:508,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:844,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:589,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:640,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:735,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:776,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:870,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:812,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:762,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:676,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:644,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:643,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:607,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:547,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:719,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:567,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:578,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:466,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:932,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:761,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:778,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:557,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:837,2:.: 0.71:0.999:. ./.:4:1086,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:934,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:708,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:569,0:.:-0.85:1.000:. -chr7.1 85143836 chr7.1_085143836 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:92,91:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,149:.:-0.10:1.000:. ./.:4:96,113:.: 0.28:1.000:. ./.:4:74,121:.: 0.05:1.000:. ./.:4:126,83:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,160:.: 1.37:1.000:. ./.:4:58,70:.:-1.05:1.000:. ./.:4:110,118:.: 0.59:1.000:. ./.:4:60,135:.: 0.05:1.000:. ./.:4:34,24:.:-2.21:1.000:. ./.:4:37,33:.:-2.01:1.000:. ./.:4:30,134:.:-0.46:1.000:. ./.:4:81,84:.:-0.44:1.000:. ./.:4:62,140:.: 0.16:1.000:. ./.:4:110,152:.: 1.15:1.000:. ./.:4:106,192:.: 1.74:1.000:. ./.:4:136,163:.: 1.76:0.995:. ./.:4:99,135:.: 0.69:1.000:. ./.:4:123,155:.: 1.42:1.000:. ./.:4:86,123:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,43:.:-1.94:1.000:. ./.:4:98,66:.:-0.46:1.000:. ./.:4:82,92:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,97:.:-0.30:1.000:. ./.:4:20,23:.:-2.45:1.000:. ./.:4:103,233:.: 2.37:1.000:. ./.:4:118,138:.: 1.05:1.000:. ./.:4:91,97:.:-0.07:1.000:. ./.:4:84,82:.:-0.43:1.000:. ./.:4:100,140:.: 0.79:1.000:. ./.:4:90,220:.: 1.94:1.000:. ./.:4:105,128:.: 0.67:1.000:. ./.:4:29,26:.:-2.25:1.000:. ./.:4:18,41:.:-2.19:1.000:. ./.:3:14,15:.:-2.68:1.000:. ./.:4:101,119:.: 0.46:1.000:. ./.:4:77,204:.: 1.46:1.000:. ./.:4:81,101:.:-0.16:1.000:. ./.:4:142,165:.: 1.89:1.000:. ./.:4:93,190:.: 1.50:1.000:. ./.:4:74,132:.: 0.23:1.000:. ./.:4:130,131:.: 1.14:1.000:. ./.:4:175,127:.: 1.81:1.000:. ./.:4:111,116:.: 0.58:1.000:. ./.:4:79,127:.: 0.23:1.000:. ./.:4:66,137:.: 0.18:1.000:. ./.:3:71,70:.:-0.84:1.000:. ./.:4:216,135:.: 2.62:1.000:. ./.:4:114,113:.: 0.58:1.000:. ./.:4:159,124:.: 1.50:1.000:. ./.:4:84,91:.:-0.28:1.000:. ./.:4:98,188:.: 1.55:1.000:. ./.:4:92,94:.:-0.10:1.000:. ./.:4:121,92:.: 0.35:1.000:. ./.:4:110,78:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,200:.: 1.70:1.000:. ./.:4:95,107:.: 0.16:1.000:. ./.:4:152,157:.: 1.93:1.000:. ./.:4:65,131:.: 0.07:1.000:. ./.:6:64,85:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,101:.:-0.49:1.000:. ./.:4:142,132:.: 1.35:1.000:. ./.:4:158,133:.: 1.63:1.000:. ./.:4:139,117:.: 1.05:1.000:. ./.:4:63,101:.:-0.46:1.000:. ./.:4:165,131:.: 1.71:1.000:. ./.:4:27,71:.:-1.55:1.000:. ./.:4:72,105:.:-0.25:1.000:. ./.:4:109,100:.: 0.28:0.936:. ./.:4:61,105:.:-0.43:1.000:. ./.:4:180,96:.: 1.38:1.000:. ./.:4:56,94:.:-0.69:0.999:. ./.:4:160,161:.: 2.12:1.000:. ./.:4:102,128:.: 0.63:1.000:. ./.:4:65,128:.: 0.02:1.000:. ./.:4:105,135:.: 0.79:1.000:. ./.:4:112,129:.: 0.81:1.000:. ./.:4:87,74:.:-0.51:1.000:. ./.:4:104,120:.: 0.53:1.000:. ./.:4:110,124:.: 0.69:1.000:. ./.:4:48,101:.:-0.71:0.989:. ./.:4:67,132:.: 0.12:1.000:. ./.:4:112,69:.:-0.18:1.000:. ./.:4:62,115:.:-0.25:1.000:. ./.:4:119,135:.: 1.02:1.000:. ./.:4:94,93:.:-0.08:1.000:. ./.:4:73,71:.:-0.79:1.000:. ./.:4:74,82:.:-0.59:1.000:. ./.:4:63,121:.:-0.13:1.000:. ./.:4:116,103:.: 0.44:1.000:. ./.:4:52,113:.:-0.44:1.000:. ./.:4:55,135:.:-0.03:1.000:. ./.:4:113,129:.: 0.82:1.000:. ./.:4:124,78:.: 0.16:1.000:. ./.:4:92,76:.:-0.40:1.000:. ./.:4:119,137:.: 1.05:1.000:. ./.:4:55,53:.:-1.38:1.000:. ./.:4:79,93:.:-0.33:1.000:. ./.:4:79,102:.:-0.18:1.000:. ./.:4:87,116:.: 0.18:1.000:. ./.:4:48,60:.:-1.38:1.000:. ./.:4:84,127:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,35:.:-1.91:1.000:. ./.:5:58,93:.:-0.67:0.679:. ./.:4:65,103:.:-0.40:1.000:. ./.:4:94,129:.: 0.51:1.000:. ./.:4:96,106:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:88,131:.: 0.44:1.000:. ./.:4:61,115:.:-0.26:1.000:. ./.:4:70,81:.:-0.67:1.000:. ./.:4:205,152:.: 2.72:1.000:. ./.:4:60,59:.:-1.20:0.999:. ./.:4:58,109:.:-0.41:1.000:. ./.:4:31,75:.:-1.42:1.000:. ./.:4:78,104:.:-0.16:1.000:. ./.:4:82,90:.:-0.33:1.000:. ./.:4:135,93:.: 0.59:1.000:. ./.:4:83,87:.:-0.36:1.000:. ./.:4:77,84:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,104:.: 0.25:1.000:. ./.:4:82,87:.:-0.38:1.000:. ./.:4:83,83:.:-0.43:1.000:. ./.:4:98,124:.: 0.49:1.000:. ./.:4:96,92:.:-0.07:1.000:. ./.:4:123,67:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,72:.:-1.04:1.000:. ./.:4:57,109:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,51:.:-1.53:1.000:. ./.:4:70,72:.:-0.82:1.000:. ./.:4:59,125:.:-0.13:1.000:. ./.:4:53,130:.:-0.15:1.000:. ./.:4:50,40:.:-1.68:1.000:. ./.:4:88,81:.:-0.38:1.000:. ./.:4:65,50:.:-1.27:1.000:. ./.:4:107,107:.: 0.36:1.000:. ./.:4:100,106:.: 0.23:1.000:. ./.:4:76,50:.:-1.09:1.000:. ./.:4:52,54:.:-1.42:1.000:. ./.:4:61,76:.:-0.91:1.000:. ./.:4:70,124:.: 0.03:1.000:. ./.:4:70,73:.:-0.81:1.000:. ./.:4:58,66:.:-1.12:1.000:. ./.:4:86,43:.:-1.04:1.000:. ./.:4:65,129:.: 0.03:1.000:. ./.:4:79,168:.: 0.91:1.000:. ./.:4:72,88:.:-0.53:1.000:. ./.:4:91,113:.: 0.20:1.000:. ./.:4:109,138:.: 0.91:1.000:. ./.:4:68,126:.: 0.03:1.000:. ./.:4:138,91:.: 0.61:1.000:. ./.:4:53,132:.:-0.12:1.000:. ./.:4:35,16:.:-2.32:1.000:. ./.:4:33,38:.:-1.99:1.000:. ./.:4:63,165:.: 0.59:1.000:. ./.:4:80,99:.:-0.21:1.000:. ./.:4:93,109:.: 0.16:1.000:. ./.:4:94,105:.: 0.12:1.000:. ./.:4:53,84:.:-0.91:1.000:. ./.:4:97,127:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,97:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,177:.: 0.71:1.000:. ./.:4:97,129:.: 0.56:1.000:. ./.:4:89,93:.:-0.16:1.000:. ./.:4:85,97:.:-0.16:1.000:. ./.:4:124,96:.: 0.46:1.000:. ./.:4:81,86:.:-0.41:1.000:. ./.:4:36,88:.:-1.12:1.000:. ./.:4:80,74:.:-0.63:1.000:. ./.:4:30,83:.:-1.30:1.000:. ./.:4:58,80:.:-0.89:1.000:. ./.:4:51,146:.: 0.08:1.000:. ./.:4:88,96:.:-0.13:1.000:. ./.:4:58,117:.:-0.28:1.000:. ./.:4:72,145:.: 0.41:1.000:. ./.:4:87,60:.:-0.74:1.000:. ./.:4:136,156:.: 1.65:1.000:. ./.:4:87,102:.:-0.05:1.000:. ./.:4:101,157:.: 1.09:1.000:. ./.:4:46,105:.:-0.67:1.000:. ./.:4:56,133:.:-0.05:0.999:. ./.:4:113,134:.: 0.91:1.000:. ./.:4:76,91:.:-0.41:1.000:. ./.:4:93,90:.:-0.15:1.000:. ./.:4:70,123:.: 0.02:1.000:. -chr7.1 85409268 chr7.1_085409268 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,109:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,124:.:-0.91:1.000:. ./.:4:48,125:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,111:.:-1.24:1.000:. ./.:4:42,157:.: 0.94:1.000:. ./.:4:51,125:.: 0.37:1.000:. ./.:4:16,67:.:-1.93:1.000:. ./.:4:24,129:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,118:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,67:.:-2.33:1.000:. ./.:4:12,34:.:-2.85:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,119:.:-1.04:1.000:. ./.:4:51,120:.: 0.25:0.995:. ./.:4:0,171:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.20:1.000:. ./.:4:55,135:.: 0.72:1.000:. ./.:4:22,56:.:-2.05:1.000:. ./.:4:48,112:.:-0.02:1.000:. ./.:4:45,135:.: 0.47:1.000:. ./.:4:32,100:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,23:.:-3.22:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,84:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,222:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.17:1.000:. ./.:4:35,102:.:-0.59:1.000:. ./.:4:6,27:.:-3.17:1.000:. ./.:4:0,58:.:-2.55:1.000:. ./.:3:0,23:.:-3.42:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.05:1.000:. ./.:4:41,116:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,169:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,193:.: 0.80:1.000:. ./.:4:45,150:.: 0.85:1.000:. ./.:4:33,97:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.67:1.000:. ./.:3:1,195:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,31:.:-3.22:1.000:. ./.:4:39,110:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,110:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,205:.: 1.09:1.000:. ./.:4:52,147:.: 0.94:1.000:. ./.:4:45,148:.: 0.80:1.000:. ./.:4:43,109:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,177:.: 0.40:1.000:. ./.:4:47,119:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.65:1.000:. ./.:6:13,171:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,216:.: 1.37:1.000:. ./.:4:33,105:.:-0.57:1.000:. ./.:4:57,184:.: 1.98:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.35:1.000:. ./.:4:44,130:.: 0.32:1.000:. ./.:4:45,133:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.60:0.936:. ./.:4:0,148:.:-0.32:1.000:. ./.:4:57,161:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.12:0.999:. ./.:4:93,91:.: 0.57:1.000:. ./.:4:47,148:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.32:1.000:. ./.:4:47,131:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.39:1.000:. ./.:4:55,149:.: 1.07:1.000:. ./.:4:54,158:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.98:1.000:. ./.:4:41,121:.: 0.03:0.989:. ./.:4:0,192:.: 0.77:1.000:. ./.:4:58,152:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.44:1.000:. ./.:4:57,163:.: 1.46:1.000:. ./.:4:33,121:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,158:.: 1.54:1.000:. ./.:4:19,82:.:-1.48:1.000:. ./.:4:69,176:.: 2.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,147:.: 1.09:1.000:. ./.:4:101,101:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.12:1.000:. ./.:4:26,103:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.30:1.000:. ./.:5:35,199:.: 1.81:0.679:. ./.:4:0,160:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,176:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.18:1.000:. ./.:4:56,118:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,229:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,166:.: 0.13:1.000:. ./.:4:47,148:.: 0.85:1.000:. ./.:4:53,141:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,235:.: 1.84:0.999:. ./.:4:0,210:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.69:1.000:. ./.:4:43,154:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.08:1.000:. ./.:4:39,101:.:-0.52:1.000:. ./.:4:37,126:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,142:.: 0.57:1.000:. ./.:4:70,146:.: 1.37:1.000:. ./.:4:41,96:.:-0.59:1.000:. ./.:4:43,131:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,139:.: 0.89:1.000:. ./.:4:38,136:.: 0.32:1.000:. ./.:4:35,105:.:-0.52:1.000:. ./.:4:32,116:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,155:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,109:.:-1.29:1.000:. ./.:4:24,100:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.87:1.000:. ./.:4:46,118:.: 0.08:1.000:. ./.:4:48,136:.: 0.57:1.000:. ./.:4:36,140:.: 0.37:1.000:. ./.:4:41,162:.: 1.04:1.000:. ./.:4:44,165:.: 1.19:1.000:. ./.:4:36,152:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.69:1.000:. ./.:4:22,104:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,236:.: 1.86:1.000:. ./.:4:45,116:.: 0.00:1.000:. ./.:4:37,123:.:-0.02:1.000:. ./.:4:42,111:.:-0.20:1.000:. ./.:4:45,96:.:-0.49:1.000:. ./.:4:48,142:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.02:1.000:. ./.:4:11,40:.:-2.72:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,150:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,117:.:-0.02:1.000:. ./.:4:45,135:.: 0.47:1.000:. ./.:4:1,181:.: 0.52:1.000:. ./.:4:41,91:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.12:1.000:. ./.:4:33,110:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,110:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.52:1.000:. ./.:4:28,74:.:-1.46:1.000:. ./.:4:30,116:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,121:.: 0.10:1.000:. ./.:4:73,73:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.57:1.000:. ./.:4:23,77:.:-1.51:1.000:. ./.:4:28,89:.:-1.09:1.000:. ./.:4:35,119:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.52:1.000:. ./.:4:30,95:.:-0.89:1.000:. ./.:4:39,142:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,175:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,135:.:-0.24:1.000:. ./.:4:0,153:.:-0.20:0.999:. ./.:4:0,168:.: 0.18:1.000:. ./.:4:54,118:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,115:.:-1.14:1.000:. ./.:4:31,120:.:-0.24:1.000:. -chr7.1 85701790 chr7.1_085701790 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:490,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:535,2:.: 1.61:1.000:. ./.:4:534,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:390,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:135,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:163,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:369,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:453,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:412,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.70:0.995:. ./.:4:430,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:508,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:141,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:503,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:124,0:.:-3.20:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:389,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:505,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:453,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:505,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:86,0:.:-3.64:1.000:. ./.:4:160,1:.:-2.77:1.000:. ./.:3:41,0:.:-4.17:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:430,2:.: 0.39:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:448,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:425,1:.: 0.32:1.000:. ./.:3:511,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:148,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:546,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.16:1.000:. ./.:6:328,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:455,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:498,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:302,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.98:0.936:. ./.:4:356,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:296,0:.:-1.19:0.999:. ./.:4:537,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:457,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:400,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.41:0.989:. ./.:4:474,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:445,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:383,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:336,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:378,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:290,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:454,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:469,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.93:1.000:. ./.:5:488,0:.: 1.04:0.679:. ./.:4:385,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:337,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:533,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.11:0.999:. ./.:4:429,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:467,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:366,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:418,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:384,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:285,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:301,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:456,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:395,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:283,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:352,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:345,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:363,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:384,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:308,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:588,1:.: 2.22:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:353,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:399,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:350,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:112,0:.:-3.34:1.000:. ./.:4:335,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:496,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:497,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:470,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:413,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:387,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:313,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:503,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:343,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.30:1.000:. -chr7.1 85943946 chr7.1_085943946 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:117,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.21:0.995:. ./.:4:94,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.91:1.000:. ./.:3:17,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:247,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.73:1.000:. ./.:3:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.58:1.000:. ./.:6:158,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:238,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.06:0.936:. ./.:4:114,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.24:0.989:. ./.:4:228,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:223,1:.: 2.00:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:142,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:234,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.22:1.000:. ./.:5:256,0:.: 2.72:0.679:. ./.:4:159,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.59:0.999:. ./.:4:174,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:142,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.24:1.000:. -chr7.1 86096795 chr7.1_086096795 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,28:0.18: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,36:0.28: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:59,41:0.34: 0.48:1.000:0.857 0/0/1/1:4:36,75:0.62: 0.81:1.000:0.619 0/0/0/1:4:103,48:0.25: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,35:0.24: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,34:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.48:-1.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:17,8:0.25:-1.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,25:0.19: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,60:0.65: 0.03:1.000:0.756 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,44:0.41: 0.24:1.000:0.888 0/0/0/1:4:82,38:0.24: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,42:0.38: 0.30:0.995:0.580 0/1/1/1:4:33,108:0.71: 1.70:1.000:0.990 0/0/0/1:4:103,36:0.20: 1.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,73:0.52: 1.22:1.000:0.994 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,59:0.47: 0.84:1.000:0.991 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,37:0.22: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,63:0.58: 0.42:1.000:0.899 0/0/0/1:4:36,21:0.30:-0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,86:0.48: 2.23:1.000:0.995 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:97,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,14:0.61:-1.87:1.000:0.723 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.11:1.000:1.000 0/0/1:3:7,5:0.35:-2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.28:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:61,39:0.32: 0.48:1.000:0.952 0/0/0/1:4:73,31:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,37:0.29: 0.54:1.000:0.991 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,26:0.37:-0.71:1.000:0.608 0/0/1/1:4:35,57:0.56: 0.24:1.000:0.967 0/0/1/1:4:37,51:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,31:0.31:-0.06:1.000:0.976 0/0/0/1:4:47,29:0.31:-0.24:1.000:0.971 0/0/0/1:4:56,21:0.21:-0.21:1.000:1.000 0/0/1:3:56,64:0.47: 1.07:1.000:0.861 0/0/1/1:4:95,91:0.43: 3.04:1.000:0.935 0/0/0/1:4:50,33:0.33:-0.03:1.000:0.926 0/0/0/1:4:50,29:0.30:-0.15:1.000:0.988 0/0/0/1:4:29,11:0.21:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,28:0.37:-0.59:1.000:0.550 0/0/0/1:4:59,23:0.22:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,69:0.52: 1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:76,38:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,32:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,17:0.25:-0.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:39,15:0.21:-0.89:1.000:0.851 0/0/0/1:4:47,19:0.22:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,52:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,31:0.32:-0.15:1.000:0.945 0/0/0/1:4:47,16:0.20:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,43:0.65:-0.68:1.000:0.746 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,49:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,24:0.25:-0.27:0.936:0.999 0/0/1/1:4:39,53:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,14:0.16:-0.47:1.000:0.995 0/0/0/1:4:30,16:0.28:-1.13:0.999:0.997 0/0/0/1:4:60,37:0.31: 0.39:1.000:0.971 0/0/0/1:4:88,36:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,40:0.42:-0.03:1.000:0.906 0/0/0/1:4:47,23:0.26:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,46:0.52:-0.15:1.000:0.994 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,45:0.53:-0.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:47,14:0.18:-0.68:0.989:0.999 0/0/0/1:4:38,19:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,47:0.56:-0.24:1.000:0.969 0/0/0/1:4:45,25:0.29:-0.41:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,14:0.15:-0.36:1.000:0.988 0/0/0/1:4:63,32:0.26: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,22:0.36:-0.95:1.000:0.737 0/1/1/1:4:16,35:0.63:-0.98:1.000:0.518 0/0/0/1:4:27,14:0.27:-1.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,19:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,23:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,37:0.27: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,41:0.39: 0.18:1.000:0.693 0/0/0/1:4:52,15:0.17:-0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,49:0.63:-0.38:1.000:0.569 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.22:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,30:0.47:-0.80:1.000:0.990 0/1/1/1:4:20,62:0.70:-0.06:1.000:0.981 0/0/0/1:4:26,18:0.34:-1.19:1.000:0.864 0/0/1/1:4:33,48:0.53:-0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:19,32:0.57:-0.98:1.000:0.951 0/0/0/1/1:5:54,32:0.30: 0.06:0.679:0.508 0/0/0/1:4:43,19:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,37:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,53:0.57: 0.00:1.000:0.943 0/0/1/1:4:41,34:0.39:-0.27:1.000:0.666 0/0/0/1:4:91,38:0.23: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,95:0.71: 1.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:31,32:0.45:-0.62:0.999:0.975 0/0/0/1:4:64,26:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,32:0.47:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:30,40:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,39:0.55:-0.59:1.000:0.980 0/0/1/1:4:42,45:0.46: 0.09:1.000:0.985 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,40:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,52:0.28: 1.88:1.000:0.995 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,18:0.18:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,20:0.27:-0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,25:0.50:-1.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,14:0.21:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,51:0.41: 0.69:1.000:0.878 0/0/0/1:4:28,20:0.35:-1.07:1.000:0.802 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,26:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,87:0.53: 1.91:1.000:0.993 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,27:0.58:-1.25:1.000:0.899 0/0/0/1:4:33,15:0.24:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,16:0.30:-1.22:1.000:0.984 0/0/0/1:4:42,19:0.24:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,22:0.30:-0.74:1.000:0.983 0/0/1/1:4:45,51:0.47: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:25,16:0.32:-1.28:1.000:0.951 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,49:0.31: 1.31:1.000:0.969 0/0/0/1:4:84,49:0.30: 1.46:1.000:0.987 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,76:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:98,40:0.22: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,40:0.26: 1.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,45:0.23: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,43:0.28: 1.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:61,48:0.37: 0.75:1.000:0.510 0/0/1/1:4:54,61:0.47: 0.92:1.000:0.992 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,58:0.58: 0.18:1.000:0.892 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,40:0.33: 0.48:1.000:0.916 0/0/1/1:4:51,49:0.43: 0.48:1.000:0.937 0/0/1/1:4:63,69:0.46: 1.43:1.000:0.988 0/0/0/1:4:82,33:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,80:0.49: 1.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:67,33:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,74:0.56: 1.07:1.000:0.971 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,43:0.33: 0.72:1.000:0.924 0/0/0/1:4:67,33:0.26: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,21:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,24:0.29:-0.53:1.000:0.990 0/0/0/1:4:70,34:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,33:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,78:0.50: 1.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,31:0.21: 0.84:0.999:1.000 0/0/1/1:4:81,77:0.42: 2.20:1.000:0.928 0/0/0/1:4:104,60:0.29: 2.38:1.000:0.989 0/1/1/1:4:15,64:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,21:0.15: 0.63:1.000:0.992 -chr7.1 86223603 chr7.1_086223603 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:373,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:381,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:162,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:147,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.28:0.995:. ./.:4:354,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:163,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-3.51:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:90,0:.:-3.58:1.000:. ./.:4:185,0:.:-2.04:1.000:. ./.:3:71,0:.:-3.89:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:455,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.82:1.000:. ./.:3:361,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:101,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.12:1.000:. ./.:6:286,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:410,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:209,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.06:0.936:. ./.:4:293,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.41:0.999:. ./.:4:364,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.35:0.989:. ./.:4:357,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:374,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.96:1.000:. ./.:5:438,0:.: 2.04:0.679:. ./.:4:322,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:421,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:438,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:342,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:246,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:236,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:282,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:399,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:398,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:367,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:130,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:239,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:386,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:241,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:243,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:401,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.06:1.000:. -chr7.1 86433389 chr7.1_086433389 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,51:.: 0.58:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:78,16:.: 0.99:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:61,25:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,43:.: 3.83:1.000:. ./.:4:21,10:.:-1.54:1.000:. ./.:4:56,29:.: 0.62:1.000:. ./.:4:70,28:.: 1.15:1.000:. ./.:4:7,14:.:-1.94:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.82:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:47,24:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:77,29:.: 1.47:0.995:. ./.:4:54,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:66,33:.: 1.19:1.000:. ./.:4:43,60:.: 1.35:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.22:1.000:. ./.:4:40,28:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,39:.: 0.42:1.000:. ./.:4:62,29:.: 0.87:1.000:. ./.:4:7,3:.:-2.38:1.000:. ./.:4:74,27:.: 1.27:1.000:. ./.:4:50,50:.: 1.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:45,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.26:1.000:. ./.:4:77,18:.: 1.03:1.000:. ./.:4:4,5:.:-2.42:1.000:. ./.:4:27,12:.:-1.22:1.000:. ./.:3:8,2:.:-2.38:1.000:. ./.:4:36,16:.:-0.70:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:46,27:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,30:.: 1.07:1.000:. ./.:4:70,29:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:39,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:20,42:.:-0.30:1.000:. ./.:4:64,16:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:68,28:.: 1.07:1.000:. ./.:3:56,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:30,24:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:30,38:.:-0.06:1.000:. ./.:4:71,30:.: 1.27:1.000:. ./.:4:54,17:.: 0.06:1.000:. ./.:4:36,46:.: 0.50:1.000:. ./.:4:16,41:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,26:.: 0.10:1.000:. ./.:4:31,39:.: 0.02:1.000:. ./.:4:30,22:.:-0.70:1.000:. ./.:4:56,21:.: 0.30:1.000:. ./.:6:39,16:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:36,26:.:-0.30:1.000:. ./.:4:63,28:.: 0.87:1.000:. ./.:4:23,20:.:-1.06:1.000:. ./.:4:39,36:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,34:.: 0.42:1.000:. ./.:4:20,13:.:-1.46:1.000:. ./.:4:29,17:.:-0.94:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.10:0.936:. ./.:4:50,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:17,46:.:-0.26:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:15,55:.: 0.02:1.000:. ./.:4:61,74:.: 2.63:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:54,24:.: 0.34:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:31,45:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,35:.: 1.43:1.000:. ./.:4:49,25:.: 0.18:1.000:. ./.:4:11,14:.:-1.78:0.989:. ./.:4:74,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:23,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:27,18:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,39:.: 0.38:1.000:. ./.:4:39,17:.:-0.54:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:30,14:.:-1.02:1.000:. ./.:4:50,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:82,22:.: 1.39:1.000:. ./.:4:24,36:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:43,25:.:-0.06:1.000:. ./.:4:14,39:.:-0.66:1.000:. ./.:4:29,24:.:-0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:24,42:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:22,20:.:-1.10:1.000:. ./.:5:58,24:.: 0.50:0.679:. ./.:4:44,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:48,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,26:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,40:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,32:.: 0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:75,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:59,29:.: 0.74:1.000:. ./.:4:25,22:.:-0.90:0.999:. ./.:4:58,26:.: 0.58:1.000:. ./.:4:33,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:59,26:.: 0.62:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:16,33:.:-0.82:1.000:. ./.:4:45,42:.: 0.70:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.94:1.000:. ./.:4:42,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:42,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:59,19:.: 0.34:1.000:. ./.:4:53,13:.:-0.14:1.000:. ./.:4:67,26:.: 0.95:1.000:. ./.:4:15,52:.:-0.10:1.000:. ./.:4:51,19:.: 0.02:1.000:. ./.:4:22,11:.:-1.46:1.000:. ./.:4:47,22:.:-0.02:1.000:. ./.:4:16,16:.:-1.50:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:42,37:.: 0.38:1.000:. ./.:4:38,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,23:.: 0.18:1.000:. ./.:4:39,52:.: 0.87:1.000:. ./.:4:37,19:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,17:.:-0.70:1.000:. ./.:4:29,40:.:-0.02:1.000:. ./.:4:35,45:.: 0.42:1.000:. ./.:4:26,48:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:19,28:.:-0.90:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:51,48:.: 1.19:1.000:. ./.:4:49,26:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,65:.: 2.11:1.000:. ./.:4:69,17:.: 0.66:1.000:. ./.:4:55,26:.: 0.46:1.000:. ./.:4:85,32:.: 1.91:1.000:. ./.:4:7,10:.:-2.10:1.000:. ./.:4:17,9:.:-1.74:1.000:. ./.:4:97,34:.: 2.47:1.000:. ./.:4:62,51:.: 1.75:1.000:. ./.:4:57,34:.: 0.87:1.000:. ./.:4:56,21:.: 0.30:1.000:. ./.:4:35,24:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:59,16:.: 0.22:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:28,20:.:-0.86:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,35:.: 0.26:1.000:. ./.:4:26,51:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,20:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,48:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,20:.:-0.86:1.000:. ./.:4:42,37:.: 0.38:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:67,25:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,11:.:-0.86:1.000:. ./.:4:59,16:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,35:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,27:.: 0.91:1.000:. ./.:4:39,30:.:-0.02:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:76,37:.: 1.75:1.000:. ./.:4:66,26:.: 0.91:0.999:. ./.:4:51,33:.: 0.58:1.000:. ./.:4:79,47:.: 2.27:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:43,33:.: 0.26:1.000:. -chr7.1 86578737 chr7.1_086578737 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:78,66:0.47: 0.97:1.000:0.993 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,39:0.28: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,32:0.29: 0.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,66:0.52: 0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:107,36:0.27: 0.94:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,19:0.31:-1.56:1.000:0.966 0/0/0/1:4:82,36:0.32: 0.15:1.000:0.947 0/0/0/1:4:102,20:0.18: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:11,3:0.23:-3.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.12:-2.76:1.000:0.848 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,27:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,22:0.19: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,21:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,37:0.25: 1.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:84,66:0.45: 1.16:0.995:0.984 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,30:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,69:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-3.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:102,31:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,64:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,19:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.51:-3.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:133,29:0.19: 1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,116:0.66: 1.67:1.000:0.866 0/0/0/1:4:86,36:0.31: 0.28:1.000:0.969 0/0/0/1:4:91,29:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:118,33:0.24: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,28:0.20: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,62:0.48: 0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:5,1:0.18:-3.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,8:0.38:-2.89:1.000:0.569 0/1/1:3:4,4:0.51:-3.33:1.000:0.669 0/0/1/1:4:58,57:0.51: 0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,33:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,33:0.26: 0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,33:0.23: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,65:0.43: 1.41:1.000:0.938 0/0/0/1:4:113,39:0.27: 1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,35:0.30: 0.37:1.000:0.987 0/0/1/1:4:66,60:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:96,23:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,30:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/0:3:125,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:186,1:0.01: 2.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,63:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,38:0.34: 0.18:1.000:0.890 0/0/1/1:4:56,56:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,36:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,54:0.46: 0.28:1.000:0.986 0/0/1/1:4:79,55:0.43: 0.65:1.000:0.935 0/0/1/1:4:60,58:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,28:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,51:0.45: 0.15:1.000:0.977 0/0/1/1:4:41,57:0.57:-0.48:1.000:0.942 0/0/1/1:4:59,72:0.55: 0.56:1.000:0.982 0/0/0/0/0/1:6:76,15:0.18:-0.70:1.000:0.975 0/0/0/1:4:76,30:0.30:-0.23:1.000:0.984 0/0/0/1:4:86,26:0.25:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,24:0.20: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,32:0.28: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,70:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,61:0.53: 0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,22:0.35:-1.46:1.000:0.831 0/0/0/1:4:77,29:0.29:-0.23:1.000:0.991 0/0/0/1:4:75,28:0.29:-0.33:0.936:0.992 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,53:0.45: 0.28:1.000:0.979 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.37:0.999:1.000 0/0/1/1:4:62,67:0.53: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:83,59:0.43: 0.91:1.000:0.949 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,49:0.46:-0.10:1.000:0.988 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,54:0.46: 0.21:1.000:0.990 0/0/1/1:4:81,71:0.48: 1.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:88,34:0.30: 0.28:1.000:0.988 0/0/0/1:4:67,15:0.20:-0.99:0.989:1.000 0/0/0/1:4:99,25:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,47:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,24:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,22:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,48:0.45:-0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:33,38:0.54:-1.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:64,22:0.27:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,26:0.26:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,53:0.54:-0.48:1.000:0.987 0/0/0/1:4:67,18:0.23:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,27:0.20: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,25:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,47:0.54:-0.80:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,47:0.42: 0.09:1.000:0.917 0/0/0/1:4:82,39:0.34: 0.24:1.000:0.872 0/0/1/1:4:46,34:0.44:-1.05:1.000:0.967 0/0/1/1:4:54,46:0.47:-0.42:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,29:0.29:-0.20:1.000:0.992 0/0/0/1:4:84,35:0.31: 0.18:1.000:0.971 0/0/1/1:4:25,17:0.42:-2.25:1.000:0.915 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,18:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:138,17:0.12: 1.32:0.679:0.952 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,34:0.31: 0.05:1.000:0.968 0/0/0/1:4:62,28:0.33:-0.74:1.000:0.927 0/1/1/1:4:24,74:0.70:-0.48:1.000:0.986 0/0/0/1:4:104,36:0.28: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:106,30:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,18:0.16: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,108:0.61: 1.82:1.000:0.701 0/0/0/1:4:78,19:0.21:-0.51:0.999:1.000 0/0/0/1:4:107,38:0.28: 1.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:89,20:0.20:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,70:0.53: 0.65:1.000:0.993 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,48:0.56:-0.93:1.000:0.960 0/0/1/1:4:53,51:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:77,24:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,33:0.29: 0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,47:0.46:-0.23:1.000:0.987 0/0/1/1:4:64,74:0.54: 0.78:1.000:0.989 0/0/1/1:4:68,61:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,57:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,60:0.55:-0.17:1.000:0.978 0/0/1/1:4:65,50:0.45: 0.05:1.000:0.980 0/0/0/1:4:71,20:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,43:0.43:-0.26:1.000:0.932 0/0/0/1:4:57,25:0.32:-0.99:1.000:0.947 0/0/0/1:4:92,15:0.15:-0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:97,24:0.21: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,15:0.22:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,79:0.71:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:54,62:0.54: 0.09:1.000:0.990 0/0/0/1:4:95,24:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,63:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,35:0.42:-0.86:1.000:0.924 0/0/0/1:4:72,15:0.19:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,48:0.44:-0.01:1.000:0.967 0/0/1/1:4:51,43:0.47:-0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,49:0.44: 0.02:1.000:0.974 0/0/1/1:4:42,49:0.54:-0.70:1.000:0.988 0/1/1/1:4:12,38:0.71:-2.00:1.000:0.989 0/0/0/1:4:116,43:0.29: 1.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:96,22:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,60:0.49: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:100,26:0.22: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,55:0.46: 0.34:1.000:0.987 0/0/1/1:4:72,53:0.44: 0.37:1.000:0.966 0/0/0/1:4:114,34:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,59:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,7:0.72:-3.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,17:0.21:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,32:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,69:0.52: 0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,41:0.38: 0.02:1.000:0.518 0/0/0/1:4:71,19:0.23:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,61:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,30:0.27: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,50:0.53:-0.61:1.000:0.990 0/0/0/1:4:91,26:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,33:0.30: 0.09:1.000:0.983 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,43:0.33: 0.81:1.000:0.933 0/0/1/1:4:45,46:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:93,17:0.17:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:63,49:0.45:-0.04:1.000:0.982 0/0/0/1:4:86,27:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,52:0.47: 0.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:81,41:0.35: 0.28:1.000:0.765 0/0/0/1:4:84,13:0.14:-0.51:1.000:0.980 0/0/0/1:4:110,37:0.27: 1.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:70,68:0.51: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,54:0.53:-0.36:1.000:0.991 0/1/1/1:4:22,100:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,71:0.48: 1.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:102,26:0.22: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,55:0.43: 0.65:1.000:0.935 0/0/0/1:4:109,35:0.26: 0.97:0.999:0.999 0/0/0/1:4:102,33:0.26: 0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,77:0.50: 1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,22:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,32:0.30:-0.01:1.000:0.984 -chr7.1 87152912 chr7.1_087152912 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,107:.: 0.53:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:130,46:.: 0.34:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:141,42:.: 0.49:1.000:. ./.:4:190,54:.: 1.77:1.000:. ./.:4:118,37:.:-0.10:1.000:. ./.:4:139,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:146,53:.: 0.82:1.000:. ./.:4:45,7:.:-2.27:1.000:. ./.:4:48,18:.:-1.98:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:135,64:.: 0.82:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:153,54:.: 0.99:0.995:. ./.:4:205,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:198,57:.: 2.00:1.000:. ./.:4:119,132:.: 1.92:1.000:. ./.:4:26,22:.:-2.35:1.000:. ./.:4:117,47:.: 0.09:1.000:. ./.:4:93,96:.: 0.61:1.000:. ./.:4:144,49:.: 0.70:1.000:. ./.:4:35,10:.:-2.42:1.000:. ./.:4:150,75:.: 1.37:1.000:. ./.:4:124,106:.: 1.47:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:210,71:.: 2.55:1.000:. ./.:4:168,40:.: 1.01:1.000:. ./.:4:139,48:.: 0.57:1.000:. ./.:4:33,23:.:-2.19:1.000:. ./.:4:32,18:.:-2.31:1.000:. ./.:3:25,11:.:-2.61:1.000:. ./.:4:157,62:.: 1.24:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:121,53:.: 0.30:1.000:. ./.:4:140,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:164,53:.: 1.20:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:106,50:.:-0.08:1.000:. ./.:4:79,99:.: 0.38:1.000:. ./.:4:94,38:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:99,36:.:-0.52:1.000:. ./.:3:173,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:55,86:.:-0.40:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:45,64:.:-1.07:1.000:. ./.:4:151,57:.: 1.01:1.000:. ./.:4:113,35:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,88:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,82:.: 0.23:1.000:. ./.:4:155,44:.: 0.82:1.000:. ./.:4:58,72:.:-0.63:1.000:. ./.:4:114,43:.:-0.06:1.000:. ./.:4:103,29:.:-0.59:1.000:. ./.:6:78,38:.:-0.92:1.000:. ./.:4:84,37:.:-0.82:1.000:. ./.:4:117,35:.:-0.17:1.000:. ./.:4:141,44:.: 0.53:1.000:. ./.:4:119,34:.:-0.15:1.000:. ./.:4:91,99:.: 0.63:1.000:. ./.:4:124,52:.: 0.34:1.000:. ./.:4:133,42:.: 0.32:1.000:. ./.:4:114,20:.:-0.55:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:0.936:. ./.:4:137,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:74,97:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:85,95:.: 0.42:1.000:. ./.:4:89,95:.: 0.51:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,42:.: 0.00:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:47,78:.:-0.73:1.000:. ./.:4:133,42:.: 0.32:1.000:. ./.:4:135,45:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,35:.:-1.26:0.989:. ./.:4:138,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:60,79:.:-0.44:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:132,43:.: 0.32:1.000:. ./.:4:79,85:.: 0.09:1.000:. ./.:4:84,42:.:-0.71:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:115,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:107,53:.: 0.00:1.000:. ./.:4:99,24:.:-0.78:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:126,71:.: 0.78:1.000:. ./.:4:59,64:.:-0.78:1.000:. ./.:4:81,91:.: 0.25:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:88,25:.:-0.99:1.000:. ./.:4:65,45:.:-1.05:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.73:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:66,80:.:-0.29:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,30:.:-1.30:1.000:. ./.:5:146,31:.: 0.36:0.679:. ./.:4:90,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:136,40:.: 0.34:1.000:. ./.:4:109,41:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:142,45:.: 0.57:1.000:. ./.:4:105,48:.:-0.15:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:221,78:.: 2.93:1.000:. ./.:4:73,33:.:-1.13:0.999:. ./.:4:122,54:.: 0.34:1.000:. ./.:4:62,18:.:-1.68:1.000:. ./.:4:99,43:.:-0.38:1.000:. ./.:4:141,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,62:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,77:.:-0.52:1.000:. ./.:4:92,29:.:-0.82:1.000:. ./.:4:100,30:.:-0.63:1.000:. ./.:4:77,26:.:-1.20:1.000:. ./.:4:110,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:122,52:.: 0.30:1.000:. ./.:4:89,28:.:-0.90:1.000:. ./.:4:82,68:.:-0.21:1.000:. ./.:4:110,35:.:-0.31:1.000:. ./.:4:122,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:95,24:.:-0.86:1.000:. ./.:4:64,28:.:-1.43:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:59,56:.:-0.94:1.000:. ./.:4:114,38:.:-0.17:1.000:. ./.:4:168,53:.: 1.29:1.000:. ./.:4:73,90:.: 0.07:1.000:. ./.:4:66,30:.:-1.34:1.000:. ./.:4:63,23:.:-1.55:1.000:. ./.:4:50,52:.:-1.22:1.000:. ./.:4:70,63:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,55:.:-0.84:1.000:. ./.:4:99,47:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,43:.:-1.41:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:87,100:.: 0.57:1.000:. ./.:4:106,43:.:-0.23:1.000:. ./.:4:112,148:.: 2.11:1.000:. ./.:4:125,51:.: 0.34:1.000:. ./.:4:183,64:.: 1.83:1.000:. ./.:4:154,54:.: 1.01:1.000:. ./.:4:15,36:.:-2.29:1.000:. ./.:4:114,37:.:-0.19:1.000:. ./.:4:160,62:.: 1.31:1.000:. ./.:4:86,105:.: 0.65:1.000:. ./.:4:172,51:.: 1.33:1.000:. ./.:4:169,62:.: 1.50:1.000:. ./.:4:77,92:.: 0.19:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:150,50:.: 0.84:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:132,50:.: 0.46:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:86,73:.:-0.02:1.000:. ./.:4:99,108:.: 0.99:1.000:. ./.:4:142,51:.: 0.70:1.000:. ./.:4:85,82:.: 0.15:1.000:. ./.:4:135,35:.: 0.21:1.000:. ./.:4:105,101:.: 0.97:1.000:. ./.:4:109,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:108,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:122,52:.: 0.30:1.000:. ./.:4:124,39:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,36:.:-0.10:1.000:. ./.:4:83,72:.:-0.10:1.000:. ./.:4:237,81:.: 3.33:1.000:. ./.:4:135,56:.: 0.65:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:133,50:.: 0.49:1.000:. ./.:4:168,36:.: 0.93:0.999:. ./.:4:177,53:.: 1.47:1.000:. ./.:4:120,121:.: 1.71:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:96,45:.:-0.40:1.000:. -chr7.1 87355444 chr7.1_087355444 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,32:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,31:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-2.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,12:.:-1.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,61:.: 2.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,45:.: 1.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,7:.:-1.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,4:.:-1.97:1.000:. ./.:4:1,43:.: 1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,42:.: 0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,56:.: 1.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:0,9:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,23:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.33:0.936:. ./.:4:0,54:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,46:.: 1.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,30:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.78:0.989:. ./.:4:1,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,35:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,29:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,28:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,48:.: 1.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,59:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.93:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,33:.: 0.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,19:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,54:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.:-0.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,25:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.19:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,52:.: 1.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,16:.:-1.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,37:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,34:.: 0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,37:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,35:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,38:.: 0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,44:.: 1.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.:-0.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,43:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,47:.: 1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,39:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.11:1.000:. -chr7.1 87472437 chr7.1_087472437 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:201,76:.: 1.51:1.000:. ./.:4:126,67:.:-0.11:1.000:. ./.:4:136,63:.: 0.01:1.000:. ./.:4:113,125:.: 0.76:1.000:. ./.:4:224,83:.: 2.09:1.000:. ./.:4:179,63:.: 0.84:1.000:. ./.:4:106,39:.:-1.03:1.000:. ./.:4:169,55:.: 0.49:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:20,14:.:-3.18:1.000:. ./.:4:48,11:.:-2.69:1.000:. ./.:4:129,52:.:-0.34:1.000:. ./.:4:179,61:.: 0.80:1.000:. ./.:4:183,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:139,124:.: 1.24:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.74:0.995:. ./.:4:111,130:.: 0.82:1.000:. ./.:4:129,143:.: 1.41:1.000:. ./.:4:171,68:.: 0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:101,90:.:-0.15:1.000:. ./.:4:168,68:.: 0.72:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,3:.:-3.37:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:157,63:.: 0.41:1.000:. ./.:4:140,132:.: 1.41:1.000:. ./.:4:143,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:142,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:152,49:.: 0.05:1.000:. ./.:4:31,11:.:-3.02:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.46:1.000:. ./.:3:8,0:.:-3.68:1.000:. ./.:4:174,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:111,101:.: 0.26:1.000:. ./.:4:134,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:193,62:.: 1.09:1.000:. ./.:4:180,76:.: 1.11:1.000:. ./.:4:152,46:.:-0.01:1.000:. ./.:4:145,59:.: 0.10:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.22:1.000:. ./.:3:126,145:.: 1.40:1.000:. ./.:4:76,104:.:-0.36:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,109:.:-0.01:1.000:. ./.:4:150,53:.: 0.08:1.000:. ./.:4:195,52:.: 0.93:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:148,55:.: 0.08:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:167,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.42:1.000:. ./.:6:92,65:.:-0.80:1.000:. ./.:4:90,99:.:-0.19:1.000:. ./.:4:90,104:.:-0.09:1.000:. ./.:4:149,56:.: 0.12:1.000:. ./.:4:80,92:.:-0.51:1.000:. ./.:4:145,61:.: 0.14:1.000:. ./.:4:176,66:.: 0.84:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:124,56:.:-0.36:1.000:. ./.:4:90,100:.:-0.17:0.936:. ./.:4:111,109:.: 0.41:1.000:. ./.:4:105,106:.: 0.24:1.000:. ./.:4:108,46:.:-0.86:0.999:. ./.:4:168,64:.: 0.64:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:100,128:.: 0.57:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,90:.:-0.26:1.000:. ./.:4:140,44:.:-0.28:1.000:. ./.:4:164,55:.: 0.39:1.000:. ./.:4:169,58:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,34:.:-1.17:0.989:. ./.:4:201,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:163,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:99,95:.:-0.09:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:127,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:151,52:.: 0.08:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:151,48:.: 0.01:1.000:. ./.:4:179,35:.: 0.30:1.000:. ./.:4:128,40:.:-0.59:1.000:. ./.:4:81,92:.:-0.49:1.000:. ./.:4:139,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:135,32:.:-0.61:1.000:. ./.:4:125,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:157,55:.: 0.26:1.000:. ./.:4:168,62:.: 0.60:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:89,105:.:-0.09:1.000:. ./.:4:110,21:.:-1.30:1.000:. ./.:5:175,39:.: 0.30:0.679:. ./.:4:110,47:.:-0.80:1.000:. ./.:4:139,53:.:-0.13:1.000:. ./.:4:117,50:.:-0.61:1.000:. ./.:4:163,54:.: 0.35:1.000:. ./.:4:156,174:.: 2.53:1.000:. ./.:4:176,60:.: 0.72:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:230,90:.: 2.34:1.000:. ./.:4:133,52:.:-0.26:0.999:. ./.:4:202,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,36:.:-1.36:1.000:. ./.:4:136,50:.:-0.24:1.000:. ./.:4:76,80:.:-0.82:1.000:. ./.:4:132,56:.:-0.21:1.000:. ./.:4:138,44:.:-0.32:1.000:. ./.:4:125,57:.:-0.32:1.000:. ./.:4:156,72:.: 0.57:1.000:. ./.:4:120,39:.:-0.76:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:163,55:.: 0.37:1.000:. ./.:4:96,122:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,56:.: 0.06:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,73:.:-1.02:1.000:. ./.:4:132,37:.:-0.57:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,61:.:-1.54:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:182,59:.: 0.82:1.000:. ./.:4:215,61:.: 1.49:1.000:. ./.:4:167,50:.: 0.35:1.000:. ./.:4:131,45:.:-0.44:1.000:. ./.:4:116,30:.:-1.02:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:150,47:.:-0.03:1.000:. ./.:4:97,38:.:-1.23:1.000:. ./.:4:206,81:.: 1.70:1.000:. ./.:4:255,84:.: 2.71:1.000:. ./.:4:159,70:.: 0.59:1.000:. ./.:4:207,56:.: 1.24:1.000:. ./.:4:291,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:131,41:.:-0.51:1.000:. ./.:4:110,120:.: 0.60:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:36,1:.:-3.12:1.000:. ./.:4:91,104:.:-0.07:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:158,65:.: 0.47:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:169,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:167,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:177,68:.: 0.89:1.000:. ./.:4:144,54:.:-0.01:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:149,48:.:-0.03:1.000:. ./.:4:122,123:.: 0.89:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:186,69:.: 1.09:1.000:. ./.:4:127,50:.:-0.42:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:156,51:.: 0.16:1.000:. ./.:4:138,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:129,33:.:-0.71:1.000:. ./.:4:125,48:.:-0.49:1.000:. ./.:4:179,69:.: 0.95:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:130,44:.:-0.48:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:104,132:.: 0.72:1.000:. ./.:4:115,137:.: 1.03:1.000:. ./.:4:189,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:184,76:.: 1.18:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:138,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:153,62:.: 0.32:1.000:. -chr7.1 87901077 chr7.1_087901077 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:98,98:0.52: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:80,64:0.47:-0.70:1.000:0.993 0/1/1/1:4:35,102:0.75:-0.86:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,155:0.74: 0.91:1.000:0.998 0/0/1/1:4:117,109:0.51: 1.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,98:0.78:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,78:0.48:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,95:0.56: 0.05:1.000:0.965 0/0/0/1:4:30,14:0.36:-3.03:1.000:0.683 0/1/1/1:4:16,25:0.63:-3.10:1.000:0.515 0/1/1/1:4:42,130:0.76:-0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,168:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,80:0.47: 0.19:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,167:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,142:0.76: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,77:0.46: 0.12:0.995:0.988 0/1/1/1:4:54,167:0.76: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,110:0.53: 1.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,100:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,27:0.59:-2.96:1.000:0.841 0/1/1/1:4:41,119:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,86:0.54:-0.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,136:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,23:0.64:-3.19:1.000:0.657 0/0/1/1:4:130,100:0.47: 1.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:140,50:0.31: 0.38:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,144:0.74: 0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,71:0.43: 0.17:1.000:0.938 0/0/1/1:4:97,94:0.52: 0.40:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,119:0.70:-0.02:1.000:0.984 0/1/1/1:4:14,27:0.67:-3.10:1.000:0.927 0/0/1/1:4:52,33:0.42:-2.07:1.000:0.926 0/1/1:3:5,10:0.68:-3.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,145:0.77: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,137:0.72: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:101,90:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,78:0.40: 0.94:1.000:0.808 0/0/1/1:4:118,88:0.46: 0.75:1.000:0.986 0/1/1/1:4:35,113:0.77:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,96:0.47: 0.98:1.000:0.993 0/0/1/1:4:114,114:0.52: 1.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,118:0.78:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,146:0.71: 0.84:1.000:0.989 0/0/1/1:4:100,77:0.47: 0.07:1.000:0.990 1/1/1:3:0,167:1.00:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,282:1.00: 2.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,92:0.57:-0.11:1.000:0.957 1/1/1/1:4:1,276:1.00: 2.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,43:0.30:-0.09:1.000:0.983 0/0/1/1:4:121,114:0.51: 1.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,127:0.70: 0.24:1.000:0.986 0/0/0/1:4:163,50:0.29: 0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,85:0.52:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,94:0.44: 1.33:1.000:0.967 0/0/1/1:4:101,86:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,180:0.70: 2.06:1.000:0.983 0/0/1/1:4:89,80:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:71,89:0.58:-0.32:1.000:0.548 0/1/1/1:4:43,132:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,177:0.79: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,69:0.42: 0.12:1.000:0.917 0/1/1/1:4:65,141:0.70: 0.75:1.000:0.981 0/0/1/1:4:91,69:0.46:-0.32:1.000:0.989 0/1/1/1:4:46,129:0.74: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,62:0.51:-1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,121:0.73:-0.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.09:0.936:1.000 0/1/1/1:4:36,118:0.77:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,115:0.55: 1.05:1.000:0.982 0/1/1/1:4:51,146:0.75: 0.54:0.999:0.999 0/0/1/1:4:132,127:0.52: 1.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,104:0.54: 0.61:1.000:0.986 0/0/1/1:4:72,69:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,78:0.42: 0.70:1.000:0.906 0/1/1/1:4:48,159:0.77: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,69:0.51:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,155:0.79: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,76:0.46: 0.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:62,63:0.53:-1.14:0.989:0.993 0/1/1/1:4:63,118:0.67: 0.17:1.000:0.900 0/0/1/1:4:111,89:0.47: 0.61:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,119:0.79:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,136:0.64: 1.01:1.000:0.713 0/0/0/1:4:162,49:0.28: 0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,56:0.45:-0.93:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,128:0.72: 0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,132:0.69: 0.52:1.000:0.966 0/0/1/1:4:77,89:0.56:-0.18:1.000:0.970 0/1/1/1:4:46,131:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,81:0.44: 0.63:1.000:0.961 0/0/1/1:4:67,60:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,81:0.48: 0.17:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,181:1.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,104:0.72:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,47:0.33:-0.23:1.000:0.911 0/0/1/1:4:115,84:0.45: 0.59:1.000:0.983 0/1/1/1:4:50,139:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,29:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,120:0.72:-0.09:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:102,128:0.58: 1.31:0.679:0.952 0/1/1/1:4:44,86:0.67:-1.02:1.000:0.937 0/1/1/1:4:58,110:0.67:-0.14:1.000:0.913 0/0/1/1:4:87,103:0.56: 0.38:1.000:0.961 0/0/1/1:4:63,68:0.54:-1.00:1.000:0.986 0/1/1/1:4:54,169:0.76: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,94:0.48: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,111:0.59: 0.52:1.000:0.887 0/1/1/1:4:61,150:0.72: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,80:0.45: 0.35:0.999:0.984 0/0/1/1:4:86,95:0.55: 0.17:1.000:0.982 0/0/1/1:4:89,71:0.47:-0.32:1.000:0.993 0/1/1/1:4:45,128:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,133:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,62:0.44:-0.46:1.000:0.960 0/0/0/1:4:158,26:0.20: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,125:0.76:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,125:0.76:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,58:0.44:-0.74:1.000:0.969 0/0/1/1:4:92,83:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,129:0.76:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,128:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,93:0.54: 0.17:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,100:0.70:-0.67:1.000:0.986 0/0/0/1:4:109,25:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,83:0.66:-1.07:1.000:0.883 0/1/1/1:4:36,79:0.70:-1.37:1.000:0.983 0/1/1/1:4:38,126:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,117:0.69:-0.04:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,39:0.24: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,119:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,182:0.77: 1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,32:0.24:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,104:0.75:-0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,82:0.72:-1.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,74:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,81:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,73:0.48:-0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:82,63:0.46:-0.67:1.000:0.990 0/0/1/1:4:69,75:0.54:-0.70:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,238:1.00: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,167:0.76: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,87:0.51: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,89:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,60:0.27: 2.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,76:0.52:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,143:0.75: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,83:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/0/1:4:46,10:0.23:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,67:0.51:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,118:0.54: 1.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:151,43:0.27: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,95:0.48: 0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,152:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,58:0.48:-1.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,139:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,84:0.51: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,118:0.72:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,114:0.77:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,110:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,91:0.45: 0.96:1.000:0.984 0/1/1/1:4:37,107:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,90:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,71:0.48:-0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,45:0.35:-0.67:1.000:0.759 0/0/1/1:4:62,62:0.52:-1.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,87:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,120:0.79:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,80:0.56:-0.56:1.000:0.974 0/0/1/1:4:87,75:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,62:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,135:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,96:0.53: 0.35:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,229:1.00: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,75:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:101,96:0.51: 0.54:0.999:0.996 0/1/1/1:4:62,142:0.71: 0.70:1.000:0.990 0/0/0/1:4:194,49:0.26: 1.61:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,70:0.47:-0.30:1.000:0.990 -chr7.1 88047800 chr7.1_088047800 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:114,1:.: 3.60:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.94:0.995:. ./.:4:105,0:.: 3.13:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:4,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.37:1.000:. ./.:3:76,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:6:14,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.94:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.23:0.936:. ./.:4:44,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:0.989:. ./.:4:46,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.45:1.000:. ./.:5:34,0:.:-0.18:0.679:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:118,0:.: 3.74:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,1:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,1:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:60,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.55:0.999:. ./.:4:73,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.13:1.000:. -chr7.1 88386147 chr7.1_088386147 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:75,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:70,2:.: 1.47:1.000:. ./.:4:32,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:65,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.96:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:40,1:.: 0.10:0.995:. ./.:4:51,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:69,1:.: 1.38:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.49:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:34,3:.:-0.07:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:55,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:64,2:.: 1.21:1.000:. ./.:3:110,1:.: 3.19:1.000:. ./.:4:108,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.53:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:43,2:.: 0.28:1.000:. ./.:4:44,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:27,4:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,2:.:-1.00:1.000:. ./.:6:44,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:71,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:41,2:.: 0.19:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.28:0.936:. ./.:4:30,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.62:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.09:0.999:. ./.:4:18,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:38,2:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:56,4:.: 0.94:1.000:. ./.:4:52,5:.: 0.81:1.000:. ./.:4:26,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.87:0.989:. ./.:4:34,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:45,3:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.82:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:40,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:40,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,2:.: 1.07:1.000:. ./.:4:42,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:32,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.82:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.31:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,2:.:-0.52:1.000:. ./.:5:86,3:.: 2.22:0.679:. ./.:4:51,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:61,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:19,2:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:0.999:. ./.:4:55,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:35,4:.: 0.01:1.000:. ./.:4:42,3:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:11,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:49,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:63,3:.: 1.21:1.000:. ./.:4:27,6:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:64,3:.: 1.25:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:41,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:14,1:.:-1.05:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:70,3:.: 1.52:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.44:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:42,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:93,1:.: 2.44:1.000:. ./.:4:65,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:42,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.53:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:65,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:120,0:.: 3.59:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.72:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.00:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:29,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.66:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:65,2:.: 1.25:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.21:0.999:. ./.:4:49,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:33,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.34:1.000:. -chr8.1 222722 chr8.1_000222722 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,307:.: 0.19:1.000:. ./.:4:143,126:.:-0.45:1.000:. ./.:4:61,229:.:-0.10:1.000:. ./.:4:86,252:.: 0.71:1.000:. ./.:4:103,281:.: 1.49:1.000:. ./.:4:102,304:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,180:.:-1.95:1.000:. ./.:4:64,225:.:-0.11:1.000:. ./.:4:168,151:.: 0.39:1.000:. ./.:4:170,43:.:-1.39:1.000:. ./.:4:76,119:.:-1.70:1.000:. ./.:4:178,232:.: 1.92:1.000:. ./.:4:66,220:.:-0.16:1.000:. ./.:4:182,145:.: 0.53:1.000:. ./.:4:157,157:.: 0.31:1.000:. ./.:4:82,237:.: 0.39:1.000:. ./.:4:97,241:.: 0.71:0.994:. ./.:4:190,184:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,380:.: 1.42:1.000:. ./.:4:102,317:.: 2.08:1.000:. ./.:4:51,91:.:-2.59:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,360:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,46:.:-3.25:1.000:. ./.:4:172,147:.: 0.39:1.000:. ./.:4:77,241:.: 0.37:1.000:. ./.:4:90,232:.: 0.44:1.000:. ./.:4:125,282:.: 1.87:1.000:. ./.:4:90,256:.: 0.85:1.000:. ./.:4:85,214:.: 0.05:1.000:. ./.:4:139,111:.:-0.77:1.000:. ./.:4:52,73:.:-2.88:1.000:. ./.:4:142,82:.:-1.21:1.000:. ./.:3:73,45:.:-2.99:1.000:. ./.:4:82,234:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,302:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,293:.:-0.05:1.000:. ./.:4:157,135:.:-0.06:1.000:. ./.:4:92,246:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.66:1.000:. ./.:4:79,227:.: 0.17:1.000:. ./.:4:101,213:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,251:.:-0.75:1.000:. ./.:4:180,141:.: 0.42:1.000:. ./.:4:183,166:.: 0.90:1.000:. ./.:5:99,341:.: 2.43:1.000:. ./.:4:39,85:.:-2.89:1.000:. ./.:4:57,169:.:-1.18:1.000:. ./.:4:58,131:.:-1.80:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.74:1.000:. ./.:4:95,266:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.15:1.000:. ./.:4:173,154:.: 0.53:1.000:. ./.:4:59,210:.:-0.45:1.000:. ./.:4:69,185:.:-0.70:1.000:. ./.:4:147,161:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,277:.:-0.32:1.000:. ./.:4:68,185:.:-0.72:1.000:. ./.:6:52,209:.:-0.59:1.000:. ./.:4:90,239:.: 0.56:1.000:. ./.:4:66,186:.:-0.74:1.000:. ./.:4:79,268:.: 0.86:1.000:. ./.:4:160,108:.:-0.47:1.000:. ./.:4:96,247:.: 0.80:1.000:. ./.:4:75,204:.:-0.28:1.000:. ./.:4:120,108:.:-1.14:1.000:. ./.:4:83,198:.:-0.25:1.000:. ./.:4:86,202:.:-0.13:0.887:. ./.:4:0,261:.:-0.59:1.000:. ./.:4:90,252:.: 0.78:1.000:. ./.:4:73,172:.:-0.86:0.999:. ./.:4:75,195:.:-0.43:1.000:. ./.:4:90,219:.: 0.22:1.000:. ./.:4:79,218:.: 0.02:1.000:. ./.:4:97,215:.: 0.27:1.000:. ./.:4:52,206:.:-0.64:1.000:. ./.:4:99,242:.: 0.76:1.000:. ./.:4:168,162:.: 0.58:1.000:. ./.:4:79,237:.: 0.34:1.000:. ./.:4:71,184:.:-0.69:0.985:. ./.:4:89,186:.:-0.35:1.000:. ./.:4:76,253:.: 0.56:1.000:. ./.:4:70,184:.:-0.70:1.000:. ./.:4:71,203:.:-0.37:1.000:. ./.:4:95,253:.: 0.88:1.000:. ./.:4:56,173:.:-1.12:1.000:. ./.:4:151,112:.:-0.55:1.000:. ./.:4:73,196:.:-0.45:1.000:. ./.:4:149,155:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,298:.: 0.04:1.000:. ./.:4:93,239:.: 0.61:1.000:. ./.:4:68,176:.:-0.87:1.000:. ./.:4:96,260:.: 1.01:1.000:. ./.:4:76,231:.: 0.19:1.000:. ./.:4:184,156:.: 0.74:1.000:. ./.:4:75,197:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,307:.: 0.19:1.000:. ./.:4:103,250:.: 0.96:1.000:. ./.:4:55,159:.:-1.38:1.000:. ./.:4:167,129:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,162:.:-1.31:1.000:. ./.:4:80,211:.:-0.08:0.904:. ./.:4:134,105:.:-0.96:1.000:. ./.:4:157,126:.:-0.22:1.000:. ./.:4:148,128:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,150:.: 0.05:1.000:. ./.:4:229,195:.: 2.16:0.993:. ./.:4:95,204:.: 0.05:1.000:. ./.:4:172,142:.: 0.31:1.000:. ./.:4:220,205:.: 2.18:1.000:. ./.:4:87,199:.:-0.16:0.999:. ./.:4:93,236:.: 0.56:1.000:. ./.:4:44,129:.:-2.07:1.000:. ./.:4:95,211:.: 0.17:1.000:. ./.:4:70,217:.:-0.15:1.000:. ./.:4:58,191:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.20:1.000:. ./.:4:151,131:.:-0.23:1.000:. ./.:4:173,156:.: 0.56:1.000:. ./.:4:84,207:.:-0.08:1.000:. ./.:4:86,219:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.56:1.000:. ./.:4:1,296:.: 0.02:1.000:. ./.:4:167,136:.: 0.12:1.000:. ./.:4:160,149:.: 0.22:1.000:. ./.:4:58,145:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,227:.:-1.16:1.000:. ./.:4:68,156:.:-1.21:1.000:. ./.:4:77,232:.: 0.22:1.000:. ./.:4:91,281:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,203:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,263:.:-0.55:1.000:. ./.:4:75,215:.:-0.10:1.000:. ./.:4:119,323:.: 2.46:1.000:. ./.:4:161,152:.: 0.29:1.000:. ./.:4:66,174:.:-0.94:1.000:. ./.:4:69,189:.:-0.64:1.000:. ./.:4:163,151:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,227:.: 0.37:1.000:. ./.:4:146,170:.: 0.34:1.000:. ./.:4:150,111:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,376:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,408:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,317:.: 0.36:1.000:. ./.:4:160,166:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.91:1.000:. ./.:4:89,197:.:-0.16:1.000:. ./.:4:97,318:.: 2.01:1.000:. ./.:4:96,235:.: 0.59:1.000:. ./.:4:107,72:.:-1.97:1.000:. ./.:4:124,107:.:-1.09:1.000:. ./.:4:98,239:.: 0.69:1.000:. ./.:4:174,176:.: 0.91:1.000:. ./.:4:105,303:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,355:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,289:.:-0.11:1.000:. ./.:4:77,240:.: 0.36:1.000:. ./.:4:80,214:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.67:1.000:. ./.:4:138,133:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.12:1.000:. ./.:4:62,170:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,303:.: 0.12:1.000:. ./.:4:84,211:.:-0.01:1.000:. ./.:4:78,242:.: 0.41:0.999:. ./.:4:0,279:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.42:1.000:. ./.:4:72,183:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,227:.:-1.16:1.000:. ./.:4:82,184:.:-0.50:1.000:. ./.:4:90,187:.:-0.32:1.000:. ./.:4:63,188:.:-0.75:1.000:. ./.:4:149,93:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.71:1.000:. ./.:4:88,245:.: 0.63:1.000:. ./.:4:157,167:.: 0.48:1.000:. ./.:4:150,173:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,263:.: 0.69:1.000:. ./.:4:97,304:.: 1.77:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.64:1.000:. ./.:4:83,226:.: 0.22:1.000:. -chr8.1 305693 chr8.1_000305693 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:54,80:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:56,26:0.31:-0.85:1.000:0.979 0/0/1/1:4:49,78:0.54: 0.47:1.000:0.987 0/0/1/1:4:42,71:0.56: 0.06:1.000:0.973 0/0/1/1:4:59,88:0.52: 1.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,75:0.49: 0.64:1.000:0.996 1/1/1/1:4:5,76:0.92:-0.88:1.000:0.983 0/1/1/1:4:32,125:0.73: 1.34:1.000:0.998 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.16:-2.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:18,8:0.30:-2.49:1.000:0.986 0/0/1/1:4:72,52:0.38: 0.38:1.000:0.605 0/0/1/1:4:58,86:0.52: 0.96:1.000:0.994 0/0/0/1:4:68,26:0.28:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,145:0.74: 2.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,73:0.52: 0.35:0.994:0.995 0/0/0/1:4:89,40:0.30: 0.53:1.000:0.984 0/0/0/1:4:90,40:0.30: 0.55:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,99:0.53: 1.52:1.000:0.991 0/0/1/1:4:7,9:0.49:-2.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,110:0.73: 0.79:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,149:0.85: 1.67:1.000:0.989 0/0/1/1:4:47,85:0.57: 0.61:1.000:0.941 0/1/1/1:4:3,7:0.63:-2.95:1.000:0.578 0/0/0/1:4:81,43:0.33: 0.38:1.000:0.928 0/0/1/1:4:63,80:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,73:0.54: 0.23:1.000:0.988 0/0/0/1:4:76,49:0.36: 0.41:1.000:0.662 0/0/1/1:4:77,56:0.38: 0.64:1.000:0.621 0/0/1/1:4:51,88:0.56: 0.82:1.000:0.966 0/0/0/1:4:72,49:0.37: 0.29:1.000:0.537 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-3.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.38:-2.05:1.000:0.560 0/0/0:3:1,0:0.00:-3.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,71:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,82:0.62: 0.23:1.000:0.574 0/0/1/1:4:60,77:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,33:0.29: 0.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:52,91:0.56: 0.93:1.000:0.960 0/1/1/1:4:20,85:0.75:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,66:0.53:-0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:36,79:0.62: 0.12:1.000:0.602 0/1/1/1:4:13,73:0.80:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,59:0.57:-0.56:1.000:0.948 0/0/0/1:4:68,32:0.31:-0.32:1.000:0.976 0/0/0/1/1:5:77,84:0.46: 1.46:1.000:0.833 0/0/0/1:4:37,25:0.37:-1.43:1.000:0.554 0/0/1/1:4:38,40:0.45:-0.97:1.000:0.983 0/0/1/1:4:39,54:0.51:-0.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,128:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,45:0.33: 0.53:1.000:0.922 0/1/1/1:4:16,90:0.80:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,64:0.52:-0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,112:0.78: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,52:0.56:-0.85:1.000:0.964 0/0/1/1:4:55,54:0.44:-0.06:1.000:0.967 0/0/1/1:4:37,61:0.55:-0.38:1.000:0.980 0/0/1/1:4:39,65:0.55:-0.21:1.000:0.978 0/0/1/1/1/1:6:30,68:0.62:-0.38:1.000:0.808 0/0/1/1:4:41,65:0.54:-0.15:1.000:0.988 0/0/0/1:4:58,38:0.37:-0.44:1.000:0.626 0/0/1/1:4:39,55:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,52:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,40:0.34: 0.00:1.000:0.878 0/0/1/1:4:39,59:0.53:-0.38:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,29:0.40:-1.32:1.000:0.772 0/1/1/1:4:19,103:0.79: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,51:0.57:-0.94:0.887:0.936 0/0/1/1:4:37,64:0.56:-0.29:1.000:0.965 0/0/1/1:4:46,68:0.52: 0.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,53:0.68:-1.17:0.999:0.954 0/1/1/1:4:25,110:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,89:0.56: 0.85:1.000:0.961 0/0/1/1:4:49,54:0.46:-0.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:33,51:0.53:-0.79:1.000:0.991 0/0/0/1:4:56,18:0.25:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,63:0.49: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,82:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:57,76:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,24:0.30:-0.97:0.985:0.986 0/0/0/1:4:68,22:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,50:0.38: 0.23:1.000:0.613 0/0/0/1:4:62,38:0.35:-0.32:1.000:0.762 0/0/1/1:4:34,69:0.60:-0.23:1.000:0.795 0/1/1/1:4:26,113:0.75: 0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,56:0.48:-0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,44:0.40:-0.32:1.000:0.776 0/0/0/1:4:52,30:0.34:-0.85:1.000:0.852 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,77:0.72:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:21,97:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,29:0.29:-0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,59:0.58:-0.59:1.000:0.926 0/0/0/1:4:102,49:0.31: 1.17:1.000:0.971 0/1/1/1:4:21,91:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,52:0.53:-0.73:1.000:0.992 0/1/1/1:4:21,85:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,97:0.69: 0.50:1.000:0.976 0/0/0/1:4:84,46:0.33: 0.55:1.000:0.905 0/0/1/1:4:34,49:0.52:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,37:0.31: 0.12:1.000:0.974 0/0/0/1:4:48,20:0.29:-1.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,64:0.50: 0.03:0.904:0.997 0/0/1/1:4:31,45:0.52:-1.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,44:0.37:-0.06:1.000:0.550 0/0/1/1:4:35,65:0.58:-0.32:1.000:0.920 0/0/1/1:4:55,83:0.53: 0.79:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,45:0.33: 0.47:0.993:0.903 0/1/1/1:4:32,129:0.74: 1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,63:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,84:0.54: 0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:42,68:0.55:-0.03:0.999:0.984 0/0/0/1:4:65,36:0.34:-0.29:1.000:0.895 0/0/1/1:4:33,53:0.54:-0.73:1.000:0.986 0/0/0/1:4:94,30:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,85:0.78:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,85:0.82:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,65:0.52:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,21:0.33:-1.46:1.000:0.935 0/0/0/1:4:60,36:0.35:-0.44:1.000:0.797 0/0/1/1:4:48,36:0.39:-0.79:1.000:0.689 0/0/1/1:4:55,63:0.47: 0.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,139:0.81: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,38:0.45:-1.08:1.000:0.983 0/0/0/1:4:57,34:0.35:-0.59:1.000:0.806 0/0/1/1:4:24,53:0.62:-0.99:1.000:0.584 0/1/1/1:4:13,80:0.81:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,48:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,25:0.32:-1.08:1.000:0.949 0/0/1/1:4:43,56:0.49:-0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,102:0.73: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,40:0.62:-1.55:1.000:0.566 0/1/1/1:4:19,108:0.80: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,63:0.56:-0.32:1.000:0.971 0/1/1/1:4:40,166:0.74: 2.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,44:0.36: 0.06:1.000:0.685 0/0/1/1:4:39,38:0.44:-0.99:1.000:0.965 0/0/1/1:4:37,52:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,84:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,115:0.76: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,48:0.59:-1.11:1.000:0.884 0/0/1/1:4:65,91:0.51: 1.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,103:0.58: 1.37:1.000:0.912 0/0/1/1:4:62,84:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,88:0.54: 0.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:81,115:0.51: 2.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,57:0.53:-0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:70,100:0.51: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,75:0.51: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,7:0.51:-2.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,63:0.55:-0.29:1.000:0.979 0/1/1/1:4:21,108:0.78: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,69:0.54: 0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:98,47:0.31: 0.99:1.000:0.971 0/0/1/1:4:55,62:0.47: 0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,65:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,74:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,79:0.54: 0.50:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,123:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,34:0.32:-0.26:1.000:0.958 0/1/1/1:4:20,134:0.83: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,85:0.52: 0.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:29,106:0.72: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,63:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,124:0.72: 1.40:0.999:0.994 0/1/1/1:4:21,107:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,111:0.86: 0.38:1.000:0.967 0/1/1/1:4:31,74:0.64:-0.18:1.000:0.642 0/1/1/1:4:26,61:0.63:-0.70:1.000:0.594 0/0/1/1:4:54,65:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,92:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,93:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,55:0.48:-0.32:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,173:1.00: 1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,140:0.78: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,86:0.57: 0.64:1.000:0.932 0/0/1/1:4:38,75:0.59: 0.06:1.000:0.845 0/1/1/1:4:33,123:0.72: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,95:0.57: 1.05:1.000:0.933 1/1/1/1:4:1,184:0.99: 2.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,103:0.83: 0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,101:0.52: 1.69:1.000:0.994 -chr8.1 750860 chr8.1_000750860 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,444:1.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,88:0.27:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:204,143:0.42:-0.49:1.000:0.919 0/1/1/1:4:133,342:0.72: 0.89:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,318:0.75: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:321,285:0.48: 2.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:103,290:0.73: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:229,214:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:230,188:0.46: 0.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:135,81:0.39:-1.91:1.000:0.651 0/0/1/1:4:97,89:0.48:-2.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:409,118:0.25: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,222:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:233,225:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:201,201:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:233,242:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,290:0.58: 1.21:0.994:0.927 0/0/0/1:4:337,127:0.29: 0.77:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,572:1.00: 1.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:136,430:0.76: 1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,190:0.78:-1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:102,305:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:140,369:0.72: 1.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,336:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:101,23:0.21:-2.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:252,279:0.53: 1.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:250,239:0.49: 1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,296:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,350:0.75: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:132,376:0.74: 1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:279,249:0.48: 1.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:203,230:0.53: 0.44:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,69:0.51:-2.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,139:0.60:-1.76:1.000:0.750 0/1/1:3:49,57:0.54:-3.10:1.000:0.935 0/0/1/1:4:243,259:0.52: 1.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:117,330:0.73: 0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:96,335:0.77: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,203:0.52: 0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,362:0.76: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,263:0.73:-0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:67,340:0.83: 0.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:86,293:0.77:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,263:0.78:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:274,99:0.28:-0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:176,205:0.54:-0.12:1.000:0.987 0/0/1/1/1:5:250,362:0.59: 2.37:1.000:0.968 0/0/1/1:4:126,149:0.54:-1.27:1.000:0.985 0/1/1/1:4:90,272:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,223:0.59:-0.18:1.000:0.841 0/1/1/1:4:71,231:0.76:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:126,355:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,259:0.74:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:181,171:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:192,185:0.49:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:103,316:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:145,169:0.54:-0.85:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,461:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,250:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:75,215:0.74:-1.11:1.000:0.616 0/1/1/1:4:100,313:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,183:0.56:-0.69:1.000:0.970 0/0/1/1:4:220,227:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,195:0.52:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,191:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:182,170:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:156,161:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:84,278:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,300:0.77:-0.05:0.887:1.000 1/1/1/1:4:0,363:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,228:0.52: 0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:190,206:0.52: 0.04:0.999:0.994 0/0/0/1:4:309,143:0.33: 0.64:1.000:0.913 0/1/1/1:4:115,329:0.74: 0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:181,196:0.52:-0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:183,197:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:79,290:0.78:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,140:0.44:-0.77:1.000:0.972 0/0/1/1:4:170,187:0.53:-0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:86,290:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,171:0.54:-0.77:0.985:0.990 0/1/1/1:4:108,330:0.75: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:121,311:0.72: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:156,172:0.53:-0.70:1.000:0.993 0/0/1/1:4:177,207:0.54:-0.09:1.000:0.987 0/0/1/1:4:176,217:0.55: 0.01:1.000:0.976 0/1/1/1:4:71,231:0.76:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,166:0.52:-0.77:1.000:0.995 0/1/1/1:4:94,278:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,178:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,283:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,229:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:114,325:0.74: 0.50:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,226:0.75:-1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,350:0.77: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,212:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,156:0.51:-0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,68:0.25:-1.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,275:0.71:-0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:215,212:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,162:0.46:-0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:203,200:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,200:0.82:-1.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,164:0.52:-0.80:0.904:0.995 0/0/1/1:4:147,144:0.50:-1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:161,159:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,162:0.48:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:215,233:0.52: 0.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:402,138:0.27: 1.59:0.993:0.997 0/0/1/1:4:197,176:0.48:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:258,65:0.22:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:308,321:0.51: 2.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,239:0.73:-0.71:0.999:0.997 0/0/1/1:4:190,213:0.53: 0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:69,216:0.75:-1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:103,305:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:208,189:0.48: 0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:170,192:0.53:-0.33:1.000:0.991 0/1/1/1:4:72,266:0.78:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,89:0.32:-1.04:1.000:0.960 0/0/1/1:4:207,156:0.44:-0.32:1.000:0.963 0/0/1/1:4:146,129:0.47:-1.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:112,313:0.73: 0.35:1.000:0.998 0/1/1/1:4:117,340:0.74: 0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,241:0.71:-0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:194,208:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:274,62:0.21:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,83:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,190:0.76:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,120:0.49:-1.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,161:0.49:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:234,210:0.48: 0.56:1.000:0.994 0/1/1/1:4:49,160:0.76:-1.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,256:0.73:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,274:0.75:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:137,465:0.77: 2.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,182:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:77,254:0.76:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,223:0.75:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,162:0.54:-0.96:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,406:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,144:0.47:-0.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:210,202:0.49: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,149:0.51:-1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:133,399:0.75: 1.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,539:1.00: 1.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,423:1.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,107:0.30:-0.18:1.000:0.983 0/1/1/1:4:112,395:0.77: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,242:0.77:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:136,382:0.73: 1.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:214,176:0.46:-0.03:1.000:0.986 0/1/1/1:4:58,105:0.64:-2.48:1.000:0.722 0/0/0/1:4:322,80:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:137,341:0.71: 0.92:1.000:0.992 0/0/1/1:4:249,213:0.47: 0.75:1.000:0.991 0/1/1/1:4:127,425:0.77: 1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:117,360:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,312:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:111,376:0.77: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,341:0.73: 0.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:89,232:0.72:-0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:265,81:0.25:-0.50:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,450:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,405:0.77: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,340:0.73: 0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:204,199:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:339,122:0.28: 0.74:0.999:0.994 0/1/1/1:4:125,322:0.72: 0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:108,342:0.76: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,165:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,275:0.80:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,199:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:177,157:0.48:-0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:68,225:0.76:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,84:0.26:-0.50:1.000:0.998 0/1/1/1:4:138,388:0.73: 1.44:1.000:0.998 0/0/1/1:4:230,202:0.47: 0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:250,245:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:200,184:0.48:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:253,227:0.48: 0.95:1.000:0.994 0/0/1/1:4:309,294:0.49: 2.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:152,433:0.74: 2.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:83,280:0.77:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,206:0.53: 0.02:1.000:0.994 -chr8.1 1319707 chr8.1_001319707 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:86,104:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,39:0.24:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,98:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,167:0.73: 1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,117:0.55: 0.84:1.000:0.984 0/1/1/1:4:23,90:0.73:-1.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,108:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:120,44:0.22: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-2.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,45:0.49:-2.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,95:0.55:-0.16:1.000:0.976 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,48:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,56:0.25: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.36:0.994:1.000 0/0/0/1:4:137,68:0.28: 1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,114:0.46: 1.58:1.000:0.986 0/0/1/1:4:87,115:0.52: 0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,55:0.62:-2.09:1.000:0.524 0/0/1/1:4:54,83:0.55:-0.67:1.000:0.975 0/0/0/1:4:102,64:0.34: 0.07:1.000:0.892 0/0/1/1:4:71,77:0.47:-0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:35,30:0.41:-2.50:1.000:0.878 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,41:0.19: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,41:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,126:0.53: 1.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,99:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,46:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,41:0.64:-2.65:1.000:0.671 0/0/1/1:4:27,55:0.62:-2.07:1.000:0.625 0/1/1:3:2,17:0.83:-3.67:1.000:0.977 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,107:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,90:0.44: 0.53:1.000:0.967 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,58:0.24: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,90:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,51:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,66:0.28: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,45:0.28:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,70:0.31: 0.76:1.000:0.969 0/0/0/1:4:107,50:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/0/1:5:208,59:0.18: 2.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,29:0.29:-1.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,95:0.56:-0.23:1.000:0.959 0/0/1/1:4:103,133:0.51: 1.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,75:0.48:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:117,116:0.45: 1.78:1.000:0.979 0/0/1/1:4:72,82:0.48:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,53:0.29:-0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,105:0.55: 0.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:102,115:0.48: 1.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,105:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,177:0.73: 1.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:129,42:0.20: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:89,42:0.27:-0.82:1.000:0.690 0/0/0/1:4:114,50:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,45:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,90:0.47: 0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:108,47:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,113:0.53: 0.76:1.000:0.990 0/0/0/1:4:56,24:0.25:-2.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,144:0.76: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,134:0.73: 0.17:0.887:0.997 0/0/1/1:4:65,92:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,39:0.30:-1.33:0.999:0.984 0/0/0/1:4:117,57:0.28: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,107:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:122,49:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,44:0.30:-0.95:1.000:0.986 0/0/0/1:4:105,48:0.26:-0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,133:0.61: 0.96:1.000:0.724 0/0/1/1:4:82,112:0.53: 0.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,86:0.44: 0.35:1.000:0.962 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-1.02:0.985:1.000 0/0/1/1:4:87,104:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,97:0.53: 0.10:1.000:0.992 0/0/0/1:4:98,50:0.29:-0.39:1.000:0.993 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,110:0.54: 0.56:1.000:0.985 0/0/1/1:4:51,84:0.57:-0.72:1.000:0.947 0/0/1/1:4:56,83:0.55:-0.62:1.000:0.984 0/0/0/1:4:88,36:0.24:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,45:0.30:-0.87:1.000:0.986 0/1/1/1:4:31,130:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,89:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,60:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,72:0.52:-0.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,107:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,101:0.54: 0.20:1.000:0.988 0/0/1/1:4:54,92:0.58:-0.44:1.000:0.925 0/0/0/1:4:86,44:0.29:-0.84:1.000:0.992 0/0/0/1:4:118,56:0.27: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,54:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,54:0.50:-1.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,103:0.54: 0.28:1.000:0.987 0/0/0/1:4:81,25:0.20:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,69:0.51:-1.00:0.904:0.996 0/0/0/1:4:92,43:0.27:-0.72:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,84:0.45: 0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:69,97:0.53: 0.07:1.000:0.991 0/0/0/1:4:111,48:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,75:0.27: 1.78:0.993:0.997 0/0/1/1:4:67,114:0.58: 0.45:1.000:0.926 0/0/0/1:4:107,49:0.26:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:159,63:0.24: 1.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,167:0.78: 0.89:0.999:1.000 0/0/0/1:4:108,52:0.28:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,107:0.77:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,115:0.59: 0.38:1.000:0.850 0/0/1/1:4:60,104:0.58: 0.02:1.000:0.910 0/0/1/1:4:77,83:0.47:-0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:74,109:0.54: 0.51:1.000:0.985 0/0/0/1:4:87,42:0.28:-0.87:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,50:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,55:0.29: 0.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,97:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,100:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,83:0.45: 0.10:1.000:0.978 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,58:0.33:-0.23:1.000:0.932 0/0/0/1:4:88,42:0.27:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,81:0.54:-0.64:1.000:0.990 0/0/0/1:4:72,26:0.22:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,103:0.59:-0.11:1.000:0.839 0/0/1/1:4:70,90:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,65:0.53:-1.30:1.000:0.992 0/1/1/1:4:31,164:0.78: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,63:0.31: 0.28:1.000:0.970 0/0/1/1:4:98,152:0.56: 2.21:1.000:0.973 0/0/1/1:4:83,93:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,47:0.29:-0.62:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,119:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,50:0.34:-0.90:1.000:0.862 0/0/1/1:4:63,109:0.58: 0.23:1.000:0.912 0/0/1/1:4:64,93:0.54:-0.16:1.000:0.987 0/0/0/1:4:121,62:0.29: 0.51:1.000:0.992 0/0/0/1:4:70,30:0.25:-1.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,136:0.51: 2.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,220:0.74: 2.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,42:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,57:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,124:0.51: 1.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,88:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:124,65:0.29: 0.66:1.000:0.989 0/0/0/1:4:129,48:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,23:0.27:-2.32:1.000:0.998 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,112:0.49: 1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,46:0.20: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,111:0.55: 0.58:1.000:0.984 0/0/1/1:4:84,106:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,26:0.19:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,111:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,107:0.53: 0.53:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,94:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,50:0.32:-0.67:1.000:0.964 0/0/1/1:4:90,96:0.47: 0.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:115,57:0.28: 0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,177:0.75: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,69:0.48:-0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,50:0.29:-0.36:0.999:0.994 0/1/1/1:4:27,154:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,49:0.26:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:109,36:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,72:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,81:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:100,35:0.22:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,82:0.59:-0.90:1.000:0.881 0/0/0/1:4:84,34:0.24:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,178:0.74: 1.52:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,62:0.32: 0.17:1.000:0.965 0/0/0/1:4:105,58:0.31: 0.00:1.000:0.979 0/0/1/1:4:82,89:0.47: 0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,105:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:159,65:0.24: 1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,117:0.44: 1.88:1.000:0.974 0/1/1/1:4:29,133:0.76:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,54:0.26: 0.33:1.000:0.999 -chr8.1 1414262 chr8.1_001414262 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:174,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.29:0.994:. ./.:4:142,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.64:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.89:1.000:. ./.:5:285,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:174,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.01:1.000:. ./.:6:173,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:276,0:.: 2.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:236,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.:-0.94:0.887:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:294,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:170,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.21:0.985:. ./.:4:185,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.42:0.904:. ./.:4:70,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.81:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.80:0.993:. ./.:4:59,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:221,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:324,0:.: 3.11:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:114,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.03:1.000:. -chr8.1 1552131 chr8.1_001552131 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:333,135:0.27: 0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:270,92:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:320,131:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:235,222:0.47: 0.59:1.000:0.991 0/0/1/1:4:234,273:0.52: 1.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:242,241:0.48: 0.87:1.000:0.995 0/1/1/1:4:85,245:0.72:-0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:105,319:0.73: 0.24:1.000:0.998 0/0/0/0:4:401,12:0.03: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,1:0.01:-3.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,37:0.31:-3.08:1.000:0.966 0/0/1/1:4:277,211:0.41: 0.92:1.000:0.876 0/0/1/1:4:201,213:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:456,1:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:418,11:0.02: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,204:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:366,104:0.20: 0.73:0.994:1.000 0/0/0/1:4:362,112:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:407,154:0.25: 1.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:376,136:0.24: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,46:0.29:-2.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:196,202:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:250,261:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:226,193:0.44: 0.19:1.000:0.968 0/0/0/1:4:63,10:0.13:-3.47:1.000:0.857 0/0/0/0:4:504,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:212,173:0.43:-0.17:1.000:0.945 0/0/0/1:4:317,84:0.19: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:395,154:0.26: 1.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:317,83:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,229:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/0:4:334,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,21:0.45:-3.77:1.000:0.977 0/0/0/1:4:113,52:0.29:-2.50:1.000:0.990 0/0/1:3:45,15:0.23:-3.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:362,95:0.19: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,234:0.48: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:222,225:0.48: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/0:4:478,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:340,107:0.22: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,249:0.57: 0.26:1.000:0.957 0/0/0/1:4:324,125:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:374,147:0.26: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:169,195:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:202,247:0.53: 0.51:1.000:0.992 0/0/0/1:4:284,109:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:528,149:0.20: 2.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:198,79:0.26:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:181,213:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:194,258:0.55: 0.54:1.000:0.978 0/1/1/1:4:65,282:0.80:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:411,160:0.26: 1.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:172,174:0.48:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:291,138:0.30: 0.29:1.000:0.986 0/1/1/1:4:86,297:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,227:0.49: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,203:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:203,255:0.54: 0.60:1.000:0.989 0/0/0/1:4:281,110:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:152,129:0.44:-1.27:1.000:0.673 0/0/0/1:4:245,136:0.34:-0.21:1.000:0.896 0/0/0/1:4:301,103:0.23: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:314,118:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:187,210:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:345,124:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,249:0.54: 0.43:1.000:0.985 0/0/0/1:4:238,98:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/1/1/1:4:109,366:0.75: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,244:0.53: 0.50:0.887:0.994 0/0/1/1:4:195,168:0.44:-0.40:1.000:0.972 0/0/0/1:4:315,132:0.27: 0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,193:0.48:-0.15:0.999:0.995 0/1/1/1:4:106,407:0.77: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:223,245:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,212:0.56:-0.34:1.000:0.974 0/0/1/1:4:186,193:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:328,19:0.05:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,236:0.53: 0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:200,243:0.53: 0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:259,117:0.29:-0.27:1.000:0.992 0/0/0/1:4:239,96:0.26:-0.70:0.985:0.998 0/0/0/1:4:301,141:0.30: 0.43:1.000:0.988 0/0/0/1:4:297,150:0.31: 0.49:1.000:0.968 0/0/0/1:4:274,104:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:261,111:0.28:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:113,376:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,105:0.31:-0.94:1.000:0.966 0/0/0/1:4:232,106:0.29:-0.67:1.000:0.991 0/0/0/0:4:313,17:0.05:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:344,16:0.04:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,305:0.78:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,239:0.57: 0.04:1.000:0.944 0/0/0/0:4:408,29:0.06: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,157:0.46:-0.78:1.000:0.988 0/0/0/1:4:253,140:0.33:-0.09:1.000:0.900 0/1/1/1:4:118,328:0.72: 0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:141,163:0.52:-1.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:83,259:0.74:-0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:161,231:0.57:-0.10:1.000:0.946 0/0/0/1:4:343,147:0.28: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:276,123:0.29:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:294,131:0.29: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/0:4:268,12:0.04:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,245:0.57: 0.14:0.904:0.940 0/0/0/1:4:229,85:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:269,123:0.29:-0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:131,173:0.55:-1.03:1.000:0.980 0/0/0/1:4:319,111:0.24: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:380,147:0.26: 1.33:0.993:0.999 0/1/1/1:4:79,300:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,212:0.56:-0.40:1.000:0.958 0/0/0/1:4:405,125:0.22: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,264:0.58: 0.43:0.999:0.922 0/0/0/1:4:287,151:0.32: 0.39:1.000:0.946 0/0/1/1:4:140,173:0.53:-0.93:1.000:0.991 0/0/0/1:4:305,151:0.31: 0.58:1.000:0.975 0/1/1/1:4:72,242:0.75:-0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:80,303:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,233:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:267,120:0.29:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:287,132:0.29: 0.19:1.000:0.990 0/0/0/1:4:250,129:0.32:-0.23:1.000:0.957 0/0/0/1:4:314,138:0.28: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:223,189:0.44: 0.11:1.000:0.965 0/0/1/1:4:177,224:0.54: 0.00:1.000:0.988 0/0/0/0:4:388,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,215:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,290:0.73:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,202:0.58:-0.66:1.000:0.927 0/0/0/1:4:198,105:0.32:-1.04:1.000:0.940 0/0/1/1:4:148,217:0.58:-0.38:1.000:0.931 0/1/1/1:4:87,301:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,158:0.58:-1.44:1.000:0.926 0/1/1/1:4:91,320:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:274,94:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,241:0.44: 1.28:1.000:0.970 0/0/0/1:4:279,134:0.30: 0.13:1.000:0.983 0/0/0/1:4:230,83:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,208:0.53:-0.23:1.000:0.992 0/0/0/0:4:294,20:0.06:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:183,190:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,303:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:370,9:0.02:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,84:0.28:-1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:261,274:0.49: 1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:286,338:0.52: 2.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:317,104:0.23: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,204:0.47: 0.18:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:241,119:0.31:-0.44:1.000:0.976 0/0/0/1:4:398,102:0.19: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,97:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,16:0.18:-3.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:289,92:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,277:0.51: 1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:322,115:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:385,145:0.25: 1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:250,275:0.51: 1.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:282,116:0.27:-0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:360,133:0.25: 0.97:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,194:0.48:-0.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,266:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:310,107:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,213:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:371,97:0.19: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,290:0.72:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:202,224:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:115,287:0.69: 0.01:0.999:0.979 0/1/1/1:4:104,280:0.71:-0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:200,214:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:232,106:0.29:-0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:152,160:0.49:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,227:0.53: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:179,210:0.52:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:195,203:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,173:0.52:-0.82:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,452:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,257:0.50: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:296,113:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,199:0.55:-0.56:1.000:0.977 0/1/1/1:4:101,352:0.76: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,285:0.47: 1.93:1.000:0.992 0/1/1/1:4:139,405:0.72: 1.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,272:0.74:-0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:177,192:0.50:-0.34:1.000:0.997 -chr8.1 1827441 chr8.1_001827441 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:65,63:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,51:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.16:1.000:. ./.:4:27,88:.: 0.65:1.000:. ./.:4:48,96:.: 1.58:1.000:. ./.:4:18,58:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.48:1.000:. ./.:4:18,75:.:-0.07:1.000:. ./.:4:9,18:.:-2.20:1.000:. ./.:4:3,19:.:-2.36:1.000:. ./.:4:0,133:.: 1.23:1.000:. ./.:4:31,81:.: 0.55:1.000:. ./.:4:28,82:.: 0.48:1.000:. ./.:4:25,74:.: 0.13:1.000:. ./.:4:21,86:.: 0.39:1.000:. ./.:4:24,95:.: 0.77:0.994:. ./.:4:28,105:.: 1.23:1.000:. ./.:4:33,83:.: 0.68:1.000:. ./.:4:72,72:.: 1.58:1.000:. ./.:4:15,10:.:-2.27:1.000:. ./.:4:67,56:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,95:.: 1.16:1.000:. ./.:4:23,60:.:-0.39:1.000:. ./.:4:7,13:.:-2.43:1.000:. ./.:4:24,68:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,138:.: 1.39:1.000:. ./.:4:24,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:29,117:.: 1.65:1.000:. ./.:4:24,95:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.03:1.000:. ./.:4:26,76:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.98:1.000:. ./.:4:6,15:.:-2.40:1.000:. ./.:3:3,5:.:-2.82:1.000:. ./.:4:24,86:.: 0.48:1.000:. ./.:4:34,92:.: 1.00:1.000:. ./.:4:29,85:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:38,84:.: 0.87:1.000:. ./.:4:59,40:.: 0.13:1.000:. ./.:4:18,71:.:-0.20:1.000:. ./.:4:31,61:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,64:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.49:1.000:. ./.:5:76,105:.: 2.78:1.000:. ./.:4:32,74:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.75:1.000:. ./.:4:20,40:.:-1.13:1.000:. ./.:4:22,59:.:-0.45:1.000:. ./.:4:26,66:.:-0.10:1.000:. ./.:4:51,42:.:-0.07:1.000:. ./.:4:34,74:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,46:.:-0.94:1.000:. ./.:4:17,68:.:-0.33:1.000:. ./.:6:17,58:.:-0.65:1.000:. ./.:4:24,55:.:-0.52:1.000:. ./.:4:21,56:.:-0.58:1.000:. ./.:4:27,63:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.71:1.000:. ./.:4:21,82:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,51:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,56:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.00:1.000:. ./.:4:15,60:.:-0.65:0.887:. ./.:4:0,107:.: 0.39:1.000:. ./.:4:23,60:.:-0.39:1.000:. ./.:4:6,38:.:-1.65:0.999:. ./.:4:0,94:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.62:1.000:. ./.:4:41,29:.:-0.81:1.000:. ./.:4:27,66:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,45:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.88:0.985:. ./.:4:24,85:.: 0.45:1.000:. ./.:4:22,68:.:-0.16:1.000:. ./.:4:23,74:.: 0.06:1.000:. ./.:4:12,40:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,33:.:-0.91:1.000:. ./.:4:22,57:.:-0.52:1.000:. ./.:4:33,37:.:-0.81:1.000:. ./.:4:29,67:.: 0.03:1.000:. ./.:4:25,43:.:-0.88:1.000:. ./.:4:47,23:.:-0.81:1.000:. ./.:4:62,51:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.39:1.000:. ./.:4:18,83:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,59:.:-1.17:1.000:. ./.:4:40,66:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,96:.: 1.07:1.000:. ./.:4:30,26:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,67:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,31:.:-0.94:1.000:. ./.:4:31,57:.:-0.23:0.904:. ./.:4:15,49:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,62:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.68:1.000:. ./.:4:27,91:.: 0.74:1.000:. ./.:4:44,85:.: 1.10:0.993:. ./.:4:0,99:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,111:.: 1.68:1.000:. ./.:4:24,74:.: 0.10:0.999:. ./.:4:29,67:.: 0.03:1.000:. ./.:4:18,44:.:-1.07:1.000:. ./.:4:23,75:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,61:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,50:.:-1.46:1.000:. ./.:4:20,58:.:-0.55:1.000:. ./.:4:21,47:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.06:1.000:. ./.:4:23,54:.:-0.58:1.000:. ./.:4:51,40:.:-0.13:1.000:. ./.:4:69,84:.: 1.87:1.000:. ./.:4:14,61:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.81:1.000:. ./.:4:26,38:.:-1.00:1.000:. ./.:4:15,60:.:-0.65:1.000:. ./.:4:16,61:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.77:1.000:. ./.:4:17,39:.:-1.26:1.000:. ./.:4:15,45:.:-1.13:1.000:. ./.:4:31,64:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,98:.: 1.81:1.000:. ./.:4:27,74:.: 0.19:1.000:. ./.:4:16,44:.:-1.13:1.000:. ./.:4:19,54:.:-0.71:1.000:. ./.:4:19,51:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.07:1.000:. ./.:4:25,96:.: 0.84:1.000:. ./.:4:18,41:.:-1.17:1.000:. ./.:4:31,99:.: 1.13:1.000:. ./.:4:26,95:.: 0.84:1.000:. ./.:4:29,110:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.35:1.000:. ./.:4:35,109:.: 1.58:1.000:. ./.:4:44,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:34,123:.: 2.00:1.000:. ./.:4:68,70:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,12:.:-2.69:1.000:. ./.:4:30,97:.: 1.03:1.000:. ./.:4:19,85:.: 0.29:1.000:. ./.:4:32,99:.: 1.16:1.000:. ./.:4:49,98:.: 1.68:1.000:. ./.:4:35,99:.: 1.26:1.000:. ./.:4:46,62:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,59:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.35:1.000:. ./.:4:28,69:.: 0.06:1.000:. ./.:4:17,82:.: 0.13:1.000:. ./.:4:36,93:.: 1.10:1.000:. ./.:4:25,76:.: 0.19:1.000:. ./.:4:34,87:.: 0.84:1.000:. ./.:4:29,78:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,129:.: 1.13:0.999:. ./.:4:33,86:.: 0.77:1.000:. ./.:4:36,93:.: 1.10:1.000:. ./.:4:58,55:.: 0.58:1.000:. ./.:4:16,58:.:-0.68:1.000:. ./.:4:22,88:.: 0.48:1.000:. ./.:4:24,59:.:-0.39:1.000:. ./.:4:14,48:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,147:.: 1.68:1.000:. ./.:4:29,80:.: 0.45:1.000:. ./.:4:33,88:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,139:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,149:.: 1.74:1.000:. ./.:4:41,105:.: 1.65:1.000:. ./.:4:31,68:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.81:1.000:. -chr8.1 2050308 chr8.1_002050308 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:306,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:185,40:.: 0.03:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:212,54:.: 0.71:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:198,39:.: 0.23:1.000:. ./.:4:214,38:.: 0.48:1.000:. ./.:4:69,9:.:-2.42:1.000:. ./.:4:52,17:.:-2.57:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:122,36:.:-1.09:1.000:. ./.:4:211,35:.: 0.38:1.000:. ./.:4:244,47:.: 1.13:1.000:. ./.:4:238,48:.: 1.04:0.994:. ./.:4:130,97:.: 0.06:1.000:. ./.:4:312,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:311,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:69,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:39,8:.:-2.94:1.000:. ./.:4:235,44:.: 0.93:1.000:. ./.:4:215,39:.: 0.51:1.000:. ./.:4:236,31:.: 0.73:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:259,52:.: 1.46:1.000:. ./.:4:210,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:42,11:.:-2.84:1.000:. ./.:4:51,9:.:-2.72:1.000:. ./.:3:37,8:.:-2.97:1.000:. ./.:4:184,33:.:-0.11:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:193,57:.: 0.44:1.000:. ./.:4:254,36:.: 1.11:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:172,32:.:-0.32:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:212,46:.: 0.58:1.000:. ./.:4:163,36:.:-0.41:1.000:. ./.:5:294,36:.: 1.78:1.000:. ./.:4:54,12:.:-2.62:1.000:. ./.:4:168,31:.:-0.41:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:164,33:.:-0.44:1.000:. ./.:4:157,46:.:-0.34:1.000:. ./.:4:155,31:.:-0.62:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.34:1.000:. ./.:6:152,17:.:-0.91:1.000:. ./.:4:156,29:.:-0.64:1.000:. ./.:4:182,33:.:-0.14:1.000:. ./.:4:178,36:.:-0.16:1.000:. ./.:4:141,40:.:-0.71:1.000:. ./.:4:192,37:.: 0.09:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:157,33:.:-0.56:1.000:. ./.:4:189,30:.:-0.07:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.21:0.887:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:198,26:.: 0.01:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.26:0.999:. ./.:4:233,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:177,32:.:-0.24:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:135,37:.:-0.86:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:213,34:.: 0.39:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.02:0.985:. ./.:4:195,33:.: 0.08:1.000:. ./.:4:174,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:170,37:.:-0.27:1.000:. ./.:4:178,39:.:-0.11:1.000:. ./.:4:191,51:.: 0.31:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:148,32:.:-0.72:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:126,29:.:-1.14:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:133,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:188,38:.: 0.04:1.000:. ./.:4:156,39:.:-0.47:1.000:. ./.:4:135,27:.:-1.02:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:185,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:173,42:.:-0.14:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:152,26:.:-0.76:0.904:. ./.:4:140,33:.:-0.84:1.000:. ./.:4:146,44:.:-0.56:1.000:. ./.:4:153,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:194,53:.: 0.39:1.000:. ./.:4:228,48:.: 0.88:0.993:. ./.:4:173,31:.:-0.32:1.000:. ./.:4:138,38:.:-0.79:1.000:. ./.:4:290,60:.: 2.11:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:163,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:126,33:.:-1.07:1.000:. ./.:4:147,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:143,31:.:-0.82:1.000:. ./.:4:170,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:157,45:.:-0.36:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:178,33:.:-0.21:1.000:. ./.:4:188,28:.:-0.12:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:150,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:235,53:.: 1.08:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:178,36:.:-0.16:1.000:. ./.:4:346,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:173,43:.:-0.12:1.000:. ./.:4:158,32:.:-0.56:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:128,34:.:-1.02:1.000:. ./.:4:156,33:.:-0.57:1.000:. ./.:4:179,36:.:-0.14:1.000:. ./.:4:198,34:.: 0.14:1.000:. ./.:4:135,20:.:-1.14:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:293,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:176,43:.:-0.07:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:358,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:55,22:.:-2.44:1.000:. ./.:4:157,25:.:-0.69:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:203,37:.: 0.28:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:202,34:.: 0.21:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:185,50:.: 0.19:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:195,33:.: 0.08:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:199,44:.: 0.33:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:254,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:174,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:376,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:190,36:.: 0.04:1.000:. ./.:4:232,34:.: 0.71:1.000:. ./.:4:208,46:.: 0.51:1.000:. ./.:4:268,49:.: 1.56:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.53:1.000:. -chr8.1 2191627 chr8.1_002191627 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,76:0.70:-0.55:1.000:0.988 0/1/1/1:4:27,65:0.71:-1.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,61:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,144:0.71: 2.72:1.000:0.989 0/0/1/1:4:111,91:0.47: 2.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,24:0.42:-2.19:1.000:0.915 0/0/0/1:4:98,27:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,92:0.72: 0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,45:0.77:-2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,63:0.57:-0.45:1.000:0.935 0/0/1/1:4:54,81:0.61: 0.37:1.000:0.744 0/0/1/1:4:60,59:0.51:-0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,104:0.72: 0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,105:0.80: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,78:0.45: 1.87:1.000:0.982 0/0/1/1:4:89,61:0.43: 0.88:0.994:0.936 0/1/1/1:4:34,155:0.82: 2.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,141:0.77: 2.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,148:1.00: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,82:0.71:-0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,60:0.46: 0.40:1.000:0.986 0/0/1/1:4:74,48:0.41:-0.07:1.000:0.889 0/1/1/1:4:22,39:0.64:-2.15:1.000:0.715 0/1/1/1:4:42,97:0.70: 0.51:1.000:0.983 0/0/0/1:4:127,32:0.24: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,117:0.79: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,129:0.75: 1.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,98:0.76: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,27:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,77:0.68:-0.35:1.000:0.944 0/0/1/1:4:50,47:0.50:-0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,58:0.78:-1.71:1.000:1.000 0/1/1:3:18,26:0.60:-2.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,72:0.47: 1.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:74,80:0.53: 1.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:76,78:0.52: 1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,91:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,108:0.76: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,90:0.77:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,97:0.74: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,105:0.73: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,59:0.54:-0.41:1.000:0.990 0/0/0/1:4:78,26:0.29:-0.69:1.000:0.993 0/0/1/1:4:84,56:0.42: 0.54:1.000:0.915 0/0/1/1/1:5:68,109:0.62: 1.80:1.000:0.965 0/0/1/1:4:47,54:0.54:-0.79:1.000:0.986 0/0/1/1:4:45,56:0.56:-0.79:1.000:0.964 0/0/1/1:4:55,33:0.40:-1.23:1.000:0.773 0/0/1/1:4:49,80:0.62: 0.16:1.000:0.515 0/1/1/1:4:47,152:0.76: 2.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,96:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,104:0.76: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,65:0.51: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,70:0.52: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:51,53:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,112:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,97:0.72: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:31,81:0.72:-0.41:1.000:0.750 0/1/1/1:4:26,83:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,63:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,44:0.45:-0.76:1.000:0.978 0/0/1/1:4:52,63:0.56:-0.31:1.000:0.974 0/0/1/1:4:63,45:0.44:-0.55:1.000:0.958 0/0/1/1:4:62,56:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,44:0.57:-1.57:1.000:0.944 0/0/1/1:4:51,54:0.52:-0.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,98:0.80:-0.07:0.887:1.000 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,74:0.60: 0.03:1.000:0.812 0/0/1/1:4:43,46:0.53:-1.20:0.999:0.993 0/0/1/1:4:73,60:0.47: 0.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:83,60:0.44: 0.64:1.000:0.963 0/1/1/1:4:37,114:0.75: 0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,16:0.21:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,125:1.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,64:0.53:-0.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,60:0.48: 0.13:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,134:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,64:0.71:-1.16:0.985:0.992 0/1/1/1:4:39,123:0.76: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,87:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,55:0.56:-0.82:1.000:0.971 0/0/1/1:4:82,66:0.46: 0.81:1.000:0.988 0/0/0/1:4:136,35:0.25: 1.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,95:0.80:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,91:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,36:0.47:-1.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,102:0.77: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,137:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,39:0.48:-1.37:1.000:0.994 0/1/1/1:4:39,99:0.72: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:88,38:0.33: 0.06:1.000:0.910 0/1/1/1:4:42,84:0.67: 0.06:1.000:0.913 0/0/1/1:4:62,51:0.47:-0.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:64,63:0.51: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,71:0.53: 0.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,71:0.80:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,111:0.78: 0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,68:0.56:-0.01:0.904:0.973 0/1/1/1:4:29,79:0.73:-0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,109:0.82: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,64:0.53:-0.04:1.000:0.992 0/1/1/1:4:38,68:0.64:-0.62:1.000:0.737 0/0/1/1:4:87,73:0.47: 1.22:0.993:0.992 0/0/0/1:4:116,37:0.28: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,24:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,108:0.68: 1.15:1.000:0.963 0/1/1/1:4:33,87:0.72:-0.14:0.999:0.996 0/0/1/1:4:59,66:0.54: 0.03:1.000:0.989 0/1/1/1:4:16,51:0.76:-1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,117:0.76: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,38:0.34:-0.01:1.000:0.888 0/0/0/1:4:77,30:0.31:-0.58:1.000:0.968 0/0/1/1:4:56,76:0.58: 0.27:1.000:0.906 0/0/1/1:4:54,55:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,78:0.53: 0.85:1.000:0.991 0/0/1/1:4:49,61:0.56:-0.48:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,95:0.73: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,62:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:32,82:0.72:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:73,22:0.27:-0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,35:0.44:-1.40:1.000:0.967 0/0/1/1:4:51,54:0.52:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,56:0.56:-0.79:1.000:0.964 0/0/1/1:4:66,60:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,24:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,30:0.48:-2.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,60:0.57:-0.58:1.000:0.952 0/1/1/1:4:27,81:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,121:0.79: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,79:0.69:-0.31:1.000:0.969 0/1/1/1:4:17,94:0.85:-0.45:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,73:0.80:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,81:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,71:0.51: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,34:0.31:-0.11:1.000:0.967 0/1/1/1:4:26,83:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,58:0.72:-1.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,99:0.54: 2.07:1.000:0.985 0/1/1/1:4:56,120:0.68: 1.77:1.000:0.960 0/1/1/1:4:39,100:0.72: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,38:0.30: 0.74:1.000:0.989 0/0/1/1:4:95,86:0.49: 1.94:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,107:0.71: 0.88:1.000:0.993 0/1/1/1:4:37,94:0.72: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,28:0.57:-2.53:1.000:0.954 0/0/1/1:4:36,50:0.59:-1.30:1.000:0.879 0/1/1/1:4:34,102:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,90:0.66: 0.40:1.000:0.890 0/1/1/1:4:52,120:0.70: 1.63:1.000:0.983 0/0/1/1:4:79,73:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,74:0.75:-0.89:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,62:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,55:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,43:0.45:-0.86:1.000:0.981 0/1/1/1:4:30,84:0.73:-0.35:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,73:0.70:-0.69:1.000:0.987 0/0/1/1:4:78,71:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,35:0.39:-0.93:1.000:0.637 0/0/1/1:4:68,75:0.53: 0.64:0.999:0.991 0/0/1/1:4:59,62:0.52:-0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,56:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,64:0.74:-1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,62:0.56:-0.41:1.000:0.966 0/0/1/1:4:60,61:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,54:0.48:-0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,85:0.79:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,16:0.25:-1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,33:0.22: 1.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,71:0.44: 1.53:1.000:0.964 0/1/1/1:4:47,114:0.71: 1.26:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,56:0.45: 0.13:1.000:0.983 0/0/0/1:4:104,31:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,40:0.29: 1.15:1.000:0.992 0/0/1/1:4:101,89:0.48: 2.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,46:0.42:-0.31:1.000:0.915 0/1/1/1:4:35,107:0.75: 0.61:1.000:0.999 -chr8.1 2476072 chr8.1_002476072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:216,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:89,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.70:0.994:. ./.:4:195,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:238,1:.: 1.45:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:38,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.72:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.78:1.000:. ./.:3:24,0:.:-3.60:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.79:1.000:. ./.:5:253,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:276,1:.: 2.35:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.39:1.000:. ./.:6:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.25:0.887:. ./.:4:187,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:236,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.86:0.999:. ./.:4:245,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:185,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.31:0.985:. ./.:4:197,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:215,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:84,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.57:0.904:. ./.:4:143,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.79:0.993:. ./.:4:191,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:194,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:154,1:.:-0.52:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:201,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:178,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:149,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:155,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.58:1.000:. -chr8.1 2611249 chr8.1_002611249 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.39:0.994:. ./.:4:34,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.59:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:77,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.69:1.000:. ./.:5:69,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.42:1.000:. ./.:6:40,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.76:0.887:. ./.:4:44,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:78,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.59:0.999:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:0.985:. ./.:4:47,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:89,0:.: 2.96:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.34:0.904:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.03:0.993:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:55,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:44,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:0.999:. ./.:4:35,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.82:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.05:1.000:. -chr8.1 2834289 chr8.1_002834289 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:97,123:0.54:-0.18:1.000:0.986 0/0/1/1:4:97,121:0.54:-0.21:1.000:0.988 0/0/1/1:4:130,123:0.47: 0.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:184,65:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,222:0.72: 1.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:164,158:0.47: 1.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,95:0.47:-0.59:1.000:0.992 0/0/0/1:4:204,67:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,118:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,30:0.38:-2.63:1.000:0.610 0/0/0/1:4:63,16:0.20:-2.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,117:0.42: 0.73:1.000:0.893 0/0/1/1:4:160,145:0.46: 1.27:1.000:0.988 0/0/0/1:4:196,67:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:115,111:0.47:-0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:242,85:0.26: 1.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:267,1:0.00: 0.64:0.994:1.000 0/0/1/1:4:195,137:0.40: 1.73:1.000:0.793 0/0/1/1:4:139,162:0.52: 1.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:78,220:0.73: 1.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,47:0.63:-2.68:1.000:0.571 0/0/1/1:4:149,135:0.46: 0.91:1.000:0.987 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,64:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,22:0.40:-3.02:1.000:0.812 0/0/0/1:4:189,74:0.28: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/0:4:258,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,57:0.22: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,151:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,142:0.56: 0.30:1.000:0.972 0/0/0/0:4:224,1:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,55:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,25:0.42:-2.95:1.000:0.932 0/1/1/1:4:25,55:0.68:-2.56:1.000:0.942 0/1/1:3:11,15:0.56:-3.48:1.000:0.984 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,53:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:221,78:0.26: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,70:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,63:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,148:0.54: 0.57:1.000:0.985 0/0/0/1:4:162,62:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,55:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,54:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,68:0.30:-0.21:1.000:0.981 0/0/0/0/1:5:256,79:0.23: 1.78:1.000:0.972 0/0/0/1:4:111,48:0.29:-1.22:1.000:0.989 0/0/0/1:4:126,67:0.34:-0.64:1.000:0.881 0/0/1/1:4:117,109:0.47:-0.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,38:0.22:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,144:0.52: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,94:0.44:-0.43:1.000:0.973 0/0/0/1:4:192,49:0.20: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,116:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:141,61:0.30:-0.48:1.000:0.989 0/0/1/1:4:107,119:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,112:0.56:-0.60:1.000:0.969 0/0/0/1:4:134,59:0.30:-0.64:1.000:0.986 0/0/0/0/0/1:6:151,35:0.18:-0.76:1.000:0.964 0/0/0/1:4:162,69:0.29: 0.01:1.000:0.991 0/0/0/1:4:171,46:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:244,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,96:0.47:-0.53:1.000:0.991 0/0/0/1:4:183,72:0.28: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,100:0.40: 0.16:1.000:0.823 0/0/0/1:4:122,37:0.23:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,133:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,156:0.76:-0.47:0.887:1.000 0/0/1/1:4:59,103:0.62:-1.16:1.000:0.539 0/0/0/0:4:271,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,37:0.23:-1.20:0.999:1.000 0/0/1/1:4:134,131:0.48: 0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:161,61:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,115:0.54:-0.43:1.000:0.984 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,94:0.50:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,129:0.47: 0.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,103:0.47:-0.30:1.000:0.991 0/1/1/1:4:59,186:0.75: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,38:0.28:-1.62:0.985:0.997 0/0/1/1:4:87,104:0.53:-0.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:107,147:0.56: 0.40:1.000:0.962 0/0/0/1:4:184,47:0.20: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,69:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,125:0.74:-1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,152:0.73:-0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:67,145:0.67:-0.31:1.000:0.929 0/0/1/1:4:82,103:0.54:-0.77:1.000:0.987 0/0/1/1:4:97,98:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,114:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,147:0.57: 0.37:1.000:0.952 0/0/0/1:4:114,43:0.27:-1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,99:0.52:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,52:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,101:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,88:0.41:-0.35:1.000:0.840 0/0/0/0:4:220,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,67:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:111,95:0.45:-0.42:1.000:0.976 0/1/1/1:4:69,180:0.71: 0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,96:0.55:-1.05:1.000:0.978 0/0/1/1:4:136,130:0.47: 0.61:0.904:0.993 0/0/1/1:4:105,99:0.47:-0.45:1.000:0.992 0/1/1/1:4:69,182:0.71: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,106:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,149:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,171:0.54: 1.27:0.993:0.985 0/0/0/1:4:204,76:0.27: 0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:178,60:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:179,193:0.50: 2.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,170:0.74:-0.08:0.999:0.999 0/0/0/1:4:168,52:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,119:0.74:-1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,125:0.55:-0.18:1.000:0.977 0/0/0/1:4:167,53:0.24:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,51:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,40:0.23:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,97:0.43:-0.23:1.000:0.953 0/0/0/1:4:160,51:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,56:0.30:-0.86:1.000:0.982 0/1/1/1:4:58,173:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,128:0.46: 0.66:1.000:0.988 0/0/0/1:4:129,57:0.30:-0.76:1.000:0.986 0/0/0/1:4:156,58:0.27:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:164,43:0.20:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,87:0.46:-0.84:1.000:0.990 0/0/0/1:4:134,30:0.18:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,43:0.25:-1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:110,126:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:215,65:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,39:0.27:-1.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,103:0.47:-0.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:161,54:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:184,195:0.50: 2.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,190:0.71: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:149,44:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,126:0.68:-0.84:1.000:0.964 0/0/1/1:4:103,109:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:151,56:0.27:-0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:191,47:0.19: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,129:0.58:-0.21:1.000:0.926 0/0/1/1:4:88,84:0.47:-0.99:1.000:0.993 0/0/0/1:4:212,80:0.27: 1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,152:0.54: 0.69:1.000:0.984 0/0/0/0:4:227,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,62:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,91:0.32: 0.74:1.000:0.943 0/1/1/1:4:62,171:0.72: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,74:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,155:0.49: 1.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,10:0.14:-2.71:1.000:0.961 0/0/1/1:4:95,100:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,142:0.45: 1.32:1.000:0.976 0/0/1/1:4:164,129:0.43: 1.07:1.000:0.937 0/0/1/1:4:161,157:0.48: 1.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:154,73:0.31:-0.06:1.000:0.967 0/0/0/1:4:148,66:0.30:-0.28:1.000:0.984 0/1/1/1:4:73,209:0.73: 0.88:1.000:0.998 0/0/0/1:4:142,63:0.30:-0.43:1.000:0.985 0/0/0/1:4:179,56:0.23: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,130:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,65:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,64:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,150:0.47: 1.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:124,102:0.44:-0.08:1.000:0.962 0/0/1/1:4:130,134:0.49: 0.57:0.999:0.996 0/0/1/1:4:142,123:0.45: 0.59:1.000:0.979 0/0/0/0:4:241,1:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,118:0.48: 0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:150,47:0.23:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,144:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:202,59:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,108:0.56:-0.72:1.000:0.969 0/0/0/1:4:152,46:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,104:0.26: 2.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:237,73:0.23: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,141:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,135:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:221,77:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:374,0:0.00: 2.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,86:0.24: 2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,127:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,140:0.55: 0.27:1.000:0.976 -chr8.1 3104185 chr8.1_003104185 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:233,210:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:93,289:0.74:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,212:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:379,123:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:251,221:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:276,275:0.51: 0.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:297,100:0.26:-0.22:1.000:0.999 0/0/0/0:4:411,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,331:0.76: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,135:0.41:-0.68:1.000:0.865 0/0/1/1:4:198,143:0.43:-0.65:1.000:0.946 0/0/1/1:4:201,301:0.60: 0.58:1.000:0.787 0/0/1/1:4:226,216:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:237,222:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,350:0.77: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:413,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:407,140:0.26: 0.93:0.994:0.999 0/0/1/1:4:222,233:0.52: 0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:145,423:0.73: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:240,237:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:259,172:0.41: 0.04:1.000:0.855 0/0/0/1:4:304,91:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:384,133:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:236,224:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,77:0.46:-1.94:1.000:0.987 0/0/1/1:4:220,273:0.56: 0.51:1.000:0.968 0/0/0/1:4:358,130:0.27: 0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:321,111:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:136,365:0.72: 0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:134,425:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:428,169:0.29: 1.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:196,221:0.54:-0.07:1.000:0.989 0/0/0/0:4:390,23:0.06:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,171:0.43:-0.14:1.000:0.945 0/1/1:3:118,163:0.58:-1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:324,113:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:212,230:0.53: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:198,227:0.54:-0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:227,244:0.53: 0.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:351,157:0.31: 0.63:1.000:0.965 0/0/0/1:4:363,74:0.17: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:299,119:0.29:-0.06:1.000:0.992 0/0/1/1:4:235,274:0.55: 0.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:303,112:0.27:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:257,211:0.46: 0.32:1.000:0.989 0/0/1/1:4:217,206:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:422,234:0.36: 1.76:1.000:0.943 0/0/1/1:4:877,971:0.53:10.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:295,127:0.31:-0.03:1.000:0.978 0/0/1/1:4:330,341:0.52: 1.87:1.000:0.995 0/0/0/0:4:459,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,392:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:266,71:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,215:0.53:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:277,93:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:348,127:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:295,85:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:263,256:0.51: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:174,205:0.55:-0.36:1.000:0.982 0/0/0/0/0/1:6:261,83:0.24:-0.63:1.000:0.582 0/0/0/1:4:323,122:0.28: 0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,177:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:377,154:0.30: 0.80:1.000:0.989 0/0/0/1:4:373,128:0.26: 0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,200:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:191,149:0.45:-0.66:1.000:0.979 0/0/1/1:4:220,211:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:367,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:298,222:0.44: 0.72:0.887:0.963 0/0/1/1:4:181,173:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:356,113:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:289,118:0.30:-0.15:0.999:0.989 0/0/0/1:4:408,110:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:309,124:0.29: 0.05:1.000:0.991 0/0/1/1:4:254,212:0.47: 0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:322,95:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,291:0.73:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:244,163:0.41:-0.15:1.000:0.864 0/0/0/1:4:275,86:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,198:0.46: 0.09:1.000:0.990 0/1/1/1:4:89,228:0.71:-0.83:0.985:0.990 0/0/1/1:4:184,177:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:236,224:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:163,163:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:365,128:0.26: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/0:4:428,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:173,132:0.44:-0.93:1.000:0.972 0/0/1/1:4:156,170:0.53:-0.77:1.000:0.992 0/1/1/1:4:88,262:0.73:-0.58:1.000:0.998 0/1/1/1:4:112,281:0.70:-0.25:1.000:0.988 0/0/0/1:4:373,104:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,76:0.23:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,271:0.68:-0.25:1.000:0.952 0/0/0/1:4:248,97:0.29:-0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:206,178:0.48:-0.32:1.000:0.994 0/0/0/0:4:411,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,84:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,77:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:358,110:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,194:0.53:-0.43:1.000:0.991 0/0/1/1:4:203,183:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:236,185:0.45:-0.04:1.000:0.980 0/1/1/1:4:75,191:0.71:-1.22:1.000:0.990 0/0/0/1:4:280,70:0.20:-0.58:0.904:1.000 0/0/0/1:4:329,98:0.23: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,143:0.44:-0.73:1.000:0.971 0/0/0/1:4:280,78:0.22:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,114:0.28:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:266,250:0.50: 0.69:0.993:0.997 0/0/0/0:4:352,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,72:0.22:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:460,162:0.26: 1.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:195,130:0.41:-0.77:0.999:0.861 0/0/1/1:4:220,150:0.42:-0.43:1.000:0.892 0/0/1/1:4:191,130:0.41:-0.80:1.000:0.890 0/1/1/1:4:86,276:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:358,2:0.01:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:350,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,152:0.47:-0.73:1.000:0.993 0/0/1/1:4:161,115:0.43:-1.15:1.000:0.938 0/0/1/1:4:211,182:0.48:-0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:169,136:0.46:-0.93:1.000:0.986 0/0/1/1:4:225,173:0.45:-0.21:1.000:0.975 0/0/0/1:4:378,127:0.26: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:209,182:0.48:-0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:200,185:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:291,93:0.25:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,83:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,147:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,145:0.47:-0.86:1.000:0.993 0/0/1/1:4:192,178:0.49:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/0:4:414,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,118:0.49:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:343,82:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,77:0.21:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:408,145:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:190,171:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,98:0.28:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:211,135:0.40:-0.61:1.000:0.785 0/1/1/1:4:101,203:0.66:-0.93:1.000:0.877 0/0/0/1:4:327,108:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:433,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,310:0.72:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:256,79:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:299,234:0.45: 0.82:1.000:0.980 0/0/1/1:4:332,277:0.47: 1.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:239,243:0.52: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:338,109:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:260,254:0.51: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,140:0.45:-0.80:1.000:0.975 0/0/1/1:4:254,263:0.52: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:201,204:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:215,138:0.40:-0.56:1.000:0.792 0/0/1/1:4:166,152:0.49:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:416,132:0.24: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,108:0.25: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:119,347:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:219,211:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,189:0.52:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:221,201:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:302,94:0.24:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:385,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,219:0.56:-0.21:1.000:0.972 0/0/0/1:4:305,94:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:353,149:0.30: 0.58:1.000:0.983 0/0/0/1:4:335,118:0.26: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:288,97:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:283,105:0.27:-0.29:0.999:0.997 0/0/0/1:4:343,106:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:308,102:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,172:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,164:0.51:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,196:0.48:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:316,69:0.18:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:330,89:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:274,91:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:546,1:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:326,104:0.25: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:368,112:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:264,61:0.19:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:513,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:396,152:0.28: 0.93:1.000:0.995 0/0/0/0:4:505,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,93:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:214,183:0.47:-0.22:1.000:0.993 -chr8.1 3280192 chr8.1_003280192 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:102,292:.: 0.09:1.000:. ./.:4:169,165:.:-0.68:1.000:. ./.:4:197,175:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.38:1.000:. ./.:4:264,218:.: 1.22:1.000:. ./.:4:232,228:.: 0.93:1.000:. ./.:4:88,252:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,438:.: 0.65:1.000:. ./.:4:200,205:.: 0.23:1.000:. ./.:4:114,98:.:-2.24:1.000:. ./.:4:62,223:.:-1.31:1.000:. ./.:4:182,272:.: 0.86:1.000:. ./.:4:186,175:.:-0.33:1.000:. ./.:4:117,328:.: 0.74:1.000:. ./.:4:190,194:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,430:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,455:.: 0.87:0.994:. ./.:4:226,228:.: 0.86:1.000:. ./.:4:301,226:.: 1.79:1.000:. ./.:4:295,260:.: 2.15:1.000:. ./.:4:82,101:.:-2.61:1.000:. ./.:4:104,272:.:-0.14:1.000:. ./.:4:1,420:.: 0.43:1.000:. ./.:4:112,272:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,60:.:-3.49:1.000:. ./.:4:125,368:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,395:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,350:.:-0.47:1.000:. ./.:4:273,234:.: 1.53:1.000:. ./.:4:226,244:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,515:.: 1.64:1.000:. ./.:4:94,278:.:-0.19:1.000:. ./.:4:24,99:.:-3.38:1.000:. ./.:4:108,108:.:-2.19:1.000:. ./.:3:75,44:.:-3.43:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.29:1.000:. ./.:4:118,337:.: 0.87:1.000:. ./.:4:104,273:.:-0.13:1.000:. ./.:4:111,317:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,469:.: 1.05:1.000:. ./.:4:97,261:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,359:.:-0.36:1.000:. ./.:4:112,334:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,322:.:-0.83:1.000:. ./.:4:221,220:.: 0.69:1.000:. ./.:4:122,284:.: 0.24:1.000:. ./.:5:117,398:.: 1.64:1.000:. ./.:4:136,390:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,352:.:-0.45:1.000:. ./.:4:272,200:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,267:.:-1.54:1.000:. ./.:4:242,205:.: 0.77:1.000:. ./.:4:81,255:.:-0.65:1.000:. ./.:4:96,296:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,234:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,483:.: 1.23:1.000:. ./.:4:93,286:.:-0.10:1.000:. ./.:4:99,293:.: 0.06:1.000:. ./.:4:108,249:.:-0.38:1.000:. ./.:6:0,309:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,399:.: 0.15:1.000:. ./.:4:103,262:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,406:.: 0.24:1.000:. ./.:4:102,267:.:-0.23:1.000:. ./.:4:105,329:.: 0.60:1.000:. ./.:4:203,178:.:-0.08:1.000:. ./.:4:89,247:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.32:1.000:. ./.:4:228,207:.: 0.61:0.887:. ./.:4:1,303:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,467:.: 1.02:1.000:. ./.:4:102,275:.:-0.13:0.999:. ./.:4:147,347:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,368:.:-0.24:1.000:. ./.:4:88,241:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,337:.:-0.64:1.000:. ./.:4:189,207:.: 0.11:1.000:. ./.:4:248,185:.: 0.59:1.000:. ./.:4:110,296:.: 0.24:1.000:. ./.:4:250,226:.: 1.14:1.000:. ./.:4:91,188:.:-1.38:0.985:. ./.:4:143,341:.: 1.24:1.000:. ./.:4:128,359:.: 1.28:1.000:. ./.:4:75,226:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,434:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,368:.:-0.24:1.000:. ./.:4:175,146:.:-0.84:1.000:. ./.:4:172,174:.:-0.52:1.000:. ./.:4:198,172:.:-0.22:1.000:. ./.:4:186,195:.:-0.08:1.000:. ./.:4:87,251:.:-0.63:1.000:. ./.:4:98,230:.:-0.76:1.000:. ./.:4:214,207:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,261:.:-1.61:1.000:. ./.:4:128,329:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,362:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,276:.:-0.19:1.000:. ./.:4:91,261:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,407:.: 0.26:1.000:. ./.:4:130,308:.: 0.65:1.000:. ./.:4:194,160:.:-0.42:1.000:. ./.:4:201,210:.: 0.31:1.000:. ./.:4:162,143:.:-1.05:1.000:. ./.:4:100,299:.: 0.15:0.904:. ./.:4:117,244:.:-0.33:1.000:. ./.:4:187,195:.:-0.06:1.000:. ./.:4:69,185:.:-1.70:1.000:. ./.:4:105,309:.: 0.35:1.000:. ./.:4:275,257:.: 1.85:0.993:. ./.:4:0,324:.:-0.81:1.000:. ./.:4:101,266:.:-0.26:1.000:. ./.:4:135,424:.: 2.20:1.000:. ./.:4:212,197:.: 0.28:0.999:. ./.:4:114,338:.: 0.83:1.000:. ./.:4:186,191:.:-0.13:1.000:. ./.:4:247,203:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,340:.:-0.60:1.000:. ./.:4:1,328:.:-0.74:1.000:. ./.:4:97,268:.:-0.28:1.000:. ./.:4:194,186:.:-0.09:1.000:. ./.:4:103,307:.: 0.29:1.000:. ./.:4:100,281:.:-0.08:1.000:. ./.:4:233,192:.: 0.49:1.000:. ./.:4:100,292:.: 0.06:1.000:. ./.:4:81,277:.:-0.37:1.000:. ./.:4:108,335:.: 0.72:1.000:. ./.:4:100,267:.:-0.26:1.000:. ./.:4:81,232:.:-0.95:1.000:. ./.:4:74,209:.:-1.33:1.000:. ./.:4:87,205:.:-1.22:1.000:. ./.:4:170,144:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,421:.: 0.43:1.000:. ./.:4:82,178:.:-1.63:1.000:. ./.:4:122,293:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,358:.:-0.37:1.000:. ./.:4:146,472:.: 2.96:1.000:. ./.:4:197,236:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,310:.:-0.99:1.000:. ./.:4:158,159:.:-0.90:1.000:. ./.:4:193,171:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,448:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,388:.: 0.01:1.000:. ./.:4:199,192:.: 0.05:1.000:. ./.:4:102,242:.:-0.55:1.000:. ./.:4:104,365:.: 1.05:1.000:. ./.:4:159,350:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.20:1.000:. ./.:4:81,301:.:-0.06:1.000:. ./.:4:128,346:.: 1.11:1.000:. ./.:4:199,156:.:-0.41:1.000:. ./.:4:110,335:.: 0.74:1.000:. ./.:4:193,160:.:-0.44:1.000:. ./.:4:82,128:.:-2.26:1.000:. ./.:4:155,125:.:-1.37:1.000:. ./.:4:113,305:.: 0.40:1.000:. ./.:4:85,325:.: 0.29:1.000:. ./.:4:269,252:.: 1.71:1.000:. ./.:4:132,333:.: 1.00:1.000:. ./.:4:87,234:.:-0.84:1.000:. ./.:4:236,213:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,396:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1,301:.:-1.09:1.000:. ./.:4:197,173:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,390:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,480:.: 1.19:1.000:. ./.:4:99,263:.:-0.32:1.000:. ./.:4:92,274:.:-0.27:1.000:. ./.:4:98,306:.: 0.22:0.999:. ./.:4:113,242:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,411:.: 0.31:1.000:. ./.:4:181,149:.:-0.73:1.000:. ./.:4:76,241:.:-0.90:1.000:. ./.:4:212,175:.: 0.00:1.000:. ./.:4:100,224:.:-0.81:1.000:. ./.:4:105,285:.: 0.04:1.000:. ./.:4:102,227:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,408:.: 0.27:1.000:. ./.:4:123,339:.: 0.96:1.000:. ./.:4:105,318:.: 0.46:1.000:. ./.:4:85,263:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,418:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,509:.: 1.56:1.000:. ./.:4:0,507:.: 1.53:1.000:. ./.:4:84,287:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,283:.:-0.08:1.000:. -chr8.1 3404395 chr8.1_003404395 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:72,189:0.74: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,106:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,165:0.73: 0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:113,127:0.55: 0.20:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,295:1.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,149:0.51: 1.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,123:0.72:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,112:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:120,115:0.51: 0.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:7,65:0.91:-3.03:1.000:0.937 0/0/0/1:4:58,22:0.30:-2.88:1.000:0.987 0/0/1/1:4:179,108:0.40: 1.10:1.000:0.755 0/1/1/1:4:61,182:0.76: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,134:0.51: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:128,104:0.47: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:117,127:0.54: 0.27:1.000:0.989 0/0/0/1:4:207,66:0.26: 0.83:0.994:0.998 0/1/1/1:4:80,196:0.73: 0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,248:0.78: 1.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,293:1.00: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-2.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,205:0.79: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,140:0.55: 0.66:1.000:0.982 0/0/1/1:4:105,88:0.47:-0.71:1.000:0.993 0/1/1/1:4:8,25:0.77:-3.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,131:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:175,60:0.28: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:129,105:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:70,228:0.78: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,197:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,53:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,103:0.57:-0.86:1.000:0.936 1/1/1/1:4:1,20:0.96:-4.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,87:0.87:-2.48:1.000:0.908 1/1/1:3:4,32:0.90:-3.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:213,63:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,89:0.43:-0.30:1.000:0.957 0/0/1/1:4:124,141:0.55: 0.68:1.000:0.981 0/0/1/1:4:129,117:0.49: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,121:0.54: 0.04:1.000:0.988 0/1/1/1:4:51,180:0.79: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,101:0.45: 0.06:1.000:0.982 0/1/1/1:4:80,210:0.74: 1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,108:0.46: 0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:147,136:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,110:0.47: 0.29:1.000:0.991 0/0/0/1/1:5:198,133:0.42: 1.95:1.000:0.956 0/0/0/1:4:25,4:0.16:-3.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,122:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,142:0.72:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,161:0.74:-0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,213:0.76: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,140:0.73:-0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,144:0.72:-0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,165:0.73: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,98:0.46:-0.15:1.000:0.987 0/1/1/1:4:69,174:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:70,197:0.75: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,181:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:108,106:0.51:-0.30:1.000:0.881 0/0/1/1:4:106,117:0.54:-0.13:1.000:0.987 0/0/0/1:4:166,56:0.28:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:223,54:0.22: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,146:0.70:-0.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:200,59:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,169:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,68:0.49:-1.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,173:0.75: 0.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,232:1.00: 0.04:0.887:1.000 0/0/1/1:4:129,103:0.46: 0.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:216,65:0.25: 0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,138:0.76:-0.84:0.999:1.000 0/0/1/1:4:136,130:0.51: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,125:0.53: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,124:0.54: 0.10:1.000:0.984 0/0/0/1:4:134,52:0.30:-0.84:1.000:0.984 0/1/1/1:4:49,168:0.79:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,171:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,207:0.81: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,264:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,39:0.21:-0.42:0.985:1.000 0/0/1/1:4:139,120:0.48: 0.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:146,141:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,46:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,61:0.32:-0.48:1.000:0.955 0/0/1/1:4:147,116:0.46: 0.64:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,191:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,143:0.71:-0.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:50,182:0.80: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,103:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,133:0.75:-0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,182:0.80: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,199:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:90,91:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:117,113:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,121:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,150:0.73:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:126,117:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,122:0.49: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,57:0.26: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,128:0.76:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,173:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,122:0.73:-1.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,109:0.51:-0.21:0.904:0.996 0/1/1/1:4:45,158:0.79:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,155:0.74:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,150:0.76:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,163:0.71: 0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:143,155:0.54: 1.31:0.993:0.989 0/0/1/1:4:140,143:0.52: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,118:0.53:-0.01:1.000:0.991 0/1/1/1:4:83,259:0.77: 2.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 0.47:0.999:1.000 0/0/0/1:4:202,58:0.25: 0.58:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,166:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,190:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,115:0.54:-0.21:1.000:0.986 0/0/1/1:4:116,109:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,113:0.49: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,96:0.48:-0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,103:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:181,46:0.23:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,222:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,170:0.71: 0.33:1.000:0.989 0/0/1/1:4:121,101:0.47:-0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:120,116:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,122:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,103:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,65:0.48:-1.73:1.000:0.995 0/0/0/1:4:138,56:0.31:-0.69:1.000:0.973 0/1/1/1:4:60,163:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:109,99:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,76:0.50:-1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,150:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,104:0.53:-0.51:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,295:1.00: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,163:0.71: 0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:109,117:0.53:-0.07:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,242:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,105:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:145,131:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,126:0.52: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,118:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,137:0.76:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,153:0.52: 1.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:83,203:0.73: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,142:0.51: 1.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,116:0.46: 0.64:1.000:0.987 0/0/1/1:4:149,134:0.49: 1.02:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,209:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,202:0.74: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,180:0.74: 0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,47:0.65:-2.99:1.000:0.811 0/0/1/1:4:100,80:0.46:-0.96:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,267:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,169:0.71: 0.26:1.000:0.993 0/1/1/1:4:81,213:0.74: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,120:0.48: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,114:0.49: 0.22:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,239:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,99:0.48:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,181:0.78: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,108:0.51:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:61,181:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,108:0.52:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,187:0.73: 0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,125:0.56: 0.04:1.000:0.973 0/0/1/1:4:166,148:0.49: 1.62:0.999:0.996 0/1/1/1:4:73,175:0.72: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,117:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,170:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,100:0.54:-0.71:1.000:0.990 0/1/1/1:4:48,162:0.79:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,139:0.73:-0.67:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,206:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,92:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:74,202:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,206:0.80: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,174:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,184:0.73: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,121:0.50: 0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,57:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:71,227:0.78: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,113:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,120:0.54: 0.02:1.000:0.989 -chr8.1 3449903 chr8.1_003449903 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:153,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.01:0.994:. ./.:4:215,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.30:1.000:. ./.:3:60,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.73:1.000:. ./.:5:179,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:136,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:262,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.85:0.887:. ./.:4:76,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:107,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:140,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:275,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:267,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.09:0.985:. ./.:4:173,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.65:0.904:. ./.:4:214,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.50:0.993:. ./.:4:180,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:273,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.52:0.999:. ./.:4:110,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:239,1:.: 1.71:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:111,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.13:0.999:. ./.:4:126,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.97:1.000:. -chr8.1 3778959 chr8.1_003778959 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:35,9:0.25: 1.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,6:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,19:0.47: 1.44:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,12:0.46:-0.12:1.000:0.990 0/1/1/1:4:9,30:0.75: 1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,26:0.64: 1.23:1.000:0.717 0/0/0/1:4:12,6:0.37:-1.05:1.000:0.604 0/0/1/1:4:18,14:0.46: 0.40:1.000:0.986 0/1/1/1:4:8,25:0.74: 0.50:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,3:0.97:-2.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:0.97:-2.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,10:0.36: 0.30:1.000:0.718 0/1/1/1:4:11,28:0.70: 1.13:1.000:0.986 0/0/1/1:4:18,19:0.52: 0.92:1.000:0.994 0/0/1/1:4:10,17:0.62:-0.12:1.000:0.505 0/0/0/1:4:22,6:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,6:0.18: 1.44:0.994:0.999 0/1/1/1:4:7,24:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,21:0.67: 0.30:1.000:0.904 0/0/1/1:4:21,23:0.53: 1.65:1.000:0.991 0/1/1/1:4:1,2:0.66:-2.61:1.000:0.849 0/0/0/0:4:36,2:0.07: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,6:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,14:0.55:-0.22:1.000:0.983 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:19,14:0.45: 0.50:1.000:0.976 0/0/1/1:4:13,9:0.43:-0.64:1.000:0.954 0/0/0/1:4:26,6:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,24:0.64: 0.92:1.000:0.704 0/1/1/1:4:6,20:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,28:0.58: 2.06:1.000:0.892 0/0/1/1:4:18,21:0.55: 1.13:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,1:0.97:-2.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.70:-2.19:1.000:0.983 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:21,9:0.34: 0.19:1.000:0.883 0/0/1/1:4:13,11:0.48:-0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,11:0.46:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:18,22:0.56: 1.23:1.000:0.973 0/0/0/1:4:33,5:0.16: 1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,6:0.29:-0.43:1.000:0.990 0/0/1/1:4:20,16:0.46: 0.82:1.000:0.990 0/0/1/1:4:15,14:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,6:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,23:0.80:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,35:0.74: 1.85:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:20,17:0.48: 0.92:1.000:0.712 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,7:0.44:-1.16:1.000:0.959 0/1/1/1:4:6,12:0.66:-1.05:1.000:0.849 0/0/1/1:4:18,11:0.41: 0.09:1.000:0.846 0/1/1/1:4:14,26:0.64: 1.23:1.000:0.717 0/0/0/1:4:21,7:0.29:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:27,18:0.43: 1.75:1.000:0.933 0/1/1/1:4:8,21:0.71: 0.09:1.000:0.990 0/0/1/1:4:16,10:0.41:-0.22:1.000:0.875 0/1/1/1:4:6,24:0.78: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,14:0.58:-0.43:1.000:0.892 0/0/1/1:4:14,13:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:19,6:0.29:-0.33:1.000:0.798 0/0/0/1:4:24,5:0.22: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,16:0.48: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:26,5:0.20: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,14:0.63:-0.64:1.000:0.573 0/0/1/1:4:20,16:0.46: 0.82:1.000:0.990 0/1/1/1:4:8,25:0.74: 0.50:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,10:0.75:-1.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,17:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,20:0.64: 0.30:0.887:0.669 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,13:0.38: 0.92:1.000:0.603 0/1/1/1:4:4,9:0.68:-1.57:0.999:0.951 0/0/1/1:4:22,16:0.44: 1.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:17,12:0.44: 0.09:1.000:0.963 0/0/0/1:4:21,8:0.32: 0.09:1.000:0.962 0/0/1/1:4:17,13:0.45: 0.19:1.000:0.984 0/0/1/1:4:10,11:0.53:-0.74:1.000:0.991 0/1/1/1:4:7,19:0.71:-0.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:10,25:0.70: 0.71:1.000:0.983 0/0/1/1:4:22,12:0.38: 0.61:1.000:0.621 0/0/0/1:4:16,4:0.25:-0.84:0.985:0.999 0/0/1/1:4:13,12:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,13:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,11:0.42:-0.01:1.000:0.910 0/0/0/1:4:9,2:0.23:-1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,23:0.60: 1.02:1.000:0.756 0/0/1/1:4:11,10:0.49:-0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,19:0.80:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.32: 0.09:1.000:0.962 0/1/1/1:4:9,34:0.77: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,12:0.43: 0.19:1.000:0.933 0/0/0/1:4:22,4:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,23:0.59: 1.13:1.000:0.862 0/0/0/1:4:13,6:0.35:-0.95:1.000:0.779 0/0/1/1:4:15,23:0.60: 1.02:1.000:0.756 0/0/1/1:4:19,13:0.43: 0.40:1.000:0.948 0/1/1/1:4:11,24:0.67: 0.71:1.000:0.934 0/0/0/1:4:16,2:0.14:-1.05:1.000:0.963 0/0/0/1:4:28,3:0.12: 0.30:1.000:0.783 0/0/1/1:4:26,20:0.46: 1.85:1.000:0.985 0/0/1/1:4:6,6:0.51:-1.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,19:0.84:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,6:0.51:-1.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,22:0.67: 0.40:0.904:0.939 0/0/1/1:4:10,9:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,33:0.80: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,20:0.70:-0.01:1.000:0.983 0/0/0/1:4:16,4:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,18:0.68:-0.22:0.993:0.951 0/0/1/1:4:18,17:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,12:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,18:0.54: 0.61:1.000:0.989 0/1/1/1:4:5,24:0.80: 0.09:0.999:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.46: 1.13:1.000:0.985 0/1/1/1:4:4,16:0.78:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,18:0.64:-0.01:1.000:0.645 0/0/0/1:4:9,4:0.34:-1.57:1.000:0.839 0/0/1/1:4:7,8:0.54:-1.36:1.000:0.987 0/0/1/1:4:14,15:0.53: 0.09:1.000:0.993 0/1/1/1:4:5,16:0.74:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,26:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,14:0.55:-0.22:1.000:0.983 0/0/1/1:4:20,15:0.45: 0.71:1.000:0.980 0/0/0/1:4:31,10:0.29: 1.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,16:0.57:-0.01:1.000:0.934 0/0/1/1:4:10,10:0.51:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,15:0.62:-0.43:1.000:0.558 0/0/0/1:4:13,6:0.35:-0.95:1.000:0.779 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-1.47:1.000:0.980 0/0/1/1:4:10,14:0.58:-0.43:1.000:0.892 0/1/1/1:4:9,20:0.68: 0.09:1.000:0.945 0/0/1/1:4:12,14:0.55:-0.22:1.000:0.983 0/0/1/1:4:6,4:0.43:-1.88:1.000:0.933 0/0/0/1:4:14,5:0.31:-0.95:1.000:0.980 0/0/0/1:4:14,4:0.27:-1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,17:0.61:-0.01:1.000:0.740 0/1/1/1:4:6,23:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.31:-0.95:1.000:0.980 0/1/1/1:4:3,13:0.79:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,9:0.60:-1.36:1.000:0.797 0/0/1/1:4:11,14:0.56:-0.33:1.000:0.959 0/0/1/1:4:17,16:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,19:0.74:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,10:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,19:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,12:0.43: 0.19:1.000:0.933 0/0/0/1:4:31,9:0.27: 1.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,24:0.67: 0.71:1.000:0.934 0/0/1/1:4:21,13:0.41: 0.61:1.000:0.863 0/0/1/1:4:14,13:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,22:0.51: 1.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,15:0.56:-0.12:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,4:0.97:-2.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,20:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,26:0.54: 2.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,16:0.61:-0.22:1.000:0.662 0/1/1/1:4:12,33:0.71: 1.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:19,10:0.38: 0.09:1.000:0.529 0/0/0/1:4:22,11:0.37: 0.50:1.000:0.604 0/0/1/1:4:16,11:0.43:-0.12:1.000:0.951 0/0/1/1:4:15,8:0.38:-0.53:1.000:0.564 0/0/0/1:4:23,9:0.32: 0.40:1.000:0.950 0/1/1/1:4:9,17:0.65:-0.22:1.000:0.753 0/0/0/1:4:27,3:0.12: 0.19:1.000:0.852 0/0/1/1:4:9,5:0.39:-1.47:1.000:0.665 0/0/1/1:4:15,14:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,9:0.40:-0.43:1.000:0.818 0/0/0/1:4:28,7:0.25: 0.71:0.999:0.999 0/0/0/1:4:15,6:0.33:-0.74:1.000:0.939 0/0/0/1:4:25,6:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.54:-0.95:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,15:0.56:-0.12:1.000:0.966 0/1/1/1:4:6,15:0.70:-0.74:1.000:0.983 0/0/1/1:4:22,12:0.38: 0.61:1.000:0.621 0/0/1/1:4:13,15:0.54:-0.01:1.000:0.985 0/1/1/1:4:4,18:0.79:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,18:0.45: 1.44:1.000:0.980 0/0/1/1:4:25,17:0.43: 1.44:1.000:0.945 0/0/1/1:4:14,11:0.46:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:14,21:0.60: 0.71:1.000:0.797 0/0/1/1:4:11,18:0.62: 0.09:1.000:0.606 0/0/1/1:4:27,24:0.49: 2.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,5:0.24:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,5:0.24:-0.22:1.000:1.000 -chr8.1 3892790 chr8.1_003892790 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:272,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:138,143:.: 0.27:1.000:. ./.:4:207,74:.: 0.27:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:229,93:.: 0.93:1.000:. ./.:4:249,94:.: 1.27:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:231,109:.: 1.22:1.000:. ./.:4:41,70:.:-2.45:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:206,174:.: 1.86:1.000:. ./.:4:218,74:.: 0.45:1.000:. ./.:4:229,67:.: 0.51:1.000:. ./.:4:193,67:.:-0.06:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.74:0.994:. ./.:4:209,75:.: 0.32:1.000:. ./.:4:262,96:.: 1.51:1.000:. ./.:4:269,86:.: 1.46:1.000:. ./.:4:53,28:.:-2.93:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:71,17:.:-2.82:1.000:. ./.:4:196,75:.: 0.11:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:226,86:.: 0.77:1.000:. ./.:4:251,81:.: 1.09:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:178,62:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,17:.:-2.93:1.000:. ./.:4:82,27:.:-2.48:1.000:. ./.:3:27,17:.:-3.52:1.000:. ./.:4:321,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:285,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:222,81:.: 0.62:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:223,78:.: 0.59:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:186,80:.: 0.03:1.000:. ./.:4:180,83:.:-0.02:1.000:. ./.:5:408,1:.: 2.32:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:100,39:.:-2.00:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:240,75:.: 0.82:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:230,89:.: 0.88:1.000:. ./.:4:198,72:.: 0.10:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:189,58:.:-0.27:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:207,68:.: 0.18:1.000:. ./.:6:211,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:229,2:.:-0.53:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:177,76:.:-0.18:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:220,83:.: 0.62:1.000:. ./.:4:198,84:.: 0.29:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:197,80:.: 0.21:0.887:. ./.:4:228,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:140,54:.:-1.12:0.999:. ./.:4:244,89:.: 1.10:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:221,62:.: 0.30:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:181,75:.:-0.13:1.000:. ./.:4:193,69:.:-0.03:1.000:. ./.:4:226,86:.: 0.77:1.000:. ./.:4:221,62:.: 0.30:1.000:. ./.:4:151,65:.:-0.77:0.985:. ./.:4:257,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:174,72:.:-0.29:1.000:. ./.:4:156,65:.:-0.69:1.000:. ./.:4:193,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:197,77:.: 0.16:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:232,95:.: 1.01:1.000:. ./.:4:178,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:340,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:179,69:.:-0.26:1.000:. ./.:4:179,55:.:-0.48:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:160,58:.:-0.74:1.000:. ./.:4:210,74:.: 0.32:1.000:. ./.:4:147,50:.:-1.07:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.16:0.904:. ./.:4:146,57:.:-0.98:1.000:. ./.:4:196,74:.: 0.10:1.000:. ./.:4:179,55:.:-0.48:1.000:. ./.:4:222,91:.: 0.78:1.000:. ./.:4:273,96:.: 1.68:0.993:. ./.:4:271,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:161,64:.:-0.62:1.000:. ./.:4:287,110:.: 2.13:1.000:. ./.:4:179,66:.:-0.30:0.999:. ./.:4:238,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:114,39:.:-1.78:1.000:. ./.:4:192,79:.: 0.11:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:142,52:.:-1.12:1.000:. ./.:4:186,80:.: 0.03:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:212,76:.: 0.38:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:176,84:.:-0.06:1.000:. ./.:4:222,68:.: 0.42:1.000:. ./.:4:159,64:.:-0.66:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:163,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:156,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:241,78:.: 0.88:1.000:. ./.:4:185,74:.:-0.08:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:155,56:.:-0.85:1.000:. ./.:4:140,72:.:-0.83:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:221,79:.: 0.58:1.000:. ./.:4:167,53:.:-0.70:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:372,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:159,64:.:-0.66:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:190,66:.:-0.13:1.000:. ./.:4:264,93:.: 1.49:1.000:. ./.:4:262,84:.: 1.31:1.000:. ./.:4:49,31:.:-2.95:1.000:. ./.:4:153,62:.:-0.78:1.000:. ./.:4:225,80:.: 0.66:1.000:. ./.:4:206,70:.: 0.19:1.000:. ./.:4:248,87:.: 1.14:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:223,73:.: 0.51:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:198,90:.: 0.38:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:256,90:.: 1.31:0.999:. ./.:4:245,2:.:-0.27:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:199,77:.: 0.19:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:212,93:.: 0.66:1.000:. ./.:4:230,77:.: 0.69:1.000:. ./.:4:174,79:.:-0.18:1.000:. ./.:4:193,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:392,0:.: 2.05:1.000:. ./.:4:263,92:.: 1.46:1.000:. ./.:4:242,78:.: 0.90:1.000:. ./.:4:206,72:.: 0.22:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:315,1:.: 0.83:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:177,75:.:-0.19:1.000:. -chr8.1 4245506 chr8.1_004245506 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:141,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:202,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:130,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:222,1:.: 1.91:0.994:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:48,0:.:-2.02:1.000:. ./.:3:25,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:250,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.18:1.000:. ./.:5:213,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.65:1.000:. ./.:6:108,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.67:0.887:. ./.:4:113,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:141,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.18:0.985:. ./.:4:110,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:151,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.92:0.904:. ./.:4:143,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:251,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.23:0.993:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:241,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:113,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.76:0.999:. ./.:4:111,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:256,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:244,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.72:1.000:. -chr8.1 4427180 chr8.1_004427180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:44,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:16,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.04:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:41,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:33,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:25,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:9,1:.:-2.11:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:35,6:.: 0.56:1.000:. ./.:4:35,4:.: 0.39:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:21,1:.:-1.07:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:0.994:. ./.:4:32,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:37,3:.: 0.47:1.000:. ./.:4:34,5:.: 0.39:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:41,5:.: 0.99:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:32,3:.: 0.04:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.04:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.37:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:41,7:.: 1.16:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:36,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:29,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:40,3:.: 0.73:1.000:. ./.:5:59,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:11,2:.:-1.85:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,3:.: 0.47:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.04:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,4:.: 0.73:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.30:1.000:. ./.:6:29,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.39:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:15,3:.:-1.42:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.73:0.887:. ./.:4:29,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.25:0.999:. ./.:4:38,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.21:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.13:1.000:. ./.:4:41,5:.: 0.99:1.000:. ./.:4:45,3:.: 1.16:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.64:0.985:. ./.:4:44,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.47:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.65:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:59,1:.: 2.19:1.000:. ./.:4:77,0:.: 3.66:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:37,3:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.99:0.904:. ./.:4:27,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:34,6:.: 0.47:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.64:1.000:. ./.:4:33,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:30,3:.:-0.13:0.993:. ./.:4:39,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:45,4:.: 1.25:1.000:. ./.:4:27,3:.:-0.39:0.999:. ./.:4:58,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:43,3:.: 0.99:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:24,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,7:.: 0.65:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:39,5:.: 0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.47:1.000:. ./.:4:22,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.82:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:34,4:.: 0.30:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.30:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:18,2:.:-1.25:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,1:.:-1.33:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:32,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:22,4:.:-0.73:1.000:. ./.:4:36,2:.: 0.30:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:16,2:.:-1.42:1.000:. ./.:4:33,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:36,4:.: 0.47:1.000:. ./.:4:42,2:.: 0.82:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:38,10:.: 1.16:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.64:0.999:. ./.:4:42,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:38,5:.: 0.73:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:40,4:.: 0.82:1.000:. ./.:4:29,1:.:-0.39:1.000:. ./.:4:31,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:22,7:.:-0.47:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:29,2:.:-0.30:1.000:. -chr8.1 4581778 chr8.1_004581778 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:147,19:.: 0.37:1.000:. ./.:4:32,70:.:-1.02:1.000:. ./.:4:43,83:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:91,53:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:51,32:.:-1.44:1.000:. ./.:4:146,26:.: 0.50:1.000:. ./.:4:83,57:.:-0.20:1.000:. ./.:4:13,8:.:-2.79:1.000:. ./.:4:26,27:.:-2.09:1.000:. ./.:4:34,62:.:-1.16:1.000:. ./.:4:44,84:.:-0.46:1.000:. ./.:4:140,26:.: 0.37:1.000:. ./.:4:90,51:.:-0.17:1.000:. ./.:4:151,27:.: 0.63:1.000:. ./.:4:159,36:.: 1.00:0.994:. ./.:4:153,33:.: 0.81:1.000:. ./.:4:137,77:.: 1.42:1.000:. ./.:4:132,75:.: 1.27:1.000:. ./.:4:34,18:.:-2.12:1.000:. ./.:4:80,43:.:-0.57:1.000:. ./.:4:195,21:.: 1.46:1.000:. ./.:4:100,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:4,12:.:-2.90:1.000:. ./.:4:177,43:.: 1.55:1.000:. ./.:4:170,23:.: 0.96:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:111,64:.: 0.57:1.000:. ./.:4:105,52:.: 0.17:1.000:. ./.:4:145,20:.: 0.35:1.000:. ./.:4:137,14:.: 0.04:1.000:. ./.:4:26,5:.:-2.57:1.000:. ./.:4:21,21:.:-2.33:1.000:. ./.:3:21,2:.:-2.75:1.000:. ./.:4:111,26:.:-0.26:1.000:. ./.:4:94,60:.: 0.11:1.000:. ./.:4:99,65:.: 0.33:1.000:. ./.:4:192,55:.: 2.14:1.000:. ./.:4:259,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:70,45:.:-0.74:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:185,38:.: 1.61:1.000:. ./.:4:144,30:.: 0.55:1.000:. ./.:4:60,65:.:-0.52:1.000:. ./.:4:172,24:.: 1.03:1.000:. ./.:5:149,50:.: 1.09:1.000:. ./.:4:53,13:.:-1.81:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:52,97:.: 0.00:1.000:. ./.:4:112,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:124,57:.: 0.70:1.000:. ./.:4:84,51:.:-0.31:1.000:. ./.:4:133,18:.: 0.04:1.000:. ./.:4:135,28:.: 0.31:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:132,20:.: 0.07:1.000:. ./.:4:178,43:.: 1.57:1.000:. ./.:4:107,35:.:-0.15:1.000:. ./.:6:121,11:.:-0.37:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:70,45:.:-0.74:1.000:. ./.:4:164,33:.: 1.05:1.000:. ./.:4:194,34:.: 1.72:1.000:. ./.:4:102,64:.: 0.37:1.000:. ./.:4:49,83:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,18:.:-0.85:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:76,48:.:-0.54:0.887:. ./.:4:160,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:172,32:.: 1.20:1.000:. ./.:4:88,55:.:-0.13:0.999:. ./.:4:68,123:.: 0.92:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:86,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:123,23:.:-0.07:1.000:. ./.:4:86,46:.:-0.37:1.000:. ./.:4:43,60:.:-1.00:1.000:. ./.:4:145,25:.: 0.46:1.000:. ./.:4:105,69:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,31:.:-1.37:0.985:. ./.:4:168,25:.: 0.96:1.000:. ./.:4:159,25:.: 0.76:1.000:. ./.:4:69,53:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:119,28:.:-0.04:1.000:. ./.:4:62,44:.:-0.94:1.000:. ./.:4:72,47:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,39:.:-0.22:1.000:. ./.:4:68,36:.:-0.98:1.000:. ./.:4:61,34:.:-1.18:1.000:. ./.:4:87,59:.:-0.07:1.000:. ./.:4:114,57:.: 0.48:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:181,31:.: 1.37:1.000:. ./.:4:154,39:.: 0.96:1.000:. ./.:4:106,23:.:-0.44:1.000:. ./.:4:34,79:.:-0.78:1.000:. ./.:4:126,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:113,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:35,49:.:-1.42:1.000:. ./.:4:94,61:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,32:.:-1.11:1.000:. ./.:4:89,52:.:-0.17:0.904:. ./.:4:113,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:87,68:.: 0.13:1.000:. ./.:4:67,53:.:-0.63:1.000:. ./.:4:149,32:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,106:.: 0.50:0.993:. ./.:4:127,23:.: 0.02:1.000:. ./.:4:86,49:.:-0.31:1.000:. ./.:4:250,39:.: 3.05:1.000:. ./.:4:101,58:.: 0.22:0.999:. ./.:4:104,65:.: 0.44:1.000:. ./.:4:50,34:.:-1.42:1.000:. ./.:4:101,65:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:129,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:92,47:.:-0.22:1.000:. ./.:4:65,68:.:-0.35:1.000:. ./.:4:134,32:.: 0.37:1.000:. ./.:4:90,59:.: 0.00:1.000:. ./.:4:137,59:.: 1.03:1.000:. ./.:4:85,45:.:-0.41:1.000:. ./.:4:85,40:.:-0.52:1.000:. ./.:4:136,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:83,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:32,59:.:-1.26:1.000:. ./.:4:75,42:.:-0.70:1.000:. ./.:4:56,41:.:-1.13:1.000:. ./.:4:38,70:.:-0.89:1.000:. ./.:4:150,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:57,24:.:-1.48:1.000:. ./.:4:69,45:.:-0.76:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:180,38:.: 1.51:1.000:. ./.:4:85,44:.:-0.44:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:54,34:.:-1.33:1.000:. ./.:4:83,34:.:-0.70:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:143,26:.: 0.44:1.000:. ./.:4:83,37:.:-0.63:1.000:. ./.:4:114,11:.:-0.52:1.000:. ./.:4:121,68:.: 0.87:1.000:. ./.:4:173,21:.: 0.98:1.000:. ./.:4:182,26:.: 1.29:1.000:. ./.:4:79,48:.:-0.48:1.000:. ./.:4:132,63:.: 1.00:1.000:. ./.:4:73,41:.:-0.76:1.000:. ./.:4:161,35:.: 1.03:1.000:. ./.:4:48,73:.:-0.61:1.000:. ./.:4:53,5:.:-1.98:1.000:. ./.:4:36,40:.:-1.59:1.000:. ./.:4:167,33:.: 1.11:1.000:. ./.:4:137,40:.: 0.61:1.000:. ./.:4:113,67:.: 0.68:1.000:. ./.:4:119,61:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,30:.:-1.09:1.000:. ./.:4:82,50:.:-0.37:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:116,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:42,65:.:-0.92:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:101,60:.: 0.26:1.000:. ./.:4:97,49:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,65:.:-0.83:0.999:. ./.:4:87,42:.:-0.44:1.000:. ./.:4:154,23:.: 0.61:1.000:. ./.:4:34,47:.:-1.48:1.000:. ./.:4:81,42:.:-0.57:1.000:. ./.:4:39,57:.:-1.16:1.000:. ./.:4:85,47:.:-0.37:1.000:. ./.:4:124,26:.: 0.02:1.000:. ./.:4:73,31:.:-0.98:1.000:. ./.:4:185,39:.: 1.64:1.000:. ./.:4:128,58:.: 0.81:1.000:. ./.:4:142,20:.: 0.28:1.000:. ./.:4:115,26:.:-0.17:1.000:. ./.:4:158,34:.: 0.94:1.000:. ./.:4:214,35:.: 2.18:1.000:. ./.:4:185,38:.: 1.61:1.000:. ./.:4:90,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:95,49:.:-0.11:1.000:. -chr8.1 4932113 chr8.1_004932113 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:67,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:39,49:.:-0.09:1.000:. ./.:4:50,45:.: 0.13:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:70,80:.: 1.81:1.000:. ./.:4:76,84:.: 2.11:1.000:. ./.:4:21,6:.:-1.95:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,48:.:-0.06:1.000:. ./.:4:15,17:.:-1.80:1.000:. ./.:4:24,6:.:-1.86:1.000:. ./.:4:40,22:.:-0.88:1.000:. ./.:4:47,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,33:.:-0.03:1.000:. ./.:4:43,63:.: 0.46:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.13:0.994:. ./.:4:62,76:.: 1.44:1.000:. ./.:4:86,82:.: 2.36:1.000:. ./.:4:49,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:12,9:.:-2.13:1.000:. ./.:4:53,18:.:-0.61:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:48,21:.:-0.67:1.000:. ./.:4:2,12:.:-2.35:1.000:. ./.:4:66,42:.: 0.52:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.28:1.000:. ./.:4:39,52:.: 0.00:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,8:.:-2.13:1.000:. ./.:4:12,26:.:-1.62:1.000:. ./.:3:5,5:.:-2.47:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:90,30:.: 0.89:1.000:. ./.:4:51,24:.:-0.49:1.000:. ./.:4:80,32:.: 0.64:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.49:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:107,43:.: 1.81:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:37,40:.:-0.42:1.000:. ./.:4:88,28:.: 0.77:1.000:. ./.:5:92,27:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,37:.: 0.43:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,48:.: 0.13:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:86,91:.: 2.63:1.000:. ./.:4:67,20:.:-0.12:1.000:. ./.:4:78,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:71,25:.: 0.16:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:51,23:.:-0.52:1.000:. ./.:4:73,38:.: 0.61:1.000:. ./.:4:91,26:.: 0.80:1.000:. ./.:6:53,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:55,20:.:-0.49:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:56,29:.:-0.18:1.000:. ./.:4:66,29:.: 0.13:1.000:. ./.:4:82,74:.: 1.99:1.000:. ./.:4:21,13:.:-1.74:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:29,37:.:-0.76:0.887:. ./.:4:109,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:50,13:.:-0.85:0.999:. ./.:4:68,41:.: 0.55:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:70,29:.: 0.25:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:43,46:.:-0.06:1.000:. ./.:4:29,34:.:-0.85:1.000:. ./.:4:115,43:.: 2.05:1.000:. ./.:4:61,59:.: 0.89:1.000:. ./.:4:24,21:.:-1.40:0.985:. ./.:4:80,34:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:58,23:.:-0.30:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:29,33:.:-0.88:1.000:. ./.:4:36,48:.:-0.21:1.000:. ./.:4:39,45:.:-0.21:1.000:. ./.:4:41,45:.:-0.15:1.000:. ./.:4:39,13:.:-1.19:1.000:. ./.:4:78,25:.: 0.37:1.000:. ./.:4:78,86:.: 2.23:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,45:.: 1.65:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:68,33:.: 0.31:1.000:. ./.:4:50,23:.:-0.55:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:86,28:.: 0.71:1.000:. ./.:4:17,16:.:-1.77:1.000:. ./.:4:49,49:.: 0.22:1.000:. ./.:4:28,29:.:-1.03:1.000:. ./.:4:58,28:.:-0.15:0.904:. ./.:4:41,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:65,87:.: 1.87:1.000:. ./.:4:51,44:.: 0.13:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:80,67:.: 1.71:0.993:. ./.:4:141,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:81,28:.: 0.55:1.000:. ./.:4:96,28:.: 1.01:1.000:. ./.:4:38,39:.:-0.42:0.999:. ./.:4:83,26:.: 0.55:1.000:. ./.:4:17,20:.:-1.65:1.000:. ./.:4:54,52:.: 0.46:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,30:.: 0.19:1.000:. ./.:4:47,69:.: 0.77:1.000:. ./.:4:88,30:.: 0.83:1.000:. ./.:4:74,37:.: 0.61:1.000:. ./.:4:43,43:.:-0.15:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.39:1.000:. ./.:4:73,35:.: 0.52:1.000:. ./.:4:56,27:.:-0.24:1.000:. ./.:4:37,15:.:-1.19:1.000:. ./.:4:31,17:.:-1.31:1.000:. ./.:4:48,13:.:-0.91:1.000:. ./.:4:34,24:.:-1.00:1.000:. ./.:4:58,66:.: 1.01:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,15:.:-1.16:1.000:. ./.:4:64,25:.:-0.06:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:90,28:.: 0.83:1.000:. ./.:4:60,56:.: 0.77:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:22,23:.:-1.40:1.000:. ./.:4:50,62:.: 0.64:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:18,41:.:-0.97:1.000:. ./.:4:30,18:.:-1.31:1.000:. ./.:4:93,36:.: 1.16:1.000:. ./.:4:76,25:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,35:.: 0.92:1.000:. ./.:4:65,20:.:-0.18:1.000:. ./.:4:138,47:.: 2.87:1.000:. ./.:4:51,63:.: 0.71:1.000:. ./.:4:82,30:.: 0.64:1.000:. ./.:4:63,53:.: 0.77:1.000:. ./.:4:17,1:.:-2.23:1.000:. ./.:4:23,20:.:-1.46:1.000:. ./.:4:75,31:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.28:1.000:. ./.:4:56,62:.: 0.83:1.000:. ./.:4:64,24:.:-0.09:1.000:. ./.:4:38,20:.:-1.00:1.000:. ./.:4:38,46:.:-0.21:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:42,28:.:-0.64:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:83,39:.: 0.95:1.000:. ./.:4:36,22:.:-1.00:1.000:. ./.:4:76,25:.: 0.31:0.999:. ./.:4:51,16:.:-0.73:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:32,29:.:-0.91:1.000:. ./.:4:73,33:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,36:.:-0.97:1.000:. ./.:4:61,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:60,21:.:-0.30:1.000:. ./.:4:34,14:.:-1.31:1.000:. ./.:4:62,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:82,30:.: 0.64:1.000:. ./.:4:107,48:.: 1.96:1.000:. ./.:4:83,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:47,26:.:-0.55:1.000:. ./.:4:66,34:.: 0.28:1.000:. -chr8.1 4989842 chr8.1_004989842 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:67,97:0.55:-0.01:1.000:0.979 0/0/1/1:4:62,100:0.58:-0.05:1.000:0.921 0/0/1/1:4:63,106:0.59: 0.12:1.000:0.870 0/1/1/1:4:60,124:0.64: 0.49:1.000:0.681 0/0/1/1:4:79,115:0.55: 0.73:1.000:0.978 0/0/1/1:4:59,111:0.62: 0.14:1.000:0.611 0/1/1/1:4:31,104:0.74:-0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,119:0.57: 0.78:1.000:0.953 0/0/1/1:4:67,94:0.54:-0.08:1.000:0.986 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-2.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,47:0.82:-2.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,146:0.69: 0.93:1.000:0.976 0/1/1/1:4:38,147:0.77: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,40:0.29:-0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:63,108:0.59: 0.17:1.000:0.840 0/0/0/1:4:96,49:0.34:-0.47:1.000:0.878 0/0/1/1:4:78,124:0.57: 0.93:0.994:0.933 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,181:0.73: 1.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,68:0.34: 0.93:1.000:0.884 0/0/0/1:4:36,15:0.30:-2.78:1.000:0.981 0/0/1/1:4:68,95:0.54:-0.03:1.000:0.987 0/1/1/1:4:45,151:0.74: 0.78:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,18:0.58:-3.32:1.000:0.906 0/0/0/1:4:135,60:0.31: 0.75:1.000:0.965 0/1/1/1:4:29,150:0.82: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:102,42:0.30:-0.50:1.000:0.983 0/0/1/1:4:89,104:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,166:0.75: 1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,181:0.81: 1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,43:0.32:-0.69:1.000:0.949 0/0/0/0:4:11,1:0.09:-3.73:1.000:0.919 0/0/0/1:4:37,11:0.25:-2.85:1.000:0.999 0/1/1:3:9,14:0.57:-3.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:64,104:0.58: 0.09:1.000:0.913 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,210:1.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,65:0.32: 1.15:1.000:0.964 0/0/0/1:4:134,58:0.31: 0.68:1.000:0.973 0/0/1/1:4:85,80:0.45: 0.02:1.000:0.983 0/0/0/1:4:105,46:0.31:-0.32:1.000:0.969 0/0/1/1:4:79,112:0.54: 0.66:1.000:0.984 0/1/1/1:4:33,128:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,102:0.53: 0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,111:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:88,148:0.59: 1.76:1.000:0.966 0/1/1/1:4:3,27:0.89:-3.29:1.000:0.543 0/0/1/1:4:74,93:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,122:0.77:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,79:0.51:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:45,167:0.76: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,67:0.45:-0.57:1.000:0.975 0/0/1/1:4:78,105:0.53: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:104,60:0.36:-0.01:1.000:0.684 0/0/1/1:4:88,108:0.51: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,52:0.34:-0.23:1.000:0.889 0/1/1/1:4:30,152:0.82: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,98:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:67,53:0.42:-1.08:1.000:0.516 0/0/0/1:4:125,34:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,119:0.79:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,114:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:128,68:0.35: 0.78:1.000:0.829 0/1/1/1:4:38,132:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,140:0.78: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,132:0.60: 1.05:1.000:0.789 0/0/0/1:4:135,54:0.30: 0.61:1.000:0.987 0/0/1/1:4:57,98:0.59:-0.23:0.887:0.835 0/0/1/1:4:63,69:0.48:-0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:87,85:0.46: 0.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:62,88:0.55:-0.35:0.999:0.984 0/0/1/1:4:83,96:0.49: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,81:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,73:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/1/1/1:4:33,86:0.69:-1.11:1.000:0.976 0/0/1/1:4:60,79:0.53:-0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:28,124:0.79:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,70:0.32: 1.49:1.000:0.959 0/0/0/1:4:154,38:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,101:0.69:-0.57:0.985:0.965 0/0/1/1:4:82,87:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,91:0.44: 0.78:1.000:0.962 0/1/1/1:4:29,121:0.78:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,75:0.45:-0.23:1.000:0.982 0/0/1/1:4:96,87:0.45: 0.46:1.000:0.975 0/0/0/1:4:115,35:0.26:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,28:0.27:-1.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,66:0.47:-0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:70,71:0.47:-0.57:1.000:0.991 0/1/1/1:4:43,121:0.71:-0.01:1.000:0.991 0/0/1/1:4:67,78:0.49:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,103:0.47: 0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,70:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,80:0.41: 0.56:1.000:0.856 0/0/1/1:4:95,115:0.50: 1.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:97,45:0.32:-0.55:1.000:0.948 0/0/1/1:4:85,89:0.47: 0.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:38,138:0.76: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,157:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,65:0.44:-0.62:1.000:0.967 0/0/0/1:4:104,48:0.32:-0.30:1.000:0.950 0/0/1/1:4:51,56:0.48:-1.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:63,80:0.52:-0.52:0.904:0.996 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,38:0.30:-0.81:1.000:0.984 0/0/0/1:4:100,34:0.27:-0.74:1.000:0.997 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,119:0.51: 1.25:0.993:0.996 0/0/1/1:4:56,94:0.59:-0.35:1.000:0.873 0/0/1/1:4:66,91:0.54:-0.18:1.000:0.989 0/0/0/0:4:189,1:0.01: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,102:0.50: 0.56:0.999:0.997 0/1/1/1:4:38,129:0.75: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,85:0.55:-0.52:1.000:0.976 0/1/1/1:4:49,143:0.72: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,83:0.54:-0.52:1.000:0.988 0/0/1/1:4:62,81:0.52:-0.52:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,169:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,68:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,91:0.50: 0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,89:0.66:-0.89:1.000:0.884 0/0/0/1:4:116,52:0.32: 0.09:1.000:0.962 0/0/1/1:4:60,114:0.62: 0.24:1.000:0.581 1/1/1/1:4:0,158:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,51:0.31: 0.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:78,112:0.55: 0.63:1.000:0.981 0/0/1/1:4:60,95:0.57:-0.23:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,100:0.72:-0.77:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,112:0.79:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,100:0.49: 0.61:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,150:0.74: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,46:0.31:-0.23:1.000:0.978 0/0/0/1:4:148,68:0.32: 1.27:1.000:0.952 0/0/0/1:4:142,40:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,33:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,81:0.49:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,61:0.48:-1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,86:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,91:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,89:0.51:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,232:1.00: 1.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,178:0.78: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,159:0.81: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,89:0.51:-0.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,235:1.00: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,27:0.21:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,108:0.54: 0.56:1.000:0.990 0/0/1/1:4:90,116:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,39:0.68:-2.68:1.000:0.946 0/0/1/1:4:62,72:0.49:-0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:134,41:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,156:0.75: 0.90:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,224:1.00: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,132:0.82:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,69:0.38: 0.26:1.000:0.602 0/0/1/1:4:74,122:0.58: 0.78:1.000:0.897 0/0/1/1:4:64,73:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,93:0.57:-0.28:1.000:0.951 0/0/1/1:4:85,119:0.54: 0.98:1.000:0.987 0/0/0/1:4:76,43:0.36:-1.11:1.000:0.724 0/1/1/1:4:46,156:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,99:0.55: 0.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:75,87:0.49:-0.05:0.999:0.997 0/1/1/1:4:45,123:0.70: 0.09:1.000:0.987 0/1/1/1:4:43,148:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,99:0.54: 0.12:1.000:0.985 1/1/1/1:4:1,128:0.99:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,169:0.79: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,90:0.54:-0.25:1.000:0.986 0/0/0/1:4:143,56:0.29: 0.85:1.000:0.989 0/0/1/1:4:59,106:0.61: 0.02:1.000:0.741 0/1/1/1:4:52,177:0.75: 1.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,112:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,54:0.34:-0.15:1.000:0.859 0/0/1/1:4:74,106:0.55: 0.39:1.000:0.982 0/1/1/1:4:45,241:0.82: 2.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,120:0.58: 0.71:1.000:0.901 0/0/1/1:4:71,82:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,103:0.52: 0.46:1.000:0.995 -chr8.1 5343637 chr8.1_005343637 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:61,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.14:0.994:. ./.:4:78,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:94,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:15,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.15:1.000:. ./.:5:70,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.01:1.000:. ./.:6:51,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.26:0.887:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:0.999:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:0.985:. ./.:4:58,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:0.904:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.75:0.993:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:90,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:90,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.63:0.999:. ./.:4:52,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:95,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.44:1.000:. -chr8.1 5787972 chr8.1_005787972 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:24,15:.: 0.55:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:15,8:.:-0.91:1.000:. ./.:4:30,18:.: 1.38:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:16,8:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.02:0.994:. ./.:4:11,25:.: 0.28:1.000:. ./.:4:29,19:.: 1.38:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.46:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,4:.:-2.66:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:30,15:.: 1.10:1.000:. ./.:4:22,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:36,14:.: 1.56:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.38:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.29:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,14:.: 1.10:1.000:. ./.:4:34,19:.: 1.84:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:20,20:.: 0.64:1.000:. ./.:4:37,16:.: 1.84:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:16,12:.:-0.46:1.000:. ./.:5:35,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:35,14:.: 1.47:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.46:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.37:1.000:. ./.:4:20,19:.: 0.55:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:20,20:.: 0.64:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.37:1.000:. ./.:4:48,13:.: 2.57:1.000:. ./.:4:17,9:.:-0.64:1.000:. ./.:4:37,18:.: 2.02:1.000:. ./.:4:25,19:.: 1.01:1.000:. ./.:6:24,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,18:.: 0.74:1.000:. ./.:4:10,7:.:-1.46:1.000:. ./.:4:25,12:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:15,8:.:-0.91:0.999:. ./.:4:39,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:18,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:30,14:.: 1.01:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:26,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.56:0.985:. ./.:4:45,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:23,19:.: 0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:29,13:.: 0.83:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,16:.: 1.56:1.000:. ./.:4:15,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:24,17:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.91:0.904:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.36:0.993:. ./.:4:28,14:.: 0.83:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:14,15:.:-0.36:0.999:. ./.:4:39,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:8,7:.:-1.65:1.000:. ./.:4:18,15:.: 0.00:1.000:. ./.:4:31,10:.: 0.74:1.000:. ./.:4:23,21:.: 1.01:1.000:. ./.:4:30,16:.: 1.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:16,12:.:-0.46:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:21,9:.:-0.27:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:16,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.73:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:19,16:.: 0.19:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.37:1.000:. ./.:4:15,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:11,9:.:-1.19:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:23,13:.: 0.28:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:39,17:.: 2.11:1.000:. ./.:4:27,29:.: 2.11:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.36:1.000:. ./.:4:39,16:.: 2.02:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:16,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:2,6:.:-2.29:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,12:.: 0.83:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:24,9:.: 0.00:1.000:. ./.:4:27,12:.: 0.55:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:33,14:.: 1.29:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:25,6:.:-0.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:23,17:.: 0.64:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:26,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.00:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:23,12:.: 0.19:1.000:. ./.:4:22,9:.:-0.18:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:14,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:9,5:.:-1.74:1.000:. ./.:4:8,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:27,16:.: 0.92:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:15,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:26,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:34,16:.: 1.56:1.000:. ./.:4:25,15:.: 0.64:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.55:1.000:. -chr8.1 6030183 chr8.1_006030183 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.01:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:4,2:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,3:0.28: 1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,4:0.43: 0.12:0.994:0.955 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:4,2:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:2,1:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.25: 2.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0:3:1,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,2:0.30: 0.12:1.000:0.985 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,6:0.42: 1.24:1.000:0.900 0/0/0/1:4:4,4:0.33: 1.24:1.000:0.906 0/0/0/0/0:5:2,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.28: 2.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.920 0/0/0/1:4:4,2:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,2:0.30: 0.12:1.000:0.985 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:0.887:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.64:0.999:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.17: 0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,3:0.33: 0.49:1.000:0.906 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/0/1:4:7,3:0.27: 2.00:1.000:0.998 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.39:0.985:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:4,4:0.33: 1.24:1.000:0.906 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:8,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,3:0.31: 0.87:1.000:0.974 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.26:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:2,2:0.33:-0.26:0.904:0.906 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,4:0.33: 1.24:1.000:0.906 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,4:0.36: 0.87:0.993:0.721 0/0/0/1:4:3,3:0.33: 0.49:1.000:0.906 0/0/1/1:4:2,5:0.40: 0.87:1.000:0.829 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.25: 1.24:0.999:0.999 0/0/1/1:4:0,4:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,2:0.30: 0.12:1.000:0.985 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.17: 0.49:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:8,1:0.11: 1.62:1.000:0.520 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:2,1:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:1,3:0.42:-0.26:1.000:0.900 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,1:0.14: 0.87:1.000:0.975 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 2.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,2:0.30: 0.12:1.000:0.985 0/0/0/1:4:6,3:0.28: 1.62:1.000:0.996 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,2:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,4:0.39: 0.49:1.000:0.679 0/0/1/1:4:1,2:0.39:-0.64:1.000:0.679 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:0,1:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.14: 0.87:1.000:0.975 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:2,1:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,4:0.31: 1.62:1.000:0.965 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/0/1:4:8,1:0.11: 1.62:1.000:0.520 0/0/1/1:4:2,6:0.42: 1.24:1.000:0.900 0/0/0/1:4:4,2:0.28: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:1,5:0.44: 0.49:1.000:0.974 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.39:-0.64:1.000:0.679 0/0/0/1:4:5,1:0.17: 0.49:0.999:0.997 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/0/0:4:5,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 0/0/0/1:4:4,1:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.42:-0.26:1.000:0.900 0/0/0/1:4:2,2:0.33:-0.26:1.000:0.906 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 2.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.26: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:2,6:0.42: 1.24:1.000:0.900 0/0/1/1:4:0,3:0.50:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.28:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:1,1:0.33:-1.01:1.000:0.906 -chr8.1 6061931 chr8.1_006061931 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:74,313:.: 1.42:1.000:. ./.:4:61,202:.:-0.34:1.000:. ./.:4:106,137:.:-0.62:1.000:. ./.:4:94,271:.: 1.11:1.000:. ./.:4:163,190:.: 0.94:1.000:. ./.:4:183,210:.: 1.51:1.000:. ./.:4:111,46:.:-1.84:1.000:. ./.:4:149,186:.: 0.69:1.000:. ./.:4:69,247:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,107:.:-2.55:1.000:. ./.:4:29,62:.:-2.78:1.000:. ./.:4:128,254:.: 1.35:1.000:. ./.:4:203,79:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,340:.: 0.76:1.000:. ./.:4:81,258:.: 0.74:1.000:. ./.:4:82,289:.: 1.20:1.000:. ./.:4:67,299:.: 1.13:0.994:. ./.:4:154,179:.: 0.66:1.000:. ./.:4:157,208:.: 1.11:1.000:. ./.:4:74,306:.: 1.33:1.000:. ./.:4:22,61:.:-2.89:1.000:. ./.:4:127,176:.: 0.23:1.000:. ./.:4:144,244:.: 1.44:1.000:. ./.:4:161,90:.:-0.51:1.000:. ./.:4:32,63:.:-2.72:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.05:1.000:. ./.:4:81,304:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,356:.: 0.98:1.000:. ./.:4:88,296:.: 1.38:1.000:. ./.:4:121,178:.: 0.17:1.000:. ./.:4:113,195:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,260:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,56:.:-3.06:1.000:. ./.:4:21,81:.:-2.62:1.000:. ./.:3:9,28:.:-3.55:1.000:. ./.:4:93,266:.: 1.03:1.000:. ./.:4:179,83:.:-0.35:1.000:. ./.:4:191,82:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,310:.: 0.33:1.000:. ./.:4:150,171:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,331:.: 0.63:1.000:. ./.:4:57,262:.: 0.46:1.000:. ./.:4:113,128:.:-0.65:1.000:. ./.:4:129,174:.: 0.23:1.000:. ./.:4:78,238:.: 0.42:1.000:. ./.:5:179,321:.: 3.03:1.000:. ./.:4:90,125:.:-1.02:1.000:. ./.:4:59,189:.:-0.55:1.000:. ./.:4:137,74:.:-1.08:1.000:. ./.:4:112,143:.:-0.45:1.000:. ./.:4:173,212:.: 1.40:1.000:. ./.:4:125,152:.:-0.14:1.000:. ./.:4:68,276:.: 0.81:1.000:. ./.:4:58,214:.:-0.21:1.000:. ./.:4:61,198:.:-0.39:1.000:. ./.:4:53,197:.:-0.52:1.000:. ./.:4:110,132:.:-0.63:1.000:. ./.:4:44,209:.:-0.48:1.000:. ./.:6:37,234:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.74:1.000:. ./.:4:132,147:.:-0.11:1.000:. ./.:4:66,244:.: 0.33:1.000:. ./.:4:67,185:.:-0.49:1.000:. ./.:4:135,181:.: 0.42:1.000:. ./.:4:187,64:.:-0.51:1.000:. ./.:4:40,175:.:-1.02:1.000:. ./.:4:64,244:.: 0.30:1.000:. ./.:4:140,176:.: 0.42:0.887:. ./.:4:1,322:.: 0.52:1.000:. ./.:4:67,264:.: 0.63:1.000:. ./.:4:66,83:.:-1.96:0.999:. ./.:4:132,163:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,258:.: 0.63:1.000:. ./.:4:68,285:.: 0.94:1.000:. ./.:4:120,173:.: 0.09:1.000:. ./.:4:59,197:.:-0.44:1.000:. ./.:4:216,84:.: 0.19:1.000:. ./.:4:64,266:.: 0.62:1.000:. ./.:4:56,250:.: 0.27:1.000:. ./.:4:48,164:.:-1.06:0.985:. ./.:4:67,262:.: 0.60:1.000:. ./.:4:55,277:.: 0.64:1.000:. ./.:4:110,163:.:-0.19:1.000:. ./.:4:55,296:.: 0.91:1.000:. ./.:4:146,164:.: 0.33:1.000:. ./.:4:43,177:.:-0.95:1.000:. ./.:4:69,209:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,212:.:-0.12:1.000:. ./.:4:54,278:.: 0.64:1.000:. ./.:4:137,62:.:-1.25:1.000:. ./.:4:107,162:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,274:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,201:.:-0.24:1.000:. ./.:4:61,245:.: 0.27:1.000:. ./.:4:116,148:.:-0.32:1.000:. ./.:4:55,206:.:-0.36:1.000:. ./.:4:129,116:.:-0.59:1.000:. ./.:4:126,170:.: 0.13:1.000:. ./.:4:143,177:.: 0.47:1.000:. ./.:4:74,135:.:-1.10:1.000:. ./.:4:76,291:.: 1.14:1.000:. ./.:4:45,158:.:-1.19:1.000:. ./.:4:142,195:.: 0.71:0.904:. ./.:4:0,232:.:-0.78:1.000:. ./.:4:50,227:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,194:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,317:.: 0.43:1.000:. ./.:4:188,191:.: 1.31:0.993:. ./.:4:122,162:.:-0.04:1.000:. ./.:4:126,173:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,406:.: 1.69:1.000:. ./.:4:137,145:.:-0.07:0.999:. ./.:4:108,159:.:-0.28:1.000:. ./.:4:96,106:.:-1.20:1.000:. ./.:4:144,158:.: 0.22:1.000:. ./.:4:87,125:.:-1.06:1.000:. ./.:4:118,155:.:-0.19:1.000:. ./.:4:166,66:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,112:.:-1.09:1.000:. ./.:4:93,292:.: 1.40:1.000:. ./.:4:126,151:.:-0.14:1.000:. ./.:4:71,274:.: 0.83:1.000:. ./.:4:142,183:.: 0.54:1.000:. ./.:4:181,90:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,356:.: 0.98:1.000:. ./.:4:131,182:.: 0.37:1.000:. ./.:4:92,108:.:-1.23:1.000:. ./.:4:129,47:.:-1.57:1.000:. ./.:4:89,109:.:-1.26:1.000:. ./.:4:185,77:.:-0.35:1.000:. ./.:4:119,164:.:-0.05:1.000:. ./.:4:101,42:.:-2.04:1.000:. ./.:4:205,83:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,324:.: 0.53:1.000:. ./.:4:74,288:.: 1.07:1.000:. ./.:4:67,271:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,263:.:-0.34:1.000:. ./.:4:105,135:.:-0.66:1.000:. ./.:4:59,222:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,238:.: 0.20:1.000:. ./.:4:120,160:.:-0.10:1.000:. ./.:4:60,225:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.76:1.000:. ./.:4:240,110:.: 0.90:1.000:. ./.:4:173,266:.: 2.16:1.000:. ./.:4:66,265:.: 0.63:1.000:. ./.:4:116,136:.:-0.49:1.000:. ./.:4:209,87:.: 0.13:1.000:. ./.:4:61,229:.: 0.05:1.000:. ./.:4:78,322:.: 1.61:1.000:. ./.:4:119,162:.:-0.08:1.000:. ./.:4:27,97:.:-2.31:1.000:. ./.:4:88,143:.:-0.79:1.000:. ./.:4:69,244:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,346:.: 0.84:1.000:. ./.:4:152,232:.: 1.38:1.000:. ./.:4:202,99:.: 0.20:1.000:. ./.:4:105,151:.:-0.44:1.000:. ./.:4:71,291:.: 1.07:1.000:. ./.:4:55,190:.:-0.59:1.000:. ./.:4:118,156:.:-0.18:1.000:. ./.:4:122,161:.:-0.05:1.000:. ./.:4:77,261:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,378:.: 1.30:1.000:. ./.:4:203,69:.:-0.21:1.000:. ./.:4:87,122:.:-1.10:1.000:. ./.:4:116,138:.:-0.46:0.999:. ./.:4:158,91:.:-0.54:1.000:. ./.:4:113,152:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,151:.:-0.32:1.000:. ./.:4:163,64:.:-0.85:1.000:. ./.:4:189,83:.:-0.21:1.000:. ./.:4:128,150:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,201:.:-0.56:1.000:. ./.:4:99,120:.:-0.96:1.000:. ./.:4:217,104:.: 0.49:1.000:. ./.:4:141,183:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.73:1.000:. ./.:4:86,231:.: 0.43:1.000:. ./.:4:130,158:.: 0.02:1.000:. ./.:4:164,210:.: 1.24:1.000:. ./.:4:150,216:.: 1.13:1.000:. ./.:4:116,127:.:-0.62:1.000:. ./.:4:79,266:.: 0.83:1.000:. -chr8.1 6158414 chr8.1_006158414 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:140,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:214,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:40,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.35:0.994:. ./.:4:141,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:119,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.21:1.000:. ./.:3:22,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.52:1.000:. ./.:5:220,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.04:1.000:. ./.:6:82,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:0.887:. ./.:4:132,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.94:0.999:. ./.:4:97,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.94:0.985:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:116,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.32:0.904:. ./.:4:75,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:152,1:.: 1.01:0.993:. ./.:4:122,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.28:0.999:. ./.:4:103,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:194,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.98:0.999:. ./.:4:122,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:203,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.96:1.000:. -chr8.1 6501804 chr8.1_006501804 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:89,89:0.47: 0.48:1.000:0.992 0/0/0/1:4:118,53:0.29: 0.30:1.000:0.990 0/0/0/1:4:135,33:0.19: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,46:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,54:0.23: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,45:0.24: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,19:0.21:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,80:0.50:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-2.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,28:0.59:-3.04:1.000:0.849 0/0/0/1:4:140,42:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,37:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,47:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,86:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,50:0.25: 0.72:0.994:0.999 0/0/0/1:4:137,48:0.25: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,116:0.47: 1.93:1.000:0.992 0/0/0/1:4:145,44:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,22:0.36:-2.67:1.000:0.713 0/0/0/1:4:123,38:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,40:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,64:0.47:-0.81:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,13:0.27:-3.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:132,62:0.30: 0.90:1.000:0.983 0/0/0/1:4:156,51:0.23: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,39:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,58:0.28: 0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,100:0.53: 0.48:1.000:0.993 0/0/0/1:4:113,56:0.31: 0.25:1.000:0.969 0/0/0/1:4:115,53:0.30: 0.22:1.000:0.987 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-3.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,25:0.27:-1.91:1.000:0.997 0/0/1:3:35,10:0.21:-3.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,49:0.24: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,89:0.48: 0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,88:0.45: 0.64:1.000:0.980 0/0/0/1:4:122,55:0.29: 0.46:1.000:0.990 0/0/0/1:4:158,66:0.28: 1.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:119,33:0.21:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,57:0.29: 0.75:1.000:0.993 0/0/0/1:4:137,44:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,34:0.21:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,38:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,47:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:133,106:0.42: 2.09:1.000:0.959 0/0/1/1:4:35,50:0.55:-1.96:1.000:0.980 0/0/0/1:4:114,41:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,40:0.28:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,133:0.52: 2.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:139,51:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,47:0.23: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,51:0.27: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,98:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,50:0.30:-0.12:1.000:0.980 0/0/0/0/1/1:6:82,48:0.35:-0.78:1.000:0.902 0/0/0/1:4:109,60:0.34: 0.25:1.000:0.897 0/0/1/1:4:81,103:0.53: 0.64:1.000:0.994 0/0/0/1:4:117,48:0.28: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,83:0.45: 0.40:1.000:0.976 0/0/0/1:4:148,48:0.23: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,18:0.22:-2.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,43:0.24: 0.25:0.887:1.000 0/0/1/1:4:85,74:0.44:-0.02:1.000:0.964 0/0/0/1:4:115,42:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-2.41:0.999:1.000 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,54:0.27: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:118,37:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,39:0.26:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:89,76:0.43: 0.14:1.000:0.956 0/0/0/1:4:112,37:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,46:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,78:0.47:-0.12:0.985:0.993 0/0/1/1:4:81,114:0.55: 0.93:1.000:0.983 0/0/1/1:4:64,84:0.53:-0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,80:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,49:0.27: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,31:0.24:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,40:0.26:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:61,75:0.52:-0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,81:0.52:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:81,18:0.17:-1.60:1.000:0.998 0/0/0/1:4:121,52:0.28: 0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,100:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,37:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,86:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/0:4:180,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,50:0.26: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,128:0.53: 1.80:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,23:0.29:-2.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:146,52:0.25: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,68:0.50:-0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,51:0.29: 0.22:0.904:0.993 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,37:0.21: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,40:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:195,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,49:0.22: 1.30:0.993:1.000 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:218,0:0.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,42:0.26:-0.15:0.999:0.999 0/0/1/1:4:76,98:0.53: 0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:71,35:0.31:-1.41:1.000:0.970 0/0/1/1:4:74,86:0.51: 0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:117,2:0.02:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:129,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,64:0.38:-0.04:1.000:0.594 0/0/0/1:4:83,27:0.23:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,52:0.26: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,84:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,37:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,38:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,70:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,48:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,76:0.54:-0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:68,63:0.45:-0.75:1.000:0.983 0/0/0/1:4:120,42:0.25: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:180,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,58:0.53:-1.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:122,43:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,40:0.22: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,71:0.29: 1.88:1.000:0.992 0/0/0/1:4:126,55:0.29: 0.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:120,49:0.27: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,32:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,86:0.53:-0.23:1.000:0.991 0/0/0/1:4:117,40:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,89:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,125:0.50: 1.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,102:0.48: 1.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,146:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,107:0.48: 1.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:109,49:0.29:-0.04:1.000:0.990 0/0/0/1:4:153,56:0.25: 1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,34:0.20: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,11:0.17:-2.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:70,28:0.27:-1.62:1.000:0.998 0/0/0/0:4:179,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,99:0.48: 0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,102:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,71:0.47:-0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,48:0.27: 0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:132,52:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,50:0.28: 0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:123,49:0.27: 0.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,39:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,43:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,32:0.23:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.60:0.999:1.000 0/0/0/1:4:119,44:0.26: 0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,47:0.29:-0.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:121,31:0.19:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,91:0.54:-0.02:1.000:0.990 0/0/0/1:4:90,34:0.26:-0.94:1.000:0.999 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:197,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,51:0.24: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,47:0.27: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,36:0.21: 0.04:1.000:1.000 -chr8.1 6715353 chr8.1_006715353 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:39,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:65,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:64,23:.: 0.32:1.000:. ./.:4:66,28:.: 0.60:1.000:. ./.:4:75,19:.: 0.60:1.000:. ./.:4:76,34:.: 1.26:1.000:. ./.:4:38,17:.:-1.00:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,48:.: 1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:4,9:.:-2.72:1.000:. ./.:4:83,22:.: 1.06:1.000:. ./.:4:69,16:.: 0.23:1.000:. ./.:4:92,22:.: 1.42:1.000:. ./.:4:45,37:.: 0.11:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:86,19:.: 1.06:0.994:. ./.:4:58,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:52,48:.: 0.85:1.000:. ./.:4:98,31:.: 2.04:1.000:. ./.:4:12,4:.:-2.60:1.000:. ./.:4:70,22:.: 0.52:1.000:. ./.:4:86,25:.: 1.30:1.000:. ./.:4:37,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:4,2:.:-3.01:1.000:. ./.:4:86,31:.: 1.55:1.000:. ./.:4:72,14:.: 0.28:1.000:. ./.:4:57,22:.:-0.01:1.000:. ./.:4:75,19:.: 0.60:1.000:. ./.:4:58,52:.: 1.26:1.000:. ./.:4:83,19:.: 0.93:1.000:. ./.:4:65,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.93:1.000:. ./.:4:14,3:.:-2.56:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:68,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:57,44:.: 0.89:1.000:. ./.:4:57,50:.: 1.14:1.000:. ./.:4:77,21:.: 0.77:1.000:. ./.:4:92,25:.: 1.55:1.000:. ./.:4:53,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:60,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:75,16:.: 0.48:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:54,22:.:-0.14:1.000:. ./.:4:79,16:.: 0.64:1.000:. ./.:5:73,47:.: 1.67:1.000:. ./.:4:10,18:.:-2.11:1.000:. ./.:4:60,20:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,16:.:-1.16:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:52,37:.: 0.40:1.000:. ./.:4:43,17:.:-0.79:1.000:. ./.:4:62,26:.: 0.36:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:56,38:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,19:.: 0.07:1.000:. ./.:6:34,17:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,13:.:-1.00:1.000:. ./.:4:35,26:.:-0.75:1.000:. ./.:4:62,27:.: 0.40:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:64,49:.: 1.38:1.000:. ./.:4:60,13:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,9:.:-0.96:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:65,25:.: 0.44:0.887:. ./.:4:40,34:.:-0.22:1.000:. ./.:4:77,24:.: 0.89:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.63:0.999:. ./.:4:112,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:75,24:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,19:.:-0.05:1.000:. ./.:4:45,20:.:-0.59:1.000:. ./.:4:25,34:.:-0.83:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.92:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:90,24:.: 1.42:1.000:. ./.:4:40,27:.:-0.50:0.985:. ./.:4:50,46:.: 0.69:1.000:. ./.:4:47,51:.: 0.77:1.000:. ./.:4:29,30:.:-0.83:1.000:. ./.:4:59,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,16:.:-0.22:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:31,30:.:-0.75:1.000:. ./.:4:40,26:.:-0.55:1.000:. ./.:4:63,8:.:-0.34:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.26:1.000:. ./.:4:56,41:.: 0.73:1.000:. ./.:4:40,11:.:-1.16:1.000:. ./.:4:36,30:.:-0.55:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:45,46:.: 0.48:1.000:. ./.:4:48,11:.:-0.83:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:25,22:.:-1.33:1.000:. ./.:4:55,14:.:-0.42:0.904:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.18:1.000:. ./.:4:53,17:.:-0.38:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,28:.: 1.34:0.993:. ./.:4:90,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:45,10:.:-1.00:0.999:. ./.:4:55,36:.: 0.48:1.000:. ./.:4:34,15:.:-1.24:1.000:. ./.:4:32,39:.:-0.34:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:28,29:.:-0.92:1.000:. ./.:4:44,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:63,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:31,23:.:-1.04:1.000:. ./.:4:45,17:.:-0.71:1.000:. ./.:4:77,31:.: 1.18:1.000:. ./.:4:26,38:.:-0.63:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:67,1:.:-0.46:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:39,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:28,29:.:-0.92:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.87:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,29:.:-0.83:1.000:. ./.:4:60,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:49,29:.:-0.05:1.000:. ./.:4:89,33:.: 1.75:1.000:. ./.:4:58,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:47,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:44,4:.:-1.28:1.000:. ./.:4:27,27:.:-1.04:1.000:. ./.:4:49,22:.:-0.34:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:41,42:.: 0.15:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:51,57:.: 1.18:1.000:. ./.:4:54,48:.: 0.93:1.000:. ./.:4:28,88:.: 1.51:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:53,59:.: 1.34:1.000:. ./.:4:67,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:80,26:.: 1.10:1.000:. ./.:4:74,18:.: 0.52:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.80:1.000:. ./.:4:53,19:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:54,51:.: 1.06:1.000:. ./.:4:61,44:.: 1.06:1.000:. ./.:4:36,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:84,22:.: 1.10:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:66,15:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,29:.: 0.28:1.000:. ./.:4:72,21:.: 0.56:1.000:. ./.:4:63,19:.: 0.11:1.000:. ./.:4:69,20:.: 0.40:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:56,18:.:-0.22:1.000:. ./.:4:81,23:.: 1.01:1.000:. ./.:4:64,13:.:-0.09:1.000:. ./.:4:45,35:.: 0.03:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.34:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:84,27:.: 1.30:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:68,23:.: 0.48:1.000:. -chr8.1 7004488 chr8.1_007004488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:15,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.36:1.000:. ./.:4:43,19:.: 2.65:1.000:. ./.:4:23,12:.: 0.92:1.000:. ./.:4:4,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,5:.: 0.22:1.000:. ./.:4:8,9:.:-0.23:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,4:.:-0.16:1.000:. ./.:4:19,6:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,3:.: 0.41:0.994:. ./.:4:30,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:28,8:.: 0.99:1.000:. ./.:4:18,6:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,2:.:-1.12:1.000:. ./.:4:14,2:.:-0.29:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1,4:.:-1.00:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,4:.: 0.03:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.00:1.000:. ./.:3:0,1:.:-1.25:1.000:. ./.:4:25,6:.: 0.67:1.000:. ./.:4:20,4:.: 0.22:1.000:. ./.:4:11,5:.:-0.29:1.000:. ./.:4:18,4:.: 0.09:1.000:. ./.:4:26,2:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:20,5:.: 0.28:1.000:. ./.:5:19,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.00:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,7:.: 1.56:1.000:. ./.:4:11,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:21,4:.: 0.28:1.000:. ./.:4:14,4:.:-0.16:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.23:1.000:. ./.:6:6,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:14,4:.:-0.16:1.000:. ./.:4:18,5:.: 0.15:1.000:. ./.:4:4,3:.:-0.87:1.000:. ./.:4:29,5:.: 0.86:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.93:0.887:. ./.:4:26,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:14,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.23:0.999:. ./.:4:20,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:19,8:.: 0.41:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,2:.:-0.74:1.000:. ./.:4:14,4:.:-0.16:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,12:.: 2.65:1.000:. ./.:4:22,4:.: 0.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.80:0.985:. ./.:4:36,14:.: 1.88:1.000:. ./.:4:4,8:.:-0.55:1.000:. ./.:4:10,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,4:.:-0.36:1.000:. ./.:4:42,9:.: 1.94:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:15,10:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,3:.:-0.55:1.000:. ./.:4:5,8:.:-0.48:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:21,7:.: 0.47:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.86:1.000:. ./.:4:5,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:12,13:.: 0.28:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.99:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:16,15:.: 0.67:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:11,7:.:-0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.00:0.904:. ./.:4:8,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,36:.: 3.80:1.000:. ./.:4:11,4:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,19:.: 1.50:0.993:. ./.:4:64,13:.: 3.60:1.000:. ./.:4:19,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:50,5:.: 2.20:1.000:. ./.:4:10,2:.:-0.55:0.999:. ./.:4:6,7:.:-0.48:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:19,4:.: 0.15:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.92:1.000:. ./.:4:20,13:.: 0.79:1.000:. ./.:4:51,18:.: 3.09:1.000:. ./.:4:11,7:.:-0.16:1.000:. ./.:4:10,5:.:-0.36:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:12,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:10,4:.:-0.42:1.000:. ./.:4:7,3:.:-0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:58,3:.: 2.58:1.000:. ./.:4:5,10:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.87:1.000:. ./.:4:9,8:.:-0.23:1.000:. ./.:4:22,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:4,5:.:-0.74:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:25,13:.: 1.11:1.000:. ./.:4:16,5:.: 0.03:1.000:. ./.:4:29,9:.: 1.11:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:90,25:.: 6.03:1.000:. ./.:4:6,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:10,3:.:-0.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:32,10:.: 1.37:1.000:. ./.:4:20,10:.: 0.60:1.000:. ./.:4:30,7:.: 1.05:1.000:. ./.:4:8,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:23,3:.: 0.35:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:5,4:.:-0.74:1.000:. ./.:4:22,7:.: 0.54:1.000:. ./.:4:13,13:.: 0.35:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.30:0.999:. ./.:4:12,4:.:-0.29:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:31,6:.: 1.05:1.000:. ./.:4:16,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:6,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:14,19:.: 0.79:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.73:1.000:. -chr8.1 7061320 chr8.1_007061320 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:346,91:.: 0.73:1.000:. ./.:4:175,133:.:-0.92:1.000:. ./.:4:337,83:.: 0.51:1.000:. ./.:4:188,160:.:-0.41:1.000:. ./.:4:512,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:287,190:.: 1.24:1.000:. ./.:4:239,51:.:-1.15:1.000:. ./.:4:242,176:.: 0.48:1.000:. ./.:4:190,166:.:-0.31:1.000:. ./.:4:170,34:.:-2.25:1.000:. ./.:4:62,91:.:-2.90:1.000:. ./.:4:205,210:.: 0.44:1.000:. ./.:4:332,69:.: 0.27:1.000:. ./.:4:235,186:.: 0.52:1.000:. ./.:4:223,154:.:-0.04:1.000:. ./.:4:212,162:.:-0.08:1.000:. ./.:4:125,301:.: 0.58:0.994:. ./.:4:224,194:.: 0.48:1.000:. ./.:4:393,115:.: 1.63:1.000:. ./.:4:512,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:191,3:.:-2.38:1.000:. ./.:4:309,84:.: 0.16:1.000:. ./.:4:198,177:.:-0.07:1.000:. ./.:4:191,125:.:-0.82:1.000:. ./.:4:92,51:.:-3.03:1.000:. ./.:4:262,188:.: 0.89:1.000:. ./.:4:98,266:.:-0.21:1.000:. ./.:4:219,168:.: 0.09:1.000:. ./.:4:386,95:.: 1.29:1.000:. ./.:4:338,91:.: 0.62:1.000:. ./.:4:131,307:.: 0.74:1.000:. ./.:4:210,162:.:-0.10:1.000:. ./.:4:128,23:.:-2.93:1.000:. ./.:4:180,41:.:-2.03:1.000:. ./.:3:91,15:.:-3.50:1.000:. ./.:4:122,207:.:-0.65:1.000:. ./.:4:232,158:.: 0.12:1.000:. ./.:4:235,144:.:-0.02:1.000:. ./.:4:269,198:.: 1.11:1.000:. ./.:4:251,202:.: 0.93:1.000:. ./.:4:316,74:.: 0.12:1.000:. ./.:4:232,194:.: 0.58:1.000:. ./.:4:394,104:.: 1.50:1.000:. ./.:4:242,166:.: 0.35:1.000:. ./.:4:260,188:.: 0.87:1.000:. ./.:4:230,181:.: 0.39:1.000:. ./.:5:247,290:.: 2.00:1.000:. ./.:4:100,187:.:-1.19:1.000:. ./.:4:217,172:.: 0.11:1.000:. ./.:4:391,87:.: 1.25:1.000:. ./.:4:303,81:.: 0.05:1.000:. ./.:4:423,103:.: 1.86:1.000:. ./.:4:282,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:384,97:.: 1.29:1.000:. ./.:4:252,92:.:-0.46:1.000:. ./.:4:244,207:.: 0.90:1.000:. ./.:4:311,72:.: 0.04:1.000:. ./.:4:376,100:.: 1.22:1.000:. ./.:4:319,75:.: 0.18:1.000:. ./.:6:192,145:.:-0.55:1.000:. ./.:4:211,148:.:-0.27:1.000:. ./.:4:101,246:.:-0.42:1.000:. ./.:4:125,277:.: 0.28:1.000:. ./.:4:349,76:.: 0.57:1.000:. ./.:4:130,296:.: 0.58:1.000:. ./.:4:359,100:.: 1.01:1.000:. ./.:4:174,99:.:-1.37:1.000:. ./.:4:307,81:.: 0.10:1.000:. ./.:4:448,1:.: 0.88:0.887:. ./.:4:196,149:.:-0.45:1.000:. ./.:4:136,309:.: 0.83:1.000:. ./.:4:251,59:.:-0.90:0.999:. ./.:4:319,181:.: 1.53:1.000:. ./.:4:217,169:.: 0.07:1.000:. ./.:4:222,153:.:-0.07:1.000:. ./.:4:97,242:.:-0.53:1.000:. ./.:4:352,74:.: 0.58:1.000:. ./.:4:320,92:.: 0.41:1.000:. ./.:4:310,94:.: 0.30:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:89,211:.:-1.02:0.985:. ./.:4:242,191:.: 0.67:1.000:. ./.:4:219,179:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,214:.:-1.11:1.000:. ./.:4:136,256:.: 0.15:1.000:. ./.:4:253,171:.: 0.56:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:265,63:.:-0.67:1.000:. ./.:4:317,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:197,142:.:-0.53:1.000:. ./.:4:227,60:.:-1.19:1.000:. ./.:4:311,90:.: 0.27:1.000:. ./.:4:349,106:.: 0.96:1.000:. ./.:4:163,110:.:-1.37:1.000:. ./.:4:255,177:.: 0.66:1.000:. ./.:4:249,180:.: 0.62:1.000:. ./.:4:312,75:.: 0.09:1.000:. ./.:4:214,147:.:-0.25:1.000:. ./.:4:273,142:.: 0.44:1.000:. ./.:4:120,245:.:-0.19:1.000:. ./.:4:217,43:.:-1.54:1.000:. ./.:4:352,69:.: 0.52:1.000:. ./.:4:240,64:.:-0.97:1.000:. ./.:4:195,141:.:-0.56:0.904:. ./.:4:276,72:.:-0.41:1.000:. ./.:4:305,95:.: 0.25:1.000:. ./.:4:245,72:.:-0.81:1.000:. ./.:4:316,101:.: 0.47:1.000:. ./.:4:263,208:.: 1.16:0.993:. ./.:4:200,152:.:-0.36:1.000:. ./.:4:202,151:.:-0.35:1.000:. ./.:4:474,111:.: 2.62:1.000:. ./.:4:402,2:.: 0.30:0.999:. ./.:4:128,244:.:-0.10:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:354,72:.: 0.58:1.000:. ./.:4:187,119:.:-0.95:1.000:. ./.:4:218,171:.: 0.11:1.000:. ./.:4:197,134:.:-0.63:1.000:. ./.:4:204,173:.:-0.04:1.000:. ./.:4:228,159:.: 0.09:1.000:. ./.:4:106,247:.:-0.35:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:325,78:.: 0.29:1.000:. ./.:4:198,156:.:-0.33:1.000:. ./.:4:216,150:.:-0.18:1.000:. ./.:4:216,133:.:-0.40:1.000:. ./.:4:211,150:.:-0.25:1.000:. ./.:4:152,102:.:-1.61:1.000:. ./.:4:72,174:.:-1.71:1.000:. ./.:4:307,73:.: 0.00:1.000:. ./.:4:217,177:.: 0.18:1.000:. ./.:4:141,101:.:-1.77:1.000:. ./.:4:295,76:.:-0.12:1.000:. ./.:4:176,161:.:-0.55:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:313,82:.: 0.19:1.000:. ./.:4:170,143:.:-0.86:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:190,145:.:-0.58:1.000:. ./.:4:240,144:.: 0.05:1.000:. ./.:4:184,140:.:-0.72:1.000:. ./.:4:197,131:.:-0.67:1.000:. ./.:4:285,75:.:-0.26:1.000:. ./.:4:250,224:.: 1.20:1.000:. ./.:4:401,98:.: 1.52:1.000:. ./.:4:230,185:.: 0.44:1.000:. ./.:4:207,178:.: 0.06:1.000:. ./.:4:259,222:.: 1.29:1.000:. ./.:4:406,2:.: 0.35:1.000:. ./.:4:353,94:.: 0.85:1.000:. ./.:4:311,90:.: 0.27:1.000:. ./.:4:71,43:.:-3.40:1.000:. ./.:4:138,109:.:-1.70:1.000:. ./.:4:489,1:.: 1.40:1.000:. ./.:4:336,92:.: 0.61:1.000:. ./.:4:361,83:.: 0.81:1.000:. ./.:4:211,171:.: 0.02:1.000:. ./.:4:190,132:.:-0.74:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:176,164:.:-0.51:1.000:. ./.:4:290,93:.: 0.04:1.000:. ./.:4:198,161:.:-0.27:1.000:. ./.:4:321,80:.: 0.27:1.000:. ./.:4:230,169:.: 0.24:1.000:. ./.:4:324,83:.: 0.34:1.000:. ./.:4:156,143:.:-1.04:1.000:. ./.:4:211,135:.:-0.44:0.999:. ./.:4:334,69:.: 0.29:1.000:. ./.:4:202,142:.:-0.46:1.000:. ./.:4:283,60:.:-0.48:1.000:. ./.:4:176,151:.:-0.68:1.000:. ./.:4:274,72:.:-0.44:1.000:. ./.:4:293,72:.:-0.19:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:173,116:.:-1.17:1.000:. ./.:4:410,108:.: 1.76:1.000:. ./.:4:366,99:.: 1.08:1.000:. ./.:4:321,77:.: 0.23:1.000:. ./.:4:280,86:.:-0.18:1.000:. ./.:4:236,187:.: 0.55:1.000:. ./.:4:143,312:.: 0.96:1.000:. ./.:4:409,86:.: 1.47:1.000:. ./.:4:164,119:.:-1.24:1.000:. ./.:4:206,157:.:-0.22:1.000:. -chr8.1 7232538 chr8.1_007232538 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:203,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:127,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:161,52:.: 1.58:1.000:. ./.:4:243,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:97,36:.:-0.37:1.000:. ./.:4:122,39:.: 0.31:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:51,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:114,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.87:0.994:. ./.:4:98,119:.: 1.68:1.000:. ./.:4:153,52:.: 1.38:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:127,44:.: 0.56:1.000:. ./.:4:122,34:.: 0.19:1.000:. ./.:4:38,1:.:-2.66:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:146,39:.: 0.90:1.000:. ./.:4:146,44:.: 1.02:1.000:. ./.:4:136,52:.: 0.97:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:29,8:.:-2.71:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.95:1.000:. ./.:3:30,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:118,38:.: 0.19:1.000:. ./.:4:145,44:.: 0.99:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:118,44:.: 0.34:1.000:. ./.:4:101,40:.:-0.18:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:134,48:.: 0.82:1.000:. ./.:5:234,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:105,31:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,28:.:-0.18:1.000:. ./.:4:90,24:.:-0.83:1.000:. ./.:4:152,56:.: 1.46:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:104,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:126,35:.: 0.31:1.000:. ./.:4:114,36:.: 0.04:1.000:. ./.:4:98,38:.:-0.30:1.000:. ./.:4:103,39:.:-0.15:1.000:. ./.:4:123,28:.: 0.07:1.000:. ./.:6:94,8:.:-1.13:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,43:.:-0.96:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:134,45:.: 0.75:1.000:. ./.:4:50,22:.:-1.86:1.000:. ./.:4:108,28:.:-0.30:1.000:. ./.:4:113,27:.:-0.20:0.887:. ./.:4:157,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:44,18:.:-2.10:0.999:. ./.:4:186,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:156,52:.: 1.46:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,33:.:-0.27:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:99,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:114,38:.: 0.09:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.08:0.985:. ./.:4:150,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:104,39:.:-0.13:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:73,31:.:-1.08:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:107,29:.:-0.30:1.000:. ./.:4:107,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:85,23:.:-0.98:1.000:. ./.:4:91,31:.:-0.64:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:119,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.00:0.904:. ./.:4:90,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:244,0:.: 2.33:0.993:. ./.:4:109,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:71,20:.:-1.39:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:76,37:.:-0.86:0.999:. ./.:4:129,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:86,21:.:-1.00:1.000:. ./.:4:111,35:.:-0.05:1.000:. ./.:4:67,15:.:-1.61:1.000:. ./.:4:112,30:.:-0.15:1.000:. ./.:4:102,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:100,31:.:-0.42:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:104,31:.:-0.32:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:104,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:84,24:.:-0.98:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:103,39:.:-0.15:1.000:. ./.:4:116,32:.:-0.01:1.000:. ./.:4:65,17:.:-1.61:1.000:. ./.:4:114,30:.:-0.10:1.000:. ./.:4:138,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:186,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:78,22:.:-1.17:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:96,39:.:-0.32:1.000:. ./.:4:81,30:.:-0.91:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:146,49:.: 1.14:1.000:. ./.:4:158,65:.: 1.82:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:127,33:.: 0.29:1.000:. ./.:4:151,49:.: 1.26:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:138,43:.: 0.80:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:47,8:.:-2.27:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:147,45:.: 1.07:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:157,43:.: 1.26:1.000:. ./.:4:92,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:124,32:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,29:.:-0.10:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:118,45:.: 0.36:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:137,42:.: 0.75:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.07:0.999:. ./.:4:136,41:.: 0.70:1.000:. ./.:4:106,50:.: 0.19:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:124,39:.: 0.36:1.000:. ./.:4:98,37:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:112,93:.: 1.38:1.000:. ./.:4:138,34:.: 0.58:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:112,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:120,49:.: 0.51:1.000:. ./.:4:160,51:.: 1.53:1.000:. ./.:4:149,41:.: 1.02:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.19:1.000:. -chr8.1 7433147 chr8.1_007433147 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:51,11:.:-0.64:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:52,17:.:-0.21:1.000:. ./.:4:45,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:42,30:.:-0.03:1.000:. ./.:4:40,23:.:-0.58:1.000:. ./.:4:15,10:.:-2.87:1.000:. ./.:4:45,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:39,14:.:-1.18:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:73,28:.: 1.72:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:35,26:.:-0.70:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:34,13:.:-1.54:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:48,15:.:-0.58:1.000:. ./.:4:42,32:.: 0.09:1.000:. ./.:4:77,13:.: 1.05:1.000:. ./.:4:47,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:55,12:.:-0.33:1.000:. ./.:4:54,15:.:-0.21:1.000:. ./.:4:33,19:.:-1.24:1.000:. ./.:4:40,23:.:-0.58:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:70,18:.: 0.93:1.000:. ./.:4:39,15:.:-1.12:1.000:. ./.:4:39,8:.:-1.54:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.96:1.000:. ./.:4:38,14:.:-1.24:1.000:. ./.:3:39,6:.:-1.66:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:29,25:.:-1.12:1.000:. ./.:4:40,27:.:-0.33:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:69,10:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:51,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:42,19:.:-0.70:1.000:. ./.:4:78,31:.: 2.20:1.000:. ./.:4:57,18:.: 0.15:1.000:. ./.:5:84,14:.: 1.54:1.000:. ./.:4:93,19:.: 2.38:1.000:. ./.:4:34,11:.:-1.66:1.000:. ./.:4:63,40:.: 1.84:1.000:. ./.:4:62,21:.: 0.63:1.000:. ./.:4:38,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:60,19:.: 0.39:1.000:. ./.:4:84,18:.: 1.78:1.000:. ./.:4:53,18:.:-0.09:1.000:. ./.:4:52,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,17:.: 0.81:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.27:1.000:. ./.:6:85,6:.: 1.11:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:30,15:.:-1.66:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:78,19:.: 1.48:1.000:. ./.:4:66,17:.: 0.63:1.000:. ./.:4:37,27:.:-0.52:1.000:. ./.:4:60,18:.: 0.33:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.75:1.000:. ./.:4:58,48:.: 2.02:0.887:. ./.:4:58,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:42,13:.:-1.06:0.999:. ./.:4:80,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:41,12:.:-1.18:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:45,15:.:-0.76:1.000:. ./.:4:48,16:.:-0.52:1.000:. ./.:4:64,57:.: 2.93:1.000:. ./.:4:62,14:.: 0.21:1.000:. ./.:4:66,14:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.52:0.985:. ./.:4:61,14:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,17:.: 1.54:1.000:. ./.:4:50,11:.:-0.70:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:68,17:.: 0.75:1.000:. ./.:4:62,11:.: 0.03:1.000:. ./.:4:70,17:.: 0.87:1.000:. ./.:4:75,14:.: 0.99:1.000:. ./.:4:56,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,28:.:-0.70:1.000:. ./.:4:51,13:.:-0.52:1.000:. ./.:4:81,15:.: 1.42:1.000:. ./.:4:39,10:.:-1.42:1.000:. ./.:4:80,25:.: 1.96:1.000:. ./.:4:72,18:.: 1.05:1.000:. ./.:4:75,23:.: 1.54:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:73,17:.: 1.05:1.000:. ./.:4:72,21:.: 1.24:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.88:1.000:. ./.:4:68,19:.: 0.87:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.39:1.000:. ./.:4:69,24:.: 1.24:0.904:. ./.:4:76,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:71,14:.: 0.75:1.000:. ./.:4:62,16:.: 0.33:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:63,12:.: 0.15:0.993:. ./.:4:57,11:.:-0.27:1.000:. ./.:4:57,15:.:-0.03:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:59,45:.: 1.90:0.999:. ./.:4:71,18:.: 0.99:1.000:. ./.:4:36,29:.:-0.46:1.000:. ./.:4:46,41:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,13:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.09:1.000:. ./.:4:57,45:.: 1.78:1.000:. ./.:4:59,16:.: 0.15:1.000:. ./.:4:49,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:72,25:.: 1.48:1.000:. ./.:4:62,23:.: 0.75:1.000:. ./.:4:63,16:.: 0.39:1.000:. ./.:4:46,43:.: 0.99:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:70,30:.: 1.66:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:36,27:.:-0.58:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:54,33:.: 0.87:1.000:. ./.:4:46,10:.:-1.00:1.000:. ./.:4:33,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:38,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,19:.: 0.33:1.000:. ./.:4:57,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:50,31:.: 0.51:1.000:. ./.:4:49,15:.:-0.52:1.000:. ./.:4:68,14:.: 0.57:1.000:. ./.:4:71,17:.: 0.93:1.000:. ./.:4:54,10:.:-0.52:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,41:.: 1.42:1.000:. ./.:4:41,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,28:.: 0.39:1.000:. ./.:4:47,8:.:-1.06:1.000:. ./.:4:56,28:.: 0.69:1.000:. ./.:4:58,19:.: 0.27:1.000:. ./.:4:69,25:.: 1.30:1.000:. ./.:4:57,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:40,2:.:-1.84:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.03:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:38,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:33,34:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,13:.:-0.52:1.000:. ./.:4:54,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:41,14:.:-1.06:1.000:. ./.:4:41,7:.:-1.48:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.70:1.000:. ./.:4:57,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:44,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:47,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.75:0.999:. ./.:4:29,23:.:-1.24:1.000:. ./.:4:55,11:.:-0.39:1.000:. ./.:4:48,5:.:-1.18:1.000:. ./.:4:22,22:.:-1.72:1.000:. ./.:4:28,20:.:-1.48:1.000:. ./.:4:40,13:.:-1.18:1.000:. ./.:4:44,9:.:-1.18:1.000:. ./.:4:49,12:.:-0.70:1.000:. ./.:4:28,32:.:-0.76:1.000:. ./.:4:64,22:.: 0.81:1.000:. ./.:4:52,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:33,12:.:-1.66:1.000:. ./.:4:62,14:.: 0.21:1.000:. ./.:4:68,16:.: 0.69:1.000:. ./.:4:70,16:.: 0.81:1.000:. ./.:4:42,12:.:-1.12:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.21:1.000:. -chr8.1 7486060 chr8.1_007486060 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.50:0.999:. ./.:4:32,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:46,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.45:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:5:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:6:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:0.887:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.76:0.999:. ./.:4:37,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:0.985:. ./.:4:11,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.53:0.904:. ./.:4:15,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.58:0.993:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.64:0.999:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:42,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:0.999:. ./.:4:21,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:31,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.09:1.000:. -chr8.1 7597488 chr8.1_007597488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:267,86:.: 0.40:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:230,72:.:-0.47:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:282,97:.: 0.85:1.000:. ./.:4:322,94:.: 1.48:1.000:. ./.:4:194,63:.:-1.24:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:254,91:.: 0.27:1.000:. ./.:4:210,1:.:-2.03:1.000:. ./.:4:153,58:.:-2.03:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:241,76:.:-0.21:1.000:. ./.:4:408,2:.: 1.38:1.000:. ./.:4:244,64:.:-0.37:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:284,90:.: 0.76:1.000:. ./.:4:348,111:.: 2.22:1.000:. ./.:4:295,89:.: 0.93:1.000:. ./.:4:163,75:.:-1.56:1.000:. ./.:4:216,75:.:-0.66:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:242,79:.:-0.14:1.000:. ./.:4:138,31:.:-2.74:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:254,76:.: 0.01:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:157,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:175,83:.:-1.22:1.000:. ./.:3:65,20:.:-4.18:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:273,82:.: 0.44:1.000:. ./.:4:227,96:.:-0.11:1.000:. ./.:4:343,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:280,85:.: 0.61:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:317,91:.: 1.35:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.88:1.000:. ./.:5:375,77:.: 2.10:1.000:. ./.:4:294,125:.: 1.53:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:297,124:.: 1.57:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:310,74:.: 0.93:1.000:. ./.:4:253,76:.:-0.01:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:318,94:.: 1.41:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.33:1.000:. ./.:6:275,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:242,71:.:-0.28:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:279,77:.: 0.46:1.000:. ./.:4:233,79:.:-0.30:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:259,87:.: 0.28:0.887:. ./.:4:347,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:363,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:325,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:389,2:.: 1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:257,85:.: 0.22:1.000:. ./.:4:248,73:.:-0.14:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:266,82:.: 0.32:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.98:0.985:. ./.:4:268,70:.: 0.15:1.000:. ./.:4:259,97:.: 0.46:1.000:. ./.:4:213,57:.:-1.02:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:200,62:.:-1.15:1.000:. ./.:4:220,69:.:-0.69:1.000:. ./.:4:230,74:.:-0.43:1.000:. ./.:4:236,69:.:-0.42:1.000:. ./.:4:195,71:.:-1.08:1.000:. ./.:4:259,83:.: 0.22:1.000:. ./.:4:273,80:.: 0.40:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:219,78:.:-0.55:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:287,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:317,98:.: 1.47:1.000:. ./.:4:253,73:.:-0.06:1.000:. ./.:4:215,75:.:-0.67:1.000:. ./.:4:292,91:.: 0.92:1.000:. ./.:4:203,56:.:-1.20:1.000:. ./.:4:290,82:.: 0.73:0.904:. ./.:4:296,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:245,78:.:-0.11:1.000:. ./.:4:255,68:.:-0.11:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:333,109:.: 1.93:0.993:. ./.:4:326,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:471,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:261,79:.: 0.18:0.999:. ./.:4:234,71:.:-0.42:1.000:. ./.:4:196,73:.:-1.03:1.000:. ./.:4:277,94:.: 0.71:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:223,87:.:-0.33:1.000:. ./.:4:205,77:.:-0.81:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:254,55:.:-0.35:1.000:. ./.:4:256,92:.: 0.32:1.000:. ./.:4:271,63:.: 0.08:1.000:. ./.:4:240,71:.:-0.31:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:187,53:.:-1.53:1.000:. ./.:4:223,61:.:-0.78:1.000:. ./.:4:217,80:.:-0.55:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:165,55:.:-1.87:1.000:. ./.:4:249,78:.:-0.04:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:276,91:.: 0.64:1.000:. ./.:4:215,89:.:-0.43:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:240,65:.:-0.42:1.000:. ./.:4:269,66:.: 0.10:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:309,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:230,59:.:-0.69:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:349,109:.: 2.20:1.000:. ./.:4:322,113:.: 1.81:1.000:. ./.:4:244,77:.:-0.14:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:253,87:.: 0.18:1.000:. ./.:4:223,89:.:-0.30:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:217,56:.:-0.96:1.000:. ./.:4:133,36:.:-2.74:1.000:. ./.:4:196,59:.:-1.27:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:310,96:.: 1.31:1.000:. ./.:4:266,85:.: 0.37:1.000:. ./.:4:215,57:.:-0.98:1.000:. ./.:4:306,77:.: 0.92:1.000:. ./.:4:327,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:195,61:.:-1.26:1.000:. ./.:4:325,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:268,77:.: 0.27:1.000:. ./.:4:207,67:.:-0.95:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.57:0.999:. ./.:4:264,85:.: 0.34:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:212,66:.:-0.88:1.000:. ./.:4:196,67:.:-1.14:1.000:. ./.:4:270,79:.: 0.34:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:254,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:406,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:459,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:217,73:.:-0.67:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.28:1.000:. -chr8.1 8003051 chr8.1_008003051 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:569,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:483,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:571,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:609,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:709,1:.: 1.90:1.000:. ./.:4:469,1:.:-0.19:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:561,3:.: 0.63:1.000:. ./.:4:349,2:.:-1.23:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:594,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:568,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:552,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:585,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:553,1:.: 0.54:0.999:. ./.:4:582,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:685,2:.: 1.70:1.000:. ./.:4:606,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:342,1:.:-1.30:1.000:. ./.:4:463,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:647,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:228,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:684,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:677,1:.: 1.62:1.000:. ./.:4:527,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:611,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:570,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:667,3:.: 1.55:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:350,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:328,1:.:-1.42:1.000:. ./.:3:175,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:569,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:484,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:563,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:509,1:.: 0.16:1.000:. ./.:5:797,3:.: 2.68:1.000:. ./.:4:1248,1:.: 6.59:1.000:. ./.:4:472,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:632,3:.: 1.24:1.000:. ./.:4:385,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:547,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:443,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.30:1.000:. ./.:6:332,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:420,1:.:-0.62:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:541,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:477,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.16:0.887:. ./.:4:478,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.13:0.999:. ./.:4:644,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:485,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:445,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:484,3:.:-0.04:1.000:. ./.:4:358,1:.:-1.16:0.985:. ./.:4:531,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:528,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:556,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:341,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:375,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:406,2:.:-0.73:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:386,1:.:-0.91:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:291,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:430,1:.:-0.53:0.904:. ./.:4:375,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:337,3:.:-1.32:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:678,0:.: 1.62:0.993:. ./.:4:431,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:401,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:765,1:.: 2.38:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.44:0.999:. ./.:4:465,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:355,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:491,2:.: 0.01:1.000:. ./.:4:403,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:494,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:449,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:467,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:588,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:487,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:441,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:397,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:298,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:343,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:359,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:451,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:279,1:.:-1.85:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:409,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:697,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:483,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:353,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:384,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:453,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:646,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:717,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:509,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:598,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:425,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:628,3:.: 1.21:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:354,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:587,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:582,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:488,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:640,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:469,0:.:-0.20:0.999:. ./.:4:490,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:408,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:382,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:616,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:604,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:619,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:668,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:699,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:614,1:.: 1.07:1.000:. -chr8.1 8586103 chr8.1_008586103 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:59,152:0.69:-0.42:1.000:0.969 0/0/0/1:4:197,59:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,93:0.52:-0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:213,46:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,63:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:281,70:0.23: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,43:0.27:-0.81:1.000:0.998 0/0/0/0:4:291,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,114:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:83,21:0.24:-2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,18:0.37:-3.03:1.000:0.622 0/0/0/1:4:261,52:0.19: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,51:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:127,116:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,117:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:223,81:0.30: 1.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:177,166:0.52: 1.78:0.999:0.995 0/0/0/0:4:308,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,104:0.43: 0.48:1.000:0.951 0/0/1/1:4:173,144:0.49: 1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,32:0.46:-2.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:135,126:0.52: 0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:226,54:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,77:0.42:-0.61:1.000:0.930 0/0/1/1:4:62,33:0.39:-2.36:1.000:0.644 0/0/1/1:4:144,124:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,132:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,116:0.45: 0.73:1.000:0.983 0/0/1/1:4:160,144:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,131:0.47: 1.20:1.000:0.990 0/0/0/1:4:256,59:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,110:0.47: 0.29:1.000:0.993 0/0/0/0:4:58,2:0.04:-2.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,13:0.15:-2.25:1.000:0.987 0/0/1:3:30,6:0.19:-3.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:149,110:0.46: 0.38:1.000:0.990 0/0/1/1:4:143,86:0.41:-0.12:1.000:0.890 0/0/1/1:4:163,122:0.47: 0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,119:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,146:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,116:0.51: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:110,95:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,119:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,80:0.49:-1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:189,55:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:178,33:0.18:-0.42:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:141,209:0.60: 1.90:1.000:0.971 0/0/1/1:4:177,95:0.39: 0.60:1.000:0.667 0/0/0/1:4:138,31:0.21:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,47:0.31:-1.11:1.000:0.967 0/0/1/1:4:108,113:0.54:-0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:128,130:0.53: 0.36:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:134,133:0.53: 0.51:1.000:0.993 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,41:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,114:0.64:-1.06:1.000:0.724 0/0/1/1:4:117,114:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1/1/1:6:102,88:0.50:-0.78:1.000:0.889 0/0/1/1:4:138,101:0.46: 0.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:112,83:0.47:-0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:138,123:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:233,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,104:0.48: 0.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:187,44:0.22:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,33:0.20:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:249,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:240,52:0.21: 0.93:0.887:1.000 0/0/1/1:4:109,77:0.45:-0.84:1.000:0.983 0/0/1/1:4:127,120:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:102,43:0.33:-1.53:0.999:0.902 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,55:0.26: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:165,41:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,38:0.19:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,122:0.75:-1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,53:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,74:0.31: 0.65:1.000:0.979 0/0/1/1:4:113,78:0.45:-0.76:0.985:0.978 0/0/1/1:4:92,71:0.48:-1.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,109:0.48: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,87:0.45:-0.42:1.000:0.982 0/0/1/1:4:178,133:0.47: 1.25:1.000:0.991 0/0/0/0:4:306,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,70:0.49:-1.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,44:0.28:-0.98:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,138:0.70:-0.81:1.000:0.982 0/0/1/1:4:107,86:0.49:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:174,41:0.22:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,107:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,200:0.70: 0.60:1.000:0.983 0/0/0/1:4:135,33:0.23:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,92:0.42: 0.08:1.000:0.918 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:232,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,131:0.68:-0.86:1.000:0.949 0/0/1/1:4:163,118:0.46: 0.75:1.000:0.987 0/0/1/1:4:101,73:0.46:-1.04:1.000:0.987 0/0/0/1:4:178,52:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,109:0.67:-1.34:1.000:0.927 0/0/0/1:4:164,35:0.21:-0.62:0.904:1.000 0/0/0/1:4:133,55:0.33:-0.81:1.000:0.920 0/0/0/1:4:165,51:0.27:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:121,49:0.33:-1.11:1.000:0.937 0/0/0/1:4:280,81:0.26: 2.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:228,62:0.25: 0.90:0.993:0.999 0/0/0/0:4:279,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:263,111:0.33: 2.30:1.000:0.900 0/0/0/1:4:158,58:0.31:-0.34:0.999:0.979 0/0/1/1:4:132,90:0.44:-0.24:1.000:0.974 0/0/0/1:4:162,24:0.15:-0.84:1.000:0.989 0/0/1/1:4:164,92:0.40: 0.33:1.000:0.775 0/0/0/0:4:189,1:0.01:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:182,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,92:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,38:0.24:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,47:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,69:0.46:-1.19:1.000:0.986 0/0/1/1:4:135,108:0.48: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,153:0.52: 1.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,85:0.48:-0.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,100:0.53:-0.66:1.000:0.990 0/0/0/0:4:262,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,78:0.50:-1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,85:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:194,35:0.18:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:317,0:0.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,57:0.45:-1.61:1.000:0.976 0/0/0/1:4:178,47:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,85:0.47:-0.64:1.000:0.992 0/1/1/1:4:87,235:0.69: 1.43:1.000:0.979 0/0/0/1:4:218,56:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,85:0.46:-0.59:1.000:0.989 0/0/0/1:4:182,44:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,99:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:150,39:0.24:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:228,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,99:0.48:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,45:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:157,124:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,114:0.47: 0.53:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,246:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,40:0.21:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,121:0.45: 0.93:1.000:0.984 0/0/1/1:4:138,133:0.52: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:195,148:0.47: 1.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:134,141:0.54: 0.65:1.000:0.989 0/0/1/1:4:40,32:0.48:-2.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,54:0.32:-0.71:1.000:0.963 0/0/0/1:4:239,64:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,65:0.25: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,102:0.43: 0.41:1.000:0.947 0/0/1/1:4:143,106:0.47: 0.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:72,157:0.66:-0.12:1.000:0.882 0/0/1/1:4:124,119:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:206,62:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:181,51:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:232,49:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,123:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:158,140:0.51: 1.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:201,54:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:198,51:0.24: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:275,0:0.00: 0.65:0.999:1.000 0/0/0/1:4:187,46:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,115:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,126:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:133,102:0.47:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:183,47:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,67:0.28: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,46:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,98:0.29: 2.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:242,81:0.29: 1.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:202,88:0.34: 0.90:1.000:0.861 0/0/0/0:4:286,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:286,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,87:0.26: 2.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:218,69:0.28: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,43:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,44:0.23:-0.14:1.000:1.000 -chr8.1 8641626 chr8.1_008641626 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:24,8:.:-0.50:1.000:. ./.:4:16,6:.:-1.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:11,10:.:-1.26:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:26,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:11,16:.:-0.84:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.77:1.000:. ./.:4:17,41:.: 1.31:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.70:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:22,17:.:-0.01:1.000:. ./.:4:11,12:.:-1.12:1.000:. ./.:4:15,6:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,17:.:-0.22:0.999:. ./.:4:25,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:33,10:.: 0.27:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:18,17:.:-0.29:1.000:. ./.:4:17,6:.:-1.12:1.000:. ./.:4:48,11:.: 1.38:1.000:. ./.:4:9,12:.:-1.26:1.000:. ./.:4:12,7:.:-1.40:1.000:. ./.:4:12,9:.:-1.26:1.000:. ./.:4:33,11:.: 0.34:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.84:1.000:. ./.:4:10,14:.:-1.05:1.000:. ./.:4:3,5:.:-2.16:1.000:. ./.:4:37,22:.: 1.38:1.000:. ./.:4:50,13:.: 1.65:1.000:. ./.:3:11,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:11,12:.:-1.12:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,12:.:-0.29:1.000:. ./.:4:18,17:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,13:.:-0.70:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,18:.:-0.08:1.000:. ./.:4:35,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.15:1.000:. ./.:4:48,10:.: 1.31:1.000:. ./.:4:27,33:.: 1.45:1.000:. ./.:5:33,19:.: 0.89:1.000:. ./.:4:55,67:.: 5.75:1.000:. ./.:4:16,15:.:-0.56:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:30,13:.: 0.27:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:53,12:.: 1.79:1.000:. ./.:4:15,11:.:-0.91:1.000:. ./.:4:11,24:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,9:.:-0.08:1.000:. ./.:4:46,17:.: 1.65:1.000:. ./.:4:41,17:.: 1.31:1.000:. ./.:6:27,26:.: 0.96:1.000:. ./.:4:32,28:.: 1.45:1.000:. ./.:4:16,22:.:-0.08:1.000:. ./.:4:24,31:.: 1.10:1.000:. ./.:4:58,13:.: 2.21:1.000:. ./.:4:19,17:.:-0.22:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:16,10:.:-0.91:1.000:. ./.:4:32,10:.: 0.20:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.34:0.887:. ./.:4:16,13:.:-0.70:1.000:. ./.:4:36,29:.: 1.79:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.98:0.999:. ./.:4:54,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:15,14:.:-0.70:1.000:. ./.:4:44,15:.: 1.38:1.000:. ./.:4:20,26:.: 0.48:1.000:. ./.:4:40,7:.: 0.54:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:42,10:.: 0.89:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:13,9:.:-1.19:0.985:. ./.:4:35,23:.: 1.31:1.000:. ./.:4:26,32:.: 1.31:1.000:. ./.:4:12,11:.:-1.12:1.000:. ./.:4:30,31:.: 1.52:1.000:. ./.:4:38,11:.: 0.68:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:27,10:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,13:.: 0.75:1.000:. ./.:4:17,17:.:-0.36:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,10:.: 0.68:1.000:. ./.:4:17,16:.:-0.43:1.000:. ./.:4:33,21:.: 1.03:1.000:. ./.:4:44,10:.: 1.03:1.000:. ./.:4:32,11:.: 0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:33,11:.: 0.34:1.000:. ./.:4:25,15:.: 0.06:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:26,8:.:-0.36:1.000:. ./.:4:15,12:.:-0.84:1.000:. ./.:4:36,13:.: 0.68:0.904:. ./.:4:30,6:.:-0.22:1.000:. ./.:4:48,14:.: 1.58:1.000:. ./.:4:31,14:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.98:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.20:0.993:. ./.:4:35,11:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,18:.: 1.45:1.000:. ./.:4:22,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.96:0.999:. ./.:4:26,31:.: 1.24:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:44,13:.: 1.24:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,6:.: 0.13:1.000:. ./.:4:46,12:.: 1.31:1.000:. ./.:4:31,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:22,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:21,24:.: 0.41:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:36,9:.: 0.41:1.000:. ./.:4:22,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:38,11:.: 0.68:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:27,9:.:-0.22:1.000:. ./.:4:20,15:.:-0.29:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:15,4:.:-1.40:1.000:. ./.:4:31,15:.: 0.48:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:20,16:.:-0.22:1.000:. ./.:4:25,11:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,12:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,26:.: 0.61:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:20,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:22,30:.: 0.89:1.000:. ./.:4:35,5:.: 0.06:1.000:. ./.:4:10,12:.:-1.19:1.000:. ./.:4:18,4:.:-1.19:1.000:. ./.:4:25,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:16,24:.: 0.06:1.000:. ./.:4:15,20:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.56:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:35,8:.: 0.27:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:16,25:.: 0.13:1.000:. ./.:4:18,2:.:-1.33:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.29:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.98:1.000:. ./.:4:30,6:.:-0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:13,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:16,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:27,4:.:-0.56:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.84:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.70:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:0.999:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.05:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.15:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.56:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.84:1.000:. ./.:4:27,11:.:-0.08:1.000:. ./.:4:15,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,6:.:-1.26:1.000:. -chr8.1 8940055 chr8.1_008940055 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,373:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,255:.:-0.73:1.000:. ./.:4:92,255:.:-0.69:1.000:. ./.:4:95,288:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,501:.: 1.48:1.000:. ./.:4:116,333:.: 0.75:1.000:. ./.:4:91,308:.: 0.05:1.000:. ./.:4:180,198:.:-0.25:1.000:. ./.:4:110,287:.: 0.02:1.000:. ./.:4:59,215:.:-1.71:1.000:. ./.:4:93,178:.:-1.75:1.000:. ./.:4:187,314:.: 1.48:1.000:. ./.:4:104,268:.:-0.33:1.000:. ./.:4:128,329:.: 0.86:1.000:. ./.:4:117,313:.: 0.48:1.000:. ./.:4:227,169:.: 0.00:1.000:. ./.:4:207,196:.: 0.10:0.999:. ./.:4:140,375:.: 1.67:1.000:. ./.:4:0,483:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,446:.: 0.71:1.000:. ./.:4:3,393:.: 0.00:1.000:. ./.:4:102,264:.:-0.42:1.000:. ./.:4:233,235:.: 1.01:1.000:. ./.:4:118,294:.: 0.23:1.000:. ./.:4:97,99:.:-2.81:1.000:. ./.:4:122,338:.: 0.90:1.000:. ./.:4:209,189:.: 0.03:1.000:. ./.:4:103,274:.:-0.26:1.000:. ./.:4:2,494:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.34:1.000:. ./.:4:238,224:.: 0.93:1.000:. ./.:4:78,239:.:-1.11:1.000:. ./.:4:31,141:.:-3.14:1.000:. ./.:4:82,248:.:-0.92:1.000:. ./.:3:0,161:.:-3.30:1.000:. ./.:4:215,217:.: 0.51:1.000:. ./.:4:99,242:.:-0.77:1.000:. ./.:4:95,313:.: 0.17:1.000:. ./.:4:102,300:.: 0.09:1.000:. ./.:4:107,320:.: 0.44:1.000:. ./.:4:96,293:.:-0.10:1.000:. ./.:4:42,114:.:-3.37:1.000:. ./.:4:0,413:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,275:.:-0.33:1.000:. ./.:4:251,241:.: 1.35:1.000:. ./.:4:90,299:.:-0.10:1.000:. ./.:5:257,349:.: 2.95:1.000:. ./.:4:147,210:.:-0.54:1.000:. ./.:4:90,267:.:-0.54:1.000:. ./.:4:70,252:.:-1.04:1.000:. ./.:4:84,255:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,528:.: 1.86:1.000:. ./.:4:110,339:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,428:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,316:.: 0.30:1.000:. ./.:4:116,308:.: 0.40:1.000:. ./.:4:109,337:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,504:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,355:.:-0.57:1.000:. ./.:6:98,232:.:-0.92:1.000:. ./.:4:94,306:.: 0.06:1.000:. ./.:4:190,215:.: 0.13:1.000:. ./.:4:239,233:.: 1.07:1.000:. ./.:4:90,297:.:-0.12:1.000:. ./.:4:220,221:.: 0.63:1.000:. ./.:4:97,293:.:-0.08:1.000:. ./.:4:87,252:.:-0.80:1.000:. ./.:4:95,279:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,418:.: 0.31:0.887:. ./.:4:0,342:.:-0.76:1.000:. ./.:4:251,260:.: 1.62:1.000:. ./.:4:113,348:.: 0.92:0.999:. ./.:4:236,261:.: 1.42:1.000:. ./.:4:100,297:.: 0.02:1.000:. ./.:4:99,257:.:-0.56:1.000:. ./.:4:202,180:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,420:.: 0.34:1.000:. ./.:4:97,307:.: 0.12:1.000:. ./.:4:94,331:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,425:.: 0.41:1.000:. ./.:4:92,242:.:-0.87:0.985:. ./.:4:89,352:.: 0.63:1.000:. ./.:4:135,373:.: 1.58:1.000:. ./.:4:189,166:.:-0.57:1.000:. ./.:4:193,211:.: 0.12:1.000:. ./.:4:237,231:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,345:.:-0.71:1.000:. ./.:4:75,241:.:-1.12:1.000:. ./.:4:0,405:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,315:.: 0.20:1.000:. ./.:4:98,285:.:-0.18:1.000:. ./.:4:80,281:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,472:.: 1.07:1.000:. ./.:4:70,226:.:-1.40:1.000:. ./.:4:106,366:.: 1.07:1.000:. ./.:4:222,196:.: 0.31:1.000:. ./.:4:99,273:.:-0.33:1.000:. ./.:4:170,157:.:-0.97:1.000:. ./.:4:120,351:.: 1.06:1.000:. ./.:4:226,214:.: 0.62:1.000:. ./.:4:103,321:.: 0.40:1.000:. ./.:4:125,335:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,268:.:-1.79:1.000:. ./.:4:241,200:.: 0.63:0.904:. ./.:4:75,231:.:-1.26:1.000:. ./.:4:104,316:.: 0.34:1.000:. ./.:4:102,261:.:-0.46:1.000:. ./.:4:99,263:.:-0.47:1.000:. ./.:4:299,284:.: 2.63:0.993:. ./.:4:214,226:.: 0.62:1.000:. ./.:4:217,188:.: 0.13:1.000:. ./.:4:137,413:.: 2.17:1.000:. ./.:4:0,403:.: 0.10:0.999:. ./.:4:200,216:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,275:.:-1.70:1.000:. ./.:4:0,436:.: 0.56:1.000:. ./.:4:185,225:.: 0.20:1.000:. ./.:4:155,189:.:-0.73:1.000:. ./.:4:106,297:.: 0.10:1.000:. ./.:4:187,199:.:-0.14:1.000:. ./.:4:115,275:.:-0.08:1.000:. ./.:4:184,180:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,387:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,260:.:-0.52:1.000:. ./.:4:93,295:.:-0.11:1.000:. ./.:4:121,341:.: 0.93:1.000:. ./.:4:196,208:.: 0.12:1.000:. ./.:4:161,195:.:-0.56:1.000:. ./.:4:86,201:.:-1.53:1.000:. ./.:4:131,163:.:-1.43:1.000:. ./.:4:93,299:.:-0.05:1.000:. ./.:4:187,199:.:-0.14:1.000:. ./.:4:78,210:.:-1.51:1.000:. ./.:4:98,306:.: 0.12:1.000:. ./.:4:97,307:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,518:.: 1.72:1.000:. ./.:4:90,276:.:-0.42:1.000:. ./.:4:90,269:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,344:.:-0.73:1.000:. ./.:4:84,290:.:-0.31:1.000:. ./.:4:104,315:.: 0.33:1.000:. ./.:4:187,193:.:-0.22:1.000:. ./.:4:94,266:.:-0.50:1.000:. ./.:4:92,231:.:-1.02:1.000:. ./.:4:148,364:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,531:.: 1.90:1.000:. ./.:4:0,392:.:-0.05:1.000:. ./.:4:105,321:.: 0.42:1.000:. ./.:4:128,349:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,369:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,427:.: 0.44:1.000:. ./.:4:92,314:.: 0.14:1.000:. ./.:4:62,194:.:-1.96:1.000:. ./.:4:163,151:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,443:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,322:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,457:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,336:.: 0.62:1.000:. ./.:4:74,254:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,426:.: 0.42:1.000:. ./.:4:107,313:.: 0.34:1.000:. ./.:4:68,261:.:-0.94:1.000:. ./.:4:152,173:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,379:.:-0.24:1.000:. ./.:4:83,244:.:-0.97:1.000:. ./.:4:104,328:.: 0.51:1.000:. ./.:4:171,166:.:-0.83:1.000:. ./.:4:170,164:.:-0.87:0.999:. ./.:4:85,262:.:-0.69:1.000:. ./.:4:114,296:.: 0.20:1.000:. ./.:4:78,253:.:-0.91:1.000:. ./.:4:93,250:.:-0.74:1.000:. ./.:4:83,287:.:-0.36:1.000:. ./.:4:72,233:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,321:.:-1.05:1.000:. ./.:4:183,138:.:-1.05:1.000:. ./.:4:114,381:.: 1.39:1.000:. ./.:4:128,306:.: 0.54:1.000:. ./.:4:103,341:.: 0.68:1.000:. ./.:4:97,231:.:-0.95:1.000:. ./.:4:254,239:.: 1.37:1.000:. ./.:4:262,243:.: 1.53:1.000:. ./.:4:130,343:.: 1.08:1.000:. ./.:4:195,161:.:-0.56:1.000:. ./.:4:105,330:.: 0.55:1.000:. -chr8.1 9061291 chr8.1_009061291 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:289,316:0.51: 1.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:128,336:0.71: 0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:109,343:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:243,279:0.53: 0.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:148,487:0.76: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:149,517:0.77: 1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:145,385:0.72: 0.52:1.000:0.994 0/1/1/1:4:171,423:0.70: 0.99:1.000:0.987 0/0/0/1:4:456,140:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,99:0.80:-2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,76:0.46:-2.15:1.000:0.990 0/1/1/1:4:165,596:0.77: 2.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:109,396:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:289,280:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:373,131:0.27: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:126,430:0.76: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:275,251:0.47: 0.49:0.999:0.993 1/1/1/1:4:0,514:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:334,359:0.51: 1.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:171,580:0.76: 2.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,126:0.78:-2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,371:0.73: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:293,323:0.52: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:292,284:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,60:0.63:-2.65:1.000:0.549 0/0/1/1:4:260,258:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:261,306:0.53: 0.79:1.000:0.992 0/0/1/1:4:222,245:0.52: 0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:165,524:0.75: 1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:322,331:0.50: 1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:258,277:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:245,240:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,66:0.67:-2.62:1.000:0.923 0/0/1/1:4:56,79:0.58:-2.35:1.000:0.927 0/1/1:3:18,42:0.69:-2.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,276:0.49: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:236,261:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:259,272:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,237:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:299,268:0.47: 0.79:1.000:0.991 0/1/1/1:4:109,332:0.74:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:217,238:0.52:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,326:0.82:-0.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,312:0.78:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:238,234:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:202,195:0.48:-0.44:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:473,339:0.42: 2.57:1.000:0.960 0/0/0/1:4:157,76:0.33:-1.64:1.000:0.905 0/0/1/1:4:166,197:0.53:-0.69:1.000:0.990 0/1/1/1:4:56,182:0.75:-1.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,237:0.78:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,287:0.57: 0.27:1.000:0.947 0/1/1/1:4:102,290:0.73:-0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:127,422:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,374:0.74: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:187,176:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:106,356:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:202,191:0.48:-0.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:95,304:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:124,193:0.60:-1.03:1.000:0.644 0/0/1/1:4:199,220:0.52:-0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:253,119:0.33:-0.63:1.000:0.929 0/0/1/1:4:222,191:0.46:-0.33:1.000:0.987 0/1/1/1:4:99,277:0.73:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:340,133:0.29: 0.11:1.000:0.991 0/1/1/1:4:96,271:0.73:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:254,234:0.47: 0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:106,382:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,302:0.72:-0.33:0.887:0.996 0/0/1/1:4:210,262:0.55: 0.10:1.000:0.983 0/0/1/1:4:226,238:0.51: 0.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,352:1.00:-0.77:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,431:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,288:0.51: 0.74:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,321:0.77:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,182:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,194:0.53:-0.71:1.000:0.992 0/1/1/1:4:95,332:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,317:0.72:-0.15:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,434:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,183:0.51:-0.75:0.985:0.996 0/0/0/1:4:268,110:0.30:-0.58:1.000:0.984 0/0/0/1:4:371,126:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:272,94:0.27:-0.67:1.000:0.998 0/0/1/1:4:167,167:0.49:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:123,349:0.73: 0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,288:0.79:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,187:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,222:0.55:-0.44:1.000:0.980 0/0/0/1:4:317,123:0.29:-0.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:79,263:0.76:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:85,311:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,215:0.52:-0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:154,189:0.54:-0.84:1.000:0.986 0/0/0/1:4:338,147:0.31: 0.19:1.000:0.969 0/1/1/1:4:92,321:0.77:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,238:0.74:-1.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,363:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,245:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:403,139:0.27: 0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:105,280:0.72:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:199,228:0.53:-0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:148,163:0.52:-1.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:171,214:0.55:-0.53:0.904:0.982 0/1/1/1:4:80,244:0.74:-0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,176:0.53:-0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:152,144:0.48:-1.18:1.000:0.995 0/1/1/1:4:140,467:0.76: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:307,339:0.52: 1.36:0.993:0.995 0/1/1/1:4:102,372:0.78: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,274:0.71:-0.58:1.000:0.993 0/1/1/1:4:167,482:0.73: 1.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:94,302:0.75:-0.45:0.999:0.999 0/0/0/1:4:288,112:0.29:-0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,169:0.77:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:194,254:0.56:-0.07:1.000:0.970 0/1/1/1:4:110,301:0.72:-0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,267:0.76:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,224:0.53:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:158,163:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:209,226:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:215,93:0.31:-1.09:1.000:0.971 0/1/1/1:4:97,315:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:145,480:0.76: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,174:0.49:-0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:214,225:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:101,355:0.77:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,367:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,166:0.55:-1.19:1.000:0.975 0/0/0/1:4:202,91:0.32:-1.20:1.000:0.955 0/1/1/1:4:95,270:0.73:-0.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:160,426:0.72: 0.93:1.000:0.994 0/0/1/1:4:132,129:0.49:-1.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,304:0.77:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,238:0.52:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:328,346:0.51: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,263:0.58:-0.07:1.000:0.925 0/0/1/1:4:154,169:0.52:-0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:72,255:0.77:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,96:0.29:-0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:196,192:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,301:0.74:-0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:405,159:0.29: 0.77:1.000:0.990 0/1/1/1:4:71,220:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:308,343:0.52: 1.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:307,349:0.52: 1.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:449,148:0.26: 1.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:249,255:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:293,293:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,379:0.79: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:167,532:0.75: 1.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:140,432:0.74: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,50:0.37:-2.35:1.000:0.508 0/0/1/1:4:296,295:0.49: 0.96:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,437:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:136,421:0.75: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:315,388:0.54: 1.78:1.000:0.985 0/0/1/1:4:327,361:0.52: 1.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:251,221:0.46: 0.10:1.000:0.990 0/1/1/1:4:145,499:0.76: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:285,283:0.49: 0.80:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,415:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:216,268:0.55: 0.19:1.000:0.984 0/1/1/1:4:141,401:0.73: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,171:0.52:-0.98:1.000:0.995 0/1/1/1:4:130,379:0.73: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:294,256:0.46: 0.67:1.000:0.988 1/1/1/1:4:1,572:1.00: 0.83:0.999:1.000 0/1/1/1:4:104,419:0.79: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:151,408:0.72: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:123,345:0.73: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:176,209:0.53:-0.53:1.000:0.990 0/1/1/1:4:119,371:0.75: 0.23:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,534:1.00: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,407:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:137,346:0.71: 0.18:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,700:1.00: 1.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,589:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:148,381:0.71: 0.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:127,399:0.75: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:174,527:0.74: 1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:351,331:0.48: 1.63:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,838:1.00: 2.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,249:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:125,428:0.76: 0.69:1.000:1.000 -chr8.1 9098594 chr8.1_009098594 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:73,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:61,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.22:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:70,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:56,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.90:1.000:. ./.:3:6,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:61,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:5:95,0:.: 2.81:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.15:1.000:. ./.:6:38,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.15:0.887:. ./.:4:58,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.24:0.985:. ./.:4:64,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:83,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:0.904:. ./.:4:18,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.23:0.993:. ./.:4:21,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.14:0.999:. ./.:4:67,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-1.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.95:1.000:. -chr8.1 9355125 chr8.1_009355125 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:160,192:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,253:.:-0.56:1.000:. ./.:4:97,277:.: 0.25:1.000:. ./.:4:172,178:.:-0.08:1.000:. ./.:4:102,300:.: 0.63:1.000:. ./.:4:217,270:.: 1.80:1.000:. ./.:4:114,165:.:-1.05:1.000:. ./.:4:95,296:.: 0.48:1.000:. ./.:4:171,194:.: 0.13:1.000:. ./.:4:1,204:.:-2.06:1.000:. ./.:4:77,91:.:-2.57:1.000:. ./.:4:78,323:.: 0.62:1.000:. ./.:4:213,219:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,313:.: 0.70:1.000:. ./.:4:138,203:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,410:.: 0.74:1.000:. ./.:4:100,332:.: 1.04:0.999:. ./.:4:98,332:.: 1.02:1.000:. ./.:4:359,126:.: 1.77:1.000:. ./.:4:100,367:.: 1.52:1.000:. ./.:4:38,153:.:-2.25:1.000:. ./.:4:79,272:.:-0.06:1.000:. ./.:4:199,212:.: 0.76:1.000:. ./.:4:256,102:.: 0.03:1.000:. ./.:4:42,125:.:-2.58:1.000:. ./.:4:113,393:.: 2.06:1.000:. ./.:4:122,330:.: 1.32:1.000:. ./.:4:76,270:.:-0.13:1.000:. ./.:4:183,205:.: 0.44:1.000:. ./.:4:249,105:.:-0.02:1.000:. ./.:4:218,275:.: 1.88:1.000:. ./.:4:82,284:.: 0.14:1.000:. ./.:4:25,113:.:-2.98:1.000:. ./.:4:41,166:.:-2.03:1.000:. ./.:3:49,37:.:-3.69:1.000:. ./.:4:98,345:.: 1.20:1.000:. ./.:4:256,107:.: 0.10:1.000:. ./.:4:286,106:.: 0.50:1.000:. ./.:4:107,349:.: 1.37:1.000:. ./.:4:94,325:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,257:.:-0.39:1.000:. ./.:4:81,250:.:-0.34:1.000:. ./.:4:91,286:.: 0.29:1.000:. ./.:4:156,188:.:-0.16:1.000:. ./.:4:95,282:.: 0.29:1.000:. ./.:4:152,187:.:-0.23:1.000:. ./.:5:160,268:.: 0.99:1.000:. ./.:4:136,169:.:-0.69:1.000:. ./.:4:152,163:.:-0.56:1.000:. ./.:4:182,188:.: 0.20:1.000:. ./.:4:44,220:.:-1.25:1.000:. ./.:4:292,127:.: 0.87:1.000:. ./.:4:70,249:.:-0.50:1.000:. ./.:4:189,192:.: 0.35:1.000:. ./.:4:67,226:.:-0.86:1.000:. ./.:4:236,226:.: 1.46:1.000:. ./.:4:89,267:.: 0.01:1.000:. ./.:4:187,230:.: 0.84:1.000:. ./.:4:178,208:.: 0.42:1.000:. ./.:6:92,216:.:-0.65:1.000:. ./.:4:93,289:.: 0.36:1.000:. ./.:4:169,160:.:-0.36:1.000:. ./.:4:92,348:.: 1.15:1.000:. ./.:4:105,307:.: 0.77:1.000:. ./.:4:144,219:.: 0.10:1.000:. ./.:4:184,171:.:-0.01:1.000:. ./.:4:146,159:.:-0.69:1.000:. ./.:4:74,260:.:-0.30:1.000:. ./.:4:201,197:.: 0.58:0.887:. ./.:4:146,140:.:-0.95:1.000:. ./.:4:98,340:.: 1.13:1.000:. ./.:4:71,271:.:-0.19:0.999:. ./.:4:0,540:.: 2.52:1.000:. ./.:4:188,171:.: 0.05:1.000:. ./.:4:79,264:.:-0.17:1.000:. ./.:4:173,208:.: 0.35:1.000:. ./.:4:159,164:.:-0.45:1.000:. ./.:4:185,190:.: 0.27:1.000:. ./.:4:84,320:.: 0.66:1.000:. ./.:4:70,309:.: 0.32:1.000:. ./.:4:131,146:.:-1.08:0.985:. ./.:4:177,190:.: 0.16:1.000:. ./.:4:179,216:.: 0.54:1.000:. ./.:4:137,147:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,366:.: 1.24:1.000:. ./.:4:109,277:.: 0.42:1.000:. ./.:4:65,211:.:-1.09:1.000:. ./.:4:63,241:.:-0.71:1.000:. ./.:4:168,196:.: 0.11:1.000:. ./.:4:188,200:.: 0.44:1.000:. ./.:4:122,168:.:-0.90:1.000:. ./.:4:63,242:.:-0.69:1.000:. ./.:4:153,189:.:-0.19:1.000:. ./.:4:134,118:.:-1.42:1.000:. ./.:4:182,235:.: 0.84:1.000:. ./.:4:107,338:.: 1.22:1.000:. ./.:4:74,207:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,349:.:-0.09:1.000:. ./.:4:153,197:.:-0.08:1.000:. ./.:4:175,171:.:-0.13:1.000:. ./.:4:81,247:.:-0.38:1.000:. ./.:4:84,355:.: 1.14:1.000:. ./.:4:117,158:.:-1.10:1.000:. ./.:4:92,307:.: 0.59:0.904:. ./.:4:0,350:.:-0.08:1.000:. ./.:4:75,261:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,274:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,355:.:-0.01:1.000:. ./.:4:92,308:.: 0.61:0.993:. ./.:4:71,252:.:-0.45:1.000:. ./.:4:70,280:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,606:.: 3.43:1.000:. ./.:4:169,177:.:-0.13:0.999:. ./.:4:156,197:.:-0.04:1.000:. ./.:4:133,173:.:-0.68:1.000:. ./.:4:267,104:.: 0.21:1.000:. ./.:4:91,276:.: 0.16:1.000:. ./.:4:74,266:.:-0.21:1.000:. ./.:4:237,113:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,247:.:-0.67:1.000:. ./.:4:145,210:.:-0.01:1.000:. ./.:4:140,181:.:-0.47:1.000:. ./.:4:68,244:.:-0.60:1.000:. ./.:4:80,289:.: 0.18:1.000:. ./.:4:225,93:.:-0.51:1.000:. ./.:4:96,297:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,271:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,333:.:-0.31:1.000:. ./.:4:195,62:.:-1.35:1.000:. ./.:4:113,139:.:-1.42:1.000:. ./.:4:166,188:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,320:.: 0.58:1.000:. ./.:4:188,63:.:-1.43:1.000:. ./.:4:161,195:.: 0.01:1.000:. ./.:4:79,213:.:-0.87:1.000:. ./.:4:219,232:.: 1.30:1.000:. ./.:4:102,264:.: 0.14:1.000:. ./.:4:59,204:.:-1.27:1.000:. ./.:4:120,155:.:-1.10:1.000:. ./.:4:130,171:.:-0.75:1.000:. ./.:4:196,199:.: 0.54:1.000:. ./.:4:62,263:.:-0.42:1.000:. ./.:4:148,156:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.98:1.000:. ./.:4:291,119:.: 0.74:1.000:. ./.:4:337,107:.: 1.21:1.000:. ./.:4:254,107:.: 0.07:1.000:. ./.:4:164,174:.:-0.24:1.000:. ./.:4:245,105:.:-0.08:1.000:. ./.:4:83,243:.:-0.41:1.000:. ./.:4:213,222:.: 1.09:1.000:. ./.:4:85,297:.: 0.36:1.000:. ./.:4:67,81:.:-2.84:1.000:. ./.:4:51,176:.:-1.76:1.000:. ./.:4:113,345:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,351:.:-0.06:1.000:. ./.:4:215,218:.: 1.06:1.000:. ./.:4:239,93:.:-0.32:1.000:. ./.:4:139,136:.:-1.10:1.000:. ./.:4:98,316:.: 0.80:1.000:. ./.:4:171,168:.:-0.23:1.000:. ./.:4:78,249:.:-0.39:1.000:. ./.:4:81,245:.:-0.41:1.000:. ./.:4:173,202:.: 0.27:1.000:. ./.:4:97,299:.: 0.55:1.000:. ./.:4:183,198:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,269:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,374:.: 0.25:0.999:. ./.:4:144,166:.:-0.62:1.000:. ./.:4:155,150:.:-0.69:1.000:. ./.:4:64,234:.:-0.79:1.000:. ./.:4:210,80:.:-0.90:1.000:. ./.:4:154,194:.:-0.10:1.000:. ./.:4:81,229:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,231:.:-0.69:1.000:. ./.:4:44,216:.:-1.31:1.000:. ./.:4:113,386:.: 1.96:1.000:. ./.:4:85,329:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,448:.: 1.26:1.000:. ./.:4:73,315:.: 0.44:1.000:. ./.:4:93,318:.: 0.76:1.000:. ./.:4:237,263:.: 1.98:1.000:. ./.:4:119,341:.: 1.43:1.000:. ./.:4:93,275:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,271:.:-0.25:1.000:. -chr8.1 9574446 chr8.1_009574446 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:41,15:0.33: 1.28:1.000:0.904 0/1/1/1:4:16,27:0.63: 0.40:1.000:0.557 0/0/1/1:4:16,17:0.54:-0.28:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,11:0.40:-0.35:1.000:0.765 0/0/1/1:4:29,36:0.57: 1.88:1.000:0.946 0/0/1/1:4:32,30:0.51: 1.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,6:0.42:-1.43:1.000:0.926 0/1/1/1:4:10,18:0.64:-0.62:1.000:0.707 0/0/1/1:4:45,23:0.39: 2.09:1.000:0.719 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.10:-2.17:1.000:0.828 0/1/1/1:4:22,40:0.64: 1.68:1.000:0.727 0/0/0/1:4:30,10:0.32: 0.19:1.000:0.957 0/0/1/1:4:20,21:0.54: 0.26:1.000:0.989 0/0/1/1:4:22,20:0.51: 0.33:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,41:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,24:0.65:-0.01:0.999:0.756 0/0/1/1:4:19,30:0.62: 0.80:1.000:0.608 0/0/0/1:4:70,9:0.20: 2.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,30:0.56: 1.21:1.000:0.961 0/0/1/1:4:1,1:0.53:-2.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:20,22:0.55: 0.33:1.000:0.983 0/0/1/1:4:26,18:0.45: 0.47:1.000:0.982 0/0/0/1:4:35,9:0.28: 0.47:1.000:0.995 0/0/1/1:4:1,1:0.53:-2.37:1.000:0.993 0/0/1/1:4:18,26:0.60: 0.47:1.000:0.792 0/0/1/1:4:23,33:0.60: 1.28:1.000:0.803 0/0/1/1:4:20,30:0.61: 0.87:1.000:0.723 0/0/1/1:4:27,15:0.41: 0.33:1.000:0.854 0/0/0/1:4:55,10:0.24: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,16:0.45: 0.13:1.000:0.982 0/0/1/1:4:19,31:0.62: 0.87:1.000:0.527 0/0/0/0:4:1,0:0.10:-2.44:1.000:0.828 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.37:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:19,27:0.60: 0.60:1.000:0.818 0/0/0/1:4:35,16:0.37: 0.94:1.000:0.536 0/0/0/1:4:41,11:0.29: 1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,10:0.49:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,17:0.48: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,17:0.60:-0.55:1.000:0.823 0/1/1/1:4:11,24:0.68:-0.14:1.000:0.942 0/1/1/1:4:10,22:0.68:-0.35:1.000:0.947 0/0/1/1:4:15,11:0.46:-0.75:1.000:0.990 0/0/1/1:4:14,21:0.61:-0.14:1.000:0.723 0/0/1/1:4:20,22:0.55: 0.33:1.000:0.983 0/0/0/1/1:5:43,22:0.39: 1.88:1.000:0.971 0/0/1/1:4:12,6:0.39:-1.29:1.000:0.674 0/0/1/1:4:19,11:0.42:-0.48:1.000:0.898 0/0/1/1:4:9,7:0.48:-1.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,20:0.74:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,8:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,14:0.53:-0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:20,7:0.33:-0.68:1.000:0.934 0/1/1/1:4:11,27:0.70: 0.06:1.000:0.981 0/0/0/1:4:23,8:0.33:-0.41:1.000:0.938 0/1/1/1:4:3,23:0.87:-0.75:1.000:0.908 0/0/1/1:4:28,17:0.43: 0.53:1.000:0.934 0/0/1/1:4:25,17:0.45: 0.33:1.000:0.978 0/0/0/1/1/1:6:9,8:0.50:-1.36:1.000:0.888 0/1/1/1:4:14,26:0.65: 0.19:1.000:0.767 0/0/1/1:4:41,24:0.42: 1.88:1.000:0.908 0/0/1/1:4:11,10:0.51:-1.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,22:0.73:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,17:0.36: 1.34:1.000:0.699 0/0/0/1:4:9,4:0.37:-1.63:1.000:0.602 0/0/1/1:4:12,6:0.39:-1.29:1.000:0.674 0/1/1/1:4:10,29:0.72: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,12:0.40:-0.21:0.887:0.830 0/0/0/1:4:31,6:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,16:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,7:0.75:-1.90:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.47: 0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:19,17:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,10:0.38:-0.41:1.000:0.562 0/0/0/1:4:35,4:0.19: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,16:0.45: 0.13:1.000:0.982 1/1/1/1:4:3,34:0.91:-0.01:1.000:0.935 0/1/1/1:4:7,23:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,16:0.39: 0.67:0.985:0.738 0/0/1/1:4:24,14:0.42: 0.06:1.000:0.905 0/0/0/1:4:34,13:0.34: 0.67:1.000:0.863 0/0/0/1:4:36,16:0.37: 1.01:1.000:0.602 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-1.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,31:0.72: 0.33:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,20:0.72:-0.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,25:0.81:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.28:-0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:19,13:0.45:-0.35:1.000:0.979 0/0/1/1:4:16,12:0.47:-0.62:1.000:0.992 0/0/1/1:4:22,18:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,20:0.37: 1.82:1.000:0.550 0/0/0/1:4:30,8:0.29: 0.06:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,17:0.41: 0.67:1.000:0.877 0/1/1/1:4:8,23:0.72:-0.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,14:0.64:-1.02:1.000:0.645 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,14:0.43:-0.08:1.000:0.958 0/0/1/1:4:20,15:0.47:-0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,18:0.64:-0.62:1.000:0.707 0/1/1/1:4:13,26:0.66: 0.13:1.000:0.873 0/0/0/1:4:20,5:0.28:-0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,27:0.63: 0.40:0.904:0.557 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,20:0.66:-0.48:1.000:0.873 0/1/1/1:4:11,26:0.69:-0.01:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,30:0.66: 0.53:0.993:0.873 0/1/1/1:4:5,24:0.81:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,32:0.87:-0.08:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,13:0.43:-0.21:0.999:0.945 0/0/1/1:4:32,17:0.40: 0.80:1.000:0.790 0/0/0/1:4:19,8:0.36:-0.68:1.000:0.717 0/0/0/1:4:29,5:0.23:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,22:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,10:0.27: 1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,19:0.60:-0.35:1.000:0.772 0/0/1/1:4:25,17:0.45: 0.33:1.000:0.978 0/0/1/1:4:19,13:0.45:-0.35:1.000:0.979 0/0/1/1:4:13,15:0.56:-0.62:1.000:0.974 0/0/1/1:4:23,27:0.56: 0.87:1.000:0.969 0/0/0/1:4:30,5:0.23:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,19:0.60:-0.35:1.000:0.772 0/1/1/1:4:7,25:0.75:-0.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,7:0.39:-1.09:1.000:0.674 0/0/1/1:4:16,14:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,13:0.45:-0.35:1.000:0.979 0/1/1/1:4:10,29:0.72: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,4:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,11:0.48:-0.82:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,21:0.64:-0.28:1.000:0.645 0/0/0/1:4:54,24:0.37: 2.76:1.000:0.602 0/0/1/1:4:11,17:0.61:-0.62:1.000:0.658 0/0/1/1:4:12,10:0.49:-1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,15:0.53:-0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,18:0.44: 0.60:1.000:0.962 0/0/1/1:4:16,11:0.45:-0.68:1.000:0.980 0/1/1/1:4:8,18:0.68:-0.75:1.000:0.957 0/0/1/1:4:17,12:0.46:-0.55:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,12:0.25: 2.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,10:0.23: 2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,6:0.17: 2.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:27,21:0.48: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,9:0.22: 2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,14:0.53:-0.62:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,20:0.42: 1.14:1.000:0.912 0/0/1/1:4:20,29:0.60: 0.80:1.000:0.786 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-2.10:1.000:0.674 0/0/1/1:4:15,21:0.59:-0.08:1.000:0.840 0/1/1/1:4:9,29:0.74: 0.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,18:0.37: 1.41:1.000:0.573 0/0/0/1:4:47,6:0.20: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,10:0.26: 1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:27,24:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,20:0.44: 0.87:1.000:0.973 0/1/1/1:4:4,20:0.81:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,19:0.54:-0.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,14:0.40: 0.26:1.000:0.747 0/0/1/1:4:15,19:0.57:-0.21:1.000:0.935 0/0/1/1:4:27,25:0.51: 1.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,25:0.67:-0.01:1.000:0.912 1/1/1/1:4:0,40:1.00: 0.19:0.999:1.000 0/0/1/1:4:29,21:0.46: 0.87:1.000:0.988 0/0/0/1:4:26,8:0.31:-0.21:1.000:0.978 0/1/1/1:4:10,26:0.71:-0.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:31,5:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.41:-0.28:1.000:0.885 0/1/1/1:4:8,26:0.74:-0.21:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,19:0.89:-1.09:1.000:0.606 0/1/1/1:4:3,26:0.88:-0.55:1.000:0.675 0/1/1/1:4:7,30:0.79:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,25:0.73:-0.28:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,22:0.79:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,32:0.85:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,28:0.48: 1.82:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,34:0.67: 0.87:1.000:0.927 0/1/1/1:4:13,22:0.63:-0.14:1.000:0.564 0/1/1/1:4:20,33:0.63: 1.07:1.000:0.501 -chr8.1 9740144 chr8.1_009740144 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:168,208:0.52: 2.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:174,1:0.19:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,148:0.68: 0.27:1.000:0.963 0/0/1/1:4:151,147:0.48: 1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:192,194:0.48: 2.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,167:0.68: 0.63:1.000:0.961 0/1/1/1:4:50,96:0.68:-0.69:1.000:0.952 0/1/1/1:4:67,117:0.65:-0.22:1.000:0.763 0/0/1/1:4:134,142:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,13:0.58:-2.22:1.000:0.915 0/1/1/1:4:8,15:0.67:-2.21:1.000:0.926 0/0/0/1:4:166,2:0.25:-0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,146:0.69: 0.22:1.000:0.971 0/0/1/1:4:145,162:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:134,161:0.51: 1.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,149:0.73: 0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,131:0.63: 0.09:0.999:0.607 0/0/0/0:4:324,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,183:0.49: 1.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:161,173:0.49: 1.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,10:0.45:-2.21:1.000:0.981 0/1/1/1:4:72,124:0.64:-0.07:1.000:0.713 0/1/1/1:4:67,186:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,121:0.71:-0.28:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,8:0.85:-2.37:1.000:0.986 0/0/1/1:4:116,111:0.48: 0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:70,153:0.72: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:158,118:0.45: 0.91:1.000:0.978 0/0/1/1:4:162,202:0.53: 2.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:126,136:0.49: 0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,120:0.67:-0.21:1.000:0.903 0/0/1/1:4:135,123:0.47: 0.69:1.000:0.993 0/1/1/1:4:3,10:0.82:-2.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,19:0.45:-1.95:1.000:0.980 0/1/1:3:6,7:0.50:-2.33:1.000:0.525 0/0/1/1:4:81,131:0.62: 0.12:1.000:0.568 0/1/1/1:4:57,151:0.77: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,170:0.73: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,122:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,147:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,124:0.74:-0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,131:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,140:0.58: 0.42:1.000:0.900 0/1/1/1:4:43,111:0.77:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,114:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,127:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1/1:5:100,279:0.78: 2.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:38,60:0.61:-1.28:1.000:0.673 0/0/1/1:4:109,109:0.48: 0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,66:0.64:-1.20:1.000:0.641 0/0/1/1:4:47,67:0.58:-1.09:1.000:0.932 0/0/1/1:4:176,160:0.47: 1.66:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,83:0.64:-0.88:1.000:0.728 0/0/1/1:4:100,125:0.53: 0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:156,138:0.47: 1.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:89,96:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:115,125:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,82:0.49:-0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,85:0.47:-0.25:1.000:0.991 0/0/0/1/1/1:6:66,57:0.47:-0.98:1.000:0.820 0/0/1/1:4:113,104:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:58,120:0.70:-0.30:1.000:0.988 0/1/1/1:4:39,103:0.77:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,71:0.46:-0.54:1.000:0.987 0/1/1/1:4:68,141:0.70: 0.09:1.000:0.989 0/1/1/1:4:62,115:0.67:-0.31:1.000:0.910 0/0/1/1:4:72,77:0.49:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:140,93:0.43: 0.38:1.000:0.958 0/0/1/1:4:89,103:0.50:-0.12:0.887:0.997 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,136:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,81:0.74:-1.06:0.999:0.999 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,167:0.49: 1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:150,1:0.22:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,81:0.64:-0.91:1.000:0.715 0/0/1/1:4:108,104:0.48: 0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,100:0.65:-0.57:1.000:0.831 0/0/1/1:4:98,111:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:111,130:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-0.93:0.985:1.000 0/0/1/1:4:106,102:0.48: 0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:131,101:0.45: 0.37:1.000:0.982 0/1/1/1:4:66,153:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,86:0.72:-0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,119:0.74:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:96,87:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:75,103:0.56:-0.30:1.000:0.965 0/0/1/1:4:72,63:0.47:-0.83:1.000:0.991 0/0/1/1:4:96,107:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,93:0.76:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,97:0.64:-0.60:1.000:0.734 0/0/1/1:4:112,109:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,123:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,60:0.44:-0.72:1.000:0.972 0/0/1/1:4:62,76:0.52:-0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,67:0.48:-0.85:1.000:0.996 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,106:0.69:-0.52:1.000:0.968 0/1/1/1:4:63,140:0.73: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,82:0.73:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,121:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,70:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,93:0.68:-0.75:0.904:0.959 0/0/1/1:4:70,67:0.48:-0.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:83,82:0.48:-0.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,86:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,157:0.49: 1.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:96,194:0.70: 1.09:0.993:0.982 0/1/1/1:4:63,129:0.70:-0.12:1.000:0.986 0/1/1/1:4:38,94:0.76:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,182:0.48: 2.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,94:0.48:-0.17:0.999:0.995 0/1/1/1:4:54,109:0.70:-0.48:1.000:0.981 0/0/1/1:4:74,67:0.47:-0.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:96,110:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,72:0.67:-1.12:1.000:0.903 0/1/1/1:4:39,76:0.68:-1.07:1.000:0.963 0/1/1/1:4:36,86:0.75:-0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,101:0.71:-0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:116,138:0.51: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,74:0.55:-0.90:1.000:0.975 0/0/1/1:4:116,104:0.47: 0.22:1.000:0.992 0/1/1/1:4:85,151:0.65: 0.42:1.000:0.817 0/1/1/1:4:43,109:0.76:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,102:0.46: 0.30:1.000:0.987 0/1/1/1:4:42,101:0.75:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,2:0.26:-1.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,56:0.72:-1.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,64:0.62:-1.21:1.000:0.616 0/1/1/1:4:41,90:0.72:-0.88:1.000:0.996 0/1/1/1:4:65,154:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,64:0.75:-1.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,108:0.70:-0.51:1.000:0.984 0/0/1/1:4:100,135:0.56: 0.41:1.000:0.974 0/0/1/1:4:185,209:0.50: 2.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,125:0.48: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,53:0.43:-0.84:1.000:0.954 0/0/1/1:4:77,98:0.53:-0.33:1.000:0.991 0/0/1/1:4:81,78:0.48:-0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:98,102:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,86:0.72:-0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:147,125:0.46: 0.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:70,60:0.46:-0.89:1.000:0.990 0/1/1/1:4:87,173:0.69: 0.72:1.000:0.975 0/0/1/1:4:184,227:0.52: 2.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,143:0.49: 0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,169:0.48: 1.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,169:0.73: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,109:0.47: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:185,201:0.49: 2.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:81,138:0.64: 0.21:1.000:0.669 0/0/1/1:4:14,17:0.52:-2.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,132:0.70:-0.07:1.000:0.988 0/0/1/1:4:149,142:0.48: 1.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:141,161:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,187:0.48: 2.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:71,158:0.73: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:62,132:0.71:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:160,160:0.48: 1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,146:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/1/1/1:4:65,113:0.65:-0.30:1.000:0.747 0/1/1/1:4:63,134:0.71:-0.06:1.000:0.993 0/0/1/1:4:151,163:0.49: 1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,174:0.49: 1.68:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,148:0.66: 0.35:1.000:0.858 0/1/1/1:4:53,129:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-1.20:0.999:1.000 0/1/1/1:4:69,168:0.75: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,133:0.64: 0.11:1.000:0.673 0/1/1/1:4:61,121:0.69:-0.25:1.000:0.974 0/1/1/1:4:55,98:0.65:-0.60:1.000:0.825 0/1/1/1:4:69,116:0.63:-0.21:1.000:0.611 0/1/1/1:4:50,160:0.81: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,99:0.48:-0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,141:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,136:0.69: 0.04:1.000:0.970 0/1/1/1:4:76,135:0.65: 0.11:1.000:0.817 0/0/1/1:4:170,158:0.47: 1.56:1.000:0.993 0/0/1/1:4:148,105:0.44: 0.63:1.000:0.971 0/1/1/1:4:69,152:0.72: 0.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,175:0.68: 0.79:1.000:0.953 0/1/1/1:4:87,177:0.70: 0.77:1.000:0.984 0/1/1/1:4:58,105:0.66:-0.48:1.000:0.865 0/0/0/1:4:259,2:0.25: 0.73:1.000:0.999 -chr8.1 9855628 chr8.1_009855628 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:138,166:0.51: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,67:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,184:0.68: 0.30:1.000:0.958 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,99:0.29: 1.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:163,176:0.48: 1.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:78,111:0.55:-0.57:1.000:0.981 0/0/0/1:4:222,67:0.21: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,67:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.33:-2.74:1.000:0.913 0/0/1/1:4:11,8:0.39:-2.78:1.000:0.656 0/0/1/1:4:185,140:0.40: 1.20:1.000:0.756 0/0/1/1:4:128,135:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:222,76:0.23: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,71:0.24: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,175:0.54: 0.88:1.000:0.984 0/0/1/1:4:139,175:0.52: 1.06:0.999:0.995 0/0/0/0:4:284,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:286,92:0.22: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,222:0.51: 2.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,12:0.63:-2.79:1.000:0.551 0/1/1/1:4:75,186:0.68: 0.37:1.000:0.941 0/0/0/1:4:223,74:0.22: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,136:0.49: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-2.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,70:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,157:0.46: 1.07:1.000:0.988 0/0/0/1:4:194,79:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:233,90:0.25: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:185,81:0.28: 0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,63:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:191,61:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,10:0.25:-2.56:1.000:0.999 0/0/0:3:7,0:0.00:-2.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,155:0.52: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:119,156:0.53: 0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:144,163:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,71:0.28:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:177,79:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,189:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,61:0.29:-0.52:1.000:0.993 0/0/0/1:4:150,47:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,98:0.49:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,129:0.54:-0.13:1.000:0.988 0/0/0/0:4:215,1:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:156,266:0.59: 2.46:1.000:0.968 0/0/1/1:4:32,43:0.53:-2.05:1.000:0.990 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,49:0.59:-2.01:1.000:0.863 0/1/1/1:4:50,157:0.72:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:193,67:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,182:0.80:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,72:0.27: 0.11:1.000:0.998 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:228,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,98:0.53:-0.78:1.000:0.993 0/0/0/1:4:143,54:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:114,67:0.34:-0.67:1.000:0.917 0/0/0/1:4:182,57:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,116:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,149:0.57: 0.17:1.000:0.953 0/0/0/0:4:125,1:0.01:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,147:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,123:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,49:0.23:-0.50:0.887:1.000 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,129:0.51: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:66,77:0.50:-1.17:0.999:0.997 0/0/1/1:4:83,103:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:279,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,55:0.26:-0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,54:0.26:-0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,110:0.51:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:109,141:0.53: 0.23:1.000:0.994 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,80:0.32:-0.06:1.000:0.955 0/0/0/1:4:118,53:0.28:-0.80:0.985:0.995 0/0/0/1:4:130,51:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:210,68:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,112:0.48:-0.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,75:0.44:-1.00:1.000:0.973 0/0/0/1:4:203,69:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,104:0.52:-0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:139,62:0.28:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,105:0.45:-0.19:1.000:0.974 0/0/0/1:4:182,70:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,103:0.49:-0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,149:0.73:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,173:0.56: 0.75:1.000:0.970 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,67:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,48:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,100:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,195:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,172:0.53: 0.88:1.000:0.990 0/1/1/1:4:45,146:0.73:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,66:0.29:-0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:72,95:0.53:-0.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:90,125:0.54:-0.23:0.904:0.986 0/0/0/1:4:120,48:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,49:0.20:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,53:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,96:0.29: 0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:144,199:0.54: 1.43:0.993:0.987 0/0/0/1:4:199,75:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,65:0.33:-0.71:1.000:0.906 0/0/0/1:4:239,92:0.25: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,58:0.27:-0.52:0.999:0.997 0/0/1/1:4:115,121:0.47: 0.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:83,35:0.27:-1.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:165,65:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,56:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,33:0.20:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,135:0.57:-0.15:1.000:0.939 0/0/1/1:4:82,97:0.50:-0.70:1.000:0.997 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,107:0.49:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,109:0.45:-0.11:1.000:0.980 0/1/1/1:4:86,233:0.69: 1.12:1.000:0.978 0/0/1/1:4:104,106:0.47:-0.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:173,51:0.20:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,64:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,89:0.49:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:66,73:0.49:-1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,113:0.56:-0.55:1.000:0.973 0/0/1/1:4:96,112:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,90:0.23: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,89:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:75,83:0.49:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:165,57:0.23:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,205:0.50: 1.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:187,59:0.22: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,65:0.30:-0.49:1.000:0.982 0/0/0/1:4:137,55:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,55:0.28:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/0:4:197,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,68:0.29:-0.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:183,76:0.26: 0.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,53:0.31:-1.02:1.000:0.968 0/0/1/1:4:151,189:0.52: 1.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:247,90:0.24: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,169:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/0:4:221,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,175:0.48: 1.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:114,126:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:273,109:0.26: 1.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,252:0.75: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.18:-2.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,115:0.45: 0.07:1.000:0.976 0/0/0/1:4:195,62:0.22: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:231,90:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:321,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,195:0.53: 1.46:1.000:0.993 0/1/1/1:4:68,180:0.69: 0.20:1.000:0.972 0/0/1/1:4:144,152:0.48: 0.82:1.000:0.994 0/0/0/0:4:255,1:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,102:0.44:-0.27:1.000:0.974 0/0/1/1:4:116,114:0.46:-0.03:1.000:0.987 0/0/0/1:4:186,56:0.21: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,67:0.26:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,143:0.49: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,161:0.50: 0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,165:0.51: 0.89:0.999:0.996 0/0/1/1:4:118,152:0.52: 0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,142:0.48: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,216:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,109:0.44:-0.02:1.000:0.959 0/0/1/1:4:117,139:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,140:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:120,49:0.26:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:151,66:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:183,200:0.48: 1.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:163,174:0.48: 1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:216,81:0.25: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:225,29:0.10: 0.28:1.000:0.739 0/0/0/1:4:201,73:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,81:0.21: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,227:0.51: 2.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,134:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,73:0.22: 0.81:1.000:1.000 -chr8.1 10098033 chr8.1_010098033 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:144,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:98,28:.: 0.28:1.000:. ./.:4:91,12:.:-0.37:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:132,18:.: 0.96:1.000:. ./.:4:63,10:.:-1.22:1.000:. ./.:4:126,27:.: 1.04:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:28,3:.:-2.41:1.000:. ./.:4:108,44:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,20:.: 0.22:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:121,26:.: 0.87:1.000:. ./.:4:113,15:.: 0.34:0.999:. ./.:4:188,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:97,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:124,14:.: 0.62:1.000:. ./.:4:101,14:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:125,28:.: 1.04:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:91,11:.:-0.40:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.67:1.000:. ./.:3:8,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:119,18:.: 0.59:1.000:. ./.:4:101,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:100,15:.:-0.03:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:113,14:.: 0.31:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:98,13:.:-0.15:1.000:. ./.:4:64,11:.:-1.17:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.45:1.000:. ./.:5:144,26:.: 1.53:1.000:. ./.:4:40,13:.:-1.79:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:86,11:.:-0.54:1.000:. ./.:4:64,8:.:-1.25:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:98,14:.:-0.12:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.14:1.000:. ./.:6:88,7:.:-0.60:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:117,11:.: 0.34:1.000:. ./.:4:89,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:108,11:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,22:.: 0.28:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.37:0.887:. ./.:4:122,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,10:.:-0.32:1.000:. ./.:4:74,6:.:-1.02:0.999:. ./.:4:59,26:.:-0.88:1.000:. ./.:4:183,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:86,11:.:-0.54:1.000:. ./.:4:89,11:.:-0.46:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:67,12:.:-1.05:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:69,12:.:-1.00:0.985:. ./.:4:138,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:133,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:111,20:.: 0.42:1.000:. ./.:4:74,12:.:-0.85:1.000:. ./.:4:96,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:74,15:.:-0.77:1.000:. ./.:4:77,17:.:-0.63:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:92,13:.:-0.32:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:60,23:.:-0.94:1.000:. ./.:4:81,17:.:-0.51:1.000:. ./.:4:119,17:.: 0.56:1.000:. ./.:4:52,7:.:-1.62:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:102,10:.:-0.12:0.904:. ./.:4:71,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:126,17:.: 0.76:0.993:. ./.:4:123,22:.: 0.82:1.000:. ./.:4:101,13:.:-0.06:1.000:. ./.:4:192,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:104,10:.:-0.06:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:102,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,9:.:-1.28:1.000:. ./.:4:92,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:74,19:.:-0.66:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:72,9:.:-1.00:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:121,25:.: 0.85:1.000:. ./.:4:71,15:.:-0.85:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:90,14:.:-0.34:1.000:. ./.:4:45,21:.:-1.42:1.000:. ./.:4:76,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:67,11:.:-1.08:1.000:. ./.:4:78,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:86,18:.:-0.34:1.000:. ./.:4:61,14:.:-1.17:1.000:. ./.:4:78,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:190,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:90,14:.:-0.34:1.000:. ./.:4:125,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:146,25:.: 1.55:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:143,27:.: 1.53:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:102,16:.: 0.05:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:73,15:.:-0.80:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:94,22:.: 0.00:1.000:. ./.:4:95,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:146,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:76,21:.:-0.54:1.000:. ./.:4:80,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:98,21:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,22:.:-0.57:1.000:. ./.:4:84,37:.: 0.14:0.999:. ./.:4:97,20:.: 0.02:1.000:. ./.:4:88,17:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,11:.:-0.74:1.000:. ./.:4:93,20:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,17:.:-0.63:1.000:. ./.:4:89,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:70,20:.:-0.74:1.000:. ./.:4:141,19:.: 1.24:1.000:. ./.:4:120,25:.: 0.82:1.000:. ./.:4:148,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:135,10:.: 0.82:1.000:. ./.:4:131,22:.: 1.04:1.000:. ./.:4:119,21:.: 0.68:1.000:. ./.:4:128,15:.: 0.76:1.000:. ./.:4:88,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:111,25:.: 0.56:1.000:. -chr8.1 10183440 chr8.1_010183440 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:298,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:228,53:.: 0.29:1.000:. ./.:4:203,52:.:-0.09:1.000:. ./.:4:263,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:234,88:.: 0.89:1.000:. ./.:4:152,45:.:-0.93:1.000:. ./.:4:240,74:.: 0.77:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:56,20:.:-2.70:1.000:. ./.:4:234,117:.: 1.31:1.000:. ./.:4:194,56:.:-0.16:1.000:. ./.:4:347,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:270,78:.: 1.27:1.000:. ./.:4:278,76:.: 1.36:0.999:. ./.:4:365,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:51,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:198,52:.:-0.16:1.000:. ./.:4:237,63:.: 0.57:1.000:. ./.:4:163,48:.:-0.73:1.000:. ./.:4:22,9:.:-3.35:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:250,96:.: 1.24:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:235,60:.: 0.50:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:38,0:.:-3.25:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.73:1.000:. ./.:3:24,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:240,64:.: 0.63:1.000:. ./.:4:236,56:.: 0.45:1.000:. ./.:4:185,75:.:-0.01:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:218,42:.:-0.01:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:175,46:.:-0.58:1.000:. ./.:4:252,43:.: 0.50:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.03:1.000:. ./.:5:318,60:.: 1.71:1.000:. ./.:4:189,67:.:-0.07:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:199,47:.:-0.22:1.000:. ./.:4:184,43:.:-0.50:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:186,54:.:-0.31:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:311,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:267,1:.: 0.10:1.000:. ./.:6:172,17:.:-1.05:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:214,46:.:-0.01:1.000:. ./.:4:253,58:.: 0.73:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:238,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:200,51:.:-0.15:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.03:0.887:. ./.:4:275,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:251,42:.: 0.47:1.000:. ./.:4:164,37:.:-0.87:0.999:. ./.:4:174,140:.: 0.77:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:241,42:.: 0.32:1.000:. ./.:4:156,48:.:-0.83:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:165,40:.:-0.82:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:326,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:164,46:.:-0.74:0.985:. ./.:4:330,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:191,53:.:-0.25:1.000:. ./.:4:243,52:.: 0.50:1.000:. ./.:4:219,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:140,40:.:-1.18:1.000:. ./.:4:218,45:.: 0.03:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:233,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:155,1:.:-1.53:1.000:. ./.:4:125,73:.:-0.92:1.000:. ./.:4:185,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:205,64:.: 0.12:1.000:. ./.:4:157,21:.:-1.21:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:178,42:.:-0.60:0.904:. ./.:4:216,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:282,68:.: 1.30:0.993:. ./.:4:201,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:164,42:.:-0.80:1.000:. ./.:4:447,0:.: 2.71:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:203,65:.: 0.10:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:141,44:.:-1.11:1.000:. ./.:4:196,36:.:-0.42:1.000:. ./.:4:158,35:.:-0.99:1.000:. ./.:4:210,41:.:-0.15:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:200,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:244,60:.: 0.63:1.000:. ./.:4:172,41:.:-0.70:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,34:.:-0.95:1.000:. ./.:4:112,69:.:-1.17:1.000:. ./.:4:146,29:.:-1.25:1.000:. ./.:4:149,43:.:-1.01:1.000:. ./.:4:166,45:.:-0.73:1.000:. ./.:4:214,59:.: 0.18:1.000:. ./.:4:117,34:.:-1.60:1.000:. ./.:4:192,51:.:-0.26:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:346,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:225,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:188,32:.:-0.60:1.000:. ./.:4:244,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.98:1.000:. ./.:4:250,75:.: 0.93:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:232,62:.: 0.48:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:253,61:.: 0.77:1.000:. ./.:4:43,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:187,42:.:-0.47:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:323,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:213,70:.: 0.32:1.000:. ./.:4:198,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:336,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:205,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:232,63:.: 0.50:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:344,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:214,47:.: 0.00:1.000:. ./.:4:191,55:.:-0.22:1.000:. ./.:4:142,103:.:-0.23:0.999:. ./.:4:170,62:.:-0.42:1.000:. ./.:4:179,43:.:-0.57:1.000:. ./.:4:209,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:167,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:216,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:195,49:.:-0.25:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:159,57:.:-0.66:1.000:. ./.:4:266,61:.: 0.96:1.000:. ./.:4:285,56:.: 1.17:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:228,14:.:-0.28:1.000:. ./.:4:225,56:.: 0.29:1.000:. ./.:4:268,77:.: 1.23:1.000:. ./.:4:220,71:.: 0.44:1.000:. ./.:4:175,53:.:-0.48:1.000:. ./.:4:212,62:.: 0.19:1.000:. -chr8.1 10282848 chr8.1_010282848 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:385,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:130,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:290,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:457,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:371,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:552,1:.: 2.56:1.000:. ./.:4:518,1:.: 2.18:1.000:. ./.:4:238,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:95,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:256,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:546,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:308,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.11:1.000:. ./.:3:86,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:366,2:.: 0.47:1.000:. ./.:5:428,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:33,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:308,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:254,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:338,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:230,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.57:0.887:. ./.:4:289,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:322,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.33:0.999:. ./.:4:186,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:293,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:421,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.19:0.985:. ./.:4:450,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:314,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:268,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:487,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:494,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.02:0.904:. ./.:4:330,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:364,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.01:0.993:. ./.:4:306,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:332,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:227,2:.:-1.10:1.000:. ./.:4:401,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:225,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:560,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:323,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:529,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:427,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:232,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:431,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:443,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.40:0.999:. ./.:4:231,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:226,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:241,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:338,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:385,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.53:1.000:. -chr8.1 10451508 chr8.1_010451508 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:109,45:.: 0.80:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:89,33:.: 0.05:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:9,2:.:-2.52:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:202,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:130,35:.: 1.05:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:141,46:.: 1.56:1.000:. ./.:4:135,36:.: 1.19:0.999:. ./.:4:169,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:136,42:.: 1.35:1.000:. ./.:4:24,11:.:-1.97:1.000:. ./.:4:84,37:.: 0.03:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:113,37:.: 0.70:1.000:. ./.:4:105,36:.: 0.49:1.000:. ./.:4:114,40:.: 0.80:1.000:. ./.:4:107,40:.: 0.63:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:107,36:.: 0.54:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.13:1.000:. ./.:3:8,3:.:-2.52:1.000:. ./.:4:134,53:.: 1.56:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:79,23:.:-0.41:1.000:. ./.:4:114,38:.: 0.75:1.000:. ./.:4:65,29:.:-0.60:1.000:. ./.:4:85,31:.:-0.09:1.000:. ./.:4:115,28:.: 0.54:1.000:. ./.:4:68,22:.:-0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.35:1.000:. ./.:5:171,36:.: 2.03:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,26:.:-0.67:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:96,29:.: 0.12:1.000:. ./.:4:109,31:.: 0.47:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:91,31:.: 0.05:1.000:. ./.:4:84,31:.:-0.11:1.000:. ./.:6:67,19:.:-0.78:1.000:. ./.:4:68,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:87,30:.:-0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.23:0.887:. ./.:4:103,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,22:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,26:.:-1.13:0.999:. ./.:4:130,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:92,25:.:-0.06:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:88,33:.: 0.03:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.39:0.985:. ./.:4:95,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,26:.:-0.60:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:57,19:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:74,26:.:-0.46:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:74,36:.:-0.23:1.000:. ./.:4:98,27:.: 0.12:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.39:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:42,18:.:-1.39:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,19:.:-1.13:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.01:0.904:. ./.:4:42,20:.:-1.34:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:85,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.72:0.993:. ./.:4:137,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:143,46:.: 1.61:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.11:0.999:. ./.:4:105,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:84,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:83,27:.:-0.23:1.000:. ./.:4:109,43:.: 0.75:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.36:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:78,25:.:-0.39:1.000:. ./.:4:149,51:.: 1.86:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:56,29:.:-0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:52,18:.:-1.15:1.000:. ./.:4:210,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:98,32:.: 0.24:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:98,39:.: 0.40:1.000:. ./.:4:124,34:.: 0.89:1.000:. ./.:4:107,39:.: 0.61:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:149,37:.: 1.54:1.000:. ./.:4:118,44:.: 0.98:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.39:1.000:. ./.:4:127,46:.: 1.24:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:110,48:.: 0.89:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,37:.: 0.40:1.000:. ./.:4:116,37:.: 0.77:1.000:. ./.:4:199,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.10:0.999:. ./.:4:117,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,45:.: 0.61:1.000:. ./.:4:78,27:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:91,35:.: 0.15:1.000:. ./.:4:76,15:.:-0.67:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:122,51:.: 1.24:1.000:. ./.:4:91,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,59:.: 1.54:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:136,53:.: 1.61:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.73:1.000:. -chr8.1 10584507 chr8.1_010584507 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:141,38:.: 0.35:1.000:. ./.:4:133,38:.: 0.17:1.000:. ./.:4:95,69:.: 0.01:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:138,41:.: 0.35:1.000:. ./.:4:112,88:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,39:.:-1.45:1.000:. ./.:4:143,38:.: 0.40:1.000:. ./.:4:185,50:.: 1.61:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:34,16:.:-2.55:1.000:. ./.:4:153,64:.: 1.20:1.000:. ./.:4:109,83:.: 0.64:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:139,30:.: 0.13:1.000:. ./.:4:174,44:.: 1.23:1.000:. ./.:4:177,31:.: 1.00:0.999:. ./.:4:149,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:198,53:.: 1.97:1.000:. ./.:4:195,56:.: 1.97:1.000:. ./.:4:48,6:.:-2.46:1.000:. ./.:4:96,71:.: 0.08:1.000:. ./.:4:154,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:79,72:.:-0.28:1.000:. ./.:4:10,2:.:-3.40:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:152,54:.: 0.96:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:177,43:.: 1.27:1.000:. ./.:4:160,36:.: 0.73:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:55,10:.:-2.21:1.000:. ./.:3:22,4:.:-3.09:1.000:. ./.:4:138,40:.: 0.33:1.000:. ./.:4:83,64:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,80:.: 0.19:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:260,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:89,67:.:-0.17:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:107,27:.:-0.66:1.000:. ./.:4:96,82:.: 0.33:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.62:1.000:. ./.:5:162,78:.: 1.72:1.000:. ./.:4:9,3:.:-3.40:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:58,27:.:-1.76:1.000:. ./.:4:82,37:.:-1.00:1.000:. ./.:4:180,34:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,55:.:-0.66:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:141,32:.: 0.22:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.46:1.000:. ./.:6:145,7:.:-0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:76,79:.:-0.19:1.000:. ./.:4:140,28:.: 0.10:1.000:. ./.:4:178,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:99,73:.: 0.19:1.000:. ./.:4:84,62:.:-0.39:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:120,44:.: 0.01:0.887:. ./.:4:148,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:160,29:.: 0.58:1.000:. ./.:4:88,13:.:-1.40:0.999:. ./.:4:91,61:.:-0.26:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:116,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:116,29:.:-0.41:1.000:. ./.:4:112,30:.:-0.48:1.000:. ./.:4:92,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:211,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:96,28:.:-0.89:0.985:. ./.:4:131,34:.: 0.04:1.000:. ./.:4:118,34:.:-0.26:1.000:. ./.:4:82,63:.:-0.41:1.000:. ./.:4:132,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:150,32:.: 0.42:1.000:. ./.:4:109,28:.:-0.59:1.000:. ./.:4:114,27:.:-0.50:1.000:. ./.:4:124,22:.:-0.39:1.000:. ./.:4:119,25:.:-0.44:1.000:. ./.:4:76,61:.:-0.59:1.000:. ./.:4:74,57:.:-0.73:1.000:. ./.:4:170,40:.: 1.05:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:186,48:.: 1.59:1.000:. ./.:4:154,39:.: 0.67:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,67:.:-0.39:1.000:. ./.:4:105,60:.: 0.04:1.000:. ./.:4:113,65:.: 0.33:1.000:. ./.:4:58,39:.:-1.49:1.000:. ./.:4:140,36:.: 0.28:1.000:. ./.:4:87,27:.:-1.11:1.000:. ./.:4:98,61:.:-0.10:0.904:. ./.:4:148,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:125,34:.:-0.10:1.000:. ./.:4:115,30:.:-0.41:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:93,81:.: 0.24:0.993:. ./.:4:140,31:.: 0.17:1.000:. ./.:4:136,30:.: 0.06:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:142,23:.: 0.04:0.999:. ./.:4:105,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:64,15:.:-1.90:1.000:. ./.:4:159,35:.: 0.69:1.000:. ./.:4:138,19:.:-0.14:1.000:. ./.:4:102,21:.:-0.91:1.000:. ./.:4:82,58:.:-0.53:1.000:. ./.:4:69,50:.:-1.00:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:76,55:.:-0.73:1.000:. ./.:4:138,38:.: 0.28:1.000:. ./.:4:102,80:.: 0.42:1.000:. ./.:4:82,40:.:-0.93:1.000:. ./.:4:188,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:139,35:.: 0.24:1.000:. ./.:4:68,50:.:-1.02:1.000:. ./.:4:74,49:.:-0.91:1.000:. ./.:4:55,40:.:-1.54:1.000:. ./.:4:60,45:.:-1.31:1.000:. ./.:4:145,37:.: 0.42:1.000:. ./.:4:58,40:.:-1.47:1.000:. ./.:4:65,56:.:-0.95:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:174,39:.: 1.11:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,23:.:-1.11:1.000:. ./.:4:115,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.57:1.000:. ./.:4:130,40:.: 0.15:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:122,87:.: 1.03:1.000:. ./.:4:154,43:.: 0.76:1.000:. ./.:4:146,38:.: 0.46:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:93,77:.: 0.15:1.000:. ./.:4:140,36:.: 0.28:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:180,41:.: 1.29:1.000:. ./.:4:51,15:.:-2.19:1.000:. ./.:4:68,42:.:-1.20:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:135,88:.: 1.34:1.000:. ./.:4:68,50:.:-1.02:1.000:. ./.:4:149,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:118,29:.:-0.37:1.000:. ./.:4:83,69:.:-0.26:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:88,70:.:-0.12:1.000:. ./.:4:106,66:.: 0.19:1.000:. ./.:4:111,75:.: 0.51:0.999:. ./.:4:94,61:.:-0.19:1.000:. ./.:4:134,31:.: 0.04:1.000:. ./.:4:84,58:.:-0.48:1.000:. ./.:4:77,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:78,68:.:-0.39:1.000:. ./.:4:125,23:.:-0.35:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:138,42:.: 0.37:1.000:. ./.:4:170,49:.: 1.25:1.000:. ./.:4:191,50:.: 1.74:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:151,7:.:-0.12:1.000:. ./.:4:149,44:.: 0.67:1.000:. ./.:4:147,42:.: 0.58:1.000:. ./.:4:182,58:.: 1.72:1.000:. ./.:4:80,68:.:-0.35:1.000:. ./.:4:118,27:.:-0.41:1.000:. -chr8.1 10652536 chr8.1_010652536 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:73,28:.: 0.82:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:72,21:.: 0.48:1.000:. ./.:4:65,37:.: 0.87:1.000:. ./.:4:109,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,23:.: 0.82:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:106,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:74,40:.: 1.38:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.23:0.999:. ./.:4:68,32:.: 0.78:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:88,28:.: 1.46:1.000:. ./.:4:9,1:.:-3.05:1.000:. ./.:4:80,26:.: 1.04:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:48,36:.: 0.10:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,4:.:-3.26:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.09:1.000:. ./.:3:5,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:85,26:.: 1.25:1.000:. ./.:4:69,27:.: 0.61:1.000:. ./.:4:69,22:.: 0.40:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.28:1.000:. ./.:5:117,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:85,20:.: 0.99:1.000:. ./.:4:60,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:65,21:.: 0.18:1.000:. ./.:4:41,19:.:-0.92:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.39:1.000:. ./.:6:58,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:75,20:.: 0.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:45,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:39,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,28:.: 0.44:0.887:. ./.:4:36,51:.: 0.23:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.50:0.999:. ./.:4:72,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:79,36:.: 1.42:1.000:. ./.:4:62,14:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,22:.: 1.08:1.000:. ./.:4:70,18:.: 0.27:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:0.985:. ./.:4:53,11:.:-0.75:1.000:. ./.:4:74,23:.: 0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:44,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:49,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:57,31:.: 0.27:1.000:. ./.:4:64,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:60,29:.: 0.31:1.000:. ./.:4:58,23:.:-0.03:1.000:. ./.:4:68,22:.: 0.35:1.000:. ./.:4:45,19:.:-0.75:1.000:. ./.:4:55,15:.:-0.50:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:74,17:.: 0.40:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:49,11:.:-0.92:0.904:. ./.:4:47,13:.:-0.92:1.000:. ./.:4:56,18:.:-0.33:1.000:. ./.:4:56,16:.:-0.41:1.000:. ./.:4:69,27:.: 0.61:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.93:0.993:. ./.:4:66,16:.: 0.01:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:85,24:.: 1.16:1.000:. ./.:4:59,16:.:-0.28:0.999:. ./.:4:97,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:68,24:.: 0.44:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,19:.:-0.03:1.000:. ./.:4:54,21:.:-0.28:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,22:.: 0.52:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,15:.:-1.31:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:64,18:.: 0.01:1.000:. ./.:4:50,2:.:-1.26:1.000:. ./.:4:48,18:.:-0.67:1.000:. ./.:4:76,21:.: 0.65:1.000:. ./.:4:97,36:.: 2.18:1.000:. ./.:4:76,37:.: 1.33:1.000:. ./.:4:48,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:61,18:.:-0.11:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:63,22:.: 0.14:1.000:. ./.:4:69,21:.: 0.35:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:39,17:.:-1.09:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:96,46:.: 2.57:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:60,21:.:-0.03:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:78,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:87,24:.: 1.25:1.000:. ./.:4:70,17:.: 0.23:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:62,18:.:-0.07:1.000:. ./.:4:65,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:52,13:.:-0.71:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.74:1.000:. ./.:4:86,42:.: 1.97:1.000:. ./.:4:66,21:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,22:.:-0.28:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.37:0.999:. ./.:4:67,17:.: 0.10:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:56,21:.:-0.20:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:67,27:.: 0.52:1.000:. ./.:4:62,26:.: 0.27:1.000:. ./.:4:67,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:81,21:.: 0.87:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.58:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.70:1.000:. -chr8.1 10959048 chr8.1_010959048 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:248,5:.: 0.78:1.000:. ./.:4:188,6:.:-0.02:1.000:. ./.:4:149,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:327,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:243,5:.: 0.72:1.000:. ./.:4:163,6:.:-0.36:1.000:. ./.:4:69,6:.:-1.64:1.000:. ./.:4:233,9:.: 0.63:1.000:. ./.:4:190,5:.: 0.00:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:17,6:.:-2.34:1.000:. ./.:4:168,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:213,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:252,4:.: 0.82:1.000:. ./.:4:184,7:.:-0.06:0.999:. ./.:4:334,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:226,12:.: 0.58:1.000:. ./.:4:204,9:.: 0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:157,15:.:-0.32:1.000:. ./.:4:266,4:.: 1.01:1.000:. ./.:4:103,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:292,2:.: 1.34:1.000:. ./.:4:268,3:.: 1.03:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:315,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:201,3:.: 0.12:1.000:. ./.:4:189,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:31,2:.:-2.21:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:237,3:.: 0.61:1.000:. ./.:4:156,9:.:-0.41:1.000:. ./.:4:144,12:.:-0.53:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:141,8:.:-0.63:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:170,8:.:-0.24:1.000:. ./.:4:119,10:.:-0.90:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.42:1.000:. ./.:5:245,7:.: 0.77:1.000:. ./.:4:90,24:.:-1.11:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:96,8:.:-1.24:1.000:. ./.:4:91,9:.:-1.30:1.000:. ./.:4:242,6:.: 0.72:1.000:. ./.:4:95,6:.:-1.28:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:188,5:.:-0.03:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.69:1.000:. ./.:6:187,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:314,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:125,12:.:-0.79:1.000:. ./.:4:181,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:149,11:.:-0.48:1.000:. ./.:4:122,12:.:-0.83:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:167,3:.:-0.34:0.887:. ./.:4:279,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:215,5:.: 0.33:1.000:. ./.:4:89,5:.:-1.38:0.999:. ./.:4:120,17:.:-0.79:1.000:. ./.:4:351,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:199,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:157,4:.:-0.47:1.000:. ./.:4:184,6:.:-0.07:1.000:. ./.:4:145,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:155,3:.:-0.51:0.985:. ./.:4:187,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:192,8:.: 0.06:1.000:. ./.:4:140,11:.:-0.60:1.000:. ./.:4:144,3:.:-0.66:1.000:. ./.:4:242,9:.: 0.76:1.000:. ./.:4:132,7:.:-0.77:1.000:. ./.:4:181,6:.:-0.11:1.000:. ./.:4:163,4:.:-0.39:1.000:. ./.:4:179,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:116,8:.:-0.97:1.000:. ./.:4:134,21:.:-0.55:1.000:. ./.:4:239,3:.: 0.63:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:185,5:.:-0.07:1.000:. ./.:4:157,7:.:-0.43:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:87,7:.:-1.38:1.000:. ./.:4:121,12:.:-0.85:1.000:. ./.:4:139,16:.:-0.55:1.000:. ./.:4:97,3:.:-1.30:1.000:. ./.:4:220,7:.: 0.43:1.000:. ./.:4:141,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:133,24:.:-0.52:0.904:. ./.:4:209,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:163,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:194,8:.: 0.09:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:189,14:.: 0.10:0.993:. ./.:4:208,10:.: 0.31:1.000:. ./.:4:185,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:206,2:.: 0.17:0.999:. ./.:4:115,15:.:-0.89:1.000:. ./.:4:154,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:224,8:.: 0.50:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:155,5:.:-0.48:1.000:. ./.:4:98,16:.:-1.11:1.000:. ./.:4:104,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:277,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:113,10:.:-0.98:1.000:. ./.:4:211,6:.: 0.29:1.000:. ./.:4:146,14:.:-0.48:1.000:. ./.:4:122,11:.:-0.85:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:190,7:.: 0.02:1.000:. ./.:4:106,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:86,9:.:-1.36:1.000:. ./.:4:100,14:.:-1.11:1.000:. ./.:4:107,8:.:-1.09:1.000:. ./.:4:215,10:.: 0.40:1.000:. ./.:4:76,7:.:-1.53:1.000:. ./.:4:146,8:.:-0.56:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:273,4:.: 1.11:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:177,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:171,8:.:-0.22:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:177,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:205,4:.: 0.19:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:155,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:263,11:.: 1.07:1.000:. ./.:4:214,8:.: 0.36:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:140,10:.:-0.62:1.000:. ./.:4:210,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:331,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:218,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:14,1:.:-2.45:1.000:. ./.:4:115,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:319,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:128,9:.:-0.79:1.000:. ./.:4:179,11:.:-0.07:1.000:. ./.:4:231,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:163,3:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,12:.:-0.68:1.000:. ./.:4:349,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:360,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:136,12:.:-0.64:1.000:. ./.:4:125,9:.:-0.83:1.000:. ./.:4:152,14:.:-0.40:0.999:. ./.:4:154,14:.:-0.37:1.000:. ./.:4:201,5:.: 0.14:1.000:. ./.:4:133,9:.:-0.73:1.000:. ./.:4:110,5:.:-1.09:1.000:. ./.:4:117,11:.:-0.92:1.000:. ./.:4:236,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:180,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:221,9:.: 0.47:1.000:. ./.:4:208,4:.: 0.23:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:245,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:237,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:268,7:.: 1.08:1.000:. ./.:4:281,7:.: 1.26:1.000:. ./.:4:113,6:.:-1.04:1.000:. ./.:4:235,3:.: 0.58:1.000:. -chr8.1 11097792 chr8.1_011097792 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:243,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:210,40:.: 0.11:1.000:. ./.:4:138,86:.:-0.31:1.000:. ./.:4:206,63:.: 0.42:1.000:. ./.:4:188,130:.: 1.22:1.000:. ./.:4:195,84:.: 0.58:1.000:. ./.:4:69,53:.:-1.97:1.000:. ./.:4:162,98:.: 0.27:1.000:. ./.:4:125,85:.:-0.54:1.000:. ./.:4:71,11:.:-2.62:1.000:. ./.:4:42,72:.:-2.10:1.000:. ./.:4:199,60:.: 0.26:1.000:. ./.:4:136,96:.:-0.18:1.000:. ./.:4:257,65:.: 1.28:1.000:. ./.:4:142,92:.:-0.15:1.000:. ./.:4:186,119:.: 1.00:1.000:. ./.:4:173,99:.: 0.47:0.999:. ./.:4:311,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:270,59:.: 1.40:1.000:. ./.:4:226,51:.: 0.55:1.000:. ./.:4:49,16:.:-2.90:1.000:. ./.:4:166,71:.:-0.10:1.000:. ./.:4:171,117:.: 0.73:1.000:. ./.:4:163,73:.:-0.12:1.000:. ./.:4:29,38:.:-2.87:1.000:. ./.:4:261,62:.: 1.30:1.000:. ./.:4:157,116:.: 0.48:1.000:. ./.:4:216,64:.: 0.60:1.000:. ./.:4:303,1:.: 0.99:1.000:. ./.:4:217,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:111,79:.:-0.87:1.000:. ./.:4:183,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,14:.:-2.96:1.000:. ./.:4:65,37:.:-2.30:1.000:. ./.:3:30,6:.:-3.37:1.000:. ./.:4:135,87:.:-0.35:1.000:. ./.:4:138,66:.:-0.64:1.000:. ./.:4:143,75:.:-0.41:1.000:. ./.:4:228,54:.: 0.63:1.000:. ./.:4:227,59:.: 0.70:1.000:. ./.:4:144,81:.:-0.30:1.000:. ./.:4:227,62:.: 0.74:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:208,49:.: 0.22:1.000:. ./.:4:79,157:.:-0.12:1.000:. ./.:4:255,60:.: 1.17:1.000:. ./.:5:188,169:.: 1.85:1.000:. ./.:4:78,175:.: 0.16:1.000:. ./.:4:187,53:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,76:.:-0.48:1.000:. ./.:4:141,71:.:-0.51:1.000:. ./.:4:265,56:.: 1.27:1.000:. ./.:4:114,72:.:-0.93:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:197,50:.: 0.06:1.000:. ./.:4:188,58:.: 0.05:1.000:. ./.:4:203,75:.: 0.57:1.000:. ./.:4:226,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:187,32:.:-0.39:1.000:. ./.:4:249,68:.: 1.20:1.000:. ./.:4:68,116:.:-0.96:1.000:. ./.:4:173,114:.: 0.71:1.000:. ./.:4:190,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:83,148:.:-0.20:1.000:. ./.:4:154,78:.:-0.18:1.000:. ./.:4:145,30:.:-1.11:1.000:. ./.:4:207,64:.: 0.45:1.000:. ./.:4:178,35:.:-0.49:0.887:. ./.:4:306,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:190,126:.: 1.18:1.000:. ./.:4:144,32:.:-1.09:0.999:. ./.:4:164,63:.:-0.26:1.000:. ./.:4:265,61:.: 1.35:1.000:. ./.:4:228,34:.: 0.31:1.000:. ./.:4:95,63:.:-1.39:1.000:. ./.:4:217,32:.: 0.09:1.000:. ./.:4:175,76:.: 0.13:1.000:. ./.:4:211,67:.: 0.57:1.000:. ./.:4:339,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:184,30:.:-0.48:0.985:. ./.:4:151,108:.: 0.26:1.000:. ./.:4:197,113:.: 1.09:1.000:. ./.:4:76,143:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,83:.:-0.74:1.000:. ./.:4:163,124:.: 0.71:1.000:. ./.:4:150,24:.:-1.13:1.000:. ./.:4:140,94:.:-0.15:1.000:. ./.:4:208,30:.:-0.08:1.000:. ./.:4:122,64:.:-0.93:1.000:. ./.:4:112,55:.:-1.24:1.000:. ./.:4:137,91:.:-0.25:1.000:. ./.:4:256,48:.: 0.99:1.000:. ./.:4:143,45:.:-0.90:1.000:. ./.:4:161,92:.: 0.16:1.000:. ./.:4:154,88:.:-0.02:1.000:. ./.:4:223,48:.: 0.45:1.000:. ./.:4:148,54:.:-0.67:1.000:. ./.:4:158,97:.: 0.19:1.000:. ./.:4:83,137:.:-0.38:1.000:. ./.:4:106,53:.:-1.37:1.000:. ./.:4:163,103:.: 0.37:1.000:. ./.:4:187,28:.:-0.46:1.000:. ./.:4:80,163:.: 0.00:0.904:. ./.:4:193,46:.:-0.07:1.000:. ./.:4:129,101:.:-0.22:1.000:. ./.:4:128,81:.:-0.56:1.000:. ./.:4:238,71:.: 1.07:1.000:. ./.:4:98,148:.: 0.05:0.993:. ./.:4:125,109:.:-0.15:1.000:. ./.:4:138,94:.:-0.18:1.000:. ./.:4:303,79:.: 2.26:1.000:. ./.:4:257,52:.: 1.07:0.999:. ./.:4:71,120:.:-0.85:1.000:. ./.:4:179,32:.:-0.52:1.000:. ./.:4:261,52:.: 1.13:1.000:. ./.:4:110,86:.:-0.77:1.000:. ./.:4:127,84:.:-0.52:1.000:. ./.:4:143,74:.:-0.43:1.000:. ./.:4:59,113:.:-1.16:1.000:. ./.:4:256,51:.: 1.04:1.000:. ./.:4:81,126:.:-0.59:1.000:. ./.:4:247,61:.: 1.05:1.000:. ./.:4:159,93:.: 0.14:1.000:. ./.:4:143,87:.:-0.22:1.000:. ./.:4:288,65:.: 1.79:1.000:. ./.:4:154,97:.: 0.13:1.000:. ./.:4:111,60:.:-1.17:1.000:. ./.:4:100,61:.:-1.34:1.000:. ./.:4:58,94:.:-1.48:1.000:. ./.:4:144,69:.:-0.49:1.000:. ./.:4:119,94:.:-0.49:1.000:. ./.:4:83,51:.:-1.78:1.000:. ./.:4:142,64:.:-0.61:1.000:. ./.:4:186,61:.: 0.06:1.000:. ./.:4:274,67:.: 1.59:1.000:. ./.:4:228,54:.: 0.63:1.000:. ./.:4:227,58:.: 0.68:1.000:. ./.:4:193,26:.:-0.39:1.000:. ./.:4:144,80:.:-0.31:1.000:. ./.:4:253,58:.: 1.10:1.000:. ./.:4:134,104:.:-0.08:1.000:. ./.:4:169,90:.: 0.26:1.000:. ./.:4:183,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:200,97:.: 0.87:1.000:. ./.:4:287,61:.: 1.70:1.000:. ./.:4:243,57:.: 0.92:1.000:. ./.:4:231,62:.: 0.81:1.000:. ./.:4:165,92:.: 0.22:1.000:. ./.:4:201,33:.:-0.15:1.000:. ./.:4:384,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:145,106:.: 0.13:1.000:. ./.:4:63,21:.:-2.59:1.000:. ./.:4:34,98:.:-1.81:1.000:. ./.:4:316,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:232,51:.: 0.65:1.000:. ./.:4:278,73:.: 1.75:1.000:. ./.:4:169,91:.: 0.27:1.000:. ./.:4:120,77:.:-0.75:1.000:. ./.:4:244,46:.: 0.76:1.000:. ./.:4:189,62:.: 0.13:1.000:. ./.:4:189,31:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,112:.:-1.19:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:216,50:.: 0.37:1.000:. ./.:4:139,73:.:-0.51:1.000:. ./.:4:54,143:.:-0.75:1.000:. ./.:4:171,90:.: 0.29:0.999:. ./.:4:162,92:.: 0.18:1.000:. ./.:4:202,51:.: 0.16:1.000:. ./.:4:131,70:.:-0.69:1.000:. ./.:4:117,52:.:-1.21:1.000:. ./.:4:137,70:.:-0.59:1.000:. ./.:4:198,40:.:-0.08:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:130,62:.:-0.83:1.000:. ./.:4:241,40:.: 0.61:1.000:. ./.:4:156,112:.: 0.40:1.000:. ./.:4:215,69:.: 0.66:1.000:. ./.:4:192,74:.: 0.37:1.000:. ./.:4:123,94:.:-0.43:1.000:. ./.:4:185,137:.: 1.28:1.000:. ./.:4:278,50:.: 1.38:1.000:. ./.:4:70,120:.:-0.87:1.000:. ./.:4:251,34:.: 0.68:1.000:. -chr8.1 11329939 chr8.1_011329939 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:29,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:26,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:5:32,0:.: 1.57:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.57:1.000:. ./.:6:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.80:0.887:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:32,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:0.968:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.92:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:37,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:0.904:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.69:0.993:. ./.:4:7,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:39,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.33:1.000:. -chr8.1 11413748 chr8.1_011413748 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:8,4:0.32: 0.53:1.000:0.962 0/0/1/1:4:4,3:0.39:-0.62:1.000:0.718 0/1/1/1:4:3,12:0.64: 1.21:1.000:0.633 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.84:1.000:0.962 0/0/1/1:4:12,13:0.47: 3.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,4:0.41:-0.16:1.000:0.831 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.51: 1.67:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,5:0.34: 0.98:1.000:0.895 0/0/1/1:4:4,7:0.54: 0.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:13,4:0.24: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.43: 2.13:1.000:0.942 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,1:0.10: 0.07:0.999:0.801 0/1/1/1:4:6,25:0.64: 4.87:1.000:0.679 0/0/1/1:4:3,10:0.62: 0.76:1.000:0.597 0/0/1/1:4:4,8:0.56: 0.53:1.000:0.969 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:10,3:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.41: 0.30:1.000:0.882 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:3,2:0.37:-1.07:1.000:0.568 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,7:0.45: 0.98:1.000:0.979 0/0/0/1:4:15,2:0.12: 1.67:1.000:0.708 0/0/0/1:4:10,4:0.28: 0.98:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.99:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.84:1.000:0.962 0/0/1/1:4:6,5:0.41: 0.30:1.000:0.882 0/0/0/1:4:10,3:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.35:-0.39:1.000:0.795 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,4:0.56:-0.84:1.000:0.969 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.38: 0.53:1.000:0.607 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:13,4:0.24: 1.67:1.000:0.966 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/0:4:10,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,5:0.75:-1.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.45:-0.39:1.000:0.979 0/0/1/1:4:6,7:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:4,5:0.49:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,8:0.69:-0.16:1.000:0.967 0/0/0/1:4:7,2:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.35: 1.44:1.000:0.795 0/0/1/1:4:5,4:0.41:-0.16:1.000:0.831 0/0/1/1:4:5,4:0.41:-0.16:1.000:0.831 0/0/0/0/0/0:6:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.20: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,4:0.34: 0.30:1.000:0.865 0/0/1/1:4:6,6:0.45: 0.53:0.887:0.979 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.99:0.999:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.32: 1.21:1.000:0.962 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.67:-0.62:1.000:0.913 0/1/1/1:4:1,10:0.70: 0.30:1.000:0.983 0/0/1/1:4:5,10:0.56: 1.21:1.000:0.969 0/0/0/1:4:3,1:0.25:-1.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,4:0.30: 0.76:0.968:0.988 0/0/0/1:4:7,3:0.29: 0.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:12,4:0.25: 1.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,8:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,9:0.61: 0.53:1.000:0.726 0/1/1/1:4:0,6:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,13:0.52: 2.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,7:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:3,3:0.45:-0.84:1.000:0.979 0/1/1/1:4:0,7:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.21: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,4:0.56:-0.84:1.000:0.969 0/0/0/1:4:10,3:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,4:0.45:-0.39:1.000:0.979 0/0/0/1:4:9,3:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,5:0.54:-0.39:1.000:0.990 0/0/0/1:4:6,3:0.32:-0.16:0.904:0.962 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:4,4:0.45:-0.39:1.000:0.979 0/0/0/1:4:8,1:0.11:-0.16:1.000:0.520 0/0/1/1:4:11,11:0.45: 2.81:0.993:0.979 0/0/0/0:4:9,1:0.10: 0.07:1.000:0.801 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-0.84:1.000:0.962 0/0/0/1:4:5,3:0.35:-0.39:1.000:0.795 0/0/1/1:4:3,7:0.58: 0.07:0.999:0.921 0/0/1/1:4:7,5:0.38: 0.53:1.000:0.607 0/0/1/1:4:1,3:0.61:-1.30:1.000:0.726 0/0/1/1:4:2,7:0.62:-0.16:1.000:0.534 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,6:0.56:-0.16:1.000:0.969 0/0/1/1:4:6,7:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,2:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,3:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:9,4:0.30: 0.76:1.000:0.988 0/0/1/1:4:6,5:0.41: 0.30:1.000:0.882 0/0/1/1:4:3,6:0.56:-0.16:1.000:0.969 0/0/0/1:4:8,1:0.11:-0.16:1.000:0.520 0/0/1/1:4:1,1:0.45:-1.76:1.000:0.979 0/0/0/1:4:6,3:0.32:-0.16:1.000:0.962 0/0/1/1:4:4,4:0.45:-0.39:1.000:0.979 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,2:0.56:-1.53:1.000:0.969 0/0/1/1:4:2,5:0.59:-0.62:1.000:0.885 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,7:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:0,2:0.75:-1.76:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.45:-1.76:1.000:0.979 0/0/1/1:4:6,5:0.41: 0.30:1.000:0.882 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.45: 0.53:1.000:0.979 0/0/1/1:4:1,2:0.56:-1.53:1.000:0.969 0/0/0/1:4:7,3:0.29: 0.07:1.000:0.992 0/0/1/1:4:1,3:0.61:-1.30:1.000:0.726 0/0/0/1:4:10,4:0.28: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:8,1:0.11:-0.16:1.000:0.520 0/0/0/1:4:7,4:0.34: 0.30:1.000:0.865 0/1/1/1:4:0,8:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,2:0.28:-0.62:1.000:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:10,5:0.32: 1.21:1.000:0.962 0/0/1/1:4:6,7:0.48: 0.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:2,3:0.52:-1.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,6:0.45: 0.53:1.000:0.979 0/0/0/1:4:8,2:0.20: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.53: 0.76:1.000:0.992 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.12:-0.39:1.000:0.852 0/0/1/1:4:8,6:0.39: 0.98:1.000:0.718 0/0/0/1:4:6,2:0.25:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:6,1:0.14:-0.62:1.000:0.975 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,6:0.33: 1.67:0.999:0.912 0/0/0/1:4:7,4:0.34: 0.30:1.000:0.865 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,5:0.49:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,7:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:3,4:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.45:-1.76:1.000:0.979 0/0/1/1:4:4,7:0.54: 0.30:1.000:0.987 0/0/0/1:4:7,3:0.29: 0.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:7,3:0.29: 0.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:10,2:0.17: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,6:0.45: 0.53:1.000:0.979 0/0/1/1:4:9,8:0.43: 1.67:1.000:0.935 0/0/0/0:4:13,0:0.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.17:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,2:0.14: 0.98:1.000:0.975 0/0/0/1:4:7,3:0.29: 0.07:1.000:0.992 -chr8.1 11445638 chr8.1_011445638 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:84,62:0.47:-0.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,78:0.65:-0.67:1.000:0.792 0/0/1/1:4:104,67:0.44: 0.54:1.000:0.964 0/0/1/1:4:94,63:0.45: 0.17:1.000:0.978 0/1/1/1:4:53,122:0.71: 0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:122,110:0.52: 2.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,13:0.25:-2.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,35:0.22: 1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.50:-2.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,24:0.58:-2.81:1.000:0.906 0/0/1/1:4:78,81:0.55: 0.22:1.000:0.979 0/0/1/1:4:75,67:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:51,95:0.67:-0.12:1.000:0.933 1/1/1/1:4:0,171:1.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,30:0.20: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,78:0.49: 0.70:0.999:0.996 0/1/1/1:4:66,163:0.73: 2.06:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,126:0.72: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:86,56:0.44:-0.23:1.000:0.968 0/0/0/1:4:37,11:0.27:-2.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:141,24:0.17: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,77:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,66:0.53:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,16:0.51:-3.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,67:0.44: 0.54:1.000:0.964 0/0/1/1:4:95,77:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,77:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,65:0.45: 0.33:1.000:0.975 0/1/1/1:4:43,88:0.69:-0.52:1.000:0.975 0/0/1/1:4:81,63:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,97:0.69:-0.17:1.000:0.978 0/0/0/1:4:25,11:0.35:-3.02:1.000:0.812 0/0/1/1:4:37,35:0.53:-2.07:1.000:0.992 0/0/1:3:13,4:0.27:-3.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,81:0.53: 0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,71:0.45: 0.70:1.000:0.977 0/0/1/1:4:100,59:0.42: 0.22:1.000:0.898 0/1/1/1:4:44,104:0.72:-0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:91,75:0.50: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,27:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,78:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,40:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:150,32:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,91:0.70:-0.46:1.000:0.987 0/1/1/1:4:46,104:0.71:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1/1:5:104,109:0.55: 1.64:1.000:0.890 0/0/1/1:4:41,49:0.58:-1.60:1.000:0.910 0/0/1/1:4:85,59:0.46:-0.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:76,50:0.44:-0.65:1.000:0.972 0/0/1/1:4:73,60:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,148:0.71: 1.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:140,40:0.26: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,78:0.44: 1.20:1.000:0.973 0/0/1/1:4:81,57:0.46:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:110,74:0.45: 0.88:1.000:0.979 0/0/1/1:4:87,51:0.41:-0.33:1.000:0.890 0/0/1/1:4:94,74:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,84:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/0/1/1:6:102,52:0.38: 0.09:1.000:0.775 0/0/1/1:4:79,69:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,106:0.68: 0.25:1.000:0.961 0/0/1/1:4:90,78:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,53:0.45:-0.49:1.000:0.978 0/1/1/1:4:48,111:0.71: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,76:0.46: 0.85:1.000:0.989 0/1/1/1:4:19,35:0.67:-2.54:1.000:0.924 0/0/1/1:4:88,71:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,66:0.49:-0.04:0.887:0.996 0/0/1/1:4:74,69:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,66:0.46: 0.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:99,30:0.27:-0.57:0.999:0.997 0/0/1/1:4:82,51:0.43:-0.46:1.000:0.945 0/0/1/1:4:115,84:0.47: 1.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:92,62:0.45: 0.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:93,64:0.45: 0.17:1.000:0.984 0/1/1/1:4:30,115:0.80:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,70:0.53:-0.17:1.000:0.992 0/0/1/1:4:98,75:0.48: 0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:151,29:0.19: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,84:0.74:-0.91:0.968:0.998 0/1/1/1:4:41,114:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,107:0.68: 0.33:1.000:0.948 0/1/1/1:4:49,91:0.67:-0.28:1.000:0.930 0/0/1/1:4:84,52:0.43:-0.38:1.000:0.941 0/0/0/1:4:157,35:0.21: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,43:0.40:-0.75:1.000:0.762 0/1/1/1:4:31,107:0.78:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,110:0.70: 0.25:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,23:0.27:-1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,36:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,127:0.69: 0.98:1.000:0.980 0/0/1/1:4:71,52:0.47:-0.73:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,111:0.69: 0.38:1.000:0.977 0/0/0/1:4:148,33:0.21: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,64:0.47: 0.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:98,38:0.32:-0.38:1.000:0.953 0/0/1/1:4:99,73:0.47: 0.56:1.000:0.993 0/1/1/1:4:42,115:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,32:0.48:-2.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,100:0.72:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:45,67:0.63:-1.02:1.000:0.531 0/0/1/1:4:90,56:0.43:-0.12:0.904:0.945 0/0/1/1:4:65,62:0.53:-0.62:1.000:0.991 0/1/1/1:4:43,107:0.73:-0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,102:0.72:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:74,70:0.53:-0.17:1.000:0.992 0/1/1/1:4:58,139:0.72: 1.22:0.993:0.996 0/0/0/1:4:138,38:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,60:0.43: 0.14:1.000:0.948 0/0/1/1:4:114,99:0.51: 1.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,66:0.51:-0.23:0.999:0.996 0/1/1/1:4:53,132:0.73: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,35:0.41:-1.41:1.000:0.834 0/1/1/1:4:43,122:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,29:0.21: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,25:0.21:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,72:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:42,94:0.71:-0.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:39,115:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,90:0.72:-0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,70:0.53:-0.17:1.000:0.992 0/0/0/1:4:119,31:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,58:0.41: 0.22:1.000:0.862 0/1/1/1:4:48,105:0.70: 0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:99,53:0.39: 0.04:1.000:0.722 0/0/0/1:4:96,21:0.21:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,55:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,85:0.77:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,68:0.42: 0.77:1.000:0.926 0/0/0/1:4:115,34:0.27:-0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,51:0.53:-1.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:134,37:0.25: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,74:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,88:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,94:0.54: 1.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,58:0.45:-0.20:1.000:0.982 0/0/1/1:4:81,65:0.49:-0.12:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,64:0.45: 0.17:1.000:0.984 0/0/0/1:4:141,32:0.22: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,138:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,55:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:121,93:0.48: 1.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,82:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,88:0.65:-0.23:1.000:0.756 0/1/1/1:4:47,110:0.72: 0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:120,96:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,75:0.58:-0.33:1.000:0.914 0/0/1/1:4:101,72:0.46: 0.59:1.000:0.989 0/0/1/1:4:102,99:0.54: 1.33:1.000:0.990 1/1/1/1:4:2,24:0.93:-3.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,46:0.73:-2.28:1.000:0.998 0/0/0/1:4:175,52:0.27: 2.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,99:0.49: 1.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:60,103:0.66: 0.33:1.000:0.847 0/0/1/1:4:94,77:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,52:0.41:-0.23:1.000:0.871 0/0/1/1:4:94,69:0.47: 0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,73:0.47: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,93:0.74:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,33:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,66:0.46: 0.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:168,40:0.23: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,51:0.47:-0.81:1.000:0.993 0/0/0/1:4:120,25:0.20:-0.15:0.999:1.000 0/0/0/1:4:113,32:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,29:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,49:0.46:-0.83:1.000:0.987 0/0/1/1:4:77,72:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:64,41:0.44:-1.20:1.000:0.961 0/0/0/1:4:116,35:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:106,33:0.28:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,55:0.54:-1.07:1.000:0.986 0/0/0/1:4:150,41:0.25: 1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,59:0.45:-0.12:1.000:0.981 0/0/1/1:4:116,107:0.52: 1.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:92,74:0.49: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,35:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:116,68:0.41: 0.88:1.000:0.890 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,60:0.46:-0.15:1.000:0.988 0/0/1/1:4:58,66:0.57:-0.70:1.000:0.946 -chr8.1 11632320 chr8.1_011632320 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:225,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:124,34:.: 0.78:1.000:. ./.:4:142,20:.: 0.87:1.000:. ./.:4:99,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,9:.:-1.48:1.000:. ./.:4:44,43:.:-0.74:1.000:. ./.:4:138,12:.: 0.61:1.000:. ./.:4:36,2:.:-1.78:1.000:. ./.:4:37,16:.:-1.46:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:79,23:.:-0.42:1.000:. ./.:4:142,13:.: 0.72:1.000:. ./.:4:149,17:.: 0.95:1.000:. ./.:4:90,24:.:-0.16:1.000:. ./.:4:109,18:.: 0.12:0.999:. ./.:4:217,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:174,21:.: 1.57:1.000:. ./.:4:150,22:.: 1.08:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:80,30:.:-0.24:1.000:. ./.:4:112,11:.: 0.03:1.000:. ./.:4:16,4:.:-2.17:1.000:. ./.:4:168,17:.: 1.36:1.000:. ./.:4:140,18:.: 0.78:1.000:. ./.:4:189,21:.: 1.89:1.000:. ./.:4:165,14:.: 1.23:1.000:. ./.:4:195,21:.: 2.02:1.000:. ./.:4:82,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:154,11:.: 0.93:1.000:. ./.:4:11,2:.:-2.32:1.000:. ./.:4:35,5:.:-1.74:1.000:. ./.:3:21,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:132,26:.: 0.78:1.000:. ./.:4:101,10:.:-0.22:1.000:. ./.:4:115,13:.: 0.14:1.000:. ./.:4:139,25:.: 0.91:1.000:. ./.:4:208,16:.: 2.19:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:151,22:.: 1.10:1.000:. ./.:4:122,16:.: 0.35:1.000:. ./.:4:90,11:.:-0.44:1.000:. ./.:4:77,24:.:-0.44:1.000:. ./.:4:116,43:.: 0.80:1.000:. ./.:5:160,19:.: 1.23:1.000:. ./.:4:265,32:.: 3.75:1.000:. ./.:4:138,22:.: 0.82:1.000:. ./.:4:73,23:.:-0.54:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:175,21:.: 1.59:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:170,16:.: 1.38:1.000:. ./.:4:76,33:.:-0.27:1.000:. ./.:4:143,39:.: 1.29:1.000:. ./.:4:76,29:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:144,24:.: 0.99:1.000:. ./.:6:112,11:.: 0.03:1.000:. ./.:4:105,20:.: 0.08:1.000:. ./.:4:123,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:97,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:43,27:.:-1.10:1.000:. ./.:4:118,17:.: 0.29:1.000:. ./.:4:74,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:67,21:.:-0.71:1.000:. ./.:4:71,37:.:-0.29:1.000:. ./.:4:105,11:.:-0.12:0.887:. ./.:4:202,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:111,23:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,13:.:-1.35:0.999:. ./.:4:134,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:128,33:.: 0.84:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,40:.:-0.33:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:61,14:.:-0.99:1.000:. ./.:4:83,47:.: 0.18:1.000:. ./.:4:129,24:.: 0.67:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.12:0.968:. ./.:4:149,23:.: 1.08:1.000:. ./.:4:152,9:.: 0.84:1.000:. ./.:4:105,19:.: 0.05:1.000:. ./.:4:109,19:.: 0.14:1.000:. ./.:4:35,30:.:-1.21:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:150,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:140,20:.: 0.82:1.000:. ./.:4:57,14:.:-1.08:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:108,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:130,11:.: 0.42:1.000:. ./.:4:35,32:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,27:.:-1.12:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:110,19:.: 0.16:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:103,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,16:.:-1.12:0.904:. ./.:4:65,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:99,13:.:-0.20:1.000:. ./.:4:104,12:.:-0.12:1.000:. ./.:4:114,15:.: 0.16:1.000:. ./.:4:86,12:.:-0.50:0.993:. ./.:4:31,37:.:-1.14:1.000:. ./.:4:25,24:.:-1.55:1.000:. ./.:4:151,16:.: 0.97:1.000:. ./.:4:84,14:.:-0.50:0.999:. ./.:4:111,17:.: 0.14:1.000:. ./.:4:82,9:.:-0.65:1.000:. ./.:4:140,19:.: 0.80:1.000:. ./.:4:32,28:.:-1.31:1.000:. ./.:4:40,35:.:-0.99:1.000:. ./.:4:92,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,10:.:-1.01:1.000:. ./.:4:132,28:.: 0.82:1.000:. ./.:4:80,16:.:-0.54:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:99,8:.:-0.31:1.000:. ./.:4:136,12:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,31:.:-1.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:72,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:80,15:.:-0.56:1.000:. ./.:4:56,16:.:-1.06:1.000:. ./.:4:39,29:.:-1.14:1.000:. ./.:4:61,13:.:-1.01:1.000:. ./.:4:59,18:.:-0.95:1.000:. ./.:4:125,10:.: 0.29:1.000:. ./.:4:234,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:76,37:.:-0.18:1.000:. ./.:4:96,12:.:-0.29:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.46:1.000:. ./.:4:123,22:.: 0.50:1.000:. ./.:4:126,24:.: 0.61:1.000:. ./.:4:19,29:.:-1.57:1.000:. ./.:4:138,14:.: 0.65:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.95:1.000:. ./.:4:124,15:.: 0.38:1.000:. ./.:4:166,11:.: 1.19:1.000:. ./.:4:239,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:116,36:.: 0.65:1.000:. ./.:4:114,20:.: 0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:167,15:.: 1.29:1.000:. ./.:4:89,16:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,1:.:-1.85:1.000:. ./.:4:55,9:.:-1.23:1.000:. ./.:4:113,23:.: 0.31:1.000:. ./.:4:107,12:.:-0.05:1.000:. ./.:4:112,27:.: 0.38:1.000:. ./.:4:130,12:.: 0.44:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:116,22:.: 0.35:1.000:. ./.:4:70,7:.:-0.95:1.000:. ./.:4:68,10:.:-0.93:1.000:. ./.:4:170,20:.: 1.46:1.000:. ./.:4:175,32:.: 1.83:1.000:. ./.:4:81,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:75,17:.:-0.63:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.12:0.999:. ./.:4:79,11:.:-0.67:1.000:. ./.:4:110,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:106,7:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,15:.:-0.76:1.000:. ./.:4:74,12:.:-0.76:1.000:. ./.:4:96,20:.:-0.12:1.000:. ./.:4:35,36:.:-1.08:1.000:. ./.:4:101,18:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,11:.:-0.50:1.000:. ./.:4:141,23:.: 0.91:1.000:. ./.:4:84,26:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,25:.:-1.03:1.000:. ./.:4:97,33:.: 0.18:1.000:. ./.:4:107,15:.: 0.01:1.000:. ./.:4:77,12:.:-0.69:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.80:1.000:. -chr8.1 12212736 chr8.1_012212736 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:56,202:0.78: 1.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,123:0.77:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,105:0.53: 0.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:98,90:0.48:-0.07:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,189:0.75: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,127:0.57: 0.78:1.000:0.951 0/0/1/1:4:46,64:0.58:-1.96:1.000:0.912 0/0/0/1:4:131,36:0.21:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,151:0.78: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,31:0.34:-2.43:1.000:0.880 0/0/1/1:4:71,54:0.43:-1.60:1.000:0.945 0/0/1/1:4:83,135:0.62: 0.66:1.000:0.587 0/0/1/1:4:91,99:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,90:0.50:-0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,142:0.78:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,56:0.24: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,66:0.33: 0.20:0.999:0.924 1/1/1/1:4:0,246:1.00: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,174:0.73: 1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,171:0.76: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,59:0.68:-2.52:1.000:0.950 0/0/1/1:4:88,87:0.49:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,47:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,92:0.48:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,23:0.37:-3.13:1.000:0.583 0/0/1/1:4:119,103:0.46: 0.76:1.000:0.988 0/0/0/1:4:160,58:0.26: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,103:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,94:0.53:-0.33:1.000:0.993 0/1/1/1:4:47,153:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,61:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:82,96:0.54:-0.31:1.000:0.989 0/0/0/1:4:28,12:0.30:-3.67:1.000:0.987 0/1/1/1:4:25,79:0.76:-2.11:1.000:1.000 0/0/1:3:24,23:0.49:-3.50:1.000:0.707 0/0/0/1:4:134,49:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/1/1:4:108,101:0.48: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,97:0.52:-0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:109,128:0.54: 1.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:124,117:0.48: 1.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,93:0.49:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,111:0.54: 0.30:1.000:0.984 0/0/1/1:4:111,111:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:177,55:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,87:0.45: 0.01:1.000:0.983 0/0/1/1:4:120,120:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:139,110:0.44: 1.42:1.000:0.918 0/0/1/1:4:140,118:0.45: 1.64:1.000:0.984 0/0/1/1:4:103,87:0.46:-0.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:133,143:0.52: 2.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,89:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,182:0.74: 1.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:90,94:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,110:0.49: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,90:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:133,104:0.44: 1.13:1.000:0.961 0/0/1/1:4:93,103:0.52: 0.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:60,209:0.78: 1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,97:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/0/1/1:6:94,53:0.36:-1.06:1.000:0.878 0/0/1/1:4:88,85:0.49:-0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,105:0.53: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:177,59:0.25: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,94:0.48: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,99:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,121:0.54: 0.83:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,65:0.54:-1.75:1.000:0.985 0/0/1/1:4:94,92:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,159:0.74: 0.59:0.887:0.999 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,57:0.25: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,37:0.26:-1.19:0.999:0.999 0/0/1/1:4:132,142:0.52: 2.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,130:0.56: 1.00:1.000:0.969 0/1/1/1:4:49,169:0.78: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,53:0.29:-0.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:46,150:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,94:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,100:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:99,98:0.49: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:54,121:0.69:-0.38:0.968:0.976 0/1/1/1:4:65,158:0.71: 0.78:1.000:0.991 0/1/1/1:4:51,163:0.76: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,85:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,53:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,35:0.23:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,114:0.77:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,125:0.75:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:54,158:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,127:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,67:0.49:-1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,113:0.53: 0.49:1.000:0.991 0/1/1/1:4:74,180:0.71: 1.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:73,67:0.48:-1.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:32,139:0.81:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,55:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:99,74:0.43:-0.43:1.000:0.933 0/0/1/1:4:74,81:0.52:-0.87:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,111:0.48: 1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,99:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,56:0.48:-1.79:1.000:0.994 0/1/1/1:4:54,137:0.72: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,109:0.76:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,96:0.51:-0.04:0.904:0.997 0/0/1/1:4:90,69:0.43:-0.77:1.000:0.950 0/1/1/1:4:47,139:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,143:0.71: 0.30:1.000:0.989 0/0/1/1:4:106,103:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,117:0.54: 0.59:0.993:0.986 0/0/0/1:4:121,48:0.28:-0.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:144,47:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,142:0.50: 2.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,161:0.79: 0.35:0.999:1.000 0/0/1/1:4:104,85:0.45:-0.04:1.000:0.977 0/1/1/1:4:47,120:0.72:-0.58:1.000:0.995 0/1/1/1:4:58,162:0.74: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,44:0.26:-0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:119,41:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:93,102:0.52: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:81,104:0.56:-0.14:1.000:0.966 0/0/1/1:4:113,96:0.46: 0.44:1.000:0.986 0/0/1/1:4:86,111:0.56: 0.15:1.000:0.964 0/0/1/1:4:90,90:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,122:0.56: 0.66:1.000:0.970 0/0/1/1:4:96,83:0.46:-0.29:1.000:0.988 0/0/1/1:4:88,126:0.59: 0.57:1.000:0.878 0/0/0/1:4:126,49:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,83:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,66:0.44:-1.04:1.000:0.972 0/0/1/1:4:74,74:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,112:0.64:-0.38:1.000:0.685 0/0/0/1:4:158,45:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,72:0.47:-0.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:137,123:0.47: 1.68:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,73:0.41:-0.29:1.000:0.833 0/1/1/1:4:54,187:0.78: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,106:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:96,78:0.45:-0.41:1.000:0.975 0/1/1/1:4:39,104:0.73:-1.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,143:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,116:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,44:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,126:0.74:-0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:75,75:0.50:-0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,121:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:65,177:0.73: 1.25:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,144:0.71: 0.27:1.000:0.993 0/0/1/1:4:97,105:0.52: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:109,118:0.52: 0.88:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,140:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,121:0.54: 0.83:1.000:0.990 0/0/0/1:4:166,53:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,44:0.75:-3.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,80:0.58:-1.31:1.000:0.902 0/0/1/1:4:128,90:0.41: 0.66:1.000:0.866 0/0/1/1:4:107,92:0.46: 0.20:1.000:0.987 0/0/1/1:4:106,129:0.55: 1.08:1.000:0.982 0/0/1/1:4:90,99:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,73:0.46:-0.80:1.000:0.987 0/1/1/1:4:56,142:0.72: 0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,81:0.45:-0.29:1.000:0.980 0/0/0/1:4:145,61:0.29: 0.37:1.000:0.990 0/0/1/1:4:71,96:0.57:-0.58:1.000:0.937 0/0/1/1:4:82,96:0.54:-0.31:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,101:0.53:-0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,123:0.57: 0.64:1.000:0.957 0/0/1/1:4:62,71:0.53:-1.41:1.000:0.992 0/0/1/1:4:111,95:0.46: 0.37:0.999:0.987 0/0/1/1:4:94,103:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:129,50:0.28:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,74:0.43:-0.46:1.000:0.940 0/0/1/1:4:61,95:0.61:-0.85:1.000:0.712 0/0/1/1:4:91,106:0.54: 0.15:1.000:0.990 0/0/0/1:4:127,47:0.27:-0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,91:0.51:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,44:0.29:-0.97:1.000:0.992 0/0/0/1:4:143,57:0.28: 0.22:1.000:0.995 0/0/0/1:4:135,42:0.23:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,122:0.57: 0.54:1.000:0.943 0/0/1/1:4:82,80:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:162,46:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,51:0.21: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:209,77:0.27: 2.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:65,70:0.52:-1.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,144:0.70: 0.37:1.000:0.985 -chr8.1 12284179 chr8.1_012284179 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,71:0.67: 0.45:1.000:0.898 0/0/0/1:4:69,39:0.31: 1.04:1.000:0.976 0/0/0/1:4:48,20:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,58:0.31: 2.86:1.000:0.974 0/0/1/1:4:45,91:0.59: 2.02:1.000:0.889 0/0/0/1:4:54,15:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,22:0.21: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,50:0.48: 0.59:1.000:0.994 0/0/0/1:4:12,5:0.24:-2.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,81:0.64: 1.04:1.000:0.727 0/0/1/1:4:35,70:0.58: 0.94:1.000:0.898 0/0/1/1:4:43,52:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,46:0.52: 0.03:1.000:0.994 0/0/0/0:4:113,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.29:0.999:1.000 0/0/1/1:4:41,47:0.48: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,84:0.66: 1.04:1.000:0.888 0/0/1/1:4:51,77:0.54: 1.74:1.000:0.989 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,22:0.31:-0.64:1.000:0.967 0/0/0/1:4:43,22:0.29:-0.46:1.000:0.994 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-2.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,81:0.62: 1.22:1.000:0.574 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,74:0.61: 0.97:1.000:0.732 0/1/1/1:4:20,72:0.67: 0.48:1.000:0.906 0/0/0/1:4:34,19:0.31:-0.88:1.000:0.979 0/0/1/1:4:33,44:0.52:-0.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:0,4:0.83:-2.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,8:0.29:-1.93:1.000:0.989 0/1/1:3:1,2:0.58:-2.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,23:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,28:0.39:-0.50:1.000:0.645 0/0/0/1:4:46,32:0.36:-0.01:1.000:0.708 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,50:0.48: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/1:4:30,19:0.34:-1.02:1.000:0.896 0/0/1/1:4:56,46:0.40: 0.83:1.000:0.789 0/1/1/1:4:20,62:0.65: 0.13:1.000:0.771 0/0/0/0/0:5:111,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,23:0.36:-0.78:1.000:0.703 0/1/1/1:4:16,55:0.66:-0.25:1.000:0.875 0/0/0/1:4:62,22:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,81:0.61: 1.29:1.000:0.683 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,59:0.63: 0.06:1.000:0.621 0/0/1/1:4:43,65:0.54: 1.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:40,16:0.24:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,51:0.48: 0.66:1.000:0.994 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,59:0.61: 0.20:1.000:0.699 0/0/0/0/0/0:6:51,2:0.03:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,44:0.53:-0.15:1.000:0.991 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,58:0.55: 0.55:1.000:0.981 0/0/1/1:4:25,35:0.52:-0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,58:0.59: 0.27:1.000:0.868 0/0/1/1:4:39,48:0.50: 0.31:0.887:0.997 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,39:0.47:-0.11:0.999:0.992 0/0/1/1:4:28,36:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,20:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,34:0.46:-0.39:1.000:0.986 0/0/0/1:4:25,6:0.16:-1.65:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,31:0.52:-0.85:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,51:0.49: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,59:0.44: 1.50:1.000:0.962 0/0/1/1:4:39,62:0.55: 0.80:1.000:0.983 0/0/1/1:4:20,31:0.54:-0.95:0.968:0.987 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,17:0.15: 0.59:1.000:0.984 0/0/1/1:4:43,32:0.37:-0.11:1.000:0.503 0/0/0/1:4:46,29:0.33:-0.11:1.000:0.901 0/0/1/1:4:27,29:0.47:-0.78:1.000:0.991 0/0/0/1:4:41,30:0.37:-0.25:1.000:0.553 0/0/0/0:4:52,6:0.09:-0.71:1.000:0.974 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,41:0.43: 0.24:1.000:0.951 0/0/0/1:4:32,20:0.33:-0.92:1.000:0.911 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,9:0.13:-0.78:1.000:0.928 0/0/1/1:4:37,51:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:43,23:0.30:-0.43:1.000:0.989 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,34:0.38: 0.03:1.000:0.553 0/0/0/1:4:64,36:0.31: 0.76:1.000:0.977 0/0/1/1:4:29,31:0.47:-0.64:1.000:0.991 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.13:0.904:1.000 0/0/0/1:4:47,20:0.25:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,36:0.31: 0.73:1.000:0.972 0/0/0/1:4:48,32:0.35: 0.06:1.000:0.811 0/0/1/1:4:52,44:0.41: 0.62:1.000:0.846 0/0/0/1:4:93,68:0.37: 2.90:0.993:0.555 0/0/0/1:4:63,30:0.27: 0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,51:0.55: 0.17:1.000:0.983 0/0/1/1:4:81,78:0.44: 2.83:1.000:0.967 0/0/1/1:4:42,49:0.49: 0.45:0.999:0.996 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,42:0.57:-0.46:1.000:0.949 0/0/1/1:4:23,52:0.60:-0.11:1.000:0.765 0/0/0/1:4:67,18:0.17: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,14:0.23:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,23:0.34:-0.71:1.000:0.839 0/0/0/1:4:64,29:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,83:0.68: 0.90:1.000:0.948 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,48:0.48: 0.45:1.000:0.994 0/0/0/0:4:91,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,20:0.35:-0.99:1.000:0.811 0/0/1/1:4:41,60:0.53: 0.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:41,56:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:41,21:0.29:-0.57:1.000:0.994 0/0/0/1:4:19,12:0.33:-1.65:1.000:0.899 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,53:0.54: 0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:48,18:0.22:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,9:0.27:-1.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,17:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:64,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,53:0.52: 0.48:1.000:0.995 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,37:0.42: 0.03:1.000:0.903 0/0/1/1:4:39,31:0.39:-0.29:1.000:0.708 0/0/0/1:4:39,12:0.19:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,17:0.20:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,40:0.48:-0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:36,23:0.34:-0.67:1.000:0.884 0/0/0/1:4:61,28:0.26: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,34:0.34: 0.27:1.000:0.848 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,65:0.66: 0.20:1.000:0.872 0/0/1/1:4:43,36:0.40: 0.03:1.000:0.827 0/0/0/1:4:71,47:0.35: 1.39:1.000:0.825 0/0/1/1:4:34,75:0.60: 1.08:1.000:0.799 0/0/1/1:4:69,56:0.40: 1.64:1.000:0.761 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,44:0.36: 1.04:1.000:0.739 0/0/1/1:4:51,71:0.52: 1.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:75,62:0.40: 2.06:1.000:0.802 0/1/1/1:4:26,84:0.65: 1.11:1.000:0.819 0/0/0/1:4:53,22:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,50:0.38: 1.29:1.000:0.611 0/0/0/1:4:43,21:0.27:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/1:4:58,20:0.21:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,37:0.37: 0.34:1.000:0.580 0/0/0/1:4:53,21:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,24:0.20: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,52:0.37: 1.57:0.999:0.550 0/0/0/1:4:65,22:0.21: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,25:0.34:-0.50:1.000:0.879 0/0/0/1:4:55,40:0.37: 0.59:1.000:0.573 0/0/0/1:4:44,23:0.29:-0.39:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,50:0.54: 0.13:1.000:0.986 0/0/1/1:4:39,64:0.55: 0.87:1.000:0.978 0/0/1/1:4:20,50:0.62:-0.29:1.000:0.597 0/0/1/1:4:46,51:0.48: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,79:0.54: 1.78:1.000:0.984 0/0/0/1:4:73,50:0.35: 1.57:1.000:0.749 0/0/1/1:4:71,62:0.42: 1.92:1.000:0.892 0/0/1/1:4:55,62:0.48: 1.36:1.000:0.995 0/0/0/1:4:71,28:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,24:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,28:0.17: 1.88:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,44:0.44: 0.41:1.000:0.964 -chr8.1 12474574 chr8.1_012474574 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:191,104:.: 0.15:1.000:. ./.:4:91,128:.:-0.95:1.000:. ./.:4:293,45:.: 0.77:1.000:. ./.:4:91,148:.:-0.66:1.000:. ./.:4:222,121:.: 0.84:1.000:. ./.:4:236,98:.: 0.71:1.000:. ./.:4:168,102:.:-0.21:1.000:. ./.:4:226,133:.: 1.07:1.000:. ./.:4:228,107:.: 0.72:1.000:. ./.:4:99,23:.:-2.35:1.000:. ./.:4:191,14:.:-1.15:1.000:. ./.:4:201,123:.: 0.57:1.000:. ./.:4:211,99:.: 0.36:1.000:. ./.:4:178,91:.:-0.23:1.000:. ./.:4:193,87:.:-0.07:1.000:. ./.:4:326,39:.: 1.16:1.000:. ./.:4:341,61:.: 1.69:0.999:. ./.:4:205,114:.: 0.49:1.000:. ./.:4:138,222:.: 1.08:1.000:. ./.:4:148,230:.: 1.34:1.000:. ./.:4:93,31:.:-2.32:1.000:. ./.:4:316,38:.: 1.00:1.000:. ./.:4:232,110:.: 0.83:1.000:. ./.:4:206,92:.: 0.19:1.000:. ./.:4:66,14:.:-2.95:1.000:. ./.:4:117,136:.:-0.46:1.000:. ./.:4:309,52:.: 1.10:1.000:. ./.:4:201,97:.: 0.19:1.000:. ./.:4:117,181:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,150:.:-0.28:1.000:. ./.:4:287,104:.: 1.53:1.000:. ./.:4:210,78:.: 0.05:1.000:. ./.:4:36,27:.:-3.20:1.000:. ./.:4:131,11:.:-2.06:1.000:. ./.:3:33,31:.:-3.18:1.000:. ./.:4:264,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:179,92:.:-0.20:1.000:. ./.:4:218,98:.: 0.45:1.000:. ./.:4:196,90:.: 0.02:1.000:. ./.:4:235,112:.: 0.90:1.000:. ./.:4:295,47:.: 0.83:1.000:. ./.:4:214,88:.: 0.25:1.000:. ./.:4:104,134:.:-0.67:1.000:. ./.:4:185,79:.:-0.30:1.000:. ./.:4:355,65:.: 1.95:1.000:. ./.:4:107,120:.:-0.83:1.000:. ./.:5:417,53:.: 2.67:1.000:. ./.:4:206,56:.:-0.33:1.000:. ./.:4:79,114:.:-1.32:1.000:. ./.:4:200,56:.:-0.41:1.000:. ./.:4:245,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:110,164:.:-0.15:1.000:. ./.:4:284,42:.: 0.59:1.000:. ./.:4:126,172:.: 0.19:1.000:. ./.:4:109,166:.:-0.14:1.000:. ./.:4:121,104:.:-0.86:1.000:. ./.:4:102,123:.:-0.86:1.000:. ./.:4:229,83:.: 0.39:1.000:. ./.:4:113,132:.:-0.57:1.000:. ./.:6:175,69:.:-0.59:1.000:. ./.:4:257,107:.: 1.14:1.000:. ./.:4:287,45:.: 0.68:1.000:. ./.:4:369,63:.: 2.12:1.000:. ./.:4:105,138:.:-0.60:1.000:. ./.:4:311,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:223,91:.: 0.42:1.000:. ./.:4:111,134:.:-0.57:1.000:. ./.:4:119,143:.:-0.33:1.000:. ./.:4:116,130:.:-0.56:0.887:. ./.:4:0,197:.:-1.26:1.000:. ./.:4:372,42:.: 1.86:1.000:. ./.:4:165,55:.:-0.93:0.999:. ./.:4:233,91:.: 0.57:1.000:. ./.:4:85,136:.:-0.92:1.000:. ./.:4:105,123:.:-0.82:1.000:. ./.:4:212,85:.: 0.18:1.000:. ./.:4:180,72:.:-0.47:1.000:. ./.:4:190,81:.:-0.20:1.000:. ./.:4:109,142:.:-0.49:1.000:. ./.:4:117,157:.:-0.15:1.000:. ./.:4:75,103:.:-1.54:0.968:. ./.:4:219,94:.: 0.41:1.000:. ./.:4:271,108:.: 1.36:1.000:. ./.:4:244,37:.:-0.05:1.000:. ./.:4:389,38:.: 2.05:1.000:. ./.:4:241,95:.: 0.74:1.000:. ./.:4:169,53:.:-0.90:1.000:. ./.:4:194,85:.:-0.08:1.000:. ./.:4:179,66:.:-0.57:1.000:. ./.:4:176,87:.:-0.31:1.000:. ./.:4:169,87:.:-0.41:1.000:. ./.:4:274,41:.: 0.44:1.000:. ./.:4:220,92:.: 0.39:1.000:. ./.:4:66,102:.:-1.68:1.000:. ./.:4:297,102:.: 1.65:1.000:. ./.:4:238,84:.: 0.54:1.000:. ./.:4:96,104:.:-1.22:1.000:. ./.:4:217,87:.: 0.28:1.000:. ./.:4:320,49:.: 1.21:1.000:. ./.:4:240,48:.: 0.05:1.000:. ./.:4:224,35:.:-0.37:1.000:. ./.:4:230,89:.: 0.49:1.000:. ./.:4:170,68:.:-0.67:1.000:. ./.:4:271,43:.: 0.42:0.904:. ./.:4:191,78:.:-0.23:1.000:. ./.:4:198,88:.: 0.02:1.000:. ./.:4:153,69:.:-0.90:1.000:. ./.:4:226,109:.: 0.72:1.000:. ./.:4:371,62:.: 2.14:0.993:. ./.:4:204,89:.: 0.12:1.000:. ./.:4:187,87:.:-0.15:1.000:. ./.:4:306,155:.: 2.54:1.000:. ./.:4:97,121:.:-0.96:0.999:. ./.:4:315,44:.: 1.07:1.000:. ./.:4:69,79:.:-1.97:1.000:. ./.:4:117,142:.:-0.37:1.000:. ./.:4:196,74:.:-0.21:1.000:. ./.:4:189,71:.:-0.36:1.000:. ./.:4:183,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:213,44:.:-0.40:1.000:. ./.:4:113,131:.:-0.59:1.000:. ./.:4:254,32:.: 0.02:1.000:. ./.:4:108,135:.:-0.60:1.000:. ./.:4:305,65:.: 1.23:1.000:. ./.:4:186,74:.:-0.36:1.000:. ./.:4:223,74:.: 0.18:1.000:. ./.:4:223,86:.: 0.35:1.000:. ./.:4:193,68:.:-0.34:1.000:. ./.:4:166,57:.:-0.89:1.000:. ./.:4:256,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:185,80:.:-0.28:1.000:. ./.:4:210,113:.: 0.55:1.000:. ./.:4:114,47:.:-1.78:1.000:. ./.:4:188,37:.:-0.86:1.000:. ./.:4:195,70:.:-0.28:1.000:. ./.:4:258,118:.: 1.32:1.000:. ./.:4:117,124:.:-0.63:1.000:. ./.:4:175,82:.:-0.40:1.000:. ./.:4:87,92:.:-1.52:1.000:. ./.:4:183,69:.:-0.47:1.000:. ./.:4:100,113:.:-1.03:1.000:. ./.:4:202,64:.:-0.27:1.000:. ./.:4:211,101:.: 0.39:1.000:. ./.:4:160,62:.:-0.90:1.000:. ./.:4:211,120:.: 0.67:1.000:. ./.:4:98,173:.:-0.20:1.000:. ./.:4:184,105:.: 0.06:1.000:. ./.:4:97,128:.:-0.86:1.000:. ./.:4:198,103:.: 0.23:1.000:. ./.:4:206,95:.: 0.23:1.000:. ./.:4:123,220:.: 0.84:1.000:. ./.:4:271,54:.: 0.58:1.000:. ./.:4:99,21:.:-2.37:1.000:. ./.:4:211,43:.:-0.44:1.000:. ./.:4:92,160:.:-0.47:1.000:. ./.:4:252,93:.: 0.87:1.000:. ./.:4:121,162:.:-0.02:1.000:. ./.:4:244,132:.: 1.32:1.000:. ./.:4:254,60:.: 0.42:1.000:. ./.:4:193,95:.: 0.05:1.000:. ./.:4:95,156:.:-0.49:1.000:. ./.:4:157,73:.:-0.79:1.000:. ./.:4:301,48:.: 0.93:1.000:. ./.:4:64,127:.:-1.35:1.000:. ./.:4:198,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:209,123:.: 0.68:1.000:. ./.:4:301,40:.: 0.81:1.000:. ./.:4:214,89:.: 0.26:0.999:. ./.:4:168,87:.:-0.43:1.000:. ./.:4:224,88:.: 0.39:1.000:. ./.:4:279,46:.: 0.58:1.000:. ./.:4:164,75:.:-0.66:1.000:. ./.:4:201,90:.: 0.09:1.000:. ./.:4:194,89:.:-0.02:1.000:. ./.:4:85,141:.:-0.85:1.000:. ./.:4:175,103:.:-0.10:1.000:. ./.:4:255,130:.: 1.45:1.000:. ./.:4:371,60:.: 2.11:1.000:. ./.:4:222,98:.: 0.51:1.000:. ./.:4:122,136:.:-0.39:1.000:. ./.:4:215,109:.: 0.57:1.000:. ./.:4:265,119:.: 1.43:1.000:. ./.:4:235,127:.: 1.11:1.000:. ./.:4:288,50:.: 0.77:1.000:. ./.:4:73,159:.:-0.76:1.000:. -chr8.1 12524087 chr8.1_012524087 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:270,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:156,181:.: 0.66:1.000:. ./.:4:240,122:.: 1.00:1.000:. ./.:4:297,102:.: 1.50:1.000:. ./.:4:192,84:.:-0.16:1.000:. ./.:4:166,189:.: 0.91:1.000:. ./.:4:197,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,23:.:-2.72:1.000:. ./.:4:63,38:.:-2.53:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:203,79:.:-0.08:1.000:. ./.:4:246,95:.: 0.72:1.000:. ./.:4:213,105:.: 0.41:1.000:. ./.:4:251,103:.: 0.89:1.000:. ./.:4:304,106:.: 1.65:0.999:. ./.:4:321,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:271,136:.: 1.61:1.000:. ./.:4:313,142:.: 2.26:1.000:. ./.:4:101,4:.:-2.47:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:140,188:.: 0.54:1.000:. ./.:4:225,103:.: 0.54:1.000:. ./.:4:40,52:.:-2.65:1.000:. ./.:4:234,104:.: 0.68:1.000:. ./.:4:231,81:.: 0.33:1.000:. ./.:4:185,75:.:-0.38:1.000:. ./.:4:283,109:.: 1.41:1.000:. ./.:4:281,111:.: 1.41:1.000:. ./.:4:189,226:.: 1.72:1.000:. ./.:4:234,84:.: 0.41:1.000:. ./.:4:30,42:.:-2.92:1.000:. ./.:4:99,31:.:-2.14:1.000:. ./.:3:52,23:.:-2.88:1.000:. ./.:4:231,87:.: 0.41:1.000:. ./.:4:247,109:.: 0.92:1.000:. ./.:4:260,103:.: 1.02:1.000:. ./.:4:261,118:.: 1.23:1.000:. ./.:4:306,144:.: 2.19:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:173,85:.:-0.40:1.000:. ./.:4:222,84:.: 0.25:1.000:. ./.:4:190,71:.:-0.36:1.000:. ./.:4:186,103:.: 0.02:1.000:. ./.:4:130,202:.: 0.60:1.000:. ./.:5:273,102:.: 1.18:1.000:. ./.:4:66,30:.:-2.60:1.000:. ./.:4:118,146:.:-0.32:1.000:. ./.:4:166,85:.:-0.50:1.000:. ./.:4:192,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:243,97:.: 0.71:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:226,87:.: 0.34:1.000:. ./.:4:133,187:.: 0.43:1.000:. ./.:4:144,180:.: 0.49:1.000:. ./.:4:132,166:.: 0.14:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:223,85:.: 0.27:1.000:. ./.:6:169,66:.:-0.72:1.000:. ./.:4:189,85:.:-0.19:1.000:. ./.:4:203,64:.:-0.28:1.000:. ./.:4:246,93:.: 0.69:1.000:. ./.:4:139,192:.: 0.58:1.000:. ./.:4:206,87:.: 0.07:1.000:. ./.:4:176,99:.:-0.17:1.000:. ./.:4:124,155:.:-0.12:1.000:. ./.:4:129,165:.: 0.08:1.000:. ./.:4:220,74:.: 0.08:0.887:. ./.:4:205,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:210,119:.: 0.56:1.000:. ./.:4:154,73:.:-0.82:0.999:. ./.:4:290,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:155,196:.: 0.85:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:130,188:.: 0.41:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:185,77:.:-0.35:1.000:. ./.:4:142,169:.: 0.31:1.000:. ./.:4:230,101:.: 0.58:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.27:0.968:. ./.:4:204,86:.: 0.03:1.000:. ./.:4:219,98:.: 0.39:1.000:. ./.:4:164,76:.:-0.65:1.000:. ./.:4:247,106:.: 0.88:1.000:. ./.:4:148,207:.: 0.91:1.000:. ./.:4:214,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:134,64:.:-1.22:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:187,74:.:-0.36:1.000:. ./.:4:208,66:.:-0.19:1.000:. ./.:4:239,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:314,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:103,94:.:-1.23:1.000:. ./.:4:240,90:.: 0.57:1.000:. ./.:4:149,178:.: 0.53:1.000:. ./.:4:118,123:.:-0.63:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:228,96:.: 0.49:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:191,114:.: 0.23:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:157,65:.:-0.89:0.904:. ./.:4:168,61:.:-0.80:1.000:. ./.:4:182,79:.:-0.36:1.000:. ./.:4:174,67:.:-0.63:1.000:. ./.:4:237,105:.: 0.73:1.000:. ./.:4:260,119:.: 1.23:0.993:. ./.:4:139,149:.: 0.00:1.000:. ./.:4:130,156:.:-0.03:1.000:. ./.:4:336,121:.: 2.29:1.000:. ./.:4:163,99:.:-0.35:0.999:. ./.:4:248,89:.: 0.66:1.000:. ./.:4:118,55:.:-1.55:1.000:. ./.:4:226,78:.: 0.22:1.000:. ./.:4:110,162:.:-0.21:1.000:. ./.:4:114,131:.:-0.58:1.000:. ./.:4:196,88:.:-0.05:1.000:. ./.:4:164,79:.:-0.61:1.000:. ./.:4:110,164:.:-0.19:1.000:. ./.:4:135,52:.:-1.36:1.000:. ./.:4:227,101:.: 0.54:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:198,75:.:-0.20:1.000:. ./.:4:171,98:.:-0.26:1.000:. ./.:4:110,175:.:-0.04:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:138,78:.:-0.97:1.000:. ./.:4:133,68:.:-1.18:1.000:. ./.:4:176,87:.:-0.34:1.000:. ./.:4:149,207:.: 0.92:1.000:. ./.:4:133,62:.:-1.26:1.000:. ./.:4:177,72:.:-0.53:1.000:. ./.:4:206,78:.:-0.05:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:143,165:.: 0.27:1.000:. ./.:4:194,77:.:-0.23:1.000:. ./.:4:146,66:.:-1.03:1.000:. ./.:4:169,76:.:-0.58:1.000:. ./.:4:118,168:.:-0.03:1.000:. ./.:4:94,126:.:-0.92:1.000:. ./.:4:192,92:.:-0.05:1.000:. ./.:4:161,76:.:-0.69:1.000:. ./.:4:253,114:.: 1.07:1.000:. ./.:4:224,97:.: 0.45:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:125,170:.: 0.10:1.000:. ./.:4:269,108:.: 1.21:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:264,118:.: 1.27:1.000:. ./.:4:212,102:.: 0.35:1.000:. ./.:4:69,36:.:-2.47:1.000:. ./.:4:175,56:.:-0.77:1.000:. ./.:4:293,105:.: 1.49:1.000:. ./.:4:261,107:.: 1.08:1.000:. ./.:4:181,230:.: 1.67:1.000:. ./.:4:294,105:.: 1.50:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:282,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:145,152:.: 0.12:1.000:. ./.:4:155,83:.:-0.67:1.000:. ./.:4:210,89:.: 0.15:1.000:. ./.:4:225,83:.: 0.27:1.000:. ./.:4:241,92:.: 0.61:1.000:. ./.:4:237,105:.: 0.73:1.000:. ./.:4:246,86:.: 0.60:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.88:0.999:. ./.:4:164,83:.:-0.55:1.000:. ./.:4:238,86:.: 0.49:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:142,78:.:-0.92:1.000:. ./.:4:187,66:.:-0.47:1.000:. ./.:4:187,76:.:-0.34:1.000:. ./.:4:206,66:.:-0.21:1.000:. ./.:4:116,138:.:-0.46:1.000:. ./.:4:344,119:.: 2.37:1.000:. ./.:4:281,111:.: 1.41:1.000:. ./.:4:234,93:.: 0.53:1.000:. ./.:4:145,129:.:-0.19:1.000:. ./.:4:166,204:.: 1.11:1.000:. ./.:4:170,238:.: 1.63:1.000:. ./.:4:258,117:.: 1.18:1.000:. ./.:4:151,86:.:-0.69:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.28:1.000:. -chr8.1 12587555 chr8.1_012587555 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:72,38:0.33: 0.02:1.000:0.934 0/0/0/1:4:77,25:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,98:0.71: 0.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:104,39:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,34:0.21: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,21:0.28:-1.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,68:0.57: 0.15:1.000:0.945 0/0/1/1:4:63,75:0.52: 0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,3:0.48:-3.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,10:0.53:-2.85:1.000:0.991 0/0/0/1:4:120,24:0.16: 1.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:70,27:0.26:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,67:0.58: 0.02:1.000:0.904 0/0/1/1:4:47,49:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:125,37:0.21: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,80:0.48: 1.55:0.999:0.995 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,70:0.46: 1.11:1.000:0.989 0/0/0/1:4:117,37:0.22: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-2.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,81:0.73:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,64:0.56: 0.02:1.000:0.972 0/1/1/1:4:4,8:0.64:-3.04:1.000:0.638 0/0/1/1:4:72,72:0.48: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,83:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,69:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,50:0.47:-0.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:78,77:0.48: 1.43:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,111:0.73: 1.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,61:0.49: 0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,12:0.71:-2.91:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,10:0.38:-2.63:1.000:0.576 0/0/0:3:7,0:0.00:-3.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,75:0.49: 1.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,61:0.47: 0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,68:0.44: 1.18:1.000:0.971 0/0/1/1:4:70,77:0.50: 1.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,70:0.47: 1.08:1.000:0.991 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,52:0.56:-0.63:1.000:0.968 0/0/0/1:4:66,35:0.33:-0.26:1.000:0.930 0/0/1/1:4:47,72:0.58: 0.30:1.000:0.920 0/0/0/1:4:80,36:0.29: 0.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:29,68:0.67:-0.38:1.000:0.911 0/0/0/1/1:5:78,67:0.44: 1.11:1.000:0.909 0/0/1/1:4:39,44:0.51:-0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,81:0.74:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,17:0.17:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,87:0.61: 0.87:1.000:0.730 0/0/0/0:4:84,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,48:0.48:-0.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,67:0.53: 0.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:35,107:0.72: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,57:0.55:-0.29:1.000:0.983 0/0/0/1:4:78,34:0.28: 0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,89:0.54: 1.49:1.000:0.986 0/0/1/1/1/1:6:32,57:0.61:-0.63:1.000:0.729 0/0/1/1:4:28,52:0.62:-0.91:1.000:0.565 0/0/1/1:4:60,60:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,52:0.42: 0.27:1.000:0.917 0/0/1/1:4:47,58:0.53:-0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:55,66:0.52: 0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:85,33:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,62:0.80:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,62:0.55:-0.04:1.000:0.980 0/0/0/1:4:82,34:0.27: 0.21:0.887:0.997 0/0/1/1:4:35,38:0.50:-1.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,62:0.52: 0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,15:0.20:-1.26:0.999:1.000 0/0/0/1:4:90,33:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,85:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,30:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,77:0.66: 0.05:1.000:0.875 0/0/0/1:4:62,23:0.25:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,28:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,72:0.47: 1.21:1.000:0.991 0/0/0/1:4:92,38:0.27: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:44,46:0.49:-0.60:0.968:0.996 0/0/1/1:4:54,69:0.54: 0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:60,50:0.43: 0.02:1.000:0.957 0/0/1/1:4:43,68:0.59: 0.05:1.000:0.889 0/0/1/1:4:68,63:0.46: 0.68:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,58:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,32:0.39:-0.94:1.000:0.639 0/0/0/1:4:65,23:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,52:0.42: 0.27:1.000:0.917 0/0/0/1:4:68,20:0.21:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,39:0.25: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,67:0.74:-0.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,76:0.51: 1.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,64:0.48: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,37:0.47:-1.04:1.000:0.991 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,23:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,49:0.43: 0.02:1.000:0.934 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,28:0.24:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,15:0.17:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,23:0.21:-0.20:0.904:1.000 0/0/0/1:4:59,22:0.25:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,32:0.26: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,21:0.21:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,33:0.23: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,35:0.26: 0.58:0.993:0.999 0/0/1/1:4:55,57:0.49: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,43:0.44:-0.48:1.000:0.963 0/0/0/1:4:128,49:0.26: 2.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,29:0.27:-0.29:0.999:0.997 0/0/1/1:4:56,52:0.46:-0.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:47,18:0.26:-1.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,55:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,47:0.54:-0.82:1.000:0.986 0/0/1/1:4:44,32:0.40:-1.04:1.000:0.803 0/0/1/1:4:44,55:0.53:-0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:64,25:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,93:0.71: 0.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:41,46:0.51:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,42:0.36: 0.09:1.000:0.736 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,56:0.63:-0.76:1.000:0.543 0/0/1/1:4:48,47:0.47:-0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,60:0.47: 0.43:1.000:0.991 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,50:0.54:-0.66:1.000:0.985 0/0/1/1:4:44,38:0.44:-0.85:1.000:0.972 0/0/0/1:4:61,28:0.30:-0.63:1.000:0.988 0/0/1/1:4:65,80:0.53: 1.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,34:0.48:-1.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:76,27:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,49:0.48:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:117,42:0.25: 1.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,65:0.56: 0.05:1.000:0.966 0/0/1/1:4:38,51:0.55:-0.63:1.000:0.981 0/0/0/1:4:60,22:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,44:0.41:-0.20:1.000:0.848 0/1/1/1:4:18,72:0.76:-0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,59:0.57:-0.32:1.000:0.946 0/0/1/1:4:65,49:0.41: 0.15:1.000:0.865 0/0/0/1:4:54,25:0.30:-0.94:1.000:0.987 0/0/1/1:4:59,80:0.55: 0.93:1.000:0.979 0/0/1/1:4:68,55:0.43: 0.43:1.000:0.939 0/0/1/1:4:72,77:0.50: 1.24:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,107:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,80:0.53: 1.11:1.000:0.993 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,80:0.49: 1.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,42:0.28: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,10:0.79:-3.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,20:0.27:-1.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:87,43:0.31: 0.65:1.000:0.970 0/0/0/1:4:92,45:0.31: 0.87:1.000:0.974 0/1/1/1:4:21,91:0.77: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,76:0.55: 0.71:1.000:0.979 0/0/0/1:4:82,20:0.18:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,135:0.79: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,23:0.21:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,30:0.24: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,48:0.45:-0.23:1.000:0.980 0/0/1/1:4:67,73:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,36:0.33:-0.16:1.000:0.932 0/0/0/1:4:88,36:0.27: 0.46:1.000:0.997 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.40:0.999:1.000 0/0/0/1:4:75,24:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,56:0.54:-0.29:1.000:0.989 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,48:0.41: 0.05:1.000:0.879 0/0/0/1:4:72,24:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,24:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,31:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,56:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:131,44:0.23: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,25:0.18: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,38:0.26: 0.80:1.000:0.998 0/0/0/1:4:90,43:0.30: 0.74:1.000:0.981 0/0/1/1:4:50,69:0.56: 0.30:1.000:0.974 0/1/1/1:4:43,144:0.73: 2.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:108,50:0.30: 1.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:77,16:0.16:-0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:92,32:0.24: 0.46:1.000:1.000 -chr8.1 12751017 chr8.1_012751017 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:118,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.49:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.83:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.05:1.000:. ./.:5:232,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.57:1.000:. ./.:6:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.96:0.887:. ./.:4:179,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:181,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.43:0.968:. ./.:4:167,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.39:0.960:. ./.:4:123,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.82:0.993:. ./.:4:171,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:249,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:257,0:.: 2.71:0.999:. ./.:4:117,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.65:1.000:. -chr8.1 13194072 chr8.1_013194072 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:40,21:0.32: 0.01:1.000:0.952 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,30:0.54:-0.41:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,32:0.45: 0.39:1.000:0.982 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.23:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.52:-0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:32,12:0.25:-0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:35,4:0.09:-1.15:1.000:0.919 0/0/0/1:4:28,7:0.18:-1.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,15:0.28:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:48,7:0.12:-0.30:1.000:0.641 0/0/1/1:4:27,28:0.49:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,22:0.38:-0.30:0.999:0.555 0/1/1/1:4:11,57:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,20:0.28: 0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:18,3:0.13:-2.11:1.000:0.902 0/0/0/1:4:46,17:0.24: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,24:0.30: 0.65:1.000:0.981 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,5:0.20:-2.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,22:0.36:-0.20:1.000:0.637 0/0/1/1:4:18,31:0.59:-0.62:1.000:0.861 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,17:0.29:-0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:30,9:0.21:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.48:-1.95:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,14:0.62:-2.11:1.000:0.610 0/0/1:3:13,5:0.25:-2.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,19:0.32:-0.25:1.000:0.964 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,19:0.34:-0.46:1.000:0.850 0/0/1/1:4:22,35:0.58:-0.20:1.000:0.929 0/0/0/1:4:43,20:0.29: 0.12:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,34:0.57:-0.25:1.000:0.945 0/0/0/1:4:47,11:0.17:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,14:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.26: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/0/1:5:63,10:0.12: 0.65:1.000:0.970 0/0/0/1:4:158,61:0.25: 8.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,24:0.43:-0.41:1.000:0.956 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,26:0.22: 2.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.52: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,42:0.52: 0.86:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,39:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,20:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:44,26:0.35: 0.49:1.000:0.901 0/0/1/1:4:33,33:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,22:0.27: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/1:4:47,18:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,29:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,25:0.28: 1.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,11:0.22:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,31:0.57:-0.52:1.000:0.943 0/0/0/1:4:54,21:0.25: 0.76:0.887:0.999 0/0/1/1:4:29,26:0.45:-0.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:50,16:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.36:0.999:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,30:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:42,16:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,39:0.33: 2.67:1.000:0.928 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,42:0.47: 1.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:60,20:0.23: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.52:0.968:1.000 0/0/1/1:4:37,41:0.51: 0.92:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,46:0.51: 1.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,12:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,24:0.28: 0.92:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,41:0.47: 1.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:33,14:0.27:-0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,15:0.27:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,30:0.32: 1.45:1.000:0.960 0/0/0/1:4:50,16:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,16:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,19:0.52:-1.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,38:0.43: 1.24:1.000:0.955 0/0/1/1:4:32,32:0.48: 0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,23:0.40:-0.30:1.000:0.772 0/0/0/1:4:49,9:0.14:-0.14:1.000:0.968 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,18:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,24:0.43:-0.41:1.000:0.956 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,28:0.40: 0.33:0.960:0.769 0/1/1/1:4:15,37:0.65:-0.46:1.000:0.807 0/0/1/1:4:38,33:0.45: 0.55:1.000:0.976 0/0/1/1:4:28,39:0.55: 0.33:1.000:0.979 0/0/1/1:4:33,26:0.42:-0.09:1.000:0.919 0/0/0/1:4:45,16:0.24: 0.01:0.993:1.000 0/0/1/1:4:34,32:0.47: 0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:56,17:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,29:0.45: 0.07:1.000:0.979 0/0/0/1:4:36,19:0.32:-0.30:0.999:0.948 0/0/0/1:4:67,23:0.23: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,13:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,33:0.53:-0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,26:0.39: 0.17:1.000:0.638 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,16:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,9:0.16:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:26,16:0.36:-0.99:1.000:0.700 0/0/0/1:4:53,22:0.27: 0.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,17:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,13:0.19: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,10:0.18:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:47,6:0.10:-0.41:1.000:0.744 0/0/0/0:4:67,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,14:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,30:0.47: 0.01:1.000:0.994 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,12:0.14: 0.76:1.000:0.979 0/0/1/1:4:28,27:0.47:-0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:37,14:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,30:0.43: 0.33:1.000:0.943 0/0/1/1:4:22,18:0.43:-1.10:1.000:0.949 0/0/0/1:4:53,15:0.20: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,16:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,28:0.45:-0.04:1.000:0.978 0/0/1/1:4:18,28:0.57:-0.78:1.000:0.942 0/0/0/1:4:34,8:0.17:-0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,28:0.59:-0.89:1.000:0.843 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,12:0.15: 0.70:1.000:0.983 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,24:0.31: 0.60:1.000:0.974 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,11:0.14: 0.49:1.000:0.973 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,19:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,7:0.23:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,20:0.29: 0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,22:0.28: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,45:0.59: 0.55:1.000:0.856 0/0/0/1:4:56,10:0.14: 0.28:1.000:0.956 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,19:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,33:0.47: 0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:24,16:0.38:-1.10:1.000:0.555 0/0/0/1:4:44,12:0.19:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,43:0.61: 0.28:1.000:0.744 0/0/0/1:4:43,19:0.28: 0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:27,33:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:27,9:0.23:-1.31:0.999:1.000 0/0/0/1:4:42,15:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,12:0.23:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,22:0.34:-0.04:1.000:0.841 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,25:0.30: 0.81:1.000:0.980 0/0/1/1:4:26,25:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,23:0.43:-0.52:1.000:0.952 0/0/1/1:4:31,38:0.53: 0.44:1.000:0.993 0/0/0/1:4:62,30:0.30: 1.66:1.000:0.983 0/0/0/1:4:46,13:0.20:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,32:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,14:0.19: 0.23:1.000:1.000 -chr8.1 13515240 chr8.1_013515240 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:48,64:0.55: 1.21:1.000:0.982 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,35:0.34: 0.75:1.000:0.883 0/1/1/1:4:24,57:0.70: 0.18:1.000:0.981 0/0/1/1:4:41,36:0.44: 0.05:1.000:0.971 0/0/0/1:4:71,34:0.31: 0.98:1.000:0.979 0/0/1/1:4:44,50:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,71:0.66: 0.98:1.000:0.896 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,33:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,60:0.65: 0.51:1.000:0.753 0/0/0/1:4:74,37:0.32: 1.18:0.999:0.964 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,31:0.26: 1.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,101:0.69: 2.31:1.000:0.969 0/1/1/1:4:11,22:0.65:-1.42:1.000:0.827 0/0/1/1:4:67,54:0.42: 1.51:1.000:0.922 0/0/0/1:4:67,38:0.34: 0.98:1.000:0.854 0/0/0/1:4:80,31:0.26: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,58:0.65: 0.41:1.000:0.750 0/0/0/1:4:62,28:0.29: 0.48:1.000:0.989 0/1/1/1:4:26,60:0.69: 0.35:1.000:0.971 0/1/1/1:4:26,69:0.72: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,29:0.34: 0.15:1.000:0.850 0/0/1/1:4:61,48:0.42: 1.11:1.000:0.899 0/0/1/1:4:32,24:0.41:-0.65:1.000:0.834 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,15:0.64:-1.75:1.000:0.664 0/1/1:3:1,6:0.86:-2.28:1.000:0.511 0/0/0/1:4:59,35:0.35: 0.61:1.000:0.772 0/0/0/1:4:79,27:0.24: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,25:0.18: 1.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,38:0.52:-0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,34:0.52:-0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,54:0.56: 0.58:1.000:0.970 0/1/1/1:4:31,59:0.64: 0.48:1.000:0.708 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,51:0.43: 1.24:1.000:0.938 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,36:0.58:-0.52:1.000:0.915 0/0/0/0/1:5:82,32:0.27: 1.28:1.000:0.852 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,50:0.73:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:22,15:0.38:-1.29:1.000:0.614 0/0/0/1:4:46,21:0.30:-0.29:1.000:0.988 0/0/0/1:4:70,20:0.21: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,45:0.45: 0.65:1.000:0.978 0/1/1/1:4:29,76:0.72: 0.98:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,51:0.62: 0.15:1.000:0.549 1/1/1/1:4:1,40:0.98:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,53:0.40: 1.68:1.000:0.772 0/1/1/1:4:26,49:0.64:-0.02:1.000:0.679 0/0/1/1/1/1:6:25,61:0.70: 0.35:1.000:0.865 0/1/1/1:4:24,70:0.74: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,24:0.34:-0.29:1.000:0.877 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,22:0.30:-0.22:1.000:0.984 0/0/1/1:4:20,22:0.50:-1.12:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,61:0.60: 0.75:0.887:0.747 0/0/1/1:4:40,54:0.55: 0.61:1.000:0.979 0/0/0/1:4:60,33:0.34: 0.58:1.000:0.895 0/1/1/1:4:20,41:0.66:-0.49:0.999:0.870 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,59:0.69: 0.28:1.000:0.979 0/0/0/1:4:56,33:0.35: 0.45:1.000:0.786 0/0/0/1:4:65,35:0.33: 0.81:1.000:0.917 0/0/0/1:4:46,22:0.31:-0.25:1.000:0.979 0/0/1/1:4:26,28:0.49:-0.72:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,90:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.69:0.968:1.000 0/0/1/1:4:49,36:0.40: 0.31:1.000:0.796 0/0/1/1:4:49,39:0.42: 0.41:1.000:0.911 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,24:0.32:-0.12:1.000:0.964 0/1/1/1:4:26,54:0.66: 0.15:1.000:0.889 0/1/1/1:4:13,49:0.79:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,22:0.57:-1.29:1.000:0.936 0/0/1/1:4:36,29:0.42:-0.35:1.000:0.922 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,45:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,46:0.46: 0.65:1.000:0.986 0/0/0/1:4:57,33:0.35: 0.48:1.000:0.820 0/1/1/1:4:24,44:0.63:-0.25:1.000:0.592 0/0/0/1:4:52,34:0.37: 0.35:1.000:0.511 0/1/1/1:4:18,68:0.79: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,23:0.36:-0.52:1.000:0.658 0/0/0/1:4:60,22:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:59,1:0.02:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,24:0.51:-1.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,19:0.36:-0.85:1.000:0.695 0/0/1/1:4:26,19:0.40:-1.02:1.000:0.786 0/0/1/1:4:27,37:0.56:-0.39:0.960:0.974 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,30:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,25:0.57:-1.12:1.000:0.934 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.72:0.993:1.000 0/0/1/1:4:25,32:0.54:-0.62:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,27:0.51:-0.85:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,76:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,58:0.74: 0.08:0.999:0.999 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,16:0.80:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,26:0.37:-0.29:1.000:0.602 0/1/1/1:4:19,44:0.69:-0.42:1.000:0.973 0/1/1/1:4:19,64:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,30:0.33: 0.35:1.000:0.921 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,26:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,74:0.48: 2.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,20:0.22: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,30:0.64:-0.99:1.000:0.664 0/0/0/1:4:47,27:0.35:-0.05:1.000:0.833 0/0/0/1:4:49,21:0.28:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.45:-0.49:1.000:0.980 0/0/1/1:4:38,60:0.59: 0.75:1.000:0.842 0/0/0/1:4:43,17:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,47:0.63:-0.09:1.000:0.545 0/1/1/1:4:25,59:0.69: 0.28:1.000:0.979 0/0/1/1:4:58,65:0.50: 1.58:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,76:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,52:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,48:0.72:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,44:0.68:-0.39:1.000:0.946 0/1/1/1:4:15,50:0.77:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,1:0.02:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,78:0.51: 2.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,75:0.53: 1.94:1.000:0.990 0/0/0/1:4:108,35:0.23: 2.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,17:0.33:-0.92:1.000:0.898 0/0/0/1:4:87,34:0.27: 1.51:1.000:0.998 0/1/1/1:4:21,62:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,79:0.64: 1.48:1.000:0.742 0/0/1/1:4:30,30:0.47:-0.52:1.000:0.993 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,34:0.42: 0.01:1.000:0.926 0/0/0/1:4:101,34:0.24: 1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,32:0.25: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,61:0.66: 0.51:1.000:0.857 0/0/1/1:4:32,57:0.62: 0.45:1.000:0.505 0/1/1/1:4:29,69:0.70: 0.75:1.000:0.981 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,108:0.74: 2.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,27:0.70:-1.25:1.000:0.988 0/0/1/1:4:53,56:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:61,32:0.33: 0.58:1.000:0.938 0/0/0/1:4:52,26:0.32: 0.08:0.999:0.964 0/0/1/1:4:49,59:0.52: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,59:0.42: 1.94:1.000:0.899 0/0/0/1:4:51,19:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,26:0.26: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,24:0.32:-0.19:1.000:0.942 0/1/1/1:4:24,56:0.69: 0.15:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,26:0.57:-1.05:1.000:0.948 0/0/1/1:4:44,73:0.61: 1.38:1.000:0.730 0/0/1/1:4:36,42:0.51: 0.08:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,49:0.86:-0.62:1.000:0.973 0/1/1/1:4:38,76:0.65: 1.28:1.000:0.827 0/0/0/1:4:64,32:0.32: 0.68:1.000:0.964 0/1/1/1:4:35,106:0.75: 2.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,30:0.45:-0.42:1.000:0.980 0/0/0/1:4:52,24:0.30: 0.01:1.000:0.986 -chr8.1 13763988 chr8.1_013763988 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:189,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:123,41:.:-0.75:1.000:. ./.:4:246,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:144,65:.: 0.14:1.000:. ./.:4:80,34:.:-1.73:1.000:. ./.:4:131,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:57,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:66,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:118,42:.:-0.83:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:217,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:166,66:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,57:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,2:.:-3.11:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:186,52:.: 0.71:1.000:. ./.:4:131,45:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,16:.:-3.37:1.000:. ./.:4:186,76:.: 1.19:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:184,69:.: 1.01:1.000:. ./.:4:115,46:.:-0.81:1.000:. ./.:4:152,43:.:-0.13:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:13,7:.:-3.59:1.000:. ./.:4:50,1:.:-2.98:1.000:. ./.:3:17,12:.:-3.41:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:157,50:.: 0.10:1.000:. ./.:4:133,39:.:-0.59:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:205,81:.: 1.66:1.000:. ./.:4:200,57:.: 1.09:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:183,71:.: 1.03:1.000:. ./.:5:304,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:314,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:154,56:.: 0.16:1.000:. ./.:4:211,80:.: 1.76:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:196,67:.: 1.21:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:180,56:.: 0.67:1.000:. ./.:4:145,67:.: 0.20:1.000:. ./.:4:198,78:.: 1.46:1.000:. ./.:4:146,70:.: 0.28:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:166,55:.: 0.38:1.000:. ./.:6:156,22:.:-0.47:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:156,51:.: 0.10:1.000:. ./.:4:236,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:179,62:.: 0.77:1.000:. ./.:4:88,32:.:-1.61:1.000:. ./.:4:157,44:.:-0.02:1.000:. ./.:4:178,56:.: 0.64:0.887:. ./.:4:178,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:157,70:.: 0.50:0.999:. ./.:4:298,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:173,66:.: 0.73:1.000:. ./.:4:227,1:.: 0.52:1.000:. ./.:4:161,64:.: 0.46:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:176,61:.: 0.69:1.000:. ./.:4:158,61:.: 0.34:1.000:. ./.:4:183,50:.: 0.62:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.55:0.968:. ./.:4:277,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:155,59:.: 0.24:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:144,53:.:-0.10:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:104,60:.:-0.75:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:150,61:.: 0.18:1.000:. ./.:4:130,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:242,1:.: 0.81:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.46:0.960:. ./.:4:162,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:184,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:261,1:.: 1.19:0.993:. ./.:4:158,81:.: 0.73:1.000:. ./.:4:175,68:.: 0.81:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:159,55:.: 0.24:0.999:. ./.:4:238,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:131,53:.:-0.35:1.000:. ./.:4:161,61:.: 0.40:1.000:. ./.:4:145,51:.:-0.11:1.000:. ./.:4:169,50:.: 0.34:1.000:. ./.:4:156,45:.:-0.02:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,79:.: 1.33:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:192,54:.: 0.87:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:172,62:.: 0.64:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:170,45:.: 0.26:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:135,35:.:-0.63:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:161,44:.: 0.06:1.000:. ./.:4:113,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:114,36:.:-1.02:1.000:. ./.:4:191,76:.: 1.29:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:174,61:.: 0.65:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:146,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:173,77:.: 0.95:1.000:. ./.:4:142,60:.: 0.00:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:188,78:.: 1.27:1.000:. ./.:4:199,80:.: 1.52:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:142,40:.:-0.39:1.000:. ./.:4:202,85:.: 1.68:1.000:. ./.:4:155,43:.:-0.08:1.000:. ./.:4:133,58:.:-0.21:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:208,63:.: 1.37:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:178,64:.: 0.79:1.000:. ./.:4:148,59:.: 0.10:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:135,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:132,46:.:-0.47:1.000:. ./.:4:178,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:151,54:.: 0.06:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:120,61:.:-0.41:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.73:0.999:. ./.:4:135,54:.:-0.25:1.000:. ./.:4:129,54:.:-0.37:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:130,48:.:-0.47:1.000:. ./.:4:138,53:.:-0.21:1.000:. ./.:4:134,51:.:-0.33:1.000:. ./.:4:123,48:.:-0.61:1.000:. ./.:4:102,44:.:-1.10:1.000:. ./.:4:140,58:.:-0.08:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:134,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:127,48:.:-0.53:1.000:. ./.:4:185,60:.: 0.85:1.000:. ./.:4:149,66:.: 0.26:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.45:1.000:. -chr8.1 14266142 chr8.1_014266142 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:99,44:0.31: 1.24:1.000:0.978 0/0/1/1:4:50,40:0.44:-0.56:1.000:0.967 0/0/0/1:4:66,26:0.28:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,52:0.48: 0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,111:0.73: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:105,42:0.28: 1.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:34,6:0.15:-2.25:1.000:0.988 0/0/1/1:4:49,48:0.49:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,65:0.58: 0.09:1.000:0.907 0/1/1/1:4:15,42:0.71:-1.67:1.000:0.991 0/0/0/1:4:30,9:0.23:-2.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,47:0.35: 0.93:1.000:0.806 0/0/1/1:4:62,59:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,72:0.52: 1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,55:0.45: 0.46:1.000:0.983 0/0/1/1:4:64,67:0.51: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,26:0.24: 0.12:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,120:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,25:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,70:0.43: 1.85:1.000:0.948 0/0/1/1:4:20,21:0.51:-2.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,37:0.31: 0.42:1.000:0.974 0/0/0/1:4:96,39:0.29: 0.97:1.000:0.993 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.55:-2.83:1.000:0.976 0/0/0/1:4:41,14:0.25:-1.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,38:0.26: 1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:52,66:0.55: 0.39:1.000:0.981 0/0/0/1:4:94,37:0.28: 0.83:1.000:0.995 0/0/0/1:4:98,28:0.22: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,17:0.19:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,39:0.46:-0.79:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,17:0.88:-2.96:1.000:0.789 0/1/1/1:4:13,35:0.70:-1.98:1.000:0.986 0/0/1:3:18,6:0.25:-2.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,26:0.29:-0.56:1.000:0.993 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,43:0.46:-0.46:1.000:0.986 0/0/1/1:4:50,63:0.55: 0.22:1.000:0.983 0/0/0/1:4:75,29:0.28:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,42:0.48:-0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,45:0.49:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,77:0.62: 0.49:1.000:0.598 0/0/1/1:4:54,47:0.46:-0.18:1.000:0.988 0/0/0/0/1:5:126,36:0.22: 1.88:1.000:0.984 0/0/0/1:4:57,28:0.33:-0.73:1.000:0.930 0/0/1/1:4:32,33:0.50:-1.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:50,15:0.23:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,21:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,36:0.27: 0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:85,22:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,24:0.18: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,83:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,46:0.45:-0.15:1.000:0.976 0/1/1/1:4:36,86:0.68: 0.53:1.000:0.953 0/0/0/1:4:66,18:0.21:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,16:0.20:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:72,50:0.41: 0.53:1.000:0.594 0/0/1/1:4:87,82:0.48: 2.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:63,23:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/0/1:4:75,32:0.30: 0.02:1.000:0.987 0/1/1/1:4:22,60:0.70:-0.83:1.000:0.988 0/0/0/1:4:92,28:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,18:0.24:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,28:0.51:-1.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,103:0.78: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,37:0.40:-0.52:0.887:0.816 0/0/1/1:4:73,51:0.41: 0.59:1.000:0.849 0/0/0/1:4:90,27:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.25:-1.84:0.999:0.999 0/0/0/1:4:47,11:0.19:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,58:0.41: 1.10:1.000:0.884 0/0/1/1:4:48,56:0.53:-0.08:1.000:0.992 0/0/0/1:4:60,16:0.21:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,18:0.20:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,45:0.30: 1.54:1.000:0.989 0/1/1/1:4:26,99:0.76: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,56:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:59,15:0.20:-1.10:0.968:1.000 0/0/1/1:4:58,60:0.50: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,66:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/0/1:4:75,17:0.18:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,38:0.34: 0.15:1.000:0.867 0/0/1/1:4:58,75:0.55: 0.90:1.000:0.977 0/0/1/1:4:28,23:0.45:-1.88:1.000:0.976 0/1/1/1:4:19,71:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,27:0.29:-0.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:61,59:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:48,18:0.27:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,23:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,32:0.27: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,53:0.53:-0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:63,77:0.54: 1.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:56,38:0.40:-0.42:1.000:0.798 0/1/1/1:4:19,87:0.79:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,59:0.53: 0.12:1.000:0.993 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,37:0.27: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,13:0.29:-2.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,73:0.72:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,30:0.32:-0.49:1.000:0.941 0/0/1/1:4:66,66:0.49: 0.86:0.960:0.997 0/1/1/1:4:15,67:0.79:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,63:0.68:-0.56:1.000:0.940 0/1/1/1:4:24,66:0.71:-0.56:1.000:0.989 0/1/1/1:4:36,112:0.73: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,78:0.52: 1.41:0.993:0.995 0/0/1/1:4:55,61:0.52: 0.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,51:0.52:-0.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,103:0.70: 1.17:1.000:0.987 0/0/1/1:4:68,69:0.50: 1.03:0.999:0.997 0/0/0/1:4:97,27:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,40:0.49:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,29:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,40:0.47:-0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,25:0.40:-1.51:1.000:0.789 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,53:0.57:-0.56:1.000:0.932 0/0/1/1:4:58,68:0.53: 0.66:1.000:0.992 0/0/0/1:4:71,38:0.35: 0.09:1.000:0.823 0/0/1/1:4:62,54:0.46: 0.32:1.000:0.988 0/0/0/1:4:99,22:0.18: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,60:0.55: 0.02:1.000:0.980 0/0/1/1:4:56,63:0.52: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,29:0.38:-1.07:1.000:0.615 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,27:0.26:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,17:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,58:0.45: 0.73:1.000:0.978 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,36:0.25: 1.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,57:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:134,38:0.22: 2.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,114:0.72: 1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,56:0.47: 0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,48:0.52:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,52:0.44: 0.39:1.000:0.961 0/0/1/1:4:65,53:0.44: 0.39:1.000:0.974 0/0/1/1:4:70,58:0.45: 0.73:1.000:0.978 0/0/1/1:4:53,57:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,70:0.69:-0.32:1.000:0.980 0/0/0/1:4:118,38:0.24: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,34:0.25: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,59:0.51: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,58:0.52: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,30:0.23: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,57:0.46: 0.56:1.000:0.987 0/0/1/1:4:14,19:0.56:-2.49:1.000:0.962 0/0/1/1:4:47,32:0.40:-0.93:1.000:0.804 0/0/1/1:4:59,45:0.43:-0.08:1.000:0.943 0/1/1/1:4:33,109:0.74: 1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,79:0.55: 1.17:1.000:0.981 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,53:0.53:-0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,49:0.48:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,29:0.36:-0.86:1.000:0.737 0/0/1/1:4:37,48:0.55:-0.73:1.000:0.976 0/0/0/1:4:82,18:0.18:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,62:0.45: 1.00:1.000:0.981 0/0/0/1:4:92,25:0.21: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,55:0.45: 0.49:1.000:0.980 0/0/1/1:4:71,65:0.47: 1.00:0.999:0.993 0/0/0/1:4:97,32:0.25: 0.76:1.000:0.999 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:74,22:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,35:0.26: 0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,45:0.56:-0.93:1.000:0.971 0/0/1/1:4:48,58:0.54:-0.02:1.000:0.989 0/0/0/1:4:89,35:0.28: 0.59:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,78:0.55: 1.14:1.000:0.983 0/1/1/1:4:29,89:0.72: 0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,76:0.64: 0.29:1.000:0.687 0/0/1/1:4:67,59:0.46: 0.66:1.000:0.989 0/0/0/1:4:111,40:0.26: 1.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:96,43:0.31: 1.10:1.000:0.976 0/0/1/1:4:33,45:0.56:-0.96:1.000:0.960 0/0/1/1:4:64,55:0.46: 0.42:1.000:0.986 -chr8.1 14403668 chr8.1_014403668 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:189,189:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:154,139:0.46:-0.62:1.000:0.987 0/0/1/1:4:155,173:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:295,98:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:407,133:0.23: 2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:214,232:0.51: 1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,95:0.52:-1.92:1.000:0.994 0/0/0/1:4:262,103:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:158,168:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/0:4:200,4:0.02:-1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,174:0.77:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,176:0.55:-0.39:1.000:0.983 0/0/1/1:4:176,160:0.46:-0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:295,108:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:186,165:0.46: 0.03:1.000:0.984 0/0/0/1:4:269,121:0.29: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:225,217:0.48: 1.05:0.999:0.994 0/0/0/1:4:272,94:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,271:0.51: 1.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:315,101:0.22: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,55:0.26:-1.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:173,160:0.47:-0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:188,199:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,223:0.72:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,40:0.28:-2.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:309,124:0.27: 0.95:1.000:0.998 0/0/1/1:4:187,206:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:256,98:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:294,114:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,219:0.53: 0.57:1.000:0.991 0/0/1/1:4:193,198:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:207,80:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:107,1:0.01:-2.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,45:0.20:-1.61:1.000:1.000 0/0/1:3:69,51:0.41:-2.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:187,190:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,278:0.73: 0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,298:0.76: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,112:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:301,122:0.27: 0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:194,167:0.45: 0.15:1.000:0.977 0/0/0/1:4:285,92:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:455,10:0.02: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,199:0.53: 0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:166,155:0.47:-0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:309,118:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1/1:5:215,333:0.59: 2.25:1.000:0.967 0/1/1/1:4:181,743:0.78: 6.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,90:0.26:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,228:0.53: 0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:153,171:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:244,258:0.50: 1.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,139:0.51:-0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,104:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:321,6:0.02:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,113:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:276,14:0.04:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,199:0.52: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1:4:267,102:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:165,83:0.32:-1.12:1.000:0.910 0/0/0/1:4:224,104:0.30:-0.23:1.000:0.987 0/1/1/1:4:85,248:0.72:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:208,222:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/0:4:364,10:0.02: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,285:0.75: 0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:194,211:0.51: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:161,62:0.26:-1.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:294,5:0.02:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,71:0.22:-0.63:0.887:1.000 0/0/1/1:4:189,189:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,205:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:199,80:0.27:-0.78:0.999:0.998 0/1/1/1:4:105,371:0.75: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,107:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,190:0.48: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,173:0.58:-0.67:1.000:0.898 0/0/1/1:4:172,186:0.51: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,165:0.51:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:362,8:0.02: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:423,17:0.04: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,162:0.71:-1.42:0.968:0.990 0/0/1/1:4:226,243:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:157,174:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,243:0.76:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,191:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:310,131:0.28: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:172,60:0.24:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,83:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,171:0.53:-0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:152,154:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,122:0.52:-1.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,185:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:217,193:0.46: 0.70:1.000:0.985 0/0/0/1:4:207,68:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,179:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:289,111:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/0:4:323,7:0.02:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,180:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:96,329:0.75: 0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,334:0.75: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,126:0.51:-1.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:269,85:0.22: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,114:0.50:-1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,149:0.46:-0.39:0.960:0.988 0/0/0/0:4:259,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,104:0.28: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:229,97:0.28:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:342,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:232,220:0.47: 1.17:0.993:0.993 0/0/0/1:4:260,92:0.24: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:267,108:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/0/0:4:476,0:0.00: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,88:0.26:-0.37:0.999:0.999 0/1/1/1:4:86,251:0.72:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:140,67:0.30:-1.58:1.000:0.981 0/0/1/1:4:184,189:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,90:0.28:-0.49:1.000:0.997 0/0/0/1:4:203,83:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/1/1/1:4:79,246:0.73:-0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:149,150:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:299,110:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,291:0.75: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:341,9:0.02: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,165:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:80,337:0.78: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,180:0.47: 0.28:1.000:0.992 0/0/0/1:4:242,93:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,109:0.48:-1.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,195:0.76:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,181:0.75:-1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,170:0.54:-0.47:1.000:0.987 0/0/0/1:4:234,99:0.28:-0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,174:0.70:-1.20:1.000:0.985 0/0/1/1:4:179,185:0.49: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:251,65:0.19:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,227:0.48: 1.21:1.000:0.996 0/0/0/0:4:375,12:0.03: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,71:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,69:0.24:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,179:0.48: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:255,96:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:250,93:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,124:0.43:-0.79:1.000:0.948 0/0/0/0:4:241,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:231,214:0.47: 1.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:256,253:0.48: 1.81:1.000:0.995 0/1/1/1:4:103,283:0.71: 0.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:238,109:0.29:-0.01:1.000:0.989 0/1/1/1:4:103,332:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:227,104:0.29:-0.19:1.000:0.989 0/0/0/1:4:298,114:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:250,82:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,82:0.45:-1.91:1.000:0.975 0/0/1/1:4:62,96:0.59:-2.13:1.000:0.863 0/0/0/0:4:380,13:0.03: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:386,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,102:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,305:0.73: 0.64:1.000:0.998 0/1/1/1:4:75,193:0.70:-0.90:1.000:0.983 0/0/0/1:4:294,109:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/0/0/1:4:238,74:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:238,95:0.26:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:175,167:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:258,87:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,104:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,194:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:146,163:0.51:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,167:0.48:-0.12:0.999:0.995 0/0/1/1:4:159,181:0.52:-0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:114,150:0.55:-0.94:1.000:0.977 0/0/1/1:4:127,108:0.44:-1.27:1.000:0.973 0/1/1/1:4:59,223:0.77:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,159:0.52:-0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:247,93:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:350,9:0.02: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,55:0.25:-1.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:317,116:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:344,98:0.20: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:340,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:284,23:0.07:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:284,113:0.26: 0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:235,210:0.46: 1.09:1.000:0.986 0/0/0/1:4:309,133:0.28: 1.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,155:0.51:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:184,195:0.50: 0.35:1.000:0.997 -chr8.1 14510449 chr8.1_014510449 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:90,106:.: 1.21:1.000:. ./.:4:96,67:.: 0.46:1.000:. ./.:4:74,76:.: 0.17:1.000:. ./.:4:94,43:.:-0.13:1.000:. ./.:4:115,73:.: 1.03:1.000:. ./.:4:140,88:.: 1.94:1.000:. ./.:4:45,9:.:-2.02:1.000:. ./.:4:110,59:.: 0.60:1.000:. ./.:4:73,72:.: 0.05:1.000:. ./.:4:9,6:.:-2.91:1.000:. ./.:4:20,2:.:-2.75:1.000:. ./.:4:149,69:.: 1.72:1.000:. ./.:4:100,55:.: 0.28:1.000:. ./.:4:81,104:.: 0.96:1.000:. ./.:4:102,56:.: 0.35:1.000:. ./.:4:103,98:.: 1.33:1.000:. ./.:4:82,107:.: 1.05:0.999:. ./.:4:113,100:.: 1.60:1.000:. ./.:4:109,76:.: 0.96:1.000:. ./.:4:87,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:6,4:.:-3.03:1.000:. ./.:4:91,74:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,66:.: 0.46:1.000:. ./.:4:84,58:.:-0.02:1.000:. ./.:4:3,1:.:-3.16:1.000:. ./.:4:69,52:.:-0.50:1.000:. ./.:4:92,104:.: 1.21:1.000:. ./.:4:82,90:.: 0.67:1.000:. ./.:4:80,79:.: 0.37:1.000:. ./.:4:121,48:.: 0.60:1.000:. ./.:4:84,27:.:-0.72:1.000:. ./.:4:80,94:.: 0.71:1.000:. ./.:4:6,3:.:-3.05:1.000:. ./.:4:8,12:.:-2.80:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:81,79:.: 0.39:1.000:. ./.:4:96,70:.: 0.53:1.000:. ./.:4:128,75:.: 1.37:1.000:. ./.:4:75,52:.:-0.36:1.000:. ./.:4:78,92:.: 0.62:1.000:. ./.:4:66,76:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,69:.:-0.15:1.000:. ./.:4:66,61:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,57:.:-0.43:1.000:. ./.:4:94,66:.: 0.39:1.000:. ./.:4:81,58:.:-0.08:1.000:. ./.:5:121,100:.: 1.78:1.000:. ./.:4:77,16:.:-1.13:1.000:. ./.:4:67,34:.:-0.95:1.000:. ./.:4:72,29:.:-0.95:1.000:. ./.:4:56,47:.:-0.91:1.000:. ./.:4:101,85:.: 0.99:1.000:. ./.:4:70,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:63,84:.: 0.10:1.000:. ./.:4:94,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:83,38:.:-0.50:1.000:. ./.:4:91,60:.: 0.19:1.000:. ./.:4:40,39:.:-1.45:1.000:. ./.:4:61,66:.:-0.36:1.000:. ./.:6:48,53:.:-0.95:1.000:. ./.:4:92,83:.: 0.74:1.000:. ./.:4:117,43:.: 0.39:1.000:. ./.:4:77,57:.:-0.20:1.000:. ./.:4:45,37:.:-1.38:1.000:. ./.:4:120,78:.: 1.26:1.000:. ./.:4:91,56:.: 0.10:1.000:. ./.:4:39,17:.:-1.98:1.000:. ./.:4:90,63:.: 0.23:1.000:. ./.:4:67,49:.:-0.61:0.887:. ./.:4:91,88:.: 0.83:1.000:. ./.:4:56,55:.:-0.72:1.000:. ./.:4:27,13:.:-2.34:0.999:. ./.:4:81,43:.:-0.43:1.000:. ./.:4:115,65:.: 0.85:1.000:. ./.:4:108,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:75,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:66,63:.:-0.31:1.000:. ./.:4:93,70:.: 0.46:1.000:. ./.:4:113,76:.: 1.05:1.000:. ./.:4:60,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:71,42:.:-0.68:0.968:. ./.:4:80,44:.:-0.43:1.000:. ./.:4:89,45:.:-0.20:1.000:. ./.:4:103,69:.: 0.67:1.000:. ./.:4:56,44:.:-0.97:1.000:. ./.:4:95,58:.: 0.23:1.000:. ./.:4:55,43:.:-1.02:1.000:. ./.:4:86,28:.:-0.65:1.000:. ./.:4:70,61:.:-0.27:1.000:. ./.:4:98,59:.: 0.33:1.000:. ./.:4:65,31:.:-1.07:1.000:. ./.:4:54,56:.:-0.75:1.000:. ./.:4:96,97:.: 1.15:1.000:. ./.:4:75,56:.:-0.27:1.000:. ./.:4:103,70:.: 0.69:1.000:. ./.:4:71,36:.:-0.81:1.000:. ./.:4:69,44:.:-0.68:1.000:. ./.:4:90,51:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,68:.:-0.15:1.000:. ./.:4:107,77:.: 0.94:1.000:. ./.:4:20,26:.:-2.20:1.000:. ./.:4:87,74:.: 0.42:1.000:. ./.:4:47,55:.:-0.93:1.000:. ./.:4:73,50:.:-0.45:0.960:. ./.:4:38,50:.:-1.25:1.000:. ./.:4:101,48:.: 0.14:1.000:. ./.:4:86,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:77,88:.: 0.51:1.000:. ./.:4:91,80:.: 0.64:0.993:. ./.:4:106,73:.: 0.83:1.000:. ./.:4:94,42:.:-0.15:1.000:. ./.:4:88,90:.: 0.80:1.000:. ./.:4:81,53:.:-0.20:0.999:. ./.:4:97,72:.: 0.60:1.000:. ./.:4:62,43:.:-0.86:1.000:. ./.:4:102,45:.: 0.10:1.000:. ./.:4:68,51:.:-0.54:1.000:. ./.:4:60,37:.:-1.04:1.000:. ./.:4:87,39:.:-0.38:1.000:. ./.:4:64,38:.:-0.93:1.000:. ./.:4:116,57:.: 0.69:1.000:. ./.:4:69,43:.:-0.70:1.000:. ./.:4:59,81:.:-0.06:1.000:. ./.:4:83,100:.: 0.92:1.000:. ./.:4:86,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:88,58:.: 0.07:1.000:. ./.:4:81,46:.:-0.36:1.000:. ./.:4:67,47:.:-0.65:1.000:. ./.:4:65,31:.:-1.07:1.000:. ./.:4:61,42:.:-0.91:1.000:. ./.:4:81,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:112,85:.: 1.24:1.000:. ./.:4:60,42:.:-0.93:1.000:. ./.:4:108,77:.: 0.96:1.000:. ./.:4:69,97:.: 0.53:1.000:. ./.:4:99,70:.: 0.60:1.000:. ./.:4:105,60:.: 0.51:1.000:. ./.:4:54,52:.:-0.84:1.000:. ./.:4:80,62:.:-0.02:1.000:. ./.:4:65,76:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,31:.:-1.00:1.000:. ./.:4:65,38:.:-0.91:1.000:. ./.:4:85,53:.:-0.11:1.000:. ./.:4:42,59:.:-0.95:1.000:. ./.:4:126,60:.: 0.99:1.000:. ./.:4:110,74:.: 0.94:1.000:. ./.:4:111,86:.: 1.24:1.000:. ./.:4:111,80:.: 1.10:1.000:. ./.:4:145,77:.: 1.81:1.000:. ./.:4:112,76:.: 1.03:1.000:. ./.:4:97,87:.: 0.94:1.000:. ./.:4:100,85:.: 0.96:1.000:. ./.:4:12,5:.:-2.87:1.000:. ./.:4:95,31:.:-0.38:1.000:. ./.:4:63,63:.:-0.38:1.000:. ./.:4:77,76:.: 0.23:1.000:. ./.:4:135,72:.: 1.46:1.000:. ./.:4:96,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,109:.: 1.15:1.000:. ./.:4:81,92:.: 0.69:1.000:. ./.:4:115,73:.: 1.03:1.000:. ./.:4:68,84:.: 0.21:1.000:. ./.:4:105,60:.: 0.51:1.000:. ./.:4:84,109:.: 1.15:1.000:. ./.:4:62,82:.: 0.03:1.000:. ./.:4:117,47:.: 0.48:1.000:. ./.:4:103,75:.: 0.80:1.000:. ./.:4:106,93:.: 1.28:0.999:. ./.:4:100,60:.: 0.39:1.000:. ./.:4:61,72:.:-0.22:1.000:. ./.:4:89,102:.: 1.10:1.000:. ./.:4:98,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:110,52:.: 0.44:1.000:. ./.:4:76,107:.: 0.92:1.000:. ./.:4:37,52:.:-1.22:1.000:. ./.:4:78,88:.: 0.53:1.000:. ./.:4:94,67:.: 0.42:1.000:. ./.:4:89,82:.: 0.64:1.000:. ./.:4:67,80:.: 0.10:1.000:. ./.:4:70,70:.:-0.06:1.000:. ./.:4:118,47:.: 0.51:1.000:. ./.:4:100,88:.: 1.03:1.000:. ./.:4:86,98:.: 0.94:1.000:. ./.:4:85,47:.:-0.24:1.000:. ./.:4:104,75:.: 0.83:1.000:. -chr8.1 15634371 chr8.1_015634371 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:18,6:0.28: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,9:0.54:-0.77:1.000:0.987 0/0/1/1:4:9,14:0.57: 0.16:1.000:0.942 0/0/0/1:4:12,2:0.16:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,12:0.40: 1.22:1.000:0.777 0/0/0/1:4:10,4:0.31:-1.03:1.000:0.977 0/0/0/1:4:10,2:0.19:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-1.43:1.000:0.747 0/0/0/1:4:15,7:0.34: 0.03:1.000:0.890 0/1/1/1:4:4,16:0.70:-0.24:1.000:0.983 0/0/0/0:4:29,1:0.04: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.44: 0.82:1.000:0.960 0/0/0/1:4:20,9:0.33: 0.95:1.000:0.924 0/1/1/1:4:8,19:0.63: 0.69:1.000:0.622 0/0/1/1:4:11,7:0.40:-0.50:1.000:0.791 0/0/0/1:4:13,5:0.30:-0.50:1.000:0.985 0/0/0/0:4:13,1:0.08:-1.03:0.999:0.988 0/0/0/1:4:11,5:0.33:-0.77:1.000:0.916 0/0/1/1:4:14,9:0.40: 0.16:1.000:0.809 0/0/1/1:4:10,9:0.48:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,6:0.41:-0.90:1.000:0.864 0/0/0/0:4:17,1:0.06:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,4:0.17: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,1:0.19:-2.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.77:1.000:0.663 0/0/0/1:4:14,4:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,2:0.23:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-0.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:7,3:0.32:-1.56:1.000:0.954 0/0/0/1:4:9,1:0.11:-1.56:1.000:0.563 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-1.56:1.000:0.864 0/0/1/1:4:6,10:0.58:-0.77:1.000:0.903 0/0/0/1:4:13,6:0.33:-0.37:1.000:0.902 0/0/0:3:3,0:0.00:-2.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.77:1.000:0.663 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.53:-1.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:8,12:0.57:-0.24:1.000:0.956 0/0/1/1:4:17,10:0.38: 0.69:1.000:0.612 0/0/0/1:4:23,5:0.20: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,18:0.74:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:11,4:0.29:-0.90:1.000:0.992 0/0/1/1:4:23,13:0.38: 1.88:1.000:0.503 0/0/1/1:4:12,12:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:21,9:0.32: 1.08:1.000:0.709 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,2:0.14:-0.77:1.000:0.969 0/0/1/1:4:11,18:0.58: 0.95:1.000:0.915 0/0/1/1:4:10,14:0.56: 0.29:1.000:0.974 0/0/0/1:4:17,5:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,8:0.35: 0.29:1.000:0.792 0/1/1/1:4:7,24:0.68: 1.22:1.000:0.956 0/0/0/1:4:10,5:0.35:-0.90:1.000:0.792 0/0/0/0:4:26,2:0.08: 0.82:1.000:0.988 0/0/0/1:4:14,5:0.29:-0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:22,7:0.27: 0.95:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,22:0.69: 0.82:1.000:0.971 0/0/0/0/1/1:6:23,10:0.32: 1.48:1.000:0.918 0/0/0/1:4:21,6:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,5:0.16: 1.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,7:0.30: 0.42:1.000:0.983 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,7:0.42:-0.64:1.000:0.916 0/0/0/1:4:11,6:0.37:-0.64:1.000:0.594 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,19:0.43: 3.07:0.887:0.947 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,8:0.26: 1.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,11:0.65:-0.90:0.999:0.827 0/0/1/1:4:18,12:0.41: 1.08:1.000:0.864 0/0/0/1:4:14,2:0.14:-0.77:1.000:0.969 0/0/0/1:4:16,4:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,3:0.18:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,16:0.61: 0.29:1.000:0.691 0/0/1/1:4:18,16:0.47: 1.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,17:0.52: 1.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,26:0.71: 1.35:1.000:0.990 0/0/0/1:4:18,6:0.28: 0.29:0.968:0.997 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,8:0.33: 0.55:1.000:0.933 0/0/0/1:4:25,3:0.12: 0.82:1.000:0.774 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-0.77:1.000:0.973 0/0/0/1:4:21,8:0.30: 0.95:1.000:0.987 0/0/1/1:4:12,9:0.44:-0.11:1.000:0.960 0/0/0/1:4:15,3:0.19:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.23:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.45: 0.69:1.000:0.980 0/0/1/1:4:17,12:0.42: 0.95:1.000:0.923 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-1.70:1.000:0.852 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,5:0.23: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.52:-0.64:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,8:0.29: 1.08:1.000:0.992 0/0/0/1:4:23,7:0.26: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,12:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,10:0.34: 1.22:1.000:0.867 0/0/1/1:4:15,10:0.41: 0.42:1.000:0.864 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 2.41:0.960:1.000 0/0/1/1:4:17,16:0.49: 1.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,11:0.42: 0.69:1.000:0.900 0/0/0/1:4:24,6:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.59:-0.37:1.000:0.882 0/0/0/1:4:30,10:0.28: 2.41:0.993:0.997 0/0/0/1:4:15,4:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,10:0.40: 0.55:1.000:0.756 0/0/0/1:4:17,8:0.34: 0.42:0.999:0.881 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.29:-0.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:22,9:0.31: 1.22:1.000:0.971 0/0/0/1:4:15,2:0.13:-0.64:1.000:0.929 0/0/0/1:4:20,5:0.23: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,8:0.33: 0.55:1.000:0.933 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,30:0.60: 3.20:1.000:0.787 0/0/1/1:4:9,6:0.41:-0.90:1.000:0.864 0/0/0/1:4:18,4:0.20: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.28:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,12:0.34: 2.01:1.000:0.857 0/0/0/1:4:15,6:0.31:-0.11:1.000:0.977 0/0/0/0:4:24,2:0.09: 0.55:1.000:0.967 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.44: 0.16:1.000:0.969 0/0/0/1:4:20,3:0.15: 0.16:1.000:0.983 0/0/0/1:4:14,3:0.20:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,2:0.14:-0.77:1.000:0.969 0/0/0/1:4:10,3:0.26:-1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,7:0.29: 0.55:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,6:0.44:-1.03:1.000:0.960 0/0/1/1:4:17,11:0.40: 0.82:1.000:0.820 0/0/1/1:4:10,12:0.53: 0.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:22,6:0.24: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,2:0.09: 0.42:1.000:0.945 0/0/0/1:4:23,4:0.17: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,5:0.30:-0.50:1.000:0.985 0/0/1/1:4:12,15:0.54: 0.69:1.000:0.989 0/0/0/1:4:24,6:0.23: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,1:0.05:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,7:0.28: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,9:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/0/0/0:4:14,1:0.07:-0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:11,5:0.33:-0.77:1.000:0.916 0/1/1/1:4:4,14:0.68:-0.50:1.000:0.962 0/0/1/1:4:10,12:0.53: 0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,5:0.43:-1.30:1.000:0.932 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.90:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,18:0.77:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,15:0.52: 0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:15,9:0.39: 0.29:1.000:0.663 0/0/0/1:4:15,3:0.19:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,9:0.42: 0.03:1.000:0.906 0/0/1/1:4:16,13:0.45: 0.95:1.000:0.983 0/0/0/1:4:18,3:0.16:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,4:0.25:-0.50:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,7:0.68:-1.70:1.000:0.962 0/0/1/1:4:9,7:0.44:-0.77:1.000:0.973 0/0/0/1:4:6,3:0.35:-1.70:1.000:0.792 0/0/0/0:4:16,1:0.07:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,5:0.22: 0.55:0.999:1.000 0/0/0/0:4:20,1:0.05:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.17:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,13:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,2:0.23:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.56:-0.64:1.000:0.970 0/1/1/1:4:3,13:0.71:-0.77:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,13:0.67:-0.64:1.000:0.939 0/0/1/1:4:9,8:0.47:-0.64:1.000:0.993 0/1/1/1:4:1,11:0.78:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,12:0.59:-0.37:1.000:0.882 0/0/1/1:4:10,9:0.48:-0.37:1.000:0.994 0/0/0/1:4:14,2:0.14:-0.77:1.000:0.969 0/0/0/0:4:21,1:0.05: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.26:-0.11:1.000:0.998 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,6:0.33:-0.37:1.000:0.902 -chr8.1 15724866 chr8.1_015724866 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:117,157:0.56: 0.71:1.000:0.963 0/0/1/1:4:92,146:0.60: 0.15:1.000:0.751 0/0/1/1:4:144,147:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:142,82:0.35:-0.06:1.000:0.828 0/0/0/1:4:216,85:0.26: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,215:0.69: 1.26:1.000:0.970 0/1/1/1:4:50,119:0.70:-0.90:1.000:0.984 0/0/0/1:4:162,75:0.29: 0.14:1.000:0.990 0/0/1/1:4:133,176:0.56: 1.24:1.000:0.969 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-2.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,58:0.75:-2.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,222:0.62: 1.95:1.000:0.611 0/0/1/1:4:132,161:0.54: 1.00:1.000:0.989 0/0/0/1:4:190,74:0.26: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,145:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:178,98:0.33: 0.74:1.000:0.902 0/0/1/1:4:163,172:0.50: 1.64:0.999:0.997 0/0/0/0:4:277,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,177:0.75: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,92:0.35: 0.31:1.000:0.784 0/0/0/1:4:33,19:0.35:-2.70:1.000:0.834 0/0/1/1:4:126,137:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:77,154:0.66: 0.05:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,229:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,14:0.29:-2.80:1.000:0.993 0/0/0/1:4:185,76:0.27: 0.51:1.000:0.998 0/0/1/1:4:143,175:0.54: 1.38:1.000:0.988 0/0/0/1:4:166,81:0.31: 0.29:1.000:0.979 0/0/1/1:4:133,91:0.39:-0.06:1.000:0.668 0/1/1/1:4:85,179:0.67: 0.55:1.000:0.927 0/1/1/1:4:95,212:0.68: 1.21:1.000:0.964 0/0/0/1:4:208,73:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-3.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,37:0.42:-2.20:1.000:0.928 0/0/1:3:10,7:0.39:-3.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,180:0.55: 1.46:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,249:1.00: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,214:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,88:0.24: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,80:0.24: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,148:0.52: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:206,76:0.25: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,151:0.68:-0.11:1.000:0.945 0/0/1/1:4:135,181:0.56: 1.35:1.000:0.964 0/0/1/1:4:120,78:0.38:-0.46:1.000:0.504 0/0/1/1/1:5:149,265:0.63: 2.85:1.000:0.949 0/1/1/1:4:101,229:0.69: 1.56:1.000:0.970 0/0/0/1:4:107,60:0.34:-0.93:1.000:0.878 0/1/1/1:4:52,131:0.71:-0.69:1.000:0.992 0/0/1/1:4:97,139:0.58: 0.12:1.000:0.918 0/1/1/1:4:69,189:0.73: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,167:0.63: 0.52:1.000:0.553 0/0/0/1:4:144,87:0.36: 0.05:1.000:0.724 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,76:0.34:-0.23:1.000:0.892 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,133:0.53: 0.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:109,59:0.33:-0.92:1.000:0.920 0/0/0/1/1/1:6:111,96:0.45:-0.32:1.000:0.734 0/0/0/1:4:184,91:0.31: 0.72:1.000:0.975 0/1/1/1:4:60,206:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,163:0.59: 0.68:1.000:0.866 0/0/0/0:4:176,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,252:0.76: 1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,130:0.73:-0.78:1.000:0.998 0/0/1/1:4:71,71:0.49:-1.32:1.000:0.996 0/0/0/0:4:174,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,82:0.41:-0.57:0.887:0.877 0/0/1/1:4:102,141:0.57: 0.23:1.000:0.947 0/0/1/1:4:132,180:0.57: 1.29:1.000:0.955 0/0/0/1:4:77,47:0.36:-1.59:0.999:0.696 0/1/1/1:4:63,252:0.80: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,70:0.34:-0.52:1.000:0.868 0/0/1/1:4:105,155:0.59: 0.49:1.000:0.884 0/1/1/1:4:84,156:0.64: 0.19:1.000:0.715 0/0/1/1:4:122,136:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,150:0.78:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:181,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,185:0.83:-0.08:0.968:0.999 0/0/1/1:4:120,133:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,169:0.54: 1.20:1.000:0.987 0/1/1/1:4:49,183:0.79: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,188:0.57: 1.46:1.000:0.942 0/0/0/1:4:132,79:0.35:-0.26:1.000:0.749 0/0/0/1:4:122,56:0.29:-0.76:1.000:0.991 0/0/0/1:4:169,78:0.29: 0.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:97,119:0.54:-0.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:130,131:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,145:0.76:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,127:0.51: 0.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,147:0.51: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:90,41:0.29:-1.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:142,147:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:146,83:0.34: 0.02:1.000:0.856 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,145:0.60: 0.14:1.000:0.767 0/1/1/1:4:38,208:0.84: 0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,240:0.83: 0.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,88:0.54:-1.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:195,84:0.28: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,106:0.55:-0.58:1.000:0.983 0/0/1/1:4:82,121:0.59:-0.38:0.960:0.885 0/0/0/0:4:192,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,54:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,54:0.23:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:233,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,180:0.58: 1.20:0.993:0.921 0/0/1/1:4:121,92:0.41:-0.23:1.000:0.891 0/0/1/1:4:85,83:0.48:-0.92:1.000:0.995 0/0/0/0:4:339,0:0.00: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,52:0.31:-1.09:0.999:0.975 0/1/1/1:4:70,224:0.76: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,51:0.36:-1.45:1.000:0.640 0/1/1/1:4:55,142:0.72:-0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:106,60:0.34:-0.95:1.000:0.863 0/0/1/1:4:105,83:0.42:-0.61:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,209:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,99:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,67:0.33:-0.57:1.000:0.922 0/1/1/1:4:45,122:0.73:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,171:0.51: 1.56:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,208:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,144:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,78:0.41:-0.70:1.000:0.872 0/0/1/1:4:107,133:0.54: 0.19:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,174:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,163:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:42,152:0.78:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,82:0.35:-0.09:1.000:0.799 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,145:0.66:-0.17:1.000:0.877 0/0/0/1:4:165,70:0.27: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,215:0.58: 2.10:1.000:0.918 0/0/0/0:4:180,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,79:0.36:-0.29:1.000:0.708 0/0/0/1:4:90,54:0.36:-1.29:1.000:0.742 0/0/1/1:4:89,121:0.57:-0.27:1.000:0.957 0/0/1/1:4:88,60:0.39:-1.22:1.000:0.658 0/0/0/1:4:118,75:0.37:-0.53:1.000:0.571 0/0/1/1:4:108,137:0.55: 0.26:1.000:0.982 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,172:0.73: 0.09:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,205:0.70: 0.94:1.000:0.988 0/1/1/1:4:81,256:0.76: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,79:0.40:-0.57:1.000:0.751 1/1/1/1:4:0,281:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,76:0.37:-0.49:1.000:0.583 0/0/0/1:4:141,82:0.35:-0.08:1.000:0.814 0/0/0/1:4:202,83:0.27: 0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,31:0.41:-2.37:1.000:0.847 0/0/1/1:4:100,132:0.56: 0.06:1.000:0.970 0/0/0/0:4:219,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:249,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,104:0.39: 0.38:1.000:0.724 1/1/1/1:4:1,237:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,205:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,87:0.30: 0.66:1.000:0.986 0/0/0/1:4:105,66:0.37:-0.87:1.000:0.607 0/0/1/1:4:101,71:0.39:-0.86:1.000:0.743 0/0/1/1:4:126,156:0.54: 0.83:1.000:0.986 0/0/0/1:4:121,69:0.34:-0.58:1.000:0.851 0/0/0/1:4:225,78:0.23: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,167:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,165:0.61: 0.57:1.000:0.646 0/0/1/1:4:98,135:0.57: 0.08:0.999:0.949 0/1/1/1:4:53,146:0.73:-0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,167:0.73:-0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,141:0.54: 0.43:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,234:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,133:0.69:-0.57:1.000:0.974 0/0/0/1:4:97,61:0.37:-1.07:1.000:0.605 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,80:0.43:-0.72:1.000:0.934 0/0/0/1:4:171,105:0.36: 0.74:1.000:0.679 0/0/0/1:4:205,85:0.27: 0.95:1.000:0.998 0/0/0/0:4:278,1:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,21:0.10:-0.55:1.000:0.813 0/0/1/1:4:154,105:0.39: 0.48:1.000:0.658 0/1/1/1:4:79,210:0.72: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:147,81:0.33: 0.00:1.000:0.901 0/0/1/1:4:131,143:0.51: 0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,156:0.62: 0.32:1.000:0.596 -chr8.1 15787828 chr8.1_015787828 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,93:.: 0.89:1.000:. ./.:4:47,41:.: 0.02:1.000:. ./.:4:63,56:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.25:1.000:. ./.:4:33,75:.: 0.53:1.000:. ./.:4:38,87:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.53:1.000:. ./.:4:22,85:.: 0.51:1.000:. ./.:4:10,4:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.82:1.000:. ./.:4:35,70:.: 0.46:1.000:. ./.:4:23,65:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,51:.: 0.25:1.000:. ./.:4:22,97:.: 0.81:1.000:. ./.:4:24,100:.: 0.94:1.000:. ./.:4:28,86:.: 0.69:0.999:. ./.:4:33,118:.: 1.63:1.000:. ./.:4:30,65:.: 0.20:1.000:. ./.:4:27,61:.: 0.02:1.000:. ./.:4:8,9:.:-1.79:1.000:. ./.:4:38,96:.: 1.20:1.000:. ./.:4:1,93:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.95:1.000:. ./.:4:71,49:.: 0.84:1.000:. ./.:4:48,125:.: 2.19:1.000:. ./.:4:27,101:.: 1.04:1.000:. ./.:4:55,23:.:-0.23:1.000:. ./.:4:28,80:.: 0.53:1.000:. ./.:4:3,111:.: 0.69:1.000:. ./.:4:73,75:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.07:1.000:. ./.:4:6,11:.:-1.79:1.000:. ./.:3:1,6:.:-2.05:1.000:. ./.:4:18,104:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:58,59:.: 0.76:1.000:. ./.:4:67,55:.: 0.89:1.000:. ./.:4:23,80:.: 0.41:1.000:. ./.:4:31,76:.: 0.51:1.000:. ./.:4:56,21:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,49:.:-0.46:1.000:. ./.:4:20,57:.:-0.26:1.000:. ./.:4:33,66:.: 0.30:1.000:. ./.:5:25,135:.: 1.86:1.000:. ./.:4:1,376:.: 7.41:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,70:.: 0.38:1.000:. ./.:4:36,37:.:-0.36:1.000:. ./.:4:35,65:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,62:.:-0.11:1.000:. ./.:4:55,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:29,56:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.35:1.000:. ./.:4:18,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,95:.: 0.89:1.000:. ./.:4:40,20:.:-0.69:1.000:. ./.:6:18,48:.:-0.54:1.000:. ./.:4:24,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,130:.: 1.09:1.000:. ./.:4:21,78:.: 0.30:1.000:. ./.:4:17,47:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,138:.: 1.30:1.000:. ./.:4:21,63:.:-0.08:1.000:. ./.:4:10,18:.:-1.51:1.000:. ./.:4:25,35:.:-0.69:1.000:. ./.:4:16,48:.:-0.59:0.887:. ./.:4:0,83:.:-0.11:1.000:. ./.:4:17,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:24,24:.:-1.00:0.999:. ./.:4:38,109:.: 1.53:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.21:1.000:. ./.:4:25,87:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:22,45:.:-0.51:1.000:. ./.:4:18,48:.:-0.54:1.000:. ./.:4:55,28:.:-0.11:1.000:. ./.:4:17,60:.:-0.26:0.968:. ./.:4:0,104:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,95:.: 0.20:1.000:. ./.:4:21,70:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.77:1.000:. ./.:4:33,33:.:-0.54:1.000:. ./.:4:24,58:.:-0.13:1.000:. ./.:4:28,28:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,69:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:12,63:.:-0.31:1.000:. ./.:4:64,47:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,84:.:-0.08:1.000:. ./.:4:16,27:.:-1.13:1.000:. ./.:4:17,51:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,62:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.53:1.000:. ./.:4:21,20:.:-1.18:1.000:. ./.:4:20,65:.:-0.05:1.000:. ./.:4:19,14:.:-1.38:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.46:0.960:. ./.:4:35,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:28,60:.: 0.02:1.000:. ./.:4:16,84:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,45:.: 0.30:1.000:. ./.:4:34,98:.: 1.15:0.993:. ./.:4:0,70:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.62:1.000:. ./.:4:84,91:.: 2.24:1.000:. ./.:4:18,35:.:-0.87:0.999:. ./.:4:0,102:.: 0.38:1.000:. ./.:4:16,41:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,38:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.80:1.000:. ./.:4:14,66:.:-0.18:1.000:. ./.:4:16,39:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.59:1.000:. ./.:4:47,28:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,124:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.44:1.000:. ./.:4:15,52:.:-0.51:1.000:. ./.:4:15,32:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.80:1.000:. ./.:4:21,37:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,96:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.69:1.000:. ./.:4:24,67:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,118:.: 2.12:1.000:. ./.:4:21,40:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,34:.:-1.10:1.000:. ./.:4:7,27:.:-1.36:1.000:. ./.:4:15,57:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.18:1.000:. ./.:4:26,69:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,36:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.02:1.000:. ./.:4:27,100:.: 1.02:1.000:. ./.:4:24,54:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,106:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,48:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,29:.: 0.48:1.000:. ./.:4:53,66:.: 0.81:1.000:. ./.:4:8,13:.:-1.69:1.000:. ./.:4:16,68:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,52:.: 0.89:1.000:. ./.:4:38,51:.: 0.05:1.000:. ./.:4:31,68:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,68:.: 0.00:1.000:. ./.:4:53,67:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.05:1.000:. ./.:4:17,53:.:-0.44:1.000:. ./.:4:29,92:.: 0.86:1.000:. ./.:4:28,47:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,147:.: 2.68:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.02:1.000:. ./.:4:26,70:.: 0.23:0.999:. ./.:4:0,88:.: 0.02:1.000:. ./.:4:37,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:56,44:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.44:1.000:. ./.:4:23,46:.:-0.46:1.000:. ./.:4:40,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:41,23:.:-0.59:1.000:. ./.:4:30,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,45:.: 0.74:1.000:. ./.:4:42,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:64,62:.: 0.99:1.000:. ./.:4:30,45:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,127:.: 1.02:1.000:. ./.:4:30,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.15:1.000:. ./.:4:35,74:.: 0.56:1.000:. -chr8.1 15968190 chr8.1_015968190 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:55,24:0.26: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,36:0.61:-0.10:1.000:0.659 0/0/1/1:4:27,46:0.60: 0.77:1.000:0.773 0/0/0/1:4:43,14:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,28:0.27: 1.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,35:0.55: 0.16:1.000:0.975 0/0/0/1:4:20,4:0.14:-1.75:1.000:0.967 0/0/0/1:4:46,16:0.22: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.20:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,46:0.78:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,1:0.12:-2.63:1.000:0.760 0/0/1/1:4:26,25:0.48:-0.36:1.000:0.994 0/0/0/1:4:29,15:0.30:-0.72:1.000:0.984 0/0/1/1:4:24,37:0.58: 0.16:1.000:0.905 0/0/0/1:4:37,13:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,19:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,22:0.32: 0.16:0.999:0.942 0/0/1/1:4:39,29:0.40: 0.52:1.000:0.807 0/0/1/1:4:37,63:0.60: 2.16:1.000:0.774 0/0/1/1:4:39,51:0.55: 1.65:1.000:0.981 0/1/1/1:4:3,16:0.78:-2.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,22:0.31: 0.26:1.000:0.972 0/0/0/1:4:47,22:0.27: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,16:0.32:-0.67:1.000:0.958 0/1/1/1:4:4,16:0.75:-1.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,55:0.73: 0.62:1.000:0.998 0/0/0/1:4:32,12:0.23:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,20:0.31: 0.00:1.000:0.980 0/1/1/1:4:27,85:0.71: 2.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:33,28:0.44: 0.16:1.000:0.968 0/0/0/1:4:22,8:0.22:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,35:0.55: 0.16:1.000:0.975 0/1/1/1:4:6,13:0.65:-2.01:1.000:0.771 0/0/0/1:4:19,10:0.31:-1.49:1.000:0.980 0/1/1:3:1,6:0.80:-2.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,20:0.41:-0.62:1.000:0.875 0/0/0/1:4:27,16:0.34:-0.77:1.000:0.883 0/0/0/1:4:44,20:0.27: 0.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,20:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,38:0.57: 0.31:1.000:0.943 0/0/0/1:4:38,15:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,25:0.35: 0.36:1.000:0.769 0/1/1/1:4:14,51:0.73: 0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,25:0.44:-0.15:1.000:0.958 0/0/1/1:4:41,28:0.38: 0.57:1.000:0.537 0/0/1/1:4:24,35:0.57: 0.05:1.000:0.944 0/0/0/0/1:5:73,19:0.17: 1.75:1.000:0.999 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-2.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,15:0.29:-0.67:1.000:0.991 0/0/1/1:4:12,15:0.54:-1.60:1.000:0.988 0/0/1/1:4:16,28:0.61:-0.72:1.000:0.721 0/0/1/1:4:38,39:0.50: 0.98:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,19:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,49:0.82:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:31,48:0.58: 1.08:1.000:0.901 0/0/1/1:4:28,22:0.42:-0.41:1.000:0.905 0/0/1/1:4:25,35:0.56: 0.10:1.000:0.963 0/0/0/1:4:24,15:0.35:-0.98:1.000:0.769 0/1/1/1:4:16,54:0.72: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:27,26:0.48:-0.26:1.000:0.861 0/0/0/1:4:42,25:0.34: 0.46:1.000:0.876 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,21:0.35:-0.15:1.000:0.799 0/0/1/1:4:20,32:0.59:-0.31:1.000:0.867 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,35:0.55: 0.16:1.000:0.975 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-2.06:1.000:0.988 0/1/1/1:4:16,32:0.63:-0.51:1.000:0.601 0/0/1/1:4:21,28:0.55:-0.46:0.887:0.977 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,17:0.25:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,24:0.75:-1.44:0.999:0.999 0/0/1/1:4:21,20:0.47:-0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:43,16:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,18:0.28:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,7:0.21:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,37:0.63:-0.10:1.000:0.535 0/0/1/1:4:37,45:0.53: 1.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:26,37:0.57: 0.26:1.000:0.956 0/1/1/1:4:9,55:0.80: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.24:-0.41:0.968:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.42:-1.60:1.000:0.926 0/0/0/1:4:46,26:0.32: 0.72:1.000:0.940 0/1/1/1:4:12,31:0.68:-0.77:1.000:0.950 0/0/0/1:4:32,15:0.28:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,27:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,17:0.28:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,13:0.29:-0.98:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,11:0.21:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,41:0.57: 0.57:1.000:0.942 0/0/0/1:4:32,14:0.26:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,16:0.37:-0.93:1.000:0.554 0/1/1/1:4:20,39:0.63: 0.05:1.000:0.538 0/0/1/1:4:14,12:0.44:-1.65:1.000:0.972 0/0/0/1:4:48,20:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,16:0.57:-1.60:1.000:0.946 0/0/0/1:4:43,14:0.21:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,29:0.55:-0.36:1.000:0.980 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 1.19:0.960:1.000 0/0/1/1:4:16,25:0.58:-0.87:1.000:0.893 0/0/1/1:4:24,20:0.44:-0.72:1.000:0.958 0/0/0/1:4:33,14:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,33:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:72,30:0.25: 2.27:0.993:0.999 0/0/0/1:4:34,18:0.31:-0.31:1.000:0.978 0/0/0/1:4:37,22:0.34: 0.05:1.000:0.877 0/0/1/1:4:42,41:0.48: 1.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,50:0.54: 1.65:0.999:0.988 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,22:0.60:-1.18:1.000:0.785 0/0/1/1:4:32,40:0.54: 0.72:1.000:0.988 0/0/0/1:4:33,15:0.27:-0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,15:0.35:-0.98:1.000:0.769 0/0/1/1:4:39,29:0.40: 0.52:1.000:0.807 0/0/0/1:4:36,18:0.29:-0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:27,35:0.55: 0.21:1.000:0.983 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,70:0.72: 1.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,30:0.32: 1.34:1.000:0.954 0/0/0/1:4:31,14:0.27:-0.67:1.000:0.998 0/0/0/1:4:41,17:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,43:0.57: 0.77:1.000:0.953 0/0/0/1:4:25,12:0.28:-1.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:37,13:0.22:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,40:0.67:-0.10:1.000:0.933 0/0/0/1:4:43,29:0.37: 0.72:1.000:0.510 0/0/1/1:4:23,20:0.45:-0.77:1.000:0.977 0/0/1/1:4:29,29:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:56,16:0.19: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,29:0.40: 0.52:1.000:0.807 0/0/1/1:4:29,30:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,21:0.29: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,43:0.57: 0.77:1.000:0.953 0/0/0/1:4:36,20:0.32:-0.10:1.000:0.954 0/0/0/1:4:47,25:0.31: 0.72:1.000:0.976 0/0/0/1:4:52,26:0.29: 1.03:1.000:0.991 0/0/0/1:4:42,22:0.30: 0.31:1.000:0.981 0/0/1/1:4:23,22:0.48:-0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,30:0.30: 1.55:1.000:0.984 0/0/0/1:4:60,26:0.26: 1.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,37:0.36: 1.85:1.000:0.651 0/0/1/1:4:42,43:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,17:0.24: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,43:0.56: 0.82:1.000:0.966 0/1/1/1:4:22,71:0.71: 1.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:28,43:0.58: 0.67:1.000:0.909 0/0/1/1:4:23,16:0.38:-0.98:1.000:0.605 0/0/0/1:4:28,14:0.29:-0.82:1.000:0.991 0/1/1/1:4:11,47:0.75: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,74:0.63: 2.78:1.000:0.535 0/0/1/1:4:43,64:0.57: 2.52:1.000:0.932 0/0/0/1:4:42,15:0.22:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,14:0.28:-0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,45:0.61: 0.62:1.000:0.659 0/0/0/1:4:45,12:0.18:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,24:0.53:-0.72:1.000:0.992 0/0/0/1:4:27,13:0.28:-0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:27,41:0.58: 0.52:1.000:0.918 0/0/0/1:4:11,2:0.13:-2.32:1.000:0.901 0/0/0/1:4:39,25:0.36: 0.31:1.000:0.693 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,20:0.26: 0.41:0.999:0.999 0/0/0/1:4:41,18:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,42:0.54: 0.93:1.000:0.989 0/0/1/1:4:25,40:0.59: 0.36:1.000:0.867 0/0/0/1:4:33,13:0.24:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,29:0.40: 0.52:1.000:0.807 0/1/1/1:4:13,69:0.78: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,29:0.68:-0.93:1.000:0.959 0/0/1/1:4:29,40:0.56: 0.57:1.000:0.968 0/1/1/1:4:11,60:0.79: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,40:0.57: 0.52:1.000:0.955 0/0/1/1:4:29,36:0.54: 0.36:1.000:0.989 0/0/1/1:4:33,31:0.47: 0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:41,35:0.44: 0.93:1.000:0.970 0/0/0/1:4:43,21:0.29: 0.31:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,57:0.54: 2.32:1.000:0.989 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,22:0.29: 0.46:1.000:0.994 -chr8.1 16191223 chr8.1_016191223 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:35,15:0.31: 1.59:1.000:0.971 0/0/1/1:4:18,24:0.55: 0.92:1.000:0.977 0/0/0/1:4:30,8:0.23: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,32:0.69: 1.09:1.000:0.977 0/1/1/1:4:8,35:0.78: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,9:0.30: 0.00:1.000:0.982 0/0/1/1:4:6,6:0.49:-1.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,27:0.81: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,26:0.60: 0.92:1.000:0.828 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.22:-2.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,21:0.45: 1.26:1.000:0.980 0/0/1/1:4:17,19:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,31:0.62: 1.43:1.000:0.577 0/0/1/1:4:14,14:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,25:0.50: 1.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,20:0.43: 1.26:0.999:0.949 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.27:-0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,21:0.61: 0.17:1.000:0.681 0/1/1/1:4:1,7:0.85:-1.92:1.000:0.987 0/0/0/1:4:40,19:0.33: 2.34:1.000:0.917 0/0/1/1:4:20,16:0.44: 0.42:1.000:0.966 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,2:0.64:-2.34:1.000:0.666 0/0/0/1:4:11,5:0.32:-1.25:1.000:0.947 0/0/0/1:4:40,9:0.20: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,20:0.50: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,19:0.54: 0.25:1.000:0.987 0/0/1/1:4:19,15:0.44: 0.25:1.000:0.961 0/0/1/1:4:14,9:0.39:-0.67:1.000:0.717 0/0/1/1:4:17,13:0.43:-0.08:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.25:1.000:1.000 0/0/1:3:2,1:0.34:-2.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,12:0.36: 0.25:1.000:0.708 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,19:0.48: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,17:0.58:-0.25:1.000:0.893 0/0/0/1:4:36,9:0.22: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.47: 0.59:1.000:0.990 0/1/1/1:4:9,18:0.64:-0.33:1.000:0.666 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,15:0.46: 0.09:1.000:0.988 0/1/1/1:4:6,30:0.80: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:56,13:0.20: 3.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:22,7:0.26:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,12:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,5:0.54:-1.84:1.000:0.989 0/0/0/1:4:22,6:0.23:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,15:0.33: 1.34:1.000:0.927 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,4:0.23:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.69:-0.75:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,7:0.29:-0.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,10:0.45:-0.75:1.000:0.978 0/0/0/0/1/1:6:18,12:0.40:-0.08:1.000:0.645 0/0/1/1:4:20,17:0.45: 0.51:1.000:0.982 0/0/0/1:4:22,11:0.34: 0.17:1.000:0.863 0/0/0/1:4:19,8:0.31:-0.33:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.29: 0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,16:0.45: 0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:9,14:0.59:-0.67:1.000:0.886 1/1/1/1:4:0,37:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,18:0.66:-0.41:0.887:0.876 0/0/1/1:4:20,19:0.48: 0.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,4:0.18:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-2.00:0.999:0.956 0/0/0/1:4:14,5:0.28:-1.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,28:0.64: 0.92:1.000:0.666 0/1/1/1:4:8,26:0.73: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,2:0.12:-1.08:1.000:0.770 0/0/0/1:4:13,6:0.33:-1.00:1.000:0.938 0/0/1/1:4:18,12:0.40:-0.08:1.000:0.791 1/1/1/1:4:0,37:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,22:0.70:-0.08:1.000:0.983 0/0/0/1:4:25,12:0.33: 0.51:0.968:0.908 0/0/1/1:4:13,16:0.53:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,22:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:36,14:0.29: 1.59:1.000:0.990 0/0/0/1:4:22,3:0.13:-0.50:1.000:0.910 0/1/1/1:4:5,21:0.77:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.49:-1.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,21:0.63: 0.09:1.000:0.547 0/0/1/1:4:16,13:0.44:-0.16:1.000:0.971 0/0/1/1:4:17,19:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:14,4:0.24:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,4:0.10: 1.17:1.000:0.872 0/0/1/1:4:14,10:0.41:-0.58:1.000:0.890 0/0/1/1:4:14,12:0.45:-0.41:1.000:0.984 0/0/1/1:4:18,21:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,27:0.75: 0.25:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.55:-0.67:1.000:0.983 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,13:0.27: 1.76:1.000:0.998 0/0/0/0:4:18,2:0.11:-0.92:1.000:0.569 0/0/1/1:4:11,19:0.61:-0.08:1.000:0.711 0/0/0/1:4:20,7:0.28:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,15:0.65:-0.75:0.960:0.807 0/1/1/1:4:6,23:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,30:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,12:0.67:-1.17:1.000:0.934 0/1/1/1:4:17,45:0.69: 2.60:1.000:0.975 0/1/1/1:4:20,38:0.63: 2.26:0.993:0.534 0/1/1/1:4:4,16:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,15:0.60:-0.58:1.000:0.785 0/1/1/1:4:13,38:0.71: 1.68:1.000:0.991 0/1/1/1:4:11,22:0.64: 0.17:0.999:0.666 0/0/0/1:4:24,5:0.19:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,14:0.61:-0.75:1.000:0.681 0/0/0/1:4:16,8:0.34:-0.58:1.000:0.863 0/1/1/1:4:2,16:0.87:-1.08:1.000:0.934 0/0/1/1:4:6,5:0.45:-1.67:1.000:0.978 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,12:0.61:-1.00:1.000:0.728 0/1/1/1:4:11,21:0.63: 0.09:1.000:0.547 0/0/0/1:4:30,11:0.28: 0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,20:0.70:-0.33:1.000:0.989 0/0/0/1:4:28,15:0.35: 1.01:1.000:0.747 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,18:0.54: 0.09:1.000:0.985 0/1/1/1:4:7,23:0.73:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,14:0.54:-0.50:1.000:0.986 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,4:0.17:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,6:0.34:-1.08:1.000:0.863 0/0/1/1:4:14,25:0.62: 0.67:1.000:0.632 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.47:-0.67:1.000:0.992 0/0/1/1:4:20,21:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,13:0.31: 1.09:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,40:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,21:0.52: 0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,18:0.69:-0.50:1.000:0.967 0/0/1/1:4:13,17:0.55:-0.08:1.000:0.981 0/0/1/1:4:8,12:0.58:-0.92:1.000:0.921 0/1/1/1:4:9,20:0.66:-0.16:1.000:0.861 0/0/1/1:4:23,25:0.51: 1.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,17:0.77:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,10:0.35:-0.16:1.000:0.782 0/0/0/1:4:25,9:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,21:0.61: 0.17:1.000:0.681 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,24:0.71: 0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:40,12:0.25: 1.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,17:0.48: 0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-1.84:1.000:0.770 0/0/1/1:4:11,15:0.56:-0.41:1.000:0.971 0/0/1/1:4:10,18:0.62:-0.25:1.000:0.611 0/1/1/1:4:11,22:0.64: 0.17:1.000:0.666 0/1/1/1:4:12,31:0.69: 1.01:1.000:0.968 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,17:0.57:-0.16:1.000:0.956 0/1/1/1:4:8,28:0.74: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,11:0.42:-0.41:1.000:0.916 0/0/1/1:4:23,24:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,10:0.31: 0.17:1.000:0.967 0/0/0/1:4:17,9:0.35:-0.41:1.000:0.771 0/0/0/1:4:17,10:0.37:-0.33:1.000:0.513 0/0/1/1:4:13,14:0.51:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,21:0.51: 0.76:0.999:0.996 0/0/1/1:4:15,11:0.42:-0.41:1.000:0.916 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,12:0.29: 1.09:1.000:0.993 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,17:0.40: 1.01:1.000:0.753 0/0/0/1:4:20,10:0.34:-0.08:1.000:0.863 0/1/1/1:4:5,17:0.73:-0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:17,26:0.58: 1.01:1.000:0.904 0/0/1/1:4:16,14:0.46:-0.08:1.000:0.987 0/0/1/1:4:23,26:0.52: 1.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,26:0.78: 0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,39:0.94: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,28:0.72: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:14,19:0.56: 0.17:1.000:0.972 0/0/0/1:4:35,17:0.34: 1.76:1.000:0.897 0/0/1/1:4:12,16:0.55:-0.25:1.000:0.977 0/0/1/1:4:34,31:0.47: 2.85:1.000:0.992 -chr8.1 16386087 chr8.1_016386087 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:2,3:0.58:-0.67:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-0.09:1.000:0.950 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-1.24:1.000:0.679 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:1.000:0.675 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.81:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,7:0.67: 0.77:1.000:0.906 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:0.999:0.675 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,4:0.39: 1.34:1.000:0.679 0/0/1/1:4:5,7:0.57: 1.34:1.000:0.948 0/0/0/1:4:4,1:0.30:-0.67:1.000:0.985 0/0/1/1:4:6,4:0.43: 0.77:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.33:-0.95:1.000:0.906 0/0/0/1:4:1,0:0.14:-1.81:1.000:0.975 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-1.24:1.000:0.679 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,6:0.82:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/0/0/1:4:6,2:0.33: 0.19:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,0:0.14:-1.52:1.000:0.975 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:3,1:0.33:-0.95:1.000:0.906 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:3,6:0.64: 0.48:1.000:0.675 0/0/0/1:4:3,1:0.33:-0.95:1.000:0.906 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-0.09:1.000:0.950 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-0.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.44: 1.34:1.000:0.974 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,1:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,5:0.44: 1.34:1.000:0.974 0/0/1/1:4:2,3:0.58:-0.67:1.000:0.900 0/1/1/1:4:3,6:0.64: 0.48:1.000:0.675 0/0/1/1/1:5:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.914 0/0/1/1:4:7,5:0.44: 1.34:1.000:0.974 0/1/1/1:4:3,7:0.67: 0.77:1.000:0.906 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/0/1/1:4:6,8:0.56: 1.91:1.000:0.968 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/0/1/1:4:9,9:0.50: 3.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.09:1.000:0.982 0/1/1/1:4:1,6:0.82:-0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.71:-0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:7,7:0.50: 1.91:1.000:0.997 1/1/1/1/1/1:6:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.82:-0.09:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,6:0.47: 1.62:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,1:0.28:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,8:0.86: 0.48:0.887:0.963 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:1,0:0.14:-1.81:0.999:0.975 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00: 0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00: 1.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,4:0.43: 0.77:1.000:0.955 0/1/1/1:4:4,8:0.64: 1.34:1.000:0.675 0/0/1/1:4:5,6:0.54: 1.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:4,5:0.55: 0.48:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:0.968:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/1/1/1:4:1,7:0.84: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:5,3:0.42: 0.19:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:1.000:0.675 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-0.09:1.000:0.950 0/0/1/1:4:4,3:0.45:-0.09:1.000:0.982 0/0/1/1:4:5,8:0.60: 1.62:1.000:0.822 0/0/1/1:4:9,9:0.50: 3.06:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.88: 0.77:1.000:0.852 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.52:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.46: 0.48:1.000:0.989 0/0/1/1:4:2,3:0.58:-0.67:1.000:0.900 0/1/1/1:4:1,3:0.71:-0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:3,5:0.60: 0.19:1.000:0.753 0/0/0/1:4:7,3:0.37: 0.77:1.000:0.607 0/0/1/1:4:5,8:0.60: 1.62:0.960:0.822 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:1.000:0.675 0/1/1/1:4:2,6:0.71: 0.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:3,5:0.60: 0.19:1.000:0.753 0/0/1/1:4:5,5:0.50: 0.77:0.993:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,1:0.30:-0.67:1.000:0.985 0/1/1/1:4:4,9:0.66: 1.62:1.000:0.871 0/1/1/1:4:3,7:0.67: 0.77:0.999:0.906 0/1/1/1:4:2,9:0.77: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,4:0.39: 1.34:1.000:0.679 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:1.000:0.675 0/1/1/1:4:1,2:0.64:-1.24:1.000:0.675 0/0/1/1:4:6,6:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,3:0.71:-0.95:1.000:0.991 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-0.38:1.000:0.679 0/0/1/1:4:3,5:0.60: 0.19:1.000:0.753 0/1/1/1:4:1,6:0.82:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,6:0.82:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,5:0.44: 1.34:1.000:0.974 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-0.09:1.000:0.950 0/0/1/1:4:3,5:0.60: 0.19:1.000:0.753 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-0.09:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,6:0.64: 0.48:1.000:0.675 0/1/1/1:4:2,8:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,2:0.64:-1.24:1.000:0.675 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:2,0:0.14:-1.52:1.000:0.975 0/0/0/1:4:5,2:0.36:-0.09:1.000:0.721 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:1.000:0.675 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.84: 0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:3,5:0.60: 0.19:1.000:0.753 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.58:-0.67:1.000:0.900 0/1/1/1:4:2,5:0.68:-0.09:1.000:0.950 0/1/1/1:4:1,2:0.64:-1.24:1.000:0.675 0/0/1/1:4:6,7:0.53: 1.62:1.000:0.991 0/0/0/1:4:4,1:0.30:-0.67:1.000:0.985 0/0/1/1:4:5,4:0.46: 0.48:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.54: 1.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:6,9:0.58: 2.20:1.000:0.900 0/0/1/1:4:5,6:0.54: 1.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:3,5:0.60: 0.19:1.000:0.753 0/0/0/1:4:1,0:0.14:-1.81:1.000:0.975 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,1:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/0/0/1:4:5,2:0.36:-0.09:1.000:0.721 0/0/1/1:4:8,9:0.52: 2.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:1.000:0.675 0/0/1/1:4:6,4:0.43: 0.77:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,4:0.39: 1.34:1.000:0.679 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,1:0.39:-1.24:1.000:0.679 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-0.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,10:1.00: 0.77:0.999:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,4:0.56:-0.09:1.000:0.968 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-0.38:1.000:0.679 0/0/0/1:4:4,1:0.30:-0.67:1.000:0.985 0/0/0/1:4:7,3:0.37: 0.77:1.000:0.607 0/0/0/1:4:10,4:0.36: 1.91:1.000:0.721 0/0/0/1:4:7,3:0.37: 0.77:1.000:0.607 0/1/1/1:4:4,9:0.66: 1.62:1.000:0.871 0/1/1/1:4:3,6:0.64: 0.48:1.000:0.675 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,2:0.39:-0.38:1.000:0.679 0/1/1/1:4:4,8:0.64: 1.34:1.000:0.675 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-0.38:1.000:0.675 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,5:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,4:0.75:-0.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.67:1.000:1.000 -chr8.1 16446466 chr8.1_016446466 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:27,94:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.11:1.000:. ./.:4:24,72:.:-0.69:1.000:. ./.:4:27,75:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.16:1.000:. ./.:4:22,102:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,69:.:-1.16:1.000:. ./.:4:29,83:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.27:1.000:. ./.:4:12,48:.:-2.09:1.000:. ./.:4:0,59:.:-2.13:1.000:. ./.:4:1,158:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.04:1.000:. ./.:4:22,114:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.58:1.000:. ./.:4:32,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:22,86:.:-0.23:0.999:. ./.:4:1,150:.: 1.44:1.000:. ./.:4:31,131:.: 1.86:1.000:. ./.:4:33,114:.: 1.28:1.000:. ./.:4:8,46:.:-2.32:1.000:. ./.:4:26,93:.: 0.20:1.000:. ./.:4:31,106:.: 0.89:1.000:. ./.:4:21,97:.: 0.16:1.000:. ./.:4:8,29:.:-2.98:1.000:. ./.:4:52,51:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,89:.: 0.04:1.000:. ./.:4:21,96:.: 0.12:1.000:. ./.:4:64,81:.: 1.20:1.000:. ./.:4:33,75:.:-0.23:1.000:. ./.:4:23,98:.: 0.27:1.000:. ./.:4:16,60:.:-1.47:1.000:. ./.:4:7,25:.:-3.17:1.000:. ./.:4:1,69:.:-1.70:1.000:. ./.:3:3,13:.:-3.79:1.000:. ./.:4:43,75:.: 0.16:1.000:. ./.:4:34,92:.: 0.47:1.000:. ./.:4:15,98:.:-0.04:1.000:. ./.:4:24,81:.:-0.34:1.000:. ./.:4:24,94:.: 0.16:1.000:. ./.:4:15,76:.:-0.89:1.000:. ./.:4:30,97:.: 0.51:1.000:. ./.:4:59,78:.: 0.89:1.000:. ./.:4:45,54:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,115:.: 0.08:1.000:. ./.:4:40,101:.: 1.05:1.000:. ./.:5:24,140:.: 1.94:1.000:. ./.:4:0,28:.:-3.33:1.000:. ./.:4:28,75:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,83:.:-0.11:1.000:. ./.:4:20,84:.:-0.38:1.000:. ./.:4:33,106:.: 0.97:1.000:. ./.:4:23,102:.: 0.43:1.000:. ./.:4:56,75:.: 0.66:1.000:. ./.:4:24,111:.: 0.82:1.000:. ./.:4:30,122:.: 1.47:1.000:. ./.:4:28,106:.: 0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,71:.: 0.00:1.000:. ./.:6:25,70:.:-0.73:1.000:. ./.:4:25,107:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.86:1.000:. ./.:4:22,70:.:-0.85:1.000:. ./.:4:21,71:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.04:1.000:. ./.:4:27,75:.:-0.46:1.000:. ./.:4:26,59:.:-1.12:1.000:. ./.:4:31,70:.:-0.50:1.000:. ./.:4:34,96:.: 0.62:0.887:. ./.:4:0,118:.: 0.16:1.000:. ./.:4:26,97:.: 0.35:1.000:. ./.:4:31,46:.:-1.43:0.999:. ./.:4:0,128:.: 0.55:1.000:. ./.:4:29,111:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,85:.: 0.00:1.000:. ./.:4:18,71:.:-0.96:1.000:. ./.:4:22,78:.:-0.54:1.000:. ./.:4:34,102:.: 0.86:1.000:. ./.:4:49,45:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.23:0.968:. ./.:4:0,124:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,117:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,100:.: 0.55:1.000:. ./.:4:29,113:.: 1.09:1.000:. ./.:4:23,77:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.65:1.000:. ./.:4:22,96:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,140:.: 1.01:1.000:. ./.:4:25,83:.:-0.23:1.000:. ./.:4:30,86:.: 0.08:1.000:. ./.:4:31,107:.: 0.93:1.000:. ./.:4:19,74:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.39:1.000:. ./.:4:20,84:.:-0.38:1.000:. ./.:4:25,86:.:-0.11:1.000:. ./.:4:1,105:.:-0.31:1.000:. ./.:4:41,121:.: 1.86:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.62:1.000:. ./.:4:16,70:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,146:.: 1.24:1.000:. ./.:4:21,46:.:-1.82:1.000:. ./.:4:1,139:.: 1.01:0.960:. ./.:4:9,57:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,94:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,160:.: 1.78:0.993:. ./.:4:25,88:.:-0.04:1.000:. ./.:4:27,97:.: 0.39:1.000:. ./.:4:29,98:.: 0.51:1.000:. ./.:4:30,92:.: 0.31:0.999:. ./.:4:0,115:.: 0.04:1.000:. ./.:4:30,70:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,116:.: 1.82:1.000:. ./.:4:34,111:.: 1.20:1.000:. ./.:4:23,82:.:-0.34:1.000:. ./.:4:30,95:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.97:1.000:. ./.:4:17,72:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.27:1.000:. ./.:4:47,61:.:-0.23:1.000:. ./.:4:23,98:.: 0.27:1.000:. ./.:4:28,79:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,139:.: 1.01:1.000:. ./.:4:36,73:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,80:.:-1.31:1.000:. ./.:4:15,65:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,88:.:-1.00:1.000:. ./.:4:20,93:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,72:.:-0.81:1.000:. ./.:4:21,60:.:-1.27:1.000:. ./.:4:23,108:.: 0.66:1.000:. ./.:4:23,93:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,120:.: 1.55:1.000:. ./.:4:24,102:.: 0.47:1.000:. ./.:4:16,69:.:-1.12:1.000:. ./.:4:22,74:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.47:1.000:. ./.:4:51,105:.: 1.63:1.000:. ./.:4:23,115:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.04:1.000:. ./.:4:19,72:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,120:.: 1.67:1.000:. ./.:4:41,100:.: 1.05:1.000:. ./.:4:19,79:.:-0.62:1.000:. ./.:4:26,110:.: 0.86:1.000:. ./.:4:40,120:.: 1.78:1.000:. ./.:4:25,81:.:-0.31:1.000:. ./.:4:67,63:.: 0.62:1.000:. ./.:4:26,82:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,48:.:-2.55:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.89:1.000:. ./.:4:54,83:.: 0.89:1.000:. ./.:4:25,109:.: 0.78:1.000:. ./.:4:35,112:.: 1.28:1.000:. ./.:4:29,91:.: 0.24:1.000:. ./.:4:20,70:.:-0.93:1.000:. ./.:4:30,98:.: 0.55:1.000:. ./.:4:46,89:.: 0.82:1.000:. ./.:4:51,53:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.38:1.000:. ./.:4:48,64:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,92:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,100:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.69:0.999:. ./.:4:25,97:.: 0.31:1.000:. ./.:4:38,56:.:-0.77:1.000:. ./.:4:22,89:.:-0.11:1.000:. ./.:4:20,83:.:-0.42:1.000:. ./.:4:32,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:48,66:.: 0.00:1.000:. ./.:4:44,39:.:-1.20:1.000:. ./.:4:24,68:.:-0.85:1.000:. ./.:4:41,66:.:-0.27:1.000:. ./.:4:26,100:.: 0.47:1.000:. ./.:4:24,108:.: 0.70:1.000:. ./.:4:21,67:.:-1.00:1.000:. ./.:4:28,94:.: 0.31:1.000:. ./.:4:29,100:.: 0.58:1.000:. ./.:4:68,71:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,116:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.86:1.000:. -chr8.1 16643263 chr8.1_016643263 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:50,36:0.43: 0.61:1.000:0.956 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,17:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.45:-1.06:1.000:0.977 0/0/0/1:4:77,25:0.26: 1.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,17:0.26:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,29:0.53:-0.92:1.000:0.994 0/0/0/1:4:48,21:0.32:-0.20:1.000:0.957 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-2.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,21:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:89,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,24:0.41:-0.59:1.000:0.856 0/0/1/1:4:44,26:0.39:-0.16:0.999:0.650 0/0/0/1:4:66,20:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,28:0.25: 2.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,34:0.35: 1.37:1.000:0.810 0/0/0/1:4:19,7:0.28:-2.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:38,30:0.46:-0.25:1.000:0.986 0/0/0/0:4:79,9:0.11: 0.70:1.000:0.574 0/0/0/0:4:58,5:0.08:-0.49:1.000:0.978 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-3.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,26:0.38:-0.06:1.000:0.517 0/0/0/1:4:51,12:0.20:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,18:0.34:-0.87:1.000:0.857 0/0/1/1:4:57,42:0.44: 1.23:1.000:0.967 0/0/0/1:4:49,19:0.29:-0.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:41,13:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,7:0.13:-0.82:1.000:0.928 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-3.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,5:0.16:-1.87:1.000:0.993 0/1/1:3:0,8:0.75:-3.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,10:0.14: 0.18:1.000:0.957 0/0/0/1:4:69,15:0.19: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,21:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/1:4:52,10:0.17:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,14:0.21:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.37:-0.01:1.000:0.550 0/0/0/1:4:45,24:0.36:-0.20:1.000:0.658 0/0/1/1:4:36,41:0.52: 0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:42,22:0.36:-0.44:1.000:0.706 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,19:0.21: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:110,12:0.10: 2.33:1.000:0.821 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-2.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,22:0.35:-0.35:1.000:0.810 0/0/0/1:4:20,9:0.32:-2.11:1.000:0.940 0/0/0/1:4:55,11:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,16:0.19: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.53:-0.30:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,36:0.37: 1.37:1.000:0.593 0/0/1/1:4:33,35:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,25:0.35: 0.08:1.000:0.810 0/0/0/1:4:48,26:0.37: 0.03:1.000:0.613 0/0/1/1:4:39,22:0.38:-0.59:1.000:0.511 0/0/1/1:4:35,27:0.45:-0.54:1.000:0.981 0/0/0/0/1/1:6:42,25:0.39:-0.30:1.000:0.732 0/0/1/1:4:58,34:0.38: 0.89:1.000:0.627 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,16:0.15: 1.80:1.000:0.990 0/0/1/1:4:38,27:0.43:-0.39:1.000:0.949 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,11:0.15: 0.13:1.000:0.991 0/0/0/0:4:54,6:0.11:-0.63:1.000:0.648 0/0/1/1:4:47,27:0.38: 0.03:1.000:0.567 0/0/0/1:4:46,19:0.31:-0.39:0.887:0.978 0/0/0/1:4:38,19:0.35:-0.78:1.000:0.810 0/0/0/1:4:75,11:0.14: 0.61:1.000:0.947 0/0/0/1:4:35,18:0.35:-0.97:0.999:0.751 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,32:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:66,7:0.10:-0.01:1.000:0.768 0/0/0/1:4:58,11:0.17:-0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,12:0.17: 0.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:89,10:0.11: 1.23:1.000:0.616 0/0/1/1:4:43,33:0.45: 0.13:1.000:0.980 0/0/1/1:4:23,47:0.59:-0.16:1.000:0.859 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.08:0.968:1.000 0/0/0/1:4:88,16:0.16: 1.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,18:0.20: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,1:0.01: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,8:0.14:-0.68:1.000:0.977 0/0/0/1:4:50,21:0.31:-0.11:1.000:0.973 0/0/1/1:4:32,30:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:62,16:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,19:0.20: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,27:0.47:-0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:50,35:0.43: 0.56:1.000:0.939 0/0/0/1:4:83,15:0.16: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,20:0.40:-1.02:1.000:0.789 0/0/0/1:4:74,13:0.16: 0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,25:0.38:-0.20:1.000:0.533 0/0/1/1:4:29,32:0.52:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:49,14:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,16:0.17: 1.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,10:0.20:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,11:0.13: 0.70:1.000:0.928 0/0/0/1:4:62,9:0.13:-0.11:1.000:0.940 0/0/0/1:4:68,15:0.19: 0.46:0.960:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.35:-1.11:1.000:0.747 0/0/0/1:4:56,11:0.17:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,9:0.14:-0.30:1.000:0.973 0/0/1/1:4:42,25:0.39:-0.30:1.000:0.670 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 2.47:0.993:1.000 0/0/1/1:4:45,36:0.46: 0.37:1.000:0.988 0/0/0/1:4:60,32:0.36: 0.89:1.000:0.658 0/0/1/1:4:56,45:0.46: 1.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:41,35:0.48: 0.13:0.999:0.994 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,9:0.29:-1.92:1.000:0.993 0/0/0/1:4:73,13:0.16: 0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:50,32:0.41: 0.42:1.000:0.834 0/0/0/1:4:44,21:0.34:-0.39:1.000:0.884 0/0/0/1:4:86,14:0.15: 1.28:1.000:0.985 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,13:0.19:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,42:0.60:-0.59:1.000:0.798 0/0/1/1:4:46,35:0.45: 0.37:1.000:0.977 0/0/0/1:4:76,17:0.19: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,7:0.09: 0.27:1.000:0.908 0/0/0/1:4:50,13:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.25:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,7:0.09: 0.46:1.000:0.951 0/0/1/1:4:47,41:0.48: 0.70:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:29,16:0.37:-1.35:1.000:0.558 0/0/1/1:4:30,27:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,29:0.39: 0.18:1.000:0.710 0/0/0/1:4:46,23:0.35:-0.20:1.000:0.810 0/0/1/1:4:38,28:0.44:-0.35:1.000:0.967 0/0/0/1:4:54,22:0.30: 0.13:1.000:0.982 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,27:0.34: 0.46:1.000:0.870 0/0/0/1:4:42,19:0.33:-0.59:1.000:0.936 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,26:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,37:0.41: 0.99:1.000:0.857 0/0/1/1:4:64,40:0.40: 1.47:1.000:0.789 0/0/0/1:4:86,17:0.17: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:66,21:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,10:0.14: 0.03:1.000:0.975 0/0/0/1:4:43,14:0.26:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,38:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:65,13:0.18: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,44:0.60:-0.44:1.000:0.802 0/0/0/1:4:55,29:0.36: 0.51:1.000:0.689 0/0/0/1:4:81,18:0.19: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,14:0.17: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,19:0.26: 0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,32:0.43: 0.23:1.000:0.934 0/0/1/1:4:41,29:0.43:-0.16:1.000:0.946 0/0/1/1:4:15,26:0.57:-1.54:1.000:0.939 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,49:0.60:-0.16:1.000:0.748 0/0/1/1:4:10,16:0.56:-2.26:1.000:0.961 0/0/0/1:4:44,21:0.34:-0.39:1.000:0.884 0/0/0/1:4:81,11:0.13: 0.89:1.000:0.871 0/0/0/1:4:67,20:0.24: 0.66:0.999:1.000 0/0/0/1:4:44,23:0.36:-0.30:1.000:0.711 0/0/1/1:4:37,29:0.46:-0.35:1.000:0.984 0/0/0/1:4:60,17:0.23: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,14:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,15:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,28:0.45:-0.39:1.000:0.976 0/0/1/1:4:15,38:0.61:-0.97:1.000:0.658 0/0/0/1:4:47,13:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,32:0.39: 0.61:1.000:0.658 0/0/0/1:4:68,13:0.17: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:41,18:0.32:-0.68:1.000:0.955 0/0/0/1:4:70,29:0.31: 1.23:1.000:0.977 0/0/1/1:4:33,35:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,23:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,64:0.60: 0.94:1.000:0.800 0/0/0/1:4:61,17:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,13:0.17: 0.27:1.000:0.999 -chr8.1 16918382 chr8.1_016918382 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:68,202:0.73: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:277,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,142:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,142:0.46: 0.78:1.000:0.985 0/0/1/1:4:178,165:0.47: 1.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:156,182:0.53: 1.25:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,151:0.76:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,152:0.53: 0.39:1.000:0.992 0/0/0/1:4:211,70:0.24: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,23:0.27:-2.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,19:0.30:-2.97:1.000:0.984 0/0/0/0:4:354,0:0.00: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,67:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:238,75:0.23: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,70:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:178,184:0.50: 1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,161:0.49: 1.02:0.999:0.996 0/0/0/1:4:227,85:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,177:0.46: 1.83:1.000:0.990 0/1/1/1:4:80,266:0.75: 1.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,59:0.81:-2.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,195:0.72: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:211,67:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,144:0.54: 0.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:35,14:0.27:-3.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,139:0.54:-0.02:1.000:0.989 0/0/0/1:4:203,60:0.22: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,137:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,160:0.49: 1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,151:0.48: 0.79:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,81:0.30: 0.04:1.000:0.983 0/0/0/1:4:177,59:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,31:0.54:-3.05:1.000:0.984 0/0/1/1:4:38,36:0.48:-2.78:1.000:0.995 0/1/1:3:6,24:0.78:-3.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,79:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,142:0.53: 0.12:1.000:0.992 0/0/1/1:4:163,140:0.45: 0.71:1.000:0.984 0/0/0/1:4:166,66:0.27:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:202,94:0.31: 0.61:1.000:0.978 0/1/1/1:4:55,191:0.76:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,135:0.47: 0.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,161:0.72:-0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,85:0.46:-1.14:1.000:0.989 0/0/0/1:4:188,56:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,59:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:243,134:0.35: 1.84:1.000:0.885 0/0/0/1:4:54,20:0.26:-2.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,111:0.55:-0.89:1.000:0.978 0/0/1/1:4:71,62:0.46:-1.88:1.000:0.987 0/0/1/1:4:89,95:0.51:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:136,145:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:48,191:0.78:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,154:0.53: 0.42:1.000:0.991 0/0/1/1:4:111,155:0.57: 0.15:1.000:0.940 0/0/1/1:4:113,107:0.48:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:145,141:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,178:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:132,116:0.46:-0.12:1.000:0.988 0/0/0/1/1/1:6:110,98:0.46:-0.73:1.000:0.816 0/0/1/1:4:128,134:0.51: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:169,59:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:197,78:0.27: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,108:0.48:-0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:198,73:0.26: 0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,144:0.55: 0.00:1.000:0.976 0/0/0/1:4:120,63:0.33:-1.11:1.000:0.901 0/0/1/1:4:123,157:0.55: 0.36:1.000:0.978 0/1/1/1:4:68,199:0.73: 0.17:0.887:0.997 0/0/1/1:4:130,118:0.47:-0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:203,76:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,114:0.58:-0.96:0.999:0.914 0/0/0/0:4:209,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,159:0.51: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:165,56:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,60:0.26:-0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,99:0.48:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:123,145:0.53: 0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:152,177:0.53: 1.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:70,221:0.74: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:206,0:0.00:-0.76:0.968:1.000 0/0/1/1:4:142,138:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,175:0.51: 1.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:181,68:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,51:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:154,173:0.52: 1.08:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,148:0.72:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,129:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,105:0.46:-0.44:1.000:0.985 0/0/0/1:4:193,61:0.23:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,159:0.71:-0.57:1.000:0.991 0/1/1/1:4:60,155:0.70:-0.63:1.000:0.988 0/0/1/1:4:155,148:0.48: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,97:0.51:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,163:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,131:0.55:-0.32:1.000:0.981 0/0/1/1:4:118,113:0.48:-0.38:1.000:0.995 0/0/0/1:4:157,63:0.27:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,145:0.54: 0.10:1.000:0.986 0/0/0/1:4:208,64:0.22: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,125:0.53:-0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:136,148:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,108:0.52:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:119,139:0.53: 0.03:0.960:0.992 0/0/1/1:4:104,99:0.48:-0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:136,129:0.48: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,113:0.52:-0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:140,161:0.53: 0.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:226,69:0.22: 0.59:0.993:1.000 0/0/1/1:4:146,162:0.52: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,126:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,170:0.49: 1.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,190:0.75:-0.15:0.999:0.999 0/0/0/1:4:222,75:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,106:0.73:-1.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:140,160:0.53: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,128:0.55:-0.41:1.000:0.980 0/0/1/1:4:106,124:0.53:-0.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:117,166:0.58: 0.41:1.000:0.928 0/0/0/1:4:141,61:0.29:-0.82:1.000:0.991 0/0/0/1:4:181,77:0.29: 0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:146,56:0.27:-0.82:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,282:0.75: 1.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,232:0.72: 0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:122,121:0.49:-0.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,64:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:210,77:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,44:0.25:-1.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,111:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,52:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,112:0.48:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:140,165:0.53: 0.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:71,94:0.56:-1.39:1.000:0.967 0/1/1/1:4:37,157:0.79:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,120:0.47:-0.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:78,287:0.77: 1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,129:0.49: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,124:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,170:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,53:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:130,121:0.48:-0.08:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,103:0.49:-0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:193,69:0.25: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:95,97:0.50:-0.98:1.000:0.997 0/1/1/1:4:81,277:0.75: 1.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,268:0.77: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,167:0.51: 1.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,62:0.22: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,165:0.49: 1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,219:0.74: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:193,195:0.50: 2.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:222,86:0.27: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:62,19:0.22:-2.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,70:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,202:0.75: 0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,172:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:241,89:0.26: 1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,176:0.53: 1.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:132,162:0.54: 0.58:1.000:0.986 0/1/1/1:4:65,247:0.77: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,128:0.46: 0.29:1.000:0.987 0/1/1/1:4:47,162:0.75:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,64:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,193:0.72: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,94:0.46:-0.84:1.000:0.988 0/1/1/1:4:81,238:0.73: 0.96:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,141:0.49: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/1:4:246,74:0.22: 0.97:0.999:1.000 0/1/1/1:4:57,200:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,150:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,123:0.52:-0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:108,110:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,122:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,166:0.56: 0.55:1.000:0.969 0/1/1/1:4:56,166:0.73:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:197,65:0.24: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:182,175:0.48: 1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:259,86:0.24: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,149:0.49: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,129:0.42: 0.65:1.000:0.927 0/0/1/1:4:138,160:0.53: 0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:258,76:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,261:0.74: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,142:0.55:-0.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:203,81:0.27: 0.42:1.000:0.997 -chr8.1 17058843 chr8.1_017058843 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:64,47:.:-0.71:1.000:. ./.:4:12,104:.:-0.57:1.000:. ./.:4:34,47:.:-1.54:1.000:. ./.:4:22,107:.:-0.21:1.000:. ./.:4:48,118:.: 0.82:1.000:. ./.:4:12,107:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,99:.:-0.57:1.000:. ./.:4:16,138:.: 0.49:1.000:. ./.:4:52,108:.: 0.65:1.000:. ./.:4:27,83:.:-0.74:1.000:. ./.:4:45,57:.:-0.96:1.000:. ./.:4:39,159:.: 1.71:1.000:. ./.:4:33,97:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,118:.: 0.93:1.000:. ./.:4:35,116:.: 0.40:1.000:. ./.:4:21,70:.:-1.27:1.000:. ./.:4:33,106:.: 0.07:0.999:. ./.:4:19,99:.:-0.51:1.000:. ./.:4:54,146:.: 1.77:1.000:. ./.:4:23,138:.: 0.68:1.000:. ./.:4:53,71:.:-0.35:1.000:. ./.:4:41,36:.:-1.66:1.000:. ./.:4:30,173:.: 1.85:1.000:. ./.:4:27,84:.:-0.71:1.000:. ./.:4:6,53:.:-2.16:1.000:. ./.:4:26,99:.:-0.32:1.000:. ./.:4:31,77:.:-0.79:1.000:. ./.:4:32,61:.:-1.21:1.000:. ./.:4:44,146:.: 1.49:1.000:. ./.:4:30,106:.:-0.01:1.000:. ./.:4:18,128:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,84:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,77:.:-1.66:1.000:. ./.:4:36,113:.: 0.35:1.000:. ./.:3:4,47:.:-2.38:1.000:. ./.:4:51,92:.: 0.18:1.000:. ./.:4:32,86:.:-0.51:1.000:. ./.:4:36,83:.:-0.49:1.000:. ./.:4:48,75:.:-0.38:1.000:. ./.:4:46,77:.:-0.38:1.000:. ./.:4:51,34:.:-1.43:1.000:. ./.:4:61,95:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,107:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,67:.:-1.04:1.000:. ./.:4:48,106:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,147:.: 1.38:1.000:. ./.:5:94,88:.: 1.27:1.000:. ./.:4:41,31:.:-1.79:1.000:. ./.:4:25,109:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,53:.:-1.85:1.000:. ./.:4:56,50:.:-0.85:1.000:. ./.:4:49,144:.: 1.57:1.000:. ./.:4:59,54:.:-0.65:1.000:. ./.:4:47,136:.: 1.29:1.000:. ./.:4:18,147:.: 0.79:1.000:. ./.:4:30,127:.: 0.57:1.000:. ./.:4:14,156:.: 0.93:1.000:. ./.:4:69,69:.: 0.04:1.000:. ./.:4:40,111:.: 0.40:1.000:. ./.:6:55,87:.: 0.15:1.000:. ./.:4:68,101:.: 0.90:1.000:. ./.:4:50,82:.:-0.13:1.000:. ./.:4:93,97:.: 1.49:1.000:. ./.:4:18,106:.:-0.35:1.000:. ./.:4:52,92:.: 0.21:1.000:. ./.:4:14,106:.:-0.46:1.000:. ./.:4:31,155:.: 1.38:1.000:. ./.:4:18,156:.: 1.04:1.000:. ./.:4:20,126:.: 0.26:0.887:. ./.:4:26,71:.:-1.10:1.000:. ./.:4:80,103:.: 1.29:1.000:. ./.:4:25,97:.:-0.40:0.999:. ./.:4:24,144:.: 0.88:1.000:. ./.:4:30,145:.: 1.07:1.000:. ./.:4:19,124:.: 0.18:1.000:. ./.:4:32,144:.: 1.10:1.000:. ./.:4:91,69:.: 0.65:1.000:. ./.:4:20,107:.:-0.26:1.000:. ./.:4:18,145:.: 0.74:1.000:. ./.:4:34,123:.: 0.57:1.000:. ./.:4:42,92:.:-0.07:0.968:. ./.:4:64,100:.: 0.77:1.000:. ./.:4:80,113:.: 1.57:1.000:. ./.:4:48,63:.:-0.71:1.000:. ./.:4:41,67:.:-0.79:1.000:. ./.:4:19,175:.: 1.60:1.000:. ./.:4:45,58:.:-0.93:1.000:. ./.:4:49,107:.: 0.54:1.000:. ./.:4:32,67:.:-1.04:1.000:. ./.:4:58,94:.: 0.43:1.000:. ./.:4:28,82:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,31:.:-1.77:1.000:. ./.:4:102,86:.: 1.43:1.000:. ./.:4:11,76:.:-1.38:1.000:. ./.:4:97,111:.: 1.99:1.000:. ./.:4:11,151:.: 0.71:1.000:. ./.:4:12,165:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,90:.:-1.29:1.000:. ./.:4:98,40:.: 0.04:1.000:. ./.:4:61,90:.: 0.40:1.000:. ./.:4:58,55:.:-0.65:1.000:. ./.:4:42,138:.: 1.21:1.000:. ./.:4:64,51:.:-0.60:1.000:. ./.:4:59,103:.: 0.71:0.960:. ./.:4:52,92:.: 0.21:1.000:. ./.:4:42,100:.: 0.15:1.000:. ./.:4:33,86:.:-0.49:1.000:. ./.:4:25,94:.:-0.49:1.000:. ./.:4:58,137:.: 1.63:0.993:. ./.:4:14,116:.:-0.18:1.000:. ./.:4:17,154:.: 0.96:1.000:. ./.:4:40,117:.: 0.57:1.000:. ./.:4:33,125:.: 0.60:0.999:. ./.:4:55,82:.: 0.01:1.000:. ./.:4:19,62:.:-1.54:1.000:. ./.:4:57,148:.: 1.91:1.000:. ./.:4:11,130:.: 0.13:1.000:. ./.:4:16,112:.:-0.24:1.000:. ./.:4:55,84:.: 0.07:1.000:. ./.:4:45,89:.:-0.07:1.000:. ./.:4:36,160:.: 1.66:1.000:. ./.:4:50,72:.:-0.40:1.000:. ./.:4:24,128:.: 0.43:1.000:. ./.:4:45,55:.:-1.02:1.000:. ./.:4:49,102:.: 0.40:1.000:. ./.:4:82,118:.: 1.77:1.000:. ./.:4:24,157:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.15:1.000:. ./.:4:28,63:.:-1.27:1.000:. ./.:4:37,58:.:-1.15:1.000:. ./.:4:27,82:.:-0.77:1.000:. ./.:4:13,143:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,50:.:-1.41:1.000:. ./.:4:18,63:.:-1.54:1.000:. ./.:4:44,61:.:-0.88:1.000:. ./.:4:66,53:.:-0.49:1.000:. ./.:4:13,123:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,83:.: 0.07:1.000:. ./.:4:29,110:.: 0.07:1.000:. ./.:4:67,101:.: 0.88:1.000:. ./.:4:40,127:.: 0.85:1.000:. ./.:4:23,112:.:-0.04:1.000:. ./.:4:52,96:.: 0.32:1.000:. ./.:4:58,92:.: 0.38:1.000:. ./.:4:54,115:.: 0.90:1.000:. ./.:4:56,121:.: 1.13:1.000:. ./.:4:88,49:.: 0.01:1.000:. ./.:4:29,147:.: 1.10:1.000:. ./.:4:45,89:.:-0.07:1.000:. ./.:4:24,118:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,134:.: 1.10:1.000:. ./.:4:34,92:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,92:.: 0.01:1.000:. ./.:4:20,98:.:-0.51:1.000:. ./.:4:14,128:.: 0.15:1.000:. ./.:4:43,121:.: 0.77:1.000:. ./.:4:39,227:.: 3.60:1.000:. ./.:4:38,86:.:-0.35:1.000:. ./.:4:56,31:.:-1.38:1.000:. ./.:4:52,85:.: 0.01:1.000:. ./.:4:38,145:.: 1.29:1.000:. ./.:4:16,70:.:-1.41:1.000:. ./.:4:29,70:.:-1.04:1.000:. ./.:4:38,87:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,43:.:-2.07:1.000:. ./.:4:19,94:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,79:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,84:.:-1.46:0.999:. ./.:4:16,66:.:-1.52:1.000:. ./.:4:33,60:.:-1.21:1.000:. ./.:4:43,57:.:-1.02:1.000:. ./.:4:33,64:.:-1.10:1.000:. ./.:4:13,105:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,78:.:-1.27:1.000:. ./.:4:12,93:.:-0.88:1.000:. ./.:4:13,99:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,124:.: 0.35:1.000:. ./.:4:40,126:.: 0.82:1.000:. ./.:4:32,125:.: 0.57:1.000:. ./.:4:8,123:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,143:.: 0.52:1.000:. ./.:4:36,165:.: 1.80:1.000:. ./.:4:24,117:.: 0.13:1.000:. ./.:4:26,74:.:-1.02:1.000:. ./.:4:16,117:.:-0.10:1.000:. -chr8.1 17393471 chr8.1_017393471 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:303,87:.: 0.28:1.000:. ./.:4:271,86:.:-0.14:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:212,189:.: 0.42:1.000:. ./.:4:334,117:.: 1.07:1.000:. ./.:4:319,111:.: 0.79:1.000:. ./.:4:115,102:.:-1.95:1.000:. ./.:4:203,170:.: 0.06:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:167,1:.:-2.58:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:410,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:379,2:.: 0.16:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:290,97:.: 0.24:1.000:. ./.:4:355,100:.: 1.12:0.999:. ./.:4:112,309:.: 0.68:1.000:. ./.:4:367,113:.: 1.44:1.000:. ./.:4:241,252:.: 1.61:1.000:. ./.:4:95,42:.:-2.98:1.000:. ./.:4:271,85:.:-0.16:1.000:. ./.:4:301,90:.: 0.29:1.000:. ./.:4:305,89:.: 0.33:1.000:. ./.:4:88,21:.:-3.34:1.000:. ./.:4:323,91:.: 0.59:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:339,87:.: 0.74:1.000:. ./.:4:337,111:.: 1.03:1.000:. ./.:4:356,99:.: 1.12:1.000:. ./.:4:354,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:50,40:.:-3.58:1.000:. ./.:4:152,42:.:-2.24:1.000:. ./.:3:31,79:.:-3.32:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:302,90:.: 0.31:1.000:. ./.:4:286,105:.: 0.29:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:518,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:323,93:.: 0.61:1.000:. ./.:4:288,93:.: 0.16:1.000:. ./.:4:217,241:.: 1.16:1.000:. ./.:4:298,65:.:-0.07:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:309,97:.: 0.49:1.000:. ./.:5:532,1:.: 2.12:1.000:. ./.:4:262,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:187,191:.: 0.13:1.000:. ./.:4:314,87:.: 0.42:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:355,96:.: 1.07:1.000:. ./.:4:275,102:.: 0.11:1.000:. ./.:4:345,101:.: 1.00:1.000:. ./.:4:182,147:.:-0.50:1.000:. ./.:4:226,236:.: 1.21:1.000:. ./.:4:179,187:.:-0.03:1.000:. ./.:4:343,102:.: 0.99:1.000:. ./.:4:327,104:.: 0.81:1.000:. ./.:6:243,88:.:-0.48:1.000:. ./.:4:311,115:.: 0.74:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:458,2:.: 1.18:1.000:. ./.:4:196,181:.: 0.11:1.000:. ./.:4:427,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:266,75:.:-0.35:1.000:. ./.:4:216,72:.:-1.03:1.000:. ./.:4:218,197:.: 0.60:1.000:. ./.:4:192,191:.: 0.19:0.887:. ./.:4:176,168:.:-0.31:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:215,76:.:-0.99:0.999:. ./.:4:493,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:181,161:.:-0.34:1.000:. ./.:4:294,100:.: 0.33:1.000:. ./.:4:234,61:.:-0.94:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:257,90:.:-0.27:1.000:. ./.:4:186,176:.:-0.08:1.000:. ./.:4:228,257:.: 1.50:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.99:0.968:. ./.:4:279,101:.: 0.15:1.000:. ./.:4:299,111:.: 0.54:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:230,238:.: 1.28:1.000:. ./.:4:189,54:.:-1.61:1.000:. ./.:4:222,87:.:-0.76:1.000:. ./.:4:283,78:.:-0.09:1.000:. ./.:4:360,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:151,130:.:-1.12:1.000:. ./.:4:296,91:.: 0.24:1.000:. ./.:4:447,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:152,124:.:-1.19:1.000:. ./.:4:338,94:.: 0.82:1.000:. ./.:4:254,222:.: 1.39:1.000:. ./.:4:141,165:.:-0.80:1.000:. ./.:4:248,88:.:-0.41:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:261,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:298,103:.: 0.42:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:250,94:.:-0.31:0.960:. ./.:4:325,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:290,85:.: 0.09:1.000:. ./.:4:279,80:.:-0.12:1.000:. ./.:4:281,84:.:-0.04:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.72:0.993:. ./.:4:191,174:.:-0.04:1.000:. ./.:4:156,156:.:-0.72:1.000:. ./.:4:418,138:.: 2.42:1.000:. ./.:4:179,197:.: 0.10:0.999:. ./.:4:389,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:136,95:.:-1.77:1.000:. ./.:4:288,97:.: 0.22:1.000:. ./.:4:160,174:.:-0.44:1.000:. ./.:4:165,154:.:-0.63:1.000:. ./.:4:285,87:.: 0.05:1.000:. ./.:4:304,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:293,106:.: 0.40:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:214,206:.: 0.67:1.000:. ./.:4:308,102:.: 0.54:1.000:. ./.:4:263,82:.:-0.30:1.000:. ./.:4:376,2:.: 0.13:1.000:. ./.:4:258,79:.:-0.40:1.000:. ./.:4:258,91:.:-0.25:1.000:. ./.:4:215,67:.:-1.11:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:231,76:.:-0.79:1.000:. ./.:4:181,180:.:-0.09:1.000:. ./.:4:194,56:.:-1.52:1.000:. ./.:4:211,160:.: 0.04:1.000:. ./.:4:247,78:.:-0.56:1.000:. ./.:4:345,108:.: 1.09:1.000:. ./.:4:179,171:.:-0.23:1.000:. ./.:4:283,83:.:-0.03:1.000:. ./.:4:152,165:.:-0.66:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:177,187:.:-0.05:1.000:. ./.:4:169,153:.:-0.59:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:221,75:.:-0.93:1.000:. ./.:4:238,198:.: 0.87:1.000:. ./.:4:237,239:.: 1.39:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:320,69:.: 0.27:1.000:. ./.:4:206,213:.: 0.65:1.000:. ./.:4:168,150:.:-0.65:1.000:. ./.:4:435,108:.: 2.25:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:165,2:.:-2.59:1.000:. ./.:4:201,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:237,188:.: 0.73:1.000:. ./.:4:278,95:.: 0.06:1.000:. ./.:4:322,96:.: 0.64:1.000:. ./.:4:352,109:.: 1.19:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:312,93:.: 0.47:1.000:. ./.:4:131,133:.:-1.34:1.000:. ./.:4:155,151:.:-0.80:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:191,187:.: 0.13:1.000:. ./.:4:288,84:.: 0.05:1.000:. ./.:4:161,184:.:-0.30:1.000:. ./.:4:256,83:.:-0.38:1.000:. ./.:4:260,91:.:-0.22:0.999:. ./.:4:151,179:.:-0.49:1.000:. ./.:4:267,77:.:-0.31:1.000:. ./.:4:268,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:267,77:.:-0.31:1.000:. ./.:4:272,101:.: 0.06:1.000:. ./.:4:298,77:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,190:.:-0.08:1.000:. ./.:4:226,75:.:-0.86:1.000:. ./.:4:343,112:.: 1.12:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:274,97:.: 0.04:1.000:. ./.:4:218,165:.: 0.19:1.000:. ./.:4:194,185:.: 0.14:1.000:. ./.:4:358,112:.: 1.31:1.000:. ./.:4:245,220:.: 1.25:1.000:. ./.:4:231,81:.:-0.72:1.000:. ./.:4:267,103:.: 0.02:1.000:. -chr8.1 17549431 chr8.1_017549431 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:219,199:0.49: 0.87:1.000:0.996 0/1/1/1:4:82,234:0.75:-0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,235:0.73:-0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:282,99:0.26: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:224,223:0.51: 1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,179:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,109:0.47:-1.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:215,176:0.46: 0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:296,98:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:72,203:0.75:-1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:188,94:0.34:-1.12:1.000:0.864 0/0/1/1:4:193,252:0.58: 1.26:1.000:0.923 0/0/1/1:4:172,175:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:226,199:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:270,90:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:91,250:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:188,170:0.49:-0.01:0.999:0.996 1/1/1/1:4:1,382:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:403,131:0.25: 2.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,208:0.47: 1.40:1.000:0.992 0/1/1/1:4:32,200:0.87:-1.85:1.000:0.933 0/1/1/1:4:82,235:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:336,99:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,90:0.27:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,85:0.38:-1.92:1.000:0.611 0/0/1/1:4:213,203:0.50: 0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:208,159:0.44: 0.12:1.000:0.973 0/0/1/1:4:178,178:0.51:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,212:0.49: 1.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:266,93:0.26: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:310,82:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:150,144:0.50:-0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,150:0.51:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,157:0.55:-0.97:1.000:0.980 0/0/1:3:202,57:0.22:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,168:0.46: 0.29:1.000:0.985 0/0/0/1:4:275,100:0.27: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:280,86:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,182:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:226,199:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:69,265:0.80:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,232:0.57: 0.86:1.000:0.952 0/1/1/1:4:122,361:0.76: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,154:0.48:-0.39:1.000:0.994 0/0/1/1:4:198,223:0.54: 0.91:1.000:0.987 0/0/0/1:4:274,104:0.28: 0.29:1.000:0.995 0/0/0/1/1:5:289,216:0.44: 2.14:1.000:0.921 0/0/0/1:4:80,20:0.20:-3.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,90:0.29:-0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:198,204:0.52: 0.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,239:0.80:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:338,115:0.26: 1.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,226:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,190:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,161:0.48:-0.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:315,102:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:175,179:0.52:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:224,180:0.46: 0.67:1.000:0.985 0/0/1/1:4:190,189:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:157,140:0.48:-0.90:1.000:0.873 0/0/1/1:4:185,208:0.54: 0.50:1.000:0.987 0/0/0/1:4:243,89:0.27:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:207,185:0.48: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:194,182:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:316,100:0.25: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,193:0.55: 0.01:1.000:0.980 0/0/0/1:4:211,47:0.19:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,177:0.52:-0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:208,179:0.47: 0.42:0.887:0.994 0/0/1/1:4:165,160:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:224,197:0.48: 0.91:1.000:0.995 0/1/1/1:4:78,230:0.76:-0.74:0.999:1.000 0/1/1/1:4:112,297:0.74: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:307,87:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,289:0.78: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:236,64:0.22:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,176:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:191,168:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:210,201:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,299:0.77: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,130:0.50:-1.36:0.968:0.997 0/0/0/1:4:309,119:0.28: 1.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:328,101:0.24: 1.03:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:167,195:0.55: 0.05:1.000:0.979 0/0/1/1:4:214,228:0.53: 1.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:57,189:0.78:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,177:0.54:-0.36:1.000:0.986 0/1/1/1:4:91,256:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:244,90:0.27:-0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,111:0.48:-1.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,280:0.77: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:219,215:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,71:0.27:-1.32:1.000:0.998 0/0/0/1:4:333,99:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,182:0.49: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:150,173:0.55:-0.52:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,331:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,224:0.52: 1.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:293,86:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,227:0.77:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:211,218:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:108,108:0.51:-2.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,188:0.51: 0.29:0.960:0.996 0/0/1/1:4:161,153:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,172:0.52:-0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:180,151:0.47:-0.40:1.000:0.991 0/1/1/1:4:92,254:0.74:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:236,278:0.55: 2.27:0.993:0.977 0/0/1/1:4:214,179:0.47: 0.50:1.000:0.991 0/0/1/1:4:200,221:0.54: 0.91:1.000:0.989 0/1/1/1:4:123,325:0.73: 1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:156,197:0.57:-0.08:0.999:0.948 0/0/0/1:4:321,108:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,132:0.51:-1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:311,122:0.29: 1.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:158,172:0.53:-0.42:1.000:0.991 0/0/1/1:4:175,178:0.52:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:250,90:0.27:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:163,159:0.51:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:278,103:0.28: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:264,86:0.25:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,284:0.78: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:93,232:0.72:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,81:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:316,82:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,172:0.48: 0.12:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,281:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,55:0.22:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,66:0.24:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:153,149:0.51:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:162,132:0.46:-0.94:1.000:0.988 0/0/0/1:4:176,52:0.23:-1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,229:0.54: 1.12:1.000:0.989 0/0/1/1:4:166,143:0.47:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:237,229:0.50: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,188:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,159:0.48:-0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:151,135:0.48:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,95:0.27: 0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:296,99:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,186:0.55:-0.18:1.000:0.980 0/0/0/1:4:254,100:0.29:-0.06:1.000:0.993 0/1/1/1:4:71,181:0.73:-1.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:356,134:0.28: 1.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:412,126:0.24: 2.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:282,90:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:272,96:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:379,122:0.25: 2.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:164,143:0.48:-0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:203,216:0.53: 0.88:1.000:0.993 0/1/1/1:4:88,253:0.75:-0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:137,81:0.38:-2.05:1.000:0.573 0/0/1/1:4:120,120:0.51:-1.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:124,296:0.71: 0.90:1.000:0.994 0/1/1/1:4:99,268:0.74: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:387,119:0.24: 2.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:336,103:0.24: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,146:0.48:-0.65:1.000:0.994 0/1/1/1:4:111,266:0.72: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:261,85:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,259:0.76:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,157:0.47:-0.23:1.000:0.992 0/0/1/1:4:180,168:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:186,158:0.47:-0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:178,163:0.49:-0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,126:0.48:-1.34:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,336:1.00:-0.33:0.999:1.000 0/0/1/1:4:149,175:0.55:-0.50:1.000:0.978 0/0/1/1:4:175,149:0.47:-0.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:80,189:0.71:-1.31:1.000:0.993 0/0/0/1:4:204,66:0.25:-1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,146:0.47:-0.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:95,219:0.71:-0.65:1.000:0.990 0/1/1/1:4:87,240:0.74:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,110:0.44:-1.53:1.000:0.973 0/1/1/1:4:105,261:0.72: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:114,320:0.75: 1.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,269:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,201:0.62:-0.42:1.000:0.570 0/0/1/1:4:218,156:0.43: 0.23:1.000:0.939 0/0/0/1:4:367,103:0.22: 1.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:144,365:0.73: 2.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:148,134:0.49:-1.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:108,282:0.73: 0.46:1.000:0.998 -chr8.1 17983539 chr8.1_017983539 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:288,170:.: 0.34:1.000:. ./.:4:198,116:.:-1.08:1.000:. ./.:4:218,172:.:-0.33:1.000:. ./.:4:347,39:.:-0.37:1.000:. ./.:4:385,207:.: 1.67:1.000:. ./.:4:215,124:.:-0.83:1.000:. ./.:4:165,85:.:-1.71:1.000:. ./.:4:277,81:.:-0.65:1.000:. ./.:4:275,103:.:-0.45:1.000:. ./.:4:125,50:.:-2.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:329,106:.: 0.12:1.000:. ./.:4:220,134:.:-0.69:1.000:. ./.:4:273,105:.:-0.45:1.000:. ./.:4:314,101:.:-0.08:1.000:. ./.:4:217,139:.:-0.67:1.000:. ./.:4:327,99:.: 0.03:0.999:. ./.:4:251,233:.: 0.60:1.000:. ./.:4:449,132:.: 1.56:1.000:. ./.:4:241,142:.:-0.40:1.000:. ./.:4:98,75:.:-2.47:1.000:. ./.:4:187,189:.:-0.47:1.000:. ./.:4:347,53:.:-0.23:1.000:. ./.:4:262,88:.:-0.72:1.000:. ./.:4:81,14:.:-3.24:1.000:. ./.:4:364,132:.: 0.72:1.000:. ./.:4:221,73:.:-1.28:1.000:. ./.:4:292,66:.:-0.65:1.000:. ./.:4:332,104:.: 0.13:1.000:. ./.:4:266,82:.:-0.74:1.000:. ./.:4:328,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:216,60:.:-1.46:1.000:. ./.:4:52,19:.:-3.48:1.000:. ./.:4:166,72:.:-1.83:1.000:. ./.:3:48,6:.:-3.65:1.000:. ./.:4:293,90:.:-0.40:1.000:. ./.:4:326,127:.: 0.29:1.000:. ./.:4:278,115:.:-0.30:1.000:. ./.:4:358,127:.: 0.61:1.000:. ./.:4:346,125:.: 0.47:1.000:. ./.:4:206,207:.:-0.10:1.000:. ./.:4:403,110:.: 0.89:1.000:. ./.:4:366,191:.: 1.32:1.000:. ./.:4:382,104:.: 0.62:1.000:. ./.:4:346,209:.: 1.30:1.000:. ./.:4:481,53:.: 1.09:1.000:. ./.:5:421,203:.: 1.98:1.000:. ./.:4:153,23:.:-2.44:1.000:. ./.:4:461,61:.: 0.97:1.000:. ./.:4:288,121:.:-0.14:1.000:. ./.:4:214,209:.: 0.00:1.000:. ./.:4:481,150:.: 2.05:1.000:. ./.:4:270,251:.: 0.97:1.000:. ./.:4:400,135:.: 1.10:1.000:. ./.:4:331,81:.:-0.11:1.000:. ./.:4:461,54:.: 0.91:1.000:. ./.:4:351,107:.: 0.34:1.000:. ./.:4:372,193:.: 1.40:1.000:. ./.:4:370,116:.: 0.62:1.000:. ./.:6:335,76:.:-0.12:1.000:. ./.:4:398,113:.: 0.87:1.000:. ./.:4:365,111:.: 0.52:1.000:. ./.:4:502,121:.: 1.97:1.000:. ./.:4:372,77:.: 0.25:1.000:. ./.:4:371,104:.: 0.51:1.000:. ./.:4:331,219:.: 1.25:1.000:. ./.:4:219,28:.:-1.74:1.000:. ./.:4:316,107:.: 0.00:1.000:. ./.:4:310,136:.: 0.22:0.887:. ./.:4:316,81:.:-0.26:1.000:. ./.:4:422,125:.: 1.22:1.000:. ./.:4:249,146:.:-0.28:0.999:. ./.:4:382,203:.: 1.60:1.000:. ./.:4:414,59:.: 0.49:1.000:. ./.:4:319,161:.: 0.56:1.000:. ./.:4:387,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:315,178:.: 0.69:1.000:. ./.:4:342,177:.: 0.95:1.000:. ./.:4:420,110:.: 1.05:1.000:. ./.:4:345,187:.: 1.07:1.000:. ./.:4:268,106:.:-0.49:0.968:. ./.:4:399,132:.: 1.06:1.000:. ./.:4:444,122:.: 1.41:1.000:. ./.:4:298,105:.:-0.20:1.000:. ./.:4:305,95:.:-0.23:1.000:. ./.:4:393,110:.: 0.79:1.000:. ./.:4:178,179:.:-0.66:1.000:. ./.:4:285,143:.: 0.05:1.000:. ./.:4:207,235:.: 0.18:1.000:. ./.:4:337,110:.: 0.23:1.000:. ./.:4:285,120:.:-0.18:1.000:. ./.:4:252,204:.: 0.32:1.000:. ./.:4:393,229:.: 1.96:1.000:. ./.:4:256,30:.:-1.36:1.000:. ./.:4:389,115:.: 0.80:1.000:. ./.:4:371,104:.: 0.51:1.000:. ./.:4:312,98:.:-0.13:1.000:. ./.:4:207,189:.:-0.27:1.000:. ./.:4:387,188:.: 1.50:1.000:. ./.:4:355,148:.: 0.79:1.000:. ./.:4:165,173:.:-0.84:1.000:. ./.:4:330,189:.: 0.95:1.000:. ./.:4:216,107:.:-0.99:1.000:. ./.:4:319,157:.: 0.52:0.960:. ./.:4:298,101:.:-0.24:1.000:. ./.:4:296,172:.: 0.44:1.000:. ./.:4:328,152:.: 0.56:1.000:. ./.:4:196,133:.:-0.93:1.000:. ./.:4:370,209:.: 1.54:0.993:. ./.:4:340,110:.: 0.26:1.000:. ./.:4:395,112:.: 0.83:1.000:. ./.:4:289,170:.: 0.35:1.000:. ./.:4:302,161:.: 0.39:0.999:. ./.:4:367,99:.: 0.42:1.000:. ./.:4:221,109:.:-0.92:1.000:. ./.:4:341,144:.: 0.61:1.000:. ./.:4:358,115:.: 0.49:1.000:. ./.:4:347,113:.: 0.36:1.000:. ./.:4:385,125:.: 0.86:1.000:. ./.:4:302,188:.: 0.66:1.000:. ./.:4:471,62:.: 1.08:1.000:. ./.:4:346,129:.: 0.51:1.000:. ./.:4:308,166:.: 0.50:1.000:. ./.:4:174,165:.:-0.83:1.000:. ./.:4:398,117:.: 0.91:1.000:. ./.:4:417,121:.: 1.13:1.000:. ./.:4:386,122:.: 0.84:1.000:. ./.:4:201,185:.:-0.37:1.000:. ./.:4:274,100:.:-0.49:1.000:. ./.:4:240,92:.:-0.90:1.000:. ./.:4:294,161:.: 0.31:1.000:. ./.:4:284,78:.:-0.61:1.000:. ./.:4:186,75:.:-1.60:1.000:. ./.:4:298,159:.: 0.33:1.000:. ./.:4:343,92:.: 0.12:1.000:. ./.:4:311,177:.: 0.64:1.000:. ./.:4:348,85:.: 0.10:1.000:. ./.:4:314,81:.:-0.28:1.000:. ./.:4:242,163:.:-0.18:1.000:. ./.:4:342,140:.: 0.58:1.000:. ./.:4:495,43:.: 1.13:1.000:. ./.:4:346,102:.: 0.24:1.000:. ./.:4:246,84:.:-0.92:1.000:. ./.:4:223,130:.:-0.69:1.000:. ./.:4:419,142:.: 1.36:1.000:. ./.:4:418,151:.: 1.44:1.000:. ./.:4:300,94:.:-0.29:1.000:. ./.:4:400,56:.: 0.32:1.000:. ./.:4:362,144:.: 0.82:1.000:. ./.:4:285,148:.: 0.10:1.000:. ./.:4:312,107:.:-0.04:1.000:. ./.:4:241,149:.:-0.33:1.000:. ./.:4:131,31:.:-2.58:1.000:. ./.:4:171,113:.:-1.38:1.000:. ./.:4:307,186:.: 0.69:1.000:. ./.:4:290,155:.: 0.21:1.000:. ./.:4:415,57:.: 0.48:1.000:. ./.:4:302,115:.:-0.06:1.000:. ./.:4:221,129:.:-0.72:1.000:. ./.:4:244,235:.: 0.55:1.000:. ./.:4:342,38:.:-0.43:1.000:. ./.:4:235,137:.:-0.51:1.000:. ./.:4:227,148:.:-0.48:1.000:. ./.:4:315,108:.: 0.00:1.000:. ./.:4:239,59:.:-1.24:1.000:. ./.:4:238,131:.:-0.54:1.000:. ./.:4:210,122:.:-0.90:1.000:. ./.:4:199,183:.:-0.41:0.999:. ./.:4:223,136:.:-0.64:1.000:. ./.:4:287,81:.:-0.55:1.000:. ./.:4:160,157:.:-1.05:1.000:. ./.:4:270,85:.:-0.68:1.000:. ./.:4:258,164:.:-0.01:1.000:. ./.:4:231,146:.:-0.46:1.000:. ./.:4:219,140:.:-0.64:1.000:. ./.:4:271,78:.:-0.73:1.000:. ./.:4:251,158:.:-0.14:1.000:. ./.:4:278,164:.: 0.18:1.000:. ./.:4:289,150:.: 0.15:1.000:. ./.:4:249,98:.:-0.75:1.000:. ./.:4:298,106:.:-0.19:1.000:. ./.:4:411,43:.: 0.30:1.000:. ./.:4:271,172:.: 0.19:1.000:. ./.:4:238,113:.:-0.71:1.000:. ./.:4:315,176:.: 0.67:1.000:. -chr8.1 18283682 chr8.1_018283682 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,71:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,94:.: 2.43:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,108:.: 3.07:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.85:0.999:. ./.:4:0,54:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,97:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,84:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,75:.: 1.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,81:.: 1.83:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,98:.: 2.61:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.87:1.000:. ./.:3:0,3:.:-1.78:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,91:.: 2.29:1.000:. ./.:4:0,84:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.21:1.000:. ./.:5:0,50:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,47:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,69:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.07:1.000:. ./.:6:0,27:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.02:0.887:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.11:0.999:. ./.:4:0,69:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,53:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,59:.: 0.81:0.968:. ./.:4:0,14:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.36:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1,28:.:-0.58:0.960:. ./.:4:0,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.22:1.000:. ./.:4:1,8:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.67:0.993:. ./.:4:0,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.62:0.999:. ./.:4:0,39:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1,66:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,19:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.27:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,39:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,71:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,76:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,86:.: 2.06:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,88:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,82:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,64:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.13:0.999:. ./.:4:0,47:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,65:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,63:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,80:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,36:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,94:.: 2.43:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,64:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,96:.: 2.52:1.000:. ./.:4:0,72:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,62:.: 0.95:1.000:. -chr8.1 18320176 chr8.1_018320176 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,428:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,301:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.00:1.000:. ./.:4:144,190:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1,351:.: 0.37:1.000:. ./.:4:129,358:.: 1.89:1.000:. ./.:4:72,163:.:-0.95:1.000:. ./.:4:110,171:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,184:.:-1.53:1.000:. ./.:4:0,119:.:-2.26:1.000:. ./.:4:0,549:.: 2.59:1.000:. ./.:4:4,297:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,318:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,309:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,302:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,265:.:-0.60:0.999:. ./.:4:0,338:.: 0.21:1.000:. ./.:4:158,394:.: 2.62:1.000:. ./.:4:160,294:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,414:.: 1.07:1.000:. ./.:4:170,223:.: 0.83:1.000:. ./.:4:107,261:.: 0.55:1.000:. ./.:4:64,66:.:-2.14:1.000:. ./.:4:91,257:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1,327:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,309:.:-0.11:1.000:. ./.:4:145,377:.: 2.29:1.000:. ./.:4:115,268:.: 0.72:1.000:. ./.:4:111,151:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,268:.:-0.58:1.000:. ./.:4:35,51:.:-2.64:1.000:. ./.:4:6,145:.:-1.90:1.000:. ./.:3:46,59:.:-2.42:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.81:1.000:. ./.:4:106,222:.: 0.09:1.000:. ./.:4:127,302:.: 1.24:1.000:. ./.:4:2,198:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,393:.: 0.83:1.000:. ./.:4:2,257:.:-0.68:1.000:. ./.:4:117,246:.: 0.49:1.000:. ./.:4:96,211:.:-0.14:1.000:. ./.:4:7,320:.: 0.08:1.000:. ./.:4:133,193:.: 0.07:1.000:. ./.:5:1,497:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,320:.: 0.00:1.000:. ./.:4:96,114:.:-1.24:1.000:. ./.:4:102,187:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,327:.: 0.08:1.000:. ./.:4:131,349:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,375:.: 0.63:1.000:. ./.:4:132,320:.: 1.49:1.000:. ./.:4:121,186:.:-0.14:1.000:. ./.:4:99,129:.:-1.03:1.000:. ./.:4:112,175:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,249:.:-0.80:1.000:. ./.:4:104,206:.:-0.11:1.000:. ./.:6:27,236:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,310:.:-0.09:1.000:. ./.:4:4,240:.:-0.85:1.000:. ./.:4:4,265:.:-0.57:1.000:. ./.:4:82,140:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,295:.:-0.28:1.000:. ./.:4:85,241:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,106:.:-1.52:1.000:. ./.:4:134,177:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,231:.: 0.22:0.887:. ./.:4:1,306:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.41:1.000:. ./.:4:57,136:.:-1.43:0.999:. ./.:4:0,281:.:-0.44:1.000:. ./.:4:127,188:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,345:.: 0.29:1.000:. ./.:4:90,129:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,322:.: 0.03:1.000:. ./.:4:110,281:.: 0.81:1.000:. ./.:4:103,161:.:-0.63:1.000:. ./.:4:127,263:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,283:.:-0.41:0.968:. ./.:4:3,291:.:-0.29:1.000:. ./.:4:6,336:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.97:1.000:. ./.:4:1,216:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,182:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.19:1.000:. ./.:4:6,243:.:-0.80:1.000:. ./.:4:1,325:.: 0.07:1.000:. ./.:4:2,282:.:-0.40:1.000:. ./.:4:87,222:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,350:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,382:.: 0.70:1.000:. ./.:4:93,123:.:-1.17:1.000:. ./.:4:2,299:.:-0.21:1.000:. ./.:4:124,136:.:-0.67:1.000:. ./.:4:120,166:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,450:.: 1.47:1.000:. ./.:4:1,323:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,252:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1,271:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,276:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1,280:.:-0.44:0.960:. ./.:4:3,225:.:-1.03:1.000:. ./.:4:1,241:.:-0.88:1.000:. ./.:4:1,218:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,321:.: 0.02:1.000:. ./.:4:1,388:.: 0.78:0.993:. ./.:4:141,161:.:-0.20:1.000:. ./.:4:113,157:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,311:.:-0.10:1.000:. ./.:4:115,287:.: 0.93:0.999:. ./.:4:3,288:.:-0.32:1.000:. ./.:4:98,201:.:-0.23:1.000:. ./.:4:119,339:.: 1.56:1.000:. ./.:4:97,137:.:-0.97:1.000:. ./.:4:84,158:.:-0.88:1.000:. ./.:4:122,275:.: 0.87:1.000:. ./.:4:3,252:.:-0.73:1.000:. ./.:4:138,229:.: 0.54:1.000:. ./.:4:5,292:.:-0.26:1.000:. ./.:4:110,269:.: 0.67:1.000:. ./.:4:1,455:.: 1.54:1.000:. ./.:4:112,273:.: 0.74:1.000:. ./.:4:5,304:.:-0.12:1.000:. ./.:4:125,204:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.85:1.000:. ./.:4:72,215:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,207:.:-1.26:1.000:. ./.:4:95,267:.: 0.48:1.000:. ./.:4:111,193:.:-0.18:1.000:. ./.:4:70,191:.:-0.66:1.000:. ./.:4:123,268:.: 0.81:1.000:. ./.:4:2,328:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,518:.: 2.24:1.000:. ./.:4:130,168:.:-0.24:1.000:. ./.:4:2,283:.:-0.39:1.000:. ./.:4:116,268:.: 0.73:1.000:. ./.:4:3,287:.:-0.33:1.000:. ./.:4:125,183:.:-0.13:1.000:. ./.:4:114,211:.: 0.06:1.000:. ./.:4:4,295:.:-0.23:1.000:. ./.:4:2,223:.:-1.07:1.000:. ./.:4:168,379:.: 2.57:1.000:. ./.:4:130,376:.: 2.10:1.000:. ./.:4:0,398:.: 0.89:1.000:. ./.:4:139,213:.: 0.37:1.000:. ./.:4:135,355:.: 1.92:1.000:. ./.:4:109,246:.: 0.40:1.000:. ./.:4:136,369:.: 2.09:1.000:. ./.:4:0,271:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,133:.:-2.11:1.000:. ./.:4:1,273:.:-0.51:1.000:. ./.:4:160,265:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,300:.:-0.22:1.000:. ./.:4:140,253:.: 0.83:1.000:. ./.:4:124,300:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,378:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,417:.: 1.10:1.000:. ./.:4:121,164:.:-0.39:1.000:. ./.:4:76,194:.:-0.56:1.000:. ./.:4:1,239:.:-0.90:1.000:. ./.:4:110,261:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,271:.:-0.54:1.000:. ./.:4:102,283:.: 0.74:1.000:. ./.:4:2,191:.:-1.43:1.000:. ./.:4:0,387:.: 0.76:0.999:. ./.:4:128,243:.: 0.58:1.000:. ./.:4:106,284:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1,346:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,214:.:-0.19:1.000:. ./.:4:119,248:.: 0.54:1.000:. ./.:4:121,274:.: 0.85:1.000:. ./.:4:84,150:.:-0.97:1.000:. ./.:4:82,124:.:-1.28:1.000:. ./.:4:104,330:.: 1.29:1.000:. ./.:4:2,317:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,257:.:-0.71:1.000:. ./.:4:87,239:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,225:.: 0.28:1.000:. ./.:4:153,264:.: 1.10:1.000:. ./.:4:150,439:.: 3.04:1.000:. ./.:4:0,227:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1,429:.: 1.25:1.000:. -chr8.1 18400862 chr8.1_018400862 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,194:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,246:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,245:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,119:.:-1.30:1.000:. ./.:4:0,219:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,32:.:-3.05:1.000:. ./.:4:0,33:.:-3.03:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,278:.: 1.91:0.999:. ./.:4:0,232:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,235:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,25:.:-3.19:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,17:.:-3.35:1.000:. ./.:4:0,258:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,244:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,245:.: 1.25:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,26:.:-3.17:1.000:. ./.:4:0,51:.:-2.67:1.000:. ./.:3:0,21:.:-3.27:1.000:. ./.:4:0,240:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,262:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,187:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.14:1.000:. ./.:5:0,260:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,118:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,207:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.21:1.000:. ./.:6:0,138:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,202:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,268:.: 1.71:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,133:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.52:0.887:. ./.:4:0,172:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.73:0.999:. ./.:4:0,177:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,141:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,251:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,224:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.43:0.968:. ./.:4:1,187:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,123:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,142:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,254:.: 1.43:1.000:. ./.:4:0,106:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,113:.:-1.42:1.000:. ./.:4:1,185:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.04:0.960:. ./.:4:0,138:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.99:0.993:. ./.:4:0,212:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,277:.: 1.89:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.12:0.999:. ./.:4:0,211:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,130:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,111:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,203:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,131:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,154:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.40:1.000:. ./.:4:0,183:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,253:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,104:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,252:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,237:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,31:.:-3.07:1.000:. ./.:4:0,120:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1,206:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.30:1.000:. ./.:4:0,194:.: 0.22:1.000:. ./.:4:2,188:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,241:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,188:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,208:.: 0.50:0.999:. ./.:4:0,178:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,186:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,148:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,185:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,170:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,167:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,272:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,237:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,219:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,204:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,262:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,161:.:-0.45:1.000:. -chr8.1 18612011 chr8.1_018612011 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:35,33:0.47: 0.98:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,38:0.70:-0.01:1.000:0.983 0/1/1/1:4:8,43:0.82:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,26:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,43:0.54: 1.54:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,35:0.54: 0.61:1.000:0.986 0/0/0/1:4:31,11:0.30:-0.64:1.000:0.987 0/0/1/1:4:30,29:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,40:0.73:-0.01:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-3.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-3.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00: 1.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,53:0.90: 0.36:1.000:0.778 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 1.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,61:0.82: 1.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,40:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,45:0.75: 0.30:0.999:0.999 0/0/1/1:4:33,36:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,41:0.51: 1.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:50,16:0.28: 0.86:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-3.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,25:0.45: 0.17:1.000:0.979 0/1/1/1:4:16,38:0.67: 0.11:1.000:0.931 0/0/1/1:4:20,30:0.58:-0.14:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-3.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,49:0.80: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,28:0.79:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,59:0.74: 1.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,25:0.56:-0.57:1.000:0.970 0/1/1/1:4:17,48:0.71: 0.79:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.06:-3.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-3.18:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,56:1.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,30:0.46: 0.73:1.000:0.988 0/0/1/1:4:25,37:0.57: 0.61:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.47: 0.55:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,36:0.79:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,24:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,32:0.64:-0.26:1.000:0.664 0/1/1/1:4:18,42:0.67: 0.48:1.000:0.917 0/1/1/1:4:11,44:0.77: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:23,74:0.73: 2.78:1.000:0.803 0/0/1/1:4:5,6:0.52:-2.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:23,38:0.60: 0.55:1.000:0.815 0/0/1/1:4:22,13:0.38:-1.07:1.000:0.622 0/1/1/1:4:7,23:0.73:-1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,40:0.50: 1.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,22:0.45:-0.26:1.000:0.982 0/1/1/1:4:15,66:0.78: 1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,37:0.62: 0.30:1.000:0.550 0/0/1/1:4:24,24:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,38:0.55: 0.86:1.000:0.977 0/0/1/1:4:22,23:0.49:-0.45:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,32:0.77:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:8,24:0.72:-1.26:1.000:0.793 0/1/1/1:4:15,48:0.73: 0.67:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,56:0.78: 1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,26:0.54:-0.39:1.000:0.986 0/1/1/1:4:17,46:0.70: 0.67:1.000:0.983 0/0/1/1:4:23,26:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,30:0.73:-0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:25,34:0.55: 0.42:1.000:0.976 0/0/0/1:4:38,12:0.28:-0.14:0.887:0.995 0/0/1/1:4:29,20:0.41:-0.20:1.000:0.881 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,31:0.78:-0.88:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,33:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,45:0.82: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,35:0.70:-0.26:1.000:0.982 0/1/1/1:4:11,38:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,17:0.46:-1.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:32,36:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,28:0.56:-0.26:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.39:0.968:1.000 0/0/1/1:4:24,42:0.61: 0.86:1.000:0.696 0/0/1/1:4:32,26:0.44: 0.36:1.000:0.974 0/1/1/1:4:7,45:0.84:-0.01:1.000:0.994 1/1/1/1:4:1,40:0.97:-0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,35:0.61: 0.17:1.000:0.696 0/0/1/1:4:16,29:0.62:-0.45:1.000:0.606 0/0/1/1:4:18,17:0.47:-1.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:24,22:0.47:-0.39:1.000:0.991 0/1/1/1:4:13,52:0.77: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,12:0.28:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,33:0.57: 0.23:1.000:0.957 0/1/1/1:4:17,46:0.70: 0.67:1.000:0.983 0/0/0/1:4:25,14:0.37:-0.82:1.000:0.505 0/0/1/1:4:22,29:0.55:-0.08:1.000:0.983 0/0/1/1:4:34,22:0.40: 0.23:1.000:0.799 0/0/1/1:4:21,24:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,24:0.87:-1.57:1.000:0.911 0/1/1/1:4:8,47:0.83: 0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:16,51:0.73: 0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,52:0.81: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,31:0.69:-0.57:1.000:0.971 0/1/1/1:4:8,36:0.79:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,29:0.58:-0.26:0.960:0.916 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,37:0.59: 0.48:1.000:0.857 0/0/1/1:4:18,17:0.47:-1.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:22,52:0.67: 1.35:1.000:0.927 0/1/1/1:4:14,65:0.79: 1.66:0.993:1.000 0/0/1/1:4:31,27:0.46: 0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:26,27:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,61:0.83: 1.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,12:0.31:-0.51:0.999:0.978 0/1/1/1:4:20,43:0.65: 0.67:1.000:0.816 0/0/0/1:4:21,7:0.29:-1.51:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,27:0.58:-0.45:1.000:0.930 0/0/1/1:4:25,22:0.46:-0.32:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,21:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,28:0.54:-0.14:1.000:0.989 0/1/1/1:4:11,37:0.74:-0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,52:0.88: 0.36:1.000:0.787 0/1/1/1:4:14,35:0.68:-0.20:1.000:0.959 0/0/1/1:4:22,19:0.46:-0.70:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,24:0.58:-0.76:1.000:0.930 0/0/1/1:4:19,16:0.45:-1.07:1.000:0.981 0/1/1/1:4:16,38:0.67: 0.11:1.000:0.931 0/1/1/1:4:7,39:0.82:-0.39:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,33:0.75:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,17:0.60:-1.57:1.000:0.761 0/1/1/1:4:7,31:0.78:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,21:0.59:-1.13:1.000:0.851 0/0/1/1:4:32,41:0.54: 1.29:1.000:0.988 0/1/1/1:4:9,21:0.67:-1.38:1.000:0.917 0/0/0/1:4:31,7:0.23:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,38:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,29:0.45: 0.67:1.000:0.983 0/0/1/1:4:24,30:0.53: 0.11:1.000:0.991 0/1/1/1:4:6,39:0.84:-0.45:1.000:0.993 0/0/0/1:4:29,16:0.37:-0.45:1.000:0.541 0/1/1/1:4:13,28:0.65:-0.70:1.000:0.819 0/0/1/1:4:25,27:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,26:0.59:-0.64:1.000:0.842 0/1/1/1:4:11,45:0.77: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,24:0.77:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,18:0.26: 1.91:1.000:0.998 0/0/0/1:4:49,26:0.36: 1.42:1.000:0.632 0/1/1/1:4:17,63:0.75: 1.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,59:0.78: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,18:0.28: 1.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,13:0.29:-0.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:21,34:0.59: 0.17:1.000:0.848 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.17:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:11,42:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,46:0.72: 0.55:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,59:0.80: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,37:0.56: 0.67:1.000:0.961 0/1/1/1:4:13,38:0.71:-0.08:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,37:0.50: 1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,31:0.51: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,24:0.52:-0.51:1.000:0.994 0/1/1/1:4:9,45:0.80: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,23:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,33:0.63:-0.14:1.000:0.585 0/0/0/1:4:37,14:0.31:-0.08:1.000:0.976 0/0/1/1:4:26,24:0.47:-0.14:1.000:0.992 0/1/1/1:4:13,44:0.74: 0.30:0.999:0.998 0/0/0/1:4:41,18:0.33: 0.42:1.000:0.912 0/1/1/1:4:13,42:0.73: 0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,43:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,21:0.53:-0.88:1.000:0.992 0/0/1/1:4:23,35:0.58: 0.36:1.000:0.919 0/1/1/1:4:7,51:0.86: 0.36:1.000:0.971 0/1/1/1:4:15,29:0.63:-0.51:1.000:0.574 0/1/1/1:4:13,50:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,59:0.73: 1.54:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,59:0.73: 1.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,27:0.56:-0.39:1.000:0.961 0/0/1/1:4:31,28:0.47: 0.42:1.000:0.990 0/1/1/1:4:16,53:0.73: 1.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,41:0.50: 1.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,25:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,42:0.70: 0.30:1.000:0.988 -chr8.1 18823606 chr8.1_018823606 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:41,217:0.81: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,44:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,89:0.45:-0.11:1.000:0.979 0/0/0/1:4:150,58:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:209,58:0.20: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,51:0.20: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,25:0.23:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,110:0.47: 0.57:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,7:0.16:-2.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,13:0.24:-2.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,93:0.41: 0.43:1.000:0.836 0/0/0/1:4:130,52:0.26:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,117:0.47: 0.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:105,126:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:170,78:0.29: 1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:115,133:0.50: 1.13:0.999:0.997 0/0/0/1:4:186,70:0.25: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:125,140:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:198,76:0.25: 1.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,34:0.60:-2.65:1.000:0.768 0/0/1/1:4:88,91:0.47:-0.21:1.000:0.993 0/0/0/1:4:145,51:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,114:0.57:-0.07:1.000:0.933 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-3.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,145:0.53: 1.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:99,111:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,124:0.54: 0.45:1.000:0.984 0/0/1/1:4:127,133:0.48: 1.36:1.000:0.994 0/0/1/1:4:111,148:0.53: 1.34:1.000:0.990 0/0/0/1:4:158,79:0.30: 0.92:1.000:0.981 0/0/1/1:4:87,106:0.51: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-3.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,9:0.13:-2.49:1.000:0.932 0/0/1:3:5,3:0.34:-3.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,111:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,117:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,113:0.48: 0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,112:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,135:0.52: 1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:100,114:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:115,130:0.49: 1.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,54:0.23: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,93:0.42: 0.26:1.000:0.931 0/0/0/1:4:147,57:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,61:0.25: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:132,207:0.57: 2.90:1.000:0.945 0/0/1/1:4:59,95:0.58:-0.69:1.000:0.919 0/0/0/1:4:109,58:0.32:-0.44:1.000:0.960 0/0/0/1:4:150,59:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,108:0.52: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,121:0.45: 1.15:1.000:0.981 0/0/1/1:4:93,101:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,129:0.52: 0.82:1.000:0.995 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,58:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,174:0.74: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,109:0.58:-0.26:1.000:0.910 0/0/0/1/1/1:6:81,82:0.47:-0.52:1.000:0.832 0/0/1/1:4:71,100:0.55:-0.36:1.000:0.982 0/0/1/1:4:92,117:0.52: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:103,131:0.52: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,116:0.53: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:131,56:0.27:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,37:0.23:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,67:0.29: 0.34:0.887:0.989 0/0/1/1:4:86,126:0.56: 0.43:1.000:0.972 0/0/1/1:4:107,122:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,25:0.22:-1.68:0.999:1.000 0/0/0/1:4:155,66:0.27: 0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:163,53:0.22: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,57:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,39:0.27:-1.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,167:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,52:0.27:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:197,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,68:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,83:0.50:-0.67:0.968:0.997 0/0/1/1:4:90,103:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,95:0.44: 0.18:1.000:0.972 0/0/1/1:4:101,95:0.45: 0.12:1.000:0.980 0/0/1/1:4:74,116:0.57: 0.01:1.000:0.940 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,81:0.55:-1.02:1.000:0.976 0/0/0/1:4:108,57:0.32:-0.48:1.000:0.964 0/0/1/1:4:84,88:0.48:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,106:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,43:0.27:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:72,108:0.56:-0.19:1.000:0.963 0/1/1/1:4:46,156:0.73: 0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,39:0.19:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,111:0.53: 0.10:1.000:0.991 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,145:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,134:0.55: 0.74:1.000:0.980 0/0/1/1:4:48,65:0.54:-1.49:1.000:0.989 0/0/0/1:4:124,56:0.28:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,121:0.77:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,58:0.27: 0.12:0.960:0.998 0/0/1/1:4:76,100:0.53:-0.26:1.000:0.992 0/0/0/1:4:131,40:0.21:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,39:0.27:-1.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:154,50:0.22: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,82:0.26: 1.77:0.993:0.998 0/0/0/0:4:186,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:141,1:0.01:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,83:0.23: 2.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,52:0.25: 0.03:0.999:1.000 0/0/1/1:4:88,88:0.47:-0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:77,36:0.29:-1.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,104:0.53:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,75:0.50:-0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,48:0.27:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:156,61:0.25: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,96:0.45: 0.18:1.000:0.978 0/0/0/1:4:149,51:0.23: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,122:0.54: 0.45:1.000:0.990 0/0/1/1:4:81,108:0.53:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:119,121:0.47: 0.98:1.000:0.992 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,80:0.52:-0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:81,92:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:120,54:0.28:-0.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,52:0.43:-1.49:1.000:0.937 0/0/0/1:4:155,61:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:102,97:0.45: 0.18:1.000:0.983 0/1/1/1:4:59,187:0.72: 1.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,94:0.54:-0.50:1.000:0.990 0/0/0/1:4:110,36:0.22:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,105:0.47: 0.38:1.000:0.991 0/0/0/1:4:124,51:0.26:-0.28:1.000:0.998 0/0/0/0:4:163,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,125:0.56: 0.38:1.000:0.967 0/0/0/1:4:84,28:0.23:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,122:0.42: 1.52:1.000:0.921 0/0/1/1:4:129,157:0.51: 1.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,226:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,41:0.19: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,122:0.46: 1.15:1.000:0.985 0/0/0/1:4:127,51:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,143:0.49: 1.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:145,43:0.21:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.40:-3.13:1.000:0.755 0/0/0/1:4:95,29:0.21:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,68:0.26: 0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:162,48:0.21: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,52:0.20: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,122:0.52: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,133:0.68:-0.11:1.000:0.958 0/0/1/1:4:96,102:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:127,42:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,54:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,47:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,120:0.53: 0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:99,112:0.49: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,62:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,48:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.44:0.999:1.000 0/0/0/1:4:136,46:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,103:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,80:0.47:-0.63:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,95:0.57:-0.67:1.000:0.933 0/0/0/1:4:128,38:0.21:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,49:0.28:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,62:0.31:-0.17:1.000:0.969 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,71:0.27: 0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:175,71:0.26: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,56:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,56:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,84:0.29: 1.50:1.000:0.994 0/0/0/1:4:117,40:0.23:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,61:0.26: 0.39:1.000:0.999 -chr8.1 19254060 chr8.1_019254060 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:45,83:0.67: 0.71:1.000:0.931 0/1/1/1:4:26,46:0.66:-0.95:1.000:0.887 1/1/1/1:4:0,113:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,68:0.65: 0.12:1.000:0.824 0/1/1/1:4:41,117:0.76: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,33:0.79:-1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,29:0.34:-0.39:1.000:0.842 0/0/1/1:4:66,63:0.51: 0.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,13:0.79:-2.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,10:0.44:-2.36:1.000:0.968 0/0/1/1:4:65,79:0.57: 1.18:1.000:0.941 0/1/1/1:4:37,84:0.72: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,58:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,71:0.47: 1.65:1.000:0.991 0/1/1/1:4:41,79:0.68: 0.47:1.000:0.960 0/0/0/1:4:85,36:0.32: 0.50:0.999:0.945 1/1/1/1:4:0,124:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,80:0.58: 1.18:1.000:0.918 0/1/1/1:4:22,62:0.76:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,10:0.92:-2.75:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,98:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,40:0.27: 1.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,42:0.42: 0.06:1.000:0.915 0/0/1/1:4:9,5:0.38:-2.66:1.000:0.593 0/0/1/1:4:68,69:0.53: 0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:90,83:0.50: 2.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:71,33:0.34: 0.00:1.000:0.852 0/0/1/1:4:76,55:0.44: 0.79:1.000:0.973 0/0/1/1:4:78,66:0.48: 1.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:119,38:0.27: 1.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:73,64:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:2,1:0.36:-2.98:1.000:0.707 0/1/1/1:4:10,18:0.67:-2.25:1.000:0.908 1/1/1:3:0,1:1.00:-3.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,65:0.51: 0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,53:0.43: 0.77:1.000:0.951 0/0/1/1:4:71,70:0.52: 1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:94,69:0.45: 1.74:1.000:0.977 0/0/1/1:4:86,61:0.44: 1.27:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,24:0.27:-0.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:34,63:0.67:-0.21:1.000:0.935 0/0/1/1:4:57,46:0.47:-0.03:1.000:0.992 0/1/1/1:4:30,64:0.71:-0.30:1.000:0.989 0/0/0/1:4:71,29:0.32:-0.12:1.000:0.964 0/0/1/1/1:5:82,111:0.60: 2.63:1.000:0.971 0/0/1/1:4:32,36:0.55:-1.07:1.000:0.977 0/0/0/0:4:100,1:0.01:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,83:0.78: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,101:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,71:0.50: 1.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,68:0.45: 1.65:1.000:0.979 0/0/0/1:4:59,27:0.34:-0.53:1.000:0.874 0/0/0/0:4:103,1:0.01: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,24:0.28:-0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,48:0.70:-0.98:1.000:0.985 0/0/1/1:4:67,60:0.50: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:52,21:0.31:-0.92:1.000:0.907 0/0/0/1:4:76,30:0.31: 0.06:1.000:0.975 0/0/1/1:4:68,65:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,49:0.44: 0.41:1.000:0.966 0/0/0/1:4:79,26:0.27: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,66:0.44: 1.62:1.000:0.965 0/1/1/1:4:45,86:0.68: 0.79:1.000:0.955 0/0/0/1:4:39,15:0.30:-1.48:1.000:0.982 0/0/0/1:4:74,26:0.29:-0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,55:0.64:-0.42:0.887:0.628 0/0/0/0:4:78,1:0.01:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,54:0.45: 0.65:1.000:0.982 0/1/1/1:4:17,37:0.71:-1.48:0.999:0.992 0/1/1/1:4:32,97:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,2:0.02: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,53:0.58:-0.24:1.000:0.930 0/0/0/1:4:99,26:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,80:0.75: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,97:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,40:0.38: 0.23:1.000:0.593 0/0/1/1:4:43,60:0.61:-0.03:1.000:0.732 0/0/1/1:4:54,54:0.52: 0.12:0.968:0.994 0/0/0/1:4:81,36:0.33: 0.38:1.000:0.907 0/0/0/1:4:75,26:0.28:-0.09:1.000:0.994 0/0/1/1:4:63,63:0.52: 0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:58,36:0.41:-0.30:1.000:0.847 0/0/0/1:4:67,27:0.31:-0.30:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,39:0.67:-1.30:1.000:0.937 1/1/1/1:4:0,73:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,51:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,38:0.60:-1.12:1.000:0.796 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,92:0.71: 0.88:1.000:0.992 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,32:0.35:-0.12:1.000:0.832 0/0/0/1:4:66,26:0.31:-0.36:1.000:0.976 0/0/0/1:4:66,15:0.21:-0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,80:0.73: 0.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,61:0.50: 0.68:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,55:0.64:-0.42:1.000:0.628 0/1/1/1:4:18,55:0.78:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,58:0.65:-0.36:0.960:0.830 0/0/1/1:4:46,40:0.49:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,48:0.62:-0.68:1.000:0.615 0/1/1/1:4:29,59:0.69:-0.47:1.000:0.980 0/1/1/1:4:37,58:0.63:-0.27:1.000:0.621 0/1/1/1:4:43,104:0.73: 1.27:0.993:0.998 0/0/1/1:4:51,28:0.38:-0.74:1.000:0.558 0/0/0/1:4:57,26:0.34:-0.62:1.000:0.878 0/1/1/1:4:44,87:0.69: 0.79:1.000:0.971 0/1/1/1:4:30,57:0.68:-0.50:0.999:0.952 0/0/1/1:4:78,68:0.49: 1.24:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,47:0.58:-0.59:1.000:0.901 0/0/1/1:4:64,64:0.52: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/1:4:53,16:0.26:-1.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,19:0.34:-1.27:1.000:0.888 0/0/1/1:4:57,44:0.46:-0.09:1.000:0.987 0/1/1/1:4:30,70:0.72:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,24:0.18: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,52:0.47: 0.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:36,68:0.68: 0.00:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,121:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,58:0.52: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,59:0.49: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,51:0.47: 0.26:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,38:0.47:-0.56:1.000:0.992 0/0/1/1:4:56,35:0.41:-0.39:1.000:0.857 0/1/1/1:4:29,90:0.78: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,37:0.34: 0.38:1.000:0.859 0/0/1/1:4:29,29:0.52:-1.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,52:0.64:-0.56:1.000:0.637 0/0/0/1:4:77,31:0.31: 0.12:1.000:0.969 0/1/1/1:4:39,74:0.68: 0.26:1.000:0.951 0/0/0/1:4:87,39:0.33: 0.65:1.000:0.898 0/0/0/1:4:45,22:0.35:-1.09:1.000:0.760 0/1/1/1:4:32,55:0.66:-0.50:1.000:0.844 0/0/1/1:4:54,49:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,30:0.36:-0.45:1.000:0.664 0/0/1/1:4:63,53:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,43:0.69:-1.15:1.000:0.966 0/0/0/1:4:71,25:0.29:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:82,40:0.35: 0.53:1.000:0.764 0/0/1/1:4:60,55:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:137,23:0.16: 1.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:89,36:0.31: 0.62:1.000:0.967 0/1/1/1:4:25,66:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,56:0.46: 0.68:1.000:0.990 0/1/1/1:4:40,97:0.73: 0.97:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,15:0.74:-2.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,77:0.72: 0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:32,74:0.72: 0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:33,58:0.66:-0.39:1.000:0.878 0/0/0/1:4:123,39:0.27: 1.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,61:0.54: 0.41:1.000:0.987 0/1/1/1:4:46,93:0.69: 1.03:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,1:0.01: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,57:0.65:-0.39:1.000:0.796 0/1/1/1:4:46,80:0.66: 0.65:1.000:0.863 0/0/0/1:4:75,34:0.34: 0.15:1.000:0.886 0/0/0/1:4:109,44:0.31: 1.44:1.000:0.968 0/1/1/1:4:25,79:0.78: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,31:0.53:-1.27:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.89:0.999:1.000 0/1/1/1:4:22,59:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,53:0.45: 0.56:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,49:0.44: 0.38:1.000:0.971 0/1/1/1:4:36,82:0.72: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,76:0.66: 0.44:1.000:0.886 0/1/1/1:4:14,36:0.74:-1.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,66:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,102:0.76: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,76:0.65: 0.50:1.000:0.811 0/1/1/1:4:34,54:0.64:-0.47:1.000:0.660 0/0/1/1:4:48,45:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,33:0.38:-0.33:1.000:0.564 0/0/0/1:4:157,43:0.24: 2.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,83:0.68: 0.68:1.000:0.948 0/0/1/1:4:29,36:0.58:-1.15:1.000:0.924 0/0/1/1:4:42,60:0.61:-0.06:1.000:0.669 -chr8.1 19447042 chr8.1_019447042 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:50,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.65:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.10:0.999:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:86,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.41:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:91,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.46:1.000:. ./.:5:86,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:44,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:0.887:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.83:0.999:. ./.:4:63,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:0.968:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:0.960:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.04:0.993:. ./.:4:59,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.01:0.999:. ./.:4:47,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:90,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.19:1.000:. -chr8.1 19543607 chr8.1_019543607 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,18:1.00: 0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.53:-0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:5,17:0.76: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.87:-1.71:1.000:0.940 0/0/1/1:4:5,3:0.45:-1.71:1.000:0.981 0/0/1/1:4:5,6:0.57:-1.19:1.000:0.957 0/0/1/1:4:7,9:0.58:-0.32:1.000:0.915 0/1/1/1:4:3,8:0.72:-1.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-0.32:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,12:0.67: 0.03:1.000:0.905 0/1/1/1:4:2,11:0.83:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,9:0.74:-1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,5:0.49:-1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,8:0.88:-1.54:0.999:0.745 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,20:0.90: 0.72:1.000:0.851 0/1/1/1:4:3,10:0.75:-0.84:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,8:0.72:-1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:5,6:0.57:-1.19:1.000:0.957 0/0/0/1:4:11,0:0.25:-1.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,14:0.93:-0.50:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,21:0.91: 0.90:1.000:0.913 0/1/1/1:4:2,7:0.76:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,21:0.76: 1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,11:0.83:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:5,4:0.49:-1.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,8:0.88:-1.54:1.000:0.745 0/1/1/1:4:1,3:0.74:-2.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,17:0.76: 0.72:1.000:1.000 1/1/1:3:0,8:1.00:-1.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-0.32:1.000:0.962 0/1/1/1:4:3,10:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,19:0.85: 0.72:1.000:0.982 0/1/1/1:4:2,15:0.87:-0.15:1.000:0.868 0/1/1/1:4:5,12:0.70:-0.15:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,10:0.57: 0.03:1.000:0.935 0/1/1/1:4:5,21:0.79: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,20:0.73: 1.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,19:0.70: 1.59:1.000:0.983 0/0/1/1:4:18,16:0.50: 2.81:1.000:0.997 0/1/1/1/1:5:5,23:0.81: 1.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,13:0.60: 0.72:1.000:0.760 0/0/1/1:4:16,10:0.46: 1.42:1.000:0.985 0/1/1/1:4:6,32:0.83: 3.51:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,16:0.67: 1.07:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,13:0.80:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.57: 0.72:1.000:0.957 0/0/1/1:4:12,13:0.54: 1.24:1.000:0.985 0/0/1/1:4:9,11:0.57: 0.37:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,17:0.68: 1.24:1.000:0.947 0/0/1/1/1/1:6:6,10:0.63:-0.32:1.000:0.841 0/1/1/1:4:4,15:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,26:0.75: 2.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,12:0.51: 1.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,15:0.65: 0.90:1.000:0.830 0/1/1/1:4:5,15:0.74: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,7:0.60:-1.02:1.000:0.815 0/0/1/1:4:8,5:0.46:-0.84:1.000:0.985 0/1/1/1:4:3,16:0.83: 0.20:0.887:0.998 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,19:0.68: 1.77:1.000:0.944 0/1/1/1:4:2,14:0.87:-0.32:0.999:0.940 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.56:-0.50:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,15:0.71: 0.55:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,17:0.94: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.50: 1.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,9:0.69:-0.84:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.67:0.968:1.000 0/1/1/1:4:7,30:0.80: 3.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,17:0.84: 0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,4:0.79:-2.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.72: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,8:0.45: 0.55:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,12:0.79:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,11:0.62: 0.03:1.000:0.566 0/1/1/1:4:2,12:0.85:-0.67:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,19:1.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,16:0.88: 0.03:1.000:0.745 0/0/1/1:4:14,8:0.44: 0.72:1.000:0.974 0/0/1/1:4:7,5:0.47:-1.02:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,20:0.86: 0.90:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,8:0.59:-0.67:1.000:0.880 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,15:0.71: 0.55:0.960:0.990 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:2,15:0.87:-0.15:1.000:0.868 0/1/1/1:4:6,11:0.65:-0.15:1.000:0.794 0/1/1/1:4:2,12:0.85:-0.67:1.000:0.991 0/1/1/1:4:2,12:0.85:-0.67:0.993:0.991 0/0/1/1:4:10,13:0.58: 0.90:1.000:0.905 0/0/1/1:4:8,7:0.50:-0.50:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,8:0.79:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,21:0.87: 1.07:0.999:0.940 0/1/1/1:4:7,13:0.65: 0.37:1.000:0.815 0/1/1/1:4:2,12:0.85:-0.67:1.000:0.991 0/1/1/1:4:7,16:0.69: 0.90:1.000:0.974 0/0/0/1:4:16,3:0.33: 0.20:1.000:0.900 0/0/1/1:4:11,16:0.60: 1.59:1.000:0.746 0/1/1/1:4:6,12:0.67: 0.03:1.000:0.905 0/0/1/1:4:9,14:0.62: 0.90:1.000:0.592 0/0/1/1:4:10,6:0.45:-0.32:1.000:0.981 0/1/1/1:4:4,9:0.69:-0.84:1.000:0.970 0/1/1/1:4:3,17:0.84: 0.37:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,12:0.64: 0.20:1.000:0.656 0/1/1/1:4:4,13:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,11:0.59: 0.20:1.000:0.842 1/1/1/1:4:0,24:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,15:0.82: 0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,10:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,13:0.71: 0.03:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,15:0.68: 0.72:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,11:0.83:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,10:0.82:-1.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,28:1.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.62:-0.84:1.000:0.519 0/0/1/1:4:5,8:0.62:-0.84:1.000:0.519 0/1/1/1:4:3,11:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,11:0.59: 0.20:1.000:0.842 0/0/1/1:4:11,15:0.59: 1.42:1.000:0.853 0/1/1/1:4:4,15:0.77: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,13:0.65: 0.37:1.000:0.815 0/1/1/1:4:6,15:0.71: 0.55:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,18:0.94: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,12:0.59: 0.55:1.000:0.880 0/1/1/1:4:5,21:0.79: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,9:0.69:-0.84:1.000:0.970 0/1/1/1:4:5,14:0.72: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,11:0.77:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.53:-0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:2,11:0.83:-0.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,12:0.61: 0.37:1.000:0.680 0/1/1/1:4:3,14:0.81:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.55:-0.15:1.000:0.978 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-0.50:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,7:0.64:-1.19:1.000:0.703 0/1/1/1:4:3,17:0.84: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,7:0.60:-1.02:1.000:0.815 0/1/1/1:4:5,10:0.67:-0.50:1.000:0.905 0/1/1/1:4:4,17:0.80: 0.55:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-0.15:0.999:1.000 1/1/1/1:4:2,18:0.89: 0.37:1.000:0.602 0/1/1/1:4:2,12:0.85:-0.67:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,15:0.82: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,5:0.47:-1.02:1.000:0.993 0/1/1/1:4:2,11:0.83:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,9:0.69:-0.84:1.000:0.970 0/0/1/1:4:4,6:0.61:-1.37:1.000:0.680 0/0/1/1:4:6,5:0.49:-1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-0.32:1.000:0.962 0/1/1/1:4:3,18:0.85: 0.55:1.000:0.991 0/0/1/1:4:7,8:0.56:-0.50:1.000:0.974 0/0/1/1:4:16,9:0.44: 1.24:1.000:0.971 0/0/1/1:4:9,7:0.48:-0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,18:0.89: 0.37:1.000:0.602 0/1/1/1:4:4,16:0.79: 0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 1.59:1.000:1.000 -chr8.1 19813718 chr8.1_019813718 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,466:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,397:.:-0.57:1.000:. ./.:4:3,384:.:-0.66:1.000:. ./.:4:2,461:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,553:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,485:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1,352:.:-0.97:1.000:. ./.:4:5,464:.: 0.08:1.000:. ./.:4:5,429:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,161:.:-2.71:1.000:. ./.:4:0,155:.:-2.76:1.000:. ./.:4:1,584:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,424:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,558:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1,425:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,422:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,503:.: 0.39:0.999:. ./.:4:0,450:.:-0.09:1.000:. ./.:4:8,617:.: 1.49:1.000:. ./.:4:4,549:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,102:.:-3.24:1.000:. ./.:4:0,463:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,609:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,395:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,74:.:-3.48:1.000:. ./.:4:0,515:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,446:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,420:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,486:.: 0.24:1.000:. ./.:4:1,441:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,487:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,367:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,23:.:-3.95:1.000:. ./.:4:0,125:.:-3.03:1.000:. ./.:3:0,49:.:-3.72:1.000:. ./.:4:0,463:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,465:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,488:.: 0.26:1.000:. ./.:4:10,495:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,507:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,475:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,512:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,532:.: 0.65:1.000:. ./.:4:2,466:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,573:.: 1.02:1.000:. ./.:4:4,460:.: 0.04:1.000:. ./.:5:0,717:.: 2.33:1.000:. ./.:4:0,912:.: 4.09:1.000:. ./.:4:0,357:.:-0.93:1.000:. ./.:4:4,482:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,434:.:-0.23:1.000:. ./.:4:4,523:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,459:.:-0.01:1.000:. ./.:4:8,493:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,439:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,435:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,437:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,446:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,495:.: 0.32:1.000:. ./.:6:0,422:.:-0.34:1.000:. ./.:4:2,509:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,407:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1,574:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,515:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,521:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,448:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,512:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,517:.: 0.52:1.000:. ./.:4:3,495:.: 0.35:0.887:. ./.:4:0,376:.:-0.76:1.000:. ./.:4:4,589:.: 1.21:1.000:. ./.:4:5,455:.: 0.00:0.999:. ./.:4:0,470:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,464:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,473:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,385:.:-0.68:1.000:. ./.:4:2,469:.: 0.10:1.000:. ./.:4:3,539:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,523:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,567:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,435:.:-0.23:0.968:. ./.:4:0,486:.: 0.24:1.000:. ./.:4:5,552:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,395:.:-0.59:1.000:. ./.:4:5,548:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,572:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,410:.:-0.45:1.000:. ./.:4:2,444:.:-0.13:1.000:. ./.:4:1,468:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,396:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,505:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,386:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,550:.: 0.82:1.000:. ./.:4:5,324:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,555:.: 0.86:1.000:. ./.:4:2,576:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,478:.: 0.16:1.000:. ./.:4:2,388:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,553:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,484:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,541:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,559:.: 0.90:1.000:. ./.:4:2,398:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,457:.:-0.03:0.960:. ./.:4:0,454:.:-0.05:1.000:. ./.:4:5,417:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,431:.:-0.26:1.000:. ./.:4:4,508:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,568:.: 0.98:0.993:. ./.:4:1,517:.: 0.53:1.000:. ./.:4:2,477:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,516:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,452:.:-0.07:0.999:. ./.:4:0,449:.:-0.10:1.000:. ./.:4:3,386:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,558:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,481:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,430:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,498:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,415:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,487:.: 0.25:1.000:. ./.:4:5,405:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,521:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,404:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,483:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,504:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1,529:.: 0.63:1.000:. ./.:4:3,463:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,391:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,337:.:-1.11:1.000:. ./.:4:1,418:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,402:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,321:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,482:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,445:.:-0.13:1.000:. ./.:4:8,736:.: 2.57:1.000:. ./.:4:1,521:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,515:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,363:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,450:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,496:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,523:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,418:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,473:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,545:.: 0.77:1.000:. ./.:4:7,573:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,449:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,320:.:-1.27:1.000:. ./.:4:3,533:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,460:.: 0.00:1.000:. ./.:4:4,608:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,395:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,89:.:-3.36:1.000:. ./.:4:0,323:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,499:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,496:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,598:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,545:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,363:.:-0.88:1.000:. ./.:4:3,497:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,479:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,351:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,442:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,418:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,498:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,416:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,432:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,458:.:-0.02:0.999:. ./.:4:0,396:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,454:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,366:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,347:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,446:.:-0.13:1.000:. ./.:4:3,453:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,432:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,330:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,586:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,538:.: 0.71:1.000:. ./.:4:3,484:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,401:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,492:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,673:.: 1.94:1.000:. ./.:4:6,577:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,398:.:-0.56:1.000:. ./.:4:5,476:.: 0.19:1.000:. -chr8.1 19911962 chr8.1_019911962 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:54,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.49:0.999:. ./.:4:41,47:.: 2.42:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.26:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:5,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.20:1.000:. ./.:5:89,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.56:1.000:. ./.:6:46,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.44:0.887:. ./.:4:58,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.80:0.999:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:0.968:. ./.:4:67,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.31:0.960:. ./.:4:38,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:85,0:.: 2.24:0.993:. ./.:4:57,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:89,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:87,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.42:0.999:. ./.:4:40,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.90:1.000:. -chr8.1 20037027 chr8.1_020037027 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,69:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.14:1.000:. ./.:4:21,23:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,129:.: 1.41:1.000:. ./.:4:23,86:.: 0.81:1.000:. ./.:4:18,56:.:-0.23:1.000:. ./.:4:29,69:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,28:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,67:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,29:.:-1.58:0.999:. ./.:4:0,136:.: 1.62:1.000:. ./.:4:35,69:.: 0.66:1.000:. ./.:4:38,131:.: 2.60:1.000:. ./.:4:0,81:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.01:1.000:. ./.:4:40,17:.:-0.74:1.000:. ./.:4:24,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:24,38:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,33:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,26:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.43:1.000:. ./.:4:42,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:34,52:.: 0.12:1.000:. ./.:4:26,25:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.55:1.000:. ./.:4:28,18:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.04:1.000:. ./.:3:14,5:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.69:1.000:. ./.:4:26,58:.: 0.06:1.000:. ./.:4:24,63:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,23:.:-1.75:1.000:. ./.:4:0,99:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.84:1.000:. ./.:4:34,85:.: 1.11:1.000:. ./.:4:31,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,121:.: 1.17:1.000:. ./.:4:47,41:.: 0.18:1.000:. ./.:5:0,69:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,100:.: 0.54:1.000:. ./.:4:34,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:73,110:.: 3.02:1.000:. ./.:4:0,87:.: 0.15:1.000:. ./.:4:18,51:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,114:.: 0.96:1.000:. ./.:4:31,29:.:-0.65:1.000:. ./.:4:28,52:.:-0.05:1.000:. ./.:4:38,33:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.18:1.000:. ./.:4:39,31:.:-0.35:1.000:. ./.:6:12,41:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.01:1.000:. ./.:4:36,100:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.14:1.000:. ./.:4:54,95:.: 2.00:1.000:. ./.:4:28,32:.:-0.65:1.000:. ./.:4:27,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:37,92:.: 1.41:0.887:. ./.:4:0,45:.:-1.10:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.80:1.000:. ./.:4:44,50:.: 0.36:0.999:. ./.:4:0,133:.: 1.53:1.000:. ./.:4:32,21:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,98:.: 0.48:1.000:. ./.:4:25,48:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.74:1.000:. ./.:4:34,105:.: 1.71:1.000:. ./.:4:46,93:.: 1.71:1.000:. ./.:4:48,105:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,48:.:-1.01:0.968:. ./.:4:0,97:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.98:1.000:. ./.:4:34,93:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,101:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,67:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,22:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,97:.: 0.45:1.000:. ./.:4:39,104:.: 1.82:1.000:. ./.:4:40,65:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,157:.: 2.24:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,105:.: 0.69:0.960:. ./.:4:0,33:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,131:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,138:.: 1.68:0.993:. ./.:4:26,64:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,84:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.65:1.000:. ./.:4:34,107:.: 1.76:0.999:. ./.:4:0,73:.:-0.26:1.000:. ./.:4:29,70:.: 0.51:1.000:. ./.:4:39,77:.: 1.02:1.000:. ./.:4:33,61:.: 0.36:1.000:. ./.:4:30,60:.: 0.24:1.000:. ./.:4:40,87:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.53:1.000:. ./.:4:36,46:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,89:.: 0.21:1.000:. ./.:4:32,79:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.35:1.000:. ./.:4:46,82:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.86:1.000:. ./.:4:28,62:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,102:.: 0.60:1.000:. ./.:4:37,62:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,95:.: 1.32:1.000:. ./.:4:17,58:.:-0.20:1.000:. ./.:4:26,39:.:-0.50:0.989:. ./.:4:30,91:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.55:1.000:. ./.:4:0,93:.: 0.33:1.000:. ./.:4:32,75:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,33:.:-1.46:1.000:. ./.:4:26,70:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,73:.:-0.26:1.000:. ./.:4:37,44:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,76:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.86:1.000:. ./.:4:40,129:.: 2.60:1.000:. ./.:4:36,81:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.55:1.000:. ./.:4:33,31:.:-0.53:1.000:. ./.:4:35,72:.: 0.75:1.000:. ./.:4:23,109:.: 1.50:1.000:. ./.:4:31,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.99:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.07:1.000:. ./.:4:35,61:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,40:.:-0.44:1.000:. ./.:4:27,76:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,94:.: 0.36:1.000:. ./.:4:19,22:.:-1.22:1.000:. ./.:4:26,57:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.50:1.000:. ./.:4:36,34:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.55:1.000:. ./.:4:36,109:.: 1.88:1.000:. ./.:4:0,103:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,129:.: 1.41:0.999:. ./.:4:26,80:.: 0.72:1.000:. ./.:4:14,22:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.56:1.000:. ./.:4:10,42:.:-0.89:1.000:. ./.:4:20,73:.: 0.33:1.000:. ./.:4:21,63:.: 0.06:1.000:. ./.:4:32,64:.: 0.42:1.000:. ./.:4:19,36:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,74:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,66:.: 0.04:1.000:. ./.:4:31,51:.: 0.01:1.000:. ./.:4:27,34:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,76:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,88:.: 0.18:1.000:. -chr8.1 20186348 chr8.1_020186348 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:232,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:202,44:.: 0.29:1.000:. ./.:4:324,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:257,64:.: 1.50:1.000:. ./.:4:97,18:.:-1.81:1.000:. ./.:4:199,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:318,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.76:0.999:. ./.:4:273,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:260,74:.: 1.71:1.000:. ./.:4:293,64:.: 2.08:1.000:. ./.:4:142,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:220,53:.: 0.73:1.000:. ./.:4:186,40:.:-0.03:1.000:. ./.:4:47,8:.:-2.77:1.000:. ./.:4:203,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:244,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:243,57:.: 1.16:1.000:. ./.:4:198,46:.: 0.26:1.000:. ./.:4:211,50:.: 0.53:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:54,5:.:-2.71:1.000:. ./.:4:158,2:.:-1.09:1.000:. ./.:3:46,2:.:-2.89:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:225,29:.: 0.42:1.000:. ./.:4:260,48:.: 1.29:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:190,43:.: 0.08:1.000:. ./.:4:144,38:.:-0.73:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:192,56:.: 0.33:1.000:. ./.:5:386,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:133,35:.:-0.96:1.000:. ./.:4:105,26:.:-1.55:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:233,52:.: 0.92:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:183,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:160,39:.:-0.46:1.000:. ./.:4:158,31:.:-0.62:1.000:. ./.:4:171,36:.:-0.33:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:192,48:.: 0.20:1.000:. ./.:6:162,7:.:-0.94:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:158,45:.:-0.40:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:172,30:.:-0.41:1.000:. ./.:4:151,31:.:-0.73:1.000:. ./.:4:175,36:.:-0.27:1.000:. ./.:4:156,33:.:-0.62:0.887:. ./.:4:203,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:134,47:.:-0.75:0.999:. ./.:4:224,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:208,35:.: 0.25:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:198,37:.: 0.12:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:171,36:.:-0.33:1.000:. ./.:4:200,51:.: 0.37:1.000:. ./.:4:208,60:.: 0.65:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.60:0.968:. ./.:4:240,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:231,50:.: 0.86:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:144,28:.:-0.89:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:303,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:128,33:.:-1.07:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:197,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:151,39:.:-0.61:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:320,1:.: 1.50:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.19:0.960:. ./.:4:186,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:320,0:.: 1.48:0.993:. ./.:4:226,52:.: 0.81:1.000:. ./.:4:137,31:.:-0.96:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:175,30:.:-0.36:0.999:. ./.:4:241,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:92,23:.:-1.81:1.000:. ./.:4:184,50:.: 0.10:1.000:. ./.:4:161,28:.:-0.62:1.000:. ./.:4:143,39:.:-0.73:1.000:. ./.:4:183,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:154,41:.:-0.53:1.000:. ./.:4:219,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:182,32:.:-0.22:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:172,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:183,44:.:-0.01:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:146,31:.:-0.81:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:149,45:.:-0.54:1.000:. ./.:4:206,46:.: 0.39:1.000:. ./.:4:99,24:.:-1.68:0.989:. ./.:4:155,33:.:-0.64:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:361,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:183,38:.:-0.11:1.000:. ./.:4:218,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:133,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:149,49:.:-0.48:1.000:. ./.:4:131,26:.:-1.14:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:268,55:.: 1.53:1.000:. ./.:4:217,49:.: 0.61:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:149,35:.:-0.70:1.000:. ./.:4:253,69:.: 1.51:1.000:. ./.:4:186,49:.: 0.12:1.000:. ./.:4:257,59:.: 1.42:1.000:. ./.:4:308,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:208,54:.: 0.55:1.000:. ./.:4:296,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:253,60:.: 1.37:1.000:. ./.:4:262,42:.: 1.23:1.000:. ./.:4:221,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:196,45:.: 0.21:1.000:. ./.:4:140,38:.:-0.80:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:170,36:.:-0.35:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:214,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:299,1:.: 1.16:0.999:. ./.:4:163,44:.:-0.33:1.000:. ./.:4:164,29:.:-0.56:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:179,40:.:-0.14:1.000:. ./.:4:131,30:.:-1.07:1.000:. ./.:4:215,40:.: 0.44:1.000:. ./.:4:172,56:.: 0.00:1.000:. ./.:4:131,32:.:-1.04:1.000:. ./.:4:271,49:.: 1.48:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:264,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:193,38:.: 0.05:1.000:. ./.:4:205,54:.: 0.50:1.000:. ./.:4:262,57:.: 1.47:1.000:. ./.:4:271,60:.: 1.66:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.04:1.000:. -chr8.1 20619155 chr8.1_020619155 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:2,12:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:3,7:.:-1.35:1.000:. ./.:4:2,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:6,11:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,11:.:-1.05:0.999:. ./.:4:0,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:5,12:.:-0.31:1.000:. ./.:4:3,14:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.90:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.90:1.000:. ./.:4:4,6:.:-1.35:1.000:. ./.:4:3,21:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.65:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.31:1.000:. ./.:3:0,8:.:-1.65:1.000:. ./.:4:1,9:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.49:1.000:. ./.:4:6,12:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,10:.:-1.20:1.000:. ./.:4:3,17:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:7,12:.:-0.01:1.000:. ./.:4:3,7:.:-1.35:1.000:. ./.:4:2,28:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.59:1.000:. ./.:5:2,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:2,21:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:5,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:5,11:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:2,21:.: 0.59:1.000:. ./.:4:4,17:.: 0.29:1.000:. ./.:6:2,9:.:-1.20:1.000:. ./.:4:2,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:2,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.74:0.887:. ./.:4:0,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:2,21:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.31:0.999:. ./.:4:0,32:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:4,20:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.44:1.000:. ./.:4:2,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.46:0.968:. ./.:4:0,30:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.74:1.000:. ./.:4:4,18:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,41:.: 3.28:1.000:. ./.:4:4,14:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:4,10:.:-0.75:1.000:. ./.:4:8,20:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.74:1.000:. ./.:4:4,28:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.49:1.000:. ./.:4:5,13:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.93:1.000:. ./.:4:3,16:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,36:.: 2.53:0.960:. ./.:4:3,21:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.49:1.000:. ./.:4:4,15:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.04:0.993:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.89:1.000:. ./.:4:6,18:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.04:0.999:. ./.:4:0,31:.: 1.78:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,42:.: 3.43:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:4,24:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,28:.: 1.34:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.63:1.000:. ./.:4:0,12:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:0.989:. ./.:4:0,9:.:-1.50:1.000:. ./.:4:2,9:.:-1.20:1.000:. ./.:4:4,20:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,36:.: 2.68:1.000:. ./.:4:0,27:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:1,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1,24:.: 0.89:1.000:. ./.:4:0,26:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:3,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.20:1.000:. ./.:4:3,9:.:-1.05:1.000:. ./.:4:2,11:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1,11:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.16:1.000:. ./.:4:2,7:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:2,7:.:-1.50:1.000:. ./.:4:3,5:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.14:0.999:. ./.:4:0,10:.:-1.35:1.000:. ./.:4:8,15:.: 0.59:1.000:. ./.:4:8,7:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,11:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.50:1.000:. ./.:4:3,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,13:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:5,19:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.01:1.000:. -chr8.1 20667639 chr8.1_020667639 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,40:0.23:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,59:0.29: 0.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:147,54:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,61:0.26: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,128:0.55: 0.99:1.000:0.977 0/0/0/1:4:95,62:0.36:-0.46:1.000:0.640 0/0/0/1:4:119,50:0.27:-0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,40:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,70:0.59:-1.98:1.000:0.837 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-2.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,94:0.40: 1.25:1.000:0.787 0/0/0/1:4:119,40:0.23:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,38:0.21:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,44:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:200,2:0.01: 0.82:0.999:1.000 0/0/0/1:4:137,49:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,131:0.50: 1.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,114:0.43: 1.97:1.000:0.958 0/0/1/1:4:69,49:0.38:-1.58:1.000:0.607 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,71:0.28: 1.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:136,50:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,38:0.36:-2.15:1.000:0.718 0/0/1/1:4:83,105:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,126:0.46: 2.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:93,90:0.45: 0.28:1.000:0.983 0/0/0/1:4:149,67:0.29: 1.22:1.000:0.994 0/0/0/1:4:112,30:0.19:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,82:0.75:-2.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,28:0.24:-1.92:1.000:1.000 0/0/0:3:53,5:0.08:-3.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,1:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,48:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,50:0.25: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,56:0.27: 0.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:127,39:0.22:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,1:0.01:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,118:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:105,53:0.31:-0.43:1.000:0.975 0/0/0/1:4:132,46:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,102:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/0/0:5:242,0:0.00: 1.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-3.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,51:0.29:-0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,63:0.50:-1.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:99,49:0.30:-0.72:1.000:0.980 0/0/1/1:4:104,105:0.46: 1.02:1.000:0.990 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,117:0.52: 0.88:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,86:0.44: 0.19:1.000:0.969 0/0/0/1:4:119,45:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,108:0.52: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/0:4:143,1:0.01:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,93:0.49: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/0/0/0:6:138,12:0.07:-0.66:1.000:0.620 0/0/0/0:4:207,2:0.01: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:185,1:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,91:0.49:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:178,1:0.01: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,100:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,94:0.52:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,96:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,119:0.55: 0.62:0.887:0.981 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:187,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,78:0.46:-0.46:0.999:0.987 0/0/0/1:4:156,50:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,61:0.28: 0.74:1.000:0.995 0/0/0/1:4:117,50:0.28:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,46:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,46:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:82,111:0.52: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,121:0.53: 0.99:1.000:0.993 0/0/1/1:4:109,108:0.46: 1.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:103,33:0.22:-1.06:0.968:1.000 0/0/0/0:4:185,2:0.01: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:204,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,59:0.26: 0.94:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,42:0.28:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:113,51:0.29:-0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:118,49:0.27:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:137,41:0.21: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,47:0.29:-0.66:1.000:0.993 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,51:0.24: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,27:0.23:-1.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:220,0:0.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,51:0.27:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:80,78:0.46:-0.43:1.000:0.985 0/0/0/1:4:129,35:0.20:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:196,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,45:0.22: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,51:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,37:0.26:-1.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.35:0.960:1.000 0/0/0/1:4:105,30:0.20:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,47:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,34:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,43:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,59:0.23: 1.74:0.993:1.000 0/0/0/1:4:119,59:0.31: 0.14:1.000:0.980 0/0/0/1:4:109,42:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:179,48:0.19: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,95:0.46: 0.48:0.999:0.989 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,67:0.49:-1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:90,109:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,56:0.29: 0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:119,51:0.28:-0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,37:0.26:-1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,30:0.18:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,102:0.47: 0.77:1.000:0.993 0/0/0/0:4:131,1:0.01:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,101:0.54:-0.06:1.000:0.990 0/0/0/0:4:149,1:0.01:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,52:0.27: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,59:0.29: 0.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:87,99:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,38:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,36:0.27:-1.41:1.000:0.998 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,91:0.52:-0.35:1.000:0.995 0/0/0/1:4:141,48:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,30:0.26:-1.89:0.989:0.999 0/0/0/1:4:99,43:0.28:-0.89:1.000:0.996 0/0/0/0:4:174,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,93:0.53:-0.43:1.000:0.991 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,75:0.49:-0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:128,51:0.26: 0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,56:0.29: 0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:108,36:0.23:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,50:0.28:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,35:0.28:-1.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,140:0.52: 2.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:149,60:0.26: 1.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,95:0.46: 0.54:1.000:0.986 0/0/0/1:4:121,46:0.25:-0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,93:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:106,127:0.50: 1.71:1.000:0.997 0/0/0/1:4:141,58:0.27: 0.74:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,24:0.31:-2.92:1.000:0.972 0/0/0/1:4:97,31:0.22:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,98:0.47: 0.57:1.000:0.992 0/0/0/1:4:165,53:0.22: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,114:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,71:0.29: 1.54:1.000:0.993 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,57:0.26: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:116,61:0.32: 0.11:1.000:0.960 0/0/0/1:4:116,38:0.23:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,40:0.26:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:115,67:0.34: 0.25:1.000:0.874 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,48:0.28:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/0:4:181,1:0.01: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,50:0.23: 0.74:0.999:1.000 0/0/0/1:4:117,51:0.28:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,54:0.28: 0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,52:0.28:-0.15:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,40:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,101:0.47: 0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,92:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,83:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,76:0.43:-0.32:1.000:0.954 0/0/1/1:4:92,119:0.52: 1.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:163,56:0.23: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,64:0.29: 0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:83,87:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/0/0/1:4:136,72:0.32: 0.99:1.000:0.957 0/0/0/1:4:167,66:0.26: 1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:174,68:0.26: 1.97:1.000:0.999 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,48:0.24: 0.25:1.000:1.000 -chr8.1 20789469 chr8.1_020789469 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:392,131:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:90,273:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:196,213:0.53:-0.19:1.000:0.993 0/0/1/1:4:233,224:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:267,255:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/1/1/1:4:137,380:0.74: 0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,193:0.77:-1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,319:0.73: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:320,105:0.25:-0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,96:0.49:-2.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:146,36:0.20:-2.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,299:0.61: 0.73:1.000:0.716 0/0/1/1:4:219,219:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:346,122:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:306,109:0.27:-0.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:230,237:0.52: 0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:277,96:0.26:-0.56:0.999:0.999 0/1/1/1:4:116,350:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:264,267:0.51: 1.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:145,390:0.73: 1.13:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,106:0.51:-2.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:246,219:0.48: 0.40:1.000:0.995 0/0/1/1:4:296,278:0.49: 1.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:221,205:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,114:0.82:-2.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,205:0.52:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:347,119:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:360,96:0.21: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:288,311:0.53: 1.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:201,224:0.53:-0.02:1.000:0.990 0/0/1/1:4:230,214:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:302,98:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,82:0.77:-3.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,97:0.60:-2.74:1.000:0.809 0/1/1:3:22,26:0.55:-3.95:1.000:0.964 0/0/0/1:4:345,114:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:214,204:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:248,241:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:272,83:0.24:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,114:0.29:-0.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:222,204:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:338,119:0.26: 0.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:115,316:0.74: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:216,188:0.47:-0.24:1.000:0.993 0/0/1/1:4:268,224:0.46: 0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:231,235:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/0/1:5:605,157:0.21: 3.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:302,126:0.30: 0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:194,174:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,203:0.76:-1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,183:0.45:-0.10:1.000:0.976 0/0/1/1:4:255,251:0.50: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,214:0.54:-0.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:252,224:0.48: 0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:104,318:0.76:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,196:0.51:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,294:0.76:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:286,95:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:224,191:0.47:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/0/1/1:6:300,128:0.30: 0.01:1.000:0.884 0/0/0/1:4:380,123:0.25: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:304,82:0.22:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:394,96:0.20: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,270:0.81:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,126:0.28: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,259:0.75:-0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,160:0.52:-1.21:1.000:0.994 0/1/1/1:4:118,335:0.74: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:101,298:0.75:-0.29:0.887:0.999 0/0/1/1:4:226,214:0.49: 0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:384,106:0.22: 0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,213:0.74:-1.45:0.999:0.999 0/1/1/1:4:108,291:0.73:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:251,236:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:129,330:0.72: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,205:0.53:-0.39:1.000:0.991 0/0/0/1:4:301,96:0.25:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,356:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,329:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,306:0.73:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,161:0.49:-0.95:0.968:0.996 0/0/0/1:4:357,105:0.23: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:419,131:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:316,94:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,107:0.28:-0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:137,373:0.73: 0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:162,160:0.51:-1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:199,182:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:223,193:0.47:-0.11:1.000:0.993 0/0/0/1:4:297,100:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:89,267:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,192:0.47:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:360,114:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:151,177:0.55:-1.03:1.000:0.982 0/0/0/1:4:388,112:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,344:0.73: 0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:123,319:0.73: 0.16:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,341:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:355,126:0.27: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:298,112:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:197,234:0.55: 0.04:1.000:0.980 0/0/1/1:4:234,237:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:299,85:0.22:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:254,248:0.50: 0.78:0.960:0.997 0/0/0/1:4:265,77:0.23:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,188:0.52:-0.66:1.000:0.994 0/0/1/1:4:202,172:0.47:-0.55:1.000:0.991 0/0/1/1:4:233,208:0.48: 0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:298,325:0.53: 2.04:0.993:0.992 0/1/1/1:4:132,311:0.71: 0.17:1.000:0.990 0/1/1/1:4:104,320:0.76:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:288,292:0.51: 1.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:148,322:0.69: 0.45:0.999:0.973 0/0/0/1:4:346,122:0.26: 0.43:1.000:0.998 0/1/1/1:4:76,215:0.74:-1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:325,277:0.47: 1.82:1.000:0.991 0/1/1/1:4:102,259:0.72:-0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:99,316:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:227,198:0.47:-0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:192,229:0.55:-0.06:1.000:0.978 0/0/1/1:4:208,215:0.52:-0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:351,105:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,380:0.78: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:281,250:0.48: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:234,182:0.44:-0.11:1.000:0.974 0/0/0/1:4:369,147:0.29: 0.93:1.000:0.992 0/1/1/1:4:135,348:0.72: 0.58:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,347:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,131:0.45:-1.33:1.000:0.975 0/0/0/1:4:283,79:0.22:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:101,322:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:111,346:0.76: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,111:0.41:-1.61:0.989:0.884 0/1/1/1:4:132,381:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/0/0/1:4:345,93:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:470,162:0.26: 2.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:148,349:0.71: 0.73:1.000:0.990 0/0/0/1:4:334,111:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:84,278:0.77:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:353,115:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,220:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:113,347:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,115:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:173,163:0.49:-0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:137,394:0.75: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:368,337:0.49: 2.90:1.000:0.996 0/0/0/0:4:490,0:0.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:231,226:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,235:0.54: 0.19:1.000:0.990 0/1/1/1:4:103,269:0.73:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:262,282:0.53: 1.22:1.000:0.993 0/0/1/1:4:229,229:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,44:0.28:-2.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,174:0.48:-0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:135,332:0.71: 0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:261,227:0.47: 0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:256,289:0.54: 1.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:225,266:0.55: 0.67:1.000:0.981 0/0/0/1:4:345,113:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:246,235:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,179:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,249:0.74:-0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,185:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,228:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:384,103:0.21: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,331:0.76: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,173:0.52:-0.91:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,429:1.00: 0.02:0.999:1.000 0/1/1/1:4:111,319:0.75: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:212,217:0.51: 0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,204:0.53:-0.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:163,161:0.51:-1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,360:0.75: 0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,323:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:84,250:0.75:-0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,253:0.76:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,397:0.76: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:279,255:0.49: 1.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:237,196:0.46: 0.06:1.000:0.988 0/1/1/1:4:91,303:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:134,328:0.71: 0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:304,335:0.53: 2.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:137,426:0.76: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,179:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:118,325:0.74: 0.17:1.000:0.998 -chr8.1 20956594 chr8.1_020956594 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:166,79:0.24: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,61:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,140:0.47: 0.86:1.000:0.994 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,166:0.45: 1.87:1.000:0.983 0/0/1/1:4:98,204:0.57: 1.91:1.000:0.938 0/0/0/1:4:79,39:0.25:-1.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,131:0.44: 0.88:1.000:0.965 0/1/1/1:4:12,37:0.65:-2.59:1.000:0.824 0/0/0/1:4:27,9:0.19:-2.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,137:0.40: 1.45:1.000:0.805 0/0/1/1:4:117,129:0.43: 0.91:1.000:0.939 0/0/0/1:4:152,84:0.27: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,127:0.42: 0.90:1.000:0.921 0/0/0/0:4:212,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 1.07:0.999:1.000 0/0/0/1:4:165,81:0.25: 0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,199:0.55: 2.00:1.000:0.984 0/0/1/1:4:110,170:0.50: 1.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,28:0.62:-2.77:1.000:0.620 0/0/0/1:4:137,75:0.27: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:213,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,70:0.27: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,17:0.75:-3.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:119,64:0.27:-0.21:1.000:0.998 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:223,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,82:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,161:0.54: 0.97:1.000:0.985 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,67:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.44:-3.19:1.000:0.959 0/1/1/1:4:11,37:0.67:-2.61:1.000:0.920 0/0/1:3:5,4:0.35:-3.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,67:0.28:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:154,81:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,45:0.18:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:157,60:0.21: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,64:0.26:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:190,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,67:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,150:0.55: 0.61:1.000:0.978 0/0/0/1:4:143,66:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:261,71:0.16: 2.44:1.000:0.998 0/0/0/1:4:49,26:0.26:-2.13:1.000:0.998 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,67:0.58:-1.72:1.000:0.909 0/0/1/1:4:97,98:0.41: 0.01:1.000:0.847 0/0/1/1:4:103,158:0.50: 1.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,71:0.28: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,71:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,61:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,49:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,33:0.18:-0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,60:0.23: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/0/0/0:6:179,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,73:0.28: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/0:4:182,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,52:0.31:-1.13:1.000:0.973 0/0/0/1:4:157,92:0.29: 0.97:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,119:0.58:-0.35:1.000:0.923 0/0/0/1:4:103,53:0.26:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,74:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,116:0.59:-0.47:0.887:0.875 0/0/0/0:4:192,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,41:0.32:-1.68:0.999:0.947 0/0/0/1:4:91,50:0.27:-0.95:1.000:0.997 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,72:0.30:-0.14:1.000:0.986 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,96:0.44:-0.30:1.000:0.969 0/0/1/1:4:77,123:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:123,68:0.27:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,63:0.22: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,55:0.25:-0.49:0.968:0.999 0/0/0/1:4:137,65:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,64:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,64:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:183,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,113:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,106:0.46:-0.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:67,102:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:103,109:0.42: 0.31:1.000:0.905 0/0/0/1:4:85,45:0.26:-1.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:121,78:0.31: 0.08:1.000:0.979 0/0/1/1:4:120,112:0.39: 0.66:1.000:0.682 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,66:0.19: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,70:0.30:-0.28:1.000:0.980 0/0/0/1:4:97,60:0.30:-0.67:1.000:0.988 0/0/0/1:4:105,65:0.30:-0.44:1.000:0.988 0/0/0/1:4:164,87:0.26: 1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,104:0.57:-0.72:1.000:0.939 0/0/1/1:4:79,132:0.52: 0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:88,112:0.46: 0.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:132,63:0.24: 0.01:0.960:1.000 0/0/0/1:4:123,48:0.21:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,134:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,119:0.55:-0.22:1.000:0.979 0/0/0/1:4:148,67:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,161:0.49: 1.34:0.993:0.996 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,85:0.26: 1.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,128:0.52: 0.20:0.999:0.995 0/0/0/1:4:123,55:0.23:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,94:0.58:-1.02:1.000:0.898 0/0/1/1:4:95,152:0.51: 0.93:1.000:0.996 0/0/0/0:4:114,1:0.01:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,65:0.32:-0.63:1.000:0.950 0/0/1/1:4:68,115:0.53:-0.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:163,64:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,51:0.21:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,71:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:165,95:0.28: 1.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:112,62:0.27:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,120:0.45: 0.43:1.000:0.979 0/0/0/1:4:126,58:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,34:0.23:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,37:0.21:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,52:0.27:-0.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,138:0.59: 0.08:1.000:0.857 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,43:0.27:-1.29:0.989:0.998 0/0/0/1:4:106,43:0.22:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,83:0.22: 1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,66:0.27:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/0:4:188,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,99:0.41:-0.01:1.000:0.889 0/0/1/1:4:88,146:0.52: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,157:0.53: 0.93:1.000:0.991 0/0/0/1:4:108,32:0.17:-0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:109,192:0.53: 1.89:1.000:0.990 0/0/0/1:4:171,98:0.28: 1.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:187,77:0.22: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,50:0.19: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,87:0.29: 0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:80,128:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,98:0.26: 1.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,82:0.22: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,18:0.33:-2.70:1.000:0.920 0/0/1/1:4:77,114:0.49:-0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:147,54:0.20: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,90:0.28: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:179,78:0.23: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,85:0.28: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:143,77:0.27: 0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:104,154:0.49: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/0:4:176,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,138:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/0/0:4:207,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,78:0.26: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:124,51:0.22:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,76:0.26: 0.50:0.999:0.999 0/0/0/1:4:137,73:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,134:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,55:0.27:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,147:0.49: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:147,73:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,50:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,62:0.28:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:161,83:0.26: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:195,82:0.22: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,70:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,60:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:245,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,69:0.29:-0.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:139,60:0.23: 0.08:1.000:1.000 -chr8.1 21176680 chr8.1_021176680 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:138,51:.: 0.62:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:48,53:.:-1.04:1.000:. ./.:4:163,32:.: 0.73:1.000:. ./.:4:57,43:.:-1.06:1.000:. ./.:4:152,3:.:-0.02:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:176,41:.: 1.15:1.000:. ./.:4:61,40:.:-1.04:1.000:. ./.:4:6,22:.:-2.42:1.000:. ./.:4:64,4:.:-1.66:1.000:. ./.:4:181,4:.: 0.54:1.000:. ./.:4:53,28:.:-1.42:1.000:. ./.:4:75,90:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,28:.:-1.31:1.000:. ./.:4:134,94:.: 1.36:1.000:. ./.:4:146,104:.: 1.77:0.999:. ./.:4:131,62:.: 0.70:1.000:. ./.:4:153,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:151,2:.:-0.06:1.000:. ./.:4:23,28:.:-1.99:1.000:. ./.:4:120,48:.: 0.22:1.000:. ./.:4:211,52:.: 2.02:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.37:1.000:. ./.:4:27,7:.:-2.31:1.000:. ./.:4:130,61:.: 0.66:1.000:. ./.:4:128,87:.: 1.11:1.000:. ./.:4:120,93:.: 1.07:1.000:. ./.:4:138,61:.: 0.81:1.000:. ./.:4:133,2:.:-0.40:1.000:. ./.:4:207,28:.: 1.49:1.000:. ./.:4:54,91:.:-0.21:1.000:. ./.:4:36,2:.:-2.23:1.000:. ./.:4:24,12:.:-2.27:1.000:. ./.:3:20,1:.:-2.55:1.000:. ./.:4:117,90:.: 0.96:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:79,98:.: 0.39:1.000:. ./.:4:80,103:.: 0.51:1.000:. ./.:4:99,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:132,64:.: 0.75:1.000:. ./.:4:132,58:.: 0.64:1.000:. ./.:4:169,49:.: 1.17:1.000:. ./.:4:55,41:.:-1.14:1.000:. ./.:4:128,39:.: 0.20:1.000:. ./.:5:143,103:.: 1.70:1.000:. ./.:4:195,31:.: 1.32:1.000:. ./.:4:176,21:.: 0.77:1.000:. ./.:4:148,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,49:.:-1.21:1.000:. ./.:4:126,3:.:-0.51:1.000:. ./.:4:97,58:.:-0.02:1.000:. ./.:4:121,60:.: 0.47:1.000:. ./.:4:93,31:.:-0.61:1.000:. ./.:4:211,32:.: 1.64:1.000:. ./.:4:114,31:.:-0.21:1.000:. ./.:4:152,71:.: 1.26:1.000:. ./.:4:128,77:.: 0.92:1.000:. ./.:6:109,80:.: 0.62:1.000:. ./.:4:127,90:.: 1.15:1.000:. ./.:4:120,27:.:-0.17:1.000:. ./.:4:127,97:.: 1.28:1.000:. ./.:4:119,26:.:-0.21:1.000:. ./.:4:142,44:.: 0.56:1.000:. ./.:4:110,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.61:1.000:. ./.:4:113,25:.:-0.34:1.000:. ./.:4:110,8:.:-0.72:0.887:. ./.:4:197,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:136,109:.: 1.68:1.000:. ./.:4:75,44:.:-0.70:0.999:. ./.:4:208,5:.: 1.07:1.000:. ./.:4:163,34:.: 0.77:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:155,21:.: 0.37:1.000:. ./.:4:60,63:.:-0.63:1.000:. ./.:4:105,5:.:-0.87:1.000:. ./.:4:102,37:.:-0.32:1.000:. ./.:4:115,68:.: 0.51:1.000:. ./.:4:148,4:.:-0.08:0.968:. ./.:4:119,40:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,37:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:141,69:.: 1.02:1.000:. ./.:4:178,39:.: 1.15:1.000:. ./.:4:39,37:.:-1.51:1.000:. ./.:4:51,32:.:-1.38:1.000:. ./.:4:46,71:.:-0.74:1.000:. ./.:4:83,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:117,47:.: 0.15:1.000:. ./.:4:70,70:.:-0.31:1.000:. ./.:4:135,16:.:-0.10:1.000:. ./.:4:127,39:.: 0.19:1.000:. ./.:4:164,38:.: 0.87:1.000:. ./.:4:77,21:.:-1.10:1.000:. ./.:4:157,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:110,62:.: 0.30:1.000:. ./.:4:120,33:.:-0.06:1.000:. ./.:4:35,48:.:-1.38:1.000:. ./.:4:44,34:.:-1.48:1.000:. ./.:4:58,37:.:-1.15:1.000:. ./.:4:101,42:.:-0.25:0.960:. ./.:4:62,66:.:-0.53:1.000:. ./.:4:47,36:.:-1.38:1.000:. ./.:4:43,43:.:-1.32:1.000:. ./.:4:51,94:.:-0.21:1.000:. ./.:4:67,44:.:-0.85:0.993:. ./.:4:164,25:.: 0.62:1.000:. ./.:4:133,32:.: 0.17:1.000:. ./.:4:77,116:.: 0.70:1.000:. ./.:4:86,8:.:-1.17:0.999:. ./.:4:112,34:.:-0.19:1.000:. ./.:4:87,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:150,5:.:-0.02:1.000:. ./.:4:140,29:.: 0.24:1.000:. ./.:4:155,22:.: 0.39:1.000:. ./.:4:176,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,21:.:-1.70:1.000:. ./.:4:122,34:.: 0.00:1.000:. ./.:4:79,27:.:-0.95:1.000:. ./.:4:151,69:.: 1.21:1.000:. ./.:4:107,67:.: 0.34:1.000:. ./.:4:156,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:48,29:.:-1.49:1.000:. ./.:4:91,40:.:-0.48:1.000:. ./.:4:153,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:138,2:.:-0.31:1.000:. ./.:4:69,37:.:-0.95:1.000:. ./.:4:98,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:187,34:.: 1.22:1.000:. ./.:4:128,1:.:-0.51:0.989:. ./.:4:172,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:94,87:.: 0.47:1.000:. ./.:4:143,63:.: 0.94:1.000:. ./.:4:110,36:.:-0.19:1.000:. ./.:4:101,72:.: 0.32:1.000:. ./.:4:84,2:.:-1.32:1.000:. ./.:4:45,27:.:-1.59:1.000:. ./.:4:178,35:.: 1.07:1.000:. ./.:4:136,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:66,47:.:-0.81:1.000:. ./.:4:51,66:.:-0.74:1.000:. ./.:4:122,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:246,3:.: 1.75:1.000:. ./.:4:119,59:.: 0.41:1.000:. ./.:4:106,34:.:-0.31:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:109,5:.:-0.80:1.000:. ./.:4:155,67:.: 1.24:1.000:. ./.:4:58,95:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,17:.:-2.04:1.000:. ./.:4:40,28:.:-1.66:1.000:. ./.:4:139,80:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,75:.:-0.51:1.000:. ./.:4:134,51:.: 0.54:1.000:. ./.:4:185,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:129,60:.: 0.62:1.000:. ./.:4:61,57:.:-0.72:1.000:. ./.:4:191,58:.: 1.75:1.000:. ./.:4:146,42:.: 0.60:1.000:. ./.:4:51,38:.:-1.27:1.000:. ./.:4:180,70:.: 1.77:1.000:. ./.:4:132,137:.: 2.13:1.000:. ./.:4:164,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:133,36:.: 0.24:1.000:. ./.:4:151,5:.: 0.00:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:159,48:.: 0.96:1.000:. ./.:4:40,43:.:-1.38:1.000:. ./.:4:162,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:94,59:.:-0.06:1.000:. ./.:4:104,51:.:-0.02:1.000:. ./.:4:97,32:.:-0.51:1.000:. ./.:4:135,66:.: 0.85:1.000:. ./.:4:64,95:.: 0.05:1.000:. ./.:4:57,93:.:-0.12:1.000:. ./.:4:144,27:.: 0.28:1.000:. ./.:4:187,24:.: 1.04:1.000:. ./.:4:261,42:.: 2.77:1.000:. ./.:4:207,66:.: 2.21:1.000:. ./.:4:101,31:.:-0.46:1.000:. ./.:4:176,2:.: 0.41:1.000:. -chr8.1 21333354 chr8.1_021333354 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:30,5:0.14:-0.02:1.000:0.968 0/0/0/1:4:13,3:0.18:-1.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,23:0.58:-0.02:1.000:0.914 0/0/0/1:4:60,9:0.13: 2.51:1.000:0.891 0/0/0/1:4:26,15:0.35: 0.43:1.000:0.810 0/0/1/1:4:6,14:0.61:-1.13:1.000:0.703 0/0/1/1:4:12,13:0.48:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,12:0.39:-0.46:1.000:0.694 0/0/0/1:4:18,11:0.36:-0.46:0.999:0.690 0/0/0/0:4:43,5:0.10: 0.95:1.000:0.746 0/0/0/1:4:31,15:0.31: 0.80:1.000:0.969 0/0/1/1:4:39,30:0.41: 2.51:1.000:0.856 0/0/0/1:4:16,5:0.23:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,10:0.28:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,8:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,7:0.44:-1.50:1.000:0.962 0/0/0/1:4:10,2:0.16:-1.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,11:0.31:-0.09:1.000:0.972 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,12:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,5:0.18:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,6:0.40:-1.58:1.000:0.817 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,3:0.20:-1.50:1.000:1.000 0/1/1:3:2,5:0.62:-2.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.34:-1.35:1.000:0.889 0/0/0/1:4:17,11:0.37:-0.54:1.000:0.539 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,6:0.16: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,8:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,20:0.38: 1.10:1.000:0.544 0/0/0/1:4:14,5:0.26:-1.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,15:0.28: 1.32:1.000:0.997 0/0/0/0/0:5:51,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,13:0.48:-0.76:1.000:0.996 0/0/0/0:4:17,2:0.10:-1.20:1.000:0.717 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,10:0.21: 0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,7:0.15: 0.73:1.000:0.991 0/0/0/0:4:32,4:0.11: 0.06:1.000:0.544 0/0/0/1:4:26,17:0.37: 0.58:1.000:0.510 0/0/0/1:4:15,8:0.33:-0.91:1.000:0.912 0/0/0/1:4:27,15:0.34: 0.50:1.000:0.867 0/0/0/1:4:28,13:0.31: 0.43:1.000:0.980 0/0/0/1:4:35,8:0.18: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/0/0/1:6:25,3:0.11:-0.54:1.000:0.942 0/0/0/1:4:25,8:0.24:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,26:0.47: 1.24:1.000:0.991 0/0/0/0:4:39,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,8:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,8:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,20:0.42: 0.73:1.000:0.902 0/0/0/1:4:31,14:0.30: 0.73:0.887:0.985 0/1/1/1:4:1,10:0.75:-1.80:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.29:-0.61:0.999:0.993 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,23:0.47: 0.80:1.000:0.991 0/0/0/1:4:13,8:0.36:-1.06:1.000:0.673 0/0/0/1:4:10,5:0.32:-1.50:1.000:0.955 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,8:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,19:0.34: 1.39:1.000:0.894 0/0/0/1:4:24,12:0.32: 0.06:1.000:0.955 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.02:0.968:1.000 0/0/0/1:4:41,14:0.25: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,16:0.30: 1.17:1.000:0.983 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,23:0.53: 0.28:1.000:0.990 0/0/0/1:4:42,9:0.17: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,5:0.09: 1.54:1.000:0.961 0/0/0/0:4:42,3:0.07: 0.73:1.000:0.999 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.43:-0.54:1.000:0.957 0/0/0/1:4:27,6:0.18:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.55:-0.91:1.000:0.982 0/0/0/1:4:33,13:0.27: 0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,14:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,9:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.39:-1.72:1.000:0.722 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,7:0.10: 2.28:1.000:0.695 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,9:0.22: 0.43:0.960:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,10:0.20: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,7:0.15: 0.80:1.000:0.987 0/0/0/1:4:53,12:0.18: 2.21:1.000:0.999 0/0/0/0:4:62,1:0.02: 2.06:0.993:1.000 0/0/1/1:4:14,19:0.53:-0.17:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,12:0.45:-0.76:1.000:0.978 0/0/0/1:4:55,10:0.15: 2.21:1.000:0.989 0/0/0/1:4:29,9:0.23: 0.21:0.999:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,2:0.15:-1.65:1.000:0.989 0/0/0/1:4:31,8:0.20: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:25,10:0.28:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:11,12:0.49:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,8:0.20: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,14:0.27: 1.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:34,11:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,8:0.35:-0.98:1.000:0.826 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.47:-1.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:9,5:0.34:-1.58:1.000:0.867 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,5:0.14: 0.06:1.000:0.953 0/0/1/1:4:9,16:0.57:-0.76:1.000:0.950 0/0/1/1:4:9,9:0.47:-1.28:0.989:0.991 0/0/1/1:4:7,5:0.39:-1.72:1.000:0.722 0/0/0/1:4:16,10:0.36:-0.69:1.000:0.634 0/0/0/1:4:22,12:0.34:-0.09:1.000:0.889 0/0/0/1:4:26,15:0.35: 0.43:1.000:0.810 0/0/0/1:4:28,5:0.15:-0.17:1.000:0.986 0/0/0/1:4:33,20:0.36: 1.32:1.000:0.710 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,21:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,13:0.36:-0.09:1.000:0.658 0/0/0/0:4:46,0:0.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,3:0.08: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:47,11:0.19: 1.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,34:0.53: 1.76:1.000:0.994 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,12:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,13:0.43:-0.54:1.000:0.957 0/0/0/1:4:29,17:0.35: 0.80:1.000:0.781 0/0/0/1:4:39,12:0.23: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,26:0.47: 1.24:1.000:0.991 0/0/0/1:4:48,12:0.20: 1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,16:0.22: 2.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,11:0.33:-0.24:1.000:0.927 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.19: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,19:0.56:-0.39:1.000:0.960 0/0/1/1:4:9,12:0.52:-1.06:1.000:0.994 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,21:0.57:-0.17:1.000:0.956 0/0/0/1:4:9,4:0.30:-1.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:18,21:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,6:0.21:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.33:-1.13:1.000:0.902 0/0/1/1:4:16,20:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:17,6:0.26:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/0:4:45,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.45:-1.06:1.000:0.974 0/0/0/1:4:21,8:0.27:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:34,9:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,14:0.34: 0.28:1.000:0.856 0/0/0/1:4:29,6:0.17:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:23,7:0.23:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,5:0.13: 0.13:1.000:0.931 0/0/0/1:4:18,6:0.25:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,21:0.48: 0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,13:0.47:-0.69:1.000:0.991 0/0/1/1:4:17,30:0.57: 0.87:1.000:0.953 0/0/0/1:4:27,11:0.28: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:17,7:0.28:-0.83:1.000:0.995 -chr8.1 21704255 chr8.1_021704255 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:145,185:0.59: 1.59:1.000:0.872 0/1/1/1:4:59,126:0.71:-0.50:1.000:0.992 0/1/1/1:4:65,139:0.71:-0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:144,170:0.57: 1.36:1.000:0.949 0/1/1/1:4:96,182:0.68: 0.84:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,241:1.00: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,203:0.83: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:133,67:0.36:-0.28:1.000:0.657 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-2.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,15:0.21:-2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,77:0.40:-0.20:1.000:0.800 0/1/1/1:4:81,152:0.68: 0.19:1.000:0.959 0/0/0/0:4:232,3:0.01: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,69:0.38:-0.34:1.000:0.564 0/0/1/1:4:134,155:0.56: 1.00:1.000:0.960 0/0/0/1:4:211,69:0.27: 0.87:0.999:0.997 0/1/1/1:4:65,151:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,175:0.69: 0.67:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,265:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,27:0.66:-2.55:1.000:0.851 0/1/1/1:4:64,224:0.80: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,181:0.56: 1.72:1.000:0.965 0/1/1/1:4:66,189:0.77: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,26:0.79:-2.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,74:0.41:-0.36:1.000:0.843 0/0/0/1:4:244,76:0.27: 1.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:240,81:0.28: 1.46:1.000:0.995 0/0/1/1:4:169,110:0.42: 0.86:1.000:0.920 0/1/1/1:4:59,117:0.69:-0.63:1.000:0.980 0/0/1/1:4:118,109:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/0/0:4:175,2:0.01:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,16:0.70:-2.82:1.000:0.982 0/0/1/1:4:37,49:0.60:-1.93:1.000:0.807 0/1/1:3:5,13:0.75:-2.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,84:0.30: 1.24:1.000:0.983 0/1/1/1:4:62,187:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,222:0.77: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:191,3:0.02:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,190:0.77: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,63:0.28: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:89,136:0.63: 0.08:1.000:0.607 0/0/1/1:4:89,99:0.55:-0.46:1.000:0.975 0/1/1/1:4:52,133:0.75:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,63:0.33:-0.18:1.000:0.911 0/0/0/1/1:5:291,179:0.41: 3.61:1.000:0.968 0/0/1/1:4:45,60:0.60:-1.65:1.000:0.793 0/0/1/1:4:110,82:0.45:-0.40:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,101:0.69:-0.96:1.000:0.974 0/1/1/1:4:83,154:0.68: 0.25:1.000:0.953 0/1/1/1:4:48,168:0.80:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,66:0.33:-0.07:1.000:0.898 0/1/1/1:4:52,136:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:94,72:0.46:-0.77:1.000:0.988 0/1/1/1:4:61,118:0.69:-0.59:1.000:0.972 0/0/1/1:4:114,95:0.48:-0.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:105,61:0.39:-0.77:1.000:0.743 0/0/0/0/1/1:6:146,75:0.37: 0.02:1.000:0.846 0/0/0/1:4:197,56:0.25: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,119:0.47: 0.74:1.000:0.991 0/0/0/1:4:212,49:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,93:0.66:-1.05:1.000:0.882 0/0/1/1:4:156,159:0.53: 1.37:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,56:0.42:-1.14:1.000:0.930 0/1/1/1:4:76,147:0.69: 0.05:1.000:0.972 1/1/1/1:4:0,156:1.00:-0.92:0.887:1.000 0/0/1/1:4:142,135:0.51: 0.83:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,80:0.30: 1.06:1.000:0.984 0/1/1/1:4:43,85:0.69:-1.32:0.999:0.979 0/1/1/1:4:63,113:0.67:-0.63:1.000:0.927 0/0/1/1:4:145,138:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,111:0.69:-0.75:1.000:0.975 0/0/1/1:4:135,108:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:118,62:0.37:-0.57:1.000:0.536 1/1/1/1:4:0,200:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,116:0.63:-0.39:1.000:0.562 0/1/1/1:4:72,120:0.65:-0.40:1.000:0.829 0/0/0/1:4:96,50:0.37:-1.06:0.968:0.562 0/0/1/1:4:126,128:0.53: 0.49:1.000:0.992 0/0/1/1:4:137,125:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,135:0.52: 0.81:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,54:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:78,220:0.77: 1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,87:0.69:-1.27:1.000:0.972 0/1/1/1:4:43,103:0.74:-1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:55,111:0.70:-0.77:1.000:0.984 0/0/0/1:4:141,58:0.32:-0.30:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,182:0.82: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:159,74:0.35: 0.19:1.000:0.831 0/0/1/1:4:111,84:0.46:-0.36:1.000:0.986 0/0/1/1:4:142,152:0.54: 1.07:1.000:0.985 0/1/1/1:4:63,158:0.75: 0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:67,102:0.63:-0.73:1.000:0.595 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,111:0.48: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,155:0.56: 1.00:1.000:0.960 0/1/1/1:4:51,93:0.68:-1.09:1.000:0.941 0/1/1/1:4:57,132:0.73:-0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:127,65:0.37:-0.40:1.000:0.613 0/1/1/1:4:73,190:0.75: 0.62:0.960:0.999 0/0/0/0:4:134,1:0.01:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,114:0.67:-0.62:1.000:0.935 0/1/1/1:4:62,124:0.70:-0.49:1.000:0.982 0/0/1/1:4:149,103:0.44: 0.47:1.000:0.960 0/1/1/1:4:83,188:0.72: 0.74:0.993:0.997 0/1/1/1:4:69,216:0.78: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,168:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,104:0.35: 1.46:1.000:0.776 1/1/1/1:4:0,179:1.00:-0.59:0.999:1.000 0/0/1/1:4:162,129:0.47: 1.03:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,148:0.64: 0.34:1.000:0.666 0/1/1/1:4:54,127:0.73:-0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:52,135:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,149:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,93:0.60:-0.83:1.000:0.769 0/0/0/1:4:160,79:0.36: 0.28:1.000:0.708 0/0/1/1:4:120,110:0.50: 0.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:71,123:0.66:-0.37:1.000:0.890 0/1/1/1:4:63,230:0.81: 1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,166:0.76: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,79:0.36: 0.25:1.000:0.676 0/1/1/1:4:53,102:0.69:-0.93:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,123:0.68:-0.43:1.000:0.946 0/0/1/1:4:97,86:0.50:-0.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,179:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,224:0.78: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,112:0.78:-1.03:0.989:1.000 1/1/1/1:4:0,202:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,55:0.26: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:174,218:0.58: 2.49:1.000:0.896 0/1/1/1:4:63,144:0.73:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:188,66:0.29: 0.49:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,59:0.34:-0.44:1.000:0.869 0/0/1/1:4:131,121:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,183:0.81: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,61:0.35:-0.43:1.000:0.803 0/0/0/1:4:100,44:0.33:-1.09:1.000:0.905 1/1/1/1:4:0,281:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:104,250:0.74: 1.94:1.000:0.998 0/0/0/1:4:248,60:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,69:0.36:-0.18:1.000:0.676 0/1/1/1:4:89,233:0.75: 1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,181:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,99:0.42: 0.45:1.000:0.920 0/0/0/1:4:148,73:0.36: 0.02:1.000:0.711 0/0/0/1:4:40,15:0.30:-2.38:1.000:0.984 0/1/1/1:4:51,107:0.71:-0.89:1.000:0.990 0/1/1/1:4:77,153:0.70: 0.15:1.000:0.980 0/0/1/1:4:156,83:0.37: 0.28:1.000:0.501 0/0/1/1:4:173,97:0.39: 0.73:1.000:0.654 0/1/1/1:4:76,245:0.79: 1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,142:0.57: 0.64:1.000:0.957 0/0/1/1:4:98,142:0.62: 0.29:1.000:0.565 0/0/1/1:4:131,142:0.55: 0.77:1.000:0.982 0/1/1/1:4:61,159:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,116:0.63:-0.40:1.000:0.603 0/0/1/1:4:154,165:0.54: 1.43:1.000:0.985 0/0/0/1:4:208,61:0.26: 0.71:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,223:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,193:0.77: 0.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,238:1.00: 0.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,288:1.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,126:0.55: 0.29:1.000:0.977 0/1/1/1:4:57,122:0.71:-0.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,171:0.80: 0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,219:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,143:0.74:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:69,110:0.64:-0.59:1.000:0.729 0/1/1/1:4:40,121:0.78:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,189:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:157,101:0.42: 0.55:1.000:0.908 0/0/0/1:4:140,63:0.34:-0.24:1.000:0.880 0/1/1/1:4:40,173:0.83:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:85,245:0.77: 1.59:0.956:1.000 0/0/1/1:4:195,188:0.52: 2.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:101,277:0.76: 2.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,203:0.79: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,139:0.70:-0.18:1.000:0.987 -chr8.1 21971353 chr8.1_021971353 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,214:.: 0.61:1.000:. ./.:4:49,124:.:-0.40:1.000:. ./.:4:47,140:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,124:.:-0.55:1.000:. ./.:4:131,126:.: 1.67:1.000:. ./.:4:49,156:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,129:.:-1.48:1.000:. ./.:4:61,166:.: 0.93:1.000:. ./.:4:94,97:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,30:.:-2.49:1.000:. ./.:4:18,79:.:-2.27:1.000:. ./.:4:86,130:.: 0.66:1.000:. ./.:4:85,95:.:-0.23:1.000:. ./.:4:92,106:.: 0.22:1.000:. ./.:4:108,98:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,153:.: 0.19:1.000:. ./.:4:57,201:.: 1.69:0.999:. ./.:4:146,59:.: 0.39:1.000:. ./.:4:68,213:.: 2.26:1.000:. ./.:4:50,174:.: 0.86:1.000:. ./.:4:32,62:.:-2.34:1.000:. ./.:4:0,232:.: 1.05:1.000:. ./.:4:58,177:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,32:.:-3.52:1.000:. ./.:4:53,163:.: 0.66:1.000:. ./.:4:54,156:.: 0.51:1.000:. ./.:4:43,143:.:-0.08:1.000:. ./.:4:67,147:.: 0.61:1.000:. ./.:4:57,144:.: 0.29:1.000:. ./.:4:55,155:.: 0.51:1.000:. ./.:4:84,86:.:-0.47:1.000:. ./.:4:12,51:.:-3.11:1.000:. ./.:4:49,36:.:-2.56:1.000:. ./.:3:0,44:.:-3.57:1.000:. ./.:4:56,155:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1,193:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,221:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,131:.: 2.04:1.000:. ./.:4:112,131:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,151:.: 0.02:1.000:. ./.:4:52,144:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.82:1.000:. ./.:4:108,102:.: 0.51:1.000:. ./.:4:102,89:.: 0.04:1.000:. ./.:5:122,177:.: 2.70:1.000:. ./.:4:16,68:.:-2.59:1.000:. ./.:4:37,127:.:-0.62:1.000:. ./.:4:66,161:.: 0.93:1.000:. ./.:4:35,126:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,168:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.24:1.000:. ./.:4:68,136:.: 0.36:1.000:. ./.:4:85,100:.:-0.10:1.000:. ./.:4:71,151:.: 0.81:1.000:. ./.:4:80,70:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.83:1.000:. ./.:4:57,143:.: 0.27:1.000:. ./.:6:29,123:.:-0.92:1.000:. ./.:4:36,161:.: 0.19:1.000:. ./.:4:52,146:.: 0.22:1.000:. ./.:4:50,169:.: 0.73:1.000:. ./.:4:101,97:.: 0.22:1.000:. ./.:4:57,167:.: 0.86:1.000:. ./.:4:31,162:.: 0.09:1.000:. ./.:4:78,40:.:-1.75:1.000:. ./.:4:74,93:.:-0.55:1.000:. ./.:4:55,137:.: 0.07:0.887:. ./.:4:0,177:.:-0.30:1.000:. ./.:4:51,179:.: 1.00:1.000:. ./.:4:36,134:.:-0.47:0.999:. ./.:4:69,153:.: 0.81:1.000:. ./.:4:50,156:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,156:.: 0.17:1.000:. ./.:4:41,134:.:-0.35:1.000:. ./.:4:50,152:.: 0.32:1.000:. ./.:4:39,150:.: 0.00:1.000:. ./.:4:124,102:.: 0.91:1.000:. ./.:4:49,161:.: 0.51:1.000:. ./.:4:37,94:.:-1.43:0.968:. ./.:4:54,163:.: 0.68:1.000:. ./.:4:46,162:.: 0.46:1.000:. ./.:4:51,129:.:-0.23:1.000:. ./.:4:41,178:.: 0.73:1.000:. ./.:4:72,159:.: 1.03:1.000:. ./.:4:28,130:.:-0.77:1.000:. ./.:4:83,107:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,138:.:-0.13:1.000:. ./.:4:74,91:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,165:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.25:1.000:. ./.:4:59,182:.: 1.27:1.000:. ./.:4:43,112:.:-0.84:1.000:. ./.:4:55,160:.: 0.64:1.000:. ./.:4:48,192:.: 1.25:1.000:. ./.:4:53,81:.:-1.36:1.000:. ./.:4:53,172:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,196:.: 0.17:1.000:. ./.:4:52,148:.: 0.27:1.000:. ./.:4:39,137:.:-0.32:1.000:. ./.:4:82,121:.: 0.34:1.000:. ./.:4:34,97:.:-1.43:1.000:. ./.:4:55,163:.: 0.71:0.960:. ./.:4:74,87:.:-0.69:1.000:. ./.:4:105,98:.: 0.34:1.000:. ./.:4:97,94:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,95:.: 0.14:1.000:. ./.:4:105,131:.: 1.15:0.993:. ./.:4:52,153:.: 0.39:1.000:. ./.:4:48,144:.: 0.07:1.000:. ./.:4:121,151:.: 2.04:1.000:. ./.:4:49,151:.: 0.27:0.999:. ./.:4:39,144:.:-0.15:1.000:. ./.:4:43,101:.:-1.11:1.000:. ./.:4:45,156:.: 0.29:1.000:. ./.:4:56,133:.: 0.00:1.000:. ./.:4:46,119:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.08:1.000:. ./.:4:86,75:.:-0.69:1.000:. ./.:4:91,95:.:-0.08:1.000:. ./.:4:41,146:.:-0.05:1.000:. ./.:4:43,148:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1,181:.:-0.18:1.000:. ./.:4:108,117:.: 0.88:1.000:. ./.:4:75,85:.:-0.72:1.000:. ./.:4:43,139:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,119:.:-1.73:1.000:. ./.:4:40,122:.:-0.67:1.000:. ./.:4:40,115:.:-0.84:1.000:. ./.:4:52,145:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,130:.:-1.46:0.989:. ./.:4:0,174:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,128:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,264:.: 1.84:1.000:. ./.:4:97,90:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,130:.:-0.62:1.000:. ./.:4:35,111:.:-1.06:1.000:. ./.:4:80,83:.:-0.64:1.000:. ./.:4:47,138:.:-0.10:1.000:. ./.:4:47,125:.:-0.42:1.000:. ./.:4:70,93:.:-0.64:1.000:. ./.:4:70,64:.:-1.36:1.000:. ./.:4:56,178:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.51:1.000:. ./.:4:85,90:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.71:1.000:. ./.:4:49,123:.:-0.42:1.000:. ./.:4:62,167:.: 0.98:1.000:. ./.:4:87,106:.: 0.09:1.000:. ./.:4:52,37:.:-2.47:1.000:. ./.:4:75,60:.:-1.33:1.000:. ./.:4:39,147:.:-0.08:1.000:. ./.:4:104,111:.: 0.64:1.000:. ./.:4:104,109:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,145:.:-1.09:1.000:. ./.:4:52,179:.: 1.03:1.000:. ./.:4:39,141:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,197:.: 0.19:1.000:. ./.:4:105,95:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,195:.: 0.14:1.000:. ./.:4:46,129:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.29:1.000:. ./.:4:41,135:.:-0.32:1.000:. ./.:4:60,144:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,125:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.57:1.000:. ./.:4:47,133:.:-0.23:1.000:. ./.:4:44,131:.:-0.35:1.000:. ./.:4:42,130:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,85:.:-0.64:1.000:. ./.:4:69,196:.: 1.87:1.000:. ./.:4:100,144:.: 1.35:1.000:. ./.:4:89,102:.: 0.04:1.000:. ./.:4:106,91:.: 0.19:1.000:. ./.:4:57,148:.: 0.39:0.956:. ./.:4:59,179:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,273:.: 2.06:1.000:. ./.:4:47,152:.: 0.24:1.000:. ./.:4:49,159:.: 0.46:1.000:. -chr8.1 22197807 chr8.1_022197807 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:260,1025:.: 0.71:1.000:. ./.:4:203,766:.:-0.81:1.000:. ./.:4:479,603:.:-0.27:1.000:. ./.:4:248,984:.: 0.45:1.000:. ./.:4:951,418:.: 1.11:1.000:. ./.:4:511,753:.: 0.61:1.000:. ./.:4:186,773:.:-0.86:1.000:. ./.:4:252,938:.: 0.25:1.000:. ./.:4:729,267:.:-0.68:1.000:. ./.:4:432,208:.:-2.39:1.000:. ./.:4:481,596:.:-0.29:1.000:. ./.:4:425,838:.: 0.60:1.000:. ./.:4:777,372:.: 0.05:1.000:. ./.:4:571,669:.: 0.49:1.000:. ./.:4:732,280:.:-0.60:1.000:. ./.:4:270,993:.: 0.60:1.000:. ./.:4:268,927:.: 0.27:0.999:. ./.:4:926,393:.: 0.87:1.000:. ./.:4:612,836:.: 1.49:1.000:. ./.:4:615,809:.: 1.37:1.000:. ./.:4:388,495:.:-1.22:1.000:. ./.:4:253,928:.: 0.21:1.000:. ./.:4:320,1253:.: 2.09:1.000:. ./.:4:235,888:.:-0.07:1.000:. ./.:4:318,377:.:-2.12:1.000:. ./.:4:252,824:.:-0.30:1.000:. ./.:4:259,892:.: 0.06:1.000:. ./.:4:210,806:.:-0.58:1.000:. ./.:4:341,1112:.: 1.51:1.000:. ./.:4:483,551:.:-0.50:1.000:. ./.:4:264,885:.: 0.05:1.000:. ./.:4:434,439:.:-1.27:1.000:. ./.:4:180,332:.:-3.00:1.000:. ./.:4:620,300:.:-1.05:1.000:. ./.:3:80,481:.:-2.77:1.000:. ./.:4:244,816:.:-0.37:1.000:. ./.:4:251,1000:.: 0.54:1.000:. ./.:4:246,994:.: 0.49:1.000:. ./.:4:468,545:.:-0.60:1.000:. ./.:4:478,527:.:-0.64:1.000:. ./.:4:206,932:.: 0.00:1.000:. ./.:4:228,1003:.: 0.45:1.000:. ./.:4:295,1032:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,1158:.: 0.10:1.000:. ./.:4:795,383:.: 0.19:1.000:. ./.:4:513,641:.: 0.08:1.000:. ./.:5:914,821:.: 2.86:1.000:. ./.:4:874,1132:.: 4.16:1.000:. ./.:4:188,730:.:-1.05:1.000:. ./.:4:509,661:.: 0.15:1.000:. ./.:4:406,509:.:-1.07:1.000:. ./.:4:614,715:.: 0.92:1.000:. ./.:4:219,859:.:-0.29:1.000:. ./.:4:282,991:.: 0.65:1.000:. ./.:4:486,645:.:-0.03:1.000:. ./.:4:271,901:.: 0.16:1.000:. ./.:4:425,603:.:-0.53:1.000:. ./.:4:260,1001:.: 0.59:1.000:. ./.:4:238,826:.:-0.35:1.000:. ./.:6:145,847:.:-0.70:1.000:. ./.:4:263,1008:.: 0.64:1.000:. ./.:4:476,559:.:-0.49:1.000:. ./.:4:285,957:.: 0.50:1.000:. ./.:4:446,592:.:-0.48:1.000:. ./.:4:541,674:.: 0.37:1.000:. ./.:4:438,586:.:-0.55:1.000:. ./.:4:464,646:.:-0.13:1.000:. ./.:4:487,637:.:-0.07:1.000:. ./.:4:561,657:.: 0.38:0.887:. ./.:4:0,1121:.:-0.08:1.000:. ./.:4:269,1021:.: 0.73:1.000:. ./.:4:332,1032:.: 1.08:0.999:. ./.:4:249,918:.: 0.14:1.000:. ./.:4:266,978:.: 0.51:1.000:. ./.:4:234,918:.: 0.07:1.000:. ./.:4:234,872:.:-0.15:1.000:. ./.:4:475,540:.:-0.59:1.000:. ./.:4:523,668:.: 0.25:1.000:. ./.:4:469,649:.:-0.10:1.000:. ./.:4:276,1007:.: 0.70:1.000:. ./.:4:192,674:.:-1.30:0.968:. ./.:4:511,701:.: 0.36:1.000:. ./.:4:585,633:.: 0.38:1.000:. ./.:4:409,514:.:-1.03:1.000:. ./.:4:232,890:.:-0.08:1.000:. ./.:4:270,1091:.: 1.07:1.000:. ./.:4:401,527:.:-1.01:1.000:. ./.:4:631,365:.:-0.68:1.000:. ./.:4:451,598:.:-0.43:1.000:. ./.:4:710,273:.:-0.74:1.000:. ./.:4:255,978:.: 0.46:1.000:. ./.:4:238,824:.:-0.36:1.000:. ./.:4:547,623:.: 0.15:1.000:. ./.:4:187,734:.:-1.04:1.000:. ./.:4:530,644:.: 0.17:1.000:. ./.:4:224,989:.: 0.36:1.000:. ./.:4:446,581:.:-0.53:1.000:. ./.:4:213,850:.:-0.36:1.000:. ./.:4:271,1002:.: 0.65:1.000:. ./.:4:523,616:.: 0.01:1.000:. ./.:4:531,694:.: 0.42:1.000:. ./.:4:802,366:.: 0.14:1.000:. ./.:4:385,374:.:-1.82:1.000:. ./.:4:528,806:.: 0.94:0.960:. ./.:4:344,430:.:-1.75:1.000:. ./.:4:634,329:.:-0.84:1.000:. ./.:4:666,319:.:-0.73:1.000:. ./.:4:456,573:.:-0.52:1.000:. ./.:4:992,468:.: 1.55:0.993:. ./.:4:226,950:.: 0.18:1.000:. ./.:4:216,911:.:-0.05:1.000:. ./.:4:663,783:.: 1.48:1.000:. ./.:4:543,683:.: 0.42:0.999:. ./.:4:486,678:.: 0.13:1.000:. ./.:4:329,505:.:-1.46:1.000:. ./.:4:592,704:.: 0.76:1.000:. ./.:4:275,1082:.: 1.05:1.000:. ./.:4:219,867:.:-0.25:1.000:. ./.:4:213,859:.:-0.32:1.000:. ./.:4:679,308:.:-0.72:1.000:. ./.:4:484,622:.:-0.15:1.000:. ./.:4:469,563:.:-0.51:1.000:. ./.:4:284,1070:.: 1.04:1.000:. ./.:4:279,1048:.: 0.91:1.000:. ./.:4:232,894:.:-0.06:1.000:. ./.:4:853,321:.: 0.17:1.000:. ./.:4:453,632:.:-0.25:1.000:. ./.:4:193,784:.:-0.77:1.000:. ./.:4:165,719:.:-1.22:1.000:. ./.:4:353,467:.:-1.53:1.000:. ./.:4:451,570:.:-0.56:1.000:. ./.:4:241,898:.: 0.01:1.000:. ./.:4:157,624:.:-1.71:0.989:. ./.:4:257,1045:.: 0.79:1.000:. ./.:4:205,849:.:-0.40:1.000:. ./.:4:316,1209:.: 1.86:1.000:. ./.:4:611,708:.: 0.87:1.000:. ./.:4:186,831:.:-0.58:1.000:. ./.:4:398,543:.:-0.94:1.000:. ./.:4:652,240:.:-1.18:1.000:. ./.:4:265,1046:.: 0.83:1.000:. ./.:4:181,772:.:-0.89:1.000:. ./.:4:702,297:.:-0.67:1.000:. ./.:4:358,474:.:-1.47:1.000:. ./.:4:618,787:.: 1.28:1.000:. ./.:4:382,1412:.: 3.15:1.000:. ./.:4:233,836:.:-0.33:1.000:. ./.:4:481,577:.:-0.38:1.000:. ./.:4:277,1006:.: 0.70:1.000:. ./.:4:461,638:.:-0.19:1.000:. ./.:4:267,961:.: 0.43:1.000:. ./.:4:478,560:.:-0.48:1.000:. ./.:4:477,218:.:-2.12:1.000:. ./.:4:584,255:.:-1.43:1.000:. ./.:4:277,988:.: 0.61:1.000:. ./.:4:589,768:.: 1.05:1.000:. ./.:4:640,769:.: 1.30:1.000:. ./.:4:300,1151:.: 1.50:1.000:. ./.:4:244,782:.:-0.54:1.000:. ./.:4:584,708:.: 0.74:1.000:. ./.:4:234,989:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,943:.:-0.93:1.000:. ./.:4:632,302:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,1250:.: 0.54:1.000:. ./.:4:274,947:.: 0.40:1.000:. ./.:4:248,1102:.: 1.02:1.000:. ./.:4:490,637:.:-0.05:1.000:. ./.:4:246,867:.:-0.12:1.000:. ./.:4:235,970:.: 0.32:1.000:. ./.:4:2,1148:.: 0.06:1.000:. ./.:4:380,520:.:-1.14:1.000:. ./.:4:205,717:.:-1.04:1.000:. ./.:4:493,726:.: 0.39:1.000:. ./.:4:198,862:.:-0.37:1.000:. ./.:4:231,770:.:-0.66:1.000:. ./.:4:356,470:.:-1.50:1.000:. ./.:4:287,1091:.: 1.15:1.000:. ./.:4:787,371:.: 0.10:1.000:. ./.:4:555,691:.: 0.52:1.000:. ./.:4:393,623:.:-0.58:1.000:. ./.:4:263,1046:.: 0.82:0.956:. ./.:4:320,1245:.: 2.05:1.000:. ./.:4:0,1674:.: 2.57:1.000:. ./.:4:458,579:.:-0.48:1.000:. ./.:4:253,1018:.: 0.64:1.000:. -chr8.1 22342328 chr8.1_022342328 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:72,12:0.25: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/0:4:64,3:0.08:-0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:7,16:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,11:0.15: 1.24:1.000:0.982 0/0/1/1:4:8,22:0.55:-1.07:1.000:0.978 0/0/0/1:4:90,20:0.27: 0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:69,7:0.16:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:72,7:0.15: 0.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:80,13:0.24: 0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,14:0.17: 1.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:7,22:0.59:-1.09:1.000:0.842 0/0/0/1:4:53,31:0.35: 0.18:1.000:0.786 0/0/0/1:4:68,19:0.28: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,10:0.43:-1.35:1.000:0.957 0/0/0/1:4:86,13:0.23: 0.53:0.999:1.000 1/1/1/1:4:1,25:0.93:-1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:169,22:0.20: 2.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,23:0.28: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/1:4:3,2:0.36:-1.65:1.000:0.633 0/0/1/1:4:7,14:0.48:-1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,13:0.16: 1.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,12:0.14: 1.75:1.000:0.953 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:128,11:0.14: 1.45:1.000:0.954 0/0/0/1:4:70,13:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,13:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,17:0.19: 1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,10:0.12: 1.61:1.000:0.724 0/0/0/0:4:173,2:0.02: 2.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,18:0.29:-0.05:1.000:0.989 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.67:1.000:1.000 0/0/1:3:5,1:0.26:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,15:0.26: 0.20:1.000:0.998 0/0/0/1:4:123,12:0.15: 1.36:1.000:0.991 0/0/0/0:4:125,8:0.10: 1.31:1.000:0.703 0/0/0/1:4:59,21:0.30: 0.09:1.000:0.982 0/0/0/1:4:63,20:0.29: 0.16:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,18:0.69:-1.26:1.000:0.975 0/0/0/1:4:56,28:0.33: 0.18:1.000:0.899 0/0/0/0:4:141,7:0.08: 1.66:1.000:0.985 0/0/0/1:4:99,7:0.11: 0.69:1.000:0.610 0/1/1/1:4:2,29:0.89:-1.05:1.000:0.509 0/0/0/1:4:104,12:0.18: 0.92:1.000:0.999 0/1/1/1/1:5:8,52:0.77:-0.38:1.000:0.976 0/0/0/0:4:15,1:0.11:-1.39:1.000:0.581 0/0/0/0:4:80,1:0.02: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,5:0.23:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,23:0.53:-1.02:1.000:0.993 0/0/0/1:4:149,27:0.25: 2.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,13:0.46:-1.28:1.000:0.989 0/0/0/1:4:133,21:0.24: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,17:0.28: 0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:103,7:0.11: 0.78:1.000:0.518 0/0/0/1:4:59,19:0.29: 0.04:1.000:0.989 0/0/0/1:4:43,10:0.27:-0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:117,11:0.15: 1.20:1.000:0.986 0/0/0/0/1/1:6:63,16:0.28: 0.06:1.000:0.734 0/0/0/1:4:71,14:0.26: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,16:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,17:0.29:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:45,10:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:65,20:0.29: 0.20:1.000:0.991 0/0/0/1:4:58,17:0.29:-0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:83,9:0.17: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:61,7:0.18:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,14:0.26: 0.23:0.887:0.999 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,17:0.27: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,8:0.26:-0.58:0.999:0.999 0/0/0/1:4:67,9:0.20:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,14:0.15: 2.03:1.000:0.984 0/0/0/1:4:55,9:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,11:0.17: 0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:46,22:0.33:-0.19:1.000:0.920 0/0/0/1:4:50,24:0.33:-0.05:1.000:0.918 0/0/0/1:4:59,11:0.26:-0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,13:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:90,5:0.09: 0.43:0.968:0.938 0/0/0/1:4:63,18:0.28: 0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:79,17:0.26: 0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:64,18:0.28: 0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:54,9:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,7:0.13: 0.46:1.000:0.865 0/1/1/1:4:3,25:0.82:-1.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,20:0.56:-1.14:1.000:0.960 0/1/1/1:4:1,13:0.88:-1.44:1.000:0.814 0/0/0/1:4:59,28:0.33: 0.25:1.000:0.923 0/0/0/0:4:53,1:0.03:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,15:0.48:-1.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,22:0.31: 0.13:1.000:0.980 0/0/0/0:4:82,2:0.04: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,13:0.26:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,5:0.18:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,5:0.15:-0.42:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,8:0.40:-1.37:1.000:0.757 0/0/0/1:4:59,17:0.29:-0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,24:0.30: 0.32:1.000:0.980 0/1/1/1:4:3,16:0.73:-1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,21:0.54:-1.09:1.000:0.989 0/0/0/1:4:35,21:0.35:-0.47:1.000:0.760 0/0/1/1:4:12,29:0.51:-0.82:0.960:0.996 0/0/0/1:4:43,21:0.33:-0.28:1.000:0.911 0/1/1/1:4:5,19:0.65:-1.21:1.000:0.768 0/1/1/1:4:2,16:0.81:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,26:0.94:-1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,34:0.82:-0.89:0.993:0.999 0/0/0/1:4:75,9:0.19: 0.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,7:0.16:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,22:0.86:-1.21:1.000:0.976 0/0/0/1:4:61,29:0.33: 0.32:0.999:0.922 0/0/0/1:4:60,19:0.29: 0.06:1.000:0.990 0/0/0/1:4:40,8:0.26:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,24:0.27: 1.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:59,7:0.18:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,10:0.27:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:107,11:0.16: 0.97:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,27:0.94:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,17:0.27: 0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:43,24:0.35:-0.21:1.000:0.827 0/0/0/1:4:64,22:0.30: 0.23:1.000:0.985 0/0/1/1:4:11,18:0.46:-1.09:1.000:0.990 0/0/0/1:4:75,10:0.20: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,27:0.32: 0.27:1.000:0.946 0/0/0/1:4:51,15:0.29:-0.24:1.000:0.993 0/0/0/1:4:12,6:0.33:-1.35:1.000:0.899 0/0/0/0:4:92,6:0.11: 0.50:1.000:0.649 0/0/0/1:4:51,12:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,21:0.33:-0.26:1.000:0.920 0/0/0/1:4:81,12:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,3:0.06: 0.27:0.989:1.000 0/0/0/0:4:60,3:0.08:-0.31:1.000:0.983 0/0/0/1:4:73,20:0.28: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,23:0.29: 0.60:1.000:0.993 0/0/0/1:4:65,11:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,19:0.33:-0.45:1.000:0.899 0/0/0/1:4:51,20:0.31:-0.12:1.000:0.971 0/0/0/1:4:35,19:0.34:-0.52:1.000:0.849 0/0/0/1:4:92,7:0.12: 0.53:1.000:0.805 0/0/0/1:4:64,8:0.19:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,16:0.30:-0.28:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,19:0.26: 0.73:1.000:0.998 0/0/0/0:4:159,8:0.08: 2.10:1.000:0.982 0/0/0/1:4:124,25:0.26: 1.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:112,13:0.18: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:142,8:0.09: 1.71:1.000:0.926 0/0/0/1:4:60,18:0.29: 0.04:1.000:0.992 0/0/0/1:4:168,15:0.14: 2.47:1.000:0.972 0/1/1/1:4:5,22:0.69:-1.14:1.000:0.965 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,22:0.69:-1.14:1.000:0.965 0/0/0/1:4:79,20:0.28: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,28:0.66:-0.95:1.000:0.876 0/0/0/1:4:143,26:0.25: 2.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:162,8:0.08: 2.17:1.000:0.986 0/0/0/1:4:48,16:0.30:-0.28:1.000:0.987 0/1/1/1:4:8,35:0.68:-0.77:1.000:0.963 0/0/0/1:4:130,10:0.12: 1.48:1.000:0.827 0/0/0/1:4:58,6:0.16:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,22:0.69:-1.14:1.000:0.965 0/0/0/1:4:120,9:0.12: 1.22:1.000:0.773 0/0/0/1:4:79,12:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,9:0.19: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,17:0.68:-1.28:1.000:0.944 0/0/0/1:4:14,1:0.12:-1.42:1.000:0.642 0/0/0/1:4:74,10:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:127,3:0.04: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,14:0.70:-1.37:1.000:0.985 0/0/0/1:4:95,7:0.12: 0.60:1.000:0.730 0/0/0/1:4:49,11:0.27:-0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:55,11:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,13:0.26:-0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,21:0.31: 0.04:1.000:0.979 0/0/0/1:4:80,22:0.28: 0.60:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,44:0.71:-0.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:4,20:0.72:-1.21:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,9:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,10:0.19: 0.34:0.956:1.000 0/0/0/0:4:180,7:0.06: 2.56:1.000:0.999 0/0/0/0:4:115,7:0.10: 1.06:1.000:0.820 0/0/1/1:4:11,14:0.44:-1.19:1.000:0.961 0/0/0/1:4:78,12:0.23: 0.32:1.000:1.000 -chr8.1 22472553 chr8.1_022472553 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:58,10:0.16: 0.83:1.000:0.994 0/0/1/1:4:35,29:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:39,15:0.30:-0.07:1.000:0.986 0/0/0/1:4:30,15:0.36:-0.65:1.000:0.700 0/0/0/1:4:60,19:0.26: 1.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,30:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,28:0.71:-1.10:1.000:0.989 0/1/1/1:4:11,29:0.70:-0.97:1.000:0.982 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,6:0.38:-2.46:1.000:0.571 0/0/0/1:4:57,16:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,9:0.16: 0.38:1.000:0.995 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,20:0.43:-0.33:1.000:0.949 0/0/0/1:4:44,16:0.29: 0.32:0.999:0.993 0/0/1/1:4:34,28:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:45,13:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,20:0.30: 1.03:1.000:0.982 0/0/0/0:4:22,2:0.09:-2.00:1.000:0.947 0/0/1/1:4:32,25:0.47: 0.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,24:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:24,22:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,3:0.60:-3.23:1.000:0.769 0/0/0/1:4:36,13:0.29:-0.39:1.000:0.994 0/0/0/1:4:34,13:0.30:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:38,11:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,10:0.15: 1.22:1.000:0.981 0/0/0/1:4:46,19:0.31: 0.64:1.000:0.965 0/0/1/1:4:46,31:0.43: 1.41:1.000:0.955 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.46:-3.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:17,9:0.37:-1.88:1.000:0.526 0/0/0:3:8,0:0.00:-3.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.35:-0.13:1.000:0.831 0/0/1/1:4:23,17:0.46:-0.97:1.000:0.986 0/0/1/1:4:23,25:0.54:-0.46:1.000:0.986 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,33:0.47: 1.28:1.000:0.993 0/0/0/1:4:46,13:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,28:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,18:0.52:-1.17:1.000:0.995 0/0/0/1:4:83,12:0.14: 2.57:1.000:0.951 0/0/0/1:4:60,16:0.23: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:84,17:0.18: 2.96:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,6:0.23:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,25:0.48: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,11:0.38:-1.55:1.000:0.597 0/0/0/1:4:48,10:0.19: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,14:0.20: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,26:0.38: 1.22:1.000:0.548 0/0/0/1:4:78,23:0.25: 2.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,16:0.39:-0.71:1.000:0.709 0/0/1/1:4:25,22:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,22:0.46:-0.26:1.000:0.990 0/0/0/1:4:64,16:0.22: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.31: 0.51:1.000:0.977 0/0/0/0/0/1:6:43,12:0.23:-0.01:1.000:0.683 0/0/0/1:4:51,21:0.31: 1.09:1.000:0.967 0/0/0/1:4:49,15:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,13:0.17: 1.80:1.000:0.998 0/0/1/1:4:30,25:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:47,9:0.17: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,15:0.33:-0.39:1.000:0.922 0/0/0/1:4:28,10:0.28:-1.10:1.000:0.994 0/0/1/1:4:33,30:0.51: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,31:0.47: 1.03:0.887:0.992 0/0/1/1:4:25,20:0.48:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,13:0.22: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,20:0.55:-1.10:0.999:0.983 0/0/1/1:4:34,31:0.51: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,22:0.48:-0.39:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,26:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,34:0.51: 1.09:1.000:0.997 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,29:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,32:0.43: 1.61:1.000:0.949 0/0/1/1:4:41,27:0.43: 0.83:1.000:0.940 0/0/0/1:4:33,7:0.19:-0.97:0.968:1.000 0/0/0/1:4:46,7:0.14:-0.13:1.000:0.974 0/0/0/1:4:55,13:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,14:0.30:-0.26:1.000:0.988 0/0/0/1:4:36,14:0.30:-0.33:1.000:0.984 0/1/1/1:4:19,37:0.65: 0.06:1.000:0.776 0/0/0/1:4:26,5:0.17:-1.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:57,17:0.25: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,17:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,41:0.74:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,23:0.56:-0.84:1.000:0.962 0/0/0/0:4:78,0:0.00: 1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,21:0.47:-0.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:47,9:0.17: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,36:0.73:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:35,20:0.39:-0.01:1.000:0.709 0/1/1/1:4:8,33:0.76:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,11:0.20: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,8:0.12: 0.90:1.000:0.850 0/0/0/1:4:36,5:0.13:-0.91:1.000:0.921 0/0/0/1:4:47,20:0.32: 0.77:1.000:0.950 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,26:0.50: 0.06:0.960:0.997 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,10:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,18:0.31: 0.51:1.000:0.977 0/0/0/1:4:52,14:0.23: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,21:0.31: 1.15:0.993:0.974 0/1/1/1:4:19,34:0.63:-0.13:1.000:0.612 0/1/1/1:4:13,29:0.67:-0.84:1.000:0.924 0/0/0/1:4:56,17:0.25: 1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,36:0.54: 0.90:0.999:0.985 0/0/0/1:4:58,16:0.23: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,19:0.54:-1.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:57,18:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,34:0.73:-0.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,34:0.70:-0.52:1.000:0.981 0/0/1/1:4:35,29:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:44,13:0.25: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,22:0.38: 0.45:1.000:0.597 0/0/0/1:4:43,13:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,19:0.31: 0.70:1.000:0.973 0/0/1/1:4:29,19:0.43:-0.46:1.000:0.936 0/0/1/1:4:28,16:0.39:-0.71:1.000:0.709 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.46:-0.26:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,27:0.69:-1.10:1.000:0.967 0/0/1/1:4:33,21:0.42:-0.07:1.000:0.909 0/0/0/1:4:34,7:0.18:-0.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,22:0.43:-0.01:1.000:0.949 0/1/1/1:4:11,25:0.67:-1.23:1.000:0.935 0/0/1/1:4:24,15:0.41:-1.04:0.989:0.888 0/1/1/1:4:16,31:0.65:-0.52:1.000:0.768 0/0/0/1:4:29,12:0.32:-0.91:1.000:0.964 0/0/0/1:4:59,14:0.21: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,31:0.55: 0.25:1.000:0.983 0/0/0/1:4:54,11:0.18: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,15:0.38:-0.78:1.000:0.512 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,28:0.46: 0.70:1.000:0.986 0/1/1/1:4:15,40:0.70:-0.01:1.000:0.984 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,9:0.18:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,31:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,21:0.38: 0.25:1.000:0.612 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,16:0.25: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,21:0.41:-0.01:1.000:0.871 0/0/1/1:4:36,35:0.52: 1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,13:0.19: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,15:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,15:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,40:0.57: 1.09:1.000:0.949 0/0/0/1:4:43,9:0.19:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,12:0.22: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,19:0.44:-0.59:1.000:0.974 0/0/0/1:4:41,5:0.12:-0.59:1.000:0.693 0/0/0/1:4:45,9:0.18:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,17:0.42:-0.71:1.000:0.897 0/1/1/1:4:9,21:0.68:-1.62:1.000:0.948 0/0/0/1:4:43,15:0.28: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,29:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,4:0.17:-1.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,35:0.75:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,16:0.38:-0.65:1.000:0.607 0/0/1/1:4:16,27:0.62:-0.78:1.000:0.523 0/1/1/1:4:9,33:0.74:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,18:0.42:-0.59:1.000:0.920 0/0/0/1:4:32,12:0.29:-0.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:21,10:0.35:-1.55:1.000:0.815 0/0/0/1:4:39,16:0.31:-0.01:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,20:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,19:0.44:-0.52:1.000:0.959 0/0/1/1:4:28,23:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,25:0.43: 0.45:1.000:0.957 0/0/0/1:4:43,14:0.26: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:56,15:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,18:0.45:-0.78:1.000:0.981 0/1/1/1:4:13,31:0.68:-0.71:0.956:0.957 0/0/1/1:4:26,29:0.55:-0.01:1.000:0.982 0/1/1/1:4:17,42:0.69: 0.25:1.000:0.968 0/0/1/1:4:22,21:0.52:-0.78:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,23:0.49:-0.26:1.000:0.996 -chr8.1 22623697 chr8.1_022623697 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:546,155:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:387,118:0.24:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:314,299:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:479,186:0.29: 0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:394,332:0.47: 0.94:1.000:0.992 0/0/0/1:4:530,165:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:522,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:505,161:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:341,296:0.48: 0.24:1.000:0.994 0/1/1/1:4:2,299:0.75:-2.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,94:0.40:-2.86:1.000:0.775 0/0/1/1:4:471,309:0.41: 1.36:1.000:0.849 0/0/1/1:4:286,288:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,465:0.61: 0.34:1.000:0.660 0/0/1/1:4:317,294:0.49: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:303,319:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:365,347:0.50: 0.83:0.999:0.997 0/0/1/1:4:289,269:0.50:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:626,199:0.25: 1.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:625,177:0.23: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,155:0.53:-2.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:475,142:0.24: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:587,167:0.23: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:674,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,87:0.55:-3.59:1.000:0.983 0/0/1/1:4:392,364:0.49: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:328,318:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:260,271:0.51:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:382,401:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:535,148:0.22: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:559,207:0.28: 1.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:132,388:0.63:-0.68:1.000:0.536 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:121,168:0.55:-2.50:1.000:0.983 0/0/0:3:109,0:0.00:-3.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:309,297:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:664,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:474,154:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:152,474:0.63: 0.15:1.000:0.607 0/0/1/1:4:186,511:0.62: 0.71:1.000:0.549 0/0/0/1:4:513,149:0.23: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:336,298:0.48: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:558,158:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:447,133:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:372,370:0.51: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:357,315:0.48: 0.51:1.000:0.995 0/0/1/1/1:5:358,485:0.54: 1.86:1.000:0.851 0/0/0/1:4:485,154:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:456,125:0.22:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:518,167:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:229,243:0.51:-1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:533,174:0.26: 0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:385,151:0.29:-0.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:368,328:0.48: 0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:270,250:0.49:-0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:529,173:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:296,264:0.48:-0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:535,183:0.26: 0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:279,286:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:326,234:0.43:-0.37:1.000:0.600 0/0/1/1:4:349,321:0.49: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:410,140:0.26:-0.45:1.000:0.998 0/0/1/1:4:354,356:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:307,299:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:523,176:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:466,139:0.24:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:319,282:0.48:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:325,324:0.51: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:531,190:0.27: 0.90:0.887:0.997 0/0/0/0:4:512,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:400,377:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:316,281:0.48:-0.08:0.999:0.995 0/0/0/0:4:788,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:493,134:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:455,155:0.26: 0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:435,136:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:322,265:0.46:-0.16:1.000:0.990 0/0/0/1:4:452,156:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:275,297:0.52:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:365,310:0.47: 0.54:1.000:0.993 0/0/0/1:4:402,115:0.23:-0.71:0.968:1.000 0/0/0/1:4:557,149:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:529,197:0.28: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:367,122:0.26:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:343,330:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:509,172:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:262,230:0.48:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:276,281:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:287,303:0.51:-0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:273,260:0.50:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/0:4:532,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:461,128:0.23:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:320,275:0.47:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:366,94:0.21:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:510,153:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:522,194:0.28: 0.86:1.000:0.995 0/0/1/1:4:297,247:0.47:-0.49:1.000:0.991 0/0/0/1:4:410,132:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:534,189:0.27: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:478,155:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:302,286:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:369,311:0.47: 0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:225,197:0.48:-1.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:493,135:0.22: 0.17:0.960:1.000 0/0/1/1:4:144,379:0.62:-0.66:1.000:0.604 0/0/1/1:4:277,229:0.47:-0.79:1.000:0.990 0/0/1/1:4:267,260:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:162,487:0.63: 0.33:1.000:0.564 0/0/1/1:4:436,350:0.46: 1.41:0.993:0.986 0/0/0/1:4:420,150:0.27:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:492,157:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:228,617:0.62: 1.87:1.000:0.569 0/0/0/1:4:485,159:0.26: 0.29:0.999:0.999 0/0/0/1:4:539,185:0.26: 0.92:1.000:0.998 0/0/0/1:4:375,114:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:537,179:0.26: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:460,112:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:475,129:0.22:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:572,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:304,257:0.47:-0.36:1.000:0.992 0/0/1/1:4:297,290:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:427,148:0.27:-0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:359,325:0.49: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:499,178:0.27: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/0:4:618,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:367,300:0.46: 0.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:313,291:0.49:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:430,114:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:434,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:343,128:0.28:-1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:425,127:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:454,143:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:391,0:0.00:-1.70:0.989:1.000 0/0/0/0:4:601,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:264,280:0.51:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:583,190:0.25: 1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:299,337:0.52: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:289,261:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:442,130:0.24:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:276,262:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:496,139:0.23: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:451,147:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:300,300:0.51:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:121,332:0.62:-1.21:1.000:0.551 0/0/0/1:4:629,213:0.26: 1.85:1.000:0.999 0/0/0/0:4:838,1:0.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:503,150:0.24: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:289,254:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/0:4:732,0:0.00: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:422,126:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:369,387:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,423:0.62:-0.27:1.000:0.516 0/0/1/1:4:97,109:0.52:-3.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:238,211:0.48:-1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:382,401:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:160,490:0.63: 0.34:1.000:0.586 0/0/1/1:4:386,353:0.49: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/0:4:751,1:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:413,134:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:332,314:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/0/1:4:404,129:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:380,108:0.23:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:304,284:0.50:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:482,139:0.23: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:389,334:0.47: 0.91:1.000:0.994 0/0/0/0:4:597,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:394,132:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:467,141:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:559,1:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:482,168:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:237,215:0.49:-1.22:1.000:0.996 0/0/0/0:4:461,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:498,141:0.23: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:278,247:0.48:-0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:269,281:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:246,231:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:414,346:0.47: 1.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:363,326:0.49: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:151,466:0.63: 0.08:1.000:0.595 0/0/1/1:4:302,252:0.47:-0.42:1.000:0.991 0/0/0/1:4:521,158:0.24: 0.57:0.956:1.000 0/0/0/1:4:650,183:0.23: 1.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:624,187:0.24: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:382,147:0.29:-0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:473,142:0.24: 0.06:1.000:1.000 -chr8.1 22743488 chr8.1_022743488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:107,40:0.28: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,31:0.29: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,57:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,83:0.56: 1.03:1.000:0.973 0/0/1/1:4:61,81:0.55: 1.00:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,65:0.45: 0.90:1.000:0.983 0/0/0/1:4:64,9:0.13:-0.72:1.000:0.929 0/0/0/1:4:14,7:0.34:-2.02:1.000:0.894 0/0/0/0:4:143,1:0.01: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,62:0.57: 0.05:1.000:0.941 0/0/0/1:4:113,36:0.26: 1.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,48:0.34: 0.95:1.000:0.842 0/0/1/1:4:46,32:0.40:-0.60:1.000:0.803 0/0/0/1:4:88,27:0.25: 0.33:0.999:0.999 0/0/0/1:4:103,33:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,73:0.42: 1.70:1.000:0.904 0/0/1/1:4:40,71:0.62: 0.23:1.000:0.609 0/0/0/1:4:11,4:0.28:-2.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,24:0.30:-0.52:1.000:0.981 0/0/1/1:4:49,64:0.54: 0.28:1.000:0.987 0/0/1/1:4:28,34:0.52:-1.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:8,6:0.42:-2.19:1.000:0.901 0/0/0/1:4:91,15:0.15: 0.10:1.000:0.990 0/0/0/1:4:108,36:0.26: 1.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:98,34:0.27: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:147,30:0.18: 1.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,53:0.38: 0.90:1.000:0.557 0/0/1/1:4:41,38:0.46:-0.57:1.000:0.989 0/0/0/1:4:126,23:0.17: 1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,12:0.64:-2.09:1.000:0.740 0/0/1/1:4:16,16:0.48:-1.74:1.000:0.994 0/1/1:3:3,10:0.75:-2.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,29:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,60:0.53: 0.15:1.000:0.992 0/0/0/1:4:110,35:0.26: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,28:0.21: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,23:0.16: 1.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,29:0.41:-0.82:1.000:0.864 0/0/0/1:4:96,30:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,25:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,28:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,49:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,69:0.40: 1.72:1.000:0.751 0/0/0/1/1:5:105,73:0.40: 1.90:1.000:0.971 0/0/1/1:4:99,102:0.48: 2.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,33:0.48:-0.90:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,40:0.64:-1.05:1.000:0.740 0/0/0/1:4:88,19:0.19: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,69:0.39: 1.80:1.000:0.688 0/0/1/1:4:37,33:0.45:-0.80:1.000:0.983 0/0/0/1:4:193,28:0.14: 2.97:1.000:0.951 0/0/1/1:4:43,51:0.52:-0.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,43:0.48:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,54:0.53:-0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:74,17:0.20:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,20:0.15: 1.08:1.000:0.985 0/0/0/0/1/1:6:71,30:0.30:-0.02:1.000:0.887 0/0/0/1:4:108,36:0.26: 1.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:50,68:0.55: 0.40:1.000:0.978 0/0/0/1:4:103,25:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.44:-1.12:1.000:0.968 0/0/1/1:4:68,71:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,63:0.63:-0.12:1.000:0.523 0/0/1/1:4:41,37:0.46:-0.60:1.000:0.985 0/0/1/1:4:42,55:0.54:-0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:37,38:0.48:-0.67:0.887:0.996 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,25:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,6:0.18:-1.67:0.999:0.999 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,61:0.50: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,34:0.42:-0.60:1.000:0.926 0/0/0/1:4:113,30:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,53:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,69:0.56: 0.40:1.000:0.966 0/0/0/1:4:91,29:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.35:0.968:1.000 0/0/1/1:4:56,52:0.46: 0.15:1.000:0.989 0/0/1/1:4:52,52:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,55:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,20:0.18: 0.48:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,13:0.18:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,41:0.50:-0.60:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,21:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,54:0.37: 1.08:1.000:0.575 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,37:0.41:-0.35:1.000:0.865 0/0/0/1:4:126,38:0.25: 1.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,45:0.53:-0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,62:0.58: 0.00:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,51:0.56:-0.35:1.000:0.974 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,30:0.27: 0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:40,62:0.58: 0.00:1.000:0.895 0/0/0/1:4:34,8:0.20:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,64:0.63:-0.10:1.000:0.572 0/0/0/1:4:98,24:0.21: 0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-1.02:0.960:1.000 0/0/0/1:4:99,31:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,55:0.54:-0.12:1.000:0.986 0/0/1/1:4:32,55:0.61:-0.37:1.000:0.700 0/0/0/1:4:114,36:0.26: 1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,73:0.57: 0.50:0.993:0.934 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,42:0.27: 1.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:45,60:0.55: 0.08:0.999:0.983 0/0/1/1:4:52,64:0.53: 0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:33,46:0.56:-0.57:1.000:0.970 0/0/1/1:4:111,68:0.38: 1.92:1.000:0.510 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,49:0.53:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,39:0.48:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:103,48:0.32: 1.22:1.000:0.947 0/0/1/1:4:40,54:0.55:-0.20:1.000:0.980 0/0/0/1:4:85,28:0.26: 0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,45:0.42: 0.03:1.000:0.929 0/0/1/1:4:33,45:0.55:-0.60:1.000:0.977 0/0/1/1:4:71,57:0.43: 0.65:1.000:0.950 0/0/1/1:4:43,56:0.54:-0.07:1.000:0.987 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,45:0.61:-0.77:1.000:0.682 0/0/1/1:4:38,30:0.43:-0.85:1.000:0.941 0/0/1/1:4:34,47:0.56:-0.52:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,24:0.45:-1.27:0.989:0.982 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,25:0.18: 1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:98,28:0.24: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,50:0.51:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,31:0.27: 0.53:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,55:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,57:0.38: 1.15:1.000:0.569 0/0/1/1:4:43,59:0.55: 0.00:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,54:0.44: 0.43:1.000:0.965 0/0/0/1:4:72,26:0.28:-0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,78:0.57: 0.75:1.000:0.954 0/0/1/1:4:64,65:0.48: 0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:141,36:0.22: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,69:0.42: 1.40:1.000:0.929 0/0/1/1:4:50,59:0.52: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,49:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,32:0.18: 2.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,39:0.27: 1.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:15,9:0.37:-1.94:1.000:0.546 0/0/1/1:4:28,36:0.54:-0.95:1.000:0.989 0/0/0/1:4:94,27:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,19:0.18: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,66:0.36: 2.02:1.000:0.699 0/0/1/1:4:43,57:0.55:-0.05:1.000:0.984 0/0/0/1:4:62,24:0.29:-0.40:1.000:0.992 0/0/0/1:4:89,27:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,57:0.51: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,28:0.41:-0.87:1.000:0.851 0/0/1/1:4:43,53:0.53:-0.15:1.000:0.993 0/0/0/1:4:101,24:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,29:0.22: 0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,22:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,31:0.27: 0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,38:0.48:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,61:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,25:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,19:0.29:-0.85:1.000:0.992 0/0/1/1:4:31,45:0.57:-0.65:1.000:0.951 0/0/0/1:4:94,41:0.31: 0.83:1.000:0.973 0/1/1/1:4:38,70:0.63: 0.15:1.000:0.505 0/0/0/1:4:80,29:0.28: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,54:0.53:-0.12:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-1.10:0.956:1.000 0/0/1/1:4:59,57:0.47: 0.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:46,46:0.48:-0.25:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,1:0.01:-0.07:1.000:1.000 -chr8.1 22893361 chr8.1_022893361 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.43:-1.24:1.000:0.958 0/0/0/1:4:15,11:0.37: 0.45:1.000:0.520 0/0/0/1:4:10,6:0.33:-0.60:1.000:0.899 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,18:0.60: 0.24:1.000:0.784 0/0/1/1:4:6,12:0.55:-0.39:1.000:0.979 0/0/1/1:4:6,19:0.61: 0.34:1.000:0.727 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,9:0.35: 0.13:1.000:0.811 0/0/0/1:4:18,7:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,5:0.17: 0.56:1.000:0.998 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.13:0.999:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,11:0.31: 1.08:1.000:0.974 0/0/1/1:4:15,13:0.41: 0.66:1.000:0.840 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.29: 0.03:1.000:0.992 0/0/0/1:4:24,11:0.29: 1.40:1.000:0.994 0/0/0/1:4:24,15:0.34: 1.82:1.000:0.853 0/0/0/1:4:5,1:0.15:-1.66:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,3:0.14:-0.18:1.000:0.965 0/0/0/1:4:26,12:0.29: 1.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:26,6:0.17: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,6:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,5:0.18: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,10:0.37: 0.24:1.000:0.588 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.53:-1.45:1.000:0.993 0/0/0/0:4:10,1:0.08:-1.13:1.000:0.976 0/1/1:3:0,4:0.75:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,7:0.18: 1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,10:0.35: 0.34:1.000:0.746 0/0/0/1:4:16,11:0.36: 0.56:1.000:0.680 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,12:0.34: 0.98:1.000:0.838 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.15: 0.87:1.000:0.992 0/0/0/1:4:16,7:0.28: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:9,3:0.23:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,5:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:31,7:0.17: 1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,13:0.17: 5.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:14,4:0.21:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,8:0.55:-1.03:1.000:0.979 0/0/0/1:4:13,3:0.17:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:30,10:0.23: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,6:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,7:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,6:0.30:-0.39:1.000:0.984 0/0/0/1:4:20,7:0.24: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.41:-0.29:1.000:0.886 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,8:0.30: 0.24:1.000:0.984 0/0/0/0/0/1:6:14,4:0.21:-0.39:1.000:0.896 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,3:0.09: 0.87:1.000:0.918 0/0/0/1:4:29,7:0.18: 1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:10,3:0.21:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,7:0.18: 1.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,11:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:11,3:0.20:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,9:0.54:-0.82:1.000:0.989 0/0/0/1:4:9,6:0.35:-0.71:0.887:0.746 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,9:0.21: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.46:-0.50:0.999:0.987 0/0/0/1:4:19,13:0.36: 1.08:1.000:0.691 0/0/0/1:4:17,4:0.18:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:8,5:0.34:-0.92:1.000:0.853 0/0/0/1:4:25,14:0.32: 1.82:1.000:0.949 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.39:-1.34:1.000:0.696 0/0/0/1:4:13,3:0.17:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,7:0.38:-0.60:1.000:0.631 0/0/0/1:4:13,6:0.29:-0.29:0.968:0.993 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,4:0.15: 0.24:1.000:0.992 0/0/0/1:4:37,7:0.15: 2.35:1.000:0.985 0/1/1/1:4:4,17:0.64:-0.08:1.000:0.644 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.40: 0.24:1.000:0.804 0/0/0/1:4:15,5:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,1:0.06:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.52: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:8,3:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,9:0.75:-1.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,11:0.25: 1.93:1.000:0.999 0/0/0/0:4:18,2:0.09:-0.18:1.000:0.918 0/0/0/1:4:12,7:0.33:-0.29:1.000:0.923 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,5:0.17: 0.66:0.960:0.997 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,1:0.04: 0.13:0.993:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.47: 0.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:14,7:0.30:-0.08:1.000:0.984 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,6:0.35:-0.71:0.999:0.746 0/0/0/1:4:25,8:0.23: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,4:0.39:-1.34:1.000:0.696 0/0/0/1:4:19,5:0.19: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.40:-0.92:1.000:0.824 0/0/1/1:4:5,6:0.47:-1.13:1.000:0.993 0/0/0/1:4:17,3:0.14:-0.18:1.000:0.965 0/0/0/1:4:14,4:0.21:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,4:0.17: 0.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:31,7:0.17: 1.71:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,8:0.52:-0.92:1.000:0.995 0/0/0/1:4:24,6:0.19: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,12:0.47: 0.03:1.000:0.993 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.48:-0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,6:0.27:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.46:-0.29:1.000:0.985 0/0/1/1:4:12,13:0.45: 0.34:1.000:0.981 0/0/0/1:4:9,4:0.28:-0.92:0.989:0.995 0/1/1/1:4:2,8:0.63:-1.24:1.000:0.571 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,1:0.12:-1.45:1.000:0.667 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,9:0.31: 0.45:1.000:0.971 0/0/0/1:4:10,6:0.33:-0.60:1.000:0.899 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,8:0.37:-0.29:1.000:0.541 0/0/0/1:4:21,5:0.18: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 2.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-1.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:20,6:0.21: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.31:-0.18:1.000:0.965 0/0/0/1:4:19,7:0.25: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,5:0.16: 0.77:1.000:0.995 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,6:0.19: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,9:0.36: 0.03:1.000:0.664 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,7:0.20: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,20:0.43: 1.93:1.000:0.958 0/0/0/1:4:27,8:0.21: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,8:0.28: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,8:0.59:-1.13:1.000:0.880 0/0/0/1:4:15,3:0.15:-0.39:1.000:0.992 0/0/0/0:4:22,2:0.08: 0.24:1.000:0.993 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.43:-0.39:1.000:0.958 0/0/0/1:4:12,5:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/1/1/1:4:0,14:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,6:0.38:-0.82:1.000:0.539 0/0/0/1:4:21,12:0.33: 1.19:1.000:0.937 0/0/0/1:4:13,4:0.22:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,10:0.34: 0.45:1.000:0.853 0/0/0/1:4:12,7:0.33:-0.29:1.000:0.923 0/0/0/1:4:11,5:0.28:-0.60:1.000:0.994 0/0/0/1:4:14,7:0.30:-0.08:1.000:0.984 0/0/1/1:4:6,10:0.53:-0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:18,17:0.42: 1.40:1.000:0.927 0/0/0/0:4:27,3:0.09: 0.87:1.000:0.918 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.30:-1.03:1.000:0.984 0/0/1/1:4:8,12:0.51:-0.18:0.956:0.996 0/0/0/1:4:26,11:0.27: 1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,10:0.58:-0.82:1.000:0.916 0/0/0/1:4:9,6:0.35:-0.71:1.000:0.746 0/0/1/1:4:8,7:0.41:-0.71:1.000:0.853 -chr8.1 23097291 chr8.1_023097291 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:268,78:.:-0.55:1.000:. ./.:4:200,94:.:-0.92:1.000:. ./.:4:295,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:325,122:.: 0.19:1.000:. ./.:4:317,180:.: 0.55:1.000:. ./.:4:653,133:.: 2.64:1.000:. ./.:4:315,45:.:-0.44:1.000:. ./.:4:350,50:.:-0.16:1.000:. ./.:4:265,211:.: 0.40:1.000:. ./.:4:61,39:.:-2.33:1.000:. ./.:4:84,53:.:-2.06:1.000:. ./.:4:250,179:.: 0.05:1.000:. ./.:4:371,155:.: 0.76:1.000:. ./.:4:240,197:.: 0.11:1.000:. ./.:4:224,194:.:-0.02:1.000:. ./.:4:446,59:.: 0.60:1.000:. ./.:4:512,135:.: 1.63:0.999:. ./.:4:444,162:.: 1.34:1.000:. ./.:4:412,215:.: 1.49:1.000:. ./.:4:363,171:.: 0.81:1.000:. ./.:4:107,31:.:-2.05:1.000:. ./.:4:554,47:.: 1.30:1.000:. ./.:4:417,112:.: 0.78:1.000:. ./.:4:402,99:.: 0.58:1.000:. ./.:4:80,39:.:-2.19:1.000:. ./.:4:795,142:.: 3.73:1.000:. ./.:4:332,146:.: 0.41:1.000:. ./.:4:316,113:.: 0.05:1.000:. ./.:4:558,120:.: 1.86:1.000:. ./.:4:388,195:.: 1.17:1.000:. ./.:4:408,140:.: 0.92:1.000:. ./.:4:419,165:.: 1.18:1.000:. ./.:4:79,10:.:-2.41:1.000:. ./.:4:36,56:.:-2.39:1.000:. ./.:3:38,13:.:-2.68:1.000:. ./.:4:327,115:.: 0.15:1.000:. ./.:4:439,101:.: 0.86:1.000:. ./.:4:311,60:.:-0.37:1.000:. ./.:4:432,217:.: 1.65:1.000:. ./.:4:521,225:.: 2.35:1.000:. ./.:4:272,51:.:-0.71:1.000:. ./.:4:295,99:.:-0.20:1.000:. ./.:4:422,68:.: 0.50:1.000:. ./.:4:362,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:241,125:.:-0.40:1.000:. ./.:4:291,148:.: 0.13:1.000:. ./.:5:225,153:.:-0.31:1.000:. ./.:4:303,271:.: 1.10:1.000:. ./.:4:225,84:.:-0.81:1.000:. ./.:4:283,105:.:-0.24:1.000:. ./.:4:134,70:.:-1.57:1.000:. ./.:4:198,207:.:-0.12:1.000:. ./.:4:274,52:.:-0.69:1.000:. ./.:4:429,113:.: 0.87:1.000:. ./.:4:391,96:.: 0.47:1.000:. ./.:4:419,113:.: 0.80:1.000:. ./.:4:239,85:.:-0.71:1.000:. ./.:4:515,129:.: 1.61:1.000:. ./.:4:455,94:.: 0.92:1.000:. ./.:6:160,49:.:-1.54:1.000:. ./.:4:171,84:.:-1.21:1.000:. ./.:4:278,131:.:-0.09:1.000:. ./.:4:417,122:.: 0.85:1.000:. ./.:4:368,109:.: 0.40:1.000:. ./.:4:318,174:.: 0.51:1.000:. ./.:4:452,93:.: 0.89:1.000:. ./.:4:254,113:.:-0.39:1.000:. ./.:4:364,123:.: 0.47:1.000:. ./.:4:322,93:.:-0.05:0.887:. ./.:4:172,84:.:-1.20:1.000:. ./.:4:431,132:.: 1.02:1.000:. ./.:4:267,39:.:-0.84:0.999:. ./.:4:319,133:.: 0.22:1.000:. ./.:4:311,104:.:-0.05:1.000:. ./.:4:255,102:.:-0.47:1.000:. ./.:4:425,109:.: 0.81:1.000:. ./.:4:205,141:.:-0.55:1.000:. ./.:4:350,86:.: 0.11:1.000:. ./.:4:373,92:.: 0.32:1.000:. ./.:4:364,58:.: 0.00:1.000:. ./.:4:92,100:.:-1.66:0.968:. ./.:4:282,141:.: 0.01:1.000:. ./.:4:264,198:.: 0.29:1.000:. ./.:4:301,152:.: 0.23:1.000:. ./.:4:525,116:.: 1.59:1.000:. ./.:4:176,49:.:-1.42:1.000:. ./.:4:236,81:.:-0.76:1.000:. ./.:4:110,98:.:-1.55:1.000:. ./.:4:270,79:.:-0.52:1.000:. ./.:4:131,176:.:-0.83:1.000:. ./.:4:362,45:.:-0.10:1.000:. ./.:4:399,36:.: 0.10:1.000:. ./.:4:281,166:.: 0.19:1.000:. ./.:4:320,97:.:-0.03:1.000:. ./.:4:338,157:.: 0.53:1.000:. ./.:4:543,52:.: 1.26:1.000:. ./.:4:198,71:.:-1.10:1.000:. ./.:4:294,32:.:-0.69:1.000:. ./.:4:255,88:.:-0.57:1.000:. ./.:4:380,163:.: 0.88:1.000:. ./.:4:237,65:.:-0.86:1.000:. ./.:4:288,157:.: 0.17:1.000:. ./.:4:125,91:.:-1.49:1.000:. ./.:4:267,89:.:-0.47:0.960:. ./.:4:227,138:.:-0.41:1.000:. ./.:4:281,151:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,142:.:-0.79:1.000:. ./.:4:262,116:.:-0.31:1.000:. ./.:4:221,170:.:-0.22:0.993:. ./.:4:378,44:.: 0.00:1.000:. ./.:4:434,35:.: 0.34:1.000:. ./.:4:492,132:.: 1.47:1.000:. ./.:4:310,96:.:-0.11:0.999:. ./.:4:315,155:.: 0.35:1.000:. ./.:4:215,81:.:-0.91:1.000:. ./.:4:228,162:.:-0.23:1.000:. ./.:4:462,48:.: 0.64:1.000:. ./.:4:253,45:.:-0.89:1.000:. ./.:4:260,104:.:-0.42:1.000:. ./.:4:210,136:.:-0.55:1.000:. ./.:4:125,131:.:-1.20:1.000:. ./.:4:292,110:.:-0.14:1.000:. ./.:4:470,50:.: 0.71:1.000:. ./.:4:484,56:.: 0.86:1.000:. ./.:4:297,95:.:-0.21:1.000:. ./.:4:265,170:.: 0.10:1.000:. ./.:4:226,78:.:-0.85:1.000:. ./.:4:386,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:206,77:.:-1.00:1.000:. ./.:4:172,108:.:-1.02:1.000:. ./.:4:253,83:.:-0.62:1.000:. ./.:4:436,51:.: 0.47:1.000:. ./.:4:278,62:.:-0.59:0.989:. ./.:4:320,60:.:-0.30:1.000:. ./.:4:370,89:.: 0.27:1.000:. ./.:4:237,125:.:-0.43:1.000:. ./.:4:425,85:.: 0.64:1.000:. ./.:4:392,68:.: 0.28:1.000:. ./.:4:202,75:.:-1.05:1.000:. ./.:4:264,167:.: 0.07:1.000:. ./.:4:240,83:.:-0.71:1.000:. ./.:4:242,37:.:-1.03:1.000:. ./.:4:178,194:.:-0.36:1.000:. ./.:4:146,66:.:-1.52:1.000:. ./.:4:449,134:.: 1.17:1.000:. ./.:4:348,109:.: 0.26:1.000:. ./.:4:230,141:.:-0.37:1.000:. ./.:4:390,145:.: 0.82:1.000:. ./.:4:352,117:.: 0.34:1.000:. ./.:4:309,99:.:-0.10:1.000:. ./.:4:528,141:.: 1.79:1.000:. ./.:4:268,107:.:-0.34:1.000:. ./.:4:17,27:.:-2.73:1.000:. ./.:4:241,117:.:-0.46:1.000:. ./.:4:671,69:.: 2.31:1.000:. ./.:4:354,112:.: 0.32:1.000:. ./.:4:351,166:.: 0.69:1.000:. ./.:4:380,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:307,81:.:-0.24:1.000:. ./.:4:388,134:.: 0.73:1.000:. ./.:4:568,106:.: 1.83:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:319,144:.: 0.30:1.000:. ./.:4:351,50:.:-0.15:1.000:. ./.:4:275,110:.:-0.26:1.000:. ./.:4:468,61:.: 0.78:1.000:. ./.:4:259,86:.:-0.55:1.000:. ./.:4:327,58:.:-0.26:1.000:. ./.:4:253,44:.:-0.90:1.000:. ./.:4:376,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:228,105:.:-0.64:1.000:. ./.:4:253,96:.:-0.52:1.000:. ./.:4:257,102:.:-0.45:1.000:. ./.:4:339,47:.:-0.26:1.000:. ./.:4:366,54:.:-0.01:1.000:. ./.:4:288,78:.:-0.40:1.000:. ./.:4:674,87:.: 2.46:1.000:. ./.:4:175,181:.:-0.47:1.000:. ./.:4:289,88:.:-0.32:1.000:. ./.:4:397,74:.: 0.36:1.000:. ./.:4:443,64:.: 0.62:0.956:. ./.:4:506,144:.: 1.65:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:247,95:.:-0.58:1.000:. ./.:4:322,104:.: 0.03:1.000:. -chr8.1 23238434 chr8.1_023238434 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:62,0:.: 2.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:48,1:.: 1.83:0.999:. ./.:4:37,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:17,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,0:.:-0.38:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,3:.: 1.90:1.000:. ./.:4:23,3:.: 0.25:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:25,1:.: 0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.: 0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.20:1.000:. ./.:5:36,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,2:.:-1.41:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.41:1.000:. ./.:4:87,2:.: 4.59:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.25:1.000:. ./.:6:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:41,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:26,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:28,2:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.80:0.887:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:37,2:.: 1.14:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:3,2:.:-1.20:1.000:. ./.:4:38,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:0.968:. ./.:4:30,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:41,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:60,2:.: 2.73:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:17,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:22,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.44:0.960:. ./.:4:15,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:22,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:0.993:. ./.:4:2,1:.:-1.34:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:0.999:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:24,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:2,3:.:-1.20:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.44:0.989:. ./.:4:12,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:37,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:21,2:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.48:1.000:. -chr8.1 23299032 chr8.1_023299032 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:50,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.55:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.70:1.000:. ./.:3:8,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.06:1.000:. ./.:5:58,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.48:1.000:. ./.:6:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:61,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.40:0.887:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.55:0.999:. ./.:4:132,0:.: 3.01:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.92:0.968:. ./.:4:83,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.36:0.984:. ./.:4:78,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.48:0.993:. ./.:4:62,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.48:0.999:. ./.:4:93,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.44:0.989:. ./.:4:13,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:71,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:30,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.48:0.956:. ./.:4:120,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.33:1.000:. -chr8.1 23540447 chr8.1_023540447 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.41:-1.51:1.000:0.882 0/0/0/1:4:12,4:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,4:0.36:-0.92:1.000:0.667 0/0/0/0:4:20,1:0.05: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.54:-0.04:1.000:0.988 0/1/1/1:4:2,6:0.67:-1.36:1.000:0.899 0/1/1/1:4:5,19:0.70: 0.99:1.000:0.983 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:16,2:0.12: 0.11:1.000:0.852 0/0/1/1:4:6,6:0.47:-0.77:1.000:0.992 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.47:-0.48:1.000:0.992 0/0/0/0:4:17,1:0.06: 0.11:0.999:1.000 0/0/0/1:4:18,4:0.20: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,6:0.24: 1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,4:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:5,3:0.37:-1.36:1.000:0.553 0/0/1/1:4:7,11:0.56: 0.11:1.000:0.972 0/0/1/1:4:9,9:0.47: 0.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:0,2:0.87:-2.25:1.000:0.868 0/0/0/1:4:15,3:0.19: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,3:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.47:-1.66:1.000:0.992 0/0/0/1:4:13,7:0.35: 0.40:1.000:0.783 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-0.92:1.000:0.747 0/0/1/1:4:8,8:0.47:-0.19:1.000:0.992 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.25:1.000:1.000 1/1/1:3:0,2:0.87:-2.25:1.000:0.928 0/0/1/1:4:13,8:0.38: 0.55:1.000:0.510 0/0/1/1:4:9,15:0.57: 0.99:1.000:0.952 0/0/0/1:4:12,7:0.37: 0.26:1.000:0.620 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,5:0.34:-0.33:1.000:0.882 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.47: 0.99:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,13:0.59: 0.40:1.000:0.880 0/0/0/1:4:17,5:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,5:0.28: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/0/1:5:18,3:0.16: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,3:0.27:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.19:1.000:0.915 0/0/0/1:4:19,8:0.31: 1.44:1.000:0.976 0/0/0/1:4:18,8:0.32: 1.29:1.000:0.959 0/0/1/1:4:12,14:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,4:0.17: 1.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,14:0.50: 1.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,13:0.44: 1.58:1.000:0.969 0/0/1/1:4:9,20:0.62: 1.73:1.000:0.593 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.35:-0.04:1.000:0.761 0/0/0/0/1/1:6:12,5:0.31:-0.04:1.000:0.892 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,8:0.30: 1.58:1.000:0.985 0/0/1/1:4:11,8:0.41: 0.26:1.000:0.846 0/0/0/1:4:7,4:0.36:-0.92:1.000:0.667 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.19:1.000:0.915 0/0/1/1:4:10,9:0.45: 0.26:1.000:0.979 0/0/1/1:4:4,6:0.55:-1.07:1.000:0.982 0/0/0/1:4:6,3:0.34:-1.22:1.000:0.882 0/0/1/1:4:7,7:0.47:-0.48:0.887:0.992 0/0/0/1:4:8,2:0.23:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,10:0.51: 0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,6:0.47:-0.77:0.999:0.992 0/0/1/1:4:15,17:0.49: 2.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,13:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,5:0.29: 0.11:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,17:0.61: 1.14:1.000:0.685 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,11:0.40: 1.44:1.000:0.758 0/0/0/1:4:10,5:0.34:-0.33:1.000:0.882 0/0/1/1:4:4,6:0.55:-1.07:1.000:0.982 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.26:0.968:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.19:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,4:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,6:0.26: 1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,2:0.15:-0.33:1.000:0.988 0/1/1/1:4:6,18:0.67: 0.99:1.000:0.899 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.07:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/0:4:18,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,11:0.62:-0.19:1.000:0.614 0/0/1/1:4:5,5:0.47:-1.07:1.000:0.992 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,1:0.10:-0.92:1.000:0.747 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.67:-0.19:1.000:0.899 0/0/0/1:4:13,7:0.35: 0.40:1.000:0.783 0/1/1/1:4:2,13:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,9:0.33: 1.58:1.000:0.927 0/0/0/1:4:11,2:0.17:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,3:0.31:-1.07:1.000:0.971 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,9:0.38: 0.85:0.984:0.616 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,2:0.12: 0.26:1.000:0.727 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-1.22:1.000:0.852 0/0/0/1:4:27,6:0.20: 2.32:0.993:1.000 0/1/1/1:4:6,22:0.69: 1.58:1.000:0.978 0/1/1/1:4:7,17:0.63: 0.99:1.000:0.599 0/0/0/1:4:13,2:0.15:-0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:10,12:0.51: 0.70:0.999:0.997 0/0/1/1:4:8,7:0.44:-0.33:1.000:0.972 0/0/0/1:4:7,3:0.31:-1.07:1.000:0.971 0/0/0/1:4:27,8:0.26: 2.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:5,7:0.54:-0.77:1.000:0.990 0/1/1/1:4:5,14:0.66: 0.26:1.000:0.834 0/0/1/1:4:5,9:0.58:-0.48:1.000:0.907 0/0/0/1:4:18,3:0.16: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:12,4:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,3:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.34: 0.55:1.000:0.882 0/0/1/1:4:6,7:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,17:0.74: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:38,0:0.00: 3.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.47:-0.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,13:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,8:0.56:-0.63:1.000:0.967 0/0/0/1:4:5,1:0.19:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.44:-0.63:1.000:0.966 0/1/1/1:4:3,8:0.65:-0.92:1.000:0.770 0/0/1/1:4:10,17:0.57: 1.44:0.989:0.943 0/0/1/1:4:8,14:0.58: 0.70:1.000:0.927 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,10:0.34: 1.88:1.000:0.882 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.49: 0.26:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,7:0.35: 0.40:1.000:0.783 0/1/1/1:4:3,13:0.71:-0.19:1.000:0.994 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,12:0.40: 1.73:1.000:0.803 0/0/1/1:4:7,8:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,3:0.16: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.19:1.000:0.915 0/0/1/1:4:11,9:0.43: 0.40:1.000:0.947 0/0/0/1:4:14,5:0.28: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:13,3:0.21:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,6:0.44:-0.63:1.000:0.966 0/0/1/1:4:8,7:0.44:-0.33:1.000:0.972 0/0/0/0:4:16,1:0.07:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,4:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,11:0.65:-0.33:1.000:0.812 0/0/0/1:4:17,7:0.30: 0.99:1.000:0.980 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,12:0.53: 0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:4,20:0.73: 0.99:1.000:0.998 0/0/0/0:4:14,1:0.07:-0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,3:0.29:-0.92:1.000:0.992 0/0/0/1:4:4,2:0.34:-1.66:1.000:0.882 0/1/1/1:4:4,10:0.64:-0.48:1.000:0.658 0/0/1/1:4:7,5:0.40:-0.77:1.000:0.821 0/1/1/1:4:2,8:0.70:-1.07:1.000:0.989 0/1/1/1:4:4,11:0.65:-0.33:1.000:0.812 0/0/1/1:4:2,4:0.60:-1.66:1.000:0.789 0/0/0/1:4:7,3:0.31:-1.07:1.000:0.971 0/0/1/1:4:11,11:0.47: 0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:13,15:0.50: 1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,8:0.53:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:6,7:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,15:0.53: 1.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:7,5:0.40:-0.77:1.000:0.821 0/0/0/1:4:17,4:0.21: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,2:0.10: 0.70:1.000:0.747 0/0/1/1:4:9,7:0.42:-0.19:1.000:0.915 0/0/1/1:4:5,11:0.62:-0.19:0.956:0.614 0/0/1/1:4:8,9:0.49:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,12:0.55: 0.40:1.000:0.982 0/0/0/1:4:8,1:0.12:-1.22:1.000:0.852 0/0/1/1:4:11,8:0.41: 0.26:1.000:0.846 -chr8.1 23574695 chr8.1_023574695 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:33,10:.: 1.54:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:26,11:.: 0.84:1.000:. ./.:4:22,9:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,5:.: 1.43:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.09:1.000:. ./.:4:28,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1,3:.:-3.00:1.000:. ./.:4:21,15:.: 0.73:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:19,6:.:-0.55:1.000:. ./.:4:11,16:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.44:1.000:. ./.:4:12,26:.: 0.96:1.000:. ./.:4:12,15:.:-0.32:0.999:. ./.:4:33,13:.: 1.89:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:7,3:.:-2.30:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:2,4:.:-2.76:1.000:. ./.:4:23,11:.: 0.50:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.32:1.000:. ./.:4:13,26:.: 1.08:1.000:. ./.:4:23,13:.: 0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:13,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:8,5:.:-1.95:1.000:. ./.:4:6,8:.:-1.83:1.000:. ./.:3:3,0:.:-3.11:1.000:. ./.:4:24,11:.: 0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:27,15:.: 1.43:1.000:. ./.:4:17,23:.: 1.19:1.000:. ./.:4:16,15:.: 0.15:1.000:. ./.:4:19,9:.:-0.20:1.000:. ./.:4:13,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:29,5:.: 0.50:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:18,6:.:-0.67:1.000:. ./.:5:23,26:.: 2.24:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.67:1.000:. ./.:4:15,6:.:-1.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:13,6:.:-1.25:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.09:1.000:. ./.:4:21,12:.: 0.38:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.20:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.55:1.000:. ./.:4:23,7:.: 0.03:1.000:. ./.:4:19,9:.:-0.20:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.44:1.000:. ./.:6:11,9:.:-1.13:1.000:. ./.:4:19,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:19,10:.:-0.09:1.000:. ./.:4:8,17:.:-0.55:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:30,7:.: 0.84:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:18,8:.:-0.44:1.000:. ./.:4:27,9:.: 0.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.67:0.887:. ./.:4:26,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:14,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,6:.:-1.72:0.999:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:28,5:.: 0.38:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:13,12:.:-0.55:1.000:. ./.:4:30,8:.: 0.96:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:38,10:.: 2.12:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.55:0.968:. ./.:4:26,10:.: 0.73:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:28,13:.: 1.31:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.60:1.000:. ./.:4:26,11:.: 0.84:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.32:1.000:. ./.:4:24,10:.: 0.50:1.000:. ./.:4:17,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:25,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:24,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:18,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:22,10:.: 0.26:1.000:. ./.:4:28,8:.: 0.73:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.25:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:28,7:.: 0.61:1.000:. ./.:4:25,9:.: 0.50:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.90:1.000:. ./.:4:21,14:.: 0.61:1.000:. ./.:4:24,6:.: 0.03:1.000:. ./.:4:19,12:.: 0.15:0.984:. ./.:4:15,18:.: 0.38:1.000:. ./.:4:25,7:.: 0.26:1.000:. ./.:4:25,10:.: 0.61:1.000:. ./.:4:11,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:34,9:.: 1.54:0.993:. ./.:4:21,15:.: 0.73:1.000:. ./.:4:18,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,25:.: 1.78:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:28,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,15:.: 0.73:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.32:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:17,3:.:-1.13:1.000:. ./.:4:34,8:.: 1.43:1.000:. ./.:4:24,11:.: 0.61:1.000:. ./.:4:12,11:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,10:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:15,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:21,9:.: 0.03:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:12,6:.:-1.37:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:25,12:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.44:0.989:. ./.:4:11,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:11,10:.:-1.02:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.55:1.000:. ./.:4:14,8:.:-0.90:1.000:. ./.:4:17,14:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:22,12:.: 0.50:1.000:. ./.:4:23,9:.: 0.26:1.000:. ./.:4:27,10:.: 0.84:1.000:. ./.:4:15,8:.:-0.78:1.000:. ./.:4:8,7:.:-1.72:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:24,7:.: 0.15:1.000:. ./.:4:26,9:.: 0.61:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:28,15:.: 1.54:1.000:. ./.:4:19,29:.: 2.12:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.30:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.44:1.000:. ./.:4:20,5:.:-0.55:1.000:. ./.:4:17,23:.: 1.19:1.000:. ./.:4:15,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:17,5:.:-0.90:1.000:. ./.:4:24,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:29,8:.: 0.84:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:21,9:.: 0.03:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,18:.: 0.73:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:17,10:.:-0.32:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.02:1.000:. ./.:4:21,13:.: 0.50:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,8:.: 0.50:1.000:. ./.:4:24,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:30,11:.: 1.31:1.000:. ./.:4:29,14:.: 1.54:1.000:. ./.:4:16,21:.: 0.84:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.32:1.000:. ./.:4:23,15:.: 0.96:0.956:. ./.:4:34,5:.: 1.08:1.000:. ./.:4:33,15:.: 2.12:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.78:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.43:1.000:. -chr8.1 23753542 chr8.1_023753542 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:143,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:72,48:.:-0.44:1.000:. ./.:4:126,54:.: 0.96:1.000:. ./.:4:81,61:.: 0.08:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:88,116:.: 1.52:1.000:. ./.:4:31,66:.:-0.97:1.000:. ./.:4:39,124:.: 0.57:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:29,0:.:-2.56:1.000:. ./.:4:19,8:.:-2.60:1.000:. ./.:4:140,41:.: 0.98:1.000:. ./.:4:139,39:.: 0.92:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,52:.: 0.05:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:152,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:152,61:.: 1.73:1.000:. ./.:4:117,73:.: 1.19:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.77:1.000:. ./.:4:97,54:.: 0.29:1.000:. ./.:4:93,134:.: 2.06:1.000:. ./.:4:81,87:.: 0.68:1.000:. ./.:4:16,2:.:-2.81:1.000:. ./.:4:119,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:123,56:.: 0.94:1.000:. ./.:4:95,51:.: 0.17:1.000:. ./.:4:144,76:.: 1.89:1.000:. ./.:4:115,57:.: 0.78:1.000:. ./.:4:75,82:.: 0.43:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:2,3:.:-3.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.70:1.000:. ./.:3:7,2:.:-3.02:1.000:. ./.:4:112,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:74,92:.: 0.64:1.000:. ./.:4:74,92:.: 0.64:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:61,38:.:-0.93:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:72,47:.:-0.46:1.000:. ./.:4:73,68:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,32:.: 0.54:1.000:. ./.:4:110,36:.: 0.17:1.000:. ./.:5:217,65:.: 3.34:1.000:. ./.:4:23,11:.:-2.44:1.000:. ./.:4:61,37:.:-0.95:1.000:. ./.:4:37,56:.:-1.07:1.000:. ./.:4:108,40:.: 0.22:1.000:. ./.:4:117,56:.: 0.80:1.000:. ./.:4:88,24:.:-0.62:1.000:. ./.:4:118,51:.: 0.71:1.000:. ./.:4:79,34:.:-0.60:1.000:. ./.:4:48,50:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,42:.:-0.09:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:91,39:.:-0.20:1.000:. ./.:6:98,29:.:-0.27:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:139,53:.: 1.24:1.000:. ./.:4:111,37:.: 0.22:1.000:. ./.:4:54,35:.:-1.16:1.000:. ./.:4:132,43:.: 0.85:1.000:. ./.:4:86,73:.: 0.47:1.000:. ./.:4:78,42:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,50:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,41:.:-0.58:0.887:. ./.:4:77,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:108,52:.: 0.50:1.000:. ./.:4:56,64:.:-0.44:0.999:. ./.:4:57,79:.:-0.06:1.000:. ./.:4:110,55:.: 0.61:1.000:. ./.:4:77,42:.:-0.46:1.000:. ./.:4:82,85:.: 0.66:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:80,89:.: 0.71:1.000:. ./.:4:91,55:.: 0.17:1.000:. ./.:4:83,59:.: 0.08:1.000:. ./.:4:105,42:.: 0.19:0.968:. ./.:4:116,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:110,54:.: 0.59:1.000:. ./.:4:75,48:.:-0.37:1.000:. ./.:4:61,120:.: 0.98:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:47,95:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,43:.:-0.48:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:64,43:.:-0.74:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:41,85:.:-0.30:1.000:. ./.:4:74,39:.:-0.60:1.000:. ./.:4:32,68:.:-0.90:1.000:. ./.:4:124,51:.: 0.85:1.000:. ./.:4:125,41:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,41:.: 0.50:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:91,43:.:-0.11:0.984:. ./.:4:120,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:168,55:.: 1.96:0.993:. ./.:4:40,110:.: 0.26:1.000:. ./.:4:44,91:.:-0.09:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:85,45:.:-0.20:0.999:. ./.:4:142,49:.: 1.22:1.000:. ./.:4:66,32:.:-0.95:1.000:. ./.:4:139,48:.: 1.12:1.000:. ./.:4:47,109:.: 0.40:1.000:. ./.:4:33,58:.:-1.11:1.000:. ./.:4:90,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:106,36:.: 0.08:1.000:. ./.:4:125,41:.: 0.64:1.000:. ./.:4:104,47:.: 0.29:1.000:. ./.:4:103,43:.: 0.17:1.000:. ./.:4:85,49:.:-0.11:1.000:. ./.:4:76,80:.: 0.40:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:74,81:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,74:.:-0.72:1.000:. ./.:4:47,67:.:-0.58:1.000:. ./.:4:99,33:.:-0.16:1.000:. ./.:4:74,60:.:-0.11:1.000:. ./.:4:42,97:.: 0.01:1.000:. ./.:4:71,57:.:-0.25:0.989:. ./.:4:33,68:.:-0.88:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:74,41:.:-0.55:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:69,34:.:-0.83:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:87,40:.:-0.27:1.000:. ./.:4:40,77:.:-0.51:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:106,63:.: 0.71:1.000:. ./.:4:112,60:.: 0.78:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:121,53:.: 0.82:1.000:. ./.:4:114,48:.: 0.54:1.000:. ./.:4:85,60:.: 0.15:1.000:. ./.:4:147,49:.: 1.33:1.000:. ./.:4:124,54:.: 0.92:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:119,46:.: 0.61:1.000:. ./.:4:104,55:.: 0.47:1.000:. ./.:4:196,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:152,63:.: 1.78:1.000:. ./.:4:102,120:.: 1.94:1.000:. ./.:4:115,48:.: 0.57:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:95,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:34,78:.:-0.62:1.000:. ./.:4:116,40:.: 0.40:1.000:. ./.:4:102,48:.: 0.26:1.000:. ./.:4:102,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:45,102:.: 0.19:1.000:. ./.:4:75,52:.:-0.27:1.000:. ./.:4:46,81:.:-0.27:1.000:. ./.:4:40,77:.:-0.51:1.000:. ./.:4:77,83:.: 0.50:1.000:. ./.:4:112,48:.: 0.50:1.000:. ./.:4:65,64:.:-0.23:1.000:. ./.:4:72,88:.: 0.50:1.000:. ./.:4:77,77:.: 0.36:1.000:. ./.:4:58,37:.:-1.02:1.000:. ./.:4:72,78:.: 0.26:1.000:. ./.:4:90,113:.: 1.50:1.000:. ./.:4:128,65:.: 1.26:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:62,59:.:-0.41:1.000:. ./.:4:41,117:.: 0.45:0.956:. ./.:4:108,127:.: 2.24:1.000:. ./.:4:71,104:.: 0.85:1.000:. ./.:4:59,40:.:-0.93:1.000:. ./.:4:92,50:.: 0.08:1.000:. -chr8.1 23936224 chr8.1_023936224 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:244,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:139,44:.:-0.38:1.000:. ./.:4:187,36:.: 0.36:1.000:. ./.:4:199,48:.: 0.80:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:137,117:.: 0.93:1.000:. ./.:4:84,67:.:-0.97:1.000:. ./.:4:114,99:.: 0.17:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:101,1:.:-1.87:1.000:. ./.:4:72,18:.:-2.10:1.000:. ./.:4:283,57:.: 2.52:1.000:. ./.:4:210,41:.: 0.88:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:223,63:.: 1.52:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.45:0.999:. ./.:4:229,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:229,57:.: 1.52:1.000:. ./.:4:239,55:.: 1.67:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:150,48:.:-0.10:1.000:. ./.:4:141,94:.: 0.58:1.000:. ./.:4:131,104:.: 0.58:1.000:. ./.:4:23,37:.:-2.65:1.000:. ./.:4:201,46:.: 0.80:1.000:. ./.:4:221,55:.: 1.34:1.000:. ./.:4:159,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:192,59:.: 0.88:1.000:. ./.:4:247,64:.: 1.98:1.000:. ./.:4:124,81:.: 0.03:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:37,15:.:-2.80:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.52:1.000:. ./.:3:26,4:.:-3.20:1.000:. ./.:4:194,54:.: 0.82:1.000:. ./.:4:118,95:.: 0.17:1.000:. ./.:4:117,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:142,43:.:-0.34:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:155,43:.:-0.10:1.000:. ./.:4:94,56:.:-0.99:1.000:. ./.:4:192,47:.: 0.65:1.000:. ./.:4:152,42:.:-0.18:1.000:. ./.:5:280,48:.: 2.30:1.000:. ./.:4:114,17:.:-1.34:1.000:. ./.:4:128,38:.:-0.69:1.000:. ./.:4:86,61:.:-1.04:1.000:. ./.:4:123,31:.:-0.92:1.000:. ./.:4:196,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:153,51:.: 0.01:1.000:. ./.:4:185,45:.: 0.49:1.000:. ./.:4:168,47:.: 0.21:1.000:. ./.:4:146,34:.:-0.44:1.000:. ./.:4:143,48:.:-0.23:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:162,35:.:-0.12:1.000:. ./.:6:140,28:.:-0.66:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:147,40:.:-0.31:1.000:. ./.:4:167,55:.: 0.34:1.000:. ./.:4:123,34:.:-0.86:1.000:. ./.:4:199,38:.: 0.62:1.000:. ./.:4:82,78:.:-0.80:1.000:. ./.:4:98,26:.:-1.47:1.000:. ./.:4:152,41:.:-0.20:1.000:. ./.:4:162,44:.: 0.04:0.887:. ./.:4:219,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:176,42:.: 0.27:1.000:. ./.:4:81,60:.:-1.16:0.999:. ./.:4:94,79:.:-0.56:1.000:. ./.:4:159,44:.:-0.01:1.000:. ./.:4:130,35:.:-0.71:1.000:. ./.:4:95,78:.:-0.56:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:90,74:.:-0.73:1.000:. ./.:4:171,39:.: 0.12:1.000:. ./.:4:172,39:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,32:.:-0.99:0.968:. ./.:4:216,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:174,49:.: 0.36:1.000:. ./.:4:134,36:.:-0.62:1.000:. ./.:4:101,95:.:-0.14:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:82,61:.:-1.12:1.000:. ./.:4:160,34:.:-0.18:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:114,35:.:-1.01:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:116,59:.:-0.53:1.000:. ./.:4:118,31:.:-1.01:1.000:. ./.:4:62,73:.:-1.27:1.000:. ./.:4:159,49:.: 0.08:1.000:. ./.:4:204,56:.: 1.04:1.000:. ./.:4:120,37:.:-0.86:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:143,63:.: 0.04:0.984:. ./.:4:176,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:239,82:.: 2.17:0.993:. ./.:4:123,82:.: 0.03:1.000:. ./.:4:120,77:.:-0.12:1.000:. ./.:4:332,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:134,28:.:-0.77:0.999:. ./.:4:180,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:98,27:.:-1.45:1.000:. ./.:4:170,42:.: 0.16:1.000:. ./.:4:115,70:.:-0.34:1.000:. ./.:4:80,60:.:-1.17:1.000:. ./.:4:147,44:.:-0.23:1.000:. ./.:4:124,41:.:-0.71:1.000:. ./.:4:158,42:.:-0.07:1.000:. ./.:4:113,36:.:-1.01:1.000:. ./.:4:158,41:.:-0.08:1.000:. ./.:4:209,66:.: 1.32:1.000:. ./.:4:73,71:.:-1.10:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,84:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,76:.:-1.10:1.000:. ./.:4:67,49:.:-1.62:1.000:. ./.:4:103,16:.:-1.56:1.000:. ./.:4:90,71:.:-0.79:1.000:. ./.:4:98,121:.: 0.28:1.000:. ./.:4:59,43:.:-1.87:0.989:. ./.:4:105,68:.:-0.56:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:336,0:.: 2.44:1.000:. ./.:4:188,28:.: 0.23:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:118,38:.:-0.88:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:171,41:.: 0.16:1.000:. ./.:4:99,62:.:-0.79:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:219,70:.: 1.58:1.000:. ./.:4:222,64:.: 1.52:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:187,48:.: 0.58:1.000:. ./.:4:215,43:.: 1.00:1.000:. ./.:4:190,48:.: 0.64:1.000:. ./.:4:215,62:.: 1.36:1.000:. ./.:4:218,55:.: 1.28:1.000:. ./.:4:88,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:131,44:.:-0.53:1.000:. ./.:4:207,45:.: 0.89:1.000:. ./.:4:289,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:220,60:.: 1.41:1.000:. ./.:4:152,122:.: 1.30:1.000:. ./.:4:162,56:.: 0.27:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:202,52:.: 0.93:1.000:. ./.:4:122,69:.:-0.23:1.000:. ./.:4:134,36:.:-0.62:1.000:. ./.:4:184,69:.: 0.91:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:116,110:.: 0.41:1.000:. ./.:4:150,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:123,116:.: 0.65:1.000:. ./.:4:127,115:.: 0.71:1.000:. ./.:4:124,100:.: 0.38:1.000:. ./.:4:137,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:101,98:.:-0.08:1.000:. ./.:4:103,91:.:-0.18:1.000:. ./.:4:108,76:.:-0.36:1.000:. ./.:4:138,25:.:-0.75:1.000:. ./.:4:83,73:.:-0.88:1.000:. ./.:4:142,115:.: 0.99:1.000:. ./.:4:187,53:.: 0.67:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:148,58:.: 0.04:1.000:. ./.:4:132,111:.: 0.73:0.956:. ./.:4:164,139:.: 1.84:1.000:. ./.:4:161,133:.: 1.67:1.000:. ./.:4:158,42:.:-0.07:1.000:. ./.:4:200,50:.: 0.86:1.000:. -chr8.1 24161291 chr8.1_024161291 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:195,68:0.26: 0.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:140,110:0.43:-0.20:1.000:0.958 0/0/0/1:4:165,60:0.27:-0.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,127:0.49:-0.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:270,83:0.24: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:186,198:0.51: 1.85:1.000:0.997 0/1/1/1:4:51,133:0.70:-1.20:1.000:0.988 0/1/1/1:4:100,233:0.68: 1.07:1.000:0.956 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-2.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,27:0.25:-2.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:236,62:0.21: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,62:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:286,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:304,1:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,180:0.54: 0.99:1.000:0.989 0/0/0/1:4:239,88:0.27: 0.98:0.999:0.997 0/0/0/1:4:235,87:0.27: 0.90:1.000:0.997 0/0/0/1:4:307,97:0.25: 2.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:243,183:0.43: 2.49:1.000:0.932 0/0/0/1:4:93,52:0.36:-1.80:1.000:0.713 0/0/1/1:4:142,126:0.46: 0.08:1.000:0.989 0/0/1/1:4:145,146:0.49: 0.43:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,130:0.45: 0.34:1.000:0.980 0/0/1/1:4:48,34:0.41:-2.76:1.000:0.869 0/0/0/1:4:255,88:0.26: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:202,84:0.30: 0.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:180,79:0.31:-0.06:1.000:0.977 0/0/0/1:4:228,83:0.27: 0.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:237,75:0.25: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,148:0.50: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/0:4:269,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,39:0.42:-2.62:1.000:0.929 0/0/0/1:4:126,38:0.24:-1.51:1.000:1.000 0/0/1:3:28,20:0.41:-3.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:261,87:0.26: 1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,156:0.52: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:152,153:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:332,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:332,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,134:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:188,72:0.28:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:143,158:0.52: 0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,113:0.52:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:171,61:0.27:-0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:196,71:0.27: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/0/1:5:321,75:0.19: 2.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:206,80:0.28: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:96,103:0.51:-0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:180,177:0.49: 1.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:151,41:0.22:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,107:0.28: 1.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,113:0.47:-0.38:1.000:0.991 0/0/0/1:4:219,70:0.25: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,125:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/1/1:4:144,159:0.52: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,120:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:230,70:0.24: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,50:0.26:-0.96:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:142,78:0.35:-0.65:1.000:0.890 0/0/0/1:4:163,53:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:197,78:0.29: 0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:190,78:0.29: 0.08:1.000:0.990 0/0/1/1:4:135,162:0.53: 0.52:1.000:0.990 0/0/0/1:4:220,74:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,123:0.46:-0.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:132,34:0.21:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,134:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,112:0.51:-0.71:0.887:0.996 0/0/1/1:4:118,118:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,65:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,113:0.46:-0.32:0.999:0.988 0/0/1/1:4:144,197:0.57: 1.19:1.000:0.957 0/0/1/1:4:136,146:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,120:0.52:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:130,142:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/0:4:269,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,119:0.48:-0.29:1.000:0.995 0/0/1/1:4:134,131:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,160:0.51: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,34:0.24:-1.77:0.968:1.000 0/0/0/1:4:219,84:0.28: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,68:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,60:0.27:-0.56:1.000:0.998 0/0/0/1:4:251,80:0.25: 1.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,225:0.71: 0.67:1.000:0.993 0/0/0/1:4:145,46:0.25:-1.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:181,55:0.24:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,54:0.23:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:238,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,146:0.69:-0.85:1.000:0.968 0/0/1/1:4:130,124:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/0/0/0:4:286,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,108:0.50:-0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:239,61:0.21: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,219:0.73: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,121:0.53:-0.61:1.000:0.991 0/1/1/1:4:70,156:0.67:-0.56:1.000:0.929 0/0/0/1:4:217,68:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,92:0.27: 1.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:134,40:0.23:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,75:0.25: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,127:0.50:-0.20:0.984:0.997 0/0/0/0:4:191,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,80:0.27: 0.63:1.000:0.998 0/0/0/1:4:173,55:0.25:-0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,63:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:255,84:0.25: 1.16:0.993:0.999 0/1/1/1:4:67,185:0.71:-0.17:1.000:0.993 0/1/1/1:4:64,163:0.70:-0.55:1.000:0.984 0/0/0/1:4:303,97:0.25: 2.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,94:0.42:-0.64:0.999:0.918 0/0/0/1:4:188,67:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,75:0.42:-1.32:1.000:0.921 0/0/0/1:4:210,63:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,174:0.69:-0.29:1.000:0.979 0/1/1/1:4:51,173:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:150,145:0.48: 0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:169,56:0.25:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,54:0.21:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,47:0.21:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,123:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,135:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:109,95:0.46:-0.90:1.000:0.987 0/0/0/0:4:251,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,119:0.48:-0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,148:0.76:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,80:0.46:-1.40:1.000:0.988 0/0/0/1:4:118,38:0.25:-1.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,115:0.45:-0.20:1.000:0.983 0/1/1/1:4:61,189:0.73:-0.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,80:0.48:-1.52:0.989:0.995 0/1/1/1:4:74,205:0.71: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:174,57:0.25:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:304,83:0.22: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,144:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,53:0.25:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,95:0.48:-1.07:1.000:0.996 0/0/0/0:4:211,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,141:0.52: 0.05:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,171:0.71:-0.43:1.000:0.991 0/0/0/0:4:224,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:217,183:0.45: 2.09:1.000:0.981 0/0/1/1:4:185,190:0.50: 1.71:1.000:0.997 0/0/0/0:4:347,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,66:0.27:-0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:206,188:0.47: 2.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:170,132:0.43: 0.60:1.000:0.952 0/0/0/1:4:228,97:0.30: 0.95:1.000:0.984 0/0/0/1:4:213,57:0.22: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-2.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,36:0.25:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,159:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:200,81:0.29: 0.28:1.000:0.991 0/0/0/1:4:243,77:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,180:0.47: 1.80:1.000:0.990 0/0/0/1:4:165,52:0.24:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,73:0.23: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,135:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,182:0.75:-0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,45:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,123:0.46: 0.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:187,53:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,238:0.72: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,145:0.48: 0.57:1.000:0.994 0/1/1/1:4:77,210:0.71: 0.37:1.000:0.992 0/1/1/1:4:59,168:0.72:-0.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,128:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:142,46:0.25:-1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,123:0.52:-0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:141,105:0.42:-0.26:1.000:0.923 0/0/1/1:4:104,133:0.55:-0.39:1.000:0.980 0/0/1/1:4:124,122:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:89,101:0.52:-1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:191,188:0.49: 1.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:251,76:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,81:0.27: 0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:125,150:0.53: 0.18:1.000:0.990 0/1/1/1:4:73,262:0.76: 1.10:0.956:1.000 0/0/1/1:4:139,194:0.57: 1.07:1.000:0.947 0/1/1/1:4:82,271:0.75: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,111:0.44:-0.17:1.000:0.959 0/0/1/1:4:132,157:0.53: 0.40:1.000:0.991 -chr8.1 24348571 chr8.1_024348571 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:17,20:.: 0.62:1.000:. ./.:4:24,9:.: 0.21:1.000:. ./.:4:23,9:.: 0.11:1.000:. ./.:4:37,7:.: 1.34:1.000:. ./.:4:53,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.81:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.45:1.000:. ./.:4:21,12:.: 0.21:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:22,11:.: 0.21:1.000:. ./.:4:26,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:12,22:.: 0.31:0.999:. ./.:4:29,8:.: 0.62:1.000:. ./.:4:23,14:.: 0.62:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:3,1:.:-2.76:1.000:. ./.:4:25,7:.: 0.11:1.000:. ./.:4:32,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:19,3:.:-0.91:1.000:. ./.:4:1,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:6,14:.:-1.12:1.000:. ./.:4:13,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:18,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:30,12:.: 1.13:1.000:. ./.:4:35,9:.: 1.34:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.09:1.000:. ./.:4:14,11:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.55:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:28,6:.: 0.31:1.000:. ./.:4:32,5:.: 0.62:1.000:. ./.:4:15,11:.:-0.50:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.81:1.000:. ./.:4:11,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,6:.:-0.09:1.000:. ./.:4:20,14:.: 0.31:1.000:. ./.:4:10,26:.: 0.52:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.40:1.000:. ./.:5:43,7:.: 1.95:1.000:. ./.:4:8,4:.:-1.94:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:28,8:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,7:.: 0.31:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,16:.: 0.72:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:10,8:.:-1.32:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:13,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:14,8:.:-0.91:1.000:. ./.:6:14,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,19:.: 0.31:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:31,11:.: 1.13:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:6,7:.:-1.83:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.40:0.887:. ./.:4:13,17:.:-0.09:1.000:. ./.:4:19,16:.: 0.42:1.000:. ./.:4:12,5:.:-1.42:0.999:. ./.:4:13,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,10:.: 0.72:1.000:. ./.:4:19,7:.:-0.50:1.000:. ./.:4:18,3:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,9:.:-0.91:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:30,4:.: 0.31:1.000:. ./.:4:16,12:.:-0.30:0.968:. ./.:4:27,11:.: 0.72:1.000:. ./.:4:23,12:.: 0.42:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:11,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,11:.: 0.31:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.71:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:19,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:7,6:.:-1.83:1.000:. ./.:4:36,10:.: 1.54:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:20,26:.: 1.54:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:9,10:.:-1.22:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:7,10:.:-1.42:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.11:0.984:. ./.:4:12,19:.: 0.01:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:32,14:.: 1.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.09:0.993:. ./.:4:41,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:28,12:.: 0.93:1.000:. ./.:4:56,0:.: 2.57:0.999:. ./.:4:31,9:.: 0.93:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:21,10:.: 0.01:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:35,10:.: 1.44:1.000:. ./.:4:21,11:.: 0.11:1.000:. ./.:4:22,8:.:-0.09:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.93:1.000:. ./.:4:27,13:.: 0.93:1.000:. ./.:4:31,6:.: 0.62:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:21,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:14,13:.:-0.40:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:22,5:.:-0.40:0.989:. ./.:4:31,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:19,16:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:17,17:.: 0.31:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:22,6:.:-0.30:1.000:. ./.:4:28,10:.: 0.72:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:24,8:.: 0.11:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.72:1.000:. ./.:4:15,30:.: 1.44:1.000:. ./.:4:30,8:.: 0.72:1.000:. ./.:4:26,8:.: 0.31:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:26,18:.: 1.34:1.000:. ./.:4:25,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:6,3:.:-2.24:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:17,7:.:-0.71:1.000:. ./.:4:18,12:.:-0.09:1.000:. ./.:4:28,13:.: 1.03:1.000:. ./.:4:25,7:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,18:.: 0.31:1.000:. ./.:4:24,7:.: 0.01:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.81:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:28,14:.: 1.13:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:17,15:.: 0.11:1.000:. ./.:4:40,5:.: 1.44:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.71:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.40:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:26,10:.: 0.52:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.72:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.21:0.956:. ./.:4:28,13:.: 1.03:1.000:. ./.:4:37,7:.: 1.34:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:28,5:.: 0.21:1.000:. -chr8.1 24696034 chr8.1_024696034 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:178,20:.: 0.76:1.000:. ./.:4:105,23:.:-0.40:1.000:. ./.:4:173,17:.: 0.63:1.000:. ./.:4:133,26:.: 0.12:1.000:. ./.:4:207,13:.: 1.13:1.000:. ./.:4:146,22:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,34:.:-1.19:1.000:. ./.:4:83,27:.:-0.70:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:48,5:.:-1.64:1.000:. ./.:4:235,20:.: 1.71:1.000:. ./.:4:183,7:.: 0.63:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:134,29:.: 0.18:1.000:. ./.:4:240,10:.: 1.63:0.999:. ./.:4:221,15:.: 1.39:1.000:. ./.:4:229,22:.: 1.64:1.000:. ./.:4:141,46:.: 0.58:1.000:. ./.:4:18,4:.:-2.16:1.000:. ./.:4:134,18:.: 0.00:1.000:. ./.:4:133,33:.: 0.23:1.000:. ./.:4:114,29:.:-0.15:1.000:. ./.:4:11,8:.:-2.20:1.000:. ./.:4:209,15:.: 1.19:1.000:. ./.:4:216,6:.: 1.16:1.000:. ./.:4:187,12:.: 0.78:1.000:. ./.:4:214,27:.: 1.48:1.000:. ./.:4:183,16:.: 0.78:1.000:. ./.:4:137,16:.: 0.02:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:5,12:.:-2.24:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.11:1.000:. ./.:3:6,10:.:-2.25:1.000:. ./.:4:183,18:.: 0.81:1.000:. ./.:4:144,11:.: 0.05:1.000:. ./.:4:121,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:288,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:83,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:167,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:97,15:.:-0.66:1.000:. ./.:4:99,15:.:-0.63:1.000:. ./.:4:145,14:.: 0.12:1.000:. ./.:4:159,7:.: 0.23:1.000:. ./.:5:273,14:.: 2.24:1.000:. ./.:4:52,19:.:-1.34:1.000:. ./.:4:104,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:83,16:.:-0.88:1.000:. ./.:4:121,11:.:-0.33:1.000:. ./.:4:215,12:.: 1.24:1.000:. ./.:4:102,21:.:-0.48:1.000:. ./.:4:162,9:.: 0.32:1.000:. ./.:4:115,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:100,22:.:-0.50:1.000:. ./.:4:126,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:141,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:129,15:.:-0.13:1.000:. ./.:6:100,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:130,12:.:-0.17:1.000:. ./.:4:169,17:.: 0.56:1.000:. ./.:4:134,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:71,21:.:-0.99:1.000:. ./.:4:178,11:.: 0.61:1.000:. ./.:4:88,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:84,5:.:-1.04:1.000:. ./.:4:103,20:.:-0.48:1.000:. ./.:4:99,24:.:-0.48:0.887:. ./.:4:95,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:147,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,15:.:-1.18:0.999:. ./.:4:106,42:.:-0.07:1.000:. ./.:4:121,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:101,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:70,20:.:-1.03:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:86,21:.:-0.75:1.000:. ./.:4:106,28:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,18:.:-0.48:1.000:. ./.:4:106,9:.:-0.61:0.968:. ./.:4:167,12:.: 0.45:1.000:. ./.:4:154,14:.: 0.27:1.000:. ./.:4:177,10:.: 0.58:1.000:. ./.:4:110,4:.:-0.63:1.000:. ./.:4:52,50:.:-0.83:1.000:. ./.:4:106,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:134,4:.:-0.23:1.000:. ./.:4:106,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:25,23:.:-1.72:1.000:. ./.:4:102,26:.:-0.40:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:106,14:.:-0.53:1.000:. ./.:4:168,8:.: 0.40:1.000:. ./.:4:44,31:.:-1.28:1.000:. ./.:4:72,18:.:-1.03:1.000:. ./.:4:32,32:.:-1.46:1.000:. ./.:4:153,18:.: 0.32:1.000:. ./.:4:176,19:.: 0.71:1.000:. ./.:4:112,10:.:-0.50:1.000:. ./.:4:153,17:.: 0.30:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:103,35:.:-0.23:0.984:. ./.:4:136,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:148,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:138,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:206,8:.: 1.03:1.000:. ./.:4:274,19:.: 2.34:0.993:. ./.:4:54,26:.:-1.19:1.000:. ./.:4:39,28:.:-1.41:1.000:. ./.:4:276,19:.: 2.37:1.000:. ./.:4:119,27:.:-0.10:0.999:. ./.:4:175,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:82,9:.:-1.01:1.000:. ./.:4:154,13:.: 0.25:1.000:. ./.:4:42,39:.:-1.18:1.000:. ./.:4:50,22:.:-1.33:1.000:. ./.:4:98,33:.:-0.35:1.000:. ./.:4:146,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:166,15:.: 0.48:1.000:. ./.:4:137,12:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,27:.:-0.26:1.000:. ./.:4:113,31:.:-0.13:1.000:. ./.:4:92,26:.:-0.56:1.000:. ./.:4:214,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:68,26:.:-0.96:1.000:. ./.:4:38,29:.:-1.41:1.000:. ./.:4:65,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:107,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:67,20:.:-1.08:1.000:. ./.:4:68,65:.:-0.31:1.000:. ./.:4:53,12:.:-1.44:0.989:. ./.:4:46,30:.:-1.26:1.000:. ./.:4:168,12:.: 0.47:1.000:. ./.:4:267,8:.: 2.04:1.000:. ./.:4:124,17:.:-0.18:1.000:. ./.:4:131,6:.:-0.25:1.000:. ./.:4:70,21:.:-1.01:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:86,25:.:-0.68:1.000:. ./.:4:90,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:236,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:86,3:.:-1.04:1.000:. ./.:4:173,38:.: 0.98:1.000:. ./.:4:162,33:.: 0.71:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:207,19:.: 1.23:1.000:. ./.:4:167,27:.: 0.70:1.000:. ./.:4:115,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:235,20:.: 1.71:1.000:. ./.:4:188,19:.: 0.91:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:141,8:.:-0.05:1.000:. ./.:4:127,27:.: 0.03:1.000:. ./.:4:204,9:.: 1.01:1.000:. ./.:4:237,28:.: 1.87:1.000:. ./.:4:123,29:.: 0.00:1.000:. ./.:4:185,14:.: 0.78:1.000:. ./.:4:217,12:.: 1.28:1.000:. ./.:4:135,41:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:201,12:.: 1.01:1.000:. ./.:4:136,29:.: 0.22:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:70,32:.:-0.83:1.000:. ./.:4:95,22:.:-0.58:1.000:. ./.:4:70,38:.:-0.73:1.000:. ./.:4:68,51:.:-0.55:1.000:. ./.:4:109,33:.:-0.17:1.000:. ./.:4:168,20:.: 0.60:1.000:. ./.:4:80,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:106,14:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,26:.:-0.07:1.000:. ./.:4:116,16:.:-0.33:1.000:. ./.:4:104,20:.:-0.46:1.000:. ./.:4:169,23:.: 0.66:1.000:. ./.:4:203,15:.: 1.10:1.000:. ./.:4:192,11:.: 0.85:1.000:. ./.:4:119,37:.: 0.07:1.000:. ./.:4:72,50:.:-0.50:0.956:. ./.:4:157,25:.: 0.50:1.000:. ./.:4:78,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:113,16:.:-0.38:1.000:. ./.:4:140,37:.: 0.42:1.000:. -chr8.1 24758802 chr8.1_024758802 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:0.999:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:42,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:5:28,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:47,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:6:10,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:0.887:. ./.:4:25,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:0.999:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:0.968:. ./.:4:40,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:35,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:43,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:0.984:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.18:0.993:. ./.:4:25,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:18,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:45,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:0.989:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:46,1:.: 2.72:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:42,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:36,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.90:0.956:. ./.:4:22,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.52:1.000:. -chr8.1 24869166 chr8.1_024869166 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:11,18:.: 0.62:1.000:. ./.:4:11,17:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,15:.: 0.11:1.000:. ./.:4:4,23:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,14:.: 1.01:1.000:. ./.:4:7,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:11,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:5,13:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.36:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.75:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.79:1.000:. ./.:4:6,24:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.49:1.000:. ./.:4:9,21:.: 0.75:1.000:. ./.:4:3,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:9,17:.: 0.24:0.999:. ./.:4:20,13:.: 1.14:1.000:. ./.:4:4,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:19,17:.: 1.53:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.49:1.000:. ./.:4:18,15:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,17:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:6,17:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,1:.:-3.01:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.88:1.000:. ./.:3:1,6:.:-2.23:1.000:. ./.:4:9,26:.: 1.40:1.000:. ./.:4:5,14:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.62:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:10,17:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.71:1.000:. ./.:4:11,15:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.80:1.000:. ./.:5:7,30:.: 1.66:1.000:. ./.:4:4,7:.:-1.71:1.000:. ./.:4:3,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:2,12:.:-1.32:1.000:. ./.:4:12,17:.: 0.62:1.000:. ./.:4:12,19:.: 0.88:1.000:. ./.:4:25,8:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,32:.: 1.01:1.000:. ./.:4:6,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:5,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:16,9:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.54:1.000:. ./.:6:7,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:10,22:.: 1.01:1.000:. ./.:4:4,10:.:-1.32:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.36:1.000:. ./.:4:7,15:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:9,22:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.97:1.000:. ./.:4:3,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:16,7:.:-0.15:0.887:. ./.:4:11,8:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,8:.:-2.10:0.999:. ./.:4:0,18:.:-0.80:1.000:. ./.:4:4,15:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,18:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.93:1.000:. ./.:4:6,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:9,13:.:-0.28:1.000:. ./.:4:16,27:.: 2.44:1.000:. ./.:4:12,22:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.19:0.968:. ./.:4:15,11:.: 0.24:1.000:. ./.:4:15,11:.: 0.24:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.67:1.000:. ./.:4:10,19:.: 0.62:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,8:.:-0.41:1.000:. ./.:4:15,10:.: 0.11:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,13:.: 0.24:1.000:. ./.:4:13,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,17:.: 0.62:1.000:. ./.:4:5,7:.:-1.58:1.000:. ./.:4:30,16:.: 2.83:1.000:. ./.:4:8,14:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,12:.:-0.41:1.000:. ./.:4:12,18:.: 0.75:1.000:. ./.:4:13,28:.: 2.18:1.000:. ./.:4:6,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:5,14:.:-0.67:1.000:. ./.:4:26,13:.: 1.92:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,10:.: 1.40:0.984:. ./.:4:0,16:.:-1.06:1.000:. ./.:4:23,10:.: 1.14:1.000:. ./.:4:20,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:5,19:.:-0.02:0.993:. ./.:4:7,13:.:-0.54:1.000:. ./.:4:4,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:28,13:.: 2.18:0.999:. ./.:4:9,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:8,4:.:-1.58:1.000:. ./.:4:16,18:.: 1.27:1.000:. ./.:4:12,17:.: 0.62:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:25,11:.: 1.53:1.000:. ./.:4:12,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:3,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:12,23:.: 1.40:1.000:. ./.:4:7,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,19:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.54:1.000:. ./.:4:7,11:.:-0.80:1.000:. ./.:4:6,10:.:-1.06:1.000:. ./.:4:7,9:.:-1.06:1.000:. ./.:4:11,16:.: 0.36:1.000:. ./.:4:11,20:.: 0.88:1.000:. ./.:4:2,13:.:-1.19:0.989:. ./.:4:26,13:.: 1.92:1.000:. ./.:4:6,12:.:-0.80:1.000:. ./.:4:13,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:18,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:17,13:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,13:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.93:1.000:. ./.:4:7,10:.:-0.93:1.000:. ./.:4:3,11:.:-1.32:1.000:. ./.:4:20,18:.: 1.79:1.000:. ./.:4:10,14:.:-0.02:1.000:. ./.:4:7,20:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:12,10:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,9:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,33:.: 1.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,14:.: 0.11:1.000:. ./.:4:10,11:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,20:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,29:.: 0.62:1.000:. ./.:4:6,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,10:.: 0.24:1.000:. ./.:4:6,27:.: 1.14:1.000:. ./.:4:9,18:.: 0.36:1.000:. ./.:4:4,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,26:.: 0.88:1.000:. ./.:4:9,15:.:-0.02:1.000:. ./.:4:14,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:11,13:.:-0.02:1.000:. ./.:4:9,12:.:-0.41:1.000:. ./.:4:16,13:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:4,9:.:-1.45:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.80:1.000:. ./.:4:6,10:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:4,24:.: 0.49:1.000:. ./.:4:12,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:7,23:.: 0.75:0.956:. ./.:4:0,33:.: 1.14:1.000:. ./.:4:14,25:.: 1.92:1.000:. ./.:4:12,14:.: 0.24:1.000:. ./.:4:3,15:.:-0.80:1.000:. -chr8.1 24997197 chr8.1_024997197 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:109,60:.: 0.08:1.000:. ./.:4:105,37:.:-0.62:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:134,49:.: 0.45:1.000:. ./.:4:167,68:.: 1.80:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:75,26:.:-1.69:1.000:. ./.:4:124,62:.: 0.52:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:148,61:.: 1.12:1.000:. ./.:4:147,61:.: 1.09:0.999:. ./.:4:127,60:.: 0.55:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:159,81:.: 1.93:1.000:. ./.:4:48,31:.:-2.26:1.000:. ./.:4:125,50:.: 0.24:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:177,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:24,10:.:-3.43:1.000:. ./.:4:62,43:.:-1.58:1.000:. ./.:3:30,0:.:-3.53:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:236,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:108,58:.: 0.00:1.000:. ./.:4:116,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:123,38:.:-0.13:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:5:201,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:39,0:.:-3.30:1.000:. ./.:4:105,38:.:-0.59:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:113,32:.:-0.54:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:102,39:.:-0.65:1.000:. ./.:4:152,60:.: 1.20:1.000:. ./.:4:116,48:.:-0.05:1.000:. ./.:4:142,58:.: 0.89:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.18:1.000:. ./.:6:121,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:147,61:.: 1.09:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:123,63:.: 0.52:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:124,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:108,57:.:-0.02:1.000:. ./.:4:114,38:.:-0.36:0.887:. ./.:4:71,87:.:-0.20:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.50:0.999:. ./.:4:187,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:115,49:.:-0.05:1.000:. ./.:4:97,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:137,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:172,79:.: 2.21:1.000:. ./.:4:146,59:.: 1.02:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.88:0.968:. ./.:4:152,57:.: 1.12:1.000:. ./.:4:159,61:.: 1.41:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:124,49:.: 0.19:1.000:. ./.:4:91,30:.:-1.17:1.000:. ./.:4:97,42:.:-0.70:1.000:. ./.:4:108,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:106,30:.:-0.78:1.000:. ./.:4:106,55:.:-0.13:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:92,38:.:-0.93:1.000:. ./.:4:157,58:.: 1.28:1.000:. ./.:4:121,54:.: 0.24:1.000:. ./.:4:104,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:119,40:.:-0.18:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:132,57:.: 0.60:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:114,61:.: 0.24:0.984:. ./.:4:148,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:133,43:.: 0.26:1.000:. ./.:4:131,45:.: 0.26:1.000:. ./.:4:131,51:.: 0.42:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.00:0.993:. ./.:4:114,38:.:-0.36:1.000:. ./.:4:109,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:187,72:.: 2.42:1.000:. ./.:4:125,55:.: 0.37:0.999:. ./.:4:190,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:84,30:.:-1.35:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:109,38:.:-0.49:1.000:. ./.:4:106,37:.:-0.59:1.000:. ./.:4:139,44:.: 0.45:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:152,59:.: 1.17:1.000:. ./.:4:126,46:.: 0.16:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.59:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:130,55:.: 0.50:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.01:0.989:. ./.:4:124,58:.: 0.42:1.000:. ./.:4:130,34:.:-0.05:1.000:. ./.:4:169,64:.: 1.74:1.000:. ./.:4:133,59:.: 0.68:1.000:. ./.:4:121,44:.:-0.02:1.000:. ./.:4:105,51:.:-0.26:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:124,59:.: 0.45:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:102,38:.:-0.67:1.000:. ./.:4:168,62:.: 1.67:1.000:. ./.:4:110,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:139,42:.: 0.39:1.000:. ./.:4:128,54:.: 0.42:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:158,53:.: 1.17:1.000:. ./.:4:146,54:.: 0.89:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:139,64:.: 0.96:1.000:. ./.:4:100,51:.:-0.39:1.000:. ./.:4:117,42:.:-0.18:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:116,48:.:-0.05:1.000:. ./.:4:118,64:.: 0.42:1.000:. ./.:4:121,45:.: 0.00:1.000:. ./.:4:133,58:.: 0.65:1.000:. ./.:4:126,44:.: 0.11:1.000:. ./.:4:125,48:.: 0.19:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:134,62:.: 0.78:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:105,51:.:-0.26:1.000:. ./.:4:128,43:.: 0.13:1.000:. ./.:4:135,56:.: 0.65:0.956:. ./.:4:183,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:145,57:.: 0.94:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.13:1.000:. ./.:4:101,50:.:-0.39:1.000:. -chr8.1 25317946 chr8.1_025317946 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:38,99:0.70: 0.43:1.000:0.986 0/0/1/1:4:60,72:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,128:0.82: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:74,37:0.31:-0.26:1.000:0.979 0/0/1/1:4:68,51:0.40:-0.05:1.000:0.801 0/1/1/1:4:26,72:0.71:-0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:75,78:0.48: 0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:75,47:0.36: 0.03:1.000:0.713 0/0/1/1:4:10,16:0.59:-2.53:1.000:0.859 0/0/1/1:4:10,15:0.57:-2.56:1.000:0.932 0/0/1/1:4:96,88:0.45: 1.68:1.000:0.981 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:107,47:0.28: 0.88:1.000:0.996 0/0/0/1:4:71,35:0.30:-0.40:1.000:0.982 0/0/0/1:4:109,43:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,95:0.59: 0.91:0.999:0.875 0/0/0/1:4:73,42:0.34:-0.16:1.000:0.882 0/1/1/1:4:32,114:0.76: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,102:0.71: 0.51:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,19:0.81:-2.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,26:0.26:-0.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,108:0.54: 1.87:1.000:0.988 0/1/1/1:4:30,85:0.72:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,12:0.61:-2.72:1.000:0.719 0/0/1/1:4:66,115:0.61: 1.60:1.000:0.676 0/0/0/1:4:99,34:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,37:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,96:0.53: 1.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,104:0.72: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,104:0.59: 1.26:1.000:0.834 0/0/0/1:4:99,38:0.25: 0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,27:0.93:-2.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,28:0.63:-2.08:1.000:0.532 0/1/1:3:3,15:0.82:-2.75:1.000:0.989 0/0/0/1:4:58,39:0.37:-0.64:1.000:0.501 0/1/1/1:4:37,103:0.71: 0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,67:0.45: 0.54:1.000:0.978 0/0/0/0:4:121,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,43:0.28: 0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,31:0.33:-0.93:1.000:0.907 0/0/1/1:4:48,71:0.57:-0.05:1.000:0.943 0/1/1/1:4:29,129:0.80: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,85:0.63: 0.24:1.000:0.569 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,70:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0/0:5:149,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.47:-2.64:1.000:0.993 0/1/1/1:4:32,107:0.75: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,15:0.38:-2.24:1.000:0.544 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,115:0.71: 0.99:1.000:0.990 0/0/0/1:4:65,35:0.32:-0.56:1.000:0.946 0/0/1/1:4:65,97:0.57: 1.10:1.000:0.936 0/0/1/1:4:81,83:0.48: 1.15:1.000:0.995 1/1/1/1:4:16,143:0.89: 1.02:1.000:0.539 0/0/1/1:4:76,89:0.51: 1.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,93:0.68: 0.30:1.000:0.960 0/0/1/1:4:66,91:0.55: 0.96:1.000:0.976 0/0/1/1/1/1:6:40,79:0.64:-0.05:1.000:0.875 0/0/1/1:4:61,86:0.56: 0.70:1.000:0.968 0/0/1/1:4:52,50:0.46:-0.50:1.000:0.989 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,75:0.62:-0.10:1.000:0.605 0/0/0/1:4:67,36:0.32:-0.48:1.000:0.948 0/0/0/1:4:63,38:0.35:-0.53:1.000:0.802 0/0/1/1:4:43,62:0.57:-0.42:1.000:0.958 0/0/1/1:4:68,73:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,72:0.65:-0.37:0.887:0.793 1/1/1/1:4:0,155:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,47:0.29: 0.78:1.000:0.994 0/0/0/1:4:66,37:0.33:-0.48:0.999:0.913 0/1/1/1:4:60,124:0.65: 1.68:1.000:0.802 0/1/1/1:4:29,154:0.83: 1.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,74:0.56: 0.16:1.000:0.972 0/0/1/1:4:62,84:0.55: 0.67:1.000:0.980 0/0/1/1:4:41,37:0.45:-1.14:1.000:0.977 0/0/1/1:4:65,46:0.39:-0.26:1.000:0.657 0/0/1/1:4:68,75:0.50: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,81:0.57: 0.43:1.000:0.956 0/0/1/1:4:59,68:0.51: 0.16:0.968:0.996 0/1/1/1:4:27,93:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,92:0.72: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,36:0.35:-0.66:1.000:0.813 0/0/0/1:4:72,37:0.31:-0.32:1.000:0.970 0/0/1/1:4:64,97:0.58: 1.07:1.000:0.924 0/0/0/1:4:59,19:0.22:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,31:0.34:-0.98:1.000:0.858 0/0/1/1:4:51,39:0.41:-0.82:1.000:0.838 0/0/1/1:4:48,43:0.45:-0.80:1.000:0.974 0/1/1/1:4:29,83:0.72:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,33:0.33:-0.77:1.000:0.915 0/0/0/1:4:83,54:0.37: 0.43:1.000:0.605 0/1/1/1:4:27,103:0.77: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,78:0.66:-0.18:1.000:0.880 0/0/1/1:4:51,75:0.57: 0.14:1.000:0.947 0/0/1/1:4:57,77:0.55: 0.35:1.000:0.981 0/0/0/1:4:72,37:0.31:-0.32:1.000:0.970 0/0/1/1:4:56,48:0.43:-0.45:1.000:0.956 0/0/1/1:4:71,48:0.38:-0.05:1.000:0.516 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,44:0.40:-0.50:1.000:0.823 0/0/0/1:4:43,20:0.29:-1.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:59,40:0.38:-0.58:0.984:0.525 0/0/0/1:4:66,32:0.30:-0.61:1.000:0.986 0/0/1/1:4:53,40:0.40:-0.74:1.000:0.813 0/0/0/1:4:56,29:0.31:-0.96:1.000:0.967 0/0/0/1:4:94,41:0.28: 0.38:1.000:0.996 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.46:0.993:1.000 0/0/1/1:4:63,88:0.56: 0.80:1.000:0.971 0/0/1/1:4:63,80:0.53: 0.59:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,45:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,97:0.76: 0.11:0.999:1.000 0/0/1/1:4:70,49:0.38:-0.05:1.000:0.625 0/1/1/1:4:11,31:0.72:-2.10:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,78:0.64:-0.10:1.000:0.729 0/0/1/1:4:61,80:0.54: 0.54:1.000:0.987 0/0/1/1:4:51,87:0.61: 0.46:1.000:0.732 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,85:0.54: 0.75:1.000:0.985 0/0/1/1:4:44,36:0.42:-1.09:1.000:0.924 0/0/1/1:4:52,80:0.58: 0.30:1.000:0.909 0/0/0/1:4:86,43:0.31: 0.22:1.000:0.979 0/1/1/1:4:30,90:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,44:0.38:-0.34:1.000:0.570 0/0/0/1:4:77,41:0.32:-0.08:1.000:0.953 0/0/0/1:4:74,27:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,64:0.77:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,34:0.38:-1.01:1.000:0.599 0/0/1/1:4:48,37:0.41:-0.96:1.000:0.851 0/0/1/1:4:68,117:0.61: 1.71:1.000:0.710 0/1/1/1:4:22,66:0.73:-0.88:0.989:0.998 0/1/1/1:4:25,84:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,77:0.53: 0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,94:0.68: 0.35:1.000:0.952 0/0/1/1:4:67,77:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:46,73:0.59:-0.05:1.000:0.871 0/1/1/1:4:28,81:0.72:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,47:0.46:-0.66:1.000:0.989 0/1/1/1:4:33,127:0.78: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,28:0.25:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,34:0.35:-0.80:1.000:0.824 0/0/0/1:4:74,31:0.27:-0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,112:0.71: 0.86:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,152:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,80:0.66:-0.10:1.000:0.877 0/0/1/1:4:66,101:0.58: 1.23:1.000:0.915 1/1/1/1:4:0,152:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,80:0.64:-0.02:1.000:0.729 0/0/1/1:4:77,103:0.55: 1.58:1.000:0.983 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,13:0.44:-2.48:1.000:0.962 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,85:0.52: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:130,57:0.28: 1.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,88:0.51: 1.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,107:0.73: 0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,44:0.42:-0.58:1.000:0.901 0/0/1/1:4:70,48:0.38:-0.08:1.000:0.562 0/1/1/1:4:33,118:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,77:0.52: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,135:0.77: 1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,54:0.51:-0.53:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,79:0.72:-0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,26:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,44:0.33: 0.06:1.000:0.919 0/1/1/1:4:31,81:0.70:-0.24:1.000:0.987 0/0/1/1:4:72,83:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,73:0.77:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,36:0.32:-0.42:1.000:0.964 0/0/0/1:4:90,26:0.20:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,69:0.67:-0.56:1.000:0.911 0/0/0/1:4:85,42:0.30: 0.16:1.000:0.982 0/0/0/1:4:153,66:0.27: 2.62:1.000:0.997 0/0/0/0:4:128,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,43:0.25: 0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,88:0.52: 1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:78,99:0.53: 1.50:0.956:0.991 0/0/1/1:4:76,101:0.54: 1.50:1.000:0.985 0/0/1/1:4:91,88:0.46: 1.55:1.000:0.990 0/0/0/1:4:72,37:0.31:-0.32:1.000:0.970 0/0/1/1:4:68,79:0.51: 0.70:1.000:0.996 -chr8.1 25514791 chr8.1_025514791 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:70,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:48,15:.:-1.13:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:124,39:.: 2.55:1.000:. ./.:4:72,39:.: 0.64:1.000:. ./.:4:42,12:.:-1.46:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:90,25:.: 0.79:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:58,5:.:-1.13:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:82,27:.: 0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,29:.: 0.90:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:112,1:.: 0.71:0.999:. ./.:4:124,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:86,38:.: 1.12:1.000:. ./.:4:77,24:.: 0.27:1.000:. ./.:4:16,5:.:-2.68:1.000:. ./.:4:67,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:56,26:.:-0.43:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:81,28:.: 0.56:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:32,14:.:-1.76:1.000:. ./.:3:15,6:.:-2.68:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:71,25:.: 0.09:1.000:. ./.:4:78,41:.: 0.93:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:61,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:111,36:.: 1.96:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.01:1.000:. ./.:5:112,29:.: 1.74:1.000:. ./.:4:30,8:.:-2.05:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:114,44:.: 2.37:1.000:. ./.:4:53,26:.:-0.54:1.000:. ./.:4:89,27:.: 0.82:1.000:. ./.:4:54,30:.:-0.36:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:91,34:.: 1.15:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:73,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:87,39:.: 1.19:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:121,25:.: 1.93:1.000:. ./.:4:73,27:.: 0.23:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:71,23:.: 0.01:0.887:. ./.:4:101,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.01:0.999:. ./.:4:145,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:43,27:.:-0.87:1.000:. ./.:4:76,21:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.43:0.968:. ./.:4:128,36:.: 2.59:1.000:. ./.:4:119,38:.: 2.33:1.000:. ./.:4:94,20:.: 0.75:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:31,17:.:-1.68:1.000:. ./.:4:88,27:.: 0.79:1.000:. ./.:4:61,22:.:-0.39:1.000:. ./.:4:78,20:.: 0.16:1.000:. ./.:4:54,20:.:-0.72:1.000:. ./.:4:69,33:.: 0.31:1.000:. ./.:4:59,36:.: 0.05:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:87,35:.: 1.04:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:53,25:.:-0.58:1.000:. ./.:4:85,36:.: 1.01:1.000:. ./.:4:25,11:.:-2.12:1.000:. ./.:4:87,21:.: 0.53:1.000:. ./.:4:34,13:.:-1.72:1.000:. ./.:4:100,15:.: 0.79:0.984:. ./.:4:88,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:84,32:.: 0.82:1.000:. ./.:4:80,27:.: 0.49:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:98,37:.: 1.52:0.993:. ./.:4:112,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:61,21:.:-0.43:0.999:. ./.:4:95,26:.: 1.01:1.000:. ./.:4:64,24:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,25:.: 0.45:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:52,26:.:-0.58:1.000:. ./.:4:76,29:.: 0.42:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:77,29:.: 0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:61,25:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,27:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,24:.: 0.75:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:46,21:.:-0.98:1.000:. ./.:4:72,11:.:-0.39:1.000:. ./.:4:78,26:.: 0.38:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:56,16:.:-0.80:0.989:. ./.:4:74,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:59,25:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.28:1.000:. ./.:4:93,26:.: 0.93:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:80,19:.: 0.20:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:71,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.56:1.000:. ./.:4:64,40:.: 0.38:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:69,35:.: 0.38:1.000:. ./.:4:74,27:.: 0.27:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,2:.:-2.68:1.000:. ./.:4:46,13:.:-1.28:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:73,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:49,14:.:-1.13:1.000:. ./.:4:59,24:.:-0.39:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:89,15:.: 0.38:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:67,19:.:-0.28:1.000:. ./.:4:55,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:78,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:44,21:.:-1.06:1.000:. ./.:4:51,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:63,22:.:-0.32:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.82:0.956:. ./.:4:114,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:72,20:.:-0.06:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.93:1.000:. -chr8.1 25663650 chr8.1_025663650 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:289,5:.:-0.05:1.000:. ./.:4:223,6:.:-0.80:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:202,9:.:-1.01:1.000:. ./.:4:376,13:.: 1.04:1.000:. ./.:4:305,6:.: 0.14:1.000:. ./.:4:127,2:.:-1.95:1.000:. ./.:4:178,13:.:-1.24:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:429,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:365,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:274,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:319,8:.: 0.33:0.999:. ./.:4:220,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:425,16:.: 1.64:1.000:. ./.:4:212,12:.:-0.86:1.000:. ./.:4:186,30:.:-0.95:1.000:. ./.:4:257,9:.:-0.38:1.000:. ./.:4:327,11:.: 0.45:1.000:. ./.:4:278,14:.:-0.08:1.000:. ./.:4:79,16:.:-2.34:1.000:. ./.:4:286,8:.:-0.05:1.000:. ./.:4:391,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:326,17:.: 0.51:1.000:. ./.:4:326,4:.: 0.36:1.000:. ./.:4:247,4:.:-0.55:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:92,48:.:-1.82:1.000:. ./.:4:186,23:.:-1.03:1.000:. ./.:3:128,7:.:-1.88:1.000:. ./.:4:354,4:.: 0.68:1.000:. ./.:4:264,7:.:-0.32:1.000:. ./.:4:313,6:.: 0.23:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:289,7:.:-0.03:1.000:. ./.:4:329,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:218,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:292,16:.: 0.11:1.000:. ./.:4:509,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:342,20:.: 0.73:1.000:. ./.:5:575,0:.: 3.18:1.000:. ./.:4:110,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:181,23:.:-1.09:1.000:. ./.:4:295,25:.: 0.25:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:336,13:.: 0.58:1.000:. ./.:4:275,11:.:-0.15:1.000:. ./.:4:326,17:.: 0.51:1.000:. ./.:4:189,13:.:-1.11:1.000:. ./.:4:192,26:.:-0.93:1.000:. ./.:4:177,17:.:-1.20:1.000:. ./.:4:376,22:.: 1.14:1.000:. ./.:4:293,15:.: 0.11:1.000:. ./.:6:267,19:.:-0.15:1.000:. ./.:4:322,22:.: 0.52:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:547,4:.: 2.90:1.000:. ./.:4:210,59:.:-0.34:1.000:. ./.:4:413,1:.: 1.33:1.000:. ./.:4:286,14:.: 0.02:1.000:. ./.:4:246,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:192,13:.:-1.08:1.000:. ./.:4:201,27:.:-0.81:0.887:. ./.:4:165,9:.:-1.43:1.000:. ./.:4:481,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:276,18:.:-0.05:0.999:. ./.:4:437,4:.: 1.64:1.000:. ./.:4:181,13:.:-1.20:1.000:. ./.:4:298,9:.: 0.10:1.000:. ./.:4:225,16:.:-0.66:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:294,15:.: 0.12:1.000:. ./.:4:202,33:.:-0.73:1.000:. ./.:4:209,23:.:-0.77:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.58:0.968:. ./.:4:361,13:.: 0.87:1.000:. ./.:4:390,11:.: 1.18:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:230,37:.:-0.36:1.000:. ./.:4:228,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:255,12:.:-0.36:1.000:. ./.:4:292,4:.:-0.03:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:142,20:.:-1.57:1.000:. ./.:4:257,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:143,13:.:-1.64:1.000:. ./.:4:336,15:.: 0.60:1.000:. ./.:4:209,42:.:-0.55:1.000:. ./.:4:161,25:.:-1.30:1.000:. ./.:4:311,6:.: 0.21:1.000:. ./.:4:514,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:429,4:.: 1.55:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:353,10:.: 0.74:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:322,19:.: 0.49:0.984:. ./.:4:381,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:271,7:.:-0.24:1.000:. ./.:4:272,5:.:-0.25:1.000:. ./.:4:289,4:.:-0.06:1.000:. ./.:4:473,0:.: 2.01:0.993:. ./.:4:198,10:.:-1.04:1.000:. ./.:4:203,34:.:-0.71:1.000:. ./.:4:402,5:.: 1.25:1.000:. ./.:4:219,26:.:-0.62:0.999:. ./.:4:400,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:149,27:.:-1.41:1.000:. ./.:4:400,21:.: 1.41:1.000:. ./.:4:198,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:312,15:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,36:.:-0.78:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:292,21:.: 0.17:1.000:. ./.:4:448,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:238,34:.:-0.31:1.000:. ./.:4:317,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:306,21:.: 0.33:1.000:. ./.:4:503,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:291,20:.: 0.14:1.000:. ./.:4:237,15:.:-0.54:1.000:. ./.:4:214,18:.:-0.77:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:249,18:.:-0.36:1.000:. ./.:4:171,7:.:-1.39:1.000:. ./.:4:189,13:.:-1.11:0.989:. ./.:4:221,35:.:-0.49:1.000:. ./.:4:262,6:.:-0.35:1.000:. ./.:4:372,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:198,21:.:-0.92:1.000:. ./.:4:328,12:.: 0.48:1.000:. ./.:4:180,29:.:-1.03:1.000:. ./.:4:398,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:242,28:.:-0.33:1.000:. ./.:4:324,15:.: 0.46:1.000:. ./.:4:391,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:240,11:.:-0.55:1.000:. ./.:4:229,27:.:-0.49:1.000:. ./.:4:274,18:.:-0.08:1.000:. ./.:4:437,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:295,12:.: 0.10:1.000:. ./.:4:204,16:.:-0.90:1.000:. ./.:4:140,15:.:-1.65:1.000:. ./.:4:365,5:.: 0.82:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:198,12:.:-1.02:1.000:. ./.:4:296,3:.: 0.00:1.000:. ./.:4:368,10:.: 0.91:1.000:. ./.:4:316,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:337,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:302,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:184,8:.:-1.23:1.000:. ./.:4:171,11:.:-1.34:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:200,14:.:-0.97:1.000:. ./.:4:231,5:.:-0.72:1.000:. ./.:4:188,9:.:-1.17:1.000:. ./.:4:295,6:.: 0.03:1.000:. ./.:4:297,4:.: 0.03:1.000:. ./.:4:174,9:.:-1.33:1.000:. ./.:4:256,10:.:-0.38:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:220,5:.:-0.85:1.000:. ./.:4:302,8:.: 0.13:1.000:. ./.:4:238,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:152,15:.:-1.51:1.000:. ./.:4:216,10:.:-0.84:1.000:. ./.:4:310,3:.: 0.17:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:294,4:.:-0.01:1.000:. ./.:4:186,11:.:-1.17:1.000:. ./.:4:236,16:.:-0.54:0.956:. ./.:4:366,4:.: 0.82:1.000:. ./.:4:262,13:.:-0.27:1.000:. ./.:4:238,3:.:-0.66:1.000:. ./.:4:322,3:.: 0.30:1.000:. -chr8.1 25979547 chr8.1_025979547 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:223,64:0.26: 0.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,53:0.28:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,105:0.53:-0.63:1.000:0.991 0/0/0/1:4:198,60:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:256,60:0.22: 1.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:229,62:0.25: 1.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:109,40:0.30:-1.68:1.000:0.983 0/0/1/1:4:131,121:0.51: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:190,70:0.30: 0.44:1.000:0.982 0/0/1/1:4:47,43:0.50:-2.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,58:0.47:-2.04:1.000:0.994 0/0/0/1:4:239,53:0.21: 1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,106:0.42: 0.63:1.000:0.923 0/0/1/1:4:149,122:0.48: 0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:213,42:0.19: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,201:0.72: 0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:143,127:0.50: 0.63:0.999:0.997 0/0/0/0:4:282,0:0.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:323,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:304,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,29:0.33:-2.65:1.000:0.926 0/0/1/1:4:153,109:0.45: 0.48:1.000:0.974 0/0/1/1:4:149,136:0.50: 0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,53:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,27:0.40:-3.11:1.000:0.750 0/0/0/0:4:297,0:0.00: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,197:0.70: 0.65:1.000:0.989 0/1/1/1:4:51,184:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,63:0.27: 0.63:1.000:0.998 0/0/0/0:4:274,0:0.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,117:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:103,106:0.53:-0.53:1.000:0.993 0/0/0/1:4:61,13:0.20:-3.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,32:0.32:-2.42:1.000:0.943 0/0/1:3:31,13:0.33:-3.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,134:0.52: 0.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:175,65:0.30: 0.06:1.000:0.981 0/0/1/1:4:156,120:0.46: 0.75:1.000:0.989 0/1/1/1:4:75,183:0.69: 0.40:1.000:0.974 0/0/1/1:4:158,133:0.48: 1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:120,108:0.50:-0.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,108:0.49:-0.05:1.000:0.996 0/0/0/1:4:226,56:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,113:0.53:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:125,119:0.51: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:210,49:0.22: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:157,186:0.56: 2.03:1.000:0.903 0/0/1/1:4:66,79:0.56:-1.75:1.000:0.970 0/0/0/1:4:183,45:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,67:0.34:-0.32:1.000:0.886 0/0/1/1:4:95,79:0.48:-1.20:1.000:0.995 0/0/0/0:4:311,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,81:0.47:-1.03:1.000:0.993 0/0/0/1:4:205,56:0.25: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:216,58:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:186,51:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:205,51:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,57:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:217,60:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:136,85:0.41:-0.30:1.000:0.523 0/0/1/1:4:130,96:0.45:-0.21:1.000:0.983 0/0/1/1:4:120,102:0.49:-0.28:1.000:0.996 0/1/1/1:4:56,154:0.71:-0.51:1.000:0.992 0/0/0/1:4:186,52:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,116:0.48: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:206,55:0.25: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,26:0.21:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,57:0.24: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:254,0:0.00: 0.33:0.887:1.000 0/0/0/1:4:178,56:0.27:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,192:0.67: 0.82:1.000:0.927 0/0/1/1:4:70,77:0.54:-1.72:0.999:0.987 0/0/1/1:4:139,111:0.47: 0.25:1.000:0.993 0/0/0/1:4:204,51:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,48:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,86:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:207,48:0.22: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,30:0.15:-0.03:1.000:0.986 0/0/0/1:4:208,61:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,59:0.24: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,45:0.25:-0.61:0.968:0.999 0/0/0/1:4:190,51:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:223,52:0.22: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,108:0.53:-0.47:1.000:0.992 0/1/1/1:4:46,159:0.74:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,127:0.50: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:157,34:0.21:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,55:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:171,40:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:182,51:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,27:0.21:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,111:0.52:-0.23:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,59:0.26: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,56:0.30:-0.55:1.000:0.982 0/0/0/1:4:176,47:0.25:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,114:0.45: 0.61:1.000:0.982 0/0/0/1:4:150,47:0.27:-0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,108:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,127:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:113,101:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,75:0.54:-1.75:1.000:0.990 0/0/0/1:4:224,55:0.23: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,28:0.19:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,92:0.46:-0.45:0.984:0.988 0/0/1/1:4:82,84:0.53:-1.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:151,59:0.31:-0.51:1.000:0.966 0/0/0/1:4:198,34:0.17:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:123,121:0.52: 0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:157,127:0.48: 0.90:0.993:0.994 0/0/1/1:4:148,117:0.47: 0.54:1.000:0.992 0/0/1/1:4:138,89:0.42:-0.19:1.000:0.921 0/0/1/1:4:155,157:0.52: 1.44:1.000:0.994 0/0/0/0:4:251,0:0.00: 0.27:0.999:1.000 0/0/1/1:4:145,92:0.42: 0.00:1.000:0.906 0/0/0/0:4:184,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:280,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,71:0.43:-1.16:1.000:0.954 0/0/1/1:4:133,86:0.42:-0.34:1.000:0.924 0/0/0/0:4:273,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,81:0.44:-0.74:1.000:0.964 0/0/0/1:4:195,56:0.26: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,89:0.47:-0.65:1.000:0.991 0/0/0/1:4:217,55:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,116:0.45: 0.77:1.000:0.978 0/0/0/1:4:213,51:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,43:0.19: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,100:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,89:0.48:-0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:150,42:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,69:0.43:-1.22:1.000:0.942 0/0/0/1:4:178,53:0.26:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:119,133:0.54: 0.29:1.000:0.985 0/0/0/1:4:115,38:0.28:-1.60:0.989:0.995 0/0/0/1:4:199,43:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:147,95:0.42: 0.10:1.000:0.923 0/0/0/1:4:265,82:0.27: 2.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:204,46:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,84:0.45:-0.74:1.000:0.983 0/0/0/0:4:204,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,47:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:204,47:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,80:0.45:-0.86:1.000:0.975 0/0/0/1:4:189,61:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,67:0.45:-1.45:1.000:0.975 0/0/0/0:4:350,0:0.00: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:333,0:0.00: 1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,60:0.26: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,56:0.25: 0.50:1.000:0.999 0/0/0/0:4:335,0:0.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:242,71:0.26: 1.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,192:0.72: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:91,17:0.18:-2.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,103:0.53:-0.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:235,62:0.24: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,122:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:236,68:0.26: 1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,57:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,98:0.47:-0.32:1.000:0.993 0/0/0/1:4:194,63:0.28: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,56:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:135,91:0.43:-0.21:1.000:0.952 0/0/1/1:4:95,86:0.50:-1.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:184,70:0.31: 0.33:1.000:0.975 0/0/1/1:4:116,104:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:214,58:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,93:0.51:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:151,121:0.47: 0.67:1.000:0.993 0/0/0/1:4:199,55:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:105,104:0.52:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:126,105:0.48:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:169,55:0.28:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:173,46:0.24:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,119:0.54:-0.17:1.000:0.988 0/0/0/1:4:157,45:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,94:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,129:0.49: 0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,124:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,130:0.53: 0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:162,57:0.29:-0.34:1.000:0.989 0/0/1/1:4:141,111:0.47: 0.29:0.956:0.992 0/0/1/1:4:148,159:0.54: 1.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:185,174:0.51: 2.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,108:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:215,60:0.25: 0.73:1.000:0.999 -chr8.1 26177355 chr8.1_026177355 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:296,45:.: 0.45:1.000:. ./.:4:200,38:.:-0.94:1.000:. ./.:4:300,2:.:-0.08:1.000:. ./.:4:214,35:.:-0.79:1.000:. ./.:4:324,53:.: 0.93:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:211,27:.:-0.94:1.000:. ./.:4:242,39:.:-0.36:1.000:. ./.:4:293,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:134,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:158,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:323,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:251,30:.:-0.36:1.000:. ./.:4:265,32:.:-0.14:0.999:. ./.:4:189,90:.:-0.38:1.000:. ./.:4:444,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:249,42:.:-0.22:1.000:. ./.:4:103,18:.:-2.51:1.000:. ./.:4:201,36:.:-0.95:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:81,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:420,1:.: 1.52:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:326,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:363,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:358,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:44,0:.:-3.54:1.000:. ./.:4:139,10:.:-2.13:1.000:. ./.:3:50,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:308,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:353,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:297,1:.:-0.13:1.000:. ./.:4:276,36:.: 0.06:1.000:. ./.:4:248,36:.:-0.32:1.000:. ./.:4:307,37:.: 0.49:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:421,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:339,0:.: 0.42:1.000:. ./.:5:475,1:.: 2.26:1.000:. ./.:4:698,1:.: 5.26:1.000:. ./.:4:211,31:.:-0.88:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:254,52:.:-0.02:1.000:. ./.:4:356,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:223,35:.:-0.67:1.000:. ./.:4:295,30:.: 0.23:1.000:. ./.:4:252,49:.:-0.09:1.000:. ./.:4:332,45:.: 0.93:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.52:1.000:. ./.:6:288,19:.:-0.01:1.000:. ./.:4:259,37:.:-0.16:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:457,1:.: 2.02:1.000:. ./.:4:271,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:243,46:.:-0.25:1.000:. ./.:4:262,45:.:-0.01:0.887:. ./.:4:150,74:.:-1.12:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.92:0.999:. ./.:4:414,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:256,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:253,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:282,31:.: 0.07:1.000:. ./.:4:284,28:.: 0.06:1.000:. ./.:4:253,1:.:-0.72:0.968:. ./.:4:324,48:.: 0.87:1.000:. ./.:4:268,44:.: 0.06:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:288,53:.: 0.45:1.000:. ./.:4:216,46:.:-0.61:1.000:. ./.:4:238,28:.:-0.56:1.000:. ./.:4:223,45:.:-0.53:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:205,33:.:-0.94:1.000:. ./.:4:254,35:.:-0.25:1.000:. ./.:4:355,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:193,30:.:-1.14:1.000:. ./.:4:288,64:.: 0.60:1.000:. ./.:4:249,35:.:-0.32:1.000:. ./.:4:212,41:.:-0.73:1.000:. ./.:4:209,36:.:-0.84:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:331,1:.: 0.33:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:299,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:272,38:.: 0.03:0.984:. ./.:4:299,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:260,29:.:-0.25:1.000:. ./.:4:244,36:.:-0.37:1.000:. ./.:4:243,37:.:-0.37:1.000:. ./.:4:480,0:.: 2.32:0.993:. ./.:4:280,40:.: 0.17:1.000:. ./.:4:246,41:.:-0.28:1.000:. ./.:4:337,52:.: 1.09:1.000:. ./.:4:277,46:.: 0.21:0.999:. ./.:4:306,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:242,34:.:-0.42:1.000:. ./.:4:393,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:271,32:.:-0.06:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:227,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:322,2:.: 0.22:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:237,35:.:-0.48:1.000:. ./.:4:243,49:.:-0.21:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:238,31:.:-0.52:1.000:. ./.:4:266,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:204,44:.:-0.80:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.77:0.989:. ./.:4:223,24:.:-0.81:1.000:. ./.:4:222,28:.:-0.77:1.000:. ./.:4:332,53:.: 1.04:1.000:. ./.:4:281,38:.: 0.15:1.000:. ./.:4:247,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:195,27:.:-1.15:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:286,63:.: 0.56:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:195,26:.:-1.16:1.000:. ./.:4:310,68:.: 0.95:1.000:. ./.:4:325,52:.: 0.93:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:298,44:.: 0.46:1.000:. ./.:4:212,32:.:-0.86:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:137,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:250,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:269,43:.: 0.06:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:258,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:271,40:.: 0.05:1.000:. ./.:4:279,43:.: 0.19:1.000:. ./.:4:204,35:.:-0.92:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:253,41:.:-0.18:1.000:. ./.:4:211,27:.:-0.94:1.000:. ./.:4:271,45:.: 0.11:1.000:. ./.:4:183,35:.:-1.20:1.000:. ./.:4:232,34:.:-0.56:1.000:. ./.:4:248,38:.:-0.29:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:206,33:.:-0.92:1.000:. ./.:4:224,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:423,1:.: 1.57:1.000:. ./.:4:325,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:282,27:.: 0.02:1.000:. ./.:4:210,41:.:-0.76:1.000:. ./.:4:243,46:.:-0.25:0.956:. ./.:4:397,2:.: 1.23:1.000:. ./.:4:400,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:237,42:.:-0.38:1.000:. ./.:4:276,47:.: 0.21:1.000:. -chr8.1 26331901 chr8.1_026331901 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:130,37:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,73:0.52:-0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:132,38:0.23: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,112:0.79:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,52:0.32: 0.12:1.000:0.940 0/0/1/1:4:89,68:0.43: 0.00:1.000:0.948 0/0/1/1:4:78,62:0.44:-0.40:1.000:0.967 0/1/1/1:4:42,121:0.73: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,76:0.52:-0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:34,38:0.52:-2.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,42:0.81:-2.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,82:0.53:-0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:59,68:0.53:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:78,98:0.55: 0.45:1.000:0.981 0/0/1/1:4:73,72:0.49:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,44:0.43:-1.33:1.000:0.954 0/0/1/1:4:112,111:0.49: 1.56:0.999:0.996 0/0/0/0:4:161,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,111:0.54: 1.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:146,54:0.28: 1.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-2.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,45:0.31:-0.21:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,168:1.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,132:0.80: 0.14:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:124,121:0.49: 2.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,79:0.79:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,78:0.73:-1.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:84,86:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,86:0.54: 0.00:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,67:0.53:-0.76:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,19:0.55:-2.91:1.000:0.980 0/0/0/1:4:61,14:0.19:-1.94:1.000:1.000 1/1/1:3:0,15:1.00:-3.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,89:0.75:-0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,140:0.81: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,95:0.72:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,94:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:108,82:0.43: 0.78:1.000:0.944 0/0/0/1:4:113,39:0.26:-0.12:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,94:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,107:0.52: 1.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:52,132:0.70: 0.64:1.000:0.988 0/0/1/1:4:109,89:0.45: 0.97:1.000:0.975 0/1/1/1:4:54,158:0.73: 1.30:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:105,71:0.40: 0.45:1.000:0.970 0/1/1/1:4:5,12:0.69:-3.32:1.000:0.976 0/1/1/1:4:45,122:0.72: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:66,74:0.52:-0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,33:0.27:-0.69:1.000:0.998 0/0/1/1:4:87,95:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,29:0.19: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,105:0.56: 0.61:1.000:0.959 0/1/1/1:4:27,99:0.77:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,148:0.72: 1.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,80:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,45:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,88:0.53: 0.16:1.000:0.993 0/0/0/1/1/1:6:81,116:0.58: 0.94:1.000:0.527 0/0/1/1:4:106,110:0.50: 1.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,128:0.73: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,122:0.54: 1.58:1.000:0.989 0/0/1/1:4:105,102:0.49: 1.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,178:0.78: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,98:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,104:0.73:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,84:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/1:4:192,52:0.22: 2.06:0.887:1.000 0/0/1/1:4:74,63:0.46:-0.48:1.000:0.985 0/1/1/1:4:51,184:0.77: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,69:0.53:-0.66:0.999:0.993 1/1/1/1:4:0,250:1.00: 2.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,107:0.78:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,96:0.53: 0.54:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,201:1.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,54:0.29: 0.80:1.000:0.992 0/0/1/1:4:77,94:0.54: 0.33:1.000:0.987 0/0/1/1:4:94,91:0.49: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,56:0.25: 1.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:33,117:0.76:-0.17:0.968:1.000 0/0/1/1:4:119,91:0.43: 1.25:1.000:0.948 0/0/1/1:4:103,105:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,83:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,124:0.67: 0.57:1.000:0.928 0/1/1/1:4:46,140:0.74: 0.68:1.000:0.998 0/0/0/1:4:104,25:0.20:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,31:0.22:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,84:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,99:0.51: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:118,43:0.27: 0.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,54:0.25: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,77:0.71:-1.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:128,130:0.50: 2.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,162:0.72: 1.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,78:0.51:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,85:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:83,96:0.53: 0.52:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,140:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,30:0.26:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:149,43:0.23: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,36:0.26:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:81,81:0.49: 0.12:0.984:0.997 0/0/1/1:4:93,72:0.43: 0.19:1.000:0.955 0/0/0/1:4:159,42:0.22: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,43:0.28: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,43:0.36:-0.85:1.000:0.720 0/0/1/1:4:77,93:0.54: 0.31:0.993:0.988 0/1/1/1:4:46,123:0.71: 0.28:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,136:0.78: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,44:0.25: 0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:138,43:0.25: 0.57:0.999:1.000 0/1/1/1:4:36,166:0.81: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,24:0.23:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,111:0.55: 0.97:1.000:0.978 0/1/1/1:4:35,111:0.74:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,126:0.72: 0.35:1.000:0.995 0/0/1/1:4:88,89:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,95:0.58: 0.07:1.000:0.897 0/1/1/1:4:40,134:0.75: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,83:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:152,62:0.30: 1.35:1.000:0.989 0/0/0/1:4:72,27:0.28:-1.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,113:0.79:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,73:0.44: 0.16:1.000:0.970 0/1/1/1:4:52,135:0.71: 0.71:1.000:0.990 0/0/1/1:4:99,92:0.48: 0.80:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,122:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,101:0.73:-0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:79,82:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:36,98:0.72:-0.55:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,80:0.76:-1.28:0.989:1.000 0/0/1/1:4:63,74:0.53:-0.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,74:0.54:-0.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:71,81:0.53:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:86,105:0.54: 0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:69,62:0.47:-0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:98,37:0.28:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:84,68:0.44:-0.12:1.000:0.973 0/1/1/1:4:44,121:0.72: 0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,125:0.72: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,68:0.55:-0.85:1.000:0.976 0/0/0/1:4:130,41:0.25: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:124,49:0.29: 0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:69,85:0.54:-0.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:73,85:0.53: 0.02:1.000:0.992 0/1/1/1:4:27,124:0.81:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,68:0.47:-0.31:1.000:0.991 0/0/0/1:4:129,43:0.26: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,82:0.54:-0.17:1.000:0.988 0/0/1/1:4:50,65:0.56:-1.00:1.000:0.973 0/0/1/1:4:16,11:0.41:-3.08:1.000:0.840 0/0/1/1:4:47,53:0.52:-1.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:177,66:0.28: 2.03:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,49:0.32:-0.07:1.000:0.948 0/1/1/1:4:28,112:0.79:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,136:0.77: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,79:0.55:-0.38:1.000:0.978 0/0/0/0:4:160,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,114:0.74:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,56:0.42:-0.59:1.000:0.922 0/0/1/1:4:77,68:0.46:-0.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:84,82:0.49: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,50:0.54:-1.54:1.000:0.990 0/0/1/1:4:73,73:0.49:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,74:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,61:0.49:-0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,50:0.45:-1.09:1.000:0.977 0/1/1/1:4:31,92:0.73:-0.81:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,29:0.31:-1.47:1.000:0.974 0/1/1/1:4:36,111:0.74:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,73:0.49:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,64:0.53:-0.90:1.000:0.992 0/0/0/1:4:122,52:0.30: 0.40:1.000:0.981 0/1/1/1:4:27,115:0.80:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,68:0.44:-0.12:1.000:0.973 0/0/1/1:4:92,87:0.48: 0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:116,34:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,55:0.45:-0.88:1.000:0.984 0/1/1/1:4:29,105:0.77:-0.55:0.956:1.000 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,127:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,75:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,67:0.55:-0.85:1.000:0.984 -chr8.1 26571037 chr8.1_026571037 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:219,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:254,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.49:0.999:. ./.:4:149,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:150,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:268,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.59:1.000:. ./.:3:8,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.48:1.000:. ./.:5:276,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.55:1.000:. ./.:6:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.12:0.887:. ./.:4:195,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.68:0.999:. ./.:4:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.79:0.968:. ./.:4:140,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:153,2:.: 0.48:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:203,0:.: 1.35:0.984:. ./.:4:76,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:221,0:.: 1.67:0.993:. ./.:4:192,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:232,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.16:0.999:. ./.:4:157,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:288,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.15:0.989:. ./.:4:193,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:255,1:.: 2.31:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.99:0.956:. ./.:4:152,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.46:1.000:. -chr8.1 27181477 chr8.1_027181477 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:181,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:73,35:.:-0.59:1.000:. ./.:4:126,43:.: 1.08:1.000:. ./.:4:107,38:.: 0.42:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:103,78:.: 1.41:1.000:. ./.:4:24,33:.:-1.98:1.000:. ./.:4:72,78:.: 0.56:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.83:1.000:. ./.:4:28,6:.:-2.61:1.000:. ./.:4:123,32:.: 0.70:1.000:. ./.:4:109,40:.: 0.53:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:124,45:.: 1.08:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.97:0.999:. ./.:4:163,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:121,32:.: 0.64:1.000:. ./.:4:129,31:.: 0.83:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:118,44:.: 0.89:1.000:. ./.:4:82,77:.: 0.81:1.000:. ./.:4:52,58:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,8:.:-3.27:1.000:. ./.:4:120,26:.: 0.45:1.000:. ./.:4:127,48:.: 1.24:1.000:. ./.:4:107,42:.: 0.53:1.000:. ./.:4:122,38:.: 0.83:1.000:. ./.:4:134,23:.: 0.75:1.000:. ./.:4:78,76:.: 0.67:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:12,1:.:-3.18:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.86:1.000:. ./.:3:3,5:.:-3.32:1.000:. ./.:4:138,55:.: 1.74:1.000:. ./.:4:69,77:.: 0.45:1.000:. ./.:4:93,83:.: 1.27:1.000:. ./.:4:99,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:101,35:.: 0.18:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:102,28:.: 0.01:1.000:. ./.:4:64,68:.: 0.07:1.000:. ./.:4:89,44:.: 0.10:1.000:. ./.:4:99,28:.:-0.07:1.000:. ./.:5:158,36:.: 1.76:1.000:. ./.:4:49,12:.:-1.87:1.000:. ./.:4:87,21:.:-0.59:1.000:. ./.:4:53,40:.:-1.00:1.000:. ./.:4:63,26:.:-1.11:1.000:. ./.:4:122,37:.: 0.81:1.000:. ./.:4:99,32:.: 0.04:1.000:. ./.:4:106,33:.: 0.26:1.000:. ./.:4:76,76:.: 0.62:1.000:. ./.:4:94,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:97,21:.:-0.31:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:109,40:.: 0.53:1.000:. ./.:6:101,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:89,31:.:-0.26:1.000:. ./.:4:99,35:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,23:.:-0.75:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:54,66:.:-0.26:1.000:. ./.:4:39,16:.:-2.04:1.000:. ./.:4:94,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:73,24:.:-0.89:0.887:. ./.:4:94,29:.:-0.18:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:43,31:.:-1.52:0.999:. ./.:4:69,66:.: 0.15:1.000:. ./.:4:131,34:.: 0.97:1.000:. ./.:4:91,26:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,52:.:-0.97:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:53,69:.:-0.20:1.000:. ./.:4:111,27:.: 0.23:1.000:. ./.:4:123,27:.: 0.56:1.000:. ./.:4:86,36:.:-0.20:0.968:. ./.:4:129,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,38:.: 0.34:1.000:. ./.:4:80,34:.:-0.42:1.000:. ./.:4:79,62:.: 0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:43,50:.:-1.00:1.000:. ./.:4:112,33:.: 0.42:1.000:. ./.:4:153,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:127,19:.: 0.45:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:49,63:.:-0.48:1.000:. ./.:4:76,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:57,59:.:-0.37:1.000:. ./.:4:81,25:.:-0.64:1.000:. ./.:4:110,31:.: 0.31:1.000:. ./.:4:38,25:.:-1.82:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:95,1:.:-0.92:1.000:. ./.:4:107,40:.: 0.48:0.984:. ./.:4:92,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:140,49:.: 1.63:0.993:. ./.:4:90,77:.: 1.03:1.000:. ./.:4:63,53:.:-0.37:1.000:. ./.:4:223,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:90,31:.:-0.23:0.999:. ./.:4:100,35:.: 0.15:1.000:. ./.:4:77,22:.:-0.83:1.000:. ./.:4:97,33:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,47:.:-1.19:1.000:. ./.:4:45,52:.:-0.89:1.000:. ./.:4:89,24:.:-0.45:1.000:. ./.:4:79,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:111,24:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:105,32:.: 0.21:1.000:. ./.:4:120,46:.: 1.00:1.000:. ./.:4:59,37:.:-0.92:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:65,76:.: 0.31:1.000:. ./.:4:54,63:.:-0.34:1.000:. ./.:4:59,34:.:-1.00:1.000:. ./.:4:74,25:.:-0.83:1.000:. ./.:4:72,41:.:-0.45:1.000:. ./.:4:82,82:.: 0.94:1.000:. ./.:4:47,41:.:-1.13:0.989:. ./.:4:65,44:.:-0.56:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:115,28:.: 0.37:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:75,22:.:-0.89:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:103,23:.:-0.10:1.000:. ./.:4:59,48:.:-0.61:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:146,43:.: 1.63:1.000:. ./.:4:115,47:.: 0.89:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:115,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,36:.: 1.33:1.000:. ./.:4:96,23:.:-0.29:1.000:. ./.:4:145,43:.: 1.60:1.000:. ./.:4:117,49:.: 1.00:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.94:1.000:. ./.:4:120,30:.: 0.56:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:127,32:.: 0.81:1.000:. ./.:4:91,58:.: 0.53:1.000:. ./.:4:103,32:.: 0.15:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:115,27:.: 0.34:1.000:. ./.:4:68,61:.:-0.01:1.000:. ./.:4:100,28:.:-0.04:1.000:. ./.:4:125,26:.: 0.59:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:84,61:.: 0.42:1.000:. ./.:4:105,35:.: 0.29:1.000:. ./.:4:66,79:.: 0.42:1.000:. ./.:4:67,55:.:-0.20:1.000:. ./.:4:71,76:.: 0.48:1.000:. ./.:4:94,35:.:-0.01:1.000:. ./.:4:65,51:.:-0.37:1.000:. ./.:4:80,53:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,68:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,22:.:-0.75:1.000:. ./.:4:55,75:.: 0.01:1.000:. ./.:4:83,75:.: 0.78:1.000:. ./.:4:134,41:.: 1.24:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:93,40:.: 0.10:1.000:. ./.:4:83,71:.: 0.67:0.956:. ./.:4:89,74:.: 0.92:1.000:. ./.:4:85,80:.: 0.97:1.000:. ./.:4:96,31:.:-0.07:1.000:. ./.:4:113,38:.: 0.59:1.000:. -chr8.1 27219990 chr8.1_027219990 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:349,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:188,1:.:-1.89:1.000:. ./.:4:307,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.35:0.999:. ./.:4:335,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:282,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:119,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:109,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:199,0:.:-1.72:1.000:. ./.:3:69,0:.:-3.91:1.000:. ./.:4:318,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:384,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:368,1:.: 1.14:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:318,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:362,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.83:1.000:. ./.:5:454,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:76,0:.:-3.79:1.000:. ./.:4:333,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:397,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:301,2:.: 0.03:1.000:. ./.:6:269,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:305,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:407,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:229,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.08:0.887:. ./.:4:280,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:380,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:382,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:330,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:263,1:.:-0.63:0.968:. ./.:4:376,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:216,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:387,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:231,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:412,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.13:0.984:. ./.:4:260,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.52:0.993:. ./.:4:324,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:401,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:331,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:331,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:278,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:287,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:350,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:163,0:.:-2.33:0.989:. ./.:4:323,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:394,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:346,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:235,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:399,1:.: 1.66:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:184,1:.:-1.96:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:251,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:295,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:272,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:242,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.19:0.956:. ./.:4:372,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.66:1.000:. -chr8.1 27812745 chr8.1_027812745 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:452,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:211,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:392,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:252,9:.:-0.61:1.000:. ./.:4:207,46:.:-0.68:1.000:. ./.:4:372,10:.: 0.45:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:296,11:.:-0.21:1.000:. ./.:4:209,27:.:-0.83:1.000:. ./.:4:109,56:.:-1.46:1.000:. ./.:4:112,3:.:-1.90:1.000:. ./.:4:302,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:235,27:.:-0.61:1.000:. ./.:4:249,25:.:-0.50:1.000:. ./.:4:254,20:.:-0.50:1.000:. ./.:4:206,6:.:-1.04:1.000:. ./.:4:281,15:.:-0.31:0.999:. ./.:4:313,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:504,19:.: 1.69:1.000:. ./.:4:368,26:.: 0.55:1.000:. ./.:4:121,14:.:-1.72:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:491,13:.: 1.52:1.000:. ./.:4:492,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:56,8:.:-2.34:1.000:. ./.:4:426,16:.: 0.98:1.000:. ./.:4:287,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:226,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:535,25:.: 2.01:1.000:. ./.:4:353,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:408,16:.: 0.82:1.000:. ./.:4:179,19:.:-1.17:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:82,48:.:-1.76:1.000:. ./.:3:91,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:335,17:.: 0.18:1.000:. ./.:4:516,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:475,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:269,15:.:-0.41:1.000:. ./.:4:224,31:.:-0.67:1.000:. ./.:4:406,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:337,29:.: 0.31:1.000:. ./.:4:511,2:.: 1.60:1.000:. ./.:4:387,31:.: 0.76:1.000:. ./.:4:293,64:.: 0.23:1.000:. ./.:4:330,54:.: 0.47:1.000:. ./.:5:533,42:.: 2.14:1.000:. ./.:4:27,8:.:-2.60:1.000:. ./.:4:242,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:246,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:385,22:.: 0.67:1.000:. ./.:4:517,20:.: 1.81:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:444,23:.: 1.19:1.000:. ./.:4:297,18:.:-0.14:1.000:. ./.:4:262,19:.:-0.44:1.000:. ./.:4:147,30:.:-1.35:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:360,26:.: 0.48:1.000:. ./.:6:303,8:.:-0.18:1.000:. ./.:4:316,35:.: 0.18:1.000:. ./.:4:273,20:.:-0.33:1.000:. ./.:4:322,51:.: 0.37:1.000:. ./.:4:174,47:.:-0.97:1.000:. ./.:4:323,46:.: 0.33:1.000:. ./.:4:393,25:.: 0.76:1.000:. ./.:4:232,38:.:-0.54:1.000:. ./.:4:187,37:.:-0.94:1.000:. ./.:4:302,24:.:-0.04:0.887:. ./.:4:286,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:436,40:.: 1.27:1.000:. ./.:4:465,12:.: 1.28:0.999:. ./.:4:587,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:279,18:.:-0.30:1.000:. ./.:4:282,25:.:-0.21:1.000:. ./.:4:368,21:.: 0.51:1.000:. ./.:4:390,22:.: 0.71:1.000:. ./.:4:471,23:.: 1.43:1.000:. ./.:4:158,57:.:-1.02:1.000:. ./.:4:291,17:.:-0.20:1.000:. ./.:4:303,21:.:-0.06:0.968:. ./.:4:309,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:358,36:.: 0.55:1.000:. ./.:4:324,20:.: 0.11:1.000:. ./.:4:270,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:308,30:.: 0.06:1.000:. ./.:4:109,38:.:-1.62:1.000:. ./.:4:151,60:.:-1.05:1.000:. ./.:4:303,28:.: 0.00:1.000:. ./.:4:225,31:.:-0.66:1.000:. ./.:4:446,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:414,26:.: 0.96:1.000:. ./.:4:216,11:.:-0.91:1.000:. ./.:4:291,29:.:-0.10:1.000:. ./.:4:282,17:.:-0.28:1.000:. ./.:4:163,70:.:-0.86:1.000:. ./.:4:232,17:.:-0.72:1.000:. ./.:4:576,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:417,17:.: 0.90:1.000:. ./.:4:477,26:.: 1.51:1.000:. ./.:4:164,58:.:-0.96:1.000:. ./.:4:266,25:.:-0.35:1.000:. ./.:4:307,36:.: 0.11:0.984:. ./.:4:223,50:.:-0.51:1.000:. ./.:4:142,34:.:-1.36:1.000:. ./.:4:144,51:.:-1.19:1.000:. ./.:4:130,20:.:-1.59:1.000:. ./.:4:403,47:.: 1.05:0.993:. ./.:4:305,26:.: 0.00:1.000:. ./.:4:318,34:.: 0.18:1.000:. ./.:4:172,48:.:-0.97:1.000:. ./.:4:333,33:.: 0.31:0.999:. ./.:4:444,34:.: 1.29:1.000:. ./.:4:174,17:.:-1.23:1.000:. ./.:4:451,22:.: 1.25:1.000:. ./.:4:281,28:.:-0.19:1.000:. ./.:4:285,47:.: 0.01:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:248,65:.:-0.16:1.000:. ./.:4:312,26:.: 0.06:1.000:. ./.:4:255,53:.:-0.20:1.000:. ./.:4:346,41:.: 0.49:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:526,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:314,44:.: 0.24:1.000:. ./.:4:266,56:.:-0.08:1.000:. ./.:4:268,17:.:-0.40:1.000:. ./.:4:359,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:318,25:.: 0.11:1.000:. ./.:4:400,31:.: 0.88:1.000:. ./.:4:257,17:.:-0.50:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.39:0.989:. ./.:4:334,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:255,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:309,9:.:-0.11:1.000:. ./.:4:164,36:.:-1.15:1.000:. ./.:4:265,25:.:-0.36:1.000:. ./.:4:269,24:.:-0.33:1.000:. ./.:4:215,55:.:-0.54:1.000:. ./.:4:297,25:.:-0.08:1.000:. ./.:4:263,58:.:-0.09:1.000:. ./.:4:218,24:.:-0.78:1.000:. ./.:4:98,45:.:-1.65:1.000:. ./.:4:379,26:.: 0.65:1.000:. ./.:4:640,1:.: 2.72:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:275,30:.:-0.23:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:278,23:.:-0.26:1.000:. ./.:4:392,20:.: 0.71:1.000:. ./.:4:243,27:.:-0.54:1.000:. ./.:4:87,1:.:-2.13:1.000:. ./.:4:228,19:.:-0.74:1.000:. ./.:4:292,21:.:-0.16:1.000:. ./.:4:188,41:.:-0.90:1.000:. ./.:4:282,38:.:-0.10:1.000:. ./.:4:572,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:485,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:271,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:246,13:.:-0.63:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:218,37:.:-0.67:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:137,4:.:-1.67:1.000:. ./.:4:369,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:237,11:.:-0.73:1.000:. ./.:4:241,17:.:-0.64:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:470,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:291,10:.:-0.26:1.000:. ./.:4:418,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:422,18:.: 0.96:1.000:. ./.:4:335,18:.: 0.19:1.000:. ./.:4:255,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:209,25:.:-0.85:1.000:. ./.:4:395,11:.: 0.66:1.000:. ./.:4:244,48:.:-0.34:1.000:. ./.:4:135,30:.:-1.46:1.000:. ./.:4:163,19:.:-1.31:1.000:. ./.:4:297,23:.:-0.10:0.956:. ./.:4:502,12:.: 1.61:1.000:. ./.:4:627,0:.: 2.60:1.000:. ./.:4:228,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:316,16:.: 0.01:1.000:. -chr8.1 27985709 chr8.1_027985709 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:66,118:0.57: 0.54:1.000:0.936 0/1/1/1:4:15,105:0.83:-0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,93:0.57:-0.18:1.000:0.958 0/0/1/1:4:62,122:0.59: 0.54:1.000:0.831 0/1/1/1:4:54,192:0.71: 1.74:1.000:0.992 0/0/0/1:4:163,56:0.25: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,31:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,118:0.53: 0.79:1.000:0.991 0/0/1/1:4:74,111:0.53: 0.56:1.000:0.991 0/1/1/1:4:4,34:0.85:-2.30:1.000:0.984 0/0/1/1:4:15,12:0.40:-2.52:1.000:0.808 0/1/1/1:4:18,91:0.77:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,93:0.58:-0.26:1.000:0.903 1/1/1/1:4:11,182:0.92: 0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:65,115:0.57: 0.46:1.000:0.943 1/1/1/1:4:5,189:0.96: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1:4:8,171:0.94: 0.44:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,287:1.00: 2.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:168,58:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:128,107:0.41: 1.53:1.000:0.869 0/0/1/1:4:16,36:0.62:-2.03:1.000:0.522 0/0/1/1:4:50,106:0.61:-0.01:1.000:0.680 0/0/0/1:4:74,44:0.34:-0.75:1.000:0.839 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.43:-2.52:1.000:0.951 0/0/0/1:4:133,62:0.30: 0.75:1.000:0.985 0/1/1/1:4:16,130:0.85:-0.20:1.000:0.991 1/1/1/1:4:7,138:0.93:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,99:0.47: 0.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:169,57:0.25: 1.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,60:0.36:-0.08:1.000:0.665 1/1/1/1:4:9,172:0.93: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,17:0.42:-2.34:1.000:0.930 0/1/1/1:4:10,46:0.75:-1.95:1.000:0.999 0/0/0:3:6,0:0.00:-2.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,47:0.36:-0.75:1.000:0.630 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,62:0.43:-0.49:1.000:0.933 0/1/1/1:4:16,154:0.87: 0.27:1.000:0.924 1/1/1/1:4:8,173:0.94: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,102:0.59:-0.01:1.000:0.887 1/1/1/1:4:8,169:0.94: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,115:0.50: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,47:0.34:-0.57:1.000:0.855 0/0/1/1:4:41,75:0.58:-0.78:1.000:0.919 0/0/1/1:4:70,100:0.52: 0.27:1.000:0.995 0/0/1/1/1:5:48,155:0.69: 0.91:1.000:0.568 0/0/1/1:4:45,53:0.48:-1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,106:0.55: 0.30:1.000:0.981 0/0/0/1:4:92,47:0.32:-0.34:1.000:0.962 0/0/1/1:4:44,82:0.58:-0.59:1.000:0.901 0/0/0/1:4:171,59:0.25: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,91:0.54:-0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:75,109:0.53: 0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:79,126:0.55: 0.95:1.000:0.982 0/0/1/1:4:109,142:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:64,158:0.64: 1.28:1.000:0.718 0/0/1/1:4:62,94:0.54:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:87,87:0.45: 0.34:1.000:0.976 0/1/1/1/1/1:6:17,100:0.80:-0.77:1.000:0.909 0/1/1/1:4:11,97:0.86:-0.94:1.000:0.975 0/0/1/1:4:49,106:0.62:-0.03:1.000:0.629 1/1/1/1:4:11,157:0.91: 0.23:1.000:0.931 0/0/1/1:4:59,119:0.60: 0.42:1.000:0.788 0/1/1/1:4:46,114:0.64: 0.07:1.000:0.726 0/0/0/1:4:146,64:0.29: 1.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,63:0.53:-1.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:60,124:0.61: 0.54:1.000:0.739 0/0/1/1:4:115,86:0.39: 0.87:0.887:0.676 0/1/1/1:4:11,88:0.84:-1.12:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,119:0.87:-0.49:1.000:0.892 0/0/1/1:4:61,67:0.47:-0.55:0.999:0.990 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,120:0.56: 0.67:1.000:0.966 0/1/1/1:4:17,92:0.78:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,55:0.33:-0.03:1.000:0.921 0/0/1/1:4:52,85:0.55:-0.38:1.000:0.976 0/0/0/1:4:128,38:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,153:0.60: 1.39:1.000:0.766 0/1/1/1:4:63,166:0.66: 1.41:1.000:0.838 0/0/1/1:4:17,38:0.62:-1.97:0.968:0.541 0/1/1/1:4:44,100:0.63:-0.24:1.000:0.505 0/0/1/1:4:64,113:0.57: 0.40:1.000:0.944 0/0/1/1:4:39,40:0.45:-1.50:1.000:0.982 0/1/1/1:4:19,97:0.77:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,101:0.47: 0.63:1.000:0.994 0/1/1/1:4:48,110:0.63: 0.03:1.000:0.528 0/1/1/1:4:43,115:0.66: 0.03:1.000:0.858 0/1/1/1:4:34,134:0.73: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:58,103:0.57: 0.09:1.000:0.941 0/0/0/1:4:104,33:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,104:0.55: 0.23:1.000:0.978 0/0/1/1:4:65,94:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/0/1/1:4:66,83:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,105:0.60:-0.01:1.000:0.747 0/0/1/1:4:90,99:0.47: 0.63:1.000:0.991 0/0/1/1:4:62,114:0.58: 0.38:1.000:0.914 0/1/1/1:4:12,78:0.81:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,43:0.41:-1.19:1.000:0.855 0/0/1/1:4:58,44:0.39:-1.06:1.000:0.708 0/0/1/1:4:22,38:0.57:-1.87:1.000:0.956 0/1/1/1:4:43,147:0.70: 0.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:31,66:0.61:-1.15:1.000:0.670 0/0/1/1:4:57,89:0.54:-0.20:0.984:0.986 0/1/1/1:4:14,99:0.83:-0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,156:0.69: 0.95:1.000:0.975 0/1/1/1:4:49,137:0.67: 0.58:1.000:0.907 1/1/1/1:4:0,187:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,123:0.57: 0.71:0.993:0.947 0/0/1/1:4:87,109:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,92:0.47: 0.30:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,288:1.00: 2.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,68:0.40:-0.08:0.999:0.826 0/0/0/1:4:57,38:0.37:-1.19:1.000:0.612 0/0/1/1:4:85,68:0.40:-0.07:1.000:0.808 0/0/0/1:4:111,34:0.23:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,75:0.51:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,78:0.47:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:109,35:0.24:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,94:0.62:-0.40:1.000:0.537 0/0/1/1:4:75,103:0.51: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:63,76:0.48:-0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,136:0.57: 1.12:1.000:0.952 0/0/1/1:4:51,113:0.62: 0.15:1.000:0.565 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,89:0.59:-0.42:1.000:0.857 0/0/1/1:4:72,80:0.47:-0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,76:0.77:-1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,23:0.37:-1.93:1.000:0.576 0/0/0/1:4:128,46:0.26: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,98:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-1.19:0.989:1.000 0/0/0/1:4:102,52:0.32:-0.05:1.000:0.963 1/1/1/1:4:10,135:0.90:-0.22:1.000:0.868 0/0/1/1:4:65,145:0.62: 1.04:1.000:0.546 0/0/1/1:4:65,138:0.61: 0.91:1.000:0.677 1/1/1/1:4:6,113:0.93:-0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,72:0.40: 0.13:1.000:0.789 0/0/1/1:4:48,69:0.52:-0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:61,99:0.55: 0.07:1.000:0.978 0/0/1/1:4:62,64:0.45:-0.59:1.000:0.983 0/0/1/1:4:46,94:0.60:-0.32:1.000:0.763 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,133:0.44: 2.27:1.000:0.961 0/0/0/1:4:139,48:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,101:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,119:0.51: 0.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:178,65:0.26: 1.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,85:0.39: 0.79:1.000:0.709 0/0/1/1:4:83,119:0.52: 0.89:1.000:0.994 1/1/1/1:4:5,168:0.96: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.53:-2.55:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,72:0.56:-0.82:1.000:0.960 0/0/1/1:4:71,161:0.63: 1.47:1.000:0.501 1/1/1/1:4:0,202:1.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,113:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,47:0.48:-1.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:75,190:0.65: 2.11:1.000:0.771 0/0/1/1:4:74,130:0.57: 0.93:1.000:0.947 0/0/1/1:4:79,96:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,101:0.57: 0.05:1.000:0.952 0/0/1/1:4:75,108:0.52: 0.52:1.000:0.994 1/1/1/1:4:10,170:0.92: 0.46:1.000:0.992 0/0/0/1:4:140,69:0.31: 1.02:1.000:0.974 1/1/1/1:4:2,119:0.98:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,76:0.87:-1.41:1.000:0.935 0/0/0/1:4:132,50:0.27: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,47:0.34:-0.57:1.000:0.855 0/0/1/1:4:48,82:0.56:-0.51:1.000:0.961 0/0/0/0:4:124,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,31:0.21:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,98:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,154:0.60: 1.47:1.000:0.826 0/0/1/1:4:59,94:0.55:-0.07:1.000:0.982 0/0/1/1:4:102,127:0.49: 1.41:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,88:0.53:-0.16:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,150:0.62: 1.20:1.000:0.577 0/0/1/1:4:86,103:0.48: 0.63:0.956:0.995 0/0/0/1:4:103,57:0.33: 0.07:1.000:0.917 0/0/0/1:4:91,55:0.35:-0.20:1.000:0.814 0/0/1/1:4:49,88:0.57:-0.38:1.000:0.933 1/1/1/1:4:9,123:0.90:-0.47:1.000:0.885 -chr8.1 28041599 chr8.1_028041599 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:75,47:0.40: 0.86:1.000:0.815 0/1/1/1:4:20,58:0.75:-0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,64:0.75:-0.49:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,24:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,71:0.59: 0.90:1.000:0.853 0/0/1/1:4:40,34:0.48:-0.93:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,24:0.53:-1.94:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,42:0.43: 0.15:1.000:0.935 0/0/0/1:4:51,19:0.29:-1.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:28,7:0.22:-2.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,3:0.10:-2.28:1.000:0.866 0/0/1/1:4:66,70:0.53: 1.38:1.000:0.991 0/0/1/1:4:38,41:0.54:-0.75:1.000:0.989 0/0/1/1:4:45,47:0.53:-0.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:47,21:0.32:-1.16:1.000:0.939 0/1/1/1:4:25,65:0.73:-0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,51:0.46: 0.63:0.999:0.987 0/1/1/1:4:20,68:0.78:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,29:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:49,60:0.57: 0.37:1.000:0.955 0/0/1/1:4:11,15:0.59:-2.72:1.000:0.855 0/1/1/1:4:20,73:0.79:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,38:0.31: 1.16:1.000:0.976 0/0/0/1:4:61,20:0.26:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,4:0.42:-3.32:1.000:0.905 0/0/0/1:4:85,23:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,34:0.43:-0.60:1.000:0.941 0/1/1/1:4:28,58:0.68:-0.49:1.000:0.963 0/0/1/1:4:56,64:0.55: 0.78:1.000:0.980 0/0/0/1:4:75,12:0.15:-0.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:89,20:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,30:0.47:-1.19:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-3.17:1.000:0.977 0/0/1/1:4:22,17:0.45:-2.24:1.000:0.984 0/0/1:3:13,4:0.25:-3.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,20:0.26:-0.63:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,18:0.20:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,38:0.39: 0.07:1.000:0.732 0/1/1/1:4:44,86:0.67: 1.16:1.000:0.927 0/0/1/1:4:60,56:0.50: 0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,71:0.78:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,57:0.55: 0.26:1.000:0.975 0/0/1/1:4:73,47:0.41: 0.78:1.000:0.861 0/0/0/1:4:75,25:0.26: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,75:0.56: 1.49:1.000:0.973 0/0/0/1:4:81,23:0.24: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:50,77:0.62: 1.04:1.000:0.965 0/0/0/1:4:212,44:0.19: 5.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,26:0.27: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,45:0.42: 0.52:1.000:0.897 0/1/1/1:4:18,49:0.74:-1.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,28:0.24: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,74:0.72: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:69,50:0.44: 0.75:1.000:0.965 0/0/1/1:4:60,39:0.41: 0.00:1.000:0.874 0/0/0/1:4:85,34:0.30: 0.75:1.000:0.984 0/0/1/1:4:51,52:0.52: 0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,48:0.43: 0.67:1.000:0.942 0/0/1/1:4:71,63:0.49: 1.31:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:69,53:0.45: 0.86:1.000:0.762 0/0/1/1:4:69,50:0.44: 0.75:1.000:0.965 0/0/1/1:4:58,55:0.51: 0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,81:0.73: 0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:66,47:0.43: 0.52:1.000:0.956 0/0/0/1:4:85,24:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,65:0.56: 0.78:1.000:0.970 0/0/0/1:4:66,25:0.29:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:56,48:0.48: 0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,43:0.43: 0.22:0.887:0.940 0/1/1/1:4:28,62:0.70:-0.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:58,56:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,57:0.75:-0.82:0.999:0.999 0/0/1/1:4:53,43:0.47:-0.11:1.000:0.991 0/0/0/1:4:84,32:0.29: 0.63:1.000:0.991 0/1/1/1:4:28,81:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,25:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,45:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,64:0.54: 0.86:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,62:0.49: 1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,91:0.73: 1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,31:0.36:-0.30:0.968:0.717 0/0/0/1:4:84,15:0.17: 0.00:1.000:0.998 0/0/0/1:4:101,34:0.27: 1.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,27:0.31:-0.22:1.000:0.979 0/0/1/1:4:57,64:0.55: 0.82:1.000:0.983 0/0/1/1:4:57,55:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,37:0.48:-0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:46,36:0.46:-0.63:1.000:0.986 0/1/1/1:4:21,64:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,24:0.28:-0.34:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,45:0.52:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,66:0.68: 0.00:1.000:0.944 0/0/1/1:4:64,56:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:65,9:0.14:-0.93:1.000:0.962 0/0/0/1:4:83,32:0.29: 0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:81,59:0.44: 1.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:56,48:0.48: 0.19:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,121:1.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,55:0.47: 0.90:1.000:0.991 0/0/0/1:4:84,22:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,57:0.77:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,72:0.58: 1.08:1.000:0.923 0/0/1/1:4:44,45:0.52:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,61:0.54: 0.67:0.984:0.988 0/0/1/1:4:53,33:0.40:-0.49:1.000:0.802 0/0/1/1:4:54,56:0.53: 0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:57,62:0.54: 0.75:1.000:0.988 0/1/1/1:4:25,72:0.75:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,60:0.62: 0.00:0.993:0.582 0/0/1/1:4:61,47:0.45: 0.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:55,41:0.45:-0.11:1.000:0.975 0/1/1/1:4:21,65:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,42:0.47:-0.22:0.999:0.992 0/0/0/1:4:88,43:0.34: 1.19:1.000:0.836 0/0/1/1:4:62,43:0.43: 0.22:1.000:0.940 0/0/0/1:4:83,32:0.29: 0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:40,48:0.56:-0.41:1.000:0.964 0/0/1/1:4:53,49:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:66,25:0.29:-0.30:1.000:0.992 0/0/1/1:4:60,43:0.44: 0.15:1.000:0.960 0/0/0/1:4:74,34:0.33: 0.34:1.000:0.916 0/0/0/1:4:83,26:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:39,90:0.71: 1.12:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,63:0.79:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,22:0.22: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,28:0.28: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,60:0.53: 0.67:1.000:0.992 1/1/1/1:4:1,67:0.99:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,16:0.21:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,16:0.22:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,53:0.61:-0.37:1.000:0.702 0/0/1/1:4:58,58:0.52: 0.63:1.000:0.995 0/0/0/1:4:80,18:0.20:-0.04:0.989:1.000 0/0/1/1:4:64,38:0.39: 0.11:1.000:0.691 0/0/1/1:4:56,55:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:103,23:0.20: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,50:0.44: 0.71:1.000:0.970 0/1/1/1:4:29,93:0.77: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,46:0.53:-0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:97,27:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,24:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,46:0.44: 0.34:1.000:0.973 0/0/0/1:4:72,25:0.27:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,60:0.82:-0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,64:0.50: 1.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:93,25:0.23: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,49:0.45: 0.52:1.000:0.982 0/0/0/1:4:70,16:0.20:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,28:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,48:0.44: 0.60:1.000:0.959 0/0/1/1:4:63,50:0.46: 0.52:1.000:0.988 0/1/1/1:4:18,61:0.78:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,15:0.50:-2.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,33:0.60:-1.60:1.000:0.762 0/1/1/1:4:28,74:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,69:0.70: 0.04:1.000:0.984 0/0/0/1:4:94,26:0.23: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,20:0.26:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:55,40:0.44:-0.15:1.000:0.966 0/1/1/1:4:24,58:0.72:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:72,24:0.26:-0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,56:0.74:-0.86:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,53:0.57:-0.11:1.000:0.952 0/0/1/1:4:64,44:0.43: 0.34:1.000:0.934 0/0/1/1:4:58,49:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:34,43:0.57:-0.82:1.000:0.936 0/1/1/1:4:15,47:0.76:-1.38:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,28:0.40:-0.93:1.000:0.753 0/0/1/1:4:43,25:0.38:-1.16:1.000:0.632 0/1/1/1:4:16,51:0.77:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,16:0.27:-1.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,41:0.44:-0.04:1.000:0.961 0/1/1/1:4:32,84:0.73: 0.63:1.000:0.998 0/1/1/1:4:30,68:0.70:-0.04:1.000:0.987 0/0/1/1:4:39,45:0.55:-0.56:1.000:0.977 0/1/1/1:4:27,62:0.70:-0.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,71:0.55: 1.31:1.000:0.983 0/1/1/1:4:18,50:0.74:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,47:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,37:0.50:-0.82:0.956:0.997 0/0/0/1:4:109,27:0.21: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,50:0.48: 0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:40,41:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/1/1/1:4:28,63:0.70:-0.30:1.000:0.986 -chr8.1 28078352 chr8.1_028078352 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:245,69:0.26: 1.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,96:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,167:0.66: 0.49:1.000:0.869 0/0/1/1:4:111,99:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,155:0.53: 1.54:1.000:0.992 0/1/1/1:4:102,161:0.64: 0.52:1.000:0.649 0/0/1/1:4:77,47:0.43:-1.95:1.000:0.933 0/1/1/1:4:53,186:0.78: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,150:0.54: 1.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,61:0.71:-2.61:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,32:0.44:-2.70:1.000:0.962 0/0/1/1:4:119,149:0.59: 0.61:1.000:0.867 0/1/1/1:4:86,164:0.67: 0.29:1.000:0.934 0/1/1/1:4:65,162:0.72:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:157,126:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,172:0.81:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,109:0.53:-0.21:0.999:0.990 0/0/1/1:4:172,147:0.51: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:189,143:0.48: 1.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:137,155:0.57: 1.04:1.000:0.951 0/0/1/1:4:39,28:0.47:-2.97:1.000:0.991 0/0/1/1:4:124,98:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,204:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,91:0.44:-0.01:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-3.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,113:0.46: 0.72:1.000:0.988 0/1/1/1:4:77,201:0.73: 0.79:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,226:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,208:0.77: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,52:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,171:0.69: 0.33:1.000:0.977 0/1/1/1:4:60,145:0.72:-0.51:1.000:0.995 1/1/1/1:4:2,36:0.95:-3.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,36:0.40:-2.38:1.000:0.831 0/0/1:3:23,15:0.44:-3.48:1.000:0.980 0/0/1/1:4:149,116:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,108:0.48: 0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,154:0.72:-0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,159:0.80:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,187:0.71: 0.63:1.000:0.990 0/0/1/1:4:131,103:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,125:0.54: 0.31:1.000:0.987 0/0/1/1:4:138,116:0.51: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:70,165:0.71: 0.02:1.000:0.993 0/1/1/1:4:117,185:0.64: 1.22:1.000:0.654 0/1/1/1:4:73,206:0.74: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1/1:5:115,257:0.70: 2.46:1.000:0.544 0/0/1/1:4:142,98:0.46: 0.11:1.000:0.985 0/0/1/1:4:108,93:0.51:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,109:0.57:-0.53:1.000:0.943 0/0/1/1:4:113,162:0.62: 0.74:1.000:0.603 0/0/1/1:4:173,138:0.49: 1.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:132,120:0.52: 0.33:1.000:0.994 0/1/1/1:4:81,180:0.70: 0.49:1.000:0.987 0/1/1/1:4:35,155:0.82:-0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,103:0.55:-0.58:1.000:0.977 0/1/1/1:4:37,164:0.82:-0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:231,63:0.25: 1.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,174:0.71: 0.25:1.000:0.993 0/0/1/1/1/1:6:77,132:0.65:-0.44:1.000:0.905 0/0/1/1:4:145,150:0.55: 1.09:1.000:0.980 0/0/1/1:4:129,89:0.46:-0.28:1.000:0.985 1/1/1/1:4:1,257:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,162:0.81:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:187,116:0.43: 1.23:1.000:0.945 0/1/1/1:4:90,153:0.65: 0.17:1.000:0.805 0/1/1/1:4:49,108:0.70:-1.36:1.000:0.985 0/1/1/1:4:53,166:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,110:0.49: 0.27:0.887:0.996 0/0/0/1:4:151,48:0.28:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,194:0.68: 1.07:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-1.63:0.999:1.000 0/0/1/1:4:162,101:0.43: 0.52:1.000:0.948 0/0/1/1:4:98,116:0.58:-0.35:1.000:0.922 0/0/1/1:4:106,90:0.51:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,119:0.70:-1.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:150,121:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:123,171:0.61: 1.07:1.000:0.679 0/1/1/1:4:53,181:0.78: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,172:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,93:0.46:-0.17:0.968:0.990 0/0/0/1:4:217,73:0.29: 1.00:1.000:0.992 0/0/0/1:4:251,56:0.22: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,77:0.38:-0.14:1.000:0.626 0/1/1/1:4:57,126:0.70:-0.90:1.000:0.986 0/1/1/1:4:50,161:0.77:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,98:0.53:-0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:136,103:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:147,114:0.49: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:170,96:0.41: 0.58:1.000:0.837 0/0/1/1:4:116,65:0.40:-0.94:1.000:0.824 0/0/1/1:4:165,124:0.48: 0.98:1.000:0.995 0/0/1/1:4:185,134:0.47: 1.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:69,75:0.56:-1.60:1.000:0.967 0/0/0/1:4:218,64:0.26: 0.86:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,164:0.73:-0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:60,177:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,115:0.69:-1.13:1.000:0.975 0/0/1/1:4:181,115:0.44: 1.11:1.000:0.959 0/0/1/1:4:175,105:0.42: 0.82:1.000:0.918 0/0/1/1:4:87,129:0.62:-0.31:1.000:0.514 0/0/1/1:4:149,110:0.47: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:141,114:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,118:0.48: 0.68:0.984:0.995 0/1/1/1:4:52,171:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,102:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,101:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/1/1/1:4:54,161:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,183:0.64: 1.09:0.993:0.729 0/1/1/1:4:56,184:0.77: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,172:0.81:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,203:0.79: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,117:0.47: 0.79:0.999:0.992 0/0/1/1:4:174,120:0.46: 1.07:1.000:0.985 0/0/1/1:4:110,62:0.41:-1.10:1.000:0.834 0/0/1/1:4:186,117:0.43: 1.23:1.000:0.953 0/1/1/1:4:40,152:0.79:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,194:0.99:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:252,61:0.23: 1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,137:0.64:-0.17:1.000:0.644 0/0/1/1:4:135,125:0.53: 0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:197,121:0.43: 1.50:1.000:0.938 0/1/1/1:4:55,174:0.76:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,133:0.50: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:160,84:0.39: 0.18:1.000:0.672 0/0/1/1:4:203,112:0.40: 1.45:1.000:0.793 1/1/1/1:4:0,242:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,127:0.82:-1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:127,72:0.41:-0.62:1.000:0.844 0/0/1/1:4:116,106:0.52:-0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:91,106:0.57:-0.65:1.000:0.934 0/1/1/1:4:41,142:0.78:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,68:0.42:-0.90:0.989:0.903 0/0/0/1:4:149,66:0.35:-0.33:1.000:0.805 0/0/1/1:4:112,109:0.54:-0.23:1.000:0.989 0/0/0/1:4:228,76:0.29: 1.25:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,134:0.74:-0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,144:0.74:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,87:0.46:-0.44:1.000:0.990 0/0/1/1:4:171,125:0.47: 1.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:121,103:0.51:-0.17:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,238:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,118:0.47: 0.79:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,118:0.81:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,131:0.51: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:272,56:0.21: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,77:0.30: 1.02:1.000:0.982 0/1/1/1:4:63,157:0.72:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:262,54:0.21: 1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,114:0.53: 0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:73,195:0.73: 0.61:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,237:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,49:0.56:-2.47:1.000:0.973 0/1/1/1:4:67,118:0.66:-0.87:1.000:0.858 0/1/1/1:4:34,176:0.84:-0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:31,173:0.85:-0.53:1.000:0.988 0/1/1/1:4:70,202:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:146,124:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,102:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,130:0.52: 0.68:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,95:0.53:-0.67:1.000:0.992 0/1/1/1:4:43,121:0.74:-1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:74,134:0.66:-0.46:1.000:0.891 0/0/1/1:4:109,124:0.57:-0.01:1.000:0.948 0/0/1/1:4:120,99:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,84:0.46:-0.55:1.000:0.989 0/1/1/1:4:43,166:0.80:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,155:0.77:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,98:0.47:-0.03:1.000:0.993 0/1/1/1:4:71,177:0.72: 0.25:1.000:0.996 0/1/1/1:4:75,160:0.69: 0.02:1.000:0.979 0/0/1/1:4:131,66:0.38:-0.65:1.000:0.549 0/0/1/1:4:90,130:0.62:-0.24:1.000:0.584 1/1/1/1:4:0,199:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,140:0.84:-1.17:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,200:1.00:-0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,244:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,197:0.71: 0.90:1.000:0.989 0/1/1/1:4:52,163:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,171:0.80:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,172:0.78:-0.23:0.956:1.000 0/1/1/1:4:97,200:0.69: 1.13:1.000:0.971 0/1/1/1:4:92,242:0.73: 1.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:115,106:0.53:-0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:119,113:0.53:-0.03:1.000:0.992 -chr8.1 28190308 chr8.1_028190308 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:85,21:0.17: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,32:0.39:-0.21:1.000:0.712 0/0/0/1:4:44,26:0.37:-0.57:1.000:0.539 0/0/0/1:4:100,40:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,79:0.52: 1.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:75,25:0.22: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,9:0.16:-1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,40:0.35: 0.64:1.000:0.818 0/0/0/1:4:89,39:0.28: 1.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,5:0.52:-2.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:6,4:0.41:-2.26:1.000:0.878 0/0/0/1:4:85,35:0.26: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,32:0.29: 0.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:82,38:0.29: 0.84:1.000:0.990 0/0/1/1:4:82,49:0.38: 1.15:1.000:0.511 0/0/0/1:4:104,48:0.29: 1.74:1.000:0.990 0/0/0/1:4:88,39:0.28: 1.03:0.999:0.995 0/0/1/1:4:72,46:0.40: 0.78:1.000:0.773 0/0/0/1:4:83,27:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,55:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,6:0.52:-2.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:60,21:0.23:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,21:0.18: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,4:0.75:-2.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,15:0.17:-0.35:1.000:0.998 0/0/0/0:4:114,15:0.10: 1.09:1.000:0.760 0/0/1/1:4:69,45:0.40: 0.67:1.000:0.830 0/0/0/1:4:77,21:0.19: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,9:0.09:-0.01:1.000:0.962 0/0/0/1:4:85,20:0.17: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,30:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,1:0.22:-2.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-2.21:1.000:0.960 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,19:0.13: 1.17:1.000:0.865 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,35:0.44:-0.21:1.000:0.972 0/0/0/1:4:79,28:0.23: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,13:0.17:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:114,24:0.15: 1.34:1.000:0.990 0/0/0/1:4:64,14:0.16:-0.35:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,13:0.15:-0.37:1.000:0.985 0/0/0/1:4:47,25:0.34:-0.52:1.000:0.885 0/0/0/1:4:61,27:0.28:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:99,58:0.37: 1.88:1.000:0.951 0/0/0/0:4:39,5:0.10:-1.30:1.000:0.813 0/0/0/1:4:59,34:0.36: 0.08:1.000:0.646 0/0/0/1:4:25,5:0.15:-1.70:1.000:0.982 0/0/0/1:4:40,13:0.21:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,24:0.22: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,14:0.19:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,13:0.16:-0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:95,39:0.26: 1.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:82,36:0.28: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,46:0.40: 0.75:1.000:0.813 0/0/0/1:4:63,13:0.15:-0.40:1.000:0.987 0/0/0/1:4:41,14:0.22:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:42,10:0.17:-1.08:1.000:0.985 0/0/0/1:4:88,29:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,34:0.31: 0.36:1.000:0.968 0/0/0/1:4:54,26:0.31:-0.29:1.000:0.979 0/0/1/1:4:45,36:0.48:-0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:77,35:0.29: 0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:34,10:0.20:-1.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,17:0.28:-0.99:1.000:0.995 0/0/0/1:4:70,41:0.37: 0.58:1.000:0.578 0/0/0/1:4:35,20:0.36:-0.99:0.887:0.680 0/0/1/1:4:67,45:0.41: 0.61:1.000:0.891 0/0/0/0:4:91,10:0.09: 0.30:1.000:0.967 0/0/0/1:4:16,7:0.28:-1.90:0.999:0.996 0/0/0/0:4:80,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,46:0.27: 1.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,35:0.40:-0.01:1.000:0.760 0/0/0/1:4:68,12:0.13:-0.29:1.000:0.920 0/0/0/1:4:55,11:0.15:-0.68:1.000:0.982 0/0/0/1:4:35,20:0.36:-0.99:1.000:0.680 0/0/1/1:4:59,66:0.53: 0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:58,32:0.35:-0.01:1.000:0.799 0/0/0/1:4:43,14:0.21:-0.94:0.968:1.000 0/0/0/1:4:71,30:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,38:0.30: 0.78:1.000:0.984 0/0/0/1:4:86,20:0.17: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,17:0.28:-0.97:1.000:0.997 0/0/0/1:4:68,37:0.34: 0.41:1.000:0.836 0/0/1/1:4:47,42:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,49:0.57:-0.26:1.000:0.955 0/0/1/1:4:26,18:0.43:-1.30:1.000:0.933 0/0/0/1:4:74,41:0.35: 0.70:1.000:0.787 0/0/0/1:4:40,18:0.29:-0.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,17:0.22:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,17:0.20:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,27:0.23: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,34:0.31: 0.39:1.000:0.976 0/0/0/1:4:56,20:0.23:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,34:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,22:0.42:-1.02:1.000:0.925 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,24:0.16: 1.23:1.000:0.994 0/0/0/1:4:23,4:0.13:-1.78:1.000:0.906 0/0/1/1:4:46,59:0.55: 0.41:1.000:0.983 0/0/0/1:4:32,13:0.25:-1.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,34:0.27: 0.64:0.984:0.997 0/0/0/1:4:37,21:0.36:-0.91:1.000:0.705 0/0/1/1:4:47,60:0.55: 0.47:1.000:0.983 0/0/1/1:4:54,41:0.46: 0.13:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,55:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,43:0.30: 1.23:0.993:0.985 0/0/1/1:4:78,47:0.38: 0.98:1.000:0.547 0/0/0/1:4:62,28:0.29:-0.01:1.000:0.994 0/0/1/1:4:83,71:0.50: 1.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,30:0.51:-0.77:0.999:0.996 0/0/0/1:4:74,27:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,36:0.56:-0.85:1.000:0.960 0/0/0/1:4:57,17:0.20:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,38:0.42: 0.08:1.000:0.931 0/0/1/1:4:46,28:0.38:-0.46:1.000:0.591 0/0/0/1:4:57,21:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,33:0.42:-0.26:1.000:0.925 0/0/0/1:4:88,42:0.30: 1.12:1.000:0.982 0/0/0/1:4:47,23:0.31:-0.57:1.000:0.972 0/0/1/1:4:41,28:0.42:-0.60:1.000:0.917 0/0/0/1:4:74,26:0.23: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,25:0.21: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,23:0.38:-0.82:1.000:0.567 0/0/1/1:4:23,24:0.52:-1.22:1.000:0.994 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,10:0.16:-0.97:1.000:0.993 0/0/0/1:4:33,17:0.33:-1.13:1.000:0.932 0/0/0/1:4:86,50:0.37: 1.29:1.000:0.609 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.39:0.989:1.000 0/0/0/1:4:45,10:0.16:-0.99:1.000:0.995 0/0/0/1:4:110,43:0.25: 1.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:139,60:0.27: 3.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,56:0.52: 0.61:1.000:0.995 0/0/0/1:4:48,23:0.30:-0.54:1.000:0.981 0/0/1/1:4:24,31:0.55:-0.99:1.000:0.982 0/0/1/1:4:48,29:0.38:-0.37:1.000:0.559 0/0/1/1:4:43,50:0.54: 0.08:1.000:0.990 0/0/0/1:4:55,17:0.21:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,41:0.34: 0.75:1.000:0.856 0/0/1/1:4:31,26:0.49:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:64,49:0.46: 0.64:1.000:0.988 0/0/0/1:4:106,19:0.13: 0.98:1.000:0.933 0/0/0/1:4:105,30:0.19: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,42:0.25: 1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:125,31:0.17: 1.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,44:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,27:0.21: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,39:0.30: 0.87:1.000:0.983 0/0/0/1:4:7,2:0.19:-2.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,36:0.39: 0.08:1.000:0.735 0/0/1/1:4:53,36:0.42:-0.04:1.000:0.909 0/0/1/1:4:72,70:0.51: 1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:106,36:0.22: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,51:0.47: 0.70:1.000:0.994 0/0/0/1:4:109,37:0.22: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,16:0.19:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,34:0.39:-0.06:1.000:0.725 0/0/0/1:4:94,17:0.13: 0.58:1.000:0.940 0/0/0/1:4:117,29:0.17: 1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,32:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:80,38:0.30: 0.78:1.000:0.984 0/0/1/1:4:61,50:0.48: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:57,11:0.14:-0.63:1.000:0.972 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,21:0.32:-0.77:1.000:0.959 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,16:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,27:0.38:-0.52:1.000:0.529 0/0/1/1:4:39,24:0.39:-0.77:1.000:0.637 0/0/1/1:4:48,41:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:50,31:0.39:-0.26:1.000:0.667 0/0/1/1:4:71,45:0.40: 0.72:1.000:0.747 0/0/1/1:4:82,56:0.42: 1.34:1.000:0.917 0/0/0/1:4:79,42:0.34: 0.87:1.000:0.885 0/0/0/1:4:87,31:0.23: 0.78:0.956:1.000 0/0/0/1:4:99,27:0.19: 1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:108,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,32:0.31: 0.22:1.000:0.976 0/0/1/1:4:67,42:0.39: 0.53:1.000:0.709 -chr8.1 28429901 chr8.1_028429901 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:37,28:.: 0.07:1.000:. ./.:4:38,28:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.32:1.000:. ./.:4:51,35:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,73:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.99:1.000:. ./.:4:11,23:.:-1.52:1.000:. ./.:4:17,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,51:.: 0.37:1.000:. ./.:4:1,7:.:-2.84:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.90:1.000:. ./.:4:31,57:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.78:1.000:. ./.:4:20,59:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,64:.: 0.88:1.000:. ./.:4:20,65:.: 1.09:1.000:. ./.:4:55,34:.: 1.29:0.999:. ./.:4:37,31:.: 0.22:1.000:. ./.:4:14,65:.: 0.78:1.000:. ./.:4:25,65:.: 1.34:1.000:. ./.:4:2,3:.:-3.00:1.000:. ./.:4:15,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:23,86:.: 2.31:1.000:. ./.:4:23,42:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,9:.:-2.79:1.000:. ./.:4:23,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:13,36:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.58:1.000:. ./.:4:18,58:.: 0.63:1.000:. ./.:4:29,42:.: 0.37:1.000:. ./.:4:20,55:.: 0.58:1.000:. ./.:4:9,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:2,2:.:-3.05:1.000:. ./.:4:3,10:.:-2.59:1.000:. ./.:3:0,5:.:-3.00:1.000:. ./.:4:16,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:25,53:.: 0.73:1.000:. ./.:4:25,59:.: 1.04:1.000:. ./.:4:17,46:.:-0.04:1.000:. ./.:4:16,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,48:.: 0.68:1.000:. ./.:4:41,38:.: 0.78:1.000:. ./.:4:42,23:.: 0.07:1.000:. ./.:4:19,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.19:1.000:. ./.:4:18,45:.:-0.04:1.000:. ./.:5:0,114:.: 2.57:1.000:. ./.:4:4,6:.:-2.74:1.000:. ./.:4:49,21:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,21:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.29:1.000:. ./.:4:19,57:.: 0.63:1.000:. ./.:4:23,57:.: 0.83:1.000:. ./.:4:21,49:.: 0.32:1.000:. ./.:4:19,50:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,21:.:-0.70:1.000:. ./.:4:17,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:37,24:.:-0.14:1.000:. ./.:4:17,43:.:-0.19:1.000:. ./.:6:21,34:.:-0.44:1.000:. ./.:4:47,36:.: 0.99:1.000:. ./.:4:16,55:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,30:.:-1.16:1.000:. ./.:4:18,63:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.60:1.000:. ./.:4:14,36:.:-0.70:1.000:. ./.:4:16,33:.:-0.75:1.000:. ./.:4:20,36:.:-0.39:0.887:. ./.:4:56,15:.: 0.37:1.000:. ./.:4:18,47:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.90:0.999:. ./.:4:40,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:49,38:.: 1.19:1.000:. ./.:4:37,37:.: 0.53:1.000:. ./.:4:20,49:.: 0.27:1.000:. ./.:4:14,29:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.75:1.000:. ./.:4:25,56:.: 0.88:1.000:. ./.:4:24,37:.:-0.14:1.000:. ./.:4:25,22:.:-0.85:0.968:. ./.:4:52,23:.: 0.58:1.000:. ./.:4:47,39:.: 1.14:1.000:. ./.:4:22,56:.: 0.73:1.000:. ./.:4:10,28:.:-1.31:1.000:. ./.:4:27,61:.: 1.24:1.000:. ./.:4:16,36:.:-0.60:1.000:. ./.:4:16,39:.:-0.44:1.000:. ./.:4:13,36:.:-0.75:1.000:. ./.:4:18,52:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:17,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:17,43:.:-0.19:1.000:. ./.:4:25,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,32:.: 0.48:1.000:. ./.:4:8,46:.:-0.50:1.000:. ./.:4:16,33:.:-0.75:1.000:. ./.:4:16,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:17,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,58:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:18,45:.:-0.04:1.000:. ./.:4:14,31:.:-0.95:1.000:. ./.:4:24,42:.: 0.12:0.984:. ./.:4:13,37:.:-0.70:1.000:. ./.:4:22,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:28,55:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,70:.: 0.32:0.993:. ./.:4:23,44:.: 0.17:1.000:. ./.:4:24,43:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,54:.: 0.58:1.000:. ./.:4:13,54:.: 0.17:0.999:. ./.:4:17,59:.: 0.63:1.000:. ./.:4:11,23:.:-1.52:1.000:. ./.:4:23,39:.:-0.09:1.000:. ./.:4:7,39:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,35:.:-1.47:1.000:. ./.:4:42,31:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.16:1.000:. ./.:4:32,43:.: 0.58:1.000:. ./.:4:16,37:.:-0.55:1.000:. ./.:4:23,51:.: 0.53:1.000:. ./.:4:19,64:.: 0.99:1.000:. ./.:4:18,51:.: 0.27:1.000:. ./.:4:14,38:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,30:.:-0.90:1.000:. ./.:4:12,31:.:-1.06:1.000:. ./.:4:18,50:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.90:1.000:. ./.:4:16,56:.: 0.42:1.000:. ./.:4:14,33:.:-0.85:0.989:. ./.:4:9,44:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,38:.: 0.27:1.000:. ./.:4:42,43:.: 1.09:1.000:. ./.:4:21,55:.: 0.63:1.000:. ./.:4:14,41:.:-0.44:1.000:. ./.:4:19,27:.:-0.90:1.000:. ./.:4:15,32:.:-0.85:1.000:. ./.:4:18,18:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.39:1.000:. ./.:4:11,51:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,35:.:-1.21:1.000:. ./.:4:26,61:.: 1.19:1.000:. ./.:4:35,46:.: 0.88:1.000:. ./.:4:39,35:.: 0.53:1.000:. ./.:4:21,51:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,36:.: 0.48:1.000:. ./.:4:19,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:17,53:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.58:1.000:. ./.:4:2,6:.:-2.84:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.04:1.000:. ./.:4:23,44:.: 0.17:1.000:. ./.:4:26,64:.: 1.34:1.000:. ./.:4:22,63:.: 1.09:1.000:. ./.:4:18,43:.:-0.14:1.000:. ./.:4:20,48:.: 0.22:1.000:. ./.:4:18,58:.: 0.63:1.000:. ./.:4:36,31:.: 0.17:1.000:. ./.:4:17,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.42:1.000:. ./.:4:42,37:.: 0.78:1.000:. ./.:4:31,27:.:-0.29:1.000:. ./.:4:15,53:.: 0.22:1.000:. ./.:4:22,48:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,56:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,63:.: 0.94:1.000:. ./.:4:20,52:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,64:.: 0.02:1.000:. ./.:4:11,46:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,65:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.99:1.000:. ./.:4:5,48:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,68:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,87:.: 1.19:1.000:. ./.:4:12,68:.: 0.83:1.000:. ./.:4:17,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:21,69:.: 1.34:0.956:. ./.:4:30,64:.: 1.55:1.000:. ./.:4:23,85:.: 2.26:1.000:. ./.:4:13,38:.:-0.65:1.000:. ./.:4:44,42:.: 1.14:1.000:. -chr8.1 28599169 chr8.1_028599169 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:397,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:400,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:324,85:.:-0.04:1.000:. ./.:4:542,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:372,131:.: 0.99:1.000:. ./.:4:196,93:.:-1.35:1.000:. ./.:4:321,84:.:-0.08:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:195,2:.:-2.36:1.000:. ./.:4:311,2:.:-1.09:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:394,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:373,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:462,2:.: 0.57:1.000:. ./.:4:536,0:.: 1.36:0.999:. ./.:4:415,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:401,156:.: 1.59:1.000:. ./.:4:475,134:.: 2.16:1.000:. ./.:4:217,4:.:-2.10:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:385,118:.: 0.99:1.000:. ./.:4:323,103:.: 0.15:1.000:. ./.:4:141,36:.:-2.58:1.000:. ./.:4:458,154:.: 2.19:1.000:. ./.:4:438,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:383,112:.: 0.91:1.000:. ./.:4:349,114:.: 0.56:1.000:. ./.:4:431,168:.: 2.05:1.000:. ./.:4:404,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:101,31:.:-3.08:1.000:. ./.:4:252,0:.:-1.76:1.000:. ./.:3:90,32:.:-3.19:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:311,103:.: 0.02:1.000:. ./.:4:336,85:.: 0.09:1.000:. ./.:4:521,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:376,119:.: 0.91:1.000:. ./.:4:289,95:.:-0.31:1.000:. ./.:4:431,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:355,101:.: 0.48:1.000:. ./.:5:543,1:.: 1.44:1.000:. ./.:4:803,1:.: 4.30:1.000:. ./.:4:280,98:.:-0.38:1.000:. ./.:4:425,124:.: 1.50:1.000:. ./.:4:342,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:352,106:.: 0.50:1.000:. ./.:4:404,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:349,101:.: 0.41:1.000:. ./.:4:296,87:.:-0.32:1.000:. ./.:4:363,134:.: 0.93:1.000:. ./.:4:280,84:.:-0.53:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:336,88:.: 0.13:1.000:. ./.:6:290,41:.:-0.89:1.000:. ./.:4:413,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:360,1:.:-0.56:1.000:. ./.:4:574,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:340,124:.: 0.57:1.000:. ./.:4:447,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:314,95:.:-0.04:1.000:. ./.:4:250,92:.:-0.77:1.000:. ./.:4:339,101:.: 0.30:1.000:. ./.:4:355,108:.: 0.56:0.887:. ./.:4:306,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:562,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:317,90:.:-0.06:0.999:. ./.:4:607,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:321,111:.: 0.22:1.000:. ./.:4:386,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:282,92:.:-0.42:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:315,88:.:-0.10:1.000:. ./.:4:319,94:.: 0.01:1.000:. ./.:4:374,125:.: 0.95:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.48:0.968:. ./.:4:507,1:.: 1.05:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:345,103:.: 0.39:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:353,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:402,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:287,87:.:-0.42:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:232,72:.:-1.19:1.000:. ./.:4:573,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:361,122:.: 0.78:1.000:. ./.:4:228,86:.:-1.08:1.000:. ./.:4:383,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:510,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:376,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:305,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:424,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:314,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.12:0.984:. ./.:4:343,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:368,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:312,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.69:0.993:. ./.:4:297,84:.:-0.34:1.000:. ./.:4:258,94:.:-0.66:1.000:. ./.:4:534,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:327,102:.: 0.18:0.999:. ./.:4:516,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:226,69:.:-1.29:1.000:. ./.:4:413,124:.: 1.37:1.000:. ./.:4:309,105:.: 0.02:1.000:. ./.:4:306,88:.:-0.20:1.000:. ./.:4:302,110:.: 0.00:1.000:. ./.:4:390,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:297,85:.:-0.33:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:321,99:.: 0.08:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:301,71:.:-0.44:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:285,100:.:-0.30:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:238,67:.:-1.18:1.000:. ./.:4:310,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:275,90:.:-0.52:1.000:. ./.:4:314,82:.:-0.18:1.000:. ./.:4:196,62:.:-1.69:0.989:. ./.:4:299,121:.: 0.08:1.000:. ./.:4:297,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:538,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:307,105:.: 0.00:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:269,79:.:-0.71:1.000:. ./.:4:353,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:313,106:.: 0.07:1.000:. ./.:4:301,103:.:-0.09:1.000:. ./.:4:406,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:305,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:395,121:.: 1.14:1.000:. ./.:4:358,112:.: 0.63:1.000:. ./.:4:434,2:.: 0.26:1.000:. ./.:4:285,84:.:-0.48:1.000:. ./.:4:341,88:.: 0.18:1.000:. ./.:4:269,103:.:-0.44:1.000:. ./.:4:373,115:.: 0.83:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:163,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:295,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:393,125:.: 1.16:1.000:. ./.:4:463,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:357,112:.: 0.62:1.000:. ./.:4:396,110:.: 1.03:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:477,2:.: 0.73:1.000:. ./.:4:302,93:.:-0.19:1.000:. ./.:4:278,98:.:-0.40:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:336,111:.: 0.38:1.000:. ./.:4:456,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:282,84:.:-0.51:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:278,93:.:-0.45:1.000:. ./.:4:324,99:.: 0.12:1.000:. ./.:4:301,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:276,65:.:-0.78:1.000:. ./.:4:259,99:.:-0.60:1.000:. ./.:4:252,79:.:-0.89:1.000:. ./.:4:249,92:.:-0.78:1.000:. ./.:4:244,89:.:-0.87:1.000:. ./.:4:372,145:.: 1.15:1.000:. ./.:4:522,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:280,58:.:-0.82:1.000:. ./.:4:346,112:.: 0.50:0.956:. ./.:4:451,131:.: 1.86:1.000:. ./.:4:370,116:.: 0.81:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.50:1.000:. -chr8.1 28674226 chr8.1_028674226 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:129,313:0.69: 0.08:1.000:0.971 0/0/0/1:4:230,81:0.24:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,239:0.59:-0.39:1.000:0.887 0/0/1/1:4:217,231:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:298,285:0.47: 1.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:173,226:0.55:-0.36:1.000:0.980 0/1/1/1:4:33,186:0.83:-2.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,211:0.57:-0.78:1.000:0.941 0/0/0/1:4:317,96:0.22:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,75:0.27:-1.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:135,80:0.36:-2.24:1.000:0.733 0/0/0/0:4:475,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:270,99:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:363,125:0.24: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:334,92:0.20:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,196:0.53:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:238,269:0.51: 0.74:0.999:0.996 0/0/1/1:4:215,217:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:311,275:0.45: 1.55:1.000:0.983 0/1/1/1:4:142,430:0.73: 1.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:86,153:0.62:-2.00:1.000:0.547 0/1/1/1:4:57,351:0.84:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:368,103:0.21: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,200:0.56:-0.91:1.000:0.963 0/0/1/1:4:88,57:0.38:-2.96:1.000:0.531 0/0/1/1:4:210,211:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,91:0.26:-1.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:256,125:0.31:-0.54:1.000:0.970 0/0/1/1:4:275,257:0.47: 1.00:1.000:0.991 0/1/1/1:4:99,287:0.72:-0.49:1.000:0.996 0/0/0/1:4:265,107:0.27:-0.64:1.000:0.997 0/0/0/1:4:203,77:0.26:-1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,65:0.47:-3.06:1.000:0.990 0/0/1/1:4:184,171:0.47:-0.81:1.000:0.991 0/1/1:3:39,50:0.55:-3.53:1.000:0.953 0/0/0/1:4:222,96:0.29:-1.19:1.000:0.994 0/0/1/1:4:153,192:0.54:-0.91:1.000:0.988 0/0/1/1:4:169,241:0.57:-0.25:1.000:0.945 0/0/1/1:4:175,263:0.58: 0.04:1.000:0.902 0/0/0/1:4:342,125:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,390:0.85: 0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:231,257:0.51: 0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:150,402:0.71: 1.20:1.000:0.991 0/0/1/1:4:145,231:0.60:-0.60:1.000:0.820 0/0/0/1:4:400,167:0.28: 1.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:379,130:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:361,276:0.42: 2.07:1.000:0.960 0/0/0/1:4:176,68:0.26:-1.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,202:0.49:-0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:171,321:0.63: 0.59:1.000:0.612 0/0/1/1:4:174,286:0.60: 0.26:1.000:0.757 0/0/1/1:4:287,293:0.49: 1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,233:0.55:-0.26:1.000:0.977 0/0/1/1:4:284,283:0.48: 1.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:138,198:0.57:-1.00:1.000:0.941 0/0/1/1:4:273,272:0.48: 1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:239,230:0.47: 0.36:1.000:0.994 0/1/1/1:4:115,407:0.76: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,230:0.45: 0.59:1.000:0.981 0/0/0/1/1/1:6:229,236:0.49: 0.31:1.000:0.885 0/0/1/1:4:262,231:0.45: 0.60:1.000:0.982 0/0/1/1:4:143,217:0.59:-0.76:1.000:0.891 0/0/0/1:4:381,173:0.30: 1.22:1.000:0.988 0/0/1/1:4:267,215:0.43: 0.49:1.000:0.947 0/0/0/1:4:405,118:0.21: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,242:0.57:-0.26:1.000:0.934 0/0/0/1:4:362,104:0.21: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,238:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:151,385:0.70: 1.04:0.887:0.983 0/0/1/1:4:130,203:0.59:-1.03:1.000:0.853 0/0/0/1:4:368,162:0.29: 0.98:1.000:0.992 0/0/1/1:4:167,189:0.51:-0.80:0.999:0.996 0/0/0/0:4:342,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,239:0.48: 0.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:303,130:0.28:-0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:277,110:0.27:-0.48:1.000:0.998 0/0/1/1:4:252,279:0.51: 0.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,279:0.55: 0.63:1.000:0.984 0/0/1/1:4:271,236:0.45: 0.74:1.000:0.979 0/1/1/1:4:134,430:0.74: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:364,0:0.00:-0.72:0.968:1.000 0/0/1/1:4:308,266:0.45: 1.43:1.000:0.977 0/0/1/1:4:316,303:0.47: 1.89:1.000:0.993 0/0/0/1:4:298,83:0.20:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:335,136:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,273:0.57: 0.34:1.000:0.953 0/0/1/1:4:167,180:0.50:-0.89:1.000:0.997 0/0/1/1:4:222,242:0.51: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,398:0.76: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:323,94:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,344:0.84:-0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,338:0.85:-0.49:1.000:0.986 0/0/1/1:4:349,302:0.45: 2.22:1.000:0.978 0/0/1/1:4:153,157:0.49:-1.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:318,298:0.47: 1.86:1.000:0.991 0/0/1/1:4:179,212:0.53:-0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:257,270:0.50: 0.95:1.000:0.997 0/0/0/1:4:232,135:0.35:-0.69:1.000:0.776 0/0/1/1:4:255,303:0.53: 1.27:1.000:0.993 0/0/0/1:4:295,116:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:178,236:0.55:-0.21:1.000:0.977 0/0/1/1:4:272,268:0.48: 1.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:217,220:0.49: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,262:0.53: 0.46:0.984:0.992 0/0/0/1:4:325,110:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,240:0.43: 1.04:1.000:0.951 0/0/1/1:4:247,246:0.48: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:239,241:0.49: 0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:338,146:0.29: 0.51:0.993:0.994 0/0/1/1:4:160,222:0.56:-0.53:1.000:0.960 0/0/1/1:4:208,270:0.55: 0.45:1.000:0.982 0/0/1/1:4:252,242:0.47: 0.61:1.000:0.993 0/1/1/1:4:133,389:0.72: 0.90:0.999:0.997 0/0/0/1:4:324,144:0.29: 0.35:1.000:0.991 0/1/1/1:4:125,298:0.68:-0.11:1.000:0.964 0/0/1/1:4:285,290:0.49: 1.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:229,254:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:295,105:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/1/1/1:4:141,423:0.73: 1.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:327,122:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:233,259:0.51: 0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:384,131:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:145,392:0.71: 1.05:1.000:0.992 0/1/1/1:4:63,301:0.80:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,260:0.54: 0.32:1.000:0.987 0/0/0/1:4:435,137:0.22: 1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:347,125:0.25: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,101:0.30:-1.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:182,215:0.53:-0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:280,87:0.22:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,257:0.57: 0.00:1.000:0.933 0/0/1/1:4:152,189:0.54:-0.95:1.000:0.989 0/0/1/1:4:127,158:0.54:-1.53:0.989:0.989 0/1/1/1:4:58,408:0.85: 0.32:1.000:0.986 0/0/1/1:4:238,227:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:315,318:0.49: 2.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:245,272:0.51: 0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:187,236:0.54:-0.11:1.000:0.987 0/1/1/1:4:100,362:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:376,112:0.22: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:297,279:0.47: 1.45:1.000:0.992 0/0/0/1:4:344,130:0.26: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:336,99:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:239,250:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:111,395:0.76: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:161,463:0.72: 1.94:1.000:0.996 0/1/1/1:4:110,352:0.74: 0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:329,112:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,340:0.70: 0.37:1.000:0.988 0/1/1/1:4:120,337:0.72: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:266,277:0.49: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:269,88:0.23:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,116:0.45:-1.91:1.000:0.983 0/0/0/1:4:181,64:0.25:-1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:113,371:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:263,230:0.45: 0.60:1.000:0.980 0/0/0/1:4:382,115:0.22: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,224:0.53:-0.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:152,179:0.52:-1.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:121,334:0.71: 0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:203,190:0.47:-0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:28,235:0.87:-1.75:1.000:0.919 0/0/0/1:4:287,105:0.25:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:127,285:0.67:-0.23:1.000:0.929 0/0/1/1:4:187,221:0.53:-0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,299:0.84:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:142,191:0.56:-1.03:1.000:0.972 0/0/0/1:4:226,97:0.28:-1.14:1.000:0.994 0/1/1/1:4:63,297:0.80:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,219:0.58:-0.68:1.000:0.923 0/0/1/1:4:127,161:0.54:-1.49:1.000:0.986 0/0/1/1:4:152,162:0.50:-1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:176,211:0.53:-0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:177,184:0.49:-0.75:1.000:0.997 0/1/1/1:4:95,329:0.75:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,84:0.26:-1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:180,217:0.53:-0.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:316,117:0.25:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:248,238:0.47: 0.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:195,173:0.45:-0.68:1.000:0.984 0/0/1/1:4:206,245:0.53: 0.17:0.956:0.993 0/0/0/1:4:366,139:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,265:0.50: 0.76:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,200:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:280,119:0.28:-0.36:1.000:0.995 -chr8.1 28871485 chr8.1_028871485 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:233,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:143,21:.: 0.09:1.000:. ./.:4:144,20:.: 0.09:1.000:. ./.:4:164,22:.: 0.59:1.000:. ./.:4:122,49:.: 0.25:1.000:. ./.:4:214,33:.: 1.97:1.000:. ./.:4:112,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:149,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:107,35:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,30:.:-1.99:1.000:. ./.:4:53,5:.:-2.31:1.000:. ./.:4:143,39:.: 0.50:1.000:. ./.:4:85,50:.:-0.57:1.000:. ./.:4:94,49:.:-0.38:1.000:. ./.:4:104,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:179,16:.: 0.79:1.000:. ./.:4:165,20:.: 0.57:0.999:. ./.:4:190,23:.: 1.20:1.000:. ./.:4:194,23:.: 1.29:1.000:. ./.:4:164,21:.: 0.57:1.000:. ./.:4:61,6:.:-2.11:1.000:. ./.:4:202,1:.: 0.98:1.000:. ./.:4:145,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:26,4:.:-2.95:1.000:. ./.:4:166,20:.: 0.59:1.000:. ./.:4:197,22:.: 1.34:1.000:. ./.:4:119,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:176,26:.: 0.95:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:162,19:.: 0.48:1.000:. ./.:4:104,43:.:-0.29:1.000:. ./.:4:29,8:.:-2.79:1.000:. ./.:4:51,13:.:-2.18:1.000:. ./.:3:33,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:169,25:.: 0.77:1.000:. ./.:4:213,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:211,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:121,23:.:-0.36:1.000:. ./.:4:95,48:.:-0.38:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:182,28:.: 1.14:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:124,26:.:-0.23:1.000:. ./.:4:77,49:.:-0.77:1.000:. ./.:4:121,42:.: 0.07:1.000:. ./.:5:169,57:.: 1.50:1.000:. ./.:4:46,8:.:-2.40:1.000:. ./.:4:145,16:.: 0.02:1.000:. ./.:4:161,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:149,20:.: 0.21:1.000:. ./.:4:189,33:.: 1.41:1.000:. ./.:4:107,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:175,27:.: 0.95:1.000:. ./.:4:141,20:.: 0.02:1.000:. ./.:4:136,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:104,42:.:-0.32:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:136,27:.: 0.07:1.000:. ./.:6:142,11:.:-0.16:1.000:. ./.:4:123,21:.:-0.36:1.000:. ./.:4:159,26:.: 0.57:1.000:. ./.:4:101,55:.:-0.09:1.000:. ./.:4:74,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:110,38:.:-0.27:1.000:. ./.:4:137,15:.:-0.18:1.000:. ./.:4:34,22:.:-2.36:1.000:. ./.:4:92,43:.:-0.57:1.000:. ./.:4:157,31:.: 0.64:0.887:. ./.:4:214,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:133,19:.:-0.18:1.000:. ./.:4:74,12:.:-1.68:0.999:. ./.:4:197,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:189,27:.: 1.27:1.000:. ./.:4:146,23:.: 0.21:1.000:. ./.:4:138,20:.:-0.04:1.000:. ./.:4:153,20:.: 0.30:1.000:. ./.:4:137,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:98,47:.:-0.34:1.000:. ./.:4:150,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:105,14:.:-0.93:0.968:. ./.:4:137,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:178,18:.: 0.82:1.000:. ./.:4:105,37:.:-0.41:1.000:. ./.:4:144,25:.: 0.21:1.000:. ./.:4:144,29:.: 0.30:1.000:. ./.:4:85,34:.:-0.93:1.000:. ./.:4:81,38:.:-0.93:1.000:. ./.:4:115,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:102,35:.:-0.52:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:159,27:.: 0.59:1.000:. ./.:4:130,19:.:-0.25:1.000:. ./.:4:150,12:.: 0.05:1.000:. ./.:4:121,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:79,40:.:-0.93:1.000:. ./.:4:115,15:.:-0.68:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:188,23:.: 1.16:1.000:. ./.:4:66,6:.:-1.99:1.000:. ./.:4:92,34:.:-0.77:1.000:. ./.:4:80,16:.:-1.45:1.000:. ./.:4:136,15:.:-0.20:0.984:. ./.:4:68,34:.:-1.31:1.000:. ./.:4:111,53:.: 0.09:1.000:. ./.:4:100,36:.:-0.54:1.000:. ./.:4:100,30:.:-0.68:1.000:. ./.:4:160,74:.: 1.68:0.993:. ./.:4:147,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:153,26:.: 0.43:1.000:. ./.:4:144,48:.: 0.73:1.000:. ./.:4:165,15:.: 0.45:0.999:. ./.:4:123,20:.:-0.38:1.000:. ./.:4:117,5:.:-0.86:1.000:. ./.:4:150,18:.: 0.18:1.000:. ./.:4:101,18:.:-0.93:1.000:. ./.:4:82,32:.:-1.04:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:88,28:.:-1.00:1.000:. ./.:4:154,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:74,33:.:-1.20:1.000:. ./.:4:148,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:73,39:.:-1.09:1.000:. ./.:4:84,46:.:-0.68:1.000:. ./.:4:112,20:.:-0.63:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:103,14:.:-0.97:1.000:. ./.:4:157,26:.: 0.52:1.000:. ./.:4:165,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.13:0.989:. ./.:4:226,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:167,17:.: 0.55:1.000:. ./.:4:220,25:.: 1.93:1.000:. ./.:4:103,32:.:-0.57:1.000:. ./.:4:99,17:.:-1.00:1.000:. ./.:4:137,21:.:-0.04:1.000:. ./.:4:96,36:.:-0.63:1.000:. ./.:4:99,30:.:-0.70:1.000:. ./.:4:74,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:97,38:.:-0.57:1.000:. ./.:4:86,27:.:-1.06:1.000:. ./.:4:199,24:.: 1.43:1.000:. ./.:4:191,21:.: 1.18:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:115,50:.: 0.11:1.000:. ./.:4:255,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:175,23:.: 0.86:1.000:. ./.:4:183,38:.: 1.38:1.000:. ./.:4:111,58:.: 0.21:1.000:. ./.:4:35,13:.:-2.54:1.000:. ./.:4:93,25:.:-0.95:1.000:. ./.:4:177,26:.: 0.98:1.000:. ./.:4:97,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:116,60:.: 0.36:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:163,22:.: 0.57:1.000:. ./.:4:141,31:.: 0.27:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:90,55:.:-0.34:1.000:. ./.:4:207,1:.: 1.09:1.000:. ./.:4:152,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:115,22:.:-0.52:1.000:. ./.:4:153,17:.: 0.23:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:128,19:.:-0.29:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:133,25:.:-0.04:1.000:. ./.:4:145,21:.: 0.14:1.000:. ./.:4:113,14:.:-0.75:1.000:. ./.:4:99,34:.:-0.61:1.000:. ./.:4:196,28:.: 1.45:1.000:. ./.:4:97,32:.:-0.70:1.000:. ./.:4:107,37:.:-0.36:1.000:. ./.:4:106,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:153,26:.: 0.43:0.956:. ./.:4:175,18:.: 0.75:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:105,21:.:-0.77:1.000:. ./.:4:169,24:.: 0.75:1.000:. -chr8.1 29069523 chr8.1_029069523 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:64,83:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.72:1.000:. ./.:4:49,76:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,97:.: 1.60:1.000:. ./.:4:78,94:.: 1.68:1.000:. ./.:4:37,44:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.45:1.000:. ./.:4:48,60:.:-0.03:1.000:. ./.:4:1,41:.:-1.79:1.000:. ./.:4:15,14:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.37:1.000:. ./.:4:73,69:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.13:1.000:. ./.:4:56,60:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.13:0.999:. ./.:4:0,83:.:-0.69:1.000:. ./.:4:88,91:.: 1.87:1.000:. ./.:4:89,126:.: 2.83:1.000:. ./.:4:19,22:.:-1.82:1.000:. ./.:4:77,86:.: 1.44:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.24:1.000:. ./.:4:58,63:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,26:.:-2.22:1.000:. ./.:4:52,44:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.61:1.000:. ./.:4:72,57:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.48:1.000:. ./.:4:17,30:.:-1.66:1.000:. ./.:3:12,5:.:-2.46:1.000:. ./.:4:79,56:.: 0.70:1.000:. ./.:4:61,62:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.43:1.000:. ./.:4:58,77:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.91:1.000:. ./.:4:56,88:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.59:1.000:. ./.:5:90,144:.: 3.34:1.000:. ./.:4:11,22:.:-2.03:1.000:. ./.:4:0,59:.:-1.34:1.000:. ./.:4:40,24:.:-1.20:1.000:. ./.:4:48,62:.: 0.03:1.000:. ./.:4:76,68:.: 0.94:1.000:. ./.:4:42,70:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.68:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.35:1.000:. ./.:4:55,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.77:1.000:. ./.:6:0,65:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.61:1.000:. ./.:4:49,61:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.48:1.000:. ./.:4:76,74:.: 1.10:1.000:. ./.:4:58,73:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.51:1.000:. ./.:4:40,51:.:-0.48:0.887:. ./.:4:0,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,61:.:-1.28:0.999:. ./.:4:0,56:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,72:.:-0.99:1.000:. ./.:4:50,53:.:-0.16:1.000:. ./.:4:62,83:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,57:.:-1.39:0.968:. ./.:4:52,62:.: 0.13:1.000:. ./.:4:66,68:.: 0.67:1.000:. ./.:4:60,64:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.32:1.000:. ./.:4:64,64:.: 0.51:1.000:. ./.:4:48,64:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,72:.: 0.88:1.000:. ./.:4:50,52:.:-0.19:1.000:. ./.:4:68,58:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,88:.: 1.52:1.000:. ./.:4:63,84:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,57:.:-1.39:1.000:. ./.:4:59,88:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.23:1.000:. ./.:4:63,67:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,68:.: 0.48:1.000:. ./.:4:45,59:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,77:.: 0.40:1.000:. ./.:4:40,51:.:-0.48:1.000:. ./.:4:58,87:.: 0.96:0.984:. ./.:4:0,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:70,76:.: 0.99:1.000:. ./.:4:47,55:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.80:1.000:. ./.:4:69,118:.: 2.08:0.993:. ./.:4:0,126:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,152:.: 1.15:1.000:. ./.:4:49,83:.: 0.61:0.999:. ./.:4:56,61:.: 0.21:1.000:. ./.:4:43,28:.:-1.01:1.000:. ./.:4:71,77:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.88:1.000:. ./.:4:61,71:.: 0.61:1.000:. ./.:4:54,59:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,68:.:-1.09:1.000:. ./.:4:46,68:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.27:1.000:. ./.:4:56,110:.: 1.52:1.000:. ./.:4:48,46:.:-0.40:1.000:. ./.:4:63,58:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.20:1.000:. ./.:4:42,46:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.91:1.000:. ./.:4:50,79:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,43:.:-0.56:0.989:. ./.:4:51,44:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.01:1.000:. ./.:4:74,73:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.43:1.000:. ./.:4:51,65:.: 0.19:1.000:. ./.:4:54,65:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,98:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,109:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,58:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.37:1.000:. ./.:4:76,130:.: 2.59:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.03:1.000:. ./.:4:85,109:.: 2.27:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,61:.: 0.32:1.000:. ./.:4:59,82:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,10:.:-2.32:1.000:. ./.:4:43,70:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.91:1.000:. ./.:4:80,87:.: 1.55:1.000:. ./.:4:47,66:.: 0.11:1.000:. ./.:4:65,96:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.72:1.000:. ./.:4:66,83:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,88:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,34:.:-2.00:1.000:. ./.:4:58,93:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,84:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.05:1.000:. ./.:4:55,65:.: 0.29:1.000:. ./.:4:51,42:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,71:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,149:.: 1.07:1.000:. ./.:4:100,118:.: 2.91:1.000:. ./.:4:0,113:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,110:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,150:.: 1.10:0.956:. ./.:4:0,115:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,150:.: 1.10:1.000:. ./.:4:58,52:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.43:1.000:. -chr8.1 29555961 chr8.1_029555961 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:230,102:0.26: 1.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,131:0.66:-0.42:1.000:0.885 0/0/0/1:4:117,67:0.32:-0.57:1.000:0.955 0/0/0/1:4:200,89:0.26: 0.72:1.000:0.999 0/0/0/0:4:232,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,91:0.29: 0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:209,67:0.20: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,84:0.22: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,73:0.28:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,35:0.28:-1.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,95:0.47:-0.48:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,231:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,79:0.31:-0.09:1.000:0.976 0/0/0/1:4:176,70:0.23: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,71:0.28:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:274,112:0.24: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:251,102:0.24: 1.50:0.999:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:207,125:0.33: 1.24:1.000:0.905 0/0/0/0:4:280,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,1:0.01:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,83:0.22: 0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,150:0.43: 1.16:1.000:0.946 0/0/1/1:4:133,189:0.57: 1.12:1.000:0.943 0/0/0/1:4:56,32:0.32:-1.75:1.000:0.956 0/0/0/1:4:154,99:0.35: 0.27:1.000:0.789 0/0/1/1:4:184,191:0.48: 1.77:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,78:0.34:-0.35:1.000:0.838 0/0/0/1:4:164,91:0.31: 0.30:1.000:0.971 0/0/0/1:4:227,112:0.28: 1.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:171,194:0.51: 1.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,91:0.34: 0.10:1.000:0.879 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,40:0.20:-0.75:1.000:1.000 0/1/1:3:38,55:0.58:-1.68:0.999:0.994 0/0/1/1:4:167,184:0.50: 1.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:153,166:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,183:0.49: 1.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:160,68:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:179,105:0.33: 0.65:1.000:0.936 0/0/0/1:4:180,58:0.20: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,58:0.18: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:129,129:0.47: 0.34:1.000:0.993 0/0/1/1:4:98,113:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:101,66:0.35:-0.78:1.000:0.746 0/0/0/1:4:115,57:0.28:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/0/1:5:250,106:0.25: 1.54:1.000:0.941 0/0/1/1:4:386,377:0.47: 6.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:191,51:0.17: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:155,65:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,58:0.32:-0.89:1.000:0.946 0/0/0/1:4:165,89:0.30: 0.29:1.000:0.981 0/0/0/1:4:116,73:0.34:-0.51:1.000:0.837 0/0/0/1:4:106,65:0.34:-0.73:1.000:0.883 0/0/0/1:4:221,80:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,64:0.18: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/0:4:170,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,57:0.22:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,54:0.27:-0.78:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:133,80:0.33:-0.22:1.000:0.920 0/0/0/1:4:164,75:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:188,76:0.24: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,67:0.35:-0.73:1.000:0.784 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,75:0.34:-0.44:1.000:0.851 0/0/0/1:4:126,50:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,61:0.36:-0.97:1.000:0.632 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00:-0.66:0.887:1.000 0/0/1/1:4:122,134:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,131:0.41: 0.79:1.000:0.865 0/0/0/1:4:186,54:0.19: 0.12:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,257:1.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:256,75:0.19: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,119:0.67:-0.66:1.000:0.908 0/0/1/1:4:135,162:0.52: 0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:124,67:0.30:-0.48:1.000:0.981 0/0/0/1:4:107,56:0.30:-0.83:1.000:0.988 0/0/0/0:4:207,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-1.23:0.968:1.000 0/0/0/1:4:163,54:0.21:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,64:0.21: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,62:0.27:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,155:0.56: 0.45:1.000:0.960 0/0/0/1:4:171,84:0.28: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,60:0.30:-0.68:1.000:0.989 0/0/0/1:4:217,80:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,45:0.18:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,74:0.31:-0.25:1.000:0.979 0/0/0/1:4:141,59:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,72:0.22: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,70:0.23: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,99:0.71:-1.12:1.000:0.993 0/0/1/1:4:119,107:0.44:-0.06:1.000:0.972 0/0/1/1:4:143,135:0.46: 0.58:1.000:0.986 0/0/1/1:4:78,64:0.42:-1.08:1.000:0.904 0/0/0/0:4:178,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,34:0.28:-1.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:153,61:0.24:-0.20:0.984:1.000 0/0/0/1:4:80,44:0.31:-1.30:1.000:0.975 0/0/0/0:4:182,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:144,1:0.01:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,87:0.30: 0.26:0.993:0.987 0/0/0/1:4:210,76:0.22: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,42:0.18:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/0:4:312,0:0.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.82:0.999:1.000 0/0/1/1:4:114,113:0.47:-0.04:1.000:0.993 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,70:0.35:-0.62:1.000:0.813 0/0/0/1:4:159,61:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,45:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,63:0.23:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,53:0.27:-0.80:1.000:0.997 0/0/0/1:4:161,57:0.22:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,36:0.24:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:261,99:0.23: 1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,129:0.57:-0.13:1.000:0.945 0/0/0/1:4:104,70:0.36:-0.69:1.000:0.655 0/0/0/1:4:93,60:0.35:-0.95:1.000:0.780 0/1/1/1:4:34,78:0.69:-1.45:1.000:0.979 0/0/1/1:4:80,107:0.55:-0.53:1.000:0.975 0/0/1/1:4:74,77:0.48:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:105,58:0.31:-0.83:1.000:0.973 0/0/0/1:4:248,88:0.22: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,92:0.53:-0.78:0.989:0.992 0/0/0/1:4:173,55:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,60:0.19: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:302,117:0.23: 2.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,39:0.22:-1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,50:0.41:-1.45:1.000:0.880 0/0/0/1:4:109,58:0.30:-0.78:1.000:0.985 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,67:0.36:-0.78:1.000:0.670 0/0/0/1:4:111,74:0.36:-0.56:1.000:0.686 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,80:0.19: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:253,76:0.19: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,87:0.38:-0.25:1.000:0.521 0/0/0/1:4:259,109:0.24: 1.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,115:0.35: 0.78:1.000:0.791 0/0/0/1:4:151,96:0.35: 0.20:1.000:0.815 0/0/1/1:4:52,54:0.48:-1.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,71:0.33:-0.47:1.000:0.936 0/0/0/0:4:239,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,95:0.28: 0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:133,188:0.57: 1.11:1.000:0.947 0/0/1/1:4:110,120:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/0:4:222,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,83:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,67:0.22: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,83:0.30: 0.08:1.000:0.981 0/0/0/1:4:236,65:0.18: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:273,102:0.22: 1.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,77:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,74:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,142:0.68:-0.26:1.000:0.940 0/0/0/1:4:161,83:0.29: 0.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:141,169:0.52: 0.97:1.000:0.994 0/0/0/1:4:122,65:0.30:-0.53:1.000:0.984 0/0/1/1:4:120,158:0.55: 0.58:1.000:0.979 0/0/0/1:4:131,63:0.27:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,76:0.35:-0.44:1.000:0.805 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,57:0.28:-0.73:1.000:0.994 0/0/0/1:4:198,130:0.36: 1.19:1.000:0.733 0/0/0/1:4:155,78:0.29: 0.03:1.000:0.993 0/0/0/0:4:237,1:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,36:0.13:-0.01:1.000:0.903 0/0/0/1:4:232,80:0.21: 1.00:0.956:1.000 0/0/1/1:4:196,222:0.51: 2.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:164,189:0.51: 1.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,57:0.19: 0.29:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,146:0.65:-0.09:1.000:0.768 -chr8.1 29688916 chr8.1_029688916 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:78,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:130,0:.: 3.10:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.80:0.999:. ./.:4:63,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.83:0.999:. ./.:4:32,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.80:1.000:. ./.:5:88,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.46:1.000:. ./.:6:18,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:17,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.57:0.887:. ./.:4:60,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.60:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.53:0.968:. ./.:4:68,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.84:0.984:. ./.:4:22,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:98,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:88,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.19:0.993:. ./.:4:28,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:102,0:.: 2.03:0.999:. ./.:4:30,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:0.989:. ./.:4:91,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:112,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:110,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.72:0.956:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.39:1.000:. -chr8.1 29741586 chr8.1_029741586 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,1:0.00: 1.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,61:0.27: 1.76:1.000:0.998 0/0/0/1:4:93,42:0.23: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,59:0.42: 0.69:1.000:0.907 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.61:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,70:0.48: 0.91:1.000:0.995 0/0/0/1:4:76,44:0.29: 0.51:1.000:0.990 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,78:0.51: 1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,45:0.23: 1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,12:0.40:-1.57:1.000:0.759 0/0/1/1:4:64,65:0.47: 0.71:1.000:0.994 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,68:0.48: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,50:0.43: 0.19:1.000:0.953 0/0/1/1:4:72,55:0.38: 0.66:1.000:0.589 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1:3:20,7:0.19:-1.57:0.999:0.998 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,48:0.20: 1.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,60:0.23: 2.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,1:0.01: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,1:0.01:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,56:0.24: 1.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,48:0.52:-0.27:1.000:0.995 0/0/0/0:4:114,1:0.01: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:154,0:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,55:0.32: 1.02:1.000:0.959 0/0/0/0:4:110,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,68:0.52: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/0:4:112,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,41:0.38:-0.05:1.000:0.563 0/0/1/1:4:47,56:0.51: 0.13:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,57:0.45: 0.46:1.000:0.977 0/0/0/0/0/1:6:54,11:0.13:-0.72:1.000:0.989 0/0/0/0:4:63,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,60:0.23: 2.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,34:0.34:-0.30:0.887:0.840 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,1:0.01: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,39:0.21: 0.91:0.999:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,50:0.36: 0.49:1.000:0.634 0/0/0/0:4:103,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,50:0.23: 1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,61:0.43: 0.73:1.000:0.944 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.30:0.968:1.000 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,49:0.39: 0.31:1.000:0.719 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,61:0.25: 1.87:1.000:0.999 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:151,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,72:0.51: 0.80:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 2.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:106,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.55:0.984:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00: 0.91:0.993:1.000 0/0/1/1:4:52,57:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,68:0.57: 0.15:1.000:0.950 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,43:0.37: 0.11:0.999:0.611 0/0/0/0:4:123,1:0.01: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,33:0.51:-0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,66:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,49:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,41:0.51:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:49,31:0.32:-0.39:1.000:0.950 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,71:0.53: 0.60:1.000:0.993 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,41:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,37:0.36:-0.21:1.000:0.629 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,37:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,64:0.37: 1.22:1.000:0.619 0/0/1/1:4:55,52:0.45: 0.22:1.000:0.981 0/0/0/1:4:88,38:0.23: 0.64:0.989:1.000 0/0/0/1:4:91,48:0.27: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,0:0.00:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,42:0.44:-0.21:1.000:0.967 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,45:0.46:-0.12:1.000:0.985 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,78:0.51: 1.04:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,67:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,58:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,58:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,62:0.47: 0.60:1.000:0.992 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,55:0.21: 2.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,51:0.32: 0.75:1.000:0.943 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,57:0.44: 0.51:1.000:0.962 0/0/0/0:4:55,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,68:0.30: 1.96:1.000:0.989 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,62:0.36: 1.16:1.000:0.698 0/0/0/1:4:103,45:0.23: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,49:0.25: 1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:88,55:0.32: 1.02:1.000:0.959 0/0/0/1:4:96,65:0.34: 1.42:1.000:0.850 0/0/1/1:4:37,41:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,41:0.52:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:135,82:0.31: 2.68:1.000:0.975 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,45:0.60:-0.77:1.000:0.789 0/0/1/1:4:50,54:0.50: 0.15:0.956:0.997 0/0/1/1:4:67,94:0.53: 1.42:1.000:0.992 0/0/0/1:4:131,80:0.31: 2.54:1.000:0.973 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 -chr8.1 30003258 chr8.1_030003258 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:41,43:0.46: 1.87:1.000:0.989 0/0/1/1:4:16,16:0.45:-0.98:1.000:0.980 0/0/0/1:4:34,23:0.36: 0.39:1.000:0.699 0/0/0/1:4:37,21:0.32: 0.45:1.000:0.954 0/0/0/1:4:46,26:0.32: 1.21:1.000:0.956 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,16:0.20: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,21:0.24: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.45:-2.18:1.000:0.980 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,16:0.47:-1.03:1.000:0.991 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,24:0.63:-0.98:1.000:0.619 0/0/1/1:4:17,32:0.57:-0.05:0.999:0.950 0/1/1/1:4:7,81:0.75: 2.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,24:0.23: 2.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,2:0.12:-1.97:1.000:0.834 0/0/1/1:4:31,38:0.50: 1.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-2.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:57,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,10:0.48:-1.69:1.000:0.994 0/0/1/1:4:21,17:0.40:-0.65:1.000:0.797 0/0/0/1:4:40,28:0.37: 1.00:1.000:0.604 0/0/0/1:4:71,24:0.22: 2.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,17:0.50:-1.03:1.000:0.997 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,1:0.05:-1.80:1.000:1.000 0/0/0:3:5,0:0.00:-2.46:0.999:1.000 0/0/0/0:4:35,1:0.02:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,18:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,36:0.55: 0.45:1.000:0.983 0/0/0/1:4:19,13:0.36:-0.98:1.000:0.669 0/0/1/1:4:25,31:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,31:0.64:-0.48:1.000:0.670 0/0/0/1:4:59,24:0.25: 1.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:52,23:0.27: 1.38:1.000:0.839 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,12:0.20: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,13:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,12:0.18: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,11:0.19: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,13:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,24:0.33: 0.78:1.000:0.912 0/0/1/1:4:23,27:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,15:0.28:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:20,27:0.52:-0.16:1.000:0.876 0/0/1/1:4:12,29:0.61:-0.48:1.000:0.741 0/0/0/1:4:31,14:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,18:0.49:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,9:0.15: 0.17:1.000:0.984 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,21:0.36: 0.12:1.000:0.695 0/0/0/1:4:48,22:0.27: 1.11:0.887:0.997 0/1/1/1:4:8,24:0.63:-0.98:1.000:0.619 0/0/0/1:4:31,15:0.29:-0.21:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,17:0.46:-0.92:0.999:0.990 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,15:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,15:0.48:-1.20:1.000:0.996 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,6:0.15:-0.87:1.000:0.991 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.30: 0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:24,30:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-2.08:0.968:1.000 0/0/0/1:4:37,15:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,22:0.34: 0.45:1.000:0.892 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,19:0.35:-0.10:1.000:0.776 0/0/0/1:4:46,12:0.18: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:35,10:0.19:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,10:0.30:-1.14:1.000:0.982 0/0/1/1:4:27,24:0.42: 0.06:1.000:0.924 0/0/0/0:4:45,1:0.02:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,12:0.20: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,29:0.40: 0.83:1.000:0.787 0/0/0/1:4:47,19:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,8:0.22:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,24:0.34: 0.67:1.000:0.845 0/0/0/1:4:45,25:0.32: 1.11:1.000:0.965 0/0/0/1:4:32,10:0.21:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,17:0.59:-1.36:1.000:0.882 0/0/0/1:4:42,14:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,14:0.36:-0.81:1.000:0.736 0/0/0/1:4:31,12:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,9:0.21:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,19:0.28: 0.56:0.984:0.996 0/0/1/1:4:19,17:0.42:-0.76:1.000:0.930 0/0/0/1:4:33,16:0.29:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:34,15:0.27:-0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,35:0.64:-0.21:1.000:0.708 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.45:0.993:1.000 0/0/0/1:4:48,10:0.15: 0.45:1.000:0.987 0/0/0/1:4:36,14:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,28:0.63:-0.65:1.000:0.501 0/0/0/1:4:49,14:0.19: 0.72:0.999:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,11:0.20:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,6:0.13:-0.54:1.000:0.910 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,20:0.30: 0.50:1.000:0.987 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,11:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,52:0.52: 2.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:36,44:0.50: 1.65:1.000:0.997 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,8:0.31:-1.47:1.000:0.979 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.38:-1.31:1.000:0.538 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,18:0.23: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.32:0.989:1.000 0/0/0/1:4:30,10:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,21:0.56:-0.92:1.000:0.971 0/0/0/1:4:48,26:0.31: 1.32:1.000:0.974 0/0/0/1:4:40,18:0.27: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,29:0.52: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:71,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,17:0.27: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,27:0.60:-0.59:1.000:0.830 0/0/0/1:4:69,23:0.22: 2.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,18:0.33:-0.10:1.000:0.912 0/0/1/1:4:38,33:0.42: 1.16:1.000:0.902 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,12:0.15: 1.11:1.000:0.986 0/0/0/1:4:68,18:0.18: 1.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:52,19:0.23: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,21:0.46:-0.48:1.000:0.989 0/0/0/1:4:13,3:0.16:-1.86:1.000:0.996 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,46:0.53: 1.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,36:0.59: 0.17:1.000:0.885 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:74,1:0.01: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,14:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,34:0.44: 1.05:1.000:0.973 0/0/1/1:4:36,27:0.38: 0.72:1.000:0.606 0/0/1/1:4:26,31:0.49: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,40:0.40: 2.15:1.000:0.813 0/0/1/1:4:12,21:0.56:-0.92:1.000:0.971 0/0/0/1:4:48,20:0.26: 1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,26:0.62:-0.76:1.000:0.627 0/0/1/1:4:14,11:0.39:-1.36:1.000:0.731 0/0/0/1:4:56,19:0.22: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,25:0.37: 0.56:1.000:0.543 0/0/1/1:4:26,20:0.39:-0.21:1.000:0.677 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,22:0.40:-0.05:1.000:0.809 0/0/1/1:4:30,23:0.39: 0.17:1.000:0.668 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,23:0.23: 2.04:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,36:0.65:-0.16:1.000:0.745 0/0/0/1:4:26,8:0.20:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,16:0.27: 0.06:0.956:0.997 0/0/0/0:4:67,1:0.01: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,24:0.28: 1.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:31,16:0.30:-0.16:1.000:0.986 0/0/0/1:4:21,10:0.28:-1.03:1.000:0.995 -chr8.1 30264475 chr8.1_030264475 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,115:0.76:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,141:0.56: 1.16:1.000:0.973 0/0/0/1:4:133,85:0.37: 0.79:1.000:0.585 0/0/1/1:4:112,142:0.53: 1.35:1.000:0.992 0/0/1/1:4:192,176:0.45: 3.13:1.000:0.980 0/0/0/1:4:131,46:0.25: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,125:0.51: 1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:77,153:0.65: 0.97:1.000:0.755 0/0/1/1:4:7,9:0.53:-2.37:1.000:0.991 0/0/1/1:4:8,12:0.57:-2.31:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,184:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,170:0.69: 1.16:1.000:0.968 0/1/1/1:4:42,140:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,145:0.64: 0.83:1.000:0.642 0/0/1/1:4:93,167:0.62: 1.44:1.000:0.555 0/0/1/1:4:80,73:0.45:-0.23:0.999:0.979 0/0/1/1:4:120,135:0.50: 1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:162,76:0.30: 1.10:1.000:0.983 0/0/0/1:4:216,77:0.25: 1.96:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,11:0.32:-2.10:1.000:0.964 0/0/0/1:4:137,60:0.29: 0.46:1.000:0.992 0/1/1/1:4:91,169:0.63: 1.44:1.000:0.556 0/0/0/1:4:115,68:0.35: 0.24:1.000:0.781 0/1/1/1:4:4,28:0.87:-2.12:1.000:0.914 0/0/0/1:4:160,81:0.32: 1.14:1.000:0.958 0/1/1/1:4:45,166:0.78: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,175:0.75: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,61:0.28: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:202,1:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,146:0.64: 0.85:1.000:0.663 0/1/1/1:4:35,121:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.47:-2.43:1.000:0.992 0/0/0/1:4:23,15:0.37:-2.02:1.000:0.526 0/0/0:3:16,2:0.11:-2.34:0.999:0.997 0/1/1/1:4:63,143:0.68: 0.60:1.000:0.947 0/0/0/1:4:114,63:0.34: 0.15:1.000:0.889 0/0/0/1:4:115,69:0.35: 0.25:1.000:0.749 0/1/1/1:4:59,140:0.69: 0.49:1.000:0.970 0/1/1/1:4:47,142:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,49:0.30:-0.23:1.000:0.982 0/0/0/1:4:65,41:0.37:-0.96:1.000:0.622 0/0/0/1:4:96,54:0.34:-0.28:1.000:0.866 0/1/1/1:4:44,93:0.66:-0.48:1.000:0.875 0/1/1/1:4:49,137:0.72: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:44,104:0.69:-0.31:1.000:0.969 0/0/1/1/1:5:117,227:0.64: 2.75:1.000:0.932 0/0/1/1:4:35,54:0.58:-1.23:1.000:0.904 0/0/1/1:4:67,50:0.40:-0.79:1.000:0.817 0/0/1/1:4:96,78:0.42: 0.10:1.000:0.924 0/0/1/1:4:53,61:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:139,71:0.32: 0.66:1.000:0.953 0/1/1/1:4:33,129:0.79:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,58:0.38:-0.35:1.000:0.539 0/0/1/1:4:91,137:0.58: 0.94:1.000:0.929 0/0/1/1:4:73,55:0.41:-0.62:1.000:0.833 0/0/1/1:4:84,109:0.54: 0.40:1.000:0.990 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,53:0.40:-0.65:1.000:0.763 0/0/0/0/1/1:6:43,24:0.34:-1.57:1.000:0.916 0/0/1/1:4:54,47:0.44:-1.04:1.000:0.965 0/0/1/1:4:92,123:0.54: 0.74:1.000:0.985 0/1/1/1:4:28,141:0.83: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,69:0.53:-0.70:1.000:0.991 0/1/1/1:4:54,119:0.67: 0.08:1.000:0.924 0/0/1/1:4:99,106:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,81:0.66:-0.76:1.000:0.887 0/0/1/1:4:72,106:0.57: 0.16:1.000:0.947 0/0/0/1:4:113,45:0.27:-0.15:0.887:0.998 0/0/1/1:4:58,61:0.48:-0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:24,102:0.80:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,32:0.31:-1.09:0.999:0.974 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,58:0.32: 0.10:1.000:0.964 0/1/1/1:4:19,79:0.80:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,102:0.64:-0.20:1.000:0.668 0/0/1/1:4:66,46:0.39:-0.87:1.000:0.665 0/0/1/1:4:87,111:0.53: 0.47:1.000:0.992 0/0/1/1:4:79,108:0.55: 0.30:1.000:0.979 0/0/0/1:4:120,43:0.25:-0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.42:0.968:1.000 0/0/1/1:4:62,41:0.38:-1.01:1.000:0.515 0/0/0/1:4:76,49:0.37:-0.67:1.000:0.560 0/1/1/1:4:52,103:0.65:-0.20:1.000:0.747 0/1/1/1:4:21,95:0.81:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,96:0.59:-0.17:1.000:0.879 0/1/1/1:4:47,88:0.63:-0.51:1.000:0.583 0/0/1/1:4:70,80:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,45:0.38:-0.85:1.000:0.518 0/1/1/1:4:46,99:0.67:-0.35:1.000:0.899 0/0/0/1:4:114,45:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,51:0.34:-0.40:1.000:0.871 0/0/0/1:4:75,34:0.30:-0.92:1.000:0.988 0/0/1/1:4:79,56:0.39:-0.51:1.000:0.708 0/0/1/1:4:63,94:0.57:-0.17:1.000:0.937 0/0/1/1:4:66,87:0.54:-0.23:1.000:0.987 0/0/1/1:4:46,63:0.55:-0.92:1.000:0.979 0/1/1/1:4:14,99:0.87:-0.85:1.000:0.903 0/0/0/1:4:67,44:0.37:-0.88:1.000:0.505 0/0/1/1:4:56,97:0.61:-0.23:1.000:0.669 0/0/1/1:4:59,86:0.57:-0.35:1.000:0.953 0/0/1/1:4:84,97:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,25:0.36:-1.60:1.000:0.648 0/0/1/1:4:43,70:0.60:-0.85:0.994:0.822 0/1/1/1:4:13,47:0.77:-1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,89:0.51:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,74:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/0/1/1:4:97,143:0.57: 1.13:1.000:0.946 0/1/1/1:4:69,222:0.75: 1.92:0.993:0.999 0/0/1/1:4:81,108:0.54: 0.33:1.000:0.985 0/0/1/1:4:54,74:0.55:-0.62:1.000:0.979 0/0/1/1:4:110,162:0.57: 1.63:1.000:0.946 0/0/0/1:4:98,36:0.26:-0.53:0.999:0.999 0/1/1/1:4:38,98:0.71:-0.49:1.000:0.990 0/0/0/1:4:84,34:0.27:-0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:95,34:0.25:-0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,79:0.53:-0.42:1.000:0.992 0/1/1/1:4:47,111:0.69:-0.15:1.000:0.968 0/0/0/0:4:104,1:0.01:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,114:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,38:0.26:-0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,72:0.74:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,57:0.32:-0.01:1.000:0.945 0/0/0/1:4:147,85:0.35: 1.00:1.000:0.823 0/0/0/1:4:92,24:0.20:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,95:0.71:-0.56:1.000:0.989 0/1/1/1:4:40,104:0.71:-0.37:1.000:0.991 0/1/1/1:4:17,107:0.86:-0.68:1.000:0.976 0/0/0/1:4:55,29:0.33:-1.31:1.000:0.933 0/1/1/1:4:9,75:0.89:-1.31:1.000:0.542 0/0/1/1:4:72,84:0.51:-0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:110,144:0.54: 1.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:58,26:0.29:-1.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:113,59:0.32: 0.07:1.000:0.940 0/0/1/1:4:56,48:0.43:-0.99:1.000:0.958 0/0/0/1:4:133,80:0.35: 0.71:1.000:0.744 0/0/1/1:4:89,110:0.52: 0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:45,80:0.62:-0.67:1.000:0.588 0/0/1/1:4:59,97:0.60:-0.18:1.000:0.802 0/1/1/1:4:31,64:0.66:-1.13:1.000:0.836 0/0/1/1:4:62,82:0.54:-0.37:1.000:0.987 0/1/1/1:4:45,118:0.71:-0.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,125:0.70: 0.10:1.000:0.988 0/1/1/1:4:21,39:0.63:-1.68:1.000:0.556 0/0/0/1:4:188,80:0.28: 1.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:133,84:0.37: 0.77:1.000:0.619 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,112:0.64: 0.04:1.000:0.678 0/0/0/0:4:185,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,45:0.24: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,81:0.36: 0.66:1.000:0.635 0/1/1/1:4:34,212:0.86: 1.22:1.000:0.978 0/0/0/1:4:14,8:0.34:-2.27:1.000:0.843 0/1/1/1:4:64,195:0.74: 1.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:141,64:0.30: 0.58:1.000:0.988 0/1/1/1:4:79,174:0.67: 1.33:1.000:0.924 0/1/1/1:4:74,176:0.69: 1.28:1.000:0.971 0/0/0/1:4:129,74:0.34: 0.55:1.000:0.836 0/0/1/1:4:93,64:0.38:-0.17:1.000:0.631 0/0/0/1:4:194,80:0.28: 1.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,63:0.36:-0.01:1.000:0.727 0/0/0/1:4:127,67:0.33: 0.41:1.000:0.933 0/1/1/1:4:58,169:0.73: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,103:0.48: 0.55:1.000:0.994 0/0/0/1:4:189,80:0.28: 1.58:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,124:0.65: 0.27:1.000:0.806 0/1/1/1:4:49,213:0.80: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,55:0.23: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,56:0.33:-0.10:1.000:0.924 0/0/1/1:4:93,94:0.47: 0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:123,39:0.23:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,127:0.56: 0.79:1.000:0.973 0/0/1/1:4:96,119:0.52: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:103,52:0.32:-0.20:1.000:0.959 0/1/1/1:4:59,170:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,183:0.53: 2.53:1.000:0.994 0/1/1/1:4:59,197:0.76: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,142:0.62: 0.86:1.000:0.632 0/0/1/1:4:100,144:0.56: 1.19:1.000:0.960 0/0/1/1:4:112,143:0.53: 1.36:0.956:0.991 0/1/1/1:4:72,170:0.69: 1.16:1.000:0.968 0/0/0/1:4:144,90:0.36: 1.04:1.000:0.648 0/0/0/1:4:102,45:0.29:-0.32:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,136:0.72: 0.27:1.000:0.996 -chr8.1 30530152 chr8.1_030530152 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:72,30:.: 0.61:1.000:. ./.:4:90,26:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:44,63:.: 0.76:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:110,39:.: 2.04:1.000:. ./.:4:53,15:.:-0.44:1.000:. ./.:4:97,27:.: 1.28:1.000:. ./.:4:41,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:7,6:.:-2.12:1.000:. ./.:4:3,11:.:-2.09:1.000:. ./.:4:80,56:.: 1.65:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,34:.: 0.33:1.000:. ./.:4:31,22:.:-0.89:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:74,38:.: 0.91:0.999:. ./.:4:147,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:44,70:.: 0.97:1.000:. ./.:4:92,32:.: 1.28:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:30,73:.: 0.64:1.000:. ./.:4:40,57:.: 0.45:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.93:1.000:. ./.:4:36,58:.: 0.36:1.000:. ./.:4:81,32:.: 0.94:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:72,62:.: 1.58:1.000:. ./.:4:51,77:.: 1.40:1.000:. ./.:4:52,83:.: 1.62:1.000:. ./.:4:52,39:.: 0.27:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.18:1.000:. ./.:4:9,5:.:-2.09:1.000:. ./.:3:6,16:.:-1.84:0.999:. ./.:4:45,34:.:-0.10:1.000:. ./.:4:41,63:.: 0.67:1.000:. ./.:4:64,72:.: 1.65:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:68,45:.: 0.94:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:45,22:.:-0.47:1.000:. ./.:4:37,55:.: 0.30:1.000:. ./.:4:24,53:.:-0.16:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:23,43:.:-0.50:1.000:. ./.:5:105,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:46,29:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,51:.:-0.16:1.000:. ./.:4:54,27:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:27,71:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:48,54:.: 0.61:1.000:. ./.:4:79,26:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,57:.: 0.45:1.000:. ./.:4:63,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,36:.:-0.40:1.000:. ./.:6:17,28:.:-1.14:1.000:. ./.:4:36,24:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:48,29:.:-0.16:1.000:. ./.:4:35,32:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,28:.:-0.07:1.000:. ./.:4:24,51:.:-0.22:1.000:. ./.:4:73,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:39,28:.:-0.47:0.887:. ./.:4:92,16:.: 0.79:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:27,14:.:-1.26:0.999:. ./.:4:53,47:.: 0.54:1.000:. ./.:4:36,62:.: 0.48:1.000:. ./.:4:71,10:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,54:.:-0.10:1.000:. ./.:4:33,16:.:-1.02:1.000:. ./.:4:52,19:.:-0.34:1.000:. ./.:4:66,28:.: 0.36:1.000:. ./.:4:86,28:.: 0.97:1.000:. ./.:4:38,45:.: 0.02:0.968:. ./.:4:32,26:.:-0.74:1.000:. ./.:4:31,22:.:-0.89:1.000:. ./.:4:21,31:.:-0.92:1.000:. ./.:4:59,26:.: 0.09:1.000:. ./.:4:69,21:.: 0.24:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:23,27:.:-0.99:1.000:. ./.:4:54,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:40,32:.:-0.31:1.000:. ./.:4:30,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:44,26:.:-0.37:1.000:. ./.:4:32,22:.:-0.86:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:42,19:.:-0.65:1.000:. ./.:4:50,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,17:.:-1.48:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.14:0.994:. ./.:4:23,22:.:-1.14:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.02:0.993:. ./.:4:59,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:35,8:.:-1.20:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:35,28:.:-0.59:0.999:. ./.:4:37,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:51,26:.:-0.16:1.000:. ./.:4:24,48:.:-0.31:1.000:. ./.:4:48,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:38,24:.:-0.62:1.000:. ./.:4:23,49:.:-0.31:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:38,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:18,20:.:-1.35:1.000:. ./.:4:58,24:.:-0.01:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:28,37:.:-0.53:1.000:. ./.:4:14,19:.:-1.51:1.000:. ./.:4:57,21:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:21,33:.:-0.86:1.000:. ./.:4:30,14:.:-1.17:1.000:. ./.:4:26,47:.:-0.28:1.000:. ./.:4:102,31:.: 1.55:1.000:. ./.:4:16,28:.:-1.17:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.05:1.000:. ./.:4:50,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:54,31:.: 0.09:1.000:. ./.:4:46,34:.:-0.07:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:44,15:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,19:.:-1.51:1.000:. ./.:4:53,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:52,23:.:-0.22:1.000:. ./.:4:36,26:.:-0.62:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.82:1.000:. ./.:4:39,58:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:28,60:.: 0.18:1.000:. ./.:4:52,68:.: 1.16:1.000:. ./.:4:48,26:.:-0.25:1.000:. ./.:4:73,62:.: 1.62:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.42:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:87,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:38,76:.: 0.97:1.000:. ./.:4:50,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:54,22:.:-0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:38,61:.: 0.51:1.000:. ./.:4:82,29:.: 0.88:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:46,68:.: 0.97:1.000:. ./.:4:87,47:.: 1.58:1.000:. ./.:4:73,43:.: 1.03:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:82,29:.: 0.88:1.000:. ./.:4:43,53:.: 0.42:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:37,56:.: 0.33:1.000:. ./.:4:56,29:.: 0.09:1.000:. ./.:4:74,31:.: 0.70:1.000:. ./.:4:73,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,59:.: 0.12:1.000:. ./.:4:148,59:.: 3.82:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:105,32:.: 1.68:1.000:. ./.:4:85,35:.: 1.16:0.956:. ./.:4:53,71:.: 1.28:1.000:. ./.:4:74,68:.: 1.83:1.000:. ./.:4:41,31:.:-0.31:1.000:. ./.:4:116,25:.: 1.80:1.000:. -chr8.1 30781102 chr8.1_030781102 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:173,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.26:0.999:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:212,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.34:1.000:. ./.:3:21,0:.:-2.02:0.999:. ./.:4:168,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.46:1.000:. ./.:5:186,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.51:1.000:. ./.:6:126,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:40,1:.:-1.61:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.01:0.887:. ./.:4:167,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.11:0.999:. ./.:4:225,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.35:0.968:. ./.:4:182,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:129,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.58:0.994:. ./.:4:73,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.26:0.993:. ./.:4:95,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.38:0.999:. ./.:4:160,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:59,1:.:-1.21:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:134,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:234,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:232,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:149,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.23:0.956:. ./.:4:147,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.37:1.000:. -chr8.1 30854423 chr8.1_030854423 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:20,9:0.32:-0.55:1.000:0.959 0/0/0/1:4:20,8:0.29:-0.60:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,9:0.22: 0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,7:0.24:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.28:-0.85:1.000:0.995 0/0/0/1:4:48,16:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,39:0.38: 2.59:1.000:0.614 0/0/0/1:4:23,9:0.29:-0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,11:0.48:-0.81:1.000:0.995 0/0/0/1:4:20,7:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/0:4:19,2:0.10:-0.90:1.000:0.815 0/0/0/1:4:18,6:0.26:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/0:4:21,1:0.05:-0.85:0.999:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.28:-1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,17:0.54:-0.55:1.000:0.986 0/0/1/1:4:14,11:0.44:-0.72:1.000:0.971 0/0/1/1:4:31,26:0.46: 0.64:1.000:0.986 0/0/1/1:4:10,11:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,9:0.27:-0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,8:0.40:-0.94:1.000:0.823 0/0/0/1:4:47,24:0.34: 1.23:1.000:0.838 0/0/1/1:4:10,14:0.54:-0.77:1.000:0.987 0/0/0/1:4:9,5:0.36:-1.19:1.000:0.654 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-1.24:1.000:0.964 0/0/1/1:4:17,16:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/0/0/1:4:17,5:0.24:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,22:0.33: 1.15:1.000:0.936 0/0/0/0:4:96,10:0.10: 2.72:1.000:0.834 0/1/1:3:7,9:0.53:-1.11:0.999:0.890 0/0/1/1:4:21,14:0.40:-0.30:1.000:0.823 0/0/1/1:4:6,11:0.57:-1.07:1.000:0.937 0/0/1/1:4:16,11:0.41:-0.64:1.000:0.871 0/0/0/1:4:33,7:0.18:-0.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,7:0.31:-0.81:1.000:0.970 0/0/0/1:4:25,13:0.35:-0.17:1.000:0.806 0/0/0/0:4:52,3:0.06: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.52: 0.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:47,17:0.27: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,25:0.37: 1.11:1.000:0.524 0/0/0/1:4:30,11:0.28:-0.04:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:14,19:0.54:-0.38:1.000:0.820 0/0/0/1:4:100,38:0.28: 4.08:1.000:0.994 0/0/0/0:4:61,7:0.11: 1.11:1.000:0.598 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,27:0.58:-0.04:1.000:0.917 0/0/1/1:4:25,15:0.38:-0.09:1.000:0.569 0/0/1/1:4:26,16:0.39: 0.00:1.000:0.641 0/0/1/1:4:16,10:0.39:-0.68:1.000:0.683 0/0/0/0:4:75,4:0.05: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.26: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,21:0.25: 2.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,28:0.55: 0.21:1.000:0.982 0/0/0/0/0/1:6:58,17:0.24: 1.40:1.000:0.668 0/0/0/1:4:58,13:0.19: 1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,11:0.27: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,38:0.53: 1.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:60,23:0.29: 1.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:32,9:0.23:-0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,3:0.10:-0.43:1.000:0.845 0/0/0/1:4:34,15:0.31: 0.30:1.000:0.967 0/0/1/1:4:21,30:0.54: 0.38:0.887:0.985 0/0/0/0:4:35,2:0.06:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,24:0.29: 1.87:1.000:0.993 0/0/0/1:4:46,12:0.22: 0.68:0.999:1.000 0/0/0/1:4:65,22:0.26: 1.91:1.000:0.998 0/0/0/0:4:48,4:0.08: 0.42:1.000:0.988 0/0/0/1:4:47,23:0.34: 1.19:1.000:0.896 0/0/0/1:4:31,17:0.36: 0.25:1.000:0.689 0/0/1/1:4:25,25:0.50: 0.34:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,9:0.18: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,22:0.52:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:33,12:0.28: 0.13:0.968:0.997 0/0/0/0:4:80,8:0.09: 1.96:1.000:0.893 0/0/0/0:4:104,8:0.07: 2.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,9:0.34:-0.64:1.000:0.869 0/0/0/1:4:53,20:0.28: 1.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,18:0.27: 1.15:1.000:0.998 0/0/0/1:4:30,16:0.35: 0.17:1.000:0.755 0/0/0/1:4:34,14:0.30: 0.25:1.000:0.985 0/0/1/1:4:31,23:0.43: 0.51:1.000:0.944 0/0/0/1:4:32,12:0.28: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,23:0.54:-0.13:1.000:0.984 0/0/1/1:4:21,21:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,25:0.53: 0.08:1.000:0.991 0/0/0/0:4:22,1:0.05:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,21:0.31: 1.15:1.000:0.970 0/0/0/1:4:57,20:0.27: 1.49:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,25:0.37: 1.15:1.000:0.592 0/0/1/1:4:23,25:0.51: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,40:0.47: 1.83:1.000:0.993 0/0/0/1:4:23,9:0.29:-0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:9,17:0.58:-0.68:1.000:0.926 0/0/0/1:4:73,22:0.24: 2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,23:0.55:-0.17:1.000:0.977 0/0/0/1:4:79,21:0.22: 2.47:0.994:1.000 0/0/0/1:4:42,17:0.30: 0.72:1.000:0.988 0/0/0/1:4:28,9:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,13:0.20: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.33:-0.85:1.000:0.938 0/0/1/1:4:21,16:0.44:-0.21:0.993:0.958 0/0/0/1:4:39,12:0.25: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,18:0.27: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,8:0.33:-0.72:1.000:0.932 0/0/1/1:4:31,33:0.51: 0.93:0.999:0.996 0/0/1/1:4:37,24:0.40: 0.81:1.000:0.770 0/0/1/1:4:21,29:0.54: 0.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:23,31:0.54: 0.51:1.000:0.989 0/0/0/1:4:39,17:0.31: 0.59:1.000:0.971 0/0/1/1:4:23,19:0.45: 0.00:1.000:0.984 0/0/0/1:4:43,11:0.21: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,24:0.58:-0.26:1.000:0.900 0/0/0/0:4:55,3:0.05: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,15:0.27: 0.68:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,24:0.51: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,8:0.54:-1.19:1.000:0.990 0/0/1/1:4:14,29:0.59: 0.04:1.000:0.880 0/0/0/1:4:64,14:0.19: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.42:-0.04:1.000:0.906 0/0/1/1:4:36,28:0.44: 0.93:1.000:0.967 0/0/1/1:4:14,25:0.57:-0.13:1.000:0.945 0/0/1/1:4:40,26:0.40: 1.02:1.000:0.775 0/0/1/1:4:22,29:0.53: 0.38:1.000:0.991 0/0/0/1:4:13,4:0.25:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,18:0.51:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:32,4:0.12:-0.26:1.000:0.663 0/0/0/0:4:49,1:0.02: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,14:0.31: 0.21:1.000:0.979 0/0/0/1:4:40,14:0.27: 0.51:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,16:0.26: 0.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,23:0.39: 0.72:1.000:0.737 0/0/1/1:4:31,39:0.53: 1.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:21,7:0.26:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:36,8:0.19: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.53:-0.64:1.000:0.993 0/0/0/0:4:57,4:0.07: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:24,6:0.21:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.23:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,19:0.42: 0.17:1.000:0.899 0/0/1/1:4:9,17:0.58:-0.68:1.000:0.926 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-1.49:1.000:0.990 0/0/1/1:4:5,9:0.57:-1.19:1.000:0.943 0/0/1/1:4:35,32:0.48: 1.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,6:0.46:-1.24:1.000:0.989 0/0/0/1:4:18,9:0.34:-0.64:1.000:0.869 0/0/0/1:4:24,13:0.36:-0.21:1.000:0.719 0/0/1/1:4:22,15:0.41:-0.21:1.000:0.859 0/0/1/1:4:10,11:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/0/0/1:4:14,8:0.37:-0.85:1.000:0.575 0/0/1/1:4:8,17:0.59:-0.72:1.000:0.864 0/0/0/0:4:23,1:0.04:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,11:0.52:-0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:4,6:0.55:-1.36:1.000:0.980 0/0/0/0:4:23,2:0.08:-0.72:1.000:0.980 0/0/0/1:4:13,6:0.32:-0.98:1.000:0.945 0/0/1/1:4:10,8:0.45:-1.02:1.000:0.976 0/0/0/1:4:16,3:0.16:-0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,13:0.58:-0.94:1.000:0.932 0/0/1/1:4:8,13:0.56:-0.90:1.000:0.968 0/0/1/1:4:8,12:0.55:-0.94:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-1.49:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,15:0.48:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,6:0.52:-1.32:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,18:0.57:-0.60:1.000:0.943 0/0/1/1:4:13,8:0.39:-0.90:1.000:0.641 0/0/0/1:4:17,3:0.16:-0.94:1.000:0.993 0/0/0/1:4:17,9:0.35:-0.68:0.956:0.771 0/0/0/1:4:24,7:0.24:-0.47:0.998:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.55:-0.85:1.000:0.984 0/0/0/1:4:29,4:0.13:-0.38:1.000:0.872 0/0/1/1:4:22,13:0.38:-0.30:1.000:0.524 -chr8.1 31231432 chr8.1_031231432 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:421,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:245,81:.:-0.70:1.000:. ./.:4:263,87:.:-0.39:1.000:. ./.:4:283,107:.: 0.12:1.000:. ./.:4:315,120:.: 0.70:1.000:. ./.:4:230,203:.: 0.67:1.000:. ./.:4:245,64:.:-0.92:1.000:. ./.:4:299,84:.: 0.03:1.000:. ./.:4:301,86:.: 0.08:1.000:. ./.:4:94,37:.:-3.19:1.000:. ./.:4:231,2:.:-1.89:1.000:. ./.:4:278,145:.: 0.54:1.000:. ./.:4:297,95:.: 0.15:1.000:. ./.:4:305,98:.: 0.29:1.000:. ./.:4:285,93:.:-0.03:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.58:0.999:. ./.:4:94,315:.: 0.36:1.000:. ./.:4:258,245:.: 1.57:1.000:. ./.:4:232,197:.: 0.62:1.000:. ./.:4:112,48:.:-2.82:1.000:. ./.:4:333,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:342,91:.: 0.67:1.000:. ./.:4:283,80:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,82:.:-2.81:1.000:. ./.:4:215,183:.: 0.22:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:283,82:.:-0.20:1.000:. ./.:4:243,251:.: 1.45:1.000:. ./.:4:313,85:.: 0.22:1.000:. ./.:4:327,92:.: 0.49:1.000:. ./.:4:223,70:.:-1.12:1.000:. ./.:4:41,74:.:-3.40:1.000:. ./.:4:151,0:.:-2.94:1.000:. ./.:3:20,42:.:-4.07:0.999:. ./.:4:398,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:324,95:.: 0.49:1.000:. ./.:4:317,88:.: 0.31:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:350,107:.: 0.98:1.000:. ./.:4:411,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:346,114:.: 1.02:1.000:. ./.:4:296,83:.:-0.02:1.000:. ./.:4:396,119:.: 1.72:1.000:. ./.:4:232,203:.: 0.70:1.000:. ./.:5:426,111:.: 2.00:1.000:. ./.:4:538,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:260,89:.:-0.40:1.000:. ./.:4:269,314:.: 2.59:1.000:. ./.:4:279,118:.: 0.21:1.000:. ./.:4:266,244:.: 1.66:1.000:. ./.:4:286,100:.: 0.07:1.000:. ./.:4:214,189:.: 0.29:1.000:. ./.:4:285,83:.:-0.16:1.000:. ./.:4:312,117:.: 0.62:1.000:. ./.:4:157,144:.:-1.02:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:182,164:.:-0.44:1.000:. ./.:6:324,17:.:-0.51:1.000:. ./.:4:375,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:394,139:.: 1.95:1.000:. ./.:4:197,204:.: 0.26:1.000:. ./.:4:321,103:.: 0.56:1.000:. ./.:4:193,210:.: 0.29:1.000:. ./.:4:133,136:.:-1.43:1.000:. ./.:4:189,164:.:-0.35:1.000:. ./.:4:193,195:.: 0.09:0.887:. ./.:4:327,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:473,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:295,87:.: 0.02:0.999:. ./.:4:459,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:266,87:.:-0.35:1.000:. ./.:4:286,101:.: 0.08:1.000:. ./.:4:281,77:.:-0.29:1.000:. ./.:4:321,106:.: 0.59:1.000:. ./.:4:203,212:.: 0.44:1.000:. ./.:4:184,211:.: 0.18:1.000:. ./.:4:212,202:.: 0.43:1.000:. ./.:4:230,73:.:-0.99:0.968:. ./.:4:444,3:.: 0.85:1.000:. ./.:4:490,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:280,69:.:-0.40:1.000:. ./.:4:506,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:295,91:.: 0.07:1.000:. ./.:4:247,70:.:-0.81:1.000:. ./.:4:234,81:.:-0.84:1.000:. ./.:4:285,106:.: 0.13:1.000:. ./.:4:272,83:.:-0.33:1.000:. ./.:4:234,78:.:-0.88:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:339,109:.: 0.86:1.000:. ./.:4:206,69:.:-1.35:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:311,87:.: 0.22:1.000:. ./.:4:145,161:.:-0.95:1.000:. ./.:4:238,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:428,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:268,77:.:-0.46:1.000:. ./.:4:322,97:.: 0.49:1.000:. ./.:4:238,81:.:-0.79:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.50:0.994:. ./.:4:269,73:.:-0.49:1.000:. ./.:4:287,117:.: 0.30:1.000:. ./.:4:250,93:.:-0.48:1.000:. ./.:4:292,85:.:-0.05:1.000:. ./.:4:394,107:.: 1.54:0.993:. ./.:4:301,73:.:-0.08:1.000:. ./.:4:299,134:.: 0.67:1.000:. ./.:4:419,126:.: 2.10:1.000:. ./.:4:195,181:.:-0.06:0.999:. ./.:4:404,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:164,169:.:-0.61:1.000:. ./.:4:236,192:.: 0.61:1.000:. ./.:4:304,101:.: 0.31:1.000:. ./.:4:180,197:.:-0.05:1.000:. ./.:4:284,97:.: 0.01:1.000:. ./.:4:272,87:.:-0.28:1.000:. ./.:4:301,105:.: 0.33:1.000:. ./.:4:263,96:.:-0.28:1.000:. ./.:4:213,167:.:-0.01:1.000:. ./.:4:402,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:277,108:.: 0.06:1.000:. ./.:4:345,87:.: 0.66:1.000:. ./.:4:214,203:.: 0.47:1.000:. ./.:4:257,99:.:-0.31:1.000:. ./.:4:208,73:.:-1.27:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:280,102:.: 0.02:1.000:. ./.:4:266,79:.:-0.46:1.000:. ./.:4:193,70:.:-1.50:1.000:. ./.:4:293,111:.: 0.30:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:546,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:182,204:.: 0.07:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:164,164:.:-0.67:1.000:. ./.:4:270,91:.:-0.25:1.000:. ./.:4:204,220:.: 0.56:1.000:. ./.:4:217,190:.: 0.34:1.000:. ./.:4:251,74:.:-0.71:1.000:. ./.:4:215,82:.:-1.07:1.000:. ./.:4:226,220:.: 0.84:1.000:. ./.:4:368,114:.: 1.30:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:215,164:.:-0.02:1.000:. ./.:4:378,116:.: 1.45:1.000:. ./.:4:182,138:.:-0.77:1.000:. ./.:4:227,204:.: 0.64:1.000:. ./.:4:289,69:.:-0.29:1.000:. ./.:4:116,39:.:-2.88:1.000:. ./.:4:268,79:.:-0.43:1.000:. ./.:4:172,200:.:-0.11:1.000:. ./.:4:328,93:.: 0.52:1.000:. ./.:4:248,195:.: 0.80:1.000:. ./.:4:300,106:.: 0.33:1.000:. ./.:4:358,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:274,94:.:-0.16:1.000:. ./.:4:298,78:.:-0.06:1.000:. ./.:4:254,63:.:-0.81:1.000:. ./.:4:289,93:.: 0.02:1.000:. ./.:4:261,79:.:-0.52:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:284,85:.:-0.15:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:256,98:.:-0.34:1.000:. ./.:4:240,77:.:-0.81:1.000:. ./.:4:292,76:.:-0.16:1.000:. ./.:4:249,71:.:-0.77:1.000:. ./.:4:239,61:.:-1.03:1.000:. ./.:4:209,172:.: 0.01:1.000:. ./.:4:170,163:.:-0.61:1.000:. ./.:4:181,139:.:-0.77:1.000:. ./.:4:155,125:.:-1.29:1.000:. ./.:4:246,211:.: 0.98:1.000:. ./.:4:322,109:.: 0.64:1.000:. ./.:4:315,97:.: 0.40:1.000:. ./.:4:161,147:.:-0.93:1.000:. ./.:4:330,89:.: 0.49:0.956:. ./.:4:388,105:.: 1.44:0.998:. ./.:4:357,122:.: 1.26:1.000:. ./.:4:348,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:327,98:.: 0.57:1.000:. -chr8.1 31272799 chr8.1_031272799 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:202,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:108,27:.:-0.01:1.000:. ./.:4:222,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:101,28:.:-0.16:1.000:. ./.:4:62,16:.:-1.44:1.000:. ./.:4:94,28:.:-0.33:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:9,0:.:-3.17:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:71,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:120,35:.: 0.49:1.000:. ./.:4:103,35:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:120,35:.: 0.49:1.000:. ./.:4:90,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,4:.:-3.22:1.000:. ./.:4:120,44:.: 0.72:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:124,40:.: 0.72:1.000:. ./.:4:101,29:.:-0.13:1.000:. ./.:4:103,30:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:10,1:.:-3.12:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.00:1.000:. ./.:3:1,1:.:-3.35:0.999:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:123,42:.: 0.75:1.000:. ./.:4:91,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:122,41:.: 0.70:1.000:. ./.:4:104,28:.:-0.08:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:126,46:.: 0.92:1.000:. ./.:5:235,0:.: 2.50:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.12:1.000:. ./.:4:96,31:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,21:.:-1.36:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:128,37:.: 0.75:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:149,48:.: 1.55:1.000:. ./.:4:124,32:.: 0.52:1.000:. ./.:4:101,35:.: 0.02:1.000:. ./.:4:138,28:.: 0.77:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:120,33:.: 0.44:1.000:. ./.:6:98,9:.:-0.71:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:98,32:.:-0.13:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:115,30:.: 0.24:1.000:. ./.:4:56,18:.:-1.54:1.000:. ./.:4:121,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:94,27:.:-0.36:0.887:. ./.:4:163,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:56,14:.:-1.64:0.999:. ./.:4:158,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:151,35:.: 1.27:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:82,36:.:-0.43:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,40:.: 0.67:1.000:. ./.:4:132,31:.: 0.70:1.000:. ./.:4:144,39:.: 1.20:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.09:0.968:. ./.:4:155,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:136,44:.: 1.12:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:53,23:.:-1.49:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:102,31:.:-0.06:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:106,29:.:-0.01:1.000:. ./.:4:114,28:.: 0.17:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.27:0.994:. ./.:4:120,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.17:0.993:. ./.:4:116,47:.: 0.70:1.000:. ./.:4:132,40:.: 0.92:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:127,29:.: 0.52:0.999:. ./.:4:176,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:65,24:.:-1.16:1.000:. ./.:4:131,39:.: 0.87:1.000:. ./.:4:79,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:77,18:.:-1.01:1.000:. ./.:4:109,35:.: 0.22:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:135,48:.: 1.20:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:120,37:.: 0.54:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:92,42:.:-0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:104,43:.: 0.29:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,15:.:-1.41:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:80,35:.:-0.51:1.000:. ./.:4:80,27:.:-0.71:1.000:. ./.:4:60,26:.:-1.24:1.000:. ./.:4:97,35:.:-0.08:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:111,32:.: 0.19:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:118,26:.: 0.22:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:132,28:.: 0.62:1.000:. ./.:4:126,39:.: 0.75:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:142,52:.: 1.47:1.000:. ./.:4:179,44:.: 2.20:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:127,30:.: 0.54:1.000:. ./.:4:122,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:107,51:.: 0.57:1.000:. ./.:4:124,25:.: 0.34:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.10:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:113,39:.: 0.42:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:146,35:.: 1.15:1.000:. ./.:4:112,29:.: 0.14:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:71,12:.:-1.31:1.000:. ./.:4:108,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:112,36:.: 0.32:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:111,26:.: 0.04:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:118,28:.: 0.27:1.000:. ./.:4:83,25:.:-0.69:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,23:.:-0.69:1.000:. ./.:4:112,32:.: 0.22:1.000:. ./.:4:112,32:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,30:.:-0.74:1.000:. ./.:4:114,24:.: 0.07:1.000:. ./.:4:106,37:.: 0.19:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:112,24:.: 0.02:1.000:. ./.:4:108,24:.:-0.08:0.956:. ./.:4:114,37:.: 0.39:0.998:. ./.:4:128,29:.: 0.54:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.02:1.000:. -chr8.1 31521180 chr8.1_031521180 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:292,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:167,32:.:-1.22:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:235,54:.: 0.13:1.000:. ./.:4:160,41:.:-1.19:1.000:. ./.:4:188,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:119,2:.:-2.39:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:255,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:195,43:.:-0.63:1.000:. ./.:4:272,58:.: 0.75:1.000:. ./.:4:225,42:.:-0.20:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:266,59:.: 0.67:1.000:. ./.:4:197,50:.:-0.50:1.000:. ./.:4:39,10:.:-3.47:1.000:. ./.:4:213,59:.:-0.12:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:285,59:.: 0.96:1.000:. ./.:4:153,30:.:-1.46:1.000:. ./.:4:246,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:54,2:.:-3.36:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.83:1.000:. ./.:3:71,9:.:-3.00:0.999:. ./.:4:241,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:227,45:.:-0.12:1.000:. ./.:4:230,40:.:-0.15:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:323,1:.: 0.66:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:280,67:.: 1.00:1.000:. ./.:4:207,49:.:-0.36:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:255,50:.: 0.37:1.000:. ./.:5:406,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:37,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:201,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:276,82:.: 1.17:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:266,62:.: 0.72:1.000:. ./.:4:332,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:249,85:.: 0.81:1.000:. ./.:4:192,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:262,51:.: 0.49:1.000:. ./.:4:207,55:.:-0.27:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:243,68:.: 0.46:1.000:. ./.:6:270,20:.: 0.15:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:409,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:230,66:.: 0.24:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:233,49:.: 0.03:1.000:. ./.:4:239,53:.: 0.18:1.000:. ./.:4:233,52:.: 0.07:1.000:. ./.:4:252,66:.: 0.57:0.887:. ./.:4:231,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:217,46:.:-0.26:0.999:. ./.:4:379,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:217,64:.: 0.01:1.000:. ./.:4:388,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:238,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:278,62:.: 0.90:1.000:. ./.:4:249,55:.: 0.36:1.000:. ./.:4:304,70:.: 1.41:1.000:. ./.:4:242,1:.:-0.56:0.968:. ./.:4:379,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:437,0:.: 2.35:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:308,75:.: 1.54:1.000:. ./.:4:268,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:250,58:.: 0.42:1.000:. ./.:4:307,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:411,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:178,42:.:-0.90:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:248,76:.: 0.66:1.000:. ./.:4:243,56:.: 0.28:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:353,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.94:0.994:. ./.:4:287,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.74:0.993:. ./.:4:201,50:.:-0.44:1.000:. ./.:4:241,43:.: 0.06:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:272,71:.: 0.94:0.999:. ./.:4:326,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:205,57:.:-0.27:1.000:. ./.:4:278,59:.: 0.85:1.000:. ./.:4:225,60:.: 0.07:1.000:. ./.:4:252,50:.: 0.33:1.000:. ./.:4:275,60:.: 0.82:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:212,59:.:-0.14:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:272,53:.: 0.67:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:223,50:.:-0.11:1.000:. ./.:4:379,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:273,47:.: 0.60:1.000:. ./.:4:271,1:.:-0.12:1.000:. ./.:4:220,41:.:-0.29:1.000:. ./.:4:262,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:253,65:.: 0.57:1.000:. ./.:4:164,39:.:-1.16:1.000:. ./.:4:135,38:.:-1.61:1.000:. ./.:4:192,51:.:-0.56:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:373,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:248,64:.: 0.48:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:199,51:.:-0.45:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:277,58:.: 0.82:1.000:. ./.:4:249,65:.: 0.51:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:308,64:.: 1.38:1.000:. ./.:4:282,70:.: 1.08:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:229,56:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,50:.:-0.21:1.000:. ./.:4:214,63:.:-0.05:1.000:. ./.:4:217,50:.:-0.20:1.000:. ./.:4:195,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:88,4:.:-2.82:1.000:. ./.:4:179,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:258,63:.: 0.61:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:259,53:.: 0.48:1.000:. ./.:4:224,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:171,34:.:-1.13:1.000:. ./.:4:184,36:.:-0.90:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:197,53:.:-0.45:1.000:. ./.:4:252,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:191,41:.:-0.72:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:175,36:.:-1.04:1.000:. ./.:4:177,43:.:-0.90:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:136,32:.:-1.68:1.000:. ./.:4:239,50:.: 0.13:1.000:. ./.:4:207,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:202,51:.:-0.41:1.000:. ./.:4:163,40:.:-1.16:1.000:. ./.:4:216,39:.:-0.38:1.000:. ./.:4:330,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:220,32:.:-0.42:1.000:. ./.:4:236,64:.: 0.30:0.956:. ./.:4:265,59:.: 0.66:0.998:. ./.:4:227,60:.: 0.10:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.09:1.000:. -chr8.1 32151817 chr8.1_032151817 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,279:.: 0.13:1.000:. ./.:4:143,140:.: 0.18:1.000:. ./.:4:84,242:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,336:.: 0.79:1.000:. ./.:4:84,213:.: 0.34:1.000:. ./.:4:192,213:.: 1.58:1.000:. ./.:4:51,201:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,263:.: 0.90:1.000:. ./.:4:86,277:.: 1.09:1.000:. ./.:4:23,58:.:-2.13:1.000:. ./.:4:0,171:.:-1.10:1.000:. ./.:4:231,166:.: 1.48:1.000:. ./.:4:162,148:.: 0.49:1.000:. ./.:4:82,250:.: 0.74:1.000:. ./.:4:75,247:.: 0.63:1.000:. ./.:4:101,280:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,378:.: 1.27:0.999:. ./.:4:182,183:.: 1.12:1.000:. ./.:4:90,327:.: 1.71:1.000:. ./.:4:91,311:.: 1.54:1.000:. ./.:4:18,138:.:-1.27:1.000:. ./.:4:72,197:.: 0.02:1.000:. ./.:4:72,241:.: 0.52:1.000:. ./.:4:94,256:.: 0.95:1.000:. ./.:4:46,55:.:-1.90:1.000:. ./.:4:105,354:.: 2.19:1.000:. ./.:4:88,258:.: 0.90:1.000:. ./.:4:196,160:.: 1.01:1.000:. ./.:4:71,275:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,424:.: 1.79:1.000:. ./.:4:109,307:.: 1.70:1.000:. ./.:4:100,253:.: 0.98:1.000:. ./.:4:29,60:.:-2.04:1.000:. ./.:4:0,120:.:-1.69:1.000:. ./.:3:60,31:.:-2.02:0.999:. ./.:4:86,299:.: 1.35:1.000:. ./.:4:77,292:.: 1.16:1.000:. ./.:4:75,268:.: 0.87:1.000:. ./.:4:77,250:.: 0.68:1.000:. ./.:4:103,258:.: 1.07:1.000:. ./.:4:62,161:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,256:.:-0.13:1.000:. ./.:4:72,244:.: 0.56:1.000:. ./.:4:59,186:.:-0.26:1.000:. ./.:4:119,103:.:-0.52:1.000:. ./.:4:74,188:.:-0.06:1.000:. ./.:5:158,234:.: 1.43:1.000:. ./.:4:88,202:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,259:.:-0.10:1.000:. ./.:4:190,182:.: 1.20:1.000:. ./.:4:74,90:.:-1.18:1.000:. ./.:4:85,266:.: 0.96:1.000:. ./.:4:86,85:.:-1.10:1.000:. ./.:4:67,170:.:-0.35:1.000:. ./.:4:57,215:.: 0.05:1.000:. ./.:4:2,319:.: 0.61:1.000:. ./.:4:50,167:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.33:1.000:. ./.:4:69,172:.:-0.30:1.000:. ./.:6:15,113:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,177:.:-1.03:1.000:. ./.:4:48,196:.:-0.27:1.000:. ./.:4:135,147:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,212:.:-0.07:1.000:. ./.:4:69,198:.: 0.00:1.000:. ./.:4:136,134:.: 0.03:1.000:. ./.:4:51,158:.:-0.67:1.000:. ./.:4:61,184:.:-0.26:1.000:. ./.:4:71,185:.:-0.13:0.887:. ./.:4:61,194:.:-0.14:1.000:. ./.:4:55,185:.:-0.31:1.000:. ./.:4:63,194:.:-0.12:0.999:. ./.:4:177,184:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,294:.: 0.30:1.000:. ./.:4:125,134:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,190:.:-0.02:1.000:. ./.:4:74,146:.:-0.54:1.000:. ./.:4:80,102:.:-0.98:1.000:. ./.:4:62,168:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,216:.: 0.14:1.000:. ./.:4:102,89:.:-0.87:0.968:. ./.:4:0,214:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.39:1.000:. ./.:4:57,167:.:-0.50:1.000:. ./.:4:76,223:.: 0.36:1.000:. ./.:4:53,156:.:-0.67:1.000:. ./.:4:46,132:.:-1.02:1.000:. ./.:4:46,126:.:-1.09:1.000:. ./.:4:49,140:.:-0.90:1.000:. ./.:4:67,188:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,175:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,162:.:-0.77:1.000:. ./.:4:77,166:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1,241:.:-0.29:1.000:. ./.:4:35,134:.:-1.13:1.000:. ./.:4:59,184:.:-0.28:1.000:. ./.:4:37,110:.:-1.38:1.000:. ./.:4:133,49:.:-0.98:1.000:. ./.:4:32,122:.:-1.30:1.000:. ./.:4:59,164:.:-0.51:1.000:. ./.:4:62,170:.:-0.40:1.000:. ./.:4:53,166:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,119:.:-1.27:0.994:. ./.:4:49,146:.:-0.83:1.000:. ./.:4:59,157:.:-0.59:1.000:. ./.:4:50,127:.:-1.03:1.000:. ./.:4:98,270:.: 1.15:1.000:. ./.:4:163,188:.: 0.96:0.993:. ./.:4:62,182:.:-0.27:1.000:. ./.:4:40,139:.:-1.01:1.000:. ./.:4:118,372:.: 2.55:1.000:. ./.:4:26,102:.:-1.60:0.999:. ./.:4:35,147:.:-0.98:1.000:. ./.:4:56,115:.:-1.10:1.000:. ./.:4:47,148:.:-0.83:1.000:. ./.:4:45,138:.:-0.97:1.000:. ./.:4:124,129:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.83:1.000:. ./.:4:91,89:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.93:1.000:. ./.:4:35,115:.:-1.34:1.000:. ./.:4:56,168:.:-0.50:1.000:. ./.:4:90,274:.: 1.11:1.000:. ./.:4:48,167:.:-0.60:1.000:. ./.:4:60,146:.:-0.70:1.000:. ./.:4:87,99:.:-0.93:1.000:. ./.:4:178,46:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,133:.:-1.19:1.000:. ./.:4:27,118:.:-1.40:1.000:. ./.:4:53,163:.:-0.59:1.000:. ./.:4:87,236:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,94:.:-1.64:1.000:. ./.:4:59,173:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,176:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,435:.: 1.92:1.000:. ./.:4:65,174:.:-0.32:1.000:. ./.:4:30,122:.:-1.32:1.000:. ./.:4:67,64:.:-1.56:1.000:. ./.:4:31,98:.:-1.58:1.000:. ./.:4:54,133:.:-0.92:1.000:. ./.:4:77,84:.:-1.22:1.000:. ./.:4:70,214:.: 0.19:1.000:. ./.:4:34,87:.:-1.68:1.000:. ./.:4:85,237:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,391:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.76:1.000:. ./.:4:71,219:.: 0.26:1.000:. ./.:4:103,266:.: 1.16:1.000:. ./.:4:60,156:.:-0.59:1.000:. ./.:4:93,289:.: 1.31:1.000:. ./.:4:184,165:.: 0.93:1.000:. ./.:4:14,36:.:-2.49:1.000:. ./.:4:162,191:.: 0.98:1.000:. ./.:4:91,275:.: 1.13:1.000:. ./.:4:66,219:.: 0.20:1.000:. ./.:4:93,316:.: 1.62:1.000:. ./.:4:69,258:.: 0.68:1.000:. ./.:4:65,193:.:-0.11:1.000:. ./.:4:97,289:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.47:1.000:. ./.:4:74,220:.: 0.30:1.000:. ./.:4:145,155:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,297:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,372:.: 1.20:1.000:. ./.:4:77,227:.: 0.42:1.000:. ./.:4:75,217:.: 0.28:1.000:. ./.:4:193,66:.:-0.10:1.000:. ./.:4:83,243:.: 0.67:1.000:. ./.:4:72,247:.: 0.59:1.000:. ./.:4:138,160:.: 0.35:1.000:. ./.:4:73,169:.:-0.29:1.000:. ./.:4:144,146:.: 0.26:1.000:. ./.:4:139,133:.: 0.05:1.000:. ./.:4:60,194:.:-0.15:1.000:. ./.:4:67,198:.:-0.03:1.000:. ./.:4:223,225:.: 2.07:1.000:. ./.:4:140,159:.: 0.36:1.000:. ./.:4:93,302:.: 1.46:1.000:. ./.:4:106,199:.: 0.43:1.000:. ./.:4:66,298:.: 1.11:0.956:. ./.:4:84,337:.: 1.76:0.998:. ./.:4:103,340:.: 2.01:1.000:. ./.:4:1,326:.: 0.68:1.000:. ./.:4:153,166:.: 0.59:1.000:. -chr8.1 32197967 chr8.1_032197967 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:32,0:.: 2.23:0.999:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,2:.: 1.51:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.65:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.94:0.999:. ./.:4:13,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:5:19,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,1:.: 0.36:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:35,0:.: 2.66:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:6:23,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.65:0.887:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.65:0.999:. ./.:4:37,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:19,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.07:0.968:. ./.:4:17,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:0.994:. ./.:4:21,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:0.993:. ./.:4:7,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:10,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:16,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:12,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.51:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.08:0.956:. ./.:4:11,0:.:-0.79:0.998:. ./.:4:12,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.08:1.000:. -chr8.1 32809513 chr8.1_032809513 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:23,30:0.55:-0.38:1.000:0.980 0/0/1/1:4:28,32:0.52: 0.02:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,55:0.71: 0.88:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,62:0.87: 0.59:1.000:0.884 0/1/1/1:4:18,59:0.74: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,72:0.78: 1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,60:1.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.47: 0.08:1.000:0.992 0/0/0/0:4:10,0:0.08:-2.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:3,4:0.55:-3.01:1.000:0.975 0/0/0/1:4:60,9:0.20: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,56:0.78: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,22:0.37: 0.19:1.000:0.520 0/0/1/1:4:35,29:0.45: 0.25:1.000:0.983 0/1/1/1:4:9,51:0.83: 0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,32:0.46: 0.54:0.999:0.988 0/0/1/1:4:24,29:0.53:-0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,47:0.56: 1.28:1.000:0.973 0/1/1/1:4:18,75:0.78: 1.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,10:0.49:-2.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,53:0.78: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,66:0.77: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,28:0.45: 0.19:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-3.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,39:0.46: 1.40:1.000:0.988 0/0/1/1:4:34,34:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,32:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/0/0/1:4:57,18:0.29: 0.88:1.000:0.992 0/1/1/1:4:12,57:0.81: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,57:0.77: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:43,10:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:1,0:0.08:-3.36:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,24:0.81:-1.75:1.000:1.000 1/1/1:3:0,7:1.00:-3.01:0.999:1.000 0/1/1/1:4:12,54:0.80: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,58:0.75: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,38:0.58: 0.19:1.000:0.892 0/1/1/1:4:16,62:0.77: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,14:0.26: 0.48:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,53:0.77: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,32:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,45:0.59: 0.82:1.000:0.866 0/1/1/1:4:16,47:0.72: 0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,63:0.81: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,40:0.57: 0.48:1.000:0.945 0/0/1/1/1:5:32,56:0.62: 1.63:1.000:0.967 0/0/0/0:4:2,0:0.08:-3.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,45:0.71: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-2.15:1.000:0.938 0/1/1/1:4:15,45:0.73: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:32,59:0.63: 1.80:1.000:0.538 0/1/1/1:4:8,42:0.82:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,13:0.28:-0.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,34:0.69:-0.67:1.000:0.966 0/1/1/1:4:18,45:0.69: 0.19:1.000:0.975 0/0/1/1:4:32,31:0.48: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:55,15:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1/1/1:6:16,26:0.60:-1.01:1.000:0.645 0/1/1/1:4:17,35:0.65:-0.44:1.000:0.807 0/1/1/1:4:15,65:0.79: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,30:0.43: 0.65:1.000:0.945 0/1/1/1:4:10,45:0.80:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,43:0.52: 1.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,38:0.67:-0.26:1.000:0.916 0/1/1/1:4:12,27:0.67:-1.18:1.000:0.921 0/1/1/1:4:12,42:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,49:0.74: 0.25:0.887:0.999 0/1/1/1:4:10,35:0.75:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,50:0.51: 2.08:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.67:0.999:1.000 0/0/1/1:4:40,44:0.51: 1.40:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,53:0.81: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,27:0.46:-0.04:1.000:0.985 0/1/1/1:4:13,43:0.74:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,10:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,56:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,43:0.67: 0.14:1.000:0.926 0/0/0/1:4:43,8:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,17:0.36:-0.44:0.968:0.732 0/1/1/1:4:10,58:0.84: 0.48:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,53:0.82: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,24:0.53:-0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:32,28:0.46: 0.02:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,31:0.68:-0.89:1.000:0.958 0/1/1/1:4:13,44:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,27:0.45: 0.02:1.000:0.980 0/1/1/1:4:18,40:0.67:-0.09:1.000:0.910 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,49:0.77: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,17:0.34:-0.26:1.000:0.853 0/1/1/1:4:8,41:0.82:-0.61:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,72:1.00: 0.71:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,49:0.90:-0.32:1.000:0.720 0/1/1/1:4:16,54:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,34:0.57:-0.09:1.000:0.950 0/1/1/1:4:13,45:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,26:0.61:-1.07:1.000:0.639 0/1/1/1:4:12,50:0.78: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,18:0.44:-1.07:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.09:0.994:1.000 0/0/0/1:4:28,10:0.31:-1.24:1.000:0.977 0/1/1/1:4:16,39:0.69:-0.26:1.000:0.967 0/1/1/1:4:12,41:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,40:0.58: 0.42:1.000:0.918 0/1/1/1:4:14,68:0.81: 1.28:0.993:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,49:0.52: 1.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,50:0.80: 0.08:0.999:1.000 0/1/1/1:4:10,60:0.84: 0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,31:0.68:-0.89:1.000:0.958 0/0/1/1:4:30,28:0.48:-0.09:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,42:0.80:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,46:0.80:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,42:0.80:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,35:0.61:-0.21:1.000:0.737 0/0/1/1:4:24,35:0.58:-0.04:1.000:0.931 0/0/1/1:4:38,27:0.42: 0.31:1.000:0.929 0/1/1/1:4:22,48:0.66: 0.59:1.000:0.891 0/1/1/1:4:8,45:0.83:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,39:0.48: 1.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,45:0.73: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,37:0.84:-0.95:1.000:0.993 0/1/1/1:4:9,27:0.73:-1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,25:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,35:0.57: 0.02:1.000:0.956 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,26:0.74:-1.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,20:0.57:-1.47:1.000:0.945 0/1/1/1:4:17,60:0.75: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,32:0.67:-0.78:1.000:0.933 0/1/1/1:4:10,48:0.81:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,29:0.78:-1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,29:0.47: 0.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:14,44:0.73:-0.09:1.000:0.998 1/1/1/1:4:5,46:0.89:-0.49:1.000:0.536 0/0/1/1:4:25,26:0.50:-0.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,26:0.61:-1.07:1.000:0.639 0/1/1/1:4:18,57:0.73: 0.88:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,60:0.74: 1.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,31:0.57:-0.38:1.000:0.953 0/0/1/1:4:24,24:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,65:0.76: 1.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,63:0.81: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,24:0.41: 0.08:1.000:0.846 0/0/1/1:4:29,16:0.38:-0.84:1.000:0.544 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:13,31:0.68:-0.89:1.000:0.958 0/1/1/1:4:25,48:0.64: 0.77:1.000:0.651 0/0/1/1:4:29,39:0.56: 0.48:1.000:0.972 0/0/1/1:4:26,40:0.59: 0.37:1.000:0.878 0/1/1/1:4:19,61:0.74: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,37:0.55: 0.31:1.000:0.977 0/0/1/1:4:38,41:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,37:0.75:-0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,37:0.69:-0.44:1.000:0.971 0/1/1/1:4:8,45:0.83:-0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,37:0.51: 0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,37:0.64:-0.21:1.000:0.687 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,53:0.70: 0.77:1.000:0.987 0/1/1/1:4:11,53:0.81: 0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,36:0.60:-0.09:1.000:0.777 0/0/1/1:4:24,28:0.52:-0.44:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,76:0.77: 2.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,18:0.39:-0.67:1.000:0.724 0/0/1/1:4:26,29:0.51:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,30:0.55:-0.38:1.000:0.980 0/0/1/1:4:48,45:0.48: 1.91:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,65:0.74: 1.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,42:0.47: 1.63:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,48:0.75: 0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 0.65:0.956:1.000 0/1/1/1:4:17,60:0.75: 1.00:0.998:0.999 0/0/1/1:4:30,42:0.57: 0.71:1.000:0.956 0/1/1/1:4:20,42:0.66: 0.14:1.000:0.841 0/0/1/1:4:22,33:0.58:-0.26:1.000:0.906 -chr8.1 32907519 chr8.1_032907519 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:103,38:0.25: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,38:0.29: 0.03:1.000:0.991 0/0/0/1:4:108,43:0.26: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,42:0.23: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,84:0.69:-0.02:1.000:0.973 0/0/1/1:4:92,99:0.49: 2.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,36:0.27: 0.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,38:0.27: 0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,84:0.70:-0.08:1.000:0.987 0/1/1/1:4:19,41:0.66:-1.63:1.000:0.866 0/0/0/1:4:38,23:0.35:-1.60:1.000:0.797 0/0/1/1:4:95,74:0.41: 1.39:1.000:0.855 0/1/1/1:4:26,101:0.78: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,65:0.40: 0.89:1.000:0.802 0/1/1/1:4:37,118:0.74: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,46:0.28: 0.86:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,48:0.25: 1.50:0.999:0.999 0/1/1/1:4:40,103:0.70: 0.67:1.000:0.984 0/0/1/1:4:73,83:0.50: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,67:0.45: 0.53:1.000:0.984 0/0/1/1:4:27,40:0.57:-1.43:1.000:0.950 0/0/0/1:4:75,36:0.30:-0.22:1.000:0.987 0/0/0/1:4:92,39:0.27: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,96:0.53: 1.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,33:0.52:-1.63:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,105:0.54: 1.81:1.000:0.987 0/0/0/1:4:126,48:0.25: 1.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,70:0.43: 0.89:1.000:0.955 0/0/0/1:4:70,35:0.31:-0.38:1.000:0.978 0/0/0/1:4:138,60:0.28: 2.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,60:0.32: 1.47:1.000:0.948 0/0/1/1:4:70,72:0.48: 0.64:1.000:0.994 0/1/1/1:4:3,10:0.75:-2.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:19,30:0.58:-1.93:1.000:0.894 0/0/1:3:12,4:0.23:-2.85:0.999:1.000 0/0/1/1:4:60,83:0.55: 0.67:1.000:0.979 0/0/0/1:4:112,42:0.25: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,51:0.27: 1.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,121:0.53: 2.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:62,22:0.24:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,39:0.32:-0.13:1.000:0.964 0/0/0/0:4:129,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:103,39:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,103:0.77: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,64:0.53:-0.10:1.000:0.994 0/0/1/1/1:5:71,99:0.55: 1.42:1.000:0.892 0/1/1/1:4:30,57:0.63:-0.88:1.000:0.560 0/0/0/1:4:100,35:0.24: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,59:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,53:0.56:-0.80:1.000:0.967 0/0/1/1:4:73,75:0.48: 0.81:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,73:0.71:-0.52:1.000:0.991 0/0/0/1:4:74,30:0.26:-0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:87,27:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,42:0.31: 0.14:1.000:0.970 0/0/1/1:4:39,39:0.47:-1.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:105,62:0.34: 1.33:1.000:0.843 0/0/0/1:4:90,37:0.27: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/0/0/1:6:55,13:0.17:-1.41:1.000:0.980 0/0/0/1:4:67,23:0.23:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,103:0.74: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,59:0.48:-0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:66,91:0.55: 1.06:1.000:0.980 0/1/1/1:4:40,117:0.72: 1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:70,73:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,73:0.50: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,58:0.52:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,70:0.55: 0.06:0.887:0.981 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,43:0.25: 1.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,33:0.28:-0.27:0.999:0.996 0/0/0/0:4:165,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,37:0.29:-0.05:1.000:0.992 0/0/0/1:4:79,30:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:91,40:0.28: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,70:0.57:-0.05:1.000:0.947 0/0/1/1:4:40,39:0.46:-1.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:43,52:0.52:-0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,32:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,25:0.26:-0.85:0.968:0.999 0/0/1/1:4:55,68:0.52: 0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,60:0.51:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,78:0.73:-0.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:72,36:0.31:-0.30:1.000:0.978 0/0/0/1:4:58,39:0.37:-0.60:1.000:0.513 0/1/1/1:4:20,62:0.74:-1.02:1.000:0.998 0/1/1/1:4:20,69:0.76:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,58:0.51:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,72:0.66:-0.35:1.000:0.835 0/0/0/1:4:79,43:0.33: 0.09:1.000:0.937 0/0/0/1:4:63,29:0.29:-0.74:1.000:0.992 0/0/1/1:4:51,59:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:72,33:0.29:-0.38:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,54:0.49:-0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,53:0.35: 0.56:1.000:0.758 0/0/1/1:4:32,37:0.50:-1.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,30:0.30:-0.71:1.000:0.988 0/0/0/1:4:62,21:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,57:0.46:-0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:49,52:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,81:0.74:-0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,33:0.50:-1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,59:0.57:-0.58:0.994:0.936 0/0/1/1:4:50,58:0.51:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,64:0.73:-0.94:1.000:0.998 0/1/1/1:4:22,91:0.79:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,84:0.45: 1.50:1.000:0.984 0/1/1/1:4:34,91:0.71: 0.17:0.993:0.990 0/0/0/1:4:80,30:0.25:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,22:0.26:-1.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,107:0.52: 2.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,40:0.54:-1.35:0.999:0.987 0/1/1/1:4:33,62:0.63:-0.66:1.000:0.525 0/0/1/1:4:22,30:0.55:-1.85:1.000:0.982 0/0/1/1:4:41,45:0.49:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,24:0.26:-0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:52,65:0.52:-0.05:1.000:0.994 0/0/0/1:4:72,22:0.21:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,85:0.80:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,1:0.01:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,68:0.72:-0.74:1.000:0.995 0/0/0/1:4:85,47:0.33: 0.37:1.000:0.925 0/0/0/1:4:125,39:0.22: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,27:0.31:-1.07:1.000:0.972 0/1/1/1:4:19,74:0.78:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,50:0.50:-0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:61,43:0.38:-0.41:1.000:0.631 0/0/0/0:4:58,1:0.02:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,16:0.20:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,35:0.40:-1.02:1.000:0.771 0/0/0/1:4:89,42:0.29: 0.34:1.000:0.989 0/0/0/1:4:65,19:0.21:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,26:0.30:-1.05:1.000:0.989 0/0/0/1:4:68,16:0.17:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,76:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,66:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,16:0.22:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,20:0.46:-2.15:1.000:0.986 0/1/1/1:4:17,52:0.73:-1.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:49,64:0.54:-0.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:24,41:0.60:-1.49:1.000:0.754 0/1/1/1:4:26,97:0.77: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,41:0.53:-1.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,75:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:121,34:0.20: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,25:0.15: 0.86:1.000:0.990 0/0/1/1:4:43,52:0.52:-0.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,69:0.48: 0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,69:0.53: 0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:129,36:0.20: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,78:0.53: 0.59:1.000:0.993 0/0/1/1:4:19,18:0.46:-2.26:1.000:0.985 0/1/1/1:4:18,75:0.79:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,66:0.30: 2.33:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,60:0.45: 0.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:76,69:0.45: 0.73:1.000:0.975 0/0/0/1:4:111,39:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,21:0.22:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,89:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,31:0.20: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,129:0.80: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,44:0.31: 0.28:1.000:0.966 0/0/0/1:4:92,34:0.25: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,39:0.28: 0.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,18:0.14:-0.10:1.000:0.974 0/0/0/1:4:74,32:0.28:-0.35:1.000:0.996 0/0/0/0:4:127,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,73:0.46: 0.84:1.000:0.987 0/0/0/1:4:75,37:0.30:-0.19:1.000:0.981 0/0/1/1:4:63,76:0.52: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,28:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,30:0.23:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,62:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,47:0.21: 2.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,112:0.70: 1.03:1.000:0.981 0/0/1/1:4:72,70:0.46: 0.64:1.000:0.989 0/0/1/1:4:54,59:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:107,53:0.30: 1.14:0.956:0.980 0/0/0/1:4:119,32:0.19: 0.89:0.998:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,71:0.47: 0.64:1.000:0.992 0/0/0/1:4:85,46:0.32: 0.34:1.000:0.941 -chr8.1 33091075 chr8.1_033091075 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:295,55:.: 0.30:1.000:. ./.:4:240,66:.:-0.10:1.000:. ./.:4:249,72:.: 0.04:1.000:. ./.:4:309,149:.: 1.29:1.000:. ./.:4:428,130:.: 2.20:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:285,51:.: 0.17:1.000:. ./.:4:324,146:.: 1.40:1.000:. ./.:4:397,73:.: 1.40:1.000:. ./.:4:32,6:.:-2.54:1.000:. ./.:4:30,16:.:-2.47:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:318,66:.: 0.61:1.000:. ./.:4:242,71:.:-0.04:1.000:. ./.:4:349,59:.: 0.83:1.000:. ./.:4:233,160:.: 0.69:1.000:. ./.:4:277,164:.: 1.13:0.999:. ./.:4:404,61:.: 1.35:1.000:. ./.:4:498,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:458,81:.: 2.03:1.000:. ./.:4:27,18:.:-2.48:1.000:. ./.:4:220,111:.: 0.13:1.000:. ./.:4:292,60:.: 0.32:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:10,19:.:-2.62:1.000:. ./.:4:419,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:261,64:.: 0.07:1.000:. ./.:4:200,69:.:-0.44:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:443,91:.: 1.98:1.000:. ./.:4:387,95:.: 1.51:1.000:. ./.:4:218,68:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,17:.:-2.60:1.000:. ./.:4:51,22:.:-2.22:1.000:. ./.:3:13,0:.:-2.77:0.999:. ./.:4:354,66:.: 0.94:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:237,155:.: 0.69:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:270,45:.:-0.02:1.000:. ./.:4:187,76:.:-0.49:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:262,47:.:-0.07:1.000:. ./.:4:303,37:.: 0.21:1.000:. ./.:4:300,55:.: 0.35:1.000:. ./.:5:378,66:.: 1.16:1.000:. ./.:4:108,25:.:-1.68:1.000:. ./.:4:215,99:.:-0.03:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:262,21:.:-0.31:1.000:. ./.:4:217,53:.:-0.43:1.000:. ./.:4:254,115:.: 0.48:1.000:. ./.:4:248,83:.: 0.13:1.000:. ./.:4:292,92:.: 0.61:1.000:. ./.:4:269,45:.:-0.03:1.000:. ./.:4:198,0:.:-1.08:1.000:. ./.:6:145,43:.:-1.17:1.000:. ./.:4:197,68:.:-0.47:1.000:. ./.:4:304,74:.: 0.56:1.000:. ./.:4:207,44:.:-0.60:1.000:. ./.:4:208,77:.:-0.29:1.000:. ./.:4:354,63:.: 0.91:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:167,38:.:-1.02:1.000:. ./.:4:265,91:.: 0.36:1.000:. ./.:4:293,51:.: 0.25:0.887:. ./.:4:277,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:223,47:.:-0.43:1.000:. ./.:4:166,75:.:-0.69:0.999:. ./.:4:319,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:332,128:.: 1.31:1.000:. ./.:4:267,34:.:-0.14:1.000:. ./.:4:239,41:.:-0.34:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:277,73:.: 0.30:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.99:0.968:. ./.:4:295,86:.: 0.58:1.000:. ./.:4:330,81:.: 0.86:1.000:. ./.:4:271,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:160,43:.:-1.04:1.000:. ./.:4:284,91:.: 0.53:1.000:. ./.:4:174,47:.:-0.87:1.000:. ./.:4:210,76:.:-0.28:1.000:. ./.:4:170,28:.:-1.08:1.000:. ./.:4:282,57:.: 0.20:1.000:. ./.:4:225,48:.:-0.40:1.000:. ./.:4:239,38:.:-0.36:1.000:. ./.:4:264,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:251,106:.: 0.37:1.000:. ./.:4:291,79:.: 0.48:1.000:. ./.:4:267,102:.: 0.48:1.000:. ./.:4:203,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:182,40:.:-0.86:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:400,62:.: 1.32:1.000:. ./.:4:154,26:.:-1.25:1.000:. ./.:4:291,89:.: 0.58:1.000:. ./.:4:157,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:268,49:.: 0.00:0.994:. ./.:4:173,27:.:-1.07:1.000:. ./.:4:283,78:.: 0.40:1.000:. ./.:4:223,62:.:-0.29:1.000:. ./.:4:240,178:.: 0.92:1.000:. ./.:4:414,66:.: 1.49:0.993:. ./.:4:275,113:.: 0.65:1.000:. ./.:4:232,72:.:-0.12:1.000:. ./.:4:296,222:.: 1.83:1.000:. ./.:4:247,31:.:-0.35:0.999:. ./.:4:300,43:.: 0.24:1.000:. ./.:4:205,29:.:-0.76:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:168,63:.:-0.78:1.000:. ./.:4:197,38:.:-0.75:1.000:. ./.:4:279,32:.:-0.05:1.000:. ./.:4:213,36:.:-0.62:1.000:. ./.:4:201,54:.:-0.56:1.000:. ./.:4:263,35:.:-0.17:1.000:. ./.:4:191,44:.:-0.75:1.000:. ./.:4:305,84:.: 0.66:1.000:. ./.:4:270,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:348,66:.: 0.89:1.000:. ./.:4:249,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:171,42:.:-0.95:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:137,28:.:-1.38:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:335,160:.: 1.62:1.000:. ./.:4:189,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:280,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:206,87:.:-0.22:1.000:. ./.:4:466,169:.: 2.90:1.000:. ./.:4:256,98:.: 0.34:1.000:. ./.:4:139,73:.:-0.96:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:231,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:223,73:.:-0.19:1.000:. ./.:4:215,35:.:-0.61:1.000:. ./.:4:352,63:.: 0.89:1.000:. ./.:4:124,63:.:-1.18:1.000:. ./.:4:482,63:.: 2.08:1.000:. ./.:4:384,149:.: 1.97:1.000:. ./.:4:323,68:.: 0.68:1.000:. ./.:4:264,51:.:-0.02:1.000:. ./.:4:368,90:.: 1.29:1.000:. ./.:4:325,41:.: 0.45:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:227,78:.:-0.11:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:299,52:.: 0.31:1.000:. ./.:4:234,86:.: 0.03:1.000:. ./.:4:207,106:.:-0.04:1.000:. ./.:4:353,75:.: 1.01:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:300,70:.: 0.48:1.000:. ./.:4:276,104:.: 0.58:1.000:. ./.:4:189,55:.:-0.66:1.000:. ./.:4:332,71:.: 0.79:1.000:. ./.:4:257,81:.: 0.19:1.000:. ./.:4:228,142:.: 0.48:1.000:. ./.:4:351,60:.: 0.86:1.000:. ./.:4:215,125:.: 0.21:1.000:. ./.:4:267,54:.: 0.04:1.000:. ./.:4:357,50:.: 0.82:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:236,57:.:-0.22:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:172,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:224,51:.:-0.38:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:408,63:.: 1.41:1.000:. ./.:4:196,140:.: 0.17:1.000:. ./.:4:271,97:.: 0.47:1.000:. ./.:4:316,172:.: 1.56:0.956:. ./.:4:380,88:.: 1.38:0.998:. ./.:4:319,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:324,100:.: 0.98:1.000:. ./.:4:290,61:.: 0.31:1.000:. -chr8.1 33192907 chr8.1_033192907 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:35,56:0.60:-0.18:1.000:0.783 0/1/1/1:4:17,68:0.74:-0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,47:0.63:-0.77:1.000:0.543 0/1/1/1:4:17,139:0.85: 1.83:1.000:0.987 1/1/1/1:4:8,154:0.93: 2.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,87:0.86: 0.01:1.000:0.971 0/1/1/1:4:6,39:0.82:-1.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:8,124:0.92: 1.09:1.000:0.981 0/1/1/1:4:12,71:0.80:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,36:0.56:-1.01:1.000:0.964 0/1/1/1:4:11,30:0.69:-1.73:1.000:0.968 0/1/1/1:4:20,51:0.68:-0.80:1.000:0.945 0/1/1/1:4:17,61:0.72:-0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,86:0.75: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,75:0.78:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,116:0.84: 1.06:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,117:0.84: 1.12:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,214:1.00: 3.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,94:0.78: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:9,147:0.92: 1.83:1.000:0.990 0/1/1/1:4:10,25:0.67:-1.91:1.000:0.935 0/1/1/1:4:21,98:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,81:0.77: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,51:0.83:-1.20:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,75:0.84:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,55:0.67:-0.58:1.000:0.908 0/1/1/1:4:13,85:0.82: 0.04:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,53:0.64:-0.52:1.000:0.636 0/1/1/1:4:21,83:0.74: 0.22:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,71:0.74:-0.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,70:0.83:-0.52:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,33:0.66:-1.54:1.000:0.897 0/0/1:3:18,10:0.42:-2.13:0.999:0.995 0/1/1/1:4:15,38:0.68:-1.35:1.000:0.942 0/0/1/1:4:23,28:0.55:-1.42:1.000:0.978 0/0/1/1:4:29,27:0.50:-1.26:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,98:0.81: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,42:0.64:-1.05:1.000:0.673 0/0/1/1:4:30,37:0.55:-0.92:1.000:0.975 0/1/1/1:4:22,83:0.73: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,44:0.56:-0.58:1.000:0.962 0/1/1/1:4:23,69:0.70:-0.15:1.000:0.985 0/1/1/1:4:33,76:0.66: 0.38:1.000:0.877 0/1/1/1:4:12,136:0.89: 1.58:1.000:0.517 0/0/1/1/1:5:43,111:0.68: 1.77:1.000:0.722 0/0/0/1:4:41,4:0.25:-1.60:1.000:0.999 1/1/1/1:4:9,129:0.91: 1.27:1.000:0.951 0/1/1/1:4:17,38:0.66:-1.29:1.000:0.846 0/0/1/1:4:43,23:0.42:-0.95:1.000:0.899 0/1/1/1:4:35,83:0.67: 0.65:1.000:0.902 0/1/1/1:4:27,65:0.67:-0.15:1.000:0.913 1/1/1/1:4:9,133:0.91: 1.40:1.000:0.966 1/1/1/1:4:9,106:0.89: 0.56:1.000:0.606 1/1/1/1:4:6,110:0.93: 0.59:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,154:1.00: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,38:0.47:-0.30:1.000:0.993 0/1/1/1:4:33,69:0.65: 0.16:1.000:0.754 0/0/1/1/1/1:6:30,56:0.63:-0.33:1.000:0.821 0/1/1/1:4:27,72:0.68: 0.07:1.000:0.962 1/1/1/1:4:5,101:0.94: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,98:0.65: 1.49:1.000:0.749 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,81:0.69: 0.41:1.000:0.974 0/1/1/1:4:28,67:0.67:-0.06:1.000:0.909 0/1/1/1:4:11,71:0.82:-0.46:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,82:0.76: 0.07:0.887:1.000 0/1/1/1:4:23,90:0.73: 0.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,42:0.51:-0.33:1.000:0.996 1/1/1/1:4:4,58:0.91:-1.08:0.999:0.957 0/0/0/0:4:69,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,126:0.84: 1.43:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,58:0.68:-0.52:1.000:0.958 0/1/1/1:4:28,52:0.63:-0.52:1.000:0.516 0/0/1/1:4:41,27:0.45:-0.89:1.000:0.977 0/1/1/1:4:25,70:0.69:-0.06:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,161:1.00: 1.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,50:0.64:-0.67:1.000:0.673 0/0/1/1:4:30,26:0.49:-1.26:0.968:0.996 0/1/1/1:4:18,103:0.80: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,96:0.68: 1.15:1.000:0.941 0/1/1/1:4:19,71:0.73:-0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,35:0.51:-0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,122:0.87: 1.18:1.000:0.925 0/1/1/1:4:11,76:0.83:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,87:0.82: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,58:0.66:-0.43:1.000:0.884 0/0/1/1:4:26,47:0.62:-0.74:1.000:0.545 0/0/1/1:4:33,54:0.60:-0.30:1.000:0.747 0/0/1/1:4:42,47:0.54:-0.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,39:0.47:-0.21:1.000:0.993 1/1/1/1:4:7,84:0.89:-0.18:1.000:0.662 0/1/1/1:4:28,92:0.71: 0.72:1.000:0.993 1/1/1/1:4:9,110:0.90: 0.68:1.000:0.712 1/1/1/1:4:0,101:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,84:0.73: 0.28:1.000:0.998 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,41:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,25:0.65:-1.85:1.000:0.748 0/1/1/1:4:17,99:0.80: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.49:-1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:36,68:0.63: 0.22:0.994:0.553 0/1/1/1:4:24,53:0.65:-0.61:1.000:0.832 0/1/1/1:4:14,128:0.86: 1.40:1.000:0.946 1/1/1/1:4:11,127:0.89: 1.27:1.000:0.543 1/1/1/1:4:7,126:0.93: 1.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,82:0.70: 0.41:0.993:0.982 1/1/1/1:4:7,130:0.93: 1.24:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,101:0.83: 0.56:1.000:0.997 1/1/1/1:4:7,166:0.94: 2.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,111:0.85: 0.87:0.999:0.991 0/0/1/1:4:49,45:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,50:0.88:-1.29:1.000:0.844 0/1/1/1:4:27,65:0.67:-0.15:1.000:0.913 0/1/1/1:4:10,55:0.79:-0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,92:0.79: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,68:0.62: 0.28:1.000:0.567 0/1/1/1:4:32,71:0.66: 0.19:1.000:0.837 0/1/1/1:4:20,57:0.69:-0.61:1.000:0.978 0/1/1/1:4:22,61:0.69:-0.43:1.000:0.972 0/1/1/1:4:17,117:0.83: 1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,50:0.65:-0.71:1.000:0.748 0/0/1/1:4:37,26:0.46:-1.05:1.000:0.986 0/1/1/1:4:27,100:0.73: 0.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,97:0.80: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,60:0.63:-0.18:1.000:0.606 0/0/1/1:4:25,13:0.41:-1.82:1.000:0.878 0/0/1/1:4:31,23:0.47:-1.32:1.000:0.991 0/0/1/1:4:36,23:0.44:-1.17:1.000:0.972 0/1/1/1:4:12,130:0.88: 1.40:1.000:0.657 0/0/1/1:4:27,21:0.47:-1.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,67:0.74:-0.40:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,71:0.70:-0.09:1.000:0.988 0/1/1/1:4:17,84:0.77: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,135:1.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,69:0.62: 0.31:1.000:0.535 0/1/1/1:4:28,65:0.66:-0.12:1.000:0.884 0/1/1/1:4:24,68:0.69:-0.15:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,97:0.83: 0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:19,78:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,57:0.78:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:12,138:0.89: 1.64:1.000:0.530 1/1/1/1:4:6,134:0.94: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,50:0.58:-0.37:1.000:0.911 1/1/1/1:4:4,102:0.95: 0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:9,152:0.92: 1.98:1.000:0.994 1/1/1/1:4:7,103:0.91: 0.41:1.000:0.964 0/1/1/1:4:24,103:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,68:0.72:-0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,19:0.45:-1.51:1.000:0.976 0/1/1/1:4:10,80:0.85:-0.21:1.000:0.990 0/1/1/1:4:10,105:0.88: 0.56:1.000:0.742 1/1/1/1:4:11,128:0.89: 1.30:1.000:0.568 1/1/1/1:4:9,124:0.91: 1.12:1.000:0.920 0/0/1/1:4:29,30:0.52:-1.17:1.000:0.994 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,90:0.82: 0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,117:0.88: 0.96:1.000:0.709 0/1/1/1:4:22,59:0.68:-0.49:1.000:0.963 0/1/1/1:4:23,76:0.71: 0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:18,64:0.72:-0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,67:0.78:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,79:0.83:-0.21:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,77:0.80:-0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,75:0.74:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,55:0.68:-0.64:1.000:0.956 0/0/1/1:4:28,37:0.57:-0.98:1.000:0.954 0/0/1/1:4:21,36:0.61:-1.23:1.000:0.659 0/1/1/1:4:11,59:0.78:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,58:0.74:-0.77:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,79:0.71: 0.19:1.000:0.993 1/1/1/1:4:7,95:0.91: 0.16:1.000:0.905 0/1/1/1:4:20,67:0.72:-0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,63:0.73:-0.52:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,69:0.73:-0.27:1.000:0.997 1/1/1/1:4:4,148:0.96: 1.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,135:0.95: 1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,132:0.88: 1.49:0.956:0.816 0/1/1/1:4:14,95:0.82: 0.38:0.998:0.999 0/0/1/1:4:32,43:0.57:-0.67:1.000:0.947 0/1/1/1:4:11,87:0.85: 0.04:1.000:0.991 0/1/1/1:4:27,94:0.72: 0.75:1.000:0.996 -chr8.1 33481488 chr8.1_033481488 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,56:0.49: 2.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,29:0.48: 0.60:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 1.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,63:0.49: 3.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,48:0.48: 2.31:1.000:0.995 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,44:0.54: 1.14:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,48:0.49: 2.13:1.000:0.996 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,41:0.74:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,59:0.50: 2.85:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.12:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/1:3:7,3:0.39:-1.66:0.999:0.999 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,40:0.48: 1.59:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0/0:5:48,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,30:0.50: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,41:0.43: 2.67:1.000:0.955 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,1:0.26:-0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.73:1.000:1.000 1/1/1/1/1/1:6:0,17:1.00:-1.34:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,53:0.54: 1.91:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,32:0.49: 0.73:0.887:0.996 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.98:0.999:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,50:1.00: 0.15:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,45:0.50: 1.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,28:0.46: 0.69:1.000:0.990 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.58:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,1:0.26:-0.67:1.000:0.998 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.58:0.994:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.26:0.993:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-0.62:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:27,41:0.54: 0.96:0.999:0.988 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,20:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:30,48:0.55: 1.41:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,34:0.52: 0.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.51: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.40:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.71:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:29,25:0.47: 0.33:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,66:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,30:0.57:-0.08:1.000:0.936 0/0/1/1:4:37,32:0.47: 1.00:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.28:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:33,34:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.53:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:43,48:0.50: 2.00:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,55:0.51: 2.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,44:0.54: 1.14:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,51:1.00: 0.19:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00: 0.37:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,47:0.52: 1.63:1.000:0.995 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,53:1.00: 0.28:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:40,37:0.48: 1.36:1.000:0.994 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:33,54:0.55: 1.82:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,31:0.52: 0.33:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,44:0.55: 1.09:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,52:1.00: 0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,36:0.53: 0.64:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,37:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.22:0.956:1.000 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.03:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-0.94:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. -chr8.1 33643169 chr8.1_033643169 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:49,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.41:0.999:. ./.:4:94,1:.: 2.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 1.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:58,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.97:1.000:. ./.:5:3,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.71:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:45,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.59:0.887:. ./.:4:76,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.44:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,1:.:-1.47:0.968:. ./.:4:77,1:.: 1.70:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:74,0:.: 1.54:0.994:. ./.:4:14,1:.:-0.89:1.000:. ./.:4:50,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:55,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.18:0.993:. ./.:4:63,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.71:0.999:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:10,1:.:-1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.43:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.92:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:40,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.47:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.47:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.51:0.956:. ./.:4:8,0:.:-1.18:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.30:1.000:. -chr8.1 33963306 chr8.1_033963306 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,181:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1,203:.:-0.06:1.000:. ./.:4:58,165:.: 0.30:1.000:. ./.:4:48,162:.: 0.05:1.000:. ./.:4:48,163:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.71:1.000:. ./.:4:48,146:.:-0.25:1.000:. ./.:4:40,176:.: 0.16:1.000:. ./.:4:33,162:.:-0.23:1.000:. ./.:4:11,19:.:-3.36:1.000:. ./.:4:5,35:.:-3.17:1.000:. ./.:4:1,328:.: 2.30:1.000:. ./.:4:44,173:.: 0.18:1.000:. ./.:4:91,104:.:-0.23:1.000:. ./.:4:36,176:.: 0.09:1.000:. ./.:4:121,103:.: 0.31:1.000:. ./.:4:118,109:.: 0.37:0.999:. ./.:4:127,149:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,301:.: 1.77:1.000:. ./.:4:1,323:.: 2.21:1.000:. ./.:4:6,17:.:-3.49:1.000:. ./.:4:98,133:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,184:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,278:.: 1.34:1.000:. ./.:4:2,21:.:-3.49:1.000:. ./.:4:1,250:.: 0.83:1.000:. ./.:4:67,203:.: 1.19:1.000:. ./.:4:89,104:.:-0.27:1.000:. ./.:4:65,193:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.79:1.000:. ./.:4:44,212:.: 0.92:1.000:. ./.:4:92,105:.:-0.20:1.000:. ./.:4:4,28:.:-3.32:1.000:. ./.:4:11,27:.:-3.21:1.000:. ./.:3:0,11:.:-3.72:0.999:. ./.:4:33,173:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.28:1.000:. ./.:4:73,171:.: 0.69:1.000:. ./.:4:95,119:.: 0.13:1.000:. ./.:4:60,191:.: 0.83:1.000:. ./.:4:44,156:.:-0.14:1.000:. ./.:4:97,110:.:-0.01:1.000:. ./.:4:64,205:.: 1.17:1.000:. ./.:4:22,165:.:-0.39:1.000:. ./.:4:38,167:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,160:.:-0.14:1.000:. ./.:5:100,178:.: 1.34:1.000:. ./.:4:23,116:.:-1.29:1.000:. ./.:4:26,144:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.39:1.000:. ./.:4:41,137:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,283:.: 1.47:1.000:. ./.:4:29,179:.: 0.01:1.000:. ./.:4:67,178:.: 0.71:1.000:. ./.:4:25,175:.:-0.14:1.000:. ./.:4:39,184:.: 0.30:1.000:. ./.:4:29,172:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,161:.:-0.08:1.000:. ./.:4:70,187:.: 0.94:1.000:. ./.:6:70,102:.:-0.67:1.000:. ./.:4:97,111:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,176:.: 0.01:1.000:. ./.:4:90,119:.: 0.03:1.000:. ./.:4:33,145:.:-0.56:1.000:. ./.:4:51,169:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.13:1.000:. ./.:4:32,122:.:-1.01:1.000:. ./.:4:28,174:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.43:0.887:. ./.:4:0,183:.:-0.46:1.000:. ./.:4:110,122:.: 0.47:1.000:. ./.:4:16,113:.:-1.48:0.999:. ./.:4:0,217:.: 0.18:1.000:. ./.:4:35,191:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,214:.: 0.13:1.000:. ./.:4:25,169:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,147:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,209:.: 0.03:1.000:. ./.:4:51,189:.: 0.62:1.000:. ./.:4:61,191:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.31:0.968:. ./.:4:21,153:.:-0.63:1.000:. ./.:4:33,178:.: 0.07:1.000:. ./.:4:40,123:.:-0.84:1.000:. ./.:4:94,122:.: 0.16:1.000:. ./.:4:49,194:.: 0.67:1.000:. ./.:4:30,120:.:-1.09:1.000:. ./.:4:23,140:.:-0.84:1.000:. ./.:4:57,148:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,181:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.27:1.000:. ./.:4:42,155:.:-0.20:1.000:. ./.:4:76,214:.: 1.56:1.000:. ./.:4:23,127:.:-1.09:1.000:. ./.:4:31,184:.: 0.14:1.000:. ./.:4:39,173:.: 0.09:1.000:. ./.:4:26,128:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.67:1.000:. ./.:4:49,172:.: 0.26:1.000:. ./.:4:33,179:.: 0.09:1.000:. ./.:4:33,141:.:-0.63:1.000:. ./.:4:35,169:.:-0.06:1.000:. ./.:4:36,117:.:-1.03:1.000:. ./.:4:37,196:.: 0.49:0.994:. ./.:4:77,97:.:-0.63:1.000:. ./.:4:31,160:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,127:.:-0.80:1.000:. ./.:4:111,116:.: 0.37:1.000:. ./.:4:32,218:.: 0.81:0.993:. ./.:4:39,162:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,161:.:-0.31:1.000:. ./.:4:114,120:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.14:0.999:. ./.:4:49,175:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.79:1.000:. ./.:4:29,153:.:-0.48:1.000:. ./.:4:24,147:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.60:1.000:. ./.:4:28,127:.:-0.99:1.000:. ./.:4:63,168:.: 0.45:1.000:. ./.:4:31,158:.:-0.35:1.000:. ./.:4:61,204:.: 1.09:1.000:. ./.:4:66,186:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.39:1.000:. ./.:4:49,166:.: 0.14:1.000:. ./.:4:34,149:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.46:1.000:. ./.:4:56,146:.:-0.10:1.000:. ./.:4:79,76:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1,190:.:-0.31:1.000:. ./.:4:32,163:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,139:.:-1.29:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.58:1.000:. ./.:4:106,128:.: 0.50:1.000:. ./.:4:45,227:.: 1.22:1.000:. ./.:4:36,168:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,86:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.73:1.000:. ./.:4:23,136:.:-0.92:1.000:. ./.:4:30,174:.:-0.06:1.000:. ./.:4:31,155:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,157:.:-0.18:1.000:. ./.:4:80,75:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1,293:.: 1.64:1.000:. ./.:4:44,198:.: 0.66:1.000:. ./.:4:60,176:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,192:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1,258:.: 0.98:1.000:. ./.:4:1,210:.: 0.07:1.000:. ./.:4:72,194:.: 1.11:1.000:. ./.:4:89,129:.: 0.20:1.000:. ./.:4:8,14:.:-3.51:1.000:. ./.:4:27,126:.:-1.03:1.000:. ./.:4:56,200:.: 0.92:1.000:. ./.:4:93,133:.: 0.35:1.000:. ./.:4:51,175:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,281:.: 1.39:1.000:. ./.:4:56,188:.: 0.69:1.000:. ./.:4:67,201:.: 1.15:1.000:. ./.:4:60,187:.: 0.75:1.000:. ./.:4:37,144:.:-0.50:1.000:. ./.:4:34,164:.:-0.18:1.000:. ./.:4:59,193:.: 0.84:1.000:. ./.:4:100,132:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,111:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.11:1.000:. ./.:4:50,172:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,172:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.41:1.000:. ./.:4:50,159:.: 0.03:1.000:. ./.:4:51,148:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,218:.: 0.20:1.000:. ./.:4:75,215:.: 1.56:1.000:. ./.:4:52,226:.: 1.34:1.000:. ./.:4:104,134:.: 0.58:1.000:. ./.:4:42,182:.: 0.31:1.000:. ./.:4:52,204:.: 0.92:0.956:. ./.:4:52,232:.: 1.45:0.998:. ./.:4:59,199:.: 0.96:1.000:. ./.:4:36,147:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.41:1.000:. -chr8.1 34119846 chr8.1_034119846 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:16,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:3:3,0:.:-1.29:0.999:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:4,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:5,6:.:-0.24:1.000:. ./.:4:2,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:5:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.28:1.000:. ./.:6:23,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:21,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:21,1:.: 1.20:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.81:0.887:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:0.999:. ./.:4:0,4:.:-1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,2:.:-1.16:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:12,2:.: 0.15:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.24:0.968:. ./.:4:22,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:33,1:.: 2.77:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:9,2:.:-0.24:1.000:. ./.:4:14,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:29,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:13,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:35,0:.: 2.91:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:0.994:. ./.:4:15,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.55:0.993:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:28,1:.: 2.12:0.999:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.11:1.000:. ./.:4:22,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:20,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:23,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,4:.: 0.02:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:5,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:7,1:.:-0.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.50:1.000:. ./.:4:14,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:21,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,1:.:-1.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:3,1:.:-1.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:6,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:8,1:.:-0.50:0.956:. ./.:4:3,0:.:-1.29:0.998:. ./.:4:7,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.03:1.000:. -chr8.1 34331856 chr8.1_034331856 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:205,188:0.47: 0.88:1.000:0.992 0/0/1/1:4:143,163:0.52:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/1:4:239,87:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:199,172:0.45: 0.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:153,191:0.54: 0.29:1.000:0.985 0/1/1/1:4:106,344:0.75: 1.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,44:0.25:-1.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:260,82:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,250:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,64:0.47:-2.24:1.000:0.990 0/0/1/1:4:87,117:0.56:-1.41:1.000:0.964 0/1/1/1:4:77,334:0.80: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,155:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:176,183:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,291:0.72: 0.90:1.000:0.995 0/0/0/0:4:349,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:266,111:0.29: 0.69:0.999:0.993 0/0/1/1:4:175,164:0.47: 0.23:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,506:1.00: 2.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,329:0.77: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,73:0.50:-2.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:242,102:0.29: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:160,190:0.53: 0.36:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,344:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,59:0.46:-2.34:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,379:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:205,201:0.49: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:256,87:0.25: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:88,259:0.73: 0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:136,341:0.70: 1.90:1.000:0.983 0/0/1/1:4:214,223:0.50: 1.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:171,189:0.52: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,57:0.43:-2.32:1.000:0.954 0/0/1/1:4:67,85:0.55:-2.04:1.000:0.981 0/1/1:3:21,78:0.77:-2.68:0.999:1.000 0/0/1/1:4:178,196:0.51: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,178:0.51: 0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:188,188:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:362,1:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,343:0.81: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,95:0.31:-0.28:1.000:0.971 0/0/0/1:4:252,98:0.27: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:197,197:0.49: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:150,179:0.53: 0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:173,178:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:195,196:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:296,218:0.42: 2.34:1.000:0.962 0/0/1/1:4:404,405:0.49: 5.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,166:0.58:-0.51:1.000:0.893 0/1/1/1:4:112,315:0.72: 1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,133:0.48:-0.56:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,391:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,124:0.51:-0.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,185:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,86:0.30:-0.45:1.000:0.988 0/0/1/1:4:162,169:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,136:0.48:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:176,182:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,262:0.75: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:160,91:0.35:-0.84:1.000:0.889 0/0/0/1:4:204,54:0.20:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,140:0.48:-0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:272,121:0.30: 0.88:1.000:0.985 0/0/1/1:4:142,172:0.54:-0.08:1.000:0.989 0/1/1/1:4:90,277:0.74: 0.57:1.000:0.998 0/1/1/1:4:76,222:0.73:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,141:0.73:-1.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,167:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:79,262:0.75: 0.25:0.887:0.999 0/0/0/1:4:244,82:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:228,79:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,37:0.20:-1.69:0.999:1.000 0/0/1/1:4:166,196:0.53: 0.50:1.000:0.992 0/0/1/1:4:167,181:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,167:0.50: 0.08:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:67,218:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,256:0.77: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,179:0.52: 0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,293:0.78: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,208:0.75:-0.61:0.968:0.999 0/0/1/1:4:173,162:0.47: 0.18:1.000:0.994 0/0/1/1:4:182,207:0.52: 0.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:68,248:0.77:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:235,102:0.29: 0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:238,92:0.27: 0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,93:0.48:-1.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:121,121:0.49:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:144,154:0.51:-0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,196:0.75:-0.79:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,137:0.56:-1.00:1.000:0.960 0/0/0/1:4:224,68:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,241:0.76:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,128:0.48:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:239,77:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:215,96:0.30:-0.11:1.000:0.985 0/0/1/1:4:102,145:0.58:-0.89:1.000:0.932 0/0/0/1:4:223,84:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:143,154:0.51:-0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,197:0.56: 0.31:1.000:0.970 0/0/1/1:4:90,104:0.53:-1.53:1.000:0.993 0/0/1/1:4:145,166:0.52:-0.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:52,176:0.75:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:161,63:0.27:-1.17:0.994:0.997 0/0/1/1:4:123,147:0.53:-0.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:158,132:0.45:-0.37:1.000:0.976 0/0/1/1:4:89,124:0.57:-1.30:1.000:0.946 0/0/0/1:4:258,110:0.29: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:198,174:0.46: 0.63:0.993:0.987 0/0/0/1:4:251,94:0.26: 0.30:1.000:0.998 0/0/0/1:4:186,76:0.28:-0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:387,124:0.24: 2.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,209:0.72:-0.46:0.999:0.996 0/0/1/1:4:137,138:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:55,200:0.77:-0.79:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,323:1.00: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,70:0.29:-1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:131,154:0.53:-0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:56,221:0.78:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,128:0.50:-0.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,182:0.53: 0.21:1.000:0.993 0/1/1/1:4:61,220:0.77:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,162:0.49: 0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:302,95:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,217:0.72:-0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:177,161:0.47: 0.21:1.000:0.991 0/0/1/1:4:149,146:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,63:0.28:-1.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,123:0.56:-1.27:1.000:0.966 0/0/0/1:4:150,62:0.28:-1.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:65,211:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/0/1:4:246,107:0.30: 0.40:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,152:0.78:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,188:0.52: 0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:213,74:0.25:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:239,258:0.51: 2.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,174:0.53: 0.03:1.000:0.993 0/0/0/0:4:248,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,208:0.72:-0.45:1.000:0.995 0/1/1/1:4:57,201:0.76:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,170:0.52:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:131,143:0.51:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:77,218:0.72:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,55:0.25:-1.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:96,279:0.73: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:243,242:0.49: 1.99:1.000:0.996 0/0/1/1:4:199,210:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:78,237:0.73:-0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:119,319:0.71: 1.42:1.000:0.992 0/1/1/1:4:69,232:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:202,254:0.55: 1.64:1.000:0.983 0/0/0/1:4:273,116:0.29: 0.83:1.000:0.992 0/1/1/1:4:33,130:0.78:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,118:0.52:-1.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,202:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,54:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,307:0.75: 0.99:1.000:0.999 0/1/1/1:4:93,285:0.74: 0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:128,165:0.55:-0.33:1.000:0.978 0/0/1/1:4:183,192:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:144,148:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:198,86:0.29:-0.44:1.000:0.989 0/0/1/1:4:138,201:0.58: 0.23:1.000:0.911 0/0/1/1:4:158,200:0.55: 0.46:1.000:0.982 0/0/0/0:4:363,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,190:0.55: 0.21:1.000:0.979 0/0/0/0:4:276,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,94:0.29: 0.00:1.000:0.994 0/0/1/1:4:179,167:0.47: 0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:167,171:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,151:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,138:0.52:-0.71:1.000:0.995 0/1/1/1:4:74,268:0.77: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,164:0.52:-0.14:1.000:0.995 0/0/1/1:4:124,159:0.55:-0.45:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,304:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:178,209:0.53: 0.81:1.000:0.992 0/0/1/1:4:192,186:0.48: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:240,86:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,149:0.48:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:258,97:0.27: 0.42:0.956:0.998 0/0/1/1:4:222,188:0.45: 1.09:0.998:0.980 0/0/1/1:4:213,161:0.42: 0.65:1.000:0.921 0/0/0/1:4:200,75:0.26:-0.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:185,163:0.46: 0.34:1.000:0.987 -chr8.1 34621925 chr8.1_034621925 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:46,125:.: 1.01:1.000:. ./.:4:47,108:.: 0.57:1.000:. ./.:4:64,75:.: 0.12:1.000:. ./.:4:19,119:.: 0.09:1.000:. ./.:4:59,128:.: 1.46:1.000:. ./.:4:43,131:.: 1.10:1.000:. ./.:4:26,31:.:-2.17:1.000:. ./.:4:38,109:.: 0.34:1.000:. ./.:4:29,106:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,32:.:-2.84:1.000:. ./.:4:24,35:.:-2.11:1.000:. ./.:4:35,73:.:-0.75:1.000:. ./.:4:57,84:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.43:1.000:. ./.:4:21,124:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,120:.: 1.04:1.000:. ./.:4:27,128:.: 0.57:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,178:.: 2.16:1.000:. ./.:4:55,125:.: 1.26:1.000:. ./.:4:16,56:.:-1.75:1.000:. ./.:4:11,118:.:-0.16:1.000:. ./.:4:29,110:.: 0.12:1.000:. ./.:4:13,102:.:-0.55:1.000:. ./.:4:14,51:.:-1.95:1.000:. ./.:4:23,136:.: 0.68:1.000:. ./.:4:58,89:.: 0.34:1.000:. ./.:4:24,101:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.51:1.000:. ./.:4:47,95:.: 0.20:1.000:. ./.:4:28,92:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.86:1.000:. ./.:4:3,35:.:-2.70:1.000:. ./.:4:13,53:.:-1.92:1.000:. ./.:3:4,13:.:-3.29:0.999:. ./.:4:45,99:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,96:.: 0.45:1.000:. ./.:4:28,113:.: 0.17:1.000:. ./.:4:57,135:.: 1.60:1.000:. ./.:4:30,149:.: 1.24:1.000:. ./.:4:60,73:.:-0.05:1.000:. ./.:4:23,127:.: 0.43:1.000:. ./.:4:24,183:.: 2.02:1.000:. ./.:4:22,121:.: 0.23:1.000:. ./.:4:54,81:.: 0.01:1.000:. ./.:4:24,133:.: 0.62:1.000:. ./.:5:53,119:.: 1.04:1.000:. ./.:4:84,152:.: 2.83:1.000:. ./.:4:15,107:.:-0.36:1.000:. ./.:4:54,143:.: 1.74:1.000:. ./.:4:45,113:.: 0.65:1.000:. ./.:4:34,153:.: 1.46:1.000:. ./.:4:39,76:.:-0.55:1.000:. ./.:4:31,132:.: 0.79:1.000:. ./.:4:42,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:32,116:.: 0.37:1.000:. ./.:4:28,94:.:-0.36:1.000:. ./.:4:52,113:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.90:1.000:. ./.:6:12,64:.:-1.64:1.000:. ./.:4:28,87:.:-0.55:1.000:. ./.:4:46,75:.:-0.38:1.000:. ./.:4:28,129:.: 0.62:1.000:. ./.:4:28,95:.:-0.33:1.000:. ./.:4:19,111:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,115:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,50:.:-2.37:1.000:. ./.:4:23,96:.:-0.44:1.000:. ./.:4:37,87:.:-0.30:0.887:. ./.:4:65,77:.: 0.20:1.000:. ./.:4:27,118:.: 0.29:1.000:. ./.:4:27,54:.:-1.50:0.999:. ./.:4:38,120:.: 0.65:1.000:. ./.:4:20,134:.: 0.54:1.000:. ./.:4:39,95:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,77:.:-1.14:1.000:. ./.:4:14,132:.: 0.31:1.000:. ./.:4:44,102:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,128:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.26:1.000:. ./.:4:18,77:.:-1.11:0.968:. ./.:4:38,118:.: 0.59:1.000:. ./.:4:50,81:.:-0.10:1.000:. ./.:4:19,98:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,127:.: 0.59:1.000:. ./.:4:42,108:.: 0.43:1.000:. ./.:4:29,54:.:-1.44:1.000:. ./.:4:35,79:.:-0.58:1.000:. ./.:4:30,97:.:-0.22:1.000:. ./.:4:28,98:.:-0.24:1.000:. ./.:4:34,39:.:-1.72:1.000:. ./.:4:53,101:.: 0.54:1.000:. ./.:4:30,153:.: 1.35:1.000:. ./.:4:20,89:.:-0.72:1.000:. ./.:4:69,84:.: 0.51:1.000:. ./.:4:46,109:.: 0.57:1.000:. ./.:4:16,89:.:-0.83:1.000:. ./.:4:50,83:.:-0.05:1.000:. ./.:4:61,102:.: 0.79:1.000:. ./.:4:59,113:.: 1.04:1.000:. ./.:4:21,39:.:-2.09:1.000:. ./.:4:40,88:.:-0.19:1.000:. ./.:4:14,87:.:-0.94:1.000:. ./.:4:50,87:.: 0.06:0.994:. ./.:4:0,96:.:-1.08:1.000:. ./.:4:47,120:.: 0.90:1.000:. ./.:4:29,85:.:-0.58:1.000:. ./.:4:19,104:.:-0.33:1.000:. ./.:4:49,119:.: 0.93:0.993:. ./.:4:39,130:.: 0.96:1.000:. ./.:4:36,103:.: 0.12:1.000:. ./.:4:26,147:.: 1.07:1.000:. ./.:4:45,90:.: 0.01:0.999:. ./.:4:36,90:.:-0.24:1.000:. ./.:4:23,48:.:-1.78:1.000:. ./.:4:22,130:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,57:.:-1.42:1.000:. ./.:4:23,91:.:-0.58:1.000:. ./.:4:42,131:.: 1.07:1.000:. ./.:4:26,91:.:-0.50:1.000:. ./.:4:20,154:.: 1.10:1.000:. ./.:4:23,99:.:-0.36:1.000:. ./.:4:26,105:.:-0.10:1.000:. ./.:4:55,78:.:-0.05:1.000:. ./.:4:33,108:.: 0.17:1.000:. ./.:4:36,83:.:-0.44:1.000:. ./.:4:15,103:.:-0.47:1.000:. ./.:4:28,71:.:-1.00:1.000:. ./.:4:15,90:.:-0.83:1.000:. ./.:4:11,73:.:-1.42:1.000:. ./.:4:38,91:.:-0.16:1.000:. ./.:4:50,107:.: 0.62:1.000:. ./.:4:30,58:.:-1.30:1.000:. ./.:4:76,95:.: 1.01:1.000:. ./.:4:17,124:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,152:.: 2.30:1.000:. ./.:4:24,129:.: 0.51:1.000:. ./.:4:46,88:.:-0.02:1.000:. ./.:4:54,83:.: 0.06:1.000:. ./.:4:22,95:.:-0.50:1.000:. ./.:4:25,124:.: 0.40:1.000:. ./.:4:20,107:.:-0.22:1.000:. ./.:4:22,89:.:-0.66:1.000:. ./.:4:17,69:.:-1.36:1.000:. ./.:4:51,140:.: 1.57:1.000:. ./.:4:25,132:.: 0.62:1.000:. ./.:4:44,144:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,132:.: 1.12:1.000:. ./.:4:39,70:.:-0.72:1.000:. ./.:4:25,149:.: 1.10:1.000:. ./.:4:17,106:.:-0.33:1.000:. ./.:4:6,40:.:-2.48:1.000:. ./.:4:24,42:.:-1.92:1.000:. ./.:4:32,116:.: 0.37:1.000:. ./.:4:19,106:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.68:1.000:. ./.:4:45,123:.: 0.93:1.000:. ./.:4:36,76:.:-0.63:1.000:. ./.:4:52,104:.: 0.59:1.000:. ./.:4:21,98:.:-0.44:1.000:. ./.:4:42,85:.:-0.22:1.000:. ./.:4:55,85:.: 0.15:1.000:. ./.:4:31,116:.: 0.34:1.000:. ./.:4:35,89:.:-0.30:1.000:. ./.:4:70,101:.: 1.01:1.000:. ./.:4:39,83:.:-0.36:1.000:. ./.:4:83,95:.: 1.21:1.000:. ./.:4:58,87:.: 0.29:1.000:. ./.:4:19,76:.:-1.11:1.000:. ./.:4:36,56:.:-1.19:1.000:. ./.:4:50,74:.:-0.30:1.000:. ./.:4:42,88:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,103:.:-0.19:1.000:. ./.:4:22,114:.: 0.03:1.000:. ./.:4:28,72:.:-0.97:1.000:. ./.:4:21,158:.: 1.24:1.000:. ./.:4:51,110:.: 0.73:1.000:. ./.:4:28,135:.: 0.79:1.000:. ./.:4:34,110:.: 0.26:1.000:. ./.:4:46,92:.: 0.09:0.956:. ./.:4:32,110:.: 0.20:0.998:. ./.:4:20,145:.: 0.84:1.000:. ./.:4:60,78:.: 0.09:1.000:. ./.:4:39,108:.: 0.34:1.000:. -chr8.1 34773047 chr8.1_034773047 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:136,102:0.45: 0.42:1.000:0.982 0/1/1/1:4:64,162:0.74: 0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:198,66:0.26: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,131:0.66:-0.16:1.000:0.887 0/0/1/1:4:159,118:0.45: 1.09:1.000:0.979 0/0/1/1:4:123,117:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,63:0.42:-0.95:1.000:0.916 0/0/1/1:4:126,92:0.45: 0.08:1.000:0.975 0/0/1/1:4:129,124:0.52: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:21,18:0.49:-2.98:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,23:0.47:-2.76:1.000:0.991 0/1/1/1:4:62,188:0.77: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,68:0.31: 0.29:1.000:0.972 0/0/1/1:4:144,146:0.53: 1.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:129,120:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:153,34:0.19:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,129:0.53: 0.73:0.999:0.992 0/0/1/1:4:134,120:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,202:0.72: 1.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:64,181:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,21:0.47:-2.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:199,74:0.28: 1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:137,133:0.52: 0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,148:0.78:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.53:-3.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:62,160:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,56:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/0/1:4:172,47:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,192:0.74: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,119:0.73:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:146,112:0.46: 0.77:1.000:0.986 0/0/1/1:4:108,103:0.51:-0.04:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-3.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,14:0.31:-2.85:1.000:0.968 1/1/1:3:1,7:0.88:-3.51:0.999:0.983 0/0/0/1:4:198,64:0.26: 0.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,84:0.39: 0.24:1.000:0.693 0/0/1/1:4:139,109:0.46: 0.60:1.000:0.990 0/0/0/1:4:225,38:0.16: 0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:120,108:0.50: 0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:188,48:0.22: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,103:0.48: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:142,117:0.48: 0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,105:0.46: 0.51:1.000:0.985 0/0/0/1:4:180,84:0.33: 0.87:1.000:0.898 0/1/1/1:4:56,157:0.75: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:279,68:0.21: 2.29:1.000:0.993 0/0/0/1:4:390,109:0.23: 4.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,115:0.70:-0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:142,90:0.41: 0.32:1.000:0.859 0/0/0/1:4:177,51:0.24: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,222:0.79: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,62:0.32:-0.14:1.000:0.958 0/1/1/1:4:53,176:0.78: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,76:0.42:-0.35:1.000:0.893 0/1/1/1:4:63,139:0.71:-0.19:1.000:0.990 0/1/1/1:4:52,143:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,99:0.45: 0.29:1.000:0.984 0/1/1/1:4:78,172:0.71: 0.63:1.000:0.990 0/0/0/1/1/1:6:108,76:0.44:-0.50:1.000:0.647 0/0/1/1:4:112,85:0.46:-0.28:1.000:0.985 0/0/1/1:4:152,91:0.39: 0.51:1.000:0.743 0/0/0/1:4:212,70:0.26: 1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,105:0.64:-0.76:1.000:0.721 0/0/1/1:4:97,128:0.59: 0.20:1.000:0.850 0/1/1/1:4:67,156:0.72: 0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:60,145:0.73:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:63,151:0.72: 0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:76,125:0.64:-0.21:0.887:0.727 0/1/1/1:4:56,125:0.71:-0.55:1.000:0.992 0/0/0/1:4:179,75:0.31: 0.70:1.000:0.973 0/0/0/1:4:98,46:0.34:-1.19:0.999:0.891 0/0/1/1:4:134,129:0.52: 0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:76,133:0.66:-0.07:1.000:0.852 0/1/1/1:4:74,153:0.69: 0.24:1.000:0.979 0/0/1/1:4:112,103:0.51: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,108:0.54:-0.06:1.000:0.988 0/0/1/1:4:129,99:0.46: 0.25:1.000:0.987 0/1/1/1:4:57,155:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:87,176:0.69: 0.85:1.000:0.972 0/1/1/1:4:36,136:0.80:-0.71:0.968:1.000 0/0/1/1:4:99,89:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:135,100:0.45: 0.37:1.000:0.979 0/0/1/1:4:113,123:0.55: 0.39:1.000:0.983 0/0/0/1:4:195,59:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,83:0.39: 0.20:1.000:0.679 0/0/1/1:4:108,76:0.44:-0.50:1.000:0.960 0/0/1/1:4:108,87:0.47:-0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:106,113:0.54: 0.10:1.000:0.987 0/0/1/1:4:126,129:0.53: 0.71:1.000:0.992 0/0/0/1:4:123,52:0.31:-0.65:1.000:0.969 0/0/0/1:4:182,36:0.18: 0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,144:0.53: 1.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:46,101:0.71:-1.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:160,39:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,63:0.36:-0.53:1.000:0.632 0/1/1/1:4:47,102:0.70:-1.10:1.000:0.988 0/0/1/1:4:106,85:0.47:-0.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:163,65:0.30: 0.25:1.000:0.985 0/0/0/1:4:211,56:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,85:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,101:0.47: 0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:79,95:0.57:-0.67:1.000:0.946 0/0/0/1:4:157,40:0.22:-0.28:0.994:1.000 0/0/1/1:4:106,101:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:138,109:0.47: 0.58:1.000:0.991 0/0/1/1:4:93,59:0.41:-1.05:1.000:0.860 0/0/1/1:4:105,94:0.50:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:225,87:0.29: 1.69:0.993:0.990 0/0/1/1:4:136,89:0.42: 0.20:1.000:0.902 0/0/1/1:4:101,65:0.41:-0.81:1.000:0.881 0/0/1/1:4:156,119:0.46: 1.06:1.000:0.985 0/1/1/1:4:60,112:0.67:-0.71:0.999:0.928 0/0/0/1:4:202,56:0.23: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,77:0.61:-1.41:1.000:0.686 0/1/1/1:4:66,182:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,66:0.43:-0.88:1.000:0.946 0/0/1/1:4:103,101:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:53,127:0.72:-0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:158,55:0.27: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,128:0.72:-0.52:1.000:0.995 0/0/1/1:4:74,105:0.61:-0.59:1.000:0.699 0/1/1/1:4:62,167:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:175,59:0.26: 0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,96:0.48:-0.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:131,106:0.47: 0.41:1.000:0.993 0/0/1/1:4:96,101:0.54:-0.28:1.000:0.989 0/0/1/1:4:99,109:0.55:-0.09:1.000:0.981 0/0/1/1:4:109,70:0.41:-0.59:1.000:0.878 0/0/0/1:4:157,57:0.28: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,85:0.42:-0.04:1.000:0.932 0/0/1/1:4:110,98:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:64,69:0.54:-1.37:1.000:0.985 0/0/0/1:4:108,55:0.36:-0.86:1.000:0.739 0/0/1/1:4:108,95:0.49:-0.18:1.000:0.997 0/0/1/1:4:166,135:0.47: 1.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:66,156:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,42:0.23:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,79:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,99:0.54:-0.33:1.000:0.990 0/1/1/1:4:56,120:0.70:-0.64:1.000:0.986 0/0/1/1:4:123,105:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,129:0.52: 0.78:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,60:0.48:-1.41:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,203:0.74: 1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,193:0.73: 0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,113:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:61,175:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,162:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:60,142:0.72:-0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:66,152:0.72: 0.08:1.000:0.994 0/0/0/1:4:163,56:0.27: 0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,11:0.45:-3.20:1.000:0.976 0/0/0/1:4:126,28:0.19:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,186:0.72: 0.87:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,118:0.48: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,208:0.76: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,130:0.55: 0.56:1.000:0.976 0/0/0/1:4:167,62:0.28: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:140,116:0.48: 0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,97:0.61:-0.83:1.000:0.685 0/0/1/1:4:89,67:0.45:-0.98:1.000:0.983 0/0/0/1:4:147,51:0.27:-0.26:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,149:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,44:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,105:0.53:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:193,48:0.21: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,104:0.49: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,91:0.52:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,97:0.53:-0.33:1.000:0.994 0/0/0/1:4:157,47:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,68:0.44:-0.88:1.000:0.972 0/0/1/1:4:116,100:0.49: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:130,95:0.45: 0.20:1.000:0.975 0/1/1/1:4:52,122:0.72:-0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,132:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,123:0.51: 0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:229,78:0.27: 1.61:1.000:0.998 0/0/1/1:4:140,104:0.45: 0.53:1.000:0.980 0/1/1/1:4:59,121:0.69:-0.57:1.000:0.976 0/0/1/1:4:138,97:0.44: 0.37:0.956:0.959 0/0/1/1:4:156,122:0.46: 1.11:0.998:0.989 0/0/1/1:4:138,143:0.53: 1.16:1.000:0.991 0/0/0/1:4:137,37:0.22:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,155:0.73: 0.06:1.000:0.998 -chr8.1 35028141 chr8.1_035028141 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:20,4:0.21:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.47:-1.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:10,13:0.59:-0.23:1.000:0.881 0/1/1/1:4:9,19:0.68: 0.37:1.000:0.952 0/0/1/1:4:23,13:0.41: 1.32:1.000:0.842 0/0/1/1:4:19,10:0.39: 0.49:1.000:0.703 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.35:-0.23:1.000:0.772 0/0/0/1:4:7,3:0.35:-1.77:1.000:0.810 0/0/0/1:4:5,1:0.21:-2.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,25:0.53: 2.98:1.000:0.991 0/0/1/1:4:14,20:0.61: 1.08:1.000:0.737 0/0/0/1:4:15,6:0.33:-0.46:1.000:0.901 0/0/0/1:4:18,5:0.27:-0.23:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,11:0.60:-0.70:1.000:0.806 0/0/1/1:4:11,17:0.62: 0.37:0.999:0.555 0/1/1/1:4:3,16:0.83:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:26,6:0.24: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,19:0.49: 2.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:6,2:0.30:-2.01:1.000:0.985 0/0/1/1:4:15,22:0.61: 1.44:1.000:0.682 0/1/1/1:4:7,31:0.80: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.32:-0.35:1.000:0.949 0/0/1/1:4:3,2:0.44:-2.36:1.000:0.973 0/0/1/1:4:9,8:0.51:-0.94:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,9:0.41: 0.01:1.000:0.835 0/0/1/1:4:11,9:0.49:-0.58:1.000:0.996 0/0/0/1:4:25,10:0.33: 1.20:1.000:0.901 0/0/1/1:4:9,5:0.40:-1.30:1.000:0.814 0/1/1/1:4:5,11:0.69:-1.06:1.000:0.968 0/0/0/1:4:14,4:0.27:-0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:6,9:0.62:-1.18:1.000:0.629 0/0/1/1:4:4,2:0.38:-2.25:1.000:0.569 0/0/1:3:2,1:0.38:-2.60:0.999:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.55: 0.25:1.000:0.981 0/1/1/1:4:7,17:0.70:-0.11:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,15:0.68:-0.35:1.000:0.958 0/1/1/1:4:5,12:0.70:-0.94:1.000:0.986 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,8:0.49:-0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,8:0.38:-0.11:1.000:0.569 0/0/1/1:4:13,16:0.58: 0.49:1.000:0.929 0/1/1/1:4:4,10:0.71:-1.30:1.000:0.991 0/0/1/1:4:17,12:0.46: 0.49:1.000:0.986 0/1/1/1:4:5,16:0.75:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:30,21:0.46: 3.10:1.000:0.856 0/0/1/1:4:5,6:0.57:-1.65:1.000:0.944 1/1/1/1:4:1,10:0.90:-1.65:1.000:0.861 0/0/0/1:4:9,3:0.30:-1.53:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,8:0.38:-0.11:1.000:0.569 0/0/0/1:4:19,5:0.26:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,6:0.38:-0.82:1.000:0.569 0/0/1/1:4:16,16:0.53: 0.84:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,17:0.73:-0.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,19:0.75: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,3:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.33:-1.30:1.000:0.901 0/0/1/1/1/1:6:8,18:0.69: 0.13:1.000:0.899 0/0/1/1:4:15,20:0.59: 1.20:1.000:0.851 0/0/1/1:4:10,15:0.62: 0.01:1.000:0.629 0/1/1/1:4:8,14:0.64:-0.35:1.000:0.742 0/1/1/1:4:7,16:0.69:-0.23:1.000:0.978 0/0/0/1:4:19,4:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,19:0.58: 1.08:1.000:0.907 0/0/1/1:4:13,11:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,28:0.81: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.50:-0.11:0.887:0.997 0/1/1/1:4:4,21:0.83: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,10:0.44: 0.01:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.41:0.999:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.46:-0.70:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,19:0.81:-0.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,9:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,18:0.71: 0.01:1.000:0.993 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,21:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,5:0.19: 1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,7:0.40:-0.58:0.968:0.754 0/0/1/1:4:16,19:0.57: 1.20:1.000:0.950 0/0/1/1:4:16,15:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,9:0.39: 0.13:1.000:0.717 0/0/0/1:4:16,7:0.35:-0.23:1.000:0.772 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.56:-0.94:1.000:0.970 0/0/1/1:4:13,8:0.43:-0.46:1.000:0.934 0/0/0/1:4:19,8:0.34: 0.25:1.000:0.838 0/0/0/1:4:31,12:0.33: 2.15:1.000:0.929 0/1/1/1:4:8,19:0.70: 0.25:1.000:0.985 0/1/1/1:4:13,22:0.64: 1.20:1.000:0.671 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,19:0.81:-0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,23:0.71: 0.84:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,24:0.79: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-1.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:20,8:0.33: 0.37:1.000:0.901 0/0/1/1:4:11,13:0.57:-0.11:1.000:0.952 0/0/0/1:4:12,5:0.34:-0.94:1.000:0.853 0/0/1/1:4:13,11:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,19:0.63: 0.72:0.994:0.507 0/0/1/1:4:13,8:0.43:-0.46:1.000:0.934 0/0/1/1:4:18,17:0.52: 1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,13:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,13:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,28:0.51: 4.05:0.993:0.996 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,11:0.39: 0.84:1.000:0.692 0/0/1/1:4:14,17:0.57: 0.72:0.999:0.937 0/0/1/1:4:15,10:0.44: 0.01:1.000:0.973 0/1/1/1:4:5,8:0.63:-1.41:1.000:0.534 0/0/1/1:4:19,13:0.45: 0.84:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,28:0.90: 0.72:1.000:0.722 0/0/1/1:4:16,10:0.43: 0.13:1.000:0.945 0/1/1/1:4:4,23:0.84: 0.25:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,14:0.55: 0.25:1.000:0.981 0/0/0/1:4:18,4:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.28:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,18:0.52: 1.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,10:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,9:0.42:-0.11:1.000:0.914 0/1/1/1:4:6,18:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,7:0.38:-0.46:1.000:0.569 0/0/1/1:4:10,8:0.49:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,4:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:17,11:0.44: 0.37:1.000:0.962 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,7:0.40:-0.58:1.000:0.754 0/1/1/1:4:5,13:0.71:-0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,10:0.56:-0.70:1.000:0.974 0/0/1/1:4:16,9:0.41: 0.01:1.000:0.835 0/0/1/1:4:11,17:0.62: 0.37:1.000:0.555 0/1/1/1:4:7,15:0.68:-0.35:1.000:0.958 0/0/1/1:4:18,9:0.38: 0.25:1.000:0.569 0/0/0/1:4:17,5:0.28:-0.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,16:0.79:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,23:0.73: 0.72:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,6:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,10:0.58:-0.82:1.000:0.918 0/0/1/1:4:19,21:0.55: 1.79:1.000:0.975 0/1/1/1:4:14,23:0.63: 1.44:1.000:0.601 0/0/1/1:4:20,12:0.42: 0.84:1.000:0.914 0/0/1/1:4:13,11:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,15:0.47: 1.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,14:0.51: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,15:0.52: 0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,11:0.47: 0.13:1.000:0.991 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,13:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,12:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,13:0.52: 0.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,19:0.56: 1.32:1.000:0.972 0/0/1/1:4:7,9:0.58:-1.06:1.000:0.893 0/0/0/1:4:27,4:0.16: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:21,7:0.30: 0.37:1.000:0.985 0/1/1/1:4:6,13:0.68:-0.70:1.000:0.962 0/1/1/1:4:3,10:0.75:-1.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,16:0.55: 0.72:1.000:0.983 0/0/1/1:4:15,19:0.58: 1.08:1.000:0.907 0/1/1/1:4:4,12:0.74:-1.06:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,17:0.94:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,18:0.85:-0.46:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,30:0.82: 1.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,14:0.58: 0.01:1.000:0.902 0/0/1/1:4:11,12:0.55:-0.23:1.000:0.978 0/0/1/1:4:17,9:0.39: 0.13:1.000:0.717 0/1/1/1:4:4,16:0.79:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.60: 0.13:1.000:0.819 0/1/1/1:4:4,12:0.74:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,9:0.44:-0.23:1.000:0.959 0/0/0/0:4:21,2:0.11:-0.23:1.000:0.521 0/0/0/1:4:16,7:0.35:-0.23:1.000:0.772 0/1/1/1:4:10,17:0.64: 0.25:1.000:0.681 0/0/1/1:4:13,14:0.55: 0.25:1.000:0.981 0/1/1/1:4:8,19:0.70: 0.25:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,25:1.00: 0.01:0.956:1.000 0/1/1/1:4:10,25:0.71: 1.20:0.998:0.991 0/0/1/1:4:24,24:0.53: 2.74:1.000:0.991 0/0/1/1:4:9,13:0.61:-0.35:1.000:0.715 0/0/1/1:4:18,11:0.42: 0.49:1.000:0.929 -chr8.1 35201753 chr8.1_035201753 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:51,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.61:0.999:. ./.:4:50,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:3:1,0:.:-1.95:0.999:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:29,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.36:1.000:. ./.:5:47,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:52,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.41:1.000:. ./.:6:16,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:55,0:.: 2.00:0.887:. ./.:4:17,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:23,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.44:0.968:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:47,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:39,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:56,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:0.994:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.24:0.993:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:0.999:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:54,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:58,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:70,0:.: 3.09:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.85:0.956:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.56:1.000:. -chr8.1 35397126 chr8.1_035397126 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:583,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:320,1:.:-1.70:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:203,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:169,0:.:-3.26:1.000:. ./.:4:735,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:522,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:469,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:543,2:.: 0.60:0.999:. ./.:4:472,2:.:-0.13:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:579,1:.: 0.96:1.000:. ./.:4:195,0:.:-3.00:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:555,1:.: 0.71:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:165,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:585,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:485,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:551,2:.: 0.68:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:410,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:113,0:.:-3.84:1.000:. ./.:4:232,1:.:-2.61:1.000:. ./.:3:83,0:.:-4.15:0.999:. ./.:4:507,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:506,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:530,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:474,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:547,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:477,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:625,1:.: 1.43:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.22:1.000:. ./.:5:702,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:519,1:.: 0.34:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:549,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:481,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:513,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:488,1:.: 0.02:1.000:. ./.:6:506,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:475,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:524,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:543,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:549,4:.: 0.68:0.887:. ./.:4:488,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:576,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:334,1:.:-1.56:0.999:. ./.:4:564,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:429,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:489,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.42:0.968:. ./.:4:558,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:616,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:419,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:454,2:.:-0.32:1.000:. ./.:4:516,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:439,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:355,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:460,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:543,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:524,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:614,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:566,0:.: 0.81:0.994:. ./.:4:459,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:456,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:509,1:.: 0.24:0.993:. ./.:4:473,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:486,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:596,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:555,1:.: 0.71:0.999:. ./.:4:585,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:428,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:640,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:516,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.20:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:411,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:472,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:560,1:.: 0.76:1.000:. ./.:4:564,3:.: 0.82:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:571,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:495,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:483,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:456,3:.:-0.29:1.000:. ./.:4:493,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:314,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:581,2:.: 0.99:1.000:. ./.:4:486,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:599,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:526,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:513,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:485,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:438,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:386,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:615,2:.: 1.34:1.000:. ./.:4:642,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:507,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:462,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:454,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:593,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:152,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:560,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:482,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:533,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:374,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:575,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:430,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:452,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:483,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:476,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:395,2:.:-0.92:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:423,2:.:-0.64:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:457,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:572,1:.: 0.88:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:578,0:.: 0.94:0.956:. ./.:4:678,1:.: 1.97:0.998:. ./.:4:646,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:379,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:439,2:.:-0.47:1.000:. -chr8.1 35649451 chr8.1_035649451 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:150,49:0.32: 1.49:1.000:0.952 0/1/1/1:4:49,81:0.66:-0.30:1.000:0.882 0/0/0/1:4:138,22:0.23: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,119:0.75: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,89:0.48: 1.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,111:0.72: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,76:0.70:-0.69:1.000:0.985 0/1/1/1:4:47,90:0.70:-0.12:1.000:0.982 0/1/1/1:4:52,118:0.73: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,42:0.82:-2.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,20:0.34:-1.73:1.000:0.883 0/1/1/1:4:54,120:0.73: 0.84:1.000:0.998 0/1/1/1:4:38,82:0.72:-0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,102:0.76: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,112:0.78: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,67:0.48: 0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:98,78:0.48: 0.89:0.999:0.996 0/0/1/1:4:135,66:0.39: 1.54:1.000:0.679 0/1/1/1:4:60,140:0.74: 1.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:135,89:0.45: 2.14:1.000:0.976 0/0/0/1:4:70,13:0.25:-1.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,62:0.54:-0.46:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,142:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,113:0.80: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,35:0.77:-2.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,65:0.44: 0.68:1.000:0.963 0/0/1/1:4:85,45:0.40:-0.30:1.000:0.820 0/1/1/1:4:50,81:0.66:-0.28:1.000:0.851 0/1/1/1:4:62,154:0.75: 1.93:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,71:0.45: 0.92:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,98:0.69: 0.22:1.000:0.977 0/0/1/1:4:25,17:0.45:-2.58:1.000:0.982 0/0/1/1:4:35,25:0.46:-2.12:1.000:0.989 0/1/1:3:15,21:0.62:-2.74:0.999:1.000 0/1/1/1:4:42,97:0.74:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:85,48:0.42:-0.22:1.000:0.896 0/1/1/1:4:44,76:0.67:-0.56:1.000:0.930 0/0/1/1:4:69,60:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:83,65:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:142,17:0.20: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,59:0.44: 0.19:1.000:0.974 0/1/1/1:4:45,77:0.67:-0.51:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,84:0.64:-0.04:1.000:0.675 0/1/1/1:4:43,114:0.76: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:127,91:0.46: 1.98:1.000:0.816 0/0/1/1:4:37,49:0.61:-1.44:1.000:0.710 0/1/1/1:4:37,82:0.73:-0.59:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,59:0.69:-1.34:1.000:0.980 0/0/0/1:4:74,31:0.36:-0.95:1.000:0.672 0/1/1/1:4:52,104:0.71: 0.37:1.000:0.990 0/1/1/1:4:42,65:0.65:-0.90:1.000:0.758 0/0/1/1:4:95,102:0.56: 1.44:1.000:0.973 0/1/1/1:4:34,64:0.69:-1.13:1.000:0.977 0/1/1/1:4:42,109:0.76: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,114:0.73: 0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:130,35:0.29: 0.61:1.000:0.990 0/1/1/1:4:41,104:0.76: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:65,66:0.54:-0.28:1.000:0.789 0/0/1/1:4:92,70:0.47: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:80,66:0.49: 0.11:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,93:0.73:-0.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:38,109:0.78: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,100:0.78:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,90:0.51: 1.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,120:0.74: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:111,74:0.45: 1.12:0.887:0.978 0/0/1/1:4:86,60:0.46: 0.11:1.000:0.986 0/1/1/1:4:47,85:0.68:-0.25:1.000:0.961 0/1/1/1:4:33,70:0.72:-1.00:0.999:0.995 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,93:0.68: 0.11:1.000:0.943 0/1/1/1:4:35,87:0.75:-0.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,52:0.43:-0.09:1.000:0.944 0/0/1/1:4:41,57:0.62:-1.13:1.000:0.566 0/1/1/1:4:45,119:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,97:0.72: 0.03:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,101:0.99:-1.03:0.968:1.000 0/0/1/1:4:101,90:0.51: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:100,74:0.47: 0.84:1.000:0.992 0/1/1/1:4:40,74:0.69:-0.72:1.000:0.971 0/1/1/1:4:34,61:0.68:-1.21:1.000:0.957 0/1/1/1:4:46,99:0.72: 0.09:1.000:0.996 0/0/1/1:4:84,64:0.48: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:77,55:0.46:-0.25:1.000:0.989 0/0/0/1:4:131,42:0.32: 0.81:1.000:0.959 0/0/1/1:4:71,93:0.61: 0.58:1.000:0.738 0/0/1/1:4:74,34:0.38:-0.87:1.000:0.539 0/0/0/1:4:140,17:0.20: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,81:0.46: 1.44:1.000:0.986 0/1/1/1:4:30,62:0.71:-1.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,56:0.40: 0.63:1.000:0.757 0/1/1/1:4:51,91:0.68: 0.01:1.000:0.954 0/1/1/1:4:47,93:0.70:-0.04:1.000:0.988 0/1/1/1:4:34,51:0.64:-1.47:1.000:0.675 0/0/1/1:4:87,52:0.43:-0.07:1.000:0.938 0/1/1/1:4:45,77:0.67:-0.51:1.000:0.922 0/0/0/1:4:126,36:0.30: 0.53:1.000:0.984 0/0/1/1:4:106,84:0.48: 1.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:65,53:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,67:0.46: 0.48:0.994:0.990 0/1/1/1:4:26,76:0.78:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,71:0.56:-0.15:1.000:0.967 0/0/1/1:4:80,70:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,80:0.50: 0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,115:0.67: 1.02:0.993:0.938 0/1/1/1:4:40,69:0.67:-0.85:1.000:0.929 0/1/1/1:4:39,66:0.67:-0.95:1.000:0.911 0/1/1/1:4:58,170:0.78: 2.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,81:0.48: 1.12:0.999:0.995 0/1/1/1:4:44,77:0.68:-0.54:1.000:0.941 0/0/1/1:4:57,49:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,111:0.67: 0.92:1.000:0.904 0/1/1/1:4:31,80:0.76:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,59:0.45: 0.11:1.000:0.981 0/0/1/1:4:58,67:0.57:-0.43:1.000:0.935 0/0/1/1:4:92,80:0.50: 0.79:1.000:0.997 0/1/1/1:4:34,94:0.77:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,97:0.51: 1.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,23:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,79:0.66:-0.38:1.000:0.876 0/0/1/1:4:100,54:0.41: 0.32:1.000:0.847 1/1/1/1:4:0,106:1.00:-0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,59:0.75:-1.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,54:0.67:-1.47:1.000:0.937 0/1/1/1:4:30,69:0.74:-1.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,82:0.63:-0.09:1.000:0.602 0/0/1/1:4:33,42:0.60:-1.73:1.000:0.804 0/0/1/1:4:71,41:0.42:-0.77:1.000:0.915 0/0/1/1:4:99,59:0.43: 0.42:1.000:0.936 0/0/1/1:4:122,98:0.49: 2.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,114:0.79: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,45:0.42:-0.48:1.000:0.914 0/0/1/1:4:43,55:0.60:-1.13:1.000:0.793 0/1/1/1:4:36,93:0.76:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,96:0.73:-0.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,98:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,72:0.57:-0.15:1.000:0.952 0/0/1/1:4:136,111:0.49: 2.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:131,92:0.46: 2.11:1.000:0.987 0/0/0/1:4:138,53:0.35: 1.28:1.000:0.821 1/1/1/1:4:0,161:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,92:0.51: 1.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,62:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:116,104:0.51: 2.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:62,96:0.65: 0.42:1.000:0.759 0/0/0/1:4:37,14:0.34:-2.35:1.000:0.840 0/1/1/1:4:45,82:0.68:-0.38:1.000:0.965 0/0/1/1:4:85,47:0.41:-0.25:1.000:0.875 0/0/1/1:4:111,97:0.50: 1.72:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,181:1.00: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,100:0.67: 0.45:1.000:0.912 0/0/1/1:4:74,34:0.38:-0.87:1.000:0.539 0/0/0/1:4:167,33:0.25: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,127:0.75: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,46:0.38: 0.14:1.000:0.518 0/1/1/1:4:34,69:0.71:-1.00:1.000:0.991 0/0/1/1:4:97,75:0.48: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:73,55:0.47:-0.35:1.000:0.993 0/0/1/1:4:95,54:0.42: 0.19:1.000:0.902 0/0/1/1:4:75,50:0.45:-0.43:1.000:0.978 0/1/1/1:4:43,74:0.67:-0.64:1.000:0.927 0/0/1/1:4:90,71:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,94:0.73:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,54:0.40: 0.42:1.000:0.791 0/0/1/1:4:72,43:0.43:-0.69:1.000:0.937 0/1/1/1:4:45,73:0.66:-0.61:1.000:0.853 0/1/1/1:4:54,93:0.67: 0.14:1.000:0.928 0/0/1/1:4:77,64:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,80:0.71:-0.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:50,94:0.69: 0.06:1.000:0.976 0/1/1/1:4:43,120:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,86:0.54: 0.74:1.000:0.985 1/1/1/1:4:9,135:0.95: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,133:0.75: 1.15:0.956:1.000 1/1/1/1:4:0,137:1.00:-0.12:0.998:1.000 0/1/1/1:4:61,122:0.71: 1.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:96,49:0.40: 0.09:1.000:0.762 0/1/1/1:4:39,74:0.69:-0.74:1.000:0.979 -chr8.1 35968175 chr8.1_035968175 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.88:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:19,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.07:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:0.999:. ./.:4:156,0:.: 3.83:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:115,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.14:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.49:1.000:. ./.:3:10,0:.:-1.49:0.999:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.39:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.18:1.000:. ./.:5:48,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:6:19,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.95:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.47:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.39:0.887:. ./.:4:107,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.54:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.61:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:61,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.50:0.994:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.33:0.993:. ./.:4:49,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:65,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:28,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:116,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:34,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.83:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:118,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.32:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,1:.: 1.94:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:39,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:121,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.86:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:24,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:50,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:45,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.18:0.956:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.14:1.000:. -chr8.1 36236775 chr8.1_036236775 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:9,3:0.36: 0.30:1.000:0.683 1/1/1/1:4:1,10:0.91: 0.11:1.000:0.938 0/1/1/1:4:4,12:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,14:0.82: 1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,8:0.68: 0.30:1.000:0.955 0/1/1/1:4:5,20:0.80: 2.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.65:-0.44:1.000:0.752 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,9:0.90:-0.07:1.000:0.801 0/1/1/1:4:6,11:0.66: 1.21:1.000:0.894 0/0/1/1:4:5,5:0.54:-0.07:1.000:0.987 0/1/1/1:4:2,4:0.68:-0.80:1.000:0.955 0/1/1/1:4:2,10:0.83: 0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,4:0.60:-0.62:0.999:0.781 1/1/1/1:4:1,21:0.95: 2.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.77: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,17:0.77: 2.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,10:0.72: 0.66:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,15:0.94: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.65:-0.44:1.000:0.752 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,12:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,10:0.56: 1.58:1.000:0.961 0/0/1/1:4:5,5:0.54:-0.07:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,11:0.63: 1.40:1.000:0.618 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,8:0.52: 1.21:1.000:0.995 ./:.:.,.:.:.:.:. 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1:3:1,0:0.17:-1.72:0.999:0.978 0/1/1/1:4:4,9:0.70: 0.48:1.000:0.987 0/1/1/1:4:2,9:0.82: 0.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,9:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,2:0.47:-0.99:1.000:0.990 0/1/1/1:4:3,8:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,4:0.80:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,10:0.91: 0.11:1.000:0.938 0/1/1/1:4:3,6:0.68:-0.25:1.000:0.955 0/1/1/1:4:2,4:0.68:-0.80:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:9,12:0.60: 1.95:1.000:0.971 0/1/1/1:4:1,7:0.88:-0.44:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.62:-0.99:1.000:0.503 0/0/1/1:4:3,4:0.60:-0.62:1.000:0.781 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,3:0.45:-0.44:1.000:0.977 1/1/1/1:4:1,13:0.93: 0.66:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.88:-0.44:1.000:0.852 0/0/0/1:4:6,2:0.36:-0.44:1.000:0.683 0/1/1/1:4:3,5:0.65:-0.44:1.000:0.752 0/0/1/1/1/1:6:1,2:0.68:-1.35:1.000:0.915 0/1/1/1:4:1,3:0.75:-1.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,1:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,18:0.82: 2.13:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.71:-0.07:0.887:0.991 1/1/1/1:4:0,17:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,7:0.88:-0.44:1.000:0.852 0/1/1/1:4:1,4:0.80:-0.99:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,11:0.92: 0.30:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.54:-1.17:1.000:0.987 0/1/1/1:4:2,12:0.86: 0.66:1.000:0.975 0/1/1/1:4:3,10:0.77: 0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,8:0.89:-0.25:1.000:0.520 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-0.80:0.968:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.60:-0.62:1.000:0.781 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,4:0.68:-0.80:1.000:0.955 0/1/1/1:4:3,8:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,10:0.83: 0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,5:0.65:-0.44:1.000:0.752 0/0/1/1:4:6,3:0.42:-0.25:1.000:0.908 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.86:-0.62:1.000:0.975 0/0/0/1:4:9,1:0.26:-0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,9:0.66: 0.66:1.000:0.873 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,3:0.54:-0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:5,7:0.61: 0.30:1.000:0.679 0/0/1/1:4:5,2:0.39:-0.62:1.000:0.637 0/0/1/1:4:1,1:0.54:-1.54:1.000:0.987 0/1/1/1:4:2,5:0.72:-0.62:0.994:0.996 0/1/1/1:4:1,2:0.68:-1.35:1.000:0.955 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,9:0.62: 0.85:1.000:0.503 0/1/1/1:4:4,11:0.74: 0.85:0.993:0.998 1/1/1/1:4:1,13:0.93: 0.66:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.58: 0.11:1.000:0.916 1/1/1/1:4:1,11:0.92: 0.30:0.999:0.980 0/0/1/1:4:4,2:0.42:-0.80:1.000:0.908 1/1/1/1:4:1,12:0.92: 0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,7:0.66: 0.11:1.000:0.836 0/1/1/1:4:2,12:0.86: 0.66:1.000:0.975 1/1/1/1:4:1,9:0.90:-0.07:1.000:0.801 0/1/1/1:4:1,5:0.83:-0.80:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.54:-0.80:1.000:0.987 0/1/1/1:4:3,6:0.68:-0.25:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,9:0.50: 1.76:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.54:-0.44:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.86:-0.62:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.80:-0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,16:1.00: 1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.54:-0.80:1.000:0.987 0/0/0/1:4:4,1:0.33:-0.99:1.000:0.937 0/0/1/1:4:4,6:0.62:-0.07:1.000:0.503 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,3:0.62:-0.99:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.54:-1.54:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.54:-0.80:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,17:0.89: 1.58:1.000:0.664 0/0/0/1:4:9,3:0.36: 0.30:1.000:0.683 0/0/0/1:4:11,4:0.37: 0.85:1.000:0.535 0/0/1/1:4:4,6:0.62:-0.07:1.000:0.503 0/1/1/1:4:5,13:0.73: 1.40:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,18:0.95: 1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,14:0.63: 2.31:1.000:0.593 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,9:0.82: 0.11:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,11:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,5:0.65:-0.44:1.000:0.752 1/1/1/1:4:1,9:0.90:-0.07:1.000:0.801 0/1/1/1:4:2,5:0.72:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,5:0.59:-0.25:1.000:0.876 0/0/1/1:4:9,8:0.52: 1.21:1.000:0.995 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,15:0.83: 1.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,14:0.74: 1.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,17:0.74: 2.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,21:0.81: 2.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,14:0.78: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,10:0.65: 1.03:1.000:0.752 1/1/1/1:4:0,22:1.00: 2.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,9:0.66: 0.66:1.000:0.873 0/1/1/1:4:2,6:0.75:-0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.87: 0.85:1.000:0.935 0/1/1/1:4:3,13:0.81: 1.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,18:0.90: 1.76:1.000:0.801 0/1/1/1:4:3,8:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:5,3:0.45:-0.44:1.000:0.977 0/1/1/1:4:6,16:0.73: 2.13:1.000:0.998 0/1/1/1:4:2,7:0.78:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,17:0.89: 1.58:0.956:0.664 0/1/1/1:4:3,15:0.83: 1.40:0.998:0.997 0/1/1/1:4:6,12:0.68: 1.40:1.000:0.955 0/1/1/1:4:2,8:0.80:-0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,12:1.00: 0.30:1.000:1.000 -chr8.1 36273494 chr8.1_036273494 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:45,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:49,3:.:-0.14:1.000:. ./.:4:72,4:.: 1.17:1.000:. ./.:4:40,2:.:-0.68:1.000:. ./.:4:22,3:.:-1.61:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:64,4:.: 0.73:0.999:. ./.:4:44,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:49,8:.: 0.13:1.000:. ./.:4:52,4:.: 0.08:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.94:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.70:1.000:. ./.:4:71,8:.: 1.33:1.000:. ./.:4:65,5:.: 0.84:1.000:. ./.:4:62,4:.: 0.62:1.000:. ./.:4:55,4:.: 0.24:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:84,4:.: 1.82:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.77:1.000:. ./.:3:5,2:.:-2.59:0.999:. ./.:4:84,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:46,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:112,3:.: 3.29:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:80,2:.: 1.49:1.000:. ./.:4:79,5:.: 1.60:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:50,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:60,2:.: 0.40:1.000:. ./.:5:68,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:62,3:.: 0.57:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:77,10:.: 1.76:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:57,5:.: 0.40:1.000:. ./.:4:38,4:.:-0.68:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:42,10:.:-0.14:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:55,5:.: 0.30:1.000:. ./.:6:49,2:.:-0.19:1.000:. ./.:4:51,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:85,7:.: 2.04:1.000:. ./.:4:52,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:64,5:.: 0.78:1.000:. ./.:4:47,6:.:-0.09:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:35,3:.:-0.90:1.000:. ./.:4:48,2:.:-0.25:0.887:. ./.:4:53,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.50:0.999:. ./.:4:87,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.58:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:67,7:.: 1.06:1.000:. ./.:4:67,10:.: 1.22:1.000:. ./.:4:50,7:.: 0.13:1.000:. ./.:4:70,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:58,4:.: 0.40:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.06:0.968:. ./.:4:73,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:93,4:.: 2.31:1.000:. ./.:4:53,4:.: 0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.90:0.999:. ./.:4:66,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:81,3:.: 1.60:1.000:. ./.:4:34,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:50,5:.: 0.02:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:76,3:.: 1.33:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.25:0.994:. ./.:4:60,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.33:0.993:. ./.:4:36,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:41,3:.:-0.58:0.999:. ./.:4:76,2:.: 1.27:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:48,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,5:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:30,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:43,2:.:-0.52:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:39,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:38,1:.:-0.85:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:42,1:.:-0.63:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,3:.:-1.17:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:32,4:.:-1.01:1.000:. ./.:4:48,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:35,4:.:-0.85:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:68,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:48,2:.:-0.25:1.000:. ./.:4:57,2:.: 0.24:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.39:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.30:1.000:. ./.:4:68,2:.: 0.84:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:51,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:56,3:.: 0.24:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:54,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,2:.:-0.63:1.000:. ./.:4:32,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:14,1:.:-2.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:51,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,5:.:-0.30:1.000:. ./.:4:43,3:.:-0.47:1.000:. ./.:4:67,4:.: 0.89:1.000:. ./.:4:35,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:44,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,5:.:-0.52:1.000:. ./.:4:71,2:.: 1.00:1.000:. ./.:4:39,5:.:-0.58:1.000:. ./.:4:48,3:.:-0.19:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:33,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:32,1:.:-1.17:1.000:. ./.:4:53,2:.: 0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:36,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:34,4:.:-0.90:1.000:. ./.:4:50,2:.:-0.14:1.000:. ./.:4:29,2:.:-1.28:1.000:. ./.:4:49,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:41,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:53,8:.: 0.35:0.956:. ./.:4:59,8:.: 0.68:0.998:. ./.:4:38,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:40,3:.:-0.63:1.000:. ./.:4:58,1:.: 0.24:1.000:. -chr8.1 36455576 chr8.1_036455576 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:110,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.68:0.999:. ./.:4:98,5:.:-0.13:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.94:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.62:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.33:0.999:. ./.:4:77,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.00:1.000:. ./.:5:157,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.51:1.000:. ./.:6:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.10:0.887:. ./.:4:113,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.16:0.999:. ./.:4:164,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:143,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.13:0.968:. ./.:4:160,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.17:0.999:. ./.:4:143,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:138,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.39:0.994:. ./.:4:94,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.13:0.993:. ./.:4:126,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:135,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.09:0.999:. ./.:4:132,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.49:0.956:. ./.:4:131,0:.: 0.77:0.998:. ./.:4:92,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.32:1.000:. -chr8.1 36641706 chr8.1_036641706 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:428,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:415,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:200,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:165,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:193,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:326,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:454,4:.: 1.59:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.77:0.999:. ./.:4:293,107:.: 0.80:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:150,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:305,4:.:-0.45:1.000:. ./.:4:120,0:.:-3.03:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:402,2:.: 0.85:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:75,0:.:-3.65:1.000:. ./.:4:144,0:.:-2.71:1.000:. ./.:3:71,0:.:-3.70:0.999:. ./.:4:326,3:.:-0.17:1.000:. ./.:4:354,5:.: 0.24:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:467,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:340,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:416,0:.: 1.02:1.000:. ./.:5:517,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:433,3:.: 1.29:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:319,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:456,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:422,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:296,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:419,6:.: 1.14:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.74:1.000:. ./.:6:286,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:408,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:318,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:423,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:236,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.46:0.887:. ./.:4:321,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:426,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.80:0.999:. ./.:4:417,3:.: 1.07:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:419,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:455,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:288,0:.:-0.73:0.968:. ./.:4:386,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:360,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.62:0.999:. ./.:4:359,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:316,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:368,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:268,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:246,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.87:0.994:. ./.:4:277,2:.:-0.86:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:329,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:405,1:.: 0.88:0.993:. ./.:4:347,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:332,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:460,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.25:0.999:. ./.:4:329,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:249,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:356,5:.: 0.27:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:434,6:.: 1.35:1.000:. ./.:4:284,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:379,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:349,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:410,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:348,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:257,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:371,3:.: 0.44:1.000:. ./.:4:292,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:388,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:316,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:321,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:351,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:314,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:276,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:435,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:319,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:420,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:436,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:343,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:145,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:347,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:372,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:344,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:338,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:403,3:.: 0.88:1.000:. ./.:4:318,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:341,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:287,4:.:-0.69:1.000:. ./.:4:307,2:.:-0.45:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:271,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:240,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:414,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:369,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:349,0:.: 0.10:0.956:. ./.:4:414,0:.: 0.99:0.998:. ./.:4:461,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:337,0:.:-0.06:1.000:. -chr8.1 36925813 chr8.1_036925813 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,202:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,128:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,133:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,203:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,37:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,54:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,53:.:-1.47:1.000:. ./.:4:0,39:.:-1.79:1.000:. ./.:4:2,164:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.01:0.999:. ./.:4:0,170:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,212:.: 2.16:1.000:. ./.:4:0,198:.: 1.84:1.000:. ./.:4:0,40:.:-1.76:1.000:. ./.:4:1,77:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,114:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,18:.:-2.26:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,96:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,166:.: 1.11:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.39:1.000:. ./.:4:1,44:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,18:.:-2.26:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.78:1.000:. ./.:3:0,30:.:-1.99:0.999:. ./.:4:1,89:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,131:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.60:1.000:. ./.:4:2,131:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.05:1.000:. ./.:5:0,178:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.45:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,181:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1,66:.:-1.15:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.20:1.000:. ./.:6:0,114:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,179:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,107:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,225:.: 2.46:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.05:0.887:. ./.:4:0,108:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,54:.:-1.44:0.999:. ./.:4:0,82:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.34:1.000:. ./.:4:2,69:.:-1.06:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.50:0.968:. ./.:4:0,154:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,181:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.65:1.000:. ./.:4:2,79:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,177:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.95:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.26:0.999:. ./.:4:0,139:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,236:.: 2.71:1.000:. ./.:4:0,62:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,80:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,74:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,160:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,78:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,225:.: 2.46:1.000:. ./.:4:0,202:.: 1.93:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.25:0.994:. ./.:4:0,122:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,197:.: 1.82:1.000:. ./.:4:0,161:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.88:0.993:. ./.:4:0,71:.:-1.06:1.000:. ./.:4:1,90:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,131:.: 0.34:0.999:. ./.:4:0,134:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,169:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,59:.:-1.33:1.000:. ./.:4:2,73:.:-0.96:1.000:. ./.:4:1,153:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,124:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,175:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,163:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1,88:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,77:.:-0.92:1.000:. ./.:4:2,74:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,64:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,86:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,117:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.66:1.000:. ./.:4:1,142:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,216:.: 2.25:1.000:. ./.:4:0,170:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,191:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,179:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,139:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.90:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,65:.:-1.19:1.000:. ./.:4:2,123:.: 0.18:1.000:. ./.:4:1,111:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,76:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,92:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,70:.:-1.08:1.000:. ./.:4:2,88:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,79:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,87:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,74:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,54:.:-1.42:1.000:. ./.:4:1,132:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1,88:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,106:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,123:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.24:0.956:. ./.:4:0,73:.:-1.01:0.998:. ./.:4:0,101:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,121:.: 0.13:1.000:. -chr8.1 37161205 chr8.1_037161205 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:141,321:0.76: 0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,224:0.71:-0.84:1.000:0.991 0/1/1/1:4:129,326:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:145,325:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:167,418:0.77: 1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:325,178:0.42: 0.57:1.000:0.902 0/1/1/1:4:113,214:0.72:-1.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:135,284:0.74:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:129,272:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,42:0.46:-3.03:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-3.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,337:0.79: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:139,301:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:307,207:0.47: 0.67:1.000:0.993 0/1/1/1:4:141,278:0.73:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:119,288:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:140,290:0.74:-0.09:0.999:0.998 0/0/0/1:4:371,107:0.27: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:403,263:0.46: 2.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:366,252:0.48: 1.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:84,66:0.51:-2.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:140,282:0.73:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:182,423:0.76: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:240,201:0.53: 0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,24:0.55:-3.55:1.000:0.979 0/0/1/1:4:275,201:0.49: 0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:139,295:0.74:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:265,192:0.49: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:350,268:0.51: 1.62:1.000:0.997 0/1/1/1:4:116,259:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:129,241:0.72:-0.64:1.000:0.994 0/0/1/1:4:222,144:0.46:-0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:34,30:0.54:-3.43:1.000:0.988 1/1/1/1:4:3,195:0.99:-2.21:1.000:1.000 1/1/1:3:11,64:0.88:-3.33:0.999:0.980 1/1/1/1:4:0,373:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:125,271:0.75:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:274,188:0.48: 0.20:1.000:0.994 0/1/1/1:4:155,347:0.75: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:289,186:0.46: 0.32:1.000:0.987 0/1/1/1:4:121,290:0.76:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:157,338:0.75: 0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:325,208:0.46: 0.84:1.000:0.986 0/1/1/1:4:129,326:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:162,378:0.76: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:167,315:0.72: 0.38:1.000:0.995 0/0/1/1/1:5:328,376:0.60: 2.40:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-3.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,316:0.78:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:241,139:0.43:-0.55:1.000:0.948 0/0/1/1:4:240,158:0.47:-0.39:1.000:0.991 0/0/1/1:4:281,238:0.53: 0.72:1.000:0.992 0/1/1/1:4:110,255:0.76:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:427,122:0.27: 0.99:1.000:0.998 0/1/1/1:4:113,308:0.79:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:143,305:0.74: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,181:0.49:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:158,312:0.73: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:375,80:0.22: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:103,219:0.74:-1.08:1.000:0.558 0/1/1/1:4:169,319:0.72: 0.43:1.000:0.995 0/1/1/1:4:101,255:0.77:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:289,239:0.52: 0.80:1.000:0.994 0/0/1/1:4:284,183:0.46: 0.24:1.000:0.988 0/1/1/1:4:164,353:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:292,191:0.46: 0.39:1.000:0.990 0/0/1/1:4:259,148:0.43:-0.30:1.000:0.942 0/0/1/1:4:299,183:0.45: 0.38:1.000:0.976 0/1/1/1:4:118,263:0.75:-0.54:0.887:0.999 1/1/1/1:4:0,392:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:332,223:0.47: 1.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:147,329:0.75: 0.32:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,331:1.00:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:173,353:0.73: 0.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:145,325:0.75: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,211:0.73:-1.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:397,87:0.23: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:311,236:0.50: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:260,262:0.57: 0.74:1.000:0.942 0/0/0/1:4:442,101:0.23: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,233:0.77:-1.01:0.968:1.000 1/1/1/1:4:0,460:1.00: 0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,422:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,323:0.80:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:136,268:0.73:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:168,321:0.72: 0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,225:0.77:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:137,274:0.73:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:252,189:0.50: 0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:248,207:0.53: 0.13:1.000:0.993 0/1/1/1:4:107,211:0.73:-1.11:0.999:0.997 0/1/1/1:4:145,251:0.70:-0.40:1.000:0.983 0/0/1/1:4:308,245:0.52: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,209:0.76:-1.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,425:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,353:0.76: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:260,187:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,224:0.72:-0.90:1.000:0.995 0/1/1/1:4:138,314:0.76: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,452:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:307,229:0.50: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:305,206:0.47: 0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:223,197:0.54:-0.19:1.000:0.988 0/1/1/1:4:143,329:0.76: 0.29:0.994:1.000 0/0/1/1:4:216,178:0.52:-0.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:125,324:0.78: 0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:128,282:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:270,179:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:154,391:0.77: 0.95:0.993:1.000 0/1/1/1:4:144,314:0.75: 0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:136,292:0.74:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:372,231:0.45: 1.48:1.000:0.980 0/1/1/1:4:169,379:0.75: 0.98:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,440:1.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,160:0.54:-0.88:1.000:0.990 0/0/1/1:4:292,234:0.52: 0.78:1.000:0.995 0/1/1/1:4:143,280:0.73:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:243,195:0.52:-0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:412,119:0.27: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:127,278:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:262,212:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:178,302:0.69: 0.36:1.000:0.979 0/0/0/1:4:553,143:0.25: 2.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:123,332:0.78: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:151,308:0.73: 0.17:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,438:1.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:313,198:0.46: 0.64:1.000:0.984 0/0/1/1:4:217,124:0.43:-0.90:1.000:0.942 0/0/1/1:4:175,149:0.53:-1.06:1.000:0.992 0/1/1/1:4:101,254:0.77:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:140,280:0.73:-0.19:1.000:0.998 0/1/1/1:4:136,286:0.74:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,217:0.78:-1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:110,268:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:130,294:0.75:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,534:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:295,238:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:116,269:0.76:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:237,183:0.51:-0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:119,260:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:302,212:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/1/1/1:4:190,278:0.66: 0.25:1.000:0.869 0/1/1/1:4:132,266:0.73:-0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:228,159:0.48:-0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:365,257:0.48: 1.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:217,473:0.75: 2.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:166,314:0.72: 0.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:281,178:0.46: 0.17:1.000:0.985 0/0/1/1:4:341,249:0.49: 1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:225,168:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/0/1:4:519,139:0.26: 1.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:244,193:0.51:-0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:65,64:0.57:-2.83:1.000:0.956 0/1/1/1:4:105,227:0.75:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:322,231:0.49: 1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:311,213:0.48: 0.76:1.000:0.994 0/1/1/1:4:181,388:0.74: 1.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:178,350:0.73: 0.80:1.000:0.997 0/1/1/1:4:133,274:0.74:-0.30:1.000:0.998 0/1/1/1:4:184,314:0.70: 0.52:1.000:0.980 0/1/1/1:4:131,262:0.73:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:248,147:0.44:-0.41:1.000:0.963 0/1/1/1:4:124,274:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/1/1:4:298,190:0.46: 0.43:1.000:0.986 0/1/1/1:4:109,258:0.76:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:149,293:0.73: 0.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:149,256:0.70:-0.32:1.000:0.982 0/1/1/1:4:161,286:0.70: 0.06:1.000:0.988 0/1/1/1:4:147,305:0.74: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:295,158:0.41: 0.12:1.000:0.873 0/0/1/1:4:230,153:0.47:-0.52:1.000:0.992 0/1/1/1:4:113,218:0.72:-1.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:304,199:0.46: 0.57:1.000:0.990 0/0/0/1:4:387,103:0.26: 0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:355,81:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:220,126:0.43:-0.86:1.000:0.943 0/0/0/1:4:461,102:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:201,395:0.73: 1.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:274,220:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:227,183:0.52:-0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:151,337:0.75: 0.43:0.956:0.999 0/1/1/1:4:180,370:0.74: 1.00:0.998:0.998 0/0/1/1:4:363,268:0.50: 1.74:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,356:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:150,341:0.76: 0.46:1.000:1.000 -chr8.1 37328007 chr8.1_037328007 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,413:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,178:0.51:-1.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:144,300:0.72:-0.44:1.000:0.994 0/1/1/1:4:143,285:0.71:-0.61:1.000:0.990 0/0/1/1:4:318,307:0.54: 1.40:1.000:0.988 0/0/1/1:4:352,279:0.49: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:207,125:0.42:-1.59:1.000:0.916 0/0/1/1:4:295,239:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:269,198:0.47:-0.21:1.000:0.993 0/0/1/1:4:132,107:0.50:-2.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:117,206:0.68:-1.68:1.000:0.954 0/0/1/1:4:241,228:0.53:-0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:437,103:0.22: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:350,222:0.43: 0.86:1.000:0.954 0/0/1/1:4:292,226:0.48: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:308,289:0.53: 1.12:1.000:0.991 0/1/1/1:4:197,397:0.71: 1.09:0.999:0.992 0/0/0/1:4:459,138:0.26: 1.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:212,370:0.68: 0.96:1.000:0.949 0/1/1/1:4:171,314:0.69:-0.03:1.000:0.972 0/1/1/1:4:64,166:0.76:-2.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:279,199:0.46:-0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:317,221:0.46: 0.51:1.000:0.986 0/1/1/1:4:127,279:0.73:-0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:130,69:0.39:-2.94:1.000:0.676 0/1/1/1:4:199,456:0.74: 1.71:1.000:0.998 0/1/1/1:4:153,282:0.69:-0.54:1.000:0.974 0/0/0/1:4:417,116:0.25: 0.46:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,502:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,384:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:345,176:0.38: 0.34:1.000:0.558 0/0/1/1:4:267,176:0.44:-0.45:1.000:0.971 0/0/1/1:4:147,87:0.42:-2.58:1.000:0.894 0/1/1/1:4:70,200:0.78:-2.22:1.000:1.000 0/1/1:3:53,46:0.51:-3.96:0.999:0.710 0/0/1/1:4:317,200:0.43: 0.30:1.000:0.951 0/1/1/1:4:145,396:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:135,294:0.73:-0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:361,263:0.47: 1.39:1.000:0.992 0/1/1/1:4:190,370:0.70: 0.74:1.000:0.987 0/1/1/1:4:121,312:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:175,341:0.70: 0.29:1.000:0.987 0/1/1/1:4:153,434:0.77: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,206:0.45: 0.19:1.000:0.983 0/0/0/1:4:469,97:0.20: 0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:150,363:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:465,232:0.37: 2.14:1.000:0.958 0/0/1/1:4:267,163:0.42:-0.59:1.000:0.926 0/1/1/1:4:149,283:0.70:-0.57:1.000:0.982 0/0/1/1:4:395,274:0.46: 1.85:1.000:0.985 0/0/1/1:4:300,226:0.48: 0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:188,468:0.75: 1.72:1.000:0.999 0/0/0/1:4:364,113:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/1/1/1:4:176,352:0.71: 0.41:1.000:0.991 0/0/1/1:4:276,198:0.46:-0.14:1.000:0.990 0/1/1/1:4:191,380:0.71: 0.85:1.000:0.990 0/0/1/1:4:277,180:0.44:-0.31:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,599:1.00: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,318:0.72:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1/1/1:6:159,235:0.64:-0.95:1.000:0.873 0/1/1/1:4:173,308:0.68:-0.07:1.000:0.960 0/0/1/1:4:274,215:0.49: 0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:523,149:0.25: 1.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:329,251:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:337,225:0.45: 0.76:1.000:0.976 0/1/1/1:4:141,420:0.78: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:258,140:0.39:-0.91:1.000:0.735 0/0/1/1:4:259,227:0.52:-0.02:1.000:0.996 0/1/1/1:4:157,286:0.69:-0.45:0.887:0.970 0/1/1/1:4:116,267:0.74:-1.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:375,282:0.48: 1.73:1.000:0.994 0/0/1/1:4:266,225:0.51: 0.04:0.999:0.996 0/0/1/1:4:398,234:0.41: 1.47:1.000:0.886 0/1/1/1:4:162,372:0.74: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:310,223:0.47: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:296,170:0.41:-0.22:1.000:0.852 0/1/1/1:4:146,343:0.74: 0.02:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:293,224:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:189,368:0.70: 0.71:1.000:0.987 0/0/1/1:4:245,125:0.38:-1.20:0.968:0.558 0/1/1/1:4:173,402:0.74: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:196,379:0.70: 0.89:1.000:0.986 0/0/1/1:4:247,168:0.45:-0.74:1.000:0.981 0/0/1/1:4:364,244:0.45: 1.23:1.000:0.977 0/0/1/1:4:318,245:0.48: 0.77:1.000:0.995 0/0/1/1:4:211,159:0.48:-1.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:275,262:0.54: 0.50:1.000:0.990 0/1/1/1:4:120,313:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,306:0.78:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,226:0.70:-1.49:0.999:0.988 0/1/1/1:4:138,336:0.75:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:153,426:0.77: 0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,257:0.74:-1.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:340,229:0.45: 0.83:1.000:0.978 0/0/1/1:4:327,227:0.46: 0.68:1.000:0.985 0/0/1/1:4:243,200:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/1:4:419,124:0.26: 0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:189,338:0.68: 0.40:1.000:0.962 0/0/1/1:4:276,264:0.54: 0.53:1.000:0.989 0/1/1/1:4:141,261:0.69:-0.87:1.000:0.975 0/1/1/1:4:164,362:0.73: 0.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:128,252:0.70:-1.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:294,236:0.49: 0.43:0.994:0.997 0/0/1/1:4:184,127:0.45:-1.80:1.000:0.984 0/0/1/1:4:270,227:0.51: 0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:246,225:0.53:-0.17:1.000:0.993 0/0/1/1:4:322,207:0.44: 0.42:1.000:0.961 0/0/0/1:4:493,144:0.26: 1.52:0.993:0.999 0/0/1/1:4:237,219:0.53:-0.32:1.000:0.993 0/0/1/1:4:267,224:0.51: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:361,272:0.48: 1.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:146,366:0.75: 0.25:0.999:0.999 0/0/1/1:4:327,169:0.38: 0.09:1.000:0.598 0/1/1/1:4:133,246:0.69:-1.11:1.000:0.975 0/1/1/1:4:163,305:0.69:-0.20:1.000:0.978 0/0/1/1:4:251,203:0.50:-0.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:398,99:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:154,333:0.72:-0.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:371,103:0.25:-0.14:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,453:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:269,202:0.48:-0.17:1.000:0.994 0/1/1/1:4:148,316:0.72:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:164,307:0.69:-0.17:1.000:0.978 0/1/1/1:4:153,335:0.73: 0.00:1.000:0.997 0/1/1/1:4:158,319:0.71:-0.11:1.000:0.992 0/0/0/1:4:439,107:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:544,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:129,211:0.66:-1.50:1.000:0.890 0/0/1/1:4:265,170:0.44:-0.54:1.000:0.960 0/1/1/1:4:146,285:0.70:-0.58:1.000:0.987 0/0/1/1:4:314,228:0.47: 0.56:1.000:0.991 0/1/1/1:4:111,206:0.69:-1.74:1.000:0.976 0/1/1/1:4:165,356:0.72: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:133,280:0.72:-0.76:1.000:0.995 0/1/1/1:4:209,410:0.70: 1.34:1.000:0.988 0/0/1/1:4:338,267:0.49: 1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:298,242:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:255,162:0.43:-0.72:1.000:0.955 0/0/1/1:4:283,194:0.45:-0.11:1.000:0.983 0/0/1/1:4:268,258:0.54: 0.39:1.000:0.989 0/0/0/1:4:442,108:0.23: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:291,148:0.38:-0.49:1.000:0.548 0/0/1/1:4:263,197:0.48:-0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:172,422:0.75: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:202,420:0.72: 1.37:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,454:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,179:0.47:-0.63:1.000:0.991 0/1/1/1:4:155,405:0.76: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:152,314:0.71:-0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:185,354:0.70: 0.52:1.000:0.984 0/0/0/1:4:439,116:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,106:0.60:-3.01:1.000:0.811 0/0/0/1:4:315,68:0.20:-1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:170,386:0.73: 0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:286,235:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:341,233:0.45: 0.88:1.000:0.982 0/1/1/1:4:172,315:0.69:-0.01:1.000:0.972 0/1/1/1:4:136,228:0.67:-1.26:1.000:0.917 0/1/1/1:4:156,391:0.75: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:137,270:0.70:-0.82:1.000:0.989 0/1/1/1:4:153,325:0.72:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:423,124:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/1/1/1:4:139,288:0.72:-0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:357,199:0.40: 0.70:1.000:0.796 0/1/1/1:4:146,311:0.72:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:275,189:0.45:-0.24:1.000:0.983 0/0/0/1:4:442,107:0.22: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,377:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,244:0.70:-1.22:1.000:0.989 0/0/1/1:4:209,147:0.46:-1.34:1.000:0.987 0/1/1/1:4:121,278:0.74:-0.90:1.000:0.998 0/0/1/1:4:254,177:0.46:-0.58:1.000:0.986 0/0/1/1:4:244,173:0.46:-0.72:1.000:0.989 0/1/1/1:4:176,333:0.70: 0.22:1.000:0.981 0/1/1/1:4:121,236:0.70:-1.33:1.000:0.987 0/0/1/1:4:396,270:0.45: 1.82:1.000:0.981 0/0/0/1:4:477,134:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:314,248:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:310,162:0.38:-0.16:1.000:0.631 0/0/1/1:4:303,205:0.45: 0.21:0.956:0.979 0/0/0/1:4:414,202:0.37: 1.31:0.998:0.583 0/1/1/1:4:177,352:0.71: 0.42:1.000:0.990 0/0/1/1:4:242,194:0.49:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:284,233:0.50: 0.30:1.000:0.997 -chr8.1 37429270 chr8.1_037429270 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:10,10:.:-1.27:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:30,4:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,5:.:-1.06:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:10,7:.:-1.49:1.000:. ./.:4:16,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:9,17:.:-0.85:1.000:. ./.:4:24,7:.:-0.49:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.78:1.000:. ./.:4:13,10:.:-1.06:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.63:0.999:. ./.:4:17,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:20,13:.:-0.35:1.000:. ./.:4:34,6:.: 0.15:1.000:. ./.:4:20,8:.:-0.70:1.000:. ./.:4:28,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:36,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:12,7:.:-1.35:1.000:. ./.:4:16,4:.:-1.27:1.000:. ./.:4:15,6:.:-1.20:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.92:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.56:1.000:. ./.:4:27,9:.:-0.13:1.000:. ./.:4:14,3:.:-1.49:1.000:. ./.:4:18,3:.:-1.20:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.85:1.000:. ./.:4:13,3:.:-1.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.70:1.000:. ./.:3:5,2:.:-2.20:0.999:. ./.:4:19,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:10,11:.:-1.20:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:37,6:.: 0.36:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.36:1.000:. ./.:4:38,15:.: 1.08:1.000:. ./.:4:44,12:.: 1.29:1.000:. ./.:4:38,8:.: 0.58:1.000:. ./.:5:48,5:.: 1.08:1.000:. ./.:4:76,21:.: 4.21:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.78:1.000:. ./.:4:30,10:.: 0.15:1.000:. ./.:4:40,14:.: 1.15:1.000:. ./.:4:20,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:42,16:.: 1.43:1.000:. ./.:4:50,7:.: 1.36:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:34,12:.: 0.58:1.000:. ./.:4:39,8:.: 0.65:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:18,30:.: 0.72:1.000:. ./.:6:49,12:.: 1.65:1.000:. ./.:4:36,14:.: 0.86:1.000:. ./.:4:32,6:.: 0.01:1.000:. ./.:4:40,13:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,14:.: 1.58:1.000:. ./.:4:29,20:.: 0.79:1.000:. ./.:4:43,14:.: 1.36:1.000:. ./.:4:15,22:.:-0.06:1.000:. ./.:4:37,9:.: 0.58:1.000:. ./.:4:44,15:.: 1.50:0.887:. ./.:4:25,5:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,14:.: 1.72:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:22,34:.: 1.29:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.63:1.000:. ./.:4:21,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:44,9:.: 1.08:1.000:. ./.:4:17,20:.:-0.06:1.000:. ./.:4:50,9:.: 1.50:1.000:. ./.:4:42,11:.: 1.08:1.000:. ./.:4:33,31:.: 1.86:1.000:. ./.:4:9,29:.: 0.01:0.968:. ./.:4:42,8:.: 0.86:1.000:. ./.:4:36,13:.: 0.79:1.000:. ./.:4:19,10:.:-0.63:1.000:. ./.:4:37,19:.: 1.29:1.000:. ./.:4:70,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:29,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,8:.: 1.08:1.000:. ./.:4:31,22:.: 1.08:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:42,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:39,19:.: 1.43:1.000:. ./.:4:19,8:.:-0.78:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:38,10:.: 0.72:1.000:. ./.:4:36,7:.: 0.36:1.000:. ./.:4:45,16:.: 1.65:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:22,7:.:-0.63:1.000:. ./.:4:41,12:.: 1.08:1.000:. ./.:4:16,18:.:-0.28:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.43:0.994:. ./.:4:26,23:.: 0.79:1.000:. ./.:4:55,7:.: 1.72:1.000:. ./.:4:36,8:.: 0.44:1.000:. ./.:4:26,7:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,8:.: 0.65:0.993:. ./.:4:53,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:18,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.36:0.999:. ./.:4:33,11:.: 0.44:1.000:. ./.:4:35,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:24,29:.: 1.08:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:31,11:.: 0.29:1.000:. ./.:4:21,10:.:-0.49:1.000:. ./.:4:40,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:27,8:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,15:.: 0.58:1.000:. ./.:4:49,9:.: 1.43:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:34,9:.: 0.36:1.000:. ./.:4:39,10:.: 0.79:1.000:. ./.:4:35,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:19,13:.:-0.42:1.000:. ./.:4:35,9:.: 0.44:1.000:. ./.:4:33,8:.: 0.22:1.000:. ./.:4:44,12:.: 1.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,11:.: 0.01:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:23,5:.:-0.70:1.000:. ./.:4:28,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:35,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:23,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:37,11:.: 0.72:1.000:. ./.:4:34,11:.: 0.51:1.000:. ./.:4:15,8:.:-1.06:1.000:. ./.:4:38,13:.: 0.93:1.000:. ./.:4:29,7:.:-0.13:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,7:.: 0.15:1.000:. ./.:4:22,13:.:-0.21:1.000:. ./.:4:30,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,11:.: 1.01:1.000:. ./.:4:31,8:.: 0.08:1.000:. ./.:4:16,3:.:-1.35:1.000:. ./.:4:10,16:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:34,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,5:.:-0.42:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:31,1:.:-0.42:1.000:. ./.:4:26,11:.:-0.06:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:19,5:.:-0.99:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:31,7:.: 0.01:1.000:. ./.:4:32,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.85:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.85:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:26,8:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,4:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,5:.:-0.56:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.92:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.35:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.21:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.92:1.000:. ./.:4:8,7:.:-1.63:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.06:0.956:. ./.:4:24,6:.:-0.56:0.998:. ./.:4:23,3:.:-0.85:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:14,8:.:-1.13:1.000:. -chr8.1 37654331 chr8.1_037654331 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:155,12:.: 0.69:1.000:. ./.:4:133,9:.: 0.09:1.000:. ./.:4:90,27:.:-0.50:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:104,25:.:-0.22:1.000:. ./.:4:111,27:.: 0.00:1.000:. ./.:4:102,7:.:-0.69:1.000:. ./.:4:159,11:.: 0.76:1.000:. ./.:4:149,13:.: 0.57:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:67,5:.:-1.57:1.000:. ./.:4:198,7:.: 1.60:1.000:. ./.:4:90,21:.:-0.64:1.000:. ./.:4:208,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:159,5:.: 0.62:1.000:. ./.:4:182,10:.: 1.29:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.05:0.999:. ./.:4:162,12:.: 0.86:1.000:. ./.:4:217,8:.: 2.07:1.000:. ./.:4:178,11:.: 1.21:1.000:. ./.:4:71,8:.:-1.41:1.000:. ./.:4:145,11:.: 0.43:1.000:. ./.:4:150,11:.: 0.55:1.000:. ./.:4:141,12:.: 0.36:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:166,13:.: 0.98:1.000:. ./.:4:98,15:.:-0.60:1.000:. ./.:4:148,16:.: 0.62:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:169,20:.: 1.21:1.000:. ./.:4:170,11:.: 1.02:1.000:. ./.:4:156,14:.: 0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:81,5:.:-1.24:1.000:. ./.:3:23,13:.:-2.43:0.999:. ./.:4:126,26:.: 0.33:1.000:. ./.:4:97,20:.:-0.50:1.000:. ./.:4:138,11:.: 0.26:1.000:. ./.:4:134,11:.: 0.17:1.000:. ./.:4:157,13:.: 0.76:1.000:. ./.:4:62,24:.:-1.24:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:124,15:.: 0.02:1.000:. ./.:4:105,10:.:-0.55:1.000:. ./.:4:73,14:.:-1.22:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.29:1.000:. ./.:5:161,19:.: 1.00:1.000:. ./.:4:215,75:.: 3.62:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:76,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:54,13:.:-1.69:1.000:. ./.:4:152,8:.: 0.52:1.000:. ./.:4:79,21:.:-0.91:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:150,8:.: 0.48:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:94,8:.:-0.86:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.59:1.000:. ./.:6:100,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:133,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:131,10:.: 0.07:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:151,12:.: 0.59:1.000:. ./.:4:108,7:.:-0.55:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:77,15:.:-1.10:0.887:. ./.:4:101,11:.:-0.62:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:86,4:.:-1.15:0.999:. ./.:4:142,10:.: 0.33:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:97,9:.:-0.76:1.000:. ./.:4:102,10:.:-0.62:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:80,14:.:-1.05:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:98,9:.:-0.74:0.968:. ./.:4:155,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:131,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:118,7:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:150,11:.: 0.55:1.000:. ./.:4:94,4:.:-0.95:1.000:. ./.:4:108,6:.:-0.57:1.000:. ./.:4:101,10:.:-0.64:1.000:. ./.:4:131,6:.:-0.03:1.000:. ./.:4:82,16:.:-0.95:0.999:. ./.:4:67,17:.:-1.29:1.000:. ./.:4:118,9:.:-0.26:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:75,28:.:-0.84:1.000:. ./.:4:137,13:.: 0.28:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:54,13:.:-1.69:1.000:. ./.:4:90,17:.:-0.74:1.000:. ./.:4:89,18:.:-0.74:1.000:. ./.:4:79,11:.:-1.15:1.000:. ./.:4:117,7:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:103,8:.:-0.64:0.994:. ./.:4:142,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:110,13:.:-0.36:1.000:. ./.:4:97,9:.:-0.76:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:112,12:.:-0.33:0.993:. ./.:4:146,9:.: 0.40:1.000:. ./.:4:111,13:.:-0.33:1.000:. ./.:4:281,0:.: 3.41:1.000:. ./.:4:100,19:.:-0.45:0.999:. ./.:4:69,10:.:-1.41:1.000:. ./.:4:101,10:.:-0.64:1.000:. ./.:4:135,8:.: 0.12:1.000:. ./.:4:112,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:104,7:.:-0.64:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:72,14:.:-1.24:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:80,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:104,27:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,17:.:-1.24:1.000:. ./.:4:109,5:.:-0.57:1.000:. ./.:4:110,6:.:-0.53:1.000:. ./.:4:58,22:.:-1.38:1.000:. ./.:4:74,8:.:-1.34:1.000:. ./.:4:73,6:.:-1.41:1.000:. ./.:4:80,12:.:-1.10:1.000:. ./.:4:149,14:.: 0.59:1.000:. ./.:4:59,16:.:-1.50:1.000:. ./.:4:77,20:.:-0.98:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:218,18:.: 2.33:1.000:. ./.:4:190,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:115,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:71,19:.:-1.15:1.000:. ./.:4:84,7:.:-1.12:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:66,20:.:-1.24:1.000:. ./.:4:147,8:.: 0.40:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:188,11:.: 1.45:1.000:. ./.:4:222,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:157,14:.: 0.79:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:173,11:.: 1.10:1.000:. ./.:4:116,12:.:-0.24:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:160,8:.: 0.71:1.000:. ./.:4:64,5:.:-1.65:1.000:. ./.:4:81,13:.:-1.05:1.000:. ./.:4:141,11:.: 0.33:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:188,14:.: 1.52:1.000:. ./.:4:126,12:.: 0.00:1.000:. ./.:4:81,21:.:-0.86:1.000:. ./.:4:106,27:.:-0.12:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:122,12:.:-0.10:1.000:. ./.:4:96,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:133,13:.: 0.19:1.000:. ./.:4:149,18:.: 0.69:1.000:. ./.:4:74,17:.:-1.12:1.000:. ./.:4:143,10:.: 0.36:1.000:. ./.:4:80,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:155,7:.: 0.57:1.000:. ./.:4:142,13:.: 0.40:1.000:. ./.:4:89,15:.:-0.81:1.000:. ./.:4:73,18:.:-1.12:1.000:. ./.:4:70,21:.:-1.12:1.000:. ./.:4:139,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:136,7:.: 0.12:1.000:. ./.:4:187,15:.: 1.52:1.000:. ./.:4:111,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:188,5:.: 1.31:1.000:. ./.:4:163,8:.: 0.79:0.956:. ./.:4:184,16:.: 1.48:0.998:. ./.:4:147,22:.: 0.74:1.000:. ./.:4:91,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:143,4:.: 0.21:1.000:. -chr8.1 37723102 chr8.1_037723102 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:179,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:102,39:.:-0.81:1.000:. ./.:4:168,59:.: 1.23:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:60,22:.:-2.21:1.000:. ./.:4:108,41:.:-0.62:1.000:. ./.:4:111,42:.:-0.53:1.000:. ./.:4:42,16:.:-2.78:1.000:. ./.:4:63,13:.:-2.36:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:126,36:.:-0.31:1.000:. ./.:4:128,53:.: 0.14:1.000:. ./.:4:153,43:.: 0.49:1.000:. ./.:4:100,45:.:-0.72:1.000:. ./.:4:148,37:.: 0.23:0.999:. ./.:4:123,41:.:-0.27:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:68,1:.:-2.52:1.000:. ./.:4:135,49:.: 0.21:1.000:. ./.:4:182,57:.: 1.51:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:42,28:.:-2.50:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:127,40:.:-0.19:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:117,48:.:-0.24:1.000:. ./.:4:90,38:.:-1.12:1.000:. ./.:4:43,2:.:-3.09:1.000:. ./.:4:56,14:.:-2.50:1.000:. ./.:3:45,0:.:-3.09:0.999:. ./.:4:105,33:.:-0.88:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:123,48:.:-0.10:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:134,52:.: 0.26:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:148,40:.: 0.30:1.000:. ./.:4:140,61:.: 0.61:1.000:. ./.:4:168,46:.: 0.92:1.000:. ./.:5:212,42:.: 1.87:1.000:. ./.:4:27,11:.:-3.26:1.000:. ./.:4:138,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:169,45:.: 0.92:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:120,46:.:-0.22:1.000:. ./.:4:168,46:.: 0.92:1.000:. ./.:4:182,41:.: 1.13:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.49:1.000:. ./.:6:137,46:.: 0.18:1.000:. ./.:4:150,59:.: 0.80:1.000:. ./.:4:141,48:.: 0.33:1.000:. ./.:4:146,53:.: 0.56:1.000:. ./.:4:139,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:165,54:.: 1.04:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:107,28:.:-0.95:1.000:. ./.:4:165,33:.: 0.54:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.64:0.887:. ./.:4:143,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:173,33:.: 0.73:1.000:. ./.:4:81,29:.:-1.55:0.999:. ./.:4:245,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:160,47:.: 0.75:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:170,32:.: 0.64:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:162,63:.: 1.18:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.76:0.968:. ./.:4:174,34:.: 0.78:1.000:. ./.:4:173,68:.: 1.56:1.000:. ./.:4:130,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:126,51:.: 0.04:1.000:. ./.:4:161,48:.: 0.80:1.000:. ./.:4:122,45:.:-0.19:1.000:. ./.:4:131,42:.:-0.05:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:192,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:94,36:.:-1.07:1.000:. ./.:4:172,49:.: 1.09:1.000:. ./.:4:160,42:.: 0.64:1.000:. ./.:4:148,38:.: 0.26:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:158,56:.: 0.92:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:112,39:.:-0.57:1.000:. ./.:4:174,63:.: 1.47:0.994:. ./.:4:121,46:.:-0.19:1.000:. ./.:4:152,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:133,37:.:-0.12:1.000:. ./.:4:113,49:.:-0.31:1.000:. ./.:4:179,53:.: 1.35:0.993:. ./.:4:137,54:.: 0.37:1.000:. ./.:4:160,53:.: 0.90:1.000:. ./.:4:140,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.47:0.999:. ./.:4:129,42:.:-0.10:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:130,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:127,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:222,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:116,40:.:-0.46:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:130,42:.:-0.08:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:149,45:.: 0.45:1.000:. ./.:4:149,45:.: 0.45:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:112,30:.:-0.79:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:108,47:.:-0.48:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:135,45:.: 0.11:1.000:. ./.:4:167,56:.: 1.13:1.000:. ./.:4:186,29:.: 0.94:1.000:. ./.:4:120,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:134,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:176,60:.: 1.44:1.000:. ./.:4:131,51:.: 0.16:1.000:. ./.:4:107,40:.:-0.67:1.000:. ./.:4:97,34:.:-1.05:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:178,68:.: 1.68:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:144,55:.: 0.56:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:111,38:.:-0.62:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:90,30:.:-1.31:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:146,51:.: 0.52:1.000:. ./.:4:133,56:.: 0.33:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:119,32:.:-0.57:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:118,43:.:-0.34:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:93,46:.:-0.86:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:176,42:.: 1.02:1.000:. ./.:4:133,48:.: 0.14:1.000:. ./.:4:127,28:.:-0.48:1.000:. ./.:4:151,50:.: 0.61:0.956:. ./.:4:174,58:.: 1.35:0.998:. ./.:4:207,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:106,35:.:-0.81:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.67:1.000:. -chr8.1 38033598 chr8.1_038033598 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:72,125:0.65: 0.84:1.000:0.795 0/0/1/1:4:92,58:0.42: 0.05:1.000:0.896 0/0/1/1:4:120,74:0.41: 0.79:1.000:0.856 0/1/1/1:4:57,112:0.67: 0.37:1.000:0.932 0/0/0/0:4:186,23:0.10: 1.04:1.000:0.726 0/0/1/1:4:160,97:0.40: 1.84:1.000:0.816 0/0/0/1:4:95,46:0.33:-0.10:1.000:0.912 0/0/1/1:4:119,70:0.39: 0.70:1.000:0.727 0/0/1/1:4:122,76:0.41: 0.85:1.000:0.876 0/0/0/0:4:18,2:0.09:-2.12:1.000:0.909 0/0/0/1:4:12,4:0.23:-2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,102:0.50: 1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:186,27:0.12: 1.10:1.000:0.733 0/0/0/1:4:164,38:0.18: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,64:0.36: 0.62:1.000:0.664 0/0/0/1:4:213,46:0.17: 1.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:117,79:0.44: 0.82:0.999:0.965 0/0/1/1:4:79,93:0.57: 0.42:1.000:0.932 0/0/1/1:4:75,108:0.61: 0.60:1.000:0.637 0/1/1/1:4:66,111:0.64: 0.50:1.000:0.737 0/0/0/1:4:18,3:0.13:-2.10:1.000:0.938 0/0/0/1:4:179,37:0.16: 1.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:154,71:0.32: 1.30:1.000:0.960 0/1/1/1:4:64,102:0.63: 0.32:1.000:0.617 0/0/0/1:4:10,2:0.16:-2.25:1.000:0.993 0/1/1/1:4:61,108:0.65: 0.37:1.000:0.825 0/0/1/1:4:161,94:0.39: 1.80:1.000:0.702 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,86:0.57: 0.22:1.000:0.940 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,64:0.32: 0.89:1.000:0.944 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.46:-2.25:1.000:0.986 0/0/0/1:4:10,3:0.22:-2.24:1.000:1.000 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.44:0.999:1.000 0/0/0/1:4:134,63:0.32: 0.84:1.000:0.945 0/1/1/1:4:52,85:0.64:-0.17:1.000:0.676 0/0/1/1:4:138,79:0.38: 1.17:1.000:0.627 0/0/0/1:4:130,33:0.19: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,77:0.42: 0.84:1.000:0.921 0/0/1/1:4:86,53:0.41:-0.13:1.000:0.854 0/0/0/1:4:136,27:0.16: 0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:88,49:0.38:-0.17:1.000:0.513 0/0/1/1:4:75,43:0.39:-0.48:1.000:0.633 0/0/0/1:4:127,23:0.14: 0.05:1.000:0.977 0/1/1/1:4:38,91:0.71:-0.30:1.000:0.990 0/0/0/0/1:5:298,37:0.10: 3.14:1.000:0.811 0/0/0/1:4:139,67:0.33: 0.99:1.000:0.918 0/1/1/1:4:43,76:0.65:-0.47:1.000:0.823 0/0/0/1:4:71,38:0.36:-0.63:1.000:0.651 0/0/0/0:4:98,12:0.10:-0.62:1.000:0.750 0/1/1/1:4:59,99:0.64: 0.18:1.000:0.732 0/0/0/1:4:107,15:0.12:-0.42:1.000:0.641 0/0/0/1:4:88,45:0.35:-0.23:1.000:0.802 0/0/1/1:4:110,76:0.45: 0.65:1.000:0.976 0/1/1/1:4:35,65:0.66:-0.78:1.000:0.885 0/0/1/1:4:92,52:0.38:-0.05:1.000:0.576 0/0/1/1:4:28,40:0.61:-1.32:1.000:0.656 0/0/0/1:4:77,41:0.36:-0.48:1.000:0.670 0/0/0/1/1/1:6:45,29:0.42:-1.22:1.000:0.546 0/0/0/1:4:80,40:0.34:-0.45:1.000:0.856 0/0/0/1:4:97,40:0.28:-0.17:1.000:0.994 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,33:0.37:-0.88:1.000:0.608 0/0/0/1:4:121,58:0.33: 0.53:1.000:0.925 0/1/1/1:4:35,74:0.69:-0.63:1.000:0.967 0/0/1/1:4:47,35:0.47:-1.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:93,53:0.38:-0.02:1.000:0.609 0/1/1/1:4:33,73:0.69:-0.68:0.887:0.979 0/1/1/1:4:49,85:0.65:-0.22:1.000:0.793 0/0/0/1:4:145,22:0.12: 0.33:1.000:0.826 0/0/0/1:4:53,22:0.29:-1.20:0.999:0.993 0/0/1/1:4:48,50:0.55:-0.82:1.000:0.979 0/1/1/1:4:60,96:0.63: 0.15:1.000:0.626 0/0/0/1:4:93,43:0.32:-0.18:1.000:0.958 0/0/1/1:4:64,38:0.40:-0.75:1.000:0.758 0/0/1/1:4:60,39:0.43:-0.80:1.000:0.935 0/0/1/1:4:70,42:0.40:-0.58:1.000:0.789 0/0/1/1:4:73,58:0.49:-0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,61:0.39: 0.30:1.000:0.718 0/0/1/1:4:63,35:0.37:-0.82:0.968:0.503 0/0/1/1:4:44,59:0.60:-0.73:1.000:0.785 0/1/1/1:4:36,71:0.67:-0.67:1.000:0.934 0/0/0/1:4:122,62:0.35: 0.62:1.000:0.818 0/0/0/1:4:103,25:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,57:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/0/1:4:74,27:0.25:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:58,28:0.33:-1.02:1.000:0.916 0/0/0/1:4:63,31:0.34:-0.88:1.000:0.887 0/0/1/1:4:89,59:0.43: 0.02:1.000:0.953 0/0/1/1:4:32,47:0.62:-1.14:0.999:0.589 0/0/0/1:4:67,33:0.34:-0.78:1.000:0.885 0/0/0/1:4:93,45:0.33:-0.15:1.000:0.913 0/1/1/1:4:40,81:0.68:-0.43:1.000:0.949 0/0/1/1:4:64,49:0.48:-0.57:1.000:0.995 0/0/0/1:4:72,38:0.36:-0.62:1.000:0.703 0/0/0/1:4:54,27:0.34:-1.10:1.000:0.856 0/0/0/1:4:86,18:0.16:-0.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,34:0.27:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:84,63:0.47: 0.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:61,26:0.29:-1.00:1.000:0.989 0/0/1/1:4:88,49:0.38:-0.17:1.000:0.513 0/0/0/1:4:66,18:0.20:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,22:0.17:-0.40:0.994:0.998 0/0/0/0:4:85,11:0.11:-0.85:1.000:0.602 0/0/0/1:4:71,37:0.35:-0.65:1.000:0.746 0/0/0/1:4:62,29:0.32:-0.93:1.000:0.949 0/0/0/1:4:185,31:0.13: 1.15:1.000:0.942 0/0/0/1:4:188,43:0.17: 1.40:0.993:0.999 0/0/1/1:4:104,69:0.43: 0.43:1.000:0.953 0/0/1/1:4:61,38:0.41:-0.80:1.000:0.876 0/0/0/1:4:224,57:0.19: 2.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,56:0.66:-1.00:0.999:0.853 0/0/0/1:4:100,50:0.34: 0.05:1.000:0.856 0/0/1/1:4:38,52:0.60:-0.95:1.000:0.747 0/1/1/1:4:30,55:0.66:-1.04:1.000:0.871 0/0/1/1:4:58,34:0.39:-0.92:1.000:0.716 0/0/0/1:4:111,23:0.16:-0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,31:0.36:-0.97:1.000:0.656 0/0/0/1:4:96,19:0.15:-0.53:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,82:0.64:-0.27:1.000:0.727 0/0/1/1:4:57,34:0.40:-0.93:1.000:0.772 0/0/1/1:4:65,51:0.49:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,81:0.37: 1.39:1.000:0.588 0/0/1/1:4:37,51:0.61:-0.98:1.000:0.733 0/1/1/1:4:47,72:0.63:-0.47:1.000:0.518 0/0/0/1:4:98,16:0.13:-0.55:1.000:0.922 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,27:0.33:-1.05:1.000:0.938 0/0/0/1:4:63,11:0.14:-1.22:1.000:0.964 0/0/1/1:4:38,51:0.60:-0.97:1.000:0.783 0/0/0/1:4:108,56:0.35: 0.28:1.000:0.762 0/1/1/1:4:18,38:0.69:-1.52:1.000:0.966 0/1/1/1:4:39,72:0.66:-0.60:1.000:0.879 0/0/1/1:4:96,61:0.42: 0.17:1.000:0.908 0/1/1/1:4:82,131:0.63: 1.10:1.000:0.623 0/0/1/1:4:99,55:0.37: 0.12:1.000:0.503 0/0/0/1:4:76,22:0.21:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,36:0.46:-1.02:1.000:0.988 0/0/1/1:4:58,37:0.42:-0.87:1.000:0.913 0/0/1/1:4:54,35:0.43:-0.97:1.000:0.932 0/0/0/0:4:89,10:0.09:-0.80:1.000:0.897 0/0/1/1:4:105,66:0.41: 0.40:1.000:0.891 0/0/0/1:4:59,15:0.19:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,141:0.64: 1.37:1.000:0.630 0/0/0/1:4:178,96:0.37: 2.12:1.000:0.620 0/1/1/1:4:54,92:0.65:-0.02:1.000:0.761 0/0/1/1:4:116,75:0.42: 0.74:1.000:0.930 0/1/1/1:4:48,106:0.69: 0.12:1.000:0.978 0/1/1/1:4:39,64:0.64:-0.73:1.000:0.685 0/0/1/1:4:152,102:0.44: 1.79:1.000:0.961 0/0/0/0:4:232,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.25:-2.20:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,26:0.12: 0.99:1.000:0.721 0/0/0/1:4:135,68:0.34: 0.94:1.000:0.840 0/0/0/1:4:162,23:0.12: 0.64:1.000:0.676 0/0/0/1:4:154,75:0.33: 1.37:1.000:0.903 0/1/1/1:4:63,111:0.65: 0.45:1.000:0.818 0/0/0/1:4:110,60:0.37: 0.38:1.000:0.574 0/0/0/1:4:168,63:0.26: 1.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,97:0.70:-0.13:1.000:0.986 0/0/0/1:4:114,53:0.32: 0.33:1.000:0.954 0/0/0/1:4:172,29:0.14: 0.90:1.000:0.946 0/0/0/1:4:115,62:0.37: 0.50:1.000:0.622 0/0/0/1:4:231,44:0.15: 2.14:1.000:0.988 0/0/1/1:4:62,94:0.62: 0.15:1.000:0.509 0/0/0/0:4:168,22:0.11: 0.72:1.000:0.566 0/0/0/1:4:131,24:0.14: 0.13:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,71:0.36: 0.95:1.000:0.661 0/0/0/0:4:176,23:0.11: 0.87:1.000:0.572 0/1/1/1:4:42,79:0.67:-0.43:1.000:0.898 0/0/0/1:4:123,58:0.32: 0.57:1.000:0.942 0/0/0/1:4:178,34:0.15: 1.09:1.000:0.988 0/0/0/1:4:96,32:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,92:0.65:-0.03:1.000:0.794 0/0/0/1:4:184,37:0.16: 1.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:172,38:0.17: 1.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:183,30:0.13: 1.10:1.000:0.925 0/0/0/1:4:114,56:0.34: 0.38:1.000:0.890 0/0/0/1:4:151,76:0.34: 1.34:0.956:0.842 0/0/0/1:4:183,97:0.36: 2.22:0.998:0.687 0/0/0/1:4:138,68:0.34: 0.99:1.000:0.884 0/0/0/1:4:95,52:0.37: 0.00:1.000:0.560 0/0/1/1:4:120,73:0.40: 0.77:1.000:0.825 -chr8.1 38118471 chr8.1_038118471 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:254,2:.: 1.54:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:167,45:.: 0.65:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:170,52:.: 0.85:1.000:. ./.:4:75,17:.:-1.78:1.000:. ./.:4:139,43:.: 0.04:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:64,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:58,2:.:-2.42:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:187,1:.: 0.16:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.75:0.999:. ./.:4:226,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:183,53:.: 1.14:1.000:. ./.:4:165,42:.: 0.55:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:171,52:.: 0.87:1.000:. ./.:4:133,29:.:-0.36:1.000:. ./.:4:22,2:.:-3.15:1.000:. ./.:4:172,50:.: 0.85:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:156,62:.: 0.77:1.000:. ./.:4:174,46:.: 0.81:1.000:. ./.:4:150,38:.: 0.16:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:29,9:.:-2.87:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.62:1.000:. ./.:3:14,3:.:-3.29:0.999:. ./.:4:195,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:175,49:.: 0.89:1.000:. ./.:4:160,43:.: 0.47:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:150,57:.: 0.55:1.000:. ./.:4:163,52:.: 0.71:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:177,50:.: 0.95:1.000:. ./.:5:276,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:437,1:.: 5.22:1.000:. ./.:4:131,37:.:-0.24:1.000:. ./.:4:169,39:.: 0.57:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:194,61:.: 1.52:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:182,58:.: 1.22:1.000:. ./.:4:152,27:.:-0.02:1.000:. ./.:4:176,43:.: 0.79:1.000:. ./.:4:138,45:.: 0.06:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:142,51:.: 0.27:1.000:. ./.:6:144,10:.:-0.52:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:190,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:134,30:.:-0.32:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:156,50:.: 0.53:1.000:. ./.:4:77,16:.:-1.76:1.000:. ./.:4:121,48:.:-0.22:1.000:. ./.:4:141,45:.: 0.12:0.887:. ./.:4:186,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:89,25:.:-1.33:0.999:. ./.:4:241,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:178,67:.: 1.32:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:147,53:.: 0.41:1.000:. ./.:4:143,49:.: 0.25:1.000:. ./.:4:136,58:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,49:.: 0.37:1.000:. ./.:4:125,50:.:-0.10:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.50:0.968:. ./.:4:130,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:198,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:142,40:.: 0.04:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:107,33:.:-0.81:0.999:. ./.:4:184,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:124,41:.:-0.30:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:141,47:.: 0.16:1.000:. ./.:4:102,30:.:-0.97:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.62:0.994:. ./.:4:156,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.95:0.993:. ./.:4:155,47:.: 0.45:1.000:. ./.:4:121,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:134,43:.:-0.06:0.999:. ./.:4:176,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:119,36:.:-0.50:1.000:. ./.:4:137,41:.:-0.04:1.000:. ./.:4:90,24:.:-1.33:1.000:. ./.:4:119,32:.:-0.58:1.000:. ./.:4:111,31:.:-0.76:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:153,41:.: 0.29:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:132,46:.:-0.04:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:128,56:.: 0.08:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:127,47:.:-0.12:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:88,26:.:-1.33:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:93,31:.:-1.13:1.000:. ./.:4:145,41:.: 0.12:1.000:. ./.:4:82,23:.:-1.51:1.000:. ./.:4:151,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:231,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:193,53:.: 1.34:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:113,28:.:-0.79:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:138,34:.:-0.16:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:139,60:.: 0.39:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:155,49:.: 0.49:1.000:. ./.:4:205,54:.: 1.60:1.000:. ./.:4:145,35:.: 0.00:1.000:. ./.:4:181,50:.: 1.03:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:150,50:.: 0.41:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:172,72:.: 1.30:1.000:. ./.:4:152,42:.: 0.29:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,44:.:-0.32:1.000:. ./.:4:114,40:.:-0.52:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:163,46:.: 0.59:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:151,45:.: 0.33:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:131,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:97,47:.:-0.72:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:116,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:120,34:.:-0.52:1.000:. ./.:4:133,64:.: 0.35:1.000:. ./.:4:118,48:.:-0.28:1.000:. ./.:4:131,38:.:-0.22:1.000:. ./.:4:181,45:.: 0.93:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:143,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:132,27:.:-0.42:0.956:. ./.:4:152,43:.: 0.31:0.998:. ./.:4:203,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:242,0:.: 1.26:1.000:. -chr8.1 38288479 chr8.1_038288479 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:59,22:0.31: 1.04:1.000:0.969 0/1/1/1:4:23,48:0.68: 0.61:1.000:0.959 0/0/1/1:4:41,28:0.42: 0.53:1.000:0.924 0/1/1/1:4:18,34:0.66:-0.20:1.000:0.865 0/1/1/1:4:21,62:0.76: 1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,59:0.68: 1.29:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,47:0.54: 1.29:1.000:0.987 0/0/1/1:4:17,10:0.39:-1.26:1.000:0.731 0/0/1/1:4:20,11:0.38:-1.09:1.000:0.582 0/0/1/1:4:42,54:0.56: 1.68:1.000:0.959 0/1/1/1:4:18,47:0.73: 0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,37:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,41:0.48: 1.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:33,93:0.75: 2.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,45:0.47: 1.68:0.999:0.994 0/1/1/1:4:26,73:0.75: 1.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,21:0.34: 0.48:1.000:0.847 0/1/1/1:4:18,47:0.73: 0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:20,15:0.44:-0.92:1.000:0.969 0/0/1/1:4:44,27:0.40: 0.61:1.000:0.806 0/1/1/1:4:16,39:0.72:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:36,19:0.37:-0.07:1.000:0.520 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,48:0.59: 1.08:1.000:0.873 0/0/0/1:4:71,26:0.31: 1.72:1.000:0.974 0/1/1/1:4:18,50:0.74: 0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:42,20:0.35: 0.23:1.000:0.749 0/0/0/1:4:54,23:0.33: 0.87:1.000:0.898 0/0/1/1:4:30,48:0.62: 0.91:1.000:0.576 0/1/1/1:4:29,79:0.74: 2.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,14:0.56:-1.35:1.000:0.963 0/1/1:3:8,9:0.53:-1.69:0.999:0.884 0/0/1/1:4:56,41:0.44: 1.72:1.000:0.961 0/1/1/1:4:26,43:0.63: 0.53:1.000:0.531 0/0/0/1:4:48,15:0.29: 0.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:12,52:0.82: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,18:0.20: 2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,20:0.42:-0.28:1.000:0.906 0/1/1/1:4:20,51:0.73: 0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,21:0.35: 0.36:1.000:0.744 0/1/1/1:4:8,26:0.77:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,32:0.74:-0.54:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,21:0.54:-0.75:1.000:0.988 0/0/1/1/1:5:39,62:0.62: 1.89:1.000:0.966 0/0/1/1:4:36,28:0.45: 0.31:1.000:0.979 0/0/1/1:4:14,22:0.62:-0.88:1.000:0.632 0/1/1/1:4:17,28:0.63:-0.50:1.000:0.518 0/0/1/1:4:26,18:0.43:-0.54:1.000:0.934 0/0/1/1:4:54,29:0.38: 1.12:1.000:0.523 0/1/1/1:4:14,40:0.75:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,26:0.62:-0.63:1.000:0.526 1/1/1/1:4:1,49:0.98:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,27:0.60:-0.50:1.000:0.758 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,7:0.18: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,8:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:20,21:0.51:-0.67:1.000:0.880 0/0/1/1:4:27,18:0.42:-0.50:1.000:0.906 0/1/1/1:4:20,57:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,49:0.75: 0.40:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,33:0.97:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,35:0.44: 1.04:1.000:0.973 0/1/1/1:4:18,39:0.69: 0.01:1.000:0.975 0/1/1/1:4:7,22:0.77:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.20:-1.18:0.887:1.000 0/1/1/1:4:18,41:0.70: 0.10:1.000:0.987 0/1/1/1:4:19,43:0.70: 0.23:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.58:0.999:1.000 0/0/0/1:4:64,33:0.37: 1.72:1.000:0.577 0/0/1/1:4:20,24:0.55:-0.54:1.000:0.983 0/1/1/1:4:12,50:0.81: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,29:0.65:-0.50:1.000:0.789 0/0/0/1:4:39,14:0.31:-0.16:1.000:0.978 0/0/1/1:4:13,14:0.52:-1.26:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,41:0.98:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,13:0.31:-0.33:1.000:0.977 0/0/1/1:4:17,16:0.49:-1.01:0.968:0.996 0/1/1/1:4:14,26:0.66:-0.71:1.000:0.837 0/0/1/1:4:42,24:0.39: 0.40:1.000:0.671 0/0/1/1:4:29,33:0.53: 0.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:31,28:0.48: 0.10:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,33:0.67:-0.28:1.000:0.901 0/1/1/1:4:13,30:0.70:-0.58:1.000:0.989 0/0/0/1:4:22,10:0.35:-1.05:1.000:0.824 0/0/0/1:4:49,16:0.29: 0.36:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,16:0.50:-1.05:0.999:0.997 0/0/0/1:4:28,7:0.25:-0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:59,12:0.23: 0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,26:0.59:-0.54:1.000:0.837 0/0/1/1:4:18,27:0.60:-0.50:1.000:0.758 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,6:0.22:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,32:0.53: 0.19:1.000:0.994 0/0/0/1:4:30,14:0.35:-0.54:1.000:0.784 0/0/1/1:4:33,25:0.44: 0.06:1.000:0.972 0/0/0/1:4:19,8:0.33:-1.26:1.000:0.908 0/1/1/1:4:9,23:0.73:-1.05:0.994:0.997 0/0/1/1:4:26,17:0.41:-0.58:1.000:0.887 0/1/1/1:4:16,46:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,34:0.65:-0.16:1.000:0.760 0/0/1/1:4:31,48:0.61: 0.95:1.000:0.675 0/1/1/1:4:26,83:0.77: 2.23:0.993:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,33:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,60:0.49: 2.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:12,18:0.60:-1.14:0.999:0.758 0/0/1/1:4:22,13:0.39:-0.92:1.000:0.740 0/0/1/1:4:10,16:0.62:-1.31:1.000:0.576 0/0/0/1:4:25,4:0.20:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,29:0.97:-1.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,16:0.53:-1.14:1.000:0.990 0/1/1/1:4:18,37:0.68:-0.07:1.000:0.951 0/0/0/1:4:33,8:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,18:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:19,29:0.61:-0.37:1.000:0.715 0/0/1/1:4:47,30:0.41: 0.87:1.000:0.861 0/0/1/1:4:21,15:0.43:-0.88:1.000:0.951 0/0/1/1:4:24,23:0.49:-0.41:1.000:0.996 1/1/1/1:4:2,26:0.93:-1.22:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.35:-1.48:1.000:0.784 0/0/1/1:4:18,15:0.46:-1.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:29,11:0.32:-0.71:1.000:0.964 1/1/1/1:4:1,57:0.98: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.34:-1.56:1.000:0.892 0/0/1/1:4:18,18:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,35:0.51: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,46:0.47: 1.81:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,16:0.55:-1.18:1.000:0.976 0/0/1/1:4:11,13:0.54:-1.39:1.000:0.986 0/0/1/1:4:19,16:0.46:-0.92:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,24:0.64:-0.80:1.000:0.644 0/0/1/1:4:34,34:0.50: 0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:12,12:0.50:-1.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,45:0.54: 1.17:1.000:0.989 0/0/1/1:4:40,46:0.54: 1.25:1.000:0.990 0/0/0/1:4:69,21:0.28: 1.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,46:0.64: 0.65:1.000:0.732 0/0/1/1:4:31,40:0.57: 0.61:1.000:0.957 0/0/1/1:4:19,28:0.60:-0.41:1.000:0.798 0/1/1/1:4:24,58:0.71: 1.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:18,81:0.82: 1.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,9:0.40:-1.39:1.000:0.769 0/1/1/1:4:13,55:0.82: 0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,61:0.72: 1.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:28,44:0.62: 0.65:1.000:0.632 0/1/1/1:4:20,35:0.64:-0.07:1.000:0.703 0/0/0/1:4:44,21:0.35: 0.36:1.000:0.744 0/0/0/1:4:44,13:0.28: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,46:0.46: 1.93:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,50:0.68: 0.74:1.000:0.958 0/1/1/1:4:19,32:0.63:-0.24:1.000:0.590 0/1/1/1:4:26,45:0.64: 0.61:1.000:0.672 0/1/1/1:4:25,41:0.63: 0.40:1.000:0.504 0/1/1/1:4:17,61:0.79: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,43:0.64: 0.48:1.000:0.654 0/1/1/1:4:15,52:0.78: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,16:0.33:-0.11:1.000:0.908 0/0/0/1:4:42,14:0.30:-0.03:1.000:0.989 0/0/1/1:4:34,39:0.54: 0.70:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,24:0.56:-0.58:1.000:0.967 0/1/1/1:4:20,35:0.64:-0.07:1.000:0.703 0/0/1/1:4:20,14:0.43:-0.97:1.000:0.940 0/0/1/1:4:20,24:0.55:-0.54:1.000:0.983 0/0/0/1:4:33,11:0.30:-0.54:1.000:0.989 0/0/1/1:4:37,52:0.59: 1.38:1.000:0.880 0/1/1/1:4:17,54:0.77: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,61:0.83: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,34:0.62:-0.07:1.000:0.538 1/1/1/1:4:2,45:0.96:-0.41:0.956:1.000 0/1/1/1:4:25,46:0.65: 0.61:0.998:0.820 0/0/0/1:4:64,29:0.35: 1.55:1.000:0.829 0/1/1/1:4:14,45:0.77: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,72:0.83: 1.29:1.000:0.997 -chr8.1 39142999 chr8.1_039142999 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:77,25:.: 1.54:1.000:. ./.:4:60,17:.: 0.44:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:41,15:.:-0.49:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:49,25:.: 0.31:1.000:. ./.:4:11,3:.:-2.33:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.55:1.000:. ./.:4:64,25:.: 0.96:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:58,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:83,19:.: 1.54:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:86,22:.: 1.80:0.999:. ./.:4:73,22:.: 1.23:1.000:. ./.:4:49,27:.: 0.39:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:65,19:.: 0.74:1.000:. ./.:4:52,28:.: 0.57:1.000:. ./.:4:37,17:.:-0.57:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:67,18:.: 0.79:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,26:.: 0.17:1.000:. ./.:4:55,23:.: 0.48:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:10,4:.:-2.33:1.000:. ./.:3:5,1:.:-2.68:0.999:. ./.:4:70,13:.: 0.70:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:52,11:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:72,13:.: 0.79:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:34,21:.:-0.53:1.000:. ./.:4:25,13:.:-1.28:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:39,22:.:-0.27:1.000:. ./.:5:140,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.51:1.000:. ./.:4:25,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.80:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:39,18:.:-0.44:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:26,16:.:-1.10:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:55,6:.:-0.27:1.000:. ./.:4:33,14:.:-0.88:1.000:. ./.:6:45,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:67,17:.: 0.74:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:72,19:.: 1.05:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:32,8:.:-1.19:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:25,19:.:-1.01:0.887:. ./.:4:52,13:.:-0.09:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.76:0.999:. ./.:4:32,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:53,19:.: 0.22:1.000:. ./.:4:60,27:.: 0.88:1.000:. ./.:4:25,12:.:-1.32:1.000:. ./.:4:40,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:30,16:.:-0.93:1.000:. ./.:4:32,25:.:-0.44:0.968:. ./.:4:36,15:.:-0.71:1.000:. ./.:4:62,24:.: 0.83:1.000:. ./.:4:59,17:.: 0.39:1.000:. ./.:4:46,8:.:-0.57:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:67,10:.: 0.44:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.97:0.999:. ./.:4:115,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:72,20:.: 1.10:1.000:. ./.:4:26,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,10:.:-1.28:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:51,19:.: 0.13:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:44,16:.:-0.31:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.74:0.994:. ./.:4:39,10:.:-0.79:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.76:0.993:. ./.:4:61,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:90,35:.: 2.55:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.75:0.999:. ./.:4:73,19:.: 1.10:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:34,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:39,26:.:-0.09:1.000:. ./.:4:56,14:.: 0.13:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:54,17:.: 0.17:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:16,13:.:-1.67:1.000:. ./.:4:60,10:.: 0.13:1.000:. ./.:4:45,16:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:27,13:.:-1.19:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:52,9:.:-0.27:1.000:. ./.:4:70,11:.: 0.61:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:58,11:.: 0.09:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:50,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:79,28:.: 1.76:1.000:. ./.:4:47,26:.: 0.26:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.26:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:117,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:17,2:.:-2.11:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:56,33:.: 0.96:1.000:. ./.:4:55,16:.: 0.17:1.000:. ./.:4:61,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.27:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:49,27:.: 0.39:1.000:. ./.:4:44,20:.:-0.13:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:56,25:.: 0.61:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:52,27:.: 0.52:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.31:0.956:. ./.:4:53,16:.: 0.09:0.998:. ./.:4:85,21:.: 1.71:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:63,19:.: 0.66:1.000:. -chr8.1 39382141 chr8.1_039382141 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:390,16:.:-0.57:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:380,24:.:-0.59:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:586,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,5:.:-3.35:1.000:. ./.:4:140,0:.:-2.92:1.000:. ./.:4:621,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:519,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:355,31:.:-0.75:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:369,23:.:-0.69:1.000:. ./.:4:435,21:.:-0.13:0.999:. ./.:4:255,56:.:-1.41:1.000:. ./.:4:660,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:124,1:.:-3.05:1.000:. ./.:4:347,13:.:-0.98:1.000:. ./.:4:560,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,0:.:-3.39:1.000:. ./.:4:591,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:356,25:.:-0.79:1.000:. ./.:4:390,20:.:-0.54:1.000:. ./.:4:440,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:584,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:588,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:354,24:.:-0.82:1.000:. ./.:4:100,0:.:-3.27:1.000:. ./.:4:162,0:.:-2.73:1.000:. ./.:3:67,0:.:-3.57:0.999:. ./.:4:523,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:406,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:454,17:.: 0.00:1.000:. ./.:4:438,20:.:-0.11:1.000:. ./.:4:445,16:.:-0.08:1.000:. ./.:4:378,17:.:-0.67:1.000:. ./.:4:480,17:.: 0.23:1.000:. ./.:4:529,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:774,0:.: 2.68:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.45:1.000:. ./.:5:623,21:.: 1.53:1.000:. ./.:4:552,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:655,2:.: 1.65:1.000:. ./.:4:425,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:546,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:409,20:.:-0.37:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:648,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:505,15:.: 0.44:1.000:. ./.:4:452,13:.:-0.05:1.000:. ./.:6:453,11:.:-0.06:1.000:. ./.:4:469,13:.: 0.10:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:566,17:.: 0.99:1.000:. ./.:4:622,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:504,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:580,0:.: 0.97:0.887:. ./.:4:455,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:485,19:.: 0.30:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.08:0.999:. ./.:4:713,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:368,8:.:-0.84:1.000:. ./.:4:571,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:530,1:.: 0.53:1.000:. ./.:4:449,20:.:-0.01:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.09:0.937:. ./.:4:519,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:631,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:555,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:591,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:431,16:.:-0.21:1.000:. ./.:4:327,18:.:-1.11:1.000:. ./.:4:527,0:.: 0.50:0.999:. ./.:4:301,21:.:-1.31:1.000:. ./.:4:436,18:.:-0.15:1.000:. ./.:4:334,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:582,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:450,20:.: 0.00:1.000:. ./.:4:511,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:428,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:415,28:.:-0.24:1.000:. ./.:4:302,30:.:-1.22:1.000:. ./.:4:456,29:.: 0.13:0.994:. ./.:4:427,25:.:-0.16:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:522,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:383,23:.:-0.57:1.000:. ./.:4:633,0:.: 1.44:0.993:. ./.:4:519,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:510,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:492,26:.: 0.42:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.63:0.999:. ./.:4:525,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:607,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:485,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:426,25:.:-0.17:1.000:. ./.:4:494,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:316,26:.:-1.14:1.000:. ./.:4:480,2:.: 0.10:1.000:. ./.:4:439,23:.:-0.08:1.000:. ./.:4:398,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:531,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:566,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:595,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:605,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:354,19:.:-0.86:1.000:. ./.:4:356,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:364,16:.:-0.80:1.000:. ./.:4:678,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:554,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:441,15:.:-0.13:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:374,18:.:-0.69:1.000:. ./.:4:609,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:485,26:.: 0.36:1.000:. ./.:4:385,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:502,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:593,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:455,27:.: 0.10:1.000:. ./.:4:385,21:.:-0.57:1.000:. ./.:4:84,2:.:-3.40:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:436,16:.:-0.16:1.000:. ./.:4:379,21:.:-0.62:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:551,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:376,15:.:-0.70:1.000:. ./.:4:400,34:.:-0.32:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:304,21:.:-1.29:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:357,27:.:-0.76:1.000:. ./.:4:384,10:.:-0.68:1.000:. ./.:4:526,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:347,17:.:-0.94:1.000:. ./.:4:474,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:356,25:.:-0.79:1.000:. ./.:4:340,34:.:-0.85:1.000:. ./.:4:380,1:.:-0.79:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:344,15:.:-0.99:1.000:. ./.:4:338,19:.:-1.00:1.000:. ./.:4:450,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:518,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:360,14:.:-0.85:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.51:0.956:. ./.:4:664,0:.: 1.71:0.998:. ./.:4:451,19:.: 0.00:1.000:. ./.:4:412,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.29:1.000:. -chr8.1 39840178 chr8.1_039840178 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:13,33:0.66:-0.43:1.000:0.867 0/0/0/1:4:26,12:0.28:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,19:0.45:-0.78:1.000:0.976 0/0/1/1:4:15,30:0.62:-0.49:1.000:0.606 0/0/1/1:4:46,34:0.39: 1.59:1.000:0.735 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.40:-1.08:1.000:0.771 0/0/0/1:4:28,12:0.26:-0.78:1.000:0.998 0/0/0/1:4:40,27:0.37: 0.82:1.000:0.548 0/1/1/1:4:9,36:0.73:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,11:0.63:-2.21:1.000:0.623 0/0/0/1:4:47,30:0.36: 1.41:1.000:0.720 0/0/0/1:4:33,12:0.23:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,35:0.59: 0.11:1.000:0.853 0/0/1/1:4:12,20:0.58:-1.26:1.000:0.904 0/0/1/1:4:14,26:0.60:-0.78:1.000:0.762 0/1/1/1:4:6,46:0.80:-0.07:0.999:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,23:0.25: 1.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,3:0.15:-2.09:1.000:0.981 0/1/1/1:4:10,49:0.75: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,25:0.57:-0.72:1.000:0.948 0/0/0/1:4:50,16:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,3:0.15:-2.15:1.000:0.992 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,30:0.70:-0.84:1.000:0.988 0/0/1/1:4:15,17:0.50:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,38:0.53: 0.82:1.000:0.991 0/0/0/1:4:31,13:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,29:0.50: 0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,20:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:7,6:0.43:-2.38:1.000:0.952 0/0/1/1:4:30,28:0.45: 0.29:1.000:0.984 0/1/1:3:8,12:0.56:-1.97:0.999:0.984 0/0/1/1:4:17,19:0.50:-1.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,32:0.51: 0.40:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,22:0.72:-1.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,24:0.49:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,15:0.42:-1.20:1.000:0.931 0/0/1/1:4:18,27:0.56:-0.49:1.000:0.965 0/0/1/1:4:22,43:0.61: 0.70:1.000:0.659 0/0/1/1:4:22,29:0.54:-0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:48,29:0.34: 1.41:1.000:0.844 0/0/1/1:4:29,27:0.45: 0.17:1.000:0.983 0/0/0/1/1:5:38,31:0.42: 0.94:1.000:0.958 0/0/1/1:4:10,11:0.50:-1.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,23:0.47:-0.43:1.000:0.993 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,15:0.34:-0.78:1.000:0.856 0/0/0/1:4:22,11:0.30:-1.20:1.000:0.986 0/0/0/1:4:28,13:0.28:-0.72:1.000:0.995 0/0/0/1:4:44,17:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,16:0.36:-0.72:1.000:0.713 0/0/1/1:4:24,32:0.54: 0.17:1.000:0.989 0/0/0/1:4:40,10:0.17:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,37:0.54: 0.64:1.000:0.986 0/0/1/1:4:47,43:0.45: 2.18:1.000:0.979 0/1/1/1/1/1:6:9,65:0.80: 1.23:1.000:0.916 0/1/1/1:4:10,83:0.81: 2.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,13:0.27:-0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,37:0.47: 1.29:1.000:0.990 0/0/0/1:4:51,22:0.27: 1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,31:0.61:-0.37:1.000:0.678 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,25:0.36: 0.64:1.000:0.708 0/0/0/1:4:59,23:0.24: 1.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,14:0.24:-0.19:0.887:1.000 0/0/0/1:4:17,11:0.36:-1.49:1.000:0.682 0/0/1/1:4:33,38:0.51: 1.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,9:0.22:-1.08:0.999:1.000 0/0/1/1:4:26,26:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/1/1/1:4:8,43:0.77:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.31:-0.19:1.000:0.979 0/0/1/1:4:27,31:0.51: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,23:0.39: 0.11:1.000:0.656 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,28:0.30: 1.77:1.000:0.982 0/0/1/1:4:40,35:0.44: 1.29:1.000:0.963 0/0/1/1:4:34,45:0.54: 1.53:0.937:0.990 0/0/1/1:4:27,48:0.59: 1.29:1.000:0.832 0/0/1/1:4:30,43:0.55: 1.18:1.000:0.978 0/0/1/1:4:17,35:0.62:-0.07:1.000:0.536 0/0/1/1:4:22,29:0.54:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:35,27:0.40: 0.52:1.000:0.830 0/0/0/1:4:37,15:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,19:0.35:-0.19:1.000:0.816 0/0/0/1:4:35,19:0.32: 0.05:1.000:0.959 0/0/1/1:4:29,33:0.50: 0.52:1.000:0.997 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-1.26:0.999:1.000 0/0/0/1:4:37,13:0.23:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,40:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,21:0.50:-0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,36:0.40: 1.83:1.000:0.771 0/0/0/1:4:47,18:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,45:0.54: 1.47:1.000:0.986 0/0/0/0:4:51,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,34:0.53: 0.40:1.000:0.991 0/0/1/1:4:25,27:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,19:0.29: 0.34:1.000:0.993 0/0/0/1:4:47,21:0.27: 0.88:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,64:0.67: 2.07:1.000:0.912 0/0/1/1:4:32,66:0.62: 2.66:0.994:0.532 0/1/1/1:4:8,47:0.78: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,17:0.29:-0.01:1.000:0.994 0/0/0/1:4:37,20:0.32: 0.23:1.000:0.961 0/0/1/1:4:22,22:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/0/1:4:48,29:0.34: 1.41:0.993:0.844 0/0/0/1:4:29,17:0.34:-0.43:1.000:0.891 0/0/0/1:4:34,13:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,60:0.66: 1.77:1.000:0.894 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.05:0.999:1.000 0/0/1/1:4:32,49:0.57: 1.65:1.000:0.957 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,13:0.16: 1.12:1.000:0.994 0/0/0/1:4:46,25:0.32: 1.06:1.000:0.958 0/0/1/1:4:29,40:0.54: 0.94:1.000:0.985 0/0/0/1:4:66,23:0.23: 2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,11:0.21:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,31:0.49: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,30:0.51: 0.17:1.000:0.996 0/0/0/1:4:60,27:0.27: 2.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,13:0.35:-1.14:1.000:0.795 0/0/0/1:4:49,21:0.26: 1.00:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,45:0.74: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:44,19:0.27: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.43:-0.31:1.000:0.943 0/1/1/1:4:12,45:0.72: 0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:34,12:0.23:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,15:0.35:-0.84:1.000:0.774 0/0/0/1:4:32,10:0.21:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,41:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,30:0.64:-0.60:1.000:0.724 0/0/0/1:4:24,10:0.26:-1.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,35:0.53: 0.52:1.000:0.992 0/0/0/0:4:59,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,40:0.54: 0.94:1.000:0.985 0/0/0/1:4:43,28:0.36: 1.06:1.000:0.663 0/0/0/1:4:51,25:0.29: 1.35:1.000:0.990 0/1/1/1:4:13,28:0.63:-0.72:1.000:0.573 0/0/1/1:4:22,34:0.57: 0.17:1.000:0.953 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,61:0.82: 0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,32:0.51: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,26:0.34: 0.94:1.000:0.842 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,6:0.10: 0.11:1.000:0.889 0/0/1/1:4:19,22:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,36:0.71:-0.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,13:0.45:-1.55:1.000:0.982 0/0/0/1:4:41,17:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:30,32:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:23,42:0.60: 0.70:1.000:0.791 0/0/0/1:4:43,14:0.21: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,15:0.46:-1.32:1.000:0.984 0/0/0/1:4:30,16:0.31:-0.43:1.000:0.967 0/0/1/1:4:21,15:0.39:-1.02:1.000:0.637 0/0/0/1:4:28,8:0.19:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,11:0.36:-1.49:1.000:0.682 0/0/0/1:4:26,12:0.28:-0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,13:0.60:-1.97:1.000:0.762 0/0/0/1:4:31,11:0.23:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,32:0.57:-0.07:1.000:0.935 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,16:0.31:-0.43:1.000:0.967 0/0/1/1:4:20,17:0.43:-0.96:1.000:0.946 0/0/0/1:4:21,10:0.29:-1.32:1.000:0.993 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,6:0.10:-0.13:1.000:0.738 0/0/0/0:4:38,5:0.10:-0.60:1.000:0.768 0/0/0/1:4:40,15:0.24: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,10:0.17:-0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:54,17:0.21: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,28:0.40: 0.70:1.000:0.791 0/0/0/1:4:50,26:0.31: 1.35:1.000:0.977 0/0/0/1:4:35,14:0.25:-0.25:0.956:0.999 0/0/1/1:4:21,33:0.57: 0.05:0.998:0.945 0/0/1/1:4:20,41:0.62: 0.46:1.000:0.547 0/0/0/1:4:26,13:0.30:-0.84:1.000:0.986 0/0/0/1:4:28,12:0.26:-0.78:1.000:0.998 -chr8.1 39927251 chr8.1_039927251 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:40,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.74:1.000:. ./.:4:33,21:.:-0.74:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:64,33:.: 0.85:1.000:. ./.:4:88,35:.: 1.81:1.000:. ./.:4:27,11:.:-1.34:1.000:. ./.:4:64,13:.: 0.11:1.000:. ./.:4:87,22:.: 1.29:1.000:. ./.:4:20,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:9,6:.:-2.19:1.000:. ./.:4:80,16:.: 0.81:1.000:. ./.:4:58,25:.: 0.33:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:75,14:.: 0.55:1.000:. ./.:4:83,18:.: 0.99:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.73:0.999:. ./.:4:65,28:.: 0.70:1.000:. ./.:4:100,13:.: 1.44:1.000:. ./.:4:98,19:.: 1.58:1.000:. ./.:4:19,6:.:-1.82:1.000:. ./.:4:86,14:.: 0.96:1.000:. ./.:4:84,13:.: 0.85:1.000:. ./.:4:61,10:.:-0.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:67,19:.: 0.44:1.000:. ./.:4:64,37:.: 0.99:1.000:. ./.:4:93,15:.: 1.25:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:68,12:.: 0.22:1.000:. ./.:4:98,23:.: 1.73:1.000:. ./.:4:111,12:.: 1.81:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:17,2:.:-2.04:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.70:0.999:. ./.:4:61,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:31,34:.:-0.34:1.000:. ./.:4:86,16:.: 1.03:1.000:. ./.:4:65,17:.: 0.29:1.000:. ./.:4:75,13:.: 0.51:1.000:. ./.:4:26,19:.:-1.08:1.000:. ./.:4:54,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:72,11:.: 0.33:1.000:. ./.:4:61,5:.:-0.30:1.000:. ./.:4:69,17:.: 0.44:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.29:1.000:. ./.:5:107,22:.: 2.03:1.000:. ./.:4:33,14:.:-1.00:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,15:.:-0.89:1.000:. ./.:4:94,11:.: 1.14:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.23:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:51,7:.:-0.60:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:42,15:.:-0.63:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.73:1.000:. ./.:6:53,1:.:-0.74:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:53,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,12:.: 1.03:1.000:. ./.:4:84,1:.: 0.40:1.000:. ./.:4:103,15:.: 1.62:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:48,23:.:-0.12:0.887:. ./.:4:15,6:.:-1.96:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:25,3:.:-1.70:0.999:. ./.:4:39,11:.:-0.89:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:37,5:.:-1.19:1.000:. ./.:4:82,10:.: 0.66:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:54,15:.:-0.19:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:40,6:.:-1.04:0.937:. ./.:4:71,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:48,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:59,8:.:-0.26:1.000:. ./.:4:31,15:.:-1.04:1.000:. ./.:4:54,10:.:-0.37:1.000:. ./.:4:38,6:.:-1.11:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.85:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.74:1.000:. ./.:4:72,9:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,20:.:-0.82:0.999:. ./.:4:23,19:.:-1.19:1.000:. ./.:4:80,12:.: 0.66:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:33,19:.:-0.82:1.000:. ./.:4:67,9:.: 0.07:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:20,18:.:-1.34:1.000:. ./.:4:20,8:.:-1.70:1.000:. ./.:4:42,28:.:-0.15:1.000:. ./.:4:37,3:.:-1.26:1.000:. ./.:4:55,17:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:49,9:.:-0.60:0.994:. ./.:4:72,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:52,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:52,12:.:-0.37:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,23:.: 0.70:0.993:. ./.:4:67,11:.: 0.14:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.56:1.000:. ./.:4:161,0:.: 3.21:1.000:. ./.:4:23,15:.:-1.34:0.999:. ./.:4:44,21:.:-0.34:1.000:. ./.:4:37,15:.:-0.82:1.000:. ./.:4:67,10:.: 0.11:1.000:. ./.:4:34,10:.:-1.11:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,22:.:-0.41:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.30:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:42,31:.:-0.04:1.000:. ./.:4:38,18:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,9:.:-1.00:1.000:. ./.:4:83,17:.: 0.96:1.000:. ./.:4:56,15:.:-0.12:1.000:. ./.:4:58,6:.:-0.37:1.000:. ./.:4:44,8:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,21:.:-0.60:1.000:. ./.:4:67,13:.: 0.22:1.000:. ./.:4:36,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:24,13:.:-1.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:54,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:28,9:.:-1.37:1.000:. ./.:4:38,14:.:-0.82:1.000:. ./.:4:62,7:.:-0.19:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:41,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.71:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:75,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:73,11:.: 0.36:1.000:. ./.:4:55,9:.:-0.37:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:114,19:.: 2.18:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:72,25:.: 0.85:1.000:. ./.:4:74,8:.: 0.29:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:102,13:.: 1.51:1.000:. ./.:4:50,28:.: 0.14:1.000:. ./.:4:69,14:.: 0.33:1.000:. ./.:4:29,26:.:-0.71:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:62,11:.:-0.04:1.000:. ./.:4:64,22:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,12:.: 0.29:1.000:. ./.:4:62,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,17:.: 0.22:1.000:. ./.:4:63,19:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,33:.:-0.30:1.000:. ./.:4:63,22:.: 0.40:1.000:. ./.:4:81,10:.: 0.62:1.000:. ./.:4:51,29:.: 0.22:1.000:. ./.:4:34,13:.:-1.00:1.000:. ./.:4:58,21:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,10:.: 0.22:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:68,6:.: 0.00:1.000:. ./.:4:125,15:.: 2.43:1.000:. ./.:4:71,24:.: 0.77:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:105,6:.: 1.36:1.000:. ./.:4:86,12:.: 0.88:0.956:. ./.:4:121,18:.: 2.40:0.998:. ./.:4:72,32:.: 1.10:1.000:. ./.:4:23,23:.:-1.04:1.000:. ./.:4:52,14:.:-0.30:1.000:. -chr8.1 40081616 chr8.1_040081616 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.04:0.999:. ./.:4:28,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.84:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:30,1:.:-1.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.05:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.20:0.999:. ./.:4:46,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:5:73,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.25:1.000:. ./.:6:48,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.18:0.887:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.47:0.999:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.18:0.937:. ./.:4:55,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:43,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.75:0.994:. ./.:4:61,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:81,0:.: 2.54:0.993:. ./.:4:61,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.25:0.999:. ./.:4:67,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:74,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:60,0:.: 1.04:0.956:. ./.:4:43,0:.:-0.18:0.998:. ./.:4:72,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.39:1.000:. -chr8.1 40500478 chr8.1_040500478 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:190,31:.: 1.18:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:148,34:.: 0.41:1.000:. ./.:4:187,30:.: 1.10:1.000:. ./.:4:146,38:.: 0.45:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:108,22:.:-0.62:1.000:. ./.:4:139,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:17,24:.:-2.39:1.000:. ./.:4:22,7:.:-2.63:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:152,22:.: 0.25:1.000:. ./.:4:121,61:.: 0.41:1.000:. ./.:4:160,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:84,54:.:-0.47:1.000:. ./.:4:127,74:.: 0.78:0.999:. ./.:4:145,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:283,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:270,1:.: 2.17:1.000:. ./.:4:33,10:.:-2.35:1.000:. ./.:4:71,47:.:-0.86:1.000:. ./.:4:140,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:223,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:19,5:.:-2.73:1.000:. ./.:4:270,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:136,28:.: 0.05:1.000:. ./.:4:68,57:.:-0.72:1.000:. ./.:4:202,24:.: 1.28:1.000:. ./.:4:222,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:134,29:.: 0.03:1.000:. ./.:4:68,38:.:-1.10:1.000:. ./.:4:17,5:.:-2.77:1.000:. ./.:4:19,3:.:-2.77:1.000:. ./.:3:21,0:.:-2.78:0.999:. ./.:4:135,27:.: 0.01:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:133,32:.: 0.07:1.000:. ./.:4:84,48:.:-0.58:1.000:. ./.:4:172,29:.: 0.78:1.000:. ./.:4:136,20:.:-0.11:1.000:. ./.:4:84,46:.:-0.62:1.000:. ./.:4:143,34:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,23:.:-0.98:1.000:. ./.:4:160,38:.: 0.72:1.000:. ./.:4:164,24:.: 0.53:1.000:. ./.:5:170,67:.: 1.50:1.000:. ./.:4:19,10:.:-2.63:1.000:. ./.:4:146,16:.: 0.01:1.000:. ./.:4:99,1:.:-1.22:1.000:. ./.:4:93,20:.:-0.96:1.000:. ./.:4:222,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:113,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:179,30:.: 0.94:1.000:. ./.:4:137,30:.: 0.11:1.000:. ./.:4:146,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:147,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:135,19:.:-0.15:1.000:. ./.:4:157,20:.: 0.31:1.000:. ./.:6:84,34:.:-0.86:1.000:. ./.:4:119,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:168,22:.: 0.57:1.000:. ./.:4:65,48:.:-0.96:1.000:. ./.:4:102,27:.:-0.64:1.000:. ./.:4:272,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:87,17:.:-1.14:1.000:. ./.:4:148,24:.: 0.21:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.13:0.887:. ./.:4:149,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:98,58:.:-0.11:1.000:. ./.:4:61,18:.:-1.63:0.999:. ./.:4:147,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:190,42:.: 1.40:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:117,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:148,26:.: 0.25:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:143,27:.: 0.17:1.000:. ./.:4:150,32:.: 0.41:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.17:0.937:. ./.:4:114,23:.:-0.48:1.000:. ./.:4:167,33:.: 0.76:1.000:. ./.:4:155,28:.: 0.43:1.000:. ./.:4:95,17:.:-0.98:1.000:. ./.:4:125,22:.:-0.29:1.000:. ./.:4:121,16:.:-0.48:1.000:. ./.:4:108,20:.:-0.66:1.000:. ./.:4:135,31:.: 0.09:1.000:. ./.:4:147,34:.: 0.39:1.000:. ./.:4:127,1:.:-0.66:0.999:. ./.:4:114,28:.:-0.39:1.000:. ./.:4:170,24:.: 0.65:1.000:. ./.:4:125,15:.:-0.43:1.000:. ./.:4:104,22:.:-0.70:1.000:. ./.:4:120,29:.:-0.25:1.000:. ./.:4:96,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:112,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:123,32:.:-0.13:1.000:. ./.:4:132,33:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,26:.:-0.52:1.000:. ./.:4:160,23:.: 0.43:1.000:. ./.:4:99,33:.:-0.58:1.000:. ./.:4:80,72:.:-0.19:0.994:. ./.:4:78,41:.:-0.84:1.000:. ./.:4:138,19:.:-0.09:1.000:. ./.:4:123,27:.:-0.23:1.000:. ./.:4:118,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:167,37:.: 0.84:0.993:. ./.:4:134,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:57,23:.:-1.62:1.000:. ./.:4:138,78:.: 1.08:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.01:0.999:. ./.:4:113,35:.:-0.27:1.000:. ./.:4:133,1:.:-0.54:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:73,26:.:-1.24:1.000:. ./.:4:145,27:.: 0.21:1.000:. ./.:4:128,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:99,24:.:-0.76:1.000:. ./.:4:151,27:.: 0.33:1.000:. ./.:4:142,18:.:-0.03:1.000:. ./.:4:158,31:.: 0.55:1.000:. ./.:4:164,39:.: 0.82:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:151,28:.: 0.35:1.000:. ./.:4:109,23:.:-0.58:1.000:. ./.:4:112,1:.:-0.96:1.000:. ./.:4:75,11:.:-1.50:1.000:. ./.:4:58,39:.:-1.28:1.000:. ./.:4:136,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:137,21:.:-0.07:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:98,36:.:-0.54:1.000:. ./.:4:218,28:.: 1.68:1.000:. ./.:4:181,20:.: 0.78:1.000:. ./.:4:66,43:.:-1.04:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:124,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:150,28:.: 0.33:1.000:. ./.:4:122,20:.:-0.39:1.000:. ./.:4:190,27:.: 1.10:1.000:. ./.:4:63,44:.:-1.08:1.000:. ./.:4:279,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:146,84:.: 1.36:1.000:. ./.:4:183,31:.: 1.04:1.000:. ./.:4:198,25:.: 1.22:1.000:. ./.:4:244,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:222,36:.: 1.91:1.000:. ./.:4:88,57:.:-0.33:1.000:. ./.:4:27,6:.:-2.55:1.000:. ./.:4:138,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:166,31:.: 0.70:1.000:. ./.:4:121,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:178,30:.: 0.92:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:161,24:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,27:.: 0.39:1.000:. ./.:4:173,22:.: 0.67:1.000:. ./.:4:128,20:.:-0.27:1.000:. ./.:4:113,24:.:-0.48:1.000:. ./.:4:145,22:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,33:.:-1.30:1.000:. ./.:4:138,21:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,68:.:-0.50:1.000:. ./.:4:170,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:126,28:.:-0.15:1.000:. ./.:4:124,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:192,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:126,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:136,32:.: 0.13:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:174,31:.: 0.86:1.000:. ./.:4:127,23:.:-0.23:1.000:. ./.:4:114,60:.: 0.25:1.000:. ./.:4:153,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:166,37:.: 0.82:0.956:. ./.:4:193,41:.: 1.44:0.998:. ./.:4:183,38:.: 1.18:1.000:. ./.:4:113,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.92:1.000:. -chr8.1 40574231 chr8.1_040574231 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,18:0.50:-0.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:6,54:0.89: 0.84:1.000:0.523 0/0/1/1:4:28,35:0.52: 1.03:1.000:0.994 0/0/0/1:4:42,18:0.30: 0.84:1.000:0.984 0/0/0/1:4:40,12:0.24: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.30:-0.84:1.000:0.988 0/0/0/1:4:30,14:0.32:-0.20:1.000:0.962 0/0/1/1:4:20,24:0.51:-0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:1,3:0.73:-2.78:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:23,34:0.57: 0.65:1.000:0.956 0/0/0/1:4:34,11:0.25:-0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:25,33:0.54: 0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:21,30:0.56: 0.26:1.000:0.971 0/0/1/1:4:31,26:0.43: 0.65:1.000:0.956 0/1/1/1:4:18,53:0.72: 1.55:0.999:0.996 0/1/1/1:4:14,45:0.74: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,42:0.53: 1.81:1.000:0.993 0/0/1/1:4:36,32:0.45: 1.36:1.000:0.976 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:22,20:0.45:-0.32:1.000:0.981 0/0/0/1:4:32,20:0.37: 0.32:1.000:0.521 0/0/1/1:4:21,26:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-2.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,46:0.61: 1.62:1.000:0.687 0/1/1/1:4:19,41:0.66: 0.84:1.000:0.848 0/0/0/1:4:38,22:0.36: 0.84:1.000:0.712 0/1/1/1:4:17,40:0.68: 0.65:1.000:0.943 0/0/1/1:4:19,35:0.62: 0.45:1.000:0.569 0/0/0/1:4:52,22:0.30: 1.75:1.000:0.986 0/0/0/1:4:42,20:0.32: 0.97:1.000:0.953 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0:3:1,0:0.00:-2.98:0.999:1.000 0/0/1/1:4:23,28:0.52: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,31:0.49: 0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:31,33:0.48: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,36:0.51: 1.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,54:0.86: 0.97:1.000:0.972 0/1/1/1:4:11,29:0.70:-0.45:1.000:0.986 0/0/1/1:4:23,20:0.44:-0.26:1.000:0.970 0/0/1/1:4:21,30:0.56: 0.26:1.000:0.971 0/0/0/1:4:22,11:0.33:-0.91:1.000:0.923 0/0/0/1:4:30,16:0.34:-0.07:1.000:0.857 0/0/1/1:4:25,22:0.44: 0.00:1.000:0.973 0/0/0/1/1:5:50,32:0.38: 2.26:1.000:0.963 0/0/1/1:4:7,5:0.40:-2.27:1.000:0.795 0/0/1/1:4:17,32:0.63: 0.13:1.000:0.501 0/0/0/1:4:38,15:0.29: 0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:12,14:0.51:-1.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,36:0.42: 2.33:1.000:0.892 0/0/0/1:4:30,10:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:23,31:0.54: 0.45:1.000:0.986 0/0/0/1:4:43,12:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,35:0.51: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:36,8:0.19:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.49:-0.07:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:9,14:0.58:-1.55:1.000:0.530 0/1/1/1:4:12,33:0.71:-0.13:1.000:0.991 0/0/1/1:4:33,30:0.45: 1.03:1.000:0.981 0/0/0/1:4:24,13:0.34:-0.65:1.000:0.835 0/0/0/1:4:41,10:0.20: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,33:0.48: 1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,30:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:26,10:0.28:-0.71:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,15:0.34:-0.26:1.000:0.851 0/0/1/1:4:21,25:0.51:-0.07:0.887:0.996 0/1/1/1:4:9,33:0.76:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,26:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,11:0.42:-1.42:0.999:0.916 0/1/1/1:4:11,31:0.71:-0.32:1.000:0.994 0/0/1/1:4:27,34:0.53: 0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,30:0.62:-0.07:1.000:0.513 0/0/0/1:4:38,12:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,25:0.52:-0.13:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,10:0.33:-1.10:1.000:0.923 0/0/0/1:4:37,6:0.15:-0.26:1.000:0.981 0/0/1/1:4:30,26:0.44: 0.58:1.000:0.969 0/0/1/1:4:10,16:0.59:-1.36:0.937:0.888 0/0/1/1:4:21,25:0.51:-0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,30:0.69:-0.32:1.000:0.972 0/0/0/1:4:35,14:0.29: 0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,15:0.42:-0.84:1.000:0.919 0/0/0/1:4:24,9:0.28:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,13:0.47:-1.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,19:0.53:-0.84:1.000:0.993 0/1/1/1:4:8,24:0.73:-0.97:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,35:0.82:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:26,20:0.42:-0.07:0.999:0.896 0/1/1/1:4:7,34:0.81:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,39:0.73: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,29:0.55: 0.19:1.000:0.981 0/0/1/1:4:28,26:0.46: 0.45:1.000:0.985 0/0/0/1:4:38,13:0.26: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:15,9:0.37:-1.49:1.000:0.628 0/0/0/1:4:27,10:0.28:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,32:0.69:-0.13:1.000:0.967 0/0/1/1:4:18,28:0.58:-0.07:1.000:0.919 0/1/1/1:4:9,18:0.64:-1.30:1.000:0.682 0/1/1/1:4:9,25:0.71:-0.84:1.000:0.992 0/0/1/1:4:14,14:0.47:-1.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:14,23:0.59:-0.65:0.994:0.849 0/0/1/1:4:19,18:0.46:-0.65:1.000:0.988 0/0/1/1:4:30,28:0.46: 0.71:1.000:0.986 0/0/0/1:4:23,14:0.37:-0.65:1.000:0.591 0/0/1/1:4:26,27:0.48: 0.39:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,12:0.18: 1.36:0.993:0.999 0/0/0/1:4:40,14:0.27: 0.45:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,8:0.27:-1.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,39:0.44: 2.39:1.000:0.969 0/0/1/1:4:18,18:0.47:-0.71:0.999:0.993 0/0/1/1:4:33,35:0.48: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,19:0.56:-0.97:1.000:0.962 0/0/1/1:4:12,22:0.62:-0.84:1.000:0.583 0/0/0/1:4:19,7:0.27:-1.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,10:0.29:-0.78:1.000:0.992 0/0/1/1:4:16,21:0.54:-0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:32,6:0.16:-0.58:1.000:0.997 0/1/1/1:4:9,40:0.80: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,18:0.57:-1.10:1.000:0.947 0/0/1/1:4:15,21:0.55:-0.71:1.000:0.978 0/1/1/1:4:11,32:0.72:-0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,18:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,43:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,12:0.51:-1.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,14:0.58:-1.55:1.000:0.919 0/0/1/1:4:19,15:0.42:-0.84:1.000:0.919 0/0/0/1:4:42,9:0.18: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,14:0.58:-1.55:1.000:0.919 0/1/1/1:4:11,23:0.65:-0.84:1.000:0.790 0/1/1/1:4:12,50:0.79: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,57:0.77: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,16:0.54:-1.23:1.000:0.988 0/0/0/1:4:22,11:0.33:-0.91:1.000:0.923 0/0/1/1:4:15,16:0.49:-1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,9:0.24:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,6:0.22:-1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,39:0.70: 0.45:1.000:0.983 0/0/1/1:4:13,21:0.59:-0.84:1.000:0.875 0/0/1/1:4:24,37:0.58: 0.90:1.000:0.927 0/1/1/1:4:14,61:0.80: 1.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:4,38:0.90:-0.32:1.000:0.684 0/0/0/1:4:37,9:0.20:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,37:0.53: 1.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:31,30:0.46: 0.90:1.000:0.990 0/0/1/1:4:25,22:0.44: 0.00:1.000:0.973 0/0/0/1:4:46,16:0.27: 0.97:1.000:0.998 0/0/1/1:4:2,3:0.57:-2.72:1.000:0.947 0/0/0/1:4:31,11:0.27:-0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,38:0.47: 1.88:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,35:0.54: 0.90:1.000:0.986 0/0/0/1:4:34,8:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,38:0.57: 1.03:1.000:0.938 0/1/1/1:4:13,28:0.66:-0.39:1.000:0.845 0/1/1/1:4:9,53:0.84: 0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:16,36:0.67: 0.32:1.000:0.904 0/0/1/1:4:28,27:0.46: 0.52:1.000:0.990 0/0/0/1:4:35,11:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,39:0.52: 1.55:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,39:0.49: 1.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,13:0.28: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:17,30:0.61: 0.00:1.000:0.694 0/0/0/1:4:45,14:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,24:0.73:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,22:0.46:-0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:20,25:0.52:-0.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,21:0.54:-0.65:1.000:0.990 0/0/0/1:4:31,13:0.30:-0.20:1.000:0.987 0/0/0/1:4:38,14:0.27: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,25:0.48: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,20:0.42:-0.07:1.000:0.896 0/0/0/1:4:42,13:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,13:0.22: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,31:0.45: 1.16:1.000:0.982 0/0/0/1:4:37,19:0.33: 0.58:1.000:0.900 0/0/0/1:4:35,18:0.33: 0.39:0.956:0.898 0/0/0/1:4:44,21:0.32: 1.16:0.998:0.952 0/1/1/1:4:11,51:0.81: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,20:0.58:-0.91:1.000:0.929 0/0/1/1:4:37,43:0.50: 2.13:1.000:0.997 -chr8.1 40946972 chr8.1_040946972 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:121,151:.:-0.10:1.000:. ./.:4:112,137:.:-0.40:1.000:. ./.:4:144,181:.: 0.61:1.000:. ./.:4:114,137:.:-0.38:1.000:. ./.:4:152,173:.: 0.61:1.000:. ./.:4:152,187:.: 0.80:1.000:. ./.:4:109,154:.:-0.22:1.000:. ./.:4:134,172:.: 0.36:1.000:. ./.:4:102,141:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,13:.:-3.12:1.000:. ./.:4:35,25:.:-2.92:1.000:. ./.:4:146,201:.: 0.90:1.000:. ./.:4:112,135:.:-0.43:1.000:. ./.:4:129,191:.: 0.54:1.000:. ./.:4:106,139:.:-0.46:1.000:. ./.:4:101,183:.: 0.06:1.000:. ./.:4:164,183:.: 0.90:0.999:. ./.:4:135,160:.: 0.21:1.000:. ./.:4:163,201:.: 1.13:1.000:. ./.:4:167,213:.: 1.34:1.000:. ./.:4:24,12:.:-3.24:1.000:. ./.:4:112,158:.:-0.12:1.000:. ./.:4:174,162:.: 0.76:1.000:. ./.:4:122,170:.: 0.17:1.000:. ./.:4:13,8:.:-3.44:1.000:. ./.:4:179,209:.: 1.45:1.000:. ./.:4:121,162:.: 0.05:1.000:. ./.:4:111,154:.:-0.19:1.000:. ./.:4:152,155:.: 0.37:1.000:. ./.:4:130,196:.: 0.62:1.000:. ./.:4:188,259:.: 2.24:1.000:. ./.:4:111,138:.:-0.40:1.000:. ./.:4:13,11:.:-3.40:1.000:. ./.:4:30,22:.:-3.03:1.000:. ./.:3:7,7:.:-3.54:0.999:. ./.:4:124,154:.:-0.02:1.000:. ./.:4:154,173:.: 0.64:1.000:. ./.:4:132,173:.: 0.34:1.000:. ./.:4:173,219:.: 1.50:1.000:. ./.:4:173,214:.: 1.44:1.000:. ./.:4:155,168:.: 0.58:1.000:. ./.:4:147,146:.: 0.18:1.000:. ./.:4:162,176:.: 0.78:1.000:. ./.:4:128,132:.:-0.26:1.000:. ./.:4:170,163:.: 0.72:1.000:. ./.:4:151,140:.: 0.16:1.000:. ./.:5:176,220:.: 1.56:1.000:. ./.:4:28,65:.:-2.48:1.000:. ./.:4:142,136:.:-0.02:1.000:. ./.:4:184,173:.: 1.04:1.000:. ./.:4:142,113:.:-0.32:1.000:. ./.:4:133,175:.: 0.38:1.000:. ./.:4:152,146:.: 0.25:1.000:. ./.:4:180,165:.: 0.88:1.000:. ./.:4:117,165:.: 0.04:1.000:. ./.:4:198,179:.: 1.30:1.000:. ./.:4:137,172:.: 0.40:1.000:. ./.:4:209,171:.: 1.34:1.000:. ./.:4:180,162:.: 0.84:1.000:. ./.:6:126,128:.:-0.34:1.000:. ./.:4:165,159:.: 0.60:1.000:. ./.:4:131,148:.: 0.00:1.000:. ./.:4:189,169:.: 1.05:1.000:. ./.:4:159,136:.: 0.21:1.000:. ./.:4:181,190:.: 1.22:1.000:. ./.:4:159,145:.: 0.33:1.000:. ./.:4:120,108:.:-0.68:1.000:. ./.:4:129,179:.: 0.38:1.000:. ./.:4:164,171:.: 0.74:0.887:. ./.:4:89,142:.:-0.64:1.000:. ./.:4:188,151:.: 0.80:1.000:. ./.:4:129,108:.:-0.56:0.999:. ./.:4:213,171:.: 1.40:1.000:. ./.:4:117,125:.:-0.50:1.000:. ./.:4:130,131:.:-0.24:1.000:. ./.:4:172,155:.: 0.64:1.000:. ./.:4:135,129:.:-0.20:1.000:. ./.:4:157,147:.: 0.33:1.000:. ./.:4:164,145:.: 0.40:1.000:. ./.:4:182,196:.: 1.32:1.000:. ./.:4:115,110:.:-0.72:0.937:. ./.:4:160,142:.: 0.30:1.000:. ./.:4:178,166:.: 0.86:1.000:. ./.:4:96,114:.:-0.92:1.000:. ./.:4:198,179:.: 1.30:1.000:. ./.:4:139,162:.: 0.29:1.000:. ./.:4:107,84:.:-1.18:1.000:. ./.:4:124,101:.:-0.72:1.000:. ./.:4:151,134:.: 0.08:1.000:. ./.:4:104,122:.:-0.71:1.000:. ./.:4:163,140:.: 0.32:0.999:. ./.:4:119,122:.:-0.51:1.000:. ./.:4:158,164:.: 0.57:1.000:. ./.:4:86,94:.:-1.32:1.000:. ./.:4:190,170:.: 1.08:1.000:. ./.:4:167,138:.: 0.34:1.000:. ./.:4:130,140:.:-0.12:1.000:. ./.:4:133,137:.:-0.12:1.000:. ./.:4:148,138:.: 0.09:1.000:. ./.:4:158,165:.: 0.58:1.000:. ./.:4:132,119:.:-0.38:1.000:. ./.:4:154,152:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,98:.:-1.07:1.000:. ./.:4:137,123:.:-0.26:0.994:. ./.:4:131,106:.:-0.56:1.000:. ./.:4:161,135:.: 0.22:1.000:. ./.:4:136,134:.:-0.12:1.000:. ./.:4:121,176:.: 0.24:1.000:. ./.:4:142,215:.: 1.04:0.993:. ./.:4:133,159:.: 0.17:1.000:. ./.:4:108,126:.:-0.60:1.000:. ./.:4:178,225:.: 1.65:1.000:. ./.:4:138,101:.:-0.54:0.999:. ./.:4:163,130:.: 0.18:1.000:. ./.:4:133,138:.:-0.11:1.000:. ./.:4:164,145:.: 0.40:1.000:. ./.:4:124,133:.:-0.30:1.000:. ./.:4:129,123:.:-0.36:1.000:. ./.:4:123,125:.:-0.42:1.000:. ./.:4:117,101:.:-0.82:1.000:. ./.:4:127,146:.:-0.08:1.000:. ./.:4:132,104:.:-0.58:1.000:. ./.:4:167,179:.: 0.89:1.000:. ./.:4:105,166:.:-0.11:1.000:. ./.:4:148,123:.:-0.11:1.000:. ./.:4:119,132:.:-0.38:1.000:. ./.:4:150,146:.: 0.22:1.000:. ./.:4:144,116:.:-0.26:1.000:. ./.:4:106,112:.:-0.82:1.000:. ./.:4:94,115:.:-0.94:1.000:. ./.:4:129,104:.:-0.62:1.000:. ./.:4:126,138:.:-0.20:1.000:. ./.:4:94,83:.:-1.36:1.000:. ./.:4:135,123:.:-0.28:1.000:. ./.:4:122,151:.:-0.08:1.000:. ./.:4:193,273:.: 2.49:1.000:. ./.:4:159,162:.: 0.56:1.000:. ./.:4:127,117:.:-0.47:1.000:. ./.:4:120,118:.:-0.55:1.000:. ./.:4:131,119:.:-0.39:1.000:. ./.:4:143,131:.:-0.07:1.000:. ./.:4:132,144:.:-0.04:1.000:. ./.:4:109,177:.: 0.09:1.000:. ./.:4:112,108:.:-0.79:1.000:. ./.:4:170,173:.: 0.85:1.000:. ./.:4:120,184:.: 0.33:1.000:. ./.:4:135,142:.:-0.03:1.000:. ./.:4:109,127:.:-0.58:1.000:. ./.:4:147,181:.: 0.65:1.000:. ./.:4:124,138:.:-0.23:1.000:. ./.:4:145,175:.: 0.54:1.000:. ./.:4:116,159:.:-0.06:1.000:. ./.:4:33,6:.:-3.20:1.000:. ./.:4:95,115:.:-0.92:1.000:. ./.:4:202,250:.: 2.30:1.000:. ./.:4:114,194:.: 0.38:1.000:. ./.:4:134,184:.: 0.52:1.000:. ./.:4:142,183:.: 0.61:1.000:. ./.:4:109,160:.:-0.14:1.000:. ./.:4:118,174:.: 0.17:1.000:. ./.:4:138,155:.: 0.18:1.000:. ./.:4:98,131:.:-0.67:1.000:. ./.:4:126,130:.:-0.31:1.000:. ./.:4:141,166:.: 0.37:1.000:. ./.:4:168,213:.: 1.36:1.000:. ./.:4:132,145:.:-0.03:1.000:. ./.:4:128,153:.: 0.02:1.000:. ./.:4:92,160:.:-0.36:1.000:. ./.:4:98,136:.:-0.60:1.000:. ./.:4:117,179:.: 0.22:1.000:. ./.:4:72,134:.:-0.98:1.000:. ./.:4:99,142:.:-0.51:1.000:. ./.:4:103,127:.:-0.66:1.000:. ./.:4:101,142:.:-0.48:1.000:. ./.:4:138,141:.: 0.00:1.000:. ./.:4:122,151:.:-0.08:1.000:. ./.:4:165,202:.: 1.17:1.000:. ./.:4:149,188:.: 0.77:1.000:. ./.:4:136,200:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,158:.:-0.28:1.000:. ./.:4:135,177:.: 0.44:0.956:. ./.:4:165,226:.: 1.49:0.998:. ./.:4:108,153:.:-0.24:1.000:. ./.:4:88,129:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,130:.:-0.84:1.000:. -chr8.1 41032593 chr8.1_041032593 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:113,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:238,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.21:0.999:. ./.:4:112,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:236,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.97:1.000:. ./.:3:23,0:.:-1.49:0.999:. ./.:4:92,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:102,1:.: 0.04:1.000:. ./.:5:104,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:179,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.62:1.000:. ./.:6:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:165,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:92,1:.:-0.15:0.887:. ./.:4:93,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.51:0.999:. ./.:4:145,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:203,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:211,0:.: 2.11:0.937:. ./.:4:110,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.26:0.999:. ./.:4:26,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.32:0.994:. ./.:4:151,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.14:0.993:. ./.:4:35,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:235,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:126,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:221,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:0.998:. ./.:4:13,0:.:-1.68:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:45,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.14:0.956:. ./.:4:130,0:.: 0.56:0.998:. ./.:4:129,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:43,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.13:1.000:. -chr8.1 41763345 chr8.1_041763345 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,50:0.30: 0.78:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,60:0.35: 0.90:1.000:0.822 0/0/1/1:4:45,59:0.54:-0.04:1.000:0.986 0/0/0/1:4:139,88:0.35: 2.10:1.000:0.746 0/1/1/1:4:30,106:0.77: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,130:0.70: 1.30:1.000:0.988 0/0/0/1:4:196,67:0.22: 2.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.47:-1.82:1.000:0.993 0/0/0/0:4:7,1:0.11:-1.72:1.000:0.546 0/0/0/1:4:186,56:0.20: 2.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,104:0.62: 0.97:1.000:0.544 0/0/0/1:4:123,63:0.30: 1.39:1.000:0.981 0/0/0/1:4:93,53:0.33: 0.69:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,71:0.49: 0.53:0.999:0.996 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,106:0.70: 0.74:1.000:0.981 0/0/1/1:4:97,120:0.53: 1.93:1.000:0.993 0/0/0/0:4:164,0:0.00: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.40:-1.73:1.000:0.765 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,57:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,123:0.73: 1.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,158:0.52: 3.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,66:0.58: 0.05:1.000:0.901 0/0/0/1:4:2,1:0.30:-1.80:1.000:0.986 0/1/1/1:4:4,8:0.65:-1.65:1.000:0.777 0/0/1:3:5,2:0.25:-1.73:0.999:1.000 0/1/1/1:4:57,136:0.69: 1.51:1.000:0.972 0/0/1/1:4:47,56:0.52:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,73:0.37: 1.30:1.000:0.550 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,49:0.38: 0.24:1.000:0.519 0/0/1/1:4:71,59:0.42: 0.41:1.000:0.927 0/1/1/1:4:26,65:0.70:-0.27:1.000:0.984 0/0/0/1:4:71,47:0.37: 0.20:1.000:0.618 0/0/1/1/1:5:59,112:0.64: 1.13:1.000:0.942 0/1/1/1:4:8,27:0.76:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,27:0.20: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,26:0.44:-0.90:1.000:0.972 0/0/1/1:4:24,28:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/0/0/0:4:132,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,57:0.66:-0.39:1.000:0.875 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,109:0.65: 0.97:1.000:0.833 0/0/0/1:4:71,47:0.37: 0.20:1.000:0.618 0/0/0/1:4:65,43:0.37: 0.03:1.000:0.620 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:17,38:0.67:-0.90:1.000:0.920 0/0/1/1:4:25,36:0.57:-0.79:1.000:0.955 0/0/1/1:4:31,29:0.45:-0.81:1.000:0.983 0/1/1/1:4:39,87:0.67: 0.34:1.000:0.935 0/0/0/1:4:53,28:0.31:-0.44:1.000:0.972 0/0/0/1:4:95,36:0.24: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,38:0.32: 0.03:1.000:0.959 0/0/0/1:4:70,33:0.29:-0.06:1.000:0.994 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.60:0.887:1.000 0/0/1/1:4:36,35:0.46:-0.62:1.000:0.990 0/1/1/1:4:25,80:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,41:0.70:-0.86:0.999:0.989 0/0/1/1:4:71,74:0.48: 0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:86,45:0.31: 0.43:1.000:0.975 0/0/0/1:4:46,31:0.37:-0.51:1.000:0.560 0/0/1/1:4:64,81:0.53: 0.67:1.000:0.991 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,29:0.38:-0.63:1.000:0.600 0/0/0/1:4:72,44:0.35: 0.17:1.000:0.825 0/0/0/0:4:97,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,36:0.32:-0.09:0.937:0.947 0/0/0/1:4:60,36:0.34:-0.18:1.000:0.858 0/0/1/1:4:36,37:0.48:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:67,40:0.34: 0.01:1.000:0.866 0/1/1/1:4:40,77:0.64: 0.19:1.000:0.679 0/1/1/1:4:37,104:0.72: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,35:0.56:-0.81:1.000:0.968 0/0/1/1:4:14,23:0.60:-1.21:1.000:0.789 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,41:0.35: 0.03:1.000:0.823 0/0/1/1:4:26,32:0.53:-0.84:0.999:0.994 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,41:0.37:-0.09:1.000:0.514 1/1/1/1:4:0,87:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,82:0.70: 0.15:1.000:0.983 0/0/0/1:4:57,23:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,45:0.54:-0.46:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,100:0.69: 0.60:1.000:0.979 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,36:0.53:-0.72:1.000:0.993 0/0/0/0:4:43,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.98:0.994:1.000 0/0/0/1:4:47,30:0.36:-0.51:1.000:0.725 0/0/1/1:4:29,45:0.59:-0.56:1.000:0.888 0/0/1/1:4:23,37:0.59:-0.81:1.000:0.831 0/0/1/1:4:48,81:0.61: 0.39:1.000:0.725 0/1/1/1:4:48,114:0.69: 0.97:0.993:0.970 0/1/1/1:4:43,80:0.63: 0.29:1.000:0.575 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,85:0.33: 2.23:1.000:0.923 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.52:0.999:1.000 0/1/1/1:4:34,85:0.70: 0.22:1.000:0.984 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,64:0.70:-0.30:1.000:0.988 0/0/1/1:4:53,42:0.41:-0.20:1.000:0.871 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,55:0.70:-0.51:1.000:0.984 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,20:0.32:-0.88:1.000:0.945 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,80:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,34:0.38:-0.42:1.000:0.604 0/1/1/1:4:13,25:0.64:-1.19:1.000:0.676 0/0/1/1:4:61,75:0.53: 0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:47,57:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,28:0.41:-0.76:1.000:0.885 0/1/1/1:4:25,47:0.63:-0.60:1.000:0.608 0/0/0/1:4:38,26:0.37:-0.74:1.000:0.510 0/1/1/1:4:62,146:0.69: 1.77:1.000:0.967 0/0/0/1:4:36,20:0.32:-0.88:0.998:0.945 0/0/1/1:4:30,32:0.49:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,42:0.45:-0.34:1.000:0.983 0/0/1/1:4:77,79:0.48: 0.87:1.000:0.994 0/0/0/1:4:74,37:0.30: 0.08:1.000:0.986 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,26:0.42:-0.84:1.000:0.904 0/0/0/1:4:48,25:0.31:-0.58:1.000:0.976 0/0/0/1:4:40,24:0.34:-0.74:1.000:0.858 0/1/1/1:4:19,60:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,63:0.54: 0.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:22,24:0.49:-1.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,60:0.58:-0.11:1.000:0.925 0/0/0/0:4:122,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,46:0.29: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/0:4:135,0:0.00: 0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,120:0.63: 1.37:1.000:0.551 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,92:0.69: 0.43:1.000:0.967 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,58:0.52:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:101,63:0.35: 1.01:1.000:0.782 0/0/0/1:4:128,64:0.30: 1.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:90,53:0.34: 0.64:1.000:0.886 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:95,65:0.37: 0.94:1.000:0.510 0/0/1/1:4:41,48:0.51:-0.30:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,98:0.64: 0.74:1.000:0.674 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,154:1.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,50:0.43: 0.05:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,127:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,123:0.66: 1.32:1.000:0.856 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,54:0.28: 1.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,49:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:39,64:0.60:-0.06:1.000:0.792 0/0/0/1:4:75,47:0.35: 0.27:1.000:0.771 0/0/1/1:4:56,58:0.48: 0.13:1.000:0.995 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,99:0.37: 2.45:1.000:0.584 0/1/1/1:4:50,113:0.68: 0.99:1.000:0.944 0/0/0/1:4:115,60:0.31: 1.20:1.000:0.976 0/0/0/1:4:148,69:0.28: 1.93:1.000:0.995 0/1/1/1:4:64,136:0.66: 1.63:0.956:0.884 0/0/1/1:4:150,169:0.50: 3.71:0.998:0.997 0/0/1/1:4:56,67:0.52: 0.29:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,55:0.38: 0.48:1.000:0.548 -chr8.1 42382405 chr8.1_042382405 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:12,8:0.39:-0.69:1.000:0.686 0/0/0/1:4:15,3:0.17:-0.90:1.000:0.998 0/1/1/1:4:6,19:0.74:-0.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,11:0.43:-0.15:1.000:0.935 0/0/1/1:4:13,17:0.54: 0.38:1.000:0.984 0/0/0/1:4:25,8:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,9:0.54:-1.12:1.000:0.987 0/1/1/1:4:10,21:0.65: 0.49:1.000:0.831 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,5:0.48:-1.76:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,8:0.48:-1.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,7:0.22: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,13:0.41: 0.49:1.000:0.845 0/0/1/1:4:12,14:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:28,13:0.31: 1.56:1.000:0.966 1/1/1/1:4:0,33:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,12:0.64:-0.90:0.999:0.732 0/1/1/1:4:5,12:0.68:-1.01:1.000:0.960 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,2:0.33:-2.19:1.000:0.925 0/1/1/1:4:9,21:0.68: 0.38:1.000:0.945 0/0/1/1:4:28,19:0.39: 2.20:1.000:0.728 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.48:-2.61:1.000:0.995 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,14:0.36: 1.24:1.000:0.678 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.48:1.000:0.950 0/0/1/1:4:11,10:0.46:-0.58:1.000:0.987 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,26:0.58: 1.77:1.000:0.904 0/1/1/1:4:9,34:0.77: 1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.39:-2.29:1.000:0.686 0/0/0/1:4:9,2:0.18:-1.65:1.000:0.999 0/1/1:3:3,6:0.64:-1.87:0.999:1.000 0/0/0/1:4:24,13:0.35: 1.13:1.000:0.831 0/0/0/1:4:17,6:0.26:-0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:18,21:0.52: 1.34:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,18:0.76:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.56: 1.02:1.000:0.965 0/0/0/1:4:24,8:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,9:0.38:-0.37:1.000:0.591 0/0/0/1:4:23,13:0.35: 1.02:1.000:0.751 0/0/1/1/1:5:16,34:0.66: 2.52:1.000:0.872 0/0/1/1:4:39,35:0.46: 5.09:1.000:0.985 0/0/0/1:4:19,8:0.30: 0.06:1.000:0.989 0/0/0/1:4:26,11:0.30: 1.13:1.000:0.988 0/0/1/1:4:19,19:0.48: 1.24:1.000:0.995 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,15:0.55:-0.05:1.000:0.975 0/0/1/1:4:11,13:0.52:-0.26:1.000:0.995 0/1/1/1:4:6,16:0.70:-0.48:1.000:0.988 0/0/0/1:4:17,6:0.26:-0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,11:0.33: 0.70:1.000:0.925 0/0/0/1:4:16,9:0.35:-0.15:1.000:0.762 0/0/0/1:4:23,8:0.26: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1/1/1:6:6,20:0.75:-0.05:1.000:0.524 0/0/1/1:4:12,14:0.52:-0.05:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,7:0.27:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,23:0.60: 1.13:1.000:0.798 0/0/0/1:4:21,8:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/0:4:36,1:0.03: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,3:0.23:-1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.48:-0.90:1.000:0.995 0/0/0/1:4:23,4:0.15: 0.06:0.887:0.988 0/0/1/1:4:7,9:0.54:-1.12:1.000:0.987 0/1/1/1:4:8,20:0.69: 0.17:1.000:0.975 0/0/1/1:4:9,15:0.60:-0.26:0.999:0.768 0/0/0/1:4:17,5:0.23:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,6:0.26:-0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,30:0.54: 2.84:1.000:0.985 0/0/0/1:4:27,7:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,8:0.23: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.43:-0.69:1.000:0.958 0/0/0/1:4:27,13:0.32: 1.45:1.000:0.950 0/0/0/1:4:17,4:0.19:-0.58:0.937:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.43:-0.15:1.000:0.935 0/0/0/1:4:28,5:0.15: 0.70:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,3:0.15:-0.69:1.000:0.990 0/0/1/1:4:18,22:0.53: 1.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:7,20:0.72: 0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,4:0.14: 0.38:1.000:0.948 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,7:0.36:-0.80:1.000:0.678 0/0/0/1:4:22,13:0.36: 0.92:1.000:0.645 0/0/0/1:4:18,9:0.33: 0.06:0.999:0.925 0/1/1/1:4:5,18:0.76:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,8:0.20: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,25:0.71: 0.81:1.000:0.993 0/1/1/1:4:6,20:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,6:0.33:-0.90:1.000:0.925 0/1/1/1:4:3,9:0.73:-1.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,7:0.36:-0.80:1.000:0.678 0/0/1/1:4:18,13:0.41: 0.49:1.000:0.845 0/0/1/1:4:6,4:0.39:-1.76:1.000:0.686 0/0/0/1:4:11,5:0.31:-1.12:1.000:0.973 0/0/1/1:4:7,9:0.54:-1.12:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.37:0.994:1.000 0/0/1/1:4:10,9:0.46:-0.80:1.000:0.985 0/0/0/1:4:17,9:0.34:-0.05:1.000:0.865 0/0/1/1:4:18,12:0.39: 0.38:1.000:0.686 0/1/1/1:4:7,22:0.74: 0.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,20:0.64: 0.38:0.993:0.732 0/1/1/1:4:6,20:0.75:-0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,23:0.60: 1.13:1.000:0.798 0/0/1/1:4:9,13:0.57:-0.48:0.999:0.950 0/0/1/1:4:15,13:0.45: 0.17:1.000:0.978 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,19:0.68: 0.06:1.000:0.955 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.15:1.000:0.961 0/0/1/1:4:13,9:0.40:-0.48:1.000:0.771 0/0/1/1:4:13,16:0.53: 0.27:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,9:0.42:-0.58:1.000:0.894 0/0/0/1:4:20,6:0.23:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,13:0.35: 1.13:1.000:0.831 0/1/1/1:4:6,18:0.73:-0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:22,10:0.31: 0.59:1.000:0.973 0/0/0/1:4:15,6:0.29:-0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:10,12:0.52:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,17:0.49: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,12:0.58:-0.69:1.000:0.923 1/1/1/1:4:1,19:0.94:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,8:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,26:0.79: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.35:-1.01:0.998:0.819 0/0/0/1:4:17,4:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.37:1.000:0.986 0/0/1/1:4:11,9:0.43:-0.69:1.000:0.958 0/0/1/1:4:15,12:0.43: 0.06:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,12:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:13,5:0.28:-0.90:1.000:0.996 0/0/1/1:4:7,9:0.54:-1.12:1.000:0.987 0/0/0/1:4:10,2:0.17:-1.55:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,6:0.39:-1.22:1.000:0.686 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,14:0.64:-0.58:1.000:0.732 0/1/1/1:4:9,17:0.63:-0.05:1.000:0.579 0/0/0/1:4:24,9:0.27: 0.70:1.000:0.997 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,11:0.33: 0.70:1.000:0.925 0/1/1/1:4:8,23:0.72: 0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,1:0.11:-1.87:1.000:0.573 0/0/1/1:4:9,12:0.55:-0.58:1.000:0.980 0/0/1/1:4:11,17:0.58: 0.17:1.000:0.893 0/0/1/1:4:17,16:0.47: 0.70:1.000:0.991 0/0/1/1:4:22,18:0.43: 1.45:1.000:0.958 0/0/0/1:4:29,9:0.24: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.23: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,20:0.90:-0.48:1.000:0.794 0/0/0/1:4:16,8:0.33:-0.26:1.000:0.925 0/1/1/1:4:6,14:0.68:-0.69:1.000:0.945 0/0/1/1:4:18,23:0.54: 1.56:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,19:0.71:-0.05:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,22:0.53: 1.45:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,14:0.61:-0.48:1.000:0.647 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,17:0.56: 0.27:1.000:0.960 0/0/1/1:4:18,17:0.47: 0.92:1.000:0.991 0/0/0/1:4:16,5:0.24:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,6:0.21: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,20:0.72: 0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,13:0.43: 0.27:1.000:0.955 0/0/0/0:4:29,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,20:0.52: 1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,22:0.56: 1.24:1.000:0.972 0/0/0/1:4:15,8:0.34:-0.37:1.000:0.854 0/0/0/1:4:12,4:0.25:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,14:0.71:-0.80:0.956:0.993 0/0/1/1:4:12,15:0.53: 0.06:0.998:0.991 0/0/1/1:4:24,15:0.38: 1.34:1.000:0.511 0/1/1/1:4:4,14:0.75:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.33:-0.58:1.000:0.925 -chr8.1 42826934 chr8.1_042826934 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:149,45:.:-0.09:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:166,55:.: 0.32:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:310,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:43,6:.:-2.30:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:217,65:.: 1.25:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:179,66:.: 0.68:1.000:. ./.:4:232,66:.: 1.49:0.999:. ./.:4:212,55:.: 1.02:1.000:. ./.:4:325,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:47,7:.:-2.22:1.000:. ./.:4:206,38:.: 0.67:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.71:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:165,56:.: 0.32:1.000:. ./.:4:184,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:248,59:.: 1.63:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:164,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.39:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.76:0.999:. ./.:4:259,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:234,45:.: 1.20:1.000:. ./.:4:161,39:.: 0.00:1.000:. ./.:4:197,54:.: 0.78:1.000:. ./.:4:125,38:.:-0.56:1.000:. ./.:4:161,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:238,54:.: 1.40:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.12:1.000:. ./.:5:239,66:.: 1.60:1.000:. ./.:4:68,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:129,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:283,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:183,53:.: 0.55:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:138,55:.:-0.11:1.000:. ./.:4:143,34:.:-0.35:1.000:. ./.:6:115,24:.:-0.93:1.000:. ./.:4:148,51:.:-0.02:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:175,42:.: 0.26:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.61:0.887:. ./.:4:165,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:192,59:.: 0.78:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.17:0.999:. ./.:4:263,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:201,40:.: 0.62:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:218,59:.: 1.17:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.75:0.937:. ./.:4:242,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:123,35:.:-0.64:1.000:. ./.:4:134,37:.:-0.44:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.02:0.999:. ./.:4:157,56:.: 0.20:1.000:. ./.:4:186,55:.: 0.62:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:151,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:108,21:.:-1.08:1.000:. ./.:4:151,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:117,21:.:-0.94:1.000:. ./.:4:159,43:.: 0.03:0.994:. ./.:4:110,27:.:-0.96:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:141,38:.:-0.32:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.05:0.993:. ./.:4:208,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:276,46:.: 1.86:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.23:0.999:. ./.:4:228,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:166,39:.: 0.08:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:179,62:.: 0.62:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:151,56:.: 0.11:1.000:. ./.:4:174,46:.: 0.30:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:129,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:102,24:.:-1.13:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.29:0.998:. ./.:4:144,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:135,36:.:-0.44:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:124,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:107,16:.:-1.17:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:256,71:.: 1.93:1.000:. ./.:4:202,50:.: 0.79:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:231,59:.: 1.37:1.000:. ./.:4:208,58:.: 1.00:1.000:. ./.:4:49,10:.:-2.15:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:216,53:.: 1.05:1.000:. ./.:4:230,59:.: 1.35:1.000:. ./.:4:353,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:321,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:145,35:.:-0.31:1.000:. ./.:4:215,69:.: 1.28:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:155,52:.: 0.11:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:228,45:.: 1.11:1.000:. ./.:4:126,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:168,49:.: 0.26:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:221,55:.: 1.16:1.000:. ./.:4:142,26:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:155,39:.:-0.09:1.000:. ./.:4:135,32:.:-0.50:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:310,68:.: 2.71:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:256,60:.: 1.76:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.64:0.956:. ./.:4:319,0:.: 1.81:0.998:. ./.:4:262,64:.: 1.92:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.44:1.000:. -chr8.1 42967095 chr8.1_042967095 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,140:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,126:.: 0.62:1.000:. ./.:4:36,95:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:29,100:.: 0.72:1.000:. ./.:4:13,32:.:-1.94:1.000:. ./.:4:34,92:.: 0.62:1.000:. ./.:4:30,80:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,16:.:-2.86:1.000:. ./.:4:0,8:.:-3.11:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,166:.: 1.89:0.999:. ./.:4:45,57:.:-0.14:1.000:. ./.:4:32,112:.: 1.19:1.000:. ./.:4:33,95:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,5:.:-3.20:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,90:.: 0.37:1.000:. ./.:4:38,97:.: 0.91:1.000:. ./.:4:2,5:.:-3.14:1.000:. ./.:4:37,69:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.72:1.000:. ./.:4:1,119:.: 0.43:1.000:. ./.:4:46,82:.: 0.69:1.000:. ./.:4:27,89:.: 0.31:1.000:. ./.:4:33,101:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,140:.: 1.07:1.000:. ./.:4:4,10:.:-2.92:1.000:. ./.:4:1,12:.:-2.95:1.000:. ./.:3:0,6:.:-3.17:0.999:. ./.:4:35,101:.: 0.94:1.000:. ./.:4:29,88:.: 0.34:1.000:. ./.:4:27,118:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,160:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,153:.: 1.48:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,107:.: 0.02:1.000:. ./.:4:29,103:.: 0.81:1.000:. ./.:4:28,84:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.04:1.000:. ./.:4:27,88:.: 0.28:1.000:. ./.:5:0,173:.: 2.11:1.000:. ./.:4:0,33:.:-2.32:1.000:. ./.:4:22,68:.:-0.52:1.000:. ./.:4:17,58:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.14:1.000:. ./.:4:33,110:.: 1.16:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.96:1.000:. ./.:4:33,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:27,85:.: 0.18:1.000:. ./.:4:22,67:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,63:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.10:1.000:. ./.:4:27,96:.: 0.53:1.000:. ./.:6:7,77:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,121:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,85:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,94:.: 0.37:1.000:. ./.:4:27,89:.: 0.31:1.000:. ./.:4:25,88:.: 0.21:1.000:. ./.:4:12,31:.:-2.00:1.000:. ./.:4:28,70:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,79:.:-0.23:0.887:. ./.:4:0,140:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.75:1.000:. ./.:4:11,38:.:-1.81:0.999:. ./.:4:0,135:.: 0.91:1.000:. ./.:4:30,87:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:20,77:.:-0.29:1.000:. ./.:4:20,100:.: 0.43:1.000:. ./.:4:20,80:.:-0.20:1.000:. ./.:4:33,96:.: 0.72:1.000:. ./.:4:26,77:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.29:0.937:. ./.:4:27,81:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,127:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.28:1.000:. ./.:4:39,113:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,63:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,56:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:16,41:.:-1.56:0.999:. ./.:4:0,109:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.88:1.000:. ./.:4:17,82:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.07:1.000:. ./.:4:33,87:.: 0.43:1.000:. ./.:4:12,72:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,118:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,104:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,49:.:-1.81:1.000:. ./.:4:0,122:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,76:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,89:.:-0.55:0.994:. ./.:4:0,90:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,155:.: 1.54:1.000:. ./.:4:0,125:.: 0.59:0.993:. ./.:4:30,79:.: 0.09:1.000:. ./.:4:20,79:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,158:.: 1.64:1.000:. ./.:4:27,85:.: 0.18:0.999:. ./.:4:0,113:.: 0.21:1.000:. ./.:4:27,50:.:-0.93:1.000:. ./.:4:24,93:.: 0.34:1.000:. ./.:4:20,48:.:-1.21:1.000:. ./.:4:19,58:.:-0.93:1.000:. ./.:4:19,77:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,75:.:-0.99:1.000:. ./.:4:35,86:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.04:1.000:. ./.:4:43,85:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:22,65:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:26,86:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,82:.:-0.77:1.000:. ./.:4:26,69:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,91:.:-0.48:1.000:. ./.:4:22,75:.:-0.29:1.000:. ./.:4:21,90:.: 0.15:1.000:. ./.:4:23,57:.:-0.83:0.998:. ./.:4:29,82:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,108:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,156:.: 1.57:1.000:. ./.:4:29,101:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,93:.:-0.42:1.000:. ./.:4:25,80:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,94:.:-0.39:1.000:. ./.:4:23,68:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,115:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,59:.:-1.50:1.000:. ./.:4:19,94:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,111:.: 0.15:1.000:. ./.:4:30,102:.: 0.81:1.000:. ./.:4:23,87:.: 0.12:1.000:. ./.:4:28,101:.: 0.72:1.000:. ./.:4:26,82:.: 0.05:1.000:. ./.:4:47,88:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,12:.:-2.98:1.000:. ./.:4:0,65:.:-1.31:1.000:. ./.:4:29,98:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,96:.: 1.03:1.000:. ./.:4:29,83:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,120:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.40:1.000:. ./.:4:30,82:.: 0.18:1.000:. ./.:4:15,71:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,143:.: 1.16:1.000:. ./.:4:19,97:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.10:1.000:. ./.:4:28,80:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,105:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,138:.: 1.00:1.000:. ./.:4:25,74:.:-0.23:1.000:. ./.:4:30,75:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,83:.:-0.74:1.000:. ./.:4:20,69:.:-0.55:1.000:. ./.:4:18,80:.:-0.26:1.000:. ./.:4:17,112:.: 0.72:1.000:. ./.:4:35,116:.: 1.41:1.000:. ./.:4:29,80:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,124:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,128:.: 0.69:1.000:. ./.:4:30,107:.: 0.97:1.000:. ./.:4:27,112:.: 1.03:1.000:. ./.:4:29,93:.: 0.50:0.956:. ./.:4:28,121:.: 1.35:0.998:. ./.:4:0,129:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,101:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,119:.: 0.40:1.000:. -chr8.1 43208649 chr8.1_043208649 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:204,69:.: 0.45:1.000:. ./.:4:171,48:.:-0.47:1.000:. ./.:4:157,63:.:-0.45:1.000:. ./.:4:181,60:.:-0.10:1.000:. ./.:4:322,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:135,38:.:-1.25:1.000:. ./.:4:180,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:187,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:69,0:.:-3.02:1.000:. ./.:4:78,23:.:-2.48:1.000:. ./.:4:259,68:.: 1.37:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:229,1:.:-0.28:1.000:. ./.:4:143,69:.:-0.59:1.000:. ./.:4:174,58:.:-0.25:0.999:. ./.:4:133,71:.:-0.73:1.000:. ./.:4:296,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:227,68:.: 0.82:1.000:. ./.:4:60,13:.:-2.96:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:22,8:.:-3.69:1.000:. ./.:4:225,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:135,49:.:-1.07:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:223,96:.: 1.23:1.000:. ./.:4:166,42:.:-0.66:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:7,8:.:-3.94:1.000:. ./.:4:56,23:.:-2.85:1.000:. ./.:3:23,0:.:-3.81:0.999:. ./.:4:212,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:196,63:.: 0.21:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:190,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:197,88:.: 0.65:1.000:. ./.:4:208,71:.: 0.55:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:209,75:.: 0.64:1.000:. ./.:5:359,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:178,44:.:-0.42:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:247,1:.: 0.02:1.000:. ./.:4:221,84:.: 0.99:1.000:. ./.:4:160,56:.:-0.52:1.000:. ./.:4:229,58:.: 0.69:1.000:. ./.:4:184,78:.: 0.26:1.000:. ./.:4:205,67:.: 0.43:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.23:1.000:. ./.:6:215,46:.: 0.24:1.000:. ./.:4:209,61:.: 0.40:1.000:. ./.:4:179,69:.: 0.02:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:230,69:.: 0.89:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:216,77:.: 0.79:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:195,90:.: 0.65:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.40:0.887:. ./.:4:96,130:.:-0.35:1.000:. ./.:4:232,76:.: 1.04:1.000:. ./.:4:188,40:.:-0.32:0.999:. ./.:4:267,92:.: 1.91:1.000:. ./.:4:195,76:.: 0.41:1.000:. ./.:4:201,72:.: 0.45:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:247,81:.: 1.38:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.24:0.937:. ./.:4:239,92:.: 1.44:1.000:. ./.:4:260,97:.: 1.88:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:323,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:222,77:.: 0.89:1.000:. ./.:4:172,57:.:-0.30:1.000:. ./.:4:204,67:.: 0.41:1.000:. ./.:4:215,58:.: 0.45:1.000:. ./.:4:254,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:174,66:.:-0.11:0.999:. ./.:4:183,68:.: 0.07:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:126,49:.:-1.22:1.000:. ./.:4:315,74:.: 2.42:1.000:. ./.:4:200,94:.: 0.81:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:194,60:.: 0.12:1.000:. ./.:4:230,85:.: 1.16:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:149,56:.:-0.71:1.000:. ./.:4:178,79:.: 0.18:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:225,82:.: 1.03:0.994:. ./.:4:226,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:199,65:.: 0.30:1.000:. ./.:4:185,69:.: 0.12:1.000:. ./.:4:183,69:.: 0.09:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.38:0.993:. ./.:4:202,64:.: 0.33:1.000:. ./.:4:214,75:.: 0.72:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:234,73:.: 1.03:0.999:. ./.:4:324,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:191,51:.:-0.08:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:207,85:.: 0.77:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:220,62:.: 0.60:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:175,82:.: 0.18:1.000:. ./.:4:271,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:224,75:.: 0.89:1.000:. ./.:4:143,44:.:-1.02:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:202,73:.: 0.48:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:167,43:.:-0.62:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.36:0.998:. ./.:4:181,74:.: 0.14:1.000:. ./.:4:180,72:.: 0.09:1.000:. ./.:4:219,74:.: 0.79:1.000:. ./.:4:208,62:.: 0.40:1.000:. ./.:4:172,66:.:-0.15:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:284,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:206,85:.: 0.75:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:183,54:.:-0.16:1.000:. ./.:4:171,54:.:-0.37:1.000:. ./.:4:232,76:.: 1.04:1.000:. ./.:4:237,79:.: 1.18:1.000:. ./.:4:178,63:.:-0.10:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:232,62:.: 0.81:1.000:. ./.:4:208,51:.: 0.21:1.000:. ./.:4:169,56:.:-0.37:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:58,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:203,67:.: 0.40:1.000:. ./.:4:208,73:.: 0.58:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:180,65:.:-0.03:1.000:. ./.:4:179,48:.:-0.33:1.000:. ./.:4:137,43:.:-1.13:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:166,62:.:-0.32:1.000:. ./.:4:179,57:.:-0.18:1.000:. ./.:4:162,47:.:-0.64:1.000:. ./.:4:152,67:.:-0.47:1.000:. ./.:4:207,76:.: 0.62:1.000:. ./.:4:146,63:.:-0.64:1.000:. ./.:4:185,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:182,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:144,45:.:-0.98:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:160,62:.:-0.42:1.000:. ./.:4:168,58:.:-0.35:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:161,65:.:-0.35:1.000:. ./.:4:203,9:.:-0.59:1.000:. ./.:4:162,71:.:-0.23:0.956:. ./.:4:301,2:.: 0.96:0.998:. ./.:4:254,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:149,45:.:-0.90:1.000:. ./.:4:178,64:.:-0.08:1.000:. -chr8.1 43439378 chr8.1_043439378 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:55,32:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,24:.:-0.85:1.000:. ./.:4:54,35:.:-0.05:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:65,75:.: 1.71:1.000:. ./.:4:81,71:.: 2.12:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:69,60:.: 1.33:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.75:1.000:. ./.:4:14,4:.:-2.51:1.000:. ./.:4:70,23:.: 0.08:1.000:. ./.:4:33,70:.: 0.43:1.000:. ./.:4:98,25:.: 1.12:1.000:. ./.:4:56,60:.: 0.88:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:0.999:. ./.:4:34,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:69,70:.: 1.67:1.000:. ./.:4:37,65:.: 0.39:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.92:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:53,61:.: 0.81:1.000:. ./.:4:4,2:.:-2.92:1.000:. ./.:4:84,35:.: 0.98:1.000:. ./.:4:57,31:.:-0.09:1.000:. ./.:4:84,23:.: 0.57:1.000:. ./.:4:106,2:.: 0.60:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.30:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:79,18:.: 0.22:1.000:. ./.:4:7,2:.:-2.82:1.000:. ./.:4:14,10:.:-2.30:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.99:0.999:. ./.:4:89,26:.: 0.84:1.000:. ./.:4:61,34:.: 0.15:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:49,48:.: 0.22:1.000:. ./.:4:59,21:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:182,0:.: 3.16:1.000:. ./.:4:66,26:.: 0.05:1.000:. ./.:4:44,52:.: 0.19:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.26:1.000:. ./.:5:89,63:.: 2.12:1.000:. ./.:4:17,9:.:-2.23:1.000:. ./.:4:89,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:47,49:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,42:.:-0.16:1.000:. ./.:4:117,38:.: 2.23:1.000:. ./.:4:46,45:.: 0.01:1.000:. ./.:4:85,32:.: 0.91:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:62,27:.:-0.05:1.000:. ./.:4:56,31:.:-0.12:1.000:. ./.:4:76,29:.: 0.50:1.000:. ./.:6:65,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:34,62:.: 0.19:1.000:. ./.:4:90,27:.: 0.91:1.000:. ./.:4:53,29:.:-0.30:1.000:. ./.:4:67,55:.: 1.09:1.000:. ./.:4:29,53:.:-0.30:1.000:. ./.:4:54,18:.:-0.64:1.000:. ./.:4:57,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,36:.: 0.84:0.887:. ./.:4:63,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:67,35:.: 0.39:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:101,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:48,23:.:-0.68:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:82,29:.: 0.71:1.000:. ./.:4:52,55:.: 0.57:1.000:. ./.:4:49,31:.:-0.37:1.000:. ./.:4:72,35:.: 0.57:1.000:. ./.:4:60,18:.:-0.43:0.937:. ./.:4:84,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:64,27:.: 0.01:1.000:. ./.:4:46,64:.: 0.67:1.000:. ./.:4:79,29:.: 0.60:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:23,41:.:-0.92:1.000:. ./.:4:14,51:.:-0.88:1.000:. ./.:4:25,45:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,58:.: 0.98:1.000:. ./.:4:39,22:.:-1.02:0.999:. ./.:4:62,30:.: 0.05:1.000:. ./.:4:54,61:.: 0.84:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:48,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:62,14:.:-0.50:1.000:. ./.:4:37,28:.:-0.88:1.000:. ./.:4:51,30:.:-0.33:1.000:. ./.:4:83,25:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,17:.:-1.78:1.000:. ./.:4:27,56:.:-0.26:1.000:. ./.:4:58,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.22:0.994:. ./.:4:55,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:24,53:.:-0.47:1.000:. ./.:4:25,55:.:-0.37:1.000:. ./.:4:73,28:.: 0.36:1.000:. ./.:4:79,51:.: 1.36:0.993:. ./.:4:85,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:97,31:.: 1.29:1.000:. ./.:4:41,32:.:-0.61:0.999:. ./.:4:83,34:.: 0.91:1.000:. ./.:4:19,46:.:-0.88:1.000:. ./.:4:58,40:.: 0.26:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,23:.: 0.26:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.43:1.000:. ./.:4:52,37:.:-0.05:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:44,42:.:-0.16:1.000:. ./.:4:48,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:59,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.54:1.000:. ./.:4:52,26:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,36:.:-0.61:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:56,24:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:63,15:.:-0.43:0.998:. ./.:4:54,24:.:-0.43:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:63,32:.: 0.15:1.000:. ./.:4:71,19:.:-0.02:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:59,47:.: 0.53:1.000:. ./.:4:46,43:.:-0.05:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,38:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,25:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,17:.:-1.26:1.000:. ./.:4:30,80:.: 0.67:1.000:. ./.:4:157,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:92,25:.: 0.91:1.000:. ./.:4:41,63:.: 0.46:1.000:. ./.:4:19,59:.:-0.43:1.000:. ./.:4:65,29:.: 0.12:1.000:. ./.:4:100,30:.: 1.36:1.000:. ./.:4:1,8:.:-2.82:1.000:. ./.:4:54,51:.: 0.50:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:57,29:.:-0.16:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:87,35:.: 1.09:1.000:. ./.:4:57,55:.: 0.74:1.000:. ./.:4:72,30:.: 0.39:1.000:. ./.:4:117,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:59,59:.: 0.95:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:39,25:.:-0.92:1.000:. ./.:4:60,28:.:-0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,47:.: 0.22:1.000:. ./.:4:42,24:.:-0.85:1.000:. ./.:4:71,69:.: 1.71:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:52,17:.:-0.75:1.000:. ./.:4:49,52:.: 0.36:1.000:. ./.:4:107,32:.: 1.67:1.000:. ./.:4:67,64:.: 1.40:1.000:. ./.:4:69,32:.: 0.36:1.000:. ./.:4:60,25:.:-0.19:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.29:0.956:. ./.:4:145,0:.: 1.88:0.998:. ./.:4:126,36:.: 2.47:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.54:1.000:. ./.:4:62,31:.: 0.08:1.000:. -chr8.1 43596168 chr8.1_043596168 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:110,1:.: 0.74:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:144,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:150,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:32,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.28:1.000:. ./.:3:40,0:.:-1.85:0.999:. ./.:4:71,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:5:159,1:.: 2.52:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:140,1:.: 1.83:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.79:1.000:. ./.:6:83,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.43:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.72:0.887:. ./.:4:120,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:69,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:147,1:.: 2.09:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:46,0:.:-1.63:0.937:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:98,1:.: 0.30:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:127,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.65:0.994:. ./.:4:45,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.36:0.993:. ./.:4:119,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:156,0:.: 2.38:0.999:. ./.:4:92,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:132,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:72,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:127,1:.: 1.36:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.34:0.998:. ./.:4:115,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:113,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:126,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.14:0.956:. ./.:4:101,0:.: 0.37:0.998:. ./.:4:101,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.23:1.000:. -chr8.1 44326385 chr8.1_044326385 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:48,0:.: 0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:27,0:.:-1.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.: 0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.57:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:21,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:57,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:53,0:.: 0.70:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:6:20,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.: 0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:43,0:.: 0.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.03:0.994:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.: 1.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:54,0:.: 0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.36:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-2.73:0.998:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:30,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:69,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:68,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.16:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.43:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,1:.: 1.49:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:52,0:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:57,0:.: 0.96:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:56,0:.: 0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:47,0:.: 0.30:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr8.1 44414082 chr8.1_044414082 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:38,6:.: 0.27:1.000:. ./.:4:23,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:28,5:.:-0.51:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:32,5:.:-0.23:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.15:1.000:. ./.:4:43,2:.: 0.34:1.000:. ./.:4:15,5:.:-1.43:1.000:. ./.:4:11,6:.:-1.65:1.000:. ./.:4:23,1:.:-1.15:1.000:. ./.:4:33,9:.: 0.12:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:21,7:.:-0.87:1.000:. ./.:4:23,9:.:-0.58:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:49,5:.: 0.97:0.999:. ./.:4:47,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:27,13:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:25,3:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,18:.: 0.69:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:4,5:.:-2.21:1.000:. ./.:4:57,4:.: 1.47:1.000:. ./.:4:19,2:.:-1.36:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:50,6:.: 1.12:1.000:. ./.:4:43,8:.: 0.76:1.000:. ./.:4:34,20:.: 0.97:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.50:1.000:. ./.:4:20,2:.:-1.29:1.000:. ./.:3:0,1:.:-2.78:0.999:. ./.:4:21,9:.:-0.73:1.000:. ./.:4:58,5:.: 1.61:1.000:. ./.:4:31,9:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:31,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:57,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:40,13:.: 0.90:1.000:. ./.:4:23,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:40,9:.: 0.62:1.000:. ./.:5:45,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,1:.:-2.78:1.000:. ./.:4:33,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:48,6:.: 0.97:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:43,10:.: 0.90:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:50,3:.: 0.90:1.000:. ./.:4:37,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,9:.: 1.54:1.000:. ./.:4:37,4:.: 0.05:1.000:. ./.:4:50,5:.: 1.04:1.000:. ./.:4:40,6:.: 0.41:1.000:. ./.:6:25,2:.:-0.94:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:62,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:50,5:.: 1.04:1.000:. ./.:4:37,7:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:18,4:.:-1.29:1.000:. ./.:4:45,5:.: 0.69:1.000:. ./.:4:32,14:.: 0.41:0.887:. ./.:4:38,5:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.: 3.38:1.000:. ./.:4:36,2:.:-0.16:0.999:. ./.:4:40,23:.: 1.61:1.000:. ./.:4:29,7:.:-0.30:1.000:. ./.:4:34,5:.:-0.09:1.000:. ./.:4:22,11:.:-0.51:1.000:. ./.:4:37,10:.: 0.48:1.000:. ./.:4:35,5:.:-0.02:1.000:. ./.:4:66,3:.: 2.04:1.000:. ./.:4:42,16:.: 1.26:1.000:. ./.:4:16,10:.:-1.01:0.937:. ./.:4:47,14:.: 1.47:1.000:. ./.:4:35,3:.:-0.16:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:64,1:.: 1.75:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:24,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:46,1:.: 0.48:1.000:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:30,4:.:-0.44:1.000:. ./.:4:31,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:42,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:65,5:.: 2.11:1.000:. ./.:4:27,7:.:-0.44:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:28,6:.:-0.44:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:43,4:.: 0.48:1.000:. ./.:4:29,4:.:-0.51:1.000:. ./.:4:58,0:.: 1.26:0.994:. ./.:4:25,5:.:-0.73:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.05:0.993:. ./.:4:55,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:36,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:34,10:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,3:.: 0.62:0.999:. ./.:4:36,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:41,3:.: 0.27:1.000:. ./.:4:29,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:36,3:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,8:.: 0.34:1.000:. ./.:4:69,2:.: 2.18:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:58,8:.: 1.82:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.87:1.000:. ./.:4:54,7:.: 1.47:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:24,3:.:-0.94:1.000:. ./.:4:52,11:.: 1.61:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:14,5:.:-1.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:20,9:.:-0.80:1.000:. ./.:4:36,4:.:-0.02:1.000:. ./.:4:29,6:.:-0.37:0.998:. ./.:4:53,2:.: 1.04:1.000:. ./.:4:48,3:.: 0.76:1.000:. ./.:4:31,4:.:-0.37:1.000:. ./.:4:45,7:.: 0.83:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,1:.:-1.72:1.000:. ./.:4:26,6:.:-0.58:1.000:. ./.:4:44,6:.: 0.69:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:30,2:.:-0.58:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:55,6:.: 1.47:1.000:. ./.:4:50,7:.: 1.19:1.000:. ./.:4:45,9:.: 0.97:1.000:. ./.:4:28,7:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,9:.: 1.96:1.000:. ./.:4:38,2:.:-0.02:1.000:. ./.:4:38,4:.: 0.12:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:49,8:.: 1.19:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:33,15:.: 0.55:1.000:. ./.:4:23,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.50:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:26,9:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,4:.:-1.01:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:42,7:.: 0.62:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:28,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:16,5:.:-1.36:1.000:. ./.:4:17,7:.:-1.15:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:32,6:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:44,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:48,6:.: 0.97:1.000:. ./.:4:18,10:.:-0.87:1.000:. ./.:4:29,10:.:-0.09:1.000:. ./.:4:41,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:42,9:.: 0.76:1.000:. ./.:4:20,4:.:-1.15:1.000:. ./.:4:38,6:.: 0.27:0.956:. ./.:4:19,6:.:-1.08:0.998:. ./.:4:27,2:.:-0.80:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:33,6:.:-0.09:1.000:. -chr8.1 44595490 chr8.1_044595490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:74,39:0.39: 1.32:1.000:0.658 0/1/1/1:4:24,39:0.71:-0.52:1.000:0.989 0/0/0/1:4:59,29:0.37: 0.40:1.000:0.507 0/0/1/1:4:39,36:0.50:-0.08:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.46:-1.55:1.000:0.985 0/0/1/1:4:32,38:0.59:-0.26:1.000:0.854 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,31:0.65:-0.89:1.000:0.830 0/0/1/1:4:31,27:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,56:0.77: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,36:0.58:-0.37:1.000:0.900 0/0/1/1:4:36,34:0.51:-0.26:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,19:0.37:-0.70:1.000:0.529 0/0/0/1:4:54,15:0.28:-0.30:0.999:0.995 0/0/1/1:4:34,38:0.57:-0.19:1.000:0.949 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,54:0.54: 1.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:37,12:0.30:-1.03:1.000:0.981 0/1/1/1:4:28,39:0.65:-0.37:1.000:0.794 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,27:0.87:-1.62:1.000:0.905 0/1/1/1:4:22,33:0.68:-0.81:1.000:0.945 0/0/0/1:4:41,12:0.29:-0.89:1.000:0.992 0/0/1/1:4:27,31:0.58:-0.70:1.000:0.918 0/0/0/1:4:100,36:0.32: 2.17:1.000:0.952 0/0/1/1:4:24,30:0.61:-0.85:1.000:0.685 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:19,8:0.35:-1.84:1.000:0.821 0/1/1/1:4:10,24:0.79:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.46:-0.96:1.000:0.987 1/1/1:3:0,13:1.00:-2.36:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,36:0.68:-0.63:1.000:0.945 0/1/1/1:4:32,51:0.70: 0.22:1.000:0.984 0/0/0/1:4:75,10:0.19: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,39:0.64:-0.33:1.000:0.658 0/0/1/1:4:85,50:0.41: 2.13:1.000:0.851 0/0/0/1:4:65,21:0.30: 0.33:1.000:0.982 0/0/1/1:4:40,45:0.57: 0.29:1.000:0.943 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,45:0.62: 0.11:1.000:0.557 0/1/1/1/1:5:31,55:0.74: 0.33:1.000:0.861 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,29:0.54:-0.74:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,65:0.74: 0.88:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,44:0.41: 1.54:1.000:0.848 0/0/1/1:4:46,43:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,18:0.39:-0.96:1.000:0.730 0/1/1/1:4:31,42:0.64:-0.15:1.000:0.690 0/0/0/1:4:79,34:0.35: 1.32:1.000:0.788 0/1/1/1:4:33,45:0.64: 0.03:1.000:0.717 0/0/0/0/1/1:6:60,27:0.36: 0.36:1.000:0.878 0/0/0/1:4:97,35:0.32: 2.02:1.000:0.951 0/0/1/1:4:33,29:0.49:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,58:0.64: 0.88:1.000:0.671 0/0/1/1:4:40,48:0.60: 0.40:1.000:0.827 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,38:0.65:-0.44:1.000:0.826 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,43:0.57: 0.14:1.000:0.936 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.37:0.887:1.000 0/0/1/1:4:77,42:0.39: 1.54:1.000:0.730 0/0/0/1:4:89,34:0.33: 1.69:1.000:0.920 0/0/1/1:4:25,26:0.54:-0.96:0.999:0.986 0/1/1/1:4:24,46:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,47:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,68:0.75: 1.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,60:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,57:0.75: 0.40:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.66:0.937:1.000 0/0/1/1:4:46,44:0.51: 0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,54:0.62: 0.70:1.000:0.557 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,44:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,39:0.59:-0.19:1.000:0.865 0/0/1/1:4:38,30:0.47:-0.33:1.000:0.991 0/0/0/1:4:84,31:0.32: 1.39:1.000:0.941 0/0/1/1:4:34,43:0.61: 0.00:1.000:0.634 0/0/1/1:4:51,54:0.55: 1.03:1.000:0.981 0/0/1/1:4:85,42:0.38: 1.83:1.000:0.505 0/1/1/1:4:43,68:0.70: 1.25:1.000:0.981 0/1/1/1:4:18,27:0.68:-1.18:1.000:0.945 0/0/1/1:4:53,57:0.55: 1.21:1.000:0.975 0/1/1/1:4:33,46:0.65: 0.07:1.000:0.797 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,53:0.63: 0.58:1.000:0.589 0/0/1/1:4:102,56:0.39: 2.97:1.000:0.742 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,32:0.35: 1.10:1.000:0.802 0/0/0/1:4:101,39:0.33: 2.31:1.000:0.912 0/0/1/1:4:62,37:0.41: 0.81:1.000:0.869 0/0/0/1:4:97,25:0.27: 1.65:0.994:0.997 0/0/1/1:4:37,29:0.47:-0.41:1.000:0.990 0/1/1/1:4:32,44:0.65:-0.04:1.000:0.749 0/0/1/1:4:32,35:0.56:-0.37:1.000:0.966 0/0/0/1:4:60,19:0.30: 0.07:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.55:0.993:1.000 0/0/0/1:4:70,12:0.22: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,56:0.69: 0.55:1.000:0.973 0/0/1/1:4:39,28:0.45:-0.37:1.000:0.977 0/0/1/1:4:56,65:0.58: 1.61:0.999:0.901 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,38:0.86:-1.11:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,49:0.52: 0.81:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,52:0.37: 3.12:1.000:0.601 1/1/1/1:4:0,60:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,48:0.44: 1.50:1.000:0.964 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,46:0.38: 2.28:1.000:0.508 0/0/1/1:4:67,38:0.40: 1.03:1.000:0.799 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,38:0.55:-0.11:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,33:0.46: 0.00:1.000:0.985 0/1/1/1:4:16,44:0.81:-0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,81:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,34:0.53:-0.33:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,69:1.00:-0.30:0.998:1.000 0/0/1/1:4:39,35:0.49:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,21:0.33:-0.08:1.000:0.907 0/0/1/1:4:30,23:0.46:-0.89:1.000:0.988 0/0/1/1:4:35,40:0.58:-0.08:1.000:0.924 0/0/0/1:4:97,31:0.30: 1.87:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,93:1.00: 0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,54:0.62: 0.70:1.000:0.557 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,32:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,37:0.40: 0.99:1.000:0.753 0/1/1/1:4:44,64:0.67: 1.14:1.000:0.902 0/0/0/1:4:107,30:0.28: 2.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:35,40:0.58:-0.08:1.000:0.924 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,33:0.51:-0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,47:0.70:-0.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:67,44:0.43: 1.25:1.000:0.945 0/0/0/1:4:74,23:0.30: 0.73:1.000:0.987 0/0/1/1:4:29,33:0.58:-0.55:1.000:0.930 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,24:0.37:-0.15:1.000:0.516 0/0/0/1:4:91,18:0.24: 1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,45:0.57: 0.29:1.000:0.943 0/0/0/1:4:79,36:0.36: 1.39:1.000:0.682 0/0/1/1:4:34,33:0.52:-0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,31:0.45:-0.11:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,37:0.37: 1.43:1.000:0.622 0/0/0/1:4:13,6:0.36:-2.13:1.000:0.655 0/0/1/1:4:34,30:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/0/0/1:4:64,14:0.25: 0.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,50:0.65: 0.33:1.000:0.785 0/1/1/1:4:21,37:0.73:-0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,38:0.60:-0.30:1.000:0.761 0/1/1/1:4:21,39:0.75:-0.63:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,51:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,17:0.25: 0.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:56,25:0.36: 0.14:1.000:0.724 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,45:0.77:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,73:0.99:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,30:0.43:-0.04:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,38:0.60:-0.30:0.956:0.761 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.74:0.998:1.000 0/0/1/1:4:49,41:0.48: 0.47:1.000:0.995 0/1/1/1:4:17,33:0.76:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,57:0.73: 0.47:1.000:0.997 -chr8.1 44663805 chr8.1_044663805 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:336,103:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,173:0.52:-0.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:287,87:0.24:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,212:0.49: 0.67:1.000:0.997 0/0/1/1:4:270,229:0.47: 1.44:1.000:0.991 0/0/0/1:4:305,103:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,130:0.49:-1.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:167,195:0.54:-0.27:1.000:0.986 0/0/0/1:4:254,87:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,94:0.53:-2.53:1.000:0.994 0/0/0/1:4:90,51:0.37:-3.03:1.000:0.587 0/0/1/1:4:208,300:0.59: 1.55:1.000:0.861 0/0/0/1:4:287,98:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:210,242:0.54: 0.85:1.000:0.988 0/0/1/1:4:191,182:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:208,211:0.51: 0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:202,195:0.50: 0.17:0.999:0.997 0/0/1/1:4:201,186:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:418,130:0.24: 2.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:520,0:0.00: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,43:0.25:-2.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:112,312:0.72: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:121,342:0.73: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:289,99:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,22:0.18:-3.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:258,82:0.25:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:329,106:0.25: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:180,207:0.54: 0.04:1.000:0.988 0/0/0/1:4:403,127:0.24: 1.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,74:0.20:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,303:0.73: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:159,171:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/0/0/0:4:109,7:0.06:-3.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,97:0.42:-1.88:1.000:0.928 0/0/1:3:44,42:0.50:-3.72:0.999:0.554 0/0/1/1:4:189,200:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:274,93:0.26:-0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:195,222:0.54: 0.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:182,165:0.48:-0.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:274,104:0.28:-0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:293,107:0.27: 0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:175,147:0.46:-0.77:1.000:0.990 0/0/1/1:4:223,206:0.49: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:173,146:0.47:-0.81:1.000:0.990 0/0/1/1:4:236,237:0.51: 1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:192,183:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:338,269:0.45: 2.79:1.000:0.877 0/1/1/1:4:145,338:0.69: 1.24:1.000:0.974 0/0/1/1:4:188,139:0.43:-0.71:1.000:0.953 0/0/0/1:4:240,93:0.28:-0.63:1.000:0.994 0/0/0/1:4:281,79:0.22:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,198:0.47: 0.54:1.000:0.993 0/0/1/1:4:168,167:0.51:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/0:4:454,0:0.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:208,203:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,168:0.49:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:262,104:0.29:-0.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:255,83:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:223,77:0.26:-1.05:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:165,178:0.53:-0.51:1.000:0.854 0/0/1/1:4:248,232:0.49: 1.20:1.000:0.996 0/0/0/1:4:283,71:0.20:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,209:0.51: 0.37:1.000:0.996 0/0/0/1:4:284,89:0.24:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:332,97:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:384,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,185:0.55:-0.52:1.000:0.984 0/0/0/1:4:306,98:0.25: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:187,170:0.48:-0.33:0.887:0.996 0/0/1/1:4:178,172:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:346,97:0.22: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,117:0.45:-1.48:0.999:0.979 0/1/1/1:4:78,254:0.75:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:220,202:0.49: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:227,208:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,229:0.71:-0.81:1.000:0.990 0/0/1/1:4:202,159:0.45:-0.28:1.000:0.978 0/0/0/1:4:353,117:0.25: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:307,93:0.24: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:290,109:0.28: 0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,209:0.73:-1.27:0.937:0.997 0/0/1/1:4:215,171:0.45: 0.03:1.000:0.981 0/0/1/1:4:241,252:0.52: 1.36:1.000:0.995 0/0/1/1:4:174,162:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/1/1/1:4:97,290:0.74: 0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:246,203:0.46: 0.82:1.000:0.988 0/0/0/1:4:221,64:0.23:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:239,71:0.23:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:419,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:292,92:0.24: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,90:0.25:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:273,85:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,103:0.26: 0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,132:0.46:-1.13:1.000:0.987 0/0/1/1:4:213,185:0.47: 0.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:187,190:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:216,153:0.42:-0.18:1.000:0.921 0/0/1/1:4:167,165:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:361,110:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,323:0.72: 0.73:1.000:0.995 0/0/0/0:4:369,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:342,125:0.27: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,181:0.56:-0.76:1.000:0.962 0/0/1/1:4:199,211:0.52: 0.33:0.994:0.995 0/0/1/1:4:146,173:0.55:-0.81:1.000:0.983 0/0/0/1:4:248,91:0.27:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/1:4:269,97:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:328,96:0.23: 0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,234:0.51: 1.07:0.993:0.996 0/0/1/1:4:177,198:0.53:-0.11:1.000:0.991 0/0/1/1:4:189,190:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:235,235:0.51: 1.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:339,99:0.23: 0.68:0.999:1.000 0/1/1/1:4:111,297:0.72: 0.30:1.000:0.994 0/0/0/0:4:319,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:387,130:0.26: 1.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,177:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:165,155:0.49:-0.80:1.000:0.996 0/0/0/0:4:363,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,158:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:298,100:0.26: 0.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,180:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/0:4:405,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:365,120:0.25: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:204,195:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:249,229:0.49: 1.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,167:0.49:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:159,167:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:135,153:0.54:-1.20:1.000:0.990 0/0/1/1:4:128,139:0.53:-1.46:1.000:0.993 0/0/1/1:4:196,185:0.49:-0.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:194,183:0.49:-0.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:141,125:0.48:-1.47:0.998:0.994 0/0/0/1:4:341,102:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:197,176:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:275,273:0.51: 2.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:336,109:0.25: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:224,210:0.49: 0.63:1.000:0.996 0/0/0/1:4:305,82:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:193,174:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:345,92:0.21: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,222:0.51: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:226,183:0.46: 0.32:1.000:0.984 0/0/0/1:4:255,85:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/0:4:530,0:0.00: 1.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:296,267:0.48: 2.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:219,208:0.50: 0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:196,163:0.46:-0.31:1.000:0.989 0/0/0/0:4:426,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:370,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:443,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:201,209:0.52: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,31:0.20:-2.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,162:0.52:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/1:4:293,105:0.27: 0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:344,99:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:161,378:0.69: 1.94:1.000:0.976 0/0/1/1:4:237,233:0.50: 1.08:1.000:0.997 0/0/0/1:4:289,100:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:303,112:0.27: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:165,199:0.55:-0.25:1.000:0.979 0/0/0/1:4:199,96:0.33:-1.11:1.000:0.915 0/0/1/1:4:159,194:0.55:-0.38:1.000:0.977 0/0/0/1:4:292,89:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:213,198:0.49: 0.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,210:0.54: 0.14:1.000:0.989 0/0/1/1:4:193,166:0.47:-0.31:1.000:0.992 0/0/1/1:4:169,199:0.54:-0.20:1.000:0.984 0/0/0/1:4:301,110:0.27: 0.34:1.000:0.997 0/0/1/1:4:215,190:0.48: 0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:191,150:0.45:-0.53:1.000:0.977 0/0/0/1:4:226,85:0.28:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:305,98:0.25: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:293,80:0.22:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:321,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:226,83:0.27:-0.93:1.000:0.997 0/0/0/1:4:313,119:0.28: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:215,215:0.51: 0.58:1.000:0.996 0/0/0/0:4:391,0:0.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,199:0.53:-0.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:219,212:0.50: 0.59:0.956:0.997 0/1/1/1:4:135,388:0.73: 1.74:0.998:0.997 0/0/1/1:4:271,262:0.50: 1.86:1.000:0.997 0/0/1/1:4:187,144:0.44:-0.66:1.000:0.971 0/0/1/1:4:197,196:0.51: 0.12:1.000:0.997 -chr8.1 44832149 chr8.1_044832149 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:182,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:177,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:534,0:.: 8.48:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.35:1.000:. ./.:3:11,0:.:-1.48:0.999:. ./.:4:103,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:171,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.50:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:188,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.33:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:150,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.85:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.32:1.000:. ./.:6:36,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.18:0.887:. ./.:4:42,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:68,0:.:-0.40:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:97,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.22:0.937:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:90,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.32:0.994:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:211,0:.: 2.33:0.993:. ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:91,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.74:0.998:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:45,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.64:0.997:. ./.:4:48,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.68:0.956:. ./.:4:58,0:.:-0.59:0.998:. ./.:4:159,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.31:1.000:. -chr8.1 45064704 chr8.1_045064704 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:103,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.04:0.999:. ./.:4:147,0:.: 2.48:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:44,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:73,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.80:1.000:. ./.:5:100,0:.: 1.04:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.61:1.000:. ./.:6:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.34:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:92,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.55:0.999:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.26:0.937:. ./.:4:49,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.10:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:42,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.31:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:86,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:0.994:. ./.:4:53,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.31:0.993:. ./.:4:96,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.86:0.999:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:104,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:36,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:157,0:.: 2.79:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:76,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.29:0.997:. ./.:4:45,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:140,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.92:0.956:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.35:1.000:. -chr8.1 45150815 chr8.1_045150815 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:191,50:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:195,62:0.26: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:216,44:0.18: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:231,65:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:72,179:0.70: 0.01:1.000:0.988 0/0/0/1:4:276,102:0.28: 2.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:170,40:0.20:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,72:0.27: 0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:137,118:0.47: 0.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,37:0.45:-2.75:1.000:0.976 0/1/1/1:4:29,57:0.66:-2.73:1.000:0.853 0/0/0/1:4:284,52:0.16: 1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:66,212:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,160:0.54: 0.79:1.000:0.986 0/1/1/1:4:76,168:0.68:-0.11:1.000:0.956 0/0/0/1:4:223,80:0.28: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:234,84:0.28: 1.12:0.999:0.996 0/0/0/1:4:143,74:0.35:-0.56:1.000:0.753 0/0/1/1:4:176,169:0.50: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,153:0.47: 1.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:51,8:0.14:-3.18:1.000:0.979 0/0/0/1:4:221,70:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:238,79:0.26: 1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:141,131:0.49: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,18:0.51:-3.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:227,66:0.24: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,70:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,116:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/0/0/0:4:334,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,148:0.50: 0.85:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,71:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,141:0.56: 0.07:1.000:0.971 0/0/0/1:4:34,7:0.18:-3.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,39:0.47:-2.77:1.000:0.994 0/0/0:3:51,5:0.10:-3.23:0.999:1.000 0/0/0/1:4:234,67:0.24: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,58:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:288,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,55:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,142:0.45: 1.17:1.000:0.983 0/0/0/1:4:190,62:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:173,48:0.23:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:267,0:0.00: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,102:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,232:0.73: 1.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:201,47:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:166,183:0.53: 1.63:1.000:0.778 0/0/1/1:4:47,71:0.60:-2.20:1.000:0.774 0/0/0/1:4:169,45:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,190:0.70: 0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:117,92:0.45:-0.69:1.000:0.981 0/0/1/1:4:151,157:0.52: 0.95:1.000:0.995 0/1/1/1:4:50,155:0.74:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:197,72:0.28: 0.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:180,50:0.23:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,49:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,132:0.51: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:211,65:0.25: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:193,68:0.28: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/0/0/1:6:179,44:0.21:-0.46:1.000:0.878 0/0/0/1:4:206,53:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,155:0.68:-0.44:1.000:0.963 0/0/1/1:4:98,126:0.57:-0.44:1.000:0.956 0/0/1/1:4:117,105:0.48:-0.48:1.000:0.995 0/0/1/1:4:161,154:0.50: 1.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,106:0.49:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,107:0.50:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,97:0.46:-0.58:1.000:0.988 0/0/0/1:4:199,64:0.26: 0.20:0.887:0.999 0/0/0/0:4:236,0:0.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,145:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,41:0.30:-1.75:0.999:0.988 0/0/0/0:4:278,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,70:0.28: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:178,54:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:177,59:0.26:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,122:0.49: 0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,121:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:124,145:0.54: 0.30:1.000:0.984 0/0/0/1:4:197,71:0.28: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,47:0.24:-0.76:0.937:1.000 0/0/0/1:4:195,73:0.29: 0.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:140,143:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:40,153:0.78:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,131:0.52: 0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:188,86:0.33: 0.39:1.000:0.931 0/1/1/1:4:49,132:0.72:-1.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,105:0.54:-0.89:1.000:0.988 0/0/1/1:4:109,94:0.47:-0.79:1.000:0.993 0/0/1/1:4:110,122:0.53:-0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,82:0.48:-1.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:169,56:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:165,152:0.49: 1.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:148,50:0.27:-0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:133,151:0.54: 0.55:1.000:0.989 0/0/0/1:4:197,61:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:113,97:0.47:-0.68:1.000:0.993 0/0/0/1:4:157,54:0.27:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:186,67:0.28: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,132:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,80:0.45:-1.14:1.000:0.981 0/0/0/1:4:198,50:0.21:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,98:0.51:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,63:0.25: 0.29:0.994:0.999 0/0/1/1:4:96,126:0.57:-0.48:1.000:0.944 0/1/1/1:4:65,185:0.73:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,162:0.78:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:180,138:0.45: 1.12:1.000:0.975 0/1/1/1:4:75,196:0.71: 0.34:0.993:0.993 0/0/0/1:4:218,64:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,40:0.22:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:184,170:0.49: 1.72:1.000:0.996 0/0/0/1:4:185,60:0.26:-0.09:0.999:0.999 0/0/1/1:4:148,142:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,84:0.48:-1.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:144,122:0.47: 0.25:1.000:0.992 0/0/0/1:4:147,46:0.25:-0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:114,78:0.42:-0.97:1.000:0.906 0/0/0/1:4:199,47:0.20:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,116:0.68:-1.36:1.000:0.951 0/0/0/0:4:268,1:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,155:0.69:-0.48:1.000:0.973 0/0/0/1:4:202,62:0.25: 0.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:242,64:0.22: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,58:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/1/1:4:136,122:0.48: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:122,124:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,116:0.50:-0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,108:0.52:-0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:166,62:0.29:-0.38:1.000:0.993 0/0/0/1:4:211,79:0.29: 0.65:1.000:0.993 0/0/0/1:4:135,36:0.22:-1.32:0.998:1.000 0/0/0/1:4:178,39:0.19:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:196,56:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:188,177:0.50: 1.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:142,124:0.48: 0.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:200,50:0.21:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,98:0.45:-0.49:1.000:0.984 0/1/1/1:4:51,158:0.74:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,92:0.44:-0.59:1.000:0.966 0/1/1/1:4:50,161:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,136:0.51: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:90,95:0.52:-1.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:170,129:0.44: 0.80:1.000:0.971 0/0/0/1:4:224,86:0.29: 0.99:1.000:0.991 0/0/0/1:4:228,58:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,122:0.49: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,142:0.46: 1.05:1.000:0.989 0/0/1/1:4:154,122:0.45: 0.42:1.000:0.983 0/0/0/1:4:257,86:0.27: 1.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:231,70:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,19:0.42:-3.40:1.000:0.931 0/1/1/1:4:50,162:0.75:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:308,0:0.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:138,126:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:247,86:0.27: 1.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:233,79:0.27: 1.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,112:0.44: 0.14:1.000:0.973 0/0/0/1:4:217,67:0.25: 0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,59:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,214:0.72: 0.70:1.000:0.995 0/0/0/0:4:263,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:248,63:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,55:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,60:0.24: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:163,143:0.48: 0.92:0.997:0.994 0/0/0/1:4:177,58:0.26:-0.26:1.000:0.999 0/0/0/0:4:298,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,137:0.51: 0.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,52:0.24:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,118:0.44: 0.40:1.000:0.968 0/0/0/0:4:237,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:183,46:0.21:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,117:0.51:-0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:293,69:0.20: 1.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,201:0.71: 0.50:1.000:0.989 0/0/0/1:4:214,69:0.26: 0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,152:0.51: 0.87:1.000:0.996 0/0/0/1:4:233,69:0.24: 0.85:0.956:1.000 0/0/0/1:4:267,89:0.26: 1.75:0.998:0.998 0/0/0/1:4:260,69:0.22: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,120:0.50:-0.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:199,63:0.26: 0.19:1.000:0.999 -chr8.1 45367641 chr8.1_045367641 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:123,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.26:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.70:0.999:. ./.:4:83,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.46:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.66:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:176,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.61:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.35:1.000:. ./.:3:3,0:.:-2.69:0.999:. ./.:4:120,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.22:1.000:. ./.:5:127,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.88:0.887:. ./.:4:95,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:43,0:.:-1.54:0.999:. ./.:4:82,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.28:0.937:. ./.:4:74,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.36:0.994:. ./.:4:67,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.73:0.993:. ./.:4:112,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:177,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.56:0.999:. ./.:4:75,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.43:0.998:. ./.:4:61,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:169,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.69:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.48:0.997:. ./.:4:135,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:172,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:121,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.08:0.956:. ./.:4:157,0:.: 1.74:0.998:. ./.:4:169,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.13:1.000:. -chr8.1 45601332 chr8.1_045601332 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:100,27:.: 1.66:1.000:. ./.:4:74,18:.: 0.37:1.000:. ./.:4:83,27:.: 1.03:1.000:. ./.:4:66,39:.: 0.85:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:41,13:.:-1.04:1.000:. ./.:4:69,19:.: 0.22:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:24,0:.:-2.15:1.000:. ./.:4:22,2:.:-2.15:1.000:. ./.:4:74,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:72,26:.: 0.59:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,17:.: 0.40:1.000:. ./.:4:83,22:.: 0.85:0.999:. ./.:4:62,65:.: 1.66:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:98,32:.: 1.77:1.000:. ./.:4:13,7:.:-2.29:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:8,3:.:-2.63:1.000:. ./.:4:64,33:.: 0.55:1.000:. ./.:4:76,30:.: 0.88:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:76,15:.: 0.33:1.000:. ./.:4:73,27:.: 0.66:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:116,1:.: 1.29:1.000:. ./.:4:12,4:.:-2.44:1.000:. ./.:4:15,11:.:-2.07:1.000:. ./.:3:9,0:.:-2.70:0.999:. ./.:4:95,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,26:.: 0.59:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:81,11:.: 0.37:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:46,22:.:-0.52:1.000:. ./.:4:55,23:.:-0.15:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.85:1.000:. ./.:5:144,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:60,23:.: 0.03:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:77,26:.: 0.77:1.000:. ./.:4:65,18:.: 0.03:1.000:. ./.:4:39,20:.:-0.85:1.000:. ./.:4:53,11:.:-0.67:1.000:. ./.:4:64,24:.: 0.22:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.37:1.000:. ./.:6:35,12:.:-1.30:1.000:. ./.:4:43,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:70,25:.: 0.48:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:44,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:66,24:.: 0.29:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:89,30:.: 1.36:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.63:0.887:. ./.:4:42,44:.: 0.14:1.000:. ./.:4:64,29:.: 0.40:1.000:. ./.:4:34,12:.:-1.33:0.999:. ./.:4:54,20:.:-0.30:1.000:. ./.:4:77,15:.: 0.37:1.000:. ./.:4:72,21:.: 0.40:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:84,13:.: 0.55:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.93:0.937:. ./.:4:57,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:51,26:.:-0.19:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:55,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:43,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:49,17:.:-0.59:1.000:. ./.:4:51,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:68,21:.: 0.26:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:47,18:.:-0.63:1.000:. ./.:4:67,22:.: 0.26:1.000:. ./.:4:63,16:.:-0.11:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:55,14:.:-0.48:1.000:. ./.:4:50,21:.:-0.41:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:27,11:.:-1.63:1.000:. ./.:4:61,30:.: 0.33:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:43,34:.:-0.19:0.994:. ./.:4:56,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:64,27:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,12:.:-1.22:1.000:. ./.:4:82,17:.: 0.62:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.40:0.993:. ./.:4:65,25:.: 0.29:1.000:. ./.:4:61,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:52,27:.:-0.11:0.999:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:18,7:.:-2.11:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:62,16:.:-0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:57,27:.: 0.07:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:50,27:.:-0.19:1.000:. ./.:4:94,30:.: 1.55:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:55,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:92,25:.: 1.29:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.22:0.998:. ./.:4:55,9:.:-0.67:1.000:. ./.:4:50,16:.:-0.59:1.000:. ./.:4:81,24:.: 0.85:1.000:. ./.:4:66,26:.: 0.37:1.000:. ./.:4:46,18:.:-0.67:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:40,15:.:-1.00:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:61,18:.:-0.11:1.000:. ./.:4:32,10:.:-1.48:1.000:. ./.:4:105,35:.: 2.14:1.000:. ./.:4:70,23:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,20:.: 0.59:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:91,17:.: 0.96:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:106,42:.: 2.43:1.000:. ./.:4:96,36:.: 1.84:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:83,19:.: 0.74:1.000:. ./.:4:83,26:.: 0.99:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:67,28:.: 0.48:1.000:. ./.:4:71,24:.: 0.48:1.000:. ./.:4:79,28:.: 0.92:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:71,31:.: 0.74:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.89:1.000:. ./.:4:82,16:.: 0.59:1.000:. ./.:4:66,27:.: 0.40:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.48:0.997:. ./.:4:56,16:.:-0.37:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:55,24:.:-0.11:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:82,27:.: 0.99:1.000:. ./.:4:46,15:.:-0.78:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:129,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:77,30:.: 0.92:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.14:0.956:. ./.:4:116,0:.: 1.25:0.998:. ./.:4:136,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:63,23:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,22:.: 0.22:1.000:. -chr8.1 45881467 chr8.1_045881467 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:87,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:63,25:.: 0.19:1.000:. ./.:4:81,26:.: 1.00:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:34,9:.:-1.73:1.000:. ./.:4:57,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:13,6:.:-2.75:1.000:. ./.:4:2,2:.:-3.39:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:74,15:.: 0.23:1.000:. ./.:4:69,28:.: 0.57:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.75:1.000:. ./.:4:58,17:.:-0.36:1.000:. ./.:4:50,27:.:-0.28:0.999:. ./.:4:78,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:63,19:.:-0.07:1.000:. ./.:4:78,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,6:.:-3.30:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.28:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:60,13:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:53,19:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.09:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.83:1.000:. ./.:3:1,0:.:-3.52:0.999:. ./.:4:71,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:73,40:.: 1.26:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:52,20:.:-0.49:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:73,11:.: 0.02:1.000:. ./.:4:66,41:.: 1.00:1.000:. ./.:4:60,22:.:-0.07:1.000:. ./.:5:88,29:.: 1.43:1.000:. ./.:4:10,5:.:-2.92:1.000:. ./.:4:58,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:69,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:90,26:.: 1.38:1.000:. ./.:4:62,30:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,20:.:-0.15:1.000:. ./.:4:56,25:.:-0.11:1.000:. ./.:4:60,36:.: 0.53:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.45:1.000:. ./.:6:65,22:.: 0.15:1.000:. ./.:4:67,33:.: 0.70:1.000:. ./.:4:63,22:.: 0.06:1.000:. ./.:4:94,40:.: 2.15:1.000:. ./.:4:75,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:68,22:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,20:.: 0.66:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.19:0.887:. ./.:4:66,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:73,23:.: 0.53:1.000:. ./.:4:77,13:.: 0.28:0.999:. ./.:4:89,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:66,16:.:-0.07:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:56,33:.: 0.23:1.000:. ./.:4:93,31:.: 1.72:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:76,27:.: 0.83:1.000:. ./.:4:122,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.66:0.937:. ./.:4:75,22:.: 0.57:1.000:. ./.:4:100,35:.: 2.19:1.000:. ./.:4:70,17:.: 0.15:1.000:. ./.:4:62,19:.:-0.11:1.000:. ./.:4:97,28:.: 1.77:1.000:. ./.:4:49,19:.:-0.66:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:79,1:.:-0.15:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:41,14:.:-1.22:1.000:. ./.:4:75,30:.: 0.91:1.000:. ./.:4:82,19:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,21:.: 0.06:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:80,31:.: 1.17:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:53,15:.:-0.66:1.000:. ./.:4:85,28:.: 1.26:0.994:. ./.:4:60,22:.:-0.07:1.000:. ./.:4:66,22:.: 0.19:1.000:. ./.:4:66,23:.: 0.23:1.000:. ./.:4:51,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:78,36:.: 1.30:0.993:. ./.:4:71,25:.: 0.53:1.000:. ./.:4:43,24:.:-0.70:1.000:. ./.:4:72,28:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,22:.: 0.83:0.999:. ./.:4:85,30:.: 1.34:1.000:. ./.:4:73,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:68,31:.: 0.66:1.000:. ./.:4:62,25:.: 0.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:70,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:61,20:.:-0.11:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:80,31:.: 1.17:1.000:. ./.:4:88,25:.: 1.26:1.000:. ./.:4:112,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:74,15:.: 0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,19:.:-0.24:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.24:0.998:. ./.:4:89,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.53:1.000:. ./.:4:68,37:.: 0.91:1.000:. ./.:4:64,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:59,27:.: 0.11:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:71,14:.: 0.06:1.000:. ./.:4:72,22:.: 0.45:1.000:. ./.:4:82,23:.: 0.91:1.000:. ./.:4:53,21:.:-0.41:1.000:. ./.:4:44,23:.:-0.70:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:98,27:.: 1.77:1.000:. ./.:4:72,19:.: 0.32:1.000:. ./.:4:57,17:.:-0.41:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:44,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:39,14:.:-1.30:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,27:.: 1.04:1.000:. ./.:4:67,17:.: 0.02:1.000:. ./.:4:77,1:.:-0.24:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:55,13:.:-0.66:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:41,14:.:-1.22:1.000:. ./.:4:75,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:48,10:.:-1.09:1.000:. ./.:4:61,13:.:-0.41:1.000:. ./.:4:51,19:.:-0.58:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.41:0.997:. ./.:4:62,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:53,16:.:-0.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,41:.: 1.43:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:58,11:.:-0.62:1.000:. ./.:4:52,21:.:-0.45:0.956:. ./.:4:65,21:.: 0.11:0.998:. ./.:4:89,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:51,10:.:-0.96:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.24:1.000:. -chr8.1 45994200 chr8.1_045994200 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:104,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:207,0:.: 3.29:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:85,1:.:-0.40:0.999:. ./.:4:197,0:.: 2.98:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.45:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.20:1.000:. ./.:3:16,0:.:-2.54:0.999:. ./.:4:124,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.91:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:129,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.31:1.000:. ./.:6:83,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.54:0.887:. ./.:4:113,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.29:0.999:. ./.:4:157,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:168,0:.: 2.10:0.937:. ./.:4:88,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.15:0.994:. ./.:4:91,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.12:0.993:. ./.:4:88,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.01:0.999:. ./.:4:137,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.34:0.998:. ./.:4:65,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:227,0:.: 3.90:0.997:. ./.:4:82,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.49:0.956:. ./.:4:129,0:.: 0.91:0.998:. ./.:4:173,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.64:1.000:. -chr8.1 46812751 chr8.1_046812751 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,159:1.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,59:0.52:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,117:0.80: 0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,96:0.50: 1.49:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,65:0.52:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:9,55:0.84:-1.96:1.000:0.994 0/1/1/1:4:27,94:0.75:-0.31:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,104:0.83:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,32:0.82:-2.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,23:0.62:-2.77:1.000:0.625 0/0/1/1:4:57,97:0.61: 0.65:1.000:0.726 0/1/1/1:4:28,84:0.72:-0.57:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,114:0.76: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,103:0.84:-0.34:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,105:0.82:-0.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,166:1.00: 1.00:0.999:1.000 0/0/1/1:4:70,79:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,141:0.72: 1.63:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-2.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,100:0.81:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,101:0.74:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,96:0.77:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.57:-3.32:1.000:0.955 0/1/1/1:4:37,115:0.73: 0.59:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,110:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,66:0.61:-0.77:1.000:0.739 1/1/1/1:4:0,168:1.00: 1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,89:0.70:-0.25:1.000:0.983 0/0/1/1:4:51,64:0.54:-0.48:1.000:0.990 0/0/1/1:4:4,6:0.58:-3.52:1.000:0.923 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-2.65:1.000:1.000 0/0/1:3:3,3:0.48:-3.64:0.999:0.785 0/1/1/1:4:34,89:0.70:-0.25:1.000:0.983 0/1/1/1:4:35,84:0.68:-0.37:1.000:0.956 0/1/1/1:4:41,105:0.69: 0.42:1.000:0.979 0/1/1/1:4:26,124:0.81: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,105:0.71: 0.30:1.000:0.993 0/1/1/1:4:40,120:0.72: 0.82:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,114:0.77: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,117:0.72: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,113:0.85:-0.05:1.000:0.983 0/0/1/1:4:83,70:0.44: 0.62:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,167:1.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:86,111:0.54: 1.89:1.000:0.843 0/1/1/1:4:7,32:0.80:-2.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,85:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,66:0.63:-0.89:1.000:0.560 0/1/1/1:4:47,101:0.66: 0.47:1.000:0.856 0/1/1/1:4:34,132:0.77: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,74:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/1/1/1:4:39,127:0.74: 1.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,80:0.70:-0.63:1.000:0.987 1/1/1/1:4:0,144:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,102:0.72: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,115:0.81: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,75:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/1/1/1/1/1:6:9,103:0.91:-0.57:1.000:0.795 1/1/1/1:4:0,141:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,79:0.71:-0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:82,93:0.51: 1.26:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,117:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,93:0.67: 0.07:1.000:0.918 0/1/1/1:4:31,112:0.76: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,103:0.80:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,92:0.72:-0.22:0.887:0.994 0/1/1/1:4:30,98:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,125:0.74: 0.88:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,76:0.81:-1.15:0.999:1.000 0/1/1/1:4:29,126:0.79: 0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,144:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,70:0.46: 0.42:1.000:0.988 0/1/1/1:4:25,102:0.78:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,114:0.75: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,79:0.46: 0.94:1.000:0.989 0/1/1/1:4:47,135:0.72: 1.46:1.000:0.994 0/1/1/1:4:42,127:0.73: 1.08:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,55:0.53:-0.92:0.937:0.993 1/1/1/1:4:0,139:1.00: 0.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,200:1.00: 1.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,89:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,106:0.78: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,144:0.72: 1.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,66:0.62:-0.86:1.000:0.523 0/1/1/1:4:27,100:0.76:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,101:0.74: 0.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,99:0.77:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,57:0.47:-0.45:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,105:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,149:0.73: 1.92:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,143:0.76: 1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,131:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,132:0.78: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,39:0.31:-0.37:1.000:0.965 0/1/1/1:4:47,116:0.69: 0.91:1.000:0.968 0/1/1/1:4:39,115:0.72: 0.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,75:0.76:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,172:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,105:0.75: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,110:0.72: 0.45:0.994:0.996 0/1/1/1:4:30,118:0.77: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,130:0.73: 1.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,98:0.73:-0.08:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,91:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.49: 0.85:0.993:0.996 0/1/1/1:4:28,114:0.78: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,119:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,144:0.74: 1.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,117:0.80: 0.33:0.999:1.000 0/1/1/1:4:35,113:0.74: 0.47:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,67:0.83:-1.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,126:0.74: 0.97:1.000:0.998 0/1/1/1:4:26,99:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,86:0.71:-0.42:1.000:0.991 0/1/1/1:4:30,112:0.76: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,65:0.54:-0.45:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,102:0.71: 0.21:1.000:0.991 0/1/1/1:4:47,121:0.69: 1.05:1.000:0.980 0/1/1/1:4:37,123:0.74: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,126:0.81: 0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,145:0.99: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,90:0.46: 1.63:1.000:0.988 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,88:0.76:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,43:0.43:-1.03:1.000:0.948 0/1/1/1:4:29,102:0.75:-0.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,110:0.78: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,72:0.81:-1.29:0.998:1.000 0/1/1/1:4:15,73:0.81:-1.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,173:1.00: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,101:0.75:-0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,116:0.67: 1.00:1.000:0.936 0/0/1/1:4:58,52:0.45:-0.63:1.000:0.984 0/1/1/1:4:32,106:0.74: 0.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,97:0.71:-0.02:1.000:0.994 0/1/1/1:4:47,119:0.69: 1.00:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,95:0.71:-0.08:1.000:0.992 0/1/1/1:4:36,142:0.77: 1.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00: 0.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,149:1.00: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,93:0.74:-0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:36,143:0.77: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,109:0.77: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,129:0.76: 0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,88:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:12,28:0.68:-2.65:1.000:0.940 0/0/1/1:4:41,38:0.46:-1.52:1.000:0.989 0/1/1/1:4:27,121:0.80: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,109:0.74: 0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,121:0.75: 0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,110:0.77: 0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,77:0.68:-0.63:1.000:0.940 0/1/1/1:4:29,115:0.77: 0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,82:0.71:-0.57:1.000:0.990 0/1/1/1:4:23,91:0.77:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,104:0.78:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,65:0.77:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,79:0.65:-0.42:1.000:0.801 0/1/1/1:4:30,94:0.73:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/0:4:119,0:0.00:-0.37:0.997:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,72:0.83:-1.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,49:0.54:-1.29:1.000:0.986 0/1/1/1:4:20,96:0.81:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,57:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,117:0.80: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,104:0.74: 0.13:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,64:0.64:-1.03:1.000:0.719 0/1/1/1:4:33,114:0.75: 0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,85:0.53: 0.68:1.000:0.993 0/1/1/1:4:28,102:0.76:-0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,83:0.64:-0.19:1.000:0.689 0/0/1/1:4:64,62:0.47:-0.16:0.956:0.993 0/1/1/1:4:37,117:0.73: 0.65:0.998:0.998 0/1/1/1:4:31,134:0.79: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,87:0.80:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,77:0.54: 0.13:1.000:0.984 -chr8.1 47161060 chr8.1_047161060 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:2,0:0.25:-1.04:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,0:0.25:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.85: 1.93:1.000:0.988 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,0:0.25: 0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,7:0.71: 1.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.67:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,9:0.85: 1.93:1.000:0.988 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 0/0/1/1:4:2,1:0.42:-0.67:1.000:0.900 0/0/0/1:4:3,0:0.25:-0.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,9:0.74: 2.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,5:0.75: 0.44:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,1:0.33: 0.44:1.000:0.906 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.58: 0.07:1.000:0.932 0/0/1/1/1:5:4,6:0.58: 1.93:1.000:0.950 0/0/1/1:4:9,8:0.49: 4.53:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.42: 0.44:1.000:0.900 0/0/1/1:4:5,4:0.47: 1.56:1.000:0.993 0/0/0/1:4:4,1:0.35: 0.07:1.000:0.792 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:1.000:0.503 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:1.000:0.503 0/0/0/1:4:2,0:0.25:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:6,2:0.38: 1.18:1.000:0.503 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 0/0/1/1:4:2,4:0.62: 0.44:1.000:0.503 0/0/0/1/1/1:6:5,3:0.44: 1.18:1.000:0.660 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,4:0.62: 0.44:1.000:0.503 0/0/1/1:4:3,4:0.55: 0.81:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,4:0.55: 0.81:1.000:0.976 0/0/1/1:4:2,3:0.58: 0.07:0.887:0.932 0/0/0/1:4:3,0:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,2:0.42: 0.44:1.000:0.900 0/1/1/1:4:2,7:0.71: 1.56:0.999:0.991 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-0.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,0:0.25: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,3:0.58: 0.07:1.000:0.932 0/0/1/1:4:3,5:0.59: 1.18:1.000:0.840 0/0/0/1:4:3,0:0.25:-0.67:0.937:0.999 0/0/0/1:4:7,1:0.31: 1.18:1.000:0.969 0/0/0/1:4:5,1:0.33: 0.44:1.000:0.906 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,5:0.59: 1.18:1.000:0.840 0/0/1/1:4:2,3:0.58: 0.07:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,7:0.65: 1.93:1.000:0.792 1/1/1/1:4:0,7:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,5:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,6:0.62: 1.56:1.000:0.503 0/0/1/1:4:4,5:0.54: 1.56:1.000:0.987 0/0/1/1:4:2,4:0.62: 0.44:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,2:0.45: 0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:1.000:0.503 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,8:0.72: 1.93:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 1/1/1/1:4:0,7:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,1:0.31: 1.18:0.994:0.969 0/0/0/1:4:4,1:0.35: 0.07:1.000:0.792 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.79: 0.81:0.993:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:0.999:0.503 0/0/1/1:4:3,4:0.55: 0.81:1.000:0.976 0/1/1/1:4:2,7:0.71: 1.56:1.000:0.991 0/0/1/1:4:4,7:0.60: 2.30:1.000:0.771 0/0/1/1:4:4,2:0.42: 0.44:1.000:0.900 0/0/1/1:4:2,1:0.42:-0.67:1.000:0.900 0/1/1/1:4:1,6:0.79: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,3:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,4:0.62: 0.44:1.000:0.503 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,2:0.42: 0.44:1.000:0.900 0/0/1/1:4:2,4:0.62: 0.44:1.000:0.503 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-0.30:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.44:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:2,11:0.77: 3.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:0.998:0.969 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,2:0.42: 0.44:1.000:0.900 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:1.000:0.503 0/0/0/1:4:2,0:0.25:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:1.000:0.503 0/0/1/1:4:4,6:0.58: 1.93:1.000:0.932 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.67:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,6:0.69: 1.18:1.000:0.969 0/0/1/1:4:5,2:0.39: 0.81:1.000:0.723 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:3,4:0.55: 0.81:1.000:0.976 0/0/1/1:4:2,3:0.58: 0.07:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,6:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.42:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,5:0.66: 0.81:1.000:0.873 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 1/1/1/1:4:0,8:1.00: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:2,1:0.42:-0.67:1.000:0.900 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:1.000:0.503 0/0/0/1:4:2,0:0.25:-1.04:0.997:0.999 0/1/1/1:4:1,5:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:1,0:0.25:-1.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,4:0.72: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:1,2:0.62:-0.67:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,5:1.00: 0.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 0/0/1/1:4:2,3:0.58: 0.07:1.000:0.932 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:1.000:0.969 0/1/1/1:4:1,3:0.69:-0.30:0.956:0.969 0/0/1/1:4:3,1:0.38:-0.30:0.998:0.503 0/1/1/1:4:1,6:0.79: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,0:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,0:0.25:-0.67:1.000:0.999 -chr8.1 47333767 chr8.1_047333767 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:304,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:147,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:408,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:52,0:.:-2.42:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.85:1.000:. ./.:3:41,0:.:-2.56:0.999:. ./.:4:207,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:319,1:.: 0.87:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.34:1.000:. ./.:5:408,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:73,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:425,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:241,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.88:1.000:. ./.:6:238,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.95:0.887:. ./.:4:181,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:175,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:403,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.94:0.937:. ./.:4:320,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:359,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:360,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:334,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:269,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:402,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:159,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:279,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:489,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:371,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.85:0.994:. ./.:4:235,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.58:0.993:. ./.:4:273,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.56:0.999:. ./.:4:292,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:419,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:449,0:.: 2.45:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:366,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:303,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:167,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.12:0.998:. ./.:4:252,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:385,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:250,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:365,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:355,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:274,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:240,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.67:0.997:. ./.:4:246,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:174,2:.:-0.90:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:300,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:234,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:274,2:.: 0.33:1.000:. ./.:4:257,2:.: 0.12:1.000:. ./.:4:152,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.30:0.956:. ./.:4:223,0:.:-0.32:0.998:. ./.:4:324,2:.: 0.94:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.74:1.000:. -chr8.1 47505955 chr8.1_047505955 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1185,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:847,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:882,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1142,3:.: 0.89:1.000:. ./.:4:1345,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:1071,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:684,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:1038,3:.: 0.39:1.000:. ./.:4:842,6:.:-0.54:1.000:. ./.:4:534,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:522,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:1175,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:1024,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:1052,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:826,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1113,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:1024,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:1002,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1122,11:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1207,10:.: 1.24:1.000:. ./.:4:532,0:.:-2.06:1.000:. ./.:4:1014,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1107,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:816,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:372,3:.:-2.81:1.000:. ./.:4:876,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:952,5:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1063,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1252,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:858,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:862,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:795,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:325,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:644,0:.:-1.52:1.000:. ./.:3:203,1:.:-3.64:0.999:. ./.:4:801,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:1005,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:995,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:865,3:.:-0.44:1.000:. ./.:4:720,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:1071,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1066,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:971,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:757,2:.:-0.97:1.000:. ./.:4:1142,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:1023,3:.: 0.32:1.000:. ./.:5:1401,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:304,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:900,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:661,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:795,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1113,3:.: 0.75:1.000:. ./.:4:885,1:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1221,9:.: 1.30:1.000:. ./.:4:1013,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:826,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1079,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:936,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:827,0:.:-0.64:1.000:. ./.:6:906,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1112,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:887,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1082,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:856,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:867,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:871,5:.:-0.40:1.000:. ./.:4:712,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:1077,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:807,0:.:-0.73:0.887:. ./.:4:1115,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1081,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:687,0:.:-1.31:0.999:. ./.:4:744,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:1106,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1031,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:800,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:856,4:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1074,15:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1153,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:985,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:771,0:.:-0.91:0.937:. ./.:4:1167,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:1243,5:.: 1.39:1.000:. ./.:4:943,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:742,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:1340,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:778,4:.:-0.85:1.000:. ./.:4:943,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:977,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:856,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:690,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:1074,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1023,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:812,3:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1083,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:934,3:.:-0.11:1.000:. ./.:4:903,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:910,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1315,7:.: 1.74:1.000:. ./.:4:980,2:.: 0.11:1.000:. ./.:4:835,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:974,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:802,2:.:-0.75:1.000:. ./.:4:1260,0:.: 1.45:0.994:. ./.:4:808,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:955,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:869,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:1059,5:.: 0.50:1.000:. ./.:4:1359,0:.: 1.92:0.993:. ./.:4:1225,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1118,6:.: 0.79:1.000:. ./.:4:1088,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:1085,0:.: 0.60:0.999:. ./.:4:955,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:695,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:1079,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:919,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:750,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:939,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:856,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:1094,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1065,3:.: 0.52:1.000:. ./.:4:1042,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:1093,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:967,7:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1102,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:1168,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:709,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:621,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:902,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:887,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1067,3:.: 0.53:1.000:. ./.:4:541,0:.:-2.01:0.998:. ./.:4:982,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:928,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1343,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:1015,4:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1143,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:917,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:903,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1245,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:1032,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:921,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:928,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1482,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:1470,5:.: 2.48:1.000:. ./.:4:1107,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:921,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1081,5:.: 0.61:1.000:. ./.:4:888,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1077,8:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1019,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:484,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:702,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:1069,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:1012,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1255,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:1103,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:826,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:1081,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:899,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:725,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:988,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1034,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:1048,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:1062,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:1031,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:892,0:.:-0.33:0.997:. ./.:4:943,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:835,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:946,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:841,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:970,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:999,9:.: 0.23:1.000:. ./.:4:736,3:.:-1.06:1.000:. ./.:4:718,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:1007,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1217,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1026,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:860,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:1203,0:.: 1.17:0.956:. ./.:4:1230,0:.: 1.30:0.998:. ./.:4:1301,8:.: 1.68:1.000:. ./.:4:920,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:1099,0:.: 0.67:1.000:. -chr8.1 47950122 chr8.1_047950122 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:59,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:38,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:0.999:. ./.:4:68,0:.: 3.30:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.62:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.02:0.999:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.12:1.000:. ./.:5:34,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.99:1.000:. ./.:6:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.67:0.887:. ./.:4:48,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.15:0.999:. ./.:4:57,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:26,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.76:0.937:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.51:0.994:. ./.:4:23,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:41,1:.: 1.24:0.993:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:68,0:.: 3.30:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.15:0.999:. ./.:4:23,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:27,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:39,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.55:0.998:. ./.:4:10,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:52,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 1.95:0.997:. ./.:4:21,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:44,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:54,0:.: 2.19:0.956:. ./.:4:58,0:.: 2.51:0.998:. ./.:4:45,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.79:1.000:. -chr8.1 48085220 chr8.1_048085220 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:145,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:81,44:.:-0.20:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:101,77:.: 1.18:1.000:. ./.:4:111,53:.: 0.82:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:68,45:.:-0.51:1.000:. ./.:4:63,70:.: 0.01:1.000:. ./.:4:42,38:.:-1.37:1.000:. ./.:4:122,44:.: 0.87:1.000:. ./.:4:74,39:.:-0.51:1.000:. ./.:4:60,49:.:-0.61:1.000:. ./.:4:64,69:.: 0.01:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.72:0.999:. ./.:4:66,101:.: 0.90:1.000:. ./.:4:139,72:.: 2.04:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:81,40:.:-0.30:1.000:. ./.:4:47,34:.:-1.34:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:49,42:.:-1.08:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:33,25:.:-1.94:1.000:. ./.:4:37,26:.:-1.81:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.72:1.000:. ./.:3:97,0:.:-0.93:0.999:. ./.:4:129,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:83,1:.:-1.27:1.000:. ./.:4:62,41:.:-0.77:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:60,43:.:-0.77:1.000:. ./.:4:99,63:.: 0.77:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.01:1.000:. ./.:5:160,67:.: 2.46:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:53,33:.:-1.21:1.000:. ./.:4:44,16:.:-1.89:1.000:. ./.:4:137,42:.: 1.21:1.000:. ./.:4:68,52:.:-0.33:1.000:. ./.:4:103,53:.: 0.61:1.000:. ./.:4:157,73:.: 2.54:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:79,45:.:-0.22:1.000:. ./.:4:129,36:.: 0.85:1.000:. ./.:4:98,45:.: 0.27:1.000:. ./.:6:143,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,36:.:-0.85:1.000:. ./.:4:92,48:.: 0.19:1.000:. ./.:4:62,45:.:-0.67:1.000:. ./.:4:135,61:.: 1.65:1.000:. ./.:4:95,41:.: 0.09:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:75,40:.:-0.46:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.06:0.887:. ./.:4:147,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:94,45:.: 0.17:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.68:0.999:. ./.:4:92,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:110,46:.: 0.61:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:56,52:.:-0.64:1.000:. ./.:4:194,70:.: 3.43:1.000:. ./.:4:82,50:.:-0.01:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:101,44:.: 0.32:0.937:. ./.:4:135,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:78,56:.: 0.04:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:59,42:.:-0.82:1.000:. ./.:4:136,45:.: 1.26:1.000:. ./.:4:132,66:.: 1.71:1.000:. ./.:4:123,52:.: 1.11:1.000:. ./.:4:106,44:.: 0.45:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:149,52:.: 1.78:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:86,54:.: 0.19:1.000:. ./.:4:103,35:.: 0.14:1.000:. ./.:4:239,0:.: 2.77:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:76,41:.:-0.41:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:77,37:.:-0.48:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.52:0.994:. ./.:4:79,42:.:-0.30:1.000:. ./.:4:50,54:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,34:.:-1.29:1.000:. ./.:4:85,38:.:-0.25:1.000:. ./.:4:89,61:.: 0.45:0.993:. ./.:4:112,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:129,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:86,23:.:-0.61:1.000:. ./.:4:161,62:.: 2.36:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:65,33:.:-0.90:1.000:. ./.:4:119,56:.: 1.11:1.000:. ./.:4:72,58:.:-0.07:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:105,54:.: 0.69:1.000:. ./.:4:154,53:.: 1.94:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:85,54:.: 0.17:1.000:. ./.:4:50,59:.:-0.61:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:69,57:.:-0.17:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.22:0.998:. ./.:4:158,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:73,62:.: 0.06:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:150,43:.: 1.58:1.000:. ./.:4:78,48:.:-0.17:1.000:. ./.:4:92,58:.: 0.45:1.000:. ./.:4:113,57:.: 0.98:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:79,37:.:-0.43:1.000:. ./.:4:163,69:.: 2.59:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:78,56:.: 0.04:1.000:. ./.:4:109,51:.: 0.72:1.000:. ./.:4:101,47:.: 0.40:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:109,30:.: 0.17:1.000:. ./.:4:89,37:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:72,65:.: 0.12:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:106,43:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:63,35:.:-0.90:1.000:. ./.:4:56,39:.:-0.98:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:56,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:86,133:.: 2.25:0.997:. ./.:4:139,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:55,60:.:-0.46:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:111,45:.: 0.61:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:68,38:.:-0.69:1.000:. ./.:4:98,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:76,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:97,51:.: 0.40:1.000:. ./.:4:87,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:63,51:.:-0.48:1.000:. ./.:4:77,43:.:-0.33:0.956:. ./.:4:131,0:.:-0.04:0.998:. ./.:4:222,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:120,51:.: 1.00:1.000:. -chr8.1 49032592 chr8.1_049032592 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:64,25:0.28: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,39:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,41:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,30:0.49:-0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,33:0.27: 1.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,55:0.54: 0.88:1.000:0.989 0/1/1/1:4:2,14:0.82:-2.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,58:0.72: 0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:37,14:0.27:-0.80:1.000:0.998 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.30:-1.82:1.000:0.987 0/0/1/1:4:28,19:0.39:-0.94:1.000:0.677 0/0/0/1:4:54,13:0.19:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,56:0.46: 1.57:1.000:0.988 0/0/0/1:4:85,27:0.24: 1.42:0.999:1.000 0/0/0/1:4:64,40:0.37: 1.13:1.000:0.554 0/0/0/1:4:85,31:0.26: 1.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,55:0.48: 1.31:1.000:0.995 0/0/0/1:4:22,4:0.15:-1.71:1.000:0.990 0/0/0/1:4:41,15:0.26:-0.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,36:0.50:-0.18:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,19:0.29:-0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:7,1:0.12:-2.36:1.000:0.829 0/1/1/1:4:12,53:0.76:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,16:0.28:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:59,29:0.32: 0.55:1.000:0.953 0/0/1/1:4:55,46:0.44: 1.02:1.000:0.959 0/0/0/1:4:56,16:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,38:0.65:-0.65:1.000:0.798 0/0/0/1:4:47,21:0.30:-0.18:1.000:0.984 0/1/1/1:4:1,7:0.82:-2.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:27,10:0.27:-1.31:1.000:0.998 0/0/1:3:3,3:0.48:-2.43:0.999:0.828 0/0/1/1:4:44,32:0.40: 0.11:1.000:0.824 0/1/1/1:4:16,73:0.77: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,55:0.54: 0.84:1.000:0.986 0/0/1/1:4:39,51:0.54: 0.62:1.000:0.989 0/0/0/0:4:90,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,39:0.53:-0.11:1.000:0.993 0/0/1/1:4:43,45:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,54:0.49: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:63,20:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,11:0.21:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,41:0.46: 0.44:1.000:0.988 0/0/0/0/1:5:92,20:0.18: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:7,2:0.22:-2.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,24:0.43:-0.69:1.000:0.934 0/0/0/1:4:43,13:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:73,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,31:0.27: 1.42:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,17:0.33:-0.83:1.000:0.922 0/0/1/1:4:30,34:0.51:-0.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,58:0.78:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,23:0.40:-0.65:1.000:0.803 0/0/1/1:4:33,28:0.44:-0.43:1.000:0.965 0/0/0/1:4:50,19:0.27:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:62,21:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:35,21:0.36:-0.62:1.000:0.866 0/0/0/1:4:51,13:0.20:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,14:0.20:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,27:0.27: 0.95:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,43:0.57:-0.03:1.000:0.958 0/0/0/1:4:60,11:0.15:-0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:46,51:0.50: 0.88:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,20:0.47:-1.16:1.000:0.990 0/0/1/1:4:29,33:0.51:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,26:0.57:-1.09:0.887:0.941 0/1/1/1:4:23,46:0.63:-0.14:1.000:0.543 0/0/0/1:4:48,19:0.28:-0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,32:0.68:-1.05:0.999:0.962 0/0/1/1:4:45,39:0.44: 0.40:1.000:0.973 0/0/1/1:4:60,48:0.43: 1.28:1.000:0.934 0/0/0/1:4:44,27:0.37:-0.07:1.000:0.606 0/1/1/1:4:14,45:0.72:-0.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:62,21:0.25: 0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,32:0.44:-0.14:1.000:0.972 0/0/1/1:4:64,51:0.42: 1.53:1.000:0.931 0/0/1/1:4:68,53:0.42: 1.75:1.000:0.913 0/0/0/1:4:24,13:0.34:-1.31:0.937:0.868 0/0/1/1:4:51,60:0.51: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:51,21:0.29:-0.03:1.000:0.994 0/0/0/0:4:84,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,18:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,91:0.75: 1.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,12:0.33:-1.38:1.000:0.910 0/0/0/1:4:38,23:0.36:-0.43:1.000:0.643 0/0/0/1:4:54,11:0.17:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,17:0.56:-1.60:1.000:0.974 0/0/1/1:4:36,45:0.53: 0.29:1.000:0.993 0/0/0/0:4:101,0:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:39,24:0.37:-0.36:1.000:0.598 0/0/1/1:4:46,48:0.49: 0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,37:0.48: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:58,23:0.28: 0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,57:0.71: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,35:0.46: 0.00:1.000:0.986 0/0/0/1:4:95,47:0.32: 2.51:1.000:0.950 0/0/0/1:4:22,5:0.18:-1.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:54,12:0.18:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,28:0.47:-0.58:0.994:0.992 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,26:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,24:0.31: 0.11:1.000:0.977 0/0/0/1:4:51,12:0.19:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,22:0.19: 1.57:0.993:1.000 0/0/1/1:4:40,55:0.55: 0.80:1.000:0.981 0/1/1/1:4:25,59:0.66: 0.40:1.000:0.876 0/0/0/1:4:104,30:0.22: 2.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,47:0.69:-0.32:0.999:0.974 0/0/0/1:4:69,22:0.24: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.44:-1.23:1.000:0.969 0/0/0/1:4:56,21:0.27: 0.15:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,48:0.75:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:39,16:0.28:-0.65:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,55:0.57: 0.69:1.000:0.956 0/0/0/1:4:71,24:0.25: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,61:0.50: 1.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,28:0.39:-0.14:1.000:0.693 0/0/1/1:4:27,24:0.45:-0.80:1.000:0.979 0/0/1/1:4:26,32:0.52:-0.54:1.000:0.994 0/0/1/1:4:37,63:0.60: 0.99:1.000:0.830 0/0/0/1:4:45,19:0.29:-0.32:1.000:0.992 0/0/1/1:4:26,30:0.51:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:18,21:0.51:-1.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:22,36:0.59:-0.54:1.000:0.883 0/0/0/1:4:38,10:0.21:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,30:0.54:-0.72:1.000:0.989 0/1/1/1:4:22,69:0.71: 0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,20:0.54:-1.38:0.998:0.987 0/1/1/1:4:16,36:0.65:-0.76:1.000:0.809 0/0/0/1:4:37,17:0.31:-0.69:1.000:0.978 0/0/0/1:4:89,27:0.23: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,46:0.51: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,52:0.57: 0.51:1.000:0.957 0/0/1/1:4:23,33:0.56:-0.62:1.000:0.970 0/0/0/0:4:75,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,45:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,10:0.15:-0.25:1.000:0.987 0/0/0/1:4:33,8:0.19:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,70:0.52: 2.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:66,25:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,52:0.47: 1.20:1.000:0.991 0/0/0/1:4:43,18:0.29:-0.43:1.000:0.992 0/0/1/1:4:80,69:0.44: 2.77:1.000:0.971 0/0/0/1:4:47,18:0.27:-0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,71:0.64: 1.13:1.000:0.724 0/0/1/1:4:35,39:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,5:0.19:-1.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,64:0.65: 0.69:1.000:0.833 0/0/0/1:4:66,25:0.27: 0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,61:0.49: 1.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,51:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,42:0.48: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:44,34:0.42: 0.19:1.000:0.904 0/0/0/1:4:60,23:0.27: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:54,17:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,49:0.66:-0.11:1.000:0.862 0/0/1/1:4:29,26:0.45:-0.65:1.000:0.981 0/1/1/1:4:37,84:0.65: 1.75:1.000:0.823 0/0/1/1:4:35,38:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,50:0.58: 0.33:0.997:0.927 0/0/1/1:4:22,29:0.54:-0.80:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,25:0.39:-0.43:1.000:0.732 0/0/0/1:4:19,9:0.31:-1.63:1.000:0.969 0/1/1/1:4:19,52:0.69:-0.07:1.000:0.971 0/0/0/1:4:30,8:0.21:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,45:0.65:-0.29:1.000:0.809 0/0/1/1:4:39,36:0.46: 0.08:1.000:0.986 0/0/0/1:4:33,12:0.26:-1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:73,21:0.22: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,33:0.25: 2.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,62:0.54: 1.31:1.000:0.988 0/0/0/1:4:64,17:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,26:0.45:-0.65:0.956:0.981 0/0/1/1:4:46,45:0.47: 0.66:0.998:0.993 0/0/0/1:4:43,24:0.35:-0.22:1.000:0.823 0/0/1/1:4:37,43:0.51: 0.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,44:0.49: 0.48:1.000:0.996 -chr8.1 49115377 chr8.1_049115377 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,16:0.55: 0.41:1.000:0.983 0/0/0/1:4:27,11:0.25: 1.53:1.000:0.999 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,23:0.73: 0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:11,12:0.51:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,3:0.35:-1.85:1.000:0.816 0/0/1/1:4:8,8:0.48:-0.95:1.000:0.995 0/0/0/1:4:16,4:0.18:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,6:0.44:-1.28:1.000:0.970 0/1/1/1:4:2,5:0.66:-1.96:1.000:0.884 0/0/1/1:4:15,12:0.42: 0.29:1.000:0.925 0/0/0/1:4:17,10:0.34: 0.29:1.000:0.854 0/0/0/1:4:14,8:0.33:-0.27:1.000:0.898 0/0/1/1:4:11,9:0.43:-0.50:1.000:0.944 0/0/0/1:4:13,7:0.32:-0.50:1.000:0.954 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.06:0.999:1.000 0/1/1/1:4:6,16:0.67:-0.27:1.000:0.933 0/0/0/1:4:22,13:0.34: 1.19:1.000:0.846 0/0/0/0:4:33,0:0.00: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,5:0.33:-1.17:1.000:0.929 0/0/0/1:4:12,7:0.34:-0.61:1.000:0.868 0/0/0/1:4:19,5:0.18:-0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:4,1:0.18:-2.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,9:0.33: 0.07:1.000:0.917 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,11:0.68:-1.06:1.000:0.948 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.48:-1.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:3,13:0.74:-0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,2:0.37:-2.18:1.000:0.503 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0:3:4,0:0.00:-2.30:0.999:1.000 0/0/0/1:4:14,6:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:15,7:0.29:-0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:26,6:0.16: 0.86:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,4:0.21:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,10:0.43:-0.27:1.000:0.956 0/0/0/1:4:18,7:0.25: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.32:-0.83:1.000:0.945 0/0/0/1:4:22,7:0.21: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,14:0.48: 0.41:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,26:0.65: 1.42:1.000:0.819 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:20,23:0.52: 2.09:1.000:0.655 0/0/1/1:4:2,2:0.48:-2.30:1.000:0.995 0/0/0/1:4:15,7:0.29:-0.27:1.000:0.994 0/0/1/1:4:6,9:0.57:-1.06:1.000:0.949 0/0/0/1:4:25,11:0.27: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,13:0.44: 0.41:1.000:0.974 0/0/1/1:4:9,16:0.60: 0.07:1.000:0.774 0/0/0/1:4:28,15:0.32: 2.09:1.000:0.957 0/0/1/1:4:9,10:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.41:-0.38:1.000:0.835 0/0/0/1:4:23,13:0.33: 1.31:1.000:0.912 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.16:1.000:0.987 0/0/0/0/0/1:6:18,2:0.09:-0.50:1.000:0.749 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,8:0.40:-0.61:1.000:0.768 0/1/1/1:4:9,26:0.69: 1.19:1.000:0.966 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,8:0.23: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,6:0.18: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.40: 0.18:1.000:0.788 0/0/0/1:4:21,7:0.22: 0.41:0.887:1.000 0/0/0/1:4:24,14:0.34: 1.53:1.000:0.868 0/0/1/1:4:12,19:0.58: 0.74:1.000:0.915 0/0/1/1:4:5,5:0.48:-1.62:0.999:0.995 0/0/0/1:4:25,15:0.35: 1.76:1.000:0.816 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,19:0.58: 0.74:1.000:0.915 0/0/0/1:4:14,7:0.30:-0.38:1.000:0.983 0/0/0/1:4:15,5:0.22:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,25:0.59: 1.76:1.000:0.866 0/0/0/1:4:17,8:0.29: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:19,11:0.34: 0.63:1.000:0.880 0/0/1/1:4:12,20:0.59: 0.86:0.937:0.866 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,11:0.61:-0.83:1.000:0.717 0/0/0/1:4:7,3:0.27:-1.62:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,16:0.39: 1.64:1.000:0.641 0/0/1/1:4:8,6:0.41:-1.17:1.000:0.835 0/0/0/1:4:21,6:0.19: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,14:0.35: 1.42:1.000:0.784 0/0/0/1:4:23,7:0.20: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,17:0.53: 0.74:1.000:0.993 0/0/0/1:4:20,6:0.20: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,17:0.39: 1.87:1.000:0.696 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,21:0.56: 1.31:1.000:0.973 0/0/1/1:4:22,17:0.41: 1.64:1.000:0.884 0/0/1/1:4:16,11:0.38: 0.29:1.000:0.602 0/1/1/1:4:5,26:0.77: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,14:0.31: 1.87:1.000:0.972 0/0/0/1:4:16,8:0.30:-0.05:1.000:0.983 0/0/0/1:4:12,7:0.34:-0.61:1.000:0.868 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,8:0.37:-0.50:1.000:0.503 0/0/1/1:4:17,18:0.50: 1.19:0.994:0.997 0/0/1/1:4:14,13:0.46: 0.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:12,9:0.41:-0.38:1.000:0.835 0/0/1/1:4:11,14:0.54: 0.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:15,6:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,23:0.75: 0.41:0.993:0.999 0/0/0/1:4:20,8:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:12,7:0.34:-0.61:1.000:0.868 0/0/0/1:4:21,8:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,12:0.37: 0.63:0.999:0.503 0/0/0/1:4:21,13:0.36: 1.08:1.000:0.741 0/0/0/1:4:8,5:0.36:-1.28:1.000:0.714 0/0/0/1:4:26,10:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.56:-0.27:1.000:0.964 0/0/0/1:4:13,5:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,13:0.32: 1.42:1.000:0.950 0/1/1/1:4:7,16:0.65:-0.16:1.000:0.767 0/0/0/0:4:40,0:0.00: 1.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,9:0.33: 0.07:1.000:0.917 0/0/0/1:4:35,9:0.18: 2.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,6:0.19: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,10:0.24: 1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,30:0.65: 2.09:1.000:0.783 1/1/1/1:4:0,38:1.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,9:0.32: 0.18:1.000:0.963 0/1/1/1:4:4,11:0.68:-1.06:1.000:0.948 0/0/0/1:4:21,4:0.14: 0.07:1.000:0.967 0/0/1/1:4:10,10:0.48:-0.50:1.000:0.995 0/0/0/1:4:10,3:0.20:-1.28:0.998:1.000 0/0/0/1:4:10,2:0.15:-1.40:1.000:0.982 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.58:-0.16:1.000:0.928 0/0/0/1:4:16,10:0.36: 0.18:1.000:0.714 0/0/1/1:4:17,23:0.55: 1.76:1.000:0.981 0/0/1/1:4:12,13:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,4:0.17:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,7:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.35:-0.95:1.000:0.816 0/0/0/1:4:34,7:0.15: 1.87:1.000:0.987 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.52:-1.51:1.000:0.994 0/0/0/1:4:21,11:0.31: 0.86:1.000:0.968 0/0/0/1:4:21,8:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,11:0.29: 1.08:1.000:0.991 0/0/0/1:4:17,4:0.17:-0.38:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,3:0.22:-1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,25:0.66: 1.19:1.000:0.884 0/0/0/1:4:16,9:0.33: 0.07:1.000:0.917 0/0/0/1:4:26,9:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,14:0.46: 0.52:1.000:0.990 0/0/0/1:4:21,4:0.14: 0.07:1.000:0.967 0/0/0/1:4:22,4:0.13: 0.18:1.000:0.943 0/0/0/1:4:20,8:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,5:0.21:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.45:-1.06:1.000:0.977 0/0/0/1:4:20,8:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,6:0.44:-1.28:1.000:0.970 0/0/0/1:4:12,7:0.34:-0.61:1.000:0.868 0/0/1/1:4:7,8:0.51:-1.06:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,32:1.00: 0.86:0.997:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,7:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:7,10:0.56:-0.83:1.000:0.968 0/0/1/1:4:11,11:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,16:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,4:0.12: 0.41:1.000:0.852 0/0/0/1:4:9,6:0.37:-1.06:1.000:0.503 0/0/0/1:4:21,5:0.17: 0.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:9,11:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,26:0.81: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,3:0.19:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.32:-0.83:1.000:0.945 0/1/1/1:4:6,18:0.69:-0.05:0.956:0.976 0/0/1/1:4:12,11:0.46:-0.16:0.998:0.987 0/0/0/1:4:22,9:0.26: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:9,6:0.37:-1.06:1.000:0.503 0/0/1/1:4:10,19:0.61: 0.52:1.000:0.642 -chr8.1 49303267 chr8.1_049303267 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:107,3:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,7:.:-0.46:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:17,2:.:-2.72:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:100,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.08:0.999:. ./.:4:100,9:.:-0.15:1.000:. ./.:4:212,0:.: 2.80:1.000:. ./.:4:152,10:.: 1.37:1.000:. ./.:4:56,5:.:-1.52:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:141,10:.: 1.05:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:98,14:.:-0.06:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:87,12:.:-0.43:1.000:. ./.:4:64,5:.:-1.29:1.000:. ./.:4:86,8:.:-0.58:1.000:. ./.:4:27,3:.:-2.41:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.98:1.000:. ./.:3:65,0:.:-1.41:0.999:. ./.:4:129,9:.: 0.68:1.000:. ./.:4:97,14:.:-0.09:1.000:. ./.:4:125,8:.: 0.54:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:83,16:.:-0.43:1.000:. ./.:4:66,10:.:-1.09:1.000:. ./.:4:167,10:.: 1.80:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:101,10:.:-0.09:1.000:. ./.:5:126,10:.: 0.62:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:145,8:.: 1.11:1.000:. ./.:4:156,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:133,17:.: 1.03:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:94,5:.:-0.43:1.000:. ./.:4:156,17:.: 1.68:1.000:. ./.:4:140,8:.: 0.97:1.000:. ./.:6:84,10:.:-0.58:1.000:. ./.:4:97,12:.:-0.15:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:187,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:147,7:.: 1.14:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:116,7:.: 0.25:0.887:. ./.:4:53,9:.:-1.49:1.000:. ./.:4:120,14:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.26:0.999:. ./.:4:104,10:.: 0.00:1.000:. ./.:4:95,4:.:-0.43:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.91:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.08:0.937:. ./.:4:117,12:.: 0.42:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:122,7:.: 0.42:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:91,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:209,10:.: 3.00:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:70,7:.:-1.06:1.000:. ./.:4:113,11:.: 0.28:1.000:. ./.:4:50,19:.:-1.29:1.000:. ./.:4:113,9:.: 0.22:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:151,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.52:0.994:. ./.:4:117,14:.: 0.48:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.05:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.02:0.993:. ./.:4:67,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:57,17:.:-1.15:1.000:. ./.:4:122,9:.: 0.48:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.66:0.999:. ./.:4:105,17:.: 0.22:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:202,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:54,5:.:-1.58:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:137,15:.: 1.08:1.000:. ./.:4:79,10:.:-0.72:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:80,8:.:-0.75:1.000:. ./.:4:134,20:.: 1.14:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:131,12:.: 0.83:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:84,8:.:-0.63:1.000:. ./.:4:78,18:.:-0.52:1.000:. ./.:4:101,8:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,6:.:-0.89:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:76,1:.:-1.06:0.998:. ./.:4:103,8:.:-0.09:1.000:. ./.:4:79,17:.:-0.52:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:91,9:.:-0.40:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:124,12:.: 0.62:1.000:. ./.:4:93,18:.:-0.09:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:67,5:.:-1.21:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:169,20:.: 2.14:1.000:. ./.:4:100,12:.:-0.06:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:188,8:.: 2.34:1.000:. ./.:4:171,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:111,5:.: 0.05:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:111,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,9:.:-1.15:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:89,12:.:-0.38:1.000:. ./.:4:121,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:137,7:.: 0.85:1.000:. ./.:4:84,9:.:-0.60:1.000:. ./.:4:88,12:.:-0.40:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:67,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:51,9:.:-1.55:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.03:0.997:. ./.:4:108,9:.: 0.08:1.000:. ./.:4:123,12:.: 0.60:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:59,9:.:-1.32:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:143,11:.: 1.14:1.000:. ./.:4:186,8:.: 2.28:1.000:. ./.:4:104,16:.: 0.17:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:139,5:.: 0.85:1.000:. ./.:4:89,11:.:-0.40:0.956:. ./.:4:133,0:.: 0.54:0.998:. ./.:4:139,9:.: 0.97:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:95,6:.:-0.38:1.000:. -chr8.1 49562334 chr8.1_049562334 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:480,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,192:0.51:-0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:263,115:0.31:-0.64:1.000:0.977 0/0/0/0:4:441,1:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:300,279:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:311,252:0.45: 1.13:1.000:0.983 0/0/0/1:4:247,57:0.19:-1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:337,114:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:330,109:0.25:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:182,71:0.28:-1.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:149,45:0.23:-2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:290,180:0.39: 0.24:1.000:0.662 0/0/0/1:4:298,95:0.24:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:398,138:0.26: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:329,117:0.26: 0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:326,100:0.24:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:438,0:0.00:-0.07:0.999:1.000 0/0/0/1:4:392,127:0.25: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:525,191:0.27: 2.60:1.000:0.998 0/0/0/0:4:551,1:0.00: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-2.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:298,91:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:381,112:0.23: 0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,112:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:71,13:0.16:-3.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:403,129:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:409,1:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:207,175:0.46:-0.61:1.000:0.990 0/0/0/0:4:576,2:0.00: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:372,0:0.00:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:285,112:0.28:-0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:182,139:0.44:-1.19:1.000:0.965 0/0/0/1:4:67,27:0.29:-3.37:1.000:0.992 0/0/0/0:4:213,1:0.00:-2.22:1.000:1.000 0/0/1:3:74,13:0.15:-3.44:0.999:0.701 0/0/0/1:4:313,108:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:346,104:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:297,100:0.25:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:332,110:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:278,100:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:305,129:0.30:-0.11:1.000:0.985 0/0/0/1:4:354,123:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:389,134:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:330,99:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,255:0.51: 0.43:1.000:0.996 0/0/0/0:4:487,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:445,228:0.34: 2.18:1.000:0.869 0/0/0/1:4:105,31:0.23:-2.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:337,89:0.21:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,195:0.50:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:323,102:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:452,126:0.22: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,230:0.52:-0.09:1.000:0.995 0/0/0/1:4:403,125:0.24: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:307,104:0.25:-0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:502,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:326,117:0.27:-0.02:1.000:0.998 0/0/0/1:4:431,153:0.26: 1.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:217,238:0.51: 0.09:1.000:0.996 0/0/0/0/0/0:6:365,24:0.06:-0.54:1.000:0.880 0/0/0/0:4:470,0:0.00: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:274,117:0.30:-0.52:1.000:0.983 0/0/1/1:4:282,298:0.51: 1.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:467,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:388,140:0.27: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:426,121:0.22: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:361,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,113:0.28:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:341,108:0.24: 0.04:0.887:1.000 0/0/0/1:4:304,96:0.24:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:432,148:0.26: 1.29:1.000:0.999 0/0/0/1:4:387,139:0.27: 0.77:0.999:0.998 0/0/0/1:4:442,125:0.22: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:476,2:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:259,241:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:279,105:0.28:-0.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:335,135:0.29: 0.24:1.000:0.992 0/0/1/1:4:276,237:0.47: 0.65:1.000:0.991 0/0/0/1:4:377,111:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:359,110:0.24: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:156,153:0.50:-1.31:0.915:0.997 0/0/0/0:4:596,1:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/0:4:570,1:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:313,112:0.27:-0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:343,105:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:443,147:0.25: 1.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:234,102:0.31:-1.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:385,129:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:340,91:0.21:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,125:0.30:-0.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:204,204:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:379,112:0.23: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:416,169:0.29: 1.34:1.000:0.991 0/0/0/0:4:314,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:382,126:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:412,120:0.23: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:362,125:0.26: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,294:0.62:-0.46:1.000:0.525 0/0/0/1:4:423,155:0.27: 1.27:1.000:0.998 0/0/0/1:4:378,121:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,114:0.28:-0.29:1.000:0.996 0/0/0/0:4:566,0:0.00: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:280,87:0.24:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:356,110:0.24: 0.20:0.994:1.000 0/0/0/1:4:303,74:0.20:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:352,128:0.27: 0.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:343,126:0.27: 0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:298,106:0.26:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:306,289:0.49: 1.44:0.993:0.996 0/0/0/1:4:347,83:0.19:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:338,137:0.29: 0.29:1.000:0.991 0/0/0/1:4:419,149:0.26: 1.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:353,114:0.25: 0.21:0.999:0.999 0/0/0/1:4:352,106:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:204,66:0.25:-1.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:441,124:0.22: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:399,116:0.23: 0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:345,122:0.26: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:347,143:0.29: 0.43:1.000:0.989 0/0/1/1:4:266,239:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/0/0/0:4:474,1:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:353,150:0.30: 0.55:1.000:0.984 0/0/0/1:4:379,96:0.20: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:293,91:0.24:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:409,135:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/0:4:576,1:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:241,255:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,325:0.75:-1.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:282,81:0.22:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:174,150:0.47:-1.16:1.000:0.992 0/0/0/1:4:349,100:0.22: 0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,97:0.25:-0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:222,75:0.25:-1.42:0.998:0.999 0/0/0/1:4:362,141:0.28: 0.55:1.000:0.995 0/0/0/0:4:401,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:677,0:0.00: 2.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:333,121:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:311,97:0.24:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:192,197:0.51:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:351,132:0.28: 0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:376,122:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:366,145:0.29: 0.63:1.000:0.993 0/0/0/0:4:398,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:288,94:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:445,168:0.28: 1.61:1.000:0.996 0/0/0/0:4:642,0:0.00: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:439,1:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:350,115:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:436,158:0.27: 1.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:295,109:0.27:-0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:427,107:0.20: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:311,102:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,24:0.18:-2.95:1.000:0.999 0/0/1/1:4:189,181:0.50:-0.72:1.000:0.997 0/0/0/1:4:352,104:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:405,136:0.25: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:441,136:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:395,119:0.23: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:265,77:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:387,103:0.21: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:487,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:278,100:0.27:-0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:251,63:0.20:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:301,95:0.24:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,84:0.22:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:378,143:0.28: 0.73:1.000:0.996 0/0/0/1:4:314,100:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,398:0.75:-0.44:0.997:0.999 0/0/0/0:4:454,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:325,83:0.20:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,151:0.48:-1.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:248,103:0.30:-0.90:1.000:0.988 0/0/1/1:4:176,188:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/0:4:393,1:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:244,83:0.26:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,88:0.30:-1.40:1.000:0.988 0/0/0/1:4:390,125:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,223:0.50: 0.06:1.000:0.997 0/0/0/1:4:339,136:0.29: 0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:236,166:0.42:-0.41:1.000:0.906 0/0/1/1:4:234,210:0.48:-0.01:0.956:0.995 0/0/0/1:4:367,136:0.27: 0.55:0.998:0.997 0/0/0/1:4:463,132:0.22: 1.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:326,108:0.25:-0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:224,231:0.51: 0.09:1.000:0.996 -chr8.1 49772653 chr8.1_049772653 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:118,26:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,67:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,44:0.32: 0.92:1.000:0.958 0/1/1/1:4:46,90:0.64:-0.06:1.000:0.668 0/0/1/1:4:111,60:0.42: 0.82:1.000:0.912 0/0/1/1:4:122,105:0.52: 2.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,56:0.64:-1.35:1.000:0.647 0/1/1/1:4:51,97:0.63: 0.24:1.000:0.621 0/0/1/1:4:107,69:0.46: 0.95:1.000:0.989 0/0/1/1:4:24,16:0.47:-2.48:1.000:0.992 0/0/1/1:4:12,21:0.62:-2.66:1.000:0.528 0/0/0/1:4:117,42:0.33: 0.52:1.000:0.916 0/0/1/1:4:48,85:0.62:-0.14:1.000:0.507 0/0/1/1:4:85,54:0.46: 0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:99,69:0.48: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:104,67:0.46: 0.82:1.000:0.988 0/0/1/1:4:113,77:0.48: 1.30:0.999:0.994 0/0/1/1:4:73,123:0.62: 1.45:1.000:0.597 0/0/1/1:4:118,80:0.47: 1.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:94,74:0.51: 0.75:1.000:0.997 0/0/0/1:4:52,11:0.24:-1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,24:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,43:0.40:-0.21:1.000:0.783 0/0/1/1:4:94,57:0.45: 0.32:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-3.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,81:0.46: 1.80:1.000:0.984 0/0/0/1:4:153,28:0.21: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,64:0.48: 0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,52:0.42: 0.24:1.000:0.914 0/0/1/1:4:107,68:0.46: 0.92:1.000:0.986 0/1/1/1:4:66,126:0.63: 1.35:1.000:0.628 0/0/1/1:4:109,69:0.46: 1.00:1.000:0.986 1/1/1/1:4:1,29:0.94:-2.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:34,14:0.36:-2.28:1.000:0.698 0/1/1:3:13,11:0.52:-2.89:0.999:0.758 0/0/0/1:4:136,41:0.30: 0.97:1.000:0.987 0/0/1/1:4:130,72:0.43: 1.60:1.000:0.933 0/0/0/1:4:134,32:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:100,72:0.49: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,36:0.25: 1.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:135,29:0.24: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,61:0.43: 0.80:1.000:0.940 0/0/0/1:4:149,31:0.23: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,80:0.63:-0.39:1.000:0.583 0/0/0/1:4:82,30:0.33:-0.67:1.000:0.898 0/0/1/1:4:41,67:0.61:-0.77:1.000:0.650 0/0/0/1/1:5:125,57:0.38: 1.10:1.000:0.966 0/0/0/1:4:122,39:0.31: 0.57:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,120:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,55:0.44: 0.22:1.000:0.972 0/0/0/1:4:106,24:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:65,143:0.65: 1.75:1.000:0.823 0/0/1/1:4:81,61:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,92:0.62: 0.22:1.000:0.609 0/0/1/1:4:50,75:0.60:-0.34:1.000:0.778 0/0/1/1:4:71,126:0.63: 1.48:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,68:0.44: 1.07:1.000:0.974 0/0/0/1:4:132,30:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:54,35:0.46:-1.25:1.000:0.810 0/0/1/1:4:56,55:0.54:-0.69:1.000:0.988 0/0/1/1:4:57,89:0.61: 0.19:1.000:0.722 0/0/1/1:4:113,69:0.45: 1.10:1.000:0.978 0/0/1/1:4:44,72:0.61:-0.57:1.000:0.647 0/0/1/1:4:92,61:0.47: 0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:64,103:0.61: 0.72:1.000:0.675 0/0/1/1:4:25,39:0.61:-1.88:1.000:0.723 1/1/1/1:4:0,81:1.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,29:0.20: 1.43:0.887:1.000 0/0/1/1:4:84,47:0.43:-0.19:1.000:0.940 0/1/1/1:4:48,86:0.63:-0.11:1.000:0.515 0/1/1/1:4:37,78:0.65:-0.59:0.999:0.775 0/0/0/1:4:177,43:0.26: 2.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,97:0.63: 0.24:1.000:0.621 0/0/1/1:4:100,58:0.44: 0.49:1.000:0.960 0/0/1/1:4:54,93:0.62: 0.22:1.000:0.557 0/1/1/1:4:52,105:0.64: 0.47:1.000:0.716 0/0/1/1:4:60,45:0.50:-0.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,34:0.27: 0.67:1.000:0.997 0/0/0/1:4:108,19:0.20:-0.29:0.915:1.000 0/0/1/1:4:57,85:0.60: 0.09:1.000:0.785 0/0/1/1:4:107,58:0.42: 0.67:1.000:0.915 0/0/1/1:4:66,46:0.48:-0.67:1.000:0.995 0/0/0/1:4:160,28:0.20: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,78:0.61:-0.26:1.000:0.723 0/1/1/1:4:35,66:0.63:-0.94:1.000:0.606 0/0/1/1:4:69,52:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,51:0.48:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:125,32:0.27: 0.47:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,58:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:111,21:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,43:0.31: 0.92:1.000:0.970 0/0/1/1:4:32,53:0.62:-1.35:1.000:0.627 0/0/1/1:4:71,48:0.47:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:115,65:0.43: 1.05:1.000:0.947 0/0/1/1:4:37,62:0.62:-0.99:1.000:0.606 0/0/1/1:4:87,50:0.43:-0.04:1.000:0.956 0/0/0/1:4:122,21:0.20: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,27:0.23: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,26:0.39:-1.47:1.000:0.726 0/0/0/1:4:135,31:0.25: 0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,20:0.38:-1.85:1.000:0.511 0/0/0/1:4:76,33:0.37:-0.74:0.994:0.556 0/0/1/1:4:55,47:0.52:-0.92:1.000:0.995 0/1/1/1:4:56,103:0.63: 0.52:1.000:0.562 0/0/1/1:4:49,81:0.62:-0.21:1.000:0.630 0/1/1/1:4:39,77:0.64:-0.57:1.000:0.682 0/0/1/1:4:112,67:0.44: 1.02:0.993:0.972 0/0/1/1:4:75,60:0.51:-0.09:1.000:0.996 0/1/1/1:4:37,76:0.64:-0.64:1.000:0.741 0/0/0/1:4:163,36:0.24: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,56:0.56:-0.82:0.999:0.969 0/0/0/1:4:141,23:0.19: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,71:0.68:-1.04:1.000:0.954 0/0/1/1:4:90,46:0.41:-0.06:1.000:0.843 0/0/1/1:4:43,64:0.60:-0.79:1.000:0.788 0/0/1/1:4:45,75:0.62:-0.46:1.000:0.616 0/0/1/1:4:44,57:0.58:-0.94:1.000:0.913 0/0/1/1:4:82,37:0.38:-0.49:1.000:0.555 0/0/1/1:4:74,59:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,50:0.58:-1.27:1.000:0.903 0/0/1/1:4:43,75:0.62:-0.51:1.000:0.534 0/0/0/1:4:105,16:0.18:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/1:4:103,18:0.20:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,46:0.42:-0.19:1.000:0.914 0/0/1/1:4:39,60:0.61:-0.99:1.000:0.744 0/0/1/1:4:69,64:0.53:-0.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:102,15:0.17:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,35:0.40:-0.82:1.000:0.778 0/0/0/1:4:116,24:0.23: 0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,75:0.63:-0.57:1.000:0.553 0/0/0/1:4:73,17:0.25:-1.22:0.998:0.999 0/0/1/1:4:81,50:0.45:-0.19:1.000:0.981 0/0/1/1:4:77,38:0.40:-0.59:1.000:0.780 0/0/1/1:4:121,72:0.44: 1.38:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,29:0.44:-1.50:1.000:0.960 0/0/0/1:4:68,29:0.37:-1.04:1.000:0.607 0/0/1/1:4:65,37:0.43:-0.92:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,41:0.44:-0.72:1.000:0.970 0/0/1/1:4:70,51:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,45:0.56:-1.32:1.000:0.973 0/0/1/1:4:58,87:0.60: 0.17:1.000:0.778 0/0/1/1:4:115,54:0.39: 0.77:1.000:0.664 0/0/1/1:4:46,80:0.62:-0.31:1.000:0.540 0/1/1/1:4:46,92:0.64:-0.01:1.000:0.702 0/0/1/1:4:69,112:0.61: 1.07:1.000:0.661 0/0/1/1:4:85,56:0.47: 0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:94,63:0.47: 0.47:1.000:0.993 0/0/1/1:4:102,71:0.48: 0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:33,13:0.35:-2.33:1.000:0.793 0/0/1/1:4:66,46:0.48:-0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:102,95:0.53: 1.48:1.000:0.992 0/1/1/1:4:54,96:0.63: 0.29:1.000:0.501 0/0/1/1:4:101,64:0.46: 0.67:1.000:0.986 0/0/0/1:4:147,29:0.22: 0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,19:0.20:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,25:0.21: 0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,92:0.65:-0.11:1.000:0.819 0/0/1/1:4:107,70:0.47: 0.97:1.000:0.990 0/0/1/1:4:36,59:0.61:-1.09:1.000:0.645 0/0/1/1:4:92,57:0.45: 0.27:1.000:0.982 0/0/1/1:4:95,67:0.48: 0.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,101:0.62: 0.52:1.000:0.537 0/0/1/1:4:74,50:0.47:-0.36:1.000:0.993 0/0/1/1:4:80,57:0.49:-0.04:0.997:0.996 0/0/1/1:4:83,53:0.46:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:131,33:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,39:0.41:-0.62:1.000:0.868 0/0/1/1:4:95,63:0.47: 0.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:118,17:0.17:-0.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,47:0.46:-0.44:1.000:0.986 0/1/1/1:4:35,83:0.66:-0.51:1.000:0.887 0/0/1/1:4:75,38:0.40:-0.64:1.000:0.829 0/0/1/1:4:131,87:0.47: 2.01:1.000:0.992 0/0/1/1:4:95,66:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,118:0.63: 1.15:1.000:0.511 0/1/1/1:4:43,77:0.63:-0.46:1.000:0.514 0/0/1/1:4:57,89:0.61: 0.19:0.956:0.722 0/0/1/1:4:97,81:0.52: 1.00:0.998:0.996 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 2.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,46:0.42:-0.21:1.000:0.924 0/0/1/1:4:103,59:0.43: 0.59:1.000:0.954 -chr8.1 50073130 chr8.1_050073130 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,42:0.26:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:160,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,68:0.43:-0.18:1.000:0.952 0/0/1/1:4:111,108:0.49: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,105:0.52: 0.75:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,84:0.54:-0.23:1.000:0.989 0/0/1/1:4:103,99:0.49: 0.79:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,91:0.46: 0.66:1.000:0.988 0/0/1/1:4:16,13:0.44:-2.87:1.000:0.974 0/0/0/1:4:19,11:0.36:-2.85:1.000:0.640 0/0/0/1:4:190,59:0.24: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,73:0.44:-0.03:1.000:0.973 0/0/1/1:4:109,117:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,100:0.52: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:168,48:0.22: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,46:0.22: 0.83:0.999:1.000 0/0/1/1:4:86,92:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:126,135:0.51: 2.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:177,64:0.26: 1.61:1.000:0.998 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-2.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,49:0.25: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,98:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,90:0.46: 0.64:1.000:0.986 0/1/1/1:4:6,14:0.68:-3.06:1.000:0.951 0/0/0/1:4:147,44:0.23: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:197,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,97:0.51: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:173,47:0.21: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,56:0.27: 0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:109,95:0.46: 0.83:1.000:0.989 0/0/1/1:4:82,85:0.50: 0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:3,5:0.61:-3.31:1.000:0.687 0/0/0/1:4:33,9:0.21:-2.59:1.000:1.000 0/1/1:3:5,6:0.54:-3.25:0.999:0.925 0/0/0/1:4:160,56:0.26: 1.09:1.000:0.999 0/0/0/1:4:145,43:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,48:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:152,53:0.26: 0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:176,71:0.29: 1.74:1.000:0.994 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,46:0.34:-0.67:1.000:0.846 0/0/0/1:4:111,33:0.23:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,110:0.76:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,98:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:93,96:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:128,100:0.44: 1.34:1.000:0.929 0/0/0/1:4:40,10:0.20:-2.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,104:0.75:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,58:0.53:-1.18:1.000:0.994 0/0/0/1:4:78,30:0.28:-1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,165:0.69: 1.42:1.000:0.972 0/0/1/1:4:73,74:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,82:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:98,84:0.46: 0.37:1.000:0.986 0/0/1/1:4:78,70:0.47:-0.35:1.000:0.992 0/1/1/1:4:49,135:0.71: 0.41:1.000:0.992 0/0/0/1:4:106,36:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,47:0.27: 0.22:1.000:0.998 0/0/0/0/1/1:6:80,40:0.33:-0.94:1.000:0.921 0/0/0/1:4:116,45:0.28:-0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,67:0.47:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,91:0.54: 0.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:80,77:0.49:-0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,82:0.52:-0.20:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,57:0.41:-0.56:1.000:0.863 0/0/1/1:4:79,95:0.54: 0.20:1.000:0.989 0/1/1/1:4:39,153:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,38:0.25:-0.25:0.887:0.999 0/0/0/0:4:137,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,74:0.51:-0.44:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,47:0.53:-1.62:0.999:0.993 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,68:0.47:-0.44:1.000:0.992 0/0/0/1:4:93,26:0.22:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,47:0.45:-1.28:1.000:0.978 0/1/1/1:4:39,118:0.73:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,65:0.45:-0.46:1.000:0.981 0/1/1/1:4:40,141:0.75: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,58:0.32: 0.35:1.000:0.958 0/0/0/1:4:93,29:0.24:-0.90:0.915:1.000 0/0/1/1:4:89,77:0.46: 0.03:1.000:0.988 0/0/0/1:4:133,49:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,77:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:117,40:0.25:-0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,84:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,67:0.49:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:99,37:0.27:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:100,48:0.32:-0.35:1.000:0.948 0/0/0/1:4:99,48:0.32:-0.37:1.000:0.941 0/0/1/1:4:72,49:0.40:-0.92:1.000:0.806 0/0/0/0:4:143,0:0.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,53:0.26: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,71:0.51:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:145,48:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,26:0.20:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,101:0.74:-0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:106,40:0.27:-0.39:1.000:0.997 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:165,53:0.24: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,34:0.27:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,69:0.46:-0.33:1.000:0.987 0/0/0/1:4:129,32:0.20:-0.08:0.994:1.000 0/0/1/1:4:69,73:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,93:0.47: 0.64:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,60:0.48:-0.84:1.000:0.994 0/0/1/1:4:116,113:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,109:0.52: 0.92:0.993:0.995 0/0/0/1:4:139,43:0.24: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,74:0.44: 0.01:1.000:0.974 0/0/0/1:4:176,47:0.21: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,76:0.46:-0.01:0.999:0.987 0/0/0/1:4:135,39:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,49:0.49:-1.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,78:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:69,65:0.48:-0.65:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,80:0.72:-1.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,76:0.51:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:67,62:0.48:-0.75:1.000:0.994 0/0/0/1:4:106,40:0.27:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,57:0.49:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,75:0.47:-0.14:1.000:0.992 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,32:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/0/1:4:95,43:0.31:-0.56:1.000:0.974 0/1/1/1:4:27,139:0.81: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,71:0.53:-0.69:1.000:0.992 0/0/0/1:4:113,34:0.23:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,70:0.55:-0.82:1.000:0.983 0/0/0/1:4:102,31:0.23:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,103:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,27:0.25:-1.20:0.998:0.999 0/0/0/1:4:120,40:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:110,42:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:214,68:0.24: 2.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,124:0.74:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:111,37:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,82:0.53:-0.27:1.000:0.991 0/0/1/1:4:86,78:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:36,115:0.74:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:93,81:0.46: 0.20:1.000:0.989 0/0/0/1:4:139,44:0.24: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,75:0.54:-0.61:1.000:0.986 0/0/1/1:4:102,128:0.55: 1.38:1.000:0.982 0/0/0/1:4:114,56:0.33: 0.11:1.000:0.932 0/0/1/1:4:104,91:0.46: 0.64:1.000:0.989 0/1/1/1:4:50,124:0.69: 0.20:1.000:0.974 0/0/1/1:4:96,101:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,91:0.54: 0.05:1.000:0.989 0/0/0/1:4:174,77:0.30: 1.82:1.000:0.980 0/0/0/1:4:127,51:0.28: 0.28:1.000:0.994 0/0/0/0:4:22,2:0.08:-2.97:1.000:0.982 0/0/1/1:4:57,67:0.53:-0.86:1.000:0.991 0/0/0/1:4:145,47:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,111:0.54: 0.79:1.000:0.987 0/0/1/1:4:108,116:0.51: 1.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:156,52:0.25: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:113,27:0.19:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,98:0.47: 0.85:1.000:0.994 0/0/1/1:4:69,82:0.54:-0.29:1.000:0.990 0/0/1/1:4:112,104:0.48: 1.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:119,38:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:134,52:0.28: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,97:0.50: 0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,47:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,115:0.53: 1.00:0.997:0.990 0/0/0/1:4:118,42:0.26:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:118,53:0.31: 0.13:1.000:0.976 0/0/1/1:4:103,70:0.40: 0.18:1.000:0.804 0/0/0/1:4:116,42:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:105,38:0.26:-0.46:1.000:0.998 0/0/0/1:4:116,42:0.26:-0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:103,101:0.49: 0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,103:0.55: 0.39:1.000:0.976 0/0/1/1:4:153,137:0.47: 2.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:86,103:0.54: 0.51:1.000:0.989 0/0/1/1:4:115,106:0.48: 1.19:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,135:0.69: 0.56:1.000:0.965 0/1/1/1:4:59,168:0.72: 1.32:0.956:0.994 0/0/1/1:4:96,107:0.52: 0.81:0.998:0.995 0/0/0/0:4:253,0:0.00: 1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,40:0.26:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,42:0.24: 0.13:1.000:1.000 -chr8.1 51185821 chr8.1_051185821 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:393,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:481,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:503,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:402,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:134,0:.:-2.44:1.000:. ./.:4:191,0:.:-1.86:1.000:. ./.:4:550,0:.: 1.76:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:482,0:.: 1.08:0.999:. ./.:4:487,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:576,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:108,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:490,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:92,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:541,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:422,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:490,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:395,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:99,0:.:-2.79:1.000:. ./.:4:148,0:.:-2.30:1.000:. ./.:3:62,0:.:-3.17:0.999:. ./.:4:418,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:438,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:459,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:331,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.36:1.000:. ./.:5:625,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:731,0:.: 3.59:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:273,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:497,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:460,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:340,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:329,1:.:-0.46:1.000:. ./.:6:311,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:394,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:255,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:449,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:354,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.16:0.887:. ./.:4:314,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:369,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:486,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:368,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:339,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:407,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:278,0:.:-0.98:0.915:. ./.:4:418,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:423,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:263,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:405,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:266,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:357,0:.:-0.19:0.994:. ./.:4:277,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:308,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.39:0.993:. ./.:4:375,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:311,0:.:-0.65:0.999:. ./.:4:361,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:272,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:371,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:303,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:281,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:436,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:207,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:220,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:264,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.67:0.998:. ./.:4:364,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:355,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:555,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:253,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:259,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:532,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:537,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:360,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:346,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:472,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:426,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:124,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:539,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:499,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:365,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:328,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:356,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:427,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:509,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:404,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:386,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:367,0:.:-0.09:0.997:. ./.:4:355,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:315,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:330,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:359,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:334,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:313,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:515,0:.: 1.41:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.93:0.956:. ./.:4:515,0:.: 1.41:0.998:. ./.:4:475,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.49:1.000:. -chr8.1 51348601 chr8.1_051348601 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,64:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.63:1.000:. ./.:4:19,44:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,79:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.63:1.000:. ./.:4:12,25:.:-1.47:1.000:. ./.:4:25,77:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.05:1.000:. ./.:4:4,22:.:-1.98:1.000:. ./.:4:5,28:.:-1.65:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.81:1.000:. ./.:4:19,40:.:-0.44:1.000:. ./.:4:19,43:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,43:.:-0.02:1.000:. ./.:4:24,57:.: 0.59:1.000:. ./.:4:18,77:.: 1.24:0.999:. ./.:4:23,62:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,81:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,45:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,19:.:-2.31:1.000:. ./.:4:20,48:.:-0.02:1.000:. ./.:4:19,57:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.77:1.000:. ./.:4:3,15:.:-2.35:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,73:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,50:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,53:.: 0.91:1.000:. ./.:4:34,105:.: 3.29:1.000:. ./.:4:23,68:.: 1.05:1.000:. ./.:4:3,21:.:-2.07:1.000:. ./.:4:2,24:.:-1.98:1.000:. ./.:3:0,13:.:-2.59:0.999:. ./.:4:0,45:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.25:1.000:. ./.:4:26,93:.: 2.36:1.000:. ./.:4:0,119:.: 2.36:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.45:1.000:. ./.:4:25,66:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:21,49:.: 0.07:1.000:. ./.:4:21,68:.: 0.96:1.000:. ./.:4:24,50:.: 0.26:1.000:. ./.:5:27,97:.: 2.59:1.000:. ./.:4:28,83:.: 1.99:1.000:. ./.:4:21,74:.: 1.24:1.000:. ./.:4:17,76:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.45:1.000:. ./.:4:28,61:.: 0.96:1.000:. ./.:4:18,62:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,84:.: 0.73:1.000:. ./.:4:20,64:.: 0.73:1.000:. ./.:4:34,61:.: 1.24:1.000:. ./.:4:22,59:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,93:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.63:1.000:. ./.:6:9,38:.:-1.00:1.000:. ./.:4:12,26:.:-1.42:1.000:. ./.:4:21,63:.: 0.73:1.000:. ./.:4:23,55:.: 0.45:1.000:. ./.:4:24,50:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,101:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.49:1.000:. ./.:4:10,30:.:-1.33:1.000:. ./.:4:25,58:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.12:0.887:. ./.:4:0,64:.:-0.21:1.000:. ./.:4:14,80:.: 1.19:1.000:. ./.:4:9,43:.:-0.77:0.999:. ./.:4:0,101:.: 1.52:1.000:. ./.:4:16,51:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.91:1.000:. ./.:4:16,65:.: 0.59:1.000:. ./.:4:15,42:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,46:.:-1.05:1.000:. ./.:4:23,59:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,83:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.86:0.915:. ./.:4:11,42:.:-0.72:1.000:. ./.:4:13,40:.:-0.72:1.000:. ./.:4:8,38:.:-1.05:1.000:. ./.:4:27,52:.: 0.49:1.000:. ./.:4:25,45:.: 0.07:1.000:. ./.:4:8,30:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.77:1.000:. ./.:4:0,97:.: 1.33:1.000:. ./.:4:16,35:.:-0.81:1.000:. ./.:4:16,69:.: 0.77:1.000:. ./.:4:16,61:.: 0.40:1.000:. ./.:4:12,43:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.16:1.000:. ./.:4:16,51:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,47:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.39:1.000:. ./.:4:4,29:.:-1.65:1.000:. ./.:4:10,38:.:-0.95:0.994:. ./.:4:16,34:.:-0.86:1.000:. ./.:4:15,33:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,54:.: 0.35:1.000:. ./.:4:22,47:.: 0.03:1.000:. ./.:4:27,65:.: 1.10:0.993:. ./.:4:23,53:.: 0.35:1.000:. ./.:4:15,44:.:-0.44:1.000:. ./.:4:35,72:.: 1.80:1.000:. ./.:4:16,47:.:-0.25:0.999:. ./.:4:15,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,94:.: 1.19:1.000:. ./.:4:9,42:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,40:.:-0.63:1.000:. ./.:4:0,54:.:-0.67:1.000:. ./.:4:11,48:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,71:.: 0.12:1.000:. ./.:4:20,51:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,34:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.11:1.000:. ./.:4:17,48:.:-0.16:1.000:. ./.:4:22,50:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.53:1.000:. ./.:4:10,37:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.28:1.000:. ./.:4:20,51:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,38:.:-1.42:0.998:. ./.:4:0,81:.: 0.59:1.000:. ./.:4:20,43:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,45:.: 0.26:1.000:. ./.:4:23,74:.: 1.33:1.000:. ./.:4:20,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,44:.:-1.14:1.000:. ./.:4:18,40:.:-0.49:1.000:. ./.:4:10,45:.:-0.63:1.000:. ./.:4:13,27:.:-1.33:1.000:. ./.:4:17,34:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,29:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,51:.: 0.07:1.000:. ./.:4:24,37:.:-0.35:1.000:. ./.:4:29,46:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,95:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,80:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.45:1.000:. ./.:4:28,82:.: 1.94:1.000:. ./.:4:0,18:.:-2.35:1.000:. ./.:4:9,38:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,106:.: 1.75:1.000:. ./.:4:22,66:.: 0.91:1.000:. ./.:4:19,38:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,66:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,55:.:-0.63:1.000:. ./.:4:30,29:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,51:.:-0.81:1.000:. ./.:4:22,51:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,91:.: 1.05:1.000:. ./.:4:32,60:.: 1.10:1.000:. ./.:4:17,62:.: 0.49:1.000:. ./.:4:21,42:.:-0.25:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,69:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.53:1.000:. ./.:4:19,57:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,78:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,56:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,69:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,72:.: 0.17:1.000:. ./.:4:13,69:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.21:1.000:. ./.:4:15,44:.:-0.44:1.000:. ./.:4:31,60:.: 1.05:0.956:. ./.:4:30,47:.: 0.40:0.998:. ./.:4:0,36:.:-1.51:1.000:. ./.:4:21,43:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.21:1.000:. -chr8.1 51569772 chr8.1_051569772 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:956,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:757,40:.: 0.13:1.000:. ./.:4:861,48:.: 0.57:1.000:. ./.:4:696,67:.: 0.00:1.000:. ./.:4:851,49:.: 0.54:1.000:. ./.:4:956,134:.: 1.28:1.000:. ./.:4:288,54:.:-1.65:1.000:. ./.:4:970,95:.: 1.18:1.000:. ./.:4:899,47:.: 0.72:1.000:. ./.:4:296,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:211,1:.:-2.16:1.000:. ./.:4:696,42:.:-0.10:1.000:. ./.:4:444,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1234,1:.: 1.85:1.000:. ./.:4:629,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:1064,41:.: 1.34:1.000:. ./.:4:1453,0:.: 2.71:0.999:. ./.:4:1093,1:.: 1.30:1.000:. ./.:4:1633,81:.: 3.73:1.000:. ./.:4:985,68:.: 1.14:1.000:. ./.:4:299,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:737,44:.: 0.07:1.000:. ./.:4:731,121:.: 0.35:1.000:. ./.:4:681,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:128,8:.:-2.46:1.000:. ./.:4:1110,116:.: 1.82:1.000:. ./.:4:993,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:742,52:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1082,46:.: 1.43:1.000:. ./.:4:760,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:889,91:.: 0.85:1.000:. ./.:4:545,38:.:-0.71:1.000:. ./.:4:71,4:.:-2.70:1.000:. ./.:4:196,1:.:-2.22:1.000:. ./.:3:104,3:.:-2.58:0.999:. ./.:4:795,92:.: 0.48:1.000:. ./.:4:1016,93:.: 1.36:1.000:. ./.:4:767,96:.: 0.39:1.000:. ./.:4:1129,45:.: 1.61:1.000:. ./.:4:1191,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:758,31:.: 0.10:1.000:. ./.:4:841,47:.: 0.49:1.000:. ./.:4:585,89:.:-0.35:1.000:. ./.:4:667,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:779,39:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1021,52:.: 1.21:1.000:. ./.:5:749,49:.: 0.14:1.000:. ./.:4:450,34:.:-1.10:1.000:. ./.:4:429,37:.:-1.17:1.000:. ./.:4:482,41:.:-0.94:1.000:. ./.:4:803,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:710,48:.:-0.02:1.000:. ./.:4:628,34:.:-0.40:1.000:. ./.:4:935,55:.: 0.89:1.000:. ./.:4:722,85:.: 0.17:1.000:. ./.:4:834,29:.: 0.39:1.000:. ./.:4:801,39:.: 0.30:1.000:. ./.:4:677,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:884,35:.: 0.61:1.000:. ./.:6:438,30:.:-1.16:1.000:. ./.:4:527,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:473,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:865,53:.: 0.61:1.000:. ./.:4:645,38:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1103,48:.: 1.52:1.000:. ./.:4:887,47:.: 0.67:1.000:. ./.:4:528,24:.:-0.83:1.000:. ./.:4:896,47:.: 0.70:1.000:. ./.:4:679,70:.:-0.06:0.887:. ./.:4:583,52:.:-0.50:1.000:. ./.:4:784,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:394,89:.:-1.10:0.999:. ./.:4:374,49:.:-1.34:1.000:. ./.:4:765,67:.: 0.27:1.000:. ./.:4:705,35:.:-0.09:1.000:. ./.:4:737,77:.: 0.20:1.000:. ./.:4:896,41:.: 0.68:1.000:. ./.:4:877,77:.: 0.75:1.000:. ./.:4:392,45:.:-1.28:1.000:. ./.:4:869,121:.: 0.89:1.000:. ./.:4:388,27:.:-1.37:0.915:. ./.:4:396,39:.:-1.29:1.000:. ./.:4:718,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:864,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:872,41:.: 0.59:1.000:. ./.:4:477,113:.:-0.68:1.000:. ./.:4:436,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:601,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:730,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:679,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:417,75:.:-1.07:1.000:. ./.:4:621,40:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1050,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:675,41:.:-0.19:1.000:. ./.:4:714,46:.:-0.01:1.000:. ./.:4:823,41:.: 0.39:1.000:. ./.:4:773,26:.: 0.14:1.000:. ./.:4:577,82:.:-0.41:1.000:. ./.:4:948,36:.: 0.87:1.000:. ./.:4:733,51:.: 0.08:1.000:. ./.:4:384,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:964,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:328,0:.:-1.71:1.000:. ./.:4:544,38:.:-0.71:0.994:. ./.:4:714,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:793,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:885,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:914,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:848,58:.: 0.56:0.993:. ./.:4:889,62:.: 0.74:1.000:. ./.:4:579,77:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1081,71:.: 1.52:1.000:. ./.:4:724,71:.: 0.12:0.999:. ./.:4:872,42:.: 0.59:1.000:. ./.:4:581,34:.:-0.58:1.000:. ./.:4:748,50:.: 0.14:1.000:. ./.:4:619,57:.:-0.34:1.000:. ./.:4:501,29:.:-0.92:1.000:. ./.:4:938,41:.: 0.85:1.000:. ./.:4:436,44:.:-1.11:1.000:. ./.:4:929,55:.: 0.87:1.000:. ./.:4:699,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:856,36:.: 0.50:1.000:. ./.:4:723,41:.: 0.00:1.000:. ./.:4:698,97:.: 0.12:1.000:. ./.:4:847,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:597,74:.:-0.36:1.000:. ./.:4:548,68:.:-0.58:1.000:. ./.:4:419,63:.:-1.10:1.000:. ./.:4:434,40:.:-1.14:1.000:. ./.:4:765,74:.: 0.30:1.000:. ./.:4:776,112:.: 0.49:1.000:. ./.:4:484,43:.:-0.93:0.998:. ./.:4:946,89:.: 1.07:1.000:. ./.:4:668,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:880,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:707,54:.:-0.01:1.000:. ./.:4:641,35:.:-0.34:1.000:. ./.:4:279,56:.:-1.68:1.000:. ./.:4:843,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:568,62:.:-0.52:1.000:. ./.:4:737,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:737,1:.:-0.10:1.000:. ./.:4:436,1:.:-1.28:1.000:. ./.:4:626,63:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1336,1:.: 2.25:1.000:. ./.:4:864,61:.: 0.63:1.000:. ./.:4:502,55:.:-0.81:1.000:. ./.:4:1021,74:.: 1.30:1.000:. ./.:4:790,41:.: 0.26:1.000:. ./.:4:923,137:.: 1.16:1.000:. ./.:4:543,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:230,0:.:-2.09:1.000:. ./.:4:466,25:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1106,106:.: 1.76:1.000:. ./.:4:605,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:1138,119:.: 1.94:1.000:. ./.:4:825,109:.: 0.67:1.000:. ./.:4:686,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:778,60:.: 0.29:1.000:. ./.:4:749,43:.: 0.11:1.000:. ./.:4:792,46:.: 0.29:1.000:. ./.:4:600,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:556,88:.:-0.47:1.000:. ./.:4:548,48:.:-0.66:1.000:. ./.:4:829,103:.: 0.66:1.000:. ./.:4:513,36:.:-0.84:1.000:. ./.:4:742,97:.: 0.30:0.997:. ./.:4:960,43:.: 0.94:1.000:. ./.:4:599,86:.:-0.31:1.000:. ./.:4:631,35:.:-0.38:1.000:. ./.:4:715,89:.: 0.16:1.000:. ./.:4:349,39:.:-1.47:1.000:. ./.:4:791,35:.: 0.25:1.000:. ./.:4:551,53:.:-0.63:1.000:. ./.:4:554,47:.:-0.64:1.000:. ./.:4:692,46:.:-0.10:1.000:. ./.:4:837,53:.: 0.50:1.000:. ./.:4:764,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:474,43:.:-0.97:1.000:. ./.:4:698,91:.: 0.10:0.956:. ./.:4:1149,112:.: 1.95:0.998:. ./.:4:946,53:.: 0.92:1.000:. ./.:4:756,45:.: 0.15:1.000:. ./.:4:711,44:.:-0.03:1.000:. -chr8.1 51721390 chr8.1_051721390 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:29,38:0.53: 1.72:1.000:0.992 0/1/1/1:4:6,33:0.85: 0.10:1.000:0.992 0/0/1/1:4:21,15:0.44:-0.07:1.000:0.971 0/0/1/1:4:18,29:0.59: 0.56:1.000:0.861 0/1/1/1:4:9,37:0.80: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,45:0.63: 1.83:1.000:0.597 0/1/1/1:4:12,23:0.64:-0.13:1.000:0.672 0/1/1/1:4:14,30:0.67: 0.39:1.000:0.913 0/1/1/1:4:17,42:0.70: 1.26:1.000:0.988 0/0/1/1:4:1,1:0.48:-2.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,4:0.80:-1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,35:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,28:0.58: 0.51:1.000:0.912 0/1/1/1:4:11,27:0.70: 0.04:1.000:0.987 0/1/1/1:4:7,43:0.86: 0.74:1.000:0.967 0/1/1/1:4:12,30:0.71: 0.27:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,33:0.64: 0.74:0.999:0.711 0/0/1/1:4:27,27:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,37:0.63: 1.14:1.000:0.549 0/0/1/1:4:32,38:0.50: 1.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:4,0:0.25:-1.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,30:0.81:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,46:0.88: 0.85:1.000:0.648 0/0/1/1:4:16,25:0.58: 0.22:1.000:0.907 0/0/1/1:4:2,1:0.40:-1.98:1.000:0.822 0/0/1/1:4:20,27:0.54: 0.56:1.000:0.988 0/0/1/1:4:36,39:0.49: 2.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,42:0.78: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.45: 0.79:1.000:0.979 0/0/1/1:4:18,29:0.59: 0.56:1.000:0.861 0/0/1/1:4:17,27:0.59: 0.39:1.000:0.885 0/1/1/1:4:11,32:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:3,1:0.37:-1.92:1.000:0.623 0/1/1/1:4:1,3:0.75:-1.92:1.000:0.999 0/0/1:3:1,1:0.48:-2.04:0.999:0.783 0/1/1/1:4:15,47:0.76: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,25:0.60: 0.16:1.000:0.791 0/1/1/1:4:14,48:0.77: 1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,22:0.65:-0.25:1.000:0.792 0/0/1/1:4:16,28:0.61: 0.39:1.000:0.649 0/0/1/1:4:21,18:0.46: 0.10:1.000:0.989 0/0/1/1:4:15,21:0.55:-0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:13,21:0.59:-0.19:1.000:0.857 0/1/1/1:4:8,20:0.71:-0.53:1.000:0.990 0/0/1/1:4:10,15:0.57:-0.71:1.000:0.947 0/0/1/1:4:8,9:0.49:-1.17:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:24,51:0.67: 2.18:1.000:0.821 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,11:0.46:-0.77:1.000:0.988 0/1/1/1:4:1,8:0.89:-1.63:1.000:0.520 0/0/1/1:4:9,15:0.60:-0.77:1.000:0.791 0/1/1/1:4:12,39:0.76: 0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,20:0.62:-0.36:1.000:0.514 0/0/1/1:4:21,20:0.48: 0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:17,42:0.70: 1.26:1.000:0.988 0/0/1/1:4:16,16:0.48:-0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:15,20:0.54:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:21,11:0.41:-0.30:1.000:0.856 0/0/1/1:4:12,14:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1/1/1:6:6,13:0.67:-1.05:1.000:0.921 0/0/1/1:4:11,13:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:13,21:0.59:-0.19:1.000:0.857 0/1/1/1:4:5,22:0.81:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,19:0.79:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,23:0.71:-0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:13,23:0.62:-0.07:1.000:0.612 0/0/1/1:4:5,7:0.55:-1.46:1.000:0.980 0/0/1/1:4:14,23:0.60:-0.01:1.000:0.824 0/0/1/1:4:5,7:0.55:-1.46:0.887:0.980 0/0/1/1:4:24,23:0.48: 0.56:1.000:0.994 0/0/1/1:4:14,18:0.52:-0.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:3,6:0.65:-1.63:0.999:0.792 0/1/1/1:4:5,27:0.84:-0.30:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,24:0.57: 0.16:1.000:0.947 0/1/1/1:4:6,28:0.82:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,18:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,24:0.86:-0.53:1.000:0.975 0/1/1/1:4:7,13:0.63:-1.00:1.000:0.563 0/0/1/1:4:14,23:0.60:-0.01:1.000:0.824 0/1/1/1:4:11,34:0.76: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.05:0.915:1.000 0/0/1/1:4:14,22:0.58:-0.07:1.000:0.900 0/1/1/1:4:11,27:0.70: 0.04:1.000:0.987 0/1/1/1:4:9,37:0.80: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,21:0.84:-0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:13,21:0.59:-0.19:1.000:0.857 0/1/1/1:4:9,17:0.63:-0.65:1.000:0.623 0/0/1/1:4:13,16:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:8,14:0.61:-0.88:1.000:0.649 0/1/1/1:4:13,26:0.65: 0.10:1.000:0.792 0/1/1/1:4:6,12:0.65:-1.11:1.000:0.792 0/0/1/1:4:18,13:0.44:-0.36:1.000:0.972 0/0/1/1:4:13,17:0.53:-0.42:1.000:0.992 0/0/1/1:4:15,27:0.62: 0.27:1.000:0.551 0/1/1/1:4:8,22:0.73:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,17:0.51:-0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,9:0.75:-1.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,17:0.74:-0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,10:0.45:-0.82:1.000:0.980 0/1/1/1:4:6,33:0.85: 0.10:1.000:0.992 0/1/1/1:4:2,11:0.85:-1.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,14:0.45:-0.30:1.000:0.982 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.49:-1.17:0.994:0.997 0/1/1/1:4:3,11:0.79:-1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,17:0.55:-0.48:1.000:0.976 0/0/1/1:4:9,16:0.62:-0.71:1.000:0.595 0/1/1/1:4:17,34:0.65: 0.79:1.000:0.792 0/1/1/1:4:8,37:0.82: 0.45:0.993:0.999 0/0/1/1:4:19,30:0.58: 0.68:1.000:0.893 0/0/1/1:4:9,10:0.49:-1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,43:0.80: 0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,13:0.50:-0.77:0.999:0.997 0/1/1/1:4:7,25:0.78:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.45:-0.94:1.000:0.978 0/0/1/1:4:13,20:0.58:-0.25:1.000:0.924 0/0/1/1:4:12,14:0.50:-0.65:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,24:0.86:-0.53:1.000:0.975 0/0/1/1:4:10,7:0.44:-1.17:1.000:0.967 0/1/1/1:4:7,19:0.73:-0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,10:0.39:-0.25:1.000:0.690 0/0/1/1:4:12,7:0.42:-1.05:1.000:0.914 0/0/1/1:4:15,21:0.55:-0.07:1.000:0.980 0/0/1/1:4:27,42:0.58: 1.83:1.000:0.912 0/1/1/1:4:8,15:0.63:-0.82:1.000:0.597 0/1/1/1:4:6,15:0.71:-0.94:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,21:0.78:-0.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,16:0.62:-0.71:1.000:0.595 0/1/1/1:4:4,18:0.82:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:7,11:0.58:-1.11:1.000:0.900 0/0/1/1:4:21,26:0.51: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:4,9:0.68:-1.40:0.998:0.956 0/0/1/1:4:12,7:0.42:-1.05:1.000:0.914 0/0/1/1:4:12,13:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:28,48:0.61: 2.24:1.000:0.715 0/0/1/1:4:15,19:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:7,5:0.44:-1.46:1.000:0.971 0/1/1/1:4:5,11:0.68:-1.23:1.000:0.939 0/1/1/1:4:4,24:0.86:-0.53:1.000:0.975 0/0/1/1:4:12,13:0.49:-0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,21:0.78:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,23:0.60:-0.01:1.000:0.824 0/0/1/1:4:6,10:0.60:-1.23:1.000:0.791 0/0/1/1:4:32,33:0.48: 1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:27,31:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,47:0.76: 1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,50:0.91: 1.03:1.000:0.938 0/0/1/1:4:37,34:0.47: 1.95:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,18:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,29:0.49: 1.03:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,20:0.47: 0.27:1.000:0.992 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:7,38:0.84: 0.45:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,21:0.45: 0.62:1.000:0.982 0/1/1/1:4:18,36:0.65: 0.97:1.000:0.792 0/1/1/1:4:6,43:0.88: 0.68:1.000:0.811 0/0/1/1:4:28,29:0.48: 1.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,25:0.68:-0.07:1.000:0.961 0/0/1/1:4:35,34:0.48: 1.83:1.000:0.994 0/1/1/1:4:23,44:0.64: 1.72:1.000:0.666 0/1/1/1:4:13,29:0.68: 0.27:1.000:0.950 0/1/1/1:4:14,29:0.66: 0.33:1.000:0.865 0/0/1/1:4:25,28:0.49: 0.91:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,41:0.68: 1.26:1.000:0.963 0/0/1/1:4:18,24:0.54: 0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:15,26:0.61: 0.22:1.000:0.681 1/1/1/1:4:0,47:1.00: 0.56:0.997:1.000 0/0/1/1:4:24,19:0.45: 0.33:1.000:0.983 0/0/1/1:4:26,35:0.54: 1.37:1.000:0.988 0/1/1/1:4:5,35:0.88: 0.16:1.000:0.852 0/0/1/1:4:29,21:0.44: 0.74:1.000:0.973 0/1/1/1:4:15,37:0.70: 0.85:1.000:0.988 0/0/1/1:4:26,20:0.45: 0.51:1.000:0.980 0/0/1/1:4:19,14:0.45:-0.25:1.000:0.975 0/1/1/1:4:11,42:0.79: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,48:0.72: 1.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,46:0.79: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.46: 1.14:1.000:0.988 0/1/1/1:4:7,42:0.86: 0.68:1.000:0.975 0/1/1/1:4:12,55:0.82: 1.72:0.956:0.999 1/1/1/1:4:9,73:0.89: 2.58:0.998:0.523 0/0/1/1:4:27,46:0.61: 2.06:1.000:0.733 0/1/1/1:4:10,27:0.73:-0.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:13,43:0.77: 1.08:1.000:1.000 -chr8.1 51995468 chr8.1_051995468 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:12,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.91:1.000:. ./.:3:4,0:.:-2.07:0.999:. ./.:4:12,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:20,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.62:1.000:. ./.:5:29,2:.: 2.08:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:21,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:6:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:29,1:.: 1.93:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:0.887:. ./.:4:25,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:0.999:. ./.:4:19,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.47:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:11,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.24:0.915:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:31,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:34,2:.: 2.85:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.01:0.994:. ./.:4:9,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:0.993:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.85:0.999:. ./.:4:23,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:29,2:.: 2.08:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:22,1:.: 0.85:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:0.998:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:26,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:0.997:. ./.:4:21,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:23,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.99:0.956:. ./.:4:22,0:.: 0.70:0.998:. ./.:4:22,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.47:1.000:. -chr8.1 52334164 chr8.1_052334164 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:173,55:.: 0.57:1.000:. ./.:4:130,45:.:-0.39:1.000:. ./.:4:163,52:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,61:.: 0.41:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:118,47:.:-0.57:1.000:. ./.:4:177,50:.: 0.55:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:28,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:17,4:.:-3.19:1.000:. ./.:4:194,49:.: 0.84:1.000:. ./.:4:162,58:.: 0.43:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:165,51:.: 0.35:1.000:. ./.:4:186,63:.: 0.95:0.999:. ./.:4:183,66:.: 0.95:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:223,53:.: 1.44:1.000:. ./.:4:26,4:.:-3.03:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:6,4:.:-3.39:1.000:. ./.:4:167,67:.: 0.68:1.000:. ./.:4:147,58:.: 0.15:1.000:. ./.:4:169,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:230,83:.: 2.12:1.000:. ./.:4:161,55:.: 0.35:1.000:. ./.:4:213,80:.: 1.75:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:14,0:.:-3.32:1.000:. ./.:4:35,6:.:-2.83:1.000:. ./.:3:10,0:.:-3.39:0.999:. ./.:4:198,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:164,61:.: 0.52:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:153,49:.: 0.10:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:148,50:.: 0.03:1.000:. ./.:4:142,55:.: 0.01:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:126,58:.:-0.23:1.000:. ./.:5:359,0:.: 2.95:1.000:. ./.:4:37,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:117,44:.:-0.65:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:259,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:169,50:.: 0.41:1.000:. ./.:4:145,51:.:-0.01:1.000:. ./.:4:138,44:.:-0.26:1.000:. ./.:4:168,54:.: 0.46:1.000:. ./.:4:151,57:.: 0.21:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.48:1.000:. ./.:6:125,36:.:-0.65:1.000:. ./.:4:174,52:.: 0.53:1.000:. ./.:4:172,55:.: 0.55:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:135,44:.:-0.32:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:129,46:.:-0.39:1.000:. ./.:4:186,62:.: 0.93:1.000:. ./.:4:134,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.72:0.887:. ./.:4:97,66:.:-0.61:1.000:. ./.:4:179,55:.: 0.68:1.000:. ./.:4:120,46:.:-0.56:0.999:. ./.:4:174,46:.: 0.43:1.000:. ./.:4:175,61:.: 0.72:1.000:. ./.:4:140,49:.:-0.14:1.000:. ./.:4:126,44:.:-0.48:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:153,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.68:0.915:. ./.:4:170,58:.: 0.57:1.000:. ./.:4:160,46:.: 0.17:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:171,68:.: 0.77:1.000:. ./.:4:159,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:108,37:.:-0.94:1.000:. ./.:4:155,45:.: 0.06:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:118,56:.:-0.41:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:109,32:.:-1.01:1.000:. ./.:4:165,52:.: 0.37:1.000:. ./.:4:141,39:.:-0.30:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:134,39:.:-0.43:1.000:. ./.:4:154,50:.: 0.14:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:168,46:.: 0.32:1.000:. ./.:4:154,58:.: 0.28:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:152,58:.: 0.24:0.994:. ./.:4:141,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:126,42:.:-0.52:1.000:. ./.:4:107,41:.:-0.88:1.000:. ./.:4:151,43:.:-0.05:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.41:0.993:. ./.:4:168,54:.: 0.46:1.000:. ./.:4:130,43:.:-0.43:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:137,55:.:-0.08:0.999:. ./.:4:215,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:120,47:.:-0.54:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:144,46:.:-0.12:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:133,49:.:-0.26:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:142,49:.:-0.10:1.000:. ./.:4:122,51:.:-0.43:1.000:. ./.:4:163,65:.: 0.57:1.000:. ./.:4:180,45:.: 0.52:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:168,54:.: 0.46:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:125,52:.:-0.36:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.30:0.998:. ./.:4:123,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:140,50:.:-0.12:1.000:. ./.:4:223,69:.: 1.73:1.000:. ./.:4:170,55:.: 0.52:1.000:. ./.:4:134,32:.:-0.56:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:140,47:.:-0.17:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:125,38:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,31:.:-1.57:1.000:. ./.:4:200,62:.: 1.19:1.000:. ./.:4:244,82:.: 2.35:1.000:. ./.:4:157,59:.: 0.35:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:184,63:.: 0.92:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:169,63:.: 0.64:1.000:. ./.:4:146,33:.:-0.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-3.37:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:166,63:.: 0.59:1.000:. ./.:4:207,49:.: 1.08:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:200,71:.: 1.35:1.000:. ./.:4:159,44:.: 0.12:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:151,40:.:-0.10:1.000:. ./.:4:171,52:.: 0.48:1.000:. ./.:4:169,67:.: 0.72:1.000:. ./.:4:173,45:.: 0.39:1.000:. ./.:4:136,47:.:-0.25:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.01:0.997:. ./.:4:138,37:.:-0.39:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:123,44:.:-0.54:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:131,44:.:-0.39:1.000:. ./.:4:136,46:.:-0.26:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:271,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:152,73:.: 0.52:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:264,0:.: 1.23:0.956:. ./.:4:280,0:.: 1.52:0.998:. ./.:4:265,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:141,38:.:-0.32:1.000:. ./.:4:181,57:.: 0.75:1.000:. -chr8.1 52552670 chr8.1_052552670 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,144:0.87: 0.98:1.000:0.864 0/1/1/1:4:4,161:0.78: 1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,138:0.80: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,140:0.81: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,41:0.73:-0.49:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,57:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,135:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,117:0.85: 0.58:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,145:0.75: 1.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,141:0.94: 0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,159:0.77: 1.22:0.999:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,160:0.78: 1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,170:0.79: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,27:0.73:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,127:0.86: 0.73:1.000:0.974 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,139:0.81: 0.92:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,184:0.80: 1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,100:0.91: 0.32:1.000:0.937 0/1/1/1:4:1,15:0.74:-0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,63:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/0:3:2,0:0.00:-1.12:0.999:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,132:0.86: 0.80:1.000:0.956 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,137:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,188:0.86: 1.63:1.000:0.979 0/1/1/1:4:12,121:0.73: 0.79:1.000:0.998 0/1/1/1/1:5:4,156:0.77: 1.18:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,138:0.87: 0.89:1.000:0.920 0/1/1/1:4:2,156:0.88: 1.15:1.000:0.673 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,142:0.81: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,131:0.79: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,137:0.74: 0.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,149:0.75: 1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,147:0.76: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:11,117:0.73: 0.71:1.000:0.637 0/1/1/1:4:13,155:0.74: 1.30:1.000:0.998 1/1/1/1:4:1,129:0.93: 0.74:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,142:0.74: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,117:0.74: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,128:0.79: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,143:0.75: 0.99:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.03:0.887:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,161:0.74: 1.34:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,121:0.92: 0.63:0.999:0.995 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,138:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,116:0.74: 0.66:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,134:0.93: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,118:0.85: 0.60:1.000:0.991 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.06:0.915:1.000 0/1/1/1:4:3,150:0.82: 1.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,155:0.74: 1.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,103:0.74: 0.44:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,162:0.89: 1.24:1.000:0.549 0/1/1/1:4:2,112:0.84: 0.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,96:0.74: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,94:0.90: 0.23:1.000:0.865 0/1/1/1:4:5,147:0.75: 1.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,159:0.75: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,98:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,159:0.75: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,110:0.76: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,164:0.74: 1.40:0.994:0.999 0/1/1/1:4:4,112:0.75: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,113:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,101:0.74: 0.41:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,180:0.75: 1.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,180:0.85: 1.51:0.993:0.988 1/1/1/1:4:1,128:0.93: 0.73:1.000:0.998 0/1/1/1:4:2,123:0.85: 0.67:1.000:0.984 0/1/1/1:4:3,177:0.85: 1.47:1.000:0.991 0/1/1/1:4:12,144:0.74: 1.12:0.999:0.998 0/1/1/1:4:6,160:0.75: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,146:0.74: 1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,131:0.75: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,106:0.75: 0.47:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,134:0.74: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,156:0.75: 1.21:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,119:0.74: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,102:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,135:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.97:0.998:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,141:0.87: 0.93:1.000:0.895 1/1/1/1:4:0,172:1.00: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,142:0.74: 1.02:1.000:0.999 0/1/1/1:4:9,121:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,105:0.75: 0.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,135:0.75: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,138:0.87: 0.89:1.000:0.920 1/1/1/1:4:1,115:0.92: 0.54:1.000:0.990 0/1/1/1:4:4,105:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,195:0.91: 1.72:1.000:0.914 0/1/1/1:4:5,115:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,143:0.81: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,119:0.75: 0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,95:0.90: 0.25:1.000:0.881 0/0/0/0:4:1,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,138:0.75: 0.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,155:0.77: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,138:0.80: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,135:0.75: 0.89:1.000:0.999 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,151:0.76: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,124:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,124:0.78: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:0.997:1.000 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:6,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,106:0.75: 0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,160:0.89: 1.21:1.000:0.591 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,83:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:2,144:0.87: 0.98:0.956:0.864 0/1/1/1:4:4,170:0.79: 1.38:0.998:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,110:0.92: 0.47:1.000:0.982 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 -chr8.1 52815934 chr8.1_052815934 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:219,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:187,1:.:-0.41:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:259,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:235,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:213,2:.: 0.08:1.000:. ./.:4:212,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:53,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:304,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:258,0:.: 0.86:0.999:. ./.:4:250,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:39,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:234,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:210,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:271,1:.: 1.11:1.000:. ./.:4:291,1:.: 1.48:1.000:. ./.:4:270,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:16,0:.:-3.55:1.000:. ./.:4:96,0:.:-2.09:1.000:. ./.:3:12,0:.:-3.62:0.999:. ./.:4:219,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:201,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.22:1.000:. ./.:5:319,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:231,2:.: 0.40:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.78:1.000:. ./.:6:207,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:269,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.27:0.887:. ./.:4:211,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:194,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:191,1:.:-0.34:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.83:0.915:. ./.:4:258,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:195,1:.:-0.27:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:154,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:352,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.99:0.994:. ./.:4:187,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.57:0.993:. ./.:4:227,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.93:0.999:. ./.:4:231,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.69:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:155,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:257,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:125,0:.:-1.56:0.998:. ./.:4:163,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:322,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:233,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:257,1:.: 0.86:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:195,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:312,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:250,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:153,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:42,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:248,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:281,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:202,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.65:1.000:. ./.:4:273,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.12:0.997:. ./.:4:217,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:215,1:.: 0.10:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:222,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:275,0:.: 1.17:0.956:. ./.:4:302,1:.: 1.68:0.998:. ./.:4:302,1:.: 1.68:1.000:. ./.:4:182,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.11:1.000:. -chr8.1 53067997 chr8.1_053067997 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:390,124:0.28: 0.73:1.000:0.995 0/1/1/1:4:106,300:0.73:-0.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:223,210:0.48:-0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,417:0.78: 0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:233,252:0.52: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:132,419:0.75: 1.17:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,330:1.00:-1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,496:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,261:0.53: 0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:103,186:0.64:-1.96:1.000:0.667 0/1/1/1:4:64,306:0.82:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:217,320:0.59: 1.00:1.000:0.857 0/1/1/1:4:103,321:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:255,250:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:241,206:0.46:-0.07:1.000:0.990 0/1/1/1:4:125,368:0.74: 0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:261,286:0.52: 1.12:0.999:0.995 1/1/1/1:4:1,448:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:288,277:0.49: 1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:277,345:0.55: 2.02:1.000:0.979 0/0/0/1:4:192,100:0.37:-1.92:1.000:0.604 0/0/1/1:4:212,218:0.50:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:131,429:0.76: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:226,216:0.49:-0.13:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,228:1.00:-2.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:117,430:0.78: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:367,133:0.30: 0.56:1.000:0.982 0/1/1/1:4:117,332:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:259,304:0.54: 1.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:251,259:0.50: 0.68:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,528:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,296:0.76:-0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,189:1.00:-3.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:168,174:0.51:-1.32:1.000:0.997 0/1/1:3:34,87:0.71:-3.96:0.999:1.000 0/0/1/1:4:241,275:0.53: 0.75:1.000:0.993 0/1/1/1:4:97,376:0.79: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:262,227:0.47: 0.43:1.000:0.991 0/1/1/1:4:129,397:0.75: 0.87:1.000:0.999 0/0/0/1:4:427,112:0.26: 1.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:261,250:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/1/1/1:4:124,381:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:256,265:0.51: 0.81:1.000:0.997 0/1/1/1:4:98,316:0.76:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,373:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:110,362:0.76: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:277,413:0.59: 2.83:1.000:0.969 0/0/1/1:4:98,149:0.60:-2.46:1.000:0.804 1/1/1/1:4:0,372:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,314:0.75:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:268,93:0.30:-1.10:1.000:0.988 0/1/1/1:4:112,421:0.78: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,296:0.75:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:121,334:0.73: 0.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:1,464:1.00: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,377:0.79: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,469:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,283:0.55: 0.66:1.000:0.977 0/0/1/1:4:219,229:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:147,220:0.59:-1.03:1.000:0.602 0/0/1/1:4:227,219:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,264:0.73:-1.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:114,400:0.77: 0.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:103,321:0.75:-0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:225,217:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,327:0.77:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,278:0.72:-0.82:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,486:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:245,235:0.49: 0.32:0.887:0.996 0/1/1/1:4:106,342:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:124,430:0.77: 1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,326:1.00:-1.52:0.999:1.000 0/0/1/1:4:229,277:0.54: 0.63:1.000:0.985 0/1/1/1:4:124,344:0.73: 0.18:1.000:0.997 0/1/1/1:4:101,389:0.79: 0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,413:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,321:0.76:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,377:0.78: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,502:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,256:0.53: 0.29:1.000:0.991 0/0/1/1:4:204,190:0.48:-0.70:0.915:0.995 0/1/1/1:4:123,360:0.74: 0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:254,261:0.50: 0.74:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,204:0.53:-0.82:1.000:0.993 0/0/1/1:4:244,236:0.49: 0.32:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,517:1.00: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,277:0.75:-1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:183,196:0.51:-0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:218,216:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/1:4:302,73:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:89,280:0.75:-1.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,215:0.52:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:383,117:0.28: 0.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:89,270:0.75:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:133,417:0.75: 1.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:107,369:0.77: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,257:0.72:-1.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,450:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:239,252:0.51: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:258,252:0.49: 0.68:1.000:0.996 0/0/1/1:4:186,193:0.51:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:407,136:0.29: 1.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:173,156:0.48:-1.48:1.000:0.994 0/1/1/1:4:95,347:0.78:-0.13:0.994:1.000 0/0/1/1:4:202,200:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:87,309:0.77:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:95,310:0.76:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:133,406:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:142,414:0.74: 1.23:0.993:0.999 0/1/1/1:4:96,344:0.78:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,449:1.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:320,303:0.49: 2.03:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,508:1.00: 0.66:0.999:1.000 0/0/1/1:4:218,207:0.49:-0.33:1.000:0.996 0/1/1/1:4:80,254:0.75:-1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:252,270:0.51: 0.82:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,333:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,294:0.74:-0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:120,377:0.75: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:113,305:0.72:-0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:229,250:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/1/1/1:4:111,316:0.73:-0.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:118,390:0.76: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:230,258:0.52: 0.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:212,217:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:223,236:0.51: 0.07:1.000:0.996 1/1/1/1:4:1,443:1.00:-0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,432:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,186:0.52:-1.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:117,275:0.70:-0.73:1.000:0.980 0/0/1/1:4:214,213:0.50:-0.31:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,486:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,145:0.50:-1.93:0.998:0.997 0/1/1/1:4:105,373:0.77: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,224:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:330,331:0.50: 2.48:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,444:1.00:-0.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,299:0.71:-0.43:1.000:0.992 0/1/1/1:4:97,263:0.72:-1.11:1.000:0.996 0/0/1/1:4:205,197:0.49:-0.61:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,461:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:217,175:0.45:-0.73:1.000:0.982 0/0/1/1:4:222,213:0.49:-0.21:1.000:0.996 0/1/1/1:4:94,270:0.73:-1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:123,428:0.77: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:295,307:0.51: 1.78:1.000:0.997 0/1/1/1:4:114,361:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:106,301:0.73:-0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:143,376:0.72: 0.79:1.000:0.995 0/0/1/1:4:195,215:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:158,429:0.72: 1.60:1.000:0.997 0/1/1/1:4:122,359:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,86:0.37:-2.41:1.000:0.602 0/1/1/1:4:76,239:0.75:-1.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:114,422:0.78: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,376:0.76: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:146,420:0.74: 1.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:258,285:0.52: 1.08:1.000:0.995 0/0/0/1:4:292,104:0.30:-0.68:1.000:0.984 0/0/1/1:4:264,276:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:118,285:0.70:-0.60:1.000:0.986 0/0/1/1:4:176,166:0.49:-1.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:104,302:0.74:-0.56:1.000:0.998 0/1/1/1:4:95,377:0.79: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:119,356:0.74: 0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,487:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:116,326:0.73:-0.13:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,503:1.00: 0.60:0.997:1.000 0/0/1/1:4:234,244:0.51: 0.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:217,254:0.54: 0.22:1.000:0.990 0/1/1/1:4:103,318:0.75:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:85,294:0.77:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:234,237:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:220,223:0.50:-0.12:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,292:0.72:-0.63:1.000:0.996 0/0/1/1:4:185,172:0.48:-1.15:1.000:0.995 0/0/1/1:4:292,302:0.50: 1.68:1.000:0.997 0/1/1/1:4:132,407:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:126,372:0.74: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,345:0.77:-0.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,527:1.00: 0.88:0.956:1.000 0/1/1/1:4:148,434:0.74: 1.54:0.998:0.999 0/0/0/1:4:454,167:0.31: 2.01:1.000:0.979 0/1/1/1:4:98,334:0.77:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:123,336:0.73: 0.07:1.000:0.997 -chr8.1 53338265 chr8.1_053338265 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:79,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:61,18:.: 0.37:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:57,19:.: 0.22:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:62,65:.: 2.73:1.000:. ./.:4:30,14:.:-1.35:1.000:. ./.:4:65,21:.: 0.71:1.000:. ./.:4:40,42:.: 0.52:1.000:. ./.:4:21,2:.:-2.38:1.000:. ./.:4:13,1:.:-2.83:1.000:. ./.:4:62,22:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,23:.: 0.17:1.000:. ./.:4:62,26:.: 0.81:1.000:. ./.:4:70,19:.: 0.86:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.91:0.999:. ./.:4:64,25:.: 0.86:1.000:. ./.:4:57,57:.: 2.09:1.000:. ./.:4:45,21:.:-0.27:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:57,22:.: 0.37:1.000:. ./.:4:37,48:.: 0.67:1.000:. ./.:4:3,2:.:-3.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:72,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:44,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:65,25:.: 0.91:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:44,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:49,15:.:-0.37:1.000:. ./.:4:6,4:.:-3.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-2.04:1.000:. ./.:3:9,1:.:-3.02:0.999:. ./.:4:63,22:.: 0.67:1.000:. ./.:4:46,16:.:-0.47:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:52,21:.: 0.08:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:51,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:28,42:.:-0.07:1.000:. ./.:4:53,22:.: 0.17:1.000:. ./.:4:51,23:.: 0.12:1.000:. ./.:5:77,27:.: 1.60:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:35,38:.: 0.08:1.000:. ./.:4:27,6:.:-1.89:1.000:. ./.:4:39,15:.:-0.86:1.000:. ./.:4:47,48:.: 1.16:1.000:. ./.:4:63,16:.: 0.37:1.000:. ./.:4:42,45:.: 0.76:1.000:. ./.:4:56,22:.: 0.32:1.000:. ./.:4:54,24:.: 0.32:1.000:. ./.:4:46,48:.: 1.11:1.000:. ./.:4:50,18:.:-0.17:1.000:. ./.:4:54,26:.: 0.42:1.000:. ./.:6:58,2:.:-0.56:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:58,22:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.91:1.000:. ./.:4:38,45:.: 0.57:1.000:. ./.:4:51,32:.: 0.57:1.000:. ./.:4:35,11:.:-1.25:1.000:. ./.:4:27,46:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,18:.:-0.42:0.887:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:69,21:.: 0.91:1.000:. ./.:4:41,17:.:-0.66:0.999:. ./.:4:63,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:59,24:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,23:.:-1.01:1.000:. ./.:4:36,45:.: 0.47:1.000:. ./.:4:34,38:.: 0.03:1.000:. ./.:4:46,41:.: 0.76:1.000:. ./.:4:58,19:.: 0.27:1.000:. ./.:4:45,16:.:-0.51:0.915:. ./.:4:46,19:.:-0.32:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:68,21:.: 0.86:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:80,27:.: 1.75:1.000:. ./.:4:47,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,19:.: 0.17:1.000:. ./.:4:41,16:.:-0.71:1.000:. ./.:4:54,22:.: 0.22:1.000:. ./.:4:28,29:.:-0.71:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:67,20:.: 0.76:1.000:. ./.:4:47,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:35,34:.:-0.12:1.000:. ./.:4:37,17:.:-0.86:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,15:.:-0.47:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.96:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.02:0.994:. ./.:4:31,13:.:-1.35:1.000:. ./.:4:63,24:.: 0.76:1.000:. ./.:4:40,23:.:-0.42:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:71,25:.: 1.21:0.993:. ./.:4:70,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:47,21:.:-0.17:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.96:0.999:. ./.:4:76,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:26,23:.:-1.10:1.000:. ./.:4:43,46:.: 0.86:1.000:. ./.:4:54,21:.: 0.17:1.000:. ./.:4:22,31:.:-0.91:1.000:. ./.:4:37,51:.: 0.81:1.000:. ./.:4:40,19:.:-0.61:1.000:. ./.:4:57,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:54,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:26,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:43,12:.:-0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:48,42:.: 0.91:1.000:. ./.:4:31,23:.:-0.86:1.000:. ./.:4:45,7:.:-0.96:1.000:. ./.:4:40,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:46,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:74,19:.: 1.06:1.000:. ./.:4:26,15:.:-1.50:0.998:. ./.:4:40,11:.:-1.01:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:27,35:.:-0.47:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:25,27:.:-0.96:1.000:. ./.:4:48,12:.:-0.56:1.000:. ./.:4:36,37:.: 0.08:1.000:. ./.:4:66,22:.: 0.81:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:26,14:.:-1.55:1.000:. ./.:4:53,61:.: 2.09:1.000:. ./.:4:101,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:59,20:.: 0.37:1.000:. ./.:4:46,42:.: 0.81:1.000:. ./.:4:62,55:.: 2.24:1.000:. ./.:4:31,31:.:-0.47:1.000:. ./.:4:74,29:.: 1.55:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:15,6:.:-2.48:1.000:. ./.:4:49,14:.:-0.42:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.17:1.000:. ./.:4:66,38:.: 1.60:1.000:. ./.:4:69,33:.: 1.50:1.000:. ./.:4:76,21:.: 1.26:1.000:. ./.:4:47,16:.:-0.42:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:65,20:.: 0.67:1.000:. ./.:4:34,43:.: 0.27:1.000:. ./.:4:33,17:.:-1.06:1.000:. ./.:4:56,19:.: 0.17:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:61,29:.: 0.91:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:30,48:.: 0.32:0.997:. ./.:4:55,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:54,17:.:-0.02:1.000:. ./.:4:39,18:.:-0.71:1.000:. ./.:4:36,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:54,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:46,23:.:-0.12:1.000:. ./.:4:24,29:.:-0.91:1.000:. ./.:4:25,32:.:-0.71:1.000:. ./.:4:46,59:.: 1.65:1.000:. ./.:4:56,24:.: 0.42:1.000:. ./.:4:46,43:.: 0.86:1.000:. ./.:4:39,50:.: 0.86:1.000:. ./.:4:30,34:.:-0.37:0.956:. ./.:4:56,14:.:-0.07:0.998:. ./.:4:109,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:74,18:.: 1.01:1.000:. -chr8.1 53494519 chr8.1_053494519 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,15:0.51:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,11:0.35:-0.43:1.000:0.771 0/0/0/1:4:20,7:0.31:-0.73:1.000:0.973 0/0/0/1:4:61,27:0.35: 1.57:1.000:0.821 0/0/0/1:4:41,14:0.31: 0.33:1.000:0.978 0/0/0/0:4:16,1:0.08:-1.11:1.000:0.985 0/0/0/0:4:52,2:0.05: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,4:0.49:-1.44:1.000:0.997 0/1/1/1:4:3,10:0.69:-1.26:1.000:0.968 0/1/1/1:4:8,18:0.63:-0.77:1.000:0.586 0/0/0/1:4:12,6:0.37:-1.07:1.000:0.605 0/0/0/1:4:21,9:0.34:-0.62:1.000:0.860 0/0/1/1:4:32,21:0.41: 0.25:1.000:0.889 0/0/1/1:4:23,21:0.48:-0.09:1.000:0.994 0/0/0/1:4:39,12:0.29: 0.17:1.000:0.991 0/0/1/1:4:24,17:0.43:-0.20:0.999:0.943 0/0/0/1:4:62,11:0.21: 1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,37:0.66: 0.17:1.000:0.838 0/0/1/1:4:6,8:0.55:-1.22:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,4:0.10: 0.29:1.000:0.727 0/0/0/0:4:64,1:0.02: 0.70:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-1.18:1.000:0.992 0/0/0/1:4:17,3:0.21:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,9:0.27:-0.09:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.44:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,4:0.10: 0.29:1.000:0.727 0/0/1/1:4:14,15:0.51:-0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,4:0.35:-1.26:1.000:0.816 0/0/0/0:4:44,2:0.06:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,7:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,13:0.54:-0.88:1.000:0.987 0/0/1/1:4:40,46:0.52: 1.49:1.000:0.995 0/0/1:3:12,2:0.20:-1.22:0.999:0.998 0/0/0/1:4:32,10:0.29:-0.16:1.000:0.989 0/0/0/1:4:38,9:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:32,8:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,12:0.24: 0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.45:-0.54:1.000:0.975 0/0/0/1:4:62,17:0.28: 1.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,27:0.36: 1.34:1.000:0.644 0/0/0/1:4:35,18:0.37: 0.25:1.000:0.543 0/0/0/1:4:64,10:0.19: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,28:0.43: 0.81:1.000:0.936 0/0/0/0/1:5:42,6:0.17: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,41:0.49: 1.34:1.000:0.997 0/0/0/1:4:37,6:0.19:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,11:0.20: 1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,47:0.44: 2.32:1.000:0.973 0/0/0/1:4:52,6:0.14: 0.44:1.000:0.978 0/0/1/1:4:5,9:0.60:-1.22:1.000:0.821 0/0/0/0:4:75,6:0.10: 1.30:1.000:0.727 0/0/0/0:4:48,4:0.11: 0.21:1.000:0.611 0/0/0/1:4:33,7:0.24:-0.24:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,27:0.49: 0.33:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:35,6:0.20:-0.20:1.000:0.909 0/0/1/1:4:27,16:0.40:-0.13:1.000:0.756 0/0/1/1:4:17,17:0.49:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:64,22:0.31: 1.49:1.000:0.977 0/0/0/1:4:42,18:0.34: 0.51:1.000:0.860 0/1/1/1:4:3,7:0.64:-1.37:1.000:0.656 0/1/1/1:4:28,66:0.64: 1.79:1.000:0.674 0/0/0/1:4:20,6:0.29:-0.77:1.000:0.992 0/0/1/1:4:19,11:0.39:-0.62:1.000:0.715 0/0/0/1:4:28,9:0.30:-0.35:0.887:0.987 0/0/1/1:4:32,20:0.41: 0.21:1.000:0.836 0/0/1/1:4:31,20:0.41: 0.17:1.000:0.873 0/0/0/1:4:68,8:0.15: 1.12:0.999:0.983 0/0/1/1:4:32,17:0.38: 0.10:1.000:0.531 0/0/0/1:4:32,8:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:31,19:0.40: 0.14:1.000:0.809 0/0/0/0:4:38,3:0.10:-0.20:1.000:0.759 0/0/1/1:4:23,20:0.47:-0.13:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,8:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:53,65:0.53: 2.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:33,23:0.43: 0.36:1.000:0.934 0/0/0/1:4:9,4:0.35:-1.26:0.915:0.816 0/0/1/1:4:54,68:0.53: 2.85:1.000:0.990 0/0/0/1:4:29,14:0.36:-0.13:1.000:0.678 0/0/1/1:4:18,25:0.55:-0.13:1.000:0.978 0/0/0/1:4:48,18:0.32: 0.74:1.000:0.952 0/0/0/1:4:92,16:0.21: 2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,12:0.51:-0.88:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.29:-0.92:1.000:0.993 0/0/1/1:4:28,50:0.59: 1.19:1.000:0.831 1/1/1/1:4:0,74:1.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,10:0.36:-0.58:1.000:0.705 0/0/0/1:4:56,16:0.28: 0.97:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,10:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,33:0.43: 1.19:1.000:0.958 0/0/0/1:4:51,8:0.19: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,16:0.37: 0.02:1.000:0.535 0/0/0/1:4:53,13:0.26: 0.74:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,11:0.37:-0.50:1.000:0.605 0/0/0/1:4:52,8:0.19: 0.51:0.994:0.999 0/0/1/1:4:17,13:0.44:-0.62:1.000:0.971 0/1/1/1:4:31,87:0.66: 2.70:1.000:0.893 0/0/0/1:4:36,13:0.32: 0.10:1.000:0.965 0/0/0/1:4:16,2:0.15:-1.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:63,8:0.16: 0.93:0.993:0.994 0/0/1/1:4:39,61:0.57: 2.02:1.000:0.939 0/0/0/1:4:82,12:0.18: 1.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,16:0.24: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,7:0.16: 0.59:0.999:0.994 0/0/0/1:4:55,13:0.26: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,4:0.71:-1.56:1.000:0.991 0/1/1/1:4:5,12:0.64:-1.11:1.000:0.706 0/0/0/0:4:64,3:0.06: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,5:0.17:-0.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,23:0.67:-0.58:1.000:0.909 0/0/0/1:4:62,12:0.23: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,84:0.67: 2.47:1.000:0.933 0/0/1/1:4:33,24:0.43: 0.40:1.000:0.955 0/0/1/1:4:7,11:0.57:-1.07:1.000:0.937 0/0/0/1:4:16,5:0.29:-0.95:1.000:0.989 0/0/0/1:4:44,18:0.33: 0.59:1.000:0.902 0/0/1/1:4:30,16:0.38:-0.01:1.000:0.540 0/0/0/1:4:43,4:0.12: 0.02:1.000:0.726 0/0/0/0:4:37,3:0.10:-0.24:1.000:0.691 0/0/0/1:4:26,5:0.22:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,5:0.12: 0.48:1.000:0.713 0/0/0/1:4:32,8:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:36,7:0.23:-0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,2:0.15:-1.07:0.998:0.992 0/0/0/1:4:32,8:0.27:-0.24:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,8:0.36:-0.80:1.000:0.727 0/0/1/1:4:39,56:0.56: 1.83:1.000:0.970 0/0/0/1:4:28,3:0.13:-0.58:1.000:0.943 0/0/0/1:4:40,9:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,4:0.27:-0.99:1.000:0.998 0/0/1/1:4:21,32:0.57: 0.25:1.000:0.951 0/0/1/1:4:34,27:0.45: 0.55:1.000:0.980 0/0/0/1:4:30,12:0.33:-0.16:1.000:0.918 0/0/1/1:4:9,5:0.38:-1.22:1.000:0.631 0/0/1/1:4:15,9:0.40:-0.84:1.000:0.777 0/0/1/1:4:15,32:0.62: 0.02:1.000:0.523 0/0/0/1:4:38,16:0.34: 0.29:1.000:0.878 0/0/1/1:4:43,25:0.39: 0.81:1.000:0.722 0/0/0/1:4:27,4:0.18:-0.58:1.000:0.999 0/1/1/1:4:40,121:0.67: 4.32:1.000:0.937 0/1/1/1:4:6,13:0.63:-1.03:1.000:0.509 0/0/0/1:4:41,9:0.25: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,9:0.26: 0.02:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,3:0.14:-0.65:1.000:0.978 0/0/0/1:4:44,13:0.29: 0.40:1.000:0.993 0/0/0/1:4:30,15:0.37:-0.05:1.000:0.605 0/0/0/1:4:71,7:0.12: 1.19:1.000:0.849 0/0/0/1:4:46,10:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,6:0.75:-1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:17,3:0.21:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.22:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,46:0.69: 0.48:1.000:0.979 0/0/0/1:4:25,9:0.31:-0.47:1.000:0.966 0/0/0/1:4:24,7:0.29:-0.58:1.000:0.994 0/0/0/1:4:42,4:0.12:-0.01:1.000:0.782 0/0/0/1:4:50,14:0.28: 0.66:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,10:0.26: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,20:0.38: 0.40:0.997:0.571 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.56:1.000:0.903 0/0/0/1:4:20,4:0.23:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.16:-0.77:1.000:0.995 0/0/0/1:4:29,8:0.28:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:13,10:0.44:-0.88:1.000:0.973 0/1/1/1:4:9,20:0.63:-0.65:1.000:0.561 0/0/1/1:4:6,12:0.61:-1.07:1.000:0.653 0/1/1/1:4:1,6:0.75:-1.48:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,17:0.67:-0.88:1.000:0.899 0/0/0/1:4:61,10:0.20: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,17:0.52:-0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:31,7:0.25:-0.31:1.000:0.999 0/0/0/0:4:48,1:0.03: 0.10:0.956:1.000 0/0/0/0:4:54,0:0.00: 0.29:0.998:1.000 0/0/0/1:4:41,14:0.31: 0.33:1.000:0.978 0/0/0/1:4:55,12:0.25: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,7:0.30:-0.65:1.000:0.988 -chr8.1 53767433 chr8.1_053767433 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:209,174:0.47: 1.21:1.000:0.992 0/1/1/1:4:66,208:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:154,167:0.53: 0.51:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,323:1.00: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:98,255:0.73: 0.87:1.000:0.998 0/0/1/1:4:212,213:0.51: 1.68:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,286:1.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,327:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,170:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/0/1/1:4:27,26:0.50:-2.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,31:0.56:-2.47:1.000:0.973 0/1/1/1:4:83,355:0.82: 1.83:1.000:0.999 0/0/1/1:4:163,155:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:169,193:0.55: 0.97:1.000:0.984 0/0/1/1:4:161,130:0.46: 0.17:1.000:0.989 0/1/1/1:4:88,255:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:104,238:0.71: 0.75:0.999:0.990 0/1/1/1:4:94,244:0.73: 0.70:1.000:0.998 0/0/1/1:4:206,232:0.54: 1.83:1.000:0.986 0/1/1/1:4:120,339:0.75: 2.07:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,32:0.66:-2.56:1.000:0.893 0/1/1/1:4:73,231:0.77: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,355:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,146:0.52: 0.15:1.000:0.995 0/1/1/1:4:5,26:0.84:-2.77:1.000:0.992 0/1/1/1:4:71,242:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,159:0.54: 0.26:1.000:0.985 0/0/1/1:4:148,149:0.51: 0.24:1.000:0.996 0/1/1/1:4:100,306:0.76: 1.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,285:0.77: 1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,333:1.00: 0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,132:0.50:-0.08:1.000:0.997 0/1/1/1:4:4,29:0.88:-2.74:1.000:0.680 0/1/1/1:4:18,38:0.69:-2.48:1.000:0.972 0/0/1:3:16,7:0.33:-2.86:0.999:1.000 0/1/1/1:4:94,271:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,226:0.75: 0.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:95,254:0.74: 0.83:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,195:0.78:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:193,83:0.33: 0.00:1.000:0.919 0/0/1/1:4:139,120:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:78,203:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:91,197:0.69: 0.14:1.000:0.980 0/1/1/1:4:63,174:0.74:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:160,178:0.54: 0.70:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,284:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:292,180:0.40: 2.21:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-2.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,156:0.72:-0.62:1.000:0.994 0/0/1/1:4:64,50:0.46:-1.83:1.000:0.985 0/0/0/1:4:152,41:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,261:0.73: 0.96:1.000:0.998 0/0/1/1:4:124,98:0.46:-0.61:1.000:0.987 0/0/1/1:4:152,123:0.46:-0.01:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,350:1.00: 0.84:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,209:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,183:0.72:-0.20:1.000:0.995 0/0/0/1:4:206,51:0.24:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:177,52:0.26:-0.53:1.000:0.998 0/1/1/1/1/1:6:30,126:0.82:-1.36:1.000:0.964 0/1/1/1:4:94,223:0.71: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:158,138:0.48: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:150,130:0.48: 0.05:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,203:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,143:0.47: 0.47:1.000:0.991 0/0/1/1:4:117,111:0.50:-0.54:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,235:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:79,219:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:56,169:0.76:-0.58:0.887:1.000 1/1/1/1:4:0,292:1.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,139:0.48: 0.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,146:1.00:-1.47:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,276:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,312:1.00: 0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:70,199:0.75:-0.08:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,188:1.00:-0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,152:0.73:-0.75:1.000:0.998 0/0/1/1:4:110,111:0.52:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:58,175:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:78,187:0.72:-0.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:57,158:0.74:-0.69:0.915:0.999 1/1/1/1:4:0,308:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,225:0.73: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:126,129:0.52:-0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:49,139:0.75:-0.99:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,289:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,71:0.40:-0.98:1.000:0.778 0/0/0/1:4:163,57:0.29:-0.63:1.000:0.990 0/0/0/1:4:171,47:0.25:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:203,70:0.29:-0.03:1.000:0.992 0/0/1/1:4:117,95:0.46:-0.72:1.000:0.990 0/0/1/1:4:125,130:0.52:-0.24:1.000:0.994 0/0/0/1:4:223,70:0.27: 0.19:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,209:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,197:0.77:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,169:0.74:-0.49:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,168:0.79:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,140:0.79:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,128:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:67,235:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:216,66:0.27: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:147,141:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:104,105:0.52:-0.76:1.000:0.996 0/1/1/1:4:67,193:0.75:-0.18:0.994:0.999 0/0/1/1:4:85,92:0.53:-1.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:142,109:0.45:-0.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:83,94:0.54:-1.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:142,159:0.54: 0.28:1.000:0.987 0/0/1/1:4:230,211:0.49: 1.86:0.993:0.996 0/1/1/1:4:67,221:0.78: 0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,160:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:133,330:0.72: 2.11:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,240:1.00:-0.41:0.999:1.000 0/1/1/1:4:73,208:0.75: 0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,53:0.45:-1.74:1.000:0.982 0/0/1/1:4:163,139:0.48: 0.29:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,203:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,137:0.70:-0.87:1.000:0.984 0/0/1/1:4:92,121:0.58:-0.71:1.000:0.914 0/0/1/1:4:118,121:0.52:-0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:73,225:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,117:0.56:-0.71:1.000:0.965 0/0/1/1:4:139,132:0.50:-0.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,204:0.51: 1.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,175:0.79:-0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,188:0.76:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,182:0.74:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,84:0.50:-1.17:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,139:0.77:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,104:0.54:-0.87:1.000:0.990 0/1/1/1:4:71,129:0.66:-0.86:1.000:0.842 1/1/1/1:4:0,366:1.00: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,99:0.72:-1.54:0.998:0.995 0/1/1/1:4:44,138:0.77:-1.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,181:0.75:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:94,291:0.77: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,179:0.74:-0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:76,198:0.73:-0.02:1.000:0.998 0/0/1/1:4:130,90:0.43:-0.63:1.000:0.944 0/0/1/1:4:118,88:0.45:-0.79:1.000:0.975 0/1/1/1:4:67,183:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:138,121:0.48:-0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:71,243:0.78: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,74:0.47:-1.29:1.000:0.993 0/0/1/1:4:221,201:0.49: 1.65:1.000:0.996 0/1/1/1:4:101,323:0.77: 1.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,379:1.00: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,237:0.74: 0.53:1.000:0.999 0/0/1/1:4:156,188:0.56: 0.77:1.000:0.969 0/0/1/1:4:138,126:0.49:-0.14:1.000:0.996 0/1/1/1:4:90,325:0.79: 1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,244:0.73: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,36:0.39:-2.00:1.000:0.664 0/0/1/1:4:175,142:0.46: 0.46:1.000:0.990 0/1/1/1:4:79,223:0.75: 0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,194:0.54: 1.07:1.000:0.990 0/1/1/1:4:121,317:0.73: 1.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:101,276:0.74: 1.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:212,79:0.30: 0.17:1.000:0.981 0/0/1/1:4:198,165:0.47: 0.98:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,265:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:146,146:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:147,164:0.54: 0.40:1.000:0.988 0/1/1/1:4:91,261:0.75: 0.86:1.000:0.999 0/1/1/1:4:77,152:0.67:-0.53:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,337:1.00: 0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,239:0.80: 0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,191:0.54: 0.96:0.997:0.987 0/1/1/1:4:88,264:0.76: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,249:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,153:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,198:0.79:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,66:0.26: 0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,206:0.77:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,104:0.51:-0.77:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,143:0.49: 0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:179,232:0.58: 1.53:1.000:0.927 0/0/1/1:4:151,205:0.59: 0.90:1.000:0.877 0/0/1/1:4:157,180:0.55: 0.69:1.000:0.983 0/1/1/1:4:80,218:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:117,289:0.72: 1.47:0.956:0.996 1/1/1/1:4:0,418:1.00: 1.60:0.998:1.000 0/0/1/1:4:220,218:0.51: 1.83:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,206:0.72: 0.17:1.000:0.995 0/1/1/1:4:76,256:0.78: 0.63:1.000:1.000 -chr8.1 53896871 chr8.1_053896871 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,33:.: 0.81:1.000:. ./.:4:15,15:.: 0.50:1.000:. ./.:4:4,24:.: 0.28:1.000:. ./.:4:11,37:.: 2.40:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:16,26:.: 1.77:1.000:. ./.:4:4,35:.: 1.45:1.000:. ./.:4:1,3:.:-2.26:1.000:. ./.:4:2,4:.:-2.05:1.000:. ./.:4:0,32:.: 0.71:1.000:. ./.:4:5,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:4,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:3,16:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,24:.: 0.60:0.999:. ./.:4:14,14:.: 0.28:1.000:. ./.:4:13,40:.: 2.94:1.000:. ./.:4:12,35:.: 2.30:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.05:1.000:. ./.:4:9,16:.:-0.03:1.000:. ./.:4:13,14:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,30:.: 1.45:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:4,30:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,17:.:-0.56:1.000:. ./.:4:7,26:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.25:1.000:. ./.:4:9,25:.: 0.92:1.000:. ./.:4:4,1:.:-2.15:1.000:. ./.:4:1,11:.:-1.41:1.000:. ./.:3:0,8:.:-1.84:0.999:. ./.:4:5,34:.: 1.45:1.000:. ./.:4:4,25:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:5,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,20:.: 0.07:1.000:. ./.:4:5,8:.:-1.31:1.000:. ./.:4:6,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:7,15:.:-0.35:1.000:. ./.:5:5,29:.: 0.92:1.000:. ./.:4:3,4:.:-1.94:1.000:. ./.:4:8,14:.:-0.35:1.000:. ./.:4:4,6:.:-1.62:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,13:.:-0.56:1.000:. ./.:4:3,18:.:-0.46:1.000:. ./.:4:6,21:.: 0.18:1.000:. ./.:4:12,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:9,6:.:-1.09:1.000:. ./.:4:14,10:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,28:.: 0.28:1.000:. ./.:6:5,17:.:-0.35:1.000:. ./.:4:3,19:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,11:.:-1.31:1.000:. ./.:4:9,23:.: 0.71:1.000:. ./.:4:9,17:.: 0.07:1.000:. ./.:4:6,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:6,20:.: 0.07:1.000:. ./.:4:10,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:16,24:.: 1.56:1.000:. ./.:4:6,27:.: 0.81:0.887:. ./.:4:0,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,19:.:-0.46:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.62:0.999:. ./.:4:0,12:.:-1.41:1.000:. ./.:4:6,11:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,18:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,19:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,22:.: 0.50:1.000:. ./.:4:20,23:.: 1.87:1.000:. ./.:4:2,24:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.88:0.915:. ./.:4:3,24:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.35:1.000:. ./.:4:2,9:.:-1.52:1.000:. ./.:4:12,15:.: 0.18:1.000:. ./.:4:5,11:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,19:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,19:.:-0.03:1.000:. ./.:4:6,17:.:-0.25:1.000:. ./.:4:8,13:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,17:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.31:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.25:1.000:. ./.:4:6,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:4,25:.: 0.39:0.994:. ./.:4:5,18:.:-0.25:1.000:. ./.:4:5,33:.: 1.34:1.000:. ./.:4:9,13:.:-0.35:1.000:. ./.:4:8,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:4,23:.: 0.18:0.993:. ./.:4:5,16:.:-0.46:1.000:. ./.:4:13,22:.: 1.03:1.000:. ./.:4:10,28:.: 1.34:1.000:. ./.:4:11,25:.: 1.13:0.999:. ./.:4:3,20:.:-0.25:1.000:. ./.:4:3,6:.:-1.73:1.000:. ./.:4:10,25:.: 1.03:1.000:. ./.:4:8,19:.: 0.18:1.000:. ./.:4:8,11:.:-0.67:1.000:. ./.:4:11,23:.: 0.92:1.000:. ./.:4:7,20:.: 0.18:1.000:. ./.:4:9,29:.: 1.34:1.000:. ./.:4:2,17:.:-0.67:1.000:. ./.:4:5,21:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.35:1.000:. ./.:4:3,13:.:-0.99:1.000:. ./.:4:6,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,24:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.99:1.000:. ./.:4:8,16:.:-0.14:1.000:. ./.:4:8,22:.: 0.50:1.000:. ./.:4:5,28:.: 0.81:1.000:. ./.:4:5,26:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,13:.:-1.09:0.998:. ./.:4:4,9:.:-1.31:1.000:. ./.:4:3,14:.:-0.88:1.000:. ./.:4:7,21:.: 0.28:1.000:. ./.:4:6,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:9,17:.: 0.07:1.000:. ./.:4:3,23:.: 0.07:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.46:1.000:. ./.:4:5,15:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,16:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,7:.:-1.73:1.000:. ./.:4:7,28:.: 1.03:1.000:. ./.:4:5,25:.: 0.50:1.000:. ./.:4:13,25:.: 1.34:1.000:. ./.:4:7,19:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.46:1.000:. ./.:4:8,18:.: 0.07:1.000:. ./.:4:13,33:.: 2.19:1.000:. ./.:4:4,27:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.47:1.000:. ./.:4:5,13:.:-0.78:1.000:. ./.:4:2,27:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,13:.:-0.67:1.000:. ./.:4:6,15:.:-0.46:1.000:. ./.:4:2,24:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.18:1.000:. ./.:4:15,24:.: 1.45:1.000:. ./.:4:3,24:.: 0.18:1.000:. ./.:4:10,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:11,26:.: 1.24:1.000:. ./.:4:5,20:.:-0.03:1.000:. ./.:4:16,22:.: 1.34:1.000:. ./.:4:7,27:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.60:0.997:. ./.:4:6,24:.: 0.50:1.000:. ./.:4:7,25:.: 0.71:1.000:. ./.:4:6,23:.: 0.39:1.000:. ./.:4:5,19:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,29:.: 1.13:1.000:. ./.:4:7,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:8,22:.: 0.50:1.000:. ./.:4:9,41:.: 2.62:1.000:. ./.:4:9,32:.: 1.66:1.000:. ./.:4:5,38:.: 1.87:1.000:. ./.:4:15,35:.: 2.62:1.000:. ./.:4:13,24:.: 1.24:0.956:. ./.:4:9,20:.: 0.39:0.998:. ./.:4:0,36:.: 1.13:1.000:. ./.:4:8,23:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.25:1.000:. -chr8.1 54081695 chr8.1_054081695 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:214,204:.:-0.09:1.000:. ./.:4:351,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:191,168:.:-0.74:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:363,99:.: 0.39:1.000:. ./.:4:361,105:.: 0.43:1.000:. ./.:4:323,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:371,72:.: 0.18:1.000:. ./.:4:209,75:.:-1.56:1.000:. ./.:4:173,59:.:-2.13:1.000:. ./.:4:434,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:273,90:.:-0.70:1.000:. ./.:4:294,91:.:-0.46:1.000:. ./.:4:281,95:.:-0.55:1.000:. ./.:4:241,63:.:-1.34:1.000:. ./.:4:325,79:.:-0.25:0.999:. ./.:4:362,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:463,113:.: 1.64:1.000:. ./.:4:424,108:.: 1.16:1.000:. ./.:4:90,134:.:-2.22:1.000:. ./.:4:281,102:.:-0.48:1.000:. ./.:4:554,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:354,69:.:-0.04:1.000:. ./.:4:190,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:394,82:.: 0.54:1.000:. ./.:4:170,143:.:-1.24:1.000:. ./.:4:259,89:.:-0.86:1.000:. ./.:4:432,104:.: 1.20:1.000:. ./.:4:267,75:.:-0.93:1.000:. ./.:4:462,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:227,62:.:-1.51:1.000:. ./.:4:285,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:196,82:.:-1.63:1.000:. ./.:3:143,28:.:-2.80:0.999:. ./.:4:399,88:.: 0.66:1.000:. ./.:4:349,97:.: 0.21:1.000:. ./.:4:458,108:.: 1.53:1.000:. ./.:4:313,106:.:-0.08:1.000:. ./.:4:215,160:.:-0.57:1.000:. ./.:4:189,179:.:-0.64:1.000:. ./.:4:299,89:.:-0.42:1.000:. ./.:4:445,88:.: 1.17:1.000:. ./.:4:471,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:367,130:.: 0.77:1.000:. ./.:4:573,0:.: 1.60:1.000:. ./.:5:362,223:.: 1.74:1.000:. ./.:4:115,0:.:-3.41:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:282,111:.:-0.37:1.000:. ./.:4:203,213:.:-0.12:1.000:. ./.:4:582,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:272,79:.:-0.83:1.000:. ./.:4:441,101:.: 1.26:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:440,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:235,224:.: 0.36:1.000:. ./.:4:207,187:.:-0.36:1.000:. ./.:6:353,73:.:-0.01:1.000:. ./.:4:337,99:.: 0.10:1.000:. ./.:4:265,79:.:-0.90:1.000:. ./.:4:340,119:.: 0.36:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:459,120:.: 1.67:1.000:. ./.:4:409,103:.: 0.94:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:525,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:466,128:.: 1.83:0.887:. ./.:4:381,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:372,123:.: 0.75:1.000:. ./.:4:426,0:.:-0.01:0.999:. ./.:4:472,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:540,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:497,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:425,116:.: 1.25:1.000:. ./.:4:523,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:437,105:.: 1.26:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.46:0.915:. ./.:4:556,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:365,123:.: 0.67:1.000:. ./.:4:246,96:.:-0.93:1.000:. ./.:4:352,110:.: 0.39:1.000:. ./.:4:610,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:238,58:.:-1.43:1.000:. ./.:4:214,201:.:-0.13:1.000:. ./.:4:221,195:.:-0.12:1.000:. ./.:4:204,174:.:-0.53:1.000:. ./.:4:326,104:.: 0.04:1.000:. ./.:4:206,207:.:-0.15:1.000:. ./.:4:253,174:.: 0.00:1.000:. ./.:4:363,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:309,122:.: 0.05:1.000:. ./.:4:338,114:.: 0.28:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:389,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:244,235:.: 0.57:1.000:. ./.:4:340,103:.: 0.18:1.000:. ./.:4:228,200:.: 0.02:1.000:. ./.:4:251,228:.: 0.57:1.000:. ./.:4:285,95:.:-0.51:1.000:. ./.:4:299,111:.:-0.18:0.994:. ./.:4:273,91:.:-0.69:1.000:. ./.:4:230,83:.:-1.24:1.000:. ./.:4:274,80:.:-0.80:1.000:. ./.:4:300,101:.:-0.28:1.000:. ./.:4:329,108:.: 0.11:0.993:. ./.:4:280,97:.:-0.54:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:335,115:.: 0.26:1.000:. ./.:4:565,0:.: 1.52:0.999:. ./.:4:312,105:.:-0.10:1.000:. ./.:4:361,81:.: 0.17:1.000:. ./.:4:547,117:.: 2.60:1.000:. ./.:4:458,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:464,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:383,102:.: 0.64:1.000:. ./.:4:242,68:.:-1.28:1.000:. ./.:4:398,102:.: 0.80:1.000:. ./.:4:331,89:.:-0.07:1.000:. ./.:4:469,108:.: 1.65:1.000:. ./.:4:174,178:.:-0.82:1.000:. ./.:4:424,106:.: 1.13:1.000:. ./.:4:374,108:.: 0.61:1.000:. ./.:4:419,100:.: 1.01:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:330,71:.:-0.28:1.000:. ./.:4:264,81:.:-0.89:1.000:. ./.:4:374,91:.: 0.42:1.000:. ./.:4:260,78:.:-0.97:1.000:. ./.:4:274,61:.:-1.00:0.998:. ./.:4:468,103:.: 1.58:1.000:. ./.:4:254,85:.:-0.96:1.000:. ./.:4:366,127:.: 0.73:1.000:. ./.:4:519,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:314,94:.:-0.20:1.000:. ./.:4:361,89:.: 0.26:1.000:. ./.:4:279,99:.:-0.53:1.000:. ./.:4:566,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:307,119:.:-0.01:1.000:. ./.:4:283,101:.:-0.47:1.000:. ./.:4:251,73:.:-1.12:1.000:. ./.:4:444,100:.: 1.29:1.000:. ./.:4:394,128:.: 1.05:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:397,90:.: 0.66:1.000:. ./.:4:364,95:.: 0.36:1.000:. ./.:4:396,94:.: 0.70:1.000:. ./.:4:254,80:.:-1.01:1.000:. ./.:4:98,88:.:-2.64:1.000:. ./.:4:180,57:.:-2.08:1.000:. ./.:4:387,95:.: 0.61:1.000:. ./.:4:268,104:.:-0.60:1.000:. ./.:4:348,87:.: 0.09:1.000:. ./.:4:408,115:.: 1.06:1.000:. ./.:4:174,151:.:-1.11:1.000:. ./.:4:174,216:.:-0.40:1.000:. ./.:4:400,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:293,65:.:-0.75:1.000:. ./.:4:262,97:.:-0.74:1.000:. ./.:4:372,94:.: 0.43:1.000:. ./.:4:256,89:.:-0.89:1.000:. ./.:4:439,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:239,74:.:-1.24:1.000:. ./.:4:344,0:.:-0.90:0.997:. ./.:4:390,107:.: 0.77:1.000:. ./.:4:310,84:.:-0.36:1.000:. ./.:4:210,69:.:-1.62:1.000:. ./.:4:292,76:.:-0.64:1.000:. ./.:4:213,182:.:-0.35:1.000:. ./.:4:375,85:.: 0.37:1.000:. ./.:4:325,82:.:-0.21:1.000:. ./.:4:320,81:.:-0.28:1.000:. ./.:4:412,93:.: 0.86:1.000:. ./.:4:310,97:.:-0.21:1.000:. ./.:4:348,89:.: 0.11:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:480,0:.: 0.59:0.956:. ./.:4:628,0:.: 2.21:0.998:. ./.:4:248,198:.: 0.21:1.000:. ./.:4:215,74:.:-1.51:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.39:1.000:. -chr8.1 54216647 chr8.1_054216647 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:425,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:211,22:.:-0.78:1.000:. ./.:4:333,29:.: 0.52:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:211,24:.:-0.76:1.000:. ./.:4:508,46:.: 2.45:1.000:. ./.:4:181,21:.:-1.09:1.000:. ./.:4:318,43:.: 0.51:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:81,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:201,35:.:-0.75:1.000:. ./.:4:467,1:.: 1.58:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:336,33:.: 0.59:1.000:. ./.:4:322,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:429,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:532,0:.: 2.23:1.000:. ./.:4:424,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:79,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:207,26:.:-0.78:1.000:. ./.:4:227,33:.:-0.51:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:74,0:.:-2.37:1.000:. ./.:4:381,34:.: 1.05:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:274,37:.: 0.01:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:301,33:.: 0.24:1.000:. ./.:4:258,30:.:-0.22:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.48:1.000:. ./.:4:98,0:.:-2.13:1.000:. ./.:3:24,7:.:-2.81:0.999:. ./.:4:296,37:.: 0.23:1.000:. ./.:4:392,29:.: 1.11:1.000:. ./.:4:260,38:.:-0.12:1.000:. ./.:4:228,30:.:-0.53:1.000:. ./.:4:381,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:266,31:.:-0.13:1.000:. ./.:4:299,29:.: 0.18:1.000:. ./.:4:244,32:.:-0.35:1.000:. ./.:4:242,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:249,27:.:-0.35:1.000:. ./.:4:301,0:.:-0.09:1.000:. ./.:5:511,29:.: 2.31:1.000:. ./.:4:166,48:.:-0.97:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:240,29:.:-0.42:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:243,27:.:-0.41:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:288,23:.: 0.01:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:432,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:291,19:.: 0.00:1.000:. ./.:6:193,6:.:-1.12:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:398,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:295,27:.: 0.12:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:534,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:173,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:347,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:188,24:.:-0.99:0.887:. ./.:4:207,27:.:-0.77:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:233,26:.:-0.52:0.999:. ./.:4:119,35:.:-1.57:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:229,30:.:-0.52:1.000:. ./.:4:241,22:.:-0.48:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:309,26:.: 0.25:1.000:. ./.:4:390,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:262,24:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,19:.:-2.05:0.915:. ./.:4:315,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:337,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:172,27:.:-1.12:1.000:. ./.:4:287,23:.: 0.00:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:374,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:198,16:.:-0.97:1.000:. ./.:4:294,26:.: 0.10:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:217,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:258,20:.:-0.33:1.000:. ./.:4:297,25:.: 0.12:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:183,60:.:-0.68:1.000:. ./.:4:336,22:.: 0.48:1.000:. ./.:4:187,31:.:-0.93:1.000:. ./.:4:313,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:166,0:.:-1.45:1.000:. ./.:4:262,20:.:-0.29:0.994:. ./.:4:197,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:371,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:448,32:.: 1.70:0.993:. ./.:4:302,22:.: 0.14:1.000:. ./.:4:246,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:250,36:.:-0.24:1.000:. ./.:4:256,22:.:-0.33:0.999:. ./.:4:166,20:.:-1.25:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:326,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:268,24:.:-0.18:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:384,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:201,27:.:-0.83:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:452,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:391,30:.: 1.11:1.000:. ./.:4:209,25:.:-0.77:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:279,17:.:-0.14:1.000:. ./.:4:176,38:.:-0.97:1.000:. ./.:4:178,30:.:-1.03:1.000:. ./.:4:187,16:.:-1.08:1.000:. ./.:4:212,17:.:-0.82:1.000:. ./.:4:287,32:.: 0.09:1.000:. ./.:4:136,12:.:-1.63:0.998:. ./.:4:343,24:.: 0.57:1.000:. ./.:4:305,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:363,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:231,29:.:-0.51:1.000:. ./.:4:227,18:.:-0.66:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:276,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:681,0:.: 3.72:1.000:. ./.:4:417,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:316,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:623,0:.: 3.14:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:440,35:.: 1.65:1.000:. ./.:4:323,25:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,2:.:-2.19:1.000:. ./.:4:212,17:.:-0.82:1.000:. ./.:4:432,37:.: 1.59:1.000:. ./.:4:480,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:241,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:271,30:.:-0.09:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:423,43:.: 1.56:1.000:. ./.:4:295,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:332,34:.: 0.56:1.000:. ./.:4:332,44:.: 0.66:1.000:. ./.:4:329,32:.: 0.51:1.000:. ./.:4:227,26:.:-0.58:1.000:. ./.:4:235,56:.:-0.19:0.997:. ./.:4:328,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:211,30:.:-0.70:1.000:. ./.:4:253,24:.:-0.34:1.000:. ./.:4:280,26:.:-0.04:1.000:. ./.:4:295,28:.: 0.13:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:293,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:294,29:.: 0.13:1.000:. ./.:4:492,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:292,10:.:-0.08:1.000:. ./.:4:321,42:.: 0.53:0.956:. ./.:4:252,34:.:-0.24:0.998:. ./.:4:312,39:.: 0.41:1.000:. ./.:4:276,23:.:-0.11:1.000:. ./.:4:260,37:.:-0.13:1.000:. -chr8.1 54576127 chr8.1_054576127 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:37,78:0.63: 0.51:1.000:0.568 0/1/1/1:4:14,49:0.77:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,24:0.40:-0.59:1.000:0.797 0/0/1/1:4:64,76:0.48: 1.07:1.000:0.994 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,30:0.69:-1.10:1.000:0.968 0/0/1/1:4:21,29:0.49:-0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,60:0.52: 0.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,33:0.82:-1.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,78:0.79: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,109:0.80: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,61:0.87:-0.48:1.000:0.919 0/0/1/1:4:26,29:0.47:-0.82:1.000:0.992 0/0/1/1:4:11,22:0.61:-1.30:1.000:0.666 0/0/1/1:4:17,29:0.56:-1.01:1.000:0.973 0/0/1/1:4:40,18:0.37:-0.75:1.000:0.500 0/0/1/1:4:35,53:0.51:-0.08:0.999:0.996 0/0/1/1:4:51,53:0.46: 0.27:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,76:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,61:0.49: 0.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:39,98:0.69: 1.00:1.000:0.971 0/0/1/1:4:18,30:0.55:-0.97:1.000:0.982 0/1/1/1:4:19,69:0.78:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,49:0.80:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,153:0.88: 1.80:1.000:0.715 0/1/1/1:4:23,49:0.63:-0.44:1.000:0.614 0/0/1/1:4:50,46:0.45: 0.09:1.000:0.979 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,130:0.76: 1.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,31:0.45:-0.62:1.000:0.981 0/0/1/1:4:35,57:0.54: 0.00:1.000:0.988 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,77:0.75: 0.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:42,108:0.70: 1.29:1.000:0.981 0/1/1:3:23,83:0.78: 0.31:0.999:1.000 0/1/1/1:4:18,42:0.66:-0.70:1.000:0.894 0/1/1/1:4:23,56:0.68:-0.28:1.000:0.949 0/1/1/1:4:21,68:0.76:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,46:0.57:-0.44:1.000:0.949 0/1/1/1:4:10,31:0.75:-1.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,37:0.41: 0.09:1.000:0.850 0/0/1/1:4:50,31:0.41:-0.24:1.000:0.842 0/1/1/1:4:28,90:0.76: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,101:0.76: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,177:0.72: 3.28:1.000:0.996 0/0/0/0/0:5:27,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,124:0.65: 1.93:1.000:0.818 0/1/1/1:4:43,96:0.65: 1.04:1.000:0.789 0/1/1/1:4:19,47:0.68:-0.57:1.000:0.961 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,73:0.71: 0.18:1.000:0.992 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,79:0.52: 0.85:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,50:0.72:-0.53:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,156:0.79: 2.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,67:0.66: 0.09:1.000:0.875 0/0/1/1:4:84,114:0.49: 2.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,98:0.87: 0.45:1.000:0.884 0/0/1/1/1/1:6:41,104:0.69: 1.18:1.000:0.897 0/0/1/1:4:58,100:0.56: 1.47:1.000:0.968 0/0/1/1:4:21,32:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,101:0.52: 1.64:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,75:0.65: 0.38:1.000:0.751 0/0/1/1:4:66,97:0.50: 1.58:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,85:0.62: 0.76:1.000:0.508 0/0/1/1:4:46,70:0.51: 0.54:1.000:0.996 0/1/1/1:4:43,101:0.67: 1.16:0.887:0.905 0/1/1/1:4:32,83:0.70: 0.51:1.000:0.983 0/0/1/1:4:45,59:0.49: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,93:0.53: 1.33:0.999:0.993 1/1/1/1:4:18,192:0.91: 2.62:1.000:0.963 0/1/1/1:4:28,117:0.80: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,92:0.81: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,85:0.67: 0.65:1.000:0.913 0/1/1/1:4:12,87:0.88: 0.16:1.000:0.831 0/0/1/1:4:40,32:0.43:-0.44:1.000:0.956 0/0/1/1:4:78,88:0.47: 1.64:1.000:0.993 0/1/1/1:4:49,134:0.71: 2.02:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.79:0.915:1.000 0/1/1/1:4:57,192:0.77: 3.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,91:0.55: 1.18:1.000:0.979 0/1/1/1:4:9,29:0.76:-1.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,76:0.65: 0.40:1.000:0.793 0/0/1/1:4:53,104:0.61: 1.44:1.000:0.738 0/0/1/1:4:21,34:0.54:-0.82:1.000:0.989 0/0/1/1:4:26,33:0.48:-0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,53:0.70:-0.42:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,22:0.47:-1.13:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,82:0.60: 0.73:1.000:0.826 0/0/1/1:4:27,33:0.48:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,43:0.50:-0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:33,64:0.60: 0.11:1.000:0.778 0/0/1/1:4:48,41:0.44:-0.06:1.000:0.969 0/0/1/1:4:58,89:0.52: 1.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,83:0.87: 0.07:1.000:0.899 0/0/1/1:4:21,35:0.55:-0.79:1.000:0.982 0/0/1/1:4:31,53:0.56:-0.17:1.000:0.972 0/0/1/1:4:23,30:0.49:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,59:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,91:0.50: 1.35:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,37:0.50:-0.66:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,51:0.42: 0.69:0.994:0.917 0/0/1/1:4:30,38:0.48:-0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,31:0.43:-0.46:1.000:0.948 0/0/1/1:4:55,37:0.42: 0.00:1.000:0.893 0/0/1/1:4:29,30:0.46:-0.73:1.000:0.989 0/0/0/1:4:36,1:0.25:-1.21:0.993:0.999 0/0/1/1:4:39,26:0.41:-0.59:1.000:0.888 0/1/1/1:4:34,97:0.73: 0.87:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,32:0.48:-0.75:1.000:0.995 0/1/1/1:4:48,106:0.65: 1.38:0.999:0.754 0/0/1/1:4:29,44:0.51:-0.42:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,66:0.67: 0.05:1.000:0.910 0/1/1/1:4:15,107:0.87: 0.67:1.000:0.857 0/1/1/1:4:26,72:0.72: 0.14:1.000:0.995 1/1/1/1:4:10,94:0.90: 0.27:1.000:0.841 0/0/1/1:4:54,80:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,105:0.64: 1.35:1.000:0.721 0/0/1/1:4:33,55:0.55:-0.08:1.000:0.982 0/0/1/1:4:56,102:0.58: 1.47:1.000:0.917 0/0/1/1:4:19,27:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,105:0.84: 0.71:1.000:0.993 0/1/1/1:4:15,80:0.84: 0.07:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,40:0.75:-0.86:1.000:0.999 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:18,66:0.78:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,80:0.81: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,49:0.49:-0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,65:0.78:-0.20:0.998:1.000 0/0/1/1:4:84,90:0.47: 1.82:1.000:0.991 0/0/1/1:4:61,73:0.48: 0.93:1.000:0.994 0/1/1/1:4:26,69:0.71: 0.07:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,88:0.49: 1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,43:0.40: 0.51:1.000:0.814 0/1/1/1:4:12,39:0.76:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.44:-0.68:1.000:0.967 0/0/1/1:4:36,56:0.52: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,68:0.82:-0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,44:0.70:-0.68:1.000:0.983 0/1/1/1:4:25,67:0.71: 0.00:1.000:0.991 0/1/1/1:4:49,105:0.64: 1.38:1.000:0.639 0/1/1/1:4:33,89:0.71: 0.67:1.000:0.992 0/1/1/1:4:20,77:0.79: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,69:0.56: 0.38:1.000:0.968 0/1/1/1:4:16,44:0.72:-0.70:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,71:0.64: 0.27:1.000:0.656 0/0/1/1:4:22,32:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,69:0.82:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,79:0.79: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,34:0.48:-0.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:45,69:0.52: 0.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,76:0.80: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,36:0.78:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,24:0.42:-0.75:1.000:0.915 0/0/1/1:4:32,61:0.60: 0.03:1.000:0.827 0/0/1/1:4:30,56:0.59:-0.13:1.000:0.876 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,56:0.69:-0.31:1.000:0.977 0/0/1/1:4:31,26:0.44:-0.77:1.000:0.965 0/0/1/1:4:39,52:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,27:0.43:-0.64:1.000:0.938 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:31,93:0.74: 0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,59:0.74:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,40:0.58:-0.66:1.000:0.919 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,71:0.58: 0.40:1.000:0.917 0/0/1/1:4:35,53:0.51:-0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,49:0.80:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,61:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,55:0.79:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,40:0.65:-0.75:1.000:0.775 0/0/1/1:4:24,48:0.61:-0.44:0.956:0.666 0/0/1/1:4:39,60:0.52: 0.16:0.998:0.995 0/0/1/1:4:28,43:0.52:-0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,29:0.65:-1.10:1.000:0.787 0/1/1/1:4:9,51:0.85:-0.70:1.000:0.991 -chr8.1 55294065 chr8.1_055294065 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:133,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:197,47:.: 0.53:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:349,51:.: 2.74:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:287,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:196,32:.: 0.31:1.000:. ./.:4:68,29:.:-1.54:1.000:. ./.:4:123,41:.:-0.60:1.000:. ./.:4:223,56:.: 1.03:1.000:. ./.:4:173,40:.: 0.09:1.000:. ./.:4:183,56:.: 0.46:1.000:. ./.:4:97,45:.:-0.91:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.75:0.999:. ./.:4:236,56:.: 1.21:1.000:. ./.:4:262,65:.: 1.71:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:181,54:.: 0.41:1.000:. ./.:4:160,39:.:-0.10:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:205,39:.: 0.53:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:169,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:302,22:.: 1.66:1.000:. ./.:4:59,0:.:-2.08:1.000:. ./.:3:48,0:.:-2.24:0.995:. ./.:4:201,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:202,59:.: 0.77:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:202,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:134,43:.:-0.41:1.000:. ./.:4:194,59:.: 0.66:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.70:1.000:. ./.:5:299,76:.: 2.38:1.000:. ./.:4:192,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:198,44:.: 0.50:1.000:. ./.:4:124,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:114,43:.:-0.70:1.000:. ./.:4:232,60:.: 1.21:1.000:. ./.:4:124,45:.:-0.53:1.000:. ./.:4:306,59:.: 2.24:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:236,55:.: 1.20:1.000:. ./.:4:169,48:.: 0.15:1.000:. ./.:4:175,32:.: 0.01:1.000:. ./.:6:121,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:140,41:.:-0.36:1.000:. ./.:4:150,66:.: 0.14:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:168,45:.: 0.09:1.000:. ./.:4:221,48:.: 0.89:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:274,58:.: 1.78:1.000:. ./.:4:110,0:.:-1.36:0.887:. ./.:4:188,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:228,56:.: 1.10:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.75:0.999:. ./.:4:143,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:206,56:.: 0.79:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:160,53:.: 0.09:1.000:. ./.:4:239,42:.: 1.06:1.000:. ./.:4:245,41:.: 1.13:1.000:. ./.:4:194,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:107,30:.:-0.98:0.915:. ./.:4:158,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:89,43:.:-1.05:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.93:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:113,41:.:-0.74:1.000:. ./.:4:161,45:.: 0.00:1.000:. ./.:4:137,54:.:-0.22:1.000:. ./.:4:100,62:.:-0.63:1.000:. ./.:4:194,51:.: 0.55:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:128,55:.:-0.33:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:160,45:.:-0.02:1.000:. ./.:4:192,34:.: 0.28:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:153,42:.:-0.16:1.000:. ./.:4:108,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:124,46:.:-0.51:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.09:0.994:. ./.:4:132,48:.:-0.37:1.000:. ./.:4:149,39:.:-0.26:1.000:. ./.:4:122,35:.:-0.70:1.000:. ./.:4:242,59:.: 1.34:1.000:. ./.:4:224,50:.: 0.96:0.993:. ./.:4:202,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:174,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.02:0.999:. ./.:4:78,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:162,28:.:-0.23:1.000:. ./.:4:180,66:.: 0.56:1.000:. ./.:4:158,2:.:-0.65:1.000:. ./.:4:181,48:.: 0.32:1.000:. ./.:4:237,58:.: 1.25:1.000:. ./.:4:142,36:.:-0.40:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:137,41:.:-0.40:1.000:. ./.:4:252,60:.: 1.49:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:63,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:200,42:.: 0.50:1.000:. ./.:4:179,67:.: 0.56:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:163,38:.:-0.08:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.81:0.998:. ./.:4:205,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:240,41:.: 1.06:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:168,61:.: 0.32:1.000:. ./.:4:93,52:.:-0.87:1.000:. ./.:4:204,51:.: 0.69:1.000:. ./.:4:99,57:.:-0.71:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:163,42:.:-0.02:1.000:. ./.:4:318,66:.: 2.51:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:184,61:.: 0.55:1.000:. ./.:4:278,58:.: 1.83:1.000:. ./.:4:146,48:.:-0.17:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:69,36:.:-1.43:1.000:. ./.:4:128,43:.:-0.50:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:242,49:.: 1.20:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:126,52:.:-0.40:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:183,51:.: 0.39:1.000:. ./.:4:150,50:.:-0.09:1.000:. ./.:4:317,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:277,100:.: 2.41:0.997:. ./.:4:177,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:222,52:.: 0.96:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:207,56:.: 0.80:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:219,33:.: 0.65:1.000:. ./.:4:168,33:.:-0.08:1.000:. ./.:4:297,53:.: 2.03:1.000:. ./.:4:182,65:.: 0.58:1.000:. ./.:4:327,57:.: 2.51:1.000:. ./.:4:224,47:.: 0.91:1.000:. ./.:4:344,73:.: 2.98:0.956:. ./.:4:264,0:.: 0.82:0.998:. ./.:4:141,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:209,58:.: 0.86:1.000:. -chr8.1 56089431 chr8.1_056089431 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:89,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:17,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:134,0:.: 1.02:0.999:. ./.:4:78,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:195,0:.: 2.67:1.000:. ./.:4:232,0:.: 3.68:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.54:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.73:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.43:0.995:. ./.:4:112,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:146,1:.: 1.37:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:152,0:.: 1.51:1.000:. ./.:5:85,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:104,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.67:1.000:. ./.:6:70,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.96:0.887:. ./.:4:49,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.66:0.999:. ./.:4:94,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:140,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.61:0.915:. ./.:4:77,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:47,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:21,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:50,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.18:0.994:. ./.:4:114,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.10:0.993:. ./.:4:93,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:0.999:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:65,1:.:-0.83:1.000:. ./.:4:142,2:.: 1.29:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.43:0.998:. ./.:4:60,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:48,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:55,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:87,1:.:-0.23:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:203,0:.: 2.89:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:143,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:163,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:0.997:. ./.:4:85,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:144,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.15:0.956:. ./.:4:54,0:.:-1.16:0.998:. ./.:4:152,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.15:1.000:. -chr8.1 56541312 chr8.1_056541312 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:67,27:.: 0.07:1.000:. ./.:4:47,18:.:-1.09:1.000:. ./.:4:53,22:.:-0.69:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:86,28:.: 0.86:1.000:. ./.:4:57,16:.:-0.77:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:56,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:36,35:.:-0.85:1.000:. ./.:4:65,42:.: 0.59:1.000:. ./.:4:53,64:.: 0.98:1.000:. ./.:4:73,22:.: 0.11:1.000:. ./.:4:31,34:.:-1.09:1.000:. ./.:4:58,20:.:-0.57:1.000:. ./.:4:43,30:.:-0.77:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:62,19:.:-0.45:1.000:. ./.:4:53,41:.: 0.07:1.000:. ./.:4:74,34:.: 0.63:1.000:. ./.:4:107,32:.: 1.86:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:21,37:.:-1.36:1.000:. ./.:4:36,21:.:-1.40:1.000:. ./.:4:32,10:.:-2.00:1.000:. ./.:4:49,26:.:-0.69:1.000:. ./.:4:38,16:.:-1.52:1.000:. ./.:5:152,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:45,9:.:-1.52:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.32:1.000:. ./.:4:28,7:.:-2.28:1.000:. ./.:4:33,14:.:-1.80:1.000:. ./.:4:76,35:.: 0.74:1.000:. ./.:3:44,22:.:-1.05:0.995:. ./.:4:44,21:.:-1.09:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.31:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:31,28:.:-1.32:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:70,37:.: 0.59:1.000:. ./.:4:64,71:.: 1.70:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.15:1.000:. ./.:5:73,63:.: 1.74:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:45,16:.:-1.24:1.000:. ./.:4:43,65:.: 0.63:1.000:. ./.:4:65,57:.: 1.18:1.000:. ./.:4:67,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:44,70:.: 0.86:1.000:. ./.:4:90,31:.: 1.14:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:65,21:.:-0.25:1.000:. ./.:4:48,70:.: 1.02:1.000:. ./.:4:60,42:.: 0.39:1.000:. ./.:6:107,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:149,0:.: 2.26:1.000:. ./.:4:51,48:.: 0.27:1.000:. ./.:4:54,78:.: 1.58:1.000:. ./.:4:100,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:54,54:.: 0.63:1.000:. ./.:4:36,51:.:-0.21:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:71,21:.:-0.01:1.000:. ./.:4:86,34:.: 1.10:0.887:. ./.:4:70,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:92,29:.: 1.14:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:68,23:.:-0.05:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:64,32:.: 0.15:1.000:. ./.:4:71,67:.: 1.82:1.000:. ./.:4:96,18:.: 0.86:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:59,20:.:-0.53:0.915:. ./.:4:123,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:109,44:.: 2.42:1.000:. ./.:4:28,47:.:-0.69:1.000:. ./.:4:80,44:.: 1.26:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:37,37:.:-0.73:1.000:. ./.:4:47,40:.:-0.21:1.000:. ./.:4:46,56:.: 0.39:1.000:. ./.:4:53,52:.: 0.51:1.000:. ./.:4:66,78:.: 2.06:1.000:. ./.:4:76,24:.: 0.31:1.000:. ./.:4:94,59:.: 2.42:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:116,23:.: 1.86:1.000:. ./.:4:59,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:89,33:.: 1.18:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.01:1.000:. ./.:4:101,43:.: 2.06:1.000:. ./.:4:73,28:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,52:.: 0.07:1.000:. ./.:4:63,32:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,17:.:-0.49:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.98:0.994:. ./.:4:85,31:.: 0.94:1.000:. ./.:4:44,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,62:.: 0.51:1.000:. ./.:4:49,12:.:-1.24:1.000:. ./.:4:57,63:.: 1.10:0.993:. ./.:4:82,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:68,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.14:0.999:. ./.:4:99,32:.: 1.54:1.000:. ./.:4:34,39:.:-0.77:1.000:. ./.:4:76,65:.: 1.94:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:55,17:.:-0.81:1.000:. ./.:4:66,34:.: 0.31:1.000:. ./.:4:53,45:.: 0.23:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:56,55:.: 0.74:1.000:. ./.:4:83,21:.: 0.47:1.000:. ./.:4:62,11:.:-0.77:1.000:. ./.:4:61,25:.:-0.25:1.000:. ./.:4:81,27:.: 0.63:1.000:. ./.:4:53,66:.: 1.06:1.000:. ./.:4:36,40:.:-0.65:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:58,17:.:-0.69:1.000:. ./.:4:97,28:.: 1.30:1.000:. ./.:4:65,11:.:-0.65:1.000:. ./.:4:54,23:.:-0.61:0.998:. ./.:4:62,32:.: 0.07:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:73,22:.: 0.11:1.000:. ./.:4:63,16:.:-0.53:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:52,58:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,50:.: 0.31:1.000:. ./.:4:52,24:.:-0.65:1.000:. ./.:4:49,44:.: 0.03:1.000:. ./.:4:56,17:.:-0.77:1.000:. ./.:4:64,22:.:-0.25:1.000:. ./.:4:44,71:.: 0.90:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:53,21:.:-0.73:1.000:. ./.:4:42,60:.: 0.39:1.000:. ./.:4:50,62:.: 0.78:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:56,84:.: 1.90:1.000:. ./.:4:36,48:.:-0.33:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,31:.: 1.02:1.000:. ./.:4:81,26:.: 0.59:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.61:1.000:. ./.:4:48,32:.:-0.49:1.000:. ./.:4:56,25:.:-0.45:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:54,19:.:-0.77:1.000:. ./.:4:35,33:.:-0.97:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:36,39:.:-0.69:0.997:. ./.:4:32,20:.:-1.60:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:55,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:38,14:.:-1.60:1.000:. ./.:4:41,24:.:-1.09:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:44,17:.:-1.24:1.000:. ./.:4:36,27:.:-1.17:1.000:. ./.:4:48,19:.:-1.01:1.000:. ./.:4:51,39:.:-0.09:1.000:. ./.:4:60,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:43,24:.:-1.01:1.000:. ./.:4:69,20:.:-0.13:0.956:. ./.:4:99,0:.: 0.27:0.998:. ./.:4:76,18:.: 0.07:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:61,25:.:-0.25:1.000:. -chr8.1 56679081 chr8.1_056679081 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:234,46:.: 1.27:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:161,65:.: 0.40:1.000:. ./.:4:215,44:.: 0.93:1.000:. ./.:4:146,78:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,77:.:-0.07:1.000:. ./.:4:73,44:.:-1.35:1.000:. ./.:4:196,31:.: 0.42:1.000:. ./.:4:104,85:.:-0.19:1.000:. ./.:4:23,6:.:-2.76:1.000:. ./.:4:37,5:.:-2.55:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:160,67:.: 0.42:1.000:. ./.:4:170,39:.: 0.13:1.000:. ./.:4:172,31:.: 0.03:1.000:. ./.:4:121,73:.:-0.11:1.000:. ./.:4:226,92:.: 1.88:0.999:. ./.:4:256,34:.: 1.43:1.000:. ./.:4:153,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:243,40:.: 1.32:1.000:. ./.:4:19,1:.:-2.91:1.000:. ./.:4:168,46:.: 0.21:1.000:. ./.:4:185,48:.: 0.51:1.000:. ./.:4:191,34:.: 0.38:1.000:. ./.:4:11,14:.:-2.83:1.000:. ./.:4:252,48:.: 1.59:1.000:. ./.:4:186,32:.: 0.27:1.000:. ./.:4:142,68:.: 0.14:1.000:. ./.:5:239,53:.: 1.46:1.000:. ./.:4:167,67:.: 0.53:1.000:. ./.:4:281,94:.: 2.79:1.000:. ./.:4:106,65:.:-0.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.18:1.000:. ./.:4:53,3:.:-2.33:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.92:0.995:. ./.:4:166,62:.: 0.43:1.000:. ./.:4:205,35:.: 0.62:1.000:. ./.:4:150,50:.:-0.02:1.000:. ./.:4:286,44:.: 2.07:1.000:. ./.:4:187,41:.: 0.43:1.000:. ./.:4:80,78:.:-0.69:1.000:. ./.:4:210,40:.: 0.79:1.000:. ./.:4:198,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:88,53:.:-0.96:1.000:. ./.:4:147,72:.: 0.29:1.000:. ./.:4:226,26:.: 0.82:1.000:. ./.:5:147,76:.: 0.35:1.000:. ./.:4:31,36:.:-2.15:1.000:. ./.:4:118,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:46,43:.:-1.80:1.000:. ./.:4:163,37:.:-0.02:1.000:. ./.:4:176,95:.: 1.12:1.000:. ./.:4:86,69:.:-0.74:1.000:. ./.:4:142,91:.: 0.51:1.000:. ./.:4:159,68:.: 0.42:1.000:. ./.:4:201,73:.: 1.17:1.000:. ./.:4:141,71:.: 0.18:1.000:. ./.:4:170,85:.: 0.87:1.000:. ./.:4:94,54:.:-0.85:1.000:. ./.:6:119,37:.:-0.72:1.000:. ./.:4:190,44:.: 0.53:1.000:. ./.:4:156,40:.:-0.08:1.000:. ./.:4:116,79:.:-0.10:1.000:. ./.:4:222,62:.: 1.33:1.000:. ./.:4:197,48:.: 0.71:1.000:. ./.:4:151,68:.: 0.29:1.000:. ./.:4:122,22:.:-0.92:1.000:. ./.:4:203,42:.: 0.71:1.000:. ./.:4:157,41:.:-0.05:0.887:. ./.:4:200,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:156,84:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,35:.:-1.27:0.999:. ./.:4:220,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:210,37:.: 0.74:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:148,66:.: 0.21:1.000:. ./.:4:97,80:.:-0.39:1.000:. ./.:4:164,43:.: 0.10:1.000:. ./.:4:163,35:.:-0.05:1.000:. ./.:4:146,84:.: 0.46:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.34:0.915:. ./.:4:176,37:.: 0.19:1.000:. ./.:4:153,33:.:-0.24:1.000:. ./.:4:81,33:.:-1.40:1.000:. ./.:4:109,54:.:-0.61:1.000:. ./.:4:230,41:.: 1.12:1.000:. ./.:4:120,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:206,28:.: 0.53:1.000:. ./.:4:176,71:.: 0.74:1.000:. ./.:4:143,35:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,67:.:-1.21:1.000:. ./.:4:164,31:.:-0.10:1.000:. ./.:4:194,43:.: 0.58:1.000:. ./.:4:140,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:175,72:.: 0.74:1.000:. ./.:4:260,40:.: 1.59:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:240,31:.: 1.12:1.000:. ./.:4:202,41:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,70:.:-0.68:1.000:. ./.:4:187,78:.: 1.03:1.000:. ./.:4:126,60:.:-0.24:1.000:. ./.:4:185,72:.: 0.90:0.994:. ./.:4:102,40:.:-0.95:1.000:. ./.:4:146,31:.:-0.39:1.000:. ./.:4:116,33:.:-0.84:1.000:. ./.:4:248,40:.: 1.40:1.000:. ./.:4:90,85:.:-0.42:0.993:. ./.:4:224,31:.: 0.87:1.000:. ./.:4:116,31:.:-0.87:1.000:. ./.:4:234,37:.: 1.12:1.000:. ./.:4:167,59:.: 0.40:0.999:. ./.:4:149,45:.:-0.11:1.000:. ./.:4:143,37:.:-0.34:1.000:. ./.:4:184,41:.: 0.38:1.000:. ./.:4:151,40:.:-0.16:1.000:. ./.:4:119,48:.:-0.55:1.000:. ./.:4:139,74:.: 0.19:1.000:. ./.:4:60,57:.:-1.35:1.000:. ./.:4:197,39:.: 0.56:1.000:. ./.:4:194,30:.: 0.37:1.000:. ./.:4:111,61:.:-0.47:1.000:. ./.:4:109,70:.:-0.35:1.000:. ./.:4:123,22:.:-0.90:1.000:. ./.:4:180,37:.: 0.26:1.000:. ./.:4:152,80:.: 0.50:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:90,20:.:-1.46:1.000:. ./.:4:152,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:215,26:.: 0.64:1.000:. ./.:4:147,29:.:-0.40:1.000:. ./.:4:81,24:.:-1.54:0.998:. ./.:4:222,67:.: 1.41:1.000:. ./.:4:116,68:.:-0.27:1.000:. ./.:4:298,45:.: 2.28:1.000:. ./.:4:222,57:.: 1.25:1.000:. ./.:4:98,53:.:-0.80:1.000:. ./.:4:121,54:.:-0.42:1.000:. ./.:4:160,22:.:-0.31:1.000:. ./.:4:168,27:.:-0.10:1.000:. ./.:4:164,38:.: 0.01:1.000:. ./.:4:131,64:.:-0.10:1.000:. ./.:4:129,60:.:-0.19:1.000:. ./.:4:111,114:.: 0.38:1.000:. ./.:4:272,41:.: 1.80:1.000:. ./.:4:204,79:.: 1.32:1.000:. ./.:4:188,36:.: 0.37:1.000:. ./.:4:217,75:.: 1.46:1.000:. ./.:4:130,71:.: 0.00:1.000:. ./.:4:153,72:.: 0.38:1.000:. ./.:4:166,70:.: 0.56:1.000:. ./.:4:27,2:.:-2.76:1.000:. ./.:4:43,57:.:-1.62:1.000:. ./.:4:168,79:.: 0.74:1.000:. ./.:4:165,49:.: 0.21:1.000:. ./.:4:113,70:.:-0.29:1.000:. ./.:4:136,45:.:-0.32:1.000:. ./.:4:106,46:.:-0.79:1.000:. ./.:4:217,28:.: 0.71:1.000:. ./.:4:174,74:.: 0.75:1.000:. ./.:4:106,36:.:-0.95:1.000:. ./.:4:181,34:.: 0.22:1.000:. ./.:4:194,62:.: 0.88:1.000:. ./.:4:158,80:.: 0.59:1.000:. ./.:4:138,35:.:-0.45:1.000:. ./.:4:85,63:.:-0.85:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.55:0.997:. ./.:4:81,65:.:-0.88:1.000:. ./.:4:141,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,58:.:-0.96:1.000:. ./.:4:173,24:.:-0.07:1.000:. ./.:4:146,37:.:-0.29:1.000:. ./.:4:158,40:.:-0.05:1.000:. ./.:4:187,36:.: 0.35:1.000:. ./.:4:50,65:.:-1.38:1.000:. ./.:4:214,33:.: 0.74:1.000:. ./.:4:191,42:.: 0.51:1.000:. ./.:4:197,84:.: 1.28:1.000:. ./.:4:102,55:.:-0.71:1.000:. ./.:4:128,98:.: 0.40:0.956:. ./.:4:191,38:.: 0.45:0.998:. ./.:4:138,79:.: 0.26:1.000:. ./.:4:134,31:.:-0.58:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.08:1.000:. -chr8.1 57449496 chr8.1_057449496 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:45,12:0.21: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,1:0.04:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:32,20:0.36: 1.69:1.000:0.666 0/0/0/1:4:33,7:0.17: 0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:16,21:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,17:0.42: 0.44:1.000:0.929 0/0/0/1:4:6,2:0.25:-2.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,21:0.57: 0.18:1.000:0.954 0/0/0/1:4:23,13:0.34: 0.35:1.000:0.854 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-2.00:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,4:0.09: 1.02:1.000:0.938 0/0/0/1:4:24,3:0.11:-0.40:1.000:0.520 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,9:0.29:-0.15:1.000:0.991 0/0/0/1:4:37,9:0.20: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 2.03:0.999:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 2.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,17:0.32: 1.53:1.000:0.940 0/0/0/1:4:32,21:0.37: 1.78:1.000:0.543 0/0/0/1:4:2,1:0.32:-2.41:1.000:0.955 0/0/0/1:4:33,5:0.13: 0.52:1.000:0.923 0/0/1/1:4:11,17:0.56:-0.32:1.000:0.972 0/0/0/1:4:21,10:0.31:-0.07:1.000:0.973 0/0/1/1:4:3,3:0.46:-2.16:1.000:0.986 0/1/1/1:4:11,29:0.67: 0.69:1.000:0.938 0/0/0/1:4:45,12:0.21: 2.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,7:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/0/1:5:47,9:0.16: 2.03:1.000:0.998 0/0/0/0:4:34,2:0.06: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,6:0.20:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,4:0.12: 0.18:1.000:0.708 0/0/0/1:4:4,2:0.32:-2.16:1.000:0.955 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-2.50:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:19,25:0.52: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,21:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,19:0.39: 1.11:1.000:0.725 0/0/0/1:4:26,13:0.32: 0.60:1.000:0.955 0/1/1/1:4:7,18:0.67:-0.57:1.000:0.920 0/0/0/1:4:23,5:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:25,11:0.30: 0.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:27,15:0.34: 0.85:1.000:0.875 0/0/0/1:4:23,5:0.18:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,11:0.42:-0.65:1.000:0.926 0/0/0/1:4:28,9:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:26,15:0.35: 0.77:1.000:0.887 0/0/1/1:4:16,13:0.41:-0.24:1.000:0.890 0/0/0/1:4:22,3:0.12:-0.57:1.000:0.762 0/1/1/1:4:11,27:0.66: 0.52:1.000:0.870 0/0/0/1:4:27,11:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:23,8:0.26:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:8,11:0.53:-1.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:32,11:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,11:0.48:-0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:11,11:0.46:-0.82:1.000:0.986 0/0/0/1:4:25,7:0.22: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,5:0.12: 0.77:1.000:0.801 0/0/1/1:4:21,15:0.39: 0.35:1.000:0.675 0/0/0/0/0/1:6:27,8:0.23: 0.27:1.000:0.744 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,5:0.14: 0.27:1.000:0.975 0/0/0/1:4:22,12:0.34: 0.18:1.000:0.895 0/0/0/1:4:22,11:0.32: 0.10:1.000:0.955 0/0/0/1:4:32,19:0.35: 1.61:1.000:0.775 0/0/0/1:4:18,10:0.34:-0.32:1.000:0.875 0/0/0/1:4:9,3:0.25:-1.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,6:0.29:-0.99:1.000:0.991 0/0/1/1:4:16,19:0.49: 0.27:0.887:0.997 0/0/0/1:4:31,9:0.22: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.27:-1.74:0.999:0.998 0/0/0/1:4:46,9:0.16: 1.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,11:0.28: 0.52:1.000:0.995 0/0/0/1:4:21,9:0.29:-0.15:1.000:0.991 0/0/1/1:4:13,13:0.46:-0.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:17,5:0.23:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,24:0.72:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,12:0.32: 0.35:1.000:0.955 0/0/0/1:4:33,15:0.30: 1.36:1.000:0.983 0/0/0/1:4:18,9:0.32:-0.40:0.915:0.955 0/0/0/1:4:26,6:0.19: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,10:0.25: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,7:0.21: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,23:0.59: 0.35:1.000:0.874 0/0/1/1:4:14,16:0.49:-0.15:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,7:0.31:-0.82:1.000:0.978 0/0/0/1:4:22,9:0.28:-0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:16,6:0.27:-0.82:1.000:0.998 0/0/0/1:4:29,8:0.22: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,20:0.62:-0.15:1.000:0.618 0/0/0/1:4:22,5:0.19:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,10:0.21: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.19:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,22:0.53: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,21:0.52: 0.44:1.000:0.995 0/0/0/0:4:13,1:0.07:-1.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:13,9:0.38:-0.82:1.000:0.598 0/0/0/1:4:20,10:0.32:-0.15:1.000:0.955 0/0/1/1:4:15,16:0.47:-0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:8,3:0.27:-1.74:1.000:0.998 0/0/0/0:4:29,3:0.09: 0.02:1.000:0.908 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.17:-0.15:0.994:0.997 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,5:0.17:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,11:0.41:-0.57:1.000:0.851 0/0/0/0:4:36,0:0.00: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.55:-0.57:0.993:0.980 0/0/0/1:4:31,10:0.24: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.56:-0.74:1.000:0.970 0/0/0/1:4:36,11:0.23: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.26:-1.41:0.999:0.998 0/0/1/1:4:14,14:0.46:-0.32:1.000:0.986 0/0/1/1:4:7,7:0.46:-1.49:1.000:0.986 0/0/0/1:4:22,9:0.28:-0.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:12,11:0.44:-0.74:1.000:0.967 0/0/0/1:4:13,7:0.33:-0.99:1.000:0.907 0/0/0/1:4:24,7:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,12:0.55:-0.99:1.000:0.980 0/0/0/1:4:32,11:0.25: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,3:0.12:-0.65:1.000:0.852 0/0/0/1:4:29,11:0.27: 0.69:1.000:0.997 0/0/0/1:4:34,12:0.26: 1.19:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,20:0.72:-0.49:1.000:0.995 0/0/0/1:4:19,6:0.24:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,21:0.63:-0.07:1.000:0.523 0/0/1/1:4:15,19:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:18,6:0.25:-0.65:1.000:0.999 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,20:0.75:-0.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,16:0.54:-0.40:1.000:0.986 0/0/1/1:4:9,8:0.43:-1.24:0.998:0.954 0/0/1/1:4:11,20:0.59:-0.07:1.000:0.833 0/0/0/0:4:41,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,12:0.28: 0.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:22,3:0.12:-0.57:1.000:0.762 0/0/0/1:4:21,3:0.12:-0.65:1.000:0.852 0/1/1/1:4:5,14:0.69:-1.07:1.000:0.968 0/0/0/1:4:8,4:0.32:-1.66:1.000:0.955 0/0/0/1:4:11,4:0.26:-1.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:15,4:0.21:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,6:0.16: 0.44:1.000:0.996 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,15:0.33: 0.94:1.000:0.912 0/0/0/0:4:42,0:0.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.29: 0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:22,14:0.37: 0.35:1.000:0.622 0/0/0/1:4:33,11:0.25: 1.02:1.000:0.999 0/0/0/1:4:26,17:0.37: 0.94:1.000:0.553 0/0/1/1:4:40,28:0.38: 3.03:1.000:0.626 0/0/0/1:4:45,9:0.17: 1.86:1.000:0.997 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.55:-0.57:1.000:0.980 0/0/0/1:4:24,10:0.29: 0.18:1.000:0.993 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,12:0.40:-0.32:1.000:0.777 0/0/1/1:4:13,18:0.53:-0.07:1.000:0.992 0/0/0/1:4:28,10:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,11:0.28: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,9:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,7:0.21: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,17:0.45: 0.27:1.000:0.975 0/0/0/1:4:28,14:0.32: 0.85:1.000:0.955 0/0/0/1:4:20,9:0.30:-0.24:1.000:0.985 0/0/1/1:4:16,11:0.38:-0.40:1.000:0.580 0/0/0/1:4:21,3:0.12:-0.65:1.000:0.852 0/0/0/1:4:22,14:0.37: 0.35:0.997:0.622 0/0/0/1:4:24,14:0.35: 0.52:1.000:0.806 0/0/0/1:4:22,5:0.19:-0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,10:0.40:-0.74:1.000:0.820 0/0/1/1:4:13,25:0.61: 0.52:1.000:0.720 0/0/1/1:4:17,17:0.46: 0.18:1.000:0.986 0/0/0/1:4:27,6:0.18: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:44,4:0.08: 1.36:1.000:0.980 0/0/0/1:4:26,15:0.35: 0.77:1.000:0.824 0/0/0/1:4:36,10:0.22: 1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,14:0.59:-0.82:1.000:0.887 0/0/0/1:4:33,7:0.17: 0.69:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,7:0.26:-0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,6:0.22:-0.40:0.956:1.000 0/0/1/1:4:10,15:0.55:-0.57:0.998:0.980 0/0/0/1:4:35,23:0.37: 2.20:1.000:0.539 0/0/1/1:4:7,11:0.56:-1.16:1.000:0.966 0/0/0/1:4:38,7:0.16: 1.11:1.000:0.993 -chr8.1 57601091 chr8.1_057601091 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:30,37:0.47: 0.46:1.000:0.991 0/0/1/1:4:30,38:0.47: 0.49:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,62:0.68: 0.86:1.000:0.947 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,72:0.53: 2.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:6,81:0.79: 1.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,25:0.79:-1.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,44:0.65: 0.13:1.000:0.755 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,24:0.43:-0.27:1.000:0.951 0/0/0/0:4:11,1:0.07:-1.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:66,36:0.30: 1.73:1.000:0.988 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,31:0.46: 0.09:1.000:0.988 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,63:0.80: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,25:0.45:-0.27:0.999:0.980 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:9,7:0.37:-1.40:1.000:0.581 0/1/1/1:4:20,66:0.65: 1.15:1.000:0.824 0/0/1/1:4:46,50:0.44: 1.51:1.000:0.968 0/0/0/0:4:30,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,48:0.64: 0.35:1.000:0.672 0/0/1/1:4:23,27:0.46:-0.16:1.000:0.986 0/1/1/1:4:5,62:0.79: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:53,86:0.53: 3.07:1.000:0.731 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,47:0.79:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,58:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0:3:12,0:0.00:-1.54:0.995:1.000 0/0/1/1:4:34,46:0.49: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:16,39:0.60: 0.02:1.000:0.762 0/0/1/1:4:36,79:0.58: 2.20:1.000:0.896 0/1/1/1:4:2,60:0.83: 0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,27:0.60:-0.60:1.000:0.750 0/1/1/1:4:1,58:0.84: 0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,84:0.80: 1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,70:0.51: 2.24:1.000:0.996 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,34:0.67:-0.42:1.000:0.935 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:12,87:0.75: 1.62:1.000:0.928 0/0/0/1:4:14,6:0.25:-1.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.65:-1.22:1.000:0.782 0/0/0/1:4:44,27:0.32: 0.60:1.000:0.955 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,37:0.73:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:28,25:0.40:-0.05:1.000:0.775 0/0/1/1:4:13,30:0.59:-0.42:1.000:0.842 0/0/1/1:4:16,23:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,25:0.52:-0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:12,70:0.73: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1/1/1:6:20,26:0.48:-0.31:1.000:0.864 0/0/1/1:4:37,33:0.40: 0.57:1.000:0.772 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,31:0.42: 0.31:0.887:0.895 0/0/1/1:4:31,40:0.48: 0.60:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,31:0.63:-0.45:1.000:0.541 0/0/1/1:4:20,32:0.52:-0.09:0.999:0.994 0/0/0/1:4:60,31:0.29: 1.33:1.000:0.994 0/0/0/0:4:39,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,39:0.40: 1.00:1.000:0.804 0/1/1/1:4:7,36:0.71:-0.42:1.000:0.994 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,59:0.59: 1.11:1.000:0.862 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,67:0.59: 1.55:1.000:0.879 0/0/1/1:4:46,37:0.38: 1.04:0.915:0.514 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,25:0.47:-0.34:1.000:0.992 0/1/1/1:4:10,34:0.66:-0.38:1.000:0.858 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,27:0.59:-0.56:1.000:0.872 0/0/1/1:4:14,21:0.51:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,30:0.46: 0.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:13,38:0.63:-0.13:1.000:0.620 0/1/1/1:4:14,64:0.70: 0.86:1.000:0.985 0/0/0/1:4:59,39:0.33: 1.58:1.000:0.900 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,35:0.63:-0.27:1.000:0.615 0/0/1/1:4:15,38:0.61:-0.05:1.000:0.691 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,72:0.78: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,74:0.70: 1.29:1.000:0.986 0/0/1/1:4:28,48:0.54: 0.78:1.000:0.990 0/1/1/1:4:11,37:0.66:-0.24:1.000:0.846 0/0/1/1:4:35,33:0.41: 0.49:1.000:0.863 0/0/0/1:4:37,23:0.32: 0.20:1.000:0.949 0/1/1/1:4:10,85:0.76: 1.47:0.994:1.000 0/0/1/1:4:26,22:0.39:-0.24:1.000:0.652 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,22:0.62:-0.89:1.000:0.514 0/1/1/1:4:12,56:0.70: 0.49:0.993:0.987 0/1/1/1:4:1,65:0.84: 0.42:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,40:0.63:-0.02:1.000:0.571 0/1/1/1:4:24,96:0.68: 2.38:1.000:0.958 0/1/1/1:4:11,50:0.70: 0.24:0.999:0.984 0/0/1/1:4:37,43:0.45: 0.93:1.000:0.984 0/0/0/0:4:2,0:0.00:-1.91:1.000:1.000 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,37:0.64:-0.20:1.000:0.723 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.46:-0.16:1.000:0.986 0/0/1/1:4:14,33:0.60:-0.27:1.000:0.814 0/0/0/1:4:40,21:0.29: 0.24:1.000:0.993 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,44:0.61: 0.24:1.000:0.647 0/1/1/1:4:9,79:0.77: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,39:0.40: 1.04:1.000:0.760 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,46:0.59: 0.42:1.000:0.847 0/1/1/1:4:1,45:0.83:-0.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,49:0.51: 0.97:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,18:0.73:-1.22:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,40:0.41: 1.00:1.000:0.876 0/1/1/1:4:12,37:0.64:-0.20:1.000:0.723 0/0/1/1:4:21,22:0.43:-0.42:0.998:0.953 0/0/1/1:4:14,29:0.57:-0.42:1.000:0.938 0/0/1/1:4:17,25:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/0/0:4:32,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,80:0.78: 1.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,33:0.62:-0.34:1.000:0.514 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,17:0.58:-1.07:1.000:0.922 0/0/0/0:4:26,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,39:0.44: 0.75:1.000:0.967 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.64:1.000:1.000 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,91:0.76: 1.73:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,81:0.80: 1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,18:0.53:-0.93:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,37:0.59:-0.05:1.000:0.840 0/1/1/1:4:8,84:0.78: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,39:0.66:-0.16:1.000:0.895 0/0/1/1:4:42,47:0.45: 1.26:1.000:0.976 0/0/1/1:4:50,62:0.47: 2.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:29,31:0.44: 0.20:1.000:0.962 0/1/1/1:4:14,87:0.73: 1.69:1.000:0.998 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,26:0.44:-0.16:1.000:0.967 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,82:0.77: 1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,53:0.79: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,41:0.66:-0.05:1.000:0.863 0/1/1/1:4:4,80:0.81: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,89:0.74: 1.77:0.997:0.998 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,59:0.53: 1.47:1.000:0.993 0/1/1/1:4:5,74:0.80: 0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,35:0.60:-0.16:1.000:0.828 0/1/1/1:4:14,63:0.70: 0.82:1.000:0.983 0/0/0/1:4:45,29:0.33: 0.71:1.000:0.924 0/0/1/1:4:11,25:0.59:-0.67:1.000:0.861 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,39:0.39: 1.07:1.000:0.711 0/1/1/1:4:17,49:0.63: 0.42:1.000:0.590 0/1/1/1:4:9,28:0.64:-0.64:1.000:0.738 0/0/0/1:4:25,17:0.34:-0.45:1.000:0.867 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-0.74:0.956:1.000 0/0/1/1:4:35,40:0.45: 0.75:1.000:0.981 0/0/1/1:4:38,94:0.61: 2.82:1.000:0.736 0/0/1/1:4:13,28:0.58:-0.49:1.000:0.912 0/0/1/1:4:36,44:0.47: 0.93:1.000:0.991 -chr8.1 58144557 chr8.1_058144557 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:414,63:.: 0.99:1.000:. ./.:4:307,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:273,63:.:-0.33:1.000:. ./.:4:521,68:.: 2.03:1.000:. ./.:4:514,61:.: 1.90:1.000:. ./.:4:464,26:.: 1.11:1.000:. ./.:4:377,37:.: 0.40:1.000:. ./.:4:387,67:.: 0.77:1.000:. ./.:4:208,111:.:-0.49:1.000:. ./.:4:216,6:.:-1.40:1.000:. ./.:4:144,4:.:-2.09:1.000:. ./.:4:318,61:.: 0.07:1.000:. ./.:4:346,58:.: 0.30:1.000:. ./.:4:323,61:.: 0.12:1.000:. ./.:4:323,33:.:-0.15:1.000:. ./.:4:428,25:.: 0.76:1.000:. ./.:4:495,35:.: 1.48:0.999:. ./.:4:338,46:.: 0.12:1.000:. ./.:4:362,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:346,45:.: 0.18:1.000:. ./.:4:121,27:.:-2.09:1.000:. ./.:4:326,25:.:-0.19:1.000:. ./.:4:300,105:.: 0.31:1.000:. ./.:4:397,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:118,20:.:-2.18:1.000:. ./.:4:401,32:.: 0.57:1.000:. ./.:4:271,51:.:-0.46:1.000:. ./.:4:324,57:.: 0.09:1.000:. ./.:5:414,31:.: 0.69:1.000:. ./.:4:409,31:.: 0.64:1.000:. ./.:4:460,66:.: 1.44:1.000:. ./.:4:215,37:.:-1.12:1.000:. ./.:4:181,11:.:-1.68:1.000:. ./.:4:280,15:.:-0.72:1.000:. ./.:3:114,11:.:-2.31:0.995:. ./.:4:291,98:.: 0.16:1.000:. ./.:4:343,39:.: 0.10:1.000:. ./.:4:389,27:.: 0.42:1.000:. ./.:4:366,54:.: 0.45:1.000:. ./.:4:294,25:.:-0.49:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:301,32:.:-0.36:1.000:. ./.:4:381,38:.: 0.44:1.000:. ./.:4:292,31:.:-0.45:1.000:. ./.:4:450,32:.: 1.03:1.000:. ./.:4:347,85:.: 0.57:1.000:. ./.:5:418,38:.: 0.79:1.000:. ./.:4:87,9:.:-2.58:1.000:. ./.:4:297,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:73,32:.:-2.49:1.000:. ./.:4:323,42:.:-0.06:1.000:. ./.:4:497,38:.: 1.53:1.000:. ./.:4:329,16:.:-0.25:1.000:. ./.:4:392,32:.: 0.49:1.000:. ./.:4:374,58:.: 0.57:1.000:. ./.:4:390,104:.: 1.15:1.000:. ./.:4:317,48:.:-0.06:1.000:. ./.:4:333,31:.:-0.07:1.000:. ./.:4:290,29:.:-0.49:1.000:. ./.:6:231,17:.:-1.16:1.000:. ./.:4:326,23:.:-0.21:1.000:. ./.:4:306,29:.:-0.34:1.000:. ./.:4:341,69:.: 0.36:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:342,36:.: 0.06:1.000:. ./.:4:403,38:.: 0.65:1.000:. ./.:4:339,15:.:-0.16:1.000:. ./.:4:336,65:.: 0.28:1.000:. ./.:4:380,36:.: 0.42:0.887:. ./.:4:271,54:.:-0.44:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:218,0:.:-1.44:0.999:. ./.:4:324,47:.: 0.00:1.000:. ./.:4:363,33:.: 0.23:1.000:. ./.:4:305,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:361,57:.: 0.43:1.000:. ./.:4:337,33:.:-0.01:1.000:. ./.:4:304,48:.:-0.18:1.000:. ./.:4:220,35:.:-1.09:1.000:. ./.:4:407,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:151,0:.:-2.06:0.915:. ./.:4:341,36:.: 0.05:1.000:. ./.:4:488,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:200,59:.:-1.05:1.000:. ./.:4:393,23:.: 0.42:1.000:. ./.:4:348,25:.: 0.01:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:258,25:.:-0.83:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:246,16:.:-1.02:1.000:. ./.:4:367,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:347,47:.: 0.21:1.000:. ./.:4:299,33:.:-0.37:1.000:. ./.:4:358,39:.: 0.24:1.000:. ./.:4:339,59:.: 0.25:1.000:. ./.:4:338,71:.: 0.35:1.000:. ./.:4:269,12:.:-0.85:1.000:. ./.:4:202,24:.:-1.36:1.000:. ./.:4:239,31:.:-0.95:1.000:. ./.:4:258,50:.:-0.59:1.000:. ./.:4:277,15:.:-0.74:1.000:. ./.:4:290,52:.:-0.28:1.000:. ./.:4:194,45:.:-1.24:1.000:. ./.:4:406,17:.: 0.48:0.994:. ./.:4:224,25:.:-1.15:1.000:. ./.:4:393,29:.: 0.47:1.000:. ./.:4:154,19:.:-1.86:1.000:. ./.:4:311,28:.:-0.30:1.000:. ./.:4:596,67:.: 2.73:0.993:. ./.:4:311,92:.: 0.29:1.000:. ./.:4:370,46:.: 0.42:1.000:. ./.:4:546,46:.: 2.06:1.000:. ./.:4:332,36:.:-0.03:0.999:. ./.:4:374,83:.: 0.80:1.000:. ./.:4:194,7:.:-1.59:1.000:. ./.:4:363,26:.: 0.16:1.000:. ./.:4:294,20:.:-0.54:1.000:. ./.:4:348,24:.: 0.00:1.000:. ./.:4:313,57:.:-0.01:1.000:. ./.:4:245,68:.:-0.55:1.000:. ./.:4:257,59:.:-0.52:1.000:. ./.:4:255,1:.:-1.08:1.000:. ./.:4:437,20:.: 0.80:1.000:. ./.:4:538,75:.: 2.26:1.000:. ./.:4:356,77:.: 0.57:1.000:. ./.:4:264,50:.:-0.54:1.000:. ./.:4:230,77:.:-0.60:1.000:. ./.:4:257,31:.:-0.78:1.000:. ./.:4:174,22:.:-1.64:1.000:. ./.:4:212,20:.:-1.30:1.000:. ./.:4:229,64:.:-0.73:1.000:. ./.:4:562,35:.: 2.11:1.000:. ./.:4:214,47:.:-1.03:0.998:. ./.:4:316,24:.:-0.29:1.000:. ./.:4:145,42:.:-1.73:1.000:. ./.:4:448,84:.: 1.50:1.000:. ./.:4:302,28:.:-0.39:1.000:. ./.:4:313,41:.:-0.16:1.000:. ./.:4:239,38:.:-0.88:1.000:. ./.:4:221,22:.:-1.20:1.000:. ./.:4:286,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:281,41:.:-0.46:1.000:. ./.:4:311,81:.: 0.19:1.000:. ./.:4:227,41:.:-0.97:1.000:. ./.:4:580,33:.: 2.26:1.000:. ./.:4:453,32:.: 1.06:1.000:. ./.:4:355,63:.: 0.43:1.000:. ./.:4:383,37:.: 0.45:1.000:. ./.:4:448,36:.: 1.05:1.000:. ./.:4:255,47:.:-0.65:1.000:. ./.:4:373,90:.: 0.86:1.000:. ./.:4:341,105:.: 0.70:1.000:. ./.:4:119,14:.:-2.23:1.000:. ./.:4:430,34:.: 0.86:1.000:. ./.:4:482,34:.: 1.35:1.000:. ./.:4:394,82:.: 0.98:1.000:. ./.:4:406,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:485,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:347,73:.: 0.45:1.000:. ./.:4:422,28:.: 0.73:1.000:. ./.:4:387,65:.: 0.75:1.000:. ./.:4:355,53:.: 0.34:1.000:. ./.:4:350,27:.: 0.05:1.000:. ./.:4:280,55:.:-0.34:1.000:. ./.:4:244,14:.:-1.06:1.000:. ./.:4:366,76:.: 0.66:1.000:. ./.:4:244,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:327,39:.:-0.05:0.997:. ./.:4:362,19:.: 0.09:1.000:. ./.:4:373,69:.: 0.66:1.000:. ./.:4:250,62:.:-0.56:1.000:. ./.:4:328,52:.: 0.08:1.000:. ./.:4:259,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:395,20:.: 0.41:1.000:. ./.:4:325,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:262,58:.:-0.48:1.000:. ./.:4:642,30:.: 2.81:1.000:. ./.:4:276,42:.:-0.50:1.000:. ./.:4:389,33:.: 0.47:1.000:. ./.:4:330,52:.: 0.10:1.000:. ./.:4:461,46:.: 1.27:0.956:. ./.:4:436,65:.: 1.21:1.000:. ./.:4:596,85:.: 2.89:1.000:. ./.:4:517,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:322,33:.:-0.15:1.000:. -chr8.1 58285283 chr8.1_058285283 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,26:.: 0.33:1.000:. ./.:4:4,24:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.23:1.000:. ./.:4:4,19:.: 0.02:1.000:. ./.:4:3,25:.: 0.54:1.000:. ./.:4:8,32:.: 1.80:1.000:. ./.:4:4,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:5,17:.:-0.09:1.000:. ./.:4:3,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,4:.:-1.98:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:4,31:.: 1.28:1.000:. ./.:4:6,11:.:-0.61:1.000:. ./.:4:10,20:.: 0.75:1.000:. ./.:4:7,7:.:-0.93:1.000:. ./.:4:2,21:.: 0.02:1.000:. ./.:4:7,27:.: 1.17:0.999:. ./.:4:6,12:.:-0.51:1.000:. ./.:4:2,32:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,38:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.30:1.000:. ./.:4:2,23:.: 0.23:1.000:. ./.:4:4,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:1,26:.: 0.44:1.000:. ./.:4:3,6:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,43:.: 2.12:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,15:.:-0.30:1.000:. ./.:5:0,36:.: 1.38:1.000:. ./.:4:2,27:.: 0.65:1.000:. ./.:4:5,47:.: 3.06:1.000:. ./.:4:7,10:.:-0.61:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.88:1.000:. ./.:3:0,4:.:-1.98:0.995:. ./.:4:0,30:.: 0.75:1.000:. ./.:4:3,26:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.17:1.000:. ./.:4:8,36:.: 2.22:1.000:. ./.:4:10,42:.: 3.06:1.000:. ./.:4:4,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:3,10:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.38:1.000:. ./.:4:11,13:.: 0.12:1.000:. ./.:4:10,16:.: 0.33:1.000:. ./.:4:5,18:.: 0.02:1.000:. ./.:5:8,27:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,6:.:-1.77:1.000:. ./.:4:11,11:.:-0.09:1.000:. ./.:4:14,13:.: 0.44:1.000:. ./.:4:2,18:.:-0.30:1.000:. ./.:4:14,26:.: 1.80:1.000:. ./.:4:9,13:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,24:.: 0.65:1.000:. ./.:4:1,23:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,27:.: 1.07:1.000:. ./.:4:5,12:.:-0.61:1.000:. ./.:4:8,19:.: 0.44:1.000:. ./.:4:5,18:.: 0.02:1.000:. ./.:6:1,11:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1,9:.:-1.35:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.19:1.000:. ./.:4:8,15:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,24:.: 0.33:1.000:. ./.:4:13,15:.: 0.54:1.000:. ./.:4:4,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:5,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.02:0.887:. ./.:4:0,31:.: 0.86:1.000:. ./.:4:5,10:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.19:0.999:. ./.:4:0,44:.: 2.22:1.000:. ./.:4:3,18:.:-0.19:1.000:. ./.:4:9,19:.: 0.54:1.000:. ./.:4:4,30:.: 1.17:1.000:. ./.:4:8,13:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.72:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.17:1.000:. ./.:4:5,16:.:-0.19:0.915:. ./.:4:1,17:.:-0.51:1.000:. ./.:4:3,16:.:-0.40:1.000:. ./.:4:4,14:.:-0.51:1.000:. ./.:4:5,29:.: 1.17:1.000:. ./.:4:4,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:2,7:.:-1.46:1.000:. ./.:4:2,16:.:-0.51:1.000:. ./.:4:2,12:.:-0.93:1.000:. ./.:4:3,23:.: 0.33:1.000:. ./.:4:3,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.61:1.000:. ./.:4:3,17:.:-0.30:1.000:. ./.:4:3,12:.:-0.82:1.000:. ./.:4:9,24:.: 1.07:1.000:. ./.:4:2,22:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,11:.:-0.61:1.000:. ./.:4:8,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.30:1.000:. ./.:4:3,18:.:-0.19:1.000:. ./.:4:3,8:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1,27:.: 0.54:1.000:. ./.:4:5,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:1,8:.:-1.46:0.994:. ./.:4:4,12:.:-0.72:1.000:. ./.:4:10,17:.: 0.44:1.000:. ./.:4:3,13:.:-0.72:1.000:. ./.:4:13,8:.:-0.19:1.000:. ./.:4:8,17:.: 0.23:0.993:. ./.:4:1,17:.:-0.51:1.000:. ./.:4:2,8:.:-1.35:1.000:. ./.:4:3,33:.: 1.38:1.000:. ./.:4:1,14:.:-0.82:0.999:. ./.:4:4,17:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.67:1.000:. ./.:4:3,18:.:-0.19:1.000:. ./.:4:2,16:.:-0.51:1.000:. ./.:4:13,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.56:1.000:. ./.:4:4,11:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,12:.:-0.40:1.000:. ./.:4:2,19:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.72:1.000:. ./.:4:4,22:.: 0.33:1.000:. ./.:4:2,15:.:-0.61:1.000:. ./.:4:7,10:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.46:1.000:. ./.:4:6,8:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.03:1.000:. ./.:4:5,20:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.93:0.998:. ./.:4:0,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:3,18:.:-0.19:1.000:. ./.:4:3,32:.: 1.28:1.000:. ./.:4:7,13:.:-0.30:1.000:. ./.:4:2,9:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,9:.:-1.46:1.000:. ./.:4:5,8:.:-1.03:1.000:. ./.:4:4,7:.:-1.25:1.000:. ./.:4:6,5:.:-1.25:1.000:. ./.:4:1,20:.:-0.19:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.93:1.000:. ./.:4:5,13:.:-0.51:1.000:. ./.:4:4,46:.: 2.85:1.000:. ./.:4:4,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:6,16:.:-0.09:1.000:. ./.:4:5,31:.: 1.38:1.000:. ./.:4:4,25:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.17:1.000:. ./.:4:2,17:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.67:1.000:. ./.:4:6,9:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.80:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:7,35:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,40:.: 1.80:1.000:. ./.:4:4,18:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.51:1.000:. ./.:4:3,25:.: 0.54:1.000:. ./.:4:14,17:.: 0.86:1.000:. ./.:4:0,31:.: 0.86:1.000:. ./.:4:2,25:.: 0.44:1.000:. ./.:4:2,23:.: 0.23:1.000:. ./.:4:5,19:.: 0.12:1.000:. ./.:4:11,12:.: 0.02:0.997:. ./.:4:0,22:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.38:1.000:. ./.:4:8,12:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.72:1.000:. ./.:4:6,9:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.40:1.000:. ./.:4:6,26:.: 0.96:1.000:. ./.:4:5,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:1,36:.: 1.49:1.000:. ./.:4:15,18:.: 1.07:1.000:. ./.:4:6,22:.: 0.54:1.000:. ./.:4:5,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:5,14:.:-0.40:0.956:. ./.:4:4,28:.: 0.96:1.000:. ./.:4:0,30:.: 0.75:1.000:. ./.:4:4,20:.: 0.12:1.000:. ./.:4:7,15:.:-0.09:1.000:. -chr8.1 58786275 chr8.1_058786275 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:22,50:0.70: 0.68:1.000:0.981 0/1/1/1:4:18,40:0.69: 0.11:1.000:0.974 0/1/1/1:4:9,56:0.87: 0.40:1.000:0.926 0/0/1/1:4:32,19:0.38:-0.18:1.000:0.603 0/0/1/1:4:33,54:0.60: 1.30:1.000:0.749 0/1/1/1:4:14,63:0.83: 0.89:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,13:0.73:-1.54:1.000:0.998 0/1/1/1:4:18,43:0.71: 0.23:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,32:0.56:-0.02:1.000:0.973 0/0/0/1:4:16,4:0.26:-1.46:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,33:0.76:-0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,31:0.45: 0.44:1.000:0.982 0/1/1/1:4:18,42:0.70: 0.19:1.000:0.988 0/0/0/1:4:33,11:0.30:-0.47:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,32:0.61:-0.18:1.000:0.658 0/1/1/1:4:29,59:0.67: 1.34:1.000:0.905 0/0/1/1:4:43,39:0.46: 1.10:0.999:0.985 0/1/1/1:4:38,81:0.68: 2.62:1.000:0.951 0/1/1/1:4:22,39:0.63: 0.23:1.000:0.533 0/1/1/1:4:19,45:0.71: 0.35:1.000:0.990 0/1/1/1:4:6,12:0.66:-1.54:1.000:0.879 0/0/1/1:4:30,23:0.43:-0.10:1.000:0.937 0/0/1/1:4:21,24:0.50:-0.43:1.000:0.997 0/0/1/1:4:16,27:0.61:-0.51:1.000:0.651 0/0/1/1:4:6,9:0.58:-1.67:1.000:0.919 1/1/1/1:4:9,71:0.89: 1.01:1.000:0.604 0/1/1/1:4:35,78:0.69: 2.38:1.000:0.975 0/0/1/1:4:25,33:0.54: 0.11:1.000:0.987 0/0/1/1/1:5:18,28:0.59:-0.39:1.000:0.966 0/0/1/1:4:34,52:0.58: 1.26:1.000:0.894 0/1/1/1:4:26,53:0.67: 0.97:1.000:0.907 0/1/1/1:4:16,30:0.64:-0.39:1.000:0.730 0/0/1/1:4:5,7:0.56:-1.79:1.000:0.970 0/0/1/1:4:13,18:0.55:-1.01:1.000:0.975 0/0/1:3:8,4:0.35:-1.79:0.995:1.000 0/1/1/1:4:23,42:0.64: 0.40:1.000:0.643 1/1/1/1:4:5,58:0.92: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,25:0.49:-0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,61:0.75: 1.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,55:0.82: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:22,33:0.58:-0.02:1.000:0.919 0/1/1/1:4:21,48:0.70: 0.56:1.000:0.983 0/0/1/1:4:34,20:0.38:-0.06:1.000:0.583 0/0/0/1:4:28,5:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,13:0.44:-1.09:1.000:0.962 0/0/1/1:4:36,30:0.44: 0.44:1.000:0.969 0/0/1/1/1:5:23,45:0.66: 0.52:1.000:0.879 0/0/0/1:4:194,63:0.29: 8.32:1.000:0.991 0/1/1/1:4:16,30:0.64:-0.39:1.000:0.730 0/0/1/1:4:53,70:0.54: 2.79:1.000:0.987 0/0/1/1:4:24,31:0.53:-0.02:1.000:0.991 0/0/0/1:4:42,10:0.25:-0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,48:0.56: 1.10:1.000:0.966 0/1/1/1:4:11,35:0.77:-0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,26:0.62:-0.60:1.000:0.553 0/1/1/1:4:30,65:0.68: 1.63:1.000:0.962 0/0/1/1:4:15,21:0.56:-0.80:1.000:0.970 0/1/1/1:4:11,60:0.85: 0.64:1.000:0.985 0/1/1/1:4:12,45:0.80: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:24,21:0.45:-0.43:1.000:0.744 0/0/1/1:4:35,21:0.38: 0.02:1.000:0.625 0/1/1/1:4:26,57:0.69: 1.14:1.000:0.968 0/0/0/1:4:45,24:0.36: 0.56:1.000:0.628 0/0/1/1:4:30,24:0.43:-0.06:1.000:0.956 0/0/1/1:4:23,27:0.50:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:11,51:0.83: 0.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:9,20:0.69:-1.09:1.000:0.974 0/0/1/1:4:21,21:0.47:-0.55:1.000:0.993 0/0/1/1:4:26,37:0.56: 0.31:0.887:0.962 0/1/1/1:4:16,42:0.73: 0.11:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,30:0.72:-0.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:9,28:0.77:-0.76:0.999:1.000 0/0/1/1:4:43,37:0.45: 1.01:1.000:0.977 0/0/0/1:4:51,26:0.36: 0.89:1.000:0.715 0/0/1/1:4:24,33:0.55: 0.06:1.000:0.977 0/1/1/1:4:16,34:0.68:-0.22:1.000:0.949 0/0/0/1:4:34,6:0.22:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,47:0.85: 0.02:1.000:0.991 0/0/1/1:4:23,31:0.55:-0.06:1.000:0.983 0/0/1/1:4:24,23:0.47:-0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:28,15:0.37:-0.51:0.915:0.619 0/0/1/1:4:29,26:0.45:-0.02:1.000:0.984 0/0/1/1:4:35,35:0.47: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:32,25:0.43: 0.06:1.000:0.946 0/0/0/1:4:48,27:0.37: 0.81:1.000:0.514 0/1/1/1:4:16,33:0.67:-0.27:1.000:0.921 0/1/1/1:4:14,31:0.69:-0.43:1.000:0.972 0/1/1/1:4:12,43:0.79:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,41:0.94:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,22:0.43:-0.22:1.000:0.949 0/1/1/1:4:13,37:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,66:0.87: 0.85:1.000:0.857 0/0/1/1:4:36,27:0.42: 0.31:1.000:0.924 0/0/0/1:4:30,11:0.31:-0.60:1.000:0.976 0/1/1/1:4:15,61:0.81: 0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,61:0.81: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,5:0.23:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,52:0.87: 0.19:1.000:0.879 1/1/1/1:4:6,48:0.89:-0.06:1.000:0.645 0/0/1/1:4:35,34:0.47: 0.56:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,49:0.68: 0.68:1.000:0.951 0/0/1/1:4:15,10:0.40:-1.26:1.000:0.810 0/1/1/1:4:12,35:0.76:-0.35:0.994:1.000 0/0/0/1:4:25,6:0.25:-1.01:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,39:0.68: 0.06:1.000:0.962 0/1/1/1:4:17,45:0.74: 0.27:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,27:0.72:-0.72:1.000:0.994 0/1/1/1:4:28,61:0.69: 1.39:0.993:0.965 0/0/1/1:4:24,41:0.62: 0.40:1.000:0.607 0/0/1/1:4:22,29:0.54:-0.18:1.000:0.988 0/0/1/1:4:39,34:0.45: 0.73:1.000:0.979 0/0/1/1:4:19,30:0.59:-0.27:0.999:0.838 0/0/1/1:4:37,34:0.46: 0.64:1.000:0.987 0/1/1/1:4:14,35:0.72:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,24:0.53:-0.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:13,23:0.63:-0.80:1.000:0.525 0/0/0/1:4:26,3:0.17:-1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,32:0.83:-0.68:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,34:0.71:-0.31:1.000:0.993 0/1/1/1:4:14,35:0.72:-0.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,38:0.72:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,33:0.78:-0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,68:0.85: 1.06:1.000:0.991 0/1/1/1:4:18,42:0.70: 0.19:1.000:0.988 0/0/1/1:4:21,33:0.59:-0.06:1.000:0.847 0/1/1/1:4:9,26:0.75:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,25:0.67:-0.76:1.000:0.932 0/0/1/1:4:10,17:0.62:-1.17:1.000:0.625 0/0/1/1:4:14,14:0.47:-1.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:21,32:0.58:-0.10:1.000:0.899 0/1/1/1:4:23,53:0.70: 0.85:1.000:0.985 0/0/1/1:4:17,20:0.50:-0.76:0.998:0.997 1/1/1/1:4:2,46:0.96:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.47:-0.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,67:0.53: 2.67:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,31:0.55:-0.06:1.000:0.983 0/0/1/1:4:23,29:0.53:-0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:8,21:0.73:-1.09:1.000:0.998 0/0/0/1:4:32,14:0.33:-0.39:1.000:0.903 1/1/1/1:4:3,45:0.94:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,10:0.33:-0.88:1.000:0.934 0/1/1/1:4:14,34:0.71:-0.31:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,23:0.57:-0.68:1.000:0.956 1/1/1/1:4:6,60:0.91: 0.44:1.000:0.967 0/0/0/1:4:41,14:0.30:-0.02:1.000:0.987 0/0/1/1:4:27,22:0.44:-0.27:1.000:0.963 0/0/0/1:4:29,9:0.29:-0.72:1.000:0.994 0/1/1/1:4:13,72:0.85: 1.22:1.000:0.981 0/0/1/1:4:25,23:0.46:-0.31:1.000:0.987 0/1/1/1:4:8,51:0.87: 0.15:1.000:0.902 0/1/1/1:4:18,50:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,4:0.25:-1.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,23:0.63:-0.80:1.000:0.525 0/1/1/1:4:14,61:0.82: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:13,40:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,29:0.45: 0.31:1.000:0.975 0/0/1/1:4:20,24:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,46:0.77: 0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,73:0.97: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,15:0.42:-0.84:1.000:0.924 0/0/1/1:4:18,18:0.47:-0.80:1.000:0.993 0/1/1/1:4:12,59:0.84: 0.64:1.000:0.996 1/1/1/1:4:5,45:0.90:-0.22:1.000:0.887 0/0/1/1:4:35,46:0.54: 1.06:1.000:0.988 0/1/1/1:4:11,42:0.80:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,29:0.58:-0.31:1.000:0.897 0/1/1/1:4:7,42:0.86:-0.27:0.997:0.951 0/1/1/1:4:20,41:0.67: 0.23:1.000:0.914 0/0/1/1:4:22,21:0.47:-0.51:1.000:0.990 0/1/1/1:4:12,27:0.69:-0.68:1.000:0.978 1/1/1/1:4:5,42:0.90:-0.35:1.000:0.769 1/1/1/1:4:5,49:0.91:-0.06:1.000:0.958 0/1/1/1:4:15,33:0.69:-0.31:1.000:0.970 0/1/1/1:4:5,38:0.89:-0.51:1.000:0.510 0/0/1/1:4:13,22:0.61:-0.84:1.000:0.641 0/0/1/1:4:21,25:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,38:0.72:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,41:0.86:-0.31:1.000:0.963 0/0/0/1:4:28,14:0.35:-0.55:1.000:0.748 0/0/0/1:4:25,14:0.37:-0.68:0.956:0.524 0/0/1/1:4:38,25:0.40: 0.31:1.000:0.791 0/0/1/1:4:23,38:0.61: 0.23:1.000:0.721 0/1/1/1:4:13,28:0.68:-0.60:1.000:0.958 0/1/1/1:4:21,40:0.65: 0.23:1.000:0.775 -chr8.1 58907634 chr8.1_058907634 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:14,16:0.54:-0.03:1.000:0.989 0/0/0/0:4:18,1:0.07:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,20:0.40: 1.77:1.000:0.822 0/1/1/1:4:11,22:0.69: 0.21:1.000:0.975 0/1/1/1:4:12,21:0.66: 0.21:1.000:0.845 0/0/1/1:4:15,18:0.55: 0.21:1.000:0.978 0/0/1/1:4:10,6:0.40:-1.19:1.000:0.753 0/0/1/1:4:23,28:0.56: 1.69:1.000:0.973 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.61:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:1,4:0.82:-2.09:1.000:0.999 0/0/0/0:4:29,1:0.04:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,20:0.64: 0.13:1.000:0.727 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,10:0.29: 0.87:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,15:0.50:-0.03:0.999:0.997 0/0/0/0:4:48,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,24:0.57: 1.03:1.000:0.954 0/0/0/1:4:11,2:0.19:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,20:0.46: 1.12:1.000:0.989 0/1/1/1:4:14,24:0.65: 0.62:1.000:0.801 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.29:-2.17:1.000:0.991 0/0/0/1:4:34,16:0.35: 1.61:1.000:0.792 0/0/0/1:4:22,7:0.28:-0.12:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:15,7:0.35:-0.69:1.000:0.896 0/0/1/1:4:19,25:0.58: 1.12:1.000:0.921 0/0/0/1:4:31,15:0.36: 1.28:1.000:0.743 0/0/1/1:4:11,12:0.52:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:1,1:0.50:-2.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,3:0.78:-2.17:1.000:1.000 1/1/1:3:0,1:1.00:-2.42:0.995:1.000 0/1/1/1:4:13,21:0.63: 0.29:1.000:0.627 0/0/1/1:4:14,17:0.56: 0.05:1.000:0.974 0/0/1/1:4:17,13:0.44:-0.03:1.000:0.974 0/0/1/1:4:22,14:0.41: 0.46:1.000:0.848 0/0/1/1:4:19,29:0.62: 1.45:1.000:0.576 0/0/0/1:4:34,12:0.30: 1.28:1.000:0.984 0/0/1/1:4:25,16:0.41: 0.87:1.000:0.855 0/0/1/1:4:15,19:0.57: 0.29:1.000:0.953 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,30:0.76: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,18:0.59: 0.05:1.000:0.848 0/0/1/1/1:5:15,24:0.63: 0.71:1.000:0.949 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-2.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,23:0.64: 0.54:1.000:0.683 0/0/1/1:4:20,21:0.51: 0.87:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,27:0.74: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,10:0.42:-0.45:1.000:0.900 0/0/1/1:4:23,23:0.50: 1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,17:0.42: 0.95:1.000:0.917 0/1/1/1:4:9,18:0.69:-0.28:1.000:0.975 0/0/1/1:4:13,12:0.48:-0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:17,8:0.35:-0.45:1.000:0.792 0/0/1/1/1/1:6:12,21:0.66: 0.21:1.000:0.911 0/0/1/1:4:11,6:0.38:-1.10:1.000:0.536 0/1/1/1:4:7,28:0.82: 0.38:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,17:0.52: 0.21:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,26:0.64: 0.95:1.000:0.647 0/1/1/1:4:7,12:0.65:-0.94:1.000:0.801 0/1/1/1:4:13,30:0.73: 1.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,35:0.68: 1.86:0.887:0.963 0/0/0/0:4:37,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,9:0.46:-0.86:1.000:0.987 0/0/1/1:4:16,10:0.40:-0.36:0.999:0.822 0/0/0/0:4:31,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,31:0.72: 1.20:1.000:0.995 0/0/0/0:4:16,1:0.07:-1.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:30,17:0.38: 1.36:1.000:0.630 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,16:0.72:-0.61:1.000:0.997 0/1/1/1:4:14,23:0.64: 0.54:1.000:0.683 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/1:4:9,1:0.12:-1.68:0.915:0.852 0/0/1/1:4:14,17:0.56: 0.05:1.000:0.974 0/1/1/1:4:8,16:0.69:-0.53:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,18:0.47: 0.71:1.000:0.991 0/0/0/1:4:32,15:0.35: 1.36:1.000:0.799 0/0/1/1:4:16,9:0.38:-0.45:1.000:0.612 0/0/1/1:4:11,9:0.46:-0.86:1.000:0.987 0/0/1/1:4:11,11:0.50:-0.69:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,12:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,11:0.41:-0.20:1.000:0.868 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.69:-0.28:1.000:0.975 0/0/1/1:4:21,25:0.55: 1.28:1.000:0.980 0/0/1/1:4:31,25:0.46: 2.10:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,15:0.39: 0.87:1.000:0.671 0/0/1/1:4:16,19:0.55: 0.38:1.000:0.981 0/1/1/1:4:3,5:0.64:-1.84:1.000:0.727 0/0/1/1:4:10,12:0.55:-0.69:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,7:0.39:-0.94:0.994:0.696 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,20:0.55: 0.54:1.000:0.983 0/0/1/1:4:12,13:0.52:-0.45:1.000:0.994 0/0/1/1:4:9,6:0.42:-1.27:1.000:0.900 0/0/1/1:4:22,21:0.49: 1.03:0.993:0.996 0/0/0/1:4:27,8:0.27: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,22:0.49: 1.20:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,14:0.44: 0.21:1.000:0.962 0/0/1/1:4:17,20:0.55: 0.54:0.999:0.983 0/0/1/1:4:15,23:0.62: 0.62:1.000:0.560 0/0/1/1:4:14,20:0.60: 0.29:1.000:0.780 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,14:0.57:-0.45:1.000:0.950 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/1/1/1:4:10,25:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,11:0.44:-0.36:1.000:0.960 0/0/1/1:4:15,17:0.54: 0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:20,12:0.40: 0.13:1.000:0.753 0/0/0/1:4:29,9:0.28: 0.62:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,19:0.65:-0.03:1.000:0.818 0/1/1/1:4:16,33:0.70: 1.53:1.000:0.984 0/0/1/1:4:11,13:0.55:-0.53:1.000:0.982 0/0/0/0:4:28,1:0.04:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.59:-0.94:1.000:0.861 0/0/1/1:4:6,7:0.54:-1.43:1.000:0.985 0/1/1/1:4:11,28:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,17:0.40: 1.20:1.000:0.775 0/0/1/1:4:14,15:0.52:-0.12:0.998:0.995 0/0/1/1:4:20,14:0.43: 0.29:1.000:0.937 0/0/1/1:4:10,9:0.48:-0.94:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,23:0.59: 0.79:1.000:0.886 0/0/1/1:4:17,17:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:17,7:0.33:-0.53:1.000:0.935 0/1/1/1:4:9,18:0.69:-0.28:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-0.94:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,14:0.69:-0.77:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,18:0.61:-0.03:1.000:0.636 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:18,30:0.64: 1.45:1.000:0.727 0/1/1/1:4:12,19:0.63: 0.05:1.000:0.557 0/1/1/1:4:12,21:0.66: 0.21:1.000:0.845 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,37:0.74: 1.77:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,18:0.36: 2.02:1.000:0.732 0/0/0/1:4:38,13:0.30: 1.69:1.000:0.988 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:13,17:0.58:-0.03:1.000:0.927 0/0/0/1:4:35,10:0.27: 1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:11,7:0.41:-1.02:1.000:0.848 0/1/1/1:4:12,34:0.77: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,26:0.73: 0.54:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,14:0.35: 1.03:1.000:0.747 0/1/1/1:4:4,20:0.85:-0.53:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,18:0.55: 0.21:1.000:0.978 0/0/0/1:4:27,9:0.29: 0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:50,17:0.29: 3.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,25:0.48: 1.86:1.000:0.994 0/0/0/1:4:29,9:0.28: 0.62:1.000:0.995 0/0/0/0:4:24,2:0.10:-0.36:0.997:0.874 0/0/1/1:4:15,20:0.58: 0.38:1.000:0.906 0/0/1/1:4:15,14:0.49:-0.12:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,11:0.41:-0.20:1.000:0.868 0/0/1/1:4:20,17:0.47: 0.54:1.000:0.991 0/0/1/1:4:20,12:0.40: 0.13:1.000:0.753 0/0/0/1:4:20,5:0.25:-0.45:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,8:0.42:-0.86:1.000:0.900 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,31:0.65: 1.53:1.000:0.811 0/0/0/1:4:19,8:0.33:-0.28:1.000:0.920 1/1/1/1:4:3,23:0.90:-0.36:1.000:0.747 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.20:0.956:1.000 0/0/1/1:4:25,25:0.50: 1.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,20:0.60: 0.29:1.000:0.780 0/0/1/1:4:25,16:0.41: 0.87:1.000:0.855 0/0/0/0:4:31,1:0.04: 0.13:1.000:1.000 -chr8.1 59054204 chr8.1_059054204 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:29,18:.: 1.06:1.000:. ./.:4:3,26:.:-0.33:1.000:. ./.:4:14,36:.: 1.29:1.000:. ./.:4:10,43:.: 1.52:1.000:. ./.:4:36,23:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,55:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,18:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,50:.: 1.29:1.000:. ./.:4:14,16:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:0,6:.:-2.11:1.000:. ./.:4:18,23:.: 0.60:1.000:. ./.:4:10,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,18:.:-0.18:1.000:. ./.:4:18,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,54:.: 1.60:1.000:. ./.:4:17,30:.: 1.06:0.999:. ./.:4:33,18:.: 1.37:1.000:. ./.:4:36,19:.: 1.68:1.000:. ./.:4:34,16:.: 1.29:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.34:1.000:. ./.:4:15,38:.: 1.52:1.000:. ./.:4:11,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:17,15:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,7:.:-2.03:1.000:. ./.:4:16,24:.: 0.52:1.000:. ./.:4:36,26:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.98:1.000:. ./.:5:16,48:.: 2.37:1.000:. ./.:4:24,15:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,2:.:-2.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:0,2:.:-2.42:0.995:. ./.:4:24,15:.: 0.44:1.000:. ./.:4:19,30:.: 1.21:1.000:. ./.:4:15,17:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.26:1.000:. ./.:4:5,34:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.64:1.000:. ./.:4:9,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,16:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:11,26:.: 0.29:1.000:. ./.:5:16,34:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:7,14:.:-0.95:1.000:. ./.:4:13,6:.:-1.11:1.000:. ./.:4:9,32:.: 0.60:1.000:. ./.:4:9,20:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,34:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.49:1.000:. ./.:4:6,17:.:-0.80:1.000:. ./.:4:10,18:.:-0.41:1.000:. ./.:6:6,15:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:4,19:.:-0.80:1.000:. ./.:4:18,13:.:-0.18:1.000:. ./.:4:8,15:.:-0.80:1.000:. ./.:4:23,16:.: 0.44:1.000:. ./.:4:14,28:.: 0.67:1.000:. ./.:4:9,12:.:-0.95:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.21:1.000:. ./.:4:17,15:.:-0.10:0.887:. ./.:4:12,33:.: 0.90:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.72:0.999:. ./.:4:16,10:.:-0.56:1.000:. ./.:4:14,33:.: 1.06:1.000:. ./.:4:12,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,20:.:-1.03:1.000:. ./.:4:9,12:.:-0.95:1.000:. ./.:4:12,26:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:10,31:.: 0.60:1.000:. ./.:4:17,12:.:-0.33:0.915:. ./.:4:10,23:.:-0.02:1.000:. ./.:4:25,14:.: 0.44:1.000:. ./.:4:14,28:.: 0.67:1.000:. ./.:4:15,7:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.49:1.000:. ./.:4:11,18:.:-0.33:1.000:. ./.:4:2,14:.:-1.34:1.000:. ./.:4:11,8:.:-1.11:1.000:. ./.:4:20,22:.: 0.67:1.000:. ./.:4:7,22:.:-0.33:1.000:. ./.:4:11,29:.: 0.52:1.000:. ./.:4:21,20:.: 0.60:1.000:. ./.:4:4,14:.:-1.18:1.000:. ./.:4:5,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:11,21:.:-0.10:1.000:. ./.:4:9,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.80:1.000:. ./.:4:8,25:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:1,6:.:-2.03:1.000:. ./.:4:17,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:5,11:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.21:0.994:. ./.:4:4,25:.:-0.33:1.000:. ./.:4:9,19:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,25:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.10:1.000:. ./.:4:19,26:.: 0.90:0.993:. ./.:4:0,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.72:1.000:. ./.:4:17,25:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.80:0.999:. ./.:4:19,22:.: 0.60:1.000:. ./.:4:7,18:.:-0.64:1.000:. ./.:4:21,6:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.72:1.000:. ./.:4:9,11:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.49:1.000:. ./.:4:5,11:.:-1.34:1.000:. ./.:4:16,30:.: 0.98:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:9,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:12,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:16,9:.:-0.64:1.000:. ./.:4:6,25:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.34:1.000:. ./.:4:6,13:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,16:.:-1.34:1.000:. ./.:4:15,14:.:-0.33:1.000:. ./.:4:21,29:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,7:.:-1.34:0.998:. ./.:4:9,20:.:-0.33:1.000:. ./.:4:15,19:.: 0.05:1.000:. ./.:4:37,27:.: 2.37:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.87:1.000:. ./.:4:5,18:.:-0.80:1.000:. ./.:4:14,7:.:-0.95:1.000:. ./.:4:5,21:.:-0.56:1.000:. ./.:4:12,9:.:-0.95:1.000:. ./.:4:28,16:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.49:1.000:. ./.:4:13,25:.: 0.36:1.000:. ./.:4:15,21:.: 0.21:1.000:. ./.:4:20,32:.: 1.45:1.000:. ./.:4:9,24:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,28:.: 0.52:1.000:. ./.:4:28,21:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,45:.: 0.90:1.000:. ./.:4:3,3:.:-2.11:1.000:. ./.:4:6,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:28,18:.: 0.98:1.000:. ./.:4:23,15:.: 0.36:1.000:. ./.:4:27,20:.: 1.06:1.000:. ./.:4:23,27:.: 1.29:1.000:. ./.:4:9,31:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,16:.:-0.80:1.000:. ./.:4:15,26:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,36:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,37:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.67:0.997:. ./.:4:25,28:.: 1.52:1.000:. ./.:4:8,27:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:9,22:.:-0.18:1.000:. ./.:4:11,36:.: 1.06:1.000:. ./.:4:13,31:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.64:1.000:. ./.:4:20,19:.: 0.44:1.000:. ./.:4:16,35:.: 1.37:1.000:. ./.:4:14,21:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,49:.: 1.21:1.000:. ./.:4:13,34:.: 1.06:1.000:. ./.:4:21,30:.: 1.37:0.956:. ./.:4:11,32:.: 0.75:1.000:. ./.:4:32,16:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.18:1.000:. ./.:4:17,32:.: 1.21:1.000:. -chr8.1 59306820 chr8.1_059306820 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:230,3:.:-0.65:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:223,8:.:-0.69:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:412,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:235,3:.:-0.57:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:161,8:.:-1.75:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:216,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:234,3:.:-0.59:0.999:. ./.:4:332,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:188,17:.:-1.13:1.000:. ./.:4:237,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:328,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:164,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:267,5:.: 0.01:1.000:. ./.:4:207,1:.:-1.08:1.000:. ./.:5:297,15:.: 0.70:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:205,3:.:-1.08:1.000:. ./.:4:167,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:125,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:197,0:.:-1.27:1.000:. ./.:3:117,0:.:-2.64:0.995:. ./.:4:337,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:219,6:.:-0.79:1.000:. ./.:4:206,2:.:-1.08:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:224,6:.:-0.71:1.000:. ./.:4:250,11:.:-0.17:1.000:. ./.:4:283,12:.: 0.41:1.000:. ./.:4:265,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:340,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.04:1.000:. ./.:5:365,4:.: 1.68:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:282,1:.: 0.20:1.000:. ./.:4:190,16:.:-1.12:1.000:. ./.:4:182,11:.:-1.34:1.000:. ./.:4:345,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:238,10:.:-0.40:1.000:. ./.:4:298,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:248,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:212,4:.:-0.95:1.000:. ./.:6:264,6:.:-0.02:1.000:. ./.:4:236,15:.:-0.35:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:295,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:210,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.58:0.887:. ./.:4:340,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:273,10:.: 0.20:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.27:0.999:. ./.:4:405,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:349,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:225,6:.:-0.69:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.65:0.915:. ./.:4:332,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:191,12:.:-1.17:1.000:. ./.:4:205,16:.:-0.86:1.000:. ./.:4:215,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:198,9:.:-1.10:1.000:. ./.:4:225,8:.:-0.65:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:293,16:.: 0.65:1.000:. ./.:4:329,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:155,14:.:-1.75:1.000:. ./.:4:300,6:.: 0.60:1.000:. ./.:4:160,9:.:-1.75:1.000:. ./.:4:251,19:.:-0.02:0.994:. ./.:4:163,11:.:-1.67:1.000:. ./.:4:248,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:176,3:.:-1.58:1.000:. ./.:4:414,0:.: 2.45:0.993:. ./.:4:257,6:.:-0.14:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:308,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:319,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:246,14:.:-0.19:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:215,14:.:-0.72:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:234,6:.:-0.53:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:220,6:.:-0.77:1.000:. ./.:4:215,3:.:-0.91:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:343,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:278,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:220,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:211,5:.:-0.95:1.000:. ./.:4:179,11:.:-1.39:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:311,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:216,0:.:-0.95:0.998:. ./.:4:315,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:252,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:395,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:196,11:.:-1.10:1.000:. ./.:4:252,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:261,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:306,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:166,15:.:-1.55:1.000:. ./.:4:393,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:368,9:.: 1.81:1.000:. ./.:4:337,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:344,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:228,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:251,5:.:-0.26:1.000:. ./.:4:177,10:.:-1.44:1.000:. ./.:4:319,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:252,7:.:-0.21:1.000:. ./.:4:228,5:.:-0.65:1.000:. ./.:4:383,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:194,3:.:-1.27:1.000:. ./.:4:255,4:.:-0.21:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:204,1:.:-1.13:1.000:. ./.:4:236,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:234,6:.:-0.53:1.000:. ./.:4:242,3:.:-0.45:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:174,4:.:-1.60:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.03:0.997:. ./.:4:302,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:216,2:.:-0.91:1.000:. ./.:4:184,4:.:-1.43:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:216,4:.:-0.88:1.000:. ./.:4:217,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:174,1:.:-1.65:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:234,2:.:-0.60:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:229,8:.:-0.59:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.79:0.956:. ./.:4:399,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:316,1:.: 0.79:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:358,0:.: 1.49:1.000:. -chr8.1 59523131 chr8.1_059523131 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:18,41:0.74: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,33:0.75:-0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,30:0.68:-0.51:1.000:0.955 0/0/1/1:4:40,50:0.59: 1.51:1.000:0.857 1/1/1/1:4:0,75:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,34:0.61: 0.05:1.000:0.651 0/0/1/1:4:9,7:0.47:-1.97:1.000:0.993 0/0/1/1:4:29,29:0.53: 0.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:15,44:0.79: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:2,34:0.95:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,12:0.67:-1.83:1.000:0.933 0/1/1/1:4:23,48:0.72: 0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:25,37:0.64: 0.19:1.000:0.635 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,90:1.00: 1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,27:0.60:-0.46:1.000:0.802 0/1/1/1:4:15,52:0.81: 0.43:0.999:1.000 0/0/1/1:4:61,28:0.38: 1.47:1.000:0.514 0/1/1/1:4:30,54:0.69: 1.23:1.000:0.965 0/0/1/1:4:47,44:0.51: 1.56:1.000:0.996 0/1/1/1:4:8,20:0.76:-1.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,48:0.83: 0.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,49:0.81: 0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,8:0.53:-1.97:1.000:0.992 0/0/0/1:4:28,8:0.30:-1.03:1.000:0.983 0/1/1/1:4:27,45:0.67: 0.67:1.000:0.903 1/1/1/1:4:0,61:1.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:41,37:0.50: 0.95:1.000:0.537 0/1/1/1:4:14,65:0.85: 1.00:1.000:0.987 0/1/1/1:4:17,32:0.70:-0.42:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,9:0.79:-2.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/1/1:3:1,3:0.79:-2.54:0.995:1.000 0/1/1/1:4:18,29:0.66:-0.51:1.000:0.852 0/0/1/1:4:41,25:0.43: 0.38:1.000:0.938 0/0/1/1:4:19,27:0.63:-0.56:1.000:0.503 0/1/1/1:4:10,17:0.67:-1.45:1.000:0.925 0/0/1/1:4:30,38:0.59: 0.48:1.000:0.833 0/1/1/1:4:17,34:0.71:-0.32:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,31:0.66:-0.37:1.000:0.873 0/1/1/1:4:18,34:0.70:-0.28:1.000:0.982 0/1/1/1:4:8,48:0.88:-0.09:1.000:0.767 0/1/1/1:4:17,39:0.74:-0.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:31,48:0.65: 1.00:1.000:0.767 1/1/1/1/1:5:0,57:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,17:0.84:-1.74:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,29:0.47: 0.38:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,29:1.00:-1.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,106:0.83: 3.49:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,39:0.49: 1.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:39,31:0.48: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,31:0.48: 0.57:1.000:0.994 0/0/1/1:4:38,45:0.58: 1.18:1.000:0.926 0/1/1/1:4:14,38:0.77:-0.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.08:1.000:1.000 0/1/1/1/1/1:6:19,45:0.75: 0.29:1.000:0.524 0/1/1/1:4:19,54:0.78: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,53:0.76: 0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,39:0.57: 0.71:1.000:0.951 0/1/1/1:4:31,71:0.74: 2.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,27:0.44: 0.48:1.000:0.969 0/0/1/1:4:20,12:0.42:-1.22:1.000:0.928 0/0/1/1:4:33,26:0.48: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:11,24:0.73:-1.08:0.887:0.998 0/0/1/1:4:36,18:0.39:-0.18:1.000:0.699 0/1/1/1:4:20,58:0.78: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,10:0.43:-1.50:0.999:0.950 0/1/1/1:4:16,48:0.79: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,54:0.51: 2.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,36:0.82:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:31,8:0.29:-0.89:1.000:0.992 0/1/1/1:4:18,58:0.80: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,22:0.57:-0.79:1.000:0.945 0/1/1/1:4:39,56:0.63: 1.75:1.000:0.533 0/1/1/1:4:16,30:0.70:-0.56:1.000:0.980 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.18:0.915:1.000 0/1/1/1:4:33,47:0.63: 1.04:1.000:0.505 0/1/1/1:4:22,71:0.80: 1.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,65:1.00: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,16:0.38:-0.32:1.000:0.505 0/1/1/1:4:15,32:0.73:-0.51:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,32:0.67:-0.32:1.000:0.915 0/1/1/1:4:8,25:0.80:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,25:0.58:-0.56:1.000:0.921 0/0/1/1:4:19,18:0.52:-0.98:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,81:1.00: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,40:0.69: 0.19:1.000:0.970 0/1/1/1:4:17,42:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,26:0.71:-0.89:1.000:0.992 0/1/1/1:4:22,51:0.75: 0.71:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,34:0.70:-0.28:1.000:0.982 0/0/1/1:4:20,15:0.47:-1.08:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,65:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,11:0.69:-1.92:1.000:0.973 0/0/1/1:4:15,20:0.61:-1.08:1.000:0.710 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,31:0.70:-0.51:0.994:0.988 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,52:0.76: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,59:0.69: 1.56:1.000:0.975 0/1/1/1:4:17,48:0.78: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.57:0.993:1.000 0/1/1/1:4:20,49:0.76: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,36:0.49: 0.95:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,31:0.49: 0.43:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,16:0.47:-0.98:1.000:0.992 0/1/1/1:4:17,66:0.83: 1.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,23:0.70:-1.08:1.000:0.986 0/1/1/1:4:15,44:0.79: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,28:0.63:-0.51:1.000:0.621 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,50:0.55: 1.80:1.000:0.976 0/1/1/1:4:15,39:0.77:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,37:0.51: 0.90:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,32:0.66:-0.28:1.000:0.839 0/1/1/1:4:18,42:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,33:0.66:-0.23:1.000:0.890 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,24:0.69:-0.98:1.000:0.976 0/0/1/1:4:23,27:0.57:-0.37:1.000:0.934 0/0/1/1:4:21,26:0.59:-0.51:1.000:0.872 0/1/1/1:4:13,33:0.76:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.35:-1.36:0.998:0.834 0/0/0/1:4:30,7:0.28:-0.98:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,61:0.77: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,52:0.75: 0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,50:0.69: 0.90:1.000:0.977 0/1/1/1:4:10,21:0.72:-1.27:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,24:0.67:-0.94:1.000:0.933 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,28:0.52:-0.04:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,77:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,44:0.86:-0.23:1.000:0.975 0/1/1/1:4:17,32:0.70:-0.42:1.000:0.981 0/0/1/1:4:47,54:0.57: 2.03:1.000:0.950 0/1/1/1:4:23,72:0.80: 1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,45:0.54: 1.42:1.000:0.985 0/1/1/1:4:18,58:0.80: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.50: 0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,53:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,10:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,33:0.70:-0.37:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,14:1.00:-2.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,13:0.32:-0.23:1.000:0.952 0/1/1/1:4:24,64:0.77: 1.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,26:0.78:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.60:-0.89:1.000:0.787 0/0/1/1:4:41,46:0.56: 1.37:1.000:0.963 0/1/1/1:4:9,53:0.88: 0.19:1.000:0.805 0/1/1/1:4:20,43:0.73: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,8:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:8,27:0.81:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,23:0.38: 0.67:1.000:0.565 0/1/1/1:4:15,26:0.68:-0.79:1.000:0.942 1/1/1/1:4:0,43:1.00:-0.70:0.997:1.000 0/0/1/1:4:31,26:0.49:-0.04:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.25:-1.22:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,22:0.45:-0.18:1.000:0.979 0/1/1/1:4:25,36:0.63: 0.15:1.000:0.543 0/1/1/1:4:18,47:0.77: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,50:0.75: 0.62:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,48:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,41:0.49: 1.51:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,54:0.82: 0.52:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,79:0.80: 2.17:0.956:1.000 0/1/1/1:4:12,36:0.79:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,23:0.52:-0.51:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,58:0.79: 0.90:1.000:1.000 -chr8.1 59749378 chr8.1_059749378 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.81:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.29:0.999:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:2,0:.:-3.14:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:6,0:.:-2.88:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.70:1.000:. ./.:5:91,0:.: 2.72:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-3.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.34:1.000:. ./.:5:81,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.01:1.000:. ./.:6:32,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:0.887:. ./.:4:51,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.76:0.999:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:0.915:. ./.:4:61,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:80,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.21:0.994:. ./.:4:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:0.993:. ./.:4:66,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:0.999:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:0.998:. ./.:4:54,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:3,0:.:-3.07:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.83:0.997:. ./.:4:35,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.31:0.956:. ./.:4:66,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.24:1.000:. -chr8.1 60006234 chr8.1_060006234 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.07:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.26:0.999:. ./.:4:147,0:.: 2.18:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.56:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:139,1:.: 1.98:1.000:. ./.:5:86,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:124,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:158,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.73:1.000:. ./.:4:24,0:.:-1.41:1.000:. ./.:3:2,0:.:-2.05:0.995:. ./.:4:29,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:121,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:105,2:.: 1.02:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.12:1.000:. ./.:5:176,0:.: 3.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:69,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:120,0:.: 1.40:1.000:. ./.:6:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:35,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.71:0.887:. ./.:4:37,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.91:0.999:. ./.:4:33,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.74:0.915:. ./.:4:42,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:51,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.22:0.994:. ./.:4:55,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:130,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.54:0.993:. ./.:4:122,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.06:0.999:. ./.:4:94,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:163,0:.: 2.65:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.50:0.998:. ./.:4:40,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:82,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:32,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:94,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:141,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:111,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:115,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:143,0:.: 2.07:0.997:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:124,2:.: 1.57:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:97,1:.: 0.75:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.11:0.956:. ./.:4:105,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:76,1:.: 0.14:1.000:. -chr8.1 60093238 chr8.1_060093238 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:137,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:135,23:.: 0.62:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:117,31:.: 0.43:1.000:. ./.:4:89,22:.:-0.25:1.000:. ./.:4:300,31:.: 3.80:1.000:. ./.:4:87,12:.:-0.47:1.000:. ./.:4:154,23:.: 0.96:1.000:. ./.:4:97,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.70:1.000:. ./.:4:18,22:.:-1.55:1.000:. ./.:4:164,23:.: 1.15:1.000:. ./.:4:90,43:.: 0.16:1.000:. ./.:4:91,36:.: 0.05:1.000:. ./.:4:49,35:.:-0.74:1.000:. ./.:4:207,33:.: 2.12:1.000:. ./.:4:137,39:.: 0.95:0.999:. ./.:4:129,80:.: 1.55:1.000:. ./.:4:121,31:.: 0.51:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:27,0:.:-1.79:1.000:. ./.:4:106,21:.: 0.05:1.000:. ./.:4:148,32:.: 1.02:1.000:. ./.:4:84,22:.:-0.34:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.57:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:168,53:.: 1.77:1.000:. ./.:5:204,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:72,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:198,22:.: 1.76:1.000:. ./.:4:153,56:.: 1.55:1.000:. ./.:4:34,9:.:-1.50:1.000:. ./.:4:24,8:.:-1.70:1.000:. ./.:3:7,0:.:-2.16:0.995:. ./.:4:145,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:143,23:.: 0.76:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:146,21:.: 0.78:1.000:. ./.:4:161,24:.: 1.11:1.000:. ./.:4:103,23:.: 0.03:1.000:. ./.:4:101,22:.:-0.03:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:96,34:.: 0.10:1.000:. ./.:4:84,27:.:-0.25:1.000:. ./.:5:137,57:.: 1.28:1.000:. ./.:4:92,15:.:-0.32:1.000:. ./.:4:95,37:.: 0.14:1.000:. ./.:4:135,57:.: 1.24:1.000:. ./.:4:48,16:.:-1.11:1.000:. ./.:4:95,48:.: 0.34:1.000:. ./.:4:55,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:128,24:.: 0.51:1.000:. ./.:4:138,14:.: 0.51:1.000:. ./.:4:85,30:.:-0.17:1.000:. ./.:4:100,26:.: 0.03:1.000:. ./.:4:98,14:.:-0.23:1.000:. ./.:6:76,14:.:-0.63:1.000:. ./.:4:68,9:.:-0.87:1.000:. ./.:4:54,40:.:-0.56:1.000:. ./.:4:32,39:.:-0.98:1.000:. ./.:4:80,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:73,26:.:-0.47:1.000:. ./.:4:108,13:.:-0.06:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:93,14:.:-0.32:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.32:0.887:. ./.:4:134,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:108,46:.: 0.54:1.000:. ./.:4:72,15:.:-0.69:0.999:. ./.:4:137,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:117,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:105,18:.:-0.03:1.000:. ./.:4:105,23:.: 0.06:1.000:. ./.:4:54,21:.:-0.91:1.000:. ./.:4:67,16:.:-0.76:1.000:. ./.:4:81,38:.:-0.10:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.91:0.915:. ./.:4:71,13:.:-0.74:1.000:. ./.:4:48,18:.:-1.08:1.000:. ./.:4:38,29:.:-1.06:1.000:. ./.:4:53,19:.:-0.97:1.000:. ./.:4:97,18:.:-0.17:1.000:. ./.:4:30,26:.:-1.26:1.000:. ./.:4:81,11:.:-0.60:1.000:. ./.:4:82,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:69,16:.:-0.73:1.000:. ./.:4:72,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:80,21:.:-0.43:1.000:. ./.:4:73,15:.:-0.67:1.000:. ./.:4:71,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,21:.:-1.22:1.000:. ./.:4:110,5:.:-0.17:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:61,16:.:-0.87:1.000:. ./.:4:45,16:.:-1.17:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:30,16:.:-1.44:1.000:. ./.:4:80,15:.:-0.54:0.994:. ./.:4:59,22:.:-0.80:1.000:. ./.:4:50,34:.:-0.74:1.000:. ./.:4:34,33:.:-1.06:1.000:. ./.:4:153,56:.: 1.55:1.000:. ./.:4:86,45:.: 0.12:0.993:. ./.:4:117,22:.: 0.27:1.000:. ./.:4:75,15:.:-0.63:1.000:. ./.:4:197,55:.: 2.34:1.000:. ./.:4:76,10:.:-0.71:0.999:. ./.:4:53,15:.:-1.04:1.000:. ./.:4:84,15:.:-0.47:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.91:1.000:. ./.:4:81,14:.:-0.54:1.000:. ./.:4:52,44:.:-0.52:1.000:. ./.:4:107,8:.:-0.17:1.000:. ./.:4:36,21:.:-1.24:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:39,21:.:-1.19:1.000:. ./.:4:119,20:.: 0.27:1.000:. ./.:4:184,46:.: 1.94:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:35,20:.:-1.28:1.000:. ./.:4:49,13:.:-1.15:1.000:. ./.:4:126,32:.: 0.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:93,15:.:-0.30:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:106,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:57,0:.:-1.24:0.998:. ./.:4:99,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:88,14:.:-0.41:1.000:. ./.:4:106,43:.: 0.45:1.000:. ./.:4:103,40:.: 0.34:1.000:. ./.:4:72,19:.:-0.62:1.000:. ./.:4:58,11:.:-1.02:1.000:. ./.:4:19,24:.:-1.50:1.000:. ./.:4:65,13:.:-0.86:1.000:. ./.:4:20,30:.:-1.37:1.000:. ./.:4:56,23:.:-0.84:1.000:. ./.:4:68,23:.:-0.62:1.000:. ./.:4:114,33:.: 0.41:1.000:. ./.:4:145,20:.: 0.74:1.000:. ./.:4:126,26:.: 0.51:1.000:. ./.:4:135,14:.: 0.45:1.000:. ./.:4:144,24:.: 0.80:1.000:. ./.:4:76,16:.:-0.60:1.000:. ./.:4:291,0:.: 3.06:1.000:. ./.:4:194,31:.: 1.85:1.000:. ./.:4:47,3:.:-1.37:1.000:. ./.:4:87,45:.: 0.14:1.000:. ./.:4:251,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:106,42:.: 0.43:1.000:. ./.:4:94,22:.:-0.16:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:37,49:.:-0.71:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:125,16:.: 0.30:1.000:. ./.:4:143,21:.: 0.73:1.000:. ./.:4:85,52:.: 0.23:1.000:. ./.:4:210,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:248,28:.: 2.79:1.000:. ./.:4:130,17:.: 0.41:1.000:. ./.:4:142,23:.: 0.74:1.000:. ./.:4:141,49:.: 1.20:0.997:. ./.:4:115,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:127,21:.: 0.43:1.000:. ./.:4:138,40:.: 0.98:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:115,22:.: 0.23:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:131,20:.: 0.49:1.000:. ./.:4:88,21:.:-0.29:1.000:. ./.:4:227,29:.: 2.42:1.000:. ./.:4:92,20:.:-0.23:1.000:. ./.:4:204,20:.: 1.83:1.000:. ./.:4:117,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:110,67:.: 0.96:0.956:. ./.:4:162,34:.: 1.31:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:139,14:.: 0.52:1.000:. ./.:4:118,28:.: 0.40:1.000:. -chr8.1 60242688 chr8.1_060242688 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:842,143:.: 0.01:1.000:. ./.:4:700,155:.:-0.45:1.000:. ./.:4:743,99:.:-0.49:1.000:. ./.:4:731,342:.: 0.33:1.000:. ./.:4:1058,149:.: 0.80:1.000:. ./.:4:873,192:.: 0.30:1.000:. ./.:4:506,83:.:-1.39:1.000:. ./.:4:1006,196:.: 0.78:1.000:. ./.:4:821,206:.: 0.16:1.000:. ./.:4:128,37:.:-2.89:1.000:. ./.:4:106,31:.:-2.99:1.000:. ./.:4:932,174:.: 0.44:1.000:. ./.:4:842,164:.: 0.09:1.000:. ./.:4:998,236:.: 0.90:1.000:. ./.:4:703,118:.:-0.57:1.000:. ./.:4:927,139:.: 0.30:1.000:. ./.:4:1097,50:.: 0.59:0.999:. ./.:4:1016,144:.: 0.63:1.000:. ./.:4:1085,362:.: 1.65:1.000:. ./.:4:738,283:.: 0.14:1.000:. ./.:4:85,47:.:-3.01:1.000:. ./.:4:646,268:.:-0.24:1.000:. ./.:4:803,194:.: 0.06:1.000:. ./.:4:705,47:.:-0.81:1.000:. ./.:4:79,6:.:-3.18:1.000:. ./.:4:936,157:.: 0.40:1.000:. ./.:4:728,174:.:-0.28:1.000:. ./.:4:645,311:.:-0.09:1.000:. ./.:5:801,221:.: 0.15:1.000:. ./.:4:694,348:.: 0.22:1.000:. ./.:4:751,186:.:-0.16:1.000:. ./.:4:705,109:.:-0.59:1.000:. ./.:4:34,11:.:-3.32:1.000:. ./.:4:169,40:.:-2.74:1.000:. ./.:3:30,16:.:-3.31:0.995:. ./.:4:786,352:.: 0.56:1.000:. ./.:4:940,99:.: 0.21:1.000:. ./.:4:918,347:.: 1.01:1.000:. ./.:4:962,114:.: 0.34:1.000:. ./.:4:909,217:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1035,250:.: 1.08:1.000:. ./.:4:705,343:.: 0.24:1.000:. ./.:4:695,408:.: 0.43:1.000:. ./.:4:795,233:.: 0.17:1.000:. ./.:4:889,248:.: 0.55:1.000:. ./.:4:748,190:.:-0.15:1.000:. ./.:5:938,217:.: 0.62:1.000:. ./.:4:262,108:.:-2.17:1.000:. ./.:4:891,315:.: 0.80:1.000:. ./.:4:828,194:.: 0.15:1.000:. ./.:4:726,264:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1045,219:.: 1.00:1.000:. ./.:4:894,128:.: 0.15:1.000:. ./.:4:833,351:.: 0.72:1.000:. ./.:4:824,248:.: 0.32:1.000:. ./.:4:862,178:.: 0.21:1.000:. ./.:4:1044,314:.: 1.34:1.000:. ./.:4:926,390:.: 1.19:1.000:. ./.:4:1020,251:.: 1.03:1.000:. ./.:6:540,166:.:-0.97:1.000:. ./.:4:610,215:.:-0.55:1.000:. ./.:4:831,225:.: 0.27:1.000:. ./.:4:946,223:.: 0.67:1.000:. ./.:4:588,326:.:-0.24:1.000:. ./.:4:750,212:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1061,200:.: 0.99:1.000:. ./.:4:385,133:.:-1.64:1.000:. ./.:4:868,180:.: 0.24:1.000:. ./.:4:646,173:.:-0.57:0.887:. ./.:4:643,137:.:-0.71:1.000:. ./.:4:844,147:.: 0.04:1.000:. ./.:4:619,197:.:-0.59:0.999:. ./.:4:968,268:.: 0.90:1.000:. ./.:4:1153,153:.: 1.15:1.000:. ./.:4:786,214:.: 0.07:1.000:. ./.:4:739,144:.:-0.35:1.000:. ./.:4:659,211:.:-0.39:1.000:. ./.:4:700,124:.:-0.56:1.000:. ./.:4:991,282:.: 1.03:1.000:. ./.:4:973,378:.: 1.31:1.000:. ./.:4:764,287:.: 0.25:0.915:. ./.:4:1151,365:.: 1.90:1.000:. ./.:4:884,383:.: 1.01:1.000:. ./.:4:880,218:.: 0.41:1.000:. ./.:4:620,234:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1061,382:.: 1.64:1.000:. ./.:4:849,76:.:-0.20:1.000:. ./.:4:651,178:.:-0.54:1.000:. ./.:4:756,150:.:-0.27:1.000:. ./.:4:711,270:.: 0.00:1.000:. ./.:4:562,154:.:-0.94:1.000:. ./.:4:913,145:.: 0.27:1.000:. ./.:4:815,122:.:-0.16:1.000:. ./.:4:563,206:.:-0.75:1.000:. ./.:4:977,250:.: 0.87:1.000:. ./.:4:926,254:.: 0.71:1.000:. ./.:4:733,220:.:-0.10:1.000:. ./.:4:768,223:.: 0.04:1.000:. ./.:4:630,343:.:-0.03:1.000:. ./.:4:679,346:.: 0.16:1.000:. ./.:4:462,102:.:-1.48:1.000:. ./.:4:543,227:.:-0.75:1.000:. ./.:4:461,167:.:-1.25:1.000:. ./.:4:678,57:.:-0.87:0.994:. ./.:4:648,170:.:-0.58:1.000:. ./.:4:985,225:.: 0.81:1.000:. ./.:4:833,360:.: 0.75:1.000:. ./.:4:718,340:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1233,325:.: 2.05:0.993:. ./.:4:858,131:.: 0.03:1.000:. ./.:4:834,85:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1145,264:.: 1.52:1.000:. ./.:4:837,410:.: 0.94:0.999:. ./.:4:751,282:.: 0.18:1.000:. ./.:4:490,103:.:-1.38:1.000:. ./.:4:849,290:.: 0.56:1.000:. ./.:4:635,137:.:-0.74:1.000:. ./.:4:745,212:.:-0.09:1.000:. ./.:4:815,163:.:-0.01:1.000:. ./.:4:644,263:.:-0.26:1.000:. ./.:4:900,398:.: 1.12:1.000:. ./.:4:740,141:.:-0.35:1.000:. ./.:4:898,167:.: 0.30:1.000:. ./.:4:990,92:.: 0.36:1.000:. ./.:4:687,135:.:-0.56:1.000:. ./.:4:745,123:.:-0.40:1.000:. ./.:4:660,273:.:-0.17:1.000:. ./.:4:683,163:.:-0.48:1.000:. ./.:4:502,102:.:-1.34:1.000:. ./.:4:567,173:.:-0.85:1.000:. ./.:4:674,241:.:-0.23:1.000:. ./.:4:987,53:.: 0.21:1.000:. ./.:4:355,147:.:-1.70:0.998:. ./.:4:925,143:.: 0.31:1.000:. ./.:4:665,214:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1101,319:.: 1.56:1.000:. ./.:4:1147,328:.: 1.75:1.000:. ./.:4:580,238:.:-0.58:1.000:. ./.:4:652,34:.:-1.05:1.000:. ./.:4:583,47:.:-1.24:1.000:. ./.:4:798,223:.: 0.14:1.000:. ./.:4:905,251:.: 0.62:1.000:. ./.:4:622,334:.:-0.09:1.000:. ./.:4:606,192:.:-0.65:1.000:. ./.:4:977,348:.: 1.22:1.000:. ./.:4:1077,106:.: 0.72:1.000:. ./.:4:947,305:.: 0.96:1.000:. ./.:4:759,266:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1007,275:.: 1.07:1.000:. ./.:4:811,87:.:-0.29:1.000:. ./.:4:895,297:.: 0.75:1.000:. ./.:4:1006,245:.: 0.96:1.000:. ./.:4:103,28:.:-3.01:1.000:. ./.:4:600,194:.:-0.66:1.000:. ./.:4:973,292:.: 1.01:1.000:. ./.:4:858,163:.: 0.14:1.000:. ./.:4:828,118:.:-0.12:1.000:. ./.:4:832,354:.: 0.73:1.000:. ./.:4:839,112:.:-0.11:1.000:. ./.:4:934,184:.: 0.49:1.000:. ./.:4:794,103:.:-0.30:1.000:. ./.:4:694,167:.:-0.43:1.000:. ./.:4:664,171:.:-0.52:1.000:. ./.:4:1073,193:.: 1.01:1.000:. ./.:4:700,207:.:-0.26:1.000:. ./.:4:779,373:.: 0.61:1.000:. ./.:4:762,142:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1159,84:.: 0.93:0.997:. ./.:4:871,312:.: 0.72:1.000:. ./.:4:795,309:.: 0.44:1.000:. ./.:4:598,38:.:-1.22:1.000:. ./.:4:619,71:.:-1.03:1.000:. ./.:4:734,129:.:-0.42:1.000:. ./.:4:935,126:.: 0.28:1.000:. ./.:4:547,73:.:-1.28:1.000:. ./.:4:747,220:.:-0.05:1.000:. ./.:4:982,218:.: 0.78:1.000:. ./.:4:763,233:.: 0.05:1.000:. ./.:4:960,306:.: 1.01:1.000:. ./.:4:785,148:.:-0.17:1.000:. ./.:4:851,254:.: 0.44:0.956:. ./.:4:1223,397:.: 2.26:1.000:. ./.:4:1065,309:.: 1.39:1.000:. ./.:4:646,243:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1013,248:.: 0.99:1.000:. -chr8.1 60336628 chr8.1_060336628 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,69:.: 0.94:1.000:. ./.:4:74,69:.:-0.03:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:152,58:.: 1.32:1.000:. ./.:4:104,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:186,51:.: 1.86:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:171,3:.: 0.60:1.000:. ./.:4:57,71:.:-0.33:1.000:. ./.:4:14,11:.:-2.41:1.000:. ./.:4:9,4:.:-2.65:1.000:. ./.:4:74,147:.: 1.54:1.000:. ./.:4:84,44:.:-0.33:1.000:. ./.:4:101,94:.: 1.02:1.000:. ./.:4:42,106:.: 0.07:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:155,66:.: 1.54:0.999:. ./.:4:160,53:.: 1.38:1.000:. ./.:4:69,121:.: 0.92:1.000:. ./.:4:100,54:.: 0.19:1.000:. ./.:4:6,4:.:-2.71:1.000:. ./.:4:154,62:.: 1.44:1.000:. ./.:4:158,47:.: 1.22:1.000:. ./.:4:40,84:.:-0.41:1.000:. ./.:4:11,1:.:-2.67:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:111,43:.: 0.19:1.000:. ./.:4:120,43:.: 0.37:1.000:. ./.:5:213,60:.: 2.59:1.000:. ./.:4:112,39:.: 0.13:1.000:. ./.:4:209,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:140,41:.: 0.74:1.000:. ./.:4:8,2:.:-2.71:1.000:. ./.:4:15,13:.:-2.35:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.89:0.995:. ./.:4:88,58:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,50:.:-0.21:1.000:. ./.:4:145,53:.: 1.08:1.000:. ./.:4:170,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:112,66:.: 0.68:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:127,57:.: 0.80:1.000:. ./.:4:93,69:.: 0.35:1.000:. ./.:4:112,39:.: 0.13:1.000:. ./.:4:151,33:.: 0.80:1.000:. ./.:5:179,62:.: 1.95:1.000:. ./.:4:146,26:.: 0.55:1.000:. ./.:4:137,49:.: 0.84:1.000:. ./.:4:83,39:.:-0.45:1.000:. ./.:4:38,50:.:-1.14:1.000:. ./.:4:114,93:.: 1.26:1.000:. ./.:4:70,50:.:-0.49:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:118,35:.: 0.17:1.000:. ./.:4:91,27:.:-0.53:1.000:. ./.:4:73,37:.:-0.69:1.000:. ./.:6:85,24:.:-0.71:1.000:. ./.:4:111,26:.:-0.15:1.000:. ./.:4:79,35:.:-0.61:1.000:. ./.:4:54,90:.:-0.01:1.000:. ./.:4:101,28:.:-0.31:1.000:. ./.:4:47,86:.:-0.23:1.000:. ./.:4:73,41:.:-0.61:1.000:. ./.:4:53,25:.:-1.34:1.000:. ./.:4:96,53:.: 0.09:1.000:. ./.:4:89,41:.:-0.29:0.887:. ./.:4:133,53:.: 0.84:1.000:. ./.:4:114,42:.: 0.23:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.26:0.999:. ./.:4:74,63:.:-0.15:1.000:. ./.:4:158,48:.: 1.24:1.000:. ./.:4:66,74:.:-0.09:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,90:.: 0.66:1.000:. ./.:4:75,43:.:-0.53:1.000:. ./.:4:117,55:.: 0.55:1.000:. ./.:4:125,57:.: 0.76:1.000:. ./.:4:33,101:.:-0.21:0.915:. ./.:4:111,29:.:-0.09:1.000:. ./.:4:90,41:.:-0.27:1.000:. ./.:4:51,93:.:-0.01:1.000:. ./.:4:48,27:.:-1.40:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,23:.:-1.12:1.000:. ./.:4:53,35:.:-1.14:1.000:. ./.:4:64,28:.:-1.06:1.000:. ./.:4:44,69:.:-0.63:1.000:. ./.:4:53,21:.:-1.42:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:41,73:.:-0.61:1.000:. ./.:4:109,47:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,54:.:-0.55:1.000:. ./.:4:80,44:.:-0.41:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:82,42:.:-0.41:1.000:. ./.:4:46,22:.:-1.54:1.000:. ./.:4:84,54:.:-0.13:1.000:. ./.:4:48,50:.:-0.94:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.47:0.994:. ./.:4:75,70:.: 0.01:1.000:. ./.:4:74,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:56,32:.:-1.14:1.000:. ./.:4:148,58:.: 1.24:1.000:. ./.:4:116,50:.: 0.43:0.993:. ./.:4:156,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:165,59:.: 1.60:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.31:0.999:. ./.:4:80,39:.:-0.51:1.000:. ./.:4:70,21:.:-1.08:1.000:. ./.:4:42,69:.:-0.67:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:60,63:.:-0.43:1.000:. ./.:4:95,28:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,48:.:-0.69:1.000:. ./.:4:131,47:.: 0.68:1.000:. ./.:4:74,26:.:-0.90:1.000:. ./.:4:135,36:.: 0.53:1.000:. ./.:4:125,51:.: 0.64:1.000:. ./.:4:59,28:.:-1.16:1.000:. ./.:4:93,46:.:-0.11:1.000:. ./.:4:63,34:.:-0.96:1.000:. ./.:4:46,76:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,32:.:-1.00:1.000:. ./.:4:76,29:.:-0.80:1.000:. ./.:4:66,31:.:-0.96:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.34:0.998:. ./.:4:117,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:113,42:.: 0.21:1.000:. ./.:4:129,47:.: 0.64:1.000:. ./.:4:128,56:.: 0.80:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:50,26:.:-1.38:1.000:. ./.:4:31,72:.:-0.84:1.000:. ./.:4:74,38:.:-0.65:1.000:. ./.:4:41,77:.:-0.53:1.000:. ./.:4:97,36:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,28:.:-0.76:1.000:. ./.:4:111,63:.: 0.60:1.000:. ./.:4:189,63:.: 2.17:1.000:. ./.:4:141,44:.: 0.82:1.000:. ./.:4:94,92:.: 0.84:1.000:. ./.:4:111,56:.: 0.45:1.000:. ./.:4:45,79:.:-0.41:1.000:. ./.:4:235,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:12,4:.:-2.59:1.000:. ./.:4:79,39:.:-0.53:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:167,47:.: 1.40:1.000:. ./.:4:122,48:.: 0.51:1.000:. ./.:4:97,47:.:-0.01:1.000:. ./.:4:57,75:.:-0.25:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:152,60:.: 1.36:1.000:. ./.:4:81,81:.: 0.35:1.000:. ./.:4:95,50:.: 0.01:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:84,87:.: 0.53:0.997:. ./.:4:101,41:.:-0.05:1.000:. ./.:4:146,35:.: 0.74:1.000:. ./.:4:137,50:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:88,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:133,55:.: 0.88:1.000:. ./.:4:105,43:.: 0.07:1.000:. ./.:4:61,88:.: 0.09:1.000:. ./.:4:126,119:.: 2.03:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:142,46:.: 0.88:1.000:. ./.:4:91,97:.: 0.88:1.000:. ./.:4:100,109:.: 1.30:0.956:. ./.:4:188,52:.: 1.93:1.000:. ./.:4:114,52:.: 0.43:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:109,93:.: 1.16:1.000:. -chr8.1 60624156 chr8.1_060624156 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:174,3:.: 1.21:1.000:. ./.:4:110,5:.: 0.10:1.000:. ./.:4:178,4:.: 1.30:1.000:. ./.:4:63,11:.:-0.64:1.000:. ./.:4:232,9:.: 2.35:1.000:. ./.:4:168,12:.: 1.26:1.000:. ./.:4:36,5:.:-1.23:1.000:. ./.:4:61,8:.:-0.72:1.000:. ./.:4:99,10:.:-0.01:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:12,1:.:-1.73:1.000:. ./.:4:154,3:.: 0.85:1.000:. ./.:4:63,12:.:-0.62:1.000:. ./.:4:122,7:.: 0.35:1.000:. ./.:4:111,8:.: 0.17:1.000:. ./.:4:158,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:152,9:.: 0.92:0.999:. ./.:4:123,11:.: 0.44:1.000:. ./.:4:173,11:.: 1.33:1.000:. ./.:4:154,9:.: 0.96:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:168,3:.: 1.10:1.000:. ./.:4:142,10:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,7:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.83:1.000:. ./.:4:112,9:.: 0.21:1.000:. ./.:4:202,4:.: 1.73:1.000:. ./.:4:121,10:.: 0.39:1.000:. ./.:5:260,11:.: 2.89:1.000:. ./.:4:136,2:.: 0.51:1.000:. ./.:4:96,5:.:-0.15:1.000:. ./.:4:106,7:.: 0.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:32,0:.:-1.39:1.000:. ./.:3:7,1:.:-1.82:0.995:. ./.:4:194,6:.: 1.62:1.000:. ./.:4:50,9:.:-0.90:1.000:. ./.:4:220,4:.: 2.05:1.000:. ./.:4:86,8:.:-0.28:1.000:. ./.:4:115,8:.: 0.24:1.000:. ./.:4:98,3:.:-0.15:1.000:. ./.:4:118,6:.: 0.26:1.000:. ./.:4:150,2:.: 0.76:1.000:. ./.:4:45,9:.:-0.99:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:51,17:.:-0.74:1.000:. ./.:5:223,8:.: 2.18:1.000:. ./.:4:129,5:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.87:1.000:. ./.:4:58,2:.:-0.89:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,14:.:-0.78:1.000:. ./.:4:90,6:.:-0.24:1.000:. ./.:4:120,8:.: 0.33:1.000:. ./.:4:58,18:.:-0.60:1.000:. ./.:4:27,8:.:-1.33:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.69:1.000:. ./.:4:57,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:135,6:.: 0.56:1.000:. ./.:6:87,6:.:-0.30:1.000:. ./.:4:106,10:.: 0.12:1.000:. ./.:4:39,10:.:-1.08:1.000:. ./.:4:113,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:47,10:.:-0.94:1.000:. ./.:4:129,12:.: 0.56:1.000:. ./.:4:27,9:.:-1.32:1.000:. ./.:4:77,3:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,14:.:-0.89:1.000:. ./.:4:126,1:.: 0.31:0.887:. ./.:4:108,11:.: 0.17:1.000:. ./.:4:56,15:.:-0.69:1.000:. ./.:4:45,5:.:-1.06:0.999:. ./.:4:102,5:.:-0.04:1.000:. ./.:4:72,13:.:-0.44:1.000:. ./.:4:99,7:.:-0.06:1.000:. ./.:4:59,9:.:-0.74:1.000:. ./.:4:32,11:.:-1.19:1.000:. ./.:4:139,7:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.71:1.000:. ./.:4:169,6:.: 1.17:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.35:0.915:. ./.:4:55,8:.:-0.83:1.000:. ./.:4:115,4:.: 0.17:1.000:. ./.:4:92,5:.:-0.22:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:38,9:.:-1.12:1.000:. ./.:4:67,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:81,7:.:-0.38:1.000:. ./.:4:130,6:.: 0.47:1.000:. ./.:4:71,12:.:-0.47:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:136,9:.: 0.64:1.000:. ./.:4:103,4:.:-0.04:1.000:. ./.:4:115,7:.: 0.22:1.000:. ./.:4:105,10:.: 0.10:1.000:. ./.:4:43,8:.:-1.05:1.000:. ./.:4:69,7:.:-0.60:1.000:. ./.:4:153,4:.: 0.85:1.000:. ./.:4:180,6:.: 1.37:1.000:. ./.:4:62,5:.:-0.76:1.000:. ./.:4:155,4:.: 0.89:1.000:. ./.:4:84,11:.:-0.26:1.000:. ./.:4:104,13:.: 0.13:0.994:. ./.:4:83,5:.:-0.38:1.000:. ./.:4:45,11:.:-0.96:1.000:. ./.:4:34,13:.:-1.12:1.000:. ./.:4:64,18:.:-0.49:1.000:. ./.:4:145,10:.: 0.81:0.993:. ./.:4:120,6:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,7:.:-1.01:1.000:. ./.:4:200,6:.: 1.73:1.000:. ./.:4:57,15:.:-0.67:0.999:. ./.:4:185,3:.: 1.41:1.000:. ./.:4:21,3:.:-1.53:1.000:. ./.:4:100,15:.: 0.10:1.000:. ./.:4:104,11:.: 0.10:1.000:. ./.:4:46,13:.:-0.90:1.000:. ./.:4:40,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:74,6:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,14:.: 0.13:1.000:. ./.:4:55,10:.:-0.80:1.000:. ./.:4:58,5:.:-0.83:1.000:. ./.:4:201,7:.: 1.76:1.000:. ./.:4:140,1:.: 0.56:1.000:. ./.:4:124,5:.: 0.35:1.000:. ./.:4:89,8:.:-0.22:1.000:. ./.:4:65,3:.:-0.74:1.000:. ./.:4:101,3:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,9:.:-1.15:1.000:. ./.:4:125,5:.: 0.37:1.000:. ./.:4:147,9:.: 0.83:1.000:. ./.:4:56,5:.:-0.87:0.998:. ./.:4:71,4:.:-0.62:1.000:. ./.:4:120,4:.: 0.26:1.000:. ./.:4:198,10:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,11:.:-1.76:1.000:. ./.:4:97,10:.:-0.04:1.000:. ./.:4:67,6:.:-0.65:1.000:. ./.:4:78,5:.:-0.47:1.000:. ./.:4:42,12:.:-0.99:1.000:. ./.:4:100,7:.:-0.04:1.000:. ./.:4:131,13:.: 0.62:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.26:1.000:. ./.:4:83,28:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,11:.: 0.58:1.000:. ./.:4:75,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,8:.: 0.21:1.000:. ./.:4:83,8:.:-0.33:1.000:. ./.:4:88,3:.:-0.33:1.000:. ./.:4:174,16:.: 1.44:1.000:. ./.:4:148,20:.: 1.05:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:102,12:.: 0.08:1.000:. ./.:4:120,11:.: 0.39:1.000:. ./.:4:68,13:.:-0.51:1.000:. ./.:4:241,5:.: 2.44:1.000:. ./.:4:216,1:.: 1.92:1.000:. ./.:4:110,9:.: 0.17:1.000:. ./.:4:204,4:.: 1.76:1.000:. ./.:4:56,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:99,4:.:-0.12:1.000:. ./.:4:62,17:.:-0.55:1.000:. ./.:4:123,13:.: 0.47:1.000:. ./.:4:149,8:.: 0.85:1.000:. ./.:4:58,15:.:-0.65:1.000:. ./.:4:113,12:.: 0.28:1.000:. ./.:4:145,4:.: 0.71:0.997:. ./.:4:146,7:.: 0.78:1.000:. ./.:4:195,8:.: 1.67:1.000:. ./.:4:106,3:.:-0.01:1.000:. ./.:4:102,6:.:-0.03:1.000:. ./.:4:144,1:.: 0.64:1.000:. ./.:4:105,15:.: 0.19:1.000:. ./.:4:53,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:99,5:.:-0.10:1.000:. ./.:4:168,11:.: 1.24:1.000:. ./.:4:144,11:.: 0.81:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.65:1.000:. ./.:4:62,6:.:-0.74:1.000:. ./.:4:59,14:.:-0.65:0.956:. ./.:4:161,11:.: 1.12:1.000:. ./.:4:349,0:.: 4.29:1.000:. ./.:4:48,13:.:-0.87:1.000:. ./.:4:116,12:.: 0.33:1.000:. -chr8.1 61336280 chr8.1_061336280 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:82,22:.: 0.07:1.000:. ./.:4:65,16:.:-0.89:1.000:. ./.:4:80,23:.: 0.03:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:149,1:.: 1.99:1.000:. ./.:4:46,36:.:-0.85:1.000:. ./.:4:54,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:59,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:61,10:.:-1.31:1.000:. ./.:4:92,26:.: 0.65:1.000:. ./.:4:103,22:.: 0.95:1.000:. ./.:4:69,18:.:-0.64:1.000:. ./.:4:50,48:.:-0.18:1.000:. ./.:4:57,20:.:-1.06:1.000:. ./.:4:66,15:.:-0.89:1.000:. ./.:4:76,26:.:-0.02:0.999:. ./.:4:36,91:.: 1.03:1.000:. ./.:4:93,39:.: 1.24:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:81,37:.: 0.65:1.000:. ./.:4:85,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:151,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:67,15:.:-0.85:1.000:. ./.:4:72,8:.:-0.93:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:61,26:.:-0.64:1.000:. ./.:4:49,29:.:-1.02:1.000:. ./.:5:106,64:.: 2.83:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:66,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:26,19:.:-2.40:1.000:. ./.:4:44,35:.:-0.98:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.10:1.000:. ./.:3:35,0:.:-2.81:0.995:. ./.:4:91,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:68,11:.:-0.98:1.000:. ./.:4:74,25:.:-0.14:1.000:. ./.:4:69,20:.:-0.56:1.000:. ./.:4:60,11:.:-1.31:1.000:. ./.:4:81,26:.: 0.19:1.000:. ./.:4:98,28:.: 0.99:1.000:. ./.:4:96,23:.: 0.69:1.000:. ./.:4:86,13:.:-0.14:1.000:. ./.:4:112,24:.: 1.40:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.07:1.000:. ./.:5:85,49:.: 1.32:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:70,12:.:-0.85:1.000:. ./.:4:80,36:.: 0.57:1.000:. ./.:4:58,28:.:-0.68:1.000:. ./.:4:107,22:.: 1.11:1.000:. ./.:4:87,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:98,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:78,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:52,47:.:-0.14:1.000:. ./.:4:43,46:.:-0.56:1.000:. ./.:6:137,12:.: 1.95:1.000:. ./.:4:121,31:.: 2.07:1.000:. ./.:4:67,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:101,25:.: 0.99:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:92,32:.: 0.90:1.000:. ./.:4:58,18:.:-1.10:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:73,18:.:-0.47:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.36:0.887:. ./.:4:109,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:79,45:.: 0.90:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.35:0.999:. ./.:4:120,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:93,23:.: 0.57:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,13:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,15:.:-0.98:1.000:. ./.:4:102,25:.: 1.03:1.000:. ./.:4:82,28:.: 0.32:1.000:. ./.:4:71,17:.:-0.60:0.915:. ./.:4:145,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:83,19:.:-0.02:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:62,15:.:-1.06:1.000:. ./.:4:70,30:.:-0.10:1.000:. ./.:4:53,40:.:-0.39:1.000:. ./.:4:35,33:.:-1.44:1.000:. ./.:4:61,19:.:-0.93:1.000:. ./.:4:77,29:.: 0.15:1.000:. ./.:4:70,54:.: 0.90:1.000:. ./.:4:42,0:.:-2.52:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:81,23:.: 0.07:1.000:. ./.:4:70,22:.:-0.43:1.000:. ./.:4:114,21:.: 1.36:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:47,33:.:-0.93:1.000:. ./.:4:78,26:.: 0.07:1.000:. ./.:4:48,31:.:-0.98:1.000:. ./.:4:125,38:.: 2.53:0.994:. ./.:4:66,23:.:-0.56:1.000:. ./.:4:84,28:.: 0.40:1.000:. ./.:4:78,27:.: 0.11:1.000:. ./.:4:40,58:.:-0.18:1.000:. ./.:4:101,24:.: 0.95:0.993:. ./.:4:96,19:.: 0.53:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:81,28:.: 0.28:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.61:0.999:. ./.:4:138,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:42,17:.:-1.81:1.000:. ./.:4:110,21:.: 1.20:1.000:. ./.:4:82,21:.: 0.03:1.000:. ./.:4:86,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:57,40:.:-0.22:1.000:. ./.:4:81,11:.:-0.43:1.000:. ./.:4:98,25:.: 0.86:1.000:. ./.:4:90,27:.: 0.61:1.000:. ./.:4:62,36:.:-0.18:1.000:. ./.:4:49,46:.:-0.31:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:80,11:.:-0.47:1.000:. ./.:4:46,35:.:-0.89:1.000:. ./.:4:79,17:.:-0.27:1.000:. ./.:4:62,38:.:-0.10:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:63,1:.:-1.60:0.998:. ./.:4:87,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:64,14:.:-1.02:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:85,23:.: 0.24:1.000:. ./.:4:84,17:.:-0.06:1.000:. ./.:4:56,10:.:-1.52:1.000:. ./.:4:73,20:.:-0.39:1.000:. ./.:4:65,22:.:-0.64:1.000:. ./.:4:112,25:.: 1.45:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:52,37:.:-0.56:1.000:. ./.:4:109,19:.: 1.07:1.000:. ./.:4:112,31:.: 1.70:1.000:. ./.:4:109,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:50,40:.:-0.52:1.000:. ./.:4:77,27:.: 0.07:1.000:. ./.:4:58,23:.:-0.89:1.000:. ./.:4:99,30:.: 1.11:1.000:. ./.:4:89,18:.: 0.19:1.000:. ./.:4:54,23:.:-1.06:1.000:. ./.:4:86,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:67,18:.:-0.73:1.000:. ./.:4:55,56:.: 0.36:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:87,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:91,25:.: 0.57:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:30,32:.:-1.69:1.000:. ./.:4:71,21:.:-0.43:1.000:. ./.:4:78,17:.:-0.31:1.000:. ./.:4:44,7:.:-2.15:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:84,14:.:-0.18:1.000:. ./.:4:61,39:.:-0.10:0.997:. ./.:4:97,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:91,24:.: 0.53:1.000:. ./.:4:53,29:.:-0.85:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:55,46:.:-0.06:1.000:. ./.:4:66,25:.:-0.47:1.000:. ./.:4:40,35:.:-1.14:1.000:. ./.:4:49,17:.:-1.52:1.000:. ./.:4:54,50:.: 0.07:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:41,37:.:-1.02:1.000:. ./.:4:71,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:86,22:.: 0.24:0.956:. ./.:4:107,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:117,40:.: 2.28:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:81,23:.: 0.07:1.000:. -chr8.1 61587300 chr8.1_061587300 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,55:.: 0.87:1.000:. ./.:4:29,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:74,44:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.09:1.000:. ./.:4:37,58:.: 0.80:1.000:. ./.:4:99,38:.: 2.29:1.000:. ./.:4:26,45:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,49:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.16:1.000:. ./.:4:1,8:.:-2.25:1.000:. ./.:4:0,3:.:-2.46:1.000:. ./.:4:29,75:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.12:1.000:. ./.:4:39,48:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.12:1.000:. ./.:4:71,25:.: 0.84:1.000:. ./.:4:35,49:.: 0.41:0.999:. ./.:4:0,101:.: 1.02:1.000:. ./.:4:1,84:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,90:.: 0.63:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.50:1.000:. ./.:4:68,29:.: 0.87:1.000:. ./.:4:41,71:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,60:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,10:.:-2.21:1.000:. ./.:4:34,52:.: 0.48:1.000:. ./.:4:40,44:.: 0.41:1.000:. ./.:4:65,40:.: 1.16:1.000:. ./.:5:75,66:.: 2.44:1.000:. ./.:4:0,57:.:-0.55:1.000:. ./.:4:66,31:.: 0.87:1.000:. ./.:4:62,27:.: 0.59:1.000:. ./.:4:3,4:.:-2.32:1.000:. ./.:4:4,6:.:-2.21:1.000:. ./.:3:3,4:.:-2.32:0.995:. ./.:4:36,54:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.48:1.000:. ./.:4:75,33:.: 1.26:1.000:. ./.:4:40,36:.: 0.13:1.000:. ./.:4:25,65:.: 0.63:1.000:. ./.:4:51,32:.: 0.38:1.000:. ./.:4:58,36:.: 0.77:1.000:. ./.:4:57,43:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,61:.:-0.40:1.000:. ./.:4:27,46:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.12:1.000:. ./.:5:84,55:.: 2.36:1.000:. ./.:4:3,8:.:-2.18:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.79:1.000:. ./.:4:20,15:.:-1.33:1.000:. ./.:4:20,27:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.09:1.000:. ./.:4:35,34:.:-0.12:1.000:. ./.:4:62,35:.: 0.87:1.000:. ./.:4:28,39:.:-0.19:1.000:. ./.:4:21,35:.:-0.58:1.000:. ./.:4:31,58:.: 0.59:1.000:. ./.:4:29,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:40,41:.: 0.31:1.000:. ./.:6:19,21:.:-1.15:1.000:. ./.:4:23,44:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,48:.:-0.87:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,58:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,47:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,68:.:-0.16:1.000:. ./.:4:19,38:.:-0.55:0.887:. ./.:4:35,68:.: 1.09:1.000:. ./.:4:27,56:.: 0.38:1.000:. ./.:4:13,25:.:-1.22:0.999:. ./.:4:33,50:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,75:.: 0.09:1.000:. ./.:4:27,39:.:-0.23:1.000:. ./.:4:24,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.69:1.000:. ./.:4:20,45:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.79:1.000:. ./.:4:66,40:.: 1.19:1.000:. ./.:4:21,31:.:-0.72:0.915:. ./.:4:0,67:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,85:.: 0.45:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.69:1.000:. ./.:4:30,36:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,58:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:18,41:.:-0.48:1.000:. ./.:4:18,37:.:-0.62:1.000:. ./.:4:29,40:.:-0.12:1.000:. ./.:4:16,46:.:-0.37:1.000:. ./.:4:39,24:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,47:.: 0.48:1.000:. ./.:4:22,30:.:-0.72:1.000:. ./.:4:24,38:.:-0.37:1.000:. ./.:4:25,45:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,41:.:-1.11:1.000:. ./.:4:45,22:.:-0.19:1.000:. ./.:4:43,29:.:-0.01:1.000:. ./.:4:69,32:.: 1.02:1.000:. ./.:4:27,34:.:-0.40:1.000:. ./.:4:25,42:.:-0.19:1.000:. ./.:4:10,22:.:-1.43:1.000:. ./.:4:30,22:.:-0.72:0.994:. ./.:4:25,30:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,64:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.69:1.000:. ./.:4:40,58:.: 0.91:1.000:. ./.:4:44,75:.: 1.65:0.993:. ./.:4:71,35:.: 1.19:1.000:. ./.:4:19,41:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,36:.: 1.48:1.000:. ./.:4:21,47:.:-0.16:0.999:. ./.:4:30,40:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,30:.:-1.50:1.000:. ./.:4:0,82:.: 0.34:1.000:. ./.:4:38,17:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.08:1.000:. ./.:4:19,41:.:-0.44:1.000:. ./.:4:19,31:.:-0.79:1.000:. ./.:4:24,39:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,50:.:-0.79:1.000:. ./.:4:29,47:.: 0.13:1.000:. ./.:4:88,38:.: 1.90:1.000:. ./.:4:22,35:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,59:.:-0.48:1.000:. ./.:4:25,27:.:-0.72:1.000:. ./.:4:28,22:.:-0.79:1.000:. ./.:4:30,20:.:-0.79:1.000:. ./.:4:21,21:.:-1.08:1.000:. ./.:4:25,43:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,61:.: 0.87:1.000:. ./.:4:13,19:.:-1.43:0.998:. ./.:4:16,33:.:-0.83:1.000:. ./.:4:32,38:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,79:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,69:.:-0.12:1.000:. ./.:4:31,17:.:-0.87:1.000:. ./.:4:32,27:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,42:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,45:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,49:.:-0.83:1.000:. ./.:4:0,53:.:-0.69:1.000:. ./.:4:16,21:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,103:.: 1.09:1.000:. ./.:4:32,61:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,65:.:-0.26:1.000:. ./.:4:38,51:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,62:.:-0.37:1.000:. ./.:4:0,70:.:-0.08:1.000:. ./.:4:102,38:.: 2.40:1.000:. ./.:4:77,34:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,5:.:-2.39:1.000:. ./.:4:38,32:.:-0.08:1.000:. ./.:4:64,41:.: 1.16:1.000:. ./.:4:27,61:.: 0.55:1.000:. ./.:4:44,65:.: 1.30:1.000:. ./.:4:44,58:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,74:.: 0.06:1.000:. ./.:4:91,37:.: 1.97:1.000:. ./.:4:0,63:.:-0.33:1.000:. ./.:4:22,56:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,46:.:-0.94:1.000:. ./.:4:87,34:.: 1.73:1.000:. ./.:4:71,19:.: 0.63:1.000:. ./.:4:29,46:.: 0.09:1.000:. ./.:4:62,41:.: 1.09:1.000:. ./.:4:69,30:.: 0.94:0.997:. ./.:4:0,50:.:-0.79:1.000:. ./.:4:67,25:.: 0.70:1.000:. ./.:4:56,26:.: 0.34:1.000:. ./.:4:36,37:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,34:.: 1.02:1.000:. ./.:4:35,53:.: 0.55:1.000:. ./.:4:20,43:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:52,55:.: 1.23:1.000:. ./.:4:0,77:.: 0.16:1.000:. ./.:4:38,67:.: 1.16:1.000:. ./.:4:8,48:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,68:.:-0.12:0.956:. ./.:4:57,70:.: 1.94:1.000:. ./.:4:113,46:.: 3.07:1.000:. ./.:4:38,51:.: 0.59:1.000:. ./.:4:37,47:.: 0.41:1.000:. -chr8.1 61807186 chr8.1_061807186 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:144,0:0.00: 2.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,20:0.28:-0.05:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,35:0.48:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:43,31:0.43:-0.05:1.000:0.941 0/0/1/1:4:57,44:0.44: 0.90:1.000:0.974 0/0/1/1:4:50,51:0.51: 0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,50:0.64:-0.26:1.000:0.677 0/0/1/1:4:29,63:0.61: 0.58:1.000:0.689 0/0/0/1:4:65,17:0.22: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-2.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:11,2:0.16:-2.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:87,29:0.26: 1.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,32:0.38: 0.37:1.000:0.592 0/0/0/1:4:66,21:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,18:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,37:0.41: 0.62:1.000:0.846 0/0/0/1:4:75,23:0.25: 0.79:0.999:0.999 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,29:0.26: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:105,34:0.26: 2.23:1.000:0.999 0/0/0/0:4:7,0:0.00:-2.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,44:0.52: 0.27:1.000:0.995 0/1/1/1:4:22,58:0.63: 0.16:1.000:0.604 0/0/0/1:4:64,25:0.29: 0.48:1.000:0.991 0/0/1/1:4:1,2:0.60:-2.54:1.000:0.792 0/0/1/1:4:52,40:0.44: 0.58:1.000:0.972 0/0/0/0:4:119,0:0.00: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,41:0.50: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/0/1:5:129,27:0.18: 2.83:1.000:0.998 0/0/0/1:4:107,28:0.22: 2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,39:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,38:0.48: 0.20:1.000:0.994 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-2.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,7:0.62:-2.30:1.000:0.584 0/1/1:3:0,4:0.81:-2.51:0.995:0.997 0/0/1/1:4:57,45:0.45: 0.93:1.000:0.980 0/0/0/1:4:58,22:0.29: 0.16:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,37:0.40: 0.65:1.000:0.816 0/0/1/1:4:40,44:0.52: 0.30:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,40:0.52: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:29,29:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,40:0.55:-0.23:1.000:0.980 0/0/1/1:4:47,41:0.47: 0.44:1.000:0.994 0/0/1/1:4:29,34:0.53:-0.44:1.000:0.993 0/1/1/1:4:11,67:0.71: 0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:38,36:0.49:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:73,51:0.42: 1.71:1.000:0.956 0/0/1/1:4:8,13:0.57:-1.91:1.000:0.939 0/0/1/1:4:29,29:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,10:0.41:-1.77:1.000:0.860 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,37:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,26:0.51:-0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,33:0.38: 0.44:1.000:0.628 0/0/1/1:4:31,61:0.60: 0.58:1.000:0.810 0/1/1/1:4:16,49:0.65:-0.37:1.000:0.789 0/0/0/1:4:50,19:0.29:-0.23:1.000:0.993 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.21:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:49,19:0.29:-0.26:1.000:0.828 0/0/0/1:4:60,13:0.19:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,14:0.28:-0.82:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,11:0.18:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:32,25:0.45:-0.65:1.000:0.977 0/0/0/1:4:73,22:0.24: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,24:0.32: 0.05:1.000:0.948 0/0/0/1:4:49,7:0.13:-0.68:1.000:0.918 0/0/0/1:4:42,20:0.33:-0.47:1.000:0.908 0/0/1/1:4:35,28:0.45:-0.44:0.887:0.983 0/0/0/1:4:72,15:0.18: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,20:0.33:-0.44:1.000:0.929 0/0/1/1:4:20,29:0.56:-0.93:0.999:0.972 0/0/0/1:4:54,18:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,41:0.45: 0.58:1.000:0.984 0/0/0/1:4:50,15:0.24:-0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,44:0.65:-0.58:1.000:0.744 0/0/1/1:4:21,23:0.52:-1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,34:0.52:-0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:48,34:0.42: 0.23:1.000:0.928 0/0/1/1:4:40,35:0.48:-0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:35,16:0.32:-0.86:0.915:0.942 0/0/1/1:4:45,30:0.41:-0.02:1.000:0.860 0/0/0/1:4:61,17:0.23: 0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,16:0.22: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,20:0.40:-0.86:1.000:0.804 0/1/1/1:4:18,46:0.63:-0.40:1.000:0.558 0/0/0/1:4:34,17:0.34:-0.86:1.000:0.845 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,22:0.50:-1.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:49,11:0.19:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,18:0.28:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,42:0.61:-0.47:1.000:0.735 0/0/1/1:4:48,34:0.42: 0.23:1.000:0.928 0/0/1/1:4:28,31:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/0/0/1:4:39,16:0.30:-0.72:1.000:0.984 0/0/1/1:4:27,32:0.53:-0.58:1.000:0.993 0/0/0/1:4:63,22:0.27: 0.34:1.000:0.998 0/0/0/1:4:83,19:0.20: 0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:58,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:82,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,12:0.27:-1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:37,28:0.44:-0.37:0.994:0.967 0/0/0/1:4:44,13:0.24:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,11:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,17:0.39:-1.07:1.000:0.661 0/0/0/1:4:73,20:0.23: 0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,40:0.41: 0.83:0.993:0.883 0/0/1/1:4:56,49:0.48: 1.04:1.000:0.994 0/1/1/1:4:15,49:0.66:-0.40:1.000:0.844 0/0/1/1:4:61,59:0.50: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:23,45:0.60:-0.26:0.999:0.815 0/0/1/1:4:50,36:0.43: 0.37:1.000:0.940 0/0/0/0:4:30,2:0.07:-1.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:60,20:0.26: 0.16:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,28:0.57:-1.03:1.000:0.954 0/0/1/1:4:17,26:0.56:-1.14:1.000:0.959 0/0/0/1:4:53,8:0.14:-0.51:1.000:0.957 0/0/1/1:4:25,31:0.54:-0.68:1.000:0.990 0/0/0/1:4:74,21:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,7:0.16:-1.00:1.000:0.993 0/0/0/1:4:53,21:0.29:-0.05:1.000:0.989 0/0/0/1:4:83,26:0.25: 1.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,21:0.39:-0.72:1.000:0.707 0/0/0/1:4:41,13:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,32:0.44:-0.02:1.000:0.959 0/0/1/1:4:21,23:0.52:-1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:18,13:0.43:-1.56:1.000:0.942 0/0/0/1:4:33,13:0.29:-1.03:1.000:0.990 0/0/1/1:4:37,25:0.41:-0.47:1.000:0.878 0/0/1/1:4:53,50:0.49: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,28:0.48:-0.58:0.998:0.995 0/0/1/1:4:37,22:0.38:-0.58:1.000:0.602 0/0/0/1:4:73,25:0.27: 0.79:1.000:0.998 0/0/0/1:4:102,27:0.22: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,33:0.55:-0.65:1.000:0.980 0/0/1/1:4:39,28:0.43:-0.30:1.000:0.938 0/0/0/1:4:44,18:0.30:-0.47:1.000:0.984 0/0/0/1:4:44,9:0.18:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:51,11:0.19:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,16:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,20:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:41,11:0.22:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:82,27:0.26: 1.18:1.000:0.999 0/0/0/1:4:107,21:0.17: 1.85:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,63:0.49: 1.95:1.000:0.996 0/0/0/1:4:58,24:0.30: 0.23:1.000:0.982 0/0/0/1:4:87,20:0.20: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,23:0.33:-0.12:1.000:0.922 0/0/1/1:4:60,55:0.49: 1.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:59,33:0.37: 0.58:1.000:0.582 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-2.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,58:0.54: 0.97:1.000:0.987 0/0/1/1:4:43,35:0.46: 0.09:1.000:0.986 0/0/0/1:4:67,28:0.31: 0.69:1.000:0.980 0/0/1/1:4:65,63:0.50: 1.85:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,35:0.42: 0.37:1.000:0.897 0/0/0/1:4:74,21:0.23: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,26:0.23: 1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,44:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/0/1:4:53,17:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,16:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,37:0.43: 0.41:1.000:0.957 0/0/0/1:4:41,17:0.30:-0.61:1.000:0.981 0/1/1/1:4:23,68:0.65: 0.55:1.000:0.753 0/0/1/1:4:40,38:0.50: 0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:31,40:0.54:-0.16:0.997:0.987 0/0/0/1:4:69,15:0.19: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:58,59:0.51: 1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,50:0.55: 0.37:1.000:0.979 0/0/0/1:4:62,22:0.27: 0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,20:0.28:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,22:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,15:0.29:-0.79:1.000:0.990 0/0/0/0:4:85,0:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,29:0.31: 0.76:1.000:0.974 0/0/0/1:4:88,22:0.21: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,17:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,52:0.54: 0.65:1.000:0.990 0/0/1/1:4:41,49:0.53: 0.51:0.956:0.992 0/0/1/1:4:39,82:0.61: 1.60:1.000:0.733 0/0/0/1:4:123,35:0.23: 2.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,47:0.62:-0.30:1.000:0.573 0/0/0/1:4:68,24:0.27: 0.58:1.000:0.997 -chr8.1 61954027 chr8.1_061954027 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:6,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:5:16,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.00:0.995:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.25:1.000:. ./.:5:10,0:.: 0.01:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:20,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:6:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:20,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:0.887:. ./.:4:19,0:.: 2.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.78:0.999:. ./.:4:21,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:0.915:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:21,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:0.994:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.35:0.993:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:0.999:. ./.:4:19,0:.: 2.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:6,0:.:-0.88:0.998:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:17,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.00:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:0.997:. ./.:4:11,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:7,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:16,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:13,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:10,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:14,0:.: 0.91:0.956:. ./.:4:14,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:12,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:8,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:15,0:.: 1.13:1.000:. -chr8.1 62151317 chr8.1_062151317 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:39,114:0.75: 1.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,74:0.63: 0.61:1.000:0.508 0/1/1/1:4:21,65:0.76:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,57:0.72:-0.63:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,154:1.00: 1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,111:0.76: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,44:0.88:-1.55:1.000:0.679 0/1/1/1:4:42,74:0.66: 0.40:1.000:0.855 0/1/1/1:4:33,72:0.70: 0.08:1.000:0.985 0/1/1/1:4:6,22:0.79:-2.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,11:0.54:-2.38:1.000:0.990 0/1/1/1:4:56,135:0.72: 2.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,43:0.45: 0.08:1.000:0.976 0/0/1/1:4:60,61:0.54: 0.55:1.000:0.988 0/1/1/1:4:13,67:0.84:-0.66:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,104:0.72: 1.32:1.000:0.995 0/1/1/1:4:43,96:0.70: 1.08:0.999:0.988 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,93:0.77: 0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,91:0.72: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:5,15:0.76:-2.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,133:1.00: 0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,136:0.99: 1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,69:0.74:-0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,15:0.76:-2.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,59:0.71:-0.54:1.000:0.994 0/1/1/1:4:35,111:0.77: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,84:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:42,159:0.80: 2.91:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,88:0.72: 0.64:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,81:0.73: 0.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,94:0.80: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,7:0.54:-2.61:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,19:0.95:-2.43:1.000:1.000 1/1/1:3:0,1:1.00:-3.00:0.995:1.000 1/1/1/1:4:0,124:1.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,34:0.39:-0.25:1.000:0.737 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,86:0.75: 0.40:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,71:0.72:-0.04:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,77:0.78:-0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,73:0.76:-0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,132:1.00: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,54:0.78:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,54:0.68:-0.63:1.000:0.961 0/1/1/1:4:34,61:0.66:-0.22:1.000:0.878 0/1/1/1/1:5:33,138:0.81: 2.02:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-2.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,27:0.41:-0.93:1.000:0.889 0/1/1/1:4:21,37:0.66:-1.31:1.000:0.855 0/1/1/1:4:26,64:0.72:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,64:0.70:-0.28:1.000:0.987 0/1/1/1:4:21,62:0.75:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,99:0.75: 0.93:1.000:0.999 0/1/1/1:4:35,74:0.69: 0.19:1.000:0.979 0/1/1/1:4:20,48:0.72:-1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:47,48:0.54:-0.22:1.000:0.987 0/0/1/1:4:37,44:0.57:-0.63:1.000:0.934 0/1/1/1:4:40,83:0.69: 0.61:1.000:0.974 0/1/1/1/1/1:6:14,81:0.86:-0.22:1.000:0.994 0/1/1/1:4:30,101:0.78: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,29:0.46:-0.99:1.000:0.986 0/1/1/1:4:20,63:0.77:-0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,43:0.71:-1.19:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,85:0.74: 0.40:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,25:0.39:-0.96:1.000:0.684 0/1/1/1:4:11,43:0.80:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,42:0.43: 0.13:1.000:0.941 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.22:0.887:1.000 0/0/1/1:4:59,74:0.59: 0.90:1.000:0.886 0/0/1/1:4:70,49:0.45: 0.49:1.000:0.979 0/1/1/1:4:10,30:0.76:-1.84:0.999:1.000 0/1/1/1:4:19,81:0.82:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,45:0.55:-0.46:1.000:0.978 0/1/1/1:4:43,73:0.65: 0.40:1.000:0.795 0/1/1/1:4:18,63:0.78:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,61:0.81:-0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,56:0.63:-0.31:1.000:0.591 0/0/1/1:4:73,43:0.40: 0.40:1.000:0.824 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,80:0.83:-0.16:0.915:0.998 0/1/1/1:4:16,63:0.80:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,61:0.68:-0.31:1.000:0.954 0/1/1/1:4:25,68:0.74:-0.28:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,71:0.72:-0.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,20:0.39:-1.37:1.000:0.684 0/0/1/1:4:50,50:0.54:-0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:37,47:0.59:-0.54:1.000:0.871 0/1/1/1:4:34,84:0.72: 0.46:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,45:0.71:-1.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:31,73:0.71: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:38,114:0.76: 1.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,72:0.76:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,80:0.75: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,59:0.70:-0.49:1.000:0.985 0/0/1/1:4:58,49:0.50: 0.13:1.000:0.997 0/1/1/1:4:28,81:0.75: 0.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,148:1.00: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,37:0.56:-0.96:1.000:0.965 0/1/1/1:4:31,98:0.77: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,77:0.76:-0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,90:0.77: 0.46:0.994:1.000 0/1/1/1:4:16,65:0.81:-0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,36:0.42:-0.28:1.000:0.922 0/0/1/1:4:48,30:0.42:-0.72:1.000:0.911 0/0/1/1:4:55,44:0.48:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:26,88:0.78: 0.34:0.993:1.000 0/1/1/1:4:35,95:0.74: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,78:0.79:-0.10:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,148:1.00: 1.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,75:0.75:-0.04:0.999:0.999 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,22:0.41:-1.28:1.000:0.841 0/1/1/1:4:27,78:0.75: 0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,57:0.77:-0.81:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,48:0.69:-0.93:1.000:0.976 0/0/1/1:4:41,42:0.54:-0.57:1.000:0.987 0/1/1/1:4:18,40:0.70:-1.31:1.000:0.988 0/1/1/1:4:32,83:0.73: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:44,21:0.35:-1.11:1.000:0.772 0/0/1/1:4:58,67:0.57: 0.67:1.000:0.951 0/1/1/1:4:43,105:0.72: 1.35:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,69:0.77:-0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,59:0.69:-0.43:1.000:0.968 0/0/1/1:4:38,41:0.55:-0.69:1.000:0.977 1/1/1/1:4:0,102:1.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,39:0.43:-0.10:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,104:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,97:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,36:0.59:-1.13:0.998:0.855 0/0/1/1:4:32,42:0.60:-0.84:1.000:0.824 0/1/1/1:4:18,75:0.81:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,108:0.69: 1.70:1.000:0.974 0/0/1/1:4:45,29:0.43:-0.84:1.000:0.939 0/1/1/1:4:24,48:0.68:-0.90:1.000:0.961 0/1/1/1:4:25,59:0.71:-0.54:1.000:0.994 0/1/1/1:4:22,62:0.75:-0.54:1.000:0.999 0/0/1/1:4:49,27:0.39:-0.78:1.000:0.660 0/1/1/1:4:27,68:0.73:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,73:0.66: 0.34:1.000:0.869 0/0/1/1:4:40,34:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/0/0/1:4:81,41:0.37: 0.58:1.000:0.611 0/1/1/1:4:24,103:0.82: 0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:27,88:0.77: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,79:0.79:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,39:0.48:-0.40:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,75:0.70: 0.19:1.000:0.987 0/1/1/1:4:49,132:0.74: 2.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,93:0.74: 0.73:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,20:0.87:-2.35:1.000:0.874 0/1/1/1:4:25,57:0.71:-0.60:1.000:0.991 0/1/1/1:4:26,87:0.78: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,62:0.55: 0.49:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,137:1.00: 1.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,142:0.99: 1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,79:0.72: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:34,110:0.77: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,89:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,64:0.72:-0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,33:0.37:-0.16:1.000:0.552 0/1/1/1:4:38,107:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,83:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,83:0.71: 0.49:1.000:0.992 0/1/1/1:4:26,94:0.79: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,81:0.57: 1.43:0.997:0.950 0/1/1/1:4:29,76:0.73: 0.08:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,140:1.00: 1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:31,93:0.76: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,75:0.76:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,85:0.78: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,88:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,45:0.55:-0.43:1.000:0.983 0/1/1/1:4:26,88:0.78: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,120:0.76: 1.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,86:0.71: 0.61:1.000:0.993 0/0/1/1:4:73,68:0.52: 1.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:42,80:0.67: 0.58:1.000:0.934 0/1/1/1:4:40,77:0.68: 0.43:0.956:0.941 1/1/1/1:4:0,132:1.00: 0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 2.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,69:0.79:-0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,74:0.61: 0.75:1.000:0.743 -chr8.1 62407009 chr8.1_062407009 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:84,80:.: 1.16:1.000:. ./.:4:69,28:.:-1.02:1.000:. ./.:4:86,66:.: 0.77:1.000:. ./.:4:114,23:.: 0.28:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:98,29:.:-0.04:1.000:. ./.:4:54,10:.:-2.09:1.000:. ./.:4:113,27:.: 0.38:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:22,5:.:-3.30:1.000:. ./.:4:41,16:.:-2.32:1.000:. ./.:4:104,32:.: 0.25:1.000:. ./.:4:86,29:.:-0.43:1.000:. ./.:4:67,63:.: 0.05:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:54,49:.:-0.82:1.000:. ./.:4:60,58:.:-0.34:0.999:. ./.:4:112,30:.: 0.44:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:129,39:.: 1.29:1.000:. ./.:4:10,16:.:-3.33:1.000:. ./.:4:95,29:.:-0.14:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:18,7:.:-3.36:1.000:. ./.:4:112,38:.: 0.70:1.000:. ./.:4:65,65:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,27:.:-0.34:1.000:. ./.:5:70,96:.: 1.23:1.000:. ./.:4:88,28:.:-0.40:1.000:. ./.:4:75,65:.: 0.38:1.000:. ./.:4:81,35:.:-0.40:1.000:. ./.:4:7,5:.:-3.78:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.58:1.000:. ./.:3:28,0:.:-3.26:0.995:. ./.:4:144,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,26:.:-0.63:1.000:. ./.:4:111,28:.: 0.35:1.000:. ./.:4:81,68:.: 0.67:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:70,67:.: 0.28:1.000:. ./.:4:67,68:.: 0.22:1.000:. ./.:4:140,37:.: 1.58:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:112,32:.: 0.51:1.000:. ./.:5:152,33:.: 1.84:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:96,43:.: 0.35:1.000:. ./.:4:132,33:.: 1.19:1.000:. ./.:4:105,30:.: 0.22:1.000:. ./.:4:166,1:.: 1.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:89,81:.: 1.36:1.000:. ./.:4:101,23:.:-0.14:1.000:. ./.:4:105,29:.: 0.18:1.000:. ./.:4:79,51:.: 0.05:1.000:. ./.:4:61,79:.: 0.38:1.000:. ./.:4:105,34:.: 0.35:1.000:. ./.:6:91,38:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,73:.: 0.96:1.000:. ./.:4:86,27:.:-0.50:1.000:. ./.:4:190,0:.: 2.01:1.000:. ./.:4:110,40:.: 0.70:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:107,37:.: 0.51:1.000:. ./.:4:54,13:.:-1.99:1.000:. ./.:4:95,27:.:-0.21:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.49:0.887:. ./.:4:68,56:.:-0.14:1.000:. ./.:4:93,76:.: 1.32:1.000:. ./.:4:64,11:.:-1.73:0.999:. ./.:4:97,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:107,36:.: 0.48:1.000:. ./.:4:112,29:.: 0.41:1.000:. ./.:4:91,25:.:-0.40:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:140,41:.: 1.71:1.000:. ./.:4:131,33:.: 1.16:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.14:0.915:. ./.:4:105,31:.: 0.25:1.000:. ./.:4:116,36:.: 0.77:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:117,37:.: 0.83:1.000:. ./.:4:63,17:.:-1.57:1.000:. ./.:4:61,64:.:-0.11:1.000:. ./.:4:90,60:.: 0.70:1.000:. ./.:4:102,32:.: 0.18:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:66,73:.: 0.35:1.000:. ./.:4:132,31:.: 1.13:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:97,42:.: 0.35:1.000:. ./.:4:91,32:.:-0.17:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:83,21:.:-0.79:1.000:. ./.:4:72,46:.:-0.34:1.000:. ./.:4:99,29:.:-0.01:1.000:. ./.:4:45,31:.:-1.70:1.000:. ./.:4:75,85:.: 1.03:1.000:. ./.:4:89,22:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,74:.: 0.44:0.994:. ./.:4:101,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:99,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:79,32:.:-0.56:1.000:. ./.:4:62,63:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.80:0.993:. ./.:4:62,64:.:-0.08:1.000:. ./.:4:120,32:.: 0.77:1.000:. ./.:4:124,36:.: 1.03:1.000:. ./.:4:124,28:.: 0.77:0.999:. ./.:4:158,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:71,23:.:-1.12:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:87,20:.:-0.69:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:61,58:.:-0.30:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:87,61:.: 0.64:1.000:. ./.:4:84,32:.:-0.40:1.000:. ./.:4:78,80:.: 0.96:1.000:. ./.:4:115,31:.: 0.57:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:102,27:.: 0.02:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:85,20:.:-0.76:1.000:. ./.:4:66,47:.:-0.50:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:82,25:.:-0.69:1.000:. ./.:4:81,15:.:-1.05:0.998:. ./.:4:124,23:.: 0.61:1.000:. ./.:4:64,64:.:-0.01:1.000:. ./.:4:127,33:.: 1.03:1.000:. ./.:4:114,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:62,68:.: 0.05:1.000:. ./.:4:93,30:.:-0.17:1.000:. ./.:4:165,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:114,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:94,34:.:-0.01:1.000:. ./.:4:56,54:.:-0.60:1.000:. ./.:4:123,39:.: 1.09:1.000:. ./.:4:74,91:.: 1.19:1.000:. ./.:4:98,31:.: 0.02:1.000:. ./.:4:94,53:.: 0.61:1.000:. ./.:4:101,29:.: 0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:72,79:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:21,4:.:-3.36:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:71,56:.:-0.04:1.000:. ./.:4:61,54:.:-0.43:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:57,67:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:84,28:.:-0.53:1.000:. ./.:4:94,30:.:-0.14:1.000:. ./.:4:65,57:.:-0.21:1.000:. ./.:4:81,64:.: 0.54:1.000:. ./.:4:103,25:.:-0.01:1.000:. ./.:4:46,32:.:-1.64:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.95:0.997:. ./.:4:99,28:.:-0.04:1.000:. ./.:4:83,32:.:-0.43:1.000:. ./.:4:84,29:.:-0.50:1.000:. ./.:4:51,50:.:-0.89:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.27:1.000:. ./.:4:67,69:.: 0.25:1.000:. ./.:4:70,45:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,32:.:-1.12:1.000:. ./.:4:120,25:.: 0.54:1.000:. ./.:4:130,33:.: 1.13:1.000:. ./.:4:77,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.12:0.956:. ./.:4:146,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:106,37:.: 0.48:1.000:. ./.:4:81,19:.:-0.92:1.000:. ./.:4:96,37:.: 0.15:1.000:. -chr8.1 62973207 chr8.1_062973207 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:91,159:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,162:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,274:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.05:1.000:. ./.:4:97,163:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,345:.: 1.95:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.95:1.000:. ./.:4:83,146:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,63:.:-2.53:1.000:. ./.:4:36,50:.:-2.17:1.000:. ./.:4:1,209:.:-0.19:1.000:. ./.:4:74,191:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.76:1.000:. ./.:4:76,149:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,309:.: 1.40:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.31:0.999:. ./.:4:0,279:.: 0.90:1.000:. ./.:4:124,189:.: 1.44:1.000:. ./.:4:96,190:.: 1.01:1.000:. ./.:4:18,33:.:-2.72:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.28:1.000:. ./.:4:75,111:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,53:.:-2.69:1.000:. ./.:4:114,241:.: 2.11:1.000:. ./.:4:96,173:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,216:.:-0.10:1.000:. ./.:5:0,294:.: 1.14:1.000:. ./.:4:113,169:.: 0.95:1.000:. ./.:4:1,334:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,67:.:-2.47:1.000:. ./.:4:31,42:.:-2.37:1.000:. ./.:3:17,15:.:-3.02:0.995:. ./.:4:84,167:.: 0.46:1.000:. ./.:4:81,212:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,180:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,308:.: 1.36:1.000:. ./.:4:113,242:.: 2.11:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.73:1.000:. ./.:4:1,245:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.70:1.000:. ./.:5:85,284:.: 2.33:1.000:. ./.:4:0,210:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.50:1.000:. ./.:4:53,123:.:-0.73:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.74:1.000:. ./.:4:55,185:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,260:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,232:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.01:1.000:. ./.:4:82,218:.: 1.24:1.000:. ./.:4:63,204:.: 0.71:1.000:. ./.:6:0,184:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.66:1.000:. ./.:4:64,182:.: 0.38:1.000:. ./.:4:67,149:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.70:1.000:. ./.:4:92,143:.: 0.20:1.000:. ./.:4:73,192:.: 0.68:1.000:. ./.:4:49,81:.:-1.47:1.000:. ./.:4:70,169:.: 0.27:1.000:. ./.:4:86,148:.: 0.19:0.887:. ./.:4:0,163:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,289:.: 1.06:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.93:0.999:. ./.:4:0,164:.:-0.93:1.000:. ./.:4:0,227:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,175:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.78:1.000:. ./.:4:71,186:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.51:0.915:. ./.:4:0,197:.:-0.40:1.000:. ./.:4:81,149:.: 0.12:1.000:. ./.:4:44,72:.:-1.69:1.000:. ./.:4:78,149:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,237:.: 0.23:1.000:. ./.:4:38,139:.:-0.72:1.000:. ./.:4:48,133:.:-0.66:1.000:. ./.:4:73,155:.: 0.09:1.000:. ./.:4:72,115:.:-0.56:1.000:. ./.:4:60,137:.:-0.40:1.000:. ./.:4:74,163:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.08:1.000:. ./.:4:68,186:.: 0.50:1.000:. ./.:4:67,188:.: 0.52:1.000:. ./.:4:47,108:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.51:1.000:. ./.:4:65,176:.: 0.30:1.000:. ./.:4:99,154:.: 0.49:1.000:. ./.:4:39,80:.:-1.64:1.000:. ./.:4:74,123:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,92:.:-2.07:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.39:0.994:. ./.:4:0,141:.:-1.29:1.000:. ./.:4:62,185:.: 0.39:1.000:. ./.:4:44,177:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,282:.: 0.95:1.000:. ./.:4:91,250:.: 1.89:0.993:. ./.:4:0,243:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1,279:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.24:0.999:. ./.:4:78,153:.: 0.14:1.000:. ./.:4:54,133:.:-0.56:1.000:. ./.:4:68,120:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1,200:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,169:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,235:.: 0.20:1.000:. ./.:4:54,172:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.69:1.000:. ./.:4:51,146:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,241:.: 0.31:1.000:. ./.:4:99,210:.: 1.38:1.000:. ./.:4:66,119:.:-0.59:1.000:. ./.:4:74,148:.: 0.00:1.000:. ./.:4:51,144:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,136:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,154:.:-1.08:1.000:. ./.:4:60,113:.:-0.78:1.000:. ./.:4:93,225:.: 1.52:1.000:. ./.:4:50,126:.:-0.73:0.998:. ./.:4:67,145:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.81:1.000:. ./.:4:98,166:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.51:1.000:. ./.:4:61,130:.:-0.50:1.000:. ./.:4:58,109:.:-0.88:1.000:. ./.:4:66,170:.: 0.22:1.000:. ./.:4:65,116:.:-0.66:1.000:. ./.:4:70,125:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.94:1.000:. ./.:4:110,275:.: 2.59:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.22:1.000:. ./.:4:1,176:.:-0.72:1.000:. ./.:4:103,232:.: 1.79:1.000:. ./.:4:55,111:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,349:.: 2.03:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.92:1.000:. ./.:4:18,21:.:-2.91:1.000:. ./.:4:87,181:.: 0.73:1.000:. ./.:4:0,315:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.39:1.000:. ./.:4:118,177:.: 1.16:1.000:. ./.:4:103,135:.: 0.25:1.000:. ./.:4:74,130:.:-0.29:1.000:. ./.:4:89,240:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.39:1.000:. ./.:4:88,196:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,309:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.01:0.997:. ./.:4:77,127:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,229:.: 0.12:1.000:. ./.:4:56,158:.:-0.13:1.000:. ./.:4:85,180:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.05:1.000:. ./.:4:78,129:.:-0.24:1.000:. ./.:4:1,270:.: 0.78:1.000:. ./.:4:80,135:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,293:.: 1.12:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.51:1.000:. ./.:4:1,214:.:-0.11:0.956:. ./.:4:0,261:.: 0.62:1.000:. ./.:4:93,162:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,200:.:-0.35:1.000:. -chr8.1 63364670 chr8.1_063364670 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:237,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:260,1:.: 1.33:0.999:. ./.:4:189,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:246,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:294,1:.: 1.82:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.03:1.000:. ./.:5:308,3:.: 2.06:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.76:1.000:. ./.:3:26,0:.:-2.10:0.995:. ./.:4:233,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:225,1:.: 0.82:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.57:1.000:. ./.:5:235,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:558,0:.: 5.66:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.19:1.000:. ./.:6:131,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.40:0.887:. ./.:4:211,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.54:0.999:. ./.:4:196,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.50:0.915:. ./.:4:165,1:.:-0.06:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:152,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:94,1:.:-1.09:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:72,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.49:0.994:. ./.:4:80,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:89,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:209,2:.: 0.60:0.993:. ./.:4:199,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:330,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.42:0.999:. ./.:4:166,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.70:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:241,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:100,0:.:-1.02:0.998:. ./.:4:190,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:196,2:.: 0.41:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:306,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:245,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:284,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.11:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:259,4:.: 1.36:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:295,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:240,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.90:0.997:. ./.:4:235,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:221,2:.: 0.77:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.21:0.956:. ./.:4:291,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:288,0:.: 1.72:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.48:1.000:. -chr8.1 63570134 chr8.1_063570134 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,47:.: 0.54:1.000:. ./.:4:82,22:.:-0.63:1.000:. ./.:4:65,52:.:-0.21:1.000:. ./.:4:105,23:.: 0.15:1.000:. ./.:4:204,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:128,31:.: 1.16:1.000:. ./.:4:76,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:108,21:.: 0.18:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:36,11:.:-2.49:1.000:. ./.:4:74,17:.:-1.06:1.000:. ./.:4:122,22:.: 0.67:1.000:. ./.:4:77,20:.:-0.86:1.000:. ./.:4:55,60:.:-0.28:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:77,55:.: 0.28:1.000:. ./.:4:56,68:.: 0.02:0.999:. ./.:4:79,16:.:-0.93:1.000:. ./.:4:180,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:144,38:.: 1.91:1.000:. ./.:4:60,67:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,48:.: 0.83:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:33,10:.:-2.62:1.000:. ./.:4:90,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:52,56:.:-0.50:1.000:. ./.:4:104,34:.: 0.47:1.000:. ./.:5:80,95:.: 1.68:1.000:. ./.:4:88,21:.:-0.47:1.000:. ./.:4:73,55:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,14:.:-1.16:1.000:. ./.:4:20,31:.:-2.36:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.97:1.000:. ./.:3:69,0:.:-1.77:0.995:. ./.:4:148,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:97,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:94,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:81,66:.: 0.77:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:79,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:69,60:.: 0.18:1.000:. ./.:4:105,34:.: 0.50:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:128,1:.: 0.18:1.000:. ./.:4:98,37:.: 0.37:1.000:. ./.:5:155,31:.: 2.04:1.000:. ./.:4:284,0:.: 5.23:1.000:. ./.:4:77,19:.:-0.90:1.000:. ./.:4:108,39:.: 0.77:1.000:. ./.:4:99,43:.: 0.60:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:83,53:.: 0.41:1.000:. ./.:4:114,23:.: 0.44:1.000:. ./.:4:99,31:.: 0.21:1.000:. ./.:4:51,56:.:-0.54:1.000:. ./.:4:81,58:.: 0.50:1.000:. ./.:4:93,20:.:-0.34:1.000:. ./.:6:73,29:.:-0.70:1.000:. ./.:4:64,59:.:-0.02:1.000:. ./.:4:91,15:.:-0.57:1.000:. ./.:4:161,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:91,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:87,27:.:-0.31:1.000:. ./.:4:86,28:.:-0.31:1.000:. ./.:4:71,45:.:-0.24:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.08:0.887:. ./.:4:80,49:.: 0.18:1.000:. ./.:4:59,68:.: 0.11:1.000:. ./.:4:92,18:.:-0.44:0.999:. ./.:4:95,31:.: 0.08:1.000:. ./.:4:95,32:.: 0.11:1.000:. ./.:4:79,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:78,20:.:-0.83:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:103,30:.: 0.31:1.000:. ./.:4:122,50:.: 1.58:1.000:. ./.:4:59,12:.:-1.71:0.915:. ./.:4:98,39:.: 0.44:1.000:. ./.:4:103,37:.: 0.54:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:97,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:120,16:.: 0.41:1.000:. ./.:4:71,28:.:-0.80:1.000:. ./.:4:62,51:.:-0.34:1.000:. ./.:4:98,26:.: 0.02:1.000:. ./.:4:97,25:.:-0.05:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:57,54:.:-0.41:1.000:. ./.:4:96,43:.: 0.50:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:118,42:.: 1.19:1.000:. ./.:4:86,21:.:-0.54:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:82,18:.:-0.76:1.000:. ./.:4:65,63:.: 0.15:1.000:. ./.:4:131,24:.: 1.03:1.000:. ./.:4:54,57:.:-0.41:1.000:. ./.:4:75,74:.: 0.83:1.000:. ./.:4:77,21:.:-0.83:1.000:. ./.:4:77,85:.: 1.25:0.994:. ./.:4:56,26:.:-1.35:1.000:. ./.:4:95,23:.:-0.18:1.000:. ./.:4:69,21:.:-1.09:1.000:. ./.:4:53,53:.:-0.57:1.000:. ./.:4:175,0:.: 1.68:0.993:. ./.:4:67,42:.:-0.47:1.000:. ./.:4:91,33:.: 0.02:1.000:. ./.:4:144,39:.: 1.94:1.000:. ./.:4:94,30:.: 0.02:0.999:. ./.:4:136,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:64,23:.:-1.19:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:98,40:.: 0.47:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:61,52:.:-0.34:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:66,61:.: 0.11:1.000:. ./.:4:90,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:53,86:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,30:.:-0.21:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:96,31:.: 0.11:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:78,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:59,23:.:-1.35:1.000:. ./.:4:46,33:.:-1.45:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:115,28:.: 0.64:1.000:. ./.:4:75,17:.:-1.03:0.998:. ./.:4:83,20:.:-0.67:1.000:. ./.:4:43,55:.:-0.83:1.000:. ./.:4:150,27:.: 1.74:1.000:. ./.:4:77,27:.:-0.63:1.000:. ./.:4:65,46:.:-0.41:1.000:. ./.:4:74,18:.:-1.03:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:80,25:.:-0.60:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:80,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:28,26:.:-2.26:1.000:. ./.:4:148,38:.: 2.04:1.000:. ./.:4:77,88:.: 1.35:1.000:. ./.:4:106,31:.: 0.44:1.000:. ./.:4:82,33:.:-0.28:1.000:. ./.:4:121,23:.: 0.67:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:95,64:.: 1.16:1.000:. ./.:4:79,51:.: 0.21:1.000:. ./.:4:46,2:.:-2.46:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:65,59:.: 0.02:1.000:. ./.:4:67,58:.: 0.05:1.000:. ./.:4:194,1:.: 2.33:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:95,56:.: 0.90:1.000:. ./.:4:86,26:.:-0.37:1.000:. ./.:4:62,15:.:-1.51:1.000:. ./.:4:99,19:.:-0.18:1.000:. ./.:4:80,56:.: 0.41:1.000:. ./.:4:72,40:.:-0.37:1.000:. ./.:4:97,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:88,47:.: 0.37:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.90:0.997:. ./.:4:97,22:.:-0.15:1.000:. ./.:4:107,26:.: 0.31:1.000:. ./.:4:46,40:.:-1.22:1.000:. ./.:4:68,39:.:-0.54:1.000:. ./.:4:97,26:.:-0.02:1.000:. ./.:4:58,49:.:-0.54:1.000:. ./.:4:53,46:.:-0.80:1.000:. ./.:4:75,23:.:-0.83:1.000:. ./.:4:99,36:.: 0.37:1.000:. ./.:4:109,29:.: 0.47:1.000:. ./.:4:54,61:.:-0.28:1.000:. ./.:4:117,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.24:0.956:. ./.:4:147,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:159,44:.: 2.59:1.000:. ./.:4:73,45:.:-0.18:1.000:. ./.:4:111,21:.: 0.28:1.000:. -chr8.1 63971830 chr8.1_063971830 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,18:.:-0.99:1.000:. ./.:4:1,17:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,43:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,44:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,73:.: 1.81:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.37:1.000:. ./.:4:4,59:.: 1.22:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.45:1.000:. ./.:4:3,31:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.35:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,29:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.82:1.000:. ./.:4:3,58:.: 1.12:1.000:. ./.:4:2,49:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,22:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,61:.: 1.12:1.000:. ./.:4:2,41:.: 0.24:1.000:. ./.:4:0,8:.:-1.48:1.000:. ./.:4:0,131:.: 4.56:1.000:. ./.:4:2,32:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.50:1.000:. ./.:5:1,29:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,43:.: 0.29:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.:-0.79:1.000:. ./.:3:0,2:.:-1.77:0.995:. ./.:4:1,106:.: 3.38:1.000:. ./.:4:2,62:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,95:.: 2.79:1.000:. ./.:4:0,13:.:-1.23:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,69:.: 1.52:1.000:. ./.:4:3,31:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,33:.:-0.25:1.000:. ./.:5:1,54:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,30:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:1,34:.:-0.15:1.000:. ./.:4:0,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,66:.: 1.37:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:3,53:.: 0.88:1.000:. ./.:6:0,18:.:-0.99:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,26:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,32:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:2,48:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,55:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1,50:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,80:.: 2.15:0.887:. ./.:4:0,23:.:-0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.14:0.999:. ./.:4:0,47:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1,36:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,21:.:-0.79:1.000:. ./.:4:1,76:.: 1.91:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,56:.: 0.93:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,67:.: 1.42:1.000:. ./.:4:0,40:.: 0.09:1.000:. ./.:4:1,15:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,20:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,74:.: 1.76:1.000:. ./.:4:0,48:.: 0.49:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.77:1.000:. ./.:4:0,51:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,54:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,44:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,39:.: 0.04:1.000:. ./.:4:1,47:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,17:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,14:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.84:0.994:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,27:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:0,56:.: 0.88:0.993:. ./.:4:0,21:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,46:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,29:.:-0.45:0.999:. ./.:4:0,65:.: 1.32:1.000:. ./.:4:1,32:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,47:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,19:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.84:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,41:.: 0.14:1.000:. ./.:4:1,20:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,15:.:-1.13:1.000:. ./.:4:2,31:.:-0.25:1.000:. ./.:4:2,68:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,68:.: 1.47:1.000:. ./.:4:0,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1,53:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,82:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.53:0.998:. ./.:4:0,67:.: 1.42:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,20:.:-0.84:1.000:. ./.:4:1,22:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.99:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,19:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,49:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,24:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:3,44:.: 0.44:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:4,66:.: 1.57:1.000:. ./.:4:1,58:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,63:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,34:.:-0.20:1.000:. ./.:4:4,12:.:-1.09:1.000:. ./.:4:1,24:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,58:.: 0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,39:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,63:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,20:.:-0.89:1.000:. ./.:4:1,33:.:-0.20:1.000:. ./.:4:1,32:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,57:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,31:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,42:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,50:.: 0.63:0.997:. ./.:4:1,32:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,25:.:-0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,52:.: 0.68:1.000:. ./.:4:1,47:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,23:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,21:.:-0.84:1.000:. ./.:4:3,22:.:-0.64:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.58:1.000:. ./.:4:1,26:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1,23:.:-0.69:0.956:. ./.:4:0,63:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,46:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,60:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,30:.:-0.40:1.000:. -chr8.1 64086223 chr8.1_064086223 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:415,246:.: 0.54:1.000:. ./.:4:366,113:.:-0.79:1.000:. ./.:4:365,261:.: 0.29:1.000:. ./.:4:404,253:.: 0.52:1.000:. ./.:4:483,253:.: 1.09:1.000:. ./.:4:471,256:.: 1.03:1.000:. ./.:4:300,241:.:-0.33:1.000:. ./.:4:381,293:.: 0.64:1.000:. ./.:4:374,166:.:-0.34:1.000:. ./.:4:200,48:.:-2.47:1.000:. ./.:4:129,44:.:-3.02:1.000:. ./.:4:493,136:.: 0.31:1.000:. ./.:4:372,225:.: 0.08:1.000:. ./.:4:421,228:.: 0.46:1.000:. ./.:4:397,139:.:-0.37:1.000:. ./.:4:377,324:.: 0.84:1.000:. ./.:4:373,231:.: 0.13:0.999:. ./.:4:463,211:.: 0.64:1.000:. ./.:4:603,217:.: 1.71:1.000:. ./.:4:470,324:.: 1.52:1.000:. ./.:4:167,64:.:-2.60:1.000:. ./.:4:382,212:.: 0.06:1.000:. ./.:4:465,279:.: 1.15:1.000:. ./.:4:377,126:.:-0.61:1.000:. ./.:4:73,42:.:-3.45:1.000:. ./.:4:403,243:.: 0.44:1.000:. ./.:4:436,204:.: 0.39:1.000:. ./.:4:390,183:.:-0.10:1.000:. ./.:5:586,361:.: 2.63:1.000:. ./.:4:440,200:.: 0.39:1.000:. ./.:4:348,251:.: 0.09:1.000:. ./.:4:327,154:.:-0.77:1.000:. ./.:4:87,19:.:-3.51:1.000:. ./.:4:235,97:.:-1.86:1.000:. ./.:3:49,58:.:-3.50:1.000:. ./.:4:395,198:.: 0.05:1.000:. ./.:4:393,212:.: 0.14:1.000:. ./.:4:406,221:.: 0.30:1.000:. ./.:4:394,245:.: 0.38:1.000:. ./.:4:413,188:.: 0.11:1.000:. ./.:4:354,268:.: 0.26:1.000:. ./.:4:387,248:.: 0.35:1.000:. ./.:4:462,188:.: 0.46:1.000:. ./.:4:353,109:.:-0.91:1.000:. ./.:4:507,198:.: 0.87:1.000:. ./.:4:407,193:.: 0.10:1.000:. ./.:5:591,340:.: 2.52:1.000:. ./.:4:162,94:.:-2.41:1.000:. ./.:4:371,178:.:-0.27:1.000:. ./.:4:341,108:.:-1.00:1.000:. ./.:4:384,108:.:-0.69:1.000:. ./.:4:496,153:.: 0.46:1.000:. ./.:4:370,185:.:-0.23:1.000:. ./.:4:384,265:.: 0.46:1.000:. ./.:4:361,274:.: 0.35:1.000:. ./.:4:421,202:.: 0.27:1.000:. ./.:4:380,191:.:-0.11:1.000:. ./.:4:520,170:.: 0.76:1.000:. ./.:4:392,194:.: 0.00:1.000:. ./.:6:329,154:.:-0.76:1.000:. ./.:4:369,201:.:-0.12:1.000:. ./.:4:359,165:.:-0.46:1.000:. ./.:4:514,127:.: 0.40:1.000:. ./.:4:411,180:.: 0.03:1.000:. ./.:4:407,155:.:-0.18:1.000:. ./.:4:426,161:.: 0.00:1.000:. ./.:4:329,237:.:-0.15:1.000:. ./.:4:374,222:.: 0.07:1.000:. ./.:4:444,194:.: 0.38:0.887:. ./.:4:377,246:.: 0.27:1.000:. ./.:4:468,253:.: 0.98:1.000:. ./.:4:369,213:.:-0.03:0.999:. ./.:4:477,132:.: 0.16:1.000:. ./.:4:403,229:.: 0.33:1.000:. ./.:4:422,127:.:-0.27:1.000:. ./.:4:302,200:.:-0.62:1.000:. ./.:4:424,114:.:-0.35:1.000:. ./.:4:412,214:.: 0.29:1.000:. ./.:4:401,219:.: 0.25:1.000:. ./.:4:401,177:.:-0.06:1.000:. ./.:4:371,76:.:-1.02:0.915:. ./.:4:412,215:.: 0.30:1.000:. ./.:4:454,187:.: 0.40:1.000:. ./.:4:348,118:.:-0.88:1.000:. ./.:4:368,120:.:-0.72:1.000:. ./.:4:463,316:.: 1.41:1.000:. ./.:4:296,156:.:-0.98:1.000:. ./.:4:309,175:.:-0.75:1.000:. ./.:4:367,192:.:-0.20:1.000:. ./.:4:383,120:.:-0.61:1.000:. ./.:4:331,150:.:-0.77:1.000:. ./.:4:346,231:.:-0.07:1.000:. ./.:4:433,135:.:-0.13:1.000:. ./.:4:346,161:.:-0.58:1.000:. ./.:4:423,270:.: 0.78:1.000:. ./.:4:359,240:.: 0.09:1.000:. ./.:4:342,101:.:-1.05:1.000:. ./.:4:375,157:.:-0.40:1.000:. ./.:4:450,306:.: 1.24:1.000:. ./.:4:435,217:.: 0.48:1.000:. ./.:4:386,200:.: 0.00:1.000:. ./.:4:434,204:.: 0.38:1.000:. ./.:4:295,169:.:-0.89:1.000:. ./.:4:374,316:.: 0.76:0.994:. ./.:4:397,120:.:-0.51:1.000:. ./.:4:391,152:.:-0.32:1.000:. ./.:4:355,166:.:-0.48:1.000:. ./.:4:427,216:.: 0.41:1.000:. ./.:4:553,282:.: 1.82:0.993:. ./.:4:365,275:.: 0.39:1.000:. ./.:4:356,277:.: 0.34:1.000:. ./.:4:553,279:.: 1.79:1.000:. ./.:4:385,290:.: 0.65:0.999:. ./.:4:468,225:.: 0.78:1.000:. ./.:4:273,77:.:-1.73:1.000:. ./.:4:442,129:.:-0.11:1.000:. ./.:4:367,157:.:-0.46:1.000:. ./.:4:392,123:.:-0.52:1.000:. ./.:4:352,161:.:-0.54:1.000:. ./.:4:392,156:.:-0.28:1.000:. ./.:4:406,189:.: 0.06:1.000:. ./.:4:390,183:.:-0.10:1.000:. ./.:4:436,188:.: 0.27:1.000:. ./.:4:407,281:.: 0.74:1.000:. ./.:4:419,194:.: 0.19:1.000:. ./.:4:485,215:.: 0.83:1.000:. ./.:4:396,212:.: 0.16:1.000:. ./.:4:361,113:.:-0.82:1.000:. ./.:4:313,148:.:-0.92:1.000:. ./.:4:287,131:.:-1.23:1.000:. ./.:4:377,164:.:-0.33:1.000:. ./.:4:350,346:.: 0.80:1.000:. ./.:4:238,167:.:-1.33:0.998:. ./.:4:398,201:.: 0.09:1.000:. ./.:4:325,150:.:-0.81:1.000:. ./.:4:523,279:.: 1.58:1.000:. ./.:4:410,173:.:-0.03:1.000:. ./.:4:352,278:.: 0.32:1.000:. ./.:4:303,168:.:-0.84:1.000:. ./.:4:384,101:.:-0.74:1.000:. ./.:4:424,184:.: 0.16:1.000:. ./.:4:428,120:.:-0.28:1.000:. ./.:4:350,212:.:-0.18:1.000:. ./.:4:300,158:.:-0.94:1.000:. ./.:4:588,264:.: 1.94:1.000:. ./.:4:559,282:.: 1.86:1.000:. ./.:4:399,243:.: 0.41:1.000:. ./.:4:450,130:.:-0.05:1.000:. ./.:4:483,209:.: 0.77:1.000:. ./.:4:337,103:.:-1.07:1.000:. ./.:4:459,415:.: 2.10:1.000:. ./.:4:362,320:.: 0.70:1.000:. ./.:4:139,35:.:-3.01:1.000:. ./.:4:304,148:.:-0.98:1.000:. ./.:4:390,272:.: 0.55:1.000:. ./.:4:413,215:.: 0.30:1.000:. ./.:4:561,301:.: 2.01:1.000:. ./.:4:479,249:.: 1.03:1.000:. ./.:4:372,156:.:-0.43:1.000:. ./.:4:442,352:.: 1.52:1.000:. ./.:4:396,241:.: 0.37:1.000:. ./.:4:366,99:.:-0.89:1.000:. ./.:4:332,211:.:-0.32:1.000:. ./.:4:350,296:.: 0.44:1.000:. ./.:4:293,167:.:-0.92:1.000:. ./.:4:391,273:.: 0.57:1.000:. ./.:4:307,297:.: 0.13:1.000:. ./.:4:449,200:.: 0.46:0.997:. ./.:4:421,223:.: 0.42:1.000:. ./.:4:387,228:.: 0.21:1.000:. ./.:4:354,211:.:-0.16:1.000:. ./.:4:333,213:.:-0.30:1.000:. ./.:4:429,226:.: 0.50:1.000:. ./.:4:373,194:.:-0.14:1.000:. ./.:4:338,147:.:-0.74:1.000:. ./.:4:338,138:.:-0.81:1.000:. ./.:4:466,153:.: 0.24:1.000:. ./.:4:462,287:.: 1.19:1.000:. ./.:4:432,224:.: 0.51:1.000:. ./.:4:399,157:.:-0.22:1.000:. ./.:4:454,168:.: 0.26:0.956:. ./.:4:521,264:.: 1.45:1.000:. ./.:4:530,297:.: 1.76:1.000:. ./.:4:347,264:.: 0.18:1.000:. ./.:4:451,125:.:-0.08:1.000:. -chr8.1 64345996 chr8.1_064345996 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:130,0:.: 2.59:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.51:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:31,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:119,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:167,0:.: 3.78:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:97,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.62:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:5:88,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:137,2:.: 2.88:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.49:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.29:1.000:. ./.:3:16,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:122,0:.: 2.33:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.12:1.000:. ./.:5:35,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:31,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:6:34,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.48:0.887:. ./.:4:63,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:16,0:.:-1.06:0.999:. ./.:4:44,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.81:0.915:. ./.:4:54,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:64,1:.: 0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-1.06:0.994:. ./.:4:12,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:0.993:. ./.:4:21,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.71:0.999:. ./.:4:48,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:50,1:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.65:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.39:0.998:. ./.:4:53,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:150,0:.: 3.23:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:91,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:82,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:110,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:53,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:114,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:94,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.19:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:123,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.52:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:128,0:.: 2.53:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:85,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.80:0.956:. ./.:4:43,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:96,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.80:1.000:. -chr8.1 64438433 chr8.1_064438433 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:997,180:.: 0.56:1.000:. ./.:4:837,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:998,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:933,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:1145,231:.: 1.32:1.000:. ./.:4:1330,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:544,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:961,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:800,142:.:-0.35:1.000:. ./.:4:386,1:.:-2.48:1.000:. ./.:4:328,37:.:-2.56:1.000:. ./.:4:781,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:835,137:.:-0.23:1.000:. ./.:4:1264,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:796,163:.:-0.28:1.000:. ./.:4:1044,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:944,0:.:-0.34:0.999:. ./.:4:1182,2:.: 0.58:1.000:. ./.:4:1240,188:.: 1.52:1.000:. ./.:4:1010,175:.: 0.59:1.000:. ./.:4:372,46:.:-2.36:1.000:. ./.:4:843,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:1109,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:755,138:.:-0.53:1.000:. ./.:4:265,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:937,179:.: 0.32:1.000:. ./.:4:805,145:.:-0.32:1.000:. ./.:4:1031,1:.: 0.00:1.000:. ./.:5:1533,3:.: 1.93:1.000:. ./.:4:749,161:.:-0.47:1.000:. ./.:4:862,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:832,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:255,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:262,47:.:-2.78:1.000:. ./.:3:93,7:.:-3.58:1.000:. ./.:4:804,136:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1022,171:.: 0.62:1.000:. ./.:4:942,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:1131,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1134,199:.: 1.15:1.000:. ./.:4:881,2:.:-0.57:1.000:. ./.:4:1102,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:1354,1:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1006,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:1270,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:1147,0:.: 0.44:1.000:. ./.:5:1431,177:.: 2.21:1.000:. ./.:4:248,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:946,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:922,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:986,180:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1365,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:915,144:.: 0.10:1.000:. ./.:4:1198,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:851,1:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1012,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1022,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:1046,171:.: 0.71:1.000:. ./.:4:1078,153:.: 0.76:1.000:. ./.:6:814,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:1050,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:778,126:.:-0.49:1.000:. ./.:4:1150,198:.: 1.21:1.000:. ./.:4:964,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1033,202:.: 0.78:1.000:. ./.:4:1078,196:.: 0.93:1.000:. ./.:4:788,137:.:-0.41:1.000:. ./.:4:952,156:.: 0.29:1.000:. ./.:4:850,150:.:-0.12:0.887:. ./.:4:849,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:1346,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:1015,0:.:-0.07:0.999:. ./.:4:857,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:1062,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:1071,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:811,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:1009,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:1224,188:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1355,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:1206,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:726,1:.:-1.17:0.915:. ./.:4:1220,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:944,186:.: 0.38:1.000:. ./.:4:884,168:.: 0.08:1.000:. ./.:4:752,159:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1425,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:729,111:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1008,150:.: 0.48:1.000:. ./.:4:998,166:.: 0.51:1.000:. ./.:4:800,132:.:-0.39:1.000:. ./.:4:750,111:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1060,154:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1194,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:766,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:1060,180:.: 0.80:1.000:. ./.:4:978,163:.: 0.42:1.000:. ./.:4:1078,171:.: 0.83:1.000:. ./.:4:1029,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:1193,199:.: 1.38:1.000:. ./.:4:1048,181:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1016,159:.: 0.55:1.000:. ./.:4:931,186:.: 0.33:1.000:. ./.:4:936,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:1212,0:.: 0.69:0.994:. ./.:4:853,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:961,163:.: 0.35:1.000:. ./.:4:808,171:.:-0.20:1.000:. ./.:4:861,1:.:-0.65:1.000:. ./.:4:1286,214:.: 1.80:0.993:. ./.:4:1104,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1146,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:1222,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:1175,0:.: 0.55:0.999:. ./.:4:933,215:.: 0.44:1.000:. ./.:4:514,92:.:-1.64:1.000:. ./.:4:1216,197:.: 1.46:1.000:. ./.:4:1232,1:.: 0.77:1.000:. ./.:4:1049,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:1195,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:955,166:.: 0.34:1.000:. ./.:4:1192,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1015,174:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1375,1:.: 1.32:1.000:. ./.:4:943,131:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1107,202:.: 1.06:1.000:. ./.:4:899,194:.: 0.23:1.000:. ./.:4:998,175:.: 0.54:1.000:. ./.:4:864,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:788,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:959,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:747,149:.:-0.52:1.000:. ./.:4:756,144:.:-0.51:1.000:. ./.:4:673,96:.:-1.01:0.998:. ./.:4:1043,160:.: 0.66:1.000:. ./.:4:818,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:1075,215:.: 0.99:1.000:. ./.:4:1174,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:1097,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:886,125:.:-0.08:1.000:. ./.:4:894,180:.: 0.16:1.000:. ./.:4:1282,199:.: 1.72:1.000:. ./.:4:1030,187:.: 0.71:1.000:. ./.:4:639,130:.:-1.01:1.000:. ./.:4:945,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:1265,211:.: 1.70:1.000:. ./.:4:1368,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:1190,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:964,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:1324,197:.: 1.88:1.000:. ./.:4:793,122:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1354,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:946,1:.:-0.33:1.000:. ./.:4:295,56:.:-2.62:1.000:. ./.:4:559,68:.:-1.56:1.000:. ./.:4:1114,1:.: 0.32:1.000:. ./.:4:1191,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1059,214:.: 0.92:1.000:. ./.:4:1114,185:.: 1.02:1.000:. ./.:4:635,149:.:-0.95:1.000:. ./.:4:1014,163:.: 0.56:1.000:. ./.:4:831,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:842,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:772,119:.:-0.54:1.000:. ./.:4:1025,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:736,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:1029,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:882,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1191,0:.: 0.61:0.997:. ./.:4:764,137:.:-0.50:1.000:. ./.:4:772,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:677,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:718,120:.:-0.75:1.000:. ./.:4:886,126:.:-0.08:1.000:. ./.:4:936,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:976,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:594,83:.:-1.36:1.000:. ./.:4:960,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:920,188:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1180,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:952,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:928,0:.:-0.40:0.956:. ./.:4:1278,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:1143,189:.: 1.15:1.000:. ./.:4:926,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1022,0:.:-0.04:1.000:. -chr8.1 64596419 chr8.1_064596419 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:59,22:0.28: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:32,11:0.26:-0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,19:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,28:0.34: 0.99:1.000:0.895 0/0/0/0:4:107,1:0.01: 2.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,22:0.30: 0.60:1.000:0.984 0/0/1/1:4:8,7:0.44:-1.92:1.000:0.971 0/0/0/1:4:59,29:0.33: 1.25:1.000:0.938 0/0/0/1:4:51,12:0.20: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,9:0.39:-1.62:1.000:0.727 0/0/0/1:4:54,9:0.15: 0.16:1.000:0.985 0/0/0/1:4:52,18:0.26: 0.47:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,7:0.14:-0.32:1.000:0.965 0/0/0/0:4:50,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,24:0.26: 1.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,22:0.19: 2.68:0.999:1.000 0/1/1/1:4:2,18:0.75:-1.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,19:0.29: 0.29:1.000:0.992 0/0/1/1:4:55,43:0.42: 1.68:1.000:0.908 0/0/0/1:4:6,1:0.15:-2.27:1.000:0.985 0/0/0/0:4:85,1:0.01: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,17:0.21: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,14:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,5:0.40:-2.05:1.000:0.788 0/0/0/1:4:63,31:0.33: 1.51:1.000:0.938 0/0/0/1:4:85,20:0.20: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:64,32:0.33: 1.60:1.000:0.782 0/0/0/1:4:65,14:0.18: 0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,13:0.17: 0.77:1.000:0.999 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,3:0.28:-2.10:1.000:0.996 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-1.49:1.000:1.000 0/0/1:3:4,2:0.33:-2.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,19:0.20: 1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,30:0.51:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/0:4:104,0:0.00: 1.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,13:0.15: 1.33:1.000:0.987 0/0/0/1:4:48,23:0.32: 0.51:1.000:0.952 0/0/0/1:4:40,12:0.24:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,16:0.19: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,17:0.21: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,9:0.20:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:30,10:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,30:0.44: 0.25:1.000:0.964 0/0/0/0/0:5:93,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,24:0.29: 1.07:1.000:0.993 0/0/1/1:4:16,29:0.58:-0.62:1.000:0.931 0/0/0/0:4:70,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:45,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,20:0.30: 0.29:1.000:0.983 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,30:0.43: 0.34:1.000:0.936 0/0/1/1:4:37,35:0.46: 0.55:1.000:0.987 0/0/1/1:4:29,23:0.42:-0.32:1.000:0.920 0/0/1/1:4:26,32:0.51:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,13:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/0/0/1:6:35,8:0.19:-0.71:1.000:0.946 0/0/0/1:4:41,12:0.23:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,20:0.35:-0.19:1.000:0.750 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,22:0.39:-0.19:1.000:0.639 0/0/0/1:4:58,29:0.33: 1.20:1.000:0.927 0/0/1/1:4:24,32:0.53:-0.14:1.000:0.994 0/0/0/1:4:14,6:0.30:-1.71:1.000:0.985 0/0/0/1:4:28,13:0.31:-0.79:1.000:0.966 0/0/0/1:4:53,9:0.15: 0.12:0.887:0.988 0/0/1/1:4:43,28:0.38: 0.51:1.000:0.578 0/0/0/1:4:30,10:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:14,6:0.30:-1.71:0.999:0.985 0/0/0/1:4:75,13:0.15: 1.25:1.000:0.991 0/0/1/1:4:46,38:0.43: 1.07:1.000:0.947 0/0/0/1:4:25,12:0.32:-0.97:1.000:0.951 0/0/0/1:4:32,17:0.34:-0.45:1.000:0.868 0/0/0/1:4:27,11:0.29:-0.92:1.000:0.991 0/0/0/1:4:34,10:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,11:0.20:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:62,16:0.21: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.47:-1.45:0.915:0.993 0/0/0/1:4:36,19:0.34:-0.19:1.000:0.876 0/0/0/1:4:58,8:0.13: 0.29:1.000:0.859 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,24:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/1:4:13,7:0.34:-1.71:1.000:0.850 0/0/0/1:4:21,9:0.30:-1.27:1.000:0.985 0/0/0/1:4:20,6:0.24:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.42:-0.88:1.000:0.897 0/0/0/1:4:43,14:0.25:-0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:74,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,16:0.26: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:57,10:0.15: 0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:53,11:0.18: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:29,4:0.13:-1.14:1.000:0.859 0/0/0/1:4:30,15:0.33:-0.62:1.000:0.927 0/0/0/1:4:37,8:0.18:-0.62:1.000:0.999 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,2:0.12:-1.84:1.000:0.800 0/0/0/0:4:69,5:0.07: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,10:0.17: 0.03:0.994:0.998 0/0/0/0:4:37,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,19:0.34:-0.19:1.000:0.876 0/0/0/1:4:38,22:0.36: 0.03:1.000:0.722 0/0/0/1:4:55,15:0.22: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:69,0:0.00: 0.42:0.993:1.000 0/0/0/1:4:58,14:0.20: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,18:0.38:-0.58:1.000:0.544 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 2.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,30:0.44: 0.21:0.999:0.973 0/0/0/0:4:83,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,27:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/1:4:38,9:0.20:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,4:0.22:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.20:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,30:0.39: 0.60:1.000:0.743 0/0/0/1:4:29,8:0.22:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,35:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,17:0.27: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:44,12:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,15:0.34:-0.71:1.000:0.857 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,20:0.61:-1.32:1.000:0.732 0/0/0/1:4:45,15:0.26: 0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:87,15:0.15: 1.86:1.000:0.990 0/0/1/1:4:25,17:0.39:-0.75:0.998:0.686 0/0/1/1:4:38,26:0.39: 0.21:1.000:0.701 0/0/0/1:4:55,16:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,19:0.23: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,30:0.54:-0.36:1.000:0.989 0/0/0/1:4:34,8:0.20:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:31,0:0.00:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,22:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/0/0/0:4:47,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,12:0.14: 1.20:1.000:0.975 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:32,24:0.41:-0.14:1.000:0.863 0/0/0/1:4:66,13:0.17: 0.86:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,47:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:43,13:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,35:0.57:-0.19:1.000:0.947 0/0/0/1:4:41,15:0.27:-0.14:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,37:0.35: 1.86:1.000:0.757 0/0/0/1:4:66,21:0.25: 1.20:1.000:0.999 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:48,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,30:0.38: 0.77:1.000:0.525 0/0/0/1:4:45,13:0.23:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:72,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:49,9:0.16:-0.06:1.000:0.996 0/0/0/0:4:53,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,12:0.17: 0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:34,25:0.41:-0.01:1.000:0.836 0/0/0/1:4:49,13:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,23:0.33: 0.42:1.000:0.927 0/0/1/1:4:39,43:0.49: 0.99:1.000:0.996 0/0/0/1:4:77,24:0.25: 1.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:55,13:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,10:0.16: 0.29:1.000:0.994 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-0.66:0.997:1.000 0/0/1/1:4:45,45:0.47: 1.33:1.000:0.993 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,13:0.24:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:48,11:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,18:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,24:0.57:-0.92:1.000:0.955 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:80,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:63,17:0.22: 0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,25:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:48,15:0.25: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:38,16:0.30:-0.23:0.956:0.988 0/0/0/1:4:55,18:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:76,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,27:0.45:-0.10:1.000:0.978 0/0/0/1:4:46,18:0.28: 0.21:1.000:0.994 -chr8.1 64866333 chr8.1_064866333 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:101,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:128,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:104,2:.: 0.19:0.999:. ./.:4:160,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:167,0:.: 2.62:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:52,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:94,1:.:-0.25:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.64:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:117,4:.: 0.79:1.000:. ./.:5:175,0:.: 2.94:1.000:. ./.:4:107,2:.: 0.31:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:63,0:.:-1.52:1.000:. ./.:3:11,0:.:-3.59:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.21:1.000:. ./.:5:170,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:6:80,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.33:0.887:. ./.:4:122,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.72:0.999:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.35:0.915:. ./.:4:131,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:81,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:127,2:.: 1.11:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.09:0.994:. ./.:4:75,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:166,0:.: 2.58:0.993:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:94,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:96,1:.:-0.17:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:68,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:50,0:.:-2.04:0.998:. ./.:4:61,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:155,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:160,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:138,1:.: 1.51:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.55:1.000:. ./.:4:54,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:88,2:.:-0.44:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:132,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:127,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.91:0.997:. ./.:4:110,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:74,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:105,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:136,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.63:0.956:. ./.:4:130,2:.: 1.23:1.000:. ./.:4:137,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:133,0:.: 1.27:1.000:. -chr8.1 65093988 chr8.1_065093988 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:239,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:80,31:.:-1.28:1.000:. ./.:4:122,89:.: 0.88:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.59:1.000:. ./.:4:130,118:.: 1.67:1.000:. ./.:4:159,45:.: 0.72:1.000:. ./.:4:47,43:.:-1.73:1.000:. ./.:4:88,84:.: 0.04:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:48,20:.:-2.20:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:131,44:.: 0.10:1.000:. ./.:4:137,29:.:-0.09:1.000:. ./.:4:141,45:.: 0.34:1.000:. ./.:4:152,38:.: 0.42:1.000:. ./.:4:94,79:.: 0.06:1.000:. ./.:4:155,34:.: 0.40:0.999:. ./.:4:152,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:115,90:.: 0.75:1.000:. ./.:4:73,101:.: 0.08:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:45,9:.:-2.51:1.000:. ./.:4:110,35:.:-0.55:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:83,86:.:-0.03:1.000:. ./.:5:309,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:160,52:.: 0.90:1.000:. ./.:4:118,80:.: 0.60:1.000:. ./.:4:80,67:.:-0.50:1.000:. ./.:4:22,4:.:-3.11:1.000:. ./.:4:45,40:.:-1.84:1.000:. ./.:3:25,10:.:-2.92:1.000:. ./.:4:126,41:.:-0.07:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:96,105:.: 0.66:1.000:. ./.:4:105,81:.: 0.34:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.20:1.000:. ./.:4:107,101:.: 0.81:1.000:. ./.:4:112,86:.: 0.60:1.000:. ./.:4:119,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:70,34:.:-1.43:1.000:. ./.:4:92,106:.: 0.60:1.000:. ./.:4:115,53:.:-0.05:1.000:. ./.:5:187,125:.: 3.05:1.000:. ./.:4:4,8:.:-3.41:1.000:. ./.:4:74,39:.:-1.24:1.000:. ./.:4:60,42:.:-1.47:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:147,57:.: 0.72:1.000:. ./.:4:90,98:.: 0.38:1.000:. ./.:4:155,53:.: 0.81:1.000:. ./.:4:54,87:.:-0.63:1.000:. ./.:4:56,63:.:-1.11:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:169,48:.: 1.00:1.000:. ./.:6:104,60:.:-0.14:1.000:. ./.:4:179,59:.: 1.46:1.000:. ./.:4:108,35:.:-0.59:1.000:. ./.:4:153,47:.: 0.64:1.000:. ./.:4:97,31:.:-0.91:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:109,53:.:-0.18:0.887:. ./.:4:106,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:166,55:.: 1.09:1.000:. ./.:4:35,36:.:-2.14:0.999:. ./.:4:85,41:.:-0.96:1.000:. ./.:4:120,42:.:-0.18:1.000:. ./.:4:90,41:.:-0.85:1.000:. ./.:4:70,67:.:-0.72:1.000:. ./.:4:86,32:.:-1.13:1.000:. ./.:4:138,48:.: 0.34:1.000:. ./.:4:74,91:.:-0.12:1.000:. ./.:4:151,32:.: 0.27:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.74:0.915:. ./.:4:112,38:.:-0.44:1.000:. ./.:4:158,49:.: 0.79:1.000:. ./.:4:124,32:.:-0.31:1.000:. ./.:4:77,60:.:-0.72:1.000:. ./.:4:83,109:.: 0.47:1.000:. ./.:4:122,35:.:-0.29:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:124,48:.: 0.04:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:120,31:.:-0.42:1.000:. ./.:4:161,47:.: 0.81:1.000:. ./.:4:161,50:.: 0.88:1.000:. ./.:4:49,50:.:-1.54:1.000:. ./.:4:122,127:.: 1.69:1.000:. ./.:4:105,97:.: 0.68:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,79:.:-0.31:1.000:. ./.:4:188,58:.: 1.63:1.000:. ./.:4:161,47:.: 0.81:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:95,69:.:-0.14:1.000:. ./.:4:124,124:.: 1.67:0.994:. ./.:4:89,38:.:-0.93:1.000:. ./.:4:144,42:.: 0.34:1.000:. ./.:4:139,36:.: 0.10:1.000:. ./.:4:140,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:129,75:.: 0.72:0.993:. ./.:4:102,91:.: 0.49:1.000:. ./.:4:75,93:.:-0.05:1.000:. ./.:4:69,90:.:-0.24:1.000:. ./.:4:87,95:.: 0.25:0.999:. ./.:4:103,93:.: 0.55:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.28:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:70,85:.:-0.33:1.000:. ./.:4:92,37:.:-0.89:1.000:. ./.:4:162,53:.: 0.96:1.000:. ./.:4:77,62:.:-0.68:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:127,46:.: 0.06:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:171,45:.: 0.98:1.000:. ./.:4:124,45:.:-0.03:1.000:. ./.:4:159,44:.: 0.70:1.000:. ./.:4:135,46:.: 0.23:1.000:. ./.:4:43,73:.:-1.17:1.000:. ./.:4:85,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:120,44:.:-0.14:1.000:. ./.:4:108,89:.: 0.57:1.000:. ./.:4:99,33:.:-0.83:0.998:. ./.:4:123,49:.: 0.04:1.000:. ./.:4:143,40:.: 0.27:1.000:. ./.:4:168,42:.: 0.85:1.000:. ./.:4:110,51:.:-0.20:1.000:. ./.:4:121,97:.: 1.03:1.000:. ./.:4:150,62:.: 0.90:1.000:. ./.:4:106,34:.:-0.65:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:134,60:.: 0.51:1.000:. ./.:4:151,58:.: 0.83:1.000:. ./.:4:99,29:.:-0.91:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:141,70:.: 0.88:1.000:. ./.:4:123,53:.: 0.12:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:168,66:.: 1.37:1.000:. ./.:4:112,97:.: 0.83:1.000:. ./.:4:72,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:76,68:.:-0.57:1.000:. ./.:4:134,39:.: 0.06:1.000:. ./.:4:140,41:.: 0.23:1.000:. ./.:4:126,98:.: 1.16:1.000:. ./.:4:137,42:.: 0.19:1.000:. ./.:4:139,39:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,45:.: 1.37:1.000:. ./.:4:129,55:.: 0.29:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:128,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:145,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:87,65:.:-0.40:1.000:. ./.:4:120,80:.: 0.64:1.000:. ./.:4:86,84:.:-0.01:1.000:. ./.:4:79,83:.:-0.18:0.997:. ./.:4:166,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:90,99:.: 0.40:1.000:. ./.:4:135,47:.: 0.25:1.000:. ./.:4:123,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:169,48:.: 1.00:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:161,53:.: 0.94:1.000:. ./.:4:135,50:.: 0.32:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:97,58:.:-0.33:1.000:. ./.:4:112,58:.:-0.01:0.956:. ./.:4:94,114:.: 0.81:1.000:. ./.:4:215,56:.: 2.17:1.000:. ./.:4:101,32:.:-0.80:1.000:. ./.:4:95,38:.:-0.80:1.000:. -chr8.1 65562429 chr8.1_065562429 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,45:0.49: 1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:95,38:0.40: 1.73:1.000:0.773 0/1/1/1:4:16,38:0.71:-0.35:1.000:0.990 0/0/0/0:4:95,2:0.06: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,9:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:51,18:0.38: 0.04:1.000:0.559 0/0/1/1:4:91,45:0.43: 1.80:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,25:0.40: 0.54:1.000:0.761 0/1/1/1:4:23,42:0.66:-0.06:1.000:0.894 0/1/1/1:4:19,38:0.68:-0.27:1.000:0.952 0/0/1/1:4:14,5:0.38:-1.27:1.000:0.582 0/0/0/1:4:92,28:0.36: 1.38:1.000:0.707 0/0/1/1:4:25,34:0.61:-0.22:0.999:0.653 0/0/0/1:4:131,34:0.34: 2.57:1.000:0.882 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,54:0.98:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,22:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:68,2:0.08: 0.07:1.000:0.989 0/0/0/1:4:88,4:0.12: 0.65:1.000:0.785 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,12:0.68:-1.30:1.000:0.952 0/0/1/1:4:78,41:0.44: 1.36:1.000:0.971 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,7:0.21: 0.65:1.000:1.000 1/1/1/1/1:5:0,39:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,50:0.70: 0.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:91,52:0.46: 1.99:1.000:0.986 0/0/0/1:4:71,7:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:3,16:0.83:-1.27:1.000:0.997 0/0/0/0:4:35,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0:3:5,0:0.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:53,5:0.24:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,4:0.13: 0.52:1.000:0.891 0/0/1/1:4:96,42:0.41: 1.86:1.000:0.876 0/0/0/1:4:68,9:0.27: 0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,24:0.36: 0.94:1.000:0.709 0/0/1/1:4:67,35:0.44: 0.91:1.000:0.969 0/0/0/1:4:70,3:0.11: 0.15:1.000:0.622 0/0/0/1:4:27,5:0.30:-0.93:1.000:0.985 0/0/0/1:4:66,4:0.16: 0.07:1.000:0.995 0/1/1/1:4:18,45:0.71:-0.12:1.000:0.994 0/0/0/0/1:5:76,10:0.27: 0.49:1.000:0.820 0/0/0/0:4:119,1:0.02: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,36:0.62:-0.14:1.000:0.614 0/0/0/0:4:110,3:0.07: 1.20:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/0/1:4:22,5:0.32:-1.06:1.000:0.948 0/0/0/1:4:66,10:0.28: 0.23:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,31:0.43: 0.67:1.000:0.956 0/0/1/1:4:76,39:0.44: 1.25:1.000:0.964 0/0/1/1:4:127,47:0.39: 2.80:1.000:0.647 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,55:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,4:0.19:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:38,16:0.41:-0.35:1.000:0.597 0/1/1/1:4:22,43:0.68:-0.06:1.000:0.941 0/1/1/1:4:10,37:0.77:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,16:0.48:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,32:0.54: 0.02:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.61:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:59,1:0.05:-0.19:0.887:1.000 0/0/1/1:4:58,57:0.55: 1.25:1.000:0.975 0/1/1/1:4:20,42:0.69:-0.14:1.000:0.969 0/0/1/1:4:76,36:0.42: 1.17:0.999:0.932 0/0/1/1:4:98,47:0.43: 2.04:1.000:0.938 0/1/1/1:4:8,42:0.83:-0.46:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,31:0.40: 1.07:1.000:0.782 0/0/0/1:4:22,5:0.32:-1.06:1.000:0.948 0/0/0/0:4:84,3:0.10: 0.52:1.000:0.876 0/0/0/1:4:77,4:0.14: 0.36:1.000:0.958 0/0/0/0:4:54,1:0.05:-0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,31:1.00:-0.96:0.915:1.000 0/0/1/1:4:23,30:0.61:-0.38:1.000:0.736 0/1/1/1:4:18,36:0.68:-0.35:1.000:0.952 0/0/0/1:4:23,5:0.32:-1.04:1.000:0.961 0/0/0/0:4:114,2:0.05: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,44:0.43: 1.80:1.000:0.937 0/1/1/1:4:17,34:0.68:-0.43:1.000:0.952 1/1/1/1:4:0,34:1.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,43:0.67:-0.04:1.000:0.913 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,6:0.26:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,35:0.47: 0.65:1.000:0.992 0/0/1/1:4:18,10:0.45:-1.04:1.000:0.982 0/0/0/1:4:48,2:0.11:-0.46:1.000:0.530 0/0/1/1:4:83,40:0.43: 1.46:1.000:0.941 0/0/1/1:4:80,45:0.45: 1.52:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,32:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,34:0.35: 2.30:1.000:0.811 0/0/1/1:4:68,27:0.40: 0.73:1.000:0.762 0/0/0/1:4:48,3:0.16:-0.43:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-1.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:55,6:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:81,42:0.44: 1.46:0.994:0.967 0/0/0/1:4:18,2:0.26:-1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,44:0.63: 0.17:1.000:0.519 0/1/1/1:4:9,38:0.80:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,42:0.76:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,9:0.25: 0.91:0.993:1.000 0/0/1/1:4:74,36:0.43: 1.12:1.000:0.945 0/0/1/1:4:67,28:0.40: 0.73:1.000:0.829 0/0/0/0:4:112,2:0.05: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,39:0.45: 1.09:0.999:0.982 0/0/0/0:4:86,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-0.98:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,2:0.08: 0.12:1.000:0.993 0/0/0/1:4:18,5:0.35:-1.17:1.000:0.823 0/1/1/1:4:20,36:0.66:-0.30:1.000:0.881 0/0/0/1:4:60,5:0.21:-0.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,26:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,24:0.64:-0.75:1.000:0.710 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,7:0.26: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:57,2:0.09:-0.22:1.000:0.899 0/1/1/1:4:13,22:0.65:-0.85:1.000:0.806 0/0/0/1:4:66,4:0.16: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:108,6:0.15: 1.23:1.000:0.983 0/0/0/0:4:56,1:0.05:-0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:62,2:0.09:-0.09:1.000:0.965 0/0/0/1:4:99,31:0.36: 1.65:1.000:0.661 0/0/1/1:4:42,31:0.50: 0.15:0.998:0.997 0/0/1/1:4:60,43:0.50: 0.94:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,28:0.73:-0.77:1.000:0.998 0/1/1/1:4:31,58:0.67: 0.57:1.000:0.914 0/1/1/1:4:16,51:0.75:-0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:74,45:0.47: 1.36:1.000:0.991 0/0/0/1:4:56,5:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,2:0.25:-1.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,4:0.33:-1.22:1.000:0.936 0/1/1/1:4:13,32:0.71:-0.59:1.000:0.993 0/1/1/1:4:18,28:0.64:-0.56:1.000:0.653 1/1/1/1:4:0,50:1.00:-0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,50:0.70: 0.12:1.000:0.985 0/1/1/1:4:17,35:0.68:-0.40:1.000:0.963 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,36:0.40: 1.46:1.000:0.817 0/0/1/1:4:75,36:0.43: 1.15:1.000:0.939 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:47,7:0.28:-0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,45:0.50: 1.02:1.000:0.997 0/1/1/1:4:21,51:0.71: 0.12:1.000:0.992 0/0/0/1:4:77,5:0.17: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:60,5:0.21:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:21,12:0.46:-0.90:1.000:0.986 0/0/1/1:4:64,65:0.56: 1.62:1.000:0.966 0/1/1/1:4:16,45:0.73:-0.17:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,42:0.75:-0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,42:0.48: 1.02:1.000:0.995 0/0/1/1:4:115,45:0.39: 2.44:1.000:0.740 0/0/1/1:4:85,31:0.38: 1.28:1.000:0.621 0/0/1/1:4:83,36:0.41: 1.36:1.000:0.868 0/0/0/1:4:110,10:0.23: 1.38:0.997:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,4:0.15: 0.12:1.000:0.992 0/1/1/1:4:13,28:0.69:-0.69:1.000:0.975 0/0/1/1:4:56,36:0.48: 0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:43,5:0.26:-0.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.69:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,20:0.52:-0.61:1.000:0.994 0/0/1/1:4:31,35:0.58:-0.04:1.000:0.915 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:36,8:0.32:-0.61:1.000:0.955 0/0/1/1:4:13,12:0.54:-1.11:0.956:0.986 0/0/0/1:4:112,15:0.27: 1.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:76,11:0.28: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,42:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,38:0.54: 0.36:1.000:0.990 -chr8.1 65759200 chr8.1_065759200 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:36,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:72,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:67,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:74,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:19,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.94:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:71,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:50,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:68,0:.: 1.29:1.000:. ./.:5:53,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.58:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.81:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:36,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:69,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.30:1.000:. ./.:5:84,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:54,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:73,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:6:37,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.11:0.887:. ./.:4:58,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.04:0.999:. ./.:4:63,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.81:0.915:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:93,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:65,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:67,0:.: 1.24:0.994:. ./.:4:26,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.19:0.993:. ./.:4:93,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.83:0.999:. ./.:4:69,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:51,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:52,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.20:0.998:. ./.:4:49,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:45,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:30,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:64,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:44,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:25,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:20,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:28,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:70,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:55,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:31,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:75,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:66,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.80:0.997:. ./.:4:23,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:77,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:46,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:21,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:48,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:26,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:49,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:22,0:.:-1.07:0.956:. ./.:4:66,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:63,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:47,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.78:1.000:. -chr8.1 65928243 chr8.1_065928243 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:186,36:.: 0.79:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:104,31:.:-0.91:1.000:. ./.:4:146,33:.:-0.05:1.000:. ./.:4:284,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:126,90:.: 0.67:1.000:. ./.:4:66,18:.:-1.91:1.000:. ./.:4:168,37:.: 0.46:1.000:. ./.:4:121,32:.:-0.56:1.000:. ./.:4:61,9:.:-2.19:1.000:. ./.:4:91,11:.:-1.56:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:168,28:.: 0.28:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:175,48:.: 0.81:1.000:. ./.:4:187,42:.: 0.93:0.999:. ./.:4:230,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:223,59:.: 1.96:1.000:. ./.:4:160,40:.: 0.36:1.000:. ./.:4:64,9:.:-2.13:1.000:. ./.:4:146,35:.:-0.01:1.000:. ./.:4:185,44:.: 0.93:1.000:. ./.:4:130,36:.:-0.31:1.000:. ./.:4:82,15:.:-1.66:1.000:. ./.:4:171,38:.: 0.53:1.000:. ./.:4:170,31:.: 0.38:1.000:. ./.:4:142,39:.:-0.01:1.000:. ./.:5:121,130:.: 1.36:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:136,28:.:-0.35:1.000:. ./.:4:147,29:.:-0.11:1.000:. ./.:4:56,12:.:-2.23:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.38:1.000:. ./.:3:33,4:.:-2.83:1.000:. ./.:4:181,36:.: 0.69:1.000:. ./.:4:154,45:.: 0.34:1.000:. ./.:4:163,34:.: 0.30:1.000:. ./.:4:160,45:.: 0.46:1.000:. ./.:4:168,31:.: 0.34:1.000:. ./.:4:128,33:.:-0.41:1.000:. ./.:4:193,47:.: 1.14:1.000:. ./.:4:124,84:.: 0.51:1.000:. ./.:4:159,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:117,37:.:-0.54:1.000:. ./.:4:175,47:.: 0.79:1.000:. ./.:5:230,43:.: 1.79:1.000:. ./.:4:205,54:.: 1.51:1.000:. ./.:4:161,35:.: 0.28:1.000:. ./.:4:154,28:.: 0.01:1.000:. ./.:4:135,32:.:-0.29:1.000:. ./.:4:218,68:.: 2.04:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:87,64:.:-0.60:1.000:. ./.:4:135,24:.:-0.44:1.000:. ./.:4:155,43:.: 0.32:1.000:. ./.:4:75,49:.:-1.13:1.000:. ./.:4:167,39:.: 0.48:1.000:. ./.:4:142,37:.:-0.05:1.000:. ./.:6:96,19:.:-1.31:1.000:. ./.:4:99,26:.:-1.11:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:147,32:.:-0.05:1.000:. ./.:4:188,41:.: 0.93:1.000:. ./.:4:185,65:.: 1.34:1.000:. ./.:4:75,21:.:-1.68:1.000:. ./.:4:131,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:98,34:.:-0.97:0.887:. ./.:4:190,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:189,49:.: 1.10:1.000:. ./.:4:130,29:.:-0.44:0.999:. ./.:4:267,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:182,36:.: 0.71:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:94,20:.:-1.33:1.000:. ./.:4:167,47:.: 0.63:1.000:. ./.:4:122,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:185,48:.: 1.00:1.000:. ./.:4:120,99:.: 0.73:1.000:. ./.:4:111,1:.:-1.36:0.915:. ./.:4:194,52:.: 1.26:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:186,53:.: 1.12:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:160,22:.: 0.01:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,28:.:-1.05:1.000:. ./.:4:69,26:.:-1.70:1.000:. ./.:4:185,34:.: 0.73:1.000:. ./.:4:198,43:.: 1.16:1.000:. ./.:4:117,24:.:-0.80:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:129,39:.:-0.27:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:128,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:215,24:.: 1.12:1.000:. ./.:4:83,16:.:-1.62:1.000:. ./.:4:158,39:.: 0.30:1.000:. ./.:4:78,25:.:-1.54:1.000:. ./.:4:120,28:.:-0.66:0.998:. ./.:4:107,26:.:-0.95:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,25:.:-0.74:1.000:. ./.:4:221,62:.: 1.98:0.993:. ./.:4:174,44:.: 0.71:1.000:. ./.:4:134,50:.: 0.04:1.000:. ./.:4:204,65:.: 1.71:1.000:. ./.:4:142,29:.:-0.21:0.999:. ./.:4:203,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:73,25:.:-1.64:1.000:. ./.:4:142,41:.: 0.03:1.000:. ./.:4:150,29:.:-0.05:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:164,34:.: 0.32:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:107,72:.:-0.05:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:83,67:.:-0.62:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:160,45:.: 0.46:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:101,41:.:-0.78:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:98,31:.:-1.03:1.000:. ./.:4:61,35:.:-1.68:1.000:. ./.:4:130,35:.:-0.33:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:76,20:.:-1.68:0.998:. ./.:4:154,44:.: 0.32:1.000:. ./.:4:140,23:.:-0.37:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:160,44:.: 0.44:1.000:. ./.:4:120,24:.:-0.74:1.000:. ./.:4:101,20:.:-1.19:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:155,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:61,56:.:-1.27:1.000:. ./.:4:226,52:.: 1.89:1.000:. ./.:4:222,53:.: 1.83:1.000:. ./.:4:178,44:.: 0.79:1.000:. ./.:4:84,71:.:-0.52:1.000:. ./.:4:215,56:.: 1.75:1.000:. ./.:4:149,33:.: 0.01:1.000:. ./.:4:108,100:.: 0.51:1.000:. ./.:4:155,35:.: 0.16:1.000:. ./.:4:72,15:.:-1.85:1.000:. ./.:4:42,22:.:-2.30:1.000:. ./.:4:106,70:.:-0.11:1.000:. ./.:4:202,46:.: 1.30:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.67:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:156,39:.: 0.26:1.000:. ./.:4:146,32:.:-0.07:1.000:. ./.:4:102,78:.:-0.03:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:95,84:.:-0.05:1.000:. ./.:4:121,31:.:-0.58:1.000:. ./.:4:176,35:.: 0.57:1.000:. ./.:4:109,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.25:0.997:. ./.:4:139,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:115,34:.:-0.64:1.000:. ./.:4:99,27:.:-1.09:1.000:. ./.:4:143,37:.:-0.03:1.000:. ./.:4:91,22:.:-1.35:1.000:. ./.:4:77,69:.:-0.70:1.000:. ./.:4:103,59:.:-0.39:1.000:. ./.:4:77,20:.:-1.66:1.000:. ./.:4:205,43:.: 1.30:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:97,113:.: 0.55:1.000:. ./.:4:144,23:.:-0.29:1.000:. ./.:4:162,27:.: 0.14:0.956:. ./.:4:174,47:.: 0.77:1.000:. ./.:4:208,51:.: 1.51:1.000:. ./.:4:78,51:.:-1.03:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.57:1.000:. -chr8.1 65993484 chr8.1_065993484 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:65,25:0.28:-0.48:1.000:0.995 0/0/0/1:4:77,45:0.37: 0.37:1.000:0.545 0/0/1/1:4:67,52:0.44: 0.29:1.000:0.963 0/0/0/1:4:87,24:0.22: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,72:0.60: 0.18:1.000:0.751 0/0/1/1:4:109,79:0.42: 2.11:1.000:0.919 0/0/1/1:4:50,33:0.40:-0.67:1.000:0.785 0/0/1/1:4:90,55:0.38: 0.97:1.000:0.589 0/0/0/0:4:124,11:0.08: 0.71:1.000:0.979 0/1/1/1:4:4,16:0.75:-2.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:42,0:0.00:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,61:0.46: 0.66:1.000:0.987 0/0/0/1:4:95,15:0.14: 0.05:1.000:0.967 0/0/0/1:4:84,43:0.34: 0.50:1.000:0.856 0/0/0/1:4:66,37:0.36:-0.14:1.000:0.664 0/0/1/1:4:53,68:0.55: 0.34:1.000:0.979 0/0/1/1:4:51,53:0.51:-0.11:0.999:0.996 0/0/0/0:4:173,0:0.00: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,26:0.13: 2.75:1.000:0.863 0/0/0/1:4:161,21:0.12: 1.95:1.000:0.726 0/0/1/1:4:19,22:0.53:-1.78:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,75:0.54: 0.79:1.000:0.990 0/0/0/0:4:115,12:0.10: 0.50:1.000:0.861 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-2.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,30:0.20: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,22:0.20: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,62:0.62:-0.32:1.000:0.558 0/0/0/1/1:5:125,63:0.34: 2.11:1.000:0.850 0/0/0/1:4:84,23:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,43:0.54:-0.80:1.000:0.987 0/0/1/1:4:34,63:0.62:-0.30:1.000:0.517 0/1/1/1:4:3,7:0.67:-2.60:1.000:0.904 1/1/1/1:4:2,37:0.94:-1.83:1.000:0.999 0/0/1:3:2,1:0.34:-2.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,56:0.38: 1.05:1.000:0.578 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 1.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,61:0.65:-0.51:1.000:0.827 0/0/0/1:4:123,27:0.18: 1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:23,49:0.65:-0.96:1.000:0.792 0/0/1/1:4:36,63:0.61:-0.24:1.000:0.657 0/0/1/1:4:36,55:0.59:-0.46:1.000:0.885 0/0/0/1:4:58,20:0.26:-0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:69,43:0.39: 0.10:1.000:0.645 0/0/0/1:4:90,29:0.25: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:81,80:0.50: 1.40:1.000:0.544 0/1/1/1:4:15,53:0.73:-1.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,19:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,57:0.67:-0.72:1.000:0.918 0/0/0/1:4:46,26:0.36:-0.96:1.000:0.642 0/0/1/1:4:50,48:0.49:-0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,41:0.41:-0.22:1.000:0.872 0/0/1/1:4:72,47:0.40: 0.29:1.000:0.761 0/0/0/1:4:88,43:0.33: 0.60:1.000:0.912 0/0/1/1:4:65,50:0.44: 0.18:1.000:0.959 0/0/0/0:4:110,13:0.11: 0.39:1.000:0.566 0/0/0/0:4:76,7:0.09:-0.67:1.000:0.967 0/0/1/1:4:50,35:0.41:-0.61:1.000:0.881 0/0/1/1/1/1:6:18,37:0.64:-1.41:1.000:0.883 0/0/1/1:4:32,53:0.60:-0.61:1.000:0.771 0/0/0/1:4:81,15:0.16:-0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:78,24:0.24:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,29:0.33:-0.48:1.000:0.935 0/0/0/1:4:131,16:0.11: 1.03:1.000:0.537 0/0/0/0:4:124,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,9:0.12:-0.80:1.000:0.726 0/0/0/1:4:79,18:0.19:-0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:57,29:0.34:-0.59:0.887:0.864 0/0/1/1:4:68,41:0.38: 0.02:1.000:0.549 0/0/0/1:4:61,28:0.32:-0.51:1.000:0.957 0/0/1/1:4:60,39:0.40:-0.24:0.999:0.752 0/1/1/1:4:21,49:0.67:-1.01:1.000:0.904 0/0/0/1:4:97,46:0.33: 0.92:1.000:0.937 0/0/0/1:4:90,11:0.11:-0.19:1.000:0.539 0/0/0/1:4:62,19:0.24:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,32:0.31:-0.09:1.000:0.975 0/0/0/1:4:92,31:0.26: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,46:0.34: 0.71:1.000:0.841 0/0/1/1:4:34,48:0.57:-0.69:1.000:0.946 0/0/0/0:4:74,7:0.09:-0.72:0.915:0.955 0/0/0/1:4:88,29:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,28:0.30:-0.35:1.000:0.986 0/0/0/1:4:74,38:0.34: 0.10:1.000:0.851 0/0/1/1:4:26,35:0.56:-1.25:1.000:0.966 0/0/0/1:4:100,42:0.30: 0.89:1.000:0.985 0/0/1/1:4:44,27:0.38:-0.99:1.000:0.601 0/0/0/1:4:78,17:0.18:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,18:0.20:-0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,29:0.28:-0.11:1.000:0.994 0/0/0/1:4:74,21:0.23:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,38:0.35: 0.05:1.000:0.804 0/0/1/1:4:28,39:0.57:-1.09:1.000:0.953 0/0/1/1:4:29,47:0.60:-0.85:1.000:0.808 0/0/1/1:4:72,62:0.46: 0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:58,45:0.44:-0.14:1.000:0.963 0/0/0/1:4:77,13:0.15:-0.48:1.000:0.985 0/0/1/1:4:53,75:0.57: 0.52:1.000:0.945 0/0/1/1:4:51,73:0.57: 0.42:1.000:0.938 0/1/1/1:4:39,84:0.65: 0.39:1.000:0.810 0/0/0/1:4:56,9:0.14:-1.14:1.000:0.973 0/0/0/1:4:49,23:0.32:-0.96:1.000:0.944 0/1/1/1:4:19,47:0.68:-1.12:1.000:0.944 0/0/1/1:4:33,57:0.61:-0.48:0.998:0.687 0/0/1/1:4:25,25:0.50:-1.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:94,12:0.12:-0.06:1.000:0.669 0/0/0/1:4:74,12:0.14:-0.59:1.000:0.976 0/0/0/1:4:92,37:0.29: 0.55:1.000:0.991 0/0/1/1:4:79,59:0.43: 0.79:0.993:0.942 0/0/1/1:4:39,71:0.62: 0.05:1.000:0.562 0/0/0/1:4:80,37:0.32: 0.23:1.000:0.953 0/0/1/1:4:86,87:0.50: 1.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,47:0.40: 0.26:0.999:0.791 0/0/1/1:4:31,57:0.62:-0.54:1.000:0.537 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,16:0.13: 0.60:1.000:0.856 0/1/1/1:4:36,73:0.64: 0.02:1.000:0.699 0/0/0/1:4:53,28:0.35:-0.72:1.000:0.802 0/0/0/1:4:69,39:0.36:-0.01:1.000:0.642 0/0/1/1:4:51,39:0.43:-0.48:1.000:0.956 0/0/0/1:4:94,21:0.19: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,13:0.13:-0.16:1.000:0.916 0/0/0/1:4:90,20:0.19: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,53:0.41: 0.60:1.000:0.838 0/0/0/1:4:68,34:0.34:-0.16:1.000:0.887 0/0/0/1:4:46,18:0.29:-1.17:1.000:0.993 0/0/0/1:4:77,27:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,34:0.48:-1.01:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,38:1.00:-1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,8:0.11:-0.96:1.000:0.608 0/0/1/1:4:46,45:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:93,61:0.40: 1.21:1.000:0.772 0/0/0/1:4:49,22:0.31:-0.99:0.998:0.966 0/0/0/1:4:68,29:0.30:-0.30:1.000:0.982 0/0/1/1:4:27,40:0.58:-1.09:1.000:0.914 0/0/0/1:4:106,47:0.31: 1.19:1.000:0.971 0/0/0/0:4:97,11:0.10:-0.01:1.000:0.686 0/0/1/1:4:28,41:0.58:-1.04:1.000:0.923 0/0/1/1:4:36,39:0.52:-0.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,27:0.38:-0.99:1.000:0.601 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,27:0.32:-0.61:1.000:0.949 0/0/0/1:4:70,38:0.35:-0.01:1.000:0.745 0/0/0/0:4:67,7:0.10:-0.91:1.000:0.859 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 3.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,77:0.55: 0.74:1.000:0.975 0/0/0/1:4:148,18:0.11: 1.53:1.000:0.524 0/0/0/1:4:76,36:0.33: 0.10:1.000:0.938 0/0/0/0:4:235,0:0.00: 3.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:104,15:0.13: 0.29:1.000:0.903 0/0/1/1:4:114,89:0.44: 2.51:1.000:0.965 0/0/1/1:4:49,89:0.62: 0.79:1.000:0.568 0/0/1/1:4:18,12:0.40:-2.07:1.000:0.804 0/0/0/1:4:87,43:0.33: 0.58:1.000:0.900 0/0/0/1:4:81,42:0.34: 0.39:1.000:0.835 0/0/0/1:4:74,43:0.37: 0.23:1.000:0.562 0/1/1/1:4:48,105:0.65: 1.19:1.000:0.832 0/0/1/1:4:88,69:0.44: 1.29:1.000:0.967 0/0/1/1:4:50,31:0.38:-0.72:1.000:0.631 0/0/1/1:4:71,60:0.46: 0.60:1.000:0.986 0/0/0/1:4:104,45:0.31: 1.08:1.000:0.978 0/0/0/1:4:94,33:0.27: 0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:92,16:0.15:-0.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:81,51:0.39: 0.63:1.000:0.673 0/0/1/1:4:48,58:0.54:-0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:49,84:0.61: 0.66:1.000:0.703 0/1/1/1:4:35,67:0.63:-0.16:1.000:0.565 0/0/1/1:4:73,79:0.52: 1.16:0.997:0.996 0/0/0/0:4:132,13:0.09: 0.97:1.000:0.928 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,40:0.60:-1.14:1.000:0.828 0/0/1/1:4:72,45:0.39: 0.23:1.000:0.653 0/0/1/1:4:56,34:0.38:-0.48:1.000:0.570 0/0/0/1:4:81,28:0.26: 0.02:1.000:0.998 0/0/0/0:4:81,7:0.08:-0.54:1.000:0.985 0/0/1/1:4:40,27:0.40:-1.09:1.000:0.827 0/0/1/1:4:44,78:0.62: 0.37:1.000:0.627 0/0/0/1:4:89,39:0.31: 0.52:1.000:0.975 0/0/0/0:4:157,12:0.07: 1.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:88,30:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:97,39:0.29: 0.74:0.956:0.991 0/0/0/1:4:115,64:0.36: 1.87:1.000:0.684 0/0/1/1:4:54,95:0.61: 1.08:1.000:0.645 0/0/0/1:4:96,46:0.33: 0.89:1.000:0.929 0/0/1/1:4:82,63:0.44: 0.97:1.000:0.958 -chr8.1 66355626 chr8.1_066355626 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:59,1:.: 0.21:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.17:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.89:0.999:. ./.:4:37,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:65,1:.: 0.46:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:5,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:5:84,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:56,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.97:1.000:. ./.:3:1,0:.:-2.31:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:93,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:59,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:5:92,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.84:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:22,2:.:-1.33:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:87,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:32,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:6:45,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:60,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.82:0.887:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.37:0.999:. ./.:4:35,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:79,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:47,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.01:0.915:. ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:34,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:69,1:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,1:.:-1.29:1.000:. ./.:4:35,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,1:.:-0.82:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.60:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:29,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.80:0.998:. ./.:4:40,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:66,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:39,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:113,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:73,1:.: 0.80:0.993:. ./.:4:82,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:26,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:33,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.50:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:57,1:.: 0.12:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:26,1:.:-1.20:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:28,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.73:0.998:. ./.:4:33,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:58,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:92,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:32,1:.:-0.95:1.000:. ./.:4:40,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:54,1:.:-0.01:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:107,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:47,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:33,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:129,0:.: 3.15:1.000:. ./.:4:115,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:8,1:.:-1.97:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:100,0:.: 1.91:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:99,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:84,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:106,0:.: 2.17:0.997:. ./.:4:39,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:57,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:53,1:.:-0.05:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:83,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:63,1:.: 0.38:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.59:0.956:. ./.:4:98,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:40,1:.:-0.60:1.000:. -chr8.1 66541183 chr8.1_066541183 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:127,135:.: 1.14:1.000:. ./.:4:102,87:.: 0.00:1.000:. ./.:4:126,110:.: 0.74:1.000:. ./.:4:131,127:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,211:.: 0.34:1.000:. ./.:4:0,199:.: 0.16:1.000:. ./.:4:104,72:.:-0.21:1.000:. ./.:4:139,104:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,96:.:-1.46:1.000:. ./.:4:53,69:.:-1.05:1.000:. ./.:4:108,120:.: 0.61:1.000:. ./.:4:113,106:.: 0.47:1.000:. ./.:4:161,127:.: 1.55:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.80:1.000:. ./.:4:139,120:.: 1.10:1.000:. ./.:4:139,110:.: 0.94:0.999:. ./.:4:153,56:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,205:.: 0.25:1.000:. ./.:4:151,131:.: 1.46:1.000:. ./.:4:24,52:.:-1.77:1.000:. ./.:4:0,117:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,188:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.17:1.000:. ./.:4:41,49:.:-1.55:1.000:. ./.:4:157,110:.: 1.22:1.000:. ./.:4:122,114:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,121:.:-1.07:1.000:. ./.:5:162,218:.: 2.99:1.000:. ./.:4:119,97:.: 0.42:1.000:. ./.:4:131,83:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,102:.:-1.37:1.000:. ./.:4:30,40:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,50:.:-2.18:1.000:. ./.:3:0,18:.:-2.68:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.66:1.000:. ./.:4:145,119:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.41:1.000:. ./.:4:107,76:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.88:1.000:. ./.:4:124,93:.: 0.44:1.000:. ./.:4:131,84:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,168:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,112:.:-1.21:1.000:. ./.:4:148,137:.: 1.50:1.000:. ./.:5:0,205:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.27:1.000:. ./.:4:108,86:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.63:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,190:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,124:.:-1.02:1.000:. ./.:4:142,126:.: 1.24:1.000:. ./.:4:109,108:.: 0.44:1.000:. ./.:4:140,100:.: 0.80:1.000:. ./.:4:96,129:.: 0.56:1.000:. ./.:4:113,103:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.94:1.000:. ./.:6:60,102:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,111:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,85:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.79:1.000:. ./.:4:118,106:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.13:1.000:. ./.:4:141,117:.: 1.08:1.000:. ./.:4:115,94:.: 0.31:1.000:. ./.:4:101,114:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,108:.:-1.27:0.887:. ./.:4:204,63:.: 1.22:1.000:. ./.:4:142,147:.: 1.57:1.000:. ./.:4:145,114:.: 1.10:0.999:. ./.:4:142,113:.: 1.03:1.000:. ./.:4:113,130:.: 0.84:1.000:. ./.:4:123,133:.: 1.05:1.000:. ./.:4:81,65:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.66:1.000:. ./.:4:82,70:.:-0.58:0.915:. ./.:4:133,151:.: 1.49:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,120:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,93:.:-1.51:1.000:. ./.:4:151,146:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,92:.:-1.52:1.000:. ./.:4:106,96:.: 0.20:1.000:. ./.:4:96,82:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.94:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.68:1.000:. ./.:4:95,78:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.18:1.000:. ./.:4:142,95:.: 0.75:1.000:. ./.:4:128,80:.: 0.30:1.000:. ./.:4:97,94:.: 0.03:1.000:. ./.:4:89,67:.:-0.52:1.000:. ./.:4:137,97:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.13:1.000:. ./.:4:111,91:.: 0.20:1.000:. ./.:4:101,135:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.68:1.000:. ./.:4:101,100:.: 0.19:0.998:. ./.:4:0,111:.:-1.22:1.000:. ./.:4:123,106:.: 0.63:1.000:. ./.:4:88,79:.:-0.35:1.000:. ./.:4:117,105:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,191:.: 0.03:0.993:. ./.:4:132,110:.: 0.83:1.000:. ./.:4:100,106:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,212:.: 0.36:1.000:. ./.:4:110,96:.: 0.26:0.999:. ./.:4:0,172:.:-0.27:1.000:. ./.:4:98,48:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,145:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,147:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,123:.:-1.04:1.000:. ./.:4:118,105:.: 0.53:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.80:1.000:. ./.:4:134,130:.: 1.17:1.000:. ./.:4:99,97:.: 0.11:1.000:. ./.:4:138,151:.: 1.57:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.71:1.000:. ./.:4:136,106:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,109:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.85:1.000:. ./.:4:0,92:.:-1.52:1.000:. ./.:4:85,97:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,122:.:-1.05:1.000:. ./.:4:139,95:.: 0.70:1.000:. ./.:4:73,39:.:-1.21:0.998:. ./.:4:0,82:.:-1.68:1.000:. ./.:4:108,91:.: 0.16:1.000:. ./.:4:179,133:.: 1.93:1.000:. ./.:4:129,103:.: 0.67:1.000:. ./.:4:91,74:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,87:.:-1.60:1.000:. ./.:4:0,144:.:-0.71:1.000:. ./.:4:121,118:.: 0.78:1.000:. ./.:4:0,112:.:-1.21:1.000:. ./.:4:109,87:.: 0.11:1.000:. ./.:4:72,79:.:-0.60:1.000:. ./.:4:175,172:.: 2.47:1.000:. ./.:4:172,182:.: 2.58:1.000:. ./.:4:116,139:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.50:1.000:. ./.:4:155,148:.: 1.79:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.82:1.000:. ./.:4:130,163:.: 1.63:1.000:. ./.:4:126,102:.: 0.61:1.000:. ./.:4:1,65:.:-1.93:1.000:. ./.:4:0,99:.:-1.41:1.000:. ./.:4:121,124:.: 0.88:1.000:. ./.:4:129,129:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,189:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.86:1.000:. ./.:4:130,120:.: 0.95:1.000:. ./.:4:133,128:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,146:.:-0.68:1.000:. ./.:4:116,105:.: 0.50:1.000:. ./.:4:126,126:.: 0.99:1.000:. ./.:4:109,67:.:-0.21:1.000:. ./.:4:117,143:.: 1.11:1.000:. ./.:4:138,102:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,151:.:-0.60:0.997:. ./.:4:104,118:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.21:1.000:. ./.:4:90,99:.: 0.00:1.000:. ./.:4:95,85:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,125:.:-1.00:1.000:. ./.:4:115,105:.: 0.48:1.000:. ./.:4:98,117:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,201:.: 0.19:1.000:. ./.:4:153,118:.: 1.28:1.000:. ./.:4:135,118:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,174:.:-0.24:0.956:. ./.:4:0,202:.: 0.20:1.000:. ./.:4:0,259:.: 1.10:1.000:. ./.:4:121,115:.: 0.74:1.000:. ./.:4:127,116:.: 0.84:1.000:. -chr8.1 66847714 chr8.1_066847714 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:50,10:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,9:.:-0.05:1.000:. ./.:4:58,18:.: 1.01:1.000:. ./.:4:59,13:.: 0.76:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:29,3:.:-1.71:1.000:. ./.:4:54,19:.: 0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:15,3:.:-2.58:1.000:. ./.:4:62,13:.: 0.94:1.000:. ./.:4:57,14:.: 0.70:1.000:. ./.:4:62,18:.: 1.25:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:66,13:.: 1.19:1.000:. ./.:4:81,20:.: 2.55:0.999:. ./.:4:46,12:.:-0.11:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:64,17:.: 1.31:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.89:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:6,2:.:-3.20:1.000:. ./.:4:43,20:.: 0.20:1.000:. ./.:4:56,15:.: 0.70:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:5:69,14:.: 1.44:1.000:. ./.:4:55,11:.: 0.39:1.000:. ./.:4:43,14:.:-0.17:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:11,4:.:-2.76:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.15:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.44:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:51,14:.: 0.33:1.000:. ./.:4:90,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:39,17:.:-0.23:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,12:.:-0.17:1.000:. ./.:4:51,18:.: 0.57:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:62,20:.: 1.38:1.000:. ./.:5:97,0:.: 2.30:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:32,13:.:-0.91:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:78,1:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:55,14:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,16:.:-0.05:1.000:. ./.:4:31,10:.:-1.16:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.29:1.000:. ./.:4:43,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.23:1.000:. ./.:6:52,10:.: 0.14:1.000:. ./.:4:58,17:.: 0.94:1.000:. ./.:4:53,22:.: 0.94:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:42,13:.:-0.29:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.28:1.000:. ./.:4:47,19:.: 0.39:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.42:0.887:. ./.:4:27,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:46,10:.:-0.23:1.000:. ./.:4:15,7:.:-2.33:0.999:. ./.:4:45,15:.: 0.02:1.000:. ./.:4:56,14:.: 0.63:1.000:. ./.:4:43,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:51,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:80,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:45,7:.:-0.48:0.915:. ./.:4:52,19:.: 0.70:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:41,19:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:51,13:.: 0.26:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.54:1.000:. ./.:4:65,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,14:.: 0.70:1.000:. ./.:4:89,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:57,13:.: 0.63:1.000:. ./.:4:51,21:.: 0.76:1.000:. ./.:4:49,12:.: 0.08:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.79:1.000:. ./.:4:40,17:.:-0.17:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:24,7:.:-1.78:1.000:. ./.:4:52,18:.: 0.63:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:67,16:.: 1.44:0.998:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:58,14:.: 0.76:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.91:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.48:1.000:. ./.:4:81,0:.: 1.31:0.993:. ./.:4:42,24:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,7:.:-0.73:1.000:. ./.:4:67,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:48,12:.: 0.02:0.999:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:38,8:.:-0.85:1.000:. ./.:4:76,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:45,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,19:.:-0.35:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:57,16:.: 0.82:1.000:. ./.:4:37,10:.:-0.79:1.000:. ./.:4:51,10:.: 0.08:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:54,14:.: 0.51:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:40,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:30,11:.:-1.16:1.000:. ./.:4:61,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:58,21:.: 1.19:1.000:. ./.:4:31,6:.:-1.40:0.998:. ./.:4:58,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,11:.:-0.17:1.000:. ./.:4:56,21:.: 1.07:1.000:. ./.:4:57,15:.: 0.76:1.000:. ./.:4:46,13:.:-0.05:1.000:. ./.:4:70,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:54,13:.: 0.45:1.000:. ./.:4:78,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.29:1.000:. ./.:4:31,8:.:-1.28:1.000:. ./.:4:49,15:.: 0.26:1.000:. ./.:4:70,10:.: 1.25:1.000:. ./.:4:58,22:.: 1.25:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,16:.:-0.17:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:58,16:.: 0.88:1.000:. ./.:4:45,16:.: 0.08:1.000:. ./.:4:12,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:35,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:39,16:.:-0.29:1.000:. ./.:4:45,22:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:34,14:.:-0.73:1.000:. ./.:4:39,8:.:-0.79:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:44,26:.: 0.63:1.000:. ./.:4:60,15:.: 0.94:1.000:. ./.:4:58,26:.: 1.50:1.000:. ./.:4:33,12:.:-0.91:1.000:. ./.:4:37,15:.:-0.48:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.42:0.997:. ./.:4:45,12:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:38,19:.:-0.17:1.000:. ./.:4:40,9:.:-0.66:1.000:. ./.:4:72,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:46,10:.:-0.23:1.000:. ./.:4:35,9:.:-0.97:1.000:. ./.:4:71,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:69,10:.: 1.19:1.000:. ./.:4:39,10:.:-0.66:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:68,0:.: 0.51:0.956:. ./.:4:87,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:69,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:31,13:.:-0.97:1.000:. ./.:4:45,13:.:-0.11:1.000:. -chr8.1 66963450 chr8.1_066963450 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:39,108:0.71: 1.13:1.000:0.991 0/1/1/1:4:21,100:0.80: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,91:0.63: 0.90:1.000:0.588 0/0/1/1:4:54,81:0.58: 0.78:1.000:0.916 0/0/0/1:4:101,45:0.32: 1.10:1.000:0.965 0/0/1/1:4:76,89:0.52: 1.66:1.000:0.995 0/0/1/1:4:31,19:0.38:-1.72:1.000:0.551 0/0/0/1:4:79,35:0.31: 0.16:1.000:0.967 0/0/1/1:4:57,62:0.50: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:2,4:0.64:-3.02:1.000:0.727 0/0/1/1:4:5,5:0.48:-2.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:22,108:0.81: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,74:0.60: 0.31:1.000:0.788 0/1/1/1:4:21,85:0.78:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,67:0.56: 0.22:1.000:0.970 0/0/1/1:4:58,73:0.54: 0.66:1.000:0.989 0/1/1/1:4:32,111:0.75: 1.02:0.999:0.999 0/0/1/1:4:65,84:0.54: 1.19:1.000:0.984 0/0/1/1:4:65,81:0.54: 1.10:1.000:0.990 0/0/1/1:4:75,80:0.50: 1.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:1,3:0.72:-3.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,68:0.53: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/1:4:80,37:0.32: 0.25:1.000:0.948 0/0/1/1:4:37,61:0.60:-0.31:1.000:0.783 0/0/0/1:4:5,3:0.37:-2.96:1.000:0.507 0/0/0/1:4:86,32:0.28: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:29,119:0.78: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,76:0.51: 1.07:1.000:0.997 0/1/1/1/1:5:29,129:0.79: 1.46:1.000:0.993 0/0/0/1:4:100,40:0.30: 0.93:1.000:0.989 0/0/1/1:4:56,92:0.60: 1.16:1.000:0.790 0/0/1/1:4:55,82:0.58: 0.84:1.000:0.922 0/0/1/1:4:5,4:0.44:-2.93:1.000:0.959 0/0/0/0:4:6,0:0.02:-3.02:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:86,34:0.29: 0.34:1.000:0.990 0/0/1/1:4:71,68:0.48: 0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:60,75:0.54: 0.78:1.000:0.989 0/0/1/1:4:76,70:0.47: 1.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:99,37:0.28: 0.81:1.000:0.995 0/0/1/1:4:56,65:0.52: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:77,76:0.48: 1.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,64:0.49: 0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,56:0.51:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,21:0.23:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,70:0.51: 0.72:1.000:0.996 0/0/0/1/1:5:84,90:0.50: 1.93:1.000:0.500 0/0/0/1:4:84,17:0.19:-0.22:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,55:0.49: 0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,59:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,76:0.73:-0.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:30,134:0.79: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,16:0.21:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,73:0.51: 0.84:1.000:0.996 0/0/0/1:4:76,35:0.32: 0.07:1.000:0.950 0/0/0/1:4:89,42:0.33: 0.66:1.000:0.936 0/1/1/1:4:27,103:0.77: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,87:0.69: 0.40:1.000:0.970 0/0/1/1:4:58,59:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1/1/1:6:35,54:0.59:-0.57:1.000:0.528 0/1/1/1:4:38,91:0.68: 0.60:1.000:0.955 0/0/1/1:4:74,73:0.48: 1.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,59:0.56:-0.22:1.000:0.960 0/0/1/1:4:40,57:0.57:-0.34:1.000:0.953 0/0/1/1:4:68,57:0.45: 0.49:1.000:0.975 0/0/1/1:4:63,62:0.48: 0.49:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,19:0.43:-1.93:1.000:0.955 0/1/1/1:4:23,90:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,30:0.28: 0.13:0.887:0.996 0/1/1/1:4:27,90:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,82:0.71: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:33,13:0.29:-1.84:0.999:0.990 0/1/1/1:4:40,120:0.72: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,67:0.48: 0.75:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,107:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,31:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,56:0.49: 0.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,26:0.27:-0.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:91,27:0.24: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,60:0.50: 0.22:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.54:0.915:1.000 0/0/1/1:4:39,45:0.52:-0.72:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,47:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,57:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,32:0.33:-0.28:1.000:0.927 0/0/1/1:4:72,56:0.43: 0.57:1.000:0.945 0/0/0/1:4:55,7:0.13:-1.37:1.000:0.917 0/1/1/1:4:16,52:0.74:-1.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:39,35:0.46:-1.02:1.000:0.988 0/1/1/1:4:35,103:0.72: 0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:54,19:0.27:-1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:57,61:0.50: 0.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,94:0.71: 0.54:1.000:0.994 0/0/0/1:4:58,23:0.29:-0.81:1.000:0.990 0/0/0/1:4:61,16:0.22:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,19:0.22:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,71:0.75:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,26:0.41:-1.34:1.000:0.848 0/0/1/1:4:48,43:0.46:-0.52:1.000:0.988 0/0/1/1:4:46,61:0.55:-0.04:1.000:0.979 0/1/1/1:4:9,35:0.77:-1.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,91:0.76: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,42:0.59:-1.16:1.000:0.877 0/0/1/1:4:39,39:0.48:-0.90:0.998:0.996 0/1/1/1:4:20,67:0.74:-0.63:1.000:0.999 0/0/1/1:4:58,55:0.47: 0.13:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,39:0.52:-1.04:1.000:0.996 0/1/1/1:4:24,103:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,90:0.55: 1.49:0.993:0.983 0/0/1/1:4:56,55:0.48: 0.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:56,26:0.32:-0.78:1.000:0.945 0/0/0/1:4:87,50:0.37: 0.84:1.000:0.624 0/0/0/1:4:65,19:0.24:-0.72:0.999:1.000 0/0/0/1:4:66,25:0.29:-0.52:1.000:0.994 0/0/1/1:4:67,44:0.39: 0.07:1.000:0.725 0/0/1/1:4:44,54:0.53:-0.31:1.000:0.991 0/0/1/1:4:24,31:0.54:-1.57:1.000:0.985 0/0/1/1:4:49,54:0.51:-0.16:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,67:0.78:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,17:0.23:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,77:0.75:-0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,41:0.45:-0.60:1.000:0.984 0/1/1/1:4:22,83:0.76:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,74:0.53: 0.81:1.000:0.994 0/0/0/1:4:64,34:0.35:-0.31:1.000:0.798 0/0/1/1:4:44,50:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:62,19:0.25:-0.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,46:0.45:-0.28:1.000:0.983 0/0/1/1:4:28,28:0.48:-1.55:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,55:0.71:-0.99:1.000:0.990 0/0/0/1:4:60,22:0.28:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,32:0.29: 0.13:1.000:0.990 0/0/0/1:4:55,18:0.26:-1.04:0.998:0.999 0/0/0/1:4:62,32:0.34:-0.43:1.000:0.844 0/1/1/1:4:22,99:0.80: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,101:0.57: 1.84:1.000:0.945 0/0/1/1:4:60,75:0.54: 0.78:1.000:0.989 0/0/0/1:4:61,19:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,43:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,48:0.54:-0.66:1.000:0.988 0/0/1/1:4:38,52:0.56:-0.54:1.000:0.970 0/0/1/1:4:28,39:0.56:-1.22:1.000:0.963 0/0/1/1:4:62,79:0.54: 0.96:1.000:0.987 0/1/1/1:4:16,42:0.70:-1.49:1.000:0.984 0/0/1/1:4:70,88:0.54: 1.46:1.000:0.989 0/1/1/1:4:33,89:0.70: 0.40:1.000:0.988 0/0/1/1:4:54,79:0.57: 0.72:1.000:0.936 0/1/1/1:4:29,100:0.75: 0.60:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,76:0.50: 1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:63,66:0.50: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,95:0.58: 1.43:1.000:0.895 0/0/1/1:4:69,83:0.53: 1.28:1.000:0.993 0/1/1/1:4:2,6:0.72:-2.96:1.000:0.996 0/0/0/1:4:46,13:0.24:-1.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,72:0.48: 1.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,97:0.74: 0.54:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,33:0.30: 0.13:1.000:0.984 0/0/0/1:4:57,32:0.36:-0.57:1.000:0.682 0/0/1/1:4:57,65:0.51: 0.40:1.000:0.996 0/0/1/1:4:51,67:0.55: 0.28:1.000:0.981 0/0/1/1:4:38,50:0.55:-0.60:1.000:0.981 0/1/1/1:4:26,94:0.76: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,64:0.52: 0.28:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,83:0.59: 0.78:1.000:0.840 0/0/1/1:4:83,73:0.46: 1.40:1.000:0.985 0/0/1/1:4:62,62:0.48: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,57:0.53:-0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:50,51:0.49:-0.22:0.997:0.996 0/0/1/1:4:44,58:0.55:-0.19:1.000:0.981 0/0/1/1:4:39,49:0.54:-0.60:1.000:0.989 0/1/1/1:4:26,73:0.71:-0.28:1.000:0.992 0/0/1/1:4:37,47:0.54:-0.72:1.000:0.987 0/0/1/1:4:46,61:0.55:-0.04:1.000:0.979 0/1/1/1:4:24,87:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,101:0.78: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,103:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,111:0.78: 0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,67:0.53: 0.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,113:0.78: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,67:0.57: 0.16:1.000:0.952 0/0/1/1:4:48,59:0.53:-0.04:0.956:0.991 0/0/0/1:4:94,54:0.37: 1.16:1.000:0.625 0/0/1/1:4:59,62:0.50: 0.37:1.000:0.997 0/0/1/1:4:45,47:0.49:-0.49:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,113:0.75: 1.10:1.000:0.999 -chr8.1 67018703 chr8.1_067018703 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:329,112:.: 0.18:1.000:. ./.:4:179,149:.:-1.17:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:331,98:.: 0.04:1.000:. ./.:4:391,137:.: 1.22:1.000:. ./.:4:547,1:.: 1.46:1.000:. ./.:4:295,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:434,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:340,94:.: 0.10:1.000:. ./.:4:174,55:.:-2.35:1.000:. ./.:4:235,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:304,208:.: 1.03:1.000:. ./.:4:425,1:.: 0.00:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:311,123:.: 0.10:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:303,114:.:-0.11:0.999:. ./.:4:229,0:.:-2.35:1.000:. ./.:4:400,139:.: 1.35:1.000:. ./.:4:365,112:.: 0.61:1.000:. ./.:4:148,51:.:-2.71:1.000:. ./.:4:327,109:.: 0.12:1.000:. ./.:4:362,129:.: 0.78:1.000:. ./.:4:271,97:.:-0.69:1.000:. ./.:4:136,0:.:-3.46:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:324,114:.: 0.14:1.000:. ./.:4:441,1:.: 0.19:1.000:. ./.:5:488,133:.: 2.33:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:349,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:169,0:.:-3.06:1.000:. ./.:4:230,64:.:-1.57:1.000:. ./.:3:77,32:.:-3.78:1.000:. ./.:4:343,109:.: 0.31:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:336,108:.: 0.22:1.000:. ./.:4:433,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:468,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:463,1:.: 0.45:1.000:. ./.:4:374,121:.: 0.82:1.000:. ./.:4:325,116:.: 0.18:1.000:. ./.:4:522,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:366,139:.: 0.94:1.000:. ./.:5:593,1:.: 2.01:1.000:. ./.:4:159,45:.:-2.65:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:343,105:.: 0.26:1.000:. ./.:4:365,133:.: 0.86:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:538,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:405,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:481,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:452,0:.: 0.31:1.000:. ./.:6:354,119:.: 0.56:1.000:. ./.:4:398,155:.: 1.52:1.000:. ./.:4:442,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:415,153:.: 1.70:1.000:. ./.:4:305,120:.:-0.01:1.000:. ./.:4:348,122:.: 0.53:1.000:. ./.:4:453,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:200,73:.:-1.82:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:381,130:.: 1.02:0.887:. ./.:4:267,89:.:-0.83:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:294,0:.:-1.57:0.999:. ./.:4:218,263:.: 0.66:1.000:. ./.:4:349,111:.: 0.41:1.000:. ./.:4:362,139:.: 0.90:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:315,120:.: 0.11:1.000:. ./.:4:446,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:467,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:381,117:.: 0.86:1.000:. ./.:4:277,99:.:-0.59:0.915:. ./.:4:338,123:.: 0.42:1.000:. ./.:4:404,132:.: 1.31:1.000:. ./.:4:246,81:.:-1.18:1.000:. ./.:4:382,128:.: 1.00:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:401,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:326,120:.: 0.24:1.000:. ./.:4:391,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:416,150:.: 1.67:1.000:. ./.:4:247,61:.:-1.41:1.000:. ./.:4:548,1:.: 1.47:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:470,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:332,111:.: 0.20:1.000:. ./.:4:294,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:364,121:.: 0.71:1.000:. ./.:4:347,1:.:-0.93:1.000:. ./.:4:465,0:.: 0.47:0.998:. ./.:4:287,106:.:-0.39:1.000:. ./.:4:388,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:432,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:443,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:575,2:.: 1.80:0.993:. ./.:4:424,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:411,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:387,130:.: 1.09:1.000:. ./.:4:461,0:.: 0.42:0.999:. ./.:4:359,140:.: 0.87:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:411,112:.: 1.16:1.000:. ./.:4:407,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:298,103:.:-0.30:1.000:. ./.:4:417,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:406,1:.:-0.22:1.000:. ./.:4:323,132:.: 0.35:1.000:. ./.:4:437,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:446,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:347,105:.: 0.31:1.000:. ./.:4:354,151:.: 0.94:1.000:. ./.:4:420,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:366,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:235,104:.:-1.04:1.000:. ./.:4:361,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:329,142:.: 0.54:1.000:. ./.:4:441,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:292,1:.:-1.58:0.998:. ./.:4:360,126:.: 0.72:1.000:. ./.:4:330,111:.: 0.18:1.000:. ./.:4:446,148:.: 2.01:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:385,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:318,95:.:-0.15:1.000:. ./.:4:474,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:310,107:.:-0.11:1.000:. ./.:4:299,85:.:-0.50:1.000:. ./.:4:352,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:554,1:.: 1.54:1.000:. ./.:4:411,137:.: 1.46:1.000:. ./.:4:393,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:328,114:.: 0.19:1.000:. ./.:4:504,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:301,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:466,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:396,2:.:-0.33:1.000:. ./.:4:169,61:.:-2.34:1.000:. ./.:4:364,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:451,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:430,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:336,121:.: 0.37:1.000:. ./.:4:363,113:.: 0.60:1.000:. ./.:4:261,100:.:-0.77:1.000:. ./.:4:491,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:267,99:.:-0.71:1.000:. ./.:4:257,95:.:-0.88:1.000:. ./.:4:384,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:445,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:444,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:358,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:421,1:.:-0.05:0.997:. ./.:4:301,119:.:-0.07:1.000:. ./.:4:291,105:.:-0.36:1.000:. ./.:4:248,90:.:-1.05:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:323,89:.:-0.17:1.000:. ./.:4:321,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:271,77:.:-0.93:1.000:. ./.:4:386,120:.: 0.96:1.000:. ./.:4:348,112:.: 0.41:1.000:. ./.:4:435,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:315,92:.:-0.22:1.000:. ./.:4:328,108:.: 0.12:0.956:. ./.:4:581,1:.: 1.86:1.000:. ./.:4:386,143:.: 1.23:1.000:. ./.:4:342,2:.:-0.98:1.000:. ./.:4:321,118:.: 0.16:1.000:. -chr8.1 67145688 chr8.1_067145688 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:19,68:0.74: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,57:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:63,25:0.26: 0.42:1.000:0.999 0/0/0/1:4:76,40:0.33: 1.64:1.000:0.927 0/0/0/0:4:71,4:0.05:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,11:0.49:-2.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,33:0.30: 1.07:1.000:0.985 0/0/0/1:4:51,27:0.33:-0.01:1.000:0.920 0/0/0/1:4:14,2:0.11:-2.70:1.000:0.554 0/0/1/1:4:9,14:0.60:-2.40:1.000:0.809 0/0/0/1:4:55,20:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,49:0.54: 0.60:1.000:0.990 0/0/1/1:4:31,31:0.51:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:63,33:0.33: 0.77:1.000:0.931 0/0/1/1:4:54,38:0.41: 0.60:1.000:0.860 0/0/1/1:4:49,36:0.42: 0.29:0.999:0.921 0/1/1/1:4:19,50:0.69:-0.40:1.000:0.978 0/0/1/1:4:56,37:0.39: 0.64:1.000:0.707 0/1/1/1:4:36,72:0.65: 1.29:1.000:0.748 0/1/1/1:4:6,15:0.68:-2.48:1.000:0.964 0/0/0/0:4:77,4:0.04: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,19:0.27:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:4,7:0.62:-2.92:1.000:0.563 0/0/1/1:4:44,70:0.60: 1.55:1.000:0.772 0/1/1/1:4:18,85:0.78: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,3:0.04:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:39,41:0.52: 0.08:1.000:0.680 0/0/1/1:4:50,76:0.59: 2.07:1.000:0.843 0/0/1/1:4:41,36:0.47:-0.05:1.000:0.993 0/0/0/0:4:57,6:0.09:-0.66:1.000:0.972 0/0/0/1:4:6,2:0.22:-3.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,8:0.25:-2.14:1.000:0.999 0/0/1:3:4,1:0.18:-3.18:1.000:0.988 0/0/0/1:4:47,26:0.34:-0.23:1.000:0.856 0/0/1/1:4:31,52:0.61: 0.21:1.000:0.664 0/0/0/0:4:76,5:0.06: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,42:0.45: 0.68:1.000:0.979 0/0/0/1:4:70,30:0.28: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:30,33:0.53:-0.66:1.000:0.993 0/0/1/1:4:49,32:0.39: 0.12:1.000:0.669 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:60,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:75,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,42:0.40: 1.12:1.000:0.777 0/0/0/1/1:5:48,41:0.47: 0.47:1.000:0.797 0/0/0/0:4:34,0:0.00:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,29:0.28: 0.77:1.000:0.996 0/0/0/0:4:56,4:0.06:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,24:0.41:-0.88:1.000:0.866 0/0/0/0:4:90,5:0.05: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:47,26:0.34:-0.23:1.000:0.856 0/0/1/1:4:38,27:0.41:-0.57:1.000:0.876 0/0/0/1:4:57,30:0.33: 0.38:1.000:0.927 0/0/1/1:4:63,43:0.40: 1.20:1.000:0.796 0/0/1/1:4:41,34:0.46:-0.14:1.000:0.986 0/1/1/1:4:26,70:0.70: 0.77:1.000:0.982 0/0/1/1:4:54,36:0.39: 0.51:1.000:0.734 0/0/0/0/1/1:6:40,17:0.27:-0.92:1.000:0.713 0/0/1/1:4:39,35:0.48:-0.18:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,63:0.60: 1.07:1.000:0.789 0/0/0/1:4:48,29:0.37:-0.05:1.000:0.612 0/0/0/1:4:66,24:0.24: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,28:0.27: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,64:0.57: 1.46:1.000:0.953 0/0/1/1:4:10,16:0.60:-2.27:1.000:0.761 0/1/1/1:4:24,71:0.71: 0.73:1.000:0.993 0/0/0/1:4:58,27:0.30: 0.29:0.887:0.988 0/0/1/1:4:28,46:0.61:-0.18:1.000:0.709 0/0/1/1:4:39,39:0.51:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,9:0.30:-2.18:0.999:0.984 0/0/0/1:4:60,26:0.28: 0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:79,40:0.32: 1.77:1.000:0.958 0/0/0/1:4:60,25:0.27: 0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,29:0.40:-0.31:1.000:0.823 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,28:0.27: 0.73:1.000:0.998 0/0/0/0:4:102,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,8:0.09:-0.01:1.000:0.927 0/0/0/1:4:53,20:0.25:-0.23:0.915:0.999 0/0/0/1:4:75,26:0.23: 0.99:1.000:1.000 0/0/0/0:4:79,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:60,23:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:45,28:0.37:-0.23:1.000:0.504 0/0/0/1:4:53,31:0.36: 0.25:1.000:0.720 0/0/1/1:4:31,28:0.48:-0.83:1.000:0.995 0/1/1/1:4:14,40:0.71:-1.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:35,36:0.51:-0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:41,28:0.40:-0.40:1.000:0.798 0/0/1/1:4:26,23:0.48:-1.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,45:0.67:-0.57:1.000:0.905 0/0/0/0:4:105,12:0.09: 1.68:1.000:0.927 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,78:0.60: 2.16:1.000:0.805 0/0/1/1:4:38,57:0.59: 0.73:1.000:0.860 0/1/1/1:4:18,53:0.71:-0.31:1.000:0.992 0/0/0/1:4:64,25:0.25: 0.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,79:0.80: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,35:0.46:-0.05:1.000:0.987 0/1/1/1:4:7,27:0.75:-1.92:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,64:0.74: 0.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:46,7:0.12:-1.09:1.000:0.730 0/0/1/1:4:30,43:0.58:-0.23:0.998:0.907 0/0/0/0:4:56,3:0.05:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,56:0.56: 0.90:1.000:0.963 0/0/1/1:4:46,58:0.56: 1.12:1.000:0.973 0/0/1/1:4:41,31:0.43:-0.27:1.000:0.947 0/1/1/1:4:18,77:0.77: 0.73:0.993:1.000 0/0/1/1:4:55,52:0.50: 1.25:1.000:0.997 0/0/0/1:4:60,29:0.31: 0.47:1.000:0.979 0/0/0/0:4:114,0:0.00: 1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,24:0.24: 0.42:0.999:1.000 0/0/0/1:4:62,31:0.31: 0.64:1.000:0.965 0/0/1/1:4:35,42:0.55:-0.05:1.000:0.984 0/0/0/1:4:65,35:0.33: 0.94:1.000:0.899 0/0/0/1:4:26,7:0.19:-1.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,23:0.29:-0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:37,38:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:66,28:0.27: 0.68:1.000:0.997 0/0/1/1:4:38,34:0.48:-0.27:1.000:0.995 0/0/1/1:4:32,45:0.58:-0.05:1.000:0.922 0/0/1/1:4:46,45:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,37:0.38: 0.77:1.000:0.525 0/0/0/1:4:69,26:0.25: 0.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,44:0.53: 0.21:1.000:0.991 0/0/0/1:4:48,26:0.34:-0.18:1.000:0.891 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/0:4:50,6:0.10:-0.96:1.000:0.874 0/0/0/1:4:42,20:0.30:-0.70:1.000:0.983 0/0/0/1:4:55,22:0.26:-0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,72:0.56: 2.20:1.000:0.973 0/1/1/1:4:19,44:0.67:-0.66:0.998:0.927 0/0/0/1:4:70,30:0.28: 0.94:1.000:0.997 0/0/1/1:4:46,36:0.44: 0.16:1.000:0.967 0/0/1/1:4:52,61:0.54: 1.51:1.000:0.987 0/0/0/1:4:62,38:0.37: 0.94:1.000:0.560 0/0/0/1:4:55,18:0.22:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,26:0.37:-0.44:1.000:0.523 0/0/0/1:4:57,22:0.25: 0.03:1.000:0.999 0/0/1/1:4:34,53:0.60: 0.38:1.000:0.806 0/0/0/1:4:41,22:0.33:-0.66:1.000:0.904 0/1/1/1:4:24,48:0.65:-0.27:1.000:0.748 0/0/1/1:4:23,34:0.59:-0.92:1.000:0.877 0/0/1/1:4:54,52:0.50: 1.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:39,48:0.55: 0.38:1.000:0.979 0/0/0/1:4:68,24:0.23: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:67,2:0.03:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,73:0.57: 2.07:1.000:0.936 0/0/1/1:4:52,35:0.40: 0.38:1.000:0.760 0/0/1/1:4:42,35:0.46:-0.05:1.000:0.987 0/0/0/1:4:60,35:0.36: 0.73:1.000:0.728 0/1/1/1:4:2,7:0.74:-3.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:32,35:0.53:-0.49:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,41:0.44: 0.68:1.000:0.961 0/0/1/1:4:40,39:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:57,33:0.35: 0.51:1.000:0.750 0/0/1/1:4:42,28:0.39:-0.36:1.000:0.734 0/0/0/1:4:48,22:0.29:-0.36:1.000:0.991 0/1/1/1:4:18,60:0.73:-0.01:1.000:0.998 0/0/0/1:4:47,29:0.37:-0.10:1.000:0.535 0/0/0/0:4:61,2:0.03:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,42:0.56:-0.14:1.000:0.970 0/0/1/1:4:39,33:0.46:-0.27:1.000:0.989 0/0/1/1:4:43,32:0.43:-0.14:1.000:0.934 0/0/1/1:4:49,35:0.41: 0.25:1.000:0.885 0/0/1/1:4:32,20:0.38:-1.14:1.000:0.513 0/0/0/0:4:81,0:0.00: 0.12:0.997:1.000 0/0/1/1:4:35,43:0.55:-0.01:1.000:0.979 0/0/0/0:4:47,4:0.07:-1.18:1.000:0.998 0/0/1/1:4:41,31:0.43:-0.27:1.000:0.947 0/1/1/1:4:14,62:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,47:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:56,32:0.35: 0.42:1.000:0.785 0/0/1/1:4:29,27:0.49:-0.96:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,30:0.45:-0.49:1.000:0.980 0/0/0/0:4:71,2:0.02:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,65:0.59: 1.33:1.000:0.878 0/0/1/1:4:44,35:0.44: 0.03:1.000:0.974 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.05:0.956:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00: 0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,43:0.45: 0.77:1.000:0.980 0/0/1/1:4:24,28:0.54:-1.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:72,28:0.25: 0.94:1.000:0.999 -chr8.1 67275512 chr8.1_067275512 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:220,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:220,2:.: 0.70:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.13:1.000:. ./.:4:15,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:302,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:360,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.82:0.999:. ./.:4:191,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.18:1.000:. ./.:4:224,2:.: 0.76:1.000:. ./.:4:168,2:.: 0.00:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.14:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:231,2:.: 0.85:1.000:. ./.:5:265,2:.: 1.31:1.000:. ./.:4:3,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:4,0:.:-2.22:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.97:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.21:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:282,6:.: 1.59:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:172,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:180,3:.: 0.18:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.29:1.000:. ./.:5:333,4:.: 2.24:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:257,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:142,2:.:-0.34:1.000:. ./.:6:109,5:.:-0.75:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:212,2:.: 0.59:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.84:0.887:. ./.:4:122,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.24:0.999:. ./.:4:62,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:171,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:127,2:.:-0.54:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.40:0.915:. ./.:4:152,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:165,2:.:-0.04:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:174,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:102,2:.:-0.88:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:125,4:.:-0.54:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:106,2:.:-0.83:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.05:0.998:. ./.:4:113,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:155,1:.:-0.18:1.000:. ./.:4:292,1:.: 1.65:1.000:. ./.:4:301,0:.: 1.76:0.993:. ./.:4:173,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.18:0.999:. ./.:4:191,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:95,5:.:-0.93:1.000:. ./.:4:296,3:.: 1.73:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:292,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.92:0.998:. ./.:4:107,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:374,0:.: 2.74:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:130,2:.:-0.50:1.000:. ./.:4:135,4:.:-0.41:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:348,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:229,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:55,2:.:-1.51:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:300,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:8,0:.:-2.17:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:234,2:.: 0.89:1.000:. ./.:4:339,0:.: 2.27:1.000:. ./.:4:142,2:.:-0.34:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:129,3:.:-0.50:1.000:. ./.:4:233,5:.: 0.92:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:334,3:.: 2.24:1.000:. ./.:4:274,2:.: 1.43:1.000:. ./.:4:251,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.20:0.997:. ./.:4:154,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:140,2:.:-0.37:1.000:. ./.:4:141,2:.:-0.36:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:269,4:.: 1.39:1.000:. ./.:4:208,4:.: 0.57:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:190,2:.: 0.30:0.956:. ./.:4:202,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:132,2:.:-0.48:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.63:1.000:. -chr8.1 67325128 chr8.1_067325128 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:183,55:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:143,58:0.30: 0.02:1.000:0.986 0/0/0/1:4:155,42:0.22:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:173,63:0.28: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:122,126:0.51: 0.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:218,81:0.28: 2.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:117,34:0.24:-1.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,52:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,94:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:53,65:0.55:-1.67:1.000:0.979 0/0/1/1:4:42,48:0.54:-2.24:1.000:0.990 0/0/0/1:4:214,53:0.21: 1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,143:0.71:-0.10:1.000:0.991 0/0/0/1:4:172,69:0.30: 0.84:1.000:0.988 0/1/1/1:4:45,160:0.75: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:209,56:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,70:0.27: 1.47:0.999:0.998 0/1/1/1:4:42,180:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,158:0.55: 1.81:1.000:0.982 0/0/0/1:4:204,58:0.23: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,29:0.30:-2.03:1.000:0.985 0/0/0/1:4:162,53:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:172,59:0.27: 0.63:1.000:0.998 0/0/1/1:4:116,124:0.52: 0.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:49,48:0.50:-2.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:190,58:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,61:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,100:0.45: 0.59:1.000:0.975 0/0/0/0/0:5:331,0:0.00: 2.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,141:0.52: 1.53:1.000:0.995 0/0/0/1:4:191,76:0.29: 1.37:1.000:0.989 0/0/1/1:4:106,101:0.50: 0.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:42,26:0.39:-2.68:1.000:0.709 0/0/1/1:4:47,56:0.54:-1.97:1.000:0.984 0/0/1:3:35,20:0.37:-2.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,52:0.22: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,123:0.51: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,59:0.28: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:193,58:0.24: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:136,127:0.49: 1.28:1.000:0.996 0/0/0/1:4:131,49:0.28:-0.41:1.000:0.995 0/0/0/1:4:177,40:0.19: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:218,0:0.00: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,83:0.52:-0.81:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,95:0.54:-0.49:1.000:0.987 0/0/0/1:4:151,62:0.30: 0.27:1.000:0.984 0/0/1/1/1:5:140,200:0.58: 2.85:1.000:0.961 0/0/0/1:4:147,40:0.22:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,99:0.49: 0.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,146:0.55: 1.32:1.000:0.979 0/0/1/1:4:90,85:0.49:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,137:0.51: 1.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,126:0.70:-0.55:1.000:0.989 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,50:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:166,59:0.27: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:138,49:0.27:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,107:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,86:0.49:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/0/0/1:6:120,31:0.21:-1.00:1.000:0.851 0/0/0/1:4:124,29:0.20:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,132:0.66:-0.10:1.000:0.871 0/1/1/1:4:64,166:0.70: 0.61:1.000:0.984 0/0/0/1:4:152,43:0.23:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,110:0.49: 0.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,86:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:100,42:0.31:-1.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:108,99:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:130,40:0.25:-0.61:0.887:0.999 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,111:0.50: 0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:130,40:0.25:-0.61:0.999:0.999 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,53:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,68:0.43:-0.77:1.000:0.943 0/0/0/1:4:132,31:0.20:-0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,100:0.56:-0.43:1.000:0.971 0/0/1/1:4:90,98:0.53:-0.24:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,88:0.46:-0.10:1.000:0.987 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,73:0.49:-0.98:0.915:0.996 0/0/0/1:4:160,47:0.24: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,101:0.48: 0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:44,138:0.73:-0.36:1.000:0.998 0/0/1/1:4:102,106:0.52: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,87:0.45:-0.02:1.000:0.975 0/1/1/1:4:39,96:0.69:-1.32:1.000:0.973 0/0/1/1:4:67,67:0.51:-1.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,133:0.70:-0.30:1.000:0.982 0/0/1/1:4:88,85:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:82,79:0.50:-0.79:1.000:0.997 0/0/0/1:4:148,50:0.26:-0.04:1.000:0.998 0/0/1/1:4:107,94:0.48: 0.02:1.000:0.994 0/0/0/1:4:120,41:0.27:-0.79:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,110:0.56:-0.04:1.000:0.974 0/0/1/1:4:102,98:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,63:0.46:-1.24:1.000:0.989 0/0/0/1:4:134,43:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:120,54:0.32:-0.53:1.000:0.953 0/0/0/1:4:203,64:0.25: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,76:0.53:-1.14:1.000:0.992 0/0/0/1:4:136,31:0.19:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,68:0.49:-1.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:150,34:0.19:-0.32:0.998:1.000 0/0/1/1:4:78,65:0.46:-1.16:1.000:0.989 0/1/1/1:4:43,140:0.74:-0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,120:0.80:-1.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,93:0.46: 0.12:1.000:0.988 0/0/0/1:4:190,54:0.23: 0.90:0.993:1.000 0/0/0/1:4:144,62:0.31: 0.12:1.000:0.972 0/0/0/1:4:118,35:0.24:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/1:4:247,67:0.22: 2.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,30:0.19:-0.79:0.999:1.000 0/0/1/1:4:110,101:0.49: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,62:0.44:-1.12:1.000:0.961 0/0/1/1:4:96,102:0.52:-0.04:1.000:0.995 0/0/1/1:4:89,82:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:49,119:0.69:-0.65:1.000:0.969 0/0/1/1:4:102,91:0.48:-0.14:1.000:0.995 0/1/1/1:4:38,105:0.71:-1.16:1.000:0.992 0/0/0/0:4:196,0:0.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,85:0.64:-1.44:1.000:0.740 0/0/0/1:4:167,49:0.24: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,99:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:131,45:0.27:-0.49:1.000:0.998 0/0/1/1:4:95,92:0.50:-0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,86:0.49:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,68:0.48:-1.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:94,45:0.33:-1.24:1.000:0.905 0/0/0/1:4:94,22:0.20:-1.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,84:0.52:-0.73:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,101:0.48: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/1:4:92,27:0.24:-1.65:0.998:1.000 0/0/0/1:4:152,54:0.27: 0.12:1.000:0.997 0/0/0/1:4:140,44:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:144,133:0.49: 1.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:91,100:0.53:-0.18:1.000:0.993 0/0/0/1:4:109,41:0.28:-1.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:87,73:0.46:-0.81:1.000:0.990 0/1/1/1:4:46,131:0.72:-0.47:1.000:0.994 0/0/1/1:4:107,95:0.48: 0.04:1.000:0.995 0/1/1/1:4:44,133:0.72:-0.47:1.000:0.997 0/0/1/1:4:99,92:0.49:-0.18:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,31:0.23:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,114:0.48: 0.90:1.000:0.994 0/0/0/1:4:189,65:0.27: 1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,102:0.47: 0.41:1.000:0.993 0/0/0/1:4:155,59:0.29: 0.29:1.000:0.994 0/0/1/1:4:105,134:0.56: 0.80:1.000:0.968 0/0/1/1:4:99,89:0.48:-0.24:1.000:0.995 0/0/0/0:4:270,0:0.00: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,63:0.29: 0.49:1.000:0.991 0/0/1/1:4:32,31:0.50:-2.79:1.000:0.997 0/0/1/1:4:79,80:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/0/0:4:255,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,108:0.47: 0.65:1.000:0.993 0/0/1/1:4:154,119:0.44: 1.49:1.000:0.974 0/0/0/1:4:196,55:0.23: 1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,129:0.71:-0.47:1.000:0.989 0/0/0/1:4:175,54:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,62:0.31: 0.12:1.000:0.972 0/0/0/1:4:144,51:0.27:-0.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:59,166:0.71: 0.51:1.000:0.993 0/0/0/0:4:219,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,48:0.20: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:170,59:0.27: 0.59:1.000:0.998 0/0/0/1:4:153,58:0.29: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,104:0.51: 0.10:0.997:0.996 0/0/0/1:4:134,59:0.32:-0.14:1.000:0.963 0/0/0/1:4:139,42:0.24:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,49:0.31:-0.69:1.000:0.980 0/0/0/1:4:142,43:0.24:-0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,98:0.48: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/0:4:204,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,42:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,84:0.51:-0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,192:0.53: 3.28:1.000:0.990 0/0/1/1:4:118,141:0.55: 1.20:1.000:0.984 0/0/0/1:4:155,57:0.28: 0.25:1.000:0.996 0/0/1/1:4:99,76:0.44:-0.51:1.000:0.971 0/0/1/1:4:141,117:0.46: 1.18:0.956:0.989 0/0/1/1:4:133,124:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:214,73:0.27: 1.77:1.000:0.998 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,49:0.24: 0.33:1.000:1.000 -chr8.1 67451131 chr8.1_067451131 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:82,135:0.59: 2.17:1.000:0.837 0/0/1/1:4:100,44:0.38: 0.51:1.000:0.563 0/1/1/1:4:15,177:0.84: 1.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:87,54:0.43: 0.44:1.000:0.940 0/0/1/1:4:71,137:0.62: 1.96:1.000:0.539 0/0/1/1:4:48,61:0.55:-0.29:1.000:0.983 0/1/1/1:4:16,57:0.72:-1.11:1.000:0.994 0/1/1/1:4:20,113:0.77: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,48:0.44:-0.02:1.000:0.960 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-2.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,35:0.86:-1.93:1.000:0.964 0/0/1/1:4:120,100:0.47: 2.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:21,97:0.75:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:37,49:0.55:-0.82:1.000:0.976 0/0/1/1:4:73,45:0.43:-0.09:1.000:0.937 0/1/1/1:4:23,94:0.73:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:76,53:0.44: 0.16:0.999:0.974 0/1/1/1:4:12,201:0.86: 2.08:1.000:0.971 0/0/1/1:4:105,86:0.47: 1.58:1.000:0.992 0/0/1/1:4:81,132:0.59: 2.08:1.000:0.849 0/1/1/1:4:6,26:0.74:-2.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:79,55:0.44: 0.28:1.000:0.974 0/0/1/1:4:84,58:0.44: 0.46:1.000:0.972 0/0/1/1:4:71,54:0.46: 0.07:1.000:0.986 0/1/1/1:4:5,10:0.63:-2.44:1.000:0.544 0/1/1/1:4:17,175:0.83: 1.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:67,108:0.59: 1.21:1.000:0.862 0/0/1/1:4:36,52:0.57:-0.77:1.000:0.946 0/0/0/1/1:5:103,63:0.43: 1.01:1.000:0.949 0/1/1/1:4:12,145:0.84: 0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,114:0.80: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,37:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:8,6:0.46:-2.46:1.000:0.985 0/1/1/1:4:12,36:0.69:-1.68:1.000:0.977 0/0/1:3:9,6:0.44:-2.44:1.000:0.985 0/0/1/1:4:69,127:0.61: 1.69:1.000:0.644 0/1/1/1:4:23,117:0.76: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,56:0.45: 0.32:1.000:0.975 0/1/1/1:4:20,98:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,104:0.76: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,105:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:15,117:0.81: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,63:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,75:0.70:-0.54:1.000:0.989 0/0/1/1:4:79,58:0.45: 0.35:1.000:0.982 0/0/1/1/1:5:41,127:0.70: 1.05:1.000:0.520 0/0/1/1:4:11,15:0.56:-2.18:1.000:0.968 0/0/1/1:4:24,39:0.59:-1.34:1.000:0.853 0/1/1/1:4:10,32:0.70:-1.82:1.000:0.987 0/0/1/1:4:64,36:0.41:-0.50:1.000:0.883 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,81:0.77:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,97:0.74:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,110:0.76: 0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,107:0.74: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,54:0.53:-0.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:17,106:0.78: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,92:0.73:-0.16:1.000:0.998 0/0/0/1/1/1:6:52,39:0.46:-0.70:1.000:0.776 0/0/1/1:4:73,45:0.43:-0.09:1.000:0.937 0/1/1/1:4:24,111:0.75: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,41:0.40:-0.02:1.000:0.792 0/0/1/1:4:59,37:0.43:-0.59:1.000:0.944 0/0/1/1:4:79,54:0.44: 0.25:1.000:0.970 0/1/1/1:4:22,107:0.75: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,52:0.63:-1.00:1.000:0.544 0/1/1/1:4:30,94:0.70: 0.05:1.000:0.984 0/0/1/1:4:61,95:0.58: 0.78:0.887:0.896 0/1/1/1:4:40,156:0.73: 1.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:36,50:0.56:-0.82:1.000:0.962 0/1/1/1:4:13,39:0.69:-1.59:0.999:0.977 0/0/1/1:4:85,121:0.57: 1.92:1.000:0.953 0/0/1/1:4:75,77:0.51: 0.69:1.000:0.997 0/0/1/1:4:87,47:0.41: 0.28:1.000:0.848 0/1/1/1:4:15,93:0.78:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,98:0.79:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:50,60:0.54:-0.27:1.000:0.990 0/0/1/1:4:85,41:0.39: 0.09:1.000:0.711 0/0/1/1:4:44,32:0.45:-1.04:0.915:0.981 0/0/1/1:4:72,55:0.46: 0.12:1.000:0.987 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,39:0.37: 0.35:1.000:0.608 0/0/1/1:4:50,97:0.62: 0.57:1.000:0.526 0/0/1/1:4:46,48:0.51:-0.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,87:0.74:-0.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,77:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:34,100:0.69: 0.28:1.000:0.973 0/0/1/1:4:79,52:0.44: 0.21:1.000:0.960 0/1/1/1:4:13,82:0.79:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,133:0.82: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,49:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,147:0.86: 0.76:1.000:0.955 0/1/1/1:4:9,138:0.85: 0.57:1.000:0.981 0/1/1/1:4:19,76:0.73:-0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,105:0.87:-0.27:1.000:0.921 0/1/1/1:4:9,161:0.86: 1.10:1.000:0.960 0/0/1/1:4:58,108:0.62: 1.01:1.000:0.619 0/1/1/1:4:11,52:0.75:-1.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,99:0.57: 1.01:1.000:0.934 0/0/1/1:4:23,29:0.54:-1.59:1.000:0.985 0/1/1/1:4:26,89:0.71:-0.16:0.998:0.992 0/0/0/0:4:54,0:0.00:-1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,102:0.72: 0.19:1.000:0.995 0/1/1/1:4:13,87:0.79:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,52:0.60:-0.91:1.000:0.760 0/1/1/1:4:13,193:0.85: 1.92:0.993:0.984 0/1/1/1:4:25,98:0.73: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:20,104:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,58:0.41: 0.94:1.000:0.868 0/1/1/1:4:25,104:0.74: 0.16:0.999:0.998 0/0/1/1:4:63,99:0.59: 0.92:1.000:0.888 0/1/1/1:4:9,76:0.81:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,50:0.43: 0.19:1.000:0.943 0/0/1/1:4:33,30:0.49:-1.34:1.000:0.996 0/0/1/1:4:60,39:0.43:-0.52:1.000:0.957 0/0/1/1:4:30,41:0.56:-1.16:1.000:0.968 0/1/1/1:4:25,90:0.72:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:75,60:0.47: 0.30:1.000:0.990 0/1/1/1:4:17,79:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,56:0.55:-0.52:1.000:0.979 0/1/1/1:4:39,119:0.70: 0.82:1.000:0.980 0/0/1/1:4:57,102:0.61: 0.85:1.000:0.701 0/0/1/1:4:70,103:0.57: 1.17:1.000:0.937 0/1/1/1:4:19,102:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,90:0.79:-0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,43:0.50:-0.84:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,37:0.65:-1.57:1.000:0.816 0/0/1/1:4:51,93:0.61: 0.51:1.000:0.663 0/1/1/1:4:12,167:0.85: 1.30:1.000:0.989 0/1/1/1:4:6,96:0.86:-0.45:0.998:0.977 0/1/1/1:4:52,107:0.63: 0.85:1.000:0.607 0/0/1/1:4:62,38:0.43:-0.50:1.000:0.934 0/0/1/1:4:81,148:0.61: 2.44:1.000:0.659 0/1/1/1:4:24,60:0.67:-0.86:1.000:0.899 0/1/1/1:4:17,92:0.77:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,96:0.79:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,41:0.45:-0.59:1.000:0.984 0/1/1/1:4:16,93:0.78:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:69,41:0.42:-0.27:1.000:0.919 0/0/1/1:4:74,114:0.58: 1.51:1.000:0.905 0/1/1/1:4:14,38:0.68:-1.59:1.000:0.948 0/1/1/1:4:31,131:0.74: 0.92:1.000:0.999 0/0/1/1:4:101,60:0.42: 0.89:1.000:0.918 0/0/1/1:4:44,62:0.57:-0.36:1.000:0.957 0/0/0/0:4:95,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,122:0.75: 0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,48:0.43: 0.07:1.000:0.942 0/1/1/1:4:36,129:0.72: 0.98:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,120:0.75: 0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:10,19:0.62:-2.12:1.000:0.574 0/1/1/1:4:20,92:0.75:-0.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:22,112:0.76: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,58:0.62:-0.75:1.000:0.608 0/0/1/1:4:85,135:0.59: 2.24:1.000:0.878 0/0/1/1:4:79,114:0.57: 1.62:1.000:0.947 0/0/0/1:4:88,33:0.36:-0.02:1.000:0.698 0/1/1/1:4:21,168:0.81: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,56:0.51:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/0:4:82,1:0.03:-0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,96:0.72: 0.03:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,118:0.72: 0.66:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,106:0.77: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,112:0.71: 0.53:1.000:0.992 0/1/1/1:4:19,72:0.72:-0.70:1.000:0.997 0/1/1/1:4:17,84:0.76:-0.48:0.997:1.000 0/0/1/1:4:66,116:0.61: 1.37:1.000:0.735 0/0/1/1:4:86,56:0.43: 0.46:1.000:0.957 0/0/1/1:4:60,54:0.48:-0.18:1.000:0.996 0/1/1/1:4:10,110:0.83:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:25,108:0.74: 0.25:1.000:0.999 0/0/1/1:4:68,51:0.46:-0.06:1.000:0.985 0/0/1/1:4:32,39:0.54:-1.16:1.000:0.989 0/0/1/1:4:63,31:0.39:-0.63:1.000:0.740 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,94:0.57: 0.85:1.000:0.946 0/0/1/1:4:63,59:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,21:0.30:-0.13:1.000:0.983 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-0.20:0.956:1.000 0/0/1/1:4:34,65:0.62:-0.52:1.000:0.560 0/1/1/1:4:64,151:0.66: 2.12:1.000:0.842 0/1/1/1:4:20,103:0.76: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,102:0.54: 1.42:1.000:0.986 -chr8.1 67576904 chr8.1_067576904 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:166,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:49,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:33,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.87:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.52:0.999:. ./.:4:127,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:173,0:.: 2.13:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:141,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:93,1:.:-0.58:1.000:. ./.:4:23,0:.:-3.01:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:114,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:5:160,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.50:1.000:. ./.:3:15,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.11:1.000:. ./.:5:185,0:.: 2.54:1.000:. ./.:4:31,0:.:-2.74:1.000:. ./.:4:71,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:170,0:.: 2.03:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.25:1.000:. ./.:6:105,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.11:0.887:. ./.:4:94,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.23:0.999:. ./.:4:130,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:157,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.54:0.915:. ./.:4:103,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:75,0:.:-1.23:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.35:0.998:. ./.:4:87,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:159,0:.: 1.65:0.993:. ./.:4:112,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:99,0:.:-0.41:0.999:. ./.:4:104,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:114,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:81,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:131,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:126,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:88,1:.:-0.75:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.95:0.998:. ./.:4:113,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:142,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:115,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:26,0:.:-2.91:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:149,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:123,0:.: 0.42:0.997:. ./.:4:110,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:97,1:.:-0.44:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:145,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.21:0.956:. ./.:4:137,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:162,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.76:1.000:. -chr8.1 67743899 chr8.1_067743899 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,194:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.79:1.000:. ./.:4:40,98:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,129:.: 1.04:1.000:. ./.:4:17,46:.:-2.14:1.000:. ./.:4:50,94:.: 0.12:1.000:. ./.:4:29,119:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,27:.:-3.15:1.000:. ./.:4:13,25:.:-2.84:1.000:. ./.:4:0,157:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.29:1.000:. ./.:4:35,90:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,153:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.93:0.999:. ./.:4:0,197:.: 1.60:1.000:. ./.:4:48,128:.: 1.02:1.000:. ./.:4:36,112:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,37:.:-2.87:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.13:1.000:. ./.:4:36,107:.: 0.09:1.000:. ./.:4:27,78:.:-0.97:1.000:. ./.:4:2,14:.:-3.45:1.000:. ./.:4:44,110:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.29:1.000:. ./.:5:33,178:.: 1.99:1.000:. ./.:4:0,156:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,14:.:-3.51:1.000:. ./.:4:2,38:.:-2.78:1.000:. ./.:3:9,14:.:-3.26:1.000:. ./.:4:31,128:.: 0.54:1.000:. ./.:4:54,113:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.09:1.000:. ./.:4:38,116:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.76:1.000:. ./.:4:43,116:.: 0.54:1.000:. ./.:4:41,105:.: 0.18:1.000:. ./.:4:43,118:.: 0.60:1.000:. ./.:4:49,125:.: 0.96:1.000:. ./.:5:0,213:.: 2.05:1.000:. ./.:4:25,96:.:-0.52:1.000:. ./.:4:40,114:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,97:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.68:1.000:. ./.:4:39,140:.: 1.10:1.000:. ./.:4:36,115:.: 0.32:1.000:. ./.:4:46,109:.: 0.43:1.000:. ./.:4:36,117:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,168:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,161:.: 0.60:1.000:. ./.:6:16,129:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,150:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,147:.: 0.21:1.000:. ./.:4:34,99:.:-0.19:1.000:. ./.:4:42,115:.: 0.48:1.000:. ./.:4:38,114:.: 0.34:1.000:. ./.:4:16,39:.:-2.36:1.000:. ./.:4:0,170:.: 0.85:1.000:. ./.:4:38,111:.: 0.26:0.887:. ./.:4:0,169:.: 0.82:1.000:. ./.:4:1,146:.: 0.21:1.000:. ./.:4:24,61:.:-1.53:0.999:. ./.:4:1,131:.:-0.21:1.000:. ./.:4:45,108:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.19:1.000:. ./.:4:31,100:.:-0.24:1.000:. ./.:4:25,111:.:-0.10:1.000:. ./.:4:36,104:.: 0.01:1.000:. ./.:4:47,132:.: 1.10:1.000:. ./.:4:41,118:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.01:0.915:. ./.:4:45,108:.: 0.37:1.000:. ./.:4:54,109:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,111:.:-0.80:1.000:. ./.:4:35,114:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,180:.: 1.13:1.000:. ./.:4:27,63:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.65:1.000:. ./.:4:31,91:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,130:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,127:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,115:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,185:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,121:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,49:.:-2.53:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.32:0.998:. ./.:4:0,113:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,139:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,201:.: 1.71:0.993:. ./.:4:0,174:.: 0.96:1.000:. ./.:4:47,132:.: 1.10:1.000:. ./.:4:43,160:.: 1.77:1.000:. ./.:4:44,132:.: 1.02:0.999:. ./.:4:0,134:.:-0.16:1.000:. ./.:4:32,90:.:-0.49:1.000:. ./.:4:40,109:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,82:.:-1.61:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.66:1.000:. ./.:4:1,123:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.40:1.000:. ./.:4:37,119:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.40:1.000:. ./.:4:38,129:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.51:1.000:. ./.:4:30,99:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.40:1.000:. ./.:4:37,108:.: 0.15:1.000:. ./.:4:0,109:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.25:1.000:. ./.:4:33,79:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,137:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.30:1.000:. ./.:4:19,56:.:-1.81:0.998:. ./.:4:31,111:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,162:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.68:1.000:. ./.:4:34,118:.: 0.34:1.000:. ./.:4:33,111:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,134:.:-0.16:1.000:. ./.:4:36,120:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,145:.: 0.15:1.000:. ./.:4:27,78:.:-0.97:1.000:. ./.:4:50,142:.: 1.46:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.90:1.000:. ./.:4:51,99:.: 0.29:1.000:. ./.:4:54,125:.: 1.10:1.000:. ./.:4:56,137:.: 1.49:1.000:. ./.:4:41,101:.: 0.07:1.000:. ./.:4:43,126:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,40:.:-2.78:1.000:. ./.:4:26,87:.:-0.74:1.000:. ./.:4:34,114:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,176:.: 1.02:1.000:. ./.:4:0,174:.: 0.96:1.000:. ./.:4:31,104:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.23:1.000:. ./.:4:36,97:.:-0.19:1.000:. ./.:4:37,121:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.77:1.000:. ./.:4:45,101:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,135:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,167:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.60:0.997:. ./.:4:34,78:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,128:.:-0.33:1.000:. ./.:4:40,95:.:-0.13:1.000:. ./.:4:25,64:.:-1.41:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,185:.: 1.27:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.26:1.000:. ./.:4:35,134:.: 0.82:1.000:. ./.:4:34,110:.: 0.12:1.000:. ./.:4:42,113:.: 0.43:0.956:. ./.:4:33,134:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,159:.: 0.54:1.000:. ./.:4:31,82:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,191:.: 1.43:1.000:. -chr8.1 68060141 chr8.1_068060141 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:299,68:.: 0.30:1.000:. ./.:4:391,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:268,74:.: 0.03:1.000:. ./.:4:275,82:.: 0.20:1.000:. ./.:4:355,81:.: 1.05:1.000:. ./.:4:385,95:.: 1.53:1.000:. ./.:4:195,58:.:-0.93:1.000:. ./.:4:283,89:.: 0.36:1.000:. ./.:4:229,143:.: 0.36:1.000:. ./.:4:91,0:.:-2.68:1.000:. ./.:4:55,28:.:-2.76:1.000:. ./.:4:425,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:251,61:.:-0.29:1.000:. ./.:4:289,72:.: 0.24:1.000:. ./.:4:293,76:.: 0.33:1.000:. ./.:4:416,0:.: 0.83:1.000:. ./.:4:429,0:.: 0.97:0.999:. ./.:4:405,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:324,191:.: 1.90:1.000:. ./.:4:298,229:.: 2.03:1.000:. ./.:4:65,10:.:-2.85:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:359,90:.: 1.19:1.000:. ./.:4:244,148:.: 0.57:1.000:. ./.:4:37,12:.:-3.13:1.000:. ./.:4:237,173:.: 0.77:1.000:. ./.:4:346,87:.: 1.02:1.000:. ./.:4:333,0:.:-0.06:1.000:. ./.:5:411,70:.: 1.54:1.000:. ./.:4:349,102:.: 1.21:1.000:. ./.:4:403,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:371,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:47,0:.:-3.15:1.000:. ./.:4:100,11:.:-2.46:1.000:. ./.:3:42,2:.:-3.18:1.000:. ./.:4:256,140:.: 0.62:1.000:. ./.:4:218,148:.: 0.29:1.000:. ./.:4:459,1:.: 1.31:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:306,192:.: 1.72:1.000:. ./.:4:326,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:304,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:309,47:.: 0.19:1.000:. ./.:4:268,60:.:-0.12:1.000:. ./.:4:322,69:.: 0.56:1.000:. ./.:4:300,69:.: 0.33:1.000:. ./.:5:422,88:.: 1.85:1.000:. ./.:4:316,57:.: 0.37:1.000:. ./.:4:232,58:.:-0.53:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:241,44:.:-0.58:1.000:. ./.:4:434,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:258,57:.:-0.26:1.000:. ./.:4:257,70:.:-0.13:1.000:. ./.:4:255,61:.:-0.25:1.000:. ./.:4:261,67:.:-0.12:1.000:. ./.:4:227,71:.:-0.44:1.000:. ./.:4:262,68:.:-0.09:1.000:. ./.:4:284,58:.: 0.03:1.000:. ./.:6:251,9:.:-0.85:1.000:. ./.:4:340,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:250,49:.:-0.43:1.000:. ./.:4:365,72:.: 1.06:1.000:. ./.:4:312,48:.: 0.23:1.000:. ./.:4:289,154:.: 1.13:1.000:. ./.:4:175,128:.:-0.39:1.000:. ./.:4:162,80:.:-1.05:1.000:. ./.:4:243,69:.:-0.29:1.000:. ./.:4:226,110:.:-0.03:0.887:. ./.:4:234,1:.:-1.12:1.000:. ./.:4:370,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:229,43:.:-0.72:0.999:. ./.:4:404,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:298,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:283,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:232,57:.:-0.54:1.000:. ./.:4:317,53:.: 0.34:1.000:. ./.:4:212,113:.:-0.15:1.000:. ./.:4:341,70:.: 0.78:1.000:. ./.:4:345,81:.: 0.94:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.26:0.915:. ./.:4:288,47:.:-0.04:1.000:. ./.:4:357,72:.: 0.97:1.000:. ./.:4:242,61:.:-0.39:1.000:. ./.:4:269,64:.:-0.06:1.000:. ./.:4:273,59:.:-0.07:1.000:. ./.:4:225,45:.:-0.74:1.000:. ./.:4:188,31:.:-1.29:1.000:. ./.:4:229,66:.:-0.47:1.000:. ./.:4:246,51:.:-0.45:1.000:. ./.:4:232,105:.:-0.02:1.000:. ./.:4:198,56:.:-0.92:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:218,59:.:-0.67:1.000:. ./.:4:312,66:.: 0.42:1.000:. ./.:4:329,60:.: 0.54:1.000:. ./.:4:155,40:.:-1.55:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:234,67:.:-0.41:1.000:. ./.:4:298,66:.: 0.27:1.000:. ./.:4:151,47:.:-1.52:1.000:. ./.:4:264,56:.:-0.20:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:277,0:.:-0.67:0.998:. ./.:4:317,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:256,63:.:-0.21:1.000:. ./.:4:247,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:287,89:.: 0.40:0.993:. ./.:4:340,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:228,65:.:-0.49:1.000:. ./.:4:458,134:.: 2.74:1.000:. ./.:4:230,43:.:-0.71:0.999:. ./.:4:358,68:.: 0.94:1.000:. ./.:4:132,101:.:-1.14:1.000:. ./.:4:236,129:.: 0.28:1.000:. ./.:4:298,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:249,50:.:-0.43:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:263,46:.:-0.32:1.000:. ./.:4:299,66:.: 0.28:1.000:. ./.:4:222,53:.:-0.69:1.000:. ./.:4:266,69:.:-0.04:1.000:. ./.:4:315,92:.: 0.74:1.000:. ./.:4:247,106:.: 0.15:1.000:. ./.:4:269,51:.:-0.20:1.000:. ./.:4:216,113:.:-0.11:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:287,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:159,37:.:-1.54:1.000:. ./.:4:255,55:.:-0.31:1.000:. ./.:4:308,82:.: 0.55:1.000:. ./.:4:118,76:.:-1.56:0.998:. ./.:4:208,113:.:-0.19:1.000:. ./.:4:309,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:457,131:.: 2.69:1.000:. ./.:4:289,63:.: 0.14:1.000:. ./.:4:258,53:.:-0.30:1.000:. ./.:4:178,29:.:-1.42:1.000:. ./.:4:247,51:.:-0.44:1.000:. ./.:4:185,97:.:-0.61:1.000:. ./.:4:293,34:.:-0.13:1.000:. ./.:4:292,63:.: 0.18:1.000:. ./.:4:167,43:.:-1.39:1.000:. ./.:4:245,174:.: 0.87:1.000:. ./.:4:380,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:306,78:.: 0.49:1.000:. ./.:4:272,68:.: 0.01:1.000:. ./.:4:257,191:.: 1.18:1.000:. ./.:4:231,90:.:-0.19:1.000:. ./.:4:369,94:.: 1.34:1.000:. ./.:4:383,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:74,10:.:-2.75:1.000:. ./.:4:209,120:.:-0.11:1.000:. ./.:4:306,83:.: 0.54:1.000:. ./.:4:295,64:.: 0.22:1.000:. ./.:4:379,91:.: 1.42:1.000:. ./.:4:276,173:.: 1.19:1.000:. ./.:4:295,70:.: 0.28:1.000:. ./.:4:244,104:.: 0.10:1.000:. ./.:4:296,57:.: 0.15:1.000:. ./.:4:260,57:.:-0.24:1.000:. ./.:4:259,66:.:-0.15:1.000:. ./.:4:265,76:.: 0.02:1.000:. ./.:4:367,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:324,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:299,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.66:0.997:. ./.:4:173,127:.:-0.42:1.000:. ./.:4:358,1:.: 0.22:1.000:. ./.:4:304,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:205,56:.:-0.84:1.000:. ./.:4:235,76:.:-0.30:1.000:. ./.:4:228,78:.:-0.35:1.000:. ./.:4:226,63:.:-0.54:1.000:. ./.:4:279,54:.:-0.06:1.000:. ./.:4:549,1:.: 2.28:1.000:. ./.:4:400,75:.: 1.47:1.000:. ./.:4:297,81:.: 0.42:1.000:. ./.:4:336,62:.: 0.64:1.000:. ./.:4:350,86:.: 1.05:0.956:. ./.:4:394,92:.: 1.59:1.000:. ./.:4:407,88:.: 1.69:1.000:. ./.:4:254,62:.:-0.25:1.000:. ./.:4:294,0:.:-0.48:1.000:. -chr8.1 68113149 chr8.1_068113149 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.74:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:5:26,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,0:.:-2.03:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:33,0:.: 2.43:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:36,0:.: 2.86:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:5:34,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.99:1.000:. ./.:6:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:31,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:24,0:.: 1.13:0.887:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.17:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:0.915:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,1:.: 1.13:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.89:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.70:0.998:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:0.993:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:0.999:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.60:0.998:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:30,0:.: 2.00:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.03:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.16:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.71:0.997:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.28:0.956:. ./.:4:32,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.59:1.000:. -chr8.1 68378419 chr8.1_068378419 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,79:0.47:-0.30:1.000:0.992 0/0/0/0:4:180,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,1:0.01:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:302,127:0.24: 2.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:211,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,92:0.42: 0.24:1.000:0.895 0/0/1/1:4:46,47:0.50:-1.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:32,36:0.51:-1.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,107:0.54:-0.05:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,124:0.28: 2.14:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-1.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,130:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:36,1:0.02:-1.83:1.000:1.000 0/0/0/0:4:208,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:257,1:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,108:0.50: 0.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:22,44:0.59:-1.48:1.000:0.889 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,1:0.01:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,110:0.30: 1.52:1.000:0.988 0/0/0/0/0:5:379,1:0.00: 2.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:199,1:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:166,92:0.31: 0.83:1.000:0.977 0/0/1/1:4:14,33:0.60:-1.71:1.000:0.752 0/0/0/0:4:41,0:0.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0:3:70,4:0.04:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,101:0.46: 0.27:1.000:0.989 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:172,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,96:0.25: 1.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:168,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:203,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:316,1:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,72:0.39:-0.23:1.000:0.735 0/0/0/1:4:236,139:0.33: 2.23:1.000:0.937 0/0/0/0:4:99,1:0.01:-1.07:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:267,134:0.28: 2.55:1.000:0.749 0/0/0/0:4:25,1:0.03:-1.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,95:0.52:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:143,69:0.27: 0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:83,104:0.53:-0.03:1.000:0.993 0/0/1/1:4:118,127:0.51: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:97,93:0.48: 0.01:1.000:0.995 0/0/0/0:4:317,0:0.00: 1.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:201,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,99:0.28: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:88,76:0.45:-0.30:1.000:0.975 0/0/0/1:4:176,93:0.29: 0.96:1.000:0.990 0/0/0/0/0/0:6:130,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-1.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,1:0.01:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,124:0.52: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:80,95:0.52:-0.17:1.000:0.995 0/0/0/0:4:92,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,83:0.49:-0.26:1.000:0.996 0/0/0/0:4:172,2:0.01:-0.18:0.887:1.000 0/0/0/0:4:105,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,103:0.43: 0.49:1.000:0.934 0/0/0/0:4:127,1:0.01:-0.74:0.999:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,195:1.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,89:0.46: 0.00:1.000:0.984 0/0/0/1:4:244,103:0.24: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,103:0.27: 1.50:1.000:0.998 0/0/0/0:4:290,1:0.00: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,154:1.00:-0.42:0.915:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,114:0.49: 0.49:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,85:1.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,113:0.49: 0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,93:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,96:0.52:-0.14:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,94:0.47: 0.06:1.000:0.993 0/0/0/1:4:156,80:0.28: 0.56:1.000:0.994 0/0/0/0:4:185,1:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,112:0.45: 0.60:1.000:0.982 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:110,0:0.00:-0.95:1.000:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,99:0.54:-0.21:1.000:0.989 0/0/0/1:4:162,85:0.29: 0.69:1.000:0.991 0/0/0/0:4:213,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:226,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,103:0.54:-0.12:1.000:0.989 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,84:0.30: 0.60:1.000:0.984 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.15:0.998:1.000 0/0/1/1:4:92,95:0.50:-0.03:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,94:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,134:0.56: 0.30:1.000:0.960 0/0/0/0:4:264,0:0.00: 0.90:0.993:1.000 0/0/1/1:4:91,101:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/0/0:4:185,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:263,1:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:240,1:0.00: 0.62:0.999:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,75:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,115:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,106:0.31: 1.27:1.000:0.972 0/1/1/1:4:2,85:0.75:-1.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:88,100:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:114,94:0.43: 0.23:1.000:0.949 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,127:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,99:0.24: 1.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,119:0.35: 1.39:1.000:0.784 0/0/0/0:4:187,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:193,120:0.34: 1.49:1.000:0.855 0/0/1/1:4:154,172:0.51: 1.64:1.000:0.996 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,75:0.25: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:82,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.62:0.998:1.000 0/0/0/0:4:213,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:107,103:0.48: 0.25:1.000:0.995 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,101:0.34: 0.87:1.000:0.835 1/1/1/1:4:0,100:1.00:-1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,98:0.49: 0.09:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.91:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/0/1:4:134,92:0.37: 0.44:1.000:0.526 0/0/1/1:4:137,117:0.44: 0.78:1.000:0.970 0/0/0/0:4:167,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,108:0.50: 0.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:230,107:0.26: 1.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:131,113:0.45: 0.66:1.000:0.975 0/0/1/1:4:78,76:0.48:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/0:4:362,0:0.00: 2.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,54:0.54:-1.17:1.000:0.985 0/0/0/1:4:152,69:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/0:4:337,0:0.00: 1.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,109:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:241,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,92:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:210,2:0.01: 0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:107,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,78:0.27: 0.56:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:337,1:0.00: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,1:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:216,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,192:0.47: 2.55:0.997:0.990 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:176,1:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,112:0.31: 1.45:1.000:0.968 0/0/0/0:4:177,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,95:0.28: 1.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,89:0.47:-0.06:1.000:0.993 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:197,75:0.22: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,98:0.47: 0.18:1.000:0.991 0/0/1/1:4:108,115:0.51: 0.41:0.956:0.997 0/0/0/1:4:229,137:0.33: 2.13:1.000:0.919 0/0/0/0:4:228,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/0/0:4:245,0:0.00: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,82:0.42:-0.04:1.000:0.899 -chr8.1 68878786 chr8.1_068878786 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:154,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:164,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:21,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:25,0:.:-2.95:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:180,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:39,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:222,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.07:1.000:. ./.:5:238,0:.: 2.47:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:12,0:.:-3.28:1.000:. ./.:4:36,0:.:-2.67:1.000:. ./.:3:4,0:.:-3.49:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:174,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:175,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:173,1:.: 0.84:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.56:1.000:. ./.:5:224,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-3.21:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:170,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.38:1.000:. ./.:6:122,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.23:0.887:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.53:0.999:. ./.:4:174,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.51:0.915:. ./.:4:164,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.28:0.998:. ./.:4:101,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.20:0.993:. ./.:4:140,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:123,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:160,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:143,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.42:0.998:. ./.:4:141,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:228,0:.: 2.21:1.000:. ./.:4:225,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:35,0:.:-2.70:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:168,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.28:0.997:. ./.:4:128,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:77,0:.:-1.63:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:196,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:0.956:. ./.:4:187,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.74:1.000:. -chr8.1 69332801 chr8.1_069332801 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:124,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.14:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:109,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:104,18:.: 0.80:1.000:. ./.:4:51,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:69,20:.:-0.20:1.000:. ./.:4:6,13:.:-2.31:1.000:. ./.:4:14,5:.:-2.31:1.000:. ./.:4:112,15:.: 0.95:1.000:. ./.:4:55,17:.:-0.71:1.000:. ./.:4:91,33:.: 0.86:1.000:. ./.:4:64,21:.:-0.32:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:102,26:.: 0.98:1.000:. ./.:4:154,33:.: 2.76:1.000:. ./.:4:196,1:.: 3.06:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:131,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:112,22:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.82:1.000:. ./.:4:139,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:62,17:.:-0.50:1.000:. ./.:5:204,0:.: 3.27:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:53,7:.:-1.07:1.000:. ./.:4:1,1:.:-2.82:1.000:. ./.:4:19,0:.:-2.31:1.000:. ./.:3:5,0:.:-2.73:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:80,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:87,21:.: 0.38:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,18:.:-0.68:1.000:. ./.:4:50,25:.:-0.62:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.38:1.000:. ./.:5:144,31:.: 2.40:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.34:1.000:. ./.:4:49,10:.:-1.10:1.000:. ./.:4:60,19:.:-0.50:1.000:. ./.:4:80,18:.: 0.07:1.000:. ./.:4:53,27:.:-0.47:1.000:. ./.:4:67,22:.:-0.20:1.000:. ./.:4:155,0:.: 1.79:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,12:.:-0.02:1.000:. ./.:4:92,18:.: 0.44:1.000:. ./.:4:67,23:.:-0.17:1.000:. ./.:6:71,1:.:-0.71:1.000:. ./.:4:95,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:39,32:.:-0.74:1.000:. ./.:4:63,24:.:-0.26:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:117,26:.: 1.43:1.000:. ./.:4:95,16:.: 0.47:1.000:. ./.:4:58,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:80,24:.: 0.26:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.23:0.887:. ./.:4:103,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:72,29:.: 0.17:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.92:0.999:. ./.:4:107,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:54,52:.: 0.32:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:54,20:.:-0.65:1.000:. ./.:4:101,38:.: 1.31:1.000:. ./.:4:53,33:.:-0.29:1.000:. ./.:4:135,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:43,37:.:-0.47:0.915:. ./.:4:85,1:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,27:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,21:.:-0.47:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:68,24:.:-0.11:1.000:. ./.:4:46,22:.:-0.83:1.000:. ./.:4:71,20:.:-0.14:1.000:. ./.:4:44,29:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,18:.: 0.26:1.000:. ./.:4:61,20:.:-0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:79,30:.: 0.41:1.000:. ./.:4:62,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:70,21:.:-0.14:1.000:. ./.:4:85,13:.: 0.07:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:60,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:45,21:.:-0.89:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.32:0.998:. ./.:4:47,26:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,27:.:-0.23:1.000:. ./.:4:57,14:.:-0.74:1.000:. ./.:4:60,17:.:-0.56:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.52:0.993:. ./.:4:68,15:.:-0.38:1.000:. ./.:4:73,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.29:0.999:. ./.:4:118,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:48,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:108,28:.: 1.22:1.000:. ./.:4:43,16:.:-1.10:1.000:. ./.:4:52,18:.:-0.77:1.000:. ./.:4:60,30:.:-0.17:1.000:. ./.:4:59,23:.:-0.41:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:44,19:.:-0.98:1.000:. ./.:4:102,31:.: 1.13:1.000:. ./.:4:104,25:.: 1.01:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:79,25:.: 0.26:1.000:. ./.:4:51,28:.:-0.50:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:49,20:.:-0.80:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.26:0.998:. ./.:4:82,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:67,20:.:-0.26:1.000:. ./.:4:67,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:57,18:.:-0.62:1.000:. ./.:4:36,19:.:-1.22:1.000:. ./.:4:87,25:.: 0.50:1.000:. ./.:4:51,29:.:-0.47:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:65,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:122,25:.: 1.55:1.000:. ./.:4:103,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:65,34:.: 0.11:1.000:. ./.:4:103,23:.: 0.92:1.000:. ./.:4:126,31:.: 1.85:1.000:. ./.:4:73,16:.:-0.20:1.000:. ./.:4:185,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:138,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:10,1:.:-2.55:1.000:. ./.:4:75,18:.:-0.08:1.000:. ./.:4:137,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:71,32:.: 0.23:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:146,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:71,31:.: 0.20:1.000:. ./.:4:127,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:83,21:.: 0.26:1.000:. ./.:4:45,12:.:-1.16:1.000:. ./.:4:108,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:63,40:.: 0.23:0.997:. ./.:4:90,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:112,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:74,20:.:-0.05:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:77,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:97,20:.: 0.65:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:85,22:.: 0.35:1.000:. ./.:4:52,27:.:-0.50:1.000:. ./.:4:63,27:.:-0.17:0.956:. ./.:4:79,27:.: 0.32:1.000:. ./.:4:160,0:.: 1.95:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:95,20:.: 0.59:1.000:. -chr8.1 69378115 chr8.1_069378115 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:61,52:0.44:-1.15:1.000:0.973 0/0/1/1:4:60,50:0.44:-1.21:1.000:0.962 0/0/0/1:4:95,41:0.25:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,50:0.22: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:98,50:0.29:-0.37:1.000:0.991 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,98:0.57:-0.15:1.000:0.941 0/0/0/1:4:37,16:0.25:-2.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:63,55:0.45:-1.04:1.000:0.981 0/0/0/1:4:106,58:0.31:-0.01:1.000:0.972 0/0/1/1:4:89,85:0.48: 0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:104,46:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,92:0.61:-0.68:1.000:0.655 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,45:0.18: 0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,131:0.54: 1.43:1.000:0.986 0/0/0/1:4:132,60:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:47,34:0.39:-1.86:1.000:0.730 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,78:0.58:-0.90:1.000:0.924 0/0/0/1:4:60,18:0.19:-1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,60:0.21: 1.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,44:0.32:-0.92:1.000:0.963 0/0/0/1:4:92,49:0.30:-0.52:1.000:0.982 0/0/0:3:129,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,58:0.23: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,51:0.31:-0.41:1.000:0.980 0/0/1/1:4:34,24:0.39:-2.37:1.000:0.647 0/0/0/1:4:84,29:0.21:-1.15:1.000:1.000 0/0/1:3:24,12:0.29:-2.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,44:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:100,84:0.44: 0.43:1.000:0.967 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,110:0.48: 1.36:1.000:0.994 0/0/0/0:4:192,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/0:4:168,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,47:0.24:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,66:0.23: 1.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:170,0:0.00: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:108,91:0.44: 0.76:1.000:0.914 0/0/0/0:4:246,0:0.00: 1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,51:0.21: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,76:0.29: 1.34:1.000:0.991 0/1/1/1:4:12,122:0.75:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:79,52:0.37:-0.75:1.000:0.627 0/0/1/1:4:76,84:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/0:4:156,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00: 1.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,44:0.29:-0.77:1.000:0.991 0/0/1/1:4:84,128:0.56: 1.05:1.000:0.964 0/0/1/1:4:63,99:0.57:-0.06:1.000:0.955 0/0/0/0/0/0:6:132,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,103:0.47: 1.12:1.000:0.991 0/0/1/1:4:82,125:0.56: 0.94:1.000:0.964 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,119:0.60: 0.34:1.000:0.813 0/0/1/1:4:110,108:0.49: 1.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:81,26:0.20:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,104:0.60:-0.17:1.000:0.806 0/0/0/1:4:133,61:0.26: 0.65:0.887:0.999 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,59:0.25: 0.59:1.000:0.999 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-1.04:0.999:1.000 0/0/0/0:4:162,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,91:0.54:-0.06:1.000:0.990 0/0/0/0:4:188,0:0.00: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,39:0.18: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,97:0.48: 0.79:1.000:0.994 0/0/0/1:4:165,59:0.22: 1.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,96:0.60:-0.46:0.915:0.784 0/0/0/0:4:184,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,69:0.30: 0.79:1.000:0.985 0/0/1/1:4:69,87:0.53:-0.19:1.000:0.991 0/0/0/1:4:189,65:0.21: 1.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:199,64:0.20: 2.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,63:0.49:-0.84:1.000:0.996 0/0/1/1:4:44,100:0.62:-0.46:1.000:0.594 0/0/1/1:4:115,102:0.46: 1.16:1.000:0.985 0/1/1/1:4:17,78:0.70:-1.55:1.000:0.982 0/0/1/1:4:78,73:0.47:-0.30:1.000:0.993 0/0/0/1:4:97,46:0.27:-0.48:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,75:0.45:-0.10:1.000:0.984 0/0/0/0:4:145,1:0.01:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:189,61:0.20: 1.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,56:0.27: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,103:0.60:-0.19:1.000:0.817 0/0/0/1:4:152,63:0.24: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,63:0.28: 0.56:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,49:0.35:-0.81:1.000:0.815 0/1/1/1:4:32,91:0.65:-0.92:1.000:0.757 0/0/1/1:4:83,61:0.40:-0.46:1.000:0.777 0/0/0/1:4:86,40:0.27:-0.86:1.000:0.998 0/0/0/0:4:194,0:0.00: 0.65:0.998:1.000 0/0/0/1:4:72,47:0.36:-1.01:1.000:0.658 0/0/1/1:4:114,105:0.47: 1.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:106,97:0.47: 0.85:1.000:0.991 0/0/0/1:4:90,47:0.30:-0.61:1.000:0.987 0/0/0/1:4:111,55:0.28: 0.03:0.993:0.995 0/0/0/1:4:129,59:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:205,0:0.00: 0.90:1.000:1.000 0/0/0/0:4:212,0:0.00: 1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:217,0:0.00: 1.16:0.999:1.000 0/0/0/1:4:124,58:0.27: 0.39:1.000:0.998 0/0/1/1:4:68,81:0.52:-0.35:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,104:0.56: 0.16:1.000:0.963 0/0/0/1:4:80,44:0.31:-0.90:1.000:0.970 0/0/1/1:4:69,95:0.55:-0.01:1.000:0.983 0/0/0/1:4:117,52:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,104:0.49: 1.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,103:0.49: 0.94:1.000:0.996 0/0/0/1:4:183,38:0.14: 1.25:1.000:0.970 0/0/1/1:4:54,88:0.57:-0.50:1.000:0.942 0/0/0/1:4:124,57:0.26: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,49:0.21: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,108:0.46: 1.45:1.000:0.985 0/0/0/1:4:100,67:0.37: 0.05:1.000:0.558 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,43:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:128,50:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,47:0.20: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,29:0.19:-0.86:0.998:1.000 0/0/0/1:4:131,55:0.24: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:147,52:0.21: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,53:0.17: 1.96:1.000:0.998 0/0/0/0:4:222,0:0.00: 1.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:38,102:0.64:-0.55:1.000:0.681 0/0/1/1:4:68,105:0.56: 0.19:1.000:0.961 0/0/1/1:4:128,107:0.44: 1.56:1.000:0.964 0/0/1/1:4:53,106:0.60:-0.12:1.000:0.784 0/0/0/1:4:114,43:0.22:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,39:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,140:0.49: 2.63:1.000:0.996 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,57:0.20: 1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,45:0.40:-1.32:1.000:0.828 0/0/1/1:4:129,111:0.45: 1.68:1.000:0.977 0/0/1/1:4:77,104:0.54: 0.36:1.000:0.985 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,47:0.81:-2.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,50:0.48:-1.39:1.000:0.995 0/0/0/0:4:179,1:0.00: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,96:0.45: 0.92:1.000:0.981 0/0/0/1:4:152,55:0.22: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,54:0.25: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,92:0.57:-0.37:1.000:0.939 0/0/0/1:4:117,51:0.25: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,54:0.50:-1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:89,110:0.53: 0.76:1.000:0.992 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:137,1:0.01:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:150,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,110:0.47: 1.39:0.997:0.994 0/0/0/1:4:101,40:0.23:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/0:4:103,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-1.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:81,36:0.25:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:64,78:0.53:-0.50:1.000:0.993 0/0/0/0:4:113,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,51:0.27:-0.12:1.000:0.998 0/1/1/1:4:8,74:0.75:-1.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,53:0.20: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,53:0.30:-0.24:1.000:0.986 0/0/0/1:4:117,71:0.34: 0.52:1.000:0.863 0/0/0/1:4:108,37:0.21:-0.44:0.956:1.000 0/0/0/1:4:178,61:0.21: 1.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,57:0.40:-0.70:1.000:0.828 0/0/0/0:4:146,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,34:0.16: 0.30:1.000:0.993 -chr8.1 69645734 chr8.1_069645734 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:16,6:0.30:-0.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:41,13:0.28: 1.56:1.000:0.994 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,9:0.75:-1.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:33,12:0.30: 0.95:1.000:0.987 0/0/0/1:4:35,4:0.15: 0.53:1.000:0.986 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:16,6:0.30:-0.63:1.000:0.984 0/0/0/1:4:37,8:0.25: 0.95:1.000:0.999 0/0/0/1:4:19,5:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/0:4:4,0:0.00:-1.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,21:0.35: 1.84:1.000:0.827 0/0/0/0:4:38,3:0.11: 0.67:1.000:0.639 0/0/0/1:4:16,4:0.26:-0.77:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,5:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:15,4:0.27:-0.84:1.000:0.998 0/0/1/1:4:6,12:0.50:-0.91:1.000:0.997 0/0/0/1:4:15,5:0.29:-0.77:1.000:0.992 0/0/0/1:4:50,18:0.30: 2.53:1.000:0.988 0/0/0/1:4:23,12:0.34: 0.26:1.000:0.891 0/0/0/1:4:16,9:0.34:-0.43:1.000:0.835 0/0/0/1:4:13,4:0.28:-0.98:1.000:0.995 0/0/0/1:4:12,3:0.26:-1.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,8:0.31:-0.22:1.000:0.977 0/1/1/1:4:1,8:0.67:-1.53:1.000:0.906 0/0/0/1:4:28,3:0.14:-0.01:1.000:0.968 0/0/0/1:4:27,7:0.27: 0.19:1.000:0.998 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1:3:9,15:0.48:-0.50:1.000:0.803 0/0/0/1:4:34,3:0.12: 0.40:1.000:0.706 0/0/0/1:4:24,2:0.11:-0.36:1.000:0.533 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,6:0.64:-1.66:1.000:0.721 0/0/0/1:4:9,4:0.32:-1.25:1.000:0.957 0/0/1:3:4,3:0.38:-1.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:50,13:0.27: 2.18:1.000:0.998 0/0/0/1:4:35,5:0.18: 0.60:1.000:0.999 0/0/0/1:4:28,13:0.32: 0.67:1.000:0.945 0/0/0/1:4:18,2:0.14:-0.77:1.000:0.980 0/0/0/0:4:63,2:0.04: 2.32:1.000:1.000 0/0/0/0:4:28,2:0.10:-0.08:1.000:0.866 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,7:0.32:-0.63:1.000:0.943 0/0/0/1:4:12,8:0.37:-0.77:1.000:0.626 0/0/0/1:4:34,4:0.15: 0.47:1.000:0.990 0/1/1/1:4:0,8:0.75:-1.59:1.000:0.999 0/0/0/0/0:5:66,0:0.00: 2.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,3:0.75:-1.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,3:0.21:-0.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.23: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.28: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/0:4:50,2:0.06: 1.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,6:0.26:-0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:24,5:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,6:0.27:-0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,9:0.36:-0.56:1.000:0.680 0/0/0/0:4:31,2:0.09: 0.12:1.000:0.960 0/0/0/0:4:53,0:0.00: 1.50:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:4,11:0.55:-1.11:1.000:0.744 0/0/1/1:4:5,10:0.50:-1.11:1.000:0.997 0/0/0/0:4:26,2:0.10:-0.22:1.000:0.712 0/0/0/1:4:34,5:0.19: 0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:48,10:0.25: 1.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:20,5:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:22,10:0.32: 0.05:1.000:0.951 0/0/0/0:4:36,2:0.08: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/1:4:28,9:0.29: 0.40:0.887:0.994 0/0/1/1:4:11,13:0.44:-0.50:1.000:0.962 0/0/0/1:4:24,5:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.39:0.999:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.43: 0.74:1.000:0.940 0/1/1/1:4:0,8:0.75:-1.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:21,9:0.31:-0.08:1.000:0.966 0/0/0/1:4:9,6:0.37:-1.11:1.000:0.626 0/0/1/1:4:11,8:0.38:-0.84:1.000:0.514 0/0/0/1:4:40,4:0.13: 0.88:1.000:0.925 0/0/0/0:4:47,1:0.03: 1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:29,8:0.27: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:36,7:0.24: 0.81:0.915:1.000 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-1.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,9:0.33:-0.29:1.000:0.915 0/0/0/1:4:27,9:0.29: 0.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:19,5:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:16,2:0.16:-0.91:1.000:0.996 0/0/0/0:4:49,1:0.03: 1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:32,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,2:0.11:-0.36:1.000:0.533 0/0/0/1:4:31,4:0.17: 0.26:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,4:0.14: 0.74:1.000:0.960 0/0/0/0:4:27,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,12:0.32: 0.53:1.000:0.957 0/0/0/1:4:16,8:0.33:-0.50:1.000:0.915 0/0/0/1:4:21,5:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,11:0.29: 0.95:1.000:0.993 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:34,0:0.00: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:35,4:0.15: 0.53:1.000:0.986 0/0/0/1:4:38,6:0.20: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:30,2:0.09: 0.05:1.000:0.940 0/0/0/1:4:30,9:0.28: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.13:-0.56:0.998:0.867 0/0/0/1:4:21,6:0.28:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,2:0.12:-0.43:1.000:0.665 0/0/0/1:4:21,2:0.13:-0.56:1.000:0.867 0/0/0/0:4:36,2:0.08: 0.47:1.000:0.994 0/0/0/0:4:48,2:0.06: 1.29:0.993:1.000 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,5:0.25:-0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:11,8:0.38:-0.84:1.000:0.514 0/0/0/1:4:18,10:0.34:-0.22:0.999:0.846 0/0/0/1:4:43,4:0.12: 1.08:1.000:0.827 0/0/0/0:4:16,1:0.09:-0.98:1.000:0.973 0/0/0/1:4:29,13:0.32: 0.74:1.000:0.955 0/0/0/0:4:26,2:0.10:-0.22:1.000:0.712 0/0/0/1:4:21,5:0.26:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:24,1:0.06:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.65:-1.11:1.000:0.792 0/0/0/1:4:30,4:0.17: 0.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:16,3:0.23:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:64,0:0.00: 2.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,9:0.27: 0.74:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,7:0.33:-0.70:1.000:0.915 0/0/0/0:4:57,4:0.10: 2.05:1.000:0.890 0/0/0/0:4:56,0:0.00: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:15,8:0.34:-0.56:1.000:0.877 0/0/0/1:4:19,5:0.27:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:38,6:0.20: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:42,2:0.07: 0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,3:0.23:-0.84:0.998:1.000 0/0/0/1:4:21,2:0.13:-0.56:1.000:0.867 0/0/1/1:4:2,4:0.50:-1.73:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,7:0.27: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,2:0.13:-0.56:1.000:0.867 0/0/0/1:4:27,4:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 1.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:24,4:0.21:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,8:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:34,4:0.15: 0.47:1.000:0.990 0/0/1/1:4:12,16:0.45:-0.22:1.000:0.982 0/0/0/1:4:22,8:0.30:-0.08:1.000:0.987 0/0/0/0:4:61,4:0.09: 2.32:1.000:0.951 0/0/1/1:4:8,8:0.42:-1.04:1.000:0.895 0/0/0/0:4:19,1:0.07:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/1:4:27,6:0.25: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:37,6:0.20: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,10:0.29: 0.67:1.000:0.993 0/0/0/1:4:28,4:0.18: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:23,3:0.17:-0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:17,7:0.31:-0.50:1.000:0.973 0/0/0/0:4:54,2:0.05: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:20,5:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:27,4:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:42,9:0.25: 1.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:43,13:0.28: 1.70:1.000:0.995 0/0/0/1:4:39,7:0.22: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:51,1:0.03: 1.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,9:0.75:-1.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:18,2:0.14:-0.77:1.000:0.980 0/0/0/1:4:27,4:0.19:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,6:0.28:-0.29:1.000:0.997 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,1:0.04: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:25,4:0.20:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 4.45:0.997:1.000 0/0/0/1:4:17,8:0.32:-0.43:1.000:0.940 0/0/0/1:4:29,7:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:4,6:0.47:-1.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:22,3:0.17:-0.43:1.000:0.999 0/0/0/0:4:35,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,10:0.50:-1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:10,4:0.31:-1.18:1.000:0.977 0/0/0/0:4:29,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:5,12:0.53:-0.98:1.000:0.992 0/0/0/1:4:21,8:0.30:-0.15:1.000:0.983 0/0/0/1:4:19,2:0.14:-0.70:1.000:0.960 0/0/0/1:4:29,8:0.27: 0.40:1.000:0.997 0/0/0/1:4:23,12:0.34: 0.26:0.956:0.891 0/0/0/0:4:34,2:0.08: 0.33:1.000:0.987 0/0/0/1:4:51,8:0.20: 1.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,2:0.14:-0.77:1.000:0.980 0/0/0/1:4:36,9:0.26: 0.95:1.000:0.998 -chr8.1 70099392 chr8.1_070099392 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:39,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:28,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:65,0:.: 3.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:64,0:.: 2.99:1.000:. ./.:4:56,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:41,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:50,0:.: 1.94:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:3:29,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.72:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:55,0:.: 2.32:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.67:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:37,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.52:1.000:. ./.:5:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:45,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:25,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:10,1:.:-0.97:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.82:1.000:. ./.:6:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:60,0:.: 2.69:1.000:. ./.:4:43,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.27:0.887:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:6,0:.:-1.34:0.999:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:38,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.45:0.915:. ./.:4:22,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:28,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.82:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.97:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:33,0:.: 0.67:0.993:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:0.999:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:49,0:.: 1.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:22,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:7,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:26,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:4,0:.:-1.49:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:29,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.45:0.998:. ./.:4:40,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:11,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:41,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:35,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:42,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:40,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:46,0:.: 1.64:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:22,0:.:-0.15:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:49,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:33,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:21,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:34,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,0:.: 0.90:0.956:. ./.:4:18,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:27,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.30:1.000:. -chr8.1 70367033 chr8.1_070367033 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:200,372:.:-0.18:1.000:. ./.:4:91,416:.:-0.65:1.000:. ./.:4:330,385:.: 0.85:1.000:. ./.:4:191,398:.:-0.06:1.000:. ./.:4:97,552:.: 0.37:1.000:. ./.:4:309,500:.: 1.52:1.000:. ./.:4:221,176:.:-1.44:1.000:. ./.:4:275,373:.: 0.36:1.000:. ./.:4:73,584:.: 0.43:1.000:. ./.:4:34,75:.:-3.51:1.000:. ./.:4:88,202:.:-2.21:1.000:. ./.:4:216,490:.: 0.78:1.000:. ./.:4:99,549:.: 0.36:1.000:. ./.:4:328,352:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,629:.: 0.23:1.000:. ./.:4:317,289:.: 0.06:1.000:. ./.:4:260,332:.:-0.04:1.000:. ./.:4:108,752:.: 1.89:1.000:. ./.:4:102,807:.: 2.24:1.000:. ./.:4:204,530:.: 0.98:1.000:. ./.:4:128,92:.:-2.71:1.000:. ./.:4:255,343:.: 0.00:1.000:. ./.:4:217,484:.: 0.74:1.000:. ./.:4:76,526:.: 0.03:1.000:. ./.:4:52,89:.:-3.28:1.000:. ./.:4:339,494:.: 1.69:1.000:. ./.:4:220,412:.: 0.25:1.000:. ./.:4:210,380:.:-0.05:1.000:. ./.:3:451,353:.: 1.49:1.000:. ./.:4:237,471:.: 0.79:1.000:. ./.:4:408,283:.: 0.67:1.000:. ./.:4:196,412:.: 0.08:1.000:. ./.:4:70,50:.:-3.43:1.000:. ./.:4:47,151:.:-2.87:1.000:. ./.:3:30,49:.:-3.73:1.000:. ./.:4:203,468:.: 0.53:1.000:. ./.:4:185,552:.: 1.00:1.000:. ./.:4:239,364:.: 0.04:1.000:. ./.:4:388,270:.: 0.44:1.000:. ./.:4:203,640:.: 1.77:1.000:. ./.:4:332,233:.:-0.23:1.000:. ./.:4:357,268:.: 0.20:1.000:. ./.:4:308,342:.: 0.38:1.000:. ./.:4:85,487:.:-0.18:1.000:. ./.:4:227,554:.: 1.32:1.000:. ./.:4:184,363:.:-0.36:1.000:. ./.:5:245,674:.: 2.31:1.000:. ./.:4:220,435:.: 0.41:1.000:. ./.:4:109,539:.: 0.36:1.000:. ./.:4:272,488:.: 1.17:1.000:. ./.:4:97,401:.:-0.72:1.000:. ./.:4:127,497:.: 0.19:1.000:. ./.:4:93,553:.: 0.35:1.000:. ./.:4:441,243:.: 0.62:1.000:. ./.:4:265,313:.:-0.14:1.000:. ./.:4:267,478:.: 1.06:1.000:. ./.:4:262,280:.:-0.40:1.000:. ./.:4:248,420:.: 0.51:1.000:. ./.:4:251,501:.: 1.11:1.000:. ./.:6:171,244:.:-1.31:1.000:. ./.:4:230,287:.:-0.58:1.000:. ./.:4:79,512:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,610:.: 0.09:1.000:. ./.:4:192,312:.:-0.67:1.000:. ./.:4:72,658:.: 0.95:1.000:. ./.:4:197,475:.: 0.54:1.000:. ./.:4:147,264:.:-1.34:1.000:. ./.:4:204,467:.: 0.53:1.000:. ./.:4:225,507:.: 0.97:0.887:. ./.:4:306,211:.:-0.58:1.000:. ./.:4:218,367:.:-0.09:1.000:. ./.:4:209,248:.:-1.01:0.999:. ./.:4:226,342:.:-0.21:1.000:. ./.:4:188,383:.:-0.19:1.000:. ./.:4:105,481:.:-0.08:1.000:. ./.:4:260,290:.:-0.34:1.000:. ./.:4:58,480:.:-0.43:1.000:. ./.:4:177,566:.: 1.05:1.000:. ./.:4:168,472:.: 0.31:1.000:. ./.:4:325,323:.: 0.36:1.000:. ./.:4:101,426:.:-0.51:0.915:. ./.:4:160,344:.:-0.67:1.000:. ./.:4:117,573:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,560:.:-0.27:1.000:. ./.:4:244,441:.: 0.63:1.000:. ./.:4:195,453:.: 0.36:1.000:. ./.:4:97,427:.:-0.53:1.000:. ./.:4:187,374:.:-0.26:1.000:. ./.:4:96,498:.:-0.02:1.000:. ./.:4:86,477:.:-0.25:1.000:. ./.:4:136,443:.:-0.13:1.000:. ./.:4:315,297:.: 0.10:1.000:. ./.:4:105,492:.: 0.00:1.000:. ./.:4:127,319:.:-1.09:1.000:. ./.:4:295,350:.: 0.34:1.000:. ./.:4:100,532:.: 0.25:1.000:. ./.:4:194,371:.:-0.23:1.000:. ./.:4:322,334:.: 0.42:1.000:. ./.:4:345,329:.: 0.55:1.000:. ./.:4:184,377:.:-0.26:1.000:. ./.:4:177,313:.:-0.77:1.000:. ./.:4:226,336:.:-0.25:1.000:. ./.:4:173,299:.:-0.90:1.000:. ./.:4:305,226:.:-0.48:0.998:. ./.:4:96,353:.:-1.07:1.000:. ./.:4:101,429:.:-0.49:1.000:. ./.:4:90,475:.:-0.23:1.000:. ./.:4:234,363:.: 0.00:1.000:. ./.:4:343,384:.: 0.93:0.993:. ./.:4:205,385:.:-0.05:1.000:. ./.:4:263,306:.:-0.20:1.000:. ./.:4:231,548:.: 1.31:1.000:. ./.:4:254,309:.:-0.25:0.999:. ./.:4:101,468:.:-0.20:1.000:. ./.:4:148,362:.:-0.63:1.000:. ./.:4:86,574:.: 0.45:1.000:. ./.:4:203,311:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,555:.:-0.31:1.000:. ./.:4:182,314:.:-0.73:1.000:. ./.:4:107,506:.: 0.11:1.000:. ./.:4:259,237:.:-0.73:1.000:. ./.:4:95,517:.: 0.10:1.000:. ./.:4:248,456:.: 0.77:1.000:. ./.:4:253,551:.: 1.49:1.000:. ./.:4:187,460:.: 0.36:1.000:. ./.:4:127,431:.:-0.28:1.000:. ./.:4:189,536:.: 0.92:1.000:. ./.:4:194,485:.: 0.59:1.000:. ./.:4:155,203:.:-1.72:1.000:. ./.:4:248,256:.:-0.67:1.000:. ./.:4:97,451:.:-0.36:1.000:. ./.:4:206,445:.: 0.39:1.000:. ./.:4:182,236:.:-1.29:0.998:. ./.:4:175,409:.:-0.10:1.000:. ./.:4:167,256:.:-1.25:1.000:. ./.:4:121,656:.: 1.29:1.000:. ./.:4:192,478:.: 0.52:1.000:. ./.:4:250,281:.:-0.48:1.000:. ./.:4:180,393:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,577:.:-0.15:1.000:. ./.:4:197,506:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1,573:.:-0.17:1.000:. ./.:4:103,433:.:-0.44:1.000:. ./.:4:202,216:.:-1.29:1.000:. ./.:4:192,643:.: 1.71:1.000:. ./.:4:280,379:.: 0.44:1.000:. ./.:4:173,531:.: 0.77:1.000:. ./.:4:163,399:.:-0.25:1.000:. ./.:4:206,649:.: 1.85:1.000:. ./.:4:55,534:.:-0.06:1.000:. ./.:4:426,282:.: 0.79:1.000:. ./.:4:265,276:.:-0.41:1.000:. ./.:4:42,123:.:-3.11:1.000:. ./.:4:141,424:.:-0.23:1.000:. ./.:4:351,343:.: 0.69:1.000:. ./.:4:99,546:.: 0.34:1.000:. ./.:4:89,592:.: 0.60:1.000:. ./.:4:185,497:.: 0.61:1.000:. ./.:4:0,567:.:-0.22:1.000:. ./.:4:316,345:.: 0.46:1.000:. ./.:4:142,236:.:-1.58:1.000:. ./.:4:162,369:.:-0.48:1.000:. ./.:4:107,562:.: 0.51:1.000:. ./.:4:390,278:.: 0.51:1.000:. ./.:4:347,338:.: 0.63:1.000:. ./.:4:322,265:.:-0.08:1.000:. ./.:4:274,259:.:-0.46:1.000:. ./.:4:193,498:.: 0.67:0.997:. ./.:4:183,401:.:-0.10:1.000:. ./.:4:197,297:.:-0.74:1.000:. ./.:4:196,280:.:-0.87:1.000:. ./.:4:246,241:.:-0.79:1.000:. ./.:4:221,512:.: 0.97:1.000:. ./.:4:271,257:.:-0.50:1.000:. ./.:4:207,415:.: 0.18:1.000:. ./.:4:82,431:.:-0.61:1.000:. ./.:4:254,330:.:-0.10:1.000:. ./.:4:104,533:.: 0.28:1.000:. ./.:4:331,370:.: 0.74:1.000:. ./.:4:95,495:.:-0.05:1.000:. ./.:4:83,525:.: 0.08:0.956:. ./.:4:221,729:.: 2.54:1.000:. ./.:4:255,489:.: 1.05:1.000:. ./.:4:327,180:.:-0.65:1.000:. ./.:4:220,404:.: 0.19:1.000:. -chr8.1 70591823 chr8.1_070591823 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:358,42:.: 1.56:1.000:. ./.:4:280,28:.: 0.36:1.000:. ./.:4:286,28:.: 0.44:1.000:. ./.:4:220,54:.:-0.08:1.000:. ./.:4:341,36:.: 1.26:1.000:. ./.:4:114,95:.:-0.92:1.000:. ./.:4:122,23:.:-1.75:1.000:. ./.:4:181,47:.:-0.68:1.000:. ./.:4:199,70:.:-0.14:1.000:. ./.:4:70,71:.:-1.81:1.000:. ./.:4:74,47:.:-2.07:1.000:. ./.:4:382,33:.: 1.75:1.000:. ./.:4:235,63:.: 0.23:1.000:. ./.:4:93,103:.:-1.09:1.000:. ./.:4:219,53:.:-0.10:1.000:. ./.:4:202,57:.:-0.27:1.000:. ./.:4:243,61:.: 0.31:1.000:. ./.:4:355,32:.: 1.39:1.000:. ./.:4:297,76:.: 1.21:1.000:. ./.:4:327,33:.: 1.04:1.000:. ./.:4:168,18:.:-1.22:1.000:. ./.:4:194,62:.:-0.31:1.000:. ./.:4:239,81:.: 0.52:1.000:. ./.:4:207,47:.:-0.34:1.000:. ./.:4:29,42:.:-2.72:1.000:. ./.:4:354,26:.: 1.30:1.000:. ./.:4:331,18:.: 0.90:1.000:. ./.:4:98,67:.:-1.49:1.000:. ./.:3:258,51:.: 0.38:1.000:. ./.:4:299,32:.: 0.66:1.000:. ./.:4:202,69:.:-0.12:1.000:. ./.:4:82,65:.:-1.73:1.000:. ./.:4:62,15:.:-2.64:1.000:. ./.:4:156,26:.:-1.27:1.000:. ./.:3:57,12:.:-2.74:1.000:. ./.:4:327,31:.: 1.01:1.000:. ./.:4:212,53:.:-0.20:1.000:. ./.:4:207,58:.:-0.20:1.000:. ./.:4:196,58:.:-0.34:1.000:. ./.:4:208,68:.:-0.05:1.000:. ./.:4:200,85:.: 0.06:1.000:. ./.:4:250,73:.: 0.56:1.000:. ./.:4:214,81:.: 0.19:1.000:. ./.:4:98,110:.:-0.94:1.000:. ./.:4:115,127:.:-0.49:1.000:. ./.:4:256,72:.: 0.62:1.000:. ./.:5:282,134:.: 1.77:1.000:. ./.:4:77,23:.:-2.34:1.000:. ./.:4:175,56:.:-0.64:1.000:. ./.:4:102,66:.:-1.46:1.000:. ./.:4:166,64:.:-0.65:1.000:. ./.:4:143,122:.:-0.20:1.000:. ./.:4:208,58:.:-0.18:1.000:. ./.:4:202,90:.: 0.16:1.000:. ./.:4:191,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:345,21:.: 1.12:1.000:. ./.:4:94,97:.:-1.16:1.000:. ./.:4:216,77:.: 0.17:1.000:. ./.:4:209,73:.: 0.03:1.000:. ./.:6:179,50:.:-0.66:1.000:. ./.:4:259,85:.: 0.83:1.000:. ./.:4:207,46:.:-0.35:1.000:. ./.:4:240,73:.: 0.43:1.000:. ./.:4:205,58:.:-0.22:1.000:. ./.:4:254,65:.: 0.51:1.000:. ./.:4:218,79:.: 0.22:1.000:. ./.:4:248,26:.:-0.08:1.000:. ./.:4:193,102:.: 0.19:1.000:. ./.:4:284,27:.: 0.40:0.887:. ./.:4:401,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:146,125:.:-0.12:1.000:. ./.:4:203,52:.:-0.33:0.999:. ./.:4:429,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:219,74:.: 0.17:1.000:. ./.:4:230,49:.:-0.01:1.000:. ./.:4:200,54:.:-0.34:1.000:. ./.:4:91,104:.:-1.10:1.000:. ./.:4:229,94:.: 0.56:1.000:. ./.:4:122,117:.:-0.53:1.000:. ./.:4:222,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:169,62:.:-0.64:0.915:. ./.:4:239,87:.: 0.60:1.000:. ./.:4:135,141:.:-0.05:1.000:. ./.:4:191,58:.:-0.40:1.000:. ./.:4:327,24:.: 0.92:1.000:. ./.:4:131,123:.:-0.34:1.000:. ./.:4:172,41:.:-0.87:1.000:. ./.:4:169,62:.:-0.64:1.000:. ./.:4:218,91:.: 0.38:1.000:. ./.:4:210,47:.:-0.30:1.000:. ./.:4:158,51:.:-0.92:1.000:. ./.:4:272,51:.: 0.56:1.000:. ./.:4:107,118:.:-0.72:1.000:. ./.:4:160,34:.:-1.12:1.000:. ./.:4:248,98:.: 0.86:1.000:. ./.:4:345,32:.: 1.26:1.000:. ./.:4:198,89:.: 0.09:1.000:. ./.:4:291,36:.: 0.61:1.000:. ./.:4:358,41:.: 1.54:1.000:. ./.:4:330,38:.: 1.14:1.000:. ./.:4:219,75:.: 0.18:1.000:. ./.:4:341,30:.: 1.18:1.000:. ./.:4:88,106:.:-1.12:1.000:. ./.:4:242,84:.: 0.60:0.998:. ./.:4:64,116:.:-1.30:1.000:. ./.:4:179,62:.:-0.51:1.000:. ./.:4:173,52:.:-0.72:1.000:. ./.:4:118,102:.:-0.78:1.000:. ./.:4:403,45:.: 2.18:0.993:. ./.:4:125,104:.:-0.66:1.000:. ./.:4:193,81:.:-0.08:1.000:. ./.:4:249,91:.: 0.78:1.000:. ./.:4:219,99:.: 0.49:0.999:. ./.:4:301,45:.: 0.86:1.000:. ./.:4:177,42:.:-0.79:1.000:. ./.:4:270,81:.: 0.92:1.000:. ./.:4:128,103:.:-0.64:1.000:. ./.:4:206,73:.:-0.01:1.000:. ./.:4:99,111:.:-0.91:1.000:. ./.:4:198,60:.:-0.29:1.000:. ./.:4:231,71:.: 0.28:1.000:. ./.:4:234,81:.: 0.45:1.000:. ./.:4:124,109:.:-0.61:1.000:. ./.:4:235,90:.: 0.58:1.000:. ./.:4:314,30:.: 0.83:1.000:. ./.:4:372,53:.: 1.88:1.000:. ./.:4:201,68:.:-0.14:1.000:. ./.:4:152,55:.:-0.95:1.000:. ./.:4:163,68:.:-0.64:1.000:. ./.:4:104,127:.:-0.64:1.000:. ./.:4:297,26:.: 0.56:1.000:. ./.:4:330,42:.: 1.19:1.000:. ./.:4:210,26:.:-0.57:0.998:. ./.:4:273,22:.: 0.19:1.000:. ./.:4:207,52:.:-0.27:1.000:. ./.:4:470,40:.: 2.99:1.000:. ./.:4:122,78:.:-1.04:1.000:. ./.:4:210,89:.: 0.25:1.000:. ./.:4:195,79:.:-0.08:1.000:. ./.:4:161,70:.:-0.64:1.000:. ./.:4:256,93:.: 0.90:1.000:. ./.:4:199,75:.:-0.08:1.000:. ./.:4:312,40:.: 0.93:1.000:. ./.:4:86,108:.:-1.12:1.000:. ./.:4:265,69:.: 0.70:1.000:. ./.:4:301,98:.: 1.54:1.000:. ./.:4:105,110:.:-0.85:1.000:. ./.:4:109,88:.:-1.08:1.000:. ./.:4:257,68:.: 0.58:1.000:. ./.:4:187,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:264,76:.: 0.78:1.000:. ./.:4:196,65:.:-0.25:1.000:. ./.:4:84,57:.:-1.81:1.000:. ./.:4:158,43:.:-1.03:1.000:. ./.:4:331,44:.: 1.23:1.000:. ./.:4:275,85:.: 1.04:1.000:. ./.:4:450,45:.: 2.79:1.000:. ./.:4:366,27:.: 1.47:1.000:. ./.:4:188,66:.:-0.34:1.000:. ./.:4:395,36:.: 1.96:1.000:. ./.:4:234,54:.: 0.10:1.000:. ./.:4:77,82:.:-1.57:1.000:. ./.:4:185,70:.:-0.33:1.000:. ./.:4:203,75:.:-0.03:1.000:. ./.:4:220,30:.:-0.39:1.000:. ./.:4:209,74:.: 0.04:1.000:. ./.:4:237,56:.: 0.17:1.000:. ./.:4:239,80:.: 0.51:0.997:. ./.:4:324,30:.: 0.96:1.000:. ./.:4:202,76:.:-0.03:1.000:. ./.:4:192,64:.:-0.31:1.000:. ./.:4:251,29:.: 0.00:1.000:. ./.:4:217,59:.:-0.05:1.000:. ./.:4:222,43:.:-0.20:1.000:. ./.:4:173,41:.:-0.86:1.000:. ./.:4:146,71:.:-0.82:1.000:. ./.:4:165,54:.:-0.79:1.000:. ./.:4:355,45:.: 1.56:1.000:. ./.:4:138,94:.:-0.62:1.000:. ./.:4:120,87:.:-0.95:1.000:. ./.:4:118,119:.:-0.56:0.956:. ./.:4:142,95:.:-0.56:1.000:. ./.:4:437,39:.: 2.54:1.000:. ./.:4:195,53:.:-0.42:1.000:. ./.:4:368,33:.: 1.57:1.000:. -chr8.1 71321725 chr8.1_071321725 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:154,90:.: 0.01:1.000:. ./.:4:175,96:.: 0.24:1.000:. ./.:4:117,49:.:-0.63:1.000:. ./.:4:228,77:.: 0.52:1.000:. ./.:4:46,100:.:-0.79:1.000:. ./.:4:399,123:.: 2.30:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:175,52:.:-0.13:1.000:. ./.:4:257,169:.: 1.51:1.000:. ./.:4:38,12:.:-1.58:1.000:. ./.:4:36,9:.:-1.62:1.000:. ./.:4:238,124:.: 0.98:1.000:. ./.:4:162,77:.:-0.03:1.000:. ./.:4:350,79:.: 1.53:1.000:. ./.:4:169,113:.: 0.33:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:130,48:.:-0.53:1.000:. ./.:4:515,177:.: 3.69:1.000:. ./.:4:322,240:.: 2.63:1.000:. ./.:4:251,154:.: 1.34:1.000:. ./.:4:14,15:.:-1.75:1.000:. ./.:4:95,47:.:-0.82:1.000:. ./.:4:217,99:.: 0.61:1.000:. ./.:4:236,192:.: 1.53:1.000:. ./.:4:17,2:.:-1.83:1.000:. ./.:4:202,103:.: 0.52:1.000:. ./.:4:194,92:.: 0.36:1.000:. ./.:4:148,46:.:-0.40:1.000:. ./.:3:254,115:.: 1.04:1.000:. ./.:4:77,56:.:-0.90:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:148,48:.:-0.38:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.93:1.000:. ./.:4:9,14:.:-1.80:1.000:. ./.:3:13,3:.:-1.86:1.000:. ./.:4:155,141:.: 0.44:1.000:. ./.:4:311,143:.: 1.74:1.000:. ./.:4:71,49:.:-1.00:1.000:. ./.:4:70,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:256,133:.: 1.21:1.000:. ./.:4:83,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:90,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:195,96:.: 0.40:1.000:. ./.:4:226,100:.: 0.69:1.000:. ./.:4:181,58:.:-0.03:1.000:. ./.:4:219,72:.: 0.40:1.000:. ./.:5:198,100:.: 0.46:1.000:. ./.:4:121,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:123,62:.:-0.47:1.000:. ./.:4:127,29:.:-0.71:1.000:. ./.:4:167,74:.:-0.01:1.000:. ./.:4:277,114:.: 1.22:1.000:. ./.:4:103,75:.:-0.53:1.000:. ./.:4:202,40:.: 0.00:1.000:. ./.:4:181,64:.: 0.02:1.000:. ./.:4:47,38:.:-1.29:1.000:. ./.:4:309,67:.: 1.10:1.000:. ./.:4:206,79:.: 0.35:1.000:. ./.:4:132,74:.:-0.30:1.000:. ./.:6:105,46:.:-0.75:1.000:. ./.:4:161,28:.:-0.44:1.000:. ./.:4:170,74:.: 0.01:1.000:. ./.:4:135,121:.: 0.11:1.000:. ./.:4:164,67:.:-0.09:1.000:. ./.:4:287,230:.: 2.26:1.000:. ./.:4:243,116:.: 0.96:1.000:. ./.:4:107,64:.:-0.59:1.000:. ./.:4:186,93:.: 0.30:1.000:. ./.:4:140,96:.:-0.05:0.887:. ./.:4:133,30:.:-0.65:1.000:. ./.:4:208,36:.: 0.01:1.000:. ./.:4:143,36:.:-0.52:0.999:. ./.:4:133,78:.:-0.26:1.000:. ./.:4:275,120:.: 1.25:1.000:. ./.:4:300,125:.: 1.50:1.000:. ./.:4:146,23:.:-0.60:1.000:. ./.:4:241,106:.: 0.86:1.000:. ./.:4:242,98:.: 0.80:1.000:. ./.:4:207,69:.: 0.28:1.000:. ./.:4:160,82:.: 0.00:1.000:. ./.:4:214,103:.: 0.61:0.915:. ./.:4:195,72:.: 0.20:1.000:. ./.:4:273,153:.: 1.51:1.000:. ./.:4:148,111:.: 0.14:1.000:. ./.:4:31,31:.:-1.48:1.000:. ./.:4:244,80:.: 0.67:1.000:. ./.:4:94,59:.:-0.73:1.000:. ./.:4:166,56:.:-0.17:1.000:. ./.:4:123,56:.:-0.52:1.000:. ./.:4:166,113:.: 0.30:1.000:. ./.:4:205,92:.: 0.45:1.000:. ./.:4:86,18:.:-1.14:1.000:. ./.:4:211,117:.: 0.70:1.000:. ./.:4:135,59:.:-0.40:1.000:. ./.:4:145,54:.:-0.36:1.000:. ./.:4:33,71:.:-1.14:1.000:. ./.:4:142,48:.:-0.43:1.000:. ./.:4:115,28:.:-0.82:1.000:. ./.:4:74,41:.:-1.05:1.000:. ./.:4:98,106:.:-0.31:1.000:. ./.:4:113,45:.:-0.69:1.000:. ./.:4:124,67:.:-0.42:1.000:. ./.:4:81,33:.:-1.05:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.18:0.998:. ./.:4:102,49:.:-0.75:1.000:. ./.:4:145,81:.:-0.13:1.000:. ./.:4:159,63:.:-0.17:1.000:. ./.:4:196,45:.:-0.01:1.000:. ./.:4:150,50:.:-0.35:0.993:. ./.:4:247,44:.: 0.40:1.000:. ./.:4:123,35:.:-0.69:1.000:. ./.:4:200,88:.: 0.38:1.000:. ./.:4:126,29:.:-0.72:0.999:. ./.:4:37,86:.:-0.98:1.000:. ./.:4:210,95:.: 0.52:1.000:. ./.:4:286,154:.: 1.62:1.000:. ./.:4:127,44:.:-0.59:1.000:. ./.:4:135,102:.:-0.04:1.000:. ./.:4:199,38:.:-0.04:1.000:. ./.:4:88,62:.:-0.76:1.000:. ./.:4:264,81:.: 0.84:1.000:. ./.:4:153,49:.:-0.33:1.000:. ./.:4:389,129:.: 2.27:1.000:. ./.:4:211,85:.: 0.44:1.000:. ./.:4:135,91:.:-0.13:1.000:. ./.:4:94,75:.:-0.60:1.000:. ./.:4:205,111:.: 0.61:1.000:. ./.:4:138,57:.:-0.39:1.000:. ./.:4:53,23:.:-1.37:1.000:. ./.:4:165,35:.:-0.35:1.000:. ./.:4:27,81:.:-1.10:1.000:. ./.:4:58,33:.:-1.24:1.000:. ./.:4:111,50:.:-0.67:0.998:. ./.:4:165,100:.: 0.19:1.000:. ./.:4:174,42:.:-0.22:1.000:. ./.:4:132,90:.:-0.17:1.000:. ./.:4:293,110:.: 1.32:1.000:. ./.:4:105,26:.:-0.91:1.000:. ./.:4:115,67:.:-0.49:1.000:. ./.:4:129,88:.:-0.21:1.000:. ./.:4:257,91:.: 0.87:1.000:. ./.:4:147,107:.: 0.10:1.000:. ./.:4:87,69:.:-0.71:1.000:. ./.:4:210,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:411,172:.: 2.80:1.000:. ./.:4:217,68:.: 0.35:1.000:. ./.:4:298,102:.: 1.30:1.000:. ./.:4:325,101:.: 1.51:1.000:. ./.:4:387,162:.: 2.52:1.000:. ./.:4:280,175:.: 1.75:1.000:. ./.:4:236,70:.: 0.52:1.000:. ./.:4:146,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:35,7:.:-1.64:1.000:. ./.:4:260,125:.: 1.17:1.000:. ./.:4:94,32:.:-0.95:1.000:. ./.:4:211,86:.: 0.45:1.000:. ./.:4:48,95:.:-0.82:1.000:. ./.:4:133,149:.: 0.33:1.000:. ./.:4:139,117:.: 0.11:1.000:. ./.:4:119,52:.:-0.59:1.000:. ./.:4:189,53:.: 0.00:1.000:. ./.:4:300,126:.: 1.51:1.000:. ./.:4:120,73:.:-0.40:1.000:. ./.:4:226,39:.: 0.19:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:75,1:.:-1.37:1.000:. ./.:4:215,74:.: 0.38:0.997:. ./.:4:199,112:.: 0.56:1.000:. ./.:4:85,45:.:-0.92:1.000:. ./.:4:102,39:.:-0.83:1.000:. ./.:4:86,54:.:-0.84:1.000:. ./.:4:165,68:.:-0.08:1.000:. ./.:4:231,81:.: 0.57:1.000:. ./.:4:148,55:.:-0.32:1.000:. ./.:4:160,116:.: 0.28:1.000:. ./.:4:146,53:.:-0.36:1.000:. ./.:4:90,102:.:-0.41:1.000:. ./.:4:305,97:.: 1.31:1.000:. ./.:4:240,100:.: 0.80:1.000:. ./.:4:254,150:.: 1.33:0.956:. ./.:4:337,141:.: 1.94:1.000:. ./.:4:105,99:.:-0.31:1.000:. ./.:4:192,32:.:-0.15:1.000:. ./.:4:239,84:.: 0.66:1.000:. -chr8.1 71387414 chr8.1_071387414 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:310,367:.: 0.49:1.000:. ./.:4:244,400:.: 0.31:1.000:. ./.:4:302,260:.:-0.12:1.000:. ./.:4:284,368:.: 0.36:1.000:. ./.:4:332,351:.: 0.52:1.000:. ./.:4:352,614:.: 2.02:1.000:. ./.:4:185,180:.:-1.17:1.000:. ./.:4:289,358:.: 0.33:1.000:. ./.:4:287,532:.: 1.24:1.000:. ./.:4:48,60:.:-2.53:1.000:. ./.:4:73,104:.:-2.16:1.000:. ./.:4:336,439:.: 1.01:1.000:. ./.:4:273,321:.: 0.05:1.000:. ./.:4:278,513:.: 1.09:1.000:. ./.:4:298,443:.: 0.83:1.000:. ./.:4:317,328:.: 0.32:1.000:. ./.:4:301,333:.: 0.26:1.000:. ./.:4:307,714:.: 2.32:1.000:. ./.:4:397,684:.: 2.63:1.000:. ./.:4:305,451:.: 0.91:1.000:. ./.:4:51,73:.:-2.44:1.000:. ./.:4:247,340:.: 0.01:1.000:. ./.:4:332,494:.: 1.28:1.000:. ./.:4:281,538:.: 1.24:1.000:. ./.:4:25,81:.:-2.54:1.000:. ./.:4:330,383:.: 0.68:1.000:. ./.:4:330,419:.: 0.87:1.000:. ./.:4:287,411:.: 0.60:1.000:. ./.:3:276,374:.: 0.35:1.000:. ./.:4:324,233:.:-0.15:1.000:. ./.:4:260,239:.:-0.45:1.000:. ./.:4:232,384:.: 0.17:1.000:. ./.:4:37,41:.:-2.69:1.000:. ./.:4:46,35:.:-2.67:1.000:. ./.:3:22,38:.:-2.78:1.000:. ./.:4:261,421:.: 0.52:1.000:. ./.:4:311,522:.: 1.32:1.000:. ./.:4:285,355:.: 0.29:1.000:. ./.:4:201,192:.:-1.02:1.000:. ./.:4:296,457:.: 0.89:1.000:. ./.:4:244,214:.:-0.67:1.000:. ./.:4:261,259:.:-0.34:1.000:. ./.:4:323,417:.: 0.82:1.000:. ./.:4:221,388:.: 0.13:1.000:. ./.:4:264,345:.: 0.13:1.000:. ./.:4:258,293:.:-0.18:1.000:. ./.:5:406,531:.: 1.87:1.000:. ./.:4:188,292:.:-0.56:1.000:. ./.:4:223,278:.:-0.44:1.000:. ./.:4:247,342:.: 0.02:1.000:. ./.:4:198,275:.:-0.59:1.000:. ./.:4:336,500:.: 1.33:1.000:. ./.:4:246,239:.:-0.53:1.000:. ./.:4:266,320:.: 0.01:1.000:. ./.:4:262,296:.:-0.14:1.000:. ./.:4:256,217:.:-0.59:1.000:. ./.:4:248,413:.: 0.41:1.000:. ./.:4:237,284:.:-0.34:1.000:. ./.:4:256,309:.:-0.10:1.000:. ./.:6:175,187:.:-1.18:1.000:. ./.:4:247,237:.:-0.53:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:259,301:.:-0.13:1.000:. ./.:4:173,208:.:-1.08:1.000:. ./.:4:311,575:.: 1.60:1.000:. ./.:4:256,359:.: 0.16:1.000:. ./.:4:166,231:.:-1.00:1.000:. ./.:4:246,329:.:-0.05:1.000:. ./.:4:213,277:.:-0.50:0.887:. ./.:4:245,223:.:-0.62:1.000:. ./.:4:233,355:.: 0.02:1.000:. ./.:4:198,213:.:-0.92:0.999:. ./.:4:235,266:.:-0.44:1.000:. ./.:4:305,409:.: 0.69:1.000:. ./.:4:232,354:.: 0.01:1.000:. ./.:4:166,215:.:-1.08:1.000:. ./.:4:262,332:.: 0.05:1.000:. ./.:4:259,357:.: 0.17:1.000:. ./.:4:245,380:.: 0.21:1.000:. ./.:4:284,401:.: 0.53:1.000:. ./.:4:204,323:.:-0.31:0.915:. ./.:4:247,305:.:-0.17:1.000:. ./.:4:295,391:.: 0.54:1.000:. ./.:4:237,390:.: 0.22:1.000:. ./.:4:199,120:.:-1.41:1.000:. ./.:4:276,359:.: 0.27:1.000:. ./.:4:208,219:.:-0.84:1.000:. ./.:4:207,286:.:-0.49:1.000:. ./.:4:218,237:.:-0.69:1.000:. ./.:4:242,392:.: 0.26:1.000:. ./.:4:194,280:.:-0.59:1.000:. ./.:4:216,184:.:-0.98:1.000:. ./.:4:225,374:.: 0.08:1.000:. ./.:4:251,313:.:-0.11:1.000:. ./.:4:237,249:.:-0.52:1.000:. ./.:4:217,224:.:-0.76:1.000:. ./.:4:184,224:.:-0.94:1.000:. ./.:4:209,169:.:-1.10:1.000:. ./.:4:244,214:.:-0.67:1.000:. ./.:4:229,310:.:-0.24:1.000:. ./.:4:186,240:.:-0.84:1.000:. ./.:4:257,239:.:-0.47:1.000:. ./.:4:156,172:.:-1.36:1.000:. ./.:4:217,206:.:-0.86:0.998:. ./.:4:182,218:.:-0.98:1.000:. ./.:4:226,226:.:-0.70:1.000:. ./.:4:191,232:.:-0.86:1.000:. ./.:4:267,437:.: 0.63:1.000:. ./.:4:324,365:.: 0.55:0.993:. ./.:4:274,364:.: 0.28:1.000:. ./.:4:252,229:.:-0.55:1.000:. ./.:4:357,558:.: 1.75:1.000:. ./.:4:231,250:.:-0.55:0.999:. ./.:4:242,218:.:-0.66:1.000:. ./.:4:224,357:.:-0.02:1.000:. ./.:4:278,422:.: 0.61:1.000:. ./.:4:201,260:.:-0.66:1.000:. ./.:4:233,279:.:-0.39:1.000:. ./.:4:209,240:.:-0.72:1.000:. ./.:4:221,248:.:-0.61:1.000:. ./.:4:237,400:.: 0.28:1.000:. ./.:4:224,191:.:-0.90:1.000:. ./.:4:243,428:.: 0.46:1.000:. ./.:4:323,567:.: 1.62:1.000:. ./.:4:235,289:.:-0.32:1.000:. ./.:4:248,216:.:-0.64:1.000:. ./.:4:228,326:.:-0.16:1.000:. ./.:4:184,282:.:-0.63:1.000:. ./.:4:166,166:.:-1.34:1.000:. ./.:4:189,237:.:-0.84:1.000:. ./.:4:193,174:.:-1.16:1.000:. ./.:4:250,234:.:-0.53:1.000:. ./.:4:153,162:.:-1.43:0.998:. ./.:4:257,269:.:-0.31:1.000:. ./.:4:275,247:.:-0.33:1.000:. ./.:4:375,393:.: 0.97:1.000:. ./.:4:254,417:.: 0.46:1.000:. ./.:4:198,202:.:-0.98:1.000:. ./.:4:198,268:.:-0.63:1.000:. ./.:4:194,260:.:-0.69:1.000:. ./.:4:257,340:.: 0.07:1.000:. ./.:4:252,281:.:-0.27:1.000:. ./.:4:257,254:.:-0.39:1.000:. ./.:4:169,240:.:-0.93:1.000:. ./.:4:403,678:.: 2.63:1.000:. ./.:4:457,455:.: 1.74:1.000:. ./.:4:242,481:.: 0.73:1.000:. ./.:4:295,583:.: 1.56:1.000:. ./.:4:394,556:.: 1.94:1.000:. ./.:4:250,394:.: 0.31:1.000:. ./.:4:338,475:.: 1.21:1.000:. ./.:4:292,303:.: 0.05:1.000:. ./.:4:36,77:.:-2.50:1.000:. ./.:4:267,543:.: 1.20:1.000:. ./.:4:292,284:.:-0.05:1.000:. ./.:4:361,380:.: 0.83:1.000:. ./.:4:387,338:.: 0.74:1.000:. ./.:4:324,429:.: 0.89:1.000:. ./.:4:249,399:.: 0.34:1.000:. ./.:4:333,344:.: 0.49:1.000:. ./.:4:292,357:.: 0.34:1.000:. ./.:4:255,543:.: 1.13:1.000:. ./.:4:241,305:.:-0.21:1.000:. ./.:4:320,399:.: 0.71:1.000:. ./.:4:375,351:.: 0.75:1.000:. ./.:4:336,316:.: 0.36:1.000:. ./.:4:236,237:.:-0.59:1.000:. ./.:4:259,415:.: 0.47:0.997:. ./.:4:292,419:.: 0.67:1.000:. ./.:4:290,325:.: 0.16:1.000:. ./.:4:253,302:.:-0.16:1.000:. ./.:4:203,258:.:-0.66:1.000:. ./.:4:288,397:.: 0.53:1.000:. ./.:4:244,420:.: 0.42:1.000:. ./.:4:220,269:.:-0.51:1.000:. ./.:4:199,358:.:-0.15:1.000:. ./.:4:306,407:.: 0.68:1.000:. ./.:4:278,260:.:-0.25:1.000:. ./.:4:344,589:.: 1.85:1.000:. ./.:4:259,487:.: 0.86:1.000:. ./.:4:349,577:.: 1.81:0.956:. ./.:4:404,627:.: 2.37:1.000:. ./.:4:393,505:.: 1.66:1.000:. ./.:4:264,362:.: 0.22:1.000:. ./.:4:318,419:.: 0.81:1.000:. -chr8.1 71666181 chr8.1_071666181 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:191,203:0.51: 1.07:1.000:0.996 0/0/0/1:4:190,73:0.28:-0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:71,234:0.74:-0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:316,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:206,175:0.46: 0.87:1.000:0.985 0/0/1/1:4:194,179:0.48: 0.75:1.000:0.994 0/0/1/1:4:118,114:0.49:-1.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:243,98:0.29: 0.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:293,94:0.24: 0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,31:0.24:-2.99:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,39:0.32:-3.08:1.000:0.957 0/0/0/1:4:342,78:0.19: 1.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,87:0.26: 0.06:1.000:0.998 0/0/0/1:4:274,88:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,71:0.23:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:198,175:0.47: 0.75:1.000:0.990 0/0/0/1:4:262,85:0.24: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:313,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:321,108:0.25: 1.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:340,117:0.26: 2.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,101:0.65:-2.62:1.000:0.781 0/0/1/1:4:172,148:0.46:-0.06:1.000:0.987 0/0/0/1:4:294,86:0.23: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:259,76:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-3.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,213:0.56: 0.75:1.000:0.964 0/0/1/1:4:172,184:0.51: 0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:152,179:0.53: 0.11:1.000:0.991 0/0/0:3:316,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,195:0.51: 0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:201,164:0.45: 0.63:1.000:0.975 0/0/1/1:4:142,126:0.47:-0.85:1.000:0.991 0/0/0/1:4:66,12:0.15:-3.75:1.000:0.992 0/0/1/1:4:54,62:0.53:-3.17:1.000:0.993 0/0/1:3:34,31:0.47:-3.95:1.000:0.858 0/0/1/1:4:188,181:0.49: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:237,81:0.25:-0.09:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,192:0.52: 0.60:1.000:0.994 0/0/1/1:4:190,195:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:152,178:0.53: 0.09:1.000:0.991 0/0/1/1:4:166,152:0.47:-0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:159,164:0.50:-0.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:190,179:0.48: 0.69:1.000:0.995 0/0/0/0:4:292,0:0.00:-0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:286,106:0.27: 1.04:1.000:0.998 0/0/0/0:4:344,0:0.00: 0.31:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:167,275:0.61: 1.80:1.000:0.971 0/0/0/0:4:310,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,73:0.26:-0.70:1.000:0.999 0/0/1/1:4:177,177:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,153:0.49:-0.23:1.000:0.996 0/0/0/1:4:278,98:0.26: 0.80:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,130:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:169,182:0.51: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:213,70:0.25:-0.62:1.000:0.999 0/0/1/1:4:170,163:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,77:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:177,184:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/1/1/1:4:75,208:0.71:-0.62:1.000:0.994 0/0/0/0/1/1:6:203,86:0.30:-0.53:1.000:0.858 0/0/0/1:4:258,86:0.25: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:260,71:0.21: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:269,95:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/0:4:323,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:287,88:0.23: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,88:0.28:-0.18:1.000:0.995 0/0/0/1:4:208,58:0.22:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,135:0.46:-0.52:1.000:0.989 0/0/1/1:4:160,163:0.50:-0.01:0.887:0.997 0/0/0/1:4:241,81:0.25:-0.03:1.000:0.999 0/0/0/1:4:290,108:0.27: 1.13:1.000:0.997 0/0/0/1:4:197,56:0.22:-1.08:0.999:1.000 0/0/0/1:4:284,95:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/0:4:360,0:0.00: 0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:297,0:0.00:-0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,63:0.24:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:327,0:0.00: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,175:0.52: 0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:273,95:0.26: 0.67:1.000:0.999 0/0/1/1:4:196,180:0.47: 0.80:1.000:0.994 0/0/0/0:4:278,0:0.00:-0.70:0.915:1.000 0/0/0/0:4:356,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/0:4:343,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,67:0.25:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:171,175:0.50: 0.34:1.000:0.997 0/0/0/0:4:331,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,116:0.51:-1.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:153,142:0.48:-0.44:1.000:0.994 0/0/0/1:4:240,68:0.22:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,137:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,146:0.51:-0.59:1.000:0.996 0/1/1/1:4:73,209:0.72:-0.64:1.000:0.996 0/0/0/1:4:268,98:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/0/1:4:193,65:0.25:-1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,87:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:200,158:0.44: 0.52:1.000:0.964 0/0/1/1:4:156,155:0.49:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:156,163:0.51:-0.07:1.000:0.997 0/1/1/1:4:91,280:0.73: 0.72:1.000:0.998 0/1/1/1:4:84,239:0.72:-0.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,131:0.49:-0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:168,168:0.50: 0.19:1.000:0.997 0/0/1/1:4:129,149:0.53:-0.70:1.000:0.992 0/0/1/1:4:180,179:0.49: 0.54:0.998:0.997 0/0/0/1:4:225,89:0.28:-0.15:1.000:0.995 0/0/0/1:4:247,78:0.24: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:233,70:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:271,82:0.23: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:114,280:0.69: 1.07:0.993:0.976 0/0/0/1:4:177,82:0.32:-0.99:1.000:0.964 0/0/0/1:4:233,77:0.25:-0.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:310,113:0.27: 1.51:1.000:0.998 0/0/0/1:4:264,85:0.24: 0.38:0.999:1.000 0/0/1/1:4:198,146:0.42: 0.31:1.000:0.920 0/0/0/1:4:201,67:0.25:-0.85:1.000:0.999 0/0/0/1:4:285,96:0.25: 0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,169:0.51: 0.06:1.000:0.996 0/0/0/1:4:261,70:0.21: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:243,95:0.28: 0.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:142,154:0.51:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,74:0.22: 0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:255,88:0.26: 0.29:1.000:0.999 0/0/0/0:4:354,0:0.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:82,264:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,162:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:279,89:0.24: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,172:0.48: 0.45:1.000:0.995 0/0/1/1:4:176,173:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,148:0.53:-0.75:1.000:0.992 0/0/0/1:4:206,46:0.18:-1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:155,111:0.41:-0.88:1.000:0.889 0/0/1/1:4:182,188:0.50: 0.70:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,108:0.46:-1.39:0.998:0.987 0/0/1/1:4:193,172:0.47: 0.63:1.000:0.991 0/0/0/1:4:233,72:0.24:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:348,111:0.24: 2.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:335,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,90:0.28:-0.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:64,192:0.73:-1.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:200,84:0.29:-0.61:1.000:0.989 0/0/0/1:4:271,85:0.24: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,88:0.26: 0.14:1.000:0.998 0/0/0/1:4:243,86:0.26: 0.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:193,77:0.28:-0.82:1.000:0.994 0/0/0/1:4:315,100:0.24: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:346,104:0.23: 1.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:369,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/1:4:268,90:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,107:0.28: 0.89:1.000:0.996 0/0/0/1:4:184,58:0.24:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,208:0.51: 1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:182,164:0.47: 0.34:1.000:0.992 0/0/0/1:4:84,28:0.25:-3.23:1.000:0.999 0/0/1/1:4:141,137:0.49:-0.70:1.000:0.996 0/1/1/1:4:92,247:0.71: 0.23:1.000:0.991 0/0/0/1:4:274,88:0.24: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,204:0.50: 1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:219,173:0.44: 1.04:1.000:0.964 0/0/0/1:4:248,65:0.21:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,311:0.73: 1.33:1.000:0.998 0/0/0/1:4:240,73:0.23:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,71:0.26:-0.79:1.000:0.999 0/0/0/1:4:193,91:0.32:-0.61:1.000:0.956 0/0/1/1:4:169,160:0.48: 0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,182:0.50: 0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:185,154:0.45: 0.23:1.000:0.981 0/0/1/1:4:163,151:0.48:-0.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:150,139:0.48:-0.53:0.997:0.994 0/0/0/1:4:260,79:0.23: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,163:0.46: 0.37:1.000:0.990 0/0/0/1:4:216,65:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,182:0.72:-1.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,239:0.75:-0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:263,89:0.25: 0.43:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,162:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:135,150:0.52:-0.59:1.000:0.995 0/0/0/1:4:299,99:0.25: 1.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:277,102:0.27: 0.84:1.000:0.998 0/0/0/1:4:246,87:0.26: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/0:4:283,27:0.09:-0.21:1.000:0.964 0/0/0/0:4:362,0:0.00: 0.58:0.956:1.000 0/0/0/1:4:308,98:0.24: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:132,314:0.69: 1.86:1.000:0.966 0/0/1/1:4:131,165:0.55:-0.43:1.000:0.981 0/0/0/1:4:269,103:0.28: 0.74:1.000:0.996 -chr8.1 71739741 chr8.1_071739741 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:289,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:222,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:451,1:.: 1.23:1.000:. ./.:4:346,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:354,1:.: 0.29:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,0:.:-2.76:1.000:. ./.:4:107,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:249,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:313,2:.:-0.10:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:286,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:502,1:.: 1.72:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:82,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:226,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:339,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.55:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:256,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:213,0:.:-1.09:1.000:. ./.:3:410,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:267,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:400,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.62:1.000:. ./.:4:67,0:.:-2.51:1.000:. ./.:3:45,0:.:-2.72:1.000:. ./.:4:376,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:275,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:290,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:513,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:327,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:389,0:.: 0.62:1.000:. ./.:5:367,1:.: 0.41:1.000:. ./.:4:591,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:417,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:525,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:343,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:489,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:433,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:540,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:439,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:366,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:279,0:.:-0.45:1.000:. ./.:6:279,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:295,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:322,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:424,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:413,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:393,1:.: 0.67:0.887:. ./.:4:247,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:320,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.46:0.999:. ./.:4:316,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:260,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:409,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:401,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:399,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:415,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.98:0.915:. ./.:4:459,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:296,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:208,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:254,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:266,1:.:-0.57:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:302,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:274,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:284,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:246,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:357,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:373,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:253,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.39:0.998:. ./.:4:229,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:266,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:392,0:.: 0.65:0.993:. ./.:4:290,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:273,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.92:0.999:. ./.:4:297,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:436,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:408,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:437,2:.: 1.10:1.000:. ./.:4:250,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:428,1:.: 1.00:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:438,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:362,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:285,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:386,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:263,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:212,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:375,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:359,0:.: 0.33:0.998:. ./.:4:407,1:.: 0.80:1.000:. ./.:4:289,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:354,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:458,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:358,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:215,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:445,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:259,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:217,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:573,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:323,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:420,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:524,0:.: 1.93:1.000:. ./.:4:342,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:424,1:.: 0.97:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:85,0:.:-2.33:1.000:. ./.:4:221,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:472,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:320,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:483,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:451,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:194,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:334,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:396,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:361,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:206,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:393,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:312,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:464,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:228,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:268,0:.:-0.56:0.997:. ./.:4:375,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:378,0:.: 0.51:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:262,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:269,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:315,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:306,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:441,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:449,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:310,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.34:0.956:. ./.:4:512,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:294,2:.:-0.28:1.000:. ./.:4:244,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.68:1.000:. -chr8.1 71949420 chr8.1_071949420 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:81,125:.: 0.94:1.000:. ./.:4:24,109:.:-0.23:1.000:. ./.:4:43,70:.:-0.55:1.000:. ./.:4:41,179:.: 1.16:1.000:. ./.:4:36,202:.: 1.45:1.000:. ./.:4:140,66:.: 0.94:1.000:. ./.:4:27,110:.:-0.17:1.000:. ./.:4:35,139:.: 0.43:1.000:. ./.:4:100,54:.: 0.11:1.000:. ./.:4:10,11:.:-2.02:1.000:. ./.:4:10,4:.:-2.13:1.000:. ./.:4:41,224:.: 1.88:1.000:. ./.:4:96,117:.: 1.05:1.000:. ./.:4:123,48:.: 0.38:1.000:. ./.:4:59,93:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,192:.: 1.52:1.000:. ./.:4:27,147:.: 0.43:1.000:. ./.:4:117,59:.: 0.46:1.000:. ./.:4:128,56:.: 0.59:1.000:. ./.:4:94,139:.: 1.37:1.000:. ./.:4:3,10:.:-2.15:1.000:. ./.:4:37,158:.: 0.76:1.000:. ./.:4:38,184:.: 1.20:1.000:. ./.:4:111,58:.: 0.35:1.000:. ./.:4:6,10:.:-2.10:1.000:. ./.:4:44,70:.:-0.53:1.000:. ./.:4:90,132:.: 1.20:1.000:. ./.:4:98,116:.: 1.07:1.000:. ./.:3:44,130:.: 0.43:1.000:. ./.:4:30,152:.: 0.56:1.000:. ./.:4:34,125:.: 0.19:1.000:. ./.:4:59,79:.:-0.15:1.000:. ./.:4:1,10:.:-2.18:1.000:. ./.:4:11,20:.:-1.86:1.000:. ./.:3:6,4:.:-2.20:1.000:. ./.:4:87,114:.: 0.86:1.000:. ./.:4:98,53:.: 0.06:1.000:. ./.:4:44,164:.: 0.97:1.000:. ./.:4:28,81:.:-0.61:1.000:. ./.:4:70,37:.:-0.65:1.000:. ./.:4:30,123:.: 0.09:1.000:. ./.:4:27,116:.:-0.07:1.000:. ./.:4:43,85:.:-0.31:1.000:. ./.:4:42,47:.:-0.93:1.000:. ./.:4:48,62:.:-0.60:1.000:. ./.:4:33,99:.:-0.25:1.000:. ./.:5:140,151:.: 2.30:1.000:. ./.:4:56,247:.: 2.49:1.000:. ./.:4:32,45:.:-1.13:1.000:. ./.:4:37,46:.:-1.03:1.000:. ./.:4:67,36:.:-0.71:1.000:. ./.:4:70,89:.: 0.19:1.000:. ./.:4:63,75:.:-0.15:1.000:. ./.:4:71,102:.: 0.41:1.000:. ./.:4:41,162:.: 0.89:1.000:. ./.:4:18,82:.:-0.76:1.000:. ./.:4:90,39:.:-0.29:1.000:. ./.:4:44,22:.:-1.30:1.000:. ./.:4:55,25:.:-1.08:1.000:. ./.:6:21,93:.:-0.53:1.000:. ./.:4:22,101:.:-0.39:1.000:. ./.:4:70,98:.: 0.33:1.000:. ./.:4:37,66:.:-0.71:1.000:. ./.:4:12,59:.:-1.22:1.000:. ./.:4:89,41:.:-0.28:1.000:. ./.:4:62,27:.:-0.93:1.000:. ./.:4:42,73:.:-0.52:1.000:. ./.:4:102,56:.: 0.17:1.000:. ./.:4:34,70:.:-0.69:0.887:. ./.:4:0,190:.: 0.68:1.000:. ./.:4:28,66:.:-0.85:1.000:. ./.:4:12,79:.:-0.90:0.999:. ./.:4:0,110:.:-0.60:1.000:. ./.:4:52,209:.: 1.82:1.000:. ./.:4:45,57:.:-0.73:1.000:. ./.:4:16,92:.:-0.63:1.000:. ./.:4:43,55:.:-0.79:1.000:. ./.:4:82,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:56,93:.: 0.03:1.000:. ./.:4:60,86:.:-0.02:1.000:. ./.:4:27,39:.:-1.30:0.915:. ./.:4:44,68:.:-0.57:1.000:. ./.:4:62,76:.:-0.15:1.000:. ./.:4:59,93:.: 0.08:1.000:. ./.:4:22,122:.:-0.05:1.000:. ./.:4:66,92:.: 0.17:1.000:. ./.:4:35,45:.:-1.08:1.000:. ./.:4:66,30:.:-0.82:1.000:. ./.:4:37,59:.:-0.82:1.000:. ./.:4:97,42:.:-0.13:1.000:. ./.:4:64,43:.:-0.65:1.000:. ./.:4:45,72:.:-0.49:1.000:. ./.:4:36,63:.:-0.77:1.000:. ./.:4:37,119:.: 0.14:1.000:. ./.:4:26,127:.: 0.09:1.000:. ./.:4:11,77:.:-0.95:1.000:. ./.:4:63,29:.:-0.89:1.000:. ./.:4:17,65:.:-1.05:1.000:. ./.:4:46,82:.:-0.31:1.000:. ./.:4:84,120:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,29:.:-1.13:1.000:. ./.:4:54,83:.:-0.17:1.000:. ./.:4:15,40:.:-1.48:1.000:. ./.:4:34,84:.:-0.47:0.998:. ./.:4:29,49:.:-1.11:1.000:. ./.:4:42,59:.:-0.74:1.000:. ./.:4:46,58:.:-0.69:1.000:. ./.:4:76,132:.: 0.97:1.000:. ./.:4:96,155:.: 1.66:0.993:. ./.:4:72,95:.: 0.32:1.000:. ./.:4:20,107:.:-0.33:1.000:. ./.:4:39,219:.: 1.77:1.000:. ./.:4:27,99:.:-0.34:0.999:. ./.:4:21,133:.: 0.11:1.000:. ./.:4:53,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:87,49:.:-0.18:1.000:. ./.:4:31,44:.:-1.16:1.000:. ./.:4:34,56:.:-0.92:1.000:. ./.:4:37,71:.:-0.63:1.000:. ./.:4:53,63:.:-0.50:1.000:. ./.:4:60,99:.: 0.19:1.000:. ./.:4:35,74:.:-0.61:1.000:. ./.:4:77,47:.:-0.37:1.000:. ./.:4:121,56:.: 0.48:1.000:. ./.:4:59,66:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,98:.:-0.49:1.000:. ./.:4:70,44:.:-0.53:1.000:. ./.:4:25,47:.:-1.21:1.000:. ./.:4:11,71:.:-1.05:1.000:. ./.:4:40,26:.:-1.30:1.000:. ./.:4:21,93:.:-0.53:1.000:. ./.:4:34,165:.: 0.83:1.000:. ./.:4:28,40:.:-1.27:0.998:. ./.:4:36,76:.:-0.57:1.000:. ./.:4:32,145:.: 0.48:1.000:. ./.:4:51,256:.: 2.56:1.000:. ./.:4:70,93:.: 0.25:1.000:. ./.:4:18,115:.:-0.23:1.000:. ./.:4:67,32:.:-0.77:1.000:. ./.:4:39,55:.:-0.85:1.000:. ./.:4:85,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:44,69:.:-0.55:1.000:. ./.:4:39,125:.: 0.27:1.000:. ./.:4:50,32:.:-1.05:1.000:. ./.:4:176,67:.: 1.53:1.000:. ./.:4:46,217:.: 1.85:1.000:. ./.:4:89,133:.: 1.20:1.000:. ./.:4:114,58:.: 0.40:1.000:. ./.:4:127,77:.: 0.91:1.000:. ./.:4:50,84:.:-0.21:1.000:. ./.:4:37,246:.: 2.17:1.000:. ./.:4:30,174:.: 0.91:1.000:. ./.:4:11,4:.:-2.12:1.000:. ./.:4:107,59:.: 0.30:1.000:. ./.:4:80,119:.: 0.83:1.000:. ./.:4:97,121:.: 1.13:1.000:. ./.:4:48,222:.: 1.96:1.000:. ./.:4:74,130:.: 0.91:1.000:. ./.:4:78,99:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,107:.: 0.51:1.000:. ./.:4:24,162:.: 0.62:1.000:. ./.:4:71,30:.:-0.74:1.000:. ./.:4:73,90:.: 0.25:1.000:. ./.:4:52,82:.:-0.21:1.000:. ./.:4:43,222:.: 1.88:1.000:. ./.:4:44,168:.: 1.04:1.000:. ./.:4:28,168:.: 0.78:1.000:. ./.:4:94,151:.: 1.56:0.997:. ./.:4:77,102:.: 0.51:1.000:. ./.:4:34,151:.: 0.60:1.000:. ./.:4:30,143:.: 0.41:1.000:. ./.:4:50,74:.:-0.37:1.000:. ./.:4:78,34:.:-0.57:1.000:. ./.:4:75,112:.: 0.64:1.000:. ./.:4:54,42:.:-0.82:1.000:. ./.:4:85,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:50,206:.: 1.74:1.000:. ./.:4:39,172:.: 1.02:1.000:. ./.:4:116,61:.: 0.48:1.000:. ./.:4:75,127:.: 0.88:1.000:. ./.:4:86,134:.: 1.16:0.956:. ./.:4:115,160:.: 2.04:1.000:. ./.:4:110,170:.: 2.12:1.000:. ./.:4:52,96:.: 0.01:1.000:. ./.:4:48,158:.: 0.94:1.000:. -chr8.1 72114894 chr8.1_072114894 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:58,61:0.52: 0.27:1.000:0.994 0/0/0/1:4:52,5:0.18:-0.87:1.000:0.999 0/0/1/1:4:96,40:0.38: 0.59:1.000:0.531 0/0/1/1:4:62,47:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/0/0:4:147,3:0.04: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:159,5:0.06: 1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,23:0.26: 1.07:1.000:0.998 0/0/0/1:4:137,47:0.35: 1.47:1.000:0.808 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-0.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-1.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,39:0.45:-0.10:1.000:0.981 0/0/1/1:4:54,45:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:60,42:0.46:-0.04:1.000:0.990 0/0/0/1:4:66,4:0.12:-0.63:1.000:0.646 0/0/0/1:4:194,47:0.30: 2.53:1.000:0.982 0/0/1/1:4:96,45:0.40: 0.68:1.000:0.752 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,10:1.00:-1.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:63,3:0.09:-0.71:1.000:0.930 0/0/0/0:4:180,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/0:4:146,2:0.03: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,7:0.38:-1.48:1.000:0.507 0/0/1/1:4:74,55:0.48: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:56,44:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/0:4:177,2:0.02: 1.38:1.000:1.000 0/1/1:3:1,59:0.74:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,53:0.39: 1.18:1.000:0.724 0/0/0/1:4:165,45:0.32: 1.95:1.000:0.960 0/0/0/0:4:156,1:0.01: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:56,10:0.27:-0.71:1.000:0.998 0/0/0/1:4:45,3:0.13:-1.04:1.000:0.867 0/0/0:3:15,0:0.00:-1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,5:0.15:-0.71:1.000:0.991 0/1/1/1:4:1,56:0.74:-0.87:1.000:0.999 0/0/0/0:4:166,1:0.01: 1.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,39:0.33: 1.25:1.000:0.933 0/0/0/1:4:60,14:0.30:-0.56:1.000:0.986 0/0/0/1:4:150,36:0.30: 1.51:1.000:0.983 0/0/0/1:4:172,48:0.32: 2.14:1.000:0.953 0/0/0/1:4:98,7:0.13: 0.01:1.000:0.943 0/0/0/1:4:37,3:0.15:-1.19:1.000:0.989 0/0/0/0:4:95,5:0.10:-0.08:1.000:0.781 0/0/1/1:4:59,49:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/0/0/0:5:188,4:0.04: 1.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.55:-1.63:1.000:0.982 0/0/1/1:4:41,39:0.51:-0.45:1.000:0.996 0/0/0/0:4:73,1:0.03:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,3:0.14:-1.13:1.000:0.970 0/0/0/0:4:143,7:0.09: 0.85:1.000:0.903 0/0/0/0:4:123,4:0.06: 0.42:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,66:0.44: 1.29:1.000:0.968 0/0/0/1:4:121,41:0.35: 1.07:1.000:0.823 0/0/0/1:4:119,42:0.35: 1.05:1.000:0.771 0/0/1/1:4:54,54:0.52: 0.07:1.000:0.995 0/0/1/1:4:42,48:0.53:-0.26:1.000:0.990 0/0/0/0:4:67,1:0.03:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:77,22:0.32:-0.10:1.000:0.919 0/0/1/1:4:87,44:0.41: 0.49:1.000:0.853 0/0/1/1:4:62,49:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:55,10:0.27:-0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,37:0.57:-0.80:1.000:0.951 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,42:1.00:-1.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,35:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,40:0.46:-0.10:1.000:0.987 0/0/0/1:4:49,7:0.25:-0.89:0.887:0.999 0/0/1/1:4:55,91:0.58: 0.77:1.000:0.929 0/0/0/1:4:101,38:0.36: 0.64:1.000:0.670 0/0/0/1:4:95,26:0.32: 0.31:0.999:0.959 0/0/1/1:4:45,60:0.55: 0.01:1.000:0.978 0/0/1/1:4:58,48:0.50: 0.03:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,42:0.36: 0.94:1.000:0.691 0/0/0/1:4:51,6:0.21:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,7:0.27:-1.06:1.000:0.998 0/0/0/0:4:101,2:0.04:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,36:1.00:-1.26:0.915:1.000 0/0/0/1:4:42,4:0.18:-1.08:1.000:0.999 0/0/0/0:4:51,2:0.08:-0.95:1.000:0.994 0/0/0/0:4:50,2:0.08:-0.96:1.000:0.992 0/0/0/1:4:92,27:0.33: 0.27:1.000:0.933 0/0/1/1:4:69,42:0.44: 0.13:1.000:0.967 0/0/0/0:4:84,3:0.07:-0.32:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,47:0.55:-0.39:1.000:0.980 0/0/1/1:4:45,39:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:51,11:0.29:-0.78:1.000:0.992 0/0/0/1:4:54,6:0.20:-0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,47:0.41: 0.61:1.000:0.885 0/0/0/1:4:59,4:0.13:-0.76:1.000:0.891 0/0/0/0:4:102,1:0.02:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,45:0.40: 0.64:1.000:0.784 0/0/0/0:4:91,2:0.04:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,31:0.45:-0.47:1.000:0.980 0/0/0/1:4:75,26:0.35:-0.06:1.000:0.795 0/0/1/1:4:108,46:0.38: 0.92:1.000:0.576 0/0/0/0:4:139,5:0.07: 0.74:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,32:0.49:-0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:68,48:0.47: 0.22:1.000:0.991 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,37:0.32: 1.14:0.998:0.943 0/0/0/1:4:55,5:0.17:-0.82:1.000:0.998 0/0/1/1:4:39,37:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:42,33:0.49:-0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,47:0.40: 0.72:1.000:0.815 0/0/0/1:4:158,59:0.36: 2.08:0.993:0.683 0/0/1/1:4:109,45:0.38: 0.92:1.000:0.512 0/0/0/1:4:98,38:0.37: 0.59:1.000:0.614 0/0/0/0:4:119,3:0.05: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:105,29:0.32: 0.55:0.999:0.956 0/0/0/0:4:101,2:0.04:-0.02:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-1.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.76:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,2:0.03: 0.70:1.000:1.000 0/0/0/1:4:40,4:0.18:-1.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:96,30:0.34: 0.40:1.000:0.896 0/0/0/0:4:101,3:0.06: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,40:0.46:-0.10:1.000:0.987 0/0/1/1:4:39,41:0.52:-0.45:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:135,1:0.01: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:44,12:0.32:-0.89:1.000:0.960 0/0/1/1:4:54,51:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:43,3:0.13:-1.08:1.000:0.923 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/0:4:99,1:0.02:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,28:0.46:-0.67:1.000:0.990 0/0/0/0:4:89,5:0.11:-0.19:1.000:0.601 0/0/1/1:4:117,52:0.39: 1.20:1.000:0.660 0/0/1/1:4:29,25:0.50:-0.93:0.998:0.997 0/0/0/1:4:40,6:0.25:-1.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:118,53:0.39: 1.23:1.000:0.679 0/0/1/1:4:72,64:0.51: 0.59:1.000:0.997 0/0/1/1:4:53,51:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,25:0.34:-0.08:1.000:0.841 0/0/0/1:4:70,5:0.13:-0.54:1.000:0.943 0/0/0/0:4:46,2:0.08:-1.04:1.000:0.978 1/1/1/1:4:0,30:1.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,3:0.12:-1.02:1.000:0.829 0/0/1/1:4:47,47:0.52:-0.19:1.000:0.995 0/0/1/1:4:40,26:0.45:-0.71:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,61:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,69:0.38: 2.31:1.000:0.601 0/0/1/1:4:65,48:0.47: 0.16:1.000:0.994 0/0/0/1:4:50,7:0.25:-0.87:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,3:0.12:-1.02:1.000:0.829 0/0/0/1:4:120,42:0.35: 1.07:1.000:0.783 0/0/0/1:4:186,62:0.34: 2.66:1.000:0.841 0/0/0/1:4:19,3:0.26:-1.52:1.000:0.999 0/0/0/0:4:56,2:0.07:-0.85:1.000:0.998 0/0/0/1:4:133,52:0.37: 1.49:1.000:0.598 0/0/1/1:4:74,65:0.50: 0.64:1.000:0.997 0/0/0/0:4:147,2:0.03: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,5:0.12:-0.41:1.000:0.821 0/0/0/0:4:55,1:0.04:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,54:0.35: 1.88:1.000:0.762 0/0/0/1:4:131,51:0.37: 1.44:1.000:0.606 0/0/0/1:4:41,6:0.25:-1.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,42:0.52:-0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:113,36:0.34: 0.83:1.000:0.882 0/0/0/1:4:104,36:0.35: 0.66:1.000:0.797 0/0/0/1:4:216,50:0.30: 2.99:1.000:0.987 0/0/0/1:4:157,34:0.29: 1.60:1.000:0.992 0/0/0/0:4:137,3:0.04: 0.66:0.997:1.000 1/1/1/1:4:0,58:1.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,41:0.40: 0.40:1.000:0.795 0/0/1/1:4:103,58:0.43: 1.05:1.000:0.937 0/0/0/0:4:107,1:0.02: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,46:0.51:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:38,43:0.53:-0.43:1.000:0.991 0/0/0/0:4:48,2:0.08:-1.00:1.000:0.987 0/0/0/1:4:148,45:0.33: 1.64:1.000:0.914 0/0/1/1:4:65,39:0.44: 0.00:1.000:0.963 0/0/1/1:4:80,81:0.52: 1.05:1.000:0.995 0/0/0/0:4:78,2:0.05:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,7:0.19:-0.58:0.956:1.000 0/0/0/0:4:145,6:0.08: 0.86:1.000:0.988 0/0/0/0:4:175,2:0.02: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,54:0.40: 1.12:1.000:0.806 0/0/1/1:4:72,42:0.43: 0.18:1.000:0.953 -chr8.1 72337156 chr8.1_072337156 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:234,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:234,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:125,36:.:-0.16:1.000:. ./.:4:181,64:.: 1.40:1.000:. ./.:4:205,1:.: 0.67:1.000:. ./.:4:108,29:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,44:.:-0.63:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:16,2:.:-2.82:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.90:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:127,44:.: 0.02:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:159,29:.: 0.34:1.000:. ./.:4:180,47:.: 1.06:1.000:. ./.:4:190,52:.: 1.34:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:16,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:167,56:.: 0.99:1.000:. ./.:4:136,49:.: 0.28:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:8,1:.:-2.99:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:154,36:.: 0.37:1.000:. ./.:3:135,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:180,41:.: 0.95:1.000:. ./.:4:187,52:.: 1.29:1.000:. ./.:4:172,42:.: 0.82:1.000:. ./.:4:15,11:.:-2.68:1.000:. ./.:4:20,4:.:-2.71:1.000:. ./.:3:6,0:.:-3.05:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:171,1:.: 0.04:1.000:. ./.:4:193,48:.: 1.32:1.000:. ./.:4:169,48:.: 0.88:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:163,43:.: 0.67:1.000:. ./.:4:155,30:.: 0.28:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:138,40:.: 0.15:1.000:. ./.:4:112,35:.:-0.43:1.000:. ./.:4:109,39:.:-0.41:1.000:. ./.:5:276,49:.: 2.88:1.000:. ./.:4:47,28:.:-1.76:1.000:. ./.:4:145,30:.: 0.10:1.000:. ./.:4:152,33:.: 0.28:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:183,61:.: 1.38:1.000:. ./.:4:138,43:.: 0.21:1.000:. ./.:4:183,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:115,40:.:-0.28:1.000:. ./.:4:137,43:.: 0.19:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.62:1.000:. ./.:6:99,27:.:-0.82:1.000:. ./.:4:152,39:.: 0.39:1.000:. ./.:4:158,37:.: 0.47:1.000:. ./.:4:145,36:.: 0.21:1.000:. ./.:4:76,31:.:-1.17:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.41:0.887:. ./.:4:178,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:151,38:.: 0.36:1.000:. ./.:4:56,22:.:-1.71:0.999:. ./.:4:205,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:116,47:.:-0.13:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:100,45:.:-0.46:1.000:. ./.:4:91,37:.:-0.78:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:102,55:.:-0.24:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.41:0.915:. ./.:4:85,39:.:-0.85:1.000:. ./.:4:94,52:.:-0.44:1.000:. ./.:4:156,38:.: 0.45:1.000:. ./.:4:155,35:.: 0.37:1.000:. ./.:4:121,48:.:-0.02:1.000:. ./.:4:112,30:.:-0.52:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:110,26:.:-0.63:1.000:. ./.:4:226,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:88,43:.:-0.72:1.000:. ./.:4:95,38:.:-0.69:1.000:. ./.:4:101,48:.:-0.39:1.000:. ./.:4:156,36:.: 0.41:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:234,1:.: 1.21:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:90,23:.:-1.06:1.000:. ./.:4:120,35:.:-0.28:0.998:. ./.:4:98,22:.:-0.93:1.000:. ./.:4:127,33:.:-0.18:1.000:. ./.:4:110,21:.:-0.72:1.000:. ./.:4:217,50:.: 1.81:1.000:. ./.:4:237,0:.: 1.25:0.993:. ./.:4:162,38:.: 0.56:1.000:. ./.:4:84,33:.:-0.98:1.000:. ./.:4:136,42:.: 0.15:1.000:. ./.:4:79,24:.:-1.24:0.999:. ./.:4:172,39:.: 0.76:1.000:. ./.:4:153,1:.:-0.30:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:97,14:.:-1.09:1.000:. ./.:4:105,28:.:-0.69:1.000:. ./.:4:124,28:.:-0.33:1.000:. ./.:4:139,24:.:-0.13:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:109,25:.:-0.67:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.35:1.000:. ./.:4:230,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:139,33:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:115,23:.:-0.59:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:137,31:.:-0.03:1.000:. ./.:4:180,36:.: 0.86:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.43:0.998:. ./.:4:111,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:145,37:.: 0.23:1.000:. ./.:4:237,53:.: 2.23:1.000:. ./.:4:122,35:.:-0.24:1.000:. ./.:4:75,19:.:-1.41:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:114,18:.:-0.70:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:128,37:.:-0.09:1.000:. ./.:4:144,28:.: 0.04:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:224,57:.: 2.07:1.000:. ./.:4:103,50:.:-0.31:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:113,56:.:-0.02:1.000:. ./.:4:171,37:.: 0.71:1.000:. ./.:4:10,0:.:-2.97:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:167,47:.: 0.82:1.000:. ./.:4:180,50:.: 1.12:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:153,34:.: 0.32:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:113,49:.:-0.15:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:156,37:.: 0.43:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:231,69:.: 2.42:1.000:. ./.:4:169,32:.: 0.58:1.000:. ./.:4:155,27:.: 0.23:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.84:0.997:. ./.:4:136,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:137,55:.: 0.41:1.000:. ./.:4:149,42:.: 0.39:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:191,50:.: 1.32:1.000:. ./.:4:175,53:.: 1.08:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:131,35:.:-0.07:1.000:. ./.:4:123,31:.:-0.30:0.956:. ./.:4:163,51:.: 0.82:1.000:. ./.:4:268,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.47:1.000:. -chr8.1 72561052 chr8.1_072561052 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:172,77:.: 1.07:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:159,61:.: 0.59:1.000:. ./.:4:101,76:.:-0.12:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:299,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:62,47:.:-1.23:1.000:. ./.:4:128,69:.: 0.21:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.57:1.000:. ./.:4:23,22:.:-2.29:1.000:. ./.:4:257,79:.: 2.50:1.000:. ./.:4:93,89:.:-0.03:1.000:. ./.:4:171,82:.: 1.13:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:156,97:.: 1.13:1.000:. ./.:4:94,61:.:-0.48:1.000:. ./.:4:70,307:.: 3.17:1.000:. ./.:4:286,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:194,66:.: 1.25:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.67:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:7,6:.:-2.81:1.000:. ./.:4:177,55:.: 0.79:1.000:. ./.:4:213,76:.: 1.72:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.22:1.000:. ./.:3:106,77:.:-0.02:1.000:. ./.:4:122,70:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,67:.:-0.03:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:2,1:.:-2.98:1.000:. ./.:4:28,0:.:-2.57:1.000:. ./.:3:10,0:.:-2.86:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:171,87:.: 1.22:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:90,73:.:-0.35:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:96,71:.:-0.28:1.000:. ./.:4:125,68:.: 0.15:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:102,73:.:-0.15:1.000:. ./.:5:221,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:158,92:.: 1.08:1.000:. ./.:4:72,58:.:-0.89:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:191,70:.: 1.26:1.000:. ./.:4:117,83:.: 0.26:1.000:. ./.:4:105,72:.:-0.12:1.000:. ./.:4:172,74:.: 1.02:1.000:. ./.:4:133,51:.: 0.00:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.20:1.000:. ./.:6:88,35:.:-1.00:1.000:. ./.:4:113,86:.: 0.25:1.000:. ./.:4:104,89:.: 0.15:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:90,53:.:-0.68:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:159,54:.: 0.48:1.000:. ./.:4:44,40:.:-1.65:1.000:. ./.:4:140,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.15:0.887:. ./.:4:112,165:.: 1.53:1.000:. ./.:4:125,65:.: 0.10:1.000:. ./.:4:49,40:.:-1.56:0.999:. ./.:4:133,59:.: 0.13:1.000:. ./.:4:116,77:.: 0.15:1.000:. ./.:4:133,72:.: 0.34:1.000:. ./.:4:74,75:.:-0.58:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:130,52:.:-0.03:0.915:. ./.:4:155,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:86,54:.:-0.72:1.000:. ./.:4:100,67:.:-0.28:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:138,59:.: 0.21:1.000:. ./.:4:83,59:.:-0.69:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:148,59:.: 0.38:1.000:. ./.:4:96,62:.:-0.43:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:106,62:.:-0.26:1.000:. ./.:4:127,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:122,66:.: 0.06:1.000:. ./.:4:112,39:.:-0.54:1.000:. ./.:4:153,83:.: 0.85:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:71,34:.:-1.30:1.000:. ./.:4:177,67:.: 0.98:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.78:1.000:. ./.:4:122,71:.: 0.15:0.998:. ./.:4:114,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:87,55:.:-0.69:1.000:. ./.:4:108,72:.:-0.07:1.000:. ./.:4:124,73:.: 0.21:1.000:. ./.:4:213,111:.: 2.30:0.993:. ./.:4:101,59:.:-0.40:1.000:. ./.:4:105,73:.:-0.10:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:70,59:.:-0.91:0.999:. ./.:4:150,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:129,64:.: 0.15:1.000:. ./.:4:226,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:100,61:.:-0.38:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:175,78:.: 1.13:1.000:. ./.:4:71,61:.:-0.86:1.000:. ./.:4:167,61:.: 0.72:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:86,82:.:-0.26:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:89,55:.:-0.66:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:117,71:.: 0.06:1.000:. ./.:4:92,40:.:-0.86:0.998:. ./.:4:242,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:99,79:.:-0.10:1.000:. ./.:4:131,83:.: 0.49:1.000:. ./.:4:125,70:.: 0.18:1.000:. ./.:4:66,62:.:-0.92:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:148,89:.: 0.87:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:95,72:.:-0.28:1.000:. ./.:4:108,58:.:-0.30:1.000:. ./.:4:185,88:.: 1.46:1.000:. ./.:4:146,98:.: 0.98:1.000:. ./.:4:119,89:.: 0.39:1.000:. ./.:4:249,1:.: 1.08:1.000:. ./.:4:200,107:.: 2.02:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:131,103:.: 0.82:1.000:. ./.:4:119,80:.: 0.25:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:184,79:.: 1.30:1.000:. ./.:4:124,84:.: 0.39:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:201,101:.: 1.94:1.000:. ./.:4:102,76:.:-0.10:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:98,72:.:-0.23:1.000:. ./.:4:190,70:.: 1.25:1.000:. ./.:4:121,87:.: 0.39:1.000:. ./.:4:117,92:.: 0.41:1.000:. ./.:4:78,48:.:-0.96:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.59:0.997:. ./.:4:148,93:.: 0.94:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:102,67:.:-0.25:1.000:. ./.:4:176,74:.: 1.08:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:166,69:.: 0.84:1.000:. ./.:4:113,52:.:-0.31:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:115,76:.: 0.11:1.000:. ./.:4:89,74:.:-0.35:1.000:. ./.:4:216,74:.: 1.74:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:133,0:.:-0.84:0.956:. ./.:4:171,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:290,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:131,57:.: 0.06:1.000:. ./.:4:208,76:.: 1.64:1.000:. -chr8.1 72762376 chr8.1_072762376 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:96,100:0.45: 1.57:1.000:0.977 0/0/1/1:4:84,74:0.41: 0.54:1.000:0.873 0/0/0/1:4:120,35:0.20: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,31:0.26:-0.88:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,38:0.28:-0.52:1.000:0.994 0/0/0/1:4:124,36:0.20: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:61,32:0.30:-1.23:1.000:0.980 0/0/0/0:4:115,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,40:0.26:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:12,28:0.58:-2.67:1.000:0.932 0/0/0/0:4:59,4:0.06:-2.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,73:0.34: 1.35:1.000:0.850 0/0/0/0:4:118,0:0.00:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,36:0.19: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,34:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,43:0.35:-0.85:1.000:0.750 0/0/1/1:4:54,72:0.50:-0.33:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,71:0.43: 0.21:1.000:0.938 0/0/0/1:4:166,52:0.21: 2.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,56:0.27: 1.19:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,14:0.33:-2.72:1.000:0.937 0/0/1/1:4:39,78:0.56:-0.58:1.000:0.974 0/0/0/1:4:94,49:0.30: 0.13:1.000:0.982 0/0/0/1:4:112,35:0.21: 0.24:1.000:1.000 0/0/0/0:4:46,0:0.00:-2.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:190,0:0.00: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:65,44:0.36:-0.80:1.000:0.734 0/0/0/1:4:80,32:0.25:-0.71:1.000:0.999 0/0/1:3:104,44:0.26: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,44:0.28:-0.01:1.000:0.995 0/0/0/1:4:106,33:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:0,10:0.75:-3.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:49,12:0.18:-2.10:1.000:0.999 0/0/0:3:17,1:0.05:-3.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,43:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,1:0.01: 0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,81:0.57:-0.55:1.000:0.954 0/0/0/1:4:101,58:0.32: 0.56:1.000:0.947 0/0/0/0:4:178,0:0.00: 1.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:94,38:0.26:-0.17:1.000:0.999 0/0/0/1:4:84,46:0.31:-0.23:1.000:0.968 0/0/1/1:4:78,105:0.50: 1.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:96,50:0.30: 0.21:1.000:0.982 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,49:0.29: 0.35:1.000:0.993 0/0/0/0/1:5:163,51:0.21: 2.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:11,5:0.28:-3.32:1.000:0.996 0/0/0/0:4:141,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,33:0.30:-1.12:1.000:0.984 0/0/0/1:4:92,49:0.31: 0.07:1.000:0.977 0/0/1/1:4:46,79:0.54:-0.36:1.000:0.990 0/0/0/0:4:133,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,43:0.21: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,53:0.28: 0.89:1.000:0.997 0/0/0/1:4:164,45:0.19: 1.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,60:0.26: 1.92:1.000:0.999 0/0/0/1/1/1:6:58,63:0.46:-0.47:1.000:0.780 0/0/1/1:4:33,71:0.56:-0.93:1.000:0.958 0/0/0/0:4:131,0:0.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,46:0.24: 0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,50:0.28: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:152,40:0.19: 1.46:1.000:0.999 0/0/0/0:4:171,0:0.00: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,31:0.20: 0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,41:0.21: 0.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,39:0.21: 0.73:0.887:1.000 0/0/0/1:4:103,38:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:124,42:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/0:4:94,0:0.00:-1.20:0.999:1.000 0/0/1/1:4:98,135:0.50: 2.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:90,33:0.24:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,33:0.19: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/0:4:106,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,35:0.26:-0.44:1.000:0.999 0/0/0/0:4:199,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,93:0.41: 1.65:1.000:0.868 0/0/0/1:4:110,38:0.23: 0.26:0.915:1.000 0/0/0/1:4:97,36:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:106,61:0.32: 0.78:1.000:0.945 0/0/0/1:4:61,27:0.27:-1.37:1.000:0.997 0/0/0/0:4:142,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,39:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,71:0.40: 0.45:1.000:0.813 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,38:0.23: 0.32:1.000:1.000 0/0/0/1:4:87,43:0.29:-0.23:1.000:0.990 0/0/1/1:4:58,51:0.41:-0.80:1.000:0.871 0/0/0/0:4:153,0:0.00: 0.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:78,36:0.28:-0.66:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,28:0.17: 0.35:1.000:0.997 0/0/0/0:4:169,0:0.00: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,42:0.20: 1.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,81:0.43: 0.75:1.000:0.942 0/0/0/1:4:75,29:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,59:0.34: 0.40:1.000:0.866 0/0/0/1:4:64,30:0.28:-1.20:1.000:0.994 0/0/0/1:4:83,35:0.26:-0.55:0.998:0.998 0/0/1/1:4:45,74:0.53:-0.52:1.000:0.992 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,49:0.32:-0.12:1.000:0.944 0/0/0/1:4:136,46:0.23: 1.19:0.993:1.000 0/0/0/1:4:76,44:0.32:-0.50:1.000:0.942 0/0/0/0:4:101,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,42:0.23: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/0:4:140,0:0.00: 0.05:0.999:1.000 0/0/0/1:4:91,38:0.26:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:108,0:0.00:-0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,44:0.21: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:66,45:0.36:-0.74:1.000:0.717 0/0/0/1:4:110,32:0.20: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,42:0.28:-0.09:1.000:0.996 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,71:0.41: 0.37:1.000:0.867 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-1.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:154,0:0.00: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,35:0.19: 0.81:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,31:0.18: 0.40:1.000:0.999 0/0/0/1:4:100,39:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/0/0:4:189,0:0.00: 1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:167,0:0.00: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,76:0.59:-0.93:1.000:0.845 0/0/0/1:4:101,28:0.19:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,34:0.27:-0.77:1.000:0.997 0/0/0/0:4:143,0:0.00: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/0:4:120,0:0.00:-0.50:0.998:1.000 0/0/0/1:4:136,44:0.22: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,83:0.61:-0.80:1.000:0.682 0/0/0/1:4:90,60:0.35: 0.32:1.000:0.766 0/0/0/0:4:114,0:0.00:-0.66:1.000:1.000 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,21:0.12: 0.35:1.000:0.838 0/0/0/1:4:85,38:0.27:-0.42:1.000:0.997 0/0/0/0:4:183,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:97,48:0.29: 0.18:1.000:0.990 0/0/0/1:4:82,34:0.26:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:94,33:0.23:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:200,0:0.00: 1.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,87:0.57:-0.36:1.000:0.939 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:76,79:0.45: 0.45:1.000:0.977 0/0/0/0:4:193,0:0.00: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,27:0.19:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:172,0:0.00: 0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,40:0.29:-0.39:1.000:0.993 0/0/0/1:4:35,14:0.25:-2.42:1.000:0.999 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,43:0.21: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:134,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,44:0.29:-0.09:1.000:0.992 0/0/0/1:4:142,55:0.25: 1.59:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,29:0.25:-0.93:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,35:0.21: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:130,0:0.00:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,60:0.40:-0.17:1.000:0.788 0/0/0/0:4:132,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,34:0.18: 0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:53,25:0.28:-1.64:1.000:0.994 0/0/0/1:4:83,46:0.32:-0.25:1.000:0.964 0/0/0/1:4:63,42:0.35:-0.90:1.000:0.766 0/0/0/0:4:182,0:0.00: 1.19:0.997:1.000 0/0/0/1:4:113,44:0.25: 0.51:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,59:0.51:-1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:35,75:0.56:-0.77:1.000:0.959 0/0/0/1:4:104,28:0.19:-0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,33:0.22:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,74:0.41: 0.59:1.000:0.841 0/0/0/1:4:104,31:0.20:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,66:0.42:-0.04:1.000:0.925 0/0/1/1:4:51,99:0.55: 0.32:1.000:0.978 0/0/0/1:4:81,49:0.33:-0.23:1.000:0.908 0/0/0/1:4:118,38:0.22: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,32:0.22:-0.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,45:0.30:-0.14:0.956:0.985 0/0/0/0:4:136,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,83:0.43: 0.89:1.000:0.936 0/0/0/1:4:95,44:0.28: 0.02:1.000:0.995 0/0/0/1:4:125,29:0.17: 0.43:1.000:0.998 -chr8.1 72832610 chr8.1_072832610 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:24,77:0.76: 1.09:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,66:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,55:0.50: 1.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,86:0.74: 1.67:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,33:0.43: 0.09:1.000:0.943 0/0/1/1:4:46,45:0.49: 0.67:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,12:0.86:-2.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:6,10:0.62:-2.46:1.000:0.526 0/1/1/1:4:17,86:0.83: 1.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:33,39:0.54:-0.12:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,76:0.76: 1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,61:0.75: 0.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,56:0.52: 1.34:1.000:0.994 0/0/1/1:4:52,59:0.53: 1.51:1.000:0.992 0/1/1/1:4:23,76:0.76: 1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,106:1.00: 1.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,91:0.78: 1.72:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-2.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,78:0.79: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,76:0.72: 1.26:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,87:1.00: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-2.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,66:0.76: 0.51:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,71:0.72: 0.96:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,68:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/1/1:3:32,83:0.72: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,44:0.52: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,35:0.41: 0.42:1.000:0.874 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 0.13:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:4,3:0.43:-2.83:1.000:0.943 1/1/1:3:0,7:1.00:-2.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,66:0.78: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,75:0.79: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,57:0.65: 0.51:1.000:0.819 1/1/1/1:4:0,94:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,32:0.57:-0.79:1.000:0.945 0/0/1/1:4:58,41:0.41: 1.01:1.000:0.887 1/1/1/1:4:0,96:1.00: 0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,48:0.74:-0.41:1.000:0.998 0/1/1/1:4:10,49:0.83:-0.66:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,41:0.53: 0.09:1.000:0.991 0/1/1/1/1:5:35,96:0.73: 2.34:1.000:0.817 0/0/1/1:4:30,24:0.44:-0.87:1.000:0.974 0/0/1/1:4:41,32:0.44:-0.08:1.000:0.964 0/1/1/1:4:13,45:0.77:-0.70:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,68:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,68:0.67: 1.09:1.000:0.924 0/1/1/1:4:18,38:0.68:-0.79:1.000:0.943 0/1/1/1:4:21,62:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:50,43:0.46: 0.76:1.000:0.989 0/0/1/1:4:37,29:0.44:-0.37:1.000:0.966 0/1/1/1:4:22,53:0.70: 0.00:1.000:0.988 0/1/1/1:4:26,47:0.64:-0.08:1.000:0.710 1/1/1/1:4:0,66:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:30,34:0.53:-0.45:1.000:0.835 0/0/1/1:4:27,36:0.57:-0.50:1.000:0.945 0/0/1/1:4:31,40:0.56:-0.16:1.000:0.963 0/1/1/1:4:24,48:0.66:-0.12:1.000:0.894 0/0/1/1:4:35,28:0.44:-0.50:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,95:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,51:0.77:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:6,53:0.90:-0.66:1.000:0.724 0/1/1/1:4:17,44:0.72:-0.58:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.16:0.887:1.000 0/0/1/1:4:41,46:0.53: 0.51:1.000:0.993 0/0/1/1:4:44,48:0.52: 0.71:1.000:0.995 0/0/1/1:4:29,39:0.57:-0.29:0.999:0.940 0/1/1/1:4:29,49:0.63: 0.13:1.000:0.516 0/0/1/1:4:42,56:0.57: 0.96:1.000:0.945 0/1/1/1:4:28,60:0.68: 0.55:1.000:0.952 0/0/1/1:4:33,35:0.51:-0.29:1.000:0.996 0/1/1/1:4:16,49:0.75:-0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,76:1.00: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,56:0.73: 0.05:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,80:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,44:0.77:-0.75:0.915:1.000 0/1/1/1:4:21,55:0.72: 0.05:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,65:0.84: 0.09:1.000:0.994 0/1/1/1:4:19,54:0.74:-0.08:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,31:0.52:-0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,39:0.53:-0.08:1.000:0.991 0/1/1/1:4:14,38:0.73:-0.95:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,33:0.73:-1.25:1.000:0.998 0/0/1/1:4:23,32:0.58:-0.83:1.000:0.911 1/1/1/1:4:0,63:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00: 0.34:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,38:0.73:-0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:34,41:0.55: 0.00:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,62:1.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,32:0.48:-0.37:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,50:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,32:0.84:-1.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,26:0.70:-1.58:1.000:0.985 0/1/1/1:4:25,45:0.64:-0.20:1.000:0.699 1/1/1/1:4:0,86:1.00: 0.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,34:0.81:-1.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,55:0.86:-0.45:1.000:0.975 0/1/1/1:4:6,22:0.78:-1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,48:0.66:-0.12:0.998:0.894 0/1/1/1:4:11,42:0.79:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,31:0.47:-0.37:1.000:0.992 0/0/1/1:4:35,28:0.44:-0.50:1.000:0.974 0/0/1/1:4:38,40:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,94:0.76: 2.01:0.993:1.000 0/0/1/1:4:43,34:0.44: 0.09:1.000:0.970 0/0/1/1:4:29,25:0.46:-0.87:1.000:0.989 0/1/1/1:4:28,91:0.76: 1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,25:0.48:-0.95:0.999:0.995 0/1/1/1:4:25,49:0.66:-0.04:1.000:0.869 0/0/1/1:4:14,23:0.62:-1.58:1.000:0.570 1/1/1/1:4:0,59:1.00:-0.66:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,48:0.75:-0.45:1.000:0.999 0/1/1/1:4:14,53:0.79:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,25:0.43:-0.70:1.000:0.949 0/1/1/1:4:13,42:0.76:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,69:0.80: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,28:0.46:-0.58:1.000:0.987 0/1/1/1:4:24,47:0.66:-0.16:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 1.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,47:1.00:-1.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,40:0.64:-0.54:1.000:0.724 1/1/1/1:4:0,49:1.00:-1.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,44:1.00:-1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,30:0.81:-1.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,38:0.79:-1.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,37:0.84:-1.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,36:0.44: 0.26:1.000:0.974 0/1/1/1:4:9,24:0.72:-1.75:0.998:0.997 1/1/1/1:4:0,67:1.00:-0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,34:0.52:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:50,52:0.51: 1.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,31:0.48:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,29:0.59:-1.08:1.000:0.860 1/1/1/1:4:0,46:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,27:0.69:-1.50:1.000:0.973 0/1/1/1:4:14,55:0.79:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,41:0.66:-0.54:1.000:0.863 0/0/1/1:4:43,41:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,34:0.85:-1.46:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,79:0.75: 1.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:62,66:0.52: 2.22:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,53:0.49: 1.38:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,69:0.75: 0.71:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,89:1.00: 0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,52:0.50: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,51:0.55: 0.71:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-2.96:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,85:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,66:0.76: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,36:0.47: 0.09:1.000:0.991 0/1/1/1:4:23,71:0.75: 0.80:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,103:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,53:0.84:-0.50:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,77:0.73: 1.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:44,46:0.51: 0.63:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,32:0.41: 0.13:1.000:0.866 0/1/1/1:4:29,59:0.67: 0.55:1.000:0.913 0/0/1/1:4:38,32:0.46:-0.20:1.000:0.986 0/0/1/1:4:42,42:0.50: 0.38:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,35:0.43: 0.30:1.000:0.938 1/1/1/1:4:0,71:1.00:-0.16:0.997:1.000 0/1/1/1:4:12,63:0.84: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,79:0.80: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,39:0.53:-0.04:1.000:0.993 0/1/1/1:4:19,52:0.73:-0.16:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,58:0.78:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,57:0.75: 0.05:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,74:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,73:0.54: 2.47:1.000:0.985 0/0/1/1:4:56,52:0.48: 1.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,74:0.74: 1.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:14,61:0.81: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,60:0.71: 0.38:0.956:0.992 0/1/1/1:4:22,75:0.77: 0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,116:1.00: 1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,60:0.77: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,84:0.82: 1.13:1.000:0.999 -chr8.1 73176490 chr8.1_073176490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:203,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.41:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:78,1:.:-2.12:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:272,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:144,1:.:-0.88:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:231,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:115,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.41:1.000:. ./.:3:187,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:109,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.12:1.000:. ./.:3:106,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:140,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:195,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:245,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:236,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:317,0:.: 2.34:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.14:1.000:. ./.:5:265,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:287,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:197,1:.: 0.11:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:6:235,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:344,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:238,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:224,1:.: 0.62:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.60:0.887:. ./.:4:155,2:.:-0.66:1.000:. ./.:4:267,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.88:0.999:. ./.:4:295,1:.: 1.95:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:190,1:.:-0.02:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:214,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:0.915:. ./.:4:276,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:265,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:328,1:.: 2.56:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:285,1:.: 1.76:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:226,1:.: 0.65:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:320,0:.: 2.40:0.998:. ./.:4:224,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.95:0.993:. ./.:4:187,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:282,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.61:0.999:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:206,1:.: 0.28:1.000:. ./.:4:258,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:228,1:.: 0.69:1.000:. ./.:4:209,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:233,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:216,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:241,1:.: 0.93:1.000:. ./.:4:254,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.17:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:222,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:146,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.09:0.998:. ./.:4:195,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:212,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:251,1:.: 1.12:1.000:. ./.:4:238,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:266,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:165,2:.:-0.47:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:139,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.36:0.997:. ./.:4:131,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:123,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.97:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:213,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.58:0.956:. ./.:4:211,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:202,0:.: 0.19:1.000:. -chr8.1 73208101 chr8.1_073208101 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:122,35:.: 0.79:1.000:. ./.:4:65,54:.:-0.35:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:90,29:.:-0.35:1.000:. ./.:4:113,39:.: 0.64:1.000:. ./.:4:210,0:.: 2.38:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:109,31:.: 0.28:1.000:. ./.:4:56,14:.:-1.81:1.000:. ./.:4:93,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:97,62:.: 0.85:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:92,30:.:-0.26:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:138,29:.: 1.09:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:119,33:.: 0.64:1.000:. ./.:4:133,42:.: 1.33:1.000:. ./.:4:59,9:.:-1.87:1.000:. ./.:4:129,38:.: 1.09:1.000:. ./.:4:108,35:.: 0.37:1.000:. ./.:4:74,27:.:-0.88:1.000:. ./.:4:26,0:.:-3.13:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:118,40:.: 0.82:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.70:1.000:. ./.:3:64,41:.:-0.77:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:201,0:.: 2.11:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:36,11:.:-2.50:1.000:. ./.:4:36,5:.:-2.68:1.000:. ./.:3:15,2:.:-3.40:1.000:. ./.:4:120,36:.: 0.76:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:123,25:.: 0.52:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:138,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:163,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:142,42:.: 1.60:1.000:. ./.:4:76,25:.:-0.88:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:82,30:.:-0.56:1.000:. ./.:5:161,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:47,14:.:-2.08:1.000:. ./.:4:117,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:123,22:.: 0.43:1.000:. ./.:4:186,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:162,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.54:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.91:1.000:. ./.:6:97,26:.:-0.23:1.000:. ./.:4:91,29:.:-0.32:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:117,34:.: 0.61:1.000:. ./.:4:89,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:88,32:.:-0.32:1.000:. ./.:4:125,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:53,18:.:-1.78:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:81,20:.:-0.88:0.887:. ./.:4:76,27:.:-0.82:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.51:0.999:. ./.:4:74,85:.: 0.85:1.000:. ./.:4:92,34:.:-0.14:1.000:. ./.:4:96,26:.:-0.26:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:90,31:.:-0.29:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:140,29:.: 1.15:1.000:. ./.:4:70,21:.:-1.18:0.915:. ./.:4:93,43:.: 0.16:1.000:. ./.:4:93,37:.:-0.02:1.000:. ./.:4:83,19:.:-0.85:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:104,1:.:-0.77:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:118,33:.: 0.61:1.000:. ./.:4:125,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:92,42:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,21:.:-0.53:1.000:. ./.:4:103,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:93,24:.:-0.41:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:130,46:.: 1.36:1.000:. ./.:4:94,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:112,25:.: 0.19:1.000:. ./.:4:88,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:132,0:.: 0.04:0.998:. ./.:4:94,26:.:-0.32:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:183,1:.: 1.60:0.993:. ./.:4:141,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:116,45:.: 0.91:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.53:0.999:. ./.:4:92,28:.:-0.32:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:71,25:.:-1.03:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:81,22:.:-0.82:1.000:. ./.:4:133,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:116,36:.: 0.64:1.000:. ./.:4:87,0:.:-1.30:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:84,20:.:-0.79:1.000:. ./.:4:76,27:.:-0.82:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:108,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:79,13:.:-1.15:1.000:. ./.:4:101,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:91,28:.:-0.35:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:85,0:.:-1.36:0.998:. ./.:4:70,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:83,27:.:-0.62:1.000:. ./.:4:132,41:.: 1.27:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:80,1:.:-1.48:1.000:. ./.:4:105,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:88,21:.:-0.65:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:64,16:.:-1.51:1.000:. ./.:4:89,35:.:-0.20:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:128,42:.: 1.18:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:115,28:.: 0.37:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.12:1.000:. ./.:4:78,23:.:-0.88:1.000:. ./.:4:164,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:184,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:47,8:.:-2.26:1.000:. ./.:4:115,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:170,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:126,38:.: 1.00:1.000:. ./.:4:110,36:.: 0.46:1.000:. ./.:4:83,25:.:-0.68:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.84:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:102,24:.:-0.14:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:124,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.13:0.997:. ./.:4:85,31:.:-0.44:1.000:. ./.:4:114,27:.: 0.31:1.000:. ./.:4:110,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:137,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:111,36:.: 0.49:1.000:. ./.:4:106,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:99,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:177,37:.: 2.50:1.000:. ./.:4:97,26:.:-0.23:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:120,26:.: 0.46:1.000:. ./.:4:111,40:.: 0.61:0.956:. ./.:4:170,0:.: 1.18:1.000:. ./.:4:144,38:.: 1.54:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:85,37:.:-0.26:1.000:. -chr8.1 73257545 chr8.1_073257545 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:309,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:244,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:317,1:.: 0.89:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:407,1:.: 1.91:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.53:1.000:. ./.:4:273,1:.: 0.39:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.95:1.000:. ./.:4:141,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:348,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:327,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:356,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:79,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:314,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:38,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:333,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.52:1.000:. ./.:3:293,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.08:1.000:. ./.:4:82,0:.:-1.77:1.000:. ./.:3:15,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:256,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:251,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:436,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:161,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.27:1.000:. ./.:5:321,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:98,0:.:-1.59:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:209,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:211,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:399,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:251,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:243,0:.: 0.04:1.000:. ./.:6:198,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:254,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:101,0:.:-1.56:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:271,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:325,0:.: 0.97:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:201,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.01:0.887:. ./.:4:229,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:231,0:.:-0.09:0.999:. ./.:4:212,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:389,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:315,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:406,1:.: 1.89:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.95:0.915:. ./.:4:295,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.80:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:84,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:242,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:148,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:420,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:312,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:333,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:193,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:268,0:.: 0.33:0.998:. ./.:4:170,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:208,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.41:0.993:. ./.:4:268,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.57:1.000:. ./.:4:294,0:.: 0.62:0.999:. ./.:4:198,1:.:-0.45:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:203,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:245,2:.: 0.09:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:462,0:.: 2.51:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:308,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:60,0:.:-2.02:1.000:. ./.:4:214,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:223,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.37:0.998:. ./.:4:271,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:267,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:255,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:287,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:252,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:420,0:.: 2.04:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:413,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:302,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:91,0:.:-1.67:1.000:. ./.:4:119,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:336,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:335,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:264,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:330,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:329,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.45:0.997:. ./.:4:290,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:332,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:207,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:339,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:239,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.24:0.956:. ./.:4:322,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:361,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:341,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.58:1.000:. -chr8.1 73520472 chr8.1_073520472 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:163,78:0.32: 0.87:1.000:0.945 0/0/1/1:4:78,102:0.55: 0.08:1.000:0.976 0/0/0/1:4:215,51:0.17: 1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:58,73:0.55:-0.55:1.000:0.981 0/0/0/1:4:208,108:0.35: 1.84:1.000:0.811 0/0/0/1:4:172,97:0.37: 1.24:1.000:0.515 0/0/0/0:4:130,18:0.10:-0.33:1.000:0.859 0/0/0/1:4:130,47:0.25: 0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,124:0.57: 0.42:1.000:0.947 0/0/1/1:4:13,13:0.52:-1.91:1.000:0.994 0/0/0/1:4:60,12:0.14:-1.31:1.000:0.976 0/0/1/1:4:135,119:0.51: 1.04:1.000:0.996 0/0/0/1:4:126,64:0.34: 0.21:1.000:0.862 0/0/1/1:4:89,61:0.44:-0.30:1.000:0.961 0/0/1/1:4:72,78:0.53:-0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:162,33:0.15: 0.28:1.000:0.982 0/0/0/1:4:90,23:0.18:-0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:229,96:0.28: 1.96:1.000:0.994 0/0/1/1:4:104,158:0.57: 1.15:1.000:0.946 0/0/1/1:4:178,122:0.44: 1.64:1.000:0.961 0/0/0/1:4:109,28:0.18:-0.47:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,47:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,95:0.51: 0.32:1.000:0.996 0/0/1/1:4:76,110:0.56: 0.16:1.000:0.959 0/0/1/1:4:37,26:0.45:-1.43:1.000:0.974 0/0/0/1:4:135,62:0.31: 0.30:1.000:0.972 0/0/0/1:4:170,61:0.24: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,55:0.29: 0.15:1.000:0.993 0/1/1:3:53,61:0.54:-0.77:1.000:0.929 0/0/0/1:4:216,71:0.23: 1.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,27:0.18:-0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:104,97:0.51: 0.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:42,9:0.15:-1.59:1.000:0.991 0/0/0/1:4:55,24:0.30:-1.22:1.000:0.988 0/0/1:3:40,23:0.38:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:162,129:0.49: 1.52:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,70:0.46:-0.10:1.000:0.986 0/0/0/1:4:157,63:0.27: 0.60:1.000:0.997 0/0/0/0:4:119,16:0.09:-0.50:1.000:0.906 0/0/1/1:4:131,88:0.43: 0.59:1.000:0.947 0/0/0/0:4:145,20:0.10:-0.11:1.000:0.866 0/0/0/1:4:146,23:0.11:-0.06:1.000:0.546 0/0/1/1:4:98,74:0.47:-0.02:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,37:0.48:-1.15:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,51:0.44:-0.63:1.000:0.965 0/0/1/1:4:43,54:0.55:-0.99:1.000:0.981 0/0/0/0/1:5:263,113:0.29: 2.62:1.000:0.613 0/0/1/1:4:14,16:0.54:-1.86:1.000:0.989 0/0/0/1:4:73,39:0.36:-0.80:1.000:0.726 0/0/0/1:4:37,17:0.31:-1.55:1.000:0.972 0/0/1/1:4:80,70:0.51:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:149,51:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,79:0.36: 0.69:1.000:0.729 0/0/0/1:4:174,48:0.19: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:121,55:0.31: 0.03:1.000:0.977 0/0/0/1:4:114,44:0.26:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:65,44:0.43:-0.84:1.000:0.953 0/0/0/1:4:92,34:0.25:-0.61:1.000:0.999 0/0/0/1:4:160,61:0.26: 0.61:1.000:0.999 0/0/0/0/1/1:6:62,32:0.35:-1.03:1.000:0.907 0/0/0/1:4:85,30:0.24:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:60,41:0.44:-0.94:1.000:0.960 0/0/1/1:4:75,64:0.50:-0.45:1.000:0.997 0/0/1/1:4:26,30:0.54:-1.52:1.000:0.988 0/0/1/1:4:71,118:0.58: 0.20:1.000:0.914 0/0/0/1:4:117,63:0.36: 0.08:1.000:0.699 0/0/1/1:4:100,63:0.41:-0.14:1.000:0.859 0/0/0/1:4:121,49:0.27:-0.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:112,73:0.42: 0.15:0.887:0.915 0/0/0/1:4:125,54:0.29: 0.07:1.000:0.990 0/0/0/1:4:56,20:0.24:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,29:0.26:-0.90:0.999:0.999 0/0/1/1:4:80,48:0.39:-0.59:1.000:0.728 0/0/1/1:4:38,60:0.57:-0.98:1.000:0.934 0/0/1/1:4:32,66:0.60:-0.98:1.000:0.763 0/0/0/1:4:88,41:0.32:-0.58:1.000:0.965 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,82:0.37: 0.71:1.000:0.532 0/0/1/1:4:70,66:0.52:-0.49:1.000:0.996 0/0/1/1:4:98,60:0.40:-0.20:1.000:0.790 0/0/1/1:4:28,58:0.60:-1.13:0.915:0.759 1/1/1/1:4:0,56:1.00:-1.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,82:0.75:-1.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:70,73:0.53:-0.39:1.000:0.993 0/0/0/1:4:135,33:0.17:-0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:35,58:0.58:-1.04:1.000:0.915 0/0/0/1:4:141,66:0.32: 0.43:1.000:0.962 0/0/0/1:4:80,35:0.30:-0.76:1.000:0.988 0/0/0/1:4:105,49:0.32:-0.25:1.000:0.964 0/0/1/1:4:105,71:0.43: 0.03:1.000:0.952 0/0/1/1:4:128,90:0.45: 0.58:1.000:0.975 0/0/0/1:4:191,48:0.18: 0.85:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,64:0.57:-0.89:1.000:0.938 0/0/1/1:4:81,76:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:122,56:0.31: 0.06:1.000:0.973 0/0/0/1:4:138,62:0.30: 0.34:1.000:0.981 0/0/0/1:4:108,43:0.27:-0.29:1.000:0.998 0/0/0/1:4:144,57:0.27: 0.36:1.000:0.998 0/0/0/1:4:187,51:0.19: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,86:0.28: 1.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:129,31:0.17:-0.17:1.000:0.998 0/0/0/1:4:146,59:0.27: 0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,32:0.28:-0.82:1.000:0.996 0/0/0/0:4:159,17:0.07: 0.03:0.998:0.998 0/0/1/1:4:23,33:0.56:-1.52:1.000:0.961 0/0/0/1:4:116,37:0.22:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,30:0.56:-1.57:1.000:0.970 0/0/0/1:4:84,25:0.21:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:295,56:0.14: 2.30:0.993:0.951 0/0/0/1:4:75,34:0.31:-0.84:1.000:0.978 0/0/0/1:4:129,59:0.31: 0.19:1.000:0.974 0/0/1/1:4:103,107:0.53: 0.47:1.000:0.993 0/0/0/1:4:94,53:0.37:-0.34:0.999:0.516 0/0/0/1:4:162,79:0.33: 0.87:1.000:0.926 0/0/1/1:4:51,50:0.52:-0.94:1.000:0.995 0/0/1/1:4:61,99:0.58:-0.17:1.000:0.924 0/0/0/1:4:98,43:0.30:-0.42:1.000:0.987 0/0/0/1:4:71,35:0.33:-0.87:1.000:0.912 0/0/0/1:4:73,24:0.23:-0.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,69:0.42: 0.02:1.000:0.913 0/0/0/1:4:74,34:0.31:-0.85:1.000:0.972 0/0/0/1:4:97,36:0.25:-0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,69:0.58:-0.81:1.000:0.919 0/0/0/1:4:281,99:0.24: 2.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,79:0.41: 0.38:1.000:0.880 0/0/0/1:4:108,60:0.37:-0.07:1.000:0.578 0/0/1/1:4:167,102:0.40: 1.24:1.000:0.783 0/0/1/1:4:102,85:0.50: 0.17:1.000:0.997 0/0/0/1:4:78,41:0.35:-0.71:1.000:0.777 0/0/0/1:4:59,33:0.37:-1.06:1.000:0.550 0/0/0/1:4:112,43:0.26:-0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:242,70:0.20: 1.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,39:0.24:-0.33:0.998:1.000 0/0/1/1:4:87,51:0.39:-0.46:1.000:0.644 0/0/0/1:4:55,17:0.21:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,82:0.31: 1.15:1.000:0.976 0/0/1/1:4:27,36:0.56:-1.43:1.000:0.974 0/0/0/1:4:87,36:0.28:-0.65:1.000:0.995 0/0/0/1:4:142,55:0.26: 0.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:56,66:0.54:-0.67:1.000:0.987 0/0/1/1:4:76,45:0.39:-0.68:1.000:0.681 0/0/1/1:4:66,60:0.51:-0.61:1.000:0.996 0/0/0/1:4:152,50:0.23: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,28:0.38:-1.26:1.000:0.625 0/0/1/1:4:177,134:0.47: 1.78:1.000:0.992 0/0/0/1:4:117,39:0.23:-0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,83:0.57:-0.45:1.000:0.953 0/0/1/1:4:39,77:0.60:-0.74:1.000:0.803 0/0/1/1:4:156,98:0.41: 1.04:1.000:0.853 0/0/1/1:4:154,91:0.39: 0.93:1.000:0.674 0/0/0/1:4:204,104:0.34: 1.74:1.000:0.855 0/0/0/0:4:184,28:0.11: 0.50:1.000:0.585 0/0/1/1:4:50,29:0.38:-1.22:1.000:0.602 0/0/1/1:4:169,124:0.46: 1.55:1.000:0.987 0/0/0/1:4:205,56:0.19: 1.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,74:0.32: 0.71:1.000:0.942 0/0/1/1:4:230,133:0.38: 2.45:1.000:0.589 0/0/1/1:4:184,130:0.45: 1.82:1.000:0.976 0/0/1/1:4:75,83:0.53:-0.20:1.000:0.991 0/0/0/1:4:291,76:0.18: 2.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,71:0.35: 0.41:1.000:0.753 0/0/1/1:4:27,55:0.60:-1.18:1.000:0.775 0/0/0/1:4:109,39:0.24:-0.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,57:0.23: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,26:0.14:-0.14:1.000:0.951 0/0/0/0:4:207,27:0.09: 0.78:1.000:0.940 0/0/0/1:4:168,31:0.13: 0.33:1.000:0.927 0/0/1/1:4:212,136:0.42: 2.26:0.997:0.892 0/0/0/1:4:138,78:0.37: 0.55:1.000:0.506 0/0/0/1:4:152,70:0.31: 0.63:1.000:0.971 0/0/0/1:4:78,24:0.21:-0.93:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,47:0.17: 0.99:1.000:0.997 0/0/0/1:4:187,65:0.24: 1.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,45:0.32:-0.42:1.000:0.961 0/0/0/1:4:127,38:0.21:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,72:0.41: 0.16:1.000:0.864 0/0/0/1:4:98,37:0.26:-0.50:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,67:0.29: 0.64:1.000:0.991 0/0/1/1:4:87,72:0.50:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,103:0.64:-0.46:1.000:0.654 1/1/1/1:4:0,108:1.00:-0.85:0.956:1.000 0/0/1/1:4:116,110:0.52: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:350,126:0.24: 3.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:167,57:0.23: 0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:128,76:0.39: 0.39:1.000:0.691 -chr8.1 73859024 chr8.1_073859024 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,141:.:-0.88:1.000:. ./.:4:3,95:.:-1.52:1.000:. ./.:4:2,196:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.52:1.000:. ./.:4:7,145:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,92:.:-1.59:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.56:1.000:. ./.:4:2,101:.:-1.45:1.000:. ./.:4:3,201:.: 0.02:1.000:. ./.:4:2,169:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.80:1.000:. ./.:4:1,127:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,173:.:-0.43:1.000:. ./.:4:1,204:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,268:.: 0.95:1.000:. ./.:4:5,160:.:-0.55:1.000:. ./.:4:5,115:.:-1.20:1.000:. ./.:4:6,70:.:-1.84:1.000:. ./.:4:2,197:.:-0.05:1.000:. ./.:4:3,210:.: 0.15:1.000:. ./.:4:3,121:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,85:.:-1.71:1.000:. ./.:4:4,190:.:-0.13:1.000:. ./.:4:2,79:.:-1.77:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.45:1.000:. ./.:3:6,135:.:-0.90:1.000:. ./.:4:0,125:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,257:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,49:.:-2.14:1.000:. ./.:4:0,110:.:-1.35:1.000:. ./.:3:0,5:.:-2.87:1.000:. ./.:4:12,85:.:-1.53:1.000:. ./.:4:1,187:.:-0.21:1.000:. ./.:4:2,196:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,285:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,313:.: 1.60:1.000:. ./.:4:0,309:.: 1.54:1.000:. ./.:4:2,221:.: 0.29:1.000:. ./.:4:2,142:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,366:.: 2.37:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.80:1.000:. ./.:5:1,292:.: 1.31:1.000:. ./.:4:3,34:.:-2.41:1.000:. ./.:4:1,207:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,263:.: 0.88:1.000:. ./.:4:4,130:.:-1.00:1.000:. ./.:4:0,317:.: 1.66:1.000:. ./.:4:5,239:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,379:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,228:.: 0.37:1.000:. ./.:4:2,244:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,287:.: 1.22:1.000:. ./.:4:4,300:.: 1.47:1.000:. ./.:4:3,256:.: 0.82:1.000:. ./.:6:3,189:.:-0.16:1.000:. ./.:4:9,169:.:-0.36:1.000:. ./.:4:1,187:.:-0.21:1.000:. ./.:4:10,189:.:-0.05:1.000:. ./.:4:2,216:.: 0.22:1.000:. ./.:4:9,135:.:-0.85:1.000:. ./.:4:5,239:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,118:.:-1.20:1.000:. ./.:4:2,220:.: 0.28:1.000:. ./.:4:4,149:.:-0.72:0.887:. ./.:4:2,179:.:-0.32:1.000:. ./.:4:0,351:.: 2.15:1.000:. ./.:4:0,261:.: 0.85:0.999:. ./.:4:7,154:.:-0.61:1.000:. ./.:4:1,171:.:-0.45:1.000:. ./.:4:1,256:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,311:.: 1.57:1.000:. ./.:4:2,201:.: 0.00:1.000:. ./.:4:2,245:.: 0.64:1.000:. ./.:4:0,347:.: 2.09:1.000:. ./.:4:2,257:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,167:.:-0.52:0.915:. ./.:4:1,254:.: 0.76:1.000:. ./.:4:1,284:.: 1.19:1.000:. ./.:4:2,82:.:-1.72:1.000:. ./.:4:3,234:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,357:.: 2.24:1.000:. ./.:4:0,225:.: 0.32:1.000:. ./.:4:4,202:.: 0.05:1.000:. ./.:4:4,238:.: 0.57:1.000:. ./.:4:4,133:.:-0.95:1.000:. ./.:4:3,181:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,232:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,246:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,128:.:-1.08:1.000:. ./.:4:0,338:.: 1.96:1.000:. ./.:4:7,176:.:-0.29:1.000:. ./.:4:2,226:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.60:1.000:. ./.:4:2,279:.: 1.14:1.000:. ./.:4:3,138:.:-0.90:1.000:. ./.:4:3,184:.:-0.23:1.000:. ./.:4:8,165:.:-0.43:1.000:. ./.:4:0,231:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,340:.: 1.99:0.998:. ./.:4:4,204:.: 0.08:1.000:. ./.:4:6,242:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,287:.: 1.22:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.28:1.000:. ./.:4:2,255:.: 0.79:0.993:. ./.:4:0,266:.: 0.92:1.000:. ./.:4:0,341:.: 2.01:1.000:. ./.:4:1,183:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,348:.: 2.11:0.999:. ./.:4:2,147:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,204:.: 0.03:1.000:. ./.:4:4,180:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,298:.: 1.38:1.000:. ./.:4:3,128:.:-1.04:1.000:. ./.:4:0,302:.: 1.44:1.000:. ./.:4:6,219:.: 0.32:1.000:. ./.:4:3,194:.:-0.08:1.000:. ./.:4:3,218:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,306:.: 1.50:1.000:. ./.:4:1,156:.:-0.66:1.000:. ./.:4:4,162:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,164:.:-0.53:1.000:. ./.:4:2,226:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,291:.: 1.28:1.000:. ./.:4:1,181:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,273:.: 1.02:1.000:. ./.:4:7,159:.:-0.53:1.000:. ./.:4:0,125:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.91:0.998:. ./.:4:0,161:.:-0.61:1.000:. ./.:4:1,183:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,152:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,285:.: 1.19:1.000:. ./.:4:0,310:.: 1.56:1.000:. ./.:4:4,218:.: 0.28:1.000:. ./.:4:3,152:.:-0.69:1.000:. ./.:4:3,245:.: 0.66:1.000:. ./.:4:5,139:.:-0.85:1.000:. ./.:4:6,119:.:-1.13:1.000:. ./.:4:0,276:.: 1.06:1.000:. ./.:4:2,249:.: 0.70:1.000:. ./.:4:4,247:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.45:1.000:. ./.:4:1,201:.:-0.01:1.000:. ./.:4:4,229:.: 0.44:1.000:. ./.:4:6,129:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,171:.:-0.46:1.000:. ./.:4:5,69:.:-1.87:1.000:. ./.:4:0,109:.:-1.36:1.000:. ./.:4:3,221:.: 0.31:1.000:. ./.:4:2,248:.: 0.69:1.000:. ./.:4:4,138:.:-0.88:1.000:. ./.:4:5,123:.:-1.08:1.000:. ./.:4:3,107:.:-1.35:1.000:. ./.:4:1,193:.:-0.13:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.28:1.000:. ./.:4:1,166:.:-0.52:1.000:. ./.:4:3,179:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.48:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,229:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,119:.:-1.20:1.000:. ./.:4:0,138:.:-0.94:1.000:. ./.:4:1,161:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,143:.:-0.85:1.000:. ./.:4:3,221:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,184:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.32:1.000:. ./.:4:2,107:.:-1.36:1.000:. ./.:4:3,186:.:-0.20:1.000:. ./.:4:3,157:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.58:1.000:. ./.:4:3,148:.:-0.75:1.000:. ./.:4:3,207:.: 0.11:0.956:. ./.:4:0,282:.: 1.15:1.000:. ./.:4:5,137:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.05:1.000:. ./.:4:1,157:.:-0.65:1.000:. -chr8.1 74023759 chr8.1_074023759 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:276,155:.: 0.65:1.000:. ./.:4:58,261:.:-0.88:1.000:. ./.:4:231,151:.:-0.02:1.000:. ./.:4:194,153:.:-0.50:1.000:. ./.:4:173,310:.: 1.35:1.000:. ./.:4:283,140:.: 0.54:1.000:. ./.:4:180,85:.:-1.62:1.000:. ./.:4:226,147:.:-0.15:1.000:. ./.:4:273,145:.: 0.47:1.000:. ./.:4:213,28:.:-1.94:1.000:. ./.:4:138,37:.:-2.84:1.000:. ./.:4:152,295:.: 0.86:1.000:. ./.:4:298,48:.:-0.51:1.000:. ./.:4:291,43:.:-0.68:1.000:. ./.:4:203,93:.:-1.19:1.000:. ./.:4:217,113:.:-0.73:1.000:. ./.:4:222,145:.:-0.23:1.000:. ./.:4:219,127:.:-0.51:1.000:. ./.:4:335,181:.: 1.80:1.000:. ./.:4:297,206:.: 1.63:1.000:. ./.:4:125,142:.:-1.59:1.000:. ./.:4:144,192:.:-0.65:1.000:. ./.:4:199,271:.: 1.18:1.000:. ./.:4:217,126:.:-0.55:1.000:. ./.:4:155,42:.:-2.54:1.000:. ./.:4:226,178:.: 0.28:1.000:. ./.:4:265,119:.: 0.00:1.000:. ./.:4:219,119:.:-0.62:1.000:. ./.:3:187,188:.:-0.12:1.000:. ./.:4:292,177:.: 1.16:1.000:. ./.:4:254,114:.:-0.21:1.000:. ./.:4:214,99:.:-0.96:1.000:. ./.:4:81,72:.:-3.14:1.000:. ./.:4:159,113:.:-1.52:1.000:. ./.:3:40,102:.:-3.29:1.000:. ./.:4:156,203:.:-0.34:1.000:. ./.:4:294,47:.:-0.58:1.000:. ./.:4:168,218:.: 0.03:1.000:. ./.:4:267,126:.: 0.13:1.000:. ./.:4:293,146:.: 0.75:1.000:. ./.:4:255,140:.: 0.15:1.000:. ./.:4:251,165:.: 0.44:1.000:. ./.:4:144,214:.:-0.35:1.000:. ./.:4:241,143:.: 0.00:1.000:. ./.:4:314,222:.: 2.08:1.000:. ./.:4:249,200:.: 0.89:1.000:. ./.:5:341,195:.: 2.08:1.000:. ./.:4:102,72:.:-2.86:1.000:. ./.:4:323,51:.:-0.13:1.000:. ./.:4:183,21:.:-2.45:1.000:. ./.:4:249,132:.:-0.04:1.000:. ./.:4:284,138:.: 0.52:1.000:. ./.:4:270,144:.: 0.41:1.000:. ./.:4:282,192:.: 1.23:1.000:. ./.:4:235,160:.: 0.15:1.000:. ./.:4:258,174:.: 0.66:1.000:. ./.:4:297,42:.:-0.61:1.000:. ./.:4:355,54:.: 0.35:1.000:. ./.:4:256,140:.: 0.17:1.000:. ./.:6:155,231:.: 0.03:1.000:. ./.:4:196,271:.: 1.14:1.000:. ./.:4:283,56:.:-0.61:1.000:. ./.:4:298,200:.: 1.56:1.000:. ./.:4:268,189:.: 1.00:1.000:. ./.:4:271,155:.: 0.58:1.000:. ./.:4:292,58:.:-0.46:1.000:. ./.:4:209,147:.:-0.38:1.000:. ./.:4:264,129:.: 0.13:1.000:. ./.:4:195,291:.: 1.40:0.887:. ./.:4:154,222:.:-0.10:1.000:. ./.:4:347,62:.: 0.35:1.000:. ./.:4:160,103:.:-1.64:0.999:. ./.:4:77,355:.: 0.66:1.000:. ./.:4:234,162:.: 0.17:1.000:. ./.:4:179,239:.: 0.47:1.000:. ./.:4:198,155:.:-0.42:1.000:. ./.:4:222,145:.:-0.23:1.000:. ./.:4:270,186:.: 0.99:1.000:. ./.:4:252,150:.: 0.25:1.000:. ./.:4:180,229:.: 0.35:1.000:. ./.:4:201,132:.:-0.69:0.915:. ./.:4:232,154:.: 0.03:1.000:. ./.:4:339,182:.: 1.87:1.000:. ./.:4:199,127:.:-0.79:1.000:. ./.:4:220,131:.:-0.44:1.000:. ./.:4:337,77:.: 0.41:1.000:. ./.:4:204,127:.:-0.72:1.000:. ./.:4:270,58:.:-0.76:1.000:. ./.:4:328,75:.: 0.26:1.000:. ./.:4:249,100:.:-0.47:1.000:. ./.:4:257,138:.: 0.15:1.000:. ./.:4:236,161:.: 0.18:1.000:. ./.:4:301,192:.: 1.49:1.000:. ./.:4:101,136:.:-2.00:1.000:. ./.:4:296,211:.: 1.68:1.000:. ./.:4:159,294:.: 0.95:1.000:. ./.:4:316,54:.:-0.19:1.000:. ./.:4:152,222:.:-0.13:1.000:. ./.:4:277,240:.: 1.82:1.000:. ./.:4:185,205:.: 0.09:1.000:. ./.:4:314,49:.:-0.28:1.000:. ./.:4:229,181:.: 0.36:1.000:. ./.:4:268,145:.: 0.40:1.000:. ./.:4:301,159:.: 1.04:0.998:. ./.:4:253,140:.: 0.13:1.000:. ./.:4:332,68:.: 0.22:1.000:. ./.:4:304,64:.:-0.21:1.000:. ./.:4:309,34:.:-0.55:1.000:. ./.:4:272,186:.: 1.01:0.993:. ./.:4:319,59:.:-0.08:1.000:. ./.:4:267,198:.: 1.11:1.000:. ./.:4:202,315:.: 1.82:1.000:. ./.:4:251,238:.: 1.44:0.999:. ./.:4:259,178:.: 0.73:1.000:. ./.:4:172,27:.:-2.52:1.000:. ./.:4:280,151:.: 0.65:1.000:. ./.:4:226,113:.:-0.61:1.000:. ./.:4:222,139:.:-0.31:1.000:. ./.:4:392,54:.: 0.85:1.000:. ./.:4:247,140:.: 0.05:1.000:. ./.:4:226,148:.:-0.13:1.000:. ./.:4:311,84:.: 0.15:1.000:. ./.:4:367,89:.: 0.99:1.000:. ./.:4:262,147:.: 0.35:1.000:. ./.:4:178,248:.: 0.58:1.000:. ./.:4:297,209:.: 1.67:1.000:. ./.:4:264,169:.: 0.67:1.000:. ./.:4:151,223:.:-0.13:1.000:. ./.:4:148,219:.:-0.23:1.000:. ./.:4:263,46:.:-1.02:1.000:. ./.:4:177,280:.: 1.00:1.000:. ./.:4:254,186:.: 0.77:1.000:. ./.:4:171,117:.:-1.30:0.998:. ./.:4:176,222:.: 0.20:1.000:. ./.:4:229,117:.:-0.51:1.000:. ./.:4:272,152:.: 0.55:1.000:. ./.:4:356,63:.: 0.48:1.000:. ./.:4:223,173:.: 0.17:1.000:. ./.:4:217,112:.:-0.74:1.000:. ./.:4:239,157:.: 0.17:1.000:. ./.:4:341,98:.: 0.75:1.000:. ./.:4:300,177:.: 1.27:1.000:. ./.:4:252,148:.: 0.22:1.000:. ./.:4:271,40:.:-0.99:1.000:. ./.:4:377,70:.: 0.86:1.000:. ./.:4:281,187:.: 1.15:1.000:. ./.:4:315,65:.:-0.05:1.000:. ./.:4:222,114:.:-0.65:1.000:. ./.:4:370,59:.: 0.62:1.000:. ./.:4:124,214:.:-0.62:1.000:. ./.:4:297,208:.: 1.65:1.000:. ./.:4:276,128:.: 0.28:1.000:. ./.:4:192,61:.:-1.78:1.000:. ./.:4:214,111:.:-0.80:1.000:. ./.:4:254,134:.: 0.06:1.000:. ./.:4:362,67:.: 0.62:1.000:. ./.:4:176,276:.: 0.93:1.000:. ./.:4:145,276:.: 0.51:1.000:. ./.:4:243,145:.: 0.06:1.000:. ./.:4:234,130:.:-0.27:1.000:. ./.:4:200,149:.:-0.47:1.000:. ./.:4:187,84:.:-1.54:1.000:. ./.:4:283,51:.:-0.68:1.000:. ./.:4:233,124:.:-0.36:1.000:. ./.:4:182,86:.:-1.58:1.000:. ./.:4:218,140:.:-0.35:1.000:. ./.:4:198,146:.:-0.54:1.000:. ./.:4:175,210:.: 0.02:1.000:. ./.:4:221,176:.: 0.18:1.000:. ./.:4:149,187:.:-0.65:1.000:. ./.:4:217,138:.:-0.39:1.000:. ./.:4:190,113:.:-1.10:1.000:. ./.:4:245,122:.:-0.23:1.000:. ./.:4:227,123:.:-0.46:1.000:. ./.:4:272,26:.:-1.17:1.000:. ./.:4:229,118:.:-0.50:1.000:. ./.:4:264,160:.: 0.55:1.000:. ./.:4:239,172:.: 0.37:1.000:. ./.:4:370,44:.: 0.41:1.000:. ./.:4:215,138:.:-0.42:1.000:. ./.:4:241,147:.: 0.06:0.956:. ./.:4:303,177:.: 1.31:1.000:. ./.:4:229,284:.: 1.76:1.000:. ./.:4:225,132:.:-0.36:1.000:. ./.:4:144,224:.:-0.21:1.000:. -chr8.1 74173994 chr8.1_074173994 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:24,15:0.43: 0.91:1.000:0.948 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,16:0.53: 0.24:1.000:0.991 0/0/1/1:4:21,11:0.39: 0.24:1.000:0.726 0/1/1/1:4:12,29:0.70: 1.11:1.000:0.987 0/0/1/1:4:9,14:0.62:-0.62:1.000:0.545 0/0/0/1:4:15,3:0.23:-1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,16:0.50: 0.53:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,18:1.00:-1.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.28:-1.97:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,19:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,14:0.62:-0.62:1.000:0.545 0/0/1/1:4:30,26:0.50: 2.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:25,12:0.38: 0.72:1.000:0.509 0/1/1/1:4:12,26:0.68: 0.82:1.000:0.963 0/0/0/1:4:35,16:0.37: 2.07:1.000:0.619 0/0/1/1:4:22,14:0.43: 0.62:1.000:0.957 0/0/0/1:4:47,7:0.20: 2.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,23:0.56: 1.30:1.000:0.965 0/0/1/1:4:10,9:0.51:-1.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:9,12:0.59:-0.82:1.000:0.856 0/1/1/1:4:7,19:0.72:-0.34:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,1:0.13:-1.01:1.000:0.859 0/0/1/1:4:18,21:0.56: 0.91:1.000:0.960 0/0/0/1:4:23,6:0.27:-0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,15:0.74:-0.91:1.000:0.999 0/0/1:3:23,16:0.45: 0.91:1.000:0.955 0/0/1/1:4:19,17:0.51: 0.62:1.000:0.996 0/0/0/1:4:23,4:0.21:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.53:-0.34:1.000:0.991 0/0/0/1:4:6,2:0.31:-2.07:1.000:0.977 0/1/1/1:4:3,15:0.82:-1.10:1.000:0.999 1/1/1:3:0,8:1.00:-2.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,17:0.48: 0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:13,12:0.52:-0.43:1.000:0.996 0/0/0/1:4:30,7:0.25: 0.72:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,10:0.32: 0.82:1.000:0.955 0/0/0/1:4:24,6:0.26: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,13:0.61:-0.72:1.000:0.721 0/1/1/1:4:3,19:0.86:-0.72:1.000:0.980 0/1/1/1:4:6,11:0.65:-1.20:1.000:0.821 0/0/0/1:4:29,13:0.36: 1.20:1.000:0.667 0/0/1/1/1:5:11,21:0.66: 0.24:1.000:0.852 0/0/0/1:4:26,9:0.31: 0.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:22,19:0.50: 1.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:18,5:0.28:-0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:7,17:0.70:-0.53:1.000:0.988 0/0/1/1:4:14,18:0.58: 0.24:1.000:0.897 0/1/1/1:4:5,23:0.81:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,6:0.32:-0.62:1.000:0.960 0/0/1/1:4:19,13:0.45: 0.24:1.000:0.980 0/0/1/1:4:19,15:0.48: 0.43:1.000:0.995 0/0/1/1:4:16,8:0.38:-0.53:1.000:0.616 0/0/1/1:4:19,16:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,19:0.78:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:7,13:0.66:-0.91:1.000:0.910 0/1/1/1:4:11,22:0.67: 0.34:1.000:0.919 0/0/0/1:4:19,8:0.35:-0.24:1.000:0.795 0/1/1/1:4:8,23:0.73: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,14:0.53:-0.14:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,27:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.53:-0.34:1.000:0.991 0/1/1/1:4:6,19:0.75:-0.43:1.000:0.999 0/1/1/1:4:6,17:0.73:-0.62:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.91:0.887:1.000 0/0/1/1:4:22,13:0.42: 0.53:1.000:0.908 0/0/1/1:4:18,17:0.52: 0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:12,15:0.58:-0.24:0.999:0.921 0/0/1/1:4:22,13:0.42: 0.53:1.000:0.908 0/0/0/1:4:29,10:0.31: 0.91:1.000:0.968 0/0/1/1:4:18,20:0.55: 0.82:1.000:0.975 0/0/0/1:4:26,12:0.37: 0.82:1.000:0.595 0/1/1/1:4:7,18:0.71:-0.43:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,25:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,27:0.76: 0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,16:0.75:-0.82:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,9:0.45:-0.72:0.915:0.983 0/1/1/1:4:8,15:0.66:-0.62:1.000:0.853 0/1/1/1:4:4,22:0.84:-0.34:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,20:0.73:-0.24:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,13:0.52:-0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,24:0.49: 2.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:6,14:0.70:-0.91:1.000:0.982 0/0/1/1:4:27,16:0.42: 1.30:1.000:0.911 0/0/1/1:4:23,25:0.55: 1.78:1.000:0.980 0/1/1/1:4:4,23:0.84:-0.24:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,14:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/0/1/1:4:30,17:0.41: 1.68:1.000:0.862 0/1/1/1:4:2,13:0.86:-1.39:1.000:0.972 0/0/1/1:4:24,15:0.43: 0.91:1.000:0.948 0/1/1/1:4:3,25:0.89:-0.14:1.000:0.604 0/0/1/1:4:16,8:0.38:-0.53:1.000:0.616 0/0/1/1:4:9,10:0.55:-1.01:1.000:0.975 0/0/1/1:4:19,24:0.58: 1.30:1.000:0.913 0/0/1/1:4:12,18:0.61: 0.05:1.000:0.636 0/0/1/1:4:19,14:0.47: 0.34:1.000:0.991 0/0/1/1:4:17,9:0.40:-0.34:1.000:0.749 0/1/1/1:4:4,11:0.72:-1.39:1.000:0.997 0/0/0/1:4:29,13:0.36: 1.20:0.998:0.667 0/1/1/1:4:7,18:0.71:-0.43:1.000:0.993 0/0/1/1:4:23,23:0.53: 1.59:1.000:0.991 0/0/0/1:4:20,7:0.32:-0.24:1.000:0.963 0/0/1/1:4:18,10:0.41:-0.14:1.000:0.834 0/0/1/1:4:19,18:0.52: 0.72:0.993:0.995 0/0/0/1:4:28,9:0.30: 0.72:1.000:0.984 0/0/1/1:4:9,11:0.57:-0.91:1.000:0.936 0/1/1/1:4:8,30:0.78: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,24:0.55: 1.59:0.999:0.979 0/1/1/1:4:6,22:0.77:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,9:0.58:-1.30:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,14:0.55:-0.24:1.000:0.982 0/1/1/1:4:5,23:0.81:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:15,11:0.47:-0.34:1.000:0.991 0/1/1/1:4:5,27:0.83: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:30,12:0.34: 1.20:1.000:0.869 0/0/1/1:4:21,12:0.41: 0.34:1.000:0.872 0/0/1/1:4:13,14:0.55:-0.24:1.000:0.982 0/1/1/1:4:4,30:0.88: 0.43:1.000:0.852 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,6:0.28:-0.24:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,17:1.00:-1.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.35:-1.20:1.000:0.812 0/0/0/1:4:18,7:0.33:-0.43:1.000:0.899 0/1/1/1:4:8,25:0.74: 0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:24,23:0.52: 1.68:1.000:0.994 0/1/1/1:4:6,10:0.64:-1.30:0.998:0.631 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-1.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,3:0.18:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:27,30:0.55: 2.64:1.000:0.975 0/0/1/1:4:22,12:0.40: 0.43:1.000:0.805 0/0/1/1:4:14,18:0.58: 0.24:1.000:0.897 0/1/1/1:4:4,13:0.75:-1.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:7,13:0.66:-0.91:1.000:0.840 0/1/1/1:4:5,23:0.81:-0.14:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,15:0.93:-1.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,26:0.70: 0.72:1.000:0.984 0/0/0/1:4:17,7:0.35:-0.53:1.000:0.830 0/1/1/1:4:10,29:0.73: 0.91:1.000:0.998 0/0/0/1:4:42,16:0.33: 2.74:1.000:0.917 0/0/0/1:4:28,13:0.37: 1.11:1.000:0.579 0/1/1/1:4:5,17:0.76:-0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,18:0.67:-0.24:1.000:0.919 1/1/1/1:4:0,16:1.00:-1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,29:0.56: 2.35:1.000:0.962 0/0/0/1:4:40,5:0.18: 1.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:1,5:0.82:-2.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,25:0.49: 2.55:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,19:0.58: 0.43:1.000:0.910 1/1/1/1:4:3,30:0.90: 0.34:1.000:0.867 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,15:0.64:-0.53:1.000:0.631 0/0/0/1:4:32,12:0.33: 1.39:1.000:0.928 0/0/0/1:4:28,9:0.30: 0.72:1.000:0.984 0/0/1/1:4:8,11:0.60:-1.01:1.000:0.812 0/0/1/1:4:15,20:0.59: 0.53:1.000:0.856 0/0/1/1:4:16,8:0.38:-0.53:1.000:0.616 0/0/0/1:4:28,5:0.22: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,9:0.31: 0.53:1.000:0.967 0/0/0/1:4:36,9:0.26: 1.49:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.25:-1.30:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,14:0.53:-0.14:1.000:0.991 0/0/0/1:4:27,10:0.33: 0.72:1.000:0.936 0/0/1/1:4:16,16:0.53: 0.24:1.000:0.991 0/1/1/1:4:6,14:0.70:-0.91:1.000:0.982 0/0/0/1:4:26,9:0.31: 0.53:1.000:0.967 0/0/1/1:4:19,16:0.50: 0.53:1.000:0.997 0/1/1/1:4:6,14:0.70:-0.91:1.000:0.982 0/0/0/1:4:29,13:0.36: 1.20:1.000:0.667 0/1/1/1:4:14,26:0.66: 1.01:1.000:0.840 0/0/0/1:4:24,5:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,13:0.61:-0.72:1.000:0.721 0/0/1/1:4:7,11:0.62:-1.10:0.956:0.519 0/1/1/1:4:5,18:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,29:0.70: 1.11:1.000:0.987 0/0/1/1:4:13,8:0.43:-0.82:1.000:0.939 0/0/1/1:4:12,17:0.60:-0.05:1.000:0.760 -chr8.1 74427535 chr8.1_074427535 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:6,3:0.36:-0.89:1.000:0.714 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/0:4:20,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,1:0.13:-0.89:1.000:0.940 0/0/1/1:4:14,13:0.48: 1.30:1.000:0.996 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-0.65:1.000:0.988 0/0/0/0:4:19,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:2,6:0.62:-1.01:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:3,1:0.29:-1.50:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,7:0.47:-0.16:1.000:0.993 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,10:0.50: 0.45:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:12,5:0.32: 0.08:1.000:0.942 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-0.40:1.000:0.804 0/0/0/1:4:34,4:0.13: 2.64:1.000:0.879 0/0/1/1:4:5,7:0.54:-0.53:1.000:0.987 0/0/0/0:4:11,1:0.10:-0.53:1.000:0.788 0/1/1/1:4:2,8:0.65:-0.77:1.000:0.792 0/0/0/1:4:5,2:0.32:-1.14:1.000:0.961 0/0/0/1:4:9,2:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.30:-0.16:1.000:0.984 0/0/0/1:4:6,3:0.36:-0.89:1.000:0.714 0/0/0/0:4:29,1:0.04: 1.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.41: 0.45:1.000:0.890 0/1/1/1:4:2,13:0.68:-0.16:1.000:0.961 0/0/0:3:13,1:0.09:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:5,0:0.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,2:0.10: 0.82:1.000:0.673 0/0/1/1:4:11,18:0.56: 1.55:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:3,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 0/0/0:3:2,0:0.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:13,3:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.44:-0.28:1.000:0.966 0/1/1/1:4:2,7:0.64:-0.89:1.000:0.675 0/0/0/1:4:17,6:0.30: 0.82:1.000:0.988 0/0/0/1:4:14,4:0.26: 0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:10,8:0.45: 0.21:1.000:0.982 0/0/0/1:4:19,9:0.35: 1.42:1.000:0.814 0/0/1/1:4:13,9:0.42: 0.69:1.000:0.923 1/1/1/1:4:0,5:1.00:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:23,9:0.31: 1.91:1.000:0.968 0/0/0/0:4:17,1:0.07: 0.21:1.000:0.999 0/0/0/1/1:5:16,6:0.31: 0.69:1.000:0.560 0/0/0/0:4:46,2:0.05: 3.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,10:0.63:-0.40:1.000:0.623 0/0/1/1:4:12,26:0.59: 2.64:1.000:0.851 1/1/1/1:4:0,13:1.00:-0.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,10:0.48: 0.57:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:24,4:0.17: 1.42:1.000:0.998 0/0/0/0:4:22,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,13:0.43: 1.79:1.000:0.949 0/0/1/1:4:11,12:0.51: 0.82:1.000:0.996 0/0/1/1:4:5,15:0.62: 0.45:1.000:0.503 0/0/0/0/0/0:6:3,0:0.00:-1.62:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.41: 0.45:1.000:0.890 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:13,1:0.09:-0.28:1.000:0.969 0/0/0/1:4:11,3:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:16,5:0.28: 0.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:6,2:0.29:-1.01:1.000:0.993 0/0/1/1:4:8,17:0.59: 1.06:1.000:0.864 0/0/0/0:4:25,0:0.00: 1.06:0.887:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,9:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/0:4:24,0:0.00: 0.94:0.999:1.000 0/0/0/1:4:22,3:0.14: 1.06:1.000:0.980 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,9:0.44: 0.57:1.000:0.966 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,5:0.40:-0.40:1.000:0.804 0/0/0/1:4:10,5:0.36:-0.16:1.000:0.714 0/0/1/1:4:13,10:0.44: 0.82:1.000:0.973 0/0/0/1:4:22,8:0.30: 1.67:1.000:0.984 0/0/1/1:4:6,13:0.59: 0.33:0.915:0.851 0/0/1/1:4:5,9:0.57:-0.28:1.000:0.943 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.04:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/0:4:21,0:0.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,2:0.13: 0.33:1.000:0.879 0/0/1/1:4:5,5:0.50:-0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:1,3:0.62:-1.50:1.000:0.503 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:18,6:0.29: 0.94:1.000:0.993 0/0/0/1:4:12,6:0.36: 0.21:1.000:0.714 0/0/0/1:4:21,4:0.19: 1.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-0.53:1.000:0.714 0/0/0/0:4:26,0:0.00: 1.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,2:0.29:-1.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:4,15:0.64: 0.33:1.000:0.741 0/0/0/1:4:27,6:0.22: 2.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,4:0.32:-0.28:1.000:0.961 0/1/1/1:4:4,15:0.64: 0.33:1.000:0.741 0/0/1/1:4:9,10:0.51: 0.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.65:1.000:0.951 0/0/1/1:4:13,17:0.53: 1.67:0.998:0.991 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:14,6:0.33: 0.45:1.000:0.924 0/1/1/1:4:1,6:0.68:-1.14:1.000:0.950 0/0/0/1:4:12,6:0.36: 0.21:0.993:0.714 0/0/1/1:4:9,12:0.54: 0.57:1.000:0.990 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,4:0.30:-0.16:1.000:0.984 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.16:0.999:1.000 0/0/1/1:4:5,6:0.52:-0.65:1.000:0.994 0/0/0/1:4:12,6:0.36: 0.21:1.000:0.714 0/0/1/1:4:9,14:0.55: 0.82:1.000:0.975 0/1/1/1:4:4,13:0.63: 0.08:1.000:0.594 1/1/1/1:4:0,8:1.00:-1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,20:0.59: 1.55:1.000:0.832 0/0/1/1:4:7,7:0.50:-0.28:1.000:0.997 0/0/0/1:4:21,8:0.31: 1.55:1.000:0.975 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:33,8:0.24: 3.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,16:0.58: 0.94:1.000:0.900 0/0/0/0:4:12,1:0.09:-0.40:1.000:0.918 0/0/0/1:4:7,2:0.26:-0.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:13,3:0.23:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,17:0.58: 1.18:1.000:0.926 0/0/1/1:4:6,6:0.50:-0.53:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,16:0.47: 2.16:1.000:0.994 0/0/0/0:4:10,1:0.11:-0.65:1.000:0.525 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.53:0.998:1.000 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,6:0.44:-0.28:1.000:0.966 0/0/0/1:4:12,2:0.17:-0.28:1.000:0.998 0/0/1/1:4:12,9:0.44: 0.57:1.000:0.966 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,11:0.64:-0.28:1.000:0.721 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/0/1:4:14,7:0.36: 0.57:1.000:0.714 1/1/1/1:4:0,7:1.00:-1.14:1.000:1.000 0/0/0/1:4:4,1:0.24:-1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,9:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,3:0.20: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:11,6:0.37: 0.08:1.000:0.504 0/0/1/1:4:10,6:0.39:-0.04:1.000:0.727 0/1/1/1:4:2,9:0.66:-0.65:1.000:0.863 0/0/1/1:4:10,8:0.45: 0.21:1.000:0.982 0/0/0/1:4:6,1:0.17:-1.14:1.000:0.998 0/0/0/0:4:15,0:0.00:-0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,7:0.45:-0.04:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,2:1.00:-1.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:9,5:0.38:-0.28:1.000:0.544 0/0/0/1:4:21,7:0.29: 1.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:7,6:0.47:-0.40:1.000:0.991 0/0/0/1:4:6,1:0.17:-1.14:1.000:0.998 0/0/0/0:4:14,1:0.08:-0.16:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,9:1.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,8:0.41: 0.45:1.000:0.890 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,11:0.54: 0.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:4,5:0.53:-0.89:1.000:0.993 0/0/0/1:4:21,7:0.29: 1.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,10:0.41: 1.06:1.000:0.890 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:7,3:0.33:-0.77:1.000:0.924 0/0/1/1:4:14,8:0.38: 0.69:1.000:0.615 0/0/1/1:4:8,9:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,4:0.50:-1.01:1.000:0.997 0/0/0/1:4:5,2:0.32:-1.14:1.000:0.961 0/0/1/1:4:8,8:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,17:0.56: 1.30:1.000:0.958 0/0/1/1:4:13,9:0.42: 0.69:1.000:0.923 0/0/1/1:4:5,14:0.62: 0.33:1.000:0.590 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:3,4:0.54:-1.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:6,1:0.17:-1.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:15,12:0.45: 1.30:1.000:0.982 0/0/1/1:4:4,7:0.57:-0.65:1.000:0.951 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.14:0.956:0.966 0/0/0/1:4:14,3:0.21: 0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,8:0.52:-0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,1:0.15:-1.01:1.000:0.989 0/0/1/1:4:6,7:0.52:-0.40:1.000:0.995 -chr8.1 74582413 chr8.1_074582413 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:716,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:436,85:.:-0.43:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:514,110:.: 0.28:1.000:. ./.:4:778,161:.: 2.44:1.000:. ./.:4:535,114:.: 0.45:1.000:. ./.:4:314,72:.:-1.35:1.000:. ./.:4:505,108:.: 0.20:1.000:. ./.:4:459,99:.:-0.17:1.000:. ./.:4:135,82:.:-2.51:1.000:. ./.:4:151,26:.:-2.79:1.000:. ./.:4:569,109:.: 0.65:1.000:. ./.:4:370,217:.: 0.02:1.000:. ./.:4:574,154:.: 0.99:1.000:. ./.:4:395,212:.: 0.16:1.000:. ./.:4:467,111:.:-0.04:1.000:. ./.:4:483,94:.:-0.04:1.000:. ./.:4:530,122:.: 0.47:1.000:. ./.:4:694,145:.: 1.75:1.000:. ./.:4:775,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:208,1:.:-2.57:1.000:. ./.:4:505,119:.: 0.28:1.000:. ./.:4:728,135:.: 1.92:1.000:. ./.:4:523,126:.: 0.45:1.000:. ./.:4:111,34:.:-3.01:1.000:. ./.:4:566,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:571,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:343,218:.:-0.15:1.000:. ./.:3:596,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:434,81:.:-0.47:1.000:. ./.:4:434,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:340,85:.:-1.09:1.000:. ./.:4:80,7:.:-3.41:1.000:. ./.:4:132,77:.:-2.57:1.000:. ./.:3:88,0:.:-3.40:1.000:. ./.:4:655,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:338,190:.:-0.38:1.000:. ./.:4:507,129:.: 0.36:1.000:. ./.:4:375,75:.:-0.92:1.000:. ./.:4:384,86:.:-0.78:1.000:. ./.:4:517,96:.: 0.20:1.000:. ./.:4:495,118:.: 0.20:1.000:. ./.:4:681,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:269,172:.:-0.98:1.000:. ./.:4:381,226:.: 0.16:1.000:. ./.:4:597,122:.: 0.93:1.000:. ./.:5:672,300:.: 2.67:1.000:. ./.:4:306,47:.:-1.58:1.000:. ./.:4:296,183:.:-0.72:1.000:. ./.:4:256,154:.:-1.19:1.000:. ./.:4:415,87:.:-0.56:1.000:. ./.:4:554,125:.: 0.66:1.000:. ./.:4:324,154:.:-0.72:1.000:. ./.:4:713,2:.: 0.90:1.000:. ./.:4:487,77:.:-0.13:1.000:. ./.:4:425,71:.:-0.60:1.000:. ./.:4:489,86:.:-0.06:1.000:. ./.:4:420,118:.:-0.31:1.000:. ./.:4:429,96:.:-0.40:1.000:. ./.:6:416,96:.:-0.49:1.000:. ./.:4:576,143:.: 0.93:1.000:. ./.:4:329,198:.:-0.39:1.000:. ./.:4:389,212:.: 0.12:1.000:. ./.:4:444,87:.:-0.36:1.000:. ./.:4:543,105:.: 0.44:1.000:. ./.:4:469,103:.:-0.08:1.000:. ./.:4:483,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:467,108:.:-0.06:1.000:. ./.:4:584,0:.: 0.00:0.887:. ./.:4:586,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:397,192:.: 0.04:1.000:. ./.:4:439,71:.:-0.50:0.999:. ./.:4:566,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:601,120:.: 0.94:1.000:. ./.:4:458,81:.:-0.30:1.000:. ./.:4:413,79:.:-0.63:1.000:. ./.:4:339,199:.:-0.31:1.000:. ./.:4:486,117:.: 0.13:1.000:. ./.:4:418,208:.: 0.29:1.000:. ./.:4:686,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:242,167:.:-1.20:0.915:. ./.:4:393,237:.: 0.32:1.000:. ./.:4:430,247:.: 0.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:452,61:.:-0.48:1.000:. ./.:4:408,231:.: 0.38:1.000:. ./.:4:285,141:.:-1.08:1.000:. ./.:4:466,87:.:-0.21:1.000:. ./.:4:344,191:.:-0.33:1.000:. ./.:4:453,88:.:-0.29:1.000:. ./.:4:390,73:.:-0.83:1.000:. ./.:4:612,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:581,120:.: 0.81:1.000:. ./.:4:512,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:585,132:.: 0.92:1.000:. ./.:4:506,102:.: 0.17:1.000:. ./.:4:474,116:.: 0.04:1.000:. ./.:4:418,83:.:-0.57:1.000:. ./.:4:591,129:.: 0.94:1.000:. ./.:4:714,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:386,78:.:-0.82:1.000:. ./.:4:669,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:277,172:.:-0.92:1.000:. ./.:4:520,105:.: 0.29:0.998:. ./.:4:291,170:.:-0.84:1.000:. ./.:4:351,188:.:-0.30:1.000:. ./.:4:303,180:.:-0.69:1.000:. ./.:4:335,232:.:-0.11:1.000:. ./.:4:907,1:.: 2.23:0.993:. ./.:4:378,222:.: 0.11:1.000:. ./.:4:528,108:.: 0.36:1.000:. ./.:4:674,128:.: 1.50:1.000:. ./.:4:587,136:.: 0.96:0.999:. ./.:4:387,255:.: 0.40:1.000:. ./.:4:364,78:.:-0.97:1.000:. ./.:4:597,142:.: 1.07:1.000:. ./.:4:373,185:.:-0.17:1.000:. ./.:4:351,181:.:-0.35:1.000:. ./.:4:379,213:.: 0.06:1.000:. ./.:4:359,170:.:-0.37:1.000:. ./.:4:654,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:403,229:.: 0.33:1.000:. ./.:4:507,111:.: 0.24:1.000:. ./.:4:457,145:.: 0.13:1.000:. ./.:4:698,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:582,118:.: 0.80:1.000:. ./.:4:504,112:.: 0.22:1.000:. ./.:4:249,159:.:-1.20:1.000:. ./.:4:386,71:.:-0.87:1.000:. ./.:4:399,75:.:-0.75:1.000:. ./.:4:591,87:.: 0.65:1.000:. ./.:4:514,115:.: 0.31:1.000:. ./.:4:437,0:.:-1.00:0.998:. ./.:4:563,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:450,115:.:-0.13:1.000:. ./.:4:835,155:.: 2.79:1.000:. ./.:4:332,230:.:-0.15:1.000:. ./.:4:559,93:.: 0.47:1.000:. ./.:4:422,114:.:-0.33:1.000:. ./.:4:371,204:.:-0.06:1.000:. ./.:4:527,99:.: 0.29:1.000:. ./.:4:403,232:.: 0.35:1.000:. ./.:4:682,1:.: 0.68:1.000:. ./.:4:397,77:.:-0.75:1.000:. ./.:4:655,181:.: 1.73:1.000:. ./.:4:745,150:.: 2.14:1.000:. ./.:4:388,232:.: 0.25:1.000:. ./.:4:494,96:.: 0.04:1.000:. ./.:4:536,123:.: 0.52:1.000:. ./.:4:597,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:619,136:.: 1.18:1.000:. ./.:4:459,117:.:-0.05:1.000:. ./.:4:190,31:.:-2.49:1.000:. ./.:4:468,102:.:-0.09:1.000:. ./.:4:600,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:444,245:.: 0.72:1.000:. ./.:4:749,131:.: 2.03:1.000:. ./.:4:769,1:.: 1.28:1.000:. ./.:4:376,202:.:-0.04:1.000:. ./.:4:694,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:526,99:.: 0.29:1.000:. ./.:4:388,85:.:-0.76:1.000:. ./.:4:268,189:.:-0.87:1.000:. ./.:4:631,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:423,93:.:-0.46:1.000:. ./.:4:523,131:.: 0.48:1.000:. ./.:4:433,119:.:-0.22:1.000:. ./.:4:419,256:.: 0.63:1.000:. ./.:4:643,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:527,107:.: 0.35:1.000:. ./.:4:422,98:.:-0.44:1.000:. ./.:4:446,2:.:-0.93:1.000:. ./.:4:435,98:.:-0.35:1.000:. ./.:4:595,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:372,74:.:-0.94:1.000:. ./.:4:345,86:.:-1.05:1.000:. ./.:4:522,112:.: 0.35:1.000:. ./.:4:679,113:.: 1.43:1.000:. ./.:4:421,106:.:-0.39:1.000:. ./.:4:304,201:.:-0.54:1.000:. ./.:4:450,244:.: 0.76:0.956:. ./.:4:514,300:.: 1.58:1.000:. ./.:4:977,0:.: 2.70:1.000:. ./.:4:514,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:506,120:.: 0.29:1.000:. -chr8.1 74961533 chr8.1_074961533 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:34,45:0.59: 1.55:1.000:0.864 0/1/1/1:4:7,25:0.79:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,39:0.78:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,35:0.73:-0.38:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,71:1.00: 1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,23:0.60:-0.97:1.000:0.829 0/0/0/1:4:13,3:0.25:-2.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,28:0.73:-1.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,27:0.71:-1.03:1.000:0.990 0/0/0/1:4:32,7:0.25:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,41:0.50: 2.01:1.000:0.997 0/1/1/1:4:16,38:0.72:-0.06:1.000:0.995 0/0/1/1:4:21,25:0.57:-0.58:1.000:0.958 0/0/0/1:4:35,6:0.21:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:6,40:0.88:-0.58:1.000:0.842 0/0/1/1:4:23,22:0.51:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,21:0.48:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:16,19:0.56:-1.29:1.000:0.959 0/1/1/1:4:27,46:0.65: 1.17:1.000:0.770 0/1/1/1:4:18,46:0.73: 0.58:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,37:0.77:-0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,36:0.88:-0.90:1.000:0.671 1/1/1/1:4:0,53:1.00:-0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,33:0.83:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:20,16:0.47:-1.22:1.000:0.993 0/1/1/1:4:16,28:0.65:-0.71:1.000:0.823 0/0/1/1:4:24,26:0.54:-0.32:1.000:0.986 0/0/1/1:4:18,13:0.45:-1.55:1.000:0.982 0/1/1:3:16,23:0.61:-1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,35:0.79:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,23:0.58:-0.90:1.000:0.906 0/0/1/1:4:18,9:0.38:-1.80:1.000:0.542 0/0/0/1:4:26,5:0.23:-1.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,43:0.74: 0.26:1.000:0.999 1/1/1:3:0,25:1.00:-1.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,40:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,18:0.54:-1.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,26:0.60:-0.64:1.000:0.809 0/0/1/1:4:26,16:0.42:-0.84:1.000:0.910 0/1/1/1:4:14,40:0.75:-0.06:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,19:0.39: 0.00:1.000:0.673 0/0/1/1:4:24,25:0.53:-0.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:15,34:0.71:-0.38:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,33:0.81:-0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,44:0.66: 0.84:1.000:0.891 0/1/1/1:4:17,30:0.66:-0.51:1.000:0.837 0/1/1/1/1:5:19,56:0.76: 1.29:1.000:0.953 0/0/1/1:4:12,9:0.46:-2.19:1.000:0.988 0/1/1/1:4:16,45:0.75: 0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,14:0.29: 0.39:1.000:0.993 0/0/1/1:4:34,36:0.54: 0.97:1.000:0.989 0/0/1/1:4:29,20:0.44:-0.38:1.000:0.971 0/1/1/1:4:13,48:0.80: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,31:0.48: 0.91:1.000:0.994 0/0/1/1:4:17,26:0.62:-0.77:1.000:0.525 0/1/1/1:4:13,45:0.79: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,16:0.31: 0.46:1.000:0.968 0/0/1/1:4:65,34:0.39: 2.84:1.000:0.653 0/0/1/1:4:32,43:0.59: 1.29:1.000:0.841 1/1/1/1/1/1:6:0,58:1.00: 0.20:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,37:0.60: 0.58:1.000:0.807 0/1/1/1:4:22,64:0.76: 2.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,32:0.56: 0.26:1.000:0.960 0/1/1/1:4:20,52:0.74: 1.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:29,35:0.57: 0.58:1.000:0.951 0/1/1/1:4:6,32:0.85:-1.09:1.000:0.988 0/0/1/1:4:41,37:0.50: 1.49:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,69:1.00: 0.91:0.887:1.000 0/0/1/1:4:29,23:0.47:-0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:70,14:0.23: 1.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,25:0.69:-1.16:0.999:0.975 0/1/1/1:4:21,40:0.67: 0.39:1.000:0.929 0/1/1/1:4:14,33:0.72:-0.51:1.000:0.994 0/0/1/1:4:39,37:0.51: 1.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:20,35:0.65: 0.00:1.000:0.823 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:13,59:0.83: 1.10:1.000:0.998 0/1/1/1:4:13,28:0.70:-0.90:1.000:0.983 0/1/1/1:4:17,35:0.69:-0.19:1.000:0.971 0/0/0/1:4:43,12:0.28: 0.00:0.915:0.996 0/1/1/1:4:17,39:0.71: 0.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:21,56:0.74: 1.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,44:0.82:-0.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:20,35:0.65: 0.00:1.000:0.823 0/0/1/1:4:33,21:0.43:-0.06:1.000:0.935 1/1/1/1:4:6,46:0.89:-0.19:1.000:0.516 0/0/0/1:4:51,18:0.32: 0.91:1.000:0.964 0/0/1/1:4:36,42:0.56: 1.49:1.000:0.967 0/0/1/1:4:20,23:0.56:-0.77:1.000:0.972 0/1/1/1:4:19,44:0.71: 0.52:1.000:0.993 0/0/1/1:4:37,39:0.54: 1.36:1.000:0.990 0/1/1/1:4:21,57:0.74: 1.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:11,26:0.72:-1.16:1.000:0.995 0/1/1/1:4:19,53:0.75: 1.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,64:1.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:68,29:0.35: 2.72:1.000:0.807 0/0/1/1:4:36,20:0.40: 0.07:1.000:0.777 0/1/1/1:4:21,76:0.79: 2.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,49:0.74: 0.78:1.000:0.999 0/0/1/1:4:29,18:0.42:-0.51:1.000:0.917 0/0/1/1:4:31,38:0.57: 0.91:1.000:0.941 0/1/1/1:4:21,35:0.64: 0.07:1.000:0.720 0/0/1/1:4:40,26:0.43: 0.71:0.998:0.947 0/0/1/1:4:29,22:0.46:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:40,29:0.45: 0.91:1.000:0.982 0/0/1/1:4:34,31:0.50: 0.65:1.000:0.997 0/0/0/1:4:40,9:0.25:-0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:26,41:0.63: 0.78:0.993:0.567 0/0/0/1:4:45,14:0.30: 0.26:1.000:0.989 0/1/1/1:4:20,31:0.63:-0.25:1.000:0.516 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,55:0.69: 1.68:0.999:0.979 0/1/1/1:4:15,59:0.81: 1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:27,18:0.44:-0.64:1.000:0.959 0/1/1/1:4:27,64:0.72: 2.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:24,18:0.46:-0.84:1.000:0.988 0/1/1/1:4:17,48:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,11:0.25: 0.20:1.000:0.999 0/1/1/1:4:17,49:0.75: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:34,19:0.40:-0.13:1.000:0.788 0/0/1/1:4:37,36:0.52: 1.17:1.000:0.995 0/0/1/1:4:34,26:0.46: 0.33:1.000:0.990 0/0/1/1:4:22,26:0.56:-0.45:1.000:0.961 1/1/1/1:4:0,70:1.00: 0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,43:0.69: 0.58:1.000:0.969 0/1/1/1:4:13,50:0.80: 0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:29,22:0.46:-0.25:1.000:0.989 0/1/1/1:4:19,35:0.66:-0.06:1.000:0.897 0/0/0/1:4:49,11:0.25: 0.33:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,63:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,36:0.76:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,45:0.79: 0.20:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,15:0.44:-1.16:1.000:0.967 0/1/1/1:4:22,49:0.70: 1.04:1.000:0.989 0/0/1/1:4:28,14:0.38:-0.84:1.000:0.542 0/0/1/1:4:21,31:0.62:-0.19:1.000:0.629 0/0/1/1:4:26,39:0.62: 0.65:1.000:0.583 0/1/1/1:4:20,50:0.73: 0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:43,32:0.46: 1.29:1.000:0.987 0/1/1/1:4:10,48:0.84: 0.20:1.000:0.997 0/1/1/1:4:12,43:0.79: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,11:0.20: 1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,34:0.54: 0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:27,31:0.56: 0.20:1.000:0.972 0/0/1/1:4:20,22:0.55:-0.84:1.000:0.983 0/0/1/1:4:26,14:0.39:-0.97:1.000:0.717 0/0/0/1:4:35,8:0.25:-0.77:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,52:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,43:0.73: 0.33:1.000:0.998 0/0/1/1:4:19,17:0.50:-1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:41,35:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/1/1/1:4:11,36:0.78:-0.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,25:0.48: 0.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:23,21:0.50:-0.71:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,78:1.00: 1.49:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,36:0.69:-0.13:1.000:0.979 0/0/1/1:4:25,26:0.53:-0.25:1.000:0.991 0/1/1/1:4:8,29:0.79:-1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,18:0.48:-0.97:1.000:0.995 0/0/1/1:4:26,24:0.50:-0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:24,21:0.49:-0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:15,10:0.44:-1.93:1.000:0.959 0/0/1/1:4:25,22:0.49:-0.51:1.000:0.997 0/0/1/1:4:15,18:0.57:-1.42:1.000:0.954 0/0/1/1:4:21,19:0.50:-0.97:1.000:0.997 0/0/1/1:4:21,20:0.51:-0.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:14,34:0.72:-0.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:32,21:0.43:-0.13:1.000:0.952 0/0/1/1:4:25,21:0.48:-0.58:1.000:0.996 0/0/1/1:4:25,16:0.43:-0.90:1.000:0.938 0/0/1/1:4:26,16:0.42:-0.84:1.000:0.910 0/0/0/1:4:42,15:0.32: 0.13:1.000:0.960 0/0/1/1:4:33,29:0.49: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:18,16:0.50:-1.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:15,36:0.72:-0.25:1.000:0.995 0/0/0/1:4:25,10:0.34:-1.29:1.000:0.887 0/1/1/1:4:11,28:0.73:-1.03:1.000:0.998 0/1/1/1:4:12,31:0.73:-0.77:0.956:0.998 0/1/1/1:4:14,41:0.76: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,60:0.79: 1.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:26,8:0.29:-1.35:1.000:0.990 0/0/1/1:4:33,27:0.48: 0.33:1.000:0.995 -chr8.1 75131846 chr8.1_075131846 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:66,201:.: 1.18:1.000:. ./.:4:50,156:.: 0.00:1.000:. ./.:4:100,137:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.20:1.000:. ./.:4:145,147:.: 1.66:1.000:. ./.:4:81,231:.: 2.05:1.000:. ./.:4:40,123:.:-0.83:1.000:. ./.:4:62,148:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,158:.: 0.04:1.000:. ./.:4:0,61:.:-2.79:1.000:. ./.:4:18,76:.:-2.16:1.000:. ./.:4:46,238:.: 1.51:1.000:. ./.:4:67,200:.: 1.18:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.70:1.000:. ./.:4:69,191:.: 1.05:1.000:. ./.:4:64,179:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,263:.: 1.10:0.998:. ./.:4:68,165:.: 0.52:1.000:. ./.:4:82,198:.: 1.43:1.000:. ./.:4:76,238:.: 2.09:1.000:. ./.:4:33,36:.:-2.64:1.000:. ./.:4:63,155:.: 0.24:1.000:. ./.:4:64,227:.: 1.64:1.000:. ./.:4:58,161:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,48:.:-3.05:1.000:. ./.:4:114,106:.: 0.27:1.000:. ./.:4:40,178:.: 0.24:1.000:. ./.:4:50,175:.: 0.37:1.000:. ./.:3:1,205:.: 0.00:1.000:. ./.:4:119,113:.: 0.51:1.000:. ./.:4:113,120:.: 0.52:1.000:. ./.:4:47,187:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,26:.:-3.47:1.000:. ./.:4:21,36:.:-2.87:1.000:. ./.:3:13,20:.:-3.33:1.000:. ./.:4:134,132:.: 1.16:1.000:. ./.:4:1,233:.: 0.54:1.000:. ./.:4:51,165:.: 0.20:1.000:. ./.:4:58,140:.:-0.15:1.000:. ./.:4:109,118:.: 0.41:1.000:. ./.:4:51,135:.:-0.38:1.000:. ./.:4:50,149:.:-0.13:1.000:. ./.:4:72,181:.: 0.91:1.000:. ./.:4:37,150:.:-0.36:1.000:. ./.:4:49,163:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.04:1.000:. ./.:5:122,227:.: 2.76:1.000:. ./.:4:0,100:.:-2.04:1.000:. ./.:4:88,89:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.02:1.000:. ./.:4:42,142:.:-0.42:1.000:. ./.:4:62,212:.: 1.32:1.000:. ./.:4:93,82:.:-0.59:1.000:. ./.:4:48,173:.: 0.29:1.000:. ./.:4:52,155:.: 0.02:1.000:. ./.:4:100,93:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,210:.: 0.08:1.000:. ./.:4:41,116:.:-0.94:1.000:. ./.:4:94,89:.:-0.44:1.000:. ./.:6:32,148:.:-0.50:1.000:. ./.:4:51,156:.: 0.02:1.000:. ./.:4:46,141:.:-0.36:1.000:. ./.:4:54,160:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.90:1.000:. ./.:4:62,176:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,161:.: 0.14:1.000:. ./.:4:41,121:.:-0.85:1.000:. ./.:4:107,110:.: 0.22:1.000:. ./.:4:102,97:.:-0.13:0.887:. ./.:4:43,142:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,235:.: 0.56:1.000:. ./.:4:50,123:.:-0.63:0.999:. ./.:4:44,157:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,215:.: 0.18:1.000:. ./.:4:44,169:.: 0.14:1.000:. ./.:4:42,146:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.44:1.000:. ./.:4:97,92:.:-0.32:1.000:. ./.:4:41,163:.:-0.04:1.000:. ./.:4:52,173:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.77:0.915:. ./.:4:0,201:.:-0.09:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.58:1.000:. ./.:4:51,131:.:-0.46:1.000:. ./.:4:118,91:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.20:1.000:. ./.:4:65,84:.:-1.10:1.000:. ./.:4:42,130:.:-0.65:1.000:. ./.:4:39,124:.:-0.83:1.000:. ./.:4:49,162:.: 0.10:1.000:. ./.:4:108,74:.:-0.46:1.000:. ./.:4:71,70:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.83:1.000:. ./.:4:31,129:.:-0.88:1.000:. ./.:4:49,181:.: 0.47:1.000:. ./.:4:104,81:.:-0.40:1.000:. ./.:4:29,120:.:-1.10:1.000:. ./.:4:80,88:.:-0.73:1.000:. ./.:4:82,79:.:-0.86:1.000:. ./.:4:97,100:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,114:.:-1.06:1.000:. ./.:4:40,173:.: 0.14:1.000:. ./.:4:38,113:.:-1.06:1.000:. ./.:4:38,130:.:-0.73:0.998:. ./.:4:0,177:.:-0.56:1.000:. ./.:4:34,140:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.66:1.000:. ./.:4:120,131:.: 0.87:0.993:. ./.:4:0,223:.: 0.33:1.000:. ./.:4:48,141:.:-0.32:1.000:. ./.:4:79,201:.: 1.43:1.000:. ./.:4:47,133:.:-0.50:0.999:. ./.:4:112,117:.: 0.45:1.000:. ./.:4:34,106:.:-1.27:1.000:. ./.:4:49,176:.: 0.37:1.000:. ./.:4:42,125:.:-0.75:1.000:. ./.:4:50,145:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,187:.:-0.36:1.000:. ./.:4:86,80:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.66:1.000:. ./.:4:45,141:.:-0.38:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.15:1.000:. ./.:4:131,96:.: 0.41:1.000:. ./.:4:97,104:.:-0.09:1.000:. ./.:4:47,171:.: 0.24:1.000:. ./.:4:94,119:.: 0.14:1.000:. ./.:4:67,93:.:-0.88:1.000:. ./.:4:33,112:.:-1.17:1.000:. ./.:4:0,166:.:-0.77:1.000:. ./.:4:100,125:.: 0.37:1.000:. ./.:4:120,109:.: 0.45:1.000:. ./.:4:53,60:.:-1.79:0.998:. ./.:4:94,98:.:-0.27:1.000:. ./.:4:0,217:.: 0.22:1.000:. ./.:4:69,221:.: 1.62:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.64:1.000:. ./.:4:30,135:.:-0.79:1.000:. ./.:4:85,83:.:-0.73:1.000:. ./.:4:30,124:.:-1.00:1.000:. ./.:4:38,113:.:-1.06:1.000:. ./.:4:44,118:.:-0.85:1.000:. ./.:4:59,163:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,137:.:-1.33:1.000:. ./.:4:64,210:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,272:.: 1.28:1.000:. ./.:4:0,238:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,263:.: 1.10:1.000:. ./.:4:103,91:.:-0.23:1.000:. ./.:4:67,200:.: 1.18:1.000:. ./.:4:64,184:.: 0.81:1.000:. ./.:4:7,43:.:-3.01:1.000:. ./.:4:135,123:.: 1.01:1.000:. ./.:4:109,127:.: 0.58:1.000:. ./.:4:70,203:.: 1.30:1.000:. ./.:4:126,145:.: 1.26:1.000:. ./.:4:135,116:.: 0.87:1.000:. ./.:4:60,167:.: 0.41:1.000:. ./.:4:133,113:.: 0.78:1.000:. ./.:4:50,155:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.09:1.000:. ./.:4:44,161:.:-0.02:1.000:. ./.:4:64,180:.: 0.74:1.000:. ./.:4:56,188:.: 0.74:1.000:. ./.:4:64,184:.: 0.81:1.000:. ./.:4:47,172:.: 0.25:1.000:. ./.:4:125,115:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.89:1.000:. ./.:4:63,156:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1,212:.: 0.14:1.000:. ./.:4:99,81:.:-0.50:1.000:. ./.:4:93,112:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.58:1.000:. ./.:4:33,126:.:-0.90:1.000:. ./.:4:50,148:.:-0.15:1.000:. ./.:4:70,204:.: 1.32:1.000:. ./.:4:64,187:.: 0.87:1.000:. ./.:4:0,247:.: 0.79:1.000:. ./.:4:22,206:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,240:.: 0.66:0.956:. ./.:4:79,244:.: 2.26:1.000:. ./.:4:132,136:.: 1.20:1.000:. ./.:4:54,168:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,175:.: 0.20:1.000:. -chr8.1 75206012 chr8.1_075206012 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:93,202:.: 0.63:1.000:. ./.:4:142,137:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.55:1.000:. ./.:4:84,169:.: 0.06:1.000:. ./.:4:93,280:.: 1.69:1.000:. ./.:4:1,390:.: 1.94:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,299:.: 0.69:1.000:. ./.:4:90,209:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,31:.:-2.96:1.000:. ./.:4:0,59:.:-2.57:1.000:. ./.:4:155,149:.: 0.75:1.000:. ./.:4:0,259:.: 0.14:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.10:1.000:. ./.:4:80,257:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,309:.: 0.82:1.000:. ./.:4:84,180:.: 0.21:0.998:. ./.:4:127,201:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,284:.: 0.48:1.000:. ./.:4:92,175:.: 0.25:1.000:. ./.:4:26,32:.:-2.59:1.000:. ./.:4:86,217:.: 0.74:1.000:. ./.:4:99,238:.: 1.20:1.000:. ./.:4:79,204:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,60:.:-2.56:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.07:1.000:. ./.:4:105,168:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,332:.: 1.13:1.000:. ./.:3:98,102:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,181:.:-0.92:1.000:. ./.:4:0,273:.: 0.33:1.000:. ./.:4:2,3:.:-3.31:1.000:. ./.:4:0,59:.:-2.57:1.000:. ./.:3:4,24:.:-3.00:1.000:. ./.:4:77,248:.: 1.04:1.000:. ./.:4:0,232:.:-0.22:1.000:. ./.:4:91,242:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,196:.:-0.71:1.000:. ./.:4:0,293:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.05:1.000:. ./.:4:88,242:.: 1.11:1.000:. ./.:4:64,149:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,271:.: 0.31:1.000:. ./.:4:80,164:.:-0.06:1.000:. ./.:5:0,394:.: 1.98:1.000:. ./.:4:206,422:.: 5.16:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.69:1.000:. ./.:4:85,212:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,296:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,275:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,207:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,243:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,249:.: 0.01:1.000:. ./.:6:109,140:.: 0.01:1.000:. ./.:4:142,136:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,219:.:-0.40:1.000:. ./.:4:93,217:.: 0.84:1.000:. ./.:4:62,121:.:-0.89:1.000:. ./.:4:97,232:.: 1.09:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.35:1.000:. ./.:4:49,92:.:-1.46:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.18:1.000:. ./.:4:71,201:.: 0.32:0.887:. ./.:4:87,102:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,271:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,160:.:-1.20:0.999:. ./.:4:158,71:.:-0.27:1.000:. ./.:4:81,181:.: 0.18:1.000:. ./.:4:81,141:.:-0.36:1.000:. ./.:4:0,165:.:-1.13:1.000:. ./.:4:62,202:.: 0.21:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.44:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.50:1.000:. ./.:4:92,214:.: 0.78:1.000:. ./.:4:56,126:.:-0.90:0.915:. ./.:4:85,224:.: 0.82:1.000:. ./.:4:79,196:.: 0.36:1.000:. ./.:4:84,226:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,241:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,211:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.48:1.000:. ./.:4:88,239:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,251:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.62:1.000:. ./.:4:104,167:.: 0.31:1.000:. ./.:4:60,176:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.63:1.000:. ./.:4:63,160:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,214:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.96:1.000:. ./.:4:0,231:.:-0.24:1.000:. ./.:4:97,240:.: 1.20:1.000:. ./.:4:0,171:.:-1.05:1.000:. ./.:4:94,160:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,186:.:-0.85:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.62:0.998:. ./.:4:54,155:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,213:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,208:.:-0.55:1.000:. ./.:4:0,212:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,316:.: 0.92:0.993:. ./.:4:1,250:.: 0.03:1.000:. ./.:4:0,258:.: 0.13:1.000:. ./.:4:108,285:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,220:.:-0.39:0.999:. ./.:4:0,243:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.78:1.000:. ./.:4:87,231:.: 0.94:1.000:. ./.:4:0,264:.: 0.21:1.000:. ./.:4:67,169:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,270:.: 0.29:1.000:. ./.:4:79,162:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.65:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.74:1.000:. ./.:4:0,326:.: 1.05:1.000:. ./.:4:70,192:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,182:.: 0.05:1.000:. ./.:4:0,248:.:-0.01:1.000:. ./.:4:0,174:.:-1.01:1.000:. ./.:4:59,155:.:-0.47:1.000:. ./.:4:0,148:.:-1.37:1.000:. ./.:4:71,191:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,204:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,134:.:-1.56:0.998:. ./.:4:77,215:.: 0.59:1.000:. ./.:4:73,174:.:-0.02:1.000:. ./.:4:109,213:.: 1.00:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,237:.:-0.16:1.000:. ./.:4:75,185:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,234:.:-0.20:1.000:. ./.:4:84,218:.: 0.73:1.000:. ./.:4:79,151:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,156:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,312:.: 0.86:1.000:. ./.:4:106,203:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,254:.: 0.07:1.000:. ./.:4:99,278:.: 1.75:1.000:. ./.:4:0,280:.: 0.43:1.000:. ./.:4:81,192:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,285:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,235:.:-0.18:1.000:. ./.:4:5,53:.:-2.59:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,223:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,265:.: 0.22:1.000:. ./.:4:78,271:.: 1.37:1.000:. ./.:4:89,279:.: 1.62:1.000:. ./.:4:50,208:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,281:.: 0.44:1.000:. ./.:4:68,231:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,245:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,228:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,174:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,308:.: 0.81:1.000:. ./.:4:82,154:.:-0.17:1.000:. ./.:4:63,203:.: 0.24:1.000:. ./.:4:86,138:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.18:1.000:. ./.:4:70,145:.:-0.46:1.000:. ./.:4:0,185:.:-0.86:1.000:. ./.:4:58,186:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,277:.: 0.39:1.000:. ./.:4:94,169:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,278:.: 0.41:1.000:. ./.:4:70,254:.: 1.03:1.000:. ./.:4:82,231:.: 0.88:0.956:. ./.:4:0,356:.: 1.46:1.000:. ./.:4:106,295:.: 2.07:1.000:. ./.:4:0,229:.:-0.27:1.000:. ./.:4:96,196:.: 0.59:1.000:. -chr8.1 75631452 chr8.1_075631452 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:114,38:.: 0.42:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:105,36:.: 0.07:1.000:. ./.:4:111,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:113,56:.: 0.95:1.000:. ./.:4:185,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:96,0:.:-1.34:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:99,37:.:-0.09:1.000:. ./.:4:37,5:.:-3.04:1.000:. ./.:4:68,15:.:-1.75:1.000:. ./.:4:160,1:.: 0.70:1.000:. ./.:4:106,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:103,30:.:-0.18:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.42:0.998:. ./.:4:134,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:151,49:.: 1.92:1.000:. ./.:4:147,50:.: 1.83:1.000:. ./.:4:61,29:.:-1.53:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:97,41:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:122,37:.: 0.64:1.000:. ./.:4:132,40:.: 1.04:1.000:. ./.:4:135,0:.:-0.12:1.000:. ./.:3:147,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:130,39:.: 0.95:1.000:. ./.:4:110,29:.: 0.01:1.000:. ./.:4:99,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:36,0:.:-3.23:1.000:. ./.:4:58,8:.:-2.29:1.000:. ./.:3:11,0:.:-4.02:1.000:. ./.:4:111,28:.: 0.01:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:126,1:.:-0.37:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:97,28:.:-0.43:1.000:. ./.:4:121,1:.:-0.53:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:158,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:77,38:.:-0.75:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:161,1:.: 0.73:1.000:. ./.:5:169,35:.: 2.05:1.000:. ./.:4:122,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:88,33:.:-0.56:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:77,31:.:-0.97:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:115,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:145,37:.: 1.36:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:140,51:.: 1.64:1.000:. ./.:4:104,34:.:-0.02:1.000:. ./.:6:111,20:.:-0.24:1.000:. ./.:4:100,46:.: 0.23:1.000:. ./.:4:91,38:.:-0.31:1.000:. ./.:4:135,44:.: 1.26:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:109,33:.: 0.10:1.000:. ./.:4:91,29:.:-0.59:1.000:. ./.:4:97,27:.:-0.46:1.000:. ./.:4:95,34:.:-0.31:1.000:. ./.:4:102,36:.:-0.02:0.887:. ./.:4:153,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:187,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.67:0.999:. ./.:4:159,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:129,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:123,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:97,35:.:-0.21:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.00:0.915:. ./.:4:183,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:72,37:.:-0.94:1.000:. ./.:4:125,30:.: 0.51:1.000:. ./.:4:181,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:79,29:.:-0.97:1.000:. ./.:4:95,32:.:-0.37:1.000:. ./.:4:121,22:.: 0.13:1.000:. ./.:4:91,40:.:-0.24:1.000:. ./.:4:88,39:.:-0.37:1.000:. ./.:4:100,41:.: 0.07:1.000:. ./.:4:169,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:190,1:.: 1.64:1.000:. ./.:4:110,26:.:-0.09:1.000:. ./.:4:122,25:.: 0.26:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:119,45:.: 0.79:1.000:. ./.:4:114,37:.: 0.38:1.000:. ./.:4:110,40:.: 0.35:1.000:. ./.:4:130,50:.: 1.30:1.000:. ./.:4:103,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.54:0.998:. ./.:4:108,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:119,38:.: 0.57:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:151,44:.: 1.77:0.993:. ./.:4:130,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:182,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.32:0.999:. ./.:4:88,34:.:-0.53:1.000:. ./.:4:71,24:.:-1.38:1.000:. ./.:4:114,45:.: 0.64:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:92,33:.:-0.43:1.000:. ./.:4:160,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:93,39:.:-0.21:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:110,32:.: 0.10:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:106,45:.: 0.38:1.000:. ./.:4:103,44:.: 0.26:1.000:. ./.:4:113,32:.: 0.20:1.000:. ./.:4:113,30:.: 0.13:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:92,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:84,31:.:-0.75:1.000:. ./.:4:84,23:.:-1.00:1.000:. ./.:4:81,15:.:-1.34:0.998:. ./.:4:115,32:.: 0.26:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:141,58:.: 1.89:1.000:. ./.:4:121,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,28:.:-0.81:1.000:. ./.:4:83,33:.:-0.72:1.000:. ./.:4:131,41:.: 1.04:1.000:. ./.:4:90,42:.:-0.21:1.000:. ./.:4:102,28:.:-0.28:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:152,58:.: 2.24:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:107,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:188,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:103,27:.:-0.28:1.000:. ./.:4:183,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:44,20:.:-2.35:1.000:. ./.:4:78,25:.:-1.12:1.000:. ./.:4:88,34:.:-0.53:1.000:. ./.:4:115,44:.: 0.64:1.000:. ./.:4:124,60:.: 1.42:1.000:. ./.:4:121,50:.: 1.01:1.000:. ./.:4:62,27:.:-1.56:1.000:. ./.:4:125,41:.: 0.86:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:104,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:98,26:.:-0.46:1.000:. ./.:4:149,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:173,0:.: 1.08:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:97,30:.:-0.37:1.000:. ./.:4:98,22:.:-0.59:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:82,32:.:-0.78:1.000:. ./.:4:58,17:.:-2.00:1.000:. ./.:4:193,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:119,38:.: 0.57:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:134,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.04:0.956:. ./.:4:172,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:147,45:.: 1.67:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.89:1.000:. -chr8.1 75760218 chr8.1_075760218 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:130,88:.: 1.02:1.000:. ./.:4:104,96:.: 0.67:1.000:. ./.:4:102,65:.: 0.03:1.000:. ./.:4:132,64:.: 0.59:1.000:. ./.:4:149,105:.: 1.71:1.000:. ./.:4:65,109:.: 0.17:1.000:. ./.:4:69,23:.:-1.41:1.000:. ./.:4:88,68:.:-0.18:1.000:. ./.:4:84,65:.:-0.31:1.000:. ./.:4:32,24:.:-2.11:1.000:. ./.:4:13,9:.:-2.77:1.000:. ./.:4:173,132:.: 2.70:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:91,65:.:-0.18:1.000:. ./.:4:125,37:.:-0.06:1.000:. ./.:4:151,79:.: 1.25:1.000:. ./.:4:164,71:.: 1.35:0.998:. ./.:4:157,30:.: 0.42:1.000:. ./.:4:102,48:.:-0.29:1.000:. ./.:4:145,110:.: 1.73:1.000:. ./.:4:21,31:.:-2.19:1.000:. ./.:4:141,116:.: 1.77:1.000:. ./.:4:154,130:.: 2.29:1.000:. ./.:4:89,64:.:-0.24:1.000:. ./.:4:17,9:.:-2.69:1.000:. ./.:4:74,52:.:-0.76:1.000:. ./.:4:116,70:.: 0.40:1.000:. ./.:4:98,81:.: 0.27:1.000:. ./.:3:98,92:.: 0.48:1.000:. ./.:4:133,37:.: 0.09:1.000:. ./.:4:73,48:.:-0.85:1.000:. ./.:4:60,85:.:-0.39:1.000:. ./.:4:15,14:.:-2.63:1.000:. ./.:4:29,9:.:-2.46:1.000:. ./.:3:12,16:.:-2.65:1.000:. ./.:4:84,99:.: 0.34:1.000:. ./.:4:87,41:.:-0.72:1.000:. ./.:4:138,106:.: 1.52:1.000:. ./.:4:116,63:.: 0.27:1.000:. ./.:4:64,66:.:-0.68:1.000:. ./.:4:127,68:.: 0.57:1.000:. ./.:4:121,70:.: 0.50:1.000:. ./.:4:78,153:.: 1.27:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.08:1.000:. ./.:4:99,78:.: 0.23:1.000:. ./.:4:108,58:.: 0.01:1.000:. ./.:5:119,74:.: 0.54:1.000:. ./.:4:88,46:.:-0.60:1.000:. ./.:4:102,33:.:-0.58:1.000:. ./.:4:69,25:.:-1.38:1.000:. ./.:4:72,69:.:-0.47:1.000:. ./.:4:133,76:.: 0.84:1.000:. ./.:4:104,43:.:-0.35:1.000:. ./.:4:98,158:.: 1.75:1.000:. ./.:4:104,67:.: 0.11:1.000:. ./.:4:100,29:.:-0.70:1.000:. ./.:4:81,85:.: 0.01:1.000:. ./.:4:86,22:.:-1.11:1.000:. ./.:4:80,76:.:-0.18:1.000:. ./.:6:94,76:.: 0.09:1.000:. ./.:4:135,77:.: 0.90:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:113,33:.:-0.37:1.000:. ./.:4:102,64:.: 0.01:1.000:. ./.:4:93,72:.: 0.00:1.000:. ./.:4:61,31:.:-1.41:1.000:. ./.:4:60,46:.:-1.14:1.000:. ./.:4:85,95:.: 0.28:1.000:. ./.:4:83,92:.: 0.19:0.887:. ./.:4:114,69:.: 0.34:1.000:. ./.:4:147,54:.: 0.69:1.000:. ./.:4:63,51:.:-0.99:0.999:. ./.:4:140,85:.: 1.15:1.000:. ./.:4:162,73:.: 1.35:1.000:. ./.:4:103,75:.: 0.25:1.000:. ./.:4:90,54:.:-0.41:1.000:. ./.:4:81,66:.:-0.35:1.000:. ./.:4:58,97:.:-0.20:1.000:. ./.:4:106,77:.: 0.34:1.000:. ./.:4:75,119:.: 0.56:1.000:. ./.:4:105,30:.:-0.58:0.915:. ./.:4:99,67:.: 0.01:1.000:. ./.:4:86,87:.: 0.15:1.000:. ./.:4:143,35:.: 0.25:1.000:. ./.:4:70,23:.:-1.40:1.000:. ./.:4:105,26:.:-0.66:1.000:. ./.:4:90,28:.:-0.91:1.000:. ./.:4:83,40:.:-0.82:1.000:. ./.:4:111,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:109,72:.: 0.30:1.000:. ./.:4:45,64:.:-1.09:1.000:. ./.:4:83,67:.:-0.29:1.000:. ./.:4:134,75:.: 0.84:1.000:. ./.:4:59,113:.: 0.13:1.000:. ./.:4:102,79:.: 0.30:1.000:. ./.:4:104,71:.: 0.19:1.000:. ./.:4:98,39:.:-0.55:1.000:. ./.:4:79,66:.:-0.39:1.000:. ./.:4:135,37:.: 0.13:1.000:. ./.:4:110,121:.: 1.27:1.000:. ./.:4:70,21:.:-1.43:1.000:. ./.:4:110,89:.: 0.65:1.000:. ./.:4:92,52:.:-0.41:1.000:. ./.:4:157,80:.: 1.39:0.998:. ./.:4:84,49:.:-0.62:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:91,37:.:-0.72:1.000:. ./.:4:131,36:.: 0.03:1.000:. ./.:4:139,90:.: 1.23:0.993:. ./.:4:139,47:.: 0.40:1.000:. ./.:4:105,67:.: 0.13:1.000:. ./.:4:129,148:.: 2.16:1.000:. ./.:4:98,84:.: 0.32:0.999:. ./.:4:121,47:.: 0.05:1.000:. ./.:4:36,23:.:-2.05:1.000:. ./.:4:74,43:.:-0.93:1.000:. ./.:4:90,70:.:-0.10:1.000:. ./.:4:88,36:.:-0.80:1.000:. ./.:4:113,37:.:-0.29:1.000:. ./.:4:85,38:.:-0.82:1.000:. ./.:4:108,121:.: 1.23:1.000:. ./.:4:113,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:52,67:.:-0.89:1.000:. ./.:4:88,71:.:-0.12:1.000:. ./.:4:79,97:.: 0.21:1.000:. ./.:4:119,33:.:-0.26:1.000:. ./.:4:47,86:.:-0.62:1.000:. ./.:4:50,57:.:-1.12:1.000:. ./.:4:86,75:.:-0.08:1.000:. ./.:4:47,59:.:-1.14:1.000:. ./.:4:86,61:.:-0.35:1.000:. ./.:4:156,36:.: 0.52:1.000:. ./.:4:57,50:.:-1.12:0.998:. ./.:4:53,96:.:-0.31:1.000:. ./.:4:116,75:.: 0.50:1.000:. ./.:4:144,43:.: 0.42:1.000:. ./.:4:93,46:.:-0.51:1.000:. ./.:4:96,62:.:-0.14:1.000:. ./.:4:69,63:.:-0.64:1.000:. ./.:4:116,42:.:-0.14:1.000:. ./.:4:77,42:.:-0.89:1.000:. ./.:4:113,41:.:-0.22:1.000:. ./.:4:99,70:.: 0.07:1.000:. ./.:4:66,49:.:-0.97:1.000:. ./.:4:107,48:.:-0.20:1.000:. ./.:4:170,105:.: 2.12:1.000:. ./.:4:119,43:.:-0.06:1.000:. ./.:4:96,115:.: 0.88:1.000:. ./.:4:71,95:.: 0.01:1.000:. ./.:4:80,109:.: 0.46:1.000:. ./.:4:136,96:.: 1.29:1.000:. ./.:4:122,90:.: 0.90:1.000:. ./.:4:24,22:.:-2.30:1.000:. ./.:4:42,66:.:-1.11:1.000:. ./.:4:99,82:.: 0.30:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:166,94:.: 1.83:1.000:. ./.:4:97,113:.: 0.86:1.000:. ./.:4:123,30:.:-0.24:1.000:. ./.:4:126,78:.: 0.75:1.000:. ./.:4:121,84:.: 0.77:1.000:. ./.:4:76,89:.: 0.00:1.000:. ./.:4:119,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:110,135:.: 1.54:1.000:. ./.:4:115,52:.: 0.03:1.000:. ./.:4:122,75:.: 0.61:1.000:. ./.:4:95,60:.:-0.20:1.000:. ./.:4:103,71:.: 0.17:1.000:. ./.:4:98,129:.: 1.19:1.000:. ./.:4:150,128:.: 2.18:1.000:. ./.:4:158,64:.: 1.10:1.000:. ./.:4:95,61:.:-0.18:1.000:. ./.:4:94,78:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,94:.: 0.46:1.000:. ./.:4:72,28:.:-1.26:1.000:. ./.:4:97,60:.:-0.16:1.000:. ./.:4:145,85:.: 1.25:1.000:. ./.:4:205,37:.: 1.48:1.000:. ./.:4:68,99:.: 0.03:1.000:. ./.:4:113,74:.: 0.42:1.000:. ./.:4:114,80:.: 0.56:0.956:. ./.:4:118,100:.: 1.02:1.000:. ./.:4:135,143:.: 2.18:1.000:. ./.:4:72,83:.:-0.20:1.000:. ./.:4:133,77:.: 0.86:1.000:. -chr8.1 75987621 chr8.1_075987621 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:135,120:.: 1.01:1.000:. ./.:4:80,81:.:-0.73:1.000:. ./.:4:171,42:.: 0.23:1.000:. ./.:4:173,59:.: 0.59:1.000:. ./.:4:122,106:.: 0.51:1.000:. ./.:4:287,1:.: 1.63:1.000:. ./.:4:163,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:121,88:.: 0.16:1.000:. ./.:4:56,17:.:-2.37:1.000:. ./.:4:57,15:.:-2.39:1.000:. ./.:4:133,94:.: 0.49:1.000:. ./.:4:135,39:.:-0.49:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:120,111:.: 0.57:1.000:. ./.:4:300,1:.: 1.87:1.000:. ./.:4:200,59:.: 1.09:0.998:. ./.:4:162,74:.: 0.66:1.000:. ./.:4:202,59:.: 1.12:1.000:. ./.:4:153,112:.: 1.20:1.000:. ./.:4:27,21:.:-2.83:1.000:. ./.:4:151,53:.: 0.07:1.000:. ./.:4:171,58:.: 0.53:1.000:. ./.:4:93,72:.:-0.66:1.000:. ./.:4:61,0:.:-2.59:1.000:. ./.:4:214,72:.: 1.59:1.000:. ./.:4:166,130:.: 1.78:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.49:1.000:. ./.:3:118,54:.:-0.53:1.000:. ./.:4:187,50:.: 0.68:1.000:. ./.:4:218,37:.: 1.01:1.000:. ./.:4:241,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:36,10:.:-2.87:1.000:. ./.:4:54,12:.:-2.50:1.000:. ./.:3:25,14:.:-3.00:1.000:. ./.:4:106,115:.: 0.38:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:167,48:.: 0.27:1.000:. ./.:4:247,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:191,64:.: 1.01:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:202,63:.: 1.20:1.000:. ./.:4:123,86:.: 0.16:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:183,44:.: 0.49:1.000:. ./.:5:199,44:.: 0.79:1.000:. ./.:4:176,18:.:-0.12:1.000:. ./.:4:187,43:.: 0.55:1.000:. ./.:4:320,0:.: 2.22:1.000:. ./.:4:81,88:.:-0.59:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.98:1.000:. ./.:4:141,51:.:-0.16:1.000:. ./.:4:200,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:194,65:.: 1.09:1.000:. ./.:4:249,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:245,54:.: 1.83:1.000:. ./.:4:171,39:.: 0.18:1.000:. ./.:6:64,88:.:-0.90:1.000:. ./.:4:36,138:.:-0.49:1.000:. ./.:4:170,48:.: 0.33:1.000:. ./.:4:149,92:.: 0.75:1.000:. ./.:4:154,41:.:-0.10:1.000:. ./.:4:127,112:.: 0.72:1.000:. ./.:4:221,55:.: 1.40:1.000:. ./.:4:58,66:.:-1.42:1.000:. ./.:4:136,34:.:-0.57:1.000:. ./.:4:100,81:.:-0.36:0.887:. ./.:4:135,36:.:-0.55:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.22:0.999:. ./.:4:156,99:.: 1.01:1.000:. ./.:4:227,46:.: 1.35:1.000:. ./.:4:136,39:.:-0.47:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:180,46:.: 0.47:1.000:. ./.:4:119,37:.:-0.83:1.000:. ./.:4:234,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:191,52:.: 0.79:1.000:. ./.:4:113,36:.:-0.96:0.915:. ./.:4:185,55:.: 0.73:1.000:. ./.:4:174,47:.: 0.38:1.000:. ./.:4:108,90:.:-0.05:1.000:. ./.:4:149,47:.:-0.08:1.000:. ./.:4:218,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:77,32:.:-1.70:1.000:. ./.:4:128,39:.:-0.62:1.000:. ./.:4:136,36:.:-0.53:1.000:. ./.:4:111,107:.: 0.33:1.000:. ./.:4:115,38:.:-0.88:1.000:. ./.:4:152,51:.: 0.05:1.000:. ./.:4:220,57:.: 1.42:1.000:. ./.:4:122,42:.:-0.68:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:96,93:.:-0.21:1.000:. ./.:4:106,31:.:-1.18:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:114,34:.:-0.98:1.000:. ./.:4:114,104:.: 0.33:1.000:. ./.:4:76,25:.:-1.85:1.000:. ./.:4:106,98:.: 0.07:1.000:. ./.:4:95,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.81:0.998:. ./.:4:131,31:.:-0.72:1.000:. ./.:4:168,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:240,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:174,68:.: 0.77:0.993:. ./.:4:239,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:230,54:.: 1.55:1.000:. ./.:4:168,0:.:-0.60:0.999:. ./.:4:134,57:.:-0.18:1.000:. ./.:4:113,38:.:-0.92:1.000:. ./.:4:147,43:.:-0.20:1.000:. ./.:4:130,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:106,66:.:-0.53:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:130,36:.:-0.64:1.000:. ./.:4:186,60:.: 0.85:1.000:. ./.:4:130,31:.:-0.73:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:183,51:.: 0.62:1.000:. ./.:4:87,86:.:-0.51:1.000:. ./.:4:107,81:.:-0.23:1.000:. ./.:4:104,38:.:-1.09:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:102,30:.:-1.27:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:90,73:.:-0.70:1.000:. ./.:4:168,43:.: 0.20:1.000:. ./.:4:94,18:.:-1.65:0.998:. ./.:4:80,99:.:-0.40:1.000:. ./.:4:152,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:132,115:.: 0.86:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.24:1.000:. ./.:4:97,27:.:-1.42:1.000:. ./.:4:94,82:.:-0.46:1.000:. ./.:4:152,39:.:-0.18:1.000:. ./.:4:73,82:.:-0.85:1.000:. ./.:4:93,70:.:-0.70:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:213,37:.: 0.92:1.000:. ./.:4:179,55:.: 0.62:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:182,46:.: 0.51:1.000:. ./.:4:333,0:.: 2.46:1.000:. ./.:4:95,106:.: 0.01:1.000:. ./.:4:253,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:239,1:.: 0.73:1.000:. ./.:4:29,26:.:-2.70:1.000:. ./.:4:133,27:.:-0.75:1.000:. ./.:4:196,55:.: 0.94:1.000:. ./.:4:154,49:.: 0.05:1.000:. ./.:4:91,110:.: 0.01:1.000:. ./.:4:82,90:.:-0.53:1.000:. ./.:4:118,76:.:-0.12:1.000:. ./.:4:158,54:.: 0.21:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:190,41:.: 0.57:1.000:. ./.:4:159,31:.:-0.20:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:249,1:.: 0.92:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:188,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:140,53:.:-0.14:1.000:. ./.:4:156,32:.:-0.23:1.000:. ./.:4:138,37:.:-0.47:1.000:. ./.:4:122,44:.:-0.64:1.000:. ./.:4:130,44:.:-0.49:1.000:. ./.:4:157,52:.: 0.16:1.000:. ./.:4:179,45:.: 0.44:1.000:. ./.:4:86,82:.:-0.60:1.000:. ./.:4:276,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:102,101:.: 0.05:1.000:. ./.:4:279,0:.: 1.46:1.000:. ./.:4:164,37:.: 0.01:1.000:. ./.:4:186,55:.: 0.75:0.956:. ./.:4:258,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:102,116:.: 0.33:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:177,65:.: 0.77:1.000:. -chr8.1 76052353 chr8.1_076052353 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:79,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:85,21:.: 0.18:1.000:. ./.:4:103,35:.: 0.99:1.000:. ./.:4:115,25:.: 1.04:1.000:. ./.:4:153,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:58,95:.: 1.36:1.000:. ./.:4:39,15:.:-1.13:1.000:. ./.:4:72,62:.: 0.88:1.000:. ./.:4:63,49:.: 0.33:1.000:. ./.:4:17,5:.:-1.94:1.000:. ./.:4:8,7:.:-2.12:1.000:. ./.:4:121,25:.: 1.19:1.000:. ./.:4:105,25:.: 0.78:1.000:. ./.:4:37,78:.: 0.41:1.000:. ./.:4:96,30:.: 0.68:1.000:. ./.:4:133,42:.: 1.92:1.000:. ./.:4:125,28:.: 1.36:0.998:. ./.:4:106,26:.: 0.83:1.000:. ./.:4:86,72:.: 1.49:1.000:. ./.:4:169,42:.: 2.83:1.000:. ./.:4:6,1:.:-2.32:1.000:. ./.:4:92,29:.: 0.56:1.000:. ./.:4:103,27:.: 0.78:1.000:. ./.:4:53,53:.: 0.18:1.000:. ./.:4:3,5:.:-2.29:1.000:. ./.:4:144,31:.: 1.92:1.000:. ./.:4:122,24:.: 1.19:1.000:. ./.:4:54,59:.: 0.35:1.000:. ./.:3:68,29:.:-0.05:1.000:. ./.:4:158,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:93,41:.: 0.88:1.000:. ./.:4:45,75:.: 0.53:1.000:. ./.:4:18,0:.:-2.04:1.000:. ./.:4:15,2:.:-2.07:1.000:. ./.:3:10,2:.:-2.19:1.000:. ./.:4:102,31:.: 0.86:1.000:. ./.:4:67,50:.: 0.46:1.000:. ./.:4:128,25:.: 1.36:1.000:. ./.:4:99,19:.: 0.48:1.000:. ./.:4:68,46:.: 0.38:1.000:. ./.:4:56,19:.:-0.60:1.000:. ./.:4:85,21:.: 0.18:1.000:. ./.:4:66,49:.: 0.41:1.000:. ./.:4:63,12:.:-0.60:1.000:. ./.:4:40,23:.:-0.91:1.000:. ./.:4:83,33:.: 0.43:1.000:. ./.:5:100,56:.: 1.44:1.000:. ./.:4:32,8:.:-1.49:1.000:. ./.:4:76,16:.:-0.17:1.000:. ./.:4:37,36:.:-0.65:1.000:. ./.:4:39,31:.:-0.73:1.000:. ./.:4:86,30:.: 0.43:1.000:. ./.:4:42,21:.:-0.91:1.000:. ./.:4:46,32:.:-0.53:1.000:. ./.:4:91,24:.: 0.41:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:24,60:.:-0.38:1.000:. ./.:4:57,29:.:-0.33:1.000:. ./.:4:42,33:.:-0.60:1.000:. ./.:6:57,4:.:-0.96:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:67,14:.:-0.45:1.000:. ./.:4:69,16:.:-0.35:1.000:. ./.:4:63,18:.:-0.45:1.000:. ./.:4:62,64:.: 0.68:1.000:. ./.:4:47,27:.:-0.63:1.000:. ./.:4:42,11:.:-1.16:1.000:. ./.:4:53,37:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,20:.:-0.38:0.887:. ./.:4:104,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:53,34:.:-0.30:1.000:. ./.:4:52,5:.:-1.06:0.999:. ./.:4:125,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:92,20:.: 0.33:1.000:. ./.:4:60,9:.:-0.75:1.000:. ./.:4:79,24:.: 0.10:1.000:. ./.:4:44,35:.:-0.50:1.000:. ./.:4:42,19:.:-0.96:1.000:. ./.:4:56,34:.:-0.22:1.000:. ./.:4:45,39:.:-0.38:1.000:. ./.:4:41,17:.:-1.03:0.915:. ./.:4:49,37:.:-0.33:1.000:. ./.:4:45,39:.:-0.38:1.000:. ./.:4:77,21:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:54,51:.: 0.15:1.000:. ./.:4:44,10:.:-1.13:1.000:. ./.:4:34,32:.:-0.83:1.000:. ./.:4:56,13:.:-0.75:1.000:. ./.:4:52,39:.:-0.20:1.000:. ./.:4:36,31:.:-0.80:1.000:. ./.:4:79,18:.:-0.05:1.000:. ./.:4:85,18:.: 0.10:1.000:. ./.:4:51,46:.:-0.05:1.000:. ./.:4:71,19:.:-0.22:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:43,20:.:-0.91:1.000:. ./.:4:71,14:.:-0.35:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:122,27:.: 1.26:1.000:. ./.:4:18,15:.:-1.66:1.000:. ./.:4:65,19:.:-0.38:1.000:. ./.:4:29,16:.:-1.36:1.000:. ./.:4:61,22:.:-0.40:0.998:. ./.:4:28,24:.:-1.18:1.000:. ./.:4:93,24:.: 0.46:1.000:. ./.:4:30,30:.:-0.98:1.000:. ./.:4:64,48:.: 0.33:1.000:. ./.:4:90,25:.: 0.41:0.993:. ./.:4:53,43:.:-0.07:1.000:. ./.:4:49,17:.:-0.83:1.000:. ./.:4:129,40:.: 1.77:1.000:. ./.:4:52,15:.:-0.80:0.999:. ./.:4:76,7:.:-0.40:1.000:. ./.:4:27,14:.:-1.46:1.000:. ./.:4:39,32:.:-0.70:1.000:. ./.:4:26,25:.:-1.21:1.000:. ./.:4:61,7:.:-0.78:1.000:. ./.:4:44,22:.:-0.83:1.000:. ./.:4:59,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:49,49:.:-0.02:1.000:. ./.:4:56,11:.:-0.80:1.000:. ./.:4:26,56:.:-0.43:1.000:. ./.:4:73,59:.: 0.83:1.000:. ./.:4:54,16:.:-0.73:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:45,26:.:-0.70:1.000:. ./.:4:38,27:.:-0.86:1.000:. ./.:4:33,20:.:-1.16:1.000:. ./.:4:12,38:.:-1.23:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:148,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:50,14:.:-0.88:0.998:. ./.:4:36,12:.:-1.28:1.000:. ./.:4:58,18:.:-0.58:1.000:. ./.:4:169,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:47,42:.:-0.25:1.000:. ./.:4:46,14:.:-0.98:1.000:. ./.:4:30,26:.:-1.08:1.000:. ./.:4:75,19:.:-0.12:1.000:. ./.:4:42,46:.:-0.28:1.000:. ./.:4:49,13:.:-0.93:1.000:. ./.:4:75,25:.: 0.03:1.000:. ./.:4:12,34:.:-1.33:1.000:. ./.:4:67,54:.: 0.56:1.000:. ./.:4:98,18:.: 0.43:1.000:. ./.:4:84,71:.: 1.41:1.000:. ./.:4:31,66:.:-0.05:1.000:. ./.:4:37,83:.: 0.53:1.000:. ./.:4:75,13:.:-0.28:1.000:. ./.:4:159,47:.: 2.70:1.000:. ./.:4:115,22:.: 0.96:1.000:. ./.:4:9,4:.:-2.17:1.000:. ./.:4:43,27:.:-0.73:1.000:. ./.:4:97,27:.: 0.63:1.000:. ./.:4:118,22:.: 1.04:1.000:. ./.:4:182,0:.: 2.09:1.000:. ./.:4:115,32:.: 1.21:1.000:. ./.:4:95,17:.: 0.33:1.000:. ./.:4:97,32:.: 0.76:1.000:. ./.:4:100,36:.: 0.93:1.000:. ./.:4:27,56:.:-0.40:1.000:. ./.:4:119,19:.: 0.99:1.000:. ./.:4:68,55:.: 0.61:1.000:. ./.:4:97,34:.: 0.81:1.000:. ./.:4:99,21:.: 0.53:1.000:. ./.:4:118,23:.: 1.06:1.000:. ./.:4:69,66:.: 0.91:1.000:. ./.:4:51,54:.: 0.15:1.000:. ./.:4:150,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:98,22:.: 0.53:1.000:. ./.:4:88,25:.: 0.35:1.000:. ./.:4:42,37:.:-0.50:1.000:. ./.:4:63,48:.: 0.30:1.000:. ./.:4:53,46:.: 0.00:1.000:. ./.:4:82,22:.: 0.13:1.000:. ./.:4:144,33:.: 1.97:1.000:. ./.:4:200,0:.: 2.55:1.000:. ./.:4:42,69:.: 0.30:1.000:. ./.:4:68,60:.: 0.73:1.000:. ./.:4:94,73:.: 1.72:0.956:. ./.:4:90,63:.: 1.36:1.000:. ./.:4:105,40:.: 1.16:1.000:. ./.:4:66,49:.: 0.41:1.000:. ./.:4:83,28:.: 0.30:1.000:. -chr8.1 76293439 chr8.1_076293439 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:125,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:156,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:237,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:21,1:.:-0.99:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:106,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:232,0:.: 2.00:0.998:. ./.:4:106,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:19,0:.:-1.03:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:272,0:.: 2.57:1.000:. ./.:4:117,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:120,1:.: 0.42:1.000:. ./.:4:120,0:.: 0.41:1.000:. ./.:3:121,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:132,1:.: 0.59:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.15:1.000:. ./.:3:16,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:138,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:104,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:268,0:.: 2.52:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.75:1.000:. ./.:5:132,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:205,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:118,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:6:117,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:192,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:151,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.19:0.887:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:66,0:.:-0.36:0.999:. ./.:4:149,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.65:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:91,1:.: 0.01:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.42:0.915:. ./.:4:148,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:121,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:74,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:152,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:115,1:.: 0.35:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:78,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:59,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.49:0.998:. ./.:4:85,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:125,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.15:0.993:. ./.:4:114,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:268,1:.: 2.53:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.51:0.999:. ./.:4:79,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:145,1:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:102,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:119,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.22:0.998:. ./.:4:67,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:189,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:300,1:.: 2.99:1.000:. ./.:4:96,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:13,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:314,0:.: 3.17:1.000:. ./.:4:129,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:103,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:84,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:19,1:.:-1.02:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.18:1.000:. ./.:4:15,0:.:-1.09:1.000:. ./.:4:116,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:284,2:.: 2.77:1.000:. ./.:4:136,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.21:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:107,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:124,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:113,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:111,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:110,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:134,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:239,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:96,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:140,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:225,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:14,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:163,1:.: 1.03:1.000:. ./.:4:240,0:.: 2.12:0.956:. ./.:4:175,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:11,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:101,0:.: 0.14:1.000:. -chr8.1 76404299 chr8.1_076404299 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:522,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:415,1:.:-0.73:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:462,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:547,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:546,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:385,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:245,0:.:-2.60:1.000:. ./.:4:278,0:.:-2.24:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:530,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:451,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:521,0:.: 0.42:0.998:. ./.:4:522,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:683,0:.: 2.20:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:251,0:.:-2.53:1.000:. ./.:4:476,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:486,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,0:.:-3.69:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:466,2:.:-0.16:1.000:. ./.:4:458,0:.:-0.27:1.000:. ./.:3:466,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:126,0:.:-3.90:1.000:. ./.:4:289,0:.:-2.12:1.000:. ./.:3:89,0:.:-4.30:1.000:. ./.:4:497,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:374,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:546,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:575,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:528,1:.: 0.51:1.000:. ./.:4:561,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:607,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:492,0:.: 0.11:1.000:. ./.:5:703,0:.: 2.41:1.000:. ./.:4:587,1:.: 1.16:1.000:. ./.:4:525,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:547,0:.: 0.71:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:544,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:487,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:583,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:596,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:490,1:.: 0.09:1.000:. ./.:6:448,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:493,1:.: 0.13:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:578,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:493,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:384,1:.:-1.06:1.000:. ./.:4:502,1:.: 0.23:1.000:. ./.:4:572,1:.: 0.99:0.887:. ./.:4:401,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:628,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:370,0:.:-1.23:0.999:. ./.:4:601,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:474,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:516,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:524,1:.: 0.47:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:532,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:413,0:.:-0.76:0.915:. ./.:4:528,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:624,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:637,1:.: 1.70:0.980:. ./.:4:591,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:385,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:455,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:579,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:376,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:636,0:.: 1.68:1.000:. ./.:4:546,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:556,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:534,1:.: 0.58:1.000:. ./.:4:425,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:562,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:378,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.17:0.998:. ./.:4:431,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:467,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:437,1:.:-0.48:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:576,0:.: 1.02:0.993:. ./.:4:478,1:.:-0.04:1.000:. ./.:4:520,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:624,0:.: 1.55:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.18:0.999:. ./.:4:518,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:627,0:.: 1.58:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:470,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:503,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:463,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:479,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:517,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:539,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:510,1:.: 0.31:1.000:. ./.:4:440,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:378,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:422,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:292,0:.:-2.08:0.998:. ./.:4:466,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:606,0:.: 1.35:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.91:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:444,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:560,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:638,0:.: 1.70:1.000:. ./.:4:477,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:471,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:569,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:435,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:222,0:.:-2.85:1.000:. ./.:4:336,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:580,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:584,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:588,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:514,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:459,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:480,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:466,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:449,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:448,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:478,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:437,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:352,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:462,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:415,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:439,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:536,1:.: 0.60:1.000:. ./.:4:448,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:500,0:.: 0.19:0.956:. ./.:4:598,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:608,0:.: 1.37:1.000:. ./.:4:431,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:446,0:.:-0.40:1.000:. -chr8.1 77225287 chr8.1_077225287 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,541:.:-0.05:1.000:. ./.:4:110,303:.:-1.31:1.000:. ./.:4:137,376:.:-0.33:1.000:. ./.:4:1,516:.:-0.29:1.000:. ./.:4:203,456:.: 1.10:1.000:. ./.:4:150,479:.: 0.81:1.000:. ./.:4:0,409:.:-1.35:1.000:. ./.:4:138,387:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,420:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,320:.:-2.22:1.000:. ./.:4:0,304:.:-2.38:1.000:. ./.:4:133,449:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,504:.:-0.42:1.000:. ./.:4:1,586:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,459:.:-0.86:1.000:. ./.:4:113,415:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,539:.:-0.07:0.998:. ./.:4:1,529:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,673:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,642:.: 0.93:1.000:. ./.:4:70,289:.:-1.84:1.000:. ./.:4:143,366:.:-0.37:1.000:. ./.:4:147,448:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,506:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,237:.:-3.03:1.000:. ./.:4:154,375:.:-0.17:1.000:. ./.:4:0,498:.:-0.48:1.000:. ./.:4:149,376:.:-0.21:1.000:. ./.:3:0,457:.:-0.88:1.000:. ./.:4:145,377:.:-0.24:1.000:. ./.:4:137,391:.:-0.18:1.000:. ./.:4:118,307:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,215:.:-3.22:1.000:. ./.:4:103,292:.:-1.49:1.000:. ./.:3:35,107:.:-3.96:1.000:. ./.:4:156,370:.:-0.20:1.000:. ./.:4:2,482:.:-0.61:1.000:. ./.:4:117,387:.:-0.42:1.000:. ./.:4:151,444:.: 0.47:1.000:. ./.:4:128,381:.:-0.37:1.000:. ./.:4:142,438:.: 0.33:1.000:. ./.:4:135,493:.: 0.80:1.000:. ./.:4:179,492:.: 1.22:1.000:. ./.:4:1,478:.:-0.66:1.000:. ./.:4:180,601:.: 2.30:1.000:. ./.:4:0,616:.: 0.68:1.000:. ./.:5:175,611:.: 2.35:1.000:. ./.:4:0,495:.:-0.51:1.000:. ./.:4:147,394:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,752:.: 2.01:1.000:. ./.:4:0,580:.: 0.33:1.000:. ./.:4:175,534:.: 1.59:1.000:. ./.:4:140,395:.:-0.11:1.000:. ./.:4:153,484:.: 0.89:1.000:. ./.:4:136,327:.:-0.82:1.000:. ./.:4:155,377:.:-0.14:1.000:. ./.:4:0,573:.: 0.26:1.000:. ./.:4:1,703:.: 1.54:1.000:. ./.:4:137,436:.: 0.26:1.000:. ./.:6:57,509:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,541:.:-0.05:1.000:. ./.:4:0,495:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,719:.: 1.69:1.000:. ./.:4:1,605:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,502:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,560:.: 0.13:1.000:. ./.:4:0,478:.:-0.67:1.000:. ./.:4:151,402:.: 0.06:1.000:. ./.:4:172,431:.: 0.55:0.887:. ./.:4:141,352:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,708:.: 1.58:1.000:. ./.:4:120,392:.:-0.34:0.999:. ./.:4:172,400:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1,510:.:-0.35:1.000:. ./.:4:154,454:.: 0.60:1.000:. ./.:4:128,422:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,587:.: 0.41:1.000:. ./.:4:178,495:.: 1.24:1.000:. ./.:4:126,480:.: 0.58:1.000:. ./.:4:171,488:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,528:.:-0.18:0.915:. ./.:4:0,677:.: 1.28:1.000:. ./.:4:3,716:.: 1.69:1.000:. ./.:4:0,392:.:-1.51:1.000:. ./.:4:156,434:.: 0.43:0.980:. ./.:4:0,698:.: 1.48:1.000:. ./.:4:130,376:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,562:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,539:.:-0.07:1.000:. ./.:4:3,506:.:-0.37:1.000:. ./.:4:137,356:.:-0.52:1.000:. ./.:4:140,384:.:-0.22:1.000:. ./.:4:2,597:.: 0.51:1.000:. ./.:4:114,308:.:-1.22:1.000:. ./.:4:161,505:.: 1.17:1.000:. ./.:4:191,383:.: 0.27:1.000:. ./.:4:2,646:.: 0.99:1.000:. ./.:4:299,287:.: 0.39:1.000:. ./.:4:184,517:.: 1.51:1.000:. ./.:4:124,338:.:-0.83:1.000:. ./.:4:1,628:.: 0.81:1.000:. ./.:4:1,685:.: 1.37:1.000:. ./.:4:137,411:.: 0.01:1.000:. ./.:4:185,544:.: 1.79:0.998:. ./.:4:1,529:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,497:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,599:.: 0.51:1.000:. ./.:4:0,474:.:-0.71:1.000:. ./.:4:166,484:.: 1.01:0.993:. ./.:4:0,494:.:-0.52:1.000:. ./.:4:145,496:.: 0.93:1.000:. ./.:4:179,460:.: 0.91:1.000:. ./.:4:159,557:.: 1.66:0.999:. ./.:4:153,460:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,468:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,663:.: 1.14:1.000:. ./.:4:154,444:.: 0.50:1.000:. ./.:4:0,512:.:-0.34:1.000:. ./.:4:2,647:.: 1.00:1.000:. ./.:4:133,385:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,553:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,553:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,596:.: 0.48:1.000:. ./.:4:110,353:.:-0.82:1.000:. ./.:4:152,433:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,657:.: 1.09:1.000:. ./.:4:203,453:.: 1.07:1.000:. ./.:4:279,278:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,466:.:-0.79:1.000:. ./.:4:0,480:.:-0.65:1.000:. ./.:4:172,432:.: 0.56:1.000:. ./.:4:120,366:.:-0.59:1.000:. ./.:4:91,288:.:-1.64:0.998:. ./.:4:163,413:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,524:.:-0.22:1.000:. ./.:4:1,635:.: 0.88:1.000:. ./.:4:0,565:.: 0.18:1.000:. ./.:4:157,488:.: 0.96:1.000:. ./.:4:126,402:.:-0.18:1.000:. ./.:4:1,575:.: 0.29:1.000:. ./.:4:1,607:.: 0.60:1.000:. ./.:4:1,623:.: 0.76:1.000:. ./.:4:2,481:.:-0.62:1.000:. ./.:4:0,572:.: 0.25:1.000:. ./.:4:2,671:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,664:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,570:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,523:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,643:.: 0.94:1.000:. ./.:4:128,366:.:-0.52:1.000:. ./.:4:149,467:.: 0.68:1.000:. ./.:4:134,385:.:-0.27:1.000:. ./.:4:3,258:.:-2.80:1.000:. ./.:4:128,242:.:-1.73:1.000:. ./.:4:151,414:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,577:.: 0.30:1.000:. ./.:4:188,461:.: 1.00:1.000:. ./.:4:165,389:.: 0.07:1.000:. ./.:4:1,416:.:-1.27:1.000:. ./.:4:122,399:.:-0.25:1.000:. ./.:4:128,351:.:-0.66:1.000:. ./.:4:0,369:.:-1.74:1.000:. ./.:4:0,392:.:-1.51:1.000:. ./.:4:135,365:.:-0.46:1.000:. ./.:4:128,420:.: 0.01:1.000:. ./.:4:147,399:.:-0.01:1.000:. ./.:4:118,343:.:-0.84:1.000:. ./.:4:267,239:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,533:.:-0.13:1.000:. ./.:4:128,373:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,443:.:-1.01:1.000:. ./.:4:105,313:.:-1.26:1.000:. ./.:4:150,435:.: 0.38:1.000:. ./.:4:1,475:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,412:.:-1.32:1.000:. ./.:4:118,276:.:-1.49:1.000:. ./.:4:151,453:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,605:.: 0.57:1.000:. ./.:4:0,608:.: 0.60:1.000:. ./.:4:48,412:.:-0.85:1.000:. ./.:4:3,586:.: 0.42:0.956:. ./.:4:0,672:.: 1.23:1.000:. ./.:4:189,455:.: 0.95:1.000:. ./.:4:126,371:.:-0.49:1.000:. ./.:4:144,399:.:-0.04:1.000:. -chr8.1 77394125 chr8.1_077394125 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:1,26:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,27:.:-0.91:1.000:. ./.:4:6,19:.:-1.00:1.000:. ./.:4:9,12:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,40:.: 0.38:1.000:. ./.:4:3,12:.:-1.46:1.000:. ./.:4:6,10:.:-1.42:1.000:. ./.:4:12,17:.:-0.82:1.000:. ./.:4:2,22:.:-1.05:1.000:. ./.:4:14,37:.: 0.20:1.000:. ./.:4:4,36:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,38:.:-0.40:1.000:. ./.:4:9,33:.:-0.22:1.000:. ./.:4:6,21:.:-0.91:1.000:. ./.:4:11,30:.:-0.27:1.000:. ./.:4:4,13:.:-1.37:1.000:. ./.:4:12,17:.:-0.82:0.998:. ./.:4:10,26:.:-0.50:1.000:. ./.:4:5,30:.:-0.54:1.000:. ./.:4:4,26:.:-0.77:1.000:. ./.:4:16,63:.: 1.48:1.000:. ./.:4:8,17:.:-1.00:1.000:. ./.:4:17,19:.:-0.50:1.000:. ./.:4:3,21:.:-1.05:1.000:. ./.:4:17,24:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,24:.:-1.00:1.000:. ./.:4:1,10:.:-1.65:1.000:. ./.:4:8,14:.:-1.14:1.000:. ./.:3:11,26:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,14:.:-1.23:1.000:. ./.:4:2,5:.:-1.83:1.000:. ./.:4:1,7:.:-1.78:1.000:. ./.:4:25,14:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,27:.:-0.03:1.000:. ./.:3:8,33:.:-0.27:1.000:. ./.:4:1,23:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,9:.:-1.14:1.000:. ./.:4:17,13:.:-0.77:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.59:1.000:. ./.:4:4,14:.:-1.32:1.000:. ./.:4:34,34:.: 0.98:1.000:. ./.:4:15,25:.:-0.31:1.000:. ./.:4:18,44:.: 0.70:1.000:. ./.:4:13,46:.: 0.56:1.000:. ./.:4:25,41:.: 0.89:1.000:. ./.:4:28,28:.: 0.43:1.000:. ./.:5:17,28:.:-0.08:1.000:. ./.:4:25,37:.: 0.70:1.000:. ./.:4:12,37:.: 0.10:1.000:. ./.:4:30,34:.: 0.79:1.000:. ./.:4:12,62:.: 1.25:1.000:. ./.:4:20,35:.: 0.38:1.000:. ./.:4:21,62:.: 1.67:1.000:. ./.:4:27,35:.: 0.70:1.000:. ./.:4:15,19:.:-0.59:1.000:. ./.:4:22,53:.: 1.30:1.000:. ./.:4:17,23:.:-0.31:1.000:. ./.:4:18,56:.: 1.25:1.000:. ./.:4:9,44:.: 0.29:1.000:. ./.:6:22,59:.: 1.58:1.000:. ./.:4:20,64:.: 1.71:1.000:. ./.:4:9,39:.: 0.06:1.000:. ./.:4:34,61:.: 2.22:1.000:. ./.:4:43,45:.: 1.90:1.000:. ./.:4:17,33:.: 0.15:1.000:. ./.:4:11,47:.: 0.52:1.000:. ./.:4:5,16:.:-1.19:1.000:. ./.:4:16,18:.:-0.59:1.000:. ./.:4:16,33:.: 0.10:0.887:. ./.:4:0,34:.:-0.59:1.000:. ./.:4:44,44:.: 1.90:1.000:. ./.:4:26,39:.: 0.84:0.999:. ./.:4:0,81:.: 1.58:1.000:. ./.:4:24,29:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,61:.: 0.66:1.000:. ./.:4:26,36:.: 0.70:1.000:. ./.:4:25,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:18,47:.: 0.84:1.000:. ./.:4:28,43:.: 1.12:1.000:. ./.:4:29,33:.: 0.70:1.000:. ./.:4:1,58:.: 0.56:0.915:. ./.:4:35,37:.: 1.16:1.000:. ./.:4:40,41:.: 1.58:1.000:. ./.:4:7,32:.:-0.36:1.000:. ./.:4:19,67:.: 1.81:0.980:. ./.:4:42,45:.: 1.85:1.000:. ./.:4:13,34:.: 0.01:1.000:. ./.:4:11,49:.: 0.61:1.000:. ./.:4:28,51:.: 1.48:1.000:. ./.:4:7,40:.: 0.01:1.000:. ./.:4:8,42:.: 0.15:1.000:. ./.:4:10,41:.: 0.20:1.000:. ./.:4:38,38:.: 1.35:1.000:. ./.:4:7,14:.:-1.19:1.000:. ./.:4:43,46:.: 1.94:1.000:. ./.:4:18,44:.: 0.70:1.000:. ./.:4:10,47:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,60:.: 0.61:1.000:. ./.:4:25,81:.: 2.73:1.000:. ./.:4:5,34:.:-0.36:1.000:. ./.:4:8,40:.: 0.06:1.000:. ./.:4:9,54:.: 0.75:1.000:. ./.:4:14,24:.:-0.40:1.000:. ./.:4:41,40:.: 1.58:0.998:. ./.:4:32,31:.: 0.75:1.000:. ./.:4:15,46:.: 0.66:1.000:. ./.:4:27,40:.: 0.93:1.000:. ./.:4:20,13:.:-0.63:1.000:. ./.:4:9,41:.: 0.15:0.993:. ./.:4:25,19:.:-0.13:1.000:. ./.:4:30,27:.: 0.47:1.000:. ./.:4:15,11:.:-0.96:1.000:. ./.:4:38,43:.: 1.58:0.999:. ./.:4:26,53:.: 1.48:1.000:. ./.:4:9,29:.:-0.40:1.000:. ./.:4:21,73:.: 2.17:1.000:. ./.:4:33,45:.: 1.44:1.000:. ./.:4:20,60:.: 1.53:1.000:. ./.:4:44,47:.: 2.04:1.000:. ./.:4:27,49:.: 1.35:1.000:. ./.:4:9,34:.:-0.17:1.000:. ./.:4:24,59:.: 1.67:1.000:. ./.:4:14,29:.:-0.17:1.000:. ./.:4:2,17:.:-1.28:1.000:. ./.:4:6,44:.: 0.15:1.000:. ./.:4:15,45:.: 0.61:1.000:. ./.:4:3,64:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,50:.: 0.15:1.000:. ./.:4:19,22:.:-0.27:1.000:. ./.:4:13,23:.:-0.50:1.000:. ./.:4:23,56:.: 1.48:1.000:. ./.:4:6,17:.:-1.09:1.000:. ./.:4:5,31:.:-0.50:0.998:. ./.:4:2,21:.:-1.09:1.000:. ./.:4:10,19:.:-0.82:1.000:. ./.:4:11,24:.:-0.54:1.000:. ./.:4:20,18:.:-0.40:1.000:. ./.:4:37,30:.: 0.93:1.000:. ./.:4:14,46:.: 0.61:1.000:. ./.:4:12,65:.: 1.39:1.000:. ./.:4:6,62:.: 0.98:1.000:. ./.:4:20,45:.: 0.84:1.000:. ./.:4:7,36:.:-0.17:1.000:. ./.:4:22,30:.: 0.24:1.000:. ./.:4:2,51:.: 0.29:1.000:. ./.:4:25,29:.: 0.33:1.000:. ./.:4:19,15:.:-0.59:1.000:. ./.:4:14,29:.:-0.17:1.000:. ./.:4:18,28:.:-0.03:1.000:. ./.:4:11,47:.: 0.52:1.000:. ./.:4:7,17:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,10:.:-1.69:1.000:. ./.:4:9,58:.: 0.93:1.000:. ./.:4:3,21:.:-1.05:1.000:. ./.:4:6,26:.:-0.68:1.000:. ./.:4:13,37:.: 0.15:1.000:. ./.:4:9,30:.:-0.36:1.000:. ./.:4:6,25:.:-0.73:1.000:. ./.:4:8,26:.:-0.59:1.000:. ./.:4:2,34:.:-0.50:1.000:. ./.:4:8,13:.:-1.19:1.000:. ./.:4:6,10:.:-1.42:1.000:. ./.:4:12,21:.:-0.63:1.000:. ./.:4:3,13:.:-1.42:1.000:. ./.:4:16,4:.:-1.23:1.000:. ./.:4:6,18:.:-1.05:1.000:. ./.:4:18,18:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.45:1.000:. ./.:4:6,15:.:-1.19:1.000:. ./.:4:3,19:.:-1.14:1.000:. ./.:4:13,16:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,25:.:-1.00:1.000:. ./.:4:6,16:.:-1.14:1.000:. ./.:4:12,20:.:-0.68:1.000:. ./.:4:11,21:.:-0.68:1.000:. ./.:4:3,21:.:-1.05:1.000:. ./.:4:8,9:.:-1.37:1.000:. ./.:4:16,34:.: 0.15:1.000:. ./.:4:5,10:.:-1.46:1.000:. ./.:4:4,16:.:-1.23:1.000:. ./.:4:13,15:.:-0.86:0.956:. ./.:4:21,20:.:-0.27:1.000:. ./.:4:5,31:.:-0.50:1.000:. ./.:4:6,13:.:-1.28:1.000:. ./.:4:0,37:.:-0.45:1.000:. -chr8.1 77646668 chr8.1_077646668 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/0:4:264,0:0.00: 1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:100,49:0.34:-0.71:1.000:0.878 0/0/0/1:4:158,38:0.26: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/0:4:263,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:225,62:0.27: 1.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:127,72:0.36: 0.11:1.000:0.706 0/0/0/1:4:103,27:0.27:-1.03:1.000:0.998 0/0/0/1:4:113,67:0.36:-0.20:1.000:0.630 0/0/0/1:4:156,34:0.25:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:38,7:0.21:-2.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:21,10:0.33:-2.67:1.000:0.899 0/0/0/1:4:168,72:0.32: 0.79:1.000:0.951 0/0/0/1:4:191,29:0.18: 0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:167,35:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:191,37:0.22: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,36:0.25: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/0:4:173,0:0.00:-0.32:0.998:1.000 0/0/0/1:4:125,76:0.37: 0.15:1.000:0.585 0/0/0/1:4:217,60:0.27: 1.40:1.000:0.997 0/0/0/0:4:287,0:0.00: 1.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,8:0.27:-2.59:1.000:0.997 0/0/0/1:4:215,47:0.25: 1.16:1.000:0.999 0/0/0/1:4:204,38:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,34:0.24:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:11,0:0.00:-3.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:164,27:0.19:-0.02:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,61:0.35:-0.22:1.000:0.828 0/0/0:3:242,1:0.01: 0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:127,24:0.22:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,22:0.19:-0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:88,47:0.35:-0.95:1.000:0.790 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-2.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,27:0.47:-2.35:1.000:0.991 0/0/0:3:13,0:0.00:-2.97:1.000:1.000 0/0/0/1:4:178,24:0.16: 0.16:1.000:0.996 0/0/0/1:4:149,26:0.20:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,39:0.26:-0.04:1.000:0.998 0/0/0/1:4:95,17:0.21:-1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,52:0.35:-0.73:1.000:0.772 0/0/0/1:4:155,33:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,39:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,32:0.21: 0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,35:0.28:-0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:105,70:0.38:-0.28:1.000:0.590 0/0/0/0:4:236,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:194,95:0.34: 1.60:1.000:0.849 0/0/0/0:4:36,0:0.00:-2.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,43:0.36:-1.21:1.000:0.709 0/0/0/1:4:68,13:0.22:-1.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,38:0.27:-0.25:1.000:0.998 0/0/0/1:4:214,32:0.18: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,75:0.39:-0.15:1.000:0.663 0/0/0/1:4:218,37:0.20: 1.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,47:0.26: 0.58:1.000:0.998 0/0/0/1:4:117,29:0.26:-0.76:1.000:0.999 0/0/0/1:4:170,41:0.26: 0.31:1.000:0.999 0/0/0/1:4:130,20:0.18:-0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:93,53:0.36:-0.76:1.000:0.697 0/0/0/0/0/0:6:162,9:0.07:-0.35:1.000:0.657 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,36:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:156,28:0.21:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:149,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:179,45:0.26: 0.53:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,19:0.16:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/0:4:141,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,64:0.36:-0.30:1.000:0.663 0/0/0/1:4:156,32:0.23:-0.07:0.887:1.000 0/0/0/1:4:171,44:0.26: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:157,35:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:92,18:0.22:-1.36:0.999:1.000 0/0/0/1:4:111,22:0.23:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:218,48:0.25: 1.22:1.000:0.999 0/0/0/1:4:122,58:0.33:-0.20:1.000:0.900 0/0/0/1:4:112,28:0.26:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:154,22:0.17:-0.27:1.000:0.998 0/0/1/1:4:120,80:0.38: 0.13:1.000:0.590 0/0/0/1:4:116,71:0.37:-0.09:1.000:0.572 0/0/0/1:4:162,28:0.20:-0.04:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,55:0.36:-0.70:0.915:0.671 0/0/0/1:4:166,34:0.23: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:201,48:0.26: 0.94:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,31:0.22: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,20:0.21:-1.06:0.980:1.000 0/0/0/1:4:189,46:0.26: 0.71:1.000:0.999 0/0/0/1:4:75,47:0.37:-1.16:1.000:0.528 0/0/0/1:4:156,36:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,31:0.20: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,36:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:89,43:0.34:-1.00:1.000:0.888 0/0/0/1:4:168,34:0.23: 0.16:1.000:1.000 0/0/0/0:4:236,0:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,32:0.27:-0.70:1.000:0.998 0/0/0/1:4:156,41:0.27: 0.08:1.000:0.998 0/0/0/1:4:133,26:0.22:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,31:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,73:0.54:-1.33:1.000:0.990 0/0/0/1:4:203,39:0.22: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,43:0.23: 1.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:179,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/0:4:268,0:0.00: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,67:0.39:-0.48:1.000:0.672 0/0/0/1:4:225,52:0.25: 1.40:0.998:0.999 0/0/0/1:4:126,34:0.27:-0.53:1.000:0.998 0/0/0/1:4:157,35:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:138,21:0.18:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:200,32:0.19: 0.66:1.000:1.000 0/0/0/1:4:257,49:0.22: 1.88:0.993:1.000 0/0/0/1:4:196,42:0.24: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,39:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:192,47:0.26: 0.78:1.000:0.999 0/0/0/1:4:180,38:0.24: 0.43:0.999:1.000 0/0/1/1:4:125,82:0.38: 0.25:1.000:0.560 0/0/0/1:4:98,20:0.23:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:203,47:0.25: 0.96:1.000:0.999 0/0/1/1:4:98,68:0.39:-0.43:1.000:0.662 0/0/0/1:4:129,30:0.25:-0.55:1.000:0.999 0/0/0/1:4:134,39:0.28:-0.32:1.000:0.996 0/0/0/1:4:114,60:0.35:-0.30:1.000:0.808 0/0/0/0:4:247,0:0.00: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,38:0.26:-0.04:1.000:0.999 0/0/0/1:4:189,32:0.20: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,80:0.39: 0.03:1.000:0.681 0/0/0/1:4:154,43:0.27: 0.08:1.000:0.997 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 1.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,59:0.35:-0.37:1.000:0.796 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.82:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,24:0.22:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,22:0.20:-0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:161,31:0.22: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,29:0.20: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:114,27:0.26:-0.85:0.998:0.999 0/0/0/1:4:129,26:0.23:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:234,0:0.00: 0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:280,0:0.00: 1.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,34:0.21: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,29:0.21:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,76:0.40:-0.20:1.000:0.745 0/0/0/1:4:171,33:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:188,30:0.19: 0.43:1.000:1.000 0/0/0/1:4:202,46:0.25: 0.92:1.000:0.999 0/0/0/0:4:224,0:0.00: 0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:113,27:0.26:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,59:0.26: 1.78:1.000:0.999 0/0/0/0:4:395,0:0.00: 3.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:208,56:0.27: 1.19:1.000:0.998 0/0/0/1:4:199,44:0.25: 0.84:1.000:0.999 0/0/0/1:4:184,38:0.23: 0.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:142,20:0.17:-0.50:1.000:0.998 0/0/0/1:4:229,44:0.22: 1.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,26:0.20:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/1:4:31,5:0.19:-2.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,69:0.41:-0.58:1.000:0.834 0/0/0/1:4:180,37:0.23: 0.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,36:0.20: 0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,41:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:180,33:0.21: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,40:0.23: 0.76:1.000:1.000 0/0/0/1:4:219,48:0.25: 1.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,33:0.25:-0.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:129,29:0.25:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/1:4:148,32:0.24:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:169,55:0.29: 0.53:1.000:0.993 0/0/0/1:4:114,23:0.23:-0.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,39:0.24: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:155,33:0.24:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,155:0.75:-0.60:1.000:0.999 0/0/0/0:4:248,1:0.01: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,40:0.25: 0.36:1.000:0.999 0/0/0/0:4:226,0:0.00: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,22:0.19:-0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:115,68:0.36:-0.15:1.000:0.635 0/0/0/0:4:234,1:0.01: 0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:120,23:0.22:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:133,37:0.27:-0.37:1.000:0.997 0/0/0/1:4:195,30:0.18: 0.54:1.000:0.999 0/0/0/0:4:267,2:0.01: 1.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:184,42:0.25: 0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:140,55:0.31: 0.05:1.000:0.973 0/0/0/1:4:179,53:0.28: 0.66:0.956:0.996 0/0/0/1:4:262,66:0.26: 2.25:1.000:0.999 0/0/0/1:4:260,59:0.25: 2.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:123,28:0.25:-0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:122,91:0.40: 0.34:1.000:0.774 -chr8.1 77835396 chr8.1_077835396 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:174,164:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:187,66:0.25:-1.21:1.000:0.999 0/0/0/1:4:211,68:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:240,87:0.26: 0.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:385,1:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:165,180:0.52: 0.46:1.000:0.995 0/1/1/1:4:66,163:0.70:-1.65:1.000:0.985 0/0/0/1:4:210,84:0.28:-0.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:215,75:0.25:-0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,99:0.68:-3.21:1.000:0.956 0/0/1/1:4:126,139:0.52:-0.99:1.000:0.995 0/0/1/1:4:206,132:0.39: 0.33:1.000:0.635 0/0/1/1:4:164,139:0.45:-0.30:1.000:0.984 0/1/1/1:4:83,231:0.72:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:217,73:0.24:-0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,134:0.43:-0.25:1.000:0.954 0/0/1/1:4:174,151:0.46: 0.10:0.998:0.988 0/1/1/1:4:74,225:0.74:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:201,211:0.51: 1.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:263,85:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:175,39:0.18:-1.92:1.000:0.999 0/0/0/1:4:264,76:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/0:4:353,0:0.00: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,63:0.22:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,77:0.45:-2.74:1.000:0.981 0/0/0/1:4:230,83:0.26:-0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:185,156:0.45: 0.39:1.000:0.983 0/0/1/1:4:155,154:0.49:-0.19:1.000:0.997 0/0/1:3:169,100:0.37:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/1:4:206,63:0.23:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:179,154:0.46: 0.24:1.000:0.986 0/0/1/1:4:134,140:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:117,81:0.40:-2.21:1.000:0.823 0/0/0/1:4:150,46:0.23:-2.25:1.000:1.000 0/0/0:3:250,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:331,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:170,128:0.42:-0.39:1.000:0.931 0/0/0/1:4:235,73:0.23:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:169,179:0.51: 0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:198,82:0.29:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:175,165:0.48: 0.37:1.000:0.995 0/0/0/1:4:271,88:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:304,90:0.22: 1.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:249,97:0.27: 0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:316,127:0.28: 2.24:1.000:0.996 0/0/0/1:4:241,75:0.23:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0/1:5:356,81:0.18: 2.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:315,110:0.25: 1.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:220,85:0.27:-0.27:1.000:0.997 0/1/1/1:4:106,261:0.70: 0.86:1.000:0.984 0/0/1/1:4:172,168:0.49: 0.37:1.000:0.996 0/0/1/1:4:194,203:0.51: 1.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:231,86:0.26:-0.05:1.000:0.998 0/0/1/1:4:199,202:0.50: 1.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:226,69:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:234,100:0.29: 0.26:1.000:0.990 0/1/1/1:4:89,236:0.71: 0.10:1.000:0.993 0/1/1/1:4:102,313:0.74: 1.73:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,158:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/0/0/0/0:6:289,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/0/0:4:362,0:0.00: 0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,168:0.50: 0.22:1.000:0.997 0/0/0/1:4:320,109:0.25: 1.99:1.000:0.999 0/0/0/1:4:241,87:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:253,75:0.22: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:155,148:0.48:-0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:180,60:0.24:-1.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,156:0.49:-0.08:1.000:0.996 0/0/0/1:4:268,108:0.28: 1.02:0.887:0.995 0/0/1/1:4:147,117:0.44:-1.01:1.000:0.965 0/1/1/1:4:109,331:0.74: 2.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:248,97:0.27: 0.46:0.999:0.997 0/0/0/1:4:247,99:0.28: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:155,156:0.50:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:180,209:0.53: 1.26:1.000:0.991 0/0/0/1:4:212,77:0.26:-0.56:1.000:0.999 0/0/0/1:4:254,96:0.27: 0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:295,95:0.24: 1.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:254,97:0.27: 0.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:241,115:0.32: 0.66:1.000:0.961 0/1/1/1:4:88,212:0.69:-0.36:0.915:0.980 0/0/0/1:4:301,100:0.24: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:279,112:0.28: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:202,70:0.25:-0.86:1.000:0.999 0/0/0/1:4:298,98:0.24: 1.39:0.980:1.000 0/0/1/1:4:214,196:0.47: 1.64:1.000:0.993 0/0/0/1:4:181,67:0.26:-1.30:1.000:0.998 0/1/1/1:4:80,213:0.71:-0.48:1.000:0.994 0/0/1/1:4:164,160:0.49: 0.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,165:0.53:-0.25:1.000:0.991 0/0/0/1:4:259,80:0.23: 0.35:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,143:0.49:-0.50:1.000:0.996 0/0/0/1:4:274,99:0.26: 0.97:1.000:0.999 0/0/0/1:4:176,54:0.23:-1.63:1.000:1.000 0/0/0/1:4:238,91:0.27: 0.17:1.000:0.998 0/0/0/0:4:361,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:81,216:0.71:-0.41:1.000:0.994 0/0/1/1:4:152,171:0.52: 0.06:1.000:0.994 0/0/0/1:4:320,102:0.23: 1.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:222,87:0.27:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:88,209:0.69:-0.41:1.000:0.976 0/0/1/1:4:207,188:0.47: 1.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:216,62:0.22:-0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:164,209:0.55: 0.97:0.998:0.975 0/0/1/1:4:152,173:0.53: 0.10:1.000:0.993 0/0/1/1:4:162,173:0.51: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,164:0.52:-0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:62,240:0.78:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:227,199:0.46: 1.93:0.993:0.989 0/1/1/1:4:87,238:0.72: 0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:246,72:0.22:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/0:4:401,0:0.00: 1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:260,118:0.31: 1.06:0.999:0.979 0/0/0/1:4:244,87:0.26: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:121,126:0.51:-1.32:1.000:0.997 0/1/1/1:4:94,271:0.73: 0.82:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,147:0.48:-0.34:1.000:0.996 0/0/0/1:4:310,89:0.22: 1.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,275:0.75: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:251,88:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/1/1:4:153,153:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:189,177:0.48: 0.84:1.000:0.995 0/0/1/1:4:148,208:0.58: 0.66:1.000:0.924 0/0/1/1:4:149,151:0.50:-0.36:1.000:0.997 0/0/0/0:4:346,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:300,121:0.28: 1.84:1.000:0.995 0/0/0/1:4:253,89:0.25: 0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:151,156:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:127,116:0.47:-1.39:1.000:0.993 0/1/1/1:4:63,200:0.75:-1.03:1.000:0.999 0/0/0/0:4:324,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:212,71:0.24:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:190,44:0.18:-1.56:0.998:0.999 0/0/0/0:4:301,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:144,137:0.48:-0.70:1.000:0.996 0/0/0/1:4:322,101:0.23: 1.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:172,164:0.48: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:240,86:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/1/1:4:152,160:0.51:-0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:264,93:0.25: 0.68:1.000:0.999 0/0/1/1:4:192,191:0.49: 1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:259,106:0.28: 0.82:1.000:0.994 0/0/0/1:4:200,67:0.24:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,159:0.54:-0.54:1.000:0.986 0/0/0/1:4:250,97:0.27: 0.50:1.000:0.997 0/0/1/1:4:230,214:0.48: 2.26:1.000:0.994 0/0/1/1:4:166,155:0.48: 0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:160,161:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:82,256:0.74: 0.33:1.000:0.999 0/0/0/0:4:254,0:0.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:250,78:0.23: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,143:0.51:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:113,117:0.50:-1.63:1.000:0.997 0/0/0/1:4:159,61:0.27:-1.81:1.000:0.998 0/0/1/1:4:156,154:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:166,141:0.45:-0.23:1.000:0.984 0/0/0/0:4:338,0:0.00: 0.33:1.000:1.000 0/0/0/0:4:298,0:0.00:-0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:221,61:0.21:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:175,167:0.48: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/1:4:173,73:0.29:-1.34:1.000:0.992 0/0/1/1:4:140,120:0.46:-1.08:1.000:0.986 0/0/1/1:4:123,136:0.52:-1.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,158:0.52:-0.37:1.000:0.994 0/0/1/1:4:138,171:0.55:-0.19:1.000:0.982 0/0/1/1:4:132,148:0.52:-0.72:1.000:0.994 0/0/1/1:4:134,136:0.50:-0.90:1.000:0.997 0/0/1/1:4:138,172:0.55:-0.17:1.000:0.981 0/0/1/1:4:128,192:0.59: 0.01:1.000:0.849 0/0/0/0:4:267,0:0.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,132:0.49:-0.97:1.000:0.996 0/0/0/1:4:167,56:0.24:-1.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:159,163:0.50: 0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:128,122:0.48:-1.26:1.000:0.996 0/0/1/1:4:127,119:0.48:-1.34:1.000:0.995 0/0/0/1:4:170,52:0.23:-1.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:167,165:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/0/0/1:4:252,82:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,266:0.82: 0.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:207,77:0.26:-0.65:1.000:0.998 0/0/0/1:4:260,77:0.22: 0.32:0.956:1.000 0/0/1/1:4:162,201:0.55: 0.79:1.000:0.982 0/0/0/1:4:293,98:0.24: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,119:0.49:-1.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:168,138:0.45:-0.25:1.000:0.976 -chr8.1 78051640 chr8.1_078051640 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:60,203:0.73: 0.95:1.000:0.998 0/0/0/1:4:150,50:0.25:-0.08:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,178:0.79: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:192,54:0.22: 0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,130:0.47: 0.91:1.000:0.991 0/0/1/1:4:118,155:0.53: 1.11:1.000:0.992 0/0/1/1:4:55,67:0.51:-1.36:1.000:0.996 0/0/0/1:4:189,58:0.23: 0.68:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,74:0.31: 0.47:1.000:0.977 0/1/1/1:4:7,35:0.80:-2.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,16:0.51:-2.88:1.000:0.996 0/0/1/1:4:162,127:0.42: 1.37:1.000:0.892 0/0/1/1:4:120,122:0.47: 0.60:1.000:0.993 0/0/1/1:4:129,163:0.52: 1.42:1.000:0.995 0/0/0/1:4:148,45:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,207:0.75: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,236:0.78: 1.37:0.998:1.000 0/0/0/1:4:187,69:0.27: 0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:112,138:0.52: 0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:137,172:0.52: 1.70:1.000:0.995 0/1/1/1:4:7,20:0.70:-2.91:1.000:0.988 0/0/1/1:4:97,124:0.52: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:163,79:0.32: 0.60:1.000:0.962 0/0/0/1:4:156,65:0.29: 0.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:18,10:0.34:-2.89:1.000:0.846 0/1/1/1:4:45,199:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,219:0.73: 1.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,108:0.51:-0.10:1.000:0.997 0/0/1:3:124,69:0.34:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,229:0.79: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,287:1.00: 1.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,97:0.49:-0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:5,10:0.63:-3.11:1.000:0.556 0/0/1/1:4:14,20:0.55:-2.80:1.000:0.979 0/1/1:3:3,14:0.79:-3.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:78,115:0.56:-0.20:1.000:0.969 0/0/0/1:4:157,49:0.24: 0.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,202:0.74: 0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,190:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:133,163:0.51: 1.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,175:0.73: 0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:47,215:0.79: 0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,116:0.53:-0.02:1.000:0.992 0/0/0/1:4:95,57:0.36:-0.87:1.000:0.701 0/0/0/1:4:127,51:0.28:-0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,56:0.27:-0.03:1.000:0.997 0/0/0/1/1:5:158,150:0.46: 1.68:1.000:0.850 0/0/0/1:4:49,18:0.27:-2.26:1.000:0.998 0/0/1/1:4:80,92:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,89:0.52:-0.72:1.000:0.996 0/0/1/1:4:71,77:0.49:-0.93:1.000:0.996 0/1/1/1:4:59,210:0.74: 1.04:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,100:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:52,181:0.74: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:80,121:0.56:-0.07:1.000:0.958 0/1/1/1:4:41,163:0.76:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,113:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,168:0.80:-0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,154:0.79:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:96,37:0.27:-1.18:1.000:0.723 0/0/0/1:4:132,62:0.31:-0.18:1.000:0.972 0/0/1/1:4:94,108:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,74:0.37:-0.21:1.000:0.589 0/0/0/1:4:130,54:0.29:-0.35:1.000:0.993 0/0/0/1:4:156,58:0.27: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,105:0.47: 0.08:1.000:0.991 0/0/1/1:4:43,64:0.56:-1.60:1.000:0.965 0/0/1/1:4:95,112:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:56,172:0.72: 0.37:0.887:0.995 0/1/1/1:4:43,162:0.75: 0.00:1.000:0.999 0/0/1/1:4:123,131:0.48: 0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:43,67:0.57:-1.55:0.999:0.941 0/0/1/1:4:77,123:0.58:-0.08:1.000:0.922 0/0/0/1:4:214,68:0.24: 1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,91:0.50:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,91:0.52:-0.69:1.000:0.995 0/0/0/0:4:148,0:0.00:-0.93:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,100:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:124,55:0.30:-0.43:1.000:0.985 0/0/1/1:4:116,107:0.45: 0.29:1.000:0.980 0/0/0/1:4:107,42:0.28:-0.92:0.915:0.996 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/0/0:4:211,0:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,43:0.24:-0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,225:0.79: 1.13:0.980:1.000 0/0/0/1:4:153,45:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:66,81:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:27,153:0.82:-0.41:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,103:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,121:0.57:-0.10:1.000:0.944 0/0/1/1:4:78,95:0.51:-0.52:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,192:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,49:0.28:-0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:67,85:0.52:-0.87:1.000:0.994 0/0/1/1:4:94,111:0.50: 0.00:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,133:0.53: 0.49:1.000:0.993 0/1/1/1:4:41,148:0.75:-0.26:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,140:0.78:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,151:0.74:-0.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,203:0.74: 0.91:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,128:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,161:0.74: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:112,53:0.31:-0.66:1.000:0.970 0/1/1/1:4:44,157:0.74:-0.07:0.998:0.999 0/0/0/1:4:102,39:0.27:-1.05:1.000:0.997 0/0/1/1:4:101,119:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:119,40:0.25:-0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:140,162:0.50: 1.58:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,298:1.00: 1.52:0.993:1.000 0/1/1/1:4:32,181:0.82: 0.13:1.000:0.999 0/0/1/1:4:73,115:0.57:-0.28:1.000:0.933 0/0/0/1:4:203,100:0.32: 1.60:1.000:0.954 0/0/1/1:4:88,124:0.55: 0.11:0.999:0.982 0/0/1/1:4:132,110:0.43: 0.60:1.000:0.942 0/0/1/1:4:58,69:0.51:-1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:116,139:0.51: 0.81:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,80:0.50:-0.92:1.000:0.997 0/0/0/1:4:112,44:0.28:-0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,101:0.48:-0.13:1.000:0.995 0/0/0/1:4:102,40:0.28:-1.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,124:0.55: 0.08:1.000:0.976 0/1/1/1:4:62,122:0.63:-0.35:1.000:0.508 0/0/0/1:4:137,66:0.32:-0.03:1.000:0.964 0/1/1/1:4:58,173:0.71: 0.42:1.000:0.993 0/0/1/1:4:86,96:0.49:-0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,154:0.63: 0.41:1.000:0.594 0/0/1/1:4:85,92:0.49:-0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:119,104:0.44: 0.29:1.000:0.965 0/0/0/1:4:87,49:0.35:-1.13:1.000:0.825 0/0/1/1:4:63,78:0.52:-1.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,78:0.45:-0.69:1.000:0.979 0/1/1/1:4:48,204:0.78: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,123:0.75:-0.80:0.998:0.999 0/0/1/1:4:93,114:0.51: 0.03:1.000:0.996 0/0/1/1:4:95,118:0.52: 0.13:1.000:0.995 0/0/1/1:4:128,157:0.51: 1.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,62:0.30:-0.07:1.000:0.984 0/0/1/1:4:83,93:0.49:-0.48:1.000:0.996 0/1/1/1:4:42,126:0.71:-0.61:1.000:0.993 0/0/0/1:4:138,53:0.27:-0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:92,127:0.54: 0.23:1.000:0.986 0/0/0/1:4:121,58:0.31:-0.43:1.000:0.966 0/0/1/1:4:99,125:0.52: 0.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:62,73:0.50:-1.15:1.000:0.997 0/0/0/1:4:167,74:0.30: 0.59:1.000:0.985 0/0/1/1:4:117,159:0.54: 1.16:1.000:0.988 0/0/0/1:4:202,87:0.29: 1.37:1.000:0.989 0/0/0/1:4:141,45:0.24:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,132:0.47: 0.95:1.000:0.992 0/1/1/1:4:37,165:0.78:-0.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:139,166:0.51: 1.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:70,195:0.70: 0.98:1.000:0.984 0/0/1/1:4:7,12:0.59:-3.04:1.000:0.835 0/0/1/1:4:53,64:0.51:-1.44:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,314:1.00: 1.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:89,138:0.57: 0.36:1.000:0.944 0/0/1/1:4:116,154:0.53: 1.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:131,142:0.49: 1.11:1.000:0.996 0/0/0/1:4:158,70:0.30: 0.37:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,251:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:94,112:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/0/0/1:4:124,47:0.27:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,153:0.55: 0.91:1.000:0.981 0/1/1/1:4:45,201:0.78: 0.67:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,207:0.74: 0.98:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,178:0.73: 0.42:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,159:0.76:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,125:0.51: 0.39:1.000:0.996 0/0/1/1:4:83,129:0.57: 0.11:1.000:0.943 0/0/1/1:4:126,118:0.45: 0.63:1.000:0.983 0/0/1/1:4:80,101:0.52:-0.39:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,130:0.75:-0.66:1.000:0.999 0/1/1/1:4:50,165:0.73: 0.16:1.000:0.998 0/0/1/1:4:105,103:0.46: 0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:93,113:0.51: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:47,155:0.73:-0.05:1.000:0.998 0/1/1/1:4:88,266:0.71: 2.43:1.000:0.994 0/0/1/1:4:101,151:0.56: 0.77:1.000:0.963 0/0/1/1:4:109,123:0.49: 0.44:1.000:0.997 0/0/0/1:4:163,24:0.13:-0.30:1.000:0.893 0/0/0/0:4:231,0:0.00: 0.42:0.956:1.000 0/0/0/1:4:196,82:0.29: 1.19:1.000:0.992 0/1/1/1:4:72,245:0.74: 1.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:40,158:0.76:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,125:0.48: 0.60:1.000:0.995 -chr8.1 78263194 chr8.1_078263194 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:262,384:.:-0.26:1.000:. ./.:4:228,288:.:-1.05:1.000:. ./.:4:438,239:.:-0.07:1.000:. ./.:4:154,672:.: 0.83:1.000:. ./.:4:309,420:.: 0.25:1.000:. ./.:4:315,415:.: 0.25:1.000:. ./.:4:222,378:.:-0.54:1.000:. ./.:4:285,464:.: 0.37:1.000:. ./.:4:273,351:.:-0.39:1.000:. ./.:4:115,122:.:-2.74:1.000:. ./.:4:215,137:.:-2.05:1.000:. ./.:4:433,327:.: 0.43:1.000:. ./.:4:397,391:.: 0.60:1.000:. ./.:4:330,613:.: 1.55:1.000:. ./.:4:268,361:.:-0.36:1.000:. ./.:4:320,518:.: 0.91:1.000:. ./.:4:310,586:.: 1.26:0.998:. ./.:4:349,371:.: 0.19:1.000:. ./.:4:514,302:.: 0.77:1.000:. ./.:4:345,543:.: 1.21:1.000:. ./.:4:86,122:.:-2.92:1.000:. ./.:4:165,513:.:-0.06:1.000:. ./.:4:195,711:.: 1.32:1.000:. ./.:4:274,348:.:-0.40:1.000:. ./.:4:66,167:.:-2.77:1.000:. ./.:4:490,391:.: 1.17:1.000:. ./.:4:290,598:.: 1.21:1.000:. ./.:4:298,413:.: 0.14:1.000:. ./.:3:169,521:.: 0.01:1.000:. ./.:4:486,247:.: 0.27:1.000:. ./.:4:463,152:.:-0.45:1.000:. ./.:4:256,397:.:-0.22:1.000:. ./.:4:30,110:.:-3.33:1.000:. ./.:4:171,79:.:-2.66:1.000:. ./.:3:25,8:.:-3.98:1.000:. ./.:4:289,468:.: 0.42:1.000:. ./.:4:287,497:.: 0.58:1.000:. ./.:4:308,397:.: 0.10:1.000:. ./.:4:311,378:.: 0.00:1.000:. ./.:4:466,366:.: 0.87:1.000:. ./.:4:289,381:.:-0.11:1.000:. ./.:4:433,360:.: 0.63:1.000:. ./.:4:184,690:.: 1.13:1.000:. ./.:4:278,442:.: 0.19:1.000:. ./.:4:336,532:.: 1.09:1.000:. ./.:4:151,437:.:-0.61:1.000:. ./.:5:522,428:.: 1.59:1.000:. ./.:4:283,1036:.: 3.83:1.000:. ./.:4:378,201:.:-0.67:1.000:. ./.:4:305,393:.: 0.06:1.000:. ./.:4:203,410:.:-0.46:1.000:. ./.:4:333,559:.: 1.24:1.000:. ./.:4:386,196:.:-0.65:1.000:. ./.:4:331,388:.: 0.18:1.000:. ./.:4:272,330:.:-0.53:1.000:. ./.:4:437,351:.: 0.60:1.000:. ./.:4:249,338:.:-0.62:1.000:. ./.:4:480,311:.: 0.62:1.000:. ./.:4:435,257:.: 0.02:1.000:. ./.:6:112,422:.:-0.94:1.000:. ./.:4:104,423:.:-0.98:1.000:. ./.:4:404,324:.: 0.24:1.000:. ./.:4:334,636:.: 1.71:1.000:. ./.:4:157,536:.: 0.03:1.000:. ./.:4:331,457:.: 0.60:1.000:. ./.:4:428,351:.: 0.55:1.000:. ./.:4:227,260:.:-1.23:1.000:. ./.:4:303,470:.: 0.51:1.000:. ./.:4:245,526:.: 0.50:0.887:. ./.:4:388,260:.:-0.25:1.000:. ./.:4:356,432:.: 0.60:1.000:. ./.:4:274,278:.:-0.83:0.999:. ./.:4:344,500:.: 0.94:1.000:. ./.:4:305,512:.: 0.78:1.000:. ./.:4:480,215:.: 0.04:1.000:. ./.:4:308,534:.: 0.93:1.000:. ./.:4:146,479:.:-0.39:1.000:. ./.:4:450,413:.: 1.06:1.000:. ./.:4:285,348:.:-0.34:1.000:. ./.:4:156,656:.: 0.75:1.000:. ./.:4:357,95:.:-1.44:0.915:. ./.:4:159,637:.: 0.65:1.000:. ./.:4:173,599:.: 0.51:1.000:. ./.:4:221,323:.:-0.88:1.000:. ./.:4:486,250:.: 0.29:0.980:. ./.:4:274,285:.:-0.79:1.000:. ./.:4:286,234:.:-1.02:1.000:. ./.:4:354,366:.: 0.19:1.000:. ./.:4:403,239:.:-0.28:1.000:. ./.:4:238,331:.:-0.73:1.000:. ./.:4:363,215:.:-0.67:1.000:. ./.:4:392,261:.:-0.22:1.000:. ./.:4:172,700:.: 1.11:1.000:. ./.:4:133,273:.:-1.72:1.000:. ./.:4:300,504:.: 0.70:1.000:. ./.:4:280,507:.: 0.60:1.000:. ./.:4:337,366:.: 0.09:1.000:. ./.:4:508,93:.:-0.53:1.000:. ./.:4:456,375:.: 0.86:1.000:. ./.:4:272,437:.: 0.12:1.000:. ./.:4:382,202:.:-0.64:1.000:. ./.:4:302,410:.: 0.14:1.000:. ./.:4:235,275:.:-1.09:1.000:. ./.:4:305,472:.: 0.54:0.998:. ./.:4:110,575:.:-0.02:1.000:. ./.:4:367,292:.:-0.18:1.000:. ./.:4:227,400:.:-0.37:1.000:. ./.:4:276,356:.:-0.34:1.000:. ./.:4:486,410:.: 1.26:0.993:. ./.:4:401,318:.: 0.18:1.000:. ./.:4:265,356:.:-0.41:1.000:. ./.:4:211,654:.: 1.07:1.000:. ./.:4:291,432:.: 0.21:0.999:. ./.:4:414,242:.:-0.20:1.000:. ./.:4:309,270:.:-0.67:1.000:. ./.:4:300,516:.: 0.77:1.000:. ./.:4:286,378:.:-0.15:1.000:. ./.:4:251,413:.:-0.15:1.000:. ./.:4:282,445:.: 0.23:1.000:. ./.:4:261,331:.:-0.59:1.000:. ./.:4:150,582:.: 0.26:1.000:. ./.:4:394,207:.:-0.53:1.000:. ./.:4:334,510:.: 0.94:1.000:. ./.:4:431,261:.: 0.02:1.000:. ./.:4:274,453:.: 0.23:1.000:. ./.:4:305,398:.: 0.09:1.000:. ./.:4:467,341:.: 0.72:1.000:. ./.:4:496,113:.:-0.48:1.000:. ./.:4:117,477:.:-0.58:1.000:. ./.:4:234,272:.:-1.11:1.000:. ./.:4:249,358:.:-0.50:1.000:. ./.:4:406,392:.: 0.66:1.000:. ./.:4:238,216:.:-1.43:0.998:. ./.:4:300,589:.: 1.22:1.000:. ./.:4:143,482:.:-0.39:1.000:. ./.:4:366,636:.: 1.90:1.000:. ./.:4:325,356:.:-0.05:1.000:. ./.:4:258,380:.:-0.31:1.000:. ./.:4:335,273:.:-0.49:1.000:. ./.:4:224,452:.:-0.08:1.000:. ./.:4:382,220:.:-0.53:1.000:. ./.:4:245,265:.:-1.09:1.000:. ./.:4:259,359:.:-0.43:1.000:. ./.:4:301,271:.:-0.71:1.000:. ./.:4:309,569:.: 1.15:1.000:. ./.:4:201,696:.: 1.27:1.000:. ./.:4:248,438:.:-0.02:1.000:. ./.:4:136,459:.:-0.57:1.000:. ./.:4:336,432:.: 0.48:1.000:. ./.:4:240,359:.:-0.54:1.000:. ./.:4:381,421:.: 0.69:1.000:. ./.:4:275,514:.: 0.61:1.000:. ./.:4:75,111:.:-3.05:1.000:. ./.:4:287,226:.:-1.07:1.000:. ./.:4:471,425:.: 1.26:1.000:. ./.:4:451,274:.: 0.22:1.000:. ./.:4:299,448:.: 0.35:1.000:. ./.:4:329,604:.: 1.48:1.000:. ./.:4:237,450:.:-0.01:1.000:. ./.:4:438,268:.: 0.11:1.000:. ./.:4:279,482:.: 0.44:1.000:. ./.:4:124,600:.: 0.21:1.000:. ./.:4:363,318:.:-0.05:1.000:. ./.:4:281,565:.: 0.96:1.000:. ./.:4:313,604:.: 1.39:1.000:. ./.:4:296,314:.:-0.48:1.000:. ./.:4:283,377:.:-0.17:1.000:. ./.:4:614,174:.: 0.60:1.000:. ./.:4:145,488:.:-0.34:1.000:. ./.:4:239,384:.:-0.40:1.000:. ./.:4:140,590:.: 0.25:1.000:. ./.:4:190,258:.:-1.46:1.000:. ./.:4:410,147:.:-0.80:1.000:. ./.:4:271,436:.: 0.11:1.000:. ./.:4:247,336:.:-0.64:1.000:. ./.:4:223,364:.:-0.62:1.000:. ./.:4:349,473:.: 0.81:1.000:. ./.:4:328,536:.: 1.07:1.000:. ./.:4:311,339:.:-0.23:1.000:. ./.:4:181,396:.:-0.68:1.000:. ./.:4:147,414:.:-0.78:0.956:. ./.:4:372,654:.: 2.05:1.000:. ./.:4:341,485:.: 0.83:1.000:. ./.:4:278,319:.:-0.56:1.000:. ./.:4:436,256:.: 0.02:1.000:. -chr8.1 78561484 chr8.1_078561484 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:72,73:0.47: 0.26:1.000:0.993 0/0/0/1:4:97,47:0.35: 0.24:1.000:0.799 0/0/1/1:4:35,56:0.59:-0.68:1.000:0.858 0/1/1/1:4:65,188:0.75: 2.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,124:0.76: 0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,116:0.70: 0.62:1.000:0.983 0/1/1/1:4:34,68:0.66:-0.49:1.000:0.844 0/1/1/1:4:43,121:0.75: 0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:71,77:0.48: 0.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:4,5:0.51:-2.10:1.000:0.996 0/0/1/1:4:10,13:0.53:-1.86:1.000:0.993 0/0/1/1:4:133,91:0.40: 1.63:1.000:0.827 0/0/1/1:4:67,68:0.47: 0.09:1.000:0.993 0/0/1/1:4:53,73:0.55:-0.07:1.000:0.984 0/1/1/1:4:58,107:0.63: 0.61:1.000:0.604 0/1/1/1:4:43,85:0.65:-0.04:1.000:0.818 0/0/1/1:4:75,92:0.51: 0.64:0.998:0.996 0/0/0/1:4:98,38:0.32: 0.10:1.000:0.961 0/0/1/1:4:82,109:0.53: 1.06:1.000:0.991 0/0/1/1:4:91,96:0.48: 0.99:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-2.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,167:0.85: 1.20:1.000:0.992 0/1/1/1:4:29,159:0.85: 1.01:1.000:0.986 0/0/1/1:4:49,75:0.58:-0.11:1.000:0.924 0/1/1/1:4:5,12:0.71:-1.96:1.000:0.990 0/1/1/1:4:31,69:0.69:-0.52:1.000:0.967 0/0/1/1:4:81,100:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/1/1/1:4:35,142:0.81: 0.82:1.000:1.000 0/0/1:3:75,83:0.49: 0.49:1.000:0.704 0/1/1/1:4:53,140:0.73: 1.09:1.000:0.998 0/0/1/1:4:42,59:0.55:-0.50:1.000:0.979 0/1/1/1:4:40,97:0.71: 0.12:1.000:0.991 0/1/1/1:4:3,12:0.81:-2.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,9:0.90:-2.09:1.000:0.873 0/0/0:3:1,0:0.08:-2.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,99:0.67: 0.28:1.000:0.924 0/1/1/1:4:64,120:0.64: 0.94:1.000:0.663 0/1/1/1:4:43,192:0.82: 1.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,138:0.84: 0.62:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,66:0.54:-0.28:1.000:0.985 0/1/1/1:4:25,101:0.81:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,45:0.49:-0.78:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,112:0.80: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,91:0.64: 0.17:1.000:0.628 0/1/1/1:4:30,105:0.79: 0.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,133:0.68: 1.11:1.000:0.955 0/1/1/1/1:5:30,148:0.84: 0.83:1.000:0.998 0/1/1/1:4:44,102:0.70: 0.28:1.000:0.982 0/1/1/1:4:23,78:0.78:-0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,87:0.65: 0.03:1.000:0.760 0/0/1/1:4:50,46:0.46:-0.59:1.000:0.984 0/1/1/1:4:39,157:0.81: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:9,46:0.84:-1.30:1.000:0.994 0/1/1/1:4:34,115:0.78: 0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,113:0.81: 0.19:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,72:0.77:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,61:0.48:-0.21:1.000:0.995 0/0/0/1:4:51,23:0.34:-0.97:1.000:0.878 0/0/1/1:4:22,39:0.62:-1.20:1.000:0.550 0/1/1/1/1/1:6:24,74:0.76:-0.56:1.000:0.676 0/1/1/1:4:53,96:0.63: 0.33:1.000:0.534 0/0/1/1:4:50,59:0.50:-0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:42,100:0.70: 0.21:1.000:0.988 0/1/1/1:4:37,97:0.73: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,77:0.48: 0.33:1.000:0.995 0/0/0/1:4:59,28:0.35:-0.75:1.000:0.825 0/0/1/1:4:24,36:0.57:-1.22:1.000:0.943 0/1/1/1:4:28,69:0.71:-0.57:1.000:0.993 0/1/1/1:4:31,86:0.74:-0.23:0.887:0.999 0/0/0/1:4:83,37:0.34:-0.17:1.000:0.888 0/0/1/1:4:54,85:0.59: 0.16:1.000:0.887 0/1/1/1:4:14,45:0.77:-1.23:0.999:1.000 0/0/1/1:4:96,91:0.46: 0.99:1.000:0.988 0/1/1/1:4:59,162:0.74: 1.58:1.000:0.999 0/0/0/1:4:83,33:0.32:-0.24:1.000:0.953 0/1/1/1:4:20,99:0.84:-0.19:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,105:0.76: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,32:0.71:-1.48:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,105:0.80: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,105:0.76: 0.17:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,28:0.30:-0.31:0.915:0.988 0/1/1/1:4:45,119:0.73: 0.59:1.000:0.998 0/1/1/1:4:62,140:0.69: 1.25:1.000:0.973 0/0/1/1:4:70,106:0.57: 0.80:1.000:0.935 0/1/1/1:4:33,102:0.76: 0.09:0.980:1.000 0/0/1/1:4:53,86:0.60: 0.16:1.000:0.829 0/1/1/1:4:14,45:0.77:-1.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,26:0.40:-1.15:1.000:0.827 0/0/1/1:4:30,43:0.56:-0.99:1.000:0.971 0/0/1/1:4:49,77:0.59:-0.07:1.000:0.889 0/1/1/1:4:11,27:0.71:-1.60:1.000:0.993 0/1/1/1:4:34,76:0.69:-0.35:1.000:0.969 0/1/1/1:4:50,125:0.72: 0.78:1.000:0.995 0/1/1/1:4:36,80:0.69:-0.24:1.000:0.966 0/1/1/1:4:22,105:0.83:-0.05:1.000:0.997 0/1/1/1:4:26,75:0.75:-0.50:1.000:0.999 0/0/1/1:4:36,22:0.39:-1.25:1.000:0.644 0/0/0/1:4:35,18:0.36:-1.34:1.000:0.707 0/1/1/1:4:20,60:0.76:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,77:0.65:-0.24:1.000:0.815 0/0/1/1:4:24,15:0.39:-1.58:1.000:0.687 0/0/1/1:4:43,58:0.54:-0.50:1.000:0.988 0/1/1/1:4:15,63:0.81:-0.90:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,86:0.85:-0.49:0.998:0.989 0/1/1/1:4:33,79:0.71:-0.31:1.000:0.989 0/1/1/1:4:44,84:0.64:-0.04:1.000:0.723 0/0/1/1:4:45,61:0.54:-0.42:1.000:0.988 0/1/1/1:4:76,139:0.63: 1.48:1.000:0.571 0/1/1/1:4:34,81:0.70:-0.26:0.993:0.988 0/0/1/1:4:63,52:0.44:-0.26:1.000:0.961 0/1/1/1:4:23,67:0.75:-0.70:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,241:0.83: 2.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:30,74:0.71:-0.45:0.999:0.993 0/1/1/1:4:25,94:0.80:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,43:0.49:-0.85:1.000:0.996 0/0/1/1:4:53,91:0.61: 0.24:1.000:0.668 0/1/1/1:4:14,59:0.82:-0.99:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,78:0.53: 0.14:1.000:0.993 0/1/1/1:4:34,67:0.65:-0.50:1.000:0.811 0/1/1/1:4:20,69:0.78:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,78:0.67:-0.26:1.000:0.925 0/0/1/1:4:43,32:0.42:-0.96:1.000:0.909 0/0/1/1:4:47,66:0.55:-0.30:1.000:0.979 0/0/1/1:4:47,61:0.53:-0.38:1.000:0.993 0/1/1/1:4:25,68:0.74:-0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:53,90:0.61: 0.23:1.000:0.705 0/1/1/1:4:11,29:0.73:-1.57:1.000:0.998 0/0/0/1:4:58,13:0.25:-1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:45,92:0.66: 0.12:1.000:0.884 0/0/1/1:4:47,45:0.46:-0.66:1.000:0.989 0/1/1/1:4:17,90:0.85:-0.40:1.000:0.991 0/1/1/1:4:31,90:0.75:-0.16:1.000:0.999 0/1/1/1:4:16,31:0.65:-1.44:0.998:0.766 0/1/1/1:4:15,92:0.87:-0.40:1.000:0.945 0/1/1/1:4:62,116:0.64: 0.83:1.000:0.655 0/1/1/1:4:92,195:0.67: 2.73:1.000:0.931 0/1/1/1:4:43,118:0.74: 0.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:24,80:0.78:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,26:0.60:-1.53:1.000:0.826 0/0/1/1:4:48,64:0.53:-0.31:1.000:0.990 0/0/0/1:4:49,27:0.37:-0.94:1.000:0.573 0/1/1/1:4:43,86:0.66:-0.02:1.000:0.844 0/0/1/1:4:63,67:0.48: 0.00:1.000:0.995 0/0/0/1:4:34,14:0.33:-1.43:1.000:0.939 0/0/0/1:4:86,41:0.35:-0.05:1.000:0.820 0/1/1/1:4:95,176:0.63: 2.45:1.000:0.619 0/1/1/1:4:59,123:0.67: 0.90:1.000:0.912 0/0/1/1:4:79,106:0.54: 0.96:1.000:0.989 0/0/1/1:4:82,89:0.48: 0.71:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,122:0.88: 0.17:1.000:0.832 0/1/1/1:4:56,180:0.77: 1.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,145:0.81: 0.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,8:0.81:-2.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,53:0.60:-0.78:1.000:0.779 0/0/1/1:4:36,62:0.61:-0.56:1.000:0.658 0/0/1/1:4:67,80:0.50: 0.29:1.000:0.997 0/1/1/1:4:33,183:0.85: 1.49:1.000:0.984 0/1/1/1:4:42,86:0.66:-0.04:1.000:0.887 0/1/1/1:4:65,124:0.64: 1.02:1.000:0.720 0/0/1/1:4:36,62:0.61:-0.56:1.000:0.658 0/1/1/1:4:25,130:0.84: 0.43:1.000:0.993 0/1/1/1:4:64,124:0.65: 1.01:1.000:0.766 0/0/1/1:4:70,88:0.52: 0.49:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,89:0.77:-0.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,203:0.81: 2.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,129:0.82: 0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,105:0.81: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/1:4:61,20:0.29:-0.85:1.000:0.989 0/1/1/1:4:52,128:0.71: 0.87:1.000:0.993 0/1/1/1:4:33,141:0.82: 0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:79,161:0.66: 1.91:1.000:0.879 0/0/1/1:4:21,34:0.59:-1.30:1.000:0.834 0/0/1/1:4:35,60:0.61:-0.61:1.000:0.674 0/0/1/1:4:67,89:0.53: 0.45:1.000:0.991 0/0/1/1:4:57,60:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:28,82:0.76:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,214:0.81: 2.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,120:0.56: 1.29:1.000:0.973 0/0/1/1:4:78,93:0.50: 0.71:1.000:0.997 0/1/1/1:4:72,171:0.70: 1.96:1.000:0.988 0/1/1/1:4:80,164:0.66: 1.98:0.956:0.888 0/1/1/1:4:83,177:0.67: 2.26:1.000:0.937 0/1/1/1:4:37,122:0.78: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,64:0.72:-0.71:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,38:0.31: 0.21:1.000:0.976 -chr8.1 78758713 chr8.1_078758713 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:34,104:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.54:1.000:. ./.:4:29,92:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.25:1.000:. ./.:4:42,135:.: 1.59:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,58:.:-2.20:1.000:. ./.:4:0,130:.: 0.09:1.000:. ./.:4:34,97:.: 0.12:1.000:. ./.:4:18,52:.:-1.82:1.000:. ./.:4:6,36:.:-2.71:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.86:1.000:. ./.:4:21,118:.: 0.38:1.000:. ./.:4:0,108:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,87:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,146:.: 0.60:1.000:. ./.:4:36,98:.: 0.22:0.998:. ./.:4:31,134:.: 1.21:1.000:. ./.:4:46,90:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,124:.: 1.24:1.000:. ./.:4:17,37:.:-2.33:1.000:. ./.:4:0,140:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.70:1.000:. ./.:4:24,60:.:-1.37:1.000:. ./.:4:0,23:.:-3.31:1.000:. ./.:4:31,99:.: 0.09:1.000:. ./.:4:30,122:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,142:.: 0.47:1.000:. ./.:3:0,91:.:-1.15:1.000:. ./.:4:21,108:.: 0.06:1.000:. ./.:4:25,121:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.45:1.000:. ./.:4:0,26:.:-3.22:1.000:. ./.:4:26,39:.:-1.98:1.000:. ./.:3:5,17:.:-3.34:1.000:. ./.:4:20,111:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.31:1.000:. ./.:4:28,109:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.04:1.000:. ./.:4:35,107:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,162:.: 1.11:1.000:. ./.:4:22,97:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.28:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.22:1.000:. ./.:5:31,166:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,93:.:-1.09:1.000:. ./.:4:25,74:.:-0.89:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.48:1.000:. ./.:4:30,103:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,198:.: 2.26:1.000:. ./.:4:33,125:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,164:.: 1.17:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.28:1.000:. ./.:4:30,97:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,141:.: 0.44:1.000:. ./.:4:32,86:.:-0.29:1.000:. ./.:4:33,95:.: 0.03:1.000:. ./.:6:15,98:.:-0.45:1.000:. ./.:4:27,98:.:-0.07:1.000:. ./.:4:35,104:.: 0.38:1.000:. ./.:4:34,108:.: 0.47:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.13:1.000:. ./.:4:39,104:.: 0.51:1.000:. ./.:4:35,101:.: 0.28:1.000:. ./.:4:10,39:.:-2.49:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.79:1.000:. ./.:4:26,88:.:-0.42:0.887:. ./.:4:1,109:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,151:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,74:.:-1.69:0.999:. ./.:4:0,121:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,166:.: 1.24:1.000:. ./.:4:0,129:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,116:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.13:1.000:. ./.:4:35,99:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,179:.: 1.65:1.000:. ./.:4:0,125:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,99:.:-0.89:0.915:. ./.:4:0,160:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,155:.: 0.89:1.000:. ./.:4:33,84:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,92:.:-0.26:0.980:. ./.:4:0,142:.: 0.47:1.000:. ./.:4:20,75:.:-1.02:1.000:. ./.:4:30,80:.:-0.54:1.000:. ./.:4:23,74:.:-0.96:1.000:. ./.:4:27,93:.:-0.23:1.000:. ./.:4:38,78:.:-0.35:1.000:. ./.:4:28,103:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,186:.: 1.87:1.000:. ./.:4:0,93:.:-1.09:1.000:. ./.:4:0,163:.: 1.14:1.000:. ./.:4:18,100:.:-0.29:1.000:. ./.:4:27,93:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,102:.:-0.80:1.000:. ./.:4:28,122:.: 0.73:1.000:. ./.:4:45,85:.: 0.09:1.000:. ./.:4:9,44:.:-2.36:1.000:. ./.:4:33,91:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,78:.:-1.56:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.54:0.998:. ./.:4:0,89:.:-1.21:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,118:.:-0.29:1.000:. ./.:4:50,127:.: 1.59:0.993:. ./.:4:36,127:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,110:.:-0.54:1.000:. ./.:4:0,165:.: 1.21:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.22:0.999:. ./.:4:35,114:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,71:.:-1.79:1.000:. ./.:4:0,175:.: 1.52:1.000:. ./.:4:0,135:.: 0.25:1.000:. ./.:4:21,79:.:-0.86:1.000:. ./.:4:0,120:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,132:.: 0.16:1.000:. ./.:4:27,92:.:-0.26:1.000:. ./.:4:0,138:.: 0.35:1.000:. ./.:4:32,133:.: 1.21:1.000:. ./.:4:33,92:.:-0.07:1.000:. ./.:4:37,113:.: 0.73:1.000:. ./.:4:20,95:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,88:.:-1.24:1.000:. ./.:4:0,84:.:-1.37:1.000:. ./.:4:35,98:.: 0.19:1.000:. ./.:4:26,107:.: 0.19:1.000:. ./.:4:17,71:.:-1.24:0.998:. ./.:4:23,107:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,136:.: 0.28:1.000:. ./.:4:42,119:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,100:.:-0.86:1.000:. ./.:4:35,86:.:-0.19:1.000:. ./.:4:25,89:.:-0.42:1.000:. ./.:4:39,109:.: 0.66:1.000:. ./.:4:30,101:.: 0.12:1.000:. ./.:4:33,85:.:-0.29:1.000:. ./.:4:16,65:.:-1.47:1.000:. ./.:4:47,150:.: 2.22:1.000:. ./.:4:0,158:.: 0.98:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,170:.: 1.36:1.000:. ./.:4:0,161:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,152:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,159:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,154:.: 0.86:1.000:. ./.:4:17,56:.:-1.72:1.000:. ./.:4:32,85:.:-0.32:1.000:. ./.:4:35,124:.: 1.01:1.000:. ./.:4:33,127:.: 1.05:1.000:. ./.:4:29,124:.: 0.82:1.000:. ./.:4:27,124:.: 0.76:1.000:. ./.:4:28,98:.:-0.04:1.000:. ./.:4:36,115:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,144:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,113:.:-0.45:1.000:. ./.:4:19,83:.:-0.80:1.000:. ./.:4:0,148:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,103:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,94:.:-1.05:1.000:. ./.:4:0,134:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,143:.: 0.51:1.000:. ./.:4:26,95:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,97:.:-0.96:1.000:. ./.:4:31,94:.:-0.07:1.000:. ./.:4:26,91:.:-0.32:1.000:. ./.:4:24,79:.:-0.77:1.000:. ./.:4:25,85:.:-0.54:1.000:. ./.:4:27,91:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,187:.: 1.91:1.000:. ./.:4:27,98:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,163:.: 1.14:1.000:. ./.:4:0,137:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,149:.: 0.70:0.956:. ./.:4:0,161:.: 1.08:1.000:. ./.:4:35,102:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,112:.:-0.48:1.000:. ./.:4:0,131:.: 0.12:1.000:. -chr8.1 78942204 chr8.1_078942204 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:228,96:0.28: 1.31:1.000:0.995 0/0/1/1:4:100,105:0.50:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:172,59:0.24:-0.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,186:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:165,183:0.52: 1.78:1.000:0.996 0/0/0/1:4:205,67:0.23: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:145,52:0.25:-1.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:112,120:0.51:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:125,129:0.50:-0.05:1.000:0.997 0/0/0/0:4:144,0:0.00:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:150,33:0.17:-1.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:176,138:0.43: 1.12:1.000:0.944 0/0/0/1:4:170,59:0.24:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:200,65:0.23: 0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:130,150:0.53: 0.46:1.000:0.994 0/0/0/1:4:192,72:0.26: 0.15:1.000:0.999 0/0/0/1:4:219,67:0.22: 0.57:0.998:1.000 0/0/0/1:4:228,102:0.30: 1.43:1.000:0.988 0/0/0/1:4:280,95:0.24: 2.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:149,137:0.47: 0.57:1.000:0.992 0/0/0/1:4:104,59:0.35:-1.81:1.000:0.792 0/0/1/1:4:130,127:0.48: 0.01:1.000:0.996 0/1/1/1:4:69,214:0.73: 0.52:1.000:0.998 0/0/1/1:4:100,116:0.53:-0.78:1.000:0.993 0/0/1/1:4:71,56:0.43:-2.51:1.000:0.948 0/0/0/1:4:178,79:0.29: 0.01:1.000:0.989 0/0/0/1:4:188,60:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:186,67:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/1/1:3:88,163:0.63:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:152,65:0.29:-0.76:1.000:0.993 0/0/0/0:4:293,1:0.00: 0.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,53:0.27:-1.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,57:0.50:-2.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:118,44:0.26:-1.83:1.000:0.999 0/0/1:3:63,48:0.42:-2.82:1.000:0.995 0/0/1/1:4:142,134:0.48: 0.38:1.000:0.994 0/0/1/1:4:123,145:0.53: 0.23:1.000:0.992 0/0/0/1:4:169,65:0.26:-0.43:1.000:0.998 0/0/0/1:4:200,78:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:189,74:0.27: 0.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:182,78:0.29: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:235,81:0.24: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,166:0.47: 1.76:1.000:0.992 0/0/1/1:4:152,120:0.43: 0.30:1.000:0.949 0/0/1/1:4:166,170:0.50: 1.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:81,203:0.69: 0.54:1.000:0.978 0/0/0/1/1:5:188,152:0.44: 1.62:1.000:0.924 0/1/1/1:4:11,51:0.80:-3.77:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,70:0.27:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:126,37:0.21:-1.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:187,66:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:275,70:0.19: 1.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:194,58:0.22:-0.08:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,81:0.23: 1.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,149:0.53: 0.36:1.000:0.992 0/0/0/1:4:176,66:0.26:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:176,64:0.25:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:343,1:0.00: 1.70:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:58,194:0.75:-0.08:1.000:0.531 0/1/1/1:4:85,235:0.71: 1.23:1.000:0.993 0/0/0/1:4:189,58:0.22:-0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:185,139:0.42: 1.31:1.000:0.908 0/1/1/1:4:62,197:0.74: 0.05:1.000:0.998 0/0/0/1:4:170,63:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/1:4:192,79:0.28: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,93:0.44:-1.00:1.000:0.972 0/0/0/1:4:174,66:0.26:-0.32:1.000:0.999 0/0/0/1:4:225,96:0.29: 1.25:0.887:0.994 0/0/0/1:4:160,88:0.34:-0.16:1.000:0.851 0/0/0/1:4:213,90:0.28: 0.90:1.000:0.994 0/0/1/1:4:97,97:0.49:-1.21:0.999:0.996 0/0/1/1:4:156,159:0.50: 1.14:1.000:0.997 0/0/1/1:4:120,150:0.54: 0.26:1.000:0.985 0/0/0/1:4:214,81:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,114:0.55:-1.07:1.000:0.975 0/1/1/1:4:72,202:0.71: 0.34:1.000:0.994 0/0/0/1:4:193,73:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:120,139:0.53: 0.05:1.000:0.993 0/0/1/1:4:125,141:0.52: 0.19:1.000:0.995 0/0/0/1:4:177,45:0.19:-0.67:0.915:1.000 0/1/1/1:4:74,236:0.74: 1.04:1.000:0.998 0/1/1/1:4:95,259:0.71: 1.89:1.000:0.991 0/0/1/1:4:113,113:0.49:-0.59:1.000:0.996 0/0/0/1:4:182,61:0.24:-0.26:0.980:1.000 0/0/1/1:4:166,153:0.47: 1.22:1.000:0.992 0/0/0/1:4:158,61:0.26:-0.73:1.000:0.998 0/0/0/0:4:230,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:176,65:0.26:-0.30:1.000:0.999 0/0/0/1:4:187,61:0.23:-0.16:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,53:0.24:-0.92:1.000:1.000 0/0/0/0:4:250,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,217:0.75: 0.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,107:0.49:-0.80:1.000:0.996 0/0/1/1:4:132,116:0.46:-0.16:1.000:0.986 0/0/1/1:4:122,146:0.53: 0.23:1.000:0.991 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:224,75:0.24: 0.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,87:0.28: 0.87:1.000:0.997 0/0/0/0:4:230,0:0.00:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,82:0.24: 1.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,108:0.50:-0.88:1.000:0.997 0/0/0/1:4:210,68:0.23: 0.42:0.998:1.000 0/0/1/1:4:110,122:0.52:-0.47:1.000:0.996 0/0/1/1:4:139,139:0.49: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:165,113:0.40: 0.42:1.000:0.749 0/0/0/1:4:170,63:0.26:-0.45:1.000:0.999 0/0/0/0:4:359,0:0.00: 1.99:0.993:1.000 0/0/0/0:4:250,0:0.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,149:0.50: 0.69:1.000:0.997 0/1/1/1:4:83,242:0.72: 1.33:1.000:0.996 0/0/1/1:4:149,177:0.53: 1.35:0.999:0.991 0/0/0/1:4:188,59:0.23:-0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,36:0.21:-1.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:232,93:0.27: 1.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:201,56:0.21: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:133,123:0.47:-0.01:1.000:0.993 0/0/0/1:4:162,64:0.27:-0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:146,130:0.46: 0.38:1.000:0.988 0/0/1/1:4:143,141:0.49: 0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:222,80:0.25: 0.89:1.000:0.999 0/0/1/1:4:149,134:0.46: 0.52:1.000:0.990 0/0/0/0:4:238,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:120,145:0.54: 0.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:121,158:0.55: 0.44:1.000:0.976 0/0/0/1:4:158,71:0.30:-0.53:1.000:0.987 0/0/0/1:4:212,44:0.16:-0.01:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,95:0.51:-1.46:1.000:0.996 0/0/0/1:4:168,43:0.19:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,122:0.51:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,49:0.22:-0.84:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,37:0.22:-1.83:0.998:1.000 0/0/1/1:4:133,133:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:104,112:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,154:0.48: 1.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:136,169:0.54: 0.94:1.000:0.986 0/0/1/1:4:134,148:0.51: 0.50:1.000:0.996 0/0/0/0:4:226,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,154:0.57: 0.19:1.000:0.956 0/0/0/1:4:191,74:0.27: 0.17:1.000:0.998 0/0/1/1:4:151,137:0.47: 0.61:1.000:0.991 0/0/1/1:4:111,111:0.49:-0.67:1.000:0.996 0/0/0/1:4:164,62:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/0/1/1:4:197,193:0.49: 2.59:1.000:0.996 0/0/1/1:4:172,179:0.50: 1.84:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,143:0.52: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:121,150:0.54: 0.28:1.000:0.986 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/0/1/1:4:122,114:0.47:-0.40:1.000:0.993 0/0/1/1:4:142,144:0.49: 0.57:1.000:0.997 0/0/0/1:4:152,54:0.25:-0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:142,38:0.20:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,52:0.25:-1.13:1.000:0.999 0/0/0/0:4:262,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:198,80:0.27: 0.42:1.000:0.997 0/0/1/1:4:145,162:0.52: 0.98:1.000:0.995 0/0/1/1:4:141,137:0.48: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:102,94:0.47:-1.17:1.000:0.992 0/0/0/0:4:305,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,103:0.44:-0.51:1.000:0.963 0/0/1/1:4:101,123:0.54:-0.63:1.000:0.989 0/0/0/1:4:170,56:0.23:-0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:185,68:0.25:-0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,46:0.23:-1.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,60:0.26:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:146,59:0.27:-1.00:1.000:0.997 0/0/0/0:4:213,0:0.00:-0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,101:0.44:-0.59:1.000:0.961 0/0/1/1:4:83,125:0.59:-0.94:1.000:0.884 0/0/1/1:4:119,89:0.42:-0.94:1.000:0.902 0/0/0/1:4:137,48:0.25:-1.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:254,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,57:0.25:-0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:178,64:0.25:-0.28:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,55:0.24:-0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,72:0.23: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,139:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:221,79:0.25: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:83,168:0.65:-0.10:1.000:0.799 0/1/1/1:4:76,241:0.74: 1.18:0.956:0.998 0/0/1/1:4:147,143:0.48: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:248,80:0.23: 1.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,66:0.29:-0.71:1.000:0.993 0/0/0/1:4:234,79:0.24: 1.10:1.000:1.000 -chr8.1 79129324 chr8.1_079129324 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:394,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:288,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:414,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:206,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:143,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:367,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:147,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:392,0:.: 1.61:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:341,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.90:0.998:. ./.:4:419,0:.: 1.94:1.000:. ./.:4:486,2:.: 2.77:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:144,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:70,0:.:-2.29:1.000:. ./.:4:289,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:323,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:160,0:.:-1.20:1.000:. ./.:3:268,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:222,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:146,0:.:-1.37:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:158,0:.:-1.22:1.000:. ./.:3:145,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:266,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:274,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:161,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:168,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.56:1.000:. ./.:5:328,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:114,0:.:-1.75:1.000:. ./.:4:261,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:357,0:.: 1.19:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:233,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:140,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:213,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:364,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.10:1.000:. ./.:6:231,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:359,1:.: 1.22:1.000:. ./.:4:336,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:440,0:.: 2.19:1.000:. ./.:4:276,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:368,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:232,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:197,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.13:0.887:. ./.:4:334,0:.: 0.91:1.000:. ./.:4:296,0:.: 0.45:1.000:. ./.:4:165,0:.:-1.14:0.999:. ./.:4:401,1:.: 1.73:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:396,0:.: 1.66:1.000:. ./.:4:145,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:286,0:.: 0.33:1.000:. ./.:4:304,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:230,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:204,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:321,0:.: 0.75:0.915:. ./.:4:326,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:290,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:351,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:169,0:.:-1.09:0.980:. ./.:4:262,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:333,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:342,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:262,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:246,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:291,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:251,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:283,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:255,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:376,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:170,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:212,0:.:-0.57:0.998:. ./.:4:226,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:260,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:198,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:249,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:378,0:.: 1.44:0.993:. ./.:4:325,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:196,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:240,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.85:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:183,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:338,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:219,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:162,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:282,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:350,0:.: 1.10:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:310,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:301,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:245,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:270,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:299,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:257,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.53:0.998:. ./.:4:201,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:431,0:.: 2.08:1.000:. ./.:4:229,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:149,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:237,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:324,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:370,0:.: 1.34:1.000:. ./.:4:305,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:317,0:.: 0.70:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:477,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:354,0:.: 1.15:1.000:. ./.:4:273,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:190,0:.:-0.83:1.000:. ./.:4:272,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:224,0:.:-0.42:1.000:. ./.:4:176,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.57:1.000:. ./.:4:191,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:238,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:373,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:352,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:277,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:309,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:150,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:247,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:292,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:171,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:97,0:.:-1.96:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:151,0:.:-1.31:1.000:. ./.:4:293,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:275,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:215,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:189,0:.:-0.85:1.000:. ./.:4:265,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:281,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:205,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:199,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:377,0:.: 1.43:1.000:. ./.:4:280,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:235,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:297,0:.: 0.46:0.956:. ./.:4:330,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:515,0:.: 3.10:1.000:. ./.:4:163,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:395,0:.: 1.65:1.000:. -chr8.1 79286779 chr8.1_079286779 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:24,22:0.48: 1.69:1.000:0.995 0/1/1/1:4:1,12:0.85:-1.14:1.000:0.992 0/0/1/1:4:15,15:0.50: 0.32:1.000:0.997 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,21:0.71:-0.02:1.000:0.989 0/1/1/1:4:5,13:0.65:-0.71:1.000:0.775 0/0/1/1:4:4,6:0.57:-1.39:1.000:0.955 0/0/1/1:4:7,14:0.61:-0.45:1.000:0.679 0/1/1/1:4:2,26:0.86: 0.15:1.000:0.975 0/0/0/1:4:4,2:0.37:-1.74:1.000:0.560 0/0/1/1:4:2,4:0.61:-1.74:1.000:0.679 0/0/1/1:4:18,13:0.44: 0.41:1.000:0.962 0/0/1/1:4:13,26:0.61: 1.09:1.000:0.679 0/0/1/1:4:24,16:0.42: 1.18:1.000:0.922 1/1/1/1:4:2,38:0.90: 1.18:1.000:0.801 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,16:0.48: 0.66:0.998:0.994 0/0/1/1:4:18,24:0.55: 1.35:1.000:0.982 0/0/1/1:4:20,30:0.57: 2.04:1.000:0.955 0/0/1/1:4:11,20:0.60: 0.41:1.000:0.817 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.65:1.000:0.973 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,15:0.72:-0.71:1.000:0.996 0/0/1/1:4:2,2:0.50:-1.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:10,21:0.62: 0.41:1.000:0.592 0/0/1/1:4:17,21:0.54: 1.01:1.000:0.990 0/1/1/1:4:3,18:0.74:-0.45:1.000:0.999 0/0/1:3:16,3:0.22:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,15:0.54: 0.06:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,16:0.47: 0.75:1.000:0.991 0/1/1/1:4:4,13:0.68:-0.79:1.000:0.944 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-1.82:1.000:0.922 1/1/1/1:4:0,4:1.00:-1.91:1.000:1.000 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:4,23:0.73: 0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,14:0.47: 0.32:1.000:0.993 0/0/0/0:4:20,0:0.00:-0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,27:0.75: 0.41:1.000:0.999 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,10:0.45:-0.28:1.000:0.979 0/0/1/1:4:5,4:0.46:-1.48:1.000:0.985 1/1/1/1:4:1,37:0.95: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:8,17:0.62:-0.11:1.000:0.569 0/0/0/0:4:25,1:0.05:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:11,30:0.65: 1.26:1.000:0.884 ./:.:.,.:.:.:.:. 0/1/1/1:4:4,28:0.75: 0.49:1.000:0.999 0/0/1/1:4:18,12:0.42: 0.32:1.000:0.922 0/1/1/1:4:2,23:0.84:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/0:4:30,0:0.00: 0.32:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,29:0.93: 0.32:1.000:0.999 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.37:-1.22:1.000:0.560 0/0/1/1:4:23,15:0.42: 1.01:1.000:0.906 0/0/1/1:4:15,30:0.61: 1.61:1.000:0.679 0/1/1/1:4:2,32:0.88: 0.66:1.000:0.708 0/1/1/1/1/1:6:2,14:0.75:-0.88:1.000:0.522 0/1/1/1:4:5,20:0.70:-0.11:1.000:0.985 0/1/1/1:4:12,45:0.69: 2.64:1.000:0.978 0/1/1/1:4:3,36:0.85: 1.09:1.000:0.992 0/0/0/0:4:12,0:0.00:-1.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,34:0.66: 1.69:1.000:0.865 0/0/1/1:4:12,23:0.60: 0.75:1.000:0.747 0/0/1/1:4:6,5:0.46:-1.31:1.000:0.990 0/0/1/1:4:8,16:0.61:-0.19:1.000:0.679 0/1/1/1:4:8,19:0.64: 0.06:0.887:0.638 0/0/0/0:4:17,0:0.00:-0.79:1.000:1.000 0/0/1/1:4:18,10:0.39: 0.15:1.000:0.678 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.57:0.999:1.000 0/0/0/1:4:14,5:0.32:-0.62:1.000:0.964 0/0/1/1:4:12,17:0.56: 0.23:1.000:0.971 0/0/1/1:4:16,15:0.49: 0.41:1.000:0.996 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,13:0.74:-0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:5,26:0.73: 0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:7,22:0.67: 0.23:1.000:0.930 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,23:0.62: 0.66:0.915:0.600 0/1/1/1:4:3,13:0.71:-0.88:1.000:0.991 0/1/1/1:4:5,16:0.67:-0.45:1.000:0.938 0/1/1/1:4:3,22:0.76:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,21:0.54: 1.01:0.980:0.990 0/0/1/1:4:20,17:0.47: 0.92:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:12,34:0.66: 1.69:1.000:0.865 0/0/1/1:4:18,21:0.53: 1.09:1.000:0.994 1/1/1/1:4:2,41:0.91: 1.44:1.000:0.916 0/1/1/1:4:5,18:0.69:-0.28:1.000:0.971 0/0/1/1:4:19,12:0.41: 0.41:1.000:0.876 0/0/0/0:4:21,0:0.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:7,2:0.28:-1.48:1.000:0.994 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,21:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,26:0.61: 1.09:1.000:0.679 0/0/1/1:4:8,10:0.54:-0.71:1.000:0.989 0/0/1/1:4:21,15:0.44: 0.84:1.000:0.958 0/1/1/1:4:3,13:0.71:-0.88:1.000:0.991 0/0/0/1:4:11,4:0.32:-0.97:1.000:0.958 0/0/1/1:4:17,22:0.54: 1.09:1.000:0.986 0/1/1/1:4:1,12:0.85:-1.14:1.000:0.992 0/0/0/0:4:24,0:0.00:-0.19:0.998:1.000 0/1/1/1:4:3,13:0.71:-0.88:1.000:0.991 0/0/1/1:4:13,17:0.54: 0.32:1.000:0.985 0/0/1/1:4:20,15:0.44: 0.75:1.000:0.973 0/0/1/1:4:12,20:0.58: 0.49:1.000:0.900 0/0/0/1:4:23,8:0.31: 0.41:0.993:0.971 0/0/1/1:4:21,27:0.54: 1.86:1.000:0.987 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,4:0.39:-1.31:1.000:0.733 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.62:0.999:1.000 0/1/1/1:4:7,24:0.68: 0.41:1.000:0.960 0/0/1/1:4:21,15:0.44: 0.84:1.000:0.958 0/0/1/1:4:21,18:0.47: 1.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,8:0.78:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,21:0.91:-0.37:1.000:0.938 0/0/1/1:4:14,10:0.44:-0.19:1.000:0.958 0/1/1/1:4:4,17:0.71:-0.45:1.000:0.990 0/0/0/1:4:13,2:0.19:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:11,21:0.60: 0.49:1.000:0.753 0/0/1/1:4:18,18:0.50: 0.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,36:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:4,14:0.69:-0.71:1.000:0.965 0/0/1/1:4:23,19:0.46: 1.35:1.000:0.989 0/1/1/1:4:3,32:0.83: 0.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:3,23:0.77:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,11:0.83:-1.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,18:0.51: 0.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:3,14:0.72:-0.79:1.000:0.994 0/0/1/1:4:22,13:0.40: 0.75:1.000:0.790 0/0/0/1:4:17,8:0.36:-0.11:0.998:0.690 0/0/1/1:4:7,14:0.61:-0.45:1.000:0.679 0/0/0/0:4:27,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:16,20:0.54: 0.84:1.000:0.989 0/0/1/1:4:23,12:0.38: 0.75:1.000:0.538 0/0/0/0:4:13,0:0.00:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,31:0.71: 1.01:1.000:0.992 0/1/1/1:4:5,31:0.74: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:14,29:0.62: 1.44:1.000:0.617 1/1/1/1:4:1,36:0.95: 0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:17,14:0.46: 0.41:1.000:0.989 0/0/1/1:4:12,20:0.58: 0.49:1.000:0.900 0/1/1/1:4:3,35:0.84: 1.01:1.000:0.994 0/0/0/0:4:37,1:0.04: 1.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,18:0.48: 1.01:1.000:0.995 0/0/1/1:4:4,3:0.44:-1.65:1.000:0.973 0/0/1/1:4:17,17:0.50: 0.66:1.000:0.997 0/0/0/1:4:8,2:0.27:-1.39:1.000:0.998 0/0/0/0:4:14,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:22,0:0.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,3:1.00:-1.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,28:0.73: 0.58:1.000:0.998 0/0/1/1:4:14,19:0.55: 0.58:1.000:0.979 0/0/1/1:4:24,16:0.42: 1.18:1.000:0.922 0/1/1/1:4:1,16:0.88:-0.79:1.000:0.708 0/1/1/1:4:4,15:0.69:-0.62:1.000:0.978 0/1/1/1:4:4,39:0.81: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,25:0.51: 1.86:1.000:0.996 0/0/0/0:4:16,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,13:0.86:-1.05:1.000:0.975 0/1/1/1:4:13,32:0.64: 1.61:1.000:0.697 0/0/0/0:4:19,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:25,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,32:0.83: 0.75:1.000:0.998 0/0/0/1:4:20,2:0.13:-0.37:1.000:0.878 0/1/1/1:4:3,16:0.73:-0.62:1.000:0.997 0/0/0/0:4:18,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:5,13:0.65:-0.71:1.000:0.775 0/1/1/1:4:3,38:0.85: 1.26:1.000:0.982 0/0/1/1:4:21,27:0.54: 1.86:1.000:0.987 0/1/1/1:4:2,20:0.82:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:9,19:0.62: 0.15:1.000:0.582 0/0/0/0:4:28,0:0.00: 0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:13,13:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/1/1:4:17,19:0.52: 0.84:1.000:0.995 0/1/1/1:4:8,21:0.65: 0.23:1.000:0.787 0/1/1/1:4:3,14:0.72:-0.79:0.956:0.994 0/0/1/1:4:29,17:0.40: 1.69:1.000:0.777 1/1/1/1:4:1,32:0.94: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/0:4:8,0:0.00:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,23:0.50: 1.69:1.000:0.997 -chr8.1 79406241 chr8.1_079406241 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:50,46:0.48: 0.30:1.000:0.995 0/1/1/1:4:15,54:0.74:-0.77:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,23:0.25: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/1:4:72,23:0.24: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,63:0.49: 1.57:1.000:0.996 0/0/0/1:4:74,30:0.28: 0.62:1.000:0.994 0/0/0/1:4:40,10:0.20:-1.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,28:0.26: 0.66:1.000:0.999 0/0/1/1:4:28,50:0.62:-0.41:1.000:0.542 0/0/1/1:4:6,8:0.56:-2.95:1.000:0.964 0/0/0/1:4:11,4:0.26:-2.91:1.000:0.999 0/0/1/1:4:33,55:0.61:-0.02:1.000:0.711 0/0/1/1:4:47,45:0.49: 0.14:1.000:0.996 0/0/0/1:4:73,25:0.25: 0.38:1.000:0.999 0/1/1/1:4:18,45:0.69:-1.01:1.000:0.966 0/0/0/0:4:92,0:0.00: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,42:0.43: 0.34:0.998:0.950 0/1/1/1:4:15,56:0.75:-0.69:1.000:0.999 0/0/1/1:4:51,49:0.49: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,44:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/0/0/1:4:8,4:0.33:-3.03:1.000:0.923 0/0/0/1:4:74,23:0.23: 0.34:1.000:1.000 0/0/0/1:4:73,30:0.29: 0.58:1.000:0.993 0/0/1/1:4:38,32:0.46:-0.73:1.000:0.985 0/0/1/1:4:3,3:0.50:-3.27:1.000:0.997 0/0/0/1:4:73,24:0.24: 0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,42:0.47: 0.06:1.000:0.991 0/0/0/1:4:68,33:0.32: 0.50:1.000:0.946 0/0/1:3:59,31:0.34: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,18:0.25:-0.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:47,16:0.25:-1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:62,25:0.28:-0.06:1.000:0.995 0/0/0/1:4:7,2:0.22:-3.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:17,5:0.22:-2.63:1.000:1.000 1/1/1:3:0,3:0.95:-3.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,48:0.48: 0.46:1.000:0.995 0/0/0/1:4:72,25:0.25: 0.34:1.000:0.999 0/0/0/0:4:118,0:0.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/0/0:4:96,0:0.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,39:0.43: 0.06:1.000:0.951 0/0/0/1:4:82,21:0.20: 0.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:86,26:0.23: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:76,22:0.22: 0.38:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,61:0.77:-0.53:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,23:0.24: 0.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:79,34:0.30: 0.98:1.000:0.988 0/0/0/1/1:5:79,45:0.36: 1.41:1.000:0.932 0/0/0/0:4:15,1:0.06:-2.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,44:0.46: 0.30:1.000:0.986 0/0/0/1:4:58,13:0.18:-0.69:1.000:0.999 0/1/1/1:4:19,55:0.71:-0.57:1.000:0.992 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,47:0.53:-0.02:1.000:0.992 0/0/0/0:4:109,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,18:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:67,18:0.21:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:54,54:0.50: 0.78:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,68:0.56: 1.25:1.000:0.971 0/0/0/1/1/1:6:27,34:0.55:-1.09:1.000:0.746 0/1/1/1:4:30,73:0.68: 0.58:1.000:0.955 0/0/1/1:4:45,49:0.52: 0.22:1.000:0.995 0/1/1/1:4:26,82:0.72: 0.78:1.000:0.997 0/0/0/1:4:65,10:0.13:-0.53:1.000:0.914 0/0/1/1:4:57,46:0.45: 0.58:1.000:0.975 0/0/1/1:4:41,54:0.56: 0.26:1.000:0.968 0/0/1/1:4:26,17:0.39:-1.80:1.000:0.724 0/0/0/1:4:66,28:0.29: 0.22:1.000:0.990 0/0/1/1:4:44,45:0.50: 0.02:0.887:0.997 0/0/0/1:4:67,23:0.25: 0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:86,34:0.28: 1.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:52,0:0.00:-1.44:0.999:1.000 0/0/1/1:4:39,33:0.46:-0.65:1.000:0.986 0/0/1/1:4:70,44:0.38: 1.02:1.000:0.613 0/0/1/1:4:41,50:0.54: 0.10:1.000:0.986 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,31:0.39:-0.37:1.000:0.691 0/0/1/1:4:49,75:0.59: 1.41:1.000:0.859 0/0/0/1:4:84,29:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/0/1:4:90,23:0.20: 0.98:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,64:0.74:-0.25:0.915:0.999 0/0/1/1:4:57,48:0.46: 0.66:1.000:0.985 0/0/1/1:4:68,66:0.49: 1.81:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,74:0.70: 0.54:1.000:0.980 0/0/0/1:4:44,16:0.26:-1.13:0.980:0.999 0/0/0/1:4:82,26:0.24: 0.78:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,34:0.48:-0.69:1.000:0.995 0/0/1/1:4:64,41:0.39: 0.66:1.000:0.669 0/0/1/1:4:37,49:0.56:-0.10:1.000:0.966 0/1/1/1:4:27,74:0.70: 0.50:1.000:0.986 0/0/1/1:4:36,32:0.47:-0.81:1.000:0.992 0/0/0/1:4:72,27:0.27: 0.42:1.000:0.998 0/0/0/1:4:80,27:0.25: 0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:64,15:0.19:-0.37:1.000:0.999 0/0/0/0:4:126,0:0.00: 1.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,44:0.53:-0.25:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,48:0.52: 0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:76,31:0.28: 0.74:1.000:0.994 0/0/0/1:4:70,26:0.27: 0.30:1.000:0.998 0/0/1/1:4:56,52:0.48: 0.78:1.000:0.995 0/0/0/1:4:26,11:0.29:-2.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:54,45:0.45: 0.42:1.000:0.983 0/0/0/1:4:52,23:0.30:-0.53:1.000:0.983 0/0/0/0:4:103,1:0.01: 0.62:0.998:1.000 0/0/1/1:4:45,40:0.47:-0.13:1.000:0.992 0/0/0/1:4:64,31:0.32: 0.26:1.000:0.947 0/0/0/1:4:81,28:0.25: 0.82:1.000:0.999 0/0/0/1:4:68,32:0.32: 0.46:1.000:0.963 0/0/0/1:4:104,32:0.23: 1.89:0.993:1.000 0/0/1/1:4:50,55:0.52: 0.66:1.000:0.995 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:101,29:0.22: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 1.13:0.999:1.000 0/0/1/1:4:78,58:0.42: 1.89:1.000:0.931 0/0/0/1:4:55,13:0.19:-0.81:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,30:0.29: 0.50:1.000:0.991 0/0/0/1:4:53,10:0.16:-1.01:1.000:0.993 0/1/1/1:4:20,37:0.63:-1.25:1.000:0.551 0/0/0/1:4:85,27:0.24: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:75,20:0.21: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:64,28:0.30: 0.14:1.000:0.985 0/0/1/1:4:45,50:0.52: 0.26:1.000:0.994 0/0/0/1:4:68,26:0.27: 0.22:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,54:0.49: 0.86:1.000:0.996 0/0/1/1:4:54,36:0.40: 0.06:1.000:0.771 0/0/1/1:4:51,48:0.48: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:62,47:0.43: 0.82:1.000:0.946 0/1/1/1:4:22,55:0.69:-0.45:1.000:0.966 0/1/1/1:4:19,41:0.66:-1.13:1.000:0.861 0/0/0/1:4:66,23:0.25: 0.02:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,48:0.52: 0.14:1.000:0.995 0/0/0/1:4:64,28:0.30: 0.14:1.000:0.985 0/0/0/1:4:43,14:0.24:-1.25:0.998:1.000 0/0/1/1:4:51,38:0.43: 0.02:1.000:0.933 0/0/0/1:4:63,26:0.29: 0.02:1.000:0.993 0/0/1/1:4:61,68:0.52: 1.61:1.000:0.994 0/0/0/1:4:88,28:0.24: 1.09:1.000:1.000 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,41:0.49:-0.17:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,74:0.70: 0.54:1.000:0.980 0/0/1/1:4:37,47:0.55:-0.17:1.000:0.978 0/1/1/1:4:21,66:0.72:-0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:36,31:0.46:-0.85:1.000:0.989 0/0/1/1:4:34,31:0.48:-0.93:1.000:0.994 0/1/1/1:4:31,98:0.72: 1.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:101,29:0.22: 1.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,27:0.24: 0.86:1.000:1.000 0/0/0/1:4:71,27:0.27: 0.38:1.000:0.998 0/0/0/1:4:77,35:0.31: 0.94:1.000:0.976 0/0/0/1:4:83,16:0.16: 0.42:1.000:0.994 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/0:4:95,0:0.00: 0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:7,10:0.58:-2.83:1.000:0.927 0/0/1/1:4:36,35:0.49:-0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:70,19:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:42,53:0.55: 0.26:1.000:0.980 0/0/1/1:4:54,47:0.46: 0.50:1.000:0.990 0/0/1/1:4:48,46:0.49: 0.22:1.000:0.996 0/1/1/1:4:23,61:0.70:-0.17:1.000:0.981 0/0/1/1:4:55,34:0.38: 0.02:1.000:0.561 0/0/0/0:4:99,0:0.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,35:0.48:-0.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:44,44:0.50:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/0:4:98,0:0.00: 0.38:1.000:1.000 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/0/0:4:81,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,43:0.46: 0.22:1.000:0.985 0/0/0/1:4:69,33:0.32: 0.54:1.000:0.955 0/0/1/1:4:36,37:0.51:-0.61:1.000:0.997 0/0/0/1:4:55,14:0.20:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,26:0.46:-1.29:1.000:0.989 0/0/1/1:4:49,54:0.52: 0.58:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,54:0.53: 0.46:1.000:0.990 0/0/1/1:4:30,50:0.61:-0.33:1.000:0.711 0/0/1/1:4:40,42:0.51:-0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:52,66:0.55: 1.17:1.000:0.978 0/0/0/1:4:42,24:0.36:-0.89:1.000:0.682 0/0/1/1:4:41,51:0.55: 0.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:52,39:0.43: 0.10:0.956:0.938 0/0/0/1:4:68,35:0.34: 0.58:1.000:0.892 0/1/1/1:4:32,78:0.68: 0.86:1.000:0.956 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,41:0.52:-0.41:1.000:0.994 -chr8.1 79448768 chr8.1_079448768 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:73,49:.: 0.55:1.000:. ./.:4:68,32:.:-0.18:1.000:. ./.:4:55,44:.:-0.22:1.000:. ./.:4:49,49:.:-0.25:1.000:. ./.:4:60,42:.:-0.12:1.000:. ./.:4:36,23:.:-1.55:1.000:. ./.:4:22,33:.:-1.68:1.000:. ./.:4:46,46:.:-0.45:1.000:. ./.:4:43,39:.:-0.78:1.000:. ./.:4:63,19:.:-0.78:1.000:. ./.:4:104,60:.: 1.94:1.000:. ./.:4:97,62:.: 1.78:1.000:. ./.:4:49,25:.:-1.05:1.000:. ./.:4:52,36:.:-0.58:1.000:. ./.:4:54,24:.:-0.91:1.000:. ./.:4:31,39:.:-1.18:1.000:. ./.:4:52,33:.:-0.68:0.998:. ./.:4:49,29:.:-0.91:1.000:. ./.:4:72,45:.: 0.38:1.000:. ./.:4:74,62:.: 1.01:1.000:. ./.:4:60,35:.:-0.35:1.000:. ./.:4:54,31:.:-0.68:1.000:. ./.:4:47,50:.:-0.28:1.000:. ./.:4:32,21:.:-1.74:1.000:. ./.:4:33,19:.:-1.78:1.000:. ./.:4:26,34:.:-1.51:1.000:. ./.:4:57,33:.:-0.52:1.000:. ./.:4:40,24:.:-1.38:1.000:. ./.:3:61,48:.: 0.12:1.000:. ./.:4:39,43:.:-0.78:1.000:. ./.:4:31,20:.:-1.81:1.000:. ./.:4:22,18:.:-2.18:1.000:. ./.:4:41,35:.:-0.98:1.000:. ./.:4:69,26:.:-0.35:1.000:. ./.:3:14,7:.:-2.81:1.000:. ./.:4:38,27:.:-1.35:1.000:. ./.:4:35,40:.:-1.01:1.000:. ./.:4:41,43:.:-0.71:1.000:. ./.:4:34,41:.:-1.01:1.000:. ./.:4:41,32:.:-1.08:1.000:. ./.:4:53,41:.:-0.38:1.000:. ./.:4:59,50:.: 0.12:1.000:. ./.:4:39,53:.:-0.45:1.000:. ./.:4:76,30:.: 0.02:1.000:. ./.:4:90,53:.: 1.25:1.000:. ./.:4:94,49:.: 1.25:1.000:. ./.:5:85,53:.: 1.08:1.000:. ./.:4:131,56:.: 2.71:1.000:. ./.:4:55,32:.:-0.61:1.000:. ./.:4:92,52:.: 1.28:1.000:. ./.:4:104,49:.: 1.58:1.000:. ./.:4:47,42:.:-0.55:1.000:. ./.:4:70,33:.:-0.08:1.000:. ./.:4:63,50:.: 0.25:1.000:. ./.:4:35,40:.:-1.01:1.000:. ./.:4:85,37:.: 0.55:1.000:. ./.:4:66,34:.:-0.18:1.000:. ./.:4:83,61:.: 1.28:1.000:. ./.:4:71,29:.:-0.18:1.000:. ./.:6:110,53:.: 1.91:1.000:. ./.:4:121,55:.: 2.34:1.000:. ./.:4:79,27:.: 0.02:1.000:. ./.:4:123,46:.: 2.11:1.000:. ./.:4:80,71:.: 1.51:1.000:. ./.:4:73,32:.:-0.02:1.000:. ./.:4:78,47:.: 0.65:1.000:. ./.:4:93,52:.: 1.31:1.000:. ./.:4:55,43:.:-0.25:1.000:. ./.:4:72,34:.: 0.02:0.887:. ./.:4:54,52:.: 0.02:1.000:. ./.:4:79,54:.: 0.91:1.000:. ./.:4:65,47:.: 0.22:0.999:. ./.:4:74,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:49,35:.:-0.71:1.000:. ./.:4:74,54:.: 0.75:1.000:. ./.:4:66,41:.: 0.05:1.000:. ./.:4:69,38:.: 0.05:1.000:. ./.:4:87,47:.: 0.95:1.000:. ./.:4:66,44:.: 0.15:1.000:. ./.:4:89,41:.: 0.81:1.000:. ./.:4:89,36:.: 0.65:0.915:. ./.:4:87,51:.: 1.08:1.000:. ./.:4:83,59:.: 1.21:1.000:. ./.:4:66,25:.:-0.48:1.000:. ./.:4:94,56:.: 1.48:0.980:. ./.:4:76,46:.: 0.55:1.000:. ./.:4:65,43:.: 0.08:1.000:. ./.:4:77,53:.: 0.81:1.000:. ./.:4:110,37:.: 1.38:1.000:. ./.:4:82,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:76,42:.: 0.41:1.000:. ./.:4:64,45:.: 0.12:1.000:. ./.:4:90,47:.: 1.05:1.000:. ./.:4:29,31:.:-1.51:1.000:. ./.:4:93,65:.: 1.74:1.000:. ./.:4:72,55:.: 0.71:1.000:. ./.:4:85,39:.: 0.61:1.000:. ./.:4:66,33:.:-0.22:1.000:. ./.:4:104,45:.: 1.44:1.000:. ./.:4:55,34:.:-0.55:1.000:. ./.:4:95,48:.: 1.25:1.000:. ./.:4:87,49:.: 1.01:1.000:. ./.:4:58,34:.:-0.45:1.000:. ./.:4:82,53:.: 0.98:0.998:. ./.:4:79,39:.: 0.41:1.000:. ./.:4:81,42:.: 0.58:1.000:. ./.:4:73,46:.: 0.45:1.000:. ./.:4:48,42:.:-0.52:1.000:. ./.:4:71,50:.: 0.51:0.993:. ./.:4:73,39:.: 0.22:1.000:. ./.:4:80,59:.: 1.11:1.000:. ./.:4:40,35:.:-1.01:1.000:. ./.:4:78,56:.: 0.95:0.999:. ./.:4:77,45:.: 0.55:1.000:. ./.:4:85,43:.: 0.75:1.000:. ./.:4:88,62:.: 1.48:1.000:. ./.:4:76,66:.: 1.21:1.000:. ./.:4:79,40:.: 0.45:1.000:. ./.:4:77,48:.: 0.65:1.000:. ./.:4:83,41:.: 0.61:1.000:. ./.:4:71,47:.: 0.41:1.000:. ./.:4:117,32:.: 1.44:1.000:. ./.:4:76,45:.: 0.51:1.000:. ./.:4:43,52:.:-0.35:1.000:. ./.:4:77,44:.: 0.51:1.000:. ./.:4:83,55:.: 1.08:1.000:. ./.:4:88,44:.: 0.88:1.000:. ./.:4:69,29:.:-0.25:1.000:. ./.:4:53,31:.:-0.71:1.000:. ./.:4:65,33:.:-0.25:1.000:. ./.:4:77,52:.: 0.78:1.000:. ./.:4:37,36:.:-1.08:1.000:. ./.:4:36,21:.:-1.61:0.998:. ./.:4:45,29:.:-1.05:1.000:. ./.:4:47,22:.:-1.21:1.000:. ./.:4:86,44:.: 0.81:1.000:. ./.:4:61,41:.:-0.12:1.000:. ./.:4:60,52:.: 0.22:1.000:. ./.:4:83,37:.: 0.48:1.000:. ./.:4:82,28:.: 0.15:1.000:. ./.:4:107,53:.: 1.81:1.000:. ./.:4:105,50:.: 1.64:1.000:. ./.:4:62,39:.:-0.15:1.000:. ./.:4:107,35:.: 1.21:1.000:. ./.:4:83,66:.: 1.44:1.000:. ./.:4:85,55:.: 1.15:1.000:. ./.:4:51,57:.: 0.08:1.000:. ./.:4:54,24:.:-0.91:1.000:. ./.:4:58,43:.:-0.15:1.000:. ./.:4:38,41:.:-0.88:1.000:. ./.:4:40,44:.:-0.71:1.000:. ./.:4:38,27:.:-1.35:1.000:. ./.:4:64,14:.:-0.91:1.000:. ./.:4:38,21:.:-1.55:1.000:. ./.:4:47,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:75,44:.: 0.45:1.000:. ./.:4:62,55:.: 0.38:1.000:. ./.:4:74,40:.: 0.28:1.000:. ./.:4:72,35:.: 0.05:1.000:. ./.:4:46,52:.:-0.25:1.000:. ./.:4:34,52:.:-0.65:1.000:. ./.:4:39,24:.:-1.41:1.000:. ./.:4:62,26:.:-0.58:1.000:. ./.:4:42,44:.:-0.65:1.000:. ./.:4:31,23:.:-1.71:1.000:. ./.:4:35,32:.:-1.28:1.000:. ./.:4:35,42:.:-0.95:1.000:. ./.:4:58,50:.: 0.08:1.000:. ./.:4:50,45:.:-0.35:1.000:. ./.:4:40,26:.:-1.31:1.000:. ./.:4:60,28:.:-0.58:1.000:. ./.:4:19,24:.:-2.08:1.000:. ./.:4:63,31:.:-0.38:1.000:. ./.:4:60,24:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,46:.: 0.05:1.000:. ./.:4:47,24:.:-1.15:1.000:. ./.:4:30,39:.:-1.21:1.000:. ./.:4:83,37:.: 0.48:1.000:. ./.:4:45,47:.:-0.45:1.000:. ./.:4:42,22:.:-1.38:1.000:. ./.:4:56,52:.: 0.08:0.956:. ./.:4:68,41:.: 0.12:1.000:. ./.:4:79,44:.: 0.58:1.000:. ./.:4:31,33:.:-1.38:1.000:. ./.:4:63,39:.:-0.12:1.000:. -chr8.1 79517679 chr8.1_079517679 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:119,82:.:-0.54:1.000:. ./.:4:102,97:.:-0.58:1.000:. ./.:4:128,113:.: 0.28:1.000:. ./.:4:136,113:.: 0.44:1.000:. ./.:4:138,128:.: 0.79:1.000:. ./.:4:305,0:.: 1.59:1.000:. ./.:4:142,47:.:-0.79:1.000:. ./.:4:238,1:.: 0.24:1.000:. ./.:4:131,92:.:-0.09:1.000:. ./.:4:33,49:.:-2.97:1.000:. ./.:4:43,41:.:-2.93:1.000:. ./.:4:123,135:.: 0.62:1.000:. ./.:4:106,86:.:-0.72:1.000:. ./.:4:209,59:.: 0.83:1.000:. ./.:4:116,111:.:-0.01:1.000:. ./.:4:208,53:.: 0.69:1.000:. ./.:4:77,175:.: 0.50:0.998:. ./.:4:139,119:.: 0.62:1.000:. ./.:4:180,156:.: 2.22:1.000:. ./.:4:95,220:.: 1.79:1.000:. ./.:4:35,32:.:-3.28:1.000:. ./.:4:179,54:.: 0.11:1.000:. ./.:4:213,56:.: 0.85:1.000:. ./.:4:112,104:.:-0.23:1.000:. ./.:4:45,22:.:-3.28:1.000:. ./.:4:146,98:.: 0.34:1.000:. ./.:4:60,160:.:-0.15:1.000:. ./.:4:227,0:.:-0.01:1.000:. ./.:3:82,109:.:-0.75:1.000:. ./.:4:135,125:.: 0.67:1.000:. ./.:4:117,132:.: 0.44:1.000:. ./.:4:237,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:30,21:.:-3.61:1.000:. ./.:4:110,34:.:-1.71:1.000:. ./.:3:19,10:.:-4.06:1.000:. ./.:4:115,104:.:-0.17:1.000:. ./.:4:189,51:.: 0.26:1.000:. ./.:4:217,71:.: 1.24:1.000:. ./.:4:204,59:.: 0.73:1.000:. ./.:4:232,62:.: 1.36:1.000:. ./.:4:110,101:.:-0.34:1.000:. ./.:4:96,88:.:-0.89:1.000:. ./.:4:202,45:.: 0.40:1.000:. ./.:4:108,73:.:-0.95:1.000:. ./.:4:307,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:125,103:.: 0.01:1.000:. ./.:5:272,56:.: 2.06:1.000:. ./.:4:133,63:.:-0.64:1.000:. ./.:4:149,35:.:-0.89:1.000:. ./.:4:215,45:.: 0.67:1.000:. ./.:4:100,81:.:-0.95:1.000:. ./.:4:187,49:.: 0.17:1.000:. ./.:4:181,51:.: 0.09:1.000:. ./.:4:192,56:.: 0.42:1.000:. ./.:4:176,45:.:-0.13:1.000:. ./.:4:134,93:.:-0.01:1.000:. ./.:4:175,46:.:-0.13:1.000:. ./.:4:139,106:.: 0.36:1.000:. ./.:4:201,57:.: 0.62:1.000:. ./.:6:95,99:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,161:.: 0.40:1.000:. ./.:4:95,94:.:-0.79:1.000:. ./.:4:156,125:.: 1.10:1.000:. ./.:4:133,89:.:-0.11:1.000:. ./.:4:126,103:.: 0.03:1.000:. ./.:4:118,114:.: 0.09:1.000:. ./.:4:62,186:.: 0.42:1.000:. ./.:4:225,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:138,84:.:-0.11:0.887:. ./.:4:44,122:.:-1.26:1.000:. ./.:4:220,60:.: 1.07:1.000:. ./.:4:174,59:.: 0.11:0.999:. ./.:4:62,140:.:-0.52:1.000:. ./.:4:164,52:.:-0.23:1.000:. ./.:4:103,92:.:-0.66:1.000:. ./.:4:161,37:.:-0.60:1.000:. ./.:4:185,46:.: 0.07:1.000:. ./.:4:203,45:.: 0.42:1.000:. ./.:4:297,0:.: 1.42:1.000:. ./.:4:242,63:.: 1.59:1.000:. ./.:4:105,90:.:-0.66:0.915:. ./.:4:214,60:.: 0.95:1.000:. ./.:4:263,57:.: 1.89:1.000:. ./.:4:124,96:.:-0.15:1.000:. ./.:4:135,90:.:-0.05:0.980:. ./.:4:191,51:.: 0.30:1.000:. ./.:4:142,36:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,83:.:-1.01:1.000:. ./.:4:102,82:.:-0.89:1.000:. ./.:4:140,99:.: 0.24:1.000:. ./.:4:198,45:.: 0.32:1.000:. ./.:4:106,114:.:-0.15:1.000:. ./.:4:176,121:.: 1.42:1.000:. ./.:4:130,41:.:-1.15:1.000:. ./.:4:252,68:.: 1.89:1.000:. ./.:4:123,103:.:-0.03:1.000:. ./.:4:106,96:.:-0.52:1.000:. ./.:4:181,45:.:-0.03:1.000:. ./.:4:143,107:.: 0.46:1.000:. ./.:4:132,99:.: 0.07:1.000:. ./.:4:52,143:.:-0.66:1.000:. ./.:4:60,190:.: 0.46:1.000:. ./.:4:203,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:201,56:.: 0.60:0.998:. ./.:4:167,41:.:-0.40:1.000:. ./.:4:182,27:.:-0.38:1.000:. ./.:4:186,49:.: 0.15:1.000:. ./.:4:205,66:.: 0.89:1.000:. ./.:4:156,126:.: 1.12:0.993:. ./.:4:135,88:.:-0.09:1.000:. ./.:4:195,52:.: 0.40:1.000:. ./.:4:232,64:.: 1.40:1.000:. ./.:4:171,49:.:-0.15:0.999:. ./.:4:204,55:.: 0.65:1.000:. ./.:4:156,45:.:-0.54:1.000:. ./.:4:200,65:.: 0.77:1.000:. ./.:4:209,1:.:-0.36:1.000:. ./.:4:107,81:.:-0.81:1.000:. ./.:4:181,54:.: 0.15:1.000:. ./.:4:193,1:.:-0.68:1.000:. ./.:4:131,112:.: 0.32:1.000:. ./.:4:105,85:.:-0.77:1.000:. ./.:4:206,69:.: 0.97:1.000:. ./.:4:192,64:.: 0.58:1.000:. ./.:4:122,100:.:-0.11:1.000:. ./.:4:64,119:.:-0.91:1.000:. ./.:4:176,54:.: 0.05:1.000:. ./.:4:145,48:.:-0.70:1.000:. ./.:4:159,32:.:-0.75:1.000:. ./.:4:161,46:.:-0.42:1.000:. ./.:4:124,107:.: 0.07:1.000:. ./.:4:110,110:.:-0.15:1.000:. ./.:4:88,95:.:-0.91:0.998:. ./.:4:133,84:.:-0.21:1.000:. ./.:4:102,83:.:-0.87:1.000:. ./.:4:78,248:.: 2.02:1.000:. ./.:4:183,54:.: 0.20:1.000:. ./.:4:172,44:.:-0.23:1.000:. ./.:4:159,47:.:-0.44:1.000:. ./.:4:108,87:.:-0.66:1.000:. ./.:4:141,87:.: 0.01:1.000:. ./.:4:131,96:.:-0.01:1.000:. ./.:4:66,137:.:-0.50:1.000:. ./.:4:109,72:.:-0.95:1.000:. ./.:4:133,120:.: 0.52:1.000:. ./.:4:166,109:.: 0.97:1.000:. ./.:4:197,57:.: 0.54:1.000:. ./.:4:171,46:.:-0.21:1.000:. ./.:4:179,65:.: 0.34:1.000:. ./.:4:166,49:.:-0.25:1.000:. ./.:4:220,61:.: 1.10:1.000:. ./.:4:167,51:.:-0.19:1.000:. ./.:4:54,36:.:-2.81:1.000:. ./.:4:137,38:.:-1.07:1.000:. ./.:4:143,118:.: 0.69:1.000:. ./.:4:121,125:.: 0.38:1.000:. ./.:4:131,101:.: 0.09:1.000:. ./.:4:124,147:.: 0.89:1.000:. ./.:4:90,92:.:-0.93:1.000:. ./.:4:132,130:.: 0.71:1.000:. ./.:4:193,51:.: 0.34:1.000:. ./.:4:157,36:.:-0.70:1.000:. ./.:4:116,100:.:-0.23:1.000:. ./.:4:185,66:.: 0.48:1.000:. ./.:4:193,51:.: 0.34:1.000:. ./.:4:171,57:.: 0.01:1.000:. ./.:4:169,44:.:-0.30:1.000:. ./.:4:263,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:115,95:.:-0.36:1.000:. ./.:4:107,115:.:-0.11:1.000:. ./.:4:95,82:.:-1.03:1.000:. ./.:4:98,71:.:-1.20:1.000:. ./.:4:221,69:.: 1.28:1.000:. ./.:4:60,169:.: 0.03:1.000:. ./.:4:108,103:.:-0.34:1.000:. ./.:4:112,77:.:-0.79:1.000:. ./.:4:226,62:.: 1.24:1.000:. ./.:4:73,213:.: 1.20:1.000:. ./.:4:189,44:.: 0.11:1.000:. ./.:4:194,39:.: 0.11:1.000:. ./.:4:205,63:.: 0.83:0.956:. ./.:4:247,76:.: 1.95:1.000:. ./.:4:166,146:.: 1.73:1.000:. ./.:4:194,49:.: 0.32:1.000:. ./.:4:136,88:.:-0.07:1.000:. -chr8.1 79624308 chr8.1_079624308 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:28,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:4,8:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:19,8:.: 1.17:1.000:. ./.:4:24,9:.: 1.96:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:8,7:.:-0.41:1.000:. ./.:4:2,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:17,19:.: 2.35:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:5,3:.:-1.33:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:13,7:.: 0.25:0.998:. ./.:4:13,7:.: 0.25:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:23,14:.: 2.48:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.99:1.000:. ./.:4:7,9:.:-0.28:1.000:. ./.:4:15,12:.: 1.17:1.000:. ./.:4:12,7:.: 0.11:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:3:11,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:1,0:.:-2.25:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.99:1.000:. ./.:3:2,1:.:-1.99:1.000:. ./.:4:6,3:.:-1.20:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:13,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,6:.: 0.38:1.000:. ./.:4:8,10:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,4:.: 0.25:1.000:. ./.:5:22,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:7,2:.:-1.20:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:10,10:.: 0.25:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:33,0:.: 1.96:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:6:15,9:.: 0.77:1.000:. ./.:4:10,13:.: 0.64:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:7,4:.:-0.94:1.000:. ./.:4:12,6:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:13,2:.:-0.41:0.887:. ./.:4:22,9:.: 1.69:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.73:0.999:. ./.:4:1,9:.:-1.07:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:12,10:.: 0.51:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:11,3:.:-0.54:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:10,6:.:-0.28:1.000:. ./.:4:11,7:.:-0.02:0.915:. ./.:4:10,14:.: 0.77:1.000:. ./.:4:13,11:.: 0.77:1.000:. ./.:4:14,17:.: 1.69:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:0.980:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:4,8:.:-0.81:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.60:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:18,5:.: 0.64:1.000:. ./.:4:14,10:.: 0.77:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:19,12:.: 1.69:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.46:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:25,12:.: 2.48:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,8:.: 1.56:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:37,0:.: 2.48:0.998:. ./.:4:10,2:.:-0.81:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.90:0.993:. ./.:4:20,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:11,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.51:0.999:. ./.:4:10,1:.:-0.94:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.15:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:18,7:.: 0.90:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:13,3:.:-0.28:1.000:. ./.:4:18,12:.: 1.56:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:5,7:.:-0.81:1.000:. ./.:4:8,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:14,6:.: 0.25:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:0.998:. ./.:4:13,7:.: 0.25:1.000:. ./.:4:13,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:17,9:.: 1.04:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:10,7:.:-0.15:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:8,7:.:-0.41:1.000:. ./.:4:22,19:.: 3.01:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:13,11:.: 0.77:1.000:. ./.:4:13,12:.: 0.90:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:19,14:.: 1.96:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:17,8:.: 0.90:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:13,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:15,9:.: 0.77:1.000:. ./.:4:15,8:.: 0.64:1.000:. ./.:4:15,8:.: 0.64:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:9,5:.:-0.54:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:26,7:.: 1.96:1.000:. ./.:4:13,6:.: 0.11:1.000:. ./.:4:16,9:.: 0.90:1.000:. ./.:4:22,7:.: 1.43:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.94:1.000:. ./.:4:21,10:.: 1.69:1.000:. ./.:4:5,5:.:-1.07:1.000:. ./.:4:13,12:.: 0.90:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:11,5:.:-0.28:1.000:. ./.:4:25,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:10,5:.:-0.41:1.000:. ./.:4:14,9:.: 0.64:0.956:. ./.:4:25,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:11,13:.: 0.77:1.000:. ./.:4:10,0:.:-1.07:1.000:. ./.:4:12,15:.: 1.17:1.000:. -chr8.1 79798146 chr8.1_079798146 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:127,210:0.65: 0.68:1.000:0.784 0/0/0/0:4:244,0:0.00:-0.30:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,214:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,336:0.79: 1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:107,119:0.54:-0.49:1.000:0.987 0/1/1/1:4:100,242:0.74: 0.74:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,222:0.81: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:100,197:0.69: 0.26:1.000:0.979 0/0/1/1:4:180,80:0.38:-0.13:1.000:0.587 0/1/1/1:4:19,49:0.76:-2.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,69:0.86:-2.00:1.000:0.960 0/0/0/1:4:304,79:0.32: 1.17:1.000:0.964 0/1/1/1:4:104,200:0.69: 0.34:1.000:0.971 0/1/1/1:4:107,294:0.77: 1.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,88:0.37: 0.28:1.000:0.528 1/1/1/1:4:0,312:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:107,172:0.64: 0.07:0.998:0.707 0/0/0/1:4:323,119:0.36: 1.79:1.000:0.729 0/1/1/1:4:113,230:0.70: 0.75:1.000:0.987 0/1/1/1:4:108,229:0.71: 0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:48,47:0.50:-1.87:1.000:0.997 0/1/1/1:4:90,172:0.69:-0.11:1.000:0.968 0/1/1/1:4:152,269:0.67: 1.57:1.000:0.907 0/0/1/1:4:73,89:0.57:-1.16:1.000:0.956 0/1/1/1:4:10,41:0.83:-2.33:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,212:0.70: 0.47:1.000:0.986 0/1/1/1:4:62,147:0.74:-0.66:1.000:0.999 0/1/1:3:123,273:0.72: 1.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,184:1.00:-0.93:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-1.46:1.000:1.000 0/1/1/1:4:96,153:0.64:-0.24:1.000:0.681 0/1/1/1:4:10,43:0.84:-2.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,39:0.59:-2.15:1.000:0.843 0/1/1:3:13,17:0.59:-2.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:105,91:0.48:-0.80:1.000:0.995 0/1/1/1:4:115,281:0.75: 1.31:0.979:0.999 1/1/1/1:4:0,264:1.00:-0.08:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,222:1.00:-0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,75:0.47:-1.12:1.000:0.994 0/1/1/1:4:94,256:0.77: 0.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,193:1.00:-0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,199:0.67: 0.41:1.000:0.912 0/0/1/1:4:152,73:0.39:-0.50:1.000:0.716 0/1/1/1:4:78,207:0.76: 0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,276:0.76: 1.16:1.000:1.000 0/1/1/1/1:5:103,242:0.74: 0.77:1.000:0.868 0/1/1/1:4:35,112:0.79:-1.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,95:0.54:-0.95:1.000:0.990 0/1/1/1:4:73,195:0.76:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:152,86:0.42:-0.36:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,344:1.00: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,81:0.50:-1.14:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,298:1.00: 0.27:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,237:1.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,173:1.00:-1.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,279:0.80: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,183:0.73:-0.10:1.000:0.998 0/0/1/1:4:74,74:0.51:-1.31:1.000:0.996 0/0/0/1/1/1:6:116,115:0.51:-0.43:1.000:0.885 0/0/1/1:4:206,111:0.41: 0.47:1.000:0.857 0/1/1/1:4:96,178:0.68: 0.02:1.000:0.951 0/0/1/1:4:175,117:0.44: 0.21:1.000:0.970 0/1/1/1:4:84,201:0.74: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:142,214:0.62: 0.89:1.000:0.512 0/1/1/1:4:77,201:0.76: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,132:0.70:-0.79:1.000:0.987 0/1/1/1:4:86,184:0.71:-0.02:1.000:0.994 0/0/1/1:4:89,79:0.49:-1.10:0.887:0.996 0/1/1/1:4:83,179:0.72:-0.11:1.000:0.995 0/1/1/1:4:97,344:0.81: 1.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,274:1.00: 0.02:0.999:1.000 0/0/1/1:4:172,81:0.39:-0.20:1.000:0.685 0/1/1/1:4:112,339:0.78: 1.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:148,101:0.44:-0.24:1.000:0.974 1/1/1/1:4:0,229:1.00:-0.45:1.000:1.000 0/0/1/1:4:166,172:0.52: 0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:132,93:0.45:-0.50:1.000:0.980 0/1/1/1:4:98,234:0.74: 0.63:1.000:0.999 0/1/1/1:4:92,188:0.70: 0.08:1.000:0.988 0/0/0/1:4:197,69:0.35:-0.06:0.915:0.792 0/0/1/1:4:186,198:0.53: 1.18:1.000:0.993 0/0/1/1:4:223,239:0.53: 2.00:1.000:0.992 0/0/1/1:4:172,90:0.40:-0.11:1.000:0.828 1/1/1/1:4:0,142:1.00:-1.37:0.980:1.000 0/1/1/1:4:85,322:0.82: 1.42:1.000:0.999 0/1/1/1:4:64,150:0.74:-0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,193:0.79:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,170:0.75:-0.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:162,106:0.44:-0.04:1.000:0.964 0/0/1/1:4:76,78:0.52:-1.24:1.000:0.995 1/1/1/1:4:1,174:1.00:-1.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:105,300:0.77: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,130:0.69:-0.80:1.000:0.979 1/1/1/1:4:0,349:1.00: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,113:0.54:-0.61:1.000:0.986 0/1/1/1:4:86,175:0.70:-0.12:1.000:0.987 0/0/1/1:4:59,67:0.55:-1.54:1.000:0.983 1/1/1/1:4:0,237:1.00:-0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,99:0.54:-0.88:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,314:1.00: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:99,213:0.72: 0.42:1.000:0.994 0/1/1/1:4:56,139:0.75:-0.81:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,312:1.00: 0.42:0.999:1.000 0/0/1/1:4:128,137:0.53:-0.07:1.000:0.992 0/1/1/1:4:80,304:0.82: 1.18:1.000:0.999 0/1/1/1:4:98,265:0.76: 0.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:88,257:0.78: 0.77:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,252:1.00:-0.21:0.993:1.000 0/1/1/1:4:93,197:0.71: 0.19:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,248:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:122,205:0.65: 0.58:1.000:0.821 1/1/1/1:4:0,292:1.00: 0.21:0.999:1.000 0/0/1/1:4:108,104:0.50:-0.63:1.000:0.997 0/1/1/1:4:57,175:0.79:-0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:106,337:0.79: 1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,214:0.70: 0.53:1.000:0.981 0/0/1/1:4:193,93:0.39: 0.15:1.000:0.721 0/1/1/1:4:90,302:0.80: 1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,188:0.72: 0.03:1.000:0.995 0/1/1/1:4:93,312:0.80: 1.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,184:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:99,346:0.81: 1.82:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,102:0.47:-0.48:1.000:0.993 0/0/1/1:4:86,82:0.50:-1.10:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,237:0.76: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,91:0.56:-1.12:1.000:0.958 0/0/0/0:4:235,1:0.01:-0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,126:0.55:-0.37:1.000:0.983 0/1/1/1:4:69,206:0.78: 0.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:65,102:0.64:-1.11:1.000:0.631 1/1/1/1:4:0,225:1.00:-0.50:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-1.43:0.998:1.000 0/0/1/1:4:114,74:0.44:-0.89:1.000:0.962 0/1/1/1:4:69,196:0.77:-0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,268:0.73: 1.22:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,281:0.76: 1.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,264:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,96:0.54:-0.96:1.000:0.984 0/0/1/1:4:143,104:0.45:-0.26:1.000:0.984 0/1/1/1:4:99,246:0.75: 0.77:1.000:0.999 0/0/1/1:4:148,94:0.43:-0.32:1.000:0.955 0/1/1/1:4:75,158:0.71:-0.41:1.000:0.992 0/1/1/1:4:51,134:0.76:-0.92:1.000:1.000 0/0/1/1:4:257,128:0.40: 1.19:1.000:0.768 0/1/1/1:4:161,435:0.76: 3.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,310:0.76: 1.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:87,186:0.71: 0.01:1.000:0.994 0/1/1/1:4:101,328:0.80: 1.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:92,173:0.68:-0.07:1.000:0.960 1/1/1/1:4:0,325:1.00: 0.56:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,293:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,48:0.73:-2.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:85,93:0.54:-0.99:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,201:1.00:-0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,253:0.73: 0.98:1.000:0.997 0/0/1/1:4:108,140:0.58:-0.25:1.000:0.900 0/0/1/1:4:95,99:0.52:-0.82:1.000:0.994 0/0/1/1:4:203,90:0.38: 0.22:1.000:0.582 1/1/1/1:4:0,254:1.00:-0.19:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,292:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:171,156:0.49: 0.58:1.000:0.996 0/1/1/1:4:86,164:0.69:-0.23:1.000:0.967 1/1/1/1:4:0,315:1.00: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,234:1.00:-0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,277:1.00: 0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,231:1.00:-0.43:1.000:1.000 0/0/0/0:4:161,0:0.00:-1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:118,284:0.74: 1.37:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,110:0.56:-0.74:1.000:0.966 0/1/1/1:4:76,237:0.79: 0.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,73:0.50:-1.31:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,111:0.55:-0.66:1.000:0.984 0/1/1/1:4:87,150:0.66:-0.37:1.000:0.870 0/0/1/1:4:138,73:0.41:-0.64:1.000:0.839 0/0/1/1:4:57,84:0.62:-1.38:1.000:0.591 1/1/1/1:4:0,287:1.00: 0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:77,237:0.79: 0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:90,318:0.81: 1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,129:0.44: 0.49:1.000:0.973 0/0/1/1:4:197,207:0.52: 1.39:0.956:0.994 0/1/1/1:4:138,419:0.78: 3.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:256,129:0.40: 1.19:1.000:0.783 1/1/1/1:4:1,280:1.00: 0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,96:0.40: 0.20:1.000:0.752 -chr8.1 80053642 chr8.1_080053642 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:214,264:0.52: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:201,225:0.50:-0.42:1.000:0.997 0/1/1/1:4:92,321:0.75:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:220,259:0.51: 0.13:1.000:0.996 0/0/0/1:4:408,159:0.26: 1.06:1.000:0.998 0/1/1/1:4:159,461:0.72: 1.61:1.000:0.995 0/0/1/1:4:191,238:0.52:-0.39:1.000:0.994 0/1/1/1:4:111,340:0.73:-0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:202,213:0.48:-0.53:1.000:0.995 0/0/1/1:4:123,137:0.50:-2.16:1.000:0.997 0/1/1/1:4:55,221:0.78:-1.99:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,323:0.60: 0.54:1.000:0.830 0/0/1/1:4:226,260:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/1/1/1:4:119,418:0.75: 0.74:1.000:1.000 0/0/0/1:4:327,120:0.25:-0.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:241,243:0.47: 0.19:1.000:0.993 0/0/0/1:4:361,140:0.26: 0.37:0.998:0.999 0/1/1/1:4:130,417:0.74: 0.85:1.000:0.999 0/1/1/1:4:161,521:0.74: 2.26:1.000:0.999 0/0/1/1:4:290,317:0.49: 1.47:1.000:0.996 0/0/0/1:4:196,120:0.36:-1.57:1.000:0.723 0/0/0/1:4:301,113:0.26:-0.55:1.000:0.999 0/0/1/1:4:251,300:0.51: 0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:219,247:0.50: 0.00:1.000:0.997 1/1/1/1:4:21,192:0.89:-2.65:1.000:0.543 0/1/1/1:4:100,409:0.78: 0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:328,132:0.27:-0.06:1.000:0.998 0/0/1/1:4:218,260:0.51: 0.12:1.000:0.996 0/1/1:3:149,292:0.63:-0.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:247,268:0.49: 0.51:1.000:0.996 0/0/1/1:4:239,292:0.52: 0.68:1.000:0.995 0/1/1/1:4:102,324:0.74:-0.42:1.000:0.998 0/0/1/1:4:62,49:0.42:-3.72:1.000:0.893 0/0/1/1:4:135,188:0.55:-1.50:1.000:0.977 0/1/1:3:36,126:0.75:-3.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:244,292:0.51: 0.73:1.000:0.996 0/1/1/1:4:116,386:0.74: 0.38:0.979:0.999 0/0/1/1:4:223,270:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/0/1/1:4:203,230:0.50:-0.35:1.000:0.997 0/1/1/1:4:131,400:0.73: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:326,151:0.30: 0.11:1.000:0.987 0/1/1/1:4:94,372:0.78: 0.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:224,252:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:323,110:0.24:-0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:115,459:0.78: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:235,275:0.51: 0.46:1.000:0.996 0/0/1/1/1:5:271,483:0.61: 3.01:1.000:0.969 0/0/1/1:4:55,59:0.49:-3.69:1.000:0.996 0/0/1/1:4:190,217:0.50:-0.62:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,148:0.53:-2.14:1.000:0.990 0/0/0/1:4:286,126:0.29:-0.57:1.000:0.993 0/0/1/1:4:290,315:0.49: 1.45:1.000:0.996 0/0/1/1:4:234,244:0.48: 0.12:1.000:0.995 0/1/1/1:4:120,381:0.74: 0.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:115,347:0.73:-0.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:225,263:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/1/1/1:4:98,336:0.75:-0.34:1.000:0.999 0/0/1/1:4:233,307:0.54: 0.77:1.000:0.988 0/0/1/1:4:195,234:0.51:-0.39:1.000:0.996 0/0/0/0/0/1:6:302,69:0.17:-1.00:1.000:0.986 0/0/0/0:4:474,2:0.00: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:200,221:0.49:-0.47:1.000:0.997 0/0/0/1:4:375,152:0.27: 0.64:1.000:0.998 0/0/1/1:4:227,272:0.51: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:109,410:0.77: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:97,353:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:209,265:0.53: 0.08:1.000:0.993 0/1/1/1:4:103,351:0.75:-0.13:1.000:0.999 0/0/0/1:4:334,137:0.27: 0.05:0.887:0.997 0/1/1/1:4:98,352:0.76:-0.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:272,308:0.50: 1.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:108,340:0.73:-0.19:0.999:0.998 0/0/1/1:4:245,275:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:123,373:0.73: 0.31:1.000:0.997 0/1/1/1:4:126,373:0.72: 0.34:1.000:0.996 0/1/1/1:4:112,374:0.75: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:218,245:0.50:-0.03:1.000:0.997 0/1/1/1:4:111,427:0.77: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:132,404:0.73: 0.73:1.000:0.997 0/0/1/1:4:250,290:0.51: 0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:93,289:0.73:-0.88:0.915:0.998 0/0/1/1:4:236,287:0.52: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:228,294:0.53: 0.58:1.000:0.991 0/0/0/1:4:290,103:0.25:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:236,237:0.47: 0.07:0.980:0.993 0/1/1/1:4:120,455:0.77: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,322:0.77:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:204,225:0.49:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:222,247:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:320,117:0.25:-0.30:1.000:0.999 0/1/1/1:4:86,321:0.77:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:191,258:0.54:-0.18:1.000:0.984 0/0/1/1:4:272,304:0.50: 1.15:1.000:0.997 0/0/1/1:4:136,156:0.50:-1.82:1.000:0.997 0/1/1/1:4:139,417:0.73: 0.94:1.000:0.997 0/0/0/1:4:324,116:0.25:-0.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:173,255:0.57:-0.40:1.000:0.955 1/1/1/1:4:0,393:1.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/1/1:4:241,274:0.50: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/1:4:326,130:0.27:-0.11:1.000:0.998 0/0/1/1:4:202,267:0.54: 0.03:1.000:0.988 0/0/0/1:4:332,143:0.28: 0.09:1.000:0.995 0/1/1/1:4:87,326:0.77:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:210,279:0.54: 0.24:0.999:0.987 0/0/0/1:4:299,116:0.26:-0.53:1.000:0.999 0/1/1/1:4:100,371:0.76: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,323:0.72:-0.33:1.000:0.995 0/0/1/1:4:223,258:0.51: 0.16:1.000:0.997 0/0/1/1:4:298,305:0.48: 1.43:0.993:0.994 0/0/1/1:4:221,223:0.47:-0.23:1.000:0.993 0/1/1/1:4:100,348:0.75:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:323,356:0.49: 2.23:1.000:0.997 0/1/1/1:4:104,439:0.79: 0.80:0.999:1.000 0/0/1/1:4:217,275:0.53: 0.27:1.000:0.993 0/1/1/1:4:48,196:0.78:-2.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:225,263:0.51: 0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:249,268:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/0/1:4:308,113:0.25:-0.47:1.000:0.999 0/0/1/1:4:203,268:0.54: 0.05:1.000:0.988 0/1/1/1:4:88,344:0.77:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:251,269:0.49: 0.56:1.000:0.996 0/0/1/1:4:194,239:0.52:-0.35:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,588:1.00: 1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:181,246:0.55:-0.41:1.000:0.983 0/0/1/1:4:215,244:0.50:-0.07:1.000:0.997 0/0/0/1:4:378,142:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/1/1/1:4:109,397:0.76: 0.42:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,317:0.82:-0.91:1.000:0.999 0/0/0/1:4:249,90:0.25:-1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,247:0.76:-1.58:1.000:1.000 0/0/0/1:4:273,117:0.28:-0.80:1.000:0.995 0/0/1/1:4:196,207:0.48:-0.66:1.000:0.996 0/1/1/1:4:76,240:0.73:-1.57:0.998:0.998 0/0/0/1:4:294,111:0.26:-0.64:1.000:0.999 0/0/0/1:4:307,139:0.29:-0.21:1.000:0.990 0/0/0/1:4:469,165:0.24: 1.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:120,354:0.72: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:88,413:0.81: 0.37:1.000:1.000 0/0/1/1:4:190,226:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:255,137:0.33:-0.78:1.000:0.927 0/1/1/1:4:131,417:0.74: 0.86:1.000:0.998 0/0/0/1:4:349,128:0.25: 0.11:1.000:0.999 0/0/1/1:4:221,219:0.47:-0.27:1.000:0.992 0/1/1/1:4:78,301:0.77:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:283,344:0.52: 1.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:484,179:0.25: 2.06:1.000:0.999 0/1/1/1:4:107,395:0.76: 0.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:195,275:0.56: 0.04:1.000:0.974 0/1/1/1:4:147,426:0.72: 1.12:1.000:0.995 0/0/0/1:4:285,106:0.25:-0.79:1.000:0.999 0/1/1/1:4:127,444:0.75: 1.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:213,244:0.50:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:85,147:0.61:-2.45:1.000:0.740 0/1/1/1:4:99,321:0.74:-0.48:1.000:0.999 0/0/1/1:4:232,244:0.48: 0.10:1.000:0.995 0/0/1/1:4:246,271:0.49: 0.53:1.000:0.997 0/0/0/1:4:461,178:0.26: 1.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:252,271:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/0/1:4:278,109:0.26:-0.83:1.000:0.998 0/0/1/1:4:269,341:0.53: 1.51:1.000:0.993 0/1/1/1:4:120,334:0.71:-0.13:1.000:0.992 0/0/1/1:4:195,204:0.48:-0.70:1.000:0.995 0/0/1/1:4:184,227:0.52:-0.58:1.000:0.995 0/1/1/1:4:122,358:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:179,223:0.52:-0.67:1.000:0.994 0/0/1/1:4:266,268:0.47: 0.71:1.000:0.993 0/0/1/1:4:203,265:0.54: 0.02:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,547:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:229,260:0.50: 0.24:1.000:0.997 0/0/0/1:4:319,114:0.25:-0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:294,109:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:313,95:0.22:-0.61:1.000:1.000 0/0/1/1:4:189,228:0.52:-0.51:1.000:0.996 0/0/0/1:4:293,109:0.25:-0.67:1.000:0.999 0/0/0/1:4:315,102:0.23:-0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:237,90:0.26:-1.46:1.000:0.999 0/0/1/1:4:297,358:0.52: 1.98:1.000:0.996 0/0/0/1:4:396,148:0.26: 0.82:1.000:0.999 0/1/1/1:4:148,410:0.71: 0.96:1.000:0.992 0/0/1/1:4:163,261:0.59:-0.44:1.000:0.882 0/0/1/1:4:220,293:0.54: 0.49:0.956:0.987 0/1/1/1:4:138,463:0.75: 1.41:1.000:0.999 0/0/0/1:4:444,169:0.26: 1.54:1.000:0.999 0/1/1/1:4:128,363:0.71: 0.26:1.000:0.994 0/1/1/1:4:99,351:0.76:-0.17:1.000:1.000 -chr8.1 80297233 chr8.1_080297233 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:45,110:0.73: 0.51:1.000:0.997 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,75:0.52: 0.49:1.000:0.994 0/0/1/1:4:64,67:0.55:-0.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:95,72:0.47: 0.84:1.000:0.993 0/0/0/1:4:172,46:0.25: 2.22:1.000:0.999 0/1/1/1:4:29,88:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:129,30:0.22: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,43:0.30: 0.70:1.000:0.981 0/0/1/1:4:17,14:0.49:-2.85:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,6:0.32:-3.12:1.000:0.939 0/0/0/1:4:178,36:0.20: 2.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,105:0.73: 0.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:86,65:0.47: 0.40:1.000:0.992 0/0/1/1:4:71,67:0.52: 0.05:1.000:0.994 0/1/1/1:4:49,142:0.76: 1.49:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,117:0.74: 0.70:0.998:0.998 0/0/0/1:4:95,34:0.30:-0.19:1.000:0.983 0/0/1/1:4:105,77:0.46: 1.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:98,81:0.49: 1.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:26,16:0.42:-2.55:1.000:0.916 0/0/1/1:4:86,53:0.42: 0.08:1.000:0.918 0/0/0/1:4:127,35:0.26: 0.70:1.000:0.999 0/0/0/1:4:127,38:0.27: 0.78:1.000:0.998 0/1/1/1:4:5,14:0.75:-3.18:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,85:0.48: 1.49:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,108:0.69: 0.65:1.000:0.979 0/0/1/1:4:75,72:0.53: 0.30:1.000:0.993 0/0/1:3:84,40:0.36:-0.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,122:0.74: 0.84:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,116:0.70: 0.89:1.000:0.988 0/0/0/1:4:116,50:0.34: 0.81:1.000:0.866 1/1/1/1:4:0,6:1.00:-3.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,16:0.57:-2.88:1.000:0.956 0/1/1:3:2,2:0.54:-3.59:1.000:0.917 0/0/0/1:4:143,43:0.27: 1.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:75,83:0.56: 0.59:0.979:0.969 0/1/1/1:4:41,114:0.75: 0.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:36,102:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/0/0/1:4:126,32:0.24: 0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,100:0.71: 0.21:1.000:0.992 0/0/1/1:4:68,49:0.46:-0.52:1.000:0.987 0/0/0/1:4:135,31:0.22: 0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:77,65:0.50: 0.16:1.000:0.997 0/0/0/1:4:128,33:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,67:0.47: 0.49:1.000:0.994 0/0/0/1/1:5:147,77:0.38: 2.39:1.000:0.967 0/0/1/1:4:21,17:0.49:-2.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,51:0.46:-0.44:1.000:0.990 0/1/1/1:4:26,46:0.66:-1.74:1.000:0.877 0/0/0/1:4:70,32:0.35:-0.93:1.000:0.763 0/1/1/1:4:52,116:0.71: 0.87:1.000:0.991 0/0/1/1:4:54,62:0.57:-0.55:1.000:0.954 0/0/1/1:4:83,64:0.48: 0.30:1.000:0.994 0/0/1/1:4:74,53:0.46:-0.25:1.000:0.986 0/1/1/1:4:29,88:0.76:-0.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,49:0.42:-0.22:1.000:0.923 0/1/1/1:4:41,100:0.72: 0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:88,51:0.41: 0.08:1.000:0.841 0/0/0/0/1/1:6:72,41:0.40:-0.63:1.000:0.626 0/0/1/1:4:78,49:0.43:-0.25:1.000:0.933 0/1/1/1:4:36,81:0.71:-0.52:1.000:0.992 0/0/1/1:4:72,66:0.52: 0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:77,69:0.51: 0.27:1.000:0.996 0/0/1/1:4:85,60:0.45: 0.24:1.000:0.983 0/0/1/1:4:85,58:0.45: 0.19:1.000:0.975 0/0/1/1:4:52,44:0.50:-1.09:1.000:0.997 0/0/0/1:4:125,14:0.12: 0.08:1.000:0.748 0/0/1/1:4:93,73:0.48: 0.81:0.887:0.995 0/0/1/1:4:51,59:0.57:-0.71:1.000:0.950 0/1/1/1:4:43,95:0.71: 0.05:1.000:0.990 0/0/1/1:4:63,38:0.42:-0.95:0.999:0.896 0/0/0/1:4:133,40:0.27: 1.00:1.000:0.998 0/0/1/1:4:77,78:0.54: 0.51:1.000:0.988 0/0/0/1:4:107,25:0.22:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,60:0.47: 0.08:1.000:0.993 0/0/0/1:4:112,29:0.24: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,36:0.30: 0.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:128,29:0.22: 0.57:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,33:0.23: 0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:83,24:0.26:-0.79:0.915:0.998 0/0/0/1:4:129,23:0.18: 0.43:1.000:0.999 0/0/0/1:4:136,28:0.20: 0.76:1.000:1.000 0/0/1/1:4:81,67:0.49: 0.32:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,84:0.71:-0.38:0.980:0.990 0/0/1/1:4:99,85:0.50: 1.30:1.000:0.997 0/0/0/1:4:80,27:0.29:-0.79:1.000:0.991 0/1/1/1:4:24,86:0.79:-0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,81:0.66:-0.27:1.000:0.897 0/0/1/1:4:60,59:0.53:-0.46:1.000:0.991 0/0/0/1:4:72,24:0.29:-1.09:1.000:0.992 0/1/1/1:4:44,93:0.70: 0.02:1.000:0.983 0/0/1/1:4:84,63:0.47: 0.30:1.000:0.992 0/0/0/1:4:76,23:0.27:-1.01:1.000:0.997 0/0/1/1:4:98,75:0.47: 1.00:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,71:0.51: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:38,84:0.71:-0.38:1.000:0.990 0/0/0/1:4:128,25:0.19: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:51,73:0.62:-0.33:1.000:0.620 0/0/1/1:4:92,55:0.41: 0.30:1.000:0.885 1/1/1/1:4:0,77:1.00:-1.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,91:0.71:-0.14:1.000:0.993 0/0/0/1:4:88,12:0.14:-0.98:1.000:0.974 0/1/1/1:4:31,82:0.74:-0.63:0.999:0.999 0/0/1/1:4:82,43:0.38:-0.30:1.000:0.614 0/0/0/1:4:85,36:0.34:-0.41:1.000:0.888 0/0/0/1:4:124,22:0.18: 0.27:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,86:0.71:-0.33:1.000:0.992 0/1/1/1:4:47,119:0.73: 0.81:0.993:0.998 0/1/1/1:4:37,101:0.75: 0.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:72,49:0.44:-0.41:1.000:0.974 0/0/0/1:4:166,43:0.24: 1.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,51:0.50:-0.65:0.999:0.997 0/0/1/1:4:72,82:0.57: 0.49:1.000:0.957 0/0/1/1:4:67,41:0.42:-0.76:1.000:0.911 0/1/1/1:4:44,97:0.71: 0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:77,53:0.45:-0.17:1.000:0.977 0/0/1/1:4:56,59:0.55:-0.57:1.000:0.982 0/1/1/1:4:28,94:0.78:-0.38:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,31:0.25: 0.32:1.000:0.999 0/0/1/1:4:76,56:0.46:-0.11:1.000:0.990 0/1/1/1:4:41,81:0.68:-0.38:1.000:0.963 0/0/0/1:4:112,31:0.26: 0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:103,61:0.41: 0.76:1.000:0.873 0/0/0/1:4:88,23:0.25:-0.68:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,89:0.70:-0.17:1.000:0.987 0/0/0/1:4:111,35:0.28: 0.27:1.000:0.996 0/0/0/0:4:123,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,48:0.51:-0.95:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,37:0.44:-1.20:1.000:0.970 0/0/1/1:4:72,64:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/1/1/1:4:63,103:0.64: 0.81:1.000:0.741 0/0/1/1:4:50,43:0.50:-1.17:0.998:0.997 0/0/1/1:4:72,46:0.43:-0.49:1.000:0.945 0/1/1/1:4:26,86:0.78:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,122:0.73: 0.95:1.000:0.997 0/0/1/1:4:76,68:0.51: 0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:82,43:0.38:-0.30:1.000:0.614 0/0/1/1:4:52,45:0.50:-1.06:1.000:0.997 0/0/1/1:4:77,52:0.44:-0.19:1.000:0.971 0/0/1/1:4:74,51:0.45:-0.30:1.000:0.977 0/0/0/1:4:72,32:0.35:-0.87:1.000:0.818 0/0/1/1:4:79,57:0.46: 0.00:1.000:0.987 0/0/1/1:4:73,46:0.43:-0.46:1.000:0.936 0/0/0/1:4:125,34:0.25: 0.62:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,121:0.74: 0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:97,64:0.44: 0.68:1.000:0.962 0/0/0/1:4:112,23:0.20:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,80:0.48: 1.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:79,64:0.49: 0.19:1.000:0.996 0/0/1/1:4:103,80:0.48: 1.27:1.000:0.994 0/1/1/1:4:43,109:0.73: 0.43:1.000:0.998 0/0/1/1:4:8,10:0.59:-3.21:1.000:0.886 0/0/0/1:4:73,24:0.29:-1.06:1.000:0.993 0/1/1/1:4:45,119:0.74: 0.76:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,90:0.63: 0.32:1.000:0.609 0/0/1/1:4:112,70:0.42: 1.25:1.000:0.930 0/0/0/1:4:133,50:0.31: 1.27:1.000:0.970 0/0/1/1:4:63,53:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/1/1/1:4:43,93:0.70: 0.00:1.000:0.987 0/0/1/1:4:66,55:0.49:-0.41:1.000:0.997 0/0/0/1:4:92,26:0.26:-0.49:1.000:0.999 0/1/1/1:4:38,86:0.71:-0.33:1.000:0.992 0/0/1/1:4:70,61:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:37,99:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,92:0.73:-0.19:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,87:0.70:-0.22:1.000:0.983 0/0/0/0:4:156,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,71:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:73,70:0.53: 0.19:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,95:0.81:-0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,56:0.48:-0.22:1.000:0.994 0/0/1/1:4:81,64:0.48: 0.24:1.000:0.995 0/1/1/1:4:46,111:0.72: 0.57:1.000:0.996 0/0/1/1:4:72,55:0.47:-0.25:1.000:0.993 0/0/1/1:4:65,56:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/1/1/1:4:50,108:0.70: 0.59:1.000:0.986 0/1/1/1:4:51,143:0.75: 1.57:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,67:0.46: 0.62:1.000:0.988 0/0/0/1:4:134,31:0.22: 0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:139,26:0.19: 0.78:0.956:1.000 0/0/1/1:4:124,75:0.42: 1.71:1.000:0.899 0/0/1/1:4:105,82:0.48: 1.38:1.000:0.995 0/0/1/1:4:85,71:0.49: 0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,17:0.15:-0.08:1.000:0.989 -chr8.1 80880117 chr8.1_080880117 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:163,456:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,562:.:-0.48:1.000:. ./.:4:179,447:.: 0.01:1.000:. ./.:4:183,417:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,693:.: 0.52:1.000:. ./.:4:0,749:.: 0.95:1.000:. ./.:4:184,448:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,619:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,613:.:-0.09:1.000:. ./.:4:104,256:.:-2.03:1.000:. ./.:4:155,279:.:-1.47:1.000:. ./.:4:160,577:.: 0.86:1.000:. ./.:4:150,421:.:-0.41:1.000:. ./.:4:200,505:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,562:.:-0.48:1.000:. ./.:4:177,507:.: 0.45:1.000:. ./.:4:180,490:.: 0.35:0.998:. ./.:4:204,478:.: 0.44:1.000:. ./.:4:211,620:.: 1.58:1.000:. ./.:4:219,592:.: 1.43:1.000:. ./.:4:3,365:.:-1.97:1.000:. ./.:4:0,581:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,688:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,630:.: 0.04:1.000:. ./.:4:125,170:.:-2.53:1.000:. ./.:4:229,565:.: 1.30:1.000:. ./.:4:158,491:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,560:.:-0.50:1.000:. ./.:3:187,316:.:-0.94:1.000:. ./.:4:187,543:.: 0.81:1.000:. ./.:4:214,652:.: 1.85:1.000:. ./.:4:0,602:.:-0.17:1.000:. ./.:4:128,205:.:-2.24:1.000:. ./.:4:0,326:.:-2.29:1.000:. ./.:3:59,151:.:-3.19:1.000:. ./.:4:0,635:.: 0.08:1.000:. ./.:4:158,461:.:-0.04:0.979:. ./.:4:184,498:.: 0.44:1.000:. ./.:4:206,566:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,783:.: 1.22:1.000:. ./.:4:171,450:.:-0.03:1.000:. ./.:4:200,421:.:-0.03:1.000:. ./.:4:0,663:.: 0.29:1.000:. ./.:4:0,571:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,770:.: 1.12:1.000:. ./.:4:197,460:.: 0.25:1.000:. ./.:5:0,768:.: 1.10:1.000:. ./.:4:371,1029:.: 5.95:1.000:. ./.:4:0,558:.:-0.51:1.000:. ./.:4:332,677:.: 2.95:1.000:. ./.:4:0,585:.:-0.31:1.000:. ./.:4:174,507:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,541:.:-0.64:1.000:. ./.:4:204,476:.: 0.42:1.000:. ./.:4:154,438:.:-0.25:1.000:. ./.:4:195,560:.: 1.00:1.000:. ./.:4:169,428:.:-0.21:1.000:. ./.:4:222,513:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,642:.: 0.13:1.000:. ./.:6:0,565:.:-0.46:1.000:. ./.:4:1,602:.:-0.17:1.000:. ./.:4:139,421:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,770:.: 1.12:1.000:. ./.:4:227,530:.: 1.02:1.000:. ./.:4:145,451:.:-0.22:1.000:. ./.:4:196,438:.: 0.07:1.000:. ./.:4:225,595:.: 1.50:1.000:. ./.:4:0,653:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,683:.: 0.45:0.887:. ./.:4:281,215:.:-0.99:1.000:. ./.:4:225,552:.: 1.17:1.000:. ./.:4:228,544:.: 1.13:0.999:. ./.:4:269,584:.: 1.75:1.000:. ./.:4:173,428:.:-0.18:1.000:. ./.:4:166,416:.:-0.33:1.000:. ./.:4:149,415:.:-0.47:1.000:. ./.:4:1,537:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,646:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,732:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,698:.: 0.56:1.000:. ./.:4:124,396:.:-0.80:0.915:. ./.:4:0,609:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,673:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,488:.:-1.05:1.000:. ./.:4:283,589:.: 1.90:0.980:. ./.:4:215,521:.: 0.85:1.000:. ./.:4:0,483:.:-1.09:1.000:. ./.:4:149,363:.:-0.87:1.000:. ./.:4:194,422:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,561:.:-0.49:1.000:. ./.:4:0,570:.:-0.42:1.000:. ./.:4:185,410:.:-0.23:1.000:. ./.:4:194,485:.: 0.42:1.000:. ./.:4:0,443:.:-1.40:1.000:. ./.:4:225,549:.: 1.15:1.000:. ./.:4:0,630:.: 0.04:1.000:. ./.:4:156,371:.:-0.75:1.000:. ./.:4:184,461:.: 0.16:1.000:. ./.:4:186,515:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,590:.:-0.27:1.000:. ./.:4:403,308:.: 0.66:1.000:. ./.:4:206,467:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,508:.:-0.90:1.000:. ./.:4:183,468:.: 0.20:0.999:. ./.:4:0,548:.:-0.59:1.000:. ./.:4:180,437:.:-0.06:1.000:. ./.:4:0,533:.:-0.70:1.000:. ./.:4:176,483:.: 0.26:1.000:. ./.:4:169,488:.: 0.25:0.993:. ./.:4:164,487:.: 0.20:1.000:. ./.:4:169,431:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,846:.: 1.70:1.000:. ./.:4:167,449:.:-0.07:0.999:. ./.:4:0,594:.:-0.24:1.000:. ./.:4:153,346:.:-0.97:1.000:. ./.:4:205,495:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,637:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,558:.:-0.51:1.000:. ./.:4:170,428:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,547:.:-0.60:1.000:. ./.:4:192,422:.:-0.08:1.000:. ./.:4:181,424:.:-0.15:1.000:. ./.:4:189,477:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,580:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,533:.:-0.70:1.000:. ./.:4:207,469:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,567:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,588:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,528:.:-0.74:1.000:. ./.:4:135,356:.:-1.03:1.000:. ./.:4:0,554:.:-0.54:1.000:. ./.:4:171,465:.: 0.09:1.000:. ./.:4:153,317:.:-1.19:0.998:. ./.:4:0,647:.: 0.17:1.000:. ./.:4:139,423:.:-0.48:1.000:. ./.:4:229,650:.: 1.95:1.000:. ./.:4:189,490:.: 0.42:1.000:. ./.:4:162,426:.:-0.28:1.000:. ./.:4:0,531:.:-0.72:1.000:. ./.:4:0,545:.:-0.61:1.000:. ./.:4:205,455:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,640:.: 0.12:1.000:. ./.:4:136,420:.:-0.53:1.000:. ./.:4:154,326:.:-1.11:1.000:. ./.:4:0,683:.: 0.45:1.000:. ./.:4:216,536:.: 0.98:1.000:. ./.:4:179,462:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,583:.:-0.32:1.000:. ./.:4:199,602:.: 1.35:1.000:. ./.:4:0,533:.:-0.70:1.000:. ./.:4:194,604:.: 1.33:1.000:. ./.:4:144,406:.:-0.57:1.000:. ./.:4:119,178:.:-2.52:1.000:. ./.:4:0,325:.:-2.30:1.000:. ./.:4:188,499:.: 0.48:1.000:. ./.:4:144,490:.: 0.07:1.000:. ./.:4:0,698:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,729:.: 0.80:1.000:. ./.:4:0,472:.:-1.17:1.000:. ./.:4:194,435:.: 0.03:1.000:. ./.:4:144,468:.:-0.10:1.000:. ./.:4:0,487:.:-1.06:1.000:. ./.:4:169,420:.:-0.27:1.000:. ./.:4:206,419:.: 0.00:1.000:. ./.:4:148,453:.:-0.18:1.000:. ./.:4:155,447:.:-0.17:1.000:. ./.:4:175,476:.: 0.20:1.000:. ./.:4:1,551:.:-0.56:1.000:. ./.:4:138,389:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,558:.:-0.51:1.000:. ./.:4:130,319:.:-1.35:1.000:. ./.:4:0,536:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,590:.:-0.27:1.000:. ./.:4:153,384:.:-0.67:1.000:. ./.:4:0,639:.: 0.11:1.000:. ./.:4:0,491:.:-1.03:1.000:. ./.:4:209,623:.: 1.59:1.000:. ./.:4:209,552:.: 1.05:1.000:. ./.:4:187,502:.: 0.49:1.000:. ./.:4:0,527:.:-0.75:1.000:. ./.:4:0,687:.: 0.48:0.956:. ./.:4:213,538:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,732:.: 0.82:1.000:. ./.:4:144,388:.:-0.71:1.000:. ./.:4:158,421:.:-0.35:1.000:. -chr8.1 81402569 chr8.1_081402569 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:74,179:0.69: 0.60:1.000:0.978 0/0/1/1:4:97,116:0.58:-0.14:1.000:0.916 0/1/1/1:4:44,192:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:71,134:0.66:-0.29:1.000:0.837 0/0/1/1:4:182,100:0.43: 1.14:1.000:0.933 0/1/1/1:4:24,232:0.89: 0.66:1.000:0.525 0/1/1/1:4:24,98:0.77:-1.83:1.000:1.000 1/1/1/1:4:16,197:0.91:-0.14:1.000:0.951 0/0/1/1:4:99,112:0.57:-0.18:1.000:0.947 0/0/1/1:4:46,54:0.58:-2.24:1.000:0.928 0/1/1/1:4:29,102:0.74:-1.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:87,181:0.67: 0.88:1.000:0.923 0/1/1/1:4:64,161:0.70: 0.08:1.000:0.984 1/1/1/1:4:22,235:0.90: 0.68:1.000:0.763 0/0/1/1:4:112,71:0.46:-0.70:1.000:0.986 0/1/1/1:4:37,149:0.76:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,69:0.46:-0.85:0.998:0.990 0/1/1/1:4:50,239:0.79: 1.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,281:0.77: 2.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,172:0.62: 1.18:1.000:0.544 0/0/0/1:4:103,20:0.23:-1.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,67:0.51:-1.26:1.000:0.997 0/0/1/1:4:125,100:0.51: 0.08:1.000:0.996 0/1/1/1:4:85,142:0.64: 0.12:1.000:0.638 0/1/1/1:4:29,85:0.72:-1.98:1.000:0.995 0/1/1/1:4:41,211:0.81: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,63:0.43:-0.81:1.000:0.937 0/1/1/1:4:36,139:0.76:-0.85:1.000:1.000 0/1/1:3:67,156:0.69: 0.05:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,119:0.69:-0.94:1.000:0.970 0/1/1/1:4:42,99:0.69:-1.48:1.000:0.972 1/1/1/1:4:15,171:0.90:-0.64:1.000:0.881 0/0/0/1:4:85,20:0.26:-2.15:1.000:0.998 0/0/1/1:4:92,102:0.57:-0.49:1.000:0.955 0/1/1:3:6,37:0.83:-3.30:1.000:0.940 0/1/1/1:4:77,139:0.65:-0.09:1.000:0.777 1/1/1/1:4:20,203:0.89: 0.05:0.979:0.627 0/1/1/1:4:45,143:0.73:-0.61:1.000:0.998 0/1/1/1:4:41,119:0.72:-1.13:1.000:0.995 0/1/1/1:4:40,166:0.77:-0.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:101,66:0.47:-1.00:1.000:0.990 0/1/1/1:4:66,186:0.71: 0.58:1.000:0.994 0/0/1/1:4:95,116:0.58:-0.18:1.000:0.901 0/0/0/1:4:137,55:0.36:-0.53:1.000:0.710 0/1/1/1:4:34,238:0.85: 0.96:1.000:0.986 0/0/1/1:4:94,134:0.61: 0.14:1.000:0.698 0/1/1/1/1:5:81,297:0.75: 2.93:1.000:0.918 0/0/1/1:4:48,47:0.54:-2.33:1.000:0.984 0/0/1/1:4:84,119:0.61:-0.33:1.000:0.709 0/1/1/1:4:36,70:0.66:-2.13:1.000:0.870 0/0/1/1:4:153,78:0.41: 0.19:1.000:0.855 0/1/1/1:4:41,165:0.76:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:73,141:0.66:-0.12:1.000:0.863 0/1/1/1:4:31,231:0.86: 0.77:1.000:0.969 1/1/1/1:4:18,210:0.91: 0.14:1.000:0.908 0/1/1/1:4:60,119:0.66:-0.77:1.000:0.888 0/1/1/1:4:24,179:0.86:-0.33:1.000:0.968 0/1/1/1:4:68,234:0.74: 1.51:1.000:0.999 0/1/1/1:4:68,123:0.65:-0.55:1.000:0.780 0/0/0/0/1/1:6:152,51:0.32:-0.33:1.000:0.919 0/0/0/0:4:292,0:0.00: 1.33:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,114:0.69:-1.07:1.000:0.969 0/0/0/1:4:189,75:0.36: 0.81:1.000:0.735 0/0/1/1:4:71,111:0.62:-0.72:1.000:0.505 0/1/1/1:4:78,230:0.72: 1.63:1.000:0.996 0/1/1/1:4:54,229:0.77: 1.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,111:0.53: 0.23:1.000:0.992 0/1/1/1:4:31,202:0.84: 0.23:1.000:0.994 0/0/1/1:4:93,70:0.50:-1.07:0.887:0.997 0/1/1/1:4:62,199:0.73: 0.75:1.000:0.998 0/1/1/1:4:58,175:0.72: 0.23:1.000:0.996 1/1/1/1:4:15,184:0.91:-0.40:0.999:0.949 0/0/1/1:4:135,162:0.58: 1.42:1.000:0.914 1/1/1/1:4:24,243:0.89: 0.86:1.000:0.620 0/1/1/1:4:75,245:0.73: 1.85:1.000:0.998 0/1/1/1:4:24,203:0.87: 0.12:1.000:0.859 0/1/1/1:4:96,154:0.63: 0.55:1.000:0.552 0/1/1/1:4:87,260:0.72: 2.35:1.000:0.996 1/1/1/1:4:24,262:0.90: 1.22:1.000:0.809 0/1/1/1:4:91,168:0.65: 0.71:1.000:0.809 0/1/1/1:4:57,173:0.72: 0.18:0.915:0.997 0/0/1/1:4:112,170:0.62: 1.14:1.000:0.570 0/1/1/1:4:108,190:0.64: 1.44:1.000:0.735 0/0/1/1:4:108,65:0.45:-0.88:1.000:0.975 0/1/1/1:4:65,114:0.64:-0.77:0.980:0.730 1/1/1/1:4:22,251:0.90: 0.97:1.000:0.882 1/1/1/1:4:12,193:0.93:-0.29:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,137:0.61: 0.19:1.000:0.655 0/0/1/1:4:104,147:0.61: 0.57:1.000:0.713 0/0/1/1:4:109,62:0.43:-0.92:1.000:0.954 0/1/1/1:4:46,200:0.78: 0.47:1.000:1.000 0/1/1/1:4:83,134:0.63:-0.07:1.000:0.566 0/1/1/1:4:91,186:0.67: 1.05:1.000:0.911 0/1/1/1:4:54,100:0.65:-1.24:1.000:0.813 0/1/1/1:4:29,218:0.86: 0.49:1.000:0.965 0/0/1/1:4:148,66:0.38:-0.12:1.000:0.566 0/1/1/1:4:100,166:0.63: 0.84:1.000:0.625 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:108,183:0.64: 1.31:1.000:0.666 0/0/1/1:4:174,85:0.40: 0.71:1.000:0.784 0/1/1/1:4:88,139:0.63: 0.12:1.000:0.518 0/0/1/1:4:145,90:0.45: 0.27:1.000:0.983 0/1/1/1:4:24,193:0.87:-0.07:1.000:0.921 0/1/1/1:4:65,204:0.73: 0.90:0.999:0.997 0/0/1/1:4:91,66:0.49:-1.18:1.000:0.996 1/1/1/1:4:17,219:0.91: 0.29:1.000:0.972 1/1/1/1:4:11,198:0.94:-0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,140:0.76:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:112,189:0.64: 1.50:0.993:0.658 0/1/1/1:4:69,152:0.68: 0.01:1.000:0.951 1/1/1/1:4:17,221:0.92: 0.32:1.000:0.975 0/1/1/1:4:76,184:0.69: 0.73:1.000:0.978 0/1/1/1:4:35,221:0.84: 0.66:0.999:0.996 0/1/1/1:4:77,147:0.66: 0.06:1.000:0.850 0/1/1/1:4:14,133:0.89:-1.37:1.000:0.580 0/1/1/1:4:47,166:0.74:-0.14:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,165:0.75:-0.23:1.000:1.000 0/0/0/1:4:144,53:0.34:-0.44:1.000:0.863 0/1/1/1:4:52,158:0.72:-0.20:1.000:0.997 1/1/1/1:4:16,201:0.91:-0.07:1.000:0.962 0/1/1/1:4:78,177:0.68: 0.64:1.000:0.962 0/0/1/1:4:95,144:0.62: 0.34:1.000:0.573 1/1/1/1:4:0,326:1.00: 1.96:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,163:0.68: 0.32:1.000:0.946 0/0/1/1:4:147,164:0.57: 1.68:1.000:0.953 0/0/1/1:4:133,78:0.44:-0.18:1.000:0.967 0/1/1/1:4:64,228:0.74: 1.33:1.000:0.999 0/1/1/1:4:61,165:0.71: 0.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:89,55:0.45:-1.42:1.000:0.982 0/1/1/1:4:18,174:0.89:-0.53:1.000:0.525 0/0/1/1:4:175,78:0.38: 0.60:1.000:0.565 0/1/1/1:4:70,140:0.66:-0.20:1.000:0.895 0/1/1/1:4:53,150:0.71:-0.33:0.998:0.994 0/0/1/1:4:92,52:0.43:-1.42:1.000:0.951 0/0/1/1:4:78,59:0.50:-1.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,105:0.51: 0.29:1.000:0.996 1/1/1/1:4:11,196:0.94:-0.25:1.000:1.000 1/1/1/1:4:13,227:0.94: 0.36:1.000:0.999 0/1/1/1:4:70,132:0.66:-0.35:1.000:0.836 0/0/1/1:4:155,72:0.39: 0.12:1.000:0.673 0/1/1/1:4:62,227:0.75: 1.27:1.000:0.999 0/0/1/1:4:147,73:0.40:-0.01:1.000:0.814 0/0/1/1:4:103,140:0.60: 0.42:1.000:0.779 0/1/1/1:4:44,176:0.76:-0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:142,171:0.58: 1.72:1.000:0.912 0/0/1/1:4:136,115:0.52: 0.57:1.000:0.995 1/1/1/1:4:20,241:0.91: 0.75:1.000:0.937 0/0/1/1:4:121,77:0.46:-0.42:1.000:0.987 0/1/1/1:4:26,234:0.88: 0.73:1.000:0.734 0/0/1/1:4:100,73:0.49:-0.88:1.000:0.996 1/1/1/1:4:27,288:0.90: 1.76:1.000:0.760 0/1/1/1:4:34,142:0.77:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,82:0.58:-1.33:1.000:0.899 0/1/1/1:4:40,196:0.80: 0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:74,138:0.65:-0.16:1.000:0.822 0/1/1/1:4:86,162:0.66: 0.51:1.000:0.835 0/0/1/1:4:175,101:0.44: 1.03:1.000:0.961 0/0/1/1:4:127,166:0.59: 1.35:1.000:0.833 0/0/1/1:4:123,55:0.38:-0.79:1.000:0.573 0/1/1/1:4:80,155:0.66: 0.27:1.000:0.866 1/1/1/1:4:16,220:0.92: 0.29:1.000:0.988 0/1/1/1:4:62,103:0.63:-1.03:1.000:0.627 0/1/1/1:4:58,131:0.68:-0.59:1.000:0.960 0/1/1/1:4:26,244:0.89: 0.92:1.000:0.618 0/1/1/1:4:25,100:0.76:-1.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,138:0.71:-0.62:1.000:0.994 0/1/1/1:4:36,138:0.75:-0.87:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,291:1.00: 1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,138:0.69:-0.46:1.000:0.974 0/0/1/1:4:109,61:0.43:-0.94:1.000:0.945 0/0/1/1:4:81,67:0.52:-1.35:1.000:0.996 0/0/1/1:4:94,52:0.43:-1.39:1.000:0.937 0/1/1/1:4:61,122:0.66:-0.70:1.000:0.895 0/0/1/1:4:107,67:0.46:-0.87:1.000:0.984 0/0/1/1:4:88,52:0.44:-1.50:1.000:0.970 0/0/1/1:4:91,48:0.42:-1.52:1.000:0.897 0/1/1/1:4:49,166:0.74:-0.10:1.000:0.999 0/0/1/1:4:143,89:0.45: 0.21:1.000:0.983 1/1/1/1:4:20,202:0.89: 0.03:1.000:0.612 0/1/1/1:4:57,167:0.72: 0.06:1.000:0.995 0/1/1/1:4:79,173:0.68: 0.58:0.956:0.949 1/1/1/1:4:20,264:0.92: 1.18:1.000:0.979 0/0/1/1:4:170,98:0.44: 0.88:1.000:0.960 1/1/1/1:4:19,201:0.90:-0.01:1.000:0.740 0/1/1/1:4:50,231:0.79: 1.12:1.000:1.000 -chr8.1 81501901 chr8.1_081501901 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:106,252:.: 0.66:1.000:. ./.:4:124,128:.:-0.85:1.000:. ./.:4:89,241:.: 0.26:1.000:. ./.:4:86,255:.: 0.42:1.000:. ./.:4:198,179:.: 0.93:1.000:. ./.:4:0,413:.: 1.45:1.000:. ./.:4:0,240:.:-1.02:1.000:. ./.:4:0,284:.:-0.39:1.000:. ./.:4:166,167:.: 0.31:1.000:. ./.:4:21,89:.:-2.88:1.000:. ./.:4:34,107:.:-2.44:1.000:. ./.:4:176,254:.: 1.69:1.000:. ./.:4:84,226:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.04:1.000:. ./.:4:188,141:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,314:.: 0.03:1.000:. ./.:4:188,164:.: 0.58:0.998:. ./.:4:93,311:.: 1.32:1.000:. ./.:4:108,333:.: 1.85:1.000:. ./.:4:186,188:.: 0.89:1.000:. ./.:4:42,51:.:-3.12:1.000:. ./.:4:95,213:.:-0.05:1.000:. ./.:4:237,182:.: 1.53:1.000:. ./.:4:154,159:.: 0.02:1.000:. ./.:4:0,98:.:-3.05:1.000:. ./.:4:101,301:.: 1.29:1.000:. ./.:4:185,151:.: 0.35:1.000:. ./.:4:1,266:.:-0.64:1.000:. ./.:3:123,194:.: 0.08:1.000:. ./.:4:94,258:.: 0.58:1.000:. ./.:4:101,252:.: 0.59:1.000:. ./.:4:0,272:.:-0.57:1.000:. ./.:4:2,71:.:-3.41:1.000:. ./.:4:22,103:.:-2.67:1.000:. ./.:3:5,38:.:-3.84:1.000:. ./.:4:199,156:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.12:0.979:. ./.:4:0,298:.:-0.19:1.000:. ./.:4:0,329:.: 0.25:1.000:. ./.:4:107,272:.: 0.96:1.000:. ./.:4:97,219:.: 0.06:1.000:. ./.:4:89,283:.: 0.86:1.000:. ./.:4:107,241:.: 0.52:1.000:. ./.:4:178,129:.:-0.07:1.000:. ./.:4:0,338:.: 0.38:1.000:. ./.:4:90,264:.: 0.61:1.000:. ./.:5:97,352:.: 1.96:1.000:. ./.:4:194,366:.: 3.55:1.000:. ./.:4:86,232:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,364:.: 0.75:1.000:. ./.:4:148,119:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,333:.: 0.31:1.000:. ./.:4:87,203:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,360:.: 0.69:1.000:. ./.:4:0,299:.:-0.18:1.000:. ./.:4:76,275:.: 0.56:1.000:. ./.:4:0,286:.:-0.37:1.000:. ./.:4:94,314:.: 1.38:1.000:. ./.:4:78,228:.:-0.08:1.000:. ./.:6:179,109:.:-0.34:1.000:. ./.:4:276,68:.: 0.46:1.000:. ./.:4:77,245:.: 0.15:1.000:. ./.:4:214,184:.: 1.23:1.000:. ./.:4:73,239:.: 0.01:1.000:. ./.:4:100,289:.: 1.11:1.000:. ./.:4:94,273:.: 0.79:1.000:. ./.:4:116,125:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,333:.: 0.31:1.000:. ./.:4:103,226:.: 0.25:0.887:. ./.:4:77,178:.:-0.81:1.000:. ./.:4:0,336:.: 0.35:1.000:. ./.:4:0,265:.:-0.67:0.999:. ./.:4:197,172:.: 0.82:1.000:. ./.:4:0,332:.: 0.29:1.000:. ./.:4:81,256:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.12:1.000:. ./.:4:80,227:.:-0.07:1.000:. ./.:4:97,285:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,303:.:-0.12:1.000:. ./.:4:87,274:.: 0.71:1.000:. ./.:4:78,194:.:-0.57:0.915:. ./.:4:98,229:.: 0.22:1.000:. ./.:4:89,330:.: 1.53:1.000:. ./.:4:178,113:.:-0.29:1.000:. ./.:4:84,260:.: 0.46:0.980:. ./.:4:0,340:.: 0.41:1.000:. ./.:4:0,258:.:-0.77:1.000:. ./.:4:65,196:.:-0.72:1.000:. ./.:4:56,213:.:-0.61:1.000:. ./.:4:172,126:.:-0.19:1.000:. ./.:4:81,224:.:-0.09:1.000:. ./.:4:75,197:.:-0.57:1.000:. ./.:4:91,268:.: 0.68:1.000:. ./.:4:56,176:.:-1.14:1.000:. ./.:4:0,337:.: 0.36:1.000:. ./.:4:184,152:.: 0.35:1.000:. ./.:4:73,209:.:-0.42:1.000:. ./.:4:0,254:.:-0.82:1.000:. ./.:4:87,248:.: 0.33:1.000:. ./.:4:180,179:.: 0.68:1.000:. ./.:4:78,163:.:-1.01:1.000:. ./.:4:191,171:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,244:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,309:.:-0.04:0.999:. ./.:4:73,190:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,287:.:-0.35:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,281:.:-0.44:1.000:. ./.:4:119,324:.: 1.88:0.993:. ./.:4:101,229:.: 0.26:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.65:1.000:. ./.:4:106,264:.: 0.83:1.000:. ./.:4:0,318:.: 0.09:0.999:. ./.:4:89,272:.: 0.71:1.000:. ./.:4:0,228:.:-1.19:1.000:. ./.:4:0,339:.: 0.39:1.000:. ./.:4:0,266:.:-0.65:1.000:. ./.:4:170,124:.:-0.25:1.000:. ./.:4:0,291:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,268:.:-0.62:1.000:. ./.:4:96,241:.: 0.36:1.000:. ./.:4:82,236:.: 0.09:1.000:. ./.:4:0,412:.: 1.43:1.000:. ./.:4:86,250:.: 0.35:1.000:. ./.:4:163,159:.: 0.15:1.000:. ./.:4:195,176:.: 0.85:1.000:. ./.:4:81,243:.: 0.18:1.000:. ./.:4:72,217:.:-0.32:1.000:. ./.:4:58,154:.:-1.42:1.000:. ./.:4:0,250:.:-0.88:1.000:. ./.:4:181,136:.: 0.08:1.000:. ./.:4:74,217:.:-0.29:1.000:. ./.:4:59,166:.:-1.24:0.998:. ./.:4:150,151:.:-0.15:1.000:. ./.:4:94,214:.:-0.05:1.000:. ./.:4:237,168:.: 1.33:1.000:. ./.:4:0,334:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,247:.:-0.92:1.000:. ./.:4:99,197:.:-0.22:1.000:. ./.:4:144,125:.:-0.61:1.000:. ./.:4:85,249:.: 0.32:1.000:. ./.:4:161,132:.:-0.27:1.000:. ./.:4:145,156:.:-0.15:1.000:. ./.:4:77,202:.:-0.47:1.000:. ./.:4:230,198:.: 1.66:1.000:. ./.:4:124,284:.: 1.38:1.000:. ./.:4:0,326:.: 0.21:1.000:. ./.:4:156,134:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,360:.: 0.69:1.000:. ./.:4:56,173:.:-1.18:1.000:. ./.:4:0,381:.: 0.99:1.000:. ./.:4:0,286:.:-0.37:1.000:. ./.:4:23,86:.:-2.90:1.000:. ./.:4:73,219:.:-0.28:1.000:. ./.:4:118,248:.: 0.78:1.000:. ./.:4:93,254:.: 0.51:1.000:. ./.:4:210,161:.: 0.85:1.000:. ./.:4:186,182:.: 0.81:1.000:. ./.:4:141,120:.:-0.72:1.000:. ./.:4:91,233:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.55:1.000:. ./.:4:80,179:.:-0.75:1.000:. ./.:4:77,198:.:-0.52:1.000:. ./.:4:0,323:.: 0.16:1.000:. ./.:4:0,335:.: 0.33:1.000:. ./.:4:0,297:.:-0.21:1.000:. ./.:4:0,241:.:-1.01:1.000:. ./.:4:0,273:.:-0.55:1.000:. ./.:4:80,204:.:-0.39:1.000:. ./.:4:161,123:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,168:.:-1.15:1.000:. ./.:4:144,121:.:-0.67:1.000:. ./.:4:94,199:.:-0.27:1.000:. ./.:4:172,134:.:-0.08:1.000:. ./.:4:140,140:.:-0.45:1.000:. ./.:4:123,114:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,371:.: 0.85:1.000:. ./.:4:199,135:.: 0.32:1.000:. ./.:4:0,363:.: 0.73:1.000:. ./.:4:55,229:.:-0.39:1.000:. ./.:4:101,225:.: 0.21:0.956:. ./.:4:1,438:.: 1.82:1.000:. ./.:4:242,175:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,227:.:-1.21:1.000:. ./.:4:86,248:.: 0.32:1.000:. -chr8.1 81610851 chr8.1_081610851 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:71,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:38,0:.:-1.26:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:79,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.98:1.000:. ./.:4:20,0:.:-1.91:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:54,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.64:0.998:. ./.:4:51,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:87,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:30,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:11,0:.:-2.23:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.30:1.000:. ./.:3:69,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:7,0:.:-2.38:1.000:. ./.:4:18,0:.:-1.98:1.000:. ./.:3:12,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.91:0.979:. ./.:4:99,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:125,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:131,0:.: 2.10:1.000:. ./.:4:92,0:.: 0.69:1.000:. ./.:5:97,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:14,0:.:-2.12:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:64,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:146,0:.: 2.64:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:139,0:.: 2.39:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:93,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:108,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:6:47,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:34,0:.:-1.40:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:88,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:105,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.87:0.887:. ./.:4:53,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.91:0.999:. ./.:4:68,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:123,0:.: 1.81:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.64:0.915:. ./.:4:136,0:.: 2.28:1.000:. ./.:4:84,1:.: 0.44:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:69,0:.:-0.14:0.980:. ./.:4:120,0:.: 1.71:1.000:. ./.:4:100,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:76,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:71,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:116,0:.: 1.56:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:86,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:103,0:.: 1.09:0.999:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:119,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:114,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:80,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:98,0:.: 0.91:0.993:. ./.:4:91,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:107,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:118,0:.: 1.63:0.999:. ./.:4:89,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:89,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:50,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:113,0:.: 1.45:1.000:. ./.:4:117,0:.: 1.60:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:90,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:97,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:61,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:63,0:.:-0.35:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.61:0.998:. ./.:4:56,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:62,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:99,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:109,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:74,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:83,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:65,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:55,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:102,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:51,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:75,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:91,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:13,0:.:-2.16:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:95,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:81,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.62:1.000:. ./.:4:37,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:52,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:77,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:60,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:72,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:56,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:39,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:46,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:44,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:70,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:42,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:41,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:84,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:48,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:78,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.64:1.000:. ./.:4:58,0:.:-0.53:0.956:. ./.:4:104,0:.: 1.13:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:85,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:55,0:.:-0.64:1.000:. -chr8.1 81681413 chr8.1_081681413 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:146,135:0.46: 0.27:1.000:0.985 0/0/0/0:4:215,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:122,266:0.60: 1.27:1.000:0.797 0/0/1/1:4:137,142:0.49: 0.25:1.000:0.996 0/0/0/0:4:140,0:0.00:-1.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:158,318:0.59: 2.09:1.000:0.870 0/0/1/1:4:91,92:0.48:-0.64:1.000:0.995 0/0/1/1:4:145,295:0.59: 1.75:1.000:0.862 1/1/1/1:4:0,239:1.00:-0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:36,30:0.43:-1.73:1.000:0.939 0/0/1/1:4:42,103:0.61:-0.99:1.000:0.644 0/0/0/1:4:250,107:0.25: 0.98:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,114:0.50:-0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:131,230:0.57: 1.02:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.96:1.000:1.000 0/0/0/1:4:246,129:0.30: 1.15:1.000:0.985 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-1.26:0.998:1.000 0/0/1/1:4:152,133:0.44: 0.31:1.000:0.969 0/0/1/1:4:138,317:0.61: 1.89:1.000:0.735 0/0/1/1:4:122,128:0.49:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/0:4:43,1:0.02:-1.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:157,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,111:0.47:-0.26:1.000:0.993 0/0/1/1:4:62,102:0.56:-0.82:1.000:0.965 0/0/0/1:4:251,139:0.31: 1.29:1.000:0.965 0/0/0/0:4:154,0:0.00:-0.91:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,129:0.49: 0.00:1.000:0.996 0/0/1:3:163,168:0.49: 0.74:1.000:0.693 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:263,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,186:0.57: 0.35:1.000:0.934 0/0/0/0:4:33,0:0.00:-2.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:40,38:0.46:-1.62:1.000:0.990 0/1/1:3:23,64:0.63:-1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:124,145:0.51: 0.16:1.000:0.996 0/0/1/1:4:141,260:0.58: 1.39:0.979:0.924 0/0/0/0:4:260,0:0.00: 0.08:1.000:1.000 0/0/0/0:4:238,0:0.00:-0.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:134,275:0.59: 1.46:1.000:0.855 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-1.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,138:0.34: 1.02:1.000:0.838 0/0/1/1:4:126,131:0.49: 0.05:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:140,271:0.58: 1.48:1.000:0.897 0/0/1/1:4:121,134:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/1/1/1:5:153,316:0.59: 2.02:1.000:0.968 0/0/1/1:4:70,87:0.52:-0.88:1.000:0.995 0/0/1/1:4:133,126:0.46: 0.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:87,102:0.51:-0.58:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,122:1.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:276,0:0.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,97:0.49:-0.58:1.000:0.997 0/0/0/1:4:257,116:0.26: 1.13:1.000:0.998 0/0/0/1:4:217,123:0.32: 0.82:1.000:0.951 0/0/0/0:4:235,0:0.00:-0.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,246:0.60: 1.02:1.000:0.816 0/0/1/1:4:117,274:0.61: 1.30:1.000:0.710 0/0/1/1:4:108,119:0.50:-0.23:1.000:0.997 0/0/0/0/1/1:6:35,25:0.38:-1.78:1.000:0.760 1/1/1/1:4:0,1:1.00:-2.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,124:0.52:-0.28:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,100:0.45:-0.40:1.000:0.984 0/0/1/1:4:139,272:0.59: 1.48:1.000:0.890 0/0/1/1:4:115,260:0.60: 1.15:1.000:0.755 0/0/1/1:4:97,89:0.45:-0.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:101,232:0.61: 0.76:1.000:0.735 0/0/0/0:4:127,0:0.00:-1.16:0.887:1.000 0/0/0/1:4:218,136:0.35: 0.95:1.000:0.821 0/0/1/1:4:138,129:0.46: 0.14:1.000:0.988 0/0/0/1:4:206,106:0.30: 0.56:0.999:0.988 0/0/0/0:4:303,0:0.00: 0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:143,318:0.60: 1.95:1.000:0.774 0/0/0/1:4:245,137:0.32: 1.21:1.000:0.960 0/0/0/1:4:203,124:0.34: 0.70:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,218:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:127,246:0.58: 1.13:1.000:0.897 0/0/1/1:4:108,225:0.59: 0.76:1.000:0.842 0/0/1/1:4:137,121:0.44: 0.06:1.000:0.973 0/0/1/1:4:80,213:0.62: 0.38:0.915:0.518 0/0/1/1:4:160,280:0.57: 1.75:1.000:0.946 1/1/1/1:4:0,255:1.00: 0.03:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:259,0:0.00: 0.07:0.980:1.000 0/0/1/1:4:124,257:0.59: 1.20:1.000:0.846 0/0/1/1:4:82,176:0.60: 0.06:1.000:0.813 0/0/1/1:4:109,116:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:118,115:0.47:-0.17:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,124:1.00:-1.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,193:0.59: 0.36:1.000:0.879 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,98:0.44:-0.39:1.000:0.969 0/0/1/1:4:91,103:0.51:-0.54:1.000:0.996 0/0/0/1:4:197,127:0.36: 0.67:1.000:0.738 0/0/0/0:4:122,0:0.00:-1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:97,92:0.46:-0.58:1.000:0.990 0/0/0/1:4:342,107:0.20: 1.84:1.000:1.000 0/0/0/0:4:251,0:0.00:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/0:4:128,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/0:4:237,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:92,172:0.58: 0.11:1.000:0.917 0/0/0/0:4:252,0:0.00: 0.00:0.999:1.000 1/1/1/1:4:0,84:1.00:-1.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,220:0.60: 0.66:1.000:0.818 0/0/1/1:4:108,200:0.58: 0.52:1.000:0.922 0/0/1/1:4:119,128:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/0:4:301,0:0.00: 0.46:0.993:1.000 0/0/1/1:4:149,124:0.43: 0.20:1.000:0.938 0/0/0/1:4:216,101:0.27: 0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:154,156:0.48: 0.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:207,126:0.34: 0.76:0.999:0.869 0/0/1/1:4:137,106:0.41:-0.08:1.000:0.839 0/0/1/1:4:97,164:0.57: 0.09:1.000:0.957 0/0/1/1:4:118,105:0.45:-0.27:1.000:0.975 0/0/1/1:4:92,93:0.48:-0.62:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-1.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,108:0.44:-0.16:1.000:0.958 0/0/1/1:4:99,238:0.61: 0.79:1.000:0.673 0/0/1/1:4:122,116:0.46:-0.13:1.000:0.990 0/0/1/1:4:100,138:0.54:-0.13:1.000:0.989 0/0/1/1:4:142,368:0.62: 2.40:1.000:0.560 0/0/1/1:4:143,151:0.49: 0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:159,117:0.39: 0.23:1.000:0.715 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,217:0.60: 0.59:1.000:0.779 0/0/1/1:4:110,213:0.58: 0.66:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,82:1.00:-1.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,206:0.61: 0.38:1.000:0.678 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-1.39:1.000:1.000 0/0/0/0:4:242,0:0.00:-0.09:1.000:1.000 0/0/0/1:4:159,55:0.21:-0.35:0.998:1.000 0/0/0/0:4:147,0:0.00:-0.97:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,118:0.49:-0.20:1.000:0.997 0/0/0/0:4:139,0:0.00:-1.05:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,274:0.60: 1.41:1.000:0.823 0/0/0/1:4:223,147:0.36: 1.10:1.000:0.669 0/0/1/1:4:92,107:0.51:-0.49:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-1.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:141,273:0.58: 1.51:1.000:0.897 1/1/1/1:4:0,99:1.00:-1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:112,110:0.47:-0.28:1.000:0.993 0/0/1/1:4:79,199:0.62: 0.25:1.000:0.604 1/1/1/1:4:0,284:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/0:4:185,0:0.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:137,264:0.58: 1.39:1.000:0.900 0/0/0/0:4:135,0:0.00:-1.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,283:0.60: 1.52:1.000:0.814 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:262,154:0.33: 1.53:1.000:0.918 0/0/0/0:4:225,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,35:0.50:-1.71:1.000:0.997 0/0/1/1:4:107,244:0.61: 0.92:1.000:0.744 0/0/0/0:4:264,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,121:0.45: 0.01:1.000:0.984 0/0/0/0:4:138,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,129:0.49: 0.00:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/1:4:217,105:0.28: 0.65:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,217:1.00:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,132:0.52:-0.11:1.000:0.995 0/0/0/1:4:226,138:0.34: 1.05:1.000:0.864 0/0/0/0:4:290,0:0.00: 0.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:240,0:0.00:-0.11:1.000:1.000 0/0/0/0:4:221,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/1/1:4:228,229:0.48: 1.91:1.000:0.995 0/0/1/1:4:119,144:0.52: 0.11:1.000:0.995 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/0/0:4:89,0:0.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,118:0.45:-0.02:1.000:0.977 0/0/0/0:4:116,0:0.00:-1.26:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,105:0.96:-1.36:1.000:1.000 0/0/0/0:4:93,0:0.00:-1.48:1.000:1.000 0/0/0/0:4:310,0:0.00: 0.54:1.000:1.000 0/0/0/0:4:158,0:0.00:-0.87:1.000:1.000 0/0/1/1:4:129,289:0.60: 1.55:1.000:0.766 0/1/1/1:4:32,254:0.72: 0.32:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,248:1.00:-0.03:0.956:1.000 0/0/1/1:4:170,286:0.56: 1.90:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/0/1:4:205,137:0.37: 0.84:1.000:0.623 0/0/0/1:4:252,140:0.32: 1.31:1.000:0.963 -chr8.1 81911274 chr8.1_081911274 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:0,16:.:-0.21:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:1,26:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:1,7:.:-0.98:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,14:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.03:0.998:. ./.:4:30,0:.: 1.13:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:3,42:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,2:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,42:.: 2.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,3:.:-1.45:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,18:.:-0.02:0.979:. ./.:4:3,27:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,41:.: 2.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,30:.: 1.13:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.50:1.000:. ./.:5:0,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:2,12:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,22:.: 0.36:1.000:. ./.:6:1,14:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.12:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:1,20:.: 0.27:1.000:. ./.:4:4,28:.: 1.32:0.887:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.88:0.999:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,16:.:-0.21:1.000:. ./.:4:1,14:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,5:.:-1.26:0.980:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,9:.:-0.78:1.000:. ./.:4:1,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:2,12:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:1,21:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,8:.:-0.98:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,7:.:-1.07:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.51:0.999:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,36:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.65:0.993:. ./.:4:0,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,13:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,34:.: 1.51:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.78:0.999:. ./.:4:0,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:0,30:.: 1.13:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:1,12:.:-0.50:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,26:.: 0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:2,22:.: 0.55:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,16:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:1,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.64:0.998:. ./.:4:0,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,11:.:-0.69:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,11:.:-0.69:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.64:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,40:.: 2.08:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,29:.: 1.03:1.000:. ./.:4:0,24:.: 0.55:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:1,51:.: 3.23:1.000:. ./.:4:2,4:.:-1.17:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:1,18:.: 0.08:1.000:. ./.:4:0,21:.: 0.27:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:2,0:.:-1.55:1.000:. ./.:4:1,23:.: 0.55:1.000:. ./.:4:1,24:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,22:.: 0.36:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,14:.:-0.40:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:1,35:.: 1.70:1.000:. ./.:4:0,48:.: 2.84:1.000:. ./.:4:0,42:.: 2.27:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:0,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,12:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,45:.: 2.56:1.000:. ./.:4:0,10:.:-0.78:1.000:. ./.:4:0,18:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,17:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,15:.:-0.31:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,53:.: 3.32:1.000:. ./.:4:0,26:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,20:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,23:.: 0.46:1.000:. ./.:4:0,27:.: 0.84:0.956:. ./.:4:0,26:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,25:.: 0.65:1.000:. ./.:4:0,19:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. -chr8.1 82844394 chr8.1_082844394 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:252,73:.: 0.35:1.000:. ./.:4:202,0:.:-1.27:1.000:. ./.:4:192,64:.:-0.56:1.000:. ./.:4:124,98:.:-1.01:1.000:. ./.:4:285,86:.: 0.96:1.000:. ./.:4:161,137:.: 0.00:1.000:. ./.:4:144,107:.:-0.62:1.000:. ./.:4:148,115:.:-0.47:1.000:. ./.:4:193,58:.:-0.62:1.000:. ./.:4:100,28:.:-2.25:1.000:. ./.:4:78,15:.:-2.71:1.000:. ./.:4:335,0:.: 0.49:1.000:. ./.:4:189,53:.:-0.74:1.000:. ./.:4:158,134:.:-0.08:1.000:. ./.:4:224,72:.:-0.03:1.000:. ./.:4:103,93:.:-1.35:1.000:. ./.:4:263,83:.: 0.63:0.998:. ./.:4:298,88:.: 1.16:1.000:. ./.:4:291,76:.: 0.91:1.000:. ./.:4:266,65:.: 0.43:1.000:. ./.:4:112,45:.:-1.87:1.000:. ./.:4:150,134:.:-0.19:1.000:. ./.:4:250,71:.: 0.30:1.000:. ./.:4:184,58:.:-0.74:1.000:. ./.:4:55,13:.:-3.04:1.000:. ./.:4:240,75:.: 0.22:1.000:. ./.:4:154,36:.:-1.43:1.000:. ./.:4:135,92:.:-0.94:1.000:. ./.:3:232,115:.: 0.65:1.000:. ./.:4:209,46:.:-0.57:1.000:. ./.:4:266,79:.: 0.62:1.000:. ./.:4:124,107:.:-0.89:1.000:. ./.:4:33,27:.:-3.15:1.000:. ./.:4:121,23:.:-2.04:1.000:. ./.:3:26,5:.:-3.53:1.000:. ./.:4:200,63:.:-0.47:1.000:. ./.:4:174,141:.: 0.22:0.979:. ./.:4:136,105:.:-0.76:1.000:. ./.:4:181,169:.: 0.69:1.000:. ./.:4:250,55:.: 0.09:1.000:. ./.:4:172,143:.: 0.22:1.000:. ./.:4:272,98:.: 0.95:1.000:. ./.:4:198,142:.: 0.55:1.000:. ./.:4:233,62:.:-0.04:1.000:. ./.:4:153,130:.:-0.20:1.000:. ./.:4:176,157:.: 0.46:1.000:. ./.:5:235,164:.: 1.33:1.000:. ./.:4:19,12:.:-3.53:1.000:. ./.:4:273,96:.: 0.94:1.000:. ./.:4:96,82:.:-1.59:1.000:. ./.:4:237,64:.: 0.04:1.000:. ./.:4:195,213:.: 1.45:1.000:. ./.:4:289,86:.: 1.02:1.000:. ./.:4:212,162:.: 1.00:1.000:. ./.:4:150,118:.:-0.40:1.000:. ./.:4:302,90:.: 1.24:1.000:. ./.:4:177,143:.: 0.29:1.000:. ./.:4:339,107:.: 1.95:1.000:. ./.:4:237,68:.: 0.09:1.000:. ./.:6:218,87:.: 0.09:1.000:. ./.:4:298,101:.: 1.33:1.000:. ./.:4:237,77:.: 0.21:1.000:. ./.:4:315,97:.: 1.51:1.000:. ./.:4:160,156:.: 0.24:1.000:. ./.:4:250,92:.: 0.58:1.000:. ./.:4:264,74:.: 0.53:1.000:. ./.:4:241,66:.: 0.12:1.000:. ./.:4:193,144:.: 0.51:1.000:. ./.:4:210,202:.: 1.51:0.887:. ./.:4:253,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:236,222:.: 2.11:1.000:. ./.:4:196,159:.: 0.75:0.999:. ./.:4:430,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:174,123:.:-0.02:1.000:. ./.:4:382,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:178,159:.: 0.51:1.000:. ./.:4:195,144:.: 0.54:1.000:. ./.:4:280,84:.: 0.87:1.000:. ./.:4:180,141:.: 0.30:1.000:. ./.:4:201,163:.: 0.87:1.000:. ./.:4:360,0:.: 0.82:0.915:. ./.:4:198,175:.: 0.99:1.000:. ./.:4:211,199:.: 1.48:1.000:. ./.:4:171,64:.:-0.84:1.000:. ./.:4:225,73:.: 0.00:0.980:. ./.:4:227,142:.: 0.94:1.000:. ./.:4:159,132:.:-0.10:1.000:. ./.:4:216,78:.:-0.06:1.000:. ./.:4:244,74:.: 0.26:1.000:. ./.:4:275,80:.: 0.75:1.000:. ./.:4:365,86:.: 2.02:1.000:. ./.:4:156,146:.: 0.05:1.000:. ./.:4:192,152:.: 0.61:1.000:. ./.:4:101,108:.:-1.18:1.000:. ./.:4:194,175:.: 0.94:1.000:. ./.:4:299,81:.: 1.08:1.000:. ./.:4:236,68:.: 0.08:1.000:. ./.:4:291,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:295,100:.: 1.28:1.000:. ./.:4:247,67:.: 0.21:1.000:. ./.:4:321,97:.: 1.58:1.000:. ./.:4:311,87:.: 1.32:1.000:. ./.:4:144,118:.:-0.48:1.000:. ./.:4:156,162:.: 0.26:0.999:. ./.:4:159,135:.:-0.06:1.000:. ./.:4:164,141:.: 0.09:1.000:. ./.:4:170,138:.: 0.13:1.000:. ./.:4:117,111:.:-0.93:1.000:. ./.:4:311,96:.: 1.44:0.993:. ./.:4:204,53:.:-0.54:1.000:. ./.:4:174,157:.: 0.43:1.000:. ./.:4:162,142:.: 0.08:1.000:. ./.:4:217,163:.: 1.08:0.999:. ./.:4:281,95:.: 1.03:1.000:. ./.:4:123,95:.:-1.06:1.000:. ./.:4:206,176:.: 1.11:1.000:. ./.:4:204,164:.: 0.92:1.000:. ./.:4:246,76:.: 0.31:1.000:. ./.:4:173,157:.: 0.42:1.000:. ./.:4:189,160:.: 0.67:1.000:. ./.:4:171,115:.:-0.16:1.000:. ./.:4:259,61:.: 0.29:1.000:. ./.:4:198,155:.: 0.72:1.000:. ./.:4:201,60:.:-0.49:1.000:. ./.:4:276,68:.: 0.61:1.000:. ./.:4:296,94:.: 1.21:1.000:. ./.:4:262,73:.: 0.49:1.000:. ./.:4:345,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:125,107:.:-0.88:1.000:. ./.:4:142,123:.:-0.44:1.000:. ./.:4:259,70:.: 0.41:1.000:. ./.:4:199,53:.:-0.61:1.000:. ./.:4:152,46:.:-1.33:0.998:. ./.:4:241,57:.: 0.00:1.000:. ./.:4:123,128:.:-0.62:1.000:. ./.:4:226,59:.:-0.17:1.000:. ./.:4:177,141:.: 0.26:1.000:. ./.:4:163,165:.: 0.39:1.000:. ./.:4:269,75:.: 0.61:1.000:. ./.:4:217,63:.:-0.24:1.000:. ./.:4:299,86:.: 1.15:1.000:. ./.:4:225,77:.: 0.05:1.000:. ./.:4:221,52:.:-0.33:1.000:. ./.:4:221,61:.:-0.21:1.000:. ./.:4:273,60:.: 0.46:1.000:. ./.:4:224,181:.: 1.41:1.000:. ./.:4:120,117:.:-0.81:1.000:. ./.:4:246,74:.: 0.29:1.000:. ./.:4:149,130:.:-0.25:1.000:. ./.:4:153,127:.:-0.24:1.000:. ./.:4:156,130:.:-0.16:1.000:. ./.:4:126,109:.:-0.84:1.000:. ./.:4:71,23:.:-2.70:1.000:. ./.:4:180,42:.:-1.01:1.000:. ./.:4:283,81:.: 0.87:1.000:. ./.:4:278,76:.: 0.74:1.000:. ./.:4:255,69:.: 0.34:1.000:. ./.:4:227,69:.:-0.03:1.000:. ./.:4:234,72:.: 0.10:1.000:. ./.:4:234,70:.: 0.08:1.000:. ./.:4:120,100:.:-1.03:1.000:. ./.:4:116,117:.:-0.86:1.000:. ./.:4:209,45:.:-0.58:1.000:. ./.:4:133,127:.:-0.51:1.000:. ./.:4:112,87:.:-1.31:1.000:. ./.:4:130,97:.:-0.94:1.000:. ./.:4:128,109:.:-0.81:1.000:. ./.:4:239,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:124,117:.:-0.76:1.000:. ./.:4:187,47:.:-0.85:1.000:. ./.:4:99,86:.:-1.50:1.000:. ./.:4:195,55:.:-0.64:1.000:. ./.:4:248,67:.: 0.22:1.000:. ./.:4:203,64:.:-0.41:1.000:. ./.:4:202,60:.:-0.48:1.000:. ./.:4:183,56:.:-0.78:1.000:. ./.:4:144,135:.:-0.25:1.000:. ./.:4:254,70:.: 0.34:1.000:. ./.:4:181,134:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,67:.:-1.38:1.000:. ./.:4:145,138:.:-0.20:0.956:. ./.:4:196,123:.: 0.28:1.000:. ./.:4:238,63:.: 0.04:1.000:. ./.:4:126,104:.:-0.90:1.000:. ./.:4:320,0:.: 0.29:1.000:. -chr8.1 82969689 chr8.1_082969689 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:533,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:374,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:541,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:674,0:.: 1.78:1.000:. ./.:4:636,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:377,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:190,0:.:-2.51:1.000:. ./.:4:195,0:.:-2.47:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:573,0:.: 0.88:1.000:. ./.:4:553,0:.: 0.70:0.998:. ./.:4:646,0:.: 1.53:1.000:. ./.:4:656,0:.: 1.62:1.000:. ./.:4:619,0:.: 1.29:1.000:. ./.:4:227,0:.:-2.19:1.000:. ./.:4:494,0:.: 0.18:1.000:. ./.:4:593,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:138,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:657,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:428,0:.:-0.40:1.000:. ./.:3:479,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:542,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:518,0:.: 0.39:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:126,0:.:-3.08:1.000:. ./.:4:273,0:.:-1.78:1.000:. ./.:3:100,0:.:-3.31:1.000:. ./.:4:505,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.62:0.979:. ./.:4:469,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:537,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:478,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:535,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:483,0:.: 0.08:1.000:. ./.:4:548,0:.: 0.66:1.000:. ./.:5:717,0:.: 2.16:1.000:. ./.:4:137,0:.:-2.98:1.000:. ./.:4:416,0:.:-0.51:1.000:. ./.:4:453,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:432,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:673,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:418,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:509,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:482,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:461,0:.:-0.11:1.000:. ./.:4:540,0:.: 0.59:1.000:. ./.:4:421,0:.:-0.47:1.000:. ./.:6:350,0:.:-1.10:1.000:. ./.:4:507,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:435,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:566,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:398,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:536,0:.: 0.55:1.000:. ./.:4:476,0:.: 0.02:1.000:. ./.:4:348,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:446,1:.:-0.24:0.887:. ./.:4:482,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:528,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:495,0:.: 0.19:0.999:. ./.:4:582,0:.: 0.96:1.000:. ./.:4:577,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:436,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:508,0:.: 0.30:1.000:. ./.:4:482,1:.: 0.08:1.000:. ./.:4:543,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:490,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:328,0:.:-1.29:0.915:. ./.:4:594,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:555,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:410,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:496,0:.: 0.20:0.980:. ./.:4:499,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:395,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:468,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:403,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:423,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:568,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:342,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:550,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:506,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:404,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:360,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:343,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:501,0:.: 0.24:0.999:. ./.:4:356,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:454,0:.:-0.17:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:737,1:.: 2.34:0.993:. ./.:4:466,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:429,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:615,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:472,0:.:-0.01:0.999:. ./.:4:527,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:325,0:.:-1.32:1.000:. ./.:4:538,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:515,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:477,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:489,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:414,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:512,0:.: 0.34:1.000:. ./.:4:445,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:494,1:.: 0.19:1.000:. ./.:4:460,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:447,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:565,0:.: 0.81:1.000:. ./.:4:481,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:311,0:.:-1.44:1.000:. ./.:4:308,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:312,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:433,0:.:-0.36:1.000:. ./.:4:419,0:.:-0.48:1.000:. ./.:4:262,0:.:-1.88:0.998:. ./.:4:410,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:442,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:657,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:523,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:370,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:408,0:.:-0.58:1.000:. ./.:4:498,0:.: 0.22:1.000:. ./.:4:390,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:381,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:361,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:684,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:683,0:.: 1.86:1.000:. ./.:4:484,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:488,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:627,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:424,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:589,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:443,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:160,0:.:-2.78:1.000:. ./.:4:379,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:559,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:594,0:.: 1.07:1.000:. ./.:4:685,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:549,0:.: 0.67:1.000:. ./.:4:430,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:586,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:431,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:402,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:499,0:.: 0.23:1.000:. ./.:4:465,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:557,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:399,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:473,0:.:-0.01:1.000:. ./.:4:438,1:.:-0.31:1.000:. ./.:4:475,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:396,0:.:-0.69:1.000:. ./.:4:372,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:411,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:392,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:362,0:.:-0.99:1.000:. ./.:4:356,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:562,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:575,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:593,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:464,0:.:-0.09:1.000:. ./.:4:583,0:.: 0.97:0.956:. ./.:4:690,0:.: 1.92:1.000:. ./.:4:670,0:.: 1.74:1.000:. ./.:4:427,0:.:-0.41:1.000:. ./.:4:534,0:.: 0.54:1.000:. -chr8.1 83241280 chr8.1_083241280 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:157,66:0.29: 1.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:71,100:0.56:-0.14:1.000:0.968 0/0/0/1:4:149,40:0.20: 0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:126,50:0.27:-0.02:1.000:0.997 0/0/0/1:4:182,60:0.24: 1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,88:0.44: 0.37:1.000:0.964 0/0/0/1:4:60,29:0.31:-2.06:1.000:0.967 0/0/1/1:4:90,97:0.50: 0.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,82:0.49:-0.40:1.000:0.996 0/0/0/1:4:15,7:0.31:-3.63:1.000:0.978 0/0/0/1:4:46,6:0.11:-2.93:1.000:0.530 0/0/1/1:4:134,93:0.39: 1.17:1.000:0.735 0/0/0/0:4:164,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,94:0.46: 0.44:1.000:0.988 0/0/0/1:4:129,42:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:83,83:0.48:-0.26:1.000:0.995 0/0/1/1:4:110,98:0.45: 0.72:0.998:0.982 0/0/0/1:4:146,53:0.26: 0.51:1.000:0.999 0/0/0/1:4:190,70:0.26: 1.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:108,89:0.43: 0.47:1.000:0.956 0/0/1/1:4:16,19:0.52:-3.32:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,93:0.51:-0.05:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,101:0.47: 0.72:1.000:0.991 0/0/1/1:4:87,92:0.49: 0.05:1.000:0.997 0/0/0/1:4:25,14:0.35:-3.23:1.000:0.829 0/0/0/1:4:177,59:0.24: 1.38:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,86:0.52:-0.45:1.000:0.995 0/0/0/1:4:120,44:0.26:-0.31:1.000:0.999 0/1/1:3:55,94:0.60:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/0:4:166,0:0.00:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:116,44:0.27:-0.40:1.000:0.998 0/0/1/1:4:61,81:0.55:-0.82:1.000:0.983 0/0/0/0:4:9,0:0.00:-3.93:1.000:1.000 0/0/0/0:4:44,0:0.00:-3.11:1.000:1.000 0/0/0:3:17,0:0.00:-3.74:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,90:0.51:-0.21:1.000:0.996 0/0/0/1:4:154,62:0.28: 0.91:0.979:0.996 0/0/0/1:4:139,39:0.21: 0.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:163,42:0.20: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:148,32:0.17: 0.07:1.000:0.998 0/0/1/1:4:94,95:0.48: 0.28:1.000:0.995 0/0/0/1:4:155,54:0.25: 0.75:1.000:0.999 0/1/1/1:4:62,164:0.69: 1.15:1.000:0.973 0/0/0/1:4:110,39:0.25:-0.66:1.000:0.999 0/0/0/1:4:147,54:0.26: 0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:92,123:0.55: 0.89:1.000:0.982 0/0/0/0/1:5:191,36:0.15: 1.17:1.000:0.997 0/0/1/1:4:47,55:0.52:-1.76:1.000:0.995 0/0/0/0:4:169,0:0.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,117:0.55: 0.65:1.000:0.983 0/0/1/1:4:80,80:0.48:-0.40:1.000:0.995 0/0/0/1:4:152,66:0.29: 0.96:1.000:0.991 0/0/0/0:4:198,0:0.00: 0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:113,111:0.48: 1.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:154,50:0.24: 0.63:1.000:1.000 0/0/0/0:4:197,0:0.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:90,92:0.49: 0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:139,54:0.27: 0.37:1.000:0.998 0/0/0/1:4:136,44:0.24: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1/1/1:6:67,71:0.49:-0.91:1.000:0.887 0/0/1/1:4:106,95:0.45: 0.56:1.000:0.983 0/0/0/0:4:209,0:0.00: 0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:137,57:0.28: 0.40:1.000:0.994 0/0/1/1:4:73,82:0.51:-0.52:1.000:0.996 0/0/0/1:4:188,46:0.19: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,49:0.25: 0.28:1.000:0.999 0/0/1/1:4:48,73:0.58:-1.31:1.000:0.928 0/0/1/1:4:102,115:0.51: 0.93:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,94:0.48: 0.30:0.887:0.994 0/0/0/1:4:142,43:0.22: 0.19:1.000:1.000 0/0/0/1:4:156,52:0.24: 0.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:132,34:0.20:-0.26:0.999:1.000 0/0/1/1:4:109,99:0.46: 0.72:1.000:0.986 0/0/0/1:4:133,56:0.29: 0.28:1.000:0.994 0/0/0/1:4:138,50:0.26: 0.26:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,40:0.28:-0.89:1.000:0.996 0/0/1/1:4:96,74:0.42:-0.16:1.000:0.908 0/0/0/1:4:142,48:0.24: 0.30:1.000:1.000 0/0/0/1:4:162,47:0.22: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:43,163:0.75: 0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:117,39:0.24:-0.49:0.915:1.000 0/0/0/1:4:140,42:0.22: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:132,111:0.44: 1.54:1.000:0.965 0/0/0/1:4:140,34:0.19:-0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:177,0:0.00: 0.00:0.980:1.000 0/0/1/1:4:104,114:0.50: 0.96:1.000:0.997 0/0/0/1:4:104,28:0.20:-1.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:117,47:0.28:-0.31:1.000:0.996 0/0/0/0:4:152,0:0.00:-0.59:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,107:0.53: 0.35:1.000:0.991 0/0/0/1:4:108,40:0.26:-0.68:1.000:0.999 0/0/0/1:4:137,49:0.25: 0.21:1.000:0.999 0/0/1/1:4:106,108:0.48: 0.86:1.000:0.996 0/1/1/1:4:34,115:0.73:-0.66:1.000:0.998 0/0/0/1:4:161,40:0.19: 0.56:1.000:1.000 0/0/0/1:4:130,54:0.28: 0.16:1.000:0.995 0/0/0/1:4:88,34:0.27:-1.29:1.000:0.998 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:106,114:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:82,31:0.26:-1.50:1.000:0.998 0/0/1/1:4:101,96:0.47: 0.47:1.000:0.992 0/0/0/1:4:106,48:0.30:-0.54:1.000:0.985 0/0/0/1:4:135,51:0.26: 0.21:0.999:0.998 0/0/1/1:4:85,75:0.45:-0.40:1.000:0.980 0/0/0/1:4:140,40:0.21: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,54:0.27: 0.40:1.000:0.998 0/0/0/1:4:114,49:0.29:-0.33:1.000:0.992 0/0/0/1:4:175,69:0.27: 1.57:0.993:0.997 0/0/0/1:4:142,50:0.25: 0.35:1.000:0.999 0/0/0/1:4:121,35:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:110,90:0.43: 0.54:1.000:0.953 0/0/0/1:4:141,70:0.32: 0.79:0.999:0.955 0/0/0/0:4:202,0:0.00: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:65,85:0.54:-0.63:1.000:0.986 0/0/0/1:4:144,44:0.23: 0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:122,55:0.30: 0.00:1.000:0.985 0/0/0/1:4:120,38:0.23:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:151,48:0.23: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,47:0.27:-0.16:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,149:0.72: 0.47:1.000:0.995 0/0/0/0:4:153,0:0.00:-0.56:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,96:0.45: 0.63:1.000:0.982 0/0/0/1:4:113,55:0.32:-0.21:1.000:0.964 0/0/1/1:4:94,85:0.46: 0.05:1.000:0.985 0/0/0/1:4:143,66:0.30: 0.75:1.000:0.981 0/0/0/1:4:135,55:0.28: 0.30:1.000:0.996 0/0/0/1:4:112,37:0.24:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,96:0.54:-0.19:1.000:0.985 0/0/1/1:4:61,72:0.52:-1.03:1.000:0.995 0/0/0/1:4:128,43:0.24:-0.14:1.000:1.000 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,26:0.21:-1.38:0.998:1.000 0/0/0/1:4:129,53:0.28: 0.12:1.000:0.995 0/0/1/1:4:82,94:0.51:-0.02:1.000:0.996 0/0/0/1:4:226,72:0.23: 2.83:1.000:1.000 0/0/0/1:4:136,51:0.26: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:128,34:0.20:-0.35:1.000:1.000 0/0/0/1:4:125,41:0.24:-0.26:1.000:1.000 0/0/0/1:4:119,39:0.24:-0.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:149,44:0.22: 0.37:1.000:1.000 0/0/0/1:4:135,33:0.19:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,100:0.50: 0.33:1.000:0.997 0/0/0/1:4:109,27:0.19:-0.96:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,118:0.49: 1.31:1.000:0.996 0/0/1/1:4:112,131:0.52: 1.54:1.000:0.995 0/0/0/1:4:143,63:0.29: 0.68:1.000:0.989 0/0/1/1:4:86,105:0.53: 0.33:1.000:0.993 0/0/1/1:4:104,113:0.50: 0.93:1.000:0.997 0/0/1/1:4:100,92:0.46: 0.35:1.000:0.988 0/0/0/1:4:137,48:0.25: 0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:131,44:0.24:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/0:4:26,1:0.04:-3.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,31:0.22:-0.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,42:0.23: 0.07:1.000:1.000 0/0/0/0:4:186,0:0.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/0/0:4:206,0:0.00: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,94:0.44: 0.65:1.000:0.968 0/0/0/1:4:140,37:0.20: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:153,50:0.24: 0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:118,46:0.27:-0.31:1.000:0.998 0/1/1/1:4:50,116:0.66:-0.26:1.000:0.895 0/0/0/0:4:171,0:0.00:-0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,100:0.48: 0.51:1.000:0.995 0/0/0/1:4:147,49:0.24: 0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:112,51:0.30:-0.33:1.000:0.984 0/0/0/1:4:119,48:0.28:-0.24:1.000:0.996 0/0/0/0:4:175,1:0.01:-0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,153:0.72: 0.56:1.000:0.996 0/0/0/1:4:104,42:0.28:-0.73:1.000:0.996 0/0/1/1:4:86,94:0.50: 0.07:1.000:0.997 0/0/1/1:4:71,91:0.54:-0.35:1.000:0.989 0/0/0/1:4:139,53:0.27: 0.35:1.000:0.998 0/0/1/1:4:88,98:0.51: 0.21:1.000:0.997 0/0/1/1:4:74,79:0.50:-0.56:1.000:0.997 0/0/1/1:4:72,89:0.53:-0.38:1.000:0.992 0/0/0/1:4:134,43:0.23: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:138,46:0.24: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:95,86:0.46: 0.09:1.000:0.985 0/0/1/1:4:94,81:0.44:-0.05:1.000:0.974 0/0/1/1:4:86,101:0.52: 0.23:0.956:0.995 0/0/0/1:4:169,77:0.30: 1.61:1.000:0.984 0/0/1/1:4:99,120:0.53: 0.98:1.000:0.994 0/0/1/1:4:68,96:0.56:-0.31:1.000:0.968 0/0/0/1:4:151,47:0.23: 0.49:1.000:1.000 -chr8.1 83530191 chr8.1_083530191 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:41,14:.:-0.15:1.000:. ./.:4:24,14:.:-0.93:1.000:. ./.:4:31,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:39,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:52,17:.: 0.48:1.000:. ./.:4:36,12:.:-0.47:1.000:. ./.:4:14,4:.:-1.84:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:19,9:.:-1.38:1.000:. ./.:4:37,8:.:-0.61:1.000:. ./.:4:62,9:.: 0.57:1.000:. ./.:4:24,25:.:-0.43:1.000:. ./.:4:32,9:.:-0.79:1.000:. ./.:4:48,14:.: 0.16:1.000:. ./.:4:35,12:.:-0.52:1.000:. ./.:4:43,11:.:-0.20:1.000:. ./.:4:45,34:.: 0.94:0.998:. ./.:4:56,24:.: 0.98:1.000:. ./.:4:60,20:.: 0.98:1.000:. ./.:4:58,31:.: 1.39:1.000:. ./.:4:34,5:.:-0.88:1.000:. ./.:4:40,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:51,14:.: 0.30:1.000:. ./.:4:29,9:.:-0.93:1.000:. ./.:4:26,3:.:-1.34:1.000:. ./.:4:24,11:.:-1.06:1.000:. ./.:4:29,21:.:-0.38:1.000:. ./.:4:33,0:.:-1.16:1.000:. ./.:3:40,22:.: 0.16:1.000:. ./.:4:20,10:.:-1.29:1.000:. ./.:4:19,7:.:-1.47:1.000:. ./.:4:28,0:.:-1.38:1.000:. ./.:4:17,15:.:-1.20:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.16:1.000:. ./.:3:12,4:.:-1.93:1.000:. ./.:4:40,6:.:-0.56:1.000:. ./.:4:46,11:.:-0.06:0.979:. ./.:4:71,12:.: 1.12:1.000:. ./.:4:56,15:.: 0.57:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:48,33:.: 1.03:1.000:. ./.:4:44,15:.: 0.03:1.000:. ./.:4:67,19:.: 1.26:1.000:. ./.:4:44,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:42,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:55,45:.: 1.89:1.000:. ./.:5:52,0:.:-0.29:1.000:. ./.:4:126,79:.: 6.67:1.000:. ./.:4:38,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:75,29:.: 2.07:1.000:. ./.:4:51,17:.: 0.44:1.000:. ./.:4:60,20:.: 0.98:1.000:. ./.:4:62,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:39,13:.:-0.29:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:44,19:.: 0.21:1.000:. ./.:4:38,15:.:-0.25:1.000:. ./.:4:42,17:.: 0.03:1.000:. ./.:4:53,0:.:-0.25:1.000:. ./.:6:46,21:.: 0.39:1.000:. ./.:4:48,24:.: 0.62:1.000:. ./.:4:41,8:.:-0.43:1.000:. ./.:4:61,20:.: 1.03:1.000:. ./.:4:57,33:.: 1.44:1.000:. ./.:4:55,13:.: 0.44:1.000:. ./.:4:50,17:.: 0.39:1.000:. ./.:4:41,23:.: 0.25:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:52,15:.: 0.39:0.887:. ./.:4:44,44:.: 1.35:1.000:. ./.:4:49,24:.: 0.66:1.000:. ./.:4:47,0:.:-0.52:0.999:. ./.:4:40,48:.: 1.35:1.000:. ./.:4:37,4:.:-0.79:1.000:. ./.:4:42,18:.: 0.07:1.000:. ./.:4:24,3:.:-1.43:1.000:. ./.:4:44,8:.:-0.29:1.000:. ./.:4:63,0:.: 0.21:1.000:. ./.:4:73,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:72,18:.: 1.44:1.000:. ./.:4:28,10:.:-0.93:0.915:. ./.:4:73,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:57,20:.: 0.85:1.000:. ./.:4:54,18:.: 0.62:1.000:. ./.:4:65,22:.: 1.30:0.980:. ./.:4:65,12:.: 0.85:1.000:. ./.:4:26,0:.:-1.47:1.000:. ./.:4:46,10:.:-0.11:1.000:. ./.:4:56,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:43,10:.:-0.25:1.000:. ./.:4:23,0:.:-1.61:1.000:. ./.:4:52,13:.: 0.30:1.000:. ./.:4:52,42:.: 1.62:1.000:. ./.:4:52,19:.: 0.57:1.000:. ./.:4:62,10:.: 0.62:1.000:. ./.:4:52,15:.: 0.39:1.000:. ./.:4:36,7:.:-0.70:1.000:. ./.:4:33,7:.:-0.84:1.000:. ./.:4:77,18:.: 1.66:1.000:. ./.:4:56,20:.: 0.80:1.000:. ./.:4:38,22:.: 0.07:1.000:. ./.:4:45,29:.: 0.71:1.000:. ./.:4:36,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:64,15:.: 0.94:0.999:. ./.:4:38,14:.:-0.29:1.000:. ./.:4:43,16:.: 0.03:1.000:. ./.:4:44,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:32,18:.:-0.38:1.000:. ./.:4:62,24:.: 1.26:0.993:. ./.:4:39,11:.:-0.38:1.000:. ./.:4:82,18:.: 1.89:1.000:. ./.:4:32,14:.:-0.56:1.000:. ./.:4:48,14:.: 0.16:0.999:. ./.:4:50,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:26,6:.:-1.20:1.000:. ./.:4:77,16:.: 1.57:1.000:. ./.:4:49,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:56,14:.: 0.53:1.000:. ./.:4:48,20:.: 0.44:1.000:. ./.:4:57,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:60,21:.: 1.03:1.000:. ./.:4:64,10:.: 0.71:1.000:. ./.:4:50,12:.: 0.16:1.000:. ./.:4:25,0:.:-1.52:1.000:. ./.:4:57,15:.: 0.62:1.000:. ./.:4:41,24:.: 0.30:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:32,9:.:-0.79:1.000:. ./.:4:41,6:.:-0.52:1.000:. ./.:4:30,9:.:-0.88:1.000:. ./.:4:42,16:.:-0.02:1.000:. ./.:4:40,14:.:-0.20:1.000:. ./.:4:36,11:.:-0.52:0.998:. ./.:4:59,11:.: 0.53:1.000:. ./.:4:47,24:.: 0.57:1.000:. ./.:4:56,30:.: 1.26:1.000:. ./.:4:46,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:54,17:.: 0.57:1.000:. ./.:4:41,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:40,13:.:-0.25:1.000:. ./.:4:58,12:.: 0.53:1.000:. ./.:4:41,10:.:-0.34:1.000:. ./.:4:26,13:.:-0.88:1.000:. ./.:4:28,8:.:-1.02:1.000:. ./.:4:61,27:.: 1.35:1.000:. ./.:4:60,38:.: 1.80:1.000:. ./.:4:53,12:.: 0.30:1.000:. ./.:4:43,10:.:-0.25:1.000:. ./.:4:78,28:.: 2.17:1.000:. ./.:4:45,10:.:-0.15:1.000:. ./.:4:45,17:.: 0.16:1.000:. ./.:4:47,11:.:-0.02:1.000:. ./.:4:30,5:.:-1.06:1.000:. ./.:4:17,0:.:-1.88:1.000:. ./.:4:31,14:.:-0.61:1.000:. ./.:4:58,15:.: 0.66:1.000:. ./.:4:49,9:.:-0.02:1.000:. ./.:4:51,16:.: 0.39:1.000:. ./.:4:26,9:.:-1.06:1.000:. ./.:4:41,11:.:-0.29:1.000:. ./.:4:46,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:35,9:.:-0.66:1.000:. ./.:4:37,13:.:-0.38:1.000:. ./.:4:42,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:28,8:.:-1.02:1.000:. ./.:4:39,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:39,12:.:-0.34:1.000:. ./.:4:43,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:34,28:.: 0.16:1.000:. ./.:4:21,9:.:-1.29:1.000:. ./.:4:30,19:.:-0.43:1.000:. ./.:4:24,4:.:-1.38:1.000:. ./.:4:37,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:47,21:.: 0.44:1.000:. ./.:4:44,16:.: 0.07:1.000:. ./.:4:25,9:.:-1.11:1.000:. ./.:4:27,4:.:-1.25:1.000:. ./.:4:40,29:.: 0.48:1.000:. ./.:4:49,18:.: 0.39:1.000:. ./.:4:25,10:.:-1.06:1.000:. ./.:4:38,17:.:-0.15:0.956:. ./.:4:42,9:.:-0.34:1.000:. ./.:4:60,21:.: 1.03:1.000:. ./.:4:41,12:.:-0.25:1.000:. ./.:4:50,40:.: 1.44:1.000:. -chr8.1 83708490 chr8.1_083708490 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:169,0:.:-0.21:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:191,2:.: 0.21:1.000:. ./.:4:110,41:.:-0.52:1.000:. ./.:4:200,55:.: 1.29:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.66:1.000:. ./.:4:61,18:.:-1.78:1.000:. ./.:4:149,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:55,0:.:-2.20:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:100,43:.:-0.66:1.000:. ./.:4:142,1:.:-0.66:1.000:. ./.:4:117,26:.:-0.66:1.000:. ./.:4:117,0:.:-1.12:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.07:0.998:. ./.:4:107,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:80,0:.:-1.76:1.000:. ./.:4:135,33:.:-0.23:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:15,4:.:-2.82:1.000:. ./.:4:166,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:137,0:.:-0.77:1.000:. ./.:4:83,32:.:-1.15:1.000:. ./.:3:131,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:100,30:.:-0.89:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:128,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:18,8:.:-2.70:1.000:. ./.:4:69,24:.:-1.54:1.000:. ./.:3:19,0:.:-2.82:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:92,39:.:-0.87:0.979:. ./.:4:156,43:.: 0.31:1.000:. ./.:4:189,34:.: 0.73:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:123,47:.:-0.19:1.000:. ./.:4:250,2:.: 1.24:1.000:. ./.:4:208,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:140,46:.: 0.09:1.000:. ./.:4:195,55:.: 1.20:1.000:. ./.:4:147,58:.: 0.42:1.000:. ./.:5:238,48:.: 1.83:1.000:. ./.:4:243,82:.: 2.51:1.000:. ./.:4:192,43:.: 0.94:1.000:. ./.:4:175,53:.: 0.82:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:188,63:.: 1.22:1.000:. ./.:4:201,53:.: 1.27:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.42:1.000:. ./.:4:83,51:.:-0.82:1.000:. ./.:4:224,49:.: 1.60:1.000:. ./.:4:151,1:.:-0.51:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:241,1:.: 1.06:1.000:. ./.:6:178,37:.: 0.59:1.000:. ./.:4:228,61:.: 1.88:1.000:. ./.:4:146,51:.: 0.28:1.000:. ./.:4:180,59:.: 1.01:1.000:. ./.:4:126,69:.: 0.24:1.000:. ./.:4:204,0:.: 0.40:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.19:1.000:. ./.:4:162,60:.: 0.71:0.887:. ./.:4:116,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:132,63:.: 0.24:1.000:. ./.:4:129,45:.:-0.12:0.999:. ./.:4:225,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:112,54:.:-0.26:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.10:1.000:. ./.:4:174,50:.: 0.75:1.000:. ./.:4:129,49:.:-0.05:1.000:. ./.:4:294,0:.: 1.97:1.000:. ./.:4:192,59:.: 1.22:1.000:. ./.:4:225,0:.: 0.76:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.00:0.915:. ./.:4:167,56:.: 0.73:1.000:. ./.:4:123,74:.: 0.28:1.000:. ./.:4:126,46:.:-0.16:1.000:. ./.:4:256,73:.: 2.58:0.980:. ./.:4:150,72:.: 0.71:1.000:. ./.:4:133,52:.: 0.07:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:175,58:.: 0.90:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:261,1:.: 1.41:1.000:. ./.:4:170,50:.: 0.68:1.000:. ./.:4:145,71:.: 0.61:1.000:. ./.:4:131,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:176,59:.: 0.94:1.000:. ./.:4:194,50:.: 1.10:1.000:. ./.:4:198,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:236,59:.: 1.98:1.000:. ./.:4:235,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:110,44:.:-0.47:1.000:. ./.:4:209,59:.: 1.51:0.999:. ./.:4:89,65:.:-0.47:1.000:. ./.:4:100,54:.:-0.47:1.000:. ./.:4:166,50:.: 0.61:1.000:. ./.:4:83,36:.:-1.08:1.000:. ./.:4:274,0:.: 1.62:0.993:. ./.:4:191,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:158,59:.: 0.63:1.000:. ./.:4:124,28:.:-0.51:1.000:. ./.:4:160,53:.: 0.56:0.999:. ./.:4:228,53:.: 1.74:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:131,61:.: 0.19:1.000:. ./.:4:176,62:.: 0.99:1.000:. ./.:4:159,55:.: 0.57:1.000:. ./.:4:119,46:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,50:.:-0.02:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:158,44:.: 0.36:1.000:. ./.:4:203,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:156,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.69:1.000:. ./.:4:196,62:.: 1.34:1.000:. ./.:4:232,0:.: 0.89:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:111,38:.:-0.56:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:225,68:.: 1.95:1.000:. ./.:4:137,48:.: 0.07:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.00:0.998:. ./.:4:177,63:.: 1.03:1.000:. ./.:4:92,53:.:-0.63:1.000:. ./.:4:171,66:.: 0.97:1.000:. ./.:4:108,57:.:-0.28:1.000:. ./.:4:137,46:.: 0.03:1.000:. ./.:4:248,0:.: 1.17:1.000:. ./.:4:171,51:.: 0.71:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:215,67:.: 1.76:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.07:1.000:. ./.:4:184,1:.: 0.07:1.000:. ./.:4:121,51:.:-0.16:1.000:. ./.:4:83,48:.:-0.87:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.26:1.000:. ./.:4:130,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:147,49:.: 0.26:1.000:. ./.:4:111,29:.:-0.72:1.000:. ./.:4:87,27:.:-1.17:1.000:. ./.:4:43,0:.:-2.41:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:277,1:.: 1.69:1.000:. ./.:4:128,33:.:-0.35:1.000:. ./.:4:154,35:.: 0.14:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.52:1.000:. ./.:4:119,39:.:-0.40:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.28:1.000:. ./.:4:83,35:.:-1.10:1.000:. ./.:4:76,0:.:-1.83:1.000:. ./.:4:103,29:.:-0.86:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:136,44:.:-0.02:1.000:. ./.:4:112,28:.:-0.72:1.000:. ./.:4:122,43:.:-0.28:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:142,33:.:-0.11:1.000:. ./.:4:65,33:.:-1.45:1.000:. ./.:4:157,1:.:-0.40:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:158,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:107,44:.:-0.52:1.000:. ./.:4:160,50:.: 0.50:1.000:. ./.:4:86,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:70,27:.:-1.47:1.000:. ./.:4:103,40:.:-0.66:0.956:. ./.:4:104,53:.:-0.42:1.000:. ./.:4:138,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:121,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.63:1.000:. -chr8.1 83799492 chr8.1_083799492 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:108,165:0.55:-0.28:1.000:0.980 0/0/0/0:4:405,0:0.00: 0.94:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,93:0.28: 0.00:1.000:0.996 0/0/1/1:4:231,152:0.38: 0.74:1.000:0.555 0/0/0/0:4:437,0:0.00: 1.24:1.000:1.000 0/0/1/1:4:118,343:0.62: 1.46:1.000:0.553 0/0/1/1:4:107,194:0.57:-0.02:1.000:0.946 0/0/1/1:4:99,191:0.58:-0.13:1.000:0.923 0/0/0/1:4:205,88:0.27:-0.10:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,33:0.52:-2.25:1.000:0.995 0/0/1/1:4:20,57:0.62:-2.10:1.000:0.578 0/0/0/1:4:271,75:0.19: 0.39:1.000:1.000 0/0/0/1:4:214,101:0.30: 0.11:1.000:0.989 0/1/1/1:4:1,316:0.75: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/0:4:296,0:0.00:-0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,326:0.62: 1.27:1.000:0.585 0/0/1/1:4:266,213:0.43: 1.63:0.998:0.950 0/0/0/1:4:235,82:0.23: 0.12:1.000:1.000 0/0/1/1:4:145,207:0.54: 0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:280,250:0.46: 2.10:1.000:0.988 0/0/0/1:4:79,25:0.21:-1.85:1.000:1.000 0/0/0/1:4:306,92:0.21: 0.88:1.000:1.000 0/0/0/1:4:358,96:0.19: 1.40:1.000:1.000 0/0/0/1:4:363,96:0.19: 1.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,34:0.51:-2.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:236,221:0.47: 1.42:1.000:0.994 0/0/1/1:4:176,202:0.51: 0.69:1.000:0.996 0/0/0/1:4:175,76:0.28:-0.49:1.000:0.997 0/1/1:3:115,193:0.56: 0.04:1.000:0.984 0/0/0/1:4:332,106:0.22: 1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:267,229:0.45: 1.78:1.000:0.980 0/0/1/1:4:106,190:0.57:-0.07:1.000:0.949 0/0/0/1:4:31,13:0.27:-2.41:1.000:0.998 0/0/0/0:4:94,1:0.01:-1.93:1.000:1.000 0/0/1:3:7,3:0.27:-2.72:1.000:1.000 0/0/0/1:4:303,93:0.21: 0.86:1.000:1.000 0/0/1/1:4:117,181:0.55:-0.05:0.979:0.978 0/0/1/1:4:215,204:0.48: 1.07:1.000:0.994 0/0/1/1:4:226,212:0.47: 1.25:1.000:0.994 0/0/0/1:4:262,112:0.27: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:164,128:0.42:-0.11:1.000:0.931 0/0/1/1:4:160,153:0.48: 0.09:1.000:0.995 0/0/1/1:4:179,185:0.50: 0.56:1.000:0.997 0/0/0/0:4:223,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:172,78:0.29:-0.50:1.000:0.994 0/0/1/1:4:196,164:0.44: 0.52:1.000:0.972 0/0/0/0/1:5:362,94:0.18: 1.41:1.000:0.998 0/0/0/1:4:48,28:0.35:-2.11:1.000:0.813 0/0/0/0:4:207,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:126,128:0.50:-0.46:1.000:0.997 0/0/0/1:4:116,50:0.27:-1.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:210,194:0.47: 0.93:1.000:0.992 0/0/0/0:4:267,0:0.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,239:0.61: 0.25:1.000:0.679 0/0/1/1:4:92,155:0.56:-0.52:1.000:0.964 0/0/0/1:4:266,77:0.20: 0.37:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,232:0.75:-0.65:1.000:0.999 0/0/1/1:4:66,147:0.59:-0.84:1.000:0.840 0/0/0/1:4:155,76:0.30:-0.67:1.000:0.981 0/0/0/0/0/0:6:274,0:0.00:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/0:4:310,0:0.00: 0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:160,88:0.33:-0.52:1.000:0.909 0/0/0/0:4:300,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:160,158:0.49: 0.13:1.000:0.996 0/0/1/1:4:111,181:0.56:-0.11:1.000:0.971 0/0/1/1:4:79,132:0.56:-0.86:1.000:0.966 0/0/0/1:4:209,125:0.35: 0.28:1.000:0.754 0/0/1/1:4:93,149:0.56:-0.57:1.000:0.973 0/0/0/1:4:279,72:0.18: 0.44:0.887:0.999 0/0/1/1:4:72,108:0.55:-1.15:1.000:0.982 0/0/1/1:4:104,165:0.55:-0.32:1.000:0.975 0/0/0/1:4:186,86:0.29:-0.29:0.999:0.992 0/0/0/1:4:322,93:0.20: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,178:0.56:-0.19:1.000:0.963 0/0/0/1:4:145,57:0.25:-0.94:1.000:0.999 0/0/1/1:4:159,167:0.50: 0.21:1.000:0.997 0/0/0/1:4:143,71:0.31:-0.83:1.000:0.977 0/0/0/1:4:182,70:0.25:-0.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:158,72:0.29:-0.68:1.000:0.993 0/0/1/1:4:195,174:0.46: 0.61:1.000:0.988 0/0/1/1:4:68,47:0.39:-1.75:0.915:0.712 0/0/0/1:4:181,73:0.26:-0.46:1.000:0.999 0/0/0/1:4:209,73:0.23:-0.20:1.000:1.000 0/0/0/0:4:233,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:319,92:0.20: 1.00:0.980:1.000 0/0/0/1:4:201,82:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/0/1:4:144,80:0.34:-0.74:1.000:0.897 0/0/1/1:4:78,126:0.56:-0.92:1.000:0.972 0/0/0/1:4:162,62:0.25:-0.74:1.000:0.999 0/0/0/1:4:165,76:0.29:-0.58:1.000:0.992 0/0/0/1:4:176,84:0.30:-0.40:1.000:0.987 0/0/1/1:4:129,132:0.50:-0.39:1.000:0.997 0/0/1/1:4:189,198:0.50: 0.77:1.000:0.997 0/0/1/1:4:119,106:0.46:-0.73:1.000:0.988 0/0/1/1:4:211,196:0.47: 0.96:1.000:0.993 0/0/0/0:4:392,2:0.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,130:0.57:-0.92:1.000:0.955 0/0/0/1:4:135,70:0.32:-0.91:1.000:0.959 0/0/0/1:4:265,64:0.17: 0.24:1.000:0.999 0/0/0/1:4:368,94:0.18: 1.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:60,192:0.63:-0.48:1.000:0.568 0/0/1/1:4:191,154:0.43: 0.38:1.000:0.955 0/0/0/1:4:125,49:0.25:-1.20:1.000:0.999 0/0/1/1:4:161,139:0.45:-0.03:0.999:0.982 0/0/0/1:4:136,66:0.30:-0.94:1.000:0.984 0/0/1/1:4:97,154:0.55:-0.49:1.000:0.975 0/0/0/1:4:154,68:0.28:-0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:107,186:0.57:-0.10:1.000:0.957 0/0/1/1:4:257,203:0.43: 1.45:0.993:0.940 0/0/1/1:4:77,167:0.59:-0.55:1.000:0.859 0/0/1/1:4:170,116:0.39:-0.16:1.000:0.674 0/0/0/1:4:429,133:0.21: 2.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:176,126:0.40:-0.01:0.999:0.802 0/0/0/0:4:285,0:0.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:3,159:0.74:-1.31:1.000:0.999 0/0/1/1:4:89,160:0.57:-0.51:1.000:0.948 0/0/0/1:4:160,75:0.29:-0.64:1.000:0.990 0/0/0/0:4:206,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,147:0.56:-0.61:1.000:0.972 0/0/0/1:4:116,71:0.36:-1.08:1.000:0.689 0/0/1/1:4:92,215:0.60: 0.03:1.000:0.800 0/0/0/1:4:126,58:0.29:-1.11:1.000:0.992 0/1/1/1:4:1,264:0.75:-0.36:1.000:0.999 0/0/0/1:4:215,78:0.24:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:211,63:0.21:-0.27:1.000:1.000 0/0/0/1:4:227,76:0.22:-0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:174,74:0.27:-0.52:1.000:0.998 0/0/0/0:4:165,0:0.00:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:146,53:0.24:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,167:0.75:-1.25:1.000:0.999 0/0/0/0:4:297,0:0.00:-0.06:1.000:1.000 0/0/0/1:4:349,106:0.21: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:121,102:0.45:-0.75:0.998:0.975 0/0/0/0:4:311,0:0.00: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:161,137:0.45:-0.05:1.000:0.978 0/0/0/1:4:501,131:0.19: 3.05:1.000:0.999 0/0/1/1:4:91,151:0.56:-0.57:1.000:0.967 0/0/1/1:4:147,111:0.42:-0.42:1.000:0.894 0/0/0/1:4:128,55:0.27:-1.12:1.000:0.997 0/0/0/0:4:193,0:0.00:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:96,164:0.56:-0.40:1.000:0.961 0/0/0/0:4:217,0:0.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:199,175:0.46: 0.65:1.000:0.986 0/0/1/1:4:72,133:0.57:-0.91:1.000:0.940 0/0/0/1:4:251,111:0.28: 0.54:1.000:0.996 0/0/1/1:4:238,175:0.41: 1.02:1.000:0.854 0/0/1/1:4:124,184:0.55: 0.04:1.000:0.983 0/0/0/1:4:288,77:0.19: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,344:0.75: 0.38:1.000:0.999 0/0/0/1:4:273,66:0.17: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:262,215:0.44: 1.61:1.000:0.964 0/0/1/1:4:213,191:0.46: 0.93:1.000:0.989 0/1/1/1:4:11,37:0.63:-2.37:1.000:0.627 0/0/0/1:4:176,67:0.25:-0.56:1.000:0.999 0/0/1/1:4:245,227:0.47: 1.56:1.000:0.993 0/0/0/0:4:389,0:0.00: 0.79:1.000:1.000 0/0/0/1:4:375,132:0.23: 1.89:1.000:1.000 0/0/0/1:4:366,118:0.22: 1.67:1.000:1.000 0/0/0/0:4:252,0:0.00:-0.48:1.000:1.000 0/0/1/1:4:221,201:0.47: 1.10:1.000:0.991 0/0/1/1:4:199,203:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:73,137:0.57:-0.87:1.000:0.934 0/0/0/1:4:201,103:0.32: 0.00:1.000:0.965 0/0/1/1:4:104,267:0.61: 0.63:1.000:0.705 0/0/1/1:4:206,202:0.49: 0.97:1.000:0.996 0/0/1/1:4:238,187:0.43: 1.13:1.000:0.936 0/0/1/1:4:204,196:0.48: 0.89:1.000:0.995 0/0/0/0:4:216,0:0.00:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:108,240:0.59: 0.41:1.000:0.842 0/0/0/0:4:444,0:0.00: 1.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:157,158:0.49: 0.11:1.000:0.997 0/0/0/1:4:319,90:0.20: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,72:0.29:-0.72:1.000:0.990 0/0/1/1:4:153,150:0.49:-0.01:1.000:0.996 0/0/0/0:4:280,0:0.00:-0.22:1.000:1.000 0/0/0/1:4:245,76:0.21: 0.16:1.000:1.000 0/0/1/1:4:320,301:0.48: 2.94:1.000:0.994 0/0/0/1:4:400,107:0.19: 1.89:1.000:1.000 0/1/1/1:4:1,318:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:163,60:0.24:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:223,98:0.28: 0.16:0.956:0.996 0/0/1/1:4:151,229:0.55: 0.71:1.000:0.981 0/0/0/1:4:237,106:0.28: 0.37:1.000:0.995 0/0/1/1:4:111,260:0.60: 0.63:1.000:0.798 0/0/0/1:4:188,82:0.28:-0.31:1.000:0.996 -chr8.1 83983804 chr8.1_083983804 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:34,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.54:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:0.998:. ./.:4:28,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:3:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:3:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:0.979:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.07:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:15,2:.: 0.05:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:31,0:.: 1.75:1.000:. ./.:4:21,2:.: 0.78:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.53:1.000:. ./.:5:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:32,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:6:28,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:37,0:.: 2.49:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:40,0:.: 2.85:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:25,2:.: 1.27:0.887:. ./.:4:15,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:24,1:.: 1.02:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.68:0.999:. ./.:4:35,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:1.000:. ./.:4:41,0:.: 2.97:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.02:0.915:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:38,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:24,0:.: 0.90:0.980:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.39:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:17,0:.: 0.05:0.999:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.20:0.993:. ./.:4:12,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:0.999:. ./.:4:32,0:.: 1.88:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:35,0:.: 2.24:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:1,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:15,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:3,0:.:-1.66:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.54:0.998:. ./.:4:13,2:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:26,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:27,0:.: 1.27:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.54:1.000:. ./.:4:10,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:30,0:.: 1.63:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:21,0:.: 0.53:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:22,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:9,0:.:-0.93:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:12,0:.:-0.56:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:29,0:.: 1.51:1.000:. ./.:4:11,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.32:1.000:. ./.:4:25,0:.: 1.02:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.44:1.000:. ./.:4:20,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.29:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:23,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:7,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:28,0:.: 1.39:0.956:. ./.:4:18,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:23,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:8,0:.:-1.05:1.000:. ./.:4:19,0:.: 0.29:1.000:. -chr8.1 84174416 chr8.1_084174416 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:40,183:.:-0.24:1.000:. ./.:4:74,131:.:-0.59:1.000:. ./.:4:39,195:.:-0.02:1.000:. ./.:4:54,235:.: 1.07:1.000:. ./.:4:98,157:.: 0.40:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.14:1.000:. ./.:4:40,108:.:-1.72:1.000:. ./.:4:44,187:.:-0.08:1.000:. ./.:4:76,139:.:-0.40:1.000:. ./.:4:26,100:.:-2.16:1.000:. ./.:4:52,99:.:-1.66:1.000:. ./.:4:107,156:.: 0.55:1.000:. ./.:4:85,151:.: 0.02:1.000:. ./.:4:40,206:.: 0.22:1.000:. ./.:4:127,114:.: 0.12:1.000:. ./.:4:0,205:.:-0.59:1.000:. ./.:4:53,181:.:-0.02:0.998:. ./.:4:146,135:.: 0.91:1.000:. ./.:4:60,253:.: 1.54:1.000:. ./.:4:46,233:.: 0.87:1.000:. ./.:4:38,89:.:-2.14:1.000:. ./.:4:89,174:.: 0.55:1.000:. ./.:4:58,205:.: 0.55:1.000:. ./.:4:38,166:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,37:.:-3.34:1.000:. ./.:4:0,233:.:-0.04:1.000:. ./.:4:46,207:.: 0.36:1.000:. ./.:4:76,127:.:-0.63:1.000:. ./.:3:43,174:.:-0.36:1.000:. ./.:4:40,169:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,255:.: 0.40:1.000:. ./.:4:35,172:.:-0.55:1.000:. ./.:4:44,38:.:-3.03:1.000:. ./.:4:62,62:.:-2.20:1.000:. ./.:3:2,46:.:-3.70:1.000:. ./.:4:47,172:.:-0.32:1.000:. ./.:4:108,174:.: 0.93:0.979:. ./.:4:42,183:.:-0.20:1.000:. ./.:4:34,205:.: 0.08:1.000:. ./.:4:47,163:.:-0.49:1.000:. ./.:4:109,160:.: 0.67:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.71:1.000:. ./.:4:61,228:.: 1.07:1.000:. ./.:4:137,125:.: 0.53:1.000:. ./.:4:78,151:.:-0.12:1.000:. ./.:4:101,200:.: 1.30:1.000:. ./.:5:108,244:.: 2.31:1.000:. ./.:4:41,90:.:-2.06:1.000:. ./.:4:89,169:.: 0.45:1.000:. ./.:4:129,147:.: 0.81:1.000:. ./.:4:90,109:.:-0.71:1.000:. ./.:4:78,230:.: 1.44:1.000:. ./.:4:91,114:.:-0.59:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.73:1.000:. ./.:4:71,153:.:-0.22:1.000:. ./.:4:64,239:.: 1.34:1.000:. ./.:4:46,197:.: 0.16:1.000:. ./.:4:67,237:.: 1.36:1.000:. ./.:4:36,184:.:-0.30:1.000:. ./.:6:118,119:.: 0.04:1.000:. ./.:4:161,147:.: 1.44:1.000:. ./.:4:115,168:.: 0.95:1.000:. ./.:4:173,116:.: 1.07:1.000:. ./.:4:102,166:.: 0.65:1.000:. ./.:4:64,263:.: 1.82:1.000:. ./.:4:49,196:.: 0.20:1.000:. ./.:4:20,113:.:-2.02:1.000:. ./.:4:46,203:.: 0.28:1.000:. ./.:4:101,179:.: 0.89:0.887:. ./.:4:77,135:.:-0.46:1.000:. ./.:4:123,196:.: 1.66:1.000:. ./.:4:90,104:.:-0.81:0.999:. ./.:4:131,200:.: 1.90:1.000:. ./.:4:99,183:.: 0.93:1.000:. ./.:4:96,169:.: 0.59:1.000:. ./.:4:51,147:.:-0.73:1.000:. ./.:4:162,135:.: 1.23:1.000:. ./.:4:50,205:.: 0.40:1.000:. ./.:4:87,170:.: 0.43:1.000:. ./.:4:33,191:.:-0.22:1.000:. ./.:4:129,112:.: 0.12:0.915:. ./.:4:115,150:.: 0.59:1.000:. ./.:4:150,162:.: 1.52:1.000:. ./.:4:111,82:.:-0.83:1.000:. ./.:4:52,200:.: 0.34:0.980:. ./.:4:140,156:.: 1.21:1.000:. ./.:4:90,112:.:-0.65:1.000:. ./.:4:32,176:.:-0.53:1.000:. ./.:4:87,166:.: 0.36:1.000:. ./.:4:103,133:.: 0.02:1.000:. ./.:4:44,158:.:-0.65:1.000:. ./.:4:37,175:.:-0.46:1.000:. ./.:4:109,185:.: 1.17:1.000:. ./.:4:37,155:.:-0.85:1.000:. ./.:4:48,227:.: 0.79:1.000:. ./.:4:103,160:.: 0.55:1.000:. ./.:4:40,172:.:-0.46:1.000:. ./.:4:39,137:.:-1.17:1.000:. ./.:4:42,188:.:-0.10:1.000:. ./.:4:45,179:.:-0.22:1.000:. ./.:4:0,198:.:-0.73:1.000:. ./.:4:54,228:.: 0.93:1.000:. ./.:4:59,93:.:-1.64:1.000:. ./.:4:35,223:.: 0.45:0.999:. ./.:4:122,112:.:-0.02:1.000:. ./.:4:107,151:.: 0.45:1.000:. ./.:4:90,163:.: 0.36:1.000:. ./.:4:70,155:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,272:.: 0.73:0.993:. ./.:4:36,184:.:-0.30:1.000:. ./.:4:48,218:.: 0.61:1.000:. ./.:4:105,196:.: 1.30:1.000:. ./.:4:38,201:.: 0.08:0.999:. ./.:4:112,169:.: 0.91:1.000:. ./.:4:43,172:.:-0.40:1.000:. ./.:4:109,182:.: 1.11:1.000:. ./.:4:74,129:.:-0.63:1.000:. ./.:4:151,115:.: 0.61:1.000:. ./.:4:93,165:.: 0.45:1.000:. ./.:4:95,134:.:-0.12:1.000:. ./.:4:56,182:.: 0.06:1.000:. ./.:4:90,158:.: 0.26:1.000:. ./.:4:55,242:.: 1.23:1.000:. ./.:4:47,175:.:-0.26:1.000:. ./.:4:48,169:.:-0.36:1.000:. ./.:4:110,167:.: 0.83:1.000:. ./.:4:32,151:.:-1.03:1.000:. ./.:4:122,118:.: 0.10:1.000:. ./.:4:109,81:.:-0.89:1.000:. ./.:4:37,142:.:-1.11:1.000:. ./.:4:103,142:.: 0.20:1.000:. ./.:4:32,157:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,116:.:-2.35:0.998:. ./.:4:101,140:.: 0.12:1.000:. ./.:4:85,139:.:-0.22:1.000:. ./.:4:109,182:.: 1.11:1.000:. ./.:4:111,203:.: 1.56:1.000:. ./.:4:29,154:.:-1.03:1.000:. ./.:4:35,170:.:-0.59:1.000:. ./.:4:111,117:.:-0.14:1.000:. ./.:4:64,215:.: 0.87:1.000:. ./.:4:119,126:.: 0.20:1.000:. ./.:4:43,159:.:-0.65:1.000:. ./.:4:33,126:.:-1.50:1.000:. ./.:4:114,200:.: 1.56:1.000:. ./.:4:110,215:.: 1.78:1.000:. ./.:4:87,175:.: 0.53:1.000:. ./.:4:40,182:.:-0.26:1.000:. ./.:4:49,215:.: 0.57:1.000:. ./.:4:93,144:.: 0.04:1.000:. ./.:4:40,223:.: 0.55:1.000:. ./.:4:33,197:.:-0.10:1.000:. ./.:4:32,93:.:-2.18:1.000:. ./.:4:27,124:.:-1.66:1.000:. ./.:4:0,262:.: 0.53:1.000:. ./.:4:131,152:.: 0.95:1.000:. ./.:4:56,209:.: 0.59:1.000:. ./.:4:41,175:.:-0.38:1.000:. ./.:4:121,110:.:-0.08:1.000:. ./.:4:0,222:.:-0.26:1.000:. ./.:4:42,146:.:-0.93:1.000:. ./.:4:77,138:.:-0.40:1.000:. ./.:4:85,133:.:-0.34:1.000:. ./.:4:0,269:.: 0.67:1.000:. ./.:4:45,235:.: 0.89:1.000:. ./.:4:41,175:.:-0.38:1.000:. ./.:4:35,144:.:-1.11:1.000:. ./.:4:59,125:.:-1.01:1.000:. ./.:4:37,213:.: 0.30:1.000:. ./.:4:80,141:.:-0.28:1.000:. ./.:4:65,137:.:-0.65:1.000:. ./.:4:28,120:.:-1.72:1.000:. ./.:4:49,178:.:-0.16:1.000:. ./.:4:43,171:.:-0.42:1.000:. ./.:4:140,114:.: 0.38:1.000:. ./.:4:28,154:.:-1.05:1.000:. ./.:4:33,205:.: 0.06:1.000:. ./.:4:96,141:.: 0.04:1.000:. ./.:4:52,184:.: 0.02:1.000:. ./.:4:95,129:.:-0.22:1.000:. ./.:4:94,119:.:-0.44:0.956:. ./.:4:131,187:.: 1.64:1.000:. ./.:4:108,212:.: 1.68:1.000:. ./.:4:0,206:.:-0.57:1.000:. ./.:4:107,167:.: 0.77:1.000:. -chr8.1 84295900 chr8.1_084295900 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:53,56:0.51: 0.18:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,44:0.50:-0.54:1.000:0.997 0/0/0/1:4:69,29:0.33:-0.18:1.000:0.930 0/1/1/1:4:17,67:0.79:-0.64:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,45:0.45:-0.08:1.000:0.981 0/1/1/1:4:34,97:0.73: 0.90:1.000:0.997 0/1/1/1:4:24,77:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:45,46:0.50:-0.41:1.000:0.997 0/0/1/1:4:48,44:0.48:-0.38:1.000:0.994 0/0/0/1:4:8,4:0.36:-3.00:1.000:0.705 0/0/0/1:4:24,9:0.31:-2.31:1.000:0.975 0/0/1/1:4:48,66:0.57: 0.35:1.000:0.941 0/0/1/1:4:36,41:0.53:-0.87:1.000:0.993 0/1/1/1:4:24,80:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,45:0.44: 0.02:1.000:0.968 0/1/1/1:4:25,56:0.68:-0.74:1.000:0.956 0/1/1/1:4:32,94:0.73: 0.74:0.998:0.998 0/1/1/1:4:25,91:0.77: 0.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,66:0.57: 0.35:1.000:0.941 0/1/1/1:4:25,72:0.73:-0.21:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,13:0.45:-2.45:1.000:0.983 0/1/1/1:4:25,85:0.76: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,38:0.54:-1.13:1.000:0.985 0/0/1/1:4:52,52:0.50: 0.02:1.000:0.997 1/1/1/1:4:2,22:0.91:-2.61:1.000:0.961 0/0/1/1:4:68,108:0.61: 2.38:1.000:0.739 0/1/1/1:4:11,56:0.83:-1.20:1.000:0.998 0/0/1/1:4:38,49:0.56:-0.54:1.000:0.972 1/1/1:3:0,69:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,53:0.52:-0.08:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,76:0.46: 2.12:1.000:0.985 0/0/1/1:4:45,54:0.54:-0.15:1.000:0.988 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-2.91:1.000:1.000 0/0/0/1:4:27,5:0.19:-2.35:1.000:1.000 1/1/1:3:0,7:1.00:-3.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:38,50:0.56:-0.51:1.000:0.965 0/1/1/1:4:35,78:0.68: 0.31:0.979:0.954 0/1/1/1:4:16,63:0.79:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,115:0.76: 1.49:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,31:0.29: 0.58:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,137:1.00: 1.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,71:0.54: 0.87:1.000:0.988 0/1/1/1:4:26,145:0.84: 2.22:1.000:0.995 0/0/1/1:4:68,53:0.44: 0.58:1.000:0.974 0/0/1/1:4:75,73:0.49: 1.46:1.000:0.996 1/1/1/1:4:0,128:1.00: 0.80:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:88,43:0.35: 0.90:1.000:0.917 1/1/1/1:4:0,21:1.00:-2.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,17:0.17: 0.77:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,56:0.49: 0.38:1.000:0.996 0/1/1/1:4:44,127:0.73: 2.22:1.000:0.998 0/0/0/1:4:68,29:0.33:-0.21:1.000:0.920 0/1/1/1:4:28,102:0.77: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:22,64:0.73:-0.57:1.000:0.998 0/0/1/1:4:69,64:0.48: 0.97:1.000:0.995 0/1/1/1:4:20,89:0.81: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,60:0.44: 1.13:1.000:0.971 0/0/0/1:4:93,37:0.32: 0.87:1.000:0.957 0/1/1/1/1/1:6:19,70:0.78:-0.48:1.000:0.779 0/1/1/1:4:30,86:0.73: 0.41:1.000:0.998 0/0/1/1:4:60,67:0.52: 0.77:1.000:0.994 0/0/1/1:4:65,75:0.53: 1.20:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,134:1.00: 1.00:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,51:0.50:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:65,79:0.54: 1.33:1.000:0.986 0/1/1/1:4:24,69:0.73:-0.34:1.000:0.998 0/0/1/1:4:57,52:0.48: 0.18:1.000:0.994 0/1/1/1:4:33,108:0.75: 1.23:0.887:0.999 0/1/1/1:4:29,60:0.66:-0.48:1.000:0.894 0/1/1/1:4:37,104:0.73: 1.23:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,45:0.46:-0.15:0.999:0.987 0/1/1/1:4:37,140:0.78: 2.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,77:0.75:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:86,87:0.50: 2.28:1.000:0.997 0/1/1/1:4:35,106:0.74: 1.23:1.000:0.999 0/1/1/1:4:53,107:0.66: 1.86:1.000:0.863 0/0/0/1:4:67,34:0.36:-0.08:1.000:0.673 0/0/1/1:4:59,63:0.51: 0.61:1.000:0.996 0/1/1/1:4:28,111:0.79: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,64:0.59: 0.15:0.915:0.891 0/0/1/1:4:73,86:0.53: 1.82:1.000:0.990 0/1/1/1:4:39,112:0.73: 1.56:1.000:0.998 0/0/1/1:4:48,48:0.50:-0.25:1.000:0.997 0/0/1/1:4:49,63:0.56: 0.28:0.980:0.973 0/1/1/1:4:27,81:0.74: 0.15:1.000:0.999 0/0/1/1:4:42,57:0.57:-0.15:1.000:0.950 0/0/1/1:4:74,56:0.44: 0.87:1.000:0.965 0/0/1/1:4:58,59:0.50: 0.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,70:0.57: 0.61:1.000:0.954 0/0/0/1:4:68,25:0.31:-0.34:1.000:0.980 0/1/1/1:4:32,77:0.70: 0.18:1.000:0.981 1/1/1/1:4:0,131:1.00: 0.90:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,58:0.80:-1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,79:0.72: 0.15:1.000:0.996 0/0/1/1:4:59,73:0.55: 0.94:1.000:0.983 0/0/1/1:4:55,59:0.51: 0.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:84,31:0.31: 0.38:1.000:0.979 0/0/1/1:4:64,42:0.41: 0.08:1.000:0.867 0/0/1/1:4:48,56:0.53: 0.02:1.000:0.991 0/1/1/1:4:26,70:0.72:-0.25:1.000:0.995 0/1/1/1:4:39,88:0.68: 0.77:1.000:0.960 0/0/1/1:4:37,42:0.53:-0.80:1.000:0.993 0/1/1/1:4:27,73:0.72:-0.11:0.999:0.995 0/1/1/1:4:20,84:0.80: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,91:0.72: 0.67:1.000:0.996 0/0/1/1:4:50,56:0.52: 0.08:1.000:0.994 0/1/1/1:4:16,56:0.77:-1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,49:0.44: 0.28:0.993:0.974 0/0/1/1:4:51,70:0.57: 0.58:1.000:0.943 0/1/1/1:4:27,93:0.76: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,126:0.80: 1.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,87:0.83: 0.02:0.999:0.998 0/0/0/1:4:104,29:0.26: 0.97:1.000:0.998 0/1/1/1:4:23,53:0.69:-0.90:1.000:0.968 0/1/1/1:4:29,99:0.76: 0.80:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,43:0.50:-0.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:51,58:0.53: 0.18:1.000:0.993 0/1/1/1:4:34,73:0.67: 0.12:1.000:0.929 0/0/1/1:4:46,46:0.50:-0.38:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,110:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,44:0.40: 0.38:1.000:0.784 0/1/1/1:4:24,95:0.79: 0.51:1.000:1.000 0/0/0/1:4:51,23:0.34:-0.97:1.000:0.869 0/0/1/1:4:55,58:0.51: 0.31:1.000:0.996 0/1/1/1:4:18,92:0.83: 0.21:1.000:0.998 0/0/0/1:4:84,23:0.26: 0.12:1.000:0.999 0/0/0/1:4:99,25:0.25: 0.67:1.000:0.999 0/1/1/1:4:32,63:0.65:-0.28:1.000:0.824 0/1/1/1:4:29,70:0.70:-0.15:1.000:0.982 0/0/1/1:4:61,45:0.43: 0.08:1.000:0.955 0/0/1/1:4:28,36:0.56:-1.30:1.000:0.973 0/0/1/1:4:30,37:0.55:-1.20:0.998:0.983 0/0/1/1:4:57,57:0.50: 0.35:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-0.41:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,71:0.70:-0.11:1.000:0.984 0/1/1/1:4:25,102:0.79: 0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:23,85:0.78: 0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:90,28:0.28: 0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:69,44:0.40: 0.31:1.000:0.829 0/0/1/1:4:68,63:0.48: 0.90:1.000:0.995 0/0/1/1:4:54,60:0.52: 0.35:1.000:0.995 0/1/1/1:4:23,87:0.78: 0.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:39,42:0.51:-0.74:1.000:0.996 0/0/1/1:4:56,46:0.46:-0.05:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,129:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,62:0.84:-1.00:1.000:0.995 0/0/1/1:4:53,59:0.52: 0.28:1.000:0.995 0/1/1/1:4:27,64:0.69:-0.41:1.000:0.977 0/1/1/1:4:23,78:0.76:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:14,64:0.81:-0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:17,57:0.76:-0.97:1.000:1.000 0/0/0/0:4:33,3:0.10:-2.22:1.000:0.719 0/0/0/1:4:37,17:0.34:-1.62:1.000:0.847 0/0/1/1:4:74,80:0.51: 1.66:1.000:0.996 0/0/1/1:4:43,46:0.51:-0.48:1.000:0.996 0/0/1/1:4:47,41:0.47:-0.51:1.000:0.991 0/0/1/1:4:42,52:0.55:-0.31:1.000:0.983 0/0/1/1:4:44,38:0.47:-0.71:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,57:0.57:-0.18:1.000:0.934 0/1/1/1:4:15,50:0.76:-1.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:26,71:0.72:-0.21:1.000:0.996 0/0/1/1:4:37,48:0.56:-0.61:1.000:0.970 0/1/1/1:4:31,67:0.67:-0.18:1.000:0.934 0/1/1/1:4:15,59:0.79:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,71:0.82:-0.57:1.000:0.999 0/1/1/1:4:21,65:0.74:-0.57:1.000:0.999 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.07:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:25,35:0.58:-1.43:1.000:0.928 1/1/1/1:4:0,65:1.00:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,41:0.44:-0.31:1.000:0.972 0/0/0/1:4:72,30:0.33:-0.05:1.000:0.935 0/1/1/1:4:20,51:0.71:-1.07:1.000:0.990 0/0/1/1:4:52,44:0.46:-0.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:40,40:0.50:-0.77:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,82:0.71: 0.31:1.000:0.994 0/1/1/1:4:24,96:0.79: 0.54:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,67:0.70:-0.31:1.000:0.987 0/0/1/1:4:29,48:0.62:-0.87:1.000:0.632 0/1/1/1:4:31,75:0.70: 0.08:0.956:0.982 0/1/1/1:4:34,77:0.68: 0.25:1.000:0.961 0/0/1/1:4:40,48:0.54:-0.51:1.000:0.988 0/1/1/1:4:19,56:0.73:-0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:46,64:0.57: 0.21:1.000:0.933 -chr8.1 84465640 chr8.1_084465640 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:108,0:.:-0.46:1.000:. ./.:4:139,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.74:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:100,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:219,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:82,0:.:-0.87:1.000:. ./.:4:243,0:.: 1.68:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:94,0:.:-0.68:0.998:. ./.:4:287,0:.: 2.37:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:112,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.90:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:103,0:.:-0.54:1.000:. ./.:4:154,0:.: 0.27:1.000:. ./.:3:97,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.89:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:79,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:61,0:.:-1.20:1.000:. ./.:4:109,0:.:-0.44:1.000:. ./.:3:23,0:.:-1.81:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.20:0.979:. ./.:4:84,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:143,0:.: 0.09:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:100,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.92:1.000:. ./.:4:201,0:.: 1.01:1.000:. ./.:4:175,0:.: 0.60:1.000:. ./.:5:219,0:.: 1.30:1.000:. ./.:4:136,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.27:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.73:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.63:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:159,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:96,0:.:-0.65:1.000:. ./.:4:75,0:.:-0.98:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.01:1.000:. ./.:6:224,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:290,0:.: 2.42:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:302,0:.: 2.61:1.000:. ./.:4:159,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:94,0:.:-0.68:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:60,0:.:-1.22:1.000:. ./.:4:77,0:.:-0.95:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.14:0.887:. ./.:4:153,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:223,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.12:0.999:. ./.:4:131,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:157,0:.: 0.31:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:271,0:.: 2.12:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:184,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:185,0:.: 0.76:0.915:. ./.:4:173,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:299,0:.: 2.56:1.000:. ./.:4:250,1:.: 1.80:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.11:0.980:. ./.:4:282,0:.: 2.29:1.000:. ./.:4:132,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:146,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:206,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:53,0:.:-1.33:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:199,0:.: 0.98:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.76:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:87,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:114,0:.:-0.37:0.999:. ./.:4:215,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:142,0:.: 0.08:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:88,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.95:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:171,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:196,1:.: 0.95:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.69:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:176,0:.: 0.62:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:165,0:.: 0.44:1.000:. ./.:4:98,0:.:-0.62:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:95,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:193,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:87,0:.:-0.79:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:200,0:.: 1.00:1.000:. ./.:4:66,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.77:1.000:. ./.:4:88,0:.:-0.78:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:187,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:145,0:.: 0.12:1.000:. ./.:4:216,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:253,0:.: 1.83:1.000:. ./.:4:86,0:.:-0.81:1.000:. ./.:4:249,0:.: 1.77:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:93,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:207,0:.: 1.11:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.84:1.000:. ./.:4:166,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:80,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:92,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:90,0:.:-0.75:1.000:. ./.:4:85,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:49,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:59,0:.:-1.24:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:286,0:.: 2.36:1.000:. ./.:4:110,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:83,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:255,0:.: 1.87:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:85,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.20:1.000:. ./.:4:126,0:.:-0.18:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:83,0:.:-0.86:1.000:. ./.:4:79,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:73,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:167,0:.: 0.47:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:65,0:.:-1.14:1.000:. ./.:4:69,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:67,0:.:-1.11:1.000:. ./.:4:220,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:76,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:113,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:173,0:.: 0.57:1.000:. ./.:4:81,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:215,0:.: 1.23:1.000:. ./.:4:294,0:.: 2.48:0.956:. ./.:4:213,0:.: 1.20:1.000:. ./.:4:204,0:.: 1.06:1.000:. ./:.:.,.:.:.:.:. ./.:4:170,0:.: 0.52:1.000:. -chr8.1 84497947 chr8.1_084497947 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:43,91:0.64: 0.41:1.000:0.741 0/0/0/0:4:166,0:0.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:93,46:0.31: 0.51:1.000:0.965 0/0/1/1:4:83,90:0.51: 1.17:1.000:0.996 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 0.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,187:0.72: 2.54:1.000:0.995 0/1/1/1:4:30,81:0.69:-0.03:1.000:0.968 0/0/1/1:4:52,88:0.60: 0.53:1.000:0.767 0/0/1/1:4:84,56:0.39: 0.53:1.000:0.671 1/1/1/1:4:0,12:1.00:-1.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,29:0.75:-1.48:1.000:0.999 0/0/0/1:4:133,44:0.23: 1.24:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,34:0.25: 0.26:1.000:0.999 1/1/1/1:4:2,129:0.98: 0.35:1.000:1.000 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,182:0.73: 2.31:1.000:0.998 0/0/1/1:4:91,88:0.49: 1.28:0.998:0.996 0/0/0/1:4:78,41:0.33: 0.12:1.000:0.924 0/1/1/1:4:55,124:0.66: 1.28:1.000:0.842 0/0/1/1:4:103,96:0.48: 1.67:1.000:0.994 0/0/0/1:4:20,11:0.34:-1.58:1.000:0.868 0/0/0/1:4:96,49:0.32: 0.63:1.000:0.948 0/0/0/1:4:131,44:0.23: 1.21:1.000:1.000 0/0/0/1:4:110,49:0.29: 0.90:1.000:0.991 0/1/1/1:4:4,10:0.67:-1.91:1.000:0.936 0/0/1/1:4:96,98:0.50: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,124:0.55: 2.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:87,40:0.30: 0.28:1.000:0.987 0/1/1:3:48,78:0.59: 0.26:1.000:0.998 0/0/0/1:4:153,73:0.31: 2.19:1.000:0.978 0/0/1/1:4:98,108:0.52: 1.80:1.000:0.996 0/1/1/1:4:50,111:0.65: 0.93:1.000:0.821 0/0/1/1:4:9,8:0.46:-1.85:1.000:0.989 0/0/0/0:4:23,0:0.00:-1.73:1.000:1.000 0/0/0:3:8,0:0.00:-2.02:1.000:1.000 0/0/0/1:4:131,41:0.22: 1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,85:0.71:-0.01:0.979:0.992 0/0/1/1:4:81,83:0.50: 0.99:1.000:0.997 0/0/1/1:4:68,61:0.47: 0.32:1.000:0.991 0/0/0/1:4:86,42:0.31: 0.30:1.000:0.971 0/0/1/1:4:62,46:0.42:-0.09:1.000:0.895 0/0/1/1:4:50,66:0.55: 0.06:1.000:0.977 0/0/1/1:4:67,61:0.47: 0.30:1.000:0.992 0/0/0/0:4:62,0:0.00:-0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:45,24:0.33:-0.84:1.000:0.909 0/0/1/1:4:52,55:0.51:-0.11:1.000:0.996 0/0/0/0/1:5:123,29:0.18: 0.76:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,66:0.58:-0.07:1.000:0.899 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,44:0.49:-0.48:1.000:0.997 0/0/0/1:4:39,20:0.32:-1.04:1.000:0.944 0/0/1/1:4:88,75:0.45: 0.97:1.000:0.982 0/0/0/0:4:67,0:0.00:-0.88:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,96:0.75: 0.14:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,76:0.62: 0.06:1.000:0.505 0/0/0/1:4:87,25:0.21:-0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,78:0.98:-0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,51:0.69:-0.83:1.000:0.967 0/0/0/1:4:47,28:0.36:-0.73:1.000:0.690 0/0/0/0/0/0:6:58,0:0.00:-1.06:1.000:1.000 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/0/1:4:54,31:0.35:-0.54:1.000:0.786 0/0/0/0:4:76,0:0.00:-0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,49:0.50:-0.30:1.000:0.997 0/1/1/1:4:19,63:0.72:-0.59:1.000:0.995 0/1/1/1:4:25,68:0.69:-0.38:1.000:0.970 0/0/1/1:4:28,40:0.57:-0.86:1.000:0.949 0/1/1/1:4:25,58:0.66:-0.57:1.000:0.876 0/0/0/1:4:68,29:0.28:-0.30:0.887:0.995 0/1/1/1:4:39,77:0.63: 0.06:1.000:0.590 0/1/1/1:4:17,64:0.74:-0.61:1.000:0.998 0/0/0/1:4:33,20:0.36:-1.15:0.999:0.638 0/0/0/1:4:95,38:0.27: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:35,73:0.64:-0.09:1.000:0.713 0/0/1/1:4:45,29:0.38:-0.75:1.000:0.564 0/0/1/1:4:43,60:0.56:-0.19:1.000:0.959 0/0/1/1:4:47,30:0.38:-0.69:1.000:0.533 0/0/0/1:4:50,19:0.26:-0.84:1.000:0.999 0/0/1/1:4:43,36:0.45:-0.65:1.000:0.977 0/0/1/1:4:57,54:0.48:-0.03:1.000:0.995 0/0/1/1:4:25,17:0.39:-1.37:0.915:0.727 0/0/0/1:4:58,33:0.35:-0.42:1.000:0.805 0/0/1/1:4:48,33:0.40:-0.61:1.000:0.755 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,24:0.27:-0.57:0.980:0.998 0/0/1/1:4:50,35:0.40:-0.54:1.000:0.797 0/0/1/1:4:36,30:0.45:-0.90:1.000:0.976 0/1/1/1:4:21,42:0.63:-0.96:1.000:0.620 0/0/0/1:4:39,14:0.24:-1.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:59,35:0.36:-0.36:1.000:0.702 0/0/1/1:4:39,28:0.41:-0.88:1.000:0.847 0/0/1/1:4:46,46:0.49:-0.40:1.000:0.997 0/0/1/1:4:62,65:0.51: 0.28:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,57:0.49: 0.06:1.000:0.996 0/0/1/1:4:48,57:0.53:-0.15:1.000:0.992 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,38:0.68:-1.15:1.000:0.943 0/0/1/1:4:39,27:0.40:-0.90:1.000:0.772 0/0/0/1:4:66,23:0.24:-0.46:1.000:1.000 0/0/0/1:4:102,27:0.19: 0.32:1.000:1.000 0/1/1/1:4:21,59:0.69:-0.63:1.000:0.978 0/0/1/1:4:58,60:0.50: 0.10:1.000:0.997 0/0/0/1:4:35,18:0.32:-1.15:1.000:0.942 0/0/1/1:4:38,47:0.54:-0.54:0.999:0.988 0/0/0/1:4:29,12:0.27:-1.39:1.000:0.997 0/1/1/1:4:22,58:0.68:-0.63:1.000:0.961 0/0/1/1:4:37,29:0.43:-0.90:1.000:0.947 0/0/1/1:4:44,78:0.61: 0.18:1.000:0.672 0/0/1/1:4:83,74:0.46: 0.86:0.993:0.990 0/0/1/1:4:39,67:0.61:-0.13:1.000:0.738 0/0/1/1:4:40,39:0.49:-0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:155,65:0.28: 2.08:1.000:0.996 0/0/1/1:4:33,49:0.58:-0.59:0.999:0.926 0/0/0/0:4:66,0:0.00:-0.90:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,54:1.00:-1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,42:0.62:-0.92:1.000:0.604 0/0/0/1:4:49,29:0.36:-0.67:1.000:0.708 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-0.69:1.000:1.000 0/0/1/1:4:23,38:0.60:-1.00:1.000:0.807 0/0/0/1:4:40,21:0.33:-1.00:1.000:0.925 0/1/1/1:4:19,86:0.77:-0.15:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,15:0.30:-1.25:1.000:0.989 1/1/1/1:4:0,90:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,71:0.39: 1.21:1.000:0.738 0/0/0/1:4:51,19:0.25:-0.83:1.000:0.999 0/0/0/1:4:63,32:0.32:-0.34:1.000:0.951 0/0/0/1:4:40,22:0.34:-0.98:1.000:0.868 0/0/0/0:4:40,0:0.00:-1.41:1.000:1.000 0/0/0/1:4:37,23:0.37:-1.02:1.000:0.556 1/1/1/1:4:1,54:0.98:-1.12:1.000:1.000 0/0/0/0:4:78,0:0.00:-0.67:1.000:1.000 0/0/0/1:4:140,46:0.23: 1.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,28:0.48:-1.06:0.998:0.994 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,57:0.48: 0.10:1.000:0.994 0/0/0/1:4:168,59:0.24: 2.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:32,57:0.61:-0.46:1.000:0.662 0/0/1/1:4:41,32:0.43:-0.77:1.000:0.944 0/0/0/1:4:35,11:0.22:-1.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:56,0:0.00:-1.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:19,40:0.64:-1.04:1.000:0.731 0/0/0/0:4:57,0:0.00:-1.08:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,85:0.53: 0.84:1.000:0.991 0/1/1/1:4:17,41:0.67:-1.06:1.000:0.912 0/0/0/1:4:89,49:0.34: 0.49:1.000:0.866 0/0/1/1:4:97,80:0.44: 1.24:1.000:0.972 0/0/1/1:4:60,84:0.57: 0.61:1.000:0.958 0/0/0/1:4:101,35:0.24: 0.45:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,142:0.99: 0.59:1.000:1.000 0/0/0/1:4:92,28:0.22: 0.14:1.000:1.000 0/0/1/1:4:104,129:0.54: 2.33:1.000:0.987 0/0/1/1:4:84,102:0.54: 1.42:1.000:0.990 0/1/1/1:4:2,13:0.83:-1.89:1.000:0.998 0/0/0/1:4:79,28:0.24:-0.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,105:0.58: 1.17:1.000:0.893 0/0/0/0:4:123,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/0/1:4:154,48:0.22: 1.73:1.000:1.000 0/0/0/1:4:158,52:0.23: 1.88:1.000:1.000 0/0/0/0:4:91,0:0.00:-0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:91,99:0.51: 1.50:1.000:0.996 0/0/1/1:4:92,84:0.47: 1.22:1.000:0.992 0/0/1/1:4:43,65:0.58:-0.09:1.000:0.912 0/0/0/1:4:77,39:0.32: 0.06:1.000:0.952 0/1/1/1:4:41,119:0.70: 0.92:1.000:0.984 0/0/1/1:4:96,91:0.48: 1.44:1.000:0.995 0/0/1/1:4:92,91:0.49: 1.36:1.000:0.996 0/0/1/1:4:78,77:0.49: 0.82:1.000:0.996 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,136:0.72: 1.26:1.000:0.994 0/0/0/0:4:175,0:0.00: 1.21:1.000:1.000 0/0/1/1:4:70,89:0.55: 0.90:1.000:0.984 0/0/0/1:4:104,36:0.24: 0.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,46:0.40: 0.01:1.000:0.752 0/0/1/1:4:58,74:0.55: 0.37:1.000:0.983 0/0/0/0:4:79,0:0.00:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:111,34:0.22: 0.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:116,131:0.52: 2.60:1.000:0.995 0/0/0/1:4:119,44:0.25: 0.97:1.000:0.999 1/1/1/1:4:3,167:0.98: 1.11:1.000:1.000 0/0/0/1:4:72,33:0.30:-0.15:1.000:0.987 0/0/0/1:4:93,50:0.33: 0.59:0.956:0.899 0/0/1/1:4:51,93:0.62: 0.61:1.000:0.607 0/0/1/1:4:101,64:0.38: 1.01:1.000:0.508 0/1/1/1:4:32,133:0.75: 1.01:1.000:0.999 0/0/0/1:4:69,38:0.34:-0.11:1.000:0.865 -chr8.1 84732805 chr8.1_084732805 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:23,3:.:-0.20:1.000:. ./.:4:16,1:.:-0.72:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:29,0:.:-0.03:1.000:. ./.:4:50,8:.: 1.65:1.000:. ./.:4:50,1:.: 1.25:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:31,1:.: 0.14:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:9,2:.:-1.07:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:35,3:.: 0.49:1.000:. ./.:4:33,2:.: 0.32:1.000:. ./.:4:75,6:.: 2.98:1.000:. ./.:4:32,2:.: 0.26:0.998:. ./.:4:44,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:68,6:.: 2.58:1.000:. ./.:4:21,5:.:-0.20:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:17,1:.:-0.67:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:21,3:.:-0.32:1.000:. ./.:4:4,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:31,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:21,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.38:1.000:. ./.:3:15,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:10,2:.:-1.01:1.000:. ./.:4:30,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:1,1:.:-1.59:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.01:1.000:. ./.:3:9,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:37,1:.: 0.49:1.000:. ./.:4:47,4:.: 1.25:0.979:. ./.:4:33,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:30,1:.: 0.09:1.000:. ./.:4:44,1:.: 0.90:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:20,3:.:-0.38:1.000:. ./.:4:37,0:.: 0.43:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:41,2:.: 0.78:1.000:. ./.:5:29,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:9,14:.:-0.38:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.49:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.03:1.000:. ./.:4:16,2:.:-0.67:1.000:. ./.:4:76,5:.: 2.98:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:20,4:.:-0.32:1.000:. ./.:4:32,4:.: 0.38:1.000:. ./.:4:26,7:.: 0.20:1.000:. ./.:4:28,1:.:-0.03:1.000:. ./.:4:27,3:.: 0.03:1.000:. ./.:4:41,4:.: 0.90:1.000:. ./.:6:11,2:.:-0.96:1.000:. ./.:4:11,1:.:-1.01:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.55:1.000:. ./.:4:29,4:.: 0.20:1.000:. ./.:4:14,3:.:-0.72:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:58,9:.: 2.17:1.000:. ./.:4:6,0:.:-1.36:1.000:. ./.:4:17,4:.:-0.49:1.000:. ./.:4:15,3:.:-0.67:0.887:. ./.:4:21,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:21,4:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,9:.: 0.38:0.999:. ./.:4:19,3:.:-0.43:1.000:. ./.:4:37,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:19,4:.:-0.38:1.000:. ./.:4:18,7:.:-0.26:1.000:. ./.:4:27,6:.: 0.20:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:47,3:.: 1.19:1.000:. ./.:4:28,4:.: 0.14:1.000:. ./.:4:5,2:.:-1.30:0.915:. ./.:4:61,6:.: 2.17:1.000:. ./.:4:13,4:.:-0.72:1.000:. ./.:4:15,2:.:-0.72:1.000:. ./.:4:25,6:.: 0.09:0.980:. ./.:4:40,6:.: 0.96:1.000:. ./.:4:18,2:.:-0.55:1.000:. ./.:4:34,3:.: 0.43:1.000:. ./.:4:15,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:23,4:.:-0.14:1.000:. ./.:4:14,4:.:-0.67:1.000:. ./.:4:33,3:.: 0.38:1.000:. ./.:4:43,5:.: 1.07:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:40,0:.: 0.61:1.000:. ./.:4:23,2:.:-0.26:1.000:. ./.:4:46,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:28,4:.: 0.14:1.000:. ./.:4:35,2:.: 0.43:1.000:. ./.:4:40,2:.: 0.72:1.000:. ./.:4:17,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:13,1:.:-0.90:1.000:. ./.:4:13,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:24,5:.:-0.03:0.999:. ./.:4:8,2:.:-1.13:1.000:. ./.:4:64,3:.: 2.17:1.000:. ./.:4:43,0:.: 0.78:1.000:. ./.:4:23,0:.:-0.38:1.000:. ./.:4:56,2:.: 1.65:0.993:. ./.:4:71,0:.: 2.40:1.000:. ./.:4:39,2:.: 0.67:1.000:. ./.:4:52,2:.: 1.42:1.000:. ./.:4:18,5:.:-0.38:0.999:. ./.:4:21,2:.:-0.38:1.000:. ./.:4:6,7:.:-0.96:1.000:. ./.:4:36,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:24,4:.:-0.09:1.000:. ./.:4:12,0:.:-1.01:1.000:. ./.:4:36,4:.: 0.61:1.000:. ./.:4:46,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:44,4:.: 1.07:1.000:. ./.:4:28,3:.: 0.09:1.000:. ./.:4:22,1:.:-0.38:1.000:. ./.:4:14,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:26,1:.:-0.14:1.000:. ./.:4:16,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:22,3:.:-0.26:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.01:1.000:. ./.:4:12,3:.:-0.84:1.000:. ./.:4:14,1:.:-0.84:1.000:. ./.:4:17,2:.:-0.61:1.000:. ./.:4:31,4:.: 0.32:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.61:0.998:. ./.:4:15,1:.:-0.78:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.96:1.000:. ./.:4:66,4:.: 2.35:1.000:. ./.:4:30,4:.: 0.26:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:9,3:.:-1.01:1.000:. ./.:4:29,1:.: 0.03:1.000:. ./.:4:53,4:.: 1.59:1.000:. ./.:4:9,0:.:-1.19:1.000:. ./.:4:15,4:.:-0.61:1.000:. ./.:4:11,2:.:-0.96:1.000:. ./.:4:53,3:.: 1.53:1.000:. ./.:4:27,5:.: 0.14:1.000:. ./.:4:51,2:.: 1.36:1.000:. ./.:4:18,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:121,3:.: 5.47:1.000:. ./.:4:12,6:.:-0.67:1.000:. ./.:4:33,1:.: 0.26:1.000:. ./.:4:36,1:.: 0.43:1.000:. ./.:4:5,0:.:-1.42:1.000:. ./.:4:7,1:.:-1.24:1.000:. ./.:4:36,3:.: 0.55:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:48,3:.: 1.25:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:18,1:.:-0.61:1.000:. ./.:4:27,1:.:-0.09:1.000:. ./.:4:27,5:.: 0.14:1.000:. ./.:4:19,0:.:-0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:24,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:53,1:.: 1.42:1.000:. ./.:4:53,3:.: 1.53:1.000:. ./.:4:56,1:.: 1.59:1.000:. ./.:4:27,2:.:-0.03:1.000:. ./.:4:16,3:.:-0.61:1.000:. ./.:4:6,2:.:-1.24:1.000:. ./.:4:26,3:.:-0.03:1.000:. ./.:4:18,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:20,0:.:-0.55:1.000:. ./.:4:26,2:.:-0.09:1.000:. ./.:4:8,3:.:-1.07:1.000:. ./.:4:39,1:.: 0.61:1.000:. ./.:4:27,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:59,1:.: 1.77:1.000:. ./.:4:25,1:.:-0.20:1.000:. ./.:4:20,1:.:-0.49:0.956:. ./.:4:37,2:.: 0.55:1.000:. ./.:4:32,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:34,2:.: 0.38:1.000:. ./.:4:19,1:.:-0.55:1.000:. -chr8.1 84775548 chr8.1_084775548 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:393,0:.: 0.93:1.000:. ./.:4:149,147:.:-0.30:1.000:. ./.:4:255,75:.: 0.13:1.000:. ./.:4:192,160:.: 0.41:1.000:. ./.:4:227,164:.: 0.91:1.000:. ./.:4:375,113:.: 2.14:1.000:. ./.:4:214,59:.:-0.59:1.000:. ./.:4:296,76:.: 0.67:1.000:. ./.:4:168,154:.: 0.03:1.000:. ./.:4:134,0:.:-2.36:1.000:. ./.:4:252,43:.:-0.31:1.000:. ./.:4:283,144:.: 1.37:1.000:. ./.:4:286,68:.: 0.44:1.000:. ./.:4:291,59:.: 0.39:1.000:. ./.:4:195,146:.: 0.27:1.000:. ./.:4:345,96:.: 1.54:1.000:. ./.:4:225,167:.: 0.92:0.998:. ./.:4:201,141:.: 0.29:1.000:. ./.:4:414,99:.: 2.46:1.000:. ./.:4:246,172:.: 1.25:1.000:. ./.:4:172,29:.:-1.51:1.000:. ./.:4:178,139:.:-0.03:1.000:. ./.:4:358,77:.: 1.47:1.000:. ./.:4:229,151:.: 0.77:1.000:. ./.:4:123,34:.:-2.06:1.000:. ./.:4:320,100:.: 1.28:1.000:. ./.:4:203,166:.: 0.63:1.000:. ./.:4:304,65:.: 0.63:1.000:. ./.:3:108,177:.:-0.44:1.000:. ./.:4:345,94:.: 1.52:1.000:. ./.:4:476,0:.: 1.99:1.000:. ./.:4:289,81:.: 0.64:1.000:. ./.:4:56,35:.:-2.90:1.000:. ./.:4:161,22:.:-1.73:1.000:. ./.:3:41,16:.:-3.34:1.000:. ./.:4:221,163:.: 0.82:1.000:. ./.:4:199,142:.: 0.27:0.979:. ./.:4:329,91:.: 1.28:1.000:. ./.:4:331,83:.: 1.20:1.000:. ./.:4:382,106:.: 2.14:1.000:. ./.:4:169,134:.:-0.21:1.000:. ./.:4:255,68:.: 0.04:1.000:. ./.:4:186,151:.: 0.22:1.000:. ./.:4:140,104:.:-0.96:1.000:. ./.:4:182,130:.:-0.09:1.000:. ./.:4:86,218:.:-0.20:1.000:. ./.:5:310,160:.: 1.91:1.000:. ./.:4:49,108:.:-2.06:1.000:. ./.:4:258,64:.: 0.03:1.000:. ./.:4:212,152:.: 0.57:1.000:. ./.:4:212,61:.:-0.59:1.000:. ./.:4:316,62:.: 0.74:1.000:. ./.:4:229,69:.:-0.27:1.000:. ./.:4:254,73:.: 0.10:1.000:. ./.:4:191,143:.: 0.18:1.000:. ./.:4:279,63:.: 0.29:1.000:. ./.:4:250,80:.: 0.13:1.000:. ./.:4:280,79:.: 0.50:1.000:. ./.:4:317,0:.:-0.03:1.000:. ./.:6:73,103:.:-1.82:1.000:. ./.:4:61,172:.:-1.10:1.000:. ./.:4:264,61:.: 0.07:1.000:. ./.:4:209,148:.: 0.48:1.000:. ./.:4:72,170:.:-0.98:1.000:. ./.:4:300,86:.: 0.85:1.000:. ./.:4:251,62:.:-0.08:1.000:. ./.:4:114,100:.:-1.34:1.000:. ./.:4:216,68:.:-0.45:1.000:. ./.:4:185,158:.: 0.30:0.887:. ./.:4:254,64:.:-0.02:1.000:. ./.:4:313,72:.: 0.83:1.000:. ./.:4:154,106:.:-0.76:0.999:. ./.:4:181,167:.: 0.36:1.000:. ./.:4:203,148:.: 0.40:1.000:. ./.:4:240,69:.:-0.13:1.000:. ./.:4:143,115:.:-0.78:1.000:. ./.:4:67,194:.:-0.74:1.000:. ./.:4:261,48:.:-0.13:1.000:. ./.:4:168,149:.:-0.03:1.000:. ./.:4:192,154:.: 0.34:1.000:. ./.:4:204,50:.:-0.83:0.915:. ./.:4:189,125:.:-0.07:1.000:. ./.:4:82,234:.:-0.04:1.000:. ./.:4:158,110:.:-0.65:1.000:. ./.:4:292,80:.: 0.67:0.980:. ./.:4:77,216:.:-0.34:1.000:. ./.:4:105,98:.:-1.48:1.000:. ./.:4:300,0:.:-0.25:1.000:. ./.:4:210,59:.:-0.64:1.000:. ./.:4:240,64:.:-0.20:1.000:. ./.:4:211,51:.:-0.73:1.000:. ./.:4:229,46:.:-0.57:1.000:. ./.:4:98,208:.:-0.17:1.000:. ./.:4:118,104:.:-1.24:1.000:. ./.:4:174,137:.:-0.11:1.000:. ./.:4:155,153:.:-0.15:1.000:. ./.:4:226,1:.:-1.18:1.000:. ./.:4:280,0:.:-0.50:1.000:. ./.:4:229,64:.:-0.34:1.000:. ./.:4:276,72:.: 0.36:1.000:. ./.:4:228,0:.:-1.16:1.000:. ./.:4:260,55:.:-0.06:1.000:. ./.:4:126,102:.:-1.16:1.000:. ./.:4:215,46:.:-0.74:0.999:. ./.:4:145,109:.:-0.83:1.000:. ./.:4:150,124:.:-0.58:1.000:. ./.:4:140,102:.:-0.98:1.000:. ./.:4:325,78:.: 1.06:1.000:. ./.:4:474,0:.: 1.96:0.993:. ./.:4:369,0:.: 0.63:1.000:. ./.:4:128,120:.:-0.91:1.000:. ./.:4:124,338:.: 1.81:1.000:. ./.:4:131,101:.:-1.11:0.999:. ./.:4:251,55:.:-0.17:1.000:. ./.:4:165,52:.:-1.30:1.000:. ./.:4:276,76:.: 0.41:1.000:. ./.:4:208,63:.:-0.62:1.000:. ./.:4:133,116:.:-0.90:1.000:. ./.:4:199,52:.:-0.87:1.000:. ./.:4:131,106:.:-1.05:1.000:. ./.:4:147,129:.:-0.55:1.000:. ./.:4:192,35:.:-1.18:1.000:. ./.:4:185,131:.:-0.04:1.000:. ./.:4:387,0:.: 0.86:1.000:. ./.:4:146,97:.:-0.97:1.000:. ./.:4:186,128:.:-0.07:1.000:. ./.:4:230,39:.:-0.64:1.000:. ./.:4:201,51:.:-0.86:1.000:. ./.:4:127,84:.:-1.38:1.000:. ./.:4:188,51:.:-1.02:1.000:. ./.:4:132,97:.:-1.15:1.000:. ./.:4:291,70:.: 0.53:1.000:. ./.:4:159,38:.:-1.56:0.998:. ./.:4:166,141:.:-0.16:1.000:. ./.:4:90,190:.:-0.50:1.000:. ./.:4:245,182:.: 1.37:1.000:. ./.:4:180,133:.:-0.08:1.000:. ./.:4:136,110:.:-0.93:1.000:. ./.:4:243,0:.:-0.97:1.000:. ./.:4:141,105:.:-0.93:1.000:. ./.:4:253,59:.:-0.09:1.000:. ./.:4:149,122:.:-0.62:1.000:. ./.:4:186,101:.:-0.41:1.000:. ./.:4:176,35:.:-1.38:1.000:. ./.:4:246,187:.: 1.44:1.000:. ./.:4:216,186:.: 1.05:1.000:. ./.:4:226,181:.: 1.11:1.000:. ./.:4:256,76:.: 0.16:1.000:. ./.:4:346,72:.: 1.25:1.000:. ./.:4:157,138:.:-0.31:1.000:. ./.:4:239,224:.: 1.82:1.000:. ./.:4:265,67:.: 0.16:1.000:. ./.:4:179,1:.:-1.77:1.000:. ./.:4:216,71:.:-0.41:1.000:. ./.:4:382,0:.: 0.79:1.000:. ./.:4:148,133:.:-0.49:1.000:. ./.:4:390,90:.: 2.04:1.000:. ./.:4:227,180:.: 1.11:1.000:. ./.:4:186,138:.: 0.06:1.000:. ./.:4:405,0:.: 1.09:1.000:. ./.:4:195,122:.:-0.03:1.000:. ./.:4:146,120:.:-0.68:1.000:. ./.:4:274,75:.: 0.38:1.000:. ./.:4:248,82:.: 0.13:1.000:. ./.:4:301,90:.: 0.91:1.000:. ./.:4:303,80:.: 0.81:1.000:. ./.:4:265,63:.: 0.11:1.000:. ./.:4:377,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:183,119:.:-0.22:1.000:. ./.:4:188,142:.: 0.13:1.000:. ./.:4:156,134:.:-0.37:1.000:. ./.:4:243,72:.:-0.06:1.000:. ./.:4:352,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:237,66:.:-0.21:1.000:. ./.:4:178,122:.:-0.25:1.000:. ./.:4:240,62:.:-0.22:1.000:. ./.:4:408,116:.: 2.60:1.000:. ./.:4:196,159:.: 0.45:1.000:. ./.:4:299,86:.: 0.83:1.000:. ./.:4:146,173:.:-0.01:1.000:. ./.:4:111,248:.: 0.50:0.956:. ./.:4:242,179:.: 1.29:1.000:. ./.:4:384,97:.: 2.05:1.000:. ./.:4:254,55:.:-0.13:1.000:. ./.:4:293,82:.: 0.71:1.000:. -chr8.1 85054409 chr8.1_085054409 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:60,124:0.65: 0.10:1.000:0.831 0/0/1/1:4:67,84:0.54:-0.55:1.000:0.987 0/0/0/1:4:116,47:0.37:-0.31:1.000:0.611 0/1/1/1:4:39,182:0.81: 0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,133:0.53: 1.25:1.000:0.991 0/1/1/1:4:63,195:0.73: 1.57:1.000:0.998 1/1/1/1:4:2,113:0.98:-1.26:1.000:1.000 0/0/1/1:4:72,104:0.57:-0.05:1.000:0.935 0/1/1/1:4:66,130:0.64: 0.34:1.000:0.736 0/0/1/1:4:31,24:0.45:-2.44:1.000:0.983 0/0/1/1:4:25,40:0.60:-2.25:1.000:0.809 0/1/1/1:4:66,142:0.66: 0.58:1.000:0.888 0/1/1/1:4:59,125:0.66: 0.10:1.000:0.868 1/1/1/1:4:13,161:0.92:-0.09:1.000:0.984 0/1/1/1:4:45,104:0.68:-0.59:1.000:0.948 0/1/1/1:4:58,180:0.73: 1.17:1.000:0.998 0/1/1/1:4:43,152:0.76: 0.32:0.998:1.000 1/1/1/1:4:13,198:0.93: 0.64:1.000:0.999 0/0/1/1:4:87,149:0.61: 1.13:1.000:0.654 0/1/1/1:4:46,190:0.79: 1.13:1.000:1.000 0/0/1/1:4:31,17:0.41:-2.58:1.000:0.832 0/1/1/1:4:47,158:0.75: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:107,104:0.49: 0.64:1.000:0.996 0/0/1/1:4:79,95:0.53:-0.09:1.000:0.992 0/0/1/1:4:22,14:0.43:-2.82:1.000:0.934 0/0/1/1:4:77,110:0.57: 0.16:1.000:0.943 0/1/1/1:4:49,180:0.77: 0.99:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,130:0.69: 0.06:1.000:0.979 1/1/1:3:0,169:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:111,144:0.55: 1.51:1.000:0.981 0/0/1/1:4:106,109:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/1/1/1:4:45,109:0.69:-0.49:1.000:0.970 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-2.98:1.000:1.000 0/0/1/1:4:41,23:0.41:-2.27:1.000:0.853 0/0/1:3:14,3:0.30:-3.19:1.000:1.000 0/0/1/1:4:109,103:0.48: 0.66:1.000:0.995 1/1/1/1:4:9,152:0.94:-0.35:0.979:1.000 0/1/1/1:4:50,192:0.77: 1.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,195:0.83: 1.03:1.000:0.998 0/0/1/1:4:118,67:0.41: 0.12:1.000:0.863 1/1/1/1:4:0,200:1.00: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:99,123:0.54: 0.85:1.000:0.989 0/1/1/1:4:46,168:0.76: 0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,114:0.68:-0.29:1.000:0.940 0/0/1/1:4:72,127:0.62: 0.40:1.000:0.570 1/1/1/1:4:0,222:1.00: 0.85:1.000:1.000 0/0/0/1/1:5:152,130:0.47: 2.04:1.000:0.780 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-1.63:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,51:0.43:-0.98:1.000:0.945 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,78:0.60:-1.02:1.000:0.819 0/1/1/1:4:59,226:0.77: 2.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,80:0.48:-0.23:1.000:0.995 0/1/1/1:4:61,159:0.70: 0.81:1.000:0.987 1/1/1/1:4:13,168:0.92: 0.04:1.000:0.991 0/0/1/1:4:89,116:0.55: 0.52:1.000:0.980 1/1/1/1:4:7,158:0.95:-0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,135:0.69: 0.22:1.000:0.974 0/0/1/1:4:91,54:0.42:-0.67:1.000:0.896 0/0/1/1/1/1:6:53,136:0.70: 0.20:1.000:0.874 0/1/1/1:4:51,149:0.72: 0.42:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,92:0.58:-0.51:1.000:0.896 0/1/1/1:4:48,98:0.65:-0.65:1.000:0.810 1/1/1/1:4:2,189:0.99: 0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,121:0.65: 0.02:1.000:0.818 0/0/1/1:4:63,104:0.60:-0.23:1.000:0.745 0/1/1/1:4:20,111:0.83:-0.94:1.000:0.998 0/0/1/1:4:64,92:0.57:-0.45:1.000:0.939 0/1/1/1:4:45,159:0.76: 0.50:0.887:1.000 1/1/1/1:4:6,132:0.95:-0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:6,184:0.97: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,77:0.66:-1.28:0.999:0.842 0/1/1/1:4:49,151:0.73: 0.42:1.000:0.998 1/1/1/1:4:10,178:0.94: 0.18:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,89:0.58:-0.61:1.000:0.896 0/1/1/1:4:32,153:0.81: 0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:12,159:0.92:-0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:91,64:0.44:-0.47:1.000:0.967 0/0/1/1:4:74,115:0.59: 0.20:1.000:0.858 0/1/1/1:4:47,171:0.76: 0.78:1.000:1.000 0/1/1/1:4:15,85:0.84:-1.56:0.915:0.997 0/1/1/1:4:60,123:0.65: 0.08:1.000:0.817 1/1/1/1:4:12,174:0.93: 0.14:1.000:0.998 0/0/1/1:4:55,72:0.55:-1.02:1.000:0.979 0/0/1/1:4:92,93:0.49: 0.12:0.980:0.996 0/1/1/1:4:18,159:0.89:-0.03:1.000:0.533 0/1/1/1:4:45,85:0.64:-0.96:1.000:0.630 0/1/1/1:4:45,98:0.67:-0.71:1.000:0.901 0/1/1/1:4:50,91:0.63:-0.75:1.000:0.522 0/1/1/1:4:41,105:0.70:-0.65:1.000:0.984 0/0/0/1:4:87,31:0.35:-1.20:1.000:0.782 0/1/1/1:4:64,158:0.69: 0.85:1.000:0.975 1/1/1/1:4:0,270:1.00: 1.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,110:0.68:-0.43:1.000:0.955 0/1/1/1:4:40,168:0.79: 0.58:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,110:0.50: 0.72:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,84:0.59:-0.80:1.000:0.856 0/0/1/1:4:98,50:0.40:-0.61:1.000:0.750 0/0/1/1:4:89,123:0.56: 0.66:1.000:0.961 0/0/1/1:4:106,104:0.49: 0.62:1.000:0.996 0/1/1/1:4:29,93:0.74:-1.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,159:0.78: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,74:0.59:-1.12:1.000:0.869 0/1/1/1:4:45,164:0.76: 0.60:0.999:1.000 1/1/1/1:4:8,131:0.94:-0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:11,153:0.93:-0.29:1.000:0.996 0/0/1/1:4:58,91:0.59:-0.59:1.000:0.843 1/1/1/1:4:13,173:0.92: 0.14:1.000:0.994 0/0/1/1:4:113,176:0.59: 2.18:0.993:0.854 0/1/1/1:4:55,120:0.67:-0.07:1.000:0.903 0/1/1/1:4:50,147:0.72: 0.36:1.000:0.997 0/1/1/1:4:53,220:0.79: 1.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,150:0.72: 0.44:0.999:0.997 0/0/1/1:4:131,57:0.38: 0.18:1.000:0.504 1/1/1/1:4:3,101:0.97:-1.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:13,140:0.91:-0.51:1.000:0.914 0/0/1/1:4:49,85:0.62:-0.88:1.000:0.618 0/1/1/1:4:39,99:0.70:-0.80:1.000:0.982 1/1/1/1:4:13,152:0.91:-0.27:1.000:0.968 0/0/1/1:4:47,84:0.62:-0.94:1.000:0.532 1/1/1/1:4:0,231:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,123:0.71:-0.21:1.000:0.992 1/1/1/1:4:9,191:0.95: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:123,67:0.40: 0.22:1.000:0.825 0/1/1/1:4:41,136:0.75:-0.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:59,165:0.72: 0.89:1.000:0.994 0/0/1/1:4:96,54:0.41:-0.57:1.000:0.855 0/0/1/1:4:50,31:0.42:-1.93:1.000:0.922 1/1/1/1:4:5,93:0.94:-1.59:1.000:1.000 1/1/1/1:4:5,97:0.95:-1.52:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,89:0.50:-0.09:1.000:0.997 0/0/1/1:4:102,135:0.55: 1.15:1.000:0.976 0/0/1/1:4:67,73:0.51:-0.77:0.998:0.997 0/0/1/1:4:91,116:0.54: 0.56:1.000:0.985 1/1/1/1:4:0,190:1.00: 0.22:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,198:0.73: 1.64:1.000:0.998 1/1/1/1:4:9,195:0.95: 0.50:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,139:0.75: 0.01:1.000:1.000 0/0/1/1:4:85,39:0.38:-1.08:1.000:0.592 0/0/1/1:4:55,92:0.61:-0.63:1.000:0.714 0/1/1/1:4:63,115:0.63:-0.01:1.000:0.531 0/0/1/1:4:57,87:0.59:-0.69:1.000:0.882 0/1/1/1:4:52,122:0.68:-0.09:1.000:0.956 0/0/1/1:4:54,58:0.50:-1.32:1.000:0.997 0/0/1/1:4:78,125:0.60: 0.48:1.000:0.806 1/1/1/1:4:0,271:1.00: 1.82:1.000:1.000 1/1/1/1:4:19,192:0.90: 0.64:1.000:0.827 0/0/1/1:4:96,98:0.49: 0.30:1.000:0.997 1/1/1/1:4:12,199:0.94: 0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,131:0.74:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,223:0.81: 1.82:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,193:0.76: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.51:-2.70:1.000:0.996 0/0/1/1:4:70,33:0.39:-1.50:1.000:0.636 0/0/1/1:4:105,99:0.48: 0.50:1.000:0.995 0/0/1/1:4:70,123:0.62: 0.28:1.000:0.582 0/0/1/1:4:117,133:0.52: 1.41:1.000:0.995 0/0/1/1:4:83,110:0.55: 0.28:1.000:0.976 0/0/1/1:4:62,105:0.61:-0.23:1.000:0.683 0/0/1/1:4:107,143:0.56: 1.41:1.000:0.973 0/1/1/1:4:50,179:0.76: 0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:7,137:0.95:-0.69:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,115:0.64:-0.07:1.000:0.669 0/1/1/1:4:58,160:0.71: 0.78:1.000:0.993 0/1/1/1:4:44,165:0.77: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,196:0.75: 1.47:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,162:0.77: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:157,1:0.18:-0.41:1.000:0.999 1/1/1/1:4:10,180:0.94: 0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,95:0.53:-0.09:1.000:0.992 1/1/1/1:4:0,193:1.00: 0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,79:0.54:-0.75:1.000:0.985 0/0/1/1:4:108,69:0.43:-0.03:1.000:0.936 0/1/1/1:4:58,157:0.71: 0.72:1.000:0.991 0/0/1/1:4:40,59:0.58:-1.57:1.000:0.918 0/0/1/1:4:82,73:0.47:-0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:55,187:0.75: 1.25:1.000:0.999 0/1/1/1:4:63,167:0.71: 1.01:1.000:0.989 1/1/1/1:4:15,193:0.92: 0.58:1.000:0.990 0/1/1/1:4:40,135:0.75:-0.07:1.000:0.999 1/1/1/1:4:10,178:0.94: 0.18:0.956:1.000 1/1/1/1:4:21,229:0.91: 1.41:1.000:0.926 0/1/1/1:4:75,148:0.64: 0.87:1.000:0.740 0/1/1/1:4:38,136:0.76:-0.09:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,125:0.61: 0.40:1.000:0.690 -chr8.1 85227937 chr8.1_085227937 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:76,149:0.70: 0.48:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,130:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,81:0.63:-0.70:1.000:0.513 1/1/1/1:4:0,235:1.00: 0.63:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,178:1.00:-0.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,210:1.00: 0.25:1.000:1.000 0/1/1/1:4:28,131:0.83:-0.52:1.000:0.998 0/1/1/1:4:73,137:0.69: 0.25:1.000:0.977 0/1/1/1:4:58,138:0.73: 0.04:1.000:0.997 0/1/1/1:4:10,28:0.75:-2.34:1.000:0.999 0/1/1/1:4:25,42:0.68:-1.90:1.000:0.942 0/1/1/1:4:52,199:0.80: 0.87:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,146:0.72: 0.28:1.000:0.994 0/1/1/1:4:53,218:0.81: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,127:0.76:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,221:1.00: 0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,239:1.00: 0.69:0.998:1.000 0/1/1/1:4:68,238:0.79: 1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,179:0.75: 0.74:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,293:1.00: 1.52:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,23:1.00:-2.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,227:1.00: 0.51:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,171:1.00:-0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,23:0.78:-2.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,233:1.00: 0.60:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,136:0.71: 0.13:1.000:0.990 1/1/1:3:2,241:0.99: 0.75:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,149:1.00:-0.67:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.79:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,123:0.72:-0.23:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,28:1.00:-2.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,12:0.49:-2.40:1.000:0.996 0/1/1:3:1,4:0.81:-2.84:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,143:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,213:0.78: 1.23:0.979:1.000 1/1/1/1:4:0,203:1.00: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,213:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,71:0.60:-0.83:1.000:0.771 1/1/1/1:4:0,288:1.00: 1.43:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,155:1.00:-0.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,200:1.00: 0.10:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,151:0.74: 0.24:1.000:0.999 0/1/1/1:4:43,160:0.80: 0.15:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,321:1.00: 1.93:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:85,158:0.69: 0.75:1.000:0.591 1/1/1/1:4:0,93:1.00:-1.51:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,68:0.62:-1.03:1.000:0.548 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,130:0.74:-0.23:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,271:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:47,57:0.62:-1.35:1.000:0.513 1/1/1/1:4:0,240:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,237:0.81: 1.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,185:0.76: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,146:0.74: 0.10:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,82:0.67:-0.89:1.000:0.904 1/1/1/1/1/1:6:0,164:1.00:-0.44:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,231:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:64,123:0.70:-0.09:1.000:0.981 0/1/1/1:4:49,129:0.74:-0.23:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,230:1.00: 0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,152:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:52,127:0.73:-0.21:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,140:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/1/1/1:4:62,160:0.74: 0.43:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 0.40:0.887:1.000 0/1/1/1:4:43,176:0.81: 0.39:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,218:0.79: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,96:0.83:-1.17:0.999:0.997 1/1/1/1:4:0,228:1.00: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:76,221:0.75: 1.57:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,130:0.74:-0.20:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,221:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,201:0.82: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,61:0.63:-1.27:1.000:0.588 0/1/1/1:4:69,153:0.72: 0.43:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,217:1.00: 0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:80,108:0.64:-0.08:0.915:0.707 0/1/1/1:4:53,140:0.74: 0.00:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,240:0.84: 1.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:53,138:0.74:-0.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.94:0.980:1.000 0/1/1/1:4:68,247:0.79: 1.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,109:0.78:-0.77:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,134:0.75:-0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,136:0.75:-0.15:1.000:0.999 0/1/1/1:4:46,128:0.75:-0.29:1.000:0.999 0/0/1/1:4:54,58:0.60:-1.23:1.000:0.750 1/1/1/1:4:0,169:1.00:-0.37:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,325:1.00: 1.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,170:1.00:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,208:1.00: 0.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,114:0.75:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:49,69:0.65:-1.14:1.000:0.777 1/1/1/1:4:0,163:1.00:-0.46:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,148:1.00:-0.68:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,173:1.00:-0.31:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,249:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,102:0.75:-0.85:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,203:1.00: 0.15:0.999:1.000 0/1/1/1:4:39,180:0.83: 0.39:1.000:0.998 0/1/1/1:4:48,193:0.81: 0.72:1.000:1.000 0/1/1/1:4:48,123:0.74:-0.34:1.000:0.998 0/1/1/1:4:72,204:0.75: 1.25:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,150:1.00:-0.65:0.993:1.000 0/1/1/1:4:55,135:0.73:-0.05:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,193:1.00: 0.00:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,268:1.00: 1.13:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,241:1.00: 0.72:0.999:1.000 0/0/1/1:4:69,65:0.58:-0.89:1.000:0.901 0/1/1/1:4:33,124:0.80:-0.55:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,242:0.79: 1.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,113:0.74:-0.55:1.000:0.998 0/1/1/1:4:37,121:0.78:-0.53:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,225:0.82: 1.28:1.000:0.999 0/1/1/1:4:44,118:0.74:-0.47:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,275:1.00: 1.23:1.000:1.000 0/1/1/1:4:55,128:0.72:-0.15:1.000:0.996 0/1/1/1:4:51,233:0.83: 1.37:1.000:0.998 0/1/1/1:4:56,72:0.63:-0.98:1.000:0.612 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,220:1.00: 0.40:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,82:0.65:-0.80:1.000:0.783 0/0/1/1:4:103,59:0.50:-0.47:1.000:0.997 0/1/1/1:4:29,173:0.86: 0.13:1.000:0.959 0/1/1/1:4:51,169:0.78: 0.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,136:1.00:-0.86:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,129:1.00:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,91:1.00:-1.54:0.998:1.000 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.91:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,286:1.00: 1.40:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,271:1.00: 1.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,206:0.78: 1.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,213:1.00: 0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,64:0.64:-1.24:1.000:0.722 0/1/1/1:4:38,116:0.76:-0.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,139:0.77:-0.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:37,133:0.79:-0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,200:1.00: 0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,88:0.76:-1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,160:0.73: 0.51:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,390:1.00: 2.97:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,218:0.80: 1.22:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,151:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:75,220:0.76: 1.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,190:1.00:-0.05:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,254:1.00: 0.92:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,248:1.00: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,17:0.62:-2.45:1.000:0.510 0/0/1/1:4:41,39:0.58:-1.71:1.000:0.894 1/1/1/1:4:0,133:1.00:-0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,162:0.74: 0.45:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,173:1.00:-0.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,180:0.74: 0.80:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,153:0.76: 0.16:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,144:1.00:-0.74:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,182:1.00:-0.17:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,187:0.76: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,137:0.71: 0.15:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 0.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,215:1.00: 0.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,216:1.00: 0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,177:1.00:-0.25:1.000:1.000 0/0/0/0:4:111,0:0.00:-1.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,212:0.77: 1.28:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-1.01:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,245:1.00: 0.78:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,117:1.00:-1.15:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,86:0.66:-0.76:1.000:0.864 1/1/1/1:4:0,202:1.00: 0.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,125:0.75:-0.35:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-1.23:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,245:1.00: 0.80:1.000:1.000 1/1/1/1:4:1,249:1.00: 0.86:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,186:0.76: 0.84:1.000:1.000 0/1/1/1:4:58,160:0.75: 0.37:1.000:0.999 0/1/1/1:4:82,261:0.77: 2.26:0.956:1.000 0/1/1/1:4:63,258:0.81: 1.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,189:0.75: 0.96:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,188:1.00:-0.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,131:0.70: 0.09:1.000:0.982 -chr8.1 85407917 chr8.1_085407917 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:229,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:199,1:.: 0.25:1.000:. ./.:4:280,0:.: 1.89:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:144,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.70:1.000:. ./.:4:269,0:.: 1.67:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:188,0:.: 0.00:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.35:0.998:. ./.:4:216,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:262,0:.: 1.52:1.000:. ./.:4:292,0:.: 2.14:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:223,0:.: 0.72:1.000:. ./.:4:278,0:.: 1.85:1.000:. ./.:4:210,0:.: 0.46:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:160,0:.:-0.57:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.26:1.000:. ./.:3:248,0:.: 1.24:1.000:. ./.:4:236,1:.: 1.01:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.23:1.000:. ./.:4:62,0:.:-2.58:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.43:1.000:. ./.:3:88,0:.:-2.05:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.04:0.979:. ./.:4:202,0:.: 0.29:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.70:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.06:1.000:. ./.:4:200,1:.: 0.27:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:5:336,0:.: 3.04:1.000:. ./.:4:90,0:.:-2.01:1.000:. ./.:4:158,1:.:-0.59:1.000:. ./.:4:77,0:.:-2.28:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:200,0:.: 0.25:1.000:. ./.:4:224,0:.: 0.74:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:173,0:.:-0.30:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.43:1.000:. ./.:4:135,0:.:-1.09:1.000:. ./.:6:150,0:.:-0.78:1.000:. ./.:4:185,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:217,0:.: 0.60:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:213,1:.: 0.54:1.000:. ./.:4:150,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.02:0.887:. ./.:4:195,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:221,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:151,0:.:-0.76:0.999:. ./.:4:208,0:.: 0.41:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:180,0:.:-0.16:1.000:. ./.:4:137,0:.:-1.04:1.000:. ./.:4:182,0:.:-0.12:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:150,1:.:-0.76:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.59:0.915:. ./.:4:194,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:160,1:.:-0.55:0.980:. ./.:4:216,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:162,0:.:-0.53:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.63:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:133,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:181,0:.:-0.14:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.28:1.000:. ./.:4:178,0:.:-0.20:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.24:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.67:1.000:. ./.:4:152,0:.:-0.74:1.000:. ./.:4:145,0:.:-0.88:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:260,0:.: 1.48:1.000:. ./.:4:194,1:.: 0.15:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:148,0:.:-0.82:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.87:0.999:. ./.:4:144,0:.:-0.90:1.000:. ./.:4:132,0:.:-1.15:1.000:. ./.:4:129,0:.:-1.21:1.000:. ./.:4:261,0:.: 1.50:1.000:. ./.:4:288,0:.: 2.06:0.993:. ./.:4:166,0:.:-0.45:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:228,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:155,0:.:-0.67:0.999:. ./.:4:179,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:76,0:.:-2.30:1.000:. ./.:4:212,0:.: 0.50:1.000:. ./.:4:197,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:147,0:.:-0.84:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.35:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:201,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:247,0:.: 1.22:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:183,1:.:-0.08:1.000:. ./.:4:187,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:116,0:.:-1.48:1.000:. ./.:4:120,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.59:1.000:. ./.:4:220,0:.: 0.66:1.000:. ./.:4:122,0:.:-1.35:0.998:. ./.:4:166,1:.:-0.43:1.000:. ./.:4:170,0:.:-0.37:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.37:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:169,0:.:-0.39:1.000:. ./.:4:141,0:.:-0.96:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.33:1.000:. ./.:4:179,0:.:-0.18:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:214,0:.: 0.54:1.000:. ./.:4:138,1:.:-1.00:1.000:. ./.:4:288,0:.: 2.06:1.000:. ./.:4:274,1:.: 1.79:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.15:1.000:. ./.:4:194,0:.: 0.13:1.000:. ./.:4:338,0:.: 3.08:1.000:. ./.:4:219,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:118,0:.:-1.43:1.000:. ./.:4:208,2:.: 0.46:1.000:. ./.:4:192,0:.: 0.09:1.000:. ./.:4:238,0:.: 1.03:1.000:. ./.:4:296,1:.: 2.24:1.000:. ./.:4:250,0:.: 1.28:1.000:. ./.:4:230,0:.: 0.87:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:258,0:.: 1.44:1.000:. ./.:4:127,0:.:-1.25:1.000:. ./.:4:227,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:256,0:.: 1.40:1.000:. ./.:4:87,0:.:-2.07:1.000:. ./.:4:190,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:196,0:.: 0.17:1.000:. ./.:4:239,1:.: 1.07:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:215,0:.: 0.56:1.000:. ./.:4:243,1:.: 1.15:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:177,0:.:-0.22:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:131,0:.:-1.17:1.000:. ./.:4:153,0:.:-0.72:1.000:. ./.:4:239,0:.: 1.05:1.000:. ./.:4:252,0:.: 1.32:1.000:. ./.:4:184,0:.:-0.08:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.06:1.000:. ./.:4:263,0:.: 1.54:0.956:. ./.:4:219,0:.: 0.64:1.000:. ./.:4:326,0:.: 2.84:1.000:. ./.:4:186,0:.:-0.04:1.000:. ./.:4:262,2:.: 1.56:1.000:. -chr8.1 85508914 chr8.1_085508914 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:153,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:79,18:.:-0.57:1.000:. ./.:4:111,15:.: 0.14:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:196,18:.: 2.29:1.000:. ./.:4:140,8:.: 0.68:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:124,15:.: 0.46:1.000:. ./.:4:86,19:.:-0.37:1.000:. ./.:4:22,0:.:-2.40:1.000:. ./.:4:30,5:.:-2.08:1.000:. ./.:4:97,16:.:-0.18:1.000:. ./.:4:191,0:.: 1.73:1.000:. ./.:4:113,20:.: 0.31:1.000:. ./.:4:153,5:.: 0.92:1.000:. ./.:4:138,14:.: 0.77:1.000:. ./.:4:112,19:.: 0.26:0.998:. ./.:4:130,22:.: 0.77:1.000:. ./.:4:176,16:.: 1.75:1.000:. ./.:4:122,24:.: 0.63:1.000:. ./.:4:24,4:.:-2.25:1.000:. ./.:4:117,8:.: 0.12:1.000:. ./.:4:119,7:.: 0.14:1.000:. ./.:4:66,17:.:-0.91:1.000:. ./.:4:34,0:.:-2.10:1.000:. ./.:4:187,14:.: 1.97:1.000:. ./.:4:106,8:.:-0.15:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.85:1.000:. ./.:3:54,25:.:-1.01:1.000:. ./.:4:195,0:.: 1.82:1.000:. ./.:4:176,0:.: 1.36:1.000:. ./.:4:98,8:.:-0.35:1.000:. ./.:4:15,2:.:-2.52:1.000:. ./.:4:23,0:.:-2.37:1.000:. ./.:3:18,4:.:-2.40:1.000:. ./.:4:95,18:.:-0.18:1.000:. ./.:4:140,10:.: 0.73:0.979:. ./.:4:159,0:.: 0.94:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:122,15:.: 0.41:1.000:. ./.:4:79,2:.:-0.96:1.000:. ./.:4:111,10:.: 0.02:1.000:. ./.:4:85,21:.:-0.35:1.000:. ./.:4:97,5:.:-0.45:1.000:. ./.:4:97,3:.:-0.49:1.000:. ./.:4:87,13:.:-0.49:1.000:. ./.:5:154,7:.: 0.99:1.000:. ./.:4:58,17:.:-1.10:1.000:. ./.:4:135,0:.: 0.36:1.000:. ./.:4:75,2:.:-1.06:1.000:. ./.:4:78,6:.:-0.88:1.000:. ./.:4:215,0:.: 2.31:1.000:. ./.:4:167,0:.: 1.14:1.000:. ./.:4:109,12:.: 0.02:1.000:. ./.:4:142,5:.: 0.65:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.87:1.000:. ./.:4:91,8:.:-0.52:1.000:. ./.:4:109,14:.: 0.07:1.000:. ./.:4:120,0:.:-0.01:1.000:. ./.:6:58,12:.:-1.23:1.000:. ./.:4:57,16:.:-1.15:1.000:. ./.:4:172,0:.: 1.26:1.000:. ./.:4:124,14:.: 0.43:1.000:. ./.:4:61,14:.:-1.10:1.000:. ./.:4:123,8:.: 0.26:1.000:. ./.:4:92,13:.:-0.37:1.000:. ./.:4:59,15:.:-1.13:1.000:. ./.:4:85,7:.:-0.69:1.000:. ./.:4:104,6:.:-0.25:0.887:. ./.:4:104,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:161,0:.: 0.99:1.000:. ./.:4:100,9:.:-0.27:0.999:. ./.:4:90,8:.:-0.54:1.000:. ./.:4:136,5:.: 0.51:1.000:. ./.:4:102,7:.:-0.27:1.000:. ./.:4:130,6:.: 0.38:1.000:. ./.:4:79,12:.:-0.71:1.000:. ./.:4:98,9:.:-0.32:1.000:. ./.:4:110,11:.: 0.02:1.000:. ./.:4:71,22:.:-0.66:1.000:. ./.:4:67,12:.:-1.01:0.915:. ./.:4:135,12:.: 0.65:1.000:. ./.:4:71,16:.:-0.81:1.000:. ./.:4:116,8:.: 0.09:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.73:0.980:. ./.:4:92,28:.:-0.01:1.000:. ./.:4:104,6:.:-0.25:1.000:. ./.:4:118,0:.:-0.06:1.000:. ./.:4:107,0:.:-0.32:1.000:. ./.:4:104,8:.:-0.20:1.000:. ./.:4:96,7:.:-0.42:1.000:. ./.:4:128,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:96,20:.:-0.10:1.000:. ./.:4:55,14:.:-1.25:1.000:. ./.:4:110,12:.: 0.04:1.000:. ./.:4:145,6:.: 0.75:1.000:. ./.:4:91,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:104,0:.:-0.40:1.000:. ./.:4:155,0:.: 0.85:1.000:. ./.:4:112,9:.: 0.02:1.000:. ./.:4:100,0:.:-0.49:1.000:. ./.:4:108,4:.:-0.20:1.000:. ./.:4:73,8:.:-0.96:1.000:. ./.:4:102,0:.:-0.45:0.999:. ./.:4:47,3:.:-1.71:1.000:. ./.:4:112,12:.: 0.09:1.000:. ./.:4:109,12:.: 0.02:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:197,0:.: 1.87:0.993:. ./.:4:127,0:.: 0.16:1.000:. ./.:4:104,10:.:-0.15:1.000:. ./.:4:130,16:.: 0.63:1.000:. ./.:4:108,9:.:-0.08:0.999:. ./.:4:128,0:.: 0.19:1.000:. ./.:4:65,10:.:-1.10:1.000:. ./.:4:141,0:.: 0.51:1.000:. ./.:4:147,0:.: 0.65:1.000:. ./.:4:105,6:.:-0.23:1.000:. ./.:4:130,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:79,3:.:-0.93:1.000:. ./.:4:60,17:.:-1.06:1.000:. ./.:4:116,0:.:-0.10:1.000:. ./.:4:59,25:.:-0.88:1.000:. ./.:4:150,0:.: 0.73:1.000:. ./.:4:51,13:.:-1.37:1.000:. ./.:4:106,6:.:-0.20:1.000:. ./.:4:92,10:.:-0.45:1.000:. ./.:4:67,4:.:-1.20:1.000:. ./.:4:58,3:.:-1.45:1.000:. ./.:4:63,7:.:-1.23:1.000:. ./.:4:99,5:.:-0.40:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:58,10:.:-1.27:0.998:. ./.:4:108,3:.:-0.23:1.000:. ./.:4:76,9:.:-0.86:1.000:. ./.:4:174,5:.: 1.43:1.000:. ./.:4:123,10:.: 0.31:1.000:. ./.:4:72,6:.:-1.03:1.000:. ./.:4:89,0:.:-0.76:1.000:. ./.:4:77,1:.:-1.03:1.000:. ./.:4:109,10:.:-0.03:1.000:. ./.:4:87,6:.:-0.66:1.000:. ./.:4:79,17:.:-0.59:1.000:. ./.:4:97,6:.:-0.42:1.000:. ./.:4:121,12:.: 0.31:1.000:. ./.:4:155,3:.: 0.92:1.000:. ./.:4:133,19:.: 0.77:1.000:. ./.:4:119,9:.: 0.19:1.000:. ./.:4:155,10:.: 1.09:1.000:. ./.:4:104,7:.:-0.23:1.000:. ./.:4:154,11:.: 1.09:1.000:. ./.:4:144,0:.: 0.58:1.000:. ./.:4:27,0:.:-2.27:1.000:. ./.:4:101,10:.:-0.23:1.000:. ./.:4:174,0:.: 1.31:1.000:. ./.:4:165,8:.: 1.29:1.000:. ./.:4:244,0:.: 3.02:1.000:. ./.:4:98,13:.:-0.23:1.000:. ./.:4:109,2:.:-0.23:1.000:. ./.:4:198,0:.: 1.90:1.000:. ./.:4:161,18:.: 1.43:1.000:. ./.:4:67,15:.:-0.93:1.000:. ./.:4:153,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:95,8:.:-0.42:1.000:. ./.:4:168,0:.: 1.16:1.000:. ./.:4:194,0:.: 1.80:1.000:. ./.:4:102,8:.:-0.25:1.000:. ./.:4:148,0:.: 0.68:1.000:. ./.:4:53,14:.:-1.30:1.000:. ./.:4:157,7:.: 1.07:1.000:. ./.:4:91,5:.:-0.59:1.000:. ./.:4:121,2:.: 0.07:1.000:. ./.:4:122,0:.: 0.04:1.000:. ./.:4:100,8:.:-0.30:1.000:. ./.:4:102,7:.:-0.27:1.000:. ./.:4:78,7:.:-0.86:1.000:. ./.:4:226,0:.: 2.58:1.000:. ./.:4:141,6:.: 0.65:1.000:. ./.:4:149,15:.: 1.07:1.000:. ./.:4:84,13:.:-0.57:1.000:. ./.:4:95,25:.:-0.01:0.956:. ./.:4:159,10:.: 1.19:1.000:. ./.:4:123,15:.: 0.43:1.000:. ./.:4:133,10:.: 0.55:1.000:. ./.:4:119,3:.: 0.04:1.000:. -chr8.1 85671089 chr8.1_085671089 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:151,48:.: 0.59:1.000:. ./.:4:77,86:.:-0.36:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:145,55:.: 0.61:1.000:. ./.:4:147,63:.: 0.88:1.000:. ./.:4:180,57:.: 1.59:1.000:. ./.:4:91,25:.:-1.61:1.000:. ./.:4:138,35:.:-0.10:1.000:. ./.:4:130,47:.: 0.01:1.000:. ./.:4:75,17:.:-2.24:1.000:. ./.:4:105,0:.:-1.90:1.000:. ./.:4:136,105:.: 1.70:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:131,55:.: 0.24:1.000:. ./.:4:133,40:.:-0.10:1.000:. ./.:4:177,58:.: 1.54:1.000:. ./.:4:158,39:.: 0.53:0.998:. ./.:4:87,112:.: 0.59:1.000:. ./.:4:229,0:.: 1.38:1.000:. ./.:4:149,49:.: 0.56:1.000:. ./.:4:37,45:.:-2.50:1.000:. ./.:4:88,87:.:-0.05:1.000:. ./.:4:93,111:.: 0.72:1.000:. ./.:4:125,46:.:-0.15:1.000:. ./.:4:71,0:.:-2.80:1.000:. ./.:4:181,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:165,65:.: 1.41:1.000:. ./.:4:148,54:.: 0.67:1.000:. ./.:3:91,49:.:-0.97:1.000:. ./.:4:211,0:.: 0.90:1.000:. ./.:4:167,62:.: 1.38:1.000:. ./.:4:118,43:.:-0.42:1.000:. ./.:4:19,19:.:-3.67:1.000:. ./.:4:106,0:.:-1.87:1.000:. ./.:3:43,1:.:-3.51:1.000:. ./.:4:119,52:.:-0.15:1.000:. ./.:4:179,0:.: 0.06:0.979:. ./.:4:132,47:.: 0.06:1.000:. ./.:4:160,45:.: 0.75:1.000:. ./.:4:208,0:.: 0.82:1.000:. ./.:4:98,87:.: 0.22:1.000:. ./.:4:178,0:.: 0.03:1.000:. ./.:4:106,115:.: 1.17:1.000:. ./.:4:138,52:.: 0.35:1.000:. ./.:4:227,0:.: 1.33:1.000:. ./.:4:167,50:.: 1.06:1.000:. ./.:5:262,0:.: 2.25:1.000:. ./.:4:146,58:.: 0.72:1.000:. ./.:4:189,0:.: 0.32:1.000:. ./.:4:97,116:.: 0.96:1.000:. ./.:4:94,85:.: 0.06:1.000:. ./.:4:164,69:.: 1.49:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:144,49:.: 0.43:1.000:. ./.:4:187,0:.: 0.27:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:131,56:.: 0.27:1.000:. ./.:4:233,0:.: 1.49:1.000:. ./.:4:145,34:.: 0.06:1.000:. ./.:6:71,64:.:-1.10:1.000:. ./.:4:88,78:.:-0.28:1.000:. ./.:4:168,1:.:-0.21:1.000:. ./.:4:177,57:.: 1.51:1.000:. ./.:4:150,41:.: 0.38:1.000:. ./.:4:224,0:.: 1.25:1.000:. ./.:4:191,0:.: 0.38:1.000:. ./.:4:92,25:.:-1.58:1.000:. ./.:4:126,49:.:-0.05:1.000:. ./.:4:108,84:.: 0.40:0.887:. ./.:4:126,34:.:-0.44:1.000:. ./.:4:146,67:.: 0.96:1.000:. ./.:4:128,0:.:-1.29:0.999:. ./.:4:124,116:.: 1.67:1.000:. ./.:4:207,0:.: 0.80:1.000:. ./.:4:133,54:.: 0.27:1.000:. ./.:4:175,0:.:-0.05:1.000:. ./.:4:134,39:.:-0.10:1.000:. ./.:4:172,0:.:-0.13:1.000:. ./.:4:205,0:.: 0.75:1.000:. ./.:4:94,106:.: 0.61:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.26:0.915:. ./.:4:181,0:.: 0.11:1.000:. ./.:4:138,47:.: 0.22:1.000:. ./.:4:128,47:.:-0.05:1.000:. ./.:4:206,0:.: 0.77:0.980:. ./.:4:131,24:.:-0.58:1.000:. ./.:4:138,0:.:-1.02:1.000:. ./.:4:119,35:.:-0.60:1.000:. ./.:4:154,0:.:-0.60:1.000:. ./.:4:89,86:.:-0.05:1.000:. ./.:4:134,0:.:-1.13:1.000:. ./.:4:126,43:.:-0.21:1.000:. ./.:4:166,60:.: 1.30:1.000:. ./.:4:77,61:.:-1.02:1.000:. ./.:4:186,0:.: 0.24:1.000:. ./.:4:146,47:.: 0.43:1.000:. ./.:4:113,38:.:-0.68:1.000:. ./.:4:139,0:.:-1.00:1.000:. ./.:4:195,0:.: 0.48:1.000:. ./.:4:92,95:.: 0.27:1.000:. ./.:4:76,37:.:-1.69:1.000:. ./.:4:102,104:.: 0.77:1.000:. ./.:4:136,0:.:-1.08:1.000:. ./.:4:123,46:.:-0.21:0.999:. ./.:4:56,64:.:-1.50:1.000:. ./.:4:177,0:.: 0.01:1.000:. ./.:4:159,0:.:-0.47:1.000:. ./.:4:146,53:.: 0.59:1.000:. ./.:4:176,70:.: 1.83:0.993:. ./.:4:123,49:.:-0.13:1.000:. ./.:4:157,0:.:-0.52:1.000:. ./.:4:182,56:.: 1.62:1.000:. ./.:4:193,0:.: 0.43:0.999:. ./.:4:168,0:.:-0.23:1.000:. ./.:4:122,29:.:-0.68:1.000:. ./.:4:158,53:.: 0.90:1.000:. ./.:4:103,35:.:-1.02:1.000:. ./.:4:121,41:.:-0.39:1.000:. ./.:4:136,35:.:-0.15:1.000:. ./.:4:124,0:.:-1.39:1.000:. ./.:4:111,101:.: 0.93:1.000:. ./.:4:150,0:.:-0.71:1.000:. ./.:4:217,0:.: 1.06:1.000:. ./.:4:123,48:.:-0.15:1.000:. ./.:4:125,53:.: 0.03:1.000:. ./.:4:143,55:.: 0.56:1.000:. ./.:4:171,0:.:-0.15:1.000:. ./.:4:126,38:.:-0.34:1.000:. ./.:4:66,64:.:-1.24:1.000:. ./.:4:101,39:.:-0.97:1.000:. ./.:4:121,36:.:-0.52:1.000:. ./.:4:174,0:.:-0.07:1.000:. ./.:4:126,0:.:-1.34:0.998:. ./.:4:178,54:.: 1.46:1.000:. ./.:4:119,43:.:-0.39:1.000:. ./.:4:153,61:.: 0.98:1.000:. ./.:4:176,0:.:-0.02:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:92,32:.:-1.39:1.000:. ./.:4:111,37:.:-0.76:1.000:. ./.:4:167,0:.:-0.26:1.000:. ./.:4:124,37:.:-0.42:1.000:. ./.:4:114,41:.:-0.58:1.000:. ./.:4:142,0:.:-0.92:1.000:. ./.:4:176,61:.: 1.59:1.000:. ./.:4:111,120:.: 1.43:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:84,98:.: 0.14:1.000:. ./.:4:157,51:.: 0.82:1.000:. ./.:4:96,77:.:-0.10:1.000:. ./.:4:258,0:.: 2.15:1.000:. ./.:4:125,42:.:-0.26:1.000:. ./.:4:52,11:.:-3.01:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:160,46:.: 0.77:1.000:. ./.:4:166,47:.: 0.96:1.000:. ./.:4:182,0:.: 0.14:1.000:. ./.:4:128,38:.:-0.28:1.000:. ./.:4:130,22:.:-0.65:1.000:. ./.:4:145,60:.: 0.75:1.000:. ./.:4:143,0:.:-0.89:1.000:. ./.:4:89,90:.: 0.06:1.000:. ./.:4:164,0:.:-0.34:1.000:. ./.:4:147,41:.: 0.30:1.000:. ./.:4:135,64:.: 0.59:1.000:. ./.:4:137,43:.: 0.08:1.000:. ./.:4:64,62:.:-1.34:1.000:. ./.:4:165,0:.:-0.31:1.000:. ./.:4:91,90:.: 0.11:1.000:. ./.:4:124,38:.:-0.39:1.000:. ./.:4:83,76:.:-0.47:1.000:. ./.:4:70,66:.:-1.08:1.000:. ./.:4:147,38:.: 0.22:1.000:. ./.:4:84,91:.:-0.05:1.000:. ./.:4:105,27:.:-1.18:1.000:. ./.:4:68,71:.:-1.00:1.000:. ./.:4:158,49:.: 0.80:1.000:. ./.:4:145,48:.: 0.43:1.000:. ./.:4:134,46:.: 0.08:1.000:. ./.:4:145,36:.: 0.11:1.000:. ./.:4:149,36:.: 0.22:0.956:. ./.:4:216,0:.: 1.04:1.000:. ./.:4:125,107:.: 1.46:1.000:. ./.:4:95,31:.:-1.34:1.000:. ./.:4:141,54:.: 0.48:1.000:. -chr8.1 85866069 chr8.1_085866069 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:51,206:.: 1.07:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,222:.: 0.35:1.000:. ./.:4:39,126:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,289:.: 1.73:1.000:. ./.:4:46,143:.:-0.33:1.000:. ./.:4:25,66:.:-2.35:1.000:. ./.:4:0,199:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,202:.:-0.06:1.000:. ./.:4:32,116:.:-1.17:1.000:. ./.:4:20,147:.:-0.78:1.000:. ./.:4:49,153:.:-0.06:1.000:. ./.:4:41,165:.: 0.02:1.000:. ./.:4:50,130:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,276:.: 1.47:1.000:. ./.:4:54,109:.:-0.86:1.000:. ./.:4:49,146:.:-0.20:0.998:. ./.:4:92,93:.:-0.41:1.000:. ./.:4:63,223:.: 1.67:1.000:. ./.:4:44,208:.: 0.97:1.000:. ./.:4:1,111:.:-1.92:1.000:. ./.:4:0,178:.:-0.56:1.000:. ./.:4:0,176:.:-0.60:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.27:1.000:. ./.:4:5,76:.:-2.56:1.000:. ./.:4:54,201:.: 1.03:1.000:. ./.:4:40,145:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.02:1.000:. ./.:3:44,99:.:-1.28:1.000:. ./.:4:30,165:.:-0.20:1.000:. ./.:4:38,197:.: 0.62:1.000:. ./.:4:0,150:.:-1.13:1.000:. ./.:4:8,28:.:-3.48:1.000:. ./.:4:1,182:.:-0.45:1.000:. ./.:3:6,88:.:-2.29:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.47:1.000:. ./.:4:56,146:.:-0.06:0.979:. ./.:4:51,132:.:-0.45:1.000:. ./.:4:50,160:.: 0.10:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.64:1.000:. ./.:4:45,151:.:-0.18:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.17:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,252:.: 0.97:1.000:. ./.:4:0,244:.: 0.81:1.000:. ./.:4:50,163:.: 0.17:1.000:. ./.:5:0,342:.: 2.83:1.000:. ./.:4:10,16:.:-3.69:1.000:. ./.:4:0,230:.: 0.52:1.000:. ./.:4:64,150:.: 0.19:1.000:. ./.:4:0,241:.: 0.74:1.000:. ./.:4:52,168:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,206:.: 0.02:1.000:. ./.:4:61,193:.: 1.01:1.000:. ./.:4:36,133:.:-0.74:1.000:. ./.:4:49,236:.: 1.65:1.000:. ./.:4:42,147:.:-0.33:1.000:. ./.:4:63,245:.: 2.13:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.60:1.000:. ./.:6:0,185:.:-0.41:1.000:. ./.:4:1,243:.: 0.81:1.000:. ./.:4:38,152:.:-0.31:1.000:. ./.:4:52,237:.: 1.73:1.000:. ./.:4:38,159:.:-0.16:1.000:. ./.:4:51,204:.: 1.03:1.000:. ./.:4:59,205:.: 1.22:1.000:. ./.:4:33,128:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,194:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.76:0.887:. ./.:4:90,83:.:-0.66:1.000:. ./.:4:60,189:.: 0.91:1.000:. ./.:4:0,145:.:-1.24:0.999:. ./.:4:66,175:.: 0.74:1.000:. ./.:4:45,167:.: 0.15:1.000:. ./.:4:44,162:.: 0.02:1.000:. ./.:4:41,136:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,197:.:-0.16:1.000:. ./.:4:0,256:.: 1.05:1.000:. ./.:4:0,195:.:-0.20:1.000:. ./.:4:0,201:.:-0.08:1.000:. ./.:4:50,123:.:-0.66:0.915:. ./.:4:0,242:.: 0.76:1.000:. ./.:4:0,203:.:-0.04:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.27:1.000:. ./.:4:63,206:.: 1.32:0.980:. ./.:4:0,220:.: 0.31:1.000:. ./.:4:0,190:.:-0.31:1.000:. ./.:4:38,186:.: 0.39:1.000:. ./.:4:49,182:.: 0.54:1.000:. ./.:4:0,233:.: 0.58:1.000:. ./.:4:0,179:.:-0.53:1.000:. ./.:4:44,192:.: 0.64:1.000:. ./.:4:55,144:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,163:.:-0.86:1.000:. ./.:4:38,131:.:-0.74:1.000:. ./.:4:1,252:.: 0.99:1.000:. ./.:4:52,187:.: 0.70:1.000:. ./.:4:33,128:.:-0.91:1.000:. ./.:4:67,202:.: 1.32:1.000:. ./.:4:0,283:.: 1.61:1.000:. ./.:4:79,112:.:-0.29:1.000:. ./.:4:56,244:.: 1.96:1.000:. ./.:4:0,172:.:-0.68:1.000:. ./.:4:55,160:.: 0.21:0.999:. ./.:4:0,168:.:-0.76:1.000:. ./.:4:67,187:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,191:.:-0.29:1.000:. ./.:4:48,139:.:-0.37:1.000:. ./.:4:60,222:.: 1.59:0.993:. ./.:4:53,136:.:-0.33:1.000:. ./.:4:46,153:.:-0.12:1.000:. ./.:4:0,248:.: 0.89:1.000:. ./.:4:49,166:.: 0.21:0.999:. ./.:4:0,234:.: 0.60:1.000:. ./.:4:41,129:.:-0.72:1.000:. ./.:4:51,250:.: 1.98:1.000:. ./.:4:2,172:.:-0.64:1.000:. ./.:4:0,274:.: 1.42:1.000:. ./.:4:58,146:.:-0.02:1.000:. ./.:4:0,220:.: 0.31:1.000:. ./.:4:53,167:.: 0.31:1.000:. ./.:4:41,198:.: 0.70:1.000:. ./.:4:54,163:.: 0.25:1.000:. ./.:4:0,182:.:-0.47:1.000:. ./.:4:52,197:.: 0.91:1.000:. ./.:4:48,193:.: 0.74:1.000:. ./.:4:0,223:.: 0.37:1.000:. ./.:4:0,158:.:-0.97:1.000:. ./.:4:0,159:.:-0.95:1.000:. ./.:4:42,123:.:-0.82:1.000:. ./.:4:0,243:.: 0.78:1.000:. ./.:4:33,160:.:-0.25:1.000:. ./.:4:18,129:.:-1.19:0.998:. ./.:4:0,266:.: 1.26:1.000:. ./.:4:40,126:.:-0.80:1.000:. ./.:4:60,220:.: 1.55:1.000:. ./.:4:57,128:.:-0.41:1.000:. ./.:4:47,130:.:-0.58:1.000:. ./.:4:1,188:.:-0.33:1.000:. ./.:4:0,213:.: 0.17:1.000:. ./.:4:49,219:.: 1.30:1.000:. ./.:4:0,234:.: 0.60:1.000:. ./.:4:50,168:.: 0.27:1.000:. ./.:4:36,99:.:-1.44:1.000:. ./.:4:0,297:.: 1.90:1.000:. ./.:4:66,197:.: 1.20:1.000:. ./.:4:57,128:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,192:.:-0.27:1.000:. ./.:4:47,158:.: 0.00:1.000:. ./.:4:0,242:.: 0.76:1.000:. ./.:4:68,162:.: 0.52:1.000:. ./.:4:42,121:.:-0.86:1.000:. ./.:4:19,97:.:-1.83:1.000:. ./.:4:0,127:.:-1.61:1.000:. ./.:4:52,185:.: 0.66:1.000:. ./.:4:0,245:.: 0.83:1.000:. ./.:4:45,195:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,239:.: 0.70:1.000:. ./.:4:0,193:.:-0.25:1.000:. ./.:4:38,183:.: 0.33:1.000:. ./.:4:31,117:.:-1.17:1.000:. ./.:4:1,166:.:-0.78:1.000:. ./.:4:44,147:.:-0.29:1.000:. ./.:4:39,144:.:-0.45:1.000:. ./.:4:33,121:.:-1.05:1.000:. ./.:4:41,144:.:-0.41:1.000:. ./.:4:0,121:.:-1.73:1.000:. ./.:4:0,160:.:-0.93:1.000:. ./.:4:2,175:.:-0.58:1.000:. ./.:4:0,153:.:-1.07:1.000:. ./.:4:38,106:.:-1.26:1.000:. ./.:4:0,164:.:-0.84:1.000:. ./.:4:0,236:.: 0.64:1.000:. ./.:4:44,96:.:-1.34:1.000:. ./.:4:0,216:.: 0.23:1.000:. ./.:4:0,177:.:-0.58:1.000:. ./.:4:46,155:.:-0.08:1.000:. ./.:4:55,204:.: 1.11:1.000:. ./.:4:47,144:.:-0.29:1.000:. ./.:4:1,190:.:-0.29:1.000:. ./.:4:0,183:.:-0.45:0.956:. ./.:4:54,172:.: 0.43:1.000:. ./.:4:0,307:.: 2.10:1.000:. ./.:4:39,101:.:-1.34:1.000:. ./.:4:41,148:.:-0.33:1.000:. -chr8.1 85961468 chr8.1_085961468 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:43,109:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.44:1.000:. ./.:4:46,132:.: 0.39:1.000:. ./.:4:34,95:.:-0.77:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.72:1.000:. ./.:4:98,86:.: 0.53:1.000:. ./.:4:27,86:.:-1.15:1.000:. ./.:4:47,106:.:-0.20:1.000:. ./.:4:47,111:.:-0.08:1.000:. ./.:4:3,24:.:-3.19:1.000:. ./.:4:34,23:.:-2.48:1.000:. ./.:4:35,153:.: 0.63:1.000:. ./.:4:34,92:.:-0.84:1.000:. ./.:4:105,82:.: 0.60:1.000:. ./.:4:0,143:.:-0.44:1.000:. ./.:4:59,62:.:-0.96:1.000:. ./.:4:97,76:.: 0.27:0.998:. ./.:4:91,78:.: 0.18:1.000:. ./.:4:112,78:.: 0.68:1.000:. ./.:4:102,88:.: 0.68:1.000:. ./.:4:0,44:.:-2.79:1.000:. ./.:4:0,152:.:-0.23:1.000:. ./.:4:0,184:.: 0.53:1.000:. ./.:4:53,101:.:-0.18:1.000:. ./.:4:5,22:.:-3.19:1.000:. ./.:4:113,102:.: 1.27:1.000:. ./.:4:52,51:.:-1.39:1.000:. ./.:4:0,122:.:-0.94:1.000:. ./.:3:103,44:.:-0.35:1.000:. ./.:4:48,120:.: 0.15:1.000:. ./.:4:57,161:.: 1.34:1.000:. ./.:4:36,87:.:-0.91:1.000:. ./.:4:4,6:.:-3.60:1.000:. ./.:4:0,49:.:-2.67:1.000:. ./.:3:9,16:.:-3.24:1.000:. ./.:4:36,101:.:-0.58:1.000:. ./.:4:86,75:.:-0.01:0.979:. ./.:4:48,133:.: 0.46:1.000:. ./.:4:44,143:.: 0.60:1.000:. ./.:4:52,157:.: 1.13:1.000:. ./.:4:36,125:.:-0.01:1.000:. ./.:4:50,126:.: 0.34:1.000:. ./.:4:63,153:.: 1.29:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.41:1.000:. ./.:4:40,153:.: 0.75:1.000:. ./.:4:104,90:.: 0.77:1.000:. ./.:5:53,171:.: 1.48:1.000:. ./.:4:55,68:.:-0.91:1.000:. ./.:4:0,133:.:-0.68:1.000:. ./.:4:45,150:.: 0.79:1.000:. ./.:4:0,156:.:-0.13:1.000:. ./.:4:60,148:.: 1.10:1.000:. ./.:4:0,178:.: 0.39:1.000:. ./.:4:118,103:.: 1.41:1.000:. ./.:4:77,67:.:-0.42:1.000:. ./.:4:40,148:.: 0.63:1.000:. ./.:4:89,98:.: 0.60:1.000:. ./.:4:91,81:.: 0.25:1.000:. ./.:4:1,170:.: 0.22:1.000:. ./.:6:0,157:.:-0.11:1.000:. ./.:4:0,198:.: 0.86:1.000:. ./.:4:52,119:.: 0.22:1.000:. ./.:4:66,134:.: 0.91:1.000:. ./.:4:85,81:.: 0.11:1.000:. ./.:4:83,86:.: 0.18:1.000:. ./.:4:100,93:.: 0.75:1.000:. ./.:4:90,93:.: 0.51:1.000:. ./.:4:48,121:.: 0.18:1.000:. ./.:4:0,192:.: 0.72:0.887:. ./.:4:66,68:.:-0.65:1.000:. ./.:4:51,189:.: 1.86:1.000:. ./.:4:48,130:.: 0.39:0.999:. ./.:4:58,167:.: 1.51:1.000:. ./.:4:129,78:.: 1.08:1.000:. ./.:4:46,140:.: 0.58:1.000:. ./.:4:111,108:.: 1.36:1.000:. ./.:4:60,112:.: 0.25:1.000:. ./.:4:47,139:.: 0.58:1.000:. ./.:4:47,127:.: 0.30:1.000:. ./.:4:57,160:.: 1.32:1.000:. ./.:4:40,86:.:-0.84:0.915:. ./.:4:44,144:.: 0.63:1.000:. ./.:4:64,143:.: 1.08:1.000:. ./.:4:0,95:.:-1.58:1.000:. ./.:4:60,196:.: 2.24:0.980:. ./.:4:65,142:.: 1.08:1.000:. ./.:4:34,107:.:-0.49:1.000:. ./.:4:45,114:.:-0.06:1.000:. ./.:4:63,157:.: 1.39:1.000:. ./.:4:0,163:.: 0.03:1.000:. ./.:4:57,139:.: 0.82:1.000:. ./.:4:42,108:.:-0.27:1.000:. ./.:4:105,82:.: 0.60:1.000:. ./.:4:25,72:.:-1.53:1.000:. ./.:4:126,102:.: 1.58:1.000:. ./.:4:0,179:.: 0.41:1.000:. ./.:4:47,110:.:-0.11:1.000:. ./.:4:41,100:.:-0.49:1.000:. ./.:4:62,172:.: 1.72:1.000:. ./.:4:0,172:.: 0.25:1.000:. ./.:4:92,90:.: 0.49:1.000:. ./.:4:68,185:.: 2.17:1.000:. ./.:4:38,94:.:-0.70:1.000:. ./.:4:111,90:.: 0.94:0.999:. ./.:4:0,133:.:-0.68:1.000:. ./.:4:111,59:.: 0.20:1.000:. ./.:4:33,138:.: 0.22:1.000:. ./.:4:46,122:.: 0.15:1.000:. ./.:4:51,150:.: 0.94:0.993:. ./.:4:53,122:.: 0.32:1.000:. ./.:4:95,97:.: 0.72:1.000:. ./.:4:41,155:.: 0.82:1.000:. ./.:4:96,67:.: 0.03:0.999:. ./.:4:0,181:.: 0.46:1.000:. ./.:4:88,65:.:-0.20:1.000:. ./.:4:47,151:.: 0.86:1.000:. ./.:4:1,187:.: 0.63:1.000:. ./.:4:0,140:.:-0.51:1.000:. ./.:4:66,120:.: 0.58:1.000:. ./.:4:42,115:.:-0.11:1.000:. ./.:4:93,87:.: 0.44:1.000:. ./.:4:40,122:.: 0.01:1.000:. ./.:4:159,45:.: 1.01:1.000:. ./.:4:0,116:.:-1.08:1.000:. ./.:4:106,90:.: 0.82:1.000:. ./.:4:56,137:.: 0.75:1.000:. ./.:4:44,96:.:-0.51:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.70:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.70:1.000:. ./.:4:85,77:.: 0.01:1.000:. ./.:4:0,157:.:-0.11:1.000:. ./.:4:26,102:.:-0.80:1.000:. ./.:4:74,64:.:-0.56:0.998:. ./.:4:0,150:.:-0.27:1.000:. ./.:4:93,72:.: 0.08:1.000:. ./.:4:45,154:.: 0.89:1.000:. ./.:4:102,83:.: 0.56:1.000:. ./.:4:83,66:.:-0.30:1.000:. ./.:4:0,171:.: 0.22:1.000:. ./.:4:0,126:.:-0.84:1.000:. ./.:4:102,105:.: 1.08:1.000:. ./.:4:1,167:.: 0.15:1.000:. ./.:4:74,74:.:-0.32:1.000:. ./.:4:66,72:.:-0.56:1.000:. ./.:4:45,136:.: 0.46:1.000:. ./.:4:52,128:.: 0.44:1.000:. ./.:4:100,83:.: 0.51:1.000:. ./.:4:1,153:.:-0.18:1.000:. ./.:4:81,64:.:-0.39:1.000:. ./.:4:0,132:.:-0.70:1.000:. ./.:4:89,77:.: 0.11:1.000:. ./.:4:34,99:.:-0.68:1.000:. ./.:4:15,20:.:-3.00:1.000:. ./.:4:21,81:.:-1.41:1.000:. ./.:4:63,158:.: 1.41:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.06:1.000:. ./.:4:49,124:.: 0.27:1.000:. ./.:4:60,137:.: 0.84:1.000:. ./.:4:0,117:.:-1.06:1.000:. ./.:4:31,124:.:-0.16:1.000:. ./.:4:58,81:.:-0.53:1.000:. ./.:4:31,71:.:-1.41:1.000:. ./.:4:37,87:.:-0.89:1.000:. ./.:4:97,76:.: 0.27:1.000:. ./.:4:44,97:.:-0.49:1.000:. ./.:4:29,81:.:-1.22:1.000:. ./.:4:0,136:.:-0.61:1.000:. ./.:4:0,129:.:-0.77:1.000:. ./.:4:35,108:.:-0.44:1.000:. ./.:4:0,123:.:-0.91:1.000:. ./.:4:29,67:.:-1.56:1.000:. ./.:4:1,108:.:-1.25:1.000:. ./.:4:0,149:.:-0.30:1.000:. ./.:4:26,107:.:-0.68:1.000:. ./.:4:0,164:.: 0.06:1.000:. ./.:4:0,114:.:-1.13:1.000:. ./.:4:43,130:.: 0.27:1.000:. ./.:4:62,149:.: 1.17:1.000:. ./.:4:103,87:.: 0.68:1.000:. ./.:4:37,89:.:-0.84:1.000:. ./.:4:49,125:.: 0.30:0.956:. ./.:4:106,86:.: 0.72:1.000:. ./.:4:0,173:.: 0.27:1.000:. ./.:4:78,62:.:-0.51:1.000:. ./.:4:40,111:.:-0.25:1.000:. -chr8.1 86156004 chr8.1_086156004 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/1/1/1:4:35,108:0.76: 0.31:1.000:1.000 0/0/0/0:4:70,0:0.00:-1.15:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,46:0.56:-0.93:1.000:0.972 0/1/1/1:4:50,107:0.68: 0.59:1.000:0.961 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,213:1.00: 1.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:29,60:0.67:-0.77:1.000:0.939 0/1/1/1:4:48,126:0.73: 0.93:1.000:0.998 0/0/0/1:4:87,31:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:13,21:0.61:-1.86:1.000:0.668 0/1/1/1:4:15,36:0.71:-1.52:1.000:0.992 0/0/0/1:4:124,58:0.30: 1.09:1.000:0.983 0/0/0/1:4:107,54:0.32: 0.67:1.000:0.955 0/1/1/1:4:51,164:0.77: 1.74:1.000:1.000 0/0/0/0:4:133,0:0.00: 0.11:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,192:1.00: 1.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,117:0.66: 1.01:0.998:0.843 0/0/1/1:4:91,139:0.60: 2.04:1.000:0.813 0/1/1/1:4:47,122:0.73: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,132:0.75: 1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:4,14:0.78:-2.18:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,43:0.34:-0.15:1.000:0.855 0/0/1/1:4:65,61:0.47:-0.03:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,45:0.51:-0.83:1.000:0.996 0/0/1/1:4:14,14:0.48:-1.98:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,138:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,113:0.70: 0.71:1.000:0.981 0/0/0/1:4:92,47:0.32: 0.23:1.000:0.948 0/1/1:3:31,74:0.71:-0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,73:0.63:-0.25:1.000:0.578 1/1/1/1:4:0,141:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,116:0.67: 0.91:1.000:0.924 0/0/1/1:4:15,25:0.62:-1.74:1.000:0.566 0/0/0/0:4:28,0:0.00:-1.98:1.000:1.000 0/1/1:3:9,26:0.75:-1.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,52:0.50:-0.55:1.000:0.997 0/0/1/1:4:91,116:0.55: 1.58:0.979:0.981 0/1/1/1:4:47,128:0.74: 0.95:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,142:0.78: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:48,42:0.45:-0.75:1.000:0.980 0/0/1/1:4:64,94:0.59: 0.61:1.000:0.882 0/0/1/1:4:52,42:0.43:-0.67:1.000:0.947 0/1/1/1:4:34,71:0.68:-0.45:1.000:0.946 0/0/0/0:4:125,0:0.00:-0.05:1.000:1.000 0/0/0/1:4:52,31:0.36:-0.89:1.000:0.719 0/0/1/1:4:79,94:0.53: 0.91:1.000:0.992 0/0/0/1/1:5:86,50:0.35: 0.17:1.000:0.907 0/0/1/1:4:157,201:0.55: 4.59:1.000:0.980 0/0/0/0:4:59,0:0.00:-1.36:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,102:0.57: 0.97:1.000:0.947 0/0/1/1:4:48,36:0.41:-0.87:1.000:0.876 0/1/1/1:4:32,110:0.78: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/0:4:61,0:0.00:-1.33:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,147:1.00: 0.39:1.000:1.000 0/0/1/1:4:79,82:0.49: 0.67:1.000:0.996 0/1/1/1:4:31,62:0.67:-0.69:1.000:0.905 0/1/1/1:4:35,115:0.77: 0.45:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,100:0.74: 0.17:1.000:0.999 0/0/1/1:4:59,50:0.44:-0.37:1.000:0.970 0/0/0/0/0/0:6:89,0:0.00:-0.77:1.000:1.000 0/0/0/0:4:112,0:0.00:-0.31:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,57:0.42: 0.05:1.000:0.922 0/0/1/1:4:68,57:0.44:-0.05:1.000:0.966 0/0/1/1:4:71,87:0.54: 0.61:1.000:0.989 0/1/1/1:4:47,94:0.67: 0.27:1.000:0.905 0/1/1/1:4:50,93:0.65: 0.31:1.000:0.778 0/1/1/1:4:19,53:0.74:-1.11:1.000:0.999 0/1/1/1:4:28,80:0.75:-0.39:1.000:0.999 0/0/0/1:4:77,49:0.37:-0.03:0.887:0.529 0/0/1/1:4:70,87:0.54: 0.59:1.000:0.987 0/0/1/1:4:89,83:0.47: 0.89:1.000:0.991 0/0/0/1:4:50,29:0.35:-0.97:0.999:0.784 0/0/1/1:4:84,89:0.50: 0.91:1.000:0.997 0/0/1/1:4:97,98:0.49: 1.35:1.000:0.996 0/0/0/1:4:97,49:0.32: 0.37:1.000:0.955 0/1/1/1:4:44,87:0.66: 0.07:1.000:0.891 0/0/0/1:4:92,36:0.27: 0.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:40,30:0.41:-1.15:1.000:0.876 0/0/0/1:4:71,27:0.26:-0.59:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,88:0.63: 0.23:1.000:0.553 0/0/1/1:4:40,37:0.46:-1.01:0.915:0.990 0/0/0/1:4:74,44:0.36:-0.19:1.000:0.726 0/0/0/1:4:112,40:0.25: 0.49:1.000:0.999 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,55:0.59:-0.71:0.980:0.864 0/0/0/1:4:125,35:0.21: 0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:58,21:0.25:-0.97:1.000:0.999 0/1/1/1:4:37,78:0.68:-0.25:1.000:0.952 0/0/1/1:4:55,50:0.46:-0.45:1.000:0.987 0/0/1/1:4:74,48:0.38:-0.11:1.000:0.532 0/0/1/1:4:29,29:0.48:-1.38:1.000:0.995 0/1/1/1:4:35,82:0.70:-0.21:1.000:0.989 0/0/1/1:4:81,100:0.54: 1.07:1.000:0.988 0/1/1/1:4:31,63:0.67:-0.67:1.000:0.923 0/1/1/1:4:41,83:0.67:-0.07:1.000:0.919 0/0/0/0:4:96,0:0.00:-0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:25,66:0.73:-0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:36,46:0.55:-0.91:1.000:0.981 0/0/1/1:4:50,34:0.39:-0.87:1.000:0.674 0/0/1/1:4:40,52:0.55:-0.71:1.000:0.976 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-0.61:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,99:0.71: 0.25:1.000:0.992 0/0/0/1:4:50,18:0.25:-1.19:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.31:0.999:1.000 0/0/0/1:4:87,35:0.27:-0.11:1.000:0.997 0/0/1/1:4:75,86:0.52: 0.67:1.000:0.995 0/0/1/1:4:46,31:0.39:-1.01:1.000:0.648 0/0/1/1:4:84,128:0.60: 1.68:1.000:0.818 1/1/1/1:4:0,130:1.00: 0.05:0.993:1.000 0/1/1/1:4:37,82:0.69:-0.17:1.000:0.976 0/1/1/1:4:24,51:0.68:-1.05:1.000:0.957 0/0/1/1:4:110,71:0.38: 1.07:1.000:0.516 0/0/1/1:4:36,60:0.62:-0.63:0.999:0.566 0/0/0/0:4:71,0:0.00:-1.13:1.000:1.000 0/1/1/1:4:30,101:0.78: 0.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,91:0.52: 0.87:1.000:0.995 0/0/0/1:4:52,30:0.35:-0.91:1.000:0.795 0/0/0/0:4:83,0:0.00:-0.89:1.000:1.000 0/0/1/1:4:64,93:0.58: 0.59:1.000:0.897 0/0/0/1:4:60,33:0.34:-0.69:1.000:0.877 0/1/1/1:4:40,141:0.79: 1.07:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,37:0.38:-0.67:1.000:0.534 0/1/1/1:4:39,131:0.78: 0.85:1.000:1.000 0/0/1/1:4:53,50:0.47:-0.49:1.000:0.992 0/1/1/1:4:34,75:0.69:-0.37:1.000:0.974 0/0/0/1:4:80,43:0.33:-0.09:1.000:0.905 0/0/1/1:4:30,32:0.50:-1.31:1.000:0.997 0/0/0/0:4:104,0:0.00:-0.47:1.000:1.000 0/0/0/1:4:89,35:0.27:-0.07:1.000:0.998 0/1/1/1:4:25,108:0.82: 0.11:1.000:0.999 0/0/0/1:4:85,39:0.30:-0.07:1.000:0.986 0/0/1/1:4:47,55:0.52:-0.51:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,45:1.00:-1.64:0.998:1.000 0/0/0/0:4:86,0:0.00:-0.83:1.000:1.000 0/0/1/1:4:88,75:0.44: 0.71:1.000:0.972 0/0/0/1:4:127,75:0.36: 1.48:1.000:0.743 0/0/1/1:4:97,104:0.50: 1.46:1.000:0.997 0/1/1/1:4:31,60:0.66:-0.73:1.000:0.858 0/0/1/1:4:31,28:0.46:-1.36:1.000:0.986 0/0/0/0:4:85,0:0.00:-0.85:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,66:0.65:-0.53:1.000:0.809 0/0/1/1:4:55,38:0.39:-0.69:1.000:0.716 0/1/1/1:4:46,93:0.67: 0.23:1.000:0.917 0/1/1/1:4:27,57:0.68:-0.87:1.000:0.953 0/0/0/1:4:94,41:0.29: 0.15:1.000:0.993 0/0/1/1:4:97,103:0.50: 1.44:1.000:0.997 0/0/1/1:4:114,108:0.47: 1.88:1.000:0.992 0/0/1/1:4:40,52:0.55:-0.71:1.000:0.976 0/1/1/1:4:56,194:0.78: 2.44:1.000:1.000 0/0/0/1:4:84,37:0.29:-0.13:1.000:0.992 0/1/1/1:4:51,128:0.72: 1.03:1.000:0.996 0/1/1/1:4:52,133:0.72: 1.15:1.000:0.997 0/1/1/1:4:8,20:0.72:-1.98:1.000:0.995 0/0/1/1:4:37,33:0.45:-1.15:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.19:1.000:1.000 0/0/0/0:4:126,0:0.00:-0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:45,63:0.57:-0.39:1.000:0.935 0/0/0/1:4:113,54:0.31: 0.79:1.000:0.977 0/0/0/0:4:136,0:0.00: 0.17:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,113:1.00:-0.29:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,105:0.76: 0.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:103,103:0.48: 1.56:1.000:0.995 0/0/1/1:4:90,61:0.39: 0.47:1.000:0.664 1/1/1/1:4:0,163:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/1/1/1:4:68,145:0.68: 1.70:1.000:0.959 0/1/1/1:4:50,109:0.69: 0.63:1.000:0.969 0/0/0/1:4:70,43:0.36:-0.29:1.000:0.637 0/0/0/0:4:77,0:0.00:-1.01:1.000:1.000 0/1/1/1:4:67,115:0.63: 1.09:1.000:0.535 0/0/0/0:4:65,0:0.00:-1.25:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,87:0.49: 0.91:1.000:0.996 0/0/1/1:4:45,54:0.53:-0.57:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,44:0.49:-0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:49,113:0.70: 0.69:1.000:0.986 0/0/0/0:4:99,0:0.00:-0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:37,49:0.56:-0.83:1.000:0.969 0/1/1/1:4:62,173:0.74: 2.14:1.000:0.999 0/0/0/1:4:67,41:0.36:-0.39:1.000:0.648 0/1/1/1:4:51,157:0.76: 1.60:1.000:1.000 0/0/0/1:4:141,53:0.26: 1.33:1.000:0.999 0/0/0/1:4:114,41:0.25: 0.55:0.956:0.999 0/0/1/1:4:119,109:0.46: 2.00:1.000:0.988 0/0/0/1:4:115,70:0.36: 1.15:1.000:0.663 1/1/1/1:4:0,128:1.00: 0.01:1.000:1.000 0/0/0/1:4:80,44:0.34:-0.07:1.000:0.877 -chr8.1 86309971 chr8.1_086309971 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 1/1/1/1:4:0,178:1.00: 0.71:1.000:1.000 0/0/1/1:4:98,63:0.48: 0.37:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,141:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,120:0.77: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:125,101:0.53: 1.68:1.000:0.991 1/1/1/1:4:0,190:1.00: 0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:44,116:0.79: 0.35:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,160:1.00: 0.35:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,135:0.77: 0.99:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,15:1.00:-2.58:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,24:1.00:-2.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:131,125:0.57: 2.29:1.000:0.939 0/1/1/1:4:54,114:0.75: 0.51:1.000:0.999 1/1/1/1:4:1,165:1.00: 0.47:1.000:1.000 0/0/1/1:4:105,66:0.48: 0.57:1.000:0.994 1/1/1/1:4:0,164:1.00: 0.43:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,103:0.72: 0.35:0.998:0.996 0/1/1/1:4:68,122:0.72: 0.95:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,188:1.00: 0.91:1.000:1.000 0/1/1/1:4:66,186:0.80: 2.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:13,30:0.77:-2.02:1.000:1.000 0/0/1/1:4:102,64:0.48: 0.47:1.000:0.994 0/1/1/1:4:50,134:0.79: 0.83:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,114:0.77: 0.41:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,11:1.00:-2.66:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,134:1.00:-0.18:1.000:1.000 0/1/1/1:4:59,124:0.75: 0.81:1.000:0.999 0/1/1/1:4:58,109:0.73: 0.49:1.000:0.997 0/1/1:3:53,100:0.73: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,131:0.75: 1.03:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,116:1.00:-0.54:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,112:1.00:-0.62:1.000:1.000 0/0/1/1:4:4,3:0.52:-2.74:1.000:0.996 0/1/1/1:4:15,20:0.65:-2.18:1.000:0.806 1/1/1:3:1,15:0.95:-2.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,132:0.75: 1.05:1.000:0.999 0/1/1/1:4:51,119:0.77: 0.55:0.979:1.000 0/1/1/1:4:49,125:0.78: 0.63:1.000:1.000 0/1/1/1:4:36,73:0.74:-0.68:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,154:1.00: 0.23:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,39:0.41:-0.40:1.000:0.882 1/1/1/1:4:0,111:1.00:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,93:0.77:-0.22:1.000:1.000 0/0/1/1:4:73,48:0.49:-0.44:1.000:0.996 0/1/1/1:4:46,93:0.74:-0.08:1.000:0.999 0/0/1/1:4:83,58:0.50:-0.04:1.000:0.997 0/1/1/1/1:5:66,171:0.79: 1.90:1.000:0.990 0/0/1/1:4:44,32:0.51:-1.35:1.000:0.996 0/1/1/1:4:30,80:0.79:-0.66:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,37:0.47:-0.91:1.000:0.992 0/1/1/1:4:31,61:0.74:-1.03:1.000:0.999 0/1/1/1:4:73,110:0.68: 0.81:1.000:0.953 0/1/1/1:4:48,91:0.73:-0.08:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,131:1.00:-0.24:1.000:1.000 0/1/1/1:4:54,143:0.79: 1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:33,67:0.75:-0.87:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,83:1.00:-1.21:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,103:1.00:-0.80:1.000:1.000 0/0/0/0/1/1:6:94,23:0.30:-0.52:1.000:0.880 0/0/0/1:4:130,21:0.25: 0.17:1.000:0.999 0/1/1/1:4:48,89:0.73:-0.12:1.000:0.997 0/0/1/1:4:94,55:0.46: 0.12:1.000:0.988 0/0/1/1:4:71,46:0.48:-0.52:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.34:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:24,71:0.81:-0.97:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,118:1.00:-0.50:1.000:1.000 0/0/1/1:4:75,43:0.46:-0.50:0.887:0.985 0/1/1/1:4:34,102:0.81:-0.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:41,86:0.75:-0.32:1.000:0.999 0/1/1/1:4:47,86:0.72:-0.20:0.999:0.996 0/0/0/1:4:91,32:0.36:-0.40:1.000:0.677 0/1/1/1:4:63,136:0.76: 1.14:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,92:0.75:-0.12:1.000:0.999 0/1/1/1:4:41,64:0.69:-0.76:1.000:0.970 0/0/1/1:4:89,61:0.50: 0.15:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,96:1.00:-0.95:1.000:1.000 0/1/1/1:4:56,105:0.73: 0.37:1.000:0.997 0/1/1/1:4:48,91:0.73:-0.08:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,95:1.00:-0.97:0.915:1.000 0/1/1/1:4:50,86:0.71:-0.14:1.000:0.991 0/0/1/1:4:109,53:0.42: 0.39:1.000:0.923 0/0/1/1:4:101,68:0.49: 0.53:1.000:0.996 0/0/1/1:4:40,46:0.62:-1.15:0.980:0.610 0/0/1/1:4:95,79:0.54: 0.63:1.000:0.988 0/1/1/1:4:36,86:0.77:-0.42:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,89:1.00:-1.09:1.000:1.000 0/1/1/1:4:34,77:0.76:-0.64:1.000:1.000 0/1/1/1:4:57,100:0.71: 0.29:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,121:1.00:-0.44:1.000:1.000 0/1/1/1:4:50,82:0.70:-0.22:1.000:0.984 0/0/1/1:4:108,76:0.50: 0.83:1.000:0.997 0/1/1/1:4:47,89:0.73:-0.14:1.000:0.998 0/1/1/1:4:32,89:0.80:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:86,49:0.46:-0.16:1.000:0.984 1/1/1/1:4:0,105:1.00:-0.76:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:53,101:0.73: 0.23:1.000:0.998 0/1/1/1:4:60,112:0.73: 0.59:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,114:1.00:-0.58:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,99:0.76: 0.02:1.000:1.000 0/1/1/1:4:20,54:0.79:-1.39:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,115:1.00:-0.56:0.999:1.000 0/0/1/1:4:54,32:0.46:-1.15:1.000:0.990 0/1/1/1:4:46,88:0.73:-0.18:1.000:0.998 0/1/1/1:4:39,66:0.71:-0.76:1.000:0.989 0/1/1/1:4:45,121:0.79: 0.47:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,228:1.00: 1.72:0.993:1.000 1/1/1/1:4:0,119:1.00:-0.48:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,102:0.79:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:114,90:0.53: 1.24:1.000:0.993 0/1/1/1:4:43,86:0.74:-0.28:0.999:0.999 0/1/1/1:4:48,90:0.73:-0.10:1.000:0.997 1/1/1/1:4:0,64:1.00:-1.59:1.000:1.000 0/1/1/1:4:45,98:0.76: 0.00:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,97:0.68: 0.35:1.000:0.964 0/0/1/1:4:56,54:0.58:-0.66:1.000:0.932 0/1/1/1:4:30,78:0.79:-0.70:1.000:1.000 0/1/1/1:4:46,64:0.66:-0.66:1.000:0.878 0/1/1/1:4:44,109:0.78: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:35,61:0.71:-0.95:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,125:1.00:-0.36:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,196:1.00: 1.07:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,90:0.77:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,66:0.52: 0.21:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,88:1.00:-1.11:1.000:1.000 0/1/1/1:4:27,40:0.68:-1.53:1.000:0.942 0/0/1/1:4:52,33:0.48:-1.17:1.000:0.995 1/1/1/1:4:0,72:1.00:-1.43:1.000:1.000 0/0/1/1:4:80,56:0.50:-0.14:1.000:0.997 0/1/1/1:4:41,108:0.79: 0.12:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,70:1.00:-1.47:0.998:1.000 0/0/1/1:4:81,42:0.44:-0.40:1.000:0.959 0/0/1/1:4:95,74:0.52: 0.53:1.000:0.994 0/0/1/1:4:136,101:0.51: 1.90:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,89:0.69: 0.06:1.000:0.970 0/1/1/1:4:33,56:0.71:-1.09:1.000:0.990 1/1/1/1:4:1,84:0.99:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,49:0.47:-0.24:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,97:1.00:-0.93:1.000:1.000 0/1/1/1:4:40,95:0.77:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:49,99:0.74: 0.10:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,78:1.00:-1.31:1.000:1.000 0/1/1/1:4:86,157:0.72: 2.02:1.000:0.996 0/0/1/1:4:160,119:0.51: 2.75:1.000:0.996 0/1/1/1:4:57,118:0.75: 0.65:1.000:0.999 0/1/1/1:4:52,105:0.74: 0.29:1.000:0.999 1/1/1/1:4:0,194:1.00: 1.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:93,74:0.53: 0.49:1.000:0.992 0/1/1/1:4:71,135:0.73: 1.28:1.000:0.998 0/1/1/1:4:63,123:0.74: 0.87:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,20:1.00:-2.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,183:1.00: 0.81:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,126:1.00:-0.34:1.000:1.000 0/0/1/1:4:115,75:0.48: 0.95:1.000:0.996 0/1/1/1:4:78,162:0.75: 1.96:1.000:0.999 0/1/1/1:4:55,147:0.79: 1.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:87,71:0.54: 0.31:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,180:1.00: 0.75:1.000:1.000 0/1/1/1:4:60,160:0.79: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:39,89:0.77:-0.30:1.000:1.000 0/1/1/1:4:32,87:0.79:-0.48:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,146:1.00: 0.06:1.000:1.000 0/1/1/1:4:51,86:0.71:-0.12:1.000:0.989 0/1/1/1:4:74,147:0.74: 1.58:1.000:0.999 0/0/1/1:4:77,71:0.56: 0.10:1.000:0.959 1/1/1/1:4:0,156:1.00: 0.27:1.000:1.000 0/1/1/1:4:61,118:0.73: 0.73:1.000:0.998 0/0/1/1:4:97,91:0.57: 0.91:1.000:0.950 0/0/1/1:4:91,87:0.57: 0.71:1.000:0.938 0/1/1/1:4:37,97:0.79:-0.18:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,153:1.00: 0.21:1.000:1.000 0/1/1/1:4:42,96:0.77:-0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:67,48:0.51:-0.56:1.000:0.997 0/1/1/1:4:40,90:0.76:-0.26:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,150:0.76: 1.54:1.000:1.000 0/0/1/1:4:119,73:0.47: 0.99:1.000:0.993 1/1/1/1:4:0,171:1.00: 0.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:84,82:0.58: 0.47:1.000:0.922 0/0/1/1:4:137,108:0.53: 2.06:0.956:0.993 0/1/1/1:4:57,163:0.80: 1.56:1.000:1.000 0/1/1/1:4:69,187:0.79: 2.29:1.000:1.000 1/1/1/1:4:0,175:1.00: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:63,121:0.73: 0.83:1.000:0.998 -chr8.1 86468647 chr8.1_086468647 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD ./.:4:229,292:.:-0.16:1.000:. ./.:4:278,211:.:-0.43:1.000:. ./.:4:229,278:.:-0.27:1.000:. ./.:4:152,372:.:-0.13:1.000:. ./.:4:251,363:.: 0.63:1.000:. ./.:4:210,453:.: 1.04:1.000:. ./.:4:156,316:.:-0.57:1.000:. ./.:4:255,313:.: 0.24:1.000:. ./.:4:236,320:.: 0.14:1.000:. ./.:4:92,167:.:-2.36:1.000:. ./.:4:83,203:.:-2.13:1.000:. ./.:4:289,331:.: 0.68:1.000:. ./.:4:178,357:.:-0.04:1.000:. ./.:4:158,439:.: 0.48:1.000:. ./.:4:244,266:.:-0.25:1.000:. ./.:4:177,485:.: 1.03:1.000:. ./.:4:217,504:.: 1.52:0.998:. ./.:4:192,427:.: 0.67:1.000:. ./.:4:244,605:.: 2.60:1.000:. ./.:4:216,571:.: 2.08:1.000:. ./.:4:169,103:.:-2.25:1.000:. ./.:4:242,283:.:-0.12:1.000:. ./.:4:350,213:.: 0.20:1.000:. ./.:4:244,334:.: 0.32:1.000:. ./.:4:35,143:.:-3.04:1.000:. ./.:4:206,507:.: 1.46:1.000:. ./.:4:179,413:.: 0.44:1.000:. ./.:4:239,294:.:-0.06:1.000:. ./.:3:116,418:.:-0.05:1.000:. ./.:4:190,467:.: 0.99:1.000:. ./.:4:319,441:.: 1.85:1.000:. ./.:4:221,291:.:-0.23:1.000:. ./.:4:62,188:.:-2.43:1.000:. ./.:4:104,136:.:-2.52:1.000:. ./.:3:39,90:.:-3.45:1.000:. ./.:4:281,331:.: 0.61:1.000:. ./.:4:103,503:.: 0.56:0.979:. ./.:4:175,417:.: 0.44:1.000:. ./.:4:221,500:.: 1.52:1.000:. ./.:4:325,410:.: 1.64:1.000:. ./.:4:143,368:.:-0.24:1.000:. ./.:4:236,311:.: 0.06:1.000:. ./.:4:256,358:.: 0.63:1.000:. ./.:4:213,295:.:-0.27:1.000:. ./.:4:170,421:.: 0.43:1.000:. ./.:4:76,499:.: 0.30:1.000:. ./.:5:274,489:.: 1.88:1.000:. ./.:4:83,482:.: 0.21:1.000:. ./.:4:213,289:.:-0.32:1.000:. ./.:4:141,441:.: 0.36:1.000:. ./.:4:222,130:.:-1.58:1.000:. ./.:4:191,472:.: 1.04:1.000:. ./.:4:222,277:.:-0.34:1.000:. ./.:4:181,409:.: 0.42:1.000:. ./.:4:69,465:.:-0.05:1.000:. ./.:4:184,502:.: 1.23:1.000:. ./.:4:197,392:.: 0.42:1.000:. ./.:4:184,424:.: 0.57:1.000:. ./.:4:292,192:.:-0.47:1.000:. ./.:6:191,242:.:-0.90:1.000:. ./.:4:241,259:.:-0.33:1.000:. ./.:4:142,357:.:-0.34:1.000:. ./.:4:184,485:.: 1.09:1.000:. ./.:4:70,517:.: 0.40:1.000:. ./.:4:180,402:.: 0.36:1.000:. ./.:4:169,396:.: 0.21:1.000:. ./.:4:138,317:.:-0.71:1.000:. ./.:4:259,250:.:-0.26:1.000:. ./.:4:258,323:.: 0.35:0.887:. ./.:4:97,276:.:-1.40:1.000:. ./.:4:195,471:.: 1.06:1.000:. ./.:4:120,373:.:-0.39:0.999:. ./.:4:255,340:.: 0.47:1.000:. ./.:4:76,427:.:-0.31:1.000:. ./.:4:215,250:.:-0.63:1.000:. ./.:4:91,507:.: 0.49:1.000:. ./.:4:158,378:.:-0.03:1.000:. ./.:4:226,273:.:-0.34:1.000:. ./.:4:160,404:.: 0.21:1.000:. ./.:4:277,312:.: 0.42:1.000:. ./.:4:179,199:.:-1.36:0.915:. ./.:4:174,404:.: 0.32:1.000:. ./.:4:181,441:.: 0.69:1.000:. ./.:4:226,241:.:-0.61:1.000:. ./.:4:207,503:.: 1.43:0.980:. ./.:4:169,420:.: 0.42:1.000:. ./.:4:127,361:.:-0.43:1.000:. ./.:4:199,225:.:-0.97:1.000:. ./.:4:129,361:.:-0.42:1.000:. ./.:4:271,190:.:-0.66:1.000:. ./.:4:203,263:.:-0.62:1.000:. ./.:4:123,333:.:-0.70:1.000:. ./.:4:102,549:.: 0.94:1.000:. ./.:4:171,211:.:-1.32:1.000:. ./.:4:94,546:.: 0.84:1.000:. ./.:4:262,382:.: 0.88:1.000:. ./.:4:179,232:.:-1.08:1.000:. ./.:4:213,282:.:-0.37:1.000:. ./.:4:198,433:.: 0.77:1.000:. ./.:4:380,219:.: 0.50:1.000:. ./.:4:125,307:.:-0.90:1.000:. ./.:4:246,303:.: 0.08:1.000:. ./.:4:118,291:.:-1.10:1.000:. ./.:4:167,342:.:-0.26:0.999:. ./.:4:213,272:.:-0.46:1.000:. ./.:4:72,535:.: 0.57:1.000:. ./.:4:179,333:.:-0.23:1.000:. ./.:4:158,402:.: 0.17:1.000:. ./.:4:307,396:.: 1.37:0.993:. ./.:4:242,281:.:-0.14:1.000:. ./.:4:84,448:.:-0.06:1.000:. ./.:4:230,557:.: 2.08:1.000:. ./.:4:77,435:.:-0.23:0.999:. ./.:4:287,284:.: 0.26:1.000:. ./.:4:110,307:.:-1.03:1.000:. ./.:4:176,427:.: 0.53:1.000:. ./.:4:225,328:.: 0.11:1.000:. ./.:4:196,262:.:-0.69:1.000:. ./.:4:158,393:.: 0.10:1.000:. ./.:4:141,317:.:-0.69:1.000:. ./.:4:138,393:.:-0.07:1.000:. ./.:4:120,333:.:-0.73:1.000:. ./.:4:91,488:.: 0.33:1.000:. ./.:4:303,221:.:-0.13:1.000:. ./.:4:151,383:.:-0.05:1.000:. ./.:4:137,378:.:-0.21:1.000:. ./.:4:227,263:.:-0.42:1.000:. ./.:4:279,169:.:-0.77:1.000:. ./.:4:179,219:.:-1.19:1.000:. ./.:4:117,253:.:-1.42:1.000:. ./.:4:198,248:.:-0.79:1.000:. ./.:4:173,417:.: 0.42:1.000:. ./.:4:110,265:.:-1.38:0.998:. ./.:4:231,297:.:-0.10:1.000:. ./.:4:60,349:.:-1.10:1.000:. ./.:4:227,576:.: 2.21:1.000:. ./.:4:85,530:.: 0.63:1.000:. ./.:4:65,362:.:-0.95:1.000:. ./.:4:239,147:.:-1.29:1.000:. ./.:4:178,248:.:-0.95:1.000:. ./.:4:136,377:.:-0.22:1.000:. ./.:4:288,172:.:-0.67:1.000:. ./.:4:153,379:.:-0.06:1.000:. ./.:4:101,302:.:-1.15:1.000:. ./.:4:312,406:.: 1.50:1.000:. ./.:4:169,446:.: 0.63:1.000:. ./.:4:93,494:.: 0.40:1.000:. ./.:4:281,197:.:-0.52:1.000:. ./.:4:190,546:.: 1.65:1.000:. ./.:4:253,302:.: 0.13:1.000:. ./.:4:95,606:.: 1.36:1.000:. ./.:4:184,418:.: 0.52:1.000:. ./.:4:77,128:.:-2.81:1.000:. ./.:4:159,223:.:-1.32:1.000:. ./.:4:298,380:.: 1.16:1.000:. ./.:4:308,342:.: 0.93:1.000:. ./.:4:184,448:.: 0.78:1.000:. ./.:4:305,319:.: 0.71:1.000:. ./.:4:197,294:.:-0.41:1.000:. ./.:4:250,321:.: 0.26:1.000:. ./.:4:155,389:.: 0.04:1.000:. ./.:4:212,234:.:-0.79:1.000:. ./.:4:149,385:.:-0.05:1.000:. ./.:4:162,373:.:-0.04:1.000:. ./.:4:170,459:.: 0.75:1.000:. ./.:4:144,389:.:-0.06:1.000:. ./.:4:253,319:.: 0.27:1.000:. ./.:4:295,183:.:-0.52:1.000:. ./.:4:205,246:.:-0.74:1.000:. ./.:4:267,302:.: 0.25:1.000:. ./.:4:107,332:.:-0.85:1.000:. ./.:4:295,173:.:-0.60:1.000:. ./.:4:306,194:.:-0.33:1.000:. ./.:4:204,244:.:-0.77:1.000:. ./.:4:241,297:.:-0.01:1.000:. ./.:4:248,172:.:-1.00:1.000:. ./.:4:230,606:.: 2.49:1.000:. ./.:4:192,475:.: 1.07:1.000:. ./.:4:186,451:.: 0.82:1.000:. ./.:4:162,298:.:-0.67:1.000:. ./.:4:179,459:.: 0.83:0.956:. ./.:4:126,674:.: 2.19:1.000:. ./.:4:411,275:.: 1.23:1.000:. ./.:4:129,405:.:-0.05:1.000:. ./.:4:190,295:.:-0.46:1.000:. -chr8.1 86711104 chr8.1_086711104 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/1/1:4:51,63:0.53: 0.10:1.000:0.992 0/0/0/0:4:102,0:0.00:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:77,34:0.31: 0.00:1.000:0.980 0/0/1/1:4:49,49:0.49:-0.42:1.000:0.996 0/0/0/1:4:95,46:0.32: 0.98:1.000:0.943 0/0/0/1:4:100,31:0.24: 0.65:1.000:1.000 0/1/1/1:4:18,58:0.70:-1.14:1.000:0.983 0/0/1/1:4:51,63:0.53: 0.10:1.000:0.992 0/0/0/1:4:75,21:0.22:-0.49:1.000:1.000 0/0/1/1:4:6,5:0.44:-3.25:1.000:0.974 0/0/0/1:4:13,2:0.13:-3.12:1.000:0.943 0/0/0/1:4:92,25:0.22: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,43:0.43:-0.39:1.000:0.933 0/0/1/1:4:63,56:0.46: 0.26:1.000:0.987 0/0/1/1:4:67,63:0.47: 0.62:1.000:0.993 0/0/0/1:4:72,22:0.24:-0.55:1.000:1.000 0/0/0/0:4:155,0:0.00: 1.43:0.998:1.000 0/0/0/1:4:94,30:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/0/1:4:123,21:0.15: 1.07:1.000:0.984 0/0/0/0:4:111,0:0.00: 0.00:1.000:1.000 0/0/0/1:4:8,4:0.33:-3.22:1.000:0.919 0/0/1/1:4:77,57:0.42: 0.75:1.000:0.901 0/0/0/1:4:85,29:0.26: 0.10:1.000:0.999 0/0/0/0:4:87,0:0.00:-0.78:1.000:1.000 0/0/0/1:4:2,1:0.33:-3.51:1.000:0.919 0/0/0/0:4:130,0:0.00: 0.62:1.000:1.000 0/0/0/0:4:100,0:0.00:-0.36:1.000:1.000 0/1/1/1:4:16,78:0.75:-0.55:1.000:0.999 0/0/0:3:106,2:0.02:-0.10:1.000:1.000 0/0/0/1:4:85,28:0.25: 0.07:1.000:0.999 0/0/0/1:4:108,58:0.35: 1.79:1.000:0.830 0/0/1/1:4:43,53:0.53:-0.49:1.000:0.992 0/0/0/1:4:4,1:0.20:-3.45:1.000:1.000 0/0/0/1:4:10,6:0.37:-3.09:1.000:0.568 0/0/0:3:6,0:0.00:-3.41:1.000:1.000 0/0/0/0:4:117,0:0.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,67:0.50: 0.62:0.979:0.997 0/0/1/1:4:54,52:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:71,69:0.48: 0.94:1.000:0.995 0/0/0/1:4:101,31:0.24: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:49,56:0.52:-0.19:1.000:0.996 0/0/0/1:4:108,33:0.24: 0.98:1.000:1.000 0/0/0/1:4:108,26:0.20: 0.75:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,70:0.54: 0.46:1.000:0.989 0/0/1/1:4:52,59:0.51: 0.00:1.000:0.996 0/0/0/1:4:86,31:0.27: 0.20:1.000:0.998 0/0/0/1/1:5:81,51:0.38: 0.68:1.000:0.965 0/0/0/1:4:29,8:0.22:-2.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:44,64:0.56:-0.10:1.000:0.963 0/0/1/1:4:42,39:0.47:-0.98:1.000:0.992 0/0/1/1:4:54,52:0.48:-0.16:1.000:0.995 0/0/1/1:4:72,112:0.58: 2.38:1.000:0.932 0/0/1/1:4:58,55:0.47: 0.07:1.000:0.994 0/0/0/1:4:96,31:0.25: 0.52:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,59:0.57:-0.39:1.000:0.958 0/0/0/1:4:95,36:0.28: 0.65:1.000:0.997 0/0/1/1:4:69,57:0.44: 0.49:1.000:0.971 0/0/0/1:4:84,29:0.26: 0.07:1.000:0.999 0/0/1/1:4:57,70:0.53: 0.52:1.000:0.992 0/0/0/0/1/1:6:72,35:0.32:-0.13:1.000:0.920 0/0/0/1:4:75,29:0.28:-0.23:1.000:0.996 0/0/1/1:4:61,70:0.52: 0.65:1.000:0.996 0/0/0/1:4:94,33:0.26: 0.52:1.000:0.999 0/0/0/1:4:81,38:0.32: 0.26:1.000:0.960 0/0/0/1:4:89,29:0.25: 0.23:1.000:0.999 0/0/0/1:4:104,47:0.31: 1.30:1.000:0.974 0/0/0/0:4:90,0:0.00:-0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,54:0.47: 0.07:1.000:0.991 0/0/1/1:4:66,51:0.43: 0.20:0.887:0.938 0/0/0/1:4:83,23:0.22:-0.16:1.000:1.000 0/1/1/1:4:47,100:0.63: 1.17:1.000:0.586 0/0/1/1:4:52,57:0.51:-0.06:0.999:0.996 0/0/0/0:4:145,0:0.00: 1.11:1.000:1.000 0/0/1/1:4:78,58:0.42: 0.81:1.000:0.906 0/0/0/1:4:115,47:0.29: 1.66:1.000:0.992 0/0/0/1:4:95,30:0.24: 0.46:1.000:1.000 0/0/1/1:4:68,53:0.43: 0.33:1.000:0.944 0/0/0/1:4:90,31:0.26: 0.33:1.000:0.999 0/0/1/1:4:67,77:0.52: 1.07:1.000:0.995 0/0/0/1:4:123,31:0.20: 1.40:1.000:1.000 0/0/1/1:4:43,48:0.51:-0.65:0.915:0.996 0/0/1/1:4:75,73:0.48: 1.20:1.000:0.995 0/0/1/1:4:55,77:0.56: 0.68:1.000:0.974 0/0/1/1:4:32,46:0.56:-1.07:1.000:0.967 0/0/0/1:4:93,29:0.24: 0.36:0.980:1.000 0/0/1/1:4:72,60:0.44: 0.68:1.000:0.974 0/0/1/1:4:43,51:0.52:-0.55:1.000:0.994 0/0/1/1:4:57,68:0.52: 0.46:1.000:0.994 0/0/1/1:4:36,43:0.52:-1.04:1.000:0.994 0/0/1/1:4:51,62:0.53: 0.07:1.000:0.993 0/0/0/1:4:62,26:0.29:-0.75:1.000:0.989 0/0/1/1:4:58,72:0.53: 0.62:1.000:0.992 0/0/0/1:4:124,26:0.17: 1.27:1.000:0.999 0/0/0/1:4:70,10:0.13:-1.01:1.000:0.868 0/0/0/1:4:106,39:0.27: 1.11:1.000:0.998 0/0/0/1:4:87,33:0.28: 0.29:1.000:0.997 0/0/1/1:4:56,48:0.45:-0.23:1.000:0.981 0/0/0/1:4:81,21:0.21:-0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:96,36:0.27: 0.68:1.000:0.997 0/0/0/1:4:91,24:0.21: 0.13:1.000:1.000 0/0/0/1:4:70,21:0.23:-0.65:1.000:1.000 0/0/0/1:4:99,35:0.26: 0.75:1.000:0.999 0/0/1/1:4:40,39:0.48:-1.04:1.000:0.995 0/0/0/1:4:87,26:0.23: 0.07:0.999:1.000 0/0/1/1:4:30,61:0.62:-0.65:1.000:0.518 0/0/1/1:4:59,45:0.42:-0.23:1.000:0.928 0/0/1/1:4:51,57:0.51:-0.10:1.000:0.996 0/1/1/1:4:19,71:0.72:-0.68:1.000:0.995 0/0/0/1:4:95,32:0.25: 0.52:0.993:0.999 0/0/1/1:4:44,69:0.58: 0.07:1.000:0.927 0/0/0/1:4:96,41:0.30: 0.85:1.000:0.986 0/0/0/1:4:97,30:0.24: 0.52:1.000:1.000 0/0/0/1:4:91,26:0.22: 0.20:0.999:1.000 0/0/1/1:4:60,70:0.52: 0.62:1.000:0.995 0/0/1/1:4:60,48:0.43:-0.10:1.000:0.958 0/1/1/1:4:39,99:0.66: 0.88:1.000:0.876 0/1/1/1:4:13,76:0.77:-0.72:1.000:1.000 0/0/1/1:4:59,56:0.47: 0.13:1.000:0.994 0/1/1/1:4:37,92:0.66: 0.59:1.000:0.854 0/0/1/1:4:67,55:0.44: 0.36:1.000:0.969 0/0/0/1:4:88,26:0.23: 0.10:1.000:1.000 0/0/1/1:4:55,57:0.50: 0.03:1.000:0.997 0/0/0/1:4:122,36:0.23: 1.53:1.000:1.000 0/0/1/1:4:57,52:0.47:-0.06:1.000:0.990 0/0/0/0:4:120,0:0.00: 0.29:1.000:1.000 0/0/0/1:4:109,44:0.29: 1.37:1.000:0.993 0/0/0/1:4:84,34:0.29: 0.23:1.000:0.993 0/0/1/1:4:39,56:0.56:-0.52:1.000:0.967 0/1/1/1:4:12,70:0.77:-0.94:1.000:1.000 0/0/1/1:4:46,57:0.53:-0.26:1.000:0.992 0/0/1/1:4:62,66:0.50: 0.55:1.000:0.997 0/0/0/1:4:83,28:0.25: 0.00:1.000:0.999 0/0/0/0:4:73,0:0.00:-1.24:0.998:1.000 0/0/0/1:4:87,31:0.26: 0.23:1.000:0.998 0/0/0/1:4:84,26:0.24:-0.03:1.000:1.000 0/0/0/1:4:95,29:0.24: 0.42:1.000:1.000 0/0/1/1:4:82,83:0.49: 1.76:1.000:0.996 0/0/0/1:4:75,25:0.25:-0.36:1.000:0.999 0/0/1/1:4:60,65:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:59,54:0.47: 0.07:1.000:0.991 0/0/0/1:4:75,31:0.29:-0.16:1.000:0.991 0/0/1/1:4:41,46:0.51:-0.78:1.000:0.996 0/0/0/0:4:88,0:0.00:-0.75:1.000:1.000 0/0/0/1:4:69,25:0.27:-0.55:1.000:0.998 0/0/0/1:4:95,34:0.26: 0.59:1.000:0.998 0/0/1/1:4:54,84:0.58: 0.88:1.000:0.932 0/0/1/1:4:63,54:0.45: 0.20:1.000:0.981 0/0/0/1:4:78,23:0.23:-0.32:1.000:1.000 0/0/1/1:4:61,70:0.52: 0.65:1.000:0.996 0/0/1/1:4:57,63:0.51: 0.29:1.000:0.996 0/0/0/1:4:85,27:0.24: 0.03:1.000:1.000 0/0/1/1:4:63,46:0.41:-0.06:1.000:0.886 0/0/1/1:4:3,6:0.62:-3.32:1.000:0.557 0/0/0/1:4:48,20:0.29:-1.40:1.000:0.990 0/0/0/1:4:148,47:0.24: 2.73:1.000:1.000 0/0/1/1:4:74,51:0.40: 0.46:1.000:0.797 0/0/0/1:4:90,19:0.18:-0.06:1.000:0.999 0/0/0/1:4:78,29:0.27:-0.13:1.000:0.997 0/0/1/1:4:55,46:0.45:-0.32:1.000:0.975 0/0/0/1:4:90,38:0.30: 0.55:1.000:0.988 0/0/1/1:4:41,38:0.47:-1.04:1.000:0.992 0/0/1/1:4:48,42:0.46:-0.68:1.000:0.985 0/0/1/1:4:55,64:0.52: 0.26:1.000:0.995 0/0/0/1:4:99,29:0.23: 0.55:1.000:1.000 0/0/1/1:4:71,57:0.44: 0.55:1.000:0.960 0/0/1/1:4:61,64:0.50: 0.46:1.000:0.997 0/0/1/1:4:52,43:0.44:-0.52:1.000:0.971 0/0/1/1:4:42,38:0.46:-1.01:1.000:0.990 0/0/1/1:4:51,50:0.48:-0.32:1.000:0.995 0/0/0/1:4:79,26:0.25:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:46,49:0.50:-0.52:1.000:0.997 0/0/0/1:4:67,19:0.22:-0.81:1.000:1.000 0/0/1/1:4:62,70:0.51: 0.68:1.000:0.996 0/0/0/1:4:78,27:0.26:-0.19:1.000:0.999 0/0/1/1:4:41,65:0.58:-0.16:1.000:0.919 0/0/0/1:4:66,26:0.28:-0.62:1.000:0.995 0/0/0/1:4:113,23:0.17: 0.81:1.000:0.998 0/0/0/1:4:121,29:0.20: 1.27:1.000:1.000 0/0/1/1:4:56,69:0.53: 0.46:1.000:0.992 0/0/1/1:4:42,46:0.51:-0.75:1.000:0.996 0/0/1/1:4:55,53:0.48:-0.10:0.956:0.995 0/0/1/1:4:70,73:0.50: 1.04:1.000:0.997 0/0/1/1:4:54,54:0.49:-0.10:1.000:0.996 0/0/0/1:4:54,20:0.27:-1.20:1.000:0.997 0/0/0/1:4:84,28:0.25: 0.03:1.000:0.999 -chr8.1 86989642 chr8.1_086989642 . . . . CN=4 GT:CN:AD:BAF:Z:PMC:PMD 0/0/0/1:4:47,11:0.21: 1.33:1.000:1.000 0/0/1/1:4:19,25:0.57: 0.20:1.000:0.946 0/0/0/1:4:41,11:0.24: 0.84:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,17:0.40: 0.28:1.000:0.799 0/0/1/1:4:21,30:0.59: 0.76:1.000:0.885 0/0/0/1:4:46,23:0.36: 2.21:1.000:0.713 0/0/0/1:4:13,7:0.37:-1.73:1.000:0.510 0/0/0/1:4:45,10:0.20: 1.08:1.000:1.000 0/1/1/1:4:10,20:0.65:-0.93:1.000:0.779 0/0/0/0:4:10,0:0.00:-2.54:1.000:1.000 0/0/0/1:4:6,3:0.36:-2.62:1.000:0.713 0/0/1/1:4:22,28:0.56: 0.68:1.000:0.961 0/1/1/1:4:12,23:0.64:-0.52:1.000:0.700 0/0/1/1:4:30,21:0.43: 0.76:1.000:0.956 0/0/1/1:4:21,21:0.52: 0.04:1.000:0.996 0/0/1/1:4:34,22:0.42: 1.16:1.000:0.894 0/1/1/1:4:9,42:0.79: 0.76:0.998:1.000 0/1/1/1:4:18,38:0.66: 1.16:1.000:0.856 0/0/1/1:4:20,20:0.52:-0.12:1.000:0.996 0/1/1/1:4:12,37:0.72: 0.60:1.000:0.995 0/0/1/1:4:8,6:0.45:-2.21:1.000:0.980 0/0/1/1:4:28,25:0.49: 0.92:1.000:0.996 0/0/0/1:4:40,9:0.21: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,22:0.53: 0.04:1.000:0.990 0/0/1/1:4:2,3:0.60:-2.94:1.000:0.826 0/0/1/1:4:22,16:0.44:-0.28:1.000:0.972 0/1/1/1:4:7,36:0.80: 0.12:1.000:1.000 0/0/0/1:4:46,9:0.18: 1.08:1.000:0.999 1/1/1:3:0,27:1.00:-1.17:1.000:1.000 0/0/1/1:4:20,25:0.56: 0.28:1.000:0.967 0/0/0/0:4:41,4:0.10: 0.28:1.000:0.801 0/0/0/1:4:38,10:0.23: 0.52:1.000:1.000 0/1/1/1:4:2,5:0.69:-2.78:1.000:0.968 0/0/1/1:4:3,2:0.42:-2.94:1.000:0.924 0/1/1:3:7,8:0.54:-2.13:1.000:0.945 0/0/1/1:4:15,17:0.54:-0.77:1.000:0.987 0/1/1/1:4:11,36:0.73: 0.44:0.979:0.997 0/0/1/1:4:25,20:0.47: 0.28:1.000:0.990 0/0/0/1:4:31,15:0.35: 0.36:1.000:0.785 0/0/0/1:4:27,10:0.30:-0.36:1.000:0.988 0/1/1/1:4:13,39:0.71: 0.84:1.000:0.994 0/0/0/1:4:31,10:0.27:-0.04:1.000:0.997 0/0/0/1:4:38,20:0.37: 1.33:1.000:0.577 0/0/1/1:4:23,30:0.57: 0.92:1.000:0.950 0/0/1/1:4:17,27:0.61: 0.20:1.000:0.730 1/1/1/1:4:0,44:1.00: 0.20:1.000:1.000 0/0/1/1/1:5:27,26:0.51: 0.92:1.000:0.584 1/1/1/1:4:0,58:1.00: 1.33:1.000:1.000 0/0/0/1:4:33,11:0.28: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:13,32:0.68: 0.28:1.000:0.963 0/0/0/1:4:28,8:0.25:-0.44:1.000:0.999 0/0/1/1:4:44,25:0.39: 2.21:1.000:0.644 0/0/0/1:4:29,5:0.17:-0.61:1.000:0.997 0/0/1/1:4:37,27:0.44: 1.81:1.000:0.973 0/1/1/1:4:4,25:0.83:-1.01:1.000:0.998 0/0/1/1:4:16,18:0.54:-0.61:1.000:0.988 0/0/1/1:4:24,22:0.50: 0.36:1.000:0.997 0/0/1/1:4:28,23:0.47: 0.76:1.000:0.993 0/0/0/0:4:47,0:0.00: 0.44:1.000:1.000 0/0/1/1/1/1:6:12,18:0.60:-0.93:1.000:0.609 0/1/1/1:4:15,33:0.67: 0.52:1.000:0.899 0/0/1/1:4:20,23:0.54: 0.12:1.000:0.985 0/1/1/1:4:6,37:0.83: 0.12:1.000:0.998 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/0/1/1:4:22,29:0.57: 0.76:1.000:0.945 0/0/1/1:4:16,19:0.55:-0.52:1.000:0.980 0/1/1/1:4:2,18:0.88:-1.73:1.000:0.792 0/0/0/1:4:46,9:0.18: 1.08:1.000:0.999 0/0/0/1:4:40,19:0.35: 1.41:0.887:0.819 0/1/1/1:4:13,36:0.70: 0.60:1.000:0.987 0/0/1/1:4:28,20:0.44: 0.52:1.000:0.965 0/0/1/1:4:10,12:0.55:-1.57:0.999:0.978 0/1/1/1:4:10,34:0.73: 0.20:1.000:0.998 0/1/1/1:4:11,38:0.74: 0.60:1.000:0.998 0/0/1/1:4:35,23:0.42: 1.33:1.000:0.911 0/1/1/1:4:12,33:0.70: 0.28:1.000:0.986 0/1/1/1:4:6,37:0.83: 0.12:1.000:0.998 0/0/0/1:4:32,8:0.23:-0.12:1.000:1.000 0/1/1/1:4:11,28:0.69:-0.20:1.000:0.973 0/0/1/1:4:26,29:0.54: 1.08:1.000:0.989 0/0/0/1:4:25,9:0.29:-0.61:0.915:0.991 0/0/1/1:4:13,20:0.60:-0.69:1.000:0.788 0/1/1/1:4:7,27:0.75:-0.61:1.000:0.999 0/0/1/1:4:20,19:0.51:-0.20:1.000:0.997 0/0/1/1:4:14,18:0.57:-0.77:0.980:0.957 0/1/1/1:4:9,24:0.70:-0.69:1.000:0.982 0/0/1/1:4:19,13:0.43:-0.77:1.000:0.943 0/0/0/1:4:19,7:0.30:-1.25:1.000:0.989 0/0/1/1:4:19,11:0.39:-0.93:1.000:0.693 0/0/0/1:4:35,12:0.28: 0.44:1.000:0.995 0/0/0/1:4:18,4:0.20:-1.57:1.000:1.000 0/0/1/1:4:30,24:0.47: 1.00:1.000:0.990 1/1/1/1:4:0,41:1.00:-0.04:1.000:1.000 0/0/1/1:4:33,22:0.42: 1.08:1.000:0.924 0/1/1/1:4:7,20:0.71:-1.17:1.000:0.990 0/0/1/1:4:19,21:0.54:-0.12:1.000:0.990 0/0/0/1:4:27,7:0.23:-0.61:1.000:1.000 0/0/0/1:4:28,4:0.14:-0.77:1.000:0.969 0/0/1/1:4:14,21:0.60:-0.52:1.000:0.826 0/0/0/1:4:36,5:0.14:-0.04:1.000:0.956 0/0/0/1:4:13,6:0.34:-1.81:1.000:0.864 0/0/1/1:4:30,20:0.42: 0.68:1.000:0.924 0/0/0/1:4:15,7:0.34:-1.57:1.000:0.848 0/0/1/1:4:22,23:0.52: 0.28:0.999:0.994 0/0/0/1:4:29,10:0.28:-0.20:1.000:0.995 0/1/1/1:4:11,24:0.66:-0.52:1.000:0.891 0/0/1/1:4:15,16:0.53:-0.85:1.000:0.993 0/0/1/1:4:27,20:0.45: 0.44:1.000:0.977 0/0/0/1:4:40,15:0.30: 1.08:0.993:0.986 0/0/0/1:4:25,10:0.31:-0.52:1.000:0.971 0/1/1/1:4:6,22:0.74:-1.09:1.000:0.999 0/1/1/1:4:10,41:0.76: 0.76:1.000:1.000 0/1/1/1:4:7,29:0.76:-0.44:0.999:1.000 0/0/0/1:4:30,10:0.28:-0.12:1.000:0.996 0/0/0/1:4:19,9:0.35:-1.09:1.000:0.824 0/0/1/1:4:21,16:0.45:-0.36:1.000:0.983 0/0/0/1:4:20,4:0.19:-1.41:1.000:1.000 0/0/1/1:4:24,18:0.45: 0.04:1.000:0.980 0/0/1/1:4:21,16:0.45:-0.36:1.000:0.983 0/0/1/1:4:17,20:0.55:-0.36:1.000:0.981 0/0/1/1:4:24,21:0.49: 0.28:1.000:0.996 0/0/1/1:4:19,19:0.52:-0.28:1.000:0.996 1/1/1/1:4:4,40:0.89: 0.20:1.000:0.503 0/0/0/0:4:62,0:0.00: 1.65:1.000:1.000 1/1/1/1:4:3,30:0.89:-0.69:1.000:0.503 0/1/1/1:4:11,26:0.68:-0.36:1.000:0.946 0/0/1/1:4:24,14:0.39:-0.28:1.000:0.712 0/0/1/1:4:15,10:0.42:-1.33:1.000:0.924 0/0/1/1:4:17,10:0.39:-1.17:1.000:0.732 0/0/1/1:4:19,13:0.43:-0.77:1.000:0.943 0/0/1/1:4:37,24:0.42: 1.57:1.000:0.897 0/0/1/1:4:27,24:0.49: 0.76:1.000:0.996 0/0/1/1:4:20,13:0.42:-0.69:0.998:0.899 0/0/0/1:4:21,10:0.35:-0.85:1.000:0.815 1/1/1/1:4:0,39:1.00:-0.20:1.000:1.000 0/1/1/1:4:8,28:0.74:-0.44:1.000:0.998 0/1/1/1:4:15,32:0.66: 0.44:1.000:0.868 0/1/1/1:4:9,18:0.65:-1.17:1.000:0.779 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:12,21:0.62:-0.69:1.000:0.510 0/0/1/1:4:17,20:0.55:-0.36:1.000:0.981 0/0/0/1:4:26,9:0.28:-0.52:1.000:0.994 0/1/1/1:4:7,29:0.76:-0.44:1.000:1.000 0/0/1/1:4:14,11:0.46:-1.33:1.000:0.988 0/0/1/1:4:24,38:0.61: 1.65:1.000:0.736 0/1/1/1:4:22,47:0.66: 2.21:1.000:0.870 0/1/1/1:4:14,31:0.67: 0.28:1.000:0.904 0/0/0/1:4:30,12:0.31: 0.04:1.000:0.971 0/0/0/1:4:40,20:0.36: 1.49:1.000:0.713 0/0/0/1:4:33,17:0.36: 0.68:1.000:0.637 0/1/1/1:4:10,40:0.76: 0.68:1.000:1.000 0/0/1/1:4:28,26:0.50: 1.00:1.000:0.997 0/0/0/1:4:16,3:0.18:-1.81:1.000:0.999 0/0/1/1:4:15,19:0.56:-0.61:1.000:0.962 0/0/0/1:4:46,15:0.27: 1.57:1.000:0.997 0/0/1/1:4:27,17:0.41: 0.20:1.000:0.860 0/0/1/1:4:18,24:0.57: 0.04:1.000:0.939 0/0/1/1:4:19,27:0.59: 0.36:1.000:0.891 0/0/1/1:4:12,18:0.60:-0.93:1.000:0.826 0/0/0/1:4:37,12:0.27: 0.60:1.000:0.997 0/0/1/1:4:29,19:0.42: 0.52:1.000:0.908 0/0/0/1:4:36,14:0.31: 0.68:1.000:0.979 0/0/1/1:4:14,21:0.60:-0.52:1.000:0.826 0/0/0/1:4:43,21:0.35: 1.81:1.000:0.766 0/0/0/1:4:31,14:0.34: 0.28:1.000:0.891 0/0/1/1:4:34,25:0.45: 1.41:1.000:0.975 0/0/1/1:4:24,19:0.46: 0.12:1.000:0.989 0/0/0/0:4:38,0:0.00:-0.28:1.000:1.000 0/0/1/1:4:35,30:0.48: 1.89:1.000:0.995 0/0/1/1:4:22,22:0.52: 0.20:1.000:0.996 0/1/1/1:4:17,38:0.67: 1.08:1.000:0.912 0/0/1/1:4:29,17:0.39: 0.36:1.000:0.724 0/0/0/0:4:49,0:0.00: 0.60:1.000:1.000 0/0/1/1:4:26,23:0.49: 0.60:1.000:0.996 0/0/1/1:4:17,14:0.47:-0.85:1.000:0.993 0/0/0/1:4:37,15:0.31: 0.84:1.000:0.966 0/0/1/1:4:19,20:0.53:-0.20:1.000:0.993 0/0/1/1:4:15,21:0.58:-0.44:1.000:0.904 0/0/0/1:4:32,17:0.37: 0.60:1.000:0.550 0/1/1/1:4:14,29:0.65: 0.12:1.000:0.832 0/1/1/1:4:13,26:0.65:-0.20:0.956:0.779 0/1/1/1:4:17,31:0.63: 0.52:1.000:0.590 0/0/0/1:4:49,14:0.25: 1.73:1.000:0.999 0/0/0/1:4:22,11:0.36:-0.69:1.000:0.713 0/0/1/1:4:25,20:0.47: 0.28:1.000:0.990 diff --git a/docs/BIcolors_template.css b/docs/BIcolors_template.css index 179c027..0d12431 100644 --- a/docs/BIcolors_template.css +++ b/docs/BIcolors_template.css @@ -483,11 +483,13 @@ body::after { border-top: 2px solid var(--background-light); background-image: url('usda-logo-color.png'), - url('IFAS.jpg'); - background-size: 150px 80px, 150px 80px; - background-repeat: no-repeat, no-repeat; + url('IFAS.jpg'), + url('cornell_seal_simple_web_b31b1b.png'); + background-size: 150px 80px, 150px 80px, 100px 80px; + background-repeat: no-repeat, no-repeat, no-repeat; background-position: - calc(100% - 200px) center, - calc(100% - 50px) center; + calc(100% - 530px) center, + calc(100% - 360px) center, + calc(100% - 240px) center; box-sizing: border-box; } diff --git a/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.Rmd b/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.Rmd index 8b085d9..478e1e4 100644 --- a/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.Rmd +++ b/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.Rmd @@ -1,6 +1,7 @@ --- -title: "Qploidy2 - large-scale copy number estimation in alfalfa mapping population using DArTag genotyping data" -author: "Breeding Insight - Cristiane Taniguti" +title: "Qploidy2 Tutorial" +subtitle: "Large-scale copy number estimation in alfalfa mapping population using DArTag genotyping data" +author: "Breeding Insight" date: "`r Sys.Date()`" output: html_document: @@ -72,7 +73,7 @@ highest possible copy number in the dataset * The number of markers is sufficient to provide a good resolution for the BAF distributions * The larger the amount of markers, the smaller the copy number variations that can be detected -## Install +# Install * It requires R version superior to 3.6.0 @@ -176,7 +177,7 @@ When this assumption holds for your dataset, deviations in a sample’s total de You can rapidly screen for candidate samples using the function below: -```{r, fig.width=11, fig.height=10, out.width="100%"} +```{r, fig.width=6, fig.height=5, out.width="100%"} chromosome_level_test_plot_qploidy(input = data, geno.pos = geno.pos, selected_samples = samples[1:12], # plot the first 12 @@ -288,12 +289,12 @@ plot_qploidy_standardization(x = qploidy_standardization, See `?plot_qploidy_standardization` for more plot types. -# Chromosome-level screening for abnormalities based on Z-score (optional) +## Chromosome-level screening for abnormalities based on Z-score (optional) You can use the same quick check we used before on the raw total depth (R) with the standardized z-scores. This is useful to identify samples with potential aneuploidies or large CNVs before running the HMM, and also to select samples with known ploidy to guide the BAF model selection. -```{r, fig.width=11, fig.height=10, out.width="100%"} +```{r, fig.width=6, fig.height=5, out.width="100%"} chromosome_level_test_plot_qploidy(input = qploidy_standardization, selected_samples = samples[1:12], col2test = "z") @@ -459,7 +460,7 @@ Visualize CNV tracks for multiple samples: ```{r, fig.width=11, fig.height=10, out.width="100%"} compare_cn_track(hmm_CN = multi_esti, - samples_to_plot = samples[1:30], + samples_to_plot = samples[31:50], facet_ncol = 8) ``` @@ -467,7 +468,7 @@ compare_cn_track(hmm_CN = multi_esti, # For a specific sample p <- plot_cn_track(hmm_CN = multi_esti, qploidy_standarize_result = qploidy_standardization, - sample_id = "85-126", + sample_id = "85-182", show_window_lines = TRUE) p$arranged ``` @@ -498,19 +499,16 @@ re_qploidy_standardization # Compare before and after plot_qploidy_standardization(x = qploidy_standardization, - sample = "85-126", + sample = "85-295", type = c("Ratio_hist_overall", "BAF_hist_overall")) plot_qploidy_standardization(x = re_qploidy_standardization, - sample = "85-126", + sample = "85-295", type = c("Ratio_hist_overall", "BAF_hist_overall")) ``` ## Re-run the HMM with the new standardization ```{r} - -one_sample <- re_qploidy_standardization$data[re_qploidy_standardization$data$SampleName == "J432", ] - re_multi_esti <- hmm_estimate_CN_multi( qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization, sample_ids = "all", @@ -520,28 +518,68 @@ re_multi_esti <- hmm_estimate_CN_multi( add_uniform_grid = TRUE, uniform_weight_grid = c(0.2, 0.5,0.95)) +# CNV profiles before +compare_cn_track(hmm_CN = multi_esti, + samples_to_plot = samples[91:110], + facet_ncol = 8) + +# CNV profiles after +compare_cn_track(hmm_CN = re_multi_esti, + samples_to_plot = samples[91:110], + facet_ncol = 8) +``` + +```{r, fig.width=11, fig.height=10, out.width="100%"} # Same plots can be generated p_re <- plot_cn_track(hmm_CN = re_multi_esti, - qploidy_standarize_result = qploidy_standardization, - sample_id = "85-17", + qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization, + sample_id = "85-295", show_window_lines = TRUE) p <- plot_cn_track(hmm_CN = multi_esti, qploidy_standarize_result = qploidy_standardization, - sample_id = "85-17", + sample_id = "85-295", show_window_lines = TRUE) -p$baf # before -p_re$baf # after +p$arranged #before +p_re$arranged #after +``` + +For this dataset, there are a few changes for some samples like the one showed above. +Chromosome 7 is pointed with higher number (5) of copies in the first round standardization and with +the re-standardization it is presented as 4 copies. This instability still leaves doubts about +the CNV of this particular chromosome. You can further explore tweaking the other parameters, +for example, increasing the number of markers in the windows to better fit the mixed models on the BAF distributions: -p$z # before -p_re$z # after +```{r, fig.width=11, fig.height=10, out.width="100%"} -p$cn #before -p_re$cn #after +res_tweak <- hmm_estimate_CN(qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization, + selected_model = selected_model, + sample_id = "85-295", + min_snps_per_window = 60, + cn_grid = c(2,3,4,5,6)) + +p <- plot_cn_track(hmm_CN = res_tweak, + qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization, + sample_id = "85-295", + show_window_lines = TRUE) + +p$arranged ``` -There is no difference for this dataset. Evaluate these plots for your dataset and select the best standardization object to move forward. +Explore more parameters consulting `?hmm_estimate_CN`. + +Once you get to a conclusion with results better explain the patterns, you can update your multi-sample +HMM object by using the functions: + +```{r} +final_res <- update_hmm_CN_multi(multi_esti, + res_tweak, + rm_sample = FALSE) +``` + +If you decide that the results for this sample is inconclusive, +you can set the `rm_sample` parameter to `TRUE` to remove it from your final results. # Call dosages @@ -552,8 +590,15 @@ Qploidy2 uses the BAF distributions to call dosages. See an example: ```{r} # res was generated by hmm_estimate_CN above, it contains only one sample sample_name <- "85-17" -baf <- multi_esti$by_marker$baf[multi_esti$by_marker$SampleName == sample_name] -dosages_one_sample <- call_BAF_dosages(res$by_marker$baf, selected_model = selected_model, plot=TRUE) +baf <- final_res$by_marker$baf[final_res$by_marker$SampleName == sample_name] + +selected_model <- select_best_baf_model(baf_vec = baf, + sample = sample_name, + cn_grid= c(2,3,4), + bw = c(0.02, 0.04,0.1), + plot = TRUE) + +dosages_one_sample <- call_BAF_dosages(baf, selected_model = selected_model, plot=TRUE) head(dosages_one_sample$data) dosages_one_sample$plot @@ -562,7 +607,7 @@ dosages_one_sample$plot Call dosages for all samples considering the copy number estimated: ```{r} -dosages <- call_hmm_dosages(hmm_CN = multi_esti, selected_model) +dosages <- call_hmm_dosages(hmm_CN = final_res, selected_model) head(dosages) ``` @@ -589,14 +634,14 @@ dosage_prob <- extract.gt(vcf, "PMD") dosage_prob[1:5,1:5] ``` -# Batch Plotting (Optional) +# Plotting all samples in batches (Optional) Generate CNV plots for all samples in batches: ```{r, eval=FALSE} n_plots_by_page <- c(seq(1, length(samples), by = 40), length(samples)) for(i in 1:(length(n_plots_by_page) -1)){ - comp_p <- compare_cn_track(hmm_CN = multi_esti, + comp_p <- compare_cn_track(hmm_CN = final_res, samples_to_plot = samples[n_plots_by_page[[i]]:n_plots_by_page[i+1]], facet_ncol = 12) ggsave(comp_p, filename = paste0("Samples_", n_plots_by_page[i], "_", n_plots_by_page[i +1], ".png"), height = 10, width = 11) @@ -619,7 +664,7 @@ Manuscript in preparation. Please contact the author for more information. # Acknowledgments -### Qploidy version 1.0.0 - Standardization +### Qploidy version 1.0.0 Funded in part by the Robert E. Basye Endowment in Rose Genetics, Dept. of Horticultural Sciences, Texas A&M University, and USDA’s National Institute of Food and Agriculture (NIFA), Specialty Crop @@ -628,6 +673,6 @@ of a Community Resource’’ (Award No. 2020-51181-32156); and ‘‘Developing Rose Rosette Disease Education, Socioeconomic Assessments, and Breeding RRD-Resistant Roses with Stable Black Spot Resistance’’ (Award No. 2022-51181-38330). -### Qploidy versions > 1.0.0 and Qploidy2 - HMM and BAF model selection +### Qploidy versions > 1.0.0 and Qploidy2 Supported by [Breeding Insight](https://www.breedinginsight.org/). diff --git a/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.html b/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.html index 9ed380f..dafb57a 100644 --- a/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.html +++ b/docs/Qploidy_alfalfa_tutorial.html @@ -9,11 +9,11 @@ - + - + -Qploidy2 - large-scale copy number estimation in alfalfa mapping population using DArTag genotyping data +Qploidy2 Tutorial -
-

4 Check data initial +
+

5 Check data initial status

The plot_raw function provides diagnostic plots for metrics that will be considered by Qploidy2 copy number @@ -5461,8 +5463,8 @@

4 Check data initial clear peaks, consider applying Qploidy standardization. If you already have clear peaks and do not want to try to improve them, skip to item # BAF Model Selection.

-
-

4.1 Check for batch +
+

5.1 Check for batch effect before standardization

Qploidy2 standardization assumes that each marker behaves consistently across samples, while allowing markers to differ from one @@ -5501,8 +5503,8 @@

4.1 Check for batch samples did not cluster according to genotyping year. Therefore, we can proceed with standardization using the combined dataset.

-
-

4.2 Initial screening for +
+

5.2 Initial screening for chromosome abnormalities (optional)

For some genotyping platforms, total read depth is consistent across samples. When this assumption holds for your dataset, deviations in a @@ -5514,18 +5516,18 @@

4.2 Initial screening for geno.pos = geno.pos, selected_samples = samples[1:12], # plot the first 12 col2test = "R")

-

+

Before proceeding to the standardization step, consider removing abnormal chromosomes from your reference dataset (genos).

-
-

4.3 Overview of samples +
+

5.3 Overview of samples heterozygosity

# interactive graphic if plotly package is installed
 p <- plot_heterozygosity(data, col2use = "ratio")
 p
- +

This is an interactive graphic; hover your mouse over the cells to get information on sample name, heterozygosity percentage, and the number of markers used for this estimation. Heterozygosity is an @@ -5535,8 +5537,8 @@

4.3 Overview of samples cannot be distinguished from inbred lines with higher CN.

-
-

5 Standardization

+
+

6 Standardization

Standardization of markers raw read counts or intensity data is essential for reducing technical noise and improving the accuracy of ploidy estimation. Markers from diverse platforms have different @@ -5643,8 +5645,8 @@

5 Standardization

plot_geno_by_marker(six_markers, alpha = 0.1)

-
-

6 Quality Assessment and +
+

7 Quality Assessment and Visualization

Visualize the effect of standardization for each sample and explore BAF and Z-score distributions:

@@ -5658,10 +5660,9 @@

6 Quality Assessment and

See ?plot_qploidy_standardization for more plot types.

-

-
-

7 Chromosome-level -screening for abnormalities based on Z-score (optional)

+
+

7.1 Chromosome-level +screening for abnormalities based on Z-score (optional)

You can use the same quick check we used before on the raw total depth (R) with the standardized z-scores. This is useful to identify samples with potential aneuploidies or large CNVs before running the @@ -5670,7 +5671,8 @@

7 Chromosome-level 
chromosome_level_test_plot_qploidy(input = qploidy_standardization, 
                                    selected_samples = samples[1:12], 
                                    col2test = "z")
-

+

+

8 BAF Model @@ -5860,18 +5862,18 @@

10.2 Applying to bw = c(0.02, 0.04,0.1))

Visualize CNV tracks for multiple samples:

compare_cn_track(hmm_CN = multi_esti,
-                 samples_to_plot = samples[1:30],
+                 samples_to_plot = samples[31:50],
                  facet_ncol = 8)
-

+

# For a specific sample
 p <- plot_cn_track(hmm_CN = multi_esti,
                    qploidy_standarize_result = qploidy_standardization,
-                   sample_id = "85-126",
+                   sample_id = "85-182",
                    show_window_lines = TRUE)
 p$arranged
-

+

p$baf
-

+

@@ -5913,53 +5915,81 @@

11 Re-standardization ## 6 # markers remaining with estimated BAF: 889 (32.14 %) 
# Compare before and after
 plot_qploidy_standardization(x = qploidy_standardization,
-                             sample = "85-126",
+                             sample = "85-295",
                              type = c("Ratio_hist_overall", "BAF_hist_overall"))
-

+

plot_qploidy_standardization(x = re_qploidy_standardization,
-                             sample = "85-126",
+                             sample = "85-295",
                              type = c("Ratio_hist_overall", "BAF_hist_overall"))
-

+

11.1 Re-run the HMM with the new standardization

-
one_sample <- re_qploidy_standardization$data[re_qploidy_standardization$data$SampleName == "J432", ]
-
-re_multi_esti <- hmm_estimate_CN_multi(
-  qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization,
-  sample_ids = "all",
-  n_cores = 2,
-  cn_grid =  c(2,3,4,5,6),
-  bw = c(0.02, 0.04,0.1), 
-  add_uniform_grid = TRUE, 
-  uniform_weight_grid = c(0.2, 0.5,0.95))
-
-# Same plots can be generated
-p_re <- plot_cn_track(hmm_CN = re_multi_esti,
-                      qploidy_standarize_result = qploidy_standardization,
-                      sample_id = "85-17",
-                      show_window_lines = TRUE)
-
-p <- plot_cn_track(hmm_CN = multi_esti,
-                   qploidy_standarize_result = qploidy_standardization,
-                   sample_id = "85-17",
-                   show_window_lines = TRUE)
-
-p$baf # before
-

-
p_re$baf # after
-

-
p$z # before
-

-
p_re$z # after
-

-
p$cn #before
-

-
p_re$cn #after
-

-

There is no difference for this dataset. Evaluate these plots for -your dataset and select the best standardization object to move -forward.

+
re_multi_esti <- hmm_estimate_CN_multi(
+  qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization,
+  sample_ids = "all",
+  n_cores = 2,
+  cn_grid =  c(2,3,4,5,6),
+  bw = c(0.02, 0.04,0.1), 
+  add_uniform_grid = TRUE, 
+  uniform_weight_grid = c(0.2, 0.5,0.95))
+
+# CNV profiles before
+compare_cn_track(hmm_CN = multi_esti,
+                 samples_to_plot = samples[91:110],
+                 facet_ncol = 8)
+

+
# CNV profiles after
+compare_cn_track(hmm_CN = re_multi_esti,
+                 samples_to_plot = samples[91:110],
+                 facet_ncol = 8)
+

+
# Same plots can be generated
+p_re <- plot_cn_track(hmm_CN = re_multi_esti,
+                      qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization,
+                      sample_id = "85-295",
+                      show_window_lines = TRUE)
+
+p <- plot_cn_track(hmm_CN = multi_esti,
+                   qploidy_standarize_result = qploidy_standardization,
+                   sample_id = "85-295",
+                   show_window_lines = TRUE)
+
+p$arranged #before
+

+
p_re$arranged #after
+

+

For this dataset, there are a few changes for some samples like the +one showed above. Chromosome 7 is pointed with higher number (5) of +copies in the first round standardization and with the +re-standardization it is presented as 4 copies. This instability still +leaves doubts about the CNV of this particular chromosome. You can +further explore tweaking the other parameters, for example, increasing +the number of markers in the windows to better fit the mixed models on +the BAF distributions:

+
res_tweak <- hmm_estimate_CN(qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization,
+                       selected_model = selected_model,
+                       sample_id = "85-295",
+                       min_snps_per_window = 60,
+                       cn_grid =  c(2,3,4,5,6))
+
+p <- plot_cn_track(hmm_CN = res_tweak,
+                   qploidy_standarize_result = re_qploidy_standardization,
+                   sample_id = "85-295",
+                   show_window_lines = TRUE)
+
+p$arranged
+

+

Explore more parameters consulting ?hmm_estimate_CN.

+

Once you get to a conclusion with results better explain the +patterns, you can update your multi-sample HMM object by using the +functions:

+
final_res <- update_hmm_CN_multi(multi_esti, 
+                                 res_tweak, 
+                                 rm_sample = FALSE)
+

If you decide that the results for this sample is inconclusive, you +can set the rm_sample parameter to TRUE to +remove it from your final results.

@@ -5970,19 +6000,26 @@

12 Call dosages

example:

# res was generated by hmm_estimate_CN above, it contains only one sample 
 sample_name <- "85-17"
-baf <- multi_esti$by_marker$baf[multi_esti$by_marker$SampleName == sample_name]
-dosages_one_sample <- call_BAF_dosages(res$by_marker$baf, selected_model = selected_model, plot=TRUE)
-head(dosages_one_sample$data)
+baf <- final_res$by_marker$baf[final_res$by_marker$SampleName == sample_name] + +selected_model <- select_best_baf_model(baf_vec = baf, + sample = sample_name, + cn_grid= c(2,3,4), + bw = c(0.02, 0.04,0.1), + plot = TRUE) + +dosages_one_sample <- call_BAF_dosages(baf, selected_model = selected_model, plot=TRUE) +head(dosages_one_sample$data)
dosages_one_sample$plot
-

+

Call dosages for all samples considering the copy number estimated:

-
dosages <- call_hmm_dosages(hmm_CN = multi_esti, selected_model)
+
dosages <- call_hmm_dosages(hmm_CN = final_res, selected_model)
 head(dosages)